Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score AATTGGAGAGACAAGATGAACGGCACGAAACAGGATGTTGGAACGTGGGGCAGAAATTTGCAAAAGAAGTTTGGTGAGGGGTTGGACATAGTTAGTATTAATGTAAAAGTAGTTAGTATTTTGTAGACTTAGGCTTTTGACAGTAA:1 + chr3L 15212086 5' - TAHRE 10239 1 58.22 ACTGGGACAATAAGGCGGTACAACATGAGTCAGACAGGCAAGCTAATCAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAA:1 + chr2R 9408136 5' + FB 34 1 62.33 TTAAATATTTAATAATTGTGGGCAGAGACAGCAACACCAGCAGCAGACGCATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAA:1 + chr3L 7370467 5' - Burdock 6322 2 65.75 ATGGGATACAGAGAGAGAATCGTGGAAAACATTCTACGACTAAATTATCTTATAATTTTAAGTAATGTGTTCTAGATTTTATATCTAAATCATATAATATAAAACAAAGGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 + chr3R 6523157 5' + I-element 14 1 74.66 GGCTCGGAAGAATTTCCATCACATATTTCATAAAGAATCATATGTATGTATACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 + chr2L 20253851 5' + roo 8732 2 67.81 AGAAGGCAACTCAAAATCCTGGCGAGCAGAACAGGATGTCAGTCGATGTCATTTGTTTGCCTTATGACGAGGGGCATACTACAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - 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P-element 2859 1 63.43 TCAGCTCGTTTCTTTCACCTGTTTTGCCGGGAAGTAGGCAACATTTTTTGTGTTTGCTCTTTGTGGTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:2 - chr3R 8625286 5' + jockey 61 1 55.48 TACCGCACTAGTTGAGCGCAGCTGTTAGTTGAGGTTTTTTGAAAAGTTGATATTACGATTTTGTGCTGCATACTTTCGGGCTTTAAAGTTTCCGAATGACTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAA:1 - chr3R 11568720 5' - BS 5073 1 69.18 ATATCAACACGTTTTTCAAAAGTGTGGGCGTTGTAATTTTGTAGGCGTGGCAACATGGGTCAAAAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACG:1 - chr2L 22104717 5' - INE-1 144 1 93.15 ATAATACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACGAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chr2L 12861727 5' + jockey 88 1 69.86 GCGGACTTTTTTTTGTTTTTTATCTGGTTAGTATGCTTACGCACATATTATGACTTATTAAAGTATTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACA:1 - chrX 21638161 5' + gtwin 15 2 75.34 GTACAACATGACAACCGTTCCTTACCAAAACTAGGGCTGATGGAGAATAAATACTAACACTGTTGGATACCGGTGTCATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGC:1 - 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chr3R 10900462 5' - jockey 4528 1 72.66 AACAGCCTGTCATCTTTTCCCATCAAATAACCAATCAACAATTGATATTCTGCCTGCATTCACCTGGCCGGCAAAAGTTCACTTAACTTTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 + chr3L 19702716 5' + pogo 28 1 66.44 AAAAAAAATGTTGTCCAATTCTAATTTACAGGAAAAAATGGAAGTAGATCACATTTTGCTTTCCTGGAACTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 - chr3L 14370675 5' + 412 7105 2 53.42 GTGAAGTATGCAACACTTTTTCGCCACCTCCTTTCGTTTCCTTGTGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chrX 9949574 5' + hobo 54 1 66.40 ATATATATATATAAGTATATACGAATGCTTATACTTATGTATATATAGGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 - chr3L 3433505 5' + hobo 73 1 66.44 AATTGAATGCACGTCAATATTTGACGCCTGAGGCCGCTCCACCTCCTCCTCGTCGCTGACCGTTAGGCAAACAATGAACAATTCAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:2 + chr2L 20327556 5' - roo 393 1 71.23 AGGCGTTCTCAGGCATCTGATAGCCACCAGTCGCAGAGAGAGCAGCCGGTGCGTTAGCGGGAGTGGAGGAAGCCGTTGGCTTTGGCGGGTTGCTGACAGTAAATCAAAAAACAAATTCAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAAC:1 + chr3R 13269472 5' + S-element 161 2 67.12 CTCCGGCAGTACGGTAGCAACATCATTGAAAAATGTGTCTAAGTGAATCGTCTGTTGACATCTGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTA:1 + chrX 19992568 5' + copia 4929 2 58.22 GCGGGTAAAACATTTTTCAAGCTTTTAGCGCTGCATACAAATCAACCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTT:1 + chr2L 2676585 5' - Quasimodo 187 2 66.44 GGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGACCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTT:1 + chrY 652806 5' - gypsy 389 2 65.75 CGGTACAGTGAAGCTAATGGTTGCATTAACACACCGAACGAAGCTAATTGCAAATGGGATATGCTTTCTAAGTTCATTGTTATATTTACTTCTAAAGTGTAAAATCTCTGAGAAAATGGTACTATAAACTTAATATTATAATAAAT:1 + chr2R 13750459 5' - INE-1 428 1 84.93 TACGCTTTCTAAACAAAACAAAGTAATATTGTGGAAAAAGAAAGTTCTGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACT:1 - chr2L 8852864 5' + Burdock 68 2 66.44 GTTTAGACACAAAATGCGAGTAAATGGGGAGATATAAGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGG:1 - chr2L 15523997 5' + opus 181 4 74.24 TATAAAGAGACTTATGTCAAAAACAATAGCACCATTATCTAAAGCCATTCCGAGTTCTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTT:1 + chr3L 8704501 5' - blood 7325 1 60.96 AGGCGGAGCCACCATCGGCGCAACGCCGATGGAGCGCGACAGCAGTGTGAGCGC:1 + chrX 20690542 5' + R1A1-element 389 1 85.19 TCAAAACAGCAAAAGCAAATTAAATGCAATTCAATTTTGAAAATCAAATATTTCCGACATACTGTGTCTCTATATATATATATAAGTATATACGAATGCTTATACTTATGTATATATAGGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr2R 17341048 5' + hobo 2 1 76.71 GGTTTAAGGTTACGCCACTGCCATCGATTGCCTTTGAACTGGTCTTAGCCATGAATCCAACGCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCCAACAATGTGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 29719281 5' + hobo 17 1 73.97 ATTGAAAAACCGGCTGGACAGTGAAATTCGCGTGTGCGTGTTTCGATTCTGCGGCACTACAAAAACCGATACGAAACTCCATTTATGACCGCCGTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGCCCACCCGATAACCA:1 - chr3R 12547982 5' - hobo 2912 1 67.12 GGTCCAGAAAGTGGCAACAGAAGCAGCATCAGCGAATAAAAACTTTTGGCTGTTTTTATAAATGTTTATTTAGCAGAAAGGAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 + chr3L 10111740 5' + copia 41 2 59.59 GCGCGGAAAAACACGTTACGCTGTATAAGAAAAGTCAATTTCGGATTTCGTTTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chrX 5938279 5' - pogo 2035 1 63.01 AGTTGCGGTTAAATCGAAAGTCATACTTTAACTACAATATAATATTACACGCCAAGTCAGAGGCATAAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr2R 21244807 5' + roo 10 2 74.66 TGGTCGTCTACAATGCCTTCCAGGTGGCCCTCAGTGGGTATATGTTCTACGAGGTGAGTTCGAATCTAGAGATTAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTAT:1 + chr3R 22572533 5' - HMS-Beagle 203 2 56.16 GTGACAGGAGTCCTCCATCCTCCACCGCCCCCCCTTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTTTCAGCTTTTCCTTTTGCATTCGTATTTGTGTGTCACATAATAAGCCGGGAAAGTTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGG:1 + chrX 11280693 5' - X-element 4704 1 76.03 AGCGAGCATGCTCTCATTTAGTTAGAAAAACACTTTTAAAAAGTGCACCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAAGTTTGCTTGTT:1 + chrX 7930691 5' + P-element 63 1 38.24 AGATTATATTTGTTTATCTAATAAATTACCGTGGATTCGTTATTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAG:1 - chr3R 4149055 5' - Burdock 6319 2 70.63 GACTGCGGCTAAATGCATCCAGAGCATTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chr3R 22266464 5' - roo 317 2 80.14 TAATTACAAATATATGTTTTTTTTCGAAATAACGGGTGGCAGTGGTCTAAAGAGATCCACATGTAATGAGTAGTTTCGGTATATTCTGCAATGTTCGACTAAAAGTCAGTCATCTATTAGCTTTTAAAGCGAACGGTCGTAT:1 - chr3L 15462235 5' + Cr1a 5 1 18.31 ATTTATTGCGTTTTTTACATGTTTAATAACTGCAGAATGTTTCAGCTCATTTTATTATCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATT:1 + chr3R 24301779 5' + Tabor 27 2 67.12 CCACTTTACAAATTTATTAAGGCCTCGAAGGCTCGGAAGAATTTCCATCACATATTTCATAAAGAATCATATGTATGTATACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2L 20253822 5' + roo 8703 2 58.22 TGGGGGATGGAAAAAGCCTGCGAGGGGTTGTTTACAAGAAGCCGAGGCCTTTGAAAAACGCTTTCTAATGGCCGGGATTCAGTTTTTTCTGGGGTTTCCCCGT:1 + chr2R 12699871 5' + copia 4727 1 69.90 GGTCGAACAAAGCCGACAATAAACATTCCATTCAAATGAGCCACCAAAATGGCATCAATGTCATATCAATCAAAAACTCAAACTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:2 - chr3R 22266560 5' + roo 36 2 60.96 AATTTGGAATTCATTCAAACAAACAAATAAATTGACCACATCCCCAGTTAGAAATAATTGCATTTTTGTAATGTTTAAAAATAATTAAATAAAAATGCAGAAATATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 107457 5' - roo 9053 2 72.60 ATTCTAATTTACAGGAAAAAATGGAAGTAGATCACATTTTGCTTTCCTGGAACTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3L 14370658 5' + 412 7122 2 65.07 GCAAAATAAAAAGTGATTCTGTCTCTCGCTTCGATGTATCTGTAGCTATATCCGTATCTGAGGCTGTTCGGTGTCTGTTTTTGTGAAAACCATTGAAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAA:1 - chr3R 4857982 5' + TAHRE 10372 2 66.44 ATTTGTGGACACGAAAAAAGTTTTGTTCGCCAAGACGGGCTACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAA:1 - chr2L 2675042 5' + Quasimodo 73 2 71.72 AGGGCAAGCTGGGAAAGTACTTCATTAGGGTAATTTACGATTCCAAAAAGCCAAGACATTCCTGAATCTTTATGCATTACAATAGTCAAGATAAATGAATCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTAG:1 - chrX 18747195 5' + R1A1-element 5251 1 70.00 CAGTGGTTCAAAAGGTAATCTATCTGATTGAAATTCAAAACAAATTGAAGTCTGAAGACAAAGCTCTTATTTCAATTAAAGGGATAGCATTAGCATCATCATAGCATCATTATTAAATTTGATTATCTACATTA:1 + chr3L 2869114 5' - Penelope 352 1 26.87 ATGCAATGCCACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 + chr3L 10068901 5' + 412 7124 2 66.44 CAGTCAAGATAAAAGTTCTATTGACAAGATTAAGGTTTATTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3L 18954095 5' - roo 9041 1 63.70 GGGGATTGACTAATTGATGTCCATAACATCGAGGGGATCCGGATGAGGAGAAGGATGCAGGCAACTTAAACTAAGGCTGCGATTGGTGACAGTTTGATTGATGGCTGTTGTAATTTATAATTTCTATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 - chrX 998267 5' - copia 236 1 71.92 GCAAACAAGTACACAGAAAGAAGTCGGGCATGTCTAAAAATACATTTCGAACATGCTTGTTAAATTGAGAATTTATTTCCAAAGAAATTATTCAATATTCGGTATTATATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr3R 23714175 5' + I-element 12 1 76.03 GTACTTTTAATAGTAATAAATATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAG:1 + chr2R 11609884 5' - roo 9009 2 62.33 GAAGGGCAGAGAGTCACATTCGGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chrX 22715186 5' - opus 484 2 76.03 CGGATGGATGCTGGGCAGGACTGGGATGGATGTGGGGTATCGTTTAAAATCATTCGAAAAGTAAACCAAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATT:1 + chr2R 7343229 5' + flea 4804 2 53.42 ATAAACAAACAGTATGACAAGAGCCTAATGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACA:1 + chrX 14340676 5' + P-element 419 1 28.08 ATTTATTATAATGATTCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCA:1 - chr2R 12185470 5' + accord 9 2 76.71 AGTGACGCGCATGAATGGCTTAACGAGATTCCTACTGGTTGGGACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTCTGAGTTACGGTGCTAGTTGAGCAAAACTCGGGTGCTG:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 5072 1 64.66 AATCCCAAGTTTAAATTAATGATTGCAGTTTGCGTTTGAAATGACTCGTTTGAAGGTGTCGTGTGACTTTATTTCCTTGTTTACTGTAACTCACAAGTCTCTCCTTTACTCAAGTCGACTCAAAACCTCCTCGTGGTGGTCCCCG:1 - chr3L 2206314 5' + R2-element 133 1 57.24 TAATCTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGTTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAA:1 + chrX 22398530 5' - Gypsy6A_LTR 115 1 45.21 ATCACAGATAAGCTTTGGAATTTCACCCATTGATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATAC:1 + chr3R 8293507 5' + Stalker2 38 2 58.22 CTCCTGGTTTGAAAACCCAAATAGGGCATGGTGGGCGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGAAAGCGGCCAATCCTTGTACTCGAA:1 + chrX 4788542 5' + Max-element 8278 2 61.62 TTCAATTGATGCCAATTAATCGAGGCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr2R 14767325 5' + Tirant 8128 2 71.43 GGAGGTATAGGTTTTTGTGTTTTGGCATCAGCTTGTGATATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGAC:1 + chr3L 18420936 5' + jockey 4753 1 73.29 TCGGGGGAGTTAGCAAGCTTAAATGATTTTTAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2L 15596943 5' - roo 321 2 82.88 CAACGAATTTGTTCTCCTGTTTTTTTTTAATGTTTTTCTTATTGGTTCTTCACTGTACCGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCG:1 - chrX 13565600 5' - mdg3 5248 1 59.59 GCAAATTTAAATTGAAATTTAAGCTATTATTTATATATGATTTCCCGGTAGTTTATGTACTTTATATATAATATAAAATAATTAGTTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 - chrX 18318277 5' + copia 4905 2 59.59 GGAAGTCTTCAATTGCTGATTGTGAAAGACTAAATTGAAGTAGAGAAAGTATTTAGTTTGGCATGGCTCACAATTAGGTAAATACATACAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAG:1 - chr2L 19217737 5' - springer 349 4 58.90 TGACACGTTAACCCTTTCATTACATAGCAATACATTAAAAATCCCTATTAAATCTTTAGCTATACATGATTTCGGAATGCGCATAAAGCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTT:1 - chr2L 1871068 5' - mdg3 5466 2 63.01 GAAAAGAAGTGGGAAATCTATGGTTTAACTGCACCACATTTCGATCTAAATTAAATTTGTTGAGTTATGGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chrX 19591137 5' + roo 45 2 54.29 GAAAGTGTATGGATTACGGTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chr2R 20931599 5' + blood 30 2 60.96 AATTTTCTTAAATAGGAACCAGTTTTATGATTGTAATAAAAGTTTATTTTCTTAATTATTAATAGGGTATAAAAGTATGTTGCAATATCTTTTAAGATCAGTCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGA:1 - 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roo 8977 2 80.82 ACTGACGCTTCTATTTCAATCCAACTGACTGCGGCTAAATGCATCCAGAGCATTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3R 22266438 5' - roo 9010 2 61.54 CGTGGTGCATAATTCTGCCAAGGGACACGCCCAGTTTTAAACCTAGATAAGAAAAAATTAAACCATCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 - chr3R 7655674 5' - 412 437 2 55.48 CAAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTCACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGAGAAATAACGGGATACCCGCGGC:1 + chr2R 4730084 5' + gypsy8 321 1 77.37 AATAAAGAAATTGTATTTGACAGGATGGGCAGTTGGGTGTTTTTTTACTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATG:1 + chr2L 15096892 5' - jockey 4924 1 71.92 AAGTTTATAATTTGGTTAAATTCTGTTTTCAAAGTGGCATAATGTATTAGTTCTCTTGAGTTCCTAATGCTTACCGCTTACATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 + chr3L 16643128 5' + FB 40 1 56.16 CCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3L 19938471 5' - roo 344 2 61.64 CCTAACTTACTTTGAGTCTAGTAATTTATTACTTAAAAGTAAGTTCTAAGGTATCTCCCAGCTCAGCAAATACCCACTTCCACCCTGTGAGAGTTACTTTCTGCAAAAATTGCGTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGAC:1 + chr2L 3592139 5' + R1A1-element 5226 1 75.34 AATATCTGACCATCGATCGGTCCCACTGTGCAGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr3R 17794616 5' - P-element 2837 1 45.38 GGTAGATTCAAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCCAAAAAAACCCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCT:1 - chr2R 6433217 5' + F-element 4228 1 73.57 ATGCAACCCAAGTGGGTGGCTGCCAGAGGTTCAACATTTGCCCACCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCC:1 + chr2R 13773021 5' + opus 7073 4 68.49 GAAAATGAATGAAACGGAATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 - chrX 1831287 5' + P-element 63 1 23.64 TTGCGGCGCTCCATTTCAGTGGTGTTTATGACACAAAGTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTC:1 - 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chr3L 25978820 5' + 1360 94 1 67.12 CTCGCTGCTTACTCAGAATTGCCCTTTAGCCAGGTTTCAATTGGGCCGATCGCCAAGTAAGAATATTTAAAATGTAATATTTATTGCTATCTTTAAGAAACATTTAAGAAAGCAAAAACCAGCATTTTAATA:1 - chr3L 15219960 5' + HMS-Beagle 6581 1 53.79 ATATTGCTCATACGCCACGTGAAACAGCATCGGCTTATTTTCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGTAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:2 - chr2R 8492820 5' + pogo 76 1 67.12 TAGCATTTATCTGGACCCGAGATTGCGGCTGACTCATAAAACTTTTATTGGACCCACTTGATGGGGAAGTTTTTTTTTCTTATTTTTTTTTCTTTTAAGTACGTGCCTAACAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr2L 10128033 5' + hobo 15 1 72.60 GCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTCGAAATACT:1 + chr3R 19537492 5' - hopper2 1534 1 65.07 GAGAGGTAAACATTACTAAGTCAACTTTAACCAAACACTATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTA:1 - chr2L 1922569 5' + BS 5073 1 75.71 ATTTACAGGAAAAAATGGAAGTAGATCACATTTTGCTTTCCTGGAACTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - 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chr3L 11754785 5' + Doc 130 1 48.28 CCACCTCTCTTGATTGCTTTTCCAGACCACTTCGGTTCATTGAACCAACCCCGTACCCCCTGCCCGCCAAGCTTTACCCCCTCACCGTTGGCTAATTGCTTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr3L 19702899 5' - pogo 2086 1 73.97 TGTATTGTATTGCTCGGATTAAAATAATTGTATACATATTAGAGGGCTGCATAACACCATTCAAACCATTCAAAACAACAGTCGTGCTGAGATGATCGCAAATTATCGTGCATTTAAACACGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1 - chrX 21177268 5' + Tirant 3 2 61.64 ATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAA:1 - chr3L 20910092 5' + F-element 79 1 65.07 CAATTTGTACGTCCATATATATTGAACAACGCCCTTTGTTTAAGTGCCGATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTC:1 + chr3R 29952691 5' + invader4 66 2 62.07 TGGTTCGACTGGCTCTTTGATTTCCAGTAGACGAGGCAAGTCGTAGTACACCTCGCACGAAGGTCATAACCATTTCTGGTTCTTTTTGTGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCG:1 - chr2L 22257041 5' - G6 1932 1 67.65 AATTGAGGGCAGTCGACAAAGAAGAAATACAAATCACAATGGCTGCACAAACAACCAAAACAACAACTCGACATCCGTTTTGCTGGCCCTTCAGTAATGACATTTTCAGCGGCACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGAT:1 - 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chr2L 19681096 5' - hobo 2908 1 59.38 GCCCCAGGGTAGTGACGAAAAAGGATTTAAGGCACAAATGTGATTTCTTTGCTAAGAACAAGGACGCACGACCGTTTAAGAATAATGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGA:1 - chr2L 17524091 5' - mdg3 358 1 58.22 AATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGT:1 + chr2L 12766997 5' + hobo 86 1 75.34 ACCAAGACTTGCCGCTCAACGAGAGTCGTGCAAATGAAGTCATTTCGAGTGCTCAACTCGACTATCAATTGAGGGCAAGAACTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 + chrX 8855952 5' - 297 374 2 70.37 TTAAACGTGAAATTGTTGCGGTGCATCTTGGCGTACATATTGCTCATACGCCACGTGAAACAGCATCGGCTTATTTTCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGTAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr2R 8492856 5' + pogo 40 1 58.22 ATTTAAGGCAGAGCATTTCAGACAGCACTTGTACCGTTCTAGACTTAAGAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 - chr3R 18514426 5' - pogo 2036 1 66.44 AAAGAAAAAACTCATTAAACGAAATTAGTGCAGAACTTGACATATGTAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATT:1 - chr2L 22340386 5' - HMS-Beagle2 235 2 71.92 TGCGAATCGGAGGGGGAGTGCGTTACATAGTTTGCAAATAAATTAGAATTTGCTACAGCCAGCGGCAAGCAAATTAGAAACCGCTTGAACTACACGAGGCGAAATGTGCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2L 20268874 5' - hobo 2927 1 76.03 GGAAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCCATTTCTTCTTTTGATTTTTGAGTAGGCAGA:1 - chr3R 13572091 5' - 412 407 2 72.60 TAGAAGAAAAGCTTCAGTTTGAATATTTCAAATGCTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAA:1 + chrX 13008714 5' - blood 291 2 79.45 CCCCCCATCCTAACTCTAATTTATTTTTATATGTATATAAATCGCTTTAGGTGTAGGAGAAAACTGGCAGCGAATGAATATATATGTAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATA:1 - chr3L 21043154 5' + Quasimodo 38 2 58.22 GAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chrX 19744499 5' + P-element 69 1 38.36 AAGTAGAGACTCTAGAAATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAA:2 - chr3R 1048055 5' + Stalker2 64 2 60.27 GATGGATGCTGGGCAGGACTGGGATGGATGTGGGGTATCGTTTAAAATCATTCGAAAAGTAAACCAAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGT:1 + chr2R 7343231 5' + flea 4806 2 54.79 GGGGCGGGCCAACGAGTGAGACGAGTGTTAGACATATGATGACAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATT:1 - chr2L 16202686 5' + copia 4945 2 69.86 TATATATATAACGTGTAACGTAAACACGTACAAGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 + chr3R 12547845 5' + hobo 56 1 54.11 TCATGGAACACGTTCTATGGCTTTGTTTGACAGCTCGGTCGAAAACTCAGGCATCAGTCCTCGAATGCGAAAATGTGTGTATAAATTAATTAAATGTATGGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTCGCAGGTAACG:1 + chr2L 15934525 5' - springer 7480 2 60.27 AGCCAGCAAATATTGCACTTGCATTTACAGTCATATATTTTTATGAACTGTGCATTAAGCCACAATGAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 2622636 5' - roo 353 2 55.48 GGTTCATTTAAAAAAACCAAATGGGCCATTAACAGCTTAAATTGGGCACCCTTATATAGAGCTTTTAACTAATTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 10838621 5' - roo 9024 2 55.48 GGTTGACATTTACATTTTTGGTCAGTTCGGTGAGAAAAAAGAGATGGTTCTCCGTCCTGGTTTCATGTTGTCACATAAAATGCTCCAAATAACACTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTAT:1 - chr2R 17357398 5' - hobo 491 1 61.64 ACAGCGCCGTCTTTGTTTGTATAGCACTTGTTTATCGCTGTCCTGGATGAGCGGAGACACTCGCAGGGCAGTAATAAGGGTACACTAAGAAAAGTTGATAACTTTACACGCATTAAAAAGGTCTTAATATTTAAATTTGAATTCAA:1 - chr2R 9660446 5' + TART-A 13181 1 63.01 CCACTTTACAAATACACACACAGCACACAGGCACGTGACATTGTGGTTAAGCTGGAAAAAAAGGTGAGAGTAAGCAAGAGGAAAGTGCGCCAACTTAAATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chrX 22578139 5' - 297 6960 2 73.97 TTCAACCTCAATTGGATTGTATCAATTTCTTAAGCCATTGTTCCACCATAATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3R 7305912 5' + 412 7121 2 65.75 GCATATGCAATAGTTTAGTTTTGTCCACTTATAGAAACATAAATTCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 11609969 5' + roo 75 2 70.55 AAATAATAGATTTAGGTCGAAATTGTAAGGCATCATACATATGGTACTTATTATTCATGCAATCTGACTTAAAAAAAATAAACATTTAATAATTTTTTTTAGGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGTTATTATTTTAACCGCA:1 + chr4 1165857 5' - Tc1 7 1 75.34 TTTTTCGCTTCCAGCTTGATTAAAATTTCATTAACAAAGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 + chr3L 6014956 5' + jockey 91 1 73.29 CTTATATAAGGCTTAAAATCATTAAACGGATTAATAGCTCAAGTTTTGTTCAATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr3R 7136668 5' + roo 66 2 67.12 TCGGAATGGAATATATATATTTCATAAATATTAAATTGAAAGGAAATGACTGGAAATCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chrX 10344870 5' + roo 8728 2 65.07 TTTTGATCATTATTATCTATTTTAATTTGTCGGTACATCTTTTCAATGTCTGCCGAAACAACAAATTCCCATTTTCTCCATTTAATAATAATGTCTCTGTGTTTTAATAACCAATATCCGCTTGAAAAGTAGGCCTCAACGGCAAT:1 - chr3R 19445417 5' - mariner2 161 1 65.07 AAAACCTAATAGTAAGTTCTTGGTTTTAAAATTAAATTCTTAGAGCTTATCTCAATTTATGATTTTTATATGCAGTAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTT:1 - chr3L 15374766 5' - 3S18 325 2 75.34 TACTTTAGAAATTTGTTACTGCTCTTCATATTTGTCTGGCTTTGCAAAAAAAAACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 + chrX 12344251 5' + F-element 24 1 78.08 GCCTCGATGTTTGGCCAACCCTTCGTGCTGCTGATGAGATGGCTCAATTGAGAGCTTTAATTAAATTATGTTGGTATGCACAGGATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 - chr3L 12729210 5' + opus 145 4 60.96 GTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 - chrX 22715145 5' - opus 443 2 59.59 CCTCTCCCGCCGCCCATCAGGGGCATTTCGCATATTAAACTAATTACTTCATCAACATTTTAAACTGCCAGCCAGCTTTCTTTTTTAATTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 + chr2L 2518473 5' - jockey 4956 1 52.05 TAAGTGATTGTTGAAAATGCTACAGGTGTGAAAACCATAAAATTCTCATTATTTATAATAAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAT:1 + chr3L 12729075 5' - opus 7444 2 60.96 CAATTAATATCCAATATCTGGGTGCTGGCATCATTAGTTTATTTTCCTTTCGCTGCCAACTTTATTTTTATTCCCTTTCCAACAAATATATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATT:1 - chr2L 8615468 5' + 17.6 6953 1 68.49 GGAATTGCAACACAAAAACGAACAATATTGATCGAAATAATAGGGCGCAGCATCTGCATGTTTATCAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTAT:1 + chrX 13506711 5' - hobo 328 1 55.04 GGCAACGCGCGTTTAATTTTTTATGCATGAAGTGTAAATTAAAATTAAATTGACTGTGCGGTCAAAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 - chr3L 19434173 5' + Doc 63 1 67.12 GATGCAGGCAACTTAAACTAAGGCTGCGATTGGTGACAGTTTGATTGATGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTC:1 - chrX 998214 5' - copia 183 2 67.81 CACGCATACAGTTCGTTTGTAGAATGGGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr2R 21453619 5' - hobo 2921 1 48.33 GAGTAATGGGTATCTGATAGTCGTGGAACTCTACTATACCTTTTTTGACCTGCTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr2L 3182067 5' + pogo 25 1 57.80 GATGGAGAAGCGAAGGATGTTTAGATAAATTGCGCCTGCAGAGATTTACAAATTACGCCCGAGGCGGCGAATGGCGAAAATGGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr2R 18467102 5' + roo 8702 2 56.16 TATGCTTCACATTTTTTCTGCTGCTCTTCAGGCTCGTTCCGTGTAATTTATTGAAACACATTCATTTCTCGCTATGATGTGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 - chr3R 19500736 5' + jockey 81 1 55.48 CCGAAGATCACTTACGAGAAGCCAGATAAGTGGAATGTGAACTTAGACGGCACAGCCTACAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGC:1 + chr2L 11047959 5' - Juan 4176 1 52.00 GTGTCCTCACCAACGTGAAGGAATTCCAAATAACTACAAATTCAGCTTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 - chr2L 10128166 5' - hobo 2884 1 62.31 ATTAGAATACTTCTAATCTACATTTGAGGATTGTCAATCTGATATTAATAAGCTTGAAATGGCTTGTGTTCCGATAATATCTTATAATGTAACATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTG:1 + chr2R 8374984 5' + roo 8688 2 66.44 GGTGTATATAGAGTGTTTAAACGTAGATAGTGTGCTTATTTTAAAATATTTTTAAATGTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 + chr3L 25821781 5' - opus 7452 2 55.80 AGTGAGACGAGTGTTAGACATATGATGACAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCA:1 - chr2L 16202672 5' + copia 4959 2 79.45 AGTTCCCCGACGTCCTCTGAACCTGTGGGACGACCCCCCAAAATCGGCCAAGTCAAACAACACTTCCAATTAATCAAAACCCATAACATCGCACAGTGCCTGCAATTCGTATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 + chr3L 5329039 5' - 412 7535 2 77.40 TTCTAAATCATTTTCTTAAGTTTTCCGTCAGTTTTTAAAGCTTTGCCAGTTTAAATGCGATTTATTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTT:1 - chr3R 19144478 5' - Juan 4155 1 58.90 AAGTGCTAAAAATAACATGGTGAAAAAAAGGGGTGGGGAAAAAACAAGCTGGAAAACCTGCCGAAATCAGAAACCGAAAATCGCTGGAAGCAAAACGAAAATATCAGCGTATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAG:1 + chr2R 15451456 5' + Porto1 232 1 68.28 CGTGCTCGGGATAATTGCTTCCCATCATCAGCGGCGGAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 - chrX 19744535 5' + P-element 33 1 63.01 TTTTCACAGGACTTTTGAACTTTCTTTTAAATGCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTAATTCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTTTACAATAATTTTACTACAATGATCCTTGTCAAAGGAGATCGGG:1 - chr2L 20122496 5' - X-element 4519 1 75.86 ATTTCAGTTCCATTCTTTCAGTTATCCTTTCGCCTGCGCCATTGGCAACTTTCGTTTTTTCCTTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 7655559 5' + 412 47 2 53.73 AGCACACAGTAAGTTTCTTGATTGCCAAACCCATTGTAAATATAAATTATTATTTGATAAGCGGCTCATCATAATAACGGATGCAAGTAACCAAACCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATA:1 - chr3R 30564829 5' + F-element 4572 1 58.90 TGCCACGCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGCTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACGATAAGAGTCCAGCTTTT:1 - 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P-element 2789 1 18.49 AAATAGTTTTCATATATAAAGCAGTGTGTCAACACACAGTGTGTGCTAAGGATTCAAACCTTAATTTGTTTAAATAAGCACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTA:1 + chr3L 15374602 5' + 3S18 43 2 57.53 GCTGTATTCCCGTAGAGGAACGAGCAAAATACTTTGCTCTGAAGCCTGATATGCTTATGTTTAAGTTGGCAAATAACACGATTTTTATGTGCTGATATCATTATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTT:1 - chrX 14371515 5' + jockey 374 1 71.23 ACGACTTGGACAAGCTCCGATGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTAT:1 + chr3R 22275251 5' - flea 4965 2 56.16 TGCCCAAAACCCGAAGAAGTACACAAACCTGAGTTTCCAGACGCCATAACTTTGCCAAATGGATTCCAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTAT:1 - chrX 4765939 5' - 3S18 286 2 55.48 GTGAGGGGAGTTTAAAGTTATTCTCGTGTTAAGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 + chr3L 3540080 5' - mdg3 224 2 70.55 GACATTTGCACTTTTTCCCAGGCCAAAAACCTTCTGTTGTAATGAGAAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - chr3L 9240457 5' - 412 7459 2 76.03 GAACGTAAGTAATGTAATTATTCAAAGTTCTTTGATAGCTAAATTGAATTGCAGATTATATATATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chr2R 14082392 5' - pogo 2048 1 59.59 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATGTATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCGGCCTATAAAGGGTAGGCGCGAGCACG:1 - chr3L 5685501 5' + gypsy8 345 1 75.40 TTTTCAAAAGGAGTCTGCTCTATATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAAATATGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:1 - chr2L 21082213 5' + mdg3 68 2 63.70 CAGCAAAAAGCGTTAGCACGGAAACGGAAATGACAATCGTCCTTCTATTTCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGC:1 - chrX 6587704 5' - hobo 2869 1 65.75 CGCAAGAAAGTGAGAAACGAAACCCGGATCAAAGAATAAATTTAGAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3L 12776086 5' + roo 8704 2 58.22 AAAATACTTACCACATAGGAGCGCAACAAAAATATAGAACTATATTATATTAATACATATGTAAAGATAAGGTGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr2L 12814700 5' + hobo 34 1 57.46 AGGGGAATTGTAAATGAAGAATTATCCAACAACTCCACTAACGAAATCCCGGAAAATTAGTCGAAAACGTGCCGCCTATAAATAGAGGAATATATTACGTACCATTCACAGCCGGTAATCGTCCTGGCGATTTCGGTTTGGGCAGC:1 - chr3L 6263280 5' - BS3 1364 1 65.07 GCTGATTGTGAAAGACTAAATTGAAGTAGAGAAAGTATTTAGCTTGGCATGGCTCACAATTAGGTAAATACATACAAATTAATTAAATATAAGGGGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGG:1 - chr2L 19217723 5' - springer 7492 4 55.56 CTGCTGAGCACATGCAATTAGTGCCAAATGTTTCCATATTTTTGCAAAAACGGCCGGAGCAGGTGGAGCAGCAATGCTGATCATGGGAGCAGCACAGGATGCTCTAACCAACCATGGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrX 12082145 5' + 1360 5 2 54.79 TCTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGGGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chr2L 20327673 5' + roo 90 2 79.45 CTGCAATTTGCTAGTGCATCGCACCCGGAGCAACTGCAACCGTAGGCGGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAAT:1 + chr2R 21105719 5' + Stalker2 7323 2 67.12 AAAGACATAACTGCGAAAAATATATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:2 - chr2R 8375147 5' - roo 9036 1 60.96 AGCCAACGTATTCCAATTTGCGATCTGCAAAACATTTTACTTAAGGCTAAAAAGCAATTAAAACAAATTGTGCCGTAAGTCAAGTCGGTGGGGTTACAGCCCAGTCCCCCGCAAATAAAAGAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAAAA:1 - chr2R 7737874 5' + F-element 4687 2 71.23 TAAGAGAGAAGCACGAAAACATTCAGAGAAGTATTTGCGGTTTGTAAGCGAGTAGAGACTCCCATCTCTCTCGCACCTGCAGTGCTAAGCCTTCGAAAACAGGGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 - chr3L 17896052 5' - P-element 2869 1 74.66 GAAAAGTAAAACGGACCAACAAAATCGCAAGGCTCTCAACTGAATTCAACATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chrX 3743764 5' + Tirant 8146 2 55.56 AAAATGTGTTTGATTTCCTTTTCGGTTCTGTCAATAGGTCATGCTGATACTGGGTATGTGGTGGGGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAA:1 + chr3R 11601243 5' + copia 233 1 58.90 CACCCATGGGAGCGTAATAGGTGACCCCGATTTCTGTGTGCCAGGGGATAATTGGCCAGTGCGCCCCATTAAGTTTTGGATAGCATCATCGAGCCGGATTACCGGAACTGCGTTTCTTTCGGGCATTTG:1 - chr2R 22459245 5' + 3S18 395 1 66.67 ATTAATAACGAAATTTGGAAAGGCCAGAAAAGTACTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3R 11072462 5' - roo 327 2 78.57 CTATCTATTGCTTCTATATTTATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 - chr3R 6461845 5' - Transpac 253 2 60.00 ACAAGGAAAATTAATATGTAAATGTTTGAAAATTAGATTTTGGACCAAGTCGCTTTTGTTTAGTTGGACAGCGTGTGAATTATGTTATTACAAGGCGAATGCTGCTGTTTTCGGATTTGTTAAATTTTTTTTTTTATTTTTAATAT:1 + chrX 22600493 5' - Rt1b 5150 9 57.53 AGAGCGAAGTATTTGTTGTTTCTGAAAAACTTGACTTTTAAGAAGAATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTCTTTCGTTTACTCTCCCTTTTGTACGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTGCATGCACATAAACTGCAC:1 - chrX 2516265 5' + Cr1a 264 1 70.63 CAGTTATAAACGTCGATGTGAAAGTTGGCTGTATTGGAAGCAATAACAGCAGTGATGGAAGTGAAGTATTCGAAGATTCGAAGTTGATTGGCAGACCATCTGTTTCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 + chr3L 24089472 5' - mdg1 7442 2 73.29 AGTTTTCAAAGAAAAAGTACTCTTTAGGGTTAGAGTACTTTTTCTTTGAAAACTGAATGATTTGTATATATATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGGATACGATCATATCCCCGTTAGGAATA:1 + chr3R 7819524 5' + invader3 5250 2 69.86 CGCCGCGTTTTTACCGTTTGATAACCTAGAAAAGACGCCTAGGCAGGTATGAGTGTATGCAAGAGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr2R 14486585 5' + 297 53 2 57.53 TAAGTGCCCATTACACACGGCAGCCCCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3R 5767369 5' + roo 8727 2 61.64 AACTTGCGTAAATTCCGTTTCCCGGCCACGAAAACCGAGCCACAACAGCAGCGTTTTCATGAAAAACCTATTTGCACAAACCTGGTTTTTGTGTACGAATATTCATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr3R 29381454 5' - hobo 2922 1 72.60 CCCATTTCAGAGAGTCAGCCCAACGCGGCTCAAGTATTTTGCATTGCTAAGCAGAAATTATAAATCAGGGCAATTGTTGAATATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTT:1 + chr3L 17138425 5' - F-element 4257 1 55.48 AATCCTATAAAATAAGATTCAATAAATATATTTAAATAAAGCTGCACTTCTTATATAAGGCTTAAAATCATTAAACGGATTAATAGCTCAAGTTTTGTTCAATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 7136717 5' + roo 17 2 73.97 AATTAGCGCGGCTAAAGAGCAGTGGAATAACAATACAAGCGCCAAATGGCCGGCAAACCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:3 - chr3R 29623322 5' - roo 345 2 60.27 ATCTATATATGTAGAAAAGTCCATGAAAGTGTACCTTTTGTCGCAGATGGTATATACTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr3R 6171225 5' + 297 55 2 63.01 AACCTGTTTGGACTTCAACTTTCCAAGATTTTCAGTAAGTTGTATGGGTATTCTTTTTTAAGTGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chrX 17933636 5' + roo 57 2 60.96 ATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGG:1 - chr3R 6461824 5' - Transpac 231 2 74.66 ATACCTCAAAATAATTTAAGAATGCAGTTTTAATGGCAATTCCATTTGCAGCCAAGTGGCCAGATTTCCCCGATGGAGAAACCGAAAAAACGGTCATGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr3R 26658105 5' - hobo 2933 1 79.69 AATACATACCGGTAAAATACTTACCACATAGGAGCGCAACAAAAATATAGAACTATATTATATTAATACATATGTAAAGATAAGGTGCTTAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr2L 12814687 5' + hobo 30 1 58.90 CTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr3L 13380446 5' + hobo 53 1 61.42 TGTATACTCGGAATATCTACATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCG:1 + chr3L 21765399 5' + gypsy 45 2 54.11 CTATAGTGCTATCTAAAAATGGAATTTTACGCCCACCTGGCAACTCTAGAGCAGCTCCAAAAGCTCCCTATCTACCTTACTCTCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2R 16031466 5' + hobo 34 1 61.27 AGGCAAGGCATAAGTTGAGCTTCTATCTGTTTAAATATTCCACACCCGAAAGTTGTCCACCTTTGTCGATGAATACAAAAAGGAATACAAAATATTAAGAAAATATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3L 107645 5' + roo 16 2 75.34 GAAAGTGTATGGATTACGGTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACATATAAGTACACAGCAA:1 + chr2R 20931599 5' + blood 30 2 60.96 GTAAAGTTTTGTTGCGTTCGCTTTCTCCTTCGAGCTTCTCGAAATATTTTTTTCATTTTATAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGAAGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCGGTGTGCAATAGTAT:1 + chr3R 26745200 5' + invader1 185 2 57.53 AATTAGAAAATCGCACCAATCGATGTGAGTACGTATGGAAAACTGATATGGAATCACCCGAACATAACCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chr2L 12696113 5' + pogo 49 1 58.22 GAGGCAAAGAGGCAAGTTAAAAAAAAAATATAGAAAAGAGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGAAT:1 + chr3R 13571979 5' + 412 27 2 65.75 GTCGAACAAAGCCGACAATAAACATTCCATTCAAATGAGCCACCAAAATGGCATCAATGTCATATCAATCAAAAACTCAAACTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACCTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3R 22266559 5' + roo 8701 2 60.27 CAAAAGTTGTGTCAACAATGTGAAAGATAAACAATGCGATAGTATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr3R 23565206 5' + jockey 17 1 75.56 CATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTT:1 - chr2L 23295915 5' + micropia 24 2 65.75 CCTTTCACACGACCTTGACTGCACTGCAATATATATGTGCACATATACGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 - chrX 13484200 5' + hobo 66 1 68.12 AAGAGATAATATTATTAAAAAGGCTTGTTGATATTGATTACTGTTCAAGAATGCAAAATATGATCTAAAGTTCAGTTGTTATTTTTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:1 + chr3R 6583229 5' - I-element 5313 1 58.22 ATAACTTTCCTCAACAACAGAATGGGAATGTCGACACCTCCATAAAATTAATTAACCCCCAATAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chr3R 12569573 5' + blood 54 2 54.11 CAAAATATAAATGTGCTTGGTGCAGCAACTCATGTGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCG:1 - chr4 39230 5' + springer 69 2 75.00 CACGTGCTGGATGATTTAGAATGCGATGGCCGAAATCAAATGCCAACGAAAAGGGTATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGG:1 + chr2R 23420696 5' + G2 2779 1 58.21 GTTGCATATAAAAACAATGGGCCAAAGAACTTGAAATCAATTTCAAACGTTTTAGGCAAAGCCAATTGATTTATTTGTTGTGCGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - chr3R 28788817 5' + I-element 40 1 57.93 GCAGCGCCTTCCTTTTCATTTGGTCCCTTAGTCAATTGGCGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCTT:1 - chr2L 19841561 5' + BS 64 1 68.42 GTGTTCGCTAGAGTTGGCCAGTGTTGGCCAGCGTGCGATTCGGAATGGAGTCGCGAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTA:1 + chrX 19744414 5' - P-element 2821 1 41.10 CTGCAAACGCTAACACAAGGATGTGAGTCCTGGGAAGGGAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3R 5767446 5' - roo 8990 2 72.60 TCCGCAAATGATTAATTTGCATATTTATGAGACTAAAATGAGCAGGATAGGGTGTGTGTCTGACAACTAAAACAAAGCCCAGAGAACAGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr2R 22795252 5' + hobo 33 1 63.01 TATATATTTTTGAAATAAGTGCTATTTACATGTAGTTTTACGTTTCTCATTTTAGCTATTTAAGCTATTGATTAAGCTATTTAATAAATTCATTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chrX 19591285 5' - roo 9049 2 68.28 CCCAATTCGAATTTTTTAGAAAGCTTACGGTATGCTTTTAATTCCTGTTTATGAGCTATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chr3L 8704596 5' + blood 64 2 60.96 CAGCAATTGCTGCATTATGCGAAGGACATCGTGCATCCTGCGTGTGGAATTGCCCAAATGCAAACTGAAGAGTCTCAAATTAAATCCAACAGGCTGTCCAAAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr2L 9988058 5' + hobo 19 1 71.92 GAATGCGAATGTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGGGTCCAAAAGATCGTTGC:1 + chr3L 1983427 5' - Transpac 5188 2 57.53 GCCATGACACATATAGGAAATATAAGGAAGCAACTGAGTCTTATATACCTCTAAAAAGATATTATATAATCAAGAATAACGAAGTTTTGGTATGTAGTATGTTCCCCATTGGCTTTAGCTACAAGTTGAAGCCCTTTTTT:1 + chr3R 4496160 5' - S-element 1388 1 57.86 ATTTTGGGACCTACGTTTTGAGAACATTTTTTAAAATAATGGACTAGTAAAAACTAAGGAGGAAAGTAAATACATAATAATGTACATAATTTGTACATAATGTATCATATGTTGGCTGTCTGAGCAAGAAATTTTTAGTCTCTCAA:1 + chr3L 14585764 5' + Tc1 131 1 54.11 AAAAAAGCCAAAATGAAAGAGAATTCAAATGCCTAAAACGACGAGAAGAAAGACTCAGAGAGCGGTGTATGAACCCCAAAACCCCTGGGGTTCGCTGCCCCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 + chr2L 17574312 5' - hopper 1398 1 69.86 GCCATCGATTGCCTTTGAACTGGTCTTAGCCATGAATCCAACGCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCCAACAATGTGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr3R 29719300 5' + hobo 36 1 60.96 AATTATAAGTTTAAATTCAAAAAACATTTAAGCTGCCAGCGGCTGTACCACCGAGAGCGTGCTGTGTGTGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2L 19680977 5' + hobo 28 1 57.38 AAATTTGGGATCGGCTGCTGTAATGATCACCTTGAAGAATGATAAGGAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTA:1 - chr3L 21881480 5' + invader2 4903 2 94.55 TTATGTCAAAGGAAAACAATGTTTGTTACTTCATTTATATGCCATTATTATTTGTATAATATTCGTATATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:1 + chr2R 10915636 5' + F-element 67 1 59.59 ACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 - chr2R 10666921 5' + hobo 58 1 63.57 TGTTCAATCGAATCAATCTATCATAATGGAATTAAAGGAGTTTGAGCTGTTAAGTATCAGGCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3L 2240395 5' - roo 9013 2 58.22 CACTCGCTTTGCACATCTATGTATATCTAACTCTTTGACTGAGTAATGGGTATCTGATAGTCGTGGAACTCTACTATACCTTTTTTGACCTGCTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr3L 22519129 5' + pogo 22 1 70.55 AACGTGTAACGTAAACACGTACAAGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr3R 12547854 5' + hobo 65 1 60.27 TTTTCATTGAGCAAAACTCGGTTTCCTTGGCTAACAGCAAAAAAAAATGGAATTAAAAATAATGTTATGACATATCTTTGTTCTCTTGATGTGGTTGTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTGTATCTGTTATTGTTGTTGTATTTGTTT:1 - chrX 10921265 5' + transib3 342 1 48.97 AGATTTTGCGGCAGACAAATTTATGAGCGTTAAGTGAAGGCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr3L 16197038 5' + Doc 62 1 63.33 AATATGCTGGGAAATGTGCCACACATACAGCAACATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAAC:1 + chr3L 19432534 5' + HMS-Beagle 6846 2 75.45 AAAATAATCTTTATGCCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3L 19938456 5' - roo 9023 2 52.05 GCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 - chr3R 15363471 5' + 412 76 2 75.56 GCCACAAAGAGAGGAATGCGAACGCAAGGGAGTTTTTCAAAAGGAGTCTGCTCTATATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAAATATGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 - chr2L 21082246 5' + mdg3 35 2 62.33 ACTGCCTGGCTGGCAATCTGAAAATGATTTTAGCAGGAAGCTGGCATGTCCAGAGCAATTTACTTTACTTTTGCAAGGCAAACAGGAAGTAGAAAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGC:2 - chr2L 8807978 5' - HMS-Beagle 223 2 69.86 GAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAA:1 - chr3L 23839745 5' + McClintock 5989 2 59.31 AGTTGGCTATTTATAAGCACACAGTAAGTTTCTTGATTGCCAAACCCATTGTAAATATAAATTATTATTTGATAAGCGGCTCATCATAATAACGGATGCAAGTAACCAAACCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGA:1 - chr3R 30564844 5' + F-element 4557 1 71.23 CAATTTAGGTATGCAACGTATTTTGAGGGGTTAGCAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAT:1 + chr2L 19565432 5' - jockey 4938 1 54.11 GAATCTTTCACATACGCCGTGTACTCTCTCTCTCTCCCTGTCTCTCACTTTGAGCAACAAAGATTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 + chr3R 7109128 5' - P-element 2832 1 47.95 CCTTCAGCAGTTAGCAGCCGGGCTAGTTGGGACAGAAATGTATCCCCATGTGAAATGCATGTTTGCATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGTGCTAT:1 - chr3L 5329195 5' + 412 56 2 52.74 TAGTGAAAAGTTACTGCTATCTTTTTGCTCTCTAAAAAGCGTGTCTTGTGTCGTATTTCTGTCGTTAGGCAAACATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr2L 21687578 5' - pogo 2057 1 54.79 TAGATATAGTAGCTCGATGGCAACATTTCATATGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chrX 6052944 5' - roo 323 2 75.34 CTTCCAGGTGGCCCTCAGTGGGTATATGTTCTACGAGGTGAGTTCGAATCTAGAGATTAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATC:1 + chr3R 22572549 5' - HMS-Beagle 6983 2 59.59 ACCCCATATTCTTCTAGAGTAGCGTTTATTGTTATAGATGGGCTTTGTTAGAATGTTTCCAATATCTGTTCAGCACATACAGCCGAGGGCAAGTAAGTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATAT:1 + chr2L 3393707 5' + Stalker2 23 2 68.49 CATTTAGGTATACATCTAATGTCATTTGTTCATCAGTTATCCAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2R 14921566 5' - pogo 2033 1 70.00 TTCGTAACCTGTGTCCATTTTGTATTGGGCACTAGCACTTTCTCTCTGTCGTTTGACAGGAGCGTTTGGTGCATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGCGCAGCCGGCAGGC:1 - chr2R 4352205 5' - blood 329 2 51.72 TAATTTGCCGAGCAGGTTCTGCCCCCCCTCCCCCCCCCGCCCCCCCCC:1 + chr3R 27579653 5' + accord2 225 1 68.75 TAAATTGTCACTTTATCAATTGGGGAAGGCGTGCGCAAAAGCGCAAAAGCAAATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGA:1 + chr3L 780667 5' - Burdock 190 2 63.70 TGGCATAAAATGAAGTACTTACATATATTGTAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGT:1 + chr2L 615208 5' + F-element 55 1 51.37 TAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTA:1 + chr2R 10189267 5' + Doc 73 1 67.12 GTGTTAGTTAAGTTAGAGCCAGGTGAAACCACCCGACGGCGACGTGGGACGCCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGGGC:1 - chr2R 11818284 5' - P-element 2838 1 42.40 TATTATCCTTTCTGTGTGAGCTGAGGGAAAAATAACAATCTAGTAGGGAGAGCTCCGAGCAGTTAATGAGCTTGAGGCGAAAACATAGAAGCACACATTTTCCTGTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 - chr3L 5425596 5' + blood 17 2 74.66 GGGCATTATTATGAGAGGCGAAATTTGTTTTTTTCGTACATTAGTGTTTTTCATTTTGTTGCTGCTCCCTCCCTCCCATTGGGTTGTTTAGCGGAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTACACTTATGCCGTATAATGCA:1 - chr2R 12925723 5' - jockey 308 1 66.44 GGTAATTTGTACAATTTTTGCAAAAATACATTTTTTCAAGCTTTTCCTTGTTTTATATAATTCAACATTCAATTCAACTCAATTCGAACATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2L 8909923 5' + roo 28 2 65.07 TTTTATGGTACGAAAGCTAAACAAAGTTGATTATTTTATAGTTTTGAATCAATCGAAATGGGCGAAAATACATAAATATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 - chr3R 15453790 5' - Transpac 5191 2 58.90 GGAAGAGATGACTTCGGAGGTGGAGTTATGTGCCAACCTGCAAACACTCATGTGCCCCCGAATGGGGCAACCTAATATACGGACCCAAACCCACTCACTCATACGAACACACGCATGGTGCACTTAAAAAAATAATACCAAAAATA:1 + chr2L 9139344 5' + S2 139 2 72.60 TTTATTGTTATAGATGGGCTTTGTTAGAATGTTTCCAATATCTGTTCAGCACATACAGCCGAGGGCAAGTAAGTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACA:1 + chr2L 3393731 5' + Stalker2 7295 2 52.05 TTGTGCTCATACCCTCTACCCTTCACCTTGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTG:1 + chr3R 4739734 5' + P-element 99 1 18.49 AATTGATTAAAACTGGTTTATTACAAGCTAGCCACTGACTTTAAAAATATATTATTCATAACATTGATATGTGGGATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:2 - chr3R 25414312 5' + pogo 44 1 56.85 TAAGGAAAGCAGCAGCAAATAGCCCAACAATGGCAGAAAGTCTAATATTGAAAATTTTAAAATCAGTATATCGTTTTTTCGTGTGTGTGTGTAGGCTTTGAATTTTCGTGTTTTTCTCGTCGTATTTTCCATAATTTACTATAATT:1 + chr2R 7744566 5' - transib2 257 1 63.01 CCCCGAAATAAAACTTTTTATTTTCACACAAAGTTGTGCAACCAAGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAA:1 + chr2L 17795145 5' - hopper 1337 1 71.23 GCAGTTATAAAATATTTCGTAGCATACAAAATGGCGCTGCTGCTAGAAAATTCAATTAGCCTGCAATTTTTGGCAACAGCTGGCTTTCAGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTG:1 + chr2L 3677554 5' + BS 26 1 63.01 GTACTGCGCACTTGATAAAGGCTAAACAAAGATTGTCGCTTCCCGCTTTATATAAACAGAATTATTCTACAAAGGAGGAGCCCTCACTTGAGCTGCACTTTGGATTGTAGGATGTGAATATATCGAGGGTACATTG:1 + chr3L 1728409 5' + blood 10 2 75.74 CATTCAGTTACACAAAAAGAAACGAAAACTATTTCAAGAAACCTTTGCGAATATTTGCGAAATTGATGTCAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTGAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3L 10733758 5' + 412 7104 2 53.42 AGATCACTTAAGAACTGGAATACTAGAATGTCATAAAAGCTAGTAACTTTACTCTCCAAACCTATCCGTATTTTAGCTGCTTGGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGA:1 - chr3R 31264270 5' - jockey 4952 1 54.79 ATGCGCAATTTGCATATGACAAGCTACAAAACGACTTGAACTGATGACGATGCCGCAGTTAAACGAATGTGTCCCGCCTCTTAATTGGCTAAATACATTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr2R 14921436 5' + pogo 22 1 70.55 GTAGTGAAAGAATGTAAACAGCTGGGAAAAACTGGGGGAATCTGGGGAATGTGCCTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAG:1 + chr3L 19398126 5' + gypsy5 68 2 63.70 CATGTCATTTCGATTGTAATCTGCATGACTGCCTCGCTCCTTGGGCGTGCGAAAAAAAATGGAAGAAACGAGCACGAGAGAGTGAGAGCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACTCTACAATT:1 - chr2R 17348520 5' + hobo 32 1 62.33 TTCAATCTGGAATGGCAAAAAAAAGGAAAATTCATTTTTGATTAAATGCTGGCTATGGCTTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGGGATCCAT:1 - chr2R 16503489 5' + jockey 65 1 55.17 CTTTCTCTCTATACATTTTTACATTTTTGTACCCTTTTTGTACTCTACGAGTAAATGGGTAAATGCGAAAAAACTCTGCCACGCCCACTCTAACGCCTACAAACAGCCAAAAGCTGTTAAGCCCACACTTTTGAAAAATGTTTTGT:1 + chrX 22486177 5' + INE-1 260 1 51.37 CGCATGCCAGACTGGAATCCCTGGAGTCGAGACCCGCATCCAGGACTCGTTGTCTTTTTTTTGTGTGGCCTGCCAGCCTGACGTGGCCTTATTGTAATAAACAAATATATGCCACCAATTCATAACACGTGTTTTCGTTGCAGTTG:1 + chr2L 18848677 5' - blood 7357 2 58.22 TTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACAT:1 + chr3R 8293550 5' + Stalker2 7329 2 70.55 AGGCACACGCGCATCGCTAAAAGTGTCAAATTGGCAAAAGTGGACTTGGACTTGAAGGGGAAGGCAGCGCCAGCAAGGCAAAACAGAAACATTCTAAAACAACCTTTGGATAGCCCTCTCTGCATTGTTTTTTTTTTCTTTTAATT:1 + chr2L 20970821 5' - Doc 4700 2 76.03 ACATTCGAATGGTTTCTTGTTTATTTCAACTTTGGCGTTGAAAGCGTTTCCGACTATATAAAGCATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACT:1 - chrX 11906343 5' - HMS-Beagle 6988 2 58.22 AAAGAGAATTCAAATGCCTAAAACGACGAGAAGAAAGACTCAGAGAGCGGTGTATGAACCCCAAAACCCCTGGGGTTCGCTGCCCCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGCGTTTTTCACAAGTA:1 + chr2L 17574327 5' - hopper 1383 1 59.59 AGAATGTAAACAGCTGGGAAAAACTGGGGGAATCTGGGGAATGTGCCTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCC:1 + chr3L 19398134 5' + gypsy5 76 2 69.18 GTCTTAATTAGCCCTGCGAAAAGCGCGAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 + chr2R 17872450 5' + Tirant 8142 2 58.87 TGTGTAACTTGTGGGCATGAAAGGATGCAAATTTTCTTTACACACAGGAAACATTTGATAAAGCCACACCAACACAAACACAATGGGGCAGCACACACACGTGCACACGTACACACACACACACACACACACACACACACACATGC:1 + chrX 11399262 5' + accord 185 3 60.96 TGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCC:1 + chr3L 3540135 5' - mdg3 168 2 64.38 GGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 + chr2L 23372628 5' - 1360 3335 1 70.55 CAAAGTTGATGAGAAAGTTTTCCTATCGCCTGTTTAAGCAGCTAAATTAAAAACAGATCAATTAACGTCGAATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 + chr2R 7540981 5' + F-element 63 1 54.79 AAAGGGCTTGCATCTAGCAGGATGAATGGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCACATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 - chrX 6052989 5' + roo 91 2 80.00 CATACGTTTCATGCTCGTAAATGTTAAAATCAAAATTTATTCATTGTTGCATTATTTTCACCTCTTTAACGAAAACAATCTTCGGTATATCCTGTATGTATATCGATTACAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chrX 10344710 5' - roo 397 1 49.32 AATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 + chrX 3637794 5' - roo 319 2 76.71 AAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:1 + chrX 16857070 5' + pogo 76 1 70.55 GTTAACCCTTTCATTACATAGCAATACATTAAAAATCCCTATTAAATCTTTAGCTATACATGATTTCGGAATGCGCATAAAGCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTT:1 - chr2L 1871062 5' - mdg3 5460 2 58.90 AGATAAAAAGCATTAGCAGAAAGTTTCCCAGGTCAACGAACTCTGCCAAAGCATATTGTTCTGTAGCCTGGACACTATTCCTGCTATAAAAATTCATACATATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3R 25929287 5' + 297 6595 2 76.71 AAGAGCTAGTTGTGTATTTTTTTTAAAGTATTCATTTTCTCCGGAGACTTCTGTTATATGTCTCCCATAAAAACGCTTCTGAAAAATAATTGCTTACGACATTGCCTGAAGAGAATCCCTTTTGTTTATTGAAATTCGCAAAAAAA:1 + chr3R 4595813 5' - pogo 162 1 62.33 GCACTCTAATTGTTTTTAAGTGTTTTTCCAGCAGCGACAACAGCAGCCGTGTGCAGCGCAAATGAGCCGTAATTGCATAATTCTAATTTAGCGTCGAGTTCTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr3R 26405147 5' - hobo 2919 1 73.29 CGTAATGGGGACATCAGTTGCCAGCTCTACGGCGGAATCACGACCGAAATTCCCGCCACAATGGCAGGCATCCATCAAGCAAATTGAACACGCCCCCGTCGCATATATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACAC:1 + chr3R 20720462 5' - 1731 300 1 75.17 CCAGTCAGTCAGCTGGCACTTGTTTTCCACACGCTCTCCCGCTCACGCCCAACCGCATCGAAAAGGGTTAATGTTTGGCCAGTCCTTGTACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGC:1 + chr2L 11638971 5' + springer 33 2 60.96 TATGAAAGAAATTTTTTTTAGCTATATAGTAAGTTGTTTGAGATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGTCGGGAAAACAACAAAAATAATTCATTAGATTATACACAAGCAATGGCAACTACAATACAAACAAGAGAGAATGCAATAGTC:1 + chr2R 18299065 5' - INE-1 580 1 53.42 GACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCCATTTCTTCTTTTGATTTTTGAGTAGGCAGAAAT:1 - chr3R 13572088 5' - 412 7457 2 74.66 TACAGGGATTTCATTTACAGCTAGCAAGCTGAAAATTTGGTTTCAGAACAAAAATTAATACTTAATAATACTTAATTTAGAGTCCCAAAACTATGTTGCTATTTTTATTTTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACT:1 - chr2L 16567019 5' + F-element 473 1 69.93 TGTGGGTGTATATAGAGTGTTTAAACGTAGATAGTGTGCTTATTTTAAAATATTTTTAAATGTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCA:1 + chr3L 25821777 5' - opus 445 2 55.48 TGAATATTTCAAGGTATAAAATCTTTCATACAAAATGTTAGATTTTTTAATCAAACATTTAGTGGTAATAAACCATTAGCACATTTAATGGCCCGCTAATTGATATTCAGTCGTGCTTTGGCTGCTTTTTTTTTTCTTTTTCTT:1 - chr3L 3544396 5' - Doc2-element 220 2 79.86 CCCATTGATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACA:1 + chr3R 8293532 5' + Stalker2 7311 2 58.22 TTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCA:1 - chrX 12995386 5' + blood 7094 2 73.97 AAAGTGATTACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATAC:1 - chr3R 24760611 5' + pogo 85 1 76.03 AGTGAGTCTCAAAAGTTCTGAGTGAGTAAATAAGAGGCGAAAACTTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGAGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTCAACAGCTGTAGTTATAACAGTGCATTGTTACATTACCTT:1 + chr3R 4763865 5' + hopper 1293 1 60.14 AAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chrX 3637783 5' - roo 8994 2 69.18 CTTTTGCAGTCCGCTCTTAAAGCCTAACCCCAAAAGCCTCCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chrX 20379367 5' + hobo 67 1 69.92 CAGCTAAATTAAAAACAGATCAATTAACGTCGAATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATCAAAAATCTGAAAGC:1 + chr2R 7541019 5' + F-element 100 1 79.31 TGTATGAAATTGAAACAAAATGCGCATAAATTTTGTAACGAAGCGAACGTCAAGGCGAGTCCAGGGACAGGGATCTCCAGCTCGAGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGG:1 - chr2R 18925277 5' + opus 181 4 71.20 TTCCTCTATAATAAGTGGATATGGTTTCAAGTACGTTATCTTTTTAAAATGTAATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGATCAACGCTGAAA:1 - chr3R 7764444 5' - McClintock 436 5 67.36 CCTGCTGCTTGACACTGTGCACATCCGGTTTGGGCAATGATAAGCATTTCACGGAATTTATCGCTGGGCATGGGCACGCAAGGAGCAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr3L 10069022 5' - 412 462 2 63.70 ATAATAAATATTAATTTTCATATGTATATGATTTAATTTACTCATATAATTGCCAAAATCATATGAACACATACGTTTTTAACAATATGAGAGGTCGGCAACCACTGCCTTTTTCATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCC:1 + chr3R 4986197 5' - Burdock 6388 2 71.92 CAGCTTGACAATCCACGCGAAAAACTGGCAAACAAAATATGTTTCAGCCAAGCGTACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACC:1 - chr2R 18927860 5' - 3S18 6042 2 61.27 TATGAGTTATAATTGATAAACTTGAGGGGTTGATTCATATGTAGTTTTAGGTTACTTAGTCGCTTTTACTACTATGCAGTATATATATATATAGAAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTCACACACACACACACA:1 + chr2L 14678715 5' + Quasimodo 32 2 64.14 GTTGATATATGAGTTATAATTGATAAACTTGAGGGGTTGATTCATATGTAGTTTTAGGTTACTTAGTCGCTTTTACTACTATGCAGTATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACA:3 + chr2L 14678708 5' + Quasimodo 26 2 67.12 AAAAGAGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACCTTGGTGCTATGTTT:1 + chr3R 13572013 5' + 412 7113 2 57.53 TTTAATTTCACAATCCATAGGAATAACTGAACTGTACTTAATTTTTTTTTAATCCCCTTTAAGTAAATAAAAAAATAAGCATAAATTATTGTCTTGTTAACCTTAAAAATATTTAATCTAAATTGTGTAGGAGGCTGCTCCTTCTA:1 + chr3R 26349250 5' + mdg3 5252 1 36.30 AAAAAACCTTGATGTATTTATTATTTACTGCTTTCATTTGCAGCTCACACTTTAATGCTCATTAATAACTGCCCACTTTTATTGGCCGTCCATTAAATTAATTAAATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATT:1 + chr3L 20042363 5' - flea 240 2 76.03 ATGGAAAACGCACTCAAACAAACACTTTGCATATGCCACAACCACTCCCACACTCGGACATTCTTTTATGTAAATTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 + chr2R 20117273 5' + mdg3 47 2 54.11 CAAGAACAGGGATTTCATTTACAGCTAGCAAGCTGAAAATTTGGTTTCAGAACAAAAATTAATACTTAATAATACTTAATTTAGAGTCCCAAAACTATGTTGCTATTTTTATTTTCGTCATCGGCTGCACCCGC:1 - chr2L 16567023 5' + F-element 460 1 78.36 GTGTTGCCAGATTACTTTAAGAGATTACTCAACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1 - chr2R 11691268 5' + P-element 91 1 23.29 AGAAGAGCTTCTGCTCTTTATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAGTGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATG:1 - chrY 3648931 5' - Stalker 7056 4 63.01 AGGCTGTGCGTTAATTTCAGACCCCCTTATGTAACCCCTTTTTTCGGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACC:1 - chr3R 902631 5' - R1A1-element 5289 1 53.10 CGCCGGATTTAACCTGTTTGGACTTCAACTTTCCAAGATTTTCAGTAAGTTGTATGGGTATTCTTTTTTAAGTGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chrX 17933626 5' + roo 47 2 54.11 CCCGAAGATCACTTACGAGAAGCCAGATAAGTGGAATGTGAACTTAGACGGCACAGCCTACAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATT:1 + chr2L 11047958 5' - Juan 4156 1 58.22 GAGCACAATCCTCGACGTCTACATCACGCCAACCTCGTTTGAATTGTCCTAACTCCAAAAGTTCCGACCACCGGCCCCAACTGAAAAAAAAAGTATTTACCAAAAAAGTATTTACCAATGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:2 + chr2L 232300 5' + Doc 5 1 69.18 CGTTGCGTGTTGTTCACTTGACGCCCGTTCGAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAG:1 + chr3R 10777329 5' - 297 6837 2 78.77 TATCATCCCAAAAGTATGCTTCTTTAATTTCCACGAGGCTATAGCAAAGTTTAACACCCAACTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACT:1 - chr2L 15096963 5' + jockey 4731 1 58.22 CGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chr3R 11550268 5' + F-element 26 1 55.84 CACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTT:1 - chr2L 21570250 5' + Dm88 4437 2 70.55 CCCTTGCGGGGATCGAACCCGCGACCTTTGGATTAGAAGTCCAACGCGCTATCCTCTGCGCCACCGAGGCTATGATTTTAGTGGATAGAGGACAGCACTGCTCCCAGCAGAAAATAATGTAAATTCATAAGCTAAGAAAGGAAGGA:1 + chr2R 11652370 5' + HB 395 1 49.32 AAGCAAAACATTTCAAATAATAAGGGGAAAAATGTATTTTGGCATAAAATGAAGTACTTACATATATTGTAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:2 + chr2L 615169 5' + F-element 16 1 78.08 GCTTTTCACGCTGTTGATTCTTATGGCAAGGGCACGAAAAGGTATCATATTTACCTTTTCGTGATTATCCAAGAACACAGCTAAGGCTAAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGAC:1 + chr2L 14916731 5' + gypsy 415 2 75.44 AACGTTAAACCCAAAAACGTTTTGTATATGGCTTTAAATATTTAATAATTGTGGGCAGAGACAGCAACACCAGCAGCAGACGCATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 + chr3L 7370434 5' - Burdock 6354 2 60.27 ACTATAAACAATATTCTTTTAATTTCTGTTCTCTTGCTTTTTCTGGTCTTCTGTTCTGGTCTTGTCTCGCAGATTTTGCGGCAGACAAATTTATGAGCGTTAAGTGAAGGCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chr3L 16196960 5' + Doc 18 1 76.03 TTTGGGCTTTTAATTTCTCTCTTTCCCCTACAACTCCTTATCGTTGACTAAAAGGTTATACAAGATTCGTTGAATGTATGTAACGGGTTGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGTATCAATAGCC:1 + chr2L 21253480 5' + INE-1 87 1 72.60 GGCCGCCTATTGAAACGTTGACATGGCACAGATATTTTGTCGCATAATTTTTGATAAATGATAAAGTGCTGTGGCCATTCCCGAAAGACAATAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGA:1 + chr2L 5684930 5' + Idefix 322 2 63.70 TAATATGTGTAAATAATTATTAACAAACTTTAATTAAAAAGTGCTTATACGATTTGTAAGAAGTGTTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chrX 21205087 5' + 1360 55 1 58.22 GAATCCAACGCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCCAACAATGTGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 + chr3R 29719333 5' + hobo 68 1 68.28 AACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATC:1 + chr3L 19951208 5' + Ivk 97 1 73.97 AATAAGGGGAAAAATGTATTTTGGCATAAAATGAAGTACTTACATATATTGTAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 + chr2L 615187 5' + F-element 34 1 65.75 CCCCGCAAAGTTGATGTGTCATAGGATCTTTAAATAAAGTTTGGTCCTAACTACAAAGGTATTTATTTATATTTTTTTTGGGACTAATTCTGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chrX 10838475 5' + roo 29 2 66.44 GAGCCACTATAGCGATAAGGTGCGAATGCTATCAGGGTCCGCAAGTACCCCACATATATGTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAA:1 + chr3R 8810634 5' - 297 6923 2 62.33 TGTCAACATATCTTGCCTAATTTACGAGGTTTGAATTTATGCCAACAAAACATTTTGCGGTGTTGGTGATGGTGGTGGTGGTACCACTAGTTGAGCGCCAATTATTTAAAGATTGAACGCACCG:1 - chr2L 22745871 5' - Gypsy6A_LTR 396 1 54.84 CAGCGTACGTTGAACGTGGAATGACTGGAAGTGTTTGTCTGAAATCACCTGAAAGGACCAACAGAGTTTCGCCAAATAGTTTGTCACTGTTTTTAATATCTTTCCATTCTCTGTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAAT:1 - chr2R 4854066 5' + copia 10 2 78.77 GTGGCATTGAATTAGTGATATGTGACCCATTAAACTTACAAATTGTTAAAGAACTTTACAATTTTGAGGTAAAATATGTCTAAAATTATGTTTTTTCAATGGATTACGGTGAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chrX 21204924 5' + 1360 9 2 69.86 TAAAACCAGTCAAAAAGCACTCGAAATGCCAAATGAAAATGAAAAAATCGGAAAAGACCCGCGCGAAAATCGAATATTTCTTACGCTAGCTCGAGTAGTTAAATGGACTCGTGGTTCAACATTATTTAAAAAAATTAAAAAAAAAA:1 + chr3L 17190747 5' + TART-C 11100 1 68.49 GAAGTTGAGGTCCCTGCTGTCGTTTCCGAAAAGGAGACTCTGGCAGTGGAACCCATGAAGATGGAGGAGTCTGCCCCATCGACTTCGGCTCCTGTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTCCGTC:1 - chr3L 13380568 5' - hobo 2925 1 73.88 TNCATGGCAAACTGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTT:1 - chr3R 9862990 5' + Stalker2 7298 2 50.68 CCTATTTAATGAAGAAAGGAATTGTCAAGCAATCCGTCGATAAAGAAATTGAGCTTTACGGAGAAGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 - chr2L 22177466 5' + Doc 61 1 58.22 ATACAATTTATAGTTGGCAATAAATAAATGACAATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:2 + chr3L 13380405 5' + hobo 31 1 64.38 CTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2R 14450164 5' - roo 8990 2 73.29 AGCAGATTTGCAAGTGGAGACAGAGTTTGCAGCAGTTGCACACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACA:1 - chr2L 7905966 5' - Quasimodo 7310 2 68.22 AAGAGTCGAATGGCTCGGCGGCGGAATGGATAACTTGGCTTGGGTTTTGGGCTGTTATCTTTAGCGCTCCTGGTTGATGCTAAAGTGGTTAGAGAGCTGTAGTTAAAACTCTTGCATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGTGTCG:1 - chr3R 26397095 5' + INE-1 93 1 79.17 CAACCAATTCCCAGCGCCAACTTGCCCATCTATCAAGCATCCATCTGCCCAGCTGCCATGCAAATTGGGCACGCGTTTCGCATAACCAAAAAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACAATATGCTC:1 - chr2R 16686731 5' + R1A1-element 5243 1 63.01 AATATAGAAAAAACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATA:1 - chrX 8610349 5' + mdg3 5281 2 65.07 CGATTGTGTTGTTCGATTATTTCTTTTGTCTGAATGTATTAGTGGTTCAAGTTTTGATACATTATTGTTTAGATAGATAGCTTGAGTATAGTCTAAAATGAGTTGGTAATTAATACTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTG:1 + chrX 22218755 5' + 1731 4321 2 80.14 AAAATTTTTAATGAGCCAAATGCTTTCAACTCAAAAGGCAATCTTAAAATTCGCGGAAACTAACCATAAGCTATTTAGTTACCCAAATGGACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAG:1 + chr3L 5425419 5' - blood 7360 2 63.70 AATGCGACATTTAAATGCCTTGCTTATCGGACGCGCAATTACAATGACAACGATGCCGACCGACGGACACGGAAGCGATTCGAGAAGGATATAAAGGATGAGGCGGCGAGTGAATAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTT:1 + chr3R 11080733 5' + 17.6 7226 2 78.62 ATCTAATGAGCGACCGGCCAAACGGCTATGCAATCGGCGGCCTTCCTCCACCATAGGCAACCCACCTCTACATATTTATATGAATGTATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGC:1 - chr2L 9228799 5' + Burdock 29 2 63.70 CATTTTCCACCAGCGGGGTGGTAGGGAGGTGATGAATGTACGCCACTGGAGGCACGACTCCTGCACTCGAGATATTACAACAAGGTAACCGGGTCGTTATCCTATGAACAACACTTTTCTCCGATAACCGAATTATACCAAACTT:1 + chr2R 17410402 5' - gypsy12 155 2 68.97 GGAGTCTGCTCTACATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAACTATGGTGTAGAAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTCCCTTTACTCTTAGTCATACATACTTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCT:1 - chr2L 21082204 5' + mdg3 62 2 62.60 GAATTTCACCCATTGATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTG:1 + chr3R 8293524 5' + Stalker2 7303 2 52.74 AATGTTCAGTGAAAGCGAAACACGATATAGTTTACCATTTAGCCTTTTTTATAGGCTACTTTTTCATTGACGACTACGAGTACTCCAACGCTGTCTTTATAGATATGCAACAAGCCTTCGACAAAGTATGGCATGTTGGATTATTG:1 - chr3R 18359350 5' + Helena 420 1 54.79 ATTTCAGTTCCATTCTTTCAGTTATCCTTTCGCCTGCGCCATTGGCAACTTTCGTTTTTTCCTTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr3R 7655559 5' + 412 7096 2 52.31 GCTCAGTGGTCCAAATGCGGAGTTTTCCATGGAGATTTTTCGCCGCCTCTATCAAAAAAATGATGTGGTGGGGGTAGCAAGTCACGTAATTTGCGAAATGATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr3R 12953317 5' + jockey 28 1 64.14 GGCAAAAACTCGTTGACTTTTTCACAGACACCGCAATGTGTGTATGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACA:1 - chr3R 29381581 5' + hobo 76 1 70.55 GCAACTGCAACTGAAACAACTTTTACTCACAATGAAATCCACATAAGTTTCACAACCAGAGGTATGCATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr2R 8492714 5' - pogo 2057 1 54.11 AGACTGCTAATCCTCGACAGTGTGTGCTCAACGGGATATCAGGCGGAAAAGGACAAAGAGCGCTGCATACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2L 2518628 5' + jockey 18 1 74.66 GTTGAATTTAAAAATAACACAATATGCATAATGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGA:1 - chr3R 14174768 5' - 297 311 2 78.77 CACACGAGGACCCATCTGTATAACTCCACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGGCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTA:1 - chr2R 17937181 5' - 297 6910 2 77.60 ATGAATCTAATAACTTGGCCCACACACACTGACACACATAGATTGGTAGCAAAAACAATGCCCTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGAG:1 + chr3L 17142804 5' - hobo 2889 1 51.80 CATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3L 19938491 5' - 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chr3R 30155932 5' - Doc3-element 174 1 45.89 GTGAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGGTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:1 + chrX 21087537 5' + mdg3 5263 1 70.00 CAGATAGGCTCAGCCAGAGAATGGGTCAAACAGTGGGATTCTAGAAAACCTAGGGCCATAATTCCCGACACGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 - chr2R 11379887 5' - hobo 2890 1 52.05 ATCAGGAATTTTAACAAAGATTTTATATAATAAAAGTTAGGAAAACTCAGTGTTAAAAAGTCAGTCTAAAAAAGTCATGAATATATATATATGTATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 - chrX 19766853 5' - copia 228 1 68.49 GAATGTGGGTGTCCAAGAAACACGAACAATAAGTTGCTACTGCAACAACCTCACTTTCCTTTAAAAATATAAAAGCTTTGGAGGGGGAAAAAAACAAACATAATCCTGTATATTACATTGAGAGACTAAAAATTTCTTGCTCAGAC:1 - chr3L 14585981 5' - Tc1 124 1 71.92 GTATTCATTGTGCGGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTAC:1 - chr2R 10666949 5' + hobo 9 1 72.22 ACCGTGAAACAGTTGATCTTAAAGGTATCGAGTAGATTCATCATGCCAATTACATCCGGGCCGGACTCAGGGTTGTCAAGTTTCGCATTGAAAATGAATGTAATACTTTCATGTTTTATTCAAAATTAAGCATAGTTTTAAGAGTA:1 + chr3R 28303807 5' + Transib5 440 1 58.90 AAATAGGAACCAGTTTTATGATTGTAATAAAAGTTTATTTTCTTAATTATTAATAGGGTATAAAAGTATGTTACAATATCTTTTAAGATCAGTCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAA:1 - 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chr3L 13293951 5' - accord 7031 3 68.49 CGATCAGCCCAACCTCACCTAAAGAAAAAACTCATTAAACGAAATTAGTGCAGAACTTGACATATGTAAGGAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTA:1 - chr2L 22340406 5' - HMS-Beagle2 278 2 53.66 AGTCAAATGAAAGCAATTTTTTCTCAGTGCGACAGAAGGAAGCATAAAATGCCAAAAGGAATTAAGGTTATGCCTCAGTCTGCTGTCTCTATACATACACATATATATGCCACATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 - chrX 7657568 5' + I-element 8 1 79.45 AATGGATACAGACAGATACATAGCCGTATAACTACGAGTCAAAAGATACATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAT:1 + chr2L 2336216 5' - 297 6918 2 64.14 GCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAA:1 - chrX 19744467 5' + P-element 101 1 16.44 GCTATTGGTAAGTTTCTAAGATCTGGAAAACAAATGGGATTAGTTAGACTTTTAAGTTGCCGTGCCAGATGTTTATAGCTGAAATAGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 + chr2R 15190363 5' - pogo 2068 1 64.38 GCAATGTTGGCTGCTTGGCCAATCGAATTCGTGCCGGTAACTTTATGCAATAACTTTATGCTAATTATTGATAAAATGTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chrX 18055690 5' + 297 36 2 61.64 TATTGGACCCACTTGATGGGGAAGTTTTTTTTTCTTATTTTTTTTTCTTTTAAGTACGTGCCTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chr2L 10128078 5' + hobo 60 1 57.53 CTTAATTATTGGACCTAAAAGAATGCCTTATAAATTGGAAGTAACTTTAAGTTTTATTGGGACCTATTGAACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTA:1 - chrX 16538205 5' + mdg3 33 2 58.14 ATAGGAAATCAACTCGACAATTACTTGGCGAAAAGTTCATTACCATTTTAAAAGTTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr3L 13015895 5' + hobo 63 1 65.07 TTTCGCATCGAGCACAAAAACAAGTCACAAACTTTTCGCCTAGACGGTGCTTTTTTTCCACTTTTGCACATACATACATACGTATACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chrX 13484093 5' - hobo 2900 1 58.90 TTTCCATTTGCATTAAAGCAGGCGTAACAGCCAGAGCTTGGAATCAAGTTATTACGCGTATACAAATATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr2R 11394212 5' - pogo 2053 1 54.48 ATTCAGACCCAAGTTCAGGCCTCCAATGAAAGTGATAGCCCTTATCACCAACCTCATAATCGTGACGTCATATGTGGCTAATGTGACTCATGAAAATTAATATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACAC:1 - chr2L 15934692 5' + springer 7152 2 75.34 GCATGACGATATCAATTAAAAGGGACTATAAATTGTCACTTTATCAATTGGGGAAGGCGTGCGCAAAAGCGCAAAAGCAAATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:3 + chr3L 780639 5' - Burdock 217 2 59.59 CATTTCTTTGAAATTTTTTCAGGATATTCCGATTTCTACGGGGTATTCCCAGTTCGAGTAGGCTTGGGGTCAGCTATGGATGGATTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGCTTCAGGTGGGGTTGGACGGGGTTGGTTGGGATTGG:1 + chrX 18670341 5' - G2 107 1 60.27 CAATCACTCAGAACTCGGACACACACACGAGGACCCATTTGTATAACTCCACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1 - chr2R 17937204 5' - 297 331 2 67.12 TATTTAGTATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTT:1 + chr2R 5485069 5' + 1360 79 1 72.60 GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGCCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTT:1 + chr3R 17660024 5' - micropia 393 2 63.43 CGGCAGCTCCACTTCTGCGGCCTCGGGCGCCTCCGCTTCTTCTTTTTTTTTTTCTTTCTCC:1 - chr3L 8387239 5' - Doc2-element 243 1 70.49 TTTTGTACGTGGGTTACTAGGCGACCTGCCTCGTCTAGTGGTAATCAAAGAACCAGTAGACTTACCCTCAGCATTACACCTTCCGCTCTCACCCTCTCGCTCTTTCGCTCTCCCACCCAAA:1 + chr2R 4996699 5' + Cr1a 306 1 67.77 TGGCAGTAACGTAGGAAGTTCGATTGGTTACAGCTTACAAATAGTAAGATTTATAAGCAACATCGACCAAATATTAAACTATACATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr3L 19510463 5' - pogo 2065 1 60.27 CCAGCATCATGACCAAGCAGTAAGTGGCCGATTGGACCCGAATCGAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCA:1 - chr3R 10741186 5' + 1360 3366 1 49.32 TTGCTGTTCATCTTACTTTTTTTTTGTTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATCATCATCCCCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTT:1 - chr2R 15730545 5' - R2-element 3423 1 63.01 GATTACGGTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr2R 20931610 5' + blood 7052 2 53.42 CTAGCAAAAATGTTCCAACTCCCCTGTTGCTCCTGCTGCTATTTCATTCACCCTCTTTAGGCTCCCCATATATATACATATATATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGTGTTCTCGGCACTCGCGGCCTCATACCTC:1 - chr3L 2625158 5' - opus 7466 2 56.85 TATGTTTTTTAAAAGTAATCTTTTATGATTTTAATGGTCGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chr2L 19907658 5' - hobo 2889 1 52.05 ATAGTAACAAAGTTCTCTTTTTCGTGGTGAAAATGGTTGAATATTTTTTCCATAATTTTAATAATTGTGTATCTCAGAAAAATGATAAAATCGGGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGA:1 - chr2R 20361569 5' + INE-1 560 1 80.14 TTTTATTTTTGTGCTCAACCTTTCCCTGGCTTTATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 + chr3L 14235201 5' + opus 7051 4 72.65 GTGGCACTTCGAAACTGACATTTGCACTTTTTCCCAGGCCAAAAACCTTCTGTTGTAATGAGAAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGAT:1 - chr3L 9240473 5' - 412 7475 2 65.07 ACGCAATGTTGGCTGCTTGGCCAATCGAATTCGTGCCGGTAACTTTATGCAATAACTTTATGCTAATTATTGATAAAATGTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chrX 18055688 5' + 297 34 2 63.01 GCCGTGCAAAAGTATTTTATGTGTTTGGTAAATCCATTCATAACTAAGCTAGTTGTCTTATTCAAACCCAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:2 - chr3L 17710690 5' - I-element 5303 1 52.74 GCCCTTGCCCTCTCTTTGATGCTAACTGCTCGTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr3R 10741042 5' - 1360 3365 1 67.12 TGGGATGGATGGATGGTTAGTTGGCATTTCTCCGGAGACCCTCAACCTGTTTTTTCTTAGTTTTTTTTGTTTTTTGTTTATTCGCCCTTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATTTTGTGT:1 - chr2R 14117555 5' + Cr1a 381 1 57.53 AAACAGAAACGCAAAATGCCGGCGCATGTTTGCTCGCCCAAAAAATGAGGTAAACAAACAGCAAAAAAATAAAATAAAAATAAAATACATTCTCCCGCATACACATATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 - chr3R 6472798 5' + opus 7 2 79.31 TGCATTTGCTACGAGCTTTTTGTCATGTGGCATGCAAATGAGCCGCACTGCTGGCTTTTTCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATA:1 - chrX 10698713 5' + mdg1 61 2 60.27 TAAATCAAGCAAATGTTTCTCGGAAAGTCCAAGTCACCGATCATCCATTGGTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 - chr2R 12642734 5' + pogo 65 1 64.38 CCGCATACGTAGACCGCACCAGATGGGATCCCCTTTCCCCACTGTATTGTGGGTGTGGATGGGTTTGGGGTTGGGCACGGGGCGGAGTTCGCCTTTTAATTTTTTAGTTAAATATTTAATTTATT:1 - chr3R 21985797 5' - HeT-A 12 1 76.00 CCAATTTAAGTGGGTTTTGTGTGTAAGAGCTCTGTTTATATTCCCATATTCTATATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGG:1 + chr2L 19217612 5' + gypsy6 7417 1 68.75 GGTATAAAAAGCATGCCGAAAATTGTCAAAGGGTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACTTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATAC:1 - chr3L 3580939 5' + copia 88 2 76.03 ACTTACATATATTGTAGTTTCATTTTTCAAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAAT:1 + chr2L 615224 5' + F-element 71 1 56.85 CATTAAAACCGGAAATGCATGGCCAACCCACAAAACACAAACGAGCGCAAACGCTTGGCCACACACACACGCGCACACATACGAATATGCGTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr2L 5656672 5' - hobo 2911 1 66.21 TCGAATAAAAACTTTTAGCAATATGTGTAGCTGTGTATAGCGCAAAACAAGAATTTTTCGCCAATTGTGCCAATTGATCAAAAATAATATACATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGACATATTTAGTCAAATTTACAAT:1 - chr3R 3627069 5' - 1360 202 1 71.92 GTGTGTGGCGTGAAAACGCGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 - chrX 7930737 5' - P-element 2799 1 18.05 TATTCAATAGCATAATGCTAATATCGTAAGAATATCATAGATTTAAGGCAGAGCATTTCAGACAGCACTTGTACCGTTCTAGACTTAAGAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3R 18514466 5' - pogo 2076 1 68.49 AGCAACATCATTGAAAAATGTGTCTAAGTGAATCGTCTGTTGACATCTGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATAT:1 + chrX 19992583 5' + copia 75 2 68.49 GGCTAATTTATACCCTTTACTTGTAGTGTAGAAAAGACACTTTTGATTAGTCTTGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAAC:1 - chr2R 7024479 5' + diver 5955 2 63.70 CGTCGAATGAAAATGAATGAAACGGAATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAAT:1 - chrX 1831295 5' + P-element 43 1 34.69 CAATATCTGTTCAGCACATACAGCCGAGGGCAAGTAAGTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATC:1 + chr2L 3393766 5' + Stalker2 7330 2 72.60 GGGTATGCGGTTTTTGTGGTTCGATGGCAGAATGTTGCTCACCGAGCAAGTGGCCAGCGGAAAAAAAAACAAGCAATGCAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chrX 3637886 5' + roo 8677 2 70.94 GCTCGCAATCAGGCGGGCGAGAGCAGCTACAGTGCTGAGTTGAAAGTCAACGGTTACTACCCATAGATTTCCTATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGT:1 - chr2R 7343362 5' - flea 212 2 56.85 ATTGGTTATATAAAAATATGTGATTAAGTAATATTTTATATTTAACAAGAGAGAACACGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGGATGCGAACGCGAAATTTCATGATATTCTGGGATATCGATAGATATT:1 - chr4 987548 5' - INE-1 497 1 65.07 CCATAAAAAGTGTTATTACATTTTAGAGGATTGACGTAAACCTACTTCACAACCAATGCACAAATATATAAACTTTATTTAAATTATTGTAGTAATTATGTTGAAATAGGAAGTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCTCTGTTGAAT:1 + chr3L 13402080 5' - diver 5770 1 65.07 TTTGCTAGTGCATCGCACCCGGAGCAACTGCAACCGTAGGCGGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACAT:2 + chr2R 21105725 5' + Stalker2 7329 2 71.23 ATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAGTGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCC:1 - chrY 3648912 5' - Stalker4 7144 4 55.48 AGTTACTGCTATCTTTTTGCTCTGTAAAAAGCGTGTCTTGTGTCGTATTTCTGTCGTTAGGCAAACATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chr2L 21687586 5' - pogo 2049 1 54.79 TAAAAGTCTCGTAAAACAAAAACTTCTTGTAAAACCATGATCTATTTTAATCACAATCTTTCAATAATTGTATTGCAATCACAACGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTC:1 - chr3R 8293657 5' - Stalker2 7616 2 59.59 GCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr2R 14767349 5' + Tirant 40 2 56.30 CATTACACACGGCAGCCCCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr3R 5767377 5' + roo 8735 2 67.12 GCTCACGATCTTCCGCAGTTTCAGTTCAGTTCAGTTGGTGTTGCTGCTGCTGGGTCAGTCCACATATGGCTTCCAGCTTCCAGCTACTGGTATCTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGA:1 + chr3R 24996251 5' + F-element 96 1 65.07 ATATATTTAGTTTATTTAGCTGCAATTGAACACTAAAAAATACAGCAAATTGCAGCCTGCTGAGCTCTAAAATCTTTTGTTGTAGTGCATAAAAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chrX 6213482 5' + roo 27 2 67.12 GACCAGCAGATTCAACTGGTGTCGGCTTGCTGCAACTAATAAACAAACAAAATTATAACTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCT:1 - chrX 13558279 5' + mdg3 62 2 60.96 ATATTTCAAGGTATAAAATCTTTCATACAAAATGTTAGATTTTTTAATCAAACATTTAGTGGTAATAAACCATTAGCACATTTAATGGCCCGCTAATTGATATTCAGTCGTGCTTTGGCTGCTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTCTCT:1 - chr3L 3544393 5' - Doc2-element 221 2 80.14 GTTGGAATTTACTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 - chrX 12995421 5' + blood 47 2 53.10 ATTACATTTATTATAATGATTCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATCTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCC:1 - chr2R 12185475 5' + accord 4 2 78.77 AAGGGGTATCTTTTCTGTTGAAAATACCTTTTAGATAAGATATGTTGTATAAGAAAGGCATCATATACTTTGCATATTGGACAGAGTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3R 26031824 5' + pogo 30 1 65.75 GTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 + chr3R 11873340 5' + 412 7114 2 59.59 AATGATATTATAATTACTAATGCTTTTATAGATTGAAAACTTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 + chr3R 26031704 5' - pogo 2036 1 68.89 ATACACACACACACACACACACACACACACACACACATACACATATACAC:1 + chr3L 19692543 5' + accord 7033 2 82.00 GAGTTCTGGAAAATATTGCTTTAACTTAACCAACAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAAC:1 + chr3R 20097618 5' + mdg3 5340 2 74.66 ATTCTTCGCATATGAATTGTAAATAGTTTTTGGCGAGGGTCTTTGAAGCGCCGACTGGCCGCAAACGCCGGTATGCTGTTGCAGTTGTTGTTGCTAAAAGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTACTGGTAGCTAAAGAA:1 + chr2R 18439399 5' - Doc3-element 478 1 50.68 TTTCACAACTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:2 + chr2R 14450156 5' - roo 8998 2 67.81 GTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCT:1 + chr3R 19449978 5' - roo 8641 1 64.93 TACCATGTCCTGTTGACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chrX 16995039 5' + jockey 79 1 65.52 GAATTTTCCGACAAATTGAACTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chr2L 12766973 5' + hobo 62 1 58.90 ACTCGAGTTTTAAACTCTTTCGCAATTCGAACCATGTGCATGGCAAACTGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTA:1 - chr3R 9863026 5' + Stalker2 7262 2 76.03 CGACAGAAATCAGTAATTTTTTGGAGCCATCGAACTACAAGTCATTGGAGGTGCCGATTGAGTAACTTTTAATTTTAATAACTACGATGAAGGTTACAAAGGTTATGAAGGTTCGGAAAAATAGAATTTTTGAAATTTTAAATCTG:1 + chr2R 4135145 5' + FB 31 1 65.07 GCCTTTCGTATCCTTGCAAGGCTTCGGCTTCCCAAGCCACTGCAGTTGTGGAGGCTAATCAAAAAGGAAAAATGCGAAAATCGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTAT:2 + chr2L 16202577 5' - copia 5087 2 60.27 GTATAAGAGTGCGCAAAAGTCTCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:2 - chr3R 9158283 5' + P-element 97 1 19.18 AATTTCAGTTCCATTCTTTCAGTTATCCTTTCGCCTGCGCCATTGGCAACTTTCGTTTTTTCCTTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr3R 7655558 5' + 412 7088 2 50.41 GAGCCAAATGCTTTCAACTCAAAAGGCAATCTTAAAATTCGCGGAAACTAACCATAAGCTATTTAGTTACCCAAATGGACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 + chr3L 5425431 5' - blood 336 2 56.85 ATCGTAGTCTAGTTTTTTGATTTTCTTGCATTTCTTTTCTCTGAAGGACACGGAGCTCTTTAAGTCGGGACCAATGGACTCGTAACAATGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCC:1 + chr3L 13663874 5' - 1360 451 1 60.27 GTTGGCATTAGTGGACGACTGGCTTTTAAGGCGAGCAAATGTTGGTTGCTCGTATATATATACACATACATACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCG:1 + chr2L 19634955 5' - Quasimodo 7323 2 55.48 CGATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGCACTAACGCCAAGACCTTTCCCGGAGGTCGATAT:1 + chr2L 20928067 5' + Chimpo 60 1 60.45 GCTTACTAGGAAATTAAGTCGAAGATCTACTTCTGCATATGAGCTATGTATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCT:1 - chr2R 20931721 5' - blood 7318 2 67.12 TTATTATCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTT:1 + chr3R 24301830 5' + Tabor 78 2 68.49 AATATCTACATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGG:1 + chr3L 21765410 5' + gypsy 56 2 54.11 CAAGATGTACATCGCGGTCATGATCCGAATAGTTTTAAACCGTAAACAACCGATGTTGGGAATGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAAC:1 + chr3R 4744705 5' - P-element 2670 1 46.58 TTAATCGAGGCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 + chr2R 14767340 5' + Tirant 16 2 70.83 CAATTAAATTTTTTACGCAAACAATCCCAATGAAAAGATTACTGTAATGATGGCGTTGAATTTAAAAATAACACAATATGCATAATGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGGCAGTTGA:1 - chr3R 14174822 5' - 297 6946 2 65.75 AAACAGCGCGGATTTTCCATAAACGAACGCGAATTCTTCAGGAGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chr2L 951277 5' + F-element 39 1 63.01 GAATACAAGTTATTATGGAAGTCCACCCACCAGACTCATTTTCATCTTCATGTTTTATAGGAAATCAACTCGACAATTACTTGGCGAAAAGTTCATTACCATTTTAAAAGTTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 + chr3L 13015839 5' + hobo 7 1 76.71 ACCTACTTTGCGTTCGGTTAAATGCTGCAGCCTCTTGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1 - chr3R 6149844 5' + jockey 94 1 74.66 TTCATGGTCTAATAATAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chr3L 16523182 5' + jockey 63 1 55.48 CAGAATCCGAACTGAAATCCACAGAAGCACACAATGGATACAGACAGATACATAGCCGTATAACTACGAGTCAAAAGATACATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 + chr2L 2336184 5' - 297 6949 2 68.49 ATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACAT:1 - chr3R 1048038 5' + Stalker2 81 2 71.92 GTGCACACACATATTTTAGCCAAAATTACTTTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCAC:1 + chr3R 19992605 5' + hobo 169 1 76.52 ACTCGCTTTCTGTGTCATTTTGCTTTTCTAATTTCAGTTCCATTCTTTCAGTTATCCTTTCGCCTGCGCCATTGGCAACTTTCGTTTTTTCCTTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3R 7655529 5' + 412 29 2 62.33 ATTGTTGCATTATTTTCACCTCTTTAACGAAAACAATCTTCGGTATATCCTGTATGTATATCGATTACAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 10344752 5' - roo 354 2 54.11 TAAATCGCTTTAGGTGTAGGAGAAAACTGGCAGCGAATGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATG:1 - chr3L 21043117 5' + Quasimodo 75 2 73.97 AGTGGTGCCGCCCACAAGAATCACTCTTCAGCAGGCACAGCAGCGCGTTTCTGCCTTCGAGGTTTACCGAAAGCCGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCT:1 - chr2L 11103092 5' - R1A1-element 4953 1 52.05 TTCTTATTTTTTTTTCTTTTAAGTACGTGCCTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 - chr3L 27200568 5' + hobo 84 1 77.70 CCAAATGGCGTGTTGGCAGGCCACAAGGAGCTGCGGCCGATAGGAGTCCTGCGGTCGGTTAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chr3L 13631354 5' - hobo 2934 1 71.43 TCGGCTTGGTCCCGTGCTCGGGATAATTGCTTCCCATCATCAGCGGCGGAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chrX 19744547 5' + P-element 2 2 81.89 AATGGCATCAATGTCATATCAATCAAAAACTCAAACTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCATATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr3R 22266513 5' + roo 8747 2 73.29 ATATTTTCCTTCATTGAATGTTTCTGGAAGATTTGAAATGGGAAACAATACAAAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr2L 13102959 5' + roo 8722 2 63.04 CTCGTCTGTCAACGCCTTGTGGCTATTATTTTTTTTGGCTTAAACTCCCTATATACGCATGCACATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:2 - chrX 17508921 5' + Burdock 54 2 57.53 AATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAATCCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTA:1 + chr3R 19450051 5' - roo 65 2 73.33 CAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTT:1 - chr2L 23295919 5' + micropia 4976 2 69.18 GCAGCTGTCAGCTGGCAAGATTGAAATGGTCGAGGTATTTGCAAATGTTTCCATAAAAATTTATTTATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 - chr3R 26643402 5' - 412 441 2 56.16 TAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAAT:1 + chr2L 615238 5' + F-element 85 1 66.44 ATTTGTGTGTTGGCCAGAATAGAGTTTGGCCATTAAATTCGAGTGGAATGAATGCACTATGGGACATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAAT:2 + chrX 20106323 5' - hopper 1344 1 64.38 TTTTTTTTTGATTTTATTTCACAATGTCTTTGGGTTTCCCAGAAAAATTATGCAATT:1 + chr2L 4220319 5' + INE-1 510 1 77.19 GATAAGAACTTCAATATTGTCGTAAATATTAAATTGAAAGGAAATGACTGGAAATCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chrX 10344889 5' + roo 66 2 66.44 GACATAAAAGTTGTATAATTTCGCATTGGCAGGTCTAATCCCACCAGGTAGAGAAACCCACACACAAAACGCACACCTAAGTCCCCCCACGAAAAGTATTTATGATTATATTATTATTTTTATTATGATAGTTAGAATAGTTT:1 - chr2L 1411821 5' - I-element 5342 1 74.83 CAGAATACAAACTATATATATCTTGACCAGCACGATTAGACAGGGACGATCAGACGTAAAGTTATCGGAATGGAACTTAGTAAACGGACCTATCTTTTTAAAATAGGTCTTACCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGA:1 - chr3R 5200723 5' + R1A1-element 394 1 76.71 TTCGAACATGCATCCTTTTGTGCCGGACTCGTGTTAGTTTCTGTTCATTAAAACATGTTAAACACATAATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr3R 12885976 5' + 412 7099 2 53.96 TCCCACGCAACGTAAACAATCCGCATTCGCTTATGACAAACAATCAATATCCCAAGCGGGAGATCTCGTTCCCGAAATAATGTAAACAAAAGGGCAGTACAAATACGATTTGTTTGTCTTAAGCTAAGATCAAAAGAATAAA:1 - chr3R 3744458 5' + 297 6869 2 45.07 CATTTGCAGCTCACACTTTAATGCTCATTAATAACTGCCCACTTTTATTGGCCGTCCATTAAATTAATTAAATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTAT:1 + chr3L 20042397 5' - flea 4965 2 52.74 AACGGCAATGTTTAATTAAAAACGATAAAGGACACAACGCCGGCAATGGGCAATGCAAATAAGAGACTGAATGCAAAGGGCGCCCAAAAGGGGATGCACGTAACGATATATGTAGCAATGTGTGTGATTTAACGTATTTATATTTA:1 - chrX 8185407 5' - diver2 452 1 64.38 AAAAAGTAATTTTTGTTAAATCAAAAATGATGTTATCCATATATTTTACCATATATTATACCTAATTTAACTACGATAGCCTACCTATTTCCTAAAATTATTAAAAAATTTTACTTAATTATTATTTCATTTTGTATAAATTCGCT:2 + chr2L 7298453 5' - Tc1-2 377 1 56.16 ANAAAATAGTTTTCATATATAAAGCAGTGTGTCAACACACAGTGTGTGCTAAGGATTCAAACCTTAATTTGTTTAAATAAGCACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTC:1 + chr3L 15374599 5' + 3S18 5805 2 58.90 CACCCCACTGCACATGTGTGCGCGCCATTCAAATAGGTTAGGAAAATATGTAAATGCTGCTGGCATATCGTATATGGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr3R 11483740 5' - pogo 2059 1 56.85 CAAAACGACACCTTTTGTTACTCCGATAGTAACCCGGAGCACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCA:1 + chr2L 13967498 5' + I-element 4954 1 72.60 ATCAGTTGACAATTTGAACTGCGCCGGGAAAGTGCTTTTATTGAATGGCGATCCTCTTTTTGAATCAGATCTAAGTGTGGAGGTATATTCATGTATACTAGTTCCTCCATTTTGTTGTTGTAAGCACACTCAATTCTTGATCTTAT:1 - chr3L 2530074 5' + Gypsy12A_LTR 2116 1 63.01 GTCAGTTGTTGTTGCTGTTGGAGATCATTGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAATGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCG:1 + chr2R 2666298 5' + Rt1a 25 1 60.45 GAGGATTTAAAAATTCCACAGAATAAATCCTGCACAAGCACACAAATGTTGACATTTTAATGGGCATTCCTTGCAGGAGTGATGATAACTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTA:1 - chr3R 16472216 5' - 297 155 2 60.96 ATTAATGCGCAAGTAAGTGTGGATAAGTACATCATTTGCAGCGTACTCTCGACGTAATCGGAGCACAACTGCAATGCAGTCATAAACTCGCACCAAATATCAATTTATTCATACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAA:1 - chr2L 13755675 5' + F-element 4383 1 76.03 CAGCGCGGATTTTCCATAAACGAACGCGAATTCTTCAGGAGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 + chr2L 951280 5' + F-element 32 1 65.44 AGAGCTTATTTATGCGCATATGAACAGCTCGAAGGGAGTCGGACTTTCGCCGGCATTCGTAATTGACTCACCTTTAATTTGATGAAAGCAGGTGGTGGTTGGAGGTGTCACGGTCGGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGC:1 + chr3L 10138296 5' + F-element 499 1 65.75 AAACATTTAAGCTGCCAGCGGCTGTACCACCGAGAGCGTGATGTGTGGGAATCAGAGCACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACAACTCGACTC:1 + chr2L 19680998 5' + hobo 19 1 52.17 AAGATATGTTATCATCCCAAAAGTATGCTTCTTTAATTTCCACGAGGCTATAGCAAAGTTTAACACCCAACTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAA:2 - chr2L 15096972 5' + jockey 4722 1 52.05 TTTTGCCCGAAACTTCAGCCAGCATATTAATGTTTTCAAGTACCTCATAAGCTATGGTATTATAACCAGAGTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGGGGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 - 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chr2L 19907627 5' - hobo 2858 1 73.29 ATCTGGAATGGCAAAAAAAAGGAAAATTCATTTTTGATTAAATGCTGGCTATGGCTTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr2R 16503485 5' + jockey 70 1 59.59 TGTGCAGCTTAAGATTACCACCAACAATAAATAATAATAATCGGCAGTTGTAGTTTAGTTCTTAGTTACATTTTTTCTGAATTAATAGCTTTAAGTTTGACAATTTAATTAAGATCCATTAAGTTTTTTGTTGTGTGTGTTTCTTT:1 + chr3L 5253727 5' - Tc1-2 494 1 80.14 ACAAAACTATCTGCTTGTGGGACAATGGGCCAAGGCACACGGCACACGGCTAGAGAAACAAATTTTGTCGTGTTTACGCTGCCAGATTGCCATTAATTTTATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3R 18114999 5' + 297 15 2 75.34 CTTAGGAATTATATTTGTTCCACCTTTCCTATTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTT:1 + chrX 21124902 5' + FB 60 1 75.65 ACCCCGTACCCCCTGCCCGCCAAGCTTTACCCCCTCACCGTTGGCTAATTGCTTAAATATTTACAGTATAATTCTCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr3L 19702852 5' - pogo 2079 1 57.55 TACTAGGAAATTAAGTCGAAGATCTACTTCTGCATATGAGCTATGTATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 - 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hobo 2871 1 65.75 GAACGGAAAAGCGGAAACGGACGAGCGGGGGGTCGAAAATAAATGAAAACTTTCCCTCGCCGATTGTAAGAATCACAATTTAGTTTTTCTTTTTCCGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATT:1 - chr3R 11550934 5' - F-element 293 1 69.18 CAATGCGATAGTATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr3R 23565237 5' + jockey 60 1 53.42 TTTCTGCTTTATGAAATGTATGTATGTTCCTATTGTATAATTACAACCACAATCAGATCTGGTAGTTCTGGAGTTCTTTATCTTGACATTCAAAAGTACAACAGATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:2 + chr3R 12540438 5' - roo 389 2 65.07 AAGAGGAAAGTTTGTGCCACTTTTCTTTTTCTTAGTATTGCTGCTGTCGCTTTTCCGCCTATATGTATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:1 - chr2L 9109955 5' - opus 7451 2 56.16 ACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr2R 17872484 5' + Tirant 8147 2 55.36 TATAAAACATATTAGAATTTACGTTTTACATTTTTGCATCACATCACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr2L 20262614 5' - roo 8998 2 69.86 ATTAGAATACTTCTAATCTACATTTGAGGATTGTCAATCTGATATTAATAAGCTTGAAATGGCTTGTGTTCCGATAATATCTTATAATGTAACATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2R 8374984 5' + roo 8681 2 69.78 AATGAATTTCAATACGGCGTCGCGGGCATAAAGACTGAATATATATGTGTGTGTGTGGGTGTTT:1 - chr3R 20140481 5' - accord 183 2 78.12 CTGTGGGTTTTTCCATGACCAGCAGATTCAACTGGGGTCGGCTTGCTGCAACTAATAAACAAACAAAATTATAACTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1 - chrX 13558295 5' + mdg3 5262 1 70.91 AGACATGGGGCAGACCAGACCTCAAGGAGGCATTCTCCGGCTGAAAACTGCAAAGTTCCAAGCTCGAACCTCAGCCATTCGCTCCTCTTTCTGACATTTCAGTTCATTTCAGTTTTTCCCTTTCTTTCTTTTTTCCTTTTTTTTTT:1 - chrX 9718312 5' - Doc2-element 233 6 60.96 GCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAATATCT:1 + chr3L 23456269 5' - gtwin 403 2 65.28 CATCTGGTAATTTAAGTTATTTTCCATATTACACAACCCGGCAAAAACTCGTTGACTTTTTCACAGACACCGCAATGTGTGTATGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3R 29381620 5' + hobo 37 1 60.27 CAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTT:1 + chr2R 9408183 5' + FB 81 1 73.29 CCATCGAAAGGTAAGTATCTGGCAAACCATAAAGAACTCTATCCATCCTAAAATGACATCAATATATTAGTTTGAAATAGTGTTTTGTCTTAAATTATGGTCTATATACATTTAAGATTTATATATATAATAATATTTTTTCTTTG:1 - chr2R 21847357 5' + transib1 1958 1 78.08 TCGAGGAGTCCAGACTATGGGGTACCTGGTAATTCAATTTCGATATAACAATGTTATTCAGCGACTTTCTTTTTATATACCATAAGCGAATGTTAATTTTTCTGAGGAAAATATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAG:1 + chr3R 8338064 5' + jockey 4568 1 78.08 CACACAGCACACAGGCACGTGACATTGTGGTTAAGCTGGAAAAAAAGGTGAGAGTAAGCAAGAGGAAAGTGCGCCAACTTAAATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAC:1 - chrX 22578123 5' - 297 364 2 63.45 CAACTCAGCCTCGATGTTTGGCCGACCCTTCGTGCTGCTGATGAGATGGCTCAATTGAGAGCTTTAATTAAATTATGTTGGTATGCACAGGATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr3L 12729217 5' + opus 7028 4 64.38 CGCCTGGTAATTAAAACCGAATACTCACACAATGTGCCTTAAAAACAATAAAACACCTTTTTTTAGGGTTTAAATCATTTTTTATTATTCATTAGGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAATGTCTAGCTTAAAAGATATTATG:1 + chrX 6952092 5' - G5A 2770 1 67.59 AATTATTCGACTGACGAAAAAGCTGCAGGAATCTGCGAATGCTGGCAAGATGTAAGAAAATAAGACTCAAGTGCAGTGAGAAAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chrX 2821986 5' + roo 37 2 63.01 AGGATTCAAACCTTAATTTGTTTAAATAAGCACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCATCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAGCAT:1 + chr3L 15374650 5' + 3S18 5856 2 76.71 CCCCATTTACTCTTGTGATGAAATTTCGAAACTTTGGTAAAACACTTTTTGGCCCTGTGCGAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr2L 5656501 5' + hobo 20 1 71.92 TTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTA:1 + chr3L 19951175 5' + Ivk 52 1 52.74 ACAGGGATTTCATTTACAGCTAGCAAGCTGAAAATTTGGTTTCAGAACAAAAATTAATACTTAATAATACTTAATTTAGAGTCCCAAAACTATGTTGCTATTTTTATTTTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTG:1 - chr2L 16567018 5' + F-element 470 1 71.94 ACACTTTCTAATGCTCGAAGCGTGATAAGCTGGCCCCAGCTGACGTTCGTTTTAATGCGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTGTTTTTGACACCC:1 + chr3L 939631 5' - hobo 2876 1 62.33 TCTGGCTGGCATTTCTTAATTAGCTAAAGTTCGCTCCGCCATCAATGAAGATTCATATCGGTGTGTGTGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 13568162 5' + hobo 42 1 51.08 TTTTTTTGCAAATTTTATGGTACGAAAGCTAAACAAAGTTGATTATTTTATAGTTTTGAATCAATCGAAATGGGCGAAAATACATAAATATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 - chr3R 15453802 5' - Transpac 303 2 77.17 AAATATATCTGTGTTTCGTATTACTTTCATTGCATTCTTATTAACAGATTTTCCAGTGTAGTGCTTTCTATTTCGGACCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 - chr3L 3250075 5' + P-element 42 1 56.85 ACTGCACAAACATGGAATTTAAAATTAACAAGCAACAAATAACCGAAAAAACGAGCATTTAATCGATATTCTCCAGGCGCCATTTAAACACACACCCCCTCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3L 5731205 5' + 297 6595 2 76.71 GGCAGAGAATCTTTTTTCCGCTTTTTCACAAACATGACATAAAATATACATCGCATAAAAACAGCCATACACCAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATGAATTCAAGAATTTAACAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATA:1 - chr2R 21871554 5' + Quasimodo 135 2 59.59 GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAG:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 5099 1 77.14 GTTGAAAACCCCAGAGCTCATCACCTACAATAGTTCTGTCATCGGCACGATGTTTGCGGCATTAGCTGGCAACCCTTTCCCCAAAAACGTCAACAGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2R 8467688 5' - roo 9047 1 68.49 CCATAACAATATATCTCAACATGGTTTTCTTACTAGACAAACAACTTGTACTATCATGATGGTTAGTACACACATAAGATATATTATTATAATTATTACAGGGCTCTTGTGGCCTTTAAAATATCCTTTTATTTTTTATTTAAAAT:1 + chr2R 13283102 5' - G2 3052 1 77.40 AGTGCATAAATTCATTTTGGGTACATTGAGATGTGCTTATTAGAGAACACACATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAA:1 + chrX 19766727 5' + copia 4938 2 65.75 AGTTGCTGCTCATTGTTTAGCAGTTGATTTTTTGACGCACTTTCCCGGCTGGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACA:1 - chrX 11280820 5' + X-element 87 1 67.12 CATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGC:1 - 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P-element 2855 1 63.70 TAGGCAAAATAAGCAACGGAAGTGAAATCACCATGTATAAGCGCCAGGAATCCAAAATGAAGCAGGCGAAATGCTGGAGCTCATCAAAATTCGACAACTATTATTTATGTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 - chr2L 18671772 5' - mdg1 7447 2 76.71 CTCGAGATCCAAAATATAAATGTGCTTGGTGCAGCAACTCATGTGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAAGCT:1 - chr4 39239 5' + springer 7215 2 71.92 ATACTCCACCACAGGTTTCAATCGCGTAGAAAACCCAAAGAAAACGTATTCATTCTCAATTGACTTGAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr2L 8009043 5' + roo 8702 2 53.03 AATTGCCAGGGAAATCAAAATTGGAATTGAGAATGTCCTGTAATACTTTTAATTTGAAATTGGGCAAAGATTTACTCAATTGAATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGC:1 + chr3L 15466727 5' - 412 291 2 54.11 CAAATAAATTAGAATTTGCTACAGCCAGCGGCAAGCAAATTAGAAACCGCTTGAACTACACGAGGCGAAATGTGCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr2L 20268908 5' - hobo 2930 1 72.48 GAAAACTCAGGCATCAGTCCTCGAATGCGAAAATGTGTGTATAAATTAATTAAATGTATGGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACGGGGGGTTCCTCTGTCACTGGGAGGCAGGGCGGTTGCCGC:1 + chr2L 15934565 5' - 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297 380 2 76.71 TGTTTAATAACTGCAGAATGTTTCAGCTCATTTTATTATCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1 + chr3R 24301798 5' + Tabor 46 2 54.11 TTACAGATTAAGAGGGCTCAGAGCTAAAGATAAATTCTACTTTTCCTATCCTTTGAGCAGCTATAAGAGTCATAGAAACGCATTCAGGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTATTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr2L 6716426 5' + hobo 33 1 62.50 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTATGCTGGACGCTGGAGGTGACTGTTGTTGGTGCTTGGATCCCGGATTTTAGTACACTTGCAAGGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATTAAGTCTAAAAATTGAGCTAC:1 - chrX 14317415 5' - transib2 2792 1 45.89 GTTTAGCTAACAGTGTCAACTCAGCAGCATATGTTGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGT:1 + chr2R 11691225 5' - P-element 2801 1 26.71 ATATGGCGGCAACGTGCAAAAGTGCCATAATGCTGCGCCATACAATCATTAGCATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAAT:1 + chr3R 9862884 5' - Stalker2 336 2 60.96 CTATGTATTTGCTTCTTTTTCAAATAAGTTAAAGGAACCTACTATCCTACCTATACCTACATGTTCATTAATTACGATTAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 + chr3R 25052976 5' + pogo 37 1 60.27 CTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGC:1 + chr3R 24301842 5' + Tabor 6929 2 76.71 GATTTCACAAACGAATTTGCGGTTTAAAAGTCTCGTAAAACAAAAACTTCTTGTAAAACCATGATCTATTTTAATCACAATCTTTCAATAATTGTATTGCAATCACAACGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAAT:2 - chr3R 8293681 5' - Stalker2 7640 2 74.66 TTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2R 14450169 5' - roo 321 2 76.71 CCTGCGATCAATATTAAAGCCGAACCAGCGGACAATGGAAACTCACCTGCAGCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCCCTAATAGCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3R 15363522 5' + 412 36 2 56.85 AAAACACGAAAAAAAAAAATACAAAGGGGAATAGAAGCACAGCAGCACTGCAAGAACGACATATACTAAGCACCGGGAAACAAAGAACACGCCGCCTAATCACCTTGCTCCGATCCGGCCATTTCCC:1 - chrX 2004824 5' - accord2 268 1 59.06 GCGAAAGTAATGCAAAACAATGGGCTCGAAAACCACCCACCAACACAATCACTAGCACAAAAGCGGAGAAAGAAAGACGCACAACAAATATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAGCTTAGA:1 + chr3R 28788678 5' - I-element 5321 1 61.64 GACTTATGCGGGGAATTATGAGATGCATAAATGACGCAATAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGT:1 + chr3L 22445198 5' + Transpac 80 2 73.97 CACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAATGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGC:1 + chr2R 2666331 5' + Rt1a 55 1 56.49 AGAGTGTGTTGAGGCGGCTCTATGAGTCTGTTCGTTACAATCTGGAGAATATTCAGTTCGACTTCCAGCAGCAGCAGATGGAAGGTGACGGAAGACCGTGAGGACAGAGGAGAACGGAGAAGGATATGTGAAGGGTCAAGATGCCC:1 + chr3L 26022159 5' + gypsy8 4493 1 54.11 CATAATACTCTTAGTGGAAAAATGTGCCACAACATCTTCCTGCCTTCCGTTTTCCACACATACATACATATGTATGTACATATATATTTCTATATATATATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr2R 17317534 5' - 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I-element 5293 1 60.96 AACCTAGCAGAAGTTCGCATTAAATCTACCCCGGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 + chr3L 6542013 5' + hobo 85 1 76.92 TAGTAATAGTTAATCAGCGATTTTCCATTCGAACATGCATCCTTTTGTGCCGGACTCGTGTTAGTTTCTGTTCATTAAAACATGTTAAACACATAATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr3R 12885949 5' + 412 7079 2 66.44 CCAATTTCCAACTCCTGCAAAGCAATCTCTAAAGTGTGAAATTTGAGAAATCTTTCTCGGCTTTCGCCACACTTGTCATGTAAATTATCACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGC:1 + chr3L 12928875 5' - mdg1 445 1 59.59 GTAATTTGTTTTCTTATTTAAGTGTGGGTGTATATAGAGTGTTTAAACGTAGATAGTGTGCTTATTTTAAAATATTTTTAAATGTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATA:1 + chr3L 25821755 5' - opus 467 2 64.38 CTTTACTTGTAGTGTAGAAAAGACACTTTTGATTAGTCTTGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTT:1 - chr2R 7024465 5' + diver 5969 2 73.29 AAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1 - chr3L 3540200 5' + mdg3 67 2 69.86 CCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACAT:2 + chr3R 15035071 5' + Stalker2 7329 2 71.23 AAAGAAGTACCTATTAAAGTAGAGACTCTAGAAATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACAC:1 - chr3R 1048071 5' + Stalker2 7296 2 52.74 TGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATGTTTTCGGTGCTTAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 + chr3R 26405019 5' + hobo 72 1 66.44 CCTTTTCTCTTAAAACGTACTTTTTAATCGCTTAACTTTCGCGGCGAAAGCATGTCTATTAGCTTTCAAAGCGAATGTTCGTGTTTTTTTTTTGCTCCCCGACTTTTTATTTTGTGTTTGTCAATCCAGCCGTGGTTTTTCATAAT:1 + chr2R 16107559 5' + Cr1a 63 1 63.70 AATGGGATACTAGATTCGTTGAAAATTATACAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCAAACTCCATAAAGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTATTT:1 - chr2L 21794178 5' + invader1 3664 2 58.90 TTGAAATGGCTTGTGTTCCGATAATATCTTATAATGTAACATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr2R 8375037 5' + roo 8741 2 78.77 TTACGTATCCACATCATTGTCCTGACGCCAGGCCGTGAAGTGGAGCGCCTGAACGCTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGCTCAGGG:1 + chr3R 509508 5' - R2-element 3185 1 66.44 AAATTAAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCT:1 + chr3R 19589888 5' + BS 5031 1 57.53 CCACCAAAATGGCATCAATGTCATATCAATCAAAAACTCAAACTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCATATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3R 22266520 5' + roo 8739 2 68.28 ACTGTCATGAAAAACTTGTGCTTTCAGTTTAATTTTTAATACATTTTATATATTTTCCTTCATTGAATGTTTCTGGAAGATTTGACATGGGAAACAATACAAAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAACACTTACA:1 - chr2L 13103008 5' + roo 17 2 72.60 GTTTACAGGTCTTAGATTCAGTAAGATACTTTTGCGAAAGACGTGATGTCCAATCGATTGGCTTGCCATAAAGGCATCGGGCTGTCCAACGTTTGGGCGCCAATTATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCA:1 + chr2L 887807 5' - Circe 206 2 51.37 AATAGTTTGTATTTCCCTACGAGGTTTTGACATTTCTTGACGTTAGAGTATGCGTAGCCCAAATATTTAAAAAAAATACCTTTTTTTTTATAAGTTGCCAGTTCACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2R 9868573 5' + roo 8679 2 71.92 ACAATAATAAACAAGATATAAATATCCCCACTATTTAAAGTCGCTTTGGCTCAACGAAGCTATAATTTTGTTATTGGATGTGCAGATTCACGGAATTTAATAAGTATCCGTATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTG:1 + chr2L 3317696 5' + X-element 18 1 71.92 AGGGCGGAAAAAAGGTCCAGAAAGTGGCAACAGAAGCAGCATCAGCGAATAAAAACTTTTGGCTGTTTTTATAAATGTTTATTTAGCAGAAAGGAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 + chr3L 10111727 5' + copia 28 2 67.81 CTAAAATAAGATCCATCTCAACAACCAGATATGAAAAGCCAGCACACTTGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGC:1 + chr2L 5333395 5' + mdg3 61 2 65.75 AATGATGATGATTATGGAACCATTACTGGAACACTAAAGGGCTTGCATCTAGCAGGATGAATGGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chrX 6053024 5' + roo 8721 2 57.53 ATCGTCGAAGTACTTGTCCAAAAGCTGGACCAAGGACTAAGTCTTCTGGCTAAGTCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGGGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGG:1 + chr3L 26350107 5' - Quasimodo 265 2 58.09 CAGGTGAACATTTATAAAGTACACATAGTTACACATAGGCGATACATACACAGGGTTACAGATATAATTGGGTATGGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr3R 17747396 5' + 297 6602 2 68.46 AAAAATCAAGCACATGCTAAGAACTATAGTGCTATCTAAAAATGGAATTTTACGCCCACCTGGCAACTCTAGAGCAGCTCCAAAAGCTCCCTATCTACCTTACTCTCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chr2R 16031489 5' + hobo 15 1 74.66 GACAGAATTGATGCTTTGCATTCCCCATAGATGTTTTTCTCTTCCAGCAGCAGCAGGTGGATTACTTGCGTGCATTTGCTGTGCCAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3R 30524430 5' + roo 8700 2 60.96 CCTGGTCGTCTACAATGCCTTCCAGGTGGCCCTCAGTGGGTATATGTTCTACGAGGTGAGTTCGAATCTAGAGATTAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTT:1 + chr3R 22572531 5' - HMS-Beagle 7001 2 57.53 CAATACGAATACGCCGCGTGGAAAACCGCAGTCCAGAGTAAGTAATCTTTTCCGGCAAATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chr3L 13546510 5' + hobo 18 1 71.92 TACATTGCAATCAAGCACCGATTTCTCTTGTATTTTTTTTGTTTTTTGTTAAATGATATTATAATTACTAATGCTTTTATAGATTGAAAACTTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr3R 26031653 5' - pogo 2076 1 69.18 ATTCATACATGTATGGAAATAAGCTTGTAAACTGGGATTAGAAGGATACCACTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGA:1 - chr2L 2522973 5' - mdg1 7387 2 67.12 TAGAGTTGGCCAGTGTTGGCCAGCGTGCGATTCGGAATGGAGTCGCGAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGT:1 + chrX 19744422 5' - P-element 2813 1 35.62 GGAACGCATCGTATTCATCTTTTACAGCCCGCATCCTTGGCAACCTTTGTGCATTATCTTCCGACTCTCATCTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 - chrX 10501374 5' + F-element 51 1 54.81 AAAATCACACGGTTATTATAACATTTAGGTTTTCCGTTAATAACTTTCGGTTTTACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGC:1 - chr3L 3251919 5' + P-element 2818 1 41.10 AGTTTATTCAAGCAGCATAAACCCGAAACACACTCGGAAACACACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTG:1 + chr2R 22372499 5' + I-element 72 1 71.22 TAAAAAGGCTTGTTGATATTGATTACTGTTCAAGAATGCAAAATATGATCTAAAGTTCAGTTGTTATTTTTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGC:1 + chr3R 6583244 5' - I-element 5298 1 58.90 AATAACGTGGTGTTATTATTGACCAATGTTATTTTAATCCGATAACAATGAAAAAGTTTTCAGTTTCTTATATATTTCAACAAAATTATGCTTTTTAATTTATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr2R 8942643 5' + 297 6593 2 76.71 AAACTCTTTCGCAATTCGAACCATGTGCATGGCAAACTGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACCGTATTGTTGTGTATCTACCCACACTATAACTCTTCTCTACATATATATA:1 - chr3R 9863015 5' + Stalker2 7272 2 67.59 ANTAAGTTGGCAGCTGATTCCCGCAGGCTTTCAAGAAGCAAAATGACGGCAAGTGAGGGAAAGTTGCTGCTCATTGTTTAGCAGTTGATTTTTTGACGCACTTTCCCGGCTGGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTG:1 - chrX 11280881 5' + X-element 26 1 75.34 TTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTAAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATCAACGTCGAGATCTCAGGAACTA:1 - chrX 21587764 5' + INE-1 142 1 43.84 TATCTCATGTTCAGATGCGCGGAAAAACACGTTACGCTGTATAAGAAAAGTCAATTTCGGATTTCGTTTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chrX 5938263 5' - pogo 2051 1 52.05 CCCTTCGTGCTGCTGATGAGATGGCTCAATTGAGAGCTTTAATTAAATTATGTTGGTATGCACAGGATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - 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INE-1 82 1 45.89 ATAAGGAGCATAAAAGAAGGAGACCTAGAGAAATTTTGCTCACAGAACGGCTGAGAAATGCTCTATGGCAAAAAAATAAAGTTTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr2L 12814837 5' - hobo 2902 1 59.59 TCAGAGAAGAAAAGCGGCTTATGGACAACAACAAATACGGTGCGCCCGAAAGTATGCAGCCAAATATTTATAGCACGCCAATTGACTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAAC:1 + chr2L 19841467 5' - BS 5058 1 58.22 GGACTCTGGCTGGCATTTCTTAATTAGCTAAAGTTCGCTCCGCCATCAATAAAGATTCATATCGGTGTGTGTGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr3L 13568158 5' + hobo 45 1 50.00 AACGTAAACACGTACAAGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 + chr3R 12547861 5' + hobo 72 1 65.07 CAATGCCGGAACGGCAATTGTTGAAAGTAGTTAAGAAAGGCTTGAGGGACGGGCGCTATTTCGGAGTTTCGGTCCTTTAGCAATTATTTTCTAATAGAAATATGATCATATGACGAAAACCAAAAACAAAATTGACCGAAAGCTTC:1 + chr2R 4511934 5' + transib2 115 1 60.27 TTTTGCTTTTCTAATTTCAGTTCCATTCTTTCAGTTATCCTTTCGCCTGCGCCATTGGCAACTTTCGTTTTTTCCTTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr3R 7655546 5' + 412 7099 2 50.68 ATATTCGAACGACAAACATTCCCGGAGAAATCTTAACATATAGATGTCATTAGGAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 - 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chr3R 3864896 5' + mdg1 7146 2 67.12 CGATATTGAATGCGAAAAATGTTATCAAAGTTGATGAGAAAGTTTTCCTATCGCCTGTTTAAGCAGCTAAATTAAAAACAGATCAATTAACGTCGAATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGGTTTT:1 + chr2R 7540956 5' + F-element 22 1 71.54 AATATTAAATGAACTTAAATAATATGGGATATTTAAATTAACATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCC:1 + chrX 16538110 5' - mdg3 5420 2 71.23 TTATGCCAAAATAATACGCTCTCATATCCTACCAGCTCAAGTGTCCTTCTCCAACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTT:1 - chr3R 25929435 5' - 297 6913 2 63.70 TGCCTTGCCCACTTCCACCAACCCCTAACCATTCAAAATTCAGAGTTTTCCCCATTCCCCTGACGCTTTCATATTTGTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr3R 12781607 5' + pogo 25 1 64.62 TAAATATATAAACGCATATACAATAAAACACGAAATCAAGGAGTAATCAGTTTTCAATTTATATCATTACGCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 7136563 5' - roo 355 2 52.74 GAATGGGTCTAGCTGCTGGCCAGTGTCCTGTGCAGTGGTTAGCAAAATGTCCAAACGTCTTTGGGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAA:1 + chr3L 1626197 5' - Cr1a 4277 1 56.16 TTTCTTTCACTGTATTAAGGTGCATTTCAGGGATGCGTACAACCACCTGCAGTTGGCCCCGTGAATATATACTAGAATATACTAGACGATATTAATCTCTTTATCAGCAGCACCAGGAATGTTTTGGAATAATTTGGTTATCGTAA:1 + chr3L 12132067 5' + Gypsy12A_LTR 169 1 41.78 TTAGTCTTTTAAATTTCTATCGATTTGCCACGCCCACTCTAACGTCCTATCTTATTACCCGTTCTCCCATCTTATTACCCAAAATCGATCGATATTCTAGAAAAATAATGAAATATTGCGTTTGCATTCACACTAGCTGATTAATG:1 + chr3L 27282408 5' + INE-1 535 1 39.73 AACTCACCTGCAGCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3R 15363483 5' + 412 7128 2 69.18 TGTGTGTGTTACAGTTATAACAATAAATCAACAACTGCTGGCAGCCACTGTAACTGCAGTCGACTCTCAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCT:1 - chr3L 15724561 5' + jockey 76 1 52.05 AACCTATTAAATAAAAGACTAAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr2R 12416967 5' + pogo 42 1 56.85 GACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 - chr3R 31663311 5' + jockey 95 1 75.34 AGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 + chr2R 10189268 5' + Doc 74 1 67.81 GCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTGGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACTCACATCGC:1 + chr3L 13380445 5' + hobo 65 1 61.43 ACACAACCATTTTGATTACCAAAACTAGCTTAAAAACCTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 + chr2L 3150979 5' - blood 7382 2 76.42 CAAGCTTGTAAAAACAATAATAATATCTGACCATCGATCGGTCCCACTGTGCAGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 - chr3R 17794637 5' - P-element 2842 1 54.79 AAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAAC:1 + chr2R 17872501 5' + Tirant 60 2 71.30 GAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chrX 19744496 5' + P-element 69 1 37.06 TATTTTCATAAGTTTAAAGAATTGTACCTTTGTGGAAAATAGATGAGCGAGAAATTGCGAGTATATTATACTTACATTATGAATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:2 + chr2L 10177966 5' + mdg3 5292 2 58.90 GGATGGATTCGGCTTGGTGCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAA:1 - chrX 12003972 5' + P-element 101 1 16.44 TACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGAC:1 + chr3L 3540143 5' - mdg3 176 2 70.77 TCGCTGTTGATAAGCATAAAAATCACTGGGTTTTCGCTTTAAATTTTTATGTAAACACGCGCACACCCCGGCATCCTCCATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2L 19628385 5' + hobo 42 1 55.48 CTTAATTTTTACACTTGCCGCCTTCAAATGACATCCCCTGAGGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chr2L 9109859 5' + opus 7036 4 59.05 AACATCGCACAGTGCCTGCAATTCGTATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTTTGAGTAGGCAGAAATGGTTC:1 + chr3L 5329123 5' - 412 399 2 79.45 CAAATAAGCAATTTAGGTATGCAACGTATTTTGAGGGGTTAGCAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCT:1 + chr2L 19565424 5' - jockey 4946 1 54.11 GAATGCTATCAGGGTCCGCAAGTACCCCACATATATGTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAG:1 + chr3R 8810657 5' - 297 6900 2 78.08 ACTTATAAACCTTCACTTTAATACTGAACTAATATAGTGCAATACGCAGGGAGTTCTGGAAAATATTGCTTTAACTTAACCAACAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 + chr3R 20097568 5' + mdg3 5290 2 59.59 AGAAAAGAGAAAATACCATTGCTAATTTGAAAAGAAGTGGGAAATCTATGGTTTAACTGCACCACATTTCGATCTAAATTAAATTTGTTGAGTTATGGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chrX 19591109 5' + roo 23 2 68.49 ACCCGAAAGTTGTCCACCTTTGTCGATGAATACAAAAAGGAATACAAAATATTAAGAAAATATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3L 107602 5' + roo 58 2 58.62 ANGTTTTTATGGCCCAAATGTGTTGGGCATATCTATTGAAACCAGCAAGACTAATAATAAAGCATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTC:1 + chr2R 7024384 5' - diver 6052 2 60.96 CATACCACAATCCCACCATGGTTAAACTAACACCTGAAAGTTAAAAGCCACAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCAC:1 - chr3R 7364304 5' - Quasimodo 7303 2 65.75 TCTACGGCGGAATCACGACCGAAATTCCCGCCACAATGGCAGGCATCCATCAAGCAAATTGAACACGCCCCCGTCGCATATATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAA:1 + chr3R 20720487 5' - 1731 4586 1 57.53 ATGTTGCAATGCTAAAAAGATTGTCTAATTATGAACGCAACAAATGCAAAACTTAAAGCAACTTAATATGAAACTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chrX 2821847 5' - roo 361 2 53.42 GTTTGGCACATGGCGTTGGAAGTGCGGGTGTGTGTATGTATGTAAATAGTATGTACAGTACGTACGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:2 - chr3R 17079511 5' - 1360 3332 1 60.27 GTGGAATAACAATACAAGCGCCAAATGGCCGGCAAACCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3R 29623301 5' - roo 324 2 74.66 AAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATATAAGTTAACGCAAGTAGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCAGCATACCTCACCT:1 - chrX 22715137 5' - opus 7462 2 54.92 AAGTTATGCTTCACATTTTTTCTGCTGCTCTTCAGGCTCGTTCCGTGTAATTTATTGAAACACATTCATTTCTCGCTATGATGTGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 - chr3R 19500740 5' + jockey 77 1 58.22 GAAATAATGAATTGGCCAGTGTGGGTGGCGCAAAAATACGTCACTAAATACCTGTTACATACTTGGCAACGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr2L 21715727 5' + pogo 48 1 56.85 CGAATTCGTGCCGGTAACTTTATGCAATAACTTTATGCTAATTATTGATAAAATGTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 + chrX 18055713 5' + 297 6640 2 63.70 CACCGCCCCCTTGCGGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chr3R 19537457 5' - hopper 1376 1 58.90 AAACCCGGATCAAAGAATAAATTTAGAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chr3L 12776067 5' + roo 8723 2 60.96 GGACATCAATTATGAATAATTTTTTCCCTAAAACATCTTTTGCCCCACTGTGCTTTTGGCCGCTAAAGCTGTAAATATTGTTGCTGCCTGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr3L 11296498 5' - P-element 2854 1 63.70 GCGTATACGTAATATGTGTTGTTTTTAGGCATTATACACTTTTATTGACATGTTGGAGTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTT:1 - chrX 18055817 5' - 297 333 2 63.01 GCATGGCCAACCCACAAAACACAAACGAGCGCAAACGCTTGGCCACACACACACGCGCACACATACGAATATGCGTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr2L 5656656 5' - hobo 2921 1 67.23 ATGTAGATCACCATTTATATGTTTATATGTAGCGAAGGTGCTCTGTAAGACGGAAGAGTTGTTTATGATCTATTCCCGCCTTGACTTCTATGTACCTGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 - chr3L 22445321 5' - Transpac 5208 2 68.49 CACACGACCTTGACTGCACTGCAATATATATGTGCACATATACGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAAC:1 - chrX 13484195 5' + hobo 79 1 73.29 CAGCCGGGCTAGTTGGGACAGAAATGTATCCCCATGTGAAATGCATGTTTGCATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 - chr3L 5329181 5' + 412 7123 2 63.70 AGTGGGGGGCGCTGGCGAAGAATAAGCAGAGCAAAGACAGATGGGCGCAGCAGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTG:1 + chr2L 245807 5' + P-element 235 1 39.04 GAACCACACTCCAAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTC:1 + chrX 12003940 5' - P-element 2800 1 27.40 AGATTTTGCCTTAATTAAACCTTTTGTGGCGCATACAAGTAAGGAGAGGGGGTTTCCCCAGCCCACAAGCTGGGGCAAAATCATCCTCACTCTGGCGGCCTCTGTGAGTTTGAGTTTGAGTGCGAATGTGTGTGTGTGTGTATGTA:1 + chr3R 19733768 5' - Quasimodo 34 2 65.07 GGGTTACCTTTGCTATTCATAACTTACACGGGCCATAAAATATTTATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr2R 22040919 5' + jockey 83 1 71.92 AAGTGCCATCAAGAGAGCGACAGAGTGCGAGCGTGCGAGCGAGCGAGAAGTGGAGTGAATCTTATTAGCCGAGCCAAGAAAAAAAAAAAGAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 19448231 5' - hopper 148 103 77.14 ATCTACTTGTAGAGCAGCGGCAGGCGGCAGTGTGGCTCCGTCTCGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTCCCC:1 + chrX 9218233 5' - 297 6578 1 67.14 AAAGGAAAATTCATTTTTGATTAAATGCTGGCTATGGCCTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1 - chr2R 16503467 5' + jockey 87 1 71.23 CGGCCAAACTAAAGCGGCACCGAAAAAAAACAACACAAGAATATACATCACTATATCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTT:1 - chr2R 10936740 5' + copia 58 2 61.59 CTTCGCTGGAAACTCGGCACACATTAAACAACAACGGCGATAAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr3R 31663371 5' + jockey 28 1 69.29 CCAACGAGGAGAAGACCGTCATCTACGTGCTGAGCAAGAAGGGCGAAAGCGACTTGAACGCCGAGGTAGTGGAGCATGAATTTTGTTTGAATTTATTCATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGT:1 + chr3R 4255230 5' - Stalker4 466 1 52.05 TTGTAGGGGGTTTGACTGAAGGATTCGTGTATAGTATTATTTTGAAAAGAATTTCAACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 + chr3R 18514296 5' + pogo 31 1 62.33 AGAAACTAAATGACAAAACCAACAGTGCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCAAGTGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTT:1 - chr3L 21765516 5' - gypsy 400 2 60.27 TTTAGTGCTTTAATGTTTCATTAATTTGCAATTGAACCGCAAAGTATGCAAAGCCTAATACCTACTTTGCGTTCGGTTAAATGCTGCAGCCTCTTGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chr3R 6149903 5' + jockey 34 1 67.81 GCCATAATTCAAAAGAAGATACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3L 19938570 5' + roo 8724 2 61.64 ACAATTGAAAGTCAAATTCAAGTGTATTTGCTAACGCAGACTTGCTGCGCCTATGTTTATTCGGGTAGGTATGCATGTATTCACAAAACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr3R 24760501 5' - pogo 2070 1 65.75 AGGCAAACAATGAACAATTCAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr2L 20327620 5' - roo 8993 2 71.72 TGGCTAAATAAAGTGGGCGTGTTTCTGATGGCGGTCGTTTTTTGCCCTTTGTTGTTGTTGCTATTGCCCACATCATAGCTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCT:1 + chr3R 19500609 5' - jockey 4949 1 54.11 TGCCAAACTTGGTTGGCAAACTCTTTTTCGCTTCCAGCTTGATTAAAATTTCATTAACAAAGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chr3L 6014933 5' + jockey 61 1 55.40 TTTGTAGCAATTAATATCCAATATCTGGGTGCTGGCATCATTAGTTTATTTTCCTTTCGCTGCCAACTTTATTTTTATTCCCTTTCCAACAAATATATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAA:1 - chr2L 8615475 5' + 17.6 6946 1 73.29 TTGAATGTTGTCTAATCATCTCAGCTATGTTCGGATACTCATATGAACCACATTTACTTCAACACACTGAGCGAAAATTTGGATCGAGTGACGATAGCGTTATAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2L 8009198 5' - roo 393 1 71.23 CACACATAGGGAAACACGTTCGCATATCATATCTGTGTGTGTGTGTGTGCGCAAATCAGATACTTACAAAATCACATTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCAC:1 + chrX 978746 5' + Tirant 8342 2 53.42 ACGACATAATGTGGGTTGGGCCACGAGTTCAAAAAGATATTTTTGACATTATTATTAAATGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chr3R 19445300 5' + roo 8725 2 62.33 TAATTCCTTGATTTATAGACCCAATATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2R 18467228 5' - roo 349 2 57.53 TGGGAATGGTTCAGAGATATGGCCAAATGGCGTGTTGGCAGGCCACAAGGAGCTGCGGCCGATAGGAGTCCTGCGGTCGGTTAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr3L 13631376 5' - hobo 2902 1 60.00 TATTGTTTTAATTTCCAAAGTTCTTAAAACTCCGGAACGCATCGTATTCATCTTTTACAGCCCGCATCCTTGGCAACCTTCGTGCATTATCTTCCGACTCTCATCTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 - chrX 10501407 5' + F-element 29 1 71.92 CCACTCCCACACTCGGACATTCTTTTATGTAAATTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTT:1 + chr2R 20117314 5' + mdg3 5337 2 78.32 GTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 + chr2R 20931617 5' + blood 7059 2 50.68 GCGGTGTGACGACGACCGTCGAGTGTTTTTGGCGTTTTTGAGGAGGGAGGGAGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:2 + chr3R 26845530 5' - mdg1 7389 2 63.70 TTTTAAAAACTATTTAACTAAGCACAAAAAACTAAATTACAAATCTAATGAAAACGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCTCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGGAAAATTCAAGATAAGTACGGCTTTAAAT:1 - chr2R 23061650 5' + Max-element 376 1 63.01 TAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGCAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGT:1 - chr2R 12185408 5' + accord 6916 2 65.52 TGCCTCAAAGGGCGAATGAATCCAATGCGAAGCAAACCGACGAAAAGGCAATTTGAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 + chrX 12458885 5' + pogo 65 1 65.07 AGCAGGAAGGTGGCACTGGCCATCATCTGGGGATGGAGGAAGCCAGTTATAGTCGACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCG:2 + chr3R 9657628 5' + BS 10 1 71.92 CGAGCAGTTAATGAGCTTGAGGCGAAAACATAGAAGCACACATTTTCCTGTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 - chr3L 5425541 5' + blood 7083 2 69.18 CTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGCTGTATCGACTTGTGTGTCTCCCAATTTGTGC:1 + chrX 22726201 5' - Helena 1225 1 60.27 GAAATAAAACTTTTTATTTTCACACAAAGTTGTGCAACCAAGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTG:1 + chr2L 17795149 5' - hopper 1333 1 73.97 ATAAGTTGAGCTTCTATCTGTTTAAATATTCCACACCCGAAAGTTGTCCACCTTTGTCGATGAATACAAAAAGGAATACAAAATATTAAGAAAATATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3L 107636 5' + roo 8689 2 69.18 TTTAATTAAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGACGAAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTGTTGAGTGAAGTGAACG:1 + chr2L 20985775 5' + F-element 65 1 55.73 AAAATGAGCCACAAAGAGAGGAATGCGAACGCAAGGGAGTTTTTCAAAAGGAGTCTGCTCTATATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAAATATGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACAT:2 - chr2L 21082253 5' + mdg3 5280 2 67.12 ATTATTTCAAGTTCAATCAGGAAATGTTGTTAACCACACCGCATTAGAGGAATTAGATCAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTCCCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATTTTAAATCATTGTACAT:1 - chr4 862235 5' + Cr1a 4142 1 59.59 TCACAGGGCCAAATTACTCATAAAACCCACTGAAGCCGGAAACTTCCTACTTTCCAGAACACTCGAAATCTCTAAAGATTTTCAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chrX 7624026 5' + roo 36 2 61.64 AAGTACCTTTAAAATCCCATTACCCTATTTGTGTACACAAACATAGGAGTGCGGAATAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTT:1 + chr2L 2722351 5' - flea 4952 1 60.27 GTTTTTACCAATCGAATTCGCTTCACATACAGTCGAATTCGATTTGATTTTACTTTATTACACGAGTCAAATTACGTGCATATATATAGACCTCCTTCGACCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 + chr3R 6171073 5' - 297 6958 2 74.66 AAAGATATATTCTATGTAAAAATTTTGTTCTTCGGAATGTAATCCTGTTGCTGTGTAACTCAAAAGTGTGAGTGGGGTGGAATAATTTTTTTTCTTTGTTTATTTATACTTTTCGAAGGCATACGGGGTAGCTGAAAACACCTTTG:1 - chr3L 23295887 5' - BS3 1738 1 63.01 GTTGGACGACTATGAGGATCACAGATAAGCTTTGGAATTTCACCCATTGATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAT:1 + chr3R 8293490 5' + Stalker2 21 2 69.86 TTTGCCCCACTGTGCTTTTGGCCGCTAAAGCTGTAAATATTGTTGCTGCCTGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chr3L 11296536 5' - P-element 2816 1 37.67 AACTCGCTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:2 + chr2R 10189248 5' + Doc 54 1 54.11 TGCAACTGCAACTGAAACAACTTTTACTCACAATGAAATCCACATAAGTTTCACAACCAGAGGTATGCATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr2R 8492713 5' - pogo 2069 1 59.26 TTTTGCTCTGTCTGCCGCATAATGTTAAATTAATACGCCTCCCCCTCAACGCAGCGCCTTCCTTTTCATTTGGTCCCTTAGTCAATTGGCGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGC:1 - chr2L 19841611 5' + BS 19 1 66.67 CCCGGCCCCTGCCACGCCTCGTTGCCACAGGGAACTCGGTTAGATAGCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 - chr3R 12886073 5' - 412 7473 2 69.86 TATTTAGCTGCAATTGAACACTAAAAAATACAGCAAATTGCAGCCTGCTGAGCTCTAAAATCTTTTGTTGTAGTGCATAAAAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chrX 6213494 5' + roo 8703 2 58.90 CGTTAGCCAGCGGAAGTGTATCTGCACCATATGAAAGGCCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr2L 20068054 5' - roo 8989 2 78.77 TAGCTTCTCTCCGCTTGTCCTTGTGCTTATTGTGCAGCTCGGCTTTCCTGTGTCTGAAGTTAAGTGCAACTCTAACATTGTGCAGCAGGGAGTTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr2L 8579692 5' + roo 12 2 63.01 CGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGAA:1 + chr2R 4260424 5' + micropia 5216 1 47.95 TCTGCATATCGTCTGTTTGTTCGTCCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr3R 4352152 5' + Doc 48 1 58.90 CGGCAATGCAGCATTCTGCTAATACACTTCTTCGATACTAAATGCGGCAATTTAAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACTTACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGC:1 + chr3R 14214405 5' + mdg1 7287 2 67.81 TTACAACCACAATCAGATCTGGTAGTTCTGGAGTTCTTTATCTTGACATTCAAAAGTACAACAGATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3R 12540478 5' - roo 348 2 58.22 AGCCGGATAACCGGATACAAGCGAAATTAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 - chr2R 18786037 5' - roo 8979 2 80.82 GACAGTTTTATGCACAAAGCAAGAAAATAAAGAGAAATATATCTATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCG:1 + chr3R 8884316 5' + HMS-Beagle 63 2 67.41 GCCGGAAAAAATGTAAAAAAAATGTTGTCCAATTCTAATTTACAGGAAAAAATGGAAGTAGATCACATTTTGCTTTCCTGGAACTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr3L 14370690 5' + 412 7091 2 56.16 CTTGTTTTATATAATTCAACATTCAATTCAACTCAATTCGAACATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2L 8909877 5' + roo 8738 2 68.49 CCAATCAACAATTGATATTCTGCCTGCATTCACCTGGCCGGCAAAAGTTCACTTAACTTTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 + chr3L 19702746 5' + pogo 58 1 62.33 AGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTCCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCA:2 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 5330 1 66.44 GAAATTCAAATGCTGAAATCCAATTCTGCACATTCCTTCTTCATCTTAGCTAACGTTTTTGCCCCATTCCCAAAAAGCGACATTATTCATTTGGTAAACGATTGTCCTCTGGGGTGTCTCTTGAAAAATAAAAAAGAAAAAGAAAA:1 + chr3R 12883054 5' + Doc2-element 233 7 50.68 ACGCGACATAAACGGACGGCAGGCCACAATGGCAACATCGCATCCCATCACATGCCCTTCATGCCATTCAATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTC:1 - chr2L 18087914 5' - flea 4896 2 51.91 GGTTATTTGGGATTTATTATTTTGGTTTATTGTTTTCGATAGTGTAATACAATAATGTATATGAACGGCATTCCTTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCC:1 + chr3R 11142175 5' + Max-element 8283 2 52.74 ACACTGGGTGCCATGCCTGCAGCTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTC:1 - chr3R 15035178 5' - Stalker2 7616 2 60.96 GAAACTTATGAGTGCAGAAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:2 + chrX 16857053 5' + pogo 59 1 58.90 ATTATATAGCTAATTAAACAAACATTTTGTGCTGATAAAACGCTTTAATTAATGCTCTTACAGCACTCGAATAACCTAGCAGAAGTTCGCATTAAATCTACCCCGGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 + chr3L 6541941 5' + hobo 16 1 72.60 CTCTATCTGAAACCGGAGTATCTACACGATGGAAAACCGGTGTTCCGGCCTCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAA:1 + chr2R 12872890 5' + P-element 71 1 36.99 AATTTATGACAAACTTTTTCTTTTCAAACGGTTGTGCCTTGTTTTCTTGGGATATCACTTGAAAAATCGATTTCCACACAACGCGATTGCGATAAATACTTTAATTTAATTGCATATATGTATTATATATATGTATATGTATAAAT:1 - chr2L 17152087 5' + Stalker4 244 4 67.81 TTTACCAACTCGACACCTCTTAACTCCTACTAAACATAACAACAAGACAAGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACACCCACCAAACATTTACAAAACCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTA:1 + chr3L 11128812 5' + I-element 238 1 67.59 CTCACGTAACTCGGTTACTTGAGTGGCTATGAAGCTGGGACTCGACTTAGGCTTAAGTTCCTGCTTGGTCTATCAAGAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chrX 7624171 5' - roo 9030 1 61.64 CTCCTCCTCGTCGCTGACCGTTAGGCAAACAATGAACAATTCAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2L 20327598 5' - roo 350 2 56.85 ATTGCTAATTTGAAAAGAAGTGGGAAATCTATGGTTTAACTGCACCACATTTCGATCTAAATTAAATTTGTTGAGTTATGGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chrX 19591126 5' + roo 40 2 56.85 GTCGCTCCAACTTTCGGCCTTTACGATGCACATAAATATTACGACCAAGTTCAAGTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chr3R 6603858 5' - pogo 2063 1 56.91 ACGCTGTCCAAGTTCAATTAGTTTTGTATGCGCTCCTCACAAGTTTTGCCGAACTTCTTTAATGCCAAGATTGATTCCGTCTGAAGCTGAGGCTCTGTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:2 - chr3R 8965277 5' + HMS-Beagle 22 2 70.55 CCAAATACAAGTGTGCTAATACTATTAGCGAGCTTGGCCAGAAACTAAGTAGGCCAATCGGGTGATCTTGATTAGAAGTCATGCTGGTTAGGTATGAAGTACCTTTAAGTATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGC:1 - chr3R 29901196 5' + flea 4764 1 45.21 AAAAAACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATT:1 - chrX 8610342 5' + mdg3 36 2 60.27 GCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTCACTGTCAGGGGCTACTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCT:1 + chr3R 19450130 5' - R1A1-element 271 1 57.24 GACCCCGGCAAGTTTCGTAGCAGACGTTGGCCCTGACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCGCA:1 + chr2L 23372471 5' + gtwin 15 2 75.34 CTGGGGATGGAGGAAGCCAGTTATAGTCGACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTG:1 + chr3R 9657654 5' + BS 36 1 54.11 GACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACC:1 - chrX 22386792 5' + hobo 84 1 47.69 GCAATGCTAAAAAGATTGTCTAATTATGAACGCAACAAATGCAAAACTTAAAGCAACTTAATATGAAACTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chrX 2821852 5' - roo 9020 2 55.48 GGCCTGATAAATGAAACGTAAGCCGTCAAAACAAATCGCATTGAATGAGTCAATCAAAAGCAATTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACG:1 - chr3L 13475611 5' + HMS-Beagle 6851 2 56.16 CTTGGATTTTTATAATGCAATCTCCGATTTTCGCCAACCAGAGGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTCTA:1 + chr2L 9499265 5' + Transpac 4993 2 70.55 GTGCCCTGCTTCGATTTCAATCTGATTGTATTATTGGAAATACCTACGAAAGTTATAATTATTAACGTTATTACATGACAGATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 + chr2L 8852745 5' - Burdock 6354 2 54.79 CAAACAGAAATCCAATTACTTTGCCTAAAATTAAAGCCCATTTTAAGCTATAGGCAATATTTTTCCGAGTGTGGTCACTTGCAGAGCTGCCTGACTTGCATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTT:1 - chr3R 28356161 5' + blood 7108 2 68.49 AATTTGCTGTTACGACTTGGACAAGCTCCGATGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAA:1 + chr3R 22275240 5' - flea 218 2 53.79 GAATTTCTGCTTAGACGCCATTTCGAATATCTTTTAATTGATATTCTCAGTTGGGATATAAATATAATTGGGGATAGTTATTACATTGCCTCAACAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3L 19510630 5' + pogo 23 1 65.75 GTGAAAATATTGAATGGCAGACACAAAGAGCAGAGCTCAAAACAGAGAGACAAAGGATTGCAAAATACAAAAAATATGCTGGGAAATGTGCCACACATACAGCAACATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTG:1 + chr3L 19432462 5' + HMS-Beagle 14 2 77.40 TAGACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTTTTTACTTAAAGCAAAATTGGTTAATAATTTTTTTAATAATAAATTATGACAAATTAATAAAAAATATACACTCCCTCAGCGT:1 - chr3R 3736168 5' - Tc1-2 1350 1 63.70 GTGGATAAGGATGAAAATATGTGTAGAGCGCAATATGTAAAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGTGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTT:1 + chr3L 21007523 5' - Max-element 63 2 72.60 TGAATCCATTCTCACATTGGTGTCTTTTCGCTATCATTAATCGTTATCATTTCAATTAATGGCATATATAACGCAAGCAATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAACTCCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chr3L 11887141 5' + Doc 9 1 80.14 CCTGAAAAATGCAGTGCACTTTCCAAACAAACATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAG:1 - chr2R 13773095 5' - opus 7422 2 77.93 ACAGCTCCCACAATATACTCAGCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 + chrX 10702712 5' + Tirant 22 2 61.40 GCAGGACTTGGAAGCGCCATATGAGGTAAAGGACTATGTCCGAATATACCTTGGTAAGTAATAAAAAATGCCTTTTTATACCCGTTACTCGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGAGTT:1 - chr4 860338 5' + INE-1 32 1 55.17 AAATTGATATGACGTTAAAAAGATTACAGAGTGCTAGAAGTTGTGTTATCATTTCAGATTTATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAACATAAATAAATATTAAAACATTTACCAAAACATTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATA:1 - chr2R 5438156 5' - INE-1 162 1 63.70 CTGCTGTTGTTGTAGGCGAGCGGTCGGAATTTGCGTCGGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCG:1 - chr2L 851044 5' + P-element 83 1 28.77 TCGCTCCCCACCCCCTGAATCACCACCTATTACNNANNNNNNNACTTAGTAAGNGNNNNNNNNCCAGTAACAATCGCAATCATAATAACAATAATAACA:1 - chr3L 18344516 5' + mdg1 25 2 81.82 AAGATTTTCAGTAAGTTGTATGGGTATTCTTTTTTAAGTGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chrX 17933660 5' + roo 8745 2 77.40 TAAATGTTAAAATCAAAATTTATTCATTGTTGCATTATTTTCACCTCTTTAACGAAAACAATCTTCGGTATATCCTGTATGTATATCGATTACAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 10344727 5' - roo 9043 1 38.36 TGTGTATGTAAAGTTAAGAACTGTGAGAAACTATTTTCAATAGCTATAGTCGGTGTTTTCCATTTGAGAACGATTTAATAAAGTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:2 - chrX 19310686 5' + pogo 34 1 60.96 CCTATCCTTTGAGCAGCTATAAGAGTCATAGAAACGCATTCAGGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAAC:2 - 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chr3L 10733806 5' + 412 3 2 59.59 ATGGATGGATAAACCCAGGGGCGGGCCAACGAGTGAGACGAGTGTTAGACATATGATGACAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTT:1 - chr2L 16202703 5' + copia 59 2 58.22 TGGCGGGAGAGCTAAACCAGGCGCGAGAGAGACAAGTAGAGTGCGCCGCAAAGGGAAAGAAGAGCGAGCATGCTCTCATTTAGTTAGAAAAACACTTTTAAAAAGTGCACCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGA:1 + chrX 7930629 5' + P-element 11 1 76.71 TATACACTCTGCACTGGGAAAAATTTCTTATTGTTCACCACAAACTCTATTTAACTTCAAGCAACACTAAATTATAGATCATGACGCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTAC:1 + chr2R 22616841 5' + BS 5041 1 58.90 CAAGAATAGATTCGTTGCTACATGGGGAATATTCCGTGGCACTTATCAAAGGCAGCAACAATTTAGGTTAAATACTCATTAATATTCCGGTCTGCCAAACTTTTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCT:1 - chr2L 1259444 5' - jockey 4661 1 76.71 TAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr3L 13380439 5' + hobo 47 1 56.25 ATTTTCTGTAATGACATTGAAAGACACGATTGGTGTCAACGATTTGAAGAATGAAAGTTCTGTTTTTTGTGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 8909776 5' - roo 9023 2 52.74 CTCCTTCCAACTTCCGGTCTCCCGCTGCTGATGGTTCCCCTACCAAAGTTGGCAATAAAAGCGGAAGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAA:1 + chr3R 11875596 5' - 412 226 2 53.73 GAACTTGTAAATTATTTTTCCAAAAATAAAACATCTTACAACGAAAGCTCTCCGCTCATGCAGTAAAGATGTGGATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTG:1 - chr2L 2522429 5' - mdg1 455 1 52.05 AACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAG:1 + chr2L 22031986 5' + Tabor 88 2 80.82 TGATTGTTCGTTTACCTAAATAATTCGTTTAGCAATTTTTTATTTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTT:1 - chr3R 10895766 5' + jockey 4538 1 70.55 CCCACACACACAGACACACATAGATTGGTAGCAAAAACAATGCCCTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAA:1 + chr3L 17142822 5' - hobo 2864 1 67.81 CAAATTGAATAACATACAGTTGGGGATTGGAAATAAGTTATAACTCATAAGAATCGATGTTGTTATTGACTCCAATATATTGATGTTGTTCTATAATTGATGTTGTTGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 - chr3L 13778679 5' - I-element 5343 1 75.34 GTAAGAGATAGCGAGATGGCCAAATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 - chr2R 15892230 5' + hobo 57 1 58.22 GTGAAAGTCAAAATAAGGTTAGACAATAAAAAATGAAGAAGTTTCTTTTTCGATTCAAAGCACATATGCATGTACATATATGAGTTTATATAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr2L 21687731 5' + pogo 29 1 65.75 ACTCATTACTTTGTGTCATCGAATGTTTCTTTTTATGGTTGAAAAGTATATAATTATATACTACGGAATCTGATATAAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGG:1 - chrX 9217779 5' - 297 359 2 62.33 TATGTGTTTGGTAAATCCATTCATAACTAAGCTAGTTGTCTTATTCAAACCCAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATAT:1 - chr3L 17710673 5' - I-element 5286 1 64.38 GCGTGTGCGGCGACGGCGAATCGTCGAATGAAAATGAATGAAACGGAATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1 - chrX 1831316 5' + P-element 62 1 39.86 CAAAAAAAGAGAAGAAAAGGAAAAAACTTCACACAAACAAGTTCAACAGTGACATACAGTATAATTACAAACTATTGTGACCGAATATGTGCAAATTAATTAAATGTATGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTG:1 - chr2L 16188233 5' - gypsy6 7772 4 63.70 TACTTTTATGGGGCAACAAACAGACGTTTATTCGCATTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTCCGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTGTTTTTTGACACCCTACTTGCG:1 - chr2L 19681063 5' - hobo 2868 1 68.89 TTTATTAACGTTTTTATGGCCCAAATGTGTTGGGCCTATCTATTGAAACCAGCAAGACTAATAATAACGCATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCTTTGTAATGGAGTTCGCAAATAAGAAGCATATATACACTATT:1 + chr2R 7024377 5' - diver 171 2 52.74 ATGAAATCAAATTTGCATATACATATGTATGTATGTATGTATATATATATCCTCTAATAAAAACACAATGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTT:1 - chrX 16325237 5' + Transpac 4969 2 56.16 CTTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTAAAAATCGATTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 + chrX 21844332 5' - mdg1 7411 2 50.68 GTTTGTAAGCGAGTAGAGACTCCCATCTCTCTCGCACCTGCAGTGCTAAGCCTTCGAAAACAGGGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 - chr3L 17896013 5' - P-element 2830 1 47.95 GACTGCTAATCCTCGACAGTGTGTGCTCAACGGGATATCAGGCGGAAAAGGACAAAGAGCGCTGCATACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - 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mdg1 7393 2 61.64 CATTAGCACGCCTGGATGAAGTAGATCGACCTGAAAAAATAAACTATGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACA:1 + chr2L 7905878 5' + Quasimodo 62 2 67.81 AACGCGATTTTCCGCTCAATGTGAAGCGTGTTTGTGAAAGGCTTAGTTCAAATCAAATAAATTGAATTTTACCTGGCCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAA:1 + chr3R 23718581 5' + I-element 128 1 55.48 GAAAAATGTATTTTGGCATAAAATGAAGTACTTACATATATTGTAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chr2L 615195 5' + F-element 42 1 60.27 GTTTTAAACTCTTTCGCAATTCGAACCATGTGCATGGCAAACTGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATA:1 - chr3R 9863020 5' + Stalker2 20 2 71.92 ACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGCTCTTTATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAGTGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGA:1 - chrY 3648946 5' - Stalker2 7459 2 74.66 GCCGCAGTTTGTTTGCTTGTAGGTTTAGAATTTTCGCTTACAGCAGGCATTTAATATTTCATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAAC:1 - 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chr3R 31663317 5' + jockey 89 1 71.23 AACAACAGAATGGGAATGTCGACACCTCCATAAAATTAATTAACCCCCAATAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTG:1 + chr3R 12569585 5' + blood 7077 2 62.33 AGTTAGAACTTAAAGGGGTGCCAAGACTGAGAGAGATCATAGTGCCACTTTTGTGGAACTATTCTTGTGCCCCAACCTGTTGAAATGCTACATATATCATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACT:1 - chr3R 29952834 5' - invader4 3065 2 70.55 GTTTCTGCCGCTTGTTTATTTATTTGTTTTGTCGTTTCACGGAGCATAGCGCAAAACGCTCACCCTTTTGGCATGACTGCTTCTGTCCTACGACACACGATACTTTATATACATATCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 + chr2R 17937063 5' + 297 6580 1 73.29 AAAAATAAAAATGAAAAAATTAAGGGCGAGTCGGTAGAAAACACTTTCCCTAAATCAAACACTGTCCCTAAATCAAACCCTCCCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACG:1 - chrX 12775736 5' + roo 9042 1 57.53 ATTCATTCAAACAAACAAATAAATTGACCACATCCCCAGTTAGAAATAATTGCATTTTTGTAATGTTTAAAAATAATTAAATAAAAATGCAGAAATATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3L 107465 5' - roo 9045 1 67.12 GCGTGCACCAAAGGGAGATATTCCAGGAGGCACTCGAGGCAAACCTAACCATTCATATCAATCTCGGCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAGACGCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCACGTTCT:1 - chr2L 15601643 5' + Doc 45 1 49.62 AATATTAATAAAAAACTCGTATTATTTTTGAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCT:1 - chr3L 23839774 5' + McClintock 9 2 78.77 TTCATTGTTGCATTATTTTCACCTCTTTAACGAAAACAATCTTCGGTATATCCTGTATGTATATCGATTACAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chrX 10344749 5' - roo 9021 2 52.05 CACTGATGAAAGAGTCGAGATCTTATCTTATTATTTCATATCAATCGATAAATCTTTAAGATGCTTCTAAATTGTAATCTATTTTTGACATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3R 18860735 5' + roo 8696 2 56.16 AGATATAAATATCCCCACTATTTAAAGTCGCTTTGGCTCAACGAAGCTATAATTTTGTTATTGGATGTGCAGATTCACGGAATTTAATAAGTATCCGTATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTA:1 + chr2L 3317709 5' + X-element 31 1 63.01 AATAGTAAGTTCTTGGTTTTAAAATTAAATTCTTAGAGCTTATCTCAATTTATGATTTTTATATGCAGTAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTA:1 - chr3L 15374759 5' - 3S18 6083 2 70.55 AATTAAACAAATTGATGATGAATTAAAAAGCCTTTGAAAAAGAATTAAATCAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCCGGCGACTCG:1 + chr2R 18922513 5' + opus 7068 4 65.07 ACTCGCATAAGGTTGCGATATCCTGGAAGTGGTGGGTGTATCAGGATAGCGAGCGGCACACACACATTTGTGTGTTGGCCAGAATAGAGTTTGGCCATTAAATTCGAGTGGAATGAATGCACTATGGGACATTTGGCCTGTTTTTT:1 + chrX 20106258 5' + hopper 6 2 80.14 GTTCAGCTGGCCGAGATGTATTTCCGGCTGCATCCCGAGGAGGTGGATCCCGTGTGGGGAAATCCCTGTGACGATGTGCGCCACAAGAAGATCTGGTCAAAGACCAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGA:1 + chr3L 6545813 5' - hobo 307 1 75.34 GACATAGATTTAGTATTAATATTAAGTGGTAAGTATTTTTTTGTAAACTTAGGTTTTTGGCAGTAACATGGACTGGTAACATTATTTTTCTTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAGTTCTGTTCCGCATCCACAATTTAT:1 - chrY 2831543 5' - TAHRE 10389 1 57.53 GTTGGTTGTTGTGTGTTTGTGTAATAACTGTTGTTGTTTTGCTGTCTTGCATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCC:1 + chr2R 4634507 5' - F-element 4358 1 68.49 AGAACTTGAAATCAATTTCAAACGTTTTAGGCAAAGCCAATTCATTTATTTGTTGTGCGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAA:1 - chr3R 28788792 5' + I-element 66 1 63.70 CTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACC:1 - chrX 8610300 5' + mdg3 78 2 68.49 CGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chr2L 19907574 5' + hobo 60 1 71.67 TTGCTTGTGGGTCGTGTCATATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 - 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chrX 12954950 5' - Doc2-element 4697 1 58.22 ACCTTTTAGATAAGATATGTTGTATAAGAAAGGCATCATATACTTTGCATATTGGACAGAGTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 - chr3R 26031799 5' + pogo 55 1 56.16 AACAGAATTATTCTACAAAGGAGGAGCCCTCACTTGAGCTGTACTTTGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 + chr3L 1728463 5' + blood 33 2 53.33 ATAGCGTTTAAGGTACAACTGGCATTTTCAGTTCCGAGCTTGTCGAGAAAGTCTGTCAACTTCGTTTTGCCAAGGAGACGCTCCGCTCAAAGGGAGGAAGCGTTTAATTTATTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGT:1 - chr2L 20985865 5' - F-element 4656 1 74.66 TACTATTGCATTAACCTTTGGATATGTAATCATACGATTTTTTAAATTTACTTAGAAAATGATCTGCTCTCAATAAGAGTTTATGCTTTAAATAATGAAATTTTCCCCGAAATTAAAAACGCGCGGGGTGGACTTCAACCTTTCGT:1 - chrX 14959430 5' - Max-element 8453 2 67.12 AGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr2R 12416946 5' + pogo 63 1 64.38 TTCGGCGATCATGAACATACCAAAGGTAGAGGGTTCATCTTCTGTAAAGGTGCGTGAACTGTCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 - 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chr3L 13450778 5' - P-element 2802 1 28.08 CGCAGCACGCACGTTTTGTGTTCCTCCTCTCCTCCTTTCGTGTATGTTTCTGTTTCTGTTTCGCTTTAGTTTCACTTTCATTCGTCTTCGATCGTCAAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:1 + chrX 19506038 5' + P-element 24 1 70.55 GGGCTCTCGACGCATGACGATATCAATTAAAAGGGACTATAAATTGTCACTTTATCAATTGGGGAAGGCGTGCGCAAAAGCGCAAAAGCAAATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:1 + chr3L 780628 5' - Burdock 6364 2 67.12 GCATGGAGTTTTATTGTCTGCGTAAATGCTATATAGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGA:3 - chr2R 3091698 5' + F-element 286 1 51.37 CGAAATCAAGGAGTAATCAGTTTTCAATTTATATCATTACGCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 7136593 5' - roo 325 2 73.29 TATTTAAAGTCGCTTTGGCTCAACGAAGCTATAATTTTGTTATTGGATGTGCAGATTCACGGAATTTAATAAGTATCCGTATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGC:1 + chr2L 3317727 5' + X-element 49 1 52.05 GAGTATAAAGCAAACAGCGCGGATTTTCCATAAACGAACGCGAATTCTTCAGGAGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 + chr2L 951266 5' + F-element 28 1 70.55 GTGTCATATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - 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pogo 2052 1 52.74 GAGTGAGGCGGGAAAATTGTGGGCGGCGACAGGTTGACGATTGACGGTTGAGCAGCATTTAGTGGAAGCAGTGCCTCAAAGGTGTCAAGACGAGGCAGGC:1 + chr3L 3758110 5' + R1A1-element 433 1 65.00 AGGGAGATTGGATCGGGATTAAGAATTAGAAGATCAGTCTGAATGGAGTCTGAATTGAGTCATAATCGAGATCGAGAACAGCTTCAAACAGAAGATAAGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAAC:1 + chr3R 4064027 5' - 1360 3170 1 71.53 CGCAAGAAAGTGAGAAACGAAACCCGGATCAAAGAATAAATTTAGAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3L 12776086 5' + roo 8704 2 58.22 TCGACTGTATTGCCGTGGTCTGCCCACGTGGTGCAGCCATCAGACCGCCCATGGCCCACCCCCAAGCATATACATATGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTACTTCAAAGAAATC:1 - chrX 1726779 5' + 297 6613 2 62.32 TAATGACAGGGTTTTTCAACATATGACTCCGCTGCCGACTAGTAAATGCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr2L 20223144 5' + P-element 46 1 25.83 GTAACATAAATTTTGGGACCTACGTTTTGAGAACATTTTTTAAAATAATGGACTAGTAAAAACTAAGGAGGAAAGTAAATACATAATAATGTACATAATTTGTACATAATGTATCATATGTTGGCTGTCTGAGCAAGAAATTTTTA:1 + chr3L 14585755 5' + Tc1 122 1 65.07 TTTAGCTGCAATTGAACACTAAAAAATACAGCAAATTGCAGCCTGCTGAGCTCTAAAATCTTTTGTTGTAGTGCATAAAAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chrX 6213496 5' + roo 8705 2 57.53 AACCGAGGAGCAGCAGCAGGAGCAGGGCTTTGTGACCACCACACCCAGTACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCTTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCATATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAA:1 + chrX 10042638 5' + I-element 5054 1 69.86 GCATCAAATTGATTTCATGCTGCTCCAACGTTGACTGTAGTTTTACAACGTGCATCATCCTCACTCGCGTAGATAGCGCGAGTGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTTAAACAAGTTCGGAGGGATC:1 + chr2L 18401503 5' + R1A1-element 5321 1 55.48 CTCTTCTCGCGGCAGAGGATTGCCTGTTTCGGTTGCCTTTTTGGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr2R 18266022 5' + roo 8737 2 72.54 TTTAACCCTATAGGAAAAAAGTATTTAGCTATGGTTAACTGGACTGATAGTAAAGTTAATTTACTTAAACAAGCGGGAAAGCTTTAGTCGATTTCTTCGACTATCAGATACCCATAACTCAGC:1 + chr3R 14576764 5' - 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Burdock 244 2 64.38 CGAGGCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr2R 14767345 5' + Tirant 15 2 70.18 GAATCGAGCTCTTTGAAGCGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 + chr3R 5087046 5' + P-element 16 1 68.91 GTATTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCTCTGC:1 - chrX 21638099 5' + gtwin 6993 2 70.55 CGTCATTATCATTACCATTAACAAAAGGCCACCGAGTGGTAGGCTGCACAAAGAATACGCACATATAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chrX 12137325 5' + 297 6630 2 58.22 CATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCAAAGTGATGGAAGAGCGTGATCTTGCTCTCCAGCATTGAAGAGACCCAACAATTGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAG:2 - chrX 14317416 5' + 1360 3338 1 55.86 GTCCTCACCAACGTGAAGGAATTCCAAATAACTACAAATTCAGCTTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr2L 10128164 5' - hobo 2908 1 54.81 CGACGTCGACGTCGTTCGTTTGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 + chrX 1831266 5' - P-element 2798 1 18.52 TCTTTCGATAGTTCTTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTAAAAATCGATTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chrX 21668834 5' - mdg1 7424 2 58.22 TGAGCGGAATTAATTGCAATCCGCTACGTTTTTCCGGCCACGAGCACCGACTGCCAATTTGTACGTCCATATATATTGAACAACGCCCTTTGTTTAAGTGCCGATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTC:1 + chr3R 29952637 5' + invader4 2772 2 74.66 GAAGGAAGCATAAAATGCCAAAAGGAATTAAGGTTATGCCTCAGTCTGCTGTCTCTATACATACACATATATATGCCACATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:2 - chrX 7657534 5' + I-element 42 1 56.16 ATTGGGTTCTCACATTTCTGTTACATCCTCAGGTAAGTGAATCTCTAGTTCGAACAAATGAAGAATAATAACTTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 10800614 5' - roo 388 2 63.03 GTCGCTCCAACTTTCGGCCTTTACGATGCACATAAATATTACGACCAAGTTCAAGTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 - chr3R 6603858 5' - pogo 2040 1 63.70 CAATAGTTTTGTAATTAGCTTGCGATGTCCCAGGTGATAAGTGATATTTAAGGCACTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr2R 18785948 5' + roo 8730 2 64.83 CAATGTTAATGTCATCTATAAAGCTCCCAAGATCATTGCACTCGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTC:1 + chr2R 18528393 5' - jockey 4658 1 70.55 TATGGTTAATCAAGGGAGATCTAATCAGTTGGCTGATATTGACCAATCAAACGAATAAATGAAACCAACTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCGCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr2L 11559704 5' + roo 49 2 52.52 AAATAAAATAAAAATAAAATACATTCTCCCGTATACACATATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGG:1 - chr3L 14730559 5' + opus 7182 4 73.19 TATCTGGCAGCTGGTGATAAGCCGACTTGAGGTCGATCTAAAACGTTTTTTAGGCTGAAAATAGGAAAGCGTAAGGGTAAAACCTGAATGGAATGTCTGCTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chrX 126929 5' - hobo 2935 1 78.74 ATTATTATCAATTGTGAAGTATTAAATTTTTAGTGAATGTGTTTAAAATTGTATGCATTAGGTAATTGTGAACGGTTCTTACCTTCTCAGTAATCTATTTAAAATCTTTGTAAATAGGTAAAAGCACTTTTCATTTTTAAATCTTT:1 + chr2L 9982575 5' - Dm88 4239 1 60.96 TAATTTATTTTTATATGTATATAAATCGCTTTAGGTGTAGGAGAAAACTGGCAGCGAATGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACA:1 - chr3L 21043138 5' + Quasimodo 52 2 57.53 GGAACGGCAATTGTTGAAAGTAGTTAAGAAAGGCTTGAGGGACGGGCGCTATTTCGGAGTTTCGGTCCTTTAGCAATTATTTTCTAATAGAAATATGATCATATGACGAAAACCAAAAACAAAATTGACCGA:1 + chr2R 4511941 5' + transib2 108 1 61.36 GATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCG:1 + chr3L 25782385 5' + F-element 101 1 80.82 TTGCTCTGTTGCAATTGTCACATTGTTTTGGGACACTTTTCTGCGGCTCAGTGGCGACGACGACTGTGGCAATAGTTTTGTAATTAGCTTGCGATGTCCCAGGTGATAAGTGATATTTAAGGCACTATGTTCACACATGAACACGA:2 + chr2R 18785879 5' + roo 8662 1 60.27 TTACAGCCATAATTCAAAAGAAGATACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3L 19938575 5' + roo 55 2 58.22 AAAGCACTTTGTAAATTTTTTAAGTGCCATGCAAAGGATGCAAAAAAAAAACGAGAAAAGTCCTCGCTATGAACAGAGAAGAATAATGCCTAATGACACAATTTGGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTTTTTTTT:1 - chr3R 9115399 5' + Cr1a 10 1 62.41 AGTTTGTTTAACACATTTTTTTATCATTTCGCAGCTGTAATGATAACTGATAAGGCATACACTTATAATTCAACTAGGCAAAGAATGAATTCCTTATCATAATTGTTACCACATATATTTTGTATATTTTATTTATATATAAATAT:1 - chr2L 14570819 5' - G7 1141 1 54.11 TAAAGTGTGCGTATTCGAGTTGAATGAAAATACTAGTTTCTCTAATTCCAGCTTAGTCTCTAAGAAAGCACTATAAGTGCATTTTGATTGAGCTGCCTTTTGCTGTTATTTTAGCACCTTACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTT:1 - chr2L 20282870 5' - hobo 2520 1 49.32 GCTTAGAAAAGAATTTGATGGTCGAACAAAGCCGACAATAAACATTCCATTCAAATGAGCCACCAAAATGGCATCAATGTCATATCAATCAAAAACTCAAACTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 22266579 5' + roo 8681 2 73.97 TCGAATATGGCGGCAACGTGCAAAAGTGCCATAATGCTGCGCCATACAATCATTAGCATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCT:1 + chr3R 9862880 5' - Stalker2 367 2 53.78 GAGTGGACACCATTTGCAATTTTCGCACTCGCTTTTCCGCTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr2R 17348415 5' - hobo 2915 1 52.87 CAGGAAGATAAATAGAGAACGACAATTAAACTAAAAACTTCAATTTCTGAGTATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTC:1 + chr3R 11618693 5' + McClintock 6023 2 65.07 GCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGG:1 + chr3L 1983458 5' - Transpac 5157 2 67.12 AGCCCCAAAACAAATACGAAATAATTTTGCAATTGGTGGCACGAAACTCGCATGAAAATTGCCGTGCAACAGCAATTTTTTGATGGAGTTGTCAGACGCGCTAAGGTGCGCGTGAACGAAAACGGCCTATCTAGGACAATGATGCG:1 - chr2L 3237277 5' + aurora-element 3964 1 55.48 GCGGTATTTAGAGAGGCTTATGAGTATGTAGTAGTAGCAGTAGAGTAGTAGAAACAACATCAACAACAACAACATCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chr3L 13778527 5' + I-element 48 1 52.74 AGCAGCTAAATTAAAAACAGATCAATTAACGTCGAATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGACAG:1 + chr2R 7541017 5' + F-element 99 1 78.08 CTACTTATACTAGTAATTGCTTGACGATTTTCTGAATGAAGGAGCAAACAATGAAACTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGAT:1 - chr2R 18807909 5' - BS 5030 1 63.01 TAGGTGCACTGGAAAAAGTCAAAGTTCATTGTGTATTTTGATAGCTGTGAAAATAAGATACAATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATA:1 + chrX 18561054 5' - copia 197 2 57.53 TGGGAATCGAAGGTGTTGTTTACGGCGAATTTCGAAATGGGTTGCCCGGAGAGTTTGGACCAATCATCGCGTATGCGATTACCCACACACAATATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 - chr3R 25094745 5' + P-element 17 1 72.26 AGTCTTCAATTGCTGATTGTGAAAGACTAAATTGAAGTAGAGAAAGTATTTAGTTTGGCATGGCTCACAATTAGGTAAATACATACAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGCCTCCGGCG:1 - chr2L 19217734 5' - gypsy6 7779 4 62.41 GAGGGACAACCAGTGAGATACAATCTAAGCAGGAAACTTATGAGTGCAGAAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chrX 16857021 5' + pogo 27 1 64.38 AAAAGGGGCCTTTGGCTTTTGAAGCATCGTCGCCTGCTTGTTGATTTTGTTGCTCTGTTTGTTTGGCTCAAAGCTATAAAATATATACAAATATATATAAGTTAACGCAAGATGCACTTGCATCA:1 + chr3R 6472608 5' - opus 7496 2 79.20 ACAACTTCATTATTGGCAGCTAGTAACAAATGATACAAACACCTAATCTCATTAATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 - chrX 16857157 5' - pogo 2038 1 63.70 GGAATGAAGTATTAAGCGAGCAGCAACAGAAAAAATTTAATTGAATTTGCACTGCTTTTTTGAGTTCACTTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 - chr3L 780778 5' + Burdock 6183 2 52.05 AATCAAGGCATACATACGCCGTGTCGGACGGCGGCCACGCCTCAGATTTTTTTCTTTTTATTTTATTATT:1 - chr2L 1642130 5' - BS 5099 4 34.29 GATCTGTTTCAAGTGTTCGTAGACCGTTAAAACCTTTCGCACGCCCACACAAAAAAAAAAACTTCTTGATAAAAGCCAATTTCGCAGCACATCACAAAAAAAGAAAAAAAAACAAAA:1 + chr2R 20698787 5' + gypsy7 5009 108 75.21 CAATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAACTCCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTTCGAATCGCAAGTTCGAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chr3L 11887218 5' + Doc 64 1 65.32 GCTAATCCTCGACAGTGTGTGCTCAACGGGATATCAGGCGGAAAAGGACAAAGAGCGCTGCATACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2L 2518623 5' + jockey 20 1 72.73 TGATTACCAAAACTAGCTTAAAAACCTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 + chr2L 3150991 5' - blood 7347 2 56.16 ATGTCTCTATTATTTTAGGTAGCTGGGGAAGAAAAACTGTGCCCAACTTGGCATAAAACTCTTGATTCTGAACTTATACCTTTCGAAGGGATGTTGCGAGGCGAGCTTGCGTGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTG:1 - chr3L 2341430 5' + R1A1-element 215 1 59.59 GTGCCCATTACACACGGCAGCCCCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr3R 5767372 5' + roo 8730 2 63.70 TTTGCTACTACCGAGCAACAGGTTCGCTGCAACCTTCTGGTCGCAACAACATGTTCAAAGTTCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr3R 2628972 5' + 1360 58 1 57.53 TGCCACTCGCATCCCTTTCCCAATCCCAATCTCACACCCATTTTCCATTCCATTTTCCGAATCAGGTCAATGCACAATCGCAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - chr2R 10960985 5' + Doc 47 1 52.05 GCCGAGCACACACACATGTAGGACACAAGTCCTGACCCGATTATCGAGTTGAAACTGTTTTATAAAATTTGCACCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr2L 246561 5' - P-element 2842 1 55.48 TACCAAATTTGAAACTCATATTTGTTTCACTTTGTTATGAGAATCGGGGGTTCTTCGATTTCAGCACATTTAGCTATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTAT:1 + chr3L 13475485 5' - HMS-Beagle 203 2 56.16 TAATCGGAGCCGTGTGGGCGTTCCTGGGATAAATGGAGAAGCGAAGGATGTTTAGATAAATTGCGCCTGCAGAGATTTACAAATTACGCCCGAGGCGGCGAATGGCGAAAATGGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2R 18467071 5' + roo 8671 2 78.08 GTTTTCTATCGGGGGCGTTCCAGAAATCTCTGATGGTTTTCGGTAGAGTAGGTTGGAATTCATGAGAAAAACGTGCAGAGGTTTTTCTCATGAGATTATGTGCAGGATATGCCGGGGAGCGACTGCAGCAAGAACCCAAAAACAAA:1 - chr2L 4305148 5' - Tc1 166 1 50.68 TAAGGTTGCTCCTAGGGAGACCAGGTGGGCTGAACTGGCTCTTTGAAGTACGATCTGCTCTACAATGGCAAGTAGGAATCTTTCAAATAGCTCATTTTGAAGCTTTCTCTGTAATTACTTGTCTTAAAATTTAAAAAGTTTAAAAT:1 - chr3L 6318826 5' + 1360 3030 1 60.27 GGATGGGTTGAAAGGATTCGAGCGTCGAATCCCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 - chr3R 11550313 5' + F-element 50 1 56.85 AGTCAATGTCAATGGAGTGGGCACATATGTGCATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGA:1 + chrX 1726678 5' - 297 6892 2 79.45 TAGGGATGGTTTGTGTGTAAATTTGATTTCACAACATTTTCTCAGTGCGTCGCTCCAACTTTCGGCCTTTACGATGCACATAAATATTACGACCAAGTTCAAGTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 - chr3R 6603906 5' - pogo 2088 1 76.71 CAGAGCTCATCACCTACAATAGTTCTGTCATCGGCACGATGTTTGCGGCATTAGCTGGCAACCCTTTCCCCAAAAACGTCAACAGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2R 8467699 5' - roo 9045 1 64.96 CAATGGGAATGGGAATGGGATGTGGGGATTCATCGACTGGATGGGGTGTTTTCCATTCTCGAGGATCATATATCAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGATGTATATGTTGT:1 + chr3R 12655668 5' - Idefix 57 2 73.29 AATGGTTTATATACACACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr2L 16360570 5' - hobo 2893 1 57.81 TACATATTTCGAGCAGCAAAAACAAAGTGTTTGCAGCGACAAAAAAATAGCAACAATTTATAAAAAAAATCTGCTTGCTCAGAACTCAGTGTAAGTGCGAATATGCGAGAGAGTGTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAA:1 + chr3R 23346497 5' - Rt1a 5055 1 79.45 AATATGTAGATCACCATTTATATGTTTATATGTAGCGAAGGTGCTCTGTAAGACGGAAGAGTTGTTTATGATCTATTCCCGCCTTGACTTCTATGTACCTGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr3L 22445324 5' - Transpac 292 2 70.55 GCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAG:1 + chr3L 10068921 5' + 412 91 2 80.14 GGCAAATATCACTTATAAACCTTCACTTTAATACTGAACTAATATAGTGCAATACGCAGGGAGTTCTGGAAAATATTGCTTTAACTTAACCAACAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACAT:1 + chr3R 20097558 5' + mdg3 28 2 66.44 GCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCAAGTGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTAGGTTG:1 - chr3L 21765490 5' - gypsy 374 2 76.71 CTCTGTGCATATCAACGAACGGGATCTCTNCTTNGTNANNNNNGNNTNNCNGNNNANNNNNNTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chrY 311460 5' + 1360 4 2 31.51 CTGTTGACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 + chrX 16995048 5' + jockey 89 1 71.92 ATAATGTTAAATTAATACGCCTCCCCCTCAACGCAGCGCCTTCCTTTTCATTTGGCCCCTTAGTCAATTGGCGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTAT:1 - 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Transpac 5213 2 73.97 AATTTGTCTAAAGCTGTTCAAAATCATAGCTGGGCATCACCAGAGTTTTCTAATATTTTCCTTTTCCCCTATAGAATTCTCTTTTGGCATGAAAGTATATATGTATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTT:1 - chr3R 12952998 5' + micropia 4976 2 72.60 TTAACGACTTTCCTCCCAGTGCATGCAAAGATTAAATGCGCGGAGTGGGATAAAATGCTGATAGCTGGAAGGCAGCTAAAAGTTTCTTCTTTCGGGTATGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAACTAAAAT:1 + chr2R 10773174 5' + 412 22 2 70.55 GACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chrX 16995053 5' + jockey 58 1 65.45 ATGGTTGTGAAAATGGTTATTTGGGATCTATTATTTTGGTTTATTGTTTTCGATAGTGTAATACAATAATGTATATGAACGGCATTCCTTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGC:1 + chr3R 11142161 5' + Max-element 32 2 61.11 GTGCCCCTACTTCTCTCCCTCTATATTTGTTGAAATAATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTG:1 + chr3L 13567989 5' + copia 4946 2 78.26 GTCTACATCACGCCAACCTCGTTTGAATTGTCCTAACTCCAAAAGTTCCGACCACCGGCCCCAACTGAAAAAAAAAGTATTTACCAAAAAAGTATTTACCAATGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr2L 232316 5' + Doc 21 1 58.22 CGATTCATGCTTAAAATGAAATTGTTATATGACATTTAACTAAATACTGATTTAATTAATTAATAATGATTAAGAACTCGAATTACCAACACGCGGAGCCCTTAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:2 + chr2R 18858181 5' + 297 11 2 76.03 CGGCCGAGTGCTGTTGTCCGACACCCCGGGCGTATCCTCGGCCTTCAGAGTCCAATAGAAGGATGCTATGTCTAGTGAGGTCGTGGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAAAATTCAAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAG:1 - 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flea 5001 2 70.55 ATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTAT:1 - chr3L 3540202 5' + mdg3 65 2 68.49 GTGTTTGTGTTTCCGCTTACACTCATATGAGAACAAAATGATCTATAAAATACGTTTAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr2L 770070 5' + roo 8726 2 61.64 TATTATTGACAGTTGCCGACGTCTTCTGTTCCGTTCCGTTATGTTCTGTTCAGGGCTGTCCTGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 + chr2R 22795125 5' - hobo 2885 1 54.29 GCCCGGAGAGTTTGGACCAATCATCGCGTATGCGATTACCCACACACAATATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chr3R 25094702 5' + P-element 69 1 38.36 CACGTGATTTCTGTGTCTGTGCTCTGCGCATTGCTTCTGTGCTAAAGCAACTATCATGTGAGGCACAATCTTAATTGGGAATACACAGTCCAGTCAAAATAGCTACCCACATTCGTATCCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGA:1 - chr2R 6730035 5' - F-element 4342 1 79.45 GAAAAATATATGTAGCTCACCTGCAGATAAAAGCAGGGAATAACTCAATTTTAATGTCATATCCCCTTTCAGTAAAAATTGAGGTCAACGGACCAAAATAATAAAAGAAAGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAATAGATAAGTCGT:1 + chr3R 7645051 5' + I-element 13 1 76.03 TCTTTAATAGGAGCTTCATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCCCTTACGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - 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chr3R 29952822 5' - invader4 3053 2 62.33 TTTCGTATTATTTTATAGGTTACTCATTGCTTATGTTTCTATGTTTATACTTTCTAAACTATGTTTGATATAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 + chrX 19736395 5' - pogo 2054 1 52.05 CCCTCCACCCCCCCTAAAAACAGCCATCCCCATTCCCCTTCAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3L 5329231 5' + 412 41 2 52.27 GCTGATAGCTGGAAGGCAGCTAAAAGTTTCTTCTTTCGGGTATGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 + chr2R 10773230 5' + 412 78 2 69.86 TAAAGGAGTTTGAGCTGTTAAGTATCAGGCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chr3L 2240427 5' - roo 317 2 80.14 ACGGATATAACATTGAGAAATAATTTTCTCTGTTAGAATACACTGAGAGAAGTCAATGCAAAAATTAATAGTTGTGTATAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chr3L 13016008 5' - hobo 2895 1 53.42 GACGGATCATATTTAATAACATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCG:1 - chr2R 4270289 5' + gypsy9 32 2 52.74 CTTAAACATAAAAGTTAACGACTACAAGCCACCTTGCCTATAAATTACAATACGAAATATACGAAATATGAAATTCTACTTGCGCAAATAGGAACATGAGCAGTGTGATGCTCGAATTCCGGCTGCCAAATAGCTTTTTGCAATTA:1 - chr3R 15471952 5' - diver 291 1 65.07 TGATTTATAGACCCAATATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTTG:1 - chr2R 18467220 5' - roo 342 2 61.38 GACGTTAAGTGGTCTACAACCAAAGTTATTGAGTGCATATAAAAGAAAAAGGAGTGCAAACTTATTTAGAAGTCGCGAAGAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGATCCAGTCTGTA:1 + chr3L 17444109 5' + Tc1-2 1303 1 71.23 GCCACGCCTCGTTGCCACAGGGAACTCGGTTAGATAGCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 - chr3R 12886063 5' - 412 419 2 75.18 AATGTTTCGTCGTCCTTGCAGGACCTCATTTCAATTGCAGATTCCATTAGCTGCAATTTGCTAGTGCATCGCACCCGGAGCAACTGCAACCGTAGGCGGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAA:1 + chr2R 21105669 5' + Stalker2 7273 2 68.49 TATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTA:1 - chrX 8610292 5' + mdg3 86 2 72.60 ACTCCAAATTTCCAGACATCAGGGATCGCGTGCCAAAACATTGCGTAAATCAAGCAAATGTTTCTCGGAAAGTCCAAGTCACCGATCATCCATTGGTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr2R 12642779 5' + pogo 20 1 71.92 TATACACACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2L 16360579 5' - hobo 2911 1 55.45 TACGTTTCATGCTCGTAAATGTTAAAATCAAAATTTATTCATTGTTGCATTATTTTCACCTCTTTAACGAAAACAATCTTCGGTATATCCTGTATGTATATCGATTACAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 10344712 5' - roo 396 1 48.28 GTCGCCGGCAGCGGCGCAACAGCAGCGTCGCCACAGTCACTATGCCATCGATGGTAAGAGATCGGTAATTCTCTCGCTGCCCTTAACCCGTATATATATGTACATATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAA:1 + chr3R 22676146 5' - 297 384 2 78.08 ATATCGTTTCACTGTTCATTCGACTGCTTTTGGCAGAAATTTCATTTTGATTTGGTGTTTACTTTTGGAAACATAAAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTAT:1 - chr3R 24682642 5' - Ivk 5303 1 58.33 AATTGACTCGAACTCGCACATTTTTCGCATCGAGCACAAAAACAAGTCACAAACTTTTCGCCTAGACGGTGCTTTTTTTCCACTTTTGCACATACATACATACGTATACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCTCACTCTACGTCCAC:1 + chrX 13484071 5' - hobo 2922 1 73.97 CACTGAAAAAAGGTGGCGAAGGTGGGAGATTGCTCATATCGAAACCCGTACTTCCTGTGCATTGTTCGCTTATACAGGCCAAATTCTGTAAGCCGAAATCAAAAGTTGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTT:1 - chr3R 26968510 5' + FB 15 1 69.18 ATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGAAGAGGCATTTGGCTATTTATTTTTATTTATTTATTTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTT:1 + chr3R 9201036 5' - R2-element 3225 1 64.38 AAAACTATGAAACATTTGCTGGCAGAATAACCTCCTTCAACTTGCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTA:1 + chr2R 21353193 5' + Transpac 74 2 72.60 CTTATCAAGAAAAGAAATATAGAAAAAACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTCCCTTTAC:1 - chrX 8610364 5' + mdg3 5266 1 75.34 GCAGTCGACAAAGAAGAAATACAAATCACAATGGCTGCACAAACAACCAAAACAACAACTCGACATCCGTTTTGCTGGCCCTTCAGTAATGACATTTTCAGCGGCACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATC:1 - chr3L 19431769 5' + Juan 20 1 71.92 TTTTTCACCGTGTGACCTTGGCCATTATCTTCGCTCGACGCACTTGACACACACGCTGCATACGCTGAAAAGCTGAGGTTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGAATGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATT:1 + chr3L 2335758 5' + FB 937 3 52.74 CGGGGATTGACTAATTGATGTCCATAACATCGAGGGGATCCGGATGAGGAGAAGGATGCAGGCAACTTAAACTAAGGCTGCGATTGGTGACAGTTTGATTGATGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 - chrX 998268 5' - copia 237 1 71.92 ATTTCCATTTTTAATTTGCACACAGTACTAGAAACCAACTATGAAGGCATTTTAAGTTTAAAAATTGTAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCCACCTCC:1 - chr3L 25304376 5' + F-element 400 1 55.97 AAATATTTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3R 11873329 5' + 412 50 2 52.05 TTGTATTTTTTTCGTGATTTTTCAGAGCAGTCAGCCTGATTTTGGGCTCACGCAAAACTGGTTATAAAGTTGATGCAAGTATGATTTTGCTGGCTCATTGCCACAATATTCTAGTTCCGAAGATACCATGGAGCTCCAGTAATGAT:1 + chr3R 13726618 5' - Doc3-element 4405 1 73.29 TTGCTCAATTCATTCAGTTACACAAAAAGAAACGAAAACTATTTCAAGAAACCTTTGCGAATATTTGCGAAATTGATGTCAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3L 10733768 5' + 412 7094 2 47.95 GTATTAGTTTATTTATTTTTTAGTCTTACATGTACTCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTG:1 - chr3L 2416104 5' + Doc 91 1 75.34 ACCCTGTCTGTATTTTATAGATCTATACAATTCAGGGCTTTTTAAGCCCAATTATAATTATGTTTAAATGCGGGTTGTTCCATTCTTTTGCATACATACGTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGA:1 - chr3R 14801337 5' - I-element 5331 1 73.29 GCCTATGCAAATTTGCCGAAGGACCAAGGTGAGAGAAGAGTGATTGCGGGATGGATGGATAAGCCCAGGGGCGGGCCAACGAGTGAGACGAGTGTTAGACATATGATGACAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAA:1 - chr2L 16202753 5' + copia 4878 2 78.08 CTGCGGTTGCTTCGGCCCCGTACTCGCTGGCGTATGAGCAATATTAATTGTAGCTGAAATTAATCATACGCACCGTTGCAGAGCATGGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 30524584 5' - roo 9052 2 69.17 TACTAGATTTCGATTTCGATTTCAATTCGTTTTGTTGTCGCTTCTAATCTAACATACATACATACAATACATATACATAGATATATAACTACAATTATATAGTTATGCATTACACATAGAAACGAAGAATACAAATAATACCAATT:1 + chr3R 29171628 5' + HeT-A 5890 1 73.97 CACATGGAGAGGCCCAAGTGCACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGGGTGCGGACGAATTTTTTTTT:1 - chr2L 20716396 5' + P-element 98 1 19.18 ATAGAAGATAAGTAAAAAACCTATTCGAGTTTTGTGGCTAATTTATACCCTTTACTTGTAGTGTAGAAAAGACACTTTTGATTAGTCTTGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGGGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGAT:1 - chr2R 7024514 5' + diver 32 2 64.38 TATGTAACCCCTTTTTTCGGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCAACACTGAAGGGATTACAACCAC:1 - chr3R 902604 5' - R1A1-element 5287 1 59.17 GCTAGAACTTTTATTAATATTTTCAAATTATTACTTAGCTATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATATATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAATTAGC:1 - chrX 22460233 5' + HB 6 1 76.71 CTATGATGTTGACAGAATTGATGCTTTGCATTCCCCATAGATGTTTTTCTCTTCCAGCAGCAGCAGGTGGATTACTTGCGTGCATTTGCTGTGCCAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGC:1 + chr3R 30524420 5' + roo 26 2 67.81 AGCGAAGGTGCTCTGTAAGACGGAAGAGTTGTTTATGATCTATTCCCGCCTTGACTTCTATGTACCTGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAAC:1 - chr3L 22445291 5' - Transpac 5178 2 55.48 AACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATA:1 - chr2R 10666907 5' + hobo 89 1 77.40 GCGCGAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGATACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAGGCCTCTATAC:1 + chr2R 17872472 5' + Tirant 8127 2 60.58 ATCTGCTGCATGGGAATGGTTGTTGTAAAGCTTAAGGAATGGCAAAACAAATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 + chrX 13807991 5' + pogo 66 1 66.44 AGTATCAGCGTGTTGCCGTGTTTTCTGGTTTGGCAGCTGCTTCTTGGGAACACTCACGCTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAA:1 + chrX 18675441 5' + F-element 4520 1 60.43 CACAACAGCAACAAAATTAATGAAACGAAGAAGAACAGCTGGTATAATAAATACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr2L 13102870 5' - roo 340 2 66.44 GAACGTCTTAATTAGCCCTGCGAAAAGCGCGAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr2R 17872446 5' + Tirant 8141 2 60.42 GCGAGAGTTTTAAAAATAATCGTGACCAGTCACAGTTTAGCTAACAGTGTCAACTCAGCAGCATATGTTGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATACGTGCGAG:1 + chr2R 11691191 5' - P-element 2835 1 50.00 GCCATTTTTCCTTGTTATTTTTGCACTTGTACCAAGGAGAAACATCAAAAAACGCGTGAAAAGTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTAT:1 + chr3L 18435423 5' + I-element 59 1 56.16 AATACTAAACCGAAATACTATTACTGAAGAAAATGTTCAAAATATAAATAAATATTTTACGCAAAAAGAAGCATTCAAATGTATACATTTAAATGTATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCA:1 - chr2L 13156621 5' + Max-element 28 2 64.38 TTTAATTTAGACTTTCGTGTTTGTTTTGGGTGAATCTTAAAATTTATGGGGTACTTTTAAAGGGCTTTGGGGAAATGAGGTATCGAATTTAACTTTAAAAGGAATTAGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 + chr3R 22160815 5' - copia 242 1 72.60 TCTAGATCTAATTTGCCACACAACAGACTATTTCAGATTGTATGGCATTATAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATT:1 + chrX 18318161 5' - copia 5054 2 66.44 ACTTACATATATTGTAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAAT:1 + chr2L 615224 5' + F-element 71 1 56.85 CAGACGGAGACGTGGCTGCATTGCATTTTTATTGCTTTAGGCGAGTGACCAAATTAAATAGCTACGCTTCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACC:1 - chr2L 15057305 5' + hobo 10 1 77.37 GAAGGTAAGTGATTGTTGAAAATGCTACAGGTGTGAAAACCATAAAATTCTCATTATTTATAATAAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 + chr3L 12729070 5' - opus 7449 2 57.53 CAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 - chr2R 18056870 5' + blood 7096 2 76.03 GTAGCGAAGGTGCTCTGTAAGACGGAAGAGTTGTTTATGATCTATTCCCGCCTTGACTTCTATGTACCTGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 - chr3L 22445293 5' - Transpac 261 2 54.11 ATGAATCGTGGATGTGAGACAATGAGTGTCCATCCGACATGTGGAAAAGTTTACGTTTGACTGGGTTTTTTTTCCCCCAGGGTGATACATCATACACTGCGAGAAGCGAGAGTCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr2R 14018594 5' - roo 8991 2 75.34 AATATATGTATAAGAAATAGTTTGTATGTCCCTACGAGGTTTTGACATTTCTTGACGTTAGAGTATGCGTAGCCCAAATATTTAAAAAAAATACCTTTTTTTTTATAAGTTGCCAGTTCACAGCTTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr2R 9868588 5' + roo 8664 1 80.82 ATTGTTGTATTATTTAATCCTAAAGGACATGTTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3L 21108562 5' + roo 8753 2 81.51 GAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAA:1 + chr3R 15035075 5' + Stalker2 85 2 73.97 AAACAAACACTTTGCATATGCCACAACCACTCCCACACTCGGACATTCTTTTATGTAAATTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCT:1 + chr2R 20117288 5' + mdg3 5314 2 60.96 ATAACAATTTGCTTGTGGGTCGTGTCATATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr3L 20910128 5' + F-element 43 1 55.48 AATAATTGTATGCAAATAATTATACGTTCAACAAATACCTTCTCCGCGAAAATCGCTTCAAATCAAAGGCCGCTAAACACATTCCACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 + chrX 9949466 5' - hobo 2903 1 60.69 AACAGAAAAAATTTAATTGAATTTGCACTGCTTTTTTGAGTTCACTTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTA:1 - chr3L 780754 5' + Burdock 71 2 68.49 CAATAATTCAAATTATCCACACAAGTGTCCTACTACCGGGCCGCTCTCTCTTCACTTCGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTT:1 - chr2L 42598 5' - copia 194 2 60.27 TAAATAAAAGACTAAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr2R 12416960 5' + pogo 49 1 54.79 GCGGTTAATTAGCCATCCATATGATTAATCAATCGGCCGGAGTACTTGGTCCAGAGTACTGCAGCCCGCCCCTCGCACTC:1 + chr2R 10666850 5' - hobo 2931 1 65.00 CGATAAGGTGCGAATGCTATCAGGGTCCGCAAGTACCCCACATATATGTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTT:1 + chr3R 8810646 5' - 297 6911 2 70.55 TTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATG:1 - chr2L 23295849 5' + micropia 5043 1 79.02 AATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAG:1 + chr2R 12185306 5' - accord 494 2 51.08 ATTCGGCTTAATTTAGTTTATTTAACAGCTCTTGGCTCTAATGACTGTGCAAATAGCGTGAGAGCTGGCGCCTCTTTACTGCTTCGGCGTATTTTAATGAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAA:1 + chr2R 24211492 5' - flea 4996 2 73.97 CTAAATATCCATTTGCAGGGTGAACGACATTCCGCAGCATCAATTTCTGATTATAGCAATGAAATGCACTTCAGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2L 11559824 5' - roo 361 2 54.11 TGGTAATCTAGCTAAAAGTCAAAGAATTTTCCCTATTATAATTGAAATGCTTAACTTAAACATTCGATTGTGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chr3R 14174673 5' + 297 46 2 54.79 GTAGTAATATTAATTGAAATAATAGAAAAGATATCAGGTGCATTGTTTTTGATCATAAAATATACCCTTGCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTAC:1 + chr3L 14954352 5' - transib2 2774 1 71.23 CCGTAATTGCATAATTCTAATTTAGCGTCGAGTTCTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACAC:1 - chr3R 26405081 5' - hobo 2861 1 73.91 GGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATA:1 + chr3R 19589938 5' + BS 5081 1 74.66 TTTGCCGATGTAGTTCGCGAAAAATGCGTTGATCGCACGCACGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGAA:1 + chrX 22652721 5' + ZAM 8023 2 70.40 ATCAGCGCGTTACTGCCTATTATTGCGCTTTTACACCCAGGTGCACTTACGAATTCATATGTACATGTGTATGTATATGTGTGCGTGCGCCTAAAAGTGCATGCAATTTAAAATGTGAATGTGTTTTTTTTTCTTTTTTGTTGTTG:1 - chrX 3080994 5' - gypsy7 5003 1 53.42 ATTACAAAAACGTCTTTTTTTTTCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGGCAATAAGTAAATTTTATAATACAAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAAC:1 + chr3L 23589276 5' + Bica 311 1 62.86 TGTGCGTCAAATTAGCGACGATAGCGGAACGGTGGAAATTGGAACTCGGGGACGTTATTTTTGCGATTTTTTTCCGCTTATCTAAACTACCGTGTCCCTATAGGCTTATAGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2L 5724447 5' + 1360 7 2 40.41 CTCTTCATATTTGTCTGGCTTTGCAAAAAAAAACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 + chrX 12344272 5' + F-element 36 1 67.88 TTAAAATGTCATTTATGATTTAACATATTACCTCTCCATAATATGTAGATTTCGGACAAATTGTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:1 + chr2L 22031911 5' + Tabor 6852 2 76.71 TAGAAAATTCAATTAGCCTGCAATTTTTGGCAACAGCTGGCTTTCAGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCT:1 + chr2L 3677597 5' + BS 63 1 67.86 TACACACAACTACAGTACCATTATTTTCTCTCTGTGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTACACACGCAC:1 - chr2R 10917316 5' + F-element 4450 1 74.66 CAGGCTGAGGAAGGCGGTCATGTCTGTAAGTGAGTTCCCAGAAATCCAATTAGTTGGAAGAAGGGTGTGGGGCTTATGTAACATGTTAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTG:1 - chr3L 18954255 5' + roo 32 2 62.33 AAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 - chr3L 20910097 5' + F-element 30 1 49.02 AAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 - chr3R 31663325 5' + jockey 81 1 65.75 CAGGGATTTCATTTACAGCTAGCAAGCTGAAAATTTGGTTTCAGAACAAAAATTAATACTTAATAATACTTAATTTAGAGTCCCAAAACTATGTTGCTATTTTTATTTTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTC:1 - chr2L 16567017 5' + F-element 478 1 67.81 ACACGAAAGAAAAACAAGAGTCTATTTTGTAAGGGCAATATACAATTCTACAATACAATTCTTTTTATACCCGGTACTCTAGATTCGAGACTTTCCGACCACATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGAT:1 + chr4 520286 5' + INE-1 95 1 65.07 AGTTGCGGTTAAATCGAAAGTCATACTTTAACTACAATATAATATTACACGCCAAGTCAGAGGCATAAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr2R 21244807 5' + roo 8674 2 74.66 AGAATGTTTCAGCTCATTTTATTATCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAA:1 + chr3R 24301812 5' + Tabor 6899 2 56.16 AACAGCGGCGCCAGAAACCGCAGCGAACAGAAAGCAGACATCCTTTAACAATTATTATTCAATATTTACAGAGAGATATGAACCGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr2L 12767091 5' - hobo 2931 1 68.42 ATTCTTGTTAAATAACGGGTATCTGATACTCGGGGAA:1 + chr3L 23771468 5' + INE-1 555 1 72.97 ATGGTAAATTAGAATTTGAATATCGTATCGCCATCGTGATCAGGTCAAGACATCATCAAGACGCCATCAAGATCGGGTCAATGCTCACATTATTTTAGTTGGCATTGTCGAATTTATTTTATCACATTGCTACGAAATTGGCCAAA:1 + chrX 21059135 5' + 1360 3118 1 76.71 TATATGTAAACTATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chrX 3637763 5' - roo 9014 2 55.48 GAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGCCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACAAG:1 - chr3L 1983523 5' + Transpac 5006 2 76.71 AGTACCGATACAAATCTATGTATTTGCTTCTTTTTCAAATAAGTTAAAGGAACCTACTATCCTACCTATACCTACATGTTCATTAATTACGATTAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3R 25052961 5' + pogo 22 1 69.18 GCTCTTACATATCTGCATTAGCGCCATTTTAAATGCGATAGCGATTAGCCGATAGCACTTATCGGTCACACACGCTAGCCAAACAGTACAGTCACCACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:1 - chrX 11236524 5' - copia 229 1 65.75 AATTGATATTAATGCAGCCATTTGCTCATTTTAGATTACTAATCATCTATTAATCCCACCCTAAAAATCGGATTATATAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTAT:1 - chrX 17270397 5' + 3S18 5809 2 52.05 ATGTGCAACGAAAAGCAGTGGATTTTTGCGGTACGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTA:1 + chrX 9864943 5' + hobo 87 1 77.40 CAAGAGTGACACATGCAAGAGTAACAACAAGGATTCAAATTTAATAATATGATTATATGGTAAGAACCATATCTTTAGTATGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGAATCGGCAAGCTATCTGCATTATTT:1 + chr3L 10241165 5' + pogo 40 1 52.74 GGCTTTCCTGCCAATTTTGCAGGCAATTCCCTATGACCACCACCATTCCGTTCCCGTTCCTTGACTAGTTGAAAAACAGAAAAGTTCTAGATATAATTTATATTTCTTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAGGTTTATGTTTGT:1 - chrX 17497198 5' - copia 5081 2 60.96 GCACTCACTTCGATCTGATGGCCATCGACGTTGACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 + chr3R 11730700 5' + hobo 72 1 74.62 ACTGGTTATAGACCAGTTGAGTGCCAATGTTGGCGGCTTTTTGTTGCCTCGGCTTTGGTCTGCATTATTGTTGATATATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATGATATGTACATAGATTTGGCTATTTCT:1 - chr2R 21867398 5' - 1360 339 1 51.75 CAGCAGTTGCTGGCAATTTCAAGCATACACACTTATTCATGCACCAAAAAAAATCTATTTGTTAATATTAAAGATTTTACAAGGTTTCAGAATGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 - chr2L 7167384 5' - flea 231 2 68.49 ATATCGATAGATATTGGGGAATAAATTGAGAAAAAACTTAATATTGTTCAAAAATGTGGGCGTGGCAGCTTTGCGCGATTTTAAGGCGTTAGAGTTGCCGTGATAAAAAGTTTTTTGGTAAATCGACAGAAATTTAAAAGACTAA:1 - chrX 23078693 5' - INE-1 298 1 77.24 TTTGCAATTTTCAAGGCTAATTTAACAAACGATTACCTTTTATTACCTATTACCTTTACCACTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr3R 19466672 5' + jockey 64 1 55.56 AATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACC:3 + chr3R 15035079 5' + Stalker2 89 2 76.71 ATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTG:1 + chr3L 19951157 5' + Ivk 34 1 62.33 ATTATAACCAGAGTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGGGGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 - chr3R 13198267 5' + Doc 82 1 70.55 TACGACCTGATAACTGAAAAAAGAAAAATGTGCAACGAAAAGCAGTGGATTTTTGCGGTACGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chrX 9864916 5' + hobo 60 1 58.90 GACAAAGAGCGCTGCATACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr2L 2518577 5' + jockey 70 1 58.22 AAATTCAAGATCATAGGCTTAGGTATTCTAAAATATGTAAAATAACATTTTTTATTAGAACAGGTTTATTATGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCCATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGC:1 + chr3R 24690238 5' - R1A1-element 207 1 50.00 AAACTCGTATTATTTTTGAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAA:1 - chr3L 23839762 5' + McClintock 21 2 70.55 GATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAATAGGTAATAAATTATTGGAAATTTTGCACTCCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTT:1 - chr3R 2412144 5' + R1A1-element 190 1 58.90 AAAGCTAAACAAAGTTGATTATTTTATAGTTTTGAATCAATCGAAATGGGCGAAAATACATAAATATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 - chr3R 15453778 5' - Transpac 260 2 55.48 GTACACAGAGCCACTATAGCGATAAGGTGCGAATGCTATCAGGGTCCGCAAGTACCCCACATATATGTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 + chr3R 8810627 5' - 297 349 2 57.53 TAATACTTATGTAATTTTTAATTAAAATAAAAAATGTTCTTGTATCATTTCAACCTCAATTGGATTGTATCAATTTCTTAAGCCATTGTTCCACCATAATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 7305864 5' + 412 7073 2 71.92 GGCCCGCAGCATATGGTTATACTCGCGGGGGCTGTGGTCGACTTTAAATGGAAATTTAAATGATATTCCAGGGCAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTGTTGAGTGAAGT:1 + chr3R 6578642 5' + F-element 60 1 50.68 ATTCTATCAGCGCGTTACTGCCTATTATTGCGCTTTTACACCCAGGTGCACTTACGAATTCATATGTACATGTGTATGTATATGTGTGCGTGCGCCTAAAAGTGCATGCAATTTAAAATGTGAATGTGTTTTTTTTTCTTTTTTGT:1 - chrX 3080999 5' - gypsy7 5008 1 56.85 GCTAAAGCTGTAAATATTGTTGCTGCCTGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGA:1 + chr3L 11296559 5' - P-element 2793 1 21.92 TGTTACTGGTCCTATTTTCCATAGAAATTCTCAATTGCGGCCAGTGCACAACAAAATAAACAAACCAAGCCACCTACAGAAATACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTA:1 + chrX 17508784 5' - Burdock 222 2 63.01 CAAATAACTTACAGTTACAGAATGCTGCCATTATGTTTTCAATATCCGCAGTAATTCCTTGATTTATAGACCCAATATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:2 - chr2R 18467279 5' - roo 401 1 77.40 CAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3L 16523210 5' + jockey 18 1 56.76 ATACTTTTGCTGTTGAAATATTCGGGGTCGGGCCCGAGCCATTGAGTTTAATATAAGAGTTTGTCTGCAGCTCCTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGTTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATC:1 + chr2L 8807818 5' + HMS-Beagle 41 2 57.53 ATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 + chr3L 13546572 5' + hobo 80 1 75.34 ATAATAATTCTTTCCCTCGACACTTTTGACTGGGATTGCTATAGAGGTCTTCGAGAGAGCCTGAAACCAGCTTTTTAGCCAGCACGAAGAAATCGTGTGCAAAATATCGAAGGGCGTTACCCATCTTGTTATTCG:1 + chr3L 23250417 5' - 1360 11 1 74.81 AATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTT:1 + chr3R 19589927 5' + BS 5070 1 67.12 ATGCCTAAAACGACGAGAAGAAAGACTCAGAGAGCGGTGTATGAACCCCAAAACCCCTGGGGTTCGCTGCCCCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 + chr2L 17574340 5' - hopper 1370 1 50.68 CAAGGAGCTGCATTCCCAGTGCCGTTTCGTCTCCGATGGTTAATGAGTTATGTCAAAGGAAAACAATGTTTGTTACTTCATTTATATGCCATTATTATTTGTATAATATTCGTATATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGCTT:1 + chr2R 10915589 5' + F-element 20 1 68.49 TTCCACGAGGCTATAGCAAAGTTTAACACCCAACTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 - chr2L 15096935 5' + jockey 4758 1 77.24 TTTTTCCTGAAATTTTTTTCTATATATTTCGTATATATATATATATATAACGTGTAACGTAAACACGTACAAGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 12547808 5' + hobo 17 1 68.49 ATTAATAAGTCAATGCGTTGACAGGAAATGATGTTTTGCTATGGCGACAGGATTGAGATTCATTCATTCATTTATTTACAGCTAACAAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATATGCTATGTGCGCACGGGTTTCCGGCCCGATGCT:1 + chr2L 17197697 5' - Gypsy6A_LTR 70 1 51.37 AGCTAAGAAATGGCAAGTCTGCATAACAATTGTGTCATAAAAGTTCAGAATGTTTAAAATTAAATGTTCTTCTATCGTCGTCTTTTCCGAAAGACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAG:1 + chr3L 26169647 5' - diver2 202 2 65.00 AACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGC:1 + chr2R 17872483 5' + Tirant 8179 2 64.83 TTTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACA:2 + chr3R 15035061 5' + Stalker2 7319 2 64.38 AATGCGGGGTAAAAACGGGTATGCGGTTTTTGTGGTTCGATGGCAGAATGTTGCTCACCGAGCAAGTGGCCAGCGGAAAAAAAAACAAGCAATGCAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:2 - chrX 3637902 5' + roo 8690 2 67.81 CTGCCAAAAAGAGCTTATTTATGCGCATATGAACAGCTCGAAGGGAGTCGGACTTTCGCCGGCATTCGTAATTGACTCACCTTTAATTTGATGAAAGCAGGAGGTGGTTGGTGGTGTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAA:1 + chr3L 10138287 5' + F-element 490 1 70.55 GTGAGGGAATACTCTGTGCGCATTAGCTTGGCTTGCCTAAGCAAATATTAACCATCCGCCGTGTAAGCCGCGCTTTTGCTCAGCCACTTTTTTAATAATAAAAATTTCATTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAA:1 - chr3L 13568114 5' - copia 243 1 77.40 GCTGGGCATCACCAGAGTTTTCTAATATTTTCCTTTTCCCCTATAGAATTCTCTTTTGGCATGAAAGTATATATGTATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATT:1 - chr3R 12952970 5' + micropia 5004 4 53.42 TCCACAAAATGGGGCACAAACATAATGCCGGTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGCTGTC:1 - chr2L 3393819 5' - Stalker2 322 2 71.23 GAGGGGATCCGGATGAGGAGAAGGATGCAGGCAACTTAAACTAAGGCTGCGATTGGTGACAGTTTGATTGATGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 - chrX 998237 5' - copia 206 2 52.05 GTGTGGGTGCTTAAATTGGTTTCGTGCTTTCGTGTGACGCGTGCGGAGGCGTGTAAAGCCCGGCGTGTTGCTGTGTAAGTGTGCTGAGGCTGAGGGTGTGTGCGTCGGAGCGTTACTAGAAGGAGTTCGGGACTGAGAACGCGCGG:1 - chr2L 19012069 5' + gypsy8 440 1 71.23 ATCGGGGAATATGCAATTGCAAATGGCGAGTTAAGCAAATGTGCAAAATACAATTTTCGCATTGGACCGCATTTTAATTTTGTTTTATAATTTCGCAAATAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 - chr2R 20117430 5' - mdg3 227 2 73.29 ATTGTCACATTGTTTTGGGACACTTTTCTGCGGCTCAGTGGCGACGACGACTGTGGCAATAGTTTTGTAATTAGCTTGCGATGTCCCAGGTGATAAGTGATATTTAAGGCACTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2R 18785892 5' + roo 11 2 51.37 AAAAGAAGCGCATTATAATAATTCTTTCCCTCGACACTTTTGACTGGGATTGCTATAGAGGTCTTCGAGAGAGCCTGAAACCAGCTTTTTAGCCAGCACGAAGAAATCGTGTGCAAAATATCGAAGGGCGTTACCCATCTTGTTAT:1 + chr3L 23250403 5' - 1360 14 1 76.71 AAATCTATTTGTTAATATTAAAGATTTTACAAGGTTTCAGAATGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCG:1 - chr2L 7167334 5' - flea 4940 1 69.86 AATTTCTAATGGCAGTAACGTAGGAAGTTCGATTGGTTACAGCTTACAAATAGTAAGATTTATAAGCAACATCGACCAAATATTAAACTATACATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr3L 19510454 5' - pogo 2074 1 66.44 GGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAG:1 + chr3R 19537471 5' - hopper2 1555 1 52.05 CAAAGGAAAACAATGTTTGTTACTTCATTTATATGCCATTATTATTTGTATAATATTCGTATATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAA:1 + chr2R 10915642 5' + F-element 73 1 63.70 AATAGCTACGCTTCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 - chr2L 15057249 5' + hobo 60 1 66.41 ACGAGTTCAAAAAGATATTTTTGACATTATTATTAAACGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTCCAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGGGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3R 19445322 5' + roo 8747 2 73.97 GGGAATGAGTGCGTGTAAGAGGTTACATCTCGTAAAGTGTATTTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTT:1 - chr2L 13763556 5' + Bari1 81 1 70.55 GGAGCCGCAGCAAAGGAGTGCGGCATGTGTGCTTGCCAAACTTGGTTGGCAAACTCTTTTTCGCTTCCAGCTTGATTAAAATTTCATTAACAAAGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr3L 6014900 5' + jockey 34 1 65.75 TGGCCAGAAACTAAGTAGGCCAATCGGGTGATCTTGATTAGAAGTCATGCTGGTTAGGTATGAAGTACCTTTAAGTATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAAC:1 - chr3R 29901162 5' + flea 41 2 48.63 TACAAAAAGCAGACGAGCAACAACAACTGGCTAAATAAAGTGGGCGTGTTTCTGATGGCGGTCGTTTTTTGCCCTTTGTTGTTGTTGCTATTGCCCACATCATAGCTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGT:1 + chr3R 19500582 5' - jockey 4976 1 72.60 ATATGTACATATGCAAAGATAACTGTTTTAATCAGGCGTTTAGGGTAGTTGAAAACACGAAGTTTGTGACTATTCTCGATTTTTACAATTATTTATTTCGCTTAAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAATCCTAA:1 - chr3R 4947898 5' + Tc3 1687 1 64.38 AATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCG:1 + chr2R 4260436 5' + micropia 5202 1 40.83 CAAGAGAAGAGCTTCTGCTCTTTATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAGTGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTG:1 - chrY 3648935 5' - Stalker4 7167 4 65.75 TATGCGCATGCCCCCGATTCGCGGCGATCCAAAGCGATCCAAGCGGATCCGAACGATCCAAGCCGATCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr2L 8700063 5' + P-element 52 1 44.52 GCCAGAAACCGCAGCGAACAGAAAGCAGACATCCTTTAACAATTATTATTCAATATTTACAGAGAGATATGAACCGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCATCCGATAAACACTC:1 - chr2L 12767082 5' - hobo 2909 1 58.27 GAGCCCATAGGATTGGCGTTTCCTGGGGTTTTCACTGTTGAAAAGAATGGTTTACTATGTACTATGATTTTACTATACATGATTAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:1 - chr2L 10843100 5' - I-element 5320 1 60.96 ATGGTGGCAAAGCAACCCTCAAGGCAGGGTAAGAGGAAAGTTTGTGCCACTTTTCTTTTTCTTAGTATTGCTGCTGTCGCTTTTCCGCCTATATGTATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGGTCTCGGCACT:1 - chr2L 9109985 5' - opus 479 2 63.45 GAGGATCACAGATAAGCTTTGGAATTTCACCCATTGATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACTCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTAC:1 + chr3R 8293503 5' + Stalker2 7282 2 60.96 CTTCTAATCTACATTTGAGGATTGTCAATCTGATATTAATAAGCTTGAAATGGCTTGTGTTCCGATAATATCTTATAATGTAACATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr2R 8374993 5' + roo 33 2 60.27 CCAGAATTTGGCGATAAAGAAGATGTCCGATCCACATCCCATGTGGAGCTATAAAAGCCAAGCTGTTACGACTCCAGCTCCGGCGCCTGGGTTGCGACAGCATGGAAAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTG:1 - chr3L 18808912 5' - R1A1-element 5139 1 73.97 TTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTCCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAG:1 + chr3L 23112566 5' + R1A1-element 5328 1 65.07 ATTGAAATACTTTAACTGAACTTTAAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chr3L 22635794 5' - hopper 1373 2 56.16 ATCTGCTTGCTCAGAACTCAGTGTAAGTGCGAATATGCGAGAGAGTGTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAATGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTG:1 + chr3R 23346565 5' - Rt1a 4995 1 66.19 CGGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTA:1 + chr3R 19537470 5' - hopper2 1556 1 51.37 GACGTCGACGTCGTTCGTTTGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGCGCGATTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 + chrX 1831267 5' - P-element 2814 1 20.34 AAAGGGGTGCCAAGACTGAGAGAGATCATAGTGCCACTTTTGTGGAACTATTCTTGTGCCCCAACCTGTTGAAATGCTACATATATCATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:1 - chr3R 29952823 5' - invader4 301 2 65.71 AGCAGCTCCAAAAGCTCCCTATCTACCTTACTCTCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCTACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chr2R 16031417 5' + hobo 67 1 71.43 GTGTTGGATTCATTTTGGCACTGGTTCTGCAATGCAGCAACTTAATTATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGCAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAAATTTGAATAGAGCTA:1 - chrX 3454818 5' - hopper 1021 1 71.23 AAGTGGCCTTCTTTCGAGTTCAGTTTCAATGGCCTTTATCAGCTGTTTGGCACATGGCGTTGGAAGTGCGGGTGTGTGTATGTATGTAAATAGTATGTACAGTACGTACGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr3R 17079555 5' - 1360 3376 1 76.71 TTTTGCACTTTGCGACTGCCGCTTGCATTAATATTTATATTTATATTTCCATTAGTGCGTATTTTTATCTTGGCCCGACATCTGATAGCCCGAGCTTTATTTATTTATTTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 - chr3L 2490442 5' + F-element 28 1 77.40 GTTAGAATGTTTCCAATATCTGTTCAGCACATACAGCCGAGGGCAAGTAAGTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAA:1 + chr2L 3393753 5' + Stalker2 7317 2 63.70 GCAAATCACAGTTGCAGAACGCCAAAAGAACCGAAAATCGAAGCCAAAAAAGCGTTTGCATATATTCAAGTATAAACATATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 + chr2R 6713813 5' - 297 6939 2 61.64 TATTTTATAACTATTAAGTGCTCAAGTTTGTATATATGGCATAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGTTCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGC:1 + chrX 13558195 5' - mdg3 169 2 68.49 TGTTCTTATTTCATCGAAATTGTAATCGAATCGTTATCAATAGTGCCTTTTTCTATATTTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAAT:1 - chrX 8037763 5' - Quasimodo 7307 2 62.33 ATTCGCGGAAACTAACCATAAGCTATTTAGTTACCCAAATGGACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGA:1 + chr3L 5425467 5' - blood 7312 2 71.23 ATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTT:1 - chr2R 23592060 5' + micropia 5083 4 57.53 TCAAAAGAAGATACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 - chr3L 19938562 5' + roo 8732 2 67.12 ATTTATAAGCGTGAAATTAATTCAAAAGTATCTTGCAGATACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTGTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 19907517 5' + hobo 29 1 65.75 GCAGAAAATTATATAATTTTGCAATTTCAATTCATGAGGCAGAAAAAGTGTTAGAAAGGGGCTCCATTTGAATTTCGGAAAAAATCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 12540597 5' + roo 35 2 63.45 TTTTTACACTTGCCGCCTTCAAATGACATCCCCTGAGGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr2L 9109864 5' + opus 23 2 57.78 ACAGTTAGTAAATTAAAGCAAATTGTCCAGCAAGAGGGTTGTTATGACGATATATGGTCCGATCGCCCAAAATTTCAAAACACTAAAAATACCCTAAATAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTT:1 - chr3R 2081337 5' + F-element 133 1 72.60 AAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 - chr2L 2518547 5' + jockey 83 1 75.97 CGAAACAAGCCAGAAGTTAAGTGTCTCTGAAAGTTAGTTGCAAATATTTTAGGCTTATTTATTGGTTTCTAATCGAAATGTTAGTAAGTAGTTAGTTAGTTGCACTTGACTATCAATGACTTACTATTACTATTATTATTAATATT:2 - chrX 7377149 5' - mdg1 7075 4 73.29 ATGCGTCTCGGCTTTTGTGCACAAAAGTAAACGAGCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATAC:1 + chr2L 1892297 5' - hobo 2854 1 74.48 ATTATTTCTCCATTGTTGGCTGATTATAATAAATATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGCGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTC:1 - chr3L 13365108 5' + Juan 71 1 61.64 TTATGATTTTAATGGTCGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2L 19907636 5' - hobo 2893 1 60.00 CTCTCTCTCTCTCCGTGCACCGATCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - 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chr2R 3091650 5' + F-element 334 1 76.71 GGATACGAGAGATAACCATTATAACAATTCGAAGGTCCGCGTTGGGGTGTAAATCCAGTCTCTCGTGTGATTTTTTTGGCCATCTTCTGGATTTTGTCCCCTATTTTTGTGACTTTTTTGTATATATTTATTTATTTAGAAGCGAT:1 + chr3R 5732852 5' - BS 5085 1 78.08 GATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAA:1 + chr3R 8293538 5' + Stalker2 69 2 62.33 CAATGTAATAGAGCAATCTTTATCAAAAATGTCGTAGTATTATTGTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:1 + chr3L 11228085 5' + pogo 73 1 69.18 TGCCAGCGCAGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr2R 18266087 5' - roo 328 2 72.60 CATGCACAAAGCAAGAAAATAAAGAGAAATATATCTATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCG:1 + chr3R 8884324 5' + HMS-Beagle 6878 2 75.34 TAATGAAAGAATTAGCTTGTTTTGTACTTTAATGAATGTCTAACCCTTCGAAAATCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr3R 13411802 5' + roo 8729 2 64.38 GGAATGACGGCTCCTGCAAACGCTAACACAAGGATGTGAGTCCTGGGAAGGGAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - 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chr3L 18029233 5' - Gypsy6A_LTR 215 1 56.85 GATCTTATCTTATTATTTCATATCAATCGATAAATCTTTAAGATGCTTCTAAATTGTAATCTATTTTTGACATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 18860753 5' + roo 50 2 54.11 CACGACAATAAAATATGTAATTGAGCTTCTATAAATAAATTTACCCTTCAAGCTGCATTTGATACATAAGAATATTTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGAGGTAG:1 + chr3L 25268622 5' - Cr1a 4247 1 51.37 ATCTTGGCAATGGCATCAGCTCACTGGCCAAGCGACTGACTCGCGTTTGCCACTTCTGCCCATTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCT:1 + chr2R 19067200 5' - Quasimodo 303 2 55.40 TAATAAAAGTTAGGAAAACTCAGTGTTAAAAAGTCAGTCTAAAAAAGTCATGAATATATATATATGTATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATT:1 - chrX 19766826 5' - copia 5070 2 58.22 CATGTCTGTAAGTGAGTTCCCAGAAATCCAATTAGTTGGAAGAAGGGTGTGGGGCTTATGTAACATGTTAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTAAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 18954237 5' + roo 8714 2 52.05 ATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:1 + chr2L 951335 5' + F-element 97 1 77.40 TGGACTGCGGCGGAAAAAGGTGGGCGCGCTATATAACTTTAGCGCAGACTCGAACCCGAATCCGAAACCGAGCCGGAGAATTCTCTCTCTCTCAAGTGTCCGGTCCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCC:1 - chrX 13642166 5' + P-element 16 1 75.34 GAGAGGAATGCGAACGCAAGGGAGTTTTTCAAAAGGAGTCTGCTCTATATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAAATATGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1 - chr2L 21082238 5' + mdg3 5295 2 56.85 CTCATCACCTACAATAGTTCTGTCATCGGCACGATGTTTGCGGCATTAGCTGGCAACCCTTTCCCCAAAAACGTCAACAGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2R 8467704 5' - roo 9031 1 57.53 GAGGAGAGTAATCTCAACGGAGTCGTCGACGATGAATAATATTTTGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATACATTTTTTCAAAATTCTAAAGGA:1 - chr2L 23022987 5' - FB 232 1 76.03 TCGACAGCATCTCCGTGCACAGTCCTACGTCGTTTATATTGGGAGGACCGAACAGCACACCGCCACTTAACTTGGACTAACGGATGCTCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATT:1 - chr2R 5707991 5' + 1360 190 1 61.64 TACAAATAAGATTCCAAGATAATAATAACAATAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCCTAG:1 - chrX 21668921 5' + mdg1 7144 2 76.71 GTTGATGTGTCATAGGATCTTTAAATAAAGTTTGGTCCTAACTACAAAGGTATTTATTTATATTTTTTTTGGGACTAATTCTGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chrX 10838484 5' + roo 8702 2 60.27 ATGCTAAGAGCTGCAAAAAAAAACCGCCCTTTAACAGTTATTCAATTTGTTAACGGCACTTTTCACTGCATACTTCTGGGGCACTATAAAGATTATCACGGCACCATATTTGAAATCGATCTAGATCGGATTGTAAGTCTAAATGG:1 + chr2L 8433757 5' - Q-element 624 1 62.33 CAAAACACTGGTTGACTTTTTATACGCTTTCAGAGGGCATCTCGATTATATCCAGAAGTTTGCCAGACACATTTGCGACCAAAAGAAGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACA:1 - chr2L 10685911 5' + Quasimodo 32 2 64.38 CATAGACAAGAACATAAGTGAAACACAAACTAAAGTGAACTTAATTAACAAAGTTTTCAAATCCGTATATCAATTAAGAGTGTATATCTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGC:1 - chr3R 26693472 5' - Stalker2 7619 2 59.31 AATAAATTAGTAAATATATAAACGCATATACAATAAAACACGAAATCAAGGAGTAATCAGTTTTCAATTTATAACAAACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 7136553 5' - roo 9028 1 51.37 TTTATGCCTTTCACGTGGCTATGGTGGCAAAGCAACCCTCAAGGCAGGGTAAGAGGAAAGTTTGTGCCACTTTTCTTTTTCTTAGTATTGCTGCTGTCGCTTTTCCGCCTATATGTATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTG:1 - chr2L 9110005 5' - opus 498 1 76.71 AGATGTCCTGGGAAGCGAAACCGTACGCTGCGCGGCCGTGCTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 - chr2R 2102269 5' + Doc 66 1 91.11 CTCGCCAGTTCTCCCTCAGCTAACAGCTCAGAGCTCTCGGTTTTGTTTTGTTTTCTTGTTATGATTTATTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAG:1 + chr3R 21591335 5' + Juan 4078 1 52.05 GTTGTGGTGGGGGTTGCCGCTGTGGAGAGTGCAAAGTGCATGAAACTGAAACGAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGTCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACTCTCTTCT:1 - chr3L 1983575 5' + Transpac 9 2 75.00 ATTATTTTCGAGTTAGCGTCAGCATAAAAAAAAGTCAAAACGCCTTGTCTTCAGTTCGATGAGGTTTCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr2L 16360671 5' + hobo 54 1 55.48 TACGTCTTCCTAGAACAATATATAGATTTTTAATAGACTTACCATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 + chr2L 21082137 5' - mdg3 167 2 70.34 GGCAACAACTAGTAAGTAATATGTTCATGCGATGAATTCGAAAACAAACAGGCTGCAAGGCGCTATGAAGCCAGATTGAGTTTACAGAAATCATACCGTAGGCCCAATGATATGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGG:1 - chr2L 4315637 5' - I-element 5042 1 77.24 GTGAAGGAATTCCAAATAACTACAAATTCAGCTTAGGCACCAGAGACCTGCAGCCCGCCACTCGCCCTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr2L 10128152 5' - hobo 2917 1 53.01 TTGATTTATGATGTTTTTGCTTCTCCTTAGTTAGCAACGTTCGGCGTGAGCGAGCGGAAAGACAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTA:1 + chr3R 2520452 5' - 1360 10 2 70.92 GGACCACTGTGCTAAAACCCAATTACAGAAATGTAAAATATTTTGTAAGTTTGTTTAATTCAACTTTAAGTGGAAAGTTCTCAATACATTCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGGTCCAAGCATAGTTCTGCGGATAGCTA:1 + chr3L 26851722 5' - Cr1a 4011 1 63.70 TAGGGATGGAATCGGCCCTTCCACATTCATCCTTCGCCTACCATGTCCTGTTGACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chrX 16995001 5' + jockey 23 1 70.31 TCATAGAAGAGCAATATAGCGTTTTCCTCTGTGTGGCTGTTGATATAAGATGAAGTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr2R 6713948 5' + 297 6613 2 58.40 ATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 + chr3R 11873367 5' + 412 7141 2 78.08 ATTATTTTCACCTCTTTAACGAAAACAATCTTCGGTATATCCTGTATGTATATCGATTACAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chrX 10344760 5' - roo 9010 2 59.59 CGGGTCTACGGACGCCTGGAAGCCATGCTCATGGGATTGCCGGCAGATGGTAAGAATTCAACTTCGAATGTGAATTTCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr2R 12416824 5' - pogo 2060 1 57.53 GTGGCTATACTTGAACCAGGAGAATCAGCAGCAGTAACGGCTAAAGCAGCAGTTGAAAGTCCTCACCCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 + chr3R 12781473 5' - pogo 2050 1 54.11 AAAGTGAATCTTTCACATACGCCGTGTACTCTCTCTCTCTCCCTGTCTCTCACTTTGAGCAACAAAGATTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr3R 7109123 5' - P-element 2837 1 51.37 TTGATTACCAAAACTAGCTTAAAAACCTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1 + chr2L 3150990 5' - blood 7369 2 66.40 AAATCGATACGCATTTACGGACGTATACTCGGAATATCTACATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTT:2 + chr3L 21765378 5' + gypsy 24 2 69.18 GGCAGCCCCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3R 5767387 5' + roo 81 2 73.97 AGAGATAGCGAGATGGCCAAATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 - chr2R 15892227 5' + hobo 57 1 59.44 GGCGAATCGTAAGGGTCAGTGGAGTCGGTGGCCAGCCAAGGGCAAATAGGTCGAACGGTAGCGGTGCGCGCG:1 + chr2R 4876694 5' + gypsy8 4878 2 56.94 AAAAGTGTTAAATAGAAAGCACATACAATTTTATGCAACCCAAGTGGGTGGCTGCCAGAGGTTCAACATTTGCCCACCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr2R 13772989 5' + opus 7041 4 59.59 CCCTGCGAAAAGCGCGAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr2R 17872461 5' + Tirant 39 2 55.22 ACGAGCGAAAGAGATAGCGAGATGGCCAAATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chr2R 15892236 5' + hobo 51 1 54.11 TTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAG:1 - chr2R 12185448 5' + accord 31 2 61.64 TCCTTTTAACCATGTTCCCAGCTCCTTTTCTTTGTATTCCGCTCTTATGCAACATCCTCGTATGATGGCGGACGGGCGGTGGCGGAGGCAGGTGCAGTTCAATTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAAC:1 - chr2R 20455175 5' - R2-element 3315 1 50.68 ATTGTTTACAATATTTGGTGGTTTATTAGGAGTGGGTGTTTGTTTTTTCCTTTTTTGCGCACGGCCCGCTCGGGTTCAAGGTCCAACAGTTGTACCGTTAGTTCACGGTACGTCCCCTTTGTGCACGCACCGTTACCGGTCGATC:1 - chr3L 20342065 5' - gypsy8 4876 4 68.97 AAGATCTGTTTAATGTTTCAACTTCAACTTGCACGCTTCTCGTTTGAGTGGCCAACAAATTGCTGATCGAACTCGATACGGAAACGGCTTGAAATCCTTCTTCAATCAAAAACAACGCGTATTTCTCGTTCGTTTCTACGGAAACC:1 - chr3L 18844254 5' + Doc4-element 78 1 63.01 AACAAACCTTAAGTTGAAGACCCAATTTAATTGCTACGTAAATTGCGCAGCTGCTGCGAAGTTGCAAATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chrX 22577974 5' + 297 6625 2 52.74 TAAACACTATGTGTATATATCTTTAGCCCTATTTTCTTTGTAGAGAAGATGTTATTTGTTTTCAAACACAAAGAAACATTTTCCCTAACTGCAATTCAAATTTTCAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTT:2 - chr3L 22638909 5' + Juan 4106 1 71.23 TTATTTGGTGATCTGCTGCGAGTAAACGTGCAAGAGAGAAGACAATACTGGATATACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAAT:1 + chr3L 18591490 5' + flea 4813 2 59.03 GTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTAATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACA:1 + chr3R 8293549 5' + Stalker2 7328 2 69.86 CTGGCCATCATCTGGGGATGGAGGAAGCCAGTTATAGTCGACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGT:1 + chr3R 9657643 5' + BS 25 1 61.64 TACAAGCAATTTAAACTTAAAGGATTACAACATGTTTATAAGCATTTATTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 + chr3L 10733655 5' - 412 7477 2 65.07 CTGAAACAAATTGAATTTATTTGATGAATTTGTTCACGAAATATTCATAACCATAAAATATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:2 + chr3R 25414189 5' - pogo 2042 1 63.01 AATGAAAATGAATGAAACGGAATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTT:2 - chrX 1831290 5' + P-element 96 1 19.86 GATGTCGCAGCTAGCGCTTTAAAAAACTTTCCCGCCGCAGGAAAGAGAGCACAAAAAATGTATATTTATATACATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTT:1 + chr3R 12952845 5' - micropia 406 2 56.16 CACTGCGCTCTGTTACTCTTTTGAACTCCACTGCACTTCACATCCAATATGACCGTTCGTGCTTCCTTAACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGTGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCG:1 - chr2R 544928 5' - HMS-Beagle 228 2 73.29 CTCGCCAGGAGCAGGACATTTTCGTGCGTCTCATCGATTCGGTGACCAAGCAGGTGAGTTCAAAAATATTTCAATTAGTTATAGATGATCTCATTATAAATGGTGCTATAGCTAGCAACGGAACATACATATTATATATATATTTT:1 - chr2R 14793533 5' - Dm88 4366 2 83.56 ATAATATTACACGCCAAGTCAGAGGCATAAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2R 21244845 5' + roo 8712 2 52.74 CGGATCGGAGGTATAGGTTTTTGTGTTTTGGCATCAGCTTGTGATATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCT:1 + chr3L 18420930 5' + jockey 4747 1 69.18 ACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:3 + chr3R 13572032 5' + 412 79 2 73.29 GGACGAAAGGACACTTACAGTCAAAACAGCTCAACTAGCTACCTTAAAACTTAAACAGGAATAAATTCTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 18539774 5' + roo 8717 2 56.85 ATCGCGTATGCGATTACCCACACACAATATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1 - chr3R 25094680 5' + P-element 91 1 23.29 AAACACAAACATTGACTCATACCCATGGCATTAACCATTTACTTATCATAATCGGGGCTGCCTTATTTCAACGCTTTTACACGTTGTTGATGTATTACTATATACATAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAA:1 + chr3R 4570188 5' + Juan 17 1 73.29 TGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACAC:1 - chr3R 9862978 5' + Stalker2 62 2 58.90 AGGGGCGTCTCGCATTTTTGTTGCATGCTTACAATCAGATCTGTCAGATCAGTTTCCTCTTCTCGCGGCAGAGGATTGCCTGTTTCGGTTGCCTTTTTGGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTCCAATTT:1 + chr2R 18265966 5' + roo 8685 2 71.23 TTCAGATTGTAGTAGTTCAGCCAGCCTGCCATTAGGTGCTATTTGTGAGAAACCGAAAAGGGAATGATATCAGTTGGACGAACCTTAGGCTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 - chr3R 22572683 5' + HMS-Beagle 6827 2 64.38 ACCTTAATTGGTAAATGTTTAATACTATCTTACGGATACAGATACCGTTCTCTCGATCCGCTCTCCCCAGCTCGCTCTCCCCACTCTCTCTCTCTCCGTGCACCGATCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr3L 13477332 5' - P-element 2874 1 75.34 TATTCATTGTGCGGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr2R 10666948 5' + hobo 48 1 52.74 AACAGCGGCGCCAGAAACCGCAGCGAACAGAAAGCAGACATCCTTTAACAATTATTATTCAATATTTACAGAGAGATATGAACCGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr2L 12767091 5' - hobo 2915 1 60.00 AACTCAGCCTCGATGTTTGGCCAACCCTTCGTGCTGCTGATGAGATGGCTCAATTGAGAGCTTTAATTAAATTATGTTGGTATGCACAGGATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 - chr3L 12729216 5' + opus 7027 4 65.97 GTATGAGCAATATTAATTGTAGCTGAAATTAATCATACGCACCGTTGCAGAGCATGGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3R 30524553 5' - roo 9009 2 58.22 GGCCGTAAAAACAAATAACTTTAGGCACATTATTCGGGTCAAAGTAAATTTTTTCTCCAATTTTCCAATTGTCAGCCGATGATGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGG:1 + chr2R 16017039 5' + R1A1-element 5125 1 64.96 TTTGTTTTTCGATTGCAGGAGGAGTAGGTGAGCCTACAGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTA:2 - chr3L 5948091 5' - P-element 2807 1 30.14 GAAACGGCGGCAATCGCCAAGCTTTTCATTGAAAAAATCTTTTAAGGAGAAAAGTGTTGCATAAACAAGAGCGCCCACAAAGAACTTATGTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 - chr2R 18528822 5' - jockey 4956 1 62.33 GATTAAACATATTACCTCTCCATAATATGTAGATTTCGGACAAATTGTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 + chr2L 22031927 5' + Tabor 29 2 64.38 TAATTGAATTTTTGGTATTCATTGTGCGGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:2 - chr2R 10666963 5' + hobo 33 1 63.01 TACCTCTAAAACCAGAATGCAATTGCAATTATCCTAATTCATCCATTAGCTTCGCTATAGATAAAGACCTAATAGGTTAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTAT:1 + chr2R 15529671 5' - roo 370 1 59.59 GACATTGAAAGACACGATTGGTGTCAACGATTTGAAGAATGAAAGTTCTGTTTTTTGTGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr2L 8909788 5' - roo 347 2 60.96 TTTCAATTTGTGGACACGAAAAAAGTTTTGTTCGCCAAGACGGGCTACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCAT:1 - chr2L 2675047 5' + Quasimodo 69 2 68.49 CTGCTCTTCTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGC:1 - chr2R 7741143 5' - blood 7226 2 77.78 GAGCAAGTCCAATACGGAGGAGGATGTGACTCTGAGGTTCCACTGCCCCAGTGTCGAACGGACAGATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGAC:1 + chr3L 12726073 5' + opus 398 2 68.49 AAAAGAGGAATGAAGTATTAAGCGAGCAGCAACAGAAAAAATTTAATTGAATTTGCACTGCTTTTTTGAGTTCACTTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 - chr3L 780784 5' + Burdock 41 2 54.79 GCCCAAGAAGATCAAGATCGAAATATCTTACCATAACCAAAATAGTCAAGAAAAATGAATGGTACCTGGAATGAGAAAAAAGAACAGTTCTTTGTTATTGTATTGATGTTGATTGTTGATGTTGAAAGAAAATCCGCAGTTGAAGT:2 + chr3R 6938513 5' - gypsy7 304 1 61.64 GAATAGAGTTTGGCCATTAAATTCGAGTGGAATGAATGCACTATGGGACATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATG:1 + chrX 20106339 5' - hopper 1328 1 75.34 CGCAAGGGAGTTTTTCAAAAGGAGTCTGCTCTATATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAAATATGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 - chr2L 21082224 5' + mdg3 5301 2 53.62 CACTGCTAGCAAGGACAATCGAAGCTATTGGTACACTAAGAAAAATAAACGAACTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chr2R 21353277 5' - Transpac 244 2 63.01 TTGCATAATTCCAAGCTGGTAACGAACGCGATTGTAATCGATATACGATACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 - chr3R 29997702 5' - P-element 2812 1 33.56 TGCGCAGTGAGTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAG:1 - chr3L 3540261 5' + mdg3 5272 2 70.55 GATGGCTGCATAAAATCATAGTTTAATACAAAAGTAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGGTGTTACAGCAAGTGAACATAAAAGATTAAATTTCTCTAAGGGAGTTAT:1 + chr2L 18704612 5' + I-element 479 1 76.71 CAACACAATAATTATTTCAGCAGTTTGGTAATTAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTTCACAATGCCTCGCTGCACGAAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 - chr3R 25053079 5' - pogo 2036 1 69.60 AAGAGTATAACGTTAAACCCAAAAACGTTTTGTATATGGCTTTAAATATTTAATAATTGTGGGCAGAGACAGCAACACCAGCAGCAGACGCATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTA:1 + chr3L 7370426 5' - Burdock 6362 2 65.75 TAAAATGAACCGCAAGAAAGACCCCTAATAGACGTGGAAGGTATAAAAAGCATGCCGAAAATTGTCAAAGGGTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTAGAAAAATAACGTTAAACCACACTACTTTATATT:1 - chr3L 3580978 5' + copia 4905 2 54.14 AAAGTATGCAACATAATACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 + chr2L 12861715 5' + jockey 76 1 63.01 TCCATGAGTAATGCGAGTCAATTCGTTTCCTGAAGTATATACAATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACA:1 + chr2L 13976192 5' - I-element 5277 1 68.49 ATTGAAAGACACGATTGGTGTCAACGATTTGAAGAATGAAAGTTCTGTTTTTTGTGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr2L 8909791 5' - roo 9008 2 63.01 AGGGTAAGAGTAATGCCGCGTAACTGTCGTCCCTTTCACACGACCTTGACTGCACTGCAATATATATGTGCACATATACGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chrX 13484231 5' + hobo 43 1 56.16 ATTTGTCTGAAAAGAACGCAATATTATTGGGTTGCTAAATATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chr2R 24021536 5' + pogo 11 1 71.68 GTGATTTTCCACTTGTTTTGACCAATTTGGCGATTCTGTGATTTGTCGTCTTTAATTCCCACAACATTTTTGGACGCACTCGAGCAAAAGTTATTTAAGAGTTAAATGCTTTTACTACAAATCTAAATAAAAATTTAAAAAAAAAA:1 - chr3R 18874028 5' + Doc 4693 3 67.12 GAAGACCTATGAAAAAATATAAAATAAATAAGTAAAAATATTTAATCAACCCTACCTGTTAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATATAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTGGA:1 + chr3L 14604895 5' - Circe 7109 1 64.38 CAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chr2R 14767365 5' + Tirant 8143 2 53.04 TCCTTCTGTTTACCCAATTTTGTTATTTGTACCTTTGACCTGATTATATTTACTCCACGCAACTTTTATCCATATAGTATTTTAAATGTATGTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chr3L 3910431 5' + 297 6601 2 69.86 AATGAGTGCGTGTAAGAGGTTACATCTCGTAAAGTGTATTTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTG:1 - chr2L 13763553 5' + Bari1 84 1 72.60 AAAGTGGCAACAGAAGCAGCATCAGCGAATAAAAACTTTTGGCTGTTTTTATAAATGTTTATTTAGCAGAAAGGAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGG:1 + chr3L 10111747 5' + copia 48 2 56.16 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATAT:1 - chrX 12649914 5' - blood 154 2 81.67 CATTATCGGTTTGATAGTTGACAGTGGTTTTGTTGGGTGCGTGTTGGTTTGTTTGTTGGTTAGTGTACGTGGTTAGGATGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTTGTGGCT:1 - chr2R 7650277 5' - Ivk 5001 1 64.17 ATGTCAGCAGTCATCTCGCGGCCATCTACGCCGGAATACAGCCTCTCCGTTCCGTAGTAATTGTAACCCCCAGCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCC:1 - chr2L 407431 5' + blood 7207 2 64.17 GTATAATTAAATACAATTATTAATTTTTAATGAACTCGTTACATTTATGTATGTGTTTATCAAACGTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chrX 13351698 5' - roo 350 2 56.16 ATGGCATACAATTTATAGTTGGCAATAAATAAATGACAATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr3L 13380400 5' + hobo 26 1 67.81 TTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGACGAGCGTAAGCTCTCTTCAATAAAAAAAAACGCGTATTTCTCGTTCGTT:1 + chr2R 5206896 5' + Doc4-element 66 1 66.44 GCATATATAACGCAAGCAATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAACTCCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAT:1 + chr3L 11887202 5' + Doc 70 1 63.01 TACATTTTCTAAATAGAGAAATTCCCCTTTTTATGTGTGCAAGCAGGGAGCTCCAGAACGCAACTACATAATCCGCATTACCCATACCTAATCAATTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGCCC:1 + chrX 4906109 5' + blood 494 1 65.07 AATATTTCGATATAAAAAGCGAAAGTATTTTGCTTGAACTCGCTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chr2R 10189212 5' + Doc 18 1 69.86 AAAACGGGGAATATGCAATTGCAAATGGCGAGTTAAGCAAATGTGCAAAATACAATTTTCGCATTGGACCGCATTTTAATTTTGTTTTATAATTTCGCAAATAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 - chr2R 20117432 5' - mdg3 229 2 76.03 GCTGGATGTTGAATTATCAGAAAGACGCAAAATTTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCC:2 + chr3R 15157563 5' + invader3 5240 2 56.16 TGGACAAACATAGCGAACTTCTGCATGTTACATAGTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTCCTCTACAAGTAACGGGTATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chrX 21593216 5' - roo 9035 1 50.68 ATGAGGGAAAACAAACAAATGGGCGAATGCGAATGTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 + chr3L 1983403 5' - Transpac 5213 2 74.48 GGCTCGAATTGGCTTATTATGGGGGCGGGGTGTATTGTCCACGGGTTAAGAAACGCTCGGCCTGGGACCACCTTTGCCGATCGTTGTTGAGGACCTTTGTTACTATATAAGGTCCTTTATAAGCAGCATCCAATTTATGTGACTCT:1 + chr3R 2199511 5' - Bica 4707 1 56.16 AAGTGAAAGACATAACTGCGAAAAATATATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr2R 8375152 5' - roo 9041 1 64.38 CTTTCTTTTGGCCCCCACTACGCTCACTGCAATCTGGCCAAGTAATTAATGGTTTATATACACACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2L 16360523 5' - hobo 2922 1 71.92 GAGTGACAATAGAAGGATTATCACAGGGCCAAATTACTCATAAAACCCACTGAAGCCGGAAACTTCCTACTTTCCAGAACACTCGAAATCTCTAAAGATTTTCAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 7624006 5' + roo 16 2 75.34 GATATGAAATGGCTCAGTTTTTTTAATTACCCCTGATGGGGGTCTTTTTCTTCTCTATATGCATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr3R 22676307 5' + 297 53 2 63.70 GCCTTAAAAAGAGGTCTTTTTCAACTTCTCTTGGGGCAATAGTTTTGTAATTAGCTTGCGATGTCCCAGGTGATAAGTGATATTTAAGGCACTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2R 18782256 5' + roo 31 2 40.41 AAAGTTTAATAAGAGCAAATATGATAATTCCAGACCAACCAAAGAAGCACAAAGTACACAACATACTTCTAATAATGCTTAGTTGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:2 - chr2L 17404922 5' - copia 221 1 62.33 GTTTTATTGTTGCTAGATTCACAATGGGCGGTTCTATATCCATTCGATCCGGTTTAGGTCCAGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - chr2L 246676 5' + P-element 60 1 43.15 GTCCGTTCCACTCCGCATGCCAGACTGGAATCCCTGGAGTCGAGACCCGCATCCAGGACTCGTTGTCCTTTTTTTGTGTGGCCTGCCAGCCTGACGTTGCCTTAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1 + chr2L 18848664 5' - blood 364 2 74.29 GCCTTGTCGGAGTTATAAATATGCAATTATGAGCCCGGGCCAAACAACATTGTGCTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTC:1 - chr2R 10773311 5' - 412 429 2 63.70 GGCGCTACCGCACAAGTCAGTTTTTTCCGGGCTAACCTTGAAATCGCTGGATGAATGTATATATATATATAGTCATGCATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTGT:1 + chr3R 15453659 5' + Transpac 55 2 57.53 GCAGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr2R 18266080 5' - roo 8985 2 77.40 AGAAACGTGAGTGAGCCCATTTCTGTTACATCCTTTAGTTTTGTGGTCCCTCACCAGAGAAAACAAGAATTTATGAACGACCGCTTGAGTCAAAGTGATTAACGAACAAGCATGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATA:1 + chrX 1394709 5' + jockey 302 1 76.71 CAGAAAGCAGACATCCTTTAACAATTATTATTCAATATTTACAGAGAGATATGAACCGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCCA:1 - chr2L 12767064 5' - hobo 2900 1 50.00 GGCTGCCAACAGGAAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGGGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 - chr3R 13572102 5' - 412 7517 2 51.00 AACAAATTTGTGTATTTCCTTTTAAACATAATTAACTTATAATTTGTTTGTCACAGTTCACTTCGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGGTGGTGAACAAATATTGTGAGTTCTATAAGAGTGCCGTGGGCGCCAATTAA:1 + chr3R 1146422 5' - gypsy4 277 1 79.45 CGTGGCAGTCGGTCTATTTCTGGAGCTAATGTTAATGATGCTGATGGAGAGATTTAACATTAGCTCCAAAAAGTAAAGCCCAGCCAAAGAGAGAATAAAACAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3L 13666222 5' - hopper 145 114 50.00 TATTAAACTAATTACTTCATCAACATTTTAAACTGCCAGCCAGCTTTCTTTTTTAATTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATG:1 + chr2L 2518505 5' - jockey 4924 1 65.75 ACTCGAAAAAATAGCCATGGCTAAGTTAGGCCTGAAAGTGTCGAAGTAGGCAGCGTTCGCATACACACTATCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTATTTTATTTTATTTTTTATAA:1 + chrX 769782 5' + transib1 1904 1 64.38 TTTTGTCGGCGGAGCGCGCAGCGAATGCTCTGCGTGTGCGGCGACGGCGAATCGTCGAATGAAAATGAATGAAACGGAATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chrX 1831347 5' + P-element 39 1 58.90 AACAAGCTGGAATTTCACAAATTTCATTTCAGGCCATTTCACAGCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACC:1 + chrX 17690419 5' + Doc 289 1 69.86 AAAACCAACAGTGCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCAAGTGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATG:1 - chr3L 21765502 5' - gypsy 7373 2 68.49 ACGAACTTCATATAGAGTGGATAGACTTCAATAGTCGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chr2L 11043543 5' + roo 85 2 78.08 AATAGCGATTTGTGATCTGGATTTTCTAATTCACTTTAAATTTGTATTATTTATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCT:1 - chr3R 12569676 5' - blood 7323 1 63.01 GGCGTACATATTGCTCATACGCCACGTGAAACAGCATCGGCTTATTTTCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGTAAGATATCTGCATTATTTTAAGGAAAAATAAAGAATTTATTTCTTTA:1 - chr2R 8492827 5' - pogo 2005 1 48.63 CTCTCATTGCAACTAGCAGACATACGGGATCGGGTCTCCTCCCAGCTCAGCGCAAAAAGGCAATACGTTTCATCTACCATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:2 - chrX 13808111 5' - pogo 2060 1 56.85 AATTACTGATTACTGTTTTAAACAAATGTTAATTATATAAAAAGGAAATACATATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATG:1 + chr3L 11903218 5' + micropia 67 2 71.92 CGGCTTCCACATGGAGAGGCCCAAGTGCACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1 - chr2L 20716403 5' + P-element 91 1 23.97 CTGCCGCATAATGTTAAATTAATACGCCTCCCCCTCAACGCAGCGCCTTCCTTTTCATTTGGTCCCTTAGTCAATTGGCGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCT:1 - chr2L 19841600 5' + BS 38 1 55.48 CCACGCAGCACGCACGTTTTGTGTTCCTCCTCTCCTCCTTTCGTGTATGTTTCTGTTTCTGTTTCGCTTTAGTTTCACTTTCATTCGTCTTCGATCGTCAAGAGCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 + chrX 19506035 5' + P-element 21 1 72.60 CCTTTATGAGGGGTGCTAAAATAAGATCCATCTCAACAACCAGATATGAAAAGCCAGCACACTTGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCC:1 + chr2L 5333380 5' + mdg3 5298 2 55.48 AAGATTCAATAAATATATTTAAATAAAGCTGCACTTCTTATATAAGGCTTAAAATCATTAAACGGATTAATAGCTCAAGTTTTGTTCAATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 7136704 5' + roo 30 2 65.07 ATAAGAAGTTTAGACACAAAATGCGAGTAAATGGGGAGATATAAGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCCGTC:1 - chr2L 15524004 5' + opus 74 4 70.34 ACTAGTTTATAGTCATTAGTGCTTAGGGACGGGGGAGCCTGGGCTACAGGAACGAGGAAATTTATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGCGTTAGTAGGATCTAATTATGTATTAAAAAATTTAAAATCGATTGCTTTAA:1 + chr3L 25479064 5' - Cr1a 4256 1 67.81 AAGATGGCCAGGCTGAGGAAGGCGGTCATGTCTGTAAGTGAGTTCCCAGAAATCCAATTAGTTGGAAGAAGGGTGTGGGGCTTATGTAACATGTTAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3L 18954263 5' + roo 24 2 67.81 CCATTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATACCAAAAATTTTTGAAAA:1 - chr3R 8049024 5' + Q-element 134 2 60.27 GCAATGTGAAATTCATGGAACACGTTCTATGGCTTTGTTTGACAGCTCGGTCGAAAACTCAGGCATCAGTCCTCGAATGCGAAAATGTGTGTATAAATTAATTAAATGTCTGGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCT:1 + chr2L 15934513 5' - springer 365 2 73.53 ATTCCTTGCCGTTGCGTCCCTTCAGCTCCATTGTGTCTTTTTAGTCAGTCTGGCTGTCGTGCGATAAATTTCATAGATGCATTTGGTAATTTTTAATTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTT:1 - chr3L 1397121 5' - Juan 4185 1 61.64 GGCTGGGCGGGAAAACCCGTTGCCGCCTTCCAATCGCGCTTCCAGTCGCTCAATAAATTTAATAATATACTCGTAATTATATTCTCATACGTGTGCCATTTAACTCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - chrX 9865061 5' - hobo 2924 1 70.55 TTTGGGATATCGATAGATATTGTGGAATAAAATGATTAAAAATTTTAAAATTCTTCCAAAGTGTGGTCGTGACCGGTTCTGCGGTTTTAGGGCGTTAAGTGGGCGTGGCAAAAAGTTGTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGA:1 - chrX 23078699 5' - INE-1 302 1 78.08 GCTGCCTTATTTCAACGCTTTTACACGTTGTTGATGTATTACTATATACATAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTT:1 + chr3R 4570244 5' + Juan 73 1 64.38 TATGAAGTTGTACAGACTTCTTCTATAAGTCGAACTGAAAGCACAAGCCCAATTTAAATTCCGGCTTAGAAGAAAAGCTTCAGTTTGAATATTTCAAATGCTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 + chrX 13008648 5' - blood 356 2 71.23 GTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAA:1 + chr3R 19589936 5' + BS 5074 1 72.34 CTATCCCAATGATAACATGGATCTGCATTAAGATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAG:1 + chr3R 7364225 5' + Quasimodo 81 2 76.71 AGTTGCGCTTAAAAGCGTGCTACACTTTCTAATGCTCGAAGCGTGATAAGCTGGCCCCAGCTGACGTTCGTTTTAATGCGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chr3L 939610 5' - hobo 2897 1 60.27 GTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chr2L 5656565 5' + hobo 66 1 68.75 AGGAAAGTTTAGTCGAGTTGAGTCGCTAGTTGAGTATGAAAGAAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCCTATCTTATGTAAATGAATCGCGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr3L 2240485 5' + roo 8737 2 67.59 ATTAGGAGGGAACTGTTCAATCGAATCAATCTATCATAATGGAATTAAAGGAGTTTGAGCTGTTAAGTATCAGGCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3L 2240382 5' - roo 9026 1 54.11 GCTCCTCAAATTTTTATGAAAAGGCAAACGAGGAAAAAATTCACAAAACCATATCATAAAAATTTTAGGAGCGCCAAATTAAAAAAAAGAAAATTTGCAAAAA:1 + chr3R 15658134 5' - FB 174 1 53.40 AGTGACAATAGAAGGATTATCACAGGGCCAAATTACTCATAAAACCCACTGAAGCCGGAAACTTCCTACTTTCCAGAACACTCGAAATCTCTAAAGATTTTCAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 7624007 5' + roo 8681 2 74.66 TTCACATTCGAATGGTTTCTTGTTTATTTCAACTTTGGCGTTGAAAGCGTTTCCGACTATATAAAGCATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAA:1 - chrX 11906346 5' - HMS-Beagle 195 2 56.16 CAAATCAGAAGAATTTTGCTGAATTTTCCGACAAATTGAACTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr2L 12766953 5' + hobo 25 1 64.34 TGGAATTTCACAAATTTCATTTCAGGCCATTTCACAGCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATC:1 + chrX 17690426 5' + Doc 296 1 65.07 GGTCGCTTTGCGGTGCTATTTGGCATTGCTTTTGCCTGTTTACTTGGCTACTAAATAAATTTAAGTTCTTATGCCTTTAAGAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTAT:1 - chr3R 15157704 5' - invader3 5423 2 56.16 ATTTTAAGCCACAAATTTAATTTAGTACACTTGATTTTAAAAAAAAGTACAAACTTTTCGATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCACCAC:1 + chr2L 20928009 5' + Chimpo 14 1 68.49 CGGTTAAATCGAAAGTCATACTTTAACTACAATATAATATTACACGCCAAGTCAGAGGCATAAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2R 21244812 5' + roo 8679 2 71.23 AGTATTTTCAATTACACTTCCCTATGTGCCACGCCCTCTCCCGCCGCCCATCAGGGGCATTTCGCATATTAAACTAATTACTTCATCAACATTTTAAACTGCCAGCCAGCTTTCTTTTTTAATTTATGATGATGTTTTTATTATTT:1 + chr2L 2518439 5' - jockey 4990 1 75.34 ATCCGTTCCGAATTAATTTGCTGCCCGGAAAAAAGGGCGCTAATCTGTTCGCGATGGGCGTTGAACGCAAAAATTCCTTGGTATTCGCCCGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTA:1 + chr3R 11692654 5' - R1A1-element 5180 1 61.11 CAGTTGTTGTTGCTGTTGGAGATCATTGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAATGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATA:1 + chr2R 2666300 5' + Rt1a 39 1 54.11 AAAGGCAGTTATAAAATATTTCGTAGCATACAAAATGGCGCTGCTGCTAGAAAATTCAATTAGCCTGCAATTTTTGGCAACAGCTGGCTTTCAGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAA:1 + chr2L 3677550 5' + BS 22 1 65.75 TTACAAAATTTTTTTTACGTTAAGCAACCAATTAAATGGCTTGAATGGCAACGAACATAACATAACAATAACAGCAACGATGATGGTTTATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTCAACGTCA:1 - chr4 497431 5' - Juan 166 1 69.17 ATATTGCATGCACCATTGATAAATATAGATAAATGATCGAAAGAACACACCATTGCTATGTTTACTGACAGAATTATTTTCAAAAACTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTA:1 - chr2L 19136237 5' + Burdock 71 2 64.38 TGGAAAATAGGCAAATTTCGTTCAATATTCTGAACTATTCGAATTTTTGCCGATGTAGTTCGCGAAAAATGCGTTGATCGCACGCACGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTAC:1 + chrX 22652676 5' + ZAM 35 2 61.11 CTCTTTGATGCTAACTGCTCGTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCA:1 + chr3R 10741053 5' - 1360 3354 1 59.59 TTAAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGACGAAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCCA:1 + chr2L 20985780 5' + F-element 69 1 59.23 GCACACGTCTGTCTCCGTCTCTTTCGCCGCTTCTATGCCCTTCTCTTTTCGTCGGCGTGGGTGCATTGTGGTTTTCCCGCACACACACACACACACACATGTCGGCAACCCGACCCACGGTG:1 + chr3R 10957828 5' + Rt1b 470 1 77.87 TGAAAAAGCGGTGCACTTTTTAAAAGTGTTTTTCTAACTAAATGAGAGCGTGCTCGCGCTTCTTTACCTATGCGGCGCACTCTACTTGTGTGTGTGTGGCGTGAAAACGCGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCTCGTCG:1 - chrX 7930828 5' - P-element 2877 2 78.77 TTTAGCTATACATGATTTCGGAATGCGCATAAAGCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1 - chr2L 1871014 5' - mdg3 5412 2 74.66 TATTTTTTTTGTTTTTTGTTAAATGATATTATAATTACTAATGCTTTTATAGATTGAAAACTTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGCACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTATCTT:1 + chr3R 26031683 5' - pogo 2046 1 54.11 GTTTGATTCGATGCCATGGTTTGTTTATTAACGATTTAGTTTTCAGTGCATCTGGTGTGTGTGTGAAAGGGTTAGGGTCTGGTGGTTGTGCGTGAACTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATT:1 + chr2R 8045964 5' + Cr1a 176 1 65.75 GAGGGGCGTCTCGCATTTTTGTTGCATGCTTACAATCAGATCTGTCAGATCAGTTTCCTCTTCTCGCGGCAGAGGATTGCCTGTTTCGGTTGCCTTTTTGGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2R 18265965 5' + roo 20 2 71.92 AAACAATGTTTGTTACTTCATTTATATGCCATTATTATTTGTATAATATTCGTATATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAAC:1 + chr2R 10915649 5' + F-element 80 1 68.49 TCGGGGGGTGAACGGCTAGCCGTCTAATAATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAAAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTG:1 - chr3R 22162085 5' - copia 4940 2 78.77 GATTGCTAGACTATCACATTGAAATACCAAATTTGAAACTCATATTTGTTTCACTTTGTTATGAGAATCGGGGGTTCCTCGATTTCAGCACATTTAGCTATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1 + chr3L 13475461 5' - HMS-Beagle 7023 2 71.23 TACTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 - chrX 12995412 5' + blood 7068 2 56.16 AGCGACTGTTGCATACTTATGGGTTACCTTTGCTATTCATAACTTACACGGGCCATAAAATATTTATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr2R 22040899 5' + jockey 62 1 57.93 AATCAAAAAGAAGGAAAAAATGCGAAGGTAACATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGCACTTACAAACAC:1 - chr3L 18421394 5' + hobo 81 1 75.91 TAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGAAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCGGTATATATAT:1 - chr2R 12185400 5' + accord 6924 2 69.66 AAGTTCAGAGTAATGGGAACTTCATTAGCCAACAGGTTCCACTCACGTTCATGTATTGGTGCCAACAAAGCTCTGATAATATCTGAATTGGATCTGCGGTCAATTAACTCGGATACATGATTCAGGGTAGTGGTGGGGGTTCCTGG:1 + chr2R 6126083 5' - springer 416 1 76.03 AGTATTTTATTTATTAGATAAGTATTAATTCATTAATCCAGGTAATTCCAGGCAATGAATTCATTTTACAAGTAACAACACCTACTACTCGCAAATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAA:1 - chr4 853226 5' - 1360 305 1 64.38 TTCCGACAAATTGAACTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chr2L 12766978 5' + hobo 67 1 62.33 ACTCGAGTTTTAAACTCTTTCGCAATTCGAACCATGTGCATGGCAAACTGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCCTTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTC:1 - chr3R 9863026 5' + Stalker2 7255 2 78.42 AAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 + chr2L 3151023 5' - blood 345 2 55.77 TTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGT:1 - chr2L 23069852 5' + Cr1a 4154 1 73.97 CACTAATAAGTAAACAGAGAGAGGTAAACATTACTAAGTCAACTTTAACCAAACACTATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGAT:1 - chr2L 1922587 5' + BS 5061 1 64.38 CCAGTGATATCCAGCGTAATAATCCACAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAGTGCATAAATAAATGTC:1 - chr2R 18056896 5' + blood 59 2 56.85 CTGTGCAGTGGGTACTTTAGATATACTTGGGTGTATAATTTTCTGTAATGACATTGAAAGACACGATTGGTGTCAACGATTTGAAGAATGAAAGTTCTGTTTTTTGTGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTAGTT:1 + chr2L 8909739 5' - roo 397 1 75.34 CAGTAATTCCTTGATTTATAGACCCAATATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2R 18467231 5' - roo 9016 2 55.48 TACTATTTGCATGTGTGTCAAGTGTTTGGCAGCGTGCGTTTCATGGCACAAACATTTATGCTAATAAATTGAAAATGCAAATAAACGAAAGTGTCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr3R 11730805 5' - hobo 2914 1 63.19 CACCAAGCTCCTGGCATAGCTGGGAATCATTTTAGACGACATAAACTAATTATCTTTAGATTCGCATATCGATGTGAATAAAATCAAACTGAACTAAAAGTATTTCTAAAAGCTCACAAAGACTCTCAGCGGCCACG:1 - chr3L 25877497 5' - Gypsy6A_LTR 118 1 60.58 ATGCATAAAATAGTTTTCATATATAAAGCAGTGTGTCAACACACAGTGTGTGCTAAGGATTCAAACCTTAATTTGTTTAAATAAGCACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTA:1 + chr3L 15374595 5' + 3S18 5800 2 62.76 TTGGACGCCTGTATAAATAGATCGATATTCGATTAAAACCGGTTTTTAATGGGAGAGTCTATTTTGGTACAGCTAAACATGCTACACATATACCCTTTAATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGT:1 - chr3L 2640012 5' + blood 222 2 67.59 GGTAGGTGTATCAGGATAGCGAGCGGCACACACACATTTGTGTGTTGGCCAGAATAGAGTTTGGCCATTAAATTCGAGTGGAATGAATGCACTATGGGACATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chrX 20106288 5' - hopper 1379 1 59.59 GAAAAGCGCGAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr2R 17872467 5' + Tirant 34 2 55.28 AGCGTATTAATAAAGACTGTCGAAAAATTAAAGAAAGGCTTTAAAGAAGCACAACAGCAACAAAATTAATGAAACGAAGAAGAACAGCTGGTATAATAAATACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 13102821 5' - roo 390 2 73.29 TGGCATTTCATTTTCATTTTCACCAAAATTGTTAAAACTATGTTTGCTATACATATAACCCGAAACGCAACAAAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 - chr2L 20939623 5' - hopper 1369 1 54.79 AAAGCTGGACCAAGGACTAAGTCTTCTGGCTAAGTCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTA:1 + chr3L 26350127 5' - Quasimodo 235 2 76.03 TCATCTTTTACAGCCCGCATCCTTGGCAACCTTTGTGCATTATCTTCCGACTCTCATCTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chrX 10501360 5' + F-element 33 1 58.25 GGTGTGAAAACCATAAAATTCTCATTATTTATAATAAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 + chr3L 12729099 5' - opus 443 2 72.50 TAGATTACTAATCATCTATTAATCCCACCCTAAAAATCGGATTATATAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCG:1 - chrX 17270366 5' + 3S18 75 2 67.81 ATATTATAATGATAAGATTCATGAATCAAGAAAGGATTTGGAGTTAGATAAAAGCATAATAATTTCATAACCCTCATAATTCTCGTATTGAAATACTTGGACTGAGACAAGTGCAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTTTTGGT:1 - chr2R 24421047 5' + TLD2_LTR 170 1 78.08 TGTCAACCAATCAGTGTTTATTTGCTTCTTTCATGTTGGTGCAAATAAACTCTAAATGATTTCAAAGTTATAAATGTTTGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTA:1 - chr3L 11754791 5' + Doc 125 1 50.68 CAACCTCGTTTGAATTGTCCTAACTCCAAAAGTTCCGACCACCGGCCCCAACTGAAAAAAAAAGTATTTACCAAAAAAGTATTTACCAATGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr2L 232329 5' + Doc 34 1 52.05 CCCAACCAGTAAAAAAGCCAAACAATTGTCGCGACAGTTTTTACTTCCAGTATCAAGTTACCCCAGACAGTTTTATGCACAAAGCAAGAAAATAAAGAGAAATATATCTATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACA:1 + chr3R 8884251 5' + HMS-Beagle 9 2 78.08 GCAAAAAAATAAAATAAAAATAAAATACATTCTCCCGTATACACATATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 + chr3L 12087045 5' + opus 7063 4 71.01 AAAAAATATCTTATTAACATCAAAAACGACATAGGATAATAGGATAATATAGGACCATAACTAAAATCAATTGCAATCTTGAGAATTTAATCAAAAAGAAGGAAAAAATGCGAAGGTAACATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chr3L 18421482 5' + hobo 2 1 78.77 TTTGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTT:1 - chr3R 23021008 5' + INE-1 577 1 43.15 GCGTTTAATTAAATTAAAATTTTGATTTTATCGCAACTTTGGCCCGCAGCATATGGTTATACTCGCGGGGGCTGTGGTCGACTTTAAATGGAAATTTAAATGATATTCCAGGGCAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 + chr3R 6578602 5' + F-element 20 1 76.03 AATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTAATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGC:1 - chr3R 21276639 5' - BS 5048 1 47.95 TAAGTAATATTGTAGGGGGTTTGACTGAAGGATTCGTGTATAGTATTATTTTGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3R 18514287 5' + pogo 22 1 68.49 AGTTTCGTAGCAGACGTTGGCCCTGACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCGCACATATAACAA:1 + chr2L 23372481 5' + gtwin 6941 2 68.49 TATAGGCCTGATAATATTATGTTTTTTCATACGTAGAGCTCAATACAAAATTCAGCCAATTTTCAGGCTCCAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1 - chr3R 15154670 5' - mdg1 372 2 54.11 CTAAAATAAATTATAGAAACTAAGGTATTAAATATTAATTTTCTATTTTTTCAGTTCACTTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGA:1 + chr2L 7837395 5' - jockey 4740 1 59.59 AAAGTTTAATTTAGACTTTCGTGTTTGTTTTGGGTGAATCTTAAAATTTATGGGGTACTTTTAAAGGGCTTTGGGGAAATGAGGTATCGAATTTAACTTTAAAAGGAATTAGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 + chr3R 22160811 5' - copia 246 1 75.34 CCAGTAACCAGCTTGTGCGATTACATCTCGATGAGCCTACAGAGCCTACATTATCACAATTTCTTATTGTTGTATATAGTGCCTTAATTTGTTTTTATATCTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 30213246 5' - Tc3 1571 3 36.61 TCTTCAAAATTGTTGACAATGTTTTGCAAAGAAATAATTCTTATTCCAGTGTTGCCAGATTACTTTAAGAGATTACTCAACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:2 - chr2R 11691316 5' + P-element 43 1 56.16 GATTGTATTATTGGAAATACCTACGAATGTTATAATTATTAACGTTATTACATGACAGATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTA:1 + chr2L 8852768 5' - Burdock 196 2 62.33 ATTTTAGCTATTTAAGCTATTGATTAAGCTATTTAATAAATTCATTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chrX 19591237 5' - roo 9000 2 68.49 CAGTTGGCTGGTACCCAAAGGTATTTTCGGAGCAATCAACTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAAT:1 - chrX 409921 5' + copia 248 1 72.60 ATTTCGAAACTTTGGTAAAACACTTTTTGGCCCTGTGCGAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2L 5656523 5' + hobo 42 1 56.85 GTATATTATATATATTTTTGAAATAAGTGCTATTTACATGTAGTTTTACGTTTCTCATTTTAGCTATTTAAGCTATTGATTAAGCTATTTAATAAATTCATTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chrX 19591293 5' - roo 393 1 73.29 AAGCTAAGCCCAGGAAATGAAAATCCTCTGACTTGAAGTGAGGCTTTAAAATGTGAGACCGAAGAGCTTAGGTTGTATTGAAAAATACATACGCAAGTAATGGGAGCGGGGACACAGCATCATCATTAATATGATGAAGCGTGTCC:1 - chrX 11241710 5' + Rt1b 4770 1 69.18 CAAGATAAAAGTTCTATTGACAAAATTAAGGTTTATTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3L 18954099 5' - roo 9037 1 62.33 TCCTATTGCTTTTCCCATTTCCTCGCTGCCTCTTTAAACTGCTGCTTAATGTATGGCCCCACTTCTGTTTTGTGTCGCATAATTACCAATGCCAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 - chr2L 18848847 5' + blood 7038 2 67.12 CGGAATGCAATGCCACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTA:1 + chr3L 10068897 5' + 412 67 2 63.70 GTATTTTTGCCAGTGCAGTACGAGTACCAAACAATTTGATCTACTCCAAGTCTTGTTTGGCCTTAATTAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCA:1 + chr2R 13788425 5' - roo 69 2 53.42 ATATGACTGTGAAATATTTTCAATTTGTGGACACGAAAAAAGTTTTGTTCGCCAAGACGGGCTACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACA:1 - chr2L 2675064 5' + Quasimodo 36 2 55.38 GAAATGCATCCAAGCATTAGTAGCCCATGGAGACTAAAGGGAGCAACATGCATTCCCAATGACAATGTGCTGTGTGCTGCAACGGTGCCAGGCTGGGGGCCCGGGAAACAACTAGCCCAGTCGCTAACGGAG:1 + chr2L 21951621 5' + baggins 275 1 62.88 CTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGGTGTGTGCAGCCGTCA:1 + chr2L 3151016 5' - blood 7344 2 54.03 GCTGGACGATCAGCGGTGGAAGGAAGTGCCGGTGGAAGACTGGCCGTTCCGAGTGGCCGCGGAAGACGGGTACACGCGAATGTTTTATTATTAAGGGGAGGTCGTTAATGAATAAGGTAAAAAGAAGCGGACCACGATGGTTCCCT:1 - chr3R 2894743 5' - Q-element 495 2 50.68 CTCTCAGCTATTATAAGACTAGTCGTTCTGTATAAGAGTGCGCAAAAGTCTCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 - chr3R 9158312 5' + P-element 68 1 39.04 GGCGGAGTAGGTTGAATGCAAAAGTCGCTATCGATGGGTGGGTGTAAAAAATTCATCAGAATGCAAAGGGAGAGTGTGGGAGAGACAATAACAAAAACACAACAAAAAAAACCACAACATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACA:1 - chr2R 15129978 5' + I-element 5196 1 59.59 AAAGTGCCGGAAAGAGAGACTTCTGGTCTATAAGGTCGGTTCGGATGGGGGAAGTATGTACATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTT:1 + chr2L 9228663 5' - Burdock 6333 2 60.96 GCTTAATTAAATATTTACGAAACACCCTTATGTATATGAATAATAATAAAAAGATTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 - chr2R 2052665 5' - opus 7453 2 56.39 ATAGAAAAGGCAAATACAAAAAATAAACCAGTGCCTCTTCATGACCCTCCTGAGGTGAATGCGTGCTCATTTAAGATATGGAGGTATCCTGTTTGATTTATTGTACCCTCTATCGGTACCATGTCTCCAAATCCAAAGTAGCTTAA:1 - chr4 899742 5' - Bari2 794 1 67.81 TTAAATGAGTATACATGTTATTATAACCTCCAAAAATATTCATACCGTTTACATACTTTAAATAGCAAGAAATGTGTTTTTATACCAGTTACTCGTAGAGTATACTAGATTTGTTGAATAGTATGTAACAGGCACAAGGAAGCGTT:2 + chr2L 20923047 5' + INE-1 32 1 41.78 GTGGCTATGAAGCTGGGACTCGACTTAGGCTTAAGTTCCTGCTTGGTCTATCAAGAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - 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chr2L 7894044 5' - Quasimodo 6921 2 72.80 CAGATTTTGCGGCAGACAAATTTATGAGCGTTAAGTGAAGGCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAA:2 + chr3L 16197037 5' + Doc 87 1 70.55 CTGCGCTCTGTTACTCTTTTGAACTCCACTGCACTTCACATCCAATATGACCGTTCGTGCTTCCTTAACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGTGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCA:1 - chr2R 544926 5' - HMS-Beagle 7022 2 71.92 GTATGCAACATAATACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr2L 12861718 5' + jockey 79 1 65.07 TTTCGAAATTTTCGAAAGCGGAACATTGTAAAGTGCGCCTTTGTTCTGCGCATCTCTCCCCGAAATAAAACTTTTTATTTTCACACAAAGTTGTGCAACCAAGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1 + chr2L 17795088 5' - hopper 1394 1 71.23 GCAGTCTCTGAAACTCAATATGTCCAACATGTGTTGACTGCCGCCCCTCAAACACTTTCCCAACAATTTTGTCTCATTCTATCGGTAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAAGGGGTATCTAATAG:1 - chrX 20459882 5' + INE-1 547 1 56.16 CTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAGAT:1 - chr2R 12416940 5' + pogo 69 1 66.44 AAGAAGGTTGTTAAGAAAACCGACGAGGCCCCCAAGACAACTGGATCTGAAAATGCAGACCTCGCTAGCTCTGCACCAAAGGAATAAGTTTTATTCAACATTTGCAGTATCTTCAAAATTTTCGTATTTTTGTATATTTAAATTTA:1 + chr3R 10304656 5' - Stalker4 88 4 57.53 TAATTGAAAATATTCCACATTTTCCCGCTGCCCGGTGAAGTATGCAACACTTTTTCGCCACCTCCTTTCGTTTCCTTGTGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCCACTCACACC:1 - chrX 9949608 5' + hobo 24 1 65.12 AAGTGGAAAGGTATATACTTTGAGAATGAAACAAGTTTCTAAGCAAACTTTAATTATATCCGTTATATCCGGGTATTATAGATTCGTTGAAGAAAGCGTTTCTGACTATATAAAGTGTATATATTCTTGATCACGAGCAATAGCCG:1 - chr3L 17700551 5' + INE-1 88 1 43.15 GCTTGAACTACACGAGGCGAAATGTGCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACTTCCACCCGATAAATACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACATCCT:1 + chr2L 20268956 5' - hobo 2875 1 69.83 ATAATAGGATAATATAGGACCATAACTTAAATCAATTGCAATCTTGAGAATTTAATCAAAAAGAAGGAAAAAATGCGAAGGTAACATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3L 18421447 5' + hobo 37 1 56.16 CAATGTTTGGAGTGCACTTTACCCGGCCAACTTGAAATGAATCTAATAACTTGGCCCACACACACAGACACACATAGATTGGTAGCAAAAACAATGCCCTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3L 17142768 5' - hobo 2924 1 74.29 TAATGAAACTTGCTATTCAAAAAAAAAATTAAATTATTTTCAATTATAAAAACTAACCAGAAAATACCCAGCCGTCTACAAGAGAAACGTCCAACCATTTAAATATAAAAAAACGCACAAA:1 + chr2L 16602158 5' + Tc1-2 487 1 77.69 AATTAGTAATAGTTAATCAGCGATTTTCCATTCGAACATGCATCCTTTTGTGCCGGACTCGTGTTAGTTTCTGTTCATTAAAACATGTTAAACACATAATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3R 12885946 5' + 412 7076 2 68.49 AGTAATGTCATTTTCTTATTTACTTCATTGTAGAATTCTGTAATGCTTAAGCGTCCCTGTCTAATGTTGCGTACAAGTCCTCTTACAGTTACATAGTCTTATTAATAATAAAACATTCGCGTATACTTATGTACGCAGACGATGTT:1 + chr3R 908352 5' + Q-element 570 2 57.53 AAAAGGCATAAAAAAAACCAGAGACAATGCGAGGAAAGCATTACAAAAGTTGCGCCTGCCTTTTTTGCATACAACTTACAACTGGAGTTGGAAAAAAGTAAATCGAATAACATCAGAAATACGAACTGCTTTCGAAAAACGCGAAT:1 - chr2L 13584991 5' + Fw3 2668 1 69.18 GGAGCACATGGCGCTACCGCACAAGTCAGTTTTTGCCGGGCTAACCTTGAAATCGCTGGATGTATGTATATATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:1 + chr3R 15453650 5' + Transpac 46 2 58.22 CCCTTCAGCAGTTAGCAGCCGGGCTAGTTGGGACAGAAACGTATCCCCATGTGAAATGCATGTTTGCATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 5329196 5' + 412 7095 2 51.13 CGCTCTCTCGCTCACCACGTCTTCATTCAGCATCATTCGATTCGATTCGTTCTTTTCGCCCGGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 + chrX 13642021 5' - P-element 2828 1 45.21 AATTAAAGTAATTTGTATATAATTTCGATCTGCATATCGTCTGTTTGTTCGTCCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:2 - chr3R 4352180 5' + Doc 20 1 78.08 GACAGTTCGAAAGTCGCCTCTATTTTGTCCAAGTGTAATCTCCCAAAAGGATCTAAGGAAAGGGTGTGATTATTTTTGGTCTGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAAC:1 + chrX 10502216 5' + F-element 242 1 58.90 AAAAAAGCGATAAACGCTTCAATATCTCATGTTCAGATGCGCGGAAAAACACGTTACGCTGTATAAGAAAAGTCAATTTCGGATTTCGTTTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chrX 5938241 5' - pogo 2073 1 66.44 CGATAATCCTTTCACTCGCCCCACTGCTCAGCAGTCAATAATTTGTCAATATTCAAATAGTCGACCAGTCAATGTCAATGGAGTGGGCACATATGTGCATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 + chrX 1726612 5' - 297 6958 2 73.97 ATTCCTATTATGTCAACGAGTAACGCCGAGTAAGAGCAATGGTGAACTATCCCAATGATAACATGGATCTGCATTAAGATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAC:1 + chr3R 7364179 5' + Quasimodo 35 2 62.33 AAGCTTGTAAAAACAATAATAATATCTGACCATCGATCGGTCCCACTGTGCAGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr3R 17794636 5' - P-element 2843 1 54.86 GTTCCACTCAAATAAATCAAAAGAAATTTTGTGTAAATATTTACACAGCCAGCAAATATTGCACTTGCATTTACAGTCATATATTTTTATGAACTGTGCATTAAGCCACAATGAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 2622590 5' - roo 9063 1 80.14 GTTCAAAAAGATATTTTTGACATTATTATTAAATGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chr3R 19445326 5' + roo 8751 2 80.14 AGTACTGCGCACTTGATAAAGGCTAAACAAAGATTGTCGCTTCCCGCTTTATATAAACAGAATTATTCTACAAAGGAGGAGCCCTCACTTGAGCTGTACTTTGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr3L 1728408 5' + blood 7030 2 72.60 GGCGCGTGCCCGTGAATTAATGTAATTACTCTTGTCGTAGGTTGTTAAGATGGATAGATAGATAGAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTT:1 + chr2L 7596005 5' - mdg3 190 2 53.42 TGCTGAGTTGAAAGTCAACGGTTACTACCCATAGATTTCCTATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGA:1 - chr2R 7343330 5' - flea 4939 1 72.60 ACCGAAAATCGAAGCCAAAAAAGCGTTTGCATATATTCAAGTATAAACATATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTA:1 + chr2R 6713842 5' - 297 6910 2 71.23 ATCATAGGACATCTCTTTAGCATAGATGTAAACGCATTGATTCTTTTTTTTTGTATCCTGATTACTCTTCCATTTGTTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAAC:1 + chr2L 8392558 5' - P-element 74 1 55.48 TAGGTTCAACAAGTAGTACGGTATTTTGGTAGTCTATTTTTTCACTCGGTGCCAACTCAAATTGGCACCGAGTGAAAAAATAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTG:1 + chr3L 24104301 5' - Stalker4 7284 4 71.23 AACTTGGCGAGAATTTCAATAATAATCACAGGATCTTGACATAAACATGAATGTGTAATTACGGGTTATTTGGCATAAGTTCGCTTGGTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGATCGATGTCTG:1 - chrX 9104338 5' - F-element 304 1 58.90 TTCACAAACGAATTTGCGGTTTAAAAGTCTCGTAAAACAAAAACTTCTTGTAAAACCATGATCTATTTTAATCACAATCTTTCAATAATTGTATTGCAATCACAACGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGA:1 - chr3R 8293678 5' - Stalker2 7637 2 72.60 CATTTTAATTTTGTTTTATAATTTCGCAAATAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTG:1 - chr2R 20117361 5' - mdg3 5410 2 77.40 TTAGTGCTTTAATGTTTCATTAATTTGCAATTGAACCGCAAAGTATGCAAAGCCTAATACCTACTTTGCGTTCGGTTAAATGCTGCAGCCTCTTGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3R 6149902 5' + jockey 35 1 67.12 GGAACTGAGATGGGGTTCGCCCGCTTCGCTGGGTTCGTGGCACTTCGAAACTGACATTTGCACTTTTTCCCAGGCCAAAAACCTTCTGTTGTAATGAGAAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 - chr3L 9240509 5' - 412 7520 2 64.96 CCAATAAGGCCTTTTATTCTAAAACTAAAACTAATGTTTTATTAAAGCCGATCGCATATTAACTAAAAAAAAAGAGAAAACGTCATAGTACAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAG:1 + chr3L 19468151 5' - INE-1 531 1 53.24 TTTATAATGCAATCTCCGATTTTCGCCAACCAGAGGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTCTAGTCAGTAG:1 + chr2L 9499273 5' + Transpac 5001 2 76.03 CTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGA:1 + chr3L 3540126 5' - mdg3 177 2 62.33 ACATTTTAAAGCTCCAAGGCAGGAGCTTTTTGCAAAGCTTTCTTTACAGTTGTCTGCTTACAGTTATTTATTGTTCATAATTATCTAAAAATAATCAAGATTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTT:1 - chr3R 17401832 5' + Juan 22 1 67.81 GGTGGCAGGATTGCAGGATGGACTGCGGTGGGCACTTGACAGGCGCTGATTAGGCTCCTTGTTCCTGGCTTTGACGGACGCTTTATTTCTGTGTATTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACA:1 - 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chr2L 19907645 5' - hobo 2899 1 53.66 AGAGTAAGTAATCTTTTCCCGCAAATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr3L 13546544 5' + hobo 23 1 58.97 TATCCCTCTGTCCTCTCTCCCCGTGCCTGTCCCACAATCTTTTGATTTACGACTAGGTTCTTTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGCCCACCCGATAAACAC:1 - chr2L 9988198 5' - hobo 2911 1 56.64 ATACTATGAGAACCGAGTCGCACTTGGCGTTATTTCGAAAGCTACTGAAACTGGCCATGTTGACGATACCACCCCAGCCGGGACCAATGCCAAAGATTATTTAAGATAAGAGGTATATAGTTTATAGTGAATCTACTTGGAACAGA:1 - chr2L 7712729 5' - Cr1a 4106 1 64.38 TTCAACGCTTTTACACGTTGTTGATGTATTACTATATACATAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGT:1 + chr3R 4570254 5' + Juan 83 1 71.23 TAATACATACTATGTATGTACATATATATGTAGTCGTATGTGGTGCGCTTCGTCACTACGAGGAGCGGAGTTTAAAATGACAATAATAGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATC:1 - chr3R 23075580 5' + roo 38 2 44.52 AACAGTCGGGGCGATCGGTTTTTTATTAGTTTCGCTCACAAAGAGCTTCGTTGTTGGGCTTTTTCTGGTCTCGGTCTCTCGACATTACAACAACTTCGACTTGAGCCCCTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1 + chr3L 17895864 5' + P-element 14 1 76.03 TTTCCCTTTCCAGTTGTCAACCTGAGTTTAGGTACCTCCGTCCGTCAGTCGCCTTGACACATTTTTTTCAAGATGGTGAACTGTAAAACACGTTCTCACTTGGAAACTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr3L 11529592 5' + roo 8741 2 69.86 AATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr3L 13380437 5' + hobo 63 1 60.27 ACACTGGTTGACTTTTTATACGCTTTCAGAGGGCATCTCGATTATATCCAGAAGTTTGCCAGACACATTTGCGACCAAAAGAAGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACA:1 - chr2L 10685907 5' + Quasimodo 36 2 61.64 ATCGTATTGCAATTAGCGCGGCTAAAGAGCAGTGGAATAACAATACAAGCGCCAAATGGCCGGCAAACCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 29623332 5' - roo 355 2 53.42 AAAAAGTGGCAAAAGCAAAAAATCGAAAAGTAAAACGGACCAACAAAATCGCAAGGCTCTCAACTGAATTCAACATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chrX 3743740 5' + Tirant 8120 2 70.43 AAACGGAAATCATGATAACAGATAGTGGTCTTGCGGTATTTAGAGAGGCTTATGAGTATGTAGTAGTAGCAGTAGAGTAGTAGAAACAACATCAACAACAACAACATCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGCGCC:1 + chr3L 13778495 5' + I-element 16 1 74.66 TTGCTCAGATTTAATTATGTATCGAGGCGGACTCAGTTGTGTTGTTGCACCGATTTAAAGGCGAACATGGCATGGCATGGCATGGCATGGCAGCCGGAGGTTTTTTGCATGGTAATGATTTCTAGTGAATCTACTTGG:1 - chr3R 24587446 5' - Cr1a 4112 1 63.04 ACTGTGCACATCCGGTTTGGGCAATGATAAGCATTTCACGGAATTTATCGCTGGGCGTGGGCACGCAAGGAGCAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 - chr3L 10069009 5' - 412 7502 2 53.42 TATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTT:1 - chr2R 12185379 5' - HMS-Beagle2 7189 2 68.49 AGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 - chr2R 12416943 5' + pogo 66 1 66.44 AGAATGTTTTATTAGAAAGAATAGAAACTAATTAACTTTTCGAAAGCTTTCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAA:1 + chr3L 11493092 5' - Max-element 8238 2 65.75 TCTCTGCGGAATCCATGTCTTGCCGCCATCCTGGCCACCGGCTCGTCTTTTTTTGCACGTCTGCGGCTATTGACATTAAATCGGCTGTCCGTTTAGAACTAAGTAATACAAAGAAAGAAATCTTAAGAT:1 - chr3L 17299673 5' - Chouto 104 1 62.02 CGCCTCTGTGCTACGCTGCTCGTCTGGCTGCCAACAGGAAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chr3R 13572127 5' - 412 7496 2 52.74 AATGTAAACAGCTGGGAAAAACTGGGGGAATCTGGGGAATGTGCCTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTG:1 + chr3L 19398136 5' + gypsy5 55 2 65.04 AACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - 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chr2L 20068113 5' - roo 385 2 69.86 TAGCGGGAGAGCTAAACCAGGCGCGAGAGAGACAAGTAGAGTGCGCCGCAAAGGGAAAGAAGAGCGAGCATGCTCTCATTTAGTTAGAAAAACACTTTTAAAAAGTGCACCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chrX 7930629 5' + P-element 10 2 78.62 AAAGCGAGAAAAACGTCATGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 + chr3R 25137994 5' + P-element 103 1 15.07 GAATTCTTGAGATAATGAGCGCCACCAGTGATATCCAGCGTAATAATCCACAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - chr2R 18056920 5' + blood 7037 2 66.42 TATCGTAAGAATATCATAGATTTAAGGCAGAGCATTTCAGACAGCACTTGTACCGTTCTAGACTTAAGAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTAAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chr3R 18514445 5' - pogo 2055 1 54.11 AGAAATAACATGTATTTTCTCCCGGTGCATGTCTTTTATGTTCCCTCATTCGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chrX 19162533 5' - pogo 2087 1 72.60 AGGGTGTTCTGGCCGAAAAAAAGAATTTATATATGTGTGTGTGTGTGTTACAGTTATAACAATAAATCAACAACTGCTGGCAGCCACTGTAACTGCAGTCGACTCTCAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - 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chrX 1831302 5' + P-element 84 1 28.08 TGGGCAAAGGAGGTTCGGTCGGTGTGAGATAGTAGACAGAAAGGACTTTCGAGGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTA:1 - chrX 11237467 5' + copia 4797 1 63.70 GTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTG:1 + chr3R 19589916 5' + BS 5059 1 59.59 TCTGAGCTAGCCGCTGCAAACCGTAGCGAGCGAAATAAGAAAATCAGTTCGTTACAACACAAACAGTCACTATAAAAGTTGGACAGCAAGATCGCGTGTGGAAGGAGATAGCGCGTCGGAGCGGTACCAGAAGGAGGTCGGGAGTG:1 - chr3R 3379488 5' + gypsy8 429 1 52.05 ACCCATATATAATATAATTCAAATCTGGGGTTACACAGTGGAGAGCGGCCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGAT:1 + chr3L 25272484 5' + 1360 19 1 76.03 AAGCCTAATACCTACTTTGCGTTCGGTTAAATGCTGCAGCCTCTTGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 - chr3R 6149853 5' + jockey 85 1 68.49 AGATTCTGGGCAGGTAAGAATCGAACTACACTTGTCGTGAACTCAAACCTCTTATCAAATCCTTTTAAATTCAGTTGAAGAGTAATTGATCCTGCACTTAACCATTCAAATACGTTTCTTTCTATTTTCACTTCAAATAATTAAAA:1 + chrX 11696528 5' + TLD2_LTR 96 1 78.77 CTTCCATTTGTCAATAAAAAAATCGACGCGAACATTTTACGTTTTGCCTAGGAGCACATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGTAGTGCGAAGGATGCTAAGTAATACAAAGGCATTTT:1 + chr2R 25089798 5' + HB 41 1 89.74 CACACGCACACTGCCCTCTCGATAAACCGCAACACGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCT:1 - 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FB 702 2 57.53 CTGGCGTCCAGAGCACGTGCACCTCCCCGCAATCCCACTTCGATTTTCCCGACGAGGAGCTGCCCGAGCACAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTT:1 + chr2R 23047108 5' - R1A1-element 354 1 58.02 ATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2R 8375124 5' - roo 9013 2 55.48 GTTTCCCGGCCACGAAAACCGAGCCACAACAGCAGCGTTTTCATGAAAAACCTATTTGCACAAACCTGGTTTTTGTGTACGAATATTCATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3R 29381470 5' - hobo 2909 1 62.94 TGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chrX 3637796 5' - roo 317 2 78.08 ATTTCAGCTGGAAAATACATTCTCTGTTCCAAGCCACGTGTACCAAATTGCAAATTAGTTATTTATGTGTATGGTTTTACGAAAATACGAATAATCAATCCGTATGCTGGATCTTCTATCTTTTATATTTCCTGAGATCTCGACCT:1 - chr2R 18487416 5' - INE-1 143 1 55.48 GCTGAGATCACAACGCACCGAACAGAATTTTCAGAGGATCTCGCACACCAAAGGCTGTTTTTTGGGTTTTTTTTAAACAAATTAAAAAAAACAAAAAAAA:1 + chrX 2517395 5' + Doc 4699 1 86.00 GTAATGACTTTTCTTTTGCTTTTTCCGGTACCCAACATTGAAAGTTACTTCGCTTCAAAGCCTCAATTAATTGTTATTAGACCGGCCCCTAATTTAAGTTAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 + chr2R 10760363 5' - Tabor 7303 2 70.55 ATTACTTGATTCTGCTTCGCATGTCGAGAATTTTAATTTAAGTATGTAAACTGACATTGAATAGTTTTTCGCCAGGGAGCAGCACAGCTCGTTCGCTTAGAAGTTTTTACACTTTAAGTCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACC:1 - chr3R 22175277 5' + 1360 261 1 65.75 AACAAGGATGATAACATCTAATGAGCGACCGGCCAAACGGCTATGCAATCGGCGGCCTTCCTCCACCATAGGCAACCCACCTCTACATATTTATATGAATGTATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTC:1 - chr2L 9228814 5' + Burdock 14 2 70.55 ACTATGCTCCACAACGACTACCTCTAAAACCAGAATGCAATTGCAATTATCCTAATTCATCCATTAGCTTCGCTATAGATAAAGACCTAATAGGTTAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 15529653 5' - roo 388 2 71.92 GTGTGCGAGGGTGCGGTCAAGTCGAAGCTTCCCATATTCGATAAAAAGAAGCAACAGCAAGGCGGCTAGCTGTGGTGGGGACCTTGTGATGAATATAAGCACACTACGCATTAAAATGCTCCATACGTCGTAATTGTCGTCGCCTA:1 - chr3R 19046664 5' - Copia1_DM 357 1 63.70 CAAGCACTACTCCTGCGATCAATATTAAAGCCGAACCAGCGGACAATGGAAACTCACCTGCAGCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr3R 15363533 5' + 412 25 2 65.75 GCCCCAGCTAGTTATGCACATTTTACAGTCTCTGTTTTATGGCAGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCGTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAA:1 - chr3L 19398203 5' - gypsy5 344 2 68.42 TTTTTGTCTTTTTTTTTATTTATTAGTATTATTATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTG:2 - chr3R 17012533 5' + micropia 4964 2 78.08 AATTGGAAGTTAAGTTAGCAATCTAGTTAGACCGCATTTTAATTGGGTTTGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCGCGCTTCGCGTAATCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTT:1 + chr3L 17710599 5' + I-element 71 1 60.27 TCATTTGGCTGTCACAACAAATGCCGAATTGATGCAAATGTAAATGGATTCGATATCCAGGAACGCGCCGTCGGAATCCCAAGCAGCAGTCAAGTGATGAATACAAGTATTTATTGTGACTGCTCTAGAGTACAATGCTACTGCAC:1 + chr3R 22509227 5' - Dm88 4507 2 70.55 AATTCAGGTTATTGAAAATATATTTAACCTATTAAATAAAAGACTAAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr2R 12416992 5' + pogo 17 1 73.97 CTCTCATTGCAACTAGCAGACATACGGGATCGGGTCTCCTCCCAGCTCAGCGCAAAAAGGCAATACGTTTCATCTACCATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chrX 13808111 5' - pogo 2079 1 65.35 CGACCTAAGTGCCCATTACACACGGCAGCCCCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 5767364 5' + roo 58 2 58.22 GGGTATCTTTTCTGTTGAAAATACCTTTTAGATAAGATATGTTGTATAAGAAAGGCATCATATACTTTGCATATTGGACAGAGTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3R 26031821 5' + pogo 33 1 63.70 TTGGCCCGCAGCATATGGTTATACTCGCGGGGGCTGTGGTCGACTTTAAATGGAAATTTAAATGATATTCCAGGGCAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr3R 6578640 5' + F-element 56 1 50.69 CACCAGTGCTCGCACTTGTACAAATATACACTCTGCACTGGGAAAAATTTCTTATTGTTCACCACAAACTCTATTTAACTTCAAGCAACACTAAATTATAGATCATGACGCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1 + chr2R 22616817 5' + BS 5017 1 75.34 CTATATTAATATATCTTACAACCCAATTCGAATTTTTTAGAAAGCTTACGGTATGCTTTTAATTCCTGTTTATGAGCTATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr3L 8704617 5' + blood 43 2 56.16 TTCTATCACAAACACTCGACACGCGTCGTCTTGTTTGCATTCCAGTCCGCTCCACTTCCAATCCGACTGTCCGCAGCTTCGCGCGCGTCTTGAAAGTCCCGCACATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr3L 13450841 5' - P-element 2865 1 69.86 AATGTTGCATAATCATTTCGTAACAGATCCCAAAAGTATACACTAATAAGTAAACAGAGAGAGGTAAACATTACTAAGTCAACTTTAACCAAACACTATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGT:1 - chr2L 1922627 5' + BS 5021 1 55.48 CCTCTAAAACCAGAATGCAATTGCAATTATCCTAATTCATCCATTAGCTTCGCTATAGATAAAGACCTAATAGGTTAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTT:2 + chr2R 15529673 5' - roo 368 1 58.22 TATATTGTAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 + chr2L 615231 5' + F-element 38 1 49.06 CTTGCAAGGCTTCGGCTTCCCAAGCCACTGCAGTTGTGGAGGCTAATCAAAAAGGAAAAATGCGAAAATCGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 + chr2L 16202589 5' - copia 206 2 54.11 ATATACATGTTAACTTAATACTTAATTATTTTACATTGTTAAGACGGTCTTAGATTATCTTGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACG:1 - chr3R 24760389 5' + pogo 1697 1 58.22 ATGCCCGCTGAATTTAATTCAATTGCTGACAAAAACGTGTTGTTGTGGATTCAACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGGGACACTTTGT:1 + chr3R 6404548 5' + Stalker2 7301 2 57.36 TACACTAAATCATATTTTATTAACGTTTTTATGGCCCAAATGTGTTGGGCATATCTATTGAAACCAGCAAGACTAATAATAAAGCATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAAT:1 + chr2R 7024362 5' - diver 186 2 58.90 TTGGCTGTTTTTATAAATGTTTATTTAGCAGAAAGGAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAAT:1 + chr3L 10111785 5' + copia 86 2 79.45 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCACTCTCGACACCCCGTTTTTTTT:1 - chrX 7978952 5' - hobo 2883 1 67.20 ACGTATTATTTTATCTGGCAGCTGGTGATAAGCCGACTTAAGGTCGATCTAAAACGTTTTTTAGGCTGAAAATAGGAAAGCGTAAGGGTAAAACCTGAATGGAATGTCTGCTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:2 + chrX 126918 5' - hobo 2927 1 77.40 TCATTTTGCAATTACAAATACGAATGCTCACACTTCCCTTCGTTACGACCTGATAACTGAAAAAAGAAAAATGTGCAACGAAAAGCAGTGGATTTTTGCGGTACGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chrX 9864873 5' + hobo 17 1 69.86 CCAAGATTGAGTTCTTATTCAATTTGTACGGATTTGTTGTTCGCCGGTCCTTTTGCAGTCCGCTCTTAAAGCCTAACCCCAAAAGCCTCCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chrX 20379416 5' + hobo 31 1 64.38 TATTACACCAACAGTATTACGACATGCAGTTTATGTTGTTGTAGTTCGGCTGCATTTGAATCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 - chr3R 7109235 5' + P-element 17 1 64.76 AAGAACGCAATATTATTGGGTTGCTAAATATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 + chr2R 24021547 5' + pogo 54 1 57.93 AATGCGGTGTGACGACGACCGTCGAGTGTTTTTGGCGTTTTTGAGGAGGGAGGGAGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTGTCTTTATTTGGTTTTTATTA:1 + chr3R 26845527 5' - mdg1 7392 2 60.27 CTGCGAGCGGGCATTTTAATTACCTGTTTTGCCACACTGAACCAGCTAGCTTAATAAGACGCCTTAATTTGGCTTAATTTGCGGGCGGCCACAGGGTCGTATGATCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCATCCTTTT:1 - chr3R 23452794 5' - BS 4927 1 71.23 GAATCTCACGGGAAACACTCCGATGATTTCTCCGTGGCGGCTGGGCAATTGCAACTTATCGCGCCGACTGTCGCACGGCGTTTGAGCGTTGTCAAAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCTT:1 + chr3R 5502620 5' + roo 8826 2 65.07 GGCAAACGGCGAATTGCTAACCATGTGCCCTGCGTATCTATGAGATACAAATGGGCAAAAAGGCAAGTTTACATAAGAACCTAGCATAACCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATC:1 + chrX 7597486 5' + HMS-Beagle2 26 2 51.37 AAATAAAAAGTGTTAAATAGAAAGCACATACAATTTTATGCAACCCAAGTGGGTGGCTGCCAGAGGTTCAACATTTGCCCACCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chr2R 13772984 5' + opus 7036 4 63.01 TCCATCATCATCATCAACGTTTTTCCCCTTAACTTTTTTTTTTTCTAATTCAACAATTAACGTGCTAAATCATAAGTGATTCTGTCTTTTTTTTTGGCACAGATTTCATGTCTTTTTCTGCTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTAT:1 + chrX 5923506 5' - HMS-Beagle2 483 11 77.24 AAATTAGGAAATGACCTGAAATTTAAACCCAGCACGTCATGATCTATTTTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACC:1 - chr2R 22616939 5' - BS 5019 1 67.81 ATGATTACAAAACTTTTTATTTGAGAAGAACACCGACCTGTTACAATTAGTTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATTGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGA:1 + chr3R 31708628 5' - Idefix 7176 2 64.14 ATTTGCTGCCTGAATGTTGGCTCTGATAAATAGCTTTCATTACCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCCACTGCTGCCTTG:1 + chr2R 7349558 5' - flea 4872 1 70.55 CAAGGATGTGAGTCCTGGGAAGGGAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGACATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3R 5767431 5' - roo 324 2 79.70 AGACCAGAAAAAAAAAACCAAAAAGAGAATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGC:1 - chr2L 2622712 5' + roo 93 2 86.99 TCAGTTTCCTCTTCTCGCGGCAGAGGATTGCCTGTTTCGGTTGCCTTTTTGGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr2R 18266014 5' + roo 69 2 67.81 GGGGGAGTTTTGGGGTTTCAAAGTGGACCGAACAAGTTGTTTTGCAATTTTCAAGGCTAATTTAACAAACGATTACCTTTTATTACCTATTACCTTTACCACTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3R 19466632 5' + jockey 25 1 70.55 ATTGCATTTTTATTGCTTTAGGCGAGTGACCAAATTAAATAGCTACGCTTCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACGGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - 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chr2R 9408781 5' - FB 686 2 65.75 TATGGCATACAATTTATAGTTGGCAATAAATAAATGACAATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3L 13380399 5' + hobo 25 1 68.49 AGTCTCAATGTTTGGAGTGCACTTTACCCGGCCAACTTGAAATGAATCTAATAACTTGGCCCACACACACAGACACACATAGATTGGTAGCAAAAACAATGCCCTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chr3L 17142763 5' - hobo 2923 1 74.66 GCAGCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 15363474 5' + 412 66 2 71.88 CAGGTCATGAGCAGCGTGATGCCGAAGGCAATAAAGTCCGGTGGTTTGCCTGTGAGTGTAGACGATTTTAATCAGTATTGCCGGGAGCCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAG:1 - chrX 19723683 5' + P-element 422 1 62.22 GAATGCAATTGCAATTATCCTAATTCATCCATTAGCTTCGCTATAGATAAAGACCTAATAGGTTAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2R 15529685 5' - roo 9020 2 53.42 AATTAAGGTTTATTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 18954122 5' - roo 9014 2 58.90 ATAAGAAATTCTGCCATTTTTACAATAGTATCATAATAATTTATGACGGCCCATTGAGTGTTATAAAAGCTTCAATATTTTGTAGTTTATGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGTGTTGTTT:1 - chr2L 14394666 5' + Cr1a 242 1 60.96 CTTTATGAAATGTATGTATGTTCCTATTGTATAATTACAACCACAATCAGATCTGGTAGTTCTGGAGTTCTTTATCTTGACATTCAAAAGTACAACAGATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 12540444 5' - roo 9046 1 60.96 GTGTGTGTGTGTTACAGTTATAACAATAAATCAACAACTGCTGGCAGCCACTGTAACTGCAGTCGACTCTCAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr3L 15724564 5' + jockey 73 1 51.37 GCCAATTGTATTTGAAATCGAATAAACAATTCAATTATCGAATCAATCAAGGGCTCACTCAATTGCGCTGTCTGGCCGAAACCAAAGCCAATTAAAATTATTTGGCCATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:2 + chrX 998080 5' + copia 4885 2 74.66 AATCTATCATAATGGAATTAAAGGAGTTTGAGCTGTTAAGTATCAGGCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTCGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3L 2240409 5' - roo 8999 2 66.44 GAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAAT:1 + chr3R 18514344 5' + pogo 79 1 73.97 AAAGAGTCGAGATCTTATCTTATTATTTCATATCAATCGATAAATCTTTAAGATGCTTCTAAATTGTAATCTATTTTTGACATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 18860743 5' + roo 40 2 50.68 GTATATCTATTGAAAATACTCAAAGTAATGGATGCAAGCTTCCACGTTTTATTACTTGGTTTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTA:1 + chr3R 18492883 5' + Juan 4086 1 57.53 ATGCGGGACTGCTTATCGTCGGTGTGACCAGGCTATTTCACGGATATAACATTGAGAAATAATTTTTTCTGTTAGAATACACTGAGAGAAGTCAATGCAAAAATTAATAGTTGTGTATAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - 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chrX 15666902 5' + INE-1 538 1 57.86 AGTAATATTGTAGGGGGTTTGACTGAAGGATTCGTGTATAGTATTATTTTGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3R 18514289 5' + pogo 24 1 68.49 TATCCACACAAGTGTCCTACTACCGGGCCGCTCTCTCTTCACTTCGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAA:1 - chr2L 42585 5' - copia 5050 2 69.18 CATAACTGCGAAAAATATATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr2R 8375142 5' - roo 9031 1 57.53 TATTTAACAGCTCTTGGCTCTAATGACTGTGCAAATAGCGTGAGAGCTGGCGCCTCTTTACTGCTTCGGCGTATTTTAATGAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 + chr2R 24211510 5' - flea 219 2 61.64 AAAACACAAACGAGCGCAAACGCTTGGCCACACACACACGCGCACACATACGAATATGCGTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACA:1 - chr2L 5656641 5' - hobo 2879 1 57.53 ATATAAGTTTTTGTTATGTTTGAGCTCAATTAAATCATAGTATAGTACTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTC:1 - chrX 9874210 5' - BS 5015 1 65.75 AGCTTTTCAATCAATAAACTTAATTCTTGAATCTTCAACTCAACCAGCCAGTTCAAGTGCCAAGTGCCAGACATTCAGCAATTAGTTTGTTTTCCACTTTTTTTGTGTTCGTGGCTAATGACTAACGCACTGTCA:1 - chrX 14796324 5' - gypsy2 374 1 52.59 CAGAAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:1 + chrX 16857067 5' + pogo 73 1 68.49 AATTAAATGTCAAAAATTTCCCAAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTAC:1 + chr3R 19144384 5' + Juan 51 1 49.32 AACAGATCCAGATACCCCTCTTTCCGGGCATAAATCTTAAATGTGCAGCTCTCTAATATCGAATGTTTCGACGACTGCAGTCCTCTCGAATGAAGCCCACTAACCACTGACCAAAGACACTAGAATATTATTATTATTATTATTCT:1 + chr3R 30262808 5' - mdg1 32 5 73.97 GTATTTTGCTTGAACTCGCTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr2R 10189236 5' + Doc 40 1 55.56 CCATAATCTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGTTGGAAAATGCTAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACAAATATGCTGTGTTTGCCGG:1 + chrX 22398527 5' - Gypsy6A_LTR 97 1 45.89 AGTTATGCTTCACATTTTTTCTGCTGCTCTTCAGGCTCGTTCCGTGTAATTTATTGAAACACATTCATTTCTCGCTATGATGTGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:2 - chr3R 19500739 5' + jockey 78 1 57.53 AAAAAACCCTATTTGACTAAATTTACATTAGAATATCAATTAAGGATTATAGTTGAAGTAGTTCTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCACCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 - chrX 19736528 5' + pogo 55 1 56.16 CCCTGATGAAATTCAAAACCGTCAAGTAGCCACTGCGATGGTAAAAAGAGTTACGATCAATTGCTTGCTTGAGCATGCATGCGTTACTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGTACCCGAGTTTTGCGCAACCAGAACCGTAA:1 + chrX 17670601 5' - R1A1-element 5061 1 60.27 GCCAACCCACAAAACACAAACGAGCGCAAACGCTTGGCCACACACACACGCGGACACATACGAATATGCGTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr2L 5656651 5' - hobo 2911 1 58.87 CTCGTTGCCACAGGGAACTCGGTTAGATAGCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:1 - chr3R 12886056 5' - 412 428 2 77.69 ATGTTTTTTGGCCACGATTTTTTGAACATTTAACATAATAAGGACCTGCGTAATCTATTCCAGTATTAAGAAACGGGAATGTCATCGTCACTCTATAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTG:1 - chr3R 19447261 5' - roo 377 1 66.44 AAAACGCTTAACCTATAAAAATTAACTATAACTATCTGTGCTATTAAACTTAAGCTATAAAATATAGATAAATCCTTTTGTGAACACCTACCAGTACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAA:1 + chr3L 22787292 5' + baggins 5069 1 50.68 CTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 + chr2L 12767005 5' + hobo 68 1 76.67 CGTGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATGTTTTCGGTGCTTAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTA:1 + chr3R 26405017 5' + hobo 70 1 65.07 ACCATTTGGCAAGTTTGATATAGCCTCGCCAAGAGTATTTAAACTTTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGT:1 + chr3R 15035017 5' + Stalker2 7275 2 67.12 TCTCTGCCACCCTCCACCCCCCCTAAAAACAGCCATCCCCATTCCCCTTCAGCAGTTAGCAGCCGGGCTAGTTGGGACAGAAATGTATCCCCATGTGAAATGCATGTTTGCATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 - chr3L 5329240 5' + 412 11 2 78.08 AAGTATATGTTTAACACATAGATATCCATTTATACAGATATACATTTATGTGTACAATAGAGTTATCCGGGTATATAATTCTATACATATTGTGATTTTAATCAACACACGCTCTCCACTTGGACTACAAGGTGCTGTTATTCAAC:1 + chr3R 4654207 5' + Doc4-element 2559 1 71.92 AGCAATAATAGCTGAAATACAAAAGAGATAGAGCGAGCGATAGTGAGTGCTACGGATTGCATTTGGCTTGCAGTTGCCTGCAGTTGCAAATACCAAATTATTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTT:1 - chr2R 9030783 5' - 1360 329 1 66.44 AGAACTGTGAGAAACTATTTTCAATAGCTATAGTCGGTGTTTTCCATTTGAGAACGATTTAATAAAGTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chrX 19310670 5' + pogo 50 1 52.74 ATTTCGATCTGCATATCGTCTGTTTGTTCGTCCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 - chr3R 4352159 5' + Doc 41 1 63.70 CGCACGCCCCTTATCAATTTTGATTGTCCAGCGCCCACACACACACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAAAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1 + chr2R 14486483 5' - 297 331 2 72.46 AAGCAGCATCCGCTTAGCCAGCTTGTCTAGTCTGAAGCACTCACCTTTTGCTATTAATATAAGAAGTTTAGACACAAAATGCGAGTAAATGGGGAGATATAAGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTC:1 - chr2L 15524062 5' + opus 17 2 73.97 AACAACAGGTCGGCGGGCCAGATTAGCAGGACATGTCGGCGGAACAATCCAGCGAGATAGGTCGGAACGCAGCGCGGGACATGGAGGGACACAGTTTCGGAGCTCTGCGTTTTGGACTGCGGAGCCACTAGCTGAGTAACGGGTAT:1 - chr3R 17733420 5' + INE-1 540 1 78.77 CAAACACTGATTATGGCATACAATTTATAGTTGGCAATAAATAAATGACAATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:2 + chr3L 13380388 5' + hobo 14 1 76.03 CCCGGCCAGGAGCTTAACAAATTGATTGGCCACGATGGCGGGATGGGGTCGAGAAATTAATATTCCCGGGTAGCAAACACACACACGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 - chr3L 13568300 5' - hobo 2906 1 59.59 GGTATGCAACGTATTTTGAGGGGTTAGCAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGTTCTGCTTATATTATTTTATTT:1 + chr2L 19565439 5' - jockey 4931 1 56.16 ATATACACTCTGCACTGGGAAAAATTTCTTATTGTTCACCACAAACTCTATTTAACTTCAAGCAACACTAAATTATAGATCATGACGCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTA:1 + chr2R 22616840 5' + BS 5040 1 59.59 GTTAGAGGCATCTTCGGTCCACATGCGGCTTAATTAAGCACTGAAAACTACCCAAGAGTGTAACAATAACAAATGCGAGTTACGAGTGCATAGCTACATAACAATGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTC:1 + chr2R 9020895 5' - R1A1-element 205 1 71.23 AGTGCATCAGTGAACGGACTGTCTGTGTTGTGGTCTCGCCTCCTGGCCATTCCTCAACTTTTGGCCAAGAAGTACACTCGGTTTCCCTTTTTCGAGTGGGTCAGTGCAAAGACCCTAGAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGT:1 - chr3R 30262996 5' + Tc3 305 1 72.60 GGCACAGGACTCCAGGCGAAGCGAAAACCAACGAAGTGAACCGAACCAAGCCATTTGCGTTGCTCACTGAAATGAACACCAGAATTTCTGCCTGCTGTTGTTTTAATCTATATTTTCTAAAAGGTTGAAGAAATAAAAGTGAAACA:1 + chrX 15441710 5' + HB 1494 1 59.59 CAAAGTGTCCGTATCTGATGATGACGCGGTCGTGTCCTCACCAACGTGAAGGAATTCCAAATAACTACAAATTCAGCTTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr2L 10128197 5' - hobo 2911 1 63.43 AGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCTTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTA:1 + chr3L 13380444 5' + hobo 70 1 63.70 GATAAGTGGAATGTGAACTTAGACGGCACAGCCTACAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCAT:2 + chr2L 11047983 5' - Juan 4131 1 75.34 ACATCTATGTATATCTAACTCTTTGACTGAGTAATGGGTATCTGATAGTCGTGGAACTCTACTATACCTTTTTTGACCTGCTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr3L 22519117 5' + pogo 34 1 62.33 CGTGGCAAAAAGGATTTTTTTTTTAAATTATAAAAAAAAACAGGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAGTGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATGGGTAGAT:1 - chr3L 14671919 5' - INE-1 500 1 62.33 ACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:1 + chrX 12344303 5' + F-element 67 1 58.09 CATCAACATTTTAAACTGCCAGCCAGCTTTCTTTTTTAATTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAG:2 + chr2L 2518522 5' - jockey 4907 1 77.40 CATGTTTAATAACTGCAGAATGTTTCAGCTCATTTTATTATCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1 + chr3R 24301796 5' + Tabor 6883 2 55.48 AATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chrX 3637794 5' - roo 8984 2 76.55 CTGCCCACGTGGTGCAGCCATCAGACCGCCCATGGCCCACCCCCAAGCATATACATATGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTGCCATTATTTCAAAGGAATCAGTAATGCA:1 - chrX 1726760 5' + 297 41 2 57.81 GTAAATATAAATATACACGTGTTTAAATATTCGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chrX 20369397 5' - roo 320 2 78.08 TATTGGGATCACTTGGCGAATGACTCCAGACCTCAGAACAGCTCCAACATGTGGATGCCCCTGTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTT:1 + chr3R 31051993 5' - F-element 356 1 52.63 GCTAAAACTAAAAGAAATACCAAAAGATGGAAATACAATATTATTGAAAGATGTAGATTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATT:1 + chr3R 29901028 5' - flea 4955 2 60.27 GCACGTTTTGTGTTCCTCCTCTCCTCCTTTCGTGTATGTTTCTGTTTCTGTTTCGCTTTAGTTTCACTTTCATTCGTCTTCGATCGTCAAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:2 + chrX 19506046 5' + P-element 32 1 65.07 GATATTCTCAGTTGGGATATAAATATAATTGGGGATAGTTATTACATTGCCTCAACAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chr3L 19510591 5' + pogo 62 1 62.33 TTTCGAATGTCTCCCCAAAAGACCCGTTTCTTTCGGTGTAAGACTTTTGGCGCTCTCTTCTCGCCGCTCTCTTTTCGCAGCGACGTCGACGTCGTTCGTTTGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chrX 1831186 5' - P-element 2867 1 71.92 AGGGTAGGGTAACTGGACACCACTCGACCCAGGCCCATGCCAACTCCTCCGCCTCCCAGTGGCGTGGTCACCAGCTGACCCAATTGATGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTACACTTATGCCGTATAATGCAAT:1 - chr2R 9523413 5' - jockey 306 1 59.59 ATGTATGGGGCTTACTAGGAAATTAAGTCGAAGATCTACTTCTGCATATGAGCTATGTATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTC:1 - chr2R 20931730 5' - blood 7327 1 60.96 TATTGAATGCGAAAAATGTTATCAAAGTTGATGAGAAAGTTTTCCTATCGCCTGTTTAAGCAGCTAAATTAAAAACAGATCAATTAACGTCGAATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 + chr2R 7540959 5' + F-element 41 1 61.64 GCCAACTTAAACGCAACAATGATTTTGAAAAACATTCACAGTTTTTCTAGGTTTTCTGCTCAAGCCAGACTCATTGCAGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTA:1 + chr3R 27443132 5' - 3S18 6062 2 55.17 AAATATATATATTTAAATCTTTGCCCGAATTAACACATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATTTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCT:1 + chr2L 13763492 5' - Bari1 1624 1 73.29 GCTGAACTTAAAGTTAGAACTTAAAGGGGTGCCAAGACTGAGAGAGATCATAGTGCCACTTTTGTGGAACTATTCTTGTGCCCCAACCTGTTGAAATGCTACATATATCATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATT:1 - chr3R 29952845 5' - invader4 317 2 78.08 CAGGCATTGGAAATTGACAAAACACTGGTTGACTTTTTATACGCTTTCAGAGGGCATCTCGATTATATCCAGAAGTTTGCCAGACACATTTGCGACCAAAAGAAGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATAC:1 - chr2L 10685928 5' + Quasimodo 15 2 76.03 AGCGCCACCAGTGATATCCAGCGTAATAATCCACAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr2R 18056903 5' + blood 52 2 53.42 GCGAAAATCGCTTCAAATCAAAGGCCGCTAAACACATTCCACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAA:1 + chrX 9949511 5' - hobo 2857 1 74.66 ACTGAAAAGGGGATAATGCTAAAAAAAACCAGTTTAAGCATATTTATGAAACCAGCTCATACCCTTCGTGTCGCACATCAGTCAGCGAGCGATTCAACGAAATCATTGCTTTATCCACGGCTGCAAAAGAAGCGGTGTATCTTCGC:1 + chr2L 5078400 5' + Copia1_DM 3997 1 72.60 CCAACATTGAAAGTTACTTCGCTTCAAAGCCTCAATTAATTGTTATTAGACCGGCCCCTAATTTAAGTTAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTA:1 + chr2R 10760394 5' - Tabor 433 2 53.42 ATGAAAAAGTTTTCAGTTTCTTATATATTTCAACAAAATTATGCTTTTTAATTTATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr2R 8942596 5' + 297 6640 2 65.07 GAATTTTAAAATGAACCGCAAGAAAGACCCCTAATAGACGTGGAAGGTATAAAAAGCATGCCGAAAATTGTCAAAGGGTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATG:1 - chr3L 3580984 5' + copia 4912 2 53.42 AAAGTTATTCTCGTGTTAAGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTAT:2 + chr3L 3540093 5' - mdg3 5463 2 61.64 TTAATTTCAAGTTAGGCACTCAGGAAAAGAGGTGTTCGAAATCAAGAACCCTTGCCGAAAAAATATATTAAATTTTAAGGTATCATTATTCATTTTTTTCAATTTTTTTTTGTTTTTTTATGATTT:1 - chr2R 18733036 5' - BS 5098 2 69.05 TATGCCCACTTGTGATGCGCCTTTAATTTTCAATTGGCTTAAGCTGGTTTCAGATCTAATCTAATATCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAAC:1 + chrX 16325114 5' - Transpac 5178 2 54.79 ATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chrX 3637792 5' - roo 8985 2 75.34 AATTGTTGACAATGTTTTGCAAAGAAATAATTCTTATTCCAGTGTTGCCAGATTACTTTAAGAGATTACTCAACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr2R 11691309 5' + P-element 50 1 51.37 CGCGTCATCTTACAACATCAGCCACAAGCTGGTTATAGTATAAAAAGTATGTCAGCACACACTTAGAACTCAATCCAGTACACCTGCTTTTATATGTAGGTACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACA:2 - chr3L 25950166 5' - Juan 3886 1 52.05 ATTTATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 - chr3R 6461828 5' - Transpac 235 2 71.92 CGCAAGCAATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAACTCCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTTTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr3L 11887212 5' + Doc 80 1 69.18 CACAGAAAGAAGTCGGGCATGTCTAAAAATACATTTCGAACATGCTTGTTAAATTGAGAATTTATTTCCAAAGAAATTATTCAATATTCGGTATTATATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCACA:1 - chr3R 23714164 5' + I-element 23 1 68.49 CATTGAATGTTTCTGGAAGATTTGAAATGGGAAACAATACAAAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2L 13102948 5' + roo 8739 2 72.22 CAGTGTTGCGTTCCGATTTTCGTCGAAAATATTTTTGTTTCTTTTTGCGTTTCGAAAACACTCGAAGTGCTAAAGAAAGAAGAGTAGAGCAGGGAAGAAGAATTTAATAATTATAAATTTAGGTTCG:1 - chr3R 16249811 5' - I-element 246 1 80.31 GCGCAACAAAAATATAGAACTATATTATATTAATACATATGTAAAGATAAGGTGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chr2L 12814720 5' + hobo 66 1 61.64 TGATCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGCATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGAGCGTTAGA:1 - chrY 3648882 5' - Stalker2 7398 6 72.73 TTTATGAGGGGTGCTAAAATAAGATCCATCTCAACAACCAGATATGAAAAGCCAGCACACTTGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAA:1 + chr2L 5333382 5' + mdg3 48 2 56.85 CAATTCGAACCATGTGCATGGCAAACTGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACAT:1 - chr3R 9863004 5' + Stalker2 7284 2 60.96 GCTTGGGTTGGTTATTACAGGGAGAGTAGTTGCTTCTTAGACTGCGGTGTCTGCGTGCCTTTGGAAGCCATAGAATTTCACTTCAGGATCATGTTTAATAAGTAAGTCGCGGCTCTCAATTCAACGCAACGACGCGTACTTCTCCT:1 + chr3R 851737 5' + F-element 258 1 74.66 ATCTTTGTATCTGTATCTGGAAACATGAATGTACCTACAATTGCCTAAGGGGTTGGGGTACAGTCGACACCCACTGATAAGCAACCCTCGGCAGCTTTTAACGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAA:1 + chrX 14601035 5' + opus 379 2 71.92 GCAGGAAACTTATGAGTGCAGAAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 + chrX 16857049 5' + pogo 54 1 55.86 GACTGTGAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1 + chrX 21087533 5' + mdg3 23 2 67.12 CCAACCTGGCCAAGCTGGCCATAAACAAGCGGCGCCCAGGTGGGCGTATATGTTTGGCAATTTATGGCTGAAAACATAAATTCGTTGGTACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCG:1 + chr2R 18927738 5' + 3S18 5774 2 73.77 ATTTTAAGTGATTCCTTTGGTGGGTTCTAAGCCATTCTCTTGGTTCATAGAGTCGACTGCATGTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chr3R 29719427 5' - hobo 2895 1 51.88 ATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTG:1 - chr3L 22635754 5' - hopper2 1526 1 70.55 TGCTTTTCCCATTTCCTCGCTGCCTCTTTAAACTGCTGCTTAATGTATGGCCCCACTTCTGTTTTGTGTCGCATAATTACCAATGCCAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 - chr2L 18848841 5' + blood 33 2 63.01 GTACTTTTAAAGGGCTTTGGGGAAATGAGGTATCGAATTTAACTTTAAAAGGAATTAGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTA:1 + chr3R 22160865 5' - copia 192 2 59.59 TGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 + chr2L 14262943 5' + P-element 57 1 46.58 AGATACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr2L 19907553 5' + hobo 65 1 62.33 TGGAAATATTTGCACGAAATTACAGCTCTCATTTTCAGTTGACGCGACCGATAATGCTGGGCGGATGTCGGCGTCTGACCCGTTGTTGATGTTTATGCTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTG:1 + chrX 22648879 5' - ZAM 8018 2 60.96 GAATTTGATGGTCGAACAAAGCCGACAATAAACATTCCATTCAAATGAGCCACCAAAATGGCATCAATGTCATATCAATCAAAAACTCAAACTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr3R 22266569 5' + roo 8691 2 67.12 ATCTGTCTCGCAACTCATTTTCCTGATTGATGTGCACATTTTGAAAAGCTGACACTGCCATAAATTAAAAATGCGGTCGTCGGAATGATGCTACGCATAAATGAAATAAATTCAAAAGCATAACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 + chr3R 13231702 5' + F-element 38 1 65.75 TGGTTCGCGATTTGGATAGGGTTTGAGTTCTCACTATTTGTTTGCTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCAATGTTTAAATTATTATGTATGTCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTGAG:1 + chr3R 3374374 5' - Porto1 4347 1 71.03 TTCAGGAAAGTATGACGGCAAAATCGGGGCTTTTCCGGGGGCTTGTCCCTATATATGTATATATATATGTATATATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chr3L 2625038 5' + opus 7045 4 58.22 CATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGC:1 + chr3L 21765418 5' + gypsy 64 2 59.59 ATCGCAGTCATGTGCTTTTCGTTTGAAATGCTTTCGAGGGTCGCTCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAA:1 - chr2L 1892353 5' + hobo 78 1 68.49 GGTGATCTCCATAAAATCTGGGACATCTGACATGGGCAAACAAACAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGAC:1 - chr2L 5333467 5' - mdg3 172 2 67.12 CAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 + chr3R 19989258 5' + hobo 55 1 67.48 CACGCTGCTCCTGGTGTTAGGCTATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 + chr3R 25094649 5' - P-element 2792 1 18.88 GCAAAGAGGCAAGTTAAAAAAAAAATATAGAAAAGAGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAATAAATAAAATAGCATATT:1 + chr3R 13571982 5' + 412 7083 2 63.70 ATCTTTATGCCTGTTTGTAGTATTGATATTTATGCCCTATTGATCTTCAGAATCAATATTATAATATTATATTATATATATAATACATATATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTC:1 - chr3R 7355496 5' + micropia 4986 2 52.74 ACGAATCGAGCTCTTTGAAGCGACTGACTCGAAAAGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr3R 5087044 5' + P-element 25 1 63.08 CACCTTTTTCTGCAAAGTGCGCAAAAAAGAGAAGAAACCGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACA:1 - chr3R 15243817 5' - micropia 54 4 73.97 GCGTAAGAAGAGTAAGTAAATCTAAGTAATAATATTACTTAGATTTACTTACTCTTCTTACGCTTCATAATCATCCATTTATTTTTTATTTGTATGAGTTTGGTTTTCCCTTTTTTTTTGTTTTT:1 + chr3L 6199201 5' - Bica 337 1 62.40 CAAACACTTTGCATATGCCACAACCACTCCCACACTCGGACATTCTTTTATGTAAATTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTGTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTAT:1 + chr2R 20117291 5' + mdg3 65 2 61.64 GCTAATGAAATAGCTGGAAATTCTGCTGATTAGCTCACTTAATTGCCAAAACGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 + chrX 13351603 5' + roo 8734 2 65.75 AATAAGCACTCTAATTGTTTTTAAGTGTTTTTCCAGCAGCGACAACAGCAGCCGTGTGCAGCGCAAATGAGCCGTAATTGCATAATTCTAATTTAGCGTCGAGTTCTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - chr3R 26405152 5' - hobo 2924 1 76.71 TTTGTTTGTCATCGCCTCTTAATCCAGCAGTAAAAGTAGCTGTGATTGTGATTGTGCGCACGCCCCTTATCAATTTTGATTGTCCAGCGCCCACACACACACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 + chr2R 14486427 5' - 297 6960 2 76.03 CACCAGACTCATTTTCATCTTCATGTTTTATAGGAAATCAACTCGACAATTACTTGGCGAAAAGTTCATTACCATTTTAAAAGTTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr3L 13015866 5' + hobo 13 1 69.60 GTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCC:1 + chr3L 3540136 5' - mdg3 5420 2 64.83 ATTTTGTTACCATTTTTAGGCTGGAAAAGCCGCAGCTGCCGTGGATCGATTGACGGATACGAGCAAGTACACCGGTTCCCACAAGGATGCATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGA:1 - chr3L 16355365 5' + Stalker 314 4 59.59 CCTTTTGTCAGCCAGTGCGTTTTCCCTTAACAAACCTTAAGTTGAAGACCCAATTTAATTGCTACGTAAATTGCGCAGCTGCTGCGAAGTTGCAAATATACATACATATAGTGACGCATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chrX 22577946 5' + 297 16 2 71.92 TTTTTTGTCTTTTTTTTTATTTATTAGTATTATTATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGT:1 + chrY 2458346 5' + micropia 4963 2 78.77 AATCACGATTAAACTGTCAACGGCATACTAATTAGATTTTTATTTTTATTGCGCCATGACAACGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACGGGGGGTTCCTCTGTCACTGGGAGGCAGGGCGGTTGCCGCA:1 - chr2L 15937125 5' - springer 303 4 54.07 ATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCGGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTT:1 - chr2R 23592060 5' + micropia 128 4 57.53 TATGGAGTAACCTCACGTAACTCGGTTACTTGAGTGGCTATGAAGCTGGGACTCGACTTAGGCTTAAGTTCCTGCTTGGTCTATCAAGAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chrX 7624182 5' - roo 9041 1 69.18 ATGTGCATTTTTTTAAATGTTTGTTGAAGCTCATCGATCAGCCCAACCTCACATAAAGAAAAAACTCATTAAACGAAATTAGTGCAGAACTTGACATATGTAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAA:1 - chr2L 22340440 5' - HMS-Beagle2 7172 2 69.18 GTAACAAATGATACAAACACCTAATCTCATTAATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAAAGAAT:1 - chrX 16857135 5' - pogo 2016 1 75.34 TTGTGAGTGCAAATTGTCGAATCAATTTGTAACGATTATGAAATCCTTTCGCAACGGTTGCGTAATTTGCGCAAATTAAGAGCCTGGCCCCTTTAATTCACATTGATTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTG:1 - chrX 20088463 5' - TAHRE 10408 1 70.55 CGGCAATATATCCAGCTTTGCAGACAGCAGCCACAGTGCTGATCCGCTGGTCAATCAGAACTCAATGGACCTGGAGACAAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAA:1 - chr3R 6452719 5' + F-element 4365 1 59.70 TTATGCATATTCAACAGAAATTTAATAAACTTTTAAAGGCTTGATCTTGGGTGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAGTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr2R 21244971 5' - roo 9023 2 54.11 TTACCCTATTTGTGTACACAAACATATGAGTGCGGAATAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACT:1 + chr2L 2722370 5' - flea 4933 1 75.34 TATGTTTGAGCTCAATTAAATCATAGTATAGTACTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAG:1 - chrX 9874196 5' - BS 5001 1 75.34 AGGAGTGCTGGTAAAATATTACACACGCCGCATCTGGTAATTTAAGTTATTTTCCATATTACACAACCCGGCAAAAACTCGTTGACTTTTTCACAGACACCGCAATGTGTGTATGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr3R 29381650 5' + hobo 7 1 79.45 AAATGCCTTGGTACACTAAATCATATTTTATTAACGTTTTTATGGCCCAAATGTGTTGGGCATATCTATTGAAACCAGCAAGACTAATAATAAAGCATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCG:1 + chr2R 7024351 5' - diver 197 2 66.44 CACGATCGTTTCTTTAATCGACACTTACTTACATTTGGGTTAAGCCAATTTGATTGACAATTTAAGTTGGATTTTGTTTCATGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 - chrX 4944981 5' + FB 39 1 58.90 AGTGAGAAACGAAACCCGGATCAAAGAATAAATTTAGAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3L 12776078 5' + roo 48 2 53.42 ATGATAAGCATTTCACGGAATTTATCGCTGGGCATGGGCACGCAAGGAGCAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 - 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copia 241 1 76.03 GGCTCAAATGCGAGGGGAGAAGAGTACCTGTGGTATTATTAAGGAGACTACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr2L 20253935 5' - roo 9001 2 65.75 GTTAGGAAAACTCAGTGTTAAAAAGTCAGTCTAAAAAAGTCATGAATATATATATATGTATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTT:1 - chrX 19766818 5' - copia 193 2 63.70 GCTCCGGAGCAGGAGGCAAGTAGTGAAGTCAAGTGAAGACTGAGTTGTGTGCATGAATGAATGAATGAAAGGGGCGGCAATGGGCAGCCCGCTCAGAATGCTGCCGCCGGCAAGGACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2R 14450300 5' + roo 6 2 82.88 ATTTGTTTCGTTTTGTGGCGACTGCTATTTTTTCACAACTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 14450126 5' - roo 9028 1 55.48 AAAATAATAAATATTTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 11873321 5' + 412 42 2 56.16 TTTCTATATATTTCGTATATATATATATATATATAACGTGTAACGTAAACACGTACAAGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3R 12547824 5' + hobo 31 1 58.90 AAAGAGTTGAAATACATTTATTAAGGCAGGAAAATGCACTTAAATGAAAACTGACTGAAAATTGGGTTTATCAACAGCTCGACCCATAGATTTCCTATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATT:1 + chr2R 7351300 5' - flea 4994 2 59.59 AAAATGGCTAATTAGAAAATCGCACCAATCGATGTGAGTATGTATGGAAAACTGATATGGAATCACCCGAACATAACCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr2L 12696104 5' + pogo 40 1 52.05 CCGGCCCTGTACTCTGCCGTGTGGTTGTTGTTGCTGCAGTCGCCAGTCGACACATGGTGAATATTCGAATTCAGATTCGGTCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 + chr3R 17794506 5' - P-element 2849 1 56.85 TTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAGA:1 + chr3L 25232775 5' - accord2 7547 2 71.92 CGACAGTCGCAGTTTATCCGCCGACCAAGTCGAATCAGTGAATCCACCAAATCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTT:1 + chr3R 22123754 5' - 297 6911 2 67.12 AATGGATTTTGCTGCTCCTTGTTAGTTATAGTAGTTATACGCTGCAATTGCATTAATTAAAATTTTTCGCCAGACTGCACGGCGGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 - chr2R 13052882 5' + Doc 75 1 57.53 AAGATGACCAACGATGACGGTCAAGAGACGGATGCGGGCTCCACAGTCCAAGAAGGTGATATCGTTCTTCAAGAATCATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGT:1 + chrX 15696671 5' + jockey 4695 1 62.79 AATGCCTTCCAGGTGGCCCTCAGTGGGTATATGTTCTACGAGGTGAGTTCGAATCTAGAGATTAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCCTTTGAAACT:1 + chr3R 22572544 5' - HMS-Beagle 192 2 54.79 AACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGACGAAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAA:1 + chr2L 20985783 5' + F-element 88 1 67.12 GTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGGGGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAG:1 - chr3R 13198255 5' + Doc 94 1 78.77 TTCGGTTTCTCCTTTGGGAGATTCAAATCAGAAGAATTTTGCTGAATTTTCCGACAAATTGAACTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr2L 12766930 5' + hobo 19 1 71.23 AGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGATCAACA:1 - chr3L 15374690 5' - 3S18 6014 2 78.77 AAAATCGCACCAATCGATGTGAGTACGTATGGAAAACTGATATGGAATCACCCGAACATAACCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 + chr2L 12696119 5' + pogo 55 1 62.33 CCATTAAGCCATTATCAACTAGAAAAACCAAATACTGAAAAAGAATTTTCAACAGAATTGCGAGAGCGTGTAAGCGAAATAAAGGGATAGAAGACGATAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGC:1 + chr2R 5399615 5' - gypsy12 10145 2 57.35 GTTTGATTTAATTTTTGGTTTTTTTGTCGGCGGAGCGCGCAGCGAATGCTCTGCGTGTGCGGCGACGGCGAATCGTCGAATGAAAATGAATGAAACGGAATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - chrX 1831368 5' + P-element 18 1 73.29 CTGCTGTGTGGAAAGCGAGCGAAAGCCGAACAATATCCGTGCGAGTCCGAAGAAAAGGATTCTTCCTGAGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr2R 12872987 5' - P-element 2835 1 50.00 CGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCC:1 + chrX 21087584 5' + mdg3 5298 2 54.11 ATTAGTTTAAAATATATTTAGGTTATGTGTTAAGAATGCAGAATAAAGTAAATTGTCACTCTCCAACAAGGTGACAATTTTCAAGCAAATTATAGCTCCATATGGAGGTATGGTTGTCAGATTTGGGGCTTGGCTTGCGATAGCCA:1 - chr2R 5610035 5' + BS3 1326 1 78.08 AAATAAAGATAAGAACCAACCAAAAGTTGTAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACAATAGAAAAAAGATCGCCAAACTATTTTCTTACATTGCATTCAAGAAGTTAGGATTTTTTTTTAAATAATCTAAAAAATTTTTTCCTTTTTAA:1 + chrX 5045169 5' + Stalker4 6871 2 60.96 GCAGACGAAATTCATCACCCTAAATACTACCATTACCAACTAGAGCTCAACGCGGCTTTTCTCTTAAATCATCGTAGACTGGCATGACCCTTATACAGTAATAATAGACTCTATCTAATCTTTATTATCTGTAATCTTGACTCTCT:1 + chr3R 3859966 5' + Cr1a 4227 1 58.22 ATTAGAAAAAGTTAAAGAAACGCCACGGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGG:1 + chr3L 12692095 5' + micropia 5123 2 61.64 GTTTTTACTACAATAGTTTGAGATCTGCTTGGCATTCAAGGCAGAATGGATAAAATATTTCTGCATTTAAATATACATATATATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 - chrX 21405398 5' + flea 16 2 70.40 AGCCCGCATCCTTGGCAACCTTTGTGCATTATCTTCCGACTCTCATCTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGCTGTTTGGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAA:1 - chrX 10501349 5' + F-element 87 1 63.70 GCATGAAACTGAAACGAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGCCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTGTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTT:1 - chr3L 1983538 5' + Transpac 72 2 65.07 GCCACCAATTGAATAAAATGCTACACAATGTTTAGGACGAACAAAATTGTATGCAATATAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1 - chrX 14318493 5' + 297 51 2 63.70 ATTAGAATTGAACAGAAACGAGCAAAAACAGAAAGGGTTTTTGCGCCTTATAAATATTTAATATTATTATTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAAT:1 + chrX 17270274 5' - 3S18 6054 2 51.37 TTTTATTGTCTGCGTAAATGCTATATAGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCACACGCAGACATCGAG:1 - chr2R 3091690 5' + F-element 293 1 48.97 GGCTGCATTTGAATCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACA:1 - chr3R 7109188 5' + P-element 105 1 14.38 ACGCACGTTTTGTGTTCCTCCTCTCCTCCTTTCGTGTATGTTTCTGTTTCTGTTTCGCTTTAGTTTCACTTTCATTCGTCTTCGATCGTCAAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 + chrX 19506044 5' + P-element 26 1 68.31 ACCTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTT:1 + chr2L 3151014 5' - blood 7332 1 60.14 ACACATGGTGAATATTCGAATTCAGATTCGGTCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGGATTCTGAGTGTCGTATTGAGTC:1 + chr3R 17794555 5' - P-element 2800 1 23.29 ATCGACGGCGAACAGAACGGAGCAAAGGTGCTGTAGAATGGATTTGCGGCAATTTGCGCCAGCACCCTTTCCATATCCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 - chr3R 15700448 5' + Transpac 4961 2 56.85 TAAGAGTAATATAAGCTAAATATATCTGTGTTTCGTATTACTTTCATTGCATTCTTATTAACAGATTTTCCAGTGTAGTGCTTTCTATTTCGGACCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 - chr3L 3250092 5' + P-element 25 1 68.49 AAAATGAAGAAAAATTAAAATCTGTTGGTAAAAATTATCATTATGGTCTTAAAGAGCCCGCAAGCTTCCAGATCGACGTGTACAAGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chrX 22760436 5' + roo 8700 2 60.96 ATTAAAATAATTGTATACATATTAGAGGGCTGCATAACACCATTCAAACCATTCAAAACAACAGTCGTGCTGAGATGATCGCAAATTATCGTGCATTTAAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chrX 21177251 5' + Tirant 8122 2 51.77 TCATCTAGAATTTCGAAAGCGATTCCCGTAATGGCAGCGAGCCATTAGCCTCAAGTGGCAATGTGGCAAAGTTGCGTCTAAACTTTCCATTTGTTCCGTTTAAGCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGC:1 - chr3R 14530365 5' + Rt1b 4976 1 75.34 TACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGCATCGCATCTT:1 + chr3L 19938498 5' - roo 324 2 77.70 ATGGAAGTGGAAATCGCTGTGGAAATGGGCACCGGAGCTGCTGATTTCGTGCATCGTTAAATGCTAAATCGAATGTGAAAGGGATAACGATCCGCGGAGTTGGAGACAACGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATGTTAAGGATG:1 - chr3L 4703844 5' - mdg3 100 2 70.55 AATGGCCTCTCCATCGTTTATGGCCAACTAAAACTGAGCAGCGCTGCCCACGAAGGACCCCCGAATTCGTCCTGGTTGCCTTGGAGCCCGGCCACTCCATCGTTTATGGCCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATC:1 - chrX 15421140 5' - pogo 1637 1 68.06 CGGTGAAGTATGCAACACTTTTTCGCCACCTCCTTTCGTTTCCTTGTGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chrX 9949576 5' + hobo 67 1 68.57 GCTTGTTAAATTGAGAATTTATTTCCAAAGAAATTATTCAATATTCGGTATTATATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTCTCAGCAAA:1 - chr3R 23714121 5' + I-element 66 1 67.81 TAAAACAATTTAGTCGATCAACTTCCCAAATTACCCCTCAAATAAATCAGTTATATTTCAATGCATTTGATTGCTATTTATTCAACAAGATATCCCAACCAGAGAACAGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr2L 21189850 5' + hobo 26 1 68.49 TGGGGCTATCATTTGCCAATGTAATAGAGCAATCTTTATCAAAAATGTCGTAGTATTATTGTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr3L 11228069 5' + pogo 57 1 62.33 CGGTGATTGAATGTTGTCTAATCATCTCAGCTACGTTCGGATACTCATATGAACCACATTTACTTCAACACACTGAGCGAAAATTTGGATCGAGTGACGATAGCGTTATAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCG:1 - chr2L 8009204 5' - roo 399 1 76.71 GGATCCTTGATTGGAACTGCTTTTGATTGGCGGTGTACAAAAACAAGATATAAATGGAAAAATTCCTGCTCTGCTATGGGGAAATCTACCACGTCGGTGACTACAAATCTCTCTAAACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTT:1 - chr2R 18525993 5' - Cr1a 4130 1 52.74 ATTGGAAGTAACTTTAAGTTTTATTGGGACCTATTGAACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCC:1 - chrX 16538172 5' + mdg3 83 2 74.66 CCCAATTCCGCATATCCGATTCTCCGGATATAACTCATAAGCTATAAAGGCATTTGGTAATGCACCTCAGTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chrX 20369480 5' + roo 8714 2 55.86 CGGTGGAGTTAGCAAGCTTAAATGATTTTTAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:2 + chr2L 15596944 5' - roo 8984 2 83.56 TATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:2 - chr2R 8375125 5' - roo 9014 2 54.79 AGAGTGGAAAAGAAAACGTGATTATAGTACGGTCAATTATAAGTTTTCAGTTCATCGAGGGTCTACAAATATTTATGTAAATTTGTTTCTTGGATCTGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCGTCCAGCACAACACGCACACATA:1 - chr3R 25574844 5' + 1360 3210 1 55.48 AAGAATGGTTTACTATGTACTATGATTTTACTATACATGATTAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:1 - chr2L 10843058 5' - I-element 5278 1 75.34 CTTGGTCCCGTGCTCGGGATAATTGCTTCCCATCATCAGCGGCGGAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGCCCCGTCGTAAGCCGAA:1 - chrX 19744543 5' + P-element 19 1 71.43 GCTCTTCATATTTGTCTGGCTTTGCAAAAAAAAACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 + chrX 12344271 5' + F-element 44 1 64.38 CTAACTGCTCTTGCTGATCCATCGATGGGTTAACGTAAATCATCTGCAAAAAAAAATAATAGAAATAAGGGATAAGGTTTTTTTCGAAAAAGGTTTAAGTACTAAGCAAGGAAGTTCGACAGACATTGGTCCTTCGAGCCGGATCA:1 + chrX 20491352 5' + GATE 274 2 62.33 AAAACATTTTCAAAAGCCATTGAAAACTTTAATTGAAAATATCAAATTATGTTCGAGTTAGTGTCAGCATAAAAACAAGTCAAAACGCCTTGTCTTCAGTTCGATGAGGTTTCAAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTAC:1 - chr2L 16360716 5' + hobo 9 1 72.60 ATAAACATACGCATGGAACCTAGATCGAATTATAAGTTTATTGCCTACAAATTGTGAAATTATCCAACATTGTAAAAATTCCTATGATTTACAGTTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGTTTCACTTTCATTTCTTGAATAGTTT:1 - chr3R 4514523 5' - HB 1488 1 58.90 GCCAAGAGTATTTAAACTTTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:1 + chr3R 15035044 5' + Stalker2 7301 2 52.41 ACAAAATAAAATAGCTACAAAATGGCCAAAAAAAAAAGAGCGAGCAATAGTTGGGCGAGCAGCCAAAGGCCAGGGAGTCGCGTCTGCCGCAGAGGTGTGCCCCCTGATTAAATTTATTGTTTTATTATTT:1 - chr3R 27410529 5' + INE-1 410 1 79.23 AATAAACGAACCTTTTTTGTGTAAAATGTGGCTGATATGAATGAATTTGCGTGAAATTCTCAAGATTTTATTGGCCTAAATATAGTGATCTGCCTTCGAAGGTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3R 5684014 5' + pogo 13 1 75.17 CAAACAACACTTCCAATTAATCAAAACCCATAACATCGCACAGTGCCTGCAATTCGTATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr3L 5329092 5' - 412 437 2 58.70 TTAGTTACTTAGTTCATCCTTCTACCCCAAAAAACCCACTCGTGCATTTTCCTCTGTTCCCATTGTTCCCTAGTCGACTGTTGCAATAGTTTCTAGTTTTGTGACATATTCCAAGAATGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGAG:1 - chr3R 11560121 5' + R1A1-element 166 1 80.14 CGTTATCTTAAAATAGTTACGACCCCTAGTATTAGGTCAATAAGCCGCGAATGTTTTAATAACAATGCAGTCAGAGAGAATTAGTTTGCCTTAATGTATGAGAAAATGAATATAATGTAAAAATCCTATATTAAATATTACTGTTA:1 + chr3L 23269971 5' - Cr1a 4302 1 69.86 TTTCAACTCAAAAGGCAATCTTAAAATTCGCGGAAACTAACCATAAGCTATTTAGTTACCCAAATGGACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 + chr3L 5425442 5' - blood 7337 1 54.11 TAAAGAAGTCGAATAATAATTCTTCTCCAAGAAAAAGTTATTAGTTTATCTTTTCAACTATAACTTGTGAAGGTCAAAAACCAGAATTTCTGCCTATTATGTTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACTATTAAAGAAATAAAAGCGA:1 - chr3L 2734131 5' + HB 1490 1 50.68 AAAGTACCTTTAAAATCCCATTACCCTATTTGTGAACACAAACATATGAGTGCGGAATAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATGGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCT:1 + chr2L 2722350 5' - flea 4953 1 60.27 CGGCGGAGCGCGCAGCGAATGCTCTGCGTGTGCGGCGACGGCGAATCGTCGAATGAAAATGAATGAAACGGAATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chrX 1831341 5' + P-element 45 1 54.79 ATAAAGCCGCGGGCACGGGCCTGGAAATCCGGCTTCAATGCACTGGATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTGCAAT:1 - chr3R 24759234 5' - baggins 5317 1 58.33 ANGGGACTCTATCTGAAACCGGAGTATCTACACGATGGAAAACCGGTGTTCCGGCCTCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr2R 12872884 5' + P-element 63 1 40.97 GTTATCATTTCAATTAATGGCATATATAACGCAAGCAATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAACTCCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr3L 11887183 5' + Doc 51 1 51.37 CACGCGCACACATACGAATATGCGTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr2L 5656605 5' - hobo 2909 1 67.50 ATAGGCAAATTTCGTTCAATATTCTGAACTATTCGAATTTTTGCCGATGTAGTTCGCGAAAAATGCGTTGATCGCACGCACGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAG:1 + chrX 22652682 5' + ZAM 43 2 56.16 ATGTCGCAGTCATGTGGCAGCGACCTAAGTGCCCATTACACACGGCAGCCCCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 5767344 5' + roo 8702 2 59.59 TGCGTGTAAGAGGTTACATCTCGTAAAGTGTATTTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTTG:1 - chr2L 13763547 5' + Bari1 90 1 76.71 ATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 - chr3L 3540225 5' + mdg3 5294 2 52.74 AGGAATTCCAAATAACTACAAATTCAGCTTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 - chr2L 10128148 5' - hobo 2886 1 71.82 AAGTTCACCACCCACCACCCACCGCCCGCGCCCATTAATGGCGGAAAGAGAGCAAGTGGGCTTCCACAAAATGGGGCACAAACATAATGCCGGTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTG:1 - chr2L 3393881 5' - Stalker2 384 2 67.12 CGATTGGAATTCACCTTCACATCGAACTCCATGCCACGGATGCAGCGGGTCAGGTCGGTTAGATTGGCCTCGACGCGCTTTTGCTTGAGTGTGTGCATCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTG:1 + chr2R 23601355 5' - accord 180 2 71.09 GGCTGAGCCTGAAAGCTTTCTTCAAAACTCATACACACAGACATACATACACATACACATACACACGCTCACACTCGCACACGAACACAACGCACGAAAATGATGTAGGAAACAGAGAACTGCAAGGTTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chrX 6587567 5' + hobo 13 1 75.34 TACAGTCATATATTTTTATGAACTGTGCATTAAGCCACAATGAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr2L 2622661 5' - roo 8992 2 72.60 ATTTTTTCTGTTAGAATACACTGAGAGAAGTCAATGCAAAAATTAATAGTTGTGTATAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr3L 13015986 5' - hobo 2908 1 52.25 AGTTGCGTAAGAGGCCAGAGTTAAAATTAAAGATTTATAATTAACTTTACTGCATTTTACTCAATTCTGCAAAATGCATACCATGTTTCATTGCAAAGGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTAAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 15597058 5' + roo 21 2 70.55 ATCCGGCACTTCATAAATTCATTCGTTTGTATTTAAATTACACTCAAGGTGCACGAACTGGAGATACGCACATGCCGGAGATACATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTT:1 - chr2L 10178112 5' - mdg3 5461 2 59.59 ATCAGTGAACGGACTGTCTGTGTTGTGGTCTCGCCTCCTGGCCATTCCTCAACTTTTGGCCAAGAAGTACACTCGGTTTCCCTTTTTCGAGTGGGTCAGTGCAAAGACCCTAGAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTG:1 - chr3R 30262991 5' + Tc3 310 1 69.18 TCCAGCGAGAGCCACGAATTATGGCTTCATTCCCACAGAGAAATCCCAAGTGTTAGTCCAAGTCGTTTGCATTTATTCTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGAGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2L 20327749 5' + roo 8678 2 73.97 GTTAAAAATGTATTTATTCCTACCCTTTTCGCTCAGTGTAGCCACGTGAAACTTGACTAAGACTTGTTGCTGCCGTTGCCGTTTGGGTTTTGCTGCTTTTCTAGCTGAACAGTCAACGCGTCAAGTTGCGAAAGTGCGTCGAAAAA:1 - chr2L 15337373 5' + gypsy12 283 2 73.29 TATAGAATGGGTCCAGTCTGGTGGTGGCTCAAATGCGAGGGGAGAAGAGTACCTGTGGTATTATTAAGGAGACTACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 20253960 5' - roo 9026 1 54.79 AGAACTGTGGTATTTATTTGCAAGTCGCTTGGTATTTTCCAGCGCTTTCGGCGCGGTCCCACTGGACGCGAGTGTGTTTGCGAGTGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 + chr3L 13450676 5' + P-element 33 1 63.01 GTGTTTGTTTTTTCACCGAAGTGCCGTATACTTAACCTTTCTGTAAATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGAGGTTCTCC:1 - chr2R 18922602 5' - opus 7431 2 67.12 TGTTTGCCCTACCCAAGTTGCACATGCTGTCCAGTGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATCTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 + chrX 10698636 5' - mdg1 336 2 71.92 CGGGCTTTGACAAATGGTCGGACACGCCCATTTGGATGAAAACACTTTCGTTAATATTACTTAAGCTTTTTCATCATGAAACTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCAG:1 - chr3R 12753887 5' - copia 5021 2 61.64 CTATTTGCACAAACCTGGTTTTTGTGTACGAATATTCATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCC:1 + chr3R 29381521 5' - hobo 2876 1 71.20 AGTTCAGTTTCAATGGCCTTTATCAGCTGTTTGGCACATGGCGTTGGAAGTGCGGGTGTGTGTATGTATGTAAATAGTATGTACAGTACGTACGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 - chr3R 17079539 5' - 1360 3360 1 65.75 TTTACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1 - chr2R 5485154 5' - 1360 3332 1 57.53 GTTTTGGGTGAATCTTAAAATTTATGGGGTACTTTTAAAGGGCTTTGGGGAAATGAGGTATCGAATTTAACTTTAAAAGGAATTAGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTT:1 + chr3R 22160837 5' - copia 220 1 57.53 GTTGCGCTGCCGACGTCGCAGTCGGTGCTGTTTACACAATTCCACAACCGAAGTCCAGCAACAACAAAAACAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr2L 16536631 5' - pogo 2079 1 65.32 CTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:2 - chrX 12995410 5' + blood 59 2 57.53 CACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chr3L 10068910 5' + 412 7133 2 72.60 CATCATTTTAAATGCCAATTACAGTTGGAACAGGAGCAGGAGCAATGGAGGATAAAGGATATAGGATATGGGGTAAGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 + chr3R 15700309 5' - Transpac 267 2 57.53 TCTGCAGCTCATAAAACAGCTGGCAGCGCTGCCCATTTGGCGCAGTGGGGGATCTTGAGAGTGAGACGTAAATGGGAACCGTTATTTAATTAATCATCGTTATTTAATTTAATTTATTTAATTTAATCATCCTCTCACCGTGCTGG:1 + chr3L 20323268 5' + Rt1b 218 1 77.40 CATGGCCAAGATTATCTGAGAATATTCTACCTGTTACAAACTTTACAACTAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGTGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 + chrX 22715008 5' + opus 29 4 65.03 CTCAAATATTCAAGCCACACACACACTACAAAGTCTTATACAGCAATTAAAATTAATCATAGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chrX 6213621 5' - roo 9014 2 58.22 ACTCGCTTGGAATTCCGGTATCTATATGCCTGGGGCAGACATATCTATCTATCGTGGGGATGTATGGCTGCGCACAAACGATGGTAATTACCATGCTTGTCATAGCAAAAGGGGG:1 + chr3L 700111 5' + R1A1-element 4896 1 76.52 CACTTTACAAATACACACACAGCACACAGGCACGTGACATTGTGGTTAAGCTGGAAAAAAAGGTGAGAGTAAGCAAGAGGAAAGTGCGCCAACTTAAATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 - chrX 22578138 5' - 297 6959 2 73.29 TGTTGCGGTGCATCTTGGCGTACATATTGCTCATACGCCACGTGAAACAGCATCGGCTTATTTTCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGTAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 - chr2R 8492843 5' + pogo 53 1 56.85 GACCAATATGAATAATTGCTTGTAAATGTATTTAATATTTATTTCATTCATTTTGTAGCTACCATAAACCGAATCACGTTCCTCACAAACAGACTTGGCCAAAAATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATG:1 + chrX 14408148 5' + baggins 5199 1 67.81 GAGCCATTAGACCGAATTCGGTTTGGGCTTTTGATTCCTCCCACTCCGGGCCGCTCAATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 + chr3R 19989196 5' + hobo 16 1 73.97 CGAGATCGTTAATACCGCCTTCTCAGCTCTGCCGGTTCTAGATGATGACGACGATAGCGGCGGAGCAAAGATTAAGACGGAGGTGGATCCGTTGGAGGCGAATGCGGTGAGCTGATAAGTTAAGTTAGTTGCAATTGTGAAACATT:1 - chr3R 10760363 5' + aurora-element 4236 1 73.29 TGTTGAATTTAAGACCACGCAACATTTCGAGTTGCATAACATAGAGGAAAAGAAAAACGACAGTGGCAGCTGGATGATCATTTCCGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATTATTGGGTATAACATAG:1 - chr3L 27412308 5' + Stalker 6886 4 45.52 ATGCAACACCTTTACACATAATTAGGGGCCTGTTGACTGCGCCCGACAATGGATGTGTGTGTGTGTGTCTATGTGGAAGGTAAACACATGTCTACTTTGAGGCACAGCAAAAAAAAAAAGAATATATGCA:2 - chr3L 1430047 5' + invader2 300 1 52.31 CGCAAGCAAAAATAGAGCAATTAGATAATTGCAGGACACCGGGAATGGCTAAAAAAAAATACGTTAAGAAAATAAAAAAAAAAGGAAAAA:1 - chr2L 20854065 5' + F-element 4686 5 57.78 ATATAGAAAAGTGGCAGGGAGTATCAGTATTTGTGTCGCCGCGTTTTTACCGTTTGATAACCTAGAAAAGACGCCTAGGTAGGTATGAGTGTATGCAAGAGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr2R 14486621 5' + 297 6598 2 73.29 AAAAGTTGTGTCAACAATGTGAAAGATAAACAATGCGATAGTATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 + chr3R 23565207 5' + jockey 19 1 74.26 TCCAATATGGTGCATTCATACCTCTCTGTACGCGTATATATGTGCATTCGGATCGGAGGTATAGGTTTTTGTGTTTTGGCATCAGCTTGTGATATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 + chr3L 18420882 5' + jockey 4699 1 63.01 GGCAGCTGATTCCCGCAGGCTTTCAAGAAGCAAAATGACGGCAAGTGAGGGAAAGTTGCTGCTCATTGTTTAGCAGTTGATTTTTTTGACGCACTTTCCCGGCTGGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAG:1 - chrX 11280873 5' + X-element 33 1 69.86 CAAATATATATATATACACAAAAAAAAGAGTGGGATCTGTAGGATTTTTGGCGGCTCATGTCGGGCTTGTAATTAAGGTGCCATAAAATGCCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTTGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAA:1 + chr2L 10209758 5' - baggins 5128 1 53.42 CGGCGATAAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGCTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGAGATCCATCACA:1 - chr3R 31663337 5' + jockey 69 1 54.79 TACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr2L 12861731 5' + jockey 74 1 70.31 GAAGCCATCAAACAATGACGCGAAAATGCAATTCCATGTGCGAATCTGCCACACGATGTCAGGCGAAACAGACACAAAGCATTATGGTTAATGGTAAAAAATACACAAACCGAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGA:1 + chr3R 28273487 5' + F-element 4557 1 79.45 CGCGATGATAAAGTCGGAAGTCGAGGAAGCGGCGCGTGCCCGTGAATTAATGTAATTACTCTTGTCGTAGGTTGTTAAGATGGATAGATAGATAGAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTG:1 + chr2L 7595975 5' - mdg3 5473 2 65.07 CTCAACTGGTGGAAATCGATACGCATTTACGGACGTATACTCGGAATATCTACATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCA:1 + chr3L 21765366 5' + gypsy 12 2 77.40 GAGCAGACTGACATGGCCAAGATTATCTGAGAATATTCTACCTGTTACAAACTTTACAACTAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGTGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 + chrX 22714997 5' + opus 21 2 71.23 CTTGGTTAAAAAATAGATTTTGATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGCG:1 + chr3L 19951135 5' + Ivk 6 1 80.71 ATAGCCGTATAACTACGAGTCAAAAGATACATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTT:1 + chr2L 2336235 5' - 297 317 2 77.40 AATTATCAGAAAGACGCAAAATTTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATA:1 + chr3R 15157574 5' + invader3 64 2 50.34 AACAATTTGCTTGTGGGTCGTGTCATATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chr3L 20910126 5' + F-element 36 1 57.66 CCACATTTACTTCAACACACTGAGCGAAAATTTGGATCGAGTGACGATAGCGTTATAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr2L 8009151 5' - roo 345 2 60.96 AGAAAGGGGCTCCATTTGAATTTCGGAAAAAATCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:2 - chr3R 12540545 5' + roo 8752 2 80.14 GGGCGTCGCATCTGAATACTTTAAAGTCGGGCGTGGCAGGGGGCCGGCCCCCATGTGGTATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATTGGCGCGGGCATAAATTGAAATTTATATTAATTTAAA:1 - chr3R 6114924 5' - Transib5 2599 1 71.65 GTGCATTACATCCCTACACATCCTTACACACACACACGCACAGACAAACACACAAAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAGAGAGACCCAACAATTGCTCTCAGCACAGGAGCGCATAATGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACAC:1 + chr3L 17304022 5' + Porto1 418 1 67.81 TAGAAGAAATTAAAAATAAGAGAGAATAGAAATATGTAAAATCAAGAAAAAAATTAAAACATGGATAGGAAAATAATTTAATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAG:1 + chr3R 2527712 5' - INE-1 543 1 48.63 GCAGTGGAATAACAATACAAGCGCCAAATGGCCGGCAAACCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 29623304 5' - roo 327 2 72.60 TAGCAGCATCTGAAATAATCAATTTCATTTTATAAATACAGCGGTCAAGTAGTAAAATTTTTAATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCA:1 + chr2L 12447372 5' + opus 131 2 70.55 CAATCCCAATCGACCCCATATTCTTCTAGAGTAGCGTTTATTGTTATAGATGGGCTTTGTTAGAATGTTTCCAATATCTGTTCAGCACATACAGCCGAGGGCAAGTAAGTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACT:1 + chr2L 3393695 5' + Stalker2 7259 2 76.71 CCAATTCTAATTTACAGGAAAAAATGGAAGTAGATCACATTTTGCTTTCCTGGAACTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 14370661 5' + 412 66 2 63.01 GTATCGCTTGGGAAGAAAAAGAAAATGTAAAGATTTACGAAAGTTACAAAAATGTGCTCATTGAGTTACATTTGGATTCAAATAACTCGTGGTACATAACTGGACTTAAGGTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGC:2 - chr2L 21081937 5' - mdg3 157 2 79.45 GATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGA:1 + chr2L 20928068 5' + Chimpo 51 1 62.90 GCAAATGACTTTATGAATTTGCTGTTACGACTTGGACAAGCTCCGATGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATT:1 + chr3R 22275225 5' - flea 232 2 63.70 GACATTTGTGGCCATTTAATTTGGTAATCTAGCTAAAAGTCAAAGAATTTTCCCTATTATAATTGAAATGCTTAACTTAAACATTCGATTGTGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr3R 14174652 5' + 297 6606 2 69.18 TTGCAATCCGCTACGTTTTTCCGGCCACGAGCACCGACTGCCAATTTGTACGTCCATATATATTGAACAACGCCCTTTGTTTAAGTGCCGATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTC:1 + chr3R 29952650 5' + invader4 2785 2 65.75 CTGTCCCACAATTTTTTGATTTACGACTGGGTTCTTTGCAGAGAACTGCAGCCCGCAACTCGCACTCTAGGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGCACCC:1 - chr2L 9988172 5' - hobo 2893 1 59.05 ACCTGAAAAATGCAGTGCACTTTCCAAACAAACATATATATATATAAGTTAACGAAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAG:1 - chr2R 13773096 5' - opus 7422 2 76.03 GGTGGGGGAATTACCGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGG:1 - chrX 21667992 5' + gypsy2 6498 2 76.03 TAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATA:1 - chr3R 21276646 5' - BS 5055 1 49.32 GATTTGTGAAACCATACCACAATCCCACCATGGTTAAACTAACACCTGAAAGTTAAAAGCCACAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCG:1 - chr3R 7364316 5' - Quasimodo 7316 2 57.24 TAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGG:1 + chr3L 23112567 5' + R1A1-element 5100 1 75.17 ACTTTGCCAACTTATGCAATATGGCAGGAAGTTGGCAACTTTATCAATTACATTATATCAATTCATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCC:1 + chr3R 29429492 5' + F-element 195 1 52.50 CTCCACAGTCCAAGAAGGTGATATCGTTCTTCAAGAATCATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACAACCCTC:1 + chrX 15696709 5' + jockey 4748 1 70.14 ATCTAAAACGTTTTTTAGGCTGAAAATAGGAAAGCGTAAGGGTAAAACCTGAATGGAATGTCTGCTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chrX 126964 5' - hobo 2920 1 62.62 ATGCTTACAATCAGATCTGTCAGATCAGTTTCCTCTTCTCGCGGCAGAGGATTGCCTGTTTCGGTTGCCTTTTTGGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2R 18265990 5' + roo 8709 2 54.79 CGGTCAACCAAAAAGTGAAATCAAAAATGGAAAACCTATTCAAATGAGCCAAAAATAGTGCACACATTGAGCGAATTTTACGATGAAAGCCAAATTGCGAATTACCGTTGCATTTGTCTTGTAAAATAGTGCACACATTGAGCGAA:1 - chr3R 4576716 5' - Tc3 196 1 78.08 TCTAAACCAATTTGTGCGCCCAAGTTTTTGTGCATCTATAAACTCCACTGCCGCTGACGAAGTTGATGTTGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCCCTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCG:1 + chr2L 11584496 5' - Doc 472 1 61.94 GTAATCTTTTATGATTTTAATGGTCGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCT:1 - chr2L 19907644 5' - hobo 2875 1 61.64 ACGAATAACAAAAGTTTGAACGACATAATGTGGGTTGGGCCACGAGTTCAAAAAGATATTTTTGACATTATTATTAAATGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3R 19445281 5' + roo 42 2 56.85 GAGCACATGGCGCTACCGCACAAGTCAGTTTTTGCCGGGCTAACCTTGAAATCGCTGGATGTATGTATATATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCT:1 + chr3R 15453651 5' + Transpac 47 2 57.53 GCATCCCTTTCCCAATCCCAATCTCACACCCATTTTCCATTCCATTTTCCGAATCAGGTCAATGCACAATCGCAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chr2R 10960977 5' + Doc 55 1 50.68 CAGCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTT:1 + chrX 17690460 5' + Doc 274 1 67.78 CGCAGTACCAGAGTCAATTTGTAGTTCGTCTTTGCCAGCAGTTTGAAGTCTATTAATAACGAAATTTGGAAAGGCCAGAAAAGTACTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 11072411 5' - roo 9036 1 60.96 CCGCTCACTGAAGAACTCTCCGGGCCCCACAGCCCTCCGTCCCAAAACGTTGCAGTAGAGAGAAAAAGACATTCAGTGGGTGGCAGTTCGATGCATGGTGAAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr3R 4739835 5' - P-element 2867 1 71.92 GGCGCGGATTTTCCATAAACGAACGCGAATTCTTCAGGAGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr2L 951281 5' + F-element 43 1 59.59 GGTTTTCTGTTTTTGGGCCTCAACTTAGTTTTCGATGTTTTGAAGGGCAGTTTTAAGAAGGCTTAAAATGAGTGATGAGAAAATAGTTTACTTTTAATTACATTACACAGAAGCGGAATACTTATTTATAGTTATTTATTTGGTCA:1 + chr3R 19513712 5' - Tc1-2 475 1 73.97 CAGATTCCATATAGACTTTTATTTTACTTTTTTTAACATATAAAATATACATAATACTTTTTTAAAAAGTAATGTCACAAGTAGTTTTATTTCAGATGAATTTTGCAAAGCAAAATGCTGAATTACCGTTGCATTTGTCCCACTAT:1 + chr2R 6236716 5' - Tc3 146 1 56.85 GTCGTGGCTCATAATTCAGAGTTTTCAGTTAACTGGTCGGTCGGTTGGTTTCGATTCGAGCTTGACTTGGCTCGGTTTGGTTTGGTTTTGGCCCGGTTTTGGCTTTGGCTTACGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chr3R 29623168 5' + roo 6 2 76.03 CGAATGGCAATCCAAAATGCCAACAAGCGGCAGCTTAAATCGGCCACGGGAAACACCTCTTTAATAGGAGCTTCATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr3R 26658254 5' + hobo 47 1 52.74 AAAAATCCCTTCGCTGGAAACTCGGCACACATTAAACAACAACGGCGATAAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGGGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr3R 31663379 5' + jockey 26 1 71.92 CAAGCTCCGATGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATT:1 + chr3R 22275261 5' - flea 196 2 60.96 CAGAGCCATTAGACCGAATTCGGTTTGGGCTTTTGATTCCTCCCACTCCGGGCCGCTCAATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3R 19989194 5' + hobo 14 1 75.34 GTGGGAAATCTATGGTTTAACTGCACCACATTTCGATCTAAATTAAATTTGTTGAGTTATGGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chrX 19591145 5' + roo 53 2 60.00 GCGTTGAACGATCAACGTTGTTGCCGCGACAATGCTATCTATGTATCTATTTGCGTTCTTCTGGGGTAATTCGCCTGTTTGTTTACATCCTGGAACATCCAACTAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 - chrX 6644271 5' + FB 44 1 69.86 ATTTAAGCAATCAGTGACAAATAAGCGATTCAAGTGTTTAATTTGCAATTAAACAAATTGATGATGAATTAAAAAGCCTTTGAAAAAGAATTAAATCAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr2R 18922467 5' + opus 19 2 72.60 GCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAA:1 + chrX 17690462 5' + Doc 332 1 58.90 CTCCCACTCCGGGCCGCTCAATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr3R 19989233 5' + hobo 19 1 63.39 GCCCAGTTGAAAACCCCAGAGCTCATCACCTACAATAGTTCTGTCATCGGCACGATGTTTGCGGCATTAGCTGGCAACCCTTTCCCCAAAAACGTCAACAGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 8467683 5' - roo 9053 2 72.41 CAGAAAGTTAGAAGTTTGTACTGAAGCTCATCAAAAATGAATGAAGTATATATATATTTATGATTTTGATTTATATCCTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chrX 14121855 5' + Doc 46 1 51.37 GTGGGTGTATATAGAGTGTTTAAACGTAGATAGTGTGCTTATTTTAAAATATTTTTAAATGTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAA:2 + chr3L 25821778 5' - opus 444 2 56.16 AAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGGTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAA:1 - chr3R 11550279 5' + F-element 84 1 67.81 AAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGC:1 + chr3L 23456273 5' - Gypsy6A_LTR 253 1 70.55 AATGAACTCGTTACATTTATGTATGTGTTTATCAAACGTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATATTAA:1 - chrX 13351670 5' - roo 322 2 73.97 TTGAACTCGCTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr2R 10189245 5' + Doc 51 1 52.05 CTCGCTCATTTGAATGGCTCTCACGTACCTGATGTTTTGCGGGATGATGTTTTGGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2R 8467820 5' + roo 8730 2 63.01 ATATGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCTTGCTTGAGCTTGAGCGAGGCATGTCTGTTATGCGTAACGATCGAAAACTGACTGACTGATCTCTTCTTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACAT:1 + chr2R 4284685 5' - invader1 253 2 67.81 CTTGCAAATTGCGGCCCTAATTTGTCTTTTTACCCCTTATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGACAGCGGATGTTAATGTTTACA:1 - chr2L 14677877 5' - Quasimodo 177 2 71.92 ATAACTTTTTATGGAGTGAACCCAATTTTATTTGGTCTACGCTCAGAAGTTCGAAAAAGGATTCTGCGCTAAGATAAGAACCTATGTAAAAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGTAGCTAGTCAGTAAGATTCAAACACCCGA:2 + chr2R 4044817 5' + rooA 7558 2 56.85 TAAGGGGCTGGGTAGCCTGGCGAGCTGTGGATCCATGGACTTGGCCTTACTTGGAGTTTATCTCATATTTCACATGCCGCCGCAATTACTGCGGCTACTTACTTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGC:1 + chr3R 22179467 5' - jockey 462 1 70.55 ATGGTACACTTTTTTGGATCGATTTTTCTGGTCTTCTGTTCTGGTCTTGTCTCGCAGATTTTGCGGCAGACAAATTTATGAGCGTTAAGTGAAGGCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 - chr3R 30306374 5' + Doc 33 1 49.32 CTGCACTGGGAAAAATTTCTTATTGTTCACCACAAACTCTATTTAACTTCAAGCAACACTAAATTATAGATCATGACGCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTG:1 + chr2R 22616849 5' + BS 5049 1 53.42 ACCTTTGCATTTTAAGCACAAATTTACTGCGAGTTACTGGCTTTGGTCCTCCTGCTTTTTTTTCTGGTGGACACTTTATTGTGGCTGTAAAAACTGACTGAACAAATTTGAATAA:1 + chr3L 2664486 5' + hopper 992 2 51.30 CCGTGCTCGGGATAATTGCTTCCCATCATCAGCGGCGGAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGTAGCTTACCG:1 - chrX 19744536 5' + P-element 27 1 65.96 CGGAGAATTCTCTCTCTCTCAAGTGTCCGGTCCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAA:1 - chrX 13642093 5' + P-element 89 1 25.34 AGGCAACATTTTTTGTGTTTGCTCTTTGTGGTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGCCGCGGATAAAACAAAAACGTACTTGTGATCCATCACA:1 - chr3R 8625251 5' + jockey 69 1 71.43 AATAACTCTGCGCTCGTCTCCTGCGACTGTGTGTGTGCTGAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAAACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr3R 5087164 5' - P-element 2828 1 45.89 TTTAGGTAAATAATTTAAGAAGTAAAACTAATTATGTGTCATTAAACATTCTAAATACAAGGTTAAAGTCCAGCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chrX 127079 5' + hobo 47 1 53.42 TCTACACTCCGTTCAGCGCAACAGTCGATTTTGGCTGGTCTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATACTAT:2 - chrX 21087702 5' - mdg3 5481 2 57.53 TTAGGACTCGCATCCTTGGATGCTGACTTTGCACAGAGAAAAACTATGAAACATTTGCTGGCAGAATAACCTCCTTCAACTTGCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 + chr2R 21353154 5' + Transpac 4953 2 64.14 GTGTGCAGCTTCTTGTTGGCATAATATTTGTTGCCAATATACTCCACCACAGGTTTCAATCGCGTAGAAAACCCAAAGAAAACGTATTCATTCTCAATTGACTTGAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2L 8009005 5' + roo 14 2 73.97 GAATCCACATGAAAAGCTGATCCCAGAAGCAGACTACATATTCTAGTCATGTTTTTGCTATTAAAATTCCTTAGTCTAAGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 - 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chr2R 19088165 5' + INE-1 121 1 71.23 TTTTATAAATACAGCGGTCAAGTAGTAAAATTTTTAATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGTTCTCGCGTTTTCG:1 + chr2L 12447399 5' + opus 156 4 54.17 TACCATGGGAATATTCCTTGAGTTTGAATTTGCAGTTCCACCTCATAAACAATAAAAAAAAACTCATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGG:1 + chrX 4818501 5' + Bari1 56 1 55.48 ACATGATGATGATTATGGAACCATTACTGGAACACTAAAGGGCTTGCATCTAGCAGGATGAATGGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chrX 6053025 5' + roo 56 2 56.85 ATATTAGCATACCATTAGAATACTTCTAATCTACATTTGAGGATTGTCAATCTGATATTAATAAGCTTGAAATGGCTTGTGTTCCGATAATATCTTATAATGTAACATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:2 + chr2R 8374971 5' + roo 11 2 75.34 ATATGAATTTTATTACATTTACGTATACGTACTAATTTCTATCATATTCGAACGACAAACATTCCCGGAGAAATCTTAACATATAGATGTCATTAGGAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr2R 11371408 5' - pogo 2079 1 69.18 TTAAAATTAAATTCTTAGAGCTTATCTCAATTTATGATTTTTATATGCAGTAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACAC:1 - chr3L 15374741 5' - 3S18 300 2 58.22 ATAGATCTATTCGTTTTCTGGTATTTTTGTTGCAGTTTTTTGCTCGGATCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCA:1 - chr2L 12910727 5' - Idefix 182 1 69.63 TGAATATCTTGTTATGATCTTTTTTGAATATCTTGAGCTGCGTCTTTGTCTCTGGAATCTGAATGCTGAATCTCACCCTTCTAGCTTTATATAGTTCCTGAGATCTCGGCGTTCAT:1 + chrX 20526860 5' - INE-1 139 1 73.28 TTCCACCTCATAAACAATAAAAAAAAACTCATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTTG:1 + chrX 4818536 5' + Bari1 90 1 79.31 CAAGCTTGTAAAAACAATAATAATATTCGAATTCAGATTCGGTCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 - chr3R 17794637 5' - P-element 2812 1 17.93 TAAACAAAGATTGTCGCTTCCCGCTTTATATAAACAGAATTATTCTACAAAGGAGGAGCCCTCACTTGAGCTGTACTTTGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:2 + chr3L 1728431 5' + blood 7053 2 56.85 TGGCAGTCGGGCCGAAACAGACCATGAGAGTCATTGTGGACGGCGTAGACAAGGTGAGCATTTGCCTCCAATGTATCCTTGTCCACGTAGATTACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGT:1 + chr2L 21186124 5' + hobo 2505 1 68.49 CAGTGGAACTGATCCGAAATTTCCGAATTTGGGACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chrX 22760338 5' - roo 8986 2 75.69 TTAAAATAAAAAATGTTCTTGTATCATTTCAACCTCAATTGGATTGTATCAATTTCTTAAGCCATTGTTCCACCATAATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3R 7305885 5' + 412 41 2 57.53 ATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAATTAGTATCATACTACCGACTGCGCCACT:1 - chr2R 4122891 5' - rover 365 1 78.77 GGGCGTAACCAAAGTATTTTTGGTATTCACATAGAACGTGCCAAGCTAATCATCAACAAACTTCTGCTACGTCTTTGTCTCTAGAATCCTTATGGTAAATCTAAGCCCTCTAGCTTTTATCCTTTCTGAGATCTCGACGTTCATAC:1 - chr2R 5789323 5' - INE-1 137 1 63.70 TTTGCATTAAAGCAGGCGTAACAGCCAGAGCTTGGAATCAAGTTATTACGCGTATACAAATATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 - chr2R 11394206 5' - pogo 2046 1 58.90 TTGTGGATTCAGTAAACTCGACTTTGATTTCGCTATCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGC:1 - chr3L 1728526 5' - blood 7307 2 75.35 GAAATCATAAATTACCCCAAAAAGTATGCAACATAATACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGAGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr2L 12861695 5' + jockey 37 1 40.62 AAAAACTATGCGTGTGTAAATATAAATATACACGTGTTTAAATATTCGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chrX 20369382 5' - roo 335 2 67.81 AAATGGGCGAATGCGAATGTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 + chr3L 1983419 5' - Transpac 277 2 63.01 GAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chrX 3637782 5' - roo 331 2 68.49 TTGTCTAGGCGATGCGCCGAAAAAAATATACAATACTGCGAGGAAATGGATATACATATATCATTAATTGGTAACAAGCAGAAACGTTTCCGACCATATAAAGTCTATATATTCCTGGCCATATCCGGCCATATCCGTCTGTCCGT:1 + chr3L 19666213 5' + INE-1 117 1 52.74 AATTTTCTTAAATAGGAACCAGTTTTATGATTGTAATAAAAGTTTATTTTCTTAATTATTAATAGGGTATAAAAGTATGTTACAATATCTTTTAAGATCAGTCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTA:1 - chr2L 17297103 5' + Max-element 20 2 72.60 AATACCTACACATAGGGTGTAATTAAAATGCAAGCAATAATGCACTTATATTTTAAATATATGGTATATATATAGTATAATAGTATAATATATAGCTTACATTTTCTTAACAACCAAATTTATTTTATTGTTGTTATATGGAATGT:1 - chr3R 17211699 5' + HB 99 1 72.60 ATACATTCTTACATATATCATAGTAACGCTTACGTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAG:1 + chr2L 19817821 5' - G4 3781 1 60.27 AGAGTGCGCCGCAAAGGGAAAGAAGAGCGAGCATGCTCTCATTTAGTTAGAAAAACACTTTTAAAAAGTGCACCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 + chrX 7930666 5' + P-element 48 1 52.74 GTATACCCTGCAAAAGTTGTGTCAACAATGTGAAAGATAAACACTGCAATAGTATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3R 23565196 5' + jockey 12 1 75.71 TTGCTGTGCATCTGTGTACCCGAGTATTCGTGTATCTGTGTGCTTGGCAGTTATAACACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chr2L 20269020 5' + hobo 56 1 57.14 CAGATATTAGTAATAAATATATATTTTTCCATATGTGTCACCGTTTGGGCGCCAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATA:1 - chr2L 8859045 5' - Burdock 6320 2 72.60 CATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATATAATAAACTAAAT:1 + chr2L 615244 5' + F-element 85 1 67.86 TACTCGATTTAATTTATTAATGTAAATTAAACACATTTACATGATTCACACAAGGTTGTACGCAATAAAAAGTTGTTATAGAATTCGTCTTCTGAAAATAACAATAGTTTAACTAATCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCA:1 + chr3R 25079227 5' - P-element 365 1 70.55 TTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 - chr2R 10666919 5' + hobo 77 1 69.18 AGGCGACAAAAATGTTGTAGGTGCACTGGAAAAAGTCAAAGTTCATTGTGTATTTTGATAGCTGTGAAAATAAGATACAATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 + chrX 18561037 5' - copia 214 2 56.16 ACGCTTCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACA:1 - chr2L 15057242 5' + hobo 82 1 74.66 TTTAGAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr3L 12776046 5' + roo 8744 2 75.34 TGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGCGTGCG:1 + chr2L 5656581 5' + hobo 41 1 70.11 TGAAAGACATAACTGCGAAAAATATATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr2R 8375149 5' - roo 9038 1 62.33 ACAAACTATAGCTAGATTTCATATGCTGGATGAGCTGTGCACGAAAGTAAAAACAATTTTTTAACATCAGACAGAAGACTTAAAATATTTCACGTGCTAGTGCCTATAGCACTTCAAGTGAACAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCG:1 + chr3R 9591070 5' + Doc3-element 19 2 53.42 ACAGAGAACCATAAATCGACGAAACAGTATCGAGGTTTTTTAAGGAGGATGCGGACTGATACGGCACTCTCGGAAGACTAAACAATGTTGAGTGGGTTTCCAAAATGTGTTGGTAATGCGTGTAGAGTTAAGAACTACGCATAATT:1 - chr2R 3141871 5' + invader1 3867 2 62.33 TAACTTGGCCCACACACACAGACACACATAGATTGGTAGCAAAAACAATGCCCTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3L 17142814 5' - hobo 2893 1 56.00 AACCCATACCACAAGCATCATTTTAAATGCCAATTACAGTTGGAACAGGAGCAGGAGCAATGGAGGATAAAGGATATAGGATATGGGGTAAGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 + chr3R 15700294 5' - Transpac 282 2 67.81 ATTTTAATGGTCGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACA:1 - chr2L 19907631 5' - hobo 2862 1 70.55 TTTGAATTATTGGTGTTCCGGGTTTTAGGATAGATTTTTCTTTTTTTTTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAA:1 + chr3L 25502097 5' - R2-element 3489 1 74.66 GCCATCCCCATTCCCCTTCAGCAGTTAGCAGCCGGGCTAGTTGGGACAGAAATGTATCCCCATGTGAAATGCATGTTTGCATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 5329209 5' + 412 7095 2 56.85 TTCCAGGTGCAAAATTATTCGACTGACGAAAAAGCTGCAGGAATCTGCGAATGCTGGCAAGATGTAAGAAAATAAGACTCAAGTGCAGTGAGAAAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chrX 2821998 5' + roo 25 2 71.23 ACTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGG:1 - chrX 22824264 5' - Gypsy12A_LTR 2244 1 56.85 TTTTGGTCAACTTTTCTGACTCAAAAGACTCTCGGTGGAGTTAGCAAGCTTAAATGATTTTTAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2L 15596912 5' - roo 9016 2 61.64 TAATGAGCGCCACCAGTGATATCCAGCGTAATAATCCACAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 - chr2R 18056908 5' + blood 47 2 54.11 CACACACACACTACAAAGTCTTATACAGCAATTAAAATTAATCATAGCATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chrX 6213606 5' - roo 335 2 69.86 ACCCGGGTTTAAGGTTACGCCACTGCCATCGATTGCCTTTGAACTGGTCTTAGCCATGAATCCAACGCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCCAACAATGTGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr3R 29719276 5' + hobo 12 1 77.40 ATTATTATAAAATACGAGTTTCTTCACGAAATGCACCCGCTGCTCTTAGTATTGATTTAATCGCAGCTGTATGTTCGGTCTTGAGTTGGTTCCGAATGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGT:1 - chr3R 3846852 5' - Idefix 41 2 71.23 AAACTGGGGGAATCTGGGGAATGTGCCTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCTTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCGACGCCACCACTTC:1 + chr3L 19398154 5' + gypsy5 7023 2 76.87 GAAATATGTAAACTAAAATACCGTTGAGCAAAATTGGAAAAGTATGAGTGCAATTTGAAAAAACAAACGAGTTAATCAAGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 - chr3R 11142306 5' - Max-element 8508 2 62.31 AATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAATCTCGGCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:1 + chr3L 11887219 5' + Doc 86 1 73.29 ACTTCATCAACATTTTAAACTGCCAGCCAGCTTTCTTTTTTAATTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACT:1 + chr2L 2518518 5' - jockey 4911 1 74.66 TAATATCTGACCATCGATCGGTCCCACTGTGCAGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr3R 17794617 5' - P-element 2847 1 49.59 GAGGAGCTGAAGAAGATCGCGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTC:1 - chr2L 15768909 5' + Cr1a 4402 1 78.57 TACGGAAATCATGATAACAGATAGTGGTCTTGCGGTATTTAGAGAGGCTTATGAGTATGTAGTAGTAGCAGTAGAGTAGTAGAAACAACATCAACAACAACAACATCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 + chr3L 13778496 5' + I-element 17 1 73.29 ACTATTGATAAGGTCGCAAATCCTATCCAGACGATGGCGTTGGTTTCCCAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACAT:1 - chr3R 26969356 5' + copia 4942 2 69.86 AATACTTATCAAGAAAAGAAATATAGAAAAAACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1 - chrX 8610368 5' + mdg3 5262 1 78.08 GTATATAAATCGCTTTAGGTGTAGGAGAAAACTGGCAGCGAATGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:1 - 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Tirant 399 1 76.27 TATTTCAAGGTATAAAATCTTTCATACAAAATGTTAGATTTTTTAATCAAACATTTAGTGGTAATAAACCATTAGCACATTTAATGGCCCGCTAATTGATATTCAGTCGTGCTTTGGCTGCTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTCTCTT:1 - chr3L 3544392 5' - Doc2-element 220 1 80.14 ATGGTTATTTGGGATTTATTATTTTGGTTTATTGTTTTCGATAGTGTAATACAATAATGTATATGAACGGCATTCCTTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCT:1 + chr3R 11142173 5' + Max-element 8281 2 54.11 ACAGAAATTTAATAAACTTTTAAAGGCTTGATCTTGGGTGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2R 21244958 5' - roo 9010 2 64.38 GATGCACCGAACAAAATATTGGTACTTCACATTAAATAAAATGGTACTTTTAATAGTAATAAATATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 11609841 5' - roo 9052 2 71.92 AGCTGTACCAGCTGTTTTCCGCACTAACACACGCACACTGCCCTCTCGATAAACCGCAACACGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 - chr3L 7370565 5' + Burdock 50 2 55.00 GTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGTGGCGCTGCCGTG:1 - 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chr3R 29901117 5' + flea 4832 1 71.92 CGGCGGTACTAGCGCGTCGATCTTATGCGCATGCCCCCGATTCGCGGCGATCCAAAGCGATCCAAGCGGATCCGAACGATCCAAGCCGATCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTCA:1 - chr2L 8700086 5' + P-element 24 1 62.41 ACTCACCTTTTGCTATTAATATAAGAAGTTTAGACACAAAATGCGAGTAAATGGGGAGATATAAGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAG:1 - chr2L 15524024 5' + opus 7057 4 57.93 ATGGCACCCAAATAAGCAATTTAGGTATGCAACGTATTTTGAGGGGTTAGCAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 + chr2L 19565416 5' - jockey 4954 1 59.59 TTGAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCA:1 - chr3L 23839747 5' + McClintock 5988 2 60.27 CAAAAAGTATGCAACATAATACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAACCA:1 + chr2L 12861712 5' + jockey 73 1 59.59 TATGGGCGATGACAGCTTATTAAATGGGCTGTAACTTCATCGCAAAATACATTCTTATTTTTGTGTAAGTAAGTAATGTAAGTAGAATGTATGGGGTTGGAGTTGCGCGTGAGTTACCTCCGGGGAGTCTTGCGGAGGTATTATC:1 - 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HMS-Beagle 207 2 58.90 AAATATCCGAGGGATGAGTCCTTTCAGGGGAGATGGTACTTCGGATGGGGGAGTGCGTCTGAGTCGGACATTGATACAGGTACTGGGTATTCGGGCCGCTGTGTTGACAAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGA:1 + chr3L 18316236 5' + F-element 4319 1 74.66 TGCATAAAATAGTTTTCATATATAAAGCAGTGTGTCAACACACAGTGTGTGCTAAGGATTCAAACCTTAATTTGTTTAAATAAGCACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACA:1 + chr3L 15374596 5' + 3S18 37 2 61.64 AGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 + chr2L 5656564 5' + hobo 61 1 66.94 GCGCTGTTAAGTATGCTATATTAAATTGCATTGTGTGGATTTGCACTGACGCTTCTATTTCAATCCAACTGACTGCGGCTAAATGCATCCAGAGCATTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 22266394 5' - roo 395 1 71.94 CGAAGTGCCGTATACTTAACCTTTCTGTAAATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGAT:1 - chr2R 18922586 5' - opus 412 2 79.45 GCATCATTCGATTCGATTCGTTCTTTTCGCCCGGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 + chrX 13642050 5' - P-element 2799 1 25.34 AATATCGTAAGAATATCATAGATTTAAGGCAGAGCATTTCAGACAGCACTTGTACCGTTCTAGACTTAAGAATTCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chr3R 18514447 5' - pogo 2057 1 54.11 AAGCAATTTTTTCTCAGTGCGACAGAAGGAAGCATAAAATGCCAAAAGGAATTAAGGTTATGCCTCAGTCTGCTGTCTCTATACATACACATATATATGCCACATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 - chrX 7657558 5' + I-element 18 1 72.60 ATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGTTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAAC:1 + chr2L 12447435 5' + opus 194 2 71.23 AATACAAGGTTTAGGAATACCAACATATGATATTCTCAAAAATGATGATGATTATGGAACCATTACTGGAACACTAAAGGGCTTGCATCTAGCAGGATGAATGGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chrX 6053064 5' + roo 8681 2 68.49 GCTAAACTTAGGACCCTACCTCGGTGGCAGATGCCGAAAATAAGCATATTGTTGTAATTAATAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCA:1 - chr3R 29715153 5' + hobo 303 1 58.22 CCCGCGCCCATTAATGGCGGAAAGAGAGCAAGTGGGCTTCCACAAAATGGGGCACAAACATAATGCCGGTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGT:1 - 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chr4 632193 5' + F-element 380 1 58.62 TTTAATACTATCTTACGGATACAGATACCGTTCTCTCGATCCGCTCTCCCCAGCTCGCTCTCCCCACTCTCTCTCTCTCCGTGCACCGATCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr3L 13477315 5' - P-element 2857 1 63.70 CATATTGTATATGTACACTGATGAAAGAGTCGAGATCTTATCTTATTATTTCATATCAATCGATAAATCTTTAAGATGCTTCTAAATTGTAATCTATTTTTGACATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 18860720 5' + roo 8681 2 66.44 TGCACTGGGAAAAATTTCTTATTGTTCACCACAAACTCTATTTAACTTCAAGCAACACTAAATTATAGATCATGACGCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGC:1 + chr2R 22616850 5' + BS 5050 1 52.74 AAGAGTGGACCAACCAAACGGGGAGTCCCAATTGAAAGTGTGCCAAGTAATGTTATGTGATTCCCACTTCCATGTATTTTCACATCGGCTGTATCTATTTTAAGAGCTTGATGTAAATTGTTTCCCTTACCACCTCGCCACCAAGC:1 + chr2L 10688068 5' + G6 1825 1 59.59 GCACTGATAAAGACCGAAACAAAGGAAACGGCGGCAATCGCCAAGCTTTTCATTGAAAAAATCTTTTAAGGAGAAAAGTGTTGCATAAACAAGAGCGCCCACAAAGAACTTATGTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCA:1 - chr2R 18528846 5' - jockey 4980 1 78.77 AAGATTACACGTTCAAACAGAAAACTTGCTAAAAAAATTGACAGTTTTACCAAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTT:1 - chrX 8358766 5' + Doc 72 1 63.01 AGACTTCTGGTCTATAAGGTCGGTTCGGATGGGGGAAGTATGTACATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 + chr2L 9228679 5' - Burdock 217 2 62.39 ATGTATTTTCTCCCGGTGCATGTCTTTTATGTTCCCTCATTCGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chrX 19162542 5' - pogo 2078 1 66.44 CACACAAAATAGATGCCAATCACAGAGTTCTTCGGCGGAGAGAGAGCAGCTAAAGACGCTGTCAGGTACCCCGTTCAGCCCTAGTGGCTT:1 + chr3R 11083408 5' + Rt1b 4693 1 64.44 GCCACGCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGCTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCCCTGA:1 - chrX 22913206 5' + gypsy7 5262 2 64.41 ATAGTGCTATCTAAAAATGGAATTTTACGCCCACCTGGCAACTCTAGAGCAGCTCCAAAAGCTCCCTATCTACCTTACTCTCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2R 16031464 5' + hobo 40 1 58.90 CAAGAGTCTATTTTGTAAGGGCAATATACAATTCTACAATACAATTCTTTTTATACCCGGTACTCTAGATTCGAGACTTTCCGACCACATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGT:1 + chr4 520300 5' + INE-1 109 1 74.66 ACAATTTAATTAGCCTGGTCAATAATCTCCAGGGTAAAGTTATACGAGTATATGATTTCAACGACCCGAATTTGAGCCAATTAATCTTACGCCCAAATCGCGTGCACTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr3L 9994049 5' - hobo 2923 1 75.34 GTTTCTTTCACCTGTTTTGCCGGGAAGTAGGCAACATTTTTTGTGTTTGCTCTTTGTGGTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 8625279 5' + jockey 36 1 56.52 TCTTTACAGTTGTCTGCTTACAGTTATTTATTGTTCATAATTATCTAAAAATAATCAAGATTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTT:1 - chr3R 17401792 5' + Juan 62 1 60.27 TCTGTGCATATCAACGAACGGGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrY 311459 5' + 1360 5 2 58.90 CGACACCTCCATAAAATTAATTAACCCCCAATAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 + chr3R 12569604 5' + blood 7096 2 75.34 TTAATTTTTTATGCATGAAGTGTAAATTAAAATTAAATTGACTGTGCGGTCAAAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGTTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 - chr3L 19434161 5' + Doc 75 1 70.55 GGGGCGTATGCGCAATTTGCATATGACAAGCTACAAAACGACTTGAACTGATGACGATGCCGCAGTTAAACGAATGTGTCCCGCCTCTTAATTGGCTAAATACATTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:2 + chr2R 14921429 5' + pogo 15 1 75.34 TTATTGTTATCGTTGGAAATGAAAAATTGTCCCTTTGTTGCATATAAAAACAATGGGCCAAAGAACTTGAAATCAATTTCAAACGTTTTAGGCAAAGCCAATTGATTTATTTGTTGTGCGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 - 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chr3L 1729613 5' + blood 82 2 78.08 GTTTTTACTTCCAGTATCAAGTTACCCCAGACAGTTTTATGCACAAAGCAAGAAAATAAAGAGAAATATATCTATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACG:1 + chr3R 8884287 5' + HMS-Beagle 45 2 53.42 GTGTGTAGGGTTTAATCAAATATAGAATAAATAGGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3R 18539857 5' - roo 321 2 78.77 ACTGAAGTGCAACTTTTGTCATAACGTTAAAGTGTTAGAAACGAAATTGTGCTAAATTTTTTATATATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCAGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTT:1 - chr3R 7842109 5' + 1360 3218 1 54.79 CTAGAGCAGCTCCAAAAGCTCCCTATCTACCTTACTCTCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGAACTTACA:1 - chr2R 16031421 5' + hobo 76 1 71.22 ATAAATGGAGAAGCGAAGGATGTTTAGATAAATTGCGCCTGCAGAGATTTACAAATTACGCCCGAGGCGGCGAATGGCGAAAATGGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAAT:1 + chr2R 18467099 5' + roo 19 2 66.15 ATATTGCTCATACGCCACGTGAAACAGCATCGGCTTATTTTCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGTAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAGAATTTGTACGAA:1 - chr2R 8492820 5' + pogo 76 1 65.75 CCACTGTGCAGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 - chr3R 17794594 5' - P-element 2825 1 30.83 ATCTTGGCGTACATATTGCTCATACGCCACGTGAAACAGCATCGGCTTATTTTCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGTAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chr2R 8492832 5' + pogo 64 1 64.38 TTGAGCACAAGTATTTACAACCCATGAGAGTGGAAACGAAAATGAAATCGAGCAGTGAGTGGGCACTGGAAAAGTTATGCACTCGCCAGATACATTTTGAAATCATTGATCCAATATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAA:1 - chr2L 7123182 5' - accord 7085 2 78.77 GTAGAGAAACCCACACACAAAACGCACACCTAAGTCCCCCCACGAAAAGTATTTATGATTATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAG:1 - chr2L 1411774 5' - I-element 5292 1 62.33 GACCGGAATGATTACCAATGTTTTCGGATTCGGAATGGTTCTTCTACACTTTCCCCACCGCCTAGGCGGCGCTTTCGTTTTGATTTGAATGTAAATTTGGTAACTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATA:1 - chr2L 8853923 5' - Burdock 6197 2 73.10 AGCACTATAAACAATATTCTTTTAATTTCTGTTCTCTTGCTTTTTCTGGTCTTCTGTTCTGGTCTTGTCTCGCAGATTTTGCGGCAGACAAATTTATGAGCGTTAAGTGAAGGCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr3L 16196957 5' + Doc 14 1 78.62 TCACAAATTAATTGAATTTTTGGTATTCATTGTGCGGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - 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chr3L 18574913 5' - I-element 5289 1 63.01 ACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGACGAAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAA:1 + chr2L 20985784 5' + F-element 89 1 67.81 AATCGAGGCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr2R 14767342 5' + Tirant 8115 2 75.45 AAGAGGCAAGTTAAAAAAAAAATATAGAAAAGAGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr3R 13571985 5' + 412 27 2 64.29 AACGATTACTCATGTCGACCAAATCAATTAAAAGCCATTCCCATTATCGTTAGCCAGCGGAAGTGTATCTGCACCATATGAAAGGCCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr2L 20068101 5' - roo 9036 1 61.64 GAGCGCAACAAAAATATAGAACTATATTATATTAATACATATGTAAAGATAAGGTGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 + chr2L 12814718 5' + hobo 64 1 60.27 CATGCAGTTTATGTTGTTGTAGTTCGGCTGCATTTGAATCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1 - 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jockey 4925 1 65.07 GAGTGAGACGAGTGTTAGACATATGATGACAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACC:1 - chr2L 16202673 5' + copia 89 2 78.77 CTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTCATTAC:1 + chr3L 19951180 5' + Ivk 57 1 54.79 TAAAGTACACATAGTTACACATAGGCGATACATACACAGGGTTACAGATATAATTGGGTATGGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1 - chr3R 17747382 5' + 297 6632 2 56.85 CATATGAACAGATTCCGACATAATTGAATGTGTATAATCTATAGGCTTATTGCATGATGACGTCTGCAGTTTTATAACCAAATTGAATTTCATTTCAGCTTCACACATTAAATAAATTGACTGACAACCCTAAAAGAGTGGCTACG:1 + chr3R 21817472 5' + mdg3 333 1 77.40 GTCAAGATAAAAGTTCTATTGACAAAATTAAGGTTTATTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3L 18954097 5' - roo 9039 1 63.70 GTGTAAATATAAATATACACGTGTTTAAATATTCGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAATTAGGTGACATGAGAA:1 + chrX 20369395 5' - roo 333 2 73.33 ACTTGCTTTGCACATCTATGTATATCTAACTCTTTGACTGAGTAATGGGTATCTGATAGTCGTGGAACTCTACTATACCTTTTTTGACCTGCTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3L 22519128 5' + pogo 23 1 68.49 GAATATTCCTTGAGTTTGAATTTGCAGTTCCACCTCATAAACAATAAAAAAAAACTCATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAG:1 + chrX 4818509 5' + Bari1 62 1 60.42 CATTTGAAAGCGAAAGTATTTCTCCCTCGACATTTTGGTATGCGGGGGCGCTGTGGTTGCGCAACTCGTAATAAAAGCCGGATAACCGGATACACGCGAAATTAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 18786112 5' - roo 9054 2 71.92 CCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGAAAATATAGTTATGCGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGGTGTGGCCAAAAGATCGTTGCATCCAGAAACGACTTCG:1 + chr3L 1983476 5' - Transpac 5171 2 66.67 ACTCAATTCTGCAAAATGCATACCATGTTTCATTGCAAAGGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr2L 15597000 5' + roo 8743 2 71.92 CTGCTGTCCCCATGTGTGTGCGTGTTTGTTTGCTTTGTGCGAACGATAAACAAGAATATACATATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAA:1 - chr3R 19625997 5' - flea 4961 2 60.96 GAGTGTTTTTTTTATTGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTAT:1 - chr3R 23021021 5' + INE-1 564 1 52.74 CGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGGATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGAA:1 + chr2R 4260424 5' + micropia 5216 1 43.84 TATTGCCCCCTCAGAGGAACCGGATTCCCTCCTCTTTCTTCTGCTTTCATACACTGAACAATATATTTAATCATTTTACATTTTTTTTTATATTTTTAAGAAAATACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 - chr3R 12936226 5' + F-element 30 1 50.00 AATAAATATTTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 11873326 5' + 412 47 2 52.74 AAGCTATGGTATTATAACCAGAGTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGGGGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTT:1 - chr3R 13198277 5' + Doc 72 1 63.70 CTTATGGGTTACCTTTGCTATTCATAACTTACACGGGCCATAAAATATTTATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr2R 22040914 5' + jockey 69 1 66.42 GTGAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 + chrX 21087537 5' + mdg3 27 2 64.38 AATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chr3L 13546567 5' + hobo 62 1 69.17 AACTCAGCCTCGATGTTTGGCCAACCCTTCGTGCTGCTGATGAGATGGCTCAATTGAGAGCTTTAATTAAATTATGTTGGTATGCACAGGATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - 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hobo 2912 1 65.75 AATCCTCCGTTTCTCCGTTCCTCCACTGACGCCTCTGTGCTACGCTGCTCGTCTGGCTGCCAACAGGAAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr3R 13572156 5' - 412 472 2 72.60 TGTAGCCTCGAATAATTTCCATATCCTGTGTAGCTGCTCTAATGTATTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 + chr3L 13631268 5' + hobo 68 1 65.71 GACTTATTAAAGTATTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTT:1 - chrX 21638110 5' + gtwin 66 2 63.01 ACGTTCATACGTTTCATGCTCGTAAATGTTAAAATCAAAATTTATTCATTGTTGCATTATTTTCACCTCTTTAACGAAAACAATCTTCGGTATATCCTGTATGTATATCGATTACAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chrX 10344705 5' - roo 402 1 52.74 ACTTTTCTGCGGCTCAGTGGCGACGACGACTGTGGCAATAGTTTTGTAATTAGCTTGCGATGTCCCAGGTGATAAGTGATATTTAAGGCACTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2R 18785913 5' + roo 32 2 41.10 GGGATGGTTTGTGTGTAAATTTGATTTCACAACATTTTCTCAGTGCGTCGCTCCAACTTTCGGCCTTTACGATGCACATAAATATTACGACCAAGTTCAAGTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr3R 6603904 5' - pogo 2086 1 75.34 CAATCCTCCGTTTCTCCGTTCCTCCACTGACGCCTCTGTGCTACGCTGCTCGTCTGGCTGCCAACAGGAAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr3R 13572157 5' - 412 473 2 73.29 GTACAGACTTCTTCTATAAGTCGAACTGAAAGCACAAGCCCAATTTAAATTCCGGCTTAGAAGAAAAGCTTCAGTTTGAATATTTCAAATGCTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:2 + chrX 13008657 5' - blood 347 2 65.07 AACTTACAGCCATAATTCAAAAGAAGATACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3L 19938578 5' + roo 8716 2 56.16 ATCAGTTTCTAGATCTAATTTGCCACACAACAGACTATTTCAGATTGTATGGCATTATAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTA:1 + chrX 18318154 5' - copia 192 2 61.64 AATATTAATAAAAAACTCGTATTATTTTTGAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCGTATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCT:1 - chr3L 23839774 5' + McClintock 5961 2 77.40 CAAGGAGCTGCGGCCGATAGGAGTCCTGCGGTCGGTTAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr3L 13631331 5' - hobo 2902 1 62.00 AGGACGAACGTCTTAATTAGCCCTGCGAAAAGCGCGAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 + chr2R 17872441 5' + Tirant 31 2 63.01 AGTCTAGACTTCATTTTAGCTTACTATCGAAACAATTTGACGCATATTTCGATCTTTACAAAACAATACCTTAGCTCTTATACTCGCATTTCATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAA:1 - chr3R 20840706 5' + BS 5024 1 56.85 CCACTGCTTCACACTTTGCCAACTTATGCAATATGGCAGGAAGTTGGCAACTTTATCAATTACATTATATCAATTCATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAG:1 + chr3R 29429480 5' + F-element 209 1 51.37 GTTTCCTTGGGCGAATTGAAGTATCCAGCATTCTGGTGCTGAATTTGAGCGCTGCCTGAAAGATTCTTCTCGTTTTGTATTACAACTTTGATCTGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3L 12775929 5' - roo 9045 1 67.81 ATCAGCGTTTGATTTACGCATCGCACGGCGCATAAAAAGCAAAACGGGGGCATTGAAAAAGGTTTGTTTGTGCATTTTAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCA:1 - chrX 2781322 5' + FB 45 1 55.48 CTGGGATATCGATAGATATTGTGGAATAAAATGATTAAAAATTTTAAAATTCTTCCAAAGTGTGGTCGTGACCGGTTCTGCGGTTTTAGGGCGTTAAGTGGGCGTGGCAAAAAGTTGTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGAC:1 + chr2L 9778713 5' - INE-1 301 1 78.08 TTATAATAATCAAAAGTAATATTACATGATTTAATGCTTTTTTGAACCACTTATGTCAGTATTCAAATTTCTAAGGCAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTT:1 - chr2R 9408763 5' - FB 976 2 53.42 CAACTTCCTGTTGCGCAAACATGTGTGCAGCCACAAAAATAATTAATTGGCTCGAATTCAATACTGGGAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 - chr3R 11873451 5' - 412 7495 2 51.37 AAAGCAAACAGCGCGGATTTTCCATAAACGAACGCGAATTCTTCAGGAGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:2 + chr2L 951272 5' + F-element 34 1 66.44 ATATAACGTGTAACGTAAACACGTACAAGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 + chr3R 12547850 5' + hobo 61 1 57.53 TCGAATAACCTAGCAGAAGTTCGCATTAAATCTACCCCGGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr3L 6542007 5' + hobo 65 1 69.77 TTAATCAGCGATTTTCCATTCGAACATGCATCCTTTTGTGCCGGACTCGTGTTAGTTTCTGTTCATTAAAACATGTTAAACACATAATGGTGGAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3R 12885958 5' + 412 29 2 62.86 TGGCAATTTCAAGCATACACACTTATTCATGCACCAAAAAAAATCTATTTGTTAATATTAAAGATTTTACAAGGTTTCAGAATGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 - 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copia 229 1 63.01 AATAAAAACAACCTTTTCGATTGAGAGCTTTTATTTAATATTCATAAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3R 13411884 5' - roo 332 2 69.86 TGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCCAGTCGAGAGCTG:1 - chr2L 21403559 5' + G5 4441 1 58.90 ATCTCATGTTCAGATGCGCGGAAAAACACGTTACGCTGTATAAGAAAAGTCAATTTCGGATTTCGTTTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 + chrX 5938264 5' - pogo 2050 1 52.74 ACTATCTGAGGGGGGCGCGGGTGGCAAACCACCCGAAGGTTGCTGCAGGATGACGTTCGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 - chr3L 939725 5' + hobo 63 1 60.27 TATTGTAAATTTTAAATTTGCTCCTCAGCTTCCATCTCAGTTCTTTCATTTTCTCTTTTTTAGCACAATAAAACAATAAATCAATCACAGTTAGGGCTTGTGTAGTTTTGTTTTTTTTTTGTTCGTGGGTAATGACTAACGCACTG:1 - chr3L 14601544 5' - gypsy2 377 1 76.71 TTCTATTGACAAAATTAAGGTTTATTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3L 18954110 5' - roo 9026 1 54.79 GGGCTTACGTGACTTGCCGATGACCTATAAAAAGAATTTGGACTGTCATCGTTCCAAGAAGTATTTATTTGCAAGTATTACAGGCAAATAGTTCCAAAGTTACCATATAAATTTAAGGGTTACAAATTATTAAGTATAAAAGTAAA:1 - chr3L 19014157 5' - G5 4724 1 67.12 TATTTCGATATAAAAAGCGAAAGTATTTTGCTTGAACTCGCTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 + chr2R 10189214 5' + Doc 20 1 68.49 AGACAGAATGAATTGGACGAAAGGACACTTACAGTCAAAACAGCTCAACTAGCTACCTTAAAACTTAAACAGGAATAAATTCTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 18539760 5' + roo 8703 2 59.59 GCGGCGGCAGGAAGCTGCCAGATTTTGTATGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 - chr2L 19628472 5' - hobo 2887 1 71.96 ACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 + chrX 16995054 5' + jockey 95 1 76.03 CATTCTAAATACAAGGTTAAAGTCCAGCAGACCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTCCTT:1 - chrX 127033 5' + hobo 73 1 73.81 AGTAAGTTCTTGGTTTTAAAATTAAATTCTTAGAGCTTATCTCAATTTATGATTTTTATATGCAGTAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTG:1 - chr3L 15374756 5' - 3S18 315 2 68.49 AATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCACGCGAAGAACGCC:2 + chr3L 21765435 5' + gypsy 81 2 71.23 TTTAGGAATTCTGTTCCGCTTTTTACCTGCCATCGATTTTCTTCTGTTTTACGTACATTCTGCTTATTCTGTAGCATCAGAATGAAAACGGTCGAGCGGTCAATAACCGATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGA:1 + chrX 12131133 5' + F-element 343 1 60.96 AAGAAGTGAAAGATAGATAGAAAGATAGCAAGCAAATAATATACTATCGCAAAATAGTAACACCATTATGCGTGCCAAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr3L 10241313 5' - pogo 2084 1 67.20 TAGTCCTCGATAATTGTGACACCGCCATTGCCCTTTCTGGACAACTGGGTGATAGATGGAGCTTCTAGCTGAGACCTCTGCTTTTATACGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCAAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACAC:1 + chr2R 10711563 5' - R1A1-element 5305 1 58.22 CAAATCAGAAGAATTTTGCTGAATTTTCCGACAAATTGAACTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2L 12766953 5' + hobo 42 1 56.85 CCTCCATCCTCCACCGCCCCCCCTTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTTTCAGCTTTTCCTTTTGCATTCGTATTTGTGTGTCACATAATAAGCCGGGAAAGTTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAA:1 + chrX 11280704 5' - X-element 4693 1 68.49 AAATGTTCTTGTATCATTTCAACCTCAATTGGATTGTATCAATTTCTTAAGCCATTGTTCCACCATAATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr3R 7305895 5' + 412 7104 2 54.11 ATGAAGATTGGCATTGATTTTGCTTTTATATAATATAATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACT:1 - chr3L 22007246 5' - flea 4933 1 80.82 TATAGATGGGCTTTGTTAGAATGTTTCCAATATCTGTTCAGCACATACAGCCGAGGGCAAGTAAGTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTG:1 + chr2L 3393739 5' + Stalker2 7303 2 54.11 TGGGACTCGACTTAGGCTTAAGTTCCTGCTTGGTCTATCAAGAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chrX 7624136 5' - roo 331 2 73.97 ATAATACTTATCAAGAAAAGAAATATAGAAAAAACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:2 - chrX 8610370 5' + mdg3 5260 1 79.45 AAGGAAACAATCGAAGGATTAACTGAAGAAATCAAACTGGATATGTCATCACATTGATAGGGAATAAATGGATCAACTCTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - 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chrX 11236482 5' - copia 5056 2 65.07 AGATTACTAATCATCTATTAATCCCACCCTAAAAATCGGATTATATAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGG:1 - chrX 17270365 5' + 3S18 5841 2 68.49 CTAACACAAGGATGTGAGTCCTGGGAAGGGAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr3R 5767437 5' - roo 8981 2 78.77 TTATGGGTTACCTTTGCTATTCATAACTTACACGGGCCATAAAATATTTATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr2R 22040915 5' + jockey 79 1 69.18 CNCCTTCAACCCATACCACAAGCATCATTTTAAATGCCAATTACAGTTGGAACAGGAGCAGGAGCAATGGAGGATAAAGGATATAGGATATGGGGTAAGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 + chr3R 15700287 5' - Transpac 289 2 71.92 TATCTGCTAGTTCTAACAGCGCACAAGCCGTTGGCTTTTTCCATTTGCATTAAAGCAGGCGTAACAGCCAGAGCTTGGAATCAAGTTATTACGCGTATACAAATATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr2R 11394249 5' - pogo 2089 1 73.97 GCCACTCGAATATGGCGGCAACGTGCAAAAGTGCCATAATGCTGCGCCATACAATCATTAGCATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATT:1 + chr3R 9862875 5' - Stalker2 7593 2 55.48 GAGGGGAAAGTGTGAAAAGCTGAAAGTGTATGGATTACGGTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr2R 20931578 5' + blood 9 2 73.97 ACACGCCAAGTCAGAGGCATAAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr2R 21244853 5' + roo 8720 2 58.22 TGTCAGACCTTTTAAGAAAGGAAGTGAAATATGCATAGAGCAGACAGTCATTTACATGCCATCATGTACATGAGTCAAAAGACGTTGCATCTCGTCTAGTATATTCCCCATGCATAATACTGCATTTAATATGACCCTAAATAAGA:1 - chr3L 25485537 5' - Gypsy12A_LTR 79 1 60.96 GACCCCGGCAAGTTTCGTAGCAGACGTTGGCCCTGACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCG:1 + chr2L 23372471 5' + gtwin 13 2 76.39 ACTCACTCTTTTCCAGACTTCTGGACCAGCATCTACACTTTCAAAAATCAGCCACTCAATATAGAATATAACATGTAATATAATATGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr2L 19800996 5' - roo 9038 1 61.64 AATATTGATCAATCTTTTATTGAGAGATCTTAGTATTTTATGACAATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAACAGCTCAGTGTAATAGATATGGAATAGCT:1 + chr3R 1047922 5' - Stalker2 377 2 67.12 CTAGAGCAAGAAGGAAACATTAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCCGCGACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCA:1 + chr3L 24565084 5' + 1360 3115 1 86.99 TTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACG:1 - chr2R 12185413 5' + accord 66 2 63.70 ATAAGCTATGGTATTATAACCAGAGTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGGGGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 - chr3R 13198279 5' + Doc 70 1 62.33 CAGTGTGTGCTCAACGGGATATCAGGCGGAAAAGGACAAAGAGCGCTGCATACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2L 2518611 5' + jockey 35 1 63.01 TACTTCCCAATTGAAATGCAGACGCATCGAAATGTTATAAATTTAATAATGGCCCTCTCTGCAGGTTCGCCATCCTTCGTTTGTTTGTGTGGGTATTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTT:1 + chr3R 29603634 5' - F-element 4385 1 65.75 GTTAAGTTGGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGGTTCTTTTTTTTCTATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAG:1 - chr2R 10506298 5' - 17.6 7351 2 67.81 GAGTGTGTTGGTTGCATATACATGCCACATACCAAAATATAAAGGGAATGAGGGGGAAAAAACCGAAATACGAAATAAAGAAATGTGGTATGGGGCACAGGAGGATTGTCGACCGTTTAGTTTAAATATCTCTCATCAACCATTCG:1 + chr3R 17706043 5' + G5A 235 1 79.45 GACAATTTAATATTATGAAATGTAGATATTAAAGCAAATGTTATAAATGCATAGTGCATAAAGAATATCCTTTTAATTAGTATTATAGTATAGTGTAGTATTAGTATTAATTTCAATAGCATTAAATTAAAATACTAATTAAATTA:1 - chr3L 11562800 5' + flea 4982 2 58.90 ATTTCCCAAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTG:1 + chr3R 19144399 5' + Juan 66 1 59.59 AATTGAGTATTATATAAAACTCAGTACGCGATGACATAGGTGGTGGTAAACAGAGCTGCGGGCTTTAACAGGCAGAAAGAAGTGTTTCCGACCAAGTCAAGAATATATATATAGACTTTATCTGGATCACTAGCCAAGTCGATCTT:1 + chr2L 5699190 5' + INE-1 98 1 76.03 GTTGCTGGCAATTTCAAGCATACACACTTATTCATGCACCAAAAAAAATCTATTTGTTAATATTAAAGATTTTACAAGGTTTCAGAATGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 - chr2L 7167379 5' - flea 4985 2 65.07 GGCAGTCAAGTGTGCGAAGTTCGAGATACATTTGCAGCAAATGCTTTTAACAATTTCAACTTCCACTTCCTGCAACGGCAGGCAACTAAAACGTGTGCTGATTAGTGCCACACAGCACCACTACACACACACACACACACGTATCC:1 - chrX 15259570 5' + accord 185 2 71.92 GTTAGCACACAACGACAGTCAGCCAATTAAAATTCCCTTTTAGCCAACCACTGATGATGGCCAAAAGGTTGTTATGTAATGTGCACACATAGCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTT:1 - chr2R 10760514 5' + Tabor 51 2 52.74 CTCCCTGGGGCGACAGCTGTCACCCTTGCACACACGTACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAG:1 + chr3R 17079433 5' + 1360 86 1 77.40 AACGATTTGAAGAATGAAAGTTCTGTTTTTTGTGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:2 + chr2L 8909813 5' - roo 8986 2 78.08 TCCTTGCGGCCATTTTGTTCAATCCTGTGTACCCATACATACACATGGGTGCTTGTTGGGAAAAGCTAAGGGGCCATGTCAACAAACGGGTAACGCTTTACTTCCTCGAAAGGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCT:1 - chr2R 17872628 5' - Tirant 8498 2 76.03 TTTCAGCACTATCTGAGGGGGGCGCGGGTGGCAAACCACCCGAAGGTTGCTGCAGGATGACGTTCGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chr3L 939732 5' + hobo 56 1 55.48 AAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACT:1 - chr3L 23839743 5' + McClintock 5992 2 57.53 ATGAATATTTTGTCGAAATTAAACGTAAACGTAATGGAATTGTTGTAGTTCCTTATGTTAATTACAATAATTAATGTGGTAACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2L 20262729 5' + roo 8698 2 63.70 GTTAATTTGGTCATATCCCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTAAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATCAAC:1 - chrX 21587783 5' + INE-1 123 1 43.84 AACATTTGAGATCTATTTATTACAAGTAATTAAAAATGTGATTTGACTAATCTTTAAAGCTTTACTCTCCTCAACGTTGATTTTATATTTCATTCTTATTTCGTAATATTTTAGTAGTTTAATGAATCTAATTTTATTTTTAAAGA:1 - chr3L 1783995 5' - NOF 3954 1 61.64 GCGCAAAAAAAAAAAGGACAATAGCACCTAATGGTGCGTTGTGGTGACGGGGGTTTCTAAGTCTGTGGGCATATCGGCTGCGGGGGAAGGTTGTTTGGTCTCCCAGGGGGACAACTTTTAAGTCCCTT:1 - chr3L 11838633 5' - G5A 2556 1 53.91 TTTTGTCAAGCGTTGAATTTTTGTATCTCTGTGTGTGCGAAACGTCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATAT:1 + chrX 7441039 5' + jockey 4837 1 68.49 TCGCATCCATACATTTACGATAGGTGGTCGCATGCTCGCATATTCCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTCTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACG:2 - chr3R 11483850 5' + pogo 74 1 67.12 CTCTCGAAAATGATTTGTTGCCGCTCATTCGGCAAGGTCGGCAACATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGG:1 + chr3L 19939144 5' - Quasimodo 216 2 68.75 TAGGTTACTCATTGCTTATGTTTCTATGTTTATACTTTCTAAACTATGTTTGATATAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chrX 19736410 5' - pogo 2039 1 62.33 AACTGGTAAAATGGCTAATTAGAAAATCGCACCAATCGATGTGAGTACGTATGGAAAACTGATATGGAATCACCCGAACATAACCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:2 + chr2L 12696097 5' + pogo 33 1 55.48 ACAGTTAGACAAATTCTATGCACGTCAAATGTCAATCTGCATACACATATGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACA:1 + chr3R 8965143 5' - HMS-Beagle 178 2 65.07 GGGAGGCGCTCTAAAATCGTAGTTATAGCTTTTAGATATCAGTCTAATTATATATATTATAATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACG:1 + chr3L 17702079 5' - opus 442 2 60.96 TATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCCGCGCT:1 + chr3L 3540140 5' - mdg3 163 2 69.18 GAGATACAATCTAAGCAGGAAACTTATGAGTGCAGAAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 + chrX 16857035 5' + pogo 35 1 57.14 CTTCTTAGCGGTTTCTTTATCGCCCAATATCAATCAAGTCCACAGAAATTCGTTGCACATTCGAGGATTCTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2L 11043630 5' - roo 357 2 54.79 TTTCAATTGATGCCAATTAATCGAGGCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 + chr2R 14767324 5' + Tirant 8133 2 69.18 GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGGTGAGCAGC:1 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 4937 1 68.49 TACTCGCATAATGGTAAGCGATTACAGAGTGTAATTGAAATTCTAACCAGTAACAGAACCTAACCCCATCAAAACCCTCTTGGGAAAGATTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 - chr3R 10736890 5' - copia 223 1 58.22 ACCCACATTTGCCCACTTTGGGTAGTCGTGTTTTTGATTTGTTGTGGCCCGCCGGCGTTTTAGCAGTCGCAGGTGTTGCGGCGCTCCATTTCAGTGGTGTTTATGACACAAAGTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 - chrX 10561881 5' + jockey 4679 1 78.08 GAGTGGCGAATGGGCACATCGGACATGAACTCCACGCCGCCGGCAACGATGACATCGTAGGTGTTGGTGGCTATCAGACCCATGCCCGTGGTGATGGCCTGTAATTTTTGTATTTTATTTATACTTTATTAAGGCATACGGGGTAG:1 + chr2R 23867666 5' - BS3 1753 1 71.92 TTCAACATTTTATAGCATACTTTTATGGGGCAACAAACAGACGTTTATTCGCATTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr2L 19681080 5' - hobo 2922 1 61.22 ACTGAATACTGACCACTGTTGAAAGCTAATTGCTGCAACATACAAGACCAACTAAAGATTTTTGGTGCAACATCGCGACATAAATTTGAAATTAAGTTTATAAGACCTTTTATCCATAATCAATTAAATAAATTAATTAAAAAAAA:1 - chr2L 15118204 5' + jockey2 3403 2 77.40 AGTCCTGCCAGGATCGCGGTTTGCCCCGCTGTGTGGGCTAGACGGGCGAAGAAGGATGTCATGGGAGGGAGTGGCAGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 - chrX 19992684 5' - copia 209 2 54.11 GCTCTGCGTGTGCGGCGACGGCGAATCGTCGAATGAAAATGAATGAAACGGAATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGA:1 - chrX 1831321 5' + P-element 65 1 41.10 GGTACGTACATCCGACCAACAGGATTGGGACCAATATATAAGCAGCATAAACTGGTGACAATAAATTTGTTATTGCCTGCCCTCATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCCGTTATTCCCACCAAAAAGTCAAAACCGCTTAC:1 - chr3L 27862568 5' + Quasimodo 6944 2 65.07 AGCAAATATCACTGGCGAGTGAAATGCATTAATGGGTCAGCGAAAGGGGAACAATTGCAGCTTAACAAATATACATAAAAAAAACAACAGAGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGA:1 - chr2R 20361484 5' - INE-1 538 1 93.15 TCATATGTAGTTTTAGGTTACTTAGTCGCTTTTACTACTATGCAGTATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATC:1 + chr2L 14678749 5' + Quasimodo 67 2 69.18 TATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGA:2 + chrX 17690482 5' + Doc 352 1 72.60 CTTCGTTCCCGCCGCTGACTTCATTCTTGCTGTAGCCCAAGGCCGCCAAATTGACAAGGCCAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTC:1 - chr3L 9889371 5' - Juan 4108 1 52.34 GCAAACAATCCCAATGAAAAGATTACTGTAATGATGGCGTTGAATTTAAAAATAACACAATATGCATAATGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 - chr3R 14174806 5' - 297 351 2 55.56 GATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGTTTTATTTATATAGTTAGTGTGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGG:1 - chrX 23280895 5' - R1A1-element 5317 1 63.01 AAAGTATAGATTCAAAATAATTTCTTTACAGTATAGTTGACAGTGGAACTGATCCGAAATTTCCGAATTTGGGACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGG:1 + chrX 22760298 5' - roo 366 1 57.14 ACTTTACAAATTTATTAAGGCCTCGAAGGCTCGGAAGAATTTCCATCACATATTTCATAAAGAATCATATGTATGTATACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2L 20253824 5' + roo 41 2 57.53 GCATCGTATTGCAATTAGCGCGGCTAAAGAGCAGTGGAATAACAATACAAGCGCCAAATGGCCGGCAAACCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3R 29623334 5' - roo 357 2 52.05 CGGCTCGAATTAGAAAGAAGTAATTCACACCCGGCAGCAGACCCGTTTGGGTAAACGTGGTATTTTGCACCCTAGTGCCCACTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATGTAAGAATATTTGTCATTAG:1 + chr2L 1391646 5' + 1360 395 1 56.16 ACCTTTACACATAATTAGGGGCCTGTTGACTGCGCCCGACAATGGATGTGTGTGTGTGTGTCTATGTGGAAGGTAAACACATGTCTACTTTGAGGCACAGCAAAAAAAAAAAGAATATATGCA:1 - chr3L 1430040 5' + invader2 300 1 55.28 GTTGAATAAGTCTTGCATCTGTTAATTGGAAGTTAAGTTAGCAATCTAGTTAGACCGCATTTTAATTGGGTTTGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chr3L 17710576 5' + I-element 48 1 52.74 TTTACGAAACACCCTTATGTATATGAATAATAATAAAAAGATTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAAT:1 - chr2R 2052652 5' - opus 424 2 69.18 ATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 + chr3L 13380438 5' + hobo 64 1 60.96 AATGTATGTTGTGCGTATTTGTGGCGAGTACTTACACCAACGGGTTCTGGCACTCCATTCGAGGCCAGGGCAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGC:1 + chrX 23439062 5' - R1A1-element 486 1 64.52 CGTAAAAGAAAACCAACATAAACGGGAGGAAATAAGTGTGTCGCAATGGGTCATAAAGCCAATTGGTCATCCCTCGAACCAGTTGCCAATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGATTT:1 + chr2L 20631256 5' - Ivk 155 1 64.38 TTTGGTATTCATTGTGCGGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr2R 10666953 5' + hobo 43 1 56.16 AAGAAGCAGGCAATGAAAGAATGTCAGGGGGTCAAATGGGTTAAGACTTGTGTACAAGTGGACAAGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 3646409 5' - accord 184 2 42.05 AATTGGCTTTCGCCCATTTTGAAATTCTAAGCTGTTGATGGCGTCGTTCAACCACACAGACACCGACACACATGTATGTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2R 21453517 5' + hobo 42 1 56.85 GCTATGGTATTATAACCAGAGTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGGGGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 - chr3R 13198275 5' + Doc 74 1 65.07 GGCCTAAACCTTGTGCTCCGCAGGACTGGAGGCCCGGACAAATCAGGAAGTGAAAATGGTAAATTCAGCAGGGGCTCAAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAACGCTGTTGAGCAG:1 - chr2R 24211660 5' + flea 4794 2 56.16 GGGAGGATTTATTTCCACTTTCAAGCTTTCACTAAGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 + chr3R 11163041 5' - mdg1 7372 2 74.66 GAACCGGAGATCGCGGGCTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 + chr2L 20716376 5' - P-element 2798 1 17.29 GCAGATCCATGAATTGTTGTGTGAGCAAGCATTTACGATGATATGAAATGGCTCAGTTTTTTTAATTACCCCTGATGGGGGTCTTTTTCTTCTCTATATGCATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr3R 22676346 5' + 297 14 2 76.71 GACGGCAAAATCGGGGCTTTTCCGGGGGCTTGTCCCTATATATGTATATATATAAGTATATATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chr3L 2625051 5' + opus 7150 4 60.80 TGAGGATCACAGATAAGCTTTGGAATTTCACCCATTGATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTA:1 + chr3R 8293502 5' + Stalker2 7281 2 61.64 ATTTCGCCTTAGCTCCCCCTTCAGGATCCTGCCTGATTATTATTGACAGCTGCCGACGTCTTCTGTTCCGTTCCGTTATGTTCTGTTCAGGGCTGTCCTGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr2R 22795088 5' - hobo 2916 1 67.81 TTTTGGGACCTACGTTTTGAGAACATTTTTTAAAATAATGGACTAGTAAAAACTAAGGAGGAAAGTAAATACATAATAATGTACATAATTTGTACATAATGTATCATATGTTGGCTGTCTGAGCAAGAAATTTTTAGTCTCTCAAT:1 + chr3L 14585765 5' + Tc1 132 1 58.22 CAAATACAATGTACAATGAATACAAAGCCCGCGGAGTGACGGCAATCGGCAAATCAAATTTCAAATTTCGAATCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 - chr3R 18940622 5' - mdg1 371 2 54.79 AGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr2R 18266078 5' - roo 8982 2 80.14 TTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGG:1 + chr3L 23112566 5' + R1A1-element 5100 1 74.66 ACATCTGCATCCCTTAATCACTCACACCATGTTAAAATACAGTGGTTGGGGGAGAACAATCTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAAA:1 - chr2L 21324750 5' + invader4 2767 2 68.09 AATGCGGGGTAAAAACGGGTATGCGGTTTTTGTGGTTCGATGGCAGAATGTTGCTCACCGAGCAAGTGGCCAGCGGAAAAAAAAACAAGCAATGCAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chrX 3637902 5' + roo 25 2 68.28 CCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATC:2 - chr3R 9862958 5' + Stalker2 82 2 72.60 GGCGAGCGAGGTATTCCAGGAAATGGACTAACAAGAAATGTTTATTATGTACTACGTTTTGGAGAACTTAGAAAACAGTCTCATCACGTCTCTTGGGTTAAAGTTGAAGACTAAATCGTTTGGAGAAAATTTAGTGGTGGCATTTA:1 + chr3R 29798154 5' - Bica 4445 1 56.85 CGAGATTACTAGAACATTCGCGCTACCGTCTTCATCCGACGACTACAACCAGAACATACCATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCAC:1 + chr3L 23681443 5' + Stalker 6949 4 62.33 CACAGCCAGCAAATATTGCACTTGCATTTACAGTCATATATTTTTATGAACTGTGCATTAAGCCACAATGAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 2622633 5' - roo 9020 2 53.42 GCTGGAAGGCAGCTAAAAGTTTCTTCTTTCGGGTATGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 + chr2R 10773237 5' + 412 85 2 74.66 ATTGTGTCACTTGCGGCTTTTCTCTCAGCCCTAAACAGTGTAATTGTTGTCGAGTGTATATATATCTATATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 - chr3R 8884425 5' - HMS-Beagle 6995 2 57.53 CTTTATATCCCTTTTTTCTGCTTTATGAAATGTATGTATGTTCCTATTGTATAATTACAACCACAATCAGATCTGGTAGTTCTGGAGTTCTTTATCTTGACATTCAAAAGTACAACAGATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTA:1 + chr3R 12540424 5' - roo 9066 1 74.66 ACCGATGTACAGAATCATTTCGATATTCAAATTCAATCTCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:1 - chr2L 20367360 5' + Doc 86 1 71.92 AGTCACATTCGGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chrX 22715175 5' - opus 473 2 68.49 AAGTGCGCAGAGAGAATAGGTGCGAGGGAGAGAGTGCTGTGTACACGTTGTCGGTTTGGAGTTGTGCTCATACCCTCTACCCTTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCC:1 + chr3R 4739673 5' + P-element 16 1 73.39 TCATATGAACCACATTTACTTCAACACACTGAGCGAAAATTTGGATCGAGTGACGATAGCGTTATAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr2L 8009160 5' - roo 354 2 54.79 TTTTACATGTTTAATAACTGCAGAATGTTTCAGCTCATTTTATTATCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 + chr3R 24301791 5' + Tabor 39 2 58.90 ACAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATG:1 - chrX 16473180 5' - flea 4975 2 59.59 CTGCCATAATTTATGCAATTTTAATTCAGTGGGTGTTGCTCCACTGATTGGCGGCACTTTTGTGCCGTTAAAGAATAAAAACGAAAAAGGAAAACATTATTTGCAGCACCTTTGTAGATCCATCCGTGTCAGCACGGTTTTATGAA:1 - chr3R 8162848 5' + Q-element 203 2 65.75 ATTCTTATTGTTGCTAATGAAAGAATTAGCTTGTTTTGTACTTTAATGAATGTCTAACCCTTCGAAAATCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 13411788 5' + roo 8715 2 54.79 GCGCTTCTTTACCTATGCGGCGCACTCTACTTGTGTGTGTGTGGCGTGAAAACGCGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGA:1 - chrX 7930773 5' + P-element 65 1 41.10 TGCCAAGATTGATTCCGTCTGAAGCTGAGGCTCTGTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGCT:1 - chr3R 8965215 5' + HMS-Beagle 6880 2 76.71 ACCGGTAGTTTATGTACTTTATATATAATATAAAATAATTAGTTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTG:1 - chrX 18318234 5' + copia 4948 2 73.97 TGGGAAAAATTACACAAAAATAGCACAACTGGGTTAAAAGCAATAAAGTCTATTTATATGACAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTA:1 + chr3R 23714024 5' - I-element 5295 1 60.27 GTCCGTCTAGTGCGGAATGCCGACTGTGTGGAAAGAGCTCAGAAAAGACTGCTGGGAATTAATTAATTGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr3R 5684175 5' - pogo 2051 1 55.86 CAACTTCCCAAATTACCCCTCAAATAAATCAGTTATATTTCAATGCATTTGATTGCTATTTATTCAACAAGATATCCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr2L 21189832 5' + hobo 39 1 58.16 AAGACATAACTGCGAAAAATATATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr2R 8375146 5' - roo 9035 1 60.27 GCCAGCTTGTCTAGTCTGAAGCACTCACCTTTTGCTATTAATATAAGAAGTTTAGACACAAAATGCGAGTAAATGGGGAGATATAAGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 - chr2L 15524046 5' + opus 146 4 63.01 CAGGTGTTTGGCGAGCTTCGGGGATGCCGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCATACTTGCGGCAACAC:1 - chr3L 6542051 5' - hobo 2861 1 75.38 CCGCAGTAATTCCTTGATTTATAGACCCAATATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2R 18467234 5' - roo 395 1 63.55 GAGTAGGTTCTTAAGATATTATTTTCATTTTTTTCGTAATTAACACTTTATCTCTTAGAACTGATATCCTGATTATAAGGTATATATATTTTAATCAAGATCAATAGCCGGGTCGATTTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAAAG:1 - chr2R 21286048 5' + INE-1 124 1 50.68 TGTTTAGATAAATTGCGCCTGCAGAGATTTACAAATTACGCCCGAGGCGGCGAATGGCGAAAATGGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr2R 18467119 5' + roo 8719 2 54.11 AATTTAAATAGATAGTGATTGAATAAATCACGGAATACGTTTCCTTGATTGCTGTATATTGGGCATTTTATTTGGCAAAATTAACAAAATCACTCTGGCCTTTAAAAAAATAGAAGAAAAACAAGAGAGAATACTTTAGTCGAGTT:2 + chr3R 20125961 5' - INE-1 575 1 35.62 GTTCGTGTAAGTGGATTTAAGGCAGCTGTGGCTCTTGTCCGCAATGCAAGTACATTGTACGTTTCCATCAAAATATTCATTTGCGACAGATTTGGATTAAAGTAAGCCATTCATGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATT:1 - chr3R 22860958 5' - 297 478 1 76.03 CCTTTCTAGTATATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGCTCTCTACTGCTCTCTTTCACCATTCTACTCGAAGTCCCTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTTTGGAGTAGTCAAAATAATAAACATTGGCTAGGGAGTAGA:1 + chr3R 2473803 5' + invader2 4706 1 53.42 CCGTAACATAAATTTTGGGACCTACGTTTTGAGAACATTTTTTAAAATAATGGACTAGTAAAAACTAAGGAGGAAAGTAAATACATAATAATGTACATAATTTGTACATAATGTATCATATGTTGGCTGTCTGAGCAAGAACTTTT:1 + chr3L 14585753 5' + Tc1 120 1 61.64 AATGGAGATAATGGCGGAGCAGAAGCCCCGGAGTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 - chr2L 19343991 5' + FB 27 1 62.65 CTGAAGAGTCTCAAATTAAATCCAACAGGCTGTCCAAAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAC:1 + chr2L 9988122 5' + hobo 83 1 73.97 TTATGCTTCACATTTTTTCTGCTGCTCTTCAGGCTCGTTCCGTGTAATTTATTGAAACACATTCATTTCTCGCTATGATGTGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chr3R 19500737 5' + jockey 80 1 56.16 GAGGAAAGTTTGTGCCACTTTTCTTTTTCTTAGTATTGCTGCTGTCGCTTTTCCGCCTATATGTATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 - chr2L 9109953 5' - opus 446 2 57.53 GAAACTAGTATGATACCGTTCCAACTGTGTGTCTTATCATGTGCTATATGATTACAGATTAACAATTTAGGGATATATATATATATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 + chrX 21405246 5' - flea 4980 2 63.01 TTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 + chr3R 19989266 5' + hobo 85 1 77.93 AGGGGTTTGAAGAATCTAGTAAGTCAAGTGAAAAAAACTGACTTCCACTTCACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACC:1 - chr3R 29904212 5' - flea 4794 2 73.29 TTAATGGTCGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAA:1 - chr2L 19907628 5' - hobo 2859 1 72.60 AGCTGGTGATAAGCCGACTTAAGGTCGATCTAAAACGTTTTTTAGGCTGAAAATAGGAAAGCGTAAGGGTAAAACCTGAATGGAATGTCTGCTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chrX 126937 5' - hobo 2908 1 64.38 GAGGGGCGTCTCGCATTTTTGTTGCATGCTTACAATCAGATCTGTCAGATCAGTTTCCTCTTCTCGCGGCAGAGGATTGCCTGTTTCGGTTGCCTTTTTGGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr2R 18265965 5' + roo 12 2 76.09 AAACGAAGCTGGAAAATAGGCAAATTTCGTTCAATATTCTGAACTATTCGAATTTTTGCCGATGTAGTTCGCGAAAAATGCGTTGATCGCACGCACGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCA:1 + chrX 22652667 5' + ZAM 28 2 66.44 TACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTTTTATATAATTTTAAGCAGCTGTGCGCAGTCAA:1 + chr2L 23295815 5' - micropia 5357 2 75.94 AAAAGGCCAAGACTACGCTGGCCCAGCTTTTCACTTTCGAGAAATAGTGCAGGTAACACTTGCATTGGTGTTGCTGCTGATTGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGGTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACT:1 + chr3R 6153658 5' - jockey 464 1 71.72 GTGTGAGCTGATTATGTTTGGTCGTTGTTGCTTTCAATGTCAATGAGTTGGGTGGTTTGTCAGTGGGCAAAGTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGACAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGCCA:1 - chr3R 6877525 5' - Porto1 4270 1 52.05 AGTTCGTTTATTTATAAGCGTGAAATTAATTCAAAAGTATCTTGCAGATACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr2L 19907508 5' + hobo 20 1 71.92 AATGTGCATGCTGAACAACTAAAGTACCTTTAAAATCCCATTACCCTATTTGTGTACACAAACATATGAGTGCGGAATAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 + chr2L 2722330 5' - flea 4973 2 59.59 AATTAGCGACGATAGCGGAACGGTGGAAATTGGAACTCGGGGACGTTATTTTTGCGATTTTTTTCCGCTTATCTAAACTACCGTGTCCCTATAGGCTTATAGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr2L 5724438 5' + 1360 16 1 34.25 GTTTATTGCACATAATTATTAAACCTATTTCAGAAATTAAGCTGTTTGCTTGGCTCAATGAAAGTCCAGTTTGTTTTGATAGCTCCGAATTTTTTGCTTTAGTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chr2L 17387381 5' - mdg1 7440 2 71.92 AGCACCAATCACCCGAAAGTTGGGCTCGTTTTTATCGCTACCAAAGGTATTGATTACGGTGACATTGTGACCCCGATGGGCCAGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAGCTTCGATTTCCGACAATCAGGTTGCTGCTCAACAGC:1 + chr3R 11172376 5' - flea 4804 2 62.33 CGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATAT:1 + chr3L 25232767 5' - accord2 128 2 66.44 GATGTGTGTTTGTGTGTTTGCAGGTACCGTTGAACTTTGCTTTCACATAAACAAATATTACTCACTTACATTGCTCTCCCTGGGGCGACAGCTGTCACCCTTTCACACACGTACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr3R 17079358 5' + 1360 11 1 76.71 ACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAA:1 + chr3R 19450167 5' - roo 92 2 71.20 AGTGCCATTTCGAATGCTTTTTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2R 14450097 5' - roo 358 2 53.42 TGGAAGTTGTGCAAATATTTGCCTGCATACTTTCTCCCATAAATCAATTGCATTATACGGCATAAGTGTAAAGACAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCG:1 - chr3R 31663284 5' + jockey 366 1 65.62 AAGTGGTTGCACGCGCGAAAAGAAGAGGTTGAACGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACCAA:1 + chrX 12619366 5' - hobo 2858 1 75.91 TTTGCTTAATTAAATATTTACGAAACACCCTTATGTATATGAATAATAATAAAAAGATTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCT:1 - chr2R 2052668 5' - opus 7467 2 54.92 ACCACAAACTCTATTTAACTTCAAGCAACACTAAATTATAGATCATGACGCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATA:1 + chr2R 22616877 5' + BS 5077 1 65.75 TTCTAGTTCATTTGAAGTTTTCTTAAAAATTTGTAAACAGTTCCCTGTTTTAATCAATAGATTGCCAACTATAAATGTAAGGCTATTAACAGGGACTTACTATATCAAACAATTTTCAGGGAAAATCCATTTTCAAAAAGAAATTT:1 - chr3L 14309622 5' - G5 395 1 52.05 TTATTGCCATAATTTGCCAACATTTATTCATTTATATATGTATTCATGGTCTAATAATAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3L 16523140 5' + jockey 20 1 76.71 AAATGGAAGAAACGAGCACGAGAGAGTGAGAGCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGCGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 - chr2R 17348464 5' + hobo 61 1 70.59 TTTAGGTTTCGAGATAAAATAAAATGAAAAAGTAGAAGAGTTACGATTTCCTTCCGTTCCTTTAAATATTATAATTACTAATGCTTTTATAGATTGAAAACTTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr2R 10226820 5' - pogo 2086 1 45.21 TACTCTCCAAACCTATCCGTATTTTAGCTGCTTGGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTA:1 - chr3R 31264221 5' - jockey 4903 1 79.45 TAGACAAATTCTATGCACGTCAAATGTCAATCTGCATACACATATGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATCGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAACATG:1 + chr3R 8965148 5' - HMS-Beagle 173 2 65.75 TAGGGAGAGCTCCGAGCAGTTAATGAGCTTGAGGCGAAAACATAGAAGCACACATTTTCCTGTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 - chr3L 5425553 5' + blood 60 2 60.96 ATCATTCATCTTATTTTTTGCTTTTCGTTTAGTTTGTGTTATCCTTTATATTTTCATATTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGATTGTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTG:1 - chr3L 23455778 5' - rooA 211 2 60.27 GCGTAAATGCTATATAGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGGCAATA:1 - chr2R 3091679 5' + F-element 302 1 53.15 GGCGGTGTGCCCACACAGAAAACTATTAAGTATCTAGTGCTTAGCAGATTAAAATAGATTTTCGGCATTATGATACTCTGCGGAATGTAGAATTTCATGACAGAGTATCCTGCAGCCTTCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTC:1 - chr2R 14083258 5' - baggins 4999 1 73.97 AGGAAAACAATGTTTGTTACTTCATTTATATGCCATTATTATTTGTATAATATTCGTATATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 + chr2R 10915645 5' + F-element 72 1 64.79 ATCGAGGCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCCC:1 + chr2R 14767343 5' + Tirant 8117 2 73.87 ACAACAATCCAATGGCTACAAATTTGCTGTAATACAACAACAATTACATTAAAACGCGACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCC:1 - chr3R 21979850 5' + I-element 5040 1 60.00 AGGGAGCGAATAAAATTTTATCTTGCTTCGACAAAAGCAAAATATTTATATTTTCCGAGCGTCTAAAAGCAAACAAGATACTTGAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAA:1 + chr3R 21819846 5' + mdg3 5063 1 64.38 TTGGAGTAGTTGTTTGTTTGGTTGGGGTTCAATTAAATTACAGTTTATGGGTTGAATAACTTGCATGCATTGGTAATAGTCAAAATTGCAATCTCTCCTCTCGCCTGAAATTCAGAAATTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAATA:1 - chr3R 18959682 5' - 1360 3246 1 71.23 CCACAACGACTACCTCTAAAACCAGAATGCAATTGCAATTATCCTAATTCATCCATTAGCTTCGCTATAGATAAAGACCTAATAGGTTAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAA:1 + chr2R 15529661 5' - 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I-element 5290 1 59.59 AGTTGGATGGGTTGAAAGGATTCGAGCGTCGAATCCCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 - chr3R 11550317 5' + F-element 37 1 63.50 GCAGATGGTGGGAGTCACATAGAATATTGCAAGACACAATAAAATGAAGAAAAATCTAAACTTGTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGTCGGTTTTATGGCGTTAGAGGGGGCGTGGCAAAAAGTTTTTTTTTGCAAATCG:1 - chr3L 20503566 5' - INE-1 318 1 77.40 GGGACAAACTTGTCGGACAAGTGAAAGACATAACTGCGAAAAATATATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2R 8375170 5' - roo 9059 1 76.71 TTTCTCTATGGATTTCACCTTATAAGCCCCCTAAAACCTCCCGCTTATATACATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 + chr2L 15523923 5' - opus 7449 2 63.85 GACGAGTGCTCTCATCCCAGTGCAGTTCATCAGTTGTCAGAAAAACTTGTAACGAAGCTTTCAGCATGTACAATTTCAAGCAAAGACATTTCTTCCCGCGACGTCATCTTCCTTTTGTTGAATGTGAATGCTTTTAACTC:1 + chr2L 19228118 5' + transib1 1739 1 51.43 AAACATTAAAATATAAGTTTTTGTTATGTTTGAGCTCAATTAAATCATAGTATAGTACTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAAC:1 - chrX 9874220 5' - BS 5025 1 58.90 ACAATGCATTATGGCAGACCAGAAAAAAAAAACCAAAAAGAGAATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:2 - chr2L 2622727 5' + roo 78 2 76.71 CCATGCGTGGGATTTGCAATTGCCTCGGCCTGCTCAAAAATAAGTGAATAAAAAGGGTAAAGAGCTGGGCGTACGTAATATATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTA:1 - chr3R 20720625 5' + 1731 4355 2 57.53 GTGGTGGCTCAAATGCGAGGGGAGAAGAGTACCTGTGGTATTATTAAGGAGACTACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr2L 20253940 5' - roo 9006 2 62.33 TGAAAAAACTGATTTGAAAAACGAAAAAGATTTATTGGGTTCTCACATTTCTGTTACATCCTCAGGTAAGTGAATCTCTAGTTCGAACAAATGAAGAATAATGACTTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 10800647 5' - roo 394 1 71.23 TTTTGCAAACTTCTTCTCAATTATAAGGTATTTTTAAAGTGCCTTAGAGATTCTAAAAATCACACATGCTTTGTTATTTTCGCATTTGCTCCTCTAGTTGGGCAATTTTTATTATTTATTGAATCTTCTCTTTGTGTTAAGAGACT:1 + chr2L 17074164 5' - Doc 4661 1 70.55 CAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAA:1 - chr3R 9862969 5' + Stalker2 7313 2 63.57 GTCATATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 - chr3L 20910105 5' + F-element 66 1 56.16 AAAGCCCAAGGCTGCGGTTGCTTCGGCCCCGTACTCGCTGGCGTATGAGCAATATTAATTGTAGCTGAAATTAATCATACGCACCGTTGCAGAGCATGGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 30524595 5' - roo 9051 2 71.03 GAGCGTCGAATCCCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCA:1 - chr3R 11550294 5' + F-element 68 1 58.62 CTGTAAAATGTGGCTGATATGAATGAATTTGCGTGAAATTCTCAAGATTTTATTGGCCTAAATATAGTGATCTGCCTTCGAAGGTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr3R 5684032 5' + pogo 32 1 61.64 CAGCTTCGCGAGTAAATGCTAGGGAAGTTATTTTCTCTATGTACAGGCCATAGATCGCTGTTGCTATGTACATATGTATGTATGAATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTA:1 - chr2L 19135734 5' - Burdock 6358 2 65.07 CAATACAGCGATGCACCGAACAAAATATTGGTACTTCACATTAAATAAAATGGTACTTTTAATAGTAATAAATATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2R 11609832 5' - roo 398 1 78.08 AAGAGTGACACATGCAAGAGTAACAACAAGGATTCAAATTTAATAATATGATTATATGGTAAGAACCATATCTTTAGTATGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr3L 10241166 5' + pogo 41 1 52.05 CAATATTATTGGGTTGCTAAATATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATTT:1 + chr2R 24021554 5' + pogo 62 1 61.64 GGCCATTTCACAGCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCA:2 + chrX 17690450 5' + Doc 320 1 50.68 TACCAGGCTGGACTTTGATGGGGTGGAGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr2R 16031379 5' - hobo 2914 1 67.11 CCCATAATCTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGTTGGAAAATGCAAATTCAATCTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACAAATATGCTGTGTTTGCCG:1 + chrX 22398526 5' - Gypsy6A_LTR 98 1 46.58 CCACCTCCTCCTCGTCGCTGACCGTTAGGCAAACAATGAACAATTCAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2L 20327594 5' - roo 354 2 54.11 ATTTTCTCGCCCAAGCCGAAAATGCCTACAAATGTTATGGTACCCACATCGATGAAATGGCTTTCAAATGTGGGTGTCTGCAAAAAAAATGCCAGAATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCT:1 + chr3R 10812137 5' - 17.6 6961 2 68.49 ATTTATATTAGTATTAAAACAATAAAAAATCAAATAATAGGTATGTAACGTAGCAGTATGCGTTTCCAAACCAAAAAATATCAGGATCGATAGCAGGTAGACATGGCCATGTCCGTGCGTCGGTATGAACGTCGAGATCTC:1 - chr4 112052 5' + INE-1 134 1 76.60 GCCCACGAAACTAGAAAGGATCTCAAGGATTTTGGAAAAACCAAAAGGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 13568835 5' - HMS-Beagle2 497 1 93.22 TATATTGATAAATATTGTACATATATGTAAACTATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chrX 3637742 5' - roo 9035 1 60.27 AGTGGTCCAAATGCGGAGTTTTCCATGGAGATTTTTCGCCGCCTCTATCAAAAAAATGATGTGGTGGGGGTAGCAAGTCACGTAATTTGCGAAATGATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 12953313 5' + jockey 33 1 60.96 TTCTTAGTGTCAATCTAATGACAGGGTTTTTCAACATATGACTCCGCTGCCGACTAGTAAATGCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 + chr2L 20223129 5' + P-element 57 1 31.51 ATAGGAGACAGAGATTATAATCCATAAATAATGCTGGATGTTGAATTATCAGAAAGACGCAAAATTTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACG:1 + chr3R 15157531 5' + invader3 10 2 75.34 CAGCTTTTACGTATCCACATCATTGTCCTGACGCCAGGCCGTGAAGTGGAGCGCCTGAACGCTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGT:1 + chr3R 509502 5' - R2-element 3191 1 63.70 AGAGCAGTGGAATAACAATACAAGCGCCAAATGGCCGGCAAACCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3R 29623307 5' - roo 8994 2 70.55 CGAATGTAATATCATAGGTCAGTATGGGCATCAAATTGTAGCTTAGGTTCAGGTTTCTTAGGTTGTACGGAATGTACTGATGAGAGGGAAAGGTTTTCTTGGTCACATACCCCACACATTGGTTCCCGACAGAAAGGGCAGAC:1 - chr2R 14273833 5' - aurora-element 42 1 70.63 TTTTAAAGCTCCAAGGCAGGAGCTTTTTGCAAAGCTTTCTTTACAGTTGTCTGCTTACAGTTATTTATTGTTCATAATTATCTAAAAATAATCAAGATTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTA:1 - chr3R 17401829 5' + Juan 25 1 65.75 CAGCGTAATAATCCACAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATCAATGTCTCAAGTGAGCG:1 - chr2R 18056885 5' + blood 7081 2 64.38 AACTCTTTTTCGCTTCCAGCTTGATTAAAATTTCATTAACAAAGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chr3L 6014951 5' + jockey 86 1 69.86 AAACGAATGTGTCCCGCCTCTTAATTGGCTAAATACATTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCA:1 + chr2R 14921496 5' + pogo 82 1 76.03 ATAAGCTTGTAAACTGGGATTAGAAGGATACCACTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGCGTACATTCCAGATCTA:1 - chr2L 2522955 5' - mdg1 7369 2 79.45 CGTGGCCACTGTGGCATCCAGCACAGCCTCTGGCGTCATCGGTGCCGCCACCTCCGCCAGCGATCTGACCATGTCCGTCCATCTGACCATCTGTTTGTCCTTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAGAGCT:1 + chrX 19529265 5' + INE-1 150 1 55.40 TTATACGTTCAACAAATACCTTCTCCGCGAAAATCGCTTCAAATCAAAGGCCGCTAAACACATTCCACACAGAGAACTGGAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACCCTCGGTACTCCAGGCA:1 + chrX 9949485 5' - hobo 2896 1 51.88 ACAGCCGACGTCCTGCAATTGTTGTCGACCGCATTGTGTCTGGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:1 - chr3R 6526808 5' + pogo 76 1 69.86 GCTCACGCCCAACCGCATCGAAAAGGGTTAATGTTTGGCCAGTCCTTGTACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGG:1 + chr2L 11639009 5' + springer 7189 2 63.20 CAAACAAGTGATTTCCGCAAACAATTGAAGAAAAACAGCCAGTCAGGACCAAAACGATACGAAACTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGA:1 + chr3R 25000902 5' - Doc 4258 1 55.48 CAAGGAATAAGATGCTTGCAATATTAAACGAATTAAGACTTTTCCAAGAGGATTTCGAAAAATCTTAAGTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 10429761 5' + roo 48 2 54.79 CAAAAAGTGCATTTTGTGAACTGTGCATATTTTTTGGTCAACTTTTCTGACTCAAAAGACTCTCGGTGGAGTTAGCAAGCTTAAATGATTTTTAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 15596881 5' - roo 9047 1 67.12 GAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr3R 23565259 5' + jockey 82 1 68.49 GTTGACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 + chrX 16995050 5' + jockey 91 1 73.29 TATTGTTGTATTATTTAATCCTAAAGGACATGTTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr3L 21108563 5' + roo 88 2 82.19 GGTGTATAATTTTCTGTAATGACATTGAAAGACACGATTGGTGTCAACGATTTGAAGAATGAAAGTTCTGTTTTTTGTGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2L 8909768 5' - roo 9031 1 55.48 CCCGGGGGTATGCAACACCCACAGCCAATATTTGCCACACTCCTCCTGCGGTACTCGCATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCG:1 - chr3R 23968668 5' - HMS-Beagle 182 2 60.27 AGCCCAAAACGACCCACATCAAATGGCACATGGCACAAACGAGCCGCAGAGGCACCAAAAGAATTTTCATTGCATACTTTTCAGGTGTTTGGCGAGCTTCGGGGATGCCGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chr3L 6542132 5' - hobo 2927 1 77.24 GATGATAACATCTAATGAGCGACCGGCCAAACGGCTATGCAATCGGCGGCCTTCCTCCACCATAGGCAACCCACCTCTACATATTTATATGAATGTATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGC:1 - chr2L 9228808 5' + Burdock 6156 2 69.86 CCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGTACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGG:1 - chr3R 902574 5' - R1A1-element 5299 1 75.64 CTTTCCGCACAAATGCTATTGGTAAGTTTCTAAGATCTGGAAAACAAATGGGATTAGTTAGACTTTTAAGTTGCCGTGCCAGATGTTTATAGCTGAAATAGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr2R 15190349 5' + pogo 19 1 73.97 AGCAAGTCACGTAATTTGCGAAATGATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGAGTTCACA:1 - chr3R 12953243 5' + jockey 26 1 58.82 ATAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAG:1 + chr3R 19450059 5' - roo 47 2 77.69 GTAATAATCCACAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTTCATATATCGAGGGTACACTGTACCGATAAGTACACAGCA:1 - chr2R 18056881 5' + blood 7040 2 51.49 ACCACTGACCACACCGGACCTTTTCCTACACACTCATTGATCGATTTCACATCCGCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCGGCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCA:1 + chr3R 22573824 5' - HMS-Beagle 6896 2 55.28 ATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTC:1 + chrX 17690498 5' + Doc 364 1 81.94 ATCCCATTACCCTATTTGTGTACACAAACATATGAGTGCGGAATAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGA:1 + chr2L 2722364 5' - flea 4939 1 71.23 CTGGAATACTAGAATGTCATAAAAGCTAGTAACTTTACTCTCCAAACCTATCCGTATTTTAGCTGCTTGGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAT:1 - chr3R 31264256 5' - jockey 4938 1 55.48 ATGTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGAGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 + chr3L 1983435 5' - Transpac 261 2 52.05 ACCTACTTTGCGTTCGGTTAAATGCTGCAGCCTCTTGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 - chr3R 6149844 5' + jockey 92 1 74.31 CATGCACCAAAAAAAATCTATTTGTTAATATTAAAGATTTTACAAGGTTTCAGAATGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCT:1 - 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chrX 22760438 5' + roo 8698 2 62.33 CAAATGGGCGAATGCGAATGTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAACA:1 + chr3L 1983418 5' - Transpac 5197 2 63.70 GGGGGAATTTCAGAAAAGCAGTTATTCGGCTTACTTAACAGTGTTACTTCTTCTACACTTAAAAAATAGAAATATCCATTTTGTGAGAATGAAATAAAATGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACG:1 - chr2L 18648566 5' - F-element 4365 1 73.61 ATTCTTCAGGAGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAAT:1 + chr2L 951309 5' + F-element 71 1 59.59 GAGTTCTTCAGACTCAGGTAAGGGGGATTATCGTACTTAACCAATAATCTAATTCTAATATGAATATGAATGCGATAAATCTGTTGGTGATTGTTTTTTTTTTTC:1 - chrX 7282019 5' - Doc 4595 1 65.71 ATGATCGAGAGTTAAGAGTGGGCGGCAATTTGTTTTGATAGCTCCGAATTTTTTGCTTTAGTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 - chr2L 17386874 5' - mdg1 361 2 59.59 ATTTAAAAGCTTTTCGAGTTCCGAGTAATTATAACCGTTACTCATGGGGTGAAACAACTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAAGCTTAAAGTACATATGTATGTATTACTTTTGATTTCAGGATCAATAGCCGAGTCGAT:1 - chrX 22642457 5' + INE-1 95 1 60.27 TGTCATTTGCTCAATTCATTCAGTTACACAAAAAGAAACGAAAACTATTTCAAGAAACCTTTGCGAATATTTGCGAAATTGATGTCAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr3L 10733774 5' + 412 7086 2 51.39 GCGCAGTTGAGCCCAACGCTGGTGCAATTTGTTGACCTTCTTGTGCAGCTCACTGACATGAGGATAGCGACCCTCGTTGAGCACGTGGCAGTCCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATA:1 + chr2R 13904416 5' + jockey 4815 1 67.81 GCTTTAAAAGGCTTACTTTTTGTCAACCAATCAGTGTTTATTTGCTTCTTTCATGTTGGTGCAAATAAACTCTAAATGATTTCAAAGTTATAAATGTTCGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAA:1 - chr3L 11754811 5' + Doc 103 1 65.28 CATCATTGAAAAATGTGTCTAAGTGAATCGTCTGTTGACATCTGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAA:1 + chrX 19992588 5' + copia 80 2 70.55 CTTGTCACTTCATTTCACAACTTTTTAAAAAAGCCTAGTTTATTTTTATGCGATTTTCATCTCACTCATTTGTTGATTTTATTTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTA:1 + chr3L 9905728 5' - Juan 4174 1 54.11 GAAGCGGAAGCAATGAGTAAGAGTAACTGGAATTTAGAAAATTATCTTGTTTAGAAAGTAGTTACATGATACATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACT:2 + chr3R 26693331 5' + Stalker2 7297 2 51.37 AACTCGGACACACACACGAGGACCCATTTGTATAACTCCACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATA:1 - 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chr2R 23671842 5' - copia 5088 2 43.15 GCAATAGTATTTGTTATTCGATGAAATGTTATACTGTTACAATTATCATTATTGTTTCTTAAAGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATA:1 + chr2R 10936641 5' - copia 5066 2 60.96 ATTATGTTGGGCCACACAAAAACACCAGCTAAATATAATGTATACATATATATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACG:1 - chr3L 9317566 5' + HMS-Beagle 55 2 60.14 CGATGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTT:1 + chr3R 22275268 5' - flea 4948 1 65.75 TTTTAGCGCAGAAATCTTTTGTTATATTCAGACTTTTAAGAACAACTGCCTTTCTTAGCTACAATGAATTTCCCCATCCCACTTGACCTTCTAGCTTTTATCTCTACCTTCCAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATG:1 - chr2L 15004743 5' - INE-1 138 1 60.27 AGTTGTGTCAACAATGTGAAAGATAAACAATGCGATAGTATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3R 23565210 5' + jockey 32 1 67.12 TATGAACGCAACAAATGCAAAACTTAAAGCAACTTAATATGAAACTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chrX 2821876 5' - roo 332 2 71.92 CTGAATGTTGCATTAGAATTGAACAGAAACGAGCAAAAACAGAAAGGGTTTTTGCGCCTTATAAATATTTAATATTATTATTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACAC:1 + chrX 17270263 5' - 3S18 6065 2 44.52 TGCCACAAACACACTCGTTGTCGTTTATGAATTTAATATTAAAGTGCCATTTAATTGACATTTTTTGATCAAATATAACGTTTACGTATATCGCATGCATTTTGCATCTATCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACT:1 - chr2L 19281859 5' + Circe 111 1 67.12 TTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGGGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGCAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACAT:1 + chr3R 8293550 5' + Stalker2 81 2 67.81 ATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTAC:1 - chr2R 3091654 5' + F-element 330 1 75.34 CTAGCAAGGACAATCGAAGCTATTGGTACACTAAGAAAAATAAACGAACTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 - chr2R 21353272 5' - Transpac 239 2 66.44 GCTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTA:1 - 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chr2L 20985823 5' - F-element 4614 1 55.48 TAAATTGAGAATTTATTTCCAAAGAAATTATTCAATATTCGGTATTATATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTG:1 - chr3R 23714115 5' + I-element 72 1 73.29 TCCTGATACTGCACCCTCGTACTTCTTATAAGCAAATCGGCTTAGACGAGCGTTTGCTAGAAAGTCTATCTCAATATAGATTAAAGGTCTTCCAGAATATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 - chr3R 7306049 5' - 412 7528 2 72.60 CAATTACTTAAATGGAGATGACACCTGGTTCTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTCATTCTTAATGATAAGTA:1 + chr2R 11394118 5' - pogo 1953 1 65.07 GTGCACAACAAAATAAACAAACCAAGCCACCTACAGAAATACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAA:1 + chrX 17508827 5' - Burdock 6316 2 72.60 GTTTTGTGTTCCTCCTCTCCTCCTTTCGTGTATGTTTNTGTTTCTGTTTCGCTTTAGTTTCACTTTCATTCGTCTTCGATCGTCAAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chrX 19506050 5' + P-element 30 1 64.29 CATTTGTATTTGAATATTTGAAATTTTAGCCAGAGAGCGGGCGAAACAAGGACAATTTATTATGAAACAACAAAGGTCATTGCAATGTTATACATAATCATCAGTGTGGGGTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGC:1 - chr3L 19362165 5' - F-element 4424 1 76.03 CACATAGCAATGCACAGAGAGAAAATAGAGTATCTAATGGATAAGGAAACAATCGAAGGATTAACTGAAGAAATCAAACTGGATATGTCATCACATTGATAGGGAATAAATGGATCAACTCTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr3R 18860938 5' - roo 409 1 55.48 CATTGTGGTTAAGCTGGAAAAAAAGGTGAGAGTAAGCAAGAGGAAAGTGCGCCAACTTAAATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 - chrX 22578101 5' - 297 341 2 58.90 AATTGTAAATTTCAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCG:1 - chr2L 23295931 5' + micropia 4962 2 78.47 TATCATTCTTATCATCATACAGCGTTGACGGGCCGTGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTA:1 + chrX 11268575 5' - hopper 1338 1 71.63 TTGATTAAATGCTGGCTATGGCTTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAACCAAAAACGAAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr2R 16503451 5' + jockey 70 1 73.45 TTCCATGCTCATCCGCACAAGATATGTTATCATCCCAAAAGTATGCTTCTTTAATTTCCACGAGGCTATAGCAAAGTTTAACACCCAACTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:3 - 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Stalker2 7630 2 72.60 AGGAGACCTAGAGAAATTTTGCTCACAGAACGGCTGAGAAATGCTCTATGGCAAAAAAATAAAGTTTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr2L 12814820 5' - hobo 2894 1 52.55 GTCGTTTTACGCCGCCGCTTTCATATGCCTGAATGGCTTCACCACACTCACACGCACACACACACACACACTTACACTCTCCTAAGCAGGATTTATATCTGATGGACAGAACAGGGGGGGGCAGTGCCCCCGACCCCAACGACCCG:1 - chr3L 9280230 5' + Rt1a 463 1 61.64 ATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACA:1 - chr3R 21276654 5' - BS 5063 1 54.79 TATAAATATTTTAAAATTCACTTTCAAGCAAATTCCGAAATAGGAATTTTTACACACATTGCAGTATGTATTTTCTTTTTTTTTGAGAGAGCCTAGTTAATTTCATTTAAAGATGAAGCAACAAGTGATAAATTGTTAAATTTTTT:1 - chr3L 16988327 5' + NOF 203 2 73.97 GAGGAATGAAGTATTAAGCGAGCAGCAACAGAAAAAATTTAATTGAATTTGCACTGCTTTTTTGAGTTCACTTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGA:1 - chr3L 780780 5' + Burdock 6181 2 52.05 CAGGGAGTATCAGTATTTGTGTCGCCGCGTTTTTACCGTTTGATAACCTAGAAAAGACGCCTAGGTAGGTATGAGTGTATGCAAGAGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 - 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chr3R 1048061 5' + Stalker2 58 2 56.16 TAAAACCAGAATGCAATTGCAATTATCCTAATTCATCCATTAGCTTCGCTATAGATAAAGACCTAATAGGTTAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 15529677 5' - roo 364 1 55.48 ATTCGATTTGATTTTACTTTATTACACGAGTCAAATTACGTGCATATATATAGACCTCCTTCGACCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAATTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 + chr3R 6171109 5' - 297 341 2 58.90 GAAGGTGCCATAAGTTGGGAATGGACCTGTGGAGCTGAAAGTGAGATTGGATGATGGTGAATGGGATGGGATTAGTGCATGCATTATGCATACCTATATGTTGAAATATAAGATGTGGAACAATAACTTATAGGGCAATAACTTGT:1 + chr2L 1918338 5' - HMS-Beagle2 6881 1 67.12 TTAATGCGTTTTTTCGCCCTTGCCCTCTCTTTGATGCTAACTGCTCGTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAAC:1 + chr3R 10741027 5' + 1360 9 2 77.40 ATATTTGTGAAATTACTATAAGTACTATAAGTACCATTTTAAGTGATTCCTTTGGTGGGTTCTAAGCCATTCTCTTGGTTCATAGAGTCGACTGCATGTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chr3R 29719456 5' - hobo 2932 1 68.70 CTCCGTTCCTCCACTGACGCCTCTGTGCTACGCTGCTCGTCTGGCTGCCAACAGGAAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTCTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr3R 13572144 5' - 412 7513 2 64.38 ATCTATGTATTTGCTTCTTTTTCAAATAAGTTAAAGGAACCTACTATCCTACCTATACCTACATGTTCATTAATTACGATTAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 + chr3R 25052974 5' + pogo 35 1 61.64 CACATGTCCAGAGTTCGTTTATTGATTTTACCATTTTGTTTGTTTTACTTATTTATGGTTTAGTCGGAATTTTTCCTTTGCTCCTGGTTTGAAAACCCAAATAGGGCATGGTGGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAG:1 + chrX 4788462 5' + Max-element 10 2 78.77 AAAGAAAAATATAAAAAATTGTGTCACTTGCGGCTTTTCTCTCAGCCCTAAACAGTGTAATTGTTGTCGAGTGTATATATATCTATATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTT:1 - chr3R 8884442 5' - HMS-Beagle 7012 2 65.07 AGCAGCGCTCCTTATATATATGTGCACGTGGGTGCTCGTATTACGCATACACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACT:1 + chr2R 4937709 5' + mdg3 5322 2 64.38 CCTGTCTGAAATTTATGATTAGTGGCTATTATTGGTAATTATTCGGCAGTACAAAGGAATGATACCAGTAGTACAGCGATGGCATCTGTTTTTAGGTGGTGTTTCACCTCGTCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAG:1 + chr3L 10474773 5' - G2 295 1 53.68 AGAGTATTTAAACTTTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCA:1 + chr3R 15035048 5' + Stalker2 7305 2 55.17 TTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAA:1 - chrX 22824247 5' - Gypsy12A_LTR 2242 1 50.38 AAATAAAAGTTTCAAAACACGGACTAATTACTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGCAAGCAT:1 - chr3R 27443219 5' + 3S18 5856 2 76.03 AAACATCTTCAAAGAAATATGCTATCTAAAAATAAGCGAAATAAATATATTAAGAAGCAACCGAAAACACCACTTGCGCCGTTCATTTATAGGCACGGGGATCCCGTTATTTCCCCTTTT:1 + chr2R 22776620 5' - gypsy8 314 1 60.00 ATCCATCTCAACAACCAGATATGAAAAGCCAGCACACTTGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTC:1 + chr2L 5333405 5' + mdg3 5323 2 72.60 ATATGCTTGACTTCCCTTTCAAAACTTTGATTGGGTAAATGCAATAGTATTTGTTATTCGATGAAATGTTATACTGTTACAATTATCATTATTGTTTCTTAAAGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 + chr2R 10936601 5' - copia 237 1 68.49 TTGAAAAACATTCACAGTTTTTCTAGGTTTTCTGCTCAAGCCAGACTCATTGCAGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGC:1 + chr3R 27443156 5' - 3S18 272 2 66.44 ATCGGTCATTTTGCAATTACAAATACGAATGCTCACACTTCCCTTCGTTACGACCTGATAACTGAAAAAAGAAAAATGTGCAACGAAAAGCAGTGGATTTTTGCGGTACGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chrX 9864868 5' + hobo 12 1 73.29 TCCCAGTTCTCCTCGGACTCGATCTTCGCGTGTCTGGTGTCTTCGCTGAGGACAGCAGGAGGAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCT:1 + chr3L 18901136 5' + 1360 406 1 57.53 GAGATTTTTACATGCCTTTTTTGGGACATCAATTATGAATAATTTTTTCCCTAAAACATCTTTTGCCCCACTGTGCTTTTGGCCGCTAAAGCTGTAAATATTGTTGCTGCCTGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGACG:1 + chr3L 11296475 5' - P-element 2877 2 79.45 ATGGCAGGAAGTTGGCAACTTTATCAATTACATTATATCAATTCATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAA:1 + chr3R 29429512 5' + F-element 241 1 70.55 AATTACACATATACACACCTATATATTTCTTTTCTTTTATTGTATACACATACGTATACATGTATGTACATAAGTAATATGCACAATTTATATTTTAATTCCTTTGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCC:1 - chr2R 982016 5' - Porto1 4293 1 75.34 AAATATCGGTTATTGAATAAGTTATTGAATGCTTAAAAGGTTATGCAAAAGATGCCACAGGGCATTCACATCCTGTCTTTAATGTAAGTAACTAAAGTAATTAATTACTAAAAATATCAGAAAGTAAAGTAAAGTAACGTAAAGTA:1 - chr3R 17736252 5' + TART-A 13156 1 73.97 CCAGCAGTTTGAAGTCTATTAATAACGAAATTTGGAAAGGCCAGAAAAGTACTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3R 11072445 5' - roo 338 2 67.81 AGCAGTGGAATAACAATACAAGCGCCAAATGGCCGGCAAACCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 29623305 5' - roo 328 2 71.92 GTTCTGTCTTTTGCATAAATTAGTGTTGTGCTTAGTATATCGTTGCAGAAGTTCTTTGTTTATGTTTGCTATCTTTCGTTGGAGTTTTCGTTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:1 - chr3L 23244978 5' + HMS-Beagle 28 2 66.44 GTTCCCTCATTCGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chrX 19162572 5' - pogo 2048 1 56.16 TTCTTTTTCGATTCAAAGCACATATGCATGTACATATATGAGTTTATATAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1 - chr2L 21687689 5' + pogo 71 1 67.81 TGTGGAGGAGAGACCCCTCTGAATCCATGATATTATATAAGCCAACACTCTAAGCAGTTTGAGGTGTGATGGGAATCGCTTGATAACATCCTGCTTCCTGCCGCAAGACATCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr2L 22348817 5' + 1360 11 1 76.71 GTGCCGGAAAGAGAGACTTCTGGTCTATAAGGTCGGTTCGGATGGGGGAAGTATGTACATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAAT:1 + chr2L 9228666 5' - Burdock 194 2 63.01 TATTATAATAATTTCTTAAGTCTCCCTTACGCATGAGTAATTAACCATGGAATTTGGCGCAATCTGAAAATGAGAAATGGTCAAGTAGCAAAAGGGGTTTCTCGTGCTACAGCAACTAGTTTTTTTTTTCTTATTTTTTTTTTTGT:1 + chrX 13581785 5' - G2 3076 2 77.40 TAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTTATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCT:1 + chr3L 19951166 5' + Ivk 43 1 54.79 TAATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGAAGAGGCATTTGGCTATTTATTTTTATTTATTTATTTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCT:1 - chr3L 23112568 5' - R2-element 3196 1 54.11 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGTATAT:1 - chrX 12649915 5' - blood 156 2 82.54 CATTGCCCGAGGATACCTCAGAAGCTGACGCATCTGGCAAGCATAACCATGGCAAAAAGTAAATTTACCAAGCGATTATATCGCTTCCCATGTATGGAAATTTAAAATGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCGCCGACTA:1 + chr3R 20908075 5' - INE-1 566 1 58.90 TTGAAACTGTTTTATAAAATTTGCACCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 + chr2L 246609 5' - P-element 2794 1 22.60 TCGATTTTCTTCTGTTTTACGTACATTCTGCTTATTCTGTAGCATCAGAATGAAAACGGTCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCT:1 + chrX 12131165 5' + F-element 370 1 58.16 CTCATTGAGACTTTTCTTTTTTAAACTGTTTTATAAGTTAACAATATAATATGTAGCAAATTGAAATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCT:1 - chrX 8509147 5' - F-element 4327 1 57.53 GACTTTGCACAGAGAAAAACTATGAAACATTTGCTGGCAGAATAACCTCCTTCAACTTGCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGC:1 + chr2R 21353178 5' + Transpac 4978 2 63.70 TTTGTTGAGAAACACTGCTGAGGCCCTCGGGGCATTAGAGCGGGCATTGGTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACTTAAATTACATAAGAACAGCTTACTGTGGTTCCGAATGAATTTCTTGACGTATGGCTGGTTTCC:1 - chr3R 21494229 5' - Transpac 360 1 68.84 CTTTTTCTGTGTTATTTGTTTCGTTTTGTGGCGACTGCTATTTTTTCACAACTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 14450113 5' - roo 9041 1 64.38 CGCCAAAGGGTTCTGCTGTGAAAAGCGATAAGGGGTATTTTTGCGATACGACTATCCGTGTGATGACGTATCTTCCTGCCCCCCACATGCCACCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGG:1 - chrX 19285638 5' + Quasimodo 325 2 67.12 ATTTAAAATTAACAAGCAACAAATAACCGAAAAAACGAGCATTTAATCGATATTCTCCAGGCGCCATTTAAACACACACCCCCTCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr3L 5731221 5' + 297 6609 2 66.67 TACTTGAGTGGCTATGAAGCTGGGACTCGACTTAGGCTTAAGTTCCTGCTTGGTCTATCAAGAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:2 - chrX 7624156 5' - roo 9015 2 60.27 TTTTTTATCTGGTTAGTATGCTTACGCACATATTATGACTTATTAAAGTATTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAA:1 - chrX 21638146 5' + gtwin 6946 2 65.07 CAGCAGGAAAGTCGCGCCTCCCCCTCCCCACCAAAAAAAAAACGCAAAAAAAA:1 - chr3R 22720950 5' + Bari2 909 3 90.57 GGTTTAGAATTTTCGCTTACAGCAGGCATTTAATATTTCATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATA:1 - chr2L 22032038 5' - Tabor 7241 2 73.29 AAATGACGGCAAGTGAGGGAAAGTTGCTGCTCATTGTTTAGCAGTTGATTTTTTGACGCACTTTCCCGGCTGGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGA:1 - chrX 11280841 5' + X-element 66 1 52.74 AACAGTTGTGCCAGGTGTGTTTCGACAAACTACTGCGCCTTAAGCCCGAGCTGCAAAGGATTGGCAGTGGCACGTCTCGCCGCTGCCGACGACTTCACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTT:1 - chr2R 19404863 5' + HMS-Beagle 175 2 50.68 GTATTCATCTTTTACAGCCCGCATCCTTGGCAACCTTTGTGCATTATCTTCCGACTCTCATCTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 - chrX 10501364 5' + F-element 72 1 56.16 GTTGCAAAAGTTTTCAGCACTATCTGAGGGGGGCGCGGGTGGCAAACCACCCGAAGGTTGCTGCAGGATGACGTTCGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3L 939743 5' + hobo 19 1 66.67 GACTCAGAGCGGGGCATTACAAAAAGTGCCGGAAAGAGAGACTTCTGGTCTATAAGGTCGGTTCGGATGGGGGAAGTATGTACATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 + chr2L 9228641 5' - Burdock 6354 2 58.90 ATCGTCGAAGTACTTGTCCAAAAGCTGGACCAAGGACTAAGTCTTCTGGCTAAGTCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGG:1 + chr3L 26350107 5' - Quasimodo 6994 2 59.26 TAATAATAATACCAGCAGTAATCATATTTATAATTCTATTTATAACTGTAATCCATAGTCTAAGCCACAAGGATCGCATGATAAAAGGAATATAGAAGTTATTTAATTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 10276468 5' - gypsy11 3933 3 64.17 TATCTAACTCACCGCGAAAAACACTAACCATATCATCGGTTTATGAATTTCTAAAAACCTAAATACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAATGTGGTCTTAGGT:1 - chr3L 24249081 5' + Gypsy12A_LTR 1941 3 71.92 ACAATTTGTTATTGAAAAATGCCTACTTGAAAGAAGTTCAGGAAATTAAACTGTATTTCATATTTTATTTATTTTCGATCTTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAAT:1 + chr3R 15154538 5' + mdg1 7080 2 56.85 ACTGAAGGATTCGTGTATAGTATTATTTTGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3R 18514310 5' + pogo 44 1 54.48 TTTCAATATCTGGTCCCTCTCTATTTATAAATAAAACCCGCCTGAAAATTTTACAATTTAAATGAACGGATCGAAAAGCAACTTTAGAGACCTTAAAATCAAAAACTAATCGTCCCGAGCGAGGAAAATAATATATGAAAAACAAA:1 + chrX 21032210 5' + BS4 728 1 62.33 ACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTC:1 + chr2L 22031977 5' + Tabor 6918 2 74.66 GAATATTTGATGTGCCACACATTATGTTGCAATGCTAAAAAGATTGTCTAATTATGAACGCAACAAATGCAAAACTTAAAGCAACTTAATATGAAACTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chrX 2821824 5' - roo 9048 2 69.18 GAATATGCAATTGCAAATGGCGAGTTAAGCAAATGTGCAAAATACAATTTTCGCATTGGACCGCATTTTAATTTTGTTTTATAATTTCGCAAATAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTG:2 - chr2R 20117424 5' - mdg3 5473 2 70.55 ATTTTGATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAT:2 + chr3L 19951151 5' + Ivk 28 1 66.44 AGGCTAATCAAAAAGGAAAAATGCGAAAATCGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTAAACTGCAACACCAGCA:1 + chr2L 16202628 5' - copia 167 2 79.45 AATTTGCTGTTACGACTTGGACAAGCTCCGATGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1 + chr3R 22275240 5' - flea 4976 2 53.42 GGGACAATGGGCCAAGGCACACGGCACACGGCTAGAGAAACAAATTTTGTCGTGTTTACGCTGCCAGATTGCCATTAATTTTATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 - chr3R 18114981 5' + 297 6614 2 63.01 CCGGCGCATGTTTGCTCGCCCAAAAAATGAGGTAAACAAACAGCAAAAAAATAAAATAAAAATAAAATACATTCTCCCGTATACACATATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - chr3R 6472780 5' + opus 7029 4 67.81 GTCGGGCATTTAAGTTGGATTCAATTTGCATTTGCTACGAGCTTTTTGTCATGTGGCATGCAAATGAGCCGCACTGCTGGCTTTTTCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAA:1 - chrX 10698739 5' + mdg1 7073 2 61.64 ACCTCATCTCTGGTCCTTCGCGAATTCTTGAGATAATGAGCGCCACCAGTGATATCCAGCGTAATAATCCACAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 - chr2R 18056941 5' + blood 14 2 76.71 CAAACGGCCACGCCCCCAGCGCCCCTTCTAGACCCTAGTGCCCCCCTCCCCACTCTCCAACTGAGCCTAGTAACCTGAAAAATGCAGTGCACTTTCCAAACAAACATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chr2R 13773168 5' - opus 491 2 79.45 TTTTACATTGCAATCAAGCACCGATTTCTCTTGTATTTTTTTTGTTTTTTGTTAAATGATATTATAATTACTAATGCTTTTATAGATTGAAAACTTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:2 + chr3R 26031650 5' - pogo 2079 1 71.23 AATAACAATGAAAAAGTTTTCAGTTTCTTATATATTTCAACAAAATTATGCTTTTTAATTTATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 - chr2R 8942603 5' + 297 6633 2 60.27 TAAGTTATTTTCCATATTACACAACCCGGCAAAAACTCGTTGACTTTTTCACAGACACCGCAATGTGTGTATGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chr3R 29381608 5' + hobo 49 1 52.05 CATAAATTGAATTCTTTCAGTTTCCGAAACACTATAAAATAAATGTACCCAATGTTATTTAGAATCCGAATGAAACGTATGTCTTGTAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATAC:1 - chr2L 16066686 5' + I-element 131 1 65.07 TGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCT:1 - chr3L 3540216 5' + mdg3 5303 2 58.90 GGCTTGTTGATATTGATTACTGTTCAAGAATGCAAAATATGATCTAAAGTTCAGTTGTTATTTTTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAG:1 + chr3R 6583250 5' - I-element 5292 1 63.01 TCGTTCCTGATGCCAAGCCAAGAAGCTACTGCTTAATACTGATTAGATCAGGCTCGCGACGTATTAGCACATAACTGCACCAGCTCTGATCCAAACACTGGGCCACTCACTGGGTGTCAACTTCTGTAGAATTTAAATTTAATAAT:1 - chrX 21393581 5' - TART-A 13183 1 56.85 GCAGGATAGGGTGTGTGTCTGACAACTAAAACAAAGCCCAGAGAACAGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTA:1 - chr2R 22795211 5' + hobo 74 1 67.81 TTTTTGCCAAATGTGCTTTGTTGCCTCGCCAAGGCGTTGCGGTTATTGGAGATGTGTATTGTGGATTCAGTAAACTCGACTTTGATTTCGCTATCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCA:1 - chr3L 1728616 5' - blood 349 2 41.10 TTGGGTGTACAATTGTTACTGTAACTTACTGTAATGTAGTGCACGCAAGGACTCGACTGTGAATCCTAATAAATTATGTAGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCA:1 + chr2R 10202961 5' + 17.6 6964 2 45.89 GAATTCGTGCCGGTAACTTTATGCAATAACTTTATGCTAATTATTGATAAAATGTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATCATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 + chrX 18055714 5' + 297 60 2 63.01 TCCATATGGTTCCTATGGTTCTTTGTGTGCCCTTATTAGTGAAACGCATTGAAGCCCATCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACAT:1 - chr3L 21434807 5' + hobo 100 1 60.27 ATTCGCGTGCTGAGAAGGTTGAGGAACATTTTGAGCAGCTCCAGGTTGTCACCGGTCACATTCGACACCTGGAAGCTTTATTATCTGAGTACCGGGTATCTGATAGTCGC:1 + chr2R 18169932 5' + INE-1 551 1 68.18 GGCCGGATTTAACCTGTTTGGACTTCAACTTTCCAAGATTTTCAGTAAGTTGTATGGGTATTCTTTTTTAAGTGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chrX 17933626 5' + roo 47 2 54.11 AGAGGGAAAAAATAAAAGCCAGCACGAGCCAAACAACAGCTGGGACACGGACGAGTGACACGGGCACGGGGAGGGGGACTCGGAGGCAAAAAGGACGAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAA:1 + chr2L 7932181 5' + Doc 4692 109 78.99 TTGATGCCAATTAATCGAGGCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCGGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 + chr2R 14767330 5' + Tirant 8121 2 72.66 AGCTTATTTGTGTGATATTTTATGGATTTGTAGTCGATAAAAGCCACAAACTTCCGAACTTCATATAGAGTGGATAGACTTCAATAGTCGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2L 11043490 5' + roo 8684 2 69.40 AGCGCGTTCGTTCGCTGATTTTGTTGCCACTGCAATGTTGCCGCTGCCTTAGCTGAGAAAATTATATCATCTAAATGAGTACAAAACTTTTTAGTTGAGAAGAACACCGACCTTTTACAATTAGGTCTCAAACTGAACTCTCATAG:1 - chr2L 14567365 5' - Idefix 7285 2 60.96 TTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTCGAAATACTTTAAACTGTTA:1 + chr3R 19537503 5' - hopper 1330 2 72.60 AGTATACGGCGTTTACGGTGCCAGGAAAGGGATTGTTCCAATGGAAAGTGATGCCATTCGGACTACACTCAGCGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGGAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCG:1 + chr3L 25232692 5' - accord2 203 1 78.77 CTCGGGACGAAAGCCAGAAGTATGCGACAGACGAAATGAATGGAAATGAAGGCGAGGCTTTTGGCCACGTTATCCTGGGCTGCAGTCGCACTTAACTATTAAAACTTTGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGG:1 - chr2R 9781998 5' - Doc 4504 1 76.03 GAAGAAGTAACTCATCAAACTGCGTAGTTATGGCTTGGGGCAGCTGAGTAAAATGCGATTATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGG:1 - chr2R 5800576 5' + HMS-Beagle 6852 2 56.85 ATGATGTTGACAGAATTGATGCTTTGCATTCCCCATAGATGTTTTTCTCTTCCAGCAGCAGCAGGTGGATTACTTGCGTGCATTTGCTGTGCCAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 30524422 5' + roo 19 2 70.80 GAGTCTGCCCCATCGACTTCGGCTCCTGTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGTCACCCTACTTGCGG:1 - chr3L 13380502 5' - hobo 2867 1 73.02 GCCACCATGGTTTCTTCCAATTACAATTATATCACTCATACGCAGGGTTGGACGAGAACGTCCCATCATGCTTATGTGCACACATATGGAAAAAGAATTCTTATGTACTACGCCTGCCTAGTGGCTGGGTTTTGGTTACGGC:1 + chrX 18230721 5' - Tom1 119 1 54.23 GAGATTATAATCCATAAATAATGCTGGATGTTGAATTATCAGAAAGACGCAAAATTTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGA:1 + chr3R 15157541 5' + invader3 20 2 69.86 TCTTGGAATTCAATCTGGAATGGCAAAAAAAAGGAAAATTCATTTTTGATTAAATGCTGGCTATGGCTTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr2R 16503497 5' + jockey 58 1 51.37 CTATGTATCTTATTTTATAACTTCTAACTGCATGGAGTTTTATTGTCTGCGTAAATGCTATATAGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCC:1 - chr2R 3091727 5' + F-element 257 1 71.23 AGCTCATCAAAATTCGACAACTATTATTTATGTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTA:1 - chr2L 18671695 5' - mdg1 331 2 81.51 ATTAAATATTATTAAATAAAGTAATATATTATTAAATATAATATTATTTATATATATTATTATATTATATACATATATATTATATATTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chr2R 16488287 5' + opus 28 4 66.21 ATCATAGAAAAGGAATAGCTTTTCATCTTTAGAAACATCTTAACGAAGTGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr2L 14262895 5' + P-element 9 2 76.71 CAATATTATCTTTTAAAAATAATTTTCAAAACACCAATAGCTTTCCTGACTAAAACTCATTAAGCAGCTGTCGTTGGCAATTAAAATGATAATTGGCATTCCATTTAGCATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATC:1 + chr3R 21758451 5' - Juan 4207 1 79.45 TAAATTTCAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTC:1 - chr2L 23295926 5' + micropia 13 2 73.97 CAATTCAGTTGAATTCTTTTTGCACACCACGCACTACAAAAAAAAAAACCCACTCAATTAATTCAAGAAAAATAATGCATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATCGAAAAGCCGCATACGTA:1 + chrY 1076858 5' + 17.6 43 1 55.48 TGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAAC:1 - chrX 19744464 5' + P-element 104 1 14.38 CACATTTTCCCGCTGCCCGGTGAAGTATGCAACACTTTTTCGCCACCTCCTTTCGTTTCCTTGTGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chrX 9949593 5' + hobo 25 1 60.00 CTCCGGACCAATCCTCATGGCACTCGTTAGGTGAGAAGTGCCTACTTAAGACGGAGTGCTTTCGCACGGCGCGAAAATGTCTCGATATTGATTCGGCACGGGAATCGATACTCTCTTTCCGCTCACTCACGCTGAGAGCGTAAGAA:1 + chr2R 12908276 5' - 1360 3289 1 72.60 CTGATGACGATGCCGCAGTTAAACGAATGTGTCCCGCCTCTTAATTGGCTAAATACATTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 + chr2R 14921476 5' + pogo 62 1 62.33 CACACGACCTTGACTGCACTGCAATATATATGTGCACATATACGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAATTTGTG:1 - chrX 13484195 5' + hobo 37 1 60.58 TTATGGATTTGTAGTCGATAAAAGCCACAAACTTCCGAACTTCATATAGAGTGGATAGACTTCAATAGTCGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGAAAATGAA:1 + chr2L 11043509 5' + roo 51 2 53.42 GGTATTATAACCAGAGTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGGGGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 - chr3R 13198270 5' + Doc 79 1 68.49 AATGCGTTTTAGAGAGCCGCTCTCTTGGCCAACTTTCTATTTATAAGTCTGATGTCTGATCCATGATGGAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 + chr3L 13477189 5' + P-element 64 1 41.78 ACGCTCAGTCGAGAATAGCTACAAAATAGCTAGTAGCCCGTGGTAAATTTTTCCGATTTTTTACTTGTTATATCTAAAAATACAGTTTTAGAAAGCGGTTTTTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2R 11371222 5' + pogo 18 1 71.23 ATGCTTCAGCAAAAACTACGAATAACAAAAGTTTGAACGACATAATGTGGGTTGGGCCACGAGTTCAAAAAGATATTTTTGACATTATTATTAAATGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3R 19445264 5' + roo 25 2 68.49 CTTATTTAAGTGTGGGTGTATATAGAGTGTTTAAACGTAGATAGTGTGCTTATTTTAAAATATTTTTAAATGTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 + chr3L 25821767 5' - opus 455 2 56.16 CACCTGCAGCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:2 - chr3R 15363479 5' + 412 79 2 71.92 AGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTG:1 - chrX 22715126 5' - opus 437 2 69.92 GAGAAAGGACCCTCAATCTGCATTTGAGCTGGGCAAAACGGAAAAAATGGGGTGAAAAAAATAATAATAAAGTTCAAACAGCAAAATGGGACACTGGAGATGATTATCGGTTTGTTTGTCTGTGCCGCTTTTTCAGTTTTTTATAT:1 - chr3R 12907183 5' - 412 350 2 59.59 GGTCAACTTTTCTGACTCAAAAGACTCTCGGTGGAGTTAGCAAGCTTAAATGATTTTTAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr2L 15596916 5' - roo 9012 2 64.38 GGCGACAGGGTCAGGTGTATAAATTGCACAAAAATACACACACATGCATATGACCATATATGCGCTCACATATCTCAACATATATCAAAATATATACATACATATATCTATATAGGTATAGATATATGTACATATGTACATATATG:1 + chrX 13979921 5' + G3 4508 1 67.81 CATCCTAACTCTAATTTATTTTTATATGTATATAAATCGCTTTAGGTGTAGGAGAAAACTGGCAGCGAATGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1 - chr3L 21043149 5' + Quasimodo 43 2 56.85 GGGTTCTATGCACGCAAATGTTAGGAAGCCGTCCATACAAAACTTGAGATGTATTTCCCCAGAATCTCTAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTT:1 + chr2R 5800456 5' - HMS-Beagle 198 2 56.16 ATTAATGTTGAACAAATGATTGCCACACAACCCATATGAACGGCTATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGG:1 - chr2L 16201420 5' - copia 21 2 69.18 TTTCGAGTTAGCGTCAGCATAAAAAAAAGTCAAAACGCCTTGTCTTCAGTTCGATGAGGTTTCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 - chr2L 16360666 5' + hobo 58 1 58.62 CAATCTATCATAATGGAATTAAAGGAGTTTGAGCTGTTAAGTATCAGGCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGTTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3L 2240408 5' - roo 9004 2 64.79 TGCCAAACTTGGTTGGCAAACTCTTTTTCGCTTCCAGCTTGATTAAAATTTCATTAACAAAGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 + chr3L 6014933 5' + jockey 68 1 57.53 ATTTGATGTGCCACACATTATGTTGCAATGCTAAAAAGATTGTCTAATTATGAACGCAACAAATGCAAAACTTAAAGCAACTTAATATGAAACTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chrX 2821828 5' - roo 9044 1 66.44 AGAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr3L 12776043 5' + roo 83 2 77.40 TCGTGTGTCTTGGCAGCTGGCCGAAGAACACTCTTCAAAAATATGGTTTGTTATTTGGCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3L 21108492 5' - roo 344 2 61.64 TTATCACATTATCCCAGTCTGACACTTTACTGATCTTAAAGTAATCTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGG:1 + chr2R 2052579 5' + opus 181 4 68.61 TTTTTTGTTAAATGATATTATAATTACTAATGCTTTTATAGATTGAAAACTTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr3R 26031694 5' - pogo 2035 1 64.38 TAAGTTTCTAAGATCTGGAAAACAAATGGGATTAGTTAGACTTTTAAGTTGCCGTGCCAGATGTTTATAGCTGAAATAGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr2R 15190371 5' - pogo 2060 1 58.90 AAAAAAAAAACCAAAAAGAGAATCCTGTTCACACTTGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGTTCCGTTCATATCTTATTTAAATGAATCGAGAGCGTTAAATTATATT:1 - chr2L 2622705 5' + roo 72 2 82.20 ACGTGGCCAACATTTAATCAGCTAATTAATATGAGTGCAGAAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chrX 16857211 5' + pogo 36 1 43.15 TATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chrX 3637774 5' - roo 9013 2 60.29 TTAACAATGGATATAGAAGTCTTTGTATTTTATAACTATTAAGTGCTCAAGTTTGTATATATGGCATAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTA:1 + chrX 13558170 5' - mdg3 5446 2 52.74 ACTTGTGTGTGTGTGGCGTGAAAACGCGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chrX 7930745 5' - P-element 2794 1 21.92 GGTCCACACTCATTAGTCATCAGACATGCCTGCGGGGTTGTCAGGGCCAGAAATCGAGCGAGGGCGGATAAATCGGGGGATGCGTTTTAGAGGGAGCAATCATCATCAAAGCCATACTTTCTCCAACGTGGAATTATGCCATCCAG:1 - chr3L 22650940 5' + G5 4380 1 69.18 ATACAATTTTTAAGCTGCCAAAATAGATAACTGAGAACTTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTT:1 - 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roo 8992 2 72.60 ACACAACATTTGGAATAATGTTTACTTTGATCCGAAGCAGATGACTAACATTCTTCAGCTGCCATAGAAACGTTTGGGAAATTTATATACGGGTAGTGTCCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr4 612216 5' - 1360 3368 1 58.90 AACGTCTTAATTAGCCCTGCGAAAAGCGCGAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 + chr2R 17872447 5' + Tirant 31 2 61.43 CTGAGGAAGGCGGTCATGTCTGTAAGTGAGTTCCCAGAAATCCAATTAGTTGGAAGAAGGGTGTGGGGCTTATGTAACATGTTAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:2 - chr3L 18954251 5' + roo 36 2 59.59 TCCTATCCAATCTATACTACTTTTGGGAAAGTATCAACAAGTTTACTCTGAAACGGACAAGGCTATATCGACTTTGCTGTTGATCAAGAATATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 + chr3R 6461703 5' + Transpac 4943 2 69.86 ATTTGGTAATCTAGCTAAAAGTCAAAGAATTTTCCCTATTATAATTGAAATGCTTAACTTAAACATTCGATTGTGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:2 + chr3R 14174670 5' + 297 6624 2 56.85 TGGCTCATAATTCAGAGTTTTCAGTTAACTGGTCGGTCGGTTGGTTTCGATTCGAGCTTGACTTGGCTCGGTTTGGTTTGGTTTTGGCCCGGTTTTGGCTTTGGCTTACGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3R 29623172 5' + roo 8674 2 73.29 ACTTAGGCTTAAGTTCCTGCTTGGTCTATCAAGAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - 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chr3L 9240470 5' - 412 7472 2 67.12 TTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTACCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGACATGAGAATCGCAT:1 - chr2R 8375102 5' - roo 8991 2 71.92 ATACTCGGAATATCTACATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCA:1 + chr3L 21765402 5' + gypsy 7035 2 52.74 ACGAGCATGAATGCATTTAGCATATAGCACCATATGTATGTAAAGGCTTTGTTTTTGGTTTTATTAAATTTATTCATATTTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGG:1 - chr3R 31664681 5' - jockey 4525 1 61.64 GGACTTCTTGAATTTGTCTTCGTGCCTCCATTCTCATCTGGTTTCATTCTTGATCGAAACCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTT:1 - chr2R 4840436 5' - transib2 2764 1 70.55 GTGGGTAAACTACTGCATACTAATATCGGTGTAACTAAGTGTTTGACAAAGTGATTACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3R 24760658 5' + pogo 38 1 59.59 TTATAAGCAAATCGGCTTAGACGAGCGTTTGCTAGAAAGTCTATCTCAATATAGATTAAAGGTCTTCCAGAATATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chr3R 7306024 5' - 412 7503 2 55.48 ATAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr3L 16523196 5' + jockey 34 1 53.85 TGGGTAAGCAGGATGTACCTCCCGAGGGAGCCAAGAACCGTGTGGAAGCCGCCTCGATCGACCCGGCCCAAAAGAAATCCGCCTTTAATAACTAACTTTGTAGTCCCTTGCTGCTTTTT:1 - chr3R 4504756 5' - Fw2 415 1 72.27 TGTTACTTCATTTATATGCCATTATTATTTGTATAATATTCGTATATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAA:1 + chr2R 10915659 5' + F-element 90 1 75.34 ATGAGTGATATAATCTTACATGCATTGCGTATATGTTTGCATATATAAAATATACAGTAATTACTGATTACTGTTTTAAACAAATGTTAATTATATAAAAAGGAAATATATATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGT:1 + chr3L 11903160 5' + micropia 9 2 71.92 AGGTGATATTGCAAGCCAACAAAGTGGCAACGACCGCCGAAGAAACGTACATCGTCTTCGGCAAATGCCTCTCCATAGGCAATATGCAGAACTCTGCCGGCTATGTGAGAGCTTTCAGCAAAACGCTTGGTCAGCAATGTGACCGG:1 + chr2R 1485991 5' - springer 42 2 57.53 AATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAA:1 + chr2R 14767357 5' + Tirant 59 2 57.53 TGGAAAGTTGACAGTTTCAGTGCAGTTTTCAGTGGAAAATTGGGTGTCGGCGAGGAGCTCTGATGGATTCTGCCATCTGTGGCCGGGCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1 + chr2L 7488107 5' + Transpac 61 2 59.59 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACACCGTGCACATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGGCTTCACA:1 - chr2R 3262652 5' + baggins 5143 1 65.75 CATCGAGCTAATTGATTACAACAAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAT:1 + chr3R 6578569 5' + F-element 92 1 73.97 CAGTTTTAGTTGCGCTTAAAAGCGTGCTACACTTTCTAATGCTCGAAGCGTGATAAGCTGGCCCCAGCTGACGTTCGTTTTAATGCGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr3L 939603 5' - hobo 2921 1 73.64 TACCTGTTTAATGAAGAAAGGAATTGTCAAGCAATCCGTCGATAAAGAAATTGAGCTTTACGGAGAAGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 - chr2L 22177468 5' + Doc 58 1 53.10 GATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGT:1 + chrX 21087545 5' + mdg3 5287 2 58.90 CGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTCG:1 - chr2L 19907620 5' - hobo 2851 1 78.08 AAGATATGTAAGGAACAAAGTGTCGAATTAGTCATGCACGAGTTTTCGTCTTTACATTTTATTTCTAAGACTTTCTGATGTTCACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGAT:1 + chr4 916295 5' + invader4 2700 1 62.33 TAGCTAATTAAACAAACATTTTGTGCTGATAAAACGCTTTAATTAATGCTCTTACAGCACTCGAATAACCTAGCAGAAGTTCGCATTAAATCTACCCCGGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr3L 6541947 5' + hobo 22 1 68.49 GGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGGTTCTTTTTTTTCTATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTTTGCCAA:1 - chr3L 8317599 5' - 17.6 415 2 73.97 GCCACCCATCATCACCTCCTTTTCCCGAAGCTTTTAGTACGAACGTAGATTGTACGAGTCCCACTCTCAGAATATTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGG:1 - chrX 12908166 5' - accord 7101 2 85.86 GTTGCCTTTGCTACAATTTTTGCACTTGCGTTAGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCTGTTTCTGTGAGTGTGTTTGCACACAGATACAGGCTTATGTGCTCGTGTTTTTTCCCCATTTTTTTTTCTTTTTTT:1 + chrX 3761392 5' + hopper 139 1 61.48 AACCACCCATACTCACTCACTCGTGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATGTTTTCGGTGCTTAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr3R 26404996 5' + hobo 49 1 50.68 CAGCTCATAAAACAGCTGGCAGCGCTGCCCATTTGGCGCAGTGGGGGATCTTGAGAGTGAGACGTAAATGGGAACCGTTATTTAATTAATCATCGTTATTTAATTTAATTTATTTAATTTAATCATCCTCTCACCGTGCTGGTGCC:1 + chr3L 20323272 5' + Rt1b 222 1 77.40 ATAATTTAATTTCCATAACGGAATCGGCACCGGAAGAAGTAACTCATCAAACTGCGTAGTTATGGCTTGGGGCAGCTGAGTAAAATGCGATTATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACA:1 - chr2R 5800608 5' + HMS-Beagle 6820 2 71.23 AAAACTTTCCTAGTTATAAAGAGACTTATGTCAAAAACAATAGCACCATTATCTAAACCCATTCCGAGTTCTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 + chr3L 8704487 5' - blood 7339 1 51.37 CTAATATGTATAGCAATTCAAAGTAAACCTATCTACTATTGTGATAAATATGTATAAGGAATAGATTAACGTCGTCCTCTTCAGTTTGGTAATATTCCCGAATAACGAGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAG:1 - chr2R 14820101 5' + R1A1-element 340 1 69.18 ATATAAAGTCATATACTAACCATGTGCTCCCTTTTTCACTAATCCAAATAGTAGTAATAATAGTCATCACAAATTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTGCAGACAGTAAA:1 + chr3L 24155358 5' + baggins 5178 1 50.00 AGTCGGTGAGGGAGTGGAGAAAGGCCGGCAGGCGGGGAAAACCCCAAGAACCCGGTGAAAGATTCCAGAACCGAGAGGCAAACACCAAAAACCACAATTAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAG:1 + chr3R 26012477 5' + TAHRE 10362 1 73.97 GAATGTTTCTTTTTATGGTTGAAAAGTATATAATTATATACTACGGAATCTGATATAAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAA:1 - chrX 9217759 5' - 297 339 2 63.01 AATAGGGTATAAAAGTATGTTACAATATCTTTTAAGATCAGTCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTC:1 - chr2L 17297043 5' + Max-element 8315 2 70.55 AGCCGGCAACAGGAAGAAGAAGAAGAACAGGCGCAGCCTCGCAATCAACAAAAAACAGTAAGTAGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAATCGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGCAAT:1 - chrX 5770436 5' + invader2 467 1 56.16 CTGACATGGCCAAGATTATCTGAGAATATTCTACCTGTTACAAACTTTACAACTAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGTGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chrX 22715004 5' + opus 7140 4 68.31 ACCCGAAAAGAAAGTTCGCAAGAAAGTGAGAAACGAAACCCGGATCAAAGAATAAATTTAGAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3L 12776102 5' + roo 18 2 72.14 ACGATGCCGCAGTTAAACGAATGTGTCCCGCCTCTTAATTGGCTAAATACATTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATT:1 + chr2R 14921482 5' + pogo 68 1 66.44 GAGAATGGAGTGGAGTGGTGAGTGTAACCGTCCCGACTATGATTATGAAACTAAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chrX 22517750 5' - 1360 3385 2 73.29 TTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTGCTTTTATTTGGAAATATCTTCGGATTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr2R 11609916 5' - roo 330 2 79.07 TATCAATTTCAAAAATATTCAAATCCGTTTCAATTTTATACAGAATAATATATCTGATTACTTTTAGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATAT:1 - chr2L 5723969 5' - flea 4963 2 58.90 AAAAAGCAGACGAGCAACAACAACTGGCTAAATAAAGTGGGCGTGTTTCTGATGGCGGTCGTTTTTTGCCCTTTGTTGTTGTTGCTATTGCCCACATCATAGCTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 + chr3R 19500585 5' - jockey 4973 1 70.55 GATGGGAAAAAAATGGGGCCTTATTGCCGTTGTTGCCTTGTCGCCGGGACAAAACGCTTTTCCGCCACGCTGCTCCTGGTGTTAGGCTATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCCAGAG:1 + chr3R 25094584 5' - P-element 2870 1 70.77 GGATTTTCAATGCTATGCATTGTAAATTGATATTAATGCAGCCATTTGCTCATTTTAGATTACTAATCATCTATTAATCCCACCCTAAAAATCGGATTATATAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACC:2 - chrX 17270421 5' + 3S18 20 2 68.49 TATAGTAAGACAGGGAACTGGAACACACACATCTAGATCGATAACAAAATCGATATCGTTATCGAGATCGAGATCGGGATGTTGCAAGTCGAACTACACGATGTTTTGGTGGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAA:1 + chrX 11236334 5' + copia 4881 2 75.34 AAATTAAATAGCTACGCTTCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACGCCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chr2L 15057255 5' + hobo 68 1 64.14 TCTTATTTGCCACTGACATTTAGCAAAAAATCACATAAATTGCTGCACACAGCCTTTTCGCCTCCAACGATCGACGTCAGCAGTAAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGTCTATA:1 - chr2L 15778807 5' - invader4 2955 2 54.11 ATAGAATATTCAAGAACAGGGATTTCATTTACAGCTAGCAAGCTGAAAATTTGGTTTCAGAACAAAAATTAATACTTAATAATACTTAATTTAGAGTCCCAAAACTATGTTGCTATTTTTATTTTCGTCATCGGCTGCACCCGCTC:1 - chr2L 16567033 5' + F-element 462 1 78.77 GGAGATACACGCATTCAGCTTTAACGATCGCAATTTGCTTGCTCACGGTAGGTTAAATATTTAATTATGAAATAACATATATTCTATATAGCATCATTCAATTTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 - chr2L 12447569 5' - opus 489 2 74.66 CAGAGCTCATCACCTACAATAGTTCTGTCATCGGCACGATGTTTGCGGCGTTAGCTGGCAACCCTTTCCCCAAAAACGTCAACAGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCG:1 + chr2R 8467699 5' - roo 399 1 72.50 TCCAACGCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCCAACAATGTGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chr3R 29719336 5' + hobo 66 1 69.29 GTATCTTTTCTGTTGAAAATACCTTTTAGATAAGATATGTTGTATAAGAAAGGCATCATATACTTTGCATATTGGACAGAGTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chr3R 26031819 5' + pogo 32 1 63.64 ACTTAGGCTTAAGTTCCTGCTTGGTCTATCAAGCCGCAACACAAACTTAACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chrX 7624127 5' - roo 9001 2 65.07 ATCGTCCGAAGCACAGCCTCAGGGCACACAGGCTGTGCGTTAATTTCAGACCCCCTTATGTAACCCCTTTTTTCGGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGG:1 - chr3R 902660 5' - R1A1-element 5317 1 72.60 ATTTCGGACAAATTGTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAAT:1 + chr2L 22031959 5' + Tabor 61 2 62.33 TTTGAGGCAAAAACATTTTAAAGCTCCAAGGCAGGAGCTTTTTGCAAAGCTTTCTTTACAGTTGTCTGCTTACAGTTATTTATTGTTCATAATTATCTAAAAATAATCAAGATTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGCACGCG:1 - chr3R 17401844 5' + Juan 9 1 75.86 GCATGGCCAACCCACAAAACACAAACGAGCGCAAACGCTTGGCCACACACACACGCGCACACATACGAATATGCGTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATACACACTCGG:1 - chr2L 5656656 5' - hobo 2907 1 60.15 TATTTTTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAACAACATTTGCCCACCCTTTAAAAATAATTTTTTTCATTTGCCCACCCTT:1 - chr2L 2883335 5' + FB 377 4 49.32 GAAAGGGACACACTGGGTGCCATGCCTGCAGCTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCT:2 - chr3R 15035187 5' - Stalker2 7625 2 67.12 TACTTGTAGTGTAGAAAAGACACTTTTGATTAGTCTTGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCGC:1 - chr2R 7024462 5' + diver 5972 2 75.34 GAACGCATCGTATTCATCTTTTACAGCCCGCATCCTTGGCAACCTTTGTGCATTATCTTCCGACTCTCATCTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 - chrX 10501373 5' + F-element 63 1 50.00 GCAGAACTTTGCCACAACACCTGCTCAACGAAGTGAGGGAGTGGGAGAAAATCTAAATCGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chrX 8856087 5' + 297 58 2 63.01 AACGTGTGGAAGTTCCTTGTCATGCCTTGCCCACTTCCACCAACCCCTAACCATTCAAAATTCAGAGTTTTCCCCATTCCCCTGACGCTTTCATATTTGTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr3R 12781629 5' + pogo 19 1 72.60 AATACCTGGTCCTCGGCCTCCTGTAGAAATCGTAGCCTTCTTTTTGGACAAGGACTATACACCTGAACAGAGAACTGCAGCCCGC:1 + chr2L 6716299 5' + hobo 2708 1 76.47 ACTTTATAAAAGATTTTATAATAAATTAAAACAATACTGTGTGATTAAAAGGGGAATAGTTTGTAGTTTGTAATATTTTAATTAGGGCCTAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACACGGCATG:1 - chr3R 25331556 5' - HB 1293 1 56.16 GGAATACCCTGCAAAAGTTGTGTCAACAATGTGAAAGATAAACAATGCGATAGTATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3R 23565195 5' + jockey 15 1 78.47 AAATGATTTAACTTGGGTATATAAGAAAACAGTAGAAAATATGTTTCTGTTCATATTTGGCATGATATAAAGCGTCATAAACTCCATACAAAAAAACATAATATAGTATATATGTATATTTTTGATCGGGATCAGTAGCCGAGTCG:1 - chr3L 9438652 5' + INE-1 93 1 75.34 ATTATACGTTCAACAAATACCTTCTCCGCGAAAATCGCTTCAAATCAAAGGCCGCTAAACACATTCCACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCCAGGCACCC:1 + chrX 9949484 5' - hobo 2893 1 51.82 ATAGGGGCAACAAAATTAAATAAAAATTTAGGTAGTTCTACAAATAGATAGACTAATAAATTAATAATAACACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:2 - chr2L 9317783 5' + I-element 53 1 55.48 CGCAGGAACATCCGTAACCGAATCTAGATTCAATTCTCACGTTTTCTGTAGTTGCGGTAGAAGGTAGTGTTAGACCGTTTCAAATAAATGAAGTGCTTATAATATTATAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTC:1 - chrX 16525574 5' - R1A1-element 5037 1 71.23 TGCTCAGCAGGAGACCGCCATCTATGTTCTCACCAAACAGTCCGATGTGTCCAACCTGGCTAAGCAACTGAATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTAC:1 + chr3R 26640541 5' - 412 7173 2 51.37 GTGTTTTGGCGGCGGAGATCCAGTCGATCTCTATCAAGATCTGCGTTTCGGTCGGCTCATTATGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr3R 15346858 5' + hobo 6 1 69.89 ACCGATGTAGAACCAACCACCCATACTCACTCACTCGTGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATGTTTTCGGTGCTTAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:2 + chr3R 26404982 5' + hobo 35 1 60.27 AAGCAATTTAAACTTAAAGGATTACAACATGTTTATAAGCATTTATTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 + chr3L 10733658 5' - 412 7474 2 67.12 TTTTTTTTCACCCTGGCCGCAGCTGAACGCATTTGTTTATGCGTCCAAACACGACTTTTCCGCCGTAGGATCCCATTTTGTGCGTTTCATCTTCTTCACTCGTTACGTTTTTTGAGTATTTACAAAAAATCTAAGAAAAAAAATGT:1 - chr3R 23024678 5' + Stalker2 7175 1 58.90 TAAAATGGTACTTTTAATAGTAATAAATATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2R 11609877 5' - roo 9016 2 58.90 AGAAGATAAGTAAAAAACCTATTCGAGTTTTGTGGCTAATTTATACCCTTTACTTGTAGTGTAGAAAAGACACTTTTGATTAGTCTTGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTA:1 - chr2R 7024512 5' + diver 34 2 63.01 TTGGAATTCATTCAAACAAACAAATAAATTGACCACATCCCCAGTTAGAAATAATTGCATTTTTGTAATGTTTAAAAATAATTAAATAAAAATGCAGAAATATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 107460 5' - roo 9063 1 77.44 GCGTGATATACGCGTGCTACATGATTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCTCGATGCAGG:1 - chr2L 12696198 5' - pogo 2069 1 67.44 GCGCTCGTCTCCTGCGACTGTGTGTGTGCTGAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATT:1 - chr3R 5087155 5' - P-element 2819 1 39.73 AATAGTTTTGTAATTAGCTTGCGATGTCCCAGGTGATAAGTGATATTTAAGGCACTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr2R 18785949 5' + roo 8722 2 63.24 GATATATATATAATAAAAAATGAAATATCTATATTTTAATTAAATTTTCAATCTATTCAAAATCTATTATGTAAGGGATGTACAAATATATTTCTAAACATTTATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:2 - chr2R 18326131 5' - flea 238 2 33.56 GAAGTAACTCATCAAACTGCGTAGTTATGGCTTGGGGCAGCTGAGTAAAATGCGATTATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTA:1 - chr2R 5800573 5' + HMS-Beagle 6855 2 58.90 ATATATGTAGAAAAGTCCATGAAAGTGTACCTTTTGTCGCAGATGGTATATACTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr3R 6171221 5' + 297 6640 2 65.75 AAACATTTTCATTATTTGCCAACCTGGCCAAGCTGGCCATAAACAAGCGGCGCCCAGGTGGGCGTATATGTTTGGCAATTTATGGCTGAAAACATAAATTCGTTGGTACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAG:1 + chr2R 18927720 5' + 3S18 5780 2 73.97 CGCCAGCAGTGAATAAATAAATTAAATATCCCATTATTAAACCAATCCCCTTGCAGAGTGATGTGATGTCATAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATA:1 + chr3L 2490924 5' + F-element 142 1 52.05 TAGGCAAATTTCGTTCAATATTCTGAACTATTCGAATTTTTGCCGATGTAGTTCGCGAAAAATGCGTTGATCGCACGCACGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCC:1 + chrX 22652683 5' + ZAM 32 2 60.45 CTGCATTGCATTTTTATTGCTTTAGGCGAGTGACCAAATTAAATAGCTACGCTTCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2L 15057290 5' + hobo 34 1 62.33 TAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATACAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGA:1 - chr3R 9862953 5' + Stalker2 7335 2 74.66 CAGATTATTTCAGCTGGAAAATACATTCTCTGTTCCAAGCCACGTGTACCAAATTGCAAATTAGTTATTTATGTGTATGGTTTTACGAAAATACGAATAATCAATCCGTATGCTGGATCTTCTATCTTTTATATTTCCTGAGATCT:1 - chr2R 18487422 5' - INE-1 149 1 59.59 AATTCAAATTCAAATTTGAACTAATTAAGTTGAACTAAAATTTTAAATATAACCTAAGAACTGAAGCTAGTTCTATTTCCCACGGAGCGCTGGGGACCAACAAGCCTACGTGGGAGCCCCTTTCTAAGGCTGGTGCTTCGCCTAGG:1 + chr3R 19148193 5' + Rt1b 337 1 71.23 GGGCAACACTGTGCCGATAACGATCACTCTAAACCTCACAAGCCGTCCACAACTGCTACGTCTACACCCATAGAAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATACCGGCCCCC:1 + chr2R 2118515 5' - 3S18 5755 1 60.77 AAAAATAATCTTTATGCCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 19938455 5' - roo 360 2 52.74 CATCTATTAATCCCACCCTAAAAATCGGATTATATAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAA:1 - chrX 17270354 5' + 3S18 87 2 76.03 TTTGTAGAGAAGATGTTATTTGTTTTCAAACACAAAGAAACATTTTCCCTAACTGCAATTCAAATTTTCAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTA:1 - chr3L 22638873 5' + Juan 4142 1 52.74 AAGGGAGATATTCCAGGAGGCACTCGAGGCAAACCTTACCATTCATATCAATCTCGGCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 - chr2L 15601633 5' + Doc 68 1 60.96 AAAACCCAAATAGGGCATGGTGGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTATACCAAATTTTCAAATCAAATCAAATTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCAAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGC:1 + chrX 4788553 5' + Max-element 8307 2 67.12 CGACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTGGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAAT:1 + chr3R 9657681 5' + BS 51 1 58.21 CCGAGGATACCTCAGAAGCTGACGCATCTGGCAAGCATAACCATGGCAAAAAGTAAATTTACCAAGCGATTATATCGCTTCCCATGTATGGAAATTTAAAATGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTC:1 + chr3R 20908081 5' - INE-1 574 1 60.61 TGAGGGGTTAGCAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGT:1 + chr2L 19565455 5' - jockey 4915 1 69.86 CACAACTAAAATTTCTTACAGCTACCATAATCGTAACTTAGTAAAATTCGGACCGCTAATAATCCAGCAATTTGCAGTTTTCGATTCCCACTCGAATATTTTATAATCAGCTACCGTTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTA:1 - chr3L 27091920 5' - 1360 2952 1 78.77 TAAGCTTTTGTGACCCGAAGCCTAATGCGTTAACAGCAATAACAACAACAACAACAACAACAACAGCAAAGTGTGGGCTGTGCAGCCACAAAACAACACAATCATATATATATAAAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAG:1 - chr2L 19635112 5' + Quasimodo 4 2 77.14 GTGTATAGTATTATTTTGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr3R 18514322 5' + pogo 57 1 58.90 GGTGACAGGTACACTTTAAAGTCCTTAACCAATAAAAGAAATTATAAATATGCACATAAAGATTTGAGAAGAATGCCAGATGGGCATATTTTGTCAAATTTATTATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATC:1 + chrY 3069840 5' - 1360 162 1 54.79 ATATCCGATTCTCCGGATATAACTCATAAGCTATAAAGGCATTTGGTAATGCACCTCAGTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chrX 20369469 5' + roo 61 2 59.31 GAAAAAAGAACGCCCCCCAAACTGACCAAACACCCCCAGAATCAGCATTGAATAACCATTAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCTTTGGACTTGCGAGTTTAAGATAAACACTTCCTATGAT:1 + chr3L 15458156 5' - HB 1584 1 48.39 CATTCAGTAAATCAAATTGCTATATTTATACCCGTTACTCGTATAGTAAAGGGTATAGTAGATTCGTTGAAAAATATGTAACAGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr2R 578704 5' - roo 9033 1 58.90 ACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:1 - chr2R 18056864 5' + blood 7089 2 78.20 CTTATCTAAACTACCGTGTCCCTATAGGCTTATAGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGT:1 - chr2L 5724370 5' + 1360 83 1 76.03 ATTTTTCCACACAGTACCTAGCCAAGCACAACATTTGGCTAGTTCCATTTATTACCAAAGGGCATCCAGGCTCTCTCTCTCTCTCGATTTTTGTTCAAGAGCGAGAGAGGAGAGAGCTCTACAGTGAACAGCTCTTTTCTACGCAT:1 - chr3L 21912154 5' + 1360 135 1 54.79 AGCTGGTCGATCGCTATTGAGCCAACTATCGATTAACGAAGAGCAGACGGGTGTTGCACAGAAAGAAAAAAGGATATAGTTTTCAACAAAGATTAAAGATTAACATATAGTTCAGATTGGTCATCTCGTCCTTACGGACACGCTTC:1 - chr2R 6746355 5' - Rt1a 4739 1 72.60 GAGCGCCCACCCACCCATCCGCTCCCTGGTGACACTTTAGCGTTTCCGGCCCTTCGTCCTTGCACCAGTCCGACCATCCAACCATCCGCCCATCCGACCCGAGCTTCATCAAAACGCTCTGCGCAATAAATACATTAAATCGCAAT:1 + chr3R 21545576 5' + diver2 456 1 84.25 AACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chrX 3637784 5' - roo 8993 2 69.86 AACCCCTAACCATTCAAAATTCAGAGTTTTCCCCATTCCCCTGACGCTTTCATATTTGTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr3R 12781588 5' + pogo 40 1 54.76 AGCCAAGTGGCCAGATTTCCCCGATGGAGAAACCGAAAAAACGGTCATGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGTT:1 + chr3R 26658154 5' - hobo 2917 1 55.79 GCGTAAGGGTATTCTTCGCCAGGGCAAATAATATTTTTTAAACAATTTCTAGTTTCGCTGCAGGCATAGCCAGACTCATTACCTCTCGCTCTTTTAGTGTCTTTTTATCGCTGACACCACATTCTTTTCGCTCAGACAGGGCAACG:1 - chr2R 10273044 5' + ZAM 164 2 64.38 AGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAT:1 - chrX 22715126 5' - opus 441 2 68.99 ACCTAATAGTAAGTTCTTGGTTTTAAAATTAAATTCTTAGAGCTTATCTCAATTTATGATTTTTATATGCAGTAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCA:1 - chr3L 15374763 5' - 3S18 6087 2 73.29 AGGGTTCATCAGTTCCGGGATCGAAAAGTGGGATATGACAATAGCTTTAGCTGCAACCGAACATTGAGCATTCTAAAGCCGCCGGATTCGGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAG:1 - chrX 3449346 5' - Cr1a 4298 1 63.70 CGGTGGAAAACGGACGCCAGCACCAACAACCGATGCTGAGCAAAGGGGAGGAGGGGGGGTGAGAGAAGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACT:1 + chr3L 20750697 5' - Max-element 25 2 62.33 AAATGTGCGTCAAATTAGCGACGATAGCGGAACGGTGGAAATTGGAACTCGGGGACGTTATTTTTGCGATTTTTTTCCGCTTATCTAAACTACCGTGTCCCTATAGGCTTATAGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chrX 15578096 5' - 1360 3385 2 42.47 CACAGAGAGAGAATCGTGGAAAACATTCTACGACTAAATTATCTTATAATTTTAAGTAATGTGTTCTAGATTTTATATCTAAATCATATAATATAAAACAAAGGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chr3R 6523163 5' + I-element 20 1 69.86 GTGCAGCAATATCCTGGGAGAGTCGAAAGCAACGGACGGTTGCATTGTCAAGCACAGAGGCAGAGTACATGGCTCTGTCGGACTCCTCAAAAGAAGCGGTTCATCTAAGAAGCTTTCTTGTCCGATTCTTAACCGTTTGGTTATCG:1 - chr3L 25611840 5' + Circe 59 2 79.45 AGGGAAGATGTGTGTATGTACTGGCTGACTGACGGTTCATGATGACAATTCAGAAGGAAGCATGATACAACTATCAGGCACTTTTATTCAACAGGTTACACCGAGACAACATGGACTGGCAA:1 - chr3R 31968199 5' + G-element 312 1 78.69 TGGCGGCGATTGCATTGCATTTGTGTCGCCTGTAAATCAGAACCACCGCTAGGCATCCCATCCCAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCA:1 - chr2L 19783762 5' + I-element 4954 1 55.56 TCTAGAAAATGTAATCAACTTGAATTTCAATCAGCCATTAAATTTAAAAAATTGCCCCAGCTAGTTATGCACATTTTACAGTCTCTGTTTTATGGCAGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGT:1 - chr3L 19398256 5' - gypsy5 7323 2 67.81 AGCCAGTGCGTTTTCCCTTAACAAACCTTAAGTTGAAGACCCAATTTAATTGCTACGTAAATTGCGCAGCTGCTGCGAAGTTGCAAATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chrX 22577955 5' + 297 6606 2 65.75 ACGCTTTTACACGTTGTTGATGTATTACTATATACATAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATA:1 + chr3R 4570258 5' + Juan 87 1 73.97 CAAAAAGCGTTAGCACGGAAACGGAAATGACAATCGTCCTTCTATTTCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chrX 6587701 5' - hobo 2937 1 69.33 TGCAAAGCCTAATACCTACTTTGCGTTCGGTTAAATGCTGCAGCCTCTTGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 - chr3R 6149857 5' + jockey 69 1 62.69 TCGTAAAAAAAATATACTCTTTTTCAAACATTAATAGGAATATATTAATGGTTGAAAACTAGTAAAATTATGCTTTCAACATAGTCAATCCTTATAAATGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 19800829 5' + roo 8686 2 67.81 AGTTAGTTACCATCAATAACAGAGAGTTCTGCGCTAGCTGCTGTGTTCTGAATATCATTATCATCTATTCCTTTTGAGTTAAAAAACAATATTGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 10800466 5' + roo 28 2 65.07 AGTTTGGACCAATCATCGCGTATGCGATTACCCACACACAATATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - 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P-element 2847 1 38.38 CGGATATCGGAAATCTACGTGAAAGCTTGCGGCACGCACGGTGCGAATTGTTTTAACTTACTTGGCTCAACTTTTTTTCATCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACG:1 + chr3R 18517407 5' - R1A1-element 5 1 54.11 AAATTGAGATTAAAAGAAGGAAAATATTAAATGAACTTAAATAATATGGGATATTTAAATTAACATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTT:1 + chrX 16538088 5' - mdg3 190 2 56.16 GCTCTAATAGAATTGTACGCATTAACGTTTTAATCGTAGGTGTGGTTGGGCCCTAATGCACTAGATTGAATGGGTGTTGATGTACTTATCGTTTATATTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCT:1 + chr2R 17390345 5' - P-element 334 1 67.36 CTATAAAGCAGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTT:1 + chr2R 12185282 5' - accord 7357 2 64.38 ACATTTATGCTAATAAATTGAAAATGCAAATAAACGAAAGTGTCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACAC:1 - chr3R 11730754 5' - hobo 2861 1 71.23 GGGTTGACAGACGCAAGCCCCCTTTAATGTGACAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAAGCCCTTTTAAAAAAAAAAGTTAAAAAAAACGAAAAAAAAAA:1 + chrX 16128024 5' + Doc 4702 5 48.42 GCGGGATAGGGTGTGTGTCTGACAACTAAAACAAAGCCCAGAGAACAGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGCGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - 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chr3R 25319603 5' - Doc 4459 1 68.49 AGCAAACAATGCCGGAACGGCAATTGTTGAAAGTAGTTAAGAAAGGCTTGAGGGACGGGCGCTATTTCGGAGTTTCGGTCCTTTAGCAATTATTTTCTAATAGAAATATGATCATATGACGAAAACCAAAAACAAAATTGACCG:1 + chr2R 4511928 5' + transib2 107 1 55.56 TTTGCATAAAAACAAACAGAATGATCAAGAATTTAAACATGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGA:1 + chr2L 10685798 5' - Quasimodo 7288 2 79.45 ATTTTCCTGATTGATGTGCACATTTTGAAAAGCTGACACTGCCATAAATTAAAAATGCGGTCGTCGGAATGATGCTACGCATAAATGAAATAAATTCAAAAGCATAACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chr3R 13231718 5' + F-element 54 1 54.79 GCCAGTATGCTGAAACGGTGTAAAATTAATATTTGGGTTGAATGTACTATGGCACACAAACATTCACTTGAGGCGTTGAACAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 + chr2R 4853895 5' - copia 5083 2 54.11 ATTGCACTTGCATTTACAGTCATATATTTTTATGAACTGTGCATTAAGCCACAATGAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:3 + chr2L 2622647 5' - roo 9006 2 63.01 CTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGAGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 - 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chr2R 544911 5' - HMS-Beagle 224 2 67.67 AGAGACTCTCTTTTTATTTCCCATTGCGTGTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAG:1 + chr3R 9158135 5' - P-element 2796 1 22.76 ATATATATATAAGTATATACGAATGCTTATACTTATGTATATATAGGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 + chr3L 19027677 5' + hobo 75 1 70.55 GTTTCGGTTTCTCCTTTGGGAGATTCAAATCAGAAGAATTTTGCTGAATTTTCCGACAAATTGAACTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr2L 12766928 5' + hobo 17 1 72.60 AACGAGTGTTTTTTTTATTGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGAC:1 - chr3R 23021024 5' + INE-1 561 1 54.79 CGCAGTCATGTGCTTTTCGTTTGAAATGCTTTCGAGGGTCGCTCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chr2L 1892351 5' + hobo 80 1 69.86 CGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 + chrX 19162583 5' - 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chr2L 18787399 5' - roo 334 2 62.33 CCCAATTATAATTATGTTTAAATGCGGGTTGTTCCATTCTTTTGCATACATACGTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATT:1 - chr3R 14801291 5' - I-element 5285 1 63.01 AGAGTTACAGGTGTTGATTTGCTTTTCATAGGCAAGTTGAGTGCATTTTGCGCTGCGGCTCTGCTGCTGCTCTGCTGCGGCGGCTGCGTTGAGTTGTTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCA:1 + chr3R 8816687 5' - jockey 4713 1 73.29 TCACACAACCATTTTGATTACCAAAACTAGCTTAAAAACCTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCA:1 + chr2L 3150977 5' - blood 7361 2 65.75 ACTGTGCGAAATAATTAAAGACGCCCAGAAGTATGCCACAGTCTTTCGGATGATGTTAGTGTTGCGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr2R 11379773 5' + hobo 57 1 57.53 ACACAGGCACGTGACATTGTGGTTAAGCTGGAAAAAAAGGTGAGAGTAAGCAAGAGGAAAGTGCGCCAACTTAAATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 - chrX 22578115 5' - 297 355 2 57.53 ATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATT:1 + chrX 18193713 5' - 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roo 9050 2 67.12 CGTGGTGGCGTTTCACCACTTTACCACTCACCACTTTAGATCTGATATGTTATGATGAACGGTATATCCACCTGACGATCAAGAATATATAATTATAATTATGCCTTCCTCATAATTCACTTATACAAAAGAACGACCGCGGTGGT:1 - chr3L 23979152 5' + Tom1 37 1 62.33 ATCACCCTTCCATACCATCCTGGCTTCATTTTAGCGGAGCATACTTTCCAGCGCTCGCACACTTTGTGGCTCTCATGAATTTTTCCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTC:1 - chr2R 5899325 5' + jockey 4539 1 58.90 CCTGCACCCTAACATCCTAAATCCGTTCGGCAGGGAAGAAGCCCGAAGGACACGGAA:1 + chrX 23470499 5' + gypsy8 493 1 49.12 TCTGCTTTATGAAATGTATGTATGTTCCTATTGTATAATTACAACCACAATCAGATCTGGTAGTTCTGGAGTTCTTTATCTTGACATTCAAAAGTACAACAGATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:4 + chr3R 12540440 5' - roo 9050 2 63.70 AGAGCCAAACTGGTGGCTGGCTACCATGCCAAGCGGAATCCGGAACTAGCCAAGCGATACGCCACCGCCAGCTCAAGGATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAAT:1 + chr3R 23259698 5' - Tabor 7235 2 53.42 GATAGCCAATAGCGCCCTTGTTATTTTTACTTATAAAATATCACTTCGTTTCATGGAGCACGGACTTGCATTGTTAAAAATATGTACATATGTTGTTTAAATATGTGTTTAGACATGATAAGAAGGCAAACTATAAATATGTCCTA:1 + chr2R 9873331 5' + rooA 32 2 66.44 AAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 + chr2R 10189262 5' + Doc 68 1 63.70 CAAAAATATAGAACTATATTATATTAATACATATGTAAAGATAAGGTGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 + chr2L 12814726 5' + hobo 72 1 65.75 CTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTGTGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 - 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chr2R 10960941 5' + Doc 91 1 73.97 ATTATCATCGCTTTGACTGCCGGGGCCGGATTTAACCTGTTTGGACTTCAACTTGCCAAGATTTTCAGGAAGTTGTATGGGTATTCTTTTTTAAGTGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 17933603 5' + roo 8688 2 66.44 GCAACGCTTCTTGTACAAAACAATCAGCAAAAAGGTCATCACCACCATAATTTGTCTGTTACTGTGACTGTCATTTAGTTTATAGTATATGATATGAACAGAATTCTCGTAGAGTAAAAGGGTGTACTAGATTCGTTGAAAAGTAT:1 - chr3L 20433492 5' + INE-1 10 1 74.66 TTCGCTTCCATGAACTGCCCTGCTTTGATACCATTTTCTAAATTAAGGCATACTTTCGCACAAACAAACATTCGACTGTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3R 8810768 5' + 297 38 2 58.90 AACAGCAATGTGCTGCAGCATGCTGCATCTTCCTCTTCTTTTCCCTCTTTCTGCAGTCTGCAATTTTAATTTTCGAGGTAGACTTTCGCTTTATTTTTGGAAAGCGCTGCGGTTCAGCACATTGGGGTCTCGAGAGAACCGCAGTA:1 - chr3L 22377172 5' - X-element 366 1 54.11 AAAAAAAGTCAAAACGCCTTGTCTTCAGTTCGATGAGGTTTCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chr2L 16360646 5' + hobo 80 1 73.29 TCCATAGGAATAACTGAACTGTACTTAATTTTTTTTTAATCCCCTTTAAGTAAATAAAAAAATAAGCATAAATTATTGTCTTGTTAACCTTAAAAATATTTAATCTAAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTA:1 + chr3R 26349263 5' + mdg3 5265 1 36.30 TATTGATTAGTGTTTAGGGAAATTAAGTTGTAAACATTTTCTTATTTTGATTTCATTACTTTTTTTGTATTTATATATTAACATAGGAACTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 - 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Ivk 4947 1 52.05 AAATGCATTATAATAAATATACTTCATAAAAACAATACAAACATACATAAAACATGTTCAGTGGCGTTTTGATCGCACGGCATTTAATATTACTTATGTTTCTAACAACATGGCCTTTTGACTCTACATCACTTTTAATTTCATCT:1 - chr3R 3696327 5' - G4 421 1 70.55 GAGAAAAGTTATTAGTTTGTTTTTAATAACATTTAGAGGTGTTTAAAAGTACGTAGTACAAAAATGACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCC:1 + chr2L 17296957 5' - Max-element 8491 2 52.99 TGCGCCAAAAATTGGCACATCGCCTACCACTATTTCCAGCCTTTGTAGCTTCCAAAGGCCATCCACACATTTCACTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAGTATGGA:1 - chr2L 21657935 5' + invader4 303 2 55.48 GCATATTCAACAGAAATTTAATAAACTTTTAAAGGCTTGATCTTGGGTGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2R 21244967 5' - roo 9019 2 58.22 GTAGTAACATTTTGGATAAAGCTTCTTAGTGGCTAAAAAAATGTACGTAAATACGTCTTCCTAGAACAATATATAGATTTTTAATAGACTTACCATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCT:2 + chr2L 21082086 5' - mdg3 218 2 65.75 CGGCAGAGGATTGCCTGTTTCGGTTGCCTTTTTGGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr2R 18266031 5' + roo 86 2 79.45 AAGAGTACCTGTGGTATTATTAAGGAGACTACGTGCGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGACATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATAGCATCTTAAAG:1 - 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chr3R 13198328 5' + Doc 21 1 74.66 TAGCGCTTTAAAAAACTTTCCCGCCGCAGGAAAGAGAGCACAAAAAATGTATATTTATATACATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATTTAAT:1 + chr3R 12952856 5' - micropia 5380 2 63.70 AAGGGAGTTTTTCAAAAGGAGTCTGCTCTATATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAAATATGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCA:1 - chr2L 21082221 5' + mdg3 56 2 57.04 GTCGAGATGCCCCCGACTTTGGACTTGATCTTCTCTCGGGCGCCCTCCCTTTTGTGCGTCGTTCGCAGTGCTGTTTGTTGTTGTTTTTTGAAAGTTTCGCTTGAATGTTTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTGATTTCA:1 - chrX 4564210 5' + Cr1a 406 1 69.86 ATTAGCGGGCCAGTCGCTCTGCTGGAGAGCCTATGGCTCAACCCCAACCCAAGCGAACGGCCAGAACGAACAAAAACGGGCAGCAGGATTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACC:1 + chr3R 5088921 5' - Ivk 4965 1 60.27 GAACTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr2L 12766990 5' + hobo 53 1 64.17 ACTTAGAAAGATAAAAATATTGCCCCATTTCTTAGATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTA:1 - chr2R 21822422 5' - Doc 4574 1 76.03 TCTAGTAGGGAGAGCTCCGAGCAGTTAATGAGCTTGAGGCGAAAACATAGAAGCACACATTTTCCTGTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 - chr3L 5425558 5' + blood 7066 2 57.53 TACAGCACTCGCTTTGCACATCTATGTATATCTAACTCTTTGACTGAGTAATGGGTATCTGATAGTCGTGGAACTCTACTATACCTTTTTTGACCTGCTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr3L 22519134 5' + pogo 17 1 73.97 TTATAAATACAGCGGTCAAGTAGTAAAATTTTTAATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGTTCTCGTGTTTTCGGGCC:1 + chr2L 12447401 5' + opus 160 4 52.05 CTGGTGCTGAATTTGAGCGCTGCCTGAAAGATTCTTCTCGTTTTGTATTACAACTTTGATCTGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGGCTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3L 12775961 5' - roo 9013 2 57.53 GCCCTTCGTTTTCCGGGTAATTTTATCTCACTCATTGCCTCGCCCCCTAGCTGCTTAATTTTTACACTTGCCGCCTTCAAATGACATCCCCTGAGGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 + chr2L 9109798 5' + opus 7024 2 69.18 TATTATGGAAGTCCACCCACCAGACTCATTTTCATCTTCATGTTTTATAGGAAATCAACTCGACAATTACTTGGCGAAAAGTTCATTACCATTTTAAAAGTTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3L 13015849 5' + hobo 17 1 71.23 CAGCTCTACGGCGGAATCACGACCGAAATTCCCGCCACAATGGCAGGCATCCATCAAGCAAATTGAACACGCCCCCGTCGCATATATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATC:1 + chr3R 20720483 5' - 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hopper 1341 1 66.44 CCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGT:1 - chr3R 11550282 5' + F-element 55 1 60.00 TTCAATATCCGCAGTAATTCCTTGATTTATAGACCCAATATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr2R 18467242 5' - roo 9027 1 52.05 ATCATTAGTTTATTTTCCTTTCGCTGCCAACTTTATTTTTATTCCCTTTCCAACAAATATATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGA:2 - chr2L 8615439 5' + 17.6 55 1 61.64 ACGACCGTCAAACACGAACTGATCGCAAGCGCTGCACTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 - chr2L 14263025 5' - P-element 2806 1 31.51 ATACTTATTTATAAATGCCAATTGAGCATTTTGCAGAATGCATTTAAAGACAAAATTTAAAAATTGTTGAAAAATGGGTTAGAATGGGTATGGCAAAAATTTGTTTTCCAAATCAAAAAATGTCAATACATTTTTCAAAAGTGTGG:1 + chrX 21453110 5' - INE-1 258 1 68.49 AGGTGAAGTATGCAACACTTTTTCGCCACCTCCTTTCGTTTCCTTGTGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 - 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Burdock 170 2 79.45 CAAAGGAGGAGCCCTCACTTGAGCTGTACTTTGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1 + chr3L 1728478 5' + blood 89 2 76.71 TATAAATACAGCGGTCAAGTAGTAAAATTTTTAATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGTTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 + chr2L 12447402 5' + opus 7164 4 51.37 AAACGCTAACACAAGGATGTGAGTCCTGGGAAGGGAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:2 - chr3R 5767442 5' - roo 322 2 75.34 AATACCCTTTGCAGGTCCGTTGCCAGTACTGCTAATATCAATAGTAAATAAAAAATAAAATTATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCA:1 + chr3R 19449879 5' - opus 7448 2 57.24 ATTTATTGTATCTCAACTTCCTGGAAGCAACTTGATTAAATTTCCTAATTTAAATAGCCGGAACTATTGGACAGCAAATAATGCTGAAGAGCAAATCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACAC:1 + chr3R 28290276 5' - jockey 107 1 60.96 CGGTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr2R 20931615 5' + blood 7055 2 50.69 TACTTGAGGAAAAAGCGGAGAAGACAAAAAGATAAACAAAAAATTGACAAAATGCTTTGAAAAAAGGGCTTAATTGTGGTAGATTGCAATTCTATGCATCGACGGCGCAATTAAAAGGGTAGTTAAGTGAAGTAAAAGAACCAACC:1 - 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roo 9016 2 56.16 ANCAATATTTTTGGTAAATGAAGATCACTTAAGAACTGGAATACTAGAATGTCATAAAAGCTAGTAACTTTACTCTCCAAACCTATCCGTATTTTAGCTGCTTGGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 - chr3R 31264291 5' - jockey 4973 1 68.49 CATTAAATATTTCTACGCCATTTTTCCTTGTTATTTTTGCACTTGTACCAAGGAGAAACATCAAAAAACGCGTGAAAAGTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTGCGCGCA:1 + chr3L 18435407 5' + I-element 43 1 54.79 TAGCACACAACGACAGACAGCCAATTAAAATTCCCTTTTAGCCAACCACTGATGATGGCCAAAAGGTTGTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:1 - chr2R 10760512 5' + Tabor 6892 2 55.48 CAACAAATACCTTCTCCGCGAAAATCGCTTCAAATCAAAGGCCGCTAAACACATTCCACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 + chrX 9949494 5' - hobo 2883 1 60.58 TTTATTATTTGGCTGTTGCTGCTGCTTCTTGCTCCACTTGCAACATGTGACCCGATGGGAGGATGGGGATGCCAGTATCCCACGCAATTCGCTTTAAATCTAATATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAAT:1 + chr3R 30092154 5' - I-element 5347 1 75.86 CGCCTGCTTGTTGATTTTGTTGCTCTGTTTGTTTGGCTCAAAGCTATAAAATATATACAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 + chr3R 6472638 5' - opus 7445 2 64.38 AGGCCCAGTTGAAAACCCCAGAGCTCATCACCTACAATAGTTCTGTCATCGGCACGATGTTTGCGGCATTAGCTGGCAACCCTTTCCCCAAAAACGTCAACAGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2R 8467681 5' - roo 391 2 73.29 ACGGCTCCTGCAAACGCTAACACAAGGATGTGAGTCCTGGGAAGGGAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3R 5767453 5' - roo 333 2 67.81 ATGATTCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCT:1 - chr2R 12185460 5' + accord 19 2 69.86 TGCCGATCACACTCGGCACTCATAACGGAGGACAGAGAAGGCAAACAGTCAGAAAACGGAAAATGCCTCAAAAGGGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCTGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 + chr3R 1465940 5' + 1360 70 1 52.05 CGACTGCTATTTTTTCACAACTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2R 14450144 5' - roo 9036 1 52.50 GGATATCGATAGATATTGGGGAATAAATTGAGAAAAAACTTAATATTGTTCAAAAATGTGGGCGTGGCAGCTTTGCGCGATTTTAAGGCGTTAGAGTTGCCGTGATAAAAAGTTTTTTGGTAAATCGACAGAAATTTAAAAGACTA:1 - chrX 23078695 5' - INE-1 299 1 78.08 TAACGGAAATACTAAATTAAATATAAAAATTACCAATAGCCAGCTAGCTGATTGATTTACATTGTTGCAATTGTCTGTCTTCCCTCGCCCACCAATTCAGTGAGCAATGAGAATCCCACTGGCGTATGAAATACGACAACATCGGC:1 + chr2L 11404379 5' + gypsy2 34 2 76.71 AAGTATTTTGCTTGAACTCGCTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr2R 10189234 5' + Doc 40 1 56.16 TCTCCCCAAAAGACCCGTTTCTTTCGGTGTAAGACTTTTGGCGCTCTCTTCTCGCCGCTCTCTTTTCGCAGCGACGTCGACGTCGTTCGTTTGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chrX 1831195 5' - P-element 2858 1 65.75 AAGGGCATACATATGTACATATATTGTCAAATTTACAATGCATGGATACGTGTGCACACACACAGTTGTCTGCTATCACTGTATCTCTGGCTCTTTGGCTCTCGAACAAAAATTCGAGGGGGCCTGGAGCCACCTATAGAGCCACG:1 + chr3R 24526136 5' - 1360 64 1 69.18 GAATCGAAGGTGTTGTTTACGGCGAATTTCGAAATGGGTTGCCCGGAGAGTTTGGACCAATCATCGCGTATGCGATTACCCACACACAATATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 - chr3R 25094742 5' + P-element 29 1 65.75 AAAACTGGGGGAATCTGGGGAATGTGCCTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCA:1 + chr3L 19398153 5' + gypsy5 33 2 69.05 TGTACCCATACATACACATGGGTGCTTGTTGGGAAAAGCTAAGGGGCCATGTCAACAAACGGGTAACGCTTTACTTCCTCGAAAGGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAAT:1 - chr2R 17872601 5' - Tirant 367 2 58.74 CCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr3R 19989302 5' - hobo 2893 1 76.60 ATATCTTTATGAAATCAATCAGAGAAAAGTTATTAGTTTGTTTTTAATAACATTTAGAGGTGTTTAAAAGTACGTAGTACAAAAATGACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAA:1 + chr2L 17296936 5' - Max-element 8500 2 63.01 AAATTCTCCCAATAAATAAATTGAATAACAATTTGCTTGTGGGTCGTGTCATATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 - chr3L 20910152 5' + F-element 19 1 71.92 CGTAGCTACATATATTTAGAAAATTGGACACTTTATATTATAGAATTTTCCTATCTTTAAGTAATGCTTATTTATCTTAACTTTGTAGTTTATTCTTGCATATTGTATGAAAGCAAACGTTACAATTTTTGTTTTGTTTATTTTTG:1 - chr3R 23895830 5' - Porto1 189 1 53.42 GTGTTATAATCATTAAAACCGGAAATGCATGGCCAACCCACAAAACACAAACGAGCGCAAACGCTTGGCCACACACACACGCGCACACATACGAATATGCGTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr2L 5656682 5' - hobo 2920 1 72.60 ATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chrX 3637787 5' - roo 8990 2 71.92 AAACGGAAATAATTAAGTTAAGAAAAATAGTAGGAAGTATCGAGTGGTTATCAGCTTGCAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCAGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1 + chr3L 23094148 5' + 1360 64 1 58.22 AACTGCCAAAAAGAGCTTATTTATGCGCATATGAACAGCTCGAAGGGAGTCGGACTTTCGCCGGCATTCGTAATTGACTCACCTTTAATTTGATGAAAGCAGGTGGTGGTTGGAGGTGTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCA:1 + chr3L 10138285 5' + F-element 488 1 73.29 ATGTCATTGTTGCAAAAGTTTTCAGCACTATCTGAGGGGGGCGCGGGTGGCAAACCACCCGAAGGTTGCTGCAGGATGACGTTCGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3L 939751 5' + hobo 37 1 60.27 ATTCTGCTACATTGTTAATTTAGTTATGTTTCTGTACATTTTATTGGCTTTCTAAGAATACAAGAGATCTTTTATTAATATATGCAACTTACTTACGCGTTATTCTTCCGAGTGCACGCGATCTTACGCTCTCTCTCTCTCTCGCT:1 + chrX 17178672 5' + blood 7176 2 83.56 ACTGCTCTTCATATTTGTCTGGCTTTGCAAAAAAAAACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 + chrX 12344268 5' + F-element 41 1 66.44 TGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGGGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 + chr3L 13380459 5' + hobo 55 1 67.24 ACAAATTCTATGCACGTCAAATGTCAATCTGCATACACATATGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTT:1 + chr3R 8965151 5' - HMS-Beagle 6966 2 70.55 CGCTCAATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chr3R 19989247 5' + hobo 67 1 65.07 CTCGTGTTAGTTTCTGTTCATTAAAACATGTTAAACACATAATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 + chr3R 12886003 5' + 412 7132 2 74.48 ATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 - chr3R 31663320 5' + jockey 78 1 67.39 TTGTTGATTGGATTTCACTGATTTTCATTTTTCAAGGCTAACTTACAGCCATAATTCAAAAGAAGATACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3L 19938617 5' + roo 8677 2 77.40 ACTGGTTGACTTTTTATACGCTTTCAGAGGGCATCTCGATTATATCCAGAAGTTTGCCAGACACATTTGCGACCAAAAGAAGTATATAGTAGCATATGTGCAATAGTATAAGACCACATATACTTACACACAAACACACATACACA:1 - chr2L 10685905 5' + Quasimodo 38 2 60.27 GGTCCCACTGGACGCGAGTGTGTTTGCGAGTGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1 + chr3L 13450730 5' + P-element 87 1 26.03 GAAATTTTGCTCACAGAACGGCTGAGAAATGCTCTATGGCAAAAAAATAAAGTTTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTAC:1 - chr2L 12814808 5' - hobo 2873 1 63.70 CTTAGAGCTTATCTCAATTTATGATTTTTATATGCAGTAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTA:1 - chr3L 15374728 5' - 3S18 6052 2 54.11 CATAGTTTTTGTGACACGTTCGAGAGGATCGGAGTGCAAGGAAGTGGGTTGTAGCCTCGAATAATTTCCATATCCTGTGTAGCTGCTCTAATGTATTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3L 13631219 5' + hobo 25 1 69.18 ACTCGAGGCAAACCTAACCATTCATATCAATCTCGGCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 - chr2L 15601612 5' + Doc 89 1 78.08 AATTGACGCAAATTTACACAGTACAACACTTCAAGATTGTAGCTTACTTCATATACTATTTTTTTGCATTTTGAGATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 - chr3R 10769679 5' - 297 354 2 58.22 AAATCAAGCAAATGTTTCTCGGAAAGTCCAAGTCACCGATCATCCATTGGTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 - chr2R 12642733 5' + pogo 66 1 65.07 AAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATATTATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATGTCATTGCCAACAAAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGC:1 - chr2R 5260086 5' + Tc1 1593 1 43.84 AACTAAAATCAATTGCAATCTTGAGAATTTAATCAAAAAGAAGGAAAAAATGCGAAGGTAACATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 - chr3L 18421424 5' + hobo 60 1 58.22 GNAGTTTATAAATAAAGCCCAAGCTCAGTGGTCCAAATGCGGAGTTTTCCATGGAGATTTTTCGCCGCCTCTATCAAAAAAATGATGTGGTGGGGGTAGCAAGTCACGTAATTTGCGAAATGATCATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 - chr3R 12953339 5' + jockey 7 1 78.08 TTTTTCAAATAAGTTAAAGGAACCTACTATCCTACCTATACCTACATGTTCATTAATTACGATTAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 + chr3R 25052991 5' + pogo 52 1 53.42 TGTGGCTGATATGAATGAATTTGCGTGAAATTCTCAAGATTTTATTGGCCTAAATATAGTGATCTGCCTTCGAAGGTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr3R 5684040 5' + pogo 40 1 56.85 TCACCCAAAAAATGAAACGAATGTTTGTGCCAAAAAAAAAAACAAAAAAA:1 + chrX 14985208 5' - transib1 10 6 58.00 GTTTGCAGGTACCGTTGAACTTTGCTTTCACATAAACAAATATTACTCACTTACATTGCTCTCCCTGGGGCGACAGCTGTCACCCTTGCACACACGTACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3R 17079373 5' + 1360 26 1 67.81 TTAGTTTCGCTCACAAAGAGCTTCGTTGTTGGGCTTTTTCTGGTCTCGGTCTCTCGACATTACAACAACTTCGACTTGAGCCCCTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 + chr3L 17895889 5' + P-element 17 1 69.35 GGAGAAAGAAAGACGCACAACAAATATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAGCTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTT:1 + chr3R 28788742 5' - I-element 5257 1 80.82 CGAGAGAGCGGGGCTGCGCTTGTAGTGTGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGGTTTTTTTGACACC:1 + chr2L 15057197 5' - hobo 2877 1 75.65 ACAGTCAAGATAAAAGTTCTATTGACAAAATTAAGGTTTATTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3L 18954094 5' - roo 9042 1 65.75 ATTATATAAATTATCTTCATTAGCACCATCTATAGTTGTGTCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGCCACCCTACT:1 + chr4 1107447 5' - hobo 2872 1 67.67 ATCGAAAAGGGTTAATGTTTGGCCAGTCCTTGTACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAAGCTCTGCGCATTGG:1 + chr2L 11639025 5' + springer 89 2 79.45 GGCCAAATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTA:1 - chr2R 15892213 5' + hobo 74 1 69.86 ATTTATAAACTTGCAGCAAAGTGGAAAAAACGAAGCGAACGACTCCGCGGAATGCAATGCCACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3L 10068850 5' + 412 7073 2 71.92 TGTGCCACTTTTCTTTTTCTTAGTATTGCTGCTGTCGCTTTTCCGCCTATATGTATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 - 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Stalker 7144 4 61.87 GGTCGCCAGCAGCAGCTTGGTAATTATAGCCCAATTCTGCTGCCGAAGCGGAAGCAATGAGTAAGAGTAACTGGAATTTAGAAAATTATCTTGTTTAGAAAGTAGTTACATGATACATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAAC:1 + chr3R 26693287 5' + Stalker2 5 2 75.34 TAAGATAAGATAAGATAAGATAACAAACACGTAGTCTTAAGCGCGTCATGTGCGGGTGGCTGTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 - chr2R 5064833 5' + 1360 60 1 59.59 AGCACAAAAACAAGTCACAAACTTTTCGCCTAGACGGTGCTTTTTTTCCACTTTTGCACATACATACATACGTATACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chrX 13484103 5' - hobo 2892 1 52.78 ATTAGAGGGCTGCATAACACCATTCAAACCATTCAAAACAACAGTCGTGCTGAGATGATCGCAAATTATCGTGCATTTAAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr3L 24531162 5' + Tirant 13 2 45.38 ACATCCGTTTTGCTGGCCCTTCAGTAATGACATTTTCAGCGGCACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTG:1 - chr3L 19431707 5' + Juan 82 1 71.23 CCGAGATTGCGGCTGACTCATAAAACTTTTATTGGACCCACTTGATGGGGAAGTTTTTTTTTCTTATTTTTTTTTCTTTTAAGTACGTGCCTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr2L 10128049 5' + hobo 31 1 63.01 ACTCACCTTTTGCTATTAATATAAGAAGTTTAGACACAAAATGCGAGTAAATGGGGAGATATAAGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chr2L 15524024 5' + opus 7143 4 59.32 ATTATTGAAAGCATTTTGCGGCCAACTTCAGCTGTTGACCATGTGCCCGGCCCCTGCCACGCCTCGTTGCCACAGGGAAAGCGGTTAGATAGCCATTGTAATGATGATTTCCAATTAAGAACACAA:1 - chr3R 12886118 5' - 412 7538 2 72.22 CTATGAGGATCACAGATAAGCTTTGGAATTTCACCCATTGATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAC:1 + chr3R 8293499 5' + Stalker2 30 2 63.70 ACAACACTTCCAATTAATCAAAACCCATAACATCGCACAGTGCCTGCAATTCGTATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTGATTCAATTTCTTCTTT:1 + chr3L 5329095 5' - 412 7479 2 61.64 ATTTTGATTACCAAAACTAGCTTAAAAACCTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCA:1 + chr2L 3150987 5' - blood 7351 2 58.90 TGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 + chr3L 1983442 5' - Transpac 5173 2 56.16 GATATTACGATTTTGTGCTGCATACTTTCGGGCTTTAAAGTTTCCGAATGACTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAA:1 - chr3R 11568672 5' - BS 5027 1 63.89 CACAACAGCAACAAAATTAATGAAACGAAGAAGAACAGCTGGTATAATAAATACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr2L 13102870 5' - roo 340 2 65.07 TTTGCTTAATCGGTTAGTTTGTTATCACTTAGTTTTATTGGATTTACCATTTTTACTGTTTTAAATCAAATTTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCT:1 - chr3R 20097704 5' - mdg3 5449 2 52.74 GGAGGGACATGGCCAAGGACGATGAGGGACGCTCCCCGGCAAAGTGAACGCATAATTAAATTACGCAGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAG:1 + chrX 4049724 5' - Doc 412 1 66.10 GGTGCCTGGCGGTTGCTGGGGCTTCCGCTTTGTTAGCAATCAACTTCCTGTTGCGCAAACATGTGTGCAGCCACAAAAATAATTAATTGGCTCGAATTCAATACTGGGAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTC:1 - chr3R 11873491 5' - 412 7535 2 77.40 TTAAATTCAAAAAACATTTAAGCTGCCAGCGGCTGTACCACCGAGAGCGTGCTGTGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr2L 19680987 5' + hobo 57 1 60.28 AGGAAAACAAAATTTGGATGTGGCTATAAAAAACCTTAGACCATATTCCTAACCGAACCTATTCCGAACCTTATATGCCACGCCAATCCCCCAGGGAAGACACCTCCCGATCCACCGGTTGAACCACAGACATATTAACACCCACA:1 - chrX 751719 5' + transib4 2400 1 52.05 AACAAAGTTGATTATTTTATAGTTTTGAATCAATCGAAATGGGCGAAAATACATAAATATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 - chr3R 15453771 5' - Transpac 253 2 60.27 ATTAAATAACACTGAAAGGCATTGTCATTTCAATCGCAAAACAATGCATTCGCACTCCAAAAGCATAAAGTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGC:1 - chr2R 16489242 5' - Doc 4546 1 52.05 ATCCTTTGAGCAGCTATAAGAGTCATAGAAACGCATTCAGGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGAACTTACAAACACA:1 - chr2L 6716379 5' + hobo 82 1 71.23 TGATTGGCAATCACTGCCTCTGTGTGTGCCTCTGCGTGGGCGAATGGCACTCACTTCGATCTGATGGCCATCGACGTTGACACCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3R 11730654 5' + hobo 29 1 60.90 GCTATGAAGATGGCCAGGCTGAGGAAGGCGGTCATGTCTGTAAGTGAGTTCCCAGAAATCCAATTAGTTGGAAGAAGGGTGTGGGGCTTATGTAACATGTTAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3L 18954269 5' + roo 18 2 71.92 ATTGGAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTA:1 - chr2L 21570261 5' + Dm88 4426 2 63.01 AGCTCGTTTCTTTCACCTGTTTTGCCGGGAAGTAGGCAACATTTTTTGTGTTTGCTCTTTGTGGTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr3R 8625284 5' + jockey 62 1 56.55 GTCGACAAAGAAGAAATACAAATCACAATGGCTGCACAAACAACCAAAACAACAACTCGACATCCGTTTTGCTGGCCCTTCAGTAATGACATTTTCAGCGGCACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACG:1 - chr3L 19431766 5' + Juan 7 1 78.46 TCTTTATGAAATCAATCAGAGAAAAGTTATTAGTTTGTTTTTAATAACATTTAGAGGTGTTTAAAAGTACGTAGTACAAAAATGACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 + chr2L 17296939 5' - Max-element 8508 2 65.93 AACTCGTATTATTTTTGAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAAT:1 - chr3L 23839761 5' + McClintock 22 2 69.86 GCTCTGTAAGACGGAAGAGTTGTTTATGATCTATTCCCGCCTTGACTTCTATGTACCTGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr3L 22445282 5' - Transpac 250 2 61.64 CTGTCATCGGCACGATGTTTGCGGCATTAGCTGGCAACCCTTTCCCCAAAAACGTCAACAGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr2R 8467723 5' - roo 348 2 58.90 CAGGTAATCAAGGTGTTTAAGGATAACTTGTGATCATAAGCATATGCAATAGTTTAGTTTTGTCCACTTATAGAAACATAAATTCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr2R 11610008 5' + roo 36 2 58.90 TCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTA:1 - chr2L 15057237 5' + hobo 87 1 78.08 CGTGGAATGACTGGAAGTGTTTGTCTGAAATCACCTGAAAGGACCAACAGAGTTTCGCCAAATAGTTTGTCACTGTTTTTAATATCTTTCCATTCTCTGTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 - chr2R 4854052 5' + copia 4888 2 71.63 TAAATACAAGGTTAAAGCCCAGCAGACCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chrX 127028 5' + hobo 14 1 58.06 AGGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAACTAGTGTGAATGCGTATACGAAATTATTTGCAGAACAACAGGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTCCCC:1 - chrX 20447162 5' - INE-1 571 1 64.71 TTCATGCCCATGACGGGGATGAAGCGGTTGCGCCCCTCGAACGCCTGGCTGGGGTTGCCCACTGCATACACCAACACTTATGC:1 - chr3R 29632287 5' - invader1 3806 2 54.22 TCGAGTTAGCGTCAGCATAAAAAAAAGTCAAAACGCCTTGTCTTCAGTTCGATGAGGTTTCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 - 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chr3L 1728620 5' - blood 353 2 41.10 GGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATAC:1 + chrX 16857079 5' + pogo 85 1 76.71 ACTAGCTACCTTAAAACTTAAACAGGAATAAATTCTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3R 18539807 5' + roo 8750 2 79.45 CATTAGTCACACCTTCGTTTCTTTGGGCCGAGTCGCCATTGGTGGTCTTGGCTTTGGTTTGGGCTTGGGGTTTTTGGCGAGAGGCGTGCGAATCCGGCGCAGATACAAGATATATCTGCGACATTATTCTGAGTGTTAACATATTC:1 + chrX 4476881 5' + frogger 314 1 76.71 ATCATAAGCATATGCAATAGTTTAGTTTTGTCCACTTATAGAAACATAAATTCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 - chr2R 11609976 5' + roo 68 2 65.75 AGCAGCCGGGCTAGTTGGGACAGAAATGTATCCCCATGTGAAATGCATGTTTGCATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 - chr3L 5329183 5' + 412 68 2 62.33 ACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATC:3 - chr3R 31663310 5' + jockey 96 1 76.03 GGACTCAAATTGAGTTATGCCTCGGAGAAATTCATACATGTATGGAAATAAGCTTGTAAACTGGGATTAGAAGGATACCACTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 - chr2L 2523002 5' - mdg1 378 2 55.48 TAGAGCTCGCCACTCGAATATGGCGGCAACGGGCAAAAGTGCCATAATGCTGCGCCATACAATCATTAGCATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGGAATAGATATTGAATA:1 + chr3R 9862867 5' - Stalker2 7628 2 63.03 TATAACTCATAAGAATCGATGTTGTTATTGACTCCAATATATTGATGTTGTTCTATAATTGATGTTGTTGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 - chr3L 13778641 5' - I-element 5305 1 54.11 GTAAGATCCGTCAATAAAGTTAACCAGTTGTCAAAGCCTCTTATGATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1 + chr3R 17068901 5' - mdg1 348 2 67.12 CACAAAAACTCAATGTGGGTAGATACAAATATGTATGTATGCATGTGCACAAATGTGTTTGTGCTAATATTTGACTTCTTTGCTCTTGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chrX 19506199 5' - P-element 2852 1 61.64 CGTTTTTGCCAAATGTGCTTTGTTGCCTCGCCAAGGCGTTGCGGTTATTGGAGATGTGTATTGTGGATTCAGTAAACTCGACTTTGATTTCGCTATCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 - chr3L 1728618 5' - blood 7363 2 41.10 GTCGGAATGGAATATATATATTTCATAAATATTAAATTGAAAGGAAATGACTGGAAATCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chrX 10344871 5' + roo 63 2 64.38 CGCCAACGTGGACCCCATTATCGCCAATACAATCCAAACAAAGTCCTTGTCCGCCTGTGGCGCTACCAAGCAATATTATGCAAAATGTTTCTCTAACATGTCACTTACCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGG:1 - chr4 901658 5' - 1360 3147 1 80.69 ACTGCGTATGAGTGATATAATCTTACATGCATTGCGTATATGTTTGCATATATAAAATATACAGTAATTACTGATTACTGTTTTAAACAAATGTTAATTATATAAAAAGGAAATATATATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTA:1 + chr3L 11903153 5' + micropia 2 2 76.71 ACCAAACTGTCGTCGACGGTGCAATAGCAAAACTACATTGATGGCACTTAAAGCGCGGCAGGCAAACGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAAAAGTTGAGAGAAGGTTATTGGTGG:1 + chr3L 18735643 5' + R1A1-element 219 1 57.39 CATTCACATTCATTCAACGCTCAACGGTTGGGTCGCATTGGAGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAG:1 - chrX 3743845 5' - Tirant 8431 2 70.83 TTCTAGAAGCCATGCGACTGCCGAGGAATGCGTTTTAGAGAGCCGCTCTCTTGGCCAACTTTCTATTTATAAGTCTGATGTCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr3L 13477163 5' + P-element 25 1 63.91 AAATTTAAAATATAACCAGGCAGCTTGACAATCCACGCGAAAAACTGGCAAACAAAATATGTTTCAGCCAAGCGTACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATAT:1 - chr2R 18927880 5' - 3S18 293 2 52.74 CTTCGCTGGAAACTCGGCACACATTAAACAACAACGGCGATAAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chr3R 31663371 5' + jockey 34 1 66.44 TTGCCAACCTGGCCAAGCTGGCCATAAACAAGCGGCGCCCAGGTGGGCGTATATGTTTGGCAATTTATGGCTGAAAACATAAATTCGTTGGTACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCC:1 + chr2R 18927735 5' + 3S18 5786 2 67.88 ATACGTAGAGCTCAATACAAAATTCAGCCAATTTTCAGGCTCCAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTTAGCGAGTGTA:1 - chr3R 15154642 5' - mdg1 344 2 71.92 CCTATTTGACTAAATTTACATTAGAATATCAATTAAGGATTATAGTTGAAGTAGTTCTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chrX 19736521 5' + pogo 62 1 62.33 ATTTTTCTTTTGAAAAATGAACGAAACATGATTCGCCAAAATAGCAAGAGCTAAACATACACACGAACTCACATAAATATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3R 23208265 5' + pogo 38 1 59.59 GTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACT:1 + chr2L 22031973 5' + Tabor 75 2 71.92 TAATAGGAATATATTAATGGTTGAAAACTAGTAAAATTATGCTTTCAACATAGTCAATCCTTATAAATGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr2L 19800860 5' + roo 8717 2 54.79 TCTTGAGATAATGAGCGCCACCAGTGATATCCAGCGTAATAATCCACAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 - chr2R 18056916 5' + blood 39 2 59.59 AATTGCGGCCAGTGCACAACAAAATAAACAAACCAAGCCACCTACAGAAATACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGA:1 + chrX 17508816 5' - Burdock 6328 2 64.83 ATTTTATTTCTCCAATAATTTTAGATAAACCAAAATAAACGATGACAAAAATAAACAAATTGGTCGAGACAATTGCACAACGGCGAACAACAACGAAATGATTGAGTTGTATGCATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chr3L 11230700 5' - pogo 2097 1 47.26 GAATGTAAACAGCTGGGAAAAACTGGGGGAATCTGGGGAATGTGCCTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCA:1 + chr3L 19398135 5' + gypsy5 7016 2 69.86 GACTTTCGTGCTGTTGTACGGCATTTATCAATAGTAAACTCCCAGTTTTGTCATGATTAACTTAAGGAGCAAAAAGATTACAACACTACTAAAACAAGATAGAATGCCATAGTCGAGTTCCAAGACTATCAGATACGCGTTACTTA:1 + chr2R 5114436 5' - INE-1 548 1 55.48 GATAAGCGAATGTTGTGATTAAGTATTATTACTACTTTTATTATTATTAGTTTTGCCCTGCCTCGTAATTAGTTGAGTGTGCCGTTTGTATATATTTGTATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACT:1 - chr3L 5731401 5' - 297 382 2 78.08 CGGGTATGCGGTTTTTGTGGTTCGATGGCAGAATGTTGCTCACCGAGCAAGTGGCCAGCGGAAAAAAAAACAAGCAATGCAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chrX 3637887 5' + roo 8705 2 57.53 CATGGGTCAGGCGGGTTGTGGTGGGGGTTGCCGCTGTGGAGAGTGCAAAGTGCATGAAACTGAAACGAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGTCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:2 - chr3L 1983589 5' + Transpac 21 2 71.23 TTAATAACAATACAAATATTTCGATATAAAAAGCGAAAGTATTTTGCTTGAACTCGCTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 + chr2R 10189198 5' + Doc 4 1 79.45 ATGCATTGTAAATTGATATTAATGCAGCCATTTGCTCATTTTAGATTACTAATCATCTATTAATCCCACCCTAAAAATCGGATTATATAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTT:1 - chrX 17270407 5' + 3S18 34 2 58.90 TATGAAATCAATCAGAGAAAAGTTATTAGTTTGTTTTTAATAACATTTAGAGGTGTTTAAAAGTACGTAGTACAAAAATGACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCG:1 + chr2L 17296943 5' - Max-element 8509 2 65.38 AGGCGGGTTGTGGTGGGGGTTGCCGCTGTGGAGAGTGCAAAGTGCATGAAACTGAAACGAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGTCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 - chr3L 1983581 5' + Transpac 4948 2 65.75 TTTGCAATTAAACAAATTGATGATGAATTAAAAAGCCTTTGAAAAAGAATTAAATCAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 + chr2R 18922508 5' + opus 7176 4 63.01 CCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGGC:1 - chrX 21667927 5' + gypsy2 6567 2 69.86 TATGCAACCCAAGTGGGTGGCTGCCAGAGGTTCAACATTTGCCCACCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr2R 13773020 5' + opus 35 4 58.04 GTCGGACAAGTGAAAGACATAACTGCGAAAAATATATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr2R 8375159 5' - roo 9048 2 69.18 ATTATGTTGCAATGCTAAAAAGATTGTCTAATTATGAACGCAACAAATGCAAAACTTAAAGCAACTTAATATGAAACTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chrX 2821844 5' - roo 9028 1 55.48 CCGCTCTTAAAGCCTAACCCCAAAAGCCTCCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAA:1 - chrX 20379357 5' + hobo 90 1 79.45 TCTCCCCGAAATAAAACTTTTTATTTTCACACAAAGTTGTGCAACCAAGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 + chr2L 17795142 5' + hopper 4 2 66.67 TACGCTTACGACTTCCTGTCACTTTGTGAATAATTTGTTAGTTTAATCATAAGATTACACGTTCAAACAGAAAACTTGCTAAAAAAATTGACAGTTTTACCAAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 - chrX 8358816 5' + Doc 22 1 72.60 CATTACTGAAAAAACTGATTTGAAAAACGAAAAAGATTTATTGGGTTCTCACATTTCTGTTACATCCTCAGGTAAGTGAATCTCTAGTTCGAACAAATGAAGAATAATAACTTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3R 10800653 5' - roo 400 1 76.71 GGAGGGTAGAAAGTTGAGTTTAACGGTCATATTCCCCGATACGTAAATGCCTTCTGGTTCCATATGCATCACCATATTGTCAATGTTAAATACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr2L 20817035 5' + Doc 29 1 67.86 ATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGTTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGCAC:1 + chr2L 12447435 5' + opus 7197 2 69.86 CAGCATTCTGGTGCTGAATTTGAGCGCTGCCTGAAAGATTCTTCTCGTTTTGTATTACAACTTTGATCTGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:2 + chr3L 12775954 5' - roo 356 2 54.11 TGCATCTTGGCGTACATATTGCTCATACGCCACGTGAAACAGCATCGGCCTATTTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 - chr2R 8492835 5' - pogo 2040 1 61.64 ACTTGTGGTTTTATTAGCAATGGTATTTCAGTGCATTCAATTCAATTCATTCAATTTTGCTATGCTCCTCACATTTATTTTCCCTTTAATTAATGAATTGTTCTTTTCTTCTTGTTTATT:1 - chr3L 19238605 5' - mdg3 5094 1 75.83 GTGTGGGCTGTGCAGCCACAAAACAACACAATCATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTA:1 - chr2L 19635045 5' + Quasimodo 80 2 77.40 AAAAAACTAGACCGGGAACTAGTTAGAACCAAAGGGTTGCACCAAGCAACAAGACTATTGAATTTATAGACATTCCATAACAGATTGCACAACGGAATGAAAATAATCGAAGTAGAGAAGATAGACGCGATATAGAAAAGAGAACA:1 - chr2R 4522138 5' - Cr1a 4354 1 80.82 CGTTACATAGTTTGCAAATAAATTAGAATTTGCTACAGCCAGCGGCAAGCAAATTAGAAACCGCTTGAACTACACGAGGCGAAATGTGCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2L 20268894 5' - hobo 2907 1 63.01 GCCCAACGGGTTATCGGCACTCGCTCATTTGAATGGCTCTCACGTACCTGATGTTTTGCGGGATGATGTTTTGGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2R 8467839 5' + roo 44 2 57.34 GGCTGCCACTTTTGGCCAAATCCGCTGGATGGCGCACGTGCTGGATGATTTAGAATGCGATGGCCGAAATCAAATGCCAACGAAAAGGGTATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAAT:1 + chr2R 23420662 5' + G2 2756 1 57.24 TGGATTCTTCTCTTTTCCCAATTCCGCATATCCGATTCTCCGGATATAACTCATAAGCTATAAAGGCATTTGGTAATGCACCTCAGTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chrX 20369496 5' + roo 35 2 66.44 GCGCGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGGTGAGAGTGGCGCTTTGCTCCGATTGGTCGAGAAAAAGCGAGAAAAACGTCATGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 - chr3R 5216437 5' + P-element 42 1 56.85 AAAATTGGAAAAGTATGAGTGCAATTTGAAAAAACAAACGAGTTAATCAAGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATGTTTCCCGAAATTAAAAACGCGCG:1 - chr3R 11142277 5' - Max-element 239 2 58.52 TATACATCTATATATGTAGAAAAGTCCATGAAAGTGTACCTTTTGTCGCAGATGGTATATACTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 - chr3R 6171230 5' + 297 6631 2 59.59 GGCACACAAACATTCACTTGAGGCGTTGAACAGGGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCA:1 + chr2R 4853945 5' - copia 164 2 80.14 ACAAAATAAACAAACCAAGCCACCTACAGAAATACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTG:1 + chrX 17508834 5' - Burdock 173 2 77.40 TTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCAC:1 - 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chr2L 10858443 5' - Burdock 6315 2 72.60 CATTCATCCTTCGCCTACCATGTCCTGTTGACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chrX 16995024 5' + jockey 65 1 55.48 TGTAAACATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGGGAGTACGTTGTAGTCGATTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAC:1 + chr2L 18176997 5' - INE-1 543 1 76.71 GCGGGGGGGGGGAGCGTTGCTGCTTTCCGTCCAGGGGAGCAATAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAA:1 + chrX 17531856 5' + blood 63 2 67.94 GCGCACACGTCTGTCTCCGTCTCTTTCGCCGCTTCTATGCCCTTCTCTTTTCGTCGGCGTGGGTGCATTGTGGTTTTCCCGCACACACACACACACACACATGTCGGTAACCCGACCCATGGTGACGGAATCTCGGTCCCGTCGGT:1 + chr3R 10957826 5' + Rt1b 492 1 66.44 TTGTGTTTTGGCATCAGCTTGTGATATGTACACCCCCACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr3L 18420950 5' + jockey 4685 1 57.81 CGCATATGGAGAGCTTTATGTGCCTTTAGCCATTTCGGCATATGACAATGTTTTTTGGCGTATGGCTGGTTTCCTTATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGTCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 - 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chr3L 10733778 5' + 412 7084 2 53.42 ATTTCGAATGCTTTTTCTGTGTTATTTGTTTCGTTTTGTGGCGACTGCTATTTTTTCACAACTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 14450103 5' - roo 9051 2 69.86 CTGCAGCAGTTGAACGCAATGCAGGGCAATTGCTGCGTTAAGTGCATTGGCCAAAACTGAATGTTGCATTAGAATTGAACAGAAACGAGCAAAAACAGAAAGGGTTTTTGCGCCTTATAAATATTTAATATTATTATTATTGTTT:1 + chrX 17270207 5' - invader3 5044 1 80.69 CGCTGTTAAGTATGCTATATTAAATTGCATTGTGTGGATTTGCACTGACGCTTCTATTTCAATCCAACTGACTGCGGCTAAATGCATCCAGAGCATTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:2 + chr3R 22266395 5' - roo 9050 2 67.81 AGCTATCAGTGTGCTAAATAATAAGTCATTGCCGAATGAAAACATTGTAAGTACACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 1324348 5' + 412 7119 2 64.14 AAAAAACCAGTTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAGCGTGCTCCGCACATAAGCGGTTGTTT:1 + chrX 12344298 5' + F-element 50 1 54.84 TTGGTTCATAGAGTCGACTGCATGTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCCCACTCTACGTCCACCC:1 - 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chr3R 2526466 5' - mdg3 5478 2 71.92 GCACAAATAATAGCAAATAATAAAAATGCCTTAATTTAATCTGCTCTCTTACTGCAGCAAGAAGCAGGCAATGAAAGAATGTCAGGGGGTCAAATGGGTTAAGACTTGTGTACAAGTGGACAAGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTG:2 + chrX 3646351 5' - accord 7030 2 63.01 AAAATTTGGATCGAGTGACGATAGCGTTATAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr2L 8009125 5' - roo 8999 2 76.15 CGCTGCCAACTTTATTTTTATTCCCTTTCCAACAAATATATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCA:1 - chr2L 8615418 5' + 17.6 76 2 76.03 GACAGACACAACAACGGCAGTTGGATGGGTTGAAAGGATTCGAGCGTCGAATCCCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 - chr3R 11550335 5' + F-element 28 1 71.92 AGATGACGCCACTCAGATTAGAGTACCTGCCAATTGATGGCGCCACTCGCCGCACACACATTTCCAATTTAACTTTTCCATTTATTTACCCATTCGATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1 - chrX 17531977 5' - blood 7365 2 68.49 AAGAGACGGATGCGGGCTCCACAGTCCAAGAAGGTGATATCGTTCTTCAAGAATCATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAA:1 + chrX 15696693 5' + jockey 4734 1 60.96 ATTAATGGTCCGCTGTTTCTTCGATAACCAGACAAGCACACTGGACGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTCTCTTCATATATC:1 - 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chr2R 20117430 5' - mdg3 5479 2 74.66 AGTGTCAAACTGTGCATAGGGTATTTCGCAAATAAACATTGCATACTTTCAGTCAGCACTCGCGAATGTGCAAGGCAACGCGTTTAACAATTGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3L 8395149 5' + jockey 36 1 64.38 AAAATATATATATTTAAATCTTTGCCCGAATTAACACATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATTTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTC:2 + chr2L 13763491 5' - Bari1 1625 1 72.60 GAATTAATTGAAAATATTCCACATTTTCCCGCTGCCCGGTGAAGTATGCAACACTTTTTCGCCACCTCCTTTCGTTTCCTTGTGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 - chrX 9949612 5' + hobo 36 1 60.69 GTTTTCCGGGTAATTTTATCTCACTCATTGCCTCGCCCCCTAGCTGCTTAATTTTTACACTTGCCGCCTTCAAATGACATCCCCTGAGGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGC:1 + chr2L 9109805 5' + opus 113 3 79.66 AAATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATTAATAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGTACGGCTCGATTCGTGA:1 - chr3L 23940543 5' - Cr1a 4386 1 65.07 TATGTGTCTCGTTAAATTGCTTTCCATTTCATCCTTCACACAGAAACAGAACCAACACAATAATTATTTCAGCAGTTTGGTAATTAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 - chr3R 25053129 5' - pogo 2067 1 58.22 AGGCCTGCAAGTTGCAAGCTGGCTGCCTGCCGCTGATGTTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGCTCTTGTTGTTGTTGCTCCTCCGGGTTGTTATTATTATTATATGATACATAATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATG:1 + chr3R 10474549 5' + Transpac 432 1 73.97 ATTTTGTGTGCAGAATGTGGAATGGTAATAATTTCAAAATTAAACAAAGATTCAGTTTATCTGCGTGCACTGGTGCATAAGTAAATAAAATGATTGAGTGCTCACAGCTCAGTCTGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTCTT:1 + chr2L 5732673 5' + hobo 6 1 76.71 CACCCAAGTCACGTCCTGTTGCAACAACACATCGTATCTATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAA:1 + chr3L 9317481 5' - HMS-Beagle 6972 2 72.14 GGCTTAATTAGCCCTGCGAAAAGCGCGAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGCAGACAACGAACGAGTTACCACCCCACCACCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATAGGACACTCA:1 + chr2R 17872450 5' + Tirant 37 2 55.24 ATTTTATGGATTTGTAGTCGATAAAAGCCACAAACTTCCGAACTTCATATAGAGTGGATAGACTTCAATAGTCGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 11043506 5' + roo 48 2 52.74 TAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr2R 8375115 5' - roo 340 2 61.64 TGCCTCCTGGTGGGGGACCGTTGGAGCAGCGGAGACCCCAGCTCGAGTCTCATCATCATCCCGCATAGGCAACACACCCACTGTTCAAATAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 9194963 5' + Rt1b 5144 1 67.31 TTGCACTGACGCTTCTATTTCAATACAAGCGCCAAATGGCCGGCAAACCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 22266434 5' - roo 335 2 67.12 AATGTAAACAGCTGGGAAAAACTGGGGGAATCTGGGGAATGTGCCTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCAC:1 + chr3L 19398136 5' + gypsy5 78 2 70.55 GCGTAAATGGTACGATCCTTGGCCAGGATTCGATGATCCTTGCCGGAGAATTTGTGACACGCATGCACACTCTTCGTTGCCCAATCTGACCAGTACAGCTGATTCAAGGTTATACGGTATTTTTGTAGTTGATATAATAGACTTGG:1 - chrX 14195632 5' - Stalker3T 320 1 69.18 TTTTATTTATAAACTTGCAGCAAAGTGGAAAAAACGAAGCGAACGACTCCGCGGAATGCAATGCCACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3L 10068846 5' + 412 16 2 74.66 CACGGTGACAGCTAGAGCCAGGCTGCCAGATCGCTCAGCTATTGCCTAGTGTTCGCTAGAGTTGGCCAGTGTTGGCCAGCGTGCGATTCGGAATGGAGTCGCGAGTCCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCG:1 + chrX 19744366 5' + P-element 10 2 78.26 GTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCCG:1 + chr3L 3540136 5' - mdg3 167 2 64.38 GCTGCATACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chr2L 2518567 5' + jockey 80 1 63.70 ATTTTAGGAATTCTGTTCCGCTTTTTACCTGCCATCGATTTTCTTCTGTTTTACGTACATTCTGCTTATTCTGTAGCATCAGAATGAAAACGGTCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAA:1 + chrX 12131131 5' + F-element 341 1 62.33 AACGCGTCGAGTGCTTGGAAAAAATTTAAAATATAACCAGGCAGCTTGACAATCCACGCGAAAAACTGGCAAACAAAATATGTTTCAGCCAAGCGTACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGG:2 - chr2R 18927901 5' - 3S18 6079 2 67.12 CTTAATTCAAGGTGTTTAACACGGAATTTACTTAATTCAGGGCTCTAAAATAATGTCTTGTTTCAATCAGACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chr3L 22845780 5' + blood 32 2 58.27 AAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTT:1 + chr2L 14262979 5' + P-element 93 1 21.92 CGCGCGTTTAATTTTTTATGCATGAAGTGTAAATTAAAATTAAATTGACTGTGCGGTCAAAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:2 - chr3L 19434168 5' + Doc 68 1 70.55 TATCTCAATTTATGATTTTTATATGCAGTAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACAC:1 - chr3L 15374719 5' - 3S18 6043 2 60.27 AACTCCCCTGTTGCTCCTGCTGCTATTTCATTCACCCTCTTTAGGCTCCCCATATATATACATATATATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCTGGGTTCTCG:1 - chr3L 2625142 5' - opus 484 2 61.47 CGATTCAAAGCACATATGCATGTACATATATGAGTTTATATAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAAT:1 - chr2L 21687681 5' + pogo 79 1 73.29 CAATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chr3L 13380436 5' + hobo 62 1 59.59 AGCATATTAATGTTTTCAAGTACCTCATAAGCTATGGTATTATAACCAGAGTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGGGGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr3R 13198305 5' + Doc 44 1 58.90 AGGGACAACCAGTGAGATACAATCTAAGCAGGAAACTTATGAGTGCAGAAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 + chrX 16857022 5' + pogo 28 1 63.70 AATAATGCTGGATGTTGAATTATCAGAAAGACGCAAAATTTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCAT:1 + chr3R 15157557 5' + invader3 5234 2 60.27 TTTTGCATTTCGGATTTTACACTGCATTCTGTTGGTATGACTAATCAGCGTCAGCATATGCGAAAAACAATGCCGCACCGAGTGCAATACCAACGTGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 - chr3R 24301951 5' - Tabor 461 2 69.86 GCTTAAGCAAAATTACTTGTAGTCACAGCCTGAGCCTGGTATATTTGTCAAATGGAGATAATGGCGGAGCAGAAGCCCCGGAGTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 - chr2L 19344041 5' + FB 40 1 58.22 AACAGCTATATATAGCATAACTACCACTCCACTGCACAAGACCACACTGTCCACTTGGATATCCCGACTTGGTCTCTCCTGCTTATCTAAATTTCGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTG:1 + chrX 11123896 5' - I-element 204 1 62.94 GTGATGAAATATTACATACTTGACCTCGTATTTATGCATATTCAACAGAAATTTAATAAACTTTTAAAGGCTTGATCTTGGGTGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 21245002 5' - roo 391 2 73.29 AACTATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTGTAAATAGGTG:1 + chrX 3637771 5' - roo 9006 2 59.59 CCCGGTAGTTTATGTACTTTATATATAATATAAAATAATTAGTTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTG:1 - chrX 18318234 5' + copia 79 2 73.97 CAGCTAAATTAAGTGAAAATTAAATAAAAGTAACTACAACTAAGTGAACTACAATAACAACAGTAAACCTAAGCGAAAAATAAATAAACTTAGCCAGAAATAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCG:1 - chrY 3649155 5' - rover 7064 2 71.92 CCACCCACCACCCACCGCCCGCGCCCATTAATGGCGGAAAGAGAGCAAGTGGGCTTCCACAAAATGGGGCACAAACATAATGCCGGTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCT:1 - chr2L 3393874 5' - Stalker2 377 2 62.33 TTCATAATATAAGCCTTATATTTTCTATAAAAAGATAATTAATTTACATATGAAATGACAATAAAGGCACTTTTCAAATTTAATGAAGGTTATTAAAAAGGATAAATTGTTGCAGTATCTGTTGCCAACACACACACACACACACT:1 + chr3R 10623022 5' + accord 255 2 70.55 GAAACAAGGTAATGTTTCAAATAGGATTTACCTGAATTTTTAACACAAAAACTCAGACGAACATCATAATTGGTACATACATACGTACATCAAGAACCGTTTGTGGGTGTCAACAAATTGCAATGTCTCATTTTTTTTT:1 + chr3L 12735242 5' - P-element 145 1 79.14 GGCTGCTCCTCCACTTGATTTTCCCCAACTCCATTGTAGAAAACTCGGCAGCGCGTTTTAAGCGGAGCAATCAACTTATCCGGAAAAACAGACAGCCAGATTGTTAGGCTCAATATCTACATAGAACATGTTCAGTGGCGTTTT:1 + chrX 4183069 5' - G4 497 1 68.06 ATGAAGTTTTTCATATTTAAATGCCCACATATTTAATGGGTTATACAAATATAGGGAAATTGCCAAGATAATGTGTAAACTGTAGTTATGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACC:1 + chr3R 10114664 5' + accord 7221 2 60.27 GTGCCATTTTTAAAGCGCAAGACGACTGAAATTTATCTACATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTC:1 + chr2L 22340319 5' + HMS-Beagle2 6963 2 71.23 CGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1 + chrX 21087605 5' + mdg3 67 2 69.86 GCTGAGTCCTGATTTCGACCCTCCCCCATTTCAGACTTCGCCCCTAATTCAACAAGCCAATTTGTAGCCAATTGCGAGTGCAACATCAACGGCAATGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGT:1 - chr3L 20890116 5' - opus 7338 2 63.70 AAGTCGCTGACTTGAAGAAGCCTGAAACTTTAGCAACCCTTGAGGATAACTATGAGCGGCCCGTTTTAGAAAAATATGATCCTTTTAGAATAAATTTCCTCTGGTGAACCAGCC:1 + chr4 736865 5' - R2-element 206 1 77.19 CAAAGGGAAAACTACAGTTAGACAAATTCTATGCACGTCAAATGTCAATCTGCATACACATATGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTA:1 + chr3R 8965130 5' - HMS-Beagle 6987 2 56.16 TGCTGAACAACTAAAGTACCTTTAAAATCCCATTACCCTATTTGTGTACACAAACATATGAGTGCGGAATAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTAT:1 + chr2L 2722338 5' - flea 4965 2 54.11 TCTAGCTAAAAGTCAAAGAATTTTCCCTATTATAATTGAAATGCTTAACTTAAACATTCGATTGTGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3R 14174679 5' + 297 6633 2 53.42 AAAGACACGATTGGTGTCAACGATTTGAAGAATGGAAGTTCTGTTTTTTGTGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr2L 8909795 5' - roo 346 2 62.86 CAAACTGGCCAGCAAATGATTGTGATTATGTGCATCATCACAAAGACCAAGTGTTTGTTTTTGAGAGATTGAGTTTAAATTAAATTATGATTTAAATCAAGAGTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr2R 15190542 5' + pogo 11 1 71.13 TTCGCAATTCGAACCATGTGCATGGCAAACTGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGGAACGT:1 - chr3R 9863008 5' + Stalker2 32 2 63.70 TCTGTGTGTGCCTCTGCGTGGGCGAATGGCACTCACTTCGATCTGATGGCCATCGACGTTGACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3R 11730672 5' + hobo 29 1 54.78 GGGTGGCGCAAAAATACGTCACTAAATACCTGTTACATACTTGGCAACGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1 + chr2L 21715749 5' + pogo 70 1 69.18 AGAAACCGCAGCGAACAGAAAGCAGACATCCTTTAACAATTATTATTCAATATTTACAGAGAGATATGAACCGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTT:1 - chr2L 12767079 5' - hobo 2888 1 50.34 TTTGGCGGTTAGTGGATGGGCGGTTTAATTGTCGTCAATTAGTTTAACCGCACGCACTCAGCATCACATACATATATATATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 - chr3R 22123890 5' + 297 6586 2 76.42 GATCTCGTTACTCCTGCGGCGTTTCTCCTGACAAGGTGTACTCCTTGACAACGGCCGGTATTAGGAAGTTATGGGGTAGGGTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 + chr3L 25496724 5' + mdg3 5294 2 57.53 GATGTGGATATGGACGGCACCTGCCGTCGCAACGATTGATGAAATTAAAAGGTATAAATAAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCC:1 - chr2R 11815300 5' + P-element 2730 1 43.84 CCAGAAGCAGGAAAATGAGTATTTCCAGTCGGGAGAGGTCCCTTTGCGCGGGATTCGAGTGAATCAGGGCCACCTTGGAGATCCAGTGGTGTGTAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACT:1 - chr3L 18574953 5' - I-element 5329 1 65.75 CGGCTGAGGACTCGATGCTCTTTTATATTATTTTATAAATAGTATCCAAATCAAAATCTTATAAATTCAGTAATTTTTTAACACTTAAACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTA:1 + chrX 23317673 5' - Tabor 361 2 72.86 ATGCATATTTTTCATAGTTGTTTACTTACATCGGTTTATTCGGAGAAAGACACACAAAGCAAGTGAATGTTCGTTTTCGATTCGTTTAAGGTATTCATTGAAAGGAGAACGGTGGGTAATATGGCGGCGCCCGTGAGAATGGATAA:1 + chrX 8186302 5' - GATE 475 1 72.60 GTTTAATACTATCTTACGGATACAGATACCGTTCTCTCGATCCGCTCTCCCCAGCTCGCTCTCCCCACTCTCTCTCTCTCCGTGCACCGATCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr3L 13477316 5' - P-element 2858 1 64.38 TAATTTGCTAAATTTGGTTGAATAAGTCTTGCATCTGTTAATTGGAAGTTAAGTTAGCAATCTAGTTAGACCGCATTTTAATTGGGTTTGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 + chr3L 17710560 5' + I-element 32 1 63.70 GAGAAAGCGACTGAGACATTGCGAGAAAGAGCGGGAGAGCGGAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGC:1 - chr3L 15402056 5' - GATE 8266 2 59.42 GAACTTAATTAACAAAGTTTTCAAATCCGTATATCAATTAAGAGTGTATATCTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCC:1 - chr3R 26693436 5' - Stalker2 7582 2 67.12 GGCAACTTTCTTTTGGCCCCCACTACGCTCACTGCAATCTGGCCAAGTAATTAATGGTTTATATACACACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2L 16360518 5' - hobo 2927 1 75.34 ATAAGACCGGCGGTACTAGCGCGTCGATCTTATGCGCATGCCCCCGATTCGCGGCGATCCAAAGCGATCCAAGCGGATCCGAACGATCCAAGCCGATCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1 - chr2L 8700093 5' + P-element 22 1 65.07 CACACACACTACAAAGTCTTATACAGCTATTAAAATTAATCATAGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chrX 6213604 5' - roo 333 2 70.55 ACAAACGAATTTGCGGTTTAAAAGTCTCGTAAAACAAAAACTTCTTGTAAAACCATGATCTATTTTAATCACAATCTTTCAATAATTGTATTGCAATCACAACGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATAT:1 - chr3R 8293675 5' - Stalker2 7634 2 70.55 GCCTTATTTCAACGCTTTTACACGTTGTTGATGTATTACTATATACATAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTT:1 + chr3R 4570247 5' + Juan 76 1 66.44 ACGAAAAAGCTGCAGGAATCTGCGAATGCTGGCAAGATGTAAGAAAATAAGACTCAAGTGCAGTGAGAAAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chrX 2821973 5' + roo 50 2 54.79 ATACATTAAAAATCCCTATTAAATCTTTAGCTATACATGATTTCGGAATGCGCATAAAGCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTC:1 - chr2L 1871039 5' - mdg3 5437 2 57.53 TACAGTTGTCTGCTTACAGTTATTTATTGTTCATAATTATCTAAAAATAATCAAGATTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTG:1 - chr3R 17401788 5' + Juan 66 1 63.01 AGAAAGTAGCTTAATGCTGAGGTCTCTCATAAGCTTGCGGGTGTGTGACACACAAAGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTG:1 - chr3L 18571307 5' - 297 6529 1 61.38 TTTGCATGAATAGAAACGTTGAACTTAAAATTAATTCATATATTTTAGATCTTTGTATCTGCAAATCTCTCATATCAATAATATGGTTTCATTTATATTTTCAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAAT:1 - chrX 21322877 5' + Juan 4045 1 71.23 TACACTCAGTTGTATAAAAAGACATACATCTATATAAATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAAT:1 + chrX 19101525 5' - opus 424 2 79.31 GAATGCACGTCAATATTTGACGCCTGAGGCCGCTCCACCTCCTCCTCGTCGCTGACCGTTAGGCAAACAATGAACAATTCAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATACCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 20327560 5' - roo 389 2 68.49 CTAAGCTGAATTACAAAAATAATCTTTATGCCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr3L 19938441 5' - roo 9038 1 62.33 CGGTCCAAACGCTTTATATTTGACCAGTCAGTCAGCTGGCACTTGTTTTCCACACGCTCTCCCGCTCACGCCCAACCGCATCGAAAAGGGTTAATGTTTGGCCAGTCCTTGTACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCG:1 + chr2L 11638948 5' + springer 7147 4 76.71 GATTTATTCGAGATTAAACCCATTTTGTGGTAGGGGGGAGAAAAATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 + chr3R 26643306 5' + 412 7128 2 70.55 ATCAATATTAAAGCCGAACCAGCGGACAATGGAAACTCACCTGCAGCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 15363516 5' + 412 7095 2 54.11 CTCACACCGATGTAGAACCAACCACCCATACTCACTCACTCGTGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATGTTTTCGGTGCTTAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr3R 26404977 5' + hobo 30 1 63.70 CCTGTACACATATTAAGTGAGACATTTGACATTTGTAAAGGTCTCATGGTCTCAAATTGTTCGTTTTGGTGTAAAACTTAAATTTGTAAAGTTTTAGCCCGGTCGGATAAGGTTTAGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - 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chr3L 19398216 5' - gypsy5 344 2 62.33 CAGCCACCAAAGAGAAAGCAGAGAAAGAGAAGAGATGACCAACCGAGGGGCCTTCACATATTTAGGCCCACGCAGAGCTGCCTTCCCTTCGATGGTTTAACGCAGTACCAGGTTGGCAGTATGGGAACTTAGTGCACAACCAATGT:1 - chr2R 14534383 5' + Burdock 6038 1 53.42 TAATAATATACTCGTAATTATATTCTCATACGTGTGCCATTTAACTCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 - chrX 9865002 5' - hobo 2884 1 64.57 ACGGCGTTTACGGTGCCAGGAAAGGGATTGTTCCAATGGAAAGTGATGCCATTCGGACTACACTCAGCGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCT:1 + chr3L 25232697 5' - accord2 199 1 77.24 TATTTCATGAAAATGCATTCAAATGTGCTGTGAGCAACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chrX 10429854 5' - roo 8990 2 74.66 GAAACACAATGGTTGGAATTTACTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGGATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATTTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 - chrX 12995432 5' + blood 11 2 76.67 CTATCCTTTGAGCAGCTATAAGAGTCATAGAAACGCATTCAGGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - 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pogo 2033 1 66.18 GACTTGCTCATTCTTTCCTATTGCTTTTCCCATTTCCTCGCTGCCTCTTTAAACTGCTGCTTAATGTATGGCCCCACTTCTGTTTTGTGTCGCATAATTACCAATGCCAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr2L 18848862 5' + blood 12 2 77.40 AAACGTTGTTATGCCCACTTGTGATGCGCCTTTAATTTTCAATTGGCTTAAGCTGGTTTCAGATCTAATCTAATATCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:1 + chrX 16325105 5' - Transpac 268 2 55.48 GATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAACCCCCCAAAAAAAAGCTCCAGGACATGATACTATCTGCAACTCCAT:1 + chr3R 1418286 5' + BS3 264 1 66.44 GCCACTCGCCGCACACACATTTCCAATTTAACTTTTCCATTTATTTACCCATTCGATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTC:1 - chrX 17531936 5' - blood 7324 1 63.70 CGTCGACGTCGTTCGTTTGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGAT:1 + chrX 1831269 5' - P-element 2784 1 15.07 AAAAAAATGGAAGAAACGAGCACGAGAGAGTGAGAGCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - 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P-element 2747 1 43.84 CCATTGTCGTGCGCTGTTAAGTATGCTATATTAAATTGCATTGTGTGGATTTGCACTGACGCTTCTATTTCAATCCAACTGACTGCGGCTAAATGCATCCAGAGCATTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 22266384 5' - roo 398 1 75.34 AAGAAAAAAACACTTTCTTAGCCAGAGAGCAATGGACAGAGACGCAGCGAAAATGCTGAACTGAACAGCACTGGGAAAATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGC:1 + chr3R 24304692 5' - Tabor 322 2 56.16 CCTTTGAACTGGTCTTAGCCATGAATCCAACGCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCCAACAATGTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr3R 29719311 5' + hobo 47 1 54.79 TGGAATGGACAGATTTGGCGTGAAAAAAGCTGAGGGGTCCGTATTGGTTACATGGAGAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACTG:1 + chr3L 11490216 5' + Max-element 8290 2 59.26 GGGGGAGATCATAGATGGGGGAGTTGGGGGACAGGGACTTTAGATGGTAACGTGGTAGTAACCGTTCGCTCTCCATCGGCGGTGCTCCGATGGTG:1 - chr3R 15295287 5' - R1A1-element 366 1 80.00 AAAGGTGGGCGCGCTATATAACTTTAGCGCAGACTCGAACCCGAATCCGAAACCGAGCCGGAGAATTCTCTCTCTCTCAAGTGTCCGGTCCGGGCATCATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 - 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opus 475 2 69.86 GCCGGGAAGTAGGCAACATTTTTTGTGTTTGCTCTTTGTGGTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr3R 8625261 5' + jockey 86 1 72.60 ATAAGGCATTGCAATTGAAATTGTAAATCTTGTTCTTTAGTTTTTGGATTGGCACTTCCTTTAAATTGCCAGTGAAGGCAATCAACTTGGGTTTAACCAAAGACACTAGAATAAAATTGATAAAATTGATAAAAAATAATATAGAT:1 - chr3L 16047751 5' - 1360 254 1 30.82 CGCGACAAGTGGAAGCTTTTGCACTCCCGACCATTCAAATACCTGGTCCTCGGCCTCCTGTAGAAATCGTAGCCTACTTTTTGGACAAGGACTATACACCTGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 + chr2L 6716262 5' - hobo 2918 1 71.23 ACCTATTTTTTATTAAAAAATCAACAAATGTCGTCTTTAATTTCAAATATTTTTTGTGTTCGAAATGGGTGGCCCCCATTGATTCTCGTTCACCCTTCATTTCTTAGACCGTCACGACCGCCACCCATACAAATTTTATGAGTACA:1 + chr2L 13803040 5' + hobo 2681 1 43.84 AAGCAGCATAAACCCGAAACACACTCGGAAACACACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGCGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAAC:1 + chr2R 22372508 5' + I-element 88 1 77.40 AAGCCGGCTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGCGAGCTACGGGTGCTTCCGTCTGATCGGGGGTCCTCCCTTCTCTACGCTTAGTTAGGTGCTGCCCAGGT:1 + chr2R 12185342 5' - accord 7338 2 55.24 CTTTCCTCAACAACAGAATGGGAATGTCGACACCTCCATAAAATTAATTAACCCCCAATAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGT:1 + chr3R 12569577 5' + blood 7069 2 56.85 TCATCTTCATGTTTTATAGGAAATCAACTCGACAATTACTTGGCGAAAAGTTCATTACCATTTTAAAAGTTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr3L 13015880 5' + hobo 28 1 57.94 GCATCTGAAATAATCAATTTCATTTTAAAAATACAGCGGTCAAGTAGTAAAATTTTTAATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr2L 12447377 5' + opus 136 2 65.75 CATAAGCTATGGTATTATAACCAGAGTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGAGGAAACACTCTGCGATATCATTCAAACTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 - chr3R 13198280 5' + Doc 43 1 65.75 GATTCAAATAAAACGAATCCTTGATTGTTTTTAATAGGGTTTATTGTAAATATTATAAGTCCAATGATTAGGTTGTGACAGTCGGCTGGTAATATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTACCATTCGACT:1 - chr3R 4014631 5' - invader2 162 2 75.38 GATCTTCCTTTGGTTCATTTAAAAAAACCAAATGGGCCATTAACAGCTTAAATTGGGCACCCTTATATAGAGCTTTTAACTAATTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chrX 10838632 5' - roo 9035 1 60.27 GCAGATACCGCGACACAAAGGAGTCATTTCCGCATCTGGTCAACGCCGCCAAGTATGCAACGTCCTTCTTTGTGGTTATATTTGCCCACAAATATCACACGACCACCGGTAAGTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTC:1 - chr3L 5919211 5' + BS 5071 1 78.08 CAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACT:1 + chr2L 19565466 5' - jockey 4904 1 77.40 AGTTATGGCTTGGGGCAGCTGAGTAAAATGCGATTATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGC:1 - chr2R 5800551 5' + HMS-Beagle 81 2 73.97 GTTGAAAGAGTCGAGATCTTATCTTATTATTTCATATCAATCGATAAATCTTTAAGATGCTTCTAAATTGTAATCTATTTTTGACATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:2 + chr3R 18860739 5' + roo 36 2 52.05 AAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:2 + chr3R 18514341 5' + pogo 76 1 71.92 AATATTCTTAAATTAAATGTCAAAAATTTCCCAAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACAT:1 + chr3R 19144374 5' + Juan 41 1 50.00 GTAGAAAACCCAAAGAAAACGTATTCATTCTCAATTGACTTGAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr2L 8009068 5' + roo 76 2 68.97 CTATGTTTATTCGGGTAGGTATGCATGTATTCACAAAACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAA:1 + chr3R 24760551 5' - pogo 2026 1 75.00 GTGTAGTTAGATGTAATTTGTTTTCTTATTTAAGTGTGGGTGTATATAGAGTGTTTAAACGTAGATAGTGTGCTTATTTTAAAATATTTTTAAATGTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCT:1 + chr3L 25821743 5' - opus 7482 2 72.60 GTGAATAATTTGTTAGTTTAATCATAAGATTACACGTTCAAACAGAAAACTTGCTAAAAAAATTGACAGTTTTACCAAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - chrX 8358791 5' + Doc 47 1 55.48 AATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGCTGTATCGACTTGTGTGTCTCCCAATTT:1 + chrX 22726198 5' - Helena 1229 1 57.93 CCATGAGTAATGCGAGTCAATTCGTTTCCTGAAGTATATACAATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAA:1 + chr2L 13976193 5' - I-element 5276 1 69.18 GCAATAAACGTTGTTATACCCACTTGTCATGCGCCTTTAATTTTCAATTGGCTTAAGCTGGTTTCAGATCTAATCTAATATCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 + chrX 16325100 5' - Transpac 273 2 56.16 AATTATAAAAATTACAAAAACTAACACAACAAATGTCTAGAAACTAAATGACAAAACCAACAGTGCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCAAGTGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTA:1 - chr3L 21765554 5' - gypsy 438 2 69.18 CAACCCCGACTCAGAAAAGTGCTCCAGCTCACATTAGCACTGTGTTATCAGCTATCAGTGTGCTAAATAATAAGTCATTGCCGAATGAAAACATTGTAAGTACACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3L 1324397 5' + 412 7071 2 73.29 TAATTGTATGCAAATAATTATACGTTCAACAAATACCTTCTCCGCGAAAATCGCTTCAAATCAAAGGCCGCTAAACACATTCCACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chrX 9949468 5' - hobo 2900 1 58.90 ACAAACAAATGGGCGAATGCGAATGTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 + chr3L 1983413 5' - Transpac 283 2 67.12 GCAATTTGCTAGTGCATCGCACCCGGAGCAACTGCAACCGTAGGCGGCTGTAGTGTATCCACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTC:1 + chr2R 21105721 5' + Stalker2 7325 2 67.12 AAACAAAGCTTTAACCCTTAACCCTAACCAACATCTGATATAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTCTGAGAACCATCGGAGCGCCGTGGTACGTTTGGAACGAAGACATACACAGAGACCTAAAAACCAAATTAGTAA:1 - chrX 21217569 5' + Doc 4421 1 55.17 CTGCGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1 - chr3R 31663312 5' + jockey 94 1 74.66 AGCATATGGTTATACTCGCGGGGGCTGTGGTCGACTTTAAATGGAAATTTAAATGATATTCCAGGGCAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:1 + chr3R 6578649 5' + F-element 67 1 56.85 GGAGAACGTGTCACCACCCGGCGCATTGTTGCTTTTTGTTTGCTGTTAATTTATCGTAATGCACAAAACAATTTACAAAAGTGAACAAAAAAAAATGAATACAAATATTTAAATATATTT:1 - chr3L 7441431 5' - Transib-N1_DM 292 1 68.33 AAACACAAACGAGCGCAAACGCTTGGCCACACACACACGCGCACACATACGAATATGCGTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr2L 5656640 5' - hobo 2914 1 58.18 GCGGAAGCACTATAAACAATATTCTTTTAATTTCTGTTCTCTTGCTTTTTCTGGTCTTCTGTTCTGGTCTTGTCTCGCAGATTTTGCGGCAGACAAATTTATGAGCGTTAAGTGAAGGCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 + chr3L 16196952 5' + Doc 10 1 81.51 ATGCGGGTTGTTCCATTCTTTTGCATACATACGTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATC:2 - chr3R 14801270 5' - I-element 5264 1 77.40 AAATTAGAAACCGCTTGAACTACACGAGGCGAAATGTGCGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 + chr2L 20268944 5' - hobo 2883 1 67.50 CAATACATGATTTTAGACCAGGATCCTAATTGCGTTCATAGATGGCATCAACCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAAT:1 + chr3L 19788116 5' + FB 71 1 64.38 CCCATTTCCTCGCTGCCTCTTTAAACTGCTGCTTAATGTATGGCCCCACTTCTGTTTTGTGTCGCATAATTACCAATGCCAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr2L 18848834 5' + blood 40 2 58.22 CATTATATTTTATTCCATTAATTTAGGTTAACAGCATAAAACAGGTTCATATTTGCGTCTATATCTTCTCGCGAATTGAGACGTACGATACACGGC:1 + chr2R 3283272 5' + Cr1a 4392 1 62.50 AATGCCAAACGGAACATGCTAAAAATCGAAAAAACTCGAATGCGACTCAGTGGGCCAAGCACACACAGATACTCACACACATACTCACACACATGCGAGTAAAAAAAAAAGGCGCTGCTGTGCACCGCAAAAGA:1 + chr3R 22569791 5' + Rt1a 4850 1 72.39 CTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTAT:1 - chr3R 15035156 5' - Stalker2 346 2 55.48 TAACTTATCTCAATAACCAGAAACAGAAACACCGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATTAATACAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGTAGTAGGATTTAATTATGTAATAAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTT:1 - chr3L 23401848 5' - Cr1a 4259 1 78.08 CGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTT:1 + chr3L 19951210 5' + Ivk 99 1 75.34 GTAAAACAAACACGTTTCCATTAAAAAGTCTGCGTTTGATGGCAAGCCATTTATTTATAAACGGGATAGGTGCATTAATTAATGCATGCAAATTAACACTATCACGTCGGGGTCACCAATGTTTAGCTACTGAGCTTTTTCAATAG:1 - chr2R 19074584 5' - diver2 4891 2 67.12 ATCTGTAGCACAAGTTTTTGCAATGTTTTTTAATCTGTCCTCATTATCATCAAATACTAAATAAAGCGATTGAGATTTTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATG:1 - chr3L 18591616 5' - flea 216 2 60.27 GTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr2L 19907569 5' + hobo 65 1 70.00 CGCAGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2R 18266081 5' - roo 8986 2 76.71 TAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGATCAAC:1 - chr3L 15374691 5' - 3S18 6015 2 78.77 GCAGCCCCCATAAGTATGCAATTAGTTGTATAAAACCAAAAGGTCTCTTGTATTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCA:1 - chr3R 9657752 5' - BS 5023 1 65.07 GAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3L 12776042 5' + roo 60 2 73.77 CTTGAACTGATGACGATGCCGCAGTTAAACGAATGTGTCCCGCCTCTTAATTGGCTAAATACATTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 + chr2R 14921470 5' + pogo 56 1 58.22 CAAATGAATACCTCTCGGATTTTATGTGTATCTGCATTCACAGCACTTACACTGTAACCAATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCT:1 + chr2L 1870939 5' + mdg3 62 2 58.22 CACTGTGCGACTCATTCCCCCCCCCCCTCTTTGAAATACTGGACGTGGCTGGTTTGGACCAC:1 + chr3L 19676396 5' - 297 6596 2 50.00 ACACTGCATTCTGTTGGTATGACTAATCAGCGTCAGCATATGCGAAAAACAATGCCGCACCGAGTGCAATACCAACGTGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTAT:1 - chr3R 24301933 5' - Tabor 443 2 57.53 TTTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 + chr3R 11873334 5' + 412 55 2 55.48 GCATACCCTGGTACCCCTTGTTCGCAGCGAGGAAAAAGTTAGACATGCGTGTGCTGGAAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTTATAATATCATTAGG:1 + chr3R 31887735 5' - HB 1542 1 67.86 GCTTGCCGTCCGTTCCACTCCGCATGCCAGACTGGAATCCCTGGAGTCGAGACCCGCATCCAGGACTCGTTGTCCTTTTTTTGTGTGGCCTGCCAGCCTGACGTTGCCTTAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr2L 18848657 5' - blood 7377 2 75.34 GAACCATGTGCATGGCAAACTGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACAT:1 - chr3R 9862998 5' + Stalker2 40 2 57.64 TCCGTTCCTCCACTGACGCCTCTGTGCTACGCTGCTCGTCTGGCTGCCAACAGGAAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACACGTCCGTTGTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr3R 13572143 5' - 412 460 2 64.14 TTTAAATGTATATACATCTATATATGTAGAAAAGTCCATGAAAGTGTACCTTTTGTCGCAGATGGTATATACTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3R 6171240 5' + 297 6618 2 60.14 CGGAGAGGGACTGTTCTGGGTGAGTTGGTGTAGTTGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTT:1 + chrX 7466357 5' - Quasimodo 6908 2 72.36 GGCTTGTGTGTTCTTTTACACATTTGAATTAAGTAGGCAACTAGTGACGAAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTG:1 - chr2R 14767453 5' - Tirant 334 2 67.14 CATATTGAAAAACCGGCTGGACAGTGAAATTCGCGGGTGCGTGTTTCGATTCTGCGGCACTACAAAAACCGATACGAAACTCCATTTATGACCGCCGTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chr3R 12547985 5' - hobo 2934 1 77.95 GAACTCAGTGTAAGTGCGAATATGCGAGAGAGTGTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAATGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACGTACT:1 + chr3R 23346578 5' - Rt1a 4976 1 76.71 AACGCGGCGTATGCTTGATGAGCGACCAAGTAGCGGCACGCCCGGGGGTATGCAACACCCACAGCCAATATTTGCCACACTCCTCCTGCGGTACTCGCATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAA:1 - chr3R 23968708 5' - HMS-Beagle 7029 2 71.85 TAAAATGCGAGATTAAGTTCAAGTTTGGTTATTATATGTAACTAAATAAAAGTTTCAAAACACGGACTAATTACTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGT:1 - chr3R 27443262 5' + 3S18 5813 2 52.74 ATCTAGAAATTGGAAATAACCTTACAGCAAAATCTGGCGGTTTCTTTTTGAATCGGTATCAAATTTGGGAGGATTTATTTCCACTTTCAAGCTTTCACTAAGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr3R 11162975 5' - mdg1 400 2 70.55 CTTATTCATGCACCAAAAAAAATCTATTTGTTAATATTAAAGATTTTACAAGGTTTCAGAATGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAG:1 - chr2L 7167353 5' - flea 4959 2 56.85 GTTCATTGTGGCAACACTTTAGTTTTTAGTTTCTTTCTTGGAATTCAATCTGGAATGGCAAAAAAAAGGAAAATTCATTTTTGATTAAATGCTGGCTATGGCTTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr2R 16503532 5' + jockey 22 1 72.60 AACAACCTTTTCGATTGAGAGATTTTATTTAATATTCATAAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3R 13411878 5' - roo 326 2 73.97 ATAAACTCTAAATGATTTCAAAGTTATAAATGTTTGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAAT:1 - chr3L 11754747 5' + Doc 169 1 76.03 TCTAAGCTGTTGATGGCGTCGTTCAACCACACAGACACCGACACACATGTATGTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chr2R 21453542 5' + hobo 67 1 64.38 GCTGAAACGGTGTAAAATTAATATTTGGGTTGAATGTACTATGGCACACAAACATTCACTTGAGGCGTTGAACAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1 + chr2R 4853903 5' - copia 207 2 50.34 TCAGTAAAAAGCTGTGTCGGCGGTTTTACGTATATACTACAAGCATAGCTAAGTTTATTTGTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTT:1 + chr2L 42497 5' + copia 59 2 62.07 GAATTAGGTTCATATATTGATAAATATTGTACATATATGTAAACTATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chrX 3637730 5' - roo 9047 1 68.49 GATTATCACAGGGCCAAATTACTCATAAAACCCACTGAAGCCGGAAACTTCCTACTTTCCAGAACACTCGAAATCTCTAAAGATTTTCAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chrX 7624021 5' + roo 15 2 73.08 CAAGTGTGCTAATACTATTAGCGAGCTTGGCCAGAAACTAAGTAGGCCAATCGGGTGATCTTGATTAGAAGTCATGCTGGTTAGGTATGAAGTACCTTTAAGTATATGTATGTAACATGGAGTAAGGTT:1 - chr3R 29901189 5' + flea 4754 1 45.74 AAATGGTTATTTGGGATTTATTATTTTGGTTTATTGTTTTCGATAGTGTAATACAATAATGTATATGAACGGCATTCCTTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAG:1 + chr3R 11142171 5' + Max-element 8279 2 55.48 CACGCGAAAAAGCGGAGTAAAATCTCAAATATTCAAGCCACACACACACTACAAAGTCTTATATAGCAATTAAAATTAATCATAGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chrX 6213644 5' - roo 9037 1 60.96 CTTGCTGAATGATCGATCGGTGATGGATCGGCGGTTGCCTCACAATATATATCTATATATACAGGTACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATAAAAAAACTCATAATTTTCCTCAAAAA:1 + chr3R 24396698 5' + I-element 5149 1 50.70 CATCTGACACTCATCGTTGCGATGCTTGAGCTTCTCCTCTAGCGCCTGGATGGCGGAGATTTTCATCTTGCGGTCCGTTTCCAGATTGCTCTTCTCCTCTTGGAGATTAGCTTTGGGGCTAACGCTGGGACTGGCGAAGCGATTAT:1 - chr3R 24125951 5' - Ivk 220 1 73.97 ATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAAC:1 + chr3L 13380453 5' + hobo 79 1 71.23 ATATCTGGGTGCTGGCATCATTAGTTTATTTTCCTTTCGCTGCCAACTTTATTTTTATTCCCTTTCCAACAAATATATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATA:1 - chr2L 8615455 5' + 17.6 39 2 59.59 TACAGCCAGCGGCAAGCAAATTAGAAACCGCTTGAACTACACGAGGCGAAATGTGCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTA:1 + chr2L 20268927 5' - hobo 2874 1 60.27 AAAATTAATGAAACGAAGAAGAACAGCTGGTATAATAAATACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:2 + chr2L 13102882 5' - roo 8992 2 73.29 TAGCAGTTGATTTTTTGACGCACTTTCCCGGCTGGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAATAGTGACC:1 - chrX 11280803 5' + X-element 104 1 78.77 ATGTCGGCCGCTCGTGTGCTGGACTGCATTCGCTGTGGCTATTTTTAGACAGGTTCCAAGCCACGTTTTCTAACTGTTGTTAGCGTACGAACCGGAGATCGCGGGCTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 + chr2L 20716288 5' - P-element 2873 1 76.03 GGACTTTCCCTTTTGACCCACAAAAGTAGGCTACAGAAATTAATTTAAAGAGAAGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr3L 9993910 5' + hobo 65 1 61.64 AGGAGAGCTAGTTAATAACAATGGGAAAAAAGTCTCGGTTGATATCCTATCTGCCGGAGTCAGTTAAACACATCCTAATCCGATTATCTAATTTAGCGCAGACTTTAAGCTATATATACTATTTCTTATACAATTTTACTTTAAAG:1 - chr2R 10302104 5' + TART-B 10190 1 59.59 AATTTCGATCTGCATATCGTCTGTTTGTTCGTCCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 - chr3R 4352160 5' + Doc 38 1 65.28 TCCGGTTTGGGCAATGATAAGCATTTCACGGAATTTATCGCTGGGCATGGGCACGCAAGGAGCAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGTCATCTATTTATT:1 - chr3L 10068999 5' - 412 439 2 50.00 GAGGATGTTTGTTCCGATGAATATTTTGTCGAAATTAAACGTAAACGTAATGGAATTGTTGTAGTTCCTTATGTTAATTACAATAATTAATGTGGTAACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr2L 20262745 5' + roo 18 2 74.66 GCGGGGGTTTAGCAACTGTCTCGTCGTGCAACAAACCCGAGATCTTACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATACATATATAGATACACAACCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATG:1 - chr3R 10391279 5' + R1A1-element 5231 1 66.44 TACGGTATGCTTTTAATTCCTGTTTATGAGCTATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:2 - chr3L 8704571 5' + blood 89 2 78.08 AGTACGGGACCGATTACGGGACCGAGTACGGGACTGAGTACGGGACCGAGTACGGGACCGAGTACGGGTCCTAGTACGGGAACGAGTACGGGACCTGTAAGTTAACGCGGGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTGCACGAAA:1 - chr3L 16047626 5' + Gypsy6A_LTR 26 1 66.44 CATCTCTCCCCGAAATAAAACTTTTTATTTTCACACAAAGTTGTGCAACCAAGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAAT:1 + chr2L 17795138 5' - hopper 1344 1 66.44 GCATAAATGAGTTGTGAATGATTCACCCAAAACAAGAGGTGAATAATTTAAGAGAATATTCGCAATGCGATTTATTTGTCTGATGCATTTAGATTCAAAAATTTTGGTTATTGAATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACTGT:1 - chrX 13138379 5' - McClintock 6248 2 73.29 TTTTAGAGTATTGTGTGGCATTAATGGGAGTTTTTAAAAAGTTCTGGGTATGAAGAATTGAACCAAAATGTGGTTAATGGGTTAAGCATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr3R 10769521 5' + 297 26 2 68.49 GGATGCAAGCTTCCACGTTTTATTATTACTTGGTTTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGAAATAATTAATAAATATTT:1 + chr3R 18492912 5' + Juan 4106 1 72.86 ACATGGGTCAGGCGGGTTGTGGTGGGGGTTGCCGCTGTGGAGAGGGCAAAGTGCATGAAACTGAAACGAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGTCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1 - chr3L 1983590 5' + Transpac 20 2 70.55 GTTACGTTTTTACTACAATAGTTTGAGATCTGCTTGGCATTCAAGGCAGAATGGATAAAATATTTCTGCATTTAAATATACATATATATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTG:1 - chrX 21405403 5' + flea 32 2 63.70 TGTTGCCAACAAGCTGGAATTTCACAAATTTCATTTCAGGCCATTTCACAGCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCG:1 + chrX 17690412 5' + Doc 282 1 74.66 GTTAGTTTCTGTTCATTAAAACATGTTAAACACATAATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1 + chr3R 12886008 5' + 412 7135 2 77.62 TAATTATTACTTCAAAAAAGGTGTTTAATGAATAGAGCTAGCTATGTAATGTTCATTCTGTTTAATCTTTTATAATCCTCACATTGAAGTTCAAAGGAAACAATTGTTTTAGTTTTTAATTTTTGATTTTTAATTTTAATTTTTTA:1 - chr2R 13121964 5' - P-element 2638 1 76.03 GGCCATTGCAATTCCTAACCAGTTAGCCCAGAATTTGGAAGCCAGAACATATTTATTTTTAAGGTTGTCTGCCACTTTCACAAGGGATACATTTTATTTCCAAAGGCGTTCCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGAC:1 - chr2L 5732878 5' + hobo 2709 1 78.52 TGCAATGTCAATTTTCATTGCCGCATGGGAAATTGCACAACCGCAAAGTAAGCAAAGTGATAACAGAAGCGACTTATTATGAGTTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGG:1 + chr3R 14219867 5' + jockey 298 1 58.22 AAATATTTTCAATCAGCATCGCATCTCCGTACGTAATTTTTGCGTAATGGACTAGAATGCGGTGTGACGACGACCGTCGAGTGTTTTTGGCGTTTTTGAGGAGGGAGGGAGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 + chr3R 26845472 5' - mdg1 409 2 76.71 GATGGCAAATGGAAGTGGATGCTACATGGTGGAAAATGTGATAATATCGCACTTTTCTATTTAGTTAAAAATCGCTTTCAATGGAAGATTTAAACTCGCACTGTCAAACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGCTA:1 - chr3R 18498388 5' + pogo 11 1 71.92 ACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGGTGTCGGCTGTAGGTTGAAGG:1 + chr3L 1983485 5' - Transpac 5150 2 80.16 CTGCGCAGTGAGTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:2 - chr3L 3540262 5' + mdg3 5271 2 71.23 GAGGCAGAGGCAGGAAGAACAGCAGAGGGCGGAAGCGAAGGCCGCGCGTCCTGGAGAAAGGTGGCCTGGCAGTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGACAAGGGAAC:1 - chrX 21175418 5' - Gypsy12A_LTR 2240 1 90.27 TCCGCTGTGGCCCAGCTCCAGCCGGAAAATGCATCACCAGCGGACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCA:1 - chr2L 2722438 5' + flea 4831 1 70.55 CAACTGCCAAAAAGAGCTTATTTATGCGCATATGAACAGCTCGAAGGGAGTCGGACTTTCGCCGGCATTCGTAATTGACTCACCTTTAATTTGATGAAAGCAGGTGGTGGTTGGAGGTGTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGC:1 + chr3L 10138284 5' + F-element 487 1 73.97 GCTCGCACACTTTGTGGCTCTCATGAATTTTTCCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCCCAAGGTG:1 - chr2R 5899273 5' + jockey 4591 1 76.03 ACTTAGAAAAATCGTAAAAAAAATATACTCTTTTTCAAACATTAATAGGAATATATTAATGGTTGAAAACTAGTAAAATTATGCTTTCAACATAGTCAATCCTTATAAATGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr2L 19800818 5' + roo 10 2 75.86 CGTAAACACGTACAAGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr3R 12547863 5' + hobo 58 1 62.31 TTGCCAACATTTATTCATTTATATATGTATTCATGGTCTAATAATAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr3L 16523153 5' + jockey 33 1 67.81 TCTCCTTTGGGAGATTCAAATCAGAAGAATTTTGCTGAATTTTCCGACAAATTGAACTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr2L 12766937 5' + hobo 26 1 66.44 CAAAACAAGAGATACACAAATTAATTAAACTAAATACATATAATACACAAAATAAAATACTTTTTGCTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 - chrX 21668605 5' - mdg1 7405 2 54.79 ACGTATTTTGAGGGGTTAGCAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGT:1 + chr2L 19565447 5' - jockey 4923 1 64.38 ATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAA:1 + chr3L 1983441 5' - Transpac 5197 2 56.91 TTTAAAAAAACCAAATGGGCCATTAACAGCTTAAATTGGGCACCCTTATATAGAGCTTTTAACTAATTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chrX 10838615 5' - roo 9018 2 59.59 TTACGTTTCAAAGACTTCTATTGGGGTGCAAAATTCCTGTGCTAAATTCTTTAAGCTTAAACCAAGTAATTAATTTTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTAT:1 - chr3R 18492984 5' - Juan 4167 1 52.74 CCCGAGTATTCGTGTATCTGTGTGCTTGGCAGTTATAACACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chr2L 20269002 5' + hobo 80 1 71.23 GAACGACTCCGCGGAATGCAATGCCACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr3L 10068886 5' + 412 56 2 56.16 AGCGATTAGCCGATAGCACTTATCGGTCACACACGCTAGCCAAACAGTACAGTCACCACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAA:1 - chrX 11236485 5' - copia 5060 2 62.76 CTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGT:1 - chr3R 15035139 5' - Stalker2 7577 2 66.44 TCATTTACAGCTAGCAAGCTGAAAATTTGGTTTCAGAACAAAAATTAATACTTAATAATACTTAATTTAGAGTCCCAAAACTATGTTGCTATTTTTATTTTCGTCATCGTCTGCACCCGCTCAC:1 - chr2L 16567009 5' + F-element 464 1 73.39 GTATCCACATCATTGTCCTGACGCCAGGCCGTGAAGTGGAGCGCCTGAACGCTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGCTCAGGGTGGC:1 + chr3R 509512 5' - R2-element 3181 1 69.18 AATGAAGTACTTACATATATTGTAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 + chr2L 615216 5' + F-element 63 1 51.37 CCATAATGCTGCGCCATACAATCATTAGCATACTGTAATAGGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCCTATATTGCTGTCTTTGGGTAC:1 + chr3R 9862908 5' - Stalker2 7561 2 74.66 AAATTGTAGTTAGTCGTTTTGAGAAAAGGAAGCCATAAAATCGTATCATCCATTTTCCAGCGCTTTGATTTCCCAGCGCGACTCCACTTTGTTATCATTGCGGGAGTTTACGTTGGTCAAAACCAGACACTGCTATTCTTATGAAC:1 - chrX 8446952 5' - HB 210 1 71.23 ATTTCTTTGGTTTTGTTTTTATACCCGATACTCGTATAGTAAAATGGGATACTAGATTCGTTGAAAATTATACAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCAAACTCCATAAAGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGT:1 - chr3L 4161101 5' + invader1 13 2 76.03 ATTTTCAAAGCCATTAATAAAAACAACCTTTTCGATTGAGAGATTTTATTTAATATTCATAAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3R 13411899 5' - roo 9011 2 59.59 GAAAAAAGAAAAATGTGCAACGAAAAGCAGTGGATTTTTGCGGTACGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:2 + chrX 9864931 5' + hobo 75 1 69.18 ATTACCGTTTCCAAGGACGAACGTCTTAATTAGCCCTGCGAAAAGCGCGAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 + chr2R 17872428 5' + Tirant 18 2 70.55 GAGAGAGAAAGAGAACGAGATAGTATAATGCAACTGCATAATACTATCTCGTTCTCTTTCTCTCTTTCGCGCTGCCGTACGCACTAAGCAATTATACAATTATGCAATGCATTGCCGCTAAAACAAAACAAAAAAAAAACAAATA:1 - chrX 13747073 5' - Tc3 87 2 77.24 ACGACCGCTTGGCCAGGGCCATTGCCCCATCTATTTACGAGAACGACGACATCAAGAAAGGCATCTTGCTGCAGCTCTTTGGTGGCACCAAGAATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCG:1 - chr2R 7498189 5' - R1A1-element 5192 1 65.73 TACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 + chr2L 12861731 5' + jockey 91 1 73.79 GGACTGTGAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTC:1 + chrX 21087532 5' + mdg3 5274 2 67.81 TGAGAGGCTTAGGAAACAAATTTATTGCAGAAGTTCAGTGATCCCTGTCATATGAGATTGAACCCAGAGGGAATTGTTTTTACTCACACAAGCAGGCAAATTCTATTTTTAGATTTTTTACGCTCTCAGCGTGAGCAAGCGGAAAG:1 - chrX 412079 5' + 1360 3299 1 50.00 CAGCGTCAGCATATGCGAAAAACAATGCCGCACCGAGTGCAATACCAACGTGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTT:1 - chr3R 24301906 5' - Tabor 7255 2 63.70 TCTGCCGCTTGTTTATTTATTTGTTTTGTCGTTTCACGGAGCATAGCGCAAAACGCTCACCCTTTTGGCATGACTGCTTCTGTCCTACGACACACGATACTTTATATACATATCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr2R 17937066 5' + 297 6583 2 71.23 TNGGAAAAACTGGGGGAATCTGGGGAATGTGCCTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACTACTTCCCCACC:1 + chr3L 19398148 5' + gypsy5 90 2 78.77 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCG:1 - chrX 12649914 5' - blood 146 2 81.43 TACAACAACTAAGCTTTAAAATAATAAATTCTTCGGTCGGTTGCACAACAACTTCGTGTATATACAATTTTTAAGCTGCCAAAATAGATAACTGAGAACTTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:1 - chr3R 27948353 5' - Juan 4195 1 71.23 GGTCAAGTAGTAAAATTTTTAATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGTTCTCGCGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 + chr2L 12447414 5' + opus 7176 4 56.85 GGAAGATAAGAGTGCTTATCTACACTCCGTTCAGCGCAACAGTCGATTTTGGCTGGTCTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAG:1 - chrX 21087720 5' - mdg3 247 1 69.86 TGGCTCAAAAGGCAGTTATAAAATATTTCGTAGCATACAAAATGGCGCTGCTGCTAGAAAATTCAATTAGCCTGCAATTTTTGGCAACAGCTGGCTTTCAGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGC:1 + chr2L 3677543 5' + BS 13 1 71.53 GAGACTGAGAGCGGCTTCTTAGCGGTTTCTTTATCGCCCAATATCAATCAAGTCCACAGAAATTCGTTGCACATTCGAGGATTCTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr2L 11043644 5' - roo 9037 1 61.11 ATAGTTTAACGGAAAAATCATGCAAGCAGCGACAATCGAAAGCATCATTTTACTTTACTCCTCTTCCCCAATATATATCGATACCCCAGAAAATAAAATTCGGGTTCGCATTCCCACCAGCTGAGTAACGGATATCTGATAGTCGG:1 - chrX 22768007 5' + INE-1 551 1 58.22 CATCGATTGCCTTTGAACTGGTCTTAGCCATGAATCCAACGCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCCAACAATGTGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chr3R 29719302 5' + hobo 38 1 59.59 ATATTTGTCTGGCTTTGCAAAAAAAAACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 + chrX 12344278 5' + F-element 33 1 69.53 TAATGGTTGAAAACTAGTAAAATTATGCTTTCAACATAGTCAATCCTTATAAATGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr2L 19800874 5' + roo 67 2 64.38 GAGGATGACGCAAATTGTCCACAGTCAGCCTCGAACAACGCACAGGATATTTAGGAATATTACATGTTGTTCACACTATAAACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGCTTAAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGCCTTTT:1 - chr3R 2819780 5' - rooA 296 2 63.01 ATACGTAGACAATAATTCAAATTATCCACACAAGTGTCCTACTACCGGGCCGCTCTCTCTTCACTTCGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGA:1 - chr2L 42607 5' - copia 5072 2 54.11 TGTGGTTGCGCAACTCGTAATAAAAGCCGGATAACCGGATACAAGCGAAATTCGTGTGTAAAATCCCAAATAAGTAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGTAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACA:1 - chr2R 18786061 5' - roo 9003 2 58.90 AAAAGTAAAAAAAATTATTATTAGTTCGCTTAGAAAAGCAATACATTTTTAGGATTCACACTGTTCAGCTATTGAGCTTTTTTAATAGCTGTTGCGTAAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTT:1 - chrX 13287874 5' - diver2 4832 2 54.79 ATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 + chr3R 13572036 5' + 412 7136 2 76.03 GTCAAATAGAAAAGTAAAATTTATGACCTTTCTGTAGAGAATGGGGAAAGTTTTCGCAGCCTAAGAGTAGGCTACACAAATGTCACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGGAATCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3R 27056325 5' + jockey 12 1 77.86 GTGTGTGGTTGAAGCTCGTTTGGTTGGAGCATAATAAGCGAACCGTGTCAAACCTGTGTGAAAGTTGGCCTCGACCTGTTGGCTGCATGTAAATTGAGTTATATCTGTGACGCCCAGACTGACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCA:1 - chr3R 2789763 5' + Chimpo 37 1 68.49 TAGATACTATTTTAGTCAGAGATTTCCCTAGAATAACTAACTAACTAAAAACGGAATTCGAAGAAATGAATAAAACTATATATAGTATTAAGTTATATGGCTACTGTGTATACTTCGATAGTATTTTAAATTTTACTTTATTATTC:1 - chr3L 7236809 5' - Doc3-element 164 1 43.15 TGGCATCTGTGGGGGAGTTTTGGGGTTTCAAAGTGGACCGAACAAGTTGTTTTGCAATTTTCAAGGCTAATTTAACAAACGATTACCTTTTATTACCTATTACCTTTACCACTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3R 19466622 5' + jockey 15 1 76.03 ACAGATAAGCTTTGGAATTTCACCCATTGATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATT:1 + chr3R 8293510 5' + Stalker2 41 2 56.16 AGGGGAGGCAAAGAGGCAAGTTAAAAAAAAAATATAGAAAAGAGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chr3R 13571975 5' + 412 12 2 73.33 GGTGCGCAATTCTGCATATATGTTCAAATAGAAATAAACAATGCATTATGGCAGACCAGAAAAAAAAAACCAAAAAGAGAATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr2L 2622764 5' + roo 41 2 57.53 CCGGGATCCAAGATGGACTAGATTATCCGAGGATCTCACGGGCACCAACTTAGCTGCAGGCTTCAGGTGAACCACTTTCCCTTGCTGCAACAATAGTTCACTGTAATCATTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTT:1 - chr3L 7244648 5' + roo 397 1 75.34 ACAATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGCGCTACTCGCCACGCACA:1 + chr3L 13380435 5' + hobo 61 1 57.53 GAAAAATGTTATCAAAGTTGATGAGAAAGTTTTCCTATCGCCTGTTTAAGCAGCTAAATTAAAAACAGATCAATTAACGTCGAATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 + chr2R 7540969 5' + F-element 51 1 54.79 CCTTTGAAACCAATAGGTAAGATCCGTCAATAAAGTTAACCAGTTGTCAAAGCCTCTTATGATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 + chr3R 17068885 5' - mdg1 7402 2 56.16 ACACTCTTCTCTCCTAACCCACCAGACTTGCCAAATGCTTTGGCAAAGTGTCAGGAACTAGAGTCTAACAACTTTAGAGCTCAATTATAGCTTAAGAAGTCATTGTGAAATTCTTATTACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAACTAT:1 + chr2R 2018203 5' + Copia1_DM 100 1 58.90 ATTTTTTCTGCTGCTCTTCAGGCTCGTTCCGTGTAATTTATTGAAACACATTCATTTCTCGCTATGATGTGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGCG:1 - chr3R 19500726 5' + jockey 88 1 49.65 CAAAAATTCTTAAATTCCCACATCGACACGCCGACAAAGCATTATCAAAGCATTTTCATATAACCATTGGCTTTTCTAAAGATTTTGGAAATTCAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTC:1 + chr4 348165 5' + Tc1-2 1299 1 57.53 GGTTGACTTTTTATACGCTTTCAGAGGGCATCTCGATTATATCCAGAAGTTTGCCAGACACATTTGCGACCAAAAGAAGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACC:1 - chr2L 10685902 5' + Quasimodo 41 2 58.22 GTGTCATATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTT:1 - chr3L 20910107 5' + F-element 46 1 48.44 GATTTATAAGCAACATCGACCAAATATTAAACTATACATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGA:1 + chr3L 19510510 5' - pogo 2067 1 62.89 CATGTGTGTCAAGTGTTTGGCAGCGTGCGTTTCATGGCACAAACATTTATGCTAATAAATTGAAAATGCAAATAAACGAAAGTGTCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr3R 11730796 5' - hobo 2911 1 59.42 GGAAGTGTTTTCAAAAACACGAAATTTTCTAGGAATTTTGCAATACAAATTCAAAATAATCATAAAAATGAAATGACGGCGAGTTGCTTAATTTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 - chrX 15219765 5' - pogo 2074 1 66.44 TTTTTCTTATTTTTTTTTCTTTTAAGTACGTGCCTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTAT:1 - chr3R 26746353 5' + hobo 88 1 76.71 GTGGGGGATTGTTCATTTCACCAGGCATTGATTTTGATAAACGATTACTATCAATATGGGAAGAGACAATGATCTCTACCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAG:1 - chr3R 30411484 5' - F-element 4520 1 53.79 TTCCGTGTAATTTATTGAAACACATTCATTTCTCGCTATGATGTGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTT:1 - chr3R 19500700 5' + jockey 117 1 68.49 ACTTTCCTAGTTATAAAGAGACTTATGTCAAAAACAATAGCACCATTATCTAAAGCCATTCCGAGTTCTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCT:1 + chr3L 8704490 5' - blood 7336 1 53.42 ATAATTCAACATTCAATTCAACTCAATTCGAACATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr2L 8909867 5' + roo 8748 2 75.34 GTATTCATGGTCTAATAATAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr3L 16523179 5' + jockey 60 1 53.42 TTAGAGCTTATCTCAATTTATGATTTTTATATGCAGTAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTAT:1 - chr3L 15374727 5' - 3S18 286 2 54.79 GATCACTTGCAAAAGATAAATGTTATGGCACCCAAATAAGCAATTTAGGTATGCAACGTATTTTGAGGGGTTAGCAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACT:1 + chr2L 19565392 5' - jockey 4978 1 74.66 TACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAA:1 + chrX 12344309 5' + F-element 83 1 65.07 AAAACATTTAAGCTGCCAGCGGCTGTACCACCGAGAGCGTGCTGTGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACTTTTGTGTGCGGGCGCTACTC:1 + chr2L 19680997 5' + hobo 51 1 60.00 TTTCCCATTTCCTCGCTGCCTCTTTAAACTGCTGCTTAATGTATGGCCCCACTTCTGTTTTGTGTCGCATAATTACCAATGCCAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr2L 18848837 5' + blood 37 2 60.27 GAACCTAACCCCATCAAAACCCTCTTGGGAAAGATTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGC:1 - chr3R 10736835 5' - copia 5037 2 78.77 AAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCCATTTCTTCTTTTGATTTTTGAGTAG:1 - chr3R 13572089 5' - 412 7465 2 72.66 GTGTAAGGAAGATAGATCACTGATGTTTATAAATGAATCGTAAGTGATGGGCAATTTATGGAAACTGGTGCGATTGCAACACCTTCGATTTACTGTCGTATTCCTTCATCAACTCCGGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAA:1 + chr2L 19343868 5' + FB 6 1 80.14 TAAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:2 - chr3R 31663331 5' + jockey 75 1 61.64 GAATGAGCATAATGGATTGACAGGCTTCGTTAGCAGGAGCTGGTAAGCTGAGGTCAATCAATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr2R 17387599 5' + 412 7100 2 50.81 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGTATGCGCATAT:1 - chrX 12649914 5' - blood 7167 2 85.19 GCGTGAAAGTATTGTTTTATTGTATCTAAGGCAACATCAAGCACTGCGCATTGCTTGGGTGACAAGTTTTTTTCTACTTCTTTTTACCTTATTCATTAACGACCTCCCCTTAATAATAAAACATTCGCGTGTAATTATGTACGCAG:1 + chr4 873348 5' + Q-element 562 2 57.53 GAACTGCCCTGCTTTGATACCATTTTCTAAATTAAGGCATACTTTCGCACAAACAAACATTCGACTGTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr3R 8810757 5' + 297 49 2 55.48 ATGAGCCGCCAAAACGATGAGCGGCCCGCGCCGCCACCACTAATCACAAATTTTAAAATCAGCGCGGCTCCCGCCGACGACCAGCAGAATACGTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGCCGAAGTAGAAGCGTTGCTGTCAGCCC:1 + chr3R 928345 5' + Chouto 5969 1 65.52 GTCAGCTCGTTTCTTTCACCTGTTTTGCCGGGAAGTAGGCAACATTTTTTGTGTTTGCTCTTTGTGGTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr3R 8625287 5' + jockey 60 1 54.79 AATTAATGATAAGTCACACAACCATTTTGATTACCAAAACTAGCTTAAAAACCTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1 + chr2L 3150964 5' - blood 364 2 75.69 ATGAGTAAGAGTAACTGGAATTTAGAAAATTATCTTGTTTAGAAAGTAGTTACATGATACATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACA:1 + chr3R 26693343 5' + Stalker2 61 2 59.59 TTTTAATGGTCGTCGCCCACGCCTTTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTCTTTGACACCCTACTTGCG:1 - chr2L 19907630 5' - hobo 2868 1 68.35 AAGCTCATTATTAAAATATATGTTTTATGCGTATTAGGAGTGAAAATTTTCAAAAAAAATTTTAAATTAGGAAATGACCTGAAATTTAAACCCAGCACGTCATGATCTATTTTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAA:1 - chr2R 22617000 5' - BS 5082 1 71.23 ACATATTTCGAGCAGCAAAAACAAAGTGTTTGCAGCGACAAAAAAATAGCAACAATTTATAAAAAAAATCTGCTTGCTCAGAACTCAGTGTAAGTGCGAATATGCGAGAGAGCGTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAA:1 + chr3R 23346498 5' - Rt1a 5054 1 76.71 CGTCCTTCTCCACCCCCATCACCCTTCCATACCATCCTGGCTTCATTTTAGCGGAGCATACTTTCCAGCGCTCGCACACTTTGTGGCTCTCATGAATTTTTCCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAG:1 - chr2R 5899342 5' + jockey 4522 1 70.55 ATGGGAATCGGAGTTGCAATCGGTATGTTCTTGTGTACGGGCGGGGTGTGTTCTGTGTGAGCGTGTGTGGGTGTGGCAACATGGATCAACAAACTTGAGCTGCGTCTCTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTCTTATAGTTCTTG:1 + chr2R 9021494 5' - INE-1 155 1 54.79 GTGGCCAAAAATGAAACGGTAAGCGGTGATCGATAAATATCGGCAGCAAAAAGCGTTAGCACGGAAACGGAAATGACAATCGTCCTTCTATTTCCTACCAGAGAACTGCATCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCCCCCGATACAC:1 - chrX 6587747 5' - hobo 2913 1 67.59 GATGGAGGAAGCCAGTTATAGTCGACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTA:1 + chr3R 9657659 5' + BS 41 1 50.68 CCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:2 + chr3L 3540125 5' - mdg3 5430 2 61.64 CCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACA:1 + chr3R 15035070 5' + Stalker2 80 2 70.55 ACGAAGATGGCGACAAAAACAAAAAAAAGGAAAA:1 - chr3R 24565929 5' + Doc2-element 227 1 73.53 TATGAATTCACAGAGATTTACAAATATGTTTTTTAAAAGTAATCTTTTATGATTTTAATGGTCGTCGCGCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCAATCGCACTCTACGTC:1 - chr2L 19907682 5' - hobo 2925 1 69.40 GAGGCCAAGTGCCTGACCCAAAGTGTCCGTATCTGATGATGACGCGGTCGTGTCCTCACCAACGTGAAGGAATTCCAAATAACTACAAATTCAGCTTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr2L 10128215 5' - hobo 2917 1 70.55 GCTTACGACTTCCTGTCACTTTGTGAATAATTTGTTAGTTTAATCATAAGATTACACGTTCAAAGAGAAAACTTGCTAAAAAAATTGACAGTTTTACCAAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 - chrX 8358813 5' + Doc 25 1 69.18 CTTAAACGCAACAATGATTTTGAAAAACATTCACAGTTTTTCTAGGTTTTCTGCTCAAGCCAGACTCATTGCAGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTA:1 + chr3R 27443137 5' - 3S18 291 2 53.42 GTGTGGCATAAACAAGAGCGCCCACAAAGAACTTATGTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTA:1 - chr2R 18528769 5' - jockey 4903 1 77.40 TTATTATAATGATTCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAAC:1 - chr2R 12185468 5' + accord 11 2 75.34 AACTCAAAAGGCAATCTTAAAATTCGCGGAAACTAACCATAAGCTATTTAGTTACCCAAATGGACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGTTGCAGCCGTCAGGCCACTTTTT:1 + chr3L 5425446 5' - blood 7333 1 53.42 TAGTTGCCTTCTTAGGTAATCAACACAAAAGATTTTCCAACCCAGTAAACATGAATCTTACGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATG:1 + chr3L 120574 5' - roo 314 2 60.27 ATGGCCACGCATACAGTTCGTTTGTAGAATGGGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr2R 21453624 5' - hobo 2930 1 44.74 GGGGAAATTATGAAAAGCTTGAATGTAATCTAAAATGCCAGATGCAGAACTACAAATATAAAAAAAACCCATTTATGATGGTTTGTTTTGGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTTTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTC:1 + chr3L 15485999 5' - roo 176 2 61.64 AGGATTCGCATTTATCTGGACCCGAGATTGCGGCTGACTCATAAAACTTTTATTGGACCCACTTGATGGGGAAGTTTTTTTTTCTTATTTTTTTTTCTTTTAAGTACGTGCCTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 + chr2L 10128028 5' + hobo 10 1 77.40 GGCAAAAACTGCTCTAGAAAATGTAATCAACTTGAATTTCAATCAGCCATTAAATTTAAAAAATTGCCCCAGCTAGTTATGCACATTTTACAGTCTCTGTTTTATGGCAGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCT:1 - chr3L 19398268 5' - gypsy5 396 2 76.03 GGCCGCTCCACCTCCTCCTCGTCGCTGACCGTTAGGCAAACAATGAACAATTCAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2L 20327587 5' - roo 361 2 50.00 TAGCGCGGCTAAAGAGCAGTGGAATAACAATACAAGCGCCAAATGGCCGGCAAACCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3R 29623319 5' - roo 342 2 62.33 ACTCCACGCGGATTGGGCATTATCGTCGAACTACTTGTCCAAAAGCTGGACCAAGGACTAAGTCTTCTGGCTAAGTCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGAGGTTTTTG:1 + chr3L 26350086 5' - Quasimodo 7034 2 55.17 CGATGTTGTTATTGACTCCAATATATTGATGTTGTTCTATAATTGATGTTGTTGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTA:1 - chr3L 13778625 5' - I-element 5289 1 65.07 ATACTTATCAAGAAAAGAAATATAGAAAAAACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:1 - chrX 8610367 5' + mdg3 5263 1 77.40 GTGGTGTTCTTTTGAGGTTACAGCATTTGGGTGCTCATTCATATCTATGTGAATTTAAATGATAGCTTGAAATCCAATTTAGAAGATCAACAGGGAAACCTAAAAGATCAAGTTTTCTTATTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCA:1 - chr2R 5603030 5' - Q-element 333 2 58.90 CTCACATTGAAATGAAATTAGTACTATTTAATATACGTTAAAATAAATCATTTCCATAATTTAGTAATGTTTTTTATATTATTTTAACTTTGATATTTTAGGGCCATTTATAAGTAGTTTTATATGTGTATAGAATTTTAAAATAT:1 + chr2L 2538394 5' + springer 482 1 69.18 TGGTGCAGTTAGATTTGAACGCTAGGCCGTGGACTGTGGAAAGGAATGGCCTTGGAATGGCTTGGATTCTGGTAAGGTGATATTGGAACTGAAAGGTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chr3L 22518948 5' - pogo 2078 1 69.86 AAAATGATTATAGCAAGGAAATTAGTAAAAATTTAAACGAAAATCGTAATGAAATCACAAAGCCCAATACATGTGCTTTATCAGTATTAAAAAACGATGCAAAGACAATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTG:1 - chr4 204547 5' - 1360 491 1 69.86 AAAAAAAAAGACAAAGTTAATTTACTCGATTTGGGGCTCCGCTGCGCAGTTGCCGCGCGATCGCACAAGCAACTGTTTGTGAGCTCAAAGCTTTTCTATCCCAGGGTTCAAGTCTTGGCTAGAACCC:1 - chr3L 18423190 5' + X-element 276 1 77.95 CTGGGATTTCATTTACAGCTAGCAAGCTGAAAATTTGGTTTCAGAACAAAAATTAATACTTAATAATACTTAATTTAGAGTCCCAAAACTATGTTGCTATTTTTATTTTCGTCATCGGCTGCACCCGCTC:1 - chr2L 16567017 5' + F-element 462 1 74.62 GCACACAGTAAGTTTCTTGATTGCCAAACCCATTGTAAATATAAATTATTATTTGATAAGCGGCTCATCATAATAACGGATGCAAGTAACCAAACCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGT:1 - chr3R 30564828 5' + F-element 4562 1 65.19 GTTGCGGTTAAATCGAAAGTCATACTTTAACTACAATATAATATTACACGCCAAGTCAGAGGCATAAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2R 21244808 5' + roo 8675 2 73.97 AAAGTTAGTTACCATCAATAACAGAGAGTTCTGCGCTAGCTGCTGTGTTCTGAATATCATTATCATCTATTCCTTTTGAGTTAAAAAACAATATTGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3R 10800464 5' + roo 8690 2 66.44 TTTCTTTTTTTTTGAAAATTTACAAGACAAATAAAAATGTGAAAAAATATCAGAACGTTTTTCAAAAGTGTGGACATGGCTAGAGCGACTCGGCCATTGAGAAATTCCGACCATATAAAGTATATATATTATTGATCACGATCAAT:1 + chr3L 13227336 5' + INE-1 83 1 47.95 AGGAACAAACGTTTGCTTGGCATGTTCAAGTGATAAATTCAATTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAA:1 + chr3R 27411706 5' + I-element 76 1 67.81 GAAAATTACGTGCTTAACGGGGCACAACGTTCTTTTGTTTTAAGCCAAATATATTTATTGAATTCCCTGTGTGTAGGGTTTAATCAAATATAGAATAAATAGGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGACGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 18539925 5' - roo 396 1 74.29 ACTAAAATCAATTGCAATCTTGAGAATTTAATCAAAAAGAAGGAAAAAATGCGAAGGTAACATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 - chr3L 18421423 5' + hobo 61 1 58.90 TTAAGACGTTTGGGTGTACAATTGTTACTGTAACTTACTGTAATGTAGTGCACGCAAGGACTCGACTGTGAATCCTAATAAATTATGTAGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGA:2 + chr2R 10202952 5' + 17.6 6955 1 39.73 AAAGTATAGATTCAAAATAATTTCTTTACAGTATAGTTGACAGTGGAACTGATCCGAAATTTCCGAATTTGGGACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chrX 22760298 5' - roo 360 2 54.79 AGTAGGCAATAAATAAATGACAATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACACGACTCACACCC:1 + chr3L 13380416 5' + hobo 25 1 62.79 CCCCTTGCGGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTG:2 + chr3R 19537463 5' - hopper2 1563 1 54.79 TATAACTTTCCTCAACAACAGAATGGGAATGTCGACACCTCCATAAAATTAATTAACCCCCAATAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr3R 12569572 5' + blood 53 2 53.42 CNCAGACTCGAACCCGAATCCGAAACCGAGCCGGAGAATTCTCTCTCTCTCAAGTGTCCGGTCCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 - chrX 13642124 5' + P-element 58 1 45.89 GCCACATGCCCCACCCGCGCCACCCATGCCACATGCCCCAAACTAGCATACACACACATACACATACACA:1 + chrX 18364454 5' + Quasimodo 38 2 65.71 TTGTGTGTGTGTGGCGTGAAAACGCGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 - chrX 7930743 5' - P-element 2792 1 20.55 AACAAATATCTTGTTGTAAAATAATAGTTCATACTTGCATAATTCCAAGCTGGTAACGAACGCGATTGTAATCGATATACGATACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr3R 29997736 5' - P-element 2846 1 56.16 AAACGGAAGCTCCTAAAACAAACGCTGTGGTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCTGTCGGGCT:1 - chr3R 13572089 5' - 412 7506 2 61.22 ACCTTGGGAGGACTGGTCAGTGAAAACGCTCGCTTTGTAATTATACATATTTAATGCACTTTGTTTAACGGATACTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGACAGAGGGCAATTTTGGCCGTCACCAAAGAAGTGGCTGCATAGTGC:1 - chr2R 10649760 5' + 1360 3341 1 51.37 AAATTATCATTATGGTCTTAAAGAGCCCGCAAGCTTCCAGATCGACGTGTACAAGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chrX 22760405 5' + roo 8731 2 64.38 CAGCGCCTTCCTTTTCATTTGGTCCCTTAGTCAATTGGCGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCAC:1 - chr2L 19841560 5' + BS 78 1 71.92 GTCGAAAGCAGCAGCTGATGCAGCAACTTTCTCTATGGATTTCACCTTATAAGCCCCCTAAAACCTCCCGCTTATATACATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 + chr2L 15523896 5' - opus 463 2 60.00 GTGAAAACCATAAAATTCTCATTATTTATAATAAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCACA:1 + chr3L 12729102 5' - opus 7428 2 76.30 GTTATTGAAAATATATTTAACCTATTAAATAAAAGACTAAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 - chr2R 12416985 5' + pogo 24 1 69.18 ATTAACGCAGAGAATATTTAGATGCTTATACCCCACTGCTTCACACTTTGCCAACTCATGCAATATGGCAGGAAGGTGGCAACTTTATCAATTACATTATATCAATTCATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTC:1 + chr3R 29429448 5' + F-element 177 1 70.55 TTTGAATAAATTGAATCTTTTTGCCGTTTCGATAAGAACTTCAATATTGTCGGAATGGAATATATATATTTCATAAATATTAAATTGAAAGGAAATGACTGGAAATCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chrX 10344919 5' + roo 15 2 75.34 ATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATC:1 + chr3R 19589923 5' + BS 5066 1 64.38 CACCCCCCCTAAAAACAGCCATCCCCATTCCCCTTCAGCAGTTAGCAGCCGGGCTAGTTGGGACAGAAATGTATCCCCATGTGAAATGCATGTTTGCATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr3L 5329226 5' + 412 24 2 68.97 CATATTACCTCTCCATAATATGTAGATTTCGGACAAATTGTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 + chr2L 22031934 5' + Tabor 6875 2 60.96 AACATAAATTTTGGGACCTACGTTTTGAGAACATTTTTTAAAATAATGGACTAGTAAAAACTAAGGAGGAAAGTAAATACATAATAATGTACATAATTTGTACATAATGTATCATATGTTGGCTGTCTGAGCAAGAAATTTTTAGT:1 + chr3L 14585757 5' + Tc1 124 1 63.70 TAAACAGCCTGTCATCTTTTCCCATCAAATAACCAATCAACAATTGATATTCTGCCTGCATTCACCTGGCCGGCAAAAGTTCACTTAACTTTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr3L 19702714 5' + pogo 14 1 73.88 ATAGATTGGGGCCGGTCTGCCCATATCTCTTTTGGATACATAGATCGGTTCAGCCATGCTGTCCAGGGCTTCCCGTCTAGTCTGATAGATCTGATCCCTCAGTTGTGACCTCGATAATATCGAATTAAATTTATTATATTATATAA:1 + chr3R 8829685 5' + transib3 2666 1 76.03 TATGCAACCCAAGTGGGTGGCTGCCAGAGGTTCAACATTTGCCCACCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 + chr2R 13773020 5' + opus 7063 4 65.69 AAAAATGTTGTAGGTGCACTGGAAAAAGTCAAAGTTCATTGTGTATTTTGATAGCTGTGAAAATAAGATACAATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:2 + chrX 18561044 5' - copia 5076 2 51.37 TTTTTGAAAAGTTGATATTACGATTTTGCGCTGCATACTTTCGGGCTTTAAAGTTTCCGAATGACTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCACTTAACATA:1 - chr3R 11568685 5' - BS 5038 1 54.11 CTCAAAATAATTTAAGAATGCAGTTTTAATGGCAATTCCATTTGCAGCCAAGTGGCCAGATTTCCCCGATGGAGAAACCGAAAAAACGGTCATGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3R 26658109 5' - hobo 2911 1 67.12 TACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCA:1 - chrX 21667967 5' + gypsy2 35 2 61.64 TTAGAATACTTCTAATCTACATTTGAGGATTGTCAATCTGATATTAATAAGCTTGAAATGGCTTGTGTTCCGATAATATCTTATAATGTAACATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2R 8374985 5' + roo 25 2 65.75 AAACTTTTTTACCTTAAGCTCTTAAGTACTTGGAAAAGTTAGACAAATCCTCATTTTACCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 - chr3R 19989360 5' - hobo 2929 1 74.14 GGTGGCTCAAATGCGAGGGGAGAAGAGTACCTGTGGTATTATTAAGGAGACTACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr2L 20253938 5' - roo 9004 2 63.70 AGCAGCAGCTGATGCAGCAACTTTCTCTATGGATTTCACCTTATAAGCCCCCTAAAACCTCCCGCTTATATACATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 + chr2L 15523902 5' - opus 7454 2 53.42 ATATTTGACGCCTGAGGCCGCTCCACCTCCTCCTCGACGCTGACCGTTCGGCAAACAATGAACAATACAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 20327572 5' - roo 389 2 61.19 TTTATATCCCTTTTTTCTGCTTTATGAAATGTATGTATGTTCCTATTGTATAATTACAACCACAATCAGATCTGGTAGTTCTGGAGTTCTTTATCTTGACATTCAAAAGTACAACAGATGTAAAGTCCCAAACGAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 12540425 5' - roo 9065 1 73.97 ATTGAGAGATCTTAGTATTTTATGACAATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTT:2 + chr3R 1047940 5' - Stalker2 7607 2 54.79 AGTTGATTATTTTATAGTTTTGAATCAATCGAAATGGGCGAAAATACATAAATATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGT:1 - chr3R 15453766 5' - Transpac 5167 2 63.70 GTGCCGCAGTTTGTTTGCTTGTAGGTTTAGAATTTTCGCTTACAGCAGGCATTTAATATTTCATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTA:1 - chr2L 22032061 5' - Tabor 7264 2 57.53 AAAGTTCGCTCCGCCATCAATGAAGATTCATATCGGTGTGTGTGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr3L 13568187 5' + hobo 63 1 67.41 GCCAGCGCAGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCTCAT:1 - chr2R 18266086 5' - roo 327 2 71.92 TGAGTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 - chr3L 3540254 5' + mdg3 5279 2 65.75 GTTTATTATGCAATACGCAGTTTATGTCCCATGCGGAATCAATTTCATCTCGGTATACGGTTGATTATTACTACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGA:1 - chr3R 22275368 5' + flea 4802 2 54.79 ATATGCAAAAGAAGGGTAAGAGTAATGCCGCGTAACTGTCGTCCCTTTCACACGACCTTGACTGCACTGCAATATATATGTGCACATATACGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chrX 13484243 5' + hobo 31 1 64.38 GAATCGTGTGGAAGTTATAAAAGTTTAAATAAAACTGGTTGAGTTTATTAAATGAAAAACATGCACTTCCAATAACCTCGGTACCTCACTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCG:1 + chr2R 11992370 5' + mdg1 7218 2 61.64 GCCTTCATAAACAAAATACTTGTAGTTTATCAAACCGAATGATTGTGGCTTTCTCCTTTTGTAATTTGTTATGGGAAACACTCAAAAAAGGTTTTTAATCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAATC:1 - chrX 16285968 5' - 1360 3286 1 67.81 AGCTGAATTACAAAAATAATCTTTATGCCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr3L 19938444 5' - roo 9035 1 60.27 TGCAAACTTATATTTTATGACTTTGAATTGCGTGCCCGAAAAAGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGGGCTGCAGTGATGCCAAATTTATGGAATCAGTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCAG:1 + chr2L 12324978 5' + jockey 4575 1 68.49 AGCATGTGCGTAGCCGCGGCGGCAGGAAGCTGCCAGATTTTGTATGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAAC:1 - chr2L 19628487 5' - hobo 2863 1 69.18 AACACACTGAGCGAAAATTTGGATCGAGTGACGATAGCGTTATAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2L 8009138 5' - roo 8996 2 69.86 GACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACTACTC:1 - chr3L 23678162 5' + Osvaldo 29 1 68.91 TCTACACGATGGAAAACCGGTGTTCCGGCCTCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 + chr2R 12872910 5' + P-element 44 1 34.34 ATAATTAGTAGCATTTTGTATATTTGCAATAAACGTTGTTATGCCCACTTGTGATGCGCCTTTAATTTTCAATTGGCTTAAGCTGGTTTCAGATCTAATCTAATATCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 + chrX 16325075 5' - Transpac 5217 2 76.03 GACTGTTTATTAATCTGCTCTTCCACTTGACATGTTTCAATTATTTCATCTAGTGAATATTCTTTGGCCAGAAGTTTTTTTTTAACCTAATAGGGGCCCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGATGGGCGCTGCCG:1 + chr3L 25730646 5' - Cr1a 4410 1 68.57 GCTTGACGATTTTCTGAATGAAGGAGCAAACAATGAAACTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACT:1 - chr2R 18807891 5' - BS 5012 1 75.34 TACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAA:1 + chr2L 3151036 5' - blood 7302 2 77.40 GTCAGAGTTTTCAGATCTTTGGGCCACACAAGTGAGCGAGCAGCTAAGCCATAGGATAATAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGAC:1 + chr2L 5423726 5' + Stalker4 54 4 59.59 GCTTGTTTATTTATTTGTTTTGTCGTTTCACGGAGCATAGCGCAAAACGCTCACCCTTTTGGCATGACTGCTTCTGTCCTACGACACACGATACTTTATATACATATCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr2R 17937072 5' + 297 6 2 68.06 ATACTCATGACAAAATCTACGAGTAACTGATATTTTTTTAATTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTGCATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCT:1 + chr3L 20320774 5' - Juan 4129 1 73.29 CCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAA:1 + chr3R 5087105 5' + P-element 102 1 15.75 TTTTAGCTATTTAAGCTATTGATTAAGCTATTTAATAAATTCATTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chrX 19591236 5' - roo 9030 1 60.87 TTTAATGGTCGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCACTCTAGGCACCCCGATTTTTTTGACACCC:1 - chr2L 19907629 5' - hobo 2876 1 65.38 AGTTGGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGGTTCTTTTTTTTCTATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATT:1 + chrX 19765879 5' - 17.6 7354 2 70.29 TAATTAACTTTACTGCATTTTACTCAATTCTGCAAAATGCATACCATGTTTCATTGCAAAGGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr2L 15597021 5' + roo 8722 2 57.53 AAAAACTTGTGCTTTCAGTTTAATTTTTAATACATTTTATATATTTTCCTTCATTGAATGTTTCTGGAAGATTTGAAATGGGAAACAATACAAAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2L 13102999 5' + roo 26 2 67.81 TCAACCAACACTGGCAGACAGTTTTAGTTGCGCTTAAAAGCGTGCTACACTTTCTAATGCTCGAAGCGTGATAAGCTGGCCCCAGCTGACGTTCGTTTTAATGCGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr3L 939585 5' - hobo 2933 1 82.22 CGTGCATAAATTGTAGTCAACATGTTTTCGGTGCTTAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 + chr3R 26405031 5' + hobo 84 1 74.66 TATTTTATTTATTGTAAATGTTTTGCGTAAAATAATAAATATTTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 + chr3R 11873293 5' + 412 14 2 75.34 CTCTATATTAATATATCTTACAACCCAATTCGAATTTTTTAGAAAGCTTACGGTATGCTTTTAATTCCTGTTTATGAGCTATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr3L 8704619 5' + blood 7051 2 57.93 ACTGAAAAAAGAAAAATGTGCAACGAAAAGCAGTGGATTTTTGCGGTACGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chrX 9864928 5' + hobo 66 1 65.71 GCTCAACTCGACTATCAATTGAGGGCAAGAACTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCAC:1 + chrX 8856002 5' - 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chr2L 11383546 5' - Tabor 7139 2 46.58 ACATGCAAAGGCCGCTGAACTGTACGAGCTATTCGCCACACATTCCAGCAGCTACTATGGCCCTAATGTTATAATTGGCCCGAAACGGAGAAGGACCGGAGCGAAGGACCAGTTTTTATGTTTATAACTAAAACCGCCAGTGTTAC:1 - chr3R 26774519 5' - 3S18 334 2 62.33 TTGCCGTTTTGTTTCCTTTGACTTGGAGATAATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGATGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTT:1 - chr3L 6143242 5' + Bica 16 1 75.21 ACAAATGGGCGAATGCGAATGTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 + chr3L 1983417 5' - Transpac 5198 2 64.38 ATACAAGATACCATCTGCAGACAGGCGACAACAAAAGCTGCAGAGCAAGAAAAAATATGTATATATATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 - chr2R 17317675 5' + hobo 55 1 56.85 AGTTTTTGCAATGTTTTTTAATCTGTCCTCATTATCATCAAATACTAAATAAAGCGATTGAGATTTTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATAT:1 + chr3L 15056271 5' - flea 204 2 54.79 CACAATGATTGGTAGCTGGAAAAACTTGAGCTTATGCGGAAAAATCGAAATTTTATGAGCATGAAGATTGGCATTGATTTTGCTTTTATATAATATAATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTA:1 - chr3L 22007306 5' - flea 234 2 70.55 AAAAATTGAAGAAAAAAAGAGGAATGAAGTATTAAGCGAGCAGCAACAGAAAAAATTTAATTGAATTTGCACTGCTTTTTTGAGTTCACTTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGT:1 - chr3L 780798 5' + Burdock 27 2 64.38 GTTTATATACACACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr2L 16360574 5' - hobo 2924 1 58.06 AAATTCGCGGAAACTAACCATAAGCTATTTAGTTACCCAAATGGACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 + chr3L 5425465 5' - blood 303 2 69.86 AACCACATCGATTATGGAAAACAGGAAATTCAGCAATGATATACAGGGAAAAACGCTTTGCTATCAAAATCGATATTTGAACATATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCTTTATGCGGCTGCTTATTTACTAAT:1 + chr3R 14013451 5' - 1731 4429 1 54.11 TAAAAGTCAAAGAATTTTCCCTATTATAATTGAAATGCTTAACTTAAACATTCGATTGTGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 + chr3R 14174685 5' + 297 6639 2 57.53 GCATAATTCTGCCAAGGGACACGCCCAGTTTTAAACCTAGATAAGAAAAAATTAAACCATCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 - chr3R 7655668 5' - 412 431 2 59.59 CCAATGGATGTGGAGTACGAGCCGACTGCCCAGTTACCAAATTGTCTTAGGTCGACACGGTGAGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATTTATGTACAAGTTAACACGAGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTGCACGA:1 - chr2R 3822001 5' + Gypsy6A_LTR 24 1 60.27 TATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCA:1 + chr3L 19951182 5' + Ivk 59 1 57.53 CGCACACACATTTCCAATTTAACTTTTCCATTTATTTACCCATTCGATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 - chrX 17531927 5' - blood 304 2 69.86 TAGAAGGATTATCACAGGGCCAAATTACTCATAAAACCCACTGAAGCCGGAAACTTCCTACTTTCCAGAACACTCGAAATCTCTAAAGATTTTCAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chrX 7624015 5' + roo 8689 2 69.18 TACACTCAAGGTGCACGAACTGGAGATACGCACATGCCGGAGATACATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTCTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACA:1 - chr2L 10178074 5' - mdg3 5433 2 66.18 CAATCTTTTATTGAGAGATCTTAGTATTTTATGACAATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTC:1 + chr3R 1047931 5' - Stalker2 7616 2 60.96 TTGTCAAGCAATCCGTCGATAAAGAAATTGAGCTTTACGGAGAAGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 - chr2L 22177445 5' + Doc 74 1 71.01 GAACTTAAGCTCTTAGCCGTAATAACACAAGCACAAATGAATACCTCTCGGATTTTATGTGTATCTGCATTCACAGCACTTACACTGTAACCAATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATAC:1 + chr2L 1870906 5' + mdg3 26 2 67.13 ATGGCTAAAATACACTTTCTAAAGGTCAATTTCGATTGGTACGAGCAAATAATGGTCAATATACATTCATTATTTTCATTAGATTTTAAACTAACTTAAAGTGGTAGAATCGAGTAGCATAAAAACAGTTTTTTTTTCTTTTTTTT:1 - chr3R 21919105 5' - HMS-Beagle2 491 1 38.36 ACGACAGACAGCCAATTAAAATTCCCTTTTAGCCAACCACTGATGATGGCCAAAAGGTTGTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTG:1 - chr2R 10760503 5' + Tabor 54 2 59.42 GCGGATTTTCCATAAACGAACGCGAATTCTTCAGGAGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTT:1 + chr2L 951284 5' + F-element 46 1 58.22 ATATTCATTGTTTCGAACTTCCCACAGTTGGACTACATTTGCTATAATTAATCACATTAATTATCAGACTATCGAATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGATTGCGAACGCGAAATGTCATCATTTTTCTGGGATATCGATAGATATG:1 - chr2L 22697571 5' - INE-1 497 1 61.64 GTTTAAGTGGCTATACTTGAACCAGGAGAATCAGCAGCAGTAACGGCTAAAGCAGCAGTTGAAAGTCCTCACCCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr3R 12781467 5' - pogo 2072 1 57.69 GGCATTCTTTTGTCGATTTATGTAATTATAATATTAAGTTGCCTAGATCTTGTCTTTTTAAAATTGTTTGCTTAAAAAGTACCCAAAAATGTTGATGTCCTTGAAGAATTAAATTTAAAGGGGTAAGCAAAAGATACTTTAGCTTG:1 - chr3L 10908893 5' - Fw3 387 1 76.71 ATTCTCCGGATATAACTCATAAGCTATAAAGGCATTTGGTAATGCACCTCAGTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chrX 20369462 5' + roo 8733 2 64.38 AAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAA:1 + chr2R 12185342 5' - accord 380 2 74.66 ATTAATTTCCATCCTTTATTATCCTTGTGCTTGTAATATTGCTTAGTTCAATGCACATCGACTTCATGCTGTGACAATGTTTTCGCGCTGTTTATGTGGGCGTTGCTCTCGCCGTTGCTTCTCTTTTTATTTTATTGTATTTTATA:1 - chrX 17143991 5' + transib1 1901 1 60.96 AGCCACCGCACCACCAGCTGCACCACACGCGAAGAAAATCCTTGGGAACCAGACTTGAACTAGATATAGTAGCTCGATGGCAACATTTCATATGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chrX 6052885 5' - roo 9046 1 60.96 ATATTTTCCTTCATTGAATGTTTCTGGAAGATTTGAAATGGGAAACAATACAAAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2L 13102959 5' + roo 66 2 65.07 AAAAAACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTCAGTCATACATAC:1 - chrX 8610342 5' + mdg3 5282 2 62.86 AAGTTTGATATAGCCTCGCCAAGAGTATTTAAACTTTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATA:2 + chr3R 15035027 5' + Stalker2 7285 2 60.27 CATTTATCATGCCCGCTGAATTTAATTCAATTGCTGACAAAAACGTGTTGTTGTGGATTCAACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACT:1 + chr3R 6404540 5' + Stalker2 11 2 66.32 TATCTGTTAAGTTCTTATATACATTGTTAAAGAAGCAAAACACACAAAAAGAAAAAAACAAAAACAAACGATATTCCTTTTGCTTATAAACAAACAAAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTA:1 + chrX 9172790 5' + I-element 459 1 72.60 AGGCATTGGAAATTGACAAAACACTGGTTGACTTTTTATACGCTTTCAGAGGGCATCTCGATTATATCCAGAAGTTTGCCAGACACATTTGCGACCAAAAGAAGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACT:1 - chr2L 10685927 5' + Quasimodo 16 2 75.34 CCAGCTGGCAATGCCATTCTGTTCTCTCAGCTATTATAAGACTAGTCGTTCTGTATAAGAGTGCGCAAAAGTCTCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chr3R 9158335 5' + P-element 45 1 54.79 TTAAAGGCTTGATCTTGGGTGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr2R 21244939 5' - roo 327 2 77.40 AAACTGTAGTAATTTCCACTGACTAATTTTAGTACGATTGCAGACCTATAAAAATATATATATTTAAATCTTTGCCCGAATTAACACATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACT:1 + chr2L 13763441 5' - Bari1 1676 1 64.38 ATCATATGAAATGTTTTGCTTTTTTTATAAATAATTTGATTTAACTACAATTAAATTTCGTCCGGGCTACCGTAAATTGCAATACCATTTCCTTGGACAAAAGAGTAGAGGAGCTAGAATACAAAAACGGAGGAAGCAAATTAATA:1 + chr3L 20907854 5' - Gypsy12A_LTR 2060 1 69.86 ACCAATCATCGCGTATGCGATTACCCACACACAATATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 - chr3R 25094687 5' + P-element 84 1 28.08 AACACTTTTTGGCCCTGTGCGAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chr2L 5656541 5' + hobo 60 1 56.16 ATGTATAATTTAGAATTGTAGCTTTAGACACAAAACAGCCAAAGGGATAGAATGATACCAAAGTCATCCTAAACGGGAAGGGAAAGAACCATACTGTCGTTTTGATAGGAGATCTGGAAAGGGAGACGTTGCCAGATCAACC:1 - chr2R 6576484 5' + Rt1b 34 1 73.94 GCGCCTGTCAAAACGTAAATTCAGGTGCCGAGGCGACACCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGCGACCG:1 + chr2R 13043955 5' + Doc 417 1 70.55 AATCCAGCCATCGCACAGGCAAAGCACAGCACTCGAGACCCGTCGCGTGTCTTGCTTCCTACGCAAACGACCGTCAAACACGAACTGATCGCAAGCGCTGCACTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr2L 14263091 5' - P-element 2872 1 76.71 GAATTGTAATTAATTTGTAATTTGTTGTACATATTTATCGAACCATTCTATCCCATTTAAATCAATTGTGTAACGATTTTGTTAAATATTTTATTTTGTTGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAT:1 - chr2R 22041025 5' - jockey 4969 1 64.38 ATTACGTACAAAAGGAAGTCAATTCAAGAAGCGCCCTATAATACCCCTATTCAATGTGAGTTCACTTTCGTTCATGTAAACGTATGTATTTAAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTT:1 + chr3R 8000609 5' - S-element 380 1 63.70 TCTACACTGCGCTCTGTTACTCTTTTGAACTCCACTGCACTTCACATCCAATATGACCGTTCGTGCTTCCTTAACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGTGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 - chr2R 544932 5' - HMS-Beagle 7028 2 76.03 TCGTCTCCTGCGACTGTGTGTGTGCTGAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGA:1 - chr3R 5087151 5' - P-element 2815 1 36.99 CTGTGCCATTGAAGTCGTTGAGTAATATTAGCCCGTCGTCTATTTCTTCTATTGCAGGGATGTGTTCTGCATTGGCGAACTCACACCTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAA:1 + chr2R 1252831 5' + HMS-Beagle2 250 2 65.75 ACATCATGCCTGACTGCCCCCTTTTTCCAGCTAAATTCTGATGCCGCCCCTTTACACACGTTCTGCGCGAATGATTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTG:1 - chrX 16988383 5' - jockey 65 1 54.46 GGTTTCCAACTATTGTAAAGTATTTGTATGTACAAACATACCTCATTTTAGCTGTCACCTCAAAAACTATGCGTGTGTAAATATAAATATACACGTGTTTAAATATTCGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 20369321 5' - roo 9059 1 78.08 CCCAGAGTTAAAATTAAAGATTTATAATTAACTTTACTGCATTTTACTCAATTCTGCAAAATGCATACCATGTTTCATTGCAAAGGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2L 15597045 5' + roo 33 2 61.38 CATCAATAACAGAGAGTTCTGCGCTAGCTGCTGTGTTCTGAATATCATTATCATCTATTCCTTTTGAGTTAAAAAACAATATTGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 10800476 5' + roo 8702 2 58.22 ATTCATTAAACGAGTTTTGGGAAGTTGTAGTATAGTGTCCCTAGAATAAGATATACATAAGAACG:1 + chr3L 9241083 5' + 412 7323 2 69.23 TGTGTCATAGGATCTTTAAATAAAGTTTGGTCCTAACTACAAAGGTATTTATTTATATTTTTTTTGGGACTAATTCTGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chrX 10838489 5' + roo 8707 2 56.85 TAATAAAAGGGGCCTTTGGCTTTTGAAGCATCGTCGCCTGCTTGTTGATTTTGTTGCTCTGTTTGTTTGGCTCAAAGCTATAAAATATATACAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr3R 6472604 5' - opus 476 2 70.55 ATATAATATTACACGCCAAGTCAGAGGCATAAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr2R 21244843 5' + roo 46 2 52.74 AAAAAAACCAAATGGGCCATTAACAGCTTAAATTGGGCACCCTTATATAGAGCTTTTAACTAATTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chrX 10838612 5' - roo 351 2 61.64 ACAATCTTTCAATAATTGTATTGCAATCACAACGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGTTGTCTTT:1 - chr3R 8293605 5' - Stalker2 319 2 72.73 AGCGATGCACCGAACAAAATATTGGTACTTCACATTAAATAAAATGGTACTTTTAATAGTAATAAATATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:2 + chr2R 11609838 5' - roo 392 2 73.97 GTGTATCTGCATTCACAGCACTTACACTGTAACCAATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAA:1 + chr2L 1870964 5' + mdg3 87 2 75.34 TATATCCATTCGATCCGGTTTAGGGCCAGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGGAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGGGAGGAAGGGTGGTGTGCGGACGAATTTTT:1 - chr2L 246642 5' + P-element 94 1 19.86 GAACCCGAATCCGAAACCGAGCCGGAGAATTCTCTCTCTCTCAAGTGTCCGGTCCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chrX 13642115 5' + P-element 49 1 46.09 TACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCTC:1 - chr2L 2518561 5' + jockey 80 1 66.43 CGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr3R 11873339 5' + 412 7113 2 58.90 CATTCTGGTGCTGAATTTGAGCGCTGCCTGAAAGATTCTTCTCGTTTTGTATTACAACTTTGATCTGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3L 12775957 5' - roo 353 2 56.16 CCCAGTTGTTTGATAATTTCTTTTATAATTTTTGCAATTTCTCCCCCATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGC:1 - chr3L 19319380 5' - invader2 4667 1 55.10 ATGTGAAAGTTGGCTGTATTGGAAGCAATAACAGCAGTGATGGAAGTGAAGTATTCGAAGATTCGAAGTTGATTGGCAGACCATCTGTTTCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 + chr3L 24089487 5' - mdg1 7427 2 63.01 GAACACCAAAACCAAAGTTTAAGCCAACTTAGAACAATATTGGAATTTTGGCTTTGACCTAAGCTCATTTGGCTTTGTTTTTGATTGGGCATTGTTCTGCTTTCATTGGTTTTCAGATCAAGAGGTTGTAGTATGTGCATATATCG:1 + chr2L 19992953 5' + blood 7010 1 65.75 ATCAAAACACATTTCTGTTGTTATTTTGTAGCTTTTCTTTTCATACTCAGTTTGTCATAACTCGATTAGATGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCATATGTAAATGA:1 - chr2R 15529805 5' + roo 50 2 52.05 ATAGTCGACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCT:1 + chr3R 9657676 5' + BS 55 1 58.74 ATTTCATAAATATTAAATTGAAAGGAAATGACTGGAAATCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chrX 10344852 5' + roo 82 2 77.40 GAAACAATTTGACGCATATTTCGATCTTTACAAAACAATACCTTAGCTCTTATACTCGCATTTCATGTAAGTCCTCATATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCAT:1 - chr3R 20840678 5' + BS 5052 1 54.11 AATGGACGCCACAGGCTCCTCCGATCAATATTAAAGCCGAACCAGCGGACAATGGAAACTCACCTGCAGCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr3R 15363625 5' + 412 19 2 58.22 ATAATGATCCACAATGATTCAATTTAGCAATACTATTTGAGTGCATGAATGAATGAATGAAAGGGGCGGCAATGGGCAGCCCGCTCAGAATGCTGCCGCCGGCAAGGACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2R 14451876 5' + roo 8678 2 50.00 TGAGAGAGATCATAGTGCCACTTTTGTGGAACTATTCTTGTGCCCCAACCTGTTGAAATGCTACATATATCATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAA:1 - chr3R 29952807 5' - invader4 3038 2 54.11 AGCCACTGCTAGCAAGGACAATCGAAGCTATTGGTACACTAAGAAAAATAAACGAACTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTC:1 - chr2R 21353280 5' - Transpac 5166 2 60.96 TATAGTATTATTTTGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr3R 18514325 5' + pogo 60 1 60.96 GAAAGTGACAAAGGAACAGGGAATGAGTGCGTGTAAGAGGTTACATCTCGTAAAGTGTATTTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGG:1 - chr2L 13763574 5' + Bari1 63 1 58.22 AAAGCTGACACTGCCATAAATTAAAAATGCGGTCGTCGGAATGATGCTACGCATAAATGAAATAAATTCAAAAGCATAACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTA:1 + chr3R 13231746 5' + F-element 82 1 46.58 ATTTGTCATACTTTTGAGCCATGATCAATATTCTTAGGACACTGTCAGGCAGAGGTCTTCAACTCACCAGGAGACTTCATCGACGACCCCAGATCTGCCAGATTAATTTTTCATTTTTCATAAATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTTC:1 - chr2R 8263198 5' - Tc1-2 361 1 69.86 GCCATTTCGAATATCTTTTAATTGATATTCTCAGTTGGGATATAAATATAATTGGGGATAGTTATTACATTGCCTCAACAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr3L 19510614 5' + pogo 39 1 56.16 ACGGCAGCACCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3R 5767385 5' + roo 8743 2 72.60 ATAAATAAATTAATGGAAAACGCACTCAAACAAACACTTTGCATATGCCACAACCACTCCCACACTCGGACATTCTTTTATGTAAATTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 + chr2R 20117261 5' + mdg3 5287 2 62.33 GACGGCGAATCGTCGAATGAAAATGAATGAAACGGAATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTG:1 - chrX 1831305 5' + P-element 81 1 30.14 ATTAAAATTAAATTGACTGTGCGGTCAAAATCGGCATTCCATTTTCCGAATCAGGTCAATGCACAATCGCAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGCTCTAAAAACTACAAC:1 - chr3L 19434136 5' + Doc 57 1 51.03 CCATTTTGATTACCAAAACTAGCTTAAAAACCTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 + chr2L 3150985 5' - blood 7372 2 69.29 GAGCGAGAGTTTTAAAAATAATCGTGACCAGTCACAGTTTAGCTAACAGTGTCAACTCAGCAGCATATGTTGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGCATGCTTGCAATA:1 + chr2R 11691189 5' - P-element 2843 1 53.57 TAGCCCTATTTTCTTTGTAGAGAAGATGTTATTTGTTTTCAAACACAAAGAAACATTTTCCCTAACTGCAATTCAAATTTTCAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACA:1 - chr3L 22638886 5' + Juan 4129 1 55.48 GGGGAAAGGCTGCGCGGCCAGGATATGCAAGGAGTCGCGGAGAGGGGCTACAATGGCGCCAATATTGAATGGCAAACAGAAAGGAAAACCCCAGTCCCCATGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTC:1 + chr3L 3619055 5' - Quasimodo 462 2 69.18 AACGTTCTTTTGTTTTAAGCCAAATATATTTATTGAATTCCCTGTGTGTAGGGTTTAATCAAATATAGAATAAATAGGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 18539900 5' - roo 9028 1 54.11 CTGCCAGCGGCTGTACCACCGAGAGCGTGCTGGGGGGGAATCAGGGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 + chr2L 19681009 5' + hobo 10 1 44.44 ATTGTAGGGGGTTTGACTGAAGGATTCGTGTATAGTATTATTTTGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr3R 18514295 5' + pogo 30 1 64.38 ATTTACACACCAGCTATATAAGTATTTATATGTACTATAATTTTTTTGTTTTTTTTTTGGCCTGGGGCTTTAAGAAATTGTTGAGAAAAATTCCAACTGAAATAGATCGGAAGAG:1 - chrX 8783563 5' + Penelope 73 1 61.74 CAATGAACAATTCAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2L 20327627 5' - roo 8985 2 76.71 ACCCAATTTATTTGAGTGTGAAAATTGGCCTTCGCCCATTTTGAAATTCTAAGCTGTTGATGGCGTCGTTCAACCACACAGACACCGCCACACATGTATGTACACCAGAGAACAGCATGGTTGGCACTTTTTAACCCCTCGACTCA:1 + chr2R 21453495 5' + hobo 20 1 69.18 ACACACTCGCATATATGTATGCGTATGTGTTACCCATTTACCCACACACCCATGGGCCAGCCCATCTATATGCAACGTTTTTGTTGCTCGCCCATCGTTTGGACGTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 + chr3R 28937755 5' + jockey 4693 1 72.60 CGCTAAAGCTGTAAATATTGTTGCTGCCTGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 + chr3L 11296558 5' - P-element 2794 1 22.60 TTATTACGGCAATTCTGTCGATATGCTCGCCACCGAATGCCGCGTCTGGCGCGCTCTCATTTTCTTATGATCCGTGTGAGTGAGCTAGACATACATTCTAAAATCTGTATGCTGGATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTA:1 + chr3L 24756731 5' - INE-1 154 1 67.81 CTCGAGGCAAACCTAACCATTCATATCAATCTCGGCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 - chr2L 15601611 5' + Doc 88 1 78.47 CAATTTTCAAGGCTAATTTAACAAACGATTACCTTTTATTACCTATTACCTTTACCACTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr3R 19466676 5' + jockey 70 1 58.90 CACTCGCTTATGCACACTTAGGACTCGCATCCTTGGATGCTGACTTTGCACAGAGAAAAACTATGAAACATTTGCTGGCAGAATAACCTCCTTCAACTTGCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chr2R 21353137 5' + Transpac 18 2 75.34 AACAGGAAAGCAGCTAGGGTCGCTAGGGCTCTAGCGAGAATAAACTACTCCTTCTGTCTGTCTGCAGGGCGTCATTACTGTACTCAGCCGTGTACTCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCG:1 + chr3R 902498 5' + R1A1-element 2 1 63.01 TGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTAC:1 - chr3L 22635745 5' - hopper2 1517 1 76.71 TGGACACGAAAAAAGTTTTGTTCGCCAAGACGGGCTACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTT:2 - chr2L 2675037 5' + Quasimodo 79 2 75.34 ATGTTAATAACAATACAAATATTTCGATATAAAAAGCGAAAGTATTTTGCTTGAACTCGCTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCT:1 + chr2R 10189195 5' + Doc 1 1 81.51 ATTTCATTTACAGCTAGCAAGCTGAAAATTTGGTTTCAGAACAAAAATTAATACTTAATAATACTTAATTTAGAGTCCCAAAACTATGTTGCTATTTTTATTTTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGA:1 - chr2L 16567012 5' + F-element 483 1 64.38 CCAAACCTAAAACACACTGCTATACAGGACTTTCTTTTATTATTATTATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAGCTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTA:1 - chr3R 7645169 5' - I-element 5279 1 67.12 TTCAAATAATAAGGGGAAAAATGTATTTTGGCATAAAATGAAGTACTTACATATATTGTAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 + chr2L 615180 5' + F-element 27 1 70.55 TAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATAC:1 - chr3L 3540192 5' + mdg3 75 2 75.34 AGGTATTGTCTGTTTGTTTGGTCTTCGCCAGCGGAATGTGAGTTTGCTTAGGTAATTGTGTCCTGCTAAGGGATTCATATATGGTGATAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGA:1 + chr2L 15476845 5' - R1A1-element 244 1 54.79 CCTGCTTCGATTTCAATCTGATTGTATTATTGGAAATACCTACGAAAGTTATAATTATTAACGTTATTACATGACAGATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 + chr2L 8852749 5' - Burdock 6350 2 52.05 CAAGTGTGTGGTTAACATGAAGTTAAACAGTTTATTGGCTATCATTGATTTATATGAAAATAAGTTTTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGA:1 - chrX 17229536 5' + 1360 3266 1 61.64 AACATATTACCTCTCCATAATATGTAGATTTCGGACAAATTGTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1 + chr2L 22031932 5' + Tabor 34 2 62.33 CACTATCGCCGTGAGCACACACTAATCGCAGATATAGCGATCAATCGAGTGAGAAAAGTAACGAGAGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chrX 17933747 5' - roo 353 2 56.85 TTCATTCAAACAAACAAATAAATTGACCACATCCCCAGTTAGAAATAATTGCATTTTTGTAATGTTTAAAAATAATTAAATAAAAATGCAGAAATATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 107466 5' - roo 9044 1 66.44 CATAATCATTTCGTAACAGATCCCAAAAGTATACACTAATAAGTAAACAGAGAGAGGTAAACATTACTAAGTCAACTTTAACCAAACACTATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGC:1 - chr2L 1922620 5' + BS 5028 1 50.68 CGCCCGGTGAAGTATGCAACACTTTTTGGCCACCTCCTTTCGTTTCCTTGTGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 - chrX 9949580 5' + hobo 60 1 64.96 TATGATTTAACATATTACCTCTCCATAATATGTAGATTTCGGACAAATTGTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1 + chr2L 22031924 5' + Tabor 6865 2 67.81 ACTGCAGAATGTTTCAGCTCATTTTATTATCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:3 + chr3R 24301807 5' + Tabor 55 2 52.74 CAAACGCTTGGCCACACACACACGCGCACACATACGAATATGCGTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACCCTACGACCACCCGATAAACACTAGG:1 - chr2L 5656625 5' - hobo 2907 1 49.02 CCAACAAGCTGGAATTTCACAAATTTCATTTCAGGCCATTTCACAGCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCT:1 + chrX 17690417 5' + Doc 285 1 72.22 AAAAAGAGGCGAAGAAAACTTTTAGCCGAGAACAAGAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTAC:1 - chr3R 15019527 5' + I-element 5052 1 75.34 CATAAGTTCGTTTATTTATAAGCGTGAAATTAATTCAAAAGTATCTTGCAGATACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:2 + chr2L 19907504 5' + hobo 16 1 74.66 CGTATTTATGCATATTCAACAGAAATTTAATAAACTTTTAAAGGCTTGATCTTGGGTGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:2 - chr2R 21244976 5' - roo 9028 1 55.48 CATACTCAGTTTGTCATAACTCGATTAGATGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCATATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 - chr2R 15529764 5' + roo 91 2 78.77 AGGCCTTGTTTCAACAAACTCTCAACGGATTGAATGGGTCAAGATATTAAAACATCGGATAGGCAGAGAATCGCGACTCGAATCGCTAGTGTCCTGATAATATACAGCCTAATTTTCTTTTATCAGAACTCAATGAAAACTATTGT:1 - chrX 21585937 5' - mariner2 861 1 84.93 TCTATGGTTAATCAAGGGAGATCTAATCAGTTGGCTGATATTGACCAATCAAACGAATAAATGAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2L 11559702 5' + roo 8691 2 61.34 GTGAACAAAAATCGCGTCTGGCTTTGATTTACCGTTGTGCTGCGACGAATTTCACTTTCGACTCGCGAACGATTTGAATTTGGATTGATTTGGTTTTGTGGAGGGGGCTATGTAATTGTTTTAAAAAAATGTAACAGGTATAGATG:1 + chr2L 14233862 5' - Stalker4 397 1 76.71 TGCGATAGTATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGTACGTGTT:1 + chr3R 23565240 5' + jockey 22 1 64.15 CGCCAGTCGACACATGGTGAATATTCGAATTCAGATTCGGTCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr3R 17794546 5' - P-element 2841 1 37.72 ATCCGTGGGATGATGTGAGACTATGCCAAAAGGGAGCAAATCCCAGCACAGTTTTTCCGCGTTGTCCCTACGTCATCGTCCTGTGTAGCCAACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGG:1 + chr3L 21043814 5' - Quasimodo 6958 2 63.70 GCAAAAATATTTCGCTCAATTACTTAAATGGAGATGACACCTGGTTCTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1 + chr2R 11394102 5' + pogo 71 1 66.44 AGTCAAATTACGTGCATATATATAGACCTCCTTCGACCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAATTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCAC:1 + chr3R 6171137 5' - 297 6894 2 78.08 ACTCTGCCATCAAATTAAAATAACAAACCAGCAGATTTGCAAGTGGAGACAGAGTTTGCAGCAGTTGCACACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGA:1 - chr2L 7905995 5' - Quasimodo 7322 2 52.74 TAATTTACCATTTTTATGAGTTAGGGTGTATGGATGATCCCGGTGCCTTATCAGCGATTGATGTACACATATACGGTCATCACACACAGTAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTC:1 - chr3R 22133278 5' + accord2 7282 1 63.70 TTGTAAGAGCAGAGCTTTTATATGAAAGGTTTACAATATTCAAAATACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr3R 14609191 5' + roo 73 2 69.18 CCTCGACACTTTTGACTGGGATTGCTATAGAGGTCTNCGNNNGAGCCTGAAACCAGCTTTTTAGCCAGCACGAAGAAATCGTGTGCAAAATATCGAAGGGCGTTACCCATCTTGTTATTC:1 + chr3L 23250431 5' - 1360 12 1 68.33 TATCTAAACTACCGTGTCCCTATAGGCTTATAGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCCCCAGGCTCT:1 - chr2L 5724368 5' + 1360 70 1 73.28 TTTTGTGCACAAAAGTAAACGAGCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGC:1 + chr2L 1892309 5' + hobo 151 1 49.32 GGCAGTTGGATGGGTTGAAAGGATTCGAGCGTCGAATCCCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGGGTGAAGACGTTTTT:1 - 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chrX 2821964 5' + roo 59 2 60.96 AATACTCCTTCAATATTCTTAAATTAAATGTCAAAAATTTCCCAAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTC:1 + chr3R 19144363 5' + Juan 30 1 57.53 TCTTCTAGAGTAGCGTTTATTGTTATAGATGGGCTTTGTTAGAATGTTTCCAATATCTGTTCAGCACATACAGCCGAGGGCAAGTAAGTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGT:1 + chr2L 3393716 5' + Stalker2 32 2 62.33 AACACTCTTCAAAAATATGGTTTGTTATTTGGCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3L 21108518 5' - roo 318 2 79.45 AGAATAAATTACTGGATTGAAATGTTCGTATAAGAATATAAAGATTAATTAGGTTGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTA:1 + chr2R 10913123 5' - F-element 4370 1 62.33 ATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATACACATGAACTGTATGTATGTATAAATTATCATTTTAGTAAATTTTCTATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATG:1 - chrX 21534506 5' - Burdock 193 2 69.34 ATCGAGGGACGGGCGGAAAAAAGGTCCAGAAAGTGGCAACAGAAGCAGCATCAGCGAATAAAAACTTTTGGCTGTTTTTATAAATGTTTATTTAGCAGAAAGGAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 + chr3L 10111718 5' + copia 4888 2 74.66 ATTACAAAAACTAACACAACAAATGTCTAGAAACTAAATGACAAAACCAACAGTGCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCACGCGTGTGTAAATTAGCTAAGTTCCAATAGGTC:1 - 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chr3R 8625255 5' + jockey 92 1 76.71 ACTGAGCCTAGTAACCTGAAAAATGCAGTGCACTTTCCAAACAAACATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTT:1 - chr2R 13773109 5' - opus 432 2 68.49 GGTCATTACAGTGTTGTTTTTGCTGCTGCTGCGCTTTTTTTTATTACACCAACAGTATTACGACATGCAGTTTATGTTGTTGTAGTTCGGCTGCATTTGAATCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 - chr3R 7109276 5' + P-element 17 1 74.66 CTTATTTTATAACTTCTAACTGCCTGGAGTTTTATTGTCTGCGTAAATGCTATATAGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAA:1 - chr2R 3091719 5' + F-element 244 1 75.20 GCGTAAATCAAGCAAATGTTTCTCGGAAAGTCCAAGTCACCGATCATCCATTGGTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chr2R 12642737 5' + pogo 62 1 62.33 CATACTAATATCGGTGTAACTAAGTGTTTGACAAAGTGATTACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 - chr3R 24760643 5' + pogo 53 1 61.64 GGAAAACGCACTCAAACAAACACTTTGCATATGCCACAACCACTCCCACACTCGGACATTCTTTTATGTAAATTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 + chr2R 20117275 5' + mdg3 5301 2 52.74 GCGGCAGCTGTACCAGCTGTTTTCCGCACTAACACACGCACACTGCCCTCTCGATAAACCGCAACACGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCC:1 - 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G2 2892 1 58.90 ACAAAGGTATTTATTTATATTTTTTTTGGGACTAATTCTGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chrX 10838527 5' + roo 8745 2 77.40 ACCAAATTAAATAGCTACGCTTCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 - chr2L 15057258 5' + hobo 66 1 63.70 CAGGTAAAAACACTGTTTAATGTCCTGCCCTACAAGGTGGGTGCAGAAATAGCGGACTGTACTGTTGTGCGATTGAGTTGCTCTGACTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAA:1 + chr3R 7419707 5' - I-element 57 1 59.59 CGCAGCGCCTTCCTTTTCATTTGGTCCCTTAGTCAATTGGCGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTC:1 - chr2L 19841562 5' + BS 76 1 70.55 TCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTAAGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGCATTAGCATTACCGGGGACCACCACGAGGAGGTTTTGAGTCGACTTGAGTAAAGGAGAGACTT:1 + chr3L 12344013 5' - R2-element 104 1 55.48 GCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - 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chr3L 23979152 5' + Tom1 31 1 65.00 TCGATTGTAATCTGCATGACTGCCTCGCTCCTTGGGCGTGCGAAAAAAAATGGAAGAAACGAGCACGAGAGAGTGAGAGCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr2R 17348511 5' + hobo 41 1 56.16 CAAAAATGATGATGATTATGGAACCATTACTGGAACACTAAAGGGCTTGCATCTAGCAGGATGAATGGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:2 - chrX 6053028 5' + roo 53 2 54.79 TGGTTTCAGACTAATTATTTAATTTGATTTGAACACAATTTTGAGACTGTTTCAACCAAGTAGAAACTACGTTAACAAATATAAAAAACGCATACAACGTTTTGTGCTTATAAAAATGAACTTAAATCAATTAAACACTAAATAAA:1 + chr2L 9158774 5' - McClintock 349 2 46.58 TGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAG:1 - chr3L 3540214 5' + mdg3 53 2 60.27 TTCAGGGTATCCTTCAAGTGAATTGGCTGTTGCCTGCATAAATGCAGACTTGTGTTTTGGGCGGTTTTTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr2L 16536499 5' + pogo 50 1 55.48 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACACCGTGCACATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGGCTTCACAGCC:1 - chr2R 3262649 5' + baggins 5146 1 67.81 AAACTTGTCGGACAAGTGAAAGACATAACTGCGAAAAATATATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 8375165 5' - roo 391 2 73.29 TGTGAATAATTTGTTAGTTTAATCATAAGATTACACGTTCAAACAGAAAACTTGCTAAAAAAATTGACAGTTTTACCAAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 - chrX 8358792 5' + Doc 14 1 71.93 GAACGACATAATGTGGGTTGGGCCACGAGTTCAAAAAGATATTTTTGACATTATTATTAAATGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3R 19445298 5' + roo 59 2 60.96 TTGCGGCAGACAAATTTATGAGCGTTAAGTGAAGGCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTG:1 + chr3L 16197043 5' + Doc 91 1 74.31 TCCGTGAAGCCGGGAAGGATTCTCCTCAGAATTTCAGCCATATGTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTT:1 + chr3R 14688492 5' + FB 77 1 69.86 AATTTCGAAACTTTGGTAAAACACTTTTTGGCCCTGTGCGAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2L 5656522 5' + hobo 41 1 57.53 GAAGAAATCAAACTGGATATGTCATCACATTGATAGGGAATAAATGGATCAACTCTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - 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transib4 2479 1 71.23 AATCACAAATTGAATAAGTGTGTTCTTGTTATTTCATGAAAATGCATTCAAATGTGCTGTGAGCAACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chrX 10429883 5' - roo 9019 2 54.79 AGCTGGCAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTTCTTTAAGTATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTA:1 - chr2L 22224608 5' - Rt1c 5402 1 54.79 ATGAAGCTAAACTAAGCAGGGAAACACAATGGTTGGAATTTACTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 - chrX 12995452 5' + blood 17 2 73.97 GGTTTGGGCAATGATAAGCATTTCACGGAATTTATCGCTGGGCATGGGCACGCAAGGAGCAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAA:1 - chr3L 10068996 5' - 412 7489 2 54.79 CAATTCAGTTGAATTCTTTTTGCACACCACGCACTACAAAAAAAAAAACCCACTCAATTAATTCAAGAAAAATAATGCATATAGTGACCTATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTA:1 + chrY 1076858 5' + 17.6 43 1 55.48 AAAGCCGAACCAGCGGACAATGGAAACTCACCTGCAGCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3R 15363507 5' + 412 51 2 52.74 AATTTGTATATAATTTCGATCTGCATATCGTCTGTTTGTTCGTCCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 - chr3R 4352171 5' + Doc 29 1 71.92 AGACAGATACATAGCCGTATAACTACGAGTCAAAAGATACATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGG:1 + chr2L 2336225 5' - 297 6908 2 70.55 GAATATCTACATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGG:1 + chr3L 21765409 5' + gypsy 7042 2 53.42 ATATGTAGCTCACCTGCAGATAAAAGCAGGGAATAACTCAATTTTAATGTCATATCCCCTTTCAGTAAAAATTGAGGTCAACGGACCAAAATAATAAAAGAAAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chr3R 7645058 5' + I-element 20 1 72.60 GTGTGCATAAATAATTAGAAACTATCCGAACAACTCTGCCATCAAATTAAAATAACAAACCAGCAGATTTGCAAGTGGAGACAGAGTTTGCAGCAGTTGCACACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAA:1 - chr2L 7906027 5' - Quasimodo 7354 2 73.97 ACCGCAAGAAAGACCCCTAATAGACGTGGAAGGTATAAAAAGCATGCCGAAAATTGTCAAAGGGTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTT:1 - 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chr2R 5485176 5' - 1360 3368 1 66.67 ATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGAGCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTG:1 - chr2R 3262649 5' - R1A1-element 5099 1 70.55 AACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 - chr3L 20910095 5' + F-element 48 1 54.24 AAAAAAAAACTGAAATCGAACAACTGAATCTAATGTGCATGTTAAATAATAAAAATTGATCATTTACATACATCATATTAAGTCAAATGACTTAAGGTGTAGGAGTGGCAGTAGTCAGTTCGACTCGGCTAGTGATCTTGATCA:1 + chr2L 14733651 5' - INE-1 91 1 65.97 TCTGCATATCGTCTGTTTGTTCGTCCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr3R 4352152 5' + Doc 48 1 58.90 TATAAGGTGATTGTATGATGAGATGGCTCTGCAGATATAAGCAAATGTCTAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTAT:1 + chr2L 5723864 5' + flea 4822 1 67.81 CTTCAGCCAGCATATTAATGTTTTCAAGTACCTCATAAGCTATGGTATTATAACCAGAGTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGGGGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - chr3R 13198313 5' + Doc 36 1 64.38 CACATTCATCCTTCGCCTACCATGTCCTGTTGACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAACAACGTAATTGTGATC:1 + chrX 16995022 5' + jockey 62 1 52.41 CGATAAGGTCATTGGAATGTGGAGCGCGCCCATTGATGATAGCGCAGGTAACACTTTTTACACCGTCAAATCTTGCTCGTTTTAATTCCCAAAATAAGGGGAACAAGATTATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCT:1 + chr3R 5215699 5' - jockey 4736 1 71.23 CCTCACAAGTTTTGCCGAACTTCTTTAATGCCAAGATTGATTCCGTCTGAAGCTGAGGCTCTGTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGG:1 - chr3R 8965243 5' + HMS-Beagle 56 2 57.53 ATTGCAATCTTGAGAATTTAATCAAAAAGAAGGAAAAAATGCGAAGGTAACATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTAC:1 - chr3L 18421413 5' + hobo 71 1 65.75 TGGTAAAAGCAAAAAATTTAAAAACTTACATTTATTCTTAAATATTGTATTGTATCGCTTAATTGTTTTTTTTTTATAAATT:1 - chr2L 9231491 5' - looper1 1692 1 85.37 ATTTTATAACTATTAAGTGCTCAAGTTTGTATATATGGCATAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCC:1 + chrX 13558196 5' - mdg3 168 2 70.55 TGTGAATGTGTGTGTGAAGAACCCACCGAGCACCGACGTAGCATACAGTTTTATGCTGGTTGCAGCTTGCAGCTGCCAGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGC:1 + chrX 18193437 5' - jockey 4947 1 46.58 AGATACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGCGTGCGGGCGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr2L 19907553 5' + hobo 65 1 59.59 AATTGCTTCCCATCATCAGCGGCGGAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chrX 19744523 5' + P-element 45 1 54.79 ATATCTTTATGAAATCAATCAGAGAAAAGTTATTAGTTTGTTTTTAATAACATTTAGAGGTGTTTAAAAGTACGTAGTACAAAAATGACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCG:1 + chr2L 17296936 5' - Max-element 274 2 67.15 AATGGTGTTGAGAACTGTGGTATTTATTTGCAAGTCGCTTGGTATTTTCCAGCGCTTTCGGCGCGGTCCCACTGGACGCGAGTGTGTTTGCGAGTGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTT:1 + chr3L 13450666 5' + P-element 23 1 69.86 AAAGTGCTGCCGTTGCTGATAATAAGCCGTCATCCAGGCAAAACTCCTGATGAGCAGCAACTGCGGCCAAACTAAAGCGGCACCGAAAAAAAACAACACAAGAATATACATCACTATATCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCT:1 - chr2R 10936803 5' + copia 4871 2 80.00 CACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACA:1 + chr2L 16360585 5' - hobo 2860 1 73.29 GGTCATTTATTTAACTGAATGTACAGTGTTCTGCCATTATTGTCATGATCATTATAATTTTCATCAACGTAATCATCGTTAGCTTGGCTATTCATTGTCCCTTGTTGTTTGCCTTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTAACATTCTTTT:1 + chr2L 7946152 5' - HB 381 1 78.77 GTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTT:1 + chr3R 19589896 5' + BS 5039 1 52.05 AAAAAGTTGTGATAGGGTAGGAAAAGAAAAGGACTCTTATTCTCTATATATTGTTATAACCACCAACTTAAATACATAGTTAATTGATGGTCAAACTCTGTCGTTTTTTGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATT:1 + chr2R 8280719 5' - jockey 4932 1 74.66 TCTAATCGCGGCAGGGCTGATCCGAGGGCGACCAGGGGCACATGCCGCCGACGCCGTCGTAGGTTAGTCCCTTGGGACAGGTGTATCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAG:1 - chrX 10050395 5' + Transpac 223 2 56.85 GTCTGGTTAGTATGCTTACGCACATATTATGACTTATTAAAGTATTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATA:1 - 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chr3R 4352173 5' + Doc 26 1 73.79 CGTCAGTCTGTCCGTCCGTATGAACGTCGTGATCTCAGGAACTGTACAGGCTAGAAGGGTGACATTAAGAACACAGGTTACAGGGCCATAAAGGCAGCGCAATTTTGTTAGTGTGAGTGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTG:1 + chr3L 7627892 5' - INE-1 514 1 67.12 TTGTTGAAAATGCTACAGGTGTGAAAACCATAAAATTCTCATTATTTATAATAAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1 + chr3L 12729082 5' - opus 434 2 65.75 CATTTTTCGCATCGAGCACAAAAACAAGTCACAAACTTTTCGCCTAGACGGTGCTTTTTTTCCACTTTTGCACATACATACATACGTATACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 + chrX 13484089 5' - hobo 2904 1 61.64 ATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCA:1 + chr3R 15035080 5' + Stalker2 7338 2 77.40 ACATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTAC:1 + chr3R 23020795 5' - INE-1 551 1 60.96 ACTCAAGGCTCAAATGGGAATGCAAGACACAGCGGACTAATTTTATTCCAAACGAAATTTTAAATATACATATATGCAATTGATCAAATTCGTAATAAAAATATGAAACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAG:1 - chr3L 17645572 5' + R1A1-element 5080 1 73.29 AAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGGGCGTCTCCTTGGCAAAACGACGAAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGCCGTTTT:1 + chr2L 20985782 5' + F-element 21 1 52.50 CCCAACGTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCCAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1 - chr3L 23871313 5' + Doc 81 1 69.29 GTATGACTTGGACTTTTGAGGGGACGTCAATCGCTTCTACTTCGGTGGCTAGTCTGTCTATGAAGTAATAGACGCAGCGAGCTCCCGGAATTGCTGTGAATGTTGGCGGGCTTTCTGGTTTGTGTCAGGTTTATCTTCATGTTCA:1 + chr2R 4624574 5' - Bica 142 1 86.21 TGGCGAACGGTATGGTTTGACAACTTCTGTTTATCGCGGTCAGATACATATGTACATAAACTTTAGTCTCTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAATGGTATACCATGATTCGTAAGTATATATGTTCTTGATCAGGATCAATAGT:1 + chr3R 32037275 5' + INE-1 86 1 65.07 TCCTTTGGGAGATTCAAATCAGAAGAATTTTGCTGAATTTTCCGACAAATTGAACTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2L 12766939 5' + hobo 28 1 65.07 CAGGACGACTCATCTCCACCATGTCCTCCACATCCAGCAGTGGTGCAATGCCAGCCTTCTCACTGCAAAGTGTTTAGCAATATTAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACC:1 - chrX 6588344 5' + hobo 2645 1 63.01 ACATACATATTACGAAACGCATTCCTATTATGTCAACGAGTAACGCCGAGTAAGAGCAATGGTGAACTATCCCAATGATAACATGGATCTGCATTAAGATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATAC:1 + chr3R 7364159 5' + Quasimodo 15 2 76.03 ATATAGGTTGTATATAAGCCCAGTGGAGGGATTTTTGGTGCGCCTGCACTTACCAAAAAACAACGCAAAATCGAAACCGAAATCGAAACCGAAATTGAAATTGAAAATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATT:1 - chrX 20444836 5' + Transpac 15 2 79.85 ATGTACATGCAAAAGGGAGCTGTGCCCCTACTTCTCTCCCTCTATATTTGTTGAAATAATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCC:1 + chr3L 13567968 5' + copia 4933 2 65.07 ATTATTTTGCTGACGACAGCAGGTTGGGTGGCAGATGAAGGAGGGGGATGCGGCAGCGAGAGCCGAGAACCCGGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAAC:1 + chr3L 15511922 5' + opus 7499 2 47.42 CACAGGCTGTGCGTTAATTTCAGACCCCCTTATGTAACCCCTTTTTTCGGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACA:1 - chr3R 902634 5' - R1A1-element 5306 1 61.07 AGAGGAGGAACACAAAACGTGCGTGCTGCGTGGGCGACGCTCTTTTTCAGTGTGAGAAATCGGGCGGGAGAGAGAGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chrX 19506046 5' + P-element 45 1 55.48 CAGAAAGAAGTCGGGCATGTCTAAAAATACATTTCGAACATGCTTGTTAAATTGAGAATTTATTTCCAAAGAAATTATTCAATATTCGGTATTATATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr3R 23714162 5' + I-element 25 1 67.12 TTTGCTTAATTAAATATTTACGAAACACCCTTATGTATATGAATAATAATAAAAAGATTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 - chr2R 2052668 5' - opus 440 2 58.22 AGTACCGATAAAGATTACAACATTTAGGTTTTCATTTTCATTACACATGATTCCCAGGGACTTTCACAAATGATTTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGCATTATT:1 - chr3R 11470592 5' - F-element 4590 1 52.41 AATTAATGCTGATTAATATTACTGTTATGCAGTAGAGGTATAGGCATGCATTTTTGTGAAATACCATGAATAATCATCAGGTTTAAAATGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 + chrX 2781182 5' + FB 24 1 66.91 GTCACGTTCGCTCACTTCAAATCCCATCAATGGAATACGGCAGAGATCGCAGTCATGTGCTTTTCGTTTGAAATGCTTTCGAGGGTCGCTCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr2L 1892398 5' + hobo 33 1 63.01 ATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chr2R 15892207 5' + hobo 80 1 73.97 GGCCATTGCAATTCCTAACCAGTTAGCCCAGAATTTGGAAGCCAGAACATATTTATTTTTAAGGTTGTCTGCCACTTTCACAAGGGATACATTTTATTTCCAAAGGCGTTCCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr2L 5732878 5' - hobo 2930 1 72.60 GGTAGGCATTTAGCAAAGTGTCAGTTGCGAACAAGGTTAGGCTTTGGGTATTAGAGGCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 + chr2R 11818198 5' + P-element 64 1 42.47 GCATGCTGAACAACTAAAGTACCTTTAAAATCCCATTACCCTATTTGTGTACACAAACATATGAGTGCGGAATAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAAT:1 + chr2L 2722335 5' - flea 209 2 56.16 GTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr3L 13380460 5' + hobo 63 1 71.54 AATTTCGATCTGCATATCGTCTGTTTGTTCGTCCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:2 - chr3R 4352160 5' + Doc 40 1 64.38 ATACGCTCTCATATCCTACCAGCTCAAGTGTCCTTCTCCAACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAG:1 - chr3R 25929422 5' - 297 319 2 72.60 ATAACAAGATGAGAATCTAGATTTTAACAAAATTAAATTGGCCTGAAGGTGAACGAAATTTGAACGTTTTTTTTTT:1 - chr3R 16739572 5' + Tc1 1464 1 84.21 TTCGAGCGTCGAATCCCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 - chr3R 11550297 5' + F-element 66 1 56.85 GCCTCATTAAATATTTCTACGCCATTTTTCCTTGTTATTTTTGCACTTGTACCAAGGAGAAACATCAAAAAACGCGTGAAAAGTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chr3L 18435403 5' + I-element 39 1 57.53 CCTTAAACATAAAAGTTAACGACTACAAGCCACCTTGCCTATAAATTACAATACGAAATATACGAAATATGAAATTCTACTTGCGCAAATAGGAACATGAGCAGTGTGATGCTCGAATTCCGGCTGCCAAATAGCTTTTTGCAATT:1 - chr3R 15471953 5' - diver 292 1 64.38 GGAGAGTTGCGTAAGAGGCCAGAGTTAAAATTAAAGATTTATAATTAACTTTACTGCATTTTACTCAATTCTGCAAAATGCATACCATGTTTCATTGCAAAGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2L 15597062 5' + roo 17 2 70.55 TTGGTATTGGTGCTTCGCGCTGCCGTATGCTTGAGCATTCACATTCATTCAACGCTCAACGGTTGGGTCGCATTGGAGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGTGGGCGGAGCCTTTTGTGAAGATATG:1 - chrX 3743880 5' - Tirant 8484 2 65.87 TTTTACGCAAACAATCCCAATGAAAAGATTACTGTAATGATGGCGTTGAATTTAAAAATAACACAATATGCATAATGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 - chr3R 14174812 5' - 297 6936 2 58.90 ATGCGGTCGTCGGAATGATGCTACGCATAAATGAAATAAATTCAAAAGCATAACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGA:1 + chr3R 13231772 5' + F-element 108 1 64.38 ACAACCGCAGTAATGCAACTGCAACTGAAACAACTTTTACTCACAATGAAATCCACATAAGTTTCACAACCAGAGGTATGCATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chr2R 8492700 5' - pogo 2071 1 63.70 AGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGATCAAC:1 - chr3L 15374690 5' - 3S18 250 2 79.31 ACTACTTAAGTAGTAAACAACTATACAGATATAAAACATATTAGAATTTACGTTTTACATTTTTGCATCACATCACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr2L 20262585 5' - roo 9028 1 57.24 GGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCA:1 + chr3L 10068920 5' + 412 7143 2 78.08 ATCTGCGTGCACTGGTGCATAAGTAAATAAAATGATTGAGTGCTCACAGCTCAGTCTGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr2L 5732731 5' + hobo 63 1 60.00 CGCCCTGGTATGTTGACATCGCAAATGACCGCACAGTTCGAGCAAAGACACTAGAATAAAAAGATGGTTAACAGCCATACATTGGTTTGGCACACTATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 - chr2R 5637657 5' + 1360 82 1 63.70 AGATACCATCTGCAGACAGGCGACAACAAAAGCTGCAGAGCAAGAAAAAATATGTATATATATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr2R 17317670 5' + hobo 28 1 57.02 AGACGAAAAGGGTATACTAGATCCGTTGAAGAGTATGTAACAGGCAGATATAGTTTATAGTATATAGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTTTAAATCACATCAATAGCCGAGTAGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATG:1 + chr3R 4578706 5' + INE-1 120 1 66.44 CAATGGGCTTGGTATTTCAGTTAAATAGGCGCTAAGTGTGCATTGAATGGGAAAAAAACTGATTCTCTAACATTTATTTTCTAAATGATATATAGATACAAGTACGTTTCACTTACTTTACTTATTTTCTATGATGTATGGTGATG:1 - chrX 14347185 5' + Transib5 2773 1 76.03 TATGGGATCCAGAGGGGCGTCTCGCATTTTTGTTGCATGCTTACAATCAGATCTGTCAGATCAGTTTCCTCTTCTCGCGGCAGAGGATTGCCTGTTTCGGTTGCCTTTTTGGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr2R 18265954 5' + roo 8673 2 79.45 CGAATTTTTGCCGATGTAGTTCGCGAAAAATGCGTTGATCGCACGCACGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACAAA:1 + chrX 22652715 5' + ZAM 8038 2 70.55 ACAGGGAATGAGTGCGTGTAAGAGGTTACATCTCGTAAAGTGTATTTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGGGGGGG:1 - chr2L 13763559 5' + Bari1 59 1 62.99 GCACATGGCGTTGGAAGTGCGGGTGTGTGTATGTATGTAAATAGTATGTACAGTACGTACGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 - chr3R 17079506 5' - 1360 3327 1 63.70 GAGAAATGCTCTATGGCAAAAAAATAAAGTTTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTCTTTTTGACACCCTAC:1 - chr2L 12814785 5' - hobo 2873 1 73.98 TTCAAATCGAAGTAATATCTTTGATAGGTATATTTTGTTGGTTAATTCTCTGTGTAATTCATTTACTTTAATACCACATTTGTGGTATAAATTTTTTACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr2R 5401633 5' + 1360 5 2 63.01 TGTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 + chr3L 1983436 5' - Transpac 5179 2 52.05 CCTCTCCATAATATGTAGATTTCGGACAAATTGTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 + chr2L 22031941 5' + Tabor 6882 2 56.16 TCACAGTTTTTCTAGGTTTTCTGCTCAAGCCAGACTCATTGCAGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCT:2 + chr3R 27443167 5' - 3S18 261 2 73.97 GCTTTGTTGCCTCGCCAAGGCGTTGCGGTTATTGGAGATGTGTATTGTGGATTCAGTAAACTCGACTTTGATTTCGCTATCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr3L 1728602 5' - blood 335 2 45.89 ATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCC:1 - chr2L 23295901 5' + micropia 5080 4 56.85 GCTCGCTCTGCAGCTCCTCGGCAGGTGTACCTGTCCGTGTGTGCGTGCGAGAGAGCGGGGCTGCGCTTGTAGTGTGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr2L 15057150 5' - hobo 2921 1 66.95 CGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGA:1 + chr3L 25232764 5' - accord2 131 2 64.38 TGCGTGAGCACACACAACTTGGCTACCAAGCTCAATACTTCAACCCCACGATCCCCATCTCCTCGGAGGGTTTTTCTGTACGTATAGATATACCTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr2L 21006935 5' + opus 7022 2 72.60 ATATGCAATAGTTTAGTTTTGTCCACTTATAGAAACATAAATTCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chr2R 11609967 5' + roo 77 2 71.92 ATTACACATTGGCAGGGCGAAAATGAAAGGGAGGCGGTGACAGAGACAGTCCATGACAGAGACAGAGACAGAGACAGCAGCAGAGAAAGAGACAGAGAGAGGGATTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTATTCTATT:1 + chrX 18035828 5' - 1360 331 1 71.23 ACTCTTGTGATGAAATTTCGAAACTTTGGTAAAACACTTTTTGGCCCTGTGCGAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2L 5656509 5' + hobo 28 1 66.44 AGAATGTTGCTCACCGAGCAAGTGGCCAGCGGAAAAAAAAACAAGCAATGCAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTCTA:1 - chrX 3637858 5' + roo 70 2 67.12 GATGGGTTGAAAGGATTCGAGCGTCGAATCCCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCA:1 - chr3R 11550312 5' + F-element 35 1 63.08 TATCGAACCATTCTATCCCATTTAAATCAATTGTGTAACGATTTTGTTAAATATTTTATTTTGTTGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTA:1 - chr2R 22040990 5' - jockey 4934 1 60.27 CCTATTTCAGAAATTAAGCTGTTTGCTTGGCTCAATGAAAGTCCAGTTTGTTTTGATAGCTCCGAATTTTTTGCTTTAGTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 + chr2L 17387404 5' - mdg1 7417 2 56.16 CTGCAGAGATTTACAAATTACGCCCGAGGCGGCGAATGGCGAAAATGGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr2R 18467137 5' + roo 8737 2 66.44 ACTCACCATTTTCGAGTCGCATGCAGTGGGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 27332092 5' - roo 8989 2 80.15 GTGTTCTTTTTTTTATAAAACTTTCGGTCCGAATTCGTCAATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTT:1 + chr2R 4448000 5' - invader1 3957 2 66.67 ATGATTTTAATGGTCGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 - chr2L 19907634 5' - hobo 2886 1 63.20 TATTTTCATATTTTGATATTATTCTATTCTATAACCACCCTTCCTTGGTAGCTGGTGTACATATTCTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr2R 3120393 5' - 1360 3364 1 80.51 AGAATAAAGACAATTGAAAGTCAAATTCAAGTGTATTTGCTAACGCAGACTTGCTGCGCCTATGTTTATTCGGGTAGGTATGCATGTATTCACAAAACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3R 24760492 5' - 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chr3L 15099685 5' + G4 3811 1 55.48 AATTATTATTCAATATTTACAGAGAGATATGAACCGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCC:1 - chr2L 12767042 5' - hobo 2876 1 70.83 GTTTTGACATTTCTTGACGTTAGAGTATGCGTAGCCCAAATATTTAAAAAAAATACCTTTTTTTTTATAAGTTGCCAGTTCACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr2R 9868550 5' + roo 8702 2 56.16 TTGGGTACATTGAGATGTGCTTATTAGAGAACACACATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAA:1 + chrX 19766743 5' + copia 85 2 76.71 CGAAATAATTAAAGACGCCCAGAAGTATGCCACAGTCTTTCGGATGATGTTAGTGTTGCGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr2R 11379779 5' + hobo 63 1 61.64 ATTCATTAAACGAGTTTTGGGAAGTTGTAGTATAGTGTCCCTAGAATTTTTACGACAAATATAATTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTATCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGA:1 + chr3L 9241083 5' + micropia 191 2 54.79 TTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGAAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCATTGCTATCTCGCTC:1 + chr3R 15157596 5' + invader3 5273 2 64.38 AAAAGAGTGAAATGAGAAACAGAGGCATCTAAAATATATAATATACTCTCTAGCTCATGGCAATGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATCTCTTTTCGTTACAGACAACAATTAATAAGATTAAGAAATTGAGCGTGCTTGCAA:1 - chr3R 13111376 5' - gypsy12 10066 2 67.81 AGCACATACAATTTTATGCAACCCAAGTGGGTGGCTGCCAGAGGTTCAACATTTGCCCACCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCTCTCGGCTCTC:1 + chr2R 13773006 5' + opus 147 4 56.00 AGTTGAAAGTCAACGGTTACTACCCATAGATTTCCTATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGAC:1 - chr2R 7343325 5' - flea 4934 1 76.03 AAACTGGTGCGATTGCAACACCTTCGATTTACTGTCGTATTCCTTCATCAACTCCGGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCAC:1 + chr2L 19343929 5' + FB 67 1 63.01 AAGAGAAAGCGCAGACATGCAAAGAAATGTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATGA:1 - chrX 10169000 5' + accord 185 2 75.00 GATGGCAGAATGTTGCTCACCGAGCAAGTGGCCAGCGGAAAAAAAAACAAGCAATGCAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chrX 3637864 5' + roo 8728 2 64.38 ATATTTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr3R 11873331 5' + 412 7105 2 53.42 CATAGCAGCATCTGAAATAATCAATTTCATTTTATAAATACAGCGGTCAAGTAGTAAAATTTTTAATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACT:1 + chr2L 12447370 5' + opus 129 2 71.92 GGTTTGGGCAATGATAAGCATTTCACGGAATTTATCGCTGGGCATGGGCACGCAAGGAGCAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 - chr3L 10068996 5' - 412 7490 2 54.48 ACTAAAGGGCTTGCATCTAGCAGGATGAATGGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chrX 6052992 5' + roo 89 2 79.45 TAATAGATGAAATGATTTTGCTTAATTAAATATTTACGAAACACCCTTATGTATATGAATAATAATAAAAAGATTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 - chr2R 2052684 5' - opus 460 2 58.45 TCGGTGTAAGACTTTTGGCGCTCTCTTCTCGCCGCTCTCTTTTCGCAGCGACGTCGACGTCGTTCGTTTGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAACGACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chrX 1831218 5' - P-element 2842 1 52.52 AATAGAAGATAAGTAAAAAACCTATTCGAGTTTTGTGGCTAATTTATACCCTTTACTTGTAGTGTAGAAAAGACACTTTTGATTAGTCTTGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGA:1 - chr2R 7024515 5' + diver 31 2 65.07 TGTTGCTCTTACATATCTGCATTAGCGCCATTTTAAATGCGATAGCGATTAGCCGATAGCACTTATCGGTCACACACGCTAGCCAAACAGTACAGTCACCACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chrX 11236528 5' - copia 233 1 68.49 CCAAGGGGCGTATGCGCAATTTGCATATGACAAGCTACAAAACGACTTGAACTGATGACGATGCCGCAGTTAAACGAATGTGTCCCGCCTCTTAATTGGCTAAATACATTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chr3R 28198835 5' + pogo 11 1 75.34 AATACAGCGGTCAAGTAGTAAAATTTTTAATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGTTCTCG:1 + chr2L 12447406 5' + opus 7151 4 55.04 CATAATTTGCCAACATTTATTCATTTATATATGTATTCATGGTCTAATAATAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAC:1 + chr3L 16523147 5' + jockey 27 1 71.92 AAGAACAATGGAAAAGCTTTGCCCAAAACATAAATATCTGACCACCCACCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAA:1 + chr3R 19985392 5' - hobo 225 1 66.44 GAATTCGGAATGTCTGGATTTCCACGCTCTCAATGAGAAATCGGCGCCCACATCTGCATAAGGCACTGAAAACATAGGAATCAACATTTAAAAATGTTCAGAATAATCACAAAAACCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATGCA:1 + chr2R 24944790 5' + Porto1 4375 1 60.27 ACGAAGGAAAGGGGGGCAGAGATGGAGGAAGTACGGAGGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTC:1 + chr3L 3785015 5' + opus 384 2 73.97 GTACATTCTGCTTATTCTGTAGCATCAGAATGAAAACGGTCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTACTGGCTCCAACAGAAGCCCCG:1 + chrX 12131185 5' + F-element 392 1 71.33 ATGAACAATATATCAATCAGTTTCTAGATCTAATTTGCCACACAACAGACTATTTCAGATTGTATGGCATTATAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1 + chrX 18318139 5' - copia 207 2 53.42 CCAGTATCAAGTTACCCCAGACAGTTTTATGCACAAAGCAAGAAAATAAAGAGAAATATATCTATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACG:1 + chr3R 8884297 5' + HMS-Beagle 6851 2 56.85 AACATAAGTGAAACACAAACTAAAGTGAACTTAATTAACAAAGTTTTCAAATCCGTATATCAATTAAGAGTGTATATCTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGT:1 - chr3R 26693462 5' - Stalker2 7608 2 53.42 AAAAAAAAGGAAAATTCATTTTTGATTAAATGCTGGCTATGGCTTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 - chr2R 16503472 5' + jockey 82 1 67.81 GCCAAATGATTGCAAATGAATGGGTGAGAGGTTCGGGAAACGACACCCACGAGGAAGCAGGGAAGCAAGGAGGCGAGGAAAGAGACGACGCGATGCGAGACAAATGTCATAAATATAAAATCAAATGCAAATTGGAA:1 + chr3R 11715653 5' - 297 6841 2 56.93 TTTAAAGATTTTTGATAAACTTCTTGTGAAATTTAAACTTTTTGGCTTGCAAACAAAATGTGTTCCTTTCATTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAAAGTATGATTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGT:1 + chr2L 7173976 5' - R1A1-element 5312 1 54.11 AAAAGAAATATAGAAAAAACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:2 - chrX 8610355 5' + mdg3 5275 2 69.18 GCTCCGAGCAGTTAATGAGCTTGAGGCGAAAACATAGAAGCACACATTTTCCTGTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 - chr3L 5425545 5' + blood 68 2 66.44 GTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 - chrX 19744465 5' + P-element 103 1 15.07 ATTTGACGCCTGAGGCCGCTCCACCTCCTCCTCGTCGCTGACCGTTAGGCAAACAATGAACAATTCAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTTAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr2L 20327574 5' - roo 9038 1 58.90 ATTTGTTTTTCTGTCTTTTCTAAAGTTTCACAAGTCACACACATTTTTTTTTTTCTTTAAATTAAAATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGC:1 + chr3L 11346375 5' - Porto1 4589 1 56.16 AGCTCAATACAAAATTCAGCCAATTTTCAGGCTCCAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTTAGCGAGTGTACATTCCAG:1 - chr3R 15154634 5' - mdg1 336 2 77.40 CTCATATTTATAATTGATTTAAGTATTTCTTTAGCCATCGTCTTGTGAAACACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATATATAACGCCGATCGCGGAACGTGGGAATGCTGAGCATGCAC:1 + chr3L 23648918 5' + Stalker 7041 4 67.12 TTATGCACACTTAGGACTCGCATCCTTGGATGCTGACTTTGCACAGAGAAAAACTATGAAACATTTGCTGGCAGAATAACCTCCTTCAACTTGCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:2 + chr2R 21353144 5' + Transpac 4944 2 70.55 CTGGGTGCCATGCCTGCGGCTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGT:2 - chr3R 15035175 5' - Stalker2 7613 2 57.53 TCTCCTCGCATTGGCATATCTTCATCGTTTCCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTA:1 - chr2R 979636 5' + Doc 426 1 63.95 GGTATGCAACGTATTTTGAGGGGTTAGCAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTT:1 + chr2L 19565439 5' - jockey 4931 1 58.90 TCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTCCTTACAAACACACAGTA:1 - chr2L 15057237 5' + hobo 87 1 76.71 TTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGG:1 + chr3L 3540153 5' - mdg3 5402 2 78.08 GTCGGAAAAGAGCAAAATTCGAGCAGGTCCTTTGAGTTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCT:1 - chr2L 1259660 5' - jockey 4542 1 75.34 TGCCAGACACACAAAATGCAGTGAAAATGCAGTAAAATCCATGAGTAATGCGAGTCAATTCGTTTCCTGAAGTATATACAATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 + chr2L 13976155 5' - I-element 5314 1 58.22 TTTTATTTAATTTGTTATTAATTAATTGTTTTGTTTGTGTAGCCCGTCTGTTGCAGCGCGGCATTACTAGTAGATTGCAGCTGTGATAACAGAGATCGTGCGGCGAGAAAGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGA:1 + chr3R 26984454 5' - TAHRE 10418 2 77.40 TTTTGTTATGTTTGAGCTCAATTAAATCATAGTATAGTACTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCA:1 - chrX 9874202 5' - BS 5007 1 71.23 TCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chr3L 16523207 5' + jockey 88 1 72.60 AGTTCATTTTCTAAACTCAAAAAATGAGGTTGTAAGTTCAAGGACACACAGAAGTGGAACGTTTCATATGGATTTATTCGAGATTAAACCCATTTTGTGGTAGGGGGGAGAAAAATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 + chr3R 26643236 5' + 412 5 2 66.44 CTGCGTTCCCTTTGTTTTTGTTGTTGCGCTGCCGACGTCGCAGTCGGTGCTGTTTACACAATTCCACAACCGAAGTCCAGCAACAACAAAAACAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr2L 16536653 5' - pogo 2079 1 70.55 TCCTTTTGTAATTCAAGCCACCGCACCACCAGCTGCACCACACGCGAAGAAAATCCTTGGGAACCAGACTTGAACTAGATATAGTAGCTCGATGGCAACATTTCATATGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 6052870 5' - roo 398 1 71.23 CGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGA:1 + chr3L 25232773 5' - accord2 122 2 70.55 CGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 + chr2R 14767352 5' + Tirant 8161 2 54.11 CTGGAATTTAGAAAATTATCTTGTTTAGAAAGTAGTTACATGATACATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAAT:1 + chr3R 26693357 5' + Stalker2 7323 2 69.18 AAAATAGTTTCCAGTGCTATTATCGATAAAATCACATGTGTTATGAAAAGATTCTAAATTAAAGTTCGATCAGCAAATAAACAATTTTACAGGAAGTTTGCACAATCTTGATTTTTTTTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCC:1 + chr3R 17401645 5' - Juan 4205 1 79.45 AGTTCATCAATTTGACAGCGAAATTCAATGGATTTTGCTGCTCCTTGTTAGTTATAGTAGTTATACGCTGCAATTGCATTAATTAAAATTTTTCGCCAGACTGCACGGCGGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 - chr2R 13052908 5' + Doc 49 1 75.34 TGATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAA:1 + chr3R 8293537 5' + Stalker2 7316 2 61.64 CCTCCCCCCACACTCCCCCAAAAAGAAATGCATACACACACTATCGCCGTGAGCACACACTAATCGCAGATATAGCGATCAATCGAGTGAGAAAAGTAACGAGAGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chrX 17933785 5' - roo 393 1 74.48 AATCCCATTTGCCCCGATTCCCCTCTAATGTCGCAGTCATGTGGCAGCGACCTAAGTGCCCATTACACACGGCAGCCCCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3R 5767317 5' + roo 8675 2 78.08 ATTCTTAACAATCGTTTTTGCCAAATGTGCTTTGTTGCCTCGCCAAGGCGTTGCGGTTATTGGAGATGTGTATTGTGGATTCAGTAAACTCGACTTTGATTTCGCTATCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr3L 1728630 5' - blood 7375 2 41.10 CATAAATTAATTCCTTGCCGTTGCGTCCCTTCAGCTCCATTGTGTCTTTTTAGTCAGTCTGGCTGTCGTGCGATAAATTTCATAGATGCATTTGGTAATTTTTAATTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATA:1 - chr3L 1397130 5' - Juan 4194 1 67.81 ANCAGTAAAAAATCCTGCAAAAGGAGCAGGAAAGTTGGCAGAAAGTTTCCTGCTTTTGTGTGCAAATATTTAGCACGGAAATTGCACTTGCAACAGGAGAAGTCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 + chr3R 26139368 5' - mdg1 7442 2 72.60 AGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAAC:1 + chr2L 951319 5' + F-element 80 1 66.21 ATGTGAAATTCATGGAACACGTTCTATGGCTTTGTTTGACAGCTCGGTCGAAAACTCAGGCATCAGTCCTCGAATGCGAAAATGTGTGTATAAATTAATTAAATGTATGGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTG:1 + chr2L 15934516 5' - 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hopper 1384 1 64.38 CGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTCGAAATACTTTAAACTGTTATGTTACA:1 + chr3R 19537510 5' - hopper2 1516 1 77.40 TCCAATCTCGTGCAGGGAACTGGGTGCTGGGGACAGGGAACACAACAAGTGCAATAATTTGGTCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGA:1 - chrX 18195450 5' - jockey 4530 1 61.64 TGTTATAATAATCAAAAGTAATATTACATGATTTAATGCTTTTTTGAACCACTTATGTCAGTATTCAAATTTCTAAGGCAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATT:1 - chr2R 9408765 5' - FB 978 2 54.79 CAGCTCATTGAACATCAATTCCCGAGATAATCACTTGTTGGCTGTGCGCAAACTTTATCAATCCGCGACCTAAAGGACATTTCATTTCCGATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGC:1 - chr2R 23499207 5' - jockey 4599 1 66.44 CAATGTGAAATTCATGGAACACGTTCTATGGCTTTGTTTGACAGCTCGGTCGAAAACTCAGGCATCAGTCCTCGAATGCGAAAATGTGTGTATAAATTAATTAAATGTATGGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGT:1 + chr2L 15934514 5' - gypsy6 7774 4 67.81 CCGCTTATCTAAACTACCGTGTCCCTATAGGCTTATAGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1 - 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chr4 214544 5' + INE-1 86 1 78.08 ACATTCAGAGAAGTATTTGCGGTTTGTAAGCGAGTAGAGACTCCCATCTCTCTCGCACCTGCAGTGCTAAGCCTTCGAAAACAGGGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr3L 17896034 5' - P-element 2851 1 62.33 GCCATTTCGAATGCTTTTTCTGTGTTATTTGTTTCGTTTTGTGGCGACTGCTATTTTTTCACAACTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2R 14450100 5' - roo 391 2 68.49 TGGAAAAAACGAAGCGAACGACTCCGCGGAATGCAATGCCACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3L 10068871 5' + 412 41 2 57.53 TTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGGTCGCCAAT:1 + chr3L 25232775 5' - accord2 148 2 63.56 CCTCTTTAAACTGCTGCTTAATGTATGGCCCCACTTCTGTTTTGTGTCGCATAATTACCAATGCCAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 - chr2L 18848819 5' + blood 55 2 55.48 CAGAGCCACTATAGCGATAAGGTGCGAATGCTATCAGGGTCCGCAAGTACCCCACATATATGTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGTACAACGCCAAGAA:1 + chr3R 8810632 5' - 297 346 2 59.03 GAGCAAGCATTTACGATGATATGAAATGGCTCAGTTTTTTTAATTACCCCTGATGGGGGTCTTTTTCTTCTCTATATGCATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chr3R 22676324 5' + 297 6617 2 61.64 CCGGAAATGAATTGTACTGGAATTAAATTCTTTTTGCTTGCTGAATGATCGATCGGTGATGGATCGGCGGTTGCCTCACAATATATATCTATATATACAGGGACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCC:1 + chr3R 24396662 5' + I-element 5108 1 70.80 CGTGAATAAAAGTTTTAACAATGGATATAGAAGTCTTTGTATTTTATAACTATTAAGTGCTCAAGTTTGTATATATGGCATAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTT:1 + chrX 13558156 5' - mdg3 5460 2 58.90 AGCGAGCAGCAACAGAAAAAATTTAATTGAATTTGCACTGCTTTTTTGAGTTCACTTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATA:1 - chr3L 780764 5' + Burdock 6197 2 61.64 CAATCATTTTGTTGCCTGTCTGGATGCGGTTTTCCGCTGTGGCCCAGCTCCAGCCGGAAAATGCATCACCAGCGGACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGG:1 - chr2L 2722470 5' + flea 21 2 66.40 CATCCATACATTTACGATAGGTGGTCGCATGCTCGCATATTCCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 - chr3R 11483847 5' + pogo 77 1 70.55 GTGGCTGCCAGAGGTTCAACATTTGCCCACCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGG:1 + chr2R 13773036 5' + opus 180 4 75.78 CGGTGGGGGTAGCAAGTCACGTAATTTGCGAAATGATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 - chr3R 12953253 5' + jockey 69 1 70.00 CGCAAAGTATGCAAAGCCTAATACCTACTTTGGGTTCGGTTAAATGCTGCAGCCTCTTGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3R 6149866 5' + jockey 57 1 54.96 AAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 + chr3R 11873360 5' + 412 81 2 73.29 AGCTAATTGATTTATTTACTGTGTGCGCCTGTTTTGAAATAATTTCATGCTAATTTGCTTGTTAATCGTTCGCCTCCTCCACCCATCAACACCCAACACCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr3R 27409084 5' - hobo 2930 1 77.61 TAATTTAACCATTTAGGTATACATCTAATGTCATTTGTTCATCAGTTATCCAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 - chr2R 14921575 5' - pogo 2036 1 65.07 AAACAATAGTGTGTTCTTATTTCATCGAAATTGTAATCGAATCGTTATCAATAGTGCCTTTTTCTATATTTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGT:2 - chrX 8037774 5' - Quasimodo 7318 2 54.79 CATCGATTTTCTTCTGTTTTACGTACATTCTGCTTATTCTGTAGCATCAGAATGAAAACGGTCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGC:1 + chrX 12131163 5' + F-element 367 1 56.43 AAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGACGAAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 + chr2L 20985782 5' + F-element 52 1 54.05 ATTGAGAACGTGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGCACTTAC:1 - chr2R 10666902 5' + hobo 75 1 76.38 AGAGCAGACTGACATGGCCAAGATTATCTGAGAATATTCTACCTGTTACAAACTTTACAACTAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGTGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACG:1 + chrX 22714996 5' + opus 7023 2 71.23 CGTAGGAAGTTCGATTGGTTACAGCTTACAAATAGTAAGATTTATAAGCAACATCGACCAAATATTAAACTATACATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 + chr3L 19510472 5' - pogo 2056 1 54.11 GCCTTGCTGGCTATGTGAAGCATACCGGTCTTCATCAGATCATGGAGAGTCAGTTTAACTCGACCATGCAGCACTACATGGACCGGCCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGACGTCATCGCCAAACAAAACCCCAAATCA:1 + chr2L 21356339 5' + BS3 232 1 55.71 AGCACTAAGAAATTCTTGGAACTCTTTCATCAGACGGAGCCATCCTTACTGTAGTATGCTGCTCGTCCTACCCTCTTCCTTTATTCTTAGTCATACATTCCTAGCCATAAATACCTAATTATACATTG:1 - chr3L 23560482 5' + mdg3 44 2 82.81 GGGTAGCAAGTTCACCACCCACCACCCACCGCCCGCGCCCATTAATGGCGGAAAGAGAGCAAGTGGGCTTCCACAAAATGGGGCACAAACATAATGCCGGTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATA:1 - chr2L 3393888 5' - Stalker2 391 2 71.92 GCTAATTAATATGAATGCGCAAATAATCACAATCACAACTTCATTATTGGCAGCTAGTAACAAATGATACAAACACCTAATCTCATTAATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chrX 16857191 5' - pogo 2073 1 66.90 TCTCTTAAACAACGATATAGTGGAATGTATATTTTTTTTGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCC:1 - chr3R 19449966 5' + opus 70 4 78.26 CCATTTGCTATAATTTTCCATTTCAATTGGCTTACGCATCGGAAATGTGAGATGTTAGAATTTTGCACGTGTCTGACCCTCTAGATGTTTCGCTTACACTTTTGGCCTGCTCGGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACT:1 - chr2L 16555012 5' + F-element 252 1 69.18 AAATATTGTTAGCTTAACCGAGTTGTCAGTTCCGAGCCAATGCATTTGCCTTTGCCTTTGCCTTGCTATATATTTTTTTTTTGTTCCCCCAACACGTTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAACGACCCTAATATGTACAAT:1 - chr3L 5257411 5' + 1360 3140 1 65.75 TGCGAACGCAAGGGAGTTTTTCAAAAGGAGTCTGCTCTATATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAAATATGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCT:1 - chr2L 21082230 5' + mdg3 5303 2 52.05 CCAAATAAGCAATTTAGGTATGCAACGTATTTTGAGGGGTTAGCAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGC:1 + chr2L 19565423 5' - jockey 4947 1 54.79 AGCATCAATTAATGCCCACTTAAGCCCAAAGCACCTAGTCAGCAATCCAGACTGCAAGTTTACTTACATATTTAACAACACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCATTTAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCA:1 + chr2R 23351225 5' + I-element 5145 1 55.48 TTATCAATTTTGATTGTCCAGCGCCCACACACACACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1 + chr2R 14486493 5' - 297 6912 2 79.69 TAAACTATTATCTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chrX 3637769 5' - roo 9008 2 59.59 ATCATATTTCATTGAGATTGAGCAATCAGCTGGAAGAGATGCTCTGCCCGGAATTCCCGGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCC:1 + chr3R 21734521 5' + copia 4933 2 60.96 AAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAA:1 + chr3R 21276554 5' + BS 5078 1 71.92 ATCTTTTCTAATGTCCTTCTTTTGATGATATATATGTACTTGCAGTAGTTATAATAATTTATATTTTACTTCCTTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAAC:1 - chr2R 24629626 5' - Cr1a 4109 1 47.95 CTGTGTGTTTCACTGGTCGCTTTGCGGTGCTATTTGGCATTGCTTTTGCCTGTTTACTTGGCTACTAAATAAATTTAAGTTCTTATGCCTTTAAGAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTT:1 - chr3R 15157718 5' - invader3 251 2 65.75 TTGTATATAATTTCGATCTGCATATCGTCTGTTTGTTCGTCCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr3R 4352168 5' + Doc 32 1 69.86 GCACGCCACTGCCATAAAATCAGGCATCACCATCATCATCATCTCGTGGCATCGTCATCATCTTCATGAGGTGCACGGATCCTGAACATTCGCTTCGTGCCTTTTCCTGCGTTTTGCCTCCTTTTGGTTTTTTCTGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 5316389 5' + transib1 6 3 43.15 GTCAGGTGCCCTGCTTCGATTTCAATCTGATTGTATTATTGGAAATACCTACGAAAGTTATAATTATTAACGTTATTACATGACAGATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATT:1 + chr2L 8852740 5' - Burdock 223 2 58.22 AGTAAATAAAAAATTGCAGAAGGCTTTAAATGTATATACATCTATATATGTAGAAAAGTCCATGAAAGTGTACCTTTTGTCGCAGATGGTATATACTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 - chr3R 6171264 5' + 297 6597 2 75.34 GCCAATGGGAATCGAAGGTGTTGTTTACGGCGAATTTCGAAATGGGTTGCCCGGAGAGTTTGGACCAATCATCGCGTATGCGATTACCCACACACAATATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:2 - chr3R 25094750 5' + P-element 21 1 71.23 TACAATTATTCGGCATGTGACGAGAAACAAAGGATAGAGGTATGGATCAGTAAATAGCAAAAGGAGAGTATCGCACGTAATTACATTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCT:1 - chr3R 16634259 5' + hopper 383 1 58.22 TTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr3R 11873335 5' + 412 7109 2 56.16 TAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCACGCGAAGAACGC:2 + chr3L 21765434 5' + gypsy 7067 2 70.55 CACGATGACAATAGTATGTCGTAATTTACAATCTTGCGTTTCAAATAGAACGCAGTATCATCAGTTCGGTCAATGTAAACTGGGGAGCCTTAAGTTACTTTGTAGAACGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2L 20067928 5' + roo 14 2 76.03 AAATAATCTTTATGCCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 19938457 5' - roo 358 2 52.05 GTTCAAGTTTGGTTATTATATGTAACTAAATAAAAGTTTCAAAACACGGACTAATTACTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGA:1 - chr3R 27443246 5' + 3S18 5829 2 58.90 TGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTTTTAATTAATTCCCTAGCTAACCGTATTACTATGCTTGGAACCGAGAAGTTAAGCTGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCTACGAATAAG:1 - chr3L 13355428 5' - Cr1a 4055 1 43.66 GACAGACCAGCAGCGAAAGAGATGCCACGATAACGAGCGAAAGAGATAGCGAGATGGCCAAATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr2R 15892268 5' + hobo 19 1 71.23 CGTAGTCGATCAATAGACGATCGACTACATATCCTTTGATTTACGCTTCTAGTTGAGACCTTGTTAGTCGTGTTTGCTTATAGTTTTATTTACCTTCGTTTTTGTTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCT:1 - chrX 1222212 5' - I-element 353 1 75.71 ATGTGATGCAATGCATAAAATAGTTTTCATATATAAAGCAGTGTGTCAACACACAGTGTGTGCTAAGGATTCAAACCTTAATTTGTTTAAATAAGCACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTAT:1 + chr3L 15374585 5' + 3S18 26 2 65.75 AAACAAACAAATAAATTGACCACATCCCCAGTTAGAAATAATTGCATTTTTGTAATGTTTAAAAATAATTAAATAAAAATGCAGAAATATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTT:1 + chr3L 107473 5' - roo 9037 1 61.64 AAAGGGGTATCTTTTCTGTTGAAAATACCTTTTAGATAAGATATGTTGTATAAGAAAGGCATCATATACTTTGCATATTGGACAGAGTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 26031825 5' + pogo 29 1 66.44 CGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr3R 11873339 5' + 412 7105 2 56.52 GGTGCTGTTTACACAATTCCACAACCGAAGTCCAGCAACAACAAAAACAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 - chr2L 16536608 5' - pogo 2034 1 67.81 CTTACCACATAGGAGCGCAACAAAAATATAGAACTATATTATATTAATACATATGTAAAGATAAGGTGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 + chr2L 12814706 5' + hobo 52 1 52.05 AATAATTGCATTATCAATCGATAATCGTATCGTATCTTCGAGCGGTAGGTTTCGATAAAGGGTCTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 + chrX 22517549 5' + 1360 57 1 61.64 CAAAAAGGGAGAATACGAAAAAGAGAAGTGCGAAATGGTTCTGGGAATACGATCCAGAGGGCCCATGTAAATATGTATGTAAACACAACCTAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 + chr2L 19135569 5' + Burdock 6160 2 68.75 TGGTCGCTTTGCGGTGCTATTTGGCATTGCTTTTGCCTGTTTACTTGGCTACTAAATAAATTTAAGTTCTTATGCCTTTAAGAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTA:1 - chr3R 15157705 5' - invader3 238 2 56.85 ACAAGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTCGCCACGC:1 + chr3R 12547874 5' + hobo 58 1 66.39 ACTAATTGATGTCCATAACATCGAGGGGATCCGGATGAGGAGAAGGATGCAGGCAACTTAAACTAAGGCTGCGATTGGTGACAGTTTGATTGATGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 - chrX 998259 5' - copia 228 1 66.44 TAAGCTGAATTACAAAAATAATCTTTATGCCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3L 19938442 5' - roo 9037 1 61.64 GCTCTACTCCAGCATCATGACCAAGCAGTAAGTGGCCGATTGGACCCGAATCGAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCC:1 - chr3R 10741194 5' + 1360 3358 1 54.79 ACGGACGTATACTCGGAATATCTACATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGGTAACAACTAACAATGTATTGCTTAGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTAT:1 + chr3L 21765394 5' + gypsy 29 2 62.96 CAATATTGGAAAATATGTAGGGTGCTATATATTTTCATATTTATTTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAA:1 - chrX 6863648 5' - Juan 4140 1 70.55 TGAATATTTTAATATGTTTATTCTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTT:1 - chr3L 11296270 5' - P-element 2578 1 22.60 TAGAACTATATTATATTAATACATATGTAAAGATAAGGTGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:2 + chr2L 12814734 5' + hobo 80 1 71.23 TGCTCTTCATATTTGTCTGGCTTTGCAAAAAAAAACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chrX 12344270 5' + F-element 43 1 65.07 TCCCGACTGCCCTGCATTCTTAGTCACCCAAGTCACGTCCTGTTGCAACAACACATCGTATCTATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAA:1 + chr3L 9317457 5' - HMS-Beagle 6990 2 56.85 CCGTGCAAAAGTATTTTATGTGTTTGGTAAATCCATTCATAACTAAGCTAGTTGTCTTATTCAAACCCAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 - chr3L 17710689 5' - I-element 5302 1 53.42 CTATGGATTTCACCTTATAAGCCCCCTAAAACCTCCCGCTTATATCCATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTGGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr2L 15523928 5' - opus 484 2 57.47 TATCATAGGAAATATTAAGAATGTTATAACTTTCCTCAACAACAGAATGGGAATGTCGACACCTCCATAAAATTAATTAACCCCCAATAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr3R 12569548 5' + blood 29 2 65.75 AAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTG:1 - chr3L 22635770 5' - hopper2 1542 1 59.59 GCAAAGAATCACAAACTCACATGTTGCCGCTGCTGCTGTGTTGCACAAGTCGTTGTTAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACG:1 - chrX 1825980 5' - P-element 206 1 45.21 ATTACAAAATGTTTATTGGTTAATTTCAGGGTATCCTTCAAGTGAATTGGCTGTTGCCTGCATAAATGCAGACTTGTGTTTTGGGCGGTTTTTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr2L 16536475 5' + pogo 26 1 62.33 GCAGCCAAATTGCAAATGACTTTATGAATTTGCTGTTACGACTTGGACAAGCTCCGATGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 + chr3R 22275214 5' - flea 5002 2 71.23 TCGTTATTTCAGGGCGCTGATCTTCCCACATAAATAAATTCCACAAATATGTACACGGACGTAACTATAATTAATACGACTCATTTTAGCTAAGTGGGGTGAAGCATAGTATAGTTATAGTATAAAGTAAAGTAAAATAAAGTAAA:1 + chr3R 23881884 5' + TART-A 13138 1 65.75 ACTTGATGAAATCTATATGAAATTATCACTTATGCTGCTTCTCCTCTCTTTTTGCTTCTTGTCCTTTT:1 - chr2L 17736261 5' - TAHRE 283 2 63.24 ATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAA:1 + chrX 12344313 5' + F-element 78 1 65.69 TTTTATTTATAAACTTGCAGCAAAGTGGAAAAAACGAAGCGAACGACTCCGCGGAATGCAATACCACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3L 10068846 5' + 412 16 2 73.29 TCTTACAGTTGCGGTTAAATCGAAAGTCATACTTTAACTACAATATAATATTACACGCCAAGTCAGAGGCATAAAACCGAAACGACATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr2R 21244801 5' + roo 4 2 77.40 TACTTTAACTGAACTTTAAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 - chr3L 22635787 5' - hopper 1382 1 57.69 CTGCCATAAATTAAAAATGCGGTCGTCGGAATGATGCTACGCATAAATGAAATAAATTCAAAAGCATAACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAT:1 + chr3R 13231756 5' + F-element 92 1 53.42 GCTTTCCATTTCATCCTTCACACAGAAACAGAACCAACACAATAATTATTTCAGCAGTTTGGTAATTAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAACGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chr3R 25053111 5' - pogo 2049 1 54.79 AGCTTTCTTTGTAGCGCCAAGTGAAACGTATCGGACAGATAGAAAAGAATAACAAAAAAGATATATATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGAC:1 + chr2L 8615320 5' - 17.6 441 2 62.33 TGTAAATGGAGCAGAAACGCAGACAGAATGAATTGGACGAAAGGACACTTACAGTCAAAACAGCTCAACTAGCTACCTTAAAACTTAAACAGGAATAAATTCTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 18539740 5' + roo 8683 2 73.29 TAATTAAATATTTACGAAACACCCTTATGTATATGAATAATAATAAAAAGATTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAA:1 - chr2R 2052662 5' - opus 7447 2 59.56 ATAAGGTTCACTGTACACTTCACTCCTTTCCATAGCTGTCATGTTTTTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTTTAAAGATACCACCTACGGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGG:1 - chrX 23447815 5' - Rt1b 5065 1 77.08 GAAAGATAAATATGGCTTACCAGTCGAAATGTTATAATAATCAAAAGTAATATTACATGATTTAATGCTTTTTTGAACCACTTATGTCAGTATTCAAATTTCTAAGGCAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTT:1 - chr2R 9408794 5' - FB 699 2 74.66 AAGTATTAAATGTGTAATTCAAACAAAGAAACACCCCTACCGGCAGTTATATATATACAACACACGCTCACACACACGAAAATAATAATTTCTGAAAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGAAATCTC:1 + chrX 4362990 5' - Circe 7014 1 62.33 TTGTGAGGGGAGTTTAAAGTTATTCTCGTGTTAAGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 + chr3L 3540078 5' - mdg3 227 2 72.41 CTTTTGTAGATATTTTCATAAAAGTATAGATTCAAAATAATTTCTTTACAGTATAGTTGACAGTGGAACTGATCCGAAATTTCCGAATTTGGGACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAA:1 + chrX 22760278 5' - roo 380 2 68.49 AACGATGGCAATCACTTCCCCCATTCAATTGATCCCCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAAATTGTCCGGTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGTCACATATTAAACTCATTCCCATCCCTCCTACAAACCCAACAAGA:1 + chr3L 1937174 5' + I-element 5065 1 76.03 AATGTAATCAACTTGAATTTCAATCAGCCATTAAATTTAAAAAATTGCCCCAGCTAGTTATGCACATTTTACAGTCTCTGTTTTATGGCAGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTT:1 - chr3L 19398249 5' - gypsy5 7316 2 63.01 ATTGTAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAA:1 + chr2L 615234 5' + F-element 79 1 63.19 TGAGGGCGGAGAATGGAGTGGAGTGGTGAGTGTAACCGTCCCGACTATGATTATGAAACTAAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAA:1 - chrX 22517758 5' - Tc3 315 1 78.77 GTTTATTATTTTGCTCTGTCTGCCGCATAATGTTAAATTAATACGCCTCCCCCTCAACGCAGCGCCTTCCTTTTCATTTGGTCCCTTAGTCAATTGGCGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGC:1 - chr2L 19841619 5' + BS 19 1 68.49 CGAAATTCCCGCCACAATGGCAGGCATCCATCAAGCAAATTGAACACGCCCCCGTCGCATATATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAA:1 + chr3R 20720506 5' - 1731 4574 2 55.40 AGCTAATGAAATTATAATTTCTACTCACCCCTCCACAAAGTGGGTTGCTCAGTGGCCTTCCTGTCGCTTGTCTACGCCGGAAATGAAATGACCCAGTTAAATGATTTATGGCAAGAGCCCACACACACACACACACACATGTGCAC:1 + chr3R 13133308 5' + accord 187 2 68.49 ACCCCAGTGCCGAGGCCCCAACTCATAAACAAGTTAACGACCAGGTACACTGAGAGAAAGAAGTGCTACACATTCTATCCGCGTTCTATCATGAGTTTCCCATTTTCCTGTCTCTCTATTTCTTATTTTTGTTTTCCTTTTTTTTT:1 - chr3R 17547888 5' - Doc2-element 253 1 52.05 TTTTGGTATTCATTGTGCGGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:2 - chr2R 10666954 5' + hobo 42 1 56.85 ACGCTTCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCATACCCTACA:1 - 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chr3R 8293674 5' - Stalker2 386 2 70.34 TCTTTTCGGCAAATGGCATACTCGTGCGACTAATTCGCCGTCAAAAGAACATCCACACGTACACACACATGAATATATAGATGGTTAGAGCGGCCAAACACTTACACCCACACACACGCATACACAC:1 + chrX 9399305 5' + accord 7100 2 59.06 ATTTGAATAAATTGAATCTTTTTGCCGTTTCGATAAGAACTTCAATATTGTCGGAATGGAATATATATATTTCATAAATATTAAATTGAAAGGAAATGACTGGAAATCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chrX 10344920 5' + roo 14 2 76.03 AATACGTCTTCCTAGAACAATATATAGATTTTTAATAGACTTACCATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCC:1 + chr2L 21082135 5' - mdg3 5420 2 69.18 CAACCAACATCAAAGGGATTCGATTTCAGAAAAATTCCAGCGACTGTTGCATACTTATGGGTTACCTTTGCTATTCATAACTTACACGGGCCATAAAATATTTATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGAGGACGCGTTCA:1 + chr2R 22040861 5' + jockey 24 1 69.86 GCACTATGCTCCACAACGACTACCTCTAAAACCAGAATGCAATTGCAATTATCCTAATTCATCCATTAGCTTCGCTATAGATAAAGACCTAATAGGTTAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 15529651 5' - roo 390 2 73.29 CAAGCTTTTCCTTGTTTTATATAATTCAACATTCAATTCAACTCAATTCGAACATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - 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chrX 10501372 5' + F-element 64 1 50.68 TCTTAATTATTAATAGGGTATAAAAGTATGTTACAATATCTTTTAAGATCAGTCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGC:1 - chr2L 17297054 5' + Max-element 69 2 63.01 GACTGCCCTGCATTCTTAGTCACCCAAGTCACGTCCTGTTGCAACAACACATCGTATCTATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAA:1 + chr3L 9317461 5' - HMS-Beagle 190 2 59.59 GCAGGAAGGGCAGGGCCAGGGGCAGGGTCTGGGGTTCATGTTCACAGTTGGGTTCCAAGCGACTAGCTTATTGTAGCTGAAGGATCAGGGCGAGCAGCCCTAGCACTCACAGATGAACGCCTC:1 + chrX 18491310 5' - G5 222 1 77.24 GTTCTGGCCGAAAAAAAGAATTTATATATGTGTGTGTGTGTGTTACAGTTATAACAATAAATCAACAACTGCTGGCAGCCACTGTAACTGCAGTCGACTCTCAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr3L 15724595 5' + jockey 24 1 68.99 AATGTATGTTGTGCGTATTTGTGGCGAGTACTTACAACAACGGCGTTTCCTATAAAAATAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGCACATGAACTGTTTAAAACAACCG:1 + chrX 23439062 5' - R2-element 3300 1 51.45 CCATACCACAAGCATCATTTTAAATGCCAATTACAGTTGGAACAGGAGCAGGAGCAATGGAGGATAAAGGATATAGGATATGGGGTAAGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 + chr3R 15700297 5' - Transpac 279 2 65.75 TTGCTTTTATTTTTTCTAGATTTCTTCGACCAGATAGGCTCAGCCAGAGAATGGGTCAAACAGTGGGATTCTAGAAAACCTAGGGCCATAATTCCCGACACGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr2R 11379917 5' - hobo 2920 1 72.60 GTTTTTCGATTGCAGGAGGAGTAGGTGAGCCTACAGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTG:1 - chr3L 5948088 5' - P-element 2804 1 28.08 AAATTTGTCTAAAGCTGTTCAAAATCATAGCTGGGCATCACCAGAGTTTTCTAATATTTTCCTTTTCCCCTATAGAATTCTCTTTTGGCATGAAAGTATATATGTATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTT:1 - chr3R 12952999 5' + micropia 19 2 73.29 CAATCACTTTTTCATATCTCACCATTCAAATTAAGCGATGGCACTTTTTCGCTATTTATCTGCAAATTTTTTGTTTTTTTTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAG:1 + chrX 17528082 5' - blood 427 1 56.16 ACGTAATGGAATTGTTGTAGTTCCTTATGTTAATTACAATAATTAATGTGGTAACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr2L 20262701 5' + roo 62 2 63.70 AAATTCTCAAGATTTTATTGGCCTAAATATAGTGATCTGCCTTCGAAGGTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 + chr3R 5684067 5' + pogo 67 1 64.38 TGTAATTGTTGTATTGTTGTATTATTTAATCCTAAAGGACATGTTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chr3L 21108574 5' + roo 77 2 74.66 CTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr2R 14450168 5' - roo 322 2 76.03 GGCATCATTAGTTTATTTTCCTTTCGCTGCCAACTTTATTTTTATTCCCTTTCCAACAAATATATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAG:1 - chr2L 8615442 5' + 17.6 52 1 59.59 ATCGATCGGTGATGGATCGGCGGTTGCCTCACAATATATATCTATATATACAGGTACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCA:1 + chr3R 24396709 5' + I-element 5164 1 62.33 CTGATGACGATGCCGCAGTTAAACGAATGTGTCCCGCCTCTTAATTGGCTAAATACATTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2R 14921476 5' + pogo 51 1 59.26 AAGCCGACAATAAACATTCCATTCAAATGAGCCACCAAAATGGCATCAATGTCATATCAATCAAAAACTCAAACTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCATATGTA:1 - chr3R 22266551 5' + roo 8709 2 54.79 CAATCTATACTACTTTTGGGAAAGTATCAACAAGTTTACTCTGAAACGGACAAGGCTATATCGACTTTGCTGTTGATCAAGAATATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATA:1 + chr3R 6461710 5' + Transpac 4950 2 65.07 TTGTTGCATTGCTAATGAAATAGCTGGAAATTCTGCTGATTAGCTCACTTAATTGCCAAAACGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 13351593 5' + roo 60 2 58.90 CTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 + chr2R 14450171 5' - roo 319 2 78.08 CGTCGAATCCCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAACTA:1 - chr3R 11550291 5' + F-element 72 1 59.59 GTTACTTAGTCGCTTTTACTACTATGCAGTATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATGAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATA:1 + chr2L 14678765 5' + Quasimodo 38 2 69.31 ATTAAACATTCTAAATACAAGGTTAAAGTCCAGCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chrX 127039 5' + hobo 68 1 72.44 ACATTGCGGAATGGGGCTCGTTGTGGCGCTCAAGTGGAAAATTGAATTTATTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTT:1 - chr3R 27411767 5' - I-element 5280 1 69.18 TGGCGCTTGCGGTTAATTAGCCATCCATATGATTAATCAATCGGCCGGAGTACTTGGTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGCACC:1 + chr2R 10666842 5' - hobo 2894 1 50.40 TGGCTAATTTATACCCTTTACTTGTAGTGTAGAAAAGACACTTTTGATTAGTCTTGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATTGATGCTAATTGTACTGAA:1 - chr2R 7024480 5' + diver 66 2 60.27 CTCCCGGTGCATGTCTTTTATGTTCCCTCATTCGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chrX 19162551 5' - pogo 2069 1 61.64 CTTTCAATTGATGCCAATTAATCGAGGCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATC:1 + chr2R 14767323 5' + Tirant 8132 2 69.86 AATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCT:1 + chr3L 3540131 5' - mdg3 5424 2 64.38 AATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGA:2 + chr3R 8293556 5' + Stalker2 87 2 74.66 ATACCTAGAAATGACCCAGATGTGAGTTTAAAGAACATTCTGCTTAAACTTCCGTAAAATATAACCATCGTCCTTTTGAGTTGTTTTACGTGGTTGGCCACTACGCGCAACGTTTTTGGTTGTGTGTTTTTTTTTATATTTATTG:1 - chr2R 6160145 5' - Tc1-2 484 1 80.69 GCCAATAATTGTATGCAAATAATTATACGTTCAACAAATACCTTCTCCGCGAAAATCGCTTCAAATCAAAGGCCGCTAAACACATTCCACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chrX 9949463 5' - hobo 2905 1 62.33 AAGTTGGAAAAATTTTTAATGAGCCAAATGCTTTCAACTCAAAAGGCAATCTTAAAATTCGCGGAAACTAACCATAAGCTATTTAGTTACCCAAATGGACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 + chr3L 5425411 5' - blood 7368 2 69.18 AAGAGGGGTAAATCATCGAACGCTGCTGTGCAATCAATCTATTAATACGAATCCCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAA:1 + chr2R 10245830 5' + I-element 4944 1 76.71 GTGTGTGTTACAGTTATAACAATAAATCAACAACTGCTGGCAGCCACTGTAACTGCAGTCGACTCTCAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTG:1 - chr3L 15724560 5' + jockey 77 1 52.74 TGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCA:1 - chrX 8610298 5' + mdg3 80 2 69.86 AATCTTTCACATACGCCGTGTACTCTCTCTCTCTCCCTGTCTCTCACTTTGAGCAACAAAGATTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chr3R 7109129 5' - P-element 2831 1 47.26 CAAAGAATGCAAGCAATACCCTTTGCAGGTCCGTTGCCAGTACTGCTAATATCAATAGTAAATAAAAAATAAAATTATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr3R 19449865 5' - opus 7462 2 55.86 CATAGCGCAAAACGCTCACCCTTTTGGCATGACTGCTTCTGTCCTACGACACACGATACTTTATATACATATCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr2R 17937107 5' + 297 43 2 56.16 CAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCAATTGTTGGGTCTCTTCAATGCTGGAGAGCAA:1 + chrX 14317414 5' - Porto1 357 1 78.08 GCGGAAAAACACGTTACGCTGTATAAGAAAAGTCAATTTCGGATTTCGTTTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTATCTTAAAAATGTAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chrX 5938281 5' - pogo 2034 1 61.38 CGAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGTCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 - chr3L 1983524 5' + Transpac 4958 2 64.65 TAGTGAAAGAATGTAAACAGCTGGGAAAAACTGGGGGAATCTGGGGAATGTGCCTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAG:1 + chr3L 19398127 5' + gypsy5 7007 2 64.14 AAAACTGGCAAACAAAATATGTTTCAGCCAAGCGTACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGGTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGAAGCGTACGTTT:1 - chr2R 18927840 5' - 3S18 264 2 71.11 ATAATGCCTATTGTTTTAATTTCCAAAGTTCTTAAAACTCCGGAACGCATCGTATTCATCTTTTACAGCCCGCATCCTTGGCAACCTTTGTGCATTATCTTCCGACTCTCATCTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:2 - chrX 10501415 5' + F-element 21 1 78.77 CACTGCACTTCACATCCAATATGACCGTTCGTGCTTCCTTAACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGTGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCAT:1 - chr2R 544900 5' - HMS-Beagle 6996 2 54.11 CAGTTTCATGATGCCCCCGGATCTGCCGGATCGTTGGGGATGGGTCGGATTAAATAAATGCCAGCGCAGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2R 18266146 5' - roo 9049 2 69.18 GCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 + chr3R 23565267 5' + jockey 90 1 73.97 AATTATGTTCGGTTCTGCTTTTTAGTCTCTGATTATCTTTCGGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATG:1 - chrX 15968449 5' + R1A1-element 366 1 59.00 ATCTCATTTAAACGGAGAAGAAGAACGTACAAACAATCAAACCATATGAAAAATGCTTTGTTTGGATAGAAGGATATCAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGGCAAACAAGGGGAAAACCCTTCGGCTACAGAACCTAGATAT:1 + chr3R 26627410 5' + X-element 498 1 50.00 CTCGATGTCGCAGCTAGCGCTTTAAAAAACTTTCCCGCCGCAGGAAAGAGAGCACAAAAAATGTATATTTATATACATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCT:1 + chr3R 12952842 5' - micropia 409 2 54.11 AAATTTTGGGACCTACGTTTTGAGAACATTTTTTAAAATAATGGACTAGTAAAAACTAAGGAGGAAAGTAAATACATAATAATGTACATAATTTGTACATAATGTATCATATGTTGGCTGTCTGAGCAAGAAATTTTTAGTCTCTC:1 + chr3L 14585762 5' + Tc1 129 1 55.48 GAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGTGAGGAA:1 - chrX 19744496 5' + P-element 71 1 36.55 TGATGATGAATTAAAAAGCCTTTGAAAAAGAATTAAATCAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAG:1 + chr2R 18922525 5' + opus 77 4 74.66 TTGCTGTTACGACTTGGACAAGCTCCGATGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 + chr3R 22275243 5' - flea 4973 2 51.37 CATGAGTCAGACAGGCAAGCTAATCAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCAT:1 + chr2R 9408159 5' + FB 57 1 56.85 TTTCAACATACGTGTGATTAAATTCGTTACCTAAATAAATTGACTAAGGTAAACATTTCGAATTTCTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCA:1 + chr2R 9411251 5' - FB 840 2 58.22 CCTACCCCGAAAAAATGAGCCACAAAGAGAGGAATGCGAACGCAAGGGAGTTTTTCAAAAGGAGTCTGCTCTATATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAAATATGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 - chr2L 21082264 5' + mdg3 5269 2 74.66 CAGTTTGTTTGTCATCGCCTCTTAATCCAGCAGTAAAAGTAGCTGTGATTGTGATTGTGCGCACGCCCCTTATCAATTTTGATTGTCCAGCGCCCACACACACACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACT:1 + chr2R 14486424 5' - 297 382 2 78.08 GTATTGGGCACTAGCACTTTCTCTCTGTCGTTTGACAGGAGCGTTTGGTGCATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATC:1 + chrY 388269 5' - blood 7319 2 64.38 CCAACAACCGGCCCTGTACTCTGCCGTGTGGTTGTTGTTGCTGCAGTCGCCAGTCGACACATGGTGAATATTCGAATTCAGATTCGGTCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 + chr3R 17794499 5' - P-element 2873 1 69.77 CACATTGAAATACCAAATTTGAAACTCATATTTGTTTCACTTTGTTATGAGAATCGGGGGTTCTTCGATTTCAGCACATTTAGCTATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 + chr3L 13475475 5' - HMS-Beagle 213 2 63.01 CCCAATATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2R 18467209 5' - roo 352 2 65.32 TATTGAAGTAGAGAAAGTATTTAGTTTGGCATGGCTCACAATTAGGTAAATACATACAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACGGGGGGTTCTTCTGTCACTGGGAGGCA:1 - chr2L 19217705 5' - springer 317 2 61.64 TAAAAGGGGTATCTTTTCTGTTGAAAATACCTTTTAGATAAGATATGTTGTATAAGAAAGGCATCATATACTTTGCATATTGGACAGAGTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr3R 26031827 5' + pogo 27 1 67.81 AGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 + chr3R 13572018 5' + 412 7118 2 63.70 AAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTT:2 + chr3L 19951162 5' + Ivk 39 1 58.90 AAGCAGCTAGGGTCGCTAGGGCTCTAGCGAGAATAAACTACTCCTTCTGTCTGTCTGCAGGGCGTCATTACTGTACTCAGCCGTGTACTCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACAT:1 + chr3R 902505 5' + R1A1-element 9 1 58.22 GTGTCCGTATCTGATGATGACGCGGTCGTGTCCTCACCAACGTGAAGGAATTCCAAATAACTACAAATTCAGCTTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCCAGGCAC:1 - 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roo 9016 2 52.05 GCTAATTAATATGAATGCGCAAATAATCACAATCACAACTTCATTATTGGCAGCTAGTAACAAATGATACAAACACCTAATCTCATTAATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chrX 16857191 5' - pogo 2081 1 70.80 CTGGAACTGGGTGACACACTCCGACAGGCGGATCACGTACGGATCGAGCTTATATGACTCCCAGATGAGGCCGATGCCCTCGGAGACCAGGTTAATATTTCAATAACGTTTTATTTAATTTTTCTATTTCACCACTCACTAATAAA:1 + chr3L 4821117 5' + accord2 7328 1 65.07 AACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGC:1 + chr2R 17872488 5' + Tirant 72 2 67.14 AGCGTTTAACTGCCCTTCTGTCCCTTCAATTTTTTAGGTCATATTCAAGCGGGATCTTTTCCCACTCTTCGACTATCGCAGCAATGAGATGTTGCCGTGTTTTGGGGCACCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCACAAA:1 - chr2R 5342424 5' - S-element 1255 1 80.14 AGGCGCCATTTAAACACACACCCCCTCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1 + chr3L 5731279 5' + 297 63 2 76.86 TGGAAAACAATTCACGGCCACGGATTTTAGGTCTCTGAGTCATTGGGTATCTAAACCCAGACGTTGAGGCGTCAATGGATGTTGGGATGAGCATTCTACACATATAAAAACCATTTATTTTATTTATTTAAATATTATTTTTAATT:1 + chr2R 20068217 5' - blood 6913 1 73.29 TAGGCAAATTTCGTTCAATATTCTGAACTATTCGAATTTTTGCCGATGTAGTTCGCGAAAAATGCGTTGATCGCACGCACGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTACGCCACCACGCCTACACA:1 + chrX 22652683 5' + ZAM 8000 2 57.86 ATAACATTGAGAAATAATTTTTTCTGTTAGAATACACTGAGAGAAGTCAATGCAAAAATTAATAGTTGTGTATAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - chr3L 13016002 5' - hobo 2904 1 56.49 GGTCCAGTCTGGTGGTGGCTCAAATGCGAGGGGAGAAGAGTACCTGTGGTATTATTAAGGAGACTACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2L 20253951 5' - roo 353 2 54.79 ATCTGGGGATGGAGGAAGCCAGTTATAGTCGACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTT:1 + chr3R 9657652 5' + BS 34 1 55.48 GTGTTTAAGGATAACTTGTGATCATAAGCATATGCAATAGTTTAGTTTTGTCCACTTATAGAAACATAAATTCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr2R 11609996 5' + roo 8702 2 54.41 ATGCCTGCAGCTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGA:1 - chr3R 15035166 5' - Stalker2 7604 2 52.74 GAAAAAGAGAAGTGCGAAATGGTTCTGGGAATACGATCCAGAGGGCCCATGTAAATATGTATGTAAACACAACCTAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1 + chr2L 19135585 5' + Burdock 42 2 56.85 TCACAGTCGGGTTATAGATAAATTGCAGTTTTAAACACCAAAAATGAACGCAAAAGATTATAAATCAAAACTGCATTTCTCTACTTTAAAAACGTTTTTCGAAATTTAGATTGACATTTTCATATTTTTCCATGTCCCTTTTTGGA:1 + chrX 21029538 5' + HB 59 1 75.34 TCCACAGTCCAAGAAGGTGATATCGTTCTTCAAGAATCATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGCCACCACCCTC:1 + chrX 15696710 5' + jockey 4748 1 70.63 TGATATTCTCAGTTGGGATATAAATATAATTGGGGATAGTTATTACATTGCCTCAACAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 - chr3L 19510592 5' + pogo 61 1 61.64 ATTTTTAAGTATCCACTTTACAAATTTATTAAGGCCTCGAAGGCTCGGAAGAATTTCCATCACATATTTCATAAAGAATCATATGTATGTATACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2L 20253810 5' + roo 27 2 65.75 TGTGGCAAAAAATCAGGAAAATAAAACTTAACAATGCTAAGCAAAACAGCTGGTCAAAGACAAAGGCACAGAAAATAGGCAAGAAAACAAAAGGAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCAACAGAAGCCCC:1 - chrX 8418295 5' + F-element 391 1 67.59 CAAAGTGCATGAAACTGAAACGAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGTCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTT:1 - chr3L 1983544 5' + Transpac 4985 2 62.33 GCAGTGTGGCTTACGGTTACAGATTTGAATTCTAGAAGCCATGCGACTGCCGAGGAATGCGTTTTAGAGAGCCGCTCTCTTGGCCAACTTTCTATTTATAAGTCTGATGTCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr3L 13477134 5' + P-element 9 2 78.08 TTTGCTCTGTCTGCCGCATAATGTTAAATTAATACGCCTCCCCCTCAACGCAGCGCCTTCCTTTTCATTTGGTCCCTTAGTCAATTGGCGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTT:1 - chr2L 19841610 5' + BS 4 1 74.59 GGAGGAAAGAATTGTTCTTTTATTCTAAGATTATCTTATTATCTGTACTGCATTACTGTACTGATAATAAGATTATCTTAGAATAAAAGAACAATTCTTTCCTCCGCTGTAAAGGTTGGCTTTATAAAAACAAATTTAAGATATCT:1 - chr2L 20532509 5' + Tc3 1586 1 58.90 ACGCAACTGTTGCATTTTGCACTTGAGTTTTCATTTGCCTCGTCTGTCAACGCCTTGTGGCTATTATTTTTTTTGGCTTAAACTCCCTATATACGCATGCACATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGT:1 - chrX 17508959 5' + Burdock 6152 2 74.66 CCCTGCCACGCCTCGTTGCCACAGGGAACTCGGTTAGATAGCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 - 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chr2L 5732830 5' - hobo 2893 1 57.78 GGAATTTACTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chrX 12995418 5' + blood 7062 2 52.05 CCGTGCTCGGGATAATTGCTTCCCATCATCAGCGGCGGAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 - chrX 19744536 5' + P-element 25 1 66.91 ATCAGTGTCTATTTGCTTCTTTCATGTTGGTGCAAATAAACTCTAAATGATTTCAAAGTTATAAATGTTTGTATAGTGAACGTTAAACACAAAGCGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATT:1 - chr3L 11754782 5' + Doc 112 1 50.81 GCGATTAAGATTCATGTTTTCTTGGCCGCAGCTGTAGACACGCGCGCGTACACACGCACACACACACACACTCTCAGCCGCACACGCACACTCAATTGTCAGCTGTTATCAGTGCAATTAGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGA:1 + chrX 2308804 5' - Tc1 162 1 50.68 GCAAAGAGGCAAGTTAAAAAAAAAATATAGAAAAGAGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr3R 13571982 5' + 412 7083 2 63.70 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTAAGCGCATATATGGCCAGC:1 - 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P-element 2837 1 51.37 GAAATTGCTTTAAGTAATAATTAATATGAACATTATTTCTCCATTGTTGGCTGATTATAATAAATATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACA:2 - chr3L 13365139 5' + Juan 40 1 44.52 ACTGGGAAGTAAAAATAAAGATTGCAGTGCTCAAAAATAAAGTGCTAATCAGCTTGGATAGCGATTTAACAAAGCAAAAAATAATGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGA:1 - chrX 14518050 5' + jockey 328 1 60.96 ATTGAAACACATTCATTTCTCGCTATGATGTGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAA:1 - chr3R 19500687 5' + jockey 130 1 77.40 CAAAAAGGGAGAATACGAAAAAGAGAAGTGCGAAATGGTTCTGGGAATACGATCCAGAGGGCCCATGTAAATATGTATGTAAACACAACCTAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAA:1 + chr2L 19135569 5' + Burdock 25 2 68.28 GCCATCGCCATCACAAACCGACAAGCCGACGTACCGACATCAGCATCAACAGCATCAGCCAAACAAAATGGCTGCTGTCCCCGGAACACACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGA:1 + chrX 21183259 5' - S-element 1687 1 63.01 ATTGAATAAAATGCTACACAATGTTTAGGACGAACAAAATTGTATGCAATATAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chrX 14318486 5' + 297 58 2 68.49 AAGCAGCAGTTGAAAGTCCTCACCCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTCCTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr3R 12781516 5' - pogo 2063 1 71.11 AGTTGGACGACTATGAGGATCACAGATAAGCTTTGGAATTTCACCCATTGATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATA:1 + chr3R 8293489 5' + Stalker2 7268 2 70.55 ATTCGAACCATGTGCATGGCAAACTGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATAC:3 - chr3R 9863002 5' + Stalker2 38 2 59.59 TCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTC:1 + chr3R 24301836 5' + Tabor 6923 2 72.60 GATAAGGAGAACAAGGTGGCTCTGGTCAGCGCCTCGACAATCACGGCGGCAGCAACCGCAACTCCAACCTCCCATTCGCCCACATATCAAACAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAACGCG:1 - chr3L 451543 5' + Porto1 332 1 60.27 ATCTTTGTGTATGTAAAGTTAAGAACTGTGAGAAACTATTTTCAATAGCTATAGTCGGTGTTTTCCATTTGAGAACGATTTAATAAAGTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - 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chr4 71480 5' - INE-1 90 1 75.34 ATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTAC:1 - chr2R 10666925 5' + hobo 71 1 65.07 ATTGTTGTAGTTCCTTATGTTAATTACAATAATTAATGTGGTAACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr2L 20262691 5' + roo 72 2 70.55 CAAAATTATTCGTAACTTTGCCAGCTATTACTGTTTCAGATTGTAGACTAAACTTAAATCAAACGTTTCTCGCTGTGTACTACAACCATTTTCATTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTT:1 + chrX 14213713 5' - 1360 3218 1 64.38 CTTGCTAGAACTGGTAAAATGGCTAATTAGAAAATCGCACCAATCGATGTGAGTACGTATGGAAAACTGATATGGAATCACCCGAACATAACCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr2L 12696089 5' + pogo 25 1 60.96 AGAGAGTCACATTCGGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGCTCTCGGCACTCG:1 - chrX 22715179 5' - opus 477 2 71.23 GAGTAGAGACTCCCATCTCTCTCGCACCTGCAGTGCTAAGCCTTCGAAAACAGGGGCTCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 - chr3L 17896003 5' - P-element 2842 1 48.39 CAGTCCATTGTCGGTACGTAAGTATTTTGGATAGCCTAATCTACAAAATATTTCTTTCATGAATCCAATCAAACGGATGATATAATAATCTTTTCTAATACAATAACAACATTACACTGATGTAATACAAATAATTAATATTTTAC:1 + chr3L 25725989 5' + TLD2_LTR 102 1 50.68 AATAAAGTTAATATTAGTTTTGCAAGAAAAATGGCGAAATAAAATATGACAAGGAATGCTATATGAAAAAGAAGAAGAATCTAACTTGATAATTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTT:1 - chr3L 24123350 5' + GATE 8276 2 64.38 TTTAGAAAATTATCTTGTTTAGAAAGTAGTTACATGATACATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACAT:2 + chr3R 26693363 5' + Stalker2 81 2 73.29 AAGCTGCCAGCGGCTGTACCACCGAGAGCGTGCTGTGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr2L 19681006 5' + hobo 25 1 58.89 TAATTAGCTAAAGTTCGCTCCGCCATCAATGAAGATTCATATCGGTGTGTGTGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr3L 13568178 5' + hobo 65 1 63.70 GCCTTACTTAATATCAAGTTTATGTATTTATTATCATCTATCTGTATCTATGAACTTGTTCCATTATTTTTCGGCCAGTGCATAGATAATCGTTGCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTAC:1 + chrX 19032285 5' + Cr1a 4382 1 60.96 GGAAGCCGTCCATACAAAACTTGAGATGTATTTCCCCAGAATCTCTAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAA:1 + chr2R 5800479 5' - HMS-Beagle 175 2 67.12 ACGTTCAATGCAGCACAAAATTCCAGTTGAAATGGTTAAATTCGGGAAAAGGAAGAAGGAAAGTTTAGTCGAGTTGAGTCGCTAGTTGAGTATGAAAGAAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3L 2240541 5' + roo 18 2 73.29 TATAAAAAAATAAAAATATAAGTACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCA:1 - chr2L 15031951 5' - opus 19 2 81.20 AAACAAAGAAGTACCTATTAAAGTAGAGACTCTAGAAATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTG:1 - chr3R 1048075 5' + Stalker2 44 2 55.48 TAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAA:1 - chrX 22715119 5' - opus 415 2 78.77 GGAGTCTGCTCTATATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAAATATGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAC:1 - chr2L 21082204 5' + mdg3 5329 2 68.49 CCGGCCACGAGCACCGACTGCCAATTTGTACGTCCATATATATTGAACAACGCCCTTTGTTTAAGTGCCGATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCG:1 + chr3R 29952670 5' + invader4 2793 2 56.72 AATAATTCAGGTTATTGAAAATATATTTAACCTATTAAATAAAAGACTAAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - 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chr3L 13380541 5' - hobo 2894 1 52.17 GGAACTGAGATGGGGTTCGCCCGCTTCGCTGGGTTCGTGGCACTTCGAAACTGACATTTGCACTTTTTCCCAGGCCAAAAACCTTCTGTTGTAATGAGAAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr3L 9240509 5' - 412 7511 2 60.96 TTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr3R 5087085 5' + P-element 63 1 33.86 ATGAATTTGCGTGAAATTCTCAAGATTTTATTGGCCTAAATATAGTGATCTGCCTTCGAAGGTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 + chr3R 5684054 5' + pogo 54 1 55.48 GTGAAATATTTTCAATTTGTGGACACGAAAAAAGTTTTGTTCGCCAAGACGGGCTACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACA:1 - chr2L 2675056 5' + Quasimodo 60 2 62.33 GCAGTTGTGGCCGCAGTCGCTGCTGCAGTAGCCAAATGGCCAAAAGGCAAAAGAAACTCGGCGCTCTCCTGCGTCCGCAAACAGTAGTTAAAGCGGCTACCAATCCAAAGAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGC:1 + chr2L 7907630 5' - Quasimodo 7048 2 77.93 CTTCCCATCATCAGCGGCGGAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGTTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 - chrX 19744518 5' + P-element 43 1 53.96 ATCGATGGTCAAATATCGATAGAAAATCTAGAAATGAAATCAAATTTGCATATACATATGTATGTATGTATGTATATATATATCCTCTAATAAAAACACAATGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 - chrX 16325270 5' + Transpac 4936 2 71.23 TATGATTTAACAACATTGATGGGAAACTTATGAACAGAGGAACTAAATGGGATTATAAGTATTTATAAATATATTCATAAGATGTTTACCTCCTTTGGGAAAATCTAGAGAGAGATATAGTAGGGATTTTTGAAAATATGTATGTA:1 + chr3R 29539536 5' + Dm88 4358 1 54.11 TTCCCAAGCCACTGCAGTTGTGGAGGCTAATCAAAAAGGAAAAATGCGAAAATCGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAG:1 + chr2L 16202605 5' - copia 190 2 65.07 GCCCGGAGAGTTTGGACCAATCATCGCGTATGCGATTACCCACACACAATATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chr3R 25094702 5' + P-element 47 1 45.16 ACTGCTTGCTAGTGCTGTGTGTGGCATGGCTTGAGACCTATTGCAATCGATAGTGACACGACTTGTGCTGCCTCACATCACTAGCCCAACAGCTGTTTGTACACAAAACAAGTCAAAAGTTAAGCAAATTTAATTTAATTTTAATT:1 - chr2L 3872510 5' + Rt1b 123 1 63.70 TTATGATTTAACATATTACCTCTCCATAATATGTAGATTTCGGACAAATTGTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 + chr2L 22031923 5' + Tabor 6864 2 68.49 TGCGGAATAATCTCTTTGATATGGCGATCAACACTGGCGTATTTGAAACAAATCAGCGTAGAAATTTAAATGTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATAT:1 - chr2L 17387535 5' + mdg1 50 2 52.05 GTATACGTAATATGTGTTGTTTTTAGGCATTATACACTTTTATTGACATGTTGGAGTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1 - chrX 18055815 5' - 297 331 2 64.38 TTAAAATATAACCAGGCAGCTTGACAATCCACGCGAAAAACTGGCAAACAAAATATGTTTCAGCCAAGCGTACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAAT:1 - chr2R 18927876 5' - 3S18 6054 2 51.37 TTTACGACTGCATCCCAGAGTGTTGTTAAAACTTTGCCGTGCTTAAATTCGGTTATTGTTATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAA:1 + chr3R 26352689 5' - mdg3 32 2 59.59 AAGGATTAAATTACCCAGCAATCGAAGTTCGAAACAAAGCGAAAAAATAAAATAAAAATAAAATACATTCTCCCGTATACACATATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chr3R 6475078 5' + opus 143 4 44.52 ATTGTTTTATTATTGTTTTTATAGTAGTAGTTTTACCACAATTTATTTTGGCTCTGTTAACTGTTGTGTGTTGCAGACTCCATTTACGTCTTACAAAAACGTACGATCCATACCAGTCTGCATGACCGAATTCGGACGGCCACTTG:1 + chr3L 3947344 5' - Doc4-element 443 1 71.92 AATATGACTGTGAAATATTTTCAATTTGTGGACACGAAAAAAGTTTTGTTCGCCAAGACGGGCTACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAAC:1 - chr2L 2675065 5' + Quasimodo 51 2 56.16 ATATATTATTCCGATTTTAACCATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAAAAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGC:1 - chrX 22386827 5' + hobo 65 1 66.44 ATAATTCAGGTTATTGAAAATATATTTAACCTATTAAATAAAAGACTAAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr2R 12416994 5' + pogo 15 1 75.34 GGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCA:1 - chr3L 3540211 5' + mdg3 56 2 62.33 CACTTATAAAAATATACAGAATATATAATACAGAAATATAGGCTTAAATACAGTGCAATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCA:1 - chr3L 16563407 5' + I-element 64 1 64.38 TACCGCAATCTATGCTGACTGAATAAAATTTACATTACAAAAAAAATTAAAAATTATTAAAAAGTGTAGACCTTGCAGTTTTTGTCGGCTTGTGGGTTTTAGAGTGGGCTGGGTAAGTTTTTTGGGCAAATCGATAGAAATTTAAA:1 + chrX 187227 5' - INE-1 440 1 72.60 GTGAAATATATGTAAATATTTTTCAATGTGACTTTTTGATGTATAAAAAGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTA:1 + chr3L 4355432 5' + FB 73 1 67.81 GTAGTTCTAAAAAAAATTATTATTCTTTAAAGTAATAAATCAGTAGGCGCATATAATATAGTTGTGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCGAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:2 - chr2L 9499349 5' - Transpac 5163 2 62.33 TCTCGGTCCAGGTGACAAGAATCCTAATAACTTGCTTATGAGCTGGCCTCGTGGCCAGATGATCGCCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGG:1 + chr3R 18141728 5' - F-element 4409 1 54.79 AAGAAATAAAAATAAAAGTAGATCCATTATGACCTGATGGTCCTAATAAAGTTTTAAATTCTTTATGAAGAGTTTTATTCATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTACACAATCTGATGACGACCCGA:1 - chr3R 25229585 5' + R2-element 276 1 49.66 CAGATGCATTTGTTGGGTTTCCTTGGGCGAATTGAAGTATCCAGCATTCTGGTGCTGAATTTGAGCGCTGCCTGAAAGATTCTTCTCGTTTTGTATTACAACTTTGATCTGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 12775913 5' - roo 398 1 78.77 AACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chr2R 17872483 5' + Tirant 52 2 59.20 ACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 + chr2R 10189257 5' + Doc 63 1 60.27 CAACAGCAACAAAATTAATGAAACGAAGAAGAACAGCTGGTATAATAAATACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr2L 13102872 5' - roo 9002 2 66.44 AACACTATGGAGGTGGAACAAAAGCAAAAACTACGCACACGCGCACTATTTATGGCCAGCCATTTGGATGGGAATAATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACG:1 - chr2L 3382135 5' - Stalker 7041 4 51.37 TATGAGTGCAGAAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 + chrX 16857059 5' + pogo 65 1 63.01 GAAAATGTTCAAAATATAAATAAATATTTTACGCAAAAAGAAGCATTCAAATGTATACATTTAAATGTATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGCGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTC:1 - chr2L 13156593 5' + Max-element 8285 2 50.00 CGGACTCAAATTGAGTTATGCCTCGGAGAAATTCATACATGTATGGAAATAAGCTTGTAAACTGGGATTAGAAGGATACCACTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 - chr2L 2523003 5' - mdg1 7417 2 56.16 ATTTCAGTTTGTTTTGCACTTTTTTTTGTGTTCGTGGGTAATGACTAACGCACTGTCAAATGCCCCACGTTGGGCGCCAATTATGAAAAGGGTTGGCCGGCGGTTAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGGTCGAGGGTGGCGCCTTTTG:1 + chr3L 11631925 5' - Tirant 387 2 69.86 AAATGCGGGGTAAAAACGGGTATGCGGTTTTTGTGGTTCGATGGCAGAATGTTGCTCACCGAGCAAGTGGCCAGCGGAAAAAAAAACAAGCAATGCAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - 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chr2R 21244983 5' - roo 9035 1 60.27 TCGCGTGTCTTGCTTCCTACGCAAACGACCGTCAAACACGAACTGATCGCAAGCGCTGCACTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr2L 14263049 5' + P-element 6 2 73.68 CTCTAGAAATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATA:1 - chr3R 1048046 5' + Stalker2 7321 2 66.44 TTATGAGAATATTGCCTATTAAAGGAAAAGTCATCCACATATATATATTTATTCTAAAAATATTAGGAAAGTAAATCTAACCACATAAATATTTTCTCAAAGATAACACTTTTTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGA:1 - chr3L 4355570 5' + FB 10 1 78.08 TAACTCTAATTTATTTTTATATGTATATAAATCGCTTTAGGTGTAGGAGAAAACTGGCAGCGAATGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACA:1 - chr3L 21043144 5' + Quasimodo 22 2 65.00 GTTAAATTAATACGCCTCCCCCTCAACGCAGCGCCTTCCTTTTCATTTGGTCCCTTAGTCAATTGGCGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAA:1 - chr2L 19841588 5' + BS 50 1 52.74 CAAGGCTTGTGGTAAATGGCAGCGCAGTGGGCTTGGCAATCTTCAGCAGGCGTTCCACCTTTTGCTGCTCGCCCTTGAGTCGTTGCTGCTCCAACTAATTGGAAAGAAGCCATGGTCTTAAATCAATAATTTTGTTGTTTTTGTTT:1 - chr3R 18679479 5' - gypsy11 3935 1 69.86 CGAAGCACAAAATGCAAATATGCATTATGCAAACCTAATTGCAGGCTTTGTAGTTGTTGGCACTGCAGTTGCGTAATTGTAATTGCGTTTATTGTGTGCATGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAA:1 + chr3L 17782613 5' - 1360 145 1 69.18 ATGAGAGAAGCACGAAAACATTCAGAGAAGTATTTGCGGTTTGTAAGCGAGTAGAGACTCCCATCTCTCTCGCACCTGCAGTGCTAAGCCTTCGAAAACAGGGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr3L 17896051 5' - P-element 2874 1 75.71 ACATGTGTGCGCGCCATTCAAATAGGTTAGGAAAATATGTAAATGCTGCTGGCATATCGTATATGGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chr3R 11483751 5' - pogo 2048 1 54.11 TTTTTACACTTGCCGCCTTCAAATGACATCCCCTGAGGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGT:1 + chr2L 9109864 5' + opus 186 4 72.86 CTGGGAAAAATTACACAAAAATAGCACAACTGGGTTAAAAGCAATAAAGTCTATTTATATGACAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTT:1 + chr3R 23714023 5' - I-element 5296 1 59.59 TTGCAATTAGCGCGGCTAAAGAGCAGTGGAATTACAACCACAATCAGATCTGGTAGTTCTGGAGTTCTTTATCTTGACATTCAAAAGTACAACAGATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3R 29623326 5' - roo 9043 1 39.04 AAGAAAGTTCGCAAGAAAGTGAGAAACGAAACCCGGATCAAAGAATAAATTTAGAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3L 12776095 5' + roo 31 2 64.38 GTCGAACTGAAAGCACAAGCCCAATTTAAATTCCGGCTTAGAAGAAAAGCTTCAGTTTGAATATTTCAAATGCTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 + chrX 13008676 5' - blood 7343 2 53.15 AAAAAGCGAGAAAAACGTCATGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATCTTTTTTTGAA:1 + chr3R 25137992 5' + P-element 101 1 16.44 CCCCATCACCCTTCCATACCATCCTGGCTTCATTTTAGCGGAGCATACTTTCCAGCGCTCGCACACTTTGTGGCTCTCATGAATTTTTCCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAA:1 - chr2R 5899329 5' + jockey 4535 1 61.64 TCGTGTTAGTTTCTGTTCATTAAAACATGTTAAACACATAATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 + chr3R 12886004 5' + 412 70 2 73.33 TTGCAAGTGCTTTAGTATCGCATTACGTTATTTCTGGCATGCAATTCCGTCTTAAATGGCGTGAGGTGCAGTAAAATTTCCAAAGGACATTGGATTTTCCTTGCTAAATTTATGGCCCATAAAGTGTGTCCGTTTCATT:1 - chr3L 3427641 5' - Juan 296 1 66.19 GGCGCTTTGCTCCGATTGGTCGAGAAAAAGCGAGAAAAACGTCATGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:1 + chr3R 25137968 5' + P-element 24 1 51.61 ATTTGTCTGGCTTTGCAAAAAAAAACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 + chrX 12344280 5' + F-element 52 1 60.00 CGGGCCCGGTCACGATCGCACTAATTGTTTAATTAATTTGTTTTGCATTTAAGCGTAAACAAGGCCTCAACTTTTTATTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCTTGTAAGACGC:1 - chr3L 16423048 5' - rooA 7473 2 51.37 TACAAGACTAATAAAAATATCAAATCATTTTTCAAAAGAGTGACCGTGACACTTTTGTGCGACACGTCTGTGTCTCTAGAAACTGTATGCTTAATCTGACCGCTCTAGCTTCTATAGTTCCTAAGATATCGACGTTCATACGGACG:1 + chr2R 5324617 5' - INE-1 132 1 56.85 AAGTGCCAGTCTTCATATATGTACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCCGTACTCTAGGCACC:1 + chr2R 15892164 5' - hobo 2894 1 73.40 AATTGAGGTCAACGGACCAAAATAATAAAAGAAAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACC:1 + chr3R 7645127 5' + I-element 89 1 80.82 CTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTA:1 + chr2L 19907558 5' + hobo 70 1 65.75 CGGAAACTAACCATAAGCTATTTAGTTACCCAAATGGACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGC:1 + chr3L 5425472 5' - blood 296 2 74.66 GATAGGTTCCTTACAGAGATCCATTTCAGGTGAACATTTATAAAGTACACATAGTTACACATAGGCGATACATACACAGGGTTACAGATATAATTGGGTATGGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr3R 17747422 5' + 297 6592 2 78.77 TTTCACAACATCGAGAGTTCATTTTTGTTCTTGTTGTTGGGTTCATCGCTGTTGAGTGTGTGTGTGTGTGTTAGAGTGTTAGATTGAGTGTTAGAATTGAATGACTTAAAATTGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATGTTG:1 - chr3R 24710402 5' - Cr1a 4132 1 56.16 GGAAAGTATGACGGCAAAATCGGGGCTTTTCCGGGGGCTTGGCCCTATATATGTATATATATATGTATATATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr3L 2625042 5' + opus 37 4 58.39 GTTCGTCACGTTCGCTCACTTCAAATCCCATCAATGGAATACGGCAGAGATCGCAGTCATGTGCTTTTCGTTTGAAATGCTTTCGAGGGTCGCTCGCAGAGAACTGCAATGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chr2L 1892402 5' + hobo 22 1 69.06 TGTGTAACGAAAATTCGTAGTTTGAGATACACAGATCGAGTCGCCGAAGAGTCAGAGAGCTGGAGACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTACGCATAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAA:1 - chrX 13325742 5' + invader1 339 2 54.79 CATTATCATCTATTCCTTTTGAGTTAAAAAACAATATTGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3R 10800521 5' + roo 83 2 75.34 TTTTAAATTTCTATCGATTTGCCACGCCCACTCTAACGTCCTATCTTATTACCCGTTCTCCCATCTTATTACCCAAAATCGATCGATATTCTAGAAAAATAATGAAATATTGCGTTTGCATTCACACTAGCTGATTAATGGGTATC:1 + chrX 23005472 5' + INE-1 541 1 45.21 GTGAAATTCTCAAGATTTTATTGGCCTAAATATAGTGATCTGCCTTCGAAGGTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 + chr3R 5684064 5' + pogo 64 1 62.33 TGTCAACACACAGTGTGTGCTAAGGATTCAAACCTTAATTTGTTTAAATAAGCACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCATCGGAGCTTA:1 + chr3L 15374628 5' + 3S18 69 2 61.64 AGAAAGCCCAAGGCTGCGGTTGCTTCGGCCCCGTACTCGCTGGCGTATGAGCAATATTAATTGTAGCTGAAATTAATCATACGCACCGTTGCAGAGCATGGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 30524597 5' - roo 389 2 71.92 CTGCTGGCGTTTCTCGTGCATAAATTCATTTTGGGTACATTGAGATGTGCTTATTAGAGAACACACATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACC:1 + chrX 19766713 5' + copia 55 2 56.16 AAATTAATGAAAATAAAGAAATAAAAATAAAAGTAGATCCATTATGACCTGATGGTCCTAATAAAGTTTTAAATTCTTTATGAAGAGTTTTATTCATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTACACAATC:1 + chrX 12331430 5' + R2-element 262 1 39.73 TTTTACCAATCGAATTCGCTTCACATACAGTCGAATTCGATTTGATTTTACTTTATTACACGAGTCAAATTACGTGCATATATATAGACCTCCTTCGACCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 + chr3R 6171075 5' - 297 375 2 73.29 CCGCAAAGTATGCAAAGCCTAATACCTACTTTGCGTTCGGTTAAATGCTGCAGCCTCTTGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 - chr3R 6149867 5' + jockey 71 1 58.90 ATTGGTAAAATTGAGATTAAAAGAAGGAAAATATTAAATGAACTTAAATAATATGGGTTATTTAAATTAACATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCT:1 + chrX 16538081 5' - mdg3 5449 2 51.37 CCAGAAAACATTTTCAAAAGCCATTGAAAACTTTAATTGAAAATATCAAATTATTTTCGAGTTAGCGTCAGCATAAAAAAAAGTCAAAACGCCTTGTCTTCAGTTCGATGAGGTTTCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chr2L 16360720 5' + hobo 5 1 78.08 AAATTATTGTCTTGTTAACCTTAAAAATATTTAATCTAAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATC:1 + chr3R 26349375 5' + mdg3 82 2 73.29 ATACTAGATTCGTTGAAAATTATACAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCAAACTCCATAAAGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTATTTTTCTG:1 + chr3R 28636012 5' + invader1 3669 2 62.76 CTGCGGCTCAGTGGCGACGACGACTGTGGCAATAGTTTTGTAATTAGCTTGCGATGTCCCAGGTGATAAGTGATATTTAAGGCACTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr2R 18785919 5' + roo 8702 2 45.21 AATTCACGTTCGCGTTTTGCTCTAAAAACATGGGCGTAAGAAAAGGGGGAAAAAAAATATATATATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGACGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCACATCTCTTTTT:1 - chr3L 11903315 5' - micropia 405 2 56.25 ACAAATGCTGCAAACGATCTTGCAAGGGACTCTATCTGAAACCGGAGCATCTACACGATGGAAAACCGGTGTTCCGGCCTCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 + chr2R 12872861 5' + P-element 14 1 68.64 GGGTGCCATGCCTGCAGCTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTC:1 - chr3R 15035173 5' - Stalker2 7611 2 57.53 ACGCGAATTCTTCAGGAGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:2 + chr2L 951303 5' + F-element 65 1 55.48 TAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTTGAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGG:1 + chr3L 23112567 5' + R1A1-element 39 1 68.15 AAATTCTATGCACGTCAAATGTCAATCTGCATACACATATGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCC:1 + chr3R 8965153 5' - HMS-Beagle 168 2 71.92 CGCTTCTTTACCTATGCGGCGCACTCTACTTGTGTGTGTGTGGCGTGAAAACGCGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTA:1 - chrX 7930772 5' - P-element 2821 1 40.41 CTGTAGCCAGGCGGCATTTTCAATTTCGCTGTTGATAAGCATAAAAATCACTGGGTTTTCGCTTTAAATTTTTATGTAAACACGCGCACACCCCGGCATCCTCCATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr2L 19628360 5' + hobo 17 1 72.60 TTAATGGCTTGGCGCACTTCAGGGGTTAGATCTGCTTTGATTCACCGTAAAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGT:1 + chr2R 24212196 5' + flea 384 1 65.75 ACTCTCGGTGGAGTTAGCAAGCTTAAATGATTTTTAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr2L 15596939 5' - roo 8989 2 80.14 TGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCT:1 + chr3L 1983470 5' - Transpac 243 2 72.09 TACTTGGGTGTATAATTTTCTGTAATGACATTGAAAGACACGATTGGTGTCAACGATTTGAAGAATGAAAGTTCTGTTTTTTGTGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr2L 8909762 5' - roo 9037 1 59.59 ATATATCATTGCAGATAAGATCTGCATAAGCATAGAGTTAAAGGATATACACCAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAACCATATATGTTGAAATTTCTCGCTCTTTCCTTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTG:1 - chrX 15666903 5' + INE-1 543 1 57.53 GTCAGCTTTTACGTATCCACATCATTGTCCTGACGCCAGGCCGTGAAGTGGAGCGCCTGAACGCTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCA:1 + chr3R 509500 5' - R2-element 3193 1 62.33 AGCTCTACGGCGGAATCACGACCGAAATTCCCGCCACAATGGCAGGCATCCATCAAGCAAATTGAACACGCCCCCGTCGCATATATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCC:1 + chr3R 20720484 5' - 1731 4589 1 59.59 CTTAACGAAAAACTTTCCTAGTTATAAAGAGACTTATGTCAAAAACAATAGCACCATTATCTAAAGCCATTCCGAGTTCTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 + chr3L 8704479 5' - blood 335 2 56.16 ATGTATTTGCTTCTTTTTCAAATAAGTTAAAGGAACCTACTATCCTACCTATACCTACATGTTCATTAATTACGATTAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chr3R 25052978 5' + pogo 39 1 58.90 GGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 + chr3L 10068920 5' + 412 7142 2 79.31 CCATTTTGGCTTGTAATCAGTAGGCCGTGCAAAAGTATTTTATGTGTTTGGTAAATCCATTCATAACTAAGCTAGTTGTCTTATTCAAACCCAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 - chr3L 17710713 5' - I-element 5326 1 66.44 GTTCCTGGGATAAATGGAGAAGCGAAGGATGTTTAGATAAATTGCGCCTGCAGAGATTTACAAATTACGCCCGAGGCGGCGAATGGCGAAAATGGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGC:1 + chr2R 18467090 5' + roo 26 2 65.07 TTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTG:2 - chrX 12995403 5' + blood 66 2 62.33 ACGGAGAGTTGCGTAAGAGGCCAGAGTTAAAATTAAAGATTTATAATTAACTTTACTGCATTTTACTCAATTCTGCAAAATGCATACCATGTTTCATTGCAAAGGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2L 15597064 5' + roo 15 2 73.97 GATTCGTTGAGAATTATGTAACACCTGAAATGGATATATTCTTAAACAGGCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATAATTCTAGCTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGA:1 + chr2L 21902491 5' + Ivk 35 1 59.59 GAGCAAAGGTGCTGTAGAATGGATTTGCGGCAATTTGCGCCAGCACCCTTTCCATATCCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1 - chr3R 15700429 5' + Transpac 4980 2 59.59 GACCAACTGAGACATGATTTTCGAAATTGCGTTTTGGCAAAGCTTTGTTATCATATTAAAGGGTAAATTTTTTTTTTTATTATTATATTCGGCAGGAAAATGAAATCTTCTTAAGATATCTATCGTCCTTATATGGCATGCACGAT:1 + chr2L 23181826 5' - Rt1a 5011 1 49.32 CCTTGGCAAATATTGAATCCGTATCACAGCCATAAACACTCCTTTTTCGGTCTTATCGCGACCCGTCGTTGTCTCTATCATAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCAT:1 - chr3L 19181467 5' + Cr1a 4159 1 47.95 CGTGCGTTGAAAAATACCCCCAAGTTGCCCAACGACACCCAATTCCACTTGATATGTCTTTTTGGCATTGTTAGCCTTATCAGCTGTCTATACCCGTTGAGTACGGCCCGATCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAAT:1 + chr2R 24684226 5' - Doc2-element 4718 1 76.03 ATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr2R 11609905 5' - roo 324 2 78.08 AATTCGTGCCGGTAACTTTATGCAATAACTTTATGCTAATTATTGATAAAATGTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chrX 18055715 5' + 297 61 2 65.07 GGTGGGTAAACACAAATCCCCACTGGAAAACCTTGCACTCGTCTTCCGCAAATCGAAAAAAAATCAGCACAACCACATGTTCTCTATCTTAGCCATTATGTAGTATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAA:1 + chr3R 7112246 5' + Tc1 1582 1 67.81 GTGGCTGTTCCGTATTCCGTATCGAAATCGTATAGTTTAATCGATAAATTTACCCGATAATAGCAATTAATTAAGCTAATTTTCAAAGCGTGCTCATAAAATATTGTTTCACATTCACATTCTCTTCACTTCTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 20960805 5' - gypsy2 403 1 66.44 ATATTCTTTACGTATATAATATATATTGTATATAAACATATTGCTGCAAACAAATTTAGGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3L 8889939 5' + roo 60 2 58.62 CTCTTACATATCTGCATTAGCGCCATTTTAAATGCGATAGCGATTAGCCGATAGCACTTATCGGTCACACACGCTAGCCAAACAGTACAGTCACCACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 - chrX 11236523 5' - copia 228 1 65.07 AGACACGAAAGAAAAACAAGAGTCTATTTTGTAAGGGCAATATACAATTCTACAATACAATTCTTTTTATACCCGGTACTCTAGATTCGAGACTTTCCGACCACATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCG:1 + chr4 520284 5' + INE-1 93 1 63.70 ATTTGCTTCTTTCATGTTGGTGCAAATAAACTCTAAATGATTTCAAAGTTATAGATGTTTGCATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTT:1 - chr3L 11754772 5' + Doc 132 1 53.73 AACAAGCTGGAATTTCACAAATTTCATTTCAGGCCATTTCACAGCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCG:1 + chrX 17690419 5' + Doc 290 1 69.18 CTCGAATAACCTAGCAGAAGTTCGCATTAAATCTACCCCGGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAA:1 + chr3L 6542006 5' + hobo 78 1 70.63 CAATTTCATTTTGGTTGTTGTGCTGATTTTCACTATGGATCACTAAAGGATGAATACAGTGAAGTCCAGATTTTTGTGTAGCCGGAGGAAATGAATAAAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTTTTAGTAGGATCTAATTAT:1 - chr4 1166817 5' - Cr1a 4287 1 61.64 AGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGAC:1 - chr3R 17794585 5' - P-element 2790 1 19.18 CCTTCGTTTTCCGGGTAATTTTATCTCACTCATTGCCTCGCCCCCTAGCTGCTTAATTTTTACACTTGCCGCCTTCAAATGACATCCCCTGAGGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr2L 9109800 5' + opus 7026 2 67.81 CACTTACATTGCTCTCCCTGGGGCGACAGCTGTCACCCTTGCACACACGTACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1 + chr3R 17079420 5' + 1360 71 1 68.06 GTATATGCAACCCCAGGTTGATACAGTCAAGATAAAAGTTCTATTGACAAAAATATGGTTTGTTATTTGGCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3L 18954072 5' - roo 9020 2 53.42 AGTAGGCTACACAAATGTCACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGGAATCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 + chr3R 27056390 5' + jockey 84 1 67.81 GCCAATTAATCTTACGCCCAAATCGCGTGCACTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGCTTTTTTTGACACCCTACTT:1 - chr3L 9993974 5' - hobo 2871 1 71.54 AACACAATTTACTTAATTTTTGCATATCTCGCTTCAAATTACGTTGCATAATTTTGAATAATTTTTATTCGTATTTTTTGTGTTGCTTTTTTCTGCTTTACTCTTCTCTCTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTT:1 + chr3R 5083614 5' - P-element 407 1 76.71 AATGAATTGGCCAGTGTGGGTGGCGCAAAAATACGTCACTAAATACCTGTTACATACTTGGCAACGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:2 + chr2L 21715732 5' + pogo 53 1 57.53 AAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAAC:1 - chr3R 21276616 5' - BS 5025 1 62.33 ACTTGCCGCTCAACGAGAGTCGTGCAAATGAAGTCATTTCGAGTGCTCAACTCGACTATCAATTGAGGGCAAGAACTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGG:1 + chrX 8855958 5' - 297 359 2 61.81 TATGCACATTTTACAGTCTCTGTTTTATGGCAGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGGCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATT:1 - chr3L 19398191 5' - gypsy5 7285 2 74.79 CAGTCGCCAGTCGACACATGGTGAATATTCGAATTCAGATTCGGTCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCT:1 + chr3R 17794542 5' - P-element 2817 1 33.10 CNGTGTTAAAAAGTCAGTCTAAAAAAGTCATGAATATATATATATGTATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAA:1 - chrX 19766806 5' - copia 181 2 71.92 AAACCGGAGTATCTACACGATGGAAAACCGGTGTTCCGGCCTCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr2R 12872899 5' + P-element 63 1 34.88 CTACCATGTCCTGTTGACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCG:1 + chrX 16995038 5' + jockey 79 1 61.64 CATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTG:1 + chrX 18193730 5' - hopper 1333 1 75.34 CGTTAGCTTGTTAGTTGCAAATTTATCTAGCTTGAGTTGAAAGTAATTGAAAACTGATATTAATTTCAAAGGTTTGCTTATTCAATTCTATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGAC:1 - chr2L 13232054 5' - flea 151 1 54.79 ATTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTAT:1 - chr3R 18873667 5' + micropia 5092 4 52.74 GAATCCAAGAAGATTAGCAGTGACAACAAGACACGTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - chr3L 23868300 5' - 412 7459 2 75.34 CTGCATTCTGTTGGTATGACTAATCAGCGTCAGCATATGCGAAAAACAATGCCGCACCGAGTGCAATACCAACGTGGAGTGTAATAATTGTTATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGAT:1 - chr3R 24301930 5' - Tabor 7279 2 55.48 CTAATATCGTAAGAATATCATAGATTTAAGGCAGAGCATTTCAGACAGCACTTGTACCGTTCTAGACTTAAGAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr3R 18514449 5' - pogo 2059 1 56.85 ATTATGCAATACGCAGTTTATGTCCCATGCGGAATCAATTTCATCTCGGTATACGGTTGATTATTACTACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1 - chr3R 22275364 5' + flea 4797 2 55.47 ACATCAAAGGGATTCGATTTCAGAAAAATTCCAGCGACTGTTGCATACTTATGGGTTACCTTTGCTATTCATAACTTACACGGGCCATAAAATATTTATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2R 22040867 5' + jockey 30 1 65.75 GCCGCTGTTCTCGTGTTGCCGCTGTTTTAATGAGCTATTAAAATGTTTGGGGAATTGTAGTACATGTGTAAGAGCAAATTGCCGCGGAAGAATGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAAT:1 - chr3L 12046628 5' - R1A1-element 164 1 63.01 TGTTGTTTTTGAGCTTTGCTGGAAATAAAAATTGCTGGCGATAACATTTAGGCAATTCCACTGCTGTGTCCCTCTTTTCGAAAAAAAAATGGGTTTCAGTTTATCGTGATTTCCGCCGATGGCCTACACCTC:1 - chr3L 20193548 5' + gypsy12 209 2 59.85 GATTCAAGTGTTTAATTTGCAATTAAACAAATTGATGATGAATTAAAAAGCCTTTGAAAAAGAATTAAATCAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 + chr2R 18922493 5' + opus 7161 4 54.79 GTGAGCAGGATAGGGTGTGTGTCTGACAACTAAAACAAAGCCCAGAGAACAGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 - chr2R 22795215 5' + hobo 62 1 63.04 ATTATTGCAATCTCGTTTCTCGCAACCCAAGCCCAAAACACACATCAAAGGATCTCAAACTGATTTACAGTTGCCGATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGT:1 + chr3R 13183678 5' + hobo 2549 1 52.74 ATGCGAGTCAATTCGTTTCCTGAAGTATATACAATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTAT:1 + chr2L 13976202 5' - I-element 5267 1 75.34 TGAGGACGAAGACGATGACGACGACAACACCGACAACGAGCAGCAAACCCCTGTTGGGGAATCTGCTCCAAAAACCATGAAAAAACCCAACCCGACCCCGAAGACCATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCA:1 - chrX 10163859 5' - G-element 4152 1 77.40 ATTATTTACTGCTTTCATTTGCAGCTCACACTTTAATGCTCATTAATAACTGCCCACTTTTATTGGCCGTCCATTAAATTAATTAAATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 + chr3L 20042382 5' - flea 221 2 63.01 CCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTT:1 + chr3L 3540113 5' - mdg3 190 2 53.42 ATACGAGTATATGATTTCAACGACCCGAATTTGAGCCAATTAATCTTACGCCCAAATCGCGTGCACTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 - chr3L 9994008 5' - hobo 2883 1 53.79 CGGGGAATATGCAATTGCAAATGGCGAGTTAAGCAAATGTGCAAAATACAATTTTCGCATTGGACCGCATTTTAATTTTGTTTTATAATTTCGCAAATAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCA:1 - chr2R 20117428 5' - mdg3 5477 2 73.29 TACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr2L 19907556 5' + hobo 63 1 63.12 GTTACCTATTTAATGAAGAAAGGAATTGTCAAGCAATCCGTCGATAAAGAAATTGAGCTTTACGGAGAAGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 - chr2L 22177470 5' + Doc 57 1 55.48 CGGGTTAGCTTAGCGAGCGTTAGGATGTCGGCGATATGTTAAGTTGACAGCGTTTGTTTTTCGGAATAGGATAGGGTATGGATCTGGGTTCCAGGATATCGGGATATTGGATATTGGATATGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCAT:1 - chr3R 13463225 5' - accord 7016 2 86.99 GATGAGTTACAAATCATACAGTTATGACCTGGGTGTCTCGTTAAGACTTGGGTGTCTCATAGGCACGTTGATAAATACCGGTACCTTGGCATTACAGTTGGCGGTTGAATGTTCTTCCGCATATCAAGTCGCTACGTGATCGGCTG:1 - chr3L 24153722 5' + R1-2 2953 1 59.59 ATTTGCTTGTGGGTCGTGTCATATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chr3L 20910122 5' + F-element 49 1 51.37 GGTTTTCGGTTACAGCAAATCACAGTTGCAGAACGCCAAAAGAACCGAAAATCGAAGCCAAAAAAGCGTTTGCATATATTCAAGTATAAACATATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 + chr2R 6713799 5' - 297 372 2 71.23 GTTGCTCACCGAGCAAGTGGCCAGCGGAAAAAAAAACAAGCAATGCAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chrX 3637853 5' + roo 8739 2 71.92 TTGATTTAAACGCGCCACGGACTTTCCCTTTTGACCCACAAAAGTAGGCTACAGAAATTAATTTAAAGAGAAGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr3L 9993892 5' + hobo 47 1 53.42 AACCAGGGTGTAGAATTATGGTTATGACTGACAAGTAGATAGCATAAATAATTATACCCTTTGCTCGTAGAGTAGAGTAGAGTATGTAACAGGCATTCACACTAGCTGAGTAGCG:1 + chr2L 5120219 5' + INE-1 535 1 64.35 CAAGTTAAATAAGGAGCATAAAAGAAGGAGACCTAGAGAAATTTTGCTCACAGAACGGCTGAGAAATGCTCTATGGCAAAAAAATAAAGTTTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr2L 12814845 5' - hobo 2922 1 70.90 ACATTTTCGATTATAATTTAAATGAATTTTTGAGCGTGTTAAAAAAAAAGTTATGTAGAAAGGCGGCATAGCCAAAAAAGAACAGCTAGCCAGGGGCAAAATGAACTCAAACGAAAAAAAGAGCCAAACGAGAAAAACAAATTTAA:1 + chr2L 16375688 5' - FB 729 2 55.48 AAATTAAACAATTTTTAAGTTAAGACAAATAATAATCATTATTCTTTATTAAGTGCATCAGAATACGACTGATCACTTTTAAGTTCTGTTTAAAAATAAAGTACAATTTAGATATTTATTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACTT:1 - chr3R 1960331 5' - gypsy9 5176 2 72.60 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATA:1 - chrX 12649914 5' - blood 155 2 78.69 AAACTACAATCTTTTAGCAAATGGGTATCATCACCGCACTTGAAACATTTACGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 + chr3L 23868236 5' + 412 72 2 67.12 TAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGGCTGT:1 + chr3R 19449981 5' - roo 8593 1 72.86 CAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACCCA:1 + chr2L 19907576 5' + hobo 82 1 75.71 CAAGAAAAGAAATATAGAAAAAACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTT:1 - chrX 8610359 5' + mdg3 5270 2 72.41 CCAATTAAAATTCCCTTTTAGCCAACCACTGATGATGGCCAAAAGGTTGTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGA:2 - chr2R 10760492 5' + Tabor 73 2 69.18 AATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:2 + chr3R 11873348 5' + 412 7122 2 65.07 ACAGCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCG:1 + chrX 17690459 5' + Doc 329 1 56.85 ACTGAAGAAAATGTTCAAAATATAAATAAATATTTTACGCAAAAAGAAGCATTCAAATGTATACATTTAAATGTATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTC:1 - chr2L 13156599 5' + Max-element 8285 2 49.32 ATAAAAATTACAAAAACTAACACAACAAATGTCTAGAAACTAAATGACAAAACCAACAGTGCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCAAGTGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTC:1 - chr3L 21765550 5' - gypsy 7421 2 66.44 ATTAATTGTAGCTGAAATTAATCATACGCACCGTTGCAGAGCATGGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATCGGTGACATGAGA:1 - chr3R 30524542 5' - roo 8998 2 64.38 TTTGCAATTGTTTCTATAAAGCAGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCC:1 + chr2R 12185269 5' - accord 7370 2 73.29 CCTGCAAACGCTAACACAAGGATGTGAGTCCTGGGAAGGGAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 5767447 5' - roo 8991 2 71.92 ACATTGGTGTCTTTTCGCTATCATTAATCGTTATCATTTCAATTAATGGCATATATAACGCAAGCAATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAACTCCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 + chr3L 11887154 5' + Doc 22 1 71.23 AAGCCATTCCCATTATCGTTAGCCAGCGGAAGTGTATCTGCACCATATGAAAGGCCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCT:1 - chr2L 20068070 5' - roo 352 2 63.70 CATATCGCATGGATTCTTCTCTTTTCCCAATTCCGCATATCCGATTCTCCGGATATAACTCATAAGCTATAAAGGCATTTGGTAATGCACCTCAGTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACATTTTTGGG:1 - chrX 20369505 5' + roo 8689 2 73.10 TATGCTATATTAAATTGCATTGTGTGGATTTGCACTGACGCTTCTATTTCAATCCAACTGACTGCGGCTAAATGCATCCAGAGCATTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr3R 22266405 5' - roo 9040 1 60.96 CGAATCAATTGCAATTTATTCCTTGGTTGTGAAAATGGTTATTTGGGATTTATTATTTTGGTTTATTGTTTTCGATAGTGTAATACAATAATGTATATGAACGGCATTCCTTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCG:1 + chr3R 11142139 5' + Max-element 12 2 77.40 CCTTTGAACTGGTCTTAGCCATGAATCCAACGCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCCAACAATGTGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chr3R 29719311 5' + hobo 1 1 78.00 TATATACACACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACC:1 + chr2L 16360577 5' - hobo 2877 1 65.69 GATACATTATTGTTTAGATAGATAGCTTGAGTATAGTCTAAAATGAGTTGGTAATTAATACTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTTTGTATGAGAACATACAT:1 + chrX 22218810 5' + 1731 4376 2 60.27 GGTCCAACGGTCTGCCAAAATTAAATATGACTGTGAAATATTTTCAATTTGTGGACACGAAAAAAGTTTTGTTCGCCAAGACGGGCTACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 - chr2L 2675088 5' + Quasimodo 28 2 65.75 GTCAGCTCGTTTCTTTCACCTGTTTTGCCGGGAAGTAGGCAACATTTTTTGTGTTTGCTCTTTGTGGTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - 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chr2R 20478964 5' + R2-element 3166 1 78.08 AAGTAAGACCCGCTGAAGTCGCATTGATAAAAAAAATAGAGAACAAACTAGAGAGAGCAAACTGTTAGAGAGCTCTCATATATTGTATATACAGTCGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTTGAACCTTTTATGGTTA:1 - chr2R 3382133 5' - baggins 5073 1 68.49 AAAAGAGCAGGGTCGAGGAGAAAAACTGTTGGCACTTTGCATACAAATGTGCTACCAAGCCGAAGTTATCGCAACATTTTAATAACTGGCGGCAACAGTAGCCAAGGATAACGGAGTTTTCATGGTATGGGTGAGCGTCAGCGATT:1 - chr2R 15044527 5' - G-element 3996 1 71.92 CAAGTGTTAGTCCAAGTCGTTTGCATTTATTCTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGAGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr2L 20327703 5' + roo 1 2 71.26 TAAAAAATAGATTTTGATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 + chr3L 19951141 5' + Ivk 18 1 73.29 GAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAA:2 - chr3L 23839745 5' + McClintock 38 2 58.90 ATTCATTTAAAATAAGTTGCACATCCTTTTTTCTATGGTTAATCAAGGGAGATCTAATCAGTTGGCTGATATTGACCAATCAAACGAATAAATGAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr2L 11559671 5' + roo 23 2 71.23 CATCGCTCCCTCGCAAACTTCGACATTCGAAAATTTCGCTCCCAGTTGCGAACTACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAG:1 + chr3L 11755347 5' + Doc 443 1 66.44 CTTTAGAGATCTTCTAAACTCAACTGTTTACAATACGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCC:1 - chr3R 25096069 5' - P-element 252 1 32.35 GAGTACGTATGGAAAACTGATATGGAATCACCCGAACATAACCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAGC:1 + chr2L 12696139 5' + pogo 19 1 58.89 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATAT:1 - chrX 12649914 5' - blood 156 2 81.67 GGATGAAGTTCAGATCCTTGCAGGCATTTCTCAGGTACTTGGCTCCTTTATGCCGAGTCAAATGCTCCACCTAATAATTACAGATGCATGATACTGCATTTAATATGACCCCAA:1 - chr3R 11156349 5' - Gypsy12A_LTR 85 1 60.53 CCAATGGTGTTTCGAATATCTGGCAGTGCATTAAGGTCGTTGATGACTAAATTTAGTTTATGCGACGAACAATGAAAATATAATTTGCTTGTTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATTTGTGCGTGTTGTGCT:1 + chr3R 4568940 5' - 1360 3213 1 57.24 AAAAGAGCAAACATAGAGAAACATGCGGCGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACA:1 + chr2L 18849211 5' + blood 473 1 80.14 GGCGACAACAAAAGCTGCAGAGCAAGAAAAAATATGTATATATATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAA:1 - chr2R 17317652 5' + hobo 78 1 71.23 GTTTAATTTTTAATACATTTTATATATTTTCCTTCATTGAATGTTTCTGGAAGATTTGAAATGGGAAACAATACAAAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2L 13102982 5' + roo 8706 2 56.55 GGTCATTTTGCAATTACAAATACGAATGCTCACACTTCCCTTCGTTACGACCTGATAACTGAAAAAAGAAAAATGTGCAACGAAAAGCAGTGGATTTTTGCGGTACGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chrX 9864871 5' + hobo 15 1 71.23 TCATACGCTTCGCTGGGAATTTTTAGCACATGCCAAACAGGTTAATTTTAAAATTAATTGATATTTTTACTTTTTGCTGCTTGTCATCTTCCTTTTGTTACTTTTTTGTTTTTTTTTTTAATTTGTGTCCTTCTTTTCTATTATTT:1 - chr2R 11263971 5' - X-element 4663 1 46.58 GGCGGAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGCTTGCTTGTTG:1 - chrX 19744503 5' + P-element 64 1 41.38 GTGACAGCAGTGGCAGTGGTGGCAACGATTTTAACGGCAGTGGAAACAACGGGGGCAGCAGTGCGATCAGCAGCGTGGTGGGGGGGGGTAGGGGGTCAGCATCGATGGCAGCGTTTGACGTAGCCCAATAATTTATTGCAAATTAC:1 + chr3R 24893835 5' - R1A1-element 140 1 80.82 TAAATCCGTTTTTTATCGTCCTCTGGTTCCCGTGATTTCCATGGCCTTGAAAGGGATGCTATGAGCAAAGGCAAGTGCGTTCAGATCAGTGTACGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCG:1 - chr3R 27856378 5' + HMS-Beagle2 154 2 63.70 TCTGATTCCGGCTGCGATTTTTTTTCGCATGAGTTGCAAATTCCTCCGGTTTCCCCTCAATACCCACAGCTCCGGTGATGCAACCACCAACATACGACTTTTTCACGCTTCCAACATCGTCCTACACATTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chr3L 16447045 5' + hopper 140 2 77.40 TACAAGCGCAGTGAACGCAATACGCGTAAAGCGCACCAACAACAAATTAAAATGAAAATATATTATATTCTTTGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTT:1 - chr2R 13718704 5' + 1360 296 1 54.11 TAGCGGTTCGGTTCGTCATTGTCATCGGCAAAATGACCGTTGCCGGTTATTTATGCGTCTCGGCTTTTGTGCACAAAAGTAAACGAGCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2L 1892245 5' - hobo 2907 1 63.89 ACGTTTCGATGATGTGGTTCTGTGTTATTTGTTTCGTTTTGTGGCGACTGCTATTTTTTCACAACTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 14448219 5' - roo 9054 2 61.64 AAGCACACACCAAACGGAAAAACACGAGTTTGCTTCCAGCCCGAAAGTAAATAAAATAATATCGGTAGTATCATAAATACAAAAAACTAAAAACAGGCCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAAC:1 + chrX 6863554 5' + Juan 4128 1 54.11 CATACTTATGGGTTACCTTTGCTATTCATAACTTACACGGGCCATAAAATATTTATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr2R 22040910 5' + jockey 74 1 65.75 CAGAAACGGAGCGCCTAATGAGGCATTAAACTTAACTGCTCAACTTTGCGCCTGTCAAGCGCTTATTAAATTTACCGTTTTATTGGTTTTCTATTTTGCTCCTATTCCGAGGAATTTCGATAACCAAACGATACATAATCGTCACT:1 - 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chr3R 26693429 5' - Stalker2 7575 2 71.92 GCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCTAACAATGTGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAA:1 + chr3R 29719342 5' + hobo 78 1 74.66 TAAACATTTTCATGTCATTTCGATTGTAATCTGCATGACTGCCTCGCTCCTTGGGCGTGCGAAAAAAAATGGAAGAAACGAGCACGAGAGAGTGAGAGCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2R 17348530 5' + hobo 6 1 77.69 TATAATTTCGATCTGCATATCGTCTGTTTGTTCGTCCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 - chr3R 4352163 5' + Doc 37 1 66.44 TTTATATTTCAAATGCAAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAAGTATATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGT:1 - chr3L 20095765 5' + Stalker 6961 4 71.23 ATAATTTGCCAACATTTATTCATTTATCTATGTATTCATGGTCTAATAATAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3L 16523148 5' + jockey 28 1 69.86 ATATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAA:1 + chr2R 24021574 5' + pogo 2021 1 75.34 AAAAATGTCCATTAAAAATCGTAATTGAAACGTTAATAATTTAATGCTATTTCTCGAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATCTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGACGCTCGGCTCAAGACTTTTTAT:1 + chr3R 20720104 5' + 1731 4511 1 61.64 TAGCAAGGATATGCGGCGAATTGTACGTCAACTGAAATCGCGGCTCACTTGGCGCAAACATATAGAAGCCAAATCGAAACATCTTAAACTTAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGT:1 + chr2R 10789010 5' + Doc 4229 1 73.29 GCCAGCTCTACGGCGGAATCACGACCGAAATTCCCGCCACAATGGCAGGCATCCATCAAGCAAATTGAACACGCCCCCGTCGCATATATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACC:1 + chr3R 20720481 5' - 1731 292 2 67.16 ATTTTAGCAGGAAGCTGGCATGTCCAGAGCAATTTACTTTACTTTTGCAAGGCAAACAGGAAGTAGAAAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTG:1 - chr2L 8807952 5' - HMS-Beagle 197 2 52.74 TATTTCCGACATACTGTGTCTCTATATATATATATAAGTATATACGAATGCTTATACTTATGTATATATAGGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr2R 17341096 5' + hobo 50 1 53.42 TTTTGTGGCGACTGCTATTTTTTCACAACTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 14450136 5' - roo 9019 2 53.79 GAATTCCGCTGATTGGCATTGGTTTAAATGGCCAGTTTGTGGGGCAAAAAATTCGAAGGAGGAGAGCAGGTGCAGTTGGAAAAAACAATCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTG:1 - chr3L 12029556 5' - micropia 354 2 60.27 CATCAAGCCGTCAACTGTGAAATCCATCAGCAATCCTGCAGACTGAACCCGACGGAATGACGGCTCCTGCAAACGCTAACACAAGGATGTGAGTCCTGGGAAGGGAAGGGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 5767512 5' - roo 392 2 75.34 ATTTAGAAAATTATCTTGTTTAGAAAGTAGTTACATGATACATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACA:2 + chr3R 26693362 5' + Stalker2 80 2 72.60 ACCCGAAAAGAAAGTTCGCAAGAAAGTGAGAAACGAAACCCGGATCAAAGAATAAATTTAGAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - 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chr3R 18109205 5' + Tc1 390 1 67.12 CTCGACGCATGACGATATCAATTAAAAGGGACTATAAATTGTCACTTTATCAATTGGGGAAGGCGTGCGCAAAAGCGCAAAAGCAAATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATT:2 + chr3L 780633 5' - Burdock 223 2 63.70 AATATGGTTATACACTTATCAAAGCACAAATGAGAATATAAGAAATTGCTTTAAGTAATAATTAATATGAACATTATTTCTCCATTGTTGGCTGATTATAATAAATATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAA:1 - chr3L 13365180 5' + Juan 19 1 72.60 GATCTTTGTATCTGCAAATCTCTCATATCAATAATATGGTTTCATTTATATTTTCAAGTCAATTAAGGTTTCTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATA:1 - chrX 21322830 5' + Juan 4092 1 60.96 AGAGATTGCTATATTCGCGACTATTGGATGTACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGATGTACATACATGTACACTAGTGGGCATAGCTATTTAGACACCATTAGCTTCCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAG:1 - chr2R 6164617 5' + Tc1-2 42 1 53.42 CTTTTCCGGCAAATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 + chr3L 13546556 5' + hobo 64 1 64.38 GGTTTATATACACACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGTCCCCCGTTTTTTTT:1 + chr2L 16360573 5' - hobo 2883 1 59.26 AAAATGTTCCAACTCCCCTGTTGCTCCTGCTGCTATTTCATTCACCCTCTTTAGGCTCCCCATATATATACATATATATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr3L 2625152 5' - opus 7460 2 55.48 GCCATAGCAGCATCTGAAATAATCAATTTCATTTTATAAATACAGCGGTCAAGTAGTAAAATTTTTAATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAG:1 + chr2L 12447368 5' + opus 7128 2 74.31 AAGCTGGGACTCGACTTAGGCTTAAGTTCCTGCTTGGTCTATCAAGAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chrX 7624140 5' - roo 335 2 71.23 AGACAGATATATCAAACTCGTATTGAAAACGGGCGAAGCCAAAAGGAGCATTGATGATCCATCTAATGTTTAGCATAAATCATTTTTGTGTAGCCGGCAAAATGCAGCAGGCAGCGCGAACATCACTTGCAGTACAGTTAGCACCG:1 - chrX 12481746 5' - Stalker 479 1 53.42 GTTTTACTTATTTATGGTTTAGTCGGAATTTTTCCTTTGCTCCTGGTTTGAAAACCCAAATAGGGCATGGTGGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCC:1 + chrX 4788503 5' + Max-element 51 2 50.68 GGATCAAAGAATAAATTTAGAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3L 12776061 5' + roo 8703 2 57.50 AAGATCACTTAAGAACTGGAATACTAGAATGTCATAAAAGCTAGTAACTTTACTCTCCAAACCTATCCGTATTTTAGCTGCTTGGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1 - chr3R 31264271 5' - jockey 4953 1 55.48 GTTTTTTCTTTTTACTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTG:1 - chrX 22824277 5' - Gypsy12A_LTR 2257 1 65.75 TATTAGCATACCATTAGAATACTTCTAATCTACATTTGAGGATTGTCAATCTGATATTAATAAGCTTGAAATGGCTTGTGTTCCGATAATATCTTATAATGTAACATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr2R 8374972 5' + roo 12 2 74.66 GTATGACTAATCAGCGTCAGCATATGCGAAAAACAATGCCGCACCGAGTGCAATACCAACGTGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATCG:1 - chr3R 24301917 5' - Tabor 427 2 54.79 TAATTTCTTTACAGTATAGTTGACAGTGGAACTGATCCGAAATTTCCGAATTTGGGACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chrX 22760315 5' - roo 9007 2 60.27 TGTTATCAAAGTTGATGAGAAAGTTTTCCTATCGCCTGTTTAAGCAGCTAAATTAAAAACAGATCAATTAACGTCGAATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 + chr2R 7540975 5' + F-element 49 1 53.62 CTCCTTCTGTCTGTCTGCAGGGCGTCATTACTGTACTCAGCCGTGTACTCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGA:1 + chr3R 902545 5' + R1A1-element 49 1 67.12 GCACCGACTGCCAATTTGTACGTCCATATATATTGAACAACGCCCTTTGTTTAAGTGCCGATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTA:1 + chr3R 29952680 5' + invader4 2815 2 54.79 TGACAACGATTGCTCGACTGTATTGCCGTGGTCTGCCCACGTGGTGCAGCCATCAGACCGCCCATGGCCCACCCCCAAGCATATACATATGTACATATAGTGACGTATTTGGGCGGTCCAAACCAGCCACTGCCATTATTTCAAAG:1 - chrX 1726792 5' + 297 27 2 67.81 GGCAACGCGCGTTTAATTTTTTATGCATGAAGTGTAAATTAAAATTAAATTGACTGTGCGGTCAAAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTATGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr3L 19434173 5' + Doc 46 1 61.24 AAATAAATACACATTCTGGTTTTATTATCTTAGTAAAGAATAGCAGATTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTT:1 + chr2R 20752135 5' + Burdock 255 1 67.12 GACTACATGAGTGAATAAGCGAATGAGTACATTATTTATCATAGAAGAGCAATATAGCGTTTTCCTCTGTGTGGCTGTTGATATAAGATGAAGTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr2R 6713986 5' + 297 6596 2 76.03 ACTGATCTGGGTTGGGATCGAGCTGAAGTACGAGATATAGTAGGTGTAGAGTATCTGTATCTGTTTCTGTAGCTGTATCTTTTTCTGTTTCTAAAGGAACTGAGCGAATTTATTAAAAAATTAAATAATAATGAAGTATAACTCTG:1 + chr3L 7702936 5' + Tc1-2 398 1 61.64 TACAGAGTGTAATTGAAATTCTAACCAGTAACAGAACCTAACCCCATCAAAACCCTCTTGGGAAAGATTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATT:2 - chr3R 10736868 5' - copia 201 2 56.16 GATTAAGGGAAGTCTTCAATTGCTGATTGTGAAAGACTAAATTGAAGTAGAGAAAGTATTTAGTTTGGCATGGCTCACAATTAGGTAAATACATACAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAG:1 - chr2L 19217744 5' - springer 356 4 63.70 GATCATAGTGCCACTTTTGTGGAACTATTCTTGTGCCCCAACCTGTTGAAATGCTACATATATCATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGA:1 - chr3R 29952800 5' - invader4 3031 2 58.90 CTTAAACGTGAAATTGTTGCGGTGCATCTTGGCGTACATATTGCTCATACGCCACGTGAAACAGCATCGGCTTATTTTCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGTAAGATATCTGCATTATT:1 - chr2R 8492857 5' + pogo 39 1 58.90 TAGTAGCATTTTGTATATTTGCAATAAACGTTGTTATGCCCACTTGTGATGCGCCTTTAATTTTCAATTGGCTTAAGCTGGTTTCAGATCTAATCTAATATCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:2 + chrX 16325080 5' - Transpac 5212 2 72.60 ATACGTTCAACAAATACCTTCTCCGCGAAAATCGCTTCAAATCAAAGGCCGCTAAACACATTCCACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGA:1 + chrX 9949487 5' - hobo 2881 1 58.22 GGTGTTGTGTCGGAATGCGGGCAATAATTTTGCGTATTTCTCTGGCCCTCATGTGTGTGTTTATTGGTGTAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAATTTGGCGCGCAGAACGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGG:1 - chrX 15439604 5' - Porto1 379 1 64.38 AATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAGACGAGTTTATTTCAAGCTACGAATACCAAGCTCTAAAAACTACAACAG:1 - chr3R 4352092 5' + Doc 59 1 75.26 TGTGGGGGAGTTTTGGGGTTTCAAAGTGGACCGAACAAGTTGTTTTGCAATTTTCAAGGCTAATTTAACAAACGATTACCTTTTATTACCTATTACCTTTACCACTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr3R 19466629 5' + jockey 22 1 72.60 ATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAAC:1 + chr2L 23299985 5' + invader4 397 1 75.34 ACCCTGCAAAAGTTGTGTCAACAATGTGAAAGATAAACAATGCGATAGTATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr3R 23565200 5' + jockey 22 1 73.97 GAGGTGAGTTCGAATCTAGAGATTAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTC:1 + chr3R 22572583 5' - HMS-Beagle 169 2 80.77 GTGGTCCAAATGCGGAGTTTTCCATGGAGATTTTTCGCCGCCTCTATCAAAAAAATGATGTGGTGGGGGTAGCAAGTCACGTAATTTGCGAAATGATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGC:1 - chr3R 12953312 5' + jockey 34 1 60.27 CACCTATCAAGGTATTAGGCCTTAGGTATTTAACAATCTCTTATGCAACACTGATATACAAATAGTATTACAAACTGTTACTGAAGCTGTTCTACAACTATTGTCTTGTGAAAAAGAAAAGAAGAGGCCCTTCCCAGTGCAAGGAT:1 + chr3L 14350943 5' - Porto1 4583 1 70.55 CATAAAAAAAAGAAAAAAAATATGCAAAAATAATCCTTAACACTTGAATCCCCTGGCGATTCTCTGGAATCGGAAGATGTTTAATGTGTGTTCGTAATTCAGACTTATTCCTTTTCCAATAATTGTGTGTTGGGTCATGCAGCCGC:1 + chr2R 14334777 5' + diver2 4530 1 16.44 ATGTTTCTGGAAGATTTGAAATGGGAAACAATACAAAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr2L 13102942 5' + roo 83 2 76.71 GTCTACACCTGTCTGGCTCGCAATCAGGCGGGCGAGAGCAGCTACAGTGCTGAGTTGAAAGTCAACGGTTACTACCCATAGATTTCCTATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTT:1 - chr2R 7343377 5' - flea 227 2 67.12 CTTACAAATAGTAAGATTTATAAGCAACATCGACCAAATATTAAACTATACATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTCT:1 + chr3L 19510496 5' - pogo 2032 1 65.75 ACCAGCGGACAATGGAAACTCACCTGCAGCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3R 15363499 5' + 412 7094 2 53.91 GCCCGCGCCCATTAATGGCGGAAAGAGAGCAAGTGGGCTTCCACAAAATGGGGCACAAACATAATGCCGGTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCG:1 - chr2L 3393858 5' - Stalker2 361 2 51.37 TCATAGGGTCTTTAAATAAAGTTTGGTCCTAACTACAAAGGTATTTATTTATATTTTTTTTGGGACTAATTCTGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chrX 10838493 5' + roo 47 2 54.11 GTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGC:1 - chr3R 11550263 5' + F-element 100 1 80.14 TAATGGTTTATATACACACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCC:1 + chr2L 16360569 5' - hobo 2876 1 62.33 TGGTCCTGTTCTTTCGATAGTTCTTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTAAAAATCGATTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTCTGCTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chrX 21668825 5' - mdg1 7433 2 63.01 ACAGCACTCGAGACCCGTCGCGTGTCTTGCTTCCTACGCAAACGACCGTCAAACACGAACTGATCGCAAGCGCTGCACTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCAACTTAACGTATGCT:1 - chr2L 14263066 5' - P-element 2850 1 60.84 GTTATTTTCCATATTACACAACCCGGCAAAAACTCGTTGACTTTTTCACAGACACCGCAATGTGTGTATGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chr3R 29381605 5' + hobo 52 1 54.11 ATTTGCCAACATTTATTCATTTATATATGTATTCATGGTCTAATAATAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr3L 16523151 5' + jockey 31 1 69.18 ACGGCAGCCCCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3R 5767385 5' + roo 79 2 72.60 TGTGAATTAGCTTAAAATTTGTTTTACACTCTTCAAGCTTGTAAAAACAATAATAATATCTGACCATCGATCGGTCCCACTGTGCAGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chr3R 17794670 5' - P-element 2875 1 77.40 CATAAACGTATAGTAATATTTGTGAAATTACTATAAGTACTATAAGTACCATTTTAAGTGATTCCTTTGGTGGGTTCTAAGCCATTCTCTTGGTTCATAGAGTCGACTGCATGTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chr3R 29719471 5' - hobo 2932 1 71.92 GAAAAGGACAAAGAGCGCTGCATACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - chr2L 2518583 5' + jockey 64 1 54.11 TACAGCCAGCGGCAAGCAAATTAGAAACCGCTTGAACTACACGAGGCGAAATGTGCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACC:1 + chr2L 20268927 5' - hobo 2877 1 59.44 TGGCTTTAAGTATTTAAAAATGGCTTGTGTGTTCTTTTACACATTTGAATTAAGTAGGCAACTAGTGACGAAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTCTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGT:1 - chr2R 14767474 5' - Tirant 349 2 52.74 AGAAAATTTTGAAAGCAGGAACACAAACACAAACAAGCAAAATTGGAAAAGTATGAGTGCAATTTGAAAAAACAAACGAGTTAATCAAGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGC:1 + chr3R 11142557 5' - Max-element 278 2 41.04 CATTGCCCGAGGATACCTCAGAAGCTGACGCATCTGGCAAGCATAACCATGGCAAAAAGTAAATTTACCAAGCGATTATATCGCTTCCCATGTATGGAAATTTAAAATGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCGCCG:1 + chr3R 20908075 5' - INE-1 570 1 60.56 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCAAAGTGATGGAAGAGCGTGATCTTGCTCTCCAGCATTGAAGAGACCCAACAATTGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTG:1 + chrX 20783463 5' + 1360 3329 1 62.33 GTCTACCGTCCAATTGAAAATTTCCCATCAGCAATTATGCAAGGAATAACAAACAATCCGTGAAGCCGGGAAGGATTCTCCTCAGAATTTCAGCCATATGTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 + chr3R 14688436 5' + FB 21 1 71.23 GCGCTCGTCTCCTGCGACTGTGTGTGTGCTGAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 - chr3R 5087155 5' - P-element 2838 1 45.67 AGCCCAGGCACATTACAAATGCATTAGCAGAAACCGAGGAACGGAAATATATGTGCCACCTAACCACAACAAGCTACAGCACTTGTCCCACAGATCTGGTCAACTGCGCATTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCTACTAAGAAGAA:1 - chr2R 24287900 5' + mdg3 5141 1 73.97 GCTTGTGTGGGGACGCACATCACACCGTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACG:1 - chr2R 914734 5' + micropia 5279 2 78.40 TATTTCGTGCATTGTTTGGGATCGTTGCGAATCCAACTTAAGTGGTCGTTGTACCGTATTCTTGTTTACAACGCATACAATTGACGTCTTGTTTTTTTTGAGTTGGCAGAGATTCCGGCAACTCTAACGGAATC:1 - chr2R 7025563 5' - diver 456 1 63.43 GCATGGGAAATATTAAAATAATCAATCTAATATTAATTTATTGGAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAACAACATGATTGTCG:1 + chr2L 7167257 5' + flea 4808 2 71.20 TTCAACAGAAATTTAATAAACTTTTAAAGGCTTGATCTTGGGTGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2R 21244962 5' - roo 350 2 61.64 GTCGACGTCGTTCGTTTGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATA:1 + chrX 1831270 5' - P-element 2783 1 14.38 CATATCGTCTGTTTGTTCGTCCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 - chr3R 4352148 5' + Doc 52 1 56.16 AGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACCGGCAGAGAACTGCAGGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAC:1 + chr3R 12547877 5' + hobo 83 1 74.47 GTGTGCGCGCCATTCAAATAGGTTAGGAAAATATGTAAATGCTGCTGGCATGCTCGCATATTCCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 + chr3R 11483755 5' + pogo 56 1 56.85 AAATGTTTCTCGGAAAGTCCAAGTCACCGATCATCCATTGGTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGA:1 - chr2R 12642724 5' + pogo 75 1 69.86 TTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAA:1 - chr3L 20910088 5' + F-element 83 1 67.81 GATACCGAGCGAAAGAGCCGAGCACACACACACACACACACACACGTATT:1 - chr2R 12230957 5' + accord 7030 2 56.00 GGCAACTTTCTTTTGGCCCCCACTACGCTCACTGCAATCTGGCCAAGTAATTAATGGTTTATATACACACACACAAGTGTAACTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2L 16360518 5' - hobo 2927 1 73.97 GTGAGATTTGTTTTAACAACAAAAAATGTGGTCTTGGGAAGAAAGAGTTTATTCAAGCAGCATAAACCCGAAACACACTCGGAAACACACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 + chr2R 22372454 5' + I-element 34 1 58.22 AGACCAGCAGCGAAAGAGATGCCACGATAACGAGCGAAAGAGATAGCGAGATGGCCAAATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAAATGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chr2R 15892265 5' + hobo 22 1 69.18 AGCTGAAAGTGTATGGATTACGGTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr2R 20931595 5' + blood 26 2 63.70 TATACGGCGTTTACGGTGCCAGGAAAGGGATTGTTCCAATGGAAAGTGATGCCATTCGGACTACACTCAGCGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCG:1 + chr3L 25232694 5' - accord2 203 1 79.86 AGTAACTGGAATTTAGAAAATTATCTTGTTTAGAAAGTAGTTACATGATACATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAAC:1 + chr3R 26693352 5' + Stalker2 7318 2 65.75 ATTTGAGGATTGTCAATCTGATATTAATAAGCTTGAAATGGCTTGTGTTCCGATAATATCTTATAATGTAACATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2R 8375005 5' + roo 45 2 56.85 CAATCAGAGAAAAGTTATTAGTTTGTTTTTAATAACATTTAGAGGTGTTTAAAAGTACGTAGTACAAAAATGACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGTTGCTTAAATTTTCCCC:1 + chr2L 17296951 5' - Max-element 256 2 55.00 AAACACTGATTATGGCATACAATTTATAGTTGGCAATAAATAAATGACAATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr3L 13380389 5' + hobo 15 1 75.34 AAACAGAGAGAGGTAAACATTACTAAGTCAACTTTAACCAAACACTATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATACATCGCTTCT:1 - chr2L 1922576 5' + BS 5072 1 70.55 CACGGATTTGTTGTTCGCCGGTCCTTTTGCAGTCCGCTCTTAAAGCCTAACCCCAAAAGCCTCCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chrX 20379390 5' + hobo 17 1 65.09 AAAAACTCGTATTATTTTTGAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTG:1 - chr3L 23839764 5' + McClintock 5971 2 71.92 CCCGGATGACAAGGACAGATCACTGGTGGCGTACTGCCACAACATTGAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATA:1 + chr3R 6630942 5' + I-element 4919 1 67.81 TTTTTGTTATGTTTGAGCTCAATTAAATCATAGTATAGTACTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATC:1 - chrX 9874203 5' - BS 5008 1 70.55 TCCCCCAAAAAGAAATGCATACACACACTATCGCCGTGAGCACACACTAATCGCAGATATAGCGATCAATCGAGTGAGAAAAGTAACGAGAGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:2 - chrX 17933772 5' - roo 9042 1 65.07 AAGAGACTCTCTTTTTATTTCCCATTGCGTGTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGAATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGA:1 + chr3R 9158134 5' - P-element 2797 1 23.45 CGTGCGCTGTTAAGTATGCTATATTAAATTGCATTGTGTGGATTTGCACTGACGCTTCTATTTCAATCCAACTGACTGCGGCTAAATGCATCCAGAGCATTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 22266391 5' - roo 9054 2 70.55 ATTTTTCCACCCATAAGTGTACTGTGAAGAAGTGATGACAAATATAGCATGAAATGGCCAGGTTGAAACTGCAGCAAGCCAGAAACCGAGAAAAGCAACAGCATGTGTCCCCGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGC:1 - chr3R 9948977 5' - Rt1b 4719 1 69.18 CAAGAAAACCCCCTTTTTGGGCCATGGCCCGCCACTGTCACTGCATTTTAATTTACTGCATACCTTGAGGCGCCATTCGCCTGCGCTCGCATGCCAAGTGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr2R 13381933 5' + jockey 34 1 69.86 GGAAATGAGGTATCGAATTTAACTTTAAAAGGAATTAGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAC:1 + chr3R 22160885 5' - copia 5041 2 73.29 GTTTATTTATTATTGTTATGTTGCTTGTTCTTCCCATACATATATCGTATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 + chr3R 29997632 5' + P-element 75 1 32.88 CAATTGCAAAAATCTACAAAATGCCACTGGGACAATAAGGCGGTACAACATGAGTCAGACAGGCAAGCTAATCAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCG:1 + chr2R 9408111 5' + FB 9 1 79.45 ATCTCTGTAAGATGTATTTATTTATTATTATGATAATTAAATATTATCTTCCCGATTTGAGCAACATTACCGCAAAACATTGTTGATGTTCGAGGATAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGT:1 - chr3R 16635749 5' - Doc 226 1 65.75 AAACATACGGGGCGTGCACCAAAGGGAGATATTCCAGGAGGCACTCGAGGCAAACCTAACCATTCATATCAATCTCGGCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - chr2L 15601654 5' + Doc 47 1 52.74 CTGTTTGCTTGGCTCAATGAAAGTCCAGTTTGTTTTGATAGCTCCGAATTTTTTGCTTTAGTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 + chr2L 17387422 5' - mdg1 361 2 59.59 CAATCTGGAATGGCAAAAAAAAGGAAAATTCATTTTTGATTAAATGCTGGCTATGGCTTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 - chr2R 16503487 5' + jockey 67 1 57.93 CTGGGTTCGTGGCACTTCGAAACTGACATTTGCACTTTTTCCCAGGCCAAAAACCTTCTGTTGTAATGAGAAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1 - chr3L 9240481 5' - 412 7483 2 59.59 GCAGGGTAAGAGGAAAGTTTGTGCCACTTTTCTTTTTCTTAGTATTGCTGCTGTCGCTTTTCCGCCTATATGTATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr2L 9109962 5' - opus 7482 2 56.56 GGAATCCTGTTTGGAGGGTATTTCAAAAAGTGAATACGCACCAATTTAAGTGGGTTTTGTGTGTAAGAGCTCTGTTTATATTCCCAAACTCTATATATGTAAGTTTACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGG:1 + chr2L 19217554 5' + springer 24 2 45.89 GCCGCATCTTGTTATTTGTAGCAATAAATATCCAATATCTGGGTGCTGGCATCATTAGCTTATTTTCCTTTCGCTGCCAACTTTATTTTTCTTCCCTTTCCAACAAATATATGTATATATAGTGACAGATTCACATACAAAACCA:1 - chr2L 8615489 5' + 17.6 4 2 77.93 ACGCATGACGATATCAATTAAAAGGGACTATAAATTGTCACTTTATCAATTGGGGAAGGCGTGCGCAAAAGCGCAAAAGCAAATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAA:1 + chr3L 780637 5' - Burdock 219 2 60.96 TACCCTGCAAAAGTTGTGTCAACAATGTGAAAGATAAACAATGCGATAGTATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3R 23565199 5' + jockey 21 1 74.66 GCTCTTTACGCATCTCTCCCTCTCGCTCGCTCTGCAGCTCCTCGGCAGGTGTACCTGTCCGTGTGTGCGTGCGAGAGAGCGGGGCTGCGCTTGTAGTGTGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chr2L 15057126 5' - hobo 2932 1 78.63 TAGTAAAATTATGCTTTCAACATAGTCAATCCTTATAAATGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAGTTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr2L 19800888 5' + roo 8745 2 72.60 AAAAAATGGCGAAAAGTCGCAGGCAAATATCACTTATAAACCTTCACTTTAATACTGAACTAATATAGTGCAATACGCAGGGAGTTCTGGAAAATATTGCTTTAACTTAACCAACAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTT:1 + chr3R 20097537 5' + mdg3 5259 1 80.82 TACCGGATCCGCCGATTCCTCCACCAAATCCAGGACCGCCGCCGATTCCACCGCCTCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCG:1 + chr2L 10693472 5' - Quasimodo 237 2 55.24 AATAATCTTTATGCCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:2 + chr3L 19938458 5' - roo 9021 2 52.74 CTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATA:1 - chrX 8610319 5' + mdg3 5310 2 55.17 TTTTTCAATTCAACTATTTACTTGCGTATAGGCCTGATAATATTATGTTTTTTCATACGTAGAGCTCAATACAAAATTCAGCCAATTTTCAGGCTCCAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 - chr3R 15154696 5' - mdg1 7436 2 69.18 GATGTGTGTTTGTGTGTTTGCAGGTACCGTTGAACTTTGCTTTCACATAAACAAATATTACTCACTTACATTGCTCTCCCTGGGGCGACAGCTGTCACCCTTGCACACACGTACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr3R 17079358 5' + 1360 11 1 78.08 ACAAAGGAAAAGTTTTCAAAGTGCCAACACATATTAGAGCCAGTGGGAGGTAGTCAAATATTTAATTGTGCGCTTGGCTGCCTAATGAAGTCGGACATTTAACAAAGGCGAATGGCAAACCAGAAACGAAATAAATAATAATTACT:1 + chr3L 6627296 5' + jockey 4828 1 76.71 AATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCACG:1 + chr3L 21765424 5' + gypsy 7057 2 63.70 ATTACAACAGCGGCGCCAGAAACCGCAGCGAACAGAAAGCAGACATCCTTTAACAATTATTATTCAATATTTACAGAGAGATATGAACCGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - chr2L 12767096 5' - hobo 2904 1 58.90 GTCCAAAAGCTGGACCAAGGACTAAGTCTTCTGGCTAAGTCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCG:1 + chr3L 26350122 5' - Quasimodo 252 2 70.15 ATTTGGACGAGAAAGGGACACACTGGGTGCCATGCCTGCAGCTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATA:1 - 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chr2R 3120854 5' + jockey2 452 1 62.33 CACATCAAATGGCACATGGCACAAACGAGCCGCAGAGGCACCAAAAGAATTTTCATTGCATACTTTTCAGGTGTTTGGCGAGCTTCGGGGATGCCGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr3L 6542118 5' - hobo 2912 1 67.12 ATATGCGATGAGTTACTACTGTACGGTGCGAGTATCCGAGTATCTGAGTATCTGAGTATCTGGGCACCGGAGTACGGTTGGGTACGTTTTTATGGTGACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATA:1 - chr3L 15720414 5' - jockey 4866 1 68.49 ATTAAATAAAATTAATGAAAATAAAGAAATAAAAATAAAAGTAGATCCATTATGACCTGATGGTCCTAATAAAGTTTTAAATTCTTTATGAAGAGTTTTATTCATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTT:1 - chrX 13145998 5' + R2-element 254 1 34.25 ATGGAATTTTACGCCCACCTGGCAACTCTAGAGCAGCTCCAAAAGCTCCCTATCTACCTTACTCTCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chr2R 16031448 5' + hobo 56 1 55.48 GTTGTTGTAGTTCGGCTGCATTTGAATCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTT:1 - chr3R 7109201 5' + P-element 92 1 23.29 TATCTGACCATCGATCGGTCCCACTGTGCAGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATT:1 - chr3R 17794614 5' - P-element 2819 1 39.04 GTTGCCACCGCCATAGCAGCATCTGAAATAATCAATTTCATTTTATAAATACAGCGGTCAAGTAGTAAAATTTTTAATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCT:1 + chr2L 12447359 5' + opus 118 4 79.45 ATGGCTTCATTCCCACAGAGAAATCCCAAGTGTTAGTCCAAGTCGTTTGCATTTATTCTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGAGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2L 20327729 5' + roo 8698 2 60.27 TTGGTGTCCACTTCCCGCAGAGCCCGTCCACTGGGCGTGACGGTGACTTGGGCGTTTGGCGGACTACTTTCAAACGTTTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTCTTCGTTGCGCTCGTGGACATA:1 - chr2R 22123801 5' + R1A1-element 10 1 55.71 CCAAAAAAAATCTATTTGTTAATATTAAAGATTTTACAAGGTTTCAGAATGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTT:1 - chr2L 7167341 5' - flea 4948 1 64.83 ATCACTGGGTTTTCGCTTTAAATTTTTATGTAAACACGCGCACACCCCGGCATCCTCCATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr2L 19628406 5' + hobo 63 1 59.59 ACTTATCAAGAAAAGAAATATAGAAAAAACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTT:1 - chrX 8610365 5' + mdg3 5264 1 76.55 TCATGCACTTGATCCTCCGGATTGTACGGTTTTATTCGCTGATTCCGATTTCAGGTGGATAAAGCAGACAGCTGGAAGTGGGCTGTTTTTTAGAACCACCTATAAAAAGATGGGGTGTGCTTTACGTTGGTCAAAACCAGACACTG:1 + chr2L 2457444 5' - HB 224 1 79.45 AAAGCCAAAATGAAAGAGAATTCAAATGCCTAAAACGACGAGAAGAAAGACTCAGAGAGCGGTGTATGAACCCCAAAACCCCTGGGGTTCGCTGCCCCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGT:2 + chr2L 17574315 5' - hopper 1395 1 67.81 CCGATGAATATTTTGTCGAAATTAAACGTAAACGTAATGGAATTGTTGTAGTTCCTTATGTTAATTACAATAATTAATGTGGTAACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 20262732 5' + roo 8695 2 65.75 ATGCCTTGCCCACTTCCACCAACCCCTAACCATTCAAAATTCAGAGTTTTCCCCATTCCCCTGACGCTTTCATATTTGTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr3R 12781608 5' + pogo 40 1 58.22 AGCAATCTAGTTAGACCGCATTTTAATTGGGTTTGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAA:1 + chr3L 17710615 5' + I-element 87 1 73.97 TNATTACTAGAAATATTCCTTATACGAGCATGTATATATGTCAGATCACAAATTATCACACTGTACGGACGAATGACTGGCACAAGATGAAAACCGAAATAAGAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAAC:1 + chrX 511214 5' + Doc3-element 4528 1 73.97 GCAAAAGTATTTTATGTGTTTGGTAAATCCATTCATAACTAAGCTAGTTGTCTTATTCAAACCCAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGC:1 - chr3L 17710685 5' - I-element 5298 1 56.16 TAGCAACATTAATTACTAAGCTGAATTACAAAAATAATCTTTATGCCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 19938426 5' - roo 9053 2 72.60 GGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTACTCACATGATTAGGGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCT:1 + chr3R 19589943 5' + BS 5069 1 72.09 ATACACGACTGGCAAGCTTTTTTTTCGCACAATAACCTGCATCTCATTAATAAAACAAAATTGAATATAGAGTATAATTAAGCTTTCAGTATAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 - chr3L 11855993 5' - Transpac 283 2 67.81 AGACACAATTTAATTAGCCTGGTCAATAATCTCCAGGGTAAAGTTATACGAGTATATGATTTCAACGACCCGAATTTGAGCCAATTAATCTTACGCCCAAATCGCGTGCACTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chr3L 9994053 5' - hobo 2927 1 78.08 AATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTAT:1 + chr3R 1047966 5' - Stalker2 7594 2 57.14 CGAACATAAAGCGGATGGGTCCCGAGATCATTAAAGTGCTGCCCGATATCCTGCTGGCGTCCATGGACATTGTATACCAGGAGTATGTGAAGCTAATGGACTCGAATGAAACAGTGTTGGTATAATTGTTGTAAATTGTCCCGCAC:1 + chrX 13825420 5' + accord2 7162 1 76.71 CCACAGTTGTCGCTGCAGCTGTACGAGCTCAAATGCCAGCAACTGCAAGTGGGCGACATATGTTTGTCGCTGGTGCCAAACGAGCAGCCCGCCGCACCATGTCTGCCTCACACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chrX 6823758 5' + hobo 18 1 80.00 TTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTAT:1 - chr2R 12185403 5' + accord 6918 2 69.72 CCTTATTGCATTTACAGAAGAGTAGAGCCATTATTGTGGGTTACGTTTCAAAGACTTCTATTGGGGTGCAAAATTCCTGTGCTAAATTCTTTAAGCTTAAACCAAGTAATTAATTTTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATC:1 - chr3R 18493024 5' - Juan 4207 1 72.60 GGGTGCCCGGTTTCATATGCAGGGAGCATCAGCAGCAGTAGCAGCATCAGCAGCCCTTCCTCACGAAACAACTCACCCCTTGGACACACAAACTTCAACCACACAAACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATAATCGAGTTA:1 + chr2R 14071648 5' + pogo 381 1 78.32 GAAATCGTTTATTATTCTTAACAATCGTTTTTGCCAAATGTGCTTTGTTGCCTCGCCAAGGCGTTGCGGTTATTGGAGATGTGTATTGTGGATTCAGTAAACTCGACTTTGATTTCGCTATCCTGTAATAAACCAATATATGCCAC:1 - chr3L 1728643 5' - blood 7388 2 41.10 GCGAATTGAAGTATCCAGCATTCTGGTGCTGAATTTGAGCGCTGCCTGAAAGATTCTTCTCGTTTTGTATTACAACTTTGATCTGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr3L 12775939 5' - roo 9035 1 60.96 GGCTTTTGTTGGTGATTTAACATATCTTTAATGTCATCATCACTTAACATTTTTGTGTTAACTACATACAATTTTGCCAGAGTAATAGTTTCCATTGAAATCATACAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGC:1 - chr2R 5343291 5' + Doc2-element 4439 1 63.01 AGTGCAAGGAAGTGGGTTGTAGCCTCGAATAATTTCCATATCCTGTGTAGCTGCTCTAATGTATTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr3L 13631251 5' + hobo 57 1 55.48 ACTTGTGGCTACAGCAATTTGTATAATTAAATACAATTATTAATTTTTAATGAACTCGTTACATTTATGTATGTGTTTATCAAACGTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chrX 13351718 5' - roo 9034 1 60.27 ACGGTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr2R 20931614 5' + blood 7056 2 50.68 TTTACGTACATTCTGCTTATTCTGTAGCATCAGAATGAAAACGGTCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCAACAGAAGCCC:1 + chrX 12131180 5' + F-element 390 1 69.86 ATTATATTAATACATATGTAAAGATAAGGTGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 + chr2L 12814743 5' + hobo 64 1 72.73 TACAGCCATAATTCAAAAGAAGATACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3L 19938574 5' + roo 56 2 58.90 AAAAGCCAAAATGAAAGAGAATTCAAATGCCTAAAACGACGAGAAGAAAGACTCAGAGAGCGGTGTATGAACCCCAAAACCCCTGGGGTTCGCTGCCCCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 + chr2L 17574314 5' - hopper 1396 1 68.49 CATGAATGAAGTTTGGTTCATTAGTGGAAATTCGAAGCTGTGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGGGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGA:1 + chr2L 7907995 5' - Quasimodo 6940 2 73.29 CTGGCAAAAGGAAGCAAATGTGTATACAAAATGTTTTTAATTAAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGACGAAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 + chr2L 20985740 5' + F-element 45 1 58.90 CAGCTGGCAGGAGTACGTGACTCACTCTTTTCCAGACTTCTGGACCAGCATCTACACTTTCAAAAATCAGCCACTCAATATAGAATATAACATGTAATATAATATGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2L 19801015 5' - roo 394 1 74.66 TTAGTTTGTATTTATTTATGTACTTCTTTAATTTATTATGTACTTATTGTTATCAGTTATAAATATTGTTATTAATTACGAGTCAGCACGATGAATTAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATACTGAACTCGTCTGATGTTT:1 - chr3L 26265113 5' + Gypsy12A_LTR 1878 1 80.14 ACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr3L 19938550 5' + roo 80 2 75.34 AACGCAGACAGAATGAATTGGACGAAAGGACACTTACAGTCAAAACAGCTCAACTAGCTACCTTAAAACTTAAACAGGAATAAATTCTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 18539755 5' + roo 8698 2 63.01 TCCCACAGAGAAATCCCAAGTGTTAGTCCAAGTCGTTTGCATTTATTCTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGAGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2L 20327719 5' + roo 44 2 53.42 GGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:1 - chr3R 31663307 5' + jockey 98 1 77.93 GTGCACTGGAAAAAGTCAAAGTTCATTGTGTATTTTGATAGCTGTGAAAATAAGATACAATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTT:1 + chrX 18561057 5' - copia 5063 2 59.59 TGGATTTACCATTTTTACTGTTTTAAATCAAATTTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCT:1 - chr3R 20097666 5' - mdg3 5411 2 75.34 GTGGTTAAGCTGGAAAAAAAGGTGAGAGTAAGCAAGAGGAAAGTGCGCCAACTTAAATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAT:1 - chrX 22578097 5' - 297 337 2 61.64 GTAAAATTCTAAAGATAAAAAACAAAAGCAAGAAATTAACATAATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTC:1 + chr2R 4929447 5' - Doc 4419 1 70.55 AACTCGGATATGAACAATATATCAATCAGTTTCTAGATCTAATTTGCCACACAACAGACTATTTCAGATTGTATGGCATTATAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 + chrX 18318130 5' - copia 216 2 59.59 GGTCTTAAAGAGCCCGCAAGCTTCCAGATCGACGTGTACAAGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chrX 22760392 5' + roo 8744 2 73.29 AGAACTATAGTGCTATCTAAAAATGGAATTTTACGCCCACCTGGCAACTCTAGAGCAGCTCCAAAAGCTCCCTATCTACCTTACTCTCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2R 16031470 5' + hobo 34 1 59.59 TTAGAGGTGTTTAAAAGTACGTAGTACAAAAATGACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTTAAAA:1 + chr2L 17296989 5' - Max-element 8480 2 69.03 AATATTTAAAAGTTCAAAAAAGAAAAAAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATTGCCAAATCTATGTACATACCATCACAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTACATTAGAATAT:1 - chr2R 4269699 5' + 1360 385 1 81.51 ACATTTTTTCAAGCTTTTCCTTGTTTTATATAATTCAACATTCAATTCAACTCAATTCGAACATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2L 8909896 5' + roo 8719 2 55.48 ATCTACATTTGAGGATTGTCAATCTGATATTAATAAGCTTGAAATGGCTTGTGTTCCGATAATATCTTATAATGTAACATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2R 8374999 5' + roo 8703 2 57.53 TGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGT:1 + chr3R 22275271 5' - flea 4945 1 67.81 TTAATGATAAGTCACACAACCATTTTGATTACCAAAACTAGCTTAAAAACCTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 + chr2L 3150966 5' - blood 7372 2 73.29 TATTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3L 18954132 5' - roo 9004 2 65.75 TTGCTACAGCCAGCGGCAAGCAAATTAGAAACCGCTTGAACTACACGAGGCGAAATGTGCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chr2L 20268923 5' - hobo 2899 1 51.20 ATGTTTTTAATTAAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGACGAAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 + chr2L 20985770 5' + F-element 72 1 57.34 TTTCCGGATTTTTTGTGGCGGGGCTCCGTTAATGCTGAGCATACTTTTAGGGAGCTTAGTGGCATTTACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr3L 13546658 5' - hobo 2937 1 71.28 TACTCATCCACATACTCCGCATACTCGGTTTTGAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGCGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTTTTCGAGTATCAGAA:1 + chr2R 18056818 5' - blood 7303 2 71.92 GCTTACAATCAGATCTGTCAGATCAGTTTCCTCTTCTCGCGGCAGAGGATTGCCTGTTTCGGTTGCCTTTTTGGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2R 18265992 5' + roo 8709 2 54.17 ATTACTTGGCGAAAAGTTCATTACCATTTTAAAAGTTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGCGTGCGGCTGCTACTCGCCAC:1 + chr3L 13015914 5' + hobo 56 1 70.00 GGGCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAAGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAA:1 - chr3L 5498516 5' + Doc2-element 217 2 41.10 CACAGATAATTGAATAGAAGATAAGTAAAAAACCTATTCGAGTTTTGTGGCTAATTTATACCCTTTACTTGTAGTGTAGAAAAGACACTTTTGATTAGTCTTGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGT:1 - chr2R 7024527 5' + diver 19 2 72.60 ATATATTTCTATAATGTTTTGAAACCTAACTCGTTTGCCTCTGACTAGGATGTATTCCCTGTGAGCCGCGGTTAGCGACCAAAAGGGGCCATTCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTC:1 + chr2L 23016872 5' + G2 2731 1 65.52 AATTCAACTATTTACTTGCGTATAGGCCTGATAATATTATGTTTTTTCATACGTAGAGCTCAATACAAAATTCAGCCAATTTTCAGGCTCCAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 - chr3R 15154690 5' - mdg1 7430 2 65.07 TGACGCTTAAATAGCTGTGTAATCAAATAGAAAATAGGAGTAGTAGTATATACGAACATAATGATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTATTAATAATTATAATATGAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAGATCC:1 - chr2R 10192075 5' + mdg1 7140 2 71.92 AAAACAAAAACCTACAGAATTTACCAAAAACTCATAGTTGGGAAACTGTGCACGGATCTCCCCATTTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAAAAAGGGATTTCCCTTTAAGGTTGTGATTTTATTTAGATCTCACTCTCATCGAGTGTA:1 + chr3L 19398598 5' - gypsy5 288 2 52.74 TTATTTATAAACTTGCAGCAAAGTGGAAAAAACGAAGCGAACGACTCCGCGGAATGCAATGCCACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr3L 10068848 5' + 412 7071 2 73.29 GTGCATCCTGCGTGTGGAATTGCCCAAATGCAAACTGAAGAGTCTCAAATTAAATCCAACAGGCTGTCCAAAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCTGGTGCTAC:1 + chr2L 9988088 5' + hobo 49 1 51.37 CCTTGTGAGGGGAGTTTAAAGTTATTCTCGTGTTAAGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 + chr3L 3540076 5' - mdg3 5480 2 73.29 ATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:2 - chr2R 8375113 5' - roo 338 2 63.01 GGAATATCTACATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTG:2 + chr3L 21765408 5' + gypsy 7041 2 52.74 CCTTTGCCCGAGAACTTCATGCCCCAAATTTTATGCCACAATATTTGTATTAAACATTGGGGGAAACCGAAACGACGAACTCGTGTATTGTTATGGTGTAAATCGGTTGGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2L 21189668 5' - hobo 2927 1 77.40 AGCATACCATTAGAATACTTCTAATCTACATTTGAGGATTGTCAATCTGATATTAATAAGCTTGAAATGGCTTGTGTTCCGATAATATCTTATAATGTAACATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2R 8374976 5' + roo 16 2 71.92 GTGTCGGAATGTGCGGTCAATAGATACAAAGCGAATAAGAGTGCTTCAATAAAAGATTATCGAAAAGTGCCACGAAGTAAAGTTACACTTTGTATGGAAAAGAAATAGTTTCAACAATTAACATTTTTTACTTTACTTTTTTTT:1 - chr2L 13079440 5' + Tc1-2 1388 1 77.78 CGCAGAGGCACCAAAAGAATTTTCATTGCATACTTTTCAGGTGTTTGGCGAGCTTCGGGGATGCCGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 - chr3L 6542088 5' - hobo 2898 1 52.31 GGCTTCATTCCCACAGAGAAATCCCAAGTGTTAGTCCAAGTCGTTTGCATTTATTCTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGAGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr2L 20327727 5' + roo 8700 2 58.90 TCGATTGGTTACAGCTTACAAATAGTAGGATTTATAAGCAACATCGACCAAATATTAAACTATACATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 + chr3L 19510482 5' - pogo 2046 1 57.53 GCATTTTAATTTTGTTTTATAATTTCGCAAATAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTCTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCT:1 - chr2R 20117362 5' - mdg3 159 2 75.34 GCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTC:1 - chr3L 25232907 5' + GATE 66 2 61.54 TCCTCACAAGTTTTGCCGAACTTCTTTAATGCCAAGATTGATTCCGTCTGAAGCTGAGGCTCTGTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 - chr3R 8965244 5' + HMS-Beagle 6830 2 56.00 GTGTGCTAAGGATTCAAACCTTAATTTGTTTAAATAAGCACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCATCGGAGCTTATCAGCGGAATCAAT:3 + chr3L 15374642 5' + 3S18 5848 2 71.23 AATATTTGATTTAATAATGACTTGTGGCTACAGCAATTTGTATAATTAAATACAATTATTAATTTTTAATGAACTCGTTACATTTATGTATGTGTTTATCAAACGTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chrX 13351737 5' - roo 390 2 73.29 GCCAACATTTATTCATTTATATATGTATTCATGGTCTAATAATAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:2 + chr3L 16523155 5' + jockey 35 1 66.44 CGGGTTGTTCCATTCTTTTGCATACATACGTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTA:1 - chr3R 14801267 5' - I-element 5261 1 79.45 GGCAGCGACCTAAGTGCCCATTACACACGGCAGCCCCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 5767359 5' + roo 8717 2 54.79 AAGGGGCGGCAATGGGCAGCCCGCTCAGAATGCTGCCGCCGGCAAGGACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr2R 14450231 5' + roo 8727 2 64.44 TATCAAATAAATACAGTCCTCTACTGTTCTAAATGCGACTAACATCCAAATGTACATCTCACCTTTGTTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACTTGATCACGAAT:1 + chr3R 19450148 5' + roo 8664 1 82.86 ATACGTTTCATGCTCGTAAATGTTAAAATCAAAATTTATTCATTGTTGCATTATTTTCACCTCTTTAACGAAAACAATCTTCGGTATATCCTGTATGTATATCGATTACAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 10344711 5' - roo 396 1 48.63 GCAAAGGGAAAGAAGAGCGAGCATGCTCTCATTTAGTTAGAAAAACACTTTTAAAAAGTGCACCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 + chrX 7930676 5' + P-element 58 1 45.89 CGGCGAATTTCGAAATGGGTTGCCCGGAGAGTTTGGACCAATCATCGCGTATGCGATTACCCACACACAATATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 - chr3R 25094723 5' + P-element 48 1 52.74 CGGTGAAGTATGCAACACTTTTTCGCCACCTCCTTTCGTTTCCTTGTGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chrX 9949576 5' + hobo 56 1 65.89 AGTCGAGTTGAGTCGCTAGTTGAGTATGAAAGAAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr3L 2240475 5' + roo 84 2 77.40 GTGTGGGTGTATATAGAGTGTTTAAACGTAGATAGTGTGCTTATTTTAAAATATTTTTAAATGTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 + chr3L 25821776 5' - opus 7450 2 54.48 ACAAGTGGAAGCTTTTGCACTCCCGACCATTCAAATACCTGGTCCTCGGCCTCCTGTAGAAATCGTAGCCTACTTTTTGGACAAGGACTATACACCTGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr2L 6716266 5' - hobo 2921 1 71.94 TGTGCAGATTCACGGAATTTAATAAGTATCCGTATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAA:1 + chr2L 3317774 5' + X-element 96 1 77.40 GTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCCTATGTTGCTGTCTTTGGGTA:1 + chr3R 1047986 5' - Stalker2 7562 2 73.97 ATGCGAGGGAATACTCTGTGCGCATTAGCTTGGCTTGCCTAAGCAAATATTAACCATCCGCCGTGTAAGCCGCGCTTTTGCTCAGCCACTTTTTTAATAATAAAAATTTCATTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 - chr3L 13568116 5' - copia 245 1 77.40 CTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTATAATAATAATAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAGAGAGCGTTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTAGA:1 + chr3L 10590622 5' + 1360 112 1 67.81 CCTGCGAAAAGCGCGAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 + chr2R 17872462 5' + Tirant 8137 2 58.87 TTGTTATGTTTGAGCTCAATTAAATCATAGTATAGTACTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTTTCACTAATCATG:1 - chrX 9874200 5' - BS 5005 1 71.23 CGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAG:1 + chr3L 25232767 5' - accord2 132 2 65.49 GAACAATATATTTAATCATTTTACATTTTTTTTTATATTTTTAAGAAAATACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAAT:1 - chr3R 12936171 5' + F-element 85 1 77.40 AAAGGCTTGATCTTGGGTGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr2R 21244937 5' - roo 325 2 74.66 CATAAAAAAGGAAACAAACTGGATGCAAGCAATTACTTCAAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTTCTCATTTGCAGCACCTTTCTAGATTAATTATATCACCGTGTCAGCACAGTTTTATGAAACGCAGATTAACAACCACTAAC:1 - chrX 12130936 5' + Q-element 225 2 71.92 GATCACCATTTATATGTTTATATGTAGCGAAGGGGCTCTGTAAGACGGAAGAGTTGTTTATGATCTATTCCCGCCTTGACTTCTATGTACCTGGCATATAGTTATGTGGCAGGCTGATAGGTCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 - chr3L 22445316 5' - Transpac 5203 2 63.70 CATTTACATTACATTACATATTAAAATAAAGAATATTACATATAAATGGGTCAATAAGTGGTCAATAATGGTAAGATACTCGGCCATACAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr2R 1329948 5' - roo 9040 1 63.70 CAGAGAAGTATTTGCGGTTTGTAAGCGAGTAGAGACTCCCATCTCTCTCGCACCTGCAGTGCTAAGCCTTCGAAAACAGGGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr3L 17896029 5' - P-element 2846 1 58.90 GCAATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAACTCCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGT:1 + chr3L 11887217 5' + Doc 85 1 73.97 ATTTAATTGAATTTGCACTGCTTTTTTGAGTTCACTTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAG:1 - chr3L 780744 5' + Burdock 6217 2 75.34 AAGTCGAGGGGAAAGTGTGAAAAGCTGAAAGTGTATGGATTACGGTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr2R 20931573 5' + blood 3 2 77.93 GTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTGGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGAGAAATAACGGGATACCCGCGGC:1 + chr3L 25889011 5' + gypsy8 321 1 65.52 CACTTGTTTTCAGCTGCTTTCCAGCGAAAGCGACAACTGTTGACTGCGGTGTGACCACCCAGTGGACTCTTAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 15749202 5' - roo 9013 2 51.37 GCGTAACAGCCAGAGCTTGGAATCAAGTTATTACGCGTATACAAATATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2R 11394191 5' - pogo 2033 1 68.75 ACGGAAACGGAAATGACAATCGTCCTTCTATTTCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chrX 6587687 5' - hobo 2894 1 68.27 GCATATCCGATTCTCCGGATATAACTCATAAGCTATAAAGGCATTTGGTAATGCACCTCAGTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 20369471 5' + roo 60 2 58.22 ATTTTTAATTAAAATAAAAAATGTTCTTGTATCATTTCAACCTCAATTGGCTTGTATCAATTTCTTAAGCCATTGTTCCACCATAATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr3R 7305877 5' + 412 32 2 62.07 AACTTGTCGGACAAGTGAAAGACATAACTGCGAAAAATATATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2R 8375164 5' - roo 390 2 72.60 GTGTTTTGGCGGCGGAGATCCAGTCGATCTCTATCAAGATCTGCGTTTCGGTCGGCTCATTATGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCA:1 + chr3R 15346858 5' + hobo 59 1 55.48 TGCTTTGATACCATTTTCTAAATTAAGGCATACTTTCGCACAAACAAACATTCGACTGTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr3R 8810748 5' + 297 58 2 61.64 CATCGGAAATGAGAGATGTTAGAATTTTGCACGTGGCTGACCCTTTAGATGTTTCGCTTACACTTTTGGCCTGCTCGGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACA:1 - chr2L 16554976 5' + F-element 288 1 48.63 GCTTGATCTTGGGTGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr2R 21244933 5' - roo 321 2 77.40 CTGCCAGTGCATTTTGCATTTCGGATTTTACACTGCATTCTGTTGGTATGACTAATCAGCGTCAGCATATGCGAAAAACAATGCCGCACCGAGTGCAATACCAACGTGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATA:1 - chr3R 24301962 5' - Tabor 7311 2 77.40 TCGACATTACAACAACTTCGACTTGAGCCCCTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAA:1 + chr3L 17895942 5' + P-element 71 1 26.40 GTGGAGGAGATGGATGCCACAAATTGTTTATTTGTCAATCGGTTTTTGGCTTATCAAGTGTGTTGAATGTTTATTGAGATGGGTAAGCAGTGTGCCTAAAAAGCGCTTCATATAAAAATAAGAGAGAATGCTATAATCGAGTTCCC:1 - chr2L 14640311 5' - INE-1 572 1 69.86 GAAGTATCCAGCATTCTGGTGCTGAATTTGAGCGCTGCCTGAAAGATTCTTCTCGTTTTGTATTACAACTTTGATCTGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 12775946 5' - roo 9028 1 56.16 CTTGAGTGGCTATGAAGCTGGGACTCGACTTAGGCTTAAGTTCCTGCTTGGTCTATCAAGAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 7624154 5' - roo 349 2 61.64 CAGTGTAAGTGCGAATATGCGAGAGAGTGTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAATGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACGTACTAAACA:1 + chr3R 23346583 5' - Rt1a 4971 1 80.14 TTGCCAACATTACCAAAATATGAATAAACTAGAAAAGATATCAGGTGCATTGTTTTTGATCATAAAATATACCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTT:1 - chr3L 14944646 5' + transib2 3 1 75.25 ATTAATGTAATTACTCTTGTCGTAGGTTGTTAAGATGGATAGATAGATAGAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACT:1 + chr2L 7596020 5' - mdg3 5427 2 63.70 CATTATTAAGATCGGTAATTGTAAACTGGCTTACAAATTTTAATTAGACAGCTTAAGCTTAGTTTAGTTAAGCCAATTTAGTCAAAGCACTGTCGAATGTAAAAATAGAGTTGTTGAAGACTAAATGGTTTTAATGTAATTTTTTT:1 + chr3L 17206672 5' + transib4 26 1 73.97 CGATCACCGGCTTCAGGACCACGTCCAGTATCTCGCTGAAATATTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGCTCTT:1 + chrX 23339372 5' - mdg1 7347 2 75.86 GCCGCGTTTTTACCGTTTGATAACCTAGAAAAGACGCCTAGGTAGGTATGAGTGTATGCAAGAGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:2 - chr2R 14486584 5' + 297 6635 2 58.22 GCTTTAACGATCGCAATTTGCTTGCTCACGGTAGGTTAAATATTTAATTATGAAATAACATATATTCTATATAGCATCATTCAATTTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 - chr2L 12447552 5' - opus 7475 2 67.81 ACGAAAAACTTTCCTAGTTATAAAGAGACTTATGTCAAAAACAATAGCACCATTATCTAAAGCCATTCCGAGTTCTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 + chr3L 8704483 5' - blood 345 2 59.09 AGTGAGGGAAAGTTGCTGCTCATTGTTTAGCAGTTGATTTTTTGACGCACTTTCCCGGCTGGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAA:1 - chrX 11280830 5' + X-element 77 1 60.27 ATGGGCCAAGGCACACGGCACACGGCTAGAGAAACAAATTTTGTCGTGTTTACGCTGCCAGATTGCCATTAATTTTATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chr3R 18114975 5' + 297 6620 2 58.90 GTTTTGCGTAAAATAATAAATATTTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3R 11873312 5' + 412 33 2 62.33 ATCGTGCACATGACTTTGAAGCGACTTTGAGGCAGGCAACACTGGTGAAAGGAGAAAGAAGAAAGGAAAAAGGACAGGCGCAGGACACGTGATGAATGAAGTTCCTTATATTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTAT:1 - 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roo 323 2 75.34 GCAGATAGCCACTTGAGCAAAGCGATTTCCCTGGAAAAGCCGAGTACAAAGAAAACACTGAAAGCGGCCATCAGTTAAGTGCGAACGGATCTTTCCAGTCAGTAATAATCGGCAAACTAAATTATTTAGTTATTATTTACTAAAAT:1 - chr3L 20037091 5' + Doc 140 1 66.44 ACTGTTCAAAGTGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTAT:1 - chrY 3648895 5' - Stalker 171 6 66.44 CTACGGACGCCTGGAAGCCATGCTCATGGGATTGCCGGCAGATGGTAAGAATTCAACTTCGAATGTGAATTTCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chr2R 12416829 5' - pogo 2055 1 54.11 GACCCGATTATCGAGTTGAAACTGTTTTATAAAATTTGCACCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGT:1 + chr2L 246594 5' + P-element 78 1 32.88 CCCGCCCCACGTAAATGCCGCAATTTTCTATTCTCGCCCACTTGCCACTCGCATCCATACATTTACGATAGGTGGTCGCATGCTCGCATATTCCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3R 11483898 5' + pogo 26 1 67.81 AGTCGAAAGTAAATAAAAGAAACACCACACGTACACTTTAGATACACCACAAAATGAGGTAAACAAACAGCAAAAAAATAAAATAAAAATAAAATACATTCTCCCGTATACACATATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTG:1 - 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roo 322 2 82.19 TACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr3L 19938551 5' + roo 79 2 74.66 AACACTTTAGTTTTTAGTTTCTTTCTTGGAATTCAATCTGGAATGGCAAAAAAAAGGAAAATTCATTTTTGATTAAATGCTGGCTATGGCTTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chr2R 16503520 5' + jockey 34 1 64.38 GCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 + chr3R 19989257 5' + hobo 77 1 71.92 GTTGCATACTTATGGGTTACCTTTGCTATTCATAACTTACACGGGCCATAAAATATTTATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr2R 22040906 5' + jockey 70 1 63.01 TTCTGTTTTACGTACATTCTGCTTATTCTGTAGCATCAGAATGAAAACGGTCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCTA:1 + chrX 12131174 5' + F-element 381 1 63.64 TTTATCCGTTTTATTAATGTTCTGGGCTACTATTATTGTAAATCTCTCGATGTTCCCCGTTTTAATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr3R 6526714 5' - pogo 2061 1 53.08 AACTGCAATAGCAACTGCAACTTCAACTGCATAAATGCAAAACGCGAAATGAGCATGAAGAAAACTTTTCCAAACACATTTTCACATTGCGCTCGCTCTGCCAATTGCCCCACGTCAATTAACAAAAAAACGAAAAAGAAAAAA:1 + chrX 1573942 5' + Doc2-element 235 2 52.08 ATAGTAAAAATGTATTTTAGCATTGTTTACAAATCCAAAGCTGGGAGAAACCCTATAGAAATGGATATCTTACTGGATTGATTAGGACTCCAGCCTTTTGTGTTAGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 + chr3L 14761567 5' - hobo 2887 1 71.23 ANTGCACTTGCATTTACAGTCATATATTTTTATGAACTGTGCATTAAGCCACAATGAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2L 2622647 5' - roo 9009 2 62.24 CCACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 + chr3L 10068909 5' + 412 79 2 71.92 GAGTATCAGAATTCGAAAATATCACTTGCGCGAGGATCATTTTAAATTGACATCTTAAACCATTTAAAACAAATTTGGAGTTTAGCAGTGCCTCGACCGTTGTTGAATAATTTAGATAGCAACTTAATTATTTAATTGCGAATTCA:2 + chr3L 8085931 5' - invader4 2628 1 77.40 AGCCTGGCGTGGAGCACTTGTGAATCCCGACTGCCCTGCATTCTTAGTCACCCAAGTCACGTCCTGTCGCAACAACACATCGCATCTATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCG:1 + chr3L 9317433 5' - HMS-Beagle 7014 2 63.70 GGAAAAAATTTAAAATATAACCAGGCAGCTTGACAATCCACGCGAAAAACTGGCAAACAAAATATGTTTCAGCCAAGCGTACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTC:1 - chr2R 18927885 5' - 3S18 306 2 59.42 TAATTTCAGACCCCCTTATGTAACCCCTTTTTTCGGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTAT:1 - chr3R 902620 5' - R1A1-element 5277 1 56.85 CGTTTGCATTTATTCTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGAGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGATCATATCTTATG:1 - chr2L 20327686 5' + roo 8707 2 56.25 TTACTTTTGCAAGGCAAACAGGAAGTAGAAAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGACACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCC:1 - chr2L 8807914 5' - HMS-Beagle 6955 2 77.40 CACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATAC:1 - chrX 21667964 5' + gypsy2 38 2 59.59 GGAAGATAAGTAAAAAACCTATTCGAGTTTTGTGGCTAATTTATACCCTTTACTTGTAGTGTAGAAAAGACACTTTTGATTAGTCTTGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 - 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chr2L 7974536 5' + FB 63 1 61.64 AACACACATAAAACTAACAAACCAAATGGATAGAAAATCGAAATTCGAATGCAAAAGAGCTTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGG:1 + chr2L 13055303 5' - copia 4890 2 62.33 CATTGGTAAATTGTTTGAATGCCTGAACTTGATTGATTTAAACGCGCCACGGACTTTCCCTTTTGACCCACAAAAGTAGGCTACAGAAATTAATTTAAAGAGAAGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr3L 9993860 5' + hobo 9 1 78.57 TTTCTTTTTCGATTCAAAGCACATATGCATGTACATATATGAGTTTATATAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1 - chr2L 21687690 5' + pogo 70 1 67.12 TTTTGCCCAGTTTTTCCAGCTACGTTTTTCACTTCAGCTTTGCATCGCAATTCGAGTGGAAAATTGACATATGTTTACTTTGTTGCTATTGCTTTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCTAAGACAGCAAGCAAATGT:1 + chr3R 11493345 5' - R2-element 3374 1 63.70 AAATAAATGCCAGCGCAGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr2R 18266094 5' - roo 335 2 67.81 AAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCTGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 + chr2R 14767393 5' + Tirant 63 2 75.44 ATGACTTATTAAAGTATTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAG:1 - chrX 21638112 5' + gtwin 64 2 61.64 ATAAATATTTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3R 11873327 5' + 412 7094 2 54.68 ATGCATATTTATTTTCAATAATTGCATTATCAATCGATAATCGTATCGTATCTTCGAGCGGTAGGTTTCGATAAAGGGTCTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGG:1 - chr3R 25793752 5' + 1360 41 1 45.89 GGGTCTCTTAGCGCACAGCAGGCAGCGGTCCAGGGGGTAGCAGGCGATGATAATGTTTAAAAAATGCAACAACGAGGGGATGCCAAGGAAGAATGCATACCCACTGTATGATTTGCGATCTGACAGGTCGTTTGCCCAGTCTGCGT:1 + chr2R 16684558 5' - Copia1_DM 3843 1 59.59 TTGTGTATTGGCCAAAAAGCGTCGCTGCATCAGCTTGAGCCTCTCTTCATTGTTTATTAGTGAGTGGTGAAATTGGATAAAGCGTATTGAAAAATAATAACGTGCAAGTGCGAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCA:1 + chrX 20990557 5' - accord2 7252 1 59.29 AGCAAGCGGCAGCTTAAATCGGCCACGGGAAACACCTCTTTAATAGGAGCTTCATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chr3R 26658233 5' + hobo 68 1 62.33 AGAGCTCGCCACTCGAATATGGCGGCAACGTGCAAAAGCGCCATAATGCTGCGCCATACACTCATTAGCATACTGTACTAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCA:1 + chr3R 9862868 5' - Stalker2 7623 2 58.54 ATCCCAAGGTGGATTAATTCAAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTTAGGGCGCTAGCGAAAGAAATTGTTGGAGTAGTGCTTGGGACAGTTAGTTAGTTTTTGTAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTT:1 + chr3R 19446082 5' - Stalker3T 307 1 37.67 ATTCTTATTTATTTTGCACATAATTTGTGGCCCAACTGGCACAGCAATGTTATTATTTTGTTTCTCGTATTTATTCCTCTCACCATTGCCAAACAATTTAGATGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTC:1 - chr2R 20651240 5' - 1360 107 1 67.12 GGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACA:2 - chr3R 9862977 5' + Stalker2 7311 2 59.59 TTTTGGGACACTTTTCTGCGGCTCAGTGGCGACGACGACTGTGGCAATAGTTTTGTAATTAGCTTGCGATGTCCCAGGTGATAAGTGATATTTAAGGCACTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr2R 18785904 5' + roo 8687 2 43.15 ATTGTATAATTACAACCACAATCAGATCTGGTAGTTCTGGAGTTCTTTATCTTGACATTCAAAAGTACAACAGATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 12540469 5' - roo 9021 2 52.05 GTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCA:2 - chr3R 9862950 5' + Stalker2 90 2 78.08 ACCTTTTTTGTGTAAAATGTGGCTGATATGAATGAATTTGCGTGAAATTCTCAAGATTTTATTGGCCTAAATATAGTGATCTGCCTTCGAAGGTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGTATCG:1 + chr3R 5684023 5' + pogo 20 1 69.93 TAGTCGGGGTAGGTTCACAGGCATGTACAGTTAGTTCGCAGATCGACATTGTGACTGACTTCAGCTTTGGCTGTAATCACGCCATACGATTAGTCTAGCATAAGACGTAAACAAGTTACAGTTAGAAGGGAGTTAGAAGTTTGGAA:1 - chr2L 6209708 5' - 3S18 5916 2 73.29 TCGGTGCCGCCGTTTGAAAAAGCCGGGTTTTGGAGAAATGTATGGGGCTTACTAGGAAATTAAGTCGAAGATCTACTTCTGCATATGAGCTATGTATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 - chr2R 20931767 5' - blood 7382 2 78.12 ATCATTTTGTTGCCTGTCTGGATGCGGTTTTCCGCTGTGGCCCAGCTCCAGCCGGAAAATGCATCACCAGCGGACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATG:1 - chr2L 2722468 5' + flea 4801 2 55.48 GAAGGAAGTACCTTAAACTGGAATCTTACAGATTAAGAGGGCTCAGAGCTAAAGATAAATTCTACTTTTCCTATCCTTTGAGCAGCTATAAGAGTCATAGAAACGCATTCAGGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chr2L 6716451 5' + hobo 9 1 79.31 AGAAGTTTGTTAACGACTTTCCTCCCAGTGCATGCAAAGATTAAATGCGCGGAGTGGGATAAAATGCTGATAGCTGGAAGGCAGCTAAAAGTTTCTTCTTTCGGGTATGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chr2R 10773165 5' + 412 13 2 76.71 ATTAAATGCGCGGAGTGGGATAAAATGCTGATAGCTGGAAGGCAGCTAAAAGTTTCTTCTTTCGGGTATGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr2R 10773204 5' + 412 52 2 52.05 GCCATTCTGTTCTCTCAGCTATTATAAGACTAGTCGTTCTGTATAAGAGTGCGCAAAAGTCTCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 - chr3R 9158323 5' + P-element 57 1 46.58 ATAACCGAAAAAACGAGCATTTAATCGATATTCTCCAGGCGCCATTTAAACACACACCCCCTCACATATATATAGTGACGTATTTGGGCGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3L 5731243 5' + 297 6624 2 54.01 CACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGGCAGACACT:1 - chrX 21667920 5' + gypsy2 86 2 73.97 CAGTGATACCGAGCCAGCACATAATGGCAGCCCCTAACATGCATTCCTAACTATAGCCGATACTCCAGCAGAGGCCTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATT:1 - chr2R 3130021 5' - Tc1 1550 1 57.53 AACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAAAAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chrX 22386753 5' + hobo 68 1 58.67 AAATTGTCGCTTGGCGCATTTCCCTCTGTTTGCTTGTTTTGTGCCGCAGTTTGTTTGCTTGTAGGTTTAGAATTTTCGCTTACAGCAGGCATTTAATATTTCATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCGTTATATTACTTT:1 - chr2L 22032101 5' - Tabor 465 2 71.23 ATATTACTCACTTACATTGCTCTCCCTGGGGCGACAGCTGTCACCCTTGCACACACGTACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGTCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 + chr3R 17079412 5' + 1360 65 1 61.64 GTACTTATCATTCGTGCAATCTATTTCCGATGCCATTTCATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTT:1 + chr3R 18117036 5' - F-element 4445 1 76.03 GGAGAGACCCCTCTGAATCCATGATATTATAAAAGCTTATATGTTAGATTGGGAATCGCTTGATAACATCCTGCTTCCTGCCGCAAGACATCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACTATTTTTTGGTACAC:1 + chr2L 22348823 5' + 1360 31 1 66.44 TTGTTTCGTTTTGTGGCGACTGCTATTTTTTCACAACTTCCTTCTTGGGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 14450128 5' - roo 9051 2 63.64 CGGTGCGCCCGAAAGTATGCAGCCAAATATTTATAGCACGCCAATTGACTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAA:1 + chr2L 19841504 5' - BS 5021 1 71.23 CTGCATACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chr2L 2518566 5' + jockey 79 1 65.28 AAAAGAGTATAACGTTAAACCCAAAAACGTTTTGTATATGGCTTTAAATATTTAATAATTGTGGGCAGAGACAGCAACACCAGCAGCAGACGCATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:1 + chr3L 7370424 5' - Burdock 6364 2 67.12 CTTAGACGAGCGTTTGCTAGAAGGTCTATCTCAATATAGATTAAAGGGCTTCCAGAATATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTACGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTGT:1 - chr3R 7306009 5' - 412 7493 2 56.03 ATACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr3L 19938552 5' + roo 78 2 73.97 AGTTGCAGTACTCAACAAATCAGTTAGCCATGGAATCCCCAGCCATTTAAATGGTATTTTCCAAGTCTGAAATTCCTCAGCTGCATACCTGGAAACCTTTTTCGACAAATCACTTTTCGCAGCTGGAATAAAAAAAAATGACAT:1 + chr3L 3914143 5' + P-element 138 1 54.86 ATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr3L 16523199 5' + jockey 72 1 65.22 GTGTTTAATTGTGAATTGGATGATGACTTCACGGCCGAGGTGTGCTATTAAGAGCTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCA:1 - chr3R 4738092 5' + P-element 2665 1 26.71 CCTCGACAGTGTGTGCTCAACGGGATATCAGGCGGAAAAGGACAAAGAGCGCTGCATACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr2L 2518617 5' + jockey 28 1 67.59 ATATAGTTTGAAGCGTGATCTACGCGTGCTACATGATTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 - chr2L 12696210 5' - pogo 2034 1 71.43 GTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAA:2 - chr2R 12185423 5' + accord 56 2 56.85 CAAATGTCTAGAAACTAAATGACAAAACCAACAGTGCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCAAGTGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGC:1 - chr3L 21765525 5' - gypsy 7400 2 52.82 TTTAAGTAATAATTAATATGAACATTATTTCTCCATTGTTGGCTGATTATAATAAATATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTG:1 - chr3L 13365131 5' + Juan 48 1 47.26 AATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTC:1 + chrX 16857075 5' + pogo 81 1 73.97 GGCATTAGCTGGCAACCCTTTCCCCAAAAACGTCAACAGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2R 8467745 5' - roo 326 2 73.97 AATCAGCTGGCAGGAGTACGTGACTCACTCTTTTCCAGACTTCTGGACCAGCATCTACACTTTCAAAAATCAGCCACTCAATATAGAATATAACATGTAATATAATATGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - 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chr2R 12185412 5' + accord 6913 2 63.01 TCTTAGTATTTTATGACAATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTT:1 + chr3R 1047949 5' - Stalker2 350 2 49.32 GAATTTCACCGCAACGTCTTATGCAGCACAAAATGGCGGCGCAAAAGGATGGTTGCATATACAATAACTTCATCTCATTCAATCTCTCCCAAACTCACCCCATGTAATGTAACACTCAAAAACTCAAATAATTGTACCTATATAT:1 + chr2L 6571 5' + HeT-A 5973 1 65.52 GCACATAGCAATGCACAGAGAGAAAATAGAGTATCTAATGGATAAGGAAACAATCGAAGGATTAACTGAAGAAATCAAACTGGATATGTCATCACATTGATAGGGAATAAATGGATCAACTCTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 - chr3R 18860939 5' - roo 410 1 56.16 GAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGTGGGTCCTCCTTTCTCTACACTT:1 + chr2R 12185338 5' - accord 7357 2 55.56 AGTGAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATAC:1 + chrX 21087536 5' + mdg3 26 2 64.38 GCTCGCTCTGCAGCTCCTCGGCAGGTGTACCTGTCCGTGTGTGCGTGCAAGAGAGCGGGGCTGCGCTTGTAGTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACGCGCACTCT:1 + chr2L 15057150 5' - hobo 2930 1 67.89 ATGCACTCCCACCAGCTGGATTCCTACCTGGGCGGAGTGGGCGGTATGATGAATCTGGGCGGCATGGGCCAAGTTGGCCAGATGCACCATCCGGGGATGCAATGGGCCTGTCACGGTCGCCATGTGATAG:1 + chrX 17262770 5' - Stalker 400 5 71.54 GATTTGTAGTCGATAAAAGCCACAAACTTCCGAACTTCATATAGAGTGGATAGACTTCAATAGTCGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr2L 11043514 5' + roo 54 2 56.25 CAACATTTAATCAGCTAATTAATATGAATGCGCAAATAATCACAATCACAACTTCATTATTGGCAGCTAGTAACAAATGATACAAACACCTAATCTCATTAATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chrX 16857204 5' - pogo 2085 1 75.34 CAACCCCGCCCCTCGCCCCCCTCACGACTTTCATCGCAAGGGATATATATCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGATTTTAGGAG:1 + chr3R 18114859 5' - 297 6906 2 69.86 CTGTTTGGCACATGGCGTTGGAAGTGCGGGTGTGTGTATGTATGTAAATAGTATGTACAGTACGTACGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr3R 17079513 5' - 1360 3334 1 58.90 TAGAAAGATAGCAAGCAAATAATATACTATCGCAAAATAGTAACACCATTATGCGTGCCAAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 - chr3L 10241296 5' - pogo 2046 1 59.59 TAAATGGAGCAGAAACGCAGACAGAATGAATTGGACGAAAGGACACTTACAGTCAAAACAGCTCAACTAGCTACCTTAAAACTTAAACAGGAATAAATTCTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 18539742 5' + roo 8685 2 71.92 GTGGAGAAAATGGAAAACACAAATCCTGTGTTACCTGTCCGTCTAGTGCGGAATGCCGACTGTGTGGAAAGAGCTCAGAAAAGACTGCTGGGAATTAATTAATTGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr3R 5684211 5' - pogo 2086 1 75.34 ACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAAT:1 + chr3R 21276556 5' + BS 5080 1 73.29 TAGTGTGCGCGAGAGAGCGAGACAGCGAGAGCAAGAACAGCATGGGTACAACAAAGGAGCGAAGAGAGCAAAGCGAGGGCGACGCCGCCACCACCCAAAAATAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCG:1 + chr2R 24744226 5' - blood 7178 3 78.23 ATTCAAAAGTATCTTGCAGATACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chr2L 19907536 5' + hobo 48 1 52.74 AGAGGAATGAAGTATTAAGCGAGCAGCAACAGAAAAAATTTAATTGAATTTGCACTGCTTTTTTGAGTTCACTTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAG:1 - chr3L 780781 5' + Burdock 44 2 52.74 TTCTTAATTTAAAATGTTAATAGACAATGCACAAAAAGAATTATTAAGTTTAGTGGAAATGTACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCT:1 + chr3L 23244842 5' - HMS-Beagle 6982 2 60.27 TGGGTCTTCGGCCCGTGCGTGTGCCATCTCCTTCTTCCACATCCCCCGTTAAATGCCACCCGACATGTCCGCCATATCGTCCGATTTTCCCCGTAATACACCCATATGTAAAATCTTAATGAACCAAACCTCTCACGAGGATTACT:1 - chrX 12372548 5' - BS4 637 1 74.66 AAAAGTTTTAACAATGGATATAGAAGTCTTTGTATTTTATAACTATTAAGTGCTCAAGTTTGTATATATGGCATAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTG:1 + chrX 13558163 5' - mdg3 5453 2 54.11 CCTGGGGAAGAGACATCCGAAGAACAGTGTAAGTTTTTTGCGAATTGTTATTAAAAACAATCAAATTTCACATGTGGAAAACGGAAGCATGTCCGACTATATAAAATATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTGGATCT:1 - chr4 913632 5' + INE-1 97 1 38.36 CCCGGCCCCTGCCACGCCTCGTTGTCACAGGGAACTCGGTTAGATAGCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 - chr3R 12886073 5' - 412 7473 2 69.86 TATGTAGATTTCGGACAAATTGTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTGTCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTG:1 + chr2L 22031952 5' + Tabor 54 2 56.16 ACTTTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAA:1 + chr3R 15035059 5' + Stalker2 69 2 63.01 TGGCTGTCGTGCGATAAATTTCATAGATGCATTTGGTAATTTTTAATTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTT:1 - chr3L 1397071 5' - Juan 4135 1 70.55 GAGCGACCGGCCAAACGGCTATGCAATCGGCGGCCTTCCTCCACCATAGGCAACCCACCTCTACATATTTATATGAATGTATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCC:1 - chr2L 9228792 5' + Burdock 35 2 59.31 CAGAATTTAATGCGTTTTTTCGCCCTTGCCCTCTCTTTGATGCTAACTGCTCGTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGTAACCTGCTAGTTAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr3R 10741021 5' - 1360 3386 2 78.77 ACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCACGCGAAGAAC:1 + chr3L 21765432 5' + gypsy 7065 2 69.18 TGCAACGTATTTTGAGGGGTTAGCAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTTCTTAAATTATTTTATTTTACA:1 + chr2L 19565443 5' - jockey 4927 1 62.33 GGTGGGCGTGTTGAAGAGGCCATTCCGAATCTGATGATTAACTTCAGAAATAATCGAATGGGACTTCGAATGAAAGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAAT:1 - chr3L 2744726 5' - FB 983 2 61.64 GCCAACCTCGTTTGAATTGTCCTAACTCCAAAAGTTCCGACCACCGGCCCCAACTGAAAAAAAAAGTATTTACCAAAAAAGTATTTACCAATGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr2L 232327 5' + Doc 32 1 50.68 ATACATATCGTCGTGTACATTGCAACCCGTTCAGCTTGACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGC:1 - chrX 10950431 5' - invader2 122 2 73.97 AGTTCCGACCACCGGCCCCAACTGAAAAAAAAAGTATTTACCAAAAAAGTATTTACCAATGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chr2L 232359 5' + Doc 64 1 69.18 GAAGATGTCAATCAATTATTCTTAAATCGTTTTGATATCCGTGAAATGCAGAATTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 - chrX 2266701 5' - 297 381 2 63.70 GCCCGTGAATTAATGTAATTACTCTTGTCGTAGGTTGTTAAGATGGATAGATAGATAGAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCA:1 + chr2L 7596012 5' - mdg3 5436 2 57.93 TCGTGTGTCTTCTTTTGGACTTTTAGAGAGACTTAAGAGGGATGGTCCCGTTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTTCCGACACGTCGCCATCATGCGTTGGAATAGTGAGGAG:1 - chr3R 24616220 5' + mariner2 133 1 63.79 ACTGCTTTCTGTCCAGCAAACTAAACTCAGTTTCAGGTTTCACCATAGTTTTTAAAGTTATTTTGCTTAAGTCTTCTAAACATGTCTTAAATGCATTATATATTTTATAAGTTATTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTGC:1 - chr2L 14934353 5' + baggins 5168 1 78.62 GATGGGGCACAAACATAATGCCGGTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGCTGTCTTTGGG:1 - chr2L 3393812 5' - Stalker2 7564 2 75.86 CACGCAGTACGCACACGCAAAAAAAAAAAGCATAGAAAAAGAAGGTAACAACACACCTGCCGGTTTTCGACCTTTTGACGCAGTAAAGTCAATCATGGAAATTGCCCAATAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATA:1 + chrX 6303244 5' - Circe 100 1 74.66 TGTCGTAAATTTAAACGTTTTTATTGACCATTAAGTACGGGATATCAAATTGTTTGTTTAAGGAAGAGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATAC:1 + chrX 10502525 5' + F-element 139 1 56.16 CAGTGCGCGCCCACAATTTGTTGGAACAATGCAAAAATATTTCGCTCAATTACTTAAATGGAGATGACACCTGGTTCTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr2R 11394072 5' + pogo 41 1 54.79 GGAGTCTGCCCCATCGACTTCGGCTCCTGTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGATAC:1 - chr3L 13380503 5' - hobo 2878 1 69.83 AAAATCCAAAGGAAAAGAAACCATTGTAGCCACAACAATAGAAATAAAAGAGTTAGATCGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTT:1 + chr3R 19444854 5' - R2-element 3190 1 60.27 GGAAGTATGATATTGAGGCAGTTAGTTTATTCTCTTATTGCTAATTAAGGATGATTGAAAAAATCCTGTTCATTAACGCCATGAATGATTAAATTAAAACCACAATTACGAGCGACTGCTAAAAAAAAACACAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 5625711 5' - hopper 145 108 61.54 TATTTGTAGCAATTAATATCCAATATCTGGGTGCTGGCATCATTAGTTTATTTTCCTTTCGCTGCCAACTTTATTTTTATTCCCTTTCCAACAAATATATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGT:1 - chr2L 8615477 5' + 17.6 6944 1 74.66 TAACAAAATAACAAGCATAACAAATAAAATGAAGAAAAATTAAAATCTGTTGGTAAAAATTATCATTATGGTCTTAAAGAGCCCGCAAGCTTCCAGATCGACGTGTACAAGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chrX 22760461 5' + roo 11 2 78.08 AAGAAATCCCGTCCATTTGTGGAATACCTAATCGAAGTACGTTGAACCCACTAGAAACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACC:1 - chrX 11921964 5' + Doc 310 1 61.64 ATTATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCC:1 - chr3R 30872894 5' + micropia 38 4 59.59 AAGTACTTGGAAAAGTTAGACAAATCCTCATTTTACCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCC:1 - chr3R 19989337 5' - hobo 2876 1 60.96 TTTGTTTTTTGTTAAATGATATTATAATTACTAATGCTTTTATAGATTGAAAACTTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chr3R 26031690 5' - pogo 2039 1 61.64 GACTGAAGGATTCGTGTATAGTATTATTTTGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3R 18514309 5' + pogo 44 1 54.79 AACGTTCTTTTGTTTTAAGCCAAATATATTTATTGAATTCCCTGTGTGTAGGGTTTAATCAAATATAGAATAAATAGGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 18539900 5' - roo 9028 1 54.11 ATTTTACGCCCACCTGGCAACTCTAGAGCAGCTCCAAAAGCTCCCTATCTACCTTACTCTCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 - chr2R 16031443 5' + hobo 61 1 58.90 ATTATAGAAAGCCCAAGGCTGCGGTTGCTTCGGCCCCGTACTCGCTGGCGTATGAGCAATATTAATTGTAGCTGAAATTAATCATACGCACCGTTGCAGAGCATGGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 30524602 5' - roo 394 1 75.34 AAGACACGAAAGAAAAACAAGAGTCTATTTTGTAAGGGCAATATACAATTCTACAATACAATTCTTTTTATACCCGGTACTCTAGATTCGAGACTTTCCGACCACATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTC:1 + chr4 520283 5' + INE-1 92 1 63.01 ATTGATTTCATAGCTACTGCGTTTGCTTTCGGCGCTGCTTTCCTCAAATTACATGCCACAACGGCCCTGCCAACCGAAAATTTTCGATGGGCCAAGCAATTGGGGTAAGAAAAAAACCGAGGAAAAAAAAAACAATAACAAAATAA:1 - chr3R 8208443 5' + gypsy11 3933 1 52.05 AAGGGGGACACGTGAAAGTCAAAATAAGGTTAGACAATAAAAAATGAAGAAGTTTCTTTTTCGATTCAAAGCACATATGCATGTACATATATGAGTTTATATAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2L 21687742 5' + pogo 18 1 71.92 TATTGCTCATACGCCACGTGAAACAGCATCGGCTTATTTTCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGTAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 - chr2R 8492819 5' + pogo 77 1 67.81 CATTTTTTCAAGCTTTTCCTTGTTTTATATAATTCAACATTCAATTCAACTCAATTCGAACATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2L 8909895 5' + roo 8720 2 56.16 GATATGCGACTTTTGTTTTCTTTGCGCTTACCTGTCCTCTCCGCTGTTTTCTTTGGCGCAACAAAAGCTCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTC:1 - chrX 9637179 5' - R1A1-element 4952 1 50.74 TTTGCAGGGTGAACGACATTCCGCAGCATCAATTTCTGATTATAGCAATGAAATGCACTTCAGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2L 11559813 5' - roo 9014 2 58.90 GGAGGTCAACGGTGGTGGGGGGCAGGCAAACAAACATAGCTGGCAATCACCTGGCGCCTGGCCCACCCACTCCTTGCCGTAAGATTATGCTATCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGGAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTC:1 + chr3R 16160083 5' + R1A1-element 5115 1 63.45 GTCTGCGGCTTCCACATGGAGAGGCCCAAGTGCACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 - chr2L 20716408 5' + P-element 84 1 27.78 TGTAGCGCCAAGTGAAACGTATCGGACAGATAGAAAAGAATAACAAAAAAGATATATATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGA:1 + chr2L 8615329 5' - 17.6 7359 2 68.49 ATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAA:1 + chrX 21087558 5' + mdg3 34 2 50.00 CGGGAGAGCTAAACCAGGCGCGAGAGAGACAAGTAGAGTGCGCCGCAAAGGGAAAGAAGAGCGAGCATGCTCTCATTTAGTTAGAAAAACACTTCTAAAAAGTGCACCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAG:1 + chrX 7930632 5' + P-element 14 1 74.66 AATTTGGTCCTGTTCTTTCGATAGTTCTTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTAAAAATCGATTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:3 + chrX 21668821 5' - mdg1 7437 2 67.12 GCCGGGAAGTAGGCAACATTTTTTGTGTTTGCTCTTTGTGGTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr3R 8625261 5' + jockey 73 1 69.92 GCCACAAGTGAACTCCTTGAGGACACTTGAACTAATATCATCGCTGCTGCATGTAAAATTATTCGATGCCAGGGCAACCAGTTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTC:1 + chr2R 17894111 5' - R1A1-element 458 1 50.40 TCTGCTGGTAGTACCGATACAAATCTATGTATTTGCTTCTTTTTCAAATAAGTTAAAGGAACCTACTATCCTACCTATACCTACATGTTCATTAATTACGATTAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3R 25052952 5' + pogo 13 1 75.34 GCATTTCGAGCCTGTCAGTGTCGTCTGTAATTGTTTTCCTAATGGAGGGGAGCTCTGGCTGGAGATCTGGAGAACTGGACCCCAAAAACATGACCGCACTTAAAGTTAAGTACATAAGAGCAAAGCAACGTCTCTGCCGACGGC:1 + chr2L 1367684 5' + Tabor 270 2 71.53 ATACTATTACTGAAGAAAATGTTCAAAATATAAATAAATATTTTACGCAAAAAGAAGCATTCAAATGTATACATTTAAATGTATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGA:2 - chr2L 13156607 5' + Max-element 8277 2 54.79 ATAGATGAGCGAGAAATTGCGAGTATATTATACTTACATTATGAATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACC:1 + chr2L 10178004 5' + mdg3 78 2 69.18 GGTTGACCGGCAGGCGCACAATAAATAAAATTAAAATGATGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCT:1 - chr3L 18373258 5' + F-element 328 1 72.60 GTTATAGATGGGCTTTGTTAGAATGTTTCCAATATCTGTTCAGCACATACAGCCGAGGGCAAGTAAGTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:1 + chr2L 3393737 5' + Stalker2 7301 2 52.74 AAAATTAAGGTTTATTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 18954120 5' - roo 9016 2 57.53 AAATCCATGACCGAAGCAAAATTTAAGGCGAACTCGACAGTTTATTACCCTGTTTATTTTTGCGGTTATCTATAATAACGTAAATACAGCATATAAATTGTATTACTTTTTAGAAAATATTGACAATTTCGGGACTTTACGTTGGT:1 - chr3R 31955717 5' - HB 239 1 76.03 CAGTAGCTCCAAGATGACCAACGATGACGGTCAAGAGACGGATGCGGGCTCCACAGTCCAAGAAGGTGATATCGTTCTTCAAGAATCATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chrX 15696661 5' + jockey 4694 1 65.94 AAAAAACCCTATTTGACTAAATTTACATTAGAATATCAATTAAGGATTATAGTTGAAGTAGTTCTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 - chrX 19736528 5' + pogo 55 1 57.53 CAAGTTCAGGCCTCCAATGAAAGTGATAGCCCTTATCACCAACCTCATAATCGTGACGTCATATGTGGCTAATGTGACTCATGAAAATTAATATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACC:1 - chr2L 15934683 5' + springer 7159 2 70.14 CTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chr2L 12766993 5' + hobo 66 1 69.23 ACAAATTTCAATAGAAATTTATCGTTGGCGTGGTAATAAATTAGTAAATATATAAACGCATATACAATAAAACACGAAATCAAGGAGTAATCAGTTTTCAATTTATATCATTACGCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3R 7136519 5' - roo 400 1 78.77 GAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr2R 17872476 5' + Tirant 8128 2 58.42 AAAAGGAAAATTCATTTTTGATTAAATGCTGGCTATGGCTTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr2R 16503468 5' + jockey 86 1 70.55 CCATACAAAACTTGAGATGTATTTCCCCAGAATCTCTAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCT:1 + chr2R 5800488 5' - HMS-Beagle 6962 2 73.29 TTTGCTAGACTATCACATTGAAATACCAAATTTGAAACTCATATTTGTTTCATTTTGTTATGAGAATCGGGGGTTCTTCGATCTCCGCACATTCAGCTATATAACAGTTAATAATCACAGGTATCGATTTGATTTT:1 + chr3L 13475462 5' - HMS-Beagle 236 2 69.12 CGCAGCATCAATTTCTGATTATAGCAATGAAATGCACTTCAGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr2L 11559792 5' - roo 329 2 73.29 ATTCAAAAGTATCTTGCAGATACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAAGAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGTG:1 + chr2L 19907536 5' + hobo 41 1 53.96 GTCTGGTGGTGGCTCAAATGCGAGGGGAGAAGAGTACCTGTGGTATTATTAAGGAGACTACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr2L 20253945 5' - roo 9011 2 58.90 GATTAAGTTCAAGTTTGGTTATTATATGTAACTAAATAAAAGTTTCAAAACACGGACTAATTACTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTC:1 - chr3R 27443252 5' + 3S18 5823 2 54.79 GGTGTTTCGACTCGTAAATAATTACAATTGCCCATGGACAAACATGAGCCTCAGGAATTGTTTAATTCCTCATCTGTGCTGGTTGGCAAACACTAAAATAATTATTCTCCATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCA:1 + chr2L 3397817 5' + Stalker2 57 2 75.34 CCCCTCCCGGACCATCCGGCGATGCGGAAGCCGTAGCAGGGCGCTAATTGATTGCCTGAGAGGAGACGTAGAATTTTCTTGCTTGAGTGAGCAAAACCAGAGACCAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGATAGAAGACGAT:1 + chr2R 24958562 5' - 1360 3203 1 52.78 ACGATAGCGGAACGGTGGAAATTGGAACTCGGGGACGTTATTTTTGCGATTTTTTTCCGCTTATCTAAACTACCGTGTCCCTATAGGCTTATAGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 - chr2L 5724430 5' + 1360 24 1 36.99 AGTTAAAAAAAAAATATAGAAAAGAGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chrX 21497509 5' + 412 7094 2 56.16 CAGTTCGATTGATATCCAGACTGGATACGCTGGATTCCACTGCCAGGCTACTGTTGCTCATTCCCTCCTTGATCCGGCAATTGTCCTTGAGGTCCTTAATCCAAGCACCAAAGTATTCCTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGC:1 + chr2L 18672370 5' - HB 8 1 76.03 TAGACAGCTATCGTATTTTGACTCTTGTTTGCTAAAAAAAAGCATAGTTTTAAAGTATTTGCAAGACGTTTGTATCCCCGTTAGGAATAAGAGTATTATTGCTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGTATTAAGAGATAAGAA:1 - chr3R 17048236 5' + invader3 118 2 50.35 GTTAAATTCGGGAAAAGGAAGAAGGAAAGTTTAGTCGAGTTGAGTCGCTAGTTGAGTATGAAAGAAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3L 2240507 5' + roo 52 2 55.48 GGGTGTATATAGAGTGCTTAAACGTAGATAGTGTGCTTATTTTAAAATATTTTTAAATGTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 + chr3L 25821780 5' - opus 7445 2 57.53 TTCATATATTGATAAATATTGTACATATATGTAAACTATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chrX 3637738 5' - roo 9039 1 63.01 GCATCCCTTTCCCAATCCCAATCTCACACCCATTTTCCATTCCATTTTCCGAATCAGGTCAATGCACAATCGCAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAGAACTACA:1 - chr2R 10960977 5' + Doc 55 1 49.32 GTGTGTAAGAGCTCTGTTTATATTCCCAAACTCTATATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAAGCTCTGC:1 + chr2L 19217630 5' + springer 82 2 76.03 TAAAACACTTTTTGGCCCTGTGCGAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr2L 5656538 5' + hobo 57 1 54.11 AAAAGTTGTATAATTTCGCATTGGCAGGTCTAATCCCACCAGGTAGAGAAACCCACACACAAAACGCACACCTAAGTCCCCCCACGAAAAGTATTTATGATTATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1 - chr2L 1411816 5' - I-element 5334 1 69.86 ACTCGCATCCCTTTCCCAATCCCAATCTCACACCCATTTTCCATTCCATTTTCCGAATCAGGTCAATGCACAATCGCAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 - chr2R 10960981 5' + Doc 51 1 49.32 TATTTTCAATTTGTGGACACGAAAAAAGTTTTGTTCGCCAAGACGGGCTACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATAC:1 - chr2L 2675050 5' + Quasimodo 59 2 64.75 ATCGGTTTTTTATTAGTTTCGCTCACAAAGAGCTTCGTTGTTGGGCTTTTTCTGGTCTCGGTCTCTCGACATTACAACAACTTCGACTTGAGCCCCTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr3L 17895877 5' + P-element 27 1 67.12 ATTGAATTCCCTGTGTGTAGGGTTTAATCAAATATAGAATAAATAGGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3R 18539869 5' - roo 8997 2 70.55 CTTTTGTGACCCGAAGCCTAATGCGTTAACAGCAATAACAACAACAACAACAACAACAACAGCAAAGTGTGGGCTGTGCAGCCACAAAACAACACAATCATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATA:1 - chr2L 19635108 5' + Quasimodo 14 2 71.92 GTCGGCCGGGAAAATTTAGCAAGCAGTACAGGAGGAACAAACGTTTGCTTGGCATGTTCAAGTGATAAATTCAATTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 + chr3R 27411674 5' + I-element 44 1 52.05 AAGACTAAATTGAAGTAGAGAAAGTATTTAGTTTGGCATGGCTCACAATTAGGCAAATACATACAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTA:1 - chr2L 19217712 5' - gypsy6 347 4 50.81 CCATTCTATCCCATTTAAATCAATTGTGTAACGATTTTGTTAAATATTTTATTTTGTTGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACA:1 - chr2R 22040983 5' - jockey 4927 1 65.07 CATGTGGCAGCGACCTAAGTGCCCATTACACACGGCAGCCCCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 5767354 5' + roo 8712 2 52.74 TAGAGTGTTTAAACGTAGATAGTGTGCTTATTTTAAAATATTTTTAAATGTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGT:1 + chr3L 25821789 5' - opus 7436 2 63.01 TATATATAAAAAAGTGCTCTTTTGAAAGATCAGTGAAACGAGAATTAAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1 - chr3L 3910565 5' - 297 6912 2 69.06 AAAACAGCAAAAGCAAATTAAATGCAATTCAATTTTGAAAATCAAATATTTCCGACATACTGTGTCTCTATATATATATATAAGTATATACGAATGCTTATACTTATGTATATATAGGGAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTT:1 + chr2R 17341050 5' + hobo 4 1 75.34 AATAGTTAATCAGCGATTTTCCATTCGAACATGCATCCTTTTGTGCCGGACTCGTGTTAGTTTCTGTTCATTAAAACATGTTAAACACATAATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:2 + chr3R 12885953 5' + 412 30 2 63.70 AAAAATAGCACAACTGGGTTAAAAGCAATAAAGTCTATTTATATGACAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTT:1 + chr3R 23714039 5' - I-element 5280 1 70.55 AAGAGATGCCACGATAACGAGCGAAAGAGATAGCGAGATGGCCAAATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr2R 15892252 5' + hobo 28 1 63.31 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCAAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAA:1 + chr2L 19479165 5' - R1A1-element 81 1 57.53 ACACAAACTAAAGTGAACTTAATTAACAAAGTTTTCAAATCCGTATATCAATTAAGAGTGTATATCTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTT:3 - chr3R 26693450 5' - Stalker2 348 2 57.53 GGAGCTCGAAATTCGAATCCACATGAAAAGCTGATCCCAGAAGCAGACTACATATTCTAGTCATGTTTTTGCTATTAAAATTCCTTAGTCTAAGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAA:1 - chr2L 3327101 5' + jockey 4698 1 63.01 CAAAAAATCGAATGAAAACAAATGCGAAACCAAACGAGCTTGGCAACGATGTCTCCGGCATAAAAAGTTTAAAATTAAATTCAAACTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr3R 19625853 5' + opus 140 4 67.12 TTGTTACTGTAACTTACTGTAATGTAGTGCACGCAAGGACTCGACTGTGAATCCTAATAAATTATGTAGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAAT:1 + chr2R 10202973 5' + 17.6 49 1 54.11 CTGCATGGAGTTTTATTGTCTGCGTAAATGCTATATAGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACATCTCACCGACAATCCCAAACGCA:1 - chr2R 3091700 5' + F-element 284 1 52.74 GGTTGGAATTTACTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 - chrX 12995422 5' + blood 7058 2 53.42 TACGTCACTTCGTTGTTGTTGAATTTTTAACTCGATCTCATTTTGCAGCTTCAATATTTTCAACTCATACTAAATTATGCCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCAAATGTACATTACAAGCACAGCAATTATTTAGCAAATTAGA:1 + chr3R 1268590 5' + I-element 5227 1 58.22 AAAACATTTCAAATAATAAGGGGAAAAATGTATTTTGGCATAAAATGAAGTACTTACATATATTGTAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 + chr2L 615173 5' + F-element 20 1 75.34 TGCTACAGCCAGCGGCAAGCAAATTAGAAACCGCTTGAACTACACGAGGCGAAATGTGCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACC:1 + chr2L 20268924 5' - hobo 2877 1 58.22 GCAGTATACGGCGTTTACGGTGCCAGGAAAGGGATTGTTCCAATGGAAAGTGATGCCATTCGGACTACACTCAGCGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCT:1 + chr3L 25232690 5' - accord2 205 1 81.51 AGTAAATATATAAACGCATATACAATAAAACACGAAATCAAGGAGTAATCAGTTTTCAATTTATATCATTACGCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 7136561 5' - roo 9021 2 51.37 GACCATGTGCCCGGCCCCTGCCACGCCTCGTTGCCACAGGGAACTCGGTTAGATAGCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGACGGGCTGACATCTATTTCTTCAATTTCTTC:1 - chr3R 12886082 5' - 412 7482 2 59.59 GCCATTTGCTATAATTTTCCATTTCAATTGGCTTACGCATCGGAAATGAGAGATGTTAGAATTTTGCACGTGGCTGACCCTTTAGATGTTTCGCTTACACTTTTGGCCTGCTCGGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAA:1 - chr2L 16555013 5' + F-element 244 1 76.98 GATCATATTTAATAACATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTCATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCGGTCC:1 - chr2R 4270285 5' + gypsy9 36 2 51.37 GCGGCGTTTCTCCTGACAAGGTGTACTCCTTGACAACGGCCGGTATTAGGAAGTTATGGGGTAGGGTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCAT:1 + chr3L 25496739 5' + mdg3 57 2 54.79 GAGAGATAATAATAAAAGGGGTATCTTTTCTGTTGAAAATACCTTTTAGATAAGATATGTTGTATAAGAAAGGCATCATATACTTTGCATATTGGACAGAGTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:2 - chr3R 26031839 5' + pogo 15 1 76.03 TATTGTAGCTATCATCAACTTGCCGGGGGAAGCACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCAATTTCGTATGCAATTTGAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCG:1 - chr3L 15099691 5' + G4 3805 1 59.59 AAGTTAGAAGTTTGTACTGAAGCTCATCAAAAATGAATGAAGTATATATATATTTATGATTTTGATTTATATCCTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAACAA:1 - chrX 14121851 5' + Doc 50 1 51.37 GAAATGAGAGAAGCACGCGGGCAACAAAAAAAAAAAGGGGAAAA:1 + chrX 14338563 5' + Bica 337 1 50.00 GGGGCAGAGAGTCACATTCGGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 - chrX 22715184 5' - opus 482 2 73.97 ATAGGTAGTCGAGGCGAGAGTGGGGGAAGGTGGCAGAGGTGGCAGAGTTGGCAGAGTTGGCGTAGTGAAAGAATGTAAACAGCTGGGAAAAACTGGGGGAATCTGGGGAATGTGCCTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCA:1 + chr3L 19398065 5' + gypsy5 7 2 79.45 GGCAGAGAGTCACATTCGGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chrX 22715182 5' - opus 7483 2 73.29 ACAATGCGATAGTATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3R 23565236 5' + jockey 28 1 62.07 CGTGCACCAAAGGGAGATATTCCAGGAGGCACTCGAGGCAAACCTAACCATTCATATCAATCTCGGCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGATCTAAAAACTACAACAG:1 - chr2L 15601642 5' + Doc 59 1 54.79 GTAATAATTAAACGTGCTCTTGTGTTGAACAAAAATTTCAAGTAAAGCCATTCAATAAAGAAATTGTATTTGACAGGATGGGCAGTTGGGTGTTTTTTTACTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTG:1 + chr2L 15096839 5' - jockey 4977 1 61.64 TTGACCATAATTTAATTTCCATAACGGAATCGGCACCGGAAGAAGTAACTCATCAAACTGCGTAGTTATGGCTTGGGGCAGCTGAGTAAAATGCGATTATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:1 - chr2R 5800614 5' + HMS-Beagle 6814 2 75.34 GAGCCACAAAGAGAGGAATGCGAACGCAAGGGAGTTTTTCAAAAGGAGTCTGCTCTATATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAAATATGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTA:1 - chr2L 21082248 5' + mdg3 5285 2 63.70 TGCTGCTGTGTGGAAAGCGAGCGAAAGCCGAACAATATCCGTGCGAGTCCGAAGAAAAGGATTCTTCCTGAGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr2R 12872989 5' - P-element 2837 1 51.37 CAACGTGTGGCAGTGTTTAATGAAATGTAATTGAAATAAATTAATTTTTTCACACTTTATTCCGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 + chr3L 21405383 5' - mdg1 7400 2 56.85 AATAGTGGGTAAACTACTGCATACTAATATCGGTGTAACTAAGTGTTTGACAAAGTGATTACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr3R 24760662 5' + pogo 34 1 62.33 AGCATATGCGAAAAACAATGCCGCACCGAGTGCAATACCAACGTGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTC:2 - chr3R 24301899 5' - Tabor 409 2 68.49 TATATTAAATTGCATTGTGTGGATTTGCACTGACGCTTCTATTTCAATCCAACTGACTGCGGCTAAATGCATCCAGAGCATTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr3R 22266410 5' - roo 9035 1 57.53 TGCCACGATAACGAGCGAAAGAGATAGCGAGATGGCCAAATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr2R 15892246 5' + hobo 41 1 56.16 GCGACAACAAAAGCTGCAGAGCAAGAAAAAATATGTATATATATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAAC:1 - chr2R 17317651 5' + hobo 79 1 73.97 TCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr2R 20931619 5' + blood 7061 2 52.05 AAAAGATAACTGCGCTTTTCCTCGCGCCAGCTGGCAATGCCATTCTGTTCTCTCAGCTATTATAAGACTAGTCGTTCTGTATAAGAGTGCGCAAAAGTCTCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCTGAA:1 - chr3R 9158361 5' + P-element 19 1 72.60 CTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTGGGTGAGGACTTCCTTC:1 + chrX 21772485 5' - springer 7078 1 70.71 ACTGACATTAGTCGCCAGCTCGAGGTAGCTGACTTCCTCTAATGCACAAATAATTGCAGAAGATGCTTCTGATGCGCCAGTGTTGCAGTGTCAGGTAGCCGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chr3R 21734657 5' - copia 233 1 68.49 ACCGCCATCATACTTATCGACGCACAGATTGTACTCATCCACATACTCCGCATACTCGGTTTTGAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTT:3 + chr2R 18056787 5' - blood 7334 1 54.79 AAATAAACAATGCATTATGGCAGACCAGAAAAAAAAAACCAAAAAGAGAATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAACTTATATT:1 - chr2L 2622733 5' + roo 72 2 71.23 TGGAAATTCTTTGTGATAATAATTGAAATTTAATAGACTAGTAGTCAATTATGAAAGGAAGTGATTTAGGGGGACAAGGAAATAATGAAGATTTTTGTTTTATTGGCAGCTTCAAAGGACTTTAATAAAAAAACAAATGAACAAAT:1 - chr3L 3529842 5' + S2 1603 1 65.07 AGGACATCGTGCATCCTGCGTGTGGAATTGCCCAAATGCAAACTGAAGAGTCTCAAATTAAATCCAACAGGCTGTCCAAAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:2 + chr2L 9988080 5' + hobo 41 1 56.85 CATGCCTGCAGCTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTG:1 - chr3R 15035167 5' - Stalker2 7605 2 53.42 AAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAAC:1 + chr3L 17667614 5' - P-element 74 1 15.75 CTTATTAAGTATGTAAATTTCCGCAAATGATTAATTTGCATATTTATGAGACTAAAATGAGCAGGATAGGGTGTGTGTCTGACAACTAAAACAAAGCCCAGAGAACAGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2R 22795271 5' + hobo 14 1 76.03 ATTTTTGAAATAAGTGCTATTTACATGTAGTTTTACGTTTCTCATTTTAGCTATTTAAGCTATTGATTAAGCTATTTAATAAATTCATTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chrX 19591280 5' - roo 9043 1 64.38 CTTTCTCTATGGATTTCACCTTATAAGCCCCCTAAAACCTCCCGCTTATATACATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1 + chr2L 15523922 5' - opus 434 2 66.43 CTTGATTGCTTTTCCAGACCACTTCGGTTCATTGAACCAACCCCGTACCCCCTGCCCGCCAAGCTTTACCCCCTCACCGTTGGCTAATTGCTTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr3L 19702891 5' - pogo 2085 1 71.94 CAAATGAAAGCAATTTTTTCTCAGTGCGACAGAAGGAAGCATAAAATGCCAAAAGGAATTAAGGTTATGCCTCAGTCTGCTGTCTCTATACATACACATATATATGCCACATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:2 - chrX 7657565 5' + I-element 11 1 77.40 TTAAAACTAAGCTCTATAAATTGGCAAGAATCACAATTTCTAATAACATTGTTTTTAAATACCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2L 769968 5' - roo 9013 2 61.64 ATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTTTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCTTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGGGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3R 5767405 5' + roo 80 2 78.74 CTTTTTACTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAG:1 - chrX 22824270 5' - Gypsy12A_LTR 2250 1 60.96 TATGCAACATAATACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr2L 12861719 5' + jockey 80 1 65.75 GTCGGACACGTATTGAAGGTTAAGAAAATAAAGTACATAAAATGATTAAATAAAATATAATATATAAATTCAAACATGGGCTGCGTCTGTCTCTACGTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATACCGACGTTTATACGGACAGACAG:1 + chr3R 31959160 5' - INE-1 127 1 68.49 AAATAATGGGCTTAAACGCAAATATTCAATTCGTTAATAGATCGTTCTTAACAGATTATGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGA:1 + chr3L 21966582 5' - roo 344 2 62.33 TTTGGGGTTTCAAAGTGGACCGAACAAGTTGTTTTGCAATTTTCAAGGCTAATTTAACAAACGATTACCTTTTCTTACCTATTACTTTTACCACTTAACATTCGACTGGGAGGTGAGCAATCGTGTGGA:1 + chr3R 19466640 5' + jockey 16 1 72.87 GAAGAAGAAGCCTTTCTGCCTCTTGGCGTGGGCCTAAGTCAACAACAAAGAAGCGAAGCCTCAATGCCCTGGACGGCGCCTTTTGTTATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 - chr2L 21007127 5' + opus 7026 2 69.86 CGTTCATTGTGGCAACACTTTAGTTTTTAGTTTCTTTCTTGGAATTCAATCTGGAATGGCAAAAAAAAGGAAAATTCATTTTTGATTAAATGCTGGCTATGGCTTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr2R 16503533 5' + jockey 21 1 73.29 GGAGCCTAGTAACCTGAAAAATGCAGTGCACTTTCCAAACAAACATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGACATGA:1 - chr2R 13773107 5' - opus 451 2 63.20 TCTCGTAAAACAAAAACTTCTTGTAAAACCATGATCTATTTTAATCACAATCTTTCAATAATTGTATTGCAATCACAACGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTC:1 - chr3R 8293651 5' - Stalker2 368 2 57.86 CTTTACCCGGCCAACTTGAAATGAATCTAATAACTTGGCCCACACACACAGACACACATAGATTGGTAGCAAAAACAATGCCCTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3L 17142784 5' - hobo 2924 1 70.97 CACAGAGAGAAAATAGAGTATCTAATGGATAAGGAAACAATCGAAGGATTAACTGAAGAAATCAAACTGGATATGTCATCACATTGATAGGGAATAAATGGATCAACTCTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTT:1 - chr3R 18860926 5' - roo 397 1 47.26 AAACAACAACGGCGATAAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr3R 31663346 5' + jockey 60 1 51.37 TTTTGCTAAGCTTTTCTTTAGCCTTCGCTCTCCCTGTCTCTCACTTTGAGCAACAAAGATTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr3R 7109311 5' - P-element 2828 1 26.71 TAGTAATTGCTTGACGATTTTCTGAATGAAGGAGCAAACAATGAAACTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAAC:1 - chr2R 18807899 5' - BS 5020 1 69.86 GCATCGTATTCATCTTTTACAGCCCGCATCCTTGGCAACCTTTGTGCATTATCTTCCGACTCTCATCTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAATTCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 - chrX 10501369 5' + F-element 66 1 51.03 ACTGCATGGAGTTTTATTGTCTGCGTAAATGCTATATAGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGC:1 - chr2R 3091701 5' + F-element 283 1 53.42 CTAGAGCTCGCCACTCGAATATGGCGGCAACGGGCAAAAGTGCCATAATGCTGCGCCATACAATCATTAGCATACTGTAATAAGGAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTT:1 + chr3R 9862866 5' - Stalker2 7607 2 53.90 TGGCAACAGAAGCAGCATCAGCGAATAAAAACTTTTGGCTGTTTTTATAAATGTTTATTTAGCAGAAAGGAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCAC:1 + chr3L 10111751 5' + copia 52 2 58.90 AGTATCACACTTCTCGTACAATAACAGCAAAGTTTAAAAAGAAAATGCTATTTTTGTGAAATTTACAATGCATGAGCGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGATGAAAAGAGCTGTTCGCTGTA:1 - chr4 929606 5' - 1360 130 1 64.83 TGCCACTGGGACAATAAGGCGGTACAACATGAGTCAGACAGGCAAGCTAATCAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 + chr2R 9408132 5' + FB 29 1 65.52 GTACTACTGAATAAAGGTGTAGCTTACGACTACTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATAATAGATTCGTTAGAAACAATTTATCAGGCATAATGGATCATATATATGCATATATATATTCTTGGTCAGGATCAATAG:1 + chr2L 21779747 5' + INE-1 85 1 70.55 GTCAGAGGCATAAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr2R 21244862 5' + roo 8728 2 64.14 GGAGAAAAGTGTTGCATAAACAAGAGCGCCCACAAAGAACTTATGTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACT:1 - chr2R 18528777 5' - jockey 4911 1 71.92 TACTAATGATCGGATTATTTTTCGCTCAGTGTAACCCCAAGAAATGTTCTTACCGGCAAAGAATTTAGAACTCGCTCCTCCAAACGATCTCATAAACGCGGGGAATAAAAAGGCGAAAAAAAAGCAAAAAAAAAA:1 - chrX 13704054 5' + gypsy7 5006 1 74.81 TCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 - chr2R 12416932 5' + pogo 77 1 71.23 CGCTAGTAATGACTTTTCTTTTGCTTTTTCCGGTACCCAACATTGAAAGTTACTTCGCTTCAAAGCCTCAATTAATTGTTATTAGACCGGCCCCTAATTTAAGTTAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTA:1 + chr2R 10760358 5' - Tabor 469 2 73.97 GTATTTATTTATATTTTTTTTGGGACTAATTCTGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chrX 10838533 5' + roo 8751 2 81.51 AGCTTTTTGCAAAGCTTTCTTTACAGTTGTCTGCTTACAGTTATTTATTGTTCATAATTATCTAAAAATAATCAAGATTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTG:1 - chr3R 17401809 5' + Juan 45 1 52.05 AATAATAAACACTCGTAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 + chr3L 16523195 5' + jockey 76 1 64.38 CACCCACTCACCATGCTGAAAACCCTTGCCTCATGTGGCATATTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTT:1 + chrX 7657443 5' - I-element 5280 1 70.55 AACTACAATATAATATTACACGCCAAGTCAGAGGCATAAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2R 21244836 5' + roo 8703 2 57.53 TGTTTTAAGCCAAATATATTTATTGAATTCCCTGTGTGTAGGGTTTAATCAAATATAGAATAAATAGGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 18539890 5' - roo 9018 2 56.16 AATACCTTTTAGATAAGATATGTTGTATAAGAAAGGCATCATATACTTTGCATATTGGACAGAGTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr3R 26031802 5' + pogo 52 1 54.11 ACTGTGCTTTTGGCCGCTAAAGCTGTAAATATTGTTGCTGCCTGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGT:1 + chr3L 11296544 5' - P-element 2808 1 32.19 CAGCGACTGTTGCATACTTATGGGTTACCTTTGCTATTCATAACTTACACGGGCCATAAAATATTTATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGGGATC:1 + chr2R 22040898 5' + jockey 62 1 56.16 ACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAA:1 + chrX 21087572 5' + mdg3 48 2 54.11 AACGAGTAACGCCGAGTAAGAGCAATGGTGAACTATCCCAATGATAACATGGATCTGCATTAAGATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGA:2 + chr3R 7364193 5' + Quasimodo 49 2 54.79 GCTGGCAAGATTGAAATGGTCGAGGTATTTGCAAATGTTTCCATAAAAATTTATTTATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 - chr3R 26643392 5' - 412 7484 2 63.01 ACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGCGTGAAGTGAACGCCAAAT:1 + chrX 12344303 5' + F-element 71 1 57.86 AAAAGCGTTCTTTTGTAGATATTTTCATAAAAGTATAGATTCAAAATAATTTCTTTACAGTATAGTTGACAGTGGAACTGATCCGAAATTTCCGAATTTGGGACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chrX 22760269 5' - roo 9052 2 74.66 ACAAATAACTTACAGTTACAGAATGCTGCCATTATGTTTTCAATATCCGCAGTAATTCCTTGATTTATAGACCCAATATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr2R 18467280 5' - roo 402 1 78.08 GAAGTAACCATTAATGCATTCGCGAAAACCCGAACGAACTGTCGTCTGCCTGACTGTGTCAACAAACAAACCAGCTGTAAGTGCAGCGTGACTGAAGAAACGCAAATTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTCTTC:1 + chr3R 6384647 5' + Cr1a 269 1 73.29 AAAATAGTTCAATCTTGAACTTCTTATTAAGCGCCGAGCCTAATAGATAATTGCAGACGAAATTGCATTTCCAAAAGTAAACCTAAAAGGCATCATACTTTCAGTGAGGAGCTTCGATTTAAATAATTTAAAATGGATTTTAAA:1 + chr3R 3859914 5' + Transib5 263 1 62.50 CACAAATTAATTGAATTTTTGGTATTCATTGTGCGGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr2R 10666970 5' + hobo 26 1 67.81 GTCGTTTTTTGCCCTTTGTTGTTGTTGCTATTGCCCACATCATAGCTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTTCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGG:1 + chr3R 19500642 5' - jockey 4916 1 67.81 AGATTACTTTAAGAGATTACTCAACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTG:1 - chr2R 11691260 5' + P-element 99 1 17.81 AATTATCAGAAAGACGCAAAATTTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAA:1 + chr3R 15157574 5' + invader3 65 2 50.68 CAGTAAGTGGCCGATTGGACCCGAATCGAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 - chr3R 10741169 5' + 1360 3383 2 41.10 TATAAATAATATTAATATTAATGTACTTCACAACTTCACAACTAATCGAATATATATACTTCACTTCACATATACTGTCAAATATACTGTCCCTTCAAATAGATAGACAGATATATTAAATGGCTCCAAGTGTAAAGTTATTACCT:1 - chr3R 2744250 5' + Q-element 668 2 69.86 CGACTGCCAATTTGTACGTCCATATATATTGAACAACGCCCTTTGTTTAAGTGCCGATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAAT:1 + chr3R 29952684 5' + invader4 60 2 57.53 TCATAAAAGCTAGTAACTTTACTCTCCAAACCTATCCGTATTTTAGCTGCTTGGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTG:1 - chr3R 31264240 5' - jockey 4922 1 66.44 CAAAGCCATTAATAAAAACAACCTTTTCGATTGAGAGATTTTATTTAATATTCATAAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3R 13411894 5' - roo 9006 2 63.01 CTTAAGTTGAAATGGTTGAGATTTTAATAGAGCTCAAATTTGGCTGTTTTTCAATAGGAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCC:1 - chrX 21124965 5' + FB 65 1 60.96 TTAATTGACTCGAACTCGCACATTTTTCGCATCGAGCACAAAAACAAGTCACAAACTTTTCGCCTAGACGGTGCTTTTTTTCCACTTTTGCACATACATACATACGTATACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCC:1 + chrX 13484069 5' - hobo 2924 1 75.34 TTAAAATAAAAAATGTTCTTGTATCATTTCAACCTCAATTGGATTGTATCAATTTCTTAAGCCATTGTTCCACCATAATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGTCA:1 + chr3R 7305885 5' + 412 41 2 57.53 CTTTTTGGCCCTGTGCGAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 + chr2L 5656545 5' + hobo 64 1 58.90 TCTCTAGCACTAATTAACGCAGAGAATATTTAGATGCTTATACCCCACTGCTTCACACTTTGCCAACTTATGCAATATGGCAGGAAGTTGGCAACTTTATCAATTACATTATATCAATTCATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATA:2 + chr3R 29429436 5' + F-element 165 1 81.51 AATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGC:1 - 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mdg1 7435 2 67.12 TTTTTGTTTTTTGTTAAATGATATTATAATTACTAATGCTTTTATAGATTGAAAACTTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:2 + chr3R 26031688 5' - pogo 2041 1 60.27 AAATTTATAGCAAACAATATCTTTATGCTATGTCGGTCTCAGATTTCGTTAATAATGAAATCGATAGAATGCTAAAAGAATAAATTATAAGAAAAATCAATTTCAAAAAAATTTTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGA:1 + chr3R 1931908 5' + Stalker4 6891 2 63.01 ATCTTCCATAACTCCTTTAGTAACCTCTTCAACACGGTTTTTTCACATGATTGCGCATAGAGAGTTAAAGAGCCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAAACAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATA:1 + chr4 873690 5' - Cr1a 4169 1 53.42 CAAACAACCAAAACAACAACTCGACATCCGTTTTGCTGGCCCTTCAGTAATGACATTTTCAGCGGCACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATT:1 - chr3L 19431730 5' + Juan 54 1 53.90 ATCGAAACAATAAATACGATTTAAAAACAGCTTTCAAAGGGTCGAGGGTAAAGGGCAGAGCTGGGTGCGGATACAAATTGGGGGATTTACTTATTCCAAATAATGATCAGATATAAAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCACGACC:1 - chr3R 8878340 5' + jockey 352 1 80.14 GTTTGTACTTTCTGTTTTTCCGCATCTTGGGTGTGTGCTTGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATG:1 - 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chr3R 8965288 5' + HMS-Beagle 6807 2 78.08 AGGGGTTGATTCATATGTAGTTTTAGGTTACTTAGTCGCTTTTACTACTATGCAGTATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCA:1 + chr2L 14678739 5' + Quasimodo 56 2 62.07 AAATTATGCTTCCGAATGCCAATGAGAATGGCAGAAAGCGAATGGAGTTGGTTGGCGGGTAGATGGTGGCTGGTCGCCATAATTGAACAACGTGGCGTATGAGTAACGATTCATTATATTATAAGTCTTGTAAATTTCTATCGATT:1 - chr2R 20720892 5' + INE-1 301 1 74.66 TCGATATTGGCCAAAGAAACCATCATATAAACTTATATCATTCAGAATAAATTGTATCATCAAAAAGTCAAGAAAGATCTTAGAAAATCTATAACGCTGTATCAAGTCGCTTATTCAAGTGTGTTAGAATATAAAATAAAATAATA:1 - chr3L 10295218 5' - transib1 1901 1 74.66 TTATAAGTTTAAATTCAAAAAACATTTAAGCTGCCAGCGGCTGTACCACCGAGAGCGTGCTGTGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2L 19680979 5' + hobo 28 1 59.17 GCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGNCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAA:1 + chr3L 25232769 5' - accord2 7570 2 63.57 AGAAGCACACAATGGATACAGACAGATACATAGCCGTATAACTACGAGTCAAAAGATACATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 + chr2L 2336206 5' - 297 352 2 55.71 CTAATTAATATTCAATAGCATAATGCTAATATCGTAAGAATATCATAGATTTAAGGCAGAGCATTTCAGACAGCACTTGTACCGTTCTAGACTTAAGAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr3R 18514474 5' - pogo 2084 1 73.97 AAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCCGCGCTCTCTGCAGAG:1 + chr3L 3540150 5' - mdg3 153 2 76.03 ACAACTCATTATGTTCGTGCCAAAGTTTATTATGCAATACGCAGTTTATGTCCCATGCGGAATCAATTTCATCTCGGTATACGGTTGATTATTACTACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTG:1 - chr3R 22275392 5' + flea 4777 2 71.72 CATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGC:2 + chr2L 22031988 5' + Tabor 90 2 82.19 AGGTGCCCTGCTTCGATTTCAATCTGATTGTATTATTGGAAATACCTACGAAAGTTATAATTATTAACGTTATTACATGACAGATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 + chr2L 8852743 5' - Burdock 220 2 56.16 GTTCTTTTGTAGATATTTTCATAAAAGTATAGATTCAAAATAATTTCTTTACAGTATAGTTGACAGTGGAACTGATCCGAAATTTCCGAATTTGGGACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chrX 22760275 5' - roo 9046 1 70.55 GAGACAGAGTCCTCATATAGGGTGTTCTGGCCGAAAAAAAGAATTTATATATGTGTGTGTGTGTGTTACAGTTATAACAATAAATCAACAACTGCTGGCAGCCACTGTAACTGCAGTCGACTCTCAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3L 15724618 5' + jockey 18 1 75.34 AAAAGCAAAAACTGAAGACCCAAAAAAACTTTTTTACCTTAAGCTCTTAAGTACTTGGAAAAGTTAGACAAATCCTCATTTTACCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - chr3R 19989385 5' - hobo 2924 1 76.03 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATAT:1 - chrX 12649914 5' - blood 154 2 76.56 TTTTAGTCAGATGAATTGCCAACCTTGAACCACCAACTTTTCAGGCTAAAAAACAGAAACCTCCCCCTTTCAGGATTCAACGCGCCATATACGCCTTATCTGTTGACACTTTATCGGGGATTTTATTTTTTTGTTGTTATTTTTTT:1 + chr2R 21261187 5' - gypsy11 3934 1 81.51 TAAAGTGAACAAAGAATACCATGGGAATATTCCTTGAGTTTGAATTTGCAGTTCCACCTCATAAACAATAAAAAAAAACTCATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTG:1 + chrX 4818485 5' + Bari1 40 1 59.59 ATGCGTTGGCAGACTCGAAAAAAAAGACCCAAACTCACCAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGA:1 - chr3R 20099004 5' + mdg3 165 2 73.29 GCAAACTGGCCAAATTAGCCACTCAGTGGCTCAGTTATGAGCGTTGGCTACGAAGAATCGTTTCAGTTAGAGGATATAGCCACAACGCCAAAAGCCTAAGGATGACAAGATGCCAGCAAAAAACCACAAAAAAATAAAAAAAAAAA:2 + chrX 4294553 5' + G2 3077 7 57.53 CAAACGGCCTTTGGAGTCACATTGCTATACTGTCTGATAGTTAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGCAAAGCTATGATAACATCTAAGCTAGTAAATGAAGTGGTGTGTTGGTCACCACAGAGTACGGGGCTTACTGAAGT:1 - chrX 21976899 5' + baggins 4972 1 71.22 TAATACTTATCAAGAAAAGAAATATAGAAAAAACAGCAAAGTAAGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 - chrX 8610369 5' + mdg3 5261 1 78.77 ATGTCATATTATGACGCTGATTAATAAAACTTTTCCGTGCACTTCACTCATAATTTTGTGCGACGTCGCATTCCATAAGCGGAAATGTAATTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTG:1 - chr2R 12838663 5' + Dm88 168 2 57.53 TTTGGACATTGGAACATTTATAAAACTCTTAATTGGTAAAATTGAGATTAAAAGAAGGAAAATATTAAATGAACTTAAATAATATGGGATATTTAAATTAACATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:2 + chrX 16538050 5' - mdg3 228 2 73.97 GACGTCTACATCACGCCAACCTCGTTTGAATTGTCCTAACTCCAAAAGTTCCGACCACCGGCCCCAACTGAAAAAAAAAGTATTTACCAAAAAAGTATTTACCAATGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2L 232313 5' + Doc 8 1 64.71 TGAAACAAATACAATGTACAATGAATACAAAGCCCGTGGAGTGACGGCAATCGGCAAATCAAATTTCAAATTTCGAATCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 - chr3R 18940627 5' - mdg1 376 2 54.11 CAATGAGTAAGAGTAACTGGAATTTAGAAAATTATCTTGTTTAGAAAGTAGTTACATGATACATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAA:2 + chr3R 26693341 5' + Stalker2 7307 2 58.22 GCCACTCGAATATGGCGGCAACGTGCAAAAGAGCCATAATGCTGCGCCATACAATCATTAGCATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGC:1 + chr3R 9862875 5' - Stalker2 371 2 55.83 TCAGTGTGCTAAATAATAAGTCATTGCCGAATGAAAACATTGTAAGTACACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 1324343 5' + 412 7125 2 67.81 GAAGTAGGCAACATTTTTTGTGTTTGCTCTTTGTGGTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 - chr3R 8625256 5' + jockey 91 1 76.03 CTGCTAATATACCAGGTGTTCCGATATCCCAAGGGTCACCTGAAGATACGTTTCCGAAAGCTGGATCAACTGAATTTGCTGGACCAACAGCCGACGCATATTGAGTTAGATGCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGT:1 - chr2R 14500501 5' + 1360 3223 1 69.86 ATATGACTGTGAAATATTTTCAATTTGTGGACACGAAAAAAGTTTTGTTCGCCAAGACGGGCTACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACA:1 - chr2L 2675064 5' + Quasimodo 52 2 56.85 AGAATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTGCACACTTTTGATCATTTTTAAAATTTTGTCTTATTTTATTCCCCAATATGTATCGACAAATTATGGAATTTCACGTTTGCATTCAGACAAGCTGAGTAACGGGT:1 + chr3R 20500826 5' + INE-1 538 1 71.23 CTAAATTATGAAAATCTGCTTACTTTAACATTTTCGTCTACTTATACTAGTAATTGCTTGACGATTTTCTGAATGAAGGAGCAAACAATGAAACTTTTTTTTTTTATTTTTATTTATTTAGAAGCGATTAATCAATACAAT:1 - chr2R 18807946 5' - BS 5072 1 68.79 AATCACGAATACTATATTTTTAAACAACAATATTTCCATTTGATTTTGAACTACTTTATCCCGTATTATTTTTATTAAATATTTTGTAATTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3L 14370536 5' - 412 7514 2 56.85 GGATTCCCTTTAACAGAAACTCTTTCCCTAGTTTCTAAAATTTTTGAACCTCTTGATAAGTAATCAGTTGAAATTCAAAATCCTCATCACTTTTCACGCATTTTGTTGTTGTTATTATTACTTGTGTTGTTATTGTTATTATTATT:1 + chr2R 11193499 5' - mdg1 25 2 78.08 TAGACACAAAATGCGAGTAAATGGGGAGATATAAGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGGCT:1 - chr2L 15523994 5' + opus 7191 4 75.74 TTCAAAGGATCTGAGTATGTTAGCTTGAGCTAGAATAGCGATTTGTGATCTGGATTTTCTAATTCACTTTAAATTTGTATTATTTATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 - chr3R 12569709 5' - blood 7356 2 59.59 ACTTGATTGTGTTATAATCATTAAAACCGGAAATGCATGGCCAACCCACAAAACACAAACGAGCGCAAACGCTTGGCCACACACACACGCGCACACATACGAATATGCGTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr2L 5656690 5' - hobo 2928 1 78.08 TGTGGCGACTGCTATTTTTTCACAACTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr2R 14450139 5' - roo 9015 2 56.16 GTAAAAGATATAAAAAATATATTGATAATATTGAAAATTTCAACAATAAAATCAAAAAAATATTCGAATTAATAGTTAAATGTGTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAATACTGTGTGTGGTCAG:1 - chrX 16849217 5' - R2-element 3525 1 57.53 AAGAGTGTGAAGCCCAAGACGGCAACGGCCTCGTCCGCCAACAAAGGCACTGCCGAGGACGACGCCTGGAATCTGCTGATGAACTAGAAACCGTGGCGAGCAGCTTATTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAAT:1 - chr3L 12415401 5' - HMS-Beagle2 5 2 73.97 AGCGAAAATTTGGATCGAGTGACGATAGCGTTATAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr2L 8009129 5' - roo 8987 2 76.03 CTCCCCCCACACTCCCCCAAAAAGAAATGCATACACACACTATCGCCGTGAGCACACACTAATCGCAGATATAGCGATCAATCGAGTGAGAAAAGTAACGAGAGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 17933784 5' - roo 391 2 73.29 AAAGAAATACCCGAAAAGAAAGTTCGCAAGAAAGTGAGAAACGAAACCCGGATCAAAGAATAAATTTAGAAAGCCATCAAAACGCTGCTGTTGATCCAAAACAAACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3L 12776110 5' + roo 16 2 74.66 TGGTTCCGCTAGTAAGCCCAGTTTCAAAGTTTTACACGTTTTTGCCACCACAAAATCGAATACCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCA:1 - chrX 18511644 5' - R1A1-element 5004 1 57.53 AAACGCAAAATGCCGGCGCATGTTTGCTCGCCCAAAAAATGAGGTAAACAAACAGCAAAAAAATAAAATAAAAATAAAATACATTCTCCCGTATACACATATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAG:1 - chr3R 6472792 5' + opus 12 2 77.08 ATTTATTGACAGCTTTGTTGTTTGTTCGGTTTTTGCGTATTTAAAAAGAGATTTATTACAACGAGTTATAGACCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACC:1 + chr2L 10822506 5' - R1A1-element 5014 1 50.68 TTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chrX 12995405 5' + blood 64 2 60.96 CTCACAAAGAGCTTCGTTGTTGGGCTTTTTCTGGTCTCGGTCTCTCGACATTACAACAACTTCGACTTGAGCCCCTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 + chr3L 17895898 5' + P-element 37 1 57.04 TAATTAAATACATTTGTTTGCCAAGTCAAACAGTCGGAGTGGGAGGGAGAGTGAGTGTGGATGGGGGAAATCGGGGGCTATAAATTGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGCAATTTCGACAAG:1 + chr2R 22824983 5' + invader2 4804 1 68.18 ATTGTTGCTAATGAAAGAATTAGCTTGTTTTGTACTTTAATGAATGTCTAACCCTTCGAAAATCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3R 13411794 5' + roo 57 2 58.90 TATTGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTATATATTCTAAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAAC:1 - chr3R 846268 5' - copia 174 2 76.71 CGAAAGTATGCAGCCAAATATTTATAGCACGCCAATTGACTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACT:1 + chr2L 19841513 5' - BS 5012 1 77.40 AATCTAGTAGGGAGAGCTCCGAGCAGTTAATGAGCTTGAGGCGAAAACATAGAAGCACACATTTTCCTGTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:2 - chr3L 5425560 5' + blood 53 2 56.16 ATGCAGCCATTTGCTCATTTTAGATTACTAATCATCTATTAATCCCACCCTAAAAATCGGATTATATAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGC:1 - chrX 17270386 5' + 3S18 55 2 55.48 GAGCAGATGGTAATATGTAGCTAGGCGATAGCTTAAATTAGCATTGAGTAAGGGGTTTGAAGATTTATTTCATCACTTATGATAAGATATTTATTAAAGATGCTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAA:1 - chr3R 11163157 5' + mdg1 7058 2 71.92 CCATTATGTTTTCAATATCCGCAGTAATTCCTTGATTTATAGACCCAATATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr2R 18467252 5' - roo 9037 1 58.90 TATGTGATGCAATGCATAAAATAGTTTTCATATATAAAGCAGTGTGTCAACACACAGTGTGTGCTAAGGATTCAAACCTTAATTTGTTTAAATAAGCACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTA:2 + chr3L 15374584 5' + 3S18 5790 2 68.49 GATATGCCAATAATTGTATGCAAATAATTATACGTTCAACAAATACCTTCTCCGCGAAAATCGCTTCAAATCAAAGGCCGCTAAACACATTCCACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chrX 9949458 5' - hobo 2917 1 69.06 TGTGTGTGGCGTGAAAACGCGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGC:1 - chrX 7930738 5' - P-element 2787 1 17.12 TGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAA:1 + chr3R 19589935 5' + BS 5078 1 72.60 TTCTTGTATCATTTCAACCTCAATTGGATTGTATCAATTTCTTAAGCCATTGTTCCACCATAATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr3R 7305900 5' + 412 7109 2 57.53 CAGCACTTTTACATTGCAATCAAGCACCGATTTCTCTTGTATTTTTTTTGTTTTTTGTTAAATGATATTATAATTACTAATGCTTTTATAGATTGAAAACTTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3R 26031644 5' - pogo 2085 1 75.34 AAAAATAGATTTTGATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTC:1 + chr3L 19951143 5' + Ivk 20 1 71.92 ACGCCACTCAGATTAGAGTACCTGCCAATTGATGGCGCCACTCGCCGCACACACATTTCCAATTTAACTTTTCCATTTATTTACCCATTCGATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAG:1 - 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chr2L 18671753 5' - mdg1 7428 2 63.70 TATACACTCTGCACTGGGAAAAATTTCTTATTGTTCACCACAAACTCTATTTAACTTCAAGCAACACTAAATTATAGATCATGACGCACATGATTAGTGAGCGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTA:1 + chr2R 22616841 5' + BS 5040 1 59.31 AGGAAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCCATTTCTTCTTTTGATTTTTGAGTAGGCAG:1 - chr3R 13572092 5' - 412 7461 2 71.92 AATTTTGTTTAATGCCCGGCAATGATTAACCAATAACGATAATAGCGGAGATTTGGTCCAAATTGACATTAGAATTTGCACAAACTTTGGTAAGGTCAATACCAAAAAGACTTCAAGCAGTTATTGATGCCAAAGGTGGTGTTACA:1 + chr3L 15193091 5' + Bari1 1368 1 73.29 TTGGCATTCAAGGCAGAATGGATAAAATATTTCTGCATTTAAATATACATATATATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTAT:1 - chrX 21405370 5' + flea 4822 1 68.49 AGGAAGATTACACGCATTTTGATTTTGTAGATGATTGACTTAGCAAATTCAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTG:1 + chrX 21402701 5' - flea 141 1 67.81 GCGGAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCAGGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGTAAGCCGAAG:1 - chrX 19744502 5' + P-element 20 1 59.00 GGAAGGGCAGAGAGTCACATTCGGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chrX 22715187 5' - opus 7488 2 76.71 GAATAACAAAAGTTTGAACGACATAATGTGGGTTGGGCCACGAGTTCAAAAAGATATTTTTGACATTATTATTAAATGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAACTTATGT:1 + chr3R 19445283 5' + roo 44 2 55.48 ACTCGCTAACGGCAATTGAACAAAAGCCAGCACGCTTTGTGGTCAGCTCGTTTCTTTCACCTGTTTTGCCGGGAAGTAGGCAACATTTTTTGTGTTTGCTCTTTGTGGTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:2 - chr3R 8625328 5' + jockey 18 1 78.08 AAAAATGTTCCAACTCCCCTGTTGCTCCTGCTGCTATTTCATTCACCCTCTTTAGGCTCCCCATATATATACATATATATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chr3L 2625153 5' - opus 7461 2 54.79 ACTCTTGTGATGAAATTTCGAAACTTTGGTAAAACACTTTTTGGCCCTGTGCGAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCCAC:1 + chr2L 5656509 5' + hobo 28 1 66.44 TACGGCGTTTACGGTGCCAGGAAAGGGATTGTTCCAATGGAAAGTGATGCCATTCGGACTACACTCAGCGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTC:1 + chr3L 25232696 5' - accord2 206 1 81.29 AGTAAGCTGCTGGCCAGCGAGAGCAACGAAAATGTTCGCTGCCTGTGCCAGACCCTCATATTGTTGATCAGGATCACTAGTCGAGTCG:1 - chr2R 17017403 5' + INE-1 93 1 65.91 ATGGAAAACATTTTCATTATTTGCCAACCTGGCCAAGCTGGCCATAAACAAGCGGCGCCCAGGTGGGCGTATATGTTTGGCAATTTATGGCTGAAAACATAAATTCGTTGGTACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGA:1 + chr2R 18927715 5' + 3S18 10 2 77.40 GACCCAAATGCATGTTTTTATGCCAAAATAATACGCTCTCATATCCTACCAGCTCAAGTGTCCTTCTCCAACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 - chr3R 25929452 5' - 297 6930 2 55.48 TTTACACTCTTCAAGCTTGTAAAAACAATAATAATATTCGAATTCAGATTCGGTCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTGGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 - chr3R 17794648 5' - P-element 2823 1 25.52 GCATTCCCAGTGCCGTTTCGTCTCCGATGGTTAATGAGTTATGTCAAAGGAAAACAATGTTTGTTACTTCATTTATATGCCATTATTATTTGTATAATATTCGTATATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 + chr2R 10915598 5' + F-element 29 1 62.33 CGATGCGCACTTCATTAGCTTCTTTAGGCCATCAATCAAGCTGCATTTGCATCTCGCGTCTTATGTCATCTGACCTGGTTGGGATCATTAGCCGACCCGGGGCCGCCAAATGAGATGCTGGCAGTGCCCCACAGCTGAATCCCA:1 + chrX 1185932 5' - G-element 3919 1 76.39 TTGCAGATACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 + chr2L 19907549 5' + hobo 61 1 59.59 AAAAGAAAGAATTAAGTTTCAGCTTAAAAGTTATCGTTTATTTAATAAAATTTACAAGGACTATTGTGCTGGGCGTTGCTGATGACGACACACGGGCCGTGCTGCACCTTCACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGA:1 + chr3L 18592284 5' - flea 4854 1 77.40 TCTTGGGAAGAAAGAGTTTATTCAAGCAGCATAAACCCGAAACACACTCGGAAACACACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 + chr2R 22372485 5' + I-element 42 1 56.10 ACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 13572052 5' + 412 7095 2 78.65 GTGCGAAATGGTTCTGGGAATACGATCCAGAGGGCCCATGTAAATATGTATGTAAACACAACCTAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTT:1 + chr2L 19135596 5' + Burdock 53 2 57.53 AGAATGGATAAAATATTTCTGCATTTAAATATACATATATATAAATGTAACATGGAGTAGGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCAT:1 - chrX 21405356 5' + flea 4836 1 76.71 ATAAGAAATTTTAGTCGTGTTTAGATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTACACACACACACACATACATTACCACAAAGCAACAGACATAAACCAAATCATAGAATGCCTTAGGTTATAA:1 + chr2L 23016846 5' + Quasimodo 88 2 72.60 CGGTTGCTGGGGCTTCCGCTTTGTTAGCAATCAACTTCCTGTTGCGCAAACATGTGTGCAGCCACAAAAATAATTAATTGGCTCGAATTCAATACTGGGAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGT:1 - chr3R 11873482 5' - 412 7532 2 74.29 AAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATACAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTACAT:1 + chr3R 178121 5' + BS 86 1 76.71 ATCAAATCTATAACCACTATGACCACTACTTTCACTATCTTAAAAGAGCCCTAAATTACACTGATAATCATGCATTTGATTACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAA:1 - chr3R 7177690 5' + I-element 273 1 58.90 AACATTTATAAAACTCTTAATTGGTAAAATTGAGATTAAAAGAAGGAAAATATTAAATGAACTTAAATAATATGGGATATTTAAATTAACATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1 + chrX 16538062 5' - mdg3 5468 2 65.75 ACTCAGTGTAAGTGCGAATATGCGAGAGAGTGTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAATGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACGTACTAA:1 + chr3R 23346580 5' - Rt1a 4974 1 78.08 ATTAGCAAAGCGCACCGCCTTAAGTTGAAATGGTTGAGATTTTAATAGAGCTCAAATTTGGCTGTTTTTCAATAGGAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCGCATT:1 - chrX 21124983 5' + FB 47 1 54.79 AACATTATTTCTCCATTGTTGGCTGATTATAATAAATATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTT:1 - chr3L 13365111 5' + Juan 68 1 60.96 AGGCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr2R 14767347 5' + Tirant 8145 2 57.78 TTTGGCAAAAAGTCAAAGGTAATCCAGCCTCGTCCTCTGTGTTCATAACCCATTTATCTGAACACCCACAAGTGAGCATATGGGGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCG:1 + chr3L 21977364 5' - R1A1-element 5192 1 56.85 ACCAAATTTGAAACTCATATTTGTTTCACTTTGTTATGAGAATCGGGGGTTCTTCGATTTCAGCACATTTAGCTATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATC:1 + chr3L 13475486 5' - HMS-Beagle 202 2 55.48 AGACAACGGAATTGTACTGTTCCAGAACCTGTTCATAACCGCCATCATACTTATCGACGCACAGATTGTACTCATCCACATACTCCGCATACTCGGTTTTGAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 + chr2R 18056750 5' - blood 7372 2 73.10 AACCAGGGTGTAGAATTATGGTTATGACTGACAAGTAGATAGCATAAATAATTATACCCTTTGCTCGTAGAGTAGAGTAGAGTATGTAACAGGCATTCACACTAGCTGAGTAGCGGGTATCTGATAGGCGGGAAACTCGA:1 + chr2L 5120219 5' + INE-1 560 1 52.86 ATTGCGTTTTTTACATGTTTAATAACTGCAGAATGTTTCAGCTCATTTTATTATCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGA:1 + chr3R 24301783 5' + Tabor 31 2 64.38 GACACTGTGCACATCCGGTTTGGGCAATGATAAGCATTTCACGGAATTTATCGCTGGGCATGGGCACGCAAGGAGCAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3L 10069012 5' - 412 7505 2 56.85 GAAAATACCATTGCTAATTTGAAAAGAAGTGGGAAATCTATGGTTTAACTGCACCACATTTCGATCTAAATTAAATTTGTTGAGTTATGGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chrX 19591117 5' + roo 31 2 63.01 CAAGTACTGCGCACTTGATAAAGGCTAAACAAAGATTGTCGCTTCCCGCTTTATATAAACAGAATTATTCTACAAAGGAGGAGCCCTCACTTGAGCTGTACTTTGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 + chr3L 1728406 5' + blood 17 2 73.97 AATTTGTAGTTCGTCTTTGCCAGCAGTTTGAAGTCTATTAATAACGAAATTTGGAAAGGCCAGAAAAGTACTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 11072426 5' - roo 357 2 54.79 TAGCTGCAATTTGCTAGTGCATCGCACCCGGAGCAACTGCAACCGTAGGCGGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACAT:1 + chr2R 21105716 5' + Stalker2 7320 2 65.07 GGCTGTTGCGTTCAAATAGTTGTGTTCGATCGAAAATGCTTTTGTGGCAAGTAGTGCTAGAAATCGAGTCGAATCGGAATCGGTAGTCAAAAAATCCATATTTTACGTTATTAACTATTTACTTCACTAAAATCAAGTGATTTTAT:1 - chr2R 23203893 5' - Doc3-element 42 1 67.12 TGTATTTATATTTGTGGCAGGTAATCAAGGGGTTTAAGGATAACTTGTGATCATAAGCATATGCAATAGTTTAGTTTTGTCCACTTATAGAAACATAAATTCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2R 11610025 5' + roo 8683 2 69.18 CTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr2R 14450177 5' - roo 347 2 76.79 TTCAACAGAAATTTAATAAACTTTTAAAGGCTTGATCTTGGGGGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr2R 21244962 5' - roo 351 2 61.38 TATAATTATAATAATAATAATTCACATAAACCAATATTTAGCCCAACATAAATGAAGTGCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGC:1 - chr3L 7522089 5' + Transpac 4978 2 60.96 TAATGCTCTTACAGCACTCGAATAACCTAGCAGAAGTTCGCATTAAATCTACCCCGGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr3L 6541990 5' + hobo 65 1 61.64 ACAAACTAAAGTGAACTTAATTAACAAAGTTTTCAAATCCGTATATCAATTAAGAGTGTATATCTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTAT:1 - chr3R 26693448 5' - Stalker2 7594 2 58.90 TTATAATAAACAATTTTTACGACGGGATTTTTTCGTAAATATGGCGAGCAATTAGATATGGCCATAAATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr2L 20910280 5' + roo 53 2 57.53 CATACTATCCAATTTGTTAAATTCACGCGAGTATAAAAAATGAAAAATAAATTCGATTTGAGTTCCATTGTCTAGACTTTCGTTTTTGGCTTTCCTCATTGCCAATTCGTTATTATATGTATATAAAAAACCTTAAAATTAAAAAA:1 - chr3R 17665221 5' + 1360 3021 1 76.71 GGCCGAAATCAAATGCCAACGAAAAGGGTATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGCCGACGAAATCTAC:1 + chr2R 23420723 5' + G2 2807 1 77.04 GCAGATAAAAGCAGGGAATAACTCAATTTTAATGTCATATCCCCTTTCAGTAAAAATTGAGGTCAACGGACCAAAATAATAAAAGAAAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 + chr3R 7645073 5' + I-element 35 1 62.33 AAGAATTTCCATCACATATTTCATAAAGAATCATATGTATGTATACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr2L 20253858 5' + roo 8739 2 72.60 AACAACGGCGATAAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - chr3R 31663342 5' + jockey 64 1 54.11 ATTGGGTTCTCACATTTCTGTTACATCCTCAGGTAAGTGAATCTCTAGTTCGAACAAATGAAGAATAATAACTTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACCGATTTTATTT:1 - chr3R 10800614 5' - roo 9032 1 54.35 TGTTTATTGAGAGGTCCAATAAGAAAATCAATATCGGCCCAAAAGTATACAACCTTTTCTTACAATTTCGTTATATCGCAAATATCGCAAAGGTCATAAATGACCTTGATGAAATATTACAATCCCACGGAGCGCTGGGGACCAA:1 + chr3L 11036174 5' + Rt1a 392 1 66.90 GAAAATGCTACAGGTGTGAAAACCATAAAATTCTCATTATTTATAATAAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAT:1 + chr3L 12729087 5' - opus 7444 2 66.42 GGTGGAAACTGTAAAAATGCGGTTTTATGCGGCGACATAATCTACGCAATATATGATTTTAAACTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTCTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATCTTATTATATAACTTATATTAATT:1 + chr3L 20148962 5' - Doc2-element 4694 1 61.64 CACACACACACACACACACATTTGTATTTAATCAGATGCGCATACATATTGGGAGCGGGGACACAGCATTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCA:1 - chr3R 8376615 5' + Rt1b 4810 1 64.44 ATTAGCTGGCAACCCTTTCCCCAAAAACGTCAACAGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2R 8467748 5' - 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chrX 8610296 5' + mdg3 5334 2 71.23 GCCCACCGTCGTCGTTTTAGACCCCTTTGCATTCCCCGGAATATATGTACATATAGTATGTAGACCCCGCTCCTTCTCCTGCATATACATATGTATGTGTATATCAATTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCAACAGAC:1 - chrX 21279828 5' - transib2 2788 1 71.23 TTTTTTTTGTGTTTCTTGCTCGCAGAGCCGAGTAAAACGTCGCTTTTGTTTTTGGCCAGGCTTGTTGTTTACGCTTTGCCGCATATGTCGCTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 - chr3R 18935212 5' + jockey 4707 1 61.64 ACCATGGTTGTGGACAATCTGGCAGAGATTGCCGTAAGTGTCAGCGACGACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATGGCGACCGTGACTTGGTCTCGAGTCTGCCTCTGTGTTGTGCCTCTGTGTATTGTGATTATGTATCG:1 - chr3R 8290351 5' + Stalker2 470 1 66.44 GGTTGCTGGGGCTTCCGCTTTGTTAGCAATCAACTTCCTGTTGCGCAAACATGTGTGCAGCCACAAAAATAATTAATTGGCTCGAATTCAATACTGGGAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr3R 11873481 5' - 412 472 2 70.55 GATGGGAATCGCTTGATAACATCCTGCTTCCTGCCGCAAGACATCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACTATTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCGCTCTGTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAA:1 - chr2L 22350070 5' - 1360 3288 1 65.07 GCATGGAGACGTAAAACAATTTATATGAGTTAGCAAGCTAGTTAATCTAGCAGATTCTTGCGCTTCCACACAAAATAAAGTTCGAACTCATGTGCTTTTTATACAACACAAGAGAGCATGCTATAGTCGAGTTGCCCGACTATCAG:1 + chrX 22510788 5' - INE-1 562 1 87.67 TTTACAGCCCGCATCCTTGGCAACCTTTGTGCATTATCTTCCGACTCTCATCTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 - chrX 10501354 5' + F-element 72 1 60.29 CAAAATACAAAAATCCCTTCGCTGGAAACTCGGCACACATTAAACAACAACGGCGATAAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 31663387 5' + jockey 18 1 77.40 TGGTTTGTGTACGAAGTGTGATTATTTTTCGGGGTATGGATTGCCCCAAGTTATTATCAGTGAAATAATAGTGAAACTTAAAATTTTTCATTCATAAAGTACAGAGTTAATATACTCGAAGTGGGGCTCCGCTGCCCAGCTGCC:1 + chr3L 19183146 5' + X-element 204 1 70.14 ACAAGATATAAATATCCCCACTATTTAAAGTCGCTTTGGCTCAACGAAGCTATAATTTTGTTATTGGATGTGCAGATTCACGGAATTTAATAAGTATCCGTATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATA:1 + chr2L 3317706 5' + X-element 10 1 74.22 TACTTGGAAAACAGAATTTCGTGTGTCTTGGCAGCTGGCCGAAGAACACTCTTCAAAAATATGGTTTGTTATTTGGCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3L 21108474 5' - roo 9026 1 52.74 AAAATATAGAAAAGAGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr3R 13572004 5' + 412 51 2 54.11 GGGGAAAATGAGACCGAAGACAAAAGAAGAGCCCCCAGAAGTGTGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTC:1 + chr2L 1444050 5' + BS 5063 1 70.55 ATTGATGTGCACATTTTGAAAAGCTGACACTGCCATAAATTAAAAATGCGGTCGTCGGAATGATGCTACGCATAAATGAAATAAATTCAAAAGCATAACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:2 + chr3R 13231727 5' + F-element 63 1 48.63 ATTGAGCAGTTGCGTTTGCCATTGTTTGAGTTTGAGTGTTGTGTGAATGGCCGCGAAATGTTATTTTTCTTTTCAATTTATAACATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTGCTAATTTGTAAACAAGTAATTTTTGTTA:1 + chr3R 26332238 5' + Tc1-2 1463 1 56.85 GATGAGAAATTCAGGAAAGTATGACGGCAAAATCGGGGCTTTTCCGGGGGCTTGTCCCTATATATGTATATATATATGTATATATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chr3L 2625029 5' + opus 146 4 52.05 GAAAACAAATGCGAAACCAAACGAGCTTGGCAACGATGTCTCCGGCATAAAAAGTTTAAAATTAAATTCAAACTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3R 19625866 5' + opus 7156 4 58.22 TCTCTCAGGTGATCTCCATAAAATCTGGGACATCTGACATGGGCAAACAAACAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGC:1 - chr2L 5333474 5' - mdg3 5431 2 62.33 ATAATTTAAGAAGTAAAACTAATTATGTGTCATTAAACATTCTAAATACAAGGTTAAAGTCCAGCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chrX 127070 5' + hobo 56 1 54.79 TCGCATGTTGACATTGTCGCAACAGTTTATATATGTACAAACATACGGGGCGTGCACCAAAGGGAGATATTCCAGGAGGCACTCGAGGCAAACCTAACCATTCATATCAATCTCGGCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 - chr2L 15601692 5' + Doc 9 1 78.77 TTTATAGTTTTGAATCAATCGAAATGGGCGAAAATACATAAATATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGG:1 - chr3R 15453756 5' - Transpac 238 2 70.55 GGTTAATCAAGGGAGATCTAATCAGTTGGCTGATATTGACCAATCAAACGAATAAATGAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr2L 11559707 5' + roo 59 2 62.33 TAGTAAGACAGGGAACTGGAACACACACATCTAGATCGATAACAAAATCGATATCGTTATCGAGATCGAGATCGGGATGTTGCAAGTCGAACTACACGATGTTTTGGTGGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1 + chrX 11236336 5' + copia 4883 2 73.97 AAAATGAAGTACTTACATATATTGTAGTTTCATTTTTCGAATGTAATTATTTTCGTTTTAAGATGTACGATCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 + chr2L 615214 5' + F-element 61 1 50.00 TGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:2 + chr3R 18514338 5' + pogo 73 1 69.86 TATGGAGTAACCTCACGTAACTCGGTTACTTGAGTGGCTATGAAGCTGGGACTCGACTTAGGCTTAAGTTCCTGCTTGGTCGATCAAGAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - 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Porto1 4204 1 73.97 AGAAGGGTCAGCTTTTACGTATCCACATCATTGTCCTGACGCCAGGCCGTGAAGTGGAGCGCCTGAACGCTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCC:2 + chr3R 509494 5' - R2-element 3199 1 58.22 CCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTA:1 - chr3L 22635751 5' - hopper 1330 2 72.60 GGTGGAAATCGATACGCATTTACGGACGTATACTCGGAATATCTACATCTAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCAGATAAGCTAACAACTAACAATGCATTGCTTCGTAGCAACT:1 + chr3L 21765373 5' + gypsy 7002 2 70.42 TGGGTCAGGCGGGTTGTGGTGGGGGTTGCCGCTGTGGAGAGTGCAAAGTGCATGAAACTGAAACGAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGTCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATG:1 - chr3L 1983587 5' + Transpac 4942 2 69.86 ATTAAAGCCGAACCAGCGGACAATGGAAACTCACCTGCAGCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr3R 15363510 5' + 412 48 2 51.37 GCTTTTCTAATTTCAGTTCCATTCTTTCAGTTATCCTTTCGCCTGCGCCATTGGCAACTTTCGTTTTTTCCTTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3R 7655550 5' + 412 7103 2 51.37 TACAACAAATTTCGTTGCTGGGCTACTAGGAAAACAGAATTTCGTGTGTCTTGGCAGCTGGCCGAAGAACACTCTTCAAAAATATGGTTTGTTATTTGGCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 21108451 5' - roo 9049 2 67.12 CACCAGTGATATCCAGCGTAATAATCCACAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 - chr2R 18056898 5' + blood 54 2 55.94 TGGCATTGCCCCCCAACTTCATTAGTAATAAATCCGCCTGCGCAAAAAGCACCCATGATTACTATTTAAACGAATTATTTACAAATAAAATATTTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 - chrX 5938415 5' + pogo 24 1 69.18 GGTGAAAAGTTACTGCTATCTTTTTGCTCTGTAAAAAGCGTGTCTTGTGTCGTATTTCTGTCGTTAGGCAAACATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr2L 21687579 5' - pogo 2057 1 55.17 CGTAGACAATAATTCAAATTATCCACACAAGTGTCCTACTACCGGGCCGCTCTCTCTTCACTTCGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTGGAGTTTTATGATTT:1 - chr2L 42604 5' - copia 200 2 54.79 TTAAATAAAATTAATGAAAATAAAGAAATAAAAATAAAAGTAGATCCATTATGACCTGATGGTCCTAATAAAGTTTTAAATTCTTTATGAAGAGTTTTATTCATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTA:1 - chrX 13145997 5' + R2-element 255 1 34.93 ACATGGTGAATATTCGAATTCAGATTCGGTCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:2 + chr3R 17794557 5' - P-element 2798 1 21.92 GAGTGCAGAAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATT:1 + chrX 16857062 5' + pogo 68 1 65.07 AAACTCTTAATTGGTAAAATTGAGATTAAAAGAAGGAAAATATTAAATGAACTTAAATAATATGGGATATTTAAATTAACATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTG:1 + chrX 16538072 5' - mdg3 206 2 58.90 AGCGACCAAGTAGCGGCACGCCCGGGGGTATGCAACACCCACAGCCAATATTTGCCACACTCCTCCTGCGGTACTCGCATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATC:1 - chr3R 23968688 5' - HMS-Beagle 202 2 52.74 ATATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr2R 18467205 5' - roo 8990 2 73.29 TAGGACACCCAGATAGGGATGGAATCGGCCCTTCCACATTCATCCTTCGCCTACCATGTCCTGTTGACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chrX 16994988 5' + jockey 28 1 70.55 TGAAAAAAGAAAAATGTGCAACGAAAAGCAGTGGATTTTTGCGGTACGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTA:1 + chrX 9864930 5' + hobo 74 1 68.49 CTGCTCGCTGATTAAACCCTTTTTTTACACCCCCACCACCACCCACTCACCATGCTGAAAACCCTTGCCTCATGTGGCATATTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:1 + chrX 7657404 5' - 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chr2R 13052891 5' + Doc 66 1 63.01 CGTTTATTGATTTTACCATTTTGTTTGTTTTACTTATTTATGGTTTAGTCGGAATTTTTCCTTTGCTCCTGGTTTGAAAACCCAAATAGGGCATGGTGGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGC:1 + chrX 4788477 5' + Max-element 8249 2 74.07 GGGTGGAGATGCAGGTGGAAAACGAGAGCGATTCGAATTATCGGTTGGTTAGCTGGATTAATACGGCATATTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTAGA:1 - chrX 17838070 5' + S-element 3 2 76.24 TTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATA:1 - chrX 8610299 5' + mdg3 5318 2 66.17 GTGCACTGGTGCATAAGTAAATAAAATGATTGAGTGCTCACAGCTCAGTCTGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTA:1 + chr2L 5732737 5' + hobo 70 1 64.38 GGCACAAGCCTTGATAAAATCACAAATTGAATAAGTGTGTTCTTGTTATTTCATGAAAATGCATTCAAATGTGCTGTGAGCAACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 10429900 5' - roo 9036 1 60.96 AGTTAAACGAATGTGTCCCGCCTCTTAATTGGCTAAATACATTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAA:1 + chr2R 14921492 5' + pogo 78 1 73.29 ATTGTAAATGTTTTGCGTAAAATAATAAATATTTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr3R 11873303 5' + 412 24 2 68.49 AATAAAATTATGAGAAAATATCAACAATTTTTTTTTTAATTTTATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAA:1 + chrY 1803444 5' + invader4 352 1 55.48 GCTCATTAATAACTGCCCACTTTTATTGGCCGTCCATTAAATTAATTAAATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGA:1 + chr3L 20042419 5' - flea 4943 1 67.12 ATCAATCTTTTATTGAGAGATCTTAGTATTTTATGACAATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCG:1 + chr3R 1047929 5' - Stalker2 370 2 62.33 GGAGAAGAGTACCTGTGGTATTATTAAGGAGACTACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2L 20253920 5' - roo 322 2 76.03 AAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr3R 31663330 5' + jockey 75 1 62.07 CAATTGCATTAATTAAAATTTTTCGCCAGACTGCACGGCGGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACT:1 - chr2R 13052838 5' + Doc 119 1 72.60 ATTGCGTATACGTAATATGTGTTGTTTTTAGGCATTATACACTTTTATTGACATGTTGGAGTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATA:1 - chrX 18055820 5' - 297 6917 2 60.96 AAATATTGGGATGCGGATTCAATTTCGGCCAGAATTTATGGGTAACTCTTTAAGGAATGACATTTTACTTTTTTACATCTTCAGCTCTTTCATTTTGCTTTAACCACCCACCTTCGAATTTTCCTTTTTCTCTTTCCTTTTTTTTT:1 + chr2L 19094369 5' - Doc2-element 234 1 72.60 AATATTTTCGTGGCAATGCTCTTTCCAAAATTCGCTACGTGTTAAGTTTGCTTGACCTTAGAGGAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCA:1 + chr2L 19635519 5' + Quasimodo 240 2 56.16 GGTGATGGATCGGCGGTTGCCTCACAATATATATCTATATATACAGGTACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCAC:1 + chr3R 24396716 5' + I-element 5165 1 65.71 AGGGGAGGCAAAGAGGCAAGTTAAAAAAAAATATAGAAAAGAGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGGAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3R 13571975 5' + 412 7076 2 67.59 TTGGGCGAATTGAAGTATCCAGCATTCTGGTGCTGAATTTGAGCGCTGCCTGAAAGATTCTTCTCGTTTTGTATTACAACTTTGATCTGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3L 12775935 5' - roo 9039 1 63.70 GCATTTGAATAGGCTCTACATTCACATTTATTTAAAAACAAATACAAAAATTGCCGCCACTAACTTCTCAAGTTACATCTAAACAAATGACAGATAAGGCATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAC:1 - chrX 15772975 5' - hobo 2709 1 63.70 AGCGCTACCGCACAAGTCAGTTTTTGCCGGGCTAACCTTGAAATCGCTGGATGTATGTATATATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCT:1 + chr3R 15453659 5' + Transpac 55 2 60.27 CAATCATCGCGTATGCGATTACCCACACACAATATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGAC:1 - chr3R 25094685 5' + P-element 86 1 26.71 AAGTCCTGCCAGGATCGCGGTTTGCCCCGCTGTGTGGGCTAGACGGGCGAAGAAGGATGTCATGGGAGGGAGTGGCAGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGT:1 - chrX 19992685 5' - copia 5079 2 54.79 GCTTGATGAGCGACCAAGTAGCGGCACGCCCGGGGGTATGCAACACCCACAGCCAATATTTGCCACACTCCTCCTGCGGTACTCGCATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTG:1 - chr3R 23968696 5' - HMS-Beagle 7007 4 58.62 ACCCCGAAAAAATGAGCCACAAAGAGAGGAATGCGAACGCAAGGGAGTTTTTCAAAAGGAGTCTGCTCTATATAGCCAGATATTACCTAAGATTCAAAAATATGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAG:1 - chr2L 21082261 5' + mdg3 20 2 72.60 AATACAGCGATGCACCGAACAAAATATTGGTACTTCACATTAAATAAAATGGTACTTTTAATAGTAATAAATATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2R 11609833 5' - roo 397 1 77.40 AAACATTGAAAATTATTATATATCCTGGCTGGTTGCCAAAAATGAAAAGCGTAATTTTCGCGCGCTGTTTGAGTAATTGAATCTAGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACGCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCC:1 + chrX 9768918 5' - 1360 431 1 55.48 CGATCTCGTTACTCCTGCGGCGTTTCTCCTGACAAGGTGTACTCCTTGACAACGGCCGGTATTAGGAAGTTATGGGGTAGGGTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 + chr3L 25496723 5' + mdg3 41 2 58.22 ATTGCAAATGGCGAGTTAAGCAAATGTGCAAAATACAATTTTCGCATTGGACCGCATTTTAATTTTGTTTTATAATTTCGCAAATAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTT:1 - chr2R 20117415 5' - mdg3 5467 2 65.73 AATTATTGAAAGCATTTTGCGGCCAACTGCAGCTGTTGACCATGTGCCCGGCCCCTGCCACGCCTCGTTGCCACAGGGAACTCGGTTAGATAGCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGGCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr3R 12886119 5' - 412 466 2 67.12 TGCTAATTTGCTTGTTAATCGTTCGCCTCCTCCACCNATNNNNACCCAACACCNAANNNNAGNACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr3R 27409131 5' - hobo 2892 1 51.20 GATTTTCAATGCTATGCATTGTAAATTGATATTAATGCAGCCATTTGCTCATTTTAGATTACTAATCATCTATTAATCCCACCCTAAAAATCGGATTATATAATTGCTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCC:1 - chrX 17270420 5' + 3S18 5786 2 67.81 CATTGTCAAAAGGGTTTAAGTGGCTATACTTGAACCAGGAGAATCAGCAGCAGTAACGGCTAAAGCAGCAGTTGAAAGTCCTCACCCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr3R 12781454 5' - pogo 2069 1 60.27 CATCGGCACTTTTTTTTGCTCCTCTATCAGGAAAAAATGTTTTAAAAATGCGGTCATCGTCTTTTGCGAAATTGATTTTTGATCGCGGAGGTATGGAAATAATCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACTGTTTGTGGTCAGTTTT:1 + chr3L 20050270 5' - R2-element 3521 1 51.72 AATATCTGTTCAGCACATACAGCCGAGGGCAAGTAAGTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCA:2 + chr2L 3393767 5' + Stalker2 7331 2 73.29 ACGGTGTTTATAAAGAAATGTAGACCATTTTCAAAGCCATTAATAAAAACAACCTTTTCGATTGAGAGATTTTATTTAATATTCATAAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3R 13411925 5' - roo 9037 1 61.64 ACGACTTGAACTGATGACGATGCCGCAGTTAAACGAATGTGTCCCGCCTCTTAATTGGCTAAATACATTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 + chr2R 14921466 5' + pogo 52 1 55.48 TGTTCGACTACACTGAGCACAATTATTCATCATAGTTGCCACCAATTGAATAAAATGCTACACAATGTTTAGGACGAACAAAATTGTATGCAATATAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACAAGCCACTTC:1 - chrX 14318530 5' + 297 6595 2 76.71 GTGTTTGCTCATTTGTATCTTTGTACAGCCGATGCACAGATACATCAATGGATAACTGTCCACAGCAAAAATCTATCGACTACGAGTCGATGATACTAATTGCTGGCGCGGGCCCAAAAGAGATACGGGAGGGAATGAAAAAGAG:1 + chr2L 4092176 5' + G5 487 1 65.52 ATATGGTCCTGTTCTTTCGATAGTTCTTTAAAAAATTTTATTTTGAGATATTTCTAAAAATCGACTTATGGGCGGACTGAGGGCAAATTTGGCCGTCACCAAAGAAGTGCTTAACCAATGTATGGCCGTTACGCAATTTGTTATTC:1 + chrX 21668822 5' + 1360 3377 1 54.11 TATGTTCGTGCCAAAGTTTATTATGCAATACGCAGTTTATGTCCCATGCGGAATCAATTTCATCTCGGTATACGGTTGATTATTACTACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 - chr3R 22275383 5' + flea 30 2 65.07 GGAGAAGGATGCAGGCAACTTAAACTAAGGCTGCGATTGGTGACAGTTTGATTGATGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAG:2 - chrX 998221 5' - copia 190 2 63.01 GCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAA:1 + chr2L 951333 5' + F-element 83 1 73.88 ANTTATTGAATTCCCTGTGTGTAGGGTTTAATCAAATATAGAATAAATAGGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr3R 18539873 5' - roo 9001 2 67.81 ACGACATCAAAAACTGGCAACTGTCAGTAAACTAGTAGCCTGCAAATGCACCCGCAGCGAAGATCGGGAAAACAACTAAAAAATAGCAAACAAAAATAAAAAACAACAAACAAAACCACAAAAGGAAAAAAAAAAACAA:1 - chrX 17553375 5' + gypsy7 5009 1 75.54 GGCTTAGAAGAAAAGCTTCAGTTTGAATATTTCAAATGCTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCA:1 + chrX 13008710 5' - blood 295 2 76.71 CCAACTGAAAAAAAAGTATTTACCAAAAAAGTATTTACCAATGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chr2L 232376 5' + Doc 82 1 81.51 CTCGCATAATGGTAAGCGATTACAGAGTGTAATTGAAATTCTAACCAGTAACAGAACCTAACCCCATCAAAACCCTCTTGGGAAAGATTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 - chr3R 10736888 5' - copia 221 1 58.90 ACCTTTGACCTGATTATATTTACTCCACGCAACTTTTATCCATATAGTATTTTAAATGTATGTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 + chr3L 3910461 5' + 297 50 2 60.96 AACATTTTGGATAAAGCTTCTTAGTGGCTAAAAAAATGTACGTAAATACGTCTTCCTAGAACAATATATAGATTTTTAATAGACTTACCATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTT:1 + chr2L 21082091 5' - mdg3 213 2 62.33 GCATAGCGGCAGTTGCACCATCGGGTGCTCCTTCTTTTCGGTTTTGGGTTTGTTTGCTTACGGGCGTTGTAGCGTATTTGACTAATCCACCCGAACAAGGAAATAACTGATGGGGTATAACATAGCGTCAATGCATTGTGACACTT:1 - chr3L 25995884 5' + Stalker4 58 4 76.71 GCAAATGTTAGGAAGCCGTCCATACAAAACTTGAGATGTATTTCCCCAGAATCTCTAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTA:2 + chr2R 5800469 5' - HMS-Beagle 6981 2 60.27 CCAATATCTGTTCAGCACATACAGCCGAGGGCAAGTAAGTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAAC:1 + chr2L 3393765 5' + Stalker2 60 2 67.20 AAACAAATACAATGTACAATGAATACAAAGCCCGTGGAGTGACGGCAATCGGCAAATCAAATTTCAAATTTCGAATCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 - chr3R 18940625 5' - mdg1 7412 2 52.74 TGTGTAACGGTGTATCTGTGTTGCTGTGCATCTGTGTACCCGAGTATTCGTGTATCTGTGTGCTTGGCAGTTATAACACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2L 20269040 5' + hobo 42 1 56.85 ATGTTGAATGCCAAACGGAACATGCTAAAAATCGAAAAAACTCGAATGCGACTCAGTGGGCCAAGCACACACAGATACTCACACACATACTCACACACATGCGAGTAAAAAAAAAAGGCGCTGCTGTGCACCGCAAAAGAAGATGG:1 + chr3R 22569785 5' + Rt1a 4856 1 73.97 GAGGTCAGAACAACAGGGAGCGGAGAGCACAGTTTTTCGTGCAGTTTGTCCATTAAAAGTTAATATCACTTTGCGAAAGTTCCCCGCCCGTCTTTCGGTTCAACTTTAATACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:1 - chr3R 12878289 5' + GATE 34 2 74.66 CCGAATCCGAAACCGAGCCGGAGAATTCTCTCTCTCTCAAGTGTCCGGTCCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAA:1 - chrX 13642111 5' + P-element 19 1 58.51 CAGTCAAATGTCATGAACCGAGATGGGAACTGAGATGGGGTTCGCCCGCTTCGCTGGGTTCGTGGCACTTCGAAACTGACATTTGCACTTTTTCCCAGGCCAAAAACCTTCTGTTGTAATGAGAACCTCCAATTAAGAACACAAGT:1 - chr3L 9240532 5' - 412 7536 2 75.34 TATACGCTGCAATTGCATTAATTAAAATTTTTCGCCAGACTGCACGGCGGGGATTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACTACAGTATAGTGAAAGTTAATCAGAAAGTATAAAGTGCTGTTTGCACAACTAACAA:1 - chr2R 13052847 5' + Doc 110 1 56.85 GATAGGCTTACATGAGGCAACTTGTGTACCGAACACGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAATTCATTCGGAACCACAGTAAGCTGTTCTTATGTAATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTG:1 - chr3L 22441000 5' + Transpac 438 1 78.08 AGGCCTCCAATGAAAGTGATAGCCCTTATCACCAACCTCATAATCGTGACGTCATATGTGGCTAATGTGACTCATGAAAATTAATATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGA:1 - chr2L 15934676 5' + gypsy3 3 4 79.66 ACAAACGAAGTTTTCGTTAGGGAACCAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCTATATTTCATTTTTTTTTATTCTACGTAAGGGTTAATGTTTTCAA:1 + chr3L 17895050 5' - P-element 118 1 20.83 TGCCACAACTGTGTGCCTGCCTACTATTTGCATGTGTGTCAAGTGTTTGGCAGCGTGCGTTTCATGGCACAAACATTTATGCTAATAAATTGAAAATGCAAATAAACGAAAGTGTCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 - chr3R 11730826 5' - hobo 2933 1 76.71 CAAAAATCCCTTCGCTGGAAACTCGGCACACATTAAACAACAACGGCGATAAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:2 - chr3R 31663380 5' + jockey 25 1 72.60 ACAAAGAAGTACCTATTAAAGTAGAGACTCTAGAAATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGAC:1 - chr3R 1048073 5' + Stalker2 46 2 54.11 TTTAAATGCGATAGCGATTAGCCGATAGCACTTATCGGTCACACACGCTAGCCAAACAGTACAGTCACCACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAT:1 - chrX 11236497 5' - copia 202 2 54.79 AGTTTTTTGTAAACATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGGGAGTACGTTGTAGTCGATTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACT:1 + chr2L 18176990 5' - INE-1 550 1 71.92 GATTGTCTAATTATGAACGCAACAAATGCAAAACTTAAAGCAACTTAATATGAAACTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chrX 2821865 5' - roo 347 2 63.38 ATTGCGTAAAAAATTGAAGAAAAAAAGAGGAATGAAGTATTAAGCGAGCAGCAACAGAAAAAATTTAATTGAATTTGCACTGCTTTTTTGAGTTCACTTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 - chr3L 780806 5' + Burdock 6155 2 69.86 TCCTTGTTATTTTTGCACTTGTACCAAGGAGAAACATCAAAAAACGCGTGAAAAGTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAA:1 + chr3L 18435431 5' + I-element 67 1 61.64 TTTATTATTTTGGTTTATTGTTTTCGATAGTGTAATACAATAATGTATATGAACGGCATTCCTTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGC:1 + chr3R 11142187 5' + Max-element 8295 2 60.27 CAATTAGTGCTTGAGGTTGCTGCCCTCCTTCCTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAACTTAGGACC:1 - chr3R 26845592 5' + mdg1 91 2 77.40 GGTTGAAAGGATTCGAGCGTCGAATCCCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGT:1 - chr3R 11550308 5' + F-element 55 1 53.42 ATTGAACATTTGTAATTTTCTGTACATTTCCCCCCAACACACGCATCCCATTAACCATTAATCATTCACTATTTACCATTACCCCTAATCCATCCCATTGAACCTGACCACATTGCAATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCA:1 - chr3R 9069109 5' + 1360 209 1 78.08 GATGAGCACCAGTGTATAAGGACCCGCACTGTGGTCCACCTCCTCCAGTGGGACCGAGTCCCGACTGGGATACAGAAGCAGTGTTTGTGGAGAGTCCATACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCG:1 - chr3R 7250308 5' - F-element 485 1 66.21 AGGGGCGTCTCGCATTTTTGTTGCATGCTTACAATCAGATCTGTCAGATCAGTTTCCTCTTCTCGCGGCAGAGGATTGCCTGTTTCGGTTGCCTTTTTGGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:2 + chr2R 18265966 5' + roo 8685 2 71.23 AAACAAAAATTAATTATAAAACGAAAATTTTGTTATCTTTCTAACGGTTGCTATTTCTATCGAGTAATTTGAAAGATAGTTTGGTAATTTCGTTGTATTAAGTAATAATTTAATAATGGACTAGTTTTTTTTTTAAATCGAAATGA:1 - chr3R 27005780 5' + FB 187 1 67.12 AATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGGGCTT:1 + chr3L 16523212 5' + jockey 93 1 72.60 GCTAGGTATGCACATTTTACAGTCTCTGTTTTATGGCAGGAATTAACGAGGGAAGCCTTCCAGCGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTT:1 - chr3L 19398197 5' - gypsy5 7290 2 68.33 ACAATATATCAATCAGTTTCTAGATCTAATTTGCCACACAACAGACTATTTCAGATTGTATGGCATTATAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGA:1 + chrX 18318143 5' - copia 203 2 54.11 ACTAAGATACCATGGCCAGAAGATGATGAAGAAGTAGCAGGAGAGGCAGGAGAGGCAGGAGTGGCAGGGGGGGCAGCAGGACTGCCGCAACACAAATAATAATTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 10915760 5' + Tc3 86 3 40.83 AACCGCACAGACTCAGTGAGTGTCAAACTGTGCATAGGGCATTTCGCAAATAAACATTGCATACTTTCAGTCAGCACTCGCGAATGTGCAAGGCAACGCGTTTAACAATTGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGAC:1 + chr3L 8395131 5' + jockey 17 1 78.62 TAATAGTTAATCAGCGATTTTCCATTCGAACATGCATCCTTTTGTGCCGGACTCGTGTTAGTTTCTGTTCATTAAAACATGTTAAACACATAATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3R 12885952 5' + 412 29 2 64.38 AAGGACTAATGCCAAACTGGCCAGCAAATGATTGTGATTATGTGCATCATCACAAAGACCAAGTGTTTGTTTTTGAGAGATTGAGTTTAAATTAAATTATGATTTAAATCAAGAGTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr2R 15190554 5' + pogo 3 1 76.03 GAAACGAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGTCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAG:1 - chr3L 1983528 5' + Transpac 82 2 73.29 TCTTTTTTTTTTGGTTCTTTTTTTTCTATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACT:1 - chr3L 14371599 5' - 17.6 7373 2 75.00 CTTGCGGCTTTTCTCTCAGCCCTAAACAGTGTAATTGTTGTCGAGTGTATATATATCTATATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAA:1 - chr3R 8884416 5' - HMS-Beagle 6986 2 63.70 ACTTGTGGGCACAAATAAGCACAAATACATACGTGACTACCCACCCACCTGTAAATACAAAACTTTCTCAAAGTGCGACTGTCACAATAAAATAAGATTTGACATGAAATCTCCTACGTTTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAT:1 + chr3L 2489202 5' + F-element 289 1 73.97 ATTTTGCCGTAGATTACTTTTGGTCAGACGCAATTAAATTGAGCTTGATCCAGCATCAGAGCGAGGGCCCCAGTTTATATCAGGTTATTGAATAAAAATTAGATTTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAAT:1 + chr2L 17358202 5' + Bari1 354 1 66.42 AGATATTCCAGGAGGCACTCGAGGCAAACCTAACCATTCATATCAATCTCGGCACGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTA:1 - chr2L 15601628 5' + Doc 73 1 65.75 AACGAACCACACTCCAAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGA:1 + chrX 12003937 5' - P-element 2803 1 29.45 CACTTGTGATGCGCCTTTAATTTTCAATTGGCTTAAGCTGGTTTCAGATCTAATCTAATATCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 + chrX 16325120 5' - Transpac 253 2 58.90 GCACATCCTTTTTTCTATGGTTAATCAAGGGAGATCTAATCAGTTGGCTGATATTGACCAATCAAACGAATAAATGAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2L 11559689 5' + roo 8704 2 59.31 ATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 + chr2R 14767376 5' + Tirant 46 2 62.28 GGAATCGTTATAATCCTTAAAGAACTTGACGAAAAGAACTCTCTCCTAAAAAACCCTATTTGACTAAATTTACATTAGAATATCAATTAAGGATTATAGTTGAAGTAGTTCTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 - chrX 19736576 5' + pogo 8 1 73.97 AAGTGACTGGCAAAAGTTTAGGCAAAGTTTTACGCCCCTCCAGTTCGATGGTAACTTAATAAATGTGTGAGCACTTGCCGGTTGAAATTAAATTAGCCATCCACTCAGTTGGCCTTCTCGTCTGATCGGACTCGCTTAATCATATT:1 + chr3R 26359737 5' - Rt1b 4773 1 55.48 AACAGCCATGGCAACTAAATTTTTCTACTTTTTGTTTTCCAAGTCGCCGCTGGAGATGATTACATTTCGATAAAAAAAAAACCGAGGGAAGTGCGACAGAGACGGATGAAAGCAGGAGGCAAACACCTATACACACACACACACAC:1 + chrX 8887628 5' + accord 7100 2 71.23 CGCAACTCGTAATAAAAGCCGGATAACCGGATACAAGCGAAATTAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTGGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2R 18786053 5' - roo 8996 2 68.28 ATATATGTCTTGTTTCAATCAGACATAACTACGAAAATGTTAAGTGTAAATGCCTTTTGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 - chr3L 22845984 5' - 297 341 2 60.27 GAACAAGGCATTATGCTTTCCCGCTTATTTTCCTTTTTTTTCTTTTTTTT:1 - chr2L 8756878 5' - Doc2-element 245 5 88.00 AACCCAATTTATTTGAGTGTGAAAATTGGCTTTCGCCCATTTTGAAATTCTAAGCTGTTGATGGCGTCGTTCAACCACACAGACACCGACACACATGTATGTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr2R 21453494 5' + hobo 19 1 72.60 GCATTTTTTAGTACAAAAAAAAAAACAAAGAAAAACCTTTGGAAAATCCCTAGTTGGGGGTTTTAATTTCCTTTTTTTTTT:1 - chr3L 10321268 5' - Doc2-element 252 1 29.63 ACACGACCTTGACTGCACTGCAATATATATGTGCACATATACGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chrX 13484194 5' + hobo 80 1 73.97 AAAAGTGCATTTTGTGAACTGTGCATATTTTTTGGTCAACTTTTCTGACTCAAAAGACTCTCGGTGGAGTTAGCAAGCTTAAATGATTTTTAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 15596883 5' - roo 9045 1 65.75 ACGAGGTAGCTACAATCCGCACAAAAACTCAATGTGGGTAGATACAAATATGTATGTATGCATGTGCACAAATGTGTTTGTGCTAATATTTGACTTCTTTGCTCTTGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 - chrX 19506218 5' - P-element 2871 1 74.66 TAGTAACATTTTGGATAAAGCTTCTTAGTGGCTAAAAAAATGTACGTAAATACGTCTTCCTAGAACAATATATAGATTTTTAATAGACTTACCATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTC:1 + chr2L 21082087 5' - mdg3 5469 2 65.07 TTGTTTGCCCTACCCAAGTTGCACATGCTGTCCAGTGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATCTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCA:1 + chrX 10698635 5' - mdg1 7375 2 71.23 GTTGCTGCAGTCGCCAGTCGACACATGGTGAATATTCGAATTCAGATTCGGTCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 + chr3R 17794535 5' - P-element 2820 1 36.99 GTGTGAGATCGTCTTGGGCAAGTTGGCTTTCTATGGGCTCATCTTCCTGTTTGTTGTCATCATAGTTGGTTGCATTTGTTGTTGTTGTTCGGAGACAGGCACGGTTGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATA:1 - chr3R 6404684 5' + Stalker2 7266 2 73.29 GTAGTAAACAACTATACAGATATAAAACATATTAGAATTTACGTTTTACATTTTTGCATCACATCACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2L 20262594 5' - roo 354 2 56.16 AGCGGAGTGGGATAAAATGCTGATAGCTGGAAGGCAGCTAAAAGTTTCTTCTTTCGGGTATGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr2R 10773212 5' + 412 7113 2 57.53 TGTTCATATTTATAAACGTTAATCAGATAAAAATTTGAGATATGTGATAAAAATAATTATATGTGAAAACTTATCTGTACAAAATAGAAAGTATAATTTGAGAAACTCTGTACAAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTAC:1 - chr2R 5128110 5' + mdg3 5029 1 55.48 ATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTCGAA:1 + chr3R 19537487 5' - hopper2 1539 1 61.64 TTTTATACGCTTTCAGAGGGCATCTCGATTATATCCAGAAGTTTGCCAGACACATTTGCGACCAAAAGAAGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGA:1 - chr2L 10685894 5' + Quasimodo 49 2 54.79 GACCAGCGGATTATAAGAAATGTAGATTCGGGGAATTTTTATACCCTTGTAGAGGGGATAAAGCTTTACGCATGAAACCGTATAAAAGGCTTCTTTCCAAAGAAGATAGCCTAATTTGGCATTCATAGTAATTATTATTTATTT:1 - chr2R 16487933 5' - jockey 4832 1 84.72 GCCTGAATACGTAAGAAAGTTTATCATACTCGATATTGAATGCGAAAAATGTTATCAATAATAATTCGCTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAA:1 + chr2R 7540923 5' + F-element 75 1 60.96 TATCAGGGCAACAGCATCTGGCTACGTGTGTGAATGGCCTTTTGGCCGTTTGCACTTCTTTTACCGCCATAAGTCTCTATAATCCATTTATACACACCGCTCGGGCCAAAGATTCAAAAATCGCGTGGAGAGTGTAGTTGCACTTC:1 - chrX 16778019 5' - baggins 81 1 79.45 CGTAGGCCTTTAAAAATAGATACACAAATTTACAATAAGAAGGCCATCTCGATGGGGCAGATTGCCACGCAAGCCATCATACCGCTTGGTCAGATAGATCCAGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAATTTT:1 + chrX 1223006 5' + R1A1-element 24 1 73.29 TGGAATTTACTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 - chrX 12995419 5' + blood 50 2 51.37 GCCACTCGCATCCCTTTCCCAATCCCAATCTCACACCCATTTTCCATTCCATTTTCCGAATCAGGTCAATGCACAATCGCAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:2 - chr2R 10960984 5' + Doc 48 1 51.37 AAATGAATACCTCTCGGATTTTATGTGTATCTGCATTCACAGCACTTACACTGTAACCAATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTT:1 + chr2L 1870940 5' + mdg3 63 2 58.90 TACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 - chr3R 31663311 5' + jockey 95 1 75.34 CATATATTGATAAATATTGTACATATATGTAAACTATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chrX 3637740 5' - roo 9037 1 61.64 GTGCTATTTGTGAGAAACCGAAAAGGGAATGATATCAGTTGGACGAACCTTAGGCTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACG:1 - chr3R 22572648 5' + HMS-Beagle 6851 2 59.26 AATAAAAATTTAGGTAGTTCTACAAATAGATAGACTAATAAATTAATAATAACACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTT:1 - chr2L 9317765 5' + I-element 71 1 66.44 CATTACTGGAACACTAAAGGGCTTGCATCTAGCAGGATGAATGGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chrX 6053004 5' + roo 77 2 71.23 GTGAAAAGTGGCAGCTGCAAATAAAAAGTGTCAGAGTGAACGCGTATCAATGCACTTGGATAGTGCGCCCTGTACCAGCCACATTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTT:1 - chr3R 7395793 5' - jockey 4895 1 63.20 AGAAAATGCTACTTTGTGGACGATTATTATTTGAAGTGTTGAACACTTTTTATTCTATCGAACTATCGTTTAAAAGTCAGGGAGCAGCAGTTCTCTTATACGCATGCAGTGAGAGTCGACGACAGAATGTGTGCACACGTATGCTC:1 + chr3R 18722604 5' + 1360 176 1 86.30 ATGTTCGGCGGCAGCCAGGACTTTGTGACGGACGACGGTCTCATTATACCGACGATTCCGGCTTACGTTCGGAATAAAATCGAGATAAGTGCCGATAAGACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCA:1 - chr3L 17527938 5' - Stalker4 7183 4 70.71 AATGTCTAGAAACTAAATGACAAAACCAACAGTGCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCAAGTGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGATGT:1 - chr3L 21765523 5' - gypsy 407 2 54.11 AATCTGCATGACTGCCTCGCTCCTTGGGCGTGCGAAAAAAAATGGAAGAAACGAGCACGAGAGAGTGAGAGCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chr2R 17348503 5' + hobo 49 1 50.68 GGCGGGACTCCGTTAATGCTGAGCATACTTTTAGGTAGCTTAGTGGCATTTACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGC:1 - chr3L 13546642 5' - hobo 2869 1 65.07 CTACATATTCTAGTCATGTTTTTGCTATTAAAATTCCTTAGTCTAAGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1 - chr2L 3327054 5' + jockey 4745 1 67.12 GGAAAAGGAAGAAGGAAAGTTTAGTCGAGTTGAGTCGCTAGTTGAGTATGAAAGAAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr3L 2240497 5' + roo 8726 2 62.33 CTCCCACAAAATGGGGCACAAACATAATGCCGGTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGCTG:1 - chr2L 3393821 5' - Stalker2 324 2 69.86 GTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 - chr3L 3540213 5' + mdg3 5304 2 60.42 ACCAAGCAGTAAGTGGCCGATTGGACCCGAATCGAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTC:1 - chr3R 10741175 5' + 1360 3377 1 36.99 TTGGAAAAGTTAGACAAATCCTCATTTTACCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 - chr3R 19989331 5' - hobo 2896 1 57.50 CCAAGTCGCGTAAGCTGGACTGGGATAACTTCGATACCCGCATCCGGCCAGCTCACCAGACCCACAAGTGGGCATCCAGATGAAGCAGGGGCGTAGACAATCTGTTTCTCAAATCTCAAATAATTTTTTTAATTTTTTTGTTTTAT:1 + chrX 14679806 5' - HB 318 1 68.49 AGAGCCACGAATTATGGCTTCATTCCCACAGAGAAATCCCAAGTGTTAGTCCAAGTCGTTTGCATTTATTCTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGAGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 20327742 5' + roo 21 2 69.18 AAAAGTGTTGCATAAACAAGAGCGCCCACAAAGAACTTATGTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAA:1 - chr2R 18528773 5' - jockey 4908 1 74.48 GGAGAGTCAAAAAGGTAATTTCTAGAGAAACGATCACGGAAACCTATTTAAAATGCTTGCCCGCATAATATTTAGTTTTGAAAGTTTATACGTACAATGTATATGTATAATCCACACAAGCTGAATAAATATAAATAAATCACAAA:2 + chr2L 17125484 5' + Burdock 312 1 72.60 AGGAATTGTCAAGCAATCCGTCGATAAAGAAATTGAGCTTTACGGAGAAGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 - chr2L 22177450 5' + Doc 77 1 69.18 TCTTTTATTGAGAGATCTTAGTATTTTATGACAATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGT:1 + chr3R 1047934 5' - Stalker2 365 2 58.90 AGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTA:1 - chr4 158193 5' + 1360 186 1 65.07 CACAATCCATAGGAATAACTGAACTGTACTTAATTTTTTTTTAATCCCCTTTAAGTAAATAAAAAAATAAGCATAAATTATTGTCTTGTTAACCTTAAAAATATTTAATCTAAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:1 + chr3R 26349258 5' + mdg3 5260 1 36.30 TCTTAACGAAAAACTTTCCTAGTTATAAAGAGACTTATGTCAAAAACAATAGCACCATTATCTAAAGCCATTCCGAGTTCTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 + chr3L 8704478 5' - blood 7348 2 56.85 ATCTAGTGTAGCAAAGTTGAAGTGGCGAACTTTTAACGGACGGACATTTGACGGGGCACTGGAGAAACAGAAGAATCCCATTTATGTGTTACTGCGGCACATAAATATCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGA:1 - chr3R 12522905 5' + Doc 409 1 70.55 CAGCCAATTAAAATTCCCTTTTAGCCAACCACTGATGATGGCCAAAAGGTTGTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTA:1 - 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chr2L 9109946 5' - opus 439 2 62.33 ATTGGGGAATAAATTGAGAAAAAACTTAATATTGTTCAAAAATGTGGGCGTGGCAGCTTTGCGCGATTTTAAGGCGTTAGAGTTGCCGTGATAAAAAGTTTTTTGGTAAATCGACAGAAATTTAAAAGACTAATAAAAATGTGAAA:1 + chr3R 3261446 5' - INE-1 285 1 68.49 CCTACCCAAGTTGCACATGCTGTCCAGTGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATCTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATT:1 + chrX 10698643 5' - mdg1 7367 2 76.71 GACTAAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 - chr2R 12416951 5' + pogo 58 1 60.96 CTCAAAATCCTGGCGAGCAGAACAGGATGTCAGTCGATGTCATTTGTTTGCCTTATGACGAGGGGCATACTACAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr2L 2336339 5' + 297 6624 2 56.85 TACCAGAGTCAATTTGTAGTTCGTCTTTGCCAGCAGTTTGAAGTCTATTAATAACGAAATTTGGAAAGGCCAGAAAAGTACTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3R 11072416 5' - roo 9031 1 57.53 CAAATATTTCCGACATACTGTGTCTCTATATATATATATAAGTATATACGAATGCTTATACTTATGTATATATAGGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chr2R 17341092 5' + hobo 46 1 50.68 GGTTGATATATGAGTTATAATTGATAAACTTGAGGGGTTGATTCATATGTAGTTTTAGGTTACTTAGTCGCTTTTACTACTATGCAGTATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACAC:1 + chr2L 14678707 5' + Quasimodo 25 2 65.75 GTTTTCGATAGTGTAATACAATAATGTATATGAACGGCATTCCTTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTC:1 + chr3R 11142206 5' + Max-element 58 2 68.80 GTTGGTATGACTAATCAGCGTCAGCATATGCGAAAAACAATGCCGCACCGAGTGCAATACCAACGTGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAA:1 - chr3R 24301921 5' - Tabor 431 2 53.42 ATGTAATTGAAATAAATTAATTTTTTCACACTTTATTCCGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGCGTACATTCC:1 + chr3L 21405407 5' - mdg1 338 2 72.60 ACATAAACAATAGTATAAGAAGAACATCTTTAATCATTCAAGCTAAAGATCCAATTATACATATATGAACATACTTTCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTATCATATAATTATATAATGCAGCGCTTGTAAGACGCCGCAGT:1 + chr4 329485 5' - rooA 232 2 57.53 TTAATAAACTTTTAAAGGCTTGATCTTGGGTGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAGTAGGTGACA:1 - chr2R 21244950 5' - roo 339 2 66.90 TTATTCATTGTTGCATTATTTTCACCTCTTTAACGAAAACAATCTTCGGTATATCCTGTATGTATATCGATTACAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chrX 10344746 5' - roo 360 2 50.00 ATCGGCTTTCAATTGATGCCAATTAATCGAGGCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 + chr2R 14767318 5' + Tirant 20 2 73.29 GCAAACTGAAGAGTCTCAAATTAAATCCAACAGGCTGTCCAAAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr2L 9988117 5' + hobo 65 1 66.17 ATGCCACTGGGACAATAAGGCGGTACAACATGAGTCAGACAGGCAAGCTAATCAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 + chr2R 9408131 5' + FB 23 1 68.57 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGTATGCGCATATA:1 - chrX 12649914 5' - blood 7166 2 79.66 CAATAATAAACAAGATATAAATATCCCCACTATTTAAAGTCGCTTTGGCTCAACGAAGCTATAATTTTGTTATTGGATGTGCAGATTCACGGAATTTAATAAGTATCCGTATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGA:1 + chr2L 3317697 5' + X-element 19 1 71.23 TTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr2R 8375103 5' - roo 8992 2 69.86 ACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 - chr3R 4352110 5' + Doc 88 1 81.94 ATGTCATTAAGGTGTAATTAACAAAAATTAGTAGCTGCTTAACGGGACCAACAGCAATCCACCCCGAAAATCCCTCCTCAACTAACCAAAAAACAAAAAACAATAAGGAAAAAAGAATCACGCAACCAAATATTAAGATTCTTTAA:2 - chrX 6193921 5' + Tc1 1343 1 77.40 ACTTTGCACAGAGAAAAACTATGAAACATTTGCTGGCAGAATAACCTCCTTCAACTTGCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCT:1 + chr2R 21353179 5' + Transpac 60 2 64.38 CGATACAAATCTATGTATTTGCTTCTTTTTCAAATAAGTTAAAGGAACCTACTATCCTACCTATACCTACATGTTCATTAATTACGATTAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chr3R 25052966 5' + pogo 27 1 65.75 TTGGCGAGCTTCGGGGATGCCGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACCCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACCTGCGGCAA:1 - chr3L 6542044 5' - hobo 2864 1 77.50 CCTGTGTTACCTGTCCGTCTAGTGCGGAATGCCGACTGTGTGGAAAGAGCTCAGAAAAGACTGCTGGGAATTAATTAATTGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 - chr3R 5684187 5' - pogo 2062 1 58.90 TCTACACCTGTCTGGCTCGCAATCAGGCGGGCGAGAGCAGCTACAGTGCTGAGTTGAAAGTCAACGGTTACTACCCATAGATTTCCTATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 - chr2R 7343376 5' - flea 4985 2 66.44 GGCTGATGGAGACGGATACCTCGTTTAAGTTCAAGGCGGAGGATTAGACAAACTGCAGGGATTTAATGCTTTCGGAAGTATTTAATGATTCATATCGTAATTGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCG:1 - chr3R 22608885 5' - I-element 161 1 73.97 GGCGTGGAGCACTTGTGAATCCCGACTGCCCTGCATTCTTAGTCACCCAAGTCACGTCCTGTTGCAACAACACATCGTATCTATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAC:1 + chr3L 9317438 5' - HMS-Beagle 7016 2 66.19 TGCTGAAACGGTGTAAAATTAATATTTGGGTTGAATGTACTATGGCACACAAACATTCACTTGAGGCGTTGAACAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:2 + chr2R 4853902 5' - copia 5076 2 50.00 AGCTGCACTTCTTATATAAGGCTTAAAATCATTAAACGGATTAATAGCTCAAGTTTTGTTCAATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3R 7136678 5' + roo 54 2 59.72 GAAATATAGTTTGAAGCGTGATCTACGCGTGCTACATGATTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr2L 12696213 5' - pogo 2061 1 62.39 ATCACTGTTTATGGTTCCTTTACAACTCAAAAATTGTTTCCTTGCTAATAAAAACGTCGTTAAAAATTAGAATTACGATTTTCCCGAATAATATATATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTGTGAAT:1 + chr3L 2364638 5' - INE-1 536 1 62.33 TATCAGTTCAGTTCTCAAATTATAAAAATTACAAAAACTAACACAACAAATGTCTAGAAACTAAATGACAAAACCAACAGTGCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCAAGTGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAG:1 - chr3L 21765571 5' - gypsy 7442 2 80.82 ATACTATCGCAAAATAGTAACACCATTATGCGTGCCAAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAACAATGCAGC:1 - chr3L 10241273 5' - pogo 2052 1 67.52 CATCTTTTCCCATCAAATAACCAATCAACAATTGATATTCTGCCTGCATTCACCTGGCCGGCAAAAGTTCACTTAACTTTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr3L 19702726 5' + pogo 38 1 59.59 AACTATTCTTGTGCCCCAACCTGTTGAAATGCTACATATATCATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTC:2 - chr3R 29952778 5' - invader4 3009 2 73.97 CACTACCGAAGTGCATTTCCCATTGTTGTGTTGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 - chr3R 25409753 5' + jockey 4674 1 54.84 ATTTATGATTTTTATATGCAGTAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGC:1 - chr3L 15374712 5' - 3S18 6037 2 64.83 ATCTTACAGATTAAGAGGGCTCAGAGCTAAAGATAAATTCTACTTTTCCTATCCTTTGAGCAGCTATAAGAGTCATAGAAACGCATTCAGGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr2L 6716429 5' + hobo 32 1 63.70 GTTTGGCACTAATGCAAGCAAGAAAGAAGGAAAAAAAGGGGGATCTGTTTGCATTTCGGGAGTTCTTAAAAGCTCAAGTTAAATATTTTGGTTATATTGAACGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTC:1 - chr2R 8275757 5' + P-element 253 1 72.34 GCATTTGAAGCAATTGTTAAACAAATGGAAAAGAAAAATAATCAAATAAGAGTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGT:1 + chrX 19091041 5' - jockey 4923 1 64.38 TTTGAGGATGTTTGTTCCGATGAATATTTTGTCGAAATTAAACGTAAACGTAATGGAATTGTTGTAGTTCCTTATGTTAATTACAATAATTAATGTGGTAACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2L 20262748 5' + roo 8679 2 76.71 CTATTAATATAAGAAGTTTAGACACAAAATGCGAGTAAATGGGGAGATATAAGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGG:1 - chr2L 15524012 5' + opus 67 4 66.44 CCGCATCCTTGGCAACCTTTGTGCATTATCTTCCGACTCTCATCTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAA:1 - chrX 10501346 5' + F-element 90 1 68.49 CCAACTCACACACACACACACACACACATTTGTATTTAATCAGATGCGCATACATATTGGGAGCGGGGACACCGCATTATCATTCATATGATGAAGCGTGACCGATCAGAC:1 - chr3R 17556049 5' + Rt1b 4778 1 48.65 AGTGGGCTAAAACAACAGAAACAGAGAATTTTCCTTGTAAGAATAAGAATAAATTGTAATCCATTGAAAACCTGGGGTGGACTCCATGCCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCTATCCAACCAAGTATTAGGCCC:1 + chr3R 4557578 5' + HB 1333 1 57.53 AGGGTATGTATGTTGCCAACAAGCTGGAATTTCACAAATTTCATTTCAGGCCATTTCACAGCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATAC:1 + chrX 17690402 5' + Doc 272 1 81.51 CGGGCCAACGAGTGAGACGAGTGTTAGACATATGATGACAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAA:1 - chr2L 16202682 5' + copia 4949 2 72.60 AACTGTAGTAATTTCCACTGACTAATTTTAGTACGATTGCAGACCTATAAAAATATATATATTTAAATCTTTGCCCGAATTAACACATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTT:1 + chr2L 13763442 5' - Bari1 1675 1 63.70 AGTCAGCACTCGCGAATGTGCAAGGCAACGCGTTTAACAATTGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3L 8395199 5' + jockey 36 1 57.29 GTTCTAATACTTATGTAATTTTTAATTAAAATAAAAAATGTTCTTGTATCATTTCAACCTCAATTGGATTGTATCAATTTCTTAAGCCATTGTTCCACCATAATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3R 7305860 5' + 412 7069 2 74.66 ACTCACCTTTTGCTATTAATATAAGAAGTTTAGACACAAAATGCGAGTAAATGGGGAGATATAAGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTGTTCGGGCCCCGTCAG:1 - chr2L 15524024 5' + opus 7170 4 56.55 CGAAAAAGCGGAGTAAAATCTCAAATATTCAAGCCACACACACACTACAAAGTCTTATACAGCAATTAAAATTAATCATAGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chrX 6213640 5' - roo 9033 1 59.59 CCCAAGAAAACCCCCTTTTTGGGCCATGGCCCGCCACTGTCACTGCATTTTAATTTACTGCATACCTTGAGGCGCCATTCGCCTGCGCTCGCATGCCAAGTGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr2R 13381931 5' + jockey 32 1 71.23 GACTTAAATTCAATATTGTAGAAGGGAATAAAATATTGAATATATTGATATATATATGTTCACACGCGGATCCTACCGACTGCGCCAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTT:1 - chr2L 14678874 5' - Quasimodo 7328 2 63.01 AAAAGCTGAAAGTGTATGGATTACGGTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:2 + chr2R 20931592 5' + blood 23 2 65.75 AAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCG:1 + chrY 2346870 5' - micropia 449 2 65.12 GAAAAATACTAAACCGAAATACTATTACTGAAGAAAATGTTCAAAATATAAATAAATATTTTACGCAAAAAGAAGCATTCAAATGTATACATTTAAATGTATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCG:1 - chr2L 13156625 5' + Max-element 24 2 67.12 ATGCGGGGAATTATGAGATGCATAAATGACGCAATAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACA:1 + chr3L 22445203 5' + Transpac 85 2 77.40 TTGGTGTTGCACGTCGGTGGATGCGCTTGTGGCTTCCCGGTGGCCCAGGCAACTGAATATAAACCACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 4157398 5' - hopper 149 103 80.00 TTTTTGCTTAATCGGTTAGTTTGTTATCACTTAGTTTTATTGGATTTACCATTTTTACTGTTTTAAATCAAATTTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTC:1 - chr3R 20097706 5' - mdg3 199 2 54.11 CAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGGC:1 - chrX 21667926 5' + gypsy2 6567 2 69.66 AACCTAGCAGAAGTTCGCATTAAATCTACCCCGGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTAT:1 + chr3L 6542013 5' + hobo 88 1 77.40 GTTGTGTTTTATGTTTAACTTTCTTAGAAGAATATATATGTCGCAGATCATTTAAATATAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCATGCGCCATAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCACGGGTAA:1 - chr3R 3953133 5' + invader1 115 2 68.49 TAAAATGAAGAAAAATTAAAATCTGTTGGTAAAAATTATCATTATGGTCTTAAAGAGCCCGCAAGCTTCCAGATCGACGTGTACAAGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chrX 22760437 5' + roo 35 2 61.64 CTCATATTTGTTTCACTTTGTTATGAGAATCGGGGGTTCTTCGATTTCAGCACATTTAGCTATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAA:1 + chr3L 13475499 5' - HMS-Beagle 189 2 61.64 GGTTGGTAAGAAGTTAAGATATTGAAATATAGTTTGAAGCGTGATCTACGCGTGCTACATGATTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGCGTACTTTGCTCAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 - chr2L 12696236 5' - pogo 2064 1 55.04 GTCGCAGGTGTTGCGGCGCTCCATTTCAGTGGTGTTTATGACACAAAGTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 - chrX 10561816 5' + jockey 4744 1 69.18 GTGTATTATTTGATTGTTTTATTTGATTTGAACCGCGACGATAAAAACATTTAATTGACAAACAAAAAGCGAACAATTATTCAGTGAACTATTTGTGCAAAATTGACAAGCTGCCGCCATAATTAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGA:1 - chr3L 10364166 5' + TAHRE 283 2 80.14 TTTTGGCCCCCACTACGCTCACTGCAATCTGGCCAAGTAATTAATGGTTTATATACACACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chr2L 16360528 5' - hobo 2932 1 76.34 TACTCGGCTTAATAGTGTTAAATTCCTAACAGATTGTTGAAAAAGTTCATGTCTAACAATACGCACCTGACAAATTGGACAAAGTGCGGTTCTCTAGAGCCTCCAATGTGTTGCCCCGCAGCGCTTTCAAAAAATAAAGCGAAAGA:1 - chr3L 23787006 5' + X-element 409 1 71.92 GCCATAAATTAAAAATGCGGTCGTCGGAATGATGCTACGCATAAATGAAATAAATTCAAAAGCATAACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTA:1 + chr3R 13231758 5' + F-element 82 1 50.75 CTATCAGATATCCACATAACTGAACTACACATTTTCAATAAATTGAATTTGAGTCCAATTTTTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGT:1 + chr2L 10306414 5' - 412 7184 2 57.53 AAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr2R 21244873 5' + roo 8740 2 71.92 TTTTTAAGTGTTTTTCCAGCAGCGACAACAGCAGCCGTGTGCAGCGCAAATGAGCCGTAATTGCATAATTCTAATTTAGCGTCGAGTTCTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr3R 26405135 5' - hobo 2935 1 80.51 TGTCACATTGTTTTGGGACACTTTTCTGCGGCTCAGTGGCGACGACGACTGTGGCAATAGTTTTGTAATTAGCTTGCGATGTCCCAGGTGATAAGTGATATTTAAGGCACTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:2 + chr2R 18785894 5' + roo 13 2 50.00 AAATCGATAGAAAGTGACAGTTCAAAATATTATAAAGAACAAAAGAGAATGCTTAGTCAAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGGAATGCGAACGCAAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATAG:1 + chr2R 5796542 5' - INE-1 498 1 73.29 ATCGCGAGATGGCCAAATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 - chr2R 15892223 5' + hobo 64 1 63.01 GCTTAAATTGGGCACCCTTATATAGAGCTTTTAACTAATTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chrX 10838587 5' - roo 8990 2 78.77 TTCTTATTTTTTTTTCTTTTAAGTACGTGCCTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCCCTTTTTTACCACTCGACTCACACCCCACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTCGCCCCGCACACCGCGGG:1 - chr3L 27200568 5' + hobo 68 1 66.67 GCGAAGGATGTTTAGATAAATTGCGCCTGCAGAGATTTACAAATTACGCCCGAGGCGGCGAATGGCGAAAATGGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:2 + chr2R 18467111 5' + roo 8711 2 50.68 ATATATATAACGTGTAACGTAAACACGTACAAGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr3R 12547846 5' + hobo 57 1 54.79 GTGACATCCATTTATTGCGTTTTTTACATGTTTAATAACTGCAGAATGTTTCAGCTCATTTTATTATCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1 + chr3R 24301770 5' + Tabor 6857 2 73.29 AAATATAAAATTTATATATAAATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:1 + chrX 23431587 5' - I-element 5294 1 60.96 TTTTATTTAGTGCATTTGTTAGAAGCGTTTAATGCGGATTAAATTTCGCATCGACTTATCGGCCATCTTTGTCTAACTATGCAAATGATATATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chrX 20854408 5' + hobo 28 1 66.44 TATGCTCCACAACGACTACCTCTAAAACCAGAATGCAATTGCAATTATCCTAATTCATCCATTAGCTTCGCTATAGATAAAGACCTAATAGGTTAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2R 15529655 5' - roo 9049 2 70.55 AAGAAGGGTAAGAGTAATGCCGCGTAACTGTCGTCCCTTTCACACGACCTTGACTGCACTGCAATATATATGTGCACATATACGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chrX 13484235 5' + hobo 39 1 58.90 CACCCTTCCATACCATCCTGGCTTCATTTTAGCGGAGCATACTTTCCAGCGCTCGCACACTTTGTGGCTCTCATGAATTTTTCCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGA:1 - chr2R 5899323 5' + jockey 4523 1 65.62 ATTTTAGCCCAACTAATTTGTATAGTTGTATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAATTAAAAA:1 + chr3R 17747298 5' - 297 6920 2 75.00 GGGAATGTTTCGTCGTCCTTGCAGGACCTCATTTCAATTGCAGATTCCATTAGCTGCAATTTGCTAGTGCATCGCACCCGGAGCAACTGCAACCGTAGGCGGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATA:1 + chr2R 21105666 5' + Stalker2 22 2 70.55 ATTGCACTATGCTCCACAACGACTACCTCTAAAACCAGAATGCAATTGCAATTATCCTAATTCATCCATTAGCTTCGCTATAGATAAAGACCTAATAGGTTAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2R 15529648 5' - roo 393 1 75.34 GTATGCAGAGGAGGGTTTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 + chr3L 5948054 5' + P-element 103 1 15.07 GATTTCACTGATTTTCATTTTTCAAGGCTAACTTACAGCCATAATTCAAAAGAAGATACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3L 19938607 5' + roo 23 2 70.55 TTATTGGAAATACCTACGAAAGTTATAATTATTAACGTTATTACATGACAGATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGAC:1 + chr2L 8852775 5' - Burdock 6325 2 67.12 TCTGACCATCGATCGGTCCCACTGTGCAGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr3R 17794612 5' - P-element 2829 1 41.04 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chrX 12649914 5' - P-element 2837 1 47.41 AGACCCCCTTATGTAACCCCTTTTTTCGGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCA:1 - chr3R 902613 5' - R1A1-element 5270 1 61.64 CATGACGGGCATATAATGCTGATTATGGCATATAAATACGGACATGCACATAGCAATGCACAGAGCAGAAGCTAAGCTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 18860984 5' - roo 9028 1 59.59 TAGGATCTTTAAATAAAGTTTGGTCCTAACTACAAAGGTATTTATTTATATTTTTTTTGGGACTAATTCTGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 10838496 5' + roo 8714 2 56.16 AATGCTTTCAACTCAAAAGGCAATCTTAAAATTCGCGGAAACTAACCATAAGCTATTTAGTTACCCAAATGGACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 + chr3L 5425437 5' - blood 7343 2 53.10 TTCCAAATAACTACAAATTCAGCTTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 - chr2L 10128143 5' - hobo 2883 1 75.93 AATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCACGCTCTCTAGAATTTT:1 + chr3L 25272544 5' + 1360 80 1 52.46 CAAACAAATGGGCGAATGCGAATGTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 + chr3L 1983414 5' - Transpac 282 2 66.44 GGGAAGGCGTGCGCAAAAGCGCAAAAGCAAATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGAT:1 + chr3L 780689 5' - Burdock 6304 2 78.77 CATATTTGTGGCTATTATGTTGGGCCACACAAAAACACCAGCTAAATATAATGTATACATATATATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCC:1 - chr3L 9317579 5' + HMS-Beagle 32 2 58.59 GGACAAACTTGTCGGACAAGTGAAAGACATAACTGCGAAAAATATATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2R 8375169 5' - roo 9058 1 76.03 CGTTCAAACAGAAAACTTGCTAAAAAAATTGACAGTTTTACCAAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1 - chrX 8358757 5' + Doc 81 1 69.18 ACCGGCCCTGTACTCTGCCGTGTGGTTGTTGTTGCTGCAGTCGCCAGTCGACACATGGTGAATATTCGAATTCAGATTCGGTCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr3R 17794505 5' - P-element 2850 1 57.53 AGTTTATGTTGTTGTAGTTCGGCTGCATTTGAATCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGA:1 - chr3R 7109208 5' + P-element 85 1 28.08 GAATGTTTCGCAGCTGTGCTTCGACATCACGGGCCAGTGCGATCTGCGAAACACTTTTGGCAATCTGCTGGATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGAA:1 + chr2L 13288749 5' - roo 8646 1 51.37 TTTCTGTGTGTTTCACTGGTCGCTTTGCGGTGCTATTTGGCATTGCTTTTGCCTGTTTACTTGGCTACTAAATAAATTTAAGTTCTTATGCCTTTAAGAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAA:1 - chr3R 15157721 5' - invader3 254 2 67.81 CGGGCAGTCGACAAAGAAGAAATACAAATCACAATGGCTGCACAAACAACCAAAACAACAACTCGACATCCGTTTTGCTGGCCCTTCAGTAATGACATTTTCAGCGGCACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAA:1 - chr3L 19431772 5' + Juan 17 1 73.29 ATATCCCTTTTTTCTGCTTTATGAAATGTATGTATGTTCCTATTGTATAATTACAACCACAATCAGATCTGGTAGTTCTGGAGTTCTTTATCTTGACATTCAAAAGTACAACAGATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 12540428 5' - roo 9062 1 71.92 ATTGAGTTCTTATTCAATTTGTACGGATTTGTTGTTCGCCGGTCCTTTTGCAGTCCGCTCTTAAAGCCTAACCCCAAAAGCCTCCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 - chrX 20379411 5' + hobo 36 1 62.33 GCAGTCCAGAGTAAGTAATCTTTTCCGGCAAATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr3L 13546537 5' + hobo 45 1 53.42 GGCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAAGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAAA:1 - chr3L 5498515 5' + Doc2-element 252 1 40.41 GGTGTTGAGAACTGTGGTATTTATTTGCAAGTCGCTTGGTATTTTCCAGCGCTTTCGGCGCGGTCCCACTGGACGCGAGTGTGTTTGCGAGTGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1 + chr3L 13450669 5' + P-element 14 1 73.88 ATTTGTCTGGCTTTGCAAAAAAAAACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 + chrX 12344280 5' + F-element 53 1 59.59 TAATCCACTCTCCATTCGTCTGTCAGGTGTCAGCTTAATTGTTGACAACATCTGCTGGCGCTTGCGGTTAATTAGCCATCCATATGATTAATCAATCGGCCGGAGTACTTGGTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chr2R 10666787 5' - hobo 2928 1 78.77 TGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAAT:1 + chr3R 19589937 5' + BS 5080 1 73.97 GTGTAACTAAGTGTTTGACAAAGTGATTACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 - chr3R 24760630 5' + pogo 66 1 70.55 AATAACACAAGCACAAATGAATACCTCTCGGATTTTATGTGTATCTGCATTCACAGCACTTACACTGTAACCAATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 + chr2L 1870926 5' + mdg3 5301 2 52.05 GAAATGTGGTGCTTGGCTGTTTCCGGCTCAGCGTTGGCCTCTCCTCTTCTGATGAGATGGCTCTGCAGATATAAGCAAATGTCTAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTG:1 - chr2L 5721610 5' + flea 4777 2 41.48 CACAGAAGCACACAATGGATACAGACAGATACATAGCCGTATAACTACGAGTCAAAAGATACATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 + chr2L 2336203 5' - 297 6930 2 55.48 CGATTAGGAGGGAACTGTTCAATCGAATCAATCTATCATAATGGAATTAAAGGAGTTTGAGCTGTTAAGTATCAGGCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 2240380 5' - roo 9028 1 55.48 AAGTATTTCTGTGTTTGGCTGGACAACCGCAGCTGTCAGCTGGCAAGATTGAAATGGTCGAGGTATTTGCAAATGTTTCCATAAAAATTTATTTATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chr3R 26643430 5' - 412 7522 2 67.12 CAGTGCCCCCAGAAGCAGGAAAATGAGTATTTCCAGTCGGGAGAGGTCCCTTTGCGCGGGATTCGAGTGAATCAGGGCCACCTTGGAGATCCAGTGGTGTGTAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 - chr3L 18574961 5' - I-element 5337 1 71.23 AGGGAAACAGCCAGTGAGTGTCGAAGAGGACATACAAGGACTGTAAAATCCCATATGAGAAGACATTACTCCTAGAAGAAGACTTACTTTTGTAAGAAACTGGTTTCATTTGGAAATAGCGTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 2534148 5' - roo 9009 2 50.75 AATCCATCAAAACACATTTCTGTTGTTATTTTGTAGCTTTTCTTTTCATACTCAGTTTGTCATAACTCGATTAGATGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCATATGTA:1 - chr2R 15529810 5' + roo 8709 2 55.48 ATTGGAGATGTGTATTGTGGATTCAGTAAACTCGACTTTGATTTCGCTATCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTC:1 - chr3L 1728540 5' - blood 7317 2 66.44 TATATACAAAAAAACAAGTTAAATCGGGTTATCTATATGCATTTATTAAAACACGTCTTTCGTTCTTGAGGTTCAACTTCAGAGTGAAGTTTTATTTTCAGAGGCTTTCTTCTTGAGTTGAGTACGTTCGAAGTTTGTGCAACTTG:1 - chr2L 4595580 5' - HMS-Beagle 6635 1 76.71 AATAACAATAACTCTGCGCTCGTCTCCTGCGACTGTGTGTGTGCTGAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGT:1 - chr3R 5087170 5' - P-element 2834 1 50.00 TCACTGCATTTTAATTTACTGCATACCTTGAGGCGCCATTCGCCTGCGCTCGCATGCCAAGTGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr2R 13381970 5' + jockey 72 1 56.16 GCAACAAAATTAATGAAACGAAGAAGAACAGCTGGTATAATAAATACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr2L 13102877 5' - roo 333 2 69.86 AAATGCTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCC:1 + chr2R 5070920 5' + gypsy5 26 2 26.21 GGATTGGTTATATAAAAATATGTGATTAAGTAATATTTTATATTTAACAAGAGAGAACACGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGGATGCGAACGCGAAATTTCATGATATTCTGGGATATCGATAGAT:1 - chr4 987550 5' - INE-1 500 1 63.45 TGGCCTCCGCATCAAAGCTAAACGGATGGATGCTGGGCAGGACTGGGATGGATGTGGGGTATCGTTTAAAATCATTCGAAAAGTAAACCAAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGC:2 + chr2R 7343207 5' + flea 4782 2 68.49 CCGGGTGGGGTTGGGTCCAACGGTCTGCCAAAATTAAATATGACTGTGAAATATTTTCAATTTGTGGACACGAAAAAAGTTTTGTTCGCCAAGACGGGCTACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATAC:1 - chr2L 2675101 5' + Quasimodo 15 2 74.66 GTAGTCGAAAGCAGCAGCTGATGCAGCAACTTTCTCTATGGATTTCACCTTATAAGCCCCCTAAAACCTCCCGCTTATATACATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr2L 15523893 5' - opus 7474 2 64.44 AAATGCATTCAAATGTGCTGTGAGCAACATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGCAAA:1 - chrX 10429844 5' - roo 316 2 80.14 TAGAGCAGCTCCAAAAGCTCCCTATCTACCTTACTCTCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGGGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 - chr2R 16031420 5' + hobo 75 1 71.53 TTCGCCTAGACGGTGCTTTTTTTTCCACTTTTGCACATACATACATACGTATACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGCTTTTTTTGACACCCTACTTGCGG:1 + chrX 13484127 5' - hobo 2867 1 65.07 AGTATAACTGAAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 - chrX 8610326 5' + mdg3 5304 2 50.68 TGGGGATGGGTCGGATTAAATAAATGCCAGCGCAGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2R 18266111 5' - roo 352 2 56.16 ACATAAATTTTGGGACCTACGTTTTGAGAACATTTTTTAAAATAATGGACTAGTAAAAACTAAGGAGGAAAGTAAATACATAATAATGTACATAATTTGTACATAATGTATCATATGTTGGCTGTCTGAGCAAGAAATTTTTAGTC:1 + chr3L 14585758 5' + Tc1 125 1 58.22 GGACGAGAAAGGGACACACTGGGTGCCATGCCTGCAGCTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGA:1 - chr3R 15035193 5' - Stalker2 383 2 71.23 CACTGGTGGGTGGTGGGTGCGCGCGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGGTGAGAGTGGCGCTTTGCTCCGATTGGTCGAGAAAAAGCGAGAAAAACGTCATGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr3R 25137913 5' + P-element 10 2 76.87 GCACAAGCGCAGGCACAGGTAAGCTAGTCAACCGGTTTTGCACCGGATTTTGGGCAAGCTTCATGAATTTCATTTGTTTTTTGTAAAATGCGGTTGACTGTGGATCTGTCGCATTTGAACTTGACACAAATTTCCTTTTTGTCCAC:1 + chr3L 11224207 5' - pogo 415 1 60.27 ACCCGACGGCGACGTGGGACGCCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGA:1 - chr2R 11818254 5' - P-element 2793 1 17.86 ATATTCATTTGAATAAATGTTAACTGCCAAGTTATCAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTACA:1 + chr3L 10141114 5' + F-element 84 1 75.56 CTCCCAATAAATAAATTGAATAACAATTTGCTTGTGGGTCGTGTCATATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACTAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGTCGACGTGTGCAGACGTTTTTAT:1 - chr3L 20910147 5' + F-element 24 1 67.12 TGAAAAACGAAAAAGATTTATTGGGTTCTCACATTTCTGTTACATCCTCAGGTAAGTGAATCTCTAGTTCGAACAAATGAAGAATAATAACTTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3R 10800633 5' - roo 9043 1 63.01 ATTGCAAATGGCGAGTTAAGCAAATGTGCAAAATACAATTTTCGCATTGGACCGCATTTTAATTTTGTTTTATAATTTCGCAAATAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTA:1 - chr2R 20117415 5' - mdg3 212 2 64.38 AAAAAATCGGTTGTGTTGTGACGATGTAGTTGTATTTAAAATTAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGA:1 - chr4 903785 5' + invader4 230 2 71.03 GTAGATCACCATTTATATGTTTATATGTAGCGAAGGTGCTCTGTAAGACGGAAGAGTTGTTTATGATCTATTCCCGCCTTGACTTCTATGTACCTGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:2 - chr3L 22445319 5' - Transpac 287 2 67.12 TAATATGTGTTGTTTTTAGGCATTATACACTTTTATTGACATGTTGGAGTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGA:1 - chrX 18055808 5' - 297 6905 2 69.18 GTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3R 13572019 5' + 412 50 2 60.00 ACAGCGATGCACCGAACAAAATATTGGTACTTCACATTAAATAAAATGGTACTTTTAATAGTAATAAATATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 11609836 5' - roo 394 1 75.34 TTGTTTCACTTTGTTATGAGAATCGGGGGTTCTTCGATTTCAGCACATTTAGCTATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCG:1 + chr3L 13475506 5' - HMS-Beagle 6978 2 66.44 TATCGAATCAATCAAGGGCTCACTCAATTGCGCTGTCTGGCCGAAACCAAAGCCAATTAAAATTATTTGGCCATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCA:1 + chrX 998115 5' + copia 51 2 57.53 TGGTTTTCGTTTTGCTTTACTTCCAGTAAAATACTTAATAATTGAGTGGAAACTATAACTTAAAGTATGAACTTGTATGTATAAATTAATTAAATTAAATTAATTAATTGCAGGTAACAGGGGGTTCCTCTGTCACTGGGAGGCAG:1 + chr3L 24736210 5' - springer 316 2 56.85 CCAACGCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCCAACAATGTGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chr3R 29719337 5' + hobo 48 1 65.29 TTTAACATTCCTGTGCATAATATCTATCTTTATCTTTTATGCTCGTTACTCATAGAGTAAAACGGCTTACTAAATTTCTTAAAATGTATGTAACAGGTAAGAAGCGTTTACAAGTATACATCCTCTTGATCAGGATCAATATCCGA:1 + chr2L 22196889 5' + INE-1 89 1 36.30 CTATCTAAAAATGGAATTTTACGCCCACCTGGCAACTCTAGAGCAGCTCCAAAAGCTCCCTATCTACCTTACTCTCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr2R 16031458 5' + hobo 46 1 54.79 TTATGGAATTACGCTTTCTAAACAAAACAAAGTAATATTGTGGAAAAAGAAAGTTCTGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTA:1 - chr2L 8852873 5' + Burdock 6195 2 60.27 ACTTTTACATTGCAATCAAGCACCGATTTCTCTTGTATTTTTTTTGTTTTTTGTTAAATGATATTATAATTACTAATGCTTTTATAGATTGAAAACTTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr3R 26031648 5' - pogo 2081 1 72.60 TTTTTTTTAAATTCTTTGAAATTTAAAAAATTTGAAGGGGGAATTATCCCAATGTTTTTATTCCTAAAGGCAATGATTTTTATTTTTACATTGTTTTCTTTTTTTTT:1 - chr2R 10262299 5' - transib2 2642 1 28.04 CAGAGTTTACAGGGTGTATAATTCCATTATAAGCATGGAAACAGAAGTTCATAACAATCACATCCAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTATATATCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGTTTGCCTTCT:1 + chr2L 22351690 5' - X-element 4494 1 68.84 GAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTC:1 - chrX 8610307 5' + mdg3 5323 2 63.70 GACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACACTGTGTCTATAGATCTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCTATGCGAAGTGCTTGCAGTGCCCCACAGCTGA:1 - chrY 1428635 5' - G-element 3925 1 78.08 CTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 - chrX 19744471 5' + P-element 97 1 19.18 TATGGGCAACAAGTTCGCCGCGTCCGTTCATCCCGAGCAAATGGCCTACAACACTGACCTCCATTGTGCTGCGAGTCCATTCGTATCCTTATGTATGCAAATTTGTGTGTGTGTGTGTATT:1 - chr2L 934930 5' - accord 184 2 75.21 ATACGTCTTCCTAGAACAATATATAGATTTTTAATAGACTTACCATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 + chr2L 21082136 5' - mdg3 5419 2 69.86 GCATGAAGTGTAAATTAAAATTAAATTGACTGTGCGGTCAAAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAA:1 - chr3L 19434149 5' + Doc 87 1 80.14 GATGGAGCGATGCACGGCATGGGAGTAATCCCCGCCAGCGGGCGGAATCTCCCCAATCAGCGGCGAGTTGTGATGGTAGTCCATCAAATTATTGTACCTATATATTACAAAAATTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGT:1 + chr3R 7277293 5' + TAHRE 10376 1 58.27 GATTTGCACTGACGCTTCTATTTCAATCCAACTGACTGCGGCTAAATGCATCCAGAGCATTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 22266431 5' - roo 350 2 57.53 AGATTTTGTTTAAACAATTGACACACGTACACACATGGGAAAGCGGCCATGTAGGTCAACATAGCGGTAGCATTATTTGTGCAGCTTAGTTTCAAGGGTAAATCTTTAGTTGGGGCACTGAGAATTGATTCCATTTAGTGTCAG:1 - chr2L 6479314 5' - invader3 328 1 70.83 AGTGCCATTTCGAATGCTTTTTCTGTGTTATTTGTTTCGTTTTGTGGCGACTGCTATTTTTTCACAACTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 14450097 5' - roo 394 1 73.97 GAGCGAATTTCGAATGTCTCCCCAAAAGACCCGTTTCTTTCGGTGTAAGACTTTTGGCGCTCTCTTCTCGCCGCTCTCTTTTCGCAGCGACGTCGACGTCGTTCGTTTGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chrX 1831179 5' - P-element 2874 1 76.71 GCAAAATTGGAAAAGTATGAGTGCAATTTGAAAAAACAAACGAGTTAATCAAGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATGTTTCCCGAAATTAAAA:1 - chr3R 11142279 5' - Max-element 8481 2 56.15 TCATTGAAAAAATCTTTTAAGGAGAAAAGTGTTGCATAAACAAGAGCGCCCACAAAGAACTTATGTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTT:1 - chr2R 18528797 5' - jockey 4931 1 58.22 ACCGCATGTCACAGATGGCGATGGAGATGCACTCGTCAAAGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3R 16404449 5' - roo 8992 2 73.29 TATGCATATTCAACAGAAATTTAATAAACTTTTAAAGGCTTGATCTTGGGTGCAATATAGAAAATCAATTCTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2R 21244970 5' - roo 358 2 56.16 CCGCCGTGAGCACACACTAATCGCAGATATAGCGATCAATCGAGTGAGAAAAGTAACGAGAGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chrX 17933742 5' - roo 9012 2 60.27 GGCGAGTTTAATTTGCTAAATTTGGTTGAATAAGTCTTGCATCTGTTAATTGGAAGTTAAGTTAGCAATCTAGTTAGACCGCATTTTAATTGGGTTTGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chr3L 17710552 5' + I-element 24 1 69.18 CCCAGAGCACTTTTTGATATTTATGTCGCCAGCTGTTGGCATTAGTGGACGACTGGCTTTTAAGGCGAGCAAATGTTGGTTGCTCGTATATATATACACATACATACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAA:1 + chr2L 19634921 5' - Quasimodo 7357 2 75.34 TTGACGGAGGGACAACGTCCTTCAGTTCAAAACTTTGTGAAGCAGGCCTCTTAGCTTGACTTATGAAGTATTATTATTAAGTGATTTTGTCTGTGTACTGCGACCCAGTCAGATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTC:1 + chr3L 24259084 5' - baggins 5384 1 79.14 ATAAGTCTTGCATCTGTTAATTGGAAGTTAAGTTAGCAATCTAGTTAGACCGCATTTTAATTGGGTTTGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 + chr3L 17710581 5' + I-element 53 1 52.05 GATTATATCCAGAAGTTTGCCAGACACATTTGCGACCAAAAGAAGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATG:2 - chr2L 10685868 5' + Quasimodo 75 2 72.60 TTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACAT:1 + chr3R 15035062 5' + Stalker2 7320 2 65.07 TTTTGTTTTGTTTGGCTTACTTCACTGTGGTGCATGGAAGGGGCCACCGACGAAACGTGGAACTCGTGTTCCTTGGGAGTTCATTAAGCAGCGGTAAACCTTCAGAGTGAACAGACGTGTTTTTATCGAGCTCCGTATAAAATCAC:1 + chr3L 22477092 5' + Doc3-element 30 1 63.70 TCTTAGCCATGAATCCAACGCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCCAACAATGTGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr3R 29719323 5' + hobo 28 1 57.39 ATTCTTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGAATCGTTTTCTACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCTAACCGAGTCGATGTGGCCATGTTCGTCTGTCCGTATGAACGTCTCGATCTCAGGAACTATAAAATCTG:1 + chrX 124082 5' + INE-1 151 1 79.14 CATGGGAATCCTTTATGAGGGGTGCTAAAATAAGATCCATCTCAACAACCAGATATGAAAAGCCAGCACACTTGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 + chr2L 5333371 5' + mdg3 37 2 51.37 GATAGACACCAGCTCGCAGGAAGGATGCTTTCCAGGACTCCACATCCTCCACAGTCTCGCACGAGAGCTCCAGTTGTTTGTAGTCCTATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCCATTCAGCGCAAC:1 - 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Idefix 7127 2 61.64 TGGGGAGGCAAAGAGGCAAGTTAAAAAAAAAATATAGAAAAGAGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3R 13571975 5' + 412 7076 2 67.81 GACACGGCCTAAACCTTGTGCTCCGCAGGACTGGAGGCCCGGACAAATCAGGAAATGAAAATGGTAAATTCAGCAGGGGCTCAAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAACGCTGTTG:1 - chr2R 24211665 5' + flea 32 2 60.96 GCATTTCACGGAATTTATCGCTGGGCATGGGCACGCAAGGAGCAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTTATTTT:1 - chr3L 10068979 5' - 412 419 2 63.70 GTACATATATGTAAACTATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:2 + chrX 3637758 5' - roo 9019 2 51.37 AACTTTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAA:1 + chr3R 15035058 5' + Stalker2 7316 2 62.33 ATTGTAATCGAATCGTTATCAATAGTGCCTTTTTCTATATTTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTG:1 - 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chr2L 20262738 5' + roo 8689 2 69.86 GTCGCATCCGGTGGGGATAAAAGTCACATGGACGGGCCCCAACTCACACACACACACACACACACATTTGTATTTAATCAGATGCGCATACATATTGGGAGCGGGGACACAGCATTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCG:1 + chr2L 10934093 5' + Rt1b 4771 1 62.68 TTTTTAGAATTTATTTCAGTTTGTTTTGCACTTTTTTTTGTGTTCGTGGGTAATGACTAACGCACTGTCAAATGCCCCACGTTGGGCGCCAATTATGAAAAGGGTTGGCCGGCGGTTAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1 + chr2R 22772049 5' - Tirant 399 1 74.66 ATCTTATCTTATTATTTCATATCAATCGATAAATCTTTAAGATGCTTCTAAATTGTAATCTATTTTTGACATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 18860754 5' + roo 8715 2 54.79 GACATCCATTTATTGCGTTTTTTACATGTTTAATAACTGCAGAATGTTTCAGCTCATTTTATTATCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 + chr3R 24301772 5' + Tabor 6859 2 71.92 AAATAAAACATGAAAAAAATTACAACAAAAAAGTAAATAAAACTAAATAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTT:1 - chr2R 3169868 5' - 1360 439 1 71.23 GGGGATCCGGATGAGGAGAAGGATGCAGGCAACTTAAACTAAGGCTGCGATTGGTGACAGTTTGATTGATGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - 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pogo 2090 1 76.30 ATAAATTATATTACATTATGTACCTTAGGTTATGAAAGGTGTACTACTTCCTAAGGGTTAGAGAAAATCTTTACAAAAACAAAACTAATACCATTAACCCACATTTACCTATATGACCTTTGTTGGCAATGACAGCCGCGCATCGT:1 + chrX 19202151 5' - Tc1 1306 1 78.08 GTGCGCTGTTAAGTATGCTATATTAAATTGCATTGTGTGGATTTGCACTGACGCTTCTATTTCAATCCAACTGACTGCGGCTAAATGCATCCAGAGCATTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 22266392 5' - roo 9053 2 69.86 ATCTGTTCAGCACATACAGCCGAGGGCAAGTAAGTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAG:1 + chr2L 3393770 5' + Stalker2 86 2 75.34 ACTGACGCTTCTATTTCAATCCAACTGACTGCGGCTAAATGCATCCAGAGCATTGGTAGGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 22266438 5' - roo 345 2 60.42 CTGGTTAGTATGCTTACGCACATATTATGACTTATTAAAGTATTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATA:1 - chrX 21638138 5' + gtwin 6954 2 59.59 CTCACGCCCAACCGCATCGAAAAGGGTTAATGTTTGGCCAGTCCTTGTACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGA:1 + chr2L 11639010 5' + springer 7211 2 69.18 ACTATAAGAGTTATTCACGAGTAAATAAAAAGCCCAGGTTCAATGGTAAATCAGTTAACACCATTTTATCGGTTGAATTGCACAATTGATGGGGTGATCGATCTGTTAATGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAG:1 - 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17.6 6998 2 71.92 CAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCA:1 - chr3R 9862957 5' + Stalker2 7331 2 73.29 ATCAATAGGAATTCCACGGGGGTTCCCCGAAGGTGGCCAAAACGGATGGGTTTTATGAGTGGTGGCCAAATGGCAGCGAAAGGTGTAATGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGTTCCTCTAACCATGCTTGTTGGAGC:1 - chr3R 5921519 5' + R1A1-element 4887 1 61.11 ATTACAGAAAATGGTTGACAACCAAGGAATAAGATGCTTGCAATATTAAACGAATTAAGACTTTTCCAAGAGGATTTCGAAAAATCTTAAGTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chrX 10429739 5' + roo 8690 2 67.81 TGGGCCAAGGCATTATTTTCTTTTTTTTGATTTGCATAAAGCGAGAGATTTATGGCTATAAGGCGAGATTTCTTGAATATCAAGGTTGGGCCTTCCAATTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTAATTTAACAACAAAATGTACA:1 + chr3R 14445589 5' + transib2 2757 1 67.12 CTCTCTTGTCAGTTGTTGTTGCTGTTGGAGATCATTGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAATGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGCA:1 + chr2R 2666291 5' + Rt1a 29 1 60.69 GAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGCCGTATTGAGTCTGA:1 - chr3R 5087125 5' - P-element 2797 1 20.29 TTAAAATCGAGCAATCTAAAAAGTGTCATACCAGTTAGATTGGGTGTAACCAACGCAACGTTCTCACTGTGTAGATAGCGATCTCTTCTATTCGGCGGTGTACGTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 + chr3L 3250313 5' + P-element 15 1 75.17 TAGAACCAACCACCCATACTCACTCACTCGTGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATGTTTTCGGTGCTTAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3R 26404989 5' + hobo 42 1 55.48 ACCCATGGGCCAGCCCATCTATATGCAACGTTTTTGTTGCTCGCCCATCGTTTGGACGTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 + chr3R 28937802 5' + jockey 4737 1 58.74 AATTTTCTCCATTTTTCCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGA:1 + chrX 7434406 5' - Tabor 7251 2 66.44 CGGCTTCTTAGCGGTTTCTTTATCGCCCAATATCAATCAAGTCCACAGAAATTCGTTGCACATTCGAGGATTCTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr2L 11043633 5' - roo 9030 1 55.00 GATGTGACGCAAAAATCATTCGAAAACGCAGCACAAGTTTGTTGACCAATGTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACTAACTACTTTTGAACAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTACCAATATCTGCCGATATCCCAGAAAA:1 + chrX 4630959 5' + INE-1 499 1 52.05 GTTGGAGTAGATCCCATTGGTGGAGCCCATAGGATTGGCGTTTCCTGGGGTTTTCACTGTTGAAAAGAATGGTTTACTATGTACTATGATTTTACTATACATGATTAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTT:1 - chr2L 10843122 5' - I-element 5342 1 74.66 GAGCTTGAGGCGAAAACATAGAAGCACACATTTTCCTGTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 - chr3L 5425529 5' + blood 7095 2 77.40 TAACTGGAATTTAGAAAATTATCTTGTTTAGAAAGTAGTTACATGATACATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACAT:1 + chr3R 26693354 5' + Stalker2 72 2 67.12 TTCTGGAAGATTTGAAATGGGAAACAATACAAAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chr2L 13102938 5' + roo 87 2 79.45 ATTACCTCTCCATAATATGTAGATTTCGGACAAATTGTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 + chr2L 22031937 5' + Tabor 6878 2 58.90 AAAATTATCTTGTTTAGAAAGTAGTTACATGATACATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCGAAG:1 + chr3R 26693368 5' + Stalker2 7334 2 75.34 TAGGGTGTTCTGGCCGAAAAAAAGAATTTATATATGTGTGTGTGTGTGTTACAGTTATAACAATAAATCAACAACTGCTGGCAGCCACTGTAACTGCAGTCGACTCTCAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3L 15724601 5' + jockey 35 1 65.07 CGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr2L 23372627 5' + 1360 10 2 57.28 AATTAATTGAATTTTTGGTATTCATTGTGCGGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr2R 10666966 5' + hobo 30 1 65.07 TATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCA:1 + chr3R 9657695 5' + BS 77 1 72.60 GTTGTTTAGGAACATACACAAGTGAACAAATAGCTAAGATGAACGATATATAGCACACCGATAACAATTGATTACTTTGGTGATTGCAGTACACACACACACTCGCACACCCCCACAAATACACACACACACACACACACATTTGC:1 + chr2L 9812794 5' + accord 7031 2 86.99 AGCGACCAAGTAGCGGCACGCCCGGGGGTATGCAACACCCACAGCCAATATTTGCCACACTCCTCCTGCGGTACTCGCATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCACGCGAACG:1 - chr3R 23968688 5' - HMS-Beagle 218 2 59.23 GTCTACAATGCCTTCCAGGTGGCCCTCAGTGGGTATATGTTCTACGAGGTGAGTTCGAATCTAGAGATTAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTT:1 + chr3R 22572538 5' - HMS-Beagle 6994 2 52.74 ATTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCTCTGCGC:1 - chrX 21638097 5' + gtwin 79 2 71.92 GACCGACCCCATTTACTCTTGTGATGAAATTTCGAAACTTTGGTAAAACACTTTTTGGCCCTGTGCGAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr2L 5656495 5' + hobo 14 1 76.03 GACTCAGCGATCTCACGTTTTGTCTGCGGCTTCCACATGGAGAGGCCCAAGTGCACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 - chr2L 20716429 5' + P-element 63 1 42.36 CAATGTTACATGTTCAATGTTGCAAGTTCTAATGGCACAAGCCAGCGATAATTACTGGTATAGCACACTTTTGTATCGGCGTCGATACTTTGCATCCAGATTTCTTTACATTTTCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGCACGGC:1 - chrX 6732314 5' - baggins 5116 1 76.71 CAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTAT:1 - chr2R 10666908 5' + hobo 88 1 76.71 CTTTTGTATACTAGCATTTCTTTTTCCTTTATTACACACGGTACTAGCCAACAATAAAAATACGATATTAATTCAACTACGATAAAATGAGATTGCTATAATCAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGCTACTCAGCTAGTGTGAAT:1 + chr2R 5499585 5' - INE-1 536 1 56.16 ATTACAGAGTCCAACGATGAGCTGCCAACGCAGAGAATGCACTCAGGGCACACCAATACACGCTTACATTTATGTACATATATATGTATATATATACTGCATTGCTGCATTGTAACCCTGTCACTCACACACACACACACACACAT:1 - chrX 15436166 5' + Quasimodo 37 2 58.22 CTTTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAAC:1 + chr3R 15035060 5' + Stalker2 70 2 63.70 ATGCGAGCACAATCCTCGACGCCTACATCACGCCAACCTCGTTTGAATTGTCCTAACTCCAAAAGTTCCGACCACCGGCCCCAACTGAAAAAAAAAGTATTTACCAAAAAAGTATTTACCAATGAGCATTCGGCATTCCACAGTCT:1 + chr2L 232296 5' + Doc 1 1 73.29 GGGATGGGTCGGATTAAATAAATGCCAGCGCAGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2R 18266109 5' - roo 9014 2 59.59 CTATGCAAATTTGCCGAAGGACCAAGGTGAGAGAAGAGTGATTGCGGGATGGATGGATAAACCCAGGGGCGGGCCAACGAGTGAGACGAGTGTTAGACATATGATGACAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 - chr2L 16202751 5' + copia 11 2 78.08 TCTGCTGCATGGGAATGGTTGTTGTAAAGCTTAAGGAATGGCAAAACAAATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 + chrX 13807992 5' + pogo 67 1 67.12 GGTCCCAGACAACGGAATTGTACTGTTCCAGAACCTGTTCATAACCGCCATCATACTTATCGACGCACAGATTGTACTCATCCACATACTCCGCATACTCGGTTTTGAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr2R 18056744 5' - blood 365 2 76.71 AAGGATGCAGGCAACTTAAACTAAGGCTGCGATTGGTGACAGTTTGATTGATGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTAT:1 - chrX 998217 5' - copia 186 2 65.75 GACCATTTGGCAAGTTTGATATAGCCTCGCCAAGAGTATTTAAACTTTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAG:1 + chr3R 15035016 5' + Stalker2 7274 2 67.81 GATATGCGACTTTTGTTTTCTTTGCGCTTACCTGGCCTCTCCGCTGTTTTCTTTGGCGCAACAAAAGCTCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGC:1 - chrX 9637179 5' - R1A1-element 4984 1 64.42 AAAGATAGCAAGCAAATAATATACTATCGCAAAATAGTAACACCATTATGCGTGCCAAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1 - chr3L 10241293 5' - pogo 2043 1 61.64 GACTCATACCCATGGCATTAACCATTTACTTATCATAATCGGGGCTGCCTTATTTCAACGCTTTTACACGTTGTTGATGTATTACTATATACATAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTC:1 + chr3R 4570201 5' + Juan 30 1 64.38 GGCGCGTTATAAAATTATAAAGCGAAATTGGATTTAAAAACAGCCAAGCTGTCCTGGTCTCCCAAGTGGGCAAAGCTGGCTAAGAGGGCGGATGAGAATGAGTAATTATTATTATATTTCATCATATTGCTACGTAATTGGCCAAA:1 - 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chr3R 23968673 5' - HMS-Beagle 6983 2 56.85 CAAACAACACTTCCAATTAATCAAAACCCATAACATCGCACAGTGCCTGCAATTCGTATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTC:1 + chr3L 5329092 5' - 412 429 2 60.96 GTTAAACTTAAGCTACTTACCCATCAGATTTAAAATAAAATAATACTTTGAAAAAACCTGAAATATTTTAGTTATGCAAAGGATAAATTACAAATTAAAAGCCAGGGTATTTATACCTTACAAGTATCGACTTAATATAATATAAA:1 + chr2R 22409139 5' + TAHRE 426 1 54.79 TCTCTATATTAATATATCTTACAACCCAATTCGAATTTTTTAGAAAGCTTACGGTATGCTTTTAATTCCTGTTTATGAGCTATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr3L 8704620 5' + blood 7051 2 58.22 CACAAACACACACACACACACACACACCCGTTAGCACACAACGACAGACAGCCAATTAAAATTCCCTTTTAGCCAACCACTGATGATGGCCAAAAGGTTGTTATGTAATGTGCACACATATCGAATACGCACT:1 + chrX 7978947 5' + Tabor 6848 2 75.94 ATTATATATATTTTTGAAATAAGTGCTATTTACATGTAGTTTTACGTTTCTCATTTTAGCTATTTAAGCTATTGATTAAGCTATTTAATAAATTCATTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 19591289 5' - roo 9052 2 70.55 GCATCGAAGCCAATGTGGGTGATAAGTCATTGGACCAACGAGACACTACCTTCAACGCAGAAGAGCTTATCAAGCCAAACATTCTGAACAGTATCGAACATCCTTTTTATTTGGCTATCGCATGCCAAGCCCCAGATTTGGCACCC:1 + chr2R 9898145 5' - X-element 4242 1 68.49 AGTGCGTCGCTCCAACTTTCGGCCTTTACGATGCACATAAATATTACGACCAAGTTCAAGTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr3R 6603863 5' - pogo 2059 1 56.06 ATTGTCGCAACAGTTTATATATGTACAAACATACGGGGCGTGCACCAAAGGGAGATATTCCAGGAGGCACTCGAGGCAAACCTAACCATTCATATCAATCTCGGCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 - chr2L 15601680 5' + Doc 21 1 70.55 TCAGTTTCTAGATCTAATTTGCCACACAACAGACTATTTCAGATTGTATGGCATTATAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAA:1 + chrX 18318155 5' - copia 5060 2 62.33 AAATTTTATTTTGAGATGTTTCTAAAAATCGATTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 + chrX 21844338 5' - mdg1 367 2 54.79 GGTTGCCGCTGTGGAGAGTGCAAAGTGCATGAAACTGAAACGAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGTCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 - chr3L 1983564 5' + Transpac 4964 2 54.48 GTTGAAAACTAGTAAAATTATGCTTTCAACATAGTCAATCCTTATAAATGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr2L 19800879 5' + roo 8736 2 67.81 GTGCCAAAACATTGCGTAAATCAAGCAAATGTTTCTCGGAAAGTCCAAGTCACCGATCATCCATTGGTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:2 - 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chr3L 10241312 5' - pogo 2062 1 56.85 CCTTTCCCAATCCCAATCTCACACCCATTTTCCATTCCATTTTCCGAATCAGGTCAATGCACAATCGCAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 - chr2R 10960972 5' + Doc 59 1 53.79 AACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATA:1 - chr2R 10666907 5' + hobo 89 1 76.03 GCGATTGCTTTTGTTTTCTTTACCCTTGCATCCCAAAAATCGCGAAGCATAGTAAACCCCACATGTGGTGTGCTCTGCGGCACGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACATACACATACACACACA:1 - chrX 22461825 5' - Stalker 445 1 65.07 TTTCAGCCATCGCAAAGTTGCTCTTAATTATACCTGTTAATCGTGGAGTAAAAGGGTATACTAGACTCTTTGAAAAGTATGTAACAGGTAAAAGGAAGGGTTTCTGACTCTTTAAAGTATATAAATTCTTGATCAGAATCACTAGC:1 - chr2R 12391970 5' + INE-1 86 1 76.71 GATGATGCAAGATTTTCGGATACTTTGTTTCGACGACCTATTAGCACTTGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGG:1 + chr2R 23419812 5' - G2 2786 1 66.44 AGAAATGAGGCGGCAAGAAAGGAATGGAAATGAAAAGGACAGCAGGATCAAGGATCCTACGATTCCAAAACTCAAGAGAATCAACCAAAGAAAAAAAGTATGTCTTTTTTTCGGCGAAAAAAAAAAACAAACAATGAAAAT:1 - chrX 12296939 5' + transib2 2644 1 81.56 GGTTCGGATGGATTCGGCTTGGTGCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTT:1 - chrX 12003977 5' + P-element 96 1 19.86 TTAATCGTTATCATTTCAATTAATGGCATATATAACGCAAGCAATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAACTCCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr3L 11887177 5' + Doc 45 1 55.48 GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAG:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 42 1 72.73 AGATTAAGTTCAAGTTTGGTTATTATATGTAACTAAATAAAAGTTTCAAAACACGGACTAATTACTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTT:1 - chr3R 27443253 5' + 3S18 57 2 54.11 GAAGCGAACGACTCCGCGGAATGCAATGCCACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:2 + chr3L 10068881 5' + 412 7104 2 52.74 CAGCTGTTGACCATGTGCCCGGCCCCTGCCACGCCTCGTTGCCACAGGGAACTCGGTTAGATAGCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 - chr3R 12886090 5' - 412 7528 2 63.89 ATAAAGTAGTCATTTAGTATACAAGTAGCTATAGTTTTGAACAAGTAGTGGCGACTGAAGCAGTAAATGATATAGTTCCCGTTTAATAATCGATAGGGAGCGTGCGGTCAGCTGTGACACACTAATTTAGGGTCATACTAGATGCA:1 + chrX 22821718 5' + Gypsy12A_LTR 83 1 68.49 GCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAA:1 + chrX 12344316 5' + F-element 90 1 69.86 AAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr3L 16523211 5' + jockey 83 1 67.12 ATTTTTTAAGTTTTTAGCAAGGACCTTTACAGTCTAGTGTCTTTGGTAGAACTACTACTGAGAAATACTTCGAACTGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCAGAA:1 - chr4 935644 5' - Cr1a 4078 1 53.77 AATTCAAATTATCCACACAAGTGTCCTACTACCGGGCCGCTCTCTCTTCACTTCGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAA:1 - chr2L 42594 5' - copia 5060 2 62.76 TGTTATGTTTGAGCTCAATTAAATCATAGTATAGTACTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGT:1 - chrX 9874199 5' - BS 5004 1 73.29 CAACCACAAGGCAGTCATTGTGGAAGGCAAGTCTTTGCCAAAGTATGCCTGTGGAAGCAGGGTTGCCTCTCTCACAACTGCAATCTCATCGACAACAACAACAACCGAAACAGTCTCTTCAACTCAACCGATTCAGTCA:1 + chr2R 1104919 5' + Doc4-element 342 1 48.92 ATGAACGAAACAAAGCCTTAGTACGTGTGAGCGAGCAACAAAATACGTATCAAATTATAGCCTAAATAGCAGTTACGAAACCACCGAACCACGAGCATCCAATAATTTATTGTCAATTACTTCCAAACCGCTTGTTTTTAATTCGC:1 + chr3R 31827771 5' - R1A1-element 114 1 66.44 GCACCGAACAAAATATTGGTACTTCACATTAAATAAAATGGTACTTTTAATAGTAATAAATATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2R 11609844 5' - roo 9049 2 69.86 GTAATGGTCATTCGATGGTCAGTCATTCTGTTAATAGGGGCAACAAAATTAAATAAAAATTTAGGTAGTTCTACAAATAGATAGACTAATAAATTAATAATAACACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 - chr2L 9317816 5' + I-element 20 1 71.92 TATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 + chr3R 23565248 5' + jockey 71 1 60.96 TTTAACTTTCTTAGAAGAATATATATGTCGCAGATCATTTAAATATAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCATGCGCCATAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAAC:1 - chr3R 3953120 5' + invader1 3705 2 76.32 CGATTCGGAGATGGAAGTGAGACGAGCGCCAAGAACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 + chr3L 9240408 5' + 412 87 2 77.40 CTCAATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGT:1 + chr3R 19989249 5' + hobo 69 1 66.44 ATTGATAAATATTGTACATATATGTAAACTATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chrX 3637745 5' - roo 9032 1 58.22 ATAGCTCACACATAAAACGCCAGTGTTTTGGCGGCGGAGATCCAGTCGATCTCTATCAAGATCTGCGTTTCGGTCGGCTCATTATGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr3R 15346836 5' + hobo 37 1 59.59 AAAAATTTCAAGTAAAGCCATTCAATAAAGAAATTGTATTTGACAGGATGGGCAGTTGGGTGTTTTTTTACTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 + chr2L 15096869 5' - jockey 4954 1 53.96 TTTGAGCAGCTATAAGAGTCATAGAAACGCATTCAGGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACGCCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAA:1 - 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chr2L 15057310 5' + hobo 11 1 77.62 AGCTATAAAGGCATTTGGTAATGCACCTCAGTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chrX 20369441 5' + roo 8754 2 78.77 ATGCCCCTGCATAAAGGTTGGTAAGAAGTTAAGATATTGAAATATAGTTTGAAGCGTGATCTACGCGTGCTACATGATTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 - chr2L 12696251 5' - pogo 2062 1 58.90 AGTGTTTAATGAAATGTAATTGAAATAAATTAATTTTTTCACACTTTATTCCGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 + chr3L 21405394 5' - mdg1 7389 2 64.38 CAACGAGGAGAAGACCGTCATCTACGTGCTGAGCAAGAAGGGCGAAATCGACTTGAACGCCGAGGTAGTGGAGCATGAATTTTGTTTGAATTTATTCATTTTATTTCTTTTGGCTACGGACACTTCA:1 + chr3R 4255231 5' - Stalker4 484 1 57.48 GTCCAAGAAGGTGATATCGTTCTTCAAGAATCATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCC:1 + chrX 15696716 5' + jockey 4757 1 76.71 ACGTCCTCTGAACCTGTGGGACGACCCCCCAAAATCGGCCAAGTCAAACAACACTTCCAATTAATCAAAACCCATAACATCGCACAGTGCCTGCAATTCGTATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 + chr3L 5329048 5' - 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chr4 39242 5' + springer 62 2 66.92 GTCTCGCATACGGATACGCATACGCCCTGTTGGCGCAGCTGGAAAAGCCATTTGGCCCGCCGCTTCGGATTTTGGCCCATTCTGAACTCATTTGAATTTAACACTTTTAATAATGTGCGGCGCCAAAAAAGTTTTTTTTTTTCGTT:1 + chr3L 19199667 5' + FB 881 1 70.55 TCATAGACAAGAACATAAGTGAAACACAAACTAAAGTGAACTTAATTAACAAAGTTTTCAAATCCGTATATCAATTAAGAGTGTATATCTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAG:1 - chr3R 26693473 5' - Stalker2 7620 2 60.00 TTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCC:1 + chrX 17690500 5' + Doc 340 1 79.66 CTCTCTTCTCGCCGCTCTCTTTTCGCAGCGACTGAAAAAGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTA:1 + chrX 1831238 5' - P-element 2770 1 21.92 TTTAGTTGCCTATGATATGAGGGTTCGTCCGCTTTCTCAAGTACTTGACTCTGATGTCGAGAAAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATAT:1 + chr3R 10785673 5' + Tirant 477 1 56.85 TAAAGCATTGGTAAATTGTTTGAATGCCTGAACTTGATTGATTTAAACGCGCCACGGACTTTCCCTTTTGACCCACAAAAGTAGGCTACAGAAATTAATTTAAAGAGAAGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr3L 9993855 5' + hobo 9 1 79.31 GAAATATGTAAACTAAAATACCGTTGAGCAAAATTGGAAAAGTATGAGTGCAATTTGAAAAAACAAACGAGTTAATCAAGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCG:1 - 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chrX 13164012 5' - BS 4918 1 59.59 AATGGGCAGCCCGCTCAGAATGCTGCCGCCGGCAAGGACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr2R 14450221 5' + roo 8748 2 73.97 ACATTTTACCCGACACCAGGATTGGGTTAGGTAGCAATGTAGAAGACAGTTTTTTGTAAAATGCGGTTGACTGTGGATCTGTCGCATTTGAACTTGGCACAAATTTCCTTTTTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTG:1 - chrX 23035086 5' - pogo 388 1 67.12 TTAATGGAAAACGCACTCAAACAAACACTTTGCATATGCCACAACCACTCCCACACTCGGACATTCTTTTATGTAAATTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAG:1 + chr2R 20117270 5' + mdg3 44 2 56.16 GGGGCCGATTGGACCCGAATCGAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATT:1 - chr3R 10741163 5' + 1360 3376 1 39.85 GGATGGGAAACAGTAAGGCCTGCACAAAGGACTGCACAAATAAATAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 13571414 5' + 412 42 2 47.95 ATAGCGATAAGGTGCGAATGCTATCAGGGTCCGCAAGTACCCCACATATATGTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGT:1 + chr3R 8810642 5' - 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chr2L 2518615 5' + jockey 31 1 65.75 CAAAACTAGCTTAAAAACCTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:2 + chr2L 3150998 5' - blood 7340 1 51.37 ACATAGCCGTATAACTACGAGTCAAAAGATACATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAG:1 + chr2L 2336233 5' - 297 6900 2 76.03 ATCAAAACATTTTGCAAAAGTGTGGGCTTGGCAGTTTGGTCGGTTTGTGTTCGTTAAAGTAGGCGTGGAAACATCGGTTTGTATGGATGGGTATGCTTAATCTGAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATA:1 + chrX 22902355 5' - INE-1 138 1 77.40 AAAATATTACACACGCCGCATCTGGTAATTTAAGTTATTTTCCATATTACACAACCCGGCAAAAACTCGTTGACTTTTTCACAGACACCGCAATGTGTGTATGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3R 29381638 5' + hobo 19 1 71.23 TNGATAACAGTAGATACCGCGAAAACGGTCCCCCTTTTGATATCGGAAAGTCGAAAATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGATCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAA:1 + chr3R 30910975 5' - 1360 104 1 61.64 ACAATCTTCGGTATATCCTGTATGTATATCGATTACAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chrX 10344797 5' - roo 8986 2 76.03 GACAACCAAGGAATAAGATGCTTGCAATATTAAACGAATTAAGACTTTTCCAAGAGGATTTCGAAAAATCTTAAGTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chrX 10429755 5' + roo 42 2 56.85 ATAGAGTCGACTGCATGTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr3R 29719381 5' - hobo 2907 1 76.00 TTGCTAATATGTGTAAATAATTATTAACAAACTTTAATTAAAAAGTGCTTATACGATTTGTAAGAAGTGTTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chrX 21205091 5' + 1360 51 1 55.48 AAGTGGAAAAAACGAAGCGAACGACTCCGCGGAATGCAATGCCACCTCAGCGGGCAGCTCCTTTTTACATCCTTTTCCGTACTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr3L 10068868 5' + 412 17 2 69.60 TAGTTGAGAATCATGTGCTGCTCCCATGATTTTCTTACGTAGTATTATAATCTTCAAACAGATGACATCTACACTGACTTTAGTAATGCATTTGACTCTGTTAATCAGAGTAAGGAAACTTCCTTCTAGTAAGGAAACTTGAT:1 + chr3L 27178264 5' + Q-element 351 2 79.02 AAACATCTTAACGAAGTGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:2 + chr2L 14262927 5' + P-element 41 1 56.16 GATGGAGGTTAAACATCATATCAGACTAAATACTTATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATT:1 + chr2R 19071438 5' + Idefix 197 1 76.03 ACCCCCATCACCCTTCCATACCATCCTGGCTTCATTTTAGCGGAGCATACTTTCCAGCGCTCGCACACTTTGTGGCTCTCATGAATTTTTCCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAG:1 - chr2R 5899331 5' + jockey 4533 1 63.01 AATCAATTGCAATTTATTCCTTGGTTGTGAAAATGGTTATTTGGGTTTTATTATTTTGGTTTATTGTTTTCGATAGTGTAATACAATAATGTATATGAACGGCATTCCTTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTT:1 + chr3R 11142141 5' + Max-element 7 2 78.42 GTTTAAATATTCCACACCCGAAAGTTGTCCACCTTTGTCGATGAATACAAAAAGGAATACAAAATATTAAGAAAATATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 107617 5' + roo 44 2 56.16 TATGGTATAATCTTTTTGGCTTTACCTGTAAAGCTAAATTAGGCTACCAATATGGTTAACTACGAGATGTGTGTTTAGATTTAAGCTTTAACCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 + chr3L 6563292 5' + I-element 50 1 64.38 AATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 + chr3R 13572041 5' + 412 88 2 79.45 CTATGATGTTGACAGAATTGATGCTTTGCATTCCCCATAGATGTTTTTCTCTTCCAGCAGCAGCAGGTGGATTACTTGCGTGCATTTGCTGTGCCAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3R 30524420 5' + roo 8690 2 67.81 TTATATAAATTAAACAATTTTTAAGTTAAGACAAATAATAATCATTATTCTTTATTAAGTGCATCAGAATACGACTGATCACTTTTAAGTTCTGTTTAAAAATAAAGTACAATTTAGATATTTATTTCTGTCAACGTTGCGCCTCG:1 + chr2R 10074728 5' - gypsy9 5182 2 67.81 AAGGAAATGAAAATGGTAAATTCAGCAGGGGCTCAAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAACGCTGTTGAGCA:1 - chr2R 24211617 5' + flea 36 2 63.73 AAGAAGGAGACCTAGAGAAATTTTGCTCACAGAACGGCTGAGAAATGCTCTATGGCAAAAAAATAAAGTTTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chr2L 12814824 5' - hobo 2889 1 52.74 AAGTGATTGTTGAAAATGCTACAGGTGTGAAAACCATAAAATTCTCATTATTTATAATAAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:2 + chr3L 12729076 5' - opus 7443 2 61.64 ATCTTTATGCCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3L 19938462 5' - roo 353 2 55.48 AAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGATTAAATTGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTC:1 + chr3R 8293546 5' + Stalker2 7325 2 67.81 CAATCCTCGACGTCTACATCACGCCAACCTCGTTTGAATTGTCCTAACTCCAAAAGTTCCGACCACCGGCCCCAACTGAAAAAAAAAGTATTTACCAAAAAAGTATTTACCAATGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 + chr2L 232305 5' + Doc 10 1 65.75 GATTATGGCATACAATTTATAGTTGGCAATAAATAAATGACAATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr3L 13380396 5' + hobo 22 1 70.55 TCCGTCTAGTGCGGAATGCCGACTGTGTGGAAAGAGCTCAGAAAAGACTGCTGGGAATTAATTAATTGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chr3R 5684174 5' - pogo 2049 1 56.85 TTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTAC:1 + chr3L 19951181 5' + Ivk 57 1 56.55 AATGCTATATAGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATC:1 - chr2R 3091674 5' + F-element 290 1 55.56 ATTTATTATTTACTGCTTTCATTTGCAGCTCGCACTTTAATGCTCATTAATAACTGCCCACTTTTATTGGCCGTCCATTAAATTAATTAAATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAA:1 + chr3L 20042378 5' - flea 4984 2 64.38 TAGCTTAAAAACCTCTTCCAAAAGATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTT:1 + chr2L 3151004 5' - blood 7334 1 55.48 TAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGCAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAA:1 - chr2R 12185408 5' + accord 64 2 64.03 TTTGCCGAACTTCTTTAATGCCGCTGGGATCCGTTGATATCGAACCGAAGAAAACAAAGCCTCCGCCAAAATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAAAATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 - chr3R 8965233 5' + HMS-Beagle 6827 2 44.09 GGAATTACGCTTTCTAAACAAAACAAAGTAATATTGTGGAAAAAGAAAGTTCTGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAG:1 - chr2L 8852869 5' + Burdock 63 2 63.01 TCCAGCTCACATTAGCACTGTGTTATCAGCTATCAGTGTGCTAAATAATAAGTCATTGCCGAATGAAAACATTGTAAGTACACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr3L 1324375 5' + 412 7093 2 58.22 CACGCCCACTTTTTAATATGGGCCAAATAACCTGAGTCATCTAACCCGAACTTTCTTTGTCCACAGCTCAAGGAGAAAGAACCCGCGATAAGATGTACGAGCCCATTGGAGGATATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 + chr3R 24851772 5' + blood 47 2 76.03 GGCATCACTCCTCGAATGCGAAAATGTGTGTATAAATTAATTAATTGAATGGGTGCAAGTCCCTCGCCGCGCTCTCCGGCGTAAGATGCAGGGAACGGGGGGGTCCTCTGTCACTGTCAGGCAGGGCGG:1 + chr2L 15934574 5' - springer 7448 2 55.81 ATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCT:1 + chr3L 24291982 5' + 1360 72 1 69.18 GGGTTGAAAGGATTCGAGCGTCGAATCCCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr3R 11550309 5' + F-element 43 1 58.52 TCGATAGTTTCCTGCAGTGCTGCCACCTGTGCTATCGCGCTGCCATCACTATCATTGTTTACATGTACATATGTATGTACATGTACATGTACATACATGTATGTAATTCTTTTGTAGGGTCAGAATTTATTTCGGCCCGAAAATCG:1 + chr3L 24231561 5' + 1360 3185 1 79.45 CGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGA:1 + chr3R 5087073 5' + P-element 70 1 37.67 TGCATAAATTGTAGTCAACATGTTTTCGGTGCTTAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr3R 26405033 5' + hobo 39 1 64.65 ATCTAGCATCAGGCCATACGCCCACGCTTCGCTAAAAGTTTGCTACTACCGAGCAACAGGTTCGCTGCAACCTTCTGGTCGCAACAACATGTTCAAAGTTCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATT:1 + chr3R 2628934 5' + 1360 20 1 65.07 TGAAACAACTTTTACTCACAATGAAATCCACATAAGTTTCACAACCAGAGGTATGCATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 + chr2R 8492725 5' - pogo 2046 1 60.96 AGCTAAACTAAGCAGGGAAACACAATGGTTGGAATTTACTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - 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transib2 2440 1 69.86 GGTTGGCTGCAAACCCAATTTGATATTGTAATATTATTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 - chrX 12458965 5' - pogo 2034 1 71.97 CGCATTTACGGACGTATACTCGGAATATCTACATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAAC:1 + chr3L 21765387 5' + gypsy 33 2 63.01 AGAATGGGGAAAGTTTTCGCAGCCTAAGAGTAGGCTACACAAATGTCACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGGAATCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3R 27056362 5' + jockey 56 1 50.68 TGTCGATCGCAAATTATTAGTTTTTTTTGTTGATAAGTCAACGACGGCATTCTCAGGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGACATAATCTAAGTCTTGTGCATTTTTTGTCTTTGTGTCTTGTTTACTCTCCCTTTTGTG:1 - chr2R 3522225 5' + Cr1a 212 1 61.64 ACATGCCAATTGGACAGCGAAGCCAGCGTCGACGCTGACGTCGCAGCCAGCAGCGAGCAAAACAAGTTTTTGTATTTTTTTTTTT:1 - chrX 3694992 5' - HMS-Beagle2 490 1 71.76 CAGTGGGTACTTTAGATATACTTGGGTGTATAATTTTCTGTAATGACATTGAAAGACACGATTGGTGTCAACGATTTGAAGAATGAAAGTTCTGTTTTTTGTGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2L 8909744 5' - 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chr3R 908420 5' - Cr1a 4005 1 73.97 GAAGCTAAACTAAGCAGGGAAACACAATGGTTGGAATTTACTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chrX 12995450 5' + blood 19 2 72.60 ATCATTTCAATTAATGGCATATATAACGCAAGCAATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAACTCCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 + chr3L 11887186 5' + Doc 54 1 52.74 TCATATATTGATAAATATTGTACATATATGTAAACTATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chrX 3637739 5' - roo 9038 1 62.33 CGAATAAACAATTCAATTATCGAATCAATCAAGGGCTCACTCAATTGCGCTGTCTGGCCGAAACCAAAGCCAATTAAAATTATTTGGCCATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATA:1 + chrX 998098 5' + copia 4903 2 62.33 GATGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTT:1 + chr3R 22275269 5' - flea 4947 1 66.44 TGTGAGAAACCGAAAAGGGAATGATATCAGTTGGACGAACCTTAGGCTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACA:1 - 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roo 324 2 80.82 TTAGAAAAGAATTTGATGGTCGAACAAAGCCGACAATAAACATTCCATTCAAATGAGCCACCAAAATGGCATCAATGTCATATCAATCAAAAACTCAAACTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 22266577 5' + roo 8683 2 72.60 ATAATAGTTCATACTTGCATAATTCCAAGCTGGTAACGAACGCGATTGTAATCGATATACGATACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr3R 29997716 5' - P-element 2829 1 43.36 TTCAAATCAGAAGAATTTTGCTGAATTTTCCGACAAATTGAACTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2L 12766951 5' + hobo 40 1 56.85 TTAATTCAAAAGTATCTTGCAGATACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr2L 19907533 5' + hobo 23 1 64.52 AATCTAGTTAGACCGCATTTTAATTGGGTTTGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCA:1 + chr3L 17710618 5' + I-element 90 1 76.03 ATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGAGCGCTAGATCGTAT:1 - chrY 3648863 5' - Stalker 155 6 78.46 CTGTGAGAGTTCGTCAAAGTCTGAAAGTGACAAAGGAACAGGGAATGAGTGCGTGTAAGAGGTTACATCTCGTAAAGTGTATTTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGGATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGC:1 - chr2L 13763596 5' + Bari1 41 1 58.22 CTTTCATTACATAGCAATACATTAAAAATCCCTATTAAATCTTTAGCTATACATGATTTCGGAATGCGCATAAAGCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTG:1 - chr2L 1871055 5' - mdg3 201 2 54.11 GTTTAATTTGCTAAATTTGGTTGAATAAGTCTTGCATCTGTTAATTGGAAGTTAAGTTAGCAATCTAGTTAGACCGCATTTTAATTGGGTTTGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 + chr3L 17710557 5' + I-element 29 1 65.75 GTCGGCGCTTGAATTAAACGTTTTCTTAATTTAAAATGTTAATAGACAATGCACAAAAAGAATTATTAAGTTTAGTGGAAATGTACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCA:1 + chr3L 23244820 5' - HMS-Beagle 7005 2 60.00 CGTTGCCGGAAGCGGATGCGAGCGGTGGTGCTGGCTACGGTGGTGCTGCGGGCGGTGGTGGAAGCGGCGGATATGGTGGTGGTTTCTCGGCTGGAAAGCATAAGGGGGGGATAAGGTAAAATAGAAAAAAAAAA:1 - chrX 21206512 5' + F-element 4681 1 70.15 GTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAG:1 + chr3L 25232774 5' - accord2 7548 2 71.23 GTGTTACCTGTCCGTCTAGTGCGGAATGCCGACTGTGTGGAAAGAGCTCAGAAAAGACTGCTGGGAATTAATTAATTGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr3R 5684184 5' - pogo 2059 1 56.85 TCAGAGCCGGCGTATGGAGGGCGGCGATTGCCCGACTAAAGAAACCGCCAGGTGACTTGTACATAATTCCAGCAATTTTTTTACCTTCGTACCATCGGCTACAGGAGAGTCACATAAATTGGATGCTGCTTATAAAGGACCTTAT:1 + chr3L 12963745 5' + Bica 4725 1 53.79 ANTTGATTTCATAGCTACTGCGTTTGCTTTCGGCGCTGCTTTCCTCAAATTACATGCCACAACGGCCCTGCCAACCGAAAATTTTCGATGGGCCAAGCAATTGGGGTAAGAAAAAAACCGAGGAAAAAAAAACAATAACAAAATAA:1 - chr3R 8208444 5' + gypsy11 3933 1 50.68 TGCACTTTGGCCTCATTAAATATTTCTACGCCATTTTTCCTTGTTATTTTTGCACTTGTACCAAGGAGAAACATCAAAAAACGCGTGAAAAGTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chr3L 18435394 5' + I-element 30 1 63.70 GAACTGAAAGCACAAGCCCAATTTAAATTCCGGCTTAGAAGAAAAGCTTCAGTTTGAATATTTCAAATGCTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 + chrX 13008679 5' - blood 7350 2 54.89 TGGGTTTTCGCTTTAAATTTTTATGTAAACACGCGCACACCCCGGCATCCTCCATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 + chr2L 19628411 5' + hobo 68 1 63.01 TAGCTGGCAACCCTTTCCCCAAAAACGTCAACAGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2R 8467750 5' - 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chrX 13642159 5' + P-element 22 1 70.34 TACTTACGTGTGCGTGTTAGTATCTGTGTAACGGTGTATCTGTGTTGCTGTGCATCTGTGTACCCGAGTATTCGTGTATCTGTGTGCTTGGCAGTTATAACACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr2L 20269064 5' + hobo 18 1 73.29 GTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAACAGATCGTTG:1 + chr3L 1983437 5' - Transpac 5189 2 54.81 GCCGTCCATACAAAACTTGAGATGTATTTCCCCAGAATCTCTAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTT:1 + chr2R 5800483 5' - HMS-Beagle 6967 2 69.86 ATTTGCTGTTGAACGAAAGTCGGAAGCTCTTATTTTGATTCGTCTTTGAACATGACTATTAAGTATTTTAAATATTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAA:1 + chr3R 4869403 5' + I-element 5169 1 52.74 TTGCAAGGGACTCTATCTGAAACCGGAGTATCTACACGATGGAAAACCGGTGTTCCGGCCTCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:1 + chr2R 12872880 5' + P-element 61 1 43.84 CGTTTTCTATGAACCAGAAAGTTCAAGGCAGTAAAAACAGCCAATGATTTGAGACAAAAGAAGAGTAGTTCTAAAAAAAATTATTATTCTTTAAAGTAATAAATCAGTAGGCGCATATAATATAGTTGTGTGGAAGGTTGATAGGG:1 - chr2L 9499414 5' - Transpac 5227 2 75.34 CTGCAAAAGGAGCAGGAAAGTTGGCAGAAAGTTTCCTGCTTTTGTGTGCAAATATTTAGCACGGAAATTGCACTTGCAACAGGAGAAGTCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 + chr3R 26139382 5' - mdg1 7428 2 63.70 AAAACGAAGAACTGCAATTTCGCAGAATAGAGAAACTATAGTTACCAGTGATTGTCCCACATCTTGTGTTCCAACATTTTTCTGGATAAACACAAGTGCCTTAAATGCTGAGCAGGGCTGTGCATAGTCTCCGTTGCCATCAAAGC:1 - chr2R 7779857 5' + HMS-Beagle 46 2 70.55 TAAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGACGAAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGGTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chr2L 20985781 5' + F-element 86 1 64.38 TGCGAAAATACTTCTAAGTATCCTCTCCCCATCGAAAACAAACTATGGCACTGAGAGAAACATTAAACAACATTATAGATTGCTTTATTCAGCTCGATAGAAACCACATACTCCTAATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGTG:1 - chr3L 15419953 5' + Cr1a 4153 1 67.81 ACAAAGGATTGCAAAATACAAAAAATATGCTGGGAAATGTGCCACACATACAGCAACATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCG:1 + chr3L 19432511 5' + HMS-Beagle 63 2 65.75 GCACATCGATTTTGGGCACAATCAACGTGTACGGCAGGTCTGTCCGGATCATGTCCACCGGAATCGCACATGCAAAGGAGACGGAGGTTTAGTTACCCAGTTATCCTCTAACCGTTCTTGTCGGAGCAAAAGGAGGAGG:1 - chr2L 18126514 5' + R1A1-element 4899 1 74.10 TAATCAATTTCATTTTATAAATACAGCGGTCAAGTAGTAAAATTTTTAATAGCTCACAAGGTCTTAATAAATTGCTGAAATCAGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGTTCT:1 + chr2L 12447387 5' + opus 7149 4 60.27 GCGTGTAAGAGGTTACATCTCGTAAAGTGTATTTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTG:1 - chr2L 13763546 5' + Bari1 46 1 67.33 AGAGTATTTAAACTTTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAA:2 + chr3R 15035048 5' + Stalker2 58 2 55.48 CTTTTTATACGCTTTCAGAGGGCATCTCGATTATATCCAGAAGTTTGCCAGACACATTTGCGACCAAAAGAAGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATA:1 - chr2L 10685896 5' + Quasimodo 46 2 54.48 ACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCTGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 + chr2R 17872489 5' + Tirant 8168 2 63.28 AAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCAT:1 - chr2L 23295906 5' + micropia 4989 2 60.27 ATATCGATAGATATTGGGGAATAATGTGAGAAAAAATTTCAAAATTGTTCATAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGTGGTTTTAGGGCCTTAGAGTGGGCATGGCAAGAAGTTTTTTTGCAAATCGATAGAAATTTAGAAAACAAA:1 - chrX 23078693 5' + Penelope 615 1 67.12 GCGAATAGATTTTAAACCCACACTTACTGCCATTGCAGGAACAGTAACTTTATTTCCGACTTTGATGCTATGCTCATGAGAAAGAAGGAAGAGAATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAAC:1 - chrX 16311235 5' + F-element 4282 1 62.33 TATGTCAACGAGTAACGCCGAGTAAGAGCAATGGTGAACTATCCCAATGATAACATGGATCTGCATTAAGATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1 + chr3R 7364187 5' + Quasimodo 43 2 56.85 TAGACGGGCGAAGAAGGATGTCATGGGAGGGAGTGGCAGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACC:1 - chrX 19992646 5' - copia 171 2 76.03 TTTTGATTTACGACTAGGTTCTTTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 - chr2L 9988159 5' - hobo 2926 1 59.32 AGCGGAGCAGTCGTCTTGGCAAAATTGTTAACACTTTAGCTCGGATCGGATCGTATCGTATCGTATCGTATCGGATCGGATCGTTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATA:1 + chr2L 8699949 5' - P-element 2852 1 60.96 CAAAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGAC:1 + chrX 12003950 5' - P-element 2790 1 19.18 AGCCAGTTATAGTCGACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTT:1 + chr3R 9657668 5' + BS 46 1 52.82 CATTTCTTAATTAGCTAAAGTTCGCTCCGCCATCAATGAAGATTCATATCGGTGTGTGTGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr3L 13568171 5' + hobo 58 1 58.90 AAATATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr2R 11609901 5' - roo 328 2 75.34 CCCTGGATGCTAAATCTGCTGGATTATCCTCTGACTTAACATGATTCCATTCAGTATTTTTTAATTTCCGAATGTCATCCGTTCTTCTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 - chr3R 19446472 5' - I-element 5322 1 64.38 AATGACATATAATAAATTCCTTAATGAGTCTATTCCATTTCAAGGAAATTTATTAAAACTTTCGAGTTTAAGTTTTTTCTGTTTTCGTATATTGTTTACTATAGCTTTCGTTGTCTTATGTTCTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAAT:1 - chr2R 5952438 5' - I-element 4912 1 73.29 AGGAATAAGATGCTTGCAATATTAAACGAATTAAGACTTTTCCAAGAGGATTTCGAAAAATCTTAAGTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chrX 10429763 5' + roo 8713 2 55.86 GCCACAATATTTGTATTAAACATTGGGGGAAACCGAAACGACGAACTCGTGTATTGTTATGGTGTAAATCGGTTGGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr2L 21189702 5' - hobo 2893 1 54.11 GTCTGTCCGTCCGTATGAACGTCGTGATCTCAGGAACTGTACAGGCTAGAAGGTTGACATTAAGAACACAGTTTACAGGGCCATAAAGGCAGCGCAATTTTGTTAGTGTGAGTGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGAT:1 + chr2R 7048628 5' - INE-1 510 1 66.90 TGAGAAAATCTTTCGTTTCCATTTTTGATTAATTTTTGTAGGTGCGAAACTAATAAGGGTATATAAAACTCATTGAAAATGATGTAAGAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATAAAATGTACCTATATTCTTGATCAGGATCAAT:1 - chr2R 928967 5' + INE-1 83 1 75.34 ACTAGCGCGTCGATCTTATGCGCATGCCCCCGATTCGCGGCGATCCAAAGCGATCCAAGCGGATCCGAACGATCCAAGCCGATCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 - chr2L 8700079 5' + P-element 30 1 57.86 TCATGACCAAGCAGTAAGTGGCCGATTGGACCCGAATCGAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGT:1 - chr3R 10741180 5' + 1360 3372 1 45.21 ATTTGCCCCGATTCCCCTCTAATGTCGCAGTCATGTGGCAGCGACCTAAGTGCCCATTACACACGGCAGCCCCGTATCCATCATATCAAAACGCTTCCTATCCCTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 5767323 5' + roo 8681 2 73.97 TGTCGCAGCTAGCGCTTTAAAAAACTTTCCCGCCGCAGGAAAGAGAGCACAAAAAATGTATATTTATATACATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCATCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTA:1 + chr3R 12952847 5' - micropia 404 2 56.16 TAAGCTATGGTATTATAACCAGAGTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGGGGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 - chr3R 13198278 5' + Doc 62 1 60.58 TTTAAACTTTGAACTTCTGGTCTAAAAGGCGTTCTTCTATACGATGAGTATAGCGTATACTTGTATGAACAAGAAAAAGACTACATCATACAGCTTCCGAAGAATTATATTATTATTATGGTTGTTGTTGTTATTATTATTGTTGT:1 + chrX 20564479 5' - mdg1 20 5 73.29 ACACAGGCTGTGCGTTAATTTCAGACCCCCTTATGTAACCCCTTTTTTCGGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACA:1 - chr3R 902635 5' - R1A1-element 5292 1 55.48 CCTATGTCATACAGCCTGGCGTGGAGCACTTGTGAATCCCGACTGCCCTGCATTCTTAGTCACCCACGTCACGTCCTGTTGCAACAACACATCGTATCTATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 + chr3L 9317421 5' - HMS-Beagle 232 2 74.31 CAACATGATGACATTCACTCGAATAATGGGGGACTCTATTGCCCATCCTACTCTTATTGTTCTATCTCGCTCTGACAACGACTTCCGGCATGATGCAACCGTGCGTATGCTATAGTCGAGTACAACGACTATCAGATACCCGTTAC:1 + chr2L 6589158 5' - INE-1 551 1 70.55 TACTGGTGGAAATCGATACGCATTTACGGACGTATACTCGGAATATCTACATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACT:1 + chr3L 21765369 5' + gypsy 7002 2 74.66 ATAGACAACCAACCTTCGCCAACTTAAACGCAACAATGATTTTGAAAAACATTCACAGTTTTTCTAGGTTTTCTGCTCAAGCCAGACTCATTGCAGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTCATTTTCATTTAT:1 + chr3R 27443115 5' - 3S18 317 2 68.31 TTCTTAAATTAAATGTCAAAAATTTCCCAAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTG:1 + chr3R 19144378 5' + Juan 45 1 47.26 CTCTCGGATTTTATGTGTATCTGCATTCACAGCACTTACACTGTAACCAATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCAT:1 + chr2L 1870950 5' + mdg3 5325 2 65.75 GGTCAAAGTTATAGCACTTCAGTGCCTGGGGGAATCTGCTTGGTTCTAAATCATTTTCTTAAGTTTTCCGTCAGTTTTTAAAGCTTTGCCAGTTTAAATGCGATTTATTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATA:1 - chr3R 19144521 5' - Juan 4198 1 65.07 AACTGAAAACTAACAGTTACACGCGAAAAAGCGGAGTAAAATCTCAAATATTCAAGCCACACACACACTACAAAGTCTTATACAGCAATTAAAATTAATCATAGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chrX 6213663 5' - roo 393 1 75.34 GAATGCACGTCAATATTTGACGCCTGAGGCCGCTCCACCTCCTCCTCGTCGCTGACCGTTAGGCAAACAATGAACAATTCAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 20327560 5' - roo 9052 2 68.49 GGTAAAACACTTTTTGGCCCTGTGCGAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 + chr2L 5656536 5' + hobo 55 1 52.74 TTAAAGATTGCAATGTGCATGCTGAACAACTAAAGTACCTTTAAAATCCCATTACCCTATTTGTGTACACAAACATATGAGTGCGGAATAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAA:1 + chr2L 2722319 5' - flea 4984 2 67.12 TTTAAAGCCGAGATGATCACTGAGAGCGGAGAGAGGAGTGGGAAGGGGAGGAGCAGATGGGAAACGTAAGCGAAGTCGGAGCTTAATGGTTTCCATTGTTTGACGAGCCCCCATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 - chr3R 4677142 5' - flea 243 2 67.12 TGTCATTTTGCTTTTCTAATTTCAGTTCCATTCTTTCAGTTATCCTTTCGCCTGCGCCATTGGCAACTTTCGTTTTTTCCTTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr3R 7655541 5' + 412 40 2 54.48 CATGTCAGTGGATTCATTGCCCGAGGATACCTCAGAAGCTGACGCATCTGGCAAGCATAACCATGGCAAAAAGTAAATTTACCAAGCGATTATATCGCTTCCCATGTATGGAAATTTAAAATGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTC:1 + chr3R 20908061 5' - INE-1 580 1 68.49 ATTGTCTGCGTAAATGCTATATAGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCG:1 - chr2R 3091686 5' + F-element 291 1 51.08 CGTAAACACGTACAAGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 + chr3R 12547863 5' + hobo 72 1 65.97 CTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTAC:1 + chr3L 19951180 5' + Ivk 57 1 56.16 TTTGAATTGTCCTAACTCCAAAAGCTCCGACCACCGGCCCCAACTGAAAAAAAAAGTATTTACCAAAAAAGTATTTACCAATGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 + chr2L 232337 5' + Doc 19 1 50.41 TATTATATGAATTCACAGAGAATTACAAATATGTTTTTTAAAAGTAATCTTTTATGATTTTAATGGTCGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chr2L 19907687 5' - hobo 2918 1 69.86 CTGATTTGAAAAACGAAAAAGATTTATTGGGTTCTCACATTTCTGTTACATCCTCAGGTAAGTGAATCTCTAGTTCGAACAAATGAAGAATAATAACTTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 10800639 5' - roo 9049 2 67.12 AGAGCTCAAAACAGAGAGACAAAGGATTGCAAAATACAAAAAATATGCTGGGAAATGTGCCACACATACAGCAACATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACG:1 + chr3L 19432493 5' + HMS-Beagle 6841 2 56.16 GTTATGTTTGAGCTCAATTAAATCATAGTATAGTACTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTG:1 - chrX 9874198 5' - BS 5003 1 73.97 TTTTCGCTTTAAATTTTTATGTAAACACGCGCACACCCCGGCATCCTCCATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 + chr2L 19628415 5' + hobo 72 1 65.75 GTCCAGCGAGAGCCACGAATTATGGCTTCATTCCCACAGAGAAATCCCAAGTGTTAGTCCAAGTCGTTTGCATTTATTCTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGAGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2L 20327750 5' + roo 13 2 74.66 AAAAAGTCAGCGGCGGGAGGACAGCCGTGATCGGTGGGAAATCACAAGGGCAGTACCGCAGGATTTTGCAAAGGTGGCCCCTTAGCGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCCAGATAGG:1 - chr3L 23679298 5' + roo 228 2 62.90 ATTTCAATAGAAATTTATCGTTGGCGTGGTAATAAATTAGTAAATATATAGACGCATATACAATAAAACACGAAATCAAGGAGTAATCAGTTTTCAATTTATATCATTACGCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 7136523 5' - roo 396 1 74.66 ATGAAAAAGTCAGCTTAAAAAATATATGTAAATGCGTCTGCATTAAATTATGATAGATTACCAATAAATGTGACAATAATCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACA:1 + chr3L 6248258 5' - roo 8766 2 52.82 CTCGAAATGTGAGACTCAGAGCGGGGCATTACAAAAAGTGCCGGAAAGAGAGACTTCTGGTCTATAAGGTCGGTTCGGATGGGGGAAGTATGTACATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:1 + chr2L 9228629 5' - Burdock 230 2 65.75 CCACAGAAATTCGTTGCACATTCGAGGATTCTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACACGT:1 - chr2L 11043591 5' - roo 398 1 56.72 GCTTCCCATCATCAGCGGCGGAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGCATACACTTAAATTCAGTG:1 - chrX 19744519 5' + P-element 49 1 52.05 CATCAGTTCGGTCAATGTAAACTGGGGAGCCTTAAGTTACTTTGTAGAACGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr2L 20067986 5' + roo 8736 2 67.12 AATCCCTACCAGATTCTGCCCATCTACACAGGTGATCAGATCAAGCTCTATAAGGAGCGGAAAATCGGTGAGCTACCGCCGCACATCTTTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATA:1 - chr2L 15052092 5' - hobo 2500 1 64.38 GTCTGCTTACAGTTATTTATTGTTCATAATTATCTAAAAATAATCAAGATTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTT:1 - chr3R 17401781 5' + Juan 73 1 67.81 TGTGCGTTAATTTCAGACCCCCTTATGTAACCCCTTTTTTCGGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGC:1 - chr3R 902627 5' - R1A1-element 5284 1 52.05 TTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAA:2 + chr3R 21276558 5' + BS 5082 1 74.66 GACTAGAATGCGGTGTGACGACGACCGTCGAGTGTTTTTGGCGTTTTTGAGGAGGGAGGGAGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1 + chr3R 26845521 5' - mdg1 360 2 57.53 TTTATCTAAGTAATATTGTAGGGGGTTTGACTGAAGGATTCGTGTATAGTATTATTTTGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr3R 18514281 5' + pogo 16 1 68.49 GTTGCTAGCTGAAACCAAAAAGTTTTGGCTGTTAGTGAAAAGTTACTGCTATCTTTTTGCTCTGTAAAAAGCGTGTCTTGTGTCGTATTTCTGTCGTTAGGCAAACATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr2L 21687546 5' - pogo 2089 1 78.08 CAATTAATTGTTATTAGACCGGCCCCTAATTTAAGTTAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATAT:2 + chr2R 10760426 5' - Tabor 7240 2 75.34 GAGAAGACAAAAAGGACTTGGCGTGGTCGAAAGGGACAGTGGAGTCAGTGGTCGGCATAGGTGGTCCCAGGCCATGATTGTTGGTTAAGGTCTTGAGCCCGGG:1 + chr2R 2016926 5' - I-element 159 1 71.84 GGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 - chr2R 10666936 5' + hobo 60 1 57.53 ATGCCTTCCAGGTGGCCCTCAGTGGGTATATGTTCTACGAGGTGAGTTCGAATCTAGAGATTAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTA:1 + chr3R 22572545 5' - HMS-Beagle 6987 2 56.85 AAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 - chr3R 31663330 5' + jockey 76 1 62.33 GTTTTCGAATTTTAGTGATTCAATAAAAAATACAAGACTACCGGCATAGGCTATAAACCTTGAAAACAACAAAAAAAAAAACGTACAAA:1 - chr3L 17806486 5' - Tc1 1468 1 75.28 GCAAAAATACGTCACTAAATACCTGTTACATACTTGGCAACGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 + chr2L 21715756 5' + pogo 77 1 73.97 GGGAAAGCACACACCAAACGGAAAAACACGAGTTTGCTTCCAGCCCGAAAGTAAATAAAATAATATCGGTAGTATCATAAATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCT:1 + chrX 6863550 5' + Juan 4124 1 56.85 ATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAAT:1 - chr3L 20910100 5' + F-element 71 1 59.59 CGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCTGTTCTGCAACTGAGAGCCGAG:1 + chr3L 25232773 5' - accord2 7600 2 52.63 CCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTT:1 - chr3R 4352128 5' + Doc 72 1 69.86 GTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 - chrX 22715143 5' - opus 472 2 59.13 TGGCTGGCCAACGCGGCGTATGCTTGATGAGCGACCAAGTAGCGGCACGCCCGGGGGTATGCAACACCCACAGCCAATATTTGCCACACTCCTCCTGCGGTACTCGCATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1 - chr3R 23968717 5' - HMS-Beagle 231 2 72.60 AATGGTCGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACCAAA:1 - chr2L 19907626 5' - hobo 2857 1 72.60 AAAACCCACTCAATTAATTCAAGAAAAATAATGCATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAA:1 + chrY 253844 5' + 17.6 87 2 77.40 AATGCCAGTTATCAAATCACGCTCACGGATCCAACGGCTGATTCATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACC:1 + chr2L 20264878 5' + roo 198 2 70.55 GCACAAGCTCAATATTGAAACGTAGAAAAACTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTTCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAAT:1 + chr3L 11890792 5' - Doc 4373 1 78.77 CCATTTAATTTGGTAATCTAGCTAAAAGTCAAAGAATTTTCCCTATTATAATTGAAATGCTTAACTTAAACATTCGATTGTGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3R 14174663 5' + 297 6617 2 61.64 GTATATTAGTGTAGATATGTATGCTTCCTAAATCACGCTCTGCCCGACAAAACAGGAAAGAAATATAACAAAAACGAAGATCTTGAAACGGTAAATGAAGACAGCGCAACTGATTCTGCTAAGCCCCCACCTATCATTCTGTCT:1 + chr3L 24400102 5' + G4 163 1 72.22 AAATTAAAAATGCGGTCGTCGGAATGATGCTACGCATAAATGAAATAAATTCAAAAGCATAACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAG:1 + chr3R 13231763 5' + F-element 99 1 58.22 GAACGCGAATTCTTCAGGAGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGGCGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGCTG:1 + chr2L 951301 5' + F-element 47 1 52.31 CCCAGGATCCTGATTTATTTTAAATATTGATGACGGCACTGGTCAACAACAAGATCCGAGATCTTGTGCCACTAACAAGGGAGATTGACCAAGGCATGATTCCTGCGCAACTACTTGCAATGCGTTGGAATGAGCATCAGAAGCTA:1 + chr2R 3760463 5' - G3 300 1 79.45 AATTCTGTTTTCAAAGTGGCATAATGTATTAGTTCTCTTGAGTTCCTAATGCTTACCGCTTACATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATG:1 + chr3L 16643146 5' + FB 58 1 58.22 AAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chr2R 10189258 5' + Doc 64 1 60.96 CGGAACGCATCGTATTCATCTTTTACAGCCCGCATCCTTGGCAACCTTTGTGCATTATCTTCCGACTCTCATCTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:2 - chrX 10501375 5' + F-element 61 1 51.37 CTTGTCCGTTTTGTGGTTAACTTGTTTCGGTTTCCTTTCTTTTTGATTGTCTAACATGTGTTCGGTGCTCCCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2R 17341204 5' - hobo 2893 1 52.82 ATTCCCAGTGCCGTTTCGTCTCCGATGGTTAATGAGTTATGTCAAAGGAAAACAATGTTTGTTACTTCATTTATATGCCATTATTATTTGTATAATATTCGTATATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 + chr2R 10915600 5' + F-element 31 1 60.96 ACACAAACATTGACTCATACCCATGGCATTAACCATTTACTTATCATAATCGGGGCTGCCTTATTTCAACGCTTTTACACGTTGTTGATGTATTACTATATACATAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAT:1 + chr3R 4570190 5' + Juan 19 1 71.92 GGTACTAGCGCGTCGATCTTATGCGCATGCCCCCGATTCGCGGCGATCCAAAGCGATCCAAGCGGATCCGAACGATCCAAGCCGATCCGAACCATGATGCAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 - chr2L 8700082 5' + P-element 17 1 64.62 AAGCCACACACACACTACAAAGTCTTATACAGCAATTAAAATTAATCATAGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 6213610 5' - roo 9020 2 59.69 ATATTTACATGATTGTATAATCCATCAAAACACATTTCTGTTGTTATTTTGTAGCTTTTCTTTTCATACTCAGTTTGTCATAACTCGATTAGATGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2R 15529828 5' + roo 8691 2 67.81 ACTGTCAAAATCCAAATGCCATAAATCTGCTAACTCGAGTGGCTAAATTATAGAGTACGCTAGCATTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chr2R 12642626 5' - pogo 2048 1 57.53 AAAAATTTAATTGAATTTGCACTGCTTTTTTGAGTTCACTTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGT:1 - chr3L 780748 5' + Burdock 77 2 72.60 AAAAAGAAGCATTCAAATGTATACATTTAAATGTATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAACACC:1 - chr2L 13156559 5' + Max-element 67 2 70.73 GAATTTGCTGTTACGACTTGGACAAGCTCCGATGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAA:1 + chr3R 22275239 5' - flea 4977 2 54.11 ATATGGAAGTCCACCCACCAGACTCATTTTCATCTTCATGTTTTATAGGAAATCAACTCGACAATTACTTGGCGAAAAGTTCATTACCATTTTAAAAGTTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chr3L 13015851 5' + hobo 18 1 69.66 CTTAATTTAAAATGTTAATAGACAATGCACAAAAAGAATTATTAAGTTTAGTGGAAATGTACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAG:1 + chr3L 23244844 5' - HMS-Beagle 184 2 61.64 GACTGAAGGATTCGTGTATAGTATTATTTTGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGAATTGCTTGAGTTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr3R 18514309 5' + pogo 43 1 55.17 GAAAAACAATGCCGCACCGAGTGCAATACCAACGTGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATT:1 - chr3R 24301890 5' - Tabor 400 2 74.66 GCATTTTGTATATTTGCAATAAACGTTGTTATGCCCACTTGTGATGCGCCTTTAATTTTCAATTGGCTTAAGCTGGTTTCAGATCTAATCTAATATCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 + chrX 16325085 5' - Transpac 288 2 69.18 TAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACGTCCGCCTATGAA:1 - chr2R 12185412 5' + accord 30 2 50.46 AAATGCTTTCAACTCAAAAGGCAATCTTAAAATTCGCGGAAACTAACCATAAGCTATTTAGTTACCCAAATGGACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 + chr3L 5425436 5' - blood 331 2 53.42 ACTACGCTCACTGCAATCTGGCCAAGTAATTAATGGTTTATATACACACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2L 16360539 5' - hobo 2922 1 68.46 ATCGATGTGAGTACGTATGGAAAACTGATATGGAATCACCCGAACATAACCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 + chr2L 12696131 5' + pogo 64 1 69.93 TCCAAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGGATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 + chrX 12003949 5' - P-element 2792 1 21.38 ATAAAACTATGAAAAAATTTCGAGAACTGTTCAGAAGAGCGTTAGAGTGGGCGTGGAAACATGGGGTTTGTCTCTATAATCTGTATGCTGAATCTCAACATTCTAGCTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGGC:1 + chr2R 2244987 5' - INE-1 129 1 55.48 TGAGGGGAGTTTAAAGTTATTCTCGTGTTAAGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1 + chr3L 3540081 5' - mdg3 5475 2 69.86 GAGCGAATGAGCGAGAGTTTTAAAAATAATCGTGACCAGTCACAGTTTAGCTAACAGTGTCAACTCAGCAGCATATGTTGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 + chr2R 11691181 5' - P-element 2845 1 56.85 CTTCGATTCCAACGACAAGGACATTTACATAATTGCATTCCGTGGTGCATAATTCTGCCAAGGGACACGCCCAGTTTTAAACCTAGATAAGAAAAAATTAAACCATCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 - chr3R 7655714 5' - 412 7530 2 73.97 ATGAGGGAAAACAAACAAATGGGCGAATGCGAATGTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 + chr3L 1983403 5' - Transpac 5212 2 73.97 AATATTCCACATTTTCCCGCTGCCCGGTGAAGTATGCAACACTTTTTCGCCACCTCCTTTCGTTTCCTTGTGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chrX 9949600 5' + hobo 49 1 53.42 TTATATAGCTAATTAAACAAACATTTTGTGCTGATAAAACGCTTTAATTAATGCTCTTACAGCACTCGAATAACCTAGCAGAAGTTCGCATTAAATCTACCCCGGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3L 6541942 5' + hobo 17 1 71.92 GCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr3R 23565251 5' + jockey 74 1 63.01 TTGCCGTTTCGATAAGAACTTCAATATTGTCGGAATGGAATATATATATTTCATAAATATTAAATTGAAAGGAAATGACTGGAAATCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chrX 10344899 5' + roo 35 2 61.64 CNCAGATAGGGATGGAATCGGCCCTTCCACATTCATCCTTCGCCTACCATGTCCTGTTGACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chrX 16994995 5' + jockey 35 1 65.07 CATGGGTTTTAATTCATATGATTAAATAAAGTAATGTGCAGTAAACTTTTAGAATTAATATGACATATGATTAAGCCAGAGCACCATATATCTCCACTTTAATGACAAAACTACAACTTATATTACAGTGTGTAAACAGTGTCTTG:1 - chr2L 13616074 5' + S-element 1707 1 26.03 CTAACTAAAGATGAAGCCTTTGCGATGGAACGGGCTGTGGATGCGTCTGGTATGGTGTCTATACATCACCTCCAAGTCGTGCCCTGCTCACCTGCGCTCTCTTTCTCGTATTCCTTCTCTGCCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCA:1 - chr2L 154162 5' + blood 7178 2 57.53 CTGCATGGAGTTTTATTGTCTGCGTAAATGCTATATAGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCA:1 - chr2R 3091700 5' + F-element 284 1 52.74 GATAAATATTGTACATATATGTAAACTATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:2 + chrX 3637748 5' - roo 9029 1 56.16 ACGCGTCGAGTGCTTGGAAAAAATTTAAAATATAACCAGGCAGCTTGACAATCCACGCGAAAAACTGGCAAACAAAATATGTTTCAGCCAAGCGTACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGT:1 - chr2R 18927900 5' - 3S18 313 2 66.44 AGTGCGTTTTCCCTTAACAAACCTTAAGTTGAAGACCCAATTTAATTGCTACGTAAATTGCGCAGCTGCTGCGAAGTTGCAAATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chrX 22577959 5' + 297 29 2 63.01 CTGACAGAGAGCTAGAGTCTAAAGAGACTGAGAGCGGCTTCTTAGCGGTTTCTTTATCGCCCAATATCAATCAAGTCCACAGAAATTCGTTGCACATTCGAGGATTCTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2L 11043667 5' - roo 395 1 76.03 ATTGCGGCTGGGCGGGAAAACCCGTTGCCGCCTTCCAATCGCGCTTCCAGTCGCTCAATAAATTTAATAATATACTCGTAATTATATTCTCATACGTGTGCCATTTAACTCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 - chrX 9865066 5' - hobo 2929 1 73.97 CGCAGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGTTTTAAATAG:1 - chr2R 18266081 5' - roo 345 2 70.73 GTAATAAATATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr2R 11609896 5' - roo 8997 2 71.92 TACGTAACGGGTGACAATTTGGTTCACTGCTGGCGTTTCTCGTGCATAAATTCATTTTGGGTACATTGAGATGTGCTTATTAGAGAACACACATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACT:1 + chrX 19766687 5' + copia 4898 2 65.75 CGAACGCTGGTTCACATAGCTCATTGAATTTGGTACAGTTTCCGATACTTGATCCTTGGTTCGAACTAGCCTTAAATATTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATAAATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGTTA:1 + chr2R 10322723 5' - hopper 1325 1 53.42 AGTATATGATTTCAACGACCCGAATTTGAGCCAATTAATCTTACGCCCAAATCGCGTGCACTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 - chr3L 9994003 5' - hobo 2890 1 53.38 GCATACCATTAGAATACTTCTAATCTACATTTGAGGATTGTCAATCTGATATTAATAAGCTTGAAATGGCTTGTGTTCCGATAATATCTTATAATGTAACATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2R 8374977 5' + roo 17 2 71.23 AATTTGGCAGATCTTTTCTAGATTTTACCAAACCTATAATCTTTGATAATGTAAATCTCTGATGTACATCAGTACCTTTTAAATTTGTTTAATTTAATTGTGTTTGATAATCTTACATATTGTACATATTGAATATACATATACAT:1 + chr2R 21102634 5' - Stalker2 258 2 41.10 ACATAACTGCGAAAAATATATGTCTATATAATGAAAATATTTTGGTCGGTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAACTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGAAACTGATTTTCTTT:1 - chr2R 8375143 5' - roo 9032 1 56.85 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCAGGGATCCCGTTATTTCCCTTTTTGCGCACGGCCCGCCCGGGTAC:1 - chr3R 20617764 5' - gypsy8 293 1 69.18 TAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATA:1 + chrX 21087581 5' + mdg3 5295 2 54.11 CTTTATGCCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 19938464 5' - roo 9015 2 56.85 GCTTGTAACTTCCGATGTTGACAATATATCGTAGTTCGTAATAGTGGTAAAATGCAACCGCGAATCAATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGT:1 - chr3R 4446907 5' - Quasimodo 6964 2 57.53 CAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGCGAGCGTGATATAAGATCACC:1 - chr2R 18056870 5' + blood 85 2 74.66 ATTAGGATTACGAACAAACAATCGGTACCTTATCGAAAATGGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCG:1 + chr2L 3151028 5' - blood 302 2 71.33 ACAAGCTGGAATTTCACAAATTTCATTTCAGGCCATTTCACAGCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCG:1 + chrX 17690420 5' + Doc 290 1 69.18 TGGCAATGCCATTCTGTTCTCTCAGCTATTATAAGACTAGTCGTTCTGTATAAGAGTGCGCAAAAGTCTCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr3R 9158330 5' - P-element 2837 1 51.37 GATGAGACATCACCTGTCCGTGAACAAGAGATCCAAACTGGTTGGCAGATGGGAGAAAGAAGTCCCCGAGCAATTCCCCTAATGAAATGGAATGGATTCGACAAAAGGAGGACCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACA:1 + chr3L 16972987 5' + R1A1-element 376 1 63.01 GAAAAAATCTTTTAAGGAGAAAAGTGTTGCATAAACAAGAGCGCCCACAAAGAACTTATGTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAA:1 - chr2R 18528792 5' - jockey 4926 1 61.64 TATAGAAAAGTGGCAGGGAGTATCAGTATTTGTGTCGCCGCGTTTTTACCGTTTGATAACCTAGAAAAGACGCCTAGGTAGGTATGAGTGTATGCAAGAGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - chr2R 14486620 5' + 297 18 2 72.60 AAATCGCTTTAGGTGTAGGAGAAAACTGGCAGCGAATGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGC:1 - chr3L 21043116 5' + Quasimodo 76 2 74.66 GGCCAACAAAATCGCAAGGCTCTCAACTGAATTCAACATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 + chrX 3743777 5' + Tirant 8172 2 70.00 CATTCAGCTTTAACGATCGCAATTTGCTTGCTCACGGTAGGTTAAATATTTAATTATGAAATAACATATATTCTATATAGCATCATTCAATTTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chr2L 12447558 5' - opus 484 2 75.00 TTTTGCTTTTATTTTTTCTAGATTTCTTCGACCAGATAGGCTCAGCCAGAGAATGGGTCAAACAGTGGGATTCTAGAAAACCTAGGGCCATAATTCCCGACACGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGTACTCTACGTCCAC:1 - chr2R 11379919 5' - hobo 2922 1 73.97 TTGGAATGAAAGTTGGCTTATAACTGGTTTTAATGTCCCACAGAAGTTTGTAACGAACCACACTCCAAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:2 + chrX 12003886 5' - P-element 2854 1 64.38 GGTTCGCCTAATTGGGATTGGTAAGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGCATTAGCATTACCGGGGACCACCACGAGGAGGTTTTGAGTCGACTTGAGTAAAGGAGAGACTTGTGAGTTACAGAGTAAAATTCCCCTTC:1 + chr3R 1546406 5' - R2-element 77 1 60.27 TTAAAGTAATTTGTATATAATTTCGATCTGCATATCGTCTGTTTGTTCGTCCGTGCGTTATTACGCCAACCAGTCACTTTTAAAGCAATCTGCATTAAAAATTTAGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 - chr3R 4352178 5' + Doc 18 1 78.87 GACAATTTCCTGCGCAGTGAGTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1 - chr3L 3540271 5' + mdg3 5262 1 77.40 CCTCAGAAGCTGACGCATCTGGCAAGCATAACCATGGCAAAAAGTAAATTTACCAAGCGATTATATCGCTTCCCATGTATGGAAATTTAAAATGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAG:1 + chr3R 20908090 5' - INE-1 577 1 59.17 GGGTGGGGGTTGCCGCTGTGGAGAGTGCAAAGTGCATGAAACTGAAACGAATTGCAATCGAAAACGGAAACGGGGTCAATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGATATGTTAGAATACACATGGC:1 - chr3L 1983571 5' + Transpac 4958 2 58.22 TTGGCCCTGTGCGAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACCTCGCGGG:1 + chr2L 5656549 5' + hobo 68 1 60.27 AGGTTTTGCCCCTTTGGTAATGACGTTGGAGTTGGGAGATATTACTGCCTTTCGGCCTGGAATTCTGTATTTGCGATTTGGGATAGGCTTGGGATGGCAACCGGGATTGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCG:1 - chr3L 6289221 5' - Doc 4467 1 75.34 AAACAAACATTTTGTGCTGATAAAACGCTTTAATTAATGCTCTTACAGCACTCGAATAACCTAGCAGAAGTTCGCATTAAATCTACCCCGGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3L 6541956 5' + hobo 31 1 63.70 AGAAATTATTGCCATAATTTGCCAACATTTATTCATTTATATATGTATTCATGGTCTAATAATAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3L 16523135 5' + jockey 15 1 80.14 TTTTCCTTTCGCTGCCAACTTTATTTTTATTCCCTTTCCAACAAATATATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAA:1 - chr2L 8615427 5' + 17.6 67 2 69.86 GTTGCGGTTATTGGAGATGTGTATTGTGGATTCAGTAAACTCGACTTTGATTTCGCTATCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 - chr3L 1728549 5' - blood 7353 2 51.26 TAACAATACAAATATTTCGATATAAAAAGCGAAAGTATTTTGCTTGAACTCGCTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2R 10189202 5' + Doc 8 1 76.71 AACATCAAAAACGACATAGGATAATAGGATAATATAGGACCATAACTAAAATCAATTGCAATCTTGAGAATTTAATCAAAAAGAAGGAAAAAATGCGAAGGTAACATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chr3L 18421467 5' + hobo 17 1 69.86 CCAATTTAAATTCCGGCTTAGTAGAAAAGCTTCAGTTTGAATATTTCAAATGCTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGGTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTT:1 + chrX 13008696 5' - blood 7322 1 65.28 CGTCCTTGCAGGACCTCATTTCAATTGCAGATTCCATTAGCTGCAATTTGCTAGTGCATCGCACCCGGAGCAACTGCAACCGTAGGCGGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:1 + chr2R 21105679 5' + Stalker2 7283 2 61.64 AGAAAATGGAAAACACAAATCCTGTGTTACCTGTCCGTCTAGTGCGGAATGCCGACTGTGTGGAAAGAGCTCAGAAAAGACTGCTGGGAATTAATTAATTGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr3R 5684207 5' - pogo 2082 1 72.60 TCATGCTGGACAACATAATTTTGTATTCTTTTATATTTTTTTAAATATTCTTATTTCTAATGTGCATTGGATTCTTGGCAATACTCGAGGCGCTCAGATTGTCGCATAGTAGTTTCAATGGCCCCTTGTCGAACCATCCCATCTCT:1 - chr2L 22318996 5' + frogger 474 1 55.48 TTTTAATTTTAATATTTTTATTACAGGTTAGGATATTTGTGTGTGCTGGCTTCCGCAATCACCTTGACAATAACGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGCTTAATATGAAGTAGCCCGTCTT:1 + chr3L 21291773 5' - gypsy4 6743 2 55.48 AAAGTTCATTGTGTATTTTGATAGCTGTGAAAATAAGATACAATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGC:1 + chrX 18561074 5' - copia 5046 2 71.23 CCTATGTTTATTCGGGTAGGTATGCATGTATTCACAAAACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAA:1 + chr3R 24760550 5' - pogo 2021 1 73.97 CAACATTCAATTCAACTCAATTCGAACATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chr2L 8909861 5' + roo 8754 2 79.45 GATGACCTTTGAAGTGGGTAGACAGTGTGATAGACACATATGTACATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTGTTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTT:1 + chr3R 22275269 5' - flea 4947 1 65.07 ATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAAACAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGTGC:1 + chr3R 23565263 5' + jockey 80 1 65.71 GGATTACGGTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGTGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr2R 20931609 5' + blood 7050 2 54.48 TATGCAGTAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCA:1 - chr3L 15374698 5' - 3S18 6022 2 74.66 GTGTAACGTAAACACGTACAAGACGACCCACAAACTCAGGGCTTTACGACTTACGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 + chr3R 12547857 5' + hobo 68 1 62.33 ATGTGGGGTATCGTTTAAAATCATTCGAAAAGTAAACCAAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGT:1 + chr2R 7343258 5' + flea 4833 1 73.29 TTCGCCTACCATGTCCTGTTGACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chrX 16995033 5' + jockey 74 1 61.64 AGCGGTGTATGAACCCCAAAACCCCTGGGGTTCGCTGCCCCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTA:1 + chr2L 17574372 5' - hopper 1338 1 70.55 TTTAGCCAACCACTGATGATGGCCAAAAGGTTGTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGG:1 - chr2R 10760476 5' + Tabor 89 2 80.14 ATTACTAATCATCTATTAATCCCACCCTAAAAATCGGATTATATAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAA:1 - chrX 17270363 5' + 3S18 5843 2 69.86 AATTAATGTGTTTTAAAGATGTACACGTGCACATCATGTAAAATTTATACGCGAATTAAAAAGAGTTTTCCTCTAGCTGGAGCTCCACAAAAAATATTCAACAGGTTTTACGACACTTAAGCGCGTTGGGCGCCAATTAAACCAAA:1 + chr2R 16604909 5' - gypsy10 353 1 69.18 GCAGGATGTTTAGATAAATTGCGCCTGCAGAGATTTACAAATTACGCCCGAGGCGGCGAATGGCGAAAATGGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:2 + chr2R 18467113 5' + roo 49 2 50.00 ATAATACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGCATAAAACACAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 + chr2L 12861727 5' + jockey 85 1 67.83 ACATAGATTGGTAGCAAAAACAATGCCCTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTGTTTTTTGTCACCCTACT:1 + chr3L 17142839 5' - hobo 2872 1 71.90 GAGAGACAAGTAGAGTGCGCCGCAAAGGGAAAGAAGAGCGAGCATGCTCTCATTTAGTTAGAAAAACACTTTTAAAAAGTGCACCGCGCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 + chrX 7930655 5' + P-element 37 1 60.27 GTTTTGCACTTTGCGACTGCCGCTTGCATTAATATTTATATTTATATTTCCATTAGTGCGTATTTTTATCTTGGCCCGACATCTGATAGCCCGAGCTTTATTTATTTATTTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 - chr3L 2490443 5' + F-element 27 1 78.08 TAGAAGAGACTCTCTTTTTATTTCCCATTGCGTGTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 + chr3R 9158131 5' - P-element 2799 1 25.34 AAAACAAATGGGATTAGTTAGACTTTTAAGTTGCCGTGCCAGATGTTTATAGCTGAAATAGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTCCTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 + chr2R 15190389 5' - pogo 2042 1 58.90 TAGATGTGGGTTCTATGCACGCAAATGTTAGGAAGCCGTCCATACAAAACTTGAGATGTATTTCCCCAGAATCTCTAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTT:1 + chr2R 5800449 5' - HMS-Beagle 7001 2 60.96 CAAACTTATGGAATTACGCTTTCTAAACAAAACAAAGTAATATTGTGGAAAAAGAAAGTTCTGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:1 - chr2L 8852878 5' + Burdock 6190 2 56.85 GTGTTACTCATACGCAGTGTTGTCATTTTATATTTAATAAGGGCATATATTCATTTGAATAAATGTTAACTGCCAAGTTATCAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 + chr3L 10141068 5' + F-element 49 1 53.42 TCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3L 19938475 5' - roo 340 2 64.38 ATCGGGGGTTCTTCGATTTCAGCACATGTAGCTATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTC:1 + chr3L 13475527 5' - HMS-Beagle 161 2 78.77 ATAAACAGAATTATTCTACAAAGGAGGAGCCCTCACTTGAGCTGTACTTTGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGCACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr3L 1728460 5' + blood 62 2 60.58 GAAATTAATTCAAAAGTATCTTGCAGATACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2L 19907529 5' + hobo 41 1 57.53 ATGACAGACCAGCAGCGAAAGAGATGCCACGATAACGAGCGAAAGAGATAGCGAGATGGCCAAATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chr2R 15892270 5' + hobo 17 1 72.60 ATACGCATTTACGGACGTATACTCGGAATATCTACATATAAATTGCGCACTAATGATCTTTAAATACACATAATGCCCAGAACATGCCGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATG:1 + chr3L 21765384 5' + gypsy 30 2 65.07 ATTACCGAGCCACTCTTTGAACAAACTTATGGAATTACGCTTTCTAAACAAAACAAAGTAATATTGTGGAAAAAGAAAGTTCTGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:1 - 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chr2L 2538558 5' - springer 483 1 56.85 AAAACGGGTATGCGGTTTTTGTGGTTCGATGGCAGAATGTTGCTCACCGAGCAAGTGGCCAGCGGAAAAAAAAACAAGCAATGCAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chrX 3637891 5' + roo 31 2 62.86 ACAAACGATCCCTTTTTTTCAAGGTCATTTTTGACCCACTCAACTTTTCGCGTCAGCACACCTTTCAAAAATACCGACTTATCTTGTTGTAGTTGAATTAATTTAATCTCATAATAATGGTTTTTGCATCTTGTGTCCTCACTTCG:1 - chr2L 22545871 5' + transib4 2328 1 73.29 GCCTGTCCCACAATCTTTTGATTTACGACTAGGTTCTTTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr2L 9988174 5' - hobo 2914 1 54.65 ATATGTAAACTATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:2 + chrX 3637764 5' - roo 349 2 56.16 GAAAGTTCTAGCTAGTCGCATAGTTAGAAGTTGGCTAGGCAAGGCGGTAAATGTTGGACAGTTGAGTTACTTAATTAGCATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGA:1 - chr3R 25373344 5' + INE-1 138 1 58.22 GTGTGCGTGTTAGTATCTGTGTAACGGTGTATCTGTGTTGCTGTGCATCTGTGTACCCGAGTATTCGTGTATCTGTGTGCTTGGCAGTTATAACACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2L 20269057 5' + hobo 25 1 68.49 TAAAACAAAAACTTCTTGTAAAACCATGATCTATTTTAATCACAATCTTTCAATAATTGTATTGCAATCACAACGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTG:1 - chr3R 8293646 5' - Stalker2 7605 2 52.05 ATATTTGACCAGTCAGTCAGCTGGCACTTGTTTTCCACACGCTCTCCCGCTCACGCCCAACCGCATCGAAAAGGGTTAATGTTTGGCCAGTCCTTGTACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACC:1 + chr2L 11638963 5' + springer 7159 2 67.83 TGGGCTGTAGCTCATTAGCACGCCTGGATGAAGTAGATCGACCTGAAAAAATAAACTATGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAA:1 + chr2L 7905866 5' + Quasimodo 50 2 59.59 TTACCATCAATAACAGAGAGTTCTGCGCTAGCTGCTGTGTTCTGAATATCATTATCATCTATTCCTTTTGAGTTAAAAAACAATATTGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 10800472 5' + roo 8698 2 60.96 GCAGCACGCACGTTTTGTGTTCCTCCTCTCCTCCTTTCGTGTATGTTTCTGTTTCTGTTTCGCTTTAGTTTCACTTTCATTCGTCTTCGATCGTCAAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 + chrX 19506039 5' + P-element 25 1 69.86 CAAATATGTTTTTTAAAAGTAATCTTTTATGATTTTAATGGTCGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2L 19907662 5' - hobo 2893 1 52.74 TGCTGCTCTTCAGGCTCGTTCCGTGTAATTTATTGAAACACATTCATTTCTCGCTATGATGTGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr3R 19500718 5' + jockey 86 1 51.88 ATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 + chrX 18193683 5' - hopper 1380 1 62.33 TAATATTACACGCCAAGTCAGAGGCATAAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr2R 21244846 5' + roo 49 2 53.42 TCAAGGCTAACTTACAGCCATAATTCAAAAGAAGATACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 19938586 5' + roo 8708 2 56.16 ATGTTCCAACTCCCCTGTTGCTCCTGCTGCTATTTCATTCACCCTCTTTAGGCTCCCCATATATATACATATATATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 - chr3L 2625149 5' - opus 7457 2 57.53 CGGGGGCATAATATTGTCTATATTTATTTGTCGCTTTATTTGCTGACAAGAAATATAGACAATATTATGCCCCCGCACACACACACACACACACATATAA:1 - chr3R 10923448 5' + accord 185 4 80.00 ATTTCCACACACATTATCTTCTCCTTCTCGGCCTGCTGCATATCCATAAATTAATAAATAAAGATATTCTGAATAAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTTTATTCCATATGTTCATATTGGTTTTATTATCGT:1 - chrX 7617938 5' - Porto1 4251 1 53.42 ACTTTTTGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCCTTGCAAGTGTACTAAAATCCGGGATCCAAGCACCAACAACAGTCACCTCCAGCGTCCAGCATAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGT:1 + chr3R 4718159 5' + 1360 18 1 44.52 TGGCAGAAGGCATATTCTGCTCAACAAATTGTATCATGACCAGATTAGCATTCTAAGCATGTCTAATTCAAGCCATATCCATTTTCTATACCACTGACATGCCTATTTACGGTATTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGAC:1 - chr2L 284687 5' - S-element 7 2 76.71 CAAAGAGGTCCGGGCGAATGGAATCCCAGCCTGCAGTTGTTCGTAATGATATTTGTTGGTCGGATTGGCAATATGTTGTTGATGCATTTCTACGCCCCAGTAACTAAGCGCACATCACCATCACTTAACTTTATATGTCGATCTTA:1 + chr2R 8128867 5' + pogo 1933 1 78.08 CAGCCGTCTCATAACCGTCGCACTAAATCTCCTCTCTAATCGAGTTCCTTCAGACAAATATTAAATATAAATATATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3L 24291879 5' + 1360 48 1 71.92 TTAGTTAATTGCGGCTTTGGGTCGGGGTAATCCTCGAAAGGAAATCCAATTACCTGCATGGAACCGGCGGCGCAATTGAGAGCGGCCTTCGTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTG:1 + chrX 11911441 5' - HMS-Beagle 6611 1 66.19 GAAAAGAATAAATTCTCCCAATAAATAAATTGAATAACAATTTGCTTGTGGGTCGTGTCATATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGT:1 - chr3L 20910161 5' + F-element 10 1 78.08 AACACAAGGATGTGAGTCCTGGGAAGGGAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 - chr3R 5767435 5' - roo 315 2 80.14 CGACATCATGAATGCGGGAATTTTGCGAGAAGAAATGCTGCTTATGGCTTGGACTGACTACTTTCCTATACAGCCAAAGATTAATGAATCAACACAAGATACAGTCTCAGCGACAATGTGAAC:1 + chr2R 12767802 5' + Doc 231 1 47.97 TTTTGTGGCGTAGATTATAGAATTTTTAATTAAATGTTGTTGTTGCTGTTAACAATAATGTTGCGGGATGCAAGGGGAGGTAATTCAATTAAACCGTCAACTGCACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAG:1 - chr3R 9203306 5' + Copia1_DM 142 1 56.16 CGGTGTATGAACCCCAAAACCCCTGGGGTTCGCTGCCCCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAA:1 + chr2L 17574374 5' - hopper 1336 1 71.92 CAGAAAATTTTAAGGTAAAAACGCCGGCAAATTTCCTAAAAGGAAATTTCAGCTACACAAAATTTCCTGAGCCTGGCTTCGTATGTATACCCTTTTTTTTTTAACCGTTACCGTTGCTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTT:1 + chr3L 24051734 5' - Bica 493 1 52.74 ACGTTATTAAAAAAGAAGTGAAAGATAGATAGAAAGATAGCAAGCAAATAATATACTATCGCAAAATAGTAACACCATTATGCGTGCCAAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3L 10241325 5' - pogo 2076 1 66.21 ATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTGGGTGAGGACTTC:1 + chrX 21772492 5' - springer 7082 1 73.64 GGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAAC:1 + chr3L 1983471 5' - Transpac 225 2 76.03 CGGGGACGGCTTTCCGCTGAAGATTTGCGAGCCGTGCCTGATCAAATTGCGTGAGGCCTTGAGATTCAGGAGACGCTACACAAGGACCATGGAATACGTGGCGCGCGTGACCGGCTGAACCAATCACGGTGCGCGAAGAAAGCTCG:1 + chr3L 13997454 5' - G-element 106 1 69.86 AGACCACACCCCAACTCACACCTAAATTCACAATACGTGCTGTATTGTGAATCAAAAAATTTCAGATCAACAAACTTACTCAATAGCCAATGTTATCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTCAGCTGCATTTACCAACGCAGACTG:1 + chr3L 23451974 5' + rooA 214 2 69.18 TCTTACATATCTGCATTAGCGCCATTTTAAATGCGATAGCGATTAGCCGATAGCACTTATCGGTCACACACGCTAGCCAAACAGTACAGTCACCACTGATGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATACATAAATA:1 - chrX 11236522 5' - copia 233 1 67.14 TAGAATCTCATTTCTTTTCACGTTTTCATTCATTTTATGGTGCAGCCTTTTAAAACTAAGCTCTATAAATTGGCAAGAATCACAATTTCTAATAACATTGTTTTTAAATACCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2L 769919 5' - roo 399 1 78.77 TTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCATTGCTATCTCGCTC:1 + chr3R 15157596 5' + invader3 5273 2 65.75 AATGTTATTCTGCCAGCTGGCAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATT:1 - chr2L 22224622 5' - Rt1c 5416 1 65.07 AAATAAATATTTTACGCAAAAAGAAGCATTCAAATGTATACATTTAAATGTATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCA:1 - chr2L 13156576 5' + Max-element 8287 2 59.20 TTAAGTTGGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGGTTCTTTTTTTTCTATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAA:1 + chrX 9413073 5' - 17.6 438 2 66.15 GACAAAATTAAGGTTTATTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 18954117 5' - roo 355 2 55.48 CTGACTGTGGCATAAAGTTCGATAAACTCTTTAAGTGATTTAATCGATTTTCTGGGCTAGTCGAGGAAATAAAAATACAGAAGTAGGGCGCAGGGAGAAGGGTATTTATCTTGCATAACAATCCAACATGCCATACTTTGTCGAAG:1 - chr2L 8651673 5' - Helena 411 1 52.74 CACACTTTGGTCCACTTCGAAGCTAATGCCCTACAAAATTGTTACGATCTGTGGGCCTTGAGCTAAAAAACAAGGAATGAGAATCCAACACATTGCTACTTATAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGT:1 + chr3R 14849617 5' + Stalker4 388 1 73.29 CTGTAGTCCTGGGTAAGATCTTCTAACACTAGGATATCATTCCGACTGTAGTAACATTTTGGATTATTAATCCCACTTCTGAGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTG:1 + chr2L 21082039 5' - mdg3 207 2 63.01 GCCGAGGAATGCGTTTTAGAGAGCCGCTCTCTTGGCCAACTTTCTATTTATAAGTCTGATGTCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 + chr3L 13477182 5' + P-element 57 1 46.58 AAATCACAAATTGAATAAGTGTGTTCTTGTTATTTCATGAAAATGCATTCAAATGTGCTGTGAGCAACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 10429884 5' - roo 9020 2 54.11 GAATATTCAACTTCTTTCTACTCCCCACACAGGGTTGCATTTCATGAGCCGCGCCTTAAGATAGGCATTTTTGTTACGAGTAAAAAAACCACCCGAGGCCTGCTGCGCAAGAGCCGTATGCGTGAGTGGACGCACAGTC:1 + chrX 14213616 5' - hobo 2759 1 50.36 AAAATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAA:1 + chr3R 3617309 5' - micropia 5129 2 75.34 CACAATTTGCATGCAAAGTGCCATCAAGAGAGCGACAGAGTGCGAGCGTGCGAGCGAGCGAGAAGTGGAGTGAATCTTATTAGCCGAGCCAAGAAAAAAAAAAAGAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 19448246 5' - hopper 148 103 80.00 ACTAGTCTTGTAAATTTCTATAAATATGCCAAAAACCTTTTTGCCACGCTCACTCTAACGCCCTAAAGCCGCCCACATTCCCCAATATCTATCGAAATCCTAGAAAATTTATGATATTTCTCGTTTTCATTCACACTAGCTGAGTA:2 - chr2L 23066895 5' + INE-1 532 1 40.41 GTTTTCATATATAAAGCAGTGTGTCAACACACAGTGTGTGCTAAGGATTCAAACCTTAATTTGTTTAAATAAGCACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGT:1 + chr3L 15374607 5' + 3S18 5813 2 54.11 TGGCAATGTTGAACAACAAAATATGCCTATTTACATTATTTAAATTAAAGTTTTAGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr2L 20910385 5' - roo 9007 2 63.70 TTGCGAAAATTCTGCGGCACTTGCTTTGTATTGTTAAGTGTGTTATTTATATTGTTTGAAGTAGTCTGCGGGATAGTTAGACTTATAATTGGCGCCCAAACGTGGGACAGCCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTTGACAACC:1 - chr3L 21048201 5' + Circe 285 1 50.00 AATTACAAAAACTAACACAACAAATGTCTAGAAACTAAATGACAAAACCAACAGTGCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCAAGTGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAG:1 - chr3L 21765545 5' - gypsy 429 2 63.01 GTTTAATGCAACTCGGATATGAACAATATATCAATCAGTTTCTAGATCTAATTTGCCACACAACAGACTATTTCAGATTGTATGGCATTATAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 + chrX 18318121 5' - copia 225 1 65.75 ATCTTTTAAGGAGAAAAGTGTTGCATAAACAAGAGCGCCCACAAAGAACTTATGTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTC:1 - chr2R 18528786 5' - jockey 4920 1 65.75 CAATACCAGTACATTTACAACTTAGTACATACATATGTACGCATACAAAAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGATTTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCATTTAAGACGCCG:1 + chr2R 982350 5' - rooA 236 2 39.73 ATCTATCTGAAATATTTCCCAAATTTGATGGACATTCCTTAAATCGTCGGCCATCTAAGCCCTTTGGGGGCTTTTTTGCAGGTGCTTGACGTTGGTCATATGAAAATTTGCATAATGCCACTAACTGAGTAACGGGTATCTGATAG:1 - chr3L 13170868 5' + INE-1 547 1 77.40 TTGGCCATTAACAGCTTAAATTGGGCACCCTTATATAGAGCTTTTAACTAATTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chrX 10838600 5' - roo 9003 2 69.86 ACAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACG:1 - chr2L 22063441 5' - INE-1 128 1 63.70 CTCCACTGACGCCTCTGTGCTACGCTGCTCGTCTGGCTGCCAACAGGAAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3R 13572136 5' - 412 7505 2 58.90 ATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGCAGGCGACATCAGCAAAGTGC:1 - chr2R 12185418 5' + accord 61 2 58.90 GTTTTCGCAGCCTAAGAGTAGGCTACACAAATGTCACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGGAATCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 + chr3R 27056374 5' + jockey 68 1 56.85 AAGGACGAACGTCTTAATTAGCCCTGCGAAAAGCGCGAAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCCGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCC:1 + chr2R 17872440 5' + Tirant 8105 1 79.82 GCATATTAATGTTTTCAAGTACCTCATAAGCTATGGTATTATAACCAGAGTGTGCTGTTAATTAAATGTTCACGATATGGGGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 - 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chr3L 23839717 5' + McClintock 6018 2 66.44 TACTGTAGGTAGCAACATTAATTACTAAGCTGAATTACAAAAATAATCTTTATGCCATTCTTAATTTAAATTTGCATTTAATACCTTGTTAAGCTTATATTACAATAGTAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3L 19938417 5' - roo 399 1 78.77 ATTTAAGCTGCCAGCGGCTGTACCACCGAGAGCGTGCTGTGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 + chr2L 19681002 5' + hobo 77 1 71.92 ATCGTATCGAATTGGATTACAAATAACAATCTTTTCTTAGGAAGTACATCAGTTACTTAACATAACCATTTTAATTAAAAAGGTATTTCCCTTTAAGGTTGTGATTTTATTTAGATCTCACTCTCATCGAGTGTAGCTTAAGACTG:1 + chr2L 16767037 5' - gypsy5 277 2 52.74 AACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTC:1 + chr2L 22031982 5' + Tabor 6923 2 78.08 TCTTAGAGCTTATCTCAATTTATGATTTTTATATGCAGTAGGTCGATTTTTAAATATTAATAGATCACGTGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATT:1 - chr3L 15374729 5' - 3S18 288 2 53.42 AATATTCTGAACTATTCGAATTTTTGCCGATGTAGTTCGCGAAAAATGCGTTGATCGCACGCACGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGA:1 + chrX 22652699 5' + ZAM 60 2 59.59 ACAATGCGATAGTATGCGTGCGTGAGTATGTGCGCTTGCCAGGATACACACACTCACACTGAAGCAAAACTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr3R 23565236 5' + jockey 59 1 52.74 ACAGCGCGGATTTTCCATAAACGAACGCGAATTCTTCAGGAGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 + chr2L 951279 5' + F-element 41 1 61.64 AGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACT:1 + chr2L 951319 5' + F-element 81 1 66.44 TATTTTATTTCAATTTATATTTTTATCATTACTTTACTATATCAATAAGTTCTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTTACCTTATTACACAAACACTAAGTACCTACATATAAAA:1 - chrX 20612676 5' + Juan 3923 1 65.07 ATACATATAGTTTATAATACATACCGGTAAAATACTTACCACATAGGAGCGCAACAAAAATATAGAACTATATTATATTAATACATATGTAAAGATAAGGTGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chr2L 12814672 5' + hobo 18 1 71.92 GAAAAAATTTAAAATATAACCAGGCAGCTTGACAATCCACGCGAAAAACTGGCAAACAAAATATGTTTCAGCCAAGCGTACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTA:1 - chr2R 18927884 5' - 3S18 6062 2 55.48 ATTAGGGATTCAGCAAGCTTTTTAGGCGTTTTACATGATATGTTTACGTTTCCATTCGTAGATTTTCTTAATTTCTTGAATTACATTTCTTTTAAATCAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCCACGAAAACACGTCC:1 - chr3R 17921009 5' - R1A1-element 2 1 66.90 ACACACACACTCGGACACACTGATGCAATGACTAAATGCGGCGGCGCAACGGCGTCGACGTTGGCAGCGACGGCATGGACGAAAAAAAAACTAATTGGGGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACG:1 - chrX 4939615 5' - FB 57 1 74.42 ATCATACGGTGCCTGCTAAGAATAGCAGTTGACTTCATAGTTGACTGATGTCTAGAGCCATAATGAAATATTAATGCATAAGAAAACTTATGGAGCTTAACATGGAAATTTAGATATACTAACTTTGTACTTTAATTCAATATTTT:1 - chr3L 8581318 5' - gypsy9 392 1 50.68 TTAATTTATTTAATTGAATGAGAGGTTCGAAATCTGGCAGGTAATTCATTGAGGGCTTTGTCTGCGCCCATCTCAGCCACCAAAAACGACCTGTTCCGTTTGCTTTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTA:1 + chr3R 17063651 5' + mdg1 7447 2 73.10 ATCATACTTATCGACGCACAGATTGTACTCATCCACATACTCCGCATACTCGGTTTTGAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTT:1 + chr2R 18056793 5' - blood 7328 1 58.90 ATTGCATTTACAGAAGAGTAGAGCCATTATTGTGGGTTACGTTTCAAAGACTTCTATTGGGGTGCAAAATTCCTGTGCTAAATTCTTTAAGCTTAAACCAAGTAATTAATTTTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 - chr3R 18493020 5' - Juan 4203 1 69.86 CTGGCCGAAACCAAAGCCAATTAAAATTATTTGGCCATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATA:1 + chrX 998151 5' + copia 4956 2 79.45 GATGCCCTTTTATATTATTTCATAAATAGTATCCAAATCAAAATCTTATAAATTCAGTAATTTTTTAACACTTAAATTCATTAATATACTTACCATTCAGTTATATTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACAC:1 + chrX 23353021 5' - R1A1-element 5273 1 72.60 AAGGCTAACTTACAGCCATAATTCAAAAGAAGATACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 19938584 5' + roo 8710 2 54.79 CTTCGCGCAGCTTCACTGTAGTTGAACGGTATTTACAGGCACTCAATGTGTCCAACTAATCGAGCCGACTGAGATACAACGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCAC:1 + chr3R 18539984 5' - roo 8929 2 58.90 CACTTCGGTTCATTGAACCAACCCCGTACCCCCTGCCCGCCAAGCTTTACCCCCTCACCGTTGGCTAATTGCTTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chr3L 19702872 5' - pogo 2071 1 60.45 ATAAAAACTTGCATGTTTTTTTATTCTGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTC:1 - chr3L 3543096 5' - mdg3 5471 2 52.74 TATGACCTTTCTGTAGAGAATGGGGAAAGTTTTCGCAGCCTAAGAGTAGGCTACACAAATGTCACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGGAATCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3R 27056346 5' + jockey 36 1 62.24 GGTTGGTTGATTAAAGGGAGTGGATCCGCAGACGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTGTATCTCCAGCTGTTGTTGGGGGAG:1 - chr2R 6548275 5' - F-element 418 1 60.00 CAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGCTGTCTTT:1 - chr3R 15035129 5' - Stalker2 319 2 73.29 AATTGAATTTTTGGTATTCATTGTGCGGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr2R 10666962 5' + hobo 28 1 65.00 CAAAATAATTTAAGAATGCAGTTTTAATGGCAATTCCATTTGCAGCCAAGTGGCCAGATTTCCCCGATGGAGAAACCGAAAAAACGGTCATGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3R 26658111 5' - hobo 2909 1 65.75 AGTTATAGTCGACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTC:1 + chr3R 9657672 5' + BS 54 1 56.85 TTGCACTTGCATTTACAGTCATATATTTTTATGAACTGTGCATTAAGCCACAATGAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 2622648 5' - roo 359 2 58.59 CACTTTTCTATTTAGTTAAAAATCGCTTTCAATGGAAGATTTAAACTCGCACTGTCAAACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 - chr3R 18498339 5' + pogo 57 1 60.14 GGAAATTAAGTCGAAGATCTACTTCTGCATATGAGCTATGTATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTAT:1 - chr2R 20931713 5' - blood 7326 1 67.69 TAACCCAATTTATTTGAGTGTGAAAATTGGCTTTCGCCCATTTTGAAATTCTAAGCTGTTGATGGCGTCGTTCAACCACACAGACACCGACACACATGTATGTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr2R 21453493 5' + hobo 17 1 73.79 AAGTATCTTGCAGATACTGATACCGCAGTCCGCGCAAATTGCGGACTGTGATTGCAGACTGCCAATAAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chr2L 19907542 5' + hobo 54 1 54.79 ATTCTGTTCTCTCAGCTATTATAAGACTAGTCGTTCTGTATAAGAGTGCGCAAAAGTCTCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chr3R 9158320 5' + P-element 49 1 48.15 CACAAGTTTTTTTTTCTAAATATCCATTTGCAGGGTGAACGACATTCCGCAGCATCAATTTCTGATTATAGCAATGAAATGCACTTCAGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr2L 11559839 5' - roo 9041 1 64.83 GAGGGAACTGTTCAATCGAATCAATCTATCATAATGGAATTAAAGGAGTTTGAGCTGTTAAGTATCAGGCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 2240387 5' - roo 357 2 52.74 TCCCATGTGACTCATCAACTTCACCATCAAATGTCATGGGAATCCTTTATGAGGGGTGCTAAAATAAGATCCATCTCAACAACCAGATATGAAAAGCCAGCACACTTGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chr2L 5333337 5' + mdg3 5269 2 74.66 GGCAATGGATGGCAATAAGACCCCAATGGTAAAAATTAAACCATCGATTATCAGCTGGGCGAGGAAGGACAGCACCATGATTACCCAATAATAACTTGCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACAG:1 - chr2R 14669688 5' - R1A1-element 89 1 60.27 AACAAAAATATAGAACTATATTATATTAATACATATGTAAAGATAAGGTGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGT:1 + chr2L 12814724 5' + hobo 69 1 64.14 GGTACAACATGAGTCAGACAGGCAAGCTAATCAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 + chr2R 9408152 5' + FB 50 1 52.05 TGGGTGAATCTTAAAATTTATGGGGTACTTTTAAAGGGCTTTGGGGAAATGAGGTATCGAATTTAACTTTAAAAGGAATTAGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 + chr3R 22160841 5' - copia 216 2 54.79 TCTCAGGTAATTAATTATAAAGTATATTCGATTTTTTATTTACCCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCATAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAA:1 + chr3L 18574840 5' + I-element 87 1 76.03 ACACCCAGATAGGGATGGAATCGGCCCTTCCACATTCATCCTTCGCCTACCATGTCCTGTTGACAGTTGCACTAATTGCAAAATGCTGTTGTTTGTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chrX 16994992 5' + jockey 32 1 67.81 GTTCCTATGATGTTGACAGAATTGATGCTTTGCATTCCCCATAGATGTTTTTCTCTTCCAGCAGCAGCAGGTGGATTACTTGCGTGCATTTGCTGTGCCAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 30524416 5' + roo 22 2 70.55 TGCATGTATTTTATTTTTAGAAACATCTTACATTTCAGTCTTAAAGATAATACAAATAAGCAAAATAAAAGCTTATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGC:1 - chr2L 9526293 5' - R1A1-element 195 1 55.47 GCAGACACAAAGAGCAGAGCTCAAAACAGAGAGACAAAGGATTGCAAAATACAAAAAATATGCTGGGAAATGTGCCACACATACAGCAACATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACA:1 + chr3L 19432478 5' + HMS-Beagle 24 2 69.29 AATTAAGTGAAAATATATAAGTACATGCGCCCAGCCACCGTGATTACTTCTTTTTTTTAAGTGCATAAACCTAACATCGGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGCGAGCGAGAGGAG:1 + chrX 9790219 5' - Max-element 8344 2 52.14 TTTTCGATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGA:1 + chr2L 20928063 5' + Chimpo 67 1 64.83 ATTCCACGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGTTTTATTTATATTGTGTGGGGCTTGGCAACCTCATAAACAGATTTTAACATTCCTAATGTATTGTATTTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATA:1 - chrX 23280894 5' - Stalker4 392 1 74.66 GAAAGAATTTGTGAAATTGTTTTAATAGATGAAATGATTTTGCTTAATTAAATATTTACGAAACACCCTTATGTATATGAATAATAATAAAAAGATTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 - chr2R 2052706 5' - opus 7485 2 73.94 TCGCTCTCACGCGGCGCATGCGTGCGTGGGAAAGCACCTTTGCGAGAGCGCCTACCAGGCTGGACTTTGATGGGGTGGAGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTCCGGCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2R 16031328 5' - hobo 2909 1 58.65 AATCAATCAAGGGCTCACTCAATTGCGCTGTCTGGCCGAAACCAAAGCCAATTAAAATTATTTGGCCATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCC:1 + chrX 998120 5' + copia 50 2 59.29 GCTTAATTTGCTGCCTGCCGAGCCGGCGACTTCGACTTCGACTTCGACGTCGCCTTGTCGGAGTTATAAATATGCAATTATGTGCCCGGGCCAAACAACATTGTGCTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chr2R 10773362 5' - 412 480 2 76.03 AATGCCGCGTAACTGTCGTCCCTTTCACACGACCTTGACTGCACTGCAATATATATGTGCACATATACGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chrX 13484220 5' + hobo 54 1 56.16 AATCGAGGCACGCCAAATAATTGCAGCACATGAAATGCGCAAAAGACCCAGAAATGAGTGCAAGCCAGCTGAAGTGGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAA:1 + chr2R 14767342 5' + Tirant 8126 2 68.60 TCTGAGTATGTTAGCTTGAGCTAGAATAGCGATTTGTGATCTGGATTTTCTAATTCACTTTAAATTTGTATTATTTATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr3R 12569700 5' - blood 335 2 53.42 ATCTGAAGAAATCAAACTGGATATGTCATCACATTGATAGGGAATAAATGGATCAACTCTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 18860876 5' - roo 346 2 60.27 TGGCCTCCGCATCAAAGCTAAACGGATGGATGCTGGGCAGGACTGGGATGGATGTGGGGTATCGTTTAAAATCATTCGAAAAGTAAACCAAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 + chr2R 7343207 5' + flea 14 2 74.07 CAACTTAAACGCAACAATGATTTTGAAAAACATTCACAGTTTTTCTAGGTTTTCTGCTCAAGCCAGACTCATTGCAGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATA:1 + chr3R 27443134 5' - 3S18 294 2 53.42 GAGACAAGAGGCAAACATTCTGGCAAAGGGAAAACTACAGTTAGACAAATTCTATGCACGTCAAATGTCAATCTGCATACACATATGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTA:1 + chr3R 8965107 5' - HMS-Beagle 214 2 63.70 TAAATAAATGTGCCCACACGGGTGGTTGGGTGTGCGTTCTCAGGTAGACTTTTGCGAAATATATGTGTATTTTGCGAGTGCTGGTGTAATCTATGGTGCAAGCATTTCTGTCTGAAAAACATATAAAAGCATAAAATTACCTCCGG:1 - chr2R 19320767 5' - Circe 407 1 73.97 GAATACATGGATTTAGGACACATGATTGAAGTAAGTGATGATGTAGTGCAAGAAGGTGGGAGTAGTTTTAATGCAATCGCATCGATACCATAATGTTCTTGCTCATAACAGGTATAAGTTTGGCAGTTTCTTTTTCCGTGACCGTT:1 + chr3R 19445149 5' - G7 149 1 28.08 CCCAAAATCGGCCAAGTCAAACAACACTTCCAATTAATCAAAACCCATAACATCGCACAGTGCCTGCAATTCGTATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr3L 5329075 5' - 412 473 2 64.71 AAGATTACTTACAATCTTTGTGTATGTAAAGTTAAGAACTGTGAGAAACTATTTTCAATAGCTATAGTCGGTGTTTTCCATTTGAGAACGATTTAATAAAGTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chrX 19310704 5' + pogo 16 1 73.29 CTCGCCGCTCTGTGATTAATTTAAATGGAATCAACAAAACACTTTGCACTTTAAGTTAATGTTTTTTTTCATGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTA:1 - chr3L 24518420 5' - Doc3-element 4657 1 76.71 TATTAAAATTTATTAATTTGGTCCTGTTCTTTCGATAGTTCTTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTAAAAATCGATTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGA:1 + chrX 21668807 5' - mdg1 413 2 76.71 CTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 + chr2R 10189254 5' + Doc 60 1 58.22 TTAAAGCATTTAAAAAAAAAATAAAATAAAAAA:1 + chr2L 3740508 5' - hopper 149 108 90.91 CGTTTGCCCGGCCATTGCGGGTGTCCATTCCACTTAGAATCCGCATCCGACCGATTGCCCTTATCAGTCGCAGAGGATCCCCTGCAAAGCCATTGCCGCATCCCGGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCG:1 + chr3R 19789568 5' - R1A1-element 5192 1 75.35 ATTTGTACCTTTGACCTGATTATATTTACTCCACGCAACTTTTATCCATATAGTATTTTAAATGTATGTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr3L 3910455 5' + 297 6625 2 56.85 AACAACTGTAAAGGTTTTTTATAATAATAATACCAGCAGTAATCATATTTATAATTCTATTTATAACTGTAATCCATAGTCTAAGCCACAAGGATCGCATGATAAAAGGAATATAGAAGTTATTTAATTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 10276489 5' - gypsy11 3933 3 54.61 CTGAGGCCGCTCCACCTCCTCCTCGTCGCTGACCGTTAGGCAAACAATGAACAATTCAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr2L 20327583 5' - roo 9029 1 52.74 ACTGAAGAATAAAGACAATTGAAAGTCAAATTCAAGTGTATTTGCTAACGCAGACTTGCTGCGCCTATGTTTATTCGGGTAGGTATGCATGTATTCACAAAACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr3R 24760487 5' - pogo 2084 1 75.34 TATCAATTTCTTAAGCCATTGTTCCACCATAATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 + chr3R 7305931 5' + 412 7139 2 78.62 CTCTGCAAAAAGTGCATTTTGTGAACTGTGCATATTTTTTGGTCAACTTTTCTGACTCAAAAGACTCTCGGTGGAGTTAGCAAGCTTAAATGATTTTTAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 15596876 5' - roo 9052 2 70.55 CTAAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGATCCTGAGATCTCGGCGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTTGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGT:1 + chr2R 5492219 5' - Quasimodo 7349 2 66.44 TTTCCTTTGCTTTAATATATTTTATGTCGAAGTCATATTCCGAAAGTCTAATTTTCCATCTTGTTAATTTTGAATTCGGTTCTTTTAATTTGTGTACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAA:1 - chr2L 16595235 5' - rover 7268 2 63.01 GAAATGAGGAGGCAAGTCGAGTTGACTGGAGCTGAAAGCCGACGGACGCCAAAAAGCAAACAAAGTTGTCGAAACGGTAGCATATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATAT:1 - chr3L 3777646 5' - copia 5065 2 56.16 TTTCTATGGTTAATCAAGGGAGATCTAATCAGTTGGCTGATATTGACCAATCAAACGAATAAATGAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2L 11559700 5' + roo 8716 2 54.79 CTATGGGTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGGTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATAGCAAGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCACAACAACCACCT:1 - chr2R 12185420 5' + accord 19 2 49.06 GCAAATGAAGTCATTTCGAGTGCTCAACTCGACTATCAATTGAGGGCAAGAACTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGT:1 + chrX 8855981 5' - 297 334 2 63.70 TCAATTTCGCTGTTGATAAGCATAAAAATCACTGGGTTTTCGCTTTAAATTTTTATGTAAACACGCGCACACCCCGGCATCCTCCATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr2L 19628379 5' + hobo 36 1 59.59 ACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATATTCGTTTCAAGTATTTATTGTGACTGATCTAGAGTACAATGTTACTGCACGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAAGAGGAT:1 - chr3R 9485833 5' - Dm88 4476 2 56.85 GAGAAAGGGACACACTGGGTGCCATGCCTGCAGCTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAG:1 - chr3R 15035189 5' - Stalker2 379 2 68.49 CAATATAATATTACACGCCAAGTCAGAGGCATAAAACCGAAACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr2R 21244841 5' + roo 44 2 54.11 CGTGTTTGTCAGTCTAACTGTGTGCTCAGTGCACTGCGAGAAATAATGGGACAGCTAATGGAGAAATAATCAACCATGAATATGTCGCTAAGAATCATTACGTGTTGAAAGAAGGTAAGTATAGATATAATATAGAAATAAAGTAA:1 - chr3L 4001048 5' - accord2 440 1 66.44 TCGTAGCCTACTTTTTGGACAAGGACTATACACCTGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTC:1 + chr2L 6716328 5' - hobo 2852 1 75.34 GAAGTGTTGTTATCAAAGCCATGTGGCACGGATGGGGGGTGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAAC:1 + chr2L 2522905 5' + mdg1 83 2 71.92 AATCGTCGAATGAAAATGAATGAAACGGAATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGCGTGCGGACGA:1 - chrX 1831298 5' + P-element 88 1 25.34 GCTTAGTAACGACAGCCAACCCGAAGCCAAATGTGGGGCTATCATTTGCCAATGTAATAGAGCAATCTTTATCAAAAATGTCGTAGTATTATTGTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3L 11228036 5' + pogo 24 1 69.18 TAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 + chr2L 951343 5' + F-element 61 1 75.49 GAGGTATAGGTCACAGTCATGACGAGAAATTCGTATTGAATAATTTTCAAATGGGTAAGATATTTTCCATTAGCAATGACAGTGAAAGCAAAGCTTTACTTAATATCCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAATCGTTTCTTCGCG:1 - chr3L 15298987 5' - Tc1-2 1244 1 69.18 TGGCCGAATCTCTTTACTACATGGAGACTAAATCCCAGACTGGCAACACCTTTGACAATGCAGTGATACTAACCACCTCGGTCACTCAATTGCTAGCCATTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACA:1 + chr2L 21290909 5' + diver2 364 2 67.81 ATCTTTTATGATTTTAATGGTCGTCGCCCACGCCTCTTGTCCCCGGTAAATATTTATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACT:1 - chr2L 19907641 5' - hobo 2872 1 63.70 CCAAGTTCAATTAGTTTTGTATGCGCTCCTCACAAGTTTTGCCGAACTTCTTTAATGCCAAGATTGATTCCGTCTGAAGCTGAGGCTCTGTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1 - chr3R 8965270 5' + HMS-Beagle 6818 2 69.06 ACCAAACCCAAAGTTAGCGAGCGAGTTCACACAGAAACTTAATATAGGTAGAGCCCAAAATCCTTTAAACTTCCAACAAAGAATAAGTAATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 - chr3L 25912618 5' + blood 7044 2 63.01 GCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr2L 2518558 5' + jockey 86 1 70.63 GCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTGCCT:1 + chr2L 23372626 5' - 1360 3319 1 68.66 ACACAGCACACACGATACATCCGAATGGCAATCCAAAATGCCAACAAGCGGCAGCTTAAATCGGCCACGGGAAACACCTCTTTAATAGGAGCTTCATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr3R 26658275 5' + hobo 10 1 75.38 TAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:2 + chr3L 16523197 5' + jockey 78 1 65.75 TGGCGGATCTCGGCTTGGTCCCGTGCTCGGGATAATTGCTTCCCATCATCAGCGGCGGAGGAGGCGACTTGTGTTTTCCATTTACCTGCGCGTGTCGCAGTTTCGGACTCGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 - chrX 19744556 5' + P-element 12 1 77.40 CAAATACAATGTACAATGAATACAAAGCCCGTGGAGTGACGGCAATCGGCAAATCAAATTTCAAATTTCGAATCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 - chr3R 18940622 5' - mdg1 371 2 54.79 AGTATTTTGCTTGAACTCGCTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr2R 10189235 5' + Doc 41 1 55.48 GAGTCTCAATGTTTGGAGTGCACTTTACCCGGCCAACTTGAAATGAATCTAATAACTTGGCCCACACACACAGACACACATAGATTGGTAGCAAAAACAATGCCCTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3L 17142762 5' - hobo 2924 1 75.34 GGCATTCAGGACTCCGAAGTGTATGAGTTGCGATCTTTTTTTTTTTGTATTTTGTAAATGCAAAATAATTACATTTCCGTATGCATTCGTATCTCCGCTCCTGTTTCACCTCCAAGAGCTCGGCCCCAACGCAGGCGAA:1 + chr3R 12889720 5' + R1A1-element 479 1 77.70 CTAGTGCCATTTCGAATGCTTTTTCTGTGTTATTTGTTTCGTTTTGTGGCGACTGCTATTTTTTCACAACTTCCTTCTTGTGCTTTTTGCTCTTCCTGCCACGAACAACGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:2 + chr2R 14450095 5' - roo 396 1 75.34 AAATAAGAGAGAAGCACGAAAACATTCAGAGAAGTATTTGCGGTTTGTAAGCGAGTAGAGACTCCCATCTCTCTCGCACCTGCAGTGCTAAGCCTTCGAAAACAGGGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr3L 17896055 5' - P-element 2872 1 76.71 AGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 - chr2L 2518554 5' + jockey 69 1 68.85 ACTTTAATGAATGTCTAACCCTTCGAAAATCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chr3R 13411827 5' + roo 8754 2 81.51 GCGGTCATGTCTGTAAGTGAGTTCCCAGAAATCCAATTAGTTGGAAGAAGGGTGTGGGGCTTATGTAACATGTTAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 - chr3L 18954242 5' + roo 45 2 53.42 CCCACTTCTGTTTTGTGTCGCATAATTACCAATGCCAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 - chr2L 18848790 5' + blood 84 2 75.34 GAGTTGAGTCGCTAGTTGAGTATGAAAGAAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr3L 2240471 5' + roo 8752 2 80.14 GGGGAATTATGAGATGCATAAATGACGCAATAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACAAG:1 + chr3L 22445207 5' + Transpac 5006 2 79.86 AACGAGCAGACTGACATGGCCAAGATTATCTGAGAATATTCTACCTGTTACAAACTTTACAACTAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGTGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCA:1 + chrX 22714994 5' + opus 18 2 73.29 ACAGGCTGTGCGTTAATTTCAGACCCCCTTATGTAACCCCTTTTTTCGGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGGTCCACACTGAA:1 - chr3R 902633 5' - R1A1-element 5301 1 58.52 GCACTATCTGAGGGGGGCGCGGGTGGCAAACCACCCGAAGGTTGCTGCAGGATGACGTTCGCATCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTAC:1 - chr3L 939727 5' + hobo 9 1 68.09 TAGCGCAGTACCAGAGTCAATTTGTAGTTCGTCTTTGCCAGCAGTTTGAAGTCTATTAATAACGAAATTTGGAAAGGCCAGAAAAGTACTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3R 11072408 5' - roo 9039 1 63.01 ACAAACGAAGTTTTCGTTAGGTAACCAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAA:1 + chr3L 17895050 5' - P-element 116 1 21.92 AACGTTTTTATGGCCCAAATGTGTTGGGCATATCTATTGAAACCAGCAAGACTAATAATAAAGCATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGTGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACT:1 + chr2R 7024383 5' - diver 6054 2 58.62 ATTCCTATTATGTCAACGAGTAACGCCGAGTAAGAGCAATGGTGAACTATCCCAATGATAACATGGATCTGCATTAAGATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACAC:1 + chr3R 7364179 5' + Quasimodo 29 2 65.00 CGTGAGGGAATACTCTGTGCGCATTAGCTTGGCTTGCCTAAGCAAATATTAACCATCCGCCGTGTAAGCCGCGCTTTTGCTCAGCCACTTTTTTAATAATAAAAATTTCATTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 - chr3L 13568115 5' - copia 244 1 77.40 ATCCATTACACTTTAATGCAATTAGTCGCAACACACCGCAACTTGGGTGAAAAAGTTTCGCTTCCTGTGCGCATTTAATTATCGCGCCAGAATCCTTTTGGATTCTTTTCAAGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:1 - chr3R 26139563 5' + mdg1 11 2 78.08 ATTGCGGCCAGTGCACAACAAAATAAACAAACCAAGCCACCTACAGAAATACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACGTAATGAGA:1 + chrX 17508817 5' - Burdock 190 2 64.38 AAGAAATTTATCCATTTTGGCTTGTAATCAGTAGGCCGTGCAAAAGTATTTTATGTGTTTGGTAAATCCATTCATAACTAAGCTAGTTGTCTTATTCAAACCCAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 - chr3L 17710724 5' - I-element 5337 1 73.97 GAAAGGAATTGTCAAGCAATCCGTCGATAAAGAAATTGAGCTTTACGGAGAAGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 - chr2L 22177453 5' + Doc 74 1 67.12 TGATGGATGTCCCGCACTAGCCCCCCAAAACTAAATAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 29783597 5' + BS 5094 1 82.00 AATGTTTATTGGTTAATTTCAGGGTATCCTTCAAGTGAATTGGCTGTTGCCTGCATAAATGCAGACTTGTGTTTTGGGCGGTTTTTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr2L 16536482 5' + pogo 33 1 57.53 ATAAAAGGGGTATCTTTTCTGTTGAAAATACCTTTTAGATAAGATATGTTGTATAAGAAAGGCATCATATACTTTGCATATTGGACAGAGTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - 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chrX 16538200 5' + mdg3 5307 2 55.48 AGCGAGATCTTGGTGATGAATACGGCTGGAAGCAGGTGCATGGCGATGTCTTCCGTTCTCCGCCCAACACACTGCTCTTCTCGGCGTTGGTGGGCGCTGGATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGA:1 - chr3L 5602800 5' + Tabor 6870 2 74.64 TAATAGTAATAAATATAAACTTTATTTCTTTACATTAATTATAGAGAACCCTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr2R 11609891 5' - roo 339 2 68.28 CAGAGGATTGACTCGGACGATAGTAACGACAAATCTGTAGCTTGAAGAATACCGTTAATTTGTTCCAGAATTTAAACAAAATATATGGTTAGACAAACTATAAATATGTTATATTTA:1 + chr2R 5018761 5' + rooA 7271 2 66.67 ATCGATCGGTCCCACTGTGCAGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGT:1 - chr3R 17794605 5' - P-element 2811 1 33.10 ACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 - chr2L 2518556 5' + jockey 91 1 72.60 CTTGGGAATGTTTCGTCGTCCTTGCAGGACCTCATTTCAATTGCAGATTCCATTAGCTGCAATTTGCTAGTGCATCGCACCCGGAGCAACTGCAACCGTAGGCGGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATAT:1 + chr2R 21105663 5' + Stalker2 19 2 72.60 GAAAGAGATAGCGAGATGGCCAAATATAGATCGAATCTGAATAGTGTTAGCCTGGGGAATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 - chr2R 15892230 5' + hobo 57 1 58.22 CACAATGAAATCCACATAAGTTTCACAACCAGAGGTATGCATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 + chr2R 8492741 5' - pogo 2036 1 70.71 ATACAGTCAAGATAAAAGTTCTATTGACAAAATTAAGGTTTATTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 18954092 5' - roo 9044 1 67.12 TCTAATTTATTTTTATATGTATATAAATCGCTTTAGGTGTAGGAGAAAACTGGCAGCGAATGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACA:1 - chr3L 21043140 5' + Quasimodo 52 2 58.22 AGGAGTACGTGACTCACTCTTTTCCAGACTTCTGGACCAGCATCTACACTTTCAAAAATCAGCCACTCAATATAGAATATAACATGTAATATAATATGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2L 19801007 5' - roo 386 2 69.18 TGGCAGAGCTGAAGAGAAAGGTCTGAGGATGGGATCAGTGGCCAGAAAGTTAGAAGTTTGTACTGAAGCTCATCAAAAATGAATGAAGTATATATATATTTATGATTTTGATTTATATCCTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 - chrX 14121897 5' + Doc 4 1 65.75 ATATAACCAGGCAGCTTGACAATCCACGCGAAAAACTGGCAAACAAAATATGTTTCAGCCAAGCGTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGCGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTT:1 - chr2R 18927871 5' - 3S18 6049 2 52.74 ATTAATAATATATTTCATACGGAACAAAGAATGCAAGCAATACCCTTTGCAGGTCCGTTGCCAGTACTGCTAATATCAATAGTAAATAAAAAATAAAATTATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr3R 19449828 5' - opus 482 2 71.92 AATGCCTTAATCTCGTGACAAAAACAGGCCTTCGTCGACGTGCTTCCTCCTTCGCAGTCACTGAGCCCACACCTCCCTTATCTGCACAGAATACACTAGTTTATCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCT:1 + chr3L 9023609 5' + Doc2-element 450 1 65.07 TCTCTGGTCCTTCGCGAATTCTTGAGAGAATGAGCGCCACCAGTGATATCCAGCGTAATAATCCACAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr2R 18056935 5' + blood 7031 2 71.23 TTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTTCTAAAAAAGTATGACAATAAGTATATTTTATAATTAATCTTAAATGAACAGAGGCAGTAGTCATACTCTATGCATAACATGTTCTAATACTTAATACCTGTCCGGGAGATCTAG:1 + chr3L 13220196 5' - G4 3705 1 57.53 GACTTTTCCAATGCACGATACACAAGCGAACAGAATTTATTCTGCACTGATACACTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAAT:1 + chr4 660216 5' + 1360 199 1 63.01 GGCGACAAACAACACGTATCCCCGTACTTAAAGCCAATATGATATATCCGATATATTCTTGGATTGGTTACGTAGGTATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:2 - chrX 18561172 5' + copia 4914 2 50.00 CTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chrX 19162600 5' - pogo 2059 1 66.36 AATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 + chr3L 13546567 5' + hobo 75 1 71.92 AATGGCGTGTTGGCAGGCCACAAGGAGCTGCGGCCGATAGGAGTCCTGCGGTCGGTTAATACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 - chr3L 13631351 5' + hobo 2708 1 77.50 GTAAATATATAAACGCATATACAATAAAACACGAAATCAAGGAGTAATCAGTTTTCAATTTATATCATTACGCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAATTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 7136562 5' - roo 356 2 50.68 CTCTATCAAGATCTGCGTTTCGGTCGGCTCATTATGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTA:1 + chr3R 15346886 5' + hobo 87 1 74.66 CAGAGTCCTCATATAGGGTGTTCTGGCCGAAAAAAAGAATTTATATATGTGTGTGTGTGTGTTACAGTTATAACAATAAATCAACAACTGCTGGCAGCCACTGTAACTGCAGTCGACTCTCAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr3L 15724614 5' + jockey 22 1 72.60 CATTGCAAGGTTTTGGATTTTATGCCAGTTAAATTGCAAGGAAATCCCATTGTCTGGCAATTGAACAGATGAACGTTCACAGCTAAGTTAATCATCAATGAGGGATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGA:1 + chr3R 20285275 5' - transib2 59 1 73.29 CAATCTTTCACCTGCGGCACCTGCTCCGGAACCGGATAAACTCTACAGCAAGCTGGAGATTGAGCTGCGGGGTATTGATCCGGCAGTACGGTTGTCTGCCGCGCATCAGAAAAATAAAAAGAGGCGTCTG:1 + chr3R 15229875 5' - invader1 58 2 66.92 GCTTCGTTGTTGGGCTTTTTCTGGTCTCGGTCTCTCGACATTACAACAACTTCGACTTGAGCCCCTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATCCACTTAAAT:1 + chr3L 17895908 5' + P-element 43 1 51.15 CTGTTGGTATGACTAATCAGCATCAGCATATGCGAAAAACAATGCCGCACCGAGGGCAATACCAACGTGGAGTGAAATAATTGTAATGCATTTTTGGGTTCTTTATTTTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTA:1 - chr3R 24301923 5' - Tabor 7272 2 47.95 TAGCAATACATTAAAAATCCCTATTAAATCTTTAGCTATACATGATTTCGGAGTGCGCATAAAGCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTT:1 - chr2L 1871044 5' - mdg3 5442 2 54.11 CTAAAGCTGTAAATATTGTTGCTGCCTGGTCATGATGAAATAACATAAGTAGGTCCCGCCGGCTAGAGCCATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGTGTGAAAGGAATAGCATTCTGAGTGTCGTATGGAGTCTGAGTGAG:1 + chr3L 11296560 5' - P-element 2792 1 21.23 GAGCAGGATAGGGTGTGTGTCTGACAACTAAAACAAAGCCCAGAGAACAGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 - chr2R 22795213 5' + hobo 72 1 66.44 TTTGCTTGTGGGTCGTGTCATATAAAAACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 - chr3L 20910121 5' + F-element 50 1 50.68 ATATGCGAAAAACAATGCCGCACCGAGTGCAATACCAACGTGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATT:1 - chr3R 24301896 5' - Tabor 7245 2 70.55 CTGCGAATCGATAACCGCATCATACATTTTTCCCATCAGCCAATCAAGGCGAGCAACTAAGCGTAAAAGACCTGCACTTACAGCTATCCTAATTTAAATTAATATACAGTCCCTAGCT:1 + chr2R 23456363 5' + Cr1a 3994 1 39.83 TGCGATGCGATGCGATGCGATGGCATAAGATGGGTTGGGATGCGGTGCACCGAGAGCCAAGTGCTTTTGCTTTGCTCTTGGGGGAACACGTGCCGGGTCTTTTTGGATTTTTATTTTTTTATACTCCTTTTTTTTTT:1 - chrX 6236738 5' - Doc2-element 252 1 55.47 TTATGGCATACAATTTATAGTTGGCAATAAATAAATGACAATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr3L 13380398 5' + hobo 24 1 69.18 GCGTTTTCTATTTGCTCTAGTCGGCTATCTAGCTACCTGCAATTACTTCACTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTA:1 - chr3R 6315444 5' - invader4 2671 1 65.75 TTCCTTTGCTTTAATATATTTTATGTCGAAGTCATATTCCGAAAGTCTAATTTTCCATCTTGTTAATTTTGAATTCGGTTCTTTTAATTTGTGTACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAG:1 - chr2L 16595234 5' - rover 316 2 62.33 GACTCGGCAATCAGGACAATCTGCACCACAAGATCAGTGGCTGTGCCCTGTAAGGATTACCAAGATATTATTAGAAGATGCATTTTCGAACAATATTAAACGCTTAGCAAACCCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAG:1 + chr2L 8193183 5' - Quasimodo 7205 2 63.01 GAGATACAATCTAAGCAGGAAACTTATGAGTGCAGAAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chrX 16857035 5' + pogo 41 1 54.79 TCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr3L 23146509 5' + hopper 8 2 67.13 TATTACATCGCACGAGGGACAACCAGTGAGATACAATCTAAGCAGGAAACTTATGAGTGCAGAAAAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chrX 16857008 5' + pogo 14 1 73.29 AAAATTTCCCAAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATT:1 + chr3R 19144396 5' + Juan 61 1 56.94 AGACCCCCTTATGTAACCCCTTTTTTCGGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAA:1 - chr3R 902613 5' - R1A1-element 5291 1 55.20 GGTTTGTTGTGTTTTATGTTTAACTTTCTTAGAAGAATATATATGTCGCAGATCATTTAAATATAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCATGCGCCATAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCACG:2 - chr3R 3953138 5' + invader1 110 2 71.92 ATCACATATTTCATAAAGAATCATATGTATGTATACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chr2L 20253868 5' + roo 8749 2 79.45 TAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr3L 13380439 5' + hobo 65 1 61.64 AAAGTGGAATATTTAATTTAAACCCGAGGAGAATTGTGACATCCACAAAAAAAGTTAAATAATAAAAAAAAAATAAAAA:1 + chr2L 16722571 5' + Rt1b 5149 3 88.61 AGGCAACTTAAACTAAGGCTGCGATTGGTGACAGTTTGATTGATGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTG:1 - chrX 998209 5' - copia 178 2 71.23 CGAGTTTTGTGGCTAATTTATACCCTTTACTTGTAGTGTAGAAAAGACACTTTTGATTAGTCTTGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTACATATCGATGCTAAT:1 - chr2R 7024489 5' + diver 5945 2 55.48 ATTAAAAAGGCTTGTTGATATTGATTACTGTTCAAGAATGCAAAATATGATCTAAAGTTCAGTTGTTATTTTTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:1 + chr3R 6583242 5' - I-element 5300 1 57.53 CCGTACCCCCTGCCCGCCAAGCTTTACCCCCTCACCGTTGGCTAATTGCTTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 - chr3L 19702849 5' - pogo 2036 1 63.70 TTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACC:1 + chr3L 19951181 5' + Ivk 58 1 56.85 GCATTTGGTCCAAGAAAAGTATATACATACATATGTACATGTATGTACTATCTATTGCTTCTATATTTATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 - chr3R 6461892 5' - Transpac 5218 2 77.40 GCCGGAAAGAGAGACTTCTGGTCTATAAGGTCGGTTCGGATGGGGGAAGTATGTACATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGA:2 + chr2L 9228668 5' - Burdock 192 2 64.38 CCTTGCTAGCTCACCACCTACTTGTTTTTTTTTTGTGTTTTTGCCGCCACAACACAATGGCGGGCAATAAAAAAATAGTTCATGATTTTTCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATG:1 + chr2L 5412775 5' - 17.6 7061 2 63.01 CCATTGCTAATTTGAAAAGAAGTGGGAAATCTATGGTTTAACTGCACCACATTTCGATCTAAATTAAATTTGTTGAGTTATGGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chrX 19591124 5' + roo 38 2 58.22 TATCATCCTCGACCGCTTTTGTCATTCATTCCATTTAGTACGCATCGAATTACTGTCGGCTTGTTCAGACACCCTTACACCCATCCATCCATCCATCCATTCATCTTTCTATCTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 - chr2L 7596152 5' + mdg3 5261 1 61.64 GAAAAGAAATTGCCCCAAACAGGAAAACTTTTTAGAAAGCGATTTCTTGTGCCTTGTCCTCGTCGGCTTTTCGAAGTAATCGTCAATTGATCTCGAACTATATAGAGAATATCGGCAAAAATTAAAAATTGATAAATAAATCGAAA:1 + chrX 888096 5' + Doc3-element 84 1 55.48 TCTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGAGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chr2L 20327673 5' + roo 90 2 78.08 TTTGCCCTACCCAAGTTGCACATGCTGTCCAGTGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATCTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 + chrX 10698638 5' - mdg1 7372 2 73.29 TCGATCTGTAGTCAGGGTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCCACTATTGGGCATTTGTCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr3L 23146509 5' + hopper 11 2 65.07 GTATGAGTGCAATTTGAAAAAACAAACGAGTTAATCAAGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATGTTTCCCGAAATTAAAAA:1 - chr3R 11142265 5' - Max-element 245 2 63.25 AAGATTGAGTTCTTATTCAATTTGTACGGATTTGTTGTTCGCCGGTCCTTTTGCAGTCCGCTCTTAAAGCCTAACCCCAAAAGCCTCCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chrX 20379414 5' + hobo 33 1 64.38 TGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGA:1 - chr3L 23839723 5' + McClintock 60 2 62.33 AGGAATAGCTTTTCATCTTTAGAAACATCTTAACGAAGTGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAA:1 + chr2L 14262905 5' + P-element 19 1 69.86 TCTATATATGATCGAGACATTTGCAAACTCCACCGTCAAACAAAATTCAACTTGACCTAGAACTAAGTTAGTTTTTCTTTTTATACCTGCCCATACATCCTCCACAACTTTCCAAATCTGAGCCTTAGACGTCGGGGAGTTATTCG:1 - chr3R 4524538 5' - HB 1196 1 73.97 AAAACCAACTCGCACAAAATTAAATGCGTCAGACAATTCAGGAACTGGCCAGGCAGTTGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGATTTAAGAGCGGCAGAGGGTTAAGATTACTGATAATAGGATAAAGTCTATT:1 - chr3R 1464946 5' - Cr1a 4211 1 60.27 TTTGTAAACAGTTTTTTATTGAATTAAGAGAAGCAGAGCGGAATGGGATGGAAAAAATGGAATGGGATGGTGGATTATTTAAAATTATTAAAATAATATTAGATTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 - chr3R 30092343 5' + I-element 18 1 49.32 AATCCATAAATAATGCTGGATGTTGAATTATCAGAAAGACGCAAAATTTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCAT:1 + chr3R 15157549 5' + invader3 28 2 64.38 GATTTAACATATTACCTCTCCATAATATGTAGATTTCGGACAAATTGTAAACAATAACGAACATACTTGGAAATAAAAACAAATCAAGTTATATGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 + chr2L 22031927 5' + Tabor 29 2 65.75 ACGGACCAACAAAATCGCAAGGCTCTCAACTGAATTCAACATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chrX 3743774 5' + Tirant 8143 2 59.62 CCTCGGGATTTTCCCCTCTGCCGCAGCTCAGATGTGTGTATCCTTCAAGGATGTAACATATCCGCTTAGAGGGAGGGTAAGGCGCATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTT:1 - chr3R 21505101 5' + 1360 296 1 58.90 AATGGAATACGGCAGAGATCGCAGTCATGTGCTTTTCGTTTGAAATGCTTTCGAGGGTCGCTCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 - chr2L 1892370 5' + hobo 61 1 56.85 TTTTGCAACATTTTAAATTGAGCGCAATTAATTGCAAAAATGTTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGAGTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTT:1 + chr3R 28937501 5' - jockey 4836 1 69.86 GTTTGGACCAATCATCGCGTATGCGATTACCCACACACAATATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAG:1 - chr3R 25094693 5' + P-element 66 1 35.07 CGCGACGGAATCCTGTTTGGAGGGTATTTCAAAAAGTGAATACGCACCAATTTAAGTGGGTTTTGTGTGTAAGAGCTCTGTTTATATTCCCAAACTCTATATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAG:1 + chr2L 19217548 5' + springer 18 2 45.89 TAAAAAATCCTGCAAAAGGAGCAGGAAAGTTGGCAGAAAGTTTCCTGCTTTTGTGTGCAAATATTTAGCACGGAAATTGCACTTGCAACAGGAGAAGTCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr3R 26139373 5' - mdg1 7437 2 69.86 TGTTTTGCGTAAAATAATAAATATTTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3R 11873311 5' + 412 31 2 63.45 ATATACTCCACCACAGGTTTCAATCGCGTAGAAAACCCAAAGAAAACGTATTCATTCTCAATTGACTTGAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2L 8009041 5' + roo 50 2 50.68 TGGGATGGTTTGGTTTCGGGTTTCAAAATGCTACGGGGAGGCGAGGTCTGTTTAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAACCTATCATGGTATCTACTCGAGTGCTGGTTTATCTTGTCAAATACCGTTGCGAGTTTT:1 + chrX 7798389 5' - X-element 4370 1 73.29 TCTTGGCGTACATATTGCTCATACGCCACGTGAAACAGCATCGGCTTATTTTCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGTAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 - chr2R 8492831 5' + pogo 65 1 65.07 CAGCAGAGAGTTTTGTGTAATTGAAAGGAGAATTTGGGGAGCGAGGGTGAGACGGAGCGAATACTGCAAGACAACAGAAGAACAGATAGTGTCTGCTTGTAGATTTCATGTCCCACGTTTGGGCGCCAATTATAACTCTAACGAAC:1 + chr2R 3381215 5' - Circe 232 1 73.97 AATGCATAAAATAGTTTTCATATATAAAGCAGTGTGTCAACACACAGTGTGTGCTAAGGATTCAAACCTTAATTTGTTTAAATAAGCACGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTA:1 + chr3L 15374594 5' + 3S18 5800 2 63.01 CAAGGAAGCGACATATTTAAGAGCACTCATCAACAGAATAGTGCTCTTAAGATGCTATAACGTATTTAGTATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr2R 5485007 5' + 1360 16 1 74.48 TTGTTGATTGGATTTCACTGATTTTCATTTTTCAAGGCTAACTTACAGCCATAATTCAAAAGAAGATACTCATGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGCATATATTTAAAGACT:1 - chr3L 19938617 5' + roo 13 2 77.40 GAATGTAATTGCTTTAGTTTTACGTGCTGAATATTCTTTTAAACTTAGCTAACGATGTATCGAATCTTTATCAAAATACTCCTAGGTGAATGCGCGAATGCAAACACATTTATTCCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTA:1 + chr3L 4113820 5' + INE-1 503 1 75.34 AACTATAGTGTAAGCATATTAAAGATTGCAATGTGCATGCTGAACAACTAAAGTACCTTTAAAATCCCATTACCCTATTTGTGTACACAAACATATGAGTGCGGAATAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 + chr2L 2722301 5' - flea 243 2 79.45 TCTTTTTACTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAA:1 - chrX 22824271 5' - Gypsy12A_LTR 2251 1 61.64 GTGAAAAAAACAGTGTGACCGCAAGGCAGTAATACAAAATCATCTACGTTTCATAAAACCGTGCTGACACGGTGATATGATTGATCTACAAAGGTGTTGCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACA:1 - chr2R 10838745 5' - Q-element 128 2 71.92 GTAGGATAGGGTGTGTGTCTGACAACTAAAACAAAGCCCAGAGAACAGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chr2R 22795211 5' + hobo 68 1 66.43 GAAAAATGAACGAAACATGATTCGCCAAAATAGCAAGAGCTAAACATACACACGAACTCACATAAATATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr3R 23208254 5' + pogo 49 1 57.53 CGATTCCCAGCATTAAAAAAGATTAGAATTCATTTTATGTTAATATGAATTAGGAAATGCAATTTTAATGGCATTAAATTCTTAAGAGGCTAACAATAAGATTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATATTATGAAATG:1 + chr2L 20803344 5' - Doc3-element 4634 1 52.05 AAATGTCCTTTCGTCCTATTTGTGTCAGGTGCCCTGCTTCGATTTCAATCTGATTGTATTATTGGAAATACCTACGAAAGTTATAATTATTAACGTTATTACATGACAGATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATAT:1 + chr2L 8852717 5' - Burdock 246 2 72.60 GCAGTAATGCAACTGCAACTGAAACAACTTTTACTCACAATGAAATCCACATAAGTTTCACAACCAGAGGTATGCATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr2R 8492706 5' - pogo 2065 1 59.59 CATCAAACATGGCTGGATCATTCGTTGAAAAATAGAGTTCTGAATCCAAGAAGATTAGCAGTGACAACAAGACACGTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 - chr3L 23868341 5' - 412 447 2 53.42 AGCGATAAGGTGCGAATGCTATCAGGGTCCGCAAGTACCCCACATATATGTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTT:1 + chr3R 8810644 5' - 297 6913 2 69.18 CGCACGTTTTGTGTTCCTCCTCTCCTCCTTTCGTGTATGTTTCTGTTTCTGTTTCGCTTTAGTTTCACTTTCATTCGTCTTCGATCGTCAAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 + chrX 19506045 5' + P-element 31 1 65.75 GGATTAAATACATACACATGCATATGTATACTATGTAATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCA:1 + chr2R 10601204 5' - jockey 233 1 74.66 AGCCAGAACATATTTATTTTTAAGGTTGTCTGCCACTTTCACAAGGGATACATTTTATTTCCAAAGGCGTTCCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 - chr2L 5732839 5' - hobo 2891 1 54.79 CGAATGAAAATGAATGAAACGGAATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTGAGTG:1 - chrX 1831292 5' + P-element 49 1 30.69 TATTGTTTATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATT:1 + chrX 18193705 5' - hopper 1358 1 58.22 TGTGCGTATATGAGAACAAAAAGGAAAAAGAAAAAAAAAAAGGAAAAATAAAAAAAGACACTATGATCCGGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACGCGA:1 - chrX 4931828 5' + Doc2-element 298 1 83.00 ATTGGGCTCGAAAACCACCCACCAACACAATCACTAGCACAAAAGCGGAGAAAGAAAGACGCACAACAAATATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAGCTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 + chr3R 28788696 5' - I-element 5303 1 49.32 ATGCGTTTTTTCGCCCTTGCCCTCTCTTTGATGCTAACTGCTCGTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr3R 10741030 5' - 1360 3377 1 75.34 CAGAGTAAACTGGACTCTGGCTGGCATTTCTTAATTAGCTAAAGTTCGCTCCGCCATCAATGAAGATTCATATCGGTGTGTGTGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACT:1 + chr3L 13568147 5' + hobo 31 1 60.14 AAATTTTATGGTACGAAAGCTAAACAAAGTTGATTATTTTATAGTTTTGAATCAATCGAAATGGGCGAAAATACATAAATATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 - chr3R 15453793 5' - Transpac 5194 2 60.96 TGCTAAAATAAGATCCATCTCAACAACCAGATATGAAAAGCCAGCACACTTGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAA:1 + chr2L 5333393 5' + mdg3 59 2 64.38 CTACAATAACTGCTGGGGCATTCGGCCGGACTTCATCAATACTTACTTATGTATTTGGTTAAATCAATATTTACAATTATTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 + chr3R 846168 5' + copia 41 2 60.96 GATCGACGAAGCGTGCGCTGGGAAACATGTCGGCGCCTTCAAAAGTAGCAGCTAAGCCAGCAGGAGCAGCCAAGGATTTTGTTGTTAGGTTCAATATCTACATAGAACATGTTCAGTGGCGTTTTGGTCGCACGGCTTTT:1 + chr3L 3052648 5' - G4 482 1 55.71 GGAAAGTTTTCGCAGCCTAAGAGTAGGCTACACAAATGTCACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGGAATCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chr3R 27056369 5' + jockey 9 1 74.19 ATTTAAGAATGCAGTTTTAATGGCAATTCCATTTGCAGCCAAGTGGCCAGATTTCCCCGATGGAGAAACCGAAAAAACGGTCATGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr3R 26658118 5' - hobo 2914 1 66.42 GGGAAGTAGGCAACATTTTTTGTGTTTGCTCTTTGTGGTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 - chr3R 8625258 5' + jockey 89 1 74.66 CAGTTGAAGCGGTCACAATTTAAATTGTATTCCAAAATGCACAGTGAAAAAAGTTTCGAAATAAAATCGATTTTTATGCACTATTATCTAAAGGCTGGCAATCTAGCCTAATCATTAAATGGCAAATAGATTTCATTTTTTTAAGT:1 + chr2R 10864011 5' - McClintock 410 2 65.07 TTAATTTGTTTAATTTTTATTTAACTTTGCTTTTATTTTATCTTTGCTGGTGGAGGTACGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGAG:1 + chr4 941837 5' - TAHRE 10370 1 86.99 TAATATCGTAAGAATATCATAGATTTAAGGCAGAGCATTTCAGACAGCACTTGTACCGTTCTAGACTTAAGAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr3R 18514448 5' - pogo 2058 1 56.16 AGCCTAGTTTATTTTTATGCGATTTTCATCTCACTCATTTGTTGATTTTATTTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGC:1 + chr3L 9905759 5' - Juan 4143 1 66.44 AATACACGTCCGTTCGTTAGCAATGATGAATAAAAAGTGAGTTGAATGCTGAAAAATGTCTTTTTCTTATATATAGTGACATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATA:1 - chr3R 443323 5' + Quasimodo 34 2 62.76 TAATAGGTATCAAAACTCGGCGAAAAAAGTGGCAAAAGCAAAAAATCGAAAAGTAAAACGGACCAACAAAATCGCAAGGCTCTCAACTGAATTCAACATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chrX 3743717 5' + Tirant 8128 2 71.23 AAAAACCAAATGGGCCATTAACAGCTTAAATTGGGCACCCTTATATAGAGCTTTTAACTAATTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 10838610 5' - roo 9013 2 63.01 ATTCTTCATGATGATCTTCAAGACGATGCAACAGCACACACTTCAACAGCATCGATGGCTTTTTTAAAGGGACACATTTTTCAGAGCGCCTTAACTCAAT:1 + chrX 21585427 5' + mariner2 522 1 76.00 AAATCATAAATTACCCCAAAAAGTATGCAACATAATACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr2L 12861696 5' + jockey 57 1 50.00 AAACAGCACACAAAGCTGAGAGCAAAGAGGGCCAAATCAAAGTAAATAAACAATAAAAATAATCGGGCCGTTAGCAACACATGTGCATTTTTCATCATCATCATCATGACAAGAAATTCATTCTTCATTAGAGTAATCAAAAAAAT:1 - chr3R 16510605 5' + jockey 4818 1 72.60 TCGCACAGTGGGCCAAATTAATTGGTTAACTAGCTAGCAATGGGTATTGGTGATCCAGATTTCTAGAACTTTTGATCACACTTTTGTAAAGATTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAA:1 + chrX 19298213 5' + 297 6893 2 63.01 CAGACCACTTCGGTTCATTGAACCAACCCCGTACCCCCTGCCCGCCAAGCTTTACCCCCTCACCGTTGGCTAATTGCTTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 - chr3L 19702877 5' - pogo 2100 1 78.18 ATGCAATTTGTTTAGTTTATGAATGTGTTAAGGATTTATGTATTTAAGTTTCAATTGAATAATAAAAGTAGTATTGAAAACGGTGAGTTTTGAAACTATTTTTGTTTTTTTTTTTCTT:1 - chrX 8668660 5' - Doc2-element 248 6 78.81 AAACAGCTCAACTAGCTACCTTAAAACTTAAACAGGAATAAATTCTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3R 18539797 5' + roo 76 2 72.60 ATTGAGAAATAATTTTTTCTGTTAGAATACACTGAGAGAAGTCAATGCAAAAATTAATAGTTGTGTATAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACGCTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 - chr3L 13015997 5' - hobo 2884 1 54.79 CAATTCAGTTGAATTCTTTTTGCACACCACGCACTACAAAAAAAAAAACCCACTCAATTAATTCAAGAAAAATAATGCATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCA:1 + chrY 1076858 5' + 17.6 37 2 57.86 GCTTGCTGCAACTAATAAACAAACAAAATTATAACTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 - chrX 13558255 5' + mdg3 5302 2 70.00 ATTTATATGTTTATATGTAGCGAAGGTGCTCTGTAAGACGGAAGAGTTGTTTATGATCTATTCCCGCCTTGACTTCTATGTACCTGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 - chr3L 22445309 5' - Transpac 277 2 61.64 AAGGCATATTATCAATCAATATAAACTGAGCAGAATAATTTGATGTTACCACTGCATTATCCATCCCCAGAGTTCTGTTCCATTCGTCCATATTGCTATTTTATTATGTAATTATAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCAGTTAA:1 + chrX 18871528 5' - Porto1 4189 1 56.85 AGCTCCAAGGCAGGAGCTTTTTGCAAAGCTTTCTTTACAGTTGTCTGCTTACAGTTATTTATTGTTCATAATTATCTAAAAATAATCAAGATTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCT:1 - chr3R 17401823 5' + Juan 31 1 61.64 ATAGCGGAACGGGGGAAATTGGAACTCGGGGACGTTATTTTTGCGATTTTTTTCCGCTTATCTAAACTACCGTGTCCCTATAGGCTTATAGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr2L 5724427 5' + 1360 8 2 29.92 AACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAAT:1 + chrX 12344302 5' + F-element 76 1 60.27 ACGGCAGTTGGATGGGTTGAAAGGATTCGAGCGTCGAATCCCTAAATACACTAACGCAAGTCCTTCGATAATAGAATTTAGGAGCATTTCACTCACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 - chr3R 11550322 5' + F-element 34 1 66.19 TGGTTTATATACACACACACAAGTGTATCTTTGGCTATATCGCACAACTTCCTTGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTAC:1 + chr2L 16360572 5' - hobo 2873 1 64.38 ACTCACCCCGCATCCCTTGCCGCCTACTTCTAACGCTCGTTTTTTTCAACGCTCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTAT:1 - chr3L 10111852 5' - copia 186 2 63.70 TTGGAATTGCGTGGCAGGCAGAACAAGTTCCACACATCGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATAT:1 - chrX 19890153 5' - Quasimodo 31 2 72.41 GTTTTACACTCTTCAAGCTTGTAAAAACAATAATAATATCTGACCATCGATCGGTCCCACTGTGCAGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chr3R 17794650 5' - P-element 2855 1 63.70 AAATGAAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAG:1 - chrX 8610316 5' + mdg3 5312 2 56.94 TCAACGCTTTTACACGTTGTTGATGTATTACTATATACATAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTG:1 + chr3R 4570255 5' + Juan 84 1 71.92 AATAATTCTTATTCCAGTGTTGCCAGATTACTTTAAGAGATTACTCAACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 - chr2R 11691284 5' + P-element 75 1 34.25 TATGAAATTATTAAATAAAATTAATGAAAATAAAGAAATAAAAATAAAAGTAGATCCATTATGACCTGATGGTCCTAATAAAGTTTTAAATTCTTTATGAAGAGTTTTATTCATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCG:2 + chr3R 5467401 5' + R2-element 245 1 28.08 CCCCCTTGATTTGGTGGAGGTGTGTTCACGGAGGGATAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACG:1 - chr3L 4275326 5' - mdg3 5197 1 75.34 AGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGCCAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCACTAACCCATAGCC:1 - chr2R 3091664 5' + F-element 312 1 63.77 GGCAAACAATGAACAATTCAAGAACCCAAAATCCACAAGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr2L 20327621 5' - roo 8991 2 72.60 CGGAGTTAATTATTTATTTTCCCGTTTTCAGAGAAGAAAAGCGGCTTATGGACAACAACAAATACGGTGCGCCCGAAAGTATGCAGCCAAATATTTATAGCACGCCAATTGACTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGAT:1 + chr2L 19841440 5' - BS 5085 1 76.71 AAAAATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAA:1 + chrX 16857072 5' + pogo 78 1 71.92 GTAAACTACTGCATACTAATATCGGTGTAACTAAGTGTTTGACAAAGTGATTACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr3R 24760654 5' + pogo 42 1 56.85 TAGCTTTTCCCCCCACTCTCTCTCTCTCCCACTATGTCTCACACACACACACACACATTCAC:1 + chrX 5082389 5' + accord 7033 2 66.13 AAACTAAAGTGAACTTAATTAACAAAGTTTTCAAATCCGTATATCAATTAAGAGTGTATATCTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTT:1 - 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hobo 2894 1 67.62 AAATGTTCAAAATATAAATAAATATTTTACGCAAAAAGAAGCATTCAAATGTATACATTTAAATGTATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTC:1 - chr2L 13156591 5' + Max-element 58 2 54.79 AGGGCATCTCGATTATATCCAGAAGTTTGCCAGACATATTTGCGACCAAAAGAAGTATATAGTAGCATATGAGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCATATAGGAACAGCCATAC:1 - chr2L 10685878 5' + Quasimodo 59 2 61.43 GTTGTAGGTGCACTGGAAAAAGTCAAAGTTCATTGTGTATTTTGATAGCTGTGAAAATAAGATACAATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATT:1 + chrX 18561050 5' - copia 201 2 54.79 CTCTCCGCAGATTGCAGCTGGCTTTGAGCCCGACTTTTTGGGTTCCGTTCTGGGCCAGTTTACTTTTCACTTGCGGACTTTTTGTGTAAATGGTATACCATGATTCGTAAGTATATATGTTCTTGATCAGGATCAATAGTCGAGGC:1 + chrX 3437257 5' + INE-1 92 1 58.90 GGAATTGTCAAGCAATCCGTCGATAAAGAAATTGAGCTTTACGGAGAAGAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1 - chr2L 22177449 5' + Doc 78 1 69.86 GACTTTAAATGGAAATTTAAATGATATTCCAGGGCAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGGTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 + chr3R 6578681 5' + F-element 61 1 69.44 AGCTGAATCTTTTTTTGAACTGTCCCTAACAGTGCGTAAATTGCCATTTTCAAATACATTTCAATCCGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGTTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTT:1 - 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chr3L 1324366 5' + 412 7101 2 52.41 ATAAAATATATCTTTATGAAATCAATCAGAGAAAAGTTATTAGTTTGTTTTTAATAACATTTAGAGGTGTTTAAAAGTACGTAGTACAAAAATGACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 + chr2L 17296929 5' - Max-element 8508 2 68.28 ATGATTACAAAACTTTTTATTTGAGAAGAACACCGACCTGTTACAATTAGTTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATTGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGAT:1 + chr3R 31708628 5' - Idefix 7175 2 64.38 CTCAATTGGATTGTATCAATTTCTTAAGCCATTGTTCCACCATAATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3R 7305918 5' + 412 74 2 69.86 TGCGGCTGACTCATAAAACTTTTATTGGACCCACTTGATGGGGAAGTTTTTTTTCTTATTTTTTTTTCTTTTAAGTACGTGCCTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr2L 10128056 5' + hobo 39 1 58.90 GAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCC:1 + chr2R 17872487 5' + Tirant 8106 1 70.59 GCTTACAAATAACTTACAGTTACAGAATGCTGCCATTATGTTTTCAATATCCGCAGTAATTCCTTGATTTATAGACCCAATATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr2R 18467284 5' - roo 406 1 80.82 AAAAAATAGCTAAGTCAACCCTTAAGTGGAAACGTAAGCCAAGTTAGCTGATGGACTTTTCCAAAAAGTTAATAAATGAGAAACCTATAGAATTTAAAAAAATCGAAGTAAGCAATATTAAACGTAAAAAAAATTCCCAACAATAT:1 + chr3R 18496413 5' - INE-1 388 1 47.95 GGGACAAAACGCTTTTCCGCCACGCTGCTCCTGGTGTTAGGCTATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGA:1 + chr3R 25094629 5' - P-element 2815 1 33.57 CTGTTTGAGTGTATAAATATATATTCGGAGGGGCAAAACCAGAACTTTGGGAAAGTGTGCCGAACACTTACTTAAATTATTCAAAGTACTTATCCCTTTTTCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTT:1 - chr3R 13824074 5' + Transpac 166 2 69.18 AAAACCAGCTACTATTGCTTTGCATTTTAGTGATCAATTGATTTTGCATTCAACTAAACAACACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAA:1 + chrX 12344300 5' + F-element 74 1 58.90 CCACGTTTTCTAACTGTTGTTAGCGTACGAACCGGAGATCGCGGGCTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGT:1 + chr2L 20716348 5' - P-element 2813 1 34.93 GACATCAGGGATCGCGTGCCAAAACATTGCGTAAATCAAGCAAATGTTTCTCGGAAAGTCCAAGTCACCGATCATCCATTGGTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr2R 12642765 5' + pogo 34 1 62.33 TTCAGCGACTTTCTTTTTATATACCATAAGCGAATGTTAATTTTTCTGAGGAAAATATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCC:1 + chr3R 8338120 5' + jockey 4624 1 61.64 ACAAATGCTGCAAACGATCTTGCAAGGGACTCTATCTGAAACCGGAGTATCTACACGATGGAAAACCGGTGTTCCGGCCTCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chr2R 12872861 5' + P-element 42 1 56.85 GGAGGAGTCTGCCCCATCGACTTCGGCTCCTGTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACGCGCACTCTACGTCC:1 - chr3L 13380506 5' - hobo 2924 1 50.68 GCCATTGAGTTTAATATAAGAGTTTGTCTGCAGCTCCTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAATGCCAACGAATGGTTAAGCGCGACATCCACACTTC:1 + chr2L 8807855 5' + HMS-Beagle 78 2 68.49 TAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 - chr3R 31663315 5' + jockey 91 1 72.60 AACAGGAAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCCATTTCTTCTTTTGATTTTTGAGTAGG:1 - chr3R 13572095 5' - 412 411 2 69.86 GGGCAGAGAAAGCTGAAGGACAGACAGCATTCAGTCTACCTAAATCTCAATTCATTGCCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTAATATTTCATTAAGCCACATATTAAACTCATGCCCGTCCCTCCTACAAGCCAAACAAGATATATT:1 + chr3R 9109293 5' + I-element 5071 1 76.03 GCAGCCATAATTCAAAAGAAGATACTCGTGTGCACTGAACTGTACTATTAGTTATGCTAAATTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr3L 19938573 5' + roo 57 2 59.59 ATACTTTCCAGCGCTCGCACACTTTGTGGCTCTCATGAATTTTTCCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGC:1 - chr2R 5899285 5' + jockey 4579 1 69.18 TCGCGAAATTGTCGATTTTTTCTTTAAGGTACTGAGCTGTGCCATTGGGAGGTGACGGGGCTAAATTAAAGCGATTCCGAAATTCAAGCTGTGTTTTAATAACCGAACAACCACTTGAAAAGTAGGCCTCAACGGCAAAGGCACGA:1 - chr2R 1775572 5' - mariner2 154 1 63.01 CAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr3R 13572023 5' + 412 7098 2 60.33 AATCTCTATATTAATATATCTTACAACCCAATTCGAATTTTTTAGAAAGCTTACGGTATGCTTTTAATTCCTGTTTATGAGCTATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 - 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roo 9020 2 58.46 CATCGAGGTGTTAATAAACCCGATTAAGAGTTCATTATTAACAATGCTAAGTATCAATGGCCATAGAGCAATCTACGCATTTGCGTATGTTCCATGGGTGGATTTTTGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGA:1 + chr3L 16260641 5' - Idefix 7057 2 70.55 AGGCATCAGTCCTCGAATGCGAAAATGTGTGTATAAATTAATTAAATGTATGGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACGGGGGGTTCCTCTGTCACTGGGAGGCAGGGCGGTTGCCGCAGACCTCTT:1 + chr2L 15934573 5' - gypsy6 7733 4 76.71 AAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAAA:1 - chrX 22386783 5' + hobo 91 1 53.91 AACAGCGGCGCCAGAAACCGCAGCGAACAGAAAGCAGACATCCTTTAACAATTATTATTCAATATTTACAGAGAGATATGAACCGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:2 - chr2L 12767091 5' - hobo 2899 1 53.42 AGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGA:1 + chr2R 17872486 5' + Tirant 8154 2 58.97 TGCATGGGAAATATTAAAATAATCAATCTAATATTAATTTATTGGAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAACAACATGATTGTCGGAAATCG:1 + chr2L 7167256 5' + flea 4815 1 72.18 AATGTAATTGCCAAATGAAGATCACTCCAACAACCGGCCCTGTACTCTGCCGTGTGGTTGTTGTTGCTGCAGTCGCCAGTCGACACATGGCGAATATTCGAATTCAGATTCGGTCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3R 17794473 5' + P-element 5 2 78.08 ATGTTTTGCGTAAAATAATAAATATTTTGCGTAATTAAAATGTTTGTAACAAAACGTATTGCTTTCACACTGTCCAAATATCGGAAATGTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:2 + chr3R 11873310 5' + 412 7084 2 63.70 AAGATTCTTCTCGTTTTGTATTACAACTTTGATCTGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3L 12775988 5' - roo 322 2 77.40 AACAGCCTGTCATCTTTTCCCATCAAATAACCAATCAACAATTGATATTCTGCCTGCATTCACCTGGCCGGCAAAANTTCACTTAACTTTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 + chr3L 19702716 5' + pogo 28 1 65.75 TCCGTGCGATGGTGATGATTGGCAATCACTGCCTCTGTGTGTGCCTCTGCGTGGGCGAATGGCACTCACTTCGATCTGATGGCCATCGACGTTGACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr3R 11730639 5' + hobo 27 1 65.75 AATTTGTTTATTTTTAATTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTTTTAACTTTGCTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATA:1 + chr2L 6801373 5' - HeT-A 5992 1 63.01 AGATGTGGGTTCTATGCACGCAAATGTTAGGAAGCCGTCCATACAAAACTTGAGATGTATTTCCCCAGAATCTCTAACATATAAGTTAATAATCACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCTCAAGCGACCGTTTATTGCAATTT:1 + chr2R 5800450 5' - HMS-Beagle 7001 2 61.38 CTTCTTTCGAGTTCAGTTTCAATGGCCTTTATCAGCTGTTTGGCACATGGCGTTGGAAGTGCGGGTGTGTGTATGTATGTAAATAGTATGTACAGTACGTACGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr3R 17079548 5' - 1360 3369 1 71.92 AAATATATTTAACCTATTAAATAAAAGACTAAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - 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chr3R 11142267 5' - Max-element 8457 2 67.61 ACTTCCCCTTAAGGTATACTTACTTTAAAATAATGTCTACCATCTGTCATCGCTGGATCACGGAATACTCATACTTCTGCAGCATTCCCACAGTCCGCGCTTATCCCTATCCTAAGCCATTAATTATTATTAATATTATTATTTTT:1 - chr3L 8491661 5' - mdg1 7078 2 79.45 GCTGATTAAACCCTTTTTTTACACCCCCACCACCACCCACTCACCATGCTGAAAACCCTTGCCTCATGTGGCATATTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:1 + chrX 7657410 5' - I-element 5313 1 52.05 TCAATATGATCTCATTGTTGGCTAAGTTAATGCTGTTTTCCTTATCGCATACTGTGCAATATGTCTTGGATTTTTATAATGCAATCTCCGATTTTCGCCAACCAGAGGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 + chr2L 9499201 5' + Transpac 10 2 73.29 ACCCCAAAAAGTATGCAACATAATACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr2L 12861708 5' + jockey 69 1 58.22 AGCGCAGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2R 18266083 5' - roo 8988 2 75.34 CACAAGCACTACTCCTGCGATCAATATTAAAGCCGAACCAGCGGACAATGGAAACTCACCTGCAGCTGCGATGGCAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGCATGTGCCTATGCAATCTTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3R 15363535 5' + 412 23 2 65.75 GTAGCCAGAACGGGAACCCAGAAGCCCGAAAATGTATGCAATACTAAGAACATTGAGATCTTGAAAAGTATTAAAGCTTGGATACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAG:1 + chr2L 19364049 5' + BS 4798 1 43.75 AAAGCCTAATACCTACTTTGCGTTCGGTTAAATGCTGCAGCCTCTTGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 - chr3R 6149854 5' + jockey 84 1 67.81 AGAAAAAGTGTTAGAAAGGGGCTCCATTTGAATTTCGGAAAAAATCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:2 - chr3R 12540557 5' + roo 8740 2 71.92 AGGGGTTAGCAATCCGTCCAATTCTAAAGCTTTCTTTATGGGTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTA:1 + chr2L 19565457 5' - jockey 4913 1 71.23 CACAAACTTTTCGCCTAGACGGTGCTTTTTTTCCACTTTTGCACATACATACATACGTATACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGCTAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chrX 13484118 5' - hobo 2897 1 52.42 CATATTTTTTGGTCAACTTTTCTGACTCAAAAGACTCTCGGTGGAGTTAGCAAGCTTAAATGATTTTTAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2L 15596906 5' - roo 358 2 57.53 GAAAGTTCGTCACGTTCGCTCACTTCAAATCCCATCAATGGAATACGCCAGAGATCGCAGTCATGTGCTTTTCGTTTGAAATGCTTTCGAGGGTCGCTCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2L 1892406 5' + hobo 25 1 67.12 AAGGAGTAATCAGTTTTCAATTTATATCATTACGCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3R 7136600 5' - roo 318 2 78.08 CTTCTACCAGCGCTTTATTGCCCCCTCAGAGGAACCGGATTCCCTCCTCTTTCTTCTGCTTTCATACACTGAACAATATATTTAATCATTTTACATTTTTTTTTATATTTTTAAGAAAATACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 - chr3R 12936241 5' + F-element 15 1 60.27 TAACGCAAGCAATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAACTCCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 + chr3L 11887209 5' + Doc 77 1 68.49 GCCCAAGGACCAAAAGCGACCGCAAGTTAAATAAGGAGCATAAAAGAAGGAGACCTAGAGAAATTTTGCTCACAGAACGGCTGAGAAATGCTCTATGGCAAAAAATAAAGTTTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr2L 12814867 5' - hobo 2931 1 78.77 AGAATGCCTTATAAATTGGAAGTAACTTTAAGTTTTATTGGGACCTATTGAACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:1 - chrX 16538186 5' + mdg3 68 2 64.83 GAGGAGAAGGATGCAGGCAACTTAAACTAAGGCTGCGATTGGTGACAGTTTGATTGATGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTA:1 - chrX 998223 5' - copia 192 2 61.64 GTGACACGTTCGAGAGGATCGGAGTGCAAGGAAGTGGGTTGTAGCCTCGAATAATTTCCATATCCTGTGTAGCTGCTCTAATGTATTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACTTTTG:1 + chr3L 13631229 5' + hobo 35 1 62.33 CGATTCGTTCTTTTCGCCCGGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCTATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGT:1 + chrX 13642063 5' - P-element 2822 1 21.82 TGATATATGAGTTATAATTGATAAACTTGAGGGGTTGATTCATATGTAGTTTTAGGTTACTTAGTCGCTTTTACTACTATGCAGTATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 + chr2L 14678710 5' + Quasimodo 28 2 65.75 GAAGAAAAATTAAAATCTGTTGGTAAAAATTATCATTATGGTCTTAAAGAGCCCGCAAGCTTCCAGATCGACGTGTACAAGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chrX 22760431 5' + roo 8705 2 57.53 GAACCAGGAGAATCAGCAGCAGTAACGGCTAAAGCAGCAGTTGAAAGTCCTCACCCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACCTAATTTTTT:1 + chr3R 12781485 5' - pogo 2038 1 60.96 AACCTATTCGAGTTTTGTGGCTAATTTATACCCTTTACTTGTAGTGTAGAAAAGACACTTTTGATTAGTCTTGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCG:1 - chr2R 7024497 5' + diver 49 2 52.74 TAGAAATGGGCATTGGGCATTGGGAAGGTACGGTGAAGATTGCCTAAATAGAACTCAATAAGAAACAGCTACATATGTTCAAGGCAATAGTGGCCAAAACATGTAGCGGAACAAATGCAGTCATTTATTTAGTATTTAAAATGTGT:1 - chr3L 11092124 5' - G2 3048 1 50.00 GATCTTTGTATCTGCAAATCTCTCATATCAATAATATGGTTTCATTTATATTTTCAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATA:1 - chrX 21322830 5' + Juan 4092 1 62.33 TATTACTACTATAACCTTAAAAGAACTCATATAAAATATGGTATATTTTACAAGCAATTTAAACTTAAAGGATTACAACATGTTTATAAGCATTTATTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3L 10733606 5' - 412 7525 2 63.01 AATTTCACAAATTTCATTTCAGGCCATTTCACAGCATTGGTGTTGGTGTTGTATATTTTCCACTAAAATTTTTTTTAAATTATGTACCCATATTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATC:1 + chrX 17690429 5' + Doc 296 1 64.34 CGCTGGAAACTCGGCACACATTAAACAACAACGGCGATAAAACAAATAATGGATAACTACGGGGTGAAGGGGTTAAAAATCTCATGGAAGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - 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mdg1 350 2 65.07 GGCGAAGAAGCGATACACAGATCGTGATTAACGTTTTATTAAAATAACCTAAAATTTGTTGACCTGATTATGTACGACAAAAATAAAATCTTACAAGTAAACAGTTGTCAACAAAAAATATTAAAATTTTCTTATACATATTTACT:1 - chr3R 31976598 5' + TART-B 10184 1 76.03 AATACCATTTAATGACATTTCAAAGTTCCTAATCTGCATAATAATAACCTCTTAAGCCAAAGCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTAT:2 - chr2R 9444010 5' + copia 4930 2 56.85 AATGAGGTATCGAATTTAACTTTAAAAGGAATTAGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAG:2 + chr3R 22160888 5' - copia 169 2 75.34 ACATATCGAGAACCCTTTTAACATACAAACGTAGCACTTTGTTGCAATGCGTAGAAATTAAAATTGTCACTTTTTAATTATTTTGTTAAATAATTATAAAGTTACAATTTTGTATGTATTATGCTTAATCTTAACCTTCTAGCTTT:1 + chr2R 5171982 5' - INE-1 166 1 59.59 AAGCAGGGAATAACTCAATTTTAATGTCATATCCCCTTTCAGTAAAAATTGAGGTCAACGGACCAAAATAATAAAAGAAAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chr3R 7645081 5' + I-element 43 1 56.85 TTATGCAACCCAAGTGGGTGGCTGCCAGAGGCTCAACATTTGCCCACCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chr2R 13773019 5' + opus 7149 4 56.76 AAATAGCTACGCTTCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 - chr2L 15057250 5' + hobo 63 1 66.67 GCTTAAAATTTGTTTTACACTCTTCAAGCTTGTAAAAACAATAATAATATCTGACCATCGATCGGTCCCACTGTGCAGCACTGAGCAGCTGAGCTGACCGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr3R 17794661 5' - P-element 2866 1 71.23 ATATTACTCACTTACATTGCTCTCCCTGGGGCGACAGCTGTCACCCTTGCACACACGTACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 + chr3R 17079412 5' + 1360 34 1 53.04 TGGAAGTGGATGCTACATGGTGGAAAATGTGATAATATCGCACTTTTCTATTTAGTTAAAAATCGCTTTCAATGGAAGATTTAAACTCGCACTGTCAAACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3R 18498379 5' + pogo 20 1 66.44 TTGCAATTGTTTCTATAAAGCAGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCT:1 + chr2R 12185270 5' - accord 7369 2 72.60 CACCCCCATCACCCTTCCATACCATCCTGGCTTCATTTTAGCGGAGCATACTTTCCAGCGCTCGCACACTTTGTGGCTCTCATGAATTTTTCCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGA:1 - chr2R 5899332 5' + jockey 4531 1 64.14 AATGAGTAAGAGTAACTGGAATTTAGAAAATTATCTTGTTTAGAAAGTAGTTACATGATACATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAAC:2 + chr3R 26693342 5' + Stalker2 60 2 58.90 TAGCTAAGTAAGGAGGAACTGCAGTTGACTGTACTCCTTTGTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATT:1 - chr3R 6523280 5' - I-element 5281 1 69.86 AAATGAATGAACTTGGCTTTATTTCCTGTGCAGTGGAAACGGAATTCAATCTGACAGCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 - chrX 8610311 5' + mdg3 47 2 54.76 TGACAAAATTAAGGTTTATTCTGGTAACTTCTTCTGGTAAAACCTTCTCATTGAAGCGTGTGTTTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3L 18954116 5' - roo 9037 1 57.36 TTATATTAATACATATGTAAAGATAAGGGGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr2L 12814744 5' + hobo 57 1 71.68 TGCGAAGGACATCGTGCATCCTGCGTGTGGAATTGCCCAAATGCAAACTGAAGAGTCTCAAATTAAATCCAACAGGCTGTCCAAAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTAGA:1 + chr2L 9988075 5' + hobo 36 1 60.27 ATTTTTGGCGCGCTTTCAAAGTCAGCTAAATCAGAGGTGCTTTGAATTGTGAAAATTGGCAGAAAAAGTTAAACAATGTATTGCTTTTGAGTTTTTTCAATTGTTTGCTAACAAATGTTCTAGTGTTCTTTGGAATATTACTTTTG:1 + chrX 21093886 5' + transib4 403 1 50.68 GCTCGTCCTGGCCACTGACTCCACTGATCCTTACGGCACGCCAGATCCTTCTCCTCCACTCCCAGGATCTCTACTTGCTTGTGGTGACCGTCCTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTT:1 - 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Doc 186 1 69.86 AACATTTGGTGACCCTGACGTTCGGTAACATTTCTTTATCGTGAACTCAAAAAACAGTTTAACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCA:1 - chr3L 23728645 5' - Gypsy6A_LTR 363 1 76.03 CATAAAAGTTGTATAATTTCGCATTGGCAGGTCTAATCCCACCAGGTAGAGAAACCCACACACAAAACGCACACCTAAGTCCCCCCACGAAAAGTATTTATGATTATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 - chr2L 1411819 5' - I-element 5337 1 71.92 TGTGGTTAACTTGTTTCGGTTTCCTTTCTTTTTGATTGTCTAACATGTGTTCGGTGCTCCCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACAC:1 - chr2R 17341193 5' - hobo 2878 1 58.22 GTCTAATCATCTCAGCTACGTTCGGATACTCATATGAACCACATTTACTTCAACACACTGAGCGAAAATTTGGATCGAGTGACGATAGCGTTATAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2L 8009189 5' - roo 9047 1 66.44 GAGCACTTTTCGTGTGCTTGCAATTAAAATAAATTTCAAAATAATTGTTTTCTGAGTTAAATTGTCTAGGAGTTGAGTGTAGTGCCTGAATGAACCGAATCTTATCGTCGAACGATAACCGCACATAATAATAATAATAATAATAA:1 + chrX 18507290 5' + mdg1 7067 8 55.48 TTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAT:1 + chr3R 19589933 5' + BS 5076 1 71.23 ATTTAACGTTTATTCACAAATTAATTGAATTTTTGGTATTCATTGTGCGGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - 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HMS-Beagle 6979 2 64.38 TATATATTTAAATCTTTGCCCGAATTAACACATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATTTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCG:1 + chr2L 13763497 5' - Bari1 1619 1 76.71 GCGAATGTGTATGGGCGAATTCTATTCGCATTTAACCTTTGGCAGCCATTACCAACTGGCGGCCACCAAATGGACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 + chr3L 1983431 5' - Transpac 5184 2 54.79 ACTTATTCATGCACCAAAAAAAATCTATTTGTTAATATTAAAGATTTTACAAGGTTTCAGAATGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGTTAATTATATAAA:1 - chr2L 7167354 5' - flea 201 2 54.79 ACTTTTACTCACAATGAAATCCACATAAGTTTCACAACCAGAGGTATGCATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chr2R 8492732 5' - pogo 2039 1 65.75 TGCGGTTTGTAAGCGAGTAGAGACTCCCATCTCTCTCGCACCTGCAGTGCTAAGCCTTCGAAAACAGGGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr3L 17896017 5' - P-element 2835 1 51.03 ACTGGGCATGTTCGCACTGGCCATTGCCGTGCAGATACCCCGTTTGAATGTGTCCATGAACGGCAAGGTGGCGGTGCTGCTGCTCTTGTCGCGAGATTTCTTCGCGCACCGTGATTGGTT:1 - chr3R 14725595 5' + G-element 113 1 70.00 GGATGGGTCGGATTAAATAAATGCCAGCGCAGAGTCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2R 18266108 5' - roo 349 2 58.22 AAGTATTTCTCCCTCGACATTTTGGTATGCGGGGGCGCTGTGGTTGCGCAACTCGTAATAAAAGCCGGATAACCGGATACAAGCGAAATTAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2R 18786099 5' - roo 9047 1 67.14 CCTTAAACTGGAATCTTACAGATTAAGAGGGCTCAGAGCTAAAGATAAATTCTACTTTTCCTATCCTTTGAGCAGCTATAAGAGTCATAGAAACGCATTCAGGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr2L 6716441 5' + hobo 20 1 71.92 AACTGAAACAACTTTTACTCACAATGAAATCCACATAAGTTTCACAACCAGAGGTATGCATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chr2R 8492722 5' - pogo 2049 1 58.90 ACATTGCATACTTTCAGTCAGCACTCGCGAATGTGCAAGGCAACGCGTTTAACAATTGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr3L 8395184 5' + jockey 72 1 60.27 CATTTTTATTGCTTTAGGCGAGTGACCAAATTAAATAGCTACGCTTCAGGTTTCGTTGGCTAGAACGGTACTAACATGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2L 15057282 5' + hobo 40 1 57.64 ATGCACAGAGAGAAAATAGAGTATCTAATGGATAAGGAAACAATCGAAGGATTAACTGAAGAAATCAAACTGGATATGTCATCACATTGATAGGGAATAAATGGATCAACTCTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTC:1 - chr3R 18860929 5' - roo 400 1 49.32 CTGGTGAGAAATTAAAATCATAGACAAGAACATAAGTGAAACACAAACTAAAGTGAACTTAATTAACAAAGTTTTCAAATCCGTATATCAATTAAGAGTGTATATCTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGAT:1 - chr3R 26693490 5' - Stalker2 388 2 71.23 CACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAA:1 - chr3L 20910073 5' + F-element 98 1 78.08 AAAACATTTAAGCTGCCGGCGGCTGTACCACCGAGAGCGTGCTGTGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGCGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr2L 19680997 5' + hobo 53 1 62.20 TCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1 + chr3L 19951184 5' + Ivk 50 1 55.56 GATGTTAGAATTTTGCACGTGGCTGACCCTTTAGATGTTTCGCTTACACTTTTGGCCTGCTCGGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATA:1 - chr2L 16554962 5' + F-element 302 1 56.85 TGATACCATTTTCTAAATTAAGGCATACTTTCGCACAAACAAACATTCGACTGTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1 - chr3R 8810743 5' + 297 63 2 65.07 ATAAGAACTTCAAAATAATGGAACAATTTGAACATATTGTTACTTTATACAGAGTATTTGTTACAGTGCAATTGTTGCAACATTGTTGGCAGATGAATTAAGCGAACTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTT:1 + chr3R 18626131 5' - F-element 108 1 66.44 CTCGCCAAGAGTATTTAAACTTTTGTTGTCCCCTGAAAAATTCTCGGAATATACATTCTGATATGTATGTGCGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTT:1 + chr3R 15035041 5' + Stalker2 51 2 50.68 AGTGGGTTTTGTGTGTAAGAGCTCTGTTTATATTCCCAAACTCTATATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCA:1 + chr2L 19217620 5' + springer 72 2 69.18 AAAAAGAGAGAGAGAAAAAGTTTCGCAAACGCAAACGCAGGCAGAATATGGAGTGGAAGAACGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGGCCCAACAATTACTCACAGGAGCGCAGAATGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACAC:1 + chr3L 1045623 5' + Porto1 418 1 63.70 TACGCTTTCAGAGGGCATCTCGATTATATCCAGAAGTTTGCCAGACACATTTGCGACCAAAAGAAGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGC:2 - chr2L 10685889 5' + Quasimodo 54 2 58.22 AATTGAACTTAAATTTTCTCTGCCATTAATCTTGATAATCAACGGTTCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGCGTACTTAC:1 + chr2L 12766986 5' + hobo 75 1 66.44 TCGTGTATAGTATTATTTTGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTCTAGACTTAAGAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAA:1 + chr3R 18514320 5' - pogo 2044 1 60.96 GGTTGAAAGTCTTTTCCACATTAAATACAGTCAGTTCATTTGAGCGTATAGTTGGAATTCTTGAGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGC:1 - chr3R 22113673 5' + blood 492 1 56.16 GCCTGCGCCATTGGCAACTTTCGTTTTTTCCTTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3R 7655590 5' + 412 74 2 76.15 TTATGTCGCCAGCTGTTGGCATTAGTGGACGACTGGCTTTTAAGGCGAGCAAATGTTGGTTGCTCGTATATATATACACATACATACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGAT:1 + chr2L 19634941 5' - Quasimodo 7337 2 61.64 TATGTTCCTATTGTATAATTACAACCACAATCAGATCTGGTAGTTCTGGAGTTCTTTATCTTGACATTCAAAAGTACAACAGATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr3R 12540460 5' - roo 9030 1 50.00 GTGTTTAAGGATAACTTGTGATCATAAGCATATGCAATAGTTTAGTTTTGTCCACTTATAGAAACATAAATTCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 11609996 5' + roo 8681 2 64.35 TAATGATACGACAATGAGTTGGTGAAACTATTCAAAGGGTTTTCTTCTTTAGTTATGTTATTATGACCGTCATCAACACCTTGCCAGGAACACTGATTAATGATTAAAAATATGATAAAAAGCGTTAATCGAAGTGCGGTGTAGCT:1 + chr2R 13276685 5' + BS 157 1 75.34 ATGAATACGTAAGAAAGTTTATCATACTCGATATTGAATGCGAAAAATGTTATCAAAGTTGATGAGAAAGTTTTCCTATCGCCTGTTTAAGCAGCTAAATTAAAAACAGATCAATTAACGTCGAATTAATTCGATCGCCGACGTGT:1 + chr2R 7540925 5' + F-element 10 1 81.51 CTATATATTTATTAAATTTATCATTAAACAATTGCATTAAAAAATGTTTACTATAATTCGAAATTGCTGGACAAATATGCTAACAGATGTAGATAATTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTA:1 + chr3L 15461463 5' - blood 7321 1 65.75 GTTTATTCACAAATTAATTGAATTTTTGGTATTCATTGTGCGGCGTAACAAGATGCACTTGGTCCTCGCCAACGGATTGAGAACGGGCCTCCACCAAGGACCAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr2R 10666977 5' + hobo 19 1 72.60 CGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGC:1 + chr3R 21276544 5' + BS 5068 1 65.07 CACTCTTATAAAAGTTTTTGAAACAGTGATGTAAAACTAATTCATTTTAATAGTCAACAAGTTCATAAAGTTCTTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACGACACGCACACATATAC:1 - chr2R 3172712 5' + 1360 3213 1 54.11 AAAAAAAGGAAAATTCATTTTTGATTAAATGCTGGCTATGGCTTAGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:2 - chr2R 16503471 5' + jockey 83 1 68.49 ACACTGAGAGAAGTCAATGCAAAAATTAATAGTTGTGTATAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAA:1 - chr3L 13015969 5' - hobo 2858 1 75.00 CACAACCCGGCAAAAACTCGTTGACTTTTTCACAGACACCGCAATGTGTGTATGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGCTGCTACTC:1 - chr3R 29381589 5' + hobo 51 1 58.91 TTATTCATAAAGATTAGATAAAAATTAAAAAAAAAATTATATGTTCAAATTTGCAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACAGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGC:1 - chr3R 7849653 5' - 1360 134 1 64.00 ATGTTAACCCTTGCCGCTGGCTGTCCCTCATTTTAATTTCTCAACTGCCACGGCTGCTTTTGCTGCTGCTGCTGTTGCTCGTAATACTCTAAGTTACTTTAATGGCCGGCACGCTCTCTCAATCTGTCCCCTTGTAATTTTTTTT:1 + chrX 22782990 5' + mariner2 581 1 74.48 TACACATAGTTACACATAGGCGATACATACACAGGGTTACAGATATAATTGGGTATGGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 - chr3R 17747377 5' + 297 56 2 60.27 ATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCCTTGCAAGTGTACTAAAATCCGGGATCCAAGCACCAACAACAGTCACCTCCAGCGTCCAGCATAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGTTTTTT:1 + chr2R 1344091 5' + 1360 23 1 44.52 TCCTTTCAAACTGTTACACTTTAAAAAGAGGGTTCTGCCACAAAAAAAAAATAGTAACAAAATTCAACTTGACTTAGAACTAACTTAACTTTTCTTATTAATGTTTTAATTAGGGTCTAATACTTGGTTGGATTGCCTTTGTTAGC:1 + chr2R 5516281 5' - HB 1321 1 71.92 TTAAATTGGGCACCCTTATATAGAGCTTTTAACTAATTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chrX 10838585 5' - roo 324 2 80.14 TTTATATATGTACAAACATACGGGGCGTGCACCAAAGGGAGATATTCCAGGAGGCACTCGAGGCAAACCTAACCATTCATATCAATCTCGGCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr2L 15601667 5' + Doc 34 1 61.64 AAATTTTCGTTATTCGAGGTTTTATTATGTTGCTCTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTG:1 + chr3R 14654304 5' - I-element 179 1 67.12 AAGAACTGTGAGAAACTATTTTCAATAGCTATAGTCGGTGTTTTCCATTTGAGAACGATTTAATAAAGTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chrX 19310671 5' + pogo 49 1 52.05 GGGAAAGTGTGAAAAGCTGAAAGTGTATGGATTACGGTTCGCTTCACTGCCTAGAAAACAAGAATAGTTGCGATTTCTCACCCTTAGCGAGCGTACATAGGGATTTTTAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr2R 20931581 5' + blood 7023 2 68.49 AGGTTCATATATTGATAAATATTGTACATATATGTAAACTATTATTTGAAACATGTCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chrX 3637735 5' - roo 9042 1 63.70 TTAAATAGAAAGCACATACAATTTTATGCAACCCAAGTGGGTGGCTGCCAGAGGTTCAACATTTGCCCACCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr2R 13772996 5' + opus 7160 4 55.17 ATATATGTGTGTGTGTGTGTTACAGTTATAACAATAAATCAACAACTGCTGGCAGCCACTGTAACTGCAGTCGACTCTCAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGGCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr3L 15724572 5' + jockey 58 1 48.92 CATGTATACAACAACTAAGCTTTAAAATAATAAATTCTTCGGTCGGTTGCACAACAACTTCGTGTATATACAATTTTTAAGCTGCCAAAATAGATAACTGAGAACTTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAT:1 - chr3R 27948359 5' - Juan 4201 1 75.34 ACAAACATTGACTCATACCCATGGCATTAACCATTTACTTATCATAATCGGGGCTGCCTTATTTCAACGCTTTTACACGTTGTTGATGTATTACTATATACATAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGGAAAATCT:1 + chr3R 4570192 5' + Juan 21 1 70.55 TATTAAAAAAGAAGTGAAAGATAGATAGAAAGATAGCAAGCAAATAATATACTATCGCAAAATAGTAACACCATTATGCGTGCCAAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chr3L 10241321 5' - pogo 2071 1 63.01 GAAAGTATGCTGTGAACTATTGCAGCCACCTGAAAGCATTCACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr2L 5656561 5' + hobo 31 1 54.64 GTCGCTGTACATGTCTTCTGTTGTATCACAGTTGGAGCTACGGCCCGATGAGTTAAAGCTCGATGATCTATAAAATTGGCTGAAAAGAGTTGAATTTGTAAGTAATAAGTGTTATTTTTAAAACATAACAAAAAAAATCAAAAAAA:1 - chr3L 14213146 5' + gypsy7 5002 1 67.81 ATACCATTTTCTAAATTAAGGCATACTTTCGCACAAACAAACATTCGACTGTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr3R 8810741 5' + 297 6639 2 64.75 AATGCTATCAGGGTCCGCAAGTACCCCACATATATGTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCAAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGT:1 + chr3R 8810658 5' - 297 6899 2 77.40 CGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCAC:1 + chr3R 443026 5' + gypsy2 6495 2 76.74 AGACCCAAAGACCCATATAGCCAAAGGCCCCCAGAACACAAGTGTGCCAAAGTCCAGCGCAAAAGAGTAGTGTATATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGG:1 - chr3L 8699157 5' - blood 136 2 51.77 ATGAATCCAACGCCATTTGGCTCTGAGTCAGCCTACAACGAGCCAACAATGTGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACTTTTGCGTGCGGGTGCTACT:1 + chr3R 29719331 5' + hobo 50 1 59.69 AGATGTGGGTTCTATGCACGCAAATGTTAGGAAGCCGTCCATACAAAACTTGAGATGTATTTCCCCAGAATCTCTAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGTTTTGATTTTGAAGACCGCAAGCCACCGTTTATTGCAATTTA:1 + chr2R 5800450 5' - HMS-Beagle 204 2 60.27 TCTTAAGTTTCCCTTACGCATGAGTAATTAACCAGGTAATTTGGCGCAATCTGAAAATGAGAAATGGTCACGTAGCATAAGGGGTTTGTCGTGCTCCTGCAACTGGTTTTTTTTTTCTTGTTTCTTTT:1 + chrX 13581798 5' - Doc2-element 239 2 67.19 CCATACCACAAGCATCATTTTAAATGCCAATTACAGTTGGAACAGGAGCAGGAGCAATGGAGGATAAAGGATATAGGATATGGGGTAAGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 + chr3R 15700297 5' - Transpac 290 2 71.11 ATGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATC:1 - chr4 829129 5' - INE-1 150 1 34.93 CCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATA:1 - 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chr2R 19165644 5' - accord 6 2 55.93 CGGTTTTTTATTAGTTTCGCTCACAAAGAGCTTCGTTGTTGGGCTTTTTCTGGTCTCGGTCTCTCGACATTACAACAACTTCGACTTGAGCCCCTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1 + chr3L 17895879 5' + P-element 22 1 69.06 ATTAAAGCAACAATTATTTATTTAATCATATTTCATTGAGATTGAGCAATCAGCTGGAAGAGATGCTCTGCCCGGAATTCCCGGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 + chr3R 21734497 5' + copia 40 2 58.90 AAACAGAAAACTTGCTAAAAAAATTGACAGTTTTACCAAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:1 - chrX 8358752 5' + Doc 86 1 72.60 ACCGAGCCAGGTAATATAACCGTGAAACCGGATCCGCCCGTTACATCCGGGTAGACCAAGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGAATGGAA:1 - chr3R 2509826 5' + Porto1 4260 1 58.22 AAAAATAACAGAACAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 + chr2R 17872477 5' + Tirant 8173 2 60.69 GGAAACAATCGAAGGATTAACTGAAGAAATCAAACTGGATATGTCATCACATTGATAGGGAATAAATGGATCAACTCTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - 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flea 4976 2 58.90 CGAACCAGCGGACAATGGAAACTCACCTGCAGCTGCGATGGTAAAAACCGAACCCACTAATAGCAATGCTGTAGTATGGGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr3R 15363502 5' + 412 35 2 53.60 CCCAAGGAGCTGCATTCCCAGTGCCGTTTCGTCTCCGATGGTTAATGAGTTATGTCAAAGGAAAACAATGTTTGTTACTTCATTTATATGCCATTATTATTTGTATAATATTCGTATATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:1 + chr2R 10915587 5' + F-element 18 1 69.86 GGGCGTAAGTCAGGGTGGGTGGAATCGCTGATTCGCCGGTTCGTTCGCCGACTCTTTTGACATTTTCTGCTTTCTGCTGCTGTCTTCACATTGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCAC:1 + chr2R 22974154 5' - Doc 422 1 69.23 AAATAAATGACAATAAATAGCTGAGGAATGATGTGTTGATCCTAATTTCTAGACTAGACAGCATTGCTGACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 + chr3L 13380426 5' + hobo 52 1 52.74 AATAGGAACCAGTTTTATGATTGTAATAAAAGTTTATTTTCTTAATTATTAATAGGGTATAAAAGTATGTTACAATATCTTTTAAGATCAGTCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAAT:1 - chr2L 17297093 5' + Max-element 30 2 65.75 GTATAAAAGTATGTTACAATATCTTTTAAGATCAGTCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCT:1 - 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Rt1a 5073 10 56.85 AGACGCCATTTCGAATATCTTTTAATTGATATTCTCAGTTGGGATATAAATATAATTGGGGATAGTTATTACATTGCCTCAACAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr3L 19510618 5' + pogo 9 1 71.67 GGGCGGAAAAGGACAAAGAGCGCTGCATACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr2L 2518588 5' + jockey 59 1 50.68 TCTCGGTGGAGTTAGCAAGCTTAAATGATTTTTAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:2 + chr2L 15596941 5' - roo 8987 2 81.51 GGCAATGCCATTCTGTTCTCTCAGCTATTATAAGACTAGTCGTTCTGTATAAGAGTGCGCAAAAGTCTCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 - chr3R 9158329 5' + P-element 51 1 50.68 CACCACAGGTTTCAATCGCGTAGAAAACCCAAAGAAAACGTATTCATTCTCAATTGACTTGAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr2L 8009049 5' + roo 58 2 53.42 AAGAGGAAAGTTTGTGCCACTTTTCTTTTTCTTAGTATTGCTGCTGTCGCTTTTCCGCCTATATGTATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chr2L 9109955 5' - opus 458 2 52.94 CTAGCAAAAACCAGCTATGAAAACCACTCACGCATGAAGCCAGCTCTCAGTTCGCACAATCATGCTTACGAAGAAAATCATTTTCAGCCTTAAGTTCCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 + chr3L 4440252 5' + jockey 4711 1 60.96 GCCATGCGCTGCTGCAAAGTATAACAATATAAATGCTGAAGCTTCATTTCTGAAATATCTTATACTTGCAGGAAAAATCACCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTT:1 + chr3R 26148574 5' + mdg1 199 2 57.93 AATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCAT:1 + chr3R 19589922 5' + BS 5065 1 63.70 CTGGCCAACGCGGCGTATGCTTGATGAGCGACCAAGTAGCGGCACGCCCGGGGGTATGCAACACCCACAGCCAATATTTGCCACACTCCTCCTGCGGTACTCGCATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1 - chr3R 23968714 5' - HMS-Beagle 7027 2 72.03 CCTTTCGCCGATCTCGTTACTCCTGCGGCGTTTCTCCTGACAAGGTGTACTCCTTGACAACGGCCGGTATTAGGAAGTTATGGGGTAGGGTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1 + chr3L 25496715 5' + mdg3 30 2 65.03 ACAAGAACATAAGTGAAACACAAACTAAAGTGAACTTAATTAACAAAGTTTTCAAATCCGTATATCAATTAAGAGTGTATATCTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGT:1 - chr3R 26693467 5' - Stalker2 7613 2 56.85 AGAGTATAAAGCAAACAGCGCGGATTTTCCATAAACGAACGCGAATTCTTCAGGAGTCCATATCACTCGCATGTCTTATAAGTTATTTTCAAGAGTAAACATTGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 + chr2L 951265 5' + F-element 27 1 71.23 GCGCAAATAATCACAATCACAACTTCATTATTGGCAGCTAGTAACAAATGATACAAACACCTAATCTCATTAATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAAT:1 - chrX 16857175 5' - pogo 2057 1 55.86 TTCACTTTAATACTGAACTAATATAGTGCAATACGCAGGGAGTTCTGGAAAATATTGCTTTAACTTAACCAACAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 + chr3R 20097579 5' + mdg3 5301 2 52.05 ATCGCTTGGATTGCCGACTGAGCGACAGTCGCAGTTTATCCGCCGACCAAGTCGAATCAGTGAATCCACCAAATCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 + chr3R 22123732 5' - 297 366 2 60.61 TAGCCCTGCGAAAAGCGCGAAAAATAACAGAGCAAAGTAGCATAAGCTTGCTTATTTTACGCTGCGAAGTCAACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 + chr2R 17872458 5' + Tirant 2 2 75.00 TTAAATTACACTCAAGGTGCACGAACTGGAGATACGCACATGCCGGAGATACATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGA:1 - 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chr2R 15892199 5' + hobo 16 1 52.50 TTGGAAAACAGAATTTCGTGTGTCTTGGCAGCTGGCCGAAGAACACTCTTCAAAAATATGGTTTGTTATTTGGCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 21108477 5' - roo 360 2 51.03 CGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAAAAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chrX 22386801 5' + hobo 68 1 57.72 GGGCGTGGAGCGACTAGCTGTAGCATGCAAGCGAAAATCGCGGACTTACTTCGCAAAAAGGGCCTGATAATTACTAAATTATCTTATAATTTGTTCGCTGATGGACAAACTTGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAA:1 + chr2L 21798972 5' - GATE 275 1 52.78 GGCTACTATGTAAAGCGCACCTTTGCGGCTCCCGGGGAGATTGGAGCCGCACAGAAGCGTGACGGGGATAAGAAATGAAGGGGAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGG:1 + chr3L 13383084 5' - hobo 2586 1 60.69 AAATGTTGATGTTTTTTGCGCTCTTGTTGTTTTCAGCCGTGCAGCATCTGGCGTCTGCTTGCCCCTCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAAT:1 + chrX 10559999 5' + jockey 4821 1 58.90 AAATTGAATCAACCAACATCAAAGGGATTCGATTTCAGAAAAATTCCAGCGACTGTTGCATACTTATGGGTTACCTTTGCTATTCATAACTTACACGGGCCATAAAATATTTATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr2R 22040852 5' + jockey 15 1 76.03 ATGGGTGAAAAATGGGATTGGCTGTGCTATGAAAGTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCA:1 + chrX 16857076 5' + pogo 82 1 74.66 ATATATATTTAAATCTTTGCCCGAATTAACACATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATTTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATC:1 + chr2L 13763496 5' - Bari1 1620 1 76.03 ATAAATGCCAGCGCAGAGCCGCCGAATCGGCGAAACAAAACAAAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr2R 18266092 5' - roo 333 2 69.18 AAAGCTAAATTGTCTTATAGTATATAAATATTATACCCAATGCAGGAAGCTGGCATGTCCAGAGCAATTTACTTTACTTTTGCAAGGCAAACAGGAAGTAGAAAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 + chr2L 8808521 5' - HMS-Beagle 232 2 47.95 TTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAG:1 - chr2L 23069853 5' + Cr1a 4153 1 74.66 TCGCGGAAACTAACCATAAGCTATTTAGTTACCCAAATGGACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGT:1 + chr3L 5425469 5' - blood 7310 2 72.60 TAGAGACTCTAGAAATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATA:1 - chr3R 1048052 5' + Stalker2 7315 2 62.33 CAAGGCAGGAGCTTTTTGCAAAGCTTTCTTTACAGTTGTCTGCTTACAGTTATTTATTGTTCATAATTATCTAAAAATAATCAAGATTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAG:1 - chr3R 17401818 5' + Juan 36 1 58.22 TTTTTCTCTAAGAATGTCCGAGTATCAGGTTTAATTGAATTGCCAATTTCCTCATTTTGATTTTTTCGTTTCCGATTTCTCTTTCAAAGTGAAAAAAATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGAGCGTTAGATCGTGTTAC:1 + chr3R 20169631 5' - Stalker 152 4 62.33 AATGACGGCTCCTGCAAACGCTAACACAAGGATGTGAGTCCTGGGAAGGGAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:2 - chr3R 5767457 5' - roo 337 2 65.07 TGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTC:1 - chr3L 3540212 5' + mdg3 55 2 61.64 TATATTTCTGTGTGCCGGTCTCCATCGTCTCTCTATCGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2R 18467204 5' - roo 8996 2 72.66 AGATAGGAGACGTTTAACCTGCAAGTTGATTTCACTTATCCCTTTTGCTTTTTATATTTATACTCTGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACAAGAGTCACTTATTTTTGCTACCTTTAGCTGTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCC:1 - chr3R 22264744 5' - roo 497 1 71.92 ATCGAAAGACACGAAATGGCATAAAGTCTTTAAGACTTTTGCCTTATCCGCACGCAAAACATTCGGCCATTTGGCCGTTTCGGAATCCATAAAAATGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATC:1 - chr2L 17426416 5' + hobo 2579 1 79.69 ATGTTGGTGCAAATAAACTCTAAATGATTTCAAAGTTATAAATGTTTGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATAT:1 - chr3L 11754759 5' + Doc 157 1 67.81 CATAATTTGCCAACATTTATTCATTTATATATGTATTCATGGTCTAATAATAATAAACACTCGCAAATACGCTCGCATTCCTTTCATCGCATTAAAAATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:3 + chr3L 16523147 5' + jockey 27 1 71.92 AAAATGGCGAAAAGTCGCAGGCAAATATCACTTATAAACCTTCACTTTAATACTGAACTAATATAGTGCAATACGCAGGGAGTTCTGGAAAATATTGCTTTAACTTAACCAACAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 + chr3R 20097539 5' + mdg3 5261 1 79.45 CCCACGCAGCACGCACGTTTTGTGTTCCTCCTCTCCTCCTTTCGTGTATGTTTCTGTTTCTGTTTCGCTTTAGTTTCACTTTCATTCGTCTTCGATCGTCAAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAG:1 + chrX 19506034 5' + P-element 20 1 73.29 CAATTGAAGTGCTTTTTCGTGTTCTCTTGCAGATACTAGATCGTGAGATACGAGATCAAAAAAATAGATTCATTGGTACCCATATTGCGGGTAGAGCTTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGG:1 + chrX 16374894 5' + R1A1-element 5066 1 50.69 CAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAA:1 + chr3R 19989258 5' + hobo 78 1 72.60 GGTTTAGTGGCGCCATCTAACAGATGTTCTGCTCAATTTTCATGACCAACAGATGGCGCAACTTAGGAGTTACGTATATTTTATGTTTTATGTAATTTACTTGTATTACTTTAGATAGAGAAATATGTATACTAAATTAAATACTA:1 + chr2R 22134028 5' + Tc3 1515 1 42.47 AAGAAGTCCGCGATGATAAAGTCGGAAGTCGAGGAAGCGGCGCGTGCCCGTGAATTAATGTAATTACTCTTGTCGTAGGTTGTTAAGATGGATAGATAGATAGAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 + chr2L 7595967 5' - mdg3 229 2 70.55 CACAACTCCGATGGAACCACCGAAACGCAGAAGATCACCCATGCCGGTCTGGTGGCCCGGAGTCCCGAGGGCACCGCCGCCAAGGGTACGTCAATCCGCGGACACGATTACACCGGTGTTTCACAGGCAACAAATTCTCAAGCTTT:1 - chr2R 22736766 5' + Gypsy12A_LTR 2005 1 60.27 CCGTGGTCTGCCCACGTGGTGCAGCCATCAGACCGCCCATGGCCCACCCCCAAGCATATACATATGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chrX 1726767 5' + 297 28 2 60.66 ATTTGCCGCCGATCAAAATTAACACATTACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCATGAAAAAACGCTCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCCCG:1 - chr3L 23979558 5' + F-element 392 1 78.72 TATCATCCCAAAAGTATGCTTCTTTAATTTCCACGAGGCTATAGCAAAGTTTAACACCCAACTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 - chr2L 15096963 5' + jockey 4679 1 68.09 TAGCAATATGTTGGCCAAAAGCCAGGCAGCAATCGGCCATTAACCAGTTCCCAGTTGTTTCCATTATTAGTTGACCATTGTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGC:1 - chr3R 22039933 5' + 1360 42 1 55.48 TGAAGATGGCCAGGCTGAGGAAGGCGGTCATGTCTGTAAGTGAGTTCCCAGAAATCCAATTAGTTGGAAGAAGGGTGTGGGGCTTATGTAACATGTTAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 18954265 5' + roo 8686 2 69.18 CACTGAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCGCATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACA:1 + chr4 1301729 5' + 1731 67 2 58.90 AGGTCGATCTAAAACGTTTTTTAGGCTGAAAATAGGAAAGCGTAAGGGTAAAACCTGAATGGAATGTCTGCTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chrX 126958 5' - hobo 2925 1 67.59 GCTTGGAAAAAATTTAAAATATAACCAGGCAGCTTGACAATCCACGCGAAAAACTGGCAAACAAAATATGTTTCAGCCAAGCGTACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTCATTGGTTAATTTCAGAC:1 - chr2R 18927889 5' - 3S18 302 2 58.90 ACGAAATTGGTAACATTTACTACTACATAGTCTACTGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr2R 21244882 5' + roo 82 2 77.62 CCCAGCGCATTGAACTCCGATCCAGACAAGACCTTAAGTTCAGGAATGTCGCAGATATACTCACCAAAGGTTTAAGTAAGCAAAAGCATTGTGGCATTTTGAAATCACTTGGATTTGTTTAAATTTGTAATTGCAAAACAGATAAT:1 + chr3L 2952380 5' - frogger 224 1 69.86 GAACTCAATTAACTTATTTTAAACATTTCGCTTTTCCTATGTAGAAGTACATTTTCTCTTAAACAACGATATAGTGGAATGTATATTTTTTTTGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 - chr3R 19450020 5' + opus 7027 4 69.18 CCTCAGGGCACACAGGCTGTGCGTTAATTTCAGACCCCCTTATGTAACCCCTTTTTTCGGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGTACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGG:1 - chr3R 902644 5' - R1A1-element 5317 1 69.23 CCTATCGCCATGGCTTCGCTTCCATGAACTGCCCTGCTTTGATACCATTTTCTAAATTAAGGCATACTTTCGCACAAACAAACATTCGACTGTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr3R 8810782 5' + 297 24 2 68.49 ACAATACAAATATTTCGATATAAAAAGCGAAAGTATTTTGCTTGAACTCGCTTACAAAAAGTCTAGACTTCTATTATTATAAACAGTCTTTGATGAAATTTAAATCTCAATATTTCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 + chr2R 10189204 5' + Doc 10 1 75.34 GATCATAAGCATATGCAATAGTTTAGTTTTGTCCACTTATAGAAACATAAATTCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr2R 11609977 5' + roo 67 2 65.07 CAGCGACGACGAATTAATTGAAAATATTCCACATTTTCCCGCTGCCCGGTGAAGTATGCAACACTTTTTCGCCACCTCCTTTCGTTTCCTTGTGGAATCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chrX 9949622 5' + hobo 25 1 68.06 ACAGCAGATACAAATGAGTCAAAAACGTGACTTAACTTTTTGCTTTAATTTATTTGTTTGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGCGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAGGCGG:1 + chr3R 19626012 5' + opus 7271 2 50.38 AACCATTCAAAATTCAGAGTTTTCCCCATTCCCCTGACGCTTTCATATTTGTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 - chr3R 12781581 5' + pogo 67 1 65.75 ACTATTGGTTTCTGCTTAAATTGTTCCTGGACAACAAACCGGTCACGGCCACACTTTTAAACAATTTTTAATTTTGTTCTCATATTTTCCTCACATATCTATCGCGTTCGCTTTCATAGTCCGGGGAACTCGACTGTAGCATTCTC:1 + chr3L 23288507 5' + INE-1 573 1 75.34 AAAATGTATTATAAGTCTAGCCCTTAAACTCAGTTCTAAACTTAAGCACACAGTTGGAATTGGTTGCGTTTTTCTCAGGCATACTCGATCTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTA:1 + chr3L 17564511 5' - hobo 461 1 60.96 TAATTGCAGCACTTAGATGCAATTTGCGGTGGTTATACCCATTACTCGTAGAGTACAAGGGTATACTAGGTTCGTTGAAAAGAATGTGACAGGCAGAAGGAAACGTTTTCGCCTATATAAAGTATATATATTTTTGATCAGGATCA:1 + chrX 18414812 5' + INE-1 81 1 69.86 CGTGTAATTTATTGAAACACATTCATTTCTCGCTATGATGTGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 - chr3R 19500697 5' + jockey 85 1 61.26 GGCTGATATTGACCAATCAAACGAATAAATGAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr2L 11559734 5' + roo 86 2 78.08 GTGGAGCACTTGTGAATCCCGACTGCCCTGCATTCTTAGTCACCCAAGTCACGTCCTGTTGCAACAACACATCGTATCTATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGC:1 + chr3L 9317441 5' - HMS-Beagle 210 2 60.96 CACGCCACAGGGTAGCAAGTTCACCACCCACCACCCACCGCCCGCGCCCATTAATGGCGGAAAGAGAGCAAGTGGGCTTCCACAAAATGGGGCACAAACATAATGCCGGTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTC:1 - chr2L 3393897 5' - Stalker2 7648 2 78.08 CCTTGGCCCGCCCCACGTAAATGCCGCAATTTTCTATTCTCGCCCACTTGCCACTCGCATCCATACATTTACGATAGGTGGTCGCATGCTCGCATATTCCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:2 - chr3R 11483904 5' + pogo 20 1 71.92 GTTCATTGAACCAACCCCGTACCCCCTGCCCGCCAAGCTTTACCCCCTCACCGTTGGCTAATTGCTTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 - chr3L 19702865 5' - pogo 2074 1 59.68 TATAATGAAAATATTTTGGTCGTTTTGAGTTAAATAAGCAAAAGGAAGATTATCAGTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr2R 8375117 5' - roo 9006 2 60.27 CTTGCTAAAAAAATTGACAGTTTTACCAAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGCGTAAAGCGCAGTT:1 - chrX 8358742 5' + Doc 96 1 76.71 CCATGCTCATCCGCACAAGATATGTTATCATCCCAAAAGTATGCTTCTTTAATTTCCACGAGGCTATAGCAAAGTTTAACACCCAACTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 - chr2L 15096988 5' + jockey 4706 1 59.59 TGTTCAATTCAGTTGAATTCTTTTTGCACACCACGCACTACAAAAAAAAAAACCCACTCAATTAATTCAAGAAAAATAATGCATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATA:1 + chrY 1076854 5' + 17.6 39 2 58.22 TAAGAGCACTCATCAACAGAATAGTGCTCTTAAGATGCTATAACGTATTTAGTATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 + chr2R 5485024 5' + 1360 34 1 62.33 GTTTTGTGTGTAAGAGCTCTGTTTATATTCCCAAACTCTATATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCA:1 + chr2L 19217625 5' + springer 59 2 68.75 ATCGCGTAGAAAACCCAAAGAAAACGTATTCATTCTCAATTGACTTGAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr2L 8009063 5' + roo 72 2 65.75 TATACCCTCACCAATAGATCCAGGACTTTTGATTCGCTTGCCGGGGCAAAAAGCTTTTACGCGGTCATCACAGATTAAATAAAGTATAATTTATACACCTAGGAAATCAACAAATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTT:1 - chr3L 9905888 5' + Juan 4034 1 76.55 GAGAGGTGGGGAATGTCGGTGCGACATTGAAAGCTATGCGATGAGGTGTAGGTGATATAGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAATAATGCGTCTTTGTCTCTACAATCTGTATGCTTAATCCCGACCTTCTAGCTTTTACAGTTCC:1 + chr3L 2536876 5' - INE-1 157 1 60.96 CGCTTTTTCTCAGCTACTTCTTAAGAGTCTATTTTCATAAGTTTAAAGAATTGTACCTTTGTGGAAAATAGATGAGCGAGAAATTGCGAGTATATTATACTTACATTATGAATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:2 + chr2L 10177937 5' + mdg3 5263 1 78.77 AGGAATAGCTTTTCATCTTTAGAAACATCTTAACGAAGTGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 + chr2L 14262905 5' + P-element 14 1 72.34 ACTAAAAAATACAGCAAATTGCAGCCTGCTGAGCTCTAAAATCTTTTGTTGTAGTGCATAAAAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chrX 6213513 5' + roo 58 2 58.90 CTTCAATACGAATACGCCGCGTGGAAAACCGCAGTCCAGAGTAAGTAATCTTTTCCGGCAAATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr3L 13546507 5' + hobo 15 1 73.97 TTACTGTTTATTTAAGGGTTTTAATATTTTAGCAAAGTCAAAAAGTAGCAAAAACAAGAGTCAAAGGCAATGTCAATACAAACACAATTTACAAACGCACAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATT:1 - chr3R 8932431 5' - Cr1a 173 1 53.42 AGTAGGCACTAGTCTGGTCAGGCGCCCACCTGTTCGTCTATGATCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGATTCTGCCGCTCTTAAGCAATCGATTTTAACTTTTTATTGCATAATTAGATCTTACTAACACT:1 + chr2R 5272110 5' + Cr1a 4287 1 73.29 TTTTGTCGTTTCACGGAGCATAGCGCAAAACGCTCACCCTTTTGGCATGACTGCTTCTGTCCTACGACACACGATACTTTATATACATATCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr2R 17937089 5' + 297 25 2 55.48 CCCTTTTTTCTGCTTTATGAAATGTATGTATGTTCCTATTGTATAATTACAACCACAATCAGATCTGGTAGTTCTGGAGTTCTTTATCTTGACATTCAAAAGTACAACAGATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 12540432 5' - roo 9058 1 69.18 ATGTACATACCATACACAGCAAACTTTAACTAGCCAGATAGCTGGCCCGAAGATCACTTACGAGAAGCCAGATAAGTGGAATGTGAACTTAGACGGCACAGCCTACAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAT:1 + chr2L 11047921 5' - Juan 4201 1 66.44 AACAGATAGTGGTCTTGCGGTATTTAGAGAGGCTTATGAGTATGTAGTAGTAGCAGTAGAGTAGTAGAAACAACATCAACAACAACAACATCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 + chr3L 13778511 5' + I-element 32 1 63.70 CAGCAATTTGCAGTTTTCGATTCCCACTCGAATATTTTATAATCAGCTACCCGCGCTTAATGGATATGGAAAGGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATATGTAATCTTGACTCTCTGTCGCTCTTAAAGCA:1 - chr3L 27091856 5' + Cr1a 4242 1 56.85 CAGTCGGATAAACAGGGAGAAATCGGCTGAACTAAGGGGATTTCAGCTAAGTATGAACTTTAGTTCTTTTGAAGGCATCAACAAAAAGATAGTGTTGCAATAAATCATTTTATTCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGA:1 + chr2R 11045512 5' + INE-1 506 1 71.23 ATTCGCACTCCACGCGGATTGGGCATTATCGTCGAAGTACTTGTCCAAAAGCTGGACCAAGGACTAAGTCTTCTGGCTAAGTCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGG:1 + chr3L 26350080 5' - Quasimodo 293 2 53.33 AAGAGAAAGGTCTGAGGATGGGATCAGTGGCCAGAAAGTTAGAAGTTTGTACTGAAGCTCATCAAAAATGAATGAAGTATATATATATTTATGATTTTGATTTATATCCTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 - chrX 14121886 5' + Doc 8 1 61.15 TAATCGTTATCATTTCAATTAATGGCATATATAACGCAAGCAATTTACGAATGCCTTTACTGAATAATGATCAACTCCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr3L 11887178 5' + Doc 46 1 54.79 TCCTCATATAGGGTGTTCTGGCCGAAAAAAAGAATTTATATATGTGTGTGTGTGTGTTACAGTTATAACAATAAATCAACAACTGCTGGCAGCCACTGTAACTGCAGTCGACTCTCAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chr3L 15724609 5' + jockey 27 1 69.18 ACATTATGTTGCAATGCTAAAAAGATTGTCTAATTATGAACGCAACAAATGCAAAACTTAAAGCAACTTAATATGAAACTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chrX 2821842 5' - roo 9030 1 56.85 AAATTCCTGTGCTAAATTCTTTAAGCTTAAACCAAGTAATTAATTTTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGC:1 - chr3R 18492954 5' - Juan 4137 1 73.29 GATGATGATTATGGAACCATTACTGGAACACTAAAGGGCTTGCATCTAGCAGGATGAATGGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:2 - chrX 6053021 5' + roo 8724 2 59.59 CGCTGGACCTTGGACTCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 + chr3L 25607825 5' + P-element 69 1 21.43 AACCCGAAGCCAAATGTGGGGCTATCATTTGCCAATGTAATAGAGCAATCTTTATCAAAAATGTCGTAGTATTATTGTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr3L 11228053 5' + pogo 41 1 57.53 AAAAACGGGTATGCGGTTTTTGTGGTTCGATGGCAGAATGTTGCTCACCGAGCAAGTGGCCAGCGGAAAAAAAAACAAGCAATGCAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chrX 3637892 5' + roo 32 2 62.68 GAGGTGGTTGTGGGTATCCGTGATGTCTTGGCCATGTTGTTGTTATGCGTGCTGCTGTTGTTTCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGATCGGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACA:1 + chr2L 3090020 5' + Cr1a 154 1 56.34 ACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTC:1 - chr2L 23372629 5' - Gypsy6A_LTR 280 1 52.05 ATTATTTGAAACATATCATAATGTTTTGCTGTGCATTAAGCAAAGGCTTGGCCTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chrX 3637775 5' - roo 9002 2 63.70 CTTCGCTGGGTTCGTGGCACTTCGAAACTGACATTTGCACTTTTTCCCAGGCCAAAAACCTTCTGTTGTAATGAGAAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1 - chr3L 9240486 5' - 412 435 2 56.16 CAGTTATAAAATATTTCGTAGCATACAAAATGGCGCTGCTGCTAGAAAATTCAATTAGCCTGCAATTTTTGGCAACAGCTGGCTTTCAGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGA:1 + chr2L 3677555 5' + BS 27 1 62.33 ACTAACTGACTAACTGGCCACACGCGATAAGGAACCTTTTGGGTTATTTTGTTTCAAGACTAAATAATTTATGCACCGTTTGCGGACTGCTAAATGTAAGCTTATTTGCAGTTAAGAGTCCTGACTTGGTTAGTCGGCTTAACTTC:1 - chr3L 3099068 5' + Cr1a 4084 1 63.01 TATGTGTAAATAATTATTAACAAACTTTAATTAAAAAGTGCTTATACGATTTGTAAGAAGTGTTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 - chrX 21205084 5' + 1360 58 1 60.27 TTGAGATAATGAGCGCCACCAGTGATATCCAGCGTAATAATCCACAACTGACCGTAGAATGTTTTGACTACTATAATGACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 - chr2R 18056914 5' + blood 7052 2 58.22 GTTTATTTATAAATAAGGTGTGTTGTTCGTAACTTCTTGATTTTACTTTAATTGTTTCTGAACTTTGCTGAATTTCTGTAGTGTAGTGTGTTTCTATGCTTAAATCATTATGTATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGTTTTT:1 + chr2L 16531559 5' - Porto1 4361 1 62.33 AGTCAAATTACGTGCATATATATAGACCTCCTTCGACCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAATTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCA:1 + chr3R 6171137 5' - 297 6895 2 77.93 ACACTCAAGGTGCACGAACTGTAGATACGCACATGCCGGAGATACATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTCTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTG:1 - chr2L 10178073 5' - mdg3 5422 2 69.18 AGATAAGAGTGCTTATCTACACTCCGTTCAGCGCAACAGTCGATTTTGGCTGGTCTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTA:1 - 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invader4 2801 2 78.08 GCCCCGGATGGGTTTTGGCAAGCTTTCTATAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTG:1 + chr2L 13932729 5' - jockey 4707 1 80.14 TGTTCTCTCAGCTATTATAAGACTAGTCGTTCTGTATAAGAGTGCGCAAAAGTCTCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr3R 9158316 5' + P-element 64 1 41.78 GAGAGCCACGAATTATGGCTTCATTCCCACAGAGAAATCCCAAGTGTTAGTCCAAGTCGTTTGCATTTATTCTAATTTCGAGTGTGGCCCCCACTTGAGGGGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2L 20327743 5' + roo 20 2 69.86 CGGGGAGGCAAAGAGGCAAGTTAAAAAAAAAATATAGAAAAGAGTGGCAAATAAATACAAATACAAATAGAAAAGCACGACGCGCCGGATGGCCGAACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:2 + chr3R 13571975 5' + 412 23 2 68.49 AGCAAGTTCACCACCCACCACCCACCGCCCGCGCCCATTAATGGCGGAAAGAGAGCAAGTGGGCTTCCACAAAATGGGGCACAAACATAATGCCGGTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGAG:1 - chr2L 3393884 5' - Stalker2 396 2 73.72 TGGTGGGTTCTAAGCCATTCTCTTGGTTCATAGAGTCGACTGCATGTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGCTTTTTTTGACACCCTAC:1 - 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chr2L 11559841 5' - roo 9018 2 67.12 CTCGAATATGGCGGCAACGTGCAAAAGTGCCATAATGCTGCGCCATACAATCATTAGCATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAA:1 + chr3R 9862879 5' - Stalker2 7589 2 58.22 TCCGTTGATAAAACTATGAATGTATTTATTACATAGTTAAGTGATTACTTTATATGTTTTATTACAAGTTTATTATATTTCAATAATGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAG:1 - chrX 11267706 5' + hopper 247 1 55.48 CGGAAATGAATTGTACTGGAATTAAATTCTTTTTGCTTGCTGAATGATCGATCGGTGATGGATCGGCGGTTGCCTCACAATATATATCTATATATACAGGGACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCC:1 + chr3R 24396663 5' + I-element 5108 1 71.32 ATTGATTTTACCATTTTGTTTGTTTTACTTATTTATGGTTTAGTCGGAATTTTTCCTTTGCTCCTGGTTTGAAAACCCAAATAGGGCATGGTGGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAAT:1 + chrX 4788482 5' + Max-element 8265 2 65.07 CGATGATGATTATGGAACCATTACTGGAACACTAAAGGGCTTGCATCTAGCAGGATGAATGGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chrX 6053022 5' + roo 8723 2 58.90 GAGGCAACATTTTATTAGGGAAGTGCGAATGAGGTGGGGGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACA:1 + chr2R 14489979 5' - accord2 7262 1 70.68 AACCATGTGCATGGCAAACTGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGT:2 - chr3R 9862997 5' + Stalker2 7291 2 56.16 ATCGGCTTAGACGAGCGTTTGCTAGAAAGTCTATCTCAATATAGATTAAAGGTCTTCCAGAATATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3R 7306014 5' - 412 440 2 56.85 TCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGG:1 - chrX 21667928 5' + gypsy2 78 2 69.86 AAATATTGATGAAAATATTCTTTTTTTTTAAGCCTACAAATATGTTACCCCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGAGTAAAAAAACCACCCGAGGC:1 + chrX 9861982 5' - hobo 2799 1 66.44 TTTTCTAATTTCAGTTCCATTCTTTCAGTTATCCTTTCGCCTGCGCCATTGGCAACTTTCGTTTTTTCCTTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr3R 7655552 5' + 412 7105 2 52.74 CTTCTACTTCCTTAGGTTTCTTGGGACGGGGTGCTTAAGCTCCTGCCTCACTAGGGGTTTTCCTTGGGTTAGTTGTTTTATGTTGTCACTTTGTTTTGCCGGGTGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTT:1 - chr3R 5885968 5' - BS 4964 1 71.23 TTTATTGAAACACATTCATTTCTCGCTATGATGTGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTG:1 - chr3R 19500690 5' + jockey 125 1 75.00 CAAACTGGCAGCTGCAATTCAGTTGCCAGTTAAGTGCAACTAAAATGGATTCAACCCATTGACAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCA:1 - chr3R 9862983 5' + Stalker2 57 2 55.48 ATTCTTAACAATCGTTTTTGCCAAATGTGCTTTGTTGCCTCGCCAAGGCGTTGCGGTTATTGGAGATGTGTATTGTGGATTCAGTAAACTCGACTTTGATTTCGCTATCCTGTAATAAACCAATATATGCCACC:1 - chr3L 1728630 5' - blood 375 2 44.78 GCCGCATAATGTTAAATTAATACGCCTCCCCCTCAACGCAGCGCCTTCCTTTTCATTTGGTCCCTTAGTCAATTGGCGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTT:1 - chr2L 19841598 5' + BS 40 1 54.11 TGCCTCTGTTGTTGACTAGCCGCGAGGCAATTAATTAATTTATTAACGCAAATAAACAAAGGCGCGCAAGGCGATGGAACAAATGAACTCAGAATTTGAGTGAAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCG:1 - chr3L 13204711 5' + copia 450 1 59.59 TTCAACAACTCAGCCTCGATGTTTGGCCAACCCTTCGTGCTGCTGATGAGATGGCTCAATTGAGAGCTTTAATTAAATTATGTTGGTATGCACAGGATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 - chr3L 12729222 5' + opus 20 2 69.18 GGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACG:1 + chr3L 25232768 5' - accord2 160 2 57.52 TTACATGTTTAATAACTGCAGAATGTTTCAGCTCATTTTATTATCGCTGCTATTATTGTGACCGCAGTTGTGTGTAGGCACTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1 + chr3R 24301793 5' + Tabor 41 2 57.53 TATCTTTAGCCCTATTTTCTTTGTAGAGAAGATGTTATTTGTTTTCAAACACAAAGAAACATTTTCCCTAACTGCAATTCAAATTTTCAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGC:1 - chr3L 22638892 5' + Juan 4123 1 59.59 GTAAATCAAGCAAATGTTTCTCGGAAAGTCCAAGTCACCGATCATCCATTGGTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chr2R 12642735 5' + pogo 64 1 63.70 TATATTTTACAAGCAATTTAAACTTAAAGGATTACAACATGTTTATAAGCATTTATTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 + chr3L 10733648 5' - 412 7484 2 60.27 CGGGCCGCTCAATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chr3R 19989242 5' + hobo 62 1 61.64 CGCAAGTTAAATAAGGAGCATAAAAGAAGGAGACCTAGAGAAATTTTGCTCACAGAACGGCTGAGAAATGCTCTATGGCAAAAAAATAAAGTTTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr2L 12814847 5' - hobo 2912 1 66.44 AAACTAAATGACAAAACCAACAGTGCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCAAGTGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAG:1 - chr3L 21765514 5' - gypsy 398 2 61.64 AACATATTTATATGCGACGGACCACCAAAAAAGCTTCATTAAATATATATATGGACTCTTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAAT:1 - chr3L 20910095 5' + F-element 76 1 63.01 GGACATGGTGTAGACATGGACCCAATGCCTTACCAACTTATTGCTCTATTTTCGCAAATAGTTTTCGATTTCATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTT:1 - chr2R 11921788 5' + FB 79 1 50.68 AAATTATTATTCTTTAAAGTAATAAATCAGTAGGCGCATATAATATAGTTGTGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCGAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGG:1 - chr2L 9499336 5' - Transpac 231 2 71.23 GGCGGAAAAGGACAAAGAGCGCTGCATACGCACAGGCTGAAAATGCAAATTTTCCCTTTGGCTGGCTGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr2L 2518587 5' + jockey 60 1 51.37 GTCAAGTGTCCGACTTTGGCCATATGGAAATATCAAACGGCGCATTGGATCGGGAGCTGTCCAAGATGTTCAATTTGCTAAGTGGAGTCGTGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCG:1 - chr2R 10910717 5' + F-element 119 1 65.75 TTTATATTTTACCTAGTGAATTTTAGGAATTCTGTTCCGCTTTTTACCTGCCATCGATTTTCTTCTGTTTTACGTACATTCTGCTTATTCTGTAGCATCAGAATGAAAACGGTCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCT:1 + chrX 12131112 5' + F-element 322 1 75.34 CGCCCCACGTAAATGCCGCAATTTTCTATTCTCGCCCACTTGCCACTCGCATCCATACATTTACGATAGGTGGTCGCATGCTCGCATATTCCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr3R 11483896 5' + pogo 28 1 66.44 ACAAAGGAGTCATTTCCGCATCTGGTCAACGCCGCCAAGTATGCAACGTCCTTCTTTGTGGTTATATTTGCCCACAAATATCACACGACCACCGGTAAGTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATA:1 - chr3L 5919197 5' + BS 5085 1 68.49 CGCCTCGCATGCAACATTTTTCTTTTGAAAAATGAACGAAACATGATTCGCCAAAATAGCAAGAGCTAAACATACACACGAACTCACATAAATATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3R 23208280 5' + pogo 23 1 69.86 TTTTTGTTTTTTATCTGGTTAGTATGCTTACGCACATATTGTGACTTATTAAAGTATTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAAGTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACA:1 - chrX 21638152 5' + gtwin 24 2 67.81 ACCCTAATAAATATAAAACCCAAACACCATGTGAAGAACAGGAGAAGAGGTTCGAGAATTTTGTCGCCTGCGAAACACAGGTGGAATCGTGTTAGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACATTCCTTAAGAGCATGGCTCTAG:1 - 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mdg3 209 2 56.85 ATCTGCACCATATTTGGCTACCAGGGTTCTGGTAGATATTGCAGACAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 19445520 5' - roo 9011 2 66.41 CACAAATAATAGCAAATAATAAAAATGCCTTAATTTAATCTGCTCTCTTACTGCAGCAAGAAGCAGGCAATGAAAGAATGTCAGGGGGTCAAATGGGTTAAGACTTGTGTACAAGTGGACAAGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 3646352 5' - accord 184 2 62.76 GGACGACCCCCCAAAATCGGCCAAGTCAAACAACACTTCCAATTAATCAAAACCCATAACATCGCACAGTGCCTGCAATTCGTATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chr3L 5329066 5' - 412 7508 2 58.90 ACTCTAGAAATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACAT:1 - chr3R 1048047 5' + Stalker2 7320 2 65.75 ATATAGGGTGTTCTGGCCGAAAAAAAGAATTTATATATGTGTGTGTGTGTGTTACAGTTATAACAATAAATCAACAACTGCTGGCAGCCACTGTAACTGCAGTCGACTCTCAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr3L 15724604 5' + jockey 31 1 66.21 TGGGCCATTGAGGCATGTCAGCGTTCAGGTTGGATTAGCTCGATTATCGTTGCGTTCCTCATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGAATATACATATACATGTGTATGCAGAAGGCATACATATGTTATGTATGGCTTGACCAC:1 + chr2R 21109436 5' - Stalker2 7463 2 58.22 TGGCCGTGACACTTGCAAAAATGAACATTGTTAGCCCAAATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATACTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTACTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGC:1 - chrX 12955492 5' - mdg3 5418 2 68.49 ATATTGCACTTGCATTTACAGTCATATATTTTTATGAACTGTGCATTAAGCCACAATGAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr2L 2622645 5' - roo 9008 2 61.64 ATGGAGTTTTATTGTCTGCGTAAATGCTATATAGAGTTCTTTATTGCAAGGAATGGGACTTAAATCCCCCTACCGACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACA:1 - chr2R 3091696 5' + F-element 288 1 50.00 CTGCCAACAAAGTTTGCCGCAATAAAAACGTTGACTTGGCCTACACGTTGGTGAAGACAACGACAAATTCTCCCAAGGGCAAGCCCATCGAAGCTCCGCGCCAGGGTGGGAGAACGTCTCTCCGTTGTTGAGTGCCCTTA:1 - chr3L 6563918 5' - gypsy6 7676 2 74.29 GGATGGATGCTGGGCAGGACTGGGATGGATGTGGGGTATCGTTTAAAATCATTCGAAAAGTAAACCAAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATT:1 + chr2R 7343230 5' + flea 47 2 53.10 AGTGTTGAATTAATTGCAGAGCAAACAGCAGAAAGCAAAGTCAAATGTGCAAACGCGAAAGAACAAGAGAAACGGGTTCTGGAACTCCATTCGAGGCCAGGGCAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCGTGGAGG:1 - 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chr4 39243 5' + springer 73 2 68.97 AGTTCAGTTCTCAAATTATAAAAATTACAAAAACTAACACAACAAATGTCTAGAAACTAAATGACAAAACCAACAGTGCAACCGGCTTTTTGGTCCACAGTTCAAGTGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTAT:1 - chr3L 21765567 5' - gypsy 451 2 78.08 ATATAAGTTTGTTTGGGAATTTTTCACAGATTGAAGAATGGCGTTGTGTGCGTGTCTGCCAGTTTTCGGGATTTAAGGACTTCGAGGGTCCTGGAGTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACT:1 + chr2L 9070146 5' + roo 8801 2 65.75 CTAAGAGTAGGCTACACAAATGTCACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGGAATCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr3R 27056385 5' + jockey 79 1 64.38 AAATTCTGTTTTCAAAGTGGCATAATGTATTAGTTCTCTTGAGTTCCTAATGCTTACCGCTTACATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCAT:1 + chr3L 16643145 5' + FB 57 1 57.53 GGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTT:2 - chr3R 23021005 5' + INE-1 580 1 41.78 CTCCAATCCTCCGTTTCTCCGTTCCTCCACTGACGCCTCTGTGCTACGCTGCTCGTCTGGCTGCCAACAGGAAACGGAAGCTGCTAAAACAAACGCTGTGTTTAGTTTGTAATGATGAACCCCAATTCAGAACACAAGTC:1 - chr3R 13572160 5' - 412 7535 2 78.57 TCAATGGTTGGAATTTACTTCATTTTGCATTTAAATGCATTTTTGAGCATTTACCATTTGGGTATGTGAATGATTCGCAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 - chrX 12995427 5' + blood 7053 2 56.16 GCAGGGAGTTCTGGAAAATATTGCTTTAACTTAACCAACAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCC:1 + chr3R 20097613 5' + mdg3 5335 2 71.23 CTTCTGCTTTCATACACTGAACAATATATTTAATCATTTTACATTTTTTTTTATATTTTTAAGAAAATACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:1 - chr3R 12936189 5' + F-element 67 1 65.07 GCAGGTGGATTACTTGCGTGCATTTGCTGTGCCAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr3R 30524482 5' + roo 88 2 80.82 TTGAGGTAAAATATGTCTAAAATTATGTTTTTTCAATGGATTACGGTGAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTT:1 + chrX 21204987 5' - 1360 3317 1 65.75 ACTTTTCGCCTAGACGGTGCTTTTTTTCCACTTTTGCACATACATACATACGTATACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTG:1 + chrX 13484123 5' - 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pogo 18 1 71.94 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCAC:1 - chr3R 22266428 3' + roo 9017 2 55.48 TATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAA:2 - chr3R 19589934 3' - BS 5077 1 71.92 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCACGCATATTCGTATGTGTGCGCGTGTGTGCGTGGCCAAGCGTTTGCGCTCGTTTGTGTTTTGTGGGTTGG:1 + chr2L 5656650 3' + hobo 2909 1 57.60 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAGAAATCGGTGCTTGATTGCAAT:1 - chr3R 26031656 3' + pogo 2073 1 67.12 GTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTCCAGTTCTCTGGTATGAATATTCGTACACAAAAACCAGGTTTGTGCAAATAGGTTTTTC:1 - chr3R 29381514 3' + hobo 2878 1 65.38 GCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGACTGATCTTAAAAGATATTGTAACATACTTTTATACCCTATTAATAATTAAGAAAATAAACTTTTATTACAATCATAAAACTGGTTCCTATTTAAG:1 + chr2L 17297097 3' - Max-element 26 2 68.49 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTACAATATTT:2 - chrX 3637751 3' + roo 9026 1 54.11 ATACACACACACATACACACTGCCGCACATGGAGTCATCCAATAAAGCCACCATCCATCCAGCCACCCTGCCATCCTGCCATCCTGGCATCCAGTGTTTTGTGGAAACTTTTACACGGCAGCGC:1 + chr3L 11361109 3' + accord 7102 2 75.00 ACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTATTTCAACAAATATAGAGGGAGAGAAGTAGGGGCACAGCTCCCTTTTGCATGTACATACAACGTTTTTAATTAAAAAATCCTTTGGTCAAGCAATT:1 - chr3L 13567929 3' - copia 4884 2 73.53 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAAGGGATAGGAAGCGTTTTGATATGATGGATACG:1 - chr3R 5767395 3' - roo 8749 2 78.87 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAA:1 - chr3R 30524471 3' - roo 8741 2 73.29 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGAATGGAT:1 - 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297 6795 2 67.81 GAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATGTACATATGTGTCTATCACACTGTCTACCCACTTCAAAGGTCATCGGAGCTT:1 - chr3R 22275262 3' + flea 4954 1 63.70 CTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAGTTGTAAGCATGTTTCATTAGAGAAGATAACATTATCCTAAGTAACAT:1 - chr3R 26968381 3' - FB 74 1 68.49 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCATACTAAAGATATGGTTCTTACCATATAATCATATTATTAAATTTGAATCCTTGTTGTTACTCTTGCATGTGTCACTCTTGTG:1 - chr3L 10241163 3' - pogo 38 1 54.11 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATCTGTTGTACTTTTGAATGTCAAGATAAAGAACTCCAGAACTACCAGATCTGATTGTGGTTGTAATTATACAATAGGAACATACATACATTTCATAAAGCAGAAAAA:1 - chr3R 12540436 3' + roo 9054 2 66.44 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGCCATACATTAAGCA:1 + chr2L 18848805 3' - blood 7080 2 65.07 TGCTAAACGAGTTTAGCATTACCGGGGACCACCACGAGGAGGTTTTGAGTCGACTTGAGTAACAAGGACTCTTCTGTTAGCGGGCAATGACCTCTACTCT:1 - chrX 8585686 3' - R2-element 154 1 62.00 AGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAATACAAACAGAATTCCCGAATGAGAGTAAGGAATGCGACAACATACAATTCCTGAAAGATAGTAAGGAAAGTAATAAATCAGGCGGCAGTTGAAAATCCAAACAATATGAAATGG:1 + chr2L 13112042 3' + copia 5027 2 57.53 CAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGCATTGCACTCGGCGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATGCAGTGTAAAATCCGCAATGC:1 + chr3R 24301947 3' + Tabor 7322 2 76.67 CGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACAAATTTTGGAATTCTATCCAATTTCATATTGCTGTGAAGAAGTTGTTCTCTGCCGATATTACTATTTAACCAGTTTGTGAATATACTATTTTCTTGGT:3 + chr2L 2621624 3' - BS 5067 1 66.44 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATGCCAAGTGGCAAAGTCCAACGTACGCTCCGTGCGCCGCCAGAAGAAGCTGACTTG:1 + chr2R 13382058 3' + jockey 4928 1 61.64 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGTCAAAAATAGATTACAATTTAGAAGCATCTTAAAGATTTATCGATTGATATGAAATAATAAGATAAGATCTCGACTC:2 - chr3R 18860746 3' - roo 43 2 50.68 TGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATATGCGACGGGGGCGTGTTCAATTTGCTTGATGGATGCCTGCCATTGTGGCGGGAATTTCGGTCGTGATTCCGCCGTAGAGCTGGCAACTGATGTCC:1 - chr3R 20720470 3' + 1731 4603 2 69.18 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACACACAGGGA:1 + chr3R 18539862 3' + roo 326 2 75.34 ATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGATATTCCGAGTATACGTCCGTAAAT:1 - chr3L 21765390 3' - gypsy 36 2 60.96 ACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACGTACATACACACATATCACATGCACCCCAGGTGAGCAAATGGAATGCTTGCCAAACTGTTCAAAGTGTTCCTGACTACTGCATTGGCAC:1 - chr3R 15570639 3' + accord 7055 2 65.07 AACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGCCCTGGAATATCATTTAAATTTCCATTTAAAGTCGACCACAGCCCCCGCGAGTATAACCATATGCTGCGGGCCAAAGTTGCGATAAAATCAAAATTTTAATTT:1 - chr3R 6578612 3' - F-element 19 1 74.81 ATTCTTGTGAAATAGCTTTTTTTTTCACATTCTTGTGAAATTATTTCCCACTCATTCATATTCGTTTAACTTCTGTTGAATAAAACGTGATGTGCTCTGTGGGTCACAGCTGAAGACGAACCTAAACTAGCGTCGAAGGAGCTGCG:1 + chr3R 5503740 3' + copia 363 1 71.92 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGACTATTCACCATGTGTCGACTGGC:1 - chr3R 17794547 3' + P-element 2810 1 27.78 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCTAAGCCATAGCCAGCATTTAATCAAAAATGAATTTTCCTTTTTTTTGCCATTCCAGATTGAATTCCAAGA:1 + chr2R 16503497 3' - jockey 56 1 50.69 ATTTCTGCCTACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTT:1 + chr3R 13572088 3' + 412 404 2 74.66 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGCCGCTGATGATGGGAAGCAATTATCCCGAGCACGGGACCAAGCCGAGATCCGCC:1 + chrX 19744555 3' + P-element 2877 2 78.32 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTACATACATTTAAAATACTATATGGATAAAAGTTGCGTGGAGTAAATATAATCAGGTCAAA:1 - chr3L 3910464 3' - 297 6627 2 61.15 TTTTTTTTTCGTTTTTTTCGTTTAGCGATCCAATCGTTTATAGTCTAACACGTATTGTGAGAGTGGTTAATGTTTCGTTGCAATAACCAAACTGAATATTGTATTGCTGCATGTATTTTCTCGCAGTGCTCAATTGTGGCAGCATG:2 + chr2L 12027191 3' - gypsy7 5004 1 41.78 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTATAACTGGCTTCCTCCATCCCCAGATGATGGCCAGTGCCACC:1 - chr3R 9657636 3' - BS 17 1 66.90 GTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCCGAGCAGGCCAAAAGTGTAAGCGAAACATCTAAAGGGTCAGCCACGTGCAAAATTCTAACATCTCTCATTTCCGATGCGTAAGCCAATTGAAATGGAAAATTATA:2 + chr2L 16555004 3' - F-element 260 1 67.81 CAGGTACCCCCGTCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCTGGAGGCCTCTGGAGACGTTGCAGGTGAGTTGTTGTTGTATTTGGGCTGG:1 - chr2L 1627955 3' - HeT-A 5741 2 88.64 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTTCACCATGCATCGAACTGCCACCCACTGAATGTCTTTTTCTCTCTACTGCAACGTTTTGGGACGGAGGGCTGTGGGGCCCGGAGAGTTCTTCAG:1 + chr3R 4739828 3' + P-element 2860 1 67.12 AAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCACTGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGT:1 + chr3R 15157707 3' + invader3 240 2 56.85 CAAAGCGAACGGTCGTTCCTTTCATTTCCTCCGAATTATACATAATTATTATTTTCTTAAATACTTTAAGAAAATCTTTTACTTTTCTGTCTTTATGTTTTGTTTACTCTCATTTTCATACCCGTTACTCGTAGAGTTAAAGGTTA:1 + chr2L 21346307 3' + Cr1a 9 1 65.75 AAAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATATTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGAGCAGGCCGAGGCAATTGCAAATCCCAC:1 + chr3R 20720619 3' - 1731 4360 2 53.79 TGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTAT:1 - chr3L 23635038 3' + R2-element 3444 1 69.93 CGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATGTATTTACCTAATTGTGAGCCATGCCAAACTAAATACTTTCTCTACTTCAATTTAGTCTTTCACAATCAGCAATTGAAG:1 + chr2L 19217731 3' + springer 343 2 54.79 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCCCCCATCCGTGCCACATGGCTTTGATAACAACACTTCTCCGGGGATAGTTGCAGGCCATTTTTGCAGTCTCAAGCAAACACTGC:1 - chr2L 2522858 3' - mdg1 7063 2 66.67 GTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATG:1 + chr2L 8807934 3' + HMS-Beagle 179 2 65.07 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTGATGTGATGCAAAAATGTAAAACGTAAATTCTAATATGTTTTATATCTGTATAGTTG:1 - chr2L 20262602 3' + roo 9010 2 61.64 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAACCTTCGAAGGCAGATCACTATATTTAGGCCAATAAAATCTTGAGAATTT:1 - chr3R 5684067 3' - pogo 54 1 60.90 CTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGGCTAACCAGGGTGGCGAGGTCATTAGATCATGCCAGCTT:1 - chrX 21933797 3' + gypsy11 4355 2 68.64 CTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGA:1 - chr3R 24301825 3' - Tabor 72 2 64.83 ACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGCGGATTGAAATGTATTTGAAAATGGCAATTTACGCACTGTTAGGGACAGTTCAAAAAAAGATTCAGCTGCAGGCATGGCA:1 + chr3R 15035170 3' + Stalker2 360 2 55.48 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGTACTTACAATGTTTTCATTCGGCAATGACTTATTATTTAGCACACTGATAGCTGATAACACAGTGCTAATGTGAGCTGGAGCACTTTTCTGAGTCGGGGTTG:3 + chr3L 1324397 3' - 412 18 2 73.29 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAAGAACCTAGGCGTAAATCAAAAGATTGTGGGACAGGCACGGGGAGAGGGGACAGAGGGGTACTAGGATAAATCGG:1 + chr2L 9988212 3' + hobo 2901 1 52.55 GCGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAGGCACGTACTTAAAAGAAAAAAAAATAAGAAAAAAAAACTTCCCCATCAAGTGGGTCCAATAAAAGTTTTATGAGTCAGCCGCAATCTCGG:1 - chr2L 10128049 3' - hobo 25 1 65.71 ATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGACGTTTCGCACACACAGAGATACAAAAATTCAACGCTTGACAAAAAAAAGCGCAGCCTGAG:1 - chrX 7441023 3' - jockey 4821 1 57.53 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGGGTGAGGACTTTCAACTGCTGCTTTAGCCGTTACTGCTGCTGATTCTCCTGGTTCAAGTATAGCCACTTAAACC:1 - chr3R 12781466 3' + pogo 2057 1 52.05 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGTATTTAGGGATTCGACGC:1 + chr3R 11550292 3' - F-element 71 1 60.27 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATTATATTTCATACAATTTTGTTCGTCCTAAACATTGTGTAGCATTTTATTCAA:1 + chrX 14318485 3' - 297 6632 2 67.39 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGAAATATTGAGATTTAAATTTCATCAAAGACTGTTTATAATAATAGAAGTCTAGACTTTTTGTA:2 - chr2R 10189256 3' - Doc 62 1 59.59 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGGGTGAGGACTTTCAACTGCTGCTTTAGCCGTTACTGCTGCTGATTCTCCTGGTTCAAGTATAGCC:2 - chr3R 12781475 3' + pogo 2048 1 55.48 TTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAGGAGCTGCAGACAAACTCTTATATTAAACTCAATGGCTCGGGCC:1 - chr2L 8807848 3' - HMS-Beagle 7 2 65.85 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGTGTGTGTGCCGCTC:2 - chrX 20106308 3' + hopper 1359 1 54.11 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAGCATTTGAAATATTCAAACTGAAGCTTTTCTTCTAAGCCGGAATTTAAATT:1 - chrX 13008698 3' + blood 307 2 68.49 GTGTGTGTGTGTGTGTTGCTGCAAGGATGTGAGTTTTTGAGGATCTTGGGTAAATTTCGATCGTCTACATAGCGATAATTAATTCGATTGCCGATAATCAGGCAGTAGCTTTTAGGAGTTTCTAGTTTTGTAAATTTTGCAATTT:1 - chr3R 15302191 3' - accord 179 2 58.62 CAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCAGAAGCTGACGCTTATTAATTATGCGCTTTTAATGCGCGAGAAAACATGCATTTA:1 + chr3R 23454346 3' + X-element 4454 1 73.29 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGAACTACAACAACATAAA:1 + chr3R 7109206 3' - P-element 87 1 26.71 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTTCGGCCATCCGGCGCGTCGTGCTTTTCTATTTGTATTTGTATTTATTTGCCACTCTTTTCTATATTTTTTTT:1 - chr3R 13572000 3' - 412 47 2 52.74 CATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATAT:1 + chr2L 23295852 3' - micropia 5043 1 77.40 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATGCTAAATGGAATGCCAATTATCATTTTAATTGCCAACGACAGCTGCTTAATGAGTTTTAGTCAGGAAAGCTATTGGTGT:1 - chr3R 21758481 3' + Juan 4177 1 58.90 ACTCTGCAGAGAGCGCGGCAAGCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATT:3 - chr3L 3540151 3' + mdg3 5404 2 76.71 GCGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGAAACCCTCGATTCGGGTCCAATCGGCCACTTACTGCTTGGTCATGATGCTGGAGTAGA:1 + chr3R 10741192 3' - 1360 3360 1 53.42 GACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATGTGGTCGGAAAGTCTCGAATCTAGAGTACCGGGTATAAAAAGAATTGTATTGTAGAATTGTATATTGCCCTTACAAAATAGACTCTTGTTTTTCTTTCGTGTCTT:1 - chr4 520283 3' - INE-1 92 1 63.01 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATTCAAGAGGCTGCAGCATTTAACCGAACGCAAAGTAG:1 + chr3R 6149842 3' - jockey 96 1 76.03 GAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTCGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTT:1 + chrX 22715128 3' + opus 429 2 69.23 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAATAAATATTTACCGGGGACAAGAGGCGTGGGGGACGACCATTAAAATCATAAAAGATTACTTTTAAAAAACATATTT:1 + chr2L 19907661 3' + hobo 2892 1 50.68 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGGGTGAGGACTTTCAACTGCTGCTTTAGCCGTTACTGCTGCTGATTCTCCTGGTTCAAGTATAGC:1 - chr3R 12781476 3' + pogo 2047 1 56.16 ATATGCTTTTATTTTATTTGATTTTCCGTTCAGTCTGTTTTCCCTGCGCCAAAATGTCATTCAAATTACGCAAATGTTAACGAGGAGAAA:1 + chr3L 18521103 3' + transib1 1895 2 76.67 CTTCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGGGGTTCTTTAAATATGTTGTTAAATATCTGTGCAATATAAAATCTATCAAGCTTCATGAAGAAATTATAAAAATTGCTGTA:1 + chr3R 6614585 3' - 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roo 8750 2 77.46 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTTTGGACAGCCTGTTGGATTTAATTTGAGACTCTTCAGTTTGCATTTGGGCAATTCCACAC:1 - chr2L 9988099 3' - hobo 60 1 58.22 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAACTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGA:1 - chr3R 19989250 3' - hobo 63 1 65.47 TAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATG:1 + chr3L 13365098 3' - Juan 78 1 69.23 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCACACACACACACCGATATGAATCTTCATTGATGGCGGAGCGA:1 - chr3L 13568192 3' - hobo 79 1 73.29 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTGATATTGGGCGATAAAGAAACCGCTAAGAAGCCGCTCTCAGTCTCTTTAG:1 + chr2L 11043649 3' + roo 9040 1 63.70 CGTTACTTAGCTAGTGTGAATGCGAATGCGAAATTTCATCATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGAAATAAAATGATAAACAATTTAAATGATGGTTTAGGGAATGTAGAACGGAAAACAGAGACCCAGGCAGTCTACTTTT:1 - chrX 666456 3' - INE-1 535 1 72.60 ATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATTTATGATACTACCGATATTATTTTATTTACTTTCGGGCTGGAAGCAAACTCGTGTTTTTCCGTTTGGTGTGTGCTTTCCCCGCAGCAAGTTGTGCCCTACAC:1 - chrX 6863528 3' - Juan 4102 1 71.92 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCTCCAATGCGACCCAACCGTTGAGCGTTGAATGAATGTGAATGCTCAAGCATACGGCAGCGCGAAGCACCAATACCAATGCTACCCGCACTCACACCAGCA:1 + chrX 3743903 3' + Tirant 8487 2 72.60 TCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCTGAGAAATCGGAATTGTAATGCTGATTTCCCCGAATTTCCAACGACTGAA:1 - chrX 19399977 3' + opus 7391 2 68.49 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATTGCATTCCGCGGA:1 - chr3L 10068893 3' - 412 63 2 60.96 CTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGATGAAATTTATGATAAGCCTCACACCAACGGAATCAGTTCCAGATTT:1 - chr3R 15451284 3' + Transpac 5104 2 68.49 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTATATCCGG:1 + chrX 20369457 3' - roo 8736 2 67.36 GTGTCGCTTGAATCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCTTAGACTAAGGAATTTTAATAGCAAAAACATGACTAGAATATGTAGTCTG:1 + chr2L 3327058 3' - jockey 4741 1 63.01 TTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCGGCAAAACGTTTAGTTCAATTGTTTGCGGACC:1 - chr3L 16523297 3' - Bari1 34 1 62.76 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAACCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTGTATATACTGATTTCAGCAATTTATTAAGACCTTGTGAGCTATTAAAAATTTTACTACTT:1 - chr2L 12447418 3' - opus 177 4 59.59 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACGCACATTTCGCCTCGTGTAGTTCAAGCGGTTTCTAATTTGCTTGCCGCTGGCTGTAGCAAATTCTAATTTATTTGCAAACTATGTAAC:1 - chr2L 20268895 3' + hobo 2906 1 63.01 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGAGAGATGGGAGTCTC:1 + chr3L 17895998 3' + P-element 2815 1 37.67 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCTGCATCAGCTG:1 - 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pogo 40 1 62.62 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTTATGGGCCCAGTCCATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGATTAATGCCCTTTGATGTGGCTGGGGATGCTGGATGG:1 - chr3R 31326837 3' + copia 217 2 76.26 ATTTAATTAAAAAAATTAAAAAAATACATTACATTACATTTTATGTTTTGGGCGGATTAACGGCGTGGCAACATCAGTAACGTTTAACTTGGGCTGTATCTCTAACATGTTCTACATCAATCTTTTCTTCTTCATTGGCATCATGC:1 + chr2R 1370576 3' + HB 317 1 70.55 TGGATTTCCAGAATTGTGAAATTAACACCGATCACGTAAGTGTGAATGCGATGAACAGAAAAGAATCAACCGAAACTGGCAGTGAGAGGGAGCGTGATTCATTGGCTTTATCAATTGTGCAAAATTCCGGCATTGTTTAGTC:1 - chr3R 26534811 3' + mdg3 495 1 64.79 AACTATACAAAGTATTTTACATACAAGCAGTTTCAATGTCCTTGCTGTCCTTGGTGTTGCGACGAAGCTGCAGCG:1 - chr3R 27670528 3' + Cr1a 175 1 81.33 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACCTCAGGGGATGTCATTTGAAGGCGGCAAGTGTAAAAATTAAGCAGCTAGGGG:1 - chr2L 9109849 3' - opus 7067 4 63.70 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGCACAACAAATAAATCAATTGGCTTTGCCTAAAACGTTTGAAATTGATTTCAAGTTCTTTGGCCCATTGTTTTTATATGCAACAAAGGGAC:2 + chr3R 28788825 3' - I-element 33 1 63.01 AAGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGCACGTGATCTATTAATATTTAAAAAACGACCTACTGCATATA:1 + chr3L 15374700 3' + 3S18 275 2 68.46 ACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTTGCAGCTTCCGTTTTCTGTTGGC:1 + chr3R 13572098 3' + 412 414 2 67.81 ATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCGGGGTGAGTGGGGGCGTGGC:1 + chr3L 10111863 3' + copia 198 2 55.86 GCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGTCCATTTGGGTAACTAAATAGCTTATGGTTAGTTTCCG:1 - chr3L 5425472 3' + blood 7307 2 74.66 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTATTTTGAATATTGTAAACCTTTCATATAAAAGCTCTG:1 - chr3R 14609200 3' - roo 8746 2 75.34 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCCTTTGTTTTATATTATATGATTTAGATATAAAATCTAGAACACATTACTTAAAATTATAAGATAATTTAGTCGTAGAATGTTTTC:1 - chr3R 6523181 3' - I-element 38 1 58.22 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTAATCCTAATCTTTTGGAAGAGGTTTTTAAGCTAGTTTTGGTAATCAAAATGGTTGTGTGACTTATC:1 - chr2L 3150971 3' + blood 7367 2 69.86 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCAGGGATCCCGTTATTTCCCTTTTTGCGCACGGCCCGCCCGGGTACAA:1 + chr3L 24290897 3' - 412 7127 2 67.81 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATCTGTTGTACTTTTGAATGTCAAGATAAAGAACTCCAGAACTACCAGATCTGATTGTGGTTGTAATTA:1 - chr3R 12540475 3' + roo 9037 1 48.39 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGATGGTTTAATTTTTTCTTATCTAGGTTTAAAACTGGGCGTGTCCCTTGGCAGAATTATGCACCACGGAATGCAATTATGTAAATGTCCTTGT:1 + chr3R 7655700 3' + 412 7516 2 64.38 TAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGCTTTTAAGAATCACTTTATGATAATTTTTTATTTATTTTCGATACATTTAAATATATTTGCATTT:1 + chr2R 17174608 3' - Doc 4594 1 55.71 TTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTTTTGTAAAGCTTAGATCAAATTGTTTTTCTAAGTGTTATTCTTGCCACTTTTTGTGAGGATGGCACATCGTTTGTGTGT:1 + chr3L 20041963 3' + Quasimodo 7333 2 63.01 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTGTTTTTGTTGTTGCTGGACTTCGGTTGTGGAATTGTGTAAACAGCACCGACTGCGACGTCGGCAGCGCAACAACAAAAA:1 + chr2L 16536639 3' + pogo 2065 1 60.96 GCCACCGACGGGACCGAGATTCCGTCACCATGGGTCGGGTTACCGACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGGAAAACCACAATGCACCCACGCCGACGAAAAGAGAAGGGCATAGAAGCGGCGAAAGA:1 - chr3R 10957847 3' - Rt1b 495 1 59.38 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGGGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCCCTGGTATGTACATATATGAAGACTGGCACTTGAGCGGATAGAAGGAACGGCGGGGGGGGGCGGAGAAGAAGGGGCATTAGAA:1 - chr2R 15892113 3' + hobo 2901 1 52.90 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGACTATTGAAGTCTATCCACTCTATATGAAGTTCGGAAGTTTGTGGCTTTTATCGACTAC:1 - chr2L 11043519 3' - roo 61 2 61.64 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAA:2 + chr3R 13198292 3' - Doc 57 1 53.42 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATT:1 + chr2R 24021668 3' + pogo 2051 1 55.48 AAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTT:1 + chr2L 14147250 3' - transib2 2592 1 69.86 CTGTCTACTATTTTTACCGGCATACTCAGGGAAAATAGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGGTAGATATTCTAGATCGATTGACATTAAGTATGCCATACGCATAT:1 - 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chrX 10344752 3' + roo 9018 2 53.42 GGTTTGTGCGAAACACCACCCTGAACAGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCATTCGAGTATCACGCAAGGATCATCCGTGATGAAGACATCGCACAATAACTACGAGATTCACTCGCAGCATGTTCTG:1 - chr3L 6748943 3' + X-element 4336 1 49.32 AGCACAGCCTTACATCCACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTGGCAACGTTTGGGAGGAATTTTTGCCCATGCATCCTGTACAACTTGCCAAATCTGAGCCTTAGACGTCGGTAGATTTAACATGCGACAGCTAACGGTTTTACG:1 + chr2R 13718047 3' - HB 1298 1 77.40 CAAAAGTAATATTCCAAAGAACACTAGAACATTTGTTAGCAAACAATTGAAAAAACTCAAAAGCAATACATTGTTTAACTTTTTCTGCCAATTTTCACAATTCAAAGCACCTCTGATTTAGCTGACTTTGAAAGCGCGCCAAAAAT:1 - chrX 21093886 3' - transib4 403 1 50.68 TGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTGGAGTATAACTAATTTTCTGACAATTTCTGACAAAAGTTACCACTTGCCACTCTAACCCTATAACTAATCACCTTATGCTATCGTGGTTTCCGATATATA:1 - chrX 20512486 3' + transib2 364 1 58.33 ATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGGGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGAT:1 - chr3L 19951183 3' - Ivk 60 1 58.22 CACGCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGCAGGCGATCACGGCCTTGCTCACCAATGCTTATGACTGCACGAAATGAACCCGAACGCTTCTCTACTTTTGTGATATGTGCTTTTGTTTGTATGTTTTCGTTATATTATATATA:1 + chr3R 2845189 3' + Doc3-element 341 1 61.64 GCTCACCGTTGACCATATTCTCAACGCCTGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCACTTATTGGAGCAGCTGGCACGAGACCACTATGAAAAATTTCCGATTGCCTCCAAAACTCTGCTGAAGGACTTCTA:1 - chr3R 2724193 3' + Ivk 5131 1 55.30 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAACAGAGAATGGAAAGATATTAAAAACAGTGACAAACTATTTGGCGAAACTCTGTTGGTCCTTTCAGGTGATTTCAGACAAA:1 + chr2R 4854033 3' - copia 43 2 56.16 GCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCT:2 - chr3L 3540111 3' + mdg3 5444 2 52.05 TTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGTAATAAAGTAAAATCAAATCGAATTCGACTGTATGTGAAGCGAATTCGATTG:1 - chr3R 6171081 3' + 297 6950 2 69.18 CGGAAAACAGGAAGGGAAAATAAATGGAAGGATTGCAAAGAAGGAAGGGATTGGCAAGAGCAATTAAAAACCATTAAACATTTCC:1 + chr3L 21027010 3' + ZAM 482 1 70.59 GCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAGGAGCTGCAGACAAACTCTTATATTAAACTCAATGGCTCGGGCCCGACCCCGAATATT:1 - chr2L 8807834 3' - HMS-Beagle 6830 2 55.28 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTACAATATTTATCAATATATGAACCTAATTCATATA:1 - 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chr3L 1728475 3' - blood 7097 2 74.66 GGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCGGCACTGCCGCTGCATTTGTTGCCGTCTCTTTCGCTGCACCTACACGCCTCTCTTTCGCGCATGCACATGTGCAACGCATTTTCCCAAAAATTAAATGCAA:1 + chr2R 19266307 3' - R2-element 3135 1 63.01 TAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGATAGAAAGATGAATGGATGGATGGATGGATGGGTGTAAGGGTGTCTGAACAAGCCGACAGTAATTCGATGCGTACTAAATGGAATGAATGACAAAAGCGGTCGAGGATGATAAATTTGTTG:1 + chr2L 7596161 3' - mdg3 5252 1 67.12 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTG:1 - chr3R 30524477 3' - roo 83 2 77.40 CTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTACATGATCGGAAACGCCTCATTCTGCCTATTACATATATCAATTTAAGCGGTTTTTGAATAATAATAGGGTATATTGATTTAAGCCAGAACTTTGTGCCGCAGTGAAGT:1 + chr2L 21264989 3' - INE-1 90 1 54.11 TCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGTGGGAACGAACGTACAAATACGTATATAGAACCAAAACCAGAAGAG:1 + chrX 17259430 3' + R1A1-element 5128 1 68.49 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGATAGAAAGATGAATGGATGGATGGATGGATGGGTGTAAGGGTGTCTGAACAAGCCGACAGTAATTCGATGCGTACTAAATGGAATGAATGACAAAAGCGGTCGAGG:1 + chr2L 7596146 3' - mdg3 5267 2 58.22 TATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTGATCACTAAAATGCAAAGCAATAGTAGCTGGTTTT:1 - chrX 12344300 3' - F-element 72 1 58.33 GCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAA:1 + chr3R 22572652 3' - HMS-Beagle 62 2 59.59 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAATCTTTCCCAAGAGGGTTTTGATGGGGTTAGGTTCTGTTACTAGTTAGAA:1 + chr3R 10736850 3' + copia 183 2 68.49 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTTCGTCGTTTTGCCAAGGAGACTCGCCGCTCAAAGGGAGGAAGCGTTTAATTAAA:1 - chr2L 20985775 3' - F-element 76 1 60.56 CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACA:1 + chr3L 3540214 3' - mdg3 5305 2 60.27 GAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTACATATATAGAGTTTGGGAATATAAACAGAGCTCTTACACACAAAACCCACTTAAATTGGTGCGT:1 - chr2L 19217607 3' - springer 7195 2 60.00 GTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACT:1 - chr2R 17872493 3' - Tirant 8190 2 71.92 CCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACGCACATTTCGCCTCGTGTAGTTCAAGCGGGTTCTAATTTGCTTGCCGC:1 - chr2L 20268935 3' + hobo 2867 1 65.52 AGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATACCAAGCTTTACACCAAAAGCTCTTCCCGGTTTTATAG:1 - chr3R 13232910 3' + F-element 4346 1 82.19 CCTACTTTTGTTTCAATCATAATTAGTCGGAGAATTAAAGATCGATGCCAACGCCGATCATGAGTCAATGCCAACGCCGACGCACCAGCGTTTACCTGACCCACACTATTTATTTATTTGCGAGCTGTAAACAGCAGCGCACCAG:1 - chr3R 5672768 3' + Tc1-2 323 1 70.34 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACAATCTGTGCGTCGATAAGTATGATGGCGGTTATGAACAGGTTCTGGAACAGTACAATTCCGTTGT:1 - chr2R 18056752 3' + blood 7369 2 71.23 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATG:1 - chrX 3637791 3' + roo 8986 2 74.66 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAATCTTTGTTGCTCAAAGTGAGAGACAGGGAGAGAGAGAGAGTACACGGCGTATGTGAAAGATTCACTTTTACACATCCAAAAAAGAGATGTGAGTTA:1 - chr3R 7109095 3' + P-element 2865 1 70.55 TGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTATTTCAACAAATATAGAGGGAGAGAAGTAGGGGCACAGCTCCCTTTTGCATGTACATACAACGTTTTTAATTAAAAAATCCTTTGGTCAAGCAAT:1 - chr3L 13567930 3' - copia 4895 2 67.81 TATGTTCTCATACAAAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATATTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGAGCAGGCCGAGGCAAT:1 + chr3R 20720607 3' - 1731 4373 2 58.22 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATCCTGTGCATACCAACATAATTTAATTAAA:1 + chr3L 12729155 3' - opus 7187 4 77.69 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACAATCTGTGCGTCGATAAGTATGATGGCGGTTAT:1 - chr2R 18056784 3' + blood 7337 1 52.74 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAATGTGCGTGGAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATG:1 - 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chr2R 11379735 3' - hobo 19 1 71.23 AGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCAATGCTGTGAAATGGCCTGAA:1 - chrX 17690446 3' - Doc 316 1 51.37 CAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATAGATATATTTCTCTTTATTTTCTTGCTTTGTGCATAAAACTGTCTGGGGTAACTTGATACTGGAAGTAAAAACTGTCGCGACAATTGTTTGGCTTTTTTACTGG:1 - chr3R 8884256 3' - HMS-Beagle 6810 2 74.66 GTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCAATTATTCTTATTTCCCCGCGTGTATCGATTGCCATTTCAGTCGAATGGTCCTTGCAGCGGGGCACTGTT:1 - chr3L 17704023 3' - HMS-Beagle 262 2 52.05 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGATGTTGTTGTTGTTGATGTTGTTTCTACTACTCTACTGCTACTACTACATACTCATAAGCCTCTCTAAATACCGCAAGACCACTA:1 - chr3L 13778517 3' - I-element 38 1 59.59 GTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTC:1 + chr3R 24301913 3' + Tabor 7262 2 58.90 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGGCCTTTGCTCTCTTTCCTTCTCTCCGATTCTTCTCACTCTCCGAATGGGTGAA:1 - chr3L 3249964 3' + P-element 2820 1 43.84 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGGGGCAGCGAACCCCAGGGGTTTTGGGGTTCATACACCGCTCTCTGAGTCTTTCTT:1 - chr2L 17574357 3' + hopper 1353 1 60.27 AACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATGGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCA:1 + chr3R 9862986 3' - Stalker2 54 2 52.05 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACTAACATGTTACATAAGCCCCACACCCTTCTTCCAACTAATTGGATTTCTGGGAACTCACTTACAGACATGA:1 + chr3L 18954238 3' - roo 49 2 52.74 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAAATTTTT:1 - chr3R 19144395 3' - Juan 61 1 56.55 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACGAGTTGCGCAACCACAGCGCCCCCGCATACCAAAATGTCGAGGGAGAAATACTTTCGCTTTCAAATG:1 + chr2R 18786112 3' + roo 391 2 73.29 ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTAATCCTAATCTTTTGGAAGAGGTTTTTAA:1 - chr2L 3151008 3' + blood 7330 1 58.22 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAACACTTAGTTACACCGATATTAGTATGCAG:1 + chr3R 24760646 3' + pogo 2046 1 51.37 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGAAATTTTATTGAACGG:2 + chrX 18193861 3' + hopper 1405 2 74.66 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCGGGACTTTCAAGACGCGCGCGAAG:1 + chr3L 13450765 3' + P-element 2825 1 25.45 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATCGATCGTACATCTTAAAACGAAAATAATTACATTCGAAAAA:1 - chr2L 615246 3' - F-element 85 1 70.29 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATAAGTTTCCTGCTTAGATTGTATCTC:1 - chrX 16857035 3' - pogo 41 1 54.79 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATTATGTGTTTAACATGTTTTAATGAACAGAAACTAACACGAGTCCGGCACAAAAGGATGCATGTTCGAATGGAAAATCGCTGATTAA:1 - chr3R 12885958 3' - 412 35 2 60.27 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTGCACGCCCCGTATGTTTGTACATATATAAACTGTTGCGACAA:2 + chr2L 15601679 3' - Doc 22 1 69.86 TTATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGAGCCTAATTTAATTTAGGAAGGCAGCGAAATGCGGAGGCAGCGAGGCGTTTAACCAGCAGTACTTACTACCAAATGGAGTATTATGTCCAAATGGTCAGTGATAGTTAGCCAAGAGA:1 - chr3L 19660977 3' - Quasimodo 39 4 63.01 GCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAGAAAATAGAAAAAAAAAAATTGCATGCGATTCATATGGTTTTGTCGGGCTTCAGTCACATCGCAAAGTTGGATTTC:1 + chr3R 22760993 3' + pogo 20 1 62.33 TAGCTGAGTAACGGGCATCTGTTAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTTTGTAATTTATTTTAGACTTATTTAGAATTTATTATTCAACCCCAAGGCGAGCGATAAACGCTGACACAACGAAAGCGCAGAGCCCAAACC:1 + chr3L 9117206 3' + INE-1 544 1 64.38 AAAAATTTCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATCGAAGATTTCGAAATAATGAATGGGTTCCCATGGTTCT:1 + chr3L 18237423 3' - S-element 78 1 71.23 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAATCCGAGAGGTATTCATTTGTGCTTGTGTTATTACGGCTAAGAGCTTAAGATC:1 - chr2L 1870906 3' - mdg3 5280 2 64.83 GACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTGTTGACACACTGCTTTATATATGAAAA:1 - chr3L 15374608 3' - 3S18 5814 2 53.42 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTGGGCAGGTTCAGATACA:2 + chr2R 24021685 3' + pogo 2068 1 63.01 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGG:1 + chr2R 24021656 3' + pogo 2039 1 63.70 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAGCGGAAAAGCGAGTGCGAAAATTGCAAATGGTGTCCACTCACGCACGCT:1 - chr2R 17348406 3' + hobo 2921 1 55.56 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTACA:2 - chrX 3637757 3' + roo 9020 2 50.68 CAGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGATGAGCAACCTGCACTCAAATATTGTCCATCCCAGCGGGATGTACATGAATCCCCTGCTCTACGCCAAC:1 - chr3R 25478391 3' - 1360 3359 1 56.16 ATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAAT:3 + chr2R 13052836 3' - Doc 121 1 73.97 TAATTATAAACTAATCCACCACGCCCAAGCCACAAACTCACCCAATGCAATGTAATACTCATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACACACTGTAATCCAAGGCAAAAATAAGGGAGAACAGCACGCCAGCCTTATGCAT:1 - chr3L 26026793 3' + HeT-A 5907 1 69.18 TAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATGTAAATGTACATCAATTGCATGATGATTTAGGTGAACCTGCTCTGAATATGGTGATCCAAATTTAGACTTCCAAGAGTCATCGCCTTTCCCACCAATTCAT:1 - chr3L 13440550 3' + P-element 2699 1 70.55 CACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATTTGCTTTTGCGCTTTTGCGCACGCCTTCCCCAATT:1 - chr3L 780684 3' + Burdock 173 2 75.34 TTGCATATATTCTTTTTTTTTTTGCTGTGCCTCAAAGTAGACATGTGTTTACCTTCCACATAGACACACACACACACATCCATTGTCGGGCGCAGTCAACAGGCCCCT:1 + chr3L 1430024 3' - invader2 301 1 65.74 AAGTAGGGCGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGGGTACCGAGGGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCCGCAGCTCTCTGGTTCGCATTAAAACGAACGTC:1 - chr3L 939672 3' + hobo 2871 1 80.00 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAACCTTCGAAGGCAGATCACTATATTTAGGCCAATAAAATCTTGAGAATTTCACGCAAAT:1 - chr3R 5684058 3' - pogo 58 1 58.22 AACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGGAGAGAAGAGCGGAAAAAAAAGGAGAAGAAACCAGTAGGAAAATCTCCACTCTTTACTGCTTTTTCCCAACGCCCCAGCAAATTGTCTGGCTAGCA:1 + chr2L 12865779 3' - jockey 147 1 71.23 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGATATGCAGATCGAAATTATATACAAATTACTT:1 + chr3R 4352175 3' - Doc 25 1 74.66 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACGTATATGTGCACATATATATTGCAGTGCAGTCAAGGTCGTGTGAAAGGGACGACAGTTACGCGGCATTACTCTTACCCTTCTTTTGCA:2 + chrX 13484240 3' - hobo 34 1 62.33 TTCACTGAGGCAAGAAAATCCGCAGGCCAAGTTAGGCAGATTATCGCTGAACTACAGACGGCCGAGGGCGGCCTTAATTCTGAGGGGGAGTAGTTAATTGAACTTGAAAATTCGAATGGTGTATTTATCAAATCTTTTATTGTTAA:1 + chr3L 14070575 3' + gypsy6 7330 1 66.44 GCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATGTACTACTGGTTTAATGCGAATGTCGATGGCTGAAAGAAAAAGGTTTGAGGCGGACGAGGCCAATGGCGAAAGTTGAACATTTGCAAGAACATTTGTTT:1 - chr2L 56498 3' + copia 4764 1 73.97 ATTTGGTGCACACTTCAATATGAACACTTTAAATGAAACCGCTGCGGCTGATGAATCGTTGGATAGTTGGCTAGGATTCAGATTTTTAAGATTTTCTAGTGACTTACCTCTACATACTTGTCGACGTAGTTGACATTGTCCTCCAT:1 - chr2L 3315488 3' + X-element 303 1 60.96 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGA:2 - chr3R 5087083 3' - P-element 80 1 30.82 AAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGTGCACAAT:1 + chr3L 23839725 3' - McClintock 51 2 58.99 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGGCGGCTTGTTCCTTTTGC:1 - chr2L 14262947 3' - P-element 61 1 43.84 AATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTTTCATTGTTTGCTCCTTCATTCAGAAAATCGTCAAGCAATTACTAGTATAAGTAGACGAAAATGTTAAA:1 + chr2R 18807923 3' + BS 5044 1 53.42 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACCAAAAACTTTGCAAGATTGCAAAAATTCCAACAGTTTCCTTTGATCCTGTGGTAGCTCAGCTTCATTTTTGCCCATTTAAGGT:1 - chrX 18061019 3' + 297 351 2 58.90 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACTTGTACACGTCGATCTGGAAGCTTGCGGGCTCTTTAAGACCATAATGATAATTTTTACCAACAGAT:1 + chrX 22760417 3' - roo 8719 2 56.16 AATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATATATATTTCCTTTTTATATAATTAACATTTGTTTAAAACAGTAATCAGTAATTACTG:1 - chr3L 11903214 3' - micropia 150 4 65.75 GGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAATATTTAAAATACTTAATAGTCATGTTCAAAGACGAATCAAAATAAGAGCTTCCGACTTTCGTTCAACAGCAAATTTTCAA:1 - chr3R 4869397 3' - I-element 5163 1 56.85 AAAAAAAAATCAAGTGAAAAAACCAAGACGAAACGGCCCATGAATGATGGCCAACTAATAGTTAAAGTATTTCAATTTTGTGGTTTAGCTAAAGTTCCAAGCAAAGTACAATCAAGAACTATTTATTTTCTTTAATTTTGTATATA:1 - chr3L 16184092 3' + Porto1 172 1 56.85 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAAACATTAATATGCTGGCTGAAGTTTCGG:1 + chr3R 13198319 3' - Doc 30 1 68.49 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTACAATATTTATCAATATATGAACCTA:1 - chrX 3637734 3' + roo 9043 1 65.75 AAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTCAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAATTAATTAAATTGAAGTTCACCAACACGAAACCACCAAAATCCA:1 - chr3L 22638790 3' + Juan 4134 1 73.97 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATTTTTCGCAGTTATGTCTTTCACTTGTCCGAC:1 + chr2R 8375159 3' + roo 9059 1 74.81 AACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAA:1 - chr3R 19144401 3' - Juan 68 1 60.96 TAATAGATTTTTAAAGTTCATTATAGAGTTTTTTCGTTAGTATTATAAAATGCATTAATTTGTTGGGCCTTAAATCTTCATAGTTGAAAGTAGCTTTACAATACGGAAAATTCGATTTTTTCGAAGCACTCGAAACCCGTCCCACT:1 - chr3L 13922379 3' + hopper 173 1 58.90 AAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTTCATATT:1 + chr3L 13365117 3' - Juan 62 1 56.85 GAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAAT:3 + chr3L 13365105 3' - Juan 74 1 65.07 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGACAGGAGCCGAAGTCGATGGGGCAG:1 + chr3L 13380498 3' + hobo 2897 1 69.57 CATCTCAGCTGTTGTGATCTGTAACCACATTTCTTTACTGTGTTTTTGAGTTGCGGACCAATGCAATGCGAATGCATTTCAAATGCAAATCGGCAAAATGCAACTTCGAATGCAACCGGCAGGCAGCGCCCTCAATTCACACTTGA:1 + chr3R 19316393 3' - Helena 974 1 59.59 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGTG:1 - chr3R 5087071 3' - P-element 68 1 37.67 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATTG:1 - chr2L 2336215 3' + 297 6918 2 63.70 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATTATGTGTTTAACATGTTTTAATGAACAGAAACTAACACGAGTCCGGCACAAAAGGATGCATGTTCGAATGGAAAATCGCTGATT:1 - chr3R 12885960 3' - 412 7090 2 58.90 CGCGGCAAGCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAAAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGAAATTACAATTTGAATGTAATATA:1 - chr3L 3540138 3' + mdg3 5417 2 67.81 TATAATTTAAGAAACTCTGTACAAAATAGAAAGTATAATTTGAGAAACTCTGTACAAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGGCTTTGGGGCTCCGATGTTATTGCGTGTCCTTCGGGTCCTGTGGGTCCTGTAAGCCGGTCA:1 - chr2L 1873109 3' + mdg3 5029 1 56.85 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAATTTAAGCTGTTAATGGCCCATTTGGTTTTTTTAAAT:1 + chrX 10838616 3' + roo 9019 2 58.90 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAATAAATTACACGGAACGAGCCTGAAGAGCAGCAGAAAAAATG:1 + chr3R 19500727 3' - jockey 89 1 49.66 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGCCAAATAACAAACCATATTTTTGAAGAGTGTTCTTCGGCCAGCTGCCAAGACACACGAAATTCTGTTTTCCAAGTA:1 - chr3L 21108474 3' + roo 9026 1 52.74 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGCCTCTAATACCCAAAGCCTAACCTTG:1 - chr2R 11818229 3' - P-element 69 1 25.83 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTACATTTCCACTAAACTTAATAATTCTTTTTGTGCATTGTCTATTAACATTTTAAATTAAGAAAACGTTTAATTCAAGCGCCGACAAGTGCCCTTT:1 - chr3L 23244809 3' + HMS-Beagle 219 2 67.12 ACCTAGCACCTGCAGAATGCAGGCGATCACGGCCTTGCTCACCAATGCTTATGACTGCACGAAATGAACCCGAACGCACAGAGAGCGTCTCTTTCAAGCTCCCCCCTTCCCAACGGCGTCAAGCTCAGCATCAACATCAACATCAA:1 + chr3R 14593079 3' + Doc3-element 354 1 76.71 ACTAGATTCTTTGAAATGTATGAAACAATTAGTCCTATAAAGTACATAATATGTACTATGTATAAACTTTGAGATCAGATGTGAAACAGATTCAAGATAAGAGGGAAGGATTTTTAGCTCCATACAACTTCACTTATGCGCTATCA:1 - chr2L 6279606 3' + INE-1 11 1 58.22 GTTGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGTAGATAAATTTCAGACGTCTTGCGCTTTAAAAATGGCACCCTGTTTGCATCAGCAGTAACGTTTC:1 + chr2L 22293977 3' - HMS-Beagle2 6894 2 60.19 GCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATCCTGTGCATACCAACATAATTTAATTAAAGCTCTCAATTGAGCCATCTCATCAGCAGCACGAAGGGTTGG:1 + chr3L 12729196 3' - opus 7049 4 52.05 CCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTCGTCAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAACGCCGTTGTTGTAAGTACTCGCCACAAATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCACA:1 - chrX 23291024 3' + R1A1-element 320 1 53.42 GTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATGTAAGCGCTGTAAACTTAGGGCCAGATAATAATTTACCATTTGTTATTTCCTATCGCAACACCTGGC:1 - chr2L 20520719 3' + 1360 3250 1 54.11 GTTTATCAAGATTTTGTTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATGTGGCATATATATGTGTATGTATAGAGACAGCA:1 + chrX 7657488 3' - I-element 78 1 73.53 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAA:1 - chr2R 14921471 3' - pogo 57 1 58.90 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATATTTTCTTAATATTTTGTATTCCTTTTTGTATTCATCGACAAAGGTGGACAACTTTCGGGTG:1 + chr3L 107603 3' - roo 58 2 58.22 TAAGTAATAAAAATTTGTTATAAATGTATTTAGAACTGATACAATTGGATAAGGATTTCAGTCACATGTCGATTTATTTCAGTTTTTTCTGTTTTCCGTATGCATTGCCCCGTTATCCTGGCCCTGATTGCATTAATTAGCTCCAG:1 - chrX 19970965 3' - Gypsy6A_LTR 227 1 60.96 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAAATAAAATCAACAAATGAGTGAGATGAAAATCGCATAAAAATAAACTAGGCTTTTTTAAAAAGTTGTGAAATG:1 - chr3L 9905738 3' + Juan 4164 1 52.05 AGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCAGACTGAGCTGTGAGCACTCAATCATTTTATTTACTTATGCACCAGTGCACGCAGATAAACTGAATCTTTGTTTAATTTTGAAATTATTACCATT:1 - chr2L 5732693 3' - hobo 26 1 64.38 GATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATGTTGCCTTGCC:1 - chr2L 12325024 3' - jockey 4621 1 58.90 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAATAGACTTCAAACTGCTGGCAAAGACGAACTA:1 - chr3R 11072432 3' + roo 9015 2 58.90 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAGTTAAGTGAACTTTTGCCGGCCAGGTGAATGCAGGCAGAATATCAATTGTTGATTGGTTATTTGAT:1 - chr3L 19702737 3' - pogo 49 1 56.16 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATCTGTTGTACTTTTGAATGTCAAGATAAAGAACTCCAGAACTACCAGATCTGATTGTGGTTGTAATTATACAATA:1 - chr3R 12540468 3' + roo 358 2 51.37 CTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGAT:1 + chrX 22517664 3' + 1360 3299 1 78.08 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTATATCAAACATAGTTTAGAAAGTATAAACATAGAAACATAAGCAATGAGTAACCTATAAAATAATACGAAATAT:1 - chrX 19736392 3' + pogo 2057 1 53.42 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGG:1 - chr3R 18940493 3' - mdg1 23 2 64.00 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCCTTCGATTGTTTCCTTAT:1 + chr3R 18860898 3' + roo 9032 1 45.21 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAACTTCCATGAGATTTTTAACCCCTTCACCCCGTAGTTATCCATTATTTGTTTTATCGCCGTTGTTGTTTAATGTGTGCCGAGTTTCCAGCGAAGGGATTTT:1 + chr3R 31663378 3' - jockey 27 1 71.23 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCCAAGGAAAC:1 - chr3L 12775929 3' + roo 9045 1 67.81 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACAGCAGGCAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAACACGCCGTTTCGAGTCAGGCGCTTCAAAGA:1 - chr3R 5087055 3' - P-element 51 1 44.83 GAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACATACATGTGTGTCGGTGTCTGTGTGGTTGAACGACGCCATCAACAGCTTAGAATTTCAAAATGGGCGAAAGCCAATTTTCACACTCAAATAA:1 - chr2R 21453502 3' - hobo 27 1 67.12 TTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGGTTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGCTTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCCTATTGAAAAACAGGCAAATTTGAGCTCTATTAAAATCTCAACCATTTCAAC:1 + chrX 21124960 3' - FB 70 1 61.64 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATAATAAATTGAATGATGCTATATAGAATATATGTTATTTCATAATTAAATATTTAACCTACCGTGAGCAAGCAAATTGCGATCGTTAAAGCTGAATGC:1 + chr2L 12447559 3' + opus 7482 2 72.60 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCTGATGTCTG:2 + chr2R 12642767 3' - pogo 32 1 63.70 CCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATATGTGTATACGGGAGAATGTATTTTATTTTTATTTTATTTTTTTGC:1 - chr3L 12087045 3' - opus 67 4 72.41 TGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCGGGGTGAGTGGGGGCGTGGCAGAAAGGTGAATCAACAGCAACAACAAT:1 + chr3L 10111891 3' + copia 225 1 65.07 TGTGGGCGTGATAGATTTGGGCGTGTTTTATGGTTCAAAGTGGGCGTAGGTAAAATGTTTTCGGCATATCGGTAGAAATTAGCAAACCAACTGATTTGTGGGAGTTAGGACGTAAGAAATGTTTGAAAATGCTTTGAGCAACACTC:1 + chrX 5069504 3' - INE-1 241 1 72.60 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATCGCCTATGTGTAACTATGTGTACTTTATAAATGTT:1 + chr3R 17747390 3' - 297 43 2 56.85 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGGCTACCTGACACTGCAACACTGGCGCATCAGAAGCATCTTCTGCAATTATTTGTGCATTAGAGGAAGT:1 + chr3R 21734626 3' + copia 202 2 52.74 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAATATGCCACATGAGGCAAGGGTTTTCAGCATGGTGAGTGGGTG:1 - chrX 7657443 3' + I-element 5280 1 70.55 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATTGCATTCCGCGGAGTCGTTCGCTTCGTTTTTTCCACTTTGCTGCAAGTTTATAAATAAAATGTGCATAT:1 - chr3L 10068837 3' - 412 7 2 80.82 AGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chrX 9023557 3' - P-element 2742 1 26.55 CTTCGCGTGGAGCGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCG:2 - chr3L 21765429 3' - gypsy 7062 2 67.12 CCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTTAAATATTACTATTCAACAAAAAGGTGTACGATCGAAAAATTGACTAATTTTTAGCTATTTAA:1 + chr3R 4869512 3' + I-element 5299 1 60.00 CTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATATAATCGAGATGCCCTCTGAAAGCGTATAAAAAG:1 + chr2L 10685896 3' - Quasimodo 47 2 54.11 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAGAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGTGTGTGTGCCGCTCGCTATCCTGATACACCCACC:1 - chrX 20106288 3' + hopper 1380 1 61.38 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGTCCATTTGGGTAACTAAATAGCTTATGGTTAGTTTCCGCGAATTTTAAGATTGCCTTTTGAGTTGAAAGCATTTGGCTCATTA:1 - chr3L 5425427 3' + blood 7352 2 58.90 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAACC:1 + chr2L 12696236 3' + pogo 2047 1 56.16 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAAGTGCATTTCATTGCTATAATCAGAAATTGATGCTGCGGAATGTCGTTCACCCTGCAAATGGATATTT:1 + chr2L 11559822 3' + roo 9039 1 59.23 AGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTACCAACGAATTTATGTTTTCAGCCATAAATTGCCAAACATATACGCCCACCTGGG:1 - chr2R 18927772 3' - 3S18 67 2 67.12 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTTAATTTAAATATCCCATATTATTTAAGTTCATTTAATATTTTCCTTCTTTTAATCTCAATTTTACCAATTAAGAGTTTTATAAATGTTCCAAT:1 - chrX 16538057 3' + mdg3 221 2 69.18 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCAGCGTAGCACAG:1 + chr3R 13572122 3' + 412 7504 2 54.14 ACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTACAGGGTGATGCCTAATCCATTAAAATCGAGCAATCTAAAAAGTGTCATACCAGTTAGATTGGGTGT:1 + chr3L 3250338 3' + P-element 438 1 46.58 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAA:2 + chrX 12995388 3' - blood 7092 2 72.60 AAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGAGTTTTTTTTTATTGTTTATGAGGTGGAACTGCAAAT:1 - chrX 4818528 3' - Bari1 83 1 73.97 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACATATGTATATGCTTGGGGGTGGGCCATGGGCG:1 + chrX 1726734 3' - 297 49 2 78.18 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGCAAGTTGAAGGAGGTTATTCTGCCAGCAAATGTTTCATAGTTTTTCTCTGTGCAAAGTCAGCATCCAAGGATGCGAGTCCTAAGTGTGCATAAG:2 - chr2R 21353143 3' - Transpac 24 2 71.23 GCATATTGATTTGCTTGGGTATTTTTAATAATAGAAATAATAGAGGTATAAATATGCAACAATATAATTTTTTCCTACGAAGCATTTCTTTTAAATAAAAATGCCAGAAATATAAATTGAATAGCAAACATGTCGTTCAAAGCAGG:1 - chr2L 11784417 3' + invader5 3748 2 78.77 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACTATTTCAGCTATAAACATCTGGCACGGCAACTTAAAAGTCTAACTAATCCCATTTGTTTTCCAGATCTTAGAAACTTACCAATAGCATTTGTGCGGAAAGAAACAA:1 - chr2R 15190343 3' + pogo 2088 1 78.08 CAGACAACTTTATGTGTGCACACACCTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCACTCACCTTAGAAGTTCCTGCAAGGCGAAAAATGCGCGATTAGTGGATGTCCATCCCGGGGA:1 - chr2L 2856586 3' + 1360 167 1 61.79 AAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGA:1 - chr2R 9408182 3' - FB 80 1 72.60 ACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATGCATTATTTTTCTTGAATTAATTGAGTGGGTTTTTTTTTTTGTAGTGCGTGGTGTGCAAAAAGAATTCAACTGAATTGA:1 - chrY 1076857 3' - 17.6 42 2 56.16 TTAAGGTCTTGAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTACTGGTAAGTGTCCAACAAGCCGCCAACACAGAGTGCCCCCAAATTATGAG:1 - chr3R 27195635 3' - baggins 5077 1 62.73 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGATGGTTTAATTTTTTCTTATCTAGGTTTAAAACTGGGCGTGTCCCTTG:1 + chr3R 7655656 3' + 412 419 2 67.81 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGAACCACCTTATGTTGTTTCATCATGGTTCGACTTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGCCGGCGCCGCACACGCAGAGCATTCGCTG:1 + chrX 1831329 3' - P-element 57 1 40.41 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATGCGAGTACCGCAGGAGGAGTGTGGCAAATATTGGCTGTGGGTGTTGCATACCCCCGGGCGTGCCGCTACTTGGTCGCTCATC:1 + chr3R 23968692 3' + HMS-Beagle2 276 4 57.86 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGAAACCTCATCGAACTGAAGACAAGGCGTTTTGACTTTTTTTTATGCTGACGCTAACTCGAAAATAATTTGAT:3 + chr2L 16360676 3' - hobo 49 1 52.05 AGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATGTGTTAATTCGGGCAAAGATTTAAATATATATATTTTTATAGGTCTGCAATCGTACTAAAATTAGTCAGTGGAAATTACTACAG:1 - chr2L 13763444 3' + Bari1 1673 1 62.33 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGTACTTACAATGTTTTCATTCGGCAATGACTTATTATTTAGCACACTGATAGCTGATAACACAGTGCTAATGTGAGCTGGAGCACTTTTCTGA:1 + chr3L 1324387 3' - 412 7081 2 66.44 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAG:1 + chrX 7624126 3' + roo 8985 2 80.82 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATGTGGCATATATATGTGTATGTATAGAGACAGCAGACTGAGGCATAACCTTAATTCCTTTTGGCATTTTATGCTTCCTTCT:1 + chrX 7657535 3' - I-element 41 1 56.85 CCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAACCAAGTAATAATAAAACGTGGAAGCTTGCATCCATTACTTTGAGTATTTTCAAT:1 - chr3R 18492891 3' - Juan 4079 1 57.46 GCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTGTCATCATATGTCTAACACTCGTCTCACTCGTTGGCCCGCCCCTGGGCTTATCCATCCATCCCGCAATCA:1 + chr2L 16202713 3' - copia 4918 2 51.37 TTAATAAATTGATGGATATTTACCATCATTACCAGATACTGCCAATGTAGAACAATAGTTTGTAACTATGCAAATCCTTTCCCTGCGGATAAATAAATACAAATTCGCGATGATTATTTTTGCGCATAAATGAGGTAAAAAGTAAA:2 - chr2L 12766690 3' - Ivk 168 1 73.97 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTGTTGGTTAAGTTAAAGCAATATTTTCCAGAACTCCCTGCGTATTGCACTATATTAGTTCAGTATTAAAGTGAAGGTTTATAAGTGATATTTGCCTGCGACTTTTCGC:1 - chr3R 20097545 3' - mdg3 5267 2 75.34 CAATAAATAGGAACACGCATAATAAACAAAAAGAAATCAGGTTTCCTAAAAGGACCACACTGCGTATGAGTGATATAATCTTACATGCATTGCGTATATGTTTGCATATATAAAATATACAGTAATTACTGATTACTGTTTTAAAC:1 + chr3L 11903219 3' - micropia 5110 2 79.45 AAGCCTAAGAGGAATATTGTGTTAGCTTTGTTAACTGTGTGTTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGCGATCTGCATGCCACTGG:1 - chrX 21933835 3' + gypsy11 328 2 36.00 CTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGC:1 - chr3R 19537492 3' + hopper2 1555 1 60.80 ATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTAATTTAACATTATGCGGCAGACAGAG:1 + chr2L 19841606 3' - BS 32 1 59.59 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTC:1 - chrX 13484135 3' + hobo 2890 1 64.91 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAATCCGAGAGGTATTCATTTGTGCTTGTGTTATTACGGCTAAGAGCTTAAGTTCATATATGGGGGCTT:1 - chr2L 1870892 3' - mdg3 5267 2 75.34 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGGTGACTGTACTGTTTGGCTAGCGTGTGTGACCGATAAGTGCTATCGGCTAATTGCTATCGCATTTAAAATGGCGCTAAT:1 + chrX 11236508 3' + copia 213 2 53.42 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTGATATTGGG:1 + chr2L 11043608 3' + roo 335 2 69.86 CAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCACGTTGGTTGTCATATCAAGGTGATTTTGTATATATGTAGATTATTTTAGTTTATGTGT:1 - chrX 10148580 3' + opus 7358 2 74.48 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTATTTTGAATATTGTAAACCTTTCATATAAAAGCTCTGCTCTTACAAAGCTCATTCTCTCTCGCTCTCTCTGTATCTCTGTCGCTGTGTTACAGCAGAGAAACAAAACA:1 - chr3R 14609129 3' - roo 11 2 73.97 GGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCGGTTCCGTTTGGTTAAATCGAAATTAGTATA:1 - chr3R 19628670 3' + opus 288 2 78.77 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAGCAGGTCAAAAAAGGTATAGTAGAGTTCCACGACTATCAGATACCCATTACTCAGTCAAAGAGTTAGATATACATAGATGTGCAAAGCGAGTGCTGTAGC:1 + chr3L 22519136 3' - pogo 15 1 75.34 AAAACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCCCTCTCGCTCCGGTTCCCACATCCCTCCTTTATTTATCAGCTT:1 - chr2R 3292697 3' + hopper 1411 2 64.38 TGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTATGCCATATATACAAACTTGAGCACTTAATAGTTATAAAATACAAAGACTTCTATATCCATTGTTAAAACTTTTATTCACGAATAATTATCAGTTG:1 - chrX 13558141 3' + mdg3 5477 2 70.14 ATTTATTATCATTTTCATTTCATTTCATTCATTTTTATAACAAGGTTTTAATTTTAATTTTACTGAATTGTCTATGGATGACAGTGCTGTTTTCTAGTCAGTTTTCAAGAAAATGTTCTTTAATAATCTTAAAAATAACGGTCAAT:1 - chr3R 16436653 3' - accord2 7499 2 70.55 GGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTGTATCTTATTTTCACAGCTATCAAAATACACAATGAACTTTGACTTTTTCCAGTGCACCTACAACATTTTTGTCGCCTGTGCACTAGAGTTTTTGTGGATTTCGAATCGGTTTGG:1 - chrX 18561000 3' + copia 251 1 80.14 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGCCTCTAATACCCAAAGCCTAACCTTGTTCGCAACTGACACTTTGCTAAATGCCTACCCC:1 - 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chr3R 19466674 3' - jockey 68 1 57.53 ATATATGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTTATTTTCTGACAATTTCTGACAGAAAATAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTATTGGTGGGACGAGTCTTGAAAATAACATGTTGAAGAAGGCGAG:1 + chr2L 23007180 3' + transib2 359 1 39.55 CACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGTGCTCGCCTGGGAAGACTATTCAACTACTGGACTTACATGGCATGGATTGATTTATTACATGGCGACCG:1 + chr3R 991869 3' + blood 7272 2 52.74 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCTGCATCAGCTGCTGCTTTCGAC:1 - chr2L 15523896 3' + opus 7460 2 57.53 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACCATTTTCGCCATTCGCCGCCTCGGGCGTAATT:1 - chr2R 18467152 3' - roo 88 2 76.71 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATGCAGTGT:1 + chr3R 24301933 3' + Tabor 7282 2 57.53 AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTTAAGTTCAATTTG:1 - 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chr2R 18487189 3' - INE-1 80 1 67.12 ATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTC:1 + chr3R 8965227 3' - HMS-Beagle 6865 2 67.83 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTCT:2 + chr2L 2518572 3' - jockey 75 1 61.64 CGCTCTCGATTCATTTACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCATCTAATCGAGTTATGACAAACTGAGTATGAAAAGAAAAGCTACAAAATAACAACAGAAAT:1 + chr2R 15529795 3' - roo 8724 2 57.53 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCGTTCTACAAAGTAACTTAAGGCTCCCCAGTTTACATTGAC:1 - chr2L 20067996 3' - roo 8746 2 73.97 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTACAATATTTATCAATATATGAACCTAATTCATATAAGAGC:2 - chrX 3637720 3' + roo 394 1 75.34 CTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTAAGTGCACGGGGGTCAGGAGGTCGGGATGATACGGCCGCC:1 + chrX 16994742 3' + jockey 447 1 61.54 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACAATCTGTGCGTCGATAAGTATGATGGCGGTTATGAACAGGTTCTGGAACAGTACAATTCCGTTG:1 - 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roo 8711 2 58.22 CGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACT:1 - chr3L 25232692 3' + accord2 203 1 80.14 TAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAACAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATTTTGCGATTAATTTTTGGTGATTAGCCCGTAATTTATTTGC:1 + chr3R 21454513 3' - 1360 345 1 71.92 CGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAATACAAGAGACCTTTTGGTTTTATACAACTAATTGCATACTTATGGGGGCTGCACCAATGAAATCTGCAAATTTGAATA:1 + chr3R 9657778 3' + BS 5049 1 47.26 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGACAGGAGCCGAAGCCGATGGGGCAGACTCCTCCATCTTCATGGGTTCCACTGCCAG:1 + chr3L 13380529 3' + hobo 2906 1 50.88 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAAC:1 + chr3R 4352138 3' - Doc 62 1 63.01 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCCAAGGAAACCCAACAAATGCA:1 - chr3L 12775917 3' + roo 394 1 76.03 ATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGG:1 + chr3L 13365099 3' - Juan 80 1 69.18 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTTTCATTTATTCGTTTGATTGGTCAATATCAGCCAACTGATTAGATCTCCCTTGATTAACCATAGAAAAAAGGATGTGCAACTTATTTTAAATGAATA:1 - chr2L 11559670 3' - roo 8686 2 71.92 AGGGGGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGTGCGTGTGTGTGTTTGCTACCCGGGAATATTAATTTCTCGACCCCATCCCGCCATCGTGGCCAATCAATTTGTTAAGCTCCTGGCC:1 + chr3L 13568297 3' + hobo 2919 1 60.77 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATTTGCTTTTGCGCTTTTGCGCACGCCTTCCCCAATTGATAAAGTGACAATTTATAGTCCCTTTTAATTGATATCGTCATGCA:1 - chr3L 780638 3' + Burdock 6354 2 59.59 AGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGGCTTCGAAAGTAGATAGGCCAGAGTCAGCAATCAGCACCGTTCGATGGTTTTTAGACCAGAGAAATATTCACGGAGAATTTGAGTCCAGCCAGAAGACAGTTGTTGGCCTC:1 + chr2L 19562361 3' + jockey 4738 1 78.08 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAGATGTCAACAGACGATTCACTTAGACACATTTTTCAATGATGTTGCTACCGTACTGCCGGAGTACTTAAGTCGCGTCAAGTCATGCAATGT:1 - 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I-element 24 1 68.49 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGC:1 + chrX 18193844 3' - hopper 27 1 63.01 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCACCAAGCCGAATCCATCCGAACCAAGCCGAACTAACCCGAACCGAGCCGAGCCGAACCGAACCGAACCGACGCCATACGATCCCATGCGACACGAACTGC:1 + chrX 12004054 3' - P-element 9 2 77.94 TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTT:1 + chrX 8610339 3' - mdg3 39 2 58.22 AACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTATTTTTGTGGCTGCACACATGTTTGCGCAACAGGAAGTTGATTGCTAACAAAGCGGAAGCCCCAGCAACCGCCAGG:1 + chr3R 11873487 3' + 412 478 2 74.66 TTTTGTTTTTTTTTTTAATGTTGCCAATTTAAGCTCATTTAAGCCCTTCATCGGGGCTTAACCCGTGTTAAATGCTAATCTCTAACAGCTGTTCCATAAGTCAAATGAAATGACATGTGAGTAGCCAGCGAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr2R 22952883 3' - Doc 4698 2 58.22 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATAAATAATACAAATTTAAAGTGAATTAGAAAATCCAGATCACAAATCGCTATTCTAGCTCAAGCTAACATACTCAGATCCTTTGAATATAAAACAGAACTTAACAGTTTGCTTAACA:2 + chr3R 12569740 3' + blood 375 2 80.82 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACACACAGCACGCTCTCGGTGGTACAGCCGCTGGCAGCTTAAATGTTTTTTGAATTTACACTTATAATTAAAAAACTTTTCTTCTCTGTTCCGGGCC:1 - chr2L 19680949 3' - hobo 24 1 66.44 GGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCACATTTGAAACATCTAAATGGGATGAGGCGGTAAATGGGCCTAATTTCCAAGTGAGGG:1 - chr3R 6578447 3' + F-element 395 1 56.52 TAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCAGGTGTTATGCACCTGATTTGCGCGCTATCGTAGCGGCCAACGGCCACATGAGATAGCGTCGCATCTGGGAGAGGAGAAG:1 - chr3L 784426 3' - Burdock 6195 2 60.29 AAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGCTTTATGCGCATTCCGAAATCATGTATAGCTAAAGATTTAATAGGGATTTTTAATGTATTGCTATGTAATGAAATGGTTAACG:1 + chr2L 1871063 3' + mdg3 5461 2 58.22 GCGGCAAGCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGAAATTACAATTTGAATGTAATATAA:1 - chr3L 3540137 3' + mdg3 166 2 67.12 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTGCGATTGTGCATTGACCTGATTCGGAAAATGGAATGGAAAATGG:1 + chr2R 10960948 3' - Doc 66 1 66.41 AACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACACACACTTGAACTGTGGACCAAAAAGCCGGTTGCA:1 + chr3L 21765491 3' + gypsy 375 2 76.03 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCCATACATGTATGAATTTCTCCGAGGCATAACTCAATTTGAGTCCGCTCACAGCAA:1 + chr2L 2523013 3' + mdg1 389 2 63.01 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCACCTTATCTTTACATATGTATTAATATAATATAGTTCTATATTTTTGTTGCGCTC:1 - chr2L 12814718 3' - hobo 64 1 60.27 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAAGGCAAGGTTCCTAAATTGCTGGAGGGAATAAACTATTCTATTTTCTAAAAATACTTCTTTGATCTCTTTAAAT:1 + chrX 2934867 3' + pogo 2058 1 52.05 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTCAGCAATGCTGTCTAGTCTAGAAATTAGGATCAACACATCATTCCTCAGCTATTTATTGTCATTTATTTATTGCCAACTATAAATTGTATGCC:1 - chr3L 13380402 3' - hobo 28 1 66.44 AAAATAATTTTAAACAATTTTTAGTGGAAATATTGTTTAAATCATCTACCATATTTTTATGATTTTTCCGAGCATGTAAGTTTGTTGCGTCTGCCCGATTCGAATTACAATTACAATTTTTCTCCAGCAGTGCTCAATATTTTTT:1 - chr3L 10649658 3' + transib4 107 1 64.14 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATATTGTTCGGCTTTCGCTCGCTTTCCACACAGCAGCAGAGGAGGAAGCTCAG:1 + chr2R 12873004 3' + P-element 2852 1 61.64 AACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTTAATAAAAAAAATAGATAGATATCAAATATCAGTTAAATAGAGCTATAATCCTTTTTATAGTTCTTTGTTATTCA:1 - chr2L 14254516 3' + jockey 4860 1 52.05 TGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCCCTTTTTGCAGATATATTTACTATCATTTTCTATAGCATTTTCTTTTTTTGCCAATTGTAATTTATTGCGTTCATTTTGAGTGAGCCATGTTTATTATTGTTTAACAA:1 + chr3L 20042565 3' - flea 4765 1 74.31 GCGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCAATGCTGTGAAATGGCCTGA:1 - chrX 17690447 3' - Doc 317 1 50.68 GAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAAGGAATGCCGTTCATATACATTATTGTATTACACTATCGAAA:1 - chr3R 11142208 3' - Max-element 8285 2 67.83 TGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCATACAAAATCTGGCAGCTTCCTGCCGCC:1 + chr2L 19628470 3' + hobo 2865 1 77.95 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATTCAACTATCTAATTGAATCACAAACAGTTTCATCGCAGGACATTCGATATATAGA:1 - chr3R 10736767 3' - copia 4936 2 65.75 AGATTAGTCCAATATGCTACACCGGAAATGATCATCCAGCTGCCACATTCTGCAGTTCGCTACATAACCAAGCTCTTTAATGCCATCATGACGCGCTTTAGCCTCCGCCATTCTGGCCTCCGCCTTCTGGCGCAGTTCCATATCGG:1 + chr2L 11439480 3' - Stalker 6849 2 47.95 TAATAATAATAATTAATAATAACATGGTCAATATACAAATCGTTGTGCCACGGACAAAGCAAATAATTGTAATGTATTTTAAATATGTACATGTATATATCCATTGAAAATTAAACTGTCTGTGAATTGAATATTTTAGAAACTAC:1 - 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chr2R 7351339 3' + flea 4955 2 61.64 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGTGTGTGTGCCGCTCGCTATCCTGATACACCCACCACTTCC:1 - chrX 20106282 3' + hopper 1385 1 64.38 CGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAAT:1 - chr3L 19951173 3' - Ivk 50 1 51.37 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCACGCATATTCGTATGTGTGCGCGTGTGTGTGTGGCCAAGCGTTTGCGCTCGTT:1 + chr2L 5656633 3' + hobo 2871 1 63.01 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAAGGGATAGGAAGCGTTTTGATATGATGGATACGGGGCTGCCGTGTGTAATGGG:1 - chr3R 5767375 3' - roo 8733 2 65.75 TGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATAATGTTTTGAATAAGCTTTTGACTATCAGGATAGTAATATTCTTCTTTAAATAAATTGATTGTTTTTTCTATACCCGGATGTAAAAGTTCTTTATGTTTCTTT:1 + chr2L 13412246 3' + Ivk 54 1 75.34 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATAACTCAACAAATTTAATTTAGATCGAAATGTGGTGCAGTTAAACCATAGATTTCCCACTTCTTTTCAAATTAGCAATGGTATTTTCTCT:1 - chrX 19591114 3' - roo 8692 2 65.07 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCCCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGC:1 + chr2L 20716423 3' - P-element 52 1 41.73 GGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTG:1 - chr3L 17710617 3' - I-element 89 1 75.34 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAACTTCCATGAGATTTTTAACCCCTTCACCCCGT:1 + chr3R 31663310 3' - jockey 96 1 76.03 GTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAATTATCAAGTTAGATTCTTCTTCTTTTTCATATAGCATTCCTTGTCATATTTTATTTCGCCATTTTTCTTGCAAAACTAATATTAACTTTATTAAA:1 + chr3L 24123353 3' - GATE 38 2 66.44 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGAACACTAGGCAATAGCTGAGCGATCTGGCAGCCTGGC:1 - chrX 19744382 3' + P-element 2853 1 63.01 TCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGG:2 + chr3R 9862995 3' - Stalker2 45 2 54.79 TACAGTGCGCATACACAGCTCTTTTGCACCTCAGCGAAAGAGTGATCCTTCTATTCATCAGCCATCTCAGCTGTTGTGATCTGTGACCACATTTCTTTACTGTGTTTTTGAGATGTACTATAAATGTAATAATACTGAATTTTCAT:1 - chrX 19873164 3' - Helena 1036 1 78.77 TTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACGGTGATCATTGCTTACACTCTTGGCTGTCGATTTAAACAAAGCGTCACTGATCTGCGCTGAAATTATTTGTGAAATTTACGATTG:1 + chr3L 24162178 3' - 1360 3013 1 75.34 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCATTTAATAATAATGTCAAAAATATCTTTTTGAACTCGTGGCCCAACCCACATTAT:1 - chr3R 19445305 3' - roo 66 2 65.75 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACTCTTGCATACACTCATACCTACCTAGGCGTCTTTTCTAGGTTATCAAACGGTAAAA:2 + chr2R 14486577 3' - 297 61 2 63.01 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCTGGTTTGCCGGCCATTTGGCGCTTGTATTGTTATTCCACTGCTCTTTAGCCGCGCTAATTGCAATACGATG:1 + chr3R 29623333 3' + roo 9020 2 52.74 GGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGTGAAACACACAGAAATAGCACAGT:1 + chr3R 15157730 3' + invader3 5449 2 72.60 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTAAAAATCATTTAAGCTTGCTAACTCCACCGAGAGTCTTTTGAGTCAGAAAAGTTGACCAAAAAATATGCACAGTTCACAAAATGCACTTTT:1 - chr2L 15596883 3' + roo 9045 1 65.75 GGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATATTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGAGCAGGCCGAGGCAATTGCAAATCCCACGC:1 + chr3R 20720621 3' - 1731 4340 2 62.99 GATTTCCGACAATCATGTTGTTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTCCAATAAATTAATATTAGATTGATTATTTTAATATTTCCCATGCAACACTTTATTTATT:1 - chr2L 7167242 3' - flea 4814 2 65.07 AAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACAAACATTTATAACTTTGAAATCATTTAGAGTTTATTTGCACCAACATGAAAGAAGCAAATAAACACTGATTG:1 + chr3L 11754784 3' - Doc 132 1 50.68 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCGTATATCGATTACAATCGCGTTCGTTACCAGCTTGGAATTATGCAAGTATGAACTATTATTTTACAACAAGATATTTGTTGTTATACAAGATTCGATTTTATTTTATTTAT:1 + chr3R 29997767 3' + P-element 2877 2 77.40 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTG:1 + chr2L 15601638 3' - Doc 62 1 60.00 TAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGAAGTCGTTAAATGCGGCAAAGTAAAATAAATTGAGCCAAGTCATGTTTCGAGCATGAAATGCATTTTTATTG:1 - chrX 21239193 3' - accord 6970 2 53.42 GCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAG:1 - chrX 13484124 3' + hobo 2869 1 65.07 TCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTTGGAGAAGGACACTTGAGCTGGTAGGATATGA:1 + chr3R 25929414 3' + 297 6892 2 78.08 GATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGGATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTAGCCCGTCTTGGCGAACAAAACTTTTTTCGTGTCCACAAATTGAAAAT:1 + chr2L 2675049 3' - Quasimodo 67 2 65.75 CCTGAGATCTCGACGTTCATACCAACAGACTGGCAGACGGACAGACGGACATGGCTA:1 - chr3R 8005047 3' - INE-1 137 1 89.47 TGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGCCAAGTCGAGTCAGTTACAGATGCCGACTCAGATCC:1 - chr2L 20908603 3' - FB 87 1 76.03 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTG:1 - chr2R 14767368 3' - Tirant 69 2 64.83 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATAAATTAAAAAGCATAATTTTGTTGAAATATATAAGAAACTGAAAACTTTTTCATTGTTATTGGATTAAAA:1 + chr2R 8942612 3' - 297 6624 2 56.85 CTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCG:2 - chr3R 19537450 3' + hopper 1385 1 64.58 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTCAGCAATGCTGTCTAGTCTAGAAATTAGGATCAACACATCATTCCTCAGCTATTTATTGTCATTTATTTAT:1 - chr3L 13380424 3' - hobo 50 1 51.37 TAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACAATATATGTGTATAGAGAATTTATTCTCTCCACCTTTATA:1 - chr2L 5741274 3' + mdg1 7174 2 73.10 AGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTCAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATATCA:1 + chr3R 15157691 3' + invader3 224 2 55.48 TTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTACATAAGTTCTTTGTGGGCGCTCTTGTTTATGCA:1 + chr2R 18528765 3' + jockey 4899 1 79.45 ATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAG:1 - chr3R 26693357 3' - Stalker2 7323 2 69.18 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTGATGTGATGCAAAAATGTAAAACGTAAATTCTAATATGTTTTATATCTGTATAGTTGTTTACTACTTAAGTA:1 - chr2L 20262587 3' + roo 361 2 55.48 AATATGTTAACACTCAGAATAATGTCGCAGATATACTCACCAAAGGTTTAAGTAAGCAAAAGCATTGTGGCATTTTGAAATCACTTGGATTTGTTTAAATTTGAACCCAAGAGGGTAAACATTCTGGAGCATTCCGATAGCGGCA:1 + chr3R 11860677 3' - frogger 313 1 71.03 AAGGGGGCCTTACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGGGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTTATCCT:1 - chr2L 3151031 3' + blood 7335 1 62.71 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATTTATGTGAGTTCGTGTGTATGTTTAGCTCTTGCTATTTTGGCGAATCATGTTTCTTTCATTTTTCAAAAGAAAAATGTTGCA:1 + chr3R 23208271 3' - pogo 26 1 65.00 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCTGTAGGCGCACCTACTCCTCCTGCAATCGAAAAACAAAATCAACAGGTGGCGCGC:1 + chr3L 5948108 3' + P-element 2841 1 45.74 AGTAAATATGTATAAGAAAATTTTAATATTTTTTGTTGACAACTGTTTACTTGTAAGATTTTATTTTTGTCGTACATAATCAGGTCAACAAATTTTAGGTTATTTTAATAAAACGTTAATCACGATCTGTGTATCGCTTCTTCGCC:1 + chr3R 31976598 3' - TART-B 10184 1 76.03 ACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGCAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAATTAAAAAAGAAAGCTGGCTGGCAGTTTATAATGTTGATGAAGTAATTAGTTTAAT:1 - chr2L 2518506 3' + jockey 4923 1 65.07 AAACGGAGAGGAAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTGACTGCAATGTGTGGGCTGCTTGGCCTATAAAGGCTTTCAACGAGCAGAAAAGCAACAAGGGGGCCGCG:1 + chr3L 21886433 3' + invader2 5004 2 52.14 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATTTTTCGCAGTTATTTCTTTCACTTGTCCGACAAGTTTGTCCCC:1 + chr2R 8375171 3' + roo 9060 1 76.03 ACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGTCGACGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGT:1 - chr3R 6171132 3' + 297 6899 2 74.66 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTCC:1 + chr3R 5684162 3' + pogo 2037 1 65.07 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGGTCACAGCATACTTT:1 - chr2L 5656562 3' - hobo 51 1 62.93 GACAGCATAAGCGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGAGATATGACCACGCGGGAGGTGATTAATTTTAAGGTACTAAGATACTATAGAATGAGTTCCTATTAAGATTTTACTAAGCTTCA:1 + chr2R 23041191 3' + rooA 82 2 60.27 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATTTATGTGAGTTCGTGTGTATGTTTAGCTCTTGCTATTTTGGCGAATCATGTT:1 + chr3R 23208241 3' - pogo 62 1 66.44 AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAATTT:1 + chr2L 42589 3' + copia 5054 2 66.44 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGACGTTTCGCACACACAGAGATACAAAAATTCAACGCTTGACA:1 - chrX 7441042 3' - jockey 4830 1 68.38 AGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTATGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGC:1 + chrX 17508923 3' - Burdock 52 2 55.48 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAAAGAGAGCGGCGAGAAGAGAGCGCCAAAAGTCTT:1 - chrX 1831225 3' + P-element 2828 1 45.21 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGTGTATCCTGGCAAGCGCACATACTCACGCACGCATACTATCGCATTGTTTATCTTTCACATTGTTGACACAACTTTTGC:1 - chr3R 23565205 3' - jockey 27 1 70.55 CGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATGTATTTACCTAATTGTGAGCCATGCCAAACTAAATACTTTCTCTACTTCAATTTAGTCTTTCACAATCAGCAATTGAAGACTTCCCTTAATCAATTGG:1 + chr2L 19217750 3' + springer 7499 2 67.81 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGACCTAAACCGGATCGAATGG:1 + chr2L 246637 3' - P-element 93 1 18.57 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCTTTATTATTAGTCTTGCTGGTTTCAATAGATATGCCCAACACATTTGGGCCATAAAAACGTTAATAAAATA:2 - chr2R 7024374 3' + diver 174 2 54.11 CCGGCAAACACAGCATATTTGTTAGCTCTAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTAGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAGATTATGG:1 - chrX 22398527 3' + Gypsy6A_LTR 97 1 45.89 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTTGGAGAAGGACACTTGAGCTGGAAGGATATGAGAGCGTATTATTTTGGCAT:1 + chr3R 25929433 3' + 297 6930 2 59.84 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCT:1 - chr2R 9408171 3' - FB 68 1 64.83 CTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTATTTTCCACAAAGGTACAAT:1 - chr2L 10177986 3' - mdg3 60 2 56.85 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCAAACGACTTGGACTAACACTTGGGATTTCTCTGTGGGAATGAAGCCATAATTCGTGGCTC:1 + chr2L 20327741 3' - roo 8685 2 68.97 TTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAA:1 - chr3L 13475516 3' + HMS-Beagle 176 2 72.54 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTT:1 - chr2R 15529678 3' + roo 9047 1 64.00 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATCGAATGGGTAAATAAATGGAAAAGTTAAATTGGAAATGTGTGTGCGGCG:1 + chrX 17531930 3' + blood 7318 2 67.81 TGGTCAAGCCATACATAACATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGAGGCTATATCAAACT:1 - chr3R 15035028 3' + Stalker2 216 2 59.59 CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATCTGTTGTACTTTTGAATGTCAAGATAAAGAACTCCAGAACTACCAGATCTGATTGTGGTTGTAATTATACAATAGGAACATACATACATTTCATAAAGCAGAAAAAAGGGATAT:1 - chr3R 12540428 3' + roo 9062 1 71.92 CGCTGATAAGCTCCGATGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTG:2 - chr3L 15374634 3' - 3S18 5840 2 65.75 GAGCGAGCGGAAAGACAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGC:2 - chr2L 23372626 3' + 1360 3307 1 71.92 AATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCCTCTCCCTCTACTGTAAGTACATCCA:1 + chrX 22717498 3' + P-element 2714 1 23.29 AAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGAGTAATCTCTTAAAGTAATCTGGCAA:1 + chr2R 11691265 3' - P-element 94 1 21.23 AAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAACATTTTGCATAATATTGCTTGGTAGCGCCACAGGCGGACAAGGACTTTGTTTGGATTGTATTGGCGATAATGGGGT:1 + chr4 901647 3' + 1360 372 1 54.79 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTTATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATACTGCTCGGCTTTCGCTCGCTTTCCATACAGCAGCAGAGGAGGAAGCTCAGTGGCTCTG:1 + chr2R 12873012 3' + P-element 2860 1 61.64 GGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTATTTTTGTGGCTGCACACATGTTTGCGCAACAGGAAGTTGATTGCTAACAAAGCGGAA:1 + chr3R 11873469 3' + 412 7534 2 72.80 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATA:1 + chrX 10429854 3' + roo 8990 2 74.66 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTGTTGGTTAAGTTAAAGCAATATTTTCCAGAACTCCCTGC:1 - chr3R 20097613 3' - mdg3 83 2 71.23 ACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGCGGTTGGGCGTGAGCGGGAGAGCGTGTGGAAAACAAGTGCCAGCTGACTGACTGGTCAAATATAAAGCGTTTGGACCGTGC:1 - chr2L 11638945 3' - gypsy3 7 4 78.77 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGCAATTGTTAAACGCGTTGCCTTGCACATTCGCGAGTGCTGACTGAAAGTATGCAATGTTTATTTGCGAAATGCCCTATGCACAGTTTGACACTCACTGAGTCTGTGCGGTCTG:1 - chr3L 8395129 3' - jockey 16 1 78.08 TTAAAATTAAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAAGAAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTTCTCATTCGCTTCCTTTCTTCCCGTAAATTTCTTTTTGACAAAGACA:1 - chr3L 14155437 3' + 1360 3045 1 67.81 TACTAACTAGAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGATATGGAAAGGGTGCTGGCGCAAATTGCCGCAAATCC:1 + chr3R 15700409 3' - Transpac 5000 2 73.29 GCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTATGGCAGTGTCAGCTTTTCAAAATGTGCACATC:1 - chr3R 13231730 3' - F-element 66 1 46.58 AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATGCCAAGTGGCAAAGTCCAACGTACGCTCCGTGCGCCGCCAGAAGA:1 + chr2R 13382048 3' + jockey 4919 1 68.28 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGGCTTTTGGGGTTAGGCTTTAAGAGCGGACTGCAAAAGGACCGGCGAACAACAAATCCGTACAAATTGAATAAGAACTCA:1 + chrX 20379409 3' - hobo 36 1 61.81 AAATAAATATAAATAAAATAAATAAATGTGAAATAAATATAATAGAACGCACAGGCAGTTTGAAATCTACCATCTACCAGCAACATTGTAACTTATTTATTTTAAGGTTCAAATTAAAAACAACAACAGTACACTTACAACGAAAA:1 + chrX 2554822 3' + diver2 449 2 76.71 CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTTGGAGAAGGACACTTGAGCTGGTAGGATATGAGAGCGTATTATTTTGGCATAAAAA:1 + chr3R 25929438 3' + 297 335 2 61.64 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGATTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGACACAGCTTTTTACTGAAAACTGAAGCATTCTCCCCCAAAAAATTGTTGG:1 - chr2L 42464 3' - copia 4896 2 65.75 CTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAAAA:1 + chr2R 10760477 3' - Tabor 88 2 79.45 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGAATGGC:1 - chr3L 19938470 3' + roo 345 2 60.96 ATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTTGTAATATTCCTAGTTATTTTTAAACAGTTTGGGGGCAGTTTTGTTTATATTATTTTTTCGAGTGTAGACCGCAACGCACCGCCCACATTTGGAGTGAAGC:1 - chrX 22488363 3' + FB 126 1 69.18 AGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACTGC:2 - chr3L 25232690 3' + accord2 205 1 81.51 GGCTTCTGTTGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAA:1 - chrX 12131179 3' - F-element 389 1 69.18 GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAAGGAATGCCGTTCATATACATTATTGTATTACACTATCGAAAACAATAAACCAAAATAATAAATCCCAAA:1 - chr3R 11142180 3' - Max-element 8288 2 55.48 CCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCTACTTTTT:1 - chr2L 12325016 3' - jockey 4589 1 50.82 CTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATTTATGATACTACCGATATTATTTTATTTACTTTCGGGCTGGAAGCAAACTCGTGTTTTTCCGTTTGGTGTGTGCTTTCCCCGCAGCAA:1 - chrX 6863542 3' - Juan 4116 1 62.33 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATAACTCAACAAATTTAATTTAGATCGAAATGTGGTGCAGTTAAACCATAGATTTCCCACTTCTTTTCAAATTAGCAATGGTATTTTCTCTTTT:1 - chrX 19591111 3' - roo 25 2 67.12 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTCTTAAGTCTAGAACGGTACAAGTGCTGTCTGAAATGCTCTGCCTTAAATC:1 + chr3R 18514427 3' + pogo 2037 1 65.75 ATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCCGCCTACGGTTGCAGTTGCTCCGGGTGCGATGCACTAGCAAA:1 - chr2R 21105725 3' - Stalker2 81 2 71.23 CCAGTGACAGAGGAACCCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCCATACATTTAATTAATTTATACACACATTTTCGCATTCGAGGACTGATGCCTGAGTTTTCGACCGAGCTGTCACACAAAG:1 - chr2L 15934545 3' + springer 7460 2 57.53 GCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATGTATATCCAGTATTGTCTTCTCTCTTGCACGTTTACTCGCAGCAGATCACCAAATAAATATTTCCGCATTTGAGAAC:1 - chr3L 18591470 3' - flea 38 2 59.59 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGTGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAACCAGTTATAAG:1 - chrX 12003902 3' - P-element 3 2 74.00 AACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGAATTAAAAACAAGCGATTTGATAATAAAGAGACTCGCTTGCTATTAAAGTTATAAACGCTATCCGGGAAT:1 + chr2R 14992526 3' + R1A1-element 40 1 64.38 CAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGTGATATGTTCCAATCTCTGCGTTCTTGTAGGGAGTTAAACCGAAGCTCTC:1 - chrX 14703256 3' - hobo 352 1 65.75 CGTGACGGGTATAAGACATGAGCACAAAAAAAAAAGAAATTCTCACCCAGTCAACACGGCAAAGAGACGTGGCACTGGGTGAGAATTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 10667483 3' - hobo 2652 1 56.00 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGGAAATAGAAGGACGATTGTCATTTCCGTTTCCGTGCTAACGCTTTTTGCTGCCGATATTTATCGATCACCGCTTACCGTTTCATTTTTGGCCAC:1 + chrX 6587747 3' + hobo 2921 1 71.53 AAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCTTTATTATTAGTCTTGCTGGTTTCAATAGATATGCCCAACACATTTGGGCCAT:1 - chr2R 7024392 3' + diver 6044 2 66.44 TGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAACTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCTGAAAGCCAGCTGTTGCCAAAAATTGCAGGCTAATTGA:1 - chr2L 3677605 3' - BS 77 1 73.29 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTATTTCTATTTGAACATATA:1 + chr2L 2622748 3' - roo 8721 2 62.33 TAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAG:1 + chr2L 19841573 3' - BS 65 1 63.01 ATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGA:1 - chrX 19744453 3' + P-element 2782 1 14.38 TGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCCGGGAATTCCGGGCAGAGCATCTCTTCCAGCTGATTGCTCAATCTCAATGAAATATGATTAAATAAATAATT:1 - chr3R 21734508 3' - copia 4920 2 52.05 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAACAGTTTACATATATGTACAATATTTATCAATATATGAACCTAA:1 - chrX 3637733 3' + roo 9044 1 65.07 TATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCAACTTATCCATATAGCAAACCACGCATGACAATATGCCCACTAACAACCAGTAAATTGGAGGCC:1 - chr3R 26969265 3' + copia 197 2 59.59 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAGTTAAGTGAACTTTTGCCGGCCAGGTGAATGCAGGCAGAATATCAATTGTTGTTTGGTTATTTGATGGGAAAAGATGACAG:1 - chr3L 19702722 3' - pogo 31 1 62.24 AAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAGTAATTAGTCCGTGTTTTGAAACTTTTATTTAGTTACATATAATAACCAAACTTGAACTTAATCTCGCATTTTAAACTTAATAAGTATGCAAA:1 + chr3R 27443281 3' - 3S18 29 2 65.75 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTACATTTCCGATATTTGGACAGTGTGAAAGCAATACGTTTTGTTACAAACATTTTAATTACGCAAAATATTTATTATTTTACGCAAAACATT:1 - chr3R 11873309 3' - 412 30 2 64.38 AGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAA:1 + chrX 8610294 3' - mdg3 5335 2 71.72 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCATTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTC:1 + chrX 1831287 3' - P-element 99 1 17.81 GATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTTGAAATTTGATTTGCCGATTGCCG:1 + chr3R 18940583 3' + mdg1 7371 2 81.38 CAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGGAAATCTATGGGTAGTAACCGTTGACTTTCAACTCAGCACTGAAGCTGCTCTCGCC:1 + chr2R 7343347 3' + flea 253 2 73.33 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAA:1 - chr2L 15523936 3' + opus 443 2 71.67 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGTGTGTGTGCCGCTCGCTATCCTGATACACCCACCACT:2 - chrX 20106285 3' + hopper 1382 1 63.01 CATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATTAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTTCATGGCGGATCTCCTGCAGCGCCACCTGT:1 + chr2R 13875233 3' + Quasimodo 7143 2 79.45 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTAGTGAAAGCTTGAAAGTGGAAATAAATCCTCCCAAATTTGATACCGATTCAAAAAGAAACCGCCAGATTTTGCTG:1 - chr3R 11162999 3' + mdg1 376 2 54.11 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTAGTAATAATCAACCGTATACCGAGATGAAATTGATTCCGCATGGGACATAAACTGCGTATTGCATAATAAACTTTGGCACGAACA:1 + chr3R 22275381 3' - flea 32 2 63.70 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTTTGACCGCACAGTCAATTTAATTTTAATTTACACTTCATGCATAAAAAATTAAACGCGCGTTGCCGTGTCAATTGATGAGCGGCGAAATCGCGCCAC:1 + chr3L 19434205 3' - Doc 31 1 64.38 CGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTAATTTAACATTATGCGGCAGACAGAGCAAAATAATAAACAAAAATATG:1 + chr2L 19841628 3' - BS 10 1 74.66 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGCACCCGCCTGAGAGGAAAATT:1 + chr2L 2622781 3' - roo 24 2 69.18 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGAAATTTTATTGAACGGCTT:1 + chrX 18193864 3' + hopper 1408 2 76.71 GGTGGCCACGATCGGAGACTATAGCTGAAGTGACCAAGTGGTTGCTGAATGTGTGTTGCGGCACGTTGCTGCTCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTGGGCAAAAATTTAACACAGCTCATTGGGCAAATTTGAACACGGC:1 + chr2L 16093733 3' - Chouto 245 2 70.14 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTATATCCGGAGAATCGGATATGCGGAATTGGGAAAAGAGAAGAATCCATGCGATATGATTG:1 + chrX 20369509 3' - roo 8686 2 75.34 GATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACATATGTGTATGCAGATTGACATTTGACGTGCATAGAATTTGTCTAACTGTAGTTTTCCCTTTGCCAGAATGTTT:1 - chr3R 8965119 3' + HMS-Beagle 202 2 55.48 CACACACACACACACATACCCATGTTAAGAGACTACCGGACACACACACACGCACACACTAAACAAACATATTCTTTATCGTGGCTTCAGAGGTGTTGGCTTGTGTGTGGAGTATTTGTAAGCTAGCTGAGTGACTGGCCCACTTC:1 - chrX 12992318 3' + accord 7032 4 60.27 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTTGACGATCGAAGACGAATGAAAGTGAAACTAAAGCGAAACAGAAACAGAAACATACACGAAAGGAGGAGAGGAGGAACACAAAACGTGCG:1 - chrX 19506045 3' - P-element 31 1 65.75 GTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCCGGGAATTCCGGGCAGAGCATCTCTTCCAGCT:1 - chr3R 21734548 3' - copia 4960 2 79.45 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGTTGGGTGTTAAACTTTGCTATAGCCTCGTGGAAATTAAAGAAGCATACTTTTGGGATGATAACATATCTTGTGCGGATGAGCATGGAATTT:1 + chr2L 15096993 3' - jockey 4701 1 63.01 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGATAGAATAATTTCCCCCATGAGCGGGGGCCCTCTCAAATATTTTCCAAAGCGCATTAAGGGCGTGAAGTTTTGGTTGGACTGAAATCCCTG:1 + chr2L 17795261 3' - hopper 28 1 65.07 AAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCAGGTGTATAGTCCTTGTCCAAAAAGTAGGCTACGATTTCTACAGGAGGCCGAGG:1 - chr2L 6716309 3' + hobo 2883 1 58.96 ACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATACATTTTATCAATAATTAGCAAAAAGTTATTGCATAAAGTTACCGGCACGAA:1 - chrX 18055717 3' - 297 63 2 66.44 CAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTAAAGTATTTC:1 + chr3L 22635791 3' + hopper2 1563 1 54.11 GTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAACCCTAGGGAACTACAGCTGTCTTAGGGTCGATTTAATCTTTACCAGAGATCGTGCATTCTATTTCACCACCGTT:1 - chr3L 15864053 3' - R1A1-element 261 1 50.68 CTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGCGGACGGTTGTACGAGAATGCACTTTCCCAGTGGGG:1 + chr2L 4137290 3' + R1A1-element 5041 1 75.00 TTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAATGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTACATAAGTTCTTTGTGGGCGCTCTTGTTTATGCAACACTTTTC:1 + chr2R 18528774 3' + jockey 4908 1 72.60 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACTGTTGACGTTTTTGGGGAAAGGGTTGCCAGCTAATGCCGCAAACATCGTGCCGATGACAGAACTATTGTAGGTGATGA:1 - chr2R 8467705 3' + roo 9030 1 56.85 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGACTATTGAAGTCTATCCACTCTATATGAAGTT:1 - chr2L 11043546 3' - roo 88 2 80.14 GCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAA:1 + chr2R 12185456 3' - accord 23 2 67.12 CGCTGACTTAGTCAGACCGTGGGCGGGTGCAGCCGCTGACGAAAATAAAAATAGCAACATAGTTTTGGTACTCTAAATTAAGTATTATTAACTA:1 + chr2L 16566960 3' - F-element 482 1 51.06 ACATTCTTAATCAGGATCAATAGCCGTGCCGATCTGGCTCTCTGGACTTTAAATCAATATCTTCTGTACAACATCGTTGTTTTCTTATATGGGTACACAAATATTTTAGGGTCTGACCCTACTTACCTTTGAGCTGCTTCTCATGC:1 - chr2L 5608488 3' + INE-1 84 1 72.60 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTGTAGGCTGACTC:1 - chr3R 29719355 3' - hobo 63 1 79.66 TATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTATTGCTTGTGGGCGCCTTTTCTGGTGGCTCGTCCGCCGTAGAAG:1 - chr3L 20391124 3' + blood 195 2 65.60 TGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGATGCACTGCGTCCGATTGTTTACGTGCGAATGAGGAGACTCGTCGGCCG:1 - chr3L 13480411 3' + P-element 392 1 35.62 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCTTTATTGGGGGTTAATTAATTTTATGGAGGTGTCGACATTCCCATTCTGTTGTTGAGGAAAGTTATAACATTCTTAATATT:1 - chr3R 12569558 3' - blood 7050 2 58.90 ATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTATACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTTGCAGGAGCCGTCATTCCGTCGGGTTCAGTCTGCAGGATTGCTGATGGA:1 + chr3R 5767490 3' + roo 370 1 58.90 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGACGAGGAGGAGGTGGAGCGGCCTCAGGCGTCAAATATTGACGTG:1 - chr2L 20327565 3' + roo 9047 1 65.07 TTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACCCTTTGACAATTTTCGGCATGCTTTTTATACCTTCCACGTCTATTAGGGG:1 + chr3L 3580957 3' - copia 4939 2 65.07 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGGGTGAGGACTTTCAACTGCTGCTTTAGCCGTTACTGCTGCTGATTCTCCTGGTTCAAGTATAGCCAC:1 - chr3R 12781473 3' + pogo 2050 1 54.11 GTCAGCATTCGGCCGGTTGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGTGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGG:1 - chr2R 14767389 3' - Tirant 83 2 75.36 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATA:2 - chr3R 26031683 3' + pogo 2046 1 56.85 CAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGGAACAACTAATGTCGTAGCTGACGCATTATCTCGAATAAAAATAAATAATATCACTAACAGCGATTTAGAACAATCAAGCTCAGATCAAAATACACACCATTC:1 - chr2L 22268548 3' - copia 4746 1 76.03 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGAAACAAATATGAGTTTCAAATTTGGTATTTCAATGTGATAGTC:1 - chr3L 13475469 3' + HMS-Beagle 7015 2 67.12 TAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTTT:1 + chr2R 4206660 3' - 1360 318 1 73.97 GGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCACTTGAGCAAAACGTTAAGCGTCGAAAAGAATTCGATTGTGCATAAATTTTTTCTGCCTTCTGATATGCGAATCAGGCCATCGAGTGGCTTCAAGGACTACGAGAAT:1 + chr3L 22543996 3' + INE-1 556 1 78.77 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACATTTAAATTTCTACGCTGATTTGTTTCAAATACGCCAGTGTTGATCGCCATATCAAAGAGATTATTCCGCATTTTGCCAATTATTAACGAAAACGA:1 + chr2L 17387560 3' - mdg1 17 2 73.19 ACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCAACGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAATTCCCCAGTAATTTACCATCGTGATTATGGCCAATTC:1 + chr2L 5349160 3' + F-element 257 1 69.63 ATTTTCATTTTCTTTTGTTTTCATCTTTTTTTTTAACTACCACTGTGCAATACTCTTTTGGAATTTTTAAAAATATTTAAATTGTTATTTTCTATAATTACAAATTTTGAAATAATCTAATTCTTATATTATTTAATTGTTAAGCT:1 - chr2R 16597573 3' + gtwin 7144 2 84.25 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGGTGACTGTACTGTTTGGCTAGCGTGTGTGACCGATAAGTGCTATCGGCTAATCGCTATCGCATTTAAA:1 + chrX 11236497 3' + copia 243 1 65.71 GGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGT:1 - chr3L 19951187 3' - Ivk 64 1 60.96 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACCGCGTTTTCACGCCACACACACACAAGTAGAGTGCGCCGCATAGGTAAAGAAGCGCGAGCA:1 + chrX 7930778 3' + P-element 2827 1 44.52 ATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTAGTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTATTTCAACAAATATAGAGGGAGAGAAGTAGGGGCA:1 - chr3L 13567990 3' - copia 86 2 78.77 ATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGTGACTATCTTTTGAGCATACTCCAGAAGGTTGTTGATGCCACTAACACGCGAGATTAGCACCAGCAGGCCAATT:1 + chr2R 8730598 3' + invader2 490 1 53.33 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTAAGGCAACGTCAGGCTGGCAGGCCACACAAAAAAAGGACAACGAGTCCTGGATGC:1 - chr2L 18848712 3' + blood 7322 1 61.64 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAATGGCAGGCTGGCTGAACTAC:1 + chr3R 22572672 3' - HMS-Beagle 42 2 56.85 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGCACAACAAATAAATCAATTGGCTTTGCCTAAAACGTTTGAAATTGATTTCAAGTTCTTTGGCCCATTGTTTTTATATGCAACAAA:1 + chr3R 28788820 3' - I-element 38 1 59.59 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATACATATAGGCGGAAAAGCGACAGCAGCAATACTAAGAAAAAGAAAAGTGGCACAAACTTTCCTCTTACCCTGCCTTGAG:1 + chr2L 9109968 3' + opus 7464 2 51.37 AGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAATACCTGAAAGGTCTGAATTGGCCGCTATACAACGCGCAAGATAAAGGATATCTAGAAATTGGAAATAACCTTACAGCAAAATCTGGCGGTTTCTTTTTGA:1 + chr3R 11163004 3' - mdg1 170 2 69.86 AATTTGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGGAGATTAATAAATAGAAAGATGAACTCGTTGTATCAGATTAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTGTTCTA:1 + chr2R 4261969 3' - invader4 2790 2 70.55 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCTGATG:1 + chr2R 12642763 3' - pogo 36 1 60.96 AAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATAATACAATCA:1 - chr2L 8852767 3' + Burdock 6333 2 61.64 GATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGAGAGGCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTCTCAGGAAAGACAGCGCATTTTTAAATGTTTCACATCCTTGT:1 + chr2L 6806570 3' + R2-element 3231 1 71.23 AACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCCATACATGTATGAATTTCTCCGAGGCATAACTCAATTTGAGTCCGCTCACAGCAAGGATAATCATGTGAGTC:1 + chr2L 2523030 3' + mdg1 406 2 74.66 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGAAATATTGAGATTTAAATTTCATCAAAGACTGTTTATAATAATAGAAGTCTAGACTTTTTGT:1 - chr2R 10189257 3' - Doc 63 1 60.27 AGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGTCTCTCCTTTACTCAAGTCGACTCAAAACCTCCTCGTGGTGGTCCCCGGTAATGCTAATGCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACTTACCAATCCCAATTAGGCGAACCTA:3 - chr3R 1546404 3' + R2-element 79 1 58.90 TGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTGATTTAATTCTTTTTCAAAGGCTTTTTAATTCATCATCAATTTGTTTAATTGCAAATTAAACA:1 - chr2R 18922501 3' - opus 53 4 58.22 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGCATACAACTCAATCATTTCGTTGTTGTTCGCCGTTGTGCAATTGTCTCGACCAATTTGTTTGT:1 + chr3L 11228184 3' + pogo 2047 1 56.85 CGAGGGTCTCAAGTTTGCGGTGAAACCATAAACGGATTCGGACAGGTGTCCCCCAAGCCAATGCCCTTTTCCTTTTAATAGACAACGCATTCACAGCATCCATAATGGCAGCCACATACGC:1 + chrX 17245551 3' + G7 442 1 19.01 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTATATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGTAGATGCTGGTC:1 + chr2L 19800973 3' + roo 351 2 57.53 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAAGTTATTATTCTTCATTTGTTCGAACTAGAGATTCACTTACCTGAGGATGTAACAGAAATGTGAGAACCCAATAAATCTTTTTCGTTTTTCAAATCAGTTTTTTC:1 + chr3R 10800646 3' + roo 393 1 71.92 CTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGTGCCCGCCACATCTGCCCAATAATAAGGTTGTTCAATAAAATGTGTGACCGGCCAGAGTAAATCC:1 + chr3L 9567768 3' + Cr1a 3986 1 55.48 CGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCG:1 - chr3L 25232767 3' + accord2 135 2 64.75 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGACGAGGAGGAGGTGGAGCGGCCTCAGGCGTCAAATATTGACGTGCATTCAATTCAGATGCT:1 - chr2L 20327548 3' + roo 401 1 76.71 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCTCCCTCCCTCCTCAAAAACGCCAAAAACACTCGACGGTCGTCGTCACACCGCATTCTAGTCCATTACGCAAAAATTACGTACGGAGATGCGA:1 - chr3R 26845490 3' + mdg1 391 2 64.38 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACAGGAAAATGTGTGCTTCTATGTTTTCGCCTCAAGCTCATTAACTGCTCGGAGCTCTCCCTACTAGATTGTTAT:1 + chr3L 5425565 3' - blood 7059 2 53.42 GCATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACTCATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAA:1 - chr2L 1870960 3' - mdg3 83 2 69.18 AAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTGTTGACACACTGCTTTATA:1 - chr3L 15374616 3' - 3S18 5822 2 53.42 AAAATATAACCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTTCGATAAATATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTACCGAACCCAGCTTCTATGAGCTCATCTCATTGGCTTCTCCCAAATCTTTTGGTGGAA:1 - chrX 19502440 3' + FB 442 1 67.12 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCCAGCTTCATAGCCAC:1 + chrX 7624149 3' + roo 9008 2 65.07 CATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACTCCGGGGCTTCTGCTCCGCCATTATCTCCATTTGACAAATATACCAGGCTCAGGCTGTGACTAC:1 + chr2L 19344023 3' - FB 58 1 56.85 TAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAAAATAAGAGCTTGAGGGAAAAAATTCGTACTTTGGAGTACGAAATGCGTCGTTTAGAGCAGCAGCTGAGGGACCTATTCACATGTAAGTTCTTTCGAGCGTCTCGA:1 + chrX 19748551 3' + P-element 482 1 23.29 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGGCTTTTGGGGTTAGGCTTTAAGAGCGGACTGCAAAAGGACCGGCGAACAACAAATCCGTACAAATTGAATAAGAACTCAATCTTGGCTACTGTGCGAACAACTTTCT:1 + chrX 20379437 3' - hobo 10 1 78.77 CAACTAAGCAATCAATGTAAACCATGATCAGGGGATCAGTTAGTCAGGATGGCCGAGTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATGCGACTTGCTTACTTTTTGATTGATTTCGAGCGTATCGCTCAAAAACATGT:1 - chr3R 15160674 3' + invader3 5129 1 65.07 TATGCCACTGCTAATTTGCAAACAAGTAATTTTTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCCATATGTTTATGTTACCTATTTTAACAGTAGTTTCCACAAAAAGGCTACGAAGCACAACGTCGATTGGCCTCAAAATGTTTCTTAGACC:1 + chr2R 6168958 3' + Tc1-2 1447 1 57.53 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTACTAAAGCAAAAAATTCGGAGCTATCAAAACAAACTGGACTT:1 - chr2L 17387442 3' + mdg1 7379 2 73.29 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACGTATATGTGCACATATATATTGCAGTGCAGTCAAGGTCGTGTGAAAGGGACGACAGTTACGCGGCAT:1 + chrX 13484219 3' - hobo 55 1 56.85 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACGCACACAGTCGCAGGAGACGAGCG:1 + chr3R 5087154 3' + P-element 2818 1 37.67 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCATACGCGATGATTGGTCCAAACTCTCCGGGCAACCCATTTCGAAATTCGCCGTAAACAACACCTTCGATTCCCATTGGCACGCCGCT:1 + chr3R 25094758 3' + P-element 2876 1 77.78 GTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTCTTTGTCCACCGTCTCTCAATTGCCGCTAACCGAGTGATGCTATCTTGACGCACAGTTTTAAATGGAGTTATTTGTAAATTTAAGCATAT:1 - chr2L 23313623 3' + S-element 1686 1 66.44 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGAGACTTTTGCGCACTCTTATACAGAACGACTAGTCTTATAATAGCTGAGAGAACAGAATGGCA:1 + chr3R 9158324 3' - P-element 56 1 47.26 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTATTTATTATACCAGCTGTTCTTCTTCGTTTCATTAATTTTGTTGCTGTTGTGCTTCTTTAAAGCCTTTCTTT:1 - chr2L 13102850 3' + roo 361 2 53.79 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATATTGTTCGGCTTTCGCTCGCTTTCCACACAGCAGCAGAG:1 + chr2R 12872992 3' - P-element 6 2 74.29 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAAC:1 - chr2L 20716366 3' + P-element 2795 1 22.60 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGATAGCGAAATCAAAGTCGAGTTTACTGAATCCACAATACAC:1 + chr3L 1728531 3' + blood 7308 2 72.60 TAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGC:1 - chr3L 19951211 3' - Ivk 100 1 76.03 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAGTTATTGCCCTGGAATATCATTTAAATTTCCATTTAAAGTCGACCACAGCCCCCGCGAGTATAACCATA:1 - chr3R 6578653 3' - F-element 71 1 58.22 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCATGACGGTTTTCTCGCTTTTTC:1 - chr3R 25137991 3' - P-element 82 1 17.97 GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTAGATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACACGGCACTGGACAGCATGTGCAACTTGGGTAGGGCAAACAAA:2 - chrX 10698634 3' + mdg1 7376 2 70.55 ANTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAA:1 - chrX 19162573 3' + pogo 2047 1 56.16 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTGACGGTCGTTTGCGTAGGAAGCAA:1 + chr2L 14263040 3' + P-element 2821 1 41.78 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTGCGCTTGTTTGCCTACATTTTCCA:1 + chrX 22715151 3' + opus 450 2 55.17 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAAAGTATATACCATCTGCGACAAAAGGTACACTTTCATGGACTTTTCTACATATATA:1 + chr3R 6171222 3' - 297 6639 2 65.07 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGCCGTCGCCGC:2 + chrX 1831310 3' - P-element 76 1 33.56 ATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTGTTAGCTCTAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAA:1 - chrX 22398536 3' + Gypsy6A_LTR 113 1 47.89 CTTAATCGACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTGGCAAAAAAAAGGAGGTAAATTTCCCATAGTGCGCGGGCGTGCACGCGATTATCAAATCTATGGCTGATGTCAGCCGAGA:1 - chrX 2082604 3' + Transib-N1_DM 451 1 86.61 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATATTTTCTTAATATTTTGTATTCCTTTTTGTATTCATCGACAAAGGTGGACAACTTTCGGGTGTGGAATATTTAAACAGATAGAAGCTCAACTTA:1 + chr3L 107635 3' - roo 8690 2 68.49 GAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGC:1 + chrX 22715131 3' + opus 429 2 69.18 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCTAAGCTGAATTTGTAGTTATTTGGAATTCCTTCACGTTGGTGAGGACACGACCGCGTCATCATCAGATACGGACACTTT:1 + chr2L 10128196 3' + hobo 2905 1 60.43 CGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAAAAATTATTGCCCCGTTAAATGCTTGAATATATAATGACTGCCTCTCATTTTCTGTCTTATATTACGGCAA:1 + chrX 22383102 3' - invader1 3638 2 38.36 AATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATAGTGTTTGGTTAAAGTTGACTTAGTAATGTTTACCTCTCTCTGTTTACTTATTAGTGTATACTTTTGGGA:1 + chr2L 1922600 3' - BS 5048 1 55.48 TCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGTTGCATATAGATGGGCTGGCCCATGGGTGTGTGGGTAAATGGGTAACACATACGCA:1 - chr3R 28937774 3' - jockey 4712 1 59.59 TCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTTGCTGTATGTGTGGCACATTTCCCAGCATATTTTTTGTATTTTGCA:2 - chr3L 19432520 3' - HMS-Beagle 72 2 71.92 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGAACTCGGAATGGCTTTAGATAATGGTGCTATTGTTTTTGACATAAGTCTCTTTATAACTAGGAAA:1 - chr3L 8704492 3' + blood 7334 1 54.79 GCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTC:1 - chr3L 19951186 3' - Ivk 63 1 60.27 CACTATTACAACGCATGATGGCGACTGAACCGTAACAAAACTTAGCTGTAGCCCCTCTTGAACGGTACCACTGCGCGCTGCTATGACATCAACTAATCATGGCAATTATTTGCAAATTATGCAGCGCGTTTTGCAACAATTAACAA:1 + chr2L 9734272 3' - mariner2 128 1 65.75 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCAATAGGTCCCAATAAAACTTAAAGTTACTTCCAATTTATAAGGCATTCTTTTAGGTCCAATAATTAAGTTCTTACATAGACCACATCGAATTAATAACAATGAACTTAT:2 + chrX 16538246 3' - mdg3 5261 1 79.45 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCTGTCATCTGTCTATCAGAAGCATTAACAGCTTTTACTTACTGCGCGGCAGACGCTTTAACACTCGACACAAAAGC:1 - chr2R 23504176 3' + jockey 4944 1 52.05 CATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGAGTTTTTTTTTATTGTTTATGAGGTGGAACTGCAAATTCAAACTCAAGGA:1 - chrX 4818515 3' - Bari1 70 1 65.07 GACGATTTTCGGGCCGAAATAAATTCTGACCCTACAAAAGAATTACATACATGTATGTACATGTACATGTACATACATATGTACATGTAAACAATGATAGTGATGGCAGCGCGATAGCACAGGTGGCAGCACTGCAGGAAACTAT:1 - chr3L 24231564 3' - 1360 3187 1 79.31 CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTACATATATATACGGGTTAAGGGCAGCGAGAGAATTACCGATCTCT:1 - chr3R 22676202 3' + 297 6909 2 71.92 CGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCCTTGTAAAGCGCCTCTAGTTCAGGTACAACCTCGTTATACATGGTACGCTCGATTTCGAAGATGTTGGTTCGTTTCATCATCTCCTGAATAGCCTCCACTTGGTGGGGCAACTT:1 + chr3R 25322398 3' - Doc 290 1 80.14 CTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTAACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATGCTTGTACATTTTTGGAAAAGTCCACGCTCTGAGCCGCCGAGAGGAACTGCTTGGATAACAGCTGATCAAACT:1 + chr2R 6877947 3' + Cr1a 4207 1 54.41 AATGTTAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCATTTTATAAACTAGGCGCACACATTTCAAAAACACAACGTTGTTGTC:1 - chr2L 4249796 3' - jockey 4863 1 68.49 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCTTTGTTAATGAAATTTTAATCAAGCTGGAAGCGAAAAAGAGTTTGCCAACCAAG:1 - chr3L 6014940 3' - jockey 75 1 62.33 TAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCGTGCTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTAAATAGAATAGATTCTGTTATTTGTGTTTTTATGTTAATTTTATTATATTTTCTAAAACAACAGAGCGT:1 - chr4 1170252 3' + 1360 251 1 58.90 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGAACAGGACAGCCCTGTACAGAACATAACGGAACGGGACAGAAGACGCAGGCAACTGTCCATAATAATCAGGCAGGAT:1 - chr2R 22795113 3' + hobo 2906 1 50.38 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTTCGGCCATCCGGCGCGTCGTGCTTTTCTATTTGTATTTGTATTTATTTGCCACTCTTTTCTATATTTTTTTTTTAACTTGCCTC:1 + chr3R 7565954 3' - 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chr3L 24565352 3' - hopper 1 2 54.81 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAAGGAATGCCGTTCATATACATTATTGTATTACACTATCGAAAACAATAAACCAAAATAATAAATCCCAAATAACCATTTTCACAACCAAGGAATAAATTG:1 - chr3R 11142150 3' - Max-element 8258 2 69.86 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGTTCCAGGAAAGCAAAATGTGATCTACTTCCATTTTTTCCTGTAAATTAGAATTGGACAACATTTTTTTTACATTTTTTCCGGCGTGAA:1 + chr3L 14370695 3' - 412 7086 2 59.59 CAAACACACACACAAACACACACACACACATGCAAGTGGCGCGTAGTGTGCGTAAAAAACAAGTGGATTGAAAACCGAAAGCTTTACGAAAAAATAGTCTTTCAATTAAATATTCAGTGAAATTAGTTGAGAGTGGGTGCGAAAAT:1 + chr2L 19587001 3' + gypsy3 421 2 58.90 TTTCTTTTTCCTTTTTTTTTGTATTTGGTTTTATTATTATGTTTTTTTTTTCTGTTTGTTCTTCGTCGTGTTTCGTGCGACCGCAAAAATATGCGTATGGCCATCGTCCCTTTT:1 + chrX 4441386 3' - Doc2-element 232 1 57.89 ATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTACCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGAAAATAAGCCGATGCTGTTTCACGTGGCGTATGA:1 + chr2R 8492813 3' - pogo 83 1 71.92 GATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAA:1 - 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chr3L 18585753 3' - mdg1 22 2 70.55 CGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAATCTTTCCCAAGAGGGTTTTGATGGGGTTAGGTTCTGTTACTGGGT:1 + chr3R 10736846 3' + copia 5048 2 70.55 CTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCTACTTTTTCGGGCACGCAATTCAAAGTCATAAA:1 - chr2L 12324991 3' - jockey 4588 1 59.59 TTCATTTACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAGTTTGAGTTTTTGATTGATATGACATTGATGCCATTTTGGTGGCTCATTTGAATGGAATGTTTATTGT:1 + chr3R 22266545 3' - roo 8715 2 51.37 TAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTACATATATATACGGGTTAAGGGCAGCGAGAGAATTACCGATCTCTTACCATCGATGGCATAGTGACTGTGGCGACGCTGCTGTTGCGCCGCTGCCGGC:1 - chr3R 22676149 3' + 297 381 2 76.03 CGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAATGCGAATAAACGCCTGTTTGTTGCCCCATAAAAGAATGCTATAAAATGTTGAACGCG:1 + chr2L 19681084 3' - hobo 2710 1 71.43 CATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGTCTAGTTGCTATGGTGGTAGTGCTCCACCTATTGGTAGAGAGCCCTTAGCACACGATTCCCTTTGATCTTGTCGATATGTCAG:1 + chr2R 23328713 3' - 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I-element 70 1 71.92 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAACCTTCGAAGGCAGATCACTATATTTAGGCCAATAAAATCTTGAGAATTTCACGCAAA:1 - chr3R 5684059 3' - pogo 59 1 58.90 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAACACTCGGAAAAAAGTAAAGTAAATTTAATATTCGGATTTCAAAACTATTTAATTAAATAAAACAATATAAGCTTAGAAAC:1 + chr2R 22372587 3' + I-element 5317 1 55.48 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAATCGCAACTATTCTTGTTTTCTAGGCAGTGAAGCGAACCGTAATCCA:2 - chr2R 20931608 3' - blood 39 2 54.79 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGGTGCAAATTTTATAAAACAGTTTCAACTCGATAATCGGGTCAGGACTTGTGTCCTACATGTGTGTGTGCTCGGCTTCCTTTAGTTTTCGGAGTTC:1 - chr2L 246540 3' + P-element 2863 1 69.86 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTTGTATATATTTTATAGCTTTGAGCCAAACAAACAGAGCAACAAAATCAACAAGCAGGCGACGATGCTTCAAAAGCCAAATGCCC:1 - chr3R 6472613 3' + opus 473 2 65.71 AGAAAAAAAAAAAGGAAAATCAAAAAAAAAGCTGCAAAAAAAAATTTGCAAATAAACAGACTGAGCTA:1 + chr2R 15906201 3' + Doc2-element 249 1 92.65 GATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTATATAATCCGATTTTTAGGGTGGGATTAATAGATGATTAGTAATCTAAAAT:1 + chrX 17270370 3' - 3S18 5836 2 65.07 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTGGGC:1 + chr2R 24021672 3' + pogo 2055 1 54.11 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTAAGCATGCAACAAAAATGCG:1 - chr2R 18265976 3' - roo 8671 2 77.05 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACAATCTGTGCGTCGATAAGTATGATGGCGG:1 - chr2R 18056788 3' + blood 7333 1 55.48 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAACAGGACAGCCCTGAACAGAACATAACGGAACGGAACAGAAGACGTCGGCAACTGTCAATAATAATC:1 - chr2R 22795122 3' + hobo 2927 1 66.34 AAAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGTATTTCTGTAGGTGGCTTGGTTTGTTTATTTTGTTGTGCACTGGCCGCAATTGAGAATTTCTATGGAAAATAGGACCAGTAACAGGAACA:1 - chrX 17508778 3' + Burdock 6364 2 67.12 CTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCTTTATTATTAGTCTTGCTGGTTTCAATAGATATGCCCAACACATTTGGGCCATAAAAACGTTAATAAAATATGATTTAGTGTACCA:1 - chr2R 7024359 3' + diver 6077 2 60.96 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGCAAGTTGAAGGAGGTTATTCTGCCAGCAAATGTTTCATAGTTTTTCTCTGTGCAAAGTCAGCATCCAAGGATGCGAGTCCTAAGTG:1 - chr2R 21353151 3' - Transpac 4951 2 65.75 CCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAAATGAGTGAACTGCATTTGAGTGAGTTCTTTTTTTTCTCATTAACCAGACACTTGCACATATCCTTTTCGTTTTAACGAGTAAAATTCTTTATCTGTT:1 + chr3R 23386512 3' + Quasimodo 440 2 69.18 CGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCCACCATGCCCTATTTGGGTTTTCAAACCAGGAGCAAAGGAAAAATT:1 - chrX 4788529 3' - Max-element 8312 2 68.49 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATATATTCTGGAAGACCTTTAATCTATATTGAGATAGACTTTCTAGCAAACGCTCGTCTAAGCCGATTTGCTTATA:1 + chr3R 7306023 3' + 412 7502 2 54.79 AAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGCAAAATTTCCAATAATTTATTACCTATTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATC:1 + chr3R 2412144 3' - R1A1-element 190 1 58.90 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCACACAATGCAATTTAATATAGCATACTTAACAGCGCA:1 - chr3R 22266393 3' + roo 389 2 69.18 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATATATATCCCTTGCGATGAAAGTCGTGAGGGGGGCGAGGGGCGGGGTTGGAGACATTCCCGATATATCTTG:1 - chr3R 18114837 3' + 297 6928 2 58.90 GGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGCCAGTAAAATTCAATATAGGAGCAGAGGAAATTCATTGTTTAACCTTTGTTGCTTAAATTGCTCAAATTCCTGCCATTAGTTTGAC:1 - chr3L 11750201 3' - Doc 4541 1 61.64 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAACCTTCGAAGGCAGATCACTATATTTAGGCCAATAAAATCTTGAGAATTTCACGCAAATTCATTCATATCAGCCACATT:1 - chr3R 5684038 3' - pogo 38 1 58.22 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACC:1 - chr2L 16360573 3' + hobo 2875 1 64.34 AATACCTAATGATATTATAAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGCTGCGAACAAGGGGTACCAGGGTATGCGA:1 - chr3R 31887733 3' + HB 1538 1 66.44 GTTGCTGGCAGTACCACAAAGCTGTATGCCATAAGTCCACACGGGCTTTAGTATAGTTTTGTATAAACAGACTTTATTTTTCAGAGTGGTTGCACATATATTTGTTAATTTTCACTTTTTTGTGCTGGTCGTTGGCGGTCGAATGT:1 - chr2L 19820423 3' - G4 3446 1 58.90 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCATGACCGTTTTTTCGGTTTCTCCATCGGGGAAATCTGGCCACTTGGCTGCAAATGGAATTGCCATTAAAACTGCATTCTTA:1 - chr3R 26658121 3' + hobo 2899 1 58.90 TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTACATTTCCGATATTTGGACAGTGTGAAAGCAATACG:1 - chr3R 11873364 3' - 412 85 2 76.03 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGTATTGAAATATAAGCGTCAGTGCA:1 - chr3R 22266435 3' + roo 346 2 60.27 TCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGATACTCCTATATCATCATAGTCAATCGTTTCGCTGTTGAAATCATTTAAATGTTCTTCACCATTATCTATTTGAGTAAAAGATAAATTATTTAAAGATAAAGTGTCAA:1 - chr3L 23786576 3' - I-element 474 1 76.03 TGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAACTTTTCACGCGTTTTTTGATGTTTCTCCTTGGTACAAGTGCAAAAATAACAAGGAAAA:1 - chr3L 18435428 3' - I-element 64 1 59.59 CGTGGAGCGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATT:2 - chr3L 21765424 3' - gypsy 7057 2 63.70 GACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTATTTTTTACTAAGGAAGCGGAAGATATGATATCTGAAAGTTGTCTACCACTTTTTCCACTCACTTCCTCAATTATTCAGCAG:1 - chr2L 6709347 3' - hobo 2649 1 70.00 ACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCTGAAAGCTTCGTATCCAATATGACCTCTATGGAAACTAGTAA:1 + chr3R 8810104 3' + 297 167 2 71.23 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTTGAAATTTGATTTGCCGATTGCCGTCACTCCACGGGCTTTGTATTCATTGTACATTGTATTTGTTTCATTACGCTGACAAC:1 + chr3R 18940640 3' + mdg1 7427 2 63.01 TAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGATACAAAATTAATTTACCATAGTCAAAGCTTTCTGCTTAAACGACTCA:1 + chr2R 7079539 3' + P-element 296 1 32.19 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGAAATATTAAATGCCTGCTGTAAGCGAAAATTCTAAA:1 + chr2L 22032036 3' + Tabor 400 2 74.66 TCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCATACGCGATGAT:1 + chr3R 25094683 3' - P-element 88 1 25.34 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGGGCGCGGCGCGGAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGGAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAA:1 + chr3R 29381561 3' - hobo 81 1 74.81 CATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAGTTACTCTTACTCATTGCTTCCGCTTCGGCAGCAGAATTGGGCTATAATTACCAAGCT:1 - chr3R 26693300 3' - Stalker2 7266 2 66.44 CCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGACAATCTTGATTATTTTTAGATAATTATGAACAATAAATAACTGTAAGCAGACAACTGTAAAGAAAGCTTTGCAAAAAGC:1 + chr3R 17401808 3' - Juan 46 1 51.37 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAGTACATATACGCCTGTGCTGTTGCCACATGGCCTTCTCCTTTTTCCAGCTGCAAAT:1 - chr3L 12829607 3' + mdg1 7392 2 64.38 CTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCA:1 - chrX 19744447 3' + P-element 2788 1 18.49 TAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTTGCCTTATCAATGGGTGAAATTCCAAAGCTTATCTGTGATCCTCATAGTCGTCCAACTCCGGAT:2 - chr3R 8293483 3' - Stalker2 7262 2 74.66 GTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTAGAGTCT:1 + chr3R 1048049 3' - Stalker2 7318 2 64.38 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTTGAAATTTGATTTGCCGATTGCCGTCACTCCACGGGCTTT:1 + chr3R 18940599 3' + mdg1 7386 2 70.55 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAACTTCCATGAGATTTTTAACCCCTTCACCCCGTAGTTATCCATTATTTGTTTTATCGCCGT:1 + chr3R 31663338 3' - jockey 68 1 56.85 CGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATGTGGTCGGAAAGTCTCGAATCTAGAGTACCGGGTATAAAAAGAATTGTATTGTAGAATTGTATATTGCCCTTACAAAATAGACTCTTGT:1 - chr4 520299 3' - INE-1 108 1 73.97 CTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGCGTCGGCGTTACTAATGACCCATCGCTATTCATGACCCCCGACAAAGGGAAC:1 - chr2R 16030742 3' - F-element 310 1 67.65 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATTTGTATACGCGTAATAACTTGATTCCAAGCTCTGGCTGTTACGCCTGCTTTAATG:1 + chr2R 11394202 3' + pogo 2042 1 61.64 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTCCATCATGGTTTGAATTACTTTTCATTCATTTTCATTTGACG:1 + chrX 1831295 3' - P-element 90 1 15.86 ATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATATAATCGAGATG:2 + chr2L 10685874 3' - Quasimodo 69 2 68.49 TTTGGTATTAATTACTATTTAAGTTTTAAGCGTTTGACGCTTTACAATCGCAAAATTCCGACACAAAGTTTCACA:1 - chr3R 17261895 3' - transib4 2611 1 82.67 CCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTGGCAGCTGCAAGCTGCAACCAGCATAAAACTGTATGCTACGTCGG:1 - chrX 18193469 3' + jockey 4916 1 68.28 CGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGCTCTTAACTTATATATATATAGTTTGAATTTAATTTTAAACTTTTTATGCCGGAGACATCGTTGCCAAGCTCGTTTGGTTTCGC:1 - chr3R 19625876 3' - opus 7053 4 56.16 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTATTTCAACAAATATAGAGGGAGAGAAGTAGGGGCACAGCTCCCTTTTGCATGTACATACAACGTTTTTAATTAAAAAATCCTTTGG:2 - chr3L 13567939 3' - copia 4904 2 61.64 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGATTTTCGAAGGGTTAGACATTCATTAAAGTACAAAACAAGCTAATTCTTTCATTAGC:1 - 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412 7081 2 65.97 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAAATTGTC:2 + chr3L 3540271 3' - mdg3 5262 1 77.40 TTACAAACGCAGACTGCGGCGTCTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAATCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTT:1 + chr2L 23390134 3' + rooA 220 2 56.03 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATAGTTTGAATTTAATTTTAAACTTTTTATGCCGGAGACATCGTTGCCAAGCTCGTTTGGTTTCGCATTTGTTTTCATTCGATTTTTTGTGCC:1 - chr3R 19625849 3' - opus 23 2 69.86 CGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAAATAAAATCAACAAATGAGTGAGATGAAAATCGCATAAAAATAAACTAGGCTTTTTTAAAAAGTTGTGAAATGAAGTGACAAGCACTTTGTTTATTG:1 - chr3L 9905714 3' + Juan 4188 1 63.70 CCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGAAATATTGAGATTTAAATTTCATCAAAGACTGTTTATAATAATAGAAGTCTAGACTTTTTGTAAGCGAGTTCAAGCAAAATACTTTCGCTTTTTATATCGAAATATTTGTATTGTT:1 - chr2R 10189203 3' - Doc 9 1 76.03 ACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTCATTATGCATATTGTGTTATTTTTAAATTCAACGCCATCATTACAGTAATCTTTTCATTGGGATTGTTTGCGTAAAAAATTTAATTGTTT:1 + chr3R 14174825 3' + 297 368 2 67.81 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCCACCCTAACCCCGTTCTACCGGTAAAATGAGGATTTGTCTAACTTTTCCAAGTACTTAAGAGCTTAAGGTAAAAAAGTTTTTT:1 + chr3R 19989363 3' + hobo 2902 1 60.96 TGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACCAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATACATTTAAATGTATACATTTGAATGCTTCTTTTTGCGTAAAATATTTATTTATATTTTGAACA:1 + chr2L 13156588 3' - Max-element 8296 2 55.48 TTGGGCTCCGTTCATATCATATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGATAGGTAGAAGTGGGGGGTGTGAGAAATTAAAATAAATAGAAGGGACAGCGAGGTTTGTGTTTATC:1 + chr2R 21890528 3' + roo 42 2 53.42 GAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTGTTGACACACTGCTTTATATATGAAAACTATTTTAT:2 - chr3L 15374599 3' - 3S18 5805 2 59.59 AAACTCATATCAGTTACAATAGTGACTGTTAGTTAAGTACTTTTTAAGATTTGTAAACTTATTGTTAGTCTCATAATGAGAAGCTTCAATAAATTATCATATCGCACTTGCTCAACGGACCTAGCCAGCCCAAAG:1 - chr3L 6932992 3' + Fw2 3851 1 68.89 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTATTTTTGTGGCTGCACACATGTTTGCGCAACAGGAAGTTGAT:1 + chr3R 11873453 3' + 412 7497 2 51.37 GATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAATGACCCCCCACCCAACATACAATTCCTACCAAAGATCAGTTAACAGAAAA:1 - chr3L 22982305 3' - jockey 4621 1 59.35 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTAAGCATGCAACAAAAATGCGAGACGCCCCTCTGGATCCC:1 - chr2R 18265957 3' - roo 12 2 77.40 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATTTCGTGTTTTATTGTATATGCGTTTATATATT:1 - chr3R 7136565 3' + roo 353 2 54.11 TGCTACCTTTTTTATGAAGAGGAATCACAAAGGACTCATTCCATATATGAGGGAATTGTGAAGATTCCAGAGATAAGGTGAGCAGTTTCAGTAGATTAAGTACCGCTATGACAGGCAGTAAAAACAACTTAACTTGGCTTGCCAAG:1 + chr2R 11080565 3' - Q-element 70 2 65.07 TATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATAAGTGAACTCAAAAAAGCAGTGCAAATTCAATTAAATTTTTTCTGTTGCTGCTCGCTTAATACTTCATTCCTCTTTTTTTCTTCAATTTTTTACGCAATCGCACTGCGA:1 + chr3L 780816 3' - Burdock 9 2 76.71 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATTGTGTG:3 - chr2L 2336211 3' + 297 6922 2 60.96 TATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTTTTTGCGATTTTCATACATTTTAAACTTAATTTAAGTAGAGCAGGTGGTCTTGACTAAGCAT:1 - chr3R 16497252 3' - Quasimodo 288 2 57.53 ATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTCATCACGGTCGCACTTGCTCTTCCGCTATCCACAGCTTTTTTTATTTAAATCCATTTTAAATGTCATTTTTCCGCAG:1 + chr2L 10128614 3' - hobo 2495 1 47.26 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAGTGCACGCGATTTGGGCGTAAGATTAATTGGCTCAAATTCGGGTCGTTGAAATCATATACTCGTATAACTTTACCCTGGAGATTATTGACCAGG:1 + chr3L 9994036 3' + hobo 2933 1 78.86 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGATCCGCCATGACCAAGACAGTATCACGAATGTGCCATGCGACTTAATTGCAGTCGGCTGGGGCTTGGGTGGTGTCCCTGCCTCGCAG:1 - chr3R 15364209 3' - 412 22 2 60.96 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGTGTGTGTGGGCGCTGGACAATCAAAATTGATAAGGGGCGTGCGCACAATCACAATCACAGC:1 - chr2R 14486465 3' + 297 6922 2 63.01 ACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCT:1 + chr3R 13572092 3' + 412 7467 2 70.71 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTCCATTTGGTGGCCGCCAGTTGGTAATGGCTGCCAAAGGTTAAATGCGAATAGAATTCGCCCATACACATTCGCATTCGCCCATTTGTTTGTTTTCCCTCATTG:1 - chr3L 1983401 3' + Transpac 5214 2 75.34 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAAAGTTTATATTTATTACTATTAAAAGTACCATTTTATTTAA:1 - chr2R 11609872 3' + roo 357 2 55.48 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTGTTCAACGCCTCAAGTGAATGTTTGTGTGCCATAGTACATTCAACCCAAATATTAATTTTACACCGTTTCAGCAT:1 - chr2R 4853901 3' + copia 208 2 50.00 AAAAAACGATAAAATAATTATTATTAATAATTACTACAATACTATCATGAATAATATTATTGATTTTATTCTATAAATTTGTAACTGCACATTAAGCATACATATTGCATCTTAAGGTCACTACAACTGCGTTGTCGAAATAAAAG:1 - chr3L 20931730 3' + gypsy11 3938 1 77.40 CTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACAGTAGACCGGCATTATGTTTGTGCCCCATTTTGTGGAAGCCCACTTGCTCTCTTTCCGCCATTAATGGGCGCGGGCGGTGG:1 + chr2L 3393863 3' + Stalker2 372 2 57.14 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAA:1 - chrX 1831258 3' + P-element 2839 1 32.35 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATGCACCGGGAGA:1 - chrX 19162550 3' + pogo 2070 1 62.33 AAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGGGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTCCACCCCATCAAAGTCCAGCCCGGTAGGCGCTCTCGCA:1 - chr2R 16031367 3' + hobo 2883 1 67.23 AATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGTAGATAAATTTCAGTCGTCTTGCGCTTTAAAAATGGCACCCTGTTTGCATCAGCAGTAACGTTTCCAGAATTCTTAGCAACCAGTTTAACAGCAGCAACAACGAAGAA:1 - chr2L 22340250 3' - HMS-Beagle2 11 2 75.34 GTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGGGAATGCAGATACA:1 - chr2L 1870965 3' - mdg3 88 2 76.03 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATAAATAAATTTTTATGGAAACATTTGCAAATACCTCGACCATTTCAATCTTGCCAGCTGACAGCTGCGGTTGTCCAGCCAA:1 + chr3R 26643416 3' + 412 468 2 63.16 GTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTA:1 + chr3R 1048031 3' - Stalker2 7336 2 76.71 ACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTAGAGTCTCTACTTTAATAGGTACT:1 + chr3R 1048066 3' - Stalker2 7301 2 52.74 AACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATAATACAATCAGATTGAAATCGAAGCAGGGCACCTGACACAAATAG:1 - chr2L 8852732 3' + Burdock 6367 2 63.70 AATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATGGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGCCTTTGCTACTACCCTATATTGAGCGAAACCCTCG:1 + chr3R 10741143 3' - Tc3 315 1 50.00 ATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAAATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATGTGTTAATTCGGGCAAAGATTTAAATATATATATTTTTATAG:1 - chr2L 13763486 3' + Bari1 1630 1 69.18 ATGCCTTCTGCATACATATGTATAAATAAGAATACATAGCCTTGGAACAATAGTGTGCAGATTTTTTTTCTTAGACGCACGCACCAAAGCAATTGATGTACACCCGACGGATACGGCTGG:1 + chr3R 1961190 3' + Stalker4 7189 6 68.33 TTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATAGATATATTTCTCTTTATTTTCTTGCTTTGTGCATAAAACTGTCTGGGGTAACTTGATACTGGAAGTAAAAACTG:1 - chr3R 8884285 3' - HMS-Beagle 6839 2 54.79 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGAAGGGTAGAGGGTATGAGCACAACTCCAAACCGACAACGTGTACACAGCACTCTCTCCCTCG:1 - chr3R 4739695 3' - P-element 52 1 50.00 TATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATAATTAAACGGTAACAGATAAATCAAAACCGTTGGGAAAGTTTGTTGAACAAAGAAAAAACAAC:1 + chr3L 3127227 3' - F-element 4635 1 62.33 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCGTTCTACAAAGTAACTTAAGGCTCCCCAGTTTACATTGACCGAACTGATGATACTGCGTTCTATTTGAAACGCAAGATTGTAAATTACGACATACTATTGTC:1 - chr2L 20067934 3' - roo 8684 2 71.92 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGAATATTCGTACACAAAAACCAGGTTTGTGCAAATAGGTTTTTCATGAAAACGCTGCTGTTGTGGCT:1 - chr3R 29381491 3' + hobo 2921 1 62.73 GTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTTCATATTAATTATTACTTAAAGCAATTTCTTATATTCTCATTTGTGCTTTGATAAGTGCATAACCATATTGATTGGCTAGAAA:1 + chr3L 13365193 3' - Juan 6 1 80.14 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGT:1 + chr2L 18848787 3' - blood 87 2 77.40 ATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTCAGCAATGCTGTCTAGTCTAGAAATTAGGATCA:1 - chr3L 13380462 3' - hobo 88 1 77.40 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACTAACATGTTACATAAGCCCCACACCCTTCTTCCAACTAATT:1 + chr3L 18954208 3' - roo 8743 2 73.29 TTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACCCTTGTTTCCTGTCGAACGTGAATGAGAAGGAGAAGAAGAAGCGGAAACAGGCAACGTCATAAATATGTAAGTAGTGTGTGTATGA:1 - chrX 10063025 3' + Doc 152 1 58.22 CTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTGTTGACACACTGCTTTATATAT:1 - chr3L 15374613 3' - 3S18 54 2 51.37 GCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACATATATGAAGACTGGCACTTGAGCGGATAGAAGGAACGGCGGGG:1 - chr2R 15892140 3' + hobo 2866 1 67.81 AGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATCTTAATGCAGATCCATGTTATCATTGGGATAGTTC:1 - chr3R 7364222 3' - Quasimodo 78 2 74.66 AAATCGGTTTCCATATCATTTTGGTGTGAGCATTTTTTGTCAGTTTCCTCGTCGTCATCATCCTCTTCCTCGTCTTCATCGTCCTCTTGTTCATCATCGTCGTCCTCCTCGTCCTTGTTTATGCATCGGGAAGGACTCAGGGGGTT:1 + chr3R 20238896 3' + Helitron 62 1 54.79 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTCATTGTGGCTTAATGCACAGTTCATAAAAATATATGACTGTAAATGCAAGTGCAATATTTGCTGGCTGTGTAAATATT:1 - chr2L 2622625 3' + roo 9028 1 56.16 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCAATAGGTCCCAATAAAACTTAAAGTTACTTCCAATTT:2 + chrX 16538174 3' - mdg3 5333 2 73.29 ACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATATATGTATATTTAAATGCAGAAATATTTTATCCATTCTGCCTTGAATGCCAAG:1 + chrX 21405371 3' - flea 4819 1 67.36 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCATACTAAAGATATGGTTCTTACCATATAATCATATTATTAAATTTGAATCCTTGTTGTTACTCTTGCATGTGTCACT:1 - chr3L 10241169 3' - pogo 44 1 50.00 TCATATGTTGGCTGTCTGAGCAAGAAATTTTTAGTCTCTCAATGTAATATACAGGATTATGTTTGTTTTTTTCCCCCTCCAAAGCTTTTATATTTTTAAAGGAAAGTGAGGTTGTTGCAGTAGCAACTTATTGTTCGTGTTTCTTG:1 + chr3L 14585968 3' + Tc1 111 1 63.01 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGGACCGGACACTTGAGAGAGAGAGAATTCTCCGGCTCGGTTTCGGATTCGGGTTCGAGTCTGCGCTCAAGTTATATAGCG:1 + chrX 13642140 3' - P-element 42 1 56.16 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAACAGAAGAGTGAGCGGAAAAAAATCAAATGTTCAAGACAACGACGTCGGCATGGAACACGTGTCTCTTCTGGGAGCTTACAACCCGGGGACACGTGACCA:1 - chr3L 18417965 3' + jockey 4975 1 74.66 GTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGGTAAGTCTATTAAAAATCTATATATTGTTCTAGGAAGACGTATTTACGTACA:1 - chr2L 21082127 3' + mdg3 5428 2 63.70 TCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGGTAGATTAAAAAAAAACGATAACCAAACGATTAAGAAGCGGACAAAAAAGTATACCTATTGAATCCAGGCCGCACTGCTCGCACTTCCACTGACGCAGCGAGGCGG:1 - chrX 11578369 3' - Circe 107 1 65.69 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTCACCGTAATCCATTGAAAAAACATAATTTTAGACATATTTTACCTCAAAATTGTAAAGTTCTTTAACAATTTGTAAGTTTAATGGGTCACATATCACTAATTC:1 - chrX 21204932 3' + 1360 3372 1 65.75 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTATCTCAAGAATT:1 + chr2R 18056919 3' - blood 36 2 61.64 GCAAATGATCTTGTCGACCCCATTTTCCTCCGACGTCTGAAGAGATTACATCCCCATGAACTCCTTTCAATCTCTTTATATTTTTTTAGGTTACGAAATTACATTTTATACTTATGTCTGTTAGGACGGCCGACAATGTCATCTGG:2 + chr3L 25882678 3' + G5A 2647 1 59.59 TTAACCAAAGACACTAGAATAATAGTTTTCTAGGGTCTTTGGTTTAACCCATAAACAGATAATTATGTCATTGTTATTAACGATATTTAACTGCTTTGCCAGCAATCCCACTTAATTGATTTTTTTGCTTATGTTAAAGAATTATG:1 - chr3L 18209222 3' + Tc3 238 1 62.33 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTACAATATTTATCAATATATGAACCTAATTCATATAAGAG:1 - chrX 3637721 3' + roo 393 1 74.66 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATCGAATGGGTAAATAAATGGAAAAGTTAAATTGGAAATGTGTGTGCGGCGAGTGGCGCCATCAATTGGCAGGTACTCTAATCTGAGTGGCGTCA:1 + chrX 17531974 3' + blood 350 2 66.44 TAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTGTTCAACGCCTCAAGTGAATGTTTGTGTGCCATAGTACATTCAACCCAAATATTAATTTTACACCGTTTCAGC:1 - chr2R 4853903 3' + copia 5075 2 50.68 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGAGACTTTTGCGCACTCTTATACAGAACGACTAGTCTTATAATAGCTGAGAGAACAGAATGGCATTGCCAGCTGG:1 + chr3R 9158335 3' - P-element 15 1 68.97 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATTAACCGCAAGC:1 - chr2R 10666846 3' + hobo 2887 1 57.81 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATAATCGCATTTTACTCAGCTGCCCCAAGCCATAACTACGCAGTTTGATGAGTTACTTCTTCCGGTGCCGATTCCGTTAT:1 + chr2R 5800594 3' - HMS-Beagle 32 2 64.29 GTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAATCCG:1 - chr2L 1870954 3' - mdg3 5329 2 68.49 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATCATCAGAAAAACAATCGACTTCACA:1 - chrX 21087536 3' - mdg3 5278 2 63.70 GAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGTTTGTTTGCCCATGTCAGATGTCCCAGATTTTATGGAGATCACCTGAGAGAGCCGGG:1 + chr2L 5333480 3' + mdg3 5437 2 58.22 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGAGTAATCTCTTCAAGTAATCTGG:1 + chr2R 11691262 3' - P-element 95 1 18.06 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGTCGCCACAAAACGAAACAAATAACACAGAAAAAGCATTCGAAATGGCACTA:1 - chr2R 14450096 3' + roo 395 1 74.66 CAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAATGGCAGGCTGGCTGAACTACTACAATCTGAAGTGCCAACCGGTTGACT:1 + chr3R 22572700 3' - HMS-Beagle 14 2 76.03 TAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACCGCT:1 - chr2L 20360647 3' - micropia 152 4 54.79 TGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTGGCA:1 - chr2R 20117306 3' - mdg3 5332 2 73.29 CTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATGCGAGTACCGCAGGAGGAGTGTGGCAAATATTGGCTGTGGGTGTTGCATACCCCCGGGCGTGCCGCTACTTGGTCGCTCATCAAGCATACGCCGCGTTGGCCAGCCA:1 + chr3R 23968717 3' + HMS-Beagle 7028 2 73.10 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATTATATTGCATACAATTTTGTTCGTCCTAAACATTGTGTAGCATTTTATTCAATTGGTGGCAACTATG:1 + chrX 14318500 3' - 297 44 2 58.90 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGGTTATGTTCGGGTGATTCCATATCAGTTTTCCATACGTACTCACATCGATTGGTGCGATTTTCTAATTAGCCATTTTACCAGTTCTAGCAAGGCCAT:2 - chr2L 12696084 3' - pogo 20 1 64.38 TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATATTTCTTTTCTTG:2 + chrX 8610359 3' - mdg3 19 2 71.92 CGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAATAGCCATGTTGGCCAGGGTGAGCTTTTCTTGGCCATTTCGCAGTTGACAAATGTCAGGGATGTTGCA:1 - chr2R 10190120 3' - 297 403 1 54.11 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAGTTAAGTGAACTTTTGCCGGCCAGGTGAATGCAGGCAGAATATCAATTGTTGATTTGTTATTTGATGGGAAAAGATGA:1 - chr3L 19702725 3' - pogo 37 1 58.90 GGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAATCATTATA:1 + chr2R 12185464 3' - accord 15 2 72.60 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAATGCTAGCGTACTCTATAATTTAGCCACTCGAGTTAGCAGATTTATGGCATTTG:1 - chr2R 12642638 3' + pogo 2037 1 65.52 TAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGGTTTAAAATGCACAAACAAACCTTTTTCAATGCCCCCGTTTTGCTTTTTATGCG:1 + chrX 2781294 3' - FB 73 1 65.75 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGATAGGGAGCACCGAACACATGTTAGACAATCAAAAAGAAAGGAAACCGAAACAAGTTAACCACAAAACGGACAAG:1 + chr2R 17341204 3' + hobo 2889 1 51.37 AGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATACTCAATCCCAACTACGTGCTGCACTGCCACACGAAGTGGTGATTAGAGGGG:1 + chr2L 11045622 3' - Burdock 6204 2 65.07 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATATTTTATGGTTATGAATATTTCGTGAACAAATTCATCAAATAAATTCAATT:1 - chr3R 25414197 3' + pogo 2034 1 68.49 TGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTAGCCCGTCTTGGCGAACAAAACTTTTTTCGTGTCCACAAATTGAAAATATTTC:1 + chr2L 2675054 3' - Quasimodo 62 2 63.70 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTCCTTGCCGGCGGCAGCATTCTGAGCGGGCTGCCCATTGCCGCCC:1 + chr2R 14450228 3' - roo 55 2 63.71 TGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTTGTTGACTTTGCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAATCAGTAAACACAGCAGTTACCTTTAAGTATTATTTGATCTCCTAAGTTAT:1 - chrX 17836755 3' + S-element 310 1 66.44 AACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTT:1 + chr3L 13365111 3' - Juan 68 1 60.96 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTAGAACTCGACGCTAAATTAGAATTATGCAATTACGGCTCATTTGCGCGGCACACGGCTGCTGTTGTCGCTG:1 + chr3R 26405116 3' + hobo 2913 1 61.16 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATTAACCGCAAGCGCCAGCAGATGTTGTCAACAATTAAGCTGACACCTGACAGACGAATGGAGAG:1 - chr2R 10666794 3' + hobo 2921 1 73.97 TAATAATAATATAATAATACTTCAGTTCATATATTTAATATCTTTTAAACTTCATAAATAGTGACGGCTTAATCGAAAAATATAAAAAATGTTGATACCTTTGGATCGTATTTCTGATGCAAGTAGACCAATATTGGGCCATAAAT:1 + chr3R 23696778 3' + invader3 5050 5 63.70 GACACTAGAATATTATTATTATTATTATTCTAGGGTCTTTGCACTGACCCACTCGAAAAAGGGAAACCGAGTGTACTTCTTGGCCAAAAGTTGAGGAATGGCCAGGAGGCGAGACCACAACACAGACAGTCCGTTCACTGATGCAC:1 + chr3R 30262995 3' - Tc3 306 1 71.92 TTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGTATTTAGGGATTCGACGCTCGAATCC:1 + chr3R 11550300 3' - F-element 63 1 54.79 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACTAAACCTTTAATTTACATAATGTAAATAGGCATATTTTGATGTTCAACATTGCCAAGCTATTTTTAACAAATTCATTGAAAC:1 + chr2L 20910412 3' + roo 9034 1 56.16 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCACCTTATCTTTACATATGTATTAATATAATATAGTTCTATATTTTTGTTGCGCTCCTATGTGGTAAGTATTTTACCGGTATGTATT:1 - chr2L 12814687 3' - hobo 32 1 62.07 AGTTTTTATATATATTATTCAACTTTGTAAAGAGAAACTTTTAGTTTATATAAAAATGTTCATTAGCACAGAGTTTTCTAAATGTTTTTTCAATTATCACCTAATTTGTGTTGCCTAAGCAATCTTGCGGCAAAGAAAGTTTCACG:1 - chr3L 9920565 3' + copia 4662 1 80.14 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTGAAAAGAATCCAAAAGGATTCTGGCGCGATAATTAAATGCGCACAGGAAGCGAAACTTTTTCACCCAAGTTGCGGTGTGTTGCGACTAATTG:1 + chr3R 26139545 3' - mdg1 7067 2 65.75 AGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTCCTTTCTGCTAAATAAACATTTATAAAAACAGCCAAAAGTTTTTATTCGCTGATGCTGCTTCTGTT:1 - chr3L 10111755 3' - copia 4925 2 61.64 TGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTAGAGTC:1 + chr3R 1048048 3' - Stalker2 7319 2 65.07 TTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAACTAAAGGAAAATAACTGTAACTGTTCGGCGCCCGAACAGGGACCAACAAATAAACGCGAGATAACTTTGCCGAATAATTTGAT:1 + chr3L 27973896 3' + HMS-Beagle2 272 2 79.13 AGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAACTGTGAGTGAAATGCTCCTAAAATCTATTATCG:1 + chr3R 11550257 3' - F-element 81 1 79.34 ATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGCCCATGAGGTGTGTGCTAACGAGCAGACGACGACGACGACGACGATGCCACTTGACTGACAACCTGGGAGC:1 + chr3L 935660 3' + hobo 283 1 51.37 TAGAACTATTCACTTTTATGTCCGCGTGGGCTGGGCCCAAAGAGGATAACACAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTAC:1 - chr3L 9663333 3' - Dm88 221 1 73.97 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATG:1 - chr3R 26405035 3' - hobo 69 1 72.44 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTTCGGCCATCCGGCGCGTCGTGCTTTTCTATTTGTATTTG:1 - chr3R 13572033 3' - 412 7127 2 72.86 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCCTTTGTTTTATATTATATGATTTAGATATAAAATCTAGAACACATTACTTAAAATTATAAGATAATTTAGTCGTAGAATGTTTTCCACGATTCTCTCTCTGTATCC:1 - chr3R 6523160 3' - I-element 17 1 72.60 CTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAATGAAATACCAGTAAATTATATTTTGTAGGAATCTAC:1 - chr3R 30044852 3' + R1A1-element 5215 1 75.34 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGTGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAACCAGTTATAAGCCAACTTTCATTCCAAGCAGACGTGCTGGGAGTT:1 - chrX 12003868 3' + P-element 2872 1 76.71 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAGCCTAGTTATGTAATGATCCTGAAAAATGCTTTAAAAAATTATCCACAGATTTCCAGAAA:1 - chr2L 5724293 3' + 1360 3367 1 47.26 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGTATCTCCGGCATGTGCGTATCTCCAGTTCGTGCACCTTGAGTGTAATTTAAATACAAACGAATGAATTTATGAAGTGCCGGATATACGGATGCTGT:1 + chr2L 10178125 3' + mdg3 5474 2 68.49 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGAAAAAGCCAGCAGTGCGGCTCATTTGCATGCCACATGACAAAAAGCTCGTAGCAAATGCAAATTGAATCCAACTTAAATGCCCGACCATCGCGGGC:1 + chrX 10698749 3' - mdg1 7063 2 68.49 CATTTTTGATTTCGGGGAAAATCCCTCAACAAGAAAAAAGGAAATCGCAAGAGAATGTGCATA:1 + chrX 4453461 3' + Max-element 243 2 84.13 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGA:1 + chr2L 8009140 3' + roo 334 2 68.49 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGT:1 - chr3R 22266461 3' + roo 320 2 78.08 ATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCATTAAAATGAATTTAAAGACTAGCTCTTTGCTACCTTATATAAATGGAATATTTATGGAG:1 + chrX 13503551 3' + R1A1-element 4878 1 59.59 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGTAGAATTTATCTTTAGCTCTGAGCCCTCTTAATCTGTAAGATTCCAGTTTAAGGTACTTCCT:1 + chr2L 6716449 3' - hobo 12 1 77.40 ATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTACCTGTATATATAGATATATATTGTGAGGCAACCGCCGATCCATCACCGATCGATCATTCAGCAAGCAAAAAGAATTTAATTCCAGTACAATTCATTTCCGGATTACA:1 - chr3R 24396656 3' - I-element 5111 1 71.92 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTTACCTTCGCATTTTTTCCTTCTTTTTGATTAAATTCTCAAGATTGCAATTGATTTTAGTTATGGTCCTATATTATCCTATTATCCTATGTCGTTTTTG:1 + chr3L 18421462 3' - hobo 22 1 63.70 TTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGTAATGCGCGGTATGGTAATGAATACCTTAAGTGAAAGCTGTA:2 + chr3L 10732468 3' + R1A1-element 10 1 71.23 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAAAGAGAGCGGCGAGAAGAGAGCGC:1 - chrX 1831235 3' + P-element 2820 1 38.89 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGATATGCAGATCGAAATT:1 + chr3R 4352160 3' - Doc 40 1 64.38 CATTGGGAGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCGACAGACTTAGCGCCCACCCGAACCGTACATAATGAAATAAATTGAGTTTTAGTTTGGAGGAAAGGAAACCATTAAATATGTGCTAATGCTAATAACAATGGGCG:1 + chr3R 5557835 3' + G5A 2576 1 58.90 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGAGAGTAAGGTAGATAGGGAGCTTTTGGAGCTGCTCTAGAGTTGCCAGGTGGGCGTACAATTCCATTTTTAGA:1 + chr2R 16031455 3' - hobo 49 1 51.37 AACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAAGAAACATTGTCATAAAATACTAAGATCTCTCAAT:2 - chr3R 1047940 3' + Stalker2 359 2 54.79 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTCTTAAGTCTAGAACGGTACAAGTGCTGTCTGAAATGCTCTGCCTTAA:1 + chr3R 18514424 3' + pogo 2034 1 67.81 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATATATACATATTTTTTCTTGCTCTGCAGCTTTTGTTGTCGCCTGTCTGCAGA:1 + chr2R 17317662 3' - hobo 62 1 65.00 AAAAAAAAAAACAAAAATATGGAAAAAAATGCTATCCGACGGATGTCGTTATTGTACACA:1 - chr3R 26877872 3' - hopper 141 1 63.33 CTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTATTGTCACCGGTCATGTCCTCCAAGCGAGCAAAGAAGTAGTATTTGTGTTT:1 + chrX 19551709 3' - roo 8808 2 65.07 GACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAATGACCTCGTACTTGATTAGTATAGAGTATAAATTGATTTATGG:1 - chr3R 29514114 3' + Stalker 6862 4 72.60 AGAACAGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATGGTTAAAATTTTTAAACTTATTGGTAGTGCTTATACAAGAAGAGTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAATATAAAAACAAAAAAAAA:1 - chr4 337653 3' + F-element 4576 1 87.79 ACGAGAATATACACAGAGACATACAAATAAAACTTGTCATTAAGACCAAGAGTTCCGTCCGCTAGTTCAAATATGGATTCGAGTACTACCTCATCGCCGCCTCTAACCGCCAATATGGGCATAAATCCTGTTGAATTGGTGGCATC:1 + chr3R 773641 3' + Doc3-element 4436 1 77.40 TTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCCAGCCGGGAAAGCGCGTCAAAAAATCAACTGCTAAACAATGAGCAGCAACTTTCCCTCA:1 + chrX 11280828 3' - X-element 37 1 53.85 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTTGCTGTATGTGTGGCACATTTCCCAGCATATTTTTTGTATTTTGCAATCCTTTGTCTCTCTGTTTTGAGCTCTGCTCTTTGTGTCTG:1 - chr3L 19432479 3' - HMS-Beagle 6827 2 65.75 AAGCAGAGTCTAATTTGAAATGAGATCATCTCTACTTTGCTGTTGCTAATTAACTTAACTTTTTGTAGTAATTTTTGCAACAGAATTAAACTTTAGTTTTCTATACTTATTTCGATTATCGCCACAATTTACCCCTTTCGCTTATC:1 - chr3L 3782332 3' - hopper 1163 1 35.62 AACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTCTTGCATTTAATTAACTCCAACCACTATAAAACGGTTTTGTTTTAACCGATAGTTTTTTAGGCTTTTCACCGAAGTTAATTGGTACAACCTATATAAGGGAAAAAATCCGCA:1 + chrX 22443966 3' - S-element 1702 1 74.66 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACAGTCAAAGAATTTCAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 18922639 3' + opus 473 2 66.67 GGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAATCCGAGAGGTATTCATTTGTGCTTGTGTTATTACGGCTAAGAGCTTAAG:1 - chr2L 1870909 3' - mdg3 5284 2 63.70 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACCATTCATCCTGCTAGATGCAAGCCCTTTAGTGTTCCAGTAATGGTTCCATAATCATCATCATTTTTGA:1 + chrX 6053029 3' - roo 8716 2 54.11 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGAATTTAGCATAACTAATAGTACAGTTCAGTGCACATGAGTATCTTCTTTTGAATTATGTCTG:1 + chr3L 19938572 3' - roo 58 2 60.27 ACACACACACACACACATGTTTGCCGGGTGGAATGCTGCACGAGTTCAAGCGCAAATTCCTGCAGAAGAGGTAAGTCCGCATTCCCGGTGTCCGTCTTGTACACGAAATCTGACTCATCTATTGCTCCAG:1 - chr3R 23626537 3' + accord 7031 2 80.00 ACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATATTTTCCTCAGAAAAATTAACATTCGCTTATGGTATATAAAAAGAAAGTCGCTGAATAACATTGTTATATCGAAATTGAATTACCAGGTA:1 - chr3R 8338086 3' - jockey 4590 1 63.01 GTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCTTTATTATTAGTCTTGCTGGTTTCAATAGATATGCCCAACACATTTGGGCCATAAAAACGTTAATAAAATATGATTTAGTGTACCAAGGCATTTAGCAATAGGTTTAATAATG:1 - chr2R 7024332 3' + diver 216 1 79.45 CGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGCGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCATTACATTTAAAAATATTTTAAAATAAGCACACTATCTACGTTTAAACACTCTATATACACCCACACTTAAATAAGAAAA:1 - chr3L 25821763 3' + opus 7462 2 58.90 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGTCTAAAAATAGCCACAGCGAATGCAGTCCAGCACACGAGCGGCCG:1 - chr2L 20716292 3' + P-element 2869 1 73.29 GCTTTTATTAAAAGAGCCTTAGTTGCTATATGGAGTTTGCTTGAGTGGGAAAAGCCAAGTGAGGCACGTGAGATGCAATAGATGGCTTTACGACTCCTTTAGTTCGGTTTTTAGTAAGATTTTCCCAGAAAGGTTCTTCGAC:1 + chr2R 4336851 3' - G5A 2390 1 69.01 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGCTCTCACTCTCTCGTGCTCGTTTCTTCCATTTTTTTTCGCACGCCCAAGGAGCGAGGCAGTC:1 + chr2R 17348494 3' - hobo 56 1 56.25 GGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCGCTCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTCAATTACTTCCTTTCTTTACGTCCTCGAATAAGCAAATAATATTG:1 + chr3L 2417613 3' - R1A1-element 227 1 76.71 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAG:1 - chr2R 24021542 3' - pogo 50 1 54.79 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTGCGATTGTGCATTGACCTGATTCGGAAAATGGAATGGAAAATGGGTGTGAGATTGGGATTGGGAAAGGGATGCGAGTGGCAGAGC:1 + chr2R 10960989 3' - Doc 43 1 54.79 GAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTATGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTCGCAGCCAGAC:1 + chr3R 13572106 3' + 412 429 2 61.87 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCAAACTTTATTTTTTTGCCATAGAGCATTTCTCAGCCGTTCTGTGAGCAAAATTTCTCTAGGTCTCCTTCTTTTATGCTCCTTATTTAACTTGCGGTCGCTTTTGGTCCTTGGGCGCG:1 + chr2L 12814870 3' + hobo 2935 1 81.51 CTTCTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTGATAAATCGATTTAGAAGCCGACGGGGTCTAAATAAAAAAAAAAGTGGAATTCTTTTGATTTTTCTGTGCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTCTTGGAATCGTTTGTCCGGCACCTA:1 + chr3R 28937072 3' - gypsy2 399 1 66.90 AAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACAAATTTTGGAATTCTATCCAATTTCATATTGCTGTGAAGAAGTTGTTCTCTGCCGATATTACTATTTAACCAGTTTGTGAATATACTATTTTCTT:1 + chr2L 2621621 3' - BS 5070 1 64.38 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAA:1 + chr3R 26031794 3' - pogo 60 1 59.59 ATTGTTTAATGTATTTTATTTATTTATTTAATGTTAACTTTGCTGGTGGATTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTAGCTTTTTTTAACTTTTATTTTTAACTTTTGCTGGTGGATTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGT:1 + chr4 1294992 3' - HeT-A 5 1 73.29 AAAGTGGTCCTTCGTGCCGGATTAAGAAGCAAATTCGGCTGCGAGAACCATGAATTGATGCGCTCACCTGTCACCAGGGTCTCTTCGGTGGGGTTGCGCTGGTAGAGATGACCTCGCTTCTCGTAGTGTCAAGACGCCGGCACAT:1 - chrX 4904798 3' + 3S18 365 1 73.10 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCCAAAAACAAAAGCGACGTTTTACTCGGCTCTGCGAGCAAGAAACACAA:1 + chr3R 18935206 3' - jockey 4713 1 57.53 GACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGAGTTTTTTTTTATTGTTTATGAGGTGGAACTGCAAATTCAAACTCAAGGAATATTCCCATGGTATTCTTTGTTCACTTTACCCTTTTGATG:1 - chrX 4818474 3' - Bari1 29 1 67.12 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGGACCGGACACTTGAGAGAGAGAGAATTCTCCGGCTCGGTTTCGGATTCGGGTTCGAGT:1 + chrX 13642119 3' - P-element 63 1 43.15 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATAT:1 + chr2R 8375126 3' + roo 351 2 54.11 CAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCACAACGCTGTCTGAACCAGTTCTATACCGCCCACATGGCAAGATT:1 + chr2R 13281201 3' + mdg3 5139 1 69.86 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGC:1 - chrX 19744420 3' + P-element 2820 1 38.30 AGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAGCTGCACTGTGCAAATATTCTCTCGCTCTCACCCTCTCGCTCTTTCGCTCTCCCACGCAAAACTTAAAATTTCTGACATTTGGCATAATGTCGTCTTTAAAACACTCACTT:1 - chr3R 25524921 3' + Cr1a 244 1 76.03 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCTGCATCAGCTGCTGCTTTCGACTACTCCTTCCATTTT:1 - chr2L 15523881 3' + opus 472 2 67.81 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAACTTTATTAAATCGTTCTCAAATGGAAAACACCGACTATAGCTATTGAAAATAGTTTCTCACAGTTCTTAACTTTACATACACAAAGATTGTAAGTAATCTTAA:1 + chrX 19310706 3' - pogo 14 1 74.66 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTCTTTGTCCTTTTCCGCCTGATATCCCGTTGAGCACACACTGTCGAGGATTAGCAGTCTA:1 + chr2L 2518629 3' - jockey 17 1 75.34 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTATTTCAACAAATATAGAGGGAGAGAAGTAGGGGCACAGCTCCCTTTTGCATGTACATACAACGTTTTTAATTAACAAA:1 - chr3L 13567947 3' - copia 4912 2 54.79 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCTTCTCGTAAGTGATCTTCGGGCCAGCTATCTGGCTAGTTAAAGTTTGCTGTGTATGGTATGTACATTT:1 - chr2L 11047919 3' + Juan 4203 1 67.81 CACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATG:1 - chrX 3637761 3' + roo 352 2 53.42 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTGCACGCCCCGTATGTTTGTACATATATAA:1 + chr2L 15601666 3' - Doc 35 1 60.96 TGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAGTCATTCGGAAACTTTAAAGCCCGAAAGTATGCAGCACAAAATCGTAATATCAACTTTTCAAAAAACCTCAACTAACAGCTGCGCTCAACTAGTGCGGTAAAGTAG:1 + chr3R 11568726 3' + BS 5079 1 73.29 AATAGTAACATAACAGCGCAATCAACAAGTAAATAATAAAATCCAACCTCGGGCAGTCATTGCTGAATTTGTGTTAAATGCTTTTTCGAGTGTAGCTACTCCATTAATTAT:1 - chrX 20260859 3' - BS 5045 1 51.35 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTTGCAGGAGCCGTCATTCCGTCGGGTTCAGTCTGCAGGATTGCTGATGGATTTCACAGTTG:1 + chr3R 5767501 3' + roo 9044 1 66.44 TGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTTAGATTAAATATTTTTAAGGTTAACAAGACAATAATTTATGCTTATTT:1 - chr3R 26349365 3' - mdg3 72 2 66.44 TCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTTTCCC:1 - chr3R 3617306 3' + micropia 5132 2 77.40 TTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTAGCCAATGTTCATTATTAAATGAAAACTAATTAACGTATGTGGGCCTTTTTAATCAACCGAGAATTCCCCGAATATTATCTAATCTTTGTCAAATGAA:1 + chrX 19217481 3' - invader2 4743 1 64.14 TCACAAGTCTCTCCTTTACTCAAGTCGACTCAAAACCTCCTCGTGGTGGTCCCCGGTAATGCTAATGCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACTTACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAA:1 + chr2R 22122747 3' + R2-element 100 1 52.74 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGATTTATTTGCCGGAAAAGATTACTTACTCTGGACTGCGGTTTTCCACGCGGCGTATTCGTATTGAAG:1 - 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chr3L 23773393 3' - Transib5 2696 1 61.64 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAACCTTCGAAGGCAGATCACTATATTTAGGCCAATAAAATCTTGAGAATTTCACGCAAATTCATTCATATCAGCCAC:1 - chr3R 5684041 3' - pogo 41 1 56.16 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAA:1 + chr2L 15057252 3' - hobo 72 1 67.81 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTGAAAAGAATCCAAAAGGATTCTGGCGCGATAATTAAATGCGCACAGGAAGCGAAACTTTTTCACCCAAGTTGCGGTGTGTTGCGACTAATTGCATTAAAGTGTAATGGAT:1 + chr3R 26139563 3' - mdg1 11 2 78.08 TATTGCTTATGAGTATTTTCAATTGTTTACTAACAAACGTTCTAGTGTTCTGTGGAATATTACTTTTGTATGGGACAATGAAGCACCAAGGTTAAAGTTGTATGTTTTTATCAAATGGTATTAATGTTTTTTGCCCTTTTTTACGA:1 + chr2R 23198925 3' + transib4 357 1 67.12 CTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACACGTGTTGCGGTTTATCGAGAGGGCAGTGTGCGTGTGTTAGTGCGGAAAACAGCTGG:1 + chr3L 7370558 3' - Burdock 6199 2 61.64 CGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGCGGATTGAAATGTATTTGAAAATGGCAATTTACGCACTGTTAGGGACAGTTCAAAAAAAGATTCAGCTGCAG:1 + chr3R 15035162 3' + Stalker2 352 2 51.37 CGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGCGGTTGGGCGTGAGCGGGAGAGCGTGTGGAAAACAAGTGCCAGCTGACTGACTGGTCAAAT:1 - 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chr2R 22616884 3' - BS 5084 1 70.55 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAA:1 + chr3R 13198291 3' - Doc 58 1 54.11 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGGACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTA:1 + chr3R 13198263 3' - Doc 86 1 71.92 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAATTATTT:1 - chr2R 14767356 3' - Tirant 55 2 55.94 ATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCAT:1 - chr2R 10666870 3' + hobo 2856 1 77.78 TACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAAT:1 + chr2R 13052831 3' - Doc 125 1 77.24 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAGTCATTCGGAAACTTTAAAGCCCGAAAGTATGCAGCACAAAATCGTAATATCAACTTTTCAAAAAACCTCAA:1 + chr3R 11568692 3' + BS 5045 1 50.68 TAACGTAATTAAGCCTTCTTCATAATTCACTTATCAAAAATACGTAGAAAAAAAAAGAAAAAAGAACAAAGCTAATATAGAGTAGAAATAAAAAAAAAGCTACTAAGAGTCCAAAGCAGAACGTGCTGAAATGCAATGAACGAAAA:1 - chr3L 16633128 3' + Tom1 3 1 74.66 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAAGAGAAAAACATCTATGGGGAATGCAAAGCATCAATTCTGTCAACATCATAGGAACACATAAA:1 - chr3R 30524409 3' - roo 8679 2 73.97 AATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATTATATTTACTTGCGTTCTTTGGATTAAAAAAAATCTTTCGATATGATCTTAAATTTAATCCAAGAAATTA:1 + chr3R 26920709 3' + Stalker 17 4 52.05 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTAGAATTTATTCCTGTTTAAGTTTTAAGGTAGCTAGTTGAGCTGTTTTGACTGTAAGTGTCCTTTCGTCCAATTCATTCTGTC:1 - chr3R 18539761 3' - roo 40 2 58.90 GTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATGAGGACGAAATACACACTGTTCGCTCTCCGAATACTAATTTTAAAAAATTTAATTCGAGTTCTGTTCTG:1 + chrX 1005345 3' + hobo 348 1 52.74 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGCTTGTTTGCCTACACTTTCCATGGCCCTGTTTTCCGAATGTGACTCTCTG:1 + chrX 22715180 3' + opus 479 2 72.41 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATTACTTATTCTTTGTTGGAAGTTTAAAGGATTTTGGGCTCTACCTATATTAAGTTTCTGTGTGAACTCGCTCGCTAACTTTGGGTTTGGTTCACAGGGTCTTGG:1 + chr3L 25912632 3' - blood 7030 2 72.60 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGCTCGTTTACTTTTGTGCACAAAAGCCGAGACGCATAAATAACCGGCAACGGTCATTTTGCC:1 - chr2L 1892271 3' + hobo 2899 1 52.38 CCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAGGATATAAATCAAAATCATAAATATATATATACTTCATTCATTTTTGATGAGCTTCAGTACAAACTTCTAACTTTCTGGCCACTGATCCCATCCTCAGACCTTTCTCTTCAGCTC:1 + chrX 14121892 3' - Doc 9 1 61.64 CTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAATCTTTCCCAAGAGGGTTTTGATGGGGTTAGGTTCTGTTACTGGTTAGAATTTCAAT:1 + chr3R 10736857 3' + copia 190 2 63.70 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAACTTTATTAAATCGTTCTCAAATGGAAAACACCGACTATAGCTATTGAAAATAGTTTCTCACAGTTCTTAACTTTACAT:1 + chrX 19310681 3' - pogo 39 1 57.53 TGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTAT:1 + chr2L 15057248 3' - hobo 76 1 70.55 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAAGAACCTAGTCGTAAATCAAAAGATTGTGGGACAGGCACGGGG:1 + chr2L 9988180 3' + hobo 2895 1 59.46 AATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGATTCTTTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTTG:1 - chr3R 30486950 3' + Cr1a 114 1 74.66 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGTCAAAAATAGATTACAATTTAGAAGCATCTTAAAGATTTATCGATTGATATGAAATAATAAGATAAGATCTCGACTCT:2 - chr3R 18860745 3' - roo 42 2 50.00 TACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTTGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAACCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACTGATTTCAGCAATTTATTAAGACC:1 - chr2L 12447446 3' - opus 7208 2 76.71 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTGTTTTTGTTGTTGCTGGACTTCGGTTGTGGAATTGTGTAAACAGCACCGACTGCGACGTCGGC:1 + chr2L 16536623 3' + pogo 2050 1 57.24 CGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGGGGCTCAAGTCGAAGTTGTTGTAATGTCGAGAGACCGAGACCAGAAAAAGCCCAACAACGAAGCTCTTTGTGAGCGAAACTAATAAAAAACCGATCGCCCCGAC:1 - chr3L 17895868 3' - P-element 17 1 73.79 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTA:1 + chrX 18193815 3' - hopper 56 1 55.48 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCTGCCACTCCCTCCCATGACATCCTTCTTCGCCCGTCTAGCCCACACAGCGGGGCAAACCGCGATCCTGGCAGGA:1 + chrX 19992682 3' + copia 207 2 52.74 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAATTATTTGGCGTGCCTCGATTAATTGGCATCAATTG:1 - chr2R 14767327 3' - Tirant 29 2 67.12 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATGTTTGCCTAACGACAGAAATACGACACAAGACACGCTTTTTACAGAGCAAAAAGATAGCAGTAACTTTTCACTAACAGCCAAAACTTTTTTGTT:1 - chr2L 21687558 3' + pogo 2077 1 68.49 TATGTAAGTGTGTGTGTGTGTTTGGTTTAGTTTAGTGTACAAGTCCAGCAAATTATTTACCAATTGCAAATCGCCTTTCGTTTCGAGTGCACAAATTGCCTTCTCCCAAGTCTGGACTCCCTTCGCACACCATCAAACGCCCCAAC:1 + chr3R 14390787 3' - Quasimodo 38 2 62.33 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATATATGGTGGGCAAATGTTGAACCTCTGGCAGCCAC:1 - chr2R 13773036 3' - opus 49 4 70.00 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCGTTTGCCGATTCTTATTTTTGACCACTCTGGTTTTGTTTAAGAAATTATCTCAGAGGCCGCCTGCCCATTTTTCCTAGTCTTTCTGCTTTAATTTCTGTGTGTGTGTATGTATGTGTT:1 - chrX 988463 3' + 412 478 2 75.34 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGATAGAAAGATGAATGGATGGATGGATGGATGGG:1 + chr3L 11336371 3' - P-element 24 1 40.00 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTTTGTATTGTTTCCCATTTCAAATCTTCCAGAAACATTCAATGAAGG:1 + chr2L 13102952 3' - roo 73 2 69.86 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGAAC:1 - chrX 19744416 3' + P-element 2819 1 39.73 TTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAATCGAATAGCTTCAGGGGAAGGTGGTCGACGCTGC:1 - chr3R 22581467 3' + F-element 4567 1 76.71 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTGTATCTTATTTTCACAGCTATCAAAATACACAATGAACTTTGACTTTTTCCAGTGCACCTACAACATTTTTGTCGCCTGTGCACTAGAGTTTTTGTGGATTTCGAA:1 - chrX 18561009 3' + copia 242 1 75.34 TAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCGGTGGGTAGCGGTGGGTTATATG:1 - chr3R 19537428 3' + hopper 1406 2 79.31 TACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGA:1 + chr3L 23839729 3' - McClintock 6006 2 58.22 ATGTATGTATGTTCTCATACAAAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTATTAATTACCAACTCATTTTAGACTATACTCAAGCTATCTATCTAAACAATAATG:1 - chrX 22218814 3' - 1731 4380 2 63.01 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTTACCTTCGCATTTTTTCCTTCTTTTTGATTAAATTCTCAAGATTGCAATTGATTTTAGTTATGGTCCTATATTATCCTATTATCCTATGTCGT:1 + chr3L 18421457 3' - hobo 27 1 63.70 AACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGGGTGGCTGAAAAGCTGGGTAGTCACTGAACTAAACTGCAATGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTCCTGGGACCATTTATGATTTGTGAAAAGTTTCGTGTGC:1 - chrX 13559072 3' + mdg3 186 2 68.49 CAGTGGTCTGATTTCAGATAAACATGAAAACCTGCTTTTATATAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTGAGCACATGTGTAACGTTGTTCCAGAGTCTAGGCACTAGTAATTGCAATCACTGATT:1 - chr3L 23209216 3' + Cr1a 412 1 60.96 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGATCGGTGCACGGAGAGAGAGAGAGTGGGGAGAGCGAGCTGGGGAGAGCGGATCGAGAGAACGGTATCTGTATCCGTAAGATAGGATTAAACATT:1 + chr3L 13477319 3' + P-element 2861 1 65.07 CCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGATTTAGTATCGATAAGGTAAACATACGAGGTAAACATACG:1 - chr2R 17087032 3' + Ivk 296 1 73.10 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCACGCATATTCGTATGTGTGCGCGTGTGTGGGTGGCCAAGCGTTTGCGCT:1 + chr2L 5656629 3' + hobo 2923 1 56.67 TAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTACATTTCCACTAAACTTAATAATTCTTTTTGTGCATTGTCT:1 - chr3L 23244863 3' + HMS-Beagle 6961 2 74.66 CAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTAACTTAAATTAGGGGCCGGTCTAATAACAATTAATTGAGGCTTTGAAGCGAAG:1 - chr2R 10760410 3' + Tabor 418 2 64.14 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAACCACAAAGAGCAAACACAAAAAATGTTGCCTACTTCCCGGCAAAACAGGTGAAAGAAACGAGCTGACCACA:1 + chr3R 8625291 3' - jockey 56 1 52.74 GACGTTGCAGACTGTGCAAAATTGCAACACCGATGACCAAATGCCTTACATGCAAAGTCCATCTGTGCTGCAATAACAATAAAAACTGTTTTTTGTCTTGATAACTACACCACAATATGTAACTTTCTTTAAATTAAAGGCCATAT:1 - chrX 10600920 3' + looper1 1546 1 63.01 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGAACTACAACAACATAAACTGCATGTCGTAATACTGTTGGTGTAATAAAAAAA:1 + chr3R 7109241 3' - P-element 52 1 50.68 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATAGCCTAACACCAGGAGCAGCGTGGCGGAAAAGCGTTTTGTCCCGGCGACAAGGCAACA:1 - chr3R 25094614 3' + P-element 2824 1 42.47 TTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCTCCCTCCCTCCTCAAAAACGCCAAAAACACTCGACGGTCGTCGTCACAC:1 - chr3R 26845533 3' + mdg1 7386 2 65.07 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATATAAAATTAATGGCAATCTGGCAGCGTAAACACGACAAAATTTGTTTCTCTAGCCGTGTGCCGTGTGCCTTGGCCCATTGTCCCACAAGCAGAT:1 + chr3R 18114991 3' - 297 6604 2 69.86 GATCAGGATCTATAGCCGAGTCGGTCCGGCCATATCCGTCTGTCCGTATGCTTCAAAATCTTGTCAAAATTAAAGAAACATTGTCTGCGAAAACTTAACTTTTATTGGTTCTTAACAAACTAATTTGAAACAGCTGGCCGAATTCA:1 - chrX 22482117 3' + INE-1 92 1 65.75 GCAGAGCTTCTGCCGGCTATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTACACATGAGTTGCTGCACCAAGCACATTTATATTTTGGATCT:1 + chr4 39235 3' - springer 82 2 74.66 GTCAGCGGACGAGCGGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATGCTCCACAATCCAACGGAGCTGAGAGTTGCCCCTCCTGGATACCCAAGACCTCAAGAGACTAATGCACTCAATTCAGT:1 + chrX 16801911 3' - gypsy3 15 2 56.30 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTC:2 + chrX 8610307 3' - mdg3 5323 2 63.70 ATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGACTCCTGACGAAGAGCGTTATGACAGTACAAGCTAGCCAGATTTGCAAACTAATCGAGGAT:1 + chr3R 29333208 3' - opus 7217 2 68.49 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTATTCCGCACTCATATGTTTGTGTACACAAATAGGGTAATGGGATTTTAAAGGTACTTTAGTTGTTCAGCATGCACATTGCAATCTT:1 - chr2L 2722322 3' + flea 4981 2 65.07 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCAATAGGTCCCAATAAAACTTAAAGTTACTTCCAATTTATAAGGCATTCTTTTAGGTCCAATAATTAAGTTCTTAC:2 + chrX 16538212 3' - mdg3 5295 2 56.16 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATGTTGAATTCAGTTGAGAGCCTTGCGATTTTGTTGGTCCGTTTTACTTTTCGATTTTTTGCTTT:1 - chrX 3743751 3' - Tirant 55 2 55.48 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCTAATTCCTTTTAAAGTTAAATTCGATACCTCATTTCCCCAAAGCCCTTTAAAAGTACCCCATAAATTTTAAGATTCACCCAAAACAAACACGAAAGTCTAAATTAAACTTTC:1 - chr3R 22160810 3' + copia 247 1 76.03 GTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTTCATATTAATTATTACTTAAAGCAATTTCT:1 + chr3L 13365140 3' - Juan 39 1 45.21 TGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCACATGCAGTCGACTCTATGAACCAAGAGAATGGCTTAGAACCCACCA:1 + chr3R 29719410 3' + hobo 2865 1 67.81 AACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGAAGTAAATGTGGTTCATATGAGTATCCGAACGTAGCTGAGATGATTAGACAACATTCAATCAC:1 + chr2L 8009202 3' + roo 397 1 75.34 CTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATTCAATATGTACATTGCTCTTCTCCATCACTATTTGTACCCCATCCGGTGAAATTGAAGCGTAATA:1 + chr2R 21519666 3' + Stalker2 7439 2 62.33 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATTTTTAATGCGATGAAAGGAATGCGAGCGTATTTGCGAGTGTTTATTATTATTAGACCATGAATACATATATAAATGAATAAATGTTGGCA:1 - chr3L 16523154 3' - jockey 34 1 67.12 TAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTGGTTTTTGTTTTGTTTAGGTTGAGCAGAATTGGCAGGATGCTATATGGATGTGTTACAGGCCCAATGTGAGTGCTTTCCATTGTCGTAGGGCTGTTGTTG:1 - chr3L 22952536 3' - Porto1 296 1 55.48 ACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGAACTTATTGATATAGTAAAGTAATGATAAAAATATAAATTGAAATAAAATATAAATTCCTGACAGAGATCAAGGAAATCCATTTCGTTTTAGAATATATAACATATG:2 - chr3R 27948172 3' - Juan 3867 1 73.29 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGCCTTCACTTAACGCTCATAAATTTGTCTGCC:1 - chr3L 16197047 3' - Doc 66 1 71.30 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTCTTTGTCCTTCTCCGCCT:1 + chr2L 2518588 3' - jockey 56 1 49.65 GAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATAATCAGAAAAACAATCGACTT:1 - chrX 21087540 3' - mdg3 5282 2 62.33 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACGATAGAGAGACGATGGAGACCGGCACACAGAAATATATTGGGACTATAAATCAAGGAAT:1 + chr2R 18467226 3' + roo 9033 1 51.61 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGCCGTCGCCGCACACGCAGAGCATTCGCTGCGCGCTCCGCC:1 + chrX 1831340 3' - P-element 18 1 66.95 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATAATACAATCAGATTGAAATCGAAGCAGGGCACCTGACACAA:1 - chr2L 8852736 3' + Burdock 6363 2 60.96 TGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCTAAGCCATAGCCAGCATTTAATCAAAAATGAATTTTCCTTTTTTTTGCCATTCCAGATT:1 + chr2R 16503486 3' - jockey 69 1 58.90 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCGTAAGTCGTAAAGCCCTGAGTTTGTGGGTCGTCTTGTACGTGTTTACGTTACACGTTAT:2 - chr3R 12547852 3' - hobo 63 1 58.90 TAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGTATTTCTGTAGGTGGCTTGGTTTGTTTATTTTGTTGTGCACTGGCCGCAATTGAGAATTTCTATGGAAAATAGGACCAGTAACA:1 - chrX 17508784 3' + Burdock 222 2 63.01 GTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCAATG:1 - chrX 17690463 3' - Doc 333 1 59.59 CTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTACCAACGAATTTATGTTTTCAGCCATAAATTGCCAAACATATACGCCCACCTGGGCGCCGCTTGTTTATGGCCAGCTTGGCCAGGTTGGCAAATAATGAAAATGTTT:1 - chr2R 18927720 3' - 3S18 15 2 73.97 AGATCTCAGGAAATATAAAAGATAGAAGATCCAGCATACGGATTGATTATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACATAAATAACTAATTTGCAATTTGGTACACGTGGCTTGGAACAGAGAATGTATTTTCCAGCTGAAATAATCTG:1 + chr2R 18487422 3' + INE-1 149 1 59.59 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACGAACCCAGCGAAGCGGG:1 + chr3L 9240490 3' + 412 449 2 52.21 ATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGTGGCATTCTGTCTTCTTTATTATAGAATATTTTGTATCATAATATTCAAACGATCTGCATTAAGTTTCTCCTTTCTCCTTCTTAAGAAAAAAGCTCGCCTGGCAACACAAACACAAGTGAA:1 - chr2R 10552117 3' + INE-1 560 1 63.70 TGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATAGATACGATGTGTTGTTGCAACAGGACGTGACTTGGGTGACTAAGAATGCAGGGCAGTCGGGATTCACAA:1 - chr3L 9317450 3' + HMS-Beagle 6997 2 54.79 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCGGGGTGAGTGGGGGCGTGGCAGAAAGGTGAATCAACA:1 + chr3L 10111880 3' + copia 214 2 57.53 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCTGTAACCAATCGAACTTCCTACGTTACT:1 - chr3L 19510467 3' + pogo 2061 1 57.53 AACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGAAACCCTCGATGCGGGTCCAATCGGCCACTTACTGCTTGGTCATG:1 + chr3R 10741179 3' - 1360 3373 1 34.25 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGAAACCTCATCGAACTGAAGACAAGGCGTTTTGACTTTTTTTTATGCTGACGCTAACTCGAAAATAATTTGATATTTTCAATTAAAGTTTTCAATGGCTTTTGAA:2 + chr2L 16360708 3' - hobo 17 1 69.86 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACATACATGTGTGTCGGTGTCTGTGTGGTTGAACGACGCCATCAACAGCTTAGAATTTCAAAATGGGCGAAAGCCAATTTTCACACTCAAATAAATTGGGT:1 - chr2R 21453495 3' - hobo 20 1 71.92 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAAAGAGAGCGGCGAGAAGAGAGCGCCAAAAGACTTACACCGAAAGAAACGGG:1 - chrX 1831208 3' + P-element 2850 1 57.45 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGAGAGTAAGGTAGATAGGGAGCTTTTGGAGCTGCTCTAGAGTTGCCAGGTGGGCGTAAAATTCCATTTTTAGATAGCACTATAGTTCTTAGCATGTGCTTGATTT:1 + chr2R 16031487 3' - hobo 17 1 73.29 AAAATCAAAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGTCAGCCA:1 + chr3R 13572103 3' + 412 419 2 65.75 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATAACTCAACAAATTTAATTTAGATCGAAATGTGGTGCAGTTAAACCATAGATTTCCCACTTCTTTTCAAATTAGCAATGGTATTTTCTCTTTTCTAATCTT:1 - 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blood 74 2 67.81 TATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGATGTAACCGTTGATGTACACTTACGAAGTACGTAACAAGTTCATGAACTGATTTCGTGAGCAGGT:1 - chr3L 17999672 3' - copia 186 2 56.16 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCAGAACTTTCTTTTTCCACAATATTACTTTGTTTTGTTTAGAAAGCGTAATTCCATAAGTTTGTTCAAAG:1 + chr2L 8852885 3' - Burdock 6183 2 52.05 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTTTTCCGAAATTCAAATGGAGCCCATTTCTAACA:1 + chr3R 12540549 3' - roo 84 2 77.40 TATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAA:1 - chr2L 951310 3' - F-element 72 1 60.27 TAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTATAACTGGCTTCCTCCATCCCCAGATGAT:1 - chr3R 9657649 3' - BS 31 1 57.53 TGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGCGGTAAAAAAGAGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAGCGTGTTATAACTGCCAAGCACACAGATACACGAATACTCGGGAACA:1 + chr2L 20269006 3' - hobo 76 1 64.38 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTCATTGTGGCTTAATGCACAGTTCATAAAAATATATGACTGTAAATGCAAGTGCAATATTTGCTGGCTGTGTAAATATTTACACAAAATTTCTTTTGATTT:1 - chr2L 2622603 3' + roo 9050 2 71.23 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATAATCTGCAATTCAATTTAGCTATCAAAGAACTTTGAATAATTACATTACTTACGTTCTTCTAAGGAA:1 - chr2R 14082382 3' + pogo 2056 1 55.48 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCA:1 - chrX 18193661 3' + hopper 1402 1 76.03 TTTTTTTTTGTTTTTAGTTTTTTAATAAGAGCACAATACAGTAATATCAGTTTAATAATTGAGACATATGATAAGATTAGTTTAAGCGAGGAGGAGTTTCATCAACCACATCCAAAATTGATAGTGAAATCTTGCCAACGTCCTTG:1 - chr2L 14163807 3' - Doc 4697 2 50.68 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACATACCCGAAAGAAGAAACTTTTAGCTGCCTTCCAGCTATCAGCATTTTATCCCACTCCGCGCATTTAATCTTTGCATGCACTGGGAGGAA:1 - chr2R 10773183 3' - 412 7084 2 64.38 CCTAAGAGGAATATTGTGTTAGCTTTGTTAACTGTGTGTTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGGCTAACCAG:1 - chrX 21933827 3' + gypsy11 331 2 39.23 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGTATCTCCGGCATGTGCGTATCTCCAGTTCGTGCACCTTGAGTGTAATTTAAATACAAACGAATGAATTTATGAAGTGCCGGATATACGGATGCTGTGCAAA:1 + chr2L 10178130 3' + mdg3 5479 2 71.92 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACGTATATGTGCACATATATATTGCAGTGCAGTCAAGGTCGTGTGAAAGGGACGACAGT:1 + chrX 13484209 3' - hobo 65 1 63.70 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCCCCCATCCGTGCCACATGGCTTTGATAACAACACTTCTCCGGGGATAGTTGCAGGCCATTTTTGCAGTCTCAAGCAAACACTGCCAGCAACTT:1 - chr2L 2522849 3' - mdg1 27 2 67.81 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTGTTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATT:1 - chr2L 20327628 3' + roo 320 2 76.03 GTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCATATAACTTGATTTGTTTTTATTTCCAAGTATGTTCGTTATTGTTTACA:1 - chr2L 22031972 3' - Tabor 6913 2 71.23 AAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTCAACTTACCAGGTAAGCAAAGTTATGGAAAAGGATCCAACGAATAAATTGGATTTTAAATCCACAAAAATGAAAATGAA:1 - chr2R 13561967 3' + TAHRE 10380 1 54.79 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCGGTTCATATCTCTCTGTAAATATTGAATAATAATTGTTAAAGGATGTCTGCTTTCTGTTCGCTGCGGTTTCTGGCGCCGCTGTTGTAATTTTTGTGATTTTATTATAAAAATG:1 + chr2L 12767120 3' + hobo 2928 1 75.34 AGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACT:1 + chr2R 12185411 3' - accord 68 2 65.07 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATAGATATATTTCTCTTTATTTTCTTGCTTTGTGCATAAAACTGTCTGGGGTAACTTGATACTGGAAGTAAAAACTG:1 - chr3R 8884285 3' - HMS-Beagle 42 2 55.17 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAATTGCAGCGTATAACTACTATAACTAACAAGGAGCAGCAAAATGCATTGAATTTCGCTGTC:1 + chr2R 13052895 3' - Doc 60 1 65.97 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAATTTCCGTGTGGCAATCATGCAAATACTCTTACACAAAATTACAG:1 - chr3R 27778410 3' + 297 354 2 69.86 GAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAGTAATTAGTCCGTGTTTTGAAACTTTTATTTAGTTACATATAATAACCAAACTTGAACTTAATCTCGCATTTTAAACTTAAT:1 + chr3R 27443270 3' - 3S18 40 2 58.22 GGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATTTAATTAATTTAATGGACGGCCAATAAAAGTGGGCAGTTATTAATGA:1 - chr3L 20042421 3' + flea 4941 1 68.49 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGCTTTATGCGCATTCCGACATCATGTATAGCTAAAGATTTAATAGGGATTTTTAATGTATTGCTATGTAATGAAAGGGTTAACGTGTCAGTGGTGT:1 + chr2L 1871075 3' + mdg3 221 2 66.44 CTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGAGTCGGTAGGGGGATTTAAGTCCCATTCCTTGCAATAAAGAACTCTATATA:1 + chr2R 3091669 3' - F-element 315 1 65.07 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACATACCCGAAAGAAGAAACTTTTAGCTGCCTTCCAGCTATCAG:1 - chr2R 10773231 3' - 412 7132 2 70.55 TATGTTGAGGTCTGGACTTTGAGGTGGCCAATCCAATGTGTTTACGCCAACATCTTTCAGAAACTTCGTAATCAGTTTGGCCTTATGACAGGGAGCATTATCCTGCACCGGAATGACACCAATCTTAATCGGGGACTCGCATGAGG:1 - chr2L 20115343 3' - Tc1-2 1165 1 72.60 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCTAATTCCTTTTAAAGTTAAATTCGATACCTCATTTCCCCAAAGCCCTTTAAAAGTACCCCATAAATTTTAAGATTCACCCAAAACAAACACGAAAGTCTAAATTAAACT:1 - chr3R 22160813 3' + copia 244 1 73.97 AAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTATTATTACAAATTAAACGGGGCCAATCGAAATGGACACATAT:1 + chr2L 2540880 3' + I-element 399 1 71.92 AGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAAAAAAAGCGCACAAGGAAATGAGTCTGGAGAAAGGTGAAC:1 - chrX 9948330 3' - hobo 2631 1 72.60 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACTCCAACATGTCAATAAAAGTGTATAATGCCTAAAAACAACACATATTACGTATACGCAATTTAAGAGGCAAGAACAATCGTTTTGCTTTTGTTGTTAA:1 + chrX 18055858 3' + 297 374 2 71.92 CATAAACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGA:1 - chr3L 23456283 3' + gtwin 7303 2 75.34 GNCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGGGGCTCAAGTCGAAGTTGTTGTAATGTCGAGAGACCGAGACCAGAAAAAGCCCAACAACGAAGCTCTTTGTGAGCGAAACTAATAAAAAACCGATCGCCCCGACTG:1 - chr3L 17895866 3' - P-element 16 1 74.66 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCATGACCGTTTTTTCGGGTTCTCCATCGGGGAAATCTGGCC:1 - 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chr2L 19628365 3' - hobo 21 1 69.66 TTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAATATTTAAAATACTTAATAGTCATGTTCAAAGACGAATCAAAATAAGAGCTTCCGACTTTCGTTCAACAGCAAATTTTCAATTATCAGGTAAA:1 - chr3R 4869385 3' - I-element 5151 1 65.07 TATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:1 - chr3L 23112570 3' - R1A1-element 5332 1 67.81 AGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGAGAGTGCTCTTTGGGCTGGGCGCCCATCCTTTAATTAACTTGCATTC:1 + chr3R 7763420 3' - 17.6 7391 2 68.49 CGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTATTCCGCACTCATATGTTTGTGTACACAAATAGGGTAATGGGATTTTAAAGGTACTTTAGTTGTTCAGCATGCACATT:1 - chr2L 2722330 3' + flea 4973 2 59.59 AGAGGGTCGAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGAGTCGGGCCTCTTTGGGGTAATCACTCCCCTTGGATGGGTAATTACGGTTGGAATTCATTAACCCATCACCCGGTGGTCC:1 + chr3R 7359570 3' + Quasimodo 7069 2 60.00 TATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATATATCCTTTTCCCATTTAATTTTACCTACCTTTTAATAAATACTTTAATAAGTCATAATATGTGCGTAAGCATACTAACCAGATAAAAAACAAAAAAAA:1 + chrX 21638155 3' - gtwin 21 2 71.23 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTT:1 + chr3R 13198288 3' - Doc 61 1 56.16 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGCCGTCGC:1 + chrX 1831307 3' - P-element 79 1 31.51 GGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACACACAGTCATGACACACACAGACTATCGAAAGAAAACTTATTAAATCATGCACCCAAAAGTACAGTCAGTTCAAAACATACAGTCAGACAGTCTATACAG:1 - chrX 17932052 3' + roo 8776 2 78.08 AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAAATGGACTGGACTATGATAACACTAAAGAAAGTATATTAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTT:1 - chrX 21668072 3' + mdg1 355 2 54.11 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACTCTTGCATACACTCATACCTACCTAGGCGTCTTTTCTAGGTTATCAAACGGTAAAAACGCGGCGACACAAATACTGATACTCCCTGCCACTTTTCTAT:1 + chr2R 14486619 3' - 297 6600 2 71.92 TATGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATA:1 + chrX 8610292 3' - 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chr3R 26845480 3' + mdg1 401 2 69.86 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATGCCATTAATTGAAATGAT:1 - chr3L 11887186 3' - Doc 54 1 52.74 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACCTCTGGTTGGCGAAAATCGGAGATTGCATTATAAAAATCCAAGACATATTGCACAGTATGCGATAAGGAAAACAGCATTAACTTAGCCAACAATGAGATCATATTGATGTTG:2 - chr2L 9499196 3' - Transpac 5 2 76.71 ATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTCA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 51 1 71.92 GCTACCGTGTATTGTACGGCTCGATTAAGGACAAGATAGTCGCGACATAGGAAAGAGAATATGTGTGTGTGCTAGGCATTATTAATAAAGTGGCAGTTTAACAATTTCACAGTTCCTAAACAAATCATATAAAGATATAGACAAAG:1 + chr3L 10746792 3' - Cr1a 4395 1 58.22 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGGAGTTCTCTGGGGCAAACTTTATTTTTTTGCCATAGAGCATTTCTCAGCCGTTCTGTGAGCAAAATTTCTCTAGGTCTCCTTCTTTTATGCTCCTTATTTAACTTGCGGTCGCTTTTG:1 + chr2L 12814857 3' + hobo 2928 1 74.29 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCGTTCGTTTATGGAAAA:2 - chr2L 951289 3' - F-element 51 1 54.79 AAAAAAAGAAAATCCGTTTAGTTTTTCATGTTATCCTTTTTTTATCCCATTCAATATTTTTCATATTGCTTATCACCAGAAATAGGGCACAACGTAATATTAAATACAACACATATCTATGCCTTTTTTTATTGCAGAATAACCC:1 - chrX 22844894 3' + HB 131 1 73.10 GTTTTATTTTCCTTTTTTTTTCTTTTGCTGGCTGACTTTTGTTCTGACTGCCTCTCGCCTCTCGCCTCTCACCCAGTCGCCGCCCCTTTGGATTTGTTTGCATTCAAAAGGAAA:1 - chr3R 29477573 3' - Doc2-element 252 1 81.58 CCCGGACTCCACGGAGCAGCCAGCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGACGACAGGATCGCAAGACGGAGCGATAAATCAGTCGATTAATTTATATGTATGTAGAGGCAATGCTTTCGCTTAGTTAATCTGCATC:1 - chr2R 5617510 3' + Gypsy6A_LTR 320 1 89.04 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCCAGCTTCATAGCCACTCAAGTAACCGAGTTACGTGAGGTTACTCCATACGGGG:1 + chrX 7624187 3' + roo 9047 1 73.10 GCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTGGGGAGTGCATAGAGGTCCTTCGTCCTTCATTGTACTCT:1 - chrX 19101750 3' + opus 361 2 73.29 TTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGTATTTAGGGATTCGA:1 + chr3R 11550289 3' - F-element 74 1 62.33 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCACAAGGAAACGAAAGGAGGTGGCGAAAAAGTGTTGCATACTTCACCGGGCAGCGGGAAAATGTGGAATATTTTCAATTAATTCGTCGTCGCTGGCTGCCACAATTTCA:1 + chrX 9949637 3' - hobo 12 1 77.40 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCCAAGGAAACCCAACAAATGC:1 - chr3L 12775918 3' + roo 393 1 75.34 AAAAAAAACAAAACAAAAAAAATGAAGCCAAGCCGACACCAATAGCCAAAAAAACAAATGCAGGGAAAACGACAATTTTT:1 - chr3R 21919229 3' - hopper 145 110 87.50 ACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAA:1 + chr2R 18922592 3' + opus 418 2 75.34 ATCACGACGTTTATACGGACAGGTTCTGATCTTGAGTTAGAAAGTACATATTTCCTTTTTTCGGGTCGAAACTTTTTTTTTATAAACTACTACCTACTATCTACTACTACTTAAGTATTTTCACTCGATTAGGGTTGTACAACCTC:1 + chr3L 10097493 3' - INE-1 131 1 52.74 TTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAA:1 + chr3L 22638850 3' - 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chr2L 10130643 3' + hobo 2624 1 62.33 AATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTAT:1 + chr2R 545172 3' - Cr1a 4207 1 65.07 ACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATGCCAGCTTCCTGCTAAAATCATTTTCAGATTGCCAGCCA:1 + chr2L 8807972 3' + HMS-Beagle 217 2 65.75 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGG:2 - chr3R 19537459 3' + hopper 1374 2 57.53 CGCTGACTTAGTCAGACCGTGACACCTCCAACCACCACCTGCTTTCATCAAATTAAAGGTGAGTCAATTACGAATGCCGGCGAAAGTCCGACTCCCTTCGAGCTGTTCATATGCGCATAAATAAGCTCTTTTTGGCAGTTGGCAAT:1 - chr3L 10138279 3' - F-element 482 1 77.40 TCATGATCAGGATCAATAGTCGAGTCGATCGAAGGTCGAGATCTCAGGAAATATAAAAGATAGAAGATCCAGCATACGGATTGATTATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACATAAATAACTAATTTGCAATTTGGTACACGTGGC:1 + chr2R 18487384 3' + INE-1 88 1 33.56 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAA:1 - chr2R 14450153 3' + roo 359 2 59.68 GCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATAATACAATCAGATTGAAATCGAAGCAGGGCACCTGACACAAATAGGACGAAA:1 - chr2L 8852725 3' + Burdock 238 2 68.49 AGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGATAGAAAGATGAATGGATGGATGGATGGATGGGTGTAAGGGTGTCTGAACAAGCCGACAGTAATTCGATGCGTACTAAATGGAATGAATGACAAAAGCGGTCGAGGATGATAAATTTGTTGA:1 + chr2L 7596162 3' - mdg3 5251 1 66.44 CAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGTACATATGGCTGAAATTCTGAGGAGAATCCTTCCCGGCTTCACGGATTGTTTGTTATTCCTTGCATAATTGCTGATGGGAAATTTTCAAT:1 - chr3R 14688448 3' - FB 17 1 70.77 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTGTAGGCTGACTCAGAGCCAAATGGCGTTGGATTCATGG:1 - chr3R 29719329 3' - hobo 65 1 65.75 AGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGGTAGAAGGTTGAGTAAAAAAAATGGAACAGTGATAATATGTGTCTGGACAAGAAAACGAATTGCCCCTCAAGTTCTAAAGCAGCAATTG:1 - chr3L 22844393 3' + INE-1 105 1 54.11 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTACATACATTTAAAATACTATATGGATAAAAGTTGCGTGGAGTAAATATAATCAGGTCAAAGGTACAAATAACAAAATTGGGTAAACAGAAGGAAAG:1 - chr3L 3910428 3' - 297 6598 2 71.92 GTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACATATATTTGTTGGAAAGGGAATAAAAATAAAGTTGGCAGCGAAAGGAAAATAAACTAA:1 + chr2L 8615435 3' - 17.6 59 1 64.38 TTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGGTGCACTTTTTAAAAGTGTTTTTCTAACTAAATGAGAGCATGCTCGCTC:1 - chrX 7930690 3' - P-element 72 1 36.30 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGGGGCTCAAGTCGAAGTTGTTGTAATGTCGAGAGACCGAGACCAGAAAAAGCCCAACAACGAAGCTCTTTGTGAGCGAAACTAATAAAAAAC:1 - chr3L 17895881 3' - P-element 10 2 75.20 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAAGAGAAAAACATCTATGGGGAATGCAAAGCATCAATTCTGTCAACATCATAGGAACACATAAATTG:1 - chr3R 30524406 3' - roo 8676 2 73.97 CATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGAGTTTTTTTTTATTGTTTATGAGGTGGAACTGCAAATTCAAACTCAAGGAATATTCCCATGGTATTCTTTGTTCACTTTACCCTTTTGATGTACT:1 - chrX 4818470 3' - Bari1 25 1 69.86 GTGTATAGAATTTTAAAATATTTAAAAAATATATTTCCTAATATTTCCGGTATTTCCACTCGTCCATATTTTTAGGATTTTAATTTCCATATTTTCACTTTAGCTCTAAAATAGCAAGCACGTGTAGAAACGGG:1 + chr2L 2538546 3' + springer 483 1 52.99 TTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCGTAAGTCGTAAAGCCCTGAGTT:1 - 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chrX 12458883 3' - pogo 63 1 63.70 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATT:1 - chr2L 14262967 3' - P-element 81 1 30.14 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAAACCTATAAGTCTATAGGGACACGGTAGTTTAGATAAGCGGAAAAAAATCGCAAAAATAACGTCCCCGAGTTCCAATTTCCACCGTTCCGCTATCGTCGCTAATTTG:1 + chr2L 5724440 3' - 1360 14 1 35.62 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTATCTCAAGAATTCG:1 + chr2R 18056921 3' - blood 7045 2 63.01 GAAGGAACTAAACGATTCCTAGTGACTTTAAGATTAATGAATAATAAAAAAAAAAGGTCAAGCAGTCAAGTCCCGAAGTGATGGGACGCAAAGTGTTAAGTTTCATAGTTTGAAACAACTGTACAACTCCATTTGCAATTA:1 + chr3R 2846372 3' + G5A 2807 1 79.43 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTTGGTTTACTTTTCGAATGATTTTAAACGATACCCCACATCCATCCCAGTCCTGCCCAGCATCCATCCGTTTAGCTTTG:1 - chr2R 7343219 3' - flea 35 2 61.11 AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCTGTCATCTGTCTATCAGAAGCATTAACAGCTTTTACTTACTGCGCGGCAG:1 - 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jockey 23 1 71.72 GGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATAAGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATAGTTCCACAAAAGTGGCACTATGATCTCTCTCAGTCTTGGCACCCCTTTAAGTTCTAACTTTAAGTTCAGCTCCTT:1 + chr3R 29952850 3' + invader4 3081 2 80.14 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTAAGAGCACTATTCTGTTGATGAGTGCTCTTAAATATGTCGCTT:1 - chr2R 5485012 3' - 1360 22 1 70.55 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCCCCCATCCGTGCCACATGGCTTTGATAACAACACTTCTCCGGGGATAGTTGCAGGCCATTTTTGCAGTCTCAAGCAAACACTGCCAGCAACTGAT:1 - chr2L 2522847 3' - mdg1 25 2 67.81 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTCCGCACTAGACGGACAGGCAAC:1 + chr3R 5684182 3' + pogo 2057 1 54.11 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCTGTAACCAATCGAACTTCCTACGTTA:1 - chr3L 19510469 3' + pogo 2059 1 56.16 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCATACGCGATGATTGGTCCAAACTCTCCGGGCAACCCATTTCGAAATTC:1 + chr3R 25094719 3' - P-element 52 1 50.00 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATACTCAATCCCAACTACGTGCTGCAATGCCACACGAAGTGGTGATTAGAGGGGGAGGGGGTTAAGGCGTGCTGAAATCGCCTGCATTCT:1 + chr2L 11045658 3' - Burdock 6168 2 62.33 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGCCATACATTAAGCAGCAGTTTAAAGAGGCAGCGAGGAAATGGGA:1 + chr2L 18848835 3' - blood 39 2 58.90 TTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAAAAGGGAATTTTAATTGGCTGTCTGTCGT:1 + chr2R 10760503 3' - Tabor 6899 2 61.11 TACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGACTGATCTTAAAAGATATTGTAACATACTTTTTTACCCTATTAATAAT:1 + chr2L 17297049 3' - Max-element 8272 2 55.05 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTCTCTACTTTTCCTTCG:2 - chr2R 544754 3' - HMS-Beagle 6828 2 63.70 ATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGCCGCTGAAAATGTCATTACTGAAGGGCCAG:1 + chr3L 19431695 3' - Juan 41 1 67.74 TGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATA:1 - chr3L 19951182 3' - Ivk 59 1 57.53 TCTCACTCAGACTCAATGCGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCTGTAGGCTCACCTACTCCTCCT:1 + chr3L 5948075 3' + P-element 2791 1 19.18 ACTTTACTTTTTTTTACTTTACTTTACTTTTACTACTTAACATTTTTTAATTTTCTAAATTATTTAACAATAAGAAGATAAGTTTGAGATGCGTAATTGTACTAAAAAAAACCATCAAAAAACAGTGCTTATGGATGAATAAAT:1 - chr2L 13079185 3' - TART-A 13140 1 66.67 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTTAGAGGTAGTCGTTGTGGAGCATAG:1 - chr2R 15529654 3' + roo 387 2 71.23 AGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGATATAGTGATGTATATTCTTGTGTTGTTTTTTTTCGGTGCCGCTTTAGTTTGGCCGCAGTTGCTGC:1 + chr2R 10936750 3' - copia 4925 2 56.85 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAGTTAAGTGAACTTTTGCCGGCCAGGTGAATGCAGGCAGAATATCAATTGTTGATTGGTTATGTGATGGGAAAAGAT:1 - chr3L 19702727 3' - pogo 39 1 57.53 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACACCCTACCCCATAACTTCCTAATACCGGCCGTTGTCAAGGAGTACACCTTGTCAGGAGAAACGCCGCAG:1 - chr3L 25496737 3' - mdg3 5307 2 53.42 GGGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTACGGCGGTCATAAATGGGGTTTCGGATCGGTTTTTTTAGGGCCGCAGAAACGAAACACGCACACGCGAATTTCACTGTCCAGCCGGTTTTTCAATA:1 + chr3R 12547983 3' + hobo 2931 1 69.53 TATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCT:3 + chr3R 2520346 3' + Tc1-2 1603 1 59.59 ATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGTTATAATTTGGTCTTGTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTAAGCGAGAGTTTTATTTAGCAAAGATAATAATATTCGTGTTTATATAAAGGTTTTGATTTCACGGTTAAGTAA:1 - chr2L 7778467 3' - I-element 5190 1 54.79 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACGCAACACTAACATCATCCGAAAGACTGTGGCATACTTCTGGGCGTCTTTAATTATTTCGCACAGTCCCCAGAGA:1 - chr2R 11379764 3' - hobo 48 1 51.37 CACAAAACTGTCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTTTTGATATTTTTTTTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATAATTTAATACTAGGCGAGCGACGAGCAGCTCTAGCGAAACAAAAAAGTTATGTTTTTATTGTGCAAATAAAAGC:1 - chr2L 19808835 3' + INE-1 242 1 54.79 ACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACTCCAACATGTCAATAAAAGCGTATAATGCCTAAAAACAACACATATTACGTATACGCAATTTAAGAGGCAAGAACAATCGTTTTGCTTTTGTTGTT:1 + chrX 18055856 3' + 297 6953 2 69.18 TAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCA:1 + chr2R 5674744 3' - S-element 62 1 57.53 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGAATGGCTTTACTTGAAATTTTTG:1 - chr2L 15096868 3' + jockey 4948 1 55.48 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCAGGCAGCAACAATATTTACAGCTTTAGCGGCCAAAAGCACAGTGGGGCAAAAGATGTTTTAGGGAAAAAATTATTCAT:1 - chr3L 11296509 3' + P-element 2861 1 64.06 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATACATTTAAATGTATACATTTGAATGCTTCTTTTTGCGTAAAATATTTATTTATATTTTGAACATTTTCTTCAGTAATAGTATTTCGGTTTAGTATTTTTCT:2 + chr2L 13156626 3' - Max-element 8258 2 67.81 CAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAACTTTTCACGCGTTTTTTGATGTTTCTCCTTGGTACAAG:1 - 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chr2L 12766924 3' - hobo 13 1 75.34 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACA:2 + chr3R 4352135 3' - Doc 65 1 65.07 TAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGCAAATGAAAACT:1 + chrX 17508934 3' - Burdock 6177 2 57.53 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTAATCTCTAGATTCGAACTCACCTCGTAGAACATATACCCACTGAGGGCCACCTGGAAGGCATTGTAGACGACCAGGGTGCGGCGCAGCTGGAAG:1 - chr3R 22572513 3' + HMS-Beagle 223 2 69.18 GCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGTGTGTGTGTGTGCGTGCTCAGGTCCAACTGGTTGGCGTTCGTCAATGAGGTGTCTGTCTGTCGGAATTGGCCGG:1 + chr3R 5863646 3' - Doc 4488 1 54.11 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATTTACACATATTA:2 + chrX 21205087 3' - 1360 55 1 58.22 ACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATACGGATACTTATTAAATTCCGTGAATCTGCACATCCAATAACAAAATTATAGCTTCGTTGAGCCAAAGCGACTTTAAATAGTGGGGATATTTATATCTTGTTTA:1 - chr2L 3317703 3' - X-element 25 1 67.12 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATATTTCTTTTCTTGATAAGTATT:1 + chrX 8610368 3' - mdg3 5262 1 78.08 CCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATCGGCACTTAAACAAAGGGCGTTGTTCAATATATATGGACGTACAACTTGGCAG:1 - chr3R 29952687 3' - invader4 2813 2 56.93 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGAA:1 - chrX 19744417 3' + P-element 2828 1 41.91 GGCGAAGCCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTTATTAAGTGTAACGAACTCTTTTCTTCTGCTCGCTATGAGTTGCACCGGCTT:1 + chr2R 4520044 3' + rooA 7535 2 60.95 AGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATTAGGCGGGGACTATTTACGTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTTCTTTAAAGAACTTAATTTAATTGTGATAAGACAAATATGAAATTTCAGA:1 + chr2L 13109543 3' + roo 251 2 67.12 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATGCCATTAATTGAAATGATAACGATTAATGATAGCGAAAA:3 - chr3L 11887165 3' - Doc 33 1 63.70 GTGTCAACACGGTTTTATGATACGCAGATCAACAATCACTAACCTCTTGGTGCTAACTTCTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAAACATATTTATGTACAAAATACACAAGCAAACAAACAAATATAGCCGTGCAAGTGTACATAAAT:1 + chr2L 1648795 3' + Q-element 204 2 57.53 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGC:1 + chr3R 5684157 3' + pogo 2064 1 59.65 ATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGCTTTGGCTTAAGAGGTTATTCTTATGCAGATTAGGAACTTTGAAATGT:1 + chr3R 22160950 3' - copia 75 2 66.44 GCATGTATGTAGTCCCACGGAAAATAATTGCAGCCCTGAATCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTAGACGTCAGGGGGATCTTTATATATGTATGCATGCATATTTTTCCTTTGGCAGATTGTATTACATATAATAT:1 + chr2R 4801676 3' + baggins 5291 1 63.70 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCCAAGCAGCTAAAATACGGATAGGTTTGGAGAGTAAAGTTACTAGCTTTTATGACATTCTAGTATTCCAGTTCTTAAGTGATCTTCATTTACCAAAAATA:1 + chr3R 31264286 3' + jockey 4968 1 65.75 ATATTGTTGGGAATTTTTTTTACGTTTAATATTGCTTACTTCGATTTTTTTAAATTCTATAGGTTTCTCATTTATTAACTTTTTGGAAAAGTCCATCAGCTAACTTGGCTTACGTTTCCACTTAAGGGTTGACTTAGCTATTTTTT:1 - chr3R 18496413 3' + INE-1 388 1 47.95 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGTTTTACCA:1 - chr2L 5656535 3' - hobo 54 1 52.05 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTT:1 + chr3R 5767442 3' + roo 8986 2 75.34 TATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGCAAGTTGAAGGAGGTTATTCTGCCAGCAAATGTTTCATAGTTTTTCTCTGTGCAAAGTCAGCATCCAAGGATGCGAGTCCTAAGTGT:1 - chr2R 21353150 3' - Transpac 4950 2 66.44 TGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAATAAATTAAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCT:1 + chr2L 20985793 3' + F-element 4584 1 76.03 TGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAT:1 + chr2L 15057252 3' - hobo 59 1 64.66 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGAAAATAAGCCGATGCTGTTTCACGTGGCGTATGAGCAATATGTACGCCAAGATGCACCGCAACAATTTCACGTTTAAGCAGACTTTTGCTTTGTCCCT:1 + chr2R 8492877 3' - 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chr2R 7561454 3' + Circe 7051 1 58.22 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAA:1 + chrX 8610299 3' - mdg3 79 2 69.18 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGCACAACAAATAAATCAATTGGCTTTGCCTAAAACGTTTGAAATTGATT:1 + chr3R 28788783 3' - I-element 75 1 65.75 CACTGGTAAATTACAACTCCCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGAAGAGAACAAATTACGACTTTAATTTCAAATGACCAAATGTGCAACTGATTT:1 - chrX 14538496 3' - Max-element 8419 1 69.18 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAATGAATTTATTAAATAGCTTAATCAATAGCTTAAATAGCTAAAATGAGAAACGTAAA:1 + chrX 19591249 3' + roo 348 2 60.27 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGCCTTTCATATGGTGCAGATACACTTCCGCTGGCTAACGATAATGGGAATGGCTTTTAATTGATTTGG:1 + chr2L 20068083 3' + roo 354 2 58.90 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCGTCATAAAAAACCCATAAAGAAAGCTTTAGAATTGGACGGATTGCTAACCCCTCAAAATACGTTGCATACCTAAATTGCTTATTTGGGTGCCATAACATTTATCT:1 - chr2L 19565405 3' + jockey 4965 1 67.12 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGGATCGCCTATGTGTAACTATGTGTACTTTATAAATGTTCACCTGAAATGGATCTCTGTAAGGA:1 + chr3R 17747415 3' - 297 18 2 72.60 GGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTGGTTACCGCATCAAGGAACTTTAACACTGATCACATCGACTGCGCCAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAG:1 + chrX 21534512 3' - Max-element 48 2 52.74 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAATTTGCAGTTCCACAATAATAGGAATGAATAAAAGGTGTTAAATAATAGATGTTATTCACAGTAACTATATATGTACATAGAAGA:1 - chr3R 14213594 3' + mdg1 384 2 58.22 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTTAAGTT:1 - chr2L 12766991 3' - hobo 79 1 71.03 ACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAATACATGTCCCACTGACACATTCTAATCCATTTTCAAAAAATGCAAATAATTACGGTGTTTTCTCCATTAGAAA:2 + chr2R 19887629 3' + invader3 5376 2 50.68 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTACCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGAAAATAAGCCGATGCTGTTTCACGTGGCGTATGAGCAATATGTACGCCAAGATGCACCGC:1 + chr2R 8492839 3' - pogo 57 1 59.59 TAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACAAACATTTATAACTTTGAAATCATTTAGAGTTTATTTGCACCAACATGAAAGAAGCAAATAAACACTGATTGGTT:1 + chr3L 11754787 3' - Doc 129 1 48.63 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACAT:1 - chrX 16995043 3' - jockey 84 1 68.49 ATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTATGTATATAGTAATACATCAACAACGTGTAAAAGCGTTGAAATAAGGCAGCCCCGATTATGATAAGTAAATGGTTAATGCCATGGGTATGAGTCAATGTTTGTGTTTTGGCG:1 - chr3R 4570183 3' - Juan 12 1 76.71 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCGGGGTGAGTGGGGGCGTGGCAGAAAGGTGAATCA:1 + chr3L 10111877 3' + copia 5080 2 55.48 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAGCCTAGTTATGTAATGATCCTGAAAAATG:1 - chr2L 5724323 3' + 1360 3336 1 68.49 GTAGCCGGCAGACACTGCAGATTTGCGTGGCCGCTACGAATATGAGATCGCAACAATGTGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTAATATACTTTCTTTAGTGTT:1 + chrX 21668111 3' + gypsy2 6580 2 67.81 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGTCGCCACAAAACGAAACAAATAACACAGAAAAAGCATTCGAAATGGCACTA:1 - chr2R 14450096 3' + roo 408 1 81.95 TTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAAGTGCAGGGCAATAACTTGTATGTTGCTGTATGTGTGGCATATTTCCGAGCATATTTTTTGTATTTTGCAATCCTTTGGCTC:1 - chr3L 19432508 3' - HMS-Beagle 6856 2 62.33 ATTCTCAGGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGCCAAATAACAAACCATAGTTTAGAAGAGTGTTCTTCGGCCAGCGGC:1 - chr3L 21108504 3' + roo 8996 2 68.49 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGGTAGATGAAACGTATTGCCTTTTTGCGCTGAGCTGGGAGGAGACCCGATCCCGTATGTCT:1 + chrX 13808094 3' + pogo 2043 1 58.22 ACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATAAAGTTGGATCACAAAACTAAGACGAGCTGGCAAATCAATTTTGCAATCACTTAATCCCCATTTCGAGCGTATCTCTCACATTTGAGTGCCGTGCACATTTTATAGCTT:1 - chr2R 18807428 3' + BS 4816 1 78.08 GGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAAAAAAATCAAGATTGTGCAAACTTCCTGTAAAATTGTTTATTTGCTGATCGAACTTTAATTTAGAATCTTTTCATAACACATGTGATTTTATCGATAATAGCACTGGAAACTATTTTG:1 - chr3R 17401644 3' + Juan 4206 1 80.14 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTAAAAATCATTTAAGCTTGCTAACTCCACCGAGAGACTTTTGAGTCAGAAAAGTTGACCAAAAAATATGCACAGTTCACAAAA:1 - chr2L 15596892 3' + roo 9037 1 60.00 AAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTTCATATTAATTATTACTTAAAGCAAT:1 + chr3L 13365136 3' - Juan 43 1 43.84 CTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTAATGAGATTAGGTGTTTGTATCATTTGTTACTAGCTGCCAATAAT:2 + chrX 16857149 3' + pogo 2030 1 67.12 ATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCATGACCTTTCAAGATTAAAAAGTATTTAAAAACACAGCGATTTAAATGTGGGCACAACTTTTTGAAAAAACCGCCTTAGCACAGA:1 - chr3R 26965049 3' + FB 478 1 67.36 CCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGATGATGGGGTGTGCATTTTATTGGCGATCAAAAATAATTGA:1 + chr3L 3487960 3' + 297 6526 1 72.41 CCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAGTAATTAGTCCGTGTTTTGAAACTTTTATTTAGTTACATATAATAA:1 + chr3R 27443234 3' - 3S18 5841 2 67.12 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGCAGGACACTTGTGTGGATAATTTGAATTATTGTCTACGTATT:1 + chr2L 42608 3' + copia 220 1 54.62 CATACTACATACCAAAACTTTTAAAATTTTAATAAAATAATTAAAAAATTTAGGATTAAACTTCGATTTAGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAACGACGAGCACAAAATTGCCGACGATGTGAAGATCGGTGAT:1 + chr2R 24596202 3' + S-element 1427 1 72.22 GTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACATTCTGCAGTTATTAA:1 - chr3R 24301801 3' - Tabor 6888 2 52.05 GCGAGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATGTTGAATTCAGTTGAGAGCCTTGCGATTTTGTTGGTCCGTTTTACTTTTCGATTTTTTGCTTTTGCCACTTTTTTCGCCGAGTTTTGATACC:1 - chrX 3743722 3' - Tirant 8119 2 75.00 GGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTATTGTTATTATTATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTA:1 + chrX 21668932 3' - mdg1 95 2 70.55 TTCTGAGCGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTTTAATTTGCCGCTTTTCTACGAGGCTCGGGCCCTCCGCCATTCCAACCATCGCATTGTCTTACCGACCGAAGCAAAACTTTAGCATTTTCTCATTTTCGGAAAATGTGCAAAGGG:1 - chr3R 12174689 3' + Cr1a 336 1 78.08 GTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTTTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGGTGGTGCTATAAAAAGAAGTTACAATGCCAAAGAACGGAGCGAAACGGAACGCTTGCTGGCC:1 + chrX 14339472 3' - G2 101 1 62.33 TTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACATATATTTGTTGGAAAGGGAATAAAAATAAAGTTGGCAGCGAAAGGAAAATAAACTAATGATGCCAGCACCCAGATATTGGATATTAATTGCTACAAA:1 + chr2L 8615475 3' - 17.6 6946 1 73.29 GTCCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAAAATAAAAATAGCAACATAGTTTTGGGACTCTAAATTAAGTATTATTAAGTATTAATTTTTGTTCTGAAACCAAATTTTCAGCTTGCTAGCTGTAAATGAAATCCCTGTTCTTGAATA:1 + chr2L 16567027 3' - F-element 468 1 74.66 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCCAGCTTCATAGCCACTCAAGTAACCGAGTTACGTGAGG:2 + chrX 7624172 3' + roo 9031 1 62.33 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGCGTCTGCTGCTGGTGTTGCTGTCTCTGCCCACAATTATTAAATATTTAAAGCCATATACAAAACGTTTTTGGGTTTAACGTTATACT:1 - chr3L 7370429 3' + Burdock 223 2 63.70 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATTTAATTAATTTAATGGACGGCCAATAAAAGTGGGCAGTTATTAATGAGCATTAAAGTGTGAGCTGCAAATGAAAGCAGTAAATAATAAATACATCAAGGT:1 - chr3L 20042368 3' + flea 4994 2 72.60 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATCAACCCGCGTTATTATTTTAGATTGACTGACGTTCATTATACAAACATAGAACATAGAAATGCACTTTTTATTTCGAATTTTAACCTTCCA:1 + chr3L 19788233 3' - FB 31 1 63.01 TGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGAGGCTA:1 - chr3R 15035037 3' - Stalker2 7295 2 53.42 AAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTGCTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCTA:1 + chr3L 15099686 3' - G4 3810 1 56.16 CAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTGGAATGTGTTTAGCGGCCTTTGATTTGAAGCGATTTT:1 - chrX 9949514 3' + hobo 2870 1 73.85 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATTAGAACTGCTTGCCAAATAAACAAACCAACGACCTTTTCTACAGAAGTCTCTCAAAGTAGAAAGACAAAAAGAAAGATATAAACCCCAAAACAAA:1 - chr2R 11394942 3' + pogo 2082 1 67.12 TGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATTCCCCAGGCTAACACTATTCAGATTCGATCTATATTT:1 + chr2R 15892209 3' - hobo 59 1 68.50 GAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACT:1 + chr3R 9862963 3' - Stalker2 7325 2 69.18 GATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCTAACTTAACTTCCAATTAA:1 - chr3L 17710597 3' - I-element 69 1 61.64 TCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAAACAGATGGTCTGCCAATCAACTTCGAATCTTCGAATACTTCACTTCC:1 - chr3L 24089528 3' + mdg1 7387 2 66.21 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTGCGATTGTGCATTGACCTGATTCGGAAAATGGAATGGAAAATGGGTGTGAGATTGGGATTG:1 + chr2R 10960965 3' - Doc 61 1 57.14 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTCCAGTCATTTCCTTTCAATTTAATATTTATGAAATATATATATTCCATTCCGACAATATTGAAGTTCTTATC:1 + chrX 10344889 3' - roo 44 2 55.17 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACACACAGGGAATTCAATAAATATATTTGGCTTAAAACAAAAGAACGTTGTGCCCCGTTAAGCACGTAATTTT:1 + chr3R 18539924 3' + roo 389 2 70.55 GCTTTTTTTTTTATTATTTATTGTCATTTAGTTGCAATTGTTGTTATGACTTAATAATCATACGTTGAATTATCTATATCATAGTTTCAATGCAAATGAAAGAATTTTACATCAATTAGAAGTTTCTTGTGAGCTAGCAAAATAAG:2 + chrX 3476626 3' - BS 5095 2 65.07 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTCCATTTGGTGGCCGCCAG:1 - chr3L 1983486 3' + Transpac 5220 2 63.64 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATAGCTCATAAACAGGAATTAAAAGCATACCGTAAGCTTTCTAAAAAATTCGAATTGGGTTGTAAGATATATTAATATAGAGA:1 + chr3L 8704620 3' - blood 40 2 58.22 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGCAATTGTTAAACGCGTTGCCTTGCACATTCGCGAGTGCTGACTGAAAGTATGCAATGTTTATTTGCGAAATGCCCTATGCACAGTTTGACACTCACTGAGTCTGTG:1 - chr3L 8395136 3' - jockey 23 1 74.66 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACGAGTTGCGCAACCACAGCGCCCCCGCATACCAAAATGTCGAGGGAGAAATACTTTCGCTTTC:1 + chr2R 18786107 3' + roo 386 2 69.86 CGGATCCGCCGGTTGAACCACAGACATAATAACACCCACACCTCCTTCGCCATCCACGAAACAGGCAACGGACAGAAAGATTCTTTTACTTTACAAGCTTTCGCTCGATCCTCAGATGTGGTGAAGGATCATGTAATGCCATTCCT:1 - chr2L 22543999 3' + transib4 2382 1 68.49 GATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTAGAG:1 + chr3R 1048046 3' - Stalker2 7321 2 65.75 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCGGGGTAGATTTAATGCGAACTTCTGCCAGGTCATCCAGAATTTATTGTTTATTAGCACGACAGAAATGTAAAGGAAACGTCGTTGAAAGCCT:1 + chr3L 6530201 3' - hobo 28 1 47.95 GNTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTTAGAGATTCTGGGGAAATACATCTCAAGTTTTGTATGGACGGCTTCCTAACATTTGCGTGCATAGAACCCACATCTACATTAGCAATATGA:1 - chr2R 5800435 3' + HMS-Beagle 219 2 69.18 TTATGTTATTAATTATTTACTCAAGTGATTTTATACGAAGCTTGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAGGTAAAATTGAAGACTACGCTCTCATACAGTATTTAATTGACGGCATCGAC:1 - chr2L 21400697 3' - Doc3-element 64 1 45.21 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATATATATCCCTTGCGATGAAAGTCGTGAGGGGGGCGAGGG:1 - chr3R 18114868 3' + 297 6934 2 69.72 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAACCTTTATGCAGGGGCATGACTGTCA:1 + chr2L 12696259 3' + pogo 2074 1 66.20 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTTCACCATGCATCGAACTGCCACCCACTGAATGTCTTTTTCTCTCTACTGCAACGTTTTGGGAC:1 + chr3R 4739797 3' + P-element 2829 1 45.89 GAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTAACTTAAATTAGGGGCCGGTCTAATAACAATTAATTGAGGCTTTGAAGCGAAGTAA:1 - chr2R 10760407 3' + Tabor 420 2 62.33 ACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCTTTATTATTAGTCTTGCTGGTTTCAATAGATATGCCCAACACATTTGGGCCATAAAAACGTTAATAAAATATGATTTAGTGTACCAAGGCATTTAG:1 - chr2R 7024349 3' + diver 200 2 68.28 ANCTGAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAAACACTCTCTCGCATATTCGCACTTACACTGCGTTCTGAGCAAGCAGATTTTTTTTA:1 - chr3R 23346557 3' + Rt1a 4996 1 61.64 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAAGTCGTTTTGTAGCTTGTCATATGCAAAT:1 - chr2R 14921443 3' - pogo 25 1 67.61 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGTTTGTTTTGGATCAACAGCAGCGTTTTGATGGCTTTCTAAATTTATTCTTTGATCCGGGTTTCGTTTCTCACTTTCTTGCGAACTTTCTTT:1 + chr3L 12776096 3' - roo 8694 2 65.07 CCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTATTTTCTTAAAAATATAAAAAAAAATGTAAAATGATTAAATATATTGTTCAGTGTATGAAAGCAGAAGAAAGAGGAGGGAATCCGGTTCCT:1 + chr3R 12936212 3' - F-element 44 1 49.32 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCC:1 + chr3L 10068991 3' + 412 7491 2 56.12 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAAGTGCATTTCATTGCTATAATCAGAAATTGAT:1 + chr2L 11559786 3' + roo 323 2 77.40 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAGGATATAAATCAAAATCATAAATATATATATACTTCATTCATTTTTGATGAGCTTCAGTACAAACTTCTAACTTTCTGGCCACTGATCCCATCCTCAGACCTTTCT:1 + chrX 14121883 3' - Doc 18 1 56.16 CATTTTCGAACATTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGAAAGTGGGCAAAAAGACTTGAAGCCGCCCGTCAATACAAATTTGGAACAGGAACACAAAGATAACGGAAATAATTGAAAACAAAAATGATTGACAA:1 - chr3L 22747913 3' - FB 141 1 56.16 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAAAGAGAGCGGCGAGAAGAGAGCGCCAAAAGTCTTACACCGAAAGAAACGGGTCTTTTGGGGAGACATTCGAA:1 - chrX 1831187 3' + P-element 2866 1 71.23 ACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAAGGAATGCCGTTCATATACATTATTGTATTACACTATCGAAAACAATAAACCAAAATAATAAATCCCAAATAACCATTTTCACAACCAAGGAATAAATTGCAATTG:1 - chr3R 11142144 3' - Max-element 8252 2 73.97 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGTAGAATTTATCTTT:1 + chr2L 6716401 3' - hobo 60 1 57.53 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAATAAATTACACGGAACGAGCCTGAAGAGCAGCAGA:1 + chr3R 19500720 3' - jockey 97 1 54.79 AATAATAAAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCATCGATCAGCCTTAACCTCGCACGAAGAGCGATCTCAATAAACGAAATTAACACGACTTGATAGGGAGTCCAGAATTTTCAGCAGCCATGGCAACATCAATAACAACGA:1 + chr3L 25332060 3' + F-element 180 1 77.40 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAGGCACGTACTTAAAAGAAAAAAAAATAAGAAAAAAAAACTTCCCCATCAAGTGGGTCCAATAAAAGTTTTATGAGGCAGCCGCA:1 - chr2L 10128056 3' - hobo 36 1 57.64 AATAAAATAAAATCATATTAAGATGTATATGATGGTGTTTTTTCTTCAACTTGTCCAACGATCTATTGCACTTCGCAAATAATACACTTATATGCAAGGAAGTATCTATAGCGCCTCCCTTGCTCTCTCTCCCTGTTTTTTGGACT:1 - chr2R 3143561 3' - transib1 1891 1 60.27 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCATATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTACATAAGTTCTTTGTGGGCGCTCTTGTTTATGCAACACTTTTCTCCTTAAAAGATTTTTTCAA:1 + chr2R 18528794 3' + jockey 4928 1 58.90 ATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATGCCAGCTTCCTGCTAAAATCATTTT:1 + chr2L 8807958 3' + HMS-Beagle 6999 2 56.16 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATTTACAC:2 + chrX 21205081 3' - 1360 61 1 62.33 AAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACA:1 - chr2L 1870963 3' - mdg3 86 2 73.97 AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTAACATAGTAAATCCCACAATCCTTAATCATGCCGATTTGAGCTCATTAATTGAACAAAACA:1 - chr3R 30830923 3' + copia 5064 2 57.53 AATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGTGTGT:1 - chrX 20106317 3' + hopper 1350 1 60.27 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATATTGTTCGGCTTTCGCTCGCTTTCCACACAGCAG:1 + chr2R 12872987 3' + P-element 2883 2 74.49 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAAGAGTCCATATATATATTTAATGAAGCTTTTTTGGTGGTCCGTCGCATATAAATATGTTTTTATATGACACGACCC:1 + chr3L 20910112 3' - F-element 59 1 51.37 AATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATCTTAGCTAGCACAATTTGTTTACGTTATAATTTTGCAGCCGGCCAACTGTCCAATGCTTTGACATAGTCATATTCTTGCTGACGTAGCTTCTAA:1 - chr3R 443155 3' + Quasimodo 7346 2 71.92 CGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACATAGCTCATATGCAGAAGTAGATCTTCGACTTAATTTCCTAGTAAGCCCCATACATTTCTCCAAAAC:1 + chr2R 20931741 3' + blood 349 2 60.16 GGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTACGACAAGCAACATGAATGTAGTGCAAAAGCACTTCTGTAGTTTACTACTCTTTTAAATCAAAAGCAAATTAAGTGAAATG:1 + chr3R 11020964 3' - R1A1-element 4901 1 53.42 ATATGTATATATGTATATGTATATATGTATTTGTAATGTTGCATTCGGAACATGCGGACGATTGACGACTAATCTTTAGCTTTTTGATAAGCTCAAGCTCAGCGAAATTTTAAATCGGCTGAGAAATGGCGCATGTTGT:1 + chr3L 18206551 3' + G3 4507 1 73.38 GGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATATAATCGAGATGCCCTCTGAAAGCGTATAAAAAGTCAACC:1 + chr2L 10685902 3' - Quasimodo 41 2 58.22 GTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCACAAAG:1 + chr3R 15157699 3' + invader3 5418 2 55.48 ATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATGCCA:1 + chr2L 8807937 3' + HMS-Beagle 6984 2 61.43 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAAAGAGAGCGGC:1 - chrX 1831248 3' + P-element 2805 1 29.45 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGCCAAGTCGCGCGCAACACGCATGCGCAG:1 + chrX 19162726 3' - pogo 19 1 72.60 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAACGAAAACTCCAACGAAAGATAGCAAACATAAACAAAGAACTTCTGCAACGATATACTAAGCACAACACTAATTTA:1 + chr3L 23244963 3' - HMS-Beagle 19 2 67.21 CGGCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATAATACCACAGGTACTCTTCTCCCCTCGCATTTGAGCCACCACC:1 + chr2L 20253941 3' + roo 396 1 64.89 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTTATTATAAATAATGAGAATTTTATGGTTTTCACACCTGTAGCATTTTCAACAATCACTTACCTTCCTTGTAAGGCAAGTTATTTCTAAAATGAGCTGT:1 - chr3L 12729037 3' + opus 479 2 65.75 TTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGGCTTTTGGGGTTAGGCTTTAAGAGCGGACTGCAAAAGGA:1 + chrX 20379369 3' - hobo 78 1 71.23 CTATATTTATTTACAATGTTTTTATATCTTGGAGTTTAATTATCATTGCATAAAAATAGAGAATGGGTATAAAGAGGAGAAATAAATAAAAAGCCAGGAGAAGAAGCGCAGCTGGCAGGCAAAAGGATTTACATGCGTGTATCTGT:1 - chr3L 22568625 3' - I-element 5270 1 52.05 ANGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAAAAACCGCTTTCTAAAACTGTATTTTTAGATATAACAAGTAAAAAATCGGAAAAATTTACCACGGGCTACTAGCTATTTTGTAGCTATTCTCGACTGAGCGT:1 - chr2R 11371222 3' - pogo 18 1 71.23 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGAGAGATGG:1 + chr3L 17895991 3' + P-element 2809 1 33.10 CCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTCGACGACAAAGATAAACATTAAAAATTAATCAG:1 - chr3R 22812532 3' + R1A1-element 5156 1 77.24 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACATATCACAAGCTGATGCCAAAACACAAAAACCTATACCTCCGATCC:1 - chr3L 18420931 3' - jockey 4748 1 68.49 TTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGCCTTAGAAATTTGAATACTGACATAAGTGGTTCAAAAAAGCATTAAATCATGTAATATTACTTTTGATTATTATAACATTTCGA:1 + chr2R 9408771 3' + FB 676 2 58.90 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAATCGCAACTATTCTTGTTTTCTAGGCAGTGAAGCGAACCGTAATCCATACACTTTCAGCTTTT:1 - chr2R 20931592 3' - blood 23 2 65.75 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGG:1 + chrX 18193791 3' - hopper 80 1 71.92 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCTCCAATGCGACCCAACCGTTGAGCGTTGAATGAATGTGAATGCTCAAGCATACGGCAGCGCGAAGCACCAATACCAATGCTACCCGCACTCACACCAGCACACACTCG:1 + chrX 3743911 3' + Tirant 8495 2 78.08 TGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATTAACCGCAAGCGCCAGC:1 - chr2R 10666840 3' + hobo 2879 1 57.75 ACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAAGAAACATTGTCATAAAATACTAAGATCTCTCAATA:1 - chr3R 1047939 3' + Stalker2 7608 2 55.48 ATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATATAATCG:1 + chr2L 10685869 3' - Quasimodo 74 2 71.92 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGACTAAGACTTCTTGTTTTTGCCAACCACATTTTGGTTACTATTAAAAAAATC:1 + chr3R 15051333 3' + roo 9004 2 66.44 CTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTATCTATCTATCCATCTTAACAACCTACGACAAGAGTAATTACATTAATTCACGGGCACGCGCCGCTTCCTCGACTTCCGACTTTATC:1 - chr2L 7595981 3' - mdg3 5207 1 60.27 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTCATTAAAATACGCCGAAGCAGTAAAGAGGCGCCAGCTCTCACGCTATTTGCACAGTCATTAGAGCCAAGAGCT:1 - chr2R 24211518 3' + flea 4970 2 56.16 TGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCAGAAGGCATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACACTTTGAACAGTTGAATAAAGAACCTCATAAAGAGCAGAAGCTC:1 + chrY 3648927 3' + Stalker4 203 4 60.27 CGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGGCGAGCCGTTAGTTTACCTTTTTGTGAATGCCGCAAATGTGCTCGTATTTTGCGTCTAATGTGGTCCATTAAG:1 + chr3L 9994858 3' - hobo 2731 1 51.37 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTCATTGTGGCTTAATGCACAGTTCATAAAAATATATGACTGTAAAT:1 - chr2L 2622658 3' + roo 8995 2 70.55 TAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCAACTTTATTTTTTTGCCATAGGTCATTTCTCAGCCGTTCTGTGAGCAAA:1 + chr2L 12814803 3' + hobo 2874 1 65.71 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATTTACACATATTAGCAAGTTGTCTAAACTAAACTTTGCTTAATAAAAT:1 + chrX 21205122 3' - 1360 20 1 69.18 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTTCACCATGCATCGAACTGCCACCCACTGAATGTCTTTTTCTCTCTACTGCAACGTTTTGGGACGGAGGGCTGTGGGGCCCGGAG:1 + chr3R 4739818 3' + P-element 2852 1 61.11 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAATTTGCAGTTCCACAATAATAGGAATGAATAAAAGGTGTTAAATAATAGATGTTATTCACAGTAACTATATATGTACAT:1 - chr3R 14213600 3' + mdg1 378 2 54.11 TATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGGTTCGAATT:1 + chr3R 9863003 3' - Stalker2 7285 2 60.27 GGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGG:1 - chr3L 19951188 3' - Ivk 65 1 61.64 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCAACAGAAAAG:1 + chr3R 26031815 3' - pogo 39 1 59.59 GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATTGTATATACTTCAGGAAACGAATTGACTCGCATTACTCATGGAT:1 - chr2L 13976191 3' + I-element 5278 1 67.81 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATGCTTAACCCATTAACCACATTTTGGTTCAATTCTTCATACCCAGAACTTTTTAAAAACTCCCATTAATGCCACACAATACTCTAAAA:1 - chr3R 10769521 3' - 297 6607 2 68.49 GTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAGTCATTCGGAAACTTTAAAGCCCGAAAGTATGCAGCACAAAATCGTAATATC:1 + chr3R 11568672 3' + BS 5025 1 64.38 GCCAATTTTGTGCAAATGGCTGTGAAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTTGACCCTCGATGAATTATTAAATTGGTCTTGCAGCGCTTAGCTAAATGTTT:1 - chr2L 2853862 3' - baggins 5163 1 65.75 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCCAAGGAAACCCAACAAATG:1 - chr3L 12775919 3' + roo 9055 2 74.66 CCTTAGCGTCTATCACCTTTTGCAGACGTTTTGGTACAGACTGTACCAAGCTGTGGATATAATCTATTGAAACCGGCAGGAAAATATAAAAGGGGACTAGGATTTTAAGTACACACTAC:1 + chr4 812302 3' - Tc1-2 1337 1 60.50 AGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTTTTTTGTGATTGGGTGAACTTGTATATGTGCATGCGTATGTAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACA:1 + chrX 17508904 3' - Burdock 30 2 53.33 CGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATA:1 - chr2L 8852776 3' + Burdock 6324 2 67.81 TGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCACAATCGAATGGTTAAGTTAAGCATTTCAATTATAATAGGGAAAATTCTTTGACTTTTAGCTAGATTACCAAATTAA:1 - chr3R 14174667 3' - 297 6605 2 64.62 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTATTTTCCACAAAGGTACAATTCTTTAAACTTATGAAAATA:1 - chr2L 10177966 3' - mdg3 40 2 58.90 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCGTTCTACAAAGTAACTTAAGGCTCCCCAGTTTACATTGACCGAAC:1 - chr2L 20067991 3' - roo 8737 2 69.72 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTAACGGAGTCCCGCCACAAAAAATCCGGAAATTT:1 + chr3L 13546661 3' + hobo 2936 1 75.51 ACAAAAAAAAAGAATAAAAGAATGAATTCCTAAGCATTTTTAATTAGTCATGGGAATATTTTGGTGCTGATTAATTTGTATTTTATTGAGAAGAGTTAGATAAATTTATAAAATGTACATAAGTGATTCAAGATATGTATTAAATG:1 - chrX 17718000 3' + gypsy7 5005 1 62.33 GTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGGAACTCGCGCGTCAGGGCCAACGTCTGCTACGAAACTTGCCGGGGT:1 - chr2L 23372472 3' - gtwin 6932 2 73.29 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTAATCCTAATCTTTTGGAAGAGGTTTTTAAGCTA:1 - chr2L 3151004 3' + blood 7334 1 55.48 CTACTAACTAGAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGATATGGAAAGGGTGCTGGCGCAAATTGCCGCAAATC:1 + chr3R 15700408 3' - Transpac 5001 2 73.97 AAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAATCCGAGAGGTATTCATTT:1 - chr2L 1870940 3' - mdg3 63 2 58.90 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAATAATACTACGACATTTTTGATAAAGATTGCTCTATTACATTGGCAAATGATAGCCCCACATTTGGCTTCGGGTTGGCTGTCGTTACTA:1 - chr3L 11228039 3' - pogo 27 1 67.12 GTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTATACACAACTATTAATTTTTGCATTGACTTCTCTCAGTGTATTCT:1 + chr3L 13015974 3' + hobo 2861 1 71.92 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGCTCCATACAAAATCTGGCAGCTTCCTGCCGCCGCGGCCACGCACATGC:1 + chr2L 19628486 3' + hobo 2888 1 61.67 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACAAAGGGCAGGGACGTAATCAATGCGAGTTAATGACTCACACTTACTGGGAAGGGTATTGATAACATTAGTGTTTTATTTTTTTTTTTA:1 - chrX 8129109 3' - Burdock 6168 2 43.15 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGATGGTTTAATTTTTTCTTATCTAGGTTTAAAACTGGGCGTGTCCCTTGGCAGAATTATGCACCACGGAATGCAA:1 + chr3R 7655682 3' + 412 445 2 52.05 TACTAAGCTAGTGGGAATGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTTCTGGGATATCGATAGATATGATGGAACAAAATTAGAAAAAATTTAAAAAATATTCAAGTTTAGATGGGGAAAAATAACGGGTTAAATAAAAGACAATTTGAGA:1 + chr2R 25133327 3' - INE-1 532 1 72.60 GGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATATCACAAGCTGATGCCAAAACACAAAAACCTATACCTCCGATCCGAATGCAC:1 - chr3L 18420923 3' - jockey 4740 1 63.70 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTAGTGAAAGCTTGAAAGTGGAAATAAATCCTCCCAAATTTGATACCGATTCAAAAAGAAACCGCCAGATTTTGCTGTA:1 - chr3R 11162997 3' + mdg1 7416 2 55.48 TCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATCGGCACTTAAACAAAGGGCGTTGTTCAATATATATGGACGTACAAATTGGCAGTCGGTGCTCG:1 - chr3R 29952677 3' - invader4 2794 2 53.91 AAAAAATCTAAATCTAATTTGTACTTACTTTCTCTCTCTTTTCAATAGTATAATTTTCTTCCAGATCAAATGTGACTACAGCTTGATTGATTTTACTCTGACTTAAGCATTTTTTTTTTTCAGTGTATCTGTGTGCGGTACTGGTG:1 + chr3R 17473454 3' - Quasimodo 7259 2 86.99 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTTTCTCACTGCACTTGAGTCTTATTTTCTTA:1 + chrX 2821934 3' - roo 8753 2 81.51 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCC:1 - chr3R 19989243 3' - hobo 63 1 62.33 AATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATAGATACGATGTGTTGTTGCAACAGGACGTGACTTGGGTGACTAAGAATGCAGGGCAGTCGGGATTCAC:1 - chr3L 9317452 3' + HMS-Beagle 199 2 53.42 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGTGTGTGTGTGGCTTGAATATTTGAGATTTTACTCCGCTTTTTCGCGTGT:1 + chrX 6213645 3' + roo 9038 1 63.01 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAATTTGGTCACTCGCCTAAAGCAATA:1 + chr2L 15057276 3' - hobo 48 1 52.74 ATTTTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAGGATCAATTACTCTTCAACTGAATTTAAAAGGATTTGACAAGAGGTTTGAGTTCACGACAAGTGTAGTTCGATTCTTACCTGCCCAGAATC:1 - chrX 11696529 3' - TLD2_LTR 97 1 76.71 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATACTTCATCTTATATCAACAGCCACACAGAGGAAAACGCTATATTGCTCTTCTATGATAAATAATGTACTCATTCGCTTATTCACTCA:1 + chr2R 6713979 3' - 297 6601 2 72.60 TTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATGCTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCAACGCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCGAATGTGAACAAATGAGCATAAATAAAAGGCTTTCCCAT:1 + chrX 11906376 3' + HMS-Beagle 7021 2 71.23 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGATACAGATACAGATATCTATATAGTCATGTGGTTAAGGGGTTACGCATGGCGAGATATCGATTGCGAACAAAACTGTAATGCGAAAAGTGCTTCAAGGTTGATCGCTGATCGGAT:1 - chrX 17837899 3' + S-element 1709 2 79.45 CCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATATGCGACGGGGGCGTGTTCAATTTGCTTGATGGATGCCTGCCATT:2 - chr3R 20720521 3' + 1731 4552 1 67.81 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTTACCACATTAATTATTGTAATTAACATAAGGAACTACAACAATTCC:1 + chr2L 20262694 3' - roo 69 2 68.49 TTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGTACATACTTCCCCCATCCGAACCGACCTTATAGACCAGAAGTCTCTCTTTCCGGCACTTTTTGTAATACCCCGCTCTGAGTCT:1 - chr2L 9228640 3' + Burdock 6355 2 58.22 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTATTTTCCACAAAGGTACAATTCTTTAAACTTATGAAAATAGACTCTTAAG:2 - chr2L 10177956 3' - mdg3 30 2 65.75 TATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATT:1 + chr2R 4206654 3' - 1360 324 1 69.86 TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGAAGTTAAATAGAGTTTGTGGTGA:1 - chr2R 22616875 3' - BS 5075 1 64.38 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTACAAT:1 - chrX 3637755 3' + roo 358 2 51.37 TATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTACATATATATACGGGTTAAGGGCAGCGAGAGAATTACCGATCTCTTACCATCG:1 - chr3R 22676194 3' + 297 6917 2 66.44 CCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATGTATTTACCTAATTGTGAGCCATGCCAAACTAAATACTTTCTCTACTTCAATTTAGTCTTTCACAATCAGCAATTGAAGACTTC:1 + chr2L 19217736 3' + gypsy6 7768 4 58.22 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCACACAATGCAATTTAATATAGCATACTTAATAGCG:1 - chr3R 22266395 3' + roo 400 1 72.93 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTTGTATATATTTTATAGCTTTGAGCCAAACAAACAGAGCAACAAAATCAACAAGCAGGCGACGATGCTTCAAA:1 - chr3R 6472625 3' + opus 7458 2 56.16 CGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGAAACAA:1 - chr3L 13475506 3' + HMS-Beagle 6978 2 66.44 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTGCACGCCCCGTATGTTTGTACAT:1 + chr2L 15601660 3' - Doc 41 1 56.85 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATCCCGATTTTGACCGCACAGTCAATTTAATTTTAATTTACACTTCATGCATAAAAAATTAAACGCGCGTTGCCGTGTCAATTGA:1 + chr3L 19434184 3' - Doc 24 1 61.86 ATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAAGTATATACATTGTGACACTTTGACATCATCGAAAGATGCTTTTACAAAGGTATGCCCATTTCCAATATCAAACAAATTGCCCAGCAGGTGCTCACGGGCCTAAAGTTTCTGCACG:1 + chrX 15839337 3' + Stalker3T 53 1 60.27 GTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCACCTGCCGCCTTCCATTGTCCACGTCGCCACTTTGCACACCCACTTTTCGCACAAATTGCACGTTGGGCGCCACAAAAGTTGCGACCCAAGAAAAAGCAAGCGGAAAGA:1 + chr3R 6580263 3' + I-element 5026 1 76.03 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTTGTATATATTTTATAGCTTTGAGCCAAACAAACAGAGCAACAAAATCAACAAGCAGGCGA:1 - chr3R 6472637 3' + opus 443 2 63.70 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCATCAATCAAACTGTCACCAATCGCAGCCTTAGTTTAAGTTGCCTGCATCCTTCTCCTCATCCGGATCCCCTCGATGTTATGGACATCAATTAGTCAATCCCCA:1 + chrX 998268 3' + copia 237 1 72.60 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTTACCACATTAATTATTGTAATTAACATAAGGAACTACAACAATTCCATTACGTTTACGTTTAATTTCGACAAAATATTCATCGGAAC:1 + chr2L 20262735 3' - roo 28 2 67.81 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTATAACTGGCTTCCTCCATCCCCAGATGATGGCCAGTGCCACCT:1 - chr3R 9657635 3' - BS 17 1 67.12 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTATGGCAGTGGCAGCTTTTCAAAA:1 - chr3R 13231740 3' - F-element 76 1 42.47 TGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATATAATCGAGATGCCCTCTGAAAGCGTATAAAAAGTCAACCAGTGTTTTGTCA:1 + chr2L 10685914 3' - Quasimodo 26 2 67.83 TCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGCGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCTATAATAATCTTTTTATTATTACTCATATACATAAGGG:1 + chr2R 2052641 3' + opus 7416 2 76.71 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGTGTGTGTGGGCGCTGGACAATCAAAATTGATAAGGGGCGTG:1 - chr2R 14486485 3' + 297 321 2 76.71 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATGTACATATGTGTCTATCACACTGTCTACCCACTTCAAAGGTCATCGGAGCTTGTCCAAGTCGTAACAGCAAATTCATAAAGTC:1 - chr3R 22275231 3' + flea 4985 2 59.59 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCACACAATGCAA:1 - chr3R 22266419 3' + roo 9026 1 51.37 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAAATTTGATTTAAAACAGTAAAAATGGTAAATCCAATAAAACTAAGTGATAACAAACTAACCGATTAAGCAAAAAGTTGTTTTCTGGGTTTTAATTAGTT:1 + chr3R 20097731 3' + mdg3 224 2 71.23 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCCTTCG:1 + chr3R 18860885 3' + roo 355 2 54.11 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAATACATTAGAGCAGCTACACAGGATATGGAAATTCTTCGAGG:1 - chr3L 13631273 3' - hobo 79 1 70.55 GGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCATATAACTTGATTTGTTTTTATTTCCAAGTATGTTCG:1 - chr2L 22031984 3' - Tabor 6925 2 79.45 AGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCAATGCTGTGAAATGGCCTGA:2 - chrX 17690447 3' - Doc 317 1 50.68 CAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTGCAGCTACAGATACATTTCGAGGAGCAGCGGCAACAGCGGCCACACGGACTTGGGACACGCCCACGTATCGCTGGC:1 - chrX 15420156 3' - pogo 2064 1 72.97 CGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGCCACTTTTGATTTGCCTTTCTCTACTTTCTC:1 - chr2R 16328092 3' + R1A1-element 5221 1 78.77 ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTAACTCAAGCAATTCAATAACAATAACTAAGTAGAAATTCTTTTCAAA:1 - chr3R 18514336 3' - pogo 71 1 68.49 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCATCTTCTTTGAGCTCTTACATTTCAGTTCAGAATTACAATTAATTTACAATGTAGACATGCATACATTTTTCAAAGTGTAAAATGTATTATGGTCAAAATAAATTGCAAACC:1 + chr3L 16643280 3' - FB 27 1 64.38 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGCCTGATACTTAACAGCTCAAACTCCTTTAATTCCATTATGATAGATTGATTCGATTGAACAGTTCCCTCCTAATCGTTATCAGAAATCACAGCT:1 - 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Doc2-element 254 1 77.62 ATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGG:1 + chr2L 8807929 3' + HMS-Beagle 174 2 68.49 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCACTCGCAAACACACTCGCGTCCAGTGGGACCGCGCCGAAAGCGCTGGAAAATACCAAGCGACTTGCAAATAAATACCA:1 - chr3L 13450683 3' - P-element 40 1 58.22 AGCACCTTTTCAACAAACAACAATATATGCGACGGGGGCGTGTTCAATTTGCTTGATGGATGCCTGCCATTGTGGCGGGAATTTCGGTCGTGATTCCGCC:1 - chr3R 20720492 3' + 1731 315 2 79.00 GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTTGCTGTATGTGTGGCACATTTCCCAGCATATTTTTTGTATTTTGCAATCCTTTGTCTCTCTGTTTTGAGCTCTGCTC:1 - chr3L 19432489 3' - HMS-Beagle 6837 2 58.90 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATTTGTTTTGCCATTCCTTAAGCTTTACAACAACCATTCCCATGCAGCAGATATTTTCAAAGGAGTTGTGT:1 - chrX 13807972 3' - pogo 47 1 53.42 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTTTTGTGAATACATGCATACCTACCCGAATAAACATAGGCGCAGCAAGTCTGCGTTAG:1 - chr3R 24760531 3' + pogo 2040 1 63.01 TGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTTTTAACGAGCAGTTAGCATCAAAGAG:1 - chr3R 10741053 3' + 1360 3354 1 59.59 AGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTA:1 + chr2L 42568 3' + copia 164 2 80.14 AACCCATTATGCTTTCCCTTTGAAAGATTCTTTGTCATAATGTCTGCTATCATCTCATTCGTATAAGCGTACTCCTGAATACATAATGTGATGAGACAGAACCAGGACCAGGAGCAGACAAA:1 - chr3R 20719828 3' - 1731 4235 1 51.64 AGATATATAAGATATATACAAGAATATATTTAAAAAATGTTAAATCGTTATAATTGCATTTCCGAAAACATATGTTACTTGTATTTCAATAATTTCCAATAACGCCACTTAATTTAGTTTTTTTTTAAGTGTAAGAAAGAGCAAAA:1 + chrX 10438242 3' + 412 266 2 63.70 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTGAAAAGAATCCAAAAGGATTCTGGCGCGATAATTAAATGCGCACAGGAAGCGAAACTTTTTCACCCAAGTTGCGGTGTGTTGCGACTAATTG:1 + chr3R 26139545 3' - mdg1 28 2 66.21 ACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCACAATCGAATGTTTAAGTTAAGCATTTCAATTATAATAGGGAAAATTCTTTGAC:1 - chr3R 14174690 3' - 297 6644 2 60.96 AGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCGGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATGGACTTCTCCTGCACTACATCGTGCCGCAGATGAGAAAGCATAT:1 + chrX 2231587 3' + Bica 41 1 69.86 GTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAGTTACTCTTACTCATTGCTTCCGCTTCGGCAGCAGAACTGGGCTATAATTACCAAGCTGCTGCTGGCGACC:1 - chr3R 26693287 3' - Stalker2 7253 2 73.97 GCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTCATTTTTGTACTACGTACTTTTAAACACCTCTAAATGTTATTAAAAACAAACTAATAACTTT:1 - chr2L 17296961 3' + Max-element 240 2 58.22 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGCGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAATATGGAAAATAACTTAAATTACCAGATGCGGCGTGTGTA:1 + chr3R 29381631 3' - hobo 26 1 66.44 AAGTAAATAAAATAAAATAAAATAAAATGAAATGAAATGAAATAAAGTGAAATATGCGCGAGTGAAAGTGATAGTGATGGTCGGCGGGGTTTTAATTGTTGCTATTGTCAAGGGGCGTGTGCGATGTGCCCCGCCCACAAATAGTG:1 - chrX 11465166 3' - transib1 1901 1 57.53 ATAATAATTGAAGAATTGGAGATCTTTTTAGGTGTTTATAAGCCTTTGAATTCCTAATTGGAATAGCTAAAGATCCATATTATTCAAAATGTCATCTTCAAATCTCTGGCAATTATTAGGTATACATTTTTATATGGTACTTTAA:1 + chrX 8481175 3' - rover 412 1 62.07 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATACTACCACAGGTACTCTTCTCCC:1 + chr2L 20253921 3' + roo 335 2 73.13 GCGGGACAATTTACAACAATTATACCAACAAGTTACTGTTACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATA:1 - chr3R 15095974 3' - accord2 7160 1 65.75 AGACTAACAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTATGAAATGATGATTGGATGTGAGGTTCAAAAATCTACGTCATCTAGTTCAGAATAGGAGTCTTGAGCTAAAATCGGTTGTGCATTGCCAGATGA:1 + chr3R 2769083 3' - Doc3-element 4672 1 52.05 GGGGGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGTGCGGGCGATCAACGCATTTTTCGCGAACTACATCGGCATAAATTCGAATAGTTCAGAATATTGAACGAAATTTGCCTATTATCCAGCTTCGTTTAAATTTGAGCTGGAAGA:1 - chrX 22652650 3' - ZAM 7973 2 72.60 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGT:1 - chr2R 15529681 3' + roo 360 2 52.74 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGAACTACAACAACATAAACTGCATGTCGTAATACTGTTGGTGTAATAAAAAAAAGCGCAGCAGCAGCAAAAACAACACTGTAATGACCAGGAAGAGC:1 + chr3R 7109285 3' - P-element 8 2 80.82 ACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATATTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTTTATTTTATCATTTCCATACTTGCAGATTTCTGTCCAGCGATGGCGAACTTGTAGT:1 + chr2L 17738572 3' + 1360 2981 1 69.86 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATTGAGAACCTTATTGTCCCCTGTGTCCTCCACAGTGGTTAATATTTTGGAATTGTTGGAAATCCATTTC:1 - chr3R 19445712 3' + roo 9034 1 50.68 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCTGATGTCTGGAAAT:2 + chr2R 12642772 3' - pogo 27 1 67.12 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACACACAGCACGCTCTCGGTGGTACAGCCGCTGGCAGCTTAAATGCTTTTTGAATTTAAACTTATAATTAAAAA:1 - chr2L 19680972 3' - hobo 47 1 52.05 CTTCATTTCCAGCACCTTTTTAGGTCATTTATATCACCATGTCATCTTATGGCTTGTTAGTTGGGTTTGTTTGCCTGTTTGCCCAGCCAGCTTAAGGACACCA:1 - chr3L 17188885 3' + Q-element 166 1 60.19 AATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGATATTCCG:1 - chr3L 21765407 3' - gypsy 7040 2 52.05 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTGTTGGTTAAGTTAAAGCAATATTTTCCAGAACTCCCTGCGTATTGCACTATATTAGTTCAGTATTAAAGTGAAGGTTTATAAGTGATATTTGCCTGCGACTTTTCGCCATTTT:1 - chr3R 20097539 3' - mdg3 5261 1 79.45 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAATAGACTTCAAACTGCTGGCAAAGACGAACTACAAATTGAC:1 - chr3R 11072423 3' + roo 360 2 52.74 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGCATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACT:1 + chr2R 12642709 3' - pogo 49 1 74.29 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAACAAAATAGAAACAACACAAACAACACAATGATCCGAAGCAAAACGACAAAATCGCAGGGACAACAATGAACAGTCAATGGAGGGAAAAT:1 - chr2L 20939473 3' - hopper 28 1 66.44 CTCGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTATGTACATATATGAAGACTGGCACTTGAGCGG:1 - chr2R 15892158 3' + hobo 2849 1 78.62 GCGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAATCTTTCCCAAGAGGGTTTTGATGGGGTTAGGT:1 + chr3R 10736833 3' + copia 166 2 78.77 AAAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAAATACACTTTACGAGATGTAACCTCTTACACGCAC:1 + chr2L 13763548 3' - Bari1 89 1 76.03 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATTGCATTCCGCGTAGTCGTTCGCTT:1 - chr3L 10068882 3' - 412 7105 2 53.42 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTGTTATTTTTCGCGCTTTTCGCAGGGCTAATTAAGACGTTCGTCCTTGGAAACGGTAAT:1 - chr2R 17872428 3' - Tirant 18 2 70.55 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACGCGGTGAGCGA:1 - chrX 13642028 3' + P-element 2821 1 39.04 TACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTGGTCCTTGGTGGAGGCCCGTTCTCAATCCGTTGG:1 + chr2R 10666909 3' - hobo 87 1 76.03 CTTACATACACACACACACACACACACACATTTAGAGGTTGCACAACAACAATGGCACAACTTTAACGGCTG:1 - chr2R 11051063 3' + Quasimodo 36 2 73.61 TCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTC:1 - chrX 16857069 3' - pogo 75 1 69.86 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGCGTAAGCCAAAGCCAAAACCGGGCCAAAACCAAACCAAACCGAGCCAAGTCAAGCTCGAATCGAAACCAACCGACCGACCAGTTAACTGAAAACTCTGAATTATGAGC:1 - chr3R 29623174 3' - roo 8676 2 71.92 AACATACACACACACACACACACACACACACACTCATATATCGCTTAAGAAATTAGCCC:1 - chr2R 18923413 3' + accord 7099 2 71.19 GCTGCCAGGCGTTCTTCGCGTGGAGCGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAA:1 - chr3L 21765442 3' - gypsy 88 2 76.03 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTAAGCGTATTACCGGTGGAGTTCTTATATGTGATTAAATACTTGTATTTTTTCA:1 + chr3L 24039755 3' + opus 7436 2 69.86 TAATAATTTAATAGTTTAGTTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTCAAGTTTGATTCATTGATTGATTGATTGCGTGCGGAAGAAAAGAACGACGCGCATTAAAATTTCATTTGTCATTACGAAACACTTGCGGTTTTTTCAGAA:1 + chr2R 13489179 3' - Porto1 4549 1 65.75 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGCGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACACACAGCACGCTCTCGGCGGCACAGCCGCTGGCAGCTTAA:1 - chr2L 19681004 3' - hobo 63 1 68.46 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTGTTGGTTAAGTTAAAGCAATATTTTCCAGAACTCCCTGCGTATTGCACTATATTAGTTCAGTATTAAAGTGAAGGTTTATAAGTGATATTTGCC:1 - chr3R 20097558 3' - mdg3 28 2 66.44 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGTTGCATATAG:1 - chr3R 28937820 3' - jockey 4758 1 71.92 ACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACATATGTGTATGCAGATTGACATTTGACGTGCATAGAATTTGTCTAACTGTAGT:1 - chr3R 8965140 3' + HMS-Beagle 6977 2 63.01 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGGAAATCTATGGGTAGTAACCGTTGACTTTCAACTCAGCACTGTAGCTGCTCTCGCCCGCCTGATTGCGAGCCAGACAGGCGTAGACC:1 + chr2R 7343378 3' + flea 240 2 72.39 ATATAAAAAATAAAACAATAAATTTAAAAAATGTAGCTTTCAATGTTTTATACATGATCAATTTGTTTCTCTGTACTTTTGCACACATGATTACGAATGTTGCGGTGTACCACGCGGCGTATGAGTAACGCTAAAAAGGGGAACGC:1 - chr3L 2410937 3' + gypsy11 3929 1 60.27 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACGTACGTACTGTACATACTATTTACATACATACACACACCCGCACTTCCAACGCCATGTGCCAAACAGCTGATAAAGGCCATTGAAACTGAACTCGAAAGAAGGCCACTTAAAA:1 + chr3R 17079559 3' + 1360 3380 2 79.45 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGACGCAAATTCCGACCGCTCGCCTACAACAACAGCAGCAGA:1 + chr2L 851048 3' - P-element 76 1 32.17 GGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGCAAATGAAAACTCAAGT:1 + chrX 17508939 3' - Burdock 36 2 60.96 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGGTGACTGTACTGTTTGGCTAGCGTGTGTGACCGATAAGTGCTATCGGCTAATCGC:1 + chrX 11236484 3' + copia 5082 2 56.56 AAAACTCAAAAGCAATACATTGTTTAACTTTTTCTGCCAATTTTCACAATTCAAAGCACCTCTGATTTAGCTGACTTTGAAAGCGCGCCAAAAATAAACGATAACTAGTAAAAATGTTTGGTATGTTTTCTTTATGCATACATCTA:1 + chrX 22504497 3' - transib4 352 1 67.81 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTTTATACTTGAATATATGCAAACGCTTTTTTGGCTTCGATTTTCGGTTCTTTTGGCGTTCTGCAACTGTGATTTGCTGT:1 - chr2R 6713810 3' + 297 6942 2 63.70 ACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAAAGGTAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATGCCATGAAAATATTATGTGTATGCCACATGGCCAACATAAATATTCATTTTGCC:1 + chr3R 17982054 3' - jockey 4885 1 61.64 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACACACAGGGAATTCAATAAATATATTTGGCTTAAAACAAAAGAACGTTGTGCCCCG:1 + chr3R 18539908 3' + roo 9036 1 59.59 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGTGTGTGTGGGCGCTGGACAATCAAAATTGATAAGGGGCGTGCGCACAATCACAATCACA:1 - chr2R 14486467 3' + 297 341 2 63.89 ACCCATTTTAAATTATTTAAATTATTAAATTATGAATTCCTATTCTTTGAATTTAGAAACTGCTTGAAATATGATAACATAGAATGTGTTGCATACTTGGCTGCTGCATGCTGGAAAATTCATGTAGATATCATGTAGAAGACGTG:1 + chr3L 3766918 3' - Transib5 257 1 72.60 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTGGGACTTGTTTTTGTGCTCGGTGCGAAAAATGTGCGAGTTCG:1 - chrX 13484079 3' + hobo 2930 1 73.85 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCCGGAGTGGGAGG:1 - chr3R 19989232 3' - hobo 44 1 52.17 TAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAG:1 + chr2L 19841567 3' - BS 65 1 65.71 ACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGA:1 + chr3R 4352129 3' - Doc 71 1 69.18 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGAGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGGCTTTTGGGGTTAGGCTTTAAGAGCGGACTGCAAAAGGACCGGCGAACAACAAATCCGTACAAATTGAATAAGAACTCAATCTTGGCT:1 + chrX 20379418 3' - hobo 23 1 68.57 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGTCCGCAATTTGCGCGGACTGCGGTATCAGTATCTGCAAGATACTTTTGAATTAATTT:1 - chr2L 19907530 3' - hobo 42 1 56.85 ATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAGTCAATTGGCGTGCTATAAATATTTGGCTGCATACTT:1 - chr2L 19841516 3' + BS 5009 1 79.45 ACAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTAACTCAGCTAGAGTGAATGCGGACGCGCAAATTTCATAATTTTTCTTGGACATCCATATATATTAGGGAATACAATGAAAAAAAAATGAAAAAAAATTGGCA:1 - chr2L 13487311 3' - INE-1 576 1 58.22 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATGTTGAATTCAGTTGAGAGCCTTGCGATTTTGTTGGGCCGTTTTACTTTTCGATTTTTTGCTTTTGCCACTTTTTTCGCCGAGTTT:1 - chrX 3743729 3' - Tirant 9 2 73.77 CTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAACACATTCCCACAGACTCACCTTGAGTGTCCGCAATGGACGCTGAGG:1 - chr2L 5356369 3' + F-element 457 1 69.18 TCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATTTTATGTAATTCTCGATTGCTTTTATCAATTGTTTAACTCGTAACTGTTGTAAATTTAATTTGG:1 + chr2R 13985329 3' - Quasimodo 49 2 60.27 GTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACACAATTTAAAAAAAAGTTTAGTGGAAAAT:1 - chrX 7021794 3' - Doc 353 1 73.29 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGCCTTTACTACCTCTCTTTCCCGCACTCCCTCAGTGTGCTACTC:1 - chr3R 20284438 3' - P-element 76 1 32.19 TGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTACCTGTATATATAGATATATATTGTGAGGCAACCGCCGATCCATCACCGATCGATCATTCAGCAAGCAAAAAGAATTTAATTCCAGTACAATTCATTTCCGGATT:1 - chr3R 24396659 3' - I-element 5114 1 69.86 TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAA:1 + chr3R 4352121 3' - Doc 79 1 74.66 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACCGCGTTTTCACGCCACACACACACAAGTAGAGTGCGCCGCATAGGTAAAGAA:1 + chrX 7930769 3' + P-element 2818 1 38.36 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACCTCTGGTTGGCGAAAATCGGAGATTGCATTATAAAAATCCAAGACATATTGCACAGTATGCGATAAGGAAAACAGCATTAACTTAGCCAACAATGAGATCATA:1 - chr2L 9499205 3' - Transpac 4933 2 70.55 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACAGTCAAAGAATTTCAAAAAA:1 + chr2R 18922634 3' + opus 7463 2 59.59 ACTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAGAAAATGGCATCTTACATATGCATATCTCACGCCCAGAAAAACGAAGATACACCACACCGACCCACCCCACTCACATGCCATCCAAAAGGCACCCAGCATCACCCACAGTAACTACTCTT:1 + chrX 5205094 3' - transib2 2809 1 77.40 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCTGCCACTCCCTCCCATGACATCCTTCTTCGCCCGTCTAGCCCACACAGCGGGGCAAACCGCGATCCTGGCA:1 + chrX 19992679 3' + copia 220 1 56.92 CAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCAAACTTTATTTTTTTGCCATAGAGCATTTCTCAGCCGTTCTGTGAGCAAAAT:1 + chr2L 12814805 3' + hobo 2870 1 65.75 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATAGCTCATAAACAGGAATTAAAAGCATACCGTAAGCTTTCTAAAAAATTCGAATTGGGTTGTAAGATATATTAATATAGAGATTAAAGTTCCCAAA:1 + chr3L 8704634 3' - blood 7037 2 67.81 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAGGATATAAATCAAAATCATAAATATATATATACTTCATTCATTTTTGATGAGCTTCAGTACAAACTTCTAACTTTCTGGC:2 + chrX 14121857 3' - Doc 44 1 50.00 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAAGAGAAAAACATCTATGGGGAATGCAAAGCATCAATTCTGTCAACATCATA:1 - chr3R 30524421 3' - roo 27 2 67.12 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAATAGACTTCAAACTGCTGGCAAAGACGAACT:1 - chr3R 11072433 3' + roo 350 2 59.59 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAATGGCAGGCTGGCTGAACTACTACAATCTGAAGTGCCAACCGGT:1 + chr3R 22572695 3' - HMS-Beagle 19 2 72.60 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGCGTGAACAGGAAGGGATAGGAAGCGTTTTGATATGATGGATACGGGGCTGCCGTGTGTAATGGGCACTT:1 - chr3R 5767370 3' - roo 8728 2 60.96 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTT:1 + chr3R 13572075 3' + 412 7496 2 78.72 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCCGTTACGCATCTCGTTATTCTAGTGTCTTTGGGTTAGCCTAGTTATGTAATGATCCTGAAAAATGCTTTAAAAAATTATCCACAGATTTCCAGAA:1 - chr2L 5724294 3' + 1360 3366 1 46.58 ATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCTACTTTTTCGGGCACGCAATTCAAAGTCATAAAATATAAGTTTGCACTG:1 - chr2L 12324975 3' - jockey 4572 1 70.55 TAAATATATTCGTGTTCATGTCTGAACAAATACTAACATGTTACATAAGCCCCACACCCTTCTTCCAACTAATTGGATTTCTGGGAACTCACTTACAGACATGACCGCCTGCTTCAGCGTGGCCATCTTCATCGCCAGCCTGCTG:1 + chr3L 18954279 3' - roo 8671 2 73.79 ACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGTATGTTCATTATTTAGCTGTGCT:1 - chr2R 9408184 3' - FB 75 1 72.66 GCTTACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTATATAATCCGATTTTTAGGGTGGGATTAATAGA:1 + chrX 17270352 3' - 3S18 5854 2 77.40 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCCATGCTCTGCAACGGTGCGTATGATTAATTTCAGCTACAATTAATATTGCTCATACGCCAGCGAGTACG:1 + chr3R 30524566 3' + roo 361 2 51.75 GTGTGTGTGTGTTAGTATATGCTTTCACATTTGTTACATATTTCATGTATATAATTTTTCACTTTGGCTTGTTGTGCTTAGCTGTTTATTTTTCTTGCCGGTTTCTTTCTCGTCGGTTTTTGCTGGCTGTTTTTTTTATCTTTTCT:1 + chrX 1835283 3' - Quasimodo 29 2 62.33 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATTTAATTTGTGAATAATCCAAATATCTAAAATATAAAATCTAAACGGTGATTCATACACATAACTCTGTAAAAC:1 - chr3R 5002296 3' - 297 6617 2 60.27 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATTATGTGTTTAACATGTTTTAATGAACAGAAACTAACACGAGTCCGGCACAAAAGGATGCATG:1 - chr3R 12885982 3' - 412 7112 2 60.27 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTAAGGCAACGTCAGGCTGGCAGGCCACACAAAAAAAGGACAACGAGTCCTGGATGCGGGTCTCGACTCCAGGGATTCCAGTCTGGCATGCGGAGTGGAACGGACGGCAA:1 - chr2L 18848659 3' + blood 363 2 74.66 CTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTAATCTCTAGATTCGAACTCACCTCGTAGAACATATACCCACTGAGGGCCACCTGGAAGGCATTGTAGACGACCAGGGTGCGGCGCAGCTGGAAGG:2 - chr3R 22572512 3' + HMS-Beagle 7020 2 69.18 ANAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAACATAAATAATAGTTGTCGAATTTTGATGAGCTCCAGCATTTCGCCTGCTTCATTTTGGATTCCTGGCGCTTAT:1 + chr2L 18671736 3' + mdg1 373 2 53.42 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACGATAGAGAGACGATCGAGACCGGCACACAGAAATATATTGGGTCTATAAATCAAGGAATTACTG:1 + chr2R 18467231 3' + roo 352 2 55.48 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATGTTGAATTCAGTTGAGAGCCTTGCGATTTTGTTGGTCCGTTTTACTTTTCGATTTTTTGCTTTTGCCACTTTTTTCGCCGAGTTTTGATAC:1 - chrX 3743723 3' - Tirant 8134 2 67.12 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAG:1 + chrX 7624131 3' + roo 8990 2 77.40 GTGCGGCAGCGAGCGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCTATAATAATCTTTTTATTATTATTCATATACATAAGGGTGTTTCGTAAATATTTAATTAAGCAAAATCATTTCATCTATTAAAACAATTTCAC:1 + chr2R 2052696 3' + opus 468 2 65.07 CGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTGTAGTTCCAATATGAATAAAACTCTTCATAAAGAATTTAAAACTTTATTAGGACCATCAGGTCATAATGGATCTACTTTTATTTTTATTTCTTTA:1 + chrX 15815117 3' - R2-element 275 1 48.63 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTA:1 + chr3R 11873412 3' + 412 7463 2 76.98 ATGGACACACACACACACACACGCACACCCACTCACACGTACATATCCTGCGATCGACCGCATTATTGTCACAGGTGCTTCTCGTACGTTATAATACCATCGAAGCCTCTGCATTGTGCAATTGCAT:1 - chr3L 5505041 3' + accord 7027 2 69.29 AAGATGTGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGTGATTTTACACACTAAGTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGACTTTTA:1 + chr2R 18786041 3' + roo 8988 2 75.18 CAAATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGCAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACTAGTTGCG:1 + chr2R 18786053 3' + roo 9031 1 58.18 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACTGTCAAAGAATTTCAAAA:1 + chr2R 18922632 3' + opus 7461 2 56.85 GTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATAACTTAAAGATTGCTTGAGTCATCGGCAAACAGCGATAGTGCTGATAAGGAAACCGAACCAAACATATTTC:1 - chr2L 20774603 3' + McClintock 443 2 60.96 CGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTGATCACTAAAATGCAAAGCAATAGTAGCTGGTTTTTTTTGGCAAAGCCAGACACATATGAAGAGCAGTAACAAATTTCTAAAGTACAGATTG:1 - chrX 12344244 3' - F-element 17 1 81.51 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACGAACCCAGCGAAGCGGGCGAACCCCATCTCAGTTCCCATCTCGGTTCATGACATTTGACTGA:1 + chr3L 9240533 3' + 412 7537 2 76.03 AATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGGTAAGTCTATTAAAAATCTATATATTGTTCTAGGAAGACGTATTTACGTACATTTTTTTAGCCACTAAGAAGCTTTATCCAAAAT:1 - chr2L 21082094 3' + mdg3 210 2 60.27 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTAATTATGGTATAAATATAAAAGAGTTTAAGAATAGATTGAGTAGAACCCTACGGTTTTTTTTCTCTATGCACCACAACGATCCCGTTAGCAAAGCAA:1 - chr3R 18498169 3' + pogo 2082 1 40.41 ACGGGGAACCTGACAGCGTCTTTAGCTGCTCTCTCTCCGCCGTGAACCTGGTTTTGTGGCATGCAAAGTTGCTCATCCAACCACTCATTCCCTCACCCACTGAGCCACCCACTTGGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCC:1 - chr3R 27390524 3' - Rt1b 4677 1 66.67 GCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTGTTAGCTCTAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAGATTATG:1 - chrX 22398528 3' + Gypsy6A_LTR 117 1 45.21 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAAGTTCTCAGTTATCTATTTTGGCAGCTTAAAAATTGTATATACACGAAGTTGTTGTGCAACCGACCGAAGAATTTATTATTTTAAAGCTTAGTTGTTGTATACAT:1 + chr3R 27948358 3' + Juan 4201 1 75.17 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTTCGTCGTTTTGCCAAGGAGACGCTCCGCTCAAAGGGAGGAAGCGTTTAATTAAAAACATTTTGTATACACATTTG:1 - chr2L 20985754 3' - F-element 59 1 49.32 AATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGTGTAAGATGGAAGACAGAGCTCAAGGGCCAACGAACGCACTTAGCGGCCAATT:1 - chr2R 15713458 3' + G2 2744 1 67.81 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCCACAACTGCAGTGGCTTGGGAAGCCGAAGCCTTGCAAGG:1 - chr2L 16202588 3' + copia 237 1 66.38 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTCCATTTGGTGGCCGCCAGTTGGTAATGGCTGCCAAAGGGTAAATGCGAATAGAATTCGCCCATACACATTCGCATTCGCCCATTTGTTTGTTTTCCCTCATTGTTCC:1 - chr3L 1983397 3' + Transpac 5218 2 76.71 CTTAGGGTAGATAAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAATTTTTTCCTGTCACTCCTGCTCCACTTTTAACCCTTCCGA:1 - chr3L 8661747 3' - Stalker4 8 4 76.71 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCT:1 + chrX 8610344 3' - mdg3 5286 2 61.64 GGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTGCTGCAGGCTGCTCATGGCTCCCATGGAGGAGGAGGCGGAGGCGGAGGCGGAGGAGGAGGAGGAG:1 - chr3R 10072247 3' - G2 2958 1 56.67 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTATCTCAAGAATTCGCGAAGGACCAGAGATG:1 + chr2R 18056937 3' - blood 7029 2 73.97 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCA:1 - chr2R 14921480 3' - pogo 66 1 65.07 TATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACACTTACTTGCCCTCGGCTGTATGTGCTGAACAGATATTGGAAACATTCTAACAAAGCCCATCTATAACAATAAACGCTACTCTAGAAGAATATGGGGTC:1 - chr2L 3393706 3' - Stalker2 22 2 69.18 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAATTATGCATACCTCTGGTTGTGAAACTTATGTGGATTTCATTGTGAGTAAAAGTTGTTTCAGTTGCAGTTGC:1 - chr2R 8492714 3' + pogo 2057 1 54.11 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCGGGGAGAGTGGGGGCGTGGCAGAAAGGTGAATCAACAGAAACAACAATGAG:1 + chr3L 10111894 3' + copia 245 1 72.87 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGTACTTACAATGTTTTCATTCGGCAATGACTTATTATTTAGCACAC:1 + chr3L 1324340 3' - 412 7128 2 69.86 CAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAGTTGTAAGCATGTTTCATTAGAGAAGATAACATTATCCTAAGTAACATCTTATATTTCGT:1 - chr3R 26968369 3' - FB 62 1 60.27 TTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTATACACAACTATTAATTTTTGCATTGACTTCTCTCAGTGTAT:1 + chr3L 13015971 3' + hobo 2858 1 73.97 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGCGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGTTTTACCAAAGTTTCG:1 - chr2L 5656527 3' - hobo 25 1 61.60 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCCATGCTCTGCAACGGTGCGTATGATTAATTTCAGCT:1 + chr3R 30524533 3' + roo 8989 2 71.92 ATCTTTGACATCTATACCCGTTGATGGTTCAGTAAAATCATGTAGTGCTTCCAAATAGTCGTTTCTCGTATATTAAGAGAGTATACTATTCCTTAAAAAGTATCGTGAAAGGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAAAGG:1 - chr2L 15956048 3' + Stalker4 389 1 77.24 GTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGGTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 16360582 3' + hobo 2863 1 71.23 AAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATGTATATAAATATACATTTTTTGTGCTCTCTTTCCTGCGGCGGGAAAGTTTTTTAAAGCGCTAGCTGCGAC:1 - chr3R 12952848 3' + micropia 405 2 57.64 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGAGGGGGTGTGTGTTTAAATGGCGCCTGGAGAATATCGATTAAATGCTCGTTTTTTCGGTTATTTGTTGCTTGTTAATTTTAAATTCCAT:1 - chr3L 5731216 3' - 297 19 2 72.14 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTTCGTCACTAGTTGCCTACTTAATTCAAATGTGTAAAAGAACACACAAGCCATTTTTAAATACTTAAAGCCACAGAACGTCTTTAT:1 + chr2R 14767488 3' + Tirant 363 2 58.22 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATAAATAATACAAATTTAAAGTGAATTAGAAAATCCAGATCACAAATCGCTATTCTAGCTCAAGCTAACATACTCAGATCCTTTGAATATAAAAC:1 + chr3R 12569717 3' + blood 7364 2 65.07 TTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCCGCAGTTCTCTGAAGGGCACGCGATTTGGGCGTAAGATTAATTGGCTCAA:1 + chr3L 9993978 3' + hobo 2858 1 72.14 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAACTTGTGAGGAGCGCATACAAAACTAATTGAACTTGGACAGCGTGACACT:1 + chr3R 8965283 3' - HMS-Beagle 16 2 74.66 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTGATATTGGGCGATAAAGAAACCGCTAAGAAGCC:1 + chr2L 11043632 3' + roo 359 2 53.42 GAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGGGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCTTTGTTAATGAAATTTTAATCACGCTGGAAG:1 - chr3L 6014963 3' - jockey 98 1 76.71 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGAGCGACCCTCGAAAGCATTTCAAACGAAAAGCACATGACTGCGATCTCTGCCGTATTCCATTGATGGGATTTGAAGTGAGCGAACGTGACGAACT:2 + chr2L 1892403 3' - hobo 28 1 66.44 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAATACATTAGAGCAGCTACACAGGATATGGAAATTATTCGAGGCTACAACCCACTTCCTTGCACTCCGATCCTC:1 - chr3L 13631242 3' - hobo 48 1 53.42 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCACGCATATTCGTATGTGTGCGCGTGTGTGGGTGGCCAAGCGTTTGCGCTCGTTTGGGTTTTGTGGGTTGGCCATGCATTTCCGGGTTT:1 + chr2L 5656668 3' + hobo 2910 1 60.56 TTTTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTACTTACCGGTGGTCGTGTGATATTTGTGGGCAAATATAACCACAAAGAAGGACGTTGCATACTTGGCGGCGTTGACCAGATGCGGAAATGA:1 + chr3L 5919188 3' - Tc1-2 480 3 62.33 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCCAAGCAGCTAAAATACGGATAGGTTTGGAGAGTAAAGTTACTAGCTTTTATGACATTCTAGTATTCCAGTTCTTAAGTGATCT:1 + chr3R 31264270 3' + jockey 4959 1 57.55 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATATAAAATTAATGGCAATCTGGCAGCGTAAACACGACAAAATTTGTTTCTCTAGCC:1 + chr3R 18114952 3' - 297 62 2 65.07 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACGTGGTGAGCGAGAGAGCGAGCAGAGGGGCATGTATTAAAGAGGAGGATGAGGAGCAGAG:1 - chrX 13641980 3' - P-element 7 2 79.26 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGCGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATAGCCTAACACCAGGAGCAGCGTGGCGGAAAAGCGTTTTGTCC:1 - chr3R 25094630 3' + P-element 2810 1 31.94 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCCCCCATCCGTGCCACATGGCTTTGATAACAACACTTCTCCGGGGATAGTTGCAGGCCATTTTTGCAGTCTCAAGCAAACACTGCCAGCAACTTATTCACTT:1 - chr2L 2522841 3' - mdg1 7057 2 73.29 GAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATAGTCCCCGTGGAAGTAATGGTTACG:1 - chr3L 23526494 3' + 1360 3316 1 96.77 ACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGCTGGACTTTAACCTTGTATTTAGAATGTTTAATG:1 + chrX 127040 3' - hobo 86 1 75.34 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAATTATGGTGGAACAATGGCTTAAGAAATTGATACAATCCAATTGAGGTTGAAATGATACAAGAACATTTTTTATTTTAATTAAAAATTA:1 - chr3R 7305875 3' - 412 7084 2 64.38 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCAACCGATTTACACCATAACAATACACGAGTTCGTCGTTTCGGTTTCCCCCAATGTTTAATACAAATATTGTGGCATAAAATTTGG:1 - chr2L 21189691 3' + hobo 2904 1 61.64 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTTAAATATTACTATTCAACAAAAAGGTGTACGATCGAAAAATTGACTAATTTTTAGCTATTTAACTGTT:1 + chr3R 4869517 3' + I-element 5303 1 56.85 TTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGATATGTGTGCGTGTTGGGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAATTGGGACAGGATATAGGCCAGACCCTGG:1 - chr2L 10642344 3' - 1360 3252 1 77.52 GTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTAAATGGATTGGGTTTGCTAAGAAAGTGTGGGAGAAAGTGGTGTTCGGCTATGGAAAGGAAGAAAAATGTGGCAGCAGGG:1 + chrX 4071753 3' - I-element 5185 1 61.64 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTTGGAGAAGGACACTTGAGCTGGTAGGATATGAGAGCGTATTA:1 + chr3R 25929424 3' + 297 321 2 71.23 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAAT:1 + chr3R 29381593 3' - hobo 64 1 62.33 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTTTGACAGTGCGAGTTTAAATCTTCCATTGAAAGCGATTTTTAACTAAATAGAAAAGTGCGATATTATCACATTTTCCACCATGTAGCATCCACTTCCAT:1 + chr3R 18498380 3' - pogo 19 1 67.12 ATGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAAATTGT:1 + chr3L 3540270 3' - mdg3 5263 1 76.71 ATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAG:1 - chr3R 21276541 3' - BS 5065 1 63.01 AAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAAATAAATCGCATTTAAACTGGCAAAGCTTTAAAAACTGACGGAAAACTTAAGAAAATGATTTAGA:1 + chr3R 19144477 3' + Juan 4155 1 59.31 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAATGAATTTATTAAATAGCTTAATCAATAGCTTAAATAGCTAAAATGAGAAACGTAAAACTACATGTAAATAGCACTTATTTCAAAAA:1 + chrX 19591279 3' + roo 9042 1 63.70 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGAGAGATGGGAGTCTCTACTCGCTTACAAACCGCAAATACTT:1 + chr3L 17896024 3' + P-element 2841 1 55.48 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGTGTGTGTGGGCGCTGGACAATCAAAATTGATAAGGGGCGTGCGCACAATCACAATCACAGCTACTTTTAC:1 - chr2R 14486456 3' + 297 350 2 56.85 GTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTATTAATTTTCATTCAAATATTTCACCATATTCACTTGTCATACGCACACTCATTTTTTCACACTTATTTATAGCACTGTTA:1 - chr2R 19375881 3' + 297 6583 2 50.68 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGAAATTTTAT:1 + chrX 18193854 3' - hopper 17 1 69.86 AGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTTTTTACGTTGGTTCAAAAGAGTTTAAAATGCCCTTAACTATTAACGCCCAAA:1 - chr3R 18514750 3' + pogo 1679 1 64.38 CGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACTGATTTCAGCAATTTATTAAGACCTTGTGAGCTATTAAAAATTTTACTACTTGACCGCTGTATTTATAAAATGAAATTGATTATTTCAGATGCTGCTATGGCG:1 - chr2L 12447367 3' - opus 121 2 76.60 TCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACATATGTGTATGCAGATTGACATTTGACGTGCATAGAATTTGTCTAACTGTAGTTTTCCCTTTGCCAGA:1 - chr3R 8965125 3' + HMS-Beagle 196 2 52.74 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATAGCCTAACACCAGGAGCAGCGTGGCGGAAAAGCGTTTTGTCCCGGCGACAAGGCAACAACGGCAATAAGGCGCCATTTTTT:1 - chr3R 25094591 3' + P-element 2863 1 63.85 TTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATTGCGTCATTTATGCATCTCATAATTCCCCGCATAAGTCCACCAAACAACCGACTGCGAATCCTCGTTACACAGATTGGAGCCAGTTCCC:1 - chr3L 22445147 3' - Transpac 29 2 65.75 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCCAAACCGGATGTGCACAGTG:1 + chr3L 10069010 3' + 412 450 2 55.48 GTTGTTGAATCACACTCCGCATGGTGGTCGAAAGAAGGGAACGATTCTACACGATGTAGGAATCTATAGATTATCGTTTGCCAAAAGGCCAATAATCTTTAAGGCTTTTATGCCAATAATAGCCGTTAATGGCTGGGAATTT:1 + chr2L 3935683 3' - 3S18 497 1 68.31 TNGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCATTGGTAAATACTTTTTTGGTAAATACTTTTTTTTTCAGTTGGGGCCGGTGGTCGGAACTTTTGGAGTTAGGACAATT:1 - chr2L 232341 3' - Doc 46 1 44.52 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACAGTAGACTATGTAGTAGTAAATGTTACCAATTTCGTT:1 - chr2R 21244881 3' - roo 8748 2 77.40 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACAATCTGTGCGTCGATAAGTATGATGGCGGTTATGAACAGGTTCTGG:1 - chr2R 18056771 3' + blood 7352 2 59.03 GTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATATATCCTTTTCCCATTTAATTTTACCTACCTTTTAATAAATACTTTAATAAGTCATAATATGTGCGTAAGCATACTAACCAGATAAAAAACAAAAAA:1 + chrX 21638153 3' - gtwin 23 2 69.86 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGATAGAATAATTTCCCCCATGAGCGGGGGCCCTCTCAAATATTTTCCAAAGCGCATTAAGGGCGTGAAGTTTTGGTTGGACTGAATTCCCTGG:1 + chr2L 17795262 3' - hopper 22 1 66.67 TAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCGTTGTGATTGCAATACAATTATTGAAAGATTGTGATTAAAATAGATCAT:2 + chr3R 8293621 3' + Stalker2 7580 2 63.70 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTCGAAATTTGATTTGCCGATTGCCGTCACTCCACGGGCTTTGTATTCAT:1 + chr3R 18940607 3' + mdg1 7406 2 57.46 AAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGCTCATGCAACTCCTAACTATGAGTCTACAACGATTTAAGATAAGGAGCATATAAATTCTAATGAAGTCGGGACTCTCAACTTCACTAATAATAATAAGCTTACAAATAA:1 - chrX 16677446 3' - Cr1a 4199 1 48.63 CNCATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATTAATAAATTACAAGAAATTATGACACTTAACAGAAATGTAATATGGG:1 - chr2R 13492134 3' - micropia 5118 2 69.18 AATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATGTACATATGTGTCTATCACACTGTCTACCCACTTCAAAGGTCATCGGAGCTTGTCCAAGTCGTAACAGCAAATTCATAAA:1 - chr3R 22275234 3' + flea 254 2 73.04 ATTATTTTATTTTACAAGGTGACATCTTTTACAGCACAAAATAAATATTATATTTTCTTTAGATTTTCTTTTATTGAAATGTCGCTTGAAACAATCAAATATTTTCAGAGCGATAGCAACTGGAAAACTACCGTCTGCATATGTGA:1 + chr2R 14143428 3' - jockey 4921 1 70.55 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAGGAGCTGCAGACAAACTCTTATATTAAACTCAATGGCTCGGGCCCGACCCCGAATATTTCAACAGCAAAAGTATCCAGCT:1 - chr2L 8807812 3' - HMS-Beagle 6831 2 61.64 GGCTTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTTAGTTGATAACAGCTGTGACAAAATTAATTTGATTAATTGTAGTTCGTAAGATATT:1 - chr2L 23020628 3' + Transib5 2942 1 50.00 GAAGGGCATCCTGATGACTCTTCGACAAATATATTGAAGCATACGTCGACCCTAGCAATAGGACGATAAGAAGGAAGTTTTTCATCGCGGGGAAAGTGCAGTGAGGTAACAGCCCAACCTGTTACGACACCCTGCACCTATACTCG:1 - chr2R 5043759 3' + invader1 397 2 63.01 GAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATTGACGAATTCGGACCGAAAGTTTTATAAAAAAAAGAACACAAGTAGCTTTTTTATGTATTATTAAACGTTTTTATTAATTCCAATAAAGGAAGAACTAGAGCT:1 + chr2R 4103360 3' + invader1 3997 2 63.01 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATTTTTAATGCGATGAAAGGAATGCGAGCGTATTTGCGAGTGTTTATTATTATTAGACCATGAAT:1 - chr3L 16523181 3' - jockey 62 1 54.79 AGCAAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTATTACGTGGCATTAAACACAAATAATAGTATAGAGAGCTTAAAACATGTTTAGAGCTTTCTGTTA:1 - chr2L 20909078 3' - FB 153 1 56.16 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGTTATTATTAATTTATTAGTCTATCTATTTGTAGAACTACCTAAATTTTTATTTAATTTTGTTGCCCCTAT:1 + chr2L 9317783 3' - I-element 53 1 55.48 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGAGACGAGCGCAGAGTTATTGTTAT:1 + chr3R 5087169 3' + P-element 2833 1 49.32 TACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCGCTGG:1 + chr2R 5899278 3' - jockey 4554 1 66.67 ATAAAAAAATATTAACAAAATTCAATTTGACTTAAAACTAACAGTTTTTCTTATTAATGTGTTGGACAGCCTCTGCTGCGGTGCTCTGCCGGTGCGCTGCTGCTGCGCTGCCGTCGCTGTCAAGCTGACAAACAACAACAACGCGG:1 - chr2L 21828950 3' - HB 1403 1 50.00 TTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATATGCGACGGGGGCGTGTTCAATTTGCTTGATGGATGCCTGCCATTGTGGCGGGGATTT:1 - chr3R 20720508 3' + 1731 4586 1 52.00 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCTGTAACCAATCGAACTTCCTACGTTACTGCCATTAGAAATTCGAT:1 - chr3L 19510450 3' + pogo 2078 1 69.18 AGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAAACCTATAAGCCTATAGGGACACGGTAGTTTAGATAAGCGG:1 + chr2L 5724373 3' - 1360 68 1 71.64 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACTCTTGCATACACTCATACCTACCTAGGCGTCTTTTCTAGGTTATCAAACGGTAAAAACGCGGCGACACAAATACTGATACTCCCTGCCACTTTT:1 + chr2R 14486615 3' - 297 6599 2 71.63 CTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCAGCAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 5103 1 76.71 ACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACAT:1 - chr3R 24301815 3' - Tabor 63 2 58.22 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAGTTAAGTGAACTTTTGCCGGCCAGGTGAATGCAGGCAGAATATCAATTGT:2 - chr3L 19702753 3' - pogo 65 1 67.12 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTTAAGTTCAATTTGTCGGAAAATTCAGCAAAATTCTTCTGAT:1 - chr2L 12766956 3' - hobo 45 1 54.79 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCCAAAACATCATCCCGCAAAACATCAGGTACGTGAGAGCCATTCAAATGAGCGAGTG:1 + chr2R 8467822 3' - roo 8686 2 62.50 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCCCACATATCAATGTTATGAATAATATATTTTTAAAGTCAGTGGCTAGCTTGTAATAAACCAGTTTTAATCAATTTCAAAAACTTGTT:1 + chr3R 25414325 3' - pogo 31 1 65.75 GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATATGTGTATACGGGAGAATGTATTTTATTTTTATTTTATTTTTTTGCTGTTTG:1 + chrX 15675625 3' - opus 175 4 66.44 GTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGAATTGATATAATGTAATTGATAAAGTTGCCAACTTCCTGCCATATTGCATAAGTTGGCAAAGTGTGAAGCAGTGGGGTATAAGCATCTAAATATTCT:1 - chr3R 29429458 3' - F-element 187 1 66.44 GCGAAATTTCATAATTTTTCTGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGTCTGTTACATACTTCAAAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGATATAAAAATTGTATTAATTCAAAAATCGGCCAGTAAATCCAATTTATT:1 + chrX 22519237 3' - INE-1 514 1 70.55 CTTCTGTTGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAACA:1 - chrX 12131177 3' - F-element 387 1 67.81 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCTAACTTAACTTCCAATTAACAGATGCAAGACTTATTCAACCAAATTTAGCAA:1 - chr3L 17710564 3' - I-element 36 1 60.96 CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGAT:1 + chr2L 14263004 3' + P-element 2786 1 17.24 GGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTCTGTCTGCAGTTTGGAACCTTTGGTCGCGACCCCAACTCCAGGGATCTTTTCCAGCTTCTCCAGCTGCTCCAGACTGCA:1 - chrX 8669758 3' + R1A1-element 4991 1 54.11 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGGCCTTTGCTCTCTTTCCTTCTCTCCGCTTCTTCTCACT:1 - chr3L 3249979 3' + P-element 2806 1 32.41 GGGTGGGCAAATGAAATTATTTATTTTTTAGAATGAGCAAACGAAAAAAAAATAATTTTTAAGGATGGGCAAACGATAATATATTTTTAAAAGCTGTGAAATAAGTTAAATTTTTGACTTTAAAGGTGAAAATTAAATTAATTAAA:1 - chr3L 5136235 3' - FB 643 5 64.38 AAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAATTTGAATTATT:1 + chr2L 42597 3' + copia 5062 2 60.96 ACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGAAATATTGAGATTTAAATTTCATCAAAGACTGTTTATAATAATAGAAGTCTAGA:1 - chr2R 10189265 3' - Doc 71 1 65.75 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATTTTAAACCTGATGATTATTCATGGTATTTCACAAAAATGCATGCCTATACCTCTACTGCATA:1 - chrX 2781207 3' - FB 59 1 59.59 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAA:2 - chr2L 1870960 3' - mdg3 5335 2 72.60 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTCATTGTGGCTTAATGCACAGTTCATAAAAATATATGACTGTAAATGCAAGTGCAATATTTGCTGGCTGTGTAAATATTTACACAAAATTTCTTTTGATTTATT:1 - chr2L 2622600 3' + roo 9053 2 73.29 AGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAATTTCATCGTTCCCTTCGCCGC:1 + chrX 9049106 3' - P-element 353 1 14.38 GTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATG:1 - chr3R 24301826 3' - Tabor 74 2 65.75 GTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTTGCCTTAT:1 - chr3R 8293539 3' - Stalker2 70 2 63.01 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTATTTTCCAC:1 - chr2L 10177997 3' - mdg3 5323 2 64.38 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGATATGCAGATCGAAATTATATACAAATTACTTTAAT:1 + chr3R 4352179 3' - Doc 21 1 77.40 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGCTTGTTTGCCTACACTTTCCATGGCCCTGTTT:1 + chrX 22715162 3' + opus 7463 2 59.59 GTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATGTATTTACCTAATTGTGAGCCATGCCACACTAAATACTTTCTCTACTTCAATTTAGTCTTTCACAATCAG:1 + chr2L 19217722 3' + springer 344 2 50.74 TAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATGCCAGCTTCCTG:1 + chr2L 8807945 3' + HMS-Beagle 6987 2 57.24 AGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGAAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAGCTATGATGTGGGCAATAGCAACAACAACAAAGGGCAAAA:1 - chr3R 19500648 3' + jockey 4911 1 71.72 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAATTATTATTATCAAATAGACAGAGTTAAAGAAGTACACCCCAAAATGGTTATA:1 - chr3R 13201769 3' - 297 61 2 65.07 GCTAACTATCGATGGAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAATAATACTACGACATTTTTGATAAAGATTGCTCTATTACATTGGCAAATGATAGCCCCACATTTGGCTTCGGGTTGGCTGTCGTTACTAAGCATTTCATTCTA:1 - chr3L 11228025 3' - pogo 13 1 76.71 TTTAAATTTGTATTATTTTTGATGAATCGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGATATTTTGTTCTTCGATATCTTCTTGTACATCACACCGTGTATGCTGACCATGCTCAGGGATT:1 + chr3L 8508822 3' + 1360 249 1 56.64 GATATGGACGGACGGACGGACGTCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATATATATATTTTTTTTCCCCCTTTTCTTACGCCCATGTTTTTAGAGCAAAACGCGAAC:1 + chr3L 11903308 3' + micropia 427 2 54.78 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATGAAATGCGAGTATAAGAGCTAAGGTATTGTTTTGTAAAGATCGAAATATGCGTCAAATTGTTTCGATAGTAAGCTAAAATGAAGTCTAGACTTGTAATAAAAAAAGCC:1 + chr3R 20840722 3' - BS 5008 1 67.81 ACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTAT:1 - chr3L 25232695 3' + accord2 7628 2 78.62 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAACCTTCGAAGGCAGATCACTATATTTAGGCCAATAAAATCTTGAGAATTT:2 - chr3R 5684067 3' - pogo 67 1 64.38 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATTTCAAGCTTATTAATATCAGATTGACAATCCTCAAATGTAGATTAGAAGTATTCTAATGGTATGCTAATATA:1 - chr2R 8374970 3' - roo 10 2 76.03 ATCATAAATAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAAAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAACAAAAACGAAGGTAAATAAAACTATAAGCAAACACGACTAACAAGGTCTCAACTAGAAGCGTAAATC:1 + chrX 1222175 3' + I-element 310 1 58.90 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGCCTGATACTTAACAGCTCAAACTCCTTTAATTCCATTATGATAGATTGATTCGATTGAACAG:1 - chr3L 2240394 3' + roo 350 2 57.53 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCGGGACTTTCAAGACGCGCGCGAAGCTGCGGACAGTCGGATTGGAAGTGGAGCGGACTGGAATGCAAACAAGACGACGCGTGTCGA:1 + chr3L 13450826 3' + P-element 2850 1 59.59 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATTATGTGTTTAACATGTTTTAATGAACAGAAACTAACACGAGTCCGGCACAAAAGGATGCATGTTCGAATGGAAAATCGCTGATTAACTAT:1 - chr3R 12885954 3' - 412 31 2 63.01 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACTATTTCAGCTATAAACATCTGGCACGGCAACTTAAAAGTCTAACTAATCCCATTTGTTTTCCAGA:1 - chr2R 15190384 3' + pogo 2047 1 56.85 ATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCATGAAAGCCGGCATATAATTACGATAATGCCGCCTCAATTGTGGATCGTTATGCCACTCGACCAGTGCCAAATGTCCGTCCTTCTGTTTGTCCGCCAAGTCCGCCTGGCA:1 - chrX 6053268 3' + roo 8782 2 55.48 AACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGATGGGCTTCAATGCGTTTCACTAATAAGGGCACACAAAGA:1 + chr3L 21434788 3' - hobo 119 1 73.29 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAATAGACTTCAAACTGCTGGCAAAGACGAACTACAAATTGACTCTGGTACTGCGCT:1 - chr3R 11072409 3' + roo 9038 1 62.33 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGAACTTTGAACATGTTGTTGCGACCAGAAGGTTGCAGCGAACCTGTTGCTCGGTAGTAGC:1 - chr3R 2628975 3' - 1360 61 1 59.59 TTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTCCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCAAGTTCATATCAGCTAGCAACTAACCAACTGCATGCCCTCGATTAATTCGGGT:1 - chr3R 6769658 3' - mdg1 14 8 74.66 AATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATAAATAATACAAATTTAAAGTGAATTAGAAAATCCAGATCACAAATCGCTATTCTAGCT:1 + chr3R 12569682 3' + blood 7329 1 58.90 TTGGATGATCCCATAAACAATTAGGGCCACGGCGATGGTGATGCCACTGCTTAAAATGGGTCTCGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTTGGAGGTTCTGCATTCGGAGAACCTAGTAATTCCAGGAAAACGGTCAGG:1 + chr3R 19449002 3' - gypsy4 6445 1 73.97 TTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCGGCAAAACGTTTAGTTCAATTGTTTGCGGACCG:1 - chr3L 16523296 3' - Bari1 34 1 63.01 AATTAAAAGCTTTTACTTGTTTCCTAGCAATCTGAAATGGGAAAACTATCGAAATGGGAGAGGAAATGGCTATTGAACCACTGAATGTAAATAAAATCCAAATGAAAGGGGTACCATAAATGGATTCACTTTACGCTGATTGTAGT:1 + chr2R 23771231 3' - P-element 2578 1 86.30 TGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGAGTAATCTCTTAAAG:1 + chr2R 11691254 3' - P-element 105 1 13.70 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGGCGATTTCTAATCAGAGGAGCGGAAGAGTTGAAACAAGAACGGATACTAA:1 + chr2L 20322395 3' + roo 9053 2 36.30 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATGCACCGGGAGAAAATACATGTTA:1 - 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chr3L 25821743 3' + opus 7482 2 72.60 GTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCCATATATATTCCTATCAGGATCCCGAACCGAGTCGATCTGACCTAGTCCGTCCGTCTATCCGTCCGTATGGACGTCGAGATGCCTACTACTTGTCTGAAAGTTTTGGTACCTCAGTTTGCACC:1 + chr2L 1477261 3' + INE-1 28 1 73.29 ACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCATTAATATTTTATACCCATAATTGAAATTTAC:1 + chr2L 23295927 3' - micropia 4968 2 74.66 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTGGCACGCATAATGGTGTTACTATTTTGCGATAGTATATTATTTGCTTGCTATCTTTCTATCTA:1 + chr3L 10241300 3' + pogo 2050 1 56.85 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCCATGCTCTGCAACGGTGCGTATGATTAATTTCAGCTACAATTAATATTGCTCATACGCCAGCGAGTACGGGGCCGAAGCAACCGCAGCCTTGGGCTTTCTATAATT:1 + chr3R 30524603 3' + roo 395 1 76.03 CATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGTAGATAAATTTCAGTCGTCTTGCGCTTTAAAAATGGCACCCTGTTTGCATCAGCAGTAACGTT:1 + chr2L 22293975 3' - HMS-Beagle2 56 2 54.79 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCATTTAAATGCAAA:1 + chrX 12995404 3' - blood 7076 2 61.64 AGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAATATTTAAAATACTTAATAGTCATGTTCAAAGACGAATCAAAATAAGAGCTTCCGACTTTCGTTCAACAGCAAATTTTCAATTATCAGGTAAAAAGTTCAA:1 - chr3R 4869377 3' - I-element 5143 1 70.55 TGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCAGCAGCAATTAACATGCAGCCGCTGCCGACACTTGGAGCTCAGTGCTCCTCCACGTGCAGATCCCCCTCCATAGTTTTCCTCTGCATTTTCCCA:2 + chr2L 2519178 3' + jockey 481 1 64.58 AATAAGTACCATATGTTGGCTCTCTGAGCAAGAAATTCTCTGAAAGCTTTGGTTTTTACTTACAAATACCCTTTCTAGGGTTCTTATGGTGAGTTTACTCCTCTCAGAAATTTTCTTAAATAATTATTTTATTAGTTCATATTTTT:1 - chr2L 18113424 3' + Tc1 103 1 78.08 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCAGGTACATAGAAGTCAAGGCGGGAATAGATCATAAACAACTCTTCCG:1 + chr3L 22445271 3' + Transpac 265 2 62.50 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGC:1 - chr2L 2336238 3' + 297 6908 2 77.44 TGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAAGAAACATTGTCATAAAATACTAAGATCTCTCAATAAAAGATTGATCAATA:1 - chr3R 1047924 3' + Stalker2 375 2 65.75 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATGTTTGCCTAACGACAGAAATACGACACAAGACACGCTTTTTACAGAGCAAAAAGATAGCAGTAACTTTTCACTAACAGCCAAAACTTTTTGGTTTC:1 - chr2L 21687556 3' + pogo 2079 1 71.23 TCATACTTCCGGTCAGAGATGAAATAGCCAAACAAATGGAAAAACAAAATCGCTGGCAGAAAGGACTATTTTGTTGGGCCCCTTGGAGAGACGCTTACGTAAGAAGTAGTTCCTGTGCGGGATTAAATGAAATTTTAGATTCTTAA:1 + chr3R 4497661 3' + Fw2 3687 1 75.34 CAATGTATGGAAGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTTTTGCTAAAAGTGTCACACCCACTTTTGAAATTTTAGGCTGTCTGTGCGCGTTGGACTATAACGATCCAGTCTCGAGATATT:1 - chr3R 4051880 3' + 1360 3368 1 61.67 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAG:1 - chrX 19162565 3' + pogo 2055 1 52.05 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCACAATCGAATGTTTAAGTTAAGCATTTGAATTATAATAGGGAAAATTCTTTGACTTTTAGCTAGATTACCAAATTAAATGGCCACAAATGTCAGTTTACTCTGTTTTC:1 - chr3R 14174636 3' - 297 6590 2 78.77 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGAAATATTAAATGCCTGCTGTAAGCGAAAATTCTAAACCTACAAGCAAACAAACTGCGGCACAAAACAAGCAAACAGAGGGAAATGCGCCAAGCGACAA:1 + chr2L 22032098 3' + Tabor 7301 2 69.18 CTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGTGCGTGCGATCAACGCATTTTTCGCGAACTACATCGGCAA:1 - chrX 22652722 3' - ZAM 8045 2 75.34 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAGAAATCGGTGCTTGATTGCAATGTAA:1 - chr3R 26031652 3' + pogo 2077 1 69.86 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTATATCCGGAGAAT:2 + chrX 20369462 3' - roo 69 2 64.38 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTTTTAACGAGCAGTTAGCATCAAAGAGAGGGCAAGGGCGAAAAAACGCATTAA:1 - chr3R 10741027 3' + 1360 3380 2 77.40 TTACTATTTAACTCGTTTTCTCGAGAAAATGCTACCAAAACTTAAAGAAACGGTTGCTCGTGTTGTGGACAGTTGTGTGGAGTGTATTGTATTTAATTCGAAAGCTGGGAAGAAAGAAGATTTCTTGACCCCG:1 + chr2R 2004908 3' - Bica 213 1 74.44 GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATCATAAGAGGCTTTGACAACTGGTTAACTTTATTGACGGA:1 - chr3R 17068907 3' + mdg1 7381 2 69.66 ATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTGAAAATATAAATGAAACCATATTATTGATATGAGAGATTTGCAGATACAAAGATCTAAAATATATGAATTAATTTTAAGTTCAACGTTTCTATTCATGCAAATCTT:1 + chrX 21322881 3' - Juan 4041 1 73.97 AGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGG:1 + chr3R 5684156 3' + pogo 2031 1 69.18 TGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTT:2 + chrX 22715118 3' + opus 7419 2 78.08 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTGATCACTAAAATGCAAAGCAATAG:1 - chrX 12344311 3' - F-element 85 1 66.44 TAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTTAGAGGTAG:1 - chr2R 15529670 3' + roo 371 1 60.27 GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACATTCTGCAGTTATTAAACATGTAAAA:1 - chr3R 24301791 3' - Tabor 6878 2 58.90 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGTTTCTGATGTTCTAGGGTAATAGTACACCAGTTCATCAAGTTCTTTTATAAAGAGA:2 + chr3L 23871369 3' - Doc 31 1 65.07 CGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCCGAGCAGGCCAAAAGTGTAAGCGAAACATC:1 + chr2L 16554929 3' - F-element 335 1 78.77 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATTTGCAACTTCGCAGCAGCTGCGCAATTT:1 - chrX 22578013 3' - 297 51 2 72.81 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCTTCTCGTAAGTGATCTTCGGGCCAGCTATCTGGCTAGTTAAAGTTTGCTGTGTATGGTATGTACATTTA:1 - chr2L 11047918 3' + Juan 4204 1 68.49 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGACAAATATGAAAGCGTCAGGGGAATGGGGAAAACTCTGAATTTTGAATGGTTAGGGGTTGGTGGAAGTGGGCAAG:1 + chr3R 12781604 3' - pogo 44 1 55.48 AGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGG:1 - chr3L 19951188 3' - Ivk 65 1 60.96 GCCTAAGAGGAATATTGTGTTAGCTTTGTTAACTGTGTGTTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGGCTAACC:1 - 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chr3R 13231729 3' - F-element 65 1 47.26 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCTTTATTTCCACACACCCGTTAGGGTGAGGGTAATTTCTGGAATATGTTATTTCAGAGCTTACAGTCTGG:1 + chrX 22259369 3' - roo 52 2 54.11 CCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGAATATTCGTACACAAAAACCAGATTTGGTGACCCCCAAGCATAACTAA:1 + chr3R 29378043 3' + hobo 2867 1 67.12 AAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTATGTATATAGTAATACATCAACAACGTGTAAAAGCGTTGAATTAAGGCAGCCCCG:1 - chr3R 4570240 3' - Juan 69 1 61.64 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGACATCAGACTTATAAATAGAAAGTTGGCCAAGAGAGCGGCTCTCTAAAACGCATTCCTCGGCAGTCGCATGGCTTCTAGAATTCAAATCTGTAACCGTAAGCCACACTG:1 - chr3L 13477135 3' + P-element 2877 2 77.40 GCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTATA:1 - chr3R 9657675 3' - BS 11 1 58.00 TTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAAT:1 + chr3R 4352119 3' - Doc 75 1 75.00 TGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTAGACATTTGCTTATATCTGCAGAGCCATCTCATCATACAATCACC:1 - chr2L 5723869 3' - flea 4827 1 71.23 GTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAATATTTCTAGTATACCTATATACTCTGGTCTTACATGGTAGGTATTGATTGTAAATGTAAAAGGTTTATTTAAAGTTGTTATTGTTTT:1 - chr3L 26013658 3' - invader4 2687 1 62.33 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTATATCAAACATAGTTTAGAAAGTATAAACATAGAAACATAAGCAATGAGTAACCTATAAAATAATACGAAATATGATCTAAGGATGTACA:1 - chrX 19736376 3' + pogo 2073 1 64.38 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCCAAACCGGATGTGCACAGTGTCAAGCAGCAGGAGCAAAGCGTTTTTATATCCC:1 + chr3L 10069043 3' + 412 7536 2 78.08 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACGAGTTGCGCAACCACAGCGCCCCCGCATACCAAAATGTC:1 + chr2R 18786084 3' + roo 9026 1 54.11 ACCAATAGGTGGAGCTATCACCGTAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTCGTCAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATAGCCGGGACTGGTTGTTGTTATTTTCAATCGTTTTTGCTTTGTTTTCTGAG:1 + chr2R 15575228 3' + R1A1-element 286 1 63.01 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATTACTTATTCTTTGTTGGAAGTTTAAAGGATTTTGGGCTCTACCTATATTAAGTTTCTGTGTGAACTCGCTCGCTAACTTTGGGTTTGGTTCACAGGGTC:1 + chr3L 25912628 3' - blood 7034 2 69.86 ATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTT:1 - chr2R 14921497 3' - pogo 83 1 76.71 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAACCACAAAGAGCAAACACAAAAAATGCTGCCTACTT:1 + chr3R 8625255 3' - jockey 92 1 76.71 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACGATATATGTATGGGAAGAACAAGCAACATAACAATAATAAATAAACGCGAAGACCCCAGACTCAAATTTAAATTAATTGTATTATC:1 - chr3R 29997592 3' - P-element 35 1 57.53 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTATTTTCCACAAAGGTACAATTCTTTAAACTTATGAAAATAGACTCTTAAGAAGTAGCTGAGA:1 - chr2L 10177944 3' - mdg3 18 2 73.97 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAATAGGAAAGGTGGAACAAATATAATTCCTAAGCTACCAAAATGAATTGCAACGAGCAATTAATAAATGTTTTTTTAATATA:1 - chrX 21124853 3' - FB 42 1 56.85 AAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCGAATATTTAAACACGTGTATATTTATATTTACACACGCATAGTTTTTGAGGTGACAGCTAAAATGAGGTATGTTTGTACA:1 - 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hobo 2609 1 70.55 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTCTGACT:2 - chr2R 9408163 3' - FB 61 1 59.59 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATTTCAAGCTTATTAATATCAGATTGACAAT:2 - chr2R 8375013 3' - roo 53 2 62.33 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGAAGGGTAGAGGGTATGAGCACAACTCCAAACCGACA:1 - chr3R 4739721 3' - P-element 86 1 29.45 GGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTAGCCCGTCTTGGCGAACAAAACTTTTTTCGT:1 + chr2L 2675032 3' - Quasimodo 55 2 73.50 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGCATTGCTTGTTTTTTTTTCCGCTGGCCACTTGCTCGGTG:1 + chrX 3637847 3' - roo 8745 2 76.03 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTGGTCCTTGGTGGAGGCCCG:1 + chr2R 10666894 3' - hobo 63 1 79.44 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTAACTCAAGCAATTCAATAACAATAACTAAGTAGAAATTCTTTTCAAAATAATACTATACACGAATCCTTCAGTCAAACCCCCTACAATATTACTTA:1 - chr3R 18514287 3' - pogo 22 1 68.49 CATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATATATATTTCCTTTTTATATAATTAACATTTGTTTAAAACAGTAATCAGTAATTACTGTATATTTTATATATGCAAACATATACGCA:1 - chr3L 11903185 3' - micropia 34 2 58.90 TCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAT:1 + chr2L 23069854 3' - Cr1a 4152 1 75.34 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATTTCGTGTTT:1 - chr3R 7136588 3' + roo 8994 2 69.86 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTTTGTATTGTTTCCCATTTCAAATCTTCCAGAAACATTCAATG:1 + chr2L 13102948 3' - roo 77 2 72.60 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGAAATCAGACAAAACAACGACACGCATAACTGTGAGATAATATCGTCCATTGTTCCTTCCATATAAAGGATAA:1 + chr2L 15096518 3' + jockey 4936 1 55.48 TGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAATCCGA:1 - chr2L 1870953 3' - mdg3 76 2 67.81 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATTGCGTCATTTATGCATCTCATAATTCCCCGCATAAGTCCACCAAACAACCGACTGCGAATCCTCGTTACACAGATTGGAGC:1 - chr3L 22445155 3' - Transpac 37 2 60.27 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTAATCCTAATCTTTTGGAAGAGGTTTTTAAGCTAGTTTTGCTAATCAAAATGGTTGTGTGACTTATCATTAA:1 - chr2L 3150966 3' + blood 360 2 71.92 AGACTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTTGATCGGGAGTGCTAACGCTTTCGGGTT:1 + chr2L 18764879 3' + Rt1b 4898 1 77.86 GCGTGGCGTCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTGGAAGGCAGTCTCACATTACCGTGAAACCAGATAACAATTTGGCTT:1 - chr2L 7758035 3' - ZAM 7993 2 63.75 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTTGCTGTATGTGTGGCACATTTCCCAGCGTATTTTTTGTATTTTGCAATCCTTTGTCTCTCTGTTTTGAGCTCTGCTCTTTGTG:1 - chr3L 19432483 3' - HMS-Beagle 6831 2 61.64 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACACGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTAGTTGTAAAGTTTGTAAC:1 + chr3L 17252158 3' - opus 177 4 64.38 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGTGTGTGTGTGGCTTGAATATTTGAGATTTTACTCCGC:1 + chrX 6213633 3' + roo 9026 1 54.79 AACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTTGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACTCCAACATGTCAATAAAAGTGTATAATGCCTAAAAACAACA:1 + chrX 18055801 3' + 297 6898 2 72.60 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCATCTTTAATAAATATCTTATCATAAGTGATGAAATAAATCTTCAAACCCCTTACTCAATGCTAATTTAAGCTATCGCCTAGCTACATATTACCATCTGCT:1 + chr3R 11163156 3' - mdg1 21 2 71.23 TTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTTCGTCGTTTTGCCAAGGAGACGCTCCGCTCAAAGGGAGGAAGCGTTTAATTAAAAACATTTTGTATACACA:1 - chr2L 20985758 3' - F-element 63 1 50.00 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCGGGGTAGATTTAATGCGAACTTCTGCTAGGTTATTCGAGTGCTGTAAGAGCATTAATTAAAGCGTTTTATCAGCACAAAATGTTTGTTTAATTAGCTATATAATGACACTTT:1 - chr3L 6541933 3' - hobo 8 1 78.08 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTGACGGTCGTTTGCGTAGGAAGCAAGACACGCGA:1 + chr2L 14263049 3' + P-element 2838 1 50.72 TGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACATAGTTTATTTTTTCAGGTCGATCTACTTCATCCAGGCGTGCT:1 - chr2L 7905882 3' - Quasimodo 68 2 69.86 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGGTGCAAATTTTATAAAACAGTTTCAACTCGATAATCGGGTCAGGACTTGTGTCCTACATGTGTGTGTGCTCGGCTTCCTTTAGTTTTCGGAGTT:1 - chr2L 246541 3' + P-element 2862 1 69.18 CATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTATAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAAAACAATCCTGGTATGCTTTAAAAGACAAGGTGGTTTTATTTGCGTACTTAT:1 + chr2R 5446785 3' + baggins 5361 1 67.81 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTATATCCGGAGAATCGGATATGCGGAATT:1 + chrX 20369477 3' - roo 8718 2 54.11 GTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTACTCAGCCGTGATACGGGCCGAAGCGACCGAAAAAAGGGGTTACATAAGGTGGTCTG:1 + chr3R 902614 3' + R1A1-element 5275 1 59.86 GAAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTT:1 + chrX 8610316 3' + mdg3 5039 1 42.47 TGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCCGCCTACGGTTGCAGTTGCTCCGGGTGCGATGCACTAGCAAATTGCAGCTAATGGAATC:1 - chr2R 21105708 3' - Stalker2 63 2 59.31 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTTAAATGCACGATAATTTGCGATCATCTCAGCACGACTGTTGTTTTGAATGGTTTGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTAATATGTATACAATTATTTTAATCCGAG:1 + chrX 21177256 3' - Tirant 15 2 53.42 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGATTGCCGAATGCTCATTGGTAAATACTTTTTTGGCAAATCCTTTTTTTTTCAGCTGGGGCCGGTGGTCGGACCTTTTGGAGTTAGGACAATTCAAACGAGGTTGGCGTG:1 - chr2L 232324 3' - Doc 29 1 52.74 GTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCCGAGCAGGCCAAAAGTGTAAGCGAAACATCTAAAGGGGCAGCCACGTGCAAAATTCTAACATCTCTCATTTCCGATGC:1 + chr2L 16554977 3' - F-element 287 1 47.95 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTAGAATTTATTCCTGTTTAAGTTTTAAGGTAGCTAGTTGAGCTGTTTTGACTGTAAG:1 - chr3R 18539787 3' - roo 8730 2 65.75 CGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGTATTTCTGTAGGTGGCTTGGTTTGTTTATTTTGTTGTGCACTGGCCGCAATTGAGAATTTCTATGGAAAATAGGACCAGTAACAGGAACAATGGACG:1 - chrX 17508771 3' + Burdock 237 2 72.92 TATGACCAAAGCAAAGAAACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAATGAATAAGTTTAAAGGATATCTTCAATATTATCCTCAAGAGGACGTACATTTGTCTCAAACTTCGATTCTACAATACTTACCAAC:1 + chrX 21205227 3' + 1360 496 1 61.64 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAAC:2 - chr2R 8375051 3' - roo 91 2 88.36 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGAAACCTCATCGAACTGAAGACAAGGCGTTTTGACTTTTTTTTATGCTGACGCTAACTCGAAAATAATTTGATATTT:1 + chr2L 16360680 3' - hobo 45 1 50.68 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAAGAACCTAGTCGTAAATCAAAAGATTGTGGGACAGGCACGGGG:1 + chr2L 9988180 3' + hobo 2928 1 58.97 GCATAGAAACAGTCAACGAAACTATTTAAAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATGAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAATTCATATATTTATTTCATTTATGTAGCATTTAATCATTAATCCTTTGTTACAA:1 - chr3L 14425864 3' + Porto1 4408 1 62.33 TTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATAATACAATCAGATTGAAATCGAAGCAGGGCACC:1 - chr2L 8852744 3' + Burdock 6355 2 55.48 TCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATACAAATATATACAAACGGCACACTCAACTAATTACGAGGCAGG:1 + chr3L 5731345 3' + 297 6907 2 74.66 CAAAGCTTTGTCCCGACACGGTTCAGTCGCCATCATGCGTTAAAATAGTGAGAGCGTGCCTTTGCATTTGACTCCTACTTTTCAAGCGGATGTTCGGTTATTAAAACACAGAGTTCATTTCGGACCGCACATCAAATATTACAGGT:1 + chr2R 4802725 3' + mariner2 100 1 78.77 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCCAAGCCAATTAATTAATAGTGTAATATTCTTCAGAAATTTAACAAGTCGACTGCCAA:1 - chr2R 7027804 3' + roo 345 2 59.59 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTGTCATCATATGTCTAACACTCGTCTGACTCGTTGGCCCGCCCCTGGGTTTATCCATCCATCCCTCAATCACTCTTCTCTCACC:1 + chr2L 16202726 3' - copia 28 2 61.59 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGACATCAGACTTATAAATAGAAAGTTGGCCAAGAGAGCGGCTCTCTAAAACGCATTCCTCGGCA:1 - chr3L 13477181 3' - P-element 56 1 47.26 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCCACCCCGACCCACATTTTTTTTTGGCATTCACATCCCCCGCCACTCACCAGTGGCAGCAAAAAAAAACCGGCAAAAAGCAAC:1 + chr2L 17574487 3' - hopper 35 1 58.90 CTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAAGGAATGCCGTTCATATACATTATTGTATTACACTATCGAAAACAATAAACCAAAATAATAAATCCCAAATAACCATTTTCACAACCAAGGAATAAATTGCAATTG:1 - chr3R 11142144 3' - Max-element 16 2 74.48 GTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGAAACAAATATGAGTTTC:1 - chr3L 13475495 3' + HMS-Beagle 6989 2 58.90 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGAGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGCTCTCACTCTCTCGTGCTCGTTTCTTCCATTTTTTTTCGCACGCCCAAGGAGCGAGGCAG:1 + chr2R 17348492 3' - hobo 56 1 55.63 GCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCAAATAAAACGATGTTTTTATTATTATATGCATATGTTGACATTTACAAAGCCAACAGAAAGCG:1 - chr3L 22084452 3' - 1360 108 1 56.85 CTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATGCCAGCTTCCTGCTAAAATCATTTTCAGATTGCCAGCCAGGCAGTG:1 + chr2L 8807979 3' + HMS-Beagle 224 2 70.55 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGCGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGCACGTACTTAAAAGAAAAAAAAATAAGAAAAAAAAACTTCCCCATCAAGTGGGTCCAATAAAAG:1 - chr2L 10128074 3' - hobo 56 1 52.74 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGTGTGTGTGTGGCTTGAATATTTGAGATTTTACTCCGCTTTTTCGC:1 + chrX 6213641 3' + roo 9035 1 60.69 GATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATTTTGTACAGAGTTTCTCAAATTATACTTTCTATTTTGTACAGATAAGTTTTCACATATAATTATTTTTATCACATATCTCAAATTTTTATCTGATTAACGTTTATAAATA:1 + chr2R 5128104 3' - mdg3 5035 1 54.11 AATTTGATTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTATCTTTTTCTTAAACAATAGCACTCAATTAAAATCGCGTCTAAACCCCACAAAAATCTAGTCGCAACTCATTCG:1 + chr4 853301 3' - 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hobo 14 1 76.03 AGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTATATAATCCGATTTTTAGGGTGGGATTAATAGATGATTAGTAATCTAAAATGAGCAAATGGCTGCATTAATA:1 + chrX 17270391 3' - 3S18 50 2 52.05 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGACCTAAACCGGATCGAATGGATATA:1 + chr2L 246642 3' - P-element 35 1 35.63 AGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCAAAGCTCCTCCACGGCTTCCAGATCTTTGACCTGCCTGCAAAGATTTCCATTTGCGATAGCTTTATTGGGCAAGAAGTAAATGAGAACGGCTGTTTGGAAGCTGGG:1 - chr3L 806579 3' + Max-element 8265 2 69.57 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGAACACTAGGCAATAGCTGAGCGATCTGGCAGCCTGG:1 - chrX 19744383 3' + P-element 2872 1 72.22 ACCTCGGATGGCATGCACGATTGATATGCCTCATACAGCTCATGCCTGTACATAAACATGCACCGCTCACGCTTCCTCTCTTTCTTTCCATT:1 - chrX 2498735 3' - Rt1a 5010 1 79.35 AATAATCATAATAATAATAATATATTAAATACATAACTAATCATTATAATCAAGAATTGTCTTTGCGTGAACTTTTACGGAATCATAATAGAATTGCATTCTGTTATCATATTTTTCACAATAGTGATGGTCAAAAAACCCCAA:1 + chr2R 12982458 3' + mdg1 7075 11 64.58 AGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTTGTATATATTTTATAGCTTTGAGCCAAACAAACAGAGCAACAAAATCAACAAGCAGGCGACGATGCTTCAAAAGCCAAAGGCCCCTTTTATTACCTTTGTCAA:1 - 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HMS-Beagle 54 2 55.48 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGC:1 - chr3R 30524479 3' - roo 82 2 78.32 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATCTGTTGTACTTTTGAATGTCAAGATAAAGAACTCCAGAACTACCAGATCTGATTGTGGTTGTAATTATA:1 - chr3R 12540473 3' + roo 353 2 54.79 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTGGCACGCATAATGGTGTTACTATTTTGCGATAGTATATTATTTGCTTGCTATCTTTCTATCTATCTTTCACTTCTTTTTTAAT:1 + chr3L 10241320 3' + pogo 2070 1 62.33 TTTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGGCAGTCAATTATCAATCAAATTATCAAATCAACGTGATGGTACATGCA:1 + chr3L 24916722 3' - Porto1 151 1 38.36 TTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGCTGCACTGATCTGGGATACTCAGATGATTCTCGGAGACTATTGGATCTTGTTTACCACTCGGCCAAAGAGCGATTCCGGCTTGTCTTCGAAATTGCGGG:1 + chr2R 17781013 3' + S-element 1700 1 65.07 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAGTATCATTAAAAACAAGCAAACGCTGCTAGAATTTAATGAAACTAAAGTCTGCTTAGTCTTTTATTTAATAGGTT:2 + chr2R 12416967 3' - pogo 42 1 56.85 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACCTCTGGTTGGCGAAAATCGGAGATTGCATTATAAAAATCCAAGACATATTGCACAGTATGCGATAAGGAAAACAGCATTAACTTAGCCAACAATGAGATCATATTGAT:1 - chr2L 9499200 3' - Transpac 9 2 73.97 TTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTATGCCATATATACAAACTTGAGCACTTAATAGTTATAAAATACAAAGACTTCTATATCCATTGTTAAAACTTTTATTCACGAATAATTATCAGTTGATACTGAAAAAT:1 - chrX 13558129 3' + mdg3 5487 2 77.40 TCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCACAGTCAAAAGTTTCCTAGCGTTCGTTAGCTTCTTCTCGCTCTTGCCTTCCCTTTTTATTC:1 - chr3R 17777434 3' + Cr1a 293 1 68.24 GAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGTTCACTTCGCTCCCCTCCAGCTTTTCCAAATCCCATCCCCC:1 - chrX 13496970 3' + F-element 4255 1 71.92 CCTTCGGCTACAGAACCTAGATATGGCGGCAATTCAAACCGATTTGGTTTACTTGCGCATCTCACAGCTTTATAAGTTCTGAAAATATCCAGACCTTTCAAATCTTGCCAGTATTGATTTACACTCTTCAATAAAATCCTGTAATT:1 - chr3R 25303790 3' + X-element 496 1 52.05 AGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATAGATATACACTCTTAATTGATATACGGATTTGAAAACTTTGTTAATTAAGTTCACTTTAGTTTGTGTTTCACTTATGTTCTTGTCT:1 + chr3R 26693469 3' + Stalker2 7615 2 58.22 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTACACACACAGACACACACACACACACACACACACACACACACACATACACCCATTCTACAAACGAACTGTATGCGTGGCC:1 + chr2R 21453622 3' + hobo 2908 1 44.12 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTCAGCAATGCTGTCTAGTCTAGAAATTAGGATCAACACATCATTCCTCAGCTATTTATTGTCATTTATTTATTGCCAACTATAAATTGTATGCCATAA:2 - chr3L 13380398 3' - hobo 24 1 69.18 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTTACCTTCGCATTTTTTCCTTCTTTTTGATTAAATTCTCAAGATTGCAATTGATTTTAGTTATGGTCCTATATTATCCTATTATCCTATGTCGTTTTTGATGTTAA:2 + chr3L 18421469 3' - hobo 15 1 71.23 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACTATTTCAGCTATAAACATCTGGCACGGCAACTTAAAAGTCTAACTAATCCCATTTGTTTTCCAGATCTTAGAAACTTACCAATAGCATTTGTGCGGAAA:1 - chr2R 15190350 3' + pogo 2081 1 73.29 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTTTGACAGTGCGAGTTTAAATCTTCCATTGAAAGCGATTTTTAACTAAATAGAAAAGTGCGATATTATCACATTTTCCACCATGTAGCATC:1 + chr3R 18498371 3' - pogo 28 1 60.96 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCAGCGTAGCACAGAGGCGTCAGTGGAG:1 + chr3R 13572136 3' + 412 7505 2 58.90 GCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGTGCGTGCGATCAACGCATTTTTCGCGAACTACATCGGCAAAAATTCGAATAGTTCAGAA:1 - chrX 22652703 3' - ZAM 63 2 62.07 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAAGAGTCCATATATATATTTAATGAAGCTTTTTTGGTGGTCCGTCGCATATAAATATGTTTTTATATGACACGACCCACAAGCAAATTGTTATTCAATTTATT:1 + chr3L 20910138 3' - F-element 33 1 62.33 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGTGTGTGTGTGGCTTGAATATTTGAGATTTTACTCCGCTTTTTCGCGT:1 + chrX 6213643 3' + roo 9036 1 61.64 TGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAGTTGTAAGCATGTTTCATTAGAGAAGATAACATTATCCTAAGTAACATCTTATATT:1 - chr3R 26968373 3' - FB 66 1 63.01 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTTCGGCCATCCGGCGCGTCGTGCTTTTCTATTTGTATTTGTATTTATTTGCCACTCTTTTCTATATTTTTTTTTTAACTTGCCTCTTTGCCTCCCCGAATTTGCTGTCTCCCT:1 - chr3R 13571959 3' - 412 7 2 78.08 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCCTACATCATTTTCGTGCGTTGTGTTCGTGTGCGAGTGTGAGCGTGTGTATGTGTATGTGTATGTATGTCTGTGTGT:1 - chr2R 16710257 3' - hobo 45 1 53.42 GGAAGTGAGTGCGACCTGGCCTCACATGCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTTTTTCTGTATCTTAACGTTTTACTCATATCACACTACCTGATATCACC:1 + chr3R 26499435 3' + Rt1b 4941 1 67.12 TTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCAGATGAGAGTCGGAAGATAATGCACAAAGGTTGCCAAGG:1 + chrX 10501340 3' - F-element 90 1 71.43 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAATTATGGTGGAACAATGGCTTAAGAAATTGATACAATCCAATTGAGGTTGAAATGATACAAGAACATTTTTTATTTTAATTAAAAAT:1 - chr3R 7305877 3' - 412 30 2 64.34 GGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTGTATCTTATTTTCACAGCTATCAAAATACACAATG:1 - chrX 18561080 3' + copia 171 2 75.34 AGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAATAAAGCTATTTTCAAATCAAAATCTATTTT:1 - chr3L 19951144 3' - Ivk 21 1 71.23 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGGTGGGCAAATGTTGAACCTCTGGCAGCCACCCACTTGGGTTGCATAAAATTGTATGTGCTTTCTATTTAACACTTTTTATTTTTTTTTTGGTGG:1 - chrX 8056710 3' - opus 7023 2 68.97 ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGTGCAACTGCTGCAAACTCTGTCTCCACTTGCAAATCTGCTGGTTTGTTATTTTAATTTGATGGCAGAGTTGTTCGGATAGTTTCTAATTATTTATGCACAAAAGAT:1 + chr2L 7906032 3' + Quasimodo 7359 2 78.08 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCAGACTGAGCTGTGAGCACTCAATCATTTTATTTACTTATGCACCAGTGCACGCAGATAAACTGAATCTT:1 - chr2L 5732719 3' - hobo 52 1 52.05 TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGAAATATTAAATGCCTGCTGTAAGCGAAAATTCTAAACCTACAAGCAAACAAACTGCGGCACAAAACACGCAAACAGAGGG:1 + chr2L 22032080 3' + Tabor 451 2 58.27 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGGGATGTTCGAATTGAGTTGAATTGAATGTTGAAT:1 + chr2L 8909864 3' - roo 87 2 77.40 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCGGGGTAGATTTAATGCGAACTTCTGCTAGGTTATTCGAGTGCTGTAAGAGCATTAATTAAAGCGTTTTATCAGCACAAAATGTT:1 - chr3L 6541961 3' - hobo 36 1 60.27 GTCATGTGCGGGTGGCTGTACCCAAGAACAGCAAAGTGAATTCATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCCAAGTCTATTATATCAACTACAAAATGTTGGAATTTGTGGAAATGCTTAACTAATTGGGAACACCCGATAA:1 + chr3R 22869702 3' + Stalker3T 246 1 68.49 GCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCT:1 - chr2R 544803 3' - HMS-Beagle 6877 2 73.97 CAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATGCAGTGTAAAATCCGAAATGCAAAA:1 + chr3R 24301951 3' + Tabor 483 2 82.26 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTGGTCCTTGGTGGAGGCCCGTTCTCAATCCGTTGGCGAGGACCAAGTGCATCTTGTTACGCCGCACCA:1 + chr2R 10666942 3' - 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chr2R 17872459 3' - Tirant 8121 2 68.47 AATATAATTATACATTATTTATGAAGTTCATGTGGTTATTTGAATCACAAATTTACTGTTGTGCGATGCAATGTCTATAAATATTTTGGTTTTATTATTAATTAAAACTAATTTATTTATGATATGGTATAAATGTGAACCATCTA:1 - chr3L 9266744 3' - S-element 1610 2 78.08 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTGGAGTTATACAAATGGGTCCTCGTGTGTGTGTCCGAGTT:1 + chr2R 17937193 3' + 297 6901 2 74.66 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTTTCATTTATTCGTTTGATTGGTCAATATCAGCCAACTGATTAGATCTCCCTTGATTA:1 - chr2L 11559710 3' - roo 8726 2 61.64 TTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAAAGTAATTTATAATACTTTTAATTTCAATTGGAAACCCAATTTTCAGCTACTTTTGAGAGCACCTAAAAAAATAAAAAAGCCAAATAAATCAGATTAAAAACTCCT:1 + chrX 10698507 3' - mdg1 7393 2 73.29 AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCAATAGGTCCCAATAAAACTTAAAGTTACTTCCAATTTATAAGGCATTC:1 + chrX 16538185 3' - mdg3 5322 2 65.75 CAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTAATCGTAATTAATGAACATGTAGGTATAGGTAGGATAGTAGGTTCCTTTAACTTATTTGAAAAAGAAGCAAATACATAGATTTGTATCGGTACTACCAGCAGA:1 - 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accord 24 2 66.44 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTGAAAAGAATCCAAAAGGATTCTGGCGCGATAATTAAATGCGCACAGGAAGCGAAACTTTTTCACCCAAGTTGCGGTGTGTTGCGACTAATTGCATTAAA:1 + chr3R 26139552 3' - mdg1 7060 2 70.55 TAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAAATTTTTGACATTTAATTTAAGAATATTGAAGGAGTATTTTTGT:1 - chr3R 19144358 3' - Juan 25 1 59.59 ACTATCATATACCCGTTACTCAACTAGAGGGAGGTGCCAGGAAGATGTCTCTAAAAATTTGTTGGCATAGCAACGAATATTGTAAAATAGTAATAGTAAAATGACTGCTTTTTGCGGTTAAAGTAACAATGTTTTAAAACAACTAA:1 - chr2R 16193769 3' - INE-1 548 1 53.42 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGTGTATCCTGGCAAGCGCACATACTCACGC:1 - chr3R 23565255 3' - jockey 78 1 65.75 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAGCGGTAAAGGTAATAGGTAATAAAAGGTAATCGTTTGTTAAATTAGCCTTGAAAATTCC:1 - chr3R 19466675 3' - jockey 56 1 54.14 AGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTATGCCATATATACAAACTTGAGCACTTAATAGTTATAAAATACAAAGACTTCTATATCCATTGTTAAAAC:1 - chrX 13558167 3' + mdg3 197 2 51.37 ATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAAACAAATAACATCTTCTCTACAAAGAAAATAGGGCTAAAGATATATACACATAGTGTTTAGC:1 + chr3L 22638911 3' - Juan 4104 1 71.23 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGAATGGCATAAAGATTATTTTTGTAATTC:2 - chr3L 19938448 3' + roo 9031 1 57.53 TGCACGTCACGCATCTGGGCTCCCCTGGTACGTGACGAACAAAGCAATCGAAAGAGATCTGAAAGTTACCCCTCTTGGGGATCAGAGTAATTTTCATAGCAGCCGTTATGCCTAACCTTTGACCCAGTGTAGCAAAGAAAATCTGT:1 + chrX 13765301 3' + G5 4461 1 76.71 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGCACCCGCCTGAGAGGAAAATTAAAGCCAA:1 + chr2L 2622789 3' - roo 16 2 74.66 TAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGCCTATTTTTTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATACATATATATATATTCATGACTTTTTTAGACTGACTTTTTAA:1 + chrX 19766801 3' + copia 187 2 70.37 AGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 185 2 77.14 AACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATTCTTTAACAGCAATCGATCTCCAAATCTCTGTGTTCGTCTGCTTCTCTTGATGCTTCTTTTATACAGTAGACGCTGGCTAATGTTACATCAAAGATCTTTT:1 + chr3L 23079755 3' + 17.6 171 2 66.44 CCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACCAAATATAACAGCAAGCAATACAAGCAACAACAACAGCAAAACAACAACCTAAACAGCAACCAACCAAATAATCAGATTGCACCTCTAGTC:1 + chrX 12649331 3' + Doc 475 1 65.75 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAATCGCAACTATTCTTGTTTTCTAGGCAGTGAAGCGAACCGTA:2 - chr2R 20931613 3' - blood 7055 2 51.37 AAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAA:1 + chr3L 13365104 3' - Juan 69 1 64.29 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATTGCGTCATTTATGCATCTCATAATTCCCCGCATAAGTCCACCAAACAA:1 - chr3L 22445188 3' - Transpac 4989 2 67.12 TGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAAAAATTCTTTGACAGCGGCACTAGCCATTCCCTGTTCACAATGCCACAGCCACCAATAGTACGTACCTTGAGGAACATACCAATGAAACCATTAGTCAT:1 - chr2L 549925 3' + 17.6 125 2 52.74 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCACA:1 - chr3R 22266427 3' + roo 9018 2 54.79 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATACAGGTATGAACTGCTTCAACTGCGTGCTTCTTGTGTATGC:1 + chr3R 24396777 3' + I-element 5270 1 71.23 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAATAGACTTCAAACTGCTGGCAAAGACGAACTACAAA:1 - chr3R 11072428 3' + roo 355 2 56.16 ATAGTTTTCATTGAGTTCTGATAAAAGAAAATTAGGCTGTATATTATCAGGACACTAGCGATTCGAGTCGCGATTCTCTGCCTATCCGATGTTTTAATATCTTGACCCATTCAATCCGTTGAGAGTTTGTTGAAACAAGGCCTTCG:1 + chrX 21585940 3' + mariner2 864 1 84.93 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGATTCCCTTTGAGCCTGGCAAGCAAATGTGACATTTGCGTAGCCTACTCTTAGGCTGCGAAAACTTTCCCCATTCTCT:1 - chr3R 27056360 3' - jockey 25 1 62.71 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTAAGCATGCAACAAAAATGCGAGACGCC:1 - chr2R 18265969 3' - roo 24 2 69.18 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTGGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATATCTTC:1 + chr3R 18860872 3' + roo 344 2 61.11 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCCA:1 + chr3R 18935160 3' - jockey 4759 1 74.66 AATCAAAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGGTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTGGTTTTAGCAGCTTC:1 + chr3R 13572084 3' + 412 421 2 73.60 GTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATGCAGTGTAAAATCCGAAATGCAAAATGCACTG:1 + chr3R 24301958 3' + Tabor 7307 2 74.66 ATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAATAAGCACAAAACTCTCATATTGTCAATTCTTATTGGAACTGGTGCTCTAATAATTGTTTTAGCCTTTGTGATTGCTCTACGTATTCGCCAAAAACGACG:1 - chr2L 13930784 3' + jockey 4890 1 71.92 TGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATAT:1 + chr2L 21082192 3' - mdg3 5341 2 76.71 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAATTTGGTC:1 + chr2L 15057259 3' - hobo 65 1 63.01 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTAACGGAGTCCCGCCACAAAAAATCCGGAAATTTACGTACTATGCGAAAA:1 + chr3L 13546677 3' + hobo 2909 1 63.83 CGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAA:1 - chr2L 1870960 3' - mdg3 5335 2 71.92 TATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAATATTTTATTTGTAAATAATTCGTTTAAATAGTAATCATGGGTGCTTTTTGCGCAGGCGGATTTATTACTAATG:1 + chrX 5938396 3' - pogo 36 1 58.99 GCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGGAATAAAGTGTGAAAAAATTAATTTATTTCAATTACATTTCATTAAA:1 - chr3L 21405398 3' + mdg1 347 2 66.44 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCTCCCTCCCTCCTCAAAAACGCCAAAAACACTCGACGGTCGTCGTCACACCGCATTCTAGTCCATTACGCAAAAATTACGTACGGAGATGCGATGCTGATTGAAAATATTTGCTGG:1 - chr3R 26845467 3' + mdg1 414 2 80.14 CATTTACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCATCTAATCGAGTTATGACAAACTGAGTATGAAAAGAAAAGCTACAAAATAACAACAGAAATGTGTTTTGATG:1 + chr2R 15529806 3' - roo 8713 2 52.74 AAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATATATCTTTTTTGTTATTCTTTTCTATCTGTCCGATACGTTTCACTTGGCGCTACAAAGAAAGCTACTAATATCAATGGGAAAACTACAACAAAGGCGCAGGCCA:1 - chr2L 8615280 3' + 17.6 481 2 78.08 CAGACACATGCACCGTATGCTCACATTTGGGGGGATGGGGAGTGGGAATAATTTGCGGGGAAAGAAAACTATTTGCTGAAACT:1 + chrX 2093940 3' + R1A1-element 5243 1 32.53 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCTAACTTAACTTCCAATTAACAGATGCAAGACTTATTCAACCAAATTTAGCAAATTAAACTCGCCGA:1 - chr3L 17710550 3' - I-element 22 1 70.55 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGAGCAAAGAAGTCAAATATTAGCACAAAC:1 + chrX 19506143 3' + P-element 2796 1 23.29 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATATTTCTT:1 + chrX 8610353 3' - mdg3 5277 2 67.81 GGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTGCTTCCACAACTTCATGAAAGTCATTTGGCCTGGCTTGGCTTGGCTGG:1 + chr3R 22274407 3' - flea 4732 1 71.30 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGTGTGTGTGCCGCTCGCTAT:1 - chrX 20106303 3' + hopper 1364 1 50.68 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTTTGACAGTGCGAGTTTAAATCTTCCATTGAAAGCGATTTTTAACTAAATAGAAAAGTGCGATATTATCACATTTTCCACCATGTAGCATCCACTTCCATTTGCCATTCGGGATCT:1 + chr3R 18498396 3' - pogo 3 1 78.08 GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATATGGAGTTGTACTCT:1 + chrX 22517697 3' + 1360 3332 1 58.22 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAATATGGAAAATAACTTAAATTACCAGATGCGGCGTGTGTAATATTTTACCAGC:2 + chr3R 29381644 3' - hobo 13 1 75.34 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGGTTATGTTCGGGTGATTCCATATCAGTTTTCCATACGTACTCACATCGATTGGTGCGATTTT:1 - chr2L 12696119 3' - pogo 55 1 62.33 GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATAATCGCATTTTACTCAGCTGCCCCAAGCCATAACTACGCAGTTTGATGAGTTACTTCTTCCGGTGCCGATTCCGTTATGGAAATTAA:1 + chr2R 5800603 3' - HMS-Beagle 29 2 67.81 TCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCGTATATCGATTACA:1 + chr3R 29997670 3' + P-element 2780 1 13.70 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACACACAGGGAATT:1 + chr3R 18539865 3' + roo 329 2 73.29 GACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTTCAAATGTGAGTGAGATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAATGGCAACACTGGACTGCACTCTGAGTTATCTAGGCTGA:1 + chr2L 1422213 3' - McClintock 6246 2 73.97 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGG:1 - chr2R 14450167 3' + roo 323 2 75.34 CTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGTTTGGTTACTTGCATCCGTTATTATGATGAGCCGCTTATCAAATAATAATTTATATTTACAATGGGTTTGGCAATCAAGAAACTTACTGTGTGCTTATAAATAGCCAACTG:1 + chr3R 30564845 3' - F-element 4556 1 71.92 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCTAACTTAACTTCCAATTAACAGATGCAAGACTTAT:1 - chr3L 17710581 3' - I-element 24 1 61.54 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTCTGTGTGCATGTGTTCGAGTGTCCTGCACGGACTGCTAGTTGCAAAACCTGTAAATGTCATTGGCAGACACAGACGAAAATATTTTAATAACTACTCGTATTCGTTCTGCT:1 + chrX 21183447 3' + S-element 1707 1 78.08 CGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGA:1 - chr2R 9408182 3' - FB 69 1 69.63 CCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTAT:1 + chrY 311343 3' - 1360 56 1 56.85 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTG:1 - chr2R 18266015 3' - roo 70 2 68.49 AAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGC:1 - 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hobo 74 1 69.18 GTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCCGAGCAGGCCAAAAGTGTAAGCGAAACATCTAAAGGGTCAGCCACGTGCAAAATTCTA:1 + chr2L 16554957 3' - F-element 260 1 52.53 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGT:1 + chr3R 26031799 3' - pogo 55 1 56.16 GGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGCTTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGACACAGCTTTTTA:1 - chr2L 42501 3' - copia 64 2 65.07 GTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAACCAAGTAATAATAAAACGTGGAAGCTTGCATCCATTACTTTGAGTATTTTCAATAGATATACGAAAGTAAGGATTACTTGGTTGCCAGCAGTTGATTACAAAATA:1 - chr3R 18492840 3' - Juan 4040 1 71.92 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACACAGTCGAATGTTTGTTTGTGCGAAAGTATGCCTTAATTTAGAAAATGGGATCAAAGCAGGGCAGTTCATTGAAGCGAA:1 + chr3R 8810768 3' - 297 6619 2 56.16 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAGAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGGAAATTCACATTCGAAGTTGAATTCTTACCATCTGCCGGCAATCCCATGAGCATGGCTTCC:1 - chr2R 12416841 3' + pogo 2059 1 51.54 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTGAGAGTCGACTGCAGTTACAGTGGCGGCCAGCAGTTGTTGATTTATTGTTATAACTGTAACACACACACACA:1 + chr3L 15724565 3' - jockey 60 1 46.27 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCACTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTA:1 + chrX 8610345 3' - mdg3 33 2 60.96 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACGTGGTGAGCGAGAGAGCGAGCAGAGGGGCATGTATTA:1 - chrX 13642002 3' + P-element 2847 1 58.22 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAATGCTAGCGTACTCTATAATTTAGCCACTCGAGTTAGCAGATTTATGGCATTTGGATTTTGACAGT:1 - chr2R 12642626 3' + pogo 2048 1 57.53 AGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCTTTGTGCAGCCGACGCCGACGCCTCCATTTTCCATTGCCGCTGTCATAACTGTCGCTCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG:1 + chr2L 18885844 3' - Doc 323 1 57.53 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAATAAATTACACGGAACGAGCCTGAAGAGCAGCAGAAAAAATGTGAAGCATAACTTAAGGCGTGCG:1 + chr3R 19500750 3' - jockey 67 1 65.07 TTTTTTTGTTTTTTTTTTTCGATTTTTGACGTCTGGTTTGCCCCATACGTTATGTCATGGGCGTGCGGGTTTGTGTGGCGCTGCCGCGCTATGGGCGGCGGGTGGTGGG:1 - chr2L 470467 3' - R2-element 3584 3 77.98 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGCGTCTGCTGCTGGTGTTGCTGTCTCTGCCCACAATTATTAAATATTTAAAGCCATATACAAAACGTTTTTGGGTTTAACGTTATACTCTTT:1 - chr3L 7370425 3' + Burdock 6363 2 66.44 TTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATTGACCCCGTTTCCGTTTTCGATTGCAATTCGTTTCAGTTTCATGCACTTTGCACTCTCCACAGCGGCAACCCCCA:1 + chr3L 1983568 3' - Transpac 29 2 62.41 CCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATAGG:1 - chr2R 10666867 3' + hobo 2867 1 74.02 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGGGGCAGCGAACCCCAGGGGTTTTGGGGTTCATACACCGCTCTCTGAGTCTTTCTTCTCGTCGTTTTAGGCATTTGATTTCTCTTTCATTTTGGCTTTTTTTTTGTC:1 - chr2L 17574306 3' - hopper 11 2 72.60 CGGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAGATGTCAACAGACGATTCACTTAGACACATTTTTCAATGATGTTGCTACCGTACTGCCGGAGTACTTAAGTCGCGTCAAGTCATGCAATGTCAAT:1 - chrX 19992535 3' - copia 27 2 67.12 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACTCCGGGGCTTCTGCTCCGCCATTATCTCCATTTGACAAATATACCAGGCTCAGGCTGTGACTACA:1 + chr2L 19344024 3' - FB 21 1 61.82 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACATTGTCCGTGTGTGTGGCCGAGAAAGGTCGTTTAAATACAATAAATTAGTTTAAACAGAGCATCACGACTTTAGCACCGTTTACAACA:1 - chr2R 2906097 3' - 1360 31 1 41.78 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATAAGTTTCCTGCTTAGATTGTATCTCAC:1 - chrX 16857033 3' - pogo 16 1 66.67 ATGCTGACGTCATCGCCAAACAAAACCACATTTTCGTCTGCCAGGTACCATAAATGATTACATGTCTTTTTGAGCACTGCCATTGAAATCCTCTCGTCCACTTCTCTGTAGTTTTACATAGCTCG:1 - chr2R 3456266 3' + BS3 219 1 76.80 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAATATGGAAAATAACTTAAATTACCAGATGCGGCGTGTGTAATATTTTAC:1 + chr3R 29381640 3' - hobo 17 1 72.60 TTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACTTTTAGTCCACCACAACACCTGAATCCGAACATCGGCAGAAGCAGCAGCATTTTAGTAGACACCACAACACAAAACAAAAAAAAA:1 - chr2R 10992643 3' - flea 389 1 55.48 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAGAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGTTTTGTTTTGTTTTGCCGATTCGGCGGCGCTGCGCTGG:1 + chr2R 18266085 3' + roo 326 2 72.60 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGTGTGTGTGTGGCTTGAATATTTGAGATTTTACTCCGCTTTTTCGCGTG:1 + chrX 6213644 3' + roo 9037 1 62.33 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCA:1 - chr2R 14450148 3' + roo 9006 2 62.33 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGGTAAGTCTATTAAAAATCTATATATTGTTCTAGGAAGACGTATTTACGTACATTTTTTTAGCCACTAAGAAGCTTTATCCAAAATGTTACTACAGTCGG:1 - chr2L 21082080 3' + mdg3 224 2 69.86 CAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTCCGCTGGTGACGCATTTTCCGGCTGG:1 + chr2L 2722421 3' - flea 29 2 69.05 CGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAATTTCTGGATATAATCGAGATGCCCTCTGAAAGCGTATAAA:1 + chr2L 10685893 3' - Quasimodo 32 2 57.81 GGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATTAACCGCAAGCGCCAGC:1 - chr2R 10666840 3' + hobo 2875 1 58.22 TGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCT:1 + chr2L 19841559 3' - BS 73 1 71.43 AAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTACCAACGAATTTATGTTTTCAGCCATAAATTGCCAAACATATACGCCCACCTGGGCGCCGCTTGTTTATGGCCA:1 - chr2R 18927753 3' - 3S18 34 2 56.82 GGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAA:1 + chr3L 3540249 3' - mdg3 32 2 62.33 AATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGAA:1 + chr2L 22224615 3' + Rt1c 5409 1 60.27 TAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATGCGAGTACCGCAGGAGGAGTGTGGCAAATATTGGCTGTGGGTGTTGCATACCCCCGGG:1 + chr3R 23968668 3' + HMS-Beagle 214 2 50.00 CTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGGGCTACAATGGGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATA:1 - chr3R 24301834 3' - Tabor 81 2 68.28 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGACAAATATGAAAGCGTCAGGGGAATGGGGAAAACTCTGAATTTTGAATGGTTAGGGGTTGGTGGAAGTGGG:1 + chr3R 12781600 3' - pogo 47 1 53.10 CAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGAA:1 - chr3L 3540122 3' + mdg3 189 2 57.25 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTCTTAAGTCTAGAACGGTACAAGTGCTGTCTGAAATGCTCTGCCTTAAATCTATGATATTCTTACGATATTAG:1 + chr3R 18514449 3' + pogo 2059 1 56.85 ATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGCGATTTGCCACTTGCAGCAGCTCGGCCAATTTGTGG:1 - chrX 13516943 3' - jockey 4850 1 78.77 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGTCTAAAAATAGCCACAGCGAATGCAGTCCAGCACACGAGCGGCCGACATGC:1 - chr2L 20716286 3' + P-element 2876 1 77.93 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAATTTGGTCACTCGCCTAAAGCAATAAAAATGCAATGCAGCCACGTC:1 + chr2L 15057297 3' - hobo 15 1 73.13 GTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGATTTTGTTTTTGTAAATGATATGCGTGCAAAAGTGACAGCGCTAATGGGCAGCAAAGGCTGTCCTACAGT:1 + chrX 17542856 3' + pogo 3 1 52.74 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAAT:1 + chr2L 20327679 3' - roo 8748 2 73.97 AAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTAAAG:1 + chr3L 22635785 3' + hopper2 1557 1 50.00 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTGAGTCG:1 + chr2L 20716430 3' - P-element 27 1 56.88 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGACCTAAACCGGATCGAATGGATATAGAGCCGCCCATTGTGAATCTAGCAACAATAAAACAGAGAGAACCCCGAA:1 + chr2L 246691 3' - P-element 45 1 54.79 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAAGAGTCCATATATATATTTAATGAAGCTTTTTTGGTGGTCCGTCGCATATAAATATGTTTTTATATGACACGACC:1 + chr3L 20910111 3' - F-element 53 1 51.80 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAG:1 - chr2L 20327611 3' + roo 337 2 65.75 TTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATATGCGACGGGGGCGTGTTCAATTTGCTTGATGGATGCCTGCCATTGTGGCGGGAATTTCGGTCGTGATTCCGCCGTAGAGCTGGCAACTGATGTCCCC:1 - chr3R 20720468 3' + 1731 294 1 71.03 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGTCTAAAAATAGCCACAGCGAATGCAGTCCAGCACACGAGCG:1 - chr2L 20716296 3' + P-element 2865 1 70.55 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTCAACGTCGATGGCCATCAGATCGAAGTGAGTGCCATTCGCCCACGCAGAGGCACACACAGAGGCAGTGATTGCCAATCATCACCATCGCACGGA:1 - chr3R 11730639 3' - hobo 10 1 74.42 GATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTACATATATAGAGTTTGGGAATATAAACAGAGCTCTTACACACAAAACCCACTTAAATTGGTGCGTATTCACTTTTTGAAATACCCTCCAAACAGGATTCCGTCGCGCAGTACTCAGCAA:2 - chr2L 19217535 3' - springer 7142 4 45.89 AAAAAAAAAATCAAAAAAAAATCATCTTATTATCATTTTTGACACTAGTATCTAAGCTGTTATTAGATACTAGTGTCGAAAATGACACTAAGATGTTAATTTTTAATGTTTCTCGATTTCAATGAGTCATTGTTCTCAGCTAATTA:1 - chr3L 18940761 3' - hopper 143 9 53.42 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCAACATAGAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCACTAATATTGCGTTCTTTTCAGACAAATGTCGCTGGCAGTCGCCGCAGCCATCGAAAA:1 - chr2R 24021506 3' - pogo 10 1 73.94 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAG:1 - chrX 21087600 3' - mdg3 5301 2 59.40 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTTATTATAAATAATGAGAATTTTATGGTTTTCACACCTGTAGCATTTTCAACAATCACTTACCTTCCTTGTAAGGCAAGTTATTTCTAAAATGAGCTGTTTCGC:1 - chr3L 12729032 3' + opus 7488 2 69.66 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGCTCTCACTCTCTCGTGCTCGTTTCTTCCATTTTTTTTCGCACGCCCAAGGAGCGAGGCAGTCATGCAGATTACAATCGAAATGACATGA:1 + chr2R 17348521 3' - hobo 31 1 63.01 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGGAGGATGCCGGGGTGTGCGCGTGTTTACATAAAAATTTAAAGCGAAAACCCAGTGATTTTTATGCTTATCAACAGCGAAATTGAAAATGCCG:1 - chr2L 19628371 3' - hobo 28 1 65.07 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGAATGGATCCGTAATG:1 - chr3R 18940468 3' - mdg1 18 2 71.72 CCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCCCCACCC:1 + chrX 21667993 3' - gypsy2 9 2 76.71 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGGTAGATGAAACGTATTGCCTTTTTGCGCTGAGCTGGGAGGAGACCCGATCCCGTATGTCTGCTAGTTGCAAT:1 + chrX 13808106 3' + pogo 2082 1 65.55 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTG:1 - chr3R 30524474 3' - roo 8726 2 71.88 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTTTTATATAAATTTTAAAAACATTTAAAATGTATCTATTACATTGGCATTTTGATTTTGTAATAAACATAAATACATATTATTTAAATAATATTGTAAAAACAATGCATTTTC:2 + chr3R 8335503 3' + jockey 4979 1 79.45 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGTAGAATTTATCTTTAGCTCTGAGCC:1 + chr2L 6716412 3' - hobo 49 1 52.05 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGACTGCAGCAACAACAACCACACGGCAGAG:1 - chr3R 17794517 3' + P-element 2861 1 58.54 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGGTGACTGTACTGTTTGGCTAGCGTGTGTGACCGATAAGTGCTATCGGCTAATCGCTATCGCATTTAAAATGGCGCTAATGCAGATATGTAAGA:1 + chrX 11236522 3' + copia 246 1 74.02 AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACCAGCCAAAATCGACTGTTGCGCTGAACGGAGTGTAGATAAGCACTCT:1 + chrX 21087712 3' + mdg3 239 2 64.38 CAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACAGTAGACCGGCATTATGTTTGTGCCCCATTTTGTGGAAGCCCACTTGCTCTCTTTCCGCCATTAATGGGCGC:1 + chr2L 3393854 3' + Stalker2 7605 2 48.63 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAATGAATTTATTAAATAGCTTAATCAATAGCTTAAATAGCTAAAATGAGAAACGTAAAACTACATGTAAATAGCACTTATTTCAA:1 + chrX 19591276 3' + roo 9039 1 61.64 TTCTGTTGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATG:1 - chrX 12131188 3' - F-element 386 1 73.13 ATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTACCTGTATATATAGATATATATTGTGAGGCAACCGCCGATCCATCACCGATCGATCATTCAG:1 - 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chr3L 11903193 3' - micropia 5084 4 53.42 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTAATTACCAAACTGCTGAAATAATTATTGTGTTGGTTCTGTTTCTGTGTGAAGGATGAAATGGAAAGCAATCTAAC:1 + chr3R 25053119 3' + pogo 2057 1 50.68 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATGCAAACATGCATTTCACATGGGGATACATTTCTGTCCCAACTAGCCCGGCTGCTAACTGCTGAAGGGGAATGGGGATGGCTGTTTTTAGGGGG:1 + chr3L 5329222 3' - 412 29 2 65.75 CTTATAAGTAAGAGCGAGATAGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTA:1 - chr3R 15157607 3' - invader3 98 2 73.29 TTTGGCTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATATGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAAAGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTACTGGGTGTGGTGGTCACAAAGCCCTGCTCCTGCTGCTGCTCC:1 - chrX 10042644 3' - I-element 5060 1 73.97 AGCGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTCGATTTTTATGCGAAACAATAATGATGAGTTTTTGCAAAACTTGAACAGAAATATATTACATGTGAGCTTAAA:1 + chr2R 14085825 3' + pogo 1700 1 78.77 GAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATCCTAAGATTATTTTAGAAAATGAAAGAGTAGGACTATCTTAATT:1 + chr2R 22790739 3' - Doc 162 1 69.86 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAAACATTAATATGCTGGCTGAAGTTTCGGGCAAAA:1 + chr3R 13198325 3' - Doc 24 1 72.60 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCGAACGTCATCCTGCAGCAACCTTCGGGTGGTTTGCCACCCGCGCCCCCCTCAGATAGTGCTGAAAACTTT:1 + chr3L 939737 3' - hobo 26 1 61.16 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACTGTTGACGTTTTTGGGGAAAGGGTTGCCAGCTAATGCCGCAAACA:1 - chr2R 8467738 3' + roo 334 2 68.97 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTGTGACTTGTTTTTGTGCTC:1 - chrX 13484102 3' + hobo 2891 1 52.74 TACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGAT:1 - chr3L 23456279 3' + Gypsy6A_LTR 247 1 74.66 ACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGTCGGGGAGTACTGGCGCGATGACTACCTGCCGCGTTGGCGCGAACG:1 - 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transib4 2168 1 71.23 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGTGTGTGTGCCGCTCGCTATC:1 - chrX 20106302 3' + hopper 1365 1 51.37 GCTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAATACAAGAGACCTTTTGGTTTTATACAACTAATTGCATACTTATGGGGGCTGCACTAATGAAATCTGCAAATTTGAATAGCTTAACAAAAAATATAG:1 + chr3R 9657796 3' + BS 5067 1 60.96 AAATTTCACTAAATGAAATTAAAAAGTAAATATTGCCAATTGGTAATGAAGTTAAATAAAATTCAACTTTTTTTGTATATTTTATTTGCTAACCATTTAGAGCTGGCTGTAATCAACATTTTTGCAATGCTTCTGTCTGCCGTCAG:1 - chr3R 12264631 3' + Tc3 1350 1 71.92 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTTAAATATTACTATTCAACAAAAAGGTGTACGATCGAAAAATTGACTAATTTTTAGCTATTTAACTG:1 + chr3R 4869515 3' + I-element 5301 1 58.22 ATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAATTATAATTCAAACAGTGTAAGCCGATCTTTGCGATTTTTTATTTCGTGTTGCGTGGATTTTGCAATTCGAGATGAAAGTTTGTCGCATGCATTACCGAGATTACATCACCG:1 - chr3L 21106322 3' - roo 8770 2 76.03 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGATTGCCGAACTCGG:1 + chr3L 19513496 3' + pogo 2042 1 60.27 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCCCAATCGAATGTTTAAGTTAAGCATTTCAATTATAATAGGGAAAATTCTTTGACTTTTAGCTAGATTAACAAA:1 - 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Doc 39 1 59.59 CGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTACGTGTGTGCAAGGGTGACAGCTGTCGCCCCAGGGAGAGCAATGTAAGT:2 - chr3R 17079421 3' - 1360 74 1 69.18 GCCTGTGAAGCAATTTAAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTATAATAAGTATTTCAACTTTTCTTGTTGCGTCGCTGCCTTTTGGTTGGTTTGTTTATATTATTTTGTTTATTTGTTTATTATATCTCATAAATTCTTGTTG:1 - chrX 12334377 3' + accord2 7231 1 73.97 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCCTTTGCAATGAAACATGGTATGCATTTTGCAGAATTGA:2 + chr2L 15596998 3' - roo 81 2 73.29 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCTGCCACTCCCTCCCATGACATCCTTCTTCGCCCGTCTAGCCCACACAGCGGGGCAAACCGCGATCCTGGCAGGACTTGCT:1 + chrX 19992688 3' + copia 213 2 56.85 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGAATGGCTT:1 - chr2L 15096883 3' + jockey 4933 1 65.75 ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCC:1 + chr3L 3540210 3' - mdg3 5309 2 63.01 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGTACTTACAATGTTTTCATTCGGCAATGACTTATTATTTAGCACACTGATAGCTGATAACACAGTGCTAATGTGAGCT:1 + chr3L 1324372 3' - 412 7096 2 56.16 CCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAAATAAATATGAAAATATATAGCACCCTACATATTTTCCAATAT:1 + chrX 6863646 3' + Juan 4138 1 71.92 GTCGAACGGTAACGGTGCGTGCGCAAAGAGGACTTGTAGGGTAATATGAAAAACCTTTGAAATAATCAGCAAAATACTGAAGAATTATCAAAAGGGCAAACATGTTTTAGAGTCAACATACTAAATATCCATGCAGCTCTTGAAGA:1 - chrX 6101533 3' + gypsy8 4789 4 23.29 GAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATCGAATGGGTAAATAAATGGAAAAGTTAAATTGGAAATGTGTGTGCGGC:1 + chrX 17531929 3' + blood 7317 2 68.49 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGAAGGGTAGAGGGTATGAGCACAACTCCAAACCGACAACGTGTACACAGCACTCTCTCCCTCGCACCTATT:1 - chr3R 4739687 3' - P-element 52 1 52.74 TTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGATCCTTAAGTCCCGCATTGCCAGGAACATCCAGCTTCGGGTCCTT:1 - chr3R 7543906 3' + Doc 4590 1 67.41 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTAAGCATGCAACAAAAATGCGAG:1 - chr2R 18265974 3' - roo 29 2 65.75 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGC:1 + chrX 1831301 3' + P-element 2824 1 27.40 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATTAAAACGGGGAACATCGAGAGATTTACAATAATAGTAGCCCAGAACATTAATAAAACGGATAAAGTTCG:1 - chr3R 6526709 3' + pogo 2050 1 54.11 AACGAAAGACAAAATTCTAAGTCGCGGAGCAAAATCAAAATTTTGCTAAAAAATATTCGTTGGTTAAATTGTGCCGAAGAAATGGATCTAGGAGAATTATGAATGTAGTGCAAAGTGTGGGAGGCCTTTCGGGTGGGTGACTGTAT:1 + chr3R 8966687 3' + HMS-Beagle 299 1 56.16 CGGCTCGAAGGACCAAAATGATCAAGGGAACACTGTTCACCACAATGTCCATTTCATCAGGGTTATCCATGACTTACAACCACATCAAAGTGAAGAAAGGCCCCTATGGTTGATCGGTTGGCGAAGTTCATCTCAAAGTCGTAGTC:1 + chr2L 882095 3' - GATE 269 1 69.86 AATAATTCTTATGTACTACGTGGCTATGTGACGGCGTAGTAGTGGCTGGGTTTTGGTTACAGTTGGACACTGTCTGCTCCAGTTTACCGACAAATCGTATACCGGAAGCGGTTGCATGCGGCGGCGCACG:1 - 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chr2L 15523888 3' + opus 465 2 63.01 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGCCTTTCATATGGTGCAGATACACTTCCGCTGGCTAACGATAATGGGAATGGCTTTTAATTGATTTG:1 + chr2L 20068082 3' + roo 353 2 59.59 TTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAACTTGTGAGGAGCGCATACAAAA:1 + chr3R 8965256 3' - HMS-Beagle 43 2 56.16 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAACTTTTCACGCGTTTTTTGATGTTTCTCCTTGGTACAAGTGCAAAAATAACAAGGAAAAATGGCGTAGAAATATTTAAT:1 - chr3L 18435408 3' - I-element 44 1 54.11 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTC:1 + chr2L 6716372 3' - hobo 72 1 74.42 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCATCTAATCGAGTTATGACAAACTGAGTATGAAAAGAAAAGCTACAAAATAACAACAGAAATGTGTTTTGATGGATTATACAATCATGTAAATATAAACAAACA:1 + chr2R 15529837 3' - roo 8682 2 73.97 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGCCTGATACTTAACAGCTCAAACTCCTTTAATTCCATTATGATAGATTGATTCGATTGAACAGTTCCCTCCTAATCGTTATCAGTAATCACAGCTCTCATCCGGCCGCATGAAA:1 - chr3L 2240343 3' + roo 402 1 79.45 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAGGATATAAATCAAAATCATAAATATATATATACTTCATTCATTTTTGATGAGCTTCAGTACAAACTTCTA:1 + chrX 14121847 3' - Doc 54 1 56.85 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAA:3 - chr2L 1870958 3' - mdg3 5333 2 71.23 ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCT:1 + chr2R 12642727 3' - pogo 71 1 67.59 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGTTGCATATAGATGGGCTGGCCCATGGG:1 - chr3R 28937803 3' - jockey 4739 1 59.72 GGGGTTTTGTGATTGTGTTAATTTGTATATGTGCATGCGTATTTAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAAAAATAGCCACAAAGCGTTGACAGACGAGGCAAATGAAAACACAAGTGCAAAATG:1 + chrX 17508947 3' - Burdock 2 2 74.17 ACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAGATTACTTTAAGATCAGTAAAGTGTCAGACTGGGATAA:1 - chr2R 2052587 3' - opus 85 2 76.71 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGCAGAATTAGTCCCAAAAAAAATATAAATAAATACCTTTGTAGTTAGGACCAAACTTTATTTAAAGATCCTATGACACATCAACTTTGCGGGGAAATTCA:1 - chrX 10838468 3' - roo 8686 2 71.23 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAACTTTATTAAATCGTTCTCAAATGGAAAACACCGACTATAGCTATTGAAAATAGTTTCTCACAGTT:1 + chrX 19310668 3' - pogo 52 1 54.11 GTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGC:1 + chr3L 23839704 3' - McClintock 6031 2 75.34 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCGTATATCGATTACAATCGCGTTCGTTACCAGCTTGGAATTATGCAAGTATGAACTATTATTTTACAACAAGATATTTGTTGTTATACAAGATTCGATTTTATTTTATTTATT:1 + chr3R 29997768 3' + P-element 2878 2 78.08 CAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCGATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTGGGTAGAAAAACTACGAGCTGCAAGTACCTACCTGAAATGCCTCGATCAGCAAAGCGAGGTAAATGCAT:1 - chrX 12791044 3' - Bica 479 1 52.74 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTCCATTTGGTGGCCGCCAGTTGGTAATGGCTG:1 - chr3L 1983473 3' + Transpac 274 2 65.26 ACGCTCTAAGACCGCCCAAAACTGCAAATTCCAAATTTTATTCAATTTGTTGGATATTTTTTCCAAAATTTTATTAGTCTTGTAATTTTTTATCAATTTGCGAAAAACTTTTTGGCACCCCAACACTTTTAAAAAATGATTAGAAT:1 + chr3L 24051833 3' + INE-1 345 1 43.84 GACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAAAATAAAAATAGCAACATAGTTTTGGGACTCTAAATTAAGTATTATTAAGTATTAATTTTTGTTCTGAAACCAAATTTTCAGCTTGCTAGCTGTAAATGAAATCCCTGTTCTTGAATA:1 + chr2L 16567027 3' - F-element 468 1 74.66 GATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATGCGAGTACCGCAGGAGGAGTGTGGCAAATATTGGCTGTGGGTGTTGCATACCCCCGGGCGTGCCGCTACTTGGTCGCTCATCAAGCATACGCC:1 + chr3R 23968703 3' + HMS-Beagle 7025 2 68.66 AACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTTTTATTACATTAAATATGATATCTTTTAGTTTCAGAG:1 + chr3R 19252023 3' - copia 5030 2 74.66 CAAAATTTGTCGAAAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTAATTGTATTCAGCAAATACGTGATCGGTGCTATTTTTGTTACCACAGCAAGTGCCCAAAAAAACATCTTTGCCTTGTTTGCATCTTTTTCGGGCTCTAATGCGG:1 - chr3R 23736725 3' - Tc1 270 1 70.55 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTTTATATATACGAGATTCGTTGAAAGGTATGTAAAAGGCAAAAGGAAGCGTTACCGCCATATAATATATATATATTTCTGATCAGGATCATT:1 + chr4 587134 3' - 297 26 2 65.22 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACATATATGAAGACTGGCACTTGAGCGGATAGAAGGAACGGCGG:1 - chr2R 15892142 3' + hobo 2900 1 59.09 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCCAGCTTCATAGCCACTCAAGTAACCGAGTTACGTGAGGTTACTCCATAC:2 + chrX 7624183 3' + roo 9042 1 69.86 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCGTTCGTTTATG:1 - chr2L 951294 3' - F-element 56 1 51.37 TACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' - R1A1-element 5102 1 76.03 GCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAAATACACTTTACGAGATGTAACCTCTTACACGCACTCATTCCCTGTTCCTTTGTCACTTTCAGACTTTGACGAA:1 + chr2L 13763587 3' - Bari1 50 1 52.05 AAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCAACATAGTCGCCACACACACACACACACACACACACAAGCAGACAGGCAGCTTAAACAACAATTTCCTCCATTTGCCATTAAAATACGCTTTAATTTTTGTTTGGCT:1 + chrX 20106458 3' + hopper 1406 2 73.29 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATATGGAGTTGTACTCTTAGTTTCATAATCATAGTCGGGACGGTT:1 + chrX 22517725 3' + 1360 3360 1 56.16 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATTGCATTCCGCGGAGTCGTTCG:1 - chr3L 10068885 3' - 412 55 2 55.48 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGTCGCCACAAAACGAAACAAATAACACAGAAAAAGCATTCG:1 - chr2R 14450107 3' + roo 9047 1 68.49 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACA:1 + chrX 19744485 3' - P-element 83 1 28.77 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACGATAGAGAGACGATGGAGACCGGCACACAGAAATATATTGGGTCTATAAATCAAGGAATTACTGCGGATATTG:1 + chr2R 18467240 3' + roo 361 2 50.68 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTGCACGCCCCGTATGTTTGTA:1 + chr2L 15601657 3' - Doc 44 1 54.79 TCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCTTCTAATCTTCCCAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGGAAACTCTAAACCCACATGAACTATTGAATTCCATAGAAAACATGTGTGCATAACAACGA:1 + chr3R 28185950 3' - Burdock 6320 2 60.96 TGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTTGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGTTAGTGACTCCCA:1 + chr3R 25409760 3' - jockey 4749 1 71.53 TAAGAGGAATATTGTGTTAGCTTTGTTAACTGTGTGTTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGGCTAACCAGGGTG:1 - chrX 21933823 3' + gypsy11 4309 2 41.67 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCTGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAATTTAAGCTGTTAATGGCCCATTTGGTTT:1 + chrX 10838608 3' + roo 9011 2 63.01 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAATCTTTGTTGCTCAAAGTGAGAGACAGGGAGAGAGAGAGAGTACACGGCGTATGTGAAAGAGTCACTTTTACA:1 - chr3R 7109119 3' + P-element 2841 1 52.74 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTGATCACTAAAATGCAAAGCAATAGTAGCTGGTTTTTTTTTGCAAAGCCAGACAAATATGAAGAGCAGTAACAAATTT:1 - chrX 12344259 3' - F-element 32 1 72.60 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTCAACGTCGATGGCCATCAGATCGAAGTGAGTGCCATTCGCCCACGCAGAGGCACACACAGAGGCAGTGATTGCCAATCATCACC:1 - chr3R 11730649 3' - hobo 37 1 58.90 TATGCAAAACAATAATAACAAAGGTAGCAACAACAACGATTGTCATACAGAGAAATTTTCAATGTCAAACTTTTGCATTTTACTCAGTTACTCACGTTGGGCATCGTACTAAATCTTGATTCCGCCCGTCGACAACTTATGCAATT:1 + chr3L 12801522 3' + S2 135 2 78.08 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCCAGCTTCATAGCCACTCAAGTAACCG:2 + chrX 7624160 3' + roo 355 2 57.53 CTATGTATTAATTTAAAATCTGTCCATGTGGACAATAATTAAATGTTTGGGATGTGGGGATTCATCGACTGGATGGGGTGTTTTTTGGGAGGGGATTTACACATTGATTGTTTGATCGTTAGGCAATTGTTTGTTTTGTTTGAGTT:1 + chr3R 8813723 3' - G-element 4300 1 67.81 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCCATACATGTATGAATTTCTCCGAGGCATAACTCAATTTGAGTCCGCTCACAGCAAGGATAA:1 + chr2L 2523019 3' + mdg1 7433 2 67.12 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTAGCCCGTCTTGGCGAACAAAACTTTTTTCGTGTCCACAAATAGAAAATATTTCACACTCATATTTAATTTTGGCAGAC:1 + chr2L 2675079 3' - Quasimodo 37 2 56.85 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGTCGCCACAAAACGAAACAAA:1 - chr2R 14450127 3' + roo 9027 1 54.79 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAACCACAAAGAGCAAACACAAAAAATGTTGCCTACTTCCCGGCAAAACAGGTGAAAGAAACGAGCTGA:1 + chr3R 8625286 3' - jockey 61 1 55.48 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAACTTGAACTTGGTCGTAATATTTATGTGCATCGTAAAGGCCGAAAGTTGGAGCGACGCACTGA:1 + chr3R 6603865 3' + pogo 2047 1 58.90 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTCTTAAGTCTAGAACGGTACAAGTGCTGTCTGAAATGCTCTGCCTTAAATCTATGATA:1 + chr3R 18514434 3' + pogo 2044 1 60.96 GTCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGGGGCAGCGAACCCCAGGGGTTTTGGG:1 - chr2L 17574386 3' + hopper 1326 1 79.17 TCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATCTCAAAATGCAAAAAAATAGTATATGAAGTAAGCTACAATCTTGAAG:1 + chr3R 10769651 3' + 297 326 2 67.12 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGTCCGCAATTTGCGCGGACTGCGGTATCAGTATCTGCAAGATACTTTTG:1 - chr2L 19907539 3' - hobo 44 1 53.24 CNACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTT:1 + chr3R 13572095 3' + 412 412 2 68.97 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTTTGGACAGCCTGTTGGATTTAATTTGAGACTCTTCAGTT:1 - chr2L 9988120 3' - hobo 81 1 72.60 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTAAAGCATTCAAATTATATTTATTGG:1 + chr2R 5485176 3' + 1360 3354 1 60.27 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACTAAAACTTTAATTTAAATAATGTAAATAGGCATATTTTGTTGTTCAACATTGCCAAGCTATTTTTAACAAATTCATTG:1 + chr2L 20910408 3' + roo 9030 1 57.53 ATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACATATGTGTATGCAGATTGACATTTGACGTGCATAGAATTTGTCTAACTGTAGTTTTCCCTTTGCCAGAATGT:1 - chr3R 8965121 3' + HMS-Beagle 200 2 54.11 TCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATGCCATTAATTGAAATGATAACGATTAATGATAGCGAAAAGACACCAATGTGAGAATGGAT:1 - chr3L 11887144 3' - Doc 12 1 78.08 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACTTCATCTTATATCAACAGCCACACA:1 + chr2R 6713919 3' - 297 6615 2 73.47 GNTGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGG:1 + chr3R 8965229 3' - HMS-Beagle 70 2 66.44 ATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGAGTTTTTTTTTATTGTTTATGAGGTGGAACTGCAAATTCAAACTCAAG:1 - chrX 4818517 3' - Bari1 69 1 65.73 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAGTTGTAAGCATGTTTCATTAGAGAAGATAACATTATCCTAAGTAACATCTTATATTTCGTT:1 - chr3R 26968368 3' - FB 61 1 59.59 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATTGACCCCGTTTCCGTTTTCGATTGCAATTCGTTTCAGTTTCATGCACTTTGCACTCTCCACAGCGGCA:1 + chr3L 1983561 3' - Transpac 4968 2 52.05 AGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCTATATGGTAGCAAACAGTCGAATAGAAATATGAAGAATAAATATAGAAG:1 + chr3R 6461835 3' + Transpac 5162 2 66.90 AACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAGGTACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGCGCCGTTCATCGCCACAGGTTGATTGACGGCTTTTCTAAGCGCC:1 + chr3R 1994932 3' + X-element 4372 1 64.52 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAATTGCAGCGTATAACTACTATAACTAACAAGGAGCAGCAAAATCCATTGAAGTTCGCTGTCAAAT:1 + chr2R 13052899 3' - Doc 50 1 71.74 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTCCAGTCATTTCCTTTCAATTTAATATTTATGAAATATATATATTCCATTCCGACAATATTGAAGTTCTTATCGAAAC:1 + chrX 10344894 3' - roo 8704 2 58.22 ACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGGTAAGTCTATTAAAAATCTATATATTGTTCTAGGAAGACGTATTTACGTACATTTTTTTAGCC:1 - chr2L 21082116 3' + mdg3 187 2 56.16 GTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGTTCCTTCTCCCATTCTCGCCATCCATTTGGAATGTTTGTGGTGGGCTTTCTCGTATTTATTTTTATATTCACACCTCT:1 + chr2R 18988364 3' - I-element 5124 1 58.22 TAAGGGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTAATAATATTAATTAGTCGAAATTATTTTTAAGGTTTT:1 - chr3R 11224322 3' - P-element 2823 1 15.17 TCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCTGCCACTCCCTCCCATGACATCCTTCTTCGCCCGTCTAGCCCACACAGCGGGGCAAACCGCGATCCTGGCAGGAC:1 + chrX 19992683 3' + copia 212 2 54.93 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATGCAAACATGCATTTCACATGGGGATACATTTCTGTCCCA:1 + chr3L 5329168 3' - 412 7136 2 72.60 GGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGTTTGTTTGCCCATGTCAGATGTCCCAGATTTTA:1 + chr2L 5333456 3' + mdg3 168 2 73.38 ATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTT:1 + chrX 22386783 3' - hobo 92 1 54.26 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACA:1 + chr3R 5087131 3' + P-element 2795 1 23.29 TTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATAGTTCCACAAAAGTGGCACTATGATCTCTCTCA:1 + chr3R 29952807 3' + invader4 3038 2 54.11 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACTGTTGACGTTTTTGGGGAAAGGGTTGCCAGCTAATGCC:1 - chr2R 8467745 3' + roo 326 2 73.97 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATGAAGCTCCTATTAAAGAGGTGTTTCCCGTGGCCGATTTAAGCTGCCGCTTGTTGGCATTTTGGATTGCCATTCGGATGTATCGTGTGTGCTG:1 + chr3R 26658272 3' - hobo 28 1 65.52 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCTGTAACCAATCGAACTTCCTACGTTACTGCCATTAGAAATTCGATAGACCCCAA:1 - chr3L 19510441 3' + pogo 2090 1 75.52 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATTGCACTGTATTTAAGCCTATATTTCTGTATTATATATTCTGTATATTTTTATAAGTGAAAGTCCCAAAT:2 + chr3L 16563419 3' - I-element 52 1 57.53 ATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGTTGAGATGGATCTTATTTTAGCACCCCTCATAAAGGAT:1 - chr2L 5333378 3' - mdg3 5287 2 51.09 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTATTT:1 - chr2L 10178002 3' - mdg3 75 2 67.59 GGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTAATCTCTAGATTCGAACTCACCTCGTAGAA:1 - chr3R 22572577 3' + HMS-Beagle 6955 2 78.77 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAAGCAATTAGCCAACGGTGAGGGGGTAAAGCTTGGCGGGCAGGGGGTACGGGGTTGGTTCA:1 + chr3L 19702859 3' + pogo 2059 1 52.63 TATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAAGGAAAGAGCGAGAAATTTCAACATATATGGTTCCTTCTACCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTGGTGTATATCCTTTAACTCTATGCTTATGCAGATCTTATCTGCAATGATA:1 + chrX 15666900 3' - INE-1 546 1 55.48 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGACGCAAATTCCGACCGCTCGCCTACAACAACAGCAGCAGAGTGACCGTTGGCGGACGGGAGAAACATACCTCGTGTTGCCGCTGGA:1 + chr2L 851094 3' - P-element 33 1 63.01 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAGATTGCA:1 - chr2L 16360550 3' + hobo 2921 1 65.00 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACTCTTGCATACACTCATACCTACCTAGGCGTCTTTTCTAGGTTATCAAACGGTAAAAACGCGG:1 + chr2R 14486583 3' - 297 55 2 58.90 GCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCATGACGTTTTTCTCGCTTTTTCTCGACCAATCGGAGC:1 - chr3R 25137976 3' - P-element 85 1 27.40 CCGAGATTCCGTCACCATGGGTCGGGTTACCGACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGGAAAACCACAATGCACCCACGCCGACGAAAAGAGAAGGGCATAGAAGCGGCGAAAGAGACGGAG:1 - chr3R 10957840 3' - Rt1b 482 1 68.03 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATAAATTAAAAAGCATAATTTTGTTGAAATATATAAGAAACTGAAAACTTTTTCATTGTTATTGGAT:1 + chr2R 8942607 3' - 297 48 2 57.53 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAATAAATATTTACCGGGGACAAGAGGCGTGGGCGACGACCATTAAAATCATAAAAGATTACTTTTAAAAAACATATTTGTAATTCTCTGTGAATTCATATAATATTCTTGTTAT:1 + chr2L 19907697 3' + hobo 2928 1 76.71 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGAACTACAACAACATAAACTGCATGTCGTAATACTGT:1 + chr3R 7109225 3' - P-element 68 1 39.73 GCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCCACCATGCCCTATTTGGGTTTTCAAACCAGGAGCAAAGGAAAAATTC:1 - chrX 4788528 3' - Max-element 8311 2 67.81 AGTATGACAATAAGTAAATTTTATAATTAATATAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTACATACTCTATTTCCATCCTTGCGACTGCACCGCTGGATCAGCCAGATCATGATGTCCGTGCTCAGCTGACAACCGATGT:1 - chrX 16327845 3' - G4 3809 1 52.74 GCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTCAGGGCCAACGTCTGCTACGAAACTTGCCGGGGTCGTT:1 - chr2L 23372468 3' - gtwin 12 2 77.40 TGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATG:1 - chrX 16995042 3' - jockey 81 1 67.36 TAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATGAAAGTGGAAAAGTGGTCTTAACTGAAGAATAATTAACTAAATTTCTTATGTAGTTACTATGGACTTTTCTTGGATTTTGCCA:1 + chr3R 26636835 3' - pogo 121 1 54.11 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTGTATGGCCGAGTATCTTACCATTATTGACCACTTATTGACCCATTTATATGTAATATTCTTTATTTTAATATGTAATGTAA:2 - chr2R 1329956 3' + roo 9032 1 58.22 AAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTCTGACTCATGTTGTACCG:1 - chr2R 9408151 3' - FB 49 1 52.05 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGACTTGGCCTAGACACACGGACAAGCCACTGCGCACA:1 + chr2L 20908647 3' - FB 68 1 75.40 CACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' + Tabor 7320 2 18.98 TGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATAGT:1 + chr3R 29952777 3' + invader4 249 2 74.66 GGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCACTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCT:1 + chr3R 8965210 3' - HMS-Beagle 89 2 78.77 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTAAAGTATTTCAATCGACGGTAGGCAGTT:2 + chr3L 22635809 3' + hopper 1388 1 66.44 GGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCCCCACCCCCTC:1 + chrX 21667997 3' - gypsy2 6493 2 79.45 TCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGCCTGTTTAAGAATATATCCATTTCAGGTGTTACATAATTCTCAACGAATC:1 - chr2L 21902491 3' - Ivk 35 1 59.59 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGACTATTGAAGTCTATCCACTCTATATGAAGTTCGGAAGTTTGTGGCTTTTATCGACTACAAATCCATAAAATATCACACAAATAAGCTTCAGCAGTTTGTCTC:1 - chr2L 11043475 3' - roo 17 2 72.60 TTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATAAATCATAACAAGAAAACAAAACAAAACCGAGAGCTCTGAGCTGTTAGCTGAGGGAGAACTG:1 - chr3R 21591340 3' - Juan 4083 1 55.48 TTCTAAATATTACTGCCTAAACATTAAATTTCCTTTATACTCTTAATCATATAATCTTTGTAAATACCGATTAGATTAAGTTGTCCAAGAAGGGTAATAGTACGTTAGTCAATAAAATAAAATAATTTCGTTAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 8204452 3' + jockey2 3241 1 56.85 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGCTATACGGCT:1 - chr2L 2336237 3' + 297 6896 2 78.77 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGTCTAAAAATAG:1 - chr2L 20716326 3' + P-element 2835 1 50.00 CTTGCTCTCCAGCATTGAAGAGACCCAACAATTGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTT:1 - chrX 14317415 3' + Porto1 356 1 77.40 GGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATGTATTTACCTAATTGTGAGCCATGCCAAACTAAATACTTTCTCTACTTCAATTTAGTCTTTCACAATCAGCAATTGAAGACTTCCCTTAATCAATTGGAATTGAATCTTATCT:1 + chr2L 19217765 3' + springer 377 2 78.08 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAGAACTACTTCAACTATAATCCTTAATTGATATTCTAATGTAAATTTAGTCAAATAGGGTTTTTTAGGAGAGAGTTCTTTTCGT:1 + chrX 19736548 3' - pogo 36 1 54.79 TGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGA:1 + chr3L 3540184 3' - mdg3 83 2 80.14 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAATTATTTGGCGTGCCTCGATTAATTGGCATCAA:1 - chr2R 14767330 3' - Tirant 8113 2 79.17 ATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGC:2 + chr3R 9862959 3' - Stalker2 7329 2 71.92 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGAAGGGTAGAGGGTATGAGCACAACTCCAAAC:2 - chr3R 4739726 3' - P-element 91 1 26.03 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGCACATATGTGCCCACTCCATTGACATTGACTGGTCGACTATTTGAATATTGACAAATTATTGACTG:1 - chrX 1726643 3' + 297 346 2 55.48 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATACAACTATACAAATTAGTTGGGCTAAAATGCTTAACGAGTCTAGTGTGTGCACAAAGGGGTTTCCACAGGCCA:1 - chr3R 17747254 3' + 297 349 2 55.48 CTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAATTAATTAAATTGAAGTTCACCAACACGAAACCACCAAAATCCACCGCCTTTGTTATGTCAAAGAAGTTAA:1 - chr3L 22638763 3' + Juan 4161 1 56.85 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTAATTACCAAACTGCTGAAATAATTATTGTGTTGGTTCTGTTTCTGTGTGAAGGATGAAAT:1 + chr3R 25053104 3' + pogo 2042 1 60.96 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATGCAAACATGCATTTCACATGGGGATACATTTCTGTCCCAACTAGCCCGGCTGCTAACTGCTGAAGGGGAATGGGGATGGCTGTTTTTAGGGGGGGTGGAGG:1 + chr3L 5329230 3' - 412 18 2 72.73 AATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTGGAATCCATTTGGCAAAGTTATGGCGTCTGGAAACTCAGGTTTGTGTACTTCTTCGGGTTTTGGGC:1 + chrX 4765938 3' + 3S18 285 2 56.16 GTGCCTAAGCAGAGGCTCTGGTGACCGAGAACAAACCTCCGGAACAACCCTCAATGTTAAAAGCTGGTTTTCCACATAGGTAGCCGTTTAAAACAGGGGCCATTTTTTTATATTATTTAGGGAGCGAGATCGCCCGCTTAGGATAT:1 - chr3L 25674201 3' + Rt1b 239 1 28.08 GTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAACATAATATTCAGATCAAGAAATAACTACTTTCTCGTTAATCGATTAAATTCTCACTAGATAGTTGAATTTCTTAACCAATGGAAGGCTTAC:1 - chr3R 21755289 3' - Juan 3829 1 63.70 AAACGTACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGCTATGTTTGTGTGTCCTAGTCATAGTCGTTTATTCTACAGTCTTATGTATAACTCCTCCGGCGAACTCGCTGCTCCTGCGGCGTCCTGTTCGACAAGTC:1 + chr4 145520 3' - I-element 4997 1 53.42 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGCGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCATTACATTTAAAAATATTTTAAAATAAGCACACTATCTACGTTTAAACACTCTATATACACC:1 - chr3L 25821781 3' + opus 441 2 58.22 ACATGGAAAAATACCTCTGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATATGCAAATGACAAGCATTCGCCGTTTGGCATTTTCCTCGCTGCGAACAAGGGGTACCAGGGTATGCGAAAAATAACTTGAAATCGAAAT:1 - chr3R 31887712 3' - HB 48 1 49.32 CCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTGGTGGTGGGTGTTGATGGGGGGAGGAGGCG:1 - chr3R 27409154 3' + hobo 2867 1 76.38 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAGTAATTAGTCCGTGTTTTGAAACTTTTATTTAGTTACATATAATAACCAAACTTGAACTTAATCTCGCATTTTAAACTTAATAAGTATGCAAAATGGTTT:3 + chr3R 27443288 3' - 3S18 5787 2 70.55 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATTGCGTCATTTATGCATCTCATAATTCCCCGCATAAGTCCACCAAACAACCGACTGCGAATCCTCGTTACACAGATTGGAGCCA:1 - chr3L 22445153 3' - Transpac 4954 2 61.64 GCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTTGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTCCTTTTGTTTTCTTGCCTATTTTCTGTGCCTTTGTCTTTGACCAGCTGTTTTGCTTAGCATTGTTAAGTTTTAT:1 + chrX 8418275 3' - F-element 412 1 53.42 AGGAGGAAAAGCTTGAGAATTTGTTGCCTGTGAAACACCGGTGTAATCGTGTCCGCGGATTGACGTACCCTTGGCGGCGGTGCCCTCGGGACTCCGGGCCACCAGACCGGCATGGGTGATCTTCTGCGTTTCGGTGGTTCCATCGG:1 + chr2R 22736759 3' - Gypsy12A_LTR 2012 1 55.48 TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAAC:1 - chr3R 19589932 3' - BS 5075 1 70.55 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATCAACCCGCGTTATTATTTTAGATTGACTGACGTTCATTATACAAACATAGAACATAGAAATGCAATT:1 + chr3L 19788209 3' - FB 55 1 54.79 CACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACTCTGTTGTTTTTTTTATGTATATTTGTTAAGCTGCAATTGTTCCCCTTTCGCTGACCCATTAATGCATTTCACTCGCCAGTGATATTTGCTC:1 + chr2R 20361485 3' + INE-1 539 1 93.15 GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATG:1 + chr3R 24301927 3' + Tabor 437 2 53.42 GTGCCTAGAGTACCGGGTGTTTATCGGGGGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAGATTGCA:1 - chr2L 16360550 3' + hobo 2895 1 53.42 GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGTCCATTTGGGTAACTAAATAGCTTATGGTTAGTTTCCGCGAATTTTAAGA:1 - chr3L 5425460 3' + blood 7319 2 66.44 GTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTTTGGACAGCCTGTTGGATTTAATTTGAGACTCTTC:1 - chr2L 9988124 3' - hobo 83 1 75.00 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTTTCATTTATTCGTTTGATTGGTCAATATCAGCCAACTGATTAGATCTCCCTTGATTAACCATAGAAAAAAGG:1 - chr2L 11559695 3' - roo 47 2 54.79 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGTATGAATTTTTATAGCAGGAATAGTGTCCAGGCTACAGAACAATATGCTTTGGCAGAGTTCGTTGACCTGGG:2 - chr3R 25929313 3' - 297 6621 2 58.90 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCGTGTCGGGAATTATGGCCCTAGGTTTTCTAGAATCCCACTGTTTGACCCATTCTCTGGCTGAGCCTATCTGGTCGAAGAAATCTAGAAAAAA:1 + chr2R 11379908 3' + hobo 2912 1 66.90 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCCATACATGTATGAATTTCTCCGAGGCATAACTCAATTTGAGTCCGCTCACAGCAAGGATAATCATGT:1 + chr2L 2523025 3' + mdg1 401 2 71.23 TCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCA:1 + chr3L 9240458 3' + 412 407 2 75.34 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTATACACAACTATTAATTTTTGCATTGACTTCTCTCAGTGTATTCTAACAGAAAAAATTATTTCTCAATGTTATATCCGTGAAATA:1 + chr3L 13016014 3' + hobo 2901 1 58.90 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCGTTCACCGCATTGCTCCTGATTAAAGCCTTCGCGTCTTCCACGACGTTAATCAATTTCAATGTTACATGTTCAATGT:1 - chrX 6732316 3' + roo 9029 1 54.79 ATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCTGCCATAAAACAGAGACTGTAAAATGTGCATAACTAGCTGGGGCAATTTTTTAAATTTAATGGCTG:1 + chr3L 19398225 3' + gypsy5 353 2 57.53 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATAATATTACAATATCAAATTGGGTTTGCAGCCAACCGATTAATCACATCC:1 + chrX 12458979 3' + pogo 2034 1 65.07 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCTGTAACCAATCGAACTTCC:1 - chr3L 19510476 3' + pogo 2052 1 53.42 ACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCATCTTTTACTCTGTGTTGTTCCTAAAACTATGGTCCTATGTGCAGACGAATA:1 + chr2L 16825629 3' + accord 392 2 65.07 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATTTGCAACTTCGCAGCAGCTGCGCAATTTACGTAGCAATTAAATTGGGTCTTCAACTTAAGGTTTGTT:1 - chrX 22577974 3' - 297 44 2 52.74 ATATTTGAGTATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGAGACGTGTGAAATATTATAAGGGCAATGATTGCTGTGCTTCAAGATATGACTTTTGTAGCGGGATTAGGCGAGGAGCGTTCTCCACTTCTTTGGAGATTCGCTCGCATGAA:1 + chr2L 11801479 3' + 1360 395 1 62.33 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCACATGCAGTCGACTCTATGAACCAAGAGAATGGCTTAGAACCCACCAAAGGAATCACTTAAAA:1 + chr3R 29719426 3' + hobo 2897 1 51.54 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCCAAAAACAAAAGCGACGTT:1 + chr3R 18935177 3' - jockey 4742 1 63.01 ATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTAATGAAAGGGTTAACGTGTCAGTGGTGTTAGTGTTCTCTTTGTTTTTTTTTTCTTGTGAATATTTT:1 + chr2L 1871113 3' - mdg3 113 2 53.90 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCACCAAGCCGAATCCATC:1 + chrX 12003971 3' - P-element 102 1 15.75 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAATTATGGTGGAACAATGGCTTAAGAAATTGATACAATCCAATTGAGGTTGAAATGATACAAGAACATTTTTTATTTTAATT:1 - chr3R 7305883 3' - 412 7092 2 58.90 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTACATTTCCGATATTTGGACAGTGTGAAAGCAATACGTTTTGTTACAAACATTTTAATTACGCAAAATATTTATTATTTTACGCAAAACATTTACAATA:1 - chr3R 11873302 3' - 412 23 2 69.18 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTC:1 + chrX 8610303 3' - mdg3 5327 2 66.44 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAAGGGATAGGAAGCGTTTTGATATGATGGATACGGGGCTG:1 - chr3R 5767389 3' - roo 8721 2 70.00 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAAGGTTGATTGATTAGATTCAATGAAATCGTTTTTTTTTTTGTT:1 + chr3R 2448014 3' + 1360 3366 1 63.85 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTATGGGTGGTTGGTTCTACATCGGTGTGAGTTT:1 - chr3R 26404974 3' - hobo 27 1 65.75 TATCGATTTGCCAAAAAAAACTTTTTCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAGCGGTCCTAGTATACCCGGATAAGCCGCAGGCGGCGGGAAAGTTTGGGAAATCCGAATATCAGGAAATCCAATAGACCTCCATAAC:1 - chr2R 14876510 3' + INE-1 315 1 47.06 GCCAGGACCTGGTTGACTCCATCCCAAAGCGTTGCGCCCCTATTATTGCTAATAAGGGATGGACTACCAAATATATACATATATTAGTGGGATGGACGCAGTTTTAATAGGCAATTTAATATGCGTTTTTTTATGAGGTAGTTATA:1 - chr2R 8106977 3' + Tc1 1278 1 54.11 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCCAGCTTCATAGCCACTCA:1 + chrX 7624152 3' + roo 9011 2 63.01 ACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAAGGAACAAGCATATATTATTATCATTTTTTGGATTCATTGGATTTTTCAATTTATCCCATCAATTATGATATCGAAAATGCT:1 + chr3L 21044654 3' + Quasimodo 427 2 59.59 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGAATGGCATAAAGATTATTTTTGTAATT:1 - chr3L 19938449 3' + roo 9030 1 56.85 GTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCAGGTACATAGAAGTCAAGGCGGGAATAGATCATAAACAACTCTTCCGTCTTACAGAGCACCTT:1 + chr3L 22445287 3' + Transpac 5175 2 57.93 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGCCTTTCATATGGTGCAGATACACTTCCGCTGGCTAACGATAATGGGAATGGCTTTTAA:1 + chr2L 20068074 3' + roo 345 2 65.07 GTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGTGCGTGCGATCAACGCATTTTTCGCGAACTACATCGGCAAAAATTCGAATAGTTCAGAATATTGAACGAAATTTG:1 - chrX 22652687 3' - ZAM 48 2 52.74 ACCTTCAAAAAAACAAGAAAAAACAAGAAAAAAAGCCACACCAAAATCTATTTTATAAAGAAAATTAGCATGGGGTGCAAATTAGAGAAAATTGCAATTTATTTTTCACACAATTTGTTACACTTTTTCTTTTCTCTGCGAGTGTT:1 - chr3L 3772958 3' + Doc2-element 212 1 79.45 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGAGACGAGCGCAGAGTTATTGTTATTGTTGCTTTCCTATATAAATTGCATTCAATGGCCGC:1 + chr3R 5087205 3' + P-element 2869 1 73.97 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGATAGCGAAATCAAAGTCGAGTTTACTGAATCCACAATACACATCTCCAATAACCGCAACGCCTTGGCGAGGCAACAAAGCACA:1 + chr3L 1728605 3' + blood 7350 2 43.84 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGAATTTATGTTTCTATAAGTGGACAAAACTAAACTATTGCATATGCTTATGATCACAAGTTATCCTTAAACACCTTG:1 + chr2R 11610000 3' - roo 8707 2 53.79 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGGTGCAAATTTTATAAAACAGTTTCAACTCGATAATCGGGTCAGGACTTGTGTCCTACATGTGTGTGTGCTCGGCTTCCTTT:1 - chr2L 246554 3' + P-element 2863 1 66.67 TTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTGCGATTGTGCATTGACCTGATTCGGAAAATGGAATGGAAAATGGGTGTGAGATTGGGATT:1 + chr2R 10960964 3' - Doc 68 1 59.59 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATATTGTTCGGCTTTCGCTCGCTTTCCACACAGCAGCAGAGGAGGAAGCTCAGTGGCACTGCCTCG:1 + chr2R 12873017 3' + P-element 2869 1 72.54 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGAAATTTTATTGAACGGCTTAG:1 + chrX 18193866 3' + hopper 1410 2 78.08 ATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATACCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTACATATGTGTACCCTATTCGACTTTATTTGTATGTCGTTTAATGATAAAACTTTGAC:1 + chr3L 17784017 3' + Stalker4 7164 4 67.12 TCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGGCGTCCCACGTCGCCGTCGG:1 + chr2R 11818252 3' + P-element 2785 1 15.75 CGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTTATACTTTACATAATCGGAAACGTTTCCTTCTACCTGTTACATACTTTTCAA:1 - chr2L 21902497 3' - Quasimodo 62 2 66.44 TTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAAGTTCTCAGTTATCTATTTTGGCAGCTTAAAAATTGTATATACAC:1 + chr3R 27948298 3' + Juan 4140 1 69.18 GCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTCTGACTCATGTTGT:1 - chr2R 9408155 3' - FB 53 1 54.11 TCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAAATATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATTGTATATACTTCAGGAAACGAATTGACTCGCATTACTCATGGATTTTACTGCATTTTCACTGCAT:1 - chr2L 13976170 3' + I-element 5299 1 51.37 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGAGGCCGGAACACCGGTTTTCCATCGTGTAGATACTCCGGTTTCAGATAGAGTCCCTTGCAAGATCGTT:1 - chr2R 12872873 3' - P-element 54 1 48.63 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTGTAATCGATATACATACAGGATATACCGAAGATTGTTTTCGTTAAAGAGGTGAAAATAATGCAACAATGAATAAATTTTGATTTTAACATTTACGA:1 - chrX 10344724 3' + roo 9046 1 39.73 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCGTAAGTCGTAAAGCCCTGAGCTTGTGGGTCGTCTTGTACGTG:1 - chr3R 12547869 3' - hobo 74 1 69.29 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGA:1 + chr3L 17895984 3' + P-element 2801 1 28.08 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGTGCCTTAAATATCACTTATCACCTGGGACATCGCAAGCTAATTACAAAACTATTGCCACAGTCGTC:1 - chr2R 18785937 3' - roo 8720 2 57.53 CGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACACACTCGCCAGGAAAACAAACAAACAAACCAACTAAGCAACCAACCAACCAACCAACCGACCAACCAACAAACAAACAAACAGCGAGCGCCCAGATAGACAAA:1 + chr3L 8372841 3' + F-element 266 1 72.60 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCAT:6 + chrX 8610305 3' - mdg3 5325 2 65.07 TTTATTTAAATAAAAAATAAAAATTAATAAAAAAAATGAAGAAATAAATGTTTTAATCTCTAAAAATATTCCATGTGAAGTATACAGTGATTAAAAAAGTTACTTTTTTTTAAATCTATTGCAGTACAATATGGTGTAGAACTTGT:1 + chr2L 16548691 3' + transib2 2634 1 71.92 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTTTGACCGCACAGTCAATTTAATTTTAATTTACACTTCATG:1 + chr3L 19434148 3' - Doc 88 1 80.82 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGTATTTAGGGATTCGACGCTCGAATCCTTTCAACCCATCCAACT:1 + chr3R 11550317 3' - F-element 46 1 59.59 GAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTA:1 - chr2R 14921495 3' - pogo 81 1 75.34 ATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAGAAATGCTTAAATCAAAAATTTATCTCATTAAATCCGTGTCTCGTCTCTGGCAACTTTACTCGCCACTCTCGACTGCTTTGACACTCGT:1 - chr3L 22019100 3' - flea 4943 1 64.38 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGAATGGATCCGTAATGAGTGTT:1 - chr3R 18940462 3' - mdg1 7051 2 75.34 ATGGATTCTGTTCCTAAATTATAGTGTCCACATATGTTCCGTGGAGAGATTATACTATTTACGTGTAAGGAGTTCAAGGAAAAATAGTCAAATGCATATCAAATATATTTCTTTTCTTTTAGACTTTAAAGCGAAGTGTGTTCCAA:1 - chr2R 4350408 3' - G5A 2751 1 52.74 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGTCCGCAATTTGCGCGGACTGCGGTATCAGTATCTGCAAGATACTTTTGAATTAATTTCACGCTTATAAATAAACGAACTTATGGCTT:1 - chr2L 19907500 3' - hobo 12 1 77.40 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTGTTGAGGCAATGTAATAACTATCCCCAATTATATTTATATCCCAACTGAGAATATC:1 + chr3L 19510591 3' - pogo 62 1 62.33 GCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTAATTTAACATTATGCGGCAGACAGAGCAAAATAATAAAC:1 + chr2L 19841619 3' - BS 19 1 68.49 AGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGATTTAATCGCAAATCGGAATAACGATGGAGAAT:1 - chr3R 21276488 3' - BS 5012 1 70.55 AGACTAAAAATTTCTTGCTCAGACAGCCAACATATGATACATTATGTACAAATTATGTACATTATTATGTATTTACTTTCCTCCTTAGTTTTTACTAGTCCATTATTTTAAAAAATGTTCTCAAAACGTAGGTCCCAAAATTTATG:1 - chr3L 14585759 3' - Tc1 126 1 57.53 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAAGGGATAGGAAGCGTTTTGATATGATGGATACGGTGCTGCC:1 - chr3R 5767387 3' - roo 81 2 73.97 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATACAACTATACAAATTAGTTGGGCTAAAATGCTTAACGAGTCTAGTGTGTGCACAAAGGGGTTTCCACAGGCCATTTAAAATCCCGGCAGACTCAAG:1 - chr3R 17747231 3' + 297 374 2 72.22 AATGAATTTTAAAGGATGGGCACACGAAATTATTAAGTTTTAAGAGGTGGGCAATCGAAATTATTCAGTTTTAAGAGTTGGCAAACGAAAAAAACTTCTCCCTCTATTTATATTTTTCGCTCTATTTCCTTTTTAATAAACTTTCA:1 + chr3R 16005198 3' - FB 810 3 64.38 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTA:1 + chrX 6213595 3' + roo 8988 2 76.03 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAAACACACGCTTCAATGAGAAGGTTTTACCAGAAGAAGTTACCAGAATAAACCTTAATTTTGTCA:1 - chr3L 18954116 3' + roo 356 2 54.79 ACTAGTGAAGAAAGGGCAGGATTAAGGCTGCAGGTACAAGTTGACGAAGGGTGTATTACGGATATTACGTATCAATATATACTAAAGGGGCTTTATGTTTTTTGCAAAATATTGCTCATTCTTATGCCGTGAGTGCTGAATATTCA:1 + chr2R 4471761 3' - Chouto 6106 1 65.07 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGACTGCAGCAA:1 - chr3R 17794536 3' + P-element 2838 1 41.73 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAATTATTTGGCGTGCCTCGATTAATTGGCATCAATTGAAAGCCGATTGTTGG:1 - chr2R 14767312 3' - Tirant 13 2 77.93 CGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATGTATATAAATATACATTTTTTGTGCTCTCTTTCCTGCGGCGGGAAAGTTTTTTAAAGCGCTAGCTGCGACATCGAGCAAATTGAATAAAA:1 - chr3R 12952828 3' + micropia 5434 2 75.63 AACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCA:1 + chr3R 9862986 3' - Stalker2 54 2 53.42 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCCAAGGAAACCCAACAAATGCATCT:1 - chr3L 12775914 3' + roo 397 1 78.08 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGA:1 - chrX 19162587 3' + pogo 2034 1 66.21 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAATATTTTATTTGTAAATAATTCGTTTAAATAGTAATCATGGGTGCTTTTTGCGCAGGCGG:1 + chrX 5938382 3' - pogo 57 1 58.90 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAATCTTGTCGAAATATGTTTTTAGTTCTCGATTTAGCAGTAATAAGTAGTAG:1 + chr3L 23181702 3' - 1360 20 1 71.92 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTATGGGTGGTTGG:1 - chr3R 26404994 3' - hobo 42 1 53.90 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACTGTTGACGTTTTTGGGGAAAGGGTTGCCAGCTAATGCCGCAAACATCGTGCCGATGACAGAACTAT:1 - chr2R 8467717 3' + roo 354 2 54.79 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATAATCATAAATACTTTTCGTGGGGGGACTTAGGTGTGCGTTTTGTGTGT:1 + chr2L 1411762 3' + I-element 5280 1 70.55 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAATTTGGTCACTCGCCTAAA:1 + chr2L 15057270 3' - hobo 54 1 55.48 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGTTTGTTTTGGATCAACAGCAGCGTTTTGATGGCTTTCTAAATTTATTCTTTGATCCGGGTTTCGTTTCTCACTTTCTTGCGAACTTTCTTTTCGGGTATTTCTTTC:1 + chr3L 12776111 3' - roo 8679 2 75.34 GCATGCTAATTATGCTGACTCTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAAAATCTGATAGTTACTTAAGTGCCTTAAATACTTACGTAG:1 - chr3L 10082592 3' - Tabor 169 2 73.29 CGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATACCCTTTTCGTTGGCATTTGATTTCGGCCATCGCATTCTAAATCATCCAGCACGTGCGCCATCCAGCGGATTTGGCCAAAAG:1 - chr2R 23420670 3' - G2 2751 1 60.61 CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGG:1 + chr3R 4352109 3' - Doc 91 1 82.88 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCCAAACCGGATGTGCACAGTGTCAAGCAGCAGGAGCAAAGCGTTTTT:1 + chr3L 10069036 3' + 412 7529 2 73.29 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGAATGGATCCGTAATGAGTGTTATTA:1 - chr3R 18940458 3' - mdg1 7046 2 78.62 TAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGATCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAAACAAATAACAT:1 + chr3L 22638861 3' - Juan 4154 1 59.59 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTTAGAGGTAGTCGTTGTGGAGCATAGTGCAATAAT:3 - chr2R 15529645 3' + roo 396 1 77.40 ATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCGGGGTAGATTTAATGCGAACTTCTGCTAGGTT:1 - chr3L 6542013 3' - hobo 88 1 77.40 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCCAAACCGGATGTGCACAGTGTCAAGCAGCA:1 + chr3L 10069020 3' + 412 460 2 62.33 GAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTATATAAACTCATATATGTACATGCATATGTGCTTTGAAT:1 + chr2L 21687679 3' - pogo 81 1 74.66 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGACACTTTCGTTTATTTGCATTTTCAATTTATTAGCATAAATGTTTGTGCCATGAAACGCACGCTGCCAAACACTTGACACACA:1 + chr3R 11730794 3' + hobo 2901 1 54.79 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACATGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGAATGGCATAAAGATTATTTTTGTAAT:1 - chr3L 19938450 3' + roo 9029 1 54.79 CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGG:3 - chr3L 19951188 3' - Ivk 65 1 60.96 GCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTACATTTCCACTAAACTTAATAATTCTTTTTGTGCATTGTCTATTAACATTTTAAATTAA:1 - chr3L 23244845 3' + HMS-Beagle 6979 2 62.33 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGAGACTTTTGCGCACTCTTATACAGAACGACTA:1 + chr3R 9158293 3' - P-element 87 1 26.03 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGT:1 - chr2R 20117310 3' - mdg3 84 2 76.03 CGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCCCCATATGCTCACTTGTGGGTGTTCAGATAAATGGGTTATGAACACAGAGGACGAGGCTGGATTACCTTTGACTT:1 - chr3L 21977373 3' + R1A1-element 5183 1 63.01 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGCTACTTCAATTCGCCCA:1 - chr3L 12775936 3' + roo 9038 1 61.64 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACGAGTTGCGCAACCACAGCGCCCCCGCATACCAAAATGTCGAGGGAGAAAT:1 + chr2R 18786095 3' + roo 9037 1 61.64 CAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACAACTTTTGATTTCGGCTTACAGAATTTGGCCTGTATAAGCGAACAATGC:1 + chr3R 26968452 3' - FB 73 1 67.12 GAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGTTATTATTAATTTATTAGTCTATCTATTTGTAGAACTACCTAAATTTTTATTTAATTTTGTTGCCCCT:1 + chr2L 9317781 3' - I-element 55 1 55.48 ATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAAAAGTACGCTTGGCTGAAACATATTTTGTTTGCCAGTTTTTCGCG:1 + chr2R 18927845 3' + 3S18 6054 2 61.74 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATTTATGTGAGTTCGTGTGTATGTTTAGCTCTTGCTATTTTGGCGAATCATGTTTCGTTCATTTTTCAAAAGAATAATGTTG:1 + chr3R 23208269 3' - pogo 33 1 61.38 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATAGCTCATAAACAGGAATTAAAAGCATACCGTAAGCTTTCTAAAAAATTCGAATTGGGTTGTAAGATATATTAATATAGAGATTAAAGTTCCCAAATG:1 + chr3L 8704636 3' - blood 24 2 69.18 CTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAACCAAGTAATAATAAAACGTGGAAGCTTGCATCCATTACTTTGAGTATTTTCAATAGAT:1 - chr3R 18492887 3' - Juan 4087 1 58.22 ATTATGAAATTTCGCATTCACACTAGCTAAGTAGTAACAGGCATCTGATAGTGGGAACTTGATTTTATATTACATTCGGCGTTCTGCTTGGGAAATCACAAGTCAGCAATCAGTGTACATATGTATAATAACAAGTATAGGTCTAT:1 - chrX 698532 3' + INE-1 521 1 60.96 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGGACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTATTGCTCCCCTGGACGGAAAGCAG:1 - chrX 17531875 3' - blood 7042 2 68.75 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAACACTTAGTTACAC:1 + chr3R 24760630 3' - pogo 66 1 70.55 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGAACTCGGAATGGCTTTAGATAATGGTGCTATTGTTTTTGACATAAGTCTCTTTATAACTAGGAA:1 - chr3L 8704493 3' + blood 7333 1 55.48 TGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCAATGCTGTGAAATGGCCTGAAATGAAATTTGTGAAATTCCAGCTT:1 - chrX 17690422 3' - Doc 292 1 67.81 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTATATGTGCGTATTCTTTGTGCAGCCTACCACTCGGTGGCCTTTTGTTAATGGTAATGATAATGA:1 - chrX 12137327 3' - 297 6632 2 59.59 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATAATACCACAGGTACTCTTCTCCCCTCGCATT:1 + chr2L 20253929 3' + roo 8995 2 69.86 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAG:1 - chr3L 12775967 3' + roo 9007 2 63.01 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGAAACCTCATCGAACTGAAGACAAGGCGTTTTGACTTTTTTTTATGCTGACGCTAACTCGAAAATAATTTGATATTTTCAATTAAAGTTTTCAATGGCTTT:1 + chr2L 16360704 3' - hobo 21 1 67.12 AAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAATAAAGCTATTT:1 - chr3L 19951163 3' - Ivk 40 1 58.22 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATATTTTCTTAATATTTTGTATTCCTTTTTGTATTCATCGACAAAGGTGGACAACTTTCGGGTGTGGAATATTTAAAC:1 + chr3L 107617 3' - roo 8708 2 56.16 ATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGAATTGATATAATGTAATTGATAAAGTTGCCAACTTCCTGCCATATTGCATAAGTTGGCAAAGTGTGAAGCAGTGGGGTATAAGCATCTAAATATTCTCTGCG:1 - chr3R 29429453 3' - F-element 182 1 69.86 AGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGCGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTACACATTAGTTGCTGCACCAAGCACATATATATTTTGGATCTCGAGTTACGTAC:1 + chr4 39247 3' - springer 7194 2 61.65 CACACACACACACACATACTGACACTGACAGACACAGAAACAAATGAAATAACAAAAATGTACACAAAACATAATAAAAAATAAAAACTAAAGATAAATTAATAAACAAATAAAATTATTTACAGACGAGTACACAAAACAAAAAT:1 + chrX 13599076 3' + accord 7032 2 69.86 ACAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTG:1 + chrX 22824252 3' + Gypsy12A_LTR 2236 1 50.00 TTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACTGGAATTTGGGGTATCCCTATCCAAAACTTGCCAAGCCAACACCAGAAATAA:1 + chr3L 1872142 3' + Juan 3990 1 64.38 AAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCT:1 - chr2L 14262980 3' - P-element 94 1 21.23 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCG:1 + chr3R 4352115 3' - Doc 84 1 78.62 GACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATAGTTCCACAAAAGTGGCA:1 + chr3R 29952792 3' + invader4 3023 2 64.38 CATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTATGTATATAGTAATACATCAACAACGTGTAAAAGCGTTGAAATAAGGCAGCCCCGATTATGATAAGTAAATGGTTAATGCCATGGGTATGAGTCAATGTTTGTGTTTTGGC:1 - chr3R 4570184 3' - Juan 13 1 76.03 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTATTTTCCACAAAGGTACAATTCTTTAAACTTATGAAAATAGACTCTTAAGAAGTA:1 - chr2L 10177951 3' - mdg3 25 2 69.18 AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACAACAAAATAAAATATTTAACAAAATCGTTACACAATTGATTTAAATGGG:1 + chr2R 22040974 3' + jockey 4919 1 71.03 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCA:1 - chr2L 10178009 3' - mdg3 83 2 72.60 CTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACTGATTTCAGCAATTTATTAAGACCTTGTGAGCTATTAAAAATTTTACTACTTGACCGCTGTATTTATAAAATGAAATTGATTATTTCAGATGCTGCTATGGCGG:1 - chr2L 12447366 3' - opus 125 2 74.66 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAATTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAATTTAAGCTGTTAATGGCCCATTTGGTTTTTTTAAATGAACCAAAGGAAGATCATAG:1 + chrX 10838636 3' + roo 9039 1 61.64 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATTTAATTAATTTAATGGACGGCCAATAAAAGTGGGCAGTTATTAATGAGCATTAAAGTGTGAGCTGCAAATGAAAGCAGTAAATAATAAATACATCAAGGTTTTTT:1 - chr3L 20042363 3' + flea 240 2 76.03 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCCCTTTTTGCAGATATATTTATTATCATTTTCTATAGCATTTTCTTTTTTTGCCAATTGTAATTTATTGCGTTCATTTTGAGTGAGCCATGTTTATTATTGTTTAACAAAGGATTGTT:1 + chr3L 20042574 3' - flea 4758 1 80.82 TGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGTTATTATTAATTTATTAGTCTATCTATTTGTAGAACT:1 + chr2L 9317750 3' - I-element 86 1 76.71 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTCCAGTCATTTCCTTTCAATTTAATATTTATGAAATATATATATTCCATTCCG:1 + chrX 10344869 3' - roo 8728 2 65.52 CTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAGTAATTAGTCCGTGTTTTGAAACTTTTATTTAGTTACATATAATAACCAAACTTGAACTTAATCTCGC:1 + chr3R 27443256 3' - 3S18 54 2 52.05 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACTAACATGTTACATAAGCCCCACACCCTTCTTCCAACTAATTGGATTTCTGGGAACTCACTTACAGACATGACCGCCTTCCTCA:1 + chr3L 18954250 3' - roo 8701 2 58.90 ATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAGTTTGAGTTTTTGATTGATATGACATTGATGCCATTTTGGTGGCTCATTTGAATGGAATGTTTATTGTCGGCTTTGT:1 + chr3R 22266554 3' - roo 42 2 56.85 AATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATATATCCTTTTCCCATTTAATTTTACCTACCTTTTAATAAATACTTTAATAAGTCATAATATGTGCGTAAGCATACTAACCAGATAAAAAACA:1 + chrX 21638148 3' - gtwin 28 2 66.44 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCACGCATATTCGTATGTGTGCGCGTGTGTGTGTGGCCAAGCGGTTGCGCTCGTTTGTGTTTTGTGGGTTGGCCATGCATTTCCGGTTTTAATGAT:1 + chr2L 5656674 3' + hobo 2912 1 65.75 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAAACATTAATATGCTGGCTGAAGTTTCGGG:1 + chr3R 13198320 3' - Doc 29 1 69.18 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGCCATAC:2 + chr2L 18848797 3' - blood 7088 2 70.55 CATATATTGGTTTATTACAGGATAGCGAAATCAAAGTCGAGTTTACTGAATCCACAATACACATCTCCAATAACCGCAACGCCTTGGCGAGGCAACAAAGCACATTTGGCAAAAACGATTGTTAAGAATAATAAACGATTTCAATG:1 + chr3L 1728647 3' + blood 380 1 43.15 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGATAGAAAGATGAATGGATGGATGGATGGATGGGTGTAAGGGTGTCTGAACAAGC:1 + chr2L 7596094 3' - P-element 19 1 35.62 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTGATCACTAAAATGCAAAGCAATAGTAGCTGGTT:1 - chrX 12344302 3' - F-element 76 1 60.27 TTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTAGACATTTGCTTATATCTGCAGAGCCATCTCATCATACAATCACCTTATATTACAAACTTA:1 - chr2L 5723853 3' - flea 54 2 60.27 TTCTGCCGGCTATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTACACATGAGTTGCTGCACCAAGCACATTTATATTTTGGATCTCGAGTTA:1 + chr4 39242 3' - springer 75 2 69.86 GTTATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGGTAAGCCAAATTAGTAGAACCTCGTTAAAATCGCACACAAAGGAGAAGAAGCTGCGGGAGAGCCCGGTCCATTCCAGCGCCAATTTATGTAA:1 - chrX 15154891 3' - Rt1a 5087 9 57.50 TGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGCTAAATTAGTGGGAAAAAATAAAAAAATGACTGCAAAAGTCT:1 + chr3R 20146424 3' + Doc 4453 1 70.55 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTGTTGGTTAAGTTAAAGCAATATTTTCCAGAACTCCCTGCGTAT:4 - chr3R 20097609 3' - mdg3 5331 2 68.49 TTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACCACCAAAACATCGTGTAGTTCGACTTGCAACATCCCGATCTCGATCTCGATAACGATATCGATTTTGTTATCGATCTAGATGTGTGTGTTCCAGTTCCCTGTCTTACTATAATCTAG:1 - chrX 11236328 3' - copia 4875 2 79.45 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAAACAGATGGTCTGCCAATCAACTTCGAATCTTCGAATACTTCACTTCCATCACTGCTGTTATTGCTTCCAATACAGCCAACTTTCA:1 - chr3L 24089490 3' + mdg1 7424 2 60.96 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATTTCAAGCTTATTAATATC:1 - chr2R 8375024 3' - roo 64 2 69.86 CGAGTCGCCTACTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTGATTTAATTCTTTTTCAAAGGCTTTTTAATTCATCATCAATTTGTTTAATT:1 - chr2R 18922513 3' - opus 65 4 63.70 ATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 5331 1 67.12 TAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGTACATACTTCCCCCATCCGAACCGACCTTATAGACCAGAAGTCTCTCTTTCCGGCACTTTTTGTAATGCCCCGCTCTGAGTCTCAC:1 - chr2L 9228637 3' + Burdock 6358 2 60.27 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAACTTGTGAGGAGCGCATACACA:1 + chr3R 8965255 3' - HMS-Beagle 6840 2 54.11 ATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATCGGCACTTAAACAAAGGGCGTTGTTCAATATATATGGACGTACAAATTGGCAGTCGGTGCTCGTG:1 - chr3R 29952675 3' - invader4 2808 2 50.69 TACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGATATTCCGAGTATACGTCCGTAAATGCGTATCGATTTCCAC:1 - chr3L 21765374 3' - gypsy 7007 2 71.92 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAAGAGAAAAACA:1 - chr3R 30524461 3' - roo 67 2 66.44 GTTAAGCCGACTAATCAAGTCAGAACTCTTAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAATACATATGACATCACTGGCTGATAATACGCTGTTACCAATTCCGAGCCCAAACCTGAACCCGC:1 + chr2R 14575187 3' - Cr1a 4081 1 51.64 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGTTTTACCAAAGTTTCGAAATTTCATCACAAGAGTAAATGGGGTCGGTCT:1 - chr2L 5656494 3' - hobo 13 1 76.71 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATT:1 - chr3L 10068905 3' - 412 75 2 69.18 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGCGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCAAAGTACAGCTCAAGTGAGGGCTCCTCCTTTGTAGAATAA:1 - chr3L 1728470 3' - blood 81 2 69.86 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGCTATCTAACCGAGTTCCCTGTGGCAACGAGGCGTGGCAGGGGCCGGGCACATGGTCAA:1 + chr3R 12886084 3' + 412 431 2 62.33 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGTTGAGATGGATCTTATTTTAGCACCCCTCATAAAGGATTCCCATGACATTTGATGGTGAAGTTGATGAGTCACATGGGAA:1 - chr2L 5333336 3' - mdg3 16 2 75.34 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCA:1 - chr3R 19537468 3' + hopper2 1558 1 51.37 TNTTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTGGCTTTGGTAATTGGCTTACTCCACTTTGTCCGTCGGTTTGGCTCGTCCTGCGGATTTCCCTTCGTGTTCGCTGGATGTTTTGCTTCTTTTCC:1 - chrX 11243418 3' + copia 4963 2 67.81 AATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGCTTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGA:1 - chr2L 42513 3' - copia 76 2 73.29 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGT:1 - chr3R 26405028 3' - hobo 81 1 72.60 GTGCATACGGACAGACGGACATGCGGACATACGGACATACGAACATACGAACATACGGACAAGTGATCGTGACCAAGAAGATGTATACTTTATAGATATATACTTTTCAACTCGTATACCCTTTACTATACAAG:1 - chr2R 8638740 3' - INE-1 123 1 73.88 TTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATTTATGATACTACCGATATTATTTTATTTACTTTCGGGCTGGAA:1 - chrX 6863587 3' - Juan 4161 1 74.66 ATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGATTGTTTATTTTGGCCACTTGAAGCTCC:1 - chr2L 12695065 3' + hobo 51 1 71.28 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTGTGTTTCCGAGTGTGTTTCGGGTTTATGCTGCTTGAATAAACTCTTTCTTCCCA:1 - chr2R 22372488 3' - I-element 59 1 62.77 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATAATGCCATACAATCTGAAATAGTCTGTTGTGTGGCAAATTAGATCTAGAAACTGATTGATATAT:1 - chrX 18318146 3' + copia 5069 2 56.16 AAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATAGATACGATGTGTTGTTGCAACAGGACGTGACTTGGGTG:1 - chr3L 9317481 3' + HMS-Beagle 6966 2 73.29 ATTTTAATTCAATAAATTAAATTAAAATAGAAACAGGGCGTTATTATATCTAAACTAACTAACTCGTTTTGATAAAAAAAAGAGTTACTGCCACTTACTAAAGTGTCAGAAAAACACTCATACCATTTCGCTGATAAAAAAAAACG:1 - chr2R 11480708 3' - Bari1 319 1 89.04 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCACCTTATCTTTACATATGTATTAATATAATATAGTTCTATATTTTTGTTGCGCTCCTATGTGGTAAGTATTTTACCGGTATGTATTATAAACTAT:1 - chr2L 12814678 3' - hobo 24 1 67.81 AAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTTTAACAAAACAAAAAAAAAAACAGTGTAACACCACCCTCACAAAACACGTTCACACAACAAAGTGAAACAAA:1 - chr3L 3580854 3' + copia 253 1 64.00 CGGTGGGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGATATAGTGATGTATATTCTTGTGTTGTTTTTTTTCGGTGCCGCTTTAGTTTGGCCGCAGTTGCTGC:1 + chr2R 10936750 3' - copia 4925 2 54.79 TTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCATTCGCTGCCAGTTTTCTCCTACACCTAAAGCGATTTATATACATATAA:2 + chr3L 21043128 3' - Quasimodo 64 2 66.44 TAGATCTGGAATGTACGCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTAT:1 + chr2L 2522955 3' + mdg1 331 2 79.45 GGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACATATATGAAGACTGGCACTTGAGCGGATAGAAGGAACGGCGGGTG:1 - chr2R 15892139 3' + hobo 2877 1 64.71 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATGAAGCTCCTATTAAAGAGGTGTTTCCCGTGGCCGATTTAAGCTGC:1 + chr3R 26658225 3' - hobo 75 1 67.59 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTATTTTTGTGGCTGCACACATGTTTGCGCAACAGGAAGTTGATTGCTAACAAAGCGGA:2 + chr3R 11873468 3' + 412 7512 2 61.64 AACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTCTGCACACGTATGCTCATGCATTGTTAATTTGACAAAATATGCCACGGATCCCGCTATCCCGCTATCCCATCAGCCGAACTTGTATCTATGTATCTATCAA:1 + chr3L 14922788 3' + 1360 137 1 61.64 CTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCAGATGAGAGTCGGAAGATAATGCACGAAGGTTGCCA:1 + chrX 10501337 3' - F-element 99 1 74.66 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTAAAAATCATTTAAGCTTGCTAACTCCACCGAGAGTCTTTTGAGTCAGAAAAGTTGACCAAAAAATATGCACAGTTCACAAAATG:1 - chr2L 15596890 3' + roo 9038 1 61.64 TTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTTCGTCGTTTTGCCAAGGAGACGCTCCGCTCA:1 - chr2L 20985798 3' - F-element 103 1 77.40 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATAGCTCATAAACAGGAATTAAAAGCATACCGTAAGCTTTCTAAAAAATTCGAATTGGGTTGTAAGATATATTAATATAGAGATTAAAGTTCCCAAATGTTCTA:1 + chr3L 8704641 3' - blood 19 2 72.60 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCCTAATGACATCTATATGTTAAGATTTCTCCGGGAATGTTTGTCGTTCGAATATGATAGA:1 + chr2R 11371371 3' + pogo 2042 1 63.70 GTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTTGCCTTATCAATGGGTGAAATTCCAAAGCTTATCTGTGATCCTC:2 - chr3R 8293503 3' - Stalker2 34 2 60.96 TACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGGTGG:1 + chrX 21907829 3' + Idefix 82 2 64.58 AATCCAGTGAAGAAAAAATGTCGTTTCCTGTTCGCTGCTCGTCGGCGGCTCGGATGTTTTTGAAATGGTCAGGTAACTAAATGCATTCCGCAACCGGTGTGCTCTGCAACCGTCACCGTCGCTGCATCGCCGCTG:1 + chr2L 5332644 3' - mdg3 479 1 80.00 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCGAATATTTAAACACGTGTATATTTATATTTAC:1 - chrX 20369397 3' + roo 320 2 78.08 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTCAAGTCAATTGAGAATGAATACGTTTTCTTTGGGTTTTCTACGCGATTGAAACCTGTGGTGGAGTATATTGGCAACAAATATTATGCCAACAAGAAGCTGCACACT:1 - chr2L 8009004 3' - roo 8677 2 74.66 CTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAATTGCTTTTGATTGACTCATTCAATGCGATTTGTTTTGACGGCTTACGTTTCATTTATCAGGCCATAAAAGGAGCAGATCATAATTCAAAAG:1 + chr3L 13475639 3' - HMS-Beagle 6823 2 65.75 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGAGGGGGTGTGTGTTTAAATGGCGCCTGGAGAATATC:1 - chr3L 5731269 3' - 297 6642 2 70.54 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTTCTTTCATACTCAACTAGCGACTCAACTCGACTAAACTTTCCTTCTTCCTTTTCCCGAATTTA:1 + chr3L 2240505 3' - roo 37 2 55.04 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATTGACCCCGTTTCCGTTTTCGATTGCAATTCGTTTCAGTTTCATGCACTTTGCACTCTCCACAGCGGCAACCCCCACCAC:1 + chr3L 1983572 3' - Transpac 27 2 64.44 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGTGTATCCTGGCA:1 - chr3R 23565272 3' - jockey 95 1 77.40 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTAGAACTCGACGCTAAATTAGAATTATGCAATTACGGCTCATTTGCGCTGCACACGGCTG:1 + chr3R 26405104 3' + hobo 2900 1 52.46 ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGATTTAATCG:1 - chr3R 21276512 3' - BS 5036 1 55.48 TAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACTCTGTTGTTTTTTTTATGTATATTTGTTAAGCTGCAATTGTTCCCCTTTCGCTGACCCATTAATGCATTTCACTCGCCAGTGATATTTGCTCAATCTTTATGTTA:1 + chr2R 20361498 3' + INE-1 552 1 93.15 GCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGTGTGTATATATATACCTCCTTCTCTAATAACTACGAACCGGACTGTATACGTATGTACGCATTT:1 - chr2R 21269348 3' + 1360 3270 1 56.16 GTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAATAAATTAAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGAAGTTGACAGACTTTCTCGACAAGCTCGGAACTGAAAATGCCAGTTGTACCTTA:1 + chr2L 20985857 3' + F-element 4648 1 69.18 AACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTACACACCACTGGATCTCCAAGGTGGCCCTGATTCACT:1 + chr3L 18574896 3' + I-element 5272 1 74.66 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAACTTCCATGAGATTTTTAACCCCTTCACCCCGTAGTTATCCATTATTTGTTTTATCGCCGTTGTTGTTT:1 + chr3R 31663346 3' - jockey 60 1 51.37 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATTTGCTTTTGCGCTTTTGCGCACGCCTTCCCCAATTGATAAAGTGACAATTTATAGTCCCTTTTAATTGATATCGTCATGCGTCGAG:1 - chr3L 780633 3' + Burdock 6359 2 63.70 AGTATAAATAAAAACTTTAAACTATTGTAAATATTATTAGTTATTATTAATATTAATCACTGCACTTGGTGTGATCACATTTACTTATTTTAATCCTTTAATTAAAAAGAATACTTGAACTTTCCGAACGCGGAGTTTTTCAACTG:1 - chr3L 17887805 3' + mariner2 796 1 60.27 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTGTTGGTTAAGTTAAAGCAATATTTTCCAGAACTCCCTGCGTATT:1 - chr3R 20097608 3' - mdg3 78 2 67.81 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCCCCCATCCGTGCCACATGGCTTTGATAACAACACTTCTCCGGGGATAGTTGCAGGCCATTTTTGCAGTCTCAAGCAAACACTGCCAGCAACTTATTCACTTTTTG:1 - chr2L 2522837 3' - mdg1 15 2 76.03 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTTGCAGGAGCCGTCATTCCGTCGGGTTCAGTCTGCAGGATTG:1 + chr3R 5767482 3' + roo 362 1 53.42 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTACTAAAGCAAAAAATTCGGAGCTATCAAAACAAACTGGACTTTCATTGAGCCAAGCAAACAGCTTAATTTCTGAAATAGGTTTAATAATTA:2 - chr2L 17387393 3' + mdg1 390 2 63.70 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAGTACATATACGCCTGTGCTGTTGCCACATGGCCTTCTCCTTTTTCCAGCTGCAAATCTTGGCGTGCATTTTCACGGAAGTGATTTG:1 - chr3L 12829577 3' + mdg1 383 2 58.90 GTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTATACACAACTATTAATTTTTGCATTGACTTCTCTCAG:1 + chr3L 13015966 3' + hobo 2854 1 77.24 CCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAGGATCTAGAATAACTCTGCACCTGTGATAACTGCTGTAAGTTCAGGCTACAAAGCCCAAAAATTGTGAGCAATGC:1 - chrX 4647267 3' - Rt1b 5090 1 52.05 CNAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCAT:1 - chr2R 8375042 3' - roo 8746 2 81.51 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGACCTAAACCGGATCGAATGGATATAGAGCCGCCCA:1 + chr2L 246652 3' - P-element 84 1 28.08 AACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGGAAATCTATGGGTAGTAACCGTTGACTTTCAACTCAGCACTGTAGCT:1 + chr2R 7343338 3' + flea 4948 1 66.90 GTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAATCAACAAGAGATAAACATGGCTCTTAATTAATTT:1 + chr3R 25933195 3' - 297 6949 2 78.77 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGGTTATGTTCGGGTGATTCCATATCAGTTTTCCATACGTACTCACATCGATTGGTGC:2 - chr2L 12696125 3' - pogo 61 1 66.44 GATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTA:1 + chr3R 1048037 3' - Stalker2 7330 2 72.60 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGTTATAATTTTGTTTGTTTATTAGTTGCAGCAAGCCGACACCAGTTGAATCTGCTGGTCATGGAAAAACCCACAGAGAAAGAGGCCAGCAAACAA:1 + chrX 13558315 3' - mdg3 5278 2 68.49 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCAATAGGTCCCAATAAAACTTAAAGTTACTTCCAATTTAT:1 + chrX 16538176 3' - mdg3 5331 2 71.92 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGTGTATCCTGGCAAG:1 - chr3R 23565270 3' - jockey 93 1 76.03 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACTAACATGTTACATAAGCCCCACACCCTTCTTCCAACTAATTG:1 + chr3L 18954209 3' - roo 8742 2 72.60 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATAAATAAATTTTTATGGAAACATTTGCAAATACCTCGACCATTTCAATCTTGCCAGCTGA:1 + chr3R 26643395 3' + 412 7487 2 60.96 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACACACAGCACGCTCTCGGTGGTACAGCCGCTGGCAGCTTAAATGTTTTTTGAATTTAAACTTATAATTAAAAAACTTTTCTTCTCTGTGC:1 - chr2L 19680955 3' - hobo 11 1 74.80 TGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACC:1 + chr2R 12185416 3' - accord 6909 2 60.96 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTA:1 - chr2R 18265995 3' - roo 8714 2 54.79 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATCGCCTATGTGTAACTA:1 + chr3R 17747371 3' - 297 62 2 64.38 TGGAGACTTTTTTTCATGGAATGGAGAAGTTTTTGTAGGTAGATTGGGATAGCTT:1 - chr2R 4189417 3' - S-element 1380 1 72.73 TGAGTTATGGGTATCTGATAGTCGAAGAAATCGACTAAAGCTTTCCCGCTTGTTTAAGTAAATTAACTTTACTATCAGTCCAGTTAACCATAGCTAAATACTTTTTTCCTATAGGGTTAAAAATAAAATGTCCACCTCTACGCATT:1 - chr3R 14576739 3' + INE-1 548 1 76.03 ATAATATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGAATGGCAATCTTGTGTACTATTATTCACTGAAAATAAAGGCCAAAAATCACAGAAATTTAGAAAGTTATTGAAGTAACATTAGAAAAACAAAAACTTGA:1 - chr2L 7592246 3' - mdg3 101 2 68.49 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATGCATATAGAGAAGAAAAAGACCCCCATCAGGGGTAATTAAAAAAACTGAGCCATTTCATATCATCGTAA:1 + chr3R 22676314 3' - 297 6627 2 58.90 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGGTTATGTTCGGGTGATTCCATATCAGTTTTCCATACGTACTCACATCGATTGGTGCGATTTTCTAATTAGCCATTTTACCAGTTCTAG:1 - chr2L 12696093 3' - pogo 29 1 58.22 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAATAATACTACGACATTTTTGATAAAGATTGCTCTATTACATTGGCAAATGATAGCCCCACATTTGGC:1 - chr3L 11228061 3' - pogo 49 1 56.85 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTAAGCATGCAACAAAAATGCGAGACGCCCCTCTGGATCCCAT:1 - chr2R 18265955 3' - roo 8674 2 78.77 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGTTTTACCAAAGTTTCGAAATTTCATCACA:1 - chr2L 5656514 3' - hobo 21 1 68.66 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTC:1 + chr2L 2518571 3' - jockey 76 1 62.33 TCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGATATTCCGAGTATACGTCCG:1 - chr3L 21765395 3' - gypsy 41 2 57.53 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAATCTTTGTTGCTCAAAGTGAGAGACAGGGAGAGAGAGAGAGTACACGGCGTATGTGAAAGATTCACTTTTACACATCCAAAAAAGAGATGTGAGTTAT:1 - chr3R 7109094 3' + P-element 2866 1 71.23 TCGATGTCGCGCTTAACCATTCGTTGGCATTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAGGAGCTGCAGACAAACTTTTATATTAAACTCAATGGCTC:1 - chr2L 8807853 3' - HMS-Beagle 72 2 67.61 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCACCAAGCCGAATCCATCCGAACCAAGCCGAACTAACCCGAACCGAGCCGAGCCGAACCGACCCGAACCGACGCCATACGATCCCATGCGACACGAC:1 + chrX 12004050 3' - P-element 23 1 67.81 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATGCACCGGGAGAAAATACATGTTAT:1 - chrX 19162537 3' + pogo 2083 1 69.86 AAAAAATAAAAAAAAACAAACTCGCAGCAATCGAAAAAATCGAACAAATCGACTAAACAATTACATAACTAAGAATTCAACGTTGAAAACTTGGGTGTTTTCAGGCATTCAATAAAAATTTTTATTAACAATTGTTTCAAATATTT:1 + chrX 16916734 3' + HMS-Beagle2 489 1 60.96 TCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATCGGCACTTAAACAAAGGGCGTTGTTCAATATATATGGACGTACAAATT:1 - chr3R 29952692 3' - invader4 68 2 63.01 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACATAGCTCATATGCAGAAGTAGATCTTCGACTTAATTTCCTAGTAAGCCCCATACATTTCTCCAAAACCCGGCTTTTTCAAACGGCGGCACCGAGTGTAAATC:1 + chr2R 20931776 3' + blood 361 2 74.66 GGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCGCTGGAAAGTATGCTCCGCTAAAATGAAGCCAGGATGGTATGG:1 + chr2R 5899316 3' - jockey 4548 1 52.74 TTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGTTTCGATCAAGAATGAAACCAGATGAGAATGGAGGCACGAAGACAAATTCAAGAA:1 + chr2R 4840432 3' + transib2 2760 1 67.81 GGATGGTGTCGCTTGAGTCTTCCTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGTTGCATATAGATGGGCTGGCCC:1 - chr3R 28937808 3' - jockey 4746 1 60.96 ATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGAAAATGTCAAAAAGCAAAGCAAAATGTTTTCTTCCCCCGTAAAATTGGTCTTCTGGTGCGTGTGGCACTGAAAG:1 - chr3R 4837037 3' - Quasimodo 7178 2 52.90 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCAACAGAAAAGATACCCCTTTTAT:1 + chr3R 26031828 3' - pogo 26 1 68.49 TGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGCTTTATGCGCATTCCGAAATCATGTATAGCTAAAGATTTAATAGGGATTTTTAATGTATTGCTATGTAATGAAAGGGTTAACGTGTCAGTGGTGTTAGT:1 + chr2L 1871079 3' + mdg3 225 2 70.55 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGTCCGCAATTTGCGCGGACTGCGGTATCAGTATCTGCAAGATACTTTTGAATTAATTTCACGCTTATAAATAAACGAACTTATG:1 - chr2L 19907504 3' - hobo 15 1 75.17 ACACACACACACACACAAATTCACAGAAAAAGATCCTGAAAAACACACACTCGCGGATGCATGTGAGTGTGTGCGAATGTCTGACCGGGGCGGATGCCTATTTCGCGCGATACGCACACCCCTGAAAA:1 - chr3R 25168859 3' + accord 185 2 79.69 ATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTG:1 + chr3L 9240449 3' + 412 7457 2 80.71 TAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAACTTTA:1 - chr3L 3540092 3' + mdg3 212 2 62.33 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAAAATTAATTACTTGGTTTAAGCTTAAAGAATTTAGCACAGGAATTTTGCACCCCAATAGAAGTCTTTGAA:1 + chr3R 18492978 3' + Juan 4163 1 56.25 GCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTGAGTCGGCCGGCCGACTGCTGCGTCGACCGCGACAGAGCC:1 + chr2L 20716464 3' - P-element 21 1 70.07 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCGCATTAAAACGAACGTCAGCTGGGGCCAGCTTATCACGCTTCGAGCATTAGAAAGTGTAGCACGCTTTTAAGCGCAAC:1 - chr3L 939611 3' + hobo 2913 1 67.44 TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACAGGAAAATGTGTGCTTCTATGTTTTCGCCTCAAGCTCATTAACTGCTCGGAGCTCTCCCTACTAGATTGTTATTTTTCCCTCAGCTCACACAGAAAGGA:1 + chr3L 5425591 3' - blood 7033 2 71.23 TTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAATTTGCAGTTCCACAATAATAGGAATGAATAAAAGGTGTTAAATAATAGATGTTATTCACAGTAACTATATATGTACATAGAAGAATCACGATTTTATTTT:1 - chr3R 14213578 3' + mdg1 400 2 69.18 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACTAACATGTTACATAAGCCCCACACCCTTCTTCCAACTAATTGGATTTCTGGGAACTCACTTACAGACATGACCGCCTTCCTCAGCCTGGCCATCTTCATAGCCAGCCTGC:1 + chr3L 18954277 3' - roo 10 2 77.40 TTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTC:1 - chr3R 15035075 3' - Stalker2 85 2 73.97 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGGTCTCTGTTCCAGACTGAGCTGTGAGCACTCAATCATTTTATTTACTTATGCACCAGTGCACGCAGATAAACTGAATCTTTGTTTAATTTTGAAATTATTACCATTCCACATTCTGCACACAA:1 - chr2L 5732676 3' - hobo 9 1 74.66 GGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTAGCCCGTCTTGGCGAACAAAACTTTTTTCGTGTCCACAAATTGAAAATATTTCACAGTCATATTTAATTTTGGCAGACCGTTGGACCCA:1 + chr2L 2675090 3' - Quasimodo 26 2 67.12 ATAGAAAAAAAAAACACATATACACACAGGAGATCGAAGAGCGCGGCTTGGGCACCGTACGGCTGGAGCAGGCCTCGACGTGCCACGGATGTGCCAGACAGCCGATCAGTACCAGGGCAACCAG:1 + chr2L 19568946 3' - Circe 426 1 78.23 AAAAAAAAACAAAAAAAAAGATTCCTGAAATACAAAACAGTCGAAAATGTCTACGCCATATGTGATCTTG:1 - chr3L 9491776 3' - hopper 143 11 71.43 TGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTAGCCCGTCTTGGCGAACAAAACTTTTTTCGTGTCCACAAATTGAAAATATTTCACAGT:1 + chr2L 2675059 3' - Quasimodo 56 2 60.00 TTGAAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATTGGAGCCACACTTCCCTTTACCTTCATGCAAGCACTCATTTATATTGACCATGGTGATGTTCAGGCCCACGTCTTTTTCAATCTCCTCACGAT:1 + chr2L 17798902 3' + hopper 55 1 68.49 AAAGTAAAAAAAAGTAAAGTAAAAAATGTTAATTGTTGAAACTATTTCTTTTCCATACAAAGTGTAACTTTACTTCGTGGCACTTTTCGATAATCTTTTATTGAAGCACTCTTATTCGCTTTGTATCTATTGACCGCACATTCCGA:1 + chr2L 13079437 3' + TART-A 13142 1 74.66 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGTTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACAGTCAAAGAATTTCAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 18922639 3' + opus 7485 2 68.22 GTGCAAAAACCATTATTATGAGATAAAAGTCAATAAATTGTTTTATATTTAATTAAGTTGATTGTCATTCTTCAACTGCCTCCTCTTATTATAAAGGCAATTAAATTCTTTCTTTATGCAACGAGCTAGTTCTCTTAATGTTGAAT:1 + chr2R 4521233 3' - transib4 2311 1 73.97 AGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCCTTT:1 - chr3R 19589926 3' - BS 5069 1 66.44 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGCCTTTCATATGGTGCAGATACACTTCCGCTGGCTAACGATAATGGGAATGGCTTTTAATTGATTTGGTCGACATGAGTAATCGTTCGCCGTGGCCCATTGAAGTGCAC:1 + chr2L 20068124 3' + roo 396 1 77.40 CAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGTTTGGTTACTTGCATCCGTTATTATGATGAGCCGCTTATCAAATAATAATTTATATTTACAATGGGTTTGGCAATCAAGAAACTTA:1 + chr3R 30564820 3' - F-element 4581 1 56.16 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACAGTCAAAGA:1 + chr2R 18922623 3' + opus 449 2 54.11 TCTACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTGTGTTCCGGGGACAGCAGCCATTTTGTTTGGCTGATGCTGTTGATGCTGATGTCGGTACGTCGGCTTGTCGGTTTGTGATGGCGATGGCAATGGAGA:1 - chrX 21183251 3' + S-element 1695 1 68.49 AAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGCCGCTGAAAATGTCATTACTGAAGGGCCAGCAAAACGGATGTCGAGTTGTTGTTTTGGTTGTTTGTGCAGCCATTGTGATTTGTATTTCTTCTTTGTCGACT:1 + chr3L 19431767 3' - Juan 22 1 70.55 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCAGAACTTTCTTTTTCCACAATATTACTTTGTTTTGTTTAGAAAGCGTAATTCCATAAGTTTGTTCAAAGAGTGGCTC:1 + chr2L 8852893 3' - Burdock 6175 2 54.79 AAATAAAAATTTAAAAATAATCCAGGACTCGGGAGCAGGACAATCGGCAGCAGTGACAGCTCAGCTGGATGGCGGCTACACAATGGG:1 + chr3R 24427806 3' + P-element 2696 1 75.86 GAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGAGGCTATATCAAACTTGCCAAATGGTCGTTGAATGTTT:1 - chr3R 15035005 3' - Stalker2 12 2 76.92 AAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTGCACGCCCCGTATGTTTGTACATATATAAACTGTGGCGACAATG:1 + chr2L 15601681 3' - Doc 2 1 79.69 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGACAAACTCGGCTATCCGTCGAACCCAAACCATAATAGAGTGGTGATGGGGAGCATTTTATAAGTGCCCGAACTAAAGGACATTCGAAAGATAGTTATTCA:1 - chr3R 6603712 3' - pogo 19 1 72.60 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAATCCGAGAGGTATTCATTTGTGCTTGTGTTATTACG:1 - chr2L 1870923 3' - mdg3 5298 2 54.11 TGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTTCGGCCATCCGGCGCGTCGTGCTTTTCT:1 - chr3R 13572044 3' - 412 7143 2 81.38 AGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACAACCGTGCCTGTCTCCGAACAACAACAACAAATGCAACCAACTATGATGACAACAAACAGGAAGATGAGCCCATAGAAAGCCAACTTGCCCAAGACGATCTCACACACAAGTG:1 + chr3R 6404691 3' - Stalker2 11 2 78.08 ATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCAGAACTTTCTTTTTCCACAATATTACTTTGTTTTGTTTAGAAAGCGTAATTCCATAAGTTTGTTCAAAGAGTGGCTCGGTAATTTT:1 + chr2L 8852902 3' - Burdock 8 2 71.77 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATACTCAATCCCAACTACGTGCTGCAATGCCACACGAAGTGGTGATTAGAGGGGGAGGGGGTTAAGGCGTGCTGAAATCGCCT:1 + chr2L 11045651 3' - Burdock 6175 2 57.53 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCATTGGTAAATACTTTTTTGGTAAATACTTTTTTTTTCAGTTGGGGCCGGTGGTCGGAACTTTTGGAGTTAGGACAATTCAAACGAGGTTGGCGTGAT:1 - chr2L 232322 3' - Doc 27 1 54.11 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCCAAGG:1 - chr3L 12775933 3' + roo 9041 1 65.07 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGGTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCAGCGTAGCACAG:1 + chr3R 13572122 3' + 412 438 2 54.11 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGTCGCCACAAAACGAAACA:1 - chr2R 14450129 3' + roo 409 1 78.79 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTACATACATTTAAAATACTATATGGATAAAAGTTGCGTGGAGTAAATATAATCAGGTCAAAG:2 - chr3L 3910463 3' - 297 52 2 62.33 CTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCAT:1 - chr3L 21765436 3' - gypsy 61 2 67.20 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAGAAATCGGTGCTTGATTG:2 - chr3R 26031660 3' + pogo 2069 1 64.38 GTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCATTCGCTGCCAGTTTTCTCCTACACCTAAAGCGATTTATATACATATAAAAATAAATTAGAGTTAGGATGGGG:1 + chr3L 21043152 3' - Quasimodo 40 2 58.90 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATGGTAGGCGAAGGATGAATGTGGAAGGGCCGATTCCATCCCTATCTGGG:1 - chrX 16994995 3' - jockey 34 1 66.21 TAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTCTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGAGGAATGTAAAAACCGTTTAACATTGAAAAATATTCAATTTGGAATCTCCTAGTGGGGACACTGTTAGACGAAAACGATTTTT:1 - chr2R 2590548 3' + roo 297 2 59.59 GGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGAGGCTATATCAAACTTGCCAAATGGTCGTTGAATGTT:1 - chr3R 15035006 3' - Stalker2 16 2 74.66 CACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCATCGCACAGCGGGTGCAGTTCGTCCATCAGCTGAACGGTGGAGGTGTTGAGGGCGTAGCTAAGGGCGCC:1 - chrX 19744878 3' - P-element 264 1 47.95 TAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATCTTATATCTCCCCATTTACTCGCATTTTGTGTCTAAACTTCTTA:1 + chr2L 15524003 3' - opus 7192 4 71.23 TGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAATACATTAGAGCAGCTACACAGGATATGGAAATTATTCG:1 - chr3L 13631276 3' - hobo 82 1 72.60 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAATAATACTACGACATTTTTGATAAAGATTGCTCCATTACATTGGCAAATGATAGCCCCACATTTGGCTTCGGGTTGGCTGTCGTTACTA:1 - chr3L 11228039 3' - pogo 27 1 65.75 AAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTTGCCTTATCAATGGGTGAAATTCCAAAG:1 - chr3R 8293519 3' - Stalker2 50 2 50.00 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGGAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGATATGCAGATCG:1 + chr3R 4352155 3' - Doc 44 1 60.00 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTCATTGTGGCTTAATGCACAGTTCATAAAAATATA:1 - chr2L 2622669 3' + roo 9027 1 68.93 TATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACG:1 + chrX 21667931 3' - gypsy2 6557 2 68.57 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAACTTTATTAAATCGTTCTCAAATGGAAAACACCGACTATAGCTATTGAAAATAGTT:1 + chrX 19310658 3' - pogo 62 1 60.96 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGCCAAATAACAAACCATATTTTTGAAGAGTGTTCTTCGGCCAGCTGCCAAGACACACGAAATTCTGTTTTCCA:1 - chr3L 21108478 3' + roo 358 2 52.05 CAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGAAACAAATATGAGTTTCAAAT:3 - chr3L 13475491 3' + HMS-Beagle 197 2 56.16 GAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATACATTCATATAAATATGTAGAGGTGGGTTGCCTATGGTGGAGGAAGGCCGCCGATTGCATAGCCGTTTGGCCGGTCGCTCAT:1 + chr2L 9228794 3' - Burdock 6170 2 60.27 TTGTGCTAGAATACGATTTTCGGGACGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGCTTTTACATATTTGGGGAGTTTTGGCCACTGTGGATATGAAGGTTACCAAAAGTGGTACTCAGAAGGTAAAATTACGGAT:1 + chr2R 4192795 3' - 1360 3198 1 58.78 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATGGTAGGCGAAGGATGAATGTGGAAGGGCCGATTCCATCCCTATCTGGGTGTCCTACGCAGTGG:1 - chrX 16994980 3' - jockey 20 1 76.03 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAATCCGAGAGGT:1 - chr2L 1870948 3' - mdg3 5323 2 64.38 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGCAGAATTAGTCCCAAAAAAAATATAAATAAATACCTTTGTAGTTAGGACCAAACTTTATTTAAAGATCCTATGACA:1 - chrX 10838491 3' - roo 8709 2 55.48 AAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGCAAATGAAAACTCAAGTGCA:2 + chrX 17508942 3' - Burdock 33 2 63.01 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTGGCAACCCAAACAAAATAATCAAAATCCCGAAATGCATGAACTTAACCCCAAAGGGTTGTTGCCTTCAAAGTCACTGTCAAAGGATCAGGCCATTAAGGGGG:1 - chr2L 18671581 3' - mdg1 17 2 73.43 CAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTATGCTAATGATTGTATGGCGCAGCATTATGGCACTTTTGCACGTTGCCGCCATATTCGAGTGGCGAGCTCTAGCA:1 - chr3R 9862864 3' + Stalker2 357 2 55.17 CGACCGTTCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACATCAACTTCGTCAGCATCTTGTCGGTAGGGTATGGGTAGTGGTTCTTTGTATGCGCTTGTACTTTTAAAATTGGGTTCC:1 - chr3L 11880369 3' + Doc 472 1 54.79 AAAAATTCAAATTAAATTAAAAATGGAATTATTTCGTGTTGTTTGCAGCTGATTCTGATAAGCTGGAAATATAATAAAAACTTTTTACTTGTCTCACCTTATGCATATATAGGACTTGCTTATTTCGATAGATTTATTTAATCCTT:1 + chr3L 14568216 3' - Rt1b 126 1 47.95 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGATGACGTGGTGAGC:1 - chrX 13642030 3' + P-element 2819 1 37.67 GTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCG:1 - chr3R 19537450 3' + hopper 1405 2 75.00 TAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCCTATTGAAAAACAGCCAAATTTGAGCTCTATTAAAATCTCAACCATTTC:1 + chrX 21124957 3' - FB 73 1 66.44 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGA:1 - chr2L 15523927 3' + opus 433 2 69.06 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGCTATCTAACCGAGTTCCCTGTGGCAACGAGGCGTGGCAGGGGCCGGGCACATGGTCAA:1 + chr3R 12886084 3' + 412 487 2 70.00 AGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTACATTTCCACTAAACTTAATAATTCTTTTTGTGC:1 - chr3L 23244870 3' + HMS-Beagle 158 2 79.45 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACTTGTACACGTCGATCTGGAAGCTTGCGGGCTCTTTAAGACCATAATGATAATTTTTACCAACAGATTTTAATTT:1 + chrX 22760425 3' - roo 47 2 53.42 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAAT:1 - chrX 3637778 3' + roo 8999 2 65.75 TTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACTCCAACATGTCAATAAAAGTGTATAATGCCTAAAAACAACACATATTACGTATACGCAATTTAAGA:1 + chrX 18055826 3' + 297 6923 2 56.85 TTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATACGAATATTATACAAATAATAATGGCATATAAATGAAGTAACAAA:1 - chr2R 10915657 3' - F-element 88 1 73.97 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACGAACCCAGCGAAGCGGGCGAACCCCA:1 + chr3L 9240499 3' + 412 448 2 54.79 TGGTGTTGCAGTTTAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCCA:1 - chr2L 16202625 3' + copia 170 2 77.40 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTCCGCACTAGACGGACA:1 + chr3R 5684176 3' + pogo 2051 1 55.48 AGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATATAAATATCTATCTATGAATATGACTATAAAAAAATATGGCCAACAAAACTAACAAAGTTAAGTTCTTTAAATAGTTCTGATTAATATAGATTTTATAAGTATATAGTAAG:1 - chr2L 12752168 3' - Juan 4124 1 69.18 TGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGCCACTTGGCATGCGAGCGCAGGCGAATGGCGCCTCA:1 - chr2R 13381998 3' - jockey 73 1 69.75 TATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATATTAATTTTCATGAGTCACATTAGCCACATATGACGTCACGATTATGAGGT:1 + chr2L 15934642 3' - springer 65 2 66.44 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCGGCATCCCCGAAGCTCGCCAAACACCTGAAAAGTATGCAATGAAAATTCTTTTGGTGCCTCTGCGGCTCGCTTGTGCCA:1 + chr3L 6542102 3' + hobo 2914 1 62.50 GTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCAGCGGGACACTGGGAAATCACCGGGCTACTTAAGGTCGGCACCAAGGATCTCTTTGTATTCGACCAGGGGGGATGCTACCG:1 - chrX 20001620 3' - copia 4778 1 64.23 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGTCCGCAATTTGCGCGGACTGCGGTATCAGTATCTGCAAGATACTTTTGAATTAATTTCACGCTTATAAATAAA:1 - chr2L 19907514 3' - hobo 14 1 73.88 TTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTG:1 + chr2L 8807928 3' + HMS-Beagle 189 2 65.38 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACAATCTGTGCGTCGATAAGTATGATGGCGGTTATG:1 - chr2R 18056783 3' + blood 342 2 56.15 CAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGTTTT:1 + chr3R 22572634 3' - HMS-Beagle 80 2 71.92 ACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCTCACACACATTTAAAT:1 + chr3L 3540225 3' - mdg3 5287 2 53.60 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAGCATTTGAAATATTCAAACTGAAGCTTTTCTTCTAAGCCGGAATTTAAATTGGGCTTGTGCTTTCAGT:1 - chrX 13008681 3' + blood 7335 1 56.85 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGCGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGACAGGGGCCGAAGGCGATGGGGCAGACTCCTCCATCTTCATGGGTTCC:1 + chr3L 13380521 3' + hobo 2892 1 55.83 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGGAACGCCTTTGGAAATAAAATGTATCCCTTGTGAAAGTGGCAGACAACCTTAAAAATAAATATGTTCTGGCTTCCAAATTCTGGGCTAACTGGTTAGGAATTGCAATGGCCTA:1 + chr2L 5732880 3' + hobo 2932 1 73.97 AACACGAGAGCCGAGCGCTGGGGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATCCTGTGCATACCAACATAATTTAATTAAAGCTCTCAATTGAGCCATCTCATCAGCAGCACGAAGGGTTGGCCAAACA:1 + chr3L 12729203 3' - opus 152 4 56.16 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCCTTTGTTTTATATTATATGATTTAGATATAAAATCTAGAACACATTACTTAAAATTATAAGATAATTTAGTCGTAGAATGTTTTCCACGATTCTCTC:1 - chr3R 6523169 3' - I-element 26 1 66.44 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAGGACGAAGACGGCCCAGATTCCCAGGCTGTCTTCGATGCGGAGTGGAGTACCGAATGAACTCATC:1 - chr2R 20303838 3' + mdg1 362 2 56.16 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATAATCGCATTTTACTCAGCTGCCCCAAGCCATAACTACGCAGTTTGATGAGTTACTTCTTCCGGTGC:1 + chr2R 5800582 3' - HMS-Beagle 6846 2 53.42 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATCATAAGAGGCTTTGACAACTGGTTAACTTTATTGACGGATCTTACC:1 - chr3R 17068900 3' + mdg1 350 2 66.21 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACACCCTACCCCATAACTTCCTAATACCGGCCGTTGTCAAGGAGTACACCTTGTCAGGAGAAACGCCGCAGG:1 - chr3L 25496736 3' - mdg3 54 2 52.74 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTGAACTCTGCCTCCAACCAAAGTCTCGCTCATCGATTTTTCAGAGTTGCATTCCATTTGCCGTAGGAGCAAG:1 + chr3L 14755376 3' - P-element 21 1 64.10 CTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGC:1 - chr3L 25232763 3' + accord2 7559 2 63.70 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGAACTACAACAACATAAACTGCATGTCGTAATACTGTTGGTGTAATAAAAAAAA:1 + chr3R 7109242 3' - P-element 51 1 51.37 TTTTTTTTAATATTTATTAGTTTTACATTGCCACATATTTATAAAAATAATTATTTTAAATATTCAACTTTTGGACTTCATGATAAGCAGACCCTAACATGCAAGTTTTTAAAGAAATTTTCGAGTTACTCTTATGAGATAATTCA:1 + chr3R 16765003 3' - Doc 4690 1 73.29 GCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATTCTTGATCAACAGCAAAGTCGATATAGCCTTGTCCGTTTCAGAGTAAACTTGTTGATACTTTCCCAAAAGTA:1 - chr3R 6461720 3' - Transpac 41 2 58.22 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAACATAAATAATAGTTGTCGAATTTTGATGAGCTCCAGCATTTCGCCTGCTTCATTTTGGATTCC:1 + chr2L 18671726 3' + mdg1 363 2 60.96 AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGA:1 + chr2L 42583 3' + copia 179 2 70.55 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATTTACACATA:1 + chrX 21205084 3' - 1360 58 1 60.27 TACGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCATTCACCTTAAAATTTCTTAGACTTTAAATCTAAATCTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACAT:1 + chr2R 15616423 3' + 1360 177 1 52.41 AAATTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAGGGTGG:1 + chr3R 8049031 3' - Q-element 127 2 61.64 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAGTATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTA:1 - chr2L 10178005 3' - mdg3 79 2 69.86 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGTATTTAGGGATTCGACGCTCGAATCCTTTCAACC:1 + chr3R 11550308 3' - F-element 55 1 53.42 AAATAGAAAAACTTGATGGTGAAAACTGCAGTGCGTGGGCTGTACAATAGACGCAAATCGGATTTATCTCCATTATTTGTAAACATAACTCATTATTTGCTTCATCCACGCTTACCACTCCTTCAGTTCGAGATTGTAATTCATGT:1 + chr2R 17263628 3' + Dm88 336 1 67.81 AGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTTGTTGATTTCCTAGGTGTATAAATTATACTTTATTTAATCTGCGATGACTGCGTAAAAGCTTTTTGCCCCGGCAAGCGAATCAAAAGTC:1 + chr3L 9905865 3' - Juan 4028 1 79.31 CAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGAGTGAAGGTGCAGCACGGCCCGTGTGTCGTCATCAGCAACGCCCAGCACAATAGTCCTTG:1 - chr3L 18592338 3' + flea 4800 2 61.64 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGATGTTGTTGTTGTTGATGTTGTTTCTACTACTCTACTGCTACTACTACATACTCATAAGCCTCTCTAAATACCGCAAGACCACTATCTGTTATCATGATTTCCGTTTAACTA:1 - chr3L 13778490 3' - I-element 10 1 78.62 TTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTA:1 + chr3L 23839727 3' - McClintock 55 2 59.31 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCGAATATTTAAACACGTGTATATTTATATTTACACACGCATAGTTTTTGAGGTGACAGCTAAAATGAGGTATGTTTGTACATACAAATACTTTA:1 - chrX 20369336 3' + roo 9044 1 67.81 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATTTGTTTTGCCATTCCTTAAGCTTTACAACAACCATTCCCATGCAGCAGATATTT:1 - chrX 13807987 3' - pogo 62 1 63.70 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCAACAGAAAAGATACCCCTTTTATT:1 + chr3R 26031829 3' - pogo 25 1 69.18 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATTTTTAATGCGATGAAAGGAATGCGAGCGTATTTGCG:1 - chr3L 16523208 3' - jockey 89 1 73.29 CGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATGCATTATTTTTCTTGAATTAATTGAGTGGGTTTTTTTTTTTGTAGTGCGTGGTGTGCAAAAAGAATTCAACTGAATTGAA:1 - chrY 1076856 3' - 17.6 6968 2 56.85 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACATATACGCCCACATATTAACTGTCACTTTGCTCTGGTCGACTGGGTGACACACCTCCAGATTGCCAGTCGCGACTAAGCGAAGCGTTCA:1 + chr3L 12829730 3' - mdg1 7070 2 67.81 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATGATTCTTGAAGAACGATATCACCTTCTTG:1 - chrX 15696719 3' - jockey 4758 1 78.47 CTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTAATCTCTAGATTCGAACTCACCTCGTAGAACATA:2 - chr3R 22572573 3' + HMS-Beagle 6959 2 76.03 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGAACTCGGAATGGCTTTAGATAATGGTGCTATTGTTTTTGACATAAGTCTCTTTA:1 - chr3L 8704503 3' + blood 7323 1 62.33 AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAATTTGAATTATTG:1 + chr2L 42598 3' + copia 195 2 60.00 AATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGC:1 - chr2R 24021553 3' - pogo 61 1 61.64 ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAGCATTTGAAATATTCAAACTGAAGCTTTTCTTCTAAGCCGGAATTTAAATTGGGCTTGTGCTT:1 - chrX 13008686 3' + blood 7330 1 60.27 ATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGAATTTTTTTATTTTCATTAGCTTAATTTAGAGTCTTGAATGGAGTTGAACTGAACTTGACTGTTAAAAA:1 + chr3R 14108948 3' - copia 4826 1 53.42 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGATTTGGTGGATTCACTGATTCGACTTGGTCGGCGGATAAACTGCGACTGTCGCTCAGTCGGCAATCCAAGCGATGCGACTTCTACAGCCATAATGATC:1 - chr3R 22123708 3' + 297 6957 2 71.23 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGCAAATGA:1 + chrX 17508929 3' - Burdock 46 2 54.11 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCATACTAAAGATATGGTTCTTACCATATAATCATATTATTAAATTTGAATCCTTGTTGTT:1 - chr3L 10241187 3' - pogo 62 1 61.64 CTGCCATCTACGCAAACGAACGGTTGAAGTGCGACATCAGCACTTCTCCGCTGAGCCGCTGCGACGCTGATGACGCCTCCACATGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTCGTCTTTTATAGATCACCGCTGGCCAATGAGGCT:1 + chr3L 11025698 3' + HMS-Beagle 6851 2 77.24 TTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGA:1 - chr3L 13475511 3' + HMS-Beagle 6973 2 69.86 CACGTGCGGAGTGGAAAATTTCAAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAA:1 - chrX 23406394 3' - R1A1-element 161 1 69.18 TCATTTTTTGTTTTTTTTTTTAATGTTGCCAATTTAAGCTCATTTAAGCCCTTCATCGGGGCTTAACCCGTGTTAAATGCTAATCTCTAACAGCTGTTCCATAAGTCAAATGAAATGACATGTGAGTAGCCAGCGAAAAATAAAAA:1 - chr2R 22952888 3' - transib2 2640 2 54.79 CTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCAAGTTACTTTGTCATGTTGTAAAGTAAATCTTGATGTTTTCTAGTGTTGGTCTTGGTCTATCTTAACTACAATCTATCGAATTCACGCGTCTCAGAACTCACGCGCTCA:1 - 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chr3L 19432487 3' - HMS-Beagle 6835 2 60.27 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCA:1 + chr2L 20327682 3' - roo 8745 2 71.92 TATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGCGGATTGAAATGTATTTGAAAATGGCAATTTACGCACTGTTAGGGACAGTTCAAAAAAAGATTCAGCTGCAGGCATGGCACCCAGTGTGTCCCTTTCTC:1 + chr3R 15035189 3' + Stalker2 380 2 68.97 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATAAATAATACAAATTTAAAGTGAATTAGAAAATCCAGATCACAAATCGCTATTCTAGCTCAAGCTAACATACTCA:1 + chr3R 12569698 3' + blood 7348 2 53.15 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGGAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATGCCAAGTGGCAAAGTCCAACGTACGCTCCGTGCGCCGCCAGAAGAAGCTGACTTGTTGCCTTCCGTGG:1 + chr2R 13382071 3' + jockey 4941 1 51.37 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGAACTCGGAATGGCTTTAGATAATGGTGCTATTGTTTTTGACATAAGTCTCTTTATA:1 - chr3L 8704501 3' + blood 7325 1 60.96 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAGAAATCGGTGCTTGATTGCAATGTAAA:1 - 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chr2L 14262935 3' - P-element 49 1 51.37 GCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATGTATATAAATATACATTTTTTGTGCTCTCTTTCCTGCGGCGGGAA:1 - chr3R 12952873 3' + micropia 5409 2 64.00 AATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTCATACATACATATGTACATAGCAACAGCGATCTATGGCCTGTACATAGAGAAAATAACTTCCCTAGCATTT:1 + chr2L 19135721 3' + Burdock 245 2 74.55 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAATGCTAGCGTACTCTATAATTTAGCCACTCGAGTTAGCAGATTTATGGCATTTGGATTTTGACAGTCATTTTGGAACTTCTCAAGTGCTTA:1 - chr2R 12642601 3' + pogo 2073 1 66.44 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGACTTCTCCTGTTGCAAGTGCAATTTCCGTGCTAAATATTTGCACACAAAAGCAGGAAACTTTCTGCCAACTTTC:1 - chr3R 26139397 3' + mdg1 375 2 53.42 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGACTGCAGCAACAACAACCACACGGCAGAGTACAGGGCCGGTTGTTGGAGTGATCTTCATTTGGCAATTA:2 - chr3R 17794477 3' - P-element 9 2 76.71 GTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGACTCTGGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTATTTTTATATCCTTTACTGAAATAATTTATGAATAGGCTTTATTTTTTGTTTTCATCTGCACGAATCTATTTATGTAT:1 - chr3R 19446699 3' - opus 345 2 55.86 CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTACATATATGTGGGGTACTTGCGGACCCTGATAGCATTCGCACCTTAT:1 - chr3R 8810648 3' + 297 328 2 71.92 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGAACACTAGGCAATAGCTGAGCGATCTGTCAGC:1 - chrX 19744387 3' + P-element 2848 1 58.22 CTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGCTACTCAACTCCTTCATGTATGTTTGAACCTACGAATGTATGTTTATTTTTATGCTGCCGCCGTGTGTTCTTCTGTTTTT:1 - chr3R 7108661 3' - P-element 479 1 58.22 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATGCCATTAATTGAAATGATAACGATTAATGATAGCGAAAAGACACCAATG:1 - chr3L 11887155 3' - Doc 23 1 70.55 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAGATGTCAACAGACGATTCACTTAGACACATTTTTCAATGATGTTGCTACCGTACTGCCGGAGTACTTAAGTCGCGTCAAGTCATGCAATGTCAATACACCCATTCACCT:1 - chrX 19992521 3' - copia 4882 2 76.71 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTATGGCAGTGTCAGCTTTTCAAAATGTGCACATCAATCAG:1 - chr3R 13231724 3' - F-element 60 1 50.68 CTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGTATTGAAAGTACACGGAATCGTAAGTGAGCTGTAGTTGTAACGGGTGCAGATGGGAAAAGGAT:1 + chrX 16655631 3' - Doc2-element 4401 1 57.93 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGAATATTCGTACACAAAAACCAGGTTTGTGCAAATAGGTTTTTCATGAAAACG:1 - chr3R 29381505 3' + hobo 2928 1 61.80 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTCTTTGTCCTTTTCCGCCTGATATCCCGTTGAGCACACACTGTCGAGGATTAG:1 + chr2L 2518622 3' - jockey 24 1 70.55 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAANGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGGGATGTTCGAATTGAGTTGAATTGAATGTTGAATTATATAAAACAAGGAA:1 + chr2L 8909880 3' - roo 71 2 65.75 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCTTGGTTGCACAACTTTGTGTGTAAATAAAAAGTTTTATTTCGGGGAGAGATGCGCAGAACAAAGGCGCACTTTACAA:1 - chr2L 17795113 3' + hopper 1369 1 52.74 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTTTGGACAGCCTGTTGGATTTAATTTGAGACTCTTCAGTTTGCATTTG:1 - chr2L 9988112 3' - hobo 69 1 66.20 AATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTCTCTCTTTTTCTCAATCTCTCTCCCTCTCTCCTTCGGAAAACTCAGCTGGCGAA:1 - chr3L 19432388 3' - Doc 4416 1 62.76 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATATAAAATTAATGGCAATCTGGCAGCGTAAACACGACAAAATTTGTTTCTCTAGCCGTGTGCC:1 + chr3R 18114959 3' - 297 51 2 59.15 CTGGACAGTGCCTTGCCTTGGCTAGGCGATTGCTGTGGCGCTCTAGCCTGTCGTGGTACCGGCTGGAGTGCATGTTTATTGCCCGTTTTTTATTTAATTTTTTGGATATTGCCGTTGGTGATCCCATTGTTTCACTACATGACAAC:1 + chrX 387178 3' - BS3 1518 1 56.85 ACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATTCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAAGAATTTTCTCTTCCGACAAGCAAAGGTTATTTATTGGCAGAACCCGGTAAATCTTA:1 - chr2R 17168276 3' - invader2 143 2 64.38 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCATTTAAATGCAAAATGAAGTAAATTCCAACCATTGTGTTTCCCTGCTTAGTTTAGCTTCATTC:1 + chrX 12995454 3' - blood 7025 2 75.86 GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATAAATAATACAAATTTAAAGTGAATTAGAAAATCCAGATCACAAATCGC:2 + chr3R 12569672 3' + blood 308 2 65.75 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGTATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGAGCAAAGAAGTCAAATATTAGCACAAACACATTTGTGCACATGCATACATACATATTTGTATCTAC:1 + chrX 19506181 3' + P-element 2834 1 49.32 GCAACCGCCCTGCCTCCCAGTGACAGAAGAACCCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATGTATTTACCTAATTGTGAGCCATGCCAAACTAAATACTTTCTC:1 + chr2L 19217695 3' + springer 7444 2 68.49 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACCTCTGGTTGGCGAAAATCGGAGATTGCATTATAAAAATCCAAGACATATTGCACAGTATGCGATAAGGAAAACAGCATTAACTTAGCCAACAATGAGATCATATTGATGT:1 - chr2L 9499198 3' - Transpac 7 2 75.34 CCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCG:1 + chr2L 19841576 3' - BS 59 1 60.14 CACCAGGCAGCTAGGGCGCACTTCAAGCCTAAGAGGAATATTGTGTTAGCTTTGTTAACTGTGTGTTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCAC:1 - chrX 21933838 3' + gypsy11 4279 2 35.62 CAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCC:1 + chr3R 18935159 3' - jockey 4760 1 74.66 TTTATTTTCCTTTTTCTTTTGCTTCTTACGGCCATTGGTTGCGTTATCAGAAGATTTATCATCGGCGATTTTGTTTTTGGTAACACTGAGAGCTTTTGGCTCAGAAGAAACAGTTCCCTTCTCATCGCTTTTATTTTCCCCG:1 + chr3L 5498513 3' - Doc2-element 250 1 40.14 GTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTGTGGCTTTTAACTTTCAGGTGTTAGTTTAACCATGGTGGGATTG:1 + chr3R 7364297 3' + Quasimodo 7296 2 70.55 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGGTTTGAGACTTTATTATCTACATCAGATGCATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTTGAAATTTGATTTGCCGATTGCTGTCACTCAACGGACTTTGTATTCATTGTACATTG:1 + chr3R 18940616 3' + mdg1 365 2 53.42 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACTGTTGACGTTTTTGGGGAAAGGGTTGCCAGCTAATGCCGCAAACATCGTGCCGATGACAGAACTATTGT:1 - 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chr3R 8810598 3' + 297 378 2 74.66 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACG:1 - chr3R 26405017 3' - hobo 69 1 64.83 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATGCCAAGTGGCAAAGTCCAACGTACGCTCCGTGCGCCGCCAGAAGAAGCTGACTTGTTGCCTTCCTTGGCACACAGATGCACACACAGATAC:1 - chr3L 7220323 3' + jockey 4971 1 64.03 CACACACACACACTCACACATATCCAGCCACAATATAAATTATATTTTGAGGGTAAATAAAACACTTAACGCCCTTTTATCGGGGACTATTTACTGGGCCTCTAAAAGCCAACTGGAACTGGGTCGCTTGTCGTGGCCCAAACCAA:1 - chrX 7755189 3' + accord 192 2 54.11 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCTAAGCCATAGCCAGCATTTAATCAAAAATGAATTTTCCTTTTTTTTGCCATTCCAGAT:1 + chr2R 16503485 3' - jockey 70 1 59.59 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAATAATACTACGACATTTTTGATAAAGATTGCTCTATTACATTGGCAAATGATAGCCCCACATTTGGCTTCGGGTTGGCTGTCGTT:1 - chr3L 11228043 3' - pogo 31 1 64.38 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTG:1 + chr2R 18056895 3' - blood 7064 2 56.83 GGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGT:1 - chr2L 16360588 3' + hobo 2893 1 67.27 CCTTACGCATCTTGTCATTCTAATGTCTTTGGTTAAACCCACGGAACATACACCTAATATGTGTGTGCCTTTACCTTGACGCACAGATTTTAAACTTAGCCAAAGAATCGAAATCGTGCACCCACGGACGGCAACGTA:1 - chr2R 5662967 3' + 1360 3379 2 54.35 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGC:1 - chr2L 20716370 3' + P-element 2819 1 24.58 AACAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAATAAAAAACAATAATGGCACATTCTTGCGTTTAACTTGATTTTCACATTGTTTCATATTTGATTTCATTCATTGTCGGCTAACGAAGGTGAATGAGATTGCTCTCGAGGGATTCCA:1 + chrX 18415917 3' + gypsy7 5008 2 73.94 AGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGAAAAAAAAGAAAGTAATCGGAAATCGAAGG:1 + chr2L 21965632 3' + Bica 436 1 70.59 TGAAAATGTAAATCTACTGTGGCTCCAATGCATCACGCCATGTAGCCTTGTCGCCCCGTC:1 - chr3R 6876617 3' - gtwin 7129 2 68.33 ACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCGGAAATATGATGGAAATGTAAATCTTTCAATTTTTGATGGTTCTCTTTCATAAATTTAATTTCATAATT:1 - chr3R 19449718 3' + roo 8593 1 52.74 GTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTTGCCTTATCAATGGGT:1 - chr3R 8293531 3' - Stalker2 62 2 57.53 ATAAGTTTACCTCGGTCTACTCAGAGAATAAAGCGTTTGACCATCTATTAAAACAAAATACTATCAATAAAATACGTTTCACCAACCAATATTTTCTTTGATACAAGAGACGTGTGGCCTAAATTGATATACTCCCGTAAAAATGC:1 - chr3L 24762101 3' + FB 279 1 63.70 TGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATATATCCTTTTCCCATTTAATTTTACCTACCTTTTAATAAATACTTTAATAAGTCATAATATGTGCGTAAGCATACTAACCAGATAAAAAACAAAAA:1 + chrX 21638152 3' - gtwin 24 2 69.18 TGTGACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATATAAAAATTAAATAAAACGTTATTGAAAGATAATGTTGCTCTATTAAGTTTGTGTGTTGGTGAGCGATGGAAATGGGAGTAAGATAGTAAAAAATACACAG:1 + chrX 2476264 3' - accord2 7352 1 67.12 CTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTCTTATACTTTTTTGTAAAATAAATAGAAATTTTTTAATTGATTATGGATGACAAAAATAAGGTATGGGATCATACGTACAGGCGAAAGAATGCAATAGTAAGCT:1 + chr3L 1398643 3' - Juan 4116 1 67.81 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATTAACCGCAAGCGCCAGCAGATGTTGTCAACAATTAA:1 - chr2R 10666821 3' + hobo 2909 1 61.83 GATGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATCTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTG:1 - chr2L 5333416 3' - mdg3 5334 2 78.77 AGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTT:1 + chrX 22517670 3' + 1360 3323 1 73.44 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCAACAG:1 + chr3R 26031810 3' - pogo 44 1 56.16 ANACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTG:1 + chr2L 20716425 3' - P-element 56 1 42.86 TATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGAAATATTAAATGCCTGCTGTAAGCGAAAATTCTAAACCTACAAGCAAACAAACTGCGGCACAAAACAAGCAAACA:1 + chr2L 22032075 3' + Tabor 439 2 53.42 ATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAAAATCTCAATCGCTTTATTTAGTATTTGATGATAATGAGGACAGATTAAAAAACATTGCAAAAACT:1 - chr3L 15056271 3' + flea 204 2 54.79 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCATATGAAATGTTGCCATCGAGCTACTATATCTAGTTCAAGTCTGGTTCCCAAGGATTTTCTTCGCGTGTGGTGCAGCTGGTGGTGCGGTGGCTTGAATT:1 - chrX 6052879 3' + roo 9052 2 65.07 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATTGTGTGCTTCTGTGGATTTCAGTTCGGATTCT:1 - chr2L 2336185 3' + 297 367 2 67.81 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAAT:1 + chr3R 4352119 3' - Doc 37 1 65.69 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCCATGCTCTGCAACGGTGCGTATGATTAATTTCAGCTACAATTAATATTGCTCATACGCCAGCGAGTA:1 + chr3R 30524564 3' + roo 9020 2 50.68 ATTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTTTTGTTAAATATTTTAACATTATACAATATCTATAATTACGTATTTTTAGAAATTTACAGCATTATAATAAGCTGTATGTGCATATATAGTTCGAATTTCTATAACAA:1 - chr2L 12405128 3' - I-element 5116 1 68.49 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTGATATTGGGCGATAAAG:1 + chr2L 11043616 3' + roo 343 2 64.38 CTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAATTTGAATT:1 + chr2L 42594 3' + copia 228 1 54.63 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATTGTGTGCTTCTGTGGATTTCAGTT:1 - chr2L 2336193 3' + 297 359 2 62.33 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTCTTAAGTCTAGAACGGTACAAGTGCTGTCTGAAATGCTCTGCCTTAAATCTATGATATTCTTACGATATTAGCATTATG:1 + chr3R 18514456 3' + pogo 2066 1 61.64 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGCATACAACTCAATCATTTCGTTGTTGTTCGCCGTTGTGCAATTGTCTCGACCAATTTGTTTGTTCGTCAGTTCGTTAGTTACTTTGTCTTGTGCGG:1 + chr3L 11228217 3' + pogo 2080 1 71.23 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTACGGCGGGCATAAATGGAGTTTCGTATCGGGTTTTGTAGTGCCGCAGAATCGAAACACGCACACGCGAATTTCACTGTCCAGCCGGGTTTTCAA:1 + chr3R 12547981 3' + hobo 2936 1 75.21 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATTTTTAATGCGATGAAAGGAATGCGAGCGTATTTGCGAGTGTTTATTATTATTAGACCA:1 - chr3L 16523186 3' - jockey 67 1 58.22 GTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGTGCGTGCGATCAACGCATTTTTCGCGAACTACATCGGCAAAAATTCGAATAGTTCAGAATATTGAACGAAATTTGCCTATTTTCCCGC:1 - chrX 22652674 3' - ZAM 7997 2 60.27 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACGAGTT:2 + chr2R 18786050 3' + roo 8992 2 71.92 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCTTAGACTAAGGAATTTTAATAGCAAAAACATGACTAGAATATGTAG:1 + chr2L 3327054 3' - jockey 4745 1 67.12 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTT:1 + chr3R 13198277 3' - Doc 72 1 63.70 AGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATATGTGTATACGGGAGAATGTATTTTATTTTTATTTTATTTTTTTGCTGTTT:1 + chrX 15675624 3' - opus 7179 4 67.12 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTA:1 + chr3L 22635771 3' + hopper2 1543 1 58.90 AAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACAAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATAGTGTTTGGTTAAAGTTGACTTAGTAATGTTTACCTCTCTCTGTTTAC:1 + chr2L 1922578 3' - BS 5070 1 69.18 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAA:1 - chr2R 20931654 3' - blood 85 2 76.03 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTA:1 - chr2L 10178005 3' - mdg3 79 2 69.86 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATGAAGCTCCTATTAAAGAGGTGTTTCCCGTGGCCGATTTAAGCTGCCGCTTGTTGGCATTTTGGATTGCCATTCGGATG:1 + chr3R 26658258 3' - hobo 42 1 55.86 AAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATCCCGCAGATCATCGCCTCAAGTGCACTTTAAGCACGAAGTATAGTCGTGTTTTATCACGAGCGTCTCCTGGTGAATCTACAAAAAATCGATTTTGAA:1 - chr2L 19460583 3' + G2 2729 1 68.49 ATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCAGCATCATTAATAACCCGCCCGACCGAAAATGGCAGCATTCGGCCCATCAGCAACACCTTGACCAATAAAATCAAATTAA:1 - chr3R 12179623 3' + Doc 4451 1 68.07 CGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTTGGTTTACTTTTCGAATGATTTTAAACGATACCCCACATCCATCCCAGTCCTGCCCAGCATCCA:2 - chr2R 7343233 3' - flea 51 2 56.16 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATGTTGAATTCAGTTGAGAGCCTTGCGATTTTGTTGGTCCGTTTTACTTTTCGATTTTTTGCTTTTGCCACTTTTTTCGCCGAGTTTTGATACCTATTAGCCGAAACTA:1 - chrX 3743707 3' - Tirant 8118 2 78.08 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACACACAGGGAATTCAATAAATATATTTGGCTTAAAACAAAAGAAC:1 + chr3R 18539897 3' + roo 9025 2 52.05 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCATCTTTAATAAATATCTTATCATAAGTGATGAAATAAATCTTCAAACCCCTTACTCAATGCTAATTTAAGCTATCGCCTAGCTACATA:1 + chr3R 11163144 3' - mdg1 7071 2 63.01 AAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTTAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATGTATGTATATAGAAAAACAAATGGACTAGACTTTGTTGAA:1 - chr3R 29867946 3' - S-element 76 1 72.60 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCTTCTCATAAGTGATCTTCGGGCCAGCTATCTGGCTAGTTAAAGTTTGCTGTGTATGGTATGTACATTT:1 - chr2L 11047919 3' + Juan 4203 1 66.44 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTCAGCAATGCTGTCTAGTCTAGAAATTAGGATCAACACATCATTCCTCAGCTATTTATTGTCATTTATTTATTG:1 - chr3L 13380422 3' - hobo 48 1 52.74 CTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATATATATATTTGGATTCTCCTTTTGTCTACCCCAAAGTCGCGAAAGTTAACGCATAAACCAA:1 - chr3L 20899005 3' - Quasimodo 47 2 61.54 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTCCGCACTAGACGGAC:1 + chr3R 5684175 3' + pogo 2050 1 56.16 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAACGATCCGATCCGATACGATACGATACGATACGATCCGATCCGAGCTAAAGTGTTAACAATTTTGCCAAGACGACTGCTCCGCTA:1 - chr2L 8699948 3' + P-element 2853 1 60.96 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATAAGTTTCCTGCTTAGATTGTATCTCACTGGTTGTCCCTCGTGC:1 - chrX 16857017 3' - pogo 23 1 67.12 GTTGTCTGCTGTCACTGTATGCGTAGAAAGGAGCTGTAACGCTCTTTGCTTAACTGTAAGAACTATAAAATTGCACTGTACGCACGTGCTGGGGGCATTGCTAGGAAAATTGCGGCGCTTGTTACAAGCAAAATTCCACGACCATC:1 - chr2R 4783398 3' - 1360 153 1 73.29 TGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCGAACGTCATCCTGCAGCAACCTTCGGGTGGTTTGCCACCCGCGCC:1 + chr3L 939712 3' - hobo 76 1 69.18 TTACAAATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTAAAAGCAAAATCAAAACGGTATTTTAAATGGCATTTATTACCATTTTTAATAACCCAGCATATGATGTATGAAAAATTATAATTTGGCTAGG:1 + chr3R 3750675 3' - 1360 2959 1 68.49 AGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCCATTAAGTTAATCTTATTTTGAAACACAGATCTC:1 + chr3R 23021004 3' - INE-1 572 1 43.80 AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCA:1 + chrX 8610308 3' - mdg3 5322 2 63.01 GTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCA:1 + chr3R 9862949 3' - Stalker2 7339 2 78.77 ATGTAACTTGCAGAAGGAAGCGATTTCTACCACATAAAGCATAGCATATAAAGTATATATATTCTTTATAAGGGATATATTGTTCTATATCGCTAAAGTAGAGTCTTTGAACATTTATGGTAAATCAGTTGCATACGGACAGACGG:1 - chr2R 5507018 3' + INE-1 30 1 52.05 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCTG:1 - chr2L 15523916 3' + opus 458 2 56.80 CGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGTTCTAAGTTAATTTAATTACTATACATACAGCCTTGTTAAAAAA:1 + chr2L 16180481 3' + R1A1-element 5029 1 69.86 TCACCTATTTAAACCGAAGATGTTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATA:1 - chr2R 14450151 3' + roo 9005 2 62.50 AAGAAAATAAAAAAAAAAACAAAAAAGAAAACCACACTAATAAGATCATATTTGACTTTATATGTATTATAGTAATGTATTCAGTAGCTAAATCGAAAGCCGAAGAATGAACCGAAAACGTTAGTTATCTGGCCATAACTAAGCG:1 - chrX 5409949 3' + gypsy7 5009 1 60.69 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATGTATATACATTTTATCAATAATTAGCATAAAGTTATTGCATAAAGTTACCGGCACGAATTCGATTGG:1 - chrX 18055708 3' - 297 30 2 59.02 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACAGTCAAAGAATT:1 + chr2R 18922626 3' + opus 452 2 54.11 TATTTTGAGACGATCTTTTCCTTATATTTAGGCTTGAAAGTAAAAGATCCGATGAATGCATTGATAAGAATAATGCATAAGAATAATTCGACTGACCGTGTGTAATATATCTAAAGGCTTCTAAGCTGATTAACTGTCCATCTCTG:1 - chrX 11972254 3' - transib3 2434 1 69.86 GTCCATCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAAATTATGTAGCAGCGGGATTTATTTAATTTTTTCAAGGAGCAGAAAGTCTTTCCTTTGTGTTTGTGCTATCATATCACGATTACATCTC:1 + chr2L 10609640 3' + INE-1 125 1 47.95 GTGCACGAAAACACAAAATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACTGCGAACAACGCACAAAAAAGGGCGAATAAACAAAAAACAAAAAAAACTAAGAAAAAACAGGTTGAGGGTCTCCGGAGAAATGCCAACTAACCATCC:1 + chr2R 14117545 3' - Cr1a 391 1 58.22 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGGCGTCCCACGTCGCCGTCGGGTGGTTTCACCTGGCTCTAACTTAACTAACACCACTGCAG:1 + chr2R 11818292 3' + P-element 2847 1 49.19 GCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAAGAACCTAGTCGTAAATCAAAAGACTGTGGGACAGGCAC:1 + chr2L 9988176 3' + hobo 2869 1 69.17 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATAGATATATTTCTCTTTATTTTCTTGCTTTGTGCATAAAACTGTCTGGGGTAACTTGATACTGGAAGTAAAAACTGTCGCGACAATTGT:1 - chr3R 8884272 3' - HMS-Beagle 30 2 63.70 TCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCGCTGGAAAGTATGCTCCGCTAAAATGAAGCCA:1 + chr2R 5899305 3' - jockey 4559 1 55.48 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCATTTAAATGCAAAATGAAGTAAATTCCAACCATTGTGTTTCCCTGCTTAGTTTAGCTT:1 + chrX 12995449 3' - blood 20 2 71.92 TGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGAGTTTTTTTTTATTGTTTATGAGGTGGAACTGCAAATTCAAACTCAAGGAATATTCCCATGGTATTCTTTGTTCACTTTACCCTTTTGAT:1 - chrX 4818475 3' - Bari1 30 1 66.44 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTTTAGGTTCTTTGTTCCAACAGTCTTGGATTTTAATGATCCCTATGTACAATGCGTCTCTT:1 + chr3R 7850833 3' - 1360 14 1 83.13 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGAACACTAGGCAATAGCTGAGCGATCTGGCAGCC:1 - chrX 19744386 3' + P-element 2872 1 71.54 ATTGCTCGTGATCAAGAATATATACACTTTATATAGTCAGAAACGCTTTCTTCAACGAATCTATAATACCCGGATATAACGGATATAATTAAAGTTTGCTTAGAAACTTGTTTCATTCTCAAAGTATATACCTTTCCACTTTAAAT:1 + chr3L 17700556 3' - INE-1 83 1 45.21 CCGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATAGTTTGAATTTAATTTTAAACTTTTTATGCCGGAGACATCGTTGCCAAGCTCGTTTGGTTTCGCATTTGTTTTCATTC:1 - chr3R 19625862 3' - opus 36 4 60.96 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCTAAAAGTAATCAGATATATTATTCTGTATAAAATTGAAACGGATTTGAATATTTTTGAAATTGATATGATTACATCCAAGTTTTTCACCACGGTTTGG:1 + chr2L 5724001 3' + flea 4995 2 71.92 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTC:1 + chr3L 9240463 3' + 412 7465 2 71.92 TTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGACAATCTTGATTATTTTTAGATAATTATGAACAATAAATAACTGTAAGCAGACAACTGTAAAGAAAGCT:1 + chr3R 17401797 3' - Juan 57 1 56.85 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATATTTATGTATTTTCGCCCATTTCGATTGATTCAAAACTACAAAATAATCAAC:1 + chr3R 15453765 3' + Transpac 5172 2 62.86 TATATATTCTTGATCAGGATCGATAGCCTAGTCGATCTGGCCTTGTCCACAGATTCCACGGAATCCGCTCGTGCAGGCGCCTGCATTGCATAGAAATCATCGTCATCGTTACCGAATCCATCATCCGCCGAATTGGTGTCGCCACA:1 + chrX 22986500 3' + INE-1 81 1 67.12 TGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCAT:1 - chr2R 14767376 3' - Tirant 8168 2 66.67 TAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAA:1 + chrX 17508896 3' - Burdock 6215 2 75.34 GGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGCTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTA:1 - chr2L 23069854 3' - F-element 4453 1 71.23 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGGACCGGACACTTGAGAGAGAGAGAATTCTCCGGCTCGGTTTCGGATTCGGGTTCGAGTCTGCGCTAAAGTTATATAGCGCGCC:1 + chrX 13642144 3' - P-element 38 1 60.27 CCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCGGTTCATATCTCTCTGTAAATATTGAATAATAATTGTTAAA:1 + chr2L 12767048 3' + hobo 2867 1 69.63 ATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAATTCAATTGCAGCGGAAGTTTCATTGATCACTCAAGTTCATTGATTAAAGGAT:1 - chr2L 9336002 3' + 1360 412 1 64.38 AAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTACTTACCGGTGGTCGTGTGATATTTGTGGGCAAATATAACCACAAAGAAGGACGTTGCATACTTGGCGGCGTTGACCAGATGCGGAAATGACTCCTTTGTGTCGCGGTATCTGCG:1 + chr3L 5919212 3' - BS 5070 1 78.77 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACGCAACACTAACATCATCCGAAAGACTGTGGCATACTTCTGGGCGTCTTTAA:1 - chr2R 11379787 3' - hobo 71 1 67.12 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGAGAGATGGGAGTCTCTACTCGCTT:1 + chr3L 17896007 3' + P-element 2824 1 43.84 TAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATTGCACTGTATTTAAGCCTATATTTCTGTATTATATATTCTGTATATTTTTATAAGTGAAAGTC:1 + chr3L 16563413 3' - I-element 58 1 60.27 CGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATCTCAAAATGCAAAAAAATAGTATATGAAGTAAGCTACAATCTTGAAGTGTTGTACTGTGTAAATTTGCGTCAATTTCGATGTATTTTATTATAA:1 + chr3R 10769698 3' + 297 373 2 71.23 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAATTAAAAAAGAAAGCTGGCTGGCAGTTTAAAATGTTGATGAAGTAATTAGTTTAATATGCGAAATGCCCCTGATGGGCGGCGGGAGAGGGCGTGGCACATA:1 - chr2L 2518461 3' + jockey 4968 1 60.27 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAATGCTAGCGTACTCTATAATTTAGCCACTCGAGTTAGCAGATTTATGGCATTTGGATTTTGACA:1 - chr2R 12642628 3' + pogo 2046 1 58.90 AGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAATACGAACTAGGGAAATATCAATTAAACCATCTTAAGCGGA:1 - chrX 19894628 3' + Bica 4551 1 76.71 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTAGAATTTATTCCTGTTTAAGTTTTAAGGTAGCTAGTTGAGCTGTTTTGACTGTAAGTGTCCTTTCGTCCAATT:1 - chr3R 18539770 3' - roo 8713 2 54.11 AAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGCTCGTTTACTTTTGTGCACAAAAGCCGAGACGCATAAATAACCGGCAACGGTCATTTTGC:1 - chr2L 1892272 3' + hobo 2885 1 55.40 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGACACTTTCGTTTATTTGCATTTTCAATTTATTAGCATAAATGTTTGTGCCATGAAACGCACGCTGCCAAACACT:1 + chr3R 11730785 3' + hobo 2892 1 50.00 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAATGTGCGTGGAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATGTTGCATACTTTTTGGGGTAATTTATGATTTCCAAGCACATGCCCGTGGGGCGCGG:1 - chr2L 12861671 3' - jockey 31 1 49.32 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTATATGTGCGTATTCTTTGTGCAGCCTACCACTCGGGGG:1 - chrX 12137353 3' - 297 6625 2 70.80 TGACTGTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGGAAGCTAATGGTGTCTAAATAGCTATGCCCACTAGTGTACATGTATGTACATCCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTACATCCAATAGTCGCGAATATAG:1 + chr2R 6164609 3' - Tc1-2 50 1 58.90 CAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACAGCAGTTTTGTTTTGTTTCGCCGATTCGGCGGCTCTGCGCTGGCATTTATTTAATCCGACCCATCCCCAACGATCCGGCAGATCCGGGGGCATC:1 + chr2R 18266137 3' + roo 377 1 63.01 TAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGTTTTGCGACTCGGCGGTCTCTTGTGTTATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTATAACTTG:1 - chr3R 9657670 3' - BS 31 1 48.00 TTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACACTTACTTGCCCTCGGCTGTATGTGCTGAACAGATATTGGAAACATTCTAACAA:1 - chr2L 3393751 3' - Stalker2 64 2 61.54 TAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAATTGCAGCGT:1 + chr2R 13052844 3' - Doc 113 1 68.49 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGTTTTGTTTTGTTTCGCCGATTCGGCGGCTCTGCGCTGGCATTTATTTAATCCGACCCATCCCCA:1 + chr2R 18266111 3' + roo 9016 2 56.16 GAGACGTTCTCCCACCATATCTCCCAATCTAGGAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCAGTGACAGAGGAACCCCCTGTTACCTGCAATTAATTAATTTAATTTAATTAATTTATACATACAAGTTCATACTTTAAGTT:1 - chr3L 24736266 3' + gypsy6 7696 4 65.07 AATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTACCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGAAAATAAGCCGATGCTGTTTCACGTGGCGTATGAGCAATATGTACGCCA:2 + chr2R 8492828 3' - pogo 68 1 66.44 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTC:1 + chrX 12995383 3' - blood 86 2 76.03 GCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAATTGCTTTTGATTGACTCATTCAATGCGATTTGTTT:1 + chr3L 13475583 3' - HMS-Beagle 6879 2 75.34 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGA:1 - chrX 19744418 3' + P-element 2817 1 38.36 ACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGAGTTTTTTTTTATTGTTTATGAGGTGGAACTGCAAATTCAAACTCAAGGAATATTCCCATGGTATTCTTTGTTCACTTTACCCTTTTGATGTACTTTTCT:1 - chrX 4818465 3' - Bari1 20 1 73.29 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTATATCCGGAGAATCGGATATGCGGAATTGGGAAAAGAGAAGAA:1 + chrX 20369492 3' - roo 8703 2 63.70 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAAAGTTTATATTTATTACTATTAAAAGTACCATTTTAT:1 - chr2R 11609876 3' + roo 9017 2 58.22 GGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCGGCATCCCCGAAGCTCGCCAAACACCTGAAAAGTATGCAATGAAAATTCTTTTGGTGGCTCTG:1 + chr3L 6542086 3' + hobo 2893 1 51.13 GAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAA:1 + chr2R 10760475 3' - Tabor 84 2 80.00 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATGTACATATGTGTCTATCACACTGTCTACCCACTTCAAAGGTCATCGGAGCTTGTCCAAGTCGTAACAGCAAATTCATAAAGTCA:1 - chr3R 22275230 3' + flea 227 2 60.27 TAAGGCTAGTCAACCAATTCAATAATAACAGCAAGAGCTGGAGTCGATTAAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAGTATAAAATCAAACTGAACTTAAGGCTATCGCAGTTTTCGATTTTGGGCAGAAGAATGGCGAAGTAGCCGGC:1 - chr3R 13780495 3' - springer 220 2 69.86 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTAGAATTGATTTTCTATATTGCACCCAAGATCAAGCCTTTAAAAGTTTATTAAATTTCTGTTGAATATGCATAAATACGAGGTCAAGTATGTAATATTTCATCACA:1 + chr2R 21245003 3' + roo 392 2 73.97 ATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATGAAGGAGTGATGCCGGGGCAAAGGGCAATCCCGAGATCCATTGACAGGATGCCCGGTCTGCTGGCATGCAGTCAGCGGCGG:1 - 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Burdock 6211 2 71.23 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCCACCCCGACCCACATTTTTTTTTGGCATTCACATCCCCCGCCACTCACCAGTGGCAGCAAAAAAAAACCGGCAAAAAGCAACAACCGGTAAAATC:1 + chr2L 17574500 3' + hopper 1414 2 79.20 CAATTAACTGAGCGTGATGAGATGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGAAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGACTGACGCACAACTTTCAAAAATAATAC:1 + chr3L 23839756 3' - McClintock 19 2 67.39 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTAAGCATGCAACAAGAATGCGAGACGCCCCTCTGGATC:1 - chr2R 18265959 3' - roo 8678 2 74.66 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGTCGCCACAAAACGAAACAAATAACACAGAA:1 - chr2R 14450117 3' + roo 9037 1 61.64 ATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTTTCATTGTTTGCTCCTTCATTCAGAAAATCGTCAAGCAATTACTAGTATAAGTAG:2 + chr2R 18807909 3' + BS 5030 1 63.01 GTCTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAATCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTG:1 - chr2R 982346 3' + rooA 7475 2 43.15 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGT:1 - chr3R 22266442 3' + roo 339 2 65.07 CTTTATATTTTCTTAAAAAAAAATCAAGATTTTCTTGAATTAATCATGGTATACCAAATTAATATGCTTGGTTGCAACTAGTTTCCAAAATTTGTTAATTACACACATTGATACCTAATGATTTATCAAGAGATATATTAGAAACT:1 - chr3R 14811848 3' + pogo 2019 1 86.30 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATTGCGTCATTTATGCATCTCATAATTCCCCGCATAAGTCCACCAAACAACCGACTGCGAATCCT:1 - chr3L 22445173 3' - Transpac 55 2 56.85 GGTTGAATAGTATATTCCAACAAATACCTACGTAACCAATCCAAGAATATATCGGATATATCATATTGGCTTTAAGTACGGGGATACGTGTTGTTTGTCGCCTGCTCAGCTTGGTTTTCGGAGTGTGCCAGGACTCCA:1 + chrX 18561208 3' - copia 1 2 75.36 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATCCTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCGGTAACCAATCGAACTTCCTACGGT:1 - chr3L 19510470 3' + pogo 2068 1 56.62 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATATTTATTCCTTTTCGCAGGGCTGAACTTCTGAGCATGAGAGATCACGGACATCATCCCATGGGACCCGTCGACTACTTCAGCATTAAGATCAGCT:1 + chr3R 17069025 3' - mdg1 7063 2 68.28 CTCTGCAGAGAGCGCGGCAAGCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTT:1 - chr3L 3540150 3' + mdg3 153 2 76.03 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATTTCGTGTTTTATTGTATATGCGTTTATATATTTACTAATTTATTACCACGC:1 - chr3R 7136546 3' + roo 9036 1 60.27 CTAGAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTAAGAGCAAGTGAACATAACACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACAGTAACGACCTTAGACACATCGACAACAACAACAAACAGACTGACAACAAACATTGCGAAGAACA:1 + chr3R 31347047 3' + I-element 424 1 76.03 GTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGAATTAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTAATTGACAATAAATTATTGGAAATTTTAATGATATTGGATTTATTAGGAAGGACATTTTTAAATCATGTTTATACTTTTGAGATGCTA:1 - chr3R 12330543 3' + R1A1-element 84 1 58.22 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATTTTTCGCAGTTATGTCTTTCACTTGTCCGACA:1 + chr2R 8375160 3' + roo 9049 2 69.86 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAG:2 - chr3R 26031677 3' + pogo 2052 1 52.74 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGATCGAAAATAAATAAAATATGAAATACAGTTTAATTTCCTGAACTTCTTTCAAGTAGGCATTTTTCAATAACAAATTGTTTTCATTCAGATGCTGTCAATCAAGA:1 - chr3R 15154512 3' - mdg1 16 2 74.66 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGTTCGTTTATTTTTCTTAGTGTACCAATAGCTTCGATTGTCCTTGCTAGCAGTGGCTTATCGGCGGACATCTTATCGTTCCATCGCAAAGAGTGCTGCCAGTGAAATTGATA:1 + chr2R 21353335 3' + Transpac 302 2 75.34 CGTCTTCACACGCCGGCGATCGAATGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTGATCACTAAAATGCAAAGCAATAGTAGCTGGTTTTTTTTTGCAAAGCCAGACAAATATGAAGAGCAGTAACAAATTTCTAA:1 - chrX 12344255 3' - F-element 17 1 81.48 GTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGTGCGTGTGTATATTTTGCGTTCCTGACTTTTGAGATCACTTTATGGGTTGTTGGTCTTATAA:1 + chr2R 14927579 3' - pogo 1792 1 57.53 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTGTAGGCTGACTCAGAGCCAAATGGCGTTGGATTCATGGCTAAGACCAGTTCAAAGGCAATCGATGGCAGTGGCGTAACCTTA:1 - chr3R 29719285 3' - hobo 21 1 71.23 GTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCAGGCACATTCCCCAGATTCCCCCAGGTTTTCCCAGCTGTTTAC:1 - chr3L 19398139 3' - gypsy5 81 2 72.60 GCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATCCTGTGCATACCAACATAATTTAATTAAAGCTCTCAATTGAGCCATCTCATCAGCAGCACGAAGGGTTGGCCAAACATCGAGGCTGCGTTGTTGAAGTTATCAAAATAGTATCG:1 + chr3L 12729240 3' - opus 2 2 80.14 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCCTTCGATTGTTTCCTTATCCATTAGATACTCTATTTTCTCTCTGTGCATTGCTATGT:1 + chr3R 18860937 3' + roo 408 1 54.79 GAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTACCAACGAATTTATGTTTTCAGCCATAAATTGCCAAACATATACGCCCACCTGGGCGCCGCTTG:1 - chr2R 18927763 3' - 3S18 5823 2 62.33 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTAGACATTTGCTTATATCTGCAGAGCCATCTCATCATACAATCACCTTATATTACAAACTTATTAGGGAACAGCAAGAGCTAAGCTTC:1 - chr2L 5723827 3' - flea 25 2 70.63 TAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGACTCCTTTTGAAAAACTCCCTTGCGTTCGC:1 + chr2L 21082229 3' - mdg3 5304 2 52.74 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCCAGCTTCATAGCCACTCAAGTAACCGAGTTACGTGAGGTTACTCCATACGTGGCAGCAAA:1 + chrX 7624194 3' + roo 390 2 76.03 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTATACATACATATGATTCTTTATGAAATATGTGATGGAAATTCTTCCGAGCCTTCGAGGCCTTAATAAATTTGTAAAGTG:1 - chr2L 20253823 3' - roo 40 2 58.22 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAACCTTCGAAGGCAGATCACTATATTTAGGCCAATAAAATCTTGAGAATTTCACGC:1 - chr3R 5684062 3' - pogo 62 1 60.96 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGA:1 + chrX 1831293 3' - P-element 93 1 21.92 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACATTC:1 - chr3R 24301813 3' - Tabor 6900 2 56.85 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCCAAAACATCATACCGCAAAACATCAGGTACGTGAGAGCCATTCAAATGAGCGAGTGCCGA:1 + chr2R 8467826 3' - roo 8723 2 58.62 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACGAGTTGCGCAACCACAGCGCCCCCGCATACCAAAATGTCGAGGGAGAAATACTT:1 + chr2R 18786099 3' + roo 9041 1 64.38 GCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCTGTTCTCTGGGCTTTGTTTTAGTTGTCAGACACACACCCTATCCTGCTCATTTTAGTCTCATA:1 + chr2R 22795227 3' - hobo 58 1 56.85 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGTGTGTGTGTGGCTTGAATATTTG:1 + chrX 6213619 3' + roo 350 2 59.03 TTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAAAATAAAAATAGCAACATAGTTTTGGGACTCTAAATTAAGTATTATTAAGTATTAATTTTTGTTCTGAAACCAAATTTTCAGCTTGCTAGCTGTA:1 + chr2L 16567004 3' - F-element 491 1 58.90 ACATTGAAATAATACAACAATCAAAAATCCTGCGAACAATAACTGGTTCGCCTTGGACCTACGGATTCCAGTTGTTCTTTGATAACTTTTAAATTTCGTTCGGTGGAAAATTCAGTGGATCAGTAGGTTGTCTATCGGAGACGTGC:1 - chr2R 5535205 3' + Doc4-element 2642 1 56.16 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTCCACCCCATCAAAGTCCAGCCTGGTAGGCGCTCTCGCAAAGGTGCTTTCCCACGCACGCATGCGCCGC:1 - chr2R 16031338 3' + hobo 2934 1 69.39 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAATAGACTTCAAACTGCTGGCAAAGACGAACTACAAATTGA:1 - chr3R 11072424 3' + roo 9039 1 58.46 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAACGTTTGATAAACACATACATAAATGTAACGAGTTCATTAAAAATTAATAATTGTATTTAATTATACAAATTGCTGTAGCCACAAGTCATTATTAA:1 + chrX 13351727 3' + roo 9043 1 66.44 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGA:1 - chr3L 19938475 3' + roo 9004 2 64.38 TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAG:1 + chr3L 3540262 3' - mdg3 19 2 71.23 AATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATGCTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGAGCAGGCCGAGGCAATTGCAAATCCCACGCATGGCGTCCATAGACTGCGCG:1 + chr3R 20720642 3' - 1731 4337 2 64.83 TAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTGTTGACACACTGCTTTATATATGAAAACTATTTTATGCATTGCAT:1 - chr3L 15374590 3' - 3S18 5796 2 65.75 AGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGGAAATCTATGGGTAGTAACCGTTGACTTTCAACTCAGCACTGTAGCTGCTCTC:1 + chr2R 7343344 3' + flea 4953 1 63.01 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACTTCTCTTTAAATTAATTTCTGTAGCCTACTTTTGTGGGTCAAAAGGGAAAGTCCG:1 - chr3L 9993909 3' - hobo 63 1 60.69 AATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTTGCCTTATCAATGGGTGAAATTCCAAAGCTTATCTGT:1 - chr3R 8293510 3' - Stalker2 41 2 56.16 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGGCGGCTTGTTCCTTTTGCAGCACTTCGTTAAGA:1 - chr2L 14262932 3' - P-element 46 1 52.74 ACATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCATTGCAAATGTCAAAATAGGGAAGTTAATTTTAAGAAAAGGAAAACTTGCAAAATAAGTTGTCTTTTTCCAAATTGTAGAAAATTAATTTAAATAAATT:1 - chr4 634574 3' + mariner2 826 1 72.60 TTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTGTTATTTTTCGCGCTTTTCGCAGGGCTAATTAAGACGTTCGTCCTTGGAAACGGTAATCGTATATATCCTCGAT:2 - chr2R 17872412 3' - Tirant 8109 2 80.14 AATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGACTTTGTGTCATAAACACCACTGAAATGGAGCGCCGCAACAC:1 + chrX 10561809 3' - jockey 4751 1 73.29 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATGCAAACATGCATTTCACATGGGGATACATTTCTGTCCCAACTAGCCCGGCTGCTAACTGCTGAAGGGGAATGGGGATGGCTGTTTTTA:1 + chr3L 5329217 3' - 412 7087 2 62.33 ANTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTGGCACGCATAATGGTGTTACTATTTTGCGATAGTATATTATTTGCTTGCTATCTTT:1 + chr3L 10241293 3' + pogo 2043 1 60.96 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTC:1 + chrX 22517680 3' + 1360 3365 1 54.17 TCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACAATCTGTG:1 - 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chr2L 6716325 3' + hobo 2888 1 65.49 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGAAATATTGAGATTTAAATTTCATCAAAGACTGTTTATAATAATAGAAGTCTAGACTTTTTGTAAGCGAGTTCAAGCAAAATACTTTCGCTTTTTATATCGAAATATTTG:1 - chr2R 10189210 3' - Doc 16 1 71.23 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTACGTGTGTGCAAGGGTGACAGCTGTCGCCCCAGGGAGAGCAATGTAAGTG:1 - chr3R 17079420 3' - 1360 73 1 68.49 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGTAGATAAATTTCAGTCGTCTTGCGCTTTAAAAATGGCACCCTGTTTGCATCAGCAGTAACGTTTCCAGAATTCTTAGCAACCAGTTTAACAGCAGCAACAACGAAGAAA:1 - chr2L 22340249 3' - HMS-Beagle2 6893 2 76.03 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTACATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATAAGTTTC:1 - chrX 16857053 3' + pogo 2049 1 46.27 GTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACAGCAGGTA:1 - chr3R 5087107 3' - P-element 104 1 14.38 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGCTATCTAACCGAGTTCCCTGTGGCAACGAGGCG:1 + chr3R 12886059 3' + 412 7506 2 69.70 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACCGCGTTTTCACGCCACACACACACAAGTAGAGTGCGCCGCATAGGTAAAGAAGCGCGAGCACGCTCTCATTTAGTTAGAAAAACACTTTTAAAAAGTGCACCGCTTTTT:1 + chrX 7930826 3' + P-element 2875 1 77.40 ATTGGTAAGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTAACAATATGAGGTTAATTTATGTTTTAAAAATGAATTTTGTTTTGGCACCTGT:1 + chr3R 22312268 3' - I-element 214 1 62.33 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACATACATGTGTGTCGGTGTCTGTGTGGTTGAACGACGCCATCAACAGCTTAGAATTTCAAAATGGGCGAAAGCCAATTTTCACACTCAAATAAATTGGGTTAGTTGCACA:1 - chr2R 21453485 3' - hobo 10 1 78.77 ATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATT:1 - chr3R 19589922 3' - BS 5065 1 63.70 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAATCTTTGTTGCTCAAAGTGAGAGACAGGGAGAGAGAGAGAGTACACGGCGTATGTGAAAGATTCACTTT:1 - chr3R 7109123 3' + P-element 2837 1 51.37 AAAGAAAAGTACTTATCCATTCTCACGGGCGCCGCCATATTACCCACCGTTCTCCTTTCACCCTCATTCGTGAAAATTTCTAAGTCCAAATTTCCGAATATATTTAAATACCCTCCCGTTTGAGCAACGCTTTTGTT:1 - chr3R 14973958 3' + GATE 463 1 80.29 AATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTCATGCCTAAAAAACCAAAAAAGTATTCTCAGTGTACTCACAATAAGCGAGTGAAGAAGAGCAGATGAGAGGAATGGGAGTGGGGCGG:1 + chrX 18058408 3' - 297 325 2 65.75 ATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACATATATTTGTTGGAAAGGGAATAAAAATAAAGTTGGCAGCGAAAGGAAAATAAACTAATGATGCCAGC:1 + chr2L 8615445 3' - 17.6 49 1 57.53 CCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCCAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTGGCTTAAAATATAATCATGTTGTTACTATCAGTGTGTCAGTTTTGATACCACATGCACTAGTT:1 - chr3L 3007637 3' + Idefix 6955 2 63.01 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATA:1 + chrX 8610347 3' - mdg3 5283 2 63.70 AAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAATGGGGGCAAATCGATGGTTTTTGGTTTTGTGGTCCAAAAAAGAGAGTGTGTGGGAGGGGTGGCGGGGTGTTCTCAAGTTC:1 + chr2L 12757314 3' - F-element 4612 1 54.79 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCCACAACTGCAGTGGCTTGGGAAGCCGAAGCCTTGCAAGG:1 - chr2L 16202588 3' + copia 5078 2 53.47 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCTGATGTCTGGAAATTTGG:1 + chr2R 12642776 3' - pogo 22 1 70.34 AATCTCAACCATCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACAGAAGGTTAGGGGGTCAGAGGGTGTATGGTGAATGGTGAATGGTGAATGGTGAATGGTGCATGCATCGTGCGTGGTACGATGACA:1 - chrX 20454169 3' - INE-1 164 1 56.85 AATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACACTTACTTGCCCTCGGCTGTATGTGCTGAACAGATATTGGAAACA:1 - chr2L 3393760 3' - Stalker2 7324 2 68.49 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATGCAGTGTAA:1 + chr3R 24301935 3' + Tabor 7284 2 58.90 GTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCATTCGCTGCCAGTTTTCTCCTACACCTAAAGCGATTTATATACATATAAAAATAAATTAGAGTTAGGATGGGGGGATC:1 + chr3L 21043157 3' - Quasimodo 35 2 62.33 ACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATACAGGTATGAACTGCTTCAACTGCGTGCTTCTTGTGTATGCATT:1 + chr3R 24396780 3' + I-element 5273 1 69.18 TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGGTGCACTTTTTAAAAGTGTTTTTCTAACTAAATGAGAGCATGCTCGCTCT:1 - chrX 7930689 3' - P-element 71 1 36.99 GTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATGAAGCTCCTATTAAAGAGGTGTTTCCCGTGGCCGATTT:1 + chr3R 26658218 3' - hobo 83 1 72.60 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACGAGTTGCGCAACCACAGCGCCCCCGCATACCAAAATGTCGAGGGAGAAATACTTTCGCTTTCAAATGC:1 + chr2R 18786113 3' + roo 9055 2 73.97 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATACTCAATCCCAACTACGTGCTGCAATGCCACACGAAGTGGTGATTAGAGGGGGAGGGGGTTAAGGCGTGCTGAAATCGCCTGCATTCTAGGGT:1 + chr2L 11045663 3' - Burdock 6163 2 65.75 ACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGC:1 + chr3R 13572098 3' + 412 7467 2 67.81 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGTATTTAGGGATTCGACGCT:2 + chr3R 11550293 3' - F-element 70 1 59.59 ATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTATTATAAAAAATATAAGCTGTTAAATTAAATTCCAATTAGGAGTTCATTAACCT:1 + chrX 13059387 3' - Cr1a 4068 1 65.07 TGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTTCGCCTTCTCTCTGTGATTTTTGGGGCTGATCAGCTGTTCCTTC:1 - chrX 19506488 3' + P-element 2735 1 36.99 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGAATGCGGCAGCGAGCGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCATTACATTTAAAAATATTTTAAAATAAGCACACTATCTACGTTTAAACACTCTATATACACCCAC:1 - chr3L 25821778 3' + opus 7449 2 54.17 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCAACCGATTTACACCATAACAATACACGAGTTCGTCGTTTCGGTTTCCCCCAATGTTTAATACAAATATTGTGGCATAAAATTTGGGGCATGAAGTTCTCGGGCAA:1 - chr2L 21189671 3' + hobo 2924 1 75.34 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCTAAGCTGAATTTGTAGTTATTTGGAATTCCTTCACGTTGGTGAGGACACGACCGCGTCATCATCAGATACGGACACTTTGGG:1 + chr2L 10128199 3' + hobo 2902 1 60.00 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACGTGGTGAGCGAGAGAGCGAGCAGAGGG:1 - chrX 13642012 3' + P-element 2837 1 51.37 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAGAAATCGGTGCTTGATTGC:1 - chr3R 26031659 3' + pogo 2070 1 65.07 ACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAAAAGGGAATTTTAATTGGCTGT:1 + chr2R 10760496 3' - Tabor 69 2 66.44 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGTACTTACAATGTTTTCATTCGGCAATGACTTATTATTTAGCACACTGATAGCTGA:2 + chr3L 1324350 3' - 412 65 2 63.01 TACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGTCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATATATATATTTTTTTTCCCCCTTTTCTTACGCCCATGTTTTTA:1 + chr3L 11903293 3' + micropia 5366 2 70.55 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATTCCCCAGGCTAACACTATTCAGATTCGATCTATATTTGGCCATCTCGCTATCTCTTTCG:1 + chr2R 15892231 3' - hobo 56 1 57.53 ATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTTTTTATAATGGCATTTTGATTATTATTTCGTAT:1 - chr2R 23795146 3' + roo 39 2 77.40 CTTGCTGAAGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 5121 1 65.75 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGCTATCTAACCGAGTTCCCTGTGGCAACGAGGCGTGGCAGGGGCCGGGCACATGGTCAACAGCTGCAGTTGGCCGCAAAATGCTTTCAATAATT:1 + chr3R 12886119 3' + 412 466 2 67.12 TGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTG:1 + chr2R 18056872 3' - blood 7094 2 74.66 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGCATTTAG:1 + chr3R 11550281 3' - F-element 48 1 58.04 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTC:1 + chrX 18193804 3' - hopper 67 1 63.01 TNGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTTCTTGGCGCTCGTCTCACTTCCATCTCCGAA:1 - chr3L 9240411 3' - 412 90 2 78.77 TTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAATTTTAATCTAATAGATACAAATGAAAAGGTGTTTGTGTGCTCCGCTCCGGTGTAATCGCTTTGACTCGCCGGGCTTTTTG:1 - chr3L 12690162 3' - roo 9033 1 64.71 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGACGCAAATTCCGACCGCTCGCCTACAACAACAGCAGCAGAGTGACCGTTGGCGGACGGGAGAAACATACCT:1 + chr2L 851079 3' - P-element 48 1 52.74 TATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCCACAACTGCAGTGGCTTGGGAAGCCGAAG:1 - chr2L 16202598 3' + copia 5066 2 60.27 TAACCAAGCAGCGCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAGCAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATTTACGCCCCGACA:1 - chr2R 4260421 3' - micropia 5213 1 45.89 AACCAATAAATGAAATTTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAAAATAAAAATTGGTCCTTCGATCCGGTCCTTCTCCGTTTCGGGCCAATTATAACATTAGGGCCACAGTAGCTGCTGG:1 + chr3R 26774475 3' + 3S18 312 2 54.03 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGTCGCCACAAAACG:2 - chr2R 14450134 3' + roo 9020 2 52.74 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGA:1 - chr3R 5087095 3' + P-element 2811 1 22.76 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGGTGACAAACTCGGCTATCCGTCGAACCCAAACCATAATCG:1 - chr3R 6603775 3' - pogo 55 1 66.39 TGTGAATATGTGTGTGTATGCGTTCTGGATTCTCTGTACTCCATACCCGGTACTCTGTTTTCTGTGGTATCGGTTTCGCTGTGTGTATTTATTTAGCCGAAAATTGCCGAAGCATCAAAACAGTTGGTCGGATTGGTGTTACAGCA:1 - 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chr3L 12775913 3' + roo 398 1 78.77 CATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAACGAAAAAATATATTTTATTAAGCAGATAAATTGCAAATATAGCCACAAA:1 - chr2L 15169154 3' + F-element 466 1 69.29 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCAACAGAAAAGATACCCCTTTTATTA:1 + chr3R 26031830 3' - pogo 24 1 69.86 CTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATCGAAGATTTCGAAATAATGAATGGGTTCCCATGGTTCTTATCTTCCATTAAAAATGATATTGTTGCAAATGCTGACGGGTTTTCAACAACATAATT:1 + chr3L 18237481 3' + S-element 1696 1 71.92 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTTTGGACAGCCTGTTGGATTTAATTTGAGACTCTTCAGTTTGCATTTGGGCAATTCCACACGCAGGATGCACGATGTCCTTC:1 - chr2L 9988078 3' - hobo 39 1 58.22 AGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCATTAATATTTTATACCCATAATTGAAAT:1 + chr2L 23295923 3' - micropia 16 2 71.92 CATTGAGAGACTAAAAATTTCTTGCTCAGACAGCCAACATATGATACATTATGTACAAATTATGTACATTATTATGTATTTACTTTCCTCCTTAGTTTTTACTAGTCCATTATTTTAAAAAATGTTCTCAAAACGTAGGTCCCAAA:1 - 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chr2R 24021545 3' - pogo 53 1 56.85 TTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTAT:1 - chr3R 13231761 3' - F-element 97 1 56.85 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATTTTATTTCATCATGGTGAAGGTTAGAGGGAATTAGCACAACTCCAAACCGACAACGTGAAGACAGCACTCTCTCCCTCGCACCTAGTC:1 - chr3R 4739686 3' + P-element 2871 1 59.46 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTTAGAGG:1 - chr2R 15529673 3' + roo 9054 2 69.11 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTC:1 + chrX 7624133 3' + roo 8996 2 75.35 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTGTAATCGATATACATACAGGATATACCGAAGATTGTTTTCGTTAAAGAGGTGAAAATAATGC:1 - chrX 10344758 3' + roo 9012 2 58.22 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCAGGCAGCAACAATATTTACAGCTTTAGCGGCCAAAAGCACAGTGGGGCAAAAGATG:1 - chr3L 11296531 3' + P-element 2838 1 46.51 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGCTTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGACACAGCTTTTTACTGAAAACTGAAGCATTCTCCCCCAAAAAATTGTTGGGAGGTAAACTAAGC:1 - chr2L 42450 3' - copia 13 2 76.71 AACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACAT:1 - chr2R 14921502 3' - pogo 88 1 80.14 CAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTACCAACGAATTTATGTTTTCAGCCATAAATTGCCAAACATATACGCCCACCTGG:1 - chr2R 18927773 3' - 3S18 5812 2 64.00 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGCCTTTCATATGGTGCAGATACACTTCCGCTGGCTAACGATAATGGGAATGGCTGTTA:1 + chr2L 20068073 3' + roo 351 2 64.03 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCTGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCAAC:1 + chr3R 26031808 3' - pogo 46 1 54.79 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATTGCATTCC:1 - chr3L 10068898 3' - 412 68 2 64.38 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTTAAGTTCAATTTGTCGGAAAATTC:2 - chr2L 12766973 3' - hobo 62 1 58.90 CAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATGTTGAATTCAGTTGAGAGCCTTGCGATTTTGTTGGTC:1 - chrX 3743777 3' - Tirant 8188 2 73.29 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGCCATACATTAAGCAGCAGTT:1 + chr2L 18848811 3' - blood 63 2 60.96 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATATTTCTGCATTTTTATTTAATTATTTTTAAACATTACAAAAATGCAATTATTTC:1 - chr3L 107507 3' + roo 339 2 64.38 TTTTCTTTGTTAGCTTTAAGCAGTTCGTTTTGGACACTCATAAAATAAAGAGCCATCACTCATTAACCAACGAGGCGCCCAGTTTGCCGTCCAATTGTGAGCGACTGACCTTCACAAAGCTGTAGTTATCTGCTAAATCCGAAAAA:1 - chrX 21136007 3' + gypsy3 107 2 58.90 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATAACAAGAACACACTTATTCAATTTGTGATT:1 + chrX 10429883 3' + roo 355 2 54.79 CATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATTTGCTTTTGCGCTTTTGCGCACGCCTTCCCCAATTGATAAAGTGACAATTTATAG:1 - chr3L 780664 3' + Burdock 6329 2 61.64 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCCAAACCGGATGTGCACAGTGTCAAGC:1 + chr3L 10069016 3' + 412 456 2 59.59 GCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACCTCAGGGGATGTCATTTGAAGGCGGCAAGTGTAAAAATTAAGCAGCTAGGGGGCGAGGCAATGAGTGAGATAAAATTACCCGGAAA:1 - chr2L 9109807 3' - opus 30 4 63.01 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATTTATGTGAGTTCGTGTGTATGTTTAGCTCTTGCTATTTTGGCGAATCATGTTTCGCTCATTTTTC:1 + chr3R 23208254 3' - pogo 49 1 57.53 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATACGAATTGCAGGCACTGTGCGATGTTATGGGTTTTGATTAATTGGAAGTGTTGTTTGACTTGGCCGATTT:1 - chr3L 5329079 3' + 412 442 2 52.05 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGATTTATTTGCCGGAAAAGATTACTTACTCTGGACTGCGGTTTTCCACGCGGCGTATTCG:1 - chr3L 13546515 3' - hobo 11 1 74.63 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAATAAATTACACGGAACGAGCCTGAAGAGCAGCAGAAAAAATGTGAAGCATAACTTAA:1 + chr3R 19500742 3' - jockey 75 1 59.59 AAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAATAATAACAATCATA:1 - chr3R 25554216 3' - micropia 128 4 57.53 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAAACAGATGGTCTGCCAATCAACTTCGAATCTTCGAATACTTCACTTCCATCACTGCTGTTATTGCTTCTAATACAGCCAACTTTGACATCGACGTTTATAACTGAATCATACCC:1 - chr3L 24089462 3' + mdg1 7455 2 79.02 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATAATAAATTGAATGATGCTATATAGAATATATGTTATTTCATAATTAAATATTTAACCTACCGTGAGCAAGCAAATTGCGATCGTTAAAGCTGA:1 + chr2L 12447555 3' + opus 7478 2 69.86 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACATACATGTGTGTCGGTGTCTGTGTGGTTGAACGACGCCATCAACAGCTTAGAATTTCAAAATGGGCGAAAG:1 - chr2R 21453523 3' - hobo 48 1 52.74 GTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGGTTCGAATTGCGAAAG:1 + chr3R 9863010 3' - Stalker2 7278 2 65.07 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACATAGTTTATTTTTTCAGGTCGATCTACTTCATCCAGGCGTGCTAATGAGCTACAGCCCAGAATGGATGGATGGATGGATAGATGGATGGATGGATG:1 + chr3L 22183546 3' - Quasimodo 13 2 79.45 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTAATCGTAATTAATGAACATGTAGGTATAGGTAGGATAGTAGGTTCCTTTAACTTATTTGAAAAAGAAGCAAATACATAGATTTGT:3 - chr3R 25052970 3' - pogo 31 1 63.01 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATGATTCTTGAAGAACGATATCACCTTCTTGGACTGTGGAGCCCGCATCCGTCTCTTGACCGTCATCGTTGGTCATCTTGGAGCTACTGTTT:1 - chrX 15696658 3' - jockey 4699 1 63.70 GATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTATAAACAACATGAACATGAAATTTAGCTGCTAGAAGCATATACATGCACATACATACTATAGATGCACAGCTCGTTGTGGATGGCCGTCCAATAAGCGACATAAAA:1 - chr2L 5656871 3' + hobo 2506 1 74.66 ACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACACACACTTGAACTGTGGACCAAAAAGCCGGTTGCACTGTTGGTTTTGTCATTTAGTTTCTAGACATTTGTTGTGTTAGTTTTTGTAATTTTTATAATTT:1 + chr3L 21765555 3' + gypsy 439 2 69.86 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTGTGTTTCCGAGTGTGTTTCGGGTTTATGCTGCTTGAATAAACTCTTTCTTCC:1 - chr2R 22372490 3' - I-element 70 1 66.44 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTAACTTAAATTAGGGGCCGGTCTAATAACAATTAATTGAGGCTTTGAAGCGAAGTAACTTTCAATGTTGGGTACCGGAAAAAGCAAAAGAAAAGTCA:1 - chr2R 10760367 3' + Tabor 460 2 67.81 ATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACATTCTGCAGTTATTAAACATGTAAAAAAC:1 - chr3R 24301788 3' - Tabor 36 2 60.96 AACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTGAGGCAAGTAGTGAAGTCAAGTGAAGACTGAGTTGTGTGCATGAATGAATGAATGAAAGGGGCGGCAATGGGCAGCCCGCTCAGAATGCTGCCGCCGGCAAGGACG:1 - chr2R 14450203 3' + roo 485 1 73.57 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCATACGCGATGATTGGTCCAAACTCTCCGGGCAACCCATTTCGAAATTCGCCGTAAACAACACCTTCGATTCCC:1 + chr3R 25094744 3' - P-element 25 1 68.06 AAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGTTTGGTTACTTGCATCCGTTATTATGATGAGCCGCTTATCAAATAATAATTTATATTTACAATGGGTTTGGC:1 + chr3R 30564806 3' - F-element 4595 1 53.42 ATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATACTCTGAAAGTCTACAGACGCACATGTATAGATAAGTTGATCTGGAAATCTTTTTCCCAATATT:1 - chr3L 492479 3' + FB 777 3 56.85 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGTTTGTTTTGGATCAACAGCAGCGTTTTGATGGCTTTCTAAATTTATTCTTTGAT:1 + chr3L 12776059 3' - roo 8731 2 66.44 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATAATACCACAGGTACTCTTCTCCCCTCGCATTTGAGCCACCACCAGACTGGACCCAT:1 + chr2L 20253954 3' + roo 9020 2 52.74 CGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAGCGGAAAAGCGAGTGCGAAAATTGCAAATGGTG:1 - chr2R 17348422 3' + hobo 2851 1 76.39 AAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAGTTACTCTTACTCATTGCTTCCGCT:1 - chr3R 26693333 3' - Stalker2 7299 2 52.74 TGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGACTGATCTTAAAAGATATTGTAACATACTTTTATACCCTATTAATAATTAAGAAAATAAACTTTTATTAC:1 + chr2L 17297071 3' - Max-element 8287 2 51.37 TAATAATCCTGGCGATTTTGTGATTCTCAATCACGGAGATCTGTGGACCACCAATATTATGTTCGAGTACGATGCAAAGGGACATCCCATTAATGCTGCCTTCATCGATTTCCAGTTTAGCGTGTGGAACTCACCAGCCCTCGATC:1 + chr3R 25268094 3' - BS3 1373 1 73.29 AAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCGGTGGGTAGCGGTGGGTTATATGAG:1 - chr3R 19537426 3' + hopper 1407 2 80.14 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGTGTATGCGTAATACGAGCACCCACGTGCACATATATATAAGGAGCGCTGCTCCTCGACTTGGGCTAAGAA:1 - chr2R 4937690 3' - mdg3 5303 2 51.37 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAATTTGGTCACTCGCCTAAAGCAATAAAAATGCAATGCAGCCAC:1 + chr2L 15057294 3' - hobo 28 1 65.97 GAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACACACACTTGAACTGTGGACCAAAAAGCCGGTTGCACTGTTGGTTTTGTCATTTAGTTTCTAGACATTTGTTGTGTTAGT:1 + chr3L 21765535 3' + gypsy 7406 2 56.16 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGATCGGCTTGGATCGTTCGGATCCGCTTGGATCGCTTTGGATCGCCGCGAATCGGGGGCATG:1 + chr2L 8700057 3' + P-element 2878 2 60.82 ACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTTCGTCACTAGTTGCCTACTTAATTCAAATGTGTAAAAGAACACACAAGCCATTTTTAAATACTTAAAGCCACAGAACGTCTTTATAT:1 + chr2R 14767490 3' + Tirant 365 2 56.16 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCCCGTTCGTTGATATGCACAGAG:1 + chrY 311460 3' + 1360 3385 2 53.42 CATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGT:2 + chr2R 6271496 3' - Stalker 7123 4 77.40 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAATTTATAACTTATTAATAACTTAACTTAATAACTTATTTAATTATTTAAAAAATAGTTTTTG:1 - chr2L 22307162 3' - Doc 65 1 59.59 GTCTCTTGTTTTTACTCACCCAAGTAAGCCAATTCTATTTTTTGGTTTCTTCGCTGAGGGCCAGCGACAACAAAAAATAGGGAAGTAAAGAAAGGAAAATTGAGGCGTAAAGGACGAAGGGACCCCTATTCGTTTGTTTTGTTGTG:1 - chrX 1018557 3' + 1360 3243 1 52.05 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTAGAATTGATTTTCTATATTGCACCCAAGATCAAGCCTTTAAAAGTTTATTAAATTTCTGTTGAATATGCATAAATACGAGGTCAAGTATGTAATATTTCATCACAAC:1 + chr2R 21245005 3' + roo 394 1 75.34 TAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAAATTTTTGACATTT:1 - chr3R 19144388 3' - Juan 55 1 52.05 TATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATTGACCCCGTTTCCGTTTTCGATTGCAATTCGTTTCAGTTTCATGCACTTTGCACTCTCCACAGCGGCAACCCC:1 + chr3L 1983566 3' - Transpac 31 2 60.90 AGCGAGCGGCACGACATGCATCTGGGCTACCCTGGTATGTGAGCAACAGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTTTTCCCATTGGCAGACTTTAAGGAACATTTCGTGTAAGTTATGTGCCATTCCCCCAACATTTCCCCCCTCCAA:1 + chr3L 15275093 3' + G5A 2498 1 60.96 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTT:1 - chr2L 16360562 3' + hobo 2889 1 55.71 GGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAGTCAATTGGCGTGCTATAAATATTTGGCTGCATACTTTCGGGCGCAC:1 - chr2L 19841506 3' + BS 5019 1 72.60 CAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTACAAACAGTACCATCAAGATCATCAGACCGATCGGGCGTGGGATCGGTGAGATGTTTTATCTGTTAAATTAATAATAAATTATTTT:1 + chr3R 10754624 3' + baggins 5371 1 55.48 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGATGGTTTAATTTTTTCTTATCTAGGTTTAAAACTGGGCGT:1 + chr3R 7655648 3' + 412 7464 2 73.29 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCACAATCGAATGTTTAAGTTAAGCATTTCAATTATAATAGGGAAA:1 - chr3R 14174700 3' - 297 6635 2 62.99 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCCAGACACAATGCGGTCGACAACAATTGCAGGACGTCGGCTGTCCTAATGGAAAATGGCCG:1 + chr3R 6526826 3' - pogo 58 1 57.53 CCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGGGCCACAAGCTTGTCCATAAATTAATCGATTCCAATGGCCAAAGATCTCGGCCAGCATGGAAGGGTATCGCAAGGTCATCTGTAGCTTAGCCCGGTTTAT:1 + chrX 18056104 3' - 297 6553 2 71.23 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATGGCCAAATAATTTTAATTGGCTTTGGTTTCGGCCAGACAGCGCAATTGAGTTAGCCCTTGATTGATTCGATAATTGAATTGTTTATTCGATTTCAAATACAA:1 - chrX 998085 3' - copia 19 2 70.83 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAATTTAAGCTGTTAATGGCCCA:1 + chrX 10838600 3' + roo 9003 2 69.86 GTAAATGTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGAAACCGAGGAGTTAAGCCGACTAAACAGAAAAGAAACAAAAGAACTTTAATTCCACTGTCCACTAGCAATGTCCAGTGGCCAACTCGTCATCCACGGAGT:1 + chr3L 18360034 3' - Cr1a 4104 1 50.68 GATTCGGACCGGATACTGACTTAGCATGAAGTCTAGTATCATTGACCTTACTTATGATGAAAAGGCGAAATAACCAAAATGTTAACAGCCTGTAGCTGGTCGTGCGCTCGCAACTAATCAGACTATAAGGTGTTCTGGCTATGAGT:1 - chr3R 3578470 3' - gypsy9 41 2 60.27 CGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCAGGCACATTCCCCAGATTCCCCCAGTTTTTCCCAGCTGTTTACATTCT:1 - chr3L 19398134 3' - gypsy5 76 2 68.49 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGAACTCGGAATGGCTTTAGATAATGGTGCTATTGTTTTTGACATAAGTCTCTTTATAACTAGGAAAGTTTTTCGTTAAGAGTATTTTCGCTTCGA:1 - chr3L 8704463 3' + blood 7363 2 66.44 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGC:1 + chr2R 12642737 3' - pogo 44 1 57.03 ATAATGTAAAATAACTGTATTAAATATAAGTGTTATTGGGATCTAATTATGTAATAGAAAAGTTAAAGTTATAATTTCAAGATTTACCGTAAATTTTCTGGGAAAAAGGACGTGAAAACCGAGTATATTCTTTGCGTTTCCAACTC:1 + chr3L 5376129 3' - Cr1a 4315 1 48.63 TGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGTATCTCCGGCATGTGCGTATCTCCAGTTCGTGCACCTTGAGTGTAATTTAAATAC:1 + chr2L 10178084 3' + mdg3 5433 2 61.64 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACACCTAGCACAAAAAACAGAACTTTCATTCTTCA:1 - chr2L 8909820 3' + roo 8979 2 81.51 ATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAATGTTTTGTGTGAGAGGTGTGAATATAAAAATAAATACGAGAAAGCCCACCACAAACAT:1 - chr2R 18988339 3' - pogo 1723 1 60.27 TTATTTACAATATAAAGTAATTTCCTAAAGTTAATTTAAGTATGCCCCTCAGATTTTATACGATATAAACTATTCTAACTTCCTGACAGATAATCATTGATAATCATTTTTATTGAGCAATAAACACGTTAAGTGCATCTTGTATA:1 - chr2R 12238852 3' - Doc2-element 4678 1 44.52 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATTTAATTTGTGAATAATCCAAATATCTAAAATATAAAATCTAAACGGTCATTCATACACATAACTCTG:1 - chr3R 5002302 3' - 297 42 2 57.53 ATAAAGTATTCTTAGATTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAGAAATGCTTAAATCAAAAATTTATCTCATTAAATCCGTGTCTCGTCTCTGGCAACTTTACTCGCCACTCTCGACTGCTTTGACACTCGT:1 - chr3L 22019100 3' - flea 4943 1 64.38 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCAACAGAAAAGATACC:2 + chr3R 26031820 3' - pogo 34 1 63.01 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTA:1 + chr2R 18056908 3' - blood 7058 2 54.11 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCCAAACCGGATGTGCACAGTGTCAAGCAGCAGGAGCAA:2 + chr3L 10069027 3' + 412 467 2 67.12 TAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAACCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACTGATTTCAGCAATTTATTAAGACCTTGTGAGCTATTAAAA:1 - chr2L 12447430 3' - opus 7079 4 69.18 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATAACAAGAACACACTTATTCAATTTGT:1 + chrX 10429879 3' + roo 351 2 57.53 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCCAGCTTCATAGCCACTCAAGTAACCGAGTTACGTGAGGTTACTCCATACGGGGCA:1 + chrX 7624189 3' + roo 9048 2 73.97 CTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTGATTGAATTTGTTGATTTCCTAGGTGTATAAATTATACTT:1 + chr3L 9905807 3' - Juan 4116 1 75.34 AAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCACCACGGCGGCTCGGCGAAAAGCCAATGAAAATTTCCCAACCGCAC:1 + chrX 16856499 3' - pogo 1784 1 69.18 GTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCGAATGGGCAAGACGTTTCGGCCAGTTTGACCAATTGGCGGGACCACAAGACCATCAATCAAATGCGCTCGGGTGACAAATT:1 + chr3R 10734566 3' + copia 5032 2 59.09 ACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGAGTAAAAAAACTATGCACGGATGGTGGGCATACACTTACACT:1 - chr3R 31358289 3' - hobo 2891 1 77.04 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCAGACTGAGCTGTGAGCACTCAATCATTTTATTTACTTATGCACCAGTGCA:1 - chr2L 5732738 3' - hobo 51 1 59.52 ATAAACCAACAAACCGCGAGGTTGTAATTATATATATGTATGTATGTGTATATATATACGAGCAACCAACATTTTCTCGCCTTAAAAGCCAGTC:1 - chr2L 19634971 3' + Quasimodo 7359 2 61.70 ATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTGTCATCATATGTCTAACACTCGTCTCACTCGTTGGCCCGCCCCTGG:1 + chr2L 16202689 3' - copia 4942 2 67.81 AAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATGCCAGCTTCCTGCTAAAATCATTTTCAGATTGCCAGC:1 + chr2L 8807970 3' + HMS-Beagle 7011 2 64.38 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCGT:1 - chr2L 951303 3' - F-element 65 1 55.48 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTATATCCGGAGAATCGGATATGCGGAATTGGGAAAAGAGAAGAATCC:1 + chrX 20369495 3' - roo 8679 2 76.80 AAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCGTTCGGAGTGGAGCAGTAGCAATTATAACCAAATCAACGCAATGCACAAAAATTGCTGTTTGGTCGTTGCACCCG:1 - chr2L 7598056 3' + P-element 2746 1 50.00 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACACACAGCACGCTCTCGGTGGTACAGCCGCTGGCAGCTTAAATGTTTTTTGAATTTAAACTTATAATTAAAAAACTT:1 - chr2L 19680968 3' - hobo 43 1 56.16 ATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAGATGTCAACAGACGATTCACTTAGACACATTTTTCAATGATGTTGCTACCGTACTGCCGGAGTACTTAAGTCGCGTCAAGTCATGCAATGTCAATACACCCATTCACCTTTC:1 - chrX 19992518 3' - copia 4879 2 78.77 GACTATCAGATACCCGTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGAGTAAAATTGTGGACGTGGCCGTTTTGTAGGTGAAAGGAAG:1 - chr2L 21580879 3' - INE-1 549 1 54.79 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGTCCGCAATTTGCGCGGAC:1 - chr2L 19907569 3' - hobo 81 1 73.29 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGAATGGCTTTA:1 - chr2L 15096881 3' + jockey 4935 1 64.38 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGTCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAGAAATCGGTGCTTGATTGCAATG:1 - chr3R 26031655 3' + pogo 2074 1 67.81 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATTTCAAGCTTATTAATATCAGATTGACAATCCTCAAATG:1 - chr2R 8375004 3' - roo 8708 2 56.16 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGC:1 - chr2R 15529719 3' + roo 8986 2 76.71 TTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGAATTATTTTTTTTTTGCTAGGTGACAGAAGCCAGCCGAAACTTTCAACTCACCCGTCGCTGCACTAAGAATT:1 + chrX 11918593 3' - Doc3-element 4525 1 55.48 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACTCGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGAACTCGGAATGGCTTTAGATAATGGTGCTATTGTTTTTGACATAAGTCTCTTTATAACTAGGAAAGTTTTTCGTT:1 - chr3L 8704482 3' + blood 7345 2 54.48 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTGATATTGGGCGATAAAGAAACCGCTAAGAAGCCGCTCTCAGTCT:1 + chr2L 11043643 3' + roo 9034 1 59.59 ATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCAAAGTACAGCTCAAGTGAGGGCTCCTCCTTTGT:1 - chr3L 1728477 3' - blood 7099 2 76.03 CGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAGCACGAACGGTCATATTGGATGTGAAGTGCAGTGGAGTTCAAAAGAGTAACAGAGC:1 + chr2R 544922 3' + HMS-Beagle 222 2 69.18 AAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACTCCAACATGTCAATAAAAGTGTATAATGCCTAAAAACAACACATATTACGTAT:1 + chrX 18055813 3' + 297 330 2 65.52 TTTGTATATTTGTATATTTGTGTTTGTATTTGATGTCTAAAATGTTAATTCCTAATCAAAGTTAAGTTACATAGAGGTTTATGCTCGAGCATTTGAAAGCGAAAGTATTTCTCCCTCGACATTTTGGTATGCGGGGGCGCTGTGGT:1 - chr2R 18786077 3' - Stalker 92 4 52.05 CATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGAGTTAATCATTACAACACACTAGATTGCAATTGCCTCCACCGCCACTA:1 - chr3L 1324282 3' + 412 403 2 74.66 TCCGTATGAACGTCGTGATCTCAGGAACTGTACAGGCTAGAAGGTTGACATTAAGAACACAGTTTACAGGGCCATAAAGGCAGCGCAATTTTGTTAGTGTGAGTGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGAT:1 + chr2L 9778708 3' + INE-1 134 1 60.27 TCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCGTGTAATTATTACGATTGGATATATAATTTGTAAAGAGAAACATATGTTTCCATTTTAGTTTTTTATGCTACTTTTGAGCTGCTCTGGCTGGCTGTTGTTATTTATGCACT:1 - chr3L 1166826 3' - I-element 425 1 80.14 CTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTTTTTATAAACAATTGGAATCCATTTGGCAAAGTTATGGCGTCT:1 + chrX 4765570 3' + 3S18 304 2 67.78 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGAATGGCTTTACTTGAAATTT:1 - chr2L 15096871 3' + jockey 4945 1 57.53 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGATATGCAGATCGAAATTATATACAAATTACTT:1 + chr3R 4352175 3' - Doc 23 1 75.69 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGGCTACCTGACACTGCAACACTGGCGCATCAGAAGCATCTTCTGCAATTATTTGTGCATTAGAGGAAGTCAGCTACCTCGAGCTAGCGACTAATGTCAGTTTAAGTGTGGCAA:1 + chr3R 21734670 3' + copia 246 1 76.03 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCGGACTCACGAGCATTAAATTCATCTCCTATCTTCCAAGTCTATCTATCTTTAATATAAG:1 - chr2R 15374754 3' - 1360 62 1 62.07 TCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTTTACGAGAAACCACAGCTACAGTGTGGGAAT:1 - chrX 5122199 3' - McClintock 220 2 78.32 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGAGTGGGAGTGGTTGTGGCATATGCAAAGTG:1 - chr2R 20117295 3' - mdg3 30 2 53.27 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGC:1 - chrX 19744448 3' + P-element 2787 1 17.81 CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGGAACTTAAGGCTGAAAATGATTTTCTTCGTAAGCATGATTGTGCGAACTGAGAGCTGGCTTCATGCGTGAGTGGTTTTCATAGCTGGTTTTTGCTAGCTGAACCACTCGAGCACCGC:1 - chr3L 4440232 3' - jockey 4691 1 74.66 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATAACTCAACAAATTTAATTTAGATCGAAATGTGGTGCAGTTAAACC:1 - chrX 19591158 3' - roo 8736 2 70.55 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACGAAGAGAGGACAAATTGAACAGTTTGTTACATGGAAATACCCTGTAAGGA:1 + chr2R 23395537 3' - jockey 4832 1 65.07 TTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATGCTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCAACGCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCGAATGTGAA:1 + chrX 11906346 3' + HMS-Beagle 195 2 56.16 TCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGT:1 + chr2R 4206658 3' - 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chr3L 18901509 3' - G3 4508 1 68.64 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGCCGCTGATGATGGGAAGCAATTATCCCGAGCACGGGACCAA:1 + chrX 19744542 3' - P-element 26 1 67.81 TTGCTAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAGAGCGAAAAAACAGCAGAACAAATAGCTCAGCAGAGCACAGGAGTACCAGAAATCCGACAGATACTTCCACTAGCCTAGCTACATAGTGCTGTTAGTGGCTA:1 + chrX 20652411 3' + G-element 4323 3 68.46 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGATTTTCGAAGGGTTAGACATTCATTAAAGTACAAAACAAGCTAATTCTTTCATTAGCAACAATAAGAATCGATTTTTA:1 - chr3R 13411779 3' - roo 42 2 56.85 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGG:1 - chr3R 5087040 3' - P-element 37 1 60.27 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACATATACGCCCACATATTAACTGTCACTTTGCTCTGGTCGACTGGGTGACACACCTCCAGATTGCCAGTCGCGACTAAGCGAAGCGTTCAAATCTCGCGTCTGAAATCG:1 + chr3L 12829749 3' - mdg1 13 2 80.82 CGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTAATTTAACATTATGCGGCAGACAGAGCAA:1 + chr2L 19841609 3' - BS 12 1 69.77 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCAATAGGTCCCAATAAAACTTAAAGTTACTTCCAATT:1 + chrX 16538173 3' - mdg3 82 2 73.97 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTGAATGCCACACATAACTAAAGGGGTTAAAGTTGATTTTAATAGTATTTATATGGAGCTTTGGAGGTTCTTATCACTAAAGTAAGCAATTACC:1 - chr3R 14215344 3' - mdg1 30 2 58.22 AACATTTAATAATTTTAATTTAGTTGAAACAAGAGGTTTAGCAGTAAAGAATTAATAGAATGCATTGCAGACCGAATTTTGTTGTTGCCATCCTTTGTTCTCCACTTTACCATTAACTGCTGCACTTTTACTAATTGCTCCAGGGA:1 + chr2L 18506010 3' - Tc1 52 1 81.51 AACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGTTTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGGCTCTCTGCCGCTATGTGGATCAGGTGTACAATCACTGACATATTTGCTTTCCTACTTGTATATCTGAAT:1 - chr4 864587 3' + Cr1a 4166 1 60.96 TATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAAT:1 + chr3R 9862967 3' - Stalker2 7321 2 66.44 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTGGCAGCTGCAAGCTGCAACCAGCATAAAACTGTATGCTACGTCGGTGCTCGGTGGGTTCT:1 - chrX 18193454 3' + jockey 4931 1 57.93 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCCAAGGAAACCC:1 - chr3L 12775927 3' + roo 9047 1 69.18 ACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCACTCTGGCCCAATTAAATCTCTGGGTTCTTCTAATGACCCTTCTTCTCCGCCACCACCCGCCGTTCCTTCTA:1 + chr2R 15892135 3' + hobo 2535 1 53.79 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTCTTTGTCCTTTTCCGCCTGATATCCCGTTGAGCACACACTGTCG:1 + chr2L 2518614 3' - jockey 32 1 65.07 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTGTAATCGATATACATACAGGATATACCGAAGATTGTTTTCGTTAAAGAGGTGAAAATAATGCATCAATGAATAAATTTTGATT:1 - chrX 10344737 3' + roo 9033 1 43.84 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTGGGCAGGTTCAGATACATAGA:1 + chr2R 24021689 3' + pogo 2072 1 65.75 GACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGAAGTTAAATAGAGTTTGTGGTGAACAATAAGAAATTTTTCCCAGTGCAGAGTG:1 - chr2R 22616845 3' - BS 5045 1 56.16 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAACCTTCGAAGGCAGATCACTATATTTAGGCCAATAAAATCTTGAGAATTTCACGCAAATTCATTCATATCAGCCACAT:1 - chr3R 5684039 3' - pogo 39 1 57.53 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAGATTGC:1 - chr2L 16360551 3' + hobo 2920 1 64.17 TGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGGTCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTTATTAGTTTCTTTTGGGGGCAGTTGCCACATTTTGCGCTCA:1 + chr3R 18896348 3' - invader4 393 1 73.29 TAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGG:1 - chr2L 20716343 3' + P-element 2818 1 38.36 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACGAAGAGAGGACAAATTGAACAGTTTGTTACATGGAAATACCCTGTAAGGATTGGGATCGTACTAAACAAAATCAAGATATTTAACTGCATGAT:1 + chr2R 23395580 3' - jockey 4789 1 60.27 ATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAA:2 - chr3R 3617313 3' + micropia 170 2 72.60 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGC:1 + chrX 19744502 3' - P-element 50 1 45.38 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATAAATATTTTATGGCCCGTGTAAGTTATGAATAGCAAAGGTAACCCATAAGTATGCAACAGTCGCTGGAATTTTTCTGAAATCGAATCCCTTTGATGTTGGT:1 - chr2R 22040863 3' - jockey 26 1 68.49 TTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTATGGCAGTGTCAGCTTTTCAAAATGTG:1 - chr3R 13231736 3' - F-element 69 1 43.36 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGC:1 + chr2L 18848792 3' - blood 81 2 73.79 TTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGTACATACTTCCCCCATCCGAACCGACCTTATAGACCAGAAGTCTCTCTTTCCGGCACTTTTTGTAATGCCCCGCTCTGAGTCTCACATT:1 - chr2L 9228634 3' + Burdock 6361 2 62.33 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACATAGCTCATATGCAGAAGT:1 + chr2R 20931693 3' + blood 334 2 77.78 CATAAACACGCACTCAACTCTCCCGCTCACAGCAGTTACGCTCTCAGCTCTCCCACTCTCAACACTTCCGCTCTCAGCAACTTCAGAAAACAATACCACAACTGCAGCAACTAAAAAAAAAAACCCATCAAAGCACATCACAAGTG:1 - chr2R 13189558 3' + Porto1 462 1 77.40 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTATACATACATATGATTCTTTATGAAATATGTGATGGAAATTCTTCCGAGCCTTCGAGGCCTTAATAAATTTGTAAAGTGGATACTTAAAAATGAGATGA:1 - chr2L 20253803 3' - roo 8684 2 70.55 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTGAGTCGGCCGGCCGACTGCTGCGGCGACCGCG:1 + chr2L 20716456 3' - P-element 38 1 58.90 GCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGTTTGTTTGCCCATGTCAGATGTCCCAGATTTTATGGAGATCACCTGAGAG:1 + chr2L 5333473 3' + mdg3 5431 2 62.76 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTTTATACTTGAATATATGCAAACGCTTTTTTGGCTTCGATTTTCGGTTCTTTTGGCGTTCTGCAACTGTGATTTGCTGTAACCGAAAACCATTCTCT:1 - chr2R 6713792 3' + 297 6960 2 76.03 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGGTAGATGAAACGTATTGCCTTTTTGCGCTGAGCTGGGAGGAGACCCGATCCCGTATGTCTGCTA:1 + chrX 13808098 3' + pogo 2047 1 55.48 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTGAGTCGGC:1 + chr2L 20716432 3' - P-element 56 1 45.71 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTTGGAGAAGGACACTTGAGCTGGTAGGATATGAGAGCGTATTATTTTGGCATAAAAACATGCAT:1 + chr3R 25929445 3' + 297 343 2 56.55 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTGTAGGCTGACTCAGAGCC:1 - chr3R 29719349 3' - hobo 19 1 62.50 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGGGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGAGCAACTGTCAACAGGCCATGGTAG:1 - chrX 16995038 3' - jockey 72 1 61.87 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAATCGATTATTTCATTAGAATAAAAATTAGTCATATCAAAATGTGTTATAATTTG:2 + chr3R 18600673 3' - 412 7120 2 65.07 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAACCTTCGAAGGCAGATCACTATATTTAGGCCAATAAAATCTTGAGAATTTCACGCAAATTCATTCATATCAGCCACATTTTACACAAAAAAGGTTCGTT:1 - chr3R 5684018 3' - pogo 18 1 71.92 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGAGGCCGGAACACCGGTTTTCCATCGTGTAGATACTCCGGTTTCAGATAGAGTC:1 - chr2R 12872888 3' - P-element 69 1 38.36 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATGCAAACATGCATTTCACATGGGGATACATTTCTGTCCCAACTAGCCCGGCTGCTAACTGCTGAAGGGGAATGGGGATGGCTGTGTTTAGGGG:1 + chr3L 5329221 3' - 412 7081 2 64.58 AAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAACAAAATAGAAACAACACAAACAACACAATGATCCGAAGCAAAACGACAAAATCGCAG:1 - chr2L 20939505 3' - hopper 60 1 57.53 AGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGACAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGTGAAACACACAGAAATAGCACAGTGTC:1 + chr3R 15157733 3' + invader3 266 2 73.29 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGGGTGAGGACTTTCAACTGCTGCTTTAGCCATTACTGCTGCTGATTCTCCTGGT:1 - chr3R 12781487 3' + pogo 2036 1 63.70 GAGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGAGTCGGTAGGGGGATTTAAGTCCCATTCCTTGCAATAAAGAACTCTATATAGCATTTACGCAGACAATAAAACTCCATGCAGTTAGAAGTTATAAA:1 + chr2R 3091714 3' - F-element 270 1 62.33 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTAACTCAAGCAATTCAATAACAATAACTAAGTAGAAATTCTTTTCAAAATAATACTATACACGAATCCTTCAGTCAAACCCCCTA:2 - chr3R 18514299 3' - pogo 34 1 61.64 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAAGAGAAAAACATCTA:1 - chr3R 30524457 3' - roo 8727 2 63.70 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCGGGGTGAGTGGGGGCGTGGCAGAAAGGGGAATCAACAGCAACAACAATGAGTTGGCCTTGTGTTG:1 + chr3L 10111908 3' + copia 244 1 75.00 GTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCTTATATCTCCCCATTTACTCGCATTTCGTGTCTAAACT:1 + chr2L 15523998 3' - opus 7084 2 76.03 AGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATACTCAGAAATTGAAGTTTTTAGTTTAATTGTCGTTCTCTATTTATCTT:1 - chr3R 11618697 3' - McClintock 75 2 67.81 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCTTCTCGTAAGTGATCTTCGGGCCAGCTA:1 - chr2L 11047951 3' + Juan 4163 1 53.42 TCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGAGCCTGCCAAGGGCACGGAGGTCGAACAGTAACGGTGCGGACTTTGGAC:1 + chr3L 25889010 3' + P-element 2875 2 64.77 GAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACATTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGGATCAATGATCTCCAACAGCAACAACAACTGACAAGA:1 - chr2R 2666294 3' - Rt1a 33 1 58.22 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCGGGACTTTCAAGACGCGCGCGAAGCTGCGGACAGTCGGATTGGAAGTGGAGCGGACTGGAATGCAAACAAGACGACGCGTGTCGAGTGTTTG:1 + chr3L 13450833 3' + P-element 2857 1 64.38 GCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCTTATATCTCCCCATTTACTCGCATTTTGTGTCTAAACTTCTTATATTAATAGCAAAAGGT:1 + chr2L 15524020 3' - opus 7062 4 65.07 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATACGTGTCTTGTTGTCACTGCTAATCTTCTTGGATTCAGAACTCTATT:1 + chr3L 23868311 3' + 412 417 2 67.81 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAAGTCGTT:1 - chr2R 14921465 3' - pogo 51 1 54.79 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATGGTAGG:1 - chrX 16995037 3' - jockey 62 1 60.00 ACACTAGAATATTATTATTATTATTATTCTAGGGTCTTTGCACTGACCCACTCGAAAAAGGGAAACCGAGTGTACTTCTTGGCCAAAAGTTGAGGAATGGCCAGGAGGCGAGACCACAACACAGACAGTCCGTTCACTGATGCACT:1 + chr3R 30262996 3' - Tc3 305 1 72.60 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATAAGTTTCCTGCTT:1 - chrX 16857047 3' - pogo 28 1 56.20 CTGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCTTAGACTAAGGAATTTTAATAGCAAAAACATGACTAGAATATGTAGTCTGCTTCTGGGATCAGCTTTTCATGTGGATTCG:1 + chr2L 3327088 3' - jockey 4711 1 55.48 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCA:1 - chr3L 12775965 3' + roo 9009 2 61.64 AACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTAACTTAAATTAGGGGCCGGTCTAATAACAATTAATTGAGGCTTTGAAGCGAA:1 - chr2R 10760411 3' + Tabor 7255 2 65.07 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCAGGTACATAGAAGTCAAGGCGGGAATAGAT:1 + chr3L 22445254 3' + Transpac 254 2 75.44 TACATTGAGAGACTAAAAATTTCTTGCTCAGACAGCCAACATATGATACATTATGTACAAATTATGTACATTATTATGTATTTACTTTCCTCCTTAGTTTTTACTAGTCCATTATTTTAAAAAATGTTCTCA:1 - chr3L 14585782 3' - Tc1 135 1 46.21 GCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATAGTCCCCGTGGAAGTAATGCT:1 - chr3L 23526498 3' - 1360 91 1 69.18 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATATTACATGTAGAATTGATTTTCTATATTGCACCCAAGATCAAGCCTTTAAAAGTTTATTAAATTTCTGTTGAATATGCATAAATACGAGGTCAAGTATGTAATATTTCATCACAACATG:1 + chr2R 21245008 3' + roo 397 1 77.40 AGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACAATCTGTGCGTC:1 - chr2R 18056805 3' + blood 305 2 67.12 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGAGTAATCTCTTAAAGTAATCTGGCA:1 + chr2R 11691264 3' - P-element 95 1 20.55 TTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAG:1 + chrX 8610319 3' - mdg3 59 2 55.48 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGGAAATCTATGGGTAGTAACCGTTGACTTTCAGCCTCATCGTTGGTCGTCCATCGTGCTTCTCTCAATCGAATACCCAAACCTCTCGCTCAGTTCCACCGCAGGTCG:1 - chr2R 7347683 3' + flea 5008 2 55.56 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATTTCAAGCTTAT:1 - chr2R 8375031 3' - roo 71 2 74.66 TGTGGCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAAATAGTTTAAATTGAAAAGAAAAAAAGTTAACTATGAAGGACTCTCCAATCAATTTATCACCAAAGGGTTTTAGGCATAGAAGTTATTTGAGTGTTAGCCTTTTCCAGGCAGAGTA:1 + chr2R 5499403 3' - Tc1-2 1434 1 43.15 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAATTATTATTATCAAATAGACAGAGTTAAAGAAGTACACCCCAAAATGGTTATACTTTTCCCATACAAAAACACAAATAGACCGCAAATCTGAAGCGATTGCGCAT:1 - chr3R 13201711 3' - 297 9 2 76.71 AAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCGCTGGAAAGTATGCTCCGCTAAAATGAAGCCAGGATGGTATGGAAGGGTGATG:1 + chr2R 5899326 3' - jockey 4538 1 59.59 GCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGACACCTCCAACCACCACCTGCTTTCATCAAATTAAAGGTGAGTCAATTACGAATGCCGGCGAAAGTCCGACTCCCTTCGAGCTGTTCATATGCGCATAAATAAGCTCT:1 - chr3L 10138296 3' - F-element 499 1 65.75 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATT:1 + chr2R 8375129 3' + roo 9018 2 52.05 AGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTAGGTTGTGTTTACATACATATTTACATGGGCCCTCTGGATCGT:1 - chr2L 19135617 3' - Burdock 6210 2 71.92 CCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATAATCGCATTTTACTCAGCTGCCCCAAGCCATAACTACGCAGTTTG:1 + chr2R 5800561 3' - HMS-Beagle 6848 2 61.42 TGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATGATTCTTGAAGAACGATATCACCTTCTTGGACTGTGGAGCCCG:1 - chrX 15696705 3' - jockey 4746 1 68.49 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATATATGTATATTTAAATGCAGAAATATTTTATCCATTCTGCCTTGAATGCCAAGCAGATCTCAAACTATTGTAGTAAAAACGTAAC:1 + chrX 21405403 3' - flea 32 2 63.70 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCACACACACACACCGATATGAATCTTCATTGATGGCGGAGCGAACTTTAGCTAATTA:1 - chr3L 13568178 3' - hobo 65 1 63.70 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCCAAACCGGATGTGCACAGTGTCAAGCAG:1 + chr3L 10069018 3' + 412 458 2 60.96 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTAGTGAAAGCTTGAAAGTGGAAATAAATCCTCCCAAATTTGATACCGATTCAAA:1 - chr3R 11163021 3' + mdg1 7399 2 60.43 TAGATCTGGAATGTACGCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGGAATAAAGTGTGAAAAAATTAATTTATTTCA:1 - chr3L 21405414 3' + mdg1 331 2 77.40 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGAATTGTGTTGAGTCGAGTCGCGCTATTTTGTTTCGAGCGCGCTGTGCT:1 - chr2L 850979 3' + P-element 2815 1 34.93 TGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCCGAGCAGGCCAAAAGTGTAAGCGAAACATC:1 + chr2L 16554929 3' - F-element 335 1 79.45 ACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATC:1 + chrX 21667934 3' - gypsy2 6560 2 69.86 GTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCACCTTATCTTTACATATGTATTAATATAATATAGTT:1 - chr2L 12814737 3' - hobo 83 1 73.29 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTGTTGGTTAAGTTGATTGAGATATACTGAAGAATAGGTAAGCTTTTAGATCACAGATTTTACTATGTTTCAAATATAAAGATGTTCAAAAATAAG:1 - chr3R 20099592 3' - mdg3 28 2 55.48 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGTATGAATTTTTATAGCAGGAATAGTGTCCAGGCTACAGAACAATATGCTTTGGCCGAGTTCGTTGACCTGGGAAACTTTCT:1 - chr3R 25929304 3' - 297 6612 2 63.70 AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGTAGATAAATTTCAGTCGTCTTGCGCTTTAAAAATGGCACCCTGTTTGCATCAGCAGTAACGTTTCCAGAATTCTTAGCAACCAGTTTAACAGCAGCAACAA:1 - chr2L 22340257 3' - HMS-Beagle2 6901 2 70.55 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATGATTCTTGAAGAACGATATCACCTTCTTGGACTGTGGAGCC:1 - chrX 15696707 3' - jockey 4748 1 70.55 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACTAACATGTTACATAAGCCCCACACCCTTCTTCCAACTAA:1 + chr3L 18954206 3' - roo 8731 2 71.97 ATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGTGAAAC:1 + chr3R 15157712 3' + invader3 245 2 61.64 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCCATACATGTATGAATTTCTCCGAG:1 + chr2L 2522982 3' + mdg1 7396 2 60.96 CCCAAGCCAAAAGCTGGACTCTTATCGGGAAAGCTTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCTCTGCTGCTGGTTGAATATGTTAACTTATATGCTTATAAATGATACAAGCCAAGCTATTCGGTCGCACTACAATTTATTATAAGTAATG:1 + chr3L 14217267 3' - gypsy7 62 2 76.03 AGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCTGAAAGCCAGCTGTTGCCAAAAATTGCAGGCTAATTGAATTTTCTAGCAGCAGCGCCATTTTGTATGCTACGAAATA:1 - chr2L 3677566 3' - BS 38 1 54.79 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATTGACCCCGTTTCCGTTTTCGATTGCAATTCGTTTCAGTTTCATGCACTTTGCACTCTCCACAGCGGCAACCCCCA:1 + chr3L 1983568 3' - Transpac 4949 2 61.94 CNCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGATAGCGAAATCAAAGTCGAGTTTACTGAATCCACAATACACATC:1 + chr3L 1728534 3' + blood 7311 2 69.86 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTGGCATATGCAAAGTGTTTGTTTGAGTGCGTTTTCCATTAATTTATTTATGTACAATTATTTACAAGCAATTAAC:1 - chr2R 20117236 3' - mdg3 5262 1 79.45 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGGGTGAGGACTTTCAACTGCTGCTTTAGCCGTTACTGCTGCTGATTCTCCTGGTT:1 - chr3R 12781486 3' + pogo 2037 1 63.01 CAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAA:1 - chr2L 16360575 3' + hobo 2870 1 65.07 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAATGCCAATCCCATTCGGAGAATTGGGTGGCCATGTGCCAGGCAACGAACTCCGTCTCAATTG:1 + chrX 14904635 3' + jockey 4914 1 58.22 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATA:1 - chrX 3637788 3' + roo 8989 2 72.60 ACGCTTCCTTCTGCCTGTTCCATATTTTTACACGTATATTTACATATAATAAACAACATTTTGTTTAGCTATCCTTATACGTACATTGTATAGAATAATCAATTTACCTTATAAGAGTTCCTTAAGAGTTAACTTAAAATGAAAAC:1 - chr2R 5780101 3' - INE-1 31 1 68.49 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAATATTTTATTTGTAAATAATTCGTTTAAATAGTAATCATGGGTGCTTTTTGCGCAG:1 + chrX 5938378 3' - pogo 61 1 61.64 ATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCATGCGAATTTGAACCTACTTTGCCATTCATTCGCATCCCAAAGTCCCGTCGCTTCAGGAAAATACATTGCGTTTATAAATGCGGA:1 + chrX 6425829 3' - hopper 322 1 52.74 GGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATACCCTTTTCGTTGGCATTTGATTTCGGCCATCGCATTCTAAATCATCCAGCACGTGCGCCATCCAGCGGATTTGGCCAAAAGTGGCAGCCAGGGGCCGAATCACATTA:1 - chr2R 23420644 3' - G2 2739 1 71.23 AAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTTGTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGCTCGGGCGGCAACATTTGTCTTTGATATTAAAATAGCCCCTGGCTAAGGGT:1 - chr2L 17857686 3' + Cr1a 122 1 65.07 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATAAATATTTTATGGCCCGTGTAAGTTATGAATAGCAAAGG:1 - chr2R 22040925 3' - jockey 72 1 72.87 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGCGTCTGCTGCTGGTGTTGCTGTCTCTGCCCACAATTATTAAATATTTAAAGCCATATACAAAACGTTTTTGGGTTTAACGTTATACTCTTTTACGTG:1 - chr3L 7370419 3' + Burdock 233 2 70.55 TGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTACACAAATTAAGGCTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTGCTGACACACTGCTTT:1 - chr3L 15374619 3' - 3S18 53 2 53.24 CAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGCCTTTCATATGGTGCAGATACACTTCCGCTGGCTAACGATAATGGGAATGGCTTTTAAGTGATTTGGTCGACATGAGTAATCGTTCGCCGTGGCCCATTG:1 + chr2L 20068116 3' + roo 9051 2 70.55 GCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAA:1 - chrX 17690477 3' - Doc 346 1 68.97 AGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGGTAAGTCTATTAAAAATCTATATATTGTTCTAGGAAGACGTATTTAC:1 - chr2L 21082132 3' + mdg3 171 2 67.12 TTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCG:1 + chr3L 23839716 3' - McClintock 67 2 67.12 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTACGGCGGTCATAAATTGAGTTTCGTATCGGTGTTTGTAGTGCCGCAGAAACGAAACACGCACACCCGAATTTCACTGTCC:1 + chr3R 12547967 3' + hobo 2906 1 54.74 AAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAATAAATATTTACCGGGGACAAGAGGCGTGGGCGACGACCATTAAAATCATAAAAGATTACTTTTAAAA:1 + chr2L 19907652 3' + hobo 2883 1 56.16 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATTGCATTCCGCGGAGTCGTTCGCTTCGTTTTTTCCACT:1 - chr3L 10068869 3' - 412 39 2 58.90 ATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATA:1 - chrX 12003958 3' + P-element 2782 1 15.07 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCAAAAATAGATTACAATTTAGAAGCATCTTAAAGATTTATCGATTGATATGAAATAATAAGATAAGATCTCGACTCTTTCATCAGTGTAAATATACAATATGT:1 - chr3R 18860719 3' - roo 8677 2 66.43 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACATAGCTCATATGCAGAAGTAGATCTTCGACTTAATTTCCTAGTAAGCCCCATACATTTCTCCAAAACCCGGCTTTTTCAAA:1 + chr2R 20931755 3' + blood 351 2 65.19 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCATTTAATAATAATGTCAAAAATATCTTTTTGAACTCGTGGCCCAACCCACATTATGTC:1 - chr3R 19445302 3' - roo 8727 2 63.70 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAGAACCAGGTGTCATCTCCATTTAAGTAATTGAGCGAAATATTTTTGCATTGTTCCAACAAATTGTGGGCGC:1 - chr2R 11394078 3' - pogo 46 1 51.03 GTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGACAGGAGCCGAAGTCGATGGGGCAGACTCCTCCATCTTCATTGGTT:1 + chr3L 13380519 3' + hobo 2878 1 62.88 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCACACACACACACCGATATGAATCTTCATTGATGGCGGAGCGAACTTTAGCTAATTAAGAAATGCCAGCCAGAGTCCAGTTTACTCTGTGGATAACAATG:1 - chr3L 13568135 3' - hobo 22 1 67.12 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCGAGCACAATGTTGTTTGGCCCGGGCACATAATTG:1 + chr2R 10773288 3' + 412 7486 2 74.79 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGAGAGATGGGAGTCTCTACTCGCTTACAAACCGCAAATACTTCT:1 + chr3L 17896026 3' + P-element 2843 1 56.85 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAACCTTTATGCAGGG:1 + chr2L 12696247 3' + pogo 2059 1 56.55 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAAGTCGTTTTGTAGCTTGTCATATGCAAA:1 - chr2R 14921444 3' - pogo 30 1 65.07 GAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTACCTGTATATATAGATATATATTGTGAGGCAACCGCCGATCCATCACCGATCGATCATTCAGCAAGCAAAAAGAA:1 - chr3R 24396689 3' - I-element 5144 1 50.68 GGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAACAGAAGAAAATCGATGGCAGGTAAAAAGCGGAACAGAATTCCTAAAATTCACTAGGTAAAATATAAAT:1 - chrX 12131111 3' - F-element 321 1 76.03 GAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAATTGGCGCACTTCAGATAGGTGCGACGCAGATTTGTAGTACCGATCACGAAGCGGTAG:1 - chr3R 21367026 3' + Doc 4512 1 60.96 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTCATTTCATCATGGTCCAGGTGCAAATTTTATAAAACAGTTTCAACTCG:1 - chr2L 246605 3' + P-element 2844 1 37.00 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGAATTTATGTTTCTATAAGTGGACAAAACTAAACTATTGCATATGCTTATGATCACAAGTTATCCTTAAACACCTTGATTACCTGCC:1 + chr2R 11610010 3' - roo 8698 2 60.27 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATTAACCGCAAGCGCCAGCAGATGTTGTCAACAATTAA:1 - chr2R 10666821 3' + hobo 2920 1 67.50 CCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTC:2 - chr3L 25232771 3' + accord2 124 2 69.18 TGTACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAATATTCATTTCAGTTAATTTGGTCAGATGCAAATGTAATTTTGTAAAGTCAATTAAATGAACCTCAGAGTCCGTCCCTTTG:1 + chr2R 22502794 3' - 1360 3138 1 54.79 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGAATATGCGAGCATGCGACCACCTATCGTAAATGTATGGATGCGAGTGGCAAGTGGG:1 + chr3R 11483862 3' - pogo 62 1 60.96 ACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATACATATATACTTTCATGCCAAAAGAGAATTCTATAGGGGAAAAGGAAAATATTAGAAAACTCTGGTGATGCCCAGCTATGATTTTGAACAGCTTTAGACAAATTTGTAAAAT:1 + chr3R 12953006 3' - micropia 4968 2 78.08 TTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTACGCTTGGCTGAAACATATTTTGTTTGCCAGTTTTTCGCGCGGATTGTCAAGCTGCCTGGTTATATTTTAAATTTTTTCCAAGCACTCGACGCGT:1 + chr2R 18927900 3' + 3S18 328 2 72.52 CCGGATGTGACTCGTAAAATACGAGATAAAGAATTTTTAAAGAGGACTTGTTGTGTCCTGCCATTCAAACAAATTATGAAGTGAAAACTACACAATCTTTGTTTACCTACAGTTCATCTAGACCCTTTTTGAAGCCCAGCCAGTAG:1 - chr3R 23094759 3' - Q-element 464 1 52.74 TAAGCGTCGTAAAACATATTTTTATTACTTACTCTACCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAATCTTTATTAACGAATATTAATCACAAAATAATAATTAACTTAAAAAAGTCATTGAAGTTTAAAAAACCCTTTATTAAT:1 + chr3L 16060990 3' + Gypsy6A_LTR 218 1 53.42 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTATGGCAGTGTCAGCTTTTCAAAATGTGCACATCAATCAGG:1 - chr3R 13231723 3' - F-element 59 1 51.37 AGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAGTCATTCGGAAACTTTAAAGCCCGAAAGTATGCAGCACAAAAT:2 + chr3R 11568663 3' + BS 5016 1 70.55 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACAGTAGACTATGTAGTAGTAAATGTTACCAATTTCGTTTCGGTTTTATGCCTCTGACTTGG:1 - chr2R 21244858 3' - roo 8725 2 61.64 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAGACAAATGTCGCTGGCAGTCGCCGCAG:1 - chr2R 24021516 3' - pogo 24 1 69.18 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGCAAGTTGAAGGAGGTTATTCTGCCAGCAAATGTTTCATAGTTTTTCTC:1 - chr2R 21353189 3' - Transpac 70 2 71.23 CGTAGAGTGTGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCGGCATCCCCGAAGCTCGCCAAACACCTGAAAAGTATGCAATGAAAATTCTTTTGGTGCCTCTGCGGCTCGTTT:1 + chr3L 6542096 3' + hobo 2927 1 69.72 GATTCCGCTGATAAGCTCCGATGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACT:1 - chr3L 15374639 3' - 3S18 80 2 69.18 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGA:1 - chr2L 20716356 3' + P-element 2854 1 44.33 CGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTG:1 - chr2R 20117309 3' - mdg3 5335 2 74.66 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATATATATATAGAAATATATATGTACATACATATGTATGTATGTGTGGAAAACGGAAGGCAGGAAGATGTTGTGGCACATTTTTCCACTAAGAGTATTATGAAATTTTTATA:1 - chr2R 17317523 3' + hobo 2928 1 76.71 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTATTTCAACAAATATAGAGGGAGAGAAGTAGGGGCACAGCTCCCTTTTGCATGTACATACAACGTTTTTAATTAAAAAATCCTTTGGTCAAGCAAT:1 - chr3L 13567930 3' - copia 26 2 67.81 ATTACTAGAGTACATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACACAGTCGAATGTTTGTTTGTGCGAAAGTATGCCTTAATTTAGAAAATGGTATCAAAGCAGGGCAGT:1 + chr3R 8810755 3' - 297 51 2 55.48 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATG:1 - chrX 13642044 3' + P-element 2818 1 32.33 TCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGAACTACAACAACATAA:1 + chr3R 7109205 3' - P-element 88 1 26.03 GAATAGAAGATTTTACATCCGCGCTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAAATTTTTGACATTTAATTTAAGAATATTGCAGGAGTATTTT:1 - chr3R 19144361 3' - Juan 28 1 57.53 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTGGCATATGCAAAGTGTTTGTTTGAGTGCGTTTTCCATTAATTTATTTATGTACAATTA:1 - chr2R 20117252 3' - mdg3 26 2 68.49 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAGTATCATTAAAAACAAGCAAACGCTGCTAGAATTTAATGAAACTAAAGTCTGCTTAGTCTTTTATTTAATAGGTTAAATATATTTTCAATAAC:1 + chr2R 12416985 3' - pogo 24 1 69.18 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATACATTCATATAAATATGTAGAGGTGGGTTGCCTATGGTGGAGGAAGGCCGCCGATTGCATAGCCGTTTGGCCGGTCG:1 + chr2L 9228789 3' - Burdock 39 2 56.85 AGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGGATATCTTGTTGAATAAATAGCAATCAAATGCATTGAAATATAA:1 + chr2L 21189800 3' - hobo 76 1 68.49 GAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGACAATCTTGATTATTTTTAGATAATTATGAACAATAAATAACTGTAAGCAGACAACTGTAAA:1 + chr3R 17401790 3' - Juan 64 1 61.64 GCAACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCGTTGTGATTGCAATACAATTATTGAAAGATTGTGATTAAAATA:1 + chr3R 8293615 3' + Stalker2 7574 2 67.81 GCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTGGTCGGGCGGTATTGAAGTCAAAACATTTCATTAAAGGCAGCAGC:1 - chr3L 22635688 3' - hopper 76 1 65.75 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTCCTTTCTGCTAAATAAACATTTATAAAAACAGCCAAAAGTTTTTATTCGCTGATGCTGCTTCTGTTGCCACTTTCTGGACC:1 - chr3L 10111740 3' - copia 41 2 59.59 ACAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAATATTCCAAATTATGCGGAACTTGGTCTTTGTGCGTCCTTCAGTCGCATTTTGTGCCATCGCTGCAGCTCGTGATTCATTCTACTCGTACAACTCTGTTTCTCGTTGTCAACAACTTGTTTCC:1 + chrX 708862 3' + G2 3076 1 79.45 TTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGACCTAAACCGGATCGAAT:1 + chr2L 246635 3' - P-element 101 1 16.44 ATGTCTCTTGCCGACGAGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCGGGACTTTCAAGACGCGCGCGAAGCTGCGGACAGTCGGATTGGAAGGGGAGCGGACTGGAATGCAAACAAGACGACGC:1 + chr3L 13450819 3' + P-element 2866 1 63.41 ATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAGTTACTCTT:1 - chr3R 26693349 3' - Stalker2 7314 2 63.45 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTAAAG:1 + chr2R 5485155 3' + 1360 3333 1 56.85 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATACCTACGTAACCAATCCAAGAATATATCGGATATATCATATTGGCTTTAAGTACGGGGATACGTGTTGTTTGTCGC:1 + chrX 18561171 3' - copia 4914 2 50.34 GGCTATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTACATATATAGAGTTTGGGAATATAAACAGAGCTCTTACACACAAAACCCACTTAAA:1 - chr2L 19217616 3' - springer 68 2 66.44 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATAACAAAAGGCGCCGTCCAGGGCATTGAGGCTTCGCTTCTTTGTTGTTGACTTAGGCCCACGCCAAGAGGCAGAAAGGCTTCTT:1 + chr2L 21007123 3' - opus 7030 4 67.12 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTAGAATTGATTTTCTATATTGCACCCAAGATCAAGCCTTTAAAAGTTTATTAAATTTCTGTTGAATATGCATAAATACGAGGTCAAGTATGT:1 + chr2R 21244989 3' + roo 9041 1 64.38 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTATGTACTTGGCTGGGGGACGAGCCTGCCTGCAAAACTCCTGCAACATTGCGAATGTCA:1 + chr3R 15346955 3' + hobo 2926 1 60.00 AAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATATATCTTTTTTGTTATTCTTTTCTATCTGTCCGATACGTTTCACTTGGCGCTACAAAGAAAGCTACTAATATCAATGGGAAAACTACAACAAAGGCGCAGGCC:1 - chr2L 8615281 3' + 17.6 7407 2 77.40 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGAGGACTTGATTGATATTGGGCGATAAAGAAACC:1 + chr2L 11043621 3' + roo 9014 2 60.42 ACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGGTT:1 + chr3R 9862997 3' - Stalker2 43 2 56.16 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAATCGATGCCGATCGGGTGTCGAATCTCTCGAAGCTCTCGCCCCCAATGTTGGGCACCTGCAGATTTCGCGGCGGAACGCGAACCGGTGTCCTTT:1 - chrX 13528083 3' - roo 8729 2 63.70 CGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATGTATGTGTATATATATACGAGCAACCAACATTTGCTCGCCTTAAAAGCCAGTCGTCCACTAATGCCAAC:1 - chr2L 19634955 3' + Quasimodo 7323 2 55.48 GTTCGTCCGTCCGTCCATATCGGCGTCACTCATAATGATTTTCACTACTCAATTTGTACAGCTGCGTGAGTTACCAAATTGCCTTAGATCGACACGGTGGGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGTACATATAAATC:1 - chr2R 981777 3' - micropia 426 2 51.37 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTCCTTTCTGCTAAATAAACATTTATAAAAACAGCCAAAAGTTTTTATTCGCTGATGCTGCTTCTGTTG:1 - chr3L 10111754 3' - copia 55 2 60.96 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCTGATGTCTGGAAATTTGGAGT:1 + chr2R 12642779 3' - pogo 20 1 71.92 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACCTCAGGGGATGTCATTTGAAGGCGGCAAGTGTAAAAATTAAGCAGCTAGGGGGCGAGGCAATGAGTGAGATAAAATTACCCGGAAAACGAAGGGCGGTGGTGGCTAAAAGTAATTGT:1 - chr2L 9109776 3' - opus 112 2 84.25 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAGGAGCTGCAGACAAACTCTTATATTAAACTCAATGGCTCGGGCCCGACCCCGAATATTTCAA:1 - chr2L 8807830 3' - HMS-Beagle 31 2 58.06 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTTAGAGGTAGTCGTTGTGGAGCA:1 - chr2R 15529657 3' + roo 9047 1 69.18 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAACGAAAACTCCAACGAAAGATAGCAAACATAAACAAAGAACTTCTGCAACGATATACTAAGCACAACACTAATTTATGCAAAAG:1 + chr3L 23244971 3' - HMS-Beagle 6831 2 61.64 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAATATTTTATTTGTAAATAATTCGTTTAAATAGTAATCATGGGTGCTTTTTGCGCAGGCGGATTTATTACTAATGAAGTTGGG:1 + chrX 5938404 3' - pogo 35 1 61.64 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAAATTGT:1 + chr3L 3540270 3' - mdg3 5263 1 76.71 TCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGTAACATAACACCAATGATTTATTAGAATTTTCA:1 + chr2R 15373247 3' - 1360 116 1 90.41 CAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAATTGCAG:1 + chr2R 13052841 3' - Doc 116 1 70.55 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCAC:1 + chr2R 18056893 3' - blood 7073 2 60.27 ATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGGTTCGAATTGCGAAAGAGTTTAAAA:1 + chr3R 9863019 3' - Stalker2 21 2 71.23 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTGTCATCATATGTCTAACACTCGTCTCACTCGTTGGCCCGCCCCTGGGTTTATCCATCCATCCCGCAATCACTCTTCTCTCACCTTGGTCCTTC:1 + chr2L 16202736 3' - copia 20 2 70.71 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTAATTTAACATTATGC:1 + chr2L 19841595 3' - BS 43 1 52.05 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACGTATATGTGCACATATATATTGCAGTGCAGTCAAGGTCGTGTGAAAG:1 + chrX 13484199 3' - hobo 75 1 70.55 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTG:1 + chr2L 14263013 3' + P-element 2795 1 23.45 ATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGGCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATATAATCGAGATGCCCTCTGAAAGC:1 + chr2L 10685886 3' - Quasimodo 57 2 60.27 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGACATCAGACTTATAAATAGAAAGTTGGCCAAGAGAGCGGCTCTCTAAAACGCATTCCTCGGCAGTCGCATGGCTTCTAGAATTCAAATCTGTAACCGTAAGCCAC:1 - chr3L 13477139 3' - P-element 14 1 74.66 AATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTTAGAGG:2 - chr2R 15529673 3' + roo 369 1 58.62 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATTGTGTGCTTCT:1 - chr2L 2336206 3' + 297 6927 2 57.53 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATACGAATATTATACAAATAATAATGGCATATAAATGAAGTAACAAACATTGTTTTCCTTTGACATAACTCATTAACCATCGGAGACGA:1 - chr2R 10915615 3' - F-element 46 1 50.68 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAATTATTATTATCAAATAGACAGAGTTAAAGAAGTACACCCCAAAATGGTTATACTTTTCC:1 - chr3R 13201762 3' - 297 6632 2 59.44 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAACTTGAACTTGGTCGTAATATTTATGTGCATCGTAAAGGCCGAAAGTTGGAGCGACGCACTGAGAAAATGTTGTGAAATCAAAT:1 + chr3R 6603886 3' + pogo 2068 1 63.01 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATG:1 - chr2R 15529710 3' + roo 331 2 70.55 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGC:1 + chr2L 2622761 3' - roo 8707 2 55.86 GAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACTGCCG:1 - chr3L 25232688 3' + accord2 208 1 83.45 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGCGTGTGTGCCGCTCGCTATCCTGATACAC:1 - chrX 20106293 3' + hopper 1374 2 56.16 ATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTACTAAACGGCCGAAATACTTTATCTGCTCCTGTACATTGAGCACCTGCATCATATACCAATCGCGTGCCTTCTCCACGCCATCGAGTCCGAAAAGAAGCAGTTCCCGCTGCTC:1 - chr2R 24762023 3' - P-element 2637 1 76.71 ATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGGCTTGGCACCAAATTTGAAAGTTATTTAAGTCGTTAATACAGAGTCCAAATAATA:1 - chr2R 5410316 3' + 1360 374 1 65.75 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGCCGCTGATGATGGGAAGCAATTATCCCGAGCACGGGA:1 + chrX 19744538 3' - P-element 30 1 65.07 GTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAA:1 + chr3R 19500686 3' - jockey 131 1 78.08 TTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAACTTGTGAGGAGCGC:1 + chr3R 8965248 3' - HMS-Beagle 6845 2 53.47 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGG:1 + chr3R 13198283 3' - Doc 65 1 59.31 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCCTTTCATATGGTGCAGATACACTTCCGCTGGCTAACGATAATGGGAATGGCTTTTAATTGATTTGGTC:1 + chr2L 20068085 3' + roo 9020 2 57.53 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACCGCGTTTTCACGCCACACA:1 + chrX 7930736 3' + P-element 2799 1 17.42 AAAGTACAGCAAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAAGCATTACTGGAGCTCCATGGTATCTTCGGAACGGAACTCTGCCGCATCCTTGAAGTCTGCCACAATCCTTCGGTCATGGCGCATAAATATGCGAACGATATGCTTGCCGTTC:1 - chr2L 16100082 3' + Doc3-element 4372 1 52.74 GATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTAGTTTGTTTTAAATTTTGCGTCTTTCTGATAATTCAACATCCAGCATTATTT:1 - chr3R 15157556 3' - invader3 5232 2 61.38 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCTGTAGGCTCACCTACTCCTCCTGCAATCGAAAAACAAA:1 + chr3L 5948091 3' + P-element 2807 1 30.14 AAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATT:1 + chrX 1831290 3' - P-element 96 1 19.86 GCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATGCATTATTTTTCTTGAATTAATTGAGTGGGTTTTTTTTTTTGTAGTGCGTGGTGTGCAAAAAGAATTCAACTGAATTGAACAGAA:1 - chrY 1076851 3' - 17.6 36 2 60.27 TTTTAGAAAGTATCGTTAGGTTTGAAGCACAAACTGGTTTTATCTGGAATTATTTTGACTATTTGTCGCAGCAATTTGCGAACTAATAAAATTTGCCATCATCTTACGAAGTTTGCTCATCTCGGCCTGAAGATGTGCTACCAAAG:1 + chr3R 2876325 3' - Transib5 121 1 58.90 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCAAACGA:1 + chr2L 20327687 3' - roo 8740 2 68.49 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGATATGCAGATCGAAATTATATACAAA:1 + chr3R 4352169 3' - Doc 31 1 70.55 TAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAGC:1 - chr2R 3919672 3' - 1360 123 1 65.07 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAACCTTTATG:1 + chr2L 12696242 3' + pogo 2053 1 52.74 GCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGACAGGAGCCGAAGTCGATGGGGCAGACTCCTCCATCTTCATGG:1 + chr3L 13380516 3' + hobo 2869 1 66.67 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATCGAATGGGTAAATAAATGGAAAAGTTAAATTGGAAATGTGTGTGCGGCGAGTGGCGCCATCAATTGGCAGGTACTCTAATCTGAGTGG:1 + chrX 17531969 3' + blood 7358 2 63.45 CGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAACAGAAGAAAATCGATGGCAGGTAAAAAGCGGAACAGA:1 - chrX 12131142 3' - F-element 352 1 54.79 CAAAACTCAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATAGAAAAAAAAGAACCAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACCAACT:1 - chrX 19765879 3' + 17.6 7346 2 71.23 TTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAGTCAATTGGCGTGCTATAAATATTTGGCTGCATACTTTCGGGCGCACCGTATTTGTTGTTGTCCATAAGCCGCTTTTCTTCTCTGAAAACGGGAAAATAAATAATTAACT:1 - chr2L 19841443 3' + BS 5082 1 74.66 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGCCATACATTAAGCAGCAGTTTAAAGAGGCAGCGAGGA:1 + chr2L 18848828 3' - blood 46 2 54.11 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAACTTGAACTTGGTCGTAATATTTATGTGCATCGTAAAGGCCGAAAGTTGGAG:1 + chr3R 6603854 3' + pogo 2036 1 66.44 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCATGACGTTTTTCTCGCTTTTTCTCGACCA:1 - chr3R 25137984 3' - P-element 93 1 21.92 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAAACCTATAAGCCTATAGGGACACGGTAGTTTAGATAAGCGGAAAAAAATCGCAAAAATAACGTCCCCGAGTTCCAATTTCCACCGTTCCGCTATCGTCGCTA:1 + chr2L 5724435 3' - 1360 19 1 33.56 ATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTG:1 - chr2R 17872485 3' - Tirant 67 2 64.49 ATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATAGTGTTTGGTTAAAGTTGACTTAGTAATGTTTACCTCTCTCTGTTTACTTATTAGTGTATACTTTTGGGAT:1 + chr2L 1922601 3' - BS 5047 1 54.79 GAGCTTCTGCCAGCTATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGCG:1 - chr2L 11639022 3' - springer 79 2 74.82 TTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTATGTATATAGTAATACATCAACAACGTGTAAAAGCGTTGAAATAA:1 - chr3R 4570250 3' - Juan 79 1 68.49 TGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTCCAAAAACTGCAGCAGCCAAAC:1 - chr3L 10778120 3' - copia 5027 2 75.56 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATATTTTCTTAATATTTTGTATTCCTTTTTGTATTCATCGACAAAGGTGGACAACTTTCGGGTGTGGAATATTTAAACAGATAGAAGCTCAACT:1 + chr3L 107633 3' - roo 8692 2 67.12 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAA:1 + chr3L 13546613 3' + hobo 2886 1 76.00 GAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATATGTTGTGCTTTTCCTTTATTCACCCGCCTTT:1 + chr3R 5933270 3' + P-element 31 1 21.23 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGGTGGGCAAATGTTGAACCTCTGGCAGCCACCCACTTGGGTTGCATAAAATTGTATGTGCTTTCTATTTAACACTTTTTATTTTTTTTT:1 - chr2R 13772978 3' - opus 7143 4 66.44 ATAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGAGATATGACCATGCGGGAGGTGATTAGCGCGGTCATAGTCCTCAAACATAGACAAAACAAAATTAATTGACGACAATTGTGGCGAGCGAG:1 + chr2L 15365316 3' + rooA 7323 2 73.97 AATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGGCTACCTGACACTGCAACACTGGCGCATCAGAAGCATCTTCTGCAATTATTTGTGCATTAGAGGAAG:1 + chr3R 21734625 3' + copia 201 2 53.42 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGACAAATATGAAAGCGTCAGGGGAATGGGGAAAACTCTGAATTTTGAATGGTTAGGGGTTGGTGGAAGTGGGCAAGGCATGACAAGGAACTTCCACACGTTGCCAGGAC:1 + chr3R 12781637 3' - pogo 11 1 78.08 TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTTGGTTTACTTTTCGAATGATTTTAAACGATACCCCACATCCATCCCAGTCCTGCCCAGCATCCATCCGTTTAGCTTTGATGCGGAGGCCAAC:1 - chr2R 7343205 3' - flea 23 2 69.86 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACCCTTTGACAATTTTCGGCATGCTTTTTATACCTTCCACGTCTATTAGGGGTCTTTCTTGCGGTTCATTTTAAAATTCTAACTGGCAGCCGCAACC:1 + chr3L 3581002 3' - copia 25 2 65.75 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACCATTCATCCTGCTAGATGCAAGCCCTTTAGT:1 + chrX 6052992 3' - roo 89 2 79.45 CTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATCTTAATGCAGATCCATGTTATCATTGGGATAGTTCACCATTG:2 - chr3R 7364215 3' - Quasimodo 71 2 69.86 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGACATCAGACTTATAAATAGAAAGTTGGCCAAGAGA:1 - chr3L 13477209 3' - P-element 84 1 28.08 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGCAAATGAAAACTCAAGTGCAA:1 + chrX 17508943 3' - Burdock 32 2 63.70 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCCAAACCATCATCCCGCAAAACATCAGGCACGTGAGAG:1 + chr2R 8467803 3' - roo 8726 2 70.40 CGATTAACGCTTTTTGTTATTGGTTCATTCCAAATGCCGACACCGCACGAAGCATGCTGTTATATTTGCGGAACACATGATTTCAATTTCCAAGATATTCTAGAAATGTTTGCTTTCCCGATTTGATCGAATAAAATTCGGATATA:1 + chr3R 21896159 3' - BS 142 1 56.85 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACCGCTGATAAAACGCAATACGCTCAATATGATTATAGTGTTCAGAGCACAGATTCGAGATTAGATTGAGTACTGTTCAAAATTA:1 + chr3R 29868061 3' - S-element 35 2 61.64 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTAAGCA:1 - chr2R 18265991 3' - roo 8710 2 54.11 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGT:1 + chr3R 11550275 3' - F-element 85 1 71.33 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTGTATGGCCGAGTATCTTACCATTATTGACCACTTATTGACCCATTTATATGTAATATTCTTTATTTTA:2 - chr2R 1329969 3' + roo 9019 2 53.42 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTTATGAATATTAAATAAAATCTCTCAATCGAAAAGGTTGTTTTTATTAATGGCTTTGAAAATGGTCTACATTTCTTTATAAACACCGTGCTTAATA:1 + chr3R 13411933 3' + roo 9045 1 67.12 CATACATATACATATATACATATACATACATATATACATATACACTTGCCTCAAATTGTATTTTCAGTTCGCCATTTGTAACAATGCGCACTCACACACACACACACACACACATCAAGAATGCCTGAGTGAGTGTGTGTATACTT:1 - chr2L 18020902 3' - G3 4508 1 72.60 TGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAAAAGGGAATTT:1 + chr2R 10760485 3' - Tabor 6919 2 73.97 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCACACACACACACCGATATGAATCTTCATTGATGGCGGAGCGAACTTTAGCTAATTAAGAAATGCC:1 - chr3L 13568169 3' - hobo 56 1 57.53 ATACAAATGCACACCGCATTTTTCTGTACGCTTCCGTTATTCCTGCAGACATCTACTTCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGATCTTTCGGCCTTTAAGACCATCGACTAGTTCTCAGATTTTTCCTCTGGTAAATCCAC:1 + chr2L 14378832 3' - invader1 3794 2 63.70 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGAGGGGGTGTGTGTTTAAATGGCGCCTGGAGAATATCGATTAAATGCTCGTTT:1 - chr3L 5731253 3' - 297 6643 2 63.01 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGTTTTGTTTTGTTTCGCCGATTCGGCGGCTCTGCGCTGGCATTTATTTAATCCGACCCATCCCCAACGATCCGGCCGATCCGGGGGCA:1 + chr2R 18266135 3' + roo 406 1 76.52 TGTTCATTTTTTTTTTCACTTTTTGCATTTATAAATTTCTGCCGGG:1 + chr3R 22717147 3' - invader2 294 1 86.96 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTTTAGCGAACA:1 - chrX 19744415 3' + P-element 2871 1 60.00 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGCCTGATACTTAACAGCTCAAACTCCTTTAATTCCATTATGATAGATTGATTCGATTGAACAGTTCCCTCCTAATCGTTATCAGTAATCACAGCTTTCATCCG:1 - chr3L 2240354 3' + roo 391 2 73.29 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACCATTCATCCTGCTAGATGCAAGCCCTTTAGTGTTCCAGTAATGGTTCCATAATCATCATCATTTTTGAGA:1 + chrX 6053031 3' - roo 8713 2 52.41 TGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTGGAAGGTAGAGATAAAAGCTAGAAGGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACTCTCTTGTTTTTTTTTTATCATTTTCCATACATTCTTTAACAGATTTTACGAAAATATTAAC:1 - chr2L 15004792 3' + INE-1 140 1 56.55 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCTCCTTATTTATCTCGCTTTTGTTTGGCCCCGTTCAACCAGCCGCTGCCCTCCTTTCCACCACCGTCCTCGAAAAAGAGTGTCTTACTTTGCTCGGCTTTCT:1 - chr3L 6001311 3' - hobo 18 1 71.92 TTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGTTCGATAAGATTAAATAAAGCTATTTTCAAATCAAAAT:1 - chr3L 19951151 3' - Ivk 27 1 65.52 TGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGAAAATAAGCCGATGCTGTTTCACGTGGCGTATGAGCAATATGTACGCCAAGATGCACCGCAACAATTTCACGTTTAAGCAGACTTTTGCTTTGTCCCTTATA:1 + chr2R 8492881 3' + pogo 2086 1 75.34 AATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCCTTCGATTGTTTCCTTATCCATTAGATACTCTATTTTCTCTCTGTGCATTGCTAT:1 + chr3R 18860935 3' + roo 406 1 53.42 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGCACATGCAGTCGACTCTATGAACCAAGAGAATGGCTTAGAACCCACCAAAGGAATCACTTAAAATGGTACTTATAGTACTTATAGTAATTTCACAAATAT:1 + chr3R 29719456 3' + hobo 2917 1 60.27 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATGCATATAGAGAAGAAAAAGACCCCCATCAGGGGTAATTAAAAAAACTGAGCCATTTCAT:1 + chr3R 22676304 3' - 297 56 2 65.75 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAATATTTTATTTGTAAATAATTCGTTTAAATAGTAATCATGGGTGCTTTTTGCGCAGGCGGATTTATTACTAATGAAGTT:1 + chrX 5938401 3' - pogo 34 1 61.27 GAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACATTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGGATCAATGATCTCCAACAGCA:1 - chr2R 2666310 3' - Rt1a 33 1 54.62 TTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGTAATAAAGTAAAATCAAATCGAATT:1 - chr3R 6171108 3' + 297 342 2 58.22 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATTTAATTTGTGAATAATCCAAATATCTAAAATATAAAATCTAAACGGTCATTCATACACATAACTCTGTAAAACCGACATGTGCTGGTAGTTAATTGAT:1 - chr3R 5002271 3' - 297 6592 2 78.77 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGAAGTAAATGTGGTTCATATGAGTATCCGAACGTAGCTGAGATGAT:1 + chr2L 8009184 3' + roo 9042 1 63.01 GTGTTCATGTGTGAACATAGTGCCTTAAATATCACTTATCACCTGGGACATCGCAAGCTAATTACAAAACTATTGCCACAGTCGTCGTCGCCACTGAGCCGCAGAAAAGTGTCCCAAAACAATGTGACAATTGCAACAGAGCAATA:1 - chr2R 18785877 3' - roo 8660 1 61.64 TATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTTAAGGTAAAAGAATCTAAAAAGCTCAGCTAATGCAATTCAGGCCAACTAACGAAT:1 + chr3L 6641600 3' - Burdock 92 2 61.54 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAAGGTTCATATTA:1 + chr3L 13365118 3' - Juan 61 1 56.16 GCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAGAAGTTCCAGGTGTTCTCGTAGTCCGCAGCCGTCTCGCTCACACTACTGCAGAGGAG:1 - chr2R 16517218 3' + Quasimodo 7083 2 60.96 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGGCGTCCCACGTCGCCGTCGGGCGGTTTCACCTGGCTCTAACTTAACTAAC:1 + chr2R 11818282 3' + P-element 2815 1 33.56 GGTGGTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATGATCGTAATTGGACCAATTAAAATGAACTTCAATGAAAAATACAATGCGTAGATTTAATCAATCTATGGAATGATATAGTTTCCAGTAATATTCAGTGCTAACAAAC:1 - chr3L 21918742 3' + copia 5034 2 79.45 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAACTTCCATGAGATTTTTAACCCCTTCACCCCGTAGTTATCCATTATTTGTTTTATCGCCGTTGTTGTTTAATGTGTGCCGAGTTTCCAGCGAAGGGATTTTTGTA:1 + chr3R 31663382 3' - jockey 23 1 73.97 AAAACATAGAGAAATAAAAGGTGGCGGCATATTTTCAACTCAAATATGAACACAAGAAATAATAAGATGCAGCGGAAACCAGTCATCAATTTCACTCCGAATTAGACTGGTGTCCTACATTTCAAGCTCCAGTAC:1 - chr3L 25354072 3' + invader5 3606 1 54.81 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGTCTAAAAATAGCCAC:1 - chr2L 20716322 3' + P-element 2839 1 52.74 TTTTTGTTTTTTATTTATAATTATGTTCTGTGGATGGGAGTAAGAAAATTGCAAATTGCAGAAAGAATTGCATTCAGGGCTACCCCTGAAGAAAAATGCTAGTAAATAATAATTGAATTCTAAAATATAACATAATGTGGTATTAT:1 + chrX 17088837 3' - Burdock 314 2 56.85 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCTAAGCCATAGCCAGCATTTAATCAAAAATGAATTTTCCTTTTTT:1 + chr2R 16503470 3' - jockey 84 1 69.18 ATATTTCCAATAATTAACGTTTTATAGTCAACAGCAAATAATATATATATTTTTAAAATTGTGCGGAAAATAAATCAAAAAGAGATGTTATAATTTATTATAGATAGCAGTTTAGGTTTTTTTTTCGGTGCTCCGACTTTATGCGG:1 - chr3L 2609672 3' + FB 482 1 54.11 TTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAACGAACGAATC:1 - chrX 13642064 3' + P-element 2826 1 17.14 GATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCAAGATTTATGGCCCAGGCAATTAAATTATACATACA:1 - chr2L 14168360 3' - opus 339 2 72.66 AATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTACTCAGCCGTGATACGGGCCGAAGCGACCGAAAAAAGGGGTTACATAAGGGGGTCTGAAATT:1 + chr3R 902619 3' + R1A1-element 5295 1 51.18 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCCACTGGAGCTTTGATTGATGACAGCGCCCACCGCATCGGCAGCTTCACACATTGAGTTATCGCCGGGTCTATCTCTT:1 + chr2R 20303957 3' - mdg1 34 2 59.26 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTTCGTCGTTTTGCCAAGGAGACGCTCCGCTCAAAGGGAGGAAGCGTTTAATTAAAAACATTTTGTATACACATTTGCTTCCTTT:1 - chr2L 20985746 3' - F-element 51 1 54.79 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATCTGTTGTACTTTTGAATGTCAAGATAAAGAACTCCAGAACTACCAGATCTGATTGTGGTTGTAATTATACAATAGGAACATACATACATTTCATAA:1 - chr3R 12540446 3' + roo 9044 1 59.59 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACTATTTCAGCTATAAACATCTGGCACGGCAACTTAAAAGTCTAACTAATCCCATTTGTTTTCCAGATCTT:1 - chr2R 15190380 3' + pogo 2051 1 54.11 CGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTC:1 - chrX 16857069 3' - pogo 74 1 69.66 ATGAAAAAGTGTCAGAAAATACAGAAACACTGGGACAAACACGAAATCCGCTTATTATTGTCGACCGACCCACCCACTGATGGTTGGGTGGTTGGTGCGATGGGAACTTGAAACGAAATCAAAAGTCAAAGAGGG:1 + chr3R 8614321 3' + Tc1 1585 1 62.22 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTGTAGTATGCCCCTCGTCATAAGGCAAACAAATGACATCGACTGACATCCTGTTCTGCTCGCCAGGATTTTGA:1 + chr2L 2336338 3' - 297 44 2 56.16 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTCATACATTTCCCACACACATTTA:1 + chr3L 3540222 3' - mdg3 45 2 54.79 AAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATCAACCCGCGTTATTATTTTAGATTGACTGACGTTCATTATACA:1 + chr3L 19788185 3' - FB 79 1 71.23 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATAGCCTAACACCAGGAGCAGCGTGGCGGAAAAGCGTTTTGTCCCGGCGACAAGGCAACAACGGCAATAAGGCCCCATTTTTTTCCCATCGCCATTTTCAATTTTCGTCGAGAT:1 - chr3R 25094560 3' + P-element 2878 2 79.45 TCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGC:2 + chrX 1831301 3' - P-element 85 1 27.40 CAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATTAACCG:1 - chr2R 10666851 3' + hobo 2870 1 65.00 CGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATAATCGCATTTTACTCAGCTGCCCCAAGCCATA:1 + chr2R 5800548 3' - HMS-Beagle 6878 2 75.69 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAACTTTAAACTCCCCTCACAAGGG:1 - chr3L 3540075 3' + mdg3 229 2 73.97 ATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTTCAGTTTAAAG:1 + chr3R 2520343 3' + Tc1-2 1600 1 59.59 GAATTCCATTCTGCCACCCTGAACTGGAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCACA:1 - chrX 23291024 3' + R2-element 3169 1 71.92 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCCACTGGAGCTTTGATTGATGACAGCGCCCACCGCATCGGCAGCCTCACACATTGAGTTATCGCC:1 + chr2R 20303944 3' - mdg1 7 2 68.42 CGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACAAGATAGACAGGCGAAACCGCAGCGTGAAAAATCAAATGTTACGTGCTATCGGTGCGGCCAACCGGGACATTTCTCCAACCAGTGCCCTTAAAGAAAACGAGA:1 + chr3R 12937464 3' - micropia 5095 4 67.81 TAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTACCAACGAATTTATGTTTTCAGCCATAAATTGCCAAACATATACGCCCACCTGGGCGCCGCTTGTTTATGGCCAGCTTGGCCAGG:1 - chr2R 18927742 3' - 3S18 35 2 59.72 CCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGGAAATGCGGATAAGTGCA:1 + chr3L 25232918 3' - GATE 8306 2 58.22 ACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCCAAGCAGCTAAAATACGGATAGGTTTGGAGAGTAAAGTTACTAGCTTTTATG:1 + chr3R 31264239 3' + jockey 4921 1 67.12 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTTAAGTTCAATTTGTCGGAAAATTCAGCAAAATTCTTCTGATT:2 - chr2L 12766955 3' - hobo 44 1 55.48 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAAC:1 - chr2R 18266017 3' - roo 71 2 69.66 AGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTCGAGACGTGAATCAATAATTGTCGTATTAACGTCATAAGAAGTAGTATAATATGTATAGGTGGTATAGAACGTGGTAATGTCAGATTGATA:1 + chr4 170800 3' - F-element 332 1 65.07 GAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGATCTTCTTTTGTTTATTTCGCAGCAAACATCTAAAACAATTTGGATCGCCAAATCG:1 - chr2R 17112281 3' + P-element 399 1 38.36 CCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTTGCAGGAGCCGTCATTCCGTCGGG:1 + chr3R 5767465 3' + roo 366 1 52.80 GAAATATAAATTATAAATTACAACATAGTGAAATTTTTATTATTAAAAAAGTGGCTGAGCAAAA:1 + chr3L 13568041 3' + copia 252 1 56.25 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTTTCTCACTGCACTTGAGTCTTATTTTCTTACATCTTGCCAGCATTCGCAGATTCCTGCAGCTTTT:1 + chrX 2821969 3' - roo 54 2 57.53 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGGCCTTTGCTCTCTTTCCTTCTCTCCGATTCTTCTCACTCTCCGAAT:1 - chr3L 3249971 3' + P-element 2813 1 39.04 CAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATAGATACGATGTGTTGTTGCAACAGGACGTGACTTGGGTGACTAAGAATGCAG:1 - chr3L 9317468 3' + HMS-Beagle 197 2 60.61 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTTCTTTCATACTCAACTAGCGACTCAACTCGACTAAACTTTCCTTCTTC:1 + chr3L 2240490 3' - roo 8733 2 67.12 GCCGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTCCACCCCATCAAAGTCCAGCCTGGTAGGCGCTCTCGCAAAGGTGCTTTCCCACGCACGCATGCGC:1 - chr2R 16031341 3' + hobo 2889 1 52.86 TGTCAAATTTAAAATGCATGATCATACGTGTGCACACACGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTTGAACAAAAATTCGCGAGAGTCTGGAGCCACCTCTAGACCCACTGTTTCCGGAGTCGTCATCATTTCCTGGGGTACTAGGCGAAGGT:1 + chr3L 11768695 3' - 1360 195 1 69.86 ACTCGGCTAGTGATCCTTATCACGAATATAGGCTCGGAAGCGTTTCCTTCTATTTGTGTCGCACATTTGTCAGAAATTAATCATGTTCTTGTTGTCCCGCATGGCAGTGTGTGGTCCCGTGTGTGTCCATGATACATTGGTCGCCG:1 + chr3R 7041960 3' - INE-1 91 1 61.64 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTCCTTGCCGGCGGCAGCATTCTGAGCGGGCTGCC:1 + chr2R 14450217 3' - roo 37 2 64.21 AAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAGATTGAGGGTTTATTCAATGATGAGTACAGATCGAGGTCTTCTTGTCTACTGACTAAAAATAAAGTCCTGCTTACATAGAAAGTTTTCCCG:1 + chr3L 7057295 3' - Transpac 5074 2 74.58 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGCACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTTTTGTGAATACATGCATACCTACCCGAATAAACATAGGCGCAGCAAGTC:1 - chr3R 24760539 3' + pogo 2041 1 64.96 AGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATAAGTGAACTCAAAAAAGCAGTGCAAATTCAATTAAATTTTTTCTGTTGCTGCTCGCTTA:1 + chr3L 780766 3' - Burdock 6194 2 60.00 GTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTACCTGTATATATAGATATATATTGTGAGGCAACCGCCGATCCATCACCGATCGATCATTCAGCAAGCAAAAAGAATTTAATTC:2 - chr3R 24396681 3' - I-element 5136 1 56.16 GTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCCCTTCAAAACGAATGCACTTACGCAGGGCATAGTCCTCCGGCGGGATGTCATACTGGCT:1 - chrX 19746695 3' - P-element 414 1 42.47 TCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATCTTAATGCAGATCCATGTTATCATTGGGATAGTTCACCATT:1 - chr3R 7364216 3' - Quasimodo 72 2 70.55 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTA:1 + chr3R 26031800 3' - pogo 54 1 55.48 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAAAAGGGAATTTTAATTGGCTGTCTGTCGTTGTGTGCTAACGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTT:1 - chrX 7978950 3' - Tabor 27 2 66.44 TAGCTGAGTAACGGCTATCTGATAGTCTCTTGTCTGGAAAATATAAATAGATTTCCAAACAGTTTGGTAGATATTAGAATGTTTTTTTTTCTCTTCTTAAATAAACATGTATGTAAATGTAAGGCCAGCTTATGTTCGCATTCATA:1 - chr2L 12156834 3' + INE-1 544 1 53.42 CAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAGAATTTAATCTGGAGTCGATTTCGTTTGGTTTTGTGTTTTGCAAAAAGTT:1 + chrX 13303533 3' - I-element 363 1 65.75 AAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACCGCTGATAAAACGCAATACGCTCAATATGATTATAGTGTTCA:1 + chr3R 29868020 3' - S-element 76 1 71.23 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACGAAGAGAGGACAAATTGAACAGTTTGTTACATGGAAATACCCTGT:1 + chr2R 23395532 3' - jockey 4837 1 68.49 ATTTTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAGGATCAATTACTCTTCAACTGAATTTAAAAGGATTTGATAAGAGGTTTGAGTTCACGACAAGTGTAGTTCGATTCTTACCTGCCCAGAATC:1 - chrX 11696529 3' - TLD2_LTR 97 1 78.08 CGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCGGAGTTGATGAAGGAATACGACAGTAAATCGAAGGTGTTGCAATCGCACCAGTTTCCATAAATTGCCCATCACTTACGATTCATT:1 - chr2L 19343899 3' - FB 37 1 58.90 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATTAACCGCAAGCGCCAGCAGATGTTGTCAACAATTAA:1 - chr2R 10666821 3' + hobo 2894 1 55.48 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTATATCCGGAGAATCGGATATGCGGAATTGGGAAAAGAGAAGAATCCATGCGATAT:1 + chrX 20369504 3' - roo 27 2 71.92 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCCATACATGTATGAATTTCTCCGAGGCA:1 + chr2L 2522985 3' + mdg1 7399 2 58.90 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACATAATGAGCCGACCGAAACGCAGATCTTGATAGAGATCGACTGGATCTCCGCCGCCAAAA:1 - chr3R 15346861 3' - hobo 33 1 52.99 CATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATT:1 + chrX 18193807 3' - hopper 64 1 60.96 TGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAGGCACGTACTTAAAAGAAAAAAAAATAAGAAAAAAAAACTTCCCCATCAAGTGCGTCCAAT:1 - chr2L 10128079 3' - hobo 61 1 58.22 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAGAAATC:2 - chr3R 26031672 3' + pogo 2057 1 56.16 AGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTACTGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTC:1 + chr3R 22572635 3' - HMS-Beagle 79 2 71.23 AATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTTGTTGATTTCCTAGGTGTATAAATTATACTTTATTTAATCTGCGATGACTGC:1 + chr3L 9905828 3' - Juan 4095 1 62.33 CAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAATAAATTACACGGAACGAGCCTGAAGAGCAGCAGAAAAAATGTGAAGCATAACTT:1 + chr3R 19500740 3' - jockey 77 1 58.22 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGAGAGTAAGGTAGATAGGGAGCTTTTGGAGCTGCTCTAGAGTTGCCAGGTGGGCGTAAAATTCCATTTTTAGATAGCACTATAGTTCTTAGCATGTGCTTGATTTTT:1 + chr2R 16031489 3' - hobo 15 1 74.66 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCCTTTGTTTTATATTATATGATTTAGATATAAAATCTAGAACACATTACTTAAAATTATAAGATA:1 - chr3R 6523202 3' - I-element 59 1 55.48 TTTACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCATCTAATCGAGTTATGACAAACTGAGTATGAAAAGAAAAGCTACAAAATAACAACAGAAATGTGTTTTGATGGA:1 + chr2R 15529808 3' - roo 8711 2 54.11 AAAAAGATATAAAAACAAATTAAGGCACTATATACAACAATAAGAAATTGTGATAATGTAGGCTCTGTAGGCTCATCGAGATGTAATCGCACAAGCTGGTTACTGGTTAAATTAAAATAGAATTTTGGAGGTTCTTATTATTTTAT:1 - chr3R 30213206 3' + Tc3 1577 1 53.42 TAGTTTGTAAACAGAACAAAAAAGGAAAACGACAATGTGTAGTTGTCAATTGTATTTAACTAAAAGCTATTAGAAACACCCCGCAACAACGCGGAACTCTTACTACAGCCCATCCAACGCACGCCAAAGAACCGAAATCGAAAGCC:1 - chr2R 11622766 3' + Penelope 733 1 58.90 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAACTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGAGACGAGCGCAGAGT:1 + chr3R 5087160 3' + P-element 2824 1 41.78 ATATAATATAGAAATAAAGTAATTAAAGGTGTAAATATGAATGATCTAGAAATTGATTGTTATTATATTTGCTCTTATGGTTAACATGCAACTATAGTTTCCCGTGTAGCGAGTGAAAACTTCTTTAAGCCCTTTCGACACATGTT:1 - chr3L 4000762 3' - accord2 440 1 38.36 CGTATGACCGCAAGTTAAAATTTTTCGACGCACTTTCGCAACTTGACGCGTTGACTGTTCAGCTAGAAAAGCAGCAAAACCCAAACGGCAACGGCAGCAACAAGTCTTAGTCAAGTTTCACGTGGCTACACTGAGCGAAAAGGG:1 + chr2L 15337351 3' - gypsy12 303 2 59.03 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCACCAAGCCGAATCCATCCGAACCAAGCC:1 + chrX 12003982 3' - P-element 86 1 24.11 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACATTTAAATTTCTACGCTGATTTGTTTCAAATACGCCAGTGTTGATCGCCATATCAAAGAGATTATTCCGCATTTTGCCAATTATTAACG:1 + chr2L 17387553 3' - mdg1 16 2 72.31 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTTGCAGGAGCCGTCATTCCGTCGGGTTCAGTCTGCAGGATTGCTGATGGATTTCACAGTTGACGG:1 + chr3R 5767505 3' + roo 396 1 74.81 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGATATGCAGATCGAAATTATATACAAATT:1 + chr3R 4352171 3' - Doc 29 1 71.92 AAACTGTAAAATCAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCAAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATAAAGGTATTGCCGTAAGTTAGCAAATAATCTGAATGGATACATTCCATGCAG:1 - 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chrX 9413073 3' + 17.6 7349 2 69.18 ACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACAATCGCTTCATAGAATATTCAAGAACAGGGATTTCATTTA:1 - chr2L 16567024 3' + Doc 370 1 72.60 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTG:1 - chrX 13642048 3' + P-element 2801 1 26.71 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATTTTTAATGCGATGAAAGGAATGCGAGCGTATT:1 - chr3L 16523212 3' - jockey 93 1 76.03 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTCAAGTCAATTGAGAATGAATACGTTTTCTTTGGGTTTTCTACGCGATTGAAACCTGTGGTGGAGTATATTGGCAACAAATATTATGCCAACAAGAAGCT:1 - chr2L 8009011 3' - roo 8684 2 69.86 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGTTGAGATGGATCTTATTTTAGCACCCCTCATAAAGG:2 - chr2L 5333380 3' - mdg3 5298 2 55.48 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCGAACGTCATCCTGCAGCAACCTTCGGGTGGTTTGCCACCCGCGCCCCCCTCAGATAGTGCTG:1 + chr3L 939729 3' - 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accord 7030 2 56.73 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAACTTTAAACTCCCCT:1 - chr3L 3540083 3' + mdg3 221 2 68.49 TGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGAATTGATATAATGTAATTGATAAAGTTGCCAACTTCCTGCCATATTGCATAAGTTGGCAAAGTGTGAAGCAGTGGGGTATAAGCATCTAAATATTCTC:1 - chr3R 29429457 3' - F-element 186 1 67.12 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATTTGCAACTTCGCAGCAGCTGCGCAATTTACGTAGCAATTAAATTGGGTCTTCAACTTAAGGTTTGTTAAGGGAAAACGCACTGGGTG:1 - chrX 22577954 3' - 297 22 2 65.97 TCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAATTGTGTTGCGTCGAGTCGCGCTATTTCGTTTCGA:1 - chr2L 850991 3' + P-element 2803 1 23.97 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGC:3 + chrX 8610296 3' - mdg3 5334 2 71.23 ATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAACCTATTTTCCGCTCTGTGTTTGTTGCATATAACACATACGCCATGTTGTCGAACCTTTTTTCAGCGTCTGATCCGCGCTGTCTGCAGCAGCTTTTTTGGCAATTTGCACAATGTC:1 - 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chr3L 24054333 3' - INE-1 258 1 30.14 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATATAAAATTAATGGCAATCTGGCAGCGTAAACACGACAAAATTTGTTTCTCTAGCCGTGTGCCGT:1 + chr3R 18114961 3' - 297 53 2 58.90 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATTTCAAGCTTATTAATATCAGATTGACAATCCTCAAATGTAGATTAGAAGTATTCTAATGGTATGCTAATA:1 - chr2R 8374972 3' - roo 12 2 74.66 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTCCGCACTAGACGGACAGGTAACACAGGATTTGTG:1 + chr3R 5684194 3' + pogo 2070 1 64.14 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGTTTTACCAAAGTTTCGAAATTTCATCACAAGAGT:1 - chr2L 5656509 3' - hobo 28 1 66.44 TCCAACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAG:1 + chrY 3631955 3' + gypsy 372 2 78.08 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACTATTTCAGCTATAAACATCTGGCACGGCAACTTAAAAGTCTAACTAATCCCATTTGTTTTCCAGATCTTAGAAACT:1 - chr2R 15190373 3' - pogo 43 1 57.53 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGAATTTATGTTTCTATAAGTGGACAAAACTAAACTATTGCATATGCTTATGATCACAAGTTATCCTTA:2 + chr2R 11609991 3' - roo 53 2 55.48 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGACAAACTCGGCTATCCGTCGAACCCAAACCATAATAGAGTGGTGATGGGGAGCATTTTATAAGTGCCCGAACTAAAGGACATTCGAA:1 - chr3R 6603725 3' - pogo 32 1 63.70 CCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTGGAACCAAACGAAACGGCTGTTGGC:1 - chr2L 1823638 3' - R2-element 3389 1 76.56 AAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTGCTTCCCCCGGCAAGTTGATGATA:1 + chr3L 15099682 3' - G4 3814 1 53.42 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAACCACAAAGAGCAAACACAAAAAATGTTGCCTACTTCCCG:2 + chr3R 8625259 3' - jockey 88 1 73.97 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCCCCTCCGCCGCT:1 + chrX 19744506 3' - P-element 37 1 50.41 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTTAATTTAAATATCCCATATTATTTAAGTTCATTTAATATTTTCCTTCTTTTAATCTCAATTTTACCAATTAAGAGTTTTATAAATGTTCCAATGT:1 - chrX 16538055 3' + mdg3 223 2 70.55 GTGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACA:1 + chr3R 18935147 3' - jockey 4748 1 78.69 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTGTATCTTATTTTCACAGCTATCAAAATACACAATGAACTTTGACTTTTTCCAGTGCACCTACAACATTTTTGTCGCCTGTGCACTAGAGTTTT:1 - chrX 18561022 3' + copia 229 1 66.44 ATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATG:1 - chr3L 19951212 3' - Ivk 101 1 76.71 ACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATGGAATAGCGGAATGGGTGCTTCCCAATCAGGCATC:1 + chr3L 15723523 3' - jockey 391 1 76.03 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAAAAACCGCCCAAAACACAAGTCTGCATTTATGCAGGCAACAGCCAATTCACTTGAAGGATACCCTGAAATTAACCA:1 - 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chrX 17690447 3' - Doc 317 1 50.68 CCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAGAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACCTCAGGGGATGTCATTTGAAGGCGGCAAGTGTAAAAATTAAGCAGCTAG:1 - chr2L 9109852 3' - opus 7183 4 64.38 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGAGTTAAATGGCACACGTATGAGAATATAATTACGAGTATATTATTAAATTTATTGAGCGACTGGAAGCGCGATTGGAAGGCGGCAACGG:1 + chrX 9865045 3' + hobo 2937 1 74.36 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTACTTACCGGTGGTCGTGTGATATTTGTGGGCAAATATAACCACAAAGAAGGACGTTGCATACTTGGCGGCGTTGACCAGATGCGGAAATTACTCCTTTG:1 + chr3L 5919196 3' - BS 5081 1 68.79 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACACAGTCGAATGTTTGTTTGTGCGAAAGTATGCCTTAATTTAGAAAATGGTATCAAAGCAGGGCAGTTCA:1 + chr3R 8810758 3' - 297 6625 2 53.52 AGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTGGTCCTTGGTGGAGGCCCGTTCTCAATCCGTTGGCGAGGACCAAGTGCATCTTGTTACGCCGCACAATGAATACCAAAAATTCAATTAATTTGTGAATAAACGTTA:1 + chr2R 10666981 3' - hobo 15 1 75.34 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAACCACAAAGAGCAAACACAAAAAATGTTGCCTACTTCCCGGCAAAACAGGTGAAAGAAACG:1 + chr3R 8625280 3' - jockey 67 1 59.59 TATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAACCCGCTTCAAGCAGAGCATTATTGTAATGCGACCGCTCGTAGGCCAACTGGAC:1 - chr2R 17182887 3' + Stalker 255 4 76.03 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAATAT:1 + chr3R 29381595 3' - hobo 62 1 60.96 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAATTATGGTGGAACAATGGCTTAAGAAATTGATACAATCCAATTGAGGTTGAAATGATACAAGAACATTTTTTATTTTAATTAAAAATTACATAAGTATTA:1 - chr3R 7305864 3' - 412 7073 2 71.92 TGCTGCTCAACAGCGTTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTTGAGCCCCTGCTGAATTTACCATTTTCATTTCCTGATTTGTCCGGGCCTCCAGTCCTGCGGAGCACAAGGTTTAG:1 + chr2R 24211657 3' - flea 4796 2 55.86 GTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCTACTTTTTCGGGCAC:1 - chr2L 12325009 3' - jockey 4606 1 48.63 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCTGTTCTCTGGGCTTTGTTTTAGTTGTCAGACACACACCCTATCCTGCTCATTTTAGTCTCATAAATATGCAAATTAATCAT:1 + chr2R 22795245 3' - hobo 40 1 58.22 AAGTGGGCATAAGTATTTGCACGCCTTTGTTTTAATACTAAACCAAGGGTATTCTATTAAGTTGAGGGCTGACTTACGAAGTAGTTGGTGGTGCGGGTGCCACTGCCTTTGGTGCAAGGCAGCTTAGCTTGCGTAGAACTTATACC:1 - chr3R 30365005 3' - Tc1-2 1620 1 55.48 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGA:1 - chr3R 21276548 3' - BS 5072 1 67.81 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACGAACCCAGCG:1 + chr3L 9240483 3' + 412 432 2 58.22 TGTTGCGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGGTAGATTCAAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAATCGGACAAGAAAGCTTCTTAGATGAACCGCTTCTTTTGAGGAGTCCGACAGAGCCATG:1 + chr3L 23265713 3' - Circe 7338 2 69.18 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAAAGTTTATATTTATTACTATTAAAAGTACCATTTTATT:3 - chr2R 11609875 3' + roo 9018 2 57.53 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGATTTATTTGCCGGAAAAGA:1 - chr3L 13546555 3' - hobo 63 1 63.70 AATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATTTGCTTTTGCGCTTTTGCGCACGCCTTCCCCAATTGATAAAGTGACAATTTATAGTCCCTTTTAATTGATATCGTCATGCGTCGAGAGCCCCGCGAATGTCCCC:2 - chr3L 780615 3' + Burdock 6377 2 74.66 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGATGTTGTTGTTGTTGATGTTGTTTCTACTACTCTACTGCTACTACTACATACTCATAAGCCTCTCTAAATACCGCAAGACCACTATCTGTTATCATGATTTCCGTTTAA:1 - chr3L 13778493 3' - I-element 14 1 76.03 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAATATGGAAAATAACTTAAATTACCAGATGCGGCGTGTGTAATATTTTACCAGCACTCC:1 + chr3R 29381649 3' - hobo 8 1 78.77 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTACAATAT:1 - chrX 3637753 3' + roo 9024 2 52.74 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCCATGCTCTGCAACGGTGCGTATGATTAATTTCAGCTACAATTAATATTGCTCATACG:1 + chr3R 30524554 3' + roo 386 2 58.49 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGACATCAGACTTATAAATAGAAAGTTGGCCAAGAGAGCGGCTCTCTAAAACGCATTCCTCGGCAGTCGCATGGCTTC:1 - chr3L 13477168 3' - P-element 43 1 56.16 CGTGAAATAGCGAAAAAATACACTGACAGACTTTCTATCGCAGCCCAGAGCCATCGGACAAGAACGAGAAGAAGATTGAAACGCCACCACCCTCAAGACCTGACTGACTGGGACTTGACTTAATTAATTATAACCTTCTAAATATT:1 + chr3R 4926547 3' + jockey2 3066 1 73.29 CAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTATA:1 - chr3R 9657675 3' - BS 57 1 58.90 GCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGAATATATGTATGTATATATGAGTGAATATAATTAATT:1 - chrX 11016727 3' + Quasimodo 166 2 75.34 AAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCT:1 + chr3R 1977624 3' + micropia 5391 2 59.35 AAAGTCAAATAGTAAAAAAAAATGGTTGGGCAAGAGTTCCTTTTGCTTGCTTTGTTCACGCATGAATTTGCAGGAGGGCGGCGGCGGTAAATGCGAAAATGAGAGCGGCGGCGACGCGTCACGCTTCA:1 - chr3L 2031975 3' + Rt1b 5142 1 69.53 TGCATATATTCTTTTTTTTTTTGCTGTGCCTCAAAGTAGACATGTGTTTACCTTCCACATAGACACACACACACACATCCATTGTCGGGCGCAGGCAACAGGCCCCTAA:1 + chr3L 1430026 3' - invader2 300 1 62.39 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAATCGATTATTTCATTAGAATAAAAATTAGTCATATCAAAATGTGTTATAATTTGT:1 + chr3R 18600674 3' - 412 7119 2 64.38 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTTTATACTTGAATATATGCAAACGCTTTTTTGGCTTCGATTTTCG:1 - chr2R 6713844 3' + 297 6908 2 72.60 TCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGTAATAAAG:1 - chr3R 6171125 3' + 297 6907 2 69.66 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATTGCATT:1 - chr3L 10068900 3' - 412 7123 2 65.75 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATGATTCTTGAAGAACGATATCACCTTCTTGGACTGTGGAGCCCGCATCCGTCTCTTGACCGTCATC:1 - chrX 15696683 3' - jockey 4724 1 54.11 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCACACTACAAGCGCAGCCCCGCTCTCTCGCACGCACACACGGACAGGTACACCTGCCGAGG:1 - chr2L 15057165 3' + hobo 2914 1 58.18 GCTCTCGATTCATTTACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAGTTTGAGTTTTTGATTGATATGACATTGATGCCATTTTGGTGGCTCATTTGAATGGAATG:1 + chr3R 22266537 3' - roo 8723 2 56.85 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCATCAATCAAACTGTCACCAATCGCAGCCTTAGTTTAAGTTGCCTGCATCCTTCTCCTCATCCG:1 + chrX 998228 3' + copia 200 2 57.34 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGA:1 + chrX 1831293 3' - P-element 32 1 37.65 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATTTTTCTCCCCCCTACCACAAAATGGGTTTAATCTCGAATAA:1 - chr3R 26643309 3' - 412 7131 2 72.60 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGACTGCAGCAACAACAACCACACGGCAGAGT:1 - chr3R 17794516 3' + P-element 2839 1 50.00 CNCCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATAACAAGAACACACTTAT:1 + chrX 10429870 3' + roo 342 2 63.01 CCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATT:1 + chr2L 19841580 3' - BS 58 1 58.22 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCGGGGTGAGTGGGGGCGGGGCAGAAAGGTGAATCAACAGCAA:1 + chr3L 10111884 3' + copia 5087 2 58.90 GCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCTAACTTAACTTCCAATTAACAGATGCAAGACTTATTCAACCAAATTTAGCAAATTAAACTCGCCG:1 - chr3L 17710551 3' - I-element 23 1 69.86 AATGATTTAAGATAAGTGGTATATTGGAGCATATTAGACTAATCTACCCTAAGTATACACTAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCACTACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATTTAAATATACAAATATAC:1 + chr2L 1328852 3' - Cr1a 4136 1 76.12 CAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTA:1 - chr3L 3540129 3' + mdg3 174 2 64.38 CATCTCGTCTAGTATATTCCCCATGCATAATACTGCATTTAATATGACCCTAAATAAGAATCCCACGGTTAAGCGCAAATCGGGGCCAAAAAAGTCAGGCCAAGGAGATCTCGTAGGCGAATATCCTGTGATGCTCACATGGCCCA:1 - chr2L 16055454 3' - Gypsy12A_LTR 116 1 53.42 CAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTTTCA:1 - chrX 7685270 3' + Tc1-2 1593 1 59.59 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGTCAAAAATAGATTACAATTTAGAAGCATCTTAAAGATTTATCGATTGATATGAAATAATAAGATAAGATCTCGACTCTTTCATCAGTGTACATATACAATATGTT:2 - chr3R 18860718 3' - roo 8679 2 67.81 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATTTCGTGTTTTATTGTATATGCGTTTATATATTTACTAATTTATTACCACGCCAACGATAAATTTCTATTGAAATT:1 - chr3R 7136522 3' + roo 397 1 76.71 TTCTAAGGTGAATGGCATATTTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCAAGTTATCCAACCCATATTTTCAACTCCTGTCGCAGATCCTTCAGCAAGCTATTCCTCATGTTCTGAACTTGGAAAACGAATAT:1 + chr2R 10099283 3' - 1360 217 1 52.14 GATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTTTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGTACCCGAAATGGTTAAA:1 + chrX 22386812 3' - hobo 63 1 63.57 CAGATACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATTATTTTTTCCATATAAAATCGAAAATTTTTTCAAAAATTTGGGCGTTGCAGTTGCATCATATTCGCTTTCCGAAGTTATCGCCCGCTGTATTATCAGCTCGTTTCT:1 + chr2L 21370952 3' - INE-1 536 1 63.70 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCATCTTTAATAAATATCTTATCATAAGTGATGAAATAAATCTTCAAACCCCTTACTCAATGCTAATTTAAGCTATCGCCTAGCTACATATTACC:1 + chr3R 11163149 3' - mdg1 28 2 66.44 ATTAATCCCACTTCTGAGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCATTCAGCAAAGGGTAATTCTGCATTCGATATTGCATGCTTTCGGTTCATTTTATTT:1 + chr2L 1862638 3' - mdg3 266 1 61.64 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCCACCCCGACCCACATTTTTTTTGGCATTCACATCCCCCGCC:1 + chr2L 17574444 3' - hopper 75 1 70.34 GCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCTGGGTGGTTCGATGGATTTGGTGGTTTGGTAGTTGGGTAGTCCCAACACAAGTACACCCACCCGTTGACATCGGCACAGCATGCGGAATCCAAATCAGTTTGGT:1 + chr2L 14678505 3' + Quasimodo 241 2 69.86 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAAGTTCTTGCCCTCAATTGATAGTCGAGTTGAGCACTCGAAATGACTTCATTTGCACGACTCTCGTTGAGCGGCAAGTCTT:1 - chrX 8855955 3' + 297 6941 2 63.01 ATATTCTTGATCAGGATAAATAGCCTAGTCAATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCGTCTGTATGTAAGAACGTCGAGATCTCAGGAGCTATAATTAATTTATATGAACTGCATAAGTGATTTTTTATTGCACCACCCATTACCACCGG:1 + chr2R 15333133 3' + INE-1 84 1 62.33 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCGTTCGTTTATGGAAAATCCGCGCTGTTTGCTTTA:2 - chr2L 951271 3' - F-element 33 1 67.12 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTGTGACTTGTTTTTGTGCTCGATGCGAAAAATGTGCGAGTTCG:1 - chrX 13484079 3' + hobo 2914 1 68.49 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATGTACATACACACAAAACGAGACAGCTTGTCGTGTTGGCATTTTTTTTTGTCATTCGTTATCGACAAATGCGA:1 + chr3R 14688593 3' - FB 47 1 50.00 ACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCAGAAGGCATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACACTTTGAACAGTTG:1 + chrY 3648897 3' + Stalker 173 7 65.07 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCGCATTAAAACGAACGTCAGCTGGGGCCAGCTTATCACGCTTCGAGCATTAGAAAGTGGAGCACGCTTTT:1 - chr3L 939620 3' + hobo 2916 1 64.96 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTAGCACAAAAAACAGAACTTTCATTCTTCAAATCGTTG:1 - chr2L 8909812 3' + roo 8987 2 77.40 AAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGC:1 + chr3R 13572110 3' + 412 426 2 60.96 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTATATCCGGAGAATCGGATATGCGGAATTGGGAAAAGAGAAGAAT:1 + chrX 20369493 3' - roo 8702 2 64.38 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATGGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCTTT:1 + chr3R 13572088 3' + 412 445 2 66.67 ACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACAACCGTGCCTGTCTCCGAACAACAACAACAAATGCAACCAACTATGATGACAACAAACAGGAAGATGAGCCCATAGAAAGCCAACTTGCCCA:1 + chr3R 6404670 3' - Stalker2 32 2 63.70 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGG:1 - chr3R 30524473 3' - roo 8667 2 65.71 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAACTTTATTAAATCGTTCTCAAATGGAAAACACCGACTATAGCTATTGAAAATAGTTTCTCACAGTTCTTAACTTTACATACACAAAGATTGTAAGTA:1 + chrX 19310699 3' - pogo 21 1 69.86 TCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAACGATTTTTACTCTGATCGGTCAGCATTATGTGAAGGTTAAAAATAATCGGGAGCGATGCGATTTGTTTTTATTTTGTTTGGCA:1 + chr3R 18120084 3' + mdg3 5149 1 55.48 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACGAACCC:3 + chr3L 9240479 3' + 412 428 2 60.96 CGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACG:1 - chr2R 5485067 3' - 1360 74 1 70.63 GCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGTTCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAG:1 + chr2L 19841550 3' - BS 48 1 68.87 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAAGCAATTAGCCAACGGTGAGGGGGTAAAGCTTGGCGGGCAGGGGGTACGGGGTTGGTTCAATGAACCGAAGTGGTCTGGAAAAGCAATCAAGAGAGGTGG:1 + chr3L 19702899 3' + pogo 2086 1 73.97 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGTTTTACCAAAGTTTCGAAATTTCATCACAAGAGTAAATGGG:1 - chr2L 5656502 3' - hobo 21 1 71.23 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGTATCTCCGGCATGTGCGTATCTCCAGTTCGTGCACCTTGAGTGTAATTTAAATACAAACGAATGAATTTATGAAGTGCCGGATATACGG:1 + chr2L 10178118 3' + mdg3 5467 2 63.70 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGC:1 + chrX 19162674 3' - pogo 58 1 65.41 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCAACAGAAAAGATA:1 + chr3R 26031818 3' - pogo 36 1 61.64 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTCAAGTCAATTGAGAATGAATACGTTTTCTTTGGGTTTT:2 - chr2L 8009072 3' - roo 8745 2 71.92 GGGTGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATAGTTCCACAAAAGTGGCACTATGATCTCTCTCAGTCTTGGCACCCCTTTAAGTTCTAACTTTAAGTTCAGCTCCTT:1 + chr3R 29952850 3' + invader4 322 2 81.51 TAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATCATAAGAGGCTTTGACAACTGGTTAACTTTATTGACGGATCTTACCTAT:1 - chr3R 17068897 3' + mdg1 357 2 63.12 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGGTTCGAATTGCGAAA:1 + chr3R 9863009 3' - Stalker2 7265 2 71.21 TCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATAACTCAATTATAAACAAACAGTCGGGGCGAACGTTTCTTTATCATGGCCTAGTTCTTTTTATTGATATCATTAGAAA:1 - chr3L 11352889 3' + McClintock 448 2 52.05 ATGAACGTCAAGATCTCAGGAACTAGAGGTTGAGATTTACCATTCTGTCCGCCCGTCGGTCCTTTCCGAAAAGTTCGTTAAAAGGAATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGTT:1 + chr2R 8443981 3' + INE-1 139 1 72.60 GAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCAAGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGACCAAAGAGAGAAACCAAACAAGCCGACAAACGGTAACTGGATCAGCAGAGGAATCAATC:1 - chr3R 13895104 3' + Bica 207 1 80.14 TGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAACAGAAGAAAATCGATGGCAGGTAAAAAGCGGAACAGAATTCCTAAAATTCACTAGGTAAAATATAAATAAATAAA:1 - chrX 12131104 3' - F-element 314 1 80.82 TAATTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTCTAGGCGGTTTGTGGGCGTAAAGGTGGGCATAGCAACATGGGTCAACAAAATTTCACTGCGCCTATGTCTCTAGAATAAGATTGAGAAGATAGTGGAAGAATATTTCAACGGAGCTA:1 - chr3R 4186122 3' - INE-1 254 1 73.29 CTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGAATCATACTAAATATTGCCCCAAAATTCCATTCAAACAAAGCCCCACCCTT:1 + chr2L 17580337 3' + hopper 284 1 61.54 GCTAACCAGACCGAGCGGACGCCACTTGCCCGGACTCTCCGTTAGCGACGGGTCTAGTTGTTACCCGGGCCCCCAGATATGTCTAATGTAATCGAATTCAGAAAGAGCGCTTTATTTAATTTGTTTATTTAGATTACACATGTTCA:1 + chr2R 15283992 3' - baggins 311 1 52.05 ACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCTTTATTATTAGTCTTGCTGGTTTCAATAGATATGCCCAACACATTTGGGCCATAAAAACGTTAATAAAATATGATTTAGTGTACCAAGGCATTTAGC:1 - chr2R 7024348 3' + diver 200 2 68.49 TGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAACTTGTGAGGAGCGCATACAAAACTAATTGAACTTGGACAGCG:1 + chr3R 8965276 3' - HMS-Beagle 22 2 70.34 CAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCG:1 - chr3R 19537460 3' + hopper 1373 2 56.85 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTC:1 + chr3R 5087140 3' + P-element 2807 1 30.07 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCCATTACTTTCCA:1 - chr3L 22518984 3' + pogo 2065 1 52.03 AGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCGGAATGCGTTTCTATGACTCTTCTAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGCAGAATTTATCTTTAGCTCT:1 + chr2L 6716407 3' - hobo 29 1 53.72 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGACTCCTT:1 + chr2L 21082206 3' - mdg3 75 2 66.44 GAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTATAAACGCGGCCAGTCACGTGCCACAAAGGGGCACTGAAAACCCCTGGTAAAGGACCTTCACAATAAAAC:1 + chr3L 5023512 3' - roo 213 2 53.42 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAA:1 - chr3R 5087094 3' - P-element 91 1 23.29 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGGAAATTCACATTCGAAGTTGAATTCTTACCATCTGCCGGCA:1 - chr2R 12416861 3' + pogo 2052 1 64.10 AACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCGGAGTTGATGAAGGAATACGACAGTAAATCGAAGGTGTTGCAATCG:1 - chr2L 19343938 3' - FB 76 1 69.18 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTAGCCCGTCTTGGCGAACAAAACTTTTTTCGTGTCCACAAATTGAAAATATTTCACAGTCATATTTAATTTTGGCAGAC:1 + chr2L 2675079 3' - Quasimodo 37 2 59.59 ATTTGCAAAAAAAAACTGTTTGACACACCCACTCTAAAGCCTTAAAGCAACCAAGCCATGCCTTTCAAACAATGAATGAACGAAAACGAATGAATCTTTCAAGTAACTCTGCGTTAGCACAATGTAATGTTTGTAGTGTTTATGTG:1 + chr4 520198 3' + INE-1 320 1 67.12 GTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCTGAAGCGGCAGAAACTCGCCCAGACAGCGATCCCAATCCCGATCAATGCACCTTTGCCAAAGGTGCAACGCCTCGAAAAGTCGGGTCTTTATATTCCAGCAC:1 + chr3L 16195755 3' - Doc 473 1 75.17 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGTCTAAAAATAGCCACAGCGAATGCAGTCCAGCACACGAGCGGCC:1 - chr2L 20716293 3' + P-element 2868 1 72.60 ATTAATCTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGAAATTT:1 + chrX 18193851 3' - hopper 20 1 67.81 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTATGTACTTGGCTGGGGGACGAGCCTGCCTGCAAAACTCCCGCAACATTGCGAATGTCAAGTACGAA:1 + chr3R 15346963 3' + hobo 2917 1 56.25 AGATACCCGTTACTCAGCTGGTTTGAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGCTAGATATGCCCGCAACAAGTACGCAGGCGAGGAAAATGCCAAATTGCATACGACTGCGTCACTCTTCGCGAAGAGCACC:1 - chr3L 590337 3' - INE-1 542 1 51.39 ATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACAGTAGACCGGCATTATGTTTGTGCCCCATTTTGTGGAAGCCCACTTGCTCTCTTTCCGCCATTAATGGGCGCGGGCGGTG:1 + chr2L 3393862 3' + Stalker2 381 2 60.77 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGACGAGGAGGAGGTGGAGCGGCCTCAGGCGTCAAATATTGACGTGCATTCAAT:1 - chr2L 20327557 3' + roo 9055 2 70.55 ACGGAGAGACGTTCTCCCACCATATCTCCCAATCTAGGAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCAGTGACAGAGGAACCCCCTGTTACCTGCAATTAATTAATTTAATTTAATTAATTTATACATACAAGTTCATACTTT:1 - chr3L 24736271 3' + gypsy6 7691 4 68.49 TTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGCCCTGGAATATCATTTAAATTTCCATTTAAAGTCGACCACAGCCC:1 - chr3R 6578670 3' - F-element 88 1 71.23 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTGAAAATCTTTAGAGATTTCGAGTGTTCTGGAAAGTAGGAAGTTTCCGGCTTCA:1 - chrX 7624056 3' - roo 8730 2 63.01 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCT:2 + chr2L 15601619 3' - Doc 82 1 73.29 TTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGCTTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGACACAGCTT:1 - chr2L 42505 3' - copia 68 2 67.81 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAAACACACGCTTCAATGAGAAGGTTTTACCAGAAGAATATCGTAGTTTTAAAACAGCGATTATGTTTATAGAAATGTGAATGAATCGGGGCAATGAAAG:1 + chr3L 12255120 3' + roo 391 2 41.10 TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGACATTAAGCCGACATATACACATAATAAACGCTGCATGTGTTTGCGTTGCGGTCTCAGACGGAACCAAAATATTTGGACACCACAAAGTGCAACAACA:1 - chr2R 18067384 3' - blood 7033 2 67.81 GTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACACTTACTTGCCCTCGGCTGTATGTGCTGAACAG:1 - chr2L 3393772 3' - Stalker2 88 2 76.71 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTGAAAATCTTTAGAGATTTCGAGTGTTCTGGAAAGTAGGAAGTTTCCGGCTTCAGTGGGTTTTATGAGTAATTTGG:1 - chrX 7624034 3' - roo 8708 2 56.16 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTATGGCAGTGTCAGCTTTTCAAAATGTGCACATCAA:2 - chr3R 13231728 3' - F-element 64 1 47.95 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATATGGAGTTGTACTCTTAGTTTCATAATCATAGTCGGGACGGTTACACTCACCACTCCACTCCATTCTCCG:2 + chrX 22517752 3' + 1360 3387 2 74.66 AGACTGTTCCAAGCATAGTTCTATGGTTATAAGGAGGTAAGGAGGTAATATACGGTTTGCACCCCAATTACTAGGAGACGAGGAGATCAATGAAGTTAAAAGAATATTAGATCAGAATCAATTACCTTACACACACTTTGACGAAG:1 + chr3L 24706384 3' - Cr1a 4022 1 54.79 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTATTTTCTTAAAAATATAAAAAAAAATGTAAAATGATTAAATATATTGTTCAGTGTATGAAAGCAGAAGAAA:1 + chr3R 12936192 3' - F-element 64 1 63.01 AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTGGCATATGCAAAG:1 - chr2R 20117297 3' - mdg3 5322 2 66.90 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGTCCGCAATTTGCGCGG:1 - chr2L 19907571 3' - hobo 81 1 74.31 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGCAGGTGAGTTTCCATTGTCCGCTGGTTCGGCTTTAATATTGATCGCAGGAGTAGTGCTTGT:1 + chr3R 15363534 3' - 412 7077 2 66.44 ATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGTCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATATATATATTTTTTTTCCCCCTTTTCTTACGCCCATGTTTTTAGAGCAAAACGCGAACGTGAATTGTACTTGGCG:1 + chr3L 11903325 3' + micropia 413 2 54.79 AAAAGGCTAAAAACAAAAAAAAATTTAAGGAAAGAACCGTGAAAATCGTGAAGATGTCGGCATGGCATGGCAGGGAATTGGAATT:1 - chr2R 16712684 3' + G2 3068 1 63.53 TATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATT:1 - chr2L 2336216 3' + 297 336 2 64.38 GGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAATAGAGTTTATTAATTAATCTTAAATAACTTTGGAATCGGGGATGATGGGGCAGAAATGGGAAG:1 + chrX 17466490 3' + R1A1-element 5087 1 55.94 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCACACAATGCAATTTAATATAGCATAC:1 - chr3R 22266404 3' + roo 9041 1 61.64 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGCGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGC:1 - chr3R 19537461 3' + hopper 1381 1 58.39 GTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAAATACACTTTACGAGATGTAACCTCTTACACGCACTCATTCCCTG:1 + chr2L 13763558 3' - Bari1 79 1 69.18 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGCCATACATTAAGCAGCAGTTT:1 + chr2L 18848812 3' - blood 7073 2 60.27 TATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAATATTTAAAATACTTAATAGTCATGTTCAAAGACGAATCAAAATAAGAGCTTCCGACTTTCGTTCAACAGCAAATTTTCAATTATCAGGTAAAAAGTTCAA:1 - chr3R 4869377 3' - I-element 5135 1 74.64 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATCTCAAAATGCAAAAAAATAGTATATGAAGTAAGCTACAATCTTGAAGTGTTGTACTGTGTAAATTTGC:1 + chr3R 10769672 3' + 297 347 2 53.42 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACTAAAACTTTAATTTAAATAATGTAAATAGGCATATTTTGTTGTTCAACATTGCCAAGCTATTTTTAACAAATTCATTGAAAC:1 + chr2L 20910412 3' + roo 9034 1 60.27 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATGGTAGGCGAAGGATGAATGTGG:1 - chrX 16995021 3' - jockey 61 1 53.10 AGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATTGTATATACTTCAGGAAACGAATTGACTC:1 - chr2L 13976206 3' + I-element 5263 1 78.08 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAATCGCAACTAT:1 - chr2R 20931644 3' - blood 75 2 69.18 GGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCT:1 + chrX 12649915 3' + blood 7154 2 86.36 TTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGACAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCTAAGCAGCTTTGCATTAAATGTATCTAAAAGATTTCGCATAGTTCACCACTCAGC:1 + chr3R 5152652 3' - invader2 254 1 67.12 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACAACTTTCGAGTTGCATATTCTTGTGTCGTTCGCTTTTGGCAATTTGTTTCTGCATCCAACAACGGATTCAATTGAAAATTTCGGCAGACACTCGGCAAATTTAA:1 - chr3R 28051422 3' - opus 22 2 71.23 ATTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATACTGTCAGTGTCTTCCAGTGCATACTGCACCTGGCAT:1 - chr2L 9642466 3' + I-element 5118 1 73.19 GCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTGGGAAAAAAACCCAAAACGAAACACTCAACTCCCGACCCAAATACCTATCGTATGGTAGATATATATGCAATACATATATATATAGTTTTGGGTGTT:1 + chr3L 19066474 3' + Max-element 8510 2 66.44 TTTATTTGTGCTTTATCCCATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAATTAAAAATTACCAAATGCATCTATGAAATTTAT:1 + chr3L 1397058 3' - Juan 4202 1 48.94 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATTTTTAATGCGATGAAAGGAATGCGAGCGTATTTGCGAGTGTTT:1 - chr3L 16523201 3' - jockey 82 1 68.49 CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCTG:1 - chr2L 15523916 3' + opus 437 2 63.01 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTGAGTCGGCCGGCC:1 + chr2L 20716437 3' - P-element 51 1 49.29 GCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGTCCGCAATTTGCGCGGACTGCGG:1 - chr2L 19907564 3' - hobo 58 1 65.62 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTCCGCACTAGACGGACAGGTAACACAGGAT:1 + chr3R 5684189 3' + pogo 2064 1 60.27 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCATTTAATAATAATGTCAAAAATATCTTTTTGAACTCGTGGCCCAACCCACATTATGTCGTTCAAACTTTTGTTATTCGTAGTTTTTGCTGAAGCATCAAAAACTACTC:1 - chr3R 19445252 3' - roo 8677 2 76.71 CTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGCCGTTCTCTTCGCCGCAAAA:1 + chr3R 25138012 3' + P-element 2788 1 17.81 AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCGGGGTGAG:1 + chr3L 10111851 3' + copia 5054 2 64.38 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGCAGGTGAGTTTCCATTGTCCGCTGGTTCGGCTTTAATATTGATCGCAGG:2 + chr3R 15363522 3' - 412 7089 2 58.22 TGGTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACATTATGAAATACTCCTGGATACTTTTTACAAATTCTGAATAATTCAGGGCAATCCAGACAGTCGTACAACTCGCACAACTCAGGGCGATCTTTTAATTCAAATAACACCTCCGATAG:1 - chr3L 27413036 3' - Stalker 9 4 55.48 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATATAAAATTAATGGCAATCTGGCAGCGTAAACACGACAAAATTTGTTTCTCTAGCCGCGT:1 + chr3R 18114956 3' - 297 6608 2 56.52 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATATTTATGCCTTTTCGCAGGGCTGAACTTCTGAGCATGAGAGATCACGGACATCATCCCATGGGACCCGTCGACTACTTCAGCATTAAGATCAGCTTT:1 + chr3R 17069027 3' - mdg1 12 2 73.88 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGTTTTACCAAAGTTTCGAAATTTCATCACAAGAGTAAATG:1 - chr2L 5656504 3' - hobo 23 1 69.86 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGTGTATCCTGGCAAGCGCACATACTCACGCACGCATACTATC:1 - chr3R 23565243 3' - jockey 66 1 57.53 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAGCGTTTGCAAACGTTTGGTGTGAATGAATTCCTGAAAGTATGCAA:1 + chrX 15137348 3' - jockey 4746 1 68.49 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAAAAACCGCTTTCTAAAACTGTATTTTTAGATATAACAAGTAAAAAATCGGAAAAA:1 - chr2R 11371269 3' - pogo 65 1 63.01 CTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATCTTAATGCAGATCCATGTTATCATTGGGATAGTTCACCATTGCTCTTACTCGGCGTTACT:1 - chr3R 7364197 3' - Quasimodo 53 2 57.53 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGTTATTCGCCCTGAACAAGCAATGTCGGTTAAATCAGTTTGTAATGATTGGAAGTCAACT:1 + chr3L 24987443 3' + transib2 2764 1 73.29 AAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCAGGGCATTGTTTTTGCTACCAATCTATGTGTGTCTGTGTGTGTGGGCCAAGTTATTAGATTCATTT:1 - chr3L 17142802 3' + hobo 2884 1 54.11 CCCTGGGTCCTACCGACCAATCAGTCTCCTCCCTTCGATCTCGAAGGTGTTTGAGAGACTGATTGCAGCCCGGATGGTCAGGATTATGGAAGCGAAGGGTATATGGTCGATGACGGAGCTTGGATTAATATTTTCACATTGAC:1 + chr2R 20156760 3' + BS3 424 1 70.63 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAGTCATTCGGAAACTTTAAAGCCCGAAAGCATGCAGCACAAAATCGTAATATCAACTTTTCAAAAA:1 + chr3R 11568685 3' + BS 5045 1 53.24 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTAATCGTAATTAATGAACATGTAGGTATAGGTAGGATAGTAGGTTCCTTTAACTTATTTGAAAAAGAAGCAAATACATAGATTT:1 - chr3R 25052972 3' - pogo 33 1 62.33 AGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGGACCGCAAAGCGACCAGTGAAACACACAGAAATAGCACAG:1 + chr3R 15157729 3' + invader3 5448 2 70.55 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGTTATTATTAATTTATTAGTCTATGTATTTGTAGAACTACCTATATTTTTATTTAATTTTGTTG:1 + chr2L 9317776 3' - I-element 60 1 58.90 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATAGCCTAACACCAGGAGCAGCGTGGCGGAAAAGCG:1 - chr3R 25094638 3' + P-element 2822 1 30.65 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTACCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGAAAATAAGCCGATGCTGTTTCACGTGGCGTATGAGCAATATGTACGCCAAGA:2 + chr2R 8492831 3' - pogo 65 1 65.07 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAAACATTAATATGCTGGCTGAAGTTTCGGGCA:1 + chr3R 13198322 3' - Doc 27 1 70.55 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGAC:1 + chrX 17508918 3' - Burdock 57 2 60.27 ATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATACATATATACTTTCATGCCAAAAGAGAATTCTATAGGGGAAAAGGAAAATATTAGAAAACTCTGGTGATGCCCA:1 + chr3R 12952968 3' - micropia 5006 4 54.11 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAATTAAAAAAGAAAGCTGGCTGGCAGTTTAAAATGTTGATGAAGTAATTAGTTTAATATGCGAAATGCCCCTGATGGGCGG:1 - chr2L 2518482 3' + jockey 4947 1 50.00 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAGAGTTGCGGTTTGCCAAAGCATGAAAATACTGTGGGGCGGCAAAAAAAAAACAAAAAACGGGGAATATGCAATTGCAAATGGCGAGTTAAGCAAATG:1 - chr2R 20117411 3' - mdg3 83 2 68.97 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCAACCGATTTACACCATAACAATACACGAGTTCGTCGTTTCGGTTTCCCCCAATGTTTAATACAAATATT:1 - chr2L 21189707 3' + hobo 2903 1 56.49 ATTTATATTCTTGATCAGGATCGCTAGCGTAGTCAATCTGGTAATGCCCGTATGTCTGTCCGTATGAGCGCAGGATCACCTGAACTATAGAAGCTAGAAAGTAAAGAGTAAGCATATTGAAACGCGCTAATTGACAAGACGAGAGT:1 - chr2R 7458760 3' + INE-1 80 1 77.40 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGTGGTCCCAGGCCGAGCGTTCGCTCGCCCATGGACGATACACCCAGCCCCATAACATCCTAAACCCGATCCAGCCGGCAGGTGGTCCTCTGGAGGAGAC:1 - chr3L 25496911 3' - mdg3 5307 2 70.55 CTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAATATCAGCACATTTGTGTTGTGGGCGTGG:1 + chr3L 12623789 3' + X-element 4512 1 79.86 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTGGGGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAGATTGC:1 - chr2L 16360551 3' + hobo 2906 1 54.48 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATATATTCTGGAAGACCTTTAATCTATATTGAGATAGACTTTCTAGCAAACGCTC:1 + chr3R 7306002 3' + 412 7481 2 65.07 AGATCTCGACGTTGATACGGACAGACGGACATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTTACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGATATGA:1 + chrX 21587773 3' - INE-1 133 1 43.84 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGGC:1 - chr2R 14450145 3' + roo 9012 2 59.44 GGGTATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTAGTTTGTTTTAAATTTTGCGTCTTTCTGATAATTCAACATCCAGCAT:1 - chr3R 15157561 3' - invader3 52 2 57.53 AAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAATCATTTTGGGTTAACTAATTTTGGATTCTTATCTTGGCTGTGACACAAAAACACCACATTAAACCCAATTAATATTTCCACAAC:1 + chr2R 18905668 3' + jockey 238 1 58.22 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATTGACCCCGTTTCCGTTTTCGATTGCAATTCGTTTCAGTTTCATGCACTTTGCACTCTCCACAGCGGCAACCC:1 + chr3L 1983565 3' - Transpac 4964 2 54.79 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGCATACAACTCAATCATTTCGTTGTTGTTCGCCGTTGTGCAATTGTCTCGACCAATTTGTTTGTTC:1 + chr3L 11228186 3' + pogo 2049 1 55.48 TTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATGTTATAAAATGATTGGGTCCCATTTTTTTCAAAAATCCCTAATATTTAGTTTCGTTTGGAGATATATAGTATTTTTTGAATCATAAATGATTAAGCTTTGGTATT:1 + chr3R 7149874 3' + roo 8751 2 77.40 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCTACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGAAACCTCATCGAACTGAAGACAAGGCGTTTTGACTTTTTTTTATGCTGACGCTAACTCGAAAATAATTTGATATTTT:1 + chr2L 16360681 3' - hobo 44 1 51.37 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAAC:1 - chrX 19744426 3' + P-element 2818 1 35.04 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTACAATATTTATCAATATATG:3 - chrX 3637740 3' + roo 9037 1 61.64 AGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACAGTCAAAGAATTTCAAAAAAAAAA:1 + chr2R 18922638 3' + opus 7467 2 62.33 CTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCATTCGCTGCCAGTTTTCTCCTACACCTAAAGC:1 + chr3L 21043111 3' - Quasimodo 81 2 78.08 GGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAGCTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAATATCTTTTATGATAGCAAAAATTGTGAGCGTGGCACCGCCTGTTATATATTT:1 + chrX 22913224 3' - gypsy7 23 2 54.55 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATATTTCTTTTCTT:1 + chrX 8610358 3' - mdg3 20 2 71.23 GTAGTTGTTTGAAAAATTTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATAGACAATACCAAAAGACTTGGCGAGCTTTTCCTTCTCCTTTTGCCAC:1 - chr3R 19533925 3' - hopper 1038 1 58.77 CTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGATCTCGGCGACATGGGCGTTTGGCAAAAATCCCGCG:1 + chr2L 3377229 3' - roo 8895 2 70.34 TAGGGGGGGGGAGAATGTTCACGCCAGGAACAAAACCAGGACTCAGGATCCAGGACGACTGTCAACTTGAGCCTGACAAAGTATTTGCGGCTTGCTAGTCATTTTTCGTGTTTGTGGACAGGGGCAGAGATTGTGCGTG:1 + chrX 19060311 3' + Max-element 8221 1 89.21 AGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGTTGAGATGGATCTTATTTTAGCACCCCTCATAAAGGATTCCCATGACATTTGATGGTGAAGTTGATGAGTCACATGGGAAAGTTTC:1 - chr2L 5333330 3' - mdg3 5262 1 79.45 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTATTGCTCCCCTGGACGGAAAGCAGCAACGCTCCCCCCCCCC:1 - chrX 17531858 3' - blood 7067 2 67.21 CCAGTAATAATTCTCAAAATCCTAGACTGTGCTCGCTGTATACTCGCTCCATGTTTTGCCCGAACCCCAAATTGGTGCGATGGGAGTGTGTTGTGTGTATTGAGGTGGGGGATGATGTTTTGGTTAACCTGCAGTCATAGCTTGAT:1 - chr3L 5377213 3' - Doc3-element 4394 1 45.89 TGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATACTGCATAGTAGTAAAAGCGACTAAGTAACCTAAAACTACATATGAATCAACCCCTCAAGTTTATCAATTATAACTCATATATCA:1 - chr2L 14678710 3' - Quasimodo 28 2 65.75 GCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACATCTCACCAACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATTTTTTATCATTTGGCAACGGAAAATTAACGATAGCACTTGTCTTCT:1 + chrY 779984 3' + F-element 230 1 68.49 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAACGTTTGATAAACACATACATAAATGTAACGAGTTCATTAAA:1 + chrX 13351673 3' + roo 325 2 73.29 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATAACAAGAACACACTTATTCAATTTGTGATT:1 + chrX 10429883 3' + roo 9020 2 54.48 TGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATAATTAAATTAATATATACATAAGTAAGTATTTACGTACTTCCAAAAAAATTTTCTTAT:1 + chr3R 4570311 3' + Juan 4152 1 64.54 GGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGGGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGCATGGACATATATGAAGACTGGCACTTGAGCGGATAGAAGGAAGGGCGGGTGGTGG:1 - chr2R 15892135 3' + hobo 2876 1 60.28 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAACCTTTATGCAGGGGCATGACTGTCAGCA:1 + chr2L 12696262 3' + pogo 2073 1 66.44 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGTTTTACCAAAGTTTCGAAATTTCATCACAAGAGTAA:1 - 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pogo 83 1 75.34 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAACCCATAAAGAAAGCTTTAGAATTGGACGGATTGCTAACCCCTCAAAATACGTTGCATACCTAAATTGCTTATTTGGGTGCCATAACATT:1 - chr2L 19565410 3' + jockey 4960 1 63.70 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGTTGGGTGTTAAACTTTGCTATAGCCTCGTGGAAATTAAAGAAGCATACTTTTGGGATGATAACATATCTTGTGCGGATGAGCATGGAATTTGAATTTTAAAG:1 + chr2L 15097004 3' - jockey 4690 1 70.55 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGTTTCATATTAAGTTGCTTTAAGTTTTGCATTTGTTGCGTTCATAATTAGACAATCTTTTTAGCATTGCAACATAATGT:1 - chrX 2821842 3' + roo 9030 1 56.85 CAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTATCATTTAAATTTAATTTATAAATCATGAAGTTACTTGAAAGTTCACGTTTTGAGGCTATCAACAACGCTC:1 - chr2R 1516575 3' - Transpac 4971 2 53.42 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACTGTTGACGTTTTTGGGGAAAGGGTTGCCAGCTAATGCCGCAAACATCGTGCCGATGACAGAACTATTGTAGGTGATGAGCTC:1 - chr2R 8467701 3' + roo 9034 1 59.59 TACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGATGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCA:1 - chr3L 15374645 3' - 3S18 86 2 73.29 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTAGAATTTATTCCTGTTTAAGTTTTAAGGTAGCTAGTTGAGCTGTTTTGACTGTAAGTGTC:1 - chr3R 18539783 3' - roo 62 2 63.01 TGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACACTTACTTGCCCTCGGCTGTATGTGCTGAACAGATATTGGAAACATTCTA:1 - chr2L 3393755 3' - Stalker2 7319 2 65.07 TAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAAAATAAAAATAGCAACATAGTTTTGGGACTCTAAATTAAGTATTATTAAGTATTAATTTTTGTTCTGAAACCAAATTTTCAGCTTGCTAGCTGTAAATGAAATCCCTGTTCT:1 + chr2L 16567021 3' - F-element 474 1 70.55 ATATAACCAAAGACACTAGAATATTAATTTATTATTATTGTTATAGTATAACATCTCACAACCCCTCCATAAAAACCAACTTCTTTTCCAGGGGTGCCTGGGATTAGCTAGAGGATAATCAAACTATACGGAGC:1 + chr3L 18284386 3' - Tc3 317 1 60.45 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGAGCAAAGAAGTCAAATATTAGCACAAACACATTTGTGCACATGCATACATACATATTTGTATCTACCCACATTGA:1 + chrX 19506190 3' + P-element 2844 1 55.86 TATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTATTTCAACAAATATAGAGGGAGAGAAGTAGGGGCACAGCTCCCTTTT:1 - chr3L 13567978 3' - copia 74 2 71.92 CAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCATCAATCAAACTGTCACCAATCGCAGCCTTAGTTTAAGTTGCCT:1 + chrX 998209 3' + copia 5047 2 71.23 CTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCGTATATTGGTTTATTACAGTGGTCCATTTGGGTAACTAAATAGCTTATGGTTAG:1 - chr3L 5425478 3' + blood 7305 2 76.76 AGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCAGGTGTATAGACCTTGTCCAAAAAGTAGGCTACGATTTCT:1 - chr2L 6716323 3' + hobo 2872 1 68.70 AAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCTATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCATGTTGTTATTCGGACCTGCCTTTCACTTTTTTTCTGCTAAGC:1 - chrX 4944880 3' - FB 79 1 71.23 AAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAAATACACTTTACGAGATGTAACCTCTTACACGCACTCATTCCCTGTTCCTTTGTCACTTTCAGACTTTGACGAACTCTCACAGAAAATAAAAGGGAGCCACAACA:1 + chr2L 13763618 3' - Bari1 18 1 73.79 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTAGACATTTGCTTATATCTGCAGAGCCATCTCATCATACAATCACCTTATATTACAAACTTATTAGGGAACAGCAAGAGCTAAG:1 - chr2L 5723831 3' - flea 31 2 66.90 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGCATACAACTCAATCATTTCGTTGTTGTTCGCCGTTGTGCAATTGTCTCGACCAATTTGTTTGTTCGTCAGTTCGTTAGTTACTTT:1 + chr3L 11228206 3' + pogo 2069 1 63.70 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCCAAGGAAACCCAACAAAT:1 - chr3L 12775920 3' + roo 391 2 73.97 TTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATGCAACGACATCGAGAATCGGTCTAACTGCAACTCCACTCAATTGGAGTGC:1 + chr3R 6543734 3' - 1360 3253 1 66.44 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATATTTCTTTTCTTGATAAGTATTA:3 + chrX 8610369 3' - mdg3 5261 1 78.77 AGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATTCTGGCCATATATATACTTAAGTCTTTAGCTTAGATTTAGCCCAAAT:1 + chr3L 13539494 3' + R1A1-element 5162 1 67.81 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAACCCTCCTCTGCATACATATATATATATCTATATATATAGACAGAGAGAGAGATATATATATACCTATATAGTGCT:1 - chr3L 5947986 3' - P-element 43 1 29.45 CACGTCGGCGATCGAATTGTATTTTCTTAAAAATATAAAAAAAAATGTAAAATGATTAAATATATTGTTCAGTGTATGAAAGCAGAAGAAAGAGGAGGGAATCCGGTTCCTCTGAGGGGGCAATAAAGCGCTGGTAGAAGCAGCAG:1 + chr3R 12936247 3' - F-element 9 1 64.38 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTTTTGTGAATACATGCATACCTACCCGAATAAACATAGGCGCAGCAAGTCTGCGTTAGCAAATACACT:1 - chr3R 24760521 3' + pogo 2050 1 56.16 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTATTTATTATACCAGCTGTTCTTCTTCGTTTCATTAATTTTGTTGCTGTTGTGCTTCTTTAAAGCCTT:1 - chr2L 13102855 3' + roo 9019 2 54.79 GCCCACTCTAATGCCCACAAACAGCACAAAACTGCCATGCCCACACTTTTGAAAAATGTGCTAATATTTTTTCATTTCATTTTAATTAGTCTTGTAAATTTCCACCGATTTTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAC:1 + chr3L 23747153 3' + INE-1 218 1 53.42 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATCTGTTGTACTTTTGAATGTCAAGATAAAGAACTCCAGAACTACCAGATCTGATTGTGGTTGTAATTATACAATAGGAACATACATACATTTCATAAAGCAGAA:1 - chr3R 12540439 3' + roo 9051 2 64.38 AAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAATTTTAAAAAAAATTTTTCCCGTTTCTTCGTTCTTCCCAATTTTT:1 - chr2L 9188728 3' + Doc2-element 251 5 43.94 TTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGCAAATGAAAACTCAAGTGCAAAATGCAA:1 + chrX 17508950 3' - Burdock 6161 2 68.49 AGTTATATCTATATTAATCATACCTTGACCTTTATGTGCCTTTTTATTTGCTCCTCGGGACCATGATAGGATGTCCG:1 + chr4 907106 3' - transib3 291 1 89.61 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCAT:1 + chrX 12995393 3' - blood 76 2 69.18 CTTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAATGCTTGTGTCCGCACTTCGAGGGGTTGTTGGAATTTGCAAGTTTTTCTGCTCTTGGGCTTTGCCCAGCACGCATGAGTAATTTTTCCAATTTTTGTTTCACATCT:1 + chr3R 16684372 3' + 1360 426 1 63.01 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTCCGCACTAGACGTACAG:1 + chr3R 5684177 3' + pogo 2065 1 53.38 TAATATATGTTTTTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGTGTGTGTGTTTGTGAGGTGTGTTGGGTGTGTCTTGATGGCAACCTGGACCTACTGTGCTAGCGTACCCATGGGATCCCAGGCAGGCAGTACGATCGG:1 - chrX 8440713 3' + BS4 665 1 58.04 TATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATATATATATATATATATATATATATCCTTGATAAATGATTCGTTTGAAGATGTATCTCGCAAGAA:1 - chrX 10525058 3' + flea 4962 2 68.49 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGACGCAAATTCCGACCGCTCGCCTACAACAACAGCAG:1 + chr2L 851044 3' - P-element 81 1 29.17 ACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGATGAATTCGGGATCGGGGATGAGGCAATCCTTTGTGTATGCCGATTCAATAAAACACTTATTGTGGACAAATTTCGACATATTTCAAGCGCAGTTT:1 - chr3R 4353967 3' - Doc 493 1 68.49 GCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATAATCGCATTTTACTCAGCTGCCCCAAGCCATAACT:1 + chr2R 5800551 3' - HMS-Beagle 6877 2 73.97 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTAAAGTATTTCAATCGACGGTAGGCAGTTTTG:1 + chr3L 22635812 3' + hopper 1391 1 68.49 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACAAATTTTGGAATTCTATCCAATTTCATATTGCTGTGAAGAAGTTGTTCTCTGCCGATATTACTATTTAACCAGTTTGTGAATAT:1 + chr2L 2621610 3' - BS 5081 1 56.85 GGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCT:1 - chr2L 12325028 3' - jockey 4624 1 61.38 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAAAGTATATACCATCTGCGACAAAAGGTACACTTTCATGGACTTTTCTACATATATAGATGTATAT:1 + chr3R 6171231 3' - 297 49 2 58.90 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATGCCAGCTTCCTGCTAAAATCATTTTCAGATTGCCAGCCAGG:2 + chr2L 8807974 3' + HMS-Beagle 219 2 67.12 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGAGAGATGGGAGTCTCTAC:1 + chr3L 17896001 3' + P-element 2818 1 39.73 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTAGAATTTATTCCTGTTGAATTTTCGCATTAAAAATTATGCTCCTCACTGCTTTG:1 + chr3R 18534168 3' - roo 68 2 65.75 TTTACCGTTCGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGTTTTGTGTTGACATTCGTGGGAAATGATCGCAGGTTAATTAATTTTTAAATCCACAGGACCATAAGTGATGACTTGAATACTGACTAAAGCATTTATGTTTTTGGCTT:1 - chrX 20479463 3' - Copia1_DM 173 1 72.60 CACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAAATTTTTGACATTTAATTTAA:1 - chr3R 19144381 3' - Juan 48 1 47.26 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCTGTAGGCTCACCTACTCCTCCTGCAATCGAAAAACAAAATCAACAGGTGGCGCGCATATTTCAAC:1 + chr3L 5948118 3' + P-element 2834 1 48.63 TGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTATAAAAGTATATTTCCAAACGAATATGTGAATAATTATATTAAAAATGTCAAGACCGAGAAGGCATTAATGATGTTAAGGTAGCAAGCAAGCCTTAAA:1 - chr2L 13726738 3' + R1A1-element 98 1 63.70 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATGCAAACATGCATTTCACATGGGGATACATTTCTGTCCCAACTAGCCCGGCTGCTAACTGCTGAAGGGGAATGGGGATGGCTGTTTTT:1 + chr3L 5329216 3' - 412 35 2 61.64 CTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATGTGCTAATCTCTAGATTCGAACTCACCTCGTAGAACATATACCCACTGAGGGCCACCTGG:1 - chr3R 22572552 3' + HMS-Beagle 184 2 58.90 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCCTATATATACATAAGTATAAGCATTCGTATATACTTATATATATATATAGAGACACAGTATGTCGGAAATATTTGATTTT:1 - chr2R 17341087 3' - hobo 25 1 56.15 AGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGAAAGCTTTCGAAAAGTTAATTAGTTTCTATTCTTTCTAATAAAACATTCTTTAAATAACCCAATTTATTTCG:1 - chr3L 11493070 3' + Max-element 25 2 50.68 AATCAAAAATCCCTTAATTTTGCATTACATTTTAAAGAATCTAGTATACCCTTTTAATTGTAATATAAATCACATCCGATATAGCACGAACTGAGTAATCAGGTACAAAGGATTGTCGTATTTTTGAGTCCATATTTAGGGACTGC:1 + chr2R 3901284 3' - S2 60 2 67.81 TCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTTAGAGGTAGTCGTT:1 - chr2R 15529665 3' + roo 376 1 63.70 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTGTCATTTTAAACTCCACTCCTCGTAGTGACGAAGCGCACCACATACGACTACATATATATGTACATACATAGTATGTATTATATATATACATACATA:1 + chr2R 17083723 3' - roo 22 2 39.73 ATTTTGGCCGTCACCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTACGTGTGTGCAAGGGTGACAGCTGTCGCCCCAGGGAGAGCAATGTAAGTGAGTAATATTTGTTTATGTG:1 - chr3R 17079401 3' + 1360 3327 1 48.63 CGGGAGGTGATTAGCGCGGTCATAGGCCTCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTCAGCTGCATTTACCAACGCAGACTGCGGCGTCTTACAAGCGCTGCATTATATAATTTCCTTCTCCCAGGACATGTGGATGAAAGGTCGCTGC:1 - 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chr3L 11887216 3' - Doc 84 1 73.29 CTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATGGTTTCTGCCTTGGCTGGGTTTAACAAATCGTTGTCTATCGTGGGCAACTGCATTTCGGTTCTTCCGTT:1 + chr2L 18445060 3' + hopper 334 1 71.92 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCTCCCTCCCTCCTCAAAAACGCCAAAAACACTCGACGGTCGTCGTCACACCGCATTCTAGTCCATTACGCAAAAATTACGTACGGAG:1 - chr3R 26845496 3' + mdg1 7423 2 60.27 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAGTTAAGTGAACTTTTGCCGGCCAGGTGAATGCAGGCAGAATATCAATTGTTGATTGGTTATTTGATGGGAAAAGATGACAGGCTGTTTATTGTAATGAATT:1 - chr3L 19702702 3' - pogo 14 1 76.03 CGGATCCACCGGTTGAACCACAGACATATTAACACCCACACTTCCTTTGCCCACCATCCATCTCCCTTCAAAACCGCTTTCATTTGTATATAAATACATTTTTCACTTTTGACCTTGTGGCCAAGCATCGCAAGATGCATCTCTTT:1 + chr3R 9401969 3' + transib4 2382 1 73.29 AATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTT:1 - chr2R 15529678 3' + roo 374 1 59.26 TTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATGCTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCAACGCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCGAA:1 + chrX 11906340 3' + HMS-Beagle 189 2 60.27 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAAATAAATGCTTATAAACATGTTGTAATCCTTTAAGTTTAAATTGCTTGTAAAATATACCA:1 - 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mdg3 76 2 76.03 GACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTAT:1 - chr3L 25232695 3' + accord2 200 1 78.08 GGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGACTGACGTACAACTTTCAAAAATA:1 + chr3L 23839752 3' - McClintock 5983 2 63.70 AGTCTTTTAAATTTCTATCGATTTGCCCAAAAAACTTACCCAGCCCACTCTAAAACCCACAAGCCGACAAAAACTGCAAGGTCTACACTTTTTAATAATTTTTAATTTTTTTTGTAATGTAAATTTTATTCAGTCAGCATAGATTG:1 - chrX 187232 3' + INE-1 300 1 76.03 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACAC:1 + chr3R 18539855 3' + roo 8983 2 80.14 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCTGTTCTCTGGGCTTTGTTTTAGTTGTCAGACACACACCCTATCCTGC:1 + chr2R 22795211 3' - hobo 74 1 67.81 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGGTGCACTTTTTAAAAGTGTTTTTCTAACTAAATGAGAGCATGCTCGC:1 - 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chrX 8610174 3' + mdg3 5480 2 73.10 TTTTTAATTGCTTCAACTAGGGTCTCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTTTTTCGTACATTCCCCTGGACAAAAGTCCCCAAATGGAAAACAGATACAGAAGAAACAGTTGCCTTGGAAAACATGTGAGGAATCAGGCG:1 - chr3R 4360142 3' - Tc3 1317 1 60.87 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGTGTATCCTGGCAAGCGCACATACTCACGCACGCATACTATCGCATTGTTTATCTTTCACATTGTTGACACAACTTTTGCAGGGTATTCC:1 - chr3R 23565195 3' - jockey 17 1 77.40 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTACATTTCCGATATTTGGACAGTGTGAAAGCAATACGTTTTGTTACAAACATTTTAATTA:1 - chr3R 11873341 3' - 412 7115 2 60.27 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGGTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAGATTGCAGTGAGCGTAGTGG:1 - chr2L 16360537 3' + hobo 2908 1 60.96 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAAAGT:1 - chr2R 11609909 3' + roo 8984 2 80.82 AAATATTCTAATATAAAGCCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATATGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAACGTGAAGCTGAAGGCCGACAATGTTTACGCCAATTTGGGTAAGTTAAAAAACAAACCA:1 + chr3R 19127212 3' - 1360 387 1 60.27 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGACATATTAAATGCCTGCTGTAAGCGAAAATTCTAAA:1 + chr2L 22032036 3' + Tabor 400 2 74.66 CGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATTAGATTTAGATTTGGATTTGGATTTGGATT:1 + chr2R 17797796 3' - FB 755 3 79.45 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTATTTGCGAAATTATAAAACAAAATTAAAATGCGGTCCAATGCGAAAATTGTATTTTGCACATTTGCTTAACTCGCCATTTGCAATTGCATATTC:2 + chr2R 20117424 3' + mdg3 5473 2 70.55 TCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTT:2 + chr2R 12642724 3' - pogo 75 1 69.86 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGAACTACAACAACATAAACTGCATGTCGTAATACTGTTGGTGTAATAAAA:1 + chr3R 7109238 3' - P-element 55 1 48.63 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACGTGGTGAGCGAGAGAGCGAGCAGAGGGGCATG:1 - chrX 13642007 3' + P-element 2862 1 63.49 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTATATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGTAGATGCTGGTCCAGAA:1 + chr2L 19800978 3' + roo 356 2 54.11 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTC:2 + chrX 8610343 3' - mdg3 35 2 60.96 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATGGTAGGCGAAGGAGGAATGTGGAA:1 - chrX 16995019 3' - jockey 31 1 59.32 GAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACTGCCGG:2 - chr3L 25232687 3' + accord2 208 1 83.56 ATTTGGTCCTTTGAGCCGGATCGATTCATCCTACCTTTATGGTCAACTTTCCCACGCAACATTCATTACTATCCAAAAATCCATAGATTTTCGAGCGCCAATATACCCAATACATAGTATTCCCCCAATTCGACATCGTTTGGTAT:1 + chr3R 30780066 3' + GATE 273 1 74.66 GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGGGGCTCAAGTCGAAGTTGTTGTAATGTCGAGAGACCGAGACCAGAAAAAGCCCAACAACG:1 - chr3L 17895912 3' - P-element 25 1 57.80 ATCAGTGTTGTGTTGCGACAGTAGAGCGCGAAATTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAATTTAGGCGTTTAAGTTCGATCTTTACGTTGTAGTTGGCCGCACCAGTCGACGAGCCGTACAGT:1 - chr3R 17388464 3' + Rt1b 61 1 53.12 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACACTTTATGAATATTAAATAAAATCTCTCAATCGAAAAGGTTGTTTTTATT:1 + chr3R 13411884 3' + roo 8996 2 69.86 ATTTGTTATATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTCAGGGCCAACGTCTGCTACGAAA:1 - chr2L 23372483 3' - gtwin 6943 2 67.12 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAATTTGGTCACTCGCATAAAGCAATAAAAATGCAATGCAGCCACGTCTCCGTCTGGAAATGC:1 + chr2L 15057312 3' - hobo 12 1 76.03 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGACAAACTCGGCTATCCGTCGAACCCAAACCATAATAGAGTGGTGATGGGGAGCA:1 - chr3R 6603758 3' - pogo 65 1 63.01 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTCATTGTGGCTTAATGCACAGTTCATAAAAATATATGACTGTAAATGCAAGTGCAATATTTGCTGGCTGTGTAAATATTTACACAA:1 - chr2L 2622618 3' + roo 9035 1 60.96 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGTGTGTGTGGGCGCTGGACAATCAAAATTGCTAAGGGGCGTGCGCACAATCACA:1 - chr2R 14486473 3' + 297 6914 2 66.44 GTGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATAGTTCCACAAAAGTGGCACTATGATCTCTCTCAGTCTTGGCACCCCTTTAAGTTCTAACTTTAAGTTCAGCTCC:1 + chr3R 29952848 3' + invader4 320 2 80.14 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGTATTTAGGGATTCGACGCTCGAATCCTTT:1 + chr3R 11550303 3' - F-element 60 1 52.74 AATAGCGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCGTAATTTATTTATTGGAATTAATTTATATAAGACAACTACAATACAAGTTATTTTATAAAATTATATGAAAAATTC:1 - chr3L 16204294 3' + baggins 4995 1 52.05 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCGAACGTCATCCTGCAGCAACCTTCGGGTGGTTTGCCACCCGCGCCCCCCTCA:1 + chr3L 939719 3' - hobo 69 1 64.38 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCCCTGCAAAGAACCTAGTCGTAAATCAAAAGATTGTGGG:1 + chr2L 9988168 3' + hobo 2890 1 66.35 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGAGCGACCCTCGAAAGCATTTCAAACGAAAAGCACATGACTGCGATCTCTGCCGTATTCCATTGATGGGATTTGAAGTGAGCGAACG:1 + chr2L 1892394 3' - hobo 37 1 60.27 AGCTGGAATCGTTTGCTCATTTGTTGTCTTTATTTGCCCACGTTTGGCATACCCCAAATATCGATATATTTCCCATCAAAGGCAAAATCGATAAGTTATCGTTAACTAAACATCCACAGATTGTAGTTCGTCTAATAAAGGTGTAG:1 - chr4 466776 3' + FB 48 1 68.49 GGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATAGTTCCACAAAAGTGGCACTATGATCTCTCTCAGTCTTGGCACCCCTTTAAGTTCTAACTTTAAGTTCAGCTCCTT:1 + chr3R 29952850 3' + invader4 3081 2 81.51 TTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAAATTTTTGACAT:1 - chr3R 19144390 3' - Juan 57 1 53.42 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTAACTCAAGCAATTCAATAACAATAACTAAGTAGAAATTCTTTTCAAAATAATACTATACACGAATCCTTC:1 - chr3R 18514313 3' - pogo 48 1 53.42 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACGTATATGTGCACATATATATTGCAGTGCAGTCAAGGTCGTGTGAAAGGGACGACAGTTACGCGGCATTACTCT:1 + chrX 13484225 3' - hobo 49 1 52.74 CACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACACAACTATATTATATGCGCCTACTGATTTATTACTTTAAAGAATAATAATTTTTTTTAGAACTACTCTTCTTTTGTCTCAAATCATTGGCTGTTTTTACTGCC:1 + chr2L 9499388 3' + Transpac 285 2 60.14 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCGAACGTCATCCTGCAGCAACCTTCGGGTGGTTTGCCACCCGCGCCCCCCTCAGATAGTGCTGCAA:1 + chr3L 939732 3' - hobo 55 1 55.17 TTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTAGTGAAAGCTTGAAAGTGGAAATAAATCCTCCCAAATTTGATACCGATTCAA:1 - chr3R 11163022 3' + mdg1 353 2 61.64 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTTTGTTGCGTTTCGGGTTATATGTATAGCAAACATAGTTTTAACAATTTTGGTGAAAATGAAAATGAAAT:1 + chr2L 20939619 3' + hopper 1365 1 52.05 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATAACAAGAACACACTTATTCAATTTGTGATTTTATCA:1 + chrX 10429889 3' + roo 361 2 53.42 CGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTTGTATATATTTTATAGCTTTGAGCCAAACAAACAGAGCAACAAAATCAACAAGCAGGCGACGATGCTTCAAAAGCCAAAGGCCCCTTTTATTAC:1 - chr3R 6472603 3' + opus 477 2 71.23 TGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGCTTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGACACA:1 - chr2L 42509 3' - copia 4941 2 70.55 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATGGTAGGCGAAGGATGAATG:1 - chrX 16995024 3' - jockey 65 1 55.48 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCCACAACTGCAGTGGCTTGGGAAGCCGAAGCCTTG:1 - chr2L 16202593 3' + copia 204 2 56.25 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCCAAACCGGATGTGCA:1 + chr3L 10069005 3' + 412 7498 2 52.05 GCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAAGGAATGCCGTTCATATACATTATTGTATTACACTATCGAAAACAATAAACCAAAATAATAAATCCC:2 - chr3R 11142183 3' - Max-element 8291 2 57.53 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTCATTCTGAAACCTTGTAAAATCTTTAATATTAACAAATAGATTTTTTTTGGTGCATGAATAAGTGTGTATGCTTGAAATTGCCAGCAACTGCTGCAAACTGTCAGCT:1 + chr2L 7167397 3' + flea 5003 2 77.40 ATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACATTCTGCAGTTATTAAACATGTAAAAAACGCAATAAATGGATGTCACTTTTG:1 - chr3R 24301765 3' - Tabor 13 2 76.71 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTACTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAATCGATGACGTACTTTTGCTGGATACCTTGCCGCTGCGTACTATATATTTAAA:1 - chrX 17600625 3' + 297 6959 2 63.70 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTAGAATTGATTTTCTATATTGCACCCAAGATCAAGCCTTTAAAAGTTTATTAAATTTCTGTTGAATATGCATAAATACGAGGTCAAGTATGTA:1 + chr2R 21244990 3' + roo 387 2 68.84 AACTTTCACTATACTGTTGAAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAATTGCAGCGTATAACTACTATAACTAACAAGGAGCAGCA:1 + chr2R 13052873 3' - Doc 72 1 55.97 ACTCTAACACAACGTGACCCTCTTTCATGACTTCTCTAATGAAATGATATCGAATGTCGATGTGCTTCGTCCTAGAGTGATGATTTACTGTGGGTAAACTTGTTCCATCACTGTTGTCACTTGGCGCCAAACAACTCTCAATGGAG:1 + chr3L 4877485 3' - 1731 4165 1 56.85 TGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGGAACAACAAGAGTGGGAATTATCCCTGTGCAGAATGGCACGAATGCTTACCTTTGT:1 + chr2R 5175987 3' - accord2 7335 1 64.38 GGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCCTTGGCTTCTTTTTCTTGTGGCTCCTGGCTGTTTGGTGGCATCTCTTTCTGGCCCGGTGTATTGTT:1 + chrX 5192268 3' + R1A1-element 4991 1 54.48 CGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGACTGATCTTAAAAGATATTGTAACATACTTTTATACCCTATTAATAATTAAGAAAATAAACTTTTATTACAATCATAAAAC:1 + chr2L 17297082 3' - Max-element 8276 2 58.22 CAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAACTTGTGAGGAGCGCATACAAAACTAATTGAACTTGGACAGCGTGACACTTC:1 + chr3R 8965285 3' - HMS-Beagle 14 2 76.03 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTGTAGTATGCCCCTCGTCATAAGGCAAACAAATGACATCGACTGACATCCTGTTCTGCTCGCCAGGATTTTGAGTTGCCTTCTTCGTTTTCGGGTTCC:1 + chr2L 2336363 3' - 297 19 2 73.29 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTC:1 - chr2R 24021549 3' - pogo 57 1 59.59 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCT:1 - chr3R 19589900 3' - BS 5043 1 49.32 TAATAAATAAGGTAAAAAGAAGCGGACTAAGGTGTCTCCCTTTCGGGACGTTGTGTCCTGCCATTCAGATATCTTTTATCAGGTTTCCTTACTAAATTAGGTGCCCCTGACGTAATTCCAAAAGATATACGTTTTTAATAATATAA:1 - chr4 266391 3' - Q-element 514 1 53.42 GAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATAAGTGAACTCAAAAAAGCAGTGCAAATTCAATTAAATTTTTTCTGTTGCTGCTCGCTTAATACTTCATTCCTCTTTTTTTCTTC:1 + chr3L 780791 3' - Burdock 34 2 59.59 GTGTATGTATGTATGTTCTCATACAAAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATATTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGAGCAG:1 + chr3R 20720596 3' - 1731 4384 2 65.75 AGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGCTTGTTTGCCTACACTTTCCATGGCCCTGTTTTCCG:1 + chrX 22715166 3' + opus 7467 2 62.33 TTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAATGGCACTTGTTTATTGACTTGTCTCTCAATTAAG:1 - chrX 19104063 3' - opus 7279 2 69.14 TACGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCACTTTTGCAACAAGTGCCCAAAAAATAAAAGAACCGTTACATTGAGAGTCAACATATTGTACATATTATTCATGCAATCTGATTTTAAAAAATATAAACATTTAA:1 - chr2R 11180479 3' - Tc1 213 1 56.16 GGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATATTTTCCTCAGAAAAATTAACATTCGCTTATGGTATATAAAAAGAAAGGCGCTGAATAACATTGTTATATCGAAATTGAATTACCA:1 - chr3R 8338090 3' - jockey 4593 1 59.31 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAATTATTTGGCGTGCCTCGATTA:1 - chr2R 14767341 3' - Tirant 43 2 57.53 TGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAATCTTTCCCAAGAGGGTTTTGATGGGGTTAGGTTCTGTTA:1 + chr3R 10736840 3' + copia 5042 2 75.34 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGGCCAAGGACTCCGGCCGATTGAT:1 - chr2R 10666877 3' + hobo 2875 1 77.06 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGTTTCATATTAAGTTGCTTTAAGTTTTGCATTTGTTGCGTTCATAATTAGACAATC:1 - chrX 2821865 3' + roo 343 2 64.38 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGCACATATGTGCCCACTCCATTGACATTGACTGGTCGACTATTTGAATATTGACAAATTATTGACTGCTGATCAG:1 - chrX 1726635 3' + 297 354 2 56.85 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGGTAGATGAAACGTATTGCCTTTTTGCGCTGAGCTGGGAGGAGACCCGATCCCGTATGTCTGCTAGTTG:1 + chrX 13808102 3' + pogo 2051 1 52.74 TCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATATGCGACGGGGGCGTGTTCAATTTGCTTGATGGATGCCTGCCATTGTGGCGGGAATTTCGGTCGTGATTCCGCC:1 - 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F-element 335 1 78.77 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAACCTTTAT:1 + chr2L 12696241 3' + pogo 2053 1 52.41 AAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAATGTATTCAAACATAAATTGGCCAGAAGATAAG:1 - chr2R 5070882 3' + Doc2-element 226 1 50.68 CAATAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTTGCCTTATCAATGGGTGAAATTC:1 - chr3R 8293524 3' - Stalker2 7303 2 51.37 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCGGGACTTTCAAGACGCGCGCGAAGCTGCGGACAGTCGGATTGGAAGTGGAGC:1 + chr3L 13450793 3' + P-element 2817 1 36.99 GAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAACCAAGTAATAATAAAACGTGGAAGCTTGCATCCATTA:1 - chr3R 18492908 3' - Juan 4107 1 72.41 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCCAAAACATCATCCCGCAAAACATCAGGTACGTGAGAGCCATTCAAATGAGCGAGTGCCGATAACCCGTT:1 + chr2R 8467835 3' - 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Doc 317 1 66.44 TAGCAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTAACGAGTATGAACTTCATACAAAATATGTGTATAGAGAATTTATTCTCTCCACCTTTATA:1 - chr2L 5741274 3' + mdg1 7174 2 70.34 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCCACAACTGCAGTGGCTTGGGAAGCCGAAGCCTTGCAA:1 - chr2L 16202590 3' + copia 226 1 60.00 ATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTCAAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' - R1A1-element 51 1 71.23 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATTCAAGAGGCTGCAGCATTTAACCGAACGCAAAGTAGGTATTAGGCTTTGCATACTTTGCGGTTCAATTGCAAATTAATGAAACATTAAAGCACTAAA:1 + chr3R 6149903 3' - jockey 34 1 67.81 AGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTTGAATCCACAACAACACGTTTTTGTCAGCAATTGAATTAAATTCAGCGGGCATGATAAATGTAAGCGGACGGAA:1 - chr3R 6404527 3' - Stalker2 49 2 52.05 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATATCACAAGCTGATGCCAAAACACAAAAACCTATACCTCCGATCCGA:1 - 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chr3R 19466662 3' - jockey 56 1 50.00 AGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATATGCGACGGGGGGGTGTTCAATTTGCTTGATGGATGCCTGCCATTGTGGCGGGAATTTCGGTCGTGATTCCGCCGT:1 - chr3R 20720490 3' + 1731 271 2 54.11 TGAACCCAAGTTCATCACACTTTGATTTTTAAA:1 + chr2R 12166188 3' + Stalker 7160 4 60.61 TTTAAATTAATAAATATTGCTACGCTTTTTAAGATGCAATATTTATTAAATCACTATTCGTTTTCATCATAGGAAAATAATTTAAAATATGCCGAGCATAATCAACCAACACTTCACGTTTGCAAAACCATGAATAATAAATGTTT:1 + chr3L 18375564 3' + Transib5 2599 1 29.45 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGGGTGAGGACTTTCAACTGCTGCTTTAGCCGTTACTGCTGCTGATTCTCCTGGTTCAAGTATAGCCACTTAAACCCTTTTGACAATGTCAGCCATCAGGC:1 - chr3R 12781441 3' + pogo 2082 1 69.18 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATG:1 + chr3R 24301897 3' + Tabor 407 2 69.86 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATTTTTCGCAGTTATGTCTTT:1 + chr2R 8375147 3' + roo 9036 1 60.96 GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGATATAGTGATGTATATTCTTGTGGTGTTTTTTTTCGGTGCCGCTTTAGTTTGGCCGCAGGTGCTGCTC:1 + chr2R 10936752 3' - 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gypsy8 349 1 74.62 ATTTTAAATATAAAAAATATCAGCTTTAAGGAACACATTAACTTACAATAAAGTGTATGTGAATAGGATAATATACCCAAGGAGCCAGCGAAATGCATTTGAACAAGGAGCAAAACTGAGAACATTACCGGATATCCTTCCCAGGA:2 - chr2L 17104608 3' + transib4 2577 1 28.08 TGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATCGCCTATGTGTAACTATGTGTACTTTATAAATGTTCACCTGAAATGGATCTCT:1 + chr3R 17747408 3' - 297 6605 2 69.66 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGCCCTGGAATATCATTTAAATTTCCATTTAAAGTCGACCACAGCCCCCGCGAGTATAACCATATGCTGCGGGCCAA:1 - chr3R 6578640 3' - F-element 58 1 50.68 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAAGTTATTATTCTTCATTTGTTCGAACTAGAGATTCACTTACCTGAGGATGTAACAGAAATGTGAGAACCCAATAA:1 + chr3R 10800616 3' + roo 9026 1 53.42 GATAAGAAGAAGTAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTAATCCTAATCTTTTGGAA:1 - chr2L 3151019 3' + blood 308 2 64.38 GGCTACGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGCGGTTGGGTG:1 - chr2L 11639014 3' - springer 68 2 68.38 AAAAAAAAACAAAAAACAAACTAGAATCATCTGGGAACTGAGAAGGCAGCGCTTAGAACGGGGAACACAAGCAAATTGCATGTAGCGAAACTTTTCCTTATTACGCAGGCGAAAGAAAAACAACGTGCCCATGACGCTCTCAGTTT:1 - chr3R 12898910 3' + HMS-Beagle2 489 1 71.92 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTGATCACTAAAATGCAAAGCAATAGTAGCTGGTTTTTTTTTGCAAAGCCAGACAAATATGAAGAGCAGTAACAAATTTCTAAAG:1 - chrX 12344253 3' - F-element 26 1 76.71 CAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTATAACTGGCTTCC:1 - chr3R 9657665 3' - BS 47 1 52.05 TGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATATAGATATATATACACTCGACAACAATTACACTGTTTAGGGCTGAGAGAAAAGCCGCAAGTGACACAATTTTTTATATTTTTCTTTCAAAGAGCTA:2 + chr3R 8884452 3' + HMS-Beagle 226 2 71.92 TCATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTGGAAGGTAGAGATAAAAGCTAGAAGGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACTCTCTTGTTTTTTTTTTATCATTTTCCATACATTCTTTAACAGAGTTTACGAAAATATTA:1 - chr2L 15004794 3' + INE-1 137 1 53.42 AAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTAAGGCAACGTCAGGCTGGCAGGCCACACAAAAAAAGGACAACGAGTCCTGGATGCGGG:1 - 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roo 8745 2 73.97 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTCTTTGTCCTTTTCCGCCTGATATCCCGTTGAGCACAC:1 + chr2L 2518607 3' - jockey 23 1 67.69 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGTAAATAAAAAATCGAATATACTTTATAATTAATTACCTGAGAAATCC:1 - chr3L 18574835 3' - I-element 62 1 69.84 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATTTCGTGT:1 - chr3R 7136590 3' + roo 8992 2 71.23 GCGGCAAGCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATA:1 - chr3L 3540138 3' + mdg3 166 2 67.59 AAAATTTTTTTATTTTTTTTATTTTAAATGTTTTTTAACTCACCGCGTAAACAGACTATCGACCTGTTCCTCAAGACTCAGCTAATAACTTTTGCTATGAACTG:1 + chr2L 7535396 3' - HB 323 1 71.15 CAAAATGCGTAACGGCCGTACATTGGTTTCTCACTATGCAGACACTTTTTTGGTGATCTATCAACCATTGCCATTCCACCACCTTATCGCTACATGAGTGTTTCAGTGCGGGCTCGTATCTGTGTCTCTAATGGCTGCGCACATTG:1 - chr3R 16970221 3' - 1360 3371 1 62.33 GTGAAACTATTTCTCCTAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATACAACTATACAAATTAGTTGGGCTAAAATGCTTAACGA:1 - chr3R 17747289 3' + 297 6894 2 75.34 GAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAATGTTGTTTGAAAAAACTTGGCGAATATGTGCCAGTGGGTGCATGTGACGACGGTGCCCATTCTCAAAATGAGAAAATCGATATTTACAATTACATCGAAGG:1 + chr2R 5699966 3' - diver2 4555 2 51.37 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCAGCGTAGCACAGAGGCGTCAGGGGAGGAACGGAGAAACG:1 + chr3R 13572149 3' + 412 467 2 67.36 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTTATGAATATTAAATAAAATCTCTCAATCGAAAAGGTTGTTTTTATTAATGGCTTTGAAAATGGTCTACATTTCTTTATAAACACCGTGCTTAATAATATGATATTACCAATATT:1 + chr3R 13411952 3' + roo 401 1 78.77 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACATACCCGAAAGAAGAAACTTTTAGCTGCCTTCCAGCTATCAGCATTTTATC:1 - chr2R 10773222 3' - 412 7123 2 64.38 ATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCGCTGGAAAGTATGCTCCGCTAAAATGAAGCCAGGAT:1 + chr2R 5899309 3' - 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chr3R 19989255 3' - hobo 75 1 70.55 GGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCAGGGCATTGTTTTTGCTACCAATCTATGTGTG:1 - chr3L 17142836 3' + hobo 2877 1 72.27 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAGGACGAAGACGGCCCAGATTCCCAGGCTGTCTTCGATGCGGAGTGGAGTACCGAATGAACTCATCTTCTGCG:1 - chr2R 20303831 3' + mdg1 369 2 51.37 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCACACA:2 - chr3R 22266425 3' + roo 356 2 53.42 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGTTTTGTTTTGTTTCGCCGATTCGGCGGCTCTGCGCTGGCATTTATTTAA:1 + chr2R 18266096 3' + roo 337 2 66.44 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAAACAGATGGTCTGCCAATCAACTTCGAATCTTCGAATACTTCACTTCCATCACTGCTGTTATTGCTT:1 - chr3L 24089509 3' + mdg1 7447 2 67.31 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATTCCCCAGGCTAACACTATTCAGATTCGATCTATATTTGGCCATCTCGCTATCTCTTTCGCTCGTTATCGTGGCATCTCTTTCGCT:1 + chr2R 15892257 3' - hobo 23 1 66.91 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTGTAGTATGCCCCTCGTCATAAGGCAAACAAATGACATCGACTGACATCCTGTTCTGCTCG:1 + chr2L 2336326 3' - 297 6626 2 57.04 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAAAATCTCAATCGCTTTATTTAGTATTTGATGATAATGAGGACAGATTAAAAAACATTGCAAAAACTTGTGCTA:1 + chr3L 18591611 3' + flea 4970 2 56.85 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGGCAGGATGCCTTTGGTGTATTTCCTTTTAGCCTGTCTGCTGC:1 - chr2L 9874592 3' - Doc 84 1 71.92 TGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCTAACTTAACTTCCAATTAACAGAT:1 - chr3L 17710592 3' - I-element 64 1 58.22 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAA:2 + chr3L 3540265 3' - mdg3 16 2 73.29 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGATTTATTTGCCGGAAAAGATTACTTACTCTGGACTGCGGTTTTCCACGCGGCG:1 - chr3L 13546521 3' - hobo 28 1 64.83 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATGTGGCATATATATGTGTATGTATAGAGACAGCAGACTGAGGCATAACCTTAATTCCTTATGGCATTTTATGCTTCCTTCTGTCGCACTGAGAAAAAATTGCTTTCATTT:1 + chrX 7657564 3' - I-element 12 1 75.34 GCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGG:1 - chr3L 3540124 3' + mdg3 5431 2 60.96 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAAGTTCTCAGTTATCTATTTTGGCAGCTTAAAAATTGTATATACACGAAGTTGTTGTGCAACCGACCGAAGAATTTATTATTTTAAAGCTTAGTTGTTGTATAC:1 + chr3R 27948356 3' + Juan 4199 1 73.79 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGAGAGATGGGAGTCTCTACTCGCTTACAAACCGCAAATACTTCTCTGAATGTTTTCGTGCTTCT:1 + chr3L 17896046 3' + P-element 2863 1 70.55 AGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATTACACCTGGCTGCGATTCAAATCCGGCAGATGCGGGGCA:1 + chrX 11903494 3' - G2 2869 1 73.29 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCATATAACTTGATTTGTTTTTATTTCCAAGTATGTTCGTTATTGTTTACAATTTGTCCGAAATCTACATATTATGGAGAGGTAATAT:1 - chr2L 22031935 3' - Tabor 6876 2 60.27 GATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGCGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTA:1 + chr3R 1048043 3' - Stalker2 7321 2 65.73 TTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGAGAGTAAGGTAGATAGGGAGCTTTTGGAGCTGCTCTAGAGTTG:1 + chr2R 16031426 3' - hobo 78 1 70.55 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATAAACTGAACCTTGCTACTCTATATATTAGCATTCCCTAAGGATGCG:1 - chr3R 1964571 3' - roo 8670 2 68.49 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCATATGAAATGTTGCCATCGAGCTACTATATCTAGTTCAAGTCTGGTTCCCAAGGATTTTCTTCGCGTGTGGTGCAGCTGGTGGTGCGGTGG:1 - chrX 6052887 3' + roo 395 1 65.91 CAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATTGCGTCATTTATGCATCTCATAATTCCCCGCATAAGTCCACCAAACAACCGACTGCGAATCCTCGT:1 - chr3L 22445170 3' - Transpac 52 2 54.79 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTGTGACTTGTTTTTGTGCTCGATGCGAAAAATGTGCGAGTTCGAGTCAATTAATT:1 - chrX 13484067 3' + hobo 2926 1 76.71 AAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACCGCTGATAAAACGCAATACGCTCAATATGATTATAGTG:1 + chr3R 29868016 3' - S-element 80 2 73.97 CAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCAATGTCCGTCTATCCGACTGTCCGTCTGCCCACGCGTCACGGGCCGAAAAGCAACCACCCCACTAAGCAGCCCGCCCAACTAACCCACCGCCCGCTAAAACCACCCAACGAC:1 + chr2L 16548160 3' + INE-1 95 1 62.59 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGCCAAATAACAAACCATATTTTTGAAGAGTGTTCTTCGGCCAGCTG:1 - chr3L 21108505 3' + roo 8995 2 70.55 GATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGCTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATATTTGTTGTGCGTCTTTCTTTCTCCGCTTTTG:1 - chr3R 28788735 3' + I-element 5264 1 76.03 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATATATACATATTTTTTCTTGCTCTGCAGCTTTTGTTGTCGCCTGTCTGCAGATGGTATCTTGTATCTGCACCACCCACTTTTGGTGGTGGTGCTGC:1 + chr2R 17317706 3' - hobo 24 1 67.81 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTG:1 + chr2L 11043600 3' + roo 8999 2 73.91 GCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 5329 1 65.75 AGGTATGCGGCAGCGAGCGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCATTACATTTAAAAATATTTTAAAATAAGCACACTATCTACGTTTAAACACTCTATATACACTCACACTTAAATAAGAAAACAAAT:1 - chr3L 25821758 3' + opus 464 2 60.96 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGTCTAAAAATAGCCACAGC:1 - chr2L 20716319 3' + P-element 2842 1 54.79 CACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGATTCTATGCGTGTATTTTCCGATATCGATACCGATATCGATG:1 + chr3L 6942407 3' - R1A1-element 203 1 71.92 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTG:1 - chrX 13484120 3' + hobo 2895 1 55.65 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTG:1 - chr2R 18266015 3' - roo 8733 2 68.28 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAG:1 + chr3R 4352140 3' - Doc 60 1 61.64 CAAATTAAAATTAAATTAAATTTGCTTAACTTTTGACTTGTTTTGTGTACAAACAGCTGTTGGGCTAGTGATGTGAGGCAGCACAAGTCGTGTCACTATCGATTGCAATAGGTCTCAAGCCATGCCACACACAG:1 + chr2L 3872496 3' - Rt1b 125 1 72.39 AATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAATGAATTAGAACAAATTGTTTCCAACAAAACAATGAAGTGAAATTTTGAA:1 - chr2R 16114702 3' - copia 219 2 66.44 CGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAACTTGTGAGGAGCGC:1 + chr3R 8965248 3' - HMS-Beagle 51 2 54.11 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGACATCAATTTCGCAAATATTCGCAAAGGTTTCTTGAAATAGTTTTCGTTTCTTTTTGTGTAACTG:2 + chr3L 10733754 3' - 412 55 2 57.53 AGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAAACAGATGGTCTGCCAATCAACTTCGAATCTT:1 - chr3L 24089544 3' + mdg1 7370 2 77.40 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACA:1 + chrX 10695775 3' - P-element 80 1 31.51 TGAAAAAAGGAAATTATGGTGCCGTACCCTGTATATAATTTGTACGGTCGGAAACGCTTCCTTCTTCCTGTTACATCCTTTGCATACCTAACTTGTGATGAACCTTAACAGACGATATTTTCGAATGTTAACCTGACAAACGCGAC:1 + chr2L 22323350 3' + mariner2 882 1 56.85 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAACCACAAAGAGCAAACACAAAAAATGTTGCCTACTTCCCGGCAAAACAGGTGAAAGAAACGAGCTGACCACAAAGCGTGCTGGCTTTTGTTCAATTGCCG:1 + chr3R 8625319 3' - jockey 24 1 73.43 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATCTGGGGCACTTGCATTTCTGGCTACCGGCACTCTATATACCATCGGCTTATATGGATGG:1 + chr2R 23763950 3' - blood 7073 2 60.96 AATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGCAAAAATAAATTCAATTATCTATAAACTTCTTCACCTACGTAAC:1 - chr3R 19467961 3' + jockey 4828 1 75.34 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGCACAACAAATAAATCAATTGGCTTTGCCTAAAACGTTTGAAATTGATTTCAAGTTCTTTG:1 + chr3R 28788795 3' - I-element 63 1 57.53 TCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCCTTCGATTGTTTCCTTATCCATTAGATACTCTATTTTCTCTCTGTGCATTGCTATGTGCA:1 + chr3R 18860940 3' + roo 411 1 56.85 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCAAACGACTTGGACTAACACTTGGGATTTCTCTGTGGGAATGA:1 + chr2L 20327723 3' - roo 8664 1 77.36 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTA:1 + chr3R 18860877 3' + roo 9011 2 59.59 TTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATGCTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCAACGCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCGAATGTGA:2 + chrX 11906345 3' + HMS-Beagle 194 2 56.85 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAGATATGTATATAAAGTATCGTGTGTCGTAGGACAGAAGCAGTCATGCCAAAAGGGGGAGCGTTTTGCGCTATGCTCC:1 - chr2R 17937103 3' - 297 39 2 53.42 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCATACGCGATGATTGGTCCAAACTCTCCGGGCAACCCATTTCGAAATTCGCCGTAAACAACA:1 + chr3R 25094732 3' - P-element 36 1 60.14 TAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACCATTTTCGCCATTCGCCGCCTCGGGCGTAATTTGTAAATCTCTGCAGGCGCAATTTATCTAAACATCCTTCGCTTCTCCATTTATCCCAGGAACGCCCACACGGC:1 - chr2R 18467079 3' - roo 15 2 72.60 TATGATAATTAGAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTCGGCAAACACAAAATAGGAATCGGGTCGCAAAAAATATCACTAGTTTAACTTTAAGCTTAAAGAACCGTGTTAACATGAAGTAAATTGATAAACTTTATTTTGCTT:1 - chr3L 26371242 3' - Cr1a 80 1 51.37 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTTGAAATTTGATTTGCCGATTGCCGTCACTCCACGGGCTTTGTATTCATTGTACATTGTATTTGTTTCATTACGCTGAC:1 + chr3R 18940637 3' + mdg1 7424 2 60.96 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATA:1 + chr3L 13365106 3' - Juan 73 1 64.38 AATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGAC:2 + chr3R 15157703 3' + invader3 5422 2 55.48 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAGAAATCGGTGCT:1 - chr3R 26031666 3' + pogo 2063 1 60.27 AATTAGGATTTAAAAAGTATTTTCTTTTTAAGCACATTCAGCACAAGCAGTTGATAAGAGGATATCTAAAAGCTATTTTTCAGGATTAAAATATTCAATATTCCCAAAAGATTAAAAGTACCATATCACATTCAAAATAACGTGTT:1 + chr3L 14473694 3' - transib4 2558 1 53.42 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATGCCAAGTGGCAAAGTCCAACGTACGCTCCGTGCGCCGCCAGAAGAAGCTGACTTGTTGCCTTCCTTGGCACACAGATGCACACACAGATAC:1 - chr3L 7220323 3' + jockey 4964 1 60.96 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTAAGGGCTCCGCGTGTTGGTAATTCGAGTTCTTAATCATTATTAATTAATTAAATCAGTATTTAGTTAAATGTCATATAACAATTTCATTTTAAG:1 - chr2R 18858190 3' - 297 20 2 69.86 AATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGACAATCTTGATTATTTTTAGATAATTATGAACAATAAATAACTGTAAGCAGACAACTGTAAAGAAAGCTTTG:1 + chr3R 17401800 3' - Juan 42 1 50.75 GTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAGTATTAATAATGACGATAACACCAGAGGAAGTCGTGTTTCGGCTGCG:1 - chr2L 8422007 3' - R1A1-element 5120 1 67.12 AGATCAAAACATATAAAGCTTATTTAAATTATAACGTAATTTCAACACTTCCTCTTAAGCTATATATATGTGATGTAAAACGAAAATTAATTTATTAACGTTTTTTTTTCCTTGGTCGCTGCTGGTTCTTTGTTTATGGCTGTGAA:1 + chr2L 8472456 3' - Copia1_DM 26 1 64.38 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCACGCATATTCGTATGTGTGCGCGTGTGTGTGTGGCCAAGCGTTTGCGCTCGTTTGTGTTTTGTGGGTTGGCCATGCATTTCCGGTTTTAATGATTATAACAC:1 + chr2L 5656682 3' + hobo 2920 1 72.60 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATTCTTGATCAACAGCAAAGTCGATATAGCCTTGTCCGTTTCAGAGTAAACTTGTTGATACTTT:1 - chr3R 6461730 3' - Transpac 51 2 59.59 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATAATACAATCAGATTGAAATCGAAGCAGGGCA:1 - chr2L 8852746 3' + Burdock 6353 2 54.11 AATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCTGCCATAAAACAGAGACTGTAAAATGTGCATAACTAGCTGGGGCAATTTTTTAAATTTAATGGC:1 + chr3L 19398223 3' + gypsy5 352 2 58.62 AAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATAT:1 + chr2L 10685864 3' - Quasimodo 79 2 75.34 ACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTTCATATTA:1 + chr3L 13365118 3' - Juan 49 1 52.24 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTA:1 - chrX 18193668 3' + hopper 1395 1 71.23 TACATAAACATTGTTGCAAAAGAGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAAAAGGGAATTTTAATTGGCTG:1 + chr2R 10760495 3' - Tabor 6909 2 65.75 ATGATGGAGGGCGTGACTTTGCCCCCTTTGACACTGGCCTTCGGGCTCAGCGTGGATAAGTTAAATCAATAAAATATGTTTTACGGCAAGTCATTAATTTCTCTAAATGTGAGCATGATATTTTACAAGCCAATGGATTTGTTTGA:1 - chr3R 23478170 3' - gtwin 368 2 62.33 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATCCTGTGCATACCAACATAATTTAATTAAAGCTCTCAATTGAGCCATCTCATCAGCAGCACGAAGGGATGGCCAAACATC:1 + chr3L 12729205 3' - opus 7115 2 75.93 TATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCG:1 - chr3L 25232767 3' + accord2 7556 2 66.21 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACGTATATGTGCACATATATATTGCAGTGCAGTCAAGGTCGTGTGAAAGGGACGACAGTTACGCGGCA:1 + chrX 13484218 3' - hobo 56 1 57.53 CGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCATGGGTCTGATTGCAGACAGTCAGCGTTATCGTGGCGGCATTGATAAGGTG:1 - chr3L 14097657 3' + Doc 4477 1 65.75 ATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCCGCCTACGGTTGCAGTTGCTCCGGGTGCGATGCACTAGCAAATTGCAG:1 - chr2R 21105719 3' - Stalker2 75 2 67.12 ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAATGGCAGGCTGGCTGAACTACTACAATCTGAAGTG:1 + chr3R 22572686 3' - HMS-Beagle 6824 2 66.44 AAGTCCACCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTGGGAAAAAAACCCAAAACGAAACACTCAACTCCCGACCCAAATACCTATCG:1 + chrX 4788603 3' + Max-element 8464 2 67.12 CCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTGGTCCTTGGTGGAGGCCCGTTCTCAATCCGTTGGCGAGGACCAAGTGCATCTT:1 + chr2R 10666928 3' - hobo 68 1 63.01 GTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCCCCACCCCC:1 + chrX 21667995 3' - gypsy2 7 2 78.08 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGATAGCGAAATCAAAGTCGAGTTTACTGAATCCACAATACACATCTCCAATAACCGCAACGCCTTGGCGAGGCAACAAAGCA:1 + chr3L 1728603 3' + blood 336 2 45.21 AAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAAGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACAACTAGAGTCATGCCCGTGCAATTTGGCAATTTGTTCATG:1 + chrX 8037044 3' + Quasimodo 7214 2 73.29 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTAATCGTAATTAATGAACATGTAGGTATAGGTAGGATAGTAGGTTCCTTTAACTTATTTGAAAAAGAAGCAAATACATAGATTTGTA:1 - chr3R 25052969 3' - pogo 30 1 63.70 TCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTGTTATTTTTCGCGCTTTTCGCAGGGCTAATTA:1 - chr2R 17872454 3' - Tirant 44 2 55.48 CAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTGGGAAAAAAACCCAAAACGAAACACTCAACTCCCGACCCAAATACCTATCGTATGGTAGATATATATGCAATACATATATATATAGTTTTGGGTGTTTTATTTAAATGCCCGGA:1 + chrX 4788666 3' + Max-element 8527 2 78.08 ACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTTC:1 + chr3L 13365112 3' - Juan 67 1 60.27 CACATATACAAACACACACACACACATACCCAGAGAGAGATCCAGGAAGATACACTCACAGGCACAATGAGTTTTGCGTGTGCAGATGCTGCTGTATTATGCACAGGATTGTTTTGGGGAAGTGCTGTAATAATTTATTAAATATT:1 - chr3R 12933319 3' + Quasimodo 28 2 74.66 CTAAATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGGAAGGGAGCCACTGCCAAATGTGGGAGAGTTCGGGTTTACTCTTACACCAATTTATCAGAACAGTTCCGTTTTTCACTTTCCCACACAATTTTGTT:1 - chr2R 8956596 3' - I-element 5115 1 70.55 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTTTTAACGAGCAGTTAGCATCAAAGAGAGGGCA:1 - chr3R 10741047 3' + 1360 3361 1 64.14 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGGTTCGAATTGCGAAA:1 + chr3R 9863009 3' - Stalker2 10 2 75.20 GAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACTTAATTTAATAGTATACTTGTATGATATGTGGTATCAATCGGCAAGATGTTAAAAAATAATTGGTCCTAAACATTTTAGTAAAA:1 - chr2R 18459443 3' + roo 77 2 63.01 AATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTAATGACTTTAATTCACT:1 - chr3L 16973316 3' + S-element 164 2 72.60 GCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGCGAGTCGGTCTCATCCCAGATGCTCCTGGCAATTTGT:1 - chr3L 22170023 3' - F-element 4486 1 74.66 AACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAACCTTTGGTCCTTGTCGCCATGTCTGGCATATGTGTCCTTTGCGCTTCCCTCTTCTGCA:1 - chr3L 22207830 3' + Doc 4605 1 60.27 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATGCACCG:1 - chrX 19162555 3' + pogo 2065 1 58.90 CGGCAAGCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTA:1 - chr3L 3540143 3' + mdg3 167 2 67.63 GTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGC:1 - chr2L 20360645 3' - micropia 5028 2 59.59 GTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGAGTCGGTAGGGGGATTTAAGTCCCATTCCTTGCAATAAAGAACTCTATATAGCATTTACGCAGACAATAAAACTCCATGCAGTTAGAAGTTATAAAATAAGATACA:1 + chr2R 3091724 3' - F-element 260 1 69.18 TTGCTTTGGTTTTTTTTTCGACAAATTTTGAAAAAATTAGTTTCATTAAAGGTTTTTTTTTAATTTGTTCCAAAAGAAGACCACAAATTCTCTAGTCATGGGTCGCGGAGAGCATTGTGCCGTCGAAAAAAGAAACTTGATTAAAA:1 + chr4 987673 3' + Tc1 262 1 80.14 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGTATGAATTTTTATAGCAGGAATAGTGTCCAGGCTACAGAACAATATGCTTTGGGAG:1 - chr3R 25929329 3' - 297 6637 2 65.75 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTATTTTTGTGGCTGCACACATGGTTGCGCAAC:1 + chr3R 11873442 3' + 412 435 2 56.94 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGAAACCTCATCGAACTGAAGACAAGGCGTTTTGACTTTTTTTTATGCTGACGCTAACTCGAAAATAATTTGATATTTTCAATTAAAGTTTTCAATGGCTTTTGAAAATGTTTTCTG:1 + chr2L 16360719 3' - hobo 6 1 77.40 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCATTGGTAAATACTTTTTTGGTAAATACTTTTTTTTTCAGTTGGGGCCGGTGGTCGGAACTTTTGGAGTTAGGACAATTCAAACGAGGTTGGCG:1 - chr2L 232326 3' - Doc 31 1 51.37 AGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTATATAATCCGATTTTTAGGGTGGGATTAATAGATGATTAGTAATCTAAAATGAGCAAATGGCTGCATTAATATCAATTTACAATGCATAGCATT:1 + chrX 17270413 3' - 3S18 5793 2 63.01 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGTCCATTTGGGTAACTAAATAGCTTATGGTTAGTTTCCGCGAATTTTAAGATTGCCTTTTGAGTTG:1 - chr3L 5425445 3' + blood 7334 1 56.16 GCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATTATAAAATCCCAAAAATGTTGCCAGCATTATTCGCTGAAATTAACATAAAATACCAATACGAACT:1 - chr3L 5328660 3' - 412 7233 2 55.48 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGACTGCAGCAACAACAACCACACGGCAGAGTACAGGGCCG:1 - chr3R 17794507 3' + P-element 2848 1 56.16 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTTGAAATTTGATTTGCCGATTGCCGTCACTCCACGGGCTTTGTATTCATTGTACATTG:1 + chr3R 18940616 3' + mdg1 7403 2 58.90 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAGTATCATTAAAAACAAGCAAACGCTGCTAGAATTTAATGAAACTAAAGTCTGCTTAGTCTTTTATTTAATAGGTTAAATAT:1 + chr2R 12416973 3' - pogo 36 1 60.96 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACGATATATGTATGGGAAGA:1 - chr3R 29997660 3' - P-element 103 1 15.07 TATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACAACCGTGCCTGTCTCCGAACAACAACAACAAATGCAACCAACTATGATGACAACAAACAGGAAGATGAGCCCATAGAAAGCCAACTTGCCCAAGACGATC:1 + chr3R 6404678 3' - Stalker2 7272 2 69.18 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGATATTAGATTAGATCTGAAACCAGCTTAAGCCAATTGAAAATTAAAGGCGCATCACAAGTGGGCATAACAACGTTTAT:1 - chrX 16325103 3' + Transpac 5189 2 56.85 TTTTGGCATACAGCTCTGGGGTACAGCCAGCAACAAATATTGAGATTTTACAACGCTACCAATCAAAAAAGACAAATAAGATCAATAATTTTATATAATATATTTAGAACATAAATTTGTTTTTTATACATAGAAATTATATGAAT:1 + chr2L 21057753 3' + G4 3434 1 51.37 TATGTCGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACATTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGGATCAATGAT:1 + chr3R 973196 3' - Rt1a 39 1 48.00 AGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGACGTTTCGCACACACAGAGATACAAAAAT:1 - chrX 7441055 3' - jockey 4853 1 79.45 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCCAAGCAGCTAAAATACGGATAGGTTTGGAGAGTAAAGTTACTAGCTTTTATGACATTCTAGTATTCCAGTTCTTAAGTGATCTTCATTTACCAAAAATATTGAT:1 + chr3R 31264291 3' + jockey 4973 1 69.18 TGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACTCTGTTGTTTTTTTTATGTATATTTGTTAAGCTGCAATCGTTCCCCTTTCGCTGACCCATTAATGCATTTCACTCGCCAGTGATATTTGCTCAATCTTTAT:1 + chr2R 20361494 3' + INE-1 548 1 91.78 GCTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTTGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCA:1 - chrX 12131193 3' - F-element 403 1 77.40 GAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTGGAATCCATTTGGCAAAGTTATGGCGTCTGGAAACTCAGGT:1 + chrX 4765582 3' + 3S18 260 2 73.29 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCCAAAACATCATCCCGCAAAACATCAGGTACGT:1 + chr2R 8467798 3' - roo 88 2 78.08 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTGTGTTTCCGAGTGTGTTTCGGGTTTATGCTGCTTGAATAAACTCTTTCTTCCCAAGACCACATTTTTTGTTGTTAAAACAAATCTCACAGAGC:1 - chr2R 22372449 3' - I-element 28 1 62.07 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAGCAAAAAGTATTAACCAAGAGCAAGCTATGATAAATCGATTTTTAGAAACATCTCAAAATAAAATTTGTAAAGAACTATCGAAAGAAC:1 - chrX 21668832 3' + mdg1 7426 2 59.59 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGGAATAAAGTGTGAAAAAATTAATTTATTTCAATTACATTTCATTAAACACTGCCACACGTTGCGA:1 - chr3L 21405380 3' + mdg1 365 2 54.79 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCAATAGGTCCCAATAAAACTTAAAGTTACTTCCAATTTATAAGGCATTCTTTTAGGTCCAATAATTAAGTTCTTACATAGACCACATCGAATTAATAACAATGAACT:2 + chrX 16538243 3' - mdg3 5264 1 77.40 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCTGATGTCTGGAA:1 + chr2R 12642770 3' - pogo 29 1 65.75 CGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTGGCAGTGAAAATTTTTTGGGTTAACTTATTAAGGTTATTAGGGTTAACTTATACAGTGCCATATGTAATGTTCAACCACATAACATATATCA:1 - chr3L 24803036 3' - 1360 3173 1 63.01 ATCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGTGAAAACTTAGTAAACGTGTTTGAAAGCCCCTTGGCAAAATATTTCTGCGGGATGGAAAGAACGGGCTAATCACCATATAACGCCAAACACATCATCAGTAGCATCATCA:1 + chr2L 14677628 3' + Quasimodo 250 2 77.40 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTATTGAACAAAACTTGAGCTATTAATCCGTTTAATGATTTTAAGCCTTATATAAGAAGTGCAGCTTTATTTAAATATATTTATTGAATCTTATTTTATAGGA:1 + chr3R 7136715 3' - roo 19 2 72.60 AATTTTAAATAAATAAAATAAAACCCCGGTATCAATCTACCAAGTGATTCAAAGAAAAATCACAACATGGGTCGGCGGATCACCGCAAGCGGAGGACTAGGTGGATCCAATCTTTCGCTGCACGACGAGGAGCGCTACGAAAATGA:1 + chr3R 31661458 3' + G7 1143 1 58.22 AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGAATATATAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACAATAAGATT:2 + chr3R 846273 3' + copia 179 2 73.29 AGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACATGGAATTGGAATAAACTTTCTATGAAAGGCCCGGCTCACTTGGCTG:1 + chr2L 18304581 3' + hobo 4 1 68.49 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACGACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGAGTAATCTCTTAAAGTAATCTGGCTACACTGGAATAAGAATTATTCCTTTGCAAAACATTGT:1 + chr2R 11691301 3' - P-element 58 1 43.15 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATATAATACCGAATATTGAATAATTTCTTTGGAAATAAATTCTCAATTTAACAAGCATGTTCGAAATGTATTTTTAGACAT:1 + chr3R 23714146 3' - I-element 41 1 56.16 TGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAATAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGATTGTTTTTTTACTTAGCCATACTTAAAATTTATAGCAAAAGAGGCTCCATCTTAAAATGAACTAATTAGTTTT:1 + chr3R 26365810 3' - Cr1a 254 1 50.00 GTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTTGAGT:1 - chr3R 23020778 3' + INE-1 568 1 66.44 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGAAGTAAATGTGGTTCATATGAGTATCCGAACGTAGCTGA:1 + chr2L 8009178 3' + roo 9036 1 58.90 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAAATTTGATTTAAAACAGTAAAAATGGTAAATCCAATAAAACTAAGTGATAACAAACTAACCGATTAAGCAAAAAGTTGTTTTCTGGGTTTTA:1 + chr3R 20097724 3' + mdg3 217 2 66.44 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCCAAGGAAACCCAACAAA:1 - chr3L 12775921 3' + roo 9053 2 73.29 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGATAGAAAGATGAATGGATGGATGGATGGATGGGTGTAAGGGTGTCTGAACAAGCCGACAGTAATTCGATGCGTACTAAATGGAATGAATGACAAAAGCGGTCGAGGATGATA:1 + chr2L 7596152 3' - mdg3 5261 1 61.64 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTGAGAGTCGACTGCAGTTACAGTGGCTGCCAGCAGTTGTTGATTTATTGTTATAACTGTAACACACACCCACACA:1 + chr3L 15724567 3' - jockey 70 1 49.32 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTATCTCAAGAATTCGCGAAGGACCAGAGATGAG:1 + chr2R 18056939 3' - blood 14 2 76.39 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCCATACATGTATGAATTTCTCCGAGGCATAAC:1 + chr2L 2522989 3' + mdg1 365 2 56.16 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACA:1 + chr3L 3540216 3' - mdg3 51 2 58.90 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTGTAATCGATATACATACAGGATATACCGAAGATTGTTTTCGTTAAAGAGGTGAAAATAATGCAACAATG:2 - chrX 10344751 3' + roo 355 2 53.42 ATGTATGTTCTCATACAAAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATATTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGAGCAGTCCGAGGC:1 + chr3R 20720604 3' - 1731 4376 2 60.27 AACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATGTGTTAATTCGGGCAAAGATTTAAATATATATATTTTTATAGGTCTGCAATCGTACTAAAATTAGTCAGTGGAAATT:1 - chr2L 13763451 3' + Bari1 1666 1 57.53 GGCCAAAATTTCTCTCTTTCCGCTCACTCCCGATGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAAAAATAACAACAGTAAAGCTTAATTCTATTTTTTATCAATTTCAATACATATCCGTAT:1 + chr2L 4393991 3' - 1360 3314 1 57.53 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATAACTCAACAAATTTAATTTAGATCGAAATGTGGTGCAGTTAAACCATAGA:1 - chrX 19591153 3' - roo 8731 2 67.12 TTGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGT:1 - chr2L 5333415 3' - mdg3 5333 2 78.77 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAATTACAAAATATTTAATAAAAATAATACGGGATAAAGTAGTTCAAAATCAAATGGAAATAT:1 - chr3L 14370565 3' + 412 7485 2 57.53 ATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAGTAATTAGTCCGTGTTTTGAAACTTTTATTTAGTTACATATAATAACCAAACTTGAACTTAATCTCGCATTTTAAACTTAATAAGTATG:1 + chr3R 27443277 3' - 3S18 32 2 63.45 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAATCTACATCTTTCAATAATATTGTATTTCCATCTTTTGGTATTTCTTTTAGTTTTAGCAATTCGTTTGCTGTCATAAATCGAATCGATACGTGTGTAGTTG:1 - 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chr2R 18611854 3' - blood 169 2 53.85 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTACATAAGTTCTTTGTGGGCGCTCTTGTTTATGCAACACTTTTCTCCTTAAAAGATTTTTTCAATGA:1 + chr2R 18528797 3' + jockey 4931 1 58.22 CATTTTTCGTCTTTGTTTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGGGCTTGAAAGACATTTTATTATGTTTTTTAAGTGTATTCCTATTATTCTTAGGGATTTAAAGTTCTGTATTTGCATGCTTTCAGATAGTAAATT:1 - chr2R 5581975 3' + Cr1a 194 1 62.33 AATTAAACTAATTATGTTGGTGTAGATCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAGGACATCAGCACGCCGGTCACCAACAATCAGCGAAAAA:1 - chr2R 22092142 3' - gypsy6 7805 2 40.86 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAATGGATGAGCGATTGCTTGCGCAGCTCCTTGCT:1 - chr3L 1743264 3' + hobo 2913 1 40.00 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTAAAGCATTCAAATTATATTTATTGGCTAGGCATCA:1 + chr2R 5485186 3' + 1360 3364 1 67.12 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAAGTCGTTTTGTAGCTTGTCATATGCAAATTGCGCATACGCCC:1 - chr2R 14921430 3' - pogo 16 1 74.66 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAAGAGA:1 - chr3R 30524467 3' - roo 8737 2 70.55 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGAATGGCATAAAGATTATTT:1 - chr3L 19938457 3' + roo 358 2 52.05 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATGTGGCATATATATGTGTATGTATAGAGACAGCAGACTGAGGCATAACCTTAATTCCTTTTGGCATTTTATGCTTCCTTCTGTCGC:1 + chrX 7657540 3' - I-element 36 1 60.27 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTGATATTGGGCGATAAAGAAACCGCTAAGAAGCCGC:1 + chr2L 11043634 3' + roo 361 2 53.42 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTATGGGTGGTTGGTTCTA:1 - chr3R 26404989 3' - hobo 25 1 62.79 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTATCTCAAGAATTC:1 + chr2R 18056920 3' - blood 7046 2 62.33 TTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAGTTACTCTTACT:1 - chr3R 26693346 3' - Stalker2 7312 2 61.64 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTATATATTTATGATAAACAACTATTGCGTAACTACTTGTCCATCG:1 + chr3L 20914630 3' - Transpac 14 2 55.81 AAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCACTCGCAAACACACTCGCGTCCAG:1 - chr3L 13450737 3' - P-element 94 1 21.23 TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATCTTAATGCAGATCCATGTTATCATTGGGATAGTTCACCATTGCTCTTACTCGGCGTTACTCGTTGACATAATAGGAATGCGTTTCGTAATATGTATGTGGG:1 - chr3R 7364156 3' - Quasimodo 12 2 78.08 CGACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCTATTTAATATTGCTTCAATAAAGAGGCTGCGTATTGTCGTCCACCTTTTCATCCGCCGGTGGTCCAGTA:1 + chr4 1183168 3' + Tc3 1629 1 54.11 TACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGAGGCTATATCAAACTTGCCA:1 - chr3R 15035023 3' - Stalker2 33 2 63.01 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGAGAGATGGGAG:1 + chr3L 17895994 3' + P-element 2811 1 34.93 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTTTTCCGAAATTCAAATGGAGCCCCTTTCTAACACTTTTTCTGCCTCATGAATTGAAATTGCAAAAT:1 + chr3R 12540582 3' - roo 51 2 54.79 TTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAGTTACTCTTAC:1 - chr3R 26693347 3' - Stalker2 7313 2 62.33 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGCATTAATTTCATTGAGCTCGATCCCGTTTGTTGACAACAGCAACTGCACGGCGAAAATAAAATATTTAACAGATGTCCGGAGGGCG:1 - chr2L 20913913 3' + roo 9037 1 61.64 ATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACG:1 - chr3R 21276544 3' - BS 5065 1 64.34 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGGAGGATGCCGGGGTGCGCGCGTGTTTACATAAAAATTTAAAGCGAAAACCCAGTGATTTTTATGCTTATCAACAGCGAAATTGAAAATGCCGCCTGGCTACAG:1 - chr2L 19628360 3' - hobo 17 1 71.23 CGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGACACTCCTGTTTCGCCGACATATATATGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATAGTTCCACAAAAGTGGCACTATGATCTCTCTCAGTCTTGGCACCCCTTTAAGTTC:1 + chr3R 29952829 3' + invader4 3060 2 67.12 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCAAACGACTTGGACTAACACTTGGGATTTCTCTGTGGGAATGAAGCCATAATTCGTGG:1 + chr2L 20327738 3' - roo 8689 2 66.44 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTAC:1 - chr2L 20716372 3' + P-element 2810 1 21.60 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCAGACTGAGCTGTGAGCACTCAATCATTTTATTTACTTATGCACCAGTGCACGCAGATAAACTGAATCTTTGTTTAATTTTGAAATTATTACCATTCCACATTCTGCACACA:1 - chr2L 5732677 3' - hobo 6 1 76.06 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCCGGAGTGGGAG:1 - chr3R 19989233 3' - hobo 7 1 71.00 ACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGCCGCTGAAAATGTCATTACTGAAGGGCCAGCAAAACGGATGTCGAGTTGTTGTTTTG:1 + chr3L 19431722 3' - Juan 67 1 60.96 CCCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGTAGAA:1 + chr2L 6716392 3' - hobo 69 1 63.01 CGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATATCACAAGCTGATGCCAAAACACAAAAACCTAT:1 - chr3L 18420942 3' - jockey 4759 1 76.71 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAG:1 + chr2L 15057239 3' - hobo 85 1 77.40 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGTTATTATTAATTTATTAGTCTATCTATTTGTAGAACTACCTAAATTTTTATTTA:1 + chr2L 9317767 3' - I-element 68 1 64.83 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACAGGAAAATGTGTGCTTCTATGTTTTCGCCTCAAGCTCATTAACTGCTCGGAGCTCTCCCTACTAGATTG:1 + chr3L 5425561 3' - blood 52 2 55.48 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTTGTATATATTTTATAGCTTTGAGCCAAACAAACAGAGCAACAAAATCAACAAGCAGGC:1 - chr3R 6472639 3' + opus 441 2 65.07 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCAGCGTAGCACAGAGGCGTCA:1 + chr3R 13572130 3' + 412 7523 2 65.57 CAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCCATGCTCTGCAACGGTGCGTATGATTAATTTCAGCTACAATTAATATTGCTCATACGCCAGCGA:1 + chr3R 30524561 3' + roo 367 1 52.27 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCACATGCAGTCGACTCTATGAACCAAGAGAATGGCTTAGAACCCACCAAAGGAATCACTTAAAATGGTACTTATAGTACTTATAGTAATTTCACAAATATTACTATAC:1 + chr3R 29719464 3' + hobo 2925 1 67.12 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTATATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGT:1 + chr2L 19800962 3' + roo 340 2 65.07 CNCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCAACATAGTCGCCACACACACACACACACACACACACAAGCAGACAGGCAGCTTAAACAACAATTTCCTCCATTTGCC:1 + chrX 20106428 3' - hopper 39 1 52.74 GTACGCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAATTTGCAGTTCCACAATAATAGGAATGAATAAAAGGTGTTAAAT:1 - chr3R 14213635 3' + mdg1 7381 2 69.18 ATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATGCATTATTTTTCTTGAATTAATTGAGTGGGTTTTTTTTTTTGTAG:1 - chrX 19998402 3' - 17.6 7001 2 69.44 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTAAAGCATTCAAATTATATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAAT:1 + chr2R 5485198 3' + 1360 3376 1 75.34 GAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATATATATATATATCCCTAAATTGTTAATCTGTAATCATATAGCACATGATAAGACACAC:1 - chrX 21405272 3' + flea 4954 1 67.12 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTAATTATGGTATAAATATAAAAGAGTTTAAGAATAGATTGAGTAGAACCCTACGGTTTTTTTTCTCTATGCACCACAACGATCCCGTTAGCAAAGCAACGTGA:1 - chr3R 18498164 3' + pogo 2087 1 43.15 TCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGATGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGAGTCGGTAGGGGGATTTAAGTCCCATTCCTTGCAATAAAGAACTCTATATAGCATTTACGCAGACAATAAAACTCCATGC:1 + chr2R 3091698 3' - F-element 286 1 51.37 GTCCACCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTGGGAAAAAAACCCAAAACGAAACACTCAACTCCCGACCCAAATACCTATCGTA:1 + chrX 4788605 3' + Max-element 8466 2 65.75 GAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAGCACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAC:1 - chrX 16995058 3' - jockey 98 1 76.03 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGAAAAAGCCAGCAGTGCGGCTCATTTGCATGCCACATGACAAAAAGCTCGTAGCAAATGCAAATTGAATCCAACTTAAATGCCCGACCATCGCGGGCGGGT:1 + chrX 10698753 3' - mdg1 7059 2 71.23 AAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGTGCAACTGCTGCAAACTCTGTCTCCACTTGCAAATCTGCTGGTTTGTTATTTTAATTTGATGGCAGAGTTGTTCGGATAGTTTCTAATTAT:1 + chr2L 7906017 3' + Quasimodo 7344 2 67.81 GATTTTTCTGGGATATCTATAGATTGGGAAATACATACATACATTGTTTTATTCAACCTTTAAAAAAAAGTTCACGAAATTTACCTAAAATCCTGTTTGTATGCCACAAAATAAAGTGTTTCGAACTTGAAATTCTGACGCCAAG:1 + chr3R 12363728 3' - INE-1 502 1 75.17 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAAGTCGTTTTGTAGCTTGTCATATGCAAATTGCGCA:1 - chr2R 14921437 3' - pogo 14 1 74.45 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATTTGTATACGCGTAATAACTTGATTCCAAGCTCTGGCTGTTACGCCTG:1 + chr2R 11394194 3' + pogo 2034 1 67.12 AAAAAGGAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACCGAAAAAGGAAACCAAACCAGAAAATGCGTAATGAACGGCGAAACGCGTC:1 + chrX 3543025 3' + Doc2-element 245 5 73.75 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAATATGGAAAATAACTTAAATTACCAGATGCGGCGTGTG:2 + chr3R 29381629 3' - hobo 28 1 66.44 GGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACCTCAGGGGATGTCATTTGAAGGCGGCAAGTGTAAAAATTAAGCAGCTAGGGGGGCGAGGCAATGAGTGAGATAAAATTACCCGGAAAACGAAGGG:1 - chr2L 9109799 3' - opus 7024 2 69.18 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACATACATGTGTGTCGGTGTCTGTGTGGTTGAACGACGCCATCAACAGCTTAGAATTTC:1 - chr2R 21453537 3' - hobo 62 1 60.96 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGT:1 - chr2R 14450146 3' + roo 9008 2 60.96 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGTTATAATTTTGTTTGTTTATTAGTTGCAGCAAGCCGACACCAGTTGAATCTGCTGGTCATGGAAAAACCCACAGAG:1 + chrX 13558297 3' - mdg3 22 2 66.13 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAG:1 - chr2L 20716361 3' + P-element 2800 1 26.03 AATTTATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATCATATTTTTACGCCCACTCGTACGCCTACAAACCGCCCAATATCTATCGATATCCCAG:1 + chrX 23078698 3' - FB 111 1 60.27 CTTTCCACGTAGCTAAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAAGTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAAAAAACAGGGGTTAACTTATGACAGCGATCT:1 - chr2L 12754083 3' + Quasimodo 7108 2 78.08 CAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGA:2 - chr3R 15035042 3' - Stalker2 52 2 51.37 TTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCT:1 + chrX 21087673 3' + mdg3 248 1 66.67 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTCAAGTCAATTGAGAATGAATACGTTTTCTTTGGGTTTTCTACGCGATTGAAACCT:1 - chr2L 8009055 3' - roo 52 2 56.72 GGTAAGGAATCATAATATTTTTTAATTTCATTTAGTGAAATTGTTGCCCAGGCTTTTTTAATTGTTTTAACAAAGTATACATTTATTAGTATAAATCAAAATTTCAAGTCACTGGATAGTTTAAATAATAAAAGGCAATGTTTT:1 - chr3L 27358540 3' - Tc3 1371 1 54.86 TTTTGTTTTTTTTTTCTAAATATTAGCAATTTCTCGAATTTCCGATATAATTGTCGGTTTTTTGTTTCTGTGCATCAAGCATATATGTACATACATATATATATATTTTTATAGACCGGAATTTTGATTTTAAAACAATAACTT:1 + chrX 20008702 3' - TART-B 10632 1 51.39 GGTCACCACAGAGTACTGGGCTTTTTTTAGTCAATAGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGGAACACCAACCAGGACTTTGGCAGTCTAAGATTCCCCTCCGTGAAGTACCCCGCATAAAAATCTAGATCGAAGACACGGACAA:1 + chr3L 16692373 3' + baggins 4963 1 72.60 ATTGTACTTAGGAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGCTACCATACATTTTATACCCGATATTCGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTAATAAGCAGCAGGAAGCGTTTCCGACCAAGTACATATATATATATTCTTGATC:1 - chr4 1109920 3' + Chimpo 161 1 64.38 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCA:1 - chr2R 14921477 3' - pogo 53 1 60.29 ATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAATTAAAAATTACCAAATGCATCTATGAAATTTATCGCACGACAGCCAGACTGACTAAAAAGACACAATGGAGCTGAAGGGACGCAAC:1 + chr3L 1397111 3' + Juan 4193 1 64.06 TTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTTGAAATTTGATTTGCCGATTGCCGTCACTCCACGGGCTTTGTATT:2 + chr3R 18940604 3' + mdg1 353 2 67.12 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCTCCCTCCCTCCTCAAAAACGCCAAAAACACTCGACGGTCGTCGTCACACCGCATTCTAGTCCATTACGCAAAAAT:1 - chr3R 26845507 3' + mdg1 374 2 52.74 TGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGTTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTTATATCAGAACAAATTTATTCAATCAAAACTGAAAATGTTTTTTGATTTATACGAAATATTTGAA:1 + chr2R 10189103 3' - Doc 344 1 55.48 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGTCCATTTGGGTAACTAAATAGCTTATGGTTAGTTTCCGCGAATTTTAAGATTGCCTTTTGAGTTGAAAGCATTTGG:1 - chr3L 5425434 3' + blood 333 2 54.79 TTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAATTGCAGCGTATAACTACTATAACTAACAAGGAGCAGCAAAATCCATT:1 + chr2R 13052882 3' - Doc 75 1 57.53 TNTTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGTGTGTGTGTGGCTTGAATATTTGAGATTTTACTCCG:1 + chrX 6213632 3' + roo 361 2 54.11 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTGTGACTTGTTTTTGTGCTCGATGCGAAAAATGTGCGAGTTCGAGTCAATTAATTAC:1 - chrX 13484065 3' + hobo 2928 1 78.08 TCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGCATAAGGTATTTAACAAAATATTCAATTATTTATGATTGCTTGTATTAACTTTCATCACCGTCTGTACTGTAGTTGTAGTGTACA:1 - chr2R 10960448 3' - Doc 117 1 60.96 GAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTT:1 - chr3R 8293546 3' - Stalker2 77 2 67.81 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATATTTCTTTTCTTGA:1 + chrX 8610360 3' - mdg3 5270 2 72.60 CTAGCAGCTCAAGTGATTCAGATAAGATAAGATAAGATAACAAACACGTAGTCTTAAGCACGTCATGTGCGGGTGGCTGTACCCAAGAACAGCAAATTAGCATATTCCAATTGATTTAAACATATTTTCCTCTCAGTGTTGCTGCA:1 + chrX 10521987 3' + Stalker3T 185 1 64.38 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAATTTGCAGTTCCACAATAATAGGAATGAATAAAAGGTGTTAAATAATAGATGTTATTCACAGTAACTATATATGTACATAGAAGAATCACGATTT:1 - chr3R 14213584 3' + mdg1 394 2 65.07 TATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGCGTCTGCTGCTGGTGTTGCTGTCTCTGCCCACAATTATTAAATATTTAAAGCCATATACAAAACGTTTTTGGGTTTAACGTTATACTCTTTTACGTGACAAATGCCAGAGA:1 - chr3L 7370405 3' + Burdock 6383 2 80.14 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTCAGCAATGCTGTCTAGTCTAGAAATTAGGATCAACACATC:1 - chr3L 13380455 3' - hobo 81 1 72.60 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAATGTGCGTGGAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATGTTGCATACTTTTTGGGGTAATTTA:1 - chr2L 12861702 3' - jockey 63 1 54.11 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGGAAATTCACATTCGAAGTTGAATTCTTACCATCTGCCGGCAATCCC:1 - chr2R 12416856 3' + pogo 2041 1 64.66 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGCGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGCTTGTTTGCCTACACTT:1 + chrX 22715147 3' + opus 7449 2 56.55 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACACGCAATGGGAAATAAAAAGAGAGTCTCTTCTATTCAGTTCTC:1 - chr3R 9158121 3' + P-element 2809 1 32.19 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTACTTTAACATTATGC:1 + chr2L 19841595 3' - BS 43 1 50.68 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTATTTATTATACCAGCTGTTCTTCTTCGTTTCATTAATTTTGTTGCTGTTGTGCTTCTTTAAAGCCTTTCTTTAATTTTTCGACA:1 - chr2L 13102838 3' + roo 9037 1 62.07 ATATTCTTGATCAGAATCAATAGGCGAGTCGATCTGACCTTGTTCCTGTCTCCGTTTTTGCATATTTTTTCATAGTTTTATTAGGCATGTAAATTTCTATCGTATTGGTGTAGTTCGATTGTTTTGGATGCATGATGACAC:1 + chrX 22853155 3' + INE-1 84 1 73.05 TTTTTGACACTCTACTTGCGGTAATAAAAAACTGTCGGATATTTTTTATTCCCGCAAGTAGAGTGTCAAAAAACACCCGGCTGCCTCGATTCTTATTTTTTTCGCAACGAAATTAGAGATGGAACTGAACCGATGTTCTATCTTAT:1 - chr3L 22267548 3' - hobo 2866 1 47.95 AAACATATTAATAAAAAAAAAAACCGAGCAATACAAAAAATAATAACTTATTGTCCAATCAGACATTTTTTTGGCGGAGATTGCTGACTAATTTACAATAATTAGTTAACA:1 - chrX 14620582 3' - hopper 161 2 76.58 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAACCACAAAGAGCAAACACAAAAAATGTTGCCTACTTCCCGGCAAAACAGGTGAAAGAAACGAGCTGACCACAAAGCG:1 + chr3R 8625296 3' - jockey 30 1 65.08 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGTGTGTGTGTGGCTTGAATATTTGAGATTTTACTCCGCTTTTTCGCGTGTAACTGTTAGTTTTCAGTTAC:1 + chrX 6213665 3' + roo 399 1 78.87 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGCAGGTGAGTTTCCATTGTCCGCTGGTTCGGCTTTAATATTGATCGCAGGAGTA:1 + chr3R 15363526 3' - 412 7085 2 60.96 CTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGCGGTTG:1 - chr2L 11639018 3' - springer 55 2 68.91 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGTACTTACAATGTTTTCATTCGGCAATGACTTATTATTTAGCACACTGATAGCTGATAACACAGTGCTAATGTGAGCTG:1 + chr3L 1324373 3' - 412 42 2 56.85 TGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGTTCGTTTATTTTTCTTAGTGTACCAATAGCTTCGATTGTCCTTGCTAGCAGTGGCTTATCGGCGGAC:1 + chr2R 21353291 3' + Transpac 281 2 58.54 TATCTATAGATATCGCAGAAAAATGGTGAAATTTCGGGGAGCTCGACTATAGCAATATCTCTTGTTTTATTTGAAGAACTAAAATATTTTCCTTTTAATTACCTTTTCCCAATTTAATTACATACCTCAATTTTGTGAATTAGTCT:1 - chrX 20880042 3' + INE-1 499 1 73.97 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTGTGACTTGTTTTTGTGCTCGATGCGAAAAATGTGC:1 - chrX 13484086 3' + hobo 2928 1 74.40 TTTTAATTGGAATTTTTCTTTAATACAAACATTTTGTAAATTTCGATATTGGCAGCATTATGTAATTGATGGGTATCCCAGATCTATGGGTTTAACTGTGTTATT:1 + chr3R 23483734 3' - HB 1556 1 84.76 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGAACTACA:1 + chr3R 7109196 3' - P-element 23 1 40.28 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAATCGCAACTATTCTTGTTTTCTAGGCAGTGAAGCGAACCGTAATCCATACACTTTCAGCTTTTCACACTTT:1 - chr2R 20931584 3' - blood 7026 2 69.86 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCACACAATGCAATTTAATATAGCATACTTAACAGCGCACGACAATGGAC:1 - chr3R 22266382 3' + roo 400 1 76.71 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGCAAGTTGAAGGAGGTTATTCTGCCAGCAAATGTTTCATAGTTTTTCTCTGTGCAAAGTCAGCATCCAAGGATGCGAGTCC:1 - chr2R 21353157 3' - Transpac 4957 2 61.64 ATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCGCTGGAAAGTATGCTCCGC:1 + chr2R 5899292 3' - jockey 4572 1 64.38 GAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACTAAAAACAGGAAAGGAAGCAAGCCTGCGTTAACTGAAGATTGCAATACTCTTCGCTGGAAAATGAATTATATACAAGAAATTAGGCAAAAGCATAAACAAACTGAGCAA:1 + chrX 16871988 3' - pogo 297 1 77.40 AATGCTCAGAATAATCACAAAAACCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAGCATAGAAACACACTACACTACAGAAATTCAGCAAAGTTCAGAAACAATTAAAGTAAAATCAAGAAGTTACGAACAACACA:1 - chr2L 16531577 3' + Porto1 4343 1 52.05 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGATATGCAGATCGAAATTATATACAAATTACTTT:1 + chr3R 4352176 3' - Doc 24 1 75.34 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGTAGAATTTATCTTTAGCTCT:1 + chr2L 6716407 3' - hobo 54 1 53.42 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATAATCATAAATACTTTTCGTGGGGGGACTTAGGTGTGCGTTTTGTGTGTGGGTTTCT:1 + chr2L 1411770 3' + I-element 5288 1 65.07 AAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGCGGCCAACGAGGCGTTGCGGCCCCGCAGGCGACATGCAAAATATGTAAAACACATACAACACCAAGCGAAAAGAAAGTTTTAAAAAAGATCT:1 - chr3R 19996790 3' + hobo 2527 1 66.44 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATACATTTTATCAATAATTAGCATAAAGTTATTGCATAAAGTTACCGGCACGAATTCGATTGGCCAAGCAGCCAACATTGCGTATACGTAATATTTTGC:1 - chrX 18055672 3' - 297 18 2 73.97 TTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCAGAACTTTCTTTTTCCACAATATTACTTTGTTTTGTTTAGAAAGCGTAATTCCA:1 + chr2L 8852870 3' - Burdock 6198 2 62.33 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCCAAAAACAAAAGC:1 + chr3R 18935171 3' - jockey 4748 1 67.12 CTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGTACATACTTCCCCCATCCGAACCGACCTTATAGAC:1 - chr2L 9228688 3' + Burdock 191 2 74.80 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAATTTAAGCTGTTAATGGCCCATTTGGTTTTTTTAAATGAACCAAAGGAAGATCATAGCACACAATCCT:1 + chrX 10838647 3' + roo 387 2 70.55 GCGAGATAGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTGGGCTAGCTTACTTAGCTTGTTTTAAAT:1 - chr3R 15157594 3' - invader3 5271 2 64.38 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATTTAATTAATTTAATGGACGGCCAATAAAAGAGGGCAGTTATTAATGAGCATTAAAGTGTGAGCTGCAAATGAAAGCAGTAAATAATAAATACATCAAGG:1 - chr3L 20042369 3' + flea 4993 2 70.55 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGTCTAAAAATAGCCACAGCGAATGCAGTCCAGCACACGA:1 - chr2L 20716299 3' + P-element 2862 1 68.49 GAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 192 2 74.39 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTAAACGTATTTTATAGATCATTTTGTTCTCATATGAGTGTAAGCGGAAACACAAACACAGGCTGCCA:1 + chr2L 770079 3' - roo 53 2 55.48 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCCAAGCAGCTAAAATACGGATAGGGTTG:1 + chr3R 31264214 3' + jockey 4922 1 80.83 ACTTAAAGCAAAACTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTAGACTATCGTAGTTAAATTAGGTAACATAAACATATGGATAACTTCATTGTTGATTTAACAAAAATGTGTTTGGACTTGGGCTTTGACTGCCAGCCTGTCATCATTA:1 + chr3R 26683476 3' - Tc1-2 1558 1 77.40 CGAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCACTATAAATGGCTATACATTTAAAATATGGTACGACCACATCCAAACAGATGAGTCCGAGGCTACCAACGAGTGCCTCAGGTCATCTAACCCAGAGGAATCCCCTCTAC:1 + chr2R 2146386 3' + Doc3-element 4437 1 76.71 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAA:1 - chr3R 26031690 3' + pogo 2039 1 61.64 AATGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTCGTTACTCAGCTAGTGTAAATTTTGTTTCGAAAAGTAAAGCTTAAAATAGAAAGTACCTTCAAGGTGGGATCTAACCTAGATTTACCTGGATAATTTTCTTCAACGATTCTAGTATACGGG:1 + chr2L 21268563 3' - INE-1 570 1 73.97 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAATTTGAATTATTGTCTACGTATTAGAAACTGTCATTGTGAGTCTAGTTTTACCGCCTG:1 + chr2L 42643 3' + copia 239 1 73.97 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATACGAATATTATACAAATAATAATGGCATATAAATGAAGTAACAAACATTGTTTTCCTTTGACATAACTCAT:1 - chr2R 10915631 3' - F-element 62 1 56.16 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGACTGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTGCTCACTAAAATGCAAAGCTATAGTAGCTGGTTTTTTTT:1 - chrX 12344296 3' - F-element 64 1 53.57 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCTGTAGGCTCACCTACTCC:1 + chr3L 5948071 3' + P-element 2787 1 11.64 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTGGTCCTTGGTGGAGGCCCGTTCTCAATCCGTTGGCGAGGACCAAGTGCATCTTGTTACGCCGCACAATGAATACCAAAAATTCAATTAATT:1 + chr2R 10666966 3' - hobo 9 1 76.00 GCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGGCTTTCGCTCAAATACCTAATTACCAATCTTTGTTTGAACATCCACAGATGTCACA:1 + chrX 6593347 3' - hobo 2653 1 61.38 TTGCTATGGTGATAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAATCCTTGTTAATACTTTCCTCTTTAGTAGCACTCAAAATCACTCTTCCTGATAATATATTCAGGAAAGTATCCAGGCCCAATCCTGAGT:1 + chr3R 903032 3' - R1A1-element 293 1 61.64 CAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTTGCAGGAGCCGTCATTCCGTCGGGTTCAGTCTGCAGGATTGCTGATGGATTTCACA:1 + chr3R 5767497 3' + roo 377 1 63.70 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGCGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTCCGCACTAGACGAACAGGTAACAC:1 + chr3R 5684184 3' + pogo 2077 1 61.72 TTCACACGTCGGCGATCGAATTAATTCGACGTTAATTGATCTGTTTTTAATTTAGCTGCTTAAACAGGCGATAGGAAAACTTTCTCATCAACTTTGATAACATTTTTCGCATTCAATATCGAGTATGATAAACTTTCTTACGTATT:1 - chr2R 7540928 3' - F-element 13 1 80.14 TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTG:1 - chr3L 10068915 3' - 412 85 2 76.03 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCAATAGGTCCCAATAAAACTTAAAGTTACTTCCAATTTATA:1 + chrX 16538177 3' - mdg3 78 2 71.23 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACGAGTTGCGCAACCACAGCGCCCCCGCATACCAAA:1 + chr2R 18786079 3' + roo 9021 2 52.05 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACATTTATAAGGATTGACTATGTTGAAAGCATAATTTTACTAGTTTTCAACCATTAATATATTCCTATTA:1 - chr2L 19800860 3' - roo 8717 2 54.79 ATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCCGCCTACGGTTGCAGTTGCTCCGGGTGCGATGCACTAGCAA:1 - chr2R 21105726 3' - Stalker2 81 2 71.72 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAAGTGCATTTCATTGCTATAATCAGAAATTGATGCTGCGGAATGTCGTTCACCCTGCAAATGGATATTTAGAAAAAAA:1 + chr2L 11559831 3' + roo 9032 1 58.90 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATATCACAAGCTGATGCCAAAACACAAAAACCTATACCTCCGATCCGCATGC:1 - 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chr2L 10397462 3' + Chouto 6085 1 71.63 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATA:1 + chrX 8610324 3' - mdg3 54 2 52.05 TTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGT:2 - chrX 21087572 3' - mdg3 5300 2 54.11 TCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAATTCTTGTGGTTATTCAATATAACTCACTCGTTTGCCATTGATAAAAGGAGCAGGAGGCAG:1 + chr3L 12326018 3' + Tirant 8411 2 58.90 TTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACTACATAATTTATTAGGATTCACAGTCGAGTCCTTGCGTGCACTACATTACAGTAAGTTACAGTAACAATTGTACACCCAAACGTCTTAAAAACTAC:1 - chr2R 10202945 3' - 17.6 6946 1 41.67 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATATTTCTTTTCTTGATAAGTAT:2 + chrX 8610367 3' - mdg3 5263 1 77.40 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCCATACATGTATGAATTTCTCCGAGGCAT:1 + chr2L 2522986 3' + mdg1 362 2 58.22 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGCGACGAG:1 + chr3R 5087152 3' + P-element 2829 1 39.85 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATTTGTTTTGCCATTCCTTAAGCTTTACAACAACCATACACAGCGAGTACGATTACATTTAGAGAGTTTAGTTTACAAAATTGGATAGGT:1 - chrX 13808695 3' - pogo 28 1 40.41 ACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGATTCGTG:1 - chr3R 6171133 3' + 297 6953 2 62.64 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATGCAGTGTAAAAT:1 + chr3R 24301938 3' + Tabor 448 2 60.96 GTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACCAGCCAAAATCGACTGTTGCGCTGAACGGAGTGTAGATAA:1 + chrX 21087705 3' + mdg3 232 2 59.59 TATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGT:1 + chrX 8610320 3' - mdg3 5310 2 54.79 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGGACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTGAACAAAAAACAAAAAAAATACAA:1 - chr3R 26031680 3' + pogo 2052 1 52.45 GAAATTCAAAATTAAAATTATATCAGTAGAATGTCATATTTCATAATTTCGTAAAATAAAATAAAAAAATATATGTTTATAAAAATACGCAGAATATTTATAGTATATGTATATGCATACTATGCAGAAATACAAAAGTAAGAAGA:1 + chr3L 7157812 3' + Rt1b 90 1 73.97 TGATAAATTAAGTAAAAAAAAACGTATTAACAAGTTCAACAACGAAATTGTTATACTAATGACTTAATTTCAGTTGTTTTTAACTTGAAAACGCAATGGAATAAAGGATTCCTCTTGGGTTTATGTACAATTAGTTTGTGTTTGAT:1 - 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chr2L 15096867 3' + jockey 4949 1 54.79 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATCGCCTATGTGTAACTATGTGTACTTTATAAATGTTCACCTGAAATGGATCTCTGTAAG:1 + chr3R 17747413 3' - 297 19 2 73.10 AAAAAAAGATATAAAAACAAATTAAGGCACTATATACAACAATAAGAAATTGTGATAATGTAGGCTCTGTAGGCTCATCGAGATGTAATCGCACAAGCTGGTTACTGGTTAAATTAAAATAGAATTTTGGAGGTTCTTATTATTTT:1 - chr3R 30213208 3' + Tc3 1575 1 52.05 AAGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGGACAGTTCTAGAATGGGAGGAAAGTTTGACTTTTCGAAAGTAAAATCCTGACGAAATATCCCTAAGCGAAATATATAAAATATAATTGTTAATAGACAGTTCTTAAAAAGCTTAGATCAG:1 - chr3L 15233675 3' - gypsy12 10004 2 55.17 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGTA:1 + chr2L 6716389 3' - hobo 72 1 65.75 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGGTGCAAATTTTATAAAACAGTTTCAACTCGATAATCGGGTCAGGACTTGTGTCCTACATGTGTGTGTGCTCGG:1 - chr2L 246562 3' + P-element 2841 1 54.79 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTCGAAACTATTGAAGTTTATTCCCGCTTAAGTAAAAACACGTCCGCTTTGGTTGAATGATCTTTATTCGATACTTTTATTGACTGCTT:1 + chr3L 24089642 3' - 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roo 228 2 61.38 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCAGGCAGCAACAATATTTACAGCTTTAGCG:1 - chr3L 11296558 3' + P-element 2795 1 22.76 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACTCTTGCATACACTCATACCTACCTAGGCGTCTTTTCTAGGTTATCAAACGGT:1 + chr2R 14486573 3' - 297 6640 2 64.29 GTACGCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGGAATAAAGTGTGAAAAAATTAATTTATTTCAATTACATTTCAT:1 - chr3L 21405402 3' + mdg1 343 2 69.18 GATGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTGTTGACACACTGCTT:1 - chr3L 15374620 3' - 3S18 61 2 56.16 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACATATGTATATGCTTGGGGGTGGGCCATGGGCGGTCTGATGGCTGCACCACGTGGGCAG:1 + chrX 1726760 3' - 297 6640 2 65.75 GTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGGTTCGAATTGCGAAAGAGTTTAAAACTCGAG:1 + chr3R 9863025 3' - Stalker2 15 2 75.34 TTTGTTCATATCTTGAAGCACGAAGTACGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAATTATTGCAGCTCGATGGGGGAATTCGTTGTGAATAATCGATTGGCTTATCCAGTATTAGCATATTTA:1 - chrX 922223 3' - 1360 484 1 54.11 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCCTTTGTTTTATATTATATGATTTAGATATAAAATCTAGAACACATTACTTAAAATTATAAGATAATTTAGTCGTAGAATGTTTTCCACGATTCTCTCT:1 - chr3R 6523168 3' - I-element 25 1 67.12 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCAGGTGTATAGTCCTTGTCCAAAAAGTAGGCTACGATTTCTACAGGAGGCCGAGGACCAGGTATTTGAATGGTCGGGAGTGCAAAAGCTTCCACTTGTC:1 - chr2L 6716265 3' + hobo 2915 1 69.18 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAATAATACTACGACATTTTTGATAAAGATTGCTCTATTACATTGGCAAATGATAGCCCCACATTTGGCTTCGGGTTGGCTGTCGTTACTAAGCATTTC:2 - chr3L 11228031 3' - pogo 19 1 72.60 ATTCGAATTCACATTCACATTTACATTCAAACTCGCATTCACATTTAGAGGAACAATCAGAATCACGATGAGTGCGCCAGACAGAGCGCAGACGAATCGCTATATATGTACATATGTACTACGAGTATATGTACATATATGCACCG:2 - chrX 15543397 3' + Rt1a 311 1 59.59 GATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATAGATATATTTCTCTTTATTTTCTTGCTTTGTGCATAAAACTGTCTGGGGTAACTTGATACTGGAAGTAAAAACTGTCGCGACAATTGTTTGGCTTTTTTACTGGTTG:1 - chr3R 8884253 3' - HMS-Beagle 11 2 76.71 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAGACAAATGTCGCTGGCAGTCGC:1 - chr2R 24021521 3' - pogo 29 1 65.75 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGACTATTGAAGTCTATCCACTCTATATGAAGTTCGGAAG:1 - chr2L 11043540 3' - roo 8746 2 76.03 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTT:1 - chr2L 12766996 3' - hobo 63 1 70.16 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGCCGTCGCCGCACACGCAGAGCATTCGC:1 + chrX 1831327 3' - P-element 59 1 45.21 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATAAGTTTCCTGCTTAGATTGTAT:1 - chrX 16857038 3' - pogo 44 1 52.74 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATACATATAGGCGGAAAAGCGACAGCAGCAATACTAAGAAAAAGAAAAGTGGCACAAACTTTCCTCTTACCCTGCCTTGAGGGTTGCTTTGCCACCATAG:1 + chr2L 9109987 3' + opus 7483 2 64.38 AGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAAGCAATTAGCCAACGGTGAGGGGGTAAAGCTTGGCGGGCAGGGGG:1 + chr3L 19702844 3' + pogo 2031 1 66.44 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATATGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGAAGTTAAATAGAGTTTGTGGTGAACAATAAGAAATTTTTCCCAGTGCAGAGTGTATATTTGTACAAGTGCGAGCACTGG:1 - chr2R 22616819 3' - BS 5019 1 73.97 TAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTAAGTATGAGTAGAGAAGGTGACGATTGACTAACTGAC:1 + chrX 5115320 3' - Burdock 105 2 74.48 TTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACAAACATTTATAACTTTGAAATCATTTAGAGTTTATTTGCACCAACATGAAAGAAGCAAATAAACACT:1 + chr3L 11754779 3' - Doc 137 1 54.11 TAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGTATTAGGTTATCCTTGCCACACTCACTCACTCACACACACAGAATACAGTGTGTTTAGCACAACCATTGTGGGTCGAAAAT:1 - chr2R 11179505 3' + I-element 386 1 66.67 TTTCAATAAACAAATTATTTGATTATTATGGCCGCCAATTAAAAAAAAAAACGCACGAGTAAAAAAACGTGTGGATGATGACGAAACCTGAAACTGGGCAAAAATAAAGGCAAAATGTGGAGG:1 + chrX 13980523 3' + Idefix 298 2 64.23 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTGAAAATCTTTAGAGATTTCGAGTGTTCTGGAAAGTAGGAAGTTTCCGGCTTCAGTGGGTTTTATGAGTAATTTG:1 - chrX 7624035 3' - roo 8709 2 55.48 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGACAAATATGAAAGCGTCAGGGGAATGGGGAAAACTCTGAATTTTGAATGGTTAGGGGTTGGTGGAAGTGGGCAAGGCATGACAAGGAACTTCCACACGCTGCCAGGACG:1 + chr3R 12781638 3' - pogo 10 1 77.40 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATGAAGCTCCTATTAAAGAGGTGTTTCCCGTGGCCGATTTAAGCTGCCGCTTGT:1 + chr3R 26658232 3' - hobo 69 1 63.01 CCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTTGGTTTACTTTTCGAATGATTTTAAACGATACCCCACATCCATCCCAGTCCTGCCCAGCATGCATCCGTTTAGCTTTGATGCGGAGGCCAACTAGGGC:1 - chr2R 7343199 3' - flea 17 2 71.23 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAACAATATTGTTTTTTAACTCAAAAGGAATAGATGATAATGATATTCAGAACACAGCAGCTAGCGCAGAACTCTCTGTTATTGATGGTAAC:1 - chr3R 10800471 3' - roo 8697 2 61.64 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGATCGGCTTGGATCGTTCGGATCCGCTTGGATCGCTTTGGATCGCCGCGAATCGGGGGCATGC:1 + chr2L 8700058 3' + P-element 2878 2 61.22 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGAATGGCTTTACTTGAAATTTTTGTTCAACACAAGAGCACGTTTAATTATTACATTAAT:1 - chr2L 15096833 3' + jockey 4983 1 65.75 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTTAATTTAAATATCCCATATTATTTAAGTTCATTTAATATTTTCCTTCTTTTAATCTCAATTTTACCAATTAAGAGTTTTATAAATGTTCCA:1 - 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chr2L 8807847 3' - HMS-Beagle 6840 2 59.17 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATGAAATTTTTATTATTAAAAAAGTGGCTGAGCAAAAGCGCGGCTTACACGGCGGATGGTTAATATTTGCT:2 + chr3L 13568075 3' + copia 5073 2 54.11 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCCGGGAATTCCGGGCAGAGCATCTCTTCCAGCTGATTGCTCAATCTCAATGAAATATGATTAAATAAATAATTGTTGCTTT:1 - chr3R 21734500 3' - copia 43 2 56.85 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGG:1 - chrX 12003950 3' + P-element 2790 1 20.55 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTACATATATATACGGGTTAAGGGCAGCGAGAGAATTACCGATCTCTTACCATCGATGGCATAGTGA:2 - chr3R 22676182 3' + 297 348 2 58.22 CCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTCGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACACAACTATATTATATGCGCCTACTGATTTATTACTTTAAAGAATAATAATTT:1 + chr2L 9499336 3' + Transpac 231 2 71.23 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTAATCCTAATCTTTTGGAAGAGGTTTTTAAGCTAGTTTTGGTAATCAAAATGGTTGTG:1 - chr2L 3150980 3' + blood 368 2 75.00 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGT:1 - chr2L 16360586 3' + hobo 2875 1 70.77 GGTCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAATCATGCCTCATCGAGTCGCCGGCACTTCAAACGGCCGACAATTGAAAGGCATAATTATAAATGTATCAACTAATGCATATGGCA:1 + chrX 20940705 3' - 1360 251 1 57.53 GAGTGGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCAAATGACTTCCGTCGATATCTGGCTTACTCCATATGGGAGATCGGGCCAGATAAGTG:1 + chr2R 23039366 3' + flea 126 1 61.64 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGGTATTTAAAAACAATGTTATTAGAAATTGTGATTCTTGCCAATTTATAGAGCT:1 - chr2L 769977 3' + roo 9004 2 67.81 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGACAAACTCGGCTATCCGTCGAACCCAAACCATAATAGAGTGGTGATGGGGAGCATTTTATAAGTGCCCGAACTAAAGGACA:1 - chr3R 6603731 3' - pogo 38 1 59.59 AAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTAGAGTCTCTACTTTAATAGGTACTT:1 + chr3R 1048067 3' - Stalker2 51 2 51.72 AACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAATTTGAA:2 + chr2L 42592 3' + copia 188 2 64.38 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' + P-element 2830 1 44.29 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGACGAGGAGGAGGTGGAGCGGCCTCAGGCGTCAAATA:1 - chr2L 20327573 3' + roo 9039 1 59.59 GCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCTGAAAGCCAGATGTTGCCAAAAATTGCAGGTTAATTGAATTTTCTAGCAGCAGCGCCATTTGGTAT:1 - chr2L 3677577 3' - BS 48 1 55.17 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATGCTAAATGGAATGCCAATTATCATTTTAATT:1 - chr3R 21758529 3' + Juan 4129 1 78.08 ATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGATTATGA:1 - chr3R 19589874 3' - BS 5017 1 65.75 CTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGGTTATGTTCGGGTGATTCCATATCAGTTTTCCATACGTACTCACATCG:1 - chr2L 12696133 3' - pogo 69 1 71.92 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATTCTTGATCAACAGCAAAGTCGATATAGCCTTGTCCGTTTCAGAGTAAACTTGTTGATACTTTCCCAAAAGTAGTATAGATTGGATAGGACCAATATAT:1 - chr3R 6461694 3' - Transpac 15 2 76.03 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTTTGACCGCACAGTCAATTTAATTTTAATTTACACTTCATGCATAAAAAATTAAACGCGCGTTGCCGTGTCAATTGATGAGCGGCGAAATCGCGCCACACGC:1 + chr3L 19434209 3' - Doc 27 1 67.12 ATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACAAATTTTGGAATTCTATCCAATTTCATATTGCTGTGAAGAAGTTGTTCTCTGCCGATATTACTATTTAACCAGTTTGTGAATATACTATTTTCTTGGTATGAATACAA:1 + chr2L 2621634 3' - BS 5057 1 73.29 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGCAAGTTGAAGGAGGTTATTCTGCCAGCAAATGTTTCATAGTTTTTCTCTGTGCAAAGTCAGCATCCAAGGATGCGAGTCCTAAGTGTGCATAAGCGAGTGGA:1 - chr2R 21353135 3' - Transpac 4935 2 76.71 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTAAAAATCATTTAAGCTTGCTAACTCCACCGAGAG:1 - chr2L 15596940 3' + roo 8988 2 80.82 AAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTAATTTAACATTATGCGGCAGACA:1 + chr2L 19841603 3' - BS 35 1 57.53 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATTATATTGCATACAATTTTGTTCGTCCTAAACATTGTGTAGCATTTTATTCAATTGGTGGCAACTATGATGAATAATTGTGCTCAGTGTAGTCG:1 + chrX 14318526 3' - 297 13 2 76.60 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAATAAATTACACGGAACGAGCCTGAAGAGCAGCAGAAAAAATGTGA:1 + chr3R 19500730 3' - jockey 87 1 51.37 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCAACACAACAATGGGAAATGCACT:1 + chr3R 25409744 3' - jockey 4748 1 81.89 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATTTCGTGTTTTATTGTATATGCGTTTATATATCTAC:1 - chr3R 7136562 3' + roo 9021 2 51.72 TTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATAGATACGATGTGTTGTTGCAACAGGACGTGACT:1 - chr3L 9317487 3' + HMS-Beagle 164 2 77.40 ACAGCTGTGGTCAGAATAATAGTGGTGGGCAAAAAACGCATAAAGTGCCTAAAAAGACTTCTCATAAAGCCAATAAAAGCGTTTTAAAATATTTTTCATAATTCTACATAATCTTTCGCTTGTGTTGCCGTTCTATTGAA:1 - chr2L 13261947 3' - HB 1628 1 49.29 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATA:2 - chr2L 1870961 3' - mdg3 5336 2 73.29 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGAATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATGTCACTATATATAAGAAAAAGACATTTTTCAGCATTCAACTCACTTTTTATTCATCATTGCTAACGAACG:1 + chr3R 443313 3' - Quasimodo 45 2 56.85 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGCTTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGACACAGCTTTTTACTGAAAACTGAAGCATTCTCCCCCAAAAAATTGTTGGGAGGTAAACTA:1 - chr2L 42453 3' - copia 4885 2 74.66 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCT:1 + chr2R 18922609 3' + opus 7438 2 63.70 CGCAGAGCGCTGAACTCAGTTTGGGCGCGTCAGCATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATATATCCTTTTCCCATTTAATTTTACCTACCTTTTAATAAATA:1 + chrX 21638098 3' - gtwin 6994 2 71.23 GTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCATTCGCTGCCAGTTTTCTCCTACACCTAAAGCGATTTATATACATATAAAAATAAATTAGAGTTAGGATG:1 + chr3L 21043149 3' - Quasimodo 43 2 56.85 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGAGGGGGTGTGTGTTTAAATGGCGCCTGGAGAATATCGATTAAATGCTCGTTTTTTCGGTTATTTGTTGCTTGTTAATTTTAAATTCCATGTTT:1 - chr3L 5731212 3' - 297 6602 2 71.92 TCGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAAAAAATTAAGAGTTAAATGCTTGCTGAGCTCATTATTTACGAAATTGAATTTATTAACGACTTTTATTTGCTCGAGCATTAACAAATAAATACTGT:1 + chr3L 12263952 3' + Rt1a 5035 1 65.07 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTAATTACCAAACTGCTGAAATAATTATTGTGTTGGTTCTGTTTCTGTGTGAAGGATGAAATGGAAAGCAATTTAACGAGACACATGGGCACATTATCTCGGTCTGCTTCAA:1 + chr3R 25053154 3' + pogo 2092 1 76.03 GCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATACATTTAAATGTATACATTTGAATGCTTCTTTTTGCGTAAAATATTTATTTATATTTTGA:1 + chr2L 13156585 3' - Max-element 8299 2 58.90 TGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCAGACTGAGCTGTGAGCACTCAATCATTTTATTTACTT:2 - chr2L 5732751 3' - hobo 84 1 73.97 ACTTTAATTTATTTTACTCTACCATATTTTGTTCAAATTGGATGAATGTAACATAGTGTTCGTATAATTTATTTAAAGATAAAGGTCATCGGAAGCTTTGATTTGCCTTTTTCCGAGTAAAAATACTTTTGGCAAACTTCTTGTTC:1 - chr3L 17501199 3' - TART-A 13135 1 73.97 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATATTT:1 + chrX 8610350 3' - mdg3 28 2 65.75 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTATG:1 - chr3R 26405003 3' - hobo 56 1 55.48 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAATGTTTATTTACGCAACCAGCGCAGTTGAGTGGCTGGGC:1 + chr3R 29615075 3' + roo 9042 1 72.92 GACATCTTACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAAAACCATCAGTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAACCAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATTCTACCAGTCATCAACGCAATGTGGCGGATATCTGCCCTTACAAGGCCGGG:1 + chr3L 24757763 3' + F-element 4313 1 79.45 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGA:1 + chr3R 7109190 3' - P-element 102 1 15.86 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGATAGAAAGATGAATGGATGGATGGATGGATGGGTGTAAGGGTGTCTGAACAAGCC:1 + chr2L 7596095 3' - P-element 18 1 35.62 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTGGCAGCTGCAAGCTGCAACCAGCATAAAACTGTATGCTACGTCGGTGCTCGGTGGGTTCTTCACACACACATTCACACATACACGCATGCGGATGT:1 - chrX 18193418 3' + jockey 4970 1 51.41 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGAAAAAGCCAGCAGTGCGGCTCATTTGCATGCCACATGACAAAAAGCTCGTAGCAAATGCAAATTGAATCCAACTTCAA:1 + chrX 10698731 3' - mdg1 27 2 61.54 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGTGTGTGTGCCGCTCGCTATCCTGATACACCCACCCCTTC:1 - chrX 20106283 3' + hopper 1384 1 63.01 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGATAGCGAAATCAAAGTCGAGTTTACTGAATCCACAATACACATCTCCAATAACCGCAACGCCTTGGCGAGGCAACAAAGCACATTTGGCAAAAAC:2 + chr3L 1728617 3' + blood 7362 2 41.10 CCACCCGAGGCCTGCTGCGCAAGAGCCGTATGGGTGAGTGGACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTTACAACAAGTTGCATGGATGTGCAAACACAAACAAC:1 - chr2R 22003027 3' - hobo 2788 1 75.34 TGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTAAAATGCACAAACAAACCTTTTTCAATGCCCCCGTTTTGCTTTTTATGCGCCGTGCGATGCGTAAAT:1 + chrX 2781311 3' - FB 56 1 55.48 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGA:1 + chr2L 21082200 3' - mdg3 5333 2 71.23 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAAT:1 + chr3L 3540194 3' - mdg3 5325 2 73.97 ATTATATTTTATGTAATAAGGAAATTTTTATTTTTTAGGTTAGAGTTGATTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGAATTAAGTTTTTAATTTCTAACATATTTCTATGTTATGTGTGTGTTTTAAAACAAA:1 + chr3L 25256455 3' - Burdock 398 1 61.64 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGGCTTTTGGGGTTAGGCTTTAAGAGCGGACTGCAAAAGGACCGGCGAACAACAAA:1 + chrX 20379384 3' - hobo 63 1 60.96 AAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTATGTATATAGTAATACATCAACAACGTGTAAAAGCGTTGAAATAAGG:1 - chr3R 4570248 3' - Juan 77 1 67.12 CACGTTACTCAGCTATTGTGAATGCGAACGCGATATTTCATCATTTCATTTTCGGGGTTATATTGGGTGATATTGGGTGATGTCCTCTTTGATTGTGTTTATTTTCCACTCCCTCTACATTTTCGGCGCTTTTCTTGGTTGGTTC:1 - chr2L 3661026 3' - INE-1 537 1 55.17 ACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAGCCCAGAAACAACAAGTATCGTTTATAAACTAGTTTCCAGTTCGGATGTGTGTGTGTGTACTATAGTGTGTGTGTGTGTGCAATTGATTAAACAACACAAGGGTAACCTAGGCCA:1 + chr2R 15155832 3' + I-element 5100 1 76.71 GGGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATATCACAAGCTGATGCCAAAACACAAAAACCTA:1 - chr3L 18420943 3' - jockey 4760 1 76.71 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACA:2 - chr3R 26031681 3' + pogo 2048 1 55.48 CATTATGCCATCCAGGTGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCTAGTCGAGAGCTGCACGTCACGCATCTGGGCTCCCCTGGTACGTGATGCTGGCTAAGCAATTTTCCCCCAATCACTCAAGACT:1 - chr3L 6572799 3' + G5 4387 1 74.66 GAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCTGCATCAGCTGCTGCTTTCGACTACTCCTTCCATTTTGGGCTCTTGCCTTTG:1 - chr2L 15523866 3' + opus 7490 2 78.08 GAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCGAAACTCTTTGGATTGGTAGCCGCTTTAACTACTGTTTGCGGACGCAGGAGAGCGCCGAGTTTCTTTTGCCTTTTGGCCATT:1 - chr2L 7907664 3' + Quasimodo 7013 2 54.11 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATAATACCACAGGTACTCTTCTCCCCTCGCATTCGAGCCACC:1 + chr2L 20253938 3' + roo 9040 1 51.82 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAGCCTAGTTATGTAATGATCCTGAAGAATGCTTTAAAAAATTATCCACAGATTTCCAGAA:1 - chr2L 5724294 3' + 1360 3366 1 47.95 ATTGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTGGCATATGCA:1 - chr2R 20117300 3' - mdg3 74 2 67.81 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCGGGGTAGATTTAATGCGAACTTCTGCTAGGTTATTCGAGTGCTGTAAGAGCATTAATT:1 - chr3L 6541987 3' - hobo 50 1 55.97 ACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGGTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGAT:1 - chr3L 23456282 3' + Gypsy6A_LTR 248 1 74.65 TTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAA:1 - chr2R 10666858 3' + hobo 2857 1 71.23 AGTATCTGCACAAGCAAGACCACCACCCCCACCCCGACGAGCTAGAGCCAGATTCTAAAAAGTCTACCCTTAGTACACATAACTGTCCGTCAAACTATGATTGTCACAACACGAGGGGATCATTCCGATGTTATAGAAAAATCTCA:1 - chr4 220343 3' + Gypsy12A_LTR 2160 1 55.48 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATACGAATTGCAGGCACTGTGCGATGTTATGGGTTTTGATTAATTGGAAGTGTTGTTTGACTTGGCCGATTTTGGGGG:1 - chr3L 5329073 3' + 412 448 2 54.11 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCC:1 + chr2R 12642758 3' - pogo 41 1 57.53 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTAATTTAACATTATGCGGCAGACAGAGCAAAATAATAAACAA:1 + chr2L 19841621 3' - BS 17 1 69.86 AAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGAAGGGTAGAGGGTATGAGCACAACTC:1 - chr3R 4739731 3' - P-element 96 1 22.60 CTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTTGGTTTACTTTTCGAATGATTTTAAACGATACCCCACATCCAT:1 - chr2R 7343254 3' - flea 4818 1 68.15 TAAAAATCAAATGCAATTTGGGTTGAGGAGAAGCCTCAGAATAAAATTATTAAAATTTTTTCATTTGCACGCAAATAAAAAAGCAGTTTACGTATGACGCCCACTGTAGGCGTTGTTCGCCACGGACATTACACTACTACTTATCT:1 - chr2L 14382511 3' - 297 6842 2 57.53 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTCTGACTCATGTTGTACC:1 - chr2R 9408152 3' - FB 40 1 55.15 AATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATGCCAGCTTCCTGCTAAAATCA:1 + chr2L 8807954 3' + HMS-Beagle 6995 2 53.42 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCTGCATC:2 - chr2L 15523912 3' + opus 7444 2 60.27 TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAA:1 + chr3L 3540193 3' - mdg3 74 2 74.66 TAATTTAATTTTAATTTAAATTTTTAATTTATCAAAGCTTAAATGTAATAAATCTAATTTTCTCTCTGCTATATTAAGGAATAATAAAGCATAAATTATACGTGACTTGAAGCGGATGATTATTTTATTTGTGGTAACTATGGTTT:1 + chr3L 13468036 3' + Rt1b 129 1 77.40 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCTACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCA:1 - chrX 16995052 3' - jockey 93 1 73.29 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGGTGCAAATTTTATAAAACAGTTTCAACTCGATAATCGGGTCAGGACTTGTGTCCTACATGTGTGTGTGCTCGGCT:1 - chr2L 246560 3' + P-element 2843 1 56.16 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTCCTTGCCGGCGGCAGCATTCTGAGCGGGCTGCCCATTGC:1 + chr2R 14450223 3' - roo 65 2 68.99 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGAATGGATCCGTAATGAGGGTTATTA:1 - chr3R 18940458 3' - mdg1 7044 2 78.32 GAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCATTAATA:1 + chr2L 23295902 3' - micropia 4993 2 57.53 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACCATTTTCGCCATTCGCCGCCTCGGGCGTAATTTGTAAATCTCTGCAGGCGCAATTTATCTAAACATCCTTCGCTTCTCCATTTATCCCAGGAACGCCCACACGGCTCCG:1 - chr2R 18467075 3' - roo 10 2 75.86 ACACCAACATAATTAGTTTAATTGGCGCTCAACTAGCGGGAAATACGCACCCGCCCCCGAAGACCATCAAGCCACCCCCGATCTACATCCCAGACGTGACCAACATCTCAGCCCTTGTCATTTGATTGTCTGCCGATCGGAGAAAC:1 + chr3L 15111386 3' + gypsy6 385 2 47.95 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACATTTATAAGGATTGACTATGTTGAAAGCATAATTTTACTAGTTTTCAACCATTAATATATTCCTATTAATGTTTGAAA:1 - chr2L 19800850 3' - roo 8707 2 54.79 TTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGTGTGTGTGGGCGCTGGACAATCAAAATTGATAAGGGGCGTGCGCACAATCACAATCACAG:1 - chr2R 14486466 3' + 297 340 2 63.70 GGGGAACCTGACAGCGTCTTTAGCTGCTCTCTCTCCGCCGTGAACCTGGAGCAGTGCATTAGCACATGTTCTGCTGTTTCTTCACCGTCGCCGCTGAAACACTGACTCAGTTCAGCTTTTGTAATCCATCAGCGCGGCAGCAGCGC:1 - chr2R 24826531 3' - Rt1b 4675 1 61.64 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCATGACGTTTTTCTCGCTTTTTCTCGACCAATCGGAGCA:1 - chr3R 25137975 3' - P-element 84 1 28.08 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATGCACCAAACGCTCCTGTCAAACGACAGAGAGAAAGTGCTAGTGCCCAATACAAAATGGACACAGGTTACGAAAATT:1 + chr2R 4352209 3' + blood 332 2 54.11 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAAAGTTTATATTTATTACTATTAAAAGTACCAT:1 - chr2R 11609881 3' + roo 9012 2 61.64 TTAATTTAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATT:1 + chr3L 16973457 3' - S-element 67 1 62.76 TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATAAATAAATTTTTATGGAAACATTTGCAAATACCTCGACCATTTCAATCTTGCCAGCTGACA:1 + chr3R 26643397 3' + 412 7489 2 59.59 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTGAGTCG:1 + chr2L 20716430 3' - P-element 64 1 42.47 TGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATACTGCATAGTAGTAAAAGCGACTAAGTAACCTAAAACTACATATGAATCAACC:1 - chr2L 14678742 3' - Quasimodo 60 2 64.38 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAAGAGTCCATATATATATTTAATGAAGCTTTTTTGGTGGTCCGTCGCATATAAATATGTTTTTATATGACA:1 + chr3L 20910106 3' - F-element 65 1 55.48 TCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCTCCCTCCCTCCTCAAAAACGCCAAAAACACTCGACGGTCGTCGTCACACCGCATTCTAGTCCATTACGCAAAAATTACGTACGGAGATGCGATGCTGATTGAAAATATTTGCTG:1 - chr3R 26845468 3' + mdg1 413 2 79.45 ATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAACCTTAAGTCCAGTTATGTACCACGAGTTATTTGAATCCAAATGTAACTCAATGCGCACATTTT:1 + chr2L 21081889 3' + mdg3 110 2 56.55 CTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACACATCGCGAGTGATCTGTGAGTTCATTAGGCGCACCCATGGAGCTGGAAGCCCCTCCAGGTCGCCGGTTTCCTGGTTGCGCGAGACATGGAAGTGCCGTTGGAAGTTTGTGG:1 + chr3R 16452822 3' + Stalker2 7274 2 76.03 ACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATACTTAAAGGTACTTCATACCTAACCAGCATGACTTCTAATCAAGATCACCCGATTGGCCTACTTAGTTTCTGTC:1 + chr3R 29901160 3' - flea 30 2 45.11 TGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATATAATCGAGATGCCCTCTGAAAGCGTATAAAAAGTCAACCAGTGTTTTGTCAATT:1 + chr2L 10685917 3' - Quasimodo 26 2 68.49 CTGGTGTTGCAGTTTAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCC:1 - chr2L 16202626 3' + copia 169 2 78.08 GGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACATAGTTTATTTTTTCAGGTCGATCTACTTCATCCAGGCGTGCTAATGA:1 - chr2L 7905877 3' - Quasimodo 55 2 65.71 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACGTACGTACTGTACATACTATTTACATACATACACACACCCGCACTTCCAACGCCATGCGCCA:1 + chr3R 17079508 3' + 1360 3344 1 58.02 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTGGCAT:3 - chr2R 20117305 3' - mdg3 5331 2 72.60 TGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTACATTTCCACTAAACTTAATAATTCTTTTTGTGCATTGTCTATTAACATTTTAAATTAAGAAAACGTTTAATTCAAGCGCCGACA:1 - chr3L 23244819 3' + HMS-Beagle 7005 2 60.27 TTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCACCGAATCCAAAGAGAAAAGGCCATACAAATGCAAA:1 + chr3R 13230767 3' - F-element 74 1 41.10 TATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTATTTTCCACAAAGG:1 - chr2L 10177992 3' - mdg3 66 2 60.96 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAG:1 - chr2L 16360556 3' + hobo 2900 1 53.33 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATACGAATATTATACAAATAATAATGGCATATAAATGAAGTAACAAACATTGTTTTCCTTTGACATAACTCATTAACCATCGGAGACGAAACGGCACTGGGAATGCAGCT:1 - chr2R 10915594 3' - F-element 25 1 65.07 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACCATTTTCGCCATTCGCCGCCTCGGGCGTAATTTGTA:1 - chr2R 18467148 3' - roo 75 2 72.26 AATGTCACCGTTGTTGTGGTGACGCTACTGCTTTGAGTTACGCTGCTTGTAAAGCGTTGAATTGCTGATCGGCACTCGTTTCTAATCTCGTGAGGTAATTTGCCAGCTATGAAAAATTTAAGTTTTCAAAGTCGCCAGCCAG:1 - chr2L 3244500 3' - BS 498 1 77.46 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACCATTCATCCTGCTAGATGCAAGCCCTTTAGTGTTCCAGTAATG:1 + chrX 6053004 3' - roo 8741 2 71.23 CGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTGTTTTTGGTTTTCGTCATATGATCATATTTCTATTAGAAAATAATTGCTAAAGGACCGAAACTCCGAAATAGCGCCCGTCCCTCAAGCCTTTCTTAACTACTTTCAACAATTGCCGTT:1 - chr2R 4511943 3' - transib2 124 1 66.44 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGCTGGACTTTAACCTTGTATTTAGAATGTTTAATGACACATAATTAGTTTTACTTCTTAAATTATTTACCTAAAAACAAGTAATAGAATTCTGGCAA:1 + chrX 127102 3' - hobo 23 1 69.66 GCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGACTTCTCCTGTTGCAAGTGCAATTTCCGTGCTAAATATTTGCACAC:1 - chr3R 26139425 3' + mdg1 7385 2 66.44 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAACGATCCGATCCGATACGATACGATACGATACGATCCGATCCGAGCTAAAGTGTTAACAATTTTGCCAA:1 - chr2L 8699964 3' + P-element 2857 1 58.73 TTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATGCAGTGTAAAATCCGAAATGC:1 + chr3R 24301947 3' + Tabor 7296 2 67.12 CGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATAGTACATATTTATTAATTTGGTCGGAAACGCTTCCTTCTACTTGTTACATACTTTTCAACGAATCCAG:1 + chr2L 22211544 3' - 1360 3216 1 60.27 CTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:1 - chr3L 23112570 3' - R1A1-element 5103 1 77.24 TGGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATAGATACGATGTGTTGTTGCAACAGGACGTGACTTGGGTGACTAAGAATGCAGGGCAGTCGGGATTCACAAGTGCTCC:1 - chr3L 9317443 3' + HMS-Beagle 7004 2 59.59 TTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACCACCAAAACATCGTGTAGTTCGACTTGCAACATCCCGATCTCGATCTCGATAACGATATCGATTTTGTTATCGATCTAGATGTGTGTGTTCCAGTTCCCTGTCTTACTATAATCT:1 - chrX 11236330 3' - copia 4877 2 78.08 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGATAGAATAATTTCCCCCATGAGCGGGGGCCCTCTCAAATATTTTCCAAAGCGCATTAAGGGCGTGAAGTTTTGGTTGGACTGAAATCCCTGGACGAC:1 + chr2L 17795267 3' - hopper 22 1 67.81 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCG:1 - chrX 13484129 3' + hobo 2875 1 64.44 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAATGGCAGGCTGGCTGAACTACTACAATCTGAAGTGCCAACCGGTTG:1 + chr3R 22572697 3' - HMS-Beagle 6812 2 74.48 ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTAAGAGCACTATTCTGTTGATGAGTGCTCTTA:1 - chr2R 5485024 3' - 1360 34 1 62.33 ATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGAGTACACGGCTGAGTACAGTAATGACGCCCTGCAGACAGACAGAAGGAGTAGT:1 - chr3R 902541 3' - R1A1-element 45 1 64.38 AAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAATGGGCAGAAGTGGCAAACGCGAGTCAGTCGCTTGGCCAGTGAGCTGATG:1 - chr2R 19067213 3' + Quasimodo 283 2 66.44 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGAATATCCGAGCATGCGACCACCTATCGTAAATGTATGGTTGCGAGTGGCAAGTGGGCGAGAATAGAAAATTGCG:1 + chr3R 11483880 3' - pogo 3 1 73.33 TTATTTTTTGAAAAATTTAGGAAAATTGCCGAAATTAAAGAAAAAACAAATAGGCATTTTTATCATAACTTGCTTAAAAATTATCATAAAGATGAAAGAATAACAGTTTTAACCCTGATGTGGATGCACTTTACACCACTCCAGAC:1 + chrX 10124448 3' - looper1 1797 1 73.97 AATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAACCAAGTAATAATAAAACGTGGAAGCTTGCATCCATTACTTTGAGTATTTTCAATAGATATACGAAAGTAAGGATTACTTGGTTGCCAGCA:1 - chr3R 18492855 3' - Juan 4055 1 63.01 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCAT:1 + chr3L 10068986 3' + 412 7479 2 61.64 AGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGGTAAGTCTATTAAAAATCTATATATTGTTCTAGGAAGACGTATTTACGTAC:1 - chr2L 21082128 3' + mdg3 5427 2 64.38 TTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATAAATAATACAAATTTAAAGTGAATTAGAAAAT:1 + chr3R 12569656 3' + blood 292 2 76.71 CATACACATGTATATGTATATACAATATGTACAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACATAGGATTCACCGAAAGAACAGCAAACAGAAGGCGATTGGAAAACAGATATCTGAGTTATGTTCAA:1 + chr2L 3381078 3' + Stalker2 251 2 60.96 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGCCTTCACTTAACGCTCATAAATTTGTCTGCCGCAAAATCTGC:1 - chr3L 16197036 3' - Doc 86 1 69.86 AATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGTGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCTGCCATAAAACAGAGACTGTAAAATGTGCATAACTAGCTGGGGCAATTTTTTAAATTTA:1 + chr3L 19398218 3' + gypsy5 7285 2 60.96 AGTTTGCCTACTTATCATGTCTAAACACATATTTAGACATTCTCCGGGGGGAAAAGAGTACGGCCAGTAGTCGTCTCTCATTTATGCGTTGCAGCTCCAGCTGGTCTCGCAGTGCAGTGCATCTGGCAGTTGGTAGTGGCTTTGTC:1 + chr2R 1373504 3' - rooA 7253 2 71.92 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTGGCAGCTGCAAGCTGCAACCAGCATAAAACTGTATGCTACGTCGGTGCTCGGTGGGTTCTTCACACACACATTCACACATACACGCATGCGGATG:1 - chrX 18193419 3' + jockey 4965 1 49.32 ATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTCGGAATTGTTTTATTTATTTTGTTTCTATTGGAGAGTATCGTCTCTTCGG:1 + chr3R 1267656 3' - I-element 214 1 73.29 AGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGTGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAG:1 + chr3R 8965221 3' - HMS-Beagle 6872 2 70.83 TGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGACTCCTTTTG:1 + chr2L 21082209 3' - mdg3 5324 2 65.07 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCAAACGACTTGGACTAACACTTGGGATTTCTCTGTGGGAATGA:1 + chr2L 20327723 3' - roo 40 2 56.16 CAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAAGAACCTAGTCGGAAATCAAAAGATTGGGGGACAGGCACGGGG:1 + chr2L 9988180 3' + hobo 2870 1 66.91 TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATACGAATTGCAGGCACTGTGCGATGTTATGGGTTTTGATTAATTGGAAGTGT:2 - chr3L 5329098 3' + 412 423 2 65.07 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCGTAAATAAATCATCTATACAATTAAATATA:1 + chr3L 23456279 3' + 1360 3367 1 48.63 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAACTTCCATGAGATTTTTAACCCCTTCACCCCGTAGTTATCCATTATTTGTTTTATCGCCGTTGTTGTTTAATGTGTGCCGAGTTTCCAGCGAAGGGA:1 + chr3R 31663374 3' - jockey 31 1 68.49 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCGGTTCATATCTCTCTGTAAATATTGAATAATAATTGTTAAAGGATGTCTGCTTTCTGTTCGCTGCGGTTTCTGGCGCCGCTGTTGTAATTTTTGTGATTTTATTATAAAAATGATCTC:1 + chr2L 12767125 3' + hobo 2933 1 78.77 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGACAAACTCGGCTATCCGTCGAACCCAAACCATAATAGAGTGGTGATGGGGAGCATTTTATAA:1 - chr3R 6603750 3' - pogo 46 1 54.07 GAAATAACGGGATCCCGCCGGCCTATAAAGGGACGGCGCA:1 - chr2R 5258183 3' + gypsy8 321 1 92.50 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATTTCGTGTTTTATTGTATATGCGTTTATATATTTACTAATTTATTACCACGCCAACGATAA:1 - chr3R 7136537 3' + roo 9045 1 66.44 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACGATAGAGAGACGATGGAGACCGGCACACAGAAATATATTGGGTCTATAAATCAAGGAATTACTGCGGATATTGAAAACATAATGGCAG:1 + chr2R 18467255 3' + roo 9053 2 66.92 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGACGAGGAGGAGGTGGAGCGGCCT:1 - chr2L 20327586 3' + roo 9026 1 50.68 AAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCTGCCATAAAACAGAGACTGTAAAATGTGCATAACTAGCTGGGGCAATTTTTTAAATTTAATGGC:1 + chr3L 19398223 3' + gypsy5 351 2 58.90 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCT:1 + chr2R 12642759 3' - pogo 40 1 58.22 ACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTCGAGGTATTCTTTAAACCGCGCACACAAGAATGTATTTTCCCGTTGCCAAATAACCTACTTGTTTGCCATCAACAAAATAGAGCAGTACAA:1 + chr3R 5766777 3' + roo 8700 2 62.33 GTCGGTCATCGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATCAGCAGCCCTCAAAGTTATTAATTAGAGCTTATGCAATGCAGAGCCACAGCTTCTTAGGCTCTCAACCTCTCAGCTTACC:1 + chrX 1586276 3' + Burdock 161 2 54.11 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATTTTTCGCAGTTATGTCTTTCACTTGTCCGACAAGTTTGTC:1 + chr2R 8375168 3' + roo 9057 1 75.34 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACACACAGGGAATTCAATAAATATATTTGGCTTA:1 + chr3R 18539885 3' + roo 349 2 59.59 ATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGAGTAATTAAATTCCGACAACTCGAATGTCCATTTAAGTAAGCTTAATTTGCTCATGTGCCAGCATTATGACTTCATGGAACAAGAAA:1 - 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Quasimodo 25 2 67.81 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGCCGTCGCCGCACACGCAGAGCATTCGCTGC:1 + chrX 1831330 3' - P-element 43 1 51.88 TTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAAAAATAAGAATTGGGGCGCAAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGA:1 - chr2R 3579089 3' - F-element 98 1 71.92 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGACAAACTCGGCTATCCGTCGAACCCAAACCATAATAGAGTGGTGATGGGGAGCATTTTATAAGTGCCCGAACTAAAGGACATTCGAAAGATAGTTATTCAGCCCTCAAA:1 - chr3R 6603703 3' - pogo 10 1 78.77 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATGCCATTAATTGAAATGATAACGCTTAATGATAGCG:1 - chr3L 11887169 3' - Doc 19 1 67.97 CTTCACTCAAAACAACCGACTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTGATAACTTGGCAGTTAACATTTATTCAAATGAATATATGCCCTTATTAAATATAAAATGACAACACTGCGTA:1 - chr3L 10141078 3' - F-element 59 1 52.74 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTGATCACTAAAATGCAAAGCAATAGTAGCTGGTTTTTTTTTGCAAAGCCAGACA:1 - chrX 12344283 3' - F-element 56 1 57.53 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGAGACTTTTGCGCACTCTTATACAGAACGACTAGTCTTATAATAGCTGAGAGAACAGAATGGCATTGCCAGCTGGCGCGAGGAAAAGC:1 + chr3R 9158348 3' - P-element 32 1 63.70 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGATAGAATAATTTCCCCCATGAGCGGGGGCCCTCTCAAATATTTTCCAAAGCGCATTAAGGGCGTGAAGTTTTGGTTGGACTGAAATC:1 + chr2L 17795257 3' - hopper 32 1 62.33 CGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGTCGGGCGTGGTGGCCGTGGGACCCGGTCTGTGATCAGATGAAATGAGCACTCCAGAAAGGGGATACTCACCTGCGATGGTAACTGAACAGCTCTCCTCCAT:1 + chr3R 30696514 3' + Cr1a 4410 1 61.60 GCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTCCTCCCCGCGTTAGGTTAAATAATTGCTTACTTTGGGAAAATGTATTTTCATTTTCTGAAAAATGGAGAGCTGAAAGTGGAAAACGTGAATGCAA:1 + chrX 3457299 3' - gypsy4 30 2 48.63 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTGTTATTTTTCGCGCTTTTCGCAGGGCTAATTAA:1 - chr2R 17872453 3' - Tirant 8150 2 56.16 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATTCACAC:1 - 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chr3L 13568108 3' + copia 252 1 65.07 CTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGTTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTTGAGCCCCTGCTGAATTTACCATTTTCATTT:1 + chr2R 24211613 3' - flea 4841 2 77.40 GATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTGTGGCTTTTAACTTTCAGGCGTTAGTTTAACCATGGAGGGATTGTGGTATGGCTTCACA:1 + chr3R 7364312 3' + Quasimodo 7336 2 52.89 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCCATACATGTATGAATTT:1 + chr2L 2522975 3' + mdg1 7389 2 65.75 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACATTCCGCAGTTATTAAACATGTAAAAAACGCAATAA:1 - chr3R 24301781 3' - Tabor 6866 2 65.28 CCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGTTAGTGCGAGTGCGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTGCTGCCTGTTATATACACTTTTCAACAAATCTAGTACACCCTTTTACCCAACGAGTAATGGGTATAAAAAG:1 + chr2L 13479684 3' - INE-1 551 1 58.90 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGTATCTCCGGCATGTGCGTATCTCCAGTTCGTGCACCTTGAGTGTAATTTAAATACAAACGAATGAATTTATGAAGTGCCGGATATACGGATGCTGTGCAAACATACAGC:1 + chr2L 10178138 3' + mdg3 236 2 73.79 AGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGACGTTTCGCACACACAGAGATACAAAAATTCAACGCTTGACAAAAAAAAGCGCA:1 - 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Juan 83 1 74.47 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGGAAATCTATGGGTAGTAACCGTTGACTTTCAACTCAGCACTGTAGCTGCTCTCGCCCGCCTGATTGCGAGCCAGACAGGTGTAGACCCCACGGTGCTCGG:2 + chr2R 7343391 3' + flea 5000 2 76.71 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCGAGCACAATGTTGTTTGGCCCGGGCACATAATTGCATATTTATAACTCCGACAAGGCGACGCCGAAG:1 + chr2R 10773321 3' + 412 439 2 56.85 ACCACCCTGCACAGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGATTTGAGTTTCCCGAATAGTTTACCATTTACGCCAACTTCTTTGCCCAGTTTTAATTCAAAATC:1 - chr2L 19645042 3' + X-element 4350 1 56.85 GTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCGGCATCCCCGAAGCTCGCCAAACACCTGAAAAGTATGCAATGAAAATTC:1 + chr3L 6542072 3' + hobo 2878 1 61.94 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCAGACTGAGCTGTGAGCACTCAATCATTTTATTTACTTATGCACCAGTGCACGCAGATAAACTGAATCTTTGTTTAATTTTGAAATTATTACCA:1 - chr2L 5732695 3' - hobo 28 1 63.01 ATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGAAATATTAAATGCCTGCTGTAAGCGAAAATTCTAAAC:1 + chr2L 22032037 3' + Tabor 401 2 73.97 ATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAAACAGATGGTCTGCCAATCAACTTCGAATCTTCG:1 - 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mdg1 7056 2 73.29 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATACGTGTCTTGTTGTCACTGCTAATCTTCTTGGATTCAGAACTCTATTTTTCAACGAATGATCCAGCCAGGTTTGATGACTT:1 + chr3L 23868345 3' + 412 458 2 57.55 ATAAAAGCTAGAAGGTTCAGAAAAATATGCTGCTTCCAAAGACATAGACGCAGCGCAGGTTTGCTTTAAAAGATTGACACGCCCACAAACAGTCCAAAACTTTCAAGCCATTTAATTTTTTAATTTCTCTTTCCATTTCCTGTTCA:1 - chr2L 22751592 3' + INE-1 163 1 60.96 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTAGAATTTATTCCTGTTTAAGTTTTAAGGTAGCTAGTTGAGCTGTTTTGACTGTAAGTGTCCTTTCGTCCAATTCATTCTGTCTGCGTTTCTGCTCCATTTACACCT:1 - chr3R 18539737 3' - roo 8680 2 75.34 TACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTATTGCTATTTCTTTTTGGGCTCTAAAAAGTGTT:1 + chr2R 25096945 3' - mdg1 207 2 77.78 ATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATGATTGTGTTGTTTTGTGGCTGCACAGCC:1 + chr2L 19635040 3' - Quasimodo 66 2 79.20 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTCCACCCCATCAAAGTCCAGCCTGGTAGGCGCTCTCGCAAAGGTGCTTTCCCACGCACGCATGCGCCGCGGGAGAGCGAGAGAGGCAAAACAAAA:1 - 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blood 41 2 57.53 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATGCATATAGAGAAGAAAAAGACCCCCACCAGGGGAAATTAAAAAA:1 - chr2L 16918837 3' - 297 6603 2 60.82 TATTGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAATAATACTACGACATTTTTGATAAAGATTGCTCTATTACATTGGCAAATGATAGCCCCACATTTGGCTTCGGGTTGGCT:1 - chr3L 11228049 3' - pogo 37 1 60.27 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCGTAAGTCGTAAAGCCCTGAGTTTGTGGGTCGTCTTGTACGTGTTTACGTTACACGTTATATATATATATATATACGAAATATATAGAAAAAAATTTCAGGAAAAACGTGCGG:1 - chr3R 12547801 3' - hobo 10 1 73.29 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAG:1 + chr3R 13572109 3' + 412 444 2 57.48 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTGGCAGCTGCAAGCTGCAACCAGCATAAAACTGTATGCTACGTCGGTGCTCGGTGGGTTCTTCACACACACATTCACACA:1 - chrX 18193435 3' + jockey 4949 1 45.21 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTATATCCGGAGAATCGGATATGCGGAATTGGGAAAAGAGAAGAATCCATGCGATATGATTGTA:1 + chrX 20369511 3' - roo 20 2 76.71 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGTTG:1 - chr3R 28937827 3' - jockey 4765 1 76.71 AATATATTAATTTGCTTCCTCTGATTTTGTTTACTAGCTCCTATATTCTTTTGTCGCAAGCGCGCTCAATTCTTGATCTTATACATTAATGTCTGTAGCGAAAAGGTATTTGATGCGAATGAGGACAGTTTAAAAAAACACTGCCA:1 + chr2L 21734634 3' + Gypsy12A_LTR 2056 1 75.34 CAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTAATTTAACATT:2 + chr2L 19841591 3' - BS 47 1 50.68 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGAGACGAGCGCAGCGTT:1 + chr3R 5087161 3' + P-element 2825 1 42.47 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGTTATAACTGCCAAGCACACAGATACACGAATACTCGGGTACACAGATGCACAGCAACACAGATACACCGTTACACAGATACTAACACGCACACGTAAGT:1 + chr2L 20269063 3' - hobo 19 1 72.60 GACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATACCCTTTTCGTTGGCATTTGATTTCGGCCATCGCATTCTAAATCATCCAGCACGTGCGCCATCCAGCGGATTTGGCCAAAAGTGGCAGCCAGGGGCCGAATCACATTAAACG:1 - 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BS 20 1 67.81 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAATAGACTTCAAACTGCTGGCAAAGACGAACTACAAATTGACTC:1 - chr3R 11072421 3' + roo 9026 1 54.11 CATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAGCTACAGCTCTTTTGTGTATGTG:1 - chr2R 12972136 3' + 17.6 57 1 67.61 ACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGATTTCACGAATTGCTCCATTAATAACACTAGAATTAACCGAAAGGTTACTAAAAGTC:1 + chr3L 18032026 3' - F-element 4262 1 61.64 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTTATGAATATTAAATAAAATCTCTCAATCGAAAAGGTTGTTTTTA:1 + chr3R 13411882 3' + roo 330 2 71.23 TAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTTAGTTTAGTTTGTATTTTTTTTTGAGTTTTTTATGTATTGTAGTAGGCTAGCTTAATTCTTGTTCGTTTGATTTTTTAAAATGCCATTTAACTTGCTTCAGTGTTAATTTATTCGTAT:1 + chrX 21207677 3' - 1360 345 1 51.37 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTATTGAACAAAACTTGAGCTATTAATCCGTTTAATGATTTTAAGCCTTATATAAGAAGTGCAGCTTTATTTAA:1 + chr3R 7136686 3' - roo 47 2 54.48 ATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGC:1 - chr2L 12325053 3' - jockey 4633 1 75.97 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAACCCTCCTCTGCATACATATATATATATCTATATATATAGACAGAGAGAGAGATATATATATACCTATATAGTGCTCGTGATTTGCGCTGCAAATTA:1 - chr3L 5947965 3' - P-element 22 1 41.78 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGGTTTGAGACTTTATTAACTAGACCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACACGGCACTGGACAGCATGTGCAACTTGTGTAGGGCAAACA:1 - chrX 10698636 3' + mdg1 364 2 61.86 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGCAGGTGAGTTTCCATTGTCCGCTGGTTCGGCTTTAATATTGATCGCAG:1 + chr3R 15363521 3' - 412 25 2 62.69 GTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACAAACATTTATAACTTTGAAATCATTTAGAGTTTATTTGCACCAACATGAAAGAAGCAAATAAACACTGATTGGTTGACAAAAAGTA:2 + chr3L 11754798 3' - Doc 118 1 55.48 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACA:1 + chr2R 18922603 3' + opus 438 2 65.69 AGTTCCCCGACTATCAGATACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATTATTTTTTCCATATAAAATCGAAAATTTTTTCAAAAATTTGGGCGTTGCAGTTGCATCATATTCGCTTTCCGAAGTTATCGCCCGCTGTATT:1 + chr2L 21370938 3' - INE-1 557 1 73.29 CTTTATTTTTCCTTAAAAGAAAAAAATAAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTCTTAAGTCTAGAACGGTACAAGTGCTGTCTG:1 + chr3R 18514408 3' + pogo 2019 1 75.34 TTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAAAATAAAAATAGCAACATAGGTTTGGGACTCTAAATTAAGTATTATTAAGTATTAATTTTTGTTCTGAAACCAAATTTTCAGCTTGCTAGCTGTAAATGAA:1 + chr2L 16567010 3' - F-element 485 1 61.64 AGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGGGTGCGCGTGTCGGGGTGAGTGAACAATCCACGTGTGTTTTCAGTCTTTTTGCCCGTTTTTGCTGGCTAACTTAACCGTTGCTTTTTAGCTACTCCTTG:1 + chr3R 5086551 3' - P-element 2852 1 77.86 TGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTTGTATATATTTTACAGCTTTGAGCCAAACAAACAGAGCAACAAAATCAACAAGCAGGCGACGATGC:1 - chr3R 6472631 3' + opus 7472 2 58.73 GTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTGTTATTTTTCGCGC:1 - chr2R 17872472 3' - Tirant 8169 2 57.53 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTTTATATATATAAAGTATATACCATCTGCGACAAAAGGTAAACTTTCATGGACTTTT:1 + chr3R 6171211 3' - 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pogo 73 1 74.62 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGGGGCAGCGAACCCCAGGGGTTTTGGGGTTCATACGCCGCTCTCTGAGTCTTTCT:1 - chr2L 17574358 3' + hopper 1354 1 60.42 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAA:1 - chr2L 20716355 3' + P-element 2806 1 30.14 TGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTATGGCAGTGTCAGCTTTTCAAAATGTGCACATCAATCAGGAAAATGAGTTGCGAGACAGATCGG:1 - chr3R 13231699 3' - F-element 35 1 67.81 AAGCCCGAAGGACACAGAAGGAGGATCACTACAGCGAGGAGCGATCCTGGGAGTGAGGAGAAGGATCTGGCGTGTTGTAAGGGTCAG:1 - chr3R 3380105 3' + gypsy8 496 1 85.06 ACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCATATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGA:1 - chr2R 981622 3' - 1360 45 1 60.96 AAAAATAAACAGAATCCGAAATCCTATATAAATCCTAATTATCAAAAAATCAAGTCACTAATTATGTAATGTAATTAATACCAAAATGTCCGGTATTACGCATAGTGCAATGGGGCAAATCGCTCGATGATTTTACTTGTGGACTG:1 - 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chr2L 5656546 3' - hobo 27 1 55.56 TGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCGCTGGAAAGTATGCTCCG:1 + chr2R 5899291 3' - jockey 4571 1 64.58 CTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATACCCTTTTCGTTGGCATTTGATTTCGGCCATCGCATTCTAAATCATCCAGCACGTGCGCCATCCAGCGGATTTGGC:1 - chr2R 23420676 3' - G2 2771 1 50.68 CACAGTTTAGTTTAACAAACTTACGGGCAAGTCCACAACTGTGGCACAAAGTATAATAAACGATAACATAATTTATACCTATTATTAATTGCCATAAATCTTGGAACACTAATAAGAAGAAGTCTGGGCCACAAATTCAGTGCTCA:1 + chr2L 15325648 3' + G5 49 1 51.37 CTTATTTTTTTTCTTTTTCCTCCGTTTTTTGTTTAGTTTTGGTATTTACTGACGTTTTTACTTAAGTGAATTTCGTGAGCGAGCATTACATAAACAGGTGAGGAGTACCATTACGGCTGAATAGGGGAGCGACTAGGAGGTACCC:1 - chr3R 20263549 3' - Doc2-element 241 1 73.79 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTG:1 - chr2R 14767368 3' - Tirant 8177 2 65.07 CAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTAGAGTCTCTACTTTAATAGGTA:1 + chr3R 1048064 3' - 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P-element 51 1 47.45 AAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTATATAATCCGATTTTTAGGGTGGGATTAATAGATGATTAGTAATCTAAAATGAGCAAATGGCTGCATTAATATCAATTTACAATGCATAGCATTGAAAA:2 + chrX 17270418 3' - 3S18 5788 2 66.44 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGGAGGATGCCGGGGTGTGCGCGTGTTTACATAAAAATTTAAAGCGAAAACCCAGTGATTTTTATGCTTATCAACAGCGAAATTGAAAATGCCGCCTGGCTACAGA:1 - chr2L 19628359 3' - hobo 16 1 73.29 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTGGAGCCTGAAAATTGGCTGAATTTTGTATTGAGCTCTACGTATGAAAAAACATAATATTATCAG:1 + chr3R 15154663 3' + mdg1 365 2 58.90 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGTGTGGAATGTGTTTAGCGGCCTTTGATTTGAAGCGATTTTCGCGGAGAAGGTATTTGTTGAACGTATAATTATTTGCATACAATTATTGGCATATCAGAAATATTTGAAACAT:1 - chrX 9949441 3' + hobo 2927 1 77.40 ATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCTTTATTATTAGTCTTGCTGGTTTCAATAGATATGCCCAACACATTTGGGCCATAAAAACGTTAATAAAATATGATTTAGTGTACCAAGG:2 - chr2R 7024356 3' + diver 192 2 63.01 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCCAAAACATCATCCCGCAAAACATCAGGTACGTGAGAGCCATTCAAATGAGCGAGTGCCGATAACCCG:1 + chr2R 8467833 3' - 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chr3L 17895933 3' - P-element 83 1 28.77 GCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCGAGCGAGGGAGATTTAAATAAAAATTCAACATGGCGATGGAATGGATAACTGCAATGGACAAACGGTAAGTGATTTT:1 - chr2R 6796894 3' + Doc 4454 1 58.90 AGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGAGTGTGCCACATTGTCATCACGAAACCGAAACAGCACCTACAATAAAACA:1 + chr3R 29957125 3' - invader4 3021 2 77.40 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGATCGAAAATAAATAAAATATGAAATACAGTTTAATTTCCTGAACTTCTTTCAAGTAGGCATTTTTCAATAACAAATTGTTTTCATTCAGATGCTGTCAATCAAGAAGT:1 - chr3R 15154509 3' - mdg1 13 2 76.71 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATTATGTGTTTAACATGTTTTAATGAACAGAAACTAACACGAGTCCGGCACAAAAGGATGCATGTTCGAATGGAAAATCGCTGATTAACTATTACTAATTGGAT:1 - chr3R 12885942 3' - 412 19 2 71.23 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGACAGAAACATTGACGTTATGCTACTCTCAGAGACTCACCTTACCGAAACAACTTCCAAATACTAGGATATAAATTTTATTTTACGAATCACCC:1 + chr3L 3473051 3' - Doc 41 1 64.38 AAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGAAGTAAATGTGGTTCATATGAGTATCCGAACGTAGCTGAGATGATTAGACAACATT:1 + chr2L 8009195 3' + roo 390 2 70.55 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGATATGCAGATCGAA:1 + chr3R 4352157 3' - Doc 43 1 62.33 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAACCACAAAGAGCAAACACAAAAAATGTTGCCTACTTCCCGGCAAAACAGGTGAAAGAAAC:1 + chr3R 8625279 3' - jockey 67 1 60.00 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCG:2 - chrX 21087584 3' - mdg3 5298 2 54.11 AAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGAATATGCGAGCATGCGACCACCTATCGTAAATGTATGGATGCGAGTGGC:1 + chr3R 11483855 3' - pogo 69 1 65.07 TTATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGAGCCTAATTTAATTTAGGAAGGCAGCGAAATGCGGAGGCAGCGAGG:1 - chr3L 19661048 3' - Quasimodo 39 4 57.33 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACGTGGTGAGCGAGAGAGCGAGCAGAGGGGCATGTAT:1 - chrX 13642004 3' + P-element 2855 1 61.03 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGATCGAAAATAAATAAAATATGAAATACAGTTTAATTTCCTGAACTTCTTTCAAGTAGGCATTTTTCAATAACAAATTGTTTTCATTCAGATGCT:1 - chr3R 15154523 3' - mdg1 27 2 67.12 AAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTGGGGCGAATGAGTAATATTTTCCAGCATATATAGAAAACATGTTTATTTTGAA:1 + chrX 1831010 3' - P-element 450 1 35.62 AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAACATAAATAATAGTTGTCGAATTTTGATGAGCTCCAGCATTTCGCCTGCTTCATTTTGGAT:1 + chr2L 18671723 3' + mdg1 360 2 63.01 TAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGAAATATTGAGATTTAAATTTCATCAAAGACTGTTTATAATAATAGAAGTCTA:1 - chr2R 10189267 3' - Doc 73 1 67.12 ATTTTGGCAAAACTCAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATTACATTTTAAAAAGATAACGTACTTGAAACCATATCC:1 + chr3R 7764428 3' + 17.6 7339 2 78.77 ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGTGTGTGTGCC:1 - chrX 20106312 3' + hopper 1355 1 56.85 GGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATGTGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCAATGCTGTGAAATGGCCTGAA:1 - chrX 17690446 3' - Doc 316 1 50.00 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTCAACGTCGATGGCCATCAGATCGAAGTGAGTGCCATTCGCCCACGCAGAGGCACACACAGAGGCAGTGATTGCCAATCATCACCATCGCACGGAGGTGGG:1 - chr3R 11730633 3' - hobo 15 1 72.86 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAACTCTTGATTTAAATCATAATTTAATTTAAACTCAATCTCTCAAAAACAAACACTTGGTCTTTGTGATGATGCACATAATCACAATCATTTGCTGGCC:1 + chr2R 15190536 3' - pogo 21 1 65.07 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTG:1 - chr2R 20931659 3' - blood 7087 2 77.27 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGCTTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGACACAGCTTTTTAC:1 - chr2L 42500 3' - copia 63 2 64.38 TGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAGTAATTAGTCCGTGTTTTGAAACTTTTATTTAGTTACATATAATAACCAA:1 + chr3R 27443238 3' - 3S18 72 2 64.38 AATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTGGTCGGGCGGTATTGAAGTCAAAACATTTCAT:1 - chr3L 22635701 3' - hopper 89 1 74.66 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTGCGATTGTGCATTGACCTGATTCGGAAAATGGAATGGAAAATGGGTGTGAGATTGGGATTGGGAAAGAGATGCGAGTGGCAGAGCACAAA:1 + chr2R 10960994 3' - Doc 38 1 56.85 ANGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGAGTCGGTAGGGGGATTTAAGTCCCATTCCTTGCAATAAAGAACTCTATATAGCATTTACGCAGACAATAAAACTCCATGCAGTTAGAAGTTATAAAA:1 + chr2R 3091715 3' - F-element 269 1 63.01 TTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAATACAAGAGACCTTTTGGTTTTATACAACTAATTGCATACTTATGGGGGCTGCACTAATGAAAT:1 + chr3R 9657763 3' + BS 5034 1 57.53 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGT:1 + chr2L 15601637 3' - Doc 32 1 52.63 ACTTCTATGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTAGTAATTGTGCGGCATTGGATCTGGGGAGCGGAGATAATAAAATCGAATGTCAATTGAATTTGTCGAAATCAGAAGGGAAATA:1 + chr2R 15390911 3' - 1360 219 1 68.84 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAGAACCAGGTGTCATCTCCATTTAAGTAATTGAGCGAAATATTTTTGCATTGTTCCAACAAATTGTGGGCGCGCACTGAGCTCATCTCGC:1 - 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chr3R 29867884 3' + S-element 1702 1 76.03 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGAATGGCTTTACTTGAAATTTTTGTTCAACACAAGAGCACGTTTAATTATT:1 - chr2L 15096841 3' + jockey 4975 1 60.27 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGTTCCAGGAAAGCAAAATGTGATCTACTTCCATTTTTTCCTGTAAATTAGAATTGGACAACATTTTTTTTACATTTTTTCCGGCGTGAACTAT:1 + chr3L 14370699 3' - 412 29 2 62.33 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTTTATCACTGCACTTGAGTCTTATTTTCTTACATCTTGCCATCATTCGC:1 + chrX 2821952 3' - roo 8712 2 63.41 ACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACAAATTTTGGAATTCTATCCAATTTCATATTGCTGTGAAGAAGTTGTTCTCTGCCGATATTACTATTTAACCAGTTTGTGAATATACTATTTTCTTGGTATGAATACAATC:1 + chr2L 2621636 3' - BS 5055 1 74.66 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAAATTGTC:1 + chr3L 3540271 3' - mdg3 5257 1 80.14 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACAC:1 + chr3L 3540217 3' - mdg3 50 2 58.22 GGTGGGAGAACGTCTCTCCGTTGTTGAGTGCCCTTAAGGCTAGTCAACCAATCAACCAATTTAATAATGACAGCAAGAGCTGGAGTCGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTTTAATTATAGGGCGCGCACAAAAAATGGTAACCTA:1 - chr2L 18093072 3' - gypsy6 271 4 78.77 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACACGCAATGGGAAATAAAAAGAGAGTCTCTTCTATTCAGTTCTCTTCTAAAATATTGCAT:1 - chr3R 9158105 3' + P-element 2825 1 43.15 CTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAACCAAGTAATAATAAAACGTGGAAGCTTGCATCCATT:1 - chr3R 18492909 3' - Juan 4109 1 73.29 TTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAGTCAATTGGCGTGCTATAAATATTTGGCTGCATACTTTCGGGCGCACCGTATTTGTTGTTG:1 - chr2L 19841492 3' + BS 5033 1 63.01 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCTTTGTTAATGAAATTTTAATCAAGCTGGAAGCGAAAAAGAGTTTGCCAACCAAGTTTGGCAAGCACACATGCCGCACTCCTTTGCTGCGGCTCC:1 - chr3L 6014900 3' - jockey 33 1 66.21 ATATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCCATCTGACCATGTCCATCTGTCCGTTGGTCTGTCCGTTTGCTGACCTACTCAAAGTCAAAATCTGATGATAATCTCCCATAATCTTCATCTTTACGAGCCGAGCGCAAATA:1 + chr3L 20534934 3' + INE-1 80 1 53.10 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCCACAACTGCAGTGGCTTGGGAAGCCGAAGCCTTGCAAGGA:1 - chr2L 16202587 3' + copia 5077 2 53.42 AGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTACCTGTATATATAGATATATATTGTGAGGCAACCGCCGATCCATCACCGATCGATCATTCAGCAAGCAAAAAGAATTTAATTCCAGTA:1 - chr3R 24396676 3' - I-element 5131 1 59.59 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTCCCTCCCTCCTCAAAAACGCCAAAAACACTCGACGGTCGTCGTCACACCGCATTCTAGTCCATTACGCAAAAATTACGTACGGAGATGCGATGCTGATTGAAA:1 - chr3R 26845478 3' - mdg1 19 2 72.60 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACTTCTCTTTAAATTAATTTCTGTAGCCTACTTTTGTGGGTCAAAAGGGAAAGTCCGTGTCGCGTTTAAATCAATCAAGTTC:1 - chr3L 9993884 3' - hobo 38 1 57.93 AAGCACTGCTGTTTGTCGAGAAGAACGAAACACGGCGAAGAAAGCCCTCTATGTCCAACGTGGAGATAAAGCGCTTGGTTCGGCAAGGCAAGAATGAAAATTCCTTTGCTAGAGAATTTAATCCATACCCCGACTTTAACAACAGT:1 + chr3L 18275485 3' + Tc1 480 1 64.38 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATACTCAATCCCAACTACGTGCTGCAATGCCACACGAAGTGGTGATTAGAGGG:1 + chr2L 11045621 3' - Burdock 6176 2 57.26 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGAATGGCTTTACTTGAAATTTTTGTTCAACACAAG:1 - chr2L 15096857 3' + jockey 4959 1 49.32 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGATTCCCTTTGAGCCTGGCAAGCAAATGTGACATTTGTGTAGCCTACTCTTAGGCTGCGAAAACTTTCCCCATTC:1 - chr3R 27056363 3' - jockey 57 1 50.00 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACATAGCTCATATGCAGAAGTAGATCTTCGACTTAATTTCCTAGTAAGCCCCATACATTTCTCCAAAACCCGGCTTTTTCAAACGGCGGCACCGAGTG:1 + chr2R 20931770 3' + blood 7367 2 70.55 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATCGCCTATGTGTAACTATGTGTACTTTATAAATGTTCACCTGAAATGGATC:1 + chr3R 17747405 3' - 297 6609 2 67.12 AGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGGCCGCCCGAGTCCGGATTGGGATCCGTATCGGGATGCAGCTGGTCTGCCTC:1 + chr2L 8432294 3' - F-element 325 1 68.35 TGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCATCACGTATTTCTTTAACGGATTTCCACTTGTCTCACTTT:1 - chr3L 5012497 3' + Ivk 36 1 73.29 CAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTTGGTTTACTTTTCGAATGATTTTAAACGATACCCCACATCCATCCCAGTCCTGCCCAGCATCCATCCGTTTAGCTTTGATGCGGAG:1 - chr2R 7343211 3' - flea 4786 2 65.75 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTGGCATATGCAAAGTGTTTGTTTGAGTGCGTTTTCCATTAATTTATTTATGTAC:1 - chr2R 20117257 3' - mdg3 31 2 65.07 AAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTTACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTGCCCAAACACGTACCAACGAATTTATGTTTTCAGCC:1 - chr2R 18927803 3' - 3S18 57 2 77.14 CGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTA:1 + chrX 21667939 3' - gypsy2 66 2 68.28 AAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGCAAGTTGAAGGAGGTTATTCTGCCAGCAAATGTTTCATAGTTTTT:1 - chr2R 21353192 3' - Transpac 4992 2 71.92 AAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGAAGTAAATGTGGTTCATATGAGTATCCGAACGTAGCTGAGATGATTAGACAACATTC:1 + chr2L 8009196 3' + roo 9054 2 71.23 GCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTCATTTTTGTACTACGTACTTTTAAACACCTCTAAATGTTATTAAAAACAAACTAATAACTTTTCTCTGATTGATTTCATAAAGATATATTTTATTTAAAT:1 - chr2L 17296923 3' + Max-element 8513 2 71.92 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGCAGAATTAGTCCCAAAAAAAATATAAATAAATACCTTTGTAGTTAGGACCAAACTTTATTTAAAGATCCTATGACACATCAACTTTGCGGGGAAATTCAAATACA:1 - chrX 10838462 3' - roo 8680 2 75.34 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGCATTGCTTGTTTTTTTTTCCGCTGGCCACTTGCTCGGTGAGCAACATTCTGCCATCGAACCA:1 + chrX 3637870 3' - roo 8722 2 60.27 TCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAAATTTTTGACATTTAATTTAAGAATATTGAAG:1 - chr3R 19144370 3' - Juan 37 1 52.74 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAACCTTTATGCAGGGGCATGA:1 + chr2L 12696253 3' + pogo 2064 1 60.27 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAATGAATTTATTAAATAGCTTAATCAATAGCTTAAA:1 + chrX 19591227 3' + roo 326 2 75.34 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGATAGCGAAATCAAAGTCGAGTTTACTGAATCCACAATACACATCTCCAATAACCGCAACGCCTTGGCGAGGCAACAAAGCACATTTGGCAAAAACG:1 + chr3L 1728618 3' + blood 351 2 41.10 TATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATAACTCAACAAATTTAATTTAGATCGAAATGTGGTGCAGTTAAACCATAGATTTCCCACTTCTTTTCAAATTAGCAATGGTATTTTCTCTTTTCTAAT:1 - chrX 19591106 3' - roo 8684 2 70.55 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGTTCCAGGAAAGCAAAATGTGATCTACTTCCATTTTTTCCTGTAAATTAGAATTGGACAACATTTTTTTTACATTTTTTCCGGCGTGAACTATAGAATATATAGAC:1 + chr3L 14370712 3' - 412 7069 2 69.86 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATACGAATATTATACAAATAATAATGGCATATAAATGAAGTAACAAACATTGTTTTCCTTTGACATAACTCATT:1 - chr2R 10915630 3' - F-element 61 1 55.48 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATATATACATATTTTTTCTTGCTCTGCAGCTTTTGTTGTCGCCTGTCTGCAGATGGTATCTTGTATCTGCACCACCCACTTTTGGTG:1 + chr2R 17317696 3' - hobo 20 1 68.94 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAGATGTCAACAGACGATTCACTTAGACACATTTTTCAATGATGTTGCTACCGTACTGCCGGAGTACTTAAGTCGCGT:1 - chrX 19992554 3' - copia 46 2 54.11 GTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGGTTCGAAT:1 + chr3R 9863002 3' - Stalker2 38 2 59.59 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTGAGAGTCGACTGCAGTTACAGTGGCTGCCAGCAGTTGTTGATTTATTGTTATAACTGTAACACACACACACACATATATAAATTCTTTTTTTCGGCCAGAACACCC:1 + chr3L 15724599 3' - jockey 37 1 63.70 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAGTCCAAGGTCCAGCGCGGTACCGTTAGTTCACAGTCTCTCCGCTTTCCTGGCGTCCAAGGCCGCTCCCCTGCACCCAGATTTGTGGG:1 - chrY 32445 3' + P-element 2854 1 63.70 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGATAGAAAGATGAATGGATGGATGGATGGATGAGTGTAAGGGTGTCTGAACAAGCCGACAGTAATTCGATGCGTACTAAATGGAATGAATGACAAAAGCGGTCGAGG:1 + chr2L 7596146 3' - mdg3 5267 2 58.22 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGGGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGACTTCTCCTGTTGCAAGTGCAATTTCCGTGCTAAATATTTGCACACAAAAGCA:1 - chr3R 26139418 3' + mdg1 7392 2 60.96 ACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACAGTAGACCGGCATTATGTTTGTGCCCCATTTTGTGGAAGCCCACTTGCTCTCTTTCCGCCATTAATGGGCGCGGG:1 + chr2L 3393857 3' + Stalker2 7608 2 50.68 CGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTTGCTGTATGTGTGGCACATTTCCCAGCATATTTTTTGTATTTTGCAATCCTTTGTCTCTCTGTTTTG:1 - chr3L 19432499 3' - HMS-Beagle 6847 2 57.53 CTCCCACCATATCTCCCAATCTAGGAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCAGTGACAGAGGAACCCCCTGTTACCTGCAATTAATTAATTTAATTTAATTAATTTATACATACAAGTTCATACTTT:1 - chr3L 24736271 3' + springer 268 2 65.41 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATATTGTTCGGCTTTCGCTCGCTTTCCACACAG:1 + chr2R 12872984 3' + P-element 2832 1 47.95 GAATATAATAATAATTACTAAGGGGCTAATTCAAATATCTACGGATATGCTAAGATATATATATATATATTTATATTAATATATATTCTGTAACAACTTTATGACAAGCATATCCTTTGTGGAAGGGCATCAGTTATGTGAATTAA:1 - chr2L 11052555 3' + Burdock 411 1 44.52 GGGTCGAGGGACTCCAGTTCTTCGTATTGTCGCTTTGCAGTAGCCCCTATTGAACGGCACCACTAGCGCTCCGCTATGACATCAAATAACTAAATGGCGATCATGTTTTATATTTCGATTCTGTAAGAAGCTAATAAGTAATAATA:1 - chrX 22816760 3' - mariner2 322 1 66.44 TGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTAT:1 + chrX 8610346 3' - mdg3 32 2 63.01 GGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCCCTGCGTAGGCCATTTACTTTCAGCTCACCAGAGATTGGTAAAAATGAAGGCCCTAGCACCCAGCTAAGTTTGGTGACCCAACATCGATGCTACAATGAGTCAATTGTAAA:1 + chr2R 4551910 3' + roo 268 2 66.44 AGATGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTAAGGCAACGTCAGGCTGGCAGGCCACACAAAAAAAGGACAACGAGT:1 - chr2L 18848721 3' + blood 7313 2 65.07 TGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTGTAGGCTGACTCAGAGCCAAATGGCGTTGGATTCATGGCTAA:1 - chr3R 29719325 3' - hobo 61 1 63.01 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTGGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGCTCGTTTACTTTTGTGCACAAAAGCCGAGACGCATAAATAACCGGCA:1 - chr2L 1892285 3' + hobo 2871 1 63.57 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAA:1 + chrX 19162680 3' - pogo 65 1 64.38 ANTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAGTACGAATGCGTGAATGTGTGAGTACGAAGTCGATAGATATTAGGGAATAAGATGGGAAAACGATTTTAAAATTGTTTAAAAGTGTGGGCGTGACCGTTTTGGGCGTTTCGTAG:1 - chr2R 2954002 3' - INE-1 548 1 47.95 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGACAGGAGCCGAAGTCGATGGGGCAGACTCCTCCATCTTCATGGGTTCCACTGCCAGAGTCTCCTTTTCGGAAACGACAGCAGGGACCTCAACTTCCGG:1 + chr3L 13380571 3' + hobo 2932 1 78.46 CTTACATAAACATTGTTGCGAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAG:1 - chr3R 24301824 3' - Tabor 6911 2 63.01 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTGTTACATATTTTTCAACGAATCTACTATACCCTTTACTATACGAGTAACGGGTATAAATATAGCAATTTGATTTACTGAATGAATTTAAAAAGTGCATTATTTTAT:1 + chr2R 578728 3' + roo 394 1 75.34 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCACCAAGCCGAATCCATCCGAACCAAGCCGAACTAACCCGAACCGAGCCGAGCCGAACCGAACCGAACC:1 - chr3L 12459113 3' + P-element 2881 2 73.27 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAAGAACCTAGTCGTAAATCAAAAGATTGTGGGACAGGCACGGGG:1 + chr2L 9988180 3' + hobo 2919 1 52.87 TTTGGCGTTCACTGCACTCAAAACAACCGATTTTGGGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTAGTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTAT:1 - chr3R 13231761 3' - F-element 70 1 43.70 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTGTTTTTGTTGTTGCTGGACTTCGGTTGTGGAATTGTGTAAACAGCACCGACTGCGACGTCGGCAGCGCAACAACAAAAACAAAGGGAACGCAGGCATAA:1 + chr2L 16536659 3' + pogo 2089 1 76.76 GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGA:1 - chr2L 951331 3' - F-element 93 1 74.66 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTAT:1 - chr2L 10178004 3' - mdg3 78 2 69.18 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGTAAGGGAGTGGCACCCGACACTCAAATTGGTTGAGTGGCAAAAAATACCACTCTTGCAGTTCAGACATACATACATATGTATGTACGTATGTGTTC:1 - chr3R 7090330 3' + P-element 2869 1 70.50 ACTAATGTTTACTATAGTTATTTCATTATAATTAATTATTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTCACTATTCTCTAGGTCTTGCAGAAATATTTTAGTAAAAAGAAATTTGTTAGTAAAATTATTTTTTATAGGTA:1 + chr2R 4521726 3' + Cr1a 4306 1 52.41 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAGTATCATTAAAAACAAGCAA:1 + chr2R 12416912 3' - pogo 31 1 77.50 CAACGACCCGTTTAGGAGGAGTGGTAGGCTATCGAGATCCCCTATAAGAGGAGTCGGAACCCCAATCCAGGGAGCGGGAGGTGAGCAAGCACTCCCCGCAAACGCATCTGTCCCGGGCAATGGGAATCGCTGAGCGCGTATCGCGA:1 + chr3R 27058363 3' + Rt1a 475 1 65.75 ATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAAAGATAGGGATAATTGGTAAAGGAATCCTTTTGTGGTCTGTGGTTTTTCTTATTCAGAAATCATACAAAAG:1 - chr3R 17974189 3' - jockey 4936 1 60.27 AAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTATGCCATATATACAAACTTGAGCACTTAATAGTTATAAAATACAAAGACTTCTATATCCATTGTTAAAACTTTTATTCACGAATAAT:1 - chrX 13558150 3' + mdg3 5466 2 63.01 AGGGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAATCTAATATTATTTTAATAATTTTAAATAATCCACCATCCCATTCCATTTTTTCCATCCCATTCCGCTCTGCTTCTCTTAATTCAATAAAAAACTGTTTAC:1 + chr3R 30092340 3' - I-element 21 1 47.26 AGGTCACTTGCCGACGGGACCACCTTGTGCTATGTCATCATGTGCGGGACTTTCAAGACGCGCGCGAAGCTG:1 + chr3L 13450768 3' + P-element 2866 1 43.06 TAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGTTGAGATGGATCTTATTTTAGCACCCCTCA:1 - chr2L 5333386 3' - mdg3 52 2 59.59 GGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGGAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCTTGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTTTTGTAAATAGTATGAATAAAGAGAGAGAAAGGACAATTAGTTATGGTTTTATATGCAAT:1 - chr2L 20117315 3' - G2 2732 1 58.90 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAATTATGGTGGAACAATGGCTTAAGAAATTGATAC:1 - chr3R 7305930 3' - 412 7139 2 78.08 GGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCAATGCTGTGAAATGGCCTGAA:3 - chrX 17690446 3' - Doc 316 1 51.37 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTCATTAAAATACGCCGAAGCAGTAAAGAGGCGCCAGCTCTCACGCTATTTGCACAGTCATTAGAGCCAAGAGCTGTTAAATA:1 - chr2R 24211510 3' + flea 4979 2 62.07 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGAACACTAGGCAA:1 - chrX 19744407 3' + P-element 2828 1 45.89 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAATTTGAATTATTGTCTACGTATTAGAAAC:1 + chr2L 42614 3' + copia 5079 2 54.11 CTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGGACCGGACACTTGAGAGAGAGAGAATTCTCCGGCTCGGTTTCGGATTCGGGTTCGAGTCTGCGCTAAAGTTATATAGCGCGCCCACCTTTTTCCGCCGCCGTCCATC:1 + chrX 13642168 3' - P-element 14 1 75.34 AAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGACCTAAACCGGATCGAATGGAT:1 + chr2L 246639 3' - P-element 96 1 19.31 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGGAAGGAGGGCAGCAACCTCAAGCACTAATTGCAAAACGTTTTTGGGCCACTAATTACGATGCATTGTGCTTGGCAAAATGGGGCAAAATATTTCTGC:1 + chr3R 26845685 3' - mdg1 25 2 38.36 TTCTGCCGGCTATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGCGGTTGGGCGTGA:1 - chr2L 11639011 3' - springer 75 2 69.86 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGAATGGATCCGTAATGAGTGTTAT:1 - chr3R 18940460 3' - mdg1 11 2 76.71 TGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAACCAAGTAATAATAAAACGTGGAAGCTTGCATCCATTACTTTGAGTATTTTCAATAGATATACGAAAGT:1 - chr3R 18492877 3' - Juan 4077 1 51.37 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTATATCAAACATAGTTTAGAAAGTATAAACATAGAAACATAAGTAATGAGTAACCTATAAAATAATACGAAATAT:1 - chrX 19736392 3' + pogo 2060 1 53.15 CGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGC:1 - chr3L 25232763 3' + accord2 135 2 62.94 GTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTTT:1 - chr3R 3617309 3' + micropia 182 2 79.71 TGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTATCTCAAGAATTCGCGAAG:1 + chr2R 18056926 3' - blood 29 2 66.44 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTTTAGTTTCGCACTAATAACGTTTCTGCAATTTTATTTAAGCGTAACATAGTCAAATCTATATTAGTGTTTATTTTAATCGTACATTCCAACATTTTTTCTTG:1 - chr2R 969089 3' - mdg1 7057 2 72.60 TGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGGAAAACTTTTATACGATTTTTAAAGGCGGTCTTCTTGGAATTC:1 - chr3L 18585691 3' + mdg1 7380 2 70.55 TTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTAGTAATAATCAACCGTATACCGAGATGAAATTGAT:1 + chr3R 22275331 3' - flea 4817 1 70.97 TACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGCTCTCACTCTCTCGTGCTCGTTTCTTCCATTTT:1 + chr2R 17348465 3' - hobo 87 1 76.71 AACGCTTCCTTCTGCCTGTTCCATATTTTTACACGTATATTTACATATAATAAACAACATTTTGTTTAGCTATCCTTATACGTACATTGTATAGAATAATCAATTTACCTTATAAGAGTTCCTTAAGAGTTAACTTAAAATGAAAA:1 - chr2R 5780102 3' - INE-1 32 1 67.81 AATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAATCTACATCTTTCAATAATATTGTATTTCCATCTTTTGGTATTTCTTTTAGTTTTAGCAATTCGTTTGCT:1 - chr3R 29901016 3' + flea 208 2 52.74 GTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCAGAAGGCATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACACTTTGAACAGTTGAATAAAGAACCTC:1 + chrY 3648910 3' + Stalker4 193 4 54.68 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGACACTTTCGTTTATTTGCATTTTCAATTTATTAGCATAAATGTTTGTGCCATGAAACGCACGCTGCCAAACACTTGAC:1 + chr3R 11730789 3' + hobo 2903 1 53.96 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCATCTAATCGAGTTATGACAAACTGAGTATGAAAAGAAAAGCTACAAAATAACAAC:1 + chr2R 15529789 3' - roo 66 2 61.64 AGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTG:1 - 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chr2L 10178008 3' - mdg3 82 2 71.92 AGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTGGTTACCGCATCAAGGAACTTTAACACTGATCACATCGACTGCGCCAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATA:1 + chrX 21534511 3' - Max-element 49 2 52.05 TCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCTGCCATAAAACAGAGACTGTAAAATGTGCATAACTAGCTGGGGCAATTTTTTAAATTTAATGGCTGA:1 + chr3L 19398226 3' + gypsy5 7293 2 56.85 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATAAATAAATTTTTATGGAAACATTTGCAAATACCTCGACCATTTCAATCTTGCCAGCTGACAGCTGCG:1 + chr3R 26643403 3' + 412 442 2 55.48 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTGGTCGGGCGGGATTGAAGTCAAAACATTTCATTAAAGGCAGCAGCGAATGCTGTGAAAAAGTCCACAAAAGTATCTGAAAACAAAATGTTGACAAA:1 - chr3L 22635637 3' + hopper 1406 2 75.38 TGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCA:1 - chr3R 21276527 3' - BS 5051 1 53.42 GGCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAACACAGAATATTTGCGTGGCAGCTGCGAGTCTTTGTTAGCTCTAAGAATCATCCTTTCTTCCATATTGCTACACAGAGAGGAGGAGTGGCTATTGCT:1 - chrX 22260227 3' + Gypsy6A_LTR 78 1 60.16 AGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAAT:1 + chr2R 13052836 3' - Doc 105 1 70.77 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTGTGACTTGTTTTTGTGCTCGATGCGAAAAATGTGCGAGTTCGAGTCAATTAAT:1 - chrX 13484068 3' + hobo 2925 1 76.03 TTTTTTTTTTAATTTTTATTTTGCTTACATCTTTAAGTTGTTTTTTGTTTCTTTAACAATGTATATAAGAACTTAACAGATACGCGTATGTCATCTCTGTAGGTTCAATCAAATCTGATGTATTAGTTATTATAGTTGTTGGCCT:1 - chrX 9172727 3' - Doc 4692 2 69.66 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTAATCCTAATCTTTTGGAAGAGGTTTTTAAGCT:1 - chr2L 3151005 3' + blood 7333 1 56.16 GTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGTTACTTTGAGAACGCAACATTGAACTGTCAACTGCC:1 + chr2L 2902962 3' - mdg1 7324 2 75.00 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTCCCAAATTCGGAAATTTCGGATCAGTTCCACTGTCA:1 - chrX 22760335 3' + roo 323 2 73.97 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTTTGACCGCACAGTCAATTTAATTTTAATTTACACTTCATGCATAAAAAATTAAACGCGCGTTGCCGTGTCA:1 + chr3L 19434179 3' - Doc 57 1 63.01 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACCTCAGGGGATGTCATTTGAAGGCGGCAAGTGTAAAAATTAAGCAGCTAGGGGGCGAGGCAATGAGTGAGATAAAATTACCCG:1 - chr2L 9109811 3' - opus 7037 4 60.27 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGT:1 - chrX 3637760 3' + roo 9017 2 53.42 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCAGACTGAGCTGTGAGCACTCAATCATTTTATTTACTTATGCACCAGTGCACGCAGATAAACTGAA:1 - chr2L 5732723 3' - hobo 53 1 53.85 CGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAA:1 - chrX 13484125 3' + hobo 2868 1 65.75 TNTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTAATCGTAATTAATGAACATGTAGGTATAGGTAGGATAGTAGGTTCCTTTAACT:1 - chr3R 25053002 3' - pogo 63 1 60.27 ATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCGTTGTGATTGCAATACAATTATTGAAAGATTGTGATTAAAATAGATCATGGTTTTACAAGAAGTTTTTGTTTTACGAGACTTTTAAACCGCAAATTCGTTTGTGAAATC:1 + chr3R 8293681 3' + Stalker2 7640 2 74.66 TTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTCTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTT:1 - chr2R 23443906 3' + Cr1a 191 1 77.24 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAAGAGTCCATATATATATTTAATGAAGCTTTTTTGGTGGTCCGTCGCATATAAATATGTTTTTATATGACACGACCCACAAGC:1 + chr3L 20910118 3' - F-element 53 1 49.32 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAA:2 - chr3R 26031696 3' + pogo 2033 1 65.75 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTGGGCAGGT:1 + chr2R 24021676 3' + pogo 2059 1 56.85 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGA:1 - chr3R 17794545 3' + P-element 2810 1 30.14 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATATAATACCGAATATTGAATAATTTCTTTGGAAATAAATTCTCAATTTAACAAGCATGTTCGAAATGTATTTTTAGACATGCCCGACTTCTTTCTGT:1 + chr3R 23714163 3' - I-element 24 1 67.81 GTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGGGGCTCAAGTCGAAGTTG:1 - chr3L 17895954 3' - P-element 104 1 14.38 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTA:2 + chrX 8610328 3' - mdg3 5302 2 50.68 AAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATAGATATATTTCTCTTTATTTTCTTGCTTTGTGCATAAAACTGTCTGGGGTAACTTGATACTGGAAGTAAAAACTGTCGCGAC:1 - chr3R 8884278 3' - HMS-Beagle 36 2 59.59 GGTGGATCACAGTTTCTGTCAGGCCAGCCCGCCCGAATCCCTTTTTGCCCGTCAACTGGCCATTTAATTGTACACTTTATTTGCTTCGG:1 - chr3R 9179395 3' + HMS-Beagle 495 1 73.03 AGACTCCAAAATCTAACTCCTGAGTTTCACTACACGTTTCTCCTTTAGGCAGCTCCTAGGGCGCTGGGCCCATAACCTGTTGTTTGTTGAATGTCATTAAGAACAAATTATGGTTATTAGCGGACTTCTCGCGATGTCCTAGTCCT:1 - chr3R 20707511 3' - 1731 393 1 62.33 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCCAAACCGGATGTGCACAGTGTCAAGCAGCAGG:1 + chr3L 10069022 3' + 412 7522 2 66.91 AAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTACATATGTCAAGTTCTGCACTAATTTCGTTTAATGAGTTTTTTCTT:1 + chr2L 22340385 3' + HMS-Beagle2 7117 2 72.60 ACTCGAATCGGAATCAGAATGTGAATCCAATACGATGTCTAATGGATCAGGTTTAAAATTAGACTGTAAAGACAAAAAGACATTACTTTATCCAGATTCATGTAACGAGCTATCGCTTGTTTCTTTGAATCTCCTAAGGTGACATC:1 - chr3R 19445038 3' - transib2 2537 1 67.12 TAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATGAAATTTTTATTATTAAAAAAGTGGCTGAGCAAAAGCGCGGCTTACACGGCGGATGGGTAATAT:1 + chr3L 13568070 3' + copia 5068 2 57.53 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATACATTTTATCAATAATTAGCATAAAGTTATTGCATAAAGTTACCGGCACGAATTCGATTGGCCAAGCAGCCAACATTGCGTATACGTAATATTTTGCG:1 - chrX 18055671 3' - 297 17 2 74.66 CTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTCTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGGTGGGGAAACGTGGTGACGAGTCATCGTTGTTACCGTTAGCTCTGCCTGATTCCGTTTCCGTTCTAACTTT:1 + chrX 20769126 3' - Porto1 326 1 51.37 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATGGCCAAATAATTTTAATTGGCTTTGGTTTCGGCCAGACAGCGCAATTGAGTGAGCCCTTGATTGATTCGATAATTG:1 - chrX 998111 3' - copia 4916 2 54.79 TCAACATCACCACGAATAAGCTTACACACAAAGACTGTTCCAAGAAAAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAATGCCGCCTTCTAACTAGTTTCTTGCCAGGCACGTAATAGACAGCATTCTGGAACTACAAACGCCTCCGTCAT:1 + chr3L 2327337 3' - Cr1a 4053 1 50.68 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATATCACAAGCTGATGCCAAAACACAAAAACCTATACCTCCGATCCGAATGCACATATATACGCGTACAGAGAGGTATGAATGCACCATATTGGA:1 - chr3L 18420882 3' - jockey 4699 1 63.01 TTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCT:1 - chr3L 17710615 3' - I-element 87 1 73.97 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCAAAAGTATGCAATGAAATGGTGCGGGCC:1 + chr3R 25409787 3' - jockey 4724 1 54.79 AGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7210 2 77.27 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGAATGGATCCGTAATGA:1 - chr3R 18940467 3' - mdg1 7056 2 71.92 ACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCTGCCACTCCCTCCCATGACATCCTTCTTCGCCCGTCTAGCCCACACAGCGGGGCAA:1 + chrX 19992664 3' + copia 5058 2 63.70 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACAGTAGACTATGTAGTAGTAAATGTTACCAATTTCGTTTCGGTTTTATGCCTCTGACTTGGCGTGTAATATTAT:1 - chr2R 21244845 3' - roo 48 2 52.74 ACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCTTCTCGTAAGTGATCTTCGGGCC:1 - chr2L 11047956 3' + Juan 4159 1 56.55 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACCATTCATCCTGCTAGATGCAAGCCCTTTAGTGTTCCAGTAATGGTTCCATAATC:1 + chrX 6053015 3' - roo 8730 2 63.70 CTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTACTCAGCCGTGATACGGGCCGAAGCGACCGAAAAAAGGGGTTACATAAGGGG:1 + chr3R 902609 3' + R1A1-element 5266 1 64.38 GGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACCCCTACAAACAGTACACCTACTAGCCCATGTTAATAATAATAATTATTTATCTGATCACTTCAAATGAGAAACCGCGAATATCCGTCGAAAATACGAAAACGTGCCTTCAATGAC:1 + chrX 17729712 3' + baggins 5396 1 50.68 TCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGTTTAAATAACTAAGCTATTAAATAATAGAGGCACACCCGACTTTCTAAGT:1 - 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chr2L 19907568 3' - hobo 52 1 66.10 CGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATACATTTAAATGTATACATTTGAATGCTTCTTTTTGCGTAAAATATTTAT:1 + chr2L 13156574 3' - Max-element 75 2 66.44 GTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAAAAGGGAATTTTAATTGGCTGTCTGTCGTTGTGTGCTAACGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTG:1 - chrX 7978949 3' - Tabor 24 2 67.81 GAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTATTTGCGAAATTATAAAACAAAATTAAAATGCGGTCCAATGCGAAAATTGTATTTTGC:1 + chr2R 20117388 3' + mdg3 185 2 58.90 GCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTTAATTTAAATATCCCATATTATTTAAGTTCATTTAATA:1 - chrX 16538112 3' + mdg3 5418 2 72.60 AAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGCAAGTTGAAGGAGGTTATTCTGCCAGCAAATGTTTCATAGTTTTTCTCTGTGCAAAG:1 - chr2R 21353180 3' - Transpac 4980 2 65.07 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATGTACATATGTGTCTATCACACTGTCTACCCACTTCAAAGGTCATCGGAGCTTGTCCAAGTCGTAACAGCAAATTCATAAAGTCATTTGCAATTTGGCTG:1 - chr3R 22275215 3' + flea 5001 2 70.55 GACAATTTACAACAATTATACCAACAAATTACTATGTGTGATGACCGTATATGTGTACATCAATCGCTGATAAGGCATTTCAGTTGTGGCCCACAAAGCCGCAGAACTTAAGGTGTGTGGCTACATCGCGCATACGCACTGTGGC:1 + chr2L 18740547 3' - accord2 7156 1 50.34 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGACTGCAGC:1 - chr3R 17794538 3' + P-element 2817 1 34.93 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATATAGAAATAATATATGTATAGAGAAAGAAGTGCTGCTATGTACACCATATGGTATGGAACTTAAGTTCCGG:1 - chr3R 23208116 3' + pogo 2060 1 57.53 CTTATTTTATTCTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCGATATTATATTTTTTCCTTTCCATTGTCTATCTTGGCTCGATTTCATGTATCTTGTCCTGCAGTTTTTTGTTCTTGC:1 - chr2L 1552640 3' - mdg3 5150 1 58.22 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGAGTTAATCATTACAACACACTAGATTGCAATTGCCTCCACCGCCACTATTGTGTGTTTCCATCCACTCTGCGCCACTTGG:1 - chr3L 1324250 3' + 412 7499 2 50.37 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGACATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCCGGAGTGGGAGGAA:1 - chr3R 19989230 3' - hobo 26 1 56.56 ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGGAAATCTATGGGTAGTAACCGTTGACTTTCAACTCAGCACTGTAGCTGCTCTCGCCCGCCTGATTGCGAGCC:1 + chr2R 7343363 3' + flea 4983 2 62.22 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTCTTTGTCCTTTTCCGCCTGATATCCCGTTGAGCACACACTGTCGAGGATTAGCAG:1 + chr2L 2518625 3' - jockey 21 1 72.60 CACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTCCATTTGGTGGCCGCCAGTTGGTAATGGCTGCCAAAGGTTAA:1 - chr3L 1983462 3' + Transpac 285 2 53.68 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCAGGTCTCTGATTCACGGATATTCGTATGTGTGCGCG:1 + chr2L 5656603 3' + hobo 2907 1 65.00 CGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTTGTATATATTTTATAGCTTTGAGCCAAACAAACAGAGCAACAAAATCAACAAGCAGGCGACGATGCTTCAAAAGCCAAAGGCCCCTTTTATTACCTTTGTC:2 - chr3R 6472596 3' + opus 7487 2 76.03 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGGTGACTGTACTGTTTGGCTAGCGTGTGTGACCGATAAGTGCTATCGGCTAATCGCTATCGCATTTAAAATGGCGCTAATGCAGATATGTAAGAG:1 + chrX 11236523 3' + copia 241 1 71.43 CCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGAGTTTTTTTTTATTGTTTATGAGGTGGAACTGCAAATTCAAACTCAAGGAATATTCCCATG:1 - chrX 4818504 3' - Bari1 59 1 57.53 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTG:1 - chr3R 7136599 3' + roo 319 2 77.40 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGATGTTGTTGTTGTTGATGTTGTTTCTACTACTCTACTGCTACTACTACATACTCATAAGCCTCTCTAAATACCGCAAGACCACTATCTGTTATCATGATTTC:1 - chr3L 13778500 3' - I-element 21 1 71.23 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCACACACACACACCGATATGAATCTTCATTGATGGCGGAGCGAACTTTAGCTAATTAAGAAATGCCA:1 - chr3L 13568168 3' - hobo 55 1 56.85 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGC:2 + chr3R 15363474 3' - 412 84 2 75.34 TTGGAAATTTTGCACTCCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGGTTCAATTTCGTTAATATTTTTGTGCGGCTGCAAAG:1 - chr3R 12098999 3' + R1A1-element 158 1 74.48 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCTGTAACCAATCGAACTTCCTACGTTACTGC:1 - chr3L 19510465 3' + pogo 2063 1 58.90 AACAAAAGAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACCGAGTTAATCACTTAGACAGCTAGCAAATCAAATTAATTTGTCCCTGCCTAGCGAAAAATGTTGCAAAATCATTTAGC:1 - chrX 12342273 3' + Porto1 197 1 58.22 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGTCTAAAAATAGCCAC:1 - chr2L 20716322 3' + P-element 2865 1 64.17 GATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCTACTTTTTCGGGCACGCAATTTAAA:1 - chr2L 12324999 3' - jockey 4573 1 62.60 ATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAGTTACTCTTACTCATTGCTTCCGCTTCGGCAGCAGAATTGGGCTATAATTACCAAGCTGCTGCTGGCGACC:1 - chr3R 26693287 3' - Stalker2 2 2 76.92 GNTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAGAAATCGGTGCTTG:1 - chr3R 26031664 3' + pogo 2065 1 61.64 AGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATACGGATACTTATTAAATTCCGTGAATCTGCACATCCAATAACAAAATT:1 - chr2L 3317759 3' - X-element 81 1 67.12 TGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACTTCTCTTTAAATTAATTTCTGTAGCCTACTTTTGT:1 - chr3L 9993929 3' - hobo 84 1 74.66 TGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTAATCATGTATAGTAAAATCATAGTACATAGTAAACCATTCTTTTCAACAGTGAAAACCCCAGGAAACGCCAATCC:1 + chr2L 10843091 3' + I-element 5311 1 54.79 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTGAG:1 + chr2L 20716427 3' - P-element 35 1 51.75 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTGCGATTGTGCATTGACCTGATTCGGAAAATGGAATGGAAAATGGGTGTGAGATTGGGATTGGGAAAGGGATGCGAGTGGCAGAGCACAAAT:1 + chr2R 10960995 3' - Doc 37 1 58.90 ATAATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAAAAATAACAACTGAACTTTAGATCATATTTTGCATTCTT:1 - chr3R 6583275 3' + I-element 5267 1 78.77 TTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAATAAATTAAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGAAGTTGACAGACTTTCTCGACAAGCTCGGA:1 + chr2L 20985833 3' + F-element 4624 1 52.74 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAAT:1 - chr2R 14767361 3' - Tirant 8170 2 60.27 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAATTTGGTCACTCGCCTA:1 + chr2L 15057268 3' - hobo 56 1 56.85 TATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTATCTAGTGCTGCTGTTGTGGTGTTGCTGCTGCTGATGCTGCTGCTGCT:1 + chr2L 1382390 3' + R1A1-element 5276 1 69.23 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGGTTCCAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGC:1 - chr2L 16360559 3' + hobo 2886 1 52.05 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCGGAGTTGATGAAGGAATACGACAGTAAATCGAAGGTGTTGCAATCGCACCAGTTTCCATACATTGCCCATCACTTACGATTCATTTATAAAC:1 - chr2L 19343892 3' - FB 30 1 62.33 TGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACATAGCTGCTCTTACTCACACCGACGCTTCTCAAAGAGAAAAAATACCCACC:1 - chr4 1301735 3' - 1731 4385 2 64.38 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTTTGGACAGCCTGTTGGATTTAATTTGAGACTCTTCAGTTTGCATTTGGGCAATTCCACACGCAGGATG:1 - chr2L 9988091 3' - hobo 52 1 52.74 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGA:1 + chr3R 4352144 3' - Doc 56 1 58.90 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGACGCAAATTCCGACCGCTCGCCTACA:1 + chr2L 851034 3' - P-element 84 1 23.36 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCACCTTATCTTTACATATGTATTAATATAATATAGTTCTATATTTTTGTTGCGCTCCTATGTGGTAAGTATTT:1 - chr2L 12814701 3' - hobo 46 1 52.41 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACATATACGCCCACATATTAACTGTCACTTTGCTCTGGTCGACTGGGTGACACACCTCCAGATTGCCAGTCGCGACTAAGCGAAGCGTTCAAATCTCGCGTCTGAA:1 + chr3L 12829745 3' - mdg1 7055 2 78.08 AACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATATTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGAGCAGGCCGAGGCAATTGCAAATCCCACGCATGGCGTCCATAGACTGC:1 + chr3R 20720639 3' - 1731 11 2 76.56 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAGGATATAAATCAAAATCATAAATATATATATACTTCATTCATTTTTGATGAGCTTCAGTACAAACTTCTAACTTTCTGGCCA:1 + chrX 14121859 3' - Doc 42 1 48.63 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTATCTCAAGAATTCGCGA:2 + chr2R 18056924 3' - blood 31 2 65.07 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAATACAAGAGAA:1 + chr2L 19161991 3' + pogo 2053 1 52.74 CGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAAGGAATGCCGTTCATATACATTATTGTATTACACTATCGAAA:1 - chr3R 11142208 3' - Max-element 81 2 73.97 AAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATACGGATACTTATTACATTCCGTGAATCTGCACATCCAATAACAAAATTATAGCTTCGTTGAGCCAAAGCGACTTTAAATAGTGG:1 - chr2L 3317723 3' - X-element 45 1 53.42 TTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGGCTACCTGACACTGCAACACTGGCGCATCAGAAGCATCTTCTGCAATTATTTGTGCA:1 + chr3R 21734615 3' + copia 5060 2 60.27 AATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTT:1 - chr3L 21765423 3' - gypsy 53 2 58.46 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTATGTACTTGGCTGGGGGACGAGCCTGCCTGCAAAACTCCTGCAACATTGCGAATGTCAAGTACGAAGAGCGTGTCAGCCGA:1 + chr3R 15346978 3' + hobo 2898 1 54.79 TTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGGCTAACCAGGGTGGCGAGGTCATTAGATCATGCCAGCTTCCCAAAGCAGAAACAGTCATTTCA:1 - chrX 21933773 3' + gypsy11 375 2 71.92 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGCAGAATTAGTCCCAAAAAAAATATAAATAAATACCTTTGTAGTTAGGACCAAACTTTATTTAAAGATCCTATGACACATCAACTTTGCGGGGAAATTCAAATAC:1 - chrX 10838463 3' - roo 17 2 74.66 TATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAAATAAAGCATAAGAACTGTTAAAGTTCACACGCATCAGGTCAAATATTTACACAAAACAGCCG:1 - chr2L 18872979 3' + I-element 103 1 57.53 AACCATTTCTGCCTACTCTAAAATAAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGC:1 + chr3L 10068960 3' + 412 400 2 78.08 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGCTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCTGCATC:1 - chr2L 15523912 3' + opus 441 2 60.27 CCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCATTAAGCCAATGAAAACTTGTGCCATAAAACCCGCTCAGCACGCACCGAGATATGTCAAAGAGTCACTCCGGAATT:1 + chrX 10693749 3' + mdg1 7160 2 66.93 GGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGACCTGGTCGATCCGAAGATGCGGCTACTGCTTA:1 + chr2R 18266756 3' + R1A1-element 4991 1 78.08 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGCGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCAAACGACTTGGACTAACACTTGGGAT:1 + chr2L 20327707 3' - roo 8689 2 55.65 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCC:1 - chr3L 22518995 3' + pogo 2048 1 62.02 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTGCGATTGTGCATTGACCTGATTCGGAAAATGGAATGGAG:1 + chr2R 10960943 3' - Doc 89 1 73.97 ATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGCCGCTGAAAATGTCATTACTGAAGGGCCAGCAAAACGGATGTCGAGTTGTTGTTTTGGTTGTTTGTGCAGCCATTGTGATTTGTATTTCTTCTTTGTCGACTGCCCTCAATT:1 + chr3L 19431777 3' - Juan 12 1 77.40 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGTAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACACCCTACCCCATAACTTCCTAATACCGGCCGTTGTCAAGGAGTACACCTTGTCAGGAGAAACGCCGCAGGAGTAACGAGATCGGCGAA:1 - chr3L 25496718 3' - mdg3 5287 2 62.07 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTGGCACGCATAATGGTGTTACTATTTTGCGATAGTATATTATTTGCTTGCTATCTTTCTATCTATCTTTCACTTCTTTTTTAATAACGTACAGTTGACTC:1 + chr3L 10241336 3' + pogo 2086 1 73.29 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTATTTTTGTGGCTGCA:1 + chr3R 11873426 3' + 412 417 2 68.49 CGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTCTGACTCATGTTGTACCGCCTTATTGTCCCAGTGGCATTTTGTAGATTTTTGCAATTG:1 - chr2R 9408111 3' - FB 9 1 79.45 TAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATATTTCTTTTCTTGATAAGTA:1 + chrX 8610366 3' - mdg3 5264 1 76.71 TAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAAGGAACAACGAACCCAAAAAGCTGACTGCCGGGAATAAAACACGCCCGCAGCTATCATTGCCGCAAATTATAGTGCGCTGGCCTCCACG:1 - chr2R 10963229 3' + Doc 156 1 64.38 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGGTTATGTTCGGGTGATTCCATATCAGTTTTCCATACGTACTCACATCGATTGGTGCGATTTTCTAATTAGCCAT:1 - chr2L 12696107 3' - pogo 43 1 54.11 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAAGCAATTAGCCAACGGTGAGGGGGTAAAGCTTGGCGGGCAGGGGGTACGGGGTTGGTTCAATGAACCGAAGTGG:1 + chr3L 19702873 3' + pogo 2060 1 56.16 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAA:1 + chrX 8610294 3' - mdg3 5336 2 72.60 GCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGGTAAGTCTATTAAAAATCTATATATTGTTCTAGGAAGACGTATTTACGTACATTTTTTTAGCCACTAAGAAGCTTTATCCAAAATGTTACTACAGT:1 - chr2L 21082083 3' + mdg3 222 2 68.28 TAATGCAGATATCTTACCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATAAGTTTCCTGCTTAGATTGTATCTCACTG:1 - chrX 16857031 3' - pogo 37 1 57.53 GGACACGCTTCATCATATTAATGATAATGCTGTGTCCCCGCTCCCAATATGTATGCGCATCTGATTAAATACAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTTGGGGCCCGTCCATGTGACTTTTATCCCCACCGGATGCGAAGTTGC:1 - chr2L 10934088 3' - Rt1b 4770 1 65.07 TTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTTCATATTAATTAT:1 + chr3L 13365123 3' - Juan 56 1 52.74 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAACCACAAAGAGCAAACACAAAAAATGTTGCCTACTTCCCGG:1 + chr3R 8625260 3' - jockey 87 1 73.29 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGTTTGTTTTGGATCAACAGCAGCGTTTTGATGGCTTTCTAAATTTATTCTTTGATCCGTGTTTCGTTTCTCACTTTCTTGCGAACTT:1 + chr3L 12776091 3' - roo 8699 2 60.27 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATGAAATTTTTATTATTAAAAAAGTGGCTGAGCAA:1 + chr3L 13568039 3' + copia 5037 2 78.77 TCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATAAATAATACAAATTTAAAGTGAATTAGAAAATCCAGATCACAAATCGCTATTCTAGCTCAAGCTAACATACTCAGATCCTTTGAATATAAAACAGAACTTAACAGTTT:1 + chr3R 12569732 3' + blood 367 2 75.34 AATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGTTAGTCGAAGACTGACAATCTTGATTATTTTTAGATAATTATGAACAATAAATAACTGT:2 + chr3R 17401773 3' - Juan 81 1 71.92 GCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGTTTGTTTGGAAAGTGCACTGCATTTTTCAGGTTACTAGGCGCCGTTGGAGAGTGGGGAGGGGGGCACTAGGGTCT:1 + chr2R 13773139 3' + opus 497 2 74.77 AAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATAGATACGATGTGTTGTTGCAACAGGACGTGACTTGG:1 - chr3L 9317484 3' + HMS-Beagle 7011 2 63.27 CTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAA:1 - chr3L 16973348 3' + S-element 132 2 50.68 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAATCGCAACTATTCTTGTTTTCTAGGCAGTGAAGCGAACCGTAATCCATACACTTTCAGCTT:1 - chr2R 20931594 3' - blood 25 2 64.38 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATT:1 - chr2R 8375041 3' - roo 8745 2 81.51 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGGAAATCTATGGGTAGTAACCGTTGACTTTCAACTCAGCACTGTAGCTGCTC:1 + chr2R 7343342 3' + flea 4998 2 63.64 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAATA:1 + chr3R 29381594 3' - hobo 63 1 61.64 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATGTATATGTGCACATATATATTGCAGTGCAGTCAAGGTCGTGTGAAAGGGACGACAGTTACGCGGCATTACTCTTACCCTTCT:1 + chrX 13484234 3' - hobo 40 1 56.16 CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCTTCTCCGTAAAGCTCAATTTCTTTATCGACGGATT:1 + chr2L 22177436 3' - Doc 91 1 78.77 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTAACTCAAGCAATTCAATAACAATAACTAAGTAGAAATTCTTTTCAAAATAATACTATACACGAATCCTTCAGTCAAACCCCCTACAATATTACT:2 - chr3R 18514289 3' - pogo 24 1 68.49 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTGATAACTTGGCAGTTAACATTTATTCAAATGAATATATGCCCTTATTAAATATAAAATGACAACACTGCGT:2 - chr3L 10141079 3' - F-element 60 1 54.79 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTGTAGGCTGACTCAGAGCCAAATGGCGTTGGATTCATGGCTAAGACCAGTTCAAAGGCAATCGATGGCAGTGGCGTAA:2 - chr3R 29719290 3' - hobo 26 1 67.81 AGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGA:1 + chr3L 13365102 3' - Juan 75 1 66.67 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAAATTGTCA:2 + chr3L 3540272 3' - mdg3 5261 1 78.08 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAAACATTAATATGCTGGCTG:2 + chr3R 13198310 3' - Doc 39 1 62.33 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAAGAGAAAAACATCTATG:1 - chr3R 30524455 3' - roo 61 2 62.33 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGAATGGCTTTACTTGAAATT:1 - chr2L 15096872 3' + jockey 4944 1 58.22 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCTCCCTCCCTCCTCAAAAACGCCAAAAACACACGACGGTCGTCGTCACACCGCATTC:1 - chr3R 26845526 3' + mdg1 7394 2 60.69 TTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCGGGGTGAGTGGGGGCGGGGCAGACAGGTGAATCAACAGCAACAACAA:1 + chr3L 10111890 3' + copia 224 1 61.64 ATAGATCTGGAATGTACGCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAATTTGCAGTTCCACAATAATAGGAATGAATA:1 - chr3R 14213648 3' + mdg1 7368 2 78.08 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGGAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACATACATGTGTGTCGGTGTCTGTGTGGTTGAACGACGCCATCAACAGCTTAGAATTTCAAAATGGGCGA:1 - chr2R 21453526 3' - hobo 51 1 52.05 CGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTGGGAAAAAAACCCAAAACGAAACACTCAACTCCCGACCCAAATACCTATCGTATGGTAGATATATATGCAATACATATAT:1 + chr3L 5844788 3' + Max-element 8509 2 61.54 GACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAAC:1 - chr2R 12185331 3' + accord 391 2 67.12 CCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGTATTTTAATCGGCTCGTAGATTTTTCAGAATTTGTGAGCAACATACAATAGATTATTC:1 - chr2R 8858875 3' - R1A1-element 5260 1 60.27 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCAAACGACTTGGACTAA:1 + chr2L 20327697 3' - roo 8730 2 61.64 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTCCAGTCATTTCCTTTCAATTTAATATTTATGAAATATATATATTCCATTCCG:1 + chrX 10344869 3' - roo 65 2 65.75 GTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAGTGCACGCGATTTGGGCGTAAGATTAATTGGCTCAAATTCGGGTCGT:1 + chr3L 9993989 3' + hobo 2863 1 67.12 TACATACATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTTGCCATATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGGGTACTTAATTCTCTTTGACTGAATGAACCCCCGACCGC:1 + chr4 48680 3' + INE-1 73 1 72.14 AGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCAGTTTGGTGCTAGGATCTGTTTGTAAATTGTCAGCTTGTTGGATAGCGACAATTTACTGCGCGAAGAAAGTATAAAAGTTGCAACTTTTTCCTTAGCGGAGGGGTGGGCGTTG:1 + chr3L 14841756 3' - X-element 4245 1 71.92 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATTGTATATACTTCAGGAAACGAATTGACTCGCATTACTCATGGATTTTACTGCATTTTCACTGCATTTTGTGTGTCTGGCATTGTCC:1 - chr2L 13976149 3' + I-element 5320 1 62.33 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTTTCATTTATTCGTTTGATTGGTCAATATCAGCCAACTGATTAGATCTCCCTTGATTAACCATAGAAAAAAGGATGTGCAACTTATTTTAA:1 - chr2L 11559677 3' - roo 29 2 67.12 TAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGC:1 - chr2L 10178012 3' - mdg3 86 2 74.66 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGTTTTGTTTTGTTTCGCCGATTCGGCGGCTCTGCGCTGGCATTTATTTAATCCGACCCATCCCCAACGATCCGGCAGATCCGGGGGCATCATGAAACTGGCGG:1 + chr2R 18266150 3' + roo 400 1 77.21 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAAGGAAAAAACGAAAGTTGCCAATGGCGCAGGCGAA:1 - chr3R 7655587 3' - 412 87 2 76.71 ATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAGTCAATTGGCGTGCTATAAATATTTGGCTGCATACTTTCGGGCGCACCGTATTTGTTGTTGTCCATAAGCCGCTTTTCTTCTCTGAAAACGGGAAAATAAATAAT:1 - chr2L 19841448 3' + BS 5077 1 71.23 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAATAAATATTTACCGGGGACAAGAGGCGTGGGCGACGACCATTAAAATCATAAAAGATTACTTTTAAAAAACATATTTGTAATT:1 + chr2L 19907667 3' + hobo 2898 1 56.16 TTTTTGTTTTTCTTTTTGCTTTTTTATTTGCAATGCATTTAATATTTTCACTAAAAGTGTTTCTGATCCACCCACATAGCAACCCACCCAGCAATATGCAATGCGTTTTTTGCAGCGGCAACAGCTGCACAATTCAAAATGTCAAT:1 + chr3L 15742984 3' - Doc2-element 240 1 45.89 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGAATGGCATAAAGATTA:1 - chr3L 19938460 3' + roo 9019 2 54.11 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' + P-element 2879 2 67.42 GCTGCTCAGGGTATATAACCTGGGAGCCATTTTTTTAACAGCAGGCAAAAATTACTGTTTCTATATTTTTCTTAAATCAGACCACTTGTGACGAAAAAACCAAAACAAAAATTTTAA:1 - chr2R 13900587 3' - Cr1a 477 1 64.10 ATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTTAGAGGTA:1 - chr2R 15529671 3' + roo 370 1 59.59 AAGGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAGAGAAACCTTCGAGGAGTTGGGTATCCTGCTG:1 - chr2L 19489582 3' - 297 438 1 78.08 CTCGGCGCCAACGCAGGCGAAGCTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTTTTAGGTATAGGAAATACAGGAAATTGATGAATTTAATGACTATGATAAAG:1 - chr3R 7540543 3' + R1A1-element 480 1 54.46 TGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACGTATATGTGCACATATATATTGCAGTGCAGTCAAGGTCGTGTGAAAGGGACGACAGTGACGCG:1 + chrX 13484215 3' - hobo 59 1 59.59 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGATAGAAAGATGAATGGATGGATGGATGGATGGGTGTAAGGGTGTCTGAACAAGCCGACAGTAATTCGATGCGTACTAAATGGAATGAATGACAAAAGCGGTCGAGGATG:1 + chr2L 7596149 3' - mdg3 5264 1 60.27 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGCTTTATGCGCATTCCGAAATCATGTATAGCTAAAGATTTAATAGGGATTTTTAATGTATTGCTATGTAATGAAAGGGTTAACGTGTCAGTGGTGTTAGTGTTC:1 + chr2L 1871083 3' + mdg3 5481 2 73.29 ACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACGCCCACAATGTTCCTGTTGTCATCGGTCTTTTTAGCTCCTTTTTCGCTAAGTGTGGAGCCGGCAGA:1 + chr3L 5442827 3' - R1A1-element 5310 1 52.85 CATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTCATTAAAATACGCCGAAGCAGTAAAGAGGCGCCAGCTCTCACGCTATTTGCACAGTCATTAGAGCCAAGAGCTGTTA:1 - chr2R 24211514 3' + flea 4975 2 59.31 GCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATAACAAAAGGCGCCGTCCAGGGCATTGAGGCTTCGCTTCGTTGTTGTTGACGTAGGCCCACGCCAAGAGGCAG:1 + chr2L 21007112 3' - opus 30 4 60.14 ACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCACATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCCAAGCAGCTAAAATACGGATAGGTTTGGAGAGTAAAGTTACTAGCT:1 + chr3R 31264233 3' + jockey 4915 1 69.86 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTTGAAATTTGATTTGCCGATTGCCGTCACTCCACTGGCTTTGTATTCATTGTACATTG:1 + chr3R 18940616 3' + mdg1 365 2 58.90 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATTCCCCAGGCTAACACTATTCAGATTCGATCTATATTTGGCCATCTCGCTATCTCTTTCGCTCGTTATCGTGGCATCTCTTTCG:1 + chr2R 15892255 3' - hobo 16 1 70.00 GATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATACAGGTATGAACTGCTTCAACTGCGTGCTTCTTGT:1 + chr3R 24396771 3' + I-element 5264 1 75.34 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAAAGTTTATATTTATTACTATTAAAAGTACCATTTTATTTAATGTGAAGTACCAATATTTTGTTCGGTGCATCG:1 - chr2R 11609840 3' + roo 9053 2 72.60 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCCATGCTCTGCAACGGTGCGTATGATTAATTTCAGCTACAATTAATATTGCTCATACGCCAGCGAGTACGGGGCCGAAGCAACCGCAGCCTTGGGCTTT:1 + chr3R 30524595 3' + roo 9050 2 70.55 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGTTTTGTTTTGTTTCGCCGATTCGGCGGCTCTGCGTTGGCATTTAT:1 + chr2R 18266092 3' + roo 352 2 64.57 GCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCAATGCTGTGAAATGGCCTGAAATGAAATTT:1 - chrX 17690437 3' - Doc 307 1 57.53 TTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGGGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCCCAGCAT:1 - chr2L 5656567 3' - hobo 77 1 72.26 GACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTCCTTCATCAAGTTTCCGTAGATGTAGAATTTACAAAGTGGGGTATTGGGCAAAAG:1 + chr3L 18585766 3' - mdg1 7106 2 63.70 GATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGGAGCGCAGCATGCGCGCCAAATTCATTTAATTGATTCCGTCTCAAATTGCCATTAACTGATAGAT:1 - chr2R 7749036 3' + Porto1 353 1 64.04 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTCATACATACATATGTACATAGCAACAGCGATCTATGGCCTGTACATAGAGAAAATAACTTCCCTAGCATTTAC:1 + chr2L 19135723 3' + Burdock 227 2 64.62 GTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTTGTTGATTTCCTAGGTGTATAAATTATACTTTATTTAATCTGCGATGACTGCGTAAAAGCTTTTTGCCCCGGCATGCG:1 + chr3L 9905854 3' - Juan 4069 1 54.11 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACAC:1 - chr3R 19589939 3' - BS 5081 1 75.17 CCTTTTAAGTCCCCTTCAATAACTCTATTGCTCACATACCACTGGCCACTCTCCACCTGTCACTCTTACTCTCACTCCTCCACGCCTACTACTCACTCCCCCAACTACCCATCCAGCCGAGCGATGACGTGTGGGCGCCGCTCTTG:1 + chrX 19668051 3' - G5A 2549 1 75.34 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAACCTTTATGCAGGGGCATGACTGTCAGCAC:1 + chr2L 12696263 3' + pogo 2074 1 67.12 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGGTGACTGTACTGTTTGGCTAGCGTGTGTGACCGATAAGTGCTATCGGCTAATCGCTATCGCATTTAAAATGGC:1 + chrX 11236502 3' + copia 5077 2 51.03 TATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAGAAGTACTTCAACTATATTCCTTAATTGATATTCTAATGTAAATTTAGTCA:1 + chrX 19736515 3' - pogo 68 1 65.75 TTGCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGATTGTGGAAGTACGAGGCAGACATTTCAAAATTGACACATCGATGGAAATGGGCAAAACAAAAAATTAATTGAAGAAATATTCTACTTATATTTGTTTGCTTTTCTTAGTGCATTC:1 + chr3L 7441807 3' - INE-1 555 1 76.03 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACATACATGTGTGTCGGTGTCTGTGTGGTTGAACGACGCCATCAACAGCTTA:2 - chr2R 21453544 3' - hobo 69 1 65.75 CAGGTATTAAGTATTAGAACATGTTATGCATAGAGTATGACTACTGCCTCTGTTCATTTAAGATTAATTATAAAATATACTTATTGTCATACTTTTTTAGAACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAAAAAAAATAAATTCTAGCGT:1 + chr2L 8777075 3' + G4 3719 1 63.01 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGT:1 + chrX 7624132 3' + roo 8991 2 75.34 AATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAATCCGAGA:1 - chr2L 1870951 3' - mdg3 74 2 65.75 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACGATAGAGAGACGATGGAGACCGGCACACAGAAATATATTGGGTC:1 + chr2R 18467211 3' + roo 332 2 69.18 ACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATTGGAAAGCGGAGGGATTTGGAATGCAAGATGCCAGACGGTGTAAAATTTGCATTTTTCTCCGGACAG:1 - chr2L 20631909 3' + Ivk 142 1 54.11 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAATTTGGTCACTCGCCTAAAGCAATAAAAATGCAATGCAGCCACGTCTCCGTCTG:1 + chr2L 15057305 3' - hobo 19 1 71.23 TCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTTGAAATTTGATTTGCCGATTGCCGTCA:1 + chr3R 18940586 3' + mdg1 7373 2 79.45 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATAGGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCATTTAAATGCAAAATGATGTAAATTCCA:1 + chrX 12995419 3' - blood 50 2 50.00 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCCCCCATCCGTGCCACATGGCTTTGATAACAACACTTCTCCGGGGATAGTTGCAGGCCATTTTTGCAGTCTCAAGCAAACACTGCCAGCAACTTATTCACTTTTTGTTTTC:1 - chr2L 2522832 3' - mdg1 7048 2 79.45 AACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAAACCCTACTACATACCCTACTCATATTATGTTTTAATACTTAAAACCTGTCGGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTTGGGTAAATCTAGCGATCGGCGGAGAAGGAGGCATGCAAATGAA:1 - chr3R 6696390 3' - G4 3770 1 73.29 CGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAATAGAGCTGACTATAAAGTTTCAAAAATGTAATCGGTGTCAAGAATATGCAATAACAATCA:1 - chr3R 5598706 3' - roo 8832 2 58.90 TGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCGTTCGTTTATGGAAAATCCGCGCTGTTTGCTT:1 - chr2L 951273 3' - F-element 35 1 65.75 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACTATTTCAGCTATAAACATCTGGCACGGCAACTTAAAAGTCTAACTAATCCCATTTGTTTTCCAGATCTTAGAAACTTACCAATAGCATTTGTGC:1 - chr2R 15190355 3' + pogo 2076 1 69.86 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTGATATTGGGCGATAAAGAAACCG:1 + chr2L 11043622 3' + roo 9013 2 60.27 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGCCTGATACTTAACAGCTCAAACTCCTTTAATTCCATTATGATAGATTGAT:1 - chr3L 2240406 3' + roo 338 2 65.75 ACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCAAAAGCAGGGGTACTTTCCATAATGAAACAAGGCGAAACTTTCAT:1 + chr2L 1260863 3' + jockey 4597 1 69.18 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGTCCATTTGGGTAACTAAATAGCTTATGGTTAGTTTCCGCGAATTTTAAGATTGCCTTTTGAGTTGAAAGCATTTGGCTCATTAAAAA:1 - chr3L 5425423 3' + blood 7356 2 58.90 GAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACAGTAGACCGGCATTATGTTTGTGCCCCATTTTGTGGAAGCCCACTTGCTCTCTTTCCGCCATTAATGG:1 + chr2L 3393850 3' + Stalker2 7624 2 54.47 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCCTTCGATTGTT:1 + chr3R 18860891 3' + roo 361 2 50.00 TCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGGGGCGGGCTGCCGGTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGGTATAGCCAAAGATACACTTGTGTGGGTGTAAATAAACCATTAATTACTTGGCCAGAT:1 - chr2L 16360554 3' + hobo 2918 1 57.14 CAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAGGCACGTACTTAAAAGAAAAAAAAAATAAGAAAAAAAAACTTCCCCATCAAGTGGGGCCAATAAAAGTTTTATGAGTCAGCCGCAATCTCG:1 - chr2L 10128050 3' - hobo 14 1 68.22 ATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCG:1 + chr3L 3540228 3' - mdg3 5290 2 50.34 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTACACATGACTATATTATTGCGTCATTTATGCATCTCATAATTCCCCGCATAAGTCCACCAAACAACCGACTGCGAATCCTCGTTACACAGATTGGAGCCAGTTCCCCAGCCAG:1 - chr3L 22445140 3' - Transpac 22 2 70.55 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCAAACTTTATTTTTTTGCCATAGAGCATTTCTCAGCCGTTCTGTGAGCAAAATTTCTCTAGGTCTCCTTCTTTTATGCTCCTTATTTAACTTGCGG:1 + chr2L 12814848 3' + hobo 2913 1 67.12 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATGGTAGGCGAAGGATGAA:1 - chrX 16995026 3' - jockey 23 1 63.11 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTAATTACCAAACTGCTGAAATAATTATTGTGTTGGTTCTGTTTCTGTGTGAAGGATGAAATGGAAAGCAAT:1 + chr3R 25053114 3' + pogo 2052 1 54.11 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTAAGGCAACGTCAGGCTGGCAGGCCACACAAAAAAAGGACAACGAGTCCTGGATGCGGG:1 - 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chr2L 16536516 3' - pogo 67 1 67.12 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGCCATACATTAAGCAGCAGTTTA:2 + chr2L 18848813 3' - blood 61 2 59.59 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCCTTTGCAATGAAACATGGTATGCATTTTGCAGAATTGAGTAAAATGCAGTAAAGTTAATTATAAA:1 + chr2L 15597025 3' - roo 54 2 54.79 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTGGCATATGC:1 - chr2R 20117301 3' - mdg3 5327 2 69.86 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTT:2 + chrX 8610311 3' - mdg3 5319 2 60.96 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGTTTGTTTTGGATCAACAGCAGCGTTTTGATGGCTTTCTAAATTTATTCTTTGATCCGGGTTTCGTTTCTCACTTTCTTGCGAACTTTCTTTTCGGGTATTT:1 + chr3L 12776106 3' - roo 19 2 72.41 GGAAATGGCCAGATCGACTCGGCTATTAATCCCGATCAAGAATATATATGCCTCATAGGGCCGGAAACGCGTCTGCCTCTAACCTACTTTTCAAAGAATTAAACAAGATAAAACTTAAATCGATAATATATTAAAAAAAAATTTA:1 + chr2L 5939276 3' - INE-1 107 1 69.66 ACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAATTAATTAAATTGAAGTTCACCAACACGAAACCACCAAAATCCACCGCCTTTGTTATGTCAAAGAAGTT:1 - chr3L 22638765 3' + Juan 4159 1 58.22 TGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTGGAATGTGTTTAGCGGCCTTTGATTTGAAGCGATTTTCGCGGAGAAGGGATTTGTTGAACGTATAATTATTTGCATACA:1 - chrX 9949472 3' + hobo 2896 1 54.79 CACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTTGAATCCACAACAACACGTTTTTGTCAGCAATTGAATTAAATTCAGCGGGCATGATAAATGTAAGCGGACGGAAAATGA:1 - chr3R 6404522 3' - Stalker2 44 2 55.48 TTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTATTTAATCAAATACTTTCTTGAATGTGAGTGACTCACTTTTAAAATAGGTTTATGACAAATAGGCCAAAAT:1 - chr3L 17540307 3' - Quasimodo 7325 2 52.05 TTTAGGAGGAATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGCATTGTGCCACCCCGACCCACATTTTTTTTTGGCATTCACATCCCCCGCCACTCA:1 + chr2L 17574449 3' - hopper 30 1 50.94 CCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTAACGG:1 + chr3L 13546633 3' + hobo 2867 1 69.78 GAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGCGCCGAGAACCCCGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCTATAATAATCTTTTTATTATTATTCATATACATAAGGGTGTTTCGTAAATATTT:1 + chr2R 2052657 3' + opus 7432 2 64.38 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTGATATTGGGCGATAAAGAAACCGCT:1 + chr2L 11043624 3' + roo 9018 2 58.04 ATTTTAAACTTTTTAAATTTTAAGACAAGTAATTACAGAGAAAGCTTCAAAATGAGCTATTTGAAAGATTCCTACTTGCCATTGTAGAGCAGATCGTACTTCAAAGAGCCAGTTCAGCCCACCTGGTCTCCCTAGGAGCAACCTTA:1 + chr3L 6318826 3' - 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chrX 6863547 3' - Juan 4119 1 58.33 ATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGATCAAAATGTAATGAAAAATTGTCTGCAACATTGAGATAGGAATCCACTTGTGCGAGC:1 + chr3R 20938393 3' - R2-element 3384 1 60.96 CAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGAAGTTAAATAGAGTTTGTGGTGAACAATAAGAAATTTTTCCCAG:1 - chr2R 22616854 3' - BS 5054 1 50.00 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCCTTTGCAATGAAACATGGTATGCATTTTGCAGAATTGAGTAAAATGCAGTAAAGTTAATTATAAAT:1 + chr2L 15597026 3' - roo 53 2 54.11 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGGCGGCTTGGTCCTTTTGCAGCACTTCGTTAAGATGT:1 - chr2L 14262929 3' - P-element 43 1 53.42 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACCATTCATCCTGCTAGATGCAAGCCCTTTAGTGTTCCAGTAATGGTTCCA:1 + chrX 6053010 3' - roo 71 2 67.12 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCATACGCGATGATTGGTCCAAACTCTCCGGGCAACCCATTTCGAAATTCGCCGTAAACAACA:2 + chr3R 25094732 3' - P-element 39 1 58.90 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGGAATCGCATACGCGATGATTGGTCCAAACTCTCCGGGCAACCCATTTCGAAATTCG:1 + chr3R 25094720 3' - P-element 40 1 53.33 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACGTACGTACTGTACATACTATTTACATACATACACACACCCGCACTTCCAACGCCATGTGCCAAACAGCTGATAAAGGCCA:1 + chr3R 17079526 3' + 1360 3347 1 56.85 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCT:1 + chr3L 3540189 3' - mdg3 71 2 76.26 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGCCTTCACTTAACGCTCATAAATTTGTCTGCCGCAAAATCTGCGAGACAAGACCAGAACAGAAGACCAGAAAAAGCAAGAGAACAGAAATTAAAAGAATATTGTTTATAGTGCTTC:1 - chr3L 16196955 3' - Doc 13 1 79.45 ATTGCAATCATACGTTAAGTGGATGTCGCTTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATAGCCTAACACCAGGAGCAGCGTGGCGGAAAAGCGTTTTGTCCCGGCGACAAGGCAACAACGGCAATAAGGCCCCATTT:1 - chr3R 25094594 3' + P-element 2844 1 56.16 GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATAATCGCATTTTACTCAGCTGCCCCAAGCCATAACTACGCAGTTTGATGAGTTACTTCTTCCGGTGCCGATTCCGT:1 + chr2R 5800591 3' - HMS-Beagle 6837 2 59.59 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGTCAAAAATAGATTACAATTTAGAAGCATCTTAAAGATTTATCGATTGATATGAAATAATAAGATAAGATCTCGACT:1 - chr3R 18860747 3' - roo 8708 2 51.37 CAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCCGCCTACGGTTGCAGTTGCTCCGGGTGCGATGCACTAGCAAATTGCAGCTAATGGAATCTGCAATTGAAATGAGGTCCTGC:1 - chr2R 21105686 3' - Stalker2 42 2 56.85 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATACGAATTGCAGGCACTGTGCGATGTTATGGGTTTTGATTAATTGGAAG:1 - chr3L 5329101 3' + 412 7473 2 67.12 TGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGGCTTTTGGGGTTAGGCTTTAAGAGCGGACTGCAAAAGGACCGGCGAACAACAAATCCGTACAAATTGAATAAGAACTCAATCTTGGCTACTGTGCGAACAAC:1 + chrX 20379432 3' - hobo 15 1 75.34 ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTT:1 - chr3R 19589893 3' - BS 5036 1 54.11 TATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAGTCAATTGGCGTGCTATAAATATTTGGCTGCATACTTTCGGGCGCACCGTATTTGTTGTTGTCCATAAGCCGCTTTTCTTCTC:1 - chr2L 19841470 3' + BS 5055 1 56.16 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCTTAGACTAAGGAATTTTAATAGCAAAAACATGACTAGAATATGTAGTCTGCTTCTG:1 + chr2L 3327064 3' - jockey 4735 1 60.27 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGCTATCTAACCGAGTTCCCTGTGGCAACGAGGCGTGGCAGGGGCCGGGCACATGGGCAACAGCTGCAGTTGGCCGCAAAATGCTTTCAA:1 + chr3R 12886114 3' + 412 7514 2 62.33 GTTGCTTTTGTTGCTGCTGGTGTTGTAGTTTCTGCAACTGCAGCTGATG:1 + chr2L 19503887 3' - TART-B 152 2 55.10 CGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATAATCGCATTTTACTCAGCTGCCCCAAGCCATAAC:1 + chr2R 5800550 3' - HMS-Beagle 82 2 74.66 TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCATATAACTTGATTTGTTTTTATTTCCAAGTATGTTCGTTATTGTTTACAATTTGTCCGAAATCTACATATTATGGAGAGGTAATATGTTAAATCATAAATGACATTTT:1 - chr2L 22031913 3' - Tabor 15 2 75.34 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGG:1 - chr3R 5087030 3' - P-element 27 1 67.12 AATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTACGACAAGCAACAGCGGACTGTGGTAGTATTCTCGCCCGCTAACCACACACGCTAGCCACGCCCAC:1 + chr2L 7552758 3' - R1A1-element 4864 1 81.91 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTGTTCAACGCCTCAAGTGAATGTTTGTGTGCCATAGTACATTCAACCCAAATATTAATTTTACACCGTTTCAGCATACTGGCCATAATGTAGATTTGTAAGAATTTATGTGGTTCGT:1 - chr2R 4853860 3' + copia 249 1 78.08 GAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTCCATTTGGTGGCCGCCAGTTGGTAATGG:1 - chr3L 1983476 3' + Transpac 5139 2 79.45 ACTTAAAACTGATTAAAAATGTTTATGTTAGTTGGTTCGAAACAGATTGACAGAATTCATTTTTATTAAATGGATTGTATTGACTGTTCTGAGGTTCTAAGTAATCTGATTATATTCCCTACATGTTACTTATGTACAATAGTAGA:1 + chr3L 12167976 3' - McClintock 264 2 58.22 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGCTTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGACACAG:1 - chr2L 42508 3' - copia 71 2 69.86 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTGCACGCCCC:1 + chr2L 15601646 3' - Doc 31 1 56.56 GTGCGAGTGGCGGGCTGTAGTTCTCTGGTCGCCCGTTTACTTTTGTGCACCAAAGCCGAGACGCATAAATAAACGGCAACGGTCATTTTGC:1 - chr2L 1892272 3' + hobo 2933 1 64.84 AGGAATAAAGAAAAAAAAAAACAAAACAAAAACAGTAACAAAAGAAGCCAAATAGGCTGAAGAAAAGGGAAACTGATCGACTGATAGGTGCAAATTGCTGTTGGATAAAAAAGGGATTCCCCCGAGTC:1 + chr3R 10818503 3' + Osvaldo 1520 1 89.84 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCCTATATATACATAAGTATAAGCATTCGTATATACTTATATATATATATAGAGACACAGTATGTCGGAAATATTTGATTTTC:1 - chr2R 17341086 3' - hobo 36 1 52.11 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATAATACCACAGGTACTCTTCTCCCCTCGCATTTGAGCCACCACCAGACTGGACCCATTCTATATGTACAGTGTCGTG:1 + chr2L 20253974 3' + roo 9040 1 64.38 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGAGACGGGCACAGACACAGACACAGTATTTAAAGTTCCAACTCCCGAAGTCGCAATGCAGTCTACGCTGTCCGCGCTTGGTGCTCTGATATATATTGTTAACAA:1 + chr2R 2941136 3' + roo 391 2 73.29 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACATTTATAAGGATTGACTATGTTGAAAGCATAATTTTACTAGT:1 - chr2L 19800886 3' - roo 79 2 72.60 AAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATAATTATAATTCCATTTAAAAACAGAAATTTTCTTTCAATATTGGCCCATATTTTCCACCCATTTGCCGCAAATGCTGCATCGAAAATAATGCGAATCCGAA:1 + chr2L 13157233 3' + Max-element 8248 2 75.71 TTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAAGGACTTCTCCTGTTGCAAGTGCAATTTCCGTGCTAAATATTTGCACACAAAAGCAGGAAACTTTCTGCCAACTTTCCTGCTCCTTTTGCAGGATTTTTTAC:1 - chr3R 26139372 3' + mdg1 400 2 70.55 TAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAGTTTAAACCAAAGCCTGTACGCTGGCAAAAGTAAGATGATGTGCCAAAATATACTGGCCATCATTTATCATCAAATATTTAAA:1 + chrX 6502370 3' + G2 3008 1 62.33 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTATGTACTTGGCTGGGGGACGAGCCTGCCTGCAAAACTCCTGCAACATTGCGAATGTCAAGTACGAA:1 + chr3R 15346963 3' + hobo 2898 1 49.62 TATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATATTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGAGCAGGCCGAGGCAATTGCA:1 + chr3R 20720611 3' - 1731 39 2 54.69 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATGCCATTAATTGAAATGATAACGATTAATGATAGCGAAAAGACACCA:1 - chr3L 11887158 3' - Doc 26 1 68.49 ATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCT:1 - chrX 18193737 3' + hopper 1326 1 80.14 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACATATGTATATGCTTGGGGGTGGGCCATGGGCGGTCTGATGGCTGCACCACGTGGGCAGACCACGGCAA:1 + chrX 1726770 3' - 297 6629 2 58.62 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATTTCAAGCTTATTAATATCAGATTGACAATCCTCAAA:1 - chr2R 8375006 3' - roo 8710 2 57.53 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACGTATATGTGCACATATATATTGCAGTGCAGTCAA:1 + chrX 13484186 3' - hobo 71 1 76.74 ACTTATAACCTAAGGCATTCTATGATTTGGTTTATGTCTGTTGCTTTGTGGTAATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTAGTCAAGTGTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATCTAAACACGACTAAAATTTCTT:1 - chr2L 23016848 3' - Quasimodo 90 2 73.97 TTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTGTCATCATATGTCTAACACTCGTCTCACTCGTTGGCCCGCCCCTGGGTTTATCCATCCATCCCGCAATCACTCTTCTCTCACCTTGGTCCTTCGGCAAATTTGCATA:1 + chr2L 16202750 3' - copia 9 2 79.02 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCACCAAGCCGAATCCATCCGAAC:1 + chrX 12003976 3' + P-element 2790 1 19.18 GGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTATTGTTATTATTATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATG:1 + chrX 21668936 3' - mdg1 7129 2 67.81 TCTGTGTATATTCTCGTTCCGAAGATACCACGGAGCTCCAGTGATTCTAAGAATACTAGACTGTGCCCGCTTAGACCTCTGGTTGTCGAAGTGGCTTTGGTGGGGGACCGCCGAGGGTTCCCTCCTCCGACCATAGCG:1 + chr2R 5032271 3' - Doc3-element 4431 1 55.07 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACTTCATCTTATATCAACAGCCACACAGAGGAAAACGCTATATTGCTCTTCTATGATAAA:1 + chr2R 6713952 3' - 297 6630 2 59.59 AATTGGGAAATCAAAAAAAAAACCATGTAGAAAACATCGAATTACAGATAAAAGATCTTTTTAGTGTATATTATTATTAAACAAGAGACTTCACTGACATTTTTCTCTTCAATTAAATGACTGCAATAAAAACCGTTTTTGATATT:1 - chr2L 13043766 3' - Tc1 1477 1 49.32 AGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAATCAATTATGTGCCAAAACAACTTATTATA:1 + chr3R 7835489 3' + Quasimodo 6989 2 75.83 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTGTCATCATATGTCTAACACTCGTCTCACTCGTTGGCCCGCCCCTGGGTTTATCCATCCATCCCGCAATCACTCTTCTCTCAC:1 + chr2L 16202725 3' - copia 37 2 60.27 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATGCAAACATGCATTTCACATGGGGATACATTTCTGTCCCAACTAGCCCGGCTGCTAACTGCTGAAGGGGAATGGGGA:1 + chr3L 5329205 3' - 412 7098 2 54.48 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTATTTTTGTGGCTG:1 + chr3R 11873424 3' + 412 7470 2 69.44 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTAAGCATGCAACAAAAA:1 - chr2R 18265980 3' - roo 35 2 61.64 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGGGGCTCAAGTCGAAGTTGCTGTAATGTCGAGAGACCGAGACCAG:1 - chr3L 17895928 3' - P-element 78 1 30.82 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGAATGGCATAAAGATTATTTTTGTAATTCAGCTTAGTA:1 - chr3L 19938439 3' + roo 9041 1 64.14 AAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGACACTTTCGTTTATTTGCATTTTCAATTTATTAGCATAAATGTTTGTGCCATGAAACGCACGCTG:1 + chr3R 11730776 3' + hobo 2883 1 56.16 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCGCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGGCTAAAAATAGCCACAGCTAATGCAGTCCAGC:1 - chr2L 20716305 3' + P-element 2873 1 68.22 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATGAAGCTCCTATTAAAGAGGTGTT:1 + chr3R 26658203 3' - hobo 66 1 78.07 CATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTG:1 + chr3L 22638847 3' - Juan 4168 1 70.55 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCTGTCATCTGTCTATCAGAAGCATTAACAGCTTTTACTTACTGCGCGGCAGACGCTT:1 - chr2R 23504195 3' + jockey 4965 1 53.77 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCTGTAGGCTCACCTACTCCTCCTGCAATCGAAAAACAAAATCAACAGGTGGCGCGCATATTTCAACATGCGGCTGCCAAGCGAACCGAGCGAAATA:1 + chr3L 5948148 3' + P-element 2864 1 69.18 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGAATGGCATAAAGATTATTTTTG:1 - chr3L 19938454 3' + roo 9026 1 53.79 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCATACTAAAGATATGGTTCTTACCATATAATCATATTATTAAATTTGAATCCTTGTTGTTACTCTTGCATGT:2 - chr3L 10241175 3' - pogo 50 1 53.42 TTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCATATAACTTGATTTGTTTTTATTTCCAAGTATGTT:1 - chr2L 22031986 3' - Tabor 6927 2 80.14 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAATTTGCATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTCGACTGTAGTAAAGAAAGAGGGCACATCGAAAGT:1 + chr3R 4761220 3' - hopper 40 1 65.75 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTGGCACGCATAATGGTGTTACTATTTTGCGATAGTATATTATTTGCTTGCTATCTTTCTATCTATCTTTCACTTCTTTTTTAATAACG:1 + chr3L 10241324 3' + pogo 2074 1 65.07 TTAAGGATGGGTGTATGAGTGCATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTGTTGGTTAAGTTAAAGCAATATTTTCCAGAACTCC:1 - chr3R 20097617 3' - mdg3 5339 2 72.60 GTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTCAGCGCATTTGGGGCACACAAATTTTCATTAAAAAGTTTGCTGACAATCTCAACAAGTTATA:1 + chr3R 4533194 3' + hobo 337 1 57.24 GATCCATCAGACAAAATATTGGACTCACATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATAGCAGAGAACAACAGAACGCAAATGCGTTGGAGGACAGCACTTGACTACA:1 - 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chr2L 16202617 3' + copia 5047 2 71.92 AGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCCGGGAATTCCGGGCAGAGCATCTCTTCCAGCTGATTGCTCAATCTCAATGAAATATGATTAAATA:1 - chr3R 21734515 3' - copia 4925 2 56.25 AAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCAACCGATTTACACCATAACAATACACGAGTTCGTCGTTTCGGTTTCCCCC:1 - chr2L 21189726 3' + hobo 2885 1 62.31 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGGACACTAGG:1 - chrX 19744410 3' + P-element 2825 1 42.47 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGATATAGTGATGTATATTCTTGTGTTGTTTTTTTTCGGTGCCGCTTTAGTTTGGCCGCAGTTGCTGCTCATCAGGAGTTTTGCCTGGATGACGGCTTATTATCAGCA:1 + chr2R 10936790 3' - copia 16 2 70.55 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAAAGTTTATATTTATT:1 - chr2R 11609898 3' + roo 331 2 73.29 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGAAGTAAATGTGGTTCATA:1 + chr2L 8009157 3' + roo 9015 2 56.85 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTTGAAATTTGATTTGCCGATTGCCGTCACTCCACGGGCTTTGTATTCATTGTACAT:1 + chr3R 18940614 3' + mdg1 363 2 60.27 GAGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAAGAAATGTACATTTATCTGAAGGATACAAAGT:1 + chr2R 14548981 3' + copia 4861 1 78.77 AATAATTGCAATAATAATAATAACTGACCAAACACTGGGCGGCTGGAATCCTTCGCCTGCTGCCTTCATGCTTGCCTAAGTAGGTTAATATGCCATTTGAATGTTGTGATTTTGA:1 - chr3R 11076930 3' + mdg1 28 3 63.48 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGTGTGTGTGTGGCTTGAATATTTGAGATTTTACTCCGCTTTTTCGCGTGTAACTGTTAGTTTTC:1 + chrX 6213659 3' + roo 389 2 72.60 CACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATAGATATACACTCTTAATTGATATACGGATTTGAAAACTTTGTTAATTAAGTTCACTTTAGTTTGTGTTTCACTTATGTTCTTGTCTATGATTTTAATTTCTCACCAGAAATCCTC:1 + chr3R 26693498 3' + Stalker2 396 2 76.71 AGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTGTTTAAGCGAGCTAGCATTACATATATACATACATACATTGCTACATACATCGTTACGTGCATTGACTCTAAAAAGAAATTGCCAAAATTCAGCAGAGTCTTTCGGAGAA:1 + chr3R 19448975 3' + diver2 483 1 71.92 CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGCAAATTTGCATTTTCAGCTTGTGCG:1 + chr2L 2518559 3' - jockey 79 1 68.61 CGAGGTAGCGGGGCTTCTGTTGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAA:1 - chrX 12131190 3' - F-element 400 1 76.03 CCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCCAAAAACAAAAGCGACGTTTTACTCGGCTCTGCGAGCAAGAAACACAAAA:1 + chr3R 18935208 3' - jockey 4694 1 66.67 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTAATCGTAATTAATGAACATGTAGGTATAGGTAGGATAGTAGGTTCCTTTAACTTAT:1 - chr3R 25052999 3' - pogo 60 1 58.90 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATTGTGTGCTT:3 - chr2L 2336208 3' + 297 6925 2 58.90 AGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAATC:1 - chr2L 1870956 3' - mdg3 79 2 69.18 AAAAAACAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAGAGGATCGAACGTAAGGGCAAAGTAACGGCTATTCGCTTCGTGCTGCCCATTTCCGTTTCCGC:1 + chrX 11003694 3' + Doc2-element 226 5 81.11 AAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATCAACCCGCGTTATTATTTTAGATTGACTGACGTTCATTATACAA:1 + chr3L 19788186 3' - FB 78 1 70.55 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATAACTCAACAAATTTAATTTAGATCGAAATGTGGTGCAGTTAAACCATAGATTTCCCACTTCTTTTCAAATTAGCAATGGTATTT:1 - chrX 19591119 3' - roo 8697 2 61.64 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACGATAGAGAGACGATGGAGACCGGCACACAGAAATATATTGGGTCTATAAATCAAGGAATTACTGCGGATATTGAAAACAT:1 + chr2R 18467247 3' + roo 9032 1 55.48 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTCATATATAATAAATTGAATGATGCTATATAGAATATATGTTATTTCATAATTAAATATTTAACCTACCGTGAGCAAGCAAATTGCGATCGTTAAAGC:1 + chr2L 12447552 3' + opus 7475 2 66.44 AAAACAAAACAACAAAAAAATTGAATATAAAAACTATATAAAA:1 + chr3R 30997780 3' + gypsy11 3935 1 53.49 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTCCCAAATTCGGAAATTTCGGATCAGTTCCACTGTCAACTATACTG:1 - chrX 22760326 3' + roo 8996 2 67.81 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAATATTTTATTTGTAAATAATTCGTTTAAATAGTAATCATGGGTGCTTTTTGCGCAGGCGGATTTATTACTCATGAA:1 + chrX 5938398 3' - pogo 41 1 53.42 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCCAAAACATCATCCCGCAAAACATCAGGTACGTGAGAGCCATTCAAATGAGCGAGTGCCGAT:1 + chr2R 8467827 3' - roo 59 2 58.22 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTGTAATCGATATACATACAGGATATACCGAAGATTGTTTTCGTTAAAGAGGTGAAAATAATGCAACAATGAATAAATTTTGATTTTAACATTTACGAGCATGAAACGTATGAAC:1 - chrX 10344707 3' + roo 400 1 51.37 ACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGAACTCGGAATGGCTTTAGATAATGGTGCTATTGTTTTTGAC:1 - chr3L 8704516 3' + blood 7310 2 71.23 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACATATGTATATGCTTGGGGGTGGGCCATGGGCGGTCTGATGGCTGGCCCACGGGGGCAGACCACGGCAA:1 + chrX 1726770 3' - 297 6616 2 54.55 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGTTTTCTTTCGCTTGT:1 + chrX 22715135 3' + opus 433 2 66.44 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAATTTGCAGTTCCACAATAATAGGAATGAATAAAAGGTGTTAAATAATAGATGTTATTCACAGTAACTATA:1 - chr3R 14213609 3' + mdg1 369 2 52.74 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACTAACATGTTACATAAGCCCCACACCCTTCTTCCAACTAATTGGATTTCTGGGAACTCACTTACAGACATGACCGCCTTCCT:1 + chr3L 18954248 3' - roo 8 2 73.04 AATGCGCAGAGCTTCTGCCGGCTATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGC:1 - chr2L 11639023 3' - springer 87 2 78.08 TAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAACCACACAAAAGCATGAATGAAGTTGTTGCCGCTGCTGCTGGCTACAAAAAGCGCTTGAAAAATATGTTAACGACAGTTAAAACAGCGCCAGGTCAACCGTACTGCT:1 + chr3L 939298 3' + hobo 2504 1 79.10 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAG:1 - chr3L 19938476 3' + roo 9003 2 65.07 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATATATTCTGGAAGACCTTTAATCTATATTGAGATAGACTTTCTAGCAAACGCTCGTCTAAGCCGATTTGCTT:1 + chr3R 7306020 3' + 412 7499 2 52.74 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCAAAGTACAGCTCAAGTGAGGGCTCCTCCTTTGTAGAATAATTCTGT:1 - chr3L 1728464 3' - blood 75 2 67.12 AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGATAGAAAGATGAATGGATGGATGGATGGATGGGCGTAAGGGTGTCTGAACAAGCCGACAGTAATTCGATGCGTACTAAATGGAATGAATGACAAAAGCGGTCG:1 + chr2L 7596143 3' - mdg3 17 2 57.93 ACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTGGCAGCTGCAAGCTGCAACCAGCATAAAACTGTATGCTACGTCG:1 - chrX 18193470 3' + jockey 4915 1 68.97 CCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTGCACATGTTACGATCGTTAATACGCTGTCATAAATTATAGTAAATTATGGAAAATACGACGAGAAAAACACGAAAATTCAAAGCCTACACACACACACGAAAAAACGATATACTGATTTTAA:1 + chr2R 7744671 3' + transib2 201 1 54.79 GTATAACAAGATGCGTAAAGCCATACGATTGGCTTGTTGGAATGGGCTAGCCTGTTTAAGCACTATCGCTTTGTCTGCTTCTATAGGGCTCCTTTAACCTTTAATTCTTAATGTCTCCAGTCTCCAGTTTCAAAGTCAACGGTTTT:1 + chr3R 14697995 3' + 1360 12 1 19.18 CAAATTACACGCTAAAGAGGATAACACAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAAT:1 - chr4 1267786 3' - Dm88 116 2 76.71 AGTGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATATCACAAGCTGATGCCAAAACACAAAAACCTATACCTCCGATC:1 - chr3L 18420932 3' - jockey 4749 1 68.49 GNTAAGGAAGCCGCCGACAACGTGCCCAACACCAGCGCAGCTCTGCGCAAGAAGCTGGAAAATAACTCCTTCGCCCTTCTGTCCAGCACTGAGGACGAAGACGTGACGCAAATGCAAATGCAAATGAAGGAGGGACCCGTGGGCG:1 + chr2L 13466755 3' + G-element 484 1 73.10 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTAT:1 + chrX 20369451 3' - roo 8744 2 71.92 TTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTCCCTTAAGCCCGTTCTCATTGTATAAAGCAGGAAAGAGAAGGATCGATACACCGGTCTCCACATCATATGGGTAATCCCCCGTCACGTCA:1 + chr3R 26403154 3' - hobo 470 1 71.21 AATAAATATTTTTTAAATATATGTAAGGATTAAATATTAGAAATTAGACACAATGTTTCGATGACCTTTATGTTCTTATCATGAAGATTTCGACGGGGCTACGAGCCGGTGAGATAAGAACCCAAGTTTTTAAGACTAACACATTT:1 - chr2L 7813871 3' - S-element 107 2 65.75 TGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAGTCAATTGGCGTGCTATAAATATTTGGCTGCATACTTTCGGGCGCACCGTATTTGTTGTTGTCCATAAGCCGCTT:1 - chr2L 19841478 3' + BS 5047 1 53.42 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCGGGACTTTCAAGACGCGCGCGAAGCTGCGGACAGTCGGATTGGAAGTGGAGCGGACTGGAATGCAAACAAGACG:1 + chr3L 13450815 3' + P-element 2860 1 60.80 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTGAGAGTCGACTGCAGTTACAGTGGCTGCCAGCAGTTGTTGATTTATTGTTATAACTGTAACACACACACACACATATAT:1 + chr3L 15724572 3' - jockey 65 1 46.58 TAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGCCGCTGAAAATGTCATTACTGAAGGGCCAGCAAAACGGATGTCGAGTTGTTG:1 + chr3L 19431717 3' - Juan 55 1 59.69 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGGGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAG:1 - chr3R 5087071 3' - P-element 61 1 39.57 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGGTAGATGAAACGTATTGCCTTTTTGCGCTGAGCTGGGAGGAGACCCGATCCCGTATGTCTGCTAGTTGCAATGAGAGAGTAGTGGATCAGGCTA:2 + chrX 13808128 3' + pogo 2077 1 68.49 GCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCATTAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTT:1 + chr3R 22572633 3' - HMS-Beagle 6877 2 71.23 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCATTGGTAAATACTTTTTTGGTAAATACTTTTTTTTTCAGTTGGGGCCGGTGGTCGGAACTTTTGGAGTTAGGACAATTCAAACGAGGTTGGCGTGATGTAGACGTCGAGGATT:1 - chr2L 232306 3' - Doc 11 1 67.81 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAATAAAAACATCATCAAAGCAATTTTTTATCTTATTTTAAACTAATTTTGAATTTGTTCGAATATAATATGTATGCCTAGTAAAAGTTAATTGTCAAAATAGTTTTCGCTTAGG:1 - chr3R 10895661 3' + jockey 4978 1 66.44 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTACGTGTGTGCAAGGGTGACAGCTGTCGCCCCAG:1 - chr3R 17079437 3' - 1360 64 1 75.83 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACGAACCCAGCGAAGCGGGCGAAC:1 + chr3L 9240495 3' + 412 444 2 52.05 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAA:1 - chrX 18193689 3' + hopper 1374 2 58.22 TGGACTATCAGATACCCGTTACATAGCAAGTTTAAGTGCGATGAAGATACAGATATGCAAAATATAAAGAAATAAATATTCTTACCAAGATTGCTTACTTATACATATAAGATAAAGTCGATATAAAGCTTAAAAGCTGACCGATT:1 - chr3L 11578828 3' - INE-1 551 1 31.51 GCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCAGGGCATTGTTTTTGCTACCAATCTATGTGTGTCTGTGTGTGTGGGCC:1 - chr3L 17142820 3' + hobo 2866 1 66.44 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAAACATTAATATGCTGGCTGAAGTTTCGGGCAAAATGCT:3 + chr3R 13198329 3' - Doc 20 1 75.34 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGATAGCGAAATCAAAGTCGAGTTTACTGAATCCACAATACACATCTCCAATAACCGCAACGCCTTGGCGAGGCAACAAAGC:1 + chr3L 1728602 3' + blood 7347 2 45.89 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCTAACTTAACTTCCAATTAACAGATGCAAGACTTATTCAACCAAATTT:1 - chr3L 17710569 3' - I-element 41 1 57.53 TCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACGAACCCAGCGAAGCGGGCGAACCCCATCTCAGTTCCCATCTCGGTTCATGACATTTGACTGAAAACTAG:1 + chr3L 9240540 3' + 412 7544 2 80.82 TAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCATTCGCTGCCAGTTTTCTCCTACACCTAAAGCGATTTATATACATATAAAAATAAATTAGAGTTAGGATGGGGGGATCCGACAG:1 + chr3L 21043163 3' - Quasimodo 18 2 71.85 AATCTCAACATTCTAGCTTTTATAGTTCTTGAGATCTTTACGCTCTTACGGACGGTCAGACAGGCGGAATTAAGCAATCGTTATCAATGCTAATGAATGAGCTAGTAGTTGAGTCGATATAGCATGAATTGAATAGTCTACAAAAA:1 + chrX 22796000 3' - INE-1 164 1 58.22 GCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGAATTGATATAATGTAATTGATAAAGTTGCCAACTTCCTGCCATATTG:1 - chr3R 29429508 3' - F-element 237 1 67.81 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATTTTAAACCTGATGATTATTCATGGTATTTCACAAAAATGCATGCCTATACCTCTACTGCA:1 - chrX 2781209 3' - FB 61 1 60.96 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTACACACACAGACACACACACACACACACACACACACACACACATACACCCATTCTACAAACGAACTGTATGCGTGGCCATT:1 + chr2R 21453625 3' + hobo 2937 1 58.33 AGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGACTGCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAATCAATTGGCACTAAAATACGAGAAAAAAATTAAAAATTACAAAAATGCATAGT:1 - chr3L 25825735 3' + baggins 5190 1 67.12 TTACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCATCTAATCGAGTTATGACAAACTGAGTATGAAAAGAAAAGCTACAAAATAACAACAGAAATGTGTTTTGATGGAT:1 + chr2R 15529809 3' - roo 8710 2 54.79 TTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTGATCACTAAAATGCAAAGCAATAGTAGCTGGGTTTTTTTG:1 - chrX 12344295 3' - F-element 69 1 55.48 TTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCCTTACCCCATATCCTATATCCTTTATCCTCCATTGCTCCTGCTCCTGTTCCAACTGTAATTGGCATTTAAAATGATGCTTGT:1 - chr3R 15700304 3' + Transpac 280 2 64.49 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGGAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTGTGACTTGTTTTTGTGCTCGATG:1 - chrX 13484098 3' + hobo 2906 1 60.00 ATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGCTTTGGCTTAAGAGGTTATTATTATGCAGATTAGGAA:1 + chr3R 22160939 3' - copia 86 2 73.97 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGACATCAGACTTATAAATAGAAAGTTGGCCAAGA:1 - chr3L 13477211 3' - P-element 86 1 26.71 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGACGCAAATTCCGACCGCTCGCCTACAACAACAGCAGCAGAGTGACCGTTGGCGGACGG:1 + chr2L 851066 3' - P-element 55 1 45.71 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACATATTCGGATGCCCTGACCGGTTTCGGAATCCATCGTTTTGTCCATCTGGCTGCCAGGGCTACGA:1 - chr2L 9599389 3' + P-element 2848 1 42.47 AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACAATCTGTGCGTCGATAAGAATGATGGCG:1 - chr2R 18056789 3' + blood 7332 1 56.16 CTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATGCGAGTACCGCAGGAGGAGTGTGGCAAATATTGGCTGTGGGTGTTGCATACCCCCGGGCG:1 + chr3R 23968670 3' + HMS-Beagle 6980 2 58.90 TAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTA:1 + chr3R 21276634 3' + BS 5043 1 51.37 TTAATTAAAAATAATATTTAAATAAATAAAATAAATGGTTTTTATATGTGTAGAATGCTCATCCCAACATCCATTGACGCCTCAACGTCTGGGTTTAGATACCCAATGACTCAGAGACCTAAAATCCGTGGCCGTGAATTGTTTTC:1 - chr2R 20068219 3' + blood 6911 2 71.92 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTGTG:1 - chr2R 9408166 3' - FB 57 1 59.71 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTTTGACCGCACAGTCAATTTAATTTTAATTTACACTTCATGCATAAAAAATTAAACGCGCGTTGCCGTGTCAATTGATGAGCGGCG:1 + chr3L 19434193 3' - Doc 43 1 56.16 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTGTTATTTTTCGCGCTTTTCGCAGGGCTAATTAAGACGTTCG:1 - chr2R 17872445 3' - Tirant 8141 2 60.69 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTCTTAAGTCTAGAACGGTACAAGTGCTGTCTGAAATGCTCTGCCTTAAATCTATGATATTCTTACGATATTAGCATTATGCTATTGA:1 + chr3R 18514463 3' + pogo 2073 1 66.44 AGGCTTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTTAGTTGATAACAGCTGTGACAAAATTAATTTGATTAATTGTAGTTCGTAAGATAT:1 - chr2L 23020629 3' + Transib5 2941 1 49.32 TTTTATATAATTTTTTTTTTCTTTTTTTGTTATCCCGATTCCCGATTCCCCGAGAAAGGAAGCCAAAGGCGGCCAGTAATAAATCAAAGACATTAAGTTGAATGCACCGGGGCAAAAAA:1 - chr3L 10330402 3' + Tc3 80 1 73.95 ACATTTGTTTGGCTATTTCATCTCTGACCGGAAGTATGAAAGCAACATTACATTACACAACGTGTTGTATTGTAAGGAAATCCCGCACAATTTGCTATCCGTAAAGAAGATGATAGATGCTGGAATATCCGTCGAGTTTAATAAGG:1 - chrY 536960 3' - Fw2 3704 1 69.18 GNCGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATGTATATAAATATACATTTTTTGTGCTCTCTTTCCTGCGGCGGGAAAGTTTTTTAAAGCGCTAGCTGCGACATCGAGCAAATTGAATAA:1 - chr3R 12952830 3' + micropia 421 2 60.27 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAATTTAAGCTGTTAATGGCCCATTTGGTTTTTTTAAATG:1 + chrX 10838617 3' + roo 356 2 58.22 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCT:1 + chr2L 15601632 3' - Doc 69 1 64.38 GTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAATAAATTAAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGAAGTTGACAGACTTTCTCGACA:1 + chr2L 20985825 3' + F-element 4617 1 53.79 TTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTGATCACTAAAATGCAAAGCAATAGTAGCTGGTT:1 - chrX 12344302 3' - F-element 75 1 60.00 TATTGTTATTATTATTGGTATTTTGTTCGTATATACTACAAATCTAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTCGTACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGAGGAATGGATCCGTAATG:1 - chr3R 18940468 3' - mdg1 19 2 65.75 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATA:1 + chr2R 8375117 3' + roo 9006 2 60.27 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATAAGTTTCCTGCTTAGATTGTATCTCACTGGTTGTCCCTCGTGCG:1 - chrX 16857016 3' - pogo 10 1 73.88 TAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTG:1 + chr3L 9240469 3' + 412 7471 2 67.81 ATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATTTATGATACTACCGATATTATTTTATTTACTTTCGGGCTGGAAGCAAACTCG:1 - chrX 6863578 3' - Juan 4152 1 64.38 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGTGTGTG:1 + chrX 6213602 3' + roo 331 2 69.18 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACGTACGTACTGTACATACTATTTACATACATACACACACCCGCACTTCCAACGCCATGTGCCAAACAGCTGATAAAGGCCATTGAAACTGAACTCGAAAGAAGGCCACTT:1 + chr3R 17079555 3' + 1360 3376 1 76.71 TAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGATCCCAACCGATTTACACCATAACAATACCCGAGGTCGTCGTTTCGGTTTCCCCCAATGT:1 - chr2L 21189721 3' + hobo 2874 1 61.64 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATAGCCTAACACCAGGAGCAGCGTGGCGGAAAAGCGTTTTGTCCCGGCGACA:1 - chr3R 25094622 3' + P-element 2816 1 36.99 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATATTGTTCGGCTTTCGCTCGCTTTCCACACAGCAGCAGAGGAGGAAGCT:1 + chr2R 12873001 3' + P-element 2849 1 59.59 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTC:1 + chr2L 14263010 3' + P-element 2791 1 21.23 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACGAAGAGAGGACAAATTGAACAGTTTGTTACATGGAAATACCCTGTAAGGATTGGGATCGTACTAAACAAAATCAAGATATTTAACTGC:1 + chr2R 23395575 3' - jockey 4794 1 56.85 AAATAGACGAGCGTCGGCTCTCTTCAATCAAAAACAACAACAAAAAAAAAAAGAATTTATTTCTAAAGCTAACAAAACACAGAAAACTTGCAGAAATACCCGGCCCGCTCTTTGTTTCCCTCCACCAACAAAA:1 - chr2L 9569439 3' + Doc4-element 32 1 76.69 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTATATCCGGAGAATCGGATATGCGGAATTGGGAAAAGAGAAG:1 + chrX 20369490 3' - roo 41 2 62.33 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAGTCAAGTGAACTTTTGCCGGCCAGGTGAATGCAGGCAGAATATCAATTG:1 - chr3L 19702754 3' - pogo 66 1 65.75 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATGCCAGCTTCCTGCTAAAATCATTTTCAGATTGCCAGCCAGGCAGT:1 + chr2L 8807978 3' + HMS-Beagle 7019 2 69.86 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACACGCAATGGGAAATAAAAAG:1 - chr3R 9158144 3' + P-element 2808 1 19.35 CTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACTCCAACATGTCAATAAAAGTGTATAATGCCTAAAAACAACACATATTAC:1 + chrX 18055809 3' + 297 325 2 68.49 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGAAGTAAATGTGGTTCATATGAGTATCCG:1 + chr2L 8009167 3' + roo 9025 2 51.37 GTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCACGCATATTCGTATGTGTGCGCGTGTGTG:1 + chr2L 5656609 3' + hobo 2873 1 75.00 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATATTTCTTTTCTTGATAAGTA:3 + chrX 8610366 3' - mdg3 5264 1 76.71 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGGAAATCTATGGGTAGTAACCGTTGACTTTCAACTCAGCACTGTAGCTGCTCTCGCCCGCCTGATTGCGAGCCAGACAGG:1 + chr2R 7343370 3' + flea 220 2 62.33 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGCCG:2 + chrX 1831303 3' - P-element 83 1 28.77 CCCATCCCTCCTACAAACCCAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAATTCATACTTTTTCTCATATGGTACAGTGGAGGCCCAGTACCTCCAATCGCCA:1 + chrX 948267 3' + I-element 5060 1 74.83 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATAAGTGAACTCAAAAAAGCAGTGCAAATTCAATTAAATTTTTTCTGTTGCTGCTCGCTTAATACTTCATTCCTCTTTTTTTCTTCAATTTTT:1 + chr3L 780798 3' - Burdock 6163 2 64.38 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATG:1 + chr2L 2622721 3' - roo 8748 2 80.82 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGGATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTAGCCCGTCTTGGCGAACAAAACTTTTTTCGTGTCCACAAATTGAAAATATTTCACAGTCATATTTAATTT:1 + chr2L 2675071 3' - Quasimodo 45 2 54.11 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGGGGCAGCGAACCCCAGGGGTTTTGGGGTTCATACACCGCTCTCTGAGTCTTTCTTCTCGTC:1 - chr2L 17574351 3' + hopper 1359 1 56.16 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAGTGCACGCGATTTGGGCGTAAGATTAATTGGCTCAAATTCGGGTCGTTGAAATCATATACTCGTATAACTTTACCCTG:1 + chr3L 9994020 3' + hobo 2894 1 55.48 ACGTGCTAGATCTCCCGGACAGGTATTAAGTATTAGAACATGTTATGCATAGAGTATGACTACTGCCTCTGTTCATTTAAGATTAATTATAAAATATACTTATTGTCATACTTTTTTAGAACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAA:1 - chr3L 15099602 3' + G4 3700 1 54.79 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGTCCGCAATTTGC:1 - chr2L 19907575 3' - hobo 75 1 75.37 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGAAAAAGCCAGCAGTGCGGCTCATTTGCATGCCACATGACAAAAAGCTCGTAGCAAATGCAAATTGAATCCAACTTAAATGCCCGACCATCGCGGGCG:1 + chrX 10698750 3' - mdg1 18 2 72.14 ATAATTTGGCGGGAATGGCCTTTTCTTAATCAGCTGTTTAACACTGCACCTTTAAAAGCTCATTTCCAGCACTATGACCTATGCAAATTTCGCACATTAAGCCATCATTTGATTTTAGCACACAATCCAAAGCTAATCTCCGCATC:1 - 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chr3R 11730674 3' - hobo 56 1 57.86 GATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGAAATA:1 + chr2R 544853 3' + HMS-Beagle 247 1 51.92 AAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTAAACCAGCGCACACAAAAAATATAAAAAAAAGCCGAACAAAAAAACTAGTGGAAACGGAGTAGGAACAGTCGAATGTCTGGCTTGCATTTTTGCAGTTCCCGGAATACT:1 + chr2L 18192839 3' + Tirant 296 2 72.60 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACTTCATCTTATATCAACAGCCACACAGAGGAAAACGCTATTTTTCTCTTCTTTGATAAATAATGTACTCATTC:1 + chr2R 6713966 3' - 297 20 2 64.89 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGT:1 + chrX 19744490 3' - P-element 52 1 39.17 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTATTATTATTTACTTCCAAACTACGGCTTACTTACGTTAAGTAGTTTCTAGAGGAAATGAAAAAAGAAAGAAATAATTATATAATCTTAGTGCATT:1 - chr3R 18500503 3' - blood 25 2 68.49 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCAATTTTAAGAGGAAGGTCCCGCTTGCCCTTCACTGAATTGGGGGGGTGAAAACCCGGAGTTCGTGGGCGAACTTAAAGGATTTA:1 - chr3R 4702854 3' + S-element 1679 2 67.81 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGTTGAGATGGATCTTATTTTAGCACCCCTCATAAAGGATT:1 - chr2L 5333377 3' - mdg3 5295 2 53.42 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGGATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACAGTCAAAGAATTTCAAAAAAAAA:1 + chr2R 18922637 3' + opus 7466 2 60.27 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAGTTTGAGTTTTTGATTGATATGACATTGATGCCATTTTGGTGGCTCATTTGAATGGAATGTTTATTGTCGGCTTTGTTCGACCATCAAATTTTTTT:1 + chr3R 22266573 3' - roo 23 2 66.44 CGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATGCCATTAATTGAAATGATAACGATTAATGATAGCGAAAAGACACCAATGTGAGAATGG:2 - chr3L 11887146 3' - Doc 14 1 76.71 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTTTTCCGAAATTCAAATGGAGCCCCTTTCTAACACTTTTTCTGCCTCATGAATTGAAATTGCAAAATTATATAATT:1 + chr3R 12540591 3' - roo 8706 2 58.90 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGAAGGGTAGAGGGTATGAGCACAA:1 - chr3R 4739734 3' - P-element 99 1 20.55 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGCTCTCACTCTCTCGTGCTCGTTTCTTCCATTTTTTTTCGCACGCCCAAGGAGCGAGGCAGTCATGCAGCTTACAATCGAAATGACATG:1 + chr2R 17348520 3' - hobo 31 1 61.38 AATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAGAGTTGGTCTGCCCACCGATAAAGTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCTTTAAAAAAATTTTTTTTTTT:1 + chrX 21592685 3' + FB 31 1 69.18 CGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGAC:1 - chr3L 25232765 3' + accord2 7572 2 61.07 AATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACATATATTTGTTGGAAAGGGAATAAAAATAAAGTTGGCAGCGAAAGGAATATA:1 + chr2L 8615429 3' - 17.6 6953 1 57.94 AAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATTTAATTTGGTTCGGTATTGAGCTTTCTATTTTATTTGCATCCATTAAGAATTTAGCATAAAAGTAT:1 + chr2R 14000567 3' - roo 8636 1 54.79 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATATATATCCCTTGCGATGAAAGTCGTGAGGGGGGCGAGGGGCGGGGTTGGAGACATT:1 - chr3R 18114851 3' + 297 333 2 65.75 TAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATAAATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATAATTAAATTAATATATACATAAGTAAGTATTTACGTACTTCCAAAAAAATTTTCTT:1 + chr3R 4570309 3' + Juan 4145 1 65.75 TGCTAAGGGTATGCATACAAAGTATTAGAATTACCTCAAGTTATTATAATTTCTTATGAACTATAAGTCTAAGATAGCTTAAGTACTTTGTGCAAAAAATTTCTTTCTGTGTATTTTTTAAATCTTTTCCTTTTGTTGGTTATTTT:1 - chr3R 18919802 3' + S2 1413 1 70.55 GGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATT:1 + chr2L 8807922 3' + HMS-Beagle 6963 2 73.29 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGAGGATTATTA:1 + chr2R 18056880 3' - blood 7086 2 69.18 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGAGGGGGTGTGTGTTTAAATGGCGCCTGGAGAATATCGATTAAATGCTCGTTTTT:1 - chr3L 5731251 3' - 297 6641 2 61.64 TTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGTAAATAAGGACTTAATCATTATATTCTTCAGTTAAAAGCATATGTAATATTTGGGGTCTGGAAAAAGTCAAATTGCCATTCTACGCTAAGTCTGTTGGGAATAGTGGAGTGGAGTCA:1 + chr3R 26349479 3' + mdg3 243 2 47.95 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCAACAGAAAAGAT:1 + chr3R 26031817 3' - pogo 37 1 60.96 GCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTGGTATTCGATTTCCTTTTCTTTGCCAGCTGTTGAGTGCAAGTGCCAC:1 - chr3R 15806272 3' + roo 8659 1 67.81 CAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGCCGTCGCCG:1 + chrX 1831309 3' - P-element 77 1 32.88 AGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGATATTCCGAGTATACGTCCGTAAATGCGTATCGATTTC:1 - chr3L 21765377 3' - gypsy 23 2 69.86 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCCGGTGTGAATGCGAATAAACGGCTGGTTGTTGCCCCATAAAAGAATGCTATAAAATGTTGAAC:1 + chr2L 19681081 3' + hobo 2875 1 60.27 GGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTAGTTTGTTTTAAATTTTGCGTCTTTCTGATAATTCAACATCCAGCAT:1 - chr3R 15157561 3' - invader3 5238 2 57.53 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAAAGAGAGCGGCGAGAAGAGAGCGCCAAAAGCCTTACACCGAAAGAAACGGGTCTTTTGGGGAGACATTCGAA:1 - chrX 1831187 3' + P-element 2872 1 72.86 AGCGTTTGACTCTGTTAATCATTCTCTTCTAATAAGGAAACCTAATTTGTTATGTTTTCCCGTTGATCTGCTAAATTGGATTTTAAGTTATGTGGATGGAAGGGAAACTTGCGAATTGTATGATATTGTGAAATTGTCTTGCTGCA:1 - chr2R 1924382 3' + Q-element 327 2 70.55 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACAGGAAAATGTGTGCTTCTATGTTTTCGCCTCAAGCTCATTAACTGCTCGGAGCTCTCCCTACTAGATTGTTATTTT:1 + chr3L 5425568 3' - blood 45 2 55.48 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAACACAGAAGTGGGGCCATACATTAAGCAGCAGTTTACAGAGGCAGCGAGGAAATGGGA:1 + chr2L 18848835 3' - blood 7050 2 56.16 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGACGAGGAGGAGGTGGAGCGGCCTCAGGCGTCAAATATTGACGTGCATTCAATTCAGATGCTTA:1 - chr2L 20327546 3' + roo 403 1 78.08 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGGGTATCCTGGCAAGCGCAC:1 - chr3R 23565265 3' - jockey 88 1 70.55 GCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCCAACAAAAATTCTAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACTTG:1 - chr3L 25272554 3' - 1360 114 1 67.12 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAG:1 - chr3R 5087028 3' - P-element 24 1 68.97 AGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAGTTACTCTTACTCATTGCTTCCGCTTCGGCAGCAGAATTGGGCTATAATTACCAAGCTGC:1 - chr3R 26693298 3' - Stalker2 7261 2 69.23 ANTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTAACTTAAATTAGGGGCCGGTCTAATAACAATTAATTGAGGCTTTGAAGCGAAGTAACT:1 - chr2R 10760405 3' + Tabor 7261 2 60.27 GGAATTAAGATAAAAATATTATCCGTAAGGGTTGACATATTGCATTGAGAAGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAATATATATTTTTTTTATTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAA:1 - chr3R 7019100 3' + Dm88 4306 1 53.42 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACTCTCGTTACTTTTCTCACTCGATTGATCGCTATATCTGCGATTAGTGTGTGCTCACGGCGATAGTGTGTGTATGCATTTCTTTTTGGGGGAGTG:1 + chrX 17933775 3' + roo 393 1 72.59 AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGCTTTGGCTTAAGAGGTTATTATTATGCAGATTAGGAACTTTGAAATGTCATTAAATGGTATTGAAA:1 + chr2R 9444014 3' - copia 57 2 54.11 ACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTATAAAGTAAACCACTAACGTTTATTCGTTTCGATTCAAGAGAA:1 + chr3R 22486236 3' + X-element 4502 1 71.23 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGTTTGTTTTGGATCAACAGCAGCGTTTTGATGGCTTTCTAAATTTATTCTTTGATCCGGGTTTCGTTTCTCACTTTCTT:1 + chr3L 12776083 3' - roo 8707 2 56.16 ACCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGGCGGAAGCGATCGGGCG:1 - chr2R 4295441 3' - Doc 463 1 63.27 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTATATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGTAGATGCTGGTCCAGAAGTCTGGAAAAGAGTGAGTCACGTACTCCTGCC:1 + chr2L 19801010 3' + roo 389 2 71.23 AGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATCGGCACTTAAACAAAGGGCGTTGTTCAATATATATGGACGTACAAATTGGCAGTCGGTGCTCGTGGCCGGAAAAACGTAGCGGATTGCAATTAATTCC:1 - chr3R 29952642 3' - invader4 2777 2 71.23 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATTCAAGAGGCTGCAGCATTTAACCGAACGCAAAGTAGGTATTAGGCTTTGCATACTTTGCGGTTCAA:1 + chr3R 6149872 3' - jockey 66 1 55.48 ACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCAAAAGGCATTTACACTTAACATTTTCGTAGATATGTCTGATTGAAACAAGACATATATGAAG:1 + chr3L 22845988 3' + 297 6949 2 60.98 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGCATTGCTTGTTTTTTTTTCCGCTGGCCACTTGCTCGGTGAGCAACATTCTGCCATCGAACCACAAAAACCGCATACCCGTTT:1 + chrX 3637890 3' - roo 8702 2 59.59 ATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTACGCTTGGCTGAAACATATTTTGTTTGCCCGTTTTT:1 + chr2R 18927841 3' + 3S18 6051 2 68.42 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACACAGTCGAATGTTTGTTTGTGCGAAAGTATGCCTTAATTTAGAAAATGGTATCAAAGCAGGGCAGTTCATGGAAGCGAAGCCATGGCG:1 + chr3R 8810777 3' - 297 18 2 70.37 ATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAACCTTAAGTCCAGTTATGTACCACGAGTTACTTGAATCCAAATGTAACTCAATGAGCACCTTTTT:1 + chr2L 21081890 3' + mdg3 110 2 56.16 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGTTTTGGCAATTAAGTGAGCTAATCAGCAGAATTTCCAGC:1 - chrX 13351615 3' - roo 8743 2 73.43 TTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATAAGAAATTTCAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGATGTCCTAAAAGTATCTCAATGATTATAATATGAATTTGTTAAATAGTAAACAAAAAGA:1 - chr3L 207427 3' - 1360 3324 1 60.27 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAATAGACTTCAAACTGCTGGCAAAGACGAACTACAAATT:1 - chr3R 11072426 3' + roo 9021 2 54.79 GTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCC:1 + chrX 8610297 3' - mdg3 81 2 69.86 AGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATATGCGACGGGGGCGTGTTCAATTTGCTTGATGGATGCCTGCCATTGTGGCGGGAATTTTGGTCGT:1 - chr3R 20720501 3' + 1731 4572 2 54.11 AAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTGAATGTCATTATTGTTGCGTTTGCTGCTTTATAGAAACAATTGCA:1 - chr2R 12185271 3' + accord 7368 2 71.92 CACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGACTTTTCCCGTTTTGGTTCTATTAAAATGTTGACAGCTTGTTTGGCGGCACAAGTTTTTCGCTTTCTTTGGCTAATGATAATGAAATTACGC:1 + chr3R 22268567 3' - flea 483 1 62.68 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGGTTATGTTCGGGTGATTCCATATCAGTTTTCCATACGTACTCACATCGATTGGTGCGATTTTCTAATTAGCCATTTTACCAGTTCTAGCAAGGCCATTG:1 - chr2L 12696082 3' - pogo 18 1 65.75 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGG:1 + chr2L 18848789 3' - blood 7090 2 75.00 AACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCTTTAAGAAACAATAATGATAATTGTAACAGTATAACATTTCATCGAATAACAAA:1 - chr2R 10936650 3' + copia 188 2 67.12 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGTGTGTGTGGGCGCTGGACAATCAAAATTGATAAGGGGCGTGCGCACAATCACAATCACAGCTACTT:1 - chr2R 14486460 3' + 297 346 2 59.59 CAATTTTTTTATGAAATATAATTAGGTGAGCACAATTTAATTTCTCAAGTCGCTCCCCATCAGACTCCCTCACCCTCAACCTCACCATCGCCTTTCCCCCTCCCTGCGTCCTAATCAAAAGGATTTTTATCGCCGTGGCAACCTTA:1 - chr2L 12806238 3' - S-element 1624 2 78.77 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACCCTTTGACAATTTTCGGCATGCTTTTTATACCTTCCACGTCTATTAGGGGTCTTTCTTGCGGTTCATTTTAAAATTCTAACTGGCAGCCGCAACCGGAATCCCTGCA:1 + chr3L 3581014 3' - copia 4882 2 73.97 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGGAGGATGCCGGGGTGTGCGCGTGTTTACATAAAAATTTAAAGCGAAAACCCAGTGATTTTTATGCTTATCAACAGCGAAATTGAAAATGCCGCC:1 - chr2L 19628369 3' - hobo 26 1 66.44 GTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGGTTCGAATTGCG:1 + chr3R 9863006 3' - Stalker2 34 2 62.33 TATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGTTTTATATTAACCAATGAGAGTGGTCTACTCTAGAGAAGAGTATTTCCCAA:1 + chr3L 18435005 3' + I-element 5287 1 66.44 ATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGACAGAGCGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAATAGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGATGTCTTGCGGCAGGAAGCAGGATGTTATCAAGCGATTCCCAT:1 + chr2L 22350069 3' + 1360 3287 1 64.38 AACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAAGAGTCCATATATATATTTAATGAAGCTTTTTTGGTGGTCCGTCGCATATAAATATGTTTTTATATGACACGACCCACAAGCAAATTGTTATTCAATTTATTTATTGGGAGAATTT:1 + chr3L 20910152 3' - F-element 19 1 71.92 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATATATATGTATACATTATATTTAGCTGGTGTTTTTGTGTGGCCCAACATAATAGCCACAAATATGACAACTGCAGCCACTGGG:1 + chr3L 9317597 3' - HMS-Beagle 32 2 63.70 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGGCTTTTGGGGTTAGGCTTTAAGAGCGG:1 + chrX 20379357 3' - hobo 52 1 72.22 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCAGGTACATAGAAGTCAAGGCGGGAATAGATCATAAACAACTCTTCCGTCTTACAGAGCACCTTCGCTACATATAAACATATAAATGGTGATCTACATATTTCTG:1 + chr3L 22445328 3' + Transpac 296 2 73.29 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGCGTCTGCTGCTGGTGTTGCTGTCTCTGCCCACAATTATTAAATATTTAAAGCCATATACAAAACGTTTTTGGGTTTAACGTTATA:1 - chr3L 7370431 3' + Burdock 221 2 62.33 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTAGAATTGATTTTCTATATTGCACCCAAGATCAAGCCTTTAAAAGTTTATTAAATTTCTGTTGAATATGCATAAATACGAGGTCA:2 + chr2R 21244982 3' + roo 9034 1 59.59 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCT:1 - chr2L 2336225 3' + 297 327 2 70.55 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACAT:1 + chr2R 18922604 3' + opus 7441 2 65.22 AAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGAGTACACGGCTGAGTACAGTAATGACGCCCTGCAGACAGACAGAAGGAGTAGTTTATTCTC:1 - chr3R 902533 3' - R1A1-element 37 1 58.90 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGATTTTCGAAGGGTTAGACATTCATTAAAGTACAAAACAAGCTAATTCTTTCATTAGCAACAAT:1 - chr3R 13411794 3' - roo 57 2 58.90 CTTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAAATTACAGGGGTTTTCTACTGGAAAATGGAAAATATAAAAATACTGGCCATGATACAGC:1 + chr2L 22760529 3' - invader1 3881 2 60.96 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGA:2 - chr3R 18940482 3' - mdg1 7071 2 61.64 AAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAACCAAGTAATAATAAAACGTGGAAGCTTGCATCCATTACTTTGAGTATTTTCAATAGATATACGAAAGTAAGGATTACTTGGTTGCCAGCAGTTGATTACAAAATATA:1 - chr3R 18492838 3' - Juan 4038 1 73.29 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCCACCCCGACCCACATTTTTTTTTGGCATTCACATCCCCCGCCACTCACCAGTGGCAGCAAAAAAAA:1 + chr2L 17574468 3' - hopper 20 1 61.74 GAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGAT:1 - chr3L 21765413 3' - gypsy 7046 2 56.16 GGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACATTTAGCTTTCGACTTTTCGCCTTCTTTGCCGGGTGAACAATAA:1 - chr3L 13660043 3' + jockey 165 1 70.55 AGATTATTTTTGAATCCCTGGCTGTGTGCTGAGATTCTGTGCGGAAGCCTTATGCAAGCCTCTAGTGAAACTGTTTGACTTATTTCTTGAATCGTCACAGTTTCCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATTTCTCTTCAGAAAA:1 + chr2R 5062002 3' - Q-element 272 1 77.40 AGCAAATTTGCATACTTGCGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGG:1 - chr3R 19537462 3' + hopper2 1564 1 55.48 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAAGGGATAGGAAGCGTTTTGATATGATGGATACGGGGCTGCCGTGTGTACTGGGCACTTAGGTCGCTGCCAC:1 - chr3R 5767357 3' - roo 8708 2 51.80 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATACTGCATAGTAGTAAAAGCGACTAAGTAACCTAAAACTACATATGAATCAACCCCTCAAGTTTATCAATTATAACTCATATATCAACCCA:1 - chr2L 14678705 3' - Quasimodo 23 2 69.18 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAAACAGATGGTCTGCCAATCAACTTCGAATCTTCGAATACTTCACTTCCATCACTGCTGTTATTGCTTCCAATACAGC:1 - chr3L 24089499 3' + mdg1 7415 2 54.79 TACGAAGAACTGGAGTCCCTCGACCCGTAAGCTTTTAGAAAAAGGATCATGCCATCCCTCCCTCTCTGTATCTGGGTTCGCGTTTTAATTGAGGATAAAAGTTGTTGAAAAAAAAAAGTGCACATCACAACAATCTCATCTGAGCT:1 + chrX 22819344 3' + mariner2 318 1 76.71 ATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCCCCCATCCGTGCCACATGGCTTTGATAACAACACTTCTCCGGGGA:1 - chr2L 2522897 3' - mdg1 7113 2 66.44 TGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCCAAAAACAAAAGCGACGT:1 + chr3R 18935176 3' - jockey 4743 1 63.70 TCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAATTGCAGCGTATAACTACTATAACTAACAAGGAGCAGCAAAATCCATTGAATTTCG:1 + chr2R 13052890 3' - Doc 67 1 63.01 AACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACAAAGGGCAGGGATATAAATTTTTATTCGTCGTCCTCACAAAC:1 + chr4 640511 3' - Burdock 6214 2 71.92 CTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGCCTCGTAGATTGCGGCAGTGAG:1 + chr2L 2334844 3' + 297 319 2 76.03 CACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACGGAAGAACAAACCAATTTCCAAATTGTCTAACGAAATAATCAACGACAACA:1 - chrX 17075178 3' + TAHRE 10314 1 65.07 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTTGCAGGAGCCGTCA:1 + chr3R 5767455 3' + roo 335 2 66.44 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTTGCCCGTTGGTCTATGAATACGGTTTCTAGGCCAATTAGAATGGCGTTTTTAATACGATTACGATCTTGAACTACTGCTACTACA:1 + chrX 19308665 3' + pogo 2070 1 55.48 TCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGCTCCCCCAATAAATATCCTGCGTATCCTGTGTATCAACAGTTGTTGTACCG:1 + chr2L 16937646 3' + R1A1-element 4932 1 57.39 AGGAAAAAATTCAATTAAAAGCATGGAAAGCAGCTAAAAGAGAGACAAAGTACTAAAGAGACCGCAAATCGGCTTATGGTTATGAAGCGAGTTCCAAACGTCGAATTGTGGAAATTAATTGTTGAAGCAAGACTTACCAC:1 - chr3L 184269 3' - Tc1 312 1 66.43 ATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAGAGGGGAGGTGTAGTATGATTGCTAACGACTGTAGTTGGATAAGTTTGAATAAAATTGATTTTTGTAAGGAGACTATGTATGTATATATTAAGAAGCCTAATCTCAATTGAGTTTCTCACTT:1 + chr3L 15500596 3' + blood 6979 1 78.77 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGTATGAATTTTTATAGCAGGAATAGTGTCCAGGCTACAGAACAATATGCTTTGGCAGAGTTCGTTGACC:1 - chr3R 25929317 3' - 297 6625 2 57.53 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATGTACATATGTGTCTATCACACTGTCTACCCACTTCAAAGGTCATCGGAGCTTGTCCAAGTCGTAACAGCAAATTCATAAAGTCATTT:1 - chr3R 22275227 3' + flea 4989 2 62.33 GGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGCGGTTGGGCGTGAGCGGGAGAGCGTGTGGAAAACAAGTGCCAGCTGACTGACTGGTCAAATATAAAGCGTTTGGACCGT:1 - chr2L 11638947 3' - gypsy3 9 4 77.40 GAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACCTCTGGTTGGCGAAAATCGGAGATTGCATTATAAAAATCCAAGAC:1 - chr2L 9499263 3' - Transpac 72 2 67.81 CGGATCGGTACACACATCTTCCACGATGCCACATCCTCGTTGCCCGCCCGATGCGGAAAGTGTCGGTACAGCTTGCCGTCCTCTTTCAAATATTAATAGACGAAAACAGCAAAGTTCTGG:1 + chrX 13430828 3' - Osvaldo 455 1 73.33 CTAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAG:1 - chr2R 3919673 3' - 1360 124 1 65.07 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACAGTAGACTATGTAGTAGTAAATGTTACCAATTTCGTTTCGGTTTTATGCC:1 - chr2R 21244868 3' - roo 71 2 68.49 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCAACATAGTCGCCACACACACACACACACACACACACAAGCAGACAGGCAGCTTAAACAACAATTTCCTCAATTTGCCATTAAAATACGCTTTAATTTTTGTTTGCCTTTTTG:1 + chrX 20106463 3' - hopper 4 2 73.97 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTAGAATTGATTTTCTATATTGCACCCAAGATCAAG:1 + chr2R 21244932 3' + roo 333 2 75.94 TATTGTAATTTTAAAATTTTCATCCATGTAAGGGACAGATTTATAAGCATGCCCAAAAATACCCAGGGTATCTGTGTACAAACCAAAATCCAGCGGCGAAAAGCGACAATATTTTGTTGTGGCTTCGCCAAA:1 + chrX 5996296 3' - 1360 3057 1 69.70 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCTAAGCTGAATTTGTAGTTATTTGGAATTCCTTCACGTTGGTGAGGACACGACCGCGTCATCATCAGATACGGACACTTTGGGTCAGGC:1 + chr2L 10128205 3' + hobo 2908 1 64.14 CGTTACCGTTCGACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCCTCCTTCTGGTCTC:1 + chr2R 2994308 3' - gypsy8 130 2 48.70 GCGGGCGTCTGACACGACGGGGAAGTATGCATTGTTCCGCTGCGGGTTCGGTTCGGGCTTGATCTTACACGGAAAGGTTGGAGGGATCTGTGTGCGAGG:1 - chrX 18373275 3' - Doc3-element 304 1 59.60 CTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAA:1 + chr3R 8965234 3' - HMS-Beagle 6857 2 62.68 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGAGACTTTTGCGCACTCTTATAC:1 + chr3R 9158283 3' - P-element 92 1 19.86 GACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7213 2 81.61 TCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTGTTATTTTTCGCGCTTTTCGCAGGGCTAA:1 - chr2R 17872457 3' - Tirant 8154 2 53.42 TCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAATTGCTTTTGATTGACTCATTCAATGCGATTTGTTTTGACGGCTTACGTTTCATTTATCAGGCCATA:1 + chr3L 13475614 3' - HMS-Beagle 52 2 54.11 CGATGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTT:1 - chr2L 5333417 3' - mdg3 5335 2 80.14 GCTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGT:1 + chr2L 8807917 3' + HMS-Beagle 162 2 76.03 AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAACAGAGAATGGAAAGATATTAAAAACAGTGACAAACTATTTGGCGAAACTCTGTTGGTCCTTTCAG:1 + chr2R 4854018 3' - copia 4926 2 60.00 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGAATTTAGCATAACTAATAGTACAGTTCAGTGCACATGAGTATCTTCTTTTGAATTATGGCT:1 + chr3L 19938571 3' - roo 8723 2 60.96 GACGGGACCATCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACCGCAGGCAGGCGTCGGCAGTATGGAGCGAAGACGACGTT:1 - chr3R 5087076 3' - P-element 9 2 56.10 AAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGATACGTATGTGTCCTAGAATTCAATATCAT:1 - chr2R 18035823 3' + F-element 117 1 76.00 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCTTATGGAGTTGTACTCTT:1 + chrX 22517698 3' + 1360 3342 1 54.74 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCTGCCACTCCCTCCCATGACATCCTTCTTCGCCCGTCTAGCCCACACAGCGGGGCAAACCGCG:1 + chrX 19992670 3' + copia 196 2 59.31 CTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGC:1 + chrX 19744502 3' - P-element 66 1 40.41 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGCCATACATTAAGCAG:1 + chr2L 18848806 3' - blood 68 2 64.38 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAATTATTATTATCAAATAGACAGAGTTAAAGAAGTACACCCCAAAATGGTTATACTTTTCCCATACAAAAACACAAATAGACCGCAAATCTGAAGCGA:2 - chr3R 13201719 3' - 297 6598 2 71.23 TTGGCTCTAGTCCGAGGGACAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTATTCCTTTTTGTGTTAAATGCATTTTCCATCAAATAGCTTCTCTTAATTTCTAGTAAACTTAA:1 + chr3L 3395064 3' - jockey 4722 1 54.29 AATAATTCAACAAATGGATTATATCTTATGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATACATTTTATGCTACTGGCACAGACTTGGACCACTTTTTTACAAGCCTTAGGCGCGCACTGAGGCTTCTGTAAAATCCTACTTTTGTGTTTTGA:1 + chr2R 4721458 3' - Tc1 1381 1 65.75 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAAGTCGGTTTGTAG:1 - chr2R 14921459 3' - pogo 39 1 55.71 ATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAGATGTCAACAGACGATTCACTTAGACACATTTTTCAATGATGTTGCTACCGTACTG:1 - chrX 19992574 3' - copia 66 2 62.33 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATTTCGTGTTTTATTGTATATGCGTTTATATATTTACTAATTTATTACCACGCCAACGATAAATTTCT:1 - chr3R 7136531 3' + roo 9051 2 70.55 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATTCCCCAGGCTAACACTATTCAGATTCGATCTATATTTGGCCATCTCGCTAACTCTTTCG:1 + chr2R 15892231 3' - hobo 49 1 55.40 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAACTTGTGAGGAGCGCATACAAAACTAATTGAACTTGGACAGCGTGACACTTCA:1 + chr3R 8965286 3' - HMS-Beagle 6809 2 76.71 GAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGTGAAACACACAGAAATAGCACA:1 + chr3R 15157728 3' + invader3 5447 2 71.23 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATTGTGT:1 - chr2L 2336212 3' + 297 6922 2 61.38 AAAAAAAAATCAAGTGAAAAAACCAAGACGAAACGGCCCATGAATGATGGCTAACTAATAGTTAAAGTATTTCAATTTTGTGGTTTAGCTAAAGTTCCAAGCAAAGTACAATCAAGAACTATTTATTTTCTTTAATTTTGTATATA:1 - chr3L 16184092 3' + Porto1 172 1 55.48 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGGGATGTTCGAATTGAGTTGAATTGAATGTTGAATTATATAAAACAAGGAAAAGCTTGAAAAAATG:1 + chr2L 8909895 3' - roo 8720 2 56.16 AAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTTGGAGAAGGACACTTGAGCTGGTAGGATATGAGAGCGTATTATTTTGGCATA:1 + chr3R 25929434 3' + 297 6912 2 64.38 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGTAGAATTTATCTTTAGCT:1 + chr2L 6716405 3' - hobo 56 1 54.79 GTTTAATTTAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAAT:1 + chr3L 16973456 3' - S-element 69 1 67.12 CGACAGAGCTAAGTCCCGTTGCCCTTCGATTCCGTTAGAGTTGCCGGAATCTCTGCCAACTCAAAAAAAACAAGACGTCAATTGTATGCGTTGTAAACAAGAATACGGTACAACGACCACTTAAGTTGGATTCGC:1 + chr2R 7025537 3' + diver 429 1 58.52 TGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAATGTGCGTGGAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATGTTGCATACTTTTTGGGGTAATTTATGATTTCCAAGCACATGCCCGTGGGGCGGGGTGAAAACCCAGCAGGACTCGGAGAT:1 - chr2L 12861646 3' - jockey 6 1 67.81 GTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCAGTTGGTCGGGAGGTGTAGTCGTGGGACCCGAATTAAAAAAAAAAAGAAAAAGTTCATGTTTAAATCTCTAGTTAAACATTACTAATTGTTTCAGCTAATACTCCTAAAAGTGCAATT:1 - chr3L 18590630 3' + Cr1a 4400 1 89.73 CTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCAGGTACATAGAAGTCAAGGCGGGAATAGATCATAAACAACTCTTCCGTCTTACAGAGCACCTTCGCT:1 + chr3L 22445291 3' + Transpac 277 2 56.25 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAACTTTATTAAATCGTTCTCAAATGGAAAACACCGACTATAGCTATTGAAAATAGTTTCTCACAGTTCTTAACTTTACATACACAAAGATTG:1 + chrX 19310693 3' - pogo 27 1 65.75 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAATTTGCAGTTCCACAATAATAGGAATGAATAAAAGGTGTTAAATAATAG:1 - chr3R 14213630 3' + mdg1 348 2 67.12 GGCACGAAGGGTCCTTGTACTGGAGGTATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCGAATGTTTTATTATTAAGGGGAGGTCTTTAATGAATAAGGTATAAAGAAGCGCTGTGCGAAGCAGAAACTCTGATCTCGGCCCA:1 + chr2L 21778903 3' - Q-element 604 1 78.08 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACGAACCCAGCGAAGCGGGCGAACCCCATC:1 + chr3L 9240501 3' + 412 7503 2 56.16 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGAATGGCATAAAGATTATTTTTGTAATTCAGCTTAGTAAT:2 - chr3L 19938437 3' + roo 9042 1 65.07 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGAGTAATCTCTTAAAGTAATCTGGCAACACTGGAATAAGAATTATTTCTTTGCAAAACAT:1 + chr2R 11691298 3' - P-element 61 1 43.84 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTGGAGCCTGAAAATTGGCTGAATTTTGTATTGAGCTCTACGTATGAAAAAACATAATATTATCA:1 + chr3R 15154662 3' + mdg1 7405 2 58.74 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTGACGGTCGTTTGCGTAGGAAGCAAGACACGCGACGGGTCTCG:1 + chr2L 14263058 3' + P-element 2840 1 54.48 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAATAAATTACACGGAACGAGCCTGAAGAGCAGCAGAAA:1 + chr3R 19500722 3' - jockey 95 1 53.42 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGAACACTAGGCAATAGCTGA:1 - chrX 19744400 3' + P-element 2835 1 50.68 AAGAGAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAGCAGCCANANCNCGACTGAATNNNNNTNANNGNNNNATTNAATGTGCTAATNGNTTATTACCACTAAATGTTTGATTAANAAATCTAACATTTTGTATGAAAGATTTTATACCTTGAAATA:1 + chr3L 3544392 3' + Doc2-element 220 1 67.81 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGCACAACAAATAAATCAATTGGCTTTGCCTAAAACGTTTGAAATTGATTTCAAGTTCTTTGGCCCATTGTTTTTATATGCAACAAAGGGACAATTTTTCATTTCCAACGATAACA:1 + chr3R 28788849 3' - I-element 9 1 79.45 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTATTTTGAATATTGTAAACCTTTCATATAAAAGCTCTGCTCTTACAAAGCTCATTCTCTCTCGCTCTCTCTGTATCTCTGTCGCTGTGTTACAGCAGAGAAACAAAACAAACA:1 - chr3R 14609125 3' - roo 8668 2 78.32 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAA:1 - chr3R 19537479 3' + hopper2 1560 1 53.38 TTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAGTCATTCGGAAACTTTAAAGCCCGAAAGTATGCAGCACAAAATCGTAATATCA:1 + chr3R 11568673 3' + BS 5026 1 63.70 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTATTTTCCACAAAGGTACAATTCTTTAAACTTATGAAAATAGACTCTTAAGAAGTAGCTGAGAAAAAGC:1 - chr2L 10177938 3' - mdg3 5264 1 78.08 CGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGATATTAGATTAGATCTGAAACCAGCTTAAGCCAATTGAAAATTAAAGGCGCATCACAAGTGGGCAT:1 - chrX 16325115 3' + Transpac 258 2 55.48 GTGAAAAAATGCTATTTCACAATTTATTTTCACAATCTTTAATTCACAATTTAATTGTTTATTAGGCATGGACTGGGCCCATAACCTGTTGTAATTTATAATTTATCCGCTGCGACTGGACTTTCACGGCATGGACTACAAGACGA:1 + chr2L 6140476 3' - copia 341 1 72.60 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGCTCTCACTCTCTCGTGCTCGTTTCTTCCATTTTTTTTCGCACGCCCAAGGAGCGAGGC:1 + chr2R 17348490 3' - hobo 62 1 59.59 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCATTTAAATGCAAAATGAAGTAAATTCCAACCATTGTGTTTCCCTGCTTAGTT:1 + chrX 12995443 3' - blood 7037 2 67.81 TTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCAATAGGTCCCAATAAAACTTAAAGTTACTTC:1 + chrX 16538168 3' - mdg3 87 2 77.40 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCTGTTCTCTGGGCTTTGTTTTAGTTGTCAGACACACACCCTATCCTGCTCATTTT:1 + chr2R 22795218 3' - hobo 67 1 63.01 ATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGTATCTCCGGCATGTGCGTATCTCCAGTTCGTGCACCTTGAGCGTAATTTAAATACAAACGAATGAATTTATGAAGTGCCGGA:1 + chr2L 10178111 3' + mdg3 5463 2 58.74 CTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACACACACTTGAACTGTGGACCAAAAAGCCGGTTGCACTGTTGGTTTTGTCATTTAGTTTCTAGACATTTGTTGTGTTAGTTTTTGTAATTTT:1 + chr3L 21765547 3' + gypsy 431 2 64.38 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTATATAAACTCATATATGTACATGCATATGTGCTTTGAATCGAAAAAGAAACTTCTTCATTTTTTA:1 + chr2L 21687705 3' - pogo 49 1 57.14 TCTGGAATGTACGCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCC:1 + chr2L 2522959 3' + mdg1 7373 2 76.71 TTTTTTTTTTAATTTTTATTTTGCTTACATCTTTAAGTTGTTTTTTGTTTCTTTAACAATGTATATAAGAACTTAACAGATACGCGTATGTCATCTCTGTAGGTTCAATCAAATCTGATGTATTAGTTATTATAGTTGTTGGCCTA:1 - chrX 9172726 3' - Doc 4692 2 69.86 AGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAATTATCAAGTTAGATTCTTCTTCTTTTTCATATAGCATTCCTTGTCATATTTTATTTCGCCATTTTTCTTGCAAAACTAATATTAACTTTATTAAAATGTT:2 + chr3L 24123358 3' - GATE 8268 2 69.86 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGTGGAGTAGCTTGGTCTGGCAATGGAAACATTTCGTGTGCTTTTCACCTCTTACTGAGCTGCAGTTTAATTCGGTTTTTCAATACCTAGTCCC:1 + chr3L 21405517 3' - mdg1 7068 2 65.07 ATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATATGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCATTCGCTGCCAGTTTTCTCCTACACCT:1 + chr3L 21043106 3' - Quasimodo 86 2 80.14 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACAGTCAAAGAATTTCAAAAAAA:1 + chr2R 18922635 3' + opus 7464 2 60.27 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCTAAGCTGAATTTGTAGTTATTTGGAATTCCTTCACGTTGGTGAGGACACGACCGCGTCATCATCAGATACGGACACTTTGG:1 + chr2L 10128198 3' + hobo 2937 1 78.90 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGCTCTCACTCTCTCGTGCTCGTTTCTTCCATTTTTTTTCGCACGCC:1 + chr2R 17348477 3' - hobo 63 1 65.67 TCTTCACACGGCGGCGATCGAATTATATACGAATATTATACAAATAATAATGGCATATAAATGAAGTAACAAACATTGTTTTCCTTTGACATAACTCATTAACCATCGGAGACGAAACGGCACTGGGAATGCTGCTC:1 - chr2R 10915593 3' - F-element 15 1 66.42 AGGATATGTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGGATCGGGAGGTGTCTTCCCTGGGGGATTGGCGTGGTTTATATCAGCTGGTGTATCAAGACTTAAATGGCACACAGTGTTTGGTATTCGCCGATCGACGAACCAGAC:1 + chrX 6758850 3' - transib4 2406 1 54.79 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATCGATCGTACATCTTAAAACGAAAATAATTACATTCGCAAAATGAAACTACAATATATGTAAGTACTTCATTTT:1 - chr2L 615214 3' - F-element 61 1 50.00 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAACCTTTATGCAGGGGCATGACTGTCAGCACGAATGCT:1 + chr2L 12696270 3' + pogo 2081 1 71.92 TGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTCTTTGTCC:1 + chr2L 2518578 3' - jockey 69 1 57.53 AATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCAAGACTAATCAAAAGTGTCTTTTCTACACTGCAAGTAAAGGGTATAAATTAGCCACAAAACTCGAATAGGTTTTTTACTTAT:1 + chr2R 7024507 3' - diver 39 2 58.22 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGTTTTGGCAATTAAGTGAGCTAATCAGCAGAATTTCCAGCTATTTCATTAGCAATGCAACAATGCGGCATTATTGATACGACGAA:1 - chrX 13351570 3' - roo 37 2 64.38 TATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAA:1 - chr3R 15035063 3' - Stalker2 7321 2 65.75 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACAGGAAAATGTGTGCTTCTATGTTTTCGCCTCAAGCTCATTAACTGCTCGGAGCTCTCCCTACTAGATTGTTATTTTTCCCTCAGCTCAC:1 + chr3L 5425581 3' - blood 32 2 64.38 GTGTATAGAATTTTAAAATATTTAAAAAATATATTTCCTAATATTTCCGGTATTTCCACTCGTCCATATTTTTAGGATTTTAATTTCCATATTTTCACTTTAGCTCTAAAATAGCAAGCACGTGTAGAAACGGGCTTGGCGGAAAT:1 + chr2L 2538558 3' + springer 483 1 56.85 GACTCGGCTATTGATCCCGATCAAGAATATATATATCTTATACTTACTTTTCAACGAATCTAGTATACTTACTATTACACTTACTAGCACATTTACTATCCGCTAATGGGGATAAGGACTCACCTCGATGCTTTGTTTGGTGTCCG:1 - chr2R 5769473 3' - INE-1 92 1 53.42 TGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATACCGGAGGAACCGATACCCTGGTCATCGCTGCTCACATCCGTACCTCTGTGGGCCATCTTGTTGACGCAATGCGGCCAGGG:1 + chrX 13133817 3' - P-element 2774 1 54.79 ATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGAAACCCTCGATTCGGGTCCAATCGGCCACTTACTGCTTGGTC:1 + chr3R 10741176 3' - 1360 3375 1 35.86 TTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAAACAAATAACATCTTCTCTACAAAGAAAAT:1 + chr3L 22638879 3' - Juan 4136 1 50.68 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGATATAGTGATGTATATTCTTGTGTTGTTTTTTTTCGGTGCCGCTTTAGTTTGGCCGCAGTTGCTGCTCATCAGGAGTTTTGCCTGGATGACG:2 + chr2R 10936776 3' - copia 4899 2 60.96 CTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTACATATGTCAAGTTCTGCACTAATTTCGTTTAATGAGTT:1 + chr2L 22340378 3' + HMS-Beagle2 227 2 77.40 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGGCTACCTGACACTGCAACACTGGCGCATCAGAAGCATCTTCTGCAATTATTTGTGCATTAGAGGAAGTCAGCTACCTCGAGCTGGCGACTAATGTCAGTTTAAGTGTGGCA:1 + chr3R 21734669 3' + copia 245 1 76.71 TTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAAAATAAAAATAGCAACATAGGTTTGGGACTCTAAATTAAGCATTATTAAGTATTAATTTTTGTTCTGAAACCAAATTTTCAGCTTGCTAGCTGTAAA:1 + chr2L 16567006 3' - F-element 489 1 57.53 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGCAAATGACAACTCA:1 + chrX 17508936 3' - Burdock 6175 2 57.53 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATCATAAGAGGCTTTGACAACTGGTTAACTTTATTGACGGATCTTACCTATTGGTTTCAAAGGCCTTCAGACAATAGCCCGGCATCACTTTGCACACTCGG:1 - chr3R 17068847 3' + mdg1 403 2 72.41 TATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACACTTACTTGCCCTCGGCTGTATGTGCTGAACAGATATTGGAAACATTCTAACAAAGCCCATCTATAACAATAAACGCTACTCTAGAAGAATATGGGG:1 - chr2L 3393708 3' - Stalker2 24 2 67.81 CGTAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCACTGGGAGACCAAACAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCCACAGACTTAGAAACCACCGTCACCACAACGCACCATTAGGTGCTATTGTCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 11838629 3' + G5A 2553 1 65.35 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATTGTGTGCTTCTGTGGATTTCAGTTCGGATTCTGGAATATATAC:2 - chr2L 2336174 3' + 297 6959 2 75.34 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCTGGTTTGCCGGCCATTTGGCGCTTGTATTGTTATTCCACTGCTCTTTAGCCGCGCTAATT:1 + chr3R 29623322 3' + roo 9020 2 57.04 GGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAACACCCTCGGGCTGGAATCCGTTCTCGTCA:1 - chr3L 6145250 3' - copia 64 2 79.86 GCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTCCGCATGTGTTGATGGGTTAATAAATATTTGAG:1 + chrX 5600302 3' - Stalker4 186 4 77.24 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATGCTTAACCCATTAACCACATTTTGG:1 - chr3R 10769583 3' - 297 6643 2 79.17 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATACGAATTGCAGGCACTGTGCGATGTTATGGGTTTTGATTAATTGGAAGTGTTGTTTGACTTGGCCGATTTTGGGGGGTCGTCCCACA:1 - chr3L 5329062 3' + 412 459 2 61.64 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGCATTGCTTGTTTTTTTTTCCGCTGGCCACTTGCTCGGTGAGCAACATTCTGCCATCGAACCACAAAAA:1 + chrX 3637876 3' - roo 8716 2 56.16 TGGCAAAACGTACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGCTATGTTTGTGTGTCCTAGTCAAAGTCGCATTATTGTATATTTGGTTCTTTACCCCAGCGATTGGGTAGCATCCTTTTTTCAGCTTATTGTACC:1 + chr4 142452 3' - I-element 5002 1 63.01 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATTTTAAACCTGATGATTATTCATGGTATTTCACAAAAATGCATGCCTATACCTCTACTGCATAACAGTAATATT:1 - chrX 2781196 3' - FB 48 1 52.74 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACAACAACATCAATTATAGAACAACATCAATATATTGGAGTCAATAACAACATCGATTCTTATGAGTTATAACTTATTTCCAATCC:1 + chr3L 13778656 3' + I-element 5320 1 59.59 CCAATGATTCATCAGCCGCAGCAGTTTCACTTGAATAATTCATTATATATGAAGTACTATTTGTAGACAACAACGAGGGGCAGCGCGTGCGGCGCCCTCGGCGTCTGATAGAAGTTTCCCGCTGCCACCACGATCCTTTGCCCTTG:1 - chr3R 23896432 3' - X-element 343 1 49.32 AAAATGCATGATCATACGTGTGCACACACGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTTGAACAAAAATTCGCGAGAGTCTGGAGCCACCTCTAGACCCACTGTTTCCGGAGTCGTCATCATTTCCTGGGGTACTAGGCGAAGGTTCTAAACTTG:1 + chr3L 11768705 3' - 1360 185 1 63.01 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTGACGGTCGTTTGCGTAGGAAGCAAGACACGCGACGGGT:1 + chr2L 14263054 3' + P-element 2835 1 51.37 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCA:1 + chr2L 14263006 3' + P-element 2787 1 18.49 TTTTTTTTGATTTTTTTTGTTATGTTTTAAAAATAACACTTATTACTTACAAATTCAACTCTTTTCAGCCAATTTTATAGATCATCGAGCTTTAACTCATCGGGCCGTAGCTCCAACTGTGATACAACAGAAGACATGTACAGCGA:1 + chr3L 14213145 3' - gypsy7 5003 1 67.12 GNACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATATATATTTCCTTTTTATATAATTAACATTTGTTTAAAACAGTAATCAGTAATTACTGTATATTTTATATATGCAAACATATAC:1 - chr3L 11903188 3' - micropia 37 2 56.85 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAG:1 + chr2L 21082199 3' - mdg3 82 2 71.92 AGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACATATATGAAGACTGGCACTTGAGCGG:1 - chr2R 15892158 3' + hobo 2853 1 79.43 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATAAATTAAAAAGCATAATTTTGTTGAAATATATAAGAAACTGAAAACTTTTTCATTGTTATTGGATTAAAATAACATTGGTCAATAATAAC:1 + chr2R 8942632 3' - 297 6604 2 70.55 CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAACCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACTGATTTCAGCAATTTATTAAGACCTTGTGAGCTATTAAAAATTTTACTACT:1 - chr2L 12447419 3' - opus 178 4 61.64 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTCCATTTGGTGGCCGCCAGTTGGTAATGGCTGCCAAAGGTTAAATGCGAATAGAATTCGCCCATACACATTCGCATTCGCCCATTT:1 - chr3L 1983419 3' + Transpac 282 2 65.25 CTACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTG:1 + chr3R 13572096 3' + 412 412 2 69.18 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAATATTTTATTTGTAAATAATTCGTTTAAATAGTAATCATGGGTGCTTTTTGCGC:1 + chrX 5938376 3' - pogo 62 1 62.76 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTACATAAGTTCTTTGTGGGCGCTCTTGTTTATGCAACACTTTTCTCCTTAAAAGATTTTTTCAATGAAA:1 + chr2R 18528799 3' + jockey 4933 1 56.85 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATAAGTTTCCTGCTTAGATTGTATCTCACTGGTTGTCCCTCGTGCGAT:1 - chrX 16857014 3' - pogo 20 1 69.18 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGTTATAACTGCCAAGCACACAGATACACGAATACTCGGGTACACAGATGCACAGCAACACAGATACACCGTTACACAGATAC:1 + chr2L 20269045 3' - hobo 36 1 60.69 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTCAGCAATGCTGTCTAGTCTAGAAATTAG:1 - chr3L 13380467 3' - hobo 63 1 75.86 CACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCTGAAAGCCAGCTGTTGCCAAAAATTGCAGGCTAATTGAATTTTCTAGCAGCAGCGCCATTTTGTATGCTACGAAATATTTTATAACTGC:1 - chr2L 3677554 3' - BS 26 1 63.01 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGCCTTTCATATGGTGCAGATACACTTCCGCTGGCTAACGATAATGGGAATGGCTTTTAATTGATTTGGTCGA:1 + chr2L 20068087 3' + roo 9022 2 56.16 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATGTACATATGTGTCTATCACACTGTCTACCCACTTCAAAGGTCATCGGAGCTTGTCCAAGTCGTAACAGCAAATTCATAAAGTCATTTGCAATTTGGCTGCC:1 - chr3R 22275213 3' + flea 5003 2 71.92 AAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTCTGCGCTCCGTATTTACTTATGTGTTTGTAAAACCATCCGAGGTTTTAAATAATTTCTTTTATAAATATATATATTT:1 - chr3L 8201118 3' + Cr1a 10 1 56.00 ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTTGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACATTCTGCAGTTATTAAACATGTAAAAAACGCAATAAATG:1 - chr3R 24301778 3' - Tabor 6865 2 67.81 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATGGTAGG:3 - chrX 16995037 3' - jockey 78 1 64.38 GTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAGATCTCACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCCTTAATGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATACGGTCATTAGATAAGATATATCCATTAATTTCACCTTAAAACTGAAGTTAATTTGC:1 - chrX 15558505 3' - INE-1 154 1 56.16 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAGTGCACGCGATTTGGGCGTAAGATTAATTGGCTCAAATTCGGGTCGTTGAAATCATATACTCGTATAACTTTACCCTGGAGATTATTGACCAGGCTAATTAAATTGTGTCTT:1 + chr3L 9994054 3' + hobo 2928 1 78.77 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTCAGCAATGCTGTCTAGTCTAGAAATTAGGATCAACACATCATTCCTCAGCTATTTATTGTCATTTATTTATTGCCAACTATAAA:1 - chr3L 13380411 3' - hobo 37 1 60.27 GTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGATACTATCAGCACTGCAAAATCTTCGCTCCGCTCGCAAAACCGAAAAGTAAGCAGCCGCCG:1 - chr3L 1829539 3' - 17.6 266 2 58.90 ATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACACAATCAATAACATCATCAAGTTTAACCTTCTCACCCCCGTTCATCTCCACTTTCTCGCTAAGTGGCAATGTATGTTCTACTTCTGTGA:1 + chr3L 23608503 3' + Bica 108 1 57.93 CAAAACGAAGAACTGGAGTCCCTCGACCCGTTAGATCACCTGAGAACATTGATGCAGTGAGAGCATCAATATTGCGATCTCCACGACGTTTATTTGCCTGGCGAATATTTTGTCTATCTTTTGTCAGGTGCGGCTTATTTGGTTGC:1 + chr2L 14398871 3' + mariner2 315 1 61.64 GGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTACAATTGCGACCTAGACATACTGCGACACCTTCATTTTACACCAGAAACTGCAATTTTCCTACTCACAGATCAAGTCTGCCCCA:1 - chrX 11941943 3' + roo 8949 2 58.22 GNACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAATCGCAACTATTCTTGTTTTCTAGGCAGTGAAGCGAACCGTAATCCATACACTTTCAGCTTTT:1 - chr2R 20931592 3' - blood 23 2 65.75 ANAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGTCACTTCAGTTATGGGGGCAACAATGTTTATCTGTCCTACAGAT:2 + chr2L 2227521 3' - BS 5055 1 69.18 CATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATTAAATGCAAACAAGACTGCTATCAGCGATCTTGTAGAGGCCATGTCTCAGCTGGCTGA:1 - chr3L 14774171 3' + pogo 150 1 60.27 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAACACTTAGTTACACCGATATTAGTATGCAGTAGTTTACCCACTATTCGTGCTCCTCCGCCGACG:1 + chr3R 24760680 3' - pogo 16 1 74.66 GTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAACGAAAACTCCAACGAAAGATAGCAAACATAAACAAAGAACTTC:1 + chr3L 23244931 3' - HMS-Beagle 75 2 70.55 TGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCACACACACACACCGATATGAATCTTCATTGATGGCGGAG:1 - chr3L 13568195 3' - hobo 82 1 75.34 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGCTGGACTTTAACCTTGTATTTAGAATGTTTAATGACACATAATTAGTTTTACTTCTTAAATTATTTACCTAAAAACAAGTAATAGAATTCTGGCAACTTT:1 + chrX 127106 3' - hobo 20 1 71.92 TAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCACCCGAAATGGTTATTCAATTTAATTTTATATGATTAAAGGGCTTCCGCATTGTTGTCTTTAATCTGGCAGTGACTTTGGATTGCACA:1 + chr3L 2317028 3' - F-element 158 1 63.70 GGTTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTG:1 - chr2R 20117309 3' - mdg3 83 2 73.97 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTATATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGTAGATGCTGGTCCAGAAGTCTGGAAAAGAGTGAGTCACGTACTCCTGCCAG:1 + chr2L 19801012 3' + roo 9054 2 72.60 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATATTGTTCGGCTTTC:1 + chr2R 12872967 3' + P-element 2817 1 36.81 GTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAATAAATTACACGGAACGAGCCTGAAGAGCAGC:1 + chr3R 19500717 3' - jockey 100 1 56.85 ATAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTTTATGTGTGCGTGTTCTTCCAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCTTTTAATAAAGTTTCTTTGTCTTGTCTTGAAATTAGCAAC:1 - chr3R 9175121 3' - 1360 3271 1 72.41 GGGCGATGGTAATTCCGCGATAAGCAAAGCGCACATAATTGGAAAGACACAGTCAACTGTGTCTCAACTATCTTCAAGATAATTTATTTGTGTGCGGAGGAATAACTATTCAGCGCGTTCAAGTGTTGCACAATTAAGTGTCATTA:1 - chr3L 17769848 3' - Ivk 65 1 69.86 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTATTTTCCACAAAGGTACAATTCTTTAAACTTATGAAAATAGACTCT:1 - chr2L 10177960 3' - mdg3 5286 2 63.01 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTATTTATTATACCAGCTGTTCTTCTTCGTTTCATTAATTTTGTTGCTGTTGTGCTTCTTTAAAGCCTTTC:1 - chr2L 13102853 3' + roo 357 2 53.42 CAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTAAAACGTACTTATGTGCGCGTTTAAGCAATTTTTA:1 - chr3L 13574016 3' + copia 4887 2 76.03 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCATTGGTAAATACTTTTTTGGTAAATACTTTTTTTTTCAGTTGGGGCCGGTGGTCGGAACTTTTGGAGTTAGGACAATTCAAACG:1 - chr2L 232335 3' - Doc 39 1 52.41 GTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCCAACAAAAATTCTAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCA:1 - chr3L 25272558 3' - 1360 118 1 69.86 TAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAAGAACCTAGTCGTAAATCAAAAGATTGTGGGACAGGCACGGGG:1 + chr2L 9988180 3' + hobo 2874 1 65.91 AAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCCAACCGATTTACACCATAACAATAC:1 - chr2L 21189752 3' + hobo 2884 1 80.00 GTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCAGGTACATAGAAGTCAAGGCGGGAATAGATCATAAACAACTATTCCGTCTTACAGAGCACCTTC:1 + chr3L 22445288 3' + Transpac 256 2 57.53 ACAGTTTAAAGTATTTCGAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACC:1 - chr3R 19537501 3' + hopper2 1525 1 71.23 CCCAGTGACAGAAGAACCCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATGTATTTACCTAATTGTGAGCCATGCCAAACTAAATACTTTCTCTACTTCAATTT:1 + chr2L 19217706 3' + springer 322 2 59.86 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATTTTTCGCAGTTATGTCTTTCACTTGTCCGACAAGTTTG:1 + chr2R 8375166 3' + roo 9055 2 73.97 TTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGTGTGTGTGCCG:1 - 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hobo 18 1 73.29 CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAGATGTCAACAGACGATTCACTTAGACACATTTTTCAATGATGTTGCTACCGTACTGCCGGAGTACTTAAGTCGCGTCAAGTCATGCAATGTCAATACACCCATTCACC:1 - chrX 19992522 3' - copia 4883 2 76.03 TAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATACCCTTTTCGTTGGCATTTGATTTCGGCCATCGCATTCTAAATCATCCAGCACGTGCGCCATCCAGCGGATTTGGCCAAAAGTGGCA:1 - chr2R 23420665 3' - G2 2746 1 62.88 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGCAGGTGAGTTTCCATTGTCCGCTGGTTCGG:1 + chr3R 15363503 3' - 412 54 2 55.17 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGTATTTCTGTAGGTGGCTTGGTTTGTTTATTTTGTTGTGCACTGGCCGCAATTGAGAATTTCTATGGAAAATAGGACCAGTAACAG:1 - chrX 17508783 3' + Burdock 6366 2 66.91 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCAACAGAAAAGATACCCCTTTTATTATTAT:1 + chr3R 26031834 3' - pogo 20 1 72.60 CCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGCAAATGAAAACTCAAGTGCAAAATGCAACAGTTGCGTACAGTCGCGTC:1 + chrX 17508970 3' - Burdock 5 2 82.19 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAGTGCACGCGATTTGGGCGTAAGATTAATTGGCTCAAATTCGGGTCGTTGAAATCATATACTCGTATAACTTTACCCTGG:1 + chr3L 9994021 3' + hobo 2895 1 56.16 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCACACAATGCAATTTAATATAGCATACTTAACAGCGCACGACAATGGACCT:2 - chr3R 22266380 3' + roo 402 1 78.08 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAATTATTTGGCGTGCCTCGATTAATTGGCATCAATTG:1 - chr2R 14767327 3' - Tirant 10 2 77.17 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTAGAATTTATTCCTGTTTAAGTTTTAAGGTAGCTAGTT:1 - chr3R 18539806 3' - roo 8749 2 78.77 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCCATTCCTTTCCACAGTCCACGGCCTAGCGTTCAA:1 - chr3L 22518962 3' + pogo 2064 1 60.27 CTCTTTGATAATATATAGTTAAGTTCAAAATAGAATTTACAAAATTTTTTGACTTTATGCCAAACAAAAAAGGAAATCTGGACCAGTGTGCAGTGGTCAAAATTAATTCACAATGCGACACGGCCTTCCTTCATAGACTCTCTAAC:1 + chr3R 1146221 3' - transib3 67 1 67.81 GAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACATTTACTAAGGCAAAAAATAGTTTACTCCGTGGTCAATTGATGTTATTGTCAAAAAAAATGATTAAGATTCTTGTAACGCACG:1 + chrX 22167482 3' + invader3 5421 2 57.53 CGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATACTTGACTGACATCCGCCGCGTGGCGTCCCTCCATTTGGTACGAAATTTGTACATTACGAATTAA:1 + chr3L 16563880 3' + I-element 323 1 55.17 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCTGCGTAGCACAGAGG:1 + chr3R 13572125 3' + 412 7494 2 52.05 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTACATTTCCGATATTTGGACAGTGTGAAAGCAATACGTTTTGTTACAAACATTTTAATTACG:1 - chr3R 11873339 3' - 412 7113 2 58.90 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGAAGTTCTCTGGTACGAGTTAAATGGCACACGTATGAGAATATAATTACGAG:1 + chrX 9864992 3' + hobo 2900 1 63.37 ATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACATATGTGTATGCAGATTGACATTTGACGTGCATAGAATTTGTCTAACTGTAGTTTTCCCTTTGCCAGAATGTTTGCCTCTTGTCTCGGCTTTTGCCATAAAAGCTATTGAT:1 - chr3R 8965082 3' + HMS-Beagle 7035 2 80.82 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGAACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATTGTGTGCTTCTGTGGATT:1 - chr2L 2336199 3' + 297 353 2 58.22 AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGTTGAGATGGATCTTATTTTAGCACCCCTCATAAAGGATTCCCATGACCGTTGATGGAGAAGTTGATGAGTCACATGGG:1 - chr2L 5333338 3' - mdg3 17 2 70.34 AATGTTTGTGATGGATCACAATTGCGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGCAATTGTTAAACGCGTTGCCTTGCACATTCGCGAGTGCTGACTGAAAGTATGCAA:1 - chr3L 8395187 3' - jockey 75 1 62.33 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACGAACCCAGCGAAGCG:1 + chr3L 9240488 3' + 412 441 2 53.52 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGTCTAAAAATAGCCACAGCGAATGC:1 - chr2L 20716313 3' + P-element 2855 1 61.87 TACGATCGTTAATACGCATCCAAAAATTATAGTAAAATATGGAAAATAAATGTCAAGGTATGATGTTTTACCCTACATTATTACATTGATTTCACTTTTACAATTATAATTTCTTGCAGATTTCAACTCGGTATTTAAATATAAAA:1 - chr3L 26376849 3' + transib2 233 1 56.85 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACTGTTGACGTTTTTGGGGAAAGGGTTGCCAGCTAATGC:1 - chr2R 8467746 3' + roo 325 2 74.66 GGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGTTGA:1 - chr2L 5333412 3' - mdg3 5330 2 77.40 TTTAAATTTTCTCTTATTTTATTATCCCCAATATATATATATATCCCAGAAGAAATTATGGAACTTTGCCTTAACATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTAT:1 - chr3R 17733318 3' - HeT-A 324 1 67.33 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCT:1 - chr2L 20327620 3' + roo 328 2 71.92 GTTGGGCGGGAAGTGTGGCCGTGGGACTCGTGCGACAAAAAAAAAAATCGTTATTCAAATAAAATTACAAGTGTGGGAGCGTCATACTATTTTGGCTTATCGTTAGATAAGTAATTTGTTTTGATTTTTTGTGAAATATACGATAC:1 - chr2L 2800553 3' + Cr1a 4429 1 54.11 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCTGTAACCAATCGAACTTCCTACGTTAC:2 - chr3L 19510468 3' + pogo 2060 1 56.85 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTGATATTGGGCGATAAAGAAACCGCTAAGAAGCCGCTCTCAGTCTCTTTAGACTCTAGCTCTCT:1 + chr2L 11043662 3' + roo 390 2 72.60 AATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCC:1 - chr3R 19589919 3' - BS 5062 1 61.64 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGNAAAAAAGTGCNNNCCTTNNANNNNTCTGGTGGGGATCTCNTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGC:1 - chr3R 19989245 3' - hobo 44 1 48.00 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGAGTAATCTCTTAAAGTAATCTGGCAACACTGGAATAAGAATTATTTCTTTGCAAAACATTGTCAACAATTTTGAAGAACTTCGAAATTTTATTTTTAAATTTCG:1 + chr2R 11691343 3' - P-element 16 1 74.66 AATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTGTTGACACACTGCTTTATATATGAAAACTATTTTATGCATTGC:1 - chr3L 15374592 3' - 3S18 33 2 64.38 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAATTTGGTCACTCGCCTAAAGCAATAAAAATGCAATGCAGCCACGTCTCCGTCTG:2 + chr2L 15057305 3' - hobo 19 1 72.60 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCTGTTCTCTGGGCTTTGTTTTAGTTGTCAGACACACACCCTATCCTGCTCATTTTAGTCTCATAAATATGCAAATTAA:1 + chr2R 22795241 3' - hobo 44 1 55.48 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAATATTTAAATTTAGCAAATATACCACCAAGATGCACGTGTAAGTTCATTGTGTAAGTTCTCGTTAGCCAAATGCACACGCGACAGAAGATAGTGTTTCCTTCAAAGTTA:1 + chrX 18318055 3' + copia 223 1 78.08 AAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTTCATAT:2 + chr3L 13365116 3' - Juan 63 1 57.53 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGA:1 + chr2L 11043592 3' + roo 8983 2 80.82 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCA:1 + chr3R 25094672 3' - P-element 99 1 17.81 GGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACATCAACGTTACCGAGCAATAAAACCGGATATGTTACTAAGACATTTACGTTATCTTCTAATCCCTACAACAATAAAACAAACCTACACAT:1 + chr2R 19101244 3' + Doc 483 1 63.70 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATA:1 - chrX 16857059 3' - pogo 63 1 62.50 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTGGCAACCCAAACAAAATAATCAAAATCCCGAAATGCATGAACTTAACCCCAAAGGGTTGTTGCCTTCAAAGTCACTGTCAAAGGATCAGG:1 - chr2L 18671593 3' - mdg1 32 2 63.70 GAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATG:1 + chr2R 5485131 3' + 1360 3316 1 71.94 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGTGTATCCTGGCAAGCGCACAT:1 - chr3R 23565263 3' - jockey 86 1 71.23 CTTGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCTGCAT:1 - chr2L 15523913 3' + opus 440 2 59.59 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCACCTTATCTTTACATATGTATTAATATAATATAGTTCTATATTTTTGTTGCGCTCCTATGTGGTA:1 - chr2L 12814708 3' - hobo 54 1 53.42 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAGAAGTGTGTTGTGCAGGCTTCGAAAAATCCACCGACGAAAAATGTGTGCCCATCCAACCCACAACAACATCGACTA:1 - chr2L 13930983 3' + jockey 4946 1 55.48 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCTTTGTTAATGAAATTTTAATCAAGCTGGAAGCGAAAAAGAGTTTGCCAACCAAGT:1 - chr3L 6014939 3' - jockey 74 1 61.64 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGGCCGCAATTTGCGCGGACTGCGGGATCAGTAT:1 - chr2L 19907555 3' - hobo 67 1 63.70 TCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAATAAAGCTATTTTCAAATCAAAATCTATTTTTTAACCAAGTT:1 - chr3L 19951133 3' - Ivk 10 1 78.77 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAATTGCAGCGTATAACTACTATAACCAACAAGGAGCAG:1 + chr2R 13052871 3' - Doc 86 1 50.00 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACAACAAAATAAAATATTTAACAAAATCGCTACACAATTGATTTAAATGGGATAGAATGGTTCGATAAATATGTACAACAAATTACAAATT:1 + chr2R 22041014 3' + jockey 4958 1 55.48 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCGTATATCGATTACAATCGCGTTCGTTACC:1 + chr3R 29997685 3' + P-element 2795 1 22.60 AAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGTCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATATATATATTTTTTTTCCCCCTTTTCTTACGCCCATGTTTTTAGAGCAAAACGCGAACGTGAATTGTA:1 + chr3L 11903318 3' + micropia 5391 2 56.16 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGCCTCTAATACCCAAAGCCTAACCTTGTTCG:1 - chr2R 11818225 3' - P-element 91 1 23.97 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGCGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATGCACCAAACGCTCCTGTCAAACGACAGAGAGAAA:1 - chrY 400179 3' + blood 336 2 63.00 ATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGAGTACACGGCTGAGTACAGTAATGACGCCCTGCAGACAGACAGAAGGAGTAGTTTATTCTCGC:1 - chr3R 902531 3' - R1A1-element 35 1 57.53 AGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGCT:1 + chrX 22715132 3' + opus 430 2 68.49 ACTGGACCTTGGACTCCAGCTGGCCAAGGGCGTAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGTGCACAAAGAGGACGCATCGTGAATTAACGGTACAATATGTGGACCTTGTACCTGAGCGGGCCATGCGCAAAAAGGGGGAAAACGGGATC:1 - chr3R 14499105 3' + gypsy8 101 2 81.51 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTAAGCATGCAACAAAAATGCGAGACGCCC:1 - chr2R 18265968 3' - roo 8686 2 70.34 TAGGAAATAGGTAGGCTATCGTAGTTAAATTAGGTATAATATATGGTAAAATATATGGATAACATCATTTTTGATTTAACAAAAATTACTTTTTTTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTATTAAAATGTTATAAAATGTTAT:1 + chr2R 9268324 3' - Tc1-2 1531 1 71.92 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGGAATAAAGTGTGAAAAAATTAATTTATTTCAATTACATTTCATTAAACACTGCCACACGTTGCGATGATGCTGCGAGAGTTCGAAGG:1 - chr3L 21405358 3' + mdg1 7425 2 61.64 GAATCGAGCCGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTATTAATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTTGAC:1 + chr3L 23940547 3' + Cr1a 4390 1 67.81 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATAATGCCATACAATCTGAAATAGTCTGTTGTGTGGCAAATTAGATCTAGAAACTGATTGATATATTGTTCATATCCGAGTTGCATTAAACACTGTATCTGTTT:1 - chrX 18318108 3' + copia 238 1 74.66 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCAGACTGAGCTGTGAGCACTCAATCATTTTATTTACT:1 - chr2L 5732752 3' - hobo 85 1 74.66 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTACATAAGTTCTTTGTGGGCGCTCTTGTTTATGCAACACTTTTCTCCTTAAAAGATTTTTTCAATGAAAAGCTTGGCGATTGCCGCCGTTTCCTTTGTTTCGGTCTTTATC:1 + chr2R 18528841 3' + jockey 4975 1 75.34 AACTAGGCGGCGACACACTTACTAGCATCAGCAACAACAACAACAGCG:1 + chr3R 21502399 3' + TART-A 97 2 77.08 ATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGCGGATTGAAATGTATTTGAAAATGGCAATTTACGCACTGTTAGGGACAGTTCAAAAAAAGATTCAGCTGCAGGCATGGCACCCAGTGTGTCCCTTTCTCGT:1 + chr3R 15035191 3' + Stalker2 381 2 69.86 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATATATACATACATCCAGCGATTTCAAGGGTAGCCCTGCAAAAACTGACTTGTGCGGGAGCGCCATGTGCTCCTCCAGCAACACA:1 - chr3R 15453638 3' - Transpac 23 2 65.93 ATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAATAAAAACATCATCAAAGCAATTTTTTATCTTATTTTAAACTAATTTTGAATTTGTTCGA:1 - chr3R 10895714 3' + jockey 4925 1 63.01 CTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGATATTCCGAGTA:2 - chr3L 21765403 3' - gypsy 49 2 52.05 AAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCAGGGCATTGTTTTTGCTACCAATCTATGTGTGTCTGTGTGTGTGGGCCAAGTTATTAGATTCATTTC:1 - chr3L 17142801 3' + hobo 2885 1 53.42 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCGGCATCCCCGAAGCTCGCCAAACACCTGAAAAGTATGCAATGAAAATTCTTTTTGTGCCTCTGCGGCTCGTTT:1 + chr3L 6542096 3' + hobo 2928 1 68.52 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGGTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGTTTTACCAAAGTTTCGAAATTTCATCA:1 - chr2L 5656516 3' - hobo 29 1 62.86 TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACATTCTGCAGTTATTAAACATGTAAAAAACGCAATAAATGGATGTCACTTT:1 - 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chr3R 13411798 3' - roo 8692 2 56.64 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTTTTGTGAATACATGCATACCTACCCGAATAAACATAGGCGCAGCAAGTCTGCGTTAGCAAATACACTTGAATTTGACTTTCAATTGTCTTTATTCTT:1 - chr3R 24760491 3' + pogo 2080 1 72.60 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCCAAGGAAACCCAAC:2 - chr3L 12775924 3' + roo 387 2 71.23 ACTGTATGTGTTCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCATCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTAATCAATTAAGCATCAGCAGCCCATAATTGCAGCTTATCTCTCCCTAGTT:1 + chr2R 5440061 3' + 1360 173 1 72.60 AGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATACATATATACTTTCATGCCAAAAGAGAATTCTATAGGGGAAAAGGAAAATATTAGAAAACTCTGGTGATGCCCAGCTATGATTTTGACCAGCTTTAGACAAA:1 + chr3R 12952996 3' - micropia 4972 2 72.86 ATGCGGCAGCGAGCGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCTATAATAATCTTTTTATTATTATTCATATACATAAGGGTGTTTCGTAAATATTTAATTAAGCAAAATCATTTCATCTATTAAAACAATTTCAC:1 + chr2R 2052696 3' + opus 468 2 65.07 AACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATGTACATATGTGTCTATCACACTGTCTACCCACTTCAAAGGTCATCGGAGCTTGTCCAAGTCGTAACAGCAAATTCATAAAGTCATTTGCAATTTGGCTGCCAAAGACT:1 - chr3R 22275206 3' + flea 251 2 76.71 TGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATGATTGTGTTGTTTTGTGGCTGCACAGCCCACACTTTGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGCTGTTAA:1 + chr3R 26752833 3' - Quasimodo 26 2 60.15 AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGAACTCGGAATGGCTTTAGATAATGGTGCTATTGTTTTTGACATAAGTCTCTTTATA:1 - chr3L 8704501 3' + blood 7326 1 60.69 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATATATATCCCTTGCGATGAAAGTCGTGAGGGGGGCGAGGGGCGGGGTTGGAGACATTCCCGATATATCTTGTAATTTTTAATGTTCGCAGTGTTG:1 - chr3R 18114813 3' + 297 6952 2 75.34 AACGCTCATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCAGAAGGCATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACACTTT:1 + chrY 3648888 3' + Stalker4 164 6 69.86 AGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATTTTAAACCTGATGATTATTCATGGTATTTCACAAAAATGCATGCCTATACCT:1 - chrX 2781217 3' - FB 69 1 65.75 GCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAATCCCCTTTTCCAATCGCTCGATGATTGTCATCGTAGGTGTGACTAATTGTTGGTCATTTATCTTCTTTGCTTTCTTCTCGAATTT:1 + chr2L 17252204 3' - mdg1 7268 2 58.22 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTGCACGC:2 + chr2L 15601643 3' - Doc 58 1 56.85 GGGTATCTGATATTCGGGGAACTCGACTATAGTATTCTCTCTTGTTTATATTTAATATTTCCATGATATACATATAAACTTACGCCGAGTTTTTTGGTCATGAATGTGACTCTTTGATTGAGCAAAACCACTCTAAATGAATCATT:1 + chr2L 115687 3' + INE-1 556 1 58.90 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGGTTATGTTCGGGTGATTCCATATCAGTTTTCCATACGTACTCACATCGATTGG:2 - chr2L 12696128 3' - pogo 64 1 68.49 AGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTA:1 - chr3L 19951214 3' - Ivk 103 1 78.08 GTATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTTGTCTGAATCGCCGGCAAACCCTTTTTCTAATTGGCGCCCAACCAGTTTATCGAGCGATGTTTCCTCACGGGTGCACTGGCTATCCTGTTAATACCCTCTTTTA:1 - chr2R 3564428 3' + gypsy2 6521 2 60.96 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCACATGCAGTCGACTCTATGAACCAAGAGAATGGCTTAGAACCCACCAAAGGAATCACTTAAAATGGTACTTATAGTACTTATAGTAATTTCACAAATATTACTATACGTTTA:1 + chr3R 29719469 3' + hobo 2930 1 70.55 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACTAAAACTTTAATTTAAATAATGTAAATAGGCATATTTTG:1 + chr2L 20910369 3' + roo 327 2 74.66 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGCACAACAAATAAATCAATTGGCTTTGCCTAAAACGTTTGAAATTGATTTCAAGTTCTTTGGCCCATTGTTTTTATATGCAACAAAGGGACAATTTTTCATTTCCA:1 + chr3R 28788840 3' - I-element 18 1 73.29 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGCCTGATACTTAACAGCTCAAACTCCTTTAATTCCATTAT:1 - chr3L 2240417 3' + roo 8991 2 73.29 TTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGATGGAGAACTCTGCACTTATATATATATGTGACTGCATGGCGCTTGGCCGCCGAAAACTATCACCTTAAGTGGGACTCACACCTCACCTATCTTAACTCTTCCATAGC:1 + chr3L 8515132 3' + baggins 5186 1 56.85 TATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACCACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGAGGCTATATCAAACTT:1 - chr3R 15035027 3' - Stalker2 7285 2 60.27 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGCCTTTCATATGGTGCAGATACACTTCCGCTGGCTAACGATAATGGGAATGGC:1 + chr2L 20068068 3' + roo 339 2 69.18 TTTTATAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGACCACTGTGCACGGAAACACAAAATCTAAACTTTTAAGCGAGCTGTTAAAAGAATTGATGATTGCCGCGTCCATCCGTCACTGCGGTGGCATGA:1 + chrX 6754622 3' - Cr1a 447 1 72.22 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAACCACCGCCCTGCCCAAATCAATCTCGGCCAGCGGAAGCGGAAGCATCGGCGGGGGCA:1 - chr3L 21140726 3' - roo 8748 2 55.81 TTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTATGGCAGTGTCAGCTTTTCAAAATGT:1 - chr3R 13231737 3' - F-element 73 1 41.78 TAAGATTTCGTTTTAGGCATCTAATAGAGCTTATGAAAACATGCGAAAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCATTTTTTCGGCAAACAATATATTCCTTCCCCCGTAGAGAACGTGGGATGCCACATCAAGGAGGGAGC:1 + chrX 9880137 3' - Transib5 2920 1 79.45 AGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGGCAGATGGCGGACAAATGAGCATTGCGTGTGCCATATCAAAATGGTGCTGCTACTGCTGCTGCTGCAGCTTGCAAGTTGCAAGTTGCGTGTGGCATCGTGGGTGAAAATGTTGATAAA:1 - chrX 13908777 3' - accord 7101 2 55.00 TTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAAT:1 + chr2R 12185405 3' - accord 57 2 63.57 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGTCGGCTTGTTCCTTTTGCAGCACTTCGTTAAGATGTTTCTAAAGATGAAAAGCTATTCCTTTTCTAT:1 - chr2L 14262898 3' - P-element 12 1 73.29 GAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCATACAAAATCTGGCAGCTTCCTGCCGCCG:1 + chr2L 19628471 3' + hobo 2852 1 79.43 ATTAACATTAATATTATTATTATATTATTTCGTAGACAAGTAATTCCATAAAATCGTTATAAGAATTGAACTTCAAAATGCCTATAATCACTGTTTTGTTTGAAAACCAATCATATCATTTTCATTCCTTTCAACTTCAGCATCCT:1 - 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chr3R 26349372 3' - mdg3 79 2 71.23 ACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTATTAAACGGGAAAACTCAGCCACATCCAGTCAGTC:1 + chr3R 14424695 3' + R1A1-element 4942 1 73.64 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGATCGAAAATAAATAAAATATGAAATACAGTTTAATTTCCTGAACTTCTTTCAAGTAGGCATTTTTCAATAACAAATTGTTTTCATTCAGATGCTGTCAATCAAGAAGTGT:1 - chr3R 15154507 3' - mdg1 11 2 78.08 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTACATAAGTTCTTTGTGGGCGCTCTTGTTTATGCAACACTTTTCTCCTTAAAAGATTTTTTCAATGAAAAGCTTGGCGAT:2 + chr2R 18528810 3' + jockey 4944 1 54.11 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTAACTCAAGCAATTCAATAACAATAACTAAGTAGAAATTCTTTTCAAAATAATACTATACACGAATCCTTCAGTCA:1 - chr3R 18514308 3' - pogo 43 1 55.48 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGGAAAACTTTTATACGATTTTTAAAGGCGGTCTTCTTGGAATTCCAAACTTTGGTTTTCCTTGAACTTGGTGCAGAAAAGGATTTTCTATATTTTAA:1 - chr3L 18585638 3' + mdg1 7433 2 65.75 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTCCTTGCCGGCGGCAGCATTCTGAGCGGGCTGCCCATTGCCGCCCC:1 + chr2R 14450229 3' - roo 67 2 66.42 AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTACATAAGTTCTTTGTGGGCGCTCTTGTTTATGCAACACTTTTCTCCTTAAAAGATTTTTTCAATG:1 + chr2R 18528796 3' + jockey 4930 1 58.90 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGACATCAGACTTATAAATAGAAAGTTGG:1 - chr3L 13477217 3' - P-element 92 1 22.60 ACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACTTCTCTTTAAATTAATTTCTGTAGCCTACTTTT:1 - chr3L 9993931 3' - hobo 86 1 76.03 ANTACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTATTCCGCACTCATATGTTTGTGTACACAAATAGGGTAATGGGATTTTAAAGGTACTTTAG:1 - chr2L 2722348 3' + flea 4955 2 59.59 AAGTCAAATAGTAAAAAAAAATGGTTGGGCAAGAGTTGAAAATTCCTAATTTTTAGCCCACTATTTAATAGCCACAACGAAACATGATAATTTTGCTTTACAGCAAGTCAAATGATTTAACCTTCGCT:1 - chr3L 2031599 3' + Rt1b 5143 1 71.88 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGCCGCTGATGATGGGAAGCAATTATCCCGAGCACGGG:1 + chrX 19744537 3' - P-element 9 2 75.81 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCGTTCGTTTATGGAAAATCCGCGC:1 - chr2L 951282 3' - F-element 27 1 67.44 GTCGACTTCGGTTGCTGGTGATATCTAGTAGGCCTAGTGCTAGGACATTATCATAGTCGTGTAGTTTACTTATGTGTCGCTCTACATTTGACTTTATTTTGTGTTTATAAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCA:1 - chrX 292393 3' - G3 4433 1 71.92 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATTTAAGTTGGCGCACTGTCCTCTTGCTTACTCTC:1 + chrX 22578074 3' + 297 315 2 77.24 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTAT:2 + chrX 8610323 3' - mdg3 55 2 52.74 GGCTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTATATTTCTTTTC:1 + chrX 8610356 3' - mdg3 5274 2 69.86 TTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTACATATGTCAAGTTCTGCACTAATTTCGTTTAATGAGTTTTTTCTTTATGTGAGGTTGGGCTGATCGATG:1 + chr2L 22340409 3' + HMS-Beagle2 258 2 56.16 AAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCGGCATCCCCGAAGCTCGCCAAACACCTGAAAAGTATGCAATGAAAATTCTTT:1 + chr3L 6542075 3' + hobo 2885 1 58.46 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTAATTACCAAACTGCTGAAATAATTATTGTGTTGGTTCTGTTTCTGTGTGAAGGATGAAATGGAAAGCAATTTAACGAGACACATGGGCAC:1 + chr3R 25053134 3' + pogo 2072 1 62.33 CTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTCCCAAAGTTGAACAAATTCTATACAGATTAACGCGACAAATGAATACACTGAGAACAATCGATAACACCAACAAACTAAAACATATCTGATTATATCGAGCAC:1 + chrX 19821131 3' + INE-1 562 1 69.86 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCTGTCATCTGTCTATCAGAAGCATTAACAGCTTTTACTTACTGCGCGGCAGACGCTTTAACACTCGACACAAAAGCAAATACAACCATCTAGACCAGAGAA:2 - chr2R 23504151 3' + jockey 4969 1 69.18 AAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGTGAAACACACAGAAATAGCACA:1 + chr3R 15157728 3' + invader3 5447 2 71.23 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTGTTTTTGTTGTTGCTGGACTTCGGTTGTGGAATTGTGTAAACAGCACCGACTGCGACGTCGGCAGCGCAACAACAGAAA:1 + chr2L 16536639 3' + pogo 2069 1 61.27 ATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACATATATTTGTTGGAAAGGGAATAAAAATAAAGTTGGCAGCGAAAGGAAAATAAAC:1 + chr2L 8615432 3' - 17.6 62 1 66.44 CGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATGTGTGTGTGCCGCTCGCTATCCTGATACACCCACC:1 - chrX 20106288 3' + hopper 1379 1 60.96 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGTGTATCCTGGCAAGCGCACATACTCACGCACGCATACTATCGCAT:1 - chr3R 23565239 3' - jockey 62 1 54.79 TTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTAGTAATAATCAACCGTATACCGAGATGAAATTGATTCCGCATGGGACATAAACTGCGTATTGCATAATAAACTTTGG:1 + chr3R 22275373 3' - flea 4797 2 58.22 ATTTTTACTAGTTATCGTTTATTTTTGGCGCGCTTTCAAAGTCAGCTAAATCAGAGGTGCTTTGAATTGTGAAAATTGGCAGAAAAAGTTAAACAATGTATTGCTTTTGAGTTGTTTAAACTAATATTCTTATGAGACCGAATATA:1 + chrX 22512664 3' + transib4 123 1 65.75 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAACTTGAACTTGGTCGTAATATTTATGTGCATCGTAAAGGCCGTAAGTTGGAGCGACGCACTGAGAAAATGTTGTGAAATCAAATTTACACACAAACCATCCC:1 + chr3R 6603904 3' + pogo 2086 1 73.97 CCTTCGCGTCAACTAACAGATCTCTTTTTTTCCCCGATATTCACTGGCATGTGGCTGCCCCAAGAGATGGGAGTCCGCATAGCCTTCTCTCTCGCACACTCCCTTCCTCTCTCTTTTTGTCGCACGTCAGTGCTGTAAGTGTAGCT:1 + chrX 17565708 3' - Gypsy12A_LTR 467 1 54.11 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTT:1 - chr2R 24021550 3' - pogo 58 1 60.27 TTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGG:1 - chrX 18193726 3' + hopper 1337 1 72.60 CTACTGATCCTGATCAAGAATATATACTTTATATGGTCGGAACTGGAATTATTGCGGAATACGTTTGTTCATAACTCGTTGATTGTCAAATATCCAAATTATATATATAAAATGTGGTCAATACCTGTTTAATGCTGTTAGACTAA:1 + chr2L 22326974 3' - INE-1 85 1 76.03 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGAGTTAATCATTACAACACACTAGATTGCAATTGCCTCCACCGCCACTATTGTGTGTTTCCATCCACTC:1 - chr3L 1324262 3' + 412 424 2 60.69 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACGAGTTGCGCAACCACAGCGCCCCCGCATACCAAAATG:1 + chr2R 18786082 3' + roo 9024 2 52.74 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTGTTGGTTAAGTTAAAGCAATATTTTCCAGAACTCCCTGCGTATTGCA:1 - chr3R 20097605 3' - mdg3 5327 2 65.75 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATTATATTGCATACAATTTTGTTCGTCCTAAACATTGTGTAGCATTTTATTCAATTGG:1 + chrX 14318489 3' - 297 6629 2 64.75 TGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACCCTTTGACAATTTTCGGCATGCTTTTTATACCTTCCACGTCTATTAGTGGTCTTTCTTGCGGTTCATTT:1 + chr3L 3580976 3' - copia 51 2 52.05 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTTAAATGCACGATAATTTGCGATCATCTCAGCACGACTGTTGTTTTGAATGGTTTGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTAATATGTATACAATTATTTTAATCCGAGCAATACAATAC:1 + chrX 21177267 3' - Tirant 4 2 60.96 CATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTA:1 + chr3R 11873412 3' + 412 7456 2 78.08 ATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGAGGCTATATCAAACTTGCCAAATGGTCGTTGAAT:1 - chr3R 15035009 3' - Stalker2 19 2 72.60 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGTTATAACTGCCAAGCACACAGATACACGAATACTCGGGAACACAGATGCACCGCAACACAGATACACCGTTACACAGATACTAACACGCACACGTAAGT:1 + chr2L 20269063 3' - hobo 19 1 69.86 GGTAGCGGGGCTTCTGTTGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGT:1 - chrX 12131187 3' - F-element 397 1 74.66 GTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGTGAAACACA:1 + chr3R 15157715 3' + invader3 5434 2 63.70 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGCCAAATAACATACCATATTTTTGAAGAGTGTTCTTCGTCCAGCTGCCA:1 - chr3L 21108502 3' + roo 334 2 68.49 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTATGAGTAAAGGAAGAGTGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGTTATAATTTTGTTTGTTTATTAGTTGCATCAAGCCGACACCAGT:1 + chrX 13558265 3' - mdg3 5327 2 67.59 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGGTAAGTCTATTAAAAATCTATATATTGTTCTAGGAAGACGTATTTACGTACATTTTTTTAGCCACTAAGAAGCTTTATCCAAA:2 - chr2L 21082096 3' + mdg3 5460 2 58.90 CAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAACCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGTTCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATAGTGATTTCTGCAATTTATTAAGACCTT:1 - chr2L 12447444 3' - opus 185 4 74.22 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGATATAGTGATGTATATTCTTGTGTTGTTTTTTTTCGGTGCCGCTTTAGTTTGGCCGCAGTTGCTGCTCATCAGGAGTTTTGCCTGGATGACGGCTTATT:1 + chr2R 10936783 3' - copia 23 2 65.75 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCCGGAGTGGGAGGAATCAAAA:1 - chr3R 19989224 3' - hobo 44 1 54.79 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTGTAGGCTGACTCAGAGCCAAATGGCGTTGGATTCATGGCTAAGACCAGTTCAA:1 - chr3R 29719314 3' - hobo 50 1 55.48 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACG:1 - chrX 13642038 3' + P-element 2822 1 36.30 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAATCTTTCCCAAGAGGGTTTTGATGGGGTTAGGTTCTGTTACTGGTTAGAATTTCAATTACACTCTGTAATCGCTTACCATTATGCGAGTATGTGTTCCCCCTTTAAGCTCGG:1 + chr3R 10736912 3' + copia 245 1 75.34 CAAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAATCATAACTGGAGCTCCATGTTATCTTCAGAACGAGAATATACACAGAGACTTACATTACATTTTGAATGTTTTGAATGTCTTTTAAAATATCTTTTTAACAGAGATTTCAATAATGACAAA:1 + chr3R 13788353 3' + Doc3-element 4381 1 54.79 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCACACAATGCAATTTAATATAGCATACTTAACAGCGCACGAC:1 - chr3R 22266389 3' + roo 405 1 78.36 TAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATA:1 + chrX 8610292 3' - mdg3 5338 2 73.97 TGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATTGACCCCGTTTCCGTTTTCGATTGCAATTCGTTTCAGTT:1 + chr3L 1983532 3' - Transpac 4997 2 70.55 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACATACCCGAAAGAAGAAACTTTTAGCTGCCTTCCAGCTATCAGCATTTTATCCCACTCCGCGCATTTAATCTTTGCATGCACTG:1 - chr2R 10773190 3' - 412 33 2 61.70 GCACTGGACCTTGGACTCCAGCTGACCAAGGGCGAAAAGGTCGAAGGGTAACGGTGCATGCACAAAGAAGACGCACAGTGAACTAACGGTACCGCTCTGGACCTTGGACTGCATTAAAAATTAATCTTTTAGTTCTTCATTTACTG:1 + chr3L 5814906 3' + gypsy8 99 2 76.03 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAAGAACCTAGTCGTAAATCAAAAGATTGTGGGACAGGCACGGGGAGAGAGGACAGAGGG:1 + chr2L 9988195 3' + hobo 2903 1 51.69 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGACTTCTCCTGTTGCAAGTGCAATTTCCGTGCTAAATATTTGCACACAAA:1 - chr3R 26139422 3' + mdg1 350 2 65.07 AAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAG:1 + chr3R 13572104 3' + 412 7479 2 63.57 AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCGTTCGTTTATGGAAAATCCGCGCTGTTTGCTTTATACTCTGCTTACT:1 - chr2L 951258 3' - F-element 20 1 74.66 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATCTCAAAATGCAAAAAAATAGTATATGAAGTAAGCTACAATCTTGAAGTGTTGTACTGTGTAAATTTGCGTCAATT:1 + chr3R 10769679 3' + 297 354 2 58.22 ATTATTATTCAATTATTATTATTTTAATTTGTCCGCAATGTCAGCAAACCACATTCCAAATCGTATCTTTAGATGACTTTATTCTCCTATTTACTTCTTCAATTTACTGTTCAGTTGCTGCATTGTTTCAATGTACAGCCAGAAAT:1 + chr3L 1805974 3' - invader3 5049 8 78.08 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACTCCAACATGTCAATAAAAGTGTATAATGCCTAAAAACAACACATATTACGTATACGC:1 + chrX 18055817 3' + 297 6914 2 63.01 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGGTAAGTCTATTAAAAATCTATATATTGTTCTAGGAAGACGTATTTACGTACATTTTTTTAGCCACTAAGAAGCTTTATCCAAAATGTTACTACAGT:1 - chr2L 21082083 3' + mdg3 5473 2 67.81 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGGCTTTTGGGGTTAGGCTTTAAGAGCGGACTGCAAAAGGACCGGCGAACAACAAATCCGTACAAATTGAATAAGAACTCAATCT:1 + chrX 20379413 3' - hobo 34 1 63.70 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAATGTGCGTGGAGAATGCGCTGACACAAATTTCTGGTATTATGTTGCATACTTTTTGGGGTAATGTATGCTTTCCAAGCACATGCCCGTCGGGCG:1 - chr2L 12861674 3' - jockey 32 1 45.83 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATAATACAATCAGATTGAAATCGAAGCAGGGCAC:1 - chr2L 8852745 3' + Burdock 218 2 54.79 TCACACGAAAATCCTCTCGCGAAGTCGCTTACGCGAGTCTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGATTCTCCAGCCCAGTGTAAATTTGTTAGACCACACAGAACGAATCATTTCAAAAAGGTGTTAATAACTCAACAAGCCAG:1 - chr2L 13546707 3' + Doc2-element 4564 1 55.48 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCTGGTTTGCCGGCCATTTGGCGCTTGTATTGTTATTCCACTGCTCTTTAGCCGCGCTA:1 + chr3R 29623319 3' + roo 9018 2 58.96 CGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGCGGATTGAAATGTATTTGAAAATGGCAATTTACGCACTGTTAGGGACAGTTCAAAAAAAGATTCAGCTGCAGGCATGGCAC:1 + chr3R 15035171 3' + Stalker2 361 2 56.16 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATAATACCACAGGTACTCTTCTCCCCTCGCATTTGAGCCACCACCAGA:1 + chr2L 20253944 3' + roo 346 2 59.59 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTCTTTGTCCTTT:1 + chr2L 2518581 3' - jockey 66 1 55.48 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATCGATCGTACATCTTAAAACGAAAATAATTACATTCGAAAAATGAAACTACAATATATGTAAGTACTTCATTT:1 - chr2L 615215 3' - F-element 56 1 48.57 TCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTT:1 - chr2R 12185341 3' + accord 381 2 73.97 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTGAAAAGAATCCAAAAGGATTCTGGCGCGATAATTAAATGCGCACAGGAAGCGAAACTTTTTCACCCAAGTTGCGGTGTGTTGCGACTAATT:1 + chr3R 26139544 3' - mdg1 30 2 65.07 ACCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGAGTCGGTAGGGGGATTTAAGTCCCATTCCTTGCAATAAAGAACTCTATA:1 + chr2R 3091667 3' - F-element 317 1 65.75 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGATTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGGGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGTTTTACCAAAGTTTCGAAATTTC:1 - chr2L 5656520 3' - hobo 39 1 57.53 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTAAAGAATTTCAATCGA:1 + chr3L 22635797 3' + hopper 1377 1 56.85 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAATTATTATTATCAAATAGACAGAGTTAAAGAAGTACACCCCAAAATGGTTATACTTTTCCCATACAAAAACACAAATAGACCGCAAATCTGAAGCGATTGCGCATAGTC:1 - chr3R 13201707 3' - 297 5 2 79.45 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTTCGTACGCTAACAACAGTTAGAAAACGTGGCTTGGAACCTGTCTAAAAA:1 - chr2L 20716329 3' + P-element 2833 1 48.28 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTCCGCACTAGACGG:1 + chr3R 5684173 3' + pogo 2048 1 57.53 CGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGTAAGTATATTAATGAATTTAAGTGTTAAAAAATTACTGAATTTATAAGATTTTGATTTGGATACTATTTATGAAATAATATAA:1 - chrX 23353030 3' - rover 7124 2 59.59 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAGTTAAGTGAACTTTTGCCGGCCAGGTGAATGCAGGCAGAATATCAATTGTTGATTGGTTATTTGATGGGAAAAGATG:1 - chr3L 19702726 3' - pogo 18 1 69.05 GTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATAAATCATAACAAGAAAACAAAACAAAACCGAGAGCTCCGAGCTGTTAGCT:1 - chr3R 21591352 3' - Juan 4089 1 62.14 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAAACATTAATATGCTGGCTGAAGTTTCG:1 + chr3R 13198318 3' - Doc 31 1 67.81 ATAGTTCCTGATATCTCGACGTTTATACGGGCAGACTGACATGGCTGGACTTACTTGATGATATAGTCGGAAACGCTTCCTCCATTTTCACTCTATTCGATTAGGTCATTATATTTAAAAGAATAAGTGCGGAAAAGACAATCTG:1 - chr3R 6065766 3' - INE-1 143 1 62.76 GTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAGTGCACGCGATTTGGGCGGAAGATTAATTGGCTCAAA:1 + chr3L 9993979 3' + hobo 2854 1 72.60 GCTCATCTCCCATGCGAATGAGAATGTGCGTGGAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATGTTGCATACTTTTTGGGGTAATTTATGATTTCCAAGCACATGCCCGT:1 - chr2L 12861680 3' - jockey 5 1 58.56 TAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTT:1 - chr2R 9408175 3' - FB 73 1 67.81 AACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTGAAGCGCGTCTTCATCATCTTGCTCATAGCTATGTTGGCCGACTGTCTTTTGGGACGCTCCTC:1 - chr2R 21335028 3' - R2-element 3283 1 56.55 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' + P-element 2880 2 68.89 TGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCATATAACTTGATTTGTTTTTATTTCCAAGTATGTTCGTTATTGTTTACAATTTGTCCGAAATCTACA:1 - chr2L 22031954 3' - Tabor 56 2 58.90 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAAGTCGTTTTGTAGCTTGTCATATGCAAATTGCGCATACGCCCCGA:1 - chr2R 14921427 3' - pogo 13 1 76.71 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGACCTAAACCGGATCGAATGGATATAGAGCCGCCCATTGTGAATCTAGCAACAATAAAACAGAGAGAACCCCGCAAGAGCGA:1 + chr2L 246698 3' - P-element 27 1 62.96 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATAACAAGAACACACTTATTCAATTTGTGATTTTATCAAGGCTTGTGCCGTTTCTTATATTCACAAT:1 + chrX 10429918 3' + roo 391 2 73.29 AGATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATATATCCTTTTCCCATTTAATTTTACCTACCTTTTAATAAATACTTTAATAAGTCATAATATGTGCGTAAGCATACTAACCAGATAAAAAACAAAAAAAAG:1 + chrX 21638156 3' - gtwin 6936 2 71.92 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATAATACCACAGGTACTCTTCTCCCCTCGCATTTGAGCCACCACCAGACTGGACCCATTCTATATGT:1 + chr2L 20253963 3' + roo 9029 1 56.85 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGGTAGATGAAACGTATTGCCTTTTTGCGCTGAGCTGGGAGGAGACCCGATCCCGTATGTCTGCT:1 + chrX 13808097 3' + pogo 2046 1 56.16 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAA:2 - chr3R 19589891 3' - BS 5034 1 55.48 GCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGATATTCCGAGTATACGT:1 - chr3L 21765398 3' - gypsy 7031 2 55.48 TGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAATGGCAGGCTGGCTGAACTACTACAATCTGAAGTGCCAACC:1 + chr3R 22572692 3' - HMS-Beagle 22 2 70.55 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGGCGGCTTGTTCCTTTTGCAGCACTTCGTTAAGATGTTTCTAAAG:1 - chr2L 14262921 3' - P-element 35 1 60.27 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGACGAGGAGGAGGTGGAGCGGCCTCAGGC:1 - chr2L 20327581 3' + roo 9031 1 54.11 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGGTGCACTTTTTAAAAGTGTTTTTCTAACTAAATGAGAGCATGCTCGCTCTTCTTTCCCTTTGCGGCGCACTCTACTTGTCTCTCT:1 - chrX 7930654 3' - P-element 36 1 60.96 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGGGGCAGCGAACCCCAGGGGTTTTGGGGTTCATACACCGCTCTCTGAGTCTTTCTTCTCGTCGTTTTAGGCATTTGAATTCTCTTTC:1 - chr2L 17574326 3' + hopper 1384 1 60.27 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGTAAGGGAGTGGCACCCGACACTCAAATTGGTTGAGTGGCAAAAAATACCACTCTTGCAGTTCAGACATACATACATATGTATGTACGTATGTGTTCTGT:1 - chr3R 7090327 3' + P-element 2865 1 69.18 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGAATATTCGTACACAAAAACCAGGTTTGCGCAAATAGGTTTTTCATGAAAACGCTGCTGTTGTGGCTC:1 - chr3R 29381490 3' + hobo 2937 1 71.58 GCATTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCTTTAAGAAACAATAATGATAATTGTAACAGTATAACATTTCAT:1 - chr2R 10936661 3' + copia 177 2 73.29 AGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATGCTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCAACGCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTC:1 + chrX 11906337 3' + HMS-Beagle 6982 2 62.33 GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCAACATAGTCGCCACACACACACACACACACACACACAAGGA:1 + chr3R 27499999 3' - hopper 72 1 69.23 ATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTACTCAGCCGTGATACGGGCCGAAGCGACCGAAAAAAGGGGGTA:1 + chr3R 902600 3' + R1A1-element 5257 1 70.55 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCTGATGTCTGGAAATT:1 + chr2R 12642773 3' - pogo 25 1 68.28 CAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATACATCAACAATGATTTAAGATAAGGCGTAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGGCGCCGAACCTGATGCCAGCGGCGATGAGGTGGTCGAATTTGATGCAATGGT:1 - chr2L 19448279 3' - Cr1a 4184 1 65.97 ACAGCTGCTTAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGGAGGGGGACTATATGTAGGGGTACTATAAGT:1 + chr3R 1977621 3' + micropia 382 2 62.33 ATCAGCAAAGACATCACATCCATCTCAAATTTTCGCGATGGTAATTACGCGATATGCAAAGCGCACACAATTGGAAAGACATAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGCAATAAATATAATTGATTAATTTAGA:1 - chr3R 4144698 3' + Ivk 414 1 76.71 AGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAGGAGCTGCAGACAAACTCTTATATTAAACTCAATGGCTCGGGCCCGACCCCGAATATTTCAACAGCAAAAGTATCCAGCTCTGGTTAGGTGCCCTTTGACATT:1 - chr2L 8807789 3' - HMS-Beagle 6808 2 76.03 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGC:1 + chrX 18193829 3' - hopper 42 1 52.74 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACGGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATTCCATTAATTGAAATGATAACGCTTAATGATAGCG:1 - chr3L 11887169 3' - Doc 36 1 58.62 TGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGTTTGGTTACTTGCATCCGTTATTATGATGAGCCGCTTATCAAATAATAATTTATATTTACAATGGGTTTGGCAATCAAGAAA:1 + chr3R 30564816 3' - F-element 4585 1 53.42 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTTTATACTTGAATATATGCAAACGCTTTTTTGGCTTCGATTTTCGGTTCTTTTGGCGTTCTGCAACTGTGA:1 - chr2R 6713818 3' + 297 353 2 58.22 ATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATACCTACGTAACCAATCCAAGAATATATCGGATATATCATATTGGCTTTAAGTACGG:1 + chrX 18561152 3' - copia 4935 2 64.38 TGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAGTGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAA:1 - chr3R 15035061 3' - Stalker2 71 2 63.01 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGT:1 + chr2L 15601637 3' - Doc 64 1 60.96 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTTTGTATTGTTTCCCATTTCAAATCTTCCAGAAACATTCAATGAAGGAAAATATATAAAATGTATTAAAAATTAAACTGAAACCACAAGTTTTTCATG:1 + chr2L 13103003 3' - roo 8686 2 69.18 AATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCT:1 - chr2R 17872496 3' - Tirant 86 2 73.97 GTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCAGGCACATTCCCCAGATTCCCCCAGTTTTTCC:1 - chr3L 19398150 3' - gypsy5 7020 2 78.52 ACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCAAATATTGACACACAATAAGCTGGTCGCAGTCGGAGCTTTTACTTTTCG:1 - chr3L 17335260 3' + F-element 4355 1 67.12 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTCATTGTGGCTTAATGCACAGTTCATAAAAATATATGACTGTAAATGCAAGTGCAATATTTGCTGGCTGTGTAAATATTTACACAAAATTTCTTTTG:1 - chr2L 2622607 3' + roo 9047 1 68.97 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTATTTCAACAAATATAGAGGGAGAGAAGTAGGGGCACAGCTCCCTTTTGCATGTACATACAACGTTTTTAATTAAAAAATCCTTTGGTCAAG:1 - chr3L 13567934 3' - copia 28 2 65.97 CTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCATCAACCTTCTAGACAATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATAAGGTCACTTACGCGCATCTAAATGCATTAAAAAT:1 - chr2R 3104567 3' + G2 2856 1 76.39 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTTGCCCGTTGGTAGAATATGTGTAAACATTTTTATTTGCATATAAAGCT:1 - chrX 19310562 3' + pogo 2033 1 66.44 CATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTATATAATCCGATTTTTAGGGTGGGATTAATAGATGATT:1 + chrX 17270357 3' - 3S18 84 2 73.97 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATATGGCCAACAGGTCGATGGCGATGGGGGTATGTGAGTGTGGCCCGGATGGATATGGCCA:1 - chr2L 2933181 3' - pogo 58 1 77.40 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTTCGGCCATCCGGCGCGTCGTGCTTTTCTATTTGTATTTGTATTTA:1 - chr3R 13572027 3' - 412 7127 2 69.86 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGACAAATATGAAAGCGTCAGGGGAATGGGGAAAACTCTGAATTTTGAATGGTTAGGGGTTGGTGGAAGTGGGCAAGGCATGACAAGGAACTTCCAC:1 + chr3R 12781624 3' - pogo 24 1 69.18 TAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATAAAGATCTATAAATTTATTGGTCCTATTGAGTAACGCACCACTATACTGAAAACTCCCATCCAAATAAACGAATGGATGCAAGTACGGCAGCGCAGGAG:1 - chr2L 21019357 3' - opus 403 2 76.71 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGA:1 - chr3L 12775952 3' + roo 9022 2 52.74 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGCCTGATACTTAACAGCTCAAACTCCTTTAATTCCATTATGATAGATTGATTCGATTGAACAGTTCC:1 - chr3L 2240390 3' + roo 354 2 54.79 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGACTGGCTTTACTTG:1 - chr2L 15096877 3' + jockey 4961 1 54.84 GAGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAATTATTTGGCGTGCCTCGATTAATTGGCATCAATTGAAAGCCGATTGTTGGA:1 - chr2R 14767311 3' - Tirant 12 2 78.62 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGAATATGCGAGCATGCGACCACCTATCGTAAATGTATGGATGCGAGTGGCAAGTGGG:1 + chr3R 11483862 3' - pogo 56 1 59.29 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATAAATATATGTATGAATTTTTATAGCAGGAATAGTGTTCAGGCTACAGAACAATATGCTTTGGCAGAGTTCGTTGACCTGGG:1 - chr3R 25929313 3' - 297 6619 2 58.33 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGGAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGAGCTCGAACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAA:1 - chr3R 19989254 3' - hobo 74 1 67.12 AATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACCATTTTCGCCATTCGCCGCCTCGGGCGTAATTTGTAAATCTCTGCAGGCGCAATTTATCTAAACATCCTTCGCTTCTCCATTTATCCCAGGAACGCCCACACGGCTC:1 - chr2R 18467077 3' - roo 13 2 73.97 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGA:1 - chr2L 20327608 3' + roo 9004 2 63.70 GTTTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTTATGGTAGGCTGGGTCAAATGCCTTTAAGACATGAATAGTAAATTGGGTCTCAAACTGTTTGCATAGTTATTTAAATTAATTTTTAATCGATAACTTGGTCTTTA:1 - chr3L 6614846 3' - Tirant 468 1 73.97 CGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCCGAGCAGGCCAAAAGTGTAAGCGAAACATCTAAAGGGTCAGCCACGTGCAAAATTCTAACATCTCTCATTTCCGATGCTTAAGCCAATTGAAA:1 + chr2L 16554992 3' - F-element 272 1 58.22 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGTACATACTTCCCCCATCCGAACCGACCTTATAGACCAGAAGTCTCTCTTTCCGGCACTTTTTGTAATGCCCCGCTCT:1 - chr2L 9228646 3' + Burdock 6369 2 64.29 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACGATTTAGATTTTCTCCCACTCCCTCACTTCGTTGAGCAGGTGTTGTGGCAAAGTT:1 + chrX 8856083 3' - 297 59 2 65.03 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAATTATTTGGCGTGCCTCGATTAATTGGCATCAATTGAAAGCCGATTGTTGGAA:1 - chr2R 14767310 3' - Tirant 12 2 78.77 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTTACCTTCGCATTTTTTCCTTCTTTTTGATTAAATTCTCAAGATTGCAATTGATTTTAGTTATGGT:1 + chr3L 18421429 3' - hobo 51 1 53.52 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGAGGCCGGAACACCGGTTTTCCATCGTGTAGATACTCCGGTTTCAGATAGAGTCCCTTGCAAGATCGTTTGCAGCATTTGTAAAAATGAAATGCGCACACTTTAGT:1 - chr2R 12872836 3' - P-element 17 1 73.97 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACG:1 + chr2R 18786046 3' + roo 324 2 74.66 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTATACATACATATGATTCTTTATGAAATATGTGATGGAAATT:1 - chr2L 20253861 3' - roo 78 2 74.66 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCACACAATGCAATTTAATATAGCATACTTAACA:1 - chr3R 22266398 3' + roo 9047 1 65.75 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGTTCGTTTATTTTTCTTAGTGTACCAATAGCTTCGATTG:1 + chr2R 21353262 3' + Transpac 5151 2 72.73 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACCGCGTTTTCACGCCACACACACACAAGTAGAGTGCGCCGCATAGGTAAAGAAGCGCGAGCAC:1 + chrX 7930779 3' + P-element 2829 1 45.52 GCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATTTATGATACTACCGATATTATTTTATTTACTTTCGGGCTGGAAGCAAACTCGTGTTTTTCCGTTTGGTGTGTGCTTTCCCCGCAGCA:1 - chrX 6863543 3' - Juan 4117 1 61.64 TTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATAATACAATCAGATTGAAATCGAAGCAGGGCACCTGACAC:1 - chr2L 8852738 3' + Burdock 225 2 59.59 GTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCGCTGGAAAGTATGCTCCGCTAAAATGAAGCCAGGATGGTATGGAAGGGTGATGGGGGTGGAGAAGGA:1 + chr2R 5899340 3' - jockey 4524 1 69.18 TAATATTATTATTATATTATTTCGTAGACAAGTAATTCCATAAAATCGTTATAAGAATTGAACTTCAAAATGCCTATAATCACTGTTTTGTTTGAAAACCAATCATATCATTTTCATTCCTTTCAACTTCAGCATCCTTTACAGAC:1 - chrX 7374021 3' - invader3 5053 4 73.97 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGCCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACTTGTACACGTCGATCTGGAAGCTTGCGGGCTCTTTAAGACCATAATGATAATTTTTACC:1 + chrX 22760410 3' - roo 8726 2 62.33 TTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAA:1 + chr2L 8807919 3' + HMS-Beagle 6960 2 75.34 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTTGACGATCGAAGACGAATGAAAGTGAAACTAAAGCGAAACAGAAACAGAAACATACACGAAAGGAGGAGAGGAGGAACACAAAACGTGCGTG:1 - chrX 19506043 3' - P-element 29 1 67.12 TACCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGAAAATAAGCCGATGCTGTTTCACGTGGCGTATGAGCAATATGTACGCCAAGATGCACCGCAACAATTTCACGTTTAAGCAGACTTTTGCTTTGT:1 + chr2R 8492873 3' - pogo 23 1 69.86 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCTTCTCCGTAAAGCTCAATTTCTTTATCGACGGATTGCTTGAC:1 + chr2L 22177443 3' - Doc 84 1 70.55 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACAATCTGTGCGTCGA:1 - chr2R 18056803 3' + blood 7318 2 65.75 GGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGCGTTATAAGGAAGACGAACTGCTCCGATTTTGGCATTTAAGTTGTTCCCCTTTCGTTCCTTCCGTTGTGCATATGTGTGCAAGTATACACATGT:1 - chrX 512527 3' - I-element 4993 1 66.44 GCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTAGTTTGTTTTAAATTTTGCGTCTTTCTGATAATTCAACATCCAGCATTATTTATGGATTAT:1 - chr3R 15157547 3' - invader3 26 2 65.75 AGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAAGCCCTCAGCTGAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATCCATCGCCGTCCACTTTCATGTCCGTGCTGACATGTTCACATCAATCACACGACCCTGTTGCCCGTTGGTAACTACGTT:1 + chr3R 9870960 3' + Rt1a 4959 1 54.11 CATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATATCTACTTAGTGTACGTATAATTTGTAATGGTATT:1 + chr2L 17120826 3' + blood 7073 2 75.54 GTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTGTCCTTTCAGTTTTTAATCTAGCAAATAGAAGAGCGAGCGAACAATTCGATTTACTCACACTTCGTAGAGCGTCGGGATTT:1 - chr3R 25670137 3' - R1A1-element 47 1 52.74 TGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCTCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCGAAAGATGGAAGAAAAACCGCAGCAGCAGGTGGTGGTGATTT:1 - chr3R 12947044 3' - micropia 5196 1 71.23 GGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTATATCCAGTATTGTCTTCTCTCTTGCACGTTTACTCGCAGCAGATCACCAAATAAATATTTCCGCATTTGAGAACCTGAAGTTGCGACCTAAAAACGTT:1 - chr3L 18591446 3' - flea 4771 2 73.29 AAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTATGCTAATGATTGTATGGCGCAGCATTATGGCACTTTTGCACGTTGCCGCCATATTCGAGTGGCGAG:1 - chr3R 9862872 3' + Stalker2 7596 2 53.42 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGCTTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGACACAGCTTTTTACTGAAAACTGAAGCATTCTCCCCCAAAAAATTGTTG:2 - chr2L 42465 3' - copia 4897 2 66.44 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGATGTTGTTGTTGTTGATGTTGTTTCTACTACTCTACTGCTACTACTACATACTCATAAGCCTCTCTAAATACCGCAAGACCACTATCTGTTATCATGATTTCCGTTTAACTA:1 - chr3L 13778490 3' - I-element 11 1 78.08 GTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACATTTACTAAGGCAAAAAATAGTTTACTCCGTGGTCAATTGATGTTATTGTCAAAAAAAATGATTAAGATTCTTGTAACGC:1 + chrX 22167479 3' + invader3 5418 2 55.48 AGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTATAATAAAGAATGAGCAGATAAGAGCAAAAGGCACGCTTACAATTAGTTCTGAATACATAGAAATTGCTCACAAGCAATAGCCACATAAACTACTAAACGCAACGCCTAACAACGAGTGAA:1 - 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BS 5076 1 60.27 TATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATATATCCTTTTCCCATTTAATTTTACCTACCTTTTAATAAATACTTTAATAAGTCATAATATGTGCGTAAGCATACTAACCAG:1 + chrX 21638138 3' - gtwin 38 2 59.59 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTGTAGGCTGACTCAGAGCCAAATGGCGTTGGATTCATGGCTAAGACCAGTTCAAAGGCAATC:1 - chr3R 29719306 3' - hobo 21 1 66.40 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTGTAGTATGCCCCTCGTCATAAGGCAAACAAATGACATCGACTGACATCCTGTTCTGCTCGCCAGGATTTTGAGTTGCCTTCTTCGTTTTCGGGGTC:1 + chr2L 2336362 3' - 297 20 2 71.23 TGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCATAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAACACCTGAATGAATACACAATGTTCTCTACCTCAGCAACTCCACT:1 - chr3L 16563327 3' + I-element 5277 1 69.18 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTGAGTCGGCCGGCCG:1 + chr2L 20716438 3' - P-element 53 1 48.95 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAATCTTTGTTGCTCAAAGTGAGAGACAGGGAGAGAGAGAGAGTACACGGCGTATGTGAAAGATTCACTTTTACACATCCAAAAAAGAGAT:2 - 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F-element 99 1 74.66 AAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCAAGACTAATCAAAAGTGTCTTTTCTACACTACAAGTAAAGGGTA:1 + chr2R 7024469 3' - diver 5965 2 70.55 GTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGCACGTGATCTATTAATATTTAAAAATCGACCTACTGCATATAAAAATCATAAATTGAGATA:1 + chr3L 15374719 3' + 3S18 278 2 60.27 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCACACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGGTGCAAATTTTATAAAACAGTTTCAACTCGATAATCGG:1 - chr2L 246597 3' + P-element 2807 1 31.03 CNGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATT:1 - chr2L 16360566 3' + hobo 2891 1 55.97 TGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGATACAGATACAGATATCTATATAGTCATGTGGTTAAGGGGTTACGCATGGCGAGATATCGATTGCGAACAAAACTGTAATGCGAAAAGTGCTTCAAGGTTGATCGCTGATCGGATTG:1 - chrX 17837897 3' + S-element 1711 2 80.82 CGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGAGTACACGGCTGAGTACAGTAATGACGCCCTGCAGACAGACAGAAGGAG:1 - 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flea 4785 2 39.73 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACTAACATGTTACATAAGCCCCACACCCTTCTTCCAACTAATTGGATTTCTGGGAACTCACTTACAGACATGACCGCCTTCCTCAGCC:1 + chr3L 18954253 3' - roo 8698 2 60.96 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATGCCATTAATTGAAATGATAACGATTAATGATAGCGAAAAGACACCAATGTGAG:1 - chr3L 11887151 3' - Doc 19 1 73.29 TAAGGCGTACGGGGTAGCGGAAAACCCCGTTGTCACTTTGGTTGCTATTATTTTAGTCCTTGCAGGCTGCAATCTCTGCTTCAAGTTTCGCTTTG:1 - chr2L 16163378 3' - BS3 1748 1 78.95 ATATTGATTTGCTTGGGTATTTTTAATAATAGAAATAATAGAGGTATAAATATGCAACAATATAATTTTTTCCTACGAAGCATTTCTTTTAAATAAAAATGCCAGAAATATAAATTGAATAGCAAACATGTCGTTCAAAGCAGGTA:1 - chr2L 11784415 3' + invader5 64 2 80.14 TTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAATTTGAATTATTGTCTACGTATTAGAAACTGTCATTGTGAGTC:2 + chr2L 42628 3' + copia 224 1 63.70 ATAGTCTTTAATATTTGTAATTTAAAAGGTGAAAATGAATTGTAACTTCTTTAAGAGATCGCATCTTATACATGTTCCAAGAACAATGTCTGAATGAATCCATTCACCAGGTCAATATCTATTCTTCCAAGTGACACATCTGCCC:1 - chr3L 1320687 3' + gypsy7 5093 1 62.76 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCGTTCGTTTATGGAAAATCC:1 - chr2L 951286 3' - F-element 48 1 56.85 CTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCCAGCCGGGAAAGTGCGTCAAAAAATCAACTGCTAAACAATGAGCAGCAACTTTCCCTCACTTGCCGTCATTTTGCTTC:1 + chrX 11280847 3' - X-element 42 1 60.16 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGAGACGAGCGCAGAGTTATTGTTATTGTTG:1 + chr3R 5087174 3' + P-element 2838 1 52.74 GTAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCCAGACACAATGCGGTCGACAACAATTGCAGGACGTCGGCTGTCCTAATGGAAAATGGCCGGATCAAACCCTCAATCCTTTCAGTC:1 + chr3R 6526851 3' - pogo 33 1 63.01 TTTTCTTTTTTTTTTACATTTTTTTTTCGTCCTTTTTGCCTCCGAGTCCCACTCCCCGTGCCCGTGTCACTCGTCCGTGTCCCAGCTGTTGTTTGGCTCGTGCTGGCTTTTATTTTTTTCCTCTT:1 - chr2L 7932180 3' - TART-C 11096 1 80.80 ATCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACGTACGTACTGTACATACTATTTACATACATACACACACCCGCACTTCCAACGCCATGTGCCAAACAGCTG:1 + chr3R 17079516 3' + 1360 3350 1 54.89 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGATGGTTTAATTTTTTCTTATCTAGGTTTAAAACTGGGCGTGTCCCTTGGCAGAATTATGCACCACGGAATGCAATTATGTAAATGTCCTTGTCGTTGGAAT:1 + chr3R 7655709 3' + 412 7525 2 70.55 GATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCAGCTAAAAGTGGGCGTGGCCGGGAGGGGCCATAACGCCCTCCAGTTATTTTGGAGCTTAATCAAAAGAAAAAA:1 + chr3R 11550790 3' + F-element 147 1 54.11 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGC:1 + chrX 19162699 3' - pogo 46 1 54.11 CTACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAG:1 + chr3R 13572077 3' + 412 412 2 79.53 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAAAAACCGCCCAAAACACAAGTCTGCATTTATGCAGGCAACAGCCAATTCACTTGA:1 - chr2L 16536512 3' - pogo 57 1 62.86 CGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGCTGAGCTCGCATAATAAAGTCGGCCGTGGATGAGAGAAGTGGTAAGGAGCTTGTCCAGCTCGGGATTTCTATGTTGC:1 - chr2R 10960216 3' - Doc 4283 1 55.48 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAAATAAAATCAACAAATGAGTGAGATGAAAATCGCATAAAAATAAACTAGGCTTTTTTAAAAAGTTGTGAAATGAAGTGACAAGCACTTTGTTT:1 - chr3L 9905718 3' + Juan 4184 1 60.96 ATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAAATTTTTGA:2 - chr3R 19144393 3' - Juan 60 1 55.48 GTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCCATGCTCTGCAACGGTGCGTATGATTAATTTCAGCTACAATTAATATTGCTCATACGCCAGCGAGTACGGGGCCG:1 + chr3R 30524572 3' + roo 379 1 61.07 AGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCCGTAAACAATTCGCAAAATAAACAGTATTCGCAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTTTTATTCTCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTGAACAAGACAATTTCCCGTTTTTTTAC:1 - chr2L 22216139 3' + diver2 4795 2 91.78 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGACTCCTTTTGAAAAACTCCCTTGCGTTCGCATTCCTCTCTTTGTGGCTCATTTTTTCGGG:1 + chr2L 21082259 3' - mdg3 22 2 71.23 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGATTTATTTGCCGGAAAAGAT:1 - chr3L 13546554 3' - hobo 62 1 63.01 GATCAAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTTACCAAAAGCACGCGTAGCGAAAATATCTGGCAAACTTGTTGCGAATTGAACTGTAGACCCAAGGTCAAATCCAGAACTTTAAAAAAAACCAACCTTCTGG:1 + chr3R 17077803 3' - 1360 3160 1 73.29 TAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGTTGCGGCGTCTTAACCGCAAATCCTTTTAGATATGAATTGAATTGATATATTATTTATGAT:1 + chr3L 5943904 3' - Doc2-element 107 2 57.93 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGCATACAACTCAATCATTTCGTTGTTGTTCGCCGTTGTGCAATTGTCTCGACCAATTTGTTTGTTCGTCAGTTCGTTAGTTAC:1 + chr3L 11228203 3' + pogo 2066 1 61.64 ATTTCTGAGCGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTGCTTTGGATGTTATTTTGGTTGTTGTTCTCATTCTGGCTTTGGATGTTATTTTGGTTGTTCTCATTCTTGCTTTGGATGTTGTTCTCGTTGTTATTGTGGGTGCTGTTCT:1 + chrX 18607696 3' + Cr1a 334 1 77.40 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGGAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACAACAAAATAAAATATTTAACAAAATCGTTACACAATTGATTTAAATGGGA:1 + chr2R 22040975 3' + jockey 4937 1 64.84 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGACTGCAGCAACAACAACCACACGGCAGAGTA:1 - chr3R 17794515 3' + P-element 2840 1 50.68 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAAGGAAAAAACGAAAGTTGCCAATGGCGCAGGCGAAAGGATAACTGAAAGAATGGAACTGAAATTAGAAAAGCAAAATGACC:1 - chr3R 7655541 3' - 412 41 2 53.42 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTCCGCACTAGACGCACAGGTA:1 + chr3R 5684180 3' + pogo 2055 1 52.74 TGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCTGAAAGCCAGCTGTTGCCAAAAATTGCAGGCTAATTGA:1 - chr2L 3677605 3' - BS 77 1 74.66 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGGGGAATGCCGAATTCTTCTCCGTAAAGCTCAATTTCTTTATCGACGGATTGCTTGACAATTCCTTTATTCATTAAATAGGT:1 + chr2L 22177467 3' - Doc 46 1 51.52 CGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATACATTCATATAAATATGTAGAGGTGGGTTGCCTATGGTGGAGGAAGGCCGCCGATTGCATAGCCGTTTGGCCGGTCGCTCATTAGATGTTATCATCCTTGT:1 + chr2L 9228813 3' - Burdock 15 2 71.92 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAATACATTAGAGCAGCTACACAGGATATGGAAATTATTCGAGGCTACAACCCACTTCCTTGCACTCCGATCCTCTCGAACGTGTCACAAAAACTATGCAACAA:1 - chr3L 13631213 3' - hobo 19 1 73.29 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCGTGTCGGGAATTATGGCCCTAGGTTTTCTAGAATCCCACTGTTTGACCCATTCTCTGGCTGAGCCTATCTGGTCGAAGAAATCTAGAAAAAATAAAAG:1 + chr2R 11379914 3' + hobo 2917 1 70.55 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTCAACGTCGATGGCCATCAGATCGAAGTGAGTGCCATTCGCCCACGCAGAGGCACACACAGAGGCAGTGATTGCCAATCATCACCAT:1 - chr3R 11730647 3' - hobo 34 1 60.69 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCAGCGTAGCACAGAGGC:1 + chr3R 13572126 3' + 412 7496 2 52.41 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAATCTTTCCCAAGAGGGTTTTGATGGGGTTAGGTTCTGTTACTGGTTAGAATTTCAATTACACTCTGTAATCGCTTACCATTATGCGAGTATGTGTTCCCCCTTTAAGCT:1 + chr3R 10736909 3' + copia 242 1 73.29 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAA:1 - chr2R 14450156 3' + roo 9007 2 65.69 CAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCCGCCTACGGTTGCAGTTGCTCCGGGTGCGATGCACTAGCAAATTGCAGCTAATGGAATCTGCAATAGA:1 - chr2R 21105699 3' - Stalker2 7303 2 53.42 TTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTGTTATTTTTCGCGCTTTTCGCAG:1 - chr2R 17872463 3' - Tirant 53 2 51.37 TTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATCGAAGATTTCGAAATAATGAATGGGTTCCCATGGTTCTTATCTTCCATTAAAAATGATATTGTTGCAAATGCTGACGGGTTTTCAACAACATAATTATAACAT:1 + chr3L 18237488 3' + S-element 1703 1 76.71 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTGGTCCTTGGTGGAGGCCCGTTCTCAATCCGTTGGCGAGGACCAAGCG:1 + chr2R 10666922 3' - hobo 74 1 67.12 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAAT:1 - chr3L 12775958 3' + roo 352 2 56.85 TTTTTTCCTATCTACACATTCAATTTAACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGACATGGAAAAATATGAAAATGTCAATCTAAATTTCGAAAAACGTTTTTAAAGTAGAGAAATGCAGTTTTGATTTATAATC:1 - chrX 21029593 3' - HB 114 1 54.11 CTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTTGGAGAAGGACACTTGAGCTGGTAGGATATGAGAGCGTATTATTTT:1 + chr3R 25929428 3' + 297 325 2 68.49 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATATATGTATATTTAAATGCAGAAATATTTTATCCATTCTGCCTTGAATGCCAAGCAGATCTCAAACTATTGTAGTAAAAACGTAACGAAAGCA:1 + chrX 21405410 3' - flea 4782 2 68.49 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAATAGAC:1 - chr3R 11072458 3' + roo 325 2 76.71 ACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTATGCCATATATACAAACTTGAGCACTTAATAGTTATAAAATACAAAGACTTCTATATCCATTGTTAAAACTTTTATTCACGAATAATTATCAG:1 - chrX 13558144 3' + mdg3 5472 2 67.12 CTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGAT:1 + chr2R 4206653 3' - 1360 325 1 69.18 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCAATAGGTCCCAATAAAACTTAAAGTTACTTCCAATTTATAAGG:1 + chrX 16538180 3' - mdg3 75 2 69.18 TATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGCGGATTGAAATGTATTTGAAAATGGCAATTTACGCACTGTTAGGGACAGTTCAAAAAAAGATTCAGCTGCAGGCATGGCACCCAGTGTGTCCCTTTCTCG:1 + chr3R 15035190 3' + Stalker2 7628 2 69.18 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTCATTGTGGCTTAATGCACAGTTCATAAAAATAT:1 - chr2L 2622670 3' + roo 8983 2 78.77 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTTTATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGTAGATGCTGGTCCAG:1 + chr2L 19800976 3' + roo 9018 2 55.48 TTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAGTCATTCGGAAACTTTAAAGCCCGAAAGTATGCAGCACA:1 + chr3R 11568659 3' + BS 5034 1 68.55 AGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATAGATACGATGTGTTGTTGCAACAGGACGTGACTTGGGTGACTAAGAATGCAGGTCAGTCGG:1 - chr3L 9317459 3' + HMS-Beagle 6988 2 58.22 CAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTATGAAATGCTAAACATTTTACTGCCTCCATAAAAACGTAAACGAGAATTATTTCCTTT:1 - chr3R 13063674 3' + copia 4771 1 55.81 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACAAATATGTGTGTGCCGCTCGCTATCCTGATACACCCACCACTTCCAGGATATCGCAACCTTATGC:1 - chrX 20106262 3' - hopper 10 2 76.03 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACTAACATGTTACATAAGCCCCACACCCTTCTTCCAACTAATCGGATTTCTGGGAACTCACTTACAGACATGACCGCCTTC:1 + chr3L 18954246 3' - roo 15 2 66.67 CTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGTGTATGCGTAATACGAGCACCCACGTGCACATATATATAAGGAGCGCTGCTCCTCGACTTG:1 - chr2R 4937699 3' - mdg3 60 2 57.53 CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAGTAATTAGTCCGTGTTTTGAAACTTTTATTTAGTTACATATAATAACCAAACTTGAACTTAATCTCGCATTTTAAACTTAATAAGTATGCAAAATGGTTTTAATTTGCTGCAC:1 + chr3R 27443301 3' - 3S18 9 2 79.45 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGTTGGGTGTTAAACTTTGCTATAGCCTCGTGGAAATTAAAGAAGCATACTTTTGGGATGATAACATATCTTGTGCGGATGAGCATGGAATT:1 + chr2L 15096992 3' - jockey 4702 1 62.33 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCCAGCTTCATAGCCACTCAAGTAACCGAGTT:1 + chrX 7624164 3' + roo 359 2 56.85 TTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTC:1 + chr2R 13391910 3' - transib2 2602 1 69.86 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGCTCATCCATGACTCACACTCGCGGCGGCGTCGGCGGAAGCGAAGGATGG:1 - chr2R 15530209 3' + roo 9001 2 66.44 GAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCAGTGACAGAGGAACCCCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCCATACATTTAATTAATTTATACACACATTTTCGCATTCGAGGACTGAT:1 - chr2L 15934577 3' + springer 292 4 76.03 GTTGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTTGCTGTATGTGTGGCACATTTCCCAGCATATTTTTTGTATTTTGCAATCCTTTGTCTCTCTGTTTTGAGCTCTGCTCTTTGTGTCTGCCATTCAATATTTTCACGCA:1 - chr3L 19432459 3' - HMS-Beagle 6807 2 79.45 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCGTAAGTCGTAAAGCCCTGAGTTTGTGGGTCGTCTTGTACGTGTTTACGTTACACGTTATATATATATATATATACGAAATATATAGAAAAAAATTTCAGGAAAAACGTGCGGCA:1 - chr3R 12547799 3' - hobo 8 1 74.66 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGTATAGACCTAGTTTTCATTACCGTTTTCAAACTTTGCCCCTCTATCTTGCCTCCTAGTTTTCCTTTTTTGTGT:1 - chr2R 22495243 3' + roo 327 2 50.00 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATCGATCGTACATCTTAAAACGAAAATAATTACATTCGAAAAATGAAACTACAATATATGTAAGTACTTCATTTTATGCCA:1 - chr2L 615208 3' - F-element 55 1 51.37 TTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATAGCTCATAAACAGGAATTAAAAGCATACCGTAAGCTTTCTAAA:1 + chr3L 8704582 3' - blood 78 2 70.55 AGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGTTTTATATTAACCAATGAGAGTGGTCTACTCTAGAGAAGAGTATTTCCCAAAGGGAACTCA:1 + chr3L 18435015 3' + I-element 5297 1 59.59 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTG:1 - chr3R 26405009 3' - hobo 41 1 50.40 TTGTATCGCAAAGATTCCCGGTTCGATGTCTTCACTTGTGCAGAACTCGGTGACGGCCGGCTAGTTCAAGCCTCATTTACTGCGAGGACCCGG:1 - chr4 763765 3' - ZAM 8037 2 40.86 GTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATAGAAAAAAAAGAACCAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACAAACTTA:1 - chrX 333964 3' + 17.6 7374 2 64.17 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTAAAAATCATTCAAGCTTGCTAACTCCACCGAGAGTCTTTTGAGTCAGAAAAGTTGACCAAAAAATATGCACAGTT:1 - chr2L 15596899 3' + roo 9029 1 54.79 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCAGACTGAGCTGTGAGCACTCAATCATTTTATTTACTTATGCACCAGTGCACGCA:1 - chr2L 5732734 3' - hobo 67 1 62.33 TTTTCCTACCGTAAGTTCAATAATAAAAAAAAATACTTTTTATTAAATCTCTGGAAGTCCCAACATTTTAATATAATATGTACGATAACCAATATGGCTGTAAAACGAACTAGCAGT:1 - chrX 20396831 3' + Rt1b 5131 1 68.38 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGTTGAGATGGATCTTATTTTAGCACCCCTCATAAAGGATTCCCATGACATTTGATGGTGAAGTTGATGA:1 - chr2L 5333348 3' - mdg3 5278 2 68.06 TCCTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAACTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTTTAGTCCGGGACGGAAAAATACTGTAATAGCACAATACTAAGGTTTAAATTTGAAGTAAGCGTTTGGTTCGAAGAGTA:1 - chr3R 5094085 3' + R1A1-element 5150 1 49.65 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTCATTCTGAAACCTTGTAAAATCTTTAATATTAACAAATAGATTTTTTTTGGTGCATGAATAAGTGTGTAT:1 + chr2L 7167360 3' + flea 4966 2 52.05 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGGGGCAGCGAACCCCAGGGGGTTTGGGGTTCATACACCGCTCTCTGAGTCTTTCTTCTCGTCGTTTTAG:1 - chr2L 17574344 3' + hopper 1387 1 54.40 TATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATATTTTCCTCAGAAAAATTAACATTCGCTTATGGTATATAAAAAGAAAG:1 - chr3R 8338128 3' - jockey 4632 1 67.12 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGAAATATTGAGATTTAAATTTCATCAAAGACTGTTTATAA:1 - chr2R 10189280 3' - Doc 86 1 76.03 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTGACGGTCGTTTGCGTAGGACGCAAGACACGCGACGGGTCTCGAGTGCTGTGGTTTGCCTG:1 + chr2L 14263076 3' + P-element 2857 1 63.70 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCATCTAATCGAGTTATGACAAACTGAGTATGAAAAGAAAAGCTACAAAATAACAACAGAAATGTGTTTTGATGGATTATACAATCATGTAAATATAAACAAACATGGAG:1 + chr2R 15529842 3' - roo 13 2 77.40 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGCTGGACTTTAACCTTGTATTTAGAATGTTTAATGACACATAATTAGTTTTACTTCTTAAATTATTTACCTAAAAACAAGTAATAGAATTCTGGCAACTTTAAT:1 + chrX 127109 3' - hobo 17 1 73.97 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATAATGCCATACAATCTGAAATAGTCTGTTGTGTGGCAAATTAGATCTAGAAACTGATTGATATATTGTTCATATCCGAGTTGCATTAAACACTGTATCTGTA:1 - chrX 18318109 3' + copia 237 1 73.29 TTTTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGA:1 - chr2R 22616897 3' - Tc1-2 479 3 78.77 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAGTGGTAAAGGTAATAGGTAATAAAAGGTAATCGTGTGTTAAATTAGCCTTGAAAATTGCA:1 - chr3R 19466674 3' - jockey 67 1 57.24 GGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAAATTGTCAATT:1 + chr3L 3540275 3' - mdg3 5258 1 80.14 TTAATTTTTTTAAATAAAATGATAAATGAATTTTGGTTAAGTTTAAATGCTTCCTTTCATTTTGCACTTAATCACAGTCATATTTTTTGGGGTGTAATATCATATTGTTGACTGGTGTGATAGCGTTTCGCAATTGACTATGTGTT:1 - chr2L 10723494 3' - TAHRE 74 2 51.37 CNGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCG:1 - chrX 19744419 3' + P-element 2816 1 37.67 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTACGGCGGTCATAAATGGAGTTTCGTATCGGGTTTTGTAGTGCCGCAGAATCGAAACACGCACACGCGAATTTCACTGTCCAGCCGGGTTTTCAA:1 + chr3R 12547981 3' + hobo 2922 1 68.89 CAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTCTGA:1 - chr2R 9408165 3' - FB 62 1 60.69 GAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAA:1 + chr3L 13365104 3' - Juan 74 1 65.52 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTGGTGTTGGGTGTTGATGGGTGGAGGAGGCGAACGATTAACAAGCAAATTAGCATGAAATTATTTCAAAACAGGCGCACACA:1 - chr3R 27409103 3' + hobo 2899 1 58.22 TTAACAAAAAAAAAATATGAAAAAAAAAAAGTACCCAACGGGCGGGATTAAAGGCAACTTTAATTGTTTTGAAA:1 - chr2L 19948024 3' - FB 177 1 33.78 ATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGTACATACTTCCCCCATCCGAACCGACCTTATAGACCAGAAGTCTCTCTTTCCGGCACTTTTTGTAATGCCC:1 - chr2L 9228652 3' + Burdock 248 2 71.43 AGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCTGTCATCTGTCTATCAGAAGCATTAACAGCTTTTACTTACTG:1 - chr2R 23504209 3' + jockey 4911 1 71.23 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTAATTATGGTATAAATATAAAAGAGTTTAAGAATAGATTGAGTAGAACCCTACGGTTTTTTTTCTCTATGCACCACAACGATCCCGTTAGCAAAG:1 - chr3R 18498172 3' + pogo 2079 1 39.04 TATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATACGGATACTTATTAAATTCCGTGAATCTGCACATCCAA:1 - chr2L 3317769 3' - X-element 91 1 73.97 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCCGGAGTGGGAGGAATCAAAAGCCCAAACCGAATT:1 - chr3R 19989210 3' - hobo 23 1 65.47 CGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTTGCTGTATGTGTGGCACATTTCCCAGCATATTTTTTGTATTTTGCAATCCTTTGTCTCTCTGTTTTGAGCTCTGCTCTTTGTGTC:1 - chr3L 19432481 3' - HMS-Beagle 6829 2 64.38 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATACATTTTATCAATAATTAGCATAAAGTTATTGCATAAAGTTACCGGCACGAATTCGATTGGCCA:3 - chrX 18055705 3' - 297 6632 2 58.22 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATATATACATACATCCAGCGATTTCAAGGTTAGCCCGGCAAAAACTGACTTGTGCGGTAGCGCCATGCGCTCCTCCAGCAACATAGGAGTCCGGCG:1 - chr3R 15453627 3' - Transpac 4933 2 75.91 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTAATCCTAATCTTTTGGAAGAGGTTTTTAAGCTAGTT:1 - chr2L 3151001 3' + blood 7367 2 62.07 AGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACTGCCG:1 - chr3L 25232688 3' + accord2 207 1 82.88 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCTGTAACCAATCGAACTT:1 - chr3L 19510478 3' + pogo 2050 1 54.79 AACAACAGGTTAATGGGCCCAGCGCCCTAGGAGCTGCCTAAAGGAGAAACGTGTAGTGAAACTCAGGAGTTAGATTTTGGAAAAAATGGGGAAAAAGCTTGTGATTTAAGAAAAAACAAAACAGGAGGTTTATTTGTATGTGGGGG:1 + chr2L 12308580 3' + 1731 330 1 55.48 GAATAATTGCGTTTAATTAAGCTTAAATTTTACTGGCCGGTATATTTGATTCATTATTAAATTAGGCATGCTCGTGTCTTACTCTCTGGTTCTTGATCTTTTATATTAACATTTTTATTCATACTCTATGCAAATGCACCGAGAAC:1 + chr2L 7449288 3' + S-element 1637 2 70.55 ATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCATGTTGTTTAATATTTTCTTAAAGCAAC:1 - chr3R 18510126 3' - P-element 281 1 17.12 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCGAATATTTAAACACGTGTATATTTATATTTACACACGCATAGTTTTTGAGGTGACAGCTAAAATGAGGTATGTTTGTACATACAAATACTTTACAATAGTTGGAAACC:1 - chrX 20369321 3' + roo 9059 1 78.08 ATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGA:1 + chr3L 22638848 3' - Juan 4167 1 69.86 CGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGA:1 + chrX 21667928 3' - gypsy2 77 2 69.66 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCATCAATCAAACTGTCACCAATCGCAGCCTTAGTTTAAGTTGCCTGCATCCTTCTCCTCATCCGGATCCCCTCGATGTTATGGACATCAATTAGTCAATCCCCATG:1 + chrX 998270 3' + copia 240 1 74.48 AATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCTGAAAGCCAGCTGTTGCCAAAAATTGCAGGCTAATTGAATTTTCTAGCAGCAGCGCCATTTTG:1 - chr2L 3677580 3' - BS 52 1 57.53 ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGACTCCTTTTGAAAAACTCCCTTGCG:1 + chr2L 21082224 3' - mdg3 57 2 56.16 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATACGAATATTATACAAATAATAATGGCATATAAATGAAGTAACAAACATTGTTTTCCTTTGACATAACT:1 - chr2R 10915634 3' - F-element 65 1 58.22 CAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATATGCGACGGGGGCGTGTTCAATTTGCTTGATGGATGCCTGCCATTGCGGC:1 - chr3R 20720516 3' + 1731 4598 1 50.48 TACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATAGATACGATGTGTTGTTGCAACAGGACGTGACTTGGGTGACTAAGAATG:1 - chr3L 9317471 3' + HMS-Beagle 6976 2 66.44 TTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAG:1 - chr3R 15035060 3' - Stalker2 69 2 63.45 ATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACCAGCCAAAATCGACTGTTGCGCTGAACGGAGTGTAGATAAGCACTCTTAT:1 + chrX 21087715 3' + mdg3 242 2 66.44 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGAGTTAAATGGCACACGTATGAGAATATAATTACGAGGATATTATTAAATTTATTGAGCGACTGGAAGCGCGATTGGAAGGCGGCAACGGGGTTTCCCG:1 + chrX 9865054 3' + hobo 2937 1 73.02 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGAATAAATATTTACCGGGGACAAGGGGCGGGGGCGACGACCATTAAAATCATAAAAGATTACTTTTAAAAA:1 + chr2L 19907653 3' + hobo 2909 1 52.89 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACGTGGTGAGCGAG:1 - chrX 13642027 3' + P-element 2838 1 46.15 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACGAGTTGCGCAACCACAGCGCCCCCGCATACCAA:1 + chr2R 18786078 3' + roo 356 2 52.74 TGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATGATTGTGTTGTTTTGTGGCTGCACAGCCCACACTTTGCTGTTGTTGTTGTTGT:1 + chr3L 6472500 3' - Quasimodo 60 2 63.70 CAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCGTTCGTTTATGG:1 - chr2L 951293 3' - F-element 47 1 55.07 AGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACAAAACCCAAATGAAAGCAACCTACAAATTATACACACACACACACATACGAATATGATGATCGGATATATGTATATTTAAAGGATCAAAGAACATTTTAAGCAGCACC:1 - chrX 19767450 3' + copia 4757 1 76.71 TCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATCGGCACTTAAACAAAGGGCGTTGTTCAATATATAT:1 - chr3R 29952705 3' - invader4 81 2 71.92 AAATCGGAGGAAGCAAATTAATACCTTCGGAAGAGGACAGTTCTAGAACAGGAGAAGAGGTTCGAGAATTTTGTCTTGTTTAGTCATTTTGTCAGAAATTTTGTTTTCTATTTACGAGCTAATTAATGCGTCTTCACCGTCAGAAT:1 - chr3L 24248907 3' - Gypsy12A_LTR 2061 1 53.42 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGAATGGCATAAAGATTATTTTTGTAATTCA:1 - chr3L 19938447 3' + roo 9032 1 58.22 AGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACACACACTTGAACTGTGGACCAAAAAGCCGGTTGCACTGTTGGTTTTGTCATTTAGTTTCTAGACATTTGTTG:2 + chr3L 21765528 3' + gypsy 412 2 52.05 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAATGTA:1 - chr2R 5070910 3' - Tirant 8111 2 31.51 GTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGTGTGTGTGGGCGCTGGACAATCAAAATTGATAA:1 - chr2R 14486493 3' + 297 313 2 82.19 CAATGCATACTTCACCGTCGTGTCAGACGCCCGCGTGTGCCAAATCATCCACCCGGTTACTTTGTATTGAGTACTATTATTATTATTATTATTATGTAGTGAAACAAACATATACATTACACTTAAGAAACGCGTGAAGCACATTC:1 + chr2L 5310525 3' + Doc3-element 292 1 61.64 GAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTATGTATATAGTAATACATCAACAACGTGTAAAAGCGTTGAAATA:1 - chr3R 4570251 3' - Juan 64 1 65.38 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCATTGGTAAATACTTTTTTGGTAAATACTTTTTTTTTCAGTTGGGGCCGGTGGTCGGAAC:1 - chr2L 232360 3' - Doc 65 1 69.86 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACACACAGGGAATTCAATAAATA:1 + chr3R 18539874 3' + roo 338 2 67.12 ATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTTAGAGATTCTGGGGAAATACATCTCAAGTTTTGTATGGACGGCTTCCTAACATTTGCGTGCATAGAACCCACATC:1 - chr2R 5800451 3' + HMS-Beagle 6999 2 59.59 GGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGTACTTAGCTTGTTGGTATTGTGAAAAATGCTTTTAGTGTGTCGGTGCGTTGTGATTATTTTGATAT:1 + chr3R 7661205 3' + roo 45 2 54.79 CCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATACATTTAAATGTATACATTTGAATGCTTCTTTTTGCGTAAAATATTTATTTATATTTTGAACATTTTCTTCAGTAATAGTATTTCGGTTTAGTATTTTT:1 + chr2L 13156624 3' - Max-element 8248 2 72.39 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACGTACGTACTGTACATACTATTTACATACATACACACACCCGCACTTCCAACGCCATGTGCCAAACAGCTGATAAAGGCCATTGAAACTGAACT:1 + chr3R 17079539 3' + 1360 3360 1 65.75 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAATCGCAACTATTCTTGTTTTCTAGGCAGTGAAGC:1 - chr2R 20931621 3' - blood 52 2 53.42 CTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCATATAACTTGATTTGTTTTTATTTCCAAGTATGTT:1 - chr2L 22031986 3' - Tabor 88 2 80.82 GGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTGGGATGGGATGCCTAGCGGTGGTTCTGATTTACAGGCGACACAAATGC:1 + chr2L 19783746 3' - I-element 4972 1 67.12 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCCACCCCGACCCACATTTTTTTTTGGCATTCACATCCCCCGCCACTCACCAGTGGCAGCAAAAAA:1 + chr2L 17574466 3' - hopper 53 1 54.79 ATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCATACAAAATCTGGCAGCTTCCTGCCGCCGCGGCTACGC:1 + chr2L 19628480 3' + hobo 2856 1 73.97 TTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATTGCACTGTATTTAAGCCTATATTTCTGTATTATATATTCTGTATATTTTTATAAG:1 + chr3L 16563405 3' - I-element 66 1 65.75 AAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGATATTCCGAGTATACGTCCGT:1 - chr3L 21765394 3' - gypsy 7011 2 65.38 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGA:1 - chrX 19162564 3' + pogo 2056 1 52.74 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAACTTGAACTTGGTCGTAATATTTATGTGCATCGTAAAGGCCGAAAGTTGGAGCGACGCACTGAGAAAATGTTGTGAAATCAAATTTACACACAAACC:1 + chr3R 6603899 3' + pogo 2081 1 71.92 ATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCTTTATTATTAGTCTTGCTGGTTTCAATAGATATGC:1 - chr2R 7024410 3' + diver 186 2 68.37 GTCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCGGCATCCCCGAAGCTCGCCAAACACCTGAAAAGTATGCAATGAAAATTCTTTTGGTGCCTCTGCGGCTC:1 + chr3L 6542092 3' + hobo 2897 1 53.33 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATAGCCTAACACCAGGAGCAGCGTGGC:1 - chr3R 25094647 3' + P-element 2791 1 19.86 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAAAAACCGCCCAAAACACAAGTCTGCATTTATGCAGGCAACAGCCAATTCACTTGAAGGATACCCTGAAATTAACCAATAAACATTTTGTAATAAAAAGTTCAAAAGGTTGAG:1 - chr2L 16536455 3' - pogo 6 1 74.66 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGACAAACTCGGCTATCCGTCGAACCCAAACCATAATAGAGTGGTGATGGGGAGCATTTTATAAGTGCCCGAACTAAAGGAAATTCGAAAGATAGTTATTCAGCTCTCA:1 - chr3R 6603705 3' - pogo 10 1 75.69 CACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGAGAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAACCATCTTTCCCATCCCAACAGCACATGGCCAGGACAAGCTGGA:1 - chr3L 19693073 3' - 1360 417 1 71.92 AAAGAAAAAAAAAAACAAGAAAGGGAAACGGAAGAGCTGCGGTGCTCCCTGGCAAAAAACATTTCCATGTCAGTTTACATACTTAAATTAAA:1 + chr3R 22175246 3' + gypsy7 5013 1 78.26 ACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAACTCTCATGGAAAATCCGCAAACACACGATGGCAAACTTTTTTTTAAAACCCTTACCCAAACTTTCGGCAAATATGTTGCCAAACCTTTTTT:1 - chr2L 11587648 3' + Doc 77 1 59.59 GGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTAACACTTACTTGGAATATAAAAAATACTATTATAGAACAAGATTGCCAAGAAATAAATAAAAATGTAACAATTAACGCCAACAAAATAATAACAATAAAA:1 + chr3R 21187896 3' + Copia1_DM 154 1 65.07 GTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACATTATTTATTTTATTTTATAAAAATCAGTTTATATTTATCTTTCATAGAGTATGAAAAGAAGAAAGAGC:1 - chr3R 15719872 3' + hobo 56 1 53.42 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACCAGCCAAAATCGACTGTTGCGCTGAACGGAGTGTAGATAAGCACTCTT:1 + chrX 21087713 3' + mdg3 240 2 65.07 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACATATGTGTATGCAGATTGACATTTGACGTGCATAGAATTTGTCTAACTGTAGTTTTCCCTTTGCCAGAATGTTTGCCTCTTGT:1 - chr3R 8965110 3' + HMS-Beagle2 275 4 61.64 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCAGGCAGCAACAATATTTACAGCTTTA:1 - chr3L 11296561 3' + P-element 2791 1 20.55 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAACGATCCGATCCGATACGATACGATACGATACGATCCGATCCGAGCTAAAGTGTTAACCATTTTGCCAAGACGACTGCTCC:1 - chr2L 8699952 3' + P-element 2849 1 57.53 TCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTTTCATTGTTTGCTCCTTCATTCAGAAAATCGTCAAGCAATTACTAGTATAAGTAGA:1 + chr2R 18807910 3' + BS 5031 1 62.33 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATCGATCGTACATCTTAAAACGAAAATAATTACATTCGAAAAATGAAACTACAATATATGTAAGTACTTCATT:1 - chr2L 615216 3' - F-element 58 1 49.65 GATCTTATTCATTGATGTCTGTAGAGAAAGGAAGCTGCTGCTTTTGTCCGGACTGGAGTGTCAGGTGTTCGTGTTAAAATGCCAACTAATTTCAGTGTTTTGGGCCAAGAGCTGATAGCCAGGTTGGC:1 + chr3R 16767838 3' + Gypsy12A_LTR 2130 1 78.91 ACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTTGTTGATTTCCTAGGTGTATAAATTATACTTTATTTAATCTGCGATGACTGCGTAAAAGCTTTTTGCCCCGGCAAGCGAATCAAAAGTCC:1 + chr3L 9905866 3' - Juan 4057 1 63.70 CTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGATATGGAAAGGGTGCTGGCGCAAATTGCCGCAAATCCATTCTACAGCACCTTTGCTCCGT:1 + chr3R 15700432 3' - Transpac 58 2 57.53 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTATGGG:1 - chr3R 26405001 3' - hobo 53 1 53.79 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACGGTTTCAAAATGAATTTATTAAATAGCTTAATCAATAGCTTAAATAGCTAAAATGAGAAACGT:1 + chrX 19591246 3' + roo 9009 2 60.96 AATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAAATACACTTTACGAGATGTAACCTCTTACACGCACTCATTCCCTGTTCCTTTGTCACTTTCAGACTTTGACGAACTCTCACAGAAAATAAAAGGGAGCCACAACAATT:1 + chr2L 13763621 3' - Bari1 15 1 75.86 CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTATTTCAACAAATATAGAGGGAGAGAAGTAGGGGCACAGCTCCCTTTTGCATGTACATACAACGTTTTTAATTAAAAAATCCTTTGGTCAAGCAATTACC:1 - chr3L 13567926 3' - copia 14 2 74.64 ATAGTCGGCGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTCATTTTAAATTTCCATACATGGGAAGCGATATAATCGCTTGGTAAATTTACTTTTTGCCATGGTTATGCTTGCCAGATGCGTCAGCTTCTGAGGTATCCTCG:1 - chr3R 20908082 3' + INE-1 565 1 56.43 TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCATTTAAATGCAAAATGAAGTAAATTCCAACCATTGTGTTTCCCTGCTTAGGTTAGC:1 + chrX 12995447 3' - blood 7033 2 69.18 AAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCAAGACTAATCAAAAGTGTCTTTTCTACACTACAAGTAAAG:1 + chr2R 7024465 3' - diver 81 2 73.29 AATGGCGGAAGCTTGATGGTGGCAACCGACTCGACGACAGGAATAACGGTGCCTGCGCTGTTGACGCGTTGAATTTCACCAGAGTCAGGCGAAGTGGGCGGTCATTTGCACCGCTGAGCCGAGCTTATTTAAGCCGCG:1 + chr2L 7495569 3' - Chimpo 340 1 71.01 TNCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACATATATGAAGACTGGCACTTGAGCGGATAGAAGGAACGGCGGGGG:1 - chr2R 15892139 3' + hobo 2934 1 64.56 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCACATGCAGTCGACTCTATGAACCAAGAGAATGGCTTAGAACCCACCAAAGGAATCACTTAAAATGGTACTTATAGTACTTATAGTAATTTCACACCAATCTTTTTACAGTGATTTGGCA:1 - chr2L 15344569 3' + hobo 2937 1 56.85 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACACACAGGGAATTCAATAAATATATTTGGCTTAAAACAAAAGAACGTT:1 + chr3R 18539900 3' + roo 9028 1 54.11 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTAAAAATCATTTAAGCTTGCTAACTCCACCGAGAGTCTTTTGAGTCAGAA:1 - chr2L 15596925 3' + roo 342 2 69.93 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCATCAATCAAACTGTCACCAATCGCAGCCTTAGTTTAAGTTGCCTGCATCCTTCTCCTCATCCGGA:1 + chrX 998230 3' + copia 200 2 56.55 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATAATCGCATTTTACTCAGCTGCCCCAAGCCATAACTACGCAGTTTGATGAGTTACTTCTTCCGGTGCCGATTCCG:1 + chr2R 5800590 3' - HMS-Beagle 6838 2 58.90 TCCATTTCAAATTATACTCTTTTGCGATCTTCTTTTTAAGTTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTAAATAAATGTCATTATAACGGTGCACTGTTAGGTAATTTGGTTTTCTTTTAATGGTGTCCTTACTGGTTACACAAAA:1 + chr2L 13594279 3' + hopper2 1365 1 68.49 TAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATACAGGTATGAACTGCTTCAACTGCGTGCTTCTTGTGTATGCATTGCTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 16522507 3' + I-element 5289 1 58.22 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTATATCAAACATAGTTTAGAAAGTATAAACATAGAAACATAAGCAATGAGTAACCTATAAAATAATACGAAATATGA:1 - chrX 19736390 3' + pogo 2059 1 54.79 TAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAAATAAATGCTTATAAACATGTTGTAATCCTTTAAGTTTAAATTGCTTGTAAAATATACCATATTTTATATGAGTTCTTTTAAGGTTATAGTAGTAATAATTTTTTCCGTGCAGACAAATA:1 - chr3L 10733584 3' + 412 494 1 78.08 GATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGAAACAAATATGAGTTTCAAATTTGGT:1 - chr3L 13475486 3' + HMS-Beagle 202 2 55.48 AATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGAAGTTAAATAGAGTTTGTGGTGAACAATAAGAAATTTTTCCCAGT:1 - chr2R 22616853 3' - BS 5053 1 50.68 AACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATGTTACAGGTACTGTTGACGTTTTTGGGGAAAGGGTTGCCAGCTAATGCCGCAAACATCGTGCCGATGACAGAACTATTGTAGGTGATGAGCTCTGGGGTTTTCAACTGGGCCT:1 - chr2R 8467681 3' + roo 397 1 78.57 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATGCATATAGAGAAGAAAAAGACCCCCATCAGGGGGAATTAAAAAAACTGA:1 + chr3R 22676294 3' - 297 47 2 66.14 AGTATGTAAATGATTCTTGAATGTATCTTTTAGTTGGGAACCCATCGACAAAGATCCTATTTAGTAAGTTATTTAGTCGCTCGGGACAAATGGCCTATTTGGCGGCATTTGCATTGCACAATTCCCTCGACTTGGCCGAAAAGGAA:1 + chr2R 18646643 3' + transib4 288 1 73.29 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGG:1 - chr3L 12775953 3' + roo 358 2 53.10 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCATACGCGATG:1 + chr3R 25094681 3' - P-element 90 1 23.97 AAGATATTGTTGGGAATTTTTTTTACGTTTAATATTGCTTACTTCGATTTTTTTAAATTCTATAGGTTTCTCATTTATTAACTTTTTGGAAAAGTCCATCAGCTAACTTGGCTTACGTTTCCACTTAAGGGTTGACTTAGCTATTT:1 - chr3R 18496416 3' + INE-1 385 1 45.89 AAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTACATATGCACAGTAATCAATGGATTGATTATTATTGTTTATTATTGTTTATTATTATTTTGTTTATCTCGAACCTCAGCTGAAATAATCGCAAAAG:1 - chrX 8037617 3' - Quasimodo 17 2 74.66 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCCGGAGTGGG:1 - chr3R 19989235 3' - hobo 55 1 56.85 GCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGACACCTCCAACCACCACCTGCTTTCATCAAATTAAAGGTGAGTCAATTACGAATGCCGGCGAAAGTCCGACTCCCTTCGAGCTGTTCATATGCGCATAAATAAGCTCTTTTTGGCAGTTG:1 - chr3L 10138284 3' - F-element 487 1 73.97 TTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTTTGGACAGCCTGTTGGATTTAATTTGAGACTCTTCAGTTTGC:1 - chr2L 9988117 3' - hobo 78 1 70.55 CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATTTACACATATT:1 + chrX 21205086 3' - 1360 56 1 58.90 TCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAAAAGGGAATTTTAATTGGCTGTCTGTCGTTGTGTGCTAACGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTG:1 - chrX 7978947 3' - Tabor 22 2 69.18 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGAAGTTAAATAGAGTTTGTGGTGAACAATAAGAAATTTTTCCCAGTGCAGAGTGTAT:1 - chr2R 22616842 3' - BS 5042 1 58.22 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCGAATATTTAAACACGTGTATATTTATATTTACACACGCATAGTTTTTGAGGTGACAGCTAAAATGAGGTATGTTTGTACATACAAATACTTTAC:1 - chrX 20369335 3' + roo 9047 1 69.44 GCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTAC:2 + chrX 21667968 3' - gypsy2 6522 2 62.33 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACCTCTGGTTGGCGAAAATCGGAGATTGCATTATAAAAATCCAAGACATATTGCACAGTATGTGATAAGGAAAACAGCATTAAC:1 - chr2L 9499226 3' - Transpac 4954 2 54.79 AAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGAGACTTTTGCGCACTCTTATACAGA:1 + chr3R 9158286 3' - P-element 94 1 21.23 TAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGACGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCTAACTTAACTTCCAATTAACAGATGCAAGA:1 - chr3L 17710586 3' - I-element 58 1 50.00 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAGAACCAGGTGTCATCTCCATTTAAGTAATTGAGCGAAATATTTTTGCATTGTTCCAACAAATTGTGGGCGCGCACTGAGCTCATCT:1 - chr2R 11394063 3' - pogo 32 1 60.96 GCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGAATTGATATAATGTAATTGATAAAGATGCCAACTTCCTGCCATATTG:1 - chr3R 29429508 3' - F-element 221 1 63.85 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTGAGTC:1 + chr2L 20716429 3' - P-element 32 1 53.98 GCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCG:1 - chr2L 951304 3' - F-element 66 1 56.16 TGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCTGCATCA:1 - chr2L 15523911 3' + opus 7445 2 59.59 ATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAACCAAGTAATAATAAAACGTGGAAGCTTGCATCCATTACTTTGAGTATTTTC:2 - chr3R 18492894 3' - Juan 4094 1 63.01 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTCCATTTGGTGGCCGCCAGTTGGTAATGGCTG:1 - chr3L 1983473 3' + Transpac 5184 2 68.27 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGACAGGAGCCGAAGGCGAGGGGGCAGACTCCTCCCTCTTCATGG:1 + chr3L 13380516 3' + hobo 2900 1 57.01 TGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACAC:1 - chrX 17690474 3' - Doc 344 1 67.12 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTC:2 + chr3R 18860872 3' + roo 9006 2 63.01 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGC:1 - chrX 18193678 3' + hopper 1385 1 64.38 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAAAAACCGCTTTCTAAAACTGTATTTTTAGATATAACAAGTAAAAAATCGGAAAAATTTACCACGGGCTACTAGCTATTTTGTAGCTATTCTCGACTGAGCGT:1 - chr2R 11371222 3' - pogo 18 1 71.23 TGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTGGTCCTTGGTGGAGGCCCGTTCTCAATCCGTTGGCG:1 + chr2R 10666911 3' - hobo 84 1 74.48 TCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATTTTTAATGCGATGAAAGGAATGCGAGCGTATTTGCGAGTGTT:1 - chr3L 16523202 3' - jockey 83 1 69.18 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGAC:2 - chr2L 20327607 3' + roo 9005 2 63.01 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGAC:1 - chrX 16995045 3' - jockey 86 1 69.86 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGTAAATAAAAAATCGAATATACTTTATAATTAATTACCTGAGAAATCCAGTGAGGGAGCCAACATAGAATGTATACACTTATCACCTGCGGATTGAAAAGAAGGTG:1 - chr3L 18574777 3' - I-element 24 1 75.34 CGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTAGGCTGTACTTAAGCCCCCTCTGGTCGCCACCTCTGTGCTTATCTATGCCTATGTGTAGTTTACTTTCCCGCTCTGCACAGAAACCAATTGCTGT:1 + chr2R 8283624 3' + accord 165 2 67.12 ATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTCATACATACATATGTACATAGCAACAGCGATCTATGGCCTGTACATAGAGAAAATAACTTCCCTAGCATTTACTCGCGAAGCTGATTCGT:1 + chr2L 19135740 3' + Burdock 228 2 69.18 TGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCAC:1 + chr3R 9862950 3' - Stalker2 7338 2 78.08 AAGCTGGGGTCGGAAAAAAGGAATTTTTGAAATTGGAATTTTTTCCGACCTCAGCTTACTTGATCTGTTTTATTCGTATTAATCTGTTTTCTTTAATTATTGGTCGATATATCGCCTTAGAATATCGTGTCGAAAGTTTCAAAAGC:1 - chr2L 21631364 3' + FB 10 1 61.64 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGAGGCTATATCAAACTTGCCAAATGGTCGTTGAATGTTTTGCAT:2 - chr3R 15035000 3' - Stalker2 7258 2 78.77 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGAAATATTGAGATTTAAATTTCATCAAAGACTGTTTATAATAATAGAAGTCTAGACTTTTTGTAAGCGAGTTCA:1 - chr2R 10189246 3' - Doc 25 1 60.50 TTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGA:1 + chr2L 8807930 3' + HMS-Beagle 6971 2 67.81 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCAGGCAGCAACAATATTTACAGCTTTAGCGGCCAAAAGCACAGTGGGGCAAAAGATGTTTTAGGGAAAAAATTATTCATAATTGATG:1 - chr3L 11296501 3' + P-element 2851 1 61.64 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATTTTTCGCAG:1 + chr2R 8375137 3' + roo 9026 1 54.11 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGACCTAAACCGGATCGAATGGATATAGAGCCGCCCATTGTGAATCTAGCAACAATAAAACAGAGAGAACCCC:1 + chr2L 246688 3' - P-element 48 1 52.74 ACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAACTTTAAACTCCCC:1 - chr3L 3540084 3' + mdg3 5472 2 67.81 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTGAAAATCTTTAGAGATTTCGAGTGTTCTGGAAAGTAGGAAGTTTCCGGCTTCAGTGGGTTTTATGAGTAATTTGGCCCTGTGATAA:1 - chrX 7624023 3' - roo 33 2 63.70 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTATATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGTAGATGCTGGTC:1 + chr2L 19800973 3' + roo 9026 1 54.07 ACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGAAATATTAAATGCCTGCTGTAAGCGAAAATTCTAAACCTACAAGCAAACAAACTGCGGCACAAAACAAGC:1 + chr2L 22032070 3' + Tabor 7273 2 51.37 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCAACCGATTTACACCATAACAATACACGAGTTCGTCGTTTCGGTTTCCCCCAATGTTTAATACAAATA:1 - chr2L 21189709 3' + hobo 2932 1 72.00 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCAAAGTACAGCTCAAGTGAGGGCTCCTCCTTTGTAGAATAATTCTGTTTATATAAAGCGGGAAGCGACAATCTTTGTTTAG:1 - chr3L 1728430 3' - blood 41 2 57.53 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCTAACTTAACTTCCAATTAACAGATGCAAGACTTATTCAACCAA:1 - chr3L 17710573 3' - I-element 45 1 54.79 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGGACCGGACACTTGAGAGAGAGAGAATTCTCCGGCTCGGTTTCGGATTCGGGTTCGAGTCTGCGCTAAAGTTATATAGCGCGCCCACCTTTTTCCG:1 + chrX 13642156 3' - P-element 26 1 68.49 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTCATTGTGGCTTAATGCACAGTTCATAAAAATATATGACTGTAAATGCAAGTGCAATATTTGCTGGCTGTGTAAATATTTACACAAAATTTCTTTTGACT:1 - chr2L 2622604 3' + roo 9064 1 77.10 AACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATATATATATATATCCCTAAATTGTTAATCTGTAATCATATAGCACATGATAAG:1 - chrX 21405278 3' + flea 4948 1 71.23 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTGGGCAGGTTCAGATACATAGATACAAATAC:1 + chr2R 24021698 3' + pogo 2081 1 71.92 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACGTGGTGAGCGAGAGAGCGAGCAGAGGGGCATGTATTAAAGAGGAGGATGAGGAGCAGAGCTGCCCA:1 - chrX 13641973 3' + P-element 2876 1 78.08 TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGAATGGCTTTACTTGAAA:1 - chr2L 15096874 3' + jockey 4942 1 59.59 CGAATTTATACAAAATGAAATAATAATTAAGTAAAATTTTTTAATAATTTTAGGAAATAGGTAGGCTATCGTAGTTAAATTAGGTATAATATATGGTAAAATATATGGATAACATCATTTACTGGCTAAAGTGCGGCCCCAACTGC:1 - chr2R 4698780 3' + Tc1-2 379 1 41.78 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATATGGAGTTGTACTCTTAGTTTCATAATCATAGTCGGGACG:1 + chrX 22517722 3' + 1360 3357 1 54.11 CAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCG:1 + chrX 21667962 3' - gypsy2 40 2 58.22 ATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCGTTGTGATTGCAATACAATTATTGAAAGATTGTGATTAAAATAGATCATGGTTTTACAAGAAGTTTTTGTTTTACGAGACTTTTAAACCGCAAATTCGTTTGTGA:1 + chr3R 8293677 3' + Stalker2 7636 2 71.92 AGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACCATTTTCGCCATTCGCCGCCTCGGGCGTAATTTGTAAATCTCTGCAGGCGCAATTTATCTAAACATCCTTCGCTTCTCCATTTATCCCAGGAA:1 - chr2R 18467091 3' - roo 27 2 64.38 GTACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGG:1 - chr3R 178119 3' - BS 84 1 76.71 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGCAAATGAAAACTCAAGTGCAAAATG:1 + chrX 17508947 3' - Burdock 28 2 66.44 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATTTCAAGCTTATTAATATCAGATT:1 - chr2R 8375019 3' - roo 59 2 66.44 TTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACTCCAACATGTCAATAAAAGTGTATAATGCCTAAAAACAACACATATTACGTATACGCAATTTA:1 + chrX 18055823 3' + 297 6920 2 58.90 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTCTATCTATCTATCCATCTTAACAACCTACGACAAGAGTAATTACATTAATTCACGGGCACGCGCCGCTTCCTCGACTTCCGACTTTATCATCGCGGA:1 - chr2L 7595973 3' + mdg3 223 2 66.44 ACTCAAACATAAACTTGACTATTCATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCATCAATCAAACTGTCACCAATCGCAGCCAT:1 + chrX 998195 3' + copia 5079 2 70.00 CTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTTTTGTGAATACATGCATACCTACCCGAATAAACATAGGCGCAGCAAG:1 - chr3R 24760541 3' + pogo 2030 1 67.81 CGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATGTATTTACCTAATTGTGAGCCATGCCAAACTAAATACTTTCTCTACTTCAATTTAGTCTTTCACAATCAGCAATTGAAG:1 + chr2L 19217731 3' + springer 369 2 66.67 CTTCTTCATATTGAGCGTACACAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATAAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAATTTTTATAATGTGTGATATATCTACAAAAACAATTT:1 + chr2L 1229577 3' - Quasimodo 470 2 75.34 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCACACTACAAGCGCAGCCCCGCCCTCTCGCACGCACACACGGACAGGTACACCTGCCGAGGAGCTGCAGAG:1 - chr2L 15057155 3' + hobo 2892 1 58.45 TTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTTTGACCGCACAGTCAATTTAATTTTAATTTACACTTCATGCATAAAAAATTAAA:1 + chr3L 19434162 3' - Doc 74 1 71.23 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGCAGGTGAGTTTCCATTGTCCGCTGGTTCGGCTTTAATATTGATCGCAGGAGTAGTGCT:1 + chr3R 15363531 3' - 412 27 2 64.38 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTAATTACCAAACTGCTGAAATAATTATTGTGTTGGTTCTGTTTCTGTGTGAAGGATGAAATGGAAAGCAATTTAACGAGA:2 + chr3R 25053123 3' + pogo 2061 1 54.79 ATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTCAGGGCCAACGTCTGCTACGAAACTTGCCGGG:1 - chr2L 23372474 3' - gtwin 18 2 73.29 TAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATAGTTCCACAAAAGTGGCACTATGATCTCTCTCAGTCTTGGCACCCCTTTAAGTTCTAACTTTAAGTTCAG:1 + chr3R 29952844 3' + invader4 3075 2 77.40 ATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTGGTGGTGCGACGCTGATTAACGGAAGCATTACTCACAGTCCGGAAAATCTATGGTGGGGCACGATGGGGTATGCCAAGGGGGAATGA:1 + chr3R 27412890 3' - I-element 5211 1 65.22 AATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATCATAAGAGGCTTTGACAACTGGTTAACTTTATTGACG:1 - chr3R 17068909 3' + mdg1 340 2 71.23 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAGGACGAAGACGGCCCAGATTCCCAGGCTGTCTTCGATGCGGAGTGGAGTACCGAATGAACTCATCTTCTGCGGC:1 - chr2R 20303829 3' + mdg1 373 2 50.00 TCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAAAAATAAGAATTGGGGCGCAAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAA:1 - chr2R 3341947 3' - F-element 96 1 70.55 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTTGGTAAAACTGTCAATTTTTTTAGCAAGTTTTCTGTTTGAACGTGTAATCTTATGATTAAACTAACAAATTATTCACAAAGTGACA:1 + chrX 8358800 3' - Doc 25 1 67.67 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTATGATTTATTAAACATTTATTTGGCTTAATGAATTAATTTGATTTGATTTCGACAGCGTAACGGAAATGCCTGCGAGTGTGTGCGTGCGCCTTTGTCTGTGTGGGG:1 + chr3R 21591479 3' + Juan 4201 1 73.97 CGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCATTCATTCCACTCGAATTTAATGGCCAAACTCTATTCTGGCCAACACACA:1 - chrX 20106326 3' + hopper 1341 1 66.44 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTGTAATCGATATACATACAGGATATACCGAAGATTGTTTTCGTTAAAGAGGTGAAAATAATG:1 - chrX 10344759 3' + roo 9011 2 58.90 AGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCATGTTGACCCATGTTGCCACAAACGGTACAAAACTGCCACGCCCACACTTAAAAAATGGAAGGGAAGAAATGATTCGAAAGAATGCC:1 - chr2L 21873272 3' + INE-1 156 1 78.77 GATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTAGTTTGTTTTAAATTTTGCGTCTTTCTGATAATTCAACATCCAGCATT:1 - chr3R 15157560 3' - invader3 5237 2 58.22 TTCATTATTATTCTCATTTCACACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAAGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCG:1 + chr3L 25232860 3' - accord2 67 2 58.90 GCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGTTTGTTTGGAAAGTGCACTGCATTTTTCAGGTTACTAGGCTCAGTTGGAGAGTGGGGAGGGGGGCACTAGGGTCTA:1 + chr2R 13773140 3' + opus 476 2 66.17 ACTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTGTTTCGGCCCCCGTGTTATTGTTGCTTTTTCCCGGGGTGTGGGGAATCGTTTCCAAAGGCGGGAAATGCTTTTCACGCG:1 + chr2L 8627570 3' + hopper 143 11 79.61 TATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTT:1 - chr3R 15035057 3' - Stalker2 7315 2 61.64 TAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCTGCCATAAAACAGAGACTGTAAAATGTGCATAACTAGCTG:1 + chr3L 19398199 3' + gypsy5 7267 2 75.34 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGAGGCCGGAACACCGGTTTTCCATCGTGTAGATACTCCGGTTTCAGATAGAGTCCCTTGCAAGATCGTTT:1 - chr2R 12872872 3' - P-element 53 1 49.32 GTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGGATCGGGAGGGGTCTTCCCTGGGGGATTGGCGTGGCATATAAGGTTCGGAATAGGTTCGGTTAGGAATATGGTCTAAGGTTTTTTATAGCCACATCCAAATTTTGTTTTCCTT:1 + chrX 751720 3' - transib4 2399 1 50.00 TAAGAGCGAGATAGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTAGTTTGGTT:1 - chr3R 15157599 3' - invader3 90 2 67.81 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCA:1 + chr2R 12642749 3' - pogo 50 1 54.11 GAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGCGGATTGAAATGTATTTGAAAATGGCAATTTACGCACTGTTAGGGACAGTTCAAAAAAAGATTCAGCTGCAGGCATGGCACCCAGTGTGTCCCTTT:1 + chr3R 15035186 3' + Stalker2 376 2 66.44 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACCAGCCAAAATCGACTGTTGCGCTGAACGGAGTGTAGATAAGCACTTTTATCTTCC:1 + chrX 21087720 3' + mdg3 247 1 68.49 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATTTA:1 + chrX 21205078 3' - 1360 64 1 64.38 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGAACTCGGAATGGCTTTAGATAATGGTGCTATTGTTTTTGACATAAGTCTCTTTATAACTAGGAAAGTTTTTCGTTAAGAGTATTTTCGCTTCGTGTTATCAA:1 - chr3L 8704455 3' + blood 359 2 72.60 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTCGAAATTTGAAATTTGATTTGCCGATTGCCGTCACTCCACGGGCTTTGTATTCATTGTACA:1 + chr3R 18940613 3' + mdg1 7400 2 60.96 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATACGTATGTATGCAAAAGAATGGAACAACCCGCATTTAAACATAATTATAATTGG:1 + chr3R 14801290 3' + I-element 5284 1 63.70 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAATGTGCGTGGAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATGTTGCATACTTTTTGGGGTAATTTATGATTTCCAAGCACATGCCCG:1 - chr2L 12861681 3' - jockey 27 1 48.48 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTA:1 - chr3R 19589883 3' - BS 5026 1 60.96 TTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTTCGTCGTTTTGCCAAGGAGACGCTCCGCTCAAAGGG:1 - chr2L 20985793 3' - F-element 98 1 73.97 GCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACCTTGCTTAACTCGTTTGCCTTTTCAAATTGCACTCATACTTTTCCAATTTTGCTCAACGGTATTTTAGTTTACATATTTCATCTTTGCCACCTAC:1 + chr3R 11142321 3' + Max-element 8507 2 61.64 ACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAA:1 + chrX 17508905 3' - Burdock 6206 2 69.18 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCTGTAGGCTCACCTACTCCTCCTGCAATCGAAAAACAAAATCAACAG:1 + chr3L 5948099 3' + P-element 2815 1 35.62 TAATTATCATTATTATTATTATTATTGATGTTGTTGTTGTAGTAGTTCTTGTTGTGCTTGTTGTAGTAGAAGAAGAAGACTTTATCCTGCAAAATGATTGTGAAACCACATTGCATCACTTGGCACCGCCGGTCCTTGGCATGAGA:1 - chrX 13385424 3' - mdg1 44 2 75.34 ACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAAGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTGAAGGAG:1 + chr3L 25232873 3' - accord2 45 2 48.91 GTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAATGGCAG:1 + chr3R 22572658 3' - HMS-Beagle 54 2 54.86 AAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATT:2 + chr2R 5674727 3' - S-element 79 2 69.18 GAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCCTTCGATTGTTTCCTTATCCATTAGATACTCTATTTTCTCTCTGTGCAT:1 + chr3R 18860929 3' + roo 400 1 49.32 AACGTCGTGATCTCAGGAACTGTACAGGCTAGAAGGTTGACATTAAGAACACAGTTTACAGGGCCATAAAGGCAGCGCAATTTTGTTAGTGTGAGTGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGA:1 + chr2L 7112791 3' + INE-1 142 1 62.99 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCTGGTTTGCCGGCCATTTGGCGCTTGTATTGTTATTCCACTG:1 + chr3R 29623303 3' + roo 326 2 73.29 AGTCGGCGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTCATTTTAAATTTCCATACATGGGAAGCGATATAATCGCTTGGTAAATTTACTTTTTGCCATGGTTATGCTTGCCAGATGCGTCAGCTTCTGAGGTATCCTCGGGCAATG:1 - chr3R 20908075 3' + INE-1 567 1 59.31 AGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATGATTGTGTTGTTTTGTGGCTGCACAGCCCACACTT:1 + chr2L 19635047 3' - Quasimodo 78 2 76.03 AATCAAATTTCTTTTTTCGACGGTACAATGCTTTATGCGACCCATGACTTGAGGTTGTACTTGAAATGTGTATGCATATCGGCTAGTAACAAAAAATGGTTTCAATTAATCAGAATAATATGCATTCTTAATTTATAATGAAATAA:1 - chr3L 21444123 3' - Tc1 382 1 67.81 AGGGGGAGGAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCTTAAATGTGCAACCAAGTGATTGTGTGTTATTTAGTATTGGCATTGTTGTAAAATTTATTACATCACAA:1 - chr2L 19136860 3' + Burdock 6128 1 53.42 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGAGACTTTTGCGCACTCTTATACAGAACGACTAGTCTTATAATAGCTGAGAGAACAGAATGGCATTGC:2 + chr3R 9158328 3' - P-element 52 1 50.00 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAACTTGTGAGGAGCGCATACAAAACTAATTGAACTT:1 + chr3R 8965268 3' - HMS-Beagle 6827 2 64.38 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATT:1 - chr3R 7136596 3' + roo 322 2 75.34 TTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTACTTACCGGTGGTCGTGTGATATTTGTGGGCAAATATAACCACAAAGAAGGACGTTGCATACTTGGCGGCGTTGACCAGATGCGGAAATGACTCCTTTGTGT:1 + chr3L 5919199 3' - BS 5082 1 70.34 ATGATGTGTAACGGCCATACATAGTTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTTCGCTCGCTTACGCTAAGAGCGTAAGAAATCTAAATCGTGCCGATTCGCGATCCTGGCGG:1 + chrX 2487291 3' - 1360 3370 1 80.00 TTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATGCCA:1 - chr3L 11887200 3' - Doc 68 1 62.33 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTAC:1 - chrX 3637758 3' + roo 9019 2 51.37 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTCCTTGCCGGCGGCAGCATTCTGAGCGGGCTGCCCATTGCCGCCC:1 + chr2R 14450228 3' - roo 8725 2 65.38 GTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGTAATAAAGTAAAATCAAATCGAATTCGACTGTATGTG:1 - chr3R 6171096 3' + 297 6935 2 58.90 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGACTGCAGCAACAACAACCACACGGCAGAGTACAGGGCCGGTTGTTGGAGTGATCTTCATTTGGCAATTACA:1 - chr3R 17794475 3' + P-element 2880 2 78.08 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGTTCCAGGAAAGCAAAATGTGATCTACTTCCATTTTTTCCTGTAAATTAGAATTGTACAACATTTTTTTTACATTTTTTCCGGCGTGAACTATAGAATAT:1 + chr3L 14370706 3' - 412 16 2 68.57 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAA:1 + chr2L 18848785 3' - blood 7100 2 78.77 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCGAACGTCATCCTGCAGCAACCTTCGGGTGGTTTGCCACCCGCGCCCCCCTCAGATA:1 + chr3L 939723 3' - hobo 65 1 61.64 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACAGTAGACTATGTAGTAGTAAATGTTACCAATTTCGTTTCGGTTTTATGCCTCTGACTT:1 - chr2R 21244860 3' - roo 46 2 58.14 TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTATCTCAAGAATTCGCGAAGGACCAG:1 + chr2R 18056932 3' - blood 22 2 71.03 AGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACATATGTGTATGCAGATTGACATTTGACGTGCATAGAATTTGTCTAACTGTAGTTTTCCCTTTGC:1 - chr3R 8965129 3' + HMS-Beagle 6988 2 55.48 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGACTAACTAGATTGCTAACTTAACTTCCAATTAACAGATGCAAGACTTATTCAACCAAATTTAGCAAATTAAACTCG:1 - chr3L 17710554 3' - I-element 22 1 68.31 TTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGTATAATTTTAGCTCTCCGCTCGCAGAACACAGAGTATTGTATCTAGTGTGTATTGCTTGATTTTCAGGTGATCGCTTTGG:1 - chr3L 18237317 3' + S-element 1674 1 56.85 CCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTAT:1 - chr3R 9657676 3' - BS 58 1 59.59 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGTTGCATATAGATGGGCTGGCCCATGGGTGTGTGGGTAAATGGGTAACACATACGCATACATATATGCGA:1 - chr3R 28937761 3' - jockey 4699 1 68.49 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATAAGTTTCCTGCTT:1 - chrX 16857047 3' - pogo 53 1 54.79 ATATAGTTTTAAAGCCTAAGAATTTCTAAGATAAAGGCCATATTTAGTCAAATTTGATTCTCTCATAGCGCTTATTAAGGAGGCAGCAACTGGATGAGTCAGTTTGCAACCATATCCTTGTTGACATACTTAAATATATTTTGCTC:1 - 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P-element 89 1 24.14 GGAAAAGGCACAAAGGTCGAGGACAGACCAAATATCATCCTCTCACCGTGCTGGTGCCTAAGCAGAGGCTCTGGTGTCCGAGTCGAGGCGGTACAAACCTCCATCCGTATGTCAGTTCGCTGGCATTCTGAAGTTCTGAAATTCTT:1 + chr3R 24982614 3' + Rt1b 186 1 74.66 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAGATTGCAGTGAGCGTAGTGGGGGCCAAAAGAAAGGTGCCGCATA:1 - chr2L 16360513 3' + hobo 2932 1 77.40 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTACATAAGTTCTTTGTGGGCGCTCTTGTTTATGCAACACTTTTCTCCTTAAAAGATTTTTTCAATGAAAAGCTTGGCGATTGCCGCCGTTTCCTTTGTTTCG:1 + chr2R 18528832 3' + jockey 4966 1 69.18 GAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAGTTACTCTTACTCATTGCTTCCGCTTCGGCAGCAGAATTGGGCTATAATTACCAAGCTGCTGC:1 - chr3R 26693295 3' - Stalker2 12 2 70.34 TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGTTGAGATGGATCTTATTTTAGCACCCCTCATAAAGGATTCCCA:1 - chr2L 5333373 3' - mdg3 39 2 50.68 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGCAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGCCTGATACTTAACAGCTCAAACTCCTTTAATTCCATTATGATAGATTGATTCGATTGAACAGTTCCCTCCTAATCGTTATCAGTAAT:1 - chr3L 2240369 3' + roo 9039 1 63.01 GTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTACTCAGCCGTGATACGGGCCGAAGCGACCGAAAAAAGGGGTTACATAAGGGGGTCTGAAAT:1 + chr3R 902618 3' + R1A1-element 5275 1 58.22 GCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAGGGAGCACCGAACACATGTTAGACAATCAAAAAGAAAGGAAACCGAAAC:1 + chr2R 17341181 3' + hobo 2866 1 66.44 ATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGC:1 - chr3R 21276528 3' - BS 5052 1 54.11 TTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAACTTTACATTTTGCCTT:1 - chr2L 12325027 3' - jockey 4608 1 56.15 AAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCATATAACTTGATTTGTTTTTATTTCCAAGTATGTTCGTTATTGTTTACAATTTGTCCGAAATCTACATATT:1 - chr2L 22031950 3' - Tabor 6891 2 56.16 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTCAAGTCAATTGAGAATGAATACGTTTTCTTTGGGTTTTCT:1 - 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F-element 4557 1 71.23 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATAACAAGAACACACTTATTCAATTTGTGATTTTATCAAGGCTTGTG:1 + chrX 10429898 3' + roo 9034 1 59.59 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTCAGCAATGCTGTCTAGTCTAGAAATTAGGATCAACACATCATTCCTCAGCTATTTATT:1 - chr3L 13380437 3' - hobo 63 1 60.27 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAATTATTATTATCAAATAGACAGAGTTAAAGAAGTACACCCCAAAATGGTTATACTTTTCCCATACAAAAACACAAATAGACCGCAAATCTGAAGC:1 - chr3R 13201721 3' - 297 6600 2 69.86 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAAGGAAAAAACGAAAGTTGCCAATGGCGCAGGCG:1 - chr3R 7655589 3' - 412 7129 2 75.94 CTAAGAAGGACTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTATTTGGTTTGCAGGAGGGAACAGACCAGTGATTTTCAATATTTGCAGCGGGCTTACCTGGGCACAGGCCCATGCGCCATAACAGGTGTTGATATGTTTACAGAGTA:1 - chr3L 13294996 3' - I-element 5101 1 69.86 GATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACTTAAGTTAGTGTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATTTTTGTTTAACTTTGGTGTGTTTCATTCGAGTTAATCTTGGCCAACAGC:1 + chr3L 10548234 3' + I-element 5264 1 66.44 ATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTATCTATTGGTGAGTTGAGAAAAAAAAGTGTTTTGAAATGATTCACGA:1 + chrX 8461023 3' - 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chr3R 6578668 3' - F-element 86 1 69.86 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAACATAAATAATAGTTGTCGAATTTTGATGAGCTCCAGCATTTCGCCTGCTTCATTTTGGATTCCTGGCGCTTATACATGGTGATTTCACTTCCGTTGCTTATTTTGCCTAG:1 + chr2L 18671773 3' + mdg1 414 2 79.58 ATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGAATTAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTAATTGACAATAAATTATTGGATGGTTGTCGTGCTTTGAAAAATAAATCAAAAATTTGTCCAGTTTCTCCATTGACAGCCTGCC:1 + chr2R 18119120 3' + R1A1-element 79 1 57.53 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGCATACAACTCAATCATTTCGTTGTTGTTCGCCGTTGTGCAATTGTCTCGACCAATTTGTTTGTTCGTCAGTTCG:1 + chr3L 11228195 3' + pogo 2058 1 56.16 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTTTTCCGAAATTCAAATGGAGCCCCTTTCTAACACTTTTTCT:1 + chr3R 12540557 3' - roo 8740 2 71.92 AAAGAGCTGCCATAAGTTAATATGCTTTTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTACATTTCCGATATTTGGACAGTGTGAAAGCAATACGTTTTGTTACAAACATTTTAATTACGCAAAATATTTAT:1 - chr3R 11873327 3' - 412 7101 2 52.05 GNTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTACCAACGAATTTATGTTTTCAGCCATAAATTGCCAAACATATACGCCC:1 - chr2R 18927779 3' - 3S18 74 2 71.23 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTG:1 + chr2R 18056895 3' - blood 7071 2 58.90 AACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTGGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATAT:1 + chr3L 23871304 3' - Doc 96 1 76.71 ATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTGTACGCCACCTCAG:1 + chr3L 23489367 3' - 1360 158 1 79.45 TCATAATTTTTCTGGGATATCGCTAGATATTGGGAAAGATAAAATATCACATAATATAAATATAAATATAAATATTTTTTCCCATCGGATGTAGTCTTGGTTTCTAGTTGTTTCTAAGTCTGCCCTGTCAGTTTGCTTGCTACTTC:1 - chr2R 25218485 3' - INE-1 506 1 76.03 AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACACCCTACCCCATAACTTCCTAATACCGGCCGTTGTCAAGGAGTACACCTTGTCA:1 - chr3L 25496752 3' - mdg3 70 2 63.70 ACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTGAATGTCATTATTGTTGCGTTTGCTGCTTTATAGAAACAATTGCAAAATGCC:1 - chr2R 12185264 3' + accord 7375 2 76.71 GAAAATACTGGAAATTTGCATATTTTTTCGAGGCAAAGACAGCCAGCCATCGAGGGCGACAAGAAATTTAACAAAGTACAAATTGTTATTTGATTTGATTATATAATGACGCCACACATACCCCATCATCTGCCTTTTGCAATTTG:1 + chr3R 6014080 3' + hopper2 1556 1 69.86 AAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTAGAGTCTCTACTTTAATAGGTACTTCT:2 + chr3R 1048069 3' - Stalker2 50 2 51.37 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTTGCAGGAGCCGTCATTCCGTCGGGTTCAGTCTG:1 + chr3R 5767474 3' + roo 9018 2 53.42 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCAACATAGTCGCCACACACACACACACACACACACACAAGCAGACAGGCAGCTTAAACAACAATTTCCTCCATTTGCCATTAAAATACGCTTTAATT:1 + chrX 20106447 3' - hopper 20 1 65.75 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAG:1 - chrX 13642041 3' + P-element 2834 1 38.33 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTATGGGTGGTTGGTTCTACATCGGTGTGAGTTTAGTATCGTGT:1 - chr3R 26404964 3' - hobo 17 1 72.60 GGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAATGGCAGGCTGGCTGAACTACTACAATCTGAAGTGCCAACCG:2 + chr3R 22572693 3' - HMS-Beagle 21 2 71.23 TTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCAGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGT:1 - chr3R 15035059 3' - Stalker2 7317 2 63.01 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTTGGAGAAGGACACTTGAGCTGGTAGGATATGAGAGCGTATTATTTTGGCATAAAAACATGCATTT:1 + chr3R 25929447 3' + 297 6925 2 55.48 TTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTT:1 - chrX 16857072 3' - pogo 77 1 71.72 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATAAATAATACAAATTTAAAGTGAATTAGAAAATCCAGATCACAAATCGCTATTCTAGCTCAAGCTAACATACTCAGATCCTTTGAATATAAAACAGAACTTAACAGTTTGCT:1 + chr3R 12569735 3' + blood 7382 2 77.40 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGGCCAAGAAGGAAGTTGGGAAAAAATAGCAGTCG:1 - chr2R 14450144 3' + roo 9042 1 50.00 GCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATAGATATATTTCTCTTTATTTTCTTGCTTTGTGCAT:1 - chr3R 8884325 3' - HMS-Beagle 83 2 76.03 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGACTCCTTTTGAAAAACTCCCTTGCGTTCGCATTCCTCTCTTTGTGGC:2 + chr2L 21082246 3' - mdg3 35 2 62.33 ATTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAAAAAAAAATATGTCAATATGTCAATGCCAGTCAATATGATCTTCCTAAAACTTCTGTATCAAGGGAG:1 + chr2R 12992547 3' - F-element 70 1 56.85 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACACACAGCACGCTCTCGGTGGTACAGCCG:1 - chr2L 19681016 3' - hobo 51 1 74.53 TCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCGCTGGAAAGCATGCTCCGCTA:1 + chr2R 5899294 3' - jockey 4534 1 50.91 CAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAATAATACTACGACATTTTTGATAAAGATTGCTCTATTACATTGGCA:1 - chr3L 11228082 3' - pogo 70 1 69.18 AATAATAATATTAATGTTAATTATTACAATCTACTATAGCCTTAATTTAGATTAAC:1 + chrX 7374202 3' + mdg1 7081 2 44.64 AAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGC:1 - chr2L 10178012 3' - mdg3 86 2 73.97 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTCCAGTCATTTCCTTTCAATTTAATATTTATGAAATATATATATTCCATTCCGACAATATTGAAGTTCTTATCGA:1 + chrX 10344891 3' - roo 43 2 56.16 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCAGACTGAGCTGTGAGCACTCAATCATTTTATTTACTTATGCACCAGTGCACG:1 - chr2L 5732736 3' - hobo 69 1 63.70 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAATGCTAGCGTACTCTATAATTTAGCCACTCGAGTTAGCAGATTTATGGCATTTGGATTTTGACAGTCATTTTGGAACTTCTCAAGTGCTTAGCTGCGATCAT:1 - chr2R 12642590 3' + pogo 2084 1 73.97 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTC:1 + chr3R 5684161 3' + pogo 2036 1 65.75 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTACTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTC:1 + chrX 19744499 3' - P-element 69 1 38.36 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGCTATCTAACCGAGTTCCCTGTGGCAACGAGGCGTGGCAGGGG:1 + chr3R 12886068 3' + 412 442 2 67.23 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTTCGTCGTTTTGCCAAGGAGACGCTCCGCTCAAAGGGAGGAAGCGTTTA:1 - chr2L 20985781 3' - F-element 86 1 65.75 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTAATCCTAATCTTTTGGAAGAGGTTTTTAAGCTAGTTTTGGTAATCAAAATGGTTGTGTGACTTATCATTAATTTCAATA:1 - chr2L 3150958 3' + blood 368 2 78.77 TGATACGGACAGACGGACATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTTACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGATATGACCAAATTAACGA:1 + chrX 21587785 3' - INE-1 121 1 43.84 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCGTAAATAAATCATCTATACAATTAAATA:1 + chr3L 23456277 3' + 1360 3365 1 50.00 GATGTGCGTGGCAAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTGTAGGCTGACTCAGAGCCAAATGGCGTTGGATTCATGGCT:1 - chr3R 29719327 3' - hobo 63 1 63.01 AATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATCGGCACTTAAACAAAGGGCGTTGTTCAATATATATGGACGTACAAATTGGCAGTCGGTGCTCGTGGCCGGAAAAACGTAGCGGATTGCAATTAATTCCGCTCAG:1 - chr3R 29952636 3' - invader4 12 2 75.34 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTACTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAG:1 + chrX 7624126 3' + roo 8985 2 79.45 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCAAAAGTA:1 + chr3R 25409766 3' - jockey 4745 1 69.18 GTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGCGCCGGCAGAGATTTGATAAATACATAATTGCTATTTCGACAGATTATGGTTAATATTTTT:1 - chr2R 18698912 3' - Tabor 7205 2 65.97 TACGGACAGACGGACATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTTACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGATATGACCAAATTAACGACCT:1 + chrX 21587788 3' - INE-1 118 1 43.15 GCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACGCACATTTCGCCTCGTGTAGTTCAAGCGGTTTCTAATTTGCTTGCCGC:1 - 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mdg1 7060 2 70.55 AATTATGGGCTGCAATAAACATGTCACTGGACAGCATAAGTGGCAACTACAGCCGCGACCACGAAGGACACCTCGCCCGATAGATAGCGCAAGGGCATCACTCACACCTTGGAACCACGGCTAGGCAACATCGAACACGAC:1 + chr3L 23453282 3' + rooA 53 2 68.79 AAGATTATTATTATTATTGATATAATAATTTATAGTATTGGTTCTTGGCTCTTGCAGCGATTCATTTCGTTAGTTAAGCTTTTGGCCACATTTTTTCACAGTGCATCGATTGGCAGCAGCGAGTGTGTCAGCCAGGGGGAAGCTGC:1 - chr3R 19255338 3' - mdg1 7071 2 55.48 TCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCATGCCCTATTCGACATGACTCCCCAAAAAGAAGTAC:1 + chr3R 21661359 3' + invader2 103 2 76.03 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCACAATCGAATGTTTAAGTTAAGCATTTCAATTATAATAGGGAAAATTCTTTGACTTTTAGCTAGATTACCAAATTAAATGGCCACAA:1 - chr3R 14174657 3' - 297 6598 2 72.18 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAAGAGAAAAACATCTATGGGGAATGCA:1 - chr3R 30524446 3' - roo 8716 2 56.16 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGTATTTCTGTAGGTGGCTTGGTTTGTTTATTTTGTTGTGCACTGGCCGCAATTGAGAATTTCTATGGAAAATAGGACCAG:1 - chrX 17508789 3' + Burdock 217 2 59.59 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTACGTGTGTGCAAGGGTGACAGCTGTCGCCCCAGGGAGAGCACTGTAAGTGAGTAATATTTGTTTATG:1 - chr3R 17079403 3' - 1360 47 1 54.01 TTTTTTTTCTTCTCTTTTTTTGATAAAGAAATGTATTATGCATGCCGCCAACCACGGAAAGTCATCGATTGCCATGAATGACCTTGGGGAATGGCCATTACCAGGGCCGTCTTTATTCTATCGGCAGACGAG:1 + chr3L 19937057 3' - gypsy7 5006 1 76.52 AGTGGGTATGCATTCTTCCTTGGAGGCAGTGCGTTTTCATGGACTTCAGCTAAGCAGAGCGTCGTCGCCATGAGCAGCACAGAATCGAAGTGTACCCTGCCCTGTCCCCAAGTTGAACGAA:1 + chr2R 6115880 3' + Copia1_DM 3884 1 69.42 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGATATGGAAAGGGTGCTGGCGCAAATTGCCGCAAATCCATTCTACAGCACCTTTGCTCCGTTCTGTTCGCCGTCGATTTTACACCATTTCGTCTCTATAAGAG:1 + chr3R 15700474 3' - Transpac 14 2 72.22 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAAGTCGTTTTGTAGCTT:2 - chr2R 14921456 3' - pogo 42 1 56.85 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACATATGTATATGCTTGGGGGTGGGCCATGGGCG:1 + chrX 1726734 3' - 297 48 2 77.98 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGAGCAAAGAAGTCAAATATTAGCACAAACACATTTGTGCACATGCATACATACATATTTGTATCTACCCACATTGAGTTTTTGTGCGGATTGTAGCTACCTCGTAGGTACC:1 + chrX 19506225 3' + P-element 2878 2 79.45 AGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAG:1 + chr2R 12185454 3' - accord 25 2 65.75 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCCACCCTAACCCCGTTCTACCGGTAAAATGAGGATTTGTCTAACTTTTCCAAGTACTTAAGAGCTTAAGGTAAAAAAGTTTTTTTGGGTCTT:1 + chr3R 19989371 3' + hobo 2910 1 66.44 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTTAGAGATTCTGGGGAAATACATCTCAAGTTTTGTATGGACGGCTTCCTAACATTTGCGTGCATAGAACCCACATCTACATTAGC:1 - chr2R 5800442 3' + HMS-Beagle 212 4 64.38 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTTAGAGGTAGTCGTTGTGGAGCATAGTGCAATA:2 - chr2R 15529647 3' + roo 394 1 76.03 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAATTTAAGCTGTTAATGGCCCATTTGGTTTTTTTAAATGAACCAAAGGA:1 + chrX 10838627 3' + roo 9030 1 56.85 TAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCAAGACTAATCAAAAGTGTCTTTTCTACACTACAAGTAAAGGGTATAAATTAGCCACAAAACTCGAATAGGTTTTTTACTTATCTTCTATTCAATTATC:1 + chr2R 7024523 3' - diver 23 2 70.55 TTTCAAGTGAACAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCGTATAAAATCACTTGATTTTAGTGAAGTAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATGAAACGAGCTATAGGCACGTATATTCGTATATTCGTATGCCCAAAGGTTTT:1 + chr3R 8787878 3' + Doc3-element 6 1 67.12 CTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTTTTCTTTTAGAGGGTAAATTTTACTTTTGTTTTTTTACAAAATATTATTGGGTGCTTTTTATTG:1 - chr2R 4821182 3' - invader2 4852 1 64.38 ATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGAGTTTTTTTTTATTGTTTATGAGGTGGAACTGCAAATTCAAACTCAAGGAA:1 - chrX 4818514 3' - Bari1 69 1 64.38 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTCTTAAGTCTAGAACGGTACAAGTGCTGTCTGAAATGCTCTGCCTTAAATCTATGATATTCTTACGATATTAGCATTATGC:1 + chr3R 18514457 3' + pogo 2067 1 62.33 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGCACCCGCCTGAG:1 + chr2L 2622772 3' - roo 8696 2 63.45 AGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATATAATCGAGATGCCCTCTGAAAGCGTATAAAAAGTCAACCAGTGTTTTGTCAATT:2 + chr2L 10685917 3' - Quasimodo 26 2 68.49 TGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCTGCCACTCCCTCCCATGACATCCTTCTTCGCCCGTCTAGCCCA:1 + chrX 19992651 3' + copia 5045 2 72.60 TTTTTTTTTTATTTTTCGTGGGGCACGCCTTCGCCTTGGCCCTTTGACCT:1 - chrX 14479349 3' - gypsy2 394 1 86.00 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAACATAAATAATAGTTGTCGAATTTTGATGAGCTCCAGCATTTCGCCTGCTTCATTTTGGATTCCTGGCGCTTATACATGGTGATTTCACTTCCGTTGCTTATTTTGC:1 + chr2L 18671769 3' + mdg1 406 2 74.66 AATATCTTTTAAGCTAGACATTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAATGAATAATAAAAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAGGTGTTTTATTGTTTTTAAGGCACATTGTGTGAGTATTCGGTTTTAATTACCAGGCGAACA:1 - chrX 6952088 3' + G5A 2773 1 65.07 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAAGGAAAAAACGAAAGTTGCCAATGGCGCAGGCGAAAGGATAACTGAAAGAATGGAACTGAAATTAGAAAAGCAAAATGACACAGAAAGCGAGTGCGAA:1 - chr3R 7655524 3' - 412 23 2 66.21 AAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAATAAATTAAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGAAGTTGACAGAC:1 + chr2L 20985815 3' + F-element 4606 1 60.96 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGCTCGTTTACTTTTGTGCACAAAAGCCGAGACGCATAAATAACCGGCAACGGTCATTTTGCCGATGACAATGACG:1 - chr2L 1892258 3' + hobo 2909 1 61.24 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTG:2 + chr3L 3540257 3' - mdg3 5276 2 67.81 CAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCATACGCGATGATTGGTCCAAACT:1 + chr3R 25094694 3' - P-element 77 1 32.88 ATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTATTTCGTGT:1 + chr3R 2520356 3' + Tc1-2 1613 1 63.70 ATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTGTCATGTTATTGGAATGTTTGGCCCTGGTATTAGCGACAAACAGATAAAAAGGAAAAGAAGCAAACTAAAGTGGTGACG:1 - chr3L 7368772 3' - Burdock 6362 2 58.22 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGCCGCTGATGATGGGAAGCAATTA:1 + chrX 19744524 3' - P-element 44 1 55.48 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAAACATTAATATGCTGGCTGAAGTT:2 + chr3R 13198315 3' - Doc 34 1 65.75 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAGATATGTATATAAAGTATCGTGTGTCGTAGGACAGAAGCAGTCATGCCAAAAGGGTGAGCGGTTTGCGCT:1 - chr2R 17937110 3' - 297 6627 2 58.22 GAACAGGATCACTAGCCGAGTCAGTGTAGAAAAGGCAGTAATAACATATGGATTTCTATCAATATCTAACTAAATACAAAAATGTTTTCTTAAGCTCAATAGGTTTTTGTTTCCCTTTCACCTTAGAAAGTATCTTTATTTTCCAT:1 + chr2L 14085793 3' + INE-1 92 1 61.64 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATTTCAAGCTTATTAATATCAGATTGACAATCCTCAAATGTAGATTAGAAGTA:1 - chr2R 8374991 3' - roo 8695 2 61.64 GTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGAAACAAATATGAGTTTCAAATTTGGTATTTCAATGTGATAGTCT:1 - chr3L 13475468 3' + HMS-Beagle 7016 2 67.81 TGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTTGGGTTCTTTTAAAGGCACTGGCCCTGTTAGGTGGGCGTGTGAAATACTCGGAAAAAGGGACACGCACATTGTTTGATTG:1 - chr3R 23649110 3' - I-element 4954 1 56.85 ATGAACACACACACACACACACACACACACATTGCAGAACGTTCAACAGCAAAGCAAAAACGGAATATTTATGAACGCACCACGCGACGAGGGAAAGCGAAAATGCGCCAAACTTGAAATCAGTTGGCAATTATGAGATATTTTTA:1 + chr2R 17198324 3' + accord 181 2 72.60 AAAAAAAAAAACATTTAAATATCGTCTCGCTCATGTGTTTTTTTTTTCCTGATAAGAAAAAAGCATCACCTTTTTTTTTGGTGGGGCTTAAAAAATTGTCAGGAATATTTTTCCATTTTCTATTGCTG:1 + chrX 9010022 3' + Transib5 27 2 58.59 AGTACCTGAGATCTCGGCGTTCATGCGGGCATACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTCGACAAGAATATATATCCTTTATATGATCGGAAACGCTTCCTTCTACCTGTTCTATAGTTTTCAACGAATCTAGTATAC:1 - chr3R 28636010 3' - INE-1 141 1 76.03 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATATAAAATTAATGGCAATCTGGCAGCGTAAACACGACAAAATTTGTTTCTCTAGCCGTGTGCCGTGTGCCTTGGCCCATTGTCCCACAAGCAGATAGTTTTGTGT:1 + chr3R 18115001 3' - 297 13 2 76.71 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGGACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGCATATACATATTTGTATACGCGTAATAACTTGATTCCAAGCTCTGGCTGTTACGCCTGCTTTAATGCAAATGGAAAAAGCCAAC:1 + chr2R 11394220 3' + pogo 2067 1 56.12 TTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATGTATGTGTATATATATACGAGCAACCAACATTTGCTCGCCTTAAAAGCCAGTCGGCCACTAATGCCAACAGCTGGCGAC:1 - chr2L 19634945 3' + Quasimodo 7333 2 48.63 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCTGGTTTGCCGGCCATTTGGCGCTTGTATTGTTATTCCACTGCTCTTTAGCCGCGCTAATTGCAATACGATGCTGCATGGAGTGGAGCGATGTGGAGTGGAGT:1 - chr2L 21196352 3' + roo 388 2 71.23 TAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTGTTGACACACTGCTTTATATATGAAAACTATTT:1 - chr3L 15374602 3' - 3S18 43 2 57.53 GAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATTTTTAATGCGATGAAAGGAATGCGAGC:1 - chr3L 16523217 3' - jockey 98 1 79.45 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATTATGTGTTTAACATGTTTTAATGAACAGAAACTAACACGAGTCGGGCACACAAGGATGCATGTTCGAATGG:1 - chr3R 12885973 3' - 412 7088 2 54.20 TTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTTA:1 - chr2R 15529677 3' + roo 364 1 55.48 CAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGAGACTTTTGCGCACTCTTATACAGAACGAC:1 + chr3R 9158291 3' + P-element 2798 1 24.66 CTGCTTTTTAGCTGGTACGTATTAAAGTTTTTTTTGGCATCGTTGAGGTATTTGGTATTTGACTTCCGTTTTGACTTGCACTTTTGTTTCATGAATGTTGCCCAGAACCTAGAGAAAATAAGAAAAAATACGATGTCTTAAGAATC:1 - chr3R 4497674 3' - Fw2 402 1 67.81 TGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAATAAATTAAACGCTTCCTCCCTTTGAGCGGAGCGTCTCCTTGGCAAAACGAAGTTGACAGACTTTCTCGACAAGCTCGGAACTGAAAATGCCAGTTGTA:1 + chr2L 20985852 3' + F-element 4643 1 65.75 AGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCT:1 - chr2L 11047978 3' + Juan 4136 1 71.92 CCTGCCTCCCAGTGACAGAAGAACCCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATGTATTTACCTAATTGTGAGCCATGCCAAACTAAATACTTTCTCTACTT:1 + chr2L 19217700 3' + springer 315 2 64.34 CAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATTGGTAAATTTAATTTGAAGACTGTACTAATATCTACCTCTATCTAATATCTATAATATCTATGGTAAACTGTTTTACGTTTACTGCTTAATATTATTATT:1 - chr2L 10687549 3' + Quasimodo 6967 2 46.58 TATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGACCGAATTATTATTCAATGTTTACTATTGAAAATAACTTATATGACATGCGAGTG:1 - chr2L 951328 3' - F-element 77 1 68.42 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAACTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCCCACATATCAATGATATGAATAATATATTTT:1 + chr3R 25414269 3' - pogo 60 1 73.11 ACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCAGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATCTTTTTCTTTTGAAGAGTACGCAAAAGGGTTAAATGCATTTTGTTTACCCGCGCAATC:1 + chr3R 14037310 3' - 1360 3217 1 60.27 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATC:1 - chr2R 18266003 3' - roo 58 2 60.27 CCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTTGGAAAATTGCAGTAAGGAAATGCGATGTCCTCGTTGC:1 - chr3R 26265653 3' - F-element 4211 1 64.76 CAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGGTAAGTCTATTAAAAATCTATATATTGTTCTAGGAAGACGTATTTACGTACATTTTTTTAGCCAC:1 - chr2L 21082114 3' + mdg3 189 2 54.79 AACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTATTTTTGTGGCTGCACACATGTTTGCGCAACAGGAAGTTGATTGCTAACAAAGCGGAAGCCCCAGCAACCGCC:1 + chr3R 11873484 3' + 412 7531 2 74.13 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGACAGGAGCCGAAGTCGATGGGGCAGACTCCTCCATCTTCATGGGTTCCACTGCCAGAGTCTCCTTTTCGGAA:1 + chr3L 13380545 3' + hobo 2922 1 66.67 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACAGTAGACTATGTAGTAGTAAATGTTA:1 - chr2R 21244892 3' - roo 8735 2 81.97 CAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGGCTTAACAGCTTTTGGCTGTTTGTAGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAGAGTTTTTTCGCATTTACCCATTTACTCGTAGAGTACAAAAAGGGTACAAAAATGTAAAAATGTATAGAGAGAAAGT:1 - chrX 22486176 3' - INE-1 259 1 50.68 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATACATATAGGCGGAAAAGCGACAGCAGCAATACTAAGAAAAAGAAAA:1 + chr2L 9109935 3' + opus 428 2 69.86 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAACGATCCGATCCGATACGATACGATACGATACGATCCGATCCGAGCAAAAGTGTTAACAATTTTGCCAAGACGACTGCTCCGCTGCAATATTATTA:1 - chr2L 8699937 3' + P-element 2864 1 67.81 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGTTATAATTTTGTTTGTTTATTAGTTGCAGCAAGCCGA:1 + chrX 13558258 3' - mdg3 83 2 75.34 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACCATTTTCGCCATTCGCCGCCTCGGGCGTAATTTGTAAATCTCTGCAGGCGCAATTTATCTAAACATCCTTCGCTTC:1 - chr2R 18467108 3' - roo 8708 2 52.74 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGAGAGTAAGGTAGATAGGGAGCTTTTGGAGCTGCTCTAGAGTTGCCAGGTGGGCGTAAAATTCCAT:1 + chr2R 16031448 3' - hobo 56 1 55.48 ATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGCTGCTGCTGCTGGTAGCGTACGTAGTACTGGTAGTACTGCTGATACTGCTGCTGGTAAGCAGCATTTTGGTTGGCATACCAGGCATAATTGCTCCACTGCTGGGCG:1 + chr2L 10842075 3' - 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chr2R 24211511 3' + flea 218 2 60.96 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCAACCGATTTACACCATAACAATACACGAGTTCGTCGTTTCGGTTTCCCCCAATGTTTAACACAAATATT:1 - chr2L 21189707 3' + hobo 2931 1 69.90 GAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAGTACTATACTATGATTTAATTGAGCTCAAACATAACAAAAACTTATAT:1 + chrX 9874210 3' + BS 5015 1 65.75 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGACGAGGAGGAGGTGG:1 - chr2L 20327594 3' + roo 9018 2 54.11 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAAAGAGAGCGG:2 - chrX 1831249 3' + P-element 2804 1 28.77 CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATGAAATGCGAGTATAAGAGCTAAGGTATTGTTTTGTAAAGATCGAAATATGCGTCAAATTGTTTCGATAGTAAGCTAAAATGAAGTCTAG:1 + chr3R 20840703 3' - BS 5027 1 54.79 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTATGGCAGTGTCAGCTTTTCAAAATGTGCACATCAATCAGGAAA:1 - 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mdg1 7072 2 66.44 TTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTTGGGAGAAATAATAGTTAGATATTTGTGCTGCGG:1 - chr2L 245104 3' - P-element 129 1 26.71 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCAGGCAGCAACAATATTTACAGC:1 - chr3L 11296565 3' + P-element 2787 1 17.81 TGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATC:1 + chr3L 3540226 3' - mdg3 41 2 52.05 GGAATGTACGCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAATTTGCAGTTCCACAATAATAGGAATGAATAAAAGGTGT:1 - chr3R 14213640 3' + mdg1 338 2 72.60 CAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGCGGTTGGGCGTGAGCGGGAGAGCGTGTGGAAAACAAGTGCCAGCTGACTGACT:1 - chr2L 11638973 3' - springer 7172 2 59.59 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAATCCACACAATGCAATTTATTATAGCATACTTAACAGCGCACTACAATGGACCTAT:1 - chr3R 22266378 3' + roo 404 1 76.71 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTGTAGGCTGACTCAGAGCCAAATGGCGTTG:1 - chr3R 29719338 3' - hobo 66 1 70.29 CTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGGCGGGGAACGCGACTATAGCTTTCGGTGAGTGGTTTTGCGAGTTGGAATTTTACATGAGTAGCTATTAAAGTAGGTGGTTCCGTTG:1 - chrX 16837955 3' + INE-1 543 1 80.36 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTGATAACTTGGCAGTTAACATTTATTCAAATGAATATATGCCCTTATTAAATATAAAATGACAACACTGC:1 - chr3L 10141081 3' - F-element 62 1 56.16 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTGTAATCGATATACATACAGGATATACCGAAGATTGTTTTCGTTAAAGAGGTGAAAATAATGCAACAATGAATAAATTTTGATTTTAACATTTACGAGCATGAAACGTATGA:1 - chrX 10344709 3' + roo 404 1 52.14 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCGTTCGTTTATGGAAAATCCGCG:1 - chr2L 951283 3' - F-element 45 1 58.90 TGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATAGTGTTTGGTTAAAGTTGACTTAGTAATGTTTACCTCTCTCTGTTTACTTA:1 + chr2L 1922581 3' - BS 5067 1 67.81 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAA:1 - chr3R 21276547 3' - BS 5071 1 67.12 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACGATAGAGAGACGATGGAGACCGGCACACAGAAATATATTGGGTCTATAAATCAAGGAATTACTGCGGATATTGAAAACATAATGGCA:1 + chr2R 18467254 3' + roo 402 1 73.33 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGAATTTATGTTTCTATAAGTGGACAAAACTAAACTATTGCATATGCTTATGATCACAAGTTATCCTTAAACACCTTGATTACCTGCCA:1 + chr2R 11610011 3' - roo 33 2 60.96 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGATGTTGTTGTTGTTGATGTTGTTTCTACTACTCTACTGCTACTACTACATACTCATAAGCCTCTCTAAATACCGCAA:1 - chr3L 13778525 3' - I-element 46 1 54.11 TAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATACATATATATATATTCATGACTTTTTTAGACTGACTTTTTAACACTGAGTTTT:2 + chrX 19766812 3' + copia 187 2 67.81 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTGAAAAGAATCCAAAAGGATTCTGGCGCGATAATTAAATGCGCACAGGAAGCGAAACTTTTTCACCCAAGTTGCGGTGCGTTGCGACTAATTGCATTAAAGTGT:1 + chr3R 26139556 3' - mdg1 7044 2 78.36 AGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAAAAACCTAGTCGTAAATCAAAAGAATGTGGGACAGGCACGGGGAGAGAGGACAGAGGGGTACTAGGATAAATCGGATAGAGACAGATGAAACGC:1 + chr2L 9988231 3' + hobo 2938 1 76.47 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACACACAGCACGCTCTCGGTGGTACAGCCGCTGGCAGCTTAAATGTTTTTTGAATTTAAAC:1 - chr2L 19680985 3' - hobo 60 1 60.27 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGAACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTGGATAACTGAAGAACAAATGACATTAGATGTATACCTAAATGGTTAAATTAATTTAAAAAA:1 + chr2R 14921585 3' + pogo 2046 1 57.53 CTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACC:2 - chr3R 19537471 3' + hopper2 1555 1 52.05 CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCATATAACTTGATTTGTTTTTATTTCCAAGTATGTTCGTTATTGTTTACAATTTGTCCGAAATCTACATATTATGGAGAGG:1 - chr2L 22031941 3' - Tabor 6882 2 56.16 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATATATACATATTTTTTCTTGCTCTGCAGCTTTTGTTGTCGCCTGTCTGCAGATG:1 + chr2R 17317664 3' - hobo 57 1 62.04 GAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCATCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGCCCCTATTAGGTTAAAAAAAAACTTCTGGCCAAAGAATATTCACTAGATGAAATAATTGAAACATGTCAAGTGG:1 - chr3L 25730668 3' + Cr1a 4390 1 53.62 CCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACTCCCAAAATTTACGTACCAGTTCCTCCAGACGGATGACCTCATCAGGCATTTGAGGTG:1 + chr3L 25987841 3' + Stalker 7165 4 65.07 GGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGACGCTCATGCTTGGGCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAAAATAA:1 + chrX 21772506 3' - springer 50 2 58.49 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAATGTGCGTGGAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATGTTGCATACTTTTTGGGGGAATTTATGATTTCCAAGCACATGCCCGTGGGGCGGGGTGAAAACCCAGCAGGACTCGG:1 - chr2L 12861650 3' - jockey 10 1 63.70 CTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAATAAAGCTATTTTCAA:1 - chr3L 19951159 3' - Ivk 36 1 60.96 TAAATTAAACGCAAATTTAAATAAATTAAATTAAACTTCGTTCCATACGTACGTTAAACTTTAATGGTAAATTTAAAGAAATATTTGTTAGCTACTTTCCAAACCACATCTCTATCGGAAACCAG:1 + chr3L 8198183 3' + HeT-A 325 1 60.00 GAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTCAGGATATTAAAGCATTCAACCAACGCCACCTTGAACCATTAAGC:1 + chr2L 17372005 3' + mdg1 7211 2 69.18 GTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATGCGAGTACCGCAGGAGGAGTGTGGCAAATATTGGCTGTGGGTGTTGCATACCCCCGG:1 + chr3R 23968667 3' + HMS-Beagle 6989 2 57.46 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGAACTCGGAATGGCTTTAGATAATGGTGCTATTGTTTTTGACATAAGTCTCTTTATAACTAGGAAAGTTTTTCGTTAAGAGTA:1 - chr3L 8704475 3' + blood 7351 2 58.90 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGTTTTACCAAA:1 - chr2L 5656533 3' - hobo 51 1 50.34 CCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTAGCCCGTCTTGGCGAACAAAACTTTTTTCGTG:1 + chr2L 2675033 3' - Quasimodo 83 2 77.40 TGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTGTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGGCCATTTTTAGGCGAAATGGTTAGCTAAACTTGTAGCG:1 + chr2R 12432934 3' + pogo 1723 1 68.97 ACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACTCTGTTGTTTTTTTTATGTATATTTGTTAAGCTGCAATTGTTCCCCTTTCGCTGACCCATTAATGCATTTCACTCGCCAGTGATATTTGCTCA:1 + chr2R 20361486 3' + INE-1 540 1 93.15 CTCTGTCATCGGTATTAGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTTTTTGCTGCTTCTACAAGTGCTGATCATGCGGCGCCTTGTCTTCGTTGTCTTGTGATTCCTTCACACTGGACCACGTACTAACTC:1 + chr3R 2975497 3' - Porto1 4491 1 55.48 TGTAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTAAGGATATCAAATCAAATAACCTCTGGGCCAACCGAAAGCGAGGAAAACTCCAGCCTGAGGGCAATTAAGCCGGAGGAAAATCAC:1 + chr2L 19195984 3' - Cr1a 4190 1 53.42 TGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCTAACTTAAC:1 - chr3L 17710607 3' - I-element 79 1 68.49 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATAAATATTTTATGGCCCGTGTAAGTTATGAATAGCAAAGGTAACCCATAAGTATGCAACAGTCGCTGGAATTTTTCTGAAATCGAATCCCT:1 - chr2R 22040874 3' - jockey 37 1 60.96 ATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACGCTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGAAACCCTCGATTCGGGTCCAATCGGCCACTTACTGCTTGGTCATGATGCTGGAGTAGAGCAGAC:1 + chr3R 10741198 3' - 1360 3354 1 57.53 ACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGATCAACATATTTTAATTCTTAATTAAAATTTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGAATATGGATAGAAAAGTAATTGAACACAGCTCATCTATACTGAATACA:1 - chr2R 4478818 3' + Doc 98 1 76.71 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTCCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTAT:1 + chrX 8610346 3' - mdg3 5284 2 61.64 TTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGTTGTTGTTGGAAGTGGAATAGTTGTTGTTGTGGGTTGTGTTGAAGTGGTCGAGACTTG:1 + chrX 4244859 3' - I-element 5168 1 64.38 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCACACTACAAGCGCAGCCCCGCTCTCTCGCACGCACACACGGACAGGTACACCTGCC:1 - chr2L 15057169 3' + hobo 2906 1 60.53 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGAGGCCGGAACACCGGTTTTCCATCGTGTAGATACTCCGGTTTCAGATAGAGTCCCTTGCAAGATCG:1 - chr2R 12872875 3' - P-element 56 1 47.26 GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTACACACCACTGGATCTCCAAGGTGGCCCTGATTCACTCGAATC:1 + chr3L 18574902 3' + I-element 5278 1 70.55 AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAAGAGTCCATATATATATTTAATGAAGCTTTTTTGGTGGTCCGTCGCATATAAATATGTTTTTATATGACACGACCCACAAGCAAATTGTTATTCAATTTATTTATTGGGAGAA:1 + chr3L 20910149 3' - F-element 22 1 69.86 AAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGATATTTATTATGTGACATTATGTACACAGATTCGACTATTACTATTTCTAAGCTATATTTAAATAATAATAACAGGGAGCTATACGAAAGTATCTGAACCTCAAACTGTGAGCTCGTTG:1 - chr2L 6816717 3' - 1360 387 1 67.12 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGCCTTTCATATGGTGCAGATACACTTCCGCTGGCT:1 + chr2L 20068050 3' + roo 8985 2 81.51 AAATGAAATGATTTATTTTTAAGTTCTCTTCGAAAAACTTGAGTTCACTTCTTATTGGAGTGTTTTTGGCCAATGTCTGCTAAAGTTTTGACT:1 - chr3L 18490045 3' - FB 697 2 67.74 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAAGGGATAGGAAGCGTTTTGATATGATGGATACGGGGCTGCCGTGTGTAATGGGCA:1 - chr3R 5767373 3' - roo 8730 2 64.14 CCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAACACTCGGAAAAAAGTAAAGTAAATTTAATATTCGGATTTCAAAACTATTTAATTAAATAAAA:1 + chr2R 22372569 3' + I-element 5299 1 56.85 GGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGACTTTGTGTCATAAACACCACTGAAATGGAGCGC:1 + chrX 10561801 3' - jockey 4759 1 78.77 TATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGC:1 + chrX 22715121 3' + opus 7423 2 75.86 TTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGCGTCTGCTGCTGGTGTTGCTGTCTCTGCCCACAATTATTAAATATTTAAAGCCATATACAAAACGTTTTTGGGTTTAACGTTATACTCT:1 - chr3L 7370427 3' + Burdock 6361 2 65.07 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTA:2 + chr3L 3540192 3' - mdg3 5327 2 75.34 CAAGTAATCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGTCTTTAAGTTGGTTTTAAATCGCTTAAACAAAAGAAT:1 - chr2L 17162650 3' + R1A1-element 5164 1 73.29 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATT:1 - chr2R 10666856 3' + hobo 2890 1 61.74 TGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTACATATATGTGGGGTACTTGCGGACCCTGATAGCATTCGCACCTTATCGCTATAGTGGCTCTGTGTACATTATAATTATTATTGCACGC:1 - chr3R 8810606 3' + 297 370 2 69.18 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGAGCAAAGAAGTCAAATATTAGCACAAACACATTTGTGCACATGCATACATACATATTTGTATCTACCCACATTGAG:1 + chrX 19506191 3' + P-element 2844 1 56.16 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGAGCAAAGAAGTCAAATATTAGCACAAACACATT:1 + chrX 19506148 3' + P-element 2801 1 26.71 TAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGAC:1 - chr2L 951320 3' - F-element 82 1 67.12 GGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGTTGGGTGTTAAACTTTGCTATAGCCTCGTGGAAATTAA:1 + chr2L 15096940 3' - jockey 4754 1 73.97 TTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGCTTGTTTGCCTACACTTTCC:1 + chrX 22715150 3' + opus 448 2 56.16 ATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATGCGAGTACCGCAGGAGGAGTGTGGCAAATATTGGCTGTGGGTGTTGCATACCCCCGGGCGTGCCGCTACTCGGTCGCTCATCA:1 + chr3R 23968693 3' + HMS-Beagle 7003 2 54.79 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAACGAGAGCGGCGAGAAGAGAGCGC:1 - chrX 1831235 3' + P-element 2833 1 41.22 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTTTGTATTGTTTCCCATTTCAAATCTTCCAGAAACATT:1 + chr2L 13102943 3' - roo 82 2 76.03 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTT:1 + chr3R 18860876 3' + roo 346 2 60.27 CAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACAGTAGACCGGCATTATGTTTGTGCCCCATTTTGTGGAAGCCCACTTGCTCTCTTTCCGCCATTAATGGGCGCGGGCGGTGGGTGGTGGGTG:1 + chr2L 3393873 3' + Stalker2 384 2 65.22 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAAAGTTTATATTTATTACTATTAAAAGTACCATTTTATTTAATGTGAAGTACCAATATTTTGTTCGGTGC:1 - chr2R 11609844 3' + roo 386 2 69.86 GCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGG:1 - chr3R 19537453 3' + hopper 1380 1 61.64 GCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGTATCTCCGGCATGTGCGTATCTCCAGTTCGTGCACCTTGAGTGTAATTTAAAT:1 + chr2L 10178082 3' + mdg3 179 2 63.01 ANACAAAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATATTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGAGCAGGCCGAGGCAATTGCAAATCC:1 + chr3R 20720616 3' - 1731 4364 2 51.37 CAGTGCTGTCCTCTACCCACTAAAATATAATTTTTTATTATTTTTATAATTTATTCCCCTTTTAAATATACGAATTAACTTAACCAAACTCACTTTTTAATGTTAAACACTTGAATACATTAAAGCCATTGAATCAGACGATCGCA:1 + chr3L 5425258 3' - HB 349 1 68.49 TGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGTATCTCCGGCATGTGCGTATCTCCAGTTCGTGCACCTTGAGTGTAATTTAAATACAAACGAATGAATTTATGAAGTGCCGGATATACGGATGCTGTGCAAACATA:1 + chr2L 10178134 3' + mdg3 5483 2 73.29 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGC:1 + chr3L 3540260 3' - mdg3 5273 2 69.86 GTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATATAATACCGAATATTGAATAATTTCTTTGGAAATAAATTCTCAATTTAACAAGCATGTTCGAAATGTATTTTTAGACATGCCCGACTTCTTTCTGTG:1 + chr3R 23714164 3' - I-element 22 1 68.97 CGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGCTTCATGACCGTTTTTTCGGTTTCTCCATCGGGG:1 - chr3R 26658172 3' + hobo 2851 1 78.32 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCC:3 + chr3R 18860881 3' + roo 351 2 56.85 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCATGACCGTTTTTTCGGTTTCTCCATCGGGGAAATCTGGCCACTTGGCTGCAAATGGAATTGCCATTAA:1 - chr3R 26658134 3' + hobo 2924 1 67.59 GGTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGG:1 + chr3L 23839703 3' - McClintock 6032 2 75.34 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCGTAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATGCAAACATGCATTTCACATGGGGATACATTT:1 + chr3L 5329160 3' - 412 78 2 74.44 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTCTTTGTCCTTTTCCGCCTGATATCCCGTTGAGCACACACTG:1 + chr2L 2518611 3' - jockey 35 1 63.01 CAAAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGGTTCCTGTTG:1 + chr3R 13572096 3' + 412 424 2 67.91 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAACCTTTATGCAGGGGCATGACTGTCAGCACG:1 + chr2L 12696264 3' + pogo 2075 1 67.81 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTTAGATTAAATATTTTTAAGGTTAACAAGACAATAATTTATGCTTATTTT:1 - chr3R 26349364 3' - mdg3 71 2 65.75 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATACGAATTGCAGGCACTGTGCGATGTTATGGGTTTTGATTAATTGGAAGTGTTGTTTGACTTGGCCGATTTTGGGGGGTCGTCCCAC:1 - chr3L 5329063 3' + 412 7511 2 60.96 AGTCTCTTCCGAAAGACGAAGAAGTGGCGATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAGCGTACCCGCTACCGCTCCGCCCCCCCCAAAAACGAATGCTATTTG:1 - chr3L 5699599 3' - diver2 222 2 64.35 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGACAGGAGCCGAAGTCGATGGGGCAGACTCCTCCATCTTCATGGGGTCCACTGCCAGAGTCTCCTTTT:1 + chr3L 13380540 3' + hobo 2931 1 69.00 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATTGCACTGTATTTAAGCCTATATTTCTGTATTATATAT:2 + chr3L 16563387 3' - I-element 84 1 78.08 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACCCTTTGACAATTTTCGGCATGCTTTTTATACCTTCCACGTCTATTAGGGGTCT:1 + chr3L 3580960 3' - copia 67 2 63.01 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGGGGCAGCGAACCCCAGGGGTTTTGGGGTTCATACACCGCTCTCTGAGTCTTTCTTCTCGTCGTTTTAGGCATTTGAATTCTCTTTCATTTTGGCTT:1 - chr2L 17574316 3' + hopper 1394 1 67.12 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCATTGGTAAATACTTTTTTGGTAAATACTTTTTTTTTCAGTTGGGGCCGGTGGTCGGAACT:2 - chr2L 232359 3' - Doc 64 1 69.18 AATATAAACACAAATTTAAGAGATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAGTAAGCACACATCTAACGTATACTTTGGATGTAT:1 - chr3R 4357443 3' + Tc3 1582 1 76.71 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACAACAAAATAAAATATTTAACAAAATCGTTACACAATTGATTTAAATGGGATAGAATGGTTCGATAAATATGTACAACAAATTACAA:1 + chr2R 22041011 3' + jockey 4955 1 54.79 TCCTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTGTTATTCTCCTTCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGATGTCCGCGTCATCGAACGACGGGCGCAACAAGAGCAATCGATATTTGGTTAGGAACAACTA:1 - chrX 19905239 3' + baggins 5017 1 58.22 ATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGT:2 + chrX 21667966 3' - gypsy2 6524 2 60.96 AGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGCCCTGGAATATCATTTAAATTTCCATTTAAAGTCGACCACAGCCCCCGCGAG:1 - chr3R 6578663 3' - F-element 81 1 66.44 ATTGAGAGACTAAAAATTTCTTGCTCAGACAGCCAACATATGATACATTATGTACAAATTATGTACATTATTATGTATTTACTTTCCTCCTTAGTTTTTACTAGTCCATTATTTTAAAAAATGTTCTCAAAACGTAGGTCCCAAAA:1 - chr3L 14585765 3' - Tc1 132 1 58.22 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTGATGTGATGCAAAAATGTAAAACGTAAATTCTAATATGTTTTATATCTGTATAGTTGTTTACTA:1 - chr2L 20262595 3' + roo 353 2 56.85 ACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAAACAAGGAAAAGCTGGAAAACCCACCCAGGGCAAAGTGGAAATCTCGGTTAAGTTGAAAGATTACATCCTG:1 + chr3R 6584301 3' + I-element 4891 1 56.16 AGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCA:1 - chrX 17690472 3' - Doc 342 1 65.75 ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCTGCCACTCCCTCCCATGACATCCTTCTTCGCCCGTCTAGCCCACACAGCGGGG:1 + chrX 19992661 3' + copia 5055 2 65.75 AGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATCGGCACTTAAACAAAGGGCGTTGTTCAATATATATGGACGTACAAATTGGCAGTCGGTGCTCGTGGCCGGAAAAACGTAGCGGATTGCAATTAATTCCGC:1 - chr3R 29952640 3' - invader4 15 2 73.10 GCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAACAGAAGAAAATCGATGGCAGG:2 - chrX 12131158 3' - F-element 367 1 54.48 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCACGCATATTCGTATGTGTGCGCGTGTGTGTGTGGCCAAGCGTTTGCGCTCGTTTGTGTTTTGTGGGTTGG:1 + chr2L 5656650 3' + hobo 2930 1 71.15 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCAGGGGTATAGTCCTTGTCCAAAAAGTAGGCTACGATTTCTACAGGAGGCCGAGGGCCAGGTATTTGAATG:1 - chr2L 6716293 3' + hobo 2915 1 58.47 GAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTATTTGTTTCCACAAAATATATATAGATACAATATTTAAGACACCAGCGCCGCATAACAATGAGAATGTTCAATAA:1 - chr2R 20012199 3' + R1A1-element 5146 1 49.32 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATTGTGTGCTTCTGTGGATT:1 - chr2L 2336199 3' + 297 353 2 58.22 GAGAAACGGGAATGTCTAGTCAGTATATGTGTACAAAAAGAATTCTTTTTTTTTGAACCAATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATTGAAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCA:1 + chrX 23362227 3' - rover 7123 2 69.18 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTG:1 + chr2L 14263017 3' + P-element 2816 1 29.69 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTATGGGTGGTTGGTTCTAC:1 - chr3R 26404988 3' - hobo 15 1 68.33 GTCTGCCGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAAC:1 + chrX 21667923 3' - gypsy2 6571 2 71.92 CCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCGCTGGAAAGTATGCTCCGCTAAAATGAAGCCAGGATG:1 + chr2R 5899310 3' - jockey 4552 1 51.39 ATGATGCTTAGAACAATCACAGGTGCTCCATGGTATATGACTAATCATGACATCCACAAAGACATGGAACTTCCACTTGTTAAAGACGAAATAAAGTCATGACATAAACCGGAGCAATCAAAGAAAGCGAACCACTAACAACCGGC:1 + chr2R 9002272 3' + G3 4268 1 67.81 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATTCAAGAGGCTGCAGCATTTAACCGAACGCAAAGTAGGTATTAGGCTT:2 + chr3R 6149853 3' - jockey 85 1 68.49 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCAAAGTACAGCTCAAGTGAGGGCTCCTCCTTTGTAGAATAATTCTGTTTATATAAAGCGGGAAGCGACAATCTTT:1 - chr3L 1728436 3' - blood 7058 2 53.42 AGTCTTTGTTAGCTCTAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCATCATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAGAT:1 - chrX 22398532 3' + Gypsy6A_LTR 131 1 46.88 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCGTACCGCAAAAATCCACTGCTTTTCGTTGCACATTTTTCTTTTTTCAGTTATCAGGTCGTAACGAAGGGAAGTGTGAGCATTCGTATTTGTAATTG:1 - chrX 9864881 3' - hobo 25 1 64.38 TCTTTAATGAATAAGGAAAAAAGGAGCGGACCAATATGGCGTCCTGCCTTTCAGATAGCTTGAAATCCAATTTAGAAGATCAAAAGGTAAACCTAATGTCGAGATAGATACTTTCTGATTTAGCTTAGTGGGAAATTGAGTAATTT:1 + chr3R 5677902 3' - Q-element 518 2 65.75 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTTGACGATCGAAGACGAATGAAAGTGAAACTAAAGCGAAACAGAAACAGAAACATACACGAAAGGAGGAGAGGAGGAACACAAAACGTGCGTGCTGCGTGGGCGACG:1 - chrX 19506029 3' + P-element 2872 1 76.71 AGATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTATGTATATAGTAATACATCAACAACGTGTAAAAGCG:1 - chr3R 4570259 3' - Juan 88 1 73.29 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAGT:1 - chr3L 12775943 3' + roo 9054 2 67.48 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCCAAAACATCATCCCGCAAAACATCAGGTACGTGAGAGCCATTCAAATGAGCGAGTGCCGATAACCCGTTGGGCGCC:1 + chr2R 8467842 3' - roo 8708 2 58.22 CGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGAAATATGCATTAATTTCAAAACCACTTAATTAGTGCGTCTGAT:1 + chr3R 23564444 3' - jockey 4988 1 71.23 TGCTCATCTCCCATGCGAATGATCATTTCGCAAATTACGTGACTTGCTACCCCCACCACATCATTTTTTTGATAGAGGCGGCGAAAAATCTCCATGGAAAACTCCGCATTTGGACCACTGAGCTTGGGCTTTATTTATAAAATGCT:1 + chr3R 12953340 3' - jockey 6 1 78.08 GGTTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTGGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACATTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACAT:1 - chr2L 1870962 3' - mdg3 5335 2 70.83 CGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATGTATTTACCTAATTGTGAGCCATGCCAAACTAAATACTTTCTCTACTTCAATTTAGTCTTTCACAATCAGCAATTGAAGACTTCCCTTAATCAATTG:1 + chr2L 19217749 3' + springer 7499 2 67.59 GCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGTATCTCCGGCATGTGCGTATCTCCAGTTCGTGCACCTTGAGTGTAATTTAAATACAAACGAATGAA:1 + chr2L 10178095 3' + mdg3 5444 2 54.11 CCTAGCACCTGCAGAATGCAGGCGATCACGGCCTTGCTCACCAATGCTTATGACTGCACGAAATGAACCCGAACGCACAGAGAGCGTCTCTTTCAAGCTCCCCCCTTCCCAACGGTGTCAAGTTCAGCATCAACATCAACATCAA:1 + chr3R 14593079 3' + Doc3-element 355 1 79.31 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTTGCAGGAGCCGTCATTCCGTCGG:1 + chr3R 5767464 3' + roo 349 2 58.87 ACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTG:1 + chr3R 13198259 3' - Doc 90 1 76.03 TAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATAATTAAATTAATATATACATAAGTAAGTATTTACGTACTTCCAAAAAAATTTTCTT:1 + chr3R 4570309 3' + Juan 4145 1 67.12 TTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATCTTAATGCAGATCCATGTTATCATTGGGATAGTTCACCATTGCTCTTACTCGGCGTTACTCGTTGACATAATAG:1 - chr3R 7364183 3' - Quasimodo 39 2 59.59 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATGGTAGGCGAAGGATGAATGGGGAAGGGCCGATTCCATCCCTATCTGG:1 - chrX 16994996 3' - jockey 30 1 66.43 TTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGTGAAACA:2 + chr3R 15157713 3' + invader3 246 2 62.33 CAAAATTGTAGGGCGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAGTGGTTTACCAAAGTTTCGAAATTTCATCA:1 - chr2L 5656516 3' - hobo 35 1 60.27 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTGTAGGCTGACTCAGAGCCAAA:1 - chr3R 29719346 3' - hobo 81 1 77.24 AACAGGCCAAATGCCCCAGAGTGCAATGGAGGGGCAGCGAAGGCCAGGGGTTTTGGGGTTCATAGACCGCTCTCTGAGT:1 - chr2L 17574364 3' + hopper 1413 2 58.23 TAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTGGCAGCTGCAAGCTGCAACCAGCATAAAACTGTATGCTACGTCGGTGCTCGGTGGGTTCTTCAC:1 - chrX 18193450 3' + jockey 4934 1 55.48 TTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTTAAATGCACGATAATTTGCGATCATCTCAGCACGACTGTTGTTTTGAATGGTTTGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTAATATGTATACAATTATTTTAATCCGAGCAATACAATACAT:1 + chrX 21177269 3' - Tirant 2 2 62.33 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACATTCTGCAGTTATTAAACATGTA:1 - chr3R 24301794 3' - Tabor 42 2 56.85 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATCTGTTGTACTTTTGAATGTCAAGATAAAGAACTCCAGAACTACCAGATCTGATTGTGGTTGTAATTATACAATAGGAACA:1 - chr3R 12540462 3' + roo 9028 1 48.63 CTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGATTTGGTGGATTCACTGATTCGACTTGGTCGGCGGATAAAC:1 - chr3R 22123765 3' + 297 319 2 74.66 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATTGCGTCATTTATGCATCTCATAATTCCCCGCATAAGTCCACCAAACAACCGACTGCGAATCCTCGTTACACAGATTGGAGCCAGTTCCCCAGC:1 - chr3L 22445143 3' - Transpac 25 2 68.49 TGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGACTGACGTACAACTTTCAAAAAT:1 + chr3L 23839751 3' - McClintock 32 2 63.01 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATAGCTCATAAACAGGAATTAAAAGCATACCGTAAGCTTTCTAAAAAATTCGAATTGGGTTGTAAGATATATTAATATA:2 + chr3L 8704616 3' - blood 44 2 55.48 TACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGAGTCGGTAGGGGGATTTAAGTCCCATTCCTTGCAATAAAGAACTCTATATAGCATTTACGCAGACAATAAAACTCCATGCAGTTAGAAGTTATAAAATAAGATACATAGATTTAGT:2 + chr2R 3091734 3' - F-element 250 1 76.03 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGCCGTTCTCTTCGCCGCAAA:1 + chr3R 25138011 3' + P-element 2787 1 17.12 ACAAATATATAAATATGTATATCACGTAGCTTACTGACACGATATTTGTTTATTTTAAGCTGAACCTAATTCCATTTCTCTCAGTGCTTATCTAAAACTGCGACTTTGGCGTTGGCTTTTTGTGCATGGCTTTATCAGCGACTCCA:1 - chr3R 18485253 3' + G3 4503 1 78.77 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGACTGCAGCAACAACAACCACACGGCAGAGTACAGGGCCGGTTGTT:1 - chr3R 17794501 3' + P-element 2862 1 63.77 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAGAACTACTTCAACTATAATCCTTAATTGATATTCTAATGTAAATTTAGTCAAATAGGGTTTTTTAGGAGAGAGTTCTTTTCGTCAAGTTCTTTAAGGATTA:1 + chrX 19736566 3' - pogo 18 1 67.12 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATG:1 - chr2R 15529714 3' + roo 327 2 73.29 TGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGTCCATTTGGGTAACTAAATAGCTTATGGTTAGTTTCC:1 - chr3L 5425473 3' + blood 295 2 75.34 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCACAATCGAATGTTTAAGTTAAGCATTTCAATTATAATAGGGAAAATTCTTTGACTTTTAGCTAGATTACCAAATTAA:1 - chr3R 14174667 3' - 297 6621 2 58.90 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATAAATAAATTTTTATGGAAACATTTGCAAATACCTCGACCATTTCAATCTTGCCAG:1 + chr3R 26643391 3' + 412 430 2 63.70 ATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATTCAACTATCTAATTGAATCACAAACAGTTTCATCGCAGGACATTCGATATATAGAG:1 - chr3R 10736766 3' - copia 66 2 65.07 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCCACCCCGACCCACATTTTTTTTTGGCATTCACATCCCCCGCCACTCACC:1 + chr2L 17574451 3' + hopper 1413 2 70.00 TCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTAGGTTGTGTTTACATACATATTTACATGGGCCCTCTGGATCGTATTCCCAGAACCATTTCGCACTTCT:1 - chr2L 19135592 3' - Burdock 6185 2 54.79 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATATGGAGTTGTACTCTTAGTTTCATAATCATAGTCGGGACGGTTACACTC:1 + chrX 22517731 3' + 1360 3366 1 60.27 TATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATGTTGTGGTTTTTTTTGTTGTGTTTTTGTTATTGTCTCTCCCACACTCTCCCTTTGCATTCTGATGAATTTTTTACACCCACCCAT:1 + chr2R 15129945 3' - I-element 5229 1 50.68 CGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 7217 2 79.79 ACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGTGAATGCAAAGGCAATGCTCCTGAGATTGAAATTTGAAATTTGTTTGTCAACTGCTGCAGAGCGCTATATTTATGGGTTGGATAACTTGCGCGTTTCACTTACTTTCTCATCACTCA:1 + chr3L 25255036 3' - INE-1 548 1 73.97 ACATTGTTATAAAGAAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAATAATGCAGATATCTTACCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGAAAATAAGCCGATGCTGTTTCACGTGGCGTATGAGCAAT:1 + chr2R 8492818 3' + pogo 1996 1 48.63 ATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAATTTAACAGTAACACTGGCGGGTTTATTTATAAACATAAAAATTTGTCCTTCGATCCGGGCCTTCTCCGTTTCGGGCCAATTCTAACATT:1 + chr3R 26774455 3' + 3S18 289 2 69.29 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAACCTTCGAAGGCAGATCACTATATTTAGGCCAATAAAATCTTGAGAATTTCACGCAAATTCATTCATATCAGCCACATTTTACACA:1 - chr3R 5684031 3' - pogo 31 1 63.01 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGAGGGGGTGTGTGTTTAAATGGCGCCTGGAGAATATCGATTAAATGCTCGTTTTTTCGGTTATTT:1 - chr3L 5731241 3' - 297 48 2 54.17 AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAAGTTCTCAGTTATCTATTTTGGCAGCTTAAAAATTGTATA:1 + chr3R 27948293 3' + Juan 4135 1 72.60 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAAT:1 + chr2R 24021667 3' + pogo 2050 1 56.16 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTATTCCGCACTCATATGTTTGTGTACACAAATAGGGTAATGGGATTTTAAAGGTACTTTAGTTGTTCAGCATGCACATTGCAATCT:2 - chr2L 2722323 3' + flea 221 2 64.38 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTACCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCAC:1 + chr2R 12642750 3' - pogo 49 1 52.05 TCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGAGTTTTTTTTTATTGTTTATGAGGTGGAACTGCAAATTCAAACTCAAGGAATAT:1 - chrX 4818511 3' - Bari1 66 1 62.33 TTTAAATTAAATTTTTAAATTTGTACCCTGACAGCATGAATTAAACTGTTACCTATACATGCAGACAAATCCAAATGATTGTGCTTGAATGTTTATACTCTCATTGTTTTAAATAGTGAACTTAACGTAAAAAGCAATTCAAAACA:1 + chr3L 12534456 3' - 1360 3040 2 80.14 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATGATTCTTGAAGAACGATATCACCTTCTTGGACTGTG:1 - chrX 15696712 3' - jockey 4751 1 73.61 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAACTCTTGATTTAAATCATAATTTAATTTAAACTCAATCTCTCAAAAACAAACACTTGGTCTTTG:1 + chr2R 15190501 3' - pogo 55 1 56.85 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCCAA:2 - chr3L 12775935 3' + roo 9039 1 63.70 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGAC:1 + chr2R 8375122 3' + roo 347 2 56.85 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCCACAACTGCAGTGGCTTGGGAAGCCGAAGCCTTGCAAGGATACGAAAGGCGCTGGAGCAGGCCTGCTTTTTGGACG:1 - chr2L 16202551 3' + copia 245 1 78.62 TATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTTGCCTTATCAATGGGTGAAATTCCAAAGCTTATCTGTGATC:1 - chr3R 8293506 3' - Stalker2 7285 2 58.90 CAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCG:1 + chr3L 10111844 3' + copia 178 2 69.18 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCCTTCGATTGTTTCCTTATC:2 + chr3R 18860899 3' + roo 9033 1 44.52 TATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGG:1 + chrX 8610287 3' - mdg3 5343 2 77.40 TCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTGCCACATAACTATATTGTCCATTTGGTGGCCGCCAGTTGGTAATGGCTGCCAAAGGTTAAATGCGAATAGAATTCGCCCATACACATTCGCATTCGCCCATT:1 - chr3L 1983420 3' + Transpac 293 2 70.54 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGAAATATTAAATGCCTGCTGTAAGCGAAAATTCTA:1 + chr2L 22032034 3' + Tabor 7239 2 75.69 TTTTGGATTTTGTTTATTTTCCTAAATGTTTGATTAGAACATTCAGTCGTACTTCTCTAATTGAAATCACCAGTTTCACACTTTTTTGGATTTTGTTTATTTTCCTAAATGTTTGATTAGAACATTCTTTTTCGCTTTTATTATTC:1 + chr3L 9691280 3' - transib4 2539 1 70.55 ATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATACTCAATCCCAACTACGTGCTGCAATGCCACACGAAGTGGTGATTAGAGGGGGAGGGGGT:1 + chr2L 11045630 3' - Burdock 60 2 59.59 GTGATTCTGCTAAGCCCCCACCTATCATTCTGTCTGACGTCAATGATATAAGTGAAATGCTATGAAAAGTTGGAATGTTTTATTTATTTGATGTGCAATAAACTTTGTTTGAAAATATACAGATTTATATTAACCACTGATCCATG:1 + chrX 17100584 3' + G4 150 1 57.53 GGCTATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTGGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGGGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATATTAATTTTCATGAGTCACATTAGCCACATATGACGTCAC:1 + chr2L 15934631 3' - springer 7205 2 69.57 AGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTTGCCTTATCAATGGGTGAAATTCCAAAGCTTATCTGTGATCCTCATAGTCGTCCAACTCCGGATA:1 - chr3R 8293482 3' - Stalker2 7261 2 75.34 TGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCGGGGTAGATTTAATGCGAACTTCTGCTAGGTTATT:1 - chr3L 6542010 3' - hobo 84 1 75.17 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACGTGGTGAGCGAGCGAGCGAGCAG:1 - chrX 13642016 3' + P-element 2833 1 47.26 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCTTTAAGAAACAATAATGATAATTGTAACAGTATAACATTTCATCGAATAACAAATACTATTGCATTTACCCAATCAAAGTTTTGAAAGGGAAGTCAAGCATATATGTATGTTAAGC:1 - chr2R 10936588 3' + copia 250 1 76.03 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAAAGAGAGCGGCGAGAAGAG:1 - chrX 1831240 3' + P-element 2844 1 44.35 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACATATGTGTATGCAGATTGACATTTGACGTGCATAGAATTTGTCTAACTGTAGTTTTCCCTTTGCCAGAATGTTTGCCTCTTGTCT:1 - chr3R 8965108 3' + HMS-Beagle 213 2 63.01 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATATCACAAGCTGATGCCAAAACACAAAAACCTATACCTCCGATCCGAATGCACATATATACGCGTACAGAGAGGTATGAATGCACCATATTGGATGAAAATAAGTAAA:1 - chr3L 18420868 3' - jockey 4685 1 72.60 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGACTTCTCCTGTTGCAAGTGCAATTTCCGTGCTAAATATTTGCACACAAAAGCAGGAAACTTTCTGCCAACTTTCCT:1 - chr3R 26139395 3' + mdg1 377 2 54.79 ATGTACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTTT:1 - chr3R 178121 3' - BS 86 1 78.08 CATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATACTTCTAACCCATACCCTAACCATACTGCAGCTTGGGGTATGTATGA:1 + chr2R 10578873 3' + F-element 231 1 68.49 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCGGCATCCCCGAAGCTCGCCAAACACCTGAAAAGTATGCAATGAAAATTCTTTTGGTGCCTCTGCGGCTCGTTTGTGCCATGTGCC:1 + chr3L 6542108 3' + hobo 2919 1 68.22 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCCACCCCGACCCACATTTTTTTTTGGCATTCACATCCCCCGCCACTCACCAGTGGCAGCAAAAAAAAACCGGCAAAAAGCAACAACCGGTAAAATCGA:1 + chr2L 17574502 3' + hopper 1412 2 78.29 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGAATTTATGTTTCTATAAGTGGACAAAACTAAACTATTGCATATGCTTATGATC:1 + chr2R 11609977 3' - roo 8731 2 65.07 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATCGATCGTACATCTTAAAACGAAAATAATTACATTCGAAAAATGAAACTACAATATATGTAAGTACTTCA:1 - chr2L 615218 3' - F-element 65 1 52.74 GTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTTGCCTTATCAATGGGTGAAATTCCAAAGCTTATCTGTGAT:1 - chr3R 8293507 3' - Stalker2 38 2 58.22 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTTGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCCAAAAACAAAAGCGACGTTTTACTCGGCTCTGCGAGCAAGAAACACAA:1 + chr3R 18935206 3' - jockey 4708 1 59.57 CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTTTATACTTGAATATATGCAAACGCTTTTTTGACTTCGATTTTCGGTTCTTTT:1 - chr2R 6713836 3' + 297 6916 2 67.12 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTTAAATGCACGATAATTTGCGATCATCTCAGCACGACTGTTGTTTTGAATGGTTTGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTAATATGTATAC:1 + chr3L 24531170 3' - Tirant 8139 2 41.78 ACAAAAAATAAAATAAAATAAATGAAGAAAGCAAGAAGGCGGGGCAAAAAGAATTTGAAAAGTGCAACGGCAAAAGCAACAATAATGAAACATAAGTTAAGCAAATTTTACGGATACGGTTGGATGCAAGTCTTCCTACTACTTAC:1 + chr2L 8564207 3' - transib1 1902 1 64.38 GAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACACTTACTTGCCCTCGGCTGTATGTGCTGAACAGATATTGGAAACATTCTAACAAAGCCCATCTATAACAATAAACGCTACTCTAGAAGAATATGGGGTCGATTGGGATTGTGAG:1 - chr2L 3393691 3' - Stalker2 7 2 79.45 AATCACTTGTAGGGCAATAACTTAGGTATACCATATATTTTTGTACACTATGGCAAATATAAATTCCTTTATAAAACTGTATCTGTTATTAAAAAAAGATAAAAACTGAATTACAAGTACAAGTAGGCTGCGAAATCATTTTCGAA:1 - chr2L 22393121 3' - HMS-Beagle 1 2 71.23 ATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACT:1 + chr2L 10685855 3' - Quasimodo 66 2 78.23 GATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTGAATAAAACACAAACGCAGGAGTTGGCCGCTTTGGTT:1 + chr3L 19182817 3' + micropia 427 2 63.70 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTATATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGTAGATGCTGGTCCAGAAGTCTGGAAAAGAGTGAGTCACGTACTCCTGCCAGCTGAT:1 + chr2L 19801017 3' + roo 396 1 76.03 ATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATGATTCGGCTATTACTATTTGTAAGCTATATTTAAATAATAATATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAATCCAAGCAATTTAATTAAAGTTAGGCATACTATAATCTTT:1 - chr2L 16503208 3' - 1360 367 1 72.60 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGAATATGCGAGCATGCCAGCAGCATTTACATATTTTCCTAACCTATTTGAATGGCGCGCACA:1 - chr3R 11483756 3' - pogo 57 1 57.53 CGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTACCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGAAAATAAGCCGATGCTGTTTCACGTGGCGGATGAGCAATATG:1 - chr2R 10967676 3' - pogo 74 1 66.90 AGCCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGTAGAATTTATCTTTAGCTCTGAGCCCTCTTAATCTGTAAGATTCCAGTTTAAGGTA:1 + chr2L 6716443 3' - hobo 18 1 73.29 GGCGGTTTTATTTATAAACAGTACGCTTGGCTGAAACATATTTTGTTTGCCAGTTTTTCGCGTGGATTGTCAAGCTGCCTGGTTATATTTTAAATTTT:1 + chr2R 18927881 3' + 3S18 342 1 79.59 TGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGAGTCACAATGTATGAACGTTACTTATATATATGTAGAGAAGAGTTATAGTGAGGGAAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGCGCCGATTATC:1 - chr3R 8293553 3' - Stalker2 7328 2 66.20 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTGGCGCCCAAACAGGGACCAACGAATAACGCGTACGACAGACAAAATTCTAAGTACATCGCTCATCAGGGCAATGCCGAGACTCAGTCTTT:1 - chrX 15777956 3' + HMS-Beagle2 277 2 73.29 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAGAACCAGGTGTCATCTCCATTTAAGTAATTGAGCGAAATATTTTTGCATTGTTCCAACAAATTGTGGGCGCGCAC:1 - chr2R 11394074 3' - pogo 43 1 53.42 ACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGGGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCACCATTTACTCACTCACTCAGTCAGTCAGTCAGTTCGT:1 + chr3R 25628429 3' - invader2 5028 2 73.97 GTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTCAATTACTTCCAAACCGCTTGTTTTTAATTCGCGAAAATTTGCGTCTCGTGCATTTCCGATACATGTTTCAAAACTGTAATTTCTGCTTGTT:1 - chr3R 5318025 3' - R1A1-element 158 1 61.60 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTGGTCCTTGGTGGAGGCCCGTTCTCAATCCGTTGGCGAGGACCAAGTGCATCTTGTTACGCCGCACAATGAATACC:1 + chr2R 10666950 3' - hobo 40 1 56.43 TTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATATATATGTATATATATGGGGAGCCTAAAGAGGGTGAATGAAATAG:1 + chr3L 2625120 3' + opus 7428 2 77.40 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGACTATTGAAGTCTATCCACTCTATATGAAGTTCGGAAGTTTGTGGCTTTTATCGACTACAAATCCATAAAATATCACACAAATAAGCTTCAGCAGTTT:1 - chr2L 11043480 3' - roo 8685 2 69.66 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTATATAAACTCATATATGTACATGCATATGTGCTTTGAATCGAAAAAGAAACTTCTTCATT:1 + chr2L 21687700 3' - pogo 60 1 62.33 CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCATTTAAAT:1 + chrX 12995399 3' - blood 7081 2 65.07 TTTTTTTTTTTATTATTATAAGTTTTTAATTTTGAAACGAACCTTGCACTTATCTGCCAACG:1 - chr2L 3211385 3' - Rt1a 5070 1 80.65 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTAGCACAAAAAACAGAACTTTCATTCTTCAAATCGTTGACACCAATCGTGTC:1 - chr2L 8909798 3' + roo 9001 2 67.81 CCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATCCTGTGCATACCAACATAATTTAATTAAAGCTCTCAATTGAGCCATCT:1 + chr3L 12729174 3' - opus 7184 4 67.12 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGGTAGATGAAACGTATTGCCTTTTTGCGCTGAGCTGGGAGGAGACCCGATCCCGTATGTCTGCTAGTTGCAATG:1 + chrX 13808107 3' + pogo 2056 1 54.11 GTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGCGGTTGGGCGTGAGCGGGAGAGCGTGTGGAAAACAAGTGCCAGCTGACTGACTGGTCAAATATAAAGCGTTTGGA:1 - chr2L 11638951 3' - springer 7150 2 74.66 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAAACAGATGGTCTGCCAATCAACTTCGAATCTTCGAATACTTCACTTCCATCACTGCTGTTAT:1 - chr3L 24089514 3' + mdg1 7400 2 56.85 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGAGGGGGTGTGTGTTTAAATGGCGCCTGGAGAATATCGATTAAATGCTCGTTTTTTCGGTTATTTGTTGCTTGTTAATTT:1 - chr3L 5731226 3' - 297 23 2 67.91 GGGGGGTGGTGTGTGGACGTGTGGTTAAAAACGAAAGTGATAGGCAGAAAAATATGATATTTCATGAACATTCCTTTTAGGTCTAGGGGGGAAGGGGTAACTGCCCTCCCCAACCATACCCTGGCGACGTCCTTGGTGTCTACTAT:1 - chr2R 2949170 3' + Dm88 414 1 75.34 TACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGTACATACTTCCCCCATCCGAACCGACCTTATAGACCAGAAGTCTCTCTTTCCGGCACTTTTTGTAATGCC:1 - chr2L 9228653 3' + Burdock 6371 2 63.25 TCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAATTATTT:1 - chr2R 14767356 3' - Tirant 8165 2 56.85 TAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTATGTATATAGTAATACATCAACAACGTGTAAAAGCGTTGAAATAAGGCAGCCCCGATTATGATAAGTAAATGGTTAATGCCATGGGTATGAGTCAA:1 - chr3R 4570199 3' - Juan 28 1 65.75 TAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTGTCATCATATGTCTAACACTCGTCTCACTCGTTGGCCCGCCCCTGGGTTTATCCATCCA:1 + chr2L 16202702 3' - copia 4929 2 58.90 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGCCAGCCAGCCAAAGGGAAAATTTGCATTTTCAGCCTGTGCGTATGCAGCGCTCTTTGTCCTTTTCCGCCTGATATCCCGTTGAGCACACACTGTCGAGGATTAGCAGTCT:2 + chr2L 2518628 3' - jockey 18 1 74.66 TGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATACTTTATATAGTCGCAAACGCATGTTACATTCTTTTCAACGAATCTAGTATACCCCTTT:1 + chr2R 2957714 3' - Quasimodo 60 2 63.70 AATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGCCGCTGAAAATGTCATTACTGAAGGGCCAGCAAAACGGATGTCGAGTTGTTGTTTTGGTTGTTTGTGCAG:1 + chr3L 19431735 3' - Juan 54 1 52.05 GTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGTGCGTGCGATCAACGCATTTTTCGCGAACTACATCGGCAAAAATTCGAATAGTTCAGAATATTGAACG:1 - chrX 22652694 3' - ZAM 8017 2 56.16 TTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTCATACATACATATGTACATAGCAACAGCGATCTATGGCCTGTACATAGAGAAAATAACTTCCCTAGCATTTACTCGCGAAGCTGATT:1 + chr2L 19135737 3' + Burdock 6361 2 67.12 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAGTTAAGTGAACTTTTGCCGGCCAGGTGAATGCAGGCAGAATATCAATTGTTGA:1 - chr3L 19702750 3' - pogo 62 1 65.07 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAAGTTATTATTCTTCATTTGTTCGAACTAGAGATTCACTTACCTGAGGATGTAACAGAAATGTGAGAACCCAATAAATCTTTTTCGTTTTTCAAATCAGTTT:1 + chr3R 10800642 3' + roo 9052 2 69.18 GGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATATATATTTCCTTTTTATATAATTAACATTTGTTTAAAACAGTAATCAGTAATTACTGTATA:1 - chr3L 11903210 3' - micropia 5101 4 63.01 TATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGACTCCTTTTGAAAAACTCCCTTGC:1 + chr2L 21082223 3' - mdg3 5310 2 56.85 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGAACACTAGGCAATAGCTGAGCGATCTGGCAGCC:1 - chrX 19744386 3' + P-element 2857 1 63.77 TTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACGAAAAAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGAAGACGCGACGCAAATGGAAAAGAAAACATAAACGCTGAAAGCTGGAAAAATGCGC:1 + chr3R 26966980 3' + FB 666 2 40.69 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATC:1 + chr2R 18056891 3' - blood 64 2 61.64 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCC:1 - chr3L 12775938 3' + roo 9036 1 61.64 GATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGA:2 - chr3L 19951184 3' - Ivk 61 1 58.90 AATAAAATCAGTTTTCTTGCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTTTAGAGGT:1 - chr2R 15529672 3' + roo 369 1 58.90 GCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGATGAATATTCGTACACAAAAACCAGGTTTGTGCA:1 - chr3R 29381526 3' + hobo 2866 1 73.08 TTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGACTTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACA:1 - chr2L 951336 3' - F-element 97 1 76.55 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCAGCGTAGCACAGAGGCGTCAGTGGAGGAACGGAG:1 + chr3R 13572144 3' + 412 463 2 65.73 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAA:1 - chr2L 5656546 3' - hobo 28 1 55.05 CAGAATTTTAATAGAAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTTCCATCGCCGAGTGTCATGCATTTTTCATGGCCCGCCACGAGCTCAGCTGCTCAACTAAA:1 - chrX 21217283 3' + HMS-Beagle 6590 1 58.90 GCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAAGGAATGCCGTTCATATACATTATTGTATTACACTATCGAAAACAATAAACCAAAATAATAAATCCCAAATAACCATTTTCACAACCAAGGAAT:1 - chr3R 11142156 3' - Max-element 14 2 73.28 TTTTTTTTTTTAACACAAACACAATACACGATACATAATCACAATACACAGAGGCACAACACATTACTAAAAAAGCATTAAGAGAGAGAGAGAGAGTGGCCAAAAAAGGCGG:1 - chr3R 28777703 3' - Stalker2 498 1 56.25 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGAACTACAACAACATAAACTGCATGTCGTAATACTGTTGGTGTAATAAAAAAAAGCGCAG:1 + chr3R 7109248 3' - P-element 44 1 55.86 TACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTATCGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAGCTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCC:1 + chr3R 4571527 3' + Tc3 240 1 53.42 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCCTTTGTTTTATATTATATGATTTAGATATAAAATCTAGAACACATTACTTAAAATTATAAGATAATTTAGTCGTAGAA:1 - chr3R 6523188 3' - I-element 45 1 53.42 GTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCG:1 - chr2L 23372507 3' - gtwin 6957 2 54.41 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAAAGAGAGCGGCGAGAAGAGAGCGCCAAAAGTCTT:1 - chrX 1831225 3' + P-element 2831 1 46.15 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGACAAATATGAAAGCGTCAGGGGAATGGGGAAAACTCTGAATTTTGAATGGTTAGGGGTTGGTGGAAGTGGGCAAGGCATGACAAGGAAC:1 + chr3R 12781618 3' - pogo 30 1 65.07 CAAGAAATGAAAGTGAAACATTTGTTAAATTGTTTGAAATTAAACTGTAAATCATAGGAATTTTTATCTTAAACTCTCAGGTCCAAAGCACTGCTATTTTTATGAACACATCTGTAAATCAGAGCCTAAATTCTAAGGGGATAAGG:1 + chr3R 4516745 3' + HB 1496 1 75.34 CTAAAACTCGCAACGGTATTTGACAAGATAAACCAGCACTCGAGTAGATACCATGATAGGTTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTAAACAGACCTCGCCTCCCCGTAGCATTTTGAAACCCGAAACCAAACCATCC:1 - chrX 7798391 3' + X-element 4368 1 74.66 CACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGG:1 + chr3L 17895977 3' + P-element 2794 1 23.29 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCTTCTCCGTAAAGCTCAATTTCTTTATCGACGGATTGCTTGACAATTCCTTTCTTCATTAAATAGGTAA:1 + chr2L 22177469 3' - Doc 58 1 52.74 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCAACCGATTTACACCATAACAATACACGAGTTCGTCGTTTCGGTTTCCCCCAATGTTTAATACAAATATTGTGGCATAAAATTT:1 - chr2L 21189693 3' + hobo 2903 1 60.69 CAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATAAGTGAACTCAAAAAAGCAGTGCAAATTCAATTAAATTTTTT:1 + chr3L 780749 3' - Burdock 76 2 71.92 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGTGTGTGTGTGGCTTGAATATTTGAGATTTTACTCCGCTTTTTC:2 + chrX 6213639 3' + roo 9032 1 58.90 GAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCT:1 + chr3R 22572636 3' - HMS-Beagle 78 2 70.55 ATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAA:1 + chr3R 24760617 3' - pogo 79 1 73.97 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTACTTACCGGTGGTCGTGTGATATTTGTGGGCAAATATAACCACAAAGAAGGACGTTGCATACTTGGCGGCGTTGACCAGATGCGGAAATGACTCCTTTGTGTCGCG:1 + chr3L 5919203 3' - BS 5071 1 76.81 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGT:1 + chr3L 9240468 3' + 412 417 2 68.49 GATCTGGAATGTACGCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGGAATAAAGTGTGAAAAAATTAATTTATTTCAAT:1 - chr3L 21405412 3' + mdg1 333 2 76.03 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTGCACGCCCCGTATGTTTGTACATATATAAACTGTTGCGACAATG:1 + chr2L 15601681 3' - Doc 20 1 71.23 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTATT:1 + chr3R 11873414 3' + 412 432 2 71.43 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATTCAAGAGGCTGCAGCATTTAACCGAACGC:1 + chr3R 6149835 3' - jockey 82 1 77.60 TGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACG:1 - chr3L 25232764 3' + accord2 150 2 59.06 AAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTACATTTCCACTAAACTTAATAATTCTTTTTGTGCATTGTCTATTAA:2 - chr3L 23244858 3' + HMS-Beagle 170 2 71.23 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTCCTTCATCAAGTTTCCGTAGATGTAGAATTTACAAAGTGGGGTATTGGGCAAAAGATGTATTTCTGTGAAATGAATCTTTTAAGTACAAGCTAGTGTCGGA:1 + chr3L 18585812 3' - mdg1 7060 2 71.23 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTGCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTAAAAATCATTTAAGCTTGCTAACTCCACCGAGAGTCTTTT:1 - chr2L 15596934 3' + roo 8994 2 75.34 AACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACA:1 - chr3R 24301816 3' - Tabor 6903 2 58.90 AGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGATATGGAAAGGGTGCTGGCGCAAATTGCCGCAAATCCATTCTACAGCACCTTTGCTCCGTTCTGTTCGCCGTCGAT:1 + chr3R 15700448 3' - Transpac 4961 2 56.85 CGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATAT:1 - chrX 17690481 3' - Doc 351 1 71.92 GATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATGCGAGTACCGCAGGAGGAGTGTGGCAAATATTGGCTGTGGGTGTTGCATACCCCCGGGCGTGCCGCTACTTGGTCGCTCATCAAGCATACGCCGC:1 + chr3R 23968705 3' + HMS-Beagle 229 2 69.12 TTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTATGGCAGTGTCAGCTTTTCAAAAT:1 - chr3R 13231739 3' - F-element 75 1 41.78 AGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGTTGAGATGGATCTTATTTTAGCACCCCTCATAAAGGATTCCCATGACATTTGATGGTGAAGTTGA:2 - chr2L 5333351 3' - mdg3 5283 2 65.07 AGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGGGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGTGCGTGCGATCAACGCATTTTTCGCGAACTACATCGGCAAAAATTCGAATAGTTCAGAA:1 - chrX 22652703 3' - ZAM 64 2 60.96 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGTATGAATTTTTATAGCAGGAATAGTGTCCAGGCTACAGAACAATATGCTTTGGCAGAGTTCGTTGACCTGGGAAACTTTC:1 - chr3R 25929305 3' - 297 18 2 71.21 GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTATGATTTATTAAACATTTATTTGGCTTAATGAATTAATTTGATTTGATTTCGACAGCGTAACGGAAATGCCTGCGAGTGTGTGCGTGCGCCTTT:1 + chr3R 21591467 3' + Juan 4189 1 65.75 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTT:1 - 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chr2L 16202617 3' + copia 182 2 71.13 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGCAGGTGAGTTTCCAT:1 + chr3R 15363488 3' - 412 70 2 65.75 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGTCAAAAATAGATTACAATTTAGAAGCATCTTAAAGATTTATCGATTGATATGAAATAATAAGATAAGATCTC:1 - chr3R 18860751 3' - roo 48 2 54.11 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGAAATATTAAATGCCTGCTGTAAGCGAAAATTCTAAACCTACAAGCAAACAAACTGCGGCACAAAACAAGCAAACAGAGGGAAATG:1 + chr2L 22032085 3' + Tabor 449 2 60.27 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAACTTCCATGAGATTTTTAACCCCTTCACCCCGTAGTTATCCATTATTTG:1 + chr3R 31663326 3' - jockey 74 1 63.57 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCGAACGTCATCCTGCAGCAACCTTCGGGTGGTTTGCCACCCGCGCCCCCCTCAGATAGTGCTGAAAACTTTTGCAAC:1 + chr3L 939743 3' - hobo 45 1 54.79 TGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCCAAAAACAAAA:1 + chr3R 18935169 3' - jockey 4749 1 68.28 AAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCAATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCTAAGCTCTCTCGAATTTTTGTTCGAGAGCGCGTTTTGTTGTGACATTTTAATGGCCTGACCGAGC:1 + chr3L 1676508 3' + 1360 3 2 74.66 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATAATACCACAGGTACTCTTCTCCCCTCGCATTTGAGCCACCACCAGACTGGACCCATTCTATATGTACAGTGT:1 + chr2L 20253970 3' + roo 9036 1 61.64 TTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGGTGACTGTACTGTTTGGCTAGCGTGTG:1 + chrX 11236456 3' + copia 5050 2 80.16 ATTGTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGAAAAGATTACCCAAAGCCAAGTCAAACACACTGCAATGGAAGTCCATAAACAGGCAGCACTTTGAAGCTGTGCAATCTATC:1 + chr2L 18419363 3' - TLD2_LTR 188 1 51.37 GCATAGAGCGTCCCTTTCGCTTTTTGTCTTTGAACAGAAAAAATTCATGATTGGAGTAATCAAGTGGATATCATTACAAATGATCTTTATTACCTCTATCACTTACGCATTTATTTGTTTCAGTTTCTGCCTTCTATGCGGAGCAT:1 - chr2R 9885115 3' - F-element 118 1 58.90 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCGTATATCGATTACAATCGCGTTCGTTACCAGCTTGGAATTATGCAAGTATGAACTATTATTTTACAACAAGATATTTGT:1 + chr3R 29997735 3' + P-element 2845 1 55.48 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAAGGAAAAAACGAAAGTTGCCAATGGCGCAGGCGAAAGGATAACTGAAAGAATGGAACTGAAATTAGAAAAGCAA:1 - chr3R 7655548 3' - 412 48 2 50.00 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGGTAGATGAAACGTATTGCCTTTTTGCGCTGAGCTGGGAGGAGACCCGATCCCGTATGTCTGCTAGTTGCAATGAGAGAGTAG:1 + chrX 13808116 3' + pogo 2065 1 60.27 GTGTAGTTTACTTATGTGTCGCTCTACATTTGACTTTATTTTGTGTTTATAAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCATTCATTAGGCAGACACCAAGTCGCGCCTACATTACTGCTACCTATGCATGTTCCACTG:1 - chrX 292335 3' - G3 4375 1 73.97 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAAT:1 + chr2L 42587 3' + copia 183 2 67.81 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGTGCCTTAAATATCACTTATCACCTGGGACATCGCAAGCTAATTACAAAACTATTGCCACAGTCGTCGTCGCCACTGAGCCGCAGAAAAGTGTCCCAAAACAATGTGACAA:1 - chr2R 18785893 3' - roo 12 2 50.68 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAATTTGCAGTTCCACAATAATAGGAATGAATAAAAGGTGTTAAATAATAGATGTTATTCACAGTAACTA:1 - chr3R 14213611 3' + mdg1 367 2 54.11 ATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCGAATATTTAAACACGTGTATATTTATATTTACACACGCATAGTTTTTGAGGTGACAGCTAAAATGAGGTATGTTTGTACATACAAAT:1 - chrX 20369342 3' + roo 375 1 63.70 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGAGAGATGGGAGTCTCTACTCGCTTACAAACCGCAAATA:1 + chr3L 17896021 3' + P-element 2838 1 53.42 AAAGTGTCACAATGTATGTACGTACCCTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACAACCGTGCCTGTCTCCGAACAACAACAACAAATGCAACCAACTATGATGACA:1 + chr3R 6404630 3' - Stalker2 51 2 46.58 CAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCAGGCAGCAACAATATTTACAGCTTTAGCGGCCA:1 - chr3L 11296554 3' + P-element 2798 1 25.34 TGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGT:1 + chrX 21667938 3' - gypsy2 6539 2 66.67 TTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTAATCTCTAGATTCGAACTCACCTCGTAGAACATATACCCACTGAGG:1 - chr3R 22572561 3' + HMS-Beagle 6971 2 67.81 AGTTGGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGGTTCTTTTTTT:1 + chrX 13642875 3' - gypsy7 5011 2 87.18 CGTCTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAGTAACTGCGTTAGAGTAGTCTTTGTCCGTGCAAGACATGGCGCAGTTAATGGTAACGTCGCC:1 + chr3L 23559271 3' + mdg3 5395 2 53.03 CTTATGTTTAAGCGCTCGATCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTGCTTACTTACATATTATCAATATATTTGTATATTTTTTAATGACTGCAAGAGTCGCTTTTTCTCTTTTTTTTCT:1 - chr3L 20031361 3' - Stalker3T 129 1 58.57 GGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAACATTCTACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCATTTTCCTCCTTAATGGCCTAATAAAATTAAAGATGAAGTATAAGTTAA:1 - chr2L 10316901 3' + gypsy4 6616 2 66.67 CTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATGTATATCCAGTATTGTCTTCTCTCTTGCACG:1 - chr3L 18591516 3' - flea 84 2 77.40 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTAACGGAGTCCCGCCACAAAAAATCCGGAAATTTACGT:1 + chr3L 13546665 3' + hobo 2892 1 53.42 GAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAACCATCAGCAAAATAAAGACAAGGATGAAAAAAGCCGGAATCCAAACCGAATTGATGCTCAATTTTATATTTTAAATGTTATTCAAATTGTGTCACATTTCT:1 + chrX 12237358 3' + invader2 459 1 75.34 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGAATATTCGTACACAAAAACCAGGTTTGTGCAAATAGGGTTTTCATGAAAACGCTGCTGTTGTGGC:1 - chr3R 29381492 3' + hobo 2925 1 62.86 TTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCCTTTGTTTTATATTATATGATTTAGATATAAAATCTAGAACACATTACTTAAAATTAT:1 - chr3R 6523208 3' - I-element 65 1 59.59 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTCCTTGCCGGCGGCAGCATTCTGAGCGGGCTGCCCATTGCCGCC:1 + chr2R 14450227 3' - roo 69 2 67.88 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACGTATATGTGCACATATATATTGCAGTGCAGTCAAGGTCGTGTGAAAGGGACGACAGTTACGCGGCATT:1 + chrX 13484220 3' - hobo 51 1 55.24 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCTAAGCCATAGCCAGCATTTAATCAAAAATGAATTTTCCTT:1 + chr2R 16503466 3' - jockey 88 1 71.92 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCATTGTGTGCTTCTGTG:1 - chr2L 2336203 3' + 297 6930 2 55.48 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAGATTGCAGTG:1 - chr2L 16360547 3' + hobo 2902 1 57.04 GAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCTTTATTATTAGTCTTGCTGGTTTCAATAGATATGCCCAACACATTTGGG:1 - chr2R 7024396 3' + diver 152 2 69.18 AACGCCGTACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGAGCGCATGCATCGTAAGAAACTTTATATTTGTGATACGCATCGCAACCTGCAAAGACAAAATATGTATGTTGGTAAAAGGGACGGGGACGAGGAATAGGGAAAGAACA:1 - chr4 853381 3' + 1360 28 1 73.97 AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGGTTACAGTGTAAGTGCTGTGAATGCAGATACACATAAAATCCGAGAGGTA:1 - chr2L 1870947 3' - mdg3 5322 2 63.70 CAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7197 2 73.33 ATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGATTCATATTCCATTGATACGTATATGAAAAATAAGAAAATATACCAAAATCCTAGATAGCACAATCTTAC:1 - chr2L 16005674 3' - R1A1-element 5182 1 53.10 ATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAA:1 - chr3L 16973354 3' - S-element 1590 2 54.11 TATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTACTAGGTTTCGGTATAGTTGGCACAAGTCCGTTTGGTTCCTCGGATCCTCTACTGTATCCG:1 - chr3R 6174822 3' + 297 231 2 67.68 GTTGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATGAAGCTCCTATTAAAGAGGTGTTTCCCGTGGCCGATTTAAGCTGCCGCTTGTTGGCATTTTGGATTGCCATTCGGATGTATCGTGTGTGCTGTGTTTTCGGGCA:1 + chr3R 26658284 3' - hobo 17 1 73.29 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTCAGCAATGCTGTCTAGTCTAGAAATTAGGATCAACACATCATTCCTCAGCTATTTATTGTCATTTATTTATTGCCAACTATAAATTGTATGCCATAATCA:1 - chr3L 13380395 3' - hobo 21 1 71.23 AGCAACATAGGATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACAGTAGACCGGCATTATGTTTGTGCCCCATTTTGTGGAAGC:1 + chr2L 3393822 3' + Stalker2 7573 2 69.18 GTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAAAAGCACGTGATCTATTAATATTTAAAAA:1 + chr3L 15374683 3' + 3S18 280 2 76.85 GTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGCAAGTTGAAGGAGGTTATTCTGCCAGCAAATGTT:1 - chr2R 21353203 3' - Transpac 5003 2 77.40 TGCGATGCCCATAGCGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGCCGCTCAAGTTTTACCTAAATTACAATCACTTAGAACACTTTTAGCAGACATTATGCACTCATTTTAGACTTCCGTCTAATTTACATGCCATTTAA:1 - chr2L 16090910 3' + diver2 4620 2 63.01 AAAGTTTTTATATATATTTTATTTTAGTTGGTGGAAGAAGTAATCGTTTAGCCCGCATGGGGACGCCTGTCGTCGTTTGCGTCACTCTCCCAGTTCGCTTCGCCTTTACCATGGACAATGCGACCAAGCAAGTTCCCATCCGCTAA:1 + chr2R 17564444 3' - mariner2 792 1 71.23 GCGTTTGGTTCATATTGGTCCTCCGGGAAGATATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTTATTTAACCTTTTTAGGTAAATATATTCAACAAAATCATGTAAACATTGCAACAAC:1 + chr3R 9162969 3' - R2-element 320 1 62.07 AAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCTAAGCTGAATTTGTAGTTATTTGGAATTCCTTCACGTTGGGGAGGACACGACCGCGTCATCATCA:1 + chr2L 10128182 3' + hobo 2884 1 55.48 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTC:1 - chr2L 20327613 3' + roo 8999 2 67.12 GTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGCGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGAATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGTAAAATATACAACACCAACACCAA:1 - chrX 17690465 3' - Doc 332 1 56.64 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAGACAAATGTCGCTG:1 - chr2R 24021529 3' - pogo 37 1 60.27 AATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATGCGCCTTAACCTCCCTCTAAGCGGATATGTTACATCCTTGAAGGATACACACATCTGAGCTGCGGCAGAGGGGAAAATCCCG:1 + chr3R 21505098 3' - 1360 299 1 58.22 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGGTTGATGCCATCTATGAACGCAATTAGGATCCTGGTCTAAAATCATGTATTGCCCGTAGTTCCTGGTTTAAAACGTGCTCTGTTCAAACAATTGTTCTTCTGCTTCGTTTT:1 - chr3L 19788057 3' - FB 12 1 77.40 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCAGGGGTATAGTCCTTGTCCAAAAAGTAGGCTACGATTTCTACAGGAGGCCGAGGACCAGGTATTTGAATGGTCG:1 - chr2L 6716289 3' + hobo 2897 1 53.57 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATATTTTATGGTTATGAATATTTCGTGAACAAATTCATCAAATAAATTCAATTTGTTTCAGA:1 - chr3R 25414188 3' + pogo 2043 1 62.33 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTGCACGCCCCGTATGTTTGTACATATATAAACTGTTGCGA:1 + chr2L 15601676 3' - Doc 25 1 67.81 ATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTAGTAATAATCAACCGTATACCGAGATGAAATTGATTCCGCATGGGACATAAACTGCGTATTGCATTATAAACTT:1 + chr3R 22275370 3' - flea 4800 2 54.79 TTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATATTTTCCTCAGAAAAATTAACATTCGCTTATGGTATATAAAAAGAAAGTCGCTGAATAACATTGTTATATCGAAATTGAATTACCAGGAACCC:1 - chr3R 8338083 3' - jockey 4576 1 68.89 AGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGGTGGGCAAATGTTGAACCTCTGGCAGCCACCCACTTGGGTTGCATAAAATTGTATGTGCTTTCTATTTAACACTTTTTATTTTTTTTTGGGTGGCTTGGGTTCTGCGTTTAT:1 - chr2R 13772955 3' - opus 3 2 82.19 ACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTAATCTCTAGATTCGAACTCACCTCGTAGAACATATACCCACTGAGGGCCACC:1 - chr3R 22572555 3' + HMS-Beagle 181 2 63.70 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGTGTGTAAGTTTGTATGTATGTGTAGTGGTGACGCATGGACAAAGGGTGCGGCGAACAGCAAGGGCGAGCATGTGGGGCGCAAAACAAAAAAAAATTGCAGCGCTGGGCAAATAATG:1 + chr3R 28028176 3' - accord 184 2 62.33 GAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGAC:1 - 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chr3L 27291717 3' + 1360 430 1 76.71 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCTGTAGGCTCACCTACTCCTCCTGCAATCGAAAAACAAAATCAACAGGTGGCGCGCATATTTCAACATGCGGCTGCCAAGCGAACCGAGCGAAATATCAATAAAAATGCC:1 + chr3L 5948162 3' + P-element 2878 2 78.77 ACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTACGAGGGTCATTAAACGGTGCTAA:1 - chr2R 1724327 3' + Stalker2 369 2 76.03 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGCAGAGGAAACTGATCTGA:1 - chr2R 18266009 3' - roo 16 2 60.20 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTAGCCCGTCTTGGCGAACAAAACTTTTTTCGTGTCCACACATTGAAAATATTTCACAGTCATATTTAAT:1 + chr2L 2675069 3' - Quasimodo 31 2 57.69 AATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATCGGCACTTAAACAAAGGGCGTTGTTCAATATATATGGACGTACAAATTGGCAGTCGGTGCTCGTGG:1 - chr3R 29952674 3' - invader4 2809 2 50.68 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATATATATGTATATATATGGGGAGCCTAAAGAGGGTGAATGAA:1 + chr3L 2625116 3' + opus 7427 2 79.72 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGGTGACTGTACTGTTTGGCTAGCGTGTGTGACCGATAAGTGCTATCGGCTAATCGCTATCGCATTTAAAATGG:1 + chrX 11236501 3' + copia 236 1 62.93 GACCATAGCATTCTCTCTTGTTTTTAATAGGTTTCTCTTAAATTCCTATTCCTATAGCAATTTCCCGAAAGTCATTAAAGTTCAAGATTATGGTCTGAGTACTTTCTTGGACTTACGGTATTTCAGCACCAGGAATCGCCATCGAT:1 + chr2R 10244361 3' + INE-1 580 1 70.55 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTGAAAATCTTTAGAGATTTCGAGTGTTCTGGAAAGTAGGAAGTTTCCGGCTTCAGTGGG:1 - chrX 7624051 3' - roo 8723 2 59.03 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTATATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGTAGATG:1 + chr2L 19800967 3' + roo 345 2 61.64 ACCTTATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCGAGACGTTCATATGGACAGACGGACATGGCCAGACCGACTCGGCTATTGAGTCTGATTAAAGTATATATATTACTTTATGGGGCCGAGCCCAAGTGGGGTTCCCCTCCTTGTCCCTT:1 - chr2R 8380699 3' - INE-1 157 1 78.77 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACAGCAGGCAGGCGTCGG:1 - chr3R 5087099 3' - P-element 86 1 19.85 TGTTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATGTGGCATATATATGTGTATGTATAGAGACAGCAGACTGAGGCATAACCTTAATTCCT:1 + chrX 7657512 3' - I-element 64 1 58.90 TCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGATATTCCGAGTATACGTCC:1 - chr3L 21765396 3' - gypsy 41 2 57.24 AAATTATTAAAAAAAAAAACAAGTTTGTACTTGAAAAGTACGGCGTATATCTACAGCGAAGAACGCAAGAACCCGCCAAGGCAGCGTCCAGCGATGCTGTGGCCATCTCCGTGGAACGCTAAGTATCCTGGTGTTCTCTACTTGCT:1 + chrX 20523986 3' - hopper 157 1 65.75 ACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCTGCATCAGCTGCTGCTTTCGACTACTCCTTCCATTTTGGGCTCTTGCCTTTGGA:1 - chr2L 15523864 3' + opus 7492 2 79.45 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGAATTTATGTTTCTATAAGTGGACAAAACTAAACTATTGCATATGCTTATGATCACAAGTTATCCTTAAACACCTTGATTACCTGCCACAAATATAA:1 + chr2R 11610020 3' - roo 24 2 67.12 AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTGGGAAACCAACGCCATCGTCTGGATAGGATTTGCGACCTTATCAATAGTGACATGCACAGGTG:1 + chr3R 26969370 3' - copia 4926 2 59.72 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGAGCAAAGAAGTCAAATATTAGCACAAACACATTTGCGCACATGCATACATACATATTTGTATCTACCCACATTGAGTTTTTGTGCGGATT:1 + chrX 19506205 3' + P-element 2878 2 74.60 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCATTTAAATGCAAAATGAAGTAAATTCCAA:1 + chrX 12995420 3' - blood 49 2 52.05 ATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATT:1 + chr3L 3540231 3' - mdg3 5287 2 50.34 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCAGGCAGCAACAATATTTACAGCTTTAGCGGCCAAAAGCACAGTGGGGCAAAAGATGTTTTAGGGAAAAAATTATTCATAATTGATGTCCCAAAAAAGGCATGTAAAAATC:1 - chr3L 11296477 3' + P-element 2875 1 78.08 AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATATGTATATTCTTGTTTATCGTTCGCACAAAGCAAACAAACACGCACACACATGGGGACAGCAGATACAAATGAGTCAAAAACGTGACTT:1 + chr3R 19626023 3' + flea 4987 2 67.81 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTAAAGCATTCAAATTATATTTA:1 + chr2R 5485172 3' + 1360 3350 1 57.53 AGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATTCGACGTTAATTGATCTGTTTTTAATTTAGCTGCTTAAACAGGCGATAGGAAA:1 - chr2R 7540999 3' - F-element 81 1 67.12 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAACCTTTATGC:1 + chr2L 12696243 3' + pogo 2062 1 56.52 GGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCTGCCATAAAACAGAGACTGTAAAATGTGCATAACTAGCTGGGGCAATTTTTTAAATTTAATGGCTGATTGAAA:1 + chr3L 19398232 3' + gypsy5 360 2 52.05 AATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATATTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGAGCAGGCCGAGGCA:1 + chr3R 20720605 3' - 1731 4337 2 59.26 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTAAAGTATTTCAATCGACGGTA:1 + chr3L 22635802 3' + hopper 1381 1 61.64 TATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTACCTGTATATATAGATATATATTGTGAGGCAACCGCCGATCCATCACCGATCGATCATTCAGCAAGCAAAAAGAATTTAATTCC:1 - chr3R 24396680 3' - I-element 5135 1 56.85 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAACCTTCGAAGGCAGATCACTATATTTAGGCCAATAAAATCTTGAGAATTTCACGCAAATTCATTCATATCAGCCACATTTTACACAA:1 - chr3R 5684030 3' - pogo 30 1 63.70 TTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTTGTTGATTTCCTAGGTGTATAAATTATACTTTATTTAATCTGCGATGACTGCGTAAAAGCTTTTTGCCCCGGCAAGCGAA:1 + chr3L 9905856 3' - Juan 4067 1 56.85 GGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTCTGACTCATGTTG:1 - chr2R 9408156 3' - FB 54 1 54.79 TCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGTGCAACTGCTGCAAACTCTGTCTCCACTTGCAAAT:1 + chr2L 7905961 3' + Quasimodo 7288 2 75.34 GTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATCTTAGCTAGCACAATTTGTTTACGTTATAATTTTGCAGCCGG:1 - chr3R 443207 3' + Quasimodo 7294 2 74.66 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCCATACATGTATGAATTTCTCCGAGGCATAACTCAATTTGAGTCCGCTCACAGCAAGGATAATCATGTGA:1 + chr2L 2523027 3' + mdg1 7441 2 72.60 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGGTGCAAATTTTATAAAACAGTTTCAACTCGATAATCGGGTCAGGACTTGTGTCCTACATGTGTGTGTGCTCGGCTT:1 - chr2L 246559 3' + P-element 2844 1 56.85 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTGGCACGCATAATGGTGTTACTATTTTGCGATAGTATATTATTTGCTTGCTATCTTTCTATCTATCTTTCACTTCT:1 + chr3L 10241312 3' + pogo 2062 1 56.85 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACATATGTATATGCTTGGGGGTGGGCCATGGGCG:1 + chrX 1726734 3' - 297 6628 2 77.78 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACT:1 - chr3L 23146442 3' - 1360 32 1 63.70 GTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCATTGATTGTTGGGCCACCGCTTCCGATAAATTTCAGTTTACATACGTGACAAGCCATTCAGGTAAGAAAATAAAGCCCATTGTATATTGCGTTATATAAGC:1 - chr3L 25997961 3' + 1360 409 1 63.70 AAAGATTTTTTCTTTTTTTTTTTGAACTCATTTGTCTATTAGGGAATATGTTTCTTTCCCTTGTCATTCGAAAAAGAACCAAATGATAATTTTTTATTACCACACAATCTCTGTCAGGGATTCGAGATTCTGGGGGACTGGTTTAA:1 + chr3R 12928641 3' - HMS-Beagle2 491 1 79.45 GTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTACTCAGCCGTGATACGGGCCGAAGCGACCGAAAAAAGGGGTTACATAAGGGGGTCTGAAATTAAC:1 + chr3R 902622 3' + R1A1-element 5290 1 51.85 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAGTCAGTTGGATTGAAATAGAAGCGTCAGTGCAAA:1 - chr3R 22266433 3' + roo 9012 2 58.90 TTTTTTGCAAATCGATAGCAATTAACTTGACTAATGGAAATATGAAAATATATAAAAACATTTTTAATTGTACACTGTCCATGGAAAAATAAGCCATTAGGCTGAAAGAAACAATCTTTTCTTGGTTGCTTATCAAATTCCAGGTA:1 - chr3L 19466083 3' - INE-1 310 1 46.58 ATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAATTAAAAATTACCAAATGCATCTATGAAATTTATCGCACGACAGCCAGACTGACTAAAAAGACACAATGGAGCTGAAGGGACGCAACGGCAAGGAATTAATTTAT:1 + chr3L 1397129 3' + Juan 4193 1 67.12 ATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATAGATACGATGTGTTGTTGCAACAGGACGTGACTTGGGTGACTAAGAATGCAGGGCAGTCGGGATTCACA:1 - chr3L 9317451 3' + HMS-Beagle 6996 2 54.11 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCCGGAGTGGGAGGAATCAAAAGCCCAAACCGAATTCG:1 - chr3R 19989208 3' - hobo 28 1 65.75 GCTACGAAGCAATACATTATTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGATATTCCGAGTATACGTCCGTAAATGCGTATCGATTTCCACCAGTTGAGC:1 - chr3L 21765365 3' - gypsy 11 2 78.08 AATTGGATAGGCAACAAGAAAAAGAAACAAACACAGAGTTAAGCACTGATAATAAAAACAAACAAATAGATATAGTATGTAGATTTGATAAATTGACGCGCTCATTTTCTCGCACATATGTATGTATTGGTATATGGAACAAATTG:1 + chr2R 13429551 3' + invader3 5004 1 63.01 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGACGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCACAATCGAATGTTTAAGTTAAGCATTTCAATTATAATAGGGAAAATTCTTTGACTTTTA:1 - chr3R 14174685 3' - 297 58 2 56.16 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATGCATATAGAGAAGAAAAAGACCCCCATCAGGGGTAATTAAAAAAACTGAGCCATTTCATATCATCG:1 + chr3R 22676311 3' - 297 49 2 60.96 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGAATGGATCCGTAATGAGT:1 - chr3R 18940465 3' - mdg1 16 2 73.29 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCATGACCGTTTTTTCGGTTTCTCCATCGGGGAAATCTGGCCACCTGGCTGCAAATGGAATTGCCATTAAAACTGCATTCTTAAATTATTTTGAGGTATGCCGTTGAG:1 - chr3R 26658096 3' + hobo 2926 1 75.69 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGGAATAAAGTGTGAAAAAATTAATTTATTTCAATTACATTTCAATAAACACTGCCACACGTTGCGATGATGCTGCGA:1 - chr3L 21405369 3' + mdg1 7414 2 52.74 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCCAAACCGGATGTGCACAGTGTCAAGCA:1 + chr3L 10069017 3' + 412 7510 2 60.27 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGCCACTTGGCATGCGAGCGCAGGCGAATGGCGCCTCAAGGTATGCAGTAAATTAAAATGCAGTGACAGTGGCGGGCC:1 - chr2R 13381958 3' - jockey 56 1 54.23 GGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATT:1 + chr3L 3540195 3' - mdg3 5324 2 72.60 TCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATTTAAGTTGGCGCACTTTCCTCTTGCTTACTCTCACCTTTTTTTCC:1 + chrX 22578086 3' + 297 326 2 69.18 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTCCAGTCATTTCCTTTCAATTTAATATTTATGAAATAT:1 + chrX 10344854 3' - roo 8744 2 76.03 TGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCACCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCT:1 - chr2L 12325028 3' - jockey 4614 1 58.52 AACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCCCTCTCGCTCCGGTTCCCACATCCCTCCTTTATTTATCAGCTT:1 - chr2R 3292697 3' + hopper 1413 2 65.28 ATAATAAAACATTCGCTTGTACCAATGTACGCAGACGACGTTAAATTATGCCTCCAGCACAAGGACGTTTCGTGCCAATATGGTGCCGTGAAAGTATGATTAATATTTAGTTATAAGTTCTAACTTAGAACCCCCTAAAAACCCGC:1 - chr2L 12987569 3' + Q-element 550 2 67.12 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGTACTTACAATGTTTTCATTCGGCAATGACTTATTATTTAGCA:1 + chr3L 1324337 3' - 412 78 2 71.92 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAAT:1 - chr2R 15529692 3' + roo 9015 2 57.64 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATTTTTCGCAGTTATG:1 + chr2R 8375142 3' + roo 9032 1 57.93 AGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATTAGATATAAATCTAAATCAGTTCCGGCTAAAGTTGATTTATACCTGTAAGATAATAA:2 - chr3L 11340127 3' + Quasimodo 220 2 60.96 AGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATAT:1 + chrX 22517684 3' + 1360 3319 1 65.75 GTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCC:1 + chr3R 9862977 3' - Stalker2 7310 2 59.31 AAATTATACCACAAAATCTGAAAACAAAACAAGCAATTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTAGCAAATTAGATATTAACTAAACTAAGATATATCATTTATGGCTTTTGCAGGGTGGCTGCTCTTTGGAAAACCCCTTTTATCC:1 + chr2L 4137647 3' + I-element 5175 1 65.07 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAA:1 - chr2R 14450155 3' + roo 9008 2 64.96 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTATTTCTATTTGAACAT:1 + chr2L 2622745 3' - roo 8724 2 64.38 TATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTTCGTCGTTTTGCCAAGGAGACGCTCCGCTCAAAGGGAGGAAG:1 - chr2L 20985787 3' - F-element 72 1 65.08 AACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATACATTTAAATGTATACATTTGAATGCTTCTTTTTGCGTAAAATATTTATTTATATTTTGAACATTTTCTTCAGTAATAGTATTTCGGTTTAGTATTTTTCTCAGTGCACCTAGAGCT:1 + chr2L 13156642 3' - Max-element 7 2 78.77 GGCAGCGCCCCCCGGGCGGTTGGTCGGGCGGGGTGGCCGAGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 23244250 3' + Cr1a 4411 1 88.89 ATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTAGTTTGTTTTAAATTTTGCGTCTTTCTGATAATTCAACATCCAGCATTATTTATGGATT:1 - chr3R 15157549 3' - invader3 5214 2 64.38 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTTTTCCGAAATTCAAATGGAGCCCCTTTCTAACACTTTTTCTGCC:1 + chr3R 12540560 3' - roo 8737 2 69.86 CGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCATCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAATAATACTACGACGTTTTTGATAAAGATTG:1 - chr3L 11228098 3' - pogo 86 1 76.03 ATCCGCTTTGCGTTTTTATTGATTGAATATCAGCTTAAGACTGAAACAATTGGTGTGAGAAAATCTTAGATGTACTGGGTCGCTTACTTGATCTGCGCGAAAAAAACTTCTGAAAGTTTTTATAAATCCCTCTTCATTTTACAT:1 - chr3R 18690714 3' - Tom1 304 1 68.06 CAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCAAAGGACGGACGACAGAACGTTGAAGACAATAAGACAAATATAGAAATATACTTATGATATGGCCCGTCGAGTTTAGAGAGATTTGTAGTCACCGACGTGGTAG:1 + chr2R 18525888 3' + jockey 4681 1 75.34 AAAAAACTAAACAACAAAATAATAGTAAATACAATAATAAACATAAAAAAAATATACAGAATTGTAATTTAATTTAATTTTAAATGATATTATTTTCGCTAAAATATGGGACCCTGCGACCAGGGACAGCAATAAGCTGAGTAAAC:1 + chr2L 21750553 3' + gypsy11 3933 1 59.59 GGATAATTGAAAAGGTAAACGGCAAAATATCATTGATTTATACAAAATTCACCGGGCAACGGTGTATTACCAAATAAATAAATACAAAAAACACACA:1 - chr2R 19302312 3' - Tc1-2 142 1 76.29 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGAC:1 + chr2L 11043593 3' + roo 320 2 80.14 TGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATACCTACGTAACCAATCCAAGAATATATCGGATATATCATATTGGCTTTAAGTACGGG:1 + chrX 18561153 3' - copia 4934 2 63.70 ATTATTCTAGTGTCTTTGGTGATATGGTCGTTTTTAAAAATGGATATGGATGGATATATGGAACGGTTTAGAGAAGGTAAAAGGGAAAGTCTAGCCTTAGACTACGTCATTAAAACTCATTGTTTGCAGTTTATGTTTATATAAAT:1 + chr2R 5416041 3' - Tc3 239 1 58.22 CGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACATGTTTAAATTCTTGATCATTCTGTTTGTTTTTATGCAAATGAGCCCCTTAGGT:1 - chr2L 10685784 3' + Quasimodo 7302 2 69.86 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGAATGGCTTTACTTGAAATTTTTGTTCAACACAAGAGCACGTTTAATTATTACATTAATATA:1 - chr2L 15096830 3' + jockey 4986 1 67.81 TTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGATAGATCGTATTTTTGGTGGTCTTTTTGTCTATTTGTATATTTATATTTATTAT:1 - chr2L 23069853 3' - Stalker 7061 4 96.72 GAAAACACGAGAACCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACTGATTTCAGCAATTTATTAAGACCTTGTGAGCTATTAAAAATTTTACTACTTGACCGCTGTATTTATAAAATGA:1 - chr2L 12447396 3' - opus 42 4 54.11 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTGAGTCGGCCGGCCGACTGCTGCGTCGACCGCGACAGAGCCG:1 + chr2L 20716465 3' - P-element 26 1 67.83 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTGTTTC:1 + chrX 8610343 3' - mdg3 5286 2 60.00 CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATTCAAGAGGCTGCAGCATTTAACCGAACGCAAAGTAGGTATTAGGCTTTGCATA:1 + chr3R 6149859 3' - jockey 79 1 64.38 ACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTAT:1 + chr3R 13198264 3' - Doc 85 1 72.60 CATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCAAGACTAATCAAAAGTGTCTTTTCTACACTACAAGTAAAGGGTATAAATTAGCCACAAAACTCGAATAG:1 + chr2R 7024494 3' - diver 5940 2 53.42 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCAAACTTTATTTTTTTGCCATAGAGCATTTCTCAGCCGTTCTGTGAGCAAAATTTCTCTAGGTCTCCTTCTTTTATGCTCCTTATTTAACTTGCGGTCGCTTTTGG:1 + chr2L 12814858 3' + hobo 2923 1 73.97 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTCCTTGCCGGCGGCAGCATTCTGAGCGGGCTGCCCAT:1 + chr2R 14450220 3' - roo 85 2 74.66 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGTCCATTTGGGTAACTAAATAGCTTATGGTTAGTTTCCGCGAATTTTAAGATTGCCTTTTGAGTTGAAAGCATTTGGCTCATTAAAAATT:1 - chr3L 5425421 3' + blood 7358 2 62.33 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACTCTTGCATACACTCATACCTACCTAGGCGTCTTTTCTAGGTTATCAAACGGTAAAAACGCGGCGACACAAATACTGATACTC:1 + chr2R 14486603 3' - 297 35 2 60.96 ATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTT:1 + chrX 8610340 3' - mdg3 38 2 58.90 TTCTTTTTTTTTTGTTTTGATCATTTTTGGAAAACCCATTTCTTGGTCGCTTTTTTTTCATAATTTGCTTGCCTTGCCTATTT:1 + chr3R 9286319 3' + Tc3 90 2 51.81 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGAGACTTTTGCGCACTCTTATACAGAACGACTAGTCTTATAATAGCTGAGAGAACAGAATGGC:1 + chr3R 9158323 3' + P-element 2830 1 46.58 ATAATAATAATGATAATAATAATTTAAAAAGTAGAGTTGTAATACTGCATTCGGAATTTTAGTAAATATCATTAACGACTATTTTAGGGTAAATACAGTACAAATGTGCATGTTATTTGTTTTTTGTAAGACGTTACAGACTCTAT:1 + chr4 583289 3' + mdg1 7076 8 79.45 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTAGAATTTATTCCTGTTTAAGTTTTAAGGTAGCTAGTTGAGCTGTTTTGACTGTAAGTGTCCTTTCGTCCAATTCATTCTGTCTGCGTTTCTGC:1 - chr3R 18539750 3' - roo 29 2 66.44 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATCGAATGGGTAAATAAATGGAAAAGTTAAATTGGAAATGTGTGTGCGGCGAGTGGCGCCATCAATTGGCAGGTACTCTAATCTGAGTGGCGTCAT:1 + chrX 17531975 3' + blood 351 2 67.12 GTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAATCATTGCACAAACTTATGGCCCACTCACACTAGGCCTGCATCCTTGAAGGACTTTTCTGTGGAAACTGTGCGAACTTTCC:1 + chr2L 6231535 3' - hobo 2540 1 56.16 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTTCGTCGTTTTGCCAAGGAGACGCTCCGCTCAAAGGGAGGAAGCGTTTAATTAAAAACATTTTGTATACACATTTGCTTCCTTTTGC:1 - chr2L 20985743 3' - F-element 48 1 56.85 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGCCGTCGCCGCACACGCAGAGCATTCGCTGCGCGCTCCG:2 + chrX 1831338 3' - P-element 48 1 52.74 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAATTGCAGCGTATAACTACTATAACTAACAAGGAGCAGCAAAATCCATTGAATTTCGCTGTCAAA:1 + chr2R 13052898 3' - Doc 59 1 68.49 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATAATACAATCATATTGAAATCGAAGCAGGGCACCTGACACAAATA:1 - chr2L 8852733 3' + Burdock 6366 2 61.64 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCAAATGCCTTTATAGCTTATGAGTTATATCCGGAGAATCGGATATGCGGAATTGGGAAAAGAGAAGAATCCATGCGATATGATTGT:1 + chrX 20369510 3' - roo 21 2 76.03 CACACACACACACACACATATACTTGTCCACTTGTACACAAGTCTTAACCCATTTGACCCCCTGACATTCTTTCATTGCCTGCTTCTTGCTGCAGTAAGAGAGCAGATTAAATTAAGGCATTTTTATTATTTGCTATTATTTGTGC:1 - chrX 3646351 3' + accord 7030 2 63.01 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCGTAAGTCGTAAAGCCCTGAGTTTGTGGGTCGTCTTGTACGTGTTTAC:1 - chr3R 12547864 3' - hobo 75 1 67.12 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATGTACATATGTGTCTATCACACTGTCTACCCACTTCAAAGGTCATCGGAGCTTGTCCAAGTCGTAACAGCAAATTCATAAAGTCATTTGCAATTTGGCTGCCA:1 - chr3R 22275212 3' + flea 245 2 72.60 ATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTA:1 - chr3R 443023 3' - gypsy2 20 2 70.34 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACGTATATGTGCACATATATATTGCAGTGCAGTCAAGGTCGTGTGAAAGGGACGACAG:2 + chrX 13484208 3' - hobo 66 1 64.38 CTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGCACTTCATTTATGTTGGGCTAAATATTGGTTTATGTGAATTATTATTATTATAATTATATATTTTCAAAGTATATGTACCCTTTACTTAGACTACTTATA:1 - chr3L 11855814 3' - Transpac 4937 2 71.92 GAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATATAAAAGTAAAAAATAAAATGCAATCGATGCACGAATACATTCTGTAAAAAGAACTTCGTTT:1 - chr3R 5172606 3' + roo 8827 2 58.22 TCTTAAGCTATAATTGAGCGCTGCCAGATCAAAACATATAAAGCTTATTTAAATTATAACGTAATTTCAACACATATAAATACCTTTTTGGCACTTTAGATCAAAATGACAAAGAAGAATGTTCCCTCAAACAATTACCATCGGCG:1 - chr3R 9043982 3' - Copia1_DM 51 1 50.68 GTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGCGGTTGGGCGTGAGCGGGAGAGCGTGTGGAAAACAAGTGCCAGCTGACTGA:1 - chr2L 11638975 3' - springer 37 2 58.22 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCAC:3 + chr3L 3540255 3' - mdg3 26 2 66.44 CAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCAACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAAATTTTTGACATTTAATTTAAGAATATTGAAGGAG:1 - chr3R 19144367 3' - Juan 34 1 54.79 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTACGTGTGTGCAAGGGTGACAGCTGTCGCCCCAGGGAGAGCAATGTAAGTGAGTA:1 - chr3R 17079416 3' - 1360 21 1 57.14 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTAACTCAAGCAATTCAATAACAATAACTAAGTAGAAATTCTTTTCAAAATAATACTATACACGAATCCTTCAGTCAAACCCCCTACAATATT:1 - chr3R 18514292 3' - pogo 26 1 66.90 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGTATCTCCGGCATGTGCGTATCTCCAGTTCGTGCACCTTGAGTGTAATTTAAATACAAACGAATGAATTTATGAAGTGCCGGATATACGGATGCTGTGCAAACA:1 + chr2L 10178132 3' + mdg3 5481 2 73.29 TNTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATTTGTTTTGCCATTCCTTAAGCTTTACAACAACCATTCCCATGCAGCAGATA:1 - chrX 13807990 3' - pogo 65 1 65.07 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATCAACCCGCGTTATTATTTTAGATTGACTGACGTTCATTAT:1 + chr3L 19788182 3' - FB 67 1 70.23 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTATTTATTATACCAGCTGTTCTTCTTCGTTTCATTAATTTTGTTGCTGTTGTGCTTCTTTAAAGCCTTTCT:1 - chr2L 13102852 3' + roo 9022 2 52.74 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCTGATGTCTGGAAATTTGGAGTGCA:1 + chr2R 12642782 3' - pogo 12 1 76.60 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGGACCGGACACTTGAGAGAGAGAGAATTCTCCG:1 + chrX 13642093 3' - P-element 73 1 28.46 GGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGACTTTGTGTCATAAACACCACTGAAATGGAGCGCCGCAACACCTGCGACTGCTAAAACGCCGGCGGGCCACAACAAATCAAAAACA:1 + chrX 10561853 3' - jockey 4707 1 58.90 GTTGAGAGGAACTTTCTTCTTTTTACTTCCAGCCTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGTAATAAGAATATGTTTTACGACGCTTAACTCCGATGACATTCAGACAATTTTAGATAAAAAGATTTAATTTTTAAAAATTTATTTATTGTTA:1 - chrX 9029786 3' - Gypsy6A_LTR 277 1 60.27 CTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGTGCAACTGCTGCAAACTCTGTCTCCACTTGCAA:1 + chr2L 7905959 3' + Quasimodo 7286 2 77.40 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAAGAGCAGTCGCCA:1 - chr2R 14450141 3' + roo 393 1 62.14 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAAGGGATAGGAAGCGTTTTGATATGATGGATACGGGGCTGCCGTGTGTAATGGGCACTTAGGTCGCTGCCACATGACTGCGACATTAG:1 - chr3R 5767341 3' - roo 35 2 61.64 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTA:1 + chrX 7624124 3' + roo 319 2 82.19 CGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAAGAAGATTAAGTATGTGTCACATAAATCAATGCAAATTATTTGACTAGCTCGATTGAAACTGATTCATTAAG:1 + chr2L 9229513 3' - Cr1a 359 1 54.79 CGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTGTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCAGCAACAAAATGTGGAGTATAAATTGTGCTTATAAATGGCGAGCGAAAGAGATGGGTGTTTGGTGCGTGAAAGAG:1 - chr3L 1982899 3' - Transpac 107 2 52.74 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGTGTATCCTGGC:1 - chr3R 23565273 3' - jockey 96 1 78.08 GCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAACC:1 - chr3R 17660024 3' + micropia 385 2 67.61 CAAAAAAAGAAAAAAAAATGGGGAAAAAACACGAGCACATAAGCCTGTATCTGTGTGCAAACACACTCACAGAAACAGCTCACACACACACACACACACGCACTAACGCAAGTGCAAAAATTGTAGCAAAGGCAACAACCAAAATG:1 - chrX 3761382 3' - hopper 140 1 63.70 TTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTACATATATATACGGGTTAAGGGCAGCGAGAGAATTACCG:1 - chr3R 22676208 3' + 297 322 2 76.03 TCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAACCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACTGATTTCAGCAATTTATTAAGACCTTGTGAGCTATTA:1 - chr2L 12447433 3' - opus 7195 2 69.86 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGCACAACAAATAAATCAATTGGCTTTGCCTAAAACGTTTGAAATTGATTTCAAGTTCTTTGGCCCATTGTTTTTATA:1 + chr3R 28788811 3' - I-element 47 1 53.42 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACAGGAAAATGTGTGCTTCTATGTTTTCGCCTCAAGCTCATTAACTGCTCGGAGCTCTCCCTACTAGATTGTTATTTTTCCCTCAGC:1 + chr3L 5425577 3' - blood 7047 2 61.64 TGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATAGTTTGAATTTAATTTTAAACTTTTTATGCCGGAGACATCGTTGCCAAGCTCGTT:1 - chr3R 19625885 3' - opus 169 4 62.94 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAGCGTTTGCAAACGTTTGGTGTGAATGAATTCCTGAAAGTATGCA:1 + chrX 15137347 3' - jockey 4746 1 68.97 GATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCATCTTTAATAAATATCTTATCATAAGTGATGAAATAAATCTTCAAACCCCTTACTCAATGCTAATT:1 + chr3R 11163122 3' - mdg1 7093 2 60.96 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTTTGTATTGTTTCCCATTTCAAATCTTCCAGAAACATTCAATGAAGGAAAATATATAAAATGTATTAA:1 + chr2L 13102973 3' - roo 8716 2 55.48 ACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGCACGTGATCTATTAATATTTAAAAATCGACCTACTGCATATAAAAATCATAAATTGAGATAAGCTCTAAGAATTTAATTTTAAAACCAAGA:1 + chr3L 15374749 3' + 3S18 6073 2 63.70 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTAATTACCAAACTGCTGAAATAATTATTGTGTTGGTTCTGTTTCTGTGTGAAGGATGAAATGGAAAGCAATTTAACGAGACACATGGGCACATTATCTCGGTCTGCTTCAATCGATG:1 + chr3R 25053160 3' + pogo 2098 1 80.14 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGGTAGCTGGGAAAGTTCAATTGGGCAGGTTCAGATACA:1 + chr2R 24021685 3' + pogo 2068 1 61.64 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAATTTGAATTATTGTCTACGTATTAGAAACTGTCATTGTGAGTCTAGTTTTACCGCCTGAC:1 + chr2L 42645 3' + copia 241 1 75.34 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGAAGTAAATGTGGTTCATATGAGTATCCGAACG:1 + chr2L 8009171 3' + roo 9029 1 54.11 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGCCGCTG:1 + chrX 19744507 3' - P-element 40 1 51.20 TAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCT:1 + chr3R 24301905 3' + Tabor 7254 2 64.38 ATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCG:1 + chr3R 24301891 3' + Tabor 401 2 73.97 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGAGTTAAATGGCACACGTATGAGAATATAATTAC:1 + chrX 9864989 3' + hobo 2871 1 74.80 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGACTATTGAAGTCTATCCACTCTATATGAAGTTCGGAAGTTTGTGGCTTTTATCGACTACAAATCCATAAAATATCACACAAATAAGCTTCAGCAGTTTGTCTCTCATTGACG:1 - chr2L 11043466 3' - roo 8672 2 77.40 TTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAAACAAATAACATCTTCTCTACAAAGAAAATAGAGCTAAAGATATATACACAT:1 + chr3L 22638901 3' - Juan 4114 1 64.38 TTTTTTTTAAGAAAATATTTTTCTTTAGAAATTCACTGGATTTATGGTGTGAAATTTATACACACTGTGAATATGAGTTATGTTTGTATATCACTGTATATTTCCTATATATTCTTCTCTTTTTATTAATTAACCTTAAAAAGATT:1 - chr3L 8041802 3' + hopper 163 1 69.18 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGTGTGTGGGGGCGCTGGACAATCAAAATTGA:1 - chr2R 14486496 3' + 297 347 2 77.06 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAAT:1 + chr2L 20327675 3' - roo 8706 2 66.00 ATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATCTGGGTACCAACCAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 5105 1 76.71 CAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTT:1 - chr3L 3540130 3' + mdg3 174 2 64.83 TTAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGC:1 - chr2L 10178012 3' - mdg3 86 2 73.29 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTAAACGTATTTTATAGATCATTTTGTTCTCATATGAGTGTAAGCGGAA:1 + chr2L 770060 3' - roo 66 2 67.14 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAATTGCTTTTGATTGACTCATTCAATGCGATTTGTTTTGACGGCTTACGTTTCATTTATCAGGCCATAAAAGGAGC:1 + chr3L 13475622 3' - HMS-Beagle 6840 2 55.48 CTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCCCGCGATCTCCGGTT:1 - chr2L 20716377 3' + P-element 2792 1 15.94 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCACACAGTCGGCATTCCGCACTAGACGGACAGGTAAC:1 + chr3R 5684182 3' + pogo 2057 1 55.48 TGGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGTAGAATTTATCTTTAGCTCTGAGCCCTCTTAATCTGTAAGATTCCAG:1 + chr2L 6716434 3' - hobo 27 1 67.12 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAAACATTAATATGCTGGCTGAAGTTTCGG:1 + chr3R 13198319 3' - Doc 24 1 71.43 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAATTATGGTGGAACAATGGCTTAAGAAATTGATACAATCCAATTGAGGTTGAAATGATACA:1 - chr3R 7305904 3' - 412 60 2 60.27 GCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGCATTTACTAGTCGGCAGCGGAGTCATATGTTGAAAAACCCTGTCATTAGATTGACACTAAGAAGAAATCTTCTTTGCTTTGACGGAAGTTGGGATTTAT:1 - chr2L 20223093 3' - P-element 21 1 56.16 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGAATTTAGCATAACTAATAGTACAGTTCAGTGCACATGAGTATCTTCTTTTGAATTATGGCTGTAAGTTAGCCTTGAAAAATGAAAATCAGTGAAA:1 + chr3L 19938605 3' - roo 25 2 69.18 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGGTAGATGAAACGTATTGCCTTTTTGCGCTGAGCTGGGAGGAGACCCGATCCCGTATGTCTGCTAGTTGCAATGGGAGAGTAGTGGATC:1 + chrX 13808122 3' + pogo 2087 1 70.77 AGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACA:1 + chr3L 11777678 3' - blood 26 2 33.56 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGCCGTCGCCGCACACGCAGAGCATCCGCTGCGCGCTCCGCCGACAAAAACACCAAA:1 + chrX 1831355 3' - P-element 30 1 62.07 GACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGTTGCATATAGATGGGCTGGCCCATGG:1 - chr3R 28937804 3' - jockey 4720 1 54.84 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACAGGAAAATGTGTGCTTCTATGTTTTCGCCTCAAGCTCATTAACTGCTCGGAGCTCTCC:1 + chr3L 5425550 3' - blood 63 2 63.01 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGAGAGATGGGAGTCTCTACTCGCTTACAAACCGCAAATACTTCTCTGAATGTT:1 + chr3L 17896035 3' + P-element 2852 1 63.01 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATAACA:1 + chrX 10429857 3' + roo 8993 2 72.60 ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGTATATAAGCGGGAGGTTTTAGGGGGCTTATAAGGTGAAATCCATAGAGAAAGTTGCT:1 - chr2L 15523917 3' + opus 436 2 63.70 GGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGTGAAACACACAGAAATAGCACAGTGTCC:2 + chr3R 15157734 3' + invader3 267 2 75.34 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGCA:1 + chr3R 15363475 3' - 412 7136 2 74.66 ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATATAATCGAGATGCCCTCTGAAAGCGTATAAAAAGTCAACCAGTGTTTT:2 + chr2L 10685910 3' - Quasimodo 33 2 63.70 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTGCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGAAGTAAATGTGGTTCATA:1 + chr2L 8009157 3' + roo 9015 2 55.48 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAATAAATATTTACCGGGGACAAGAGGCGTGGGCGA:1 + chr2L 19907618 3' + hobo 2875 1 75.00 TCAAAAACAAAAAGAAAAAAAAATATACCCTAAAAAAAAGCATAGAATGATTTAAGAAGCATTCGGCCACATTTTCCACCAATCGCATTTGCCCAAATGCTCAACCAATCTGAAATTGTGTCTTTGGTGCGCTTGTTGGCTTGAAA:1 + chr2R 20377750 3' + R2-element 3584 1 69.18 TTCCTGAGGCCTCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGTACCTGAAAAGAATAAATCAATAACAATGTTAGTGTCCTTGGAATTGCTGTGCGCAGGGTAAAGGTTTCCCAGAATTAAGCCTCCCCATTTGTAACTAA:1 + chrX 18901959 3' + TAHRE 10074 1 55.48 GGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAAC:1 + chrX 21667930 3' - gypsy2 76 2 69.86 TTTGATTTTCGAAAATTTTTGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACTAATTGGGCAAATGGGCAAACGATTCCTGCTTTTAAACATAAAATTTGTCCCTTGGAAGGAATAAAGTCTGTTGACAAAAATGAGGCTGA:1 + chr3R 19448117 3' - FB 144 1 67.81 ATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAGTTACTCTTACTCATTGCTTCCGCTTCGGCAGCAGAATTGGGCTATAATTACCAAGCTGCTGCTGGCGACCG:1 - chr3R 26693286 3' - Stalker2 7250 2 77.08 ATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCAAACCCAATTAAAATGCGGTCTAACTAGATTGCTAACTTAACTTCCAATTAAC:2 - chr3L 17710596 3' - I-element 68 1 60.96 TTCTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGTTGCATATAGATGGGC:1 - chr3R 28937814 3' - jockey 4752 1 65.75 TAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTTTGGGTGTTAGAGTGGGTGTGGCAAGAAGTTTTCTTGACAAATCGACAGAATATTACAAGATTAACCGCTGCCCAACTGGGATCATCATGGCGGTGGAGTG:1 + chr3L 6484861 3' - INE-1 259 1 75.34 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGAGTAATCTCTTAAAGTAATCTGGCAACACTGGAATAAGAATTATTTCTTTGCAAAACATTGTCAACAATTTTGAAGAACTTCGAAATTTTA:1 + chr2R 11691330 3' - P-element 29 1 65.75 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTAGCACAAAAAACAGAACTTTCATTCTTCAAATCGTTGACACCAATCGTGTCTTTCAATGTCATTACAGAAAATTATACACCCAAGTAT:1 - chr2L 8909761 3' + roo 9038 1 60.27 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATAATACCACAGGTACTCTTCTCCCCTCGCATTTGAGCCACCACCAGACTGGACCCATT:1 + chr2L 20253955 3' + roo 357 2 52.05 CAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTACCAACGAATTTATGTTTTCAGCCATAAATTGCCAAACATATACGCCCACCTGGGCGCCGCTTGTTGATGGCC:1 - chr2R 18927754 3' - 3S18 5812 2 55.56 CACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGT:1 + chr2L 19841577 3' - BS 61 1 60.27 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTC:1 - chr2R 14921481 3' - pogo 67 1 65.75 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGAGACGAGCGCAGAG:1 + chr3R 5087159 3' + P-element 2825 1 43.06 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAATCTTTCCCAAGAGGGTTTTGATGGGGTTAGGTTCTGTTACTGGTTAGAA:1 + chr3R 10736850 3' + copia 183 2 68.49 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACGATTCGCCGTCGCCGCACACGCAGAGCATTCGCTGCGCGCT:1 + chrX 1831335 3' - P-element 51 1 50.68 TATATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTCAGGGCCAACGTCTGCTACGAAACTTGCC:1 - chr2L 23372477 3' - gtwin 21 2 71.23 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGTATGAATTTTTATAGCAGGAATAGTGTCCAGGCTACAGAACAATATGCTTTGGCAGAGTTCGTTG:1 - chr3R 25929320 3' - 297 47 2 59.59 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAAAGGAAGAAGAGCAAGGAGGCGGAGCCATTAGGTGCATGCAGCAATTTGCTACAGAAATGGGTCCACTGGCCATGAAATAATCGTATATA:1 + chr3R 26849111 3' + mdg1 7439 2 60.96 AGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTT:1 - chr3R 19589926 3' - BS 5069 1 66.44 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGGGCACGCCCCGTATGTTTGTACAGATATAAACTGTTG:1 + chr2L 15601673 3' - Doc 26 1 63.89 TTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAACAGAAGAAAATCGATGGCAGGTAAAAAGCGGAACAGAATTCCTA:1 - chrX 12131135 3' - F-element 345 1 59.59 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGAAACCTCATCGAACTGAAGACAAGGCGTTTTGACTTTTTTTTATGCTGACGCTAACTCGAAAATAATTTGATATTTTCAATTAAAGTTTTCAATGGCTTTTGAAAAT:1 + chr2L 16360711 3' - hobo 14 1 71.92 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAATTATTATTATCAAATAGACAGAGTTAAAGAAGTACACCCC:1 - chr3R 13201781 3' - 297 6626 2 66.95 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGCTGGACTTTAACCTTGTATTTAGAATGTTTAATGACACATAATTAGTTTTACTTCTTAAATTATTTACCTAAAAACAAGTAATAGA:1 + chrX 127092 3' - hobo 34 1 62.33 ATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATAGTGTTTGGTTAAAGTTGACTTAGTAATGTTTACCTCTCTCTGTTTACTTATTAGTGTATA:1 + chr2L 1922591 3' - BS 5057 1 61.64 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTTTGGACAGCCTGTTGGATTTAATTTGAGACTCTTCAGTTTGCATTTGGGCAATTCCACACGCAGGATGCACGATGTC:1 - chr2L 9988082 3' - hobo 43 1 55.48 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGAATGG:1 - chr3R 18940478 3' - mdg1 7067 2 64.38 GAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAAACAAAGGCAAACATTTAATTGCCTGACAGAATGCAGTTTTCACAGTTTCGTCATAGAAGTTCAAAATCGAC:1 - chr3L 18824514 3' - 1360 3219 1 51.03 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCCCCCATCCGTGCCACATGGCTTTGATAACAACACTTCTCCGGGGATAGTTGCAGGCCATTTTTGCAGTCTCAAGC:1 - chr2L 2522867 3' - mdg1 7078 2 57.45 ACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGAAACAAATATGAGTTTCAAATTTGGTATTTCAATGTGATAG:1 - chr3L 13475471 3' + HMS-Beagle 217 2 65.75 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCAATAGGTCCCAATAAAACTTAAAGTTACTTCCAATTTATAAGGCATTCTTTTAGGTCCAATAATTAAGTTCTTACATAGACCACATCGAATT:2 + chrX 16538229 3' - mdg3 26 2 67.81 AATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACACAAAAAGGTCGTGCACAACGGCTTCATCTGCATCGATTCCAAGAAGGGTCTGCCATGTCGCGGC:1 - chr3L 6092385 3' - R1A1-element 12 1 50.77 ATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGCAATGCAAAACATTCAACGACCATTT:1 + chr3R 15035002 3' - Stalker2 93 2 55.17 TATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACAAACATTTATAACTTTGAAATCATTTAGAGTTTATTTGCACCAACATGAAAGAAGCAAATAAACACTGATTGGTTGACAAAA:2 + chr3L 11754794 3' - Doc 122 1 52.74 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAGAC:1 + chr3R 4352142 3' - Doc 43 1 58.02 AGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATGCCAGCTTCCTGCT:1 + chr2L 8807947 3' + HMS-Beagle 6988 2 56.16 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTATACACAACTATTAATTTTTGCATTGACTTCTCTCAGTGTATTCTAACAGAAAAAATTATTTCTCAATGTTATATCCGTGAAATAGCCTGGTCACACCGACGATAAGCAG:1 + chr3L 13016039 3' + hobo 2926 1 76.03 GGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACAAGGACTGGCCAAACATTAACCCTTTTCGATGCGGTTGGGCGTGAGCGGGAGAGCGTGTGGAAAACAAGTGCCAGCTGACTGACTGGTCAAATATAAA:1 - chr2L 11638960 3' - springer 22 2 68.49 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTGTTGTTTAGTTGAATGCAAAATCAATTTGTAACGAATTTAACGCACTCTTTCGTCCGATTCTTAAAAAT:1 - chr2R 14445637 3' - F-element 67 1 54.11 AGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTTACTGTTCTGAGTTTTTCTTTTCTTTATTGAACGTTTTCCAAGAATTTGCGCGCTTGCTAATTCCGAGAATTTGTTCTATATTTCTCACGATTCCCGGT:1 + chr3R 4520229 3' - S-element 1714 2 69.86 ACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGCACCCATTGTGAGCGTTCATTCGCTGTGATGTCGGACCTG:1 - chr2R 7517434 3' - hobo 291 1 69.47 TCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGATTCATTCATCAAATGTTCAATTAAACTGAATCTATAGCTTACAATATACATGC:1 - chr2L 15526045 3' + opus 396 2 63.70 CGATTCATTTACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCATCTAATCGAGTTATGACAAACTGAGTATGAAAAGAAAAGCTACAAAATAACAACAGAAATGTGTTT:1 + chr2R 15529801 3' - roo 8718 2 53.42 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCAATGTTTACTCTTGAAAATAACTTATAAGACATGCGAGTGATATGGACTCCTGAAGAATTCGCGTTCGTTTATGGAAAATCCGCG:1 - chr2L 951283 3' - F-element 27 1 67.19 AAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 191 2 76.92 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATTCCGTTTCATTCATTTTCATTCGACG:1 + chrX 1831295 3' - P-element 91 1 23.29 AGTACAAAGTCCTCTTATATAACTCCGTTTTAAAACCCGGTATCTGCTCCGCTTCTCTATACATACATACATAATTAAATATATTAATATGTTTACGTTTCCTTCTCAACGCATTTGCTTTGTCTATTTTGTTTTGCAATCCGCTT:1 + chr2R 6699192 3' + Doc3-element 4280 1 71.23 ATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATAATACAATCAGATTGAAATCGAAGCAGGGCACCTGACACAAATAGGACGAAAGGAC:1 - chr2L 8852721 3' + Burdock 6378 2 71.23 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGAATGGATCCGTA:1 - chr3R 18940471 3' - mdg1 22 2 69.18 GGCAGCGAGCGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCTATAATAATCTTTTTATTATTATTCATATACATAAGGGTGTTTCGTAAATATTTAATTAAGCAAAATCATTTCATCTATTAAAACAATTTCACAAAT:2 + chr2R 2052700 3' + opus 7475 2 67.81 CAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCACCTTATCTTTACATATGTATTAATATAATATAGTTCTATATTTTTGTTGCGCTCCTATGTGGTAAGTATTTTACCGGTATGCA:1 - chr2L 12814689 3' - hobo 35 1 58.90 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTCCATTTGGTGGCCGCCAGTTGGTAATGGCTG:1 - chr3L 1983473 3' + Transpac 5172 2 71.55 TGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTTGTTCGAGAGCGAGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTAGCAAATTCTTGTGAGCTCCAGTGTTGCACCTCTGAGGATACGATGATTTTAATACGATTCATAATAAAGGAAACATGGTTGTTA:1 - chr2R 3921341 3' + 1360 45 1 55.48 TATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGAGCGATGTTTTCTCGGCGGCAGCAGCGTTAAGACTAATGCGAGGGGCAGCAAAACTTCATGTTTTATGGAACTGGCTG:1 - chr3R 25094947 3' - P-element 434 1 58.04 GTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCA:1 + chr3L 22635745 3' + hopper2 1517 1 76.71 TATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGTATTTAGGGATT:1 + chr3R 11550286 3' - F-element 77 1 64.38 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCTGTAACCAATCGAA:1 - chr3L 19510481 3' + pogo 2047 1 56.85 ATATAGACAGACTAAGAACACATGAAATTAACTTAGCCTTAAGTTTGGGCAAAGCGATAAAAACTCACAAAAATGATTTAATTTGAAAGAAATCAAAATTGTGGGAATCATAGATATGCGCGACCTTTAAAATGCTTACACAACGA:1 + chr2R 5542850 3' + G4 3613 1 73.97 CCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCAAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACACACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACATGATTTGATGGCGTTTGGCGTTCGAACGGGCC:1 - chr2R 13363446 3' + 1360 83 1 75.36 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTTTGGACAGCCTGTTGGATTTAATTTGAGACTCTTCAGTTTGCATTTGGGCAATTCCACACGCAGGATGCACGATGTCCTTCGCATAATGCAGCAATTGCTGTGGTCAGGCGTG:1 - chr2L 9988046 3' - hobo 7 1 80.14 AAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAA:1 - chr3R 24301830 3' - Tabor 6917 2 68.49 GAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTA:1 + chr2L 12696222 3' + pogo 2033 1 65.07 ATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGAAACAAATATGA:1 - chr3L 13475500 3' + HMS-Beagle 188 2 62.33 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAATATGGAAAATAACTTAAATTACCAGATGCGGCGTGTGTAATATTTT:2 + chr3R 29381638 3' - hobo 19 1 71.23 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAATTAAAAAAGAAAGCTGGCTGGCAGTTTAAAATGTTGATGAAGTAATTAGTTTAATATGCGAAATGCCCCTGATGGGCGGCGGGAGAGGGCGTGGCACATAGGGAAGTGTAATTGAA:1 - chr2L 2518445 3' + jockey 4984 1 71.23 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAATACATTAGAGCAGCTACACAGGATATGGAAATTATTCGA:1 - chr3L 13631275 3' - hobo 81 1 71.92 CAAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTTGTATTTACAAAATATTTGTTGGAGGAAATAAAGTTCCAGAGAGAAGAGAGCGAAAATCTTCCAT:1 + chr3L 23206608 3' - Cr1a 221 1 59.20 TTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTT:1 - chrX 16857070 3' - pogo 76 1 70.55 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAAACATTAATATGCTGGCTG:1 + chr3R 13198310 3' - Doc 37 1 63.19 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGACTCCAGCAACAACAACCACACGGCAG:1 - chr3R 17794519 3' + P-element 2836 1 46.58 AATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATAATGCCATACAATCTGAAATAGTCTGTTGTGTGGCAAATTAGATCTAGAAACTGATTGATATATT:1 - chrX 18318145 3' + copia 5070 2 55.48 CTACGGTTAGCTAGGGATGGTAAATTAATGAAAAGGTAGAGTGCAATTTAGGGTATTAAGAAAATATACAGGTCTCCATCAAACTCCTTCAGCCATTTTATAATAATTTGATACGCCTTAATTGATCAGAGTACTCAATGTCAATG:1 + chr3L 27084716 3' - Cr1a 4002 1 56.16 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTGTG:1 - chrX 13484118 3' + hobo 2897 1 54.03 CGTATAAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGTAGGTTTAGATTAAGCCAGCATACAGATTCTAGATACATATGCTTGAAGTTCTATATACTTTTACGTTTAAAAAAATTTATTTTTATTAATTTCCCTTATTTATATG:1 - chrX 12424649 3' + INE-1 136 1 51.03 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCATTTAAATGCAAAATGAAGTAAATTCCAACCATTGTGTTTCC:1 + chrX 12995433 3' - blood 36 2 60.96 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCATTGGTAAATACTTTTTTGGTAAATACTTTTTTTTTCAGTTGGGGCCGGTGGTCGGAACTTTTGGAGTTAGGACAATTCAAACGAG:1 - chr2L 232333 3' - Doc 38 1 51.37 GATTCATTTACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCATCTAATCGAGTTATGACAAACTGAGTATGAAAAGAAAAGCTACAAAATAACAACAGAAATGTGTTTT:2 + chr2R 15529802 3' - roo 8717 2 52.74 GAGGAATATTGTGTTAGCTTTGTTAACTGTGTGTTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGGTTAACCAGGGTGGCGAGGTCATTAGATCA:1 - chrX 21933806 3' + gypsy11 336 2 47.95 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCGGGGTGA:1 + chr3L 10111850 3' + copia 184 2 65.07 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGATATTAGATTAGATCTGAAACCAGCTTAAGCCAATTGAAAATTAAAGGCGCATCACAAGTGGGCATAACAACGTTTATTGCAAATATACAAAATGCTACTAATT:1 - chrX 16325077 3' + Transpac 296 2 74.66 GNGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATTTACATTGTACATATCTCATCGCTGAAACGGATTAACCGGCTGATATGGC:1 - chrX 13738412 3' - 1360 3240 1 75.34 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTGAAAATCTTTAGAGATTTCGAGTGTTCTGGAAAGTAGGAAGTTTCCGGCTTCAGTGGGTT:1 - chrX 7624049 3' - roo 8723 2 58.22 TTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAG:1 - chr3R 9657684 3' - BS 66 1 65.07 TATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACACGCGTAGATAGGGACAGCAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 46 1 67.12 AGTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCCAAAAACAAA:1 + chr3R 18935168 3' - jockey 4751 1 67.81 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGTGGAGTAGCTTGGTCTGGCAATGGAAACATTTCGTGTGCTTTTCACCTCTTACTGAGCTGCAGTTTAATTCGGTTTTTCAATACCTAGTCCCCCTGG:1 + chr3L 21405522 3' - mdg1 7062 2 68.97 AGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGAGCGGCGAAGATGTCAATGTTCTATATGGCCAATCAAACCAGTTGGATGCATTTAGTACGGCCCTGGG:1 + chr3L 12887381 3' - Juan 3865 1 48.06 AGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATATAACTCCGGC:1 + chrX 21772513 3' - springer 7194 2 63.33 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATTATATTGCATACAATTTTGTTCGTCCTAAACATTGTGTAGCATTTTATTCAATTGGTGGCAACTATGATGAATAA:1 + chrX 14318508 3' - 297 36 2 61.64 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAACAATATTGTTTTTTAACTCAAAAGGAATAGATGATAATGATATTCAGAACACAGCAGCTAGCGCAGAACTCTCTGTTATTGATGGTAACTAACTTTTAATATAG:1 - chr3R 10800456 3' - roo 8682 2 71.92 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCT:1 - chr3L 19510494 3' + pogo 2034 1 65.75 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAATAAATTACACGGAACGAGCCTGAAGAGCAGCAGAAAAAATG:1 + chr3R 19500727 3' - jockey 64 1 60.00 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCGTACCGCAAAAATCCACTGCTTTTCGTTGCACATTTTTCTTTTTTCAGTTATCAGGTCGTAACGAAGGGAAGTGTGAGCATTCGTATTTGTAATTGCAAAATGACCG:1 - chrX 9864870 3' - hobo 14 1 71.92 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCCTTTGCAATGAAACATGGTATGCATTTTGCAGAATTGAGTAAAATGCAGTAAAGTTAA:1 + chr2L 15597018 3' - roo 61 2 59.59 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGGCTTTTGGGGTTAGGCTTTAAGAGCGGACTGCAAAAGGACCGGCG:1 + chrX 20379375 3' - hobo 71 1 66.90 GTGGCGAGTAGCACCCACACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATGAAGCTCCTATTAAAGAGGTGTTTCCCGTGGCCGATTTAAGCTGCCGCTTG:1 + chr3R 26658231 3' - hobo 56 1 58.33 AATCTTGTAGGGTTCTTGGACGGTTCACATAAACACGGGATTTCAAGAAACCCCATAGAAAAAAATCACAAGGGGACAGATCGGGGAAGAAAATGATTAAAGAAATAACGAGAACGTGGGGAAAATACATAGTTAGCCCGCCAAGA:1 - chrX 22514518 3' - mariner2 638 1 56.16 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACCATTCATCCTGCTAGATGCAAGCCCTTTAGTGTTCCAGTA:1 + chrX 6053001 3' - roo 8743 2 73.10 TTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTAATCTCTAGATTCGAACTCACCTCGTAGAACATATACCCACTGAGGGCCACCTGGAAGGCATTGTAGACGACCAGGGTG:1 - chr3R 22572528 3' + HMS-Beagle 7029 2 71.90 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCAAAA:1 + chr3R 25409763 3' - jockey 4748 1 71.23 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCAACATAGTCGCCACACACACACACACACACACACACAAGCAGACAGGCAGCTTAAACAAAAATTTCCTCCATTTGCCATTAAAATACGCTTTAATTTTT:1 + chrX 20106450 3' - hopper 4 2 72.93 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGCTGGACTTTAACCTTGTATTTAGAATGTTTAATGACACATAATTAGTTTTACTTCTTAAATTATTT:1 + chrX 127072 3' - hobo 54 1 53.42 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGGTTATGTTCGGGTGATTCCATATCAGTTTTCCATACGTACTCACATCGATTGGTGCGATTTTCTAATTAGCCATTTT:1 - chr2L 12696104 3' - pogo 40 1 52.05 TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCT:1 - chrX 1831264 3' + P-element 2789 1 18.49 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAACTTCCATGAGATTTTTAACCCCTTCACCCCGTAGTTATCCATTATTTGTTTTATCGCCGTTGTTGTTTAATGTGTGCCGAGTTTCCAGCGAAGGGATTTTTGTAT:1 + chr3R 31663383 3' - jockey 22 1 74.66 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCATTGGTAAATACTTTTTTGGTAAATACTTTTTTTTTCAGTTGGGGCCGGTGGTCGGAACTTTTGGAGTTAGGACAATTC:2 - chr2L 232340 3' - Doc 45 1 44.52 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGATTTATTTGCCGGAAAAGATTACTTAC:1 - chr3L 13546547 3' - hobo 55 1 58.22 CAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCG:1 - chr3L 11115123 3' - micropia 43 4 51.33 TTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACATGTAGACACCATGATAACACTATATCCTAACTC:1 - chr3R 7782842 3' + Quasimodo 7257 2 77.40 ATATATATGTATGTATATATATATGGAGTTCTAATAATAACTTTGCTAACTTTTAATCGATTGTATTCGTCGCACATCATTGTTTGTATCGCCATTAATAATACAATTAATCTAAAAATAGTAAAGGATACCTTCTATG:1 - chr3L 14957563 3' + 1731 4409 1 69.06 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGCTTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGACACAGCTTTTTACTGAAAACTGAAGCATTCTCCCCCAAAAAATTGTTGG:2 - chr2L 42464 3' - copia 4896 2 67.12 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATCCTGTGCATACCAACATAATTTAATTAAAGCTCTCAATTGAGCCATCTCATCAGCAGCACGAAGGGTTGGCCAAACATCGAGGCTGAGTTG:1 + chr3L 12729217 3' - opus 7024 2 67.61 TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCA:1 + chrX 8610304 3' - mdg3 5326 2 65.75 TAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGGAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTACAAACGCCTCAATCTCTCCGCTCCGATCTCCTCGTGGGCTCCCTGCAG:1 - chr3L 7119114 3' + mdg1 7299 2 65.03 CCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGATATTAGATTAGATCTGAAACCAGCTTAAGCCAATTGAA:1 - chrX 16325142 3' + Transpac 5150 2 73.97 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAATTTAAGCTGTTAATGGCCCATTTGGTTTTTTTAAATGAACCAAAGGAAGATCATAGCACA:1 + chrX 10838640 3' + roo 9043 1 65.75 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTCAAGTCAATTGAGAATGAATACGTTTTCTTTGGGTTTTCTACG:1 - chr2L 8009067 3' - roo 8740 2 68.49 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTACCCAATTTAAGCTGTTAATGGCCCATTTGGGTT:1 + chrX 10838608 3' + roo 9011 2 64.38 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGCGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCATTACATTTAAAAATATTTTAAAATAAGCACACTATCTACGTTTAAACACTCTATATACACCCACACTTAA:1 - chr3L 25821772 3' + opus 7453 2 52.74 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTGTATCTTATTTTCACAGCTATCAAAATACACAATGAACTTTGACTTT:1 - chrX 18561068 3' + copia 183 2 67.12 CAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATATTTATGTATTTTCGCCCATTTCGATTGATTCA:1 + chr3R 15453746 3' + Transpac 5147 2 76.71 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTCCACCCCATCAAAGTCCAGCCTGGGA:1 - chr2R 16031379 3' + hobo 2916 1 66.22 TAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCTTAGACTAAGGAATTTTAATAGCAAAAACATGACTAGAATATGTAGTCTGCTTCTGGGATCAGCTTTTCATGTGGA:1 + chr2L 3327084 3' - jockey 4715 1 52.74 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTGACGGTCG:1 + chr2L 14263024 3' + P-element 2822 1 34.88 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCACACTACAAGCGCAGCCCCGCTCTCTCGCACGC:1 - chr2L 15057192 3' + hobo 2910 1 64.37 GTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACATTCTGC:1 - chr3R 24301810 3' - Tabor 58 2 54.79 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATTGACCCCGTTTCCGTTTTCGATTGCAATTCGTTTCAGTTTCATGCACTTTGCAC:1 + chr3L 1983547 3' - Transpac 4982 2 60.27 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAGCAGGTCAAAAAAGGTATAGTAGAGTTCCACGACTATCAGATACCCATTACTCAGTCAAAGAGTTAGATATACATAGATGTGCAAAGCGAGTG:1 + chr3L 22519129 3' - pogo 22 1 70.55 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAATCGCAACTA:1 - chr2R 20931645 3' - blood 7087 2 69.86 CTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAACGAAATAAAAGATGCGACAACTTGCAGGCCCAACTGCTGCAGTAAGTAAAAAACTTAAAGGCTGGCGCAG:1 + chrX 14707604 3' + F-element 481 1 59.59 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCATATAACTTGATTTGTTTTTATTTCCAAGTATGTTCGTTATTGTTTACAATTTGTCCGAAATCTACATATTATGGAGAGGTAATATGTTAAATCATAAATGACATTTTA:1 - chr2L 22031912 3' - Tabor 14 2 76.03 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGTTGCATATAGATGGGCTGGCCCA:1 - chr3R 28937807 3' - jockey 4745 1 63.01 GCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCGTTGGTAGTACCCAGTTCTATATTGCTGTCAATGAGTAAC:1 + chr2R 8566995 3' + 1360 3313 1 96.99 CAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTTGGAGCCAATAGACTACCTGCAGAAGCAGCACCACCAGCAACAAATGGCGCACTTTCAGCAGCAGCGCTGTCG:1 - chr2L 18204280 3' - F-element 453 1 58.90 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGTTATTATTAATTTATTAGTCTATCTATTTGTAGAACTACCTAAATTTTTATTTAATTTTGTTGCCCCTATTAACAGAATGACTGACCATC:1 + chr2L 9317803 3' - I-element 33 1 63.01 AATATCAAACTGCTGACCCAGCATTGGGCCGGAAAGGTAAAGGTATAGGTAAAAGTCTCCTAGAAACTATGATAGGACAAGCCCGCCTTCTTTCAAGTAGCTGTCCAAGCAAACCAATAGATAAGTTAAACCTCTTTCTGATGGCC:1 + chr2R 5268764 3' + Gypsy6A_LTR 51 1 78.77 TGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGAAACCTCATCGAACTGAAGACAAGGCGTTTTGACTTTTTTTTATGCTGACGCTAACTCGAAAATAATTTGATATTTTCAATTAAAGTTTTCAATG:1 + chr2L 16360699 3' - hobo 26 1 63.70 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAACAGGACAGCCCTGAACAGAACATAACGGAACGGAACAGAAGACGTCGGCAACTGTCAATAATAATCAGGCAGGATCCTG:1 - chr2R 22795109 3' + hobo 2933 1 74.07 GAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCCGCCTACGGTTGCAGTTGCTCCGGGTGCGATGCACTAGCAAATTGCAGCTAATGGAATCTGCAATTGAAATGAGGTCCTGCAAGGACGACGAAACATTCCCAAGCTGCTAA:1 - chr2R 21105656 3' - Stalker2 7260 2 77.40 TGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTTCATATTAATTATTACTTAAAGCAATTTC:1 + chr3L 13365139 3' - Juan 40 1 44.52 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTATCTCAAGAATTCGCGAAGGACCAGAGATGA:1 + chr2R 18056938 3' - blood 7028 2 74.66 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCCTGTTTTCGAAGGCTTAGCACTGCAGGTGCGAGAGAGATGGGAGTCTCTACTCGCTTACAAACCGCAAATACTTCTCTGAATGTTTTCGTGCTTCTCTCTTAT:1 + chr3L 17896053 3' + P-element 2870 1 75.34 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGTTTCATATTAAGTTGCTTTAAGTTTTGCATTTGTTGCGTTCATAATTAGACAATCTTTTTAGCATTGCAACATAATGTGTGGCACATCAAATATTCAAAA:1 - chrX 2821820 3' + roo 389 2 71.92 AATTAAACGCAAATTTAAATAAATTAAATTAAACTTCGTTCCATACGTACGTTAAACTTTAATGGTAAATTTAAAGAAATATTTGTTAGCTACTTTCCAAACCACATCTCTATCGGAAACCAGGGCTGCCTTAACCAGCACATGTT:2 + chr3L 8198206 3' + HeT-A 327 1 67.12 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCGGGGTAGATTTAATGCGAACTTCTGCTAGGTTATTCGAGTGCTGTAAGAGCATTAATTAAAGCGTTTTATCAGC:1 - chr3L 6541971 3' - hobo 46 1 53.42 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGCATTGCTTGTTTTTTTTTCCGCTGGCCACTTGCTCGGTGAGCAACATTCTGCCATCGAACCACA:1 + chrX 3637872 3' - roo 8720 2 58.90 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCATGTTAGTACCGTTCTAGCCAACGAAACCTGAAGCGTAGCTATTTAATTTGGT:2 + chr2L 15057258 3' - hobo 66 1 63.70 ATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCCGAGCAGGCCAAAAGTGTAAGCGAAACATCTAAAGGGTCAGCCACGTGCAAAATTCTAACATCTCTCATTTCCGATGCGTAAGCCAATTGA:1 + chr2L 16554990 3' - F-element 274 1 58.22 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATACAGGTATGAACTGCTTCAACTGCGTGCTTCTTGTGTATG:1 + chr3R 24396776 3' + I-element 5270 1 71.72 GGGATAAGTAATTTTTTTAACATACACTTAGCAGGTGGTTGAAGACGAAGTGGATCACGGTTTCTTTCGAGCTTATTTGGTCTCGCACAACAACATGGTGGTTTTTGTGGCTACTGGAAAGCAAAAACGCTGG:1 + chr2R 4916337 3' - G7 1113 1 78.20 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACATACATGTGTGTCGGTGTCTGTGTGGTTGAACGACGCCATCAACAGCTTAGAATTTCAAAAT:1 - chr2R 21453532 3' - hobo 50 1 55.40 AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGA:1 + chr3L 3540264 3' - mdg3 17 2 72.60 TCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACACTTACTTGCCCTCGGCTGTATGTGCTGAACAGA:1 - chr2L 3393771 3' - Stalker2 7335 2 76.03 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGTAAATAAAAAATCGAATATACTTTTTAATTAATT:1 - chr3L 18574848 3' - I-element 48 1 74.75 TTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATATATATCCCTTGCGATGAAAGTCGTGAGGGGGGCGAGGGGCGGGGGTGGAGACATTCCCGA:1 - chr3R 18114846 3' + 297 6919 2 62.33 ATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAGTACTATACTATGATTTAATTGAGCTCAAACATAACAAAAACTTATATTTTAATGTTTTTTTT:2 + chrX 9874225 3' + BS 5030 1 55.48 ATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCAGAAGGCATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACACTTTGAACAGTTGAATAAAGAACCTCATAAAGAGCAGAAGCTCTTCTC:1 + chrY 3648932 3' + Stalker 208 4 63.70 TCTTGGTCTTATTCATTATTGTATGTAACGAAAAGATATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCAAACGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTGACTCCGATGTCGTCGCTCTTTTTTGTGTGCAGTTTT:1 - chr3L 1685212 3' + Gypsy12A_LTR 2126 1 74.66 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCACGCATATTCGTATGTGTGCGCGTGTGTGTGTGGCCAAGCGTTTGCGCTCGTTTGTGTTT:1 + chr2L 5656640 3' + hobo 2911 1 56.64 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTCATAATGTAAGTATAATATACTCGCAATTTCTCGCTCATCTATTTTCCACAAAGGTACAATTCTTTAAACTTATGAAAATAGACTCTTAAGAAGTAGCGGAGAAAAAGC:1 - chr2L 10177938 3' - mdg3 5264 1 76.71 GAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAAAAGGGAATTTT:1 + chr2R 10760486 3' - Tabor 6918 2 73.29 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATACAACTATACAAATTAGTTGGGCTAAAATGCTTAACGAGTCTAGTGTGTGCACAAAGGGGTTTCCAC:1 - chr3R 17747260 3' + 297 6924 2 56.16 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAAAGTTTATATT:1 - chr2R 11609902 3' + roo 327 2 76.03 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAAAGTTTATATTTATTACTATTAAAAGTACCATTTTATTTAATGTGAAGTACCAATATTTTGTTCGGTG:1 - chr2R 11609845 3' + roo 9048 2 69.18 AATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACT:1 + chr3L 3540252 3' - mdg3 29 2 64.38 TGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCGGCGGGTAGCGGTGGGTTATAT:1 - chr3R 19537429 3' + hopper 1404 2 76.71 CATAATATCTTTTAAGCTAGACATTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAATGAATAATAAAAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAGGTGTTTTATTGTTTTTAAGGCACATTGTGTGAGTATTCGGTTTTAATTACCAGGCGA:1 - chrX 6952091 3' + G5A 2770 1 67.12 AGCAGTTTACGGCTGACCGGACTCGTATATGTCGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACATTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGG:1 - chr2R 2666330 3' - Rt1a 66 1 58.74 TAATAAAAAAATAAAAAAAAAACGGGGAAA:1 - chr3L 3771216 3' + BS 5101 3 83.33 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCAT:1 - chr2L 8898908 3' + P-element 2819 1 45.21 GNTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTTGTAGT:1 + chrX 6213597 3' + roo 326 2 73.97 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGAGACTTTTGCGCACTCTTATACAGAACGACTAGTCTTATAATAGCTGAGAGAACAGAATGGCATTGCCAGCTGGCGCGAGGAA:1 + chr3R 9158344 3' - P-element 34 1 61.81 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATATTGTTCGGCTTTCGCTCGCTTTCCACACAGCAGCAGAGGAGGAAGCTCAGTGGCACTGCCT:1 + chr2R 12873015 3' + P-element 2872 1 73.72 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATCATAAGAGGCTTTGACAACTGGTTAACTTTATTGACGGATCTTACCTATTGGTTTCAAAGGCCTTCAGACAATAGCCCGGCATCACTT:1 - chr3R 17068858 3' + mdg1 391 2 64.38 ATCGAATTTATGAAATTTGAAAGCTGGAATAGTCTGTCCATCTATGCTAATGGGCAAACGCTTTTTATTAATTATTATTTGTACTTAAATAAGCAATTATACTTACTAAGTTTTCAGACAATAACGAGTGATGCACTAATGATGCA:1 + chr2L 21575365 3' + FB 27 1 73.29 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCACCTTATCTTTACATATGTATTAATATAATATAGTTCTATATTTTTGTTGCGCTCCTATGTGGTAAGTATTTTACCGGTATGTATTATAAACTATATGTATA:1 - chr2L 12814671 3' - hobo 17 1 72.60 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGCGTCTGCTGCTGGTGTTGCTGTCTCTGCCCACAATTATTAAATATTTAAAGCCATATACAAAACGTTTTTGGGTTTAACGTTATACTCTT:1 - chr3L 7370426 3' + Burdock 6362 2 65.75 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGAAGTTAAATAGAGTTTGTGGTGAACAATAAGAAATTTTTCCCAGTGCAGAGTGTATATTTGTACAAGTGCGAG:1 - chr2R 22616825 3' - BS 5025 1 69.86 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACAC:1 - chrX 19744434 3' + P-element 2807 1 28.57 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGGTGACTGTACTGTTTGGCTAGCGTGTGTGACCGATAAGTGCTATCGGCTAA:1 + chrX 11236480 3' + copia 5065 2 63.70 AAGTCAAATAGTAAAAAAAAATGGTTGGGCAAGAGTTGAAAATTCCTAATTTTTAGCCCACTATTTAATAGCCACAACGAAACATGACAATTTTGCTTTACTGCAAGTCAAATGATTTAACCTTCGCTAAATTATCTCGACCTCAA:1 - chr3L 2031581 3' + Rt1b 5143 1 76.71 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAGGACGAAGACGGCCCAGATTCCCAGGCTGTCTTCGATGCGGAGTGGAGTACCGAATGAACTCATCTTC:1 - chr2R 20303835 3' + mdg1 365 2 54.11 TAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAATAATTCCTTTAAACTTTATTTCATGATCGAGTAGCCGTGTCTTTAC:1 - chrY 676875 3' + I-element 4954 1 68.49 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTACATATATATACGGGTTAAGGGCAGCGAGAGAATTACCGATCTCTTACCATCGATGGCATAGTGACTGTGGCGACGCTGCTGTTGCGCCGCTG:1 - chr3R 22676154 3' + 297 376 2 72.60 CCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGCCCTGGAATATCATTTAAATTTCCATTTAAAGTCGACCACAGCCCCCGCGAGTATAACCATATGCTGCGGGCCAAAGTTGCGATAAAAT:1 - chr3R 6578626 3' - F-element 44 1 59.59 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTATATAAACTCATATATGTACATGCATATGTGCTTTGAATCGAAAAAGAAACTTCTTCATTTTTTATTGTCTAACCTTATTTTGACTTTCACGTGTCCCCCGTTG:1 + chr2L 21687744 3' - pogo 16 1 74.66 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCAGGGCATTGTTTTTGCTACCAATCTATGTGTGTCTGTGTGTGGGGGCCAAGTT:1 - chr3L 17142815 3' + hobo 2871 1 63.01 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGC:1 + chrX 19744469 3' - P-element 61 1 24.07 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAATAGACTTCAAACTGCTGGCAAAGACGAACTACAAATTGACTCTGGTACTGCGCTATCTTTG:1 - chr3R 11072402 3' + roo 9045 1 67.12 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACAGTAGACTATGTAGTAGTAAATGTTACCAATTTCGTTTCGGTTTTATGC:1 - chr2R 21244869 3' - roo 8736 2 69.18 TGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACACCCTACCCCATAACTTCCTAATACCGGCCGTTGTCAAGGAGTACACCTTGTCAGGAGAAACGCCGCAGGAGTAACGAG:1 - chr3L 25496727 3' - mdg3 23 2 65.32 AATGCAGATATCTTACCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGAAAATAAGCCGATGCTGTTTCACGTGGCGTATGAGCAATATGTACGCCAAGATGCACCGCAACAATTTCACGTTTAAGCAG:1 + chr2R 8492860 3' - pogo 36 1 60.96 TATCTATCGATATCCCAGAATATCATGAAATTTCGCGTTCGCATCCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGTGTTCTCTCTTGTTAAATATAAAATATTACTTAATCACATATTTTTATATAACCAATCC:1 + chr4 987550 3' + INE-1 499 1 63.70 GGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAATTGATTTGAATTGCACCGCATTGGTAAGAAACTGGCAACAATGCAACAATGC:1 - chrX 6538792 3' + Stalker4 196 4 64.38 GTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACT:1 - chr3R 8293548 3' - Stalker2 7327 2 69.18 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACACTCTGTGCGTCGATAAGTATGAT:1 - chr2R 18056793 3' + blood 332 2 53.85 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTATCAACAGGACATGGTAGGCGAAGGATGAATGTGGAAGGG:1 - chrX 16995016 3' - jockey 29 1 61.34 TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAATGGCAGGCTGGCTGAACTACTACAATCTGAAGTGCC:2 + chr3R 22572688 3' - HMS-Beagle 6822 2 67.81 TATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATAGTTCCACAAAAGTGGCACTATGATCTCTCTCAGTCTTGGCACCCCTTTAAGTTCTAACTTTAAGTTCAGCTC:1 + chr3R 29952847 3' + invader4 3078 2 79.45 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATTCCCCAGGCTAACACTATTCAGATTCGATCTATATTTGGCCATCTCGCTATCTCTTTCGCTCGTTATCGTGGCATCTCTTTCGCTGCTGGTCTGTCATGTTG:1 + chr2R 15892274 3' - hobo 13 1 75.34 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACAGTCAAAGAATTTCAAAAA:1 + chr2R 18922633 3' + opus 463 2 60.56 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACAGTAGACTATGTAGTAGTAAATGTTACCAATTTCGTTTCGGTTTTATGCCTC:1 - chr2R 21244866 3' - roo 69 2 67.12 CTTTGATAATATATAGTTAAGTTCAAAATAGAATTTACAAAAATGCTGCTCTCTAGCTTTATAATTTGACTTTATGCCAAACAAAAAAGGAAATCTGGACCAGTGTGCAGTGGTCAAAATTAATTCACAATGCGACACGGCCTTCC:1 + chr3R 1146204 3' - transib3 65 1 78.08 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCTGTTCTCTGGGCTTTGTTTTAGTTGTCAGACACACACCCTATCCTGCTCATTTTAGTCTCATAAATATGCAAATTAATCATTTGCGGAAATTTACATACTTAATAA:1 + chr2R 22795270 3' - hobo 15 1 75.34 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGAGGGGGTGTGTGTTTAAATGGCGCCTGGAGAATATCGATTAAATGCTCGTTTTTTCGGTTATTTGTTGCTTG:1 - chr3L 5731233 3' - 297 6623 2 57.53 TTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCCAGCCGGGAAAGTGCGTCAAAAAATCAACTGCTAAACAATGAGCAGCAACTTTCCCTCACTTGCCGTCATTTTGCTTCTTG:1 + chrX 11280850 3' - X-element 57 1 54.79 GCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCAGCAGCAACACCAATGCAAGTGTCGAACGAGGTAAATTCATACAGAAATTCATGCTACAAGTTAAATTTAAAATCGC:1 - chr2R 16508553 3' + jockey 462 1 63.01 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAAGTGCATTTCATTGCTATAATCAGAAATTGATGCTGCGGAATGTCGTTCACCCTGCAAATGGATATTTAGAA:1 + chr2L 11559826 3' + roo 9027 1 55.48 AAAGTAAAGTAAAAAAAAGTAAAGTAAAAAATGTTAATTGTTGAAACTATTTCTTTTCCATACAAAGTGTAACTTTACTTCGTGGCACTTTTCGATAATCTTTTATTGAAGCACTCTTATTCGCTTTGTATCTATTGACCGCACAT:1 + chr2L 13079432 3' + TART-A 13137 1 71.23 AATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTAAGGCAACGTCAGGCTGGCAGGCCACACAAAAAAAGGACAACGAGTCCTGGATGCG:1 - chr2L 18848711 3' + blood 7329 1 59.29 TGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGATTCCCTCCTTTGTAATTCCTTGACGCTTCTGGTCATTATTAAGGTTATCTGCCGCTTATTATTATCCCGATGGTTAT:1 + chrX 20532291 3' + R1A1-element 5268 1 58.22 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAGTATCATTAAAAACAAGCAAACGCTGCTAGAATTTAATGAAACTAAAGTCTGCTTA:1 + chr2R 12416948 3' + pogo 2040 1 62.33 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAAT:1 - chr3R 11072462 3' + roo 8985 2 79.45 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATAATACCACAGGTACTCTTCT:2 + chr2L 20253918 3' + roo 8984 2 77.40 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTATTTGCGAAATTATAAAACAAAATTAAAATGCGGTCCAATGCGAAAATTGTATTTTGCACATTTGCTTAACTCGCCATTTGCAATTGCATATTCCCCGTT:1 + chr2R 20117430 3' + mdg3 227 2 74.66 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCAACAGAAAAGATAC:1 + chr3R 26031819 3' - pogo 35 1 62.33 AGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTACATATGTCAAGTTCTGCACTAATTTCGTTTAATGAGTTTTTTCTTTATGTGAGGTTGGGCT:1 + chr2L 22340401 3' + HMS-Beagle2 250 2 61.64 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTATACACAACTATTAATTTTTGCATTGACTTCTCTCAGTGTATTCTAACAGAAAAAATTATTTCTCAATGTTATATCCGTGAAATAGCCTGGTCACACCGACGATAAG:1 + chr3L 13016036 3' + hobo 2923 1 73.97 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGAACTACAACAACATAAACTGCATGTCGTAATACTGTTGGTGTAATA:1 + chr3R 7109235 3' - P-element 58 1 46.58 CAATAATAATAATAACAATAATGATAAAAATAAAGAAAGAAATAAAAAAAAAGCCACAAAAACAATCGAAATAAAAAATAAATTGGTTGGTTGGATGGATGGATGGATACGTTTACGGTTTTACGTACAAACGTTCTTTAGCCGGT:1 + chr2R 15517381 3' + mdg1 7059 10 56.85 ATCTGGAATGTACACTCGCTAAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTGGAGCCTGAAAATTGGCTGAATTTTGTATTGAG:1 + chr3R 15154632 3' + mdg1 334 2 78.77 GCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCTTTTAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAACCAGAAAAA:1 + chr3R 19450085 3' - roo 8622 1 46.27 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCTCCCTCCCTCCTCAAAAACGCCAAAAACACTCGACGGTCGTCGTCACACCGCATTCTAGCCCATTACGCAAAAATTACG:1 - chr3R 26845503 3' + mdg1 7416 2 54.11 CATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACACACACTTGAACTGTGGACCAAAAAGCCGGTTGCACTGTTGGTTTT:1 + chr3L 21765502 3' + gypsy 7373 2 68.49 TTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATACTGCATAGTAGTAAAAGCGACTAAGTAACCTAAAACTACATATGAATCAACCCCTCAAGTTT:1 - chr2L 14678732 3' - Quasimodo 50 2 57.53 ATGACCAGAGGTTTTCTATTATGTTGAGGTCTGGACCTTGAAATGGCCAACCCAATGTGTTTACGTTAACATTTTTCAGAAACTGCGTAACCACGAGCGATTTGGACTTTTGCAATGCCGACAGACCGTCGACGACGACGATGACG:1 - chr2L 14573678 3' - Tc1-2 1184 1 61.64 AAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACCATTTCCATTGTGCGACAGCGGACCTAATGTGATCCGCATAATGAGCAACTTGAACTGCATTTCCGCCACAAAACTCATCGCTT:1 - chr3L 12871101 3' - P-element 2612 1 59.59 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGCAGGTGAGTTTCCATTGTCCGCTGGTTCGGCT:2 + chr3R 15363505 3' - 412 53 2 54.11 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCCATTCCTTTCCACAGTCCACGGCCTAGCGTTCAAATCT:1 - chr3L 22518958 3' + pogo 2068 1 63.01 AACTCAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATTACATTTTAAAAAGATAACGTACTTGAAACCATATCCACTTATTATA:1 + chr3R 7764438 3' + 17.6 422 2 71.92 TTAAAGTTTTATTTGTATTAATGGTATAACCGCGACTGCTGGCACCAATTTAGTCAATACTTTTTTATATTGCTATTTCTAAATTTCTTTAATTAATAATATTAATTACTGCGAATAAATTTTCATATTTATTTTTTAAATAAATA:1 + chr3R 28145349 3' - P-element 2688 1 17.81 GTACCGAGAGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCACGCATATTCGCATGTGTGCGCGTGTGTGTGTGGCCAAGCGCTTGCGCTCGTGTGTGTTTTGTGG:1 + chr2L 5656645 3' + hobo 2904 1 50.40 GGTCTGCAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATTTCATTCAATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCTACAAAAGGCAATTAAATAAAAGTACTTATGAGGTTCTAATTTAAGAGATGCATTGTCTTCAACTTA:2 + chr2R 3382277 3' + GATE 370 1 73.29 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTGGCAACCCAAACAAAATAATCAAAATCCCGAAATGCATGAACTTAACCCCAAAGGGTTGTTGCCTTCAAAGTCACTGTCAAAGGATCAGGCC:1 - chr2L 18671591 3' - mdg1 7068 2 65.07 TATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACACGCAATGGGAAATAAA:1 - chr3R 9158147 3' + P-element 2783 1 14.38 ACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGTTTGGTTACTTGCATCCGTTATTATGATGAGCCGCTTATCAAATAATAATTTATATTTACAATGGGTTTG:1 + chr3R 30564804 3' - F-element 4597 1 54.79 GGCTTGAAAGTAGAAGTGTACCGTGGACACGAAACAGCCAGGGCTTAAAGCTCTAACAGCTTAAAGCACTCACAGCTGATCGCCTCTTGAACAGCATATTGAATCCGCTCATCAATGCA:1 - chrX 1168720 3' - G5 286 1 76.47 TATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTCTTTGTCCACCGTCTCTCAATTGCCGCTAACCGAGTGATGCTATCTTGACGCACAGTTTTAAATGGAGTTATTTGTAAATTTAAGCATATCTTTGTGGTATGT:1 - chr2L 23313610 3' + S-element 1701 1 76.39 GGGAGCGGAGAGCGGGGGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATAAGTGCAAGTTCTTTAGG:1 + chr3R 3905858 3' - GATE 8267 2 60.50 ATGGTTCAAAAGTGTGGGCGTGACCTGTTTGGCGGCCTTAGGGCATTAGAGTGAGCGTGACAAAAAGTTATTTGGCAAATCGATAGAAATTTATAGTACTAATAAAGTTATAAATAATATCGAACCTTTTTTAAAAAGTCTAATTT:1 - chrX 6415145 3' - INE-1 253 1 77.40 CTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATGCAGTGTAAA:1 + chr3R 24301936 3' + Tabor 7285 2 59.59 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACC:1 - chr3L 12775963 3' + roo 9011 2 60.27 TATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAATAATACTACGACATTTTTGATAAAGATTGCT:1 - chr3L 11228096 3' - pogo 84 1 76.03 AAATGAAAACATTTTTATTCAACTTTTGTGCACATTCGAGGCTAAGCCTGTAAATTGTTTAACAATAACTGCTGAACTCTGTACGTGGCATACTTTTTCACAGCGAGCCAAATAAAGCTCTTAATTGTTGCGAATGGATTAAGGGT:1 - chr2L 12226939 3' + X-element 156 1 56.85 GTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGAAACCCTCGATTCGGGTCCAATCGGCCACTTACTGCTTGGTCATGATGCTGGAGT:1 + chr3R 10741189 3' - 1360 3363 1 51.37 TTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATAATGCCATACAATCTGAAATAGTCTGTTGTGTGGCAAATTAGATCTAGAAACTGA:1 - chrX 18318155 3' + copia 191 2 62.33 TTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGACGCAAATTCCGACCGCTCGCCTACAACAA:1 + chr2L 851038 3' - P-element 89 1 24.66 TATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAAACAAATAACATCTTCTCTACAAAGAAAATAGGGCTAAAGATATATACACATAGTGTTTAGCTTGCA:1 + chr3L 22638916 3' - Juan 4099 1 74.66 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAATTGCAGCGTATAACTACTATAACTAACAAGGAGCAGCAAAATCCATTGAATTTCGCTGTCA:1 + chr2R 13052896 3' - Doc 59 1 68.06 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAAATTGAATTTATCACTTGAACATGCCAAGCAAACGCTTGTTCCTCCTGTACTGCTTGCTAAATTTTC:1 - chr3R 27411683 3' - I-element 16 1 52.29 AGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCAAGACTAATCAAAAGTGTCTTTTCTACACTACAAGTAAAGGGTATAAATTAGC:1 + chr2R 7024478 3' - diver 5956 2 64.38 ATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGACTCCTTTTGAAAAACTCCCTTGCGTTCGCATTCCTCTCTTTGT:1 + chr2L 21082243 3' - mdg3 38 2 60.27 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAAGAGAAAAACTTCTATGGGGAATGCAAAGCATCAATTCTGACAACATCATAGGAACACATAAAT:1 - chr3R 30524408 3' - roo 8678 2 71.92 TAAATATCTGAATATGAAATTGTACCTTAGTTTTAAACAGAACTCAAAAGTGCTCAGTCGTATTCTGATGCACTTAAAAAAGAATAATAATTATTATTTGTCCTAACATTATAATTGTTTAATTTATAAAACCACCAACCACTTTA:1 + chr3R 4068803 3' + gypsy9 5224 2 72.60 GTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTAGTTTGTTTTAAATTTTGCGTCTTTCTGATAATTCAACATCCAGCATTATTTATGGATTATAATCTCTG:1 - chr3R 15157539 3' - invader3 18 2 71.23 AGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGAGAGTAAGGTAGATAGGGAGCTTTTGGAGCTGCTCTAGAGTTGCCAGGTGGGCGTAAAATTCCA:1 + chr2R 16031447 3' - hobo 57 1 54.11 TTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAACCAAGTAATAATAAAACGTGGAAGCTTGCATCCATTACTTTGAGTATTTTCAATAGATATACGAAAGTAAGGATTACTTGGTTGCCAGCAGTTGATTACAAA:1 - chr3R 18492843 3' - Juan 4043 1 70.55 GTTCCCCGACTATCGGATACCCGTTACTTAGCTAAAGTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGCCATTTTTGAAATTTAATCATTTTTCTAGGATGTTGATATAAGTATTATTGAATAAAATGAGAAAAAATTAAA:1 + chr3L 24731966 3' - INE-1 556 1 74.31 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTACATACATTTAAAATACTATATGGATAAAAGTTGCGTGGAGTAAATATAATCAGGTCAA:1 - chr3L 3910465 3' - 297 48 2 62.14 CTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATA:2 - chr3R 19537477 3' + hopper2 1549 1 56.16 GAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAATATTTAAAATACTTAATAGTCATGTTCAAAGACGAATCAAAATAAGAGCTTCCGACTTTCGTTCAACAGCAAATTTTCAATTATCAGGTAAAAAGTTCA:3 - chr3R 4869378 3' - I-element 5144 1 69.86 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTAACTTAAATTAGGGGCCGGTCTAATAACAATTAATTGAGGCTTTGAAGCGAAGTA:1 - chr2R 10760408 3' + Tabor 419 2 63.01 CTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTACTCAGCCGTGATACGGGCCGAAGCGACCGAAAAAAGGGGTTACATAAGGGGGTCTGAAATTAACGCACAGCCTGTGTGCCCTGAG:1 + chr3R 902643 3' + R1A1-element 5300 1 60.96 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAATGCGAATAAACGTCTGTTTGTTGCCCCATAAAAGTATGCTATAAAATGTTGAACGCGCTCAC:1 + chr2L 19681089 3' + hobo 2895 1 52.24 TCGTGTACCAAAAAATAGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGATGTCTTGCGGCAGGAAGCAGGATGTTATCAAGCGATTCCCAATCTAACATATAAGCTTTTATAATATCATGGATTCAGAGGGGTCTCT:1 - chr2L 22348825 3' - 1360 33 1 67.81 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGGTATTTTCA:1 + chr3R 26031806 3' - pogo 48 1 53.42 GGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGATTGGGGAGCGGACTAGCTTATGCCGCGGGGCAGGAGATGTTAATGAGGGGCTGGGGATGGAAACCACACAAAAGCTGCAACCTGTCAACTC:1 + chr2L 11562485 3' - roo 216 2 65.52 ATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAATATTTAAAATACTTAATAGTCATGTTCAAAGA:1 - chr3R 4869445 3' - I-element 5211 1 78.08 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACATATGTATATGCTTGGGGGTGGGCCATGGGCGGGCTGATGGCTG:1 + chrX 1726746 3' - 297 21 2 61.70 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGGAACGCCTTTGGAAATAAAATGTATCCCTTGTGAAAGTGGCAGACAACCTTAAAAATAAATATGTTCTGGCTTCCAAA:1 + chr2L 5732845 3' + hobo 2924 1 63.03 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATTTCGTGTTTTATTGTATATGCGTTTATATATTTACTAATTTATTACCACGCCAACGATAAATTTCTATTGAAAT:1 - chr3R 7136523 3' + roo 396 1 76.03 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTGCACGCCCCGTATGTTTGTACATATATAAACTG:1 + chr2L 15601670 3' - Doc 31 1 63.70 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTAGAATTGATTTTCTATATTGCACCCAAGATCAAGCCTTTAAAAGTTTATTAAATTTCTGTTGAATATGCATAAATACGAGG:1 + chr2R 21244979 3' + roo 9031 1 57.53 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACTGTTGACGTTTTTGGGGAAAGGGTTGCCAGCTAATGCCGCAAACATCG:1 - chr2R 8467735 3' + roo 336 2 67.12 GTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTCGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGCGACTTACTTATTAAACATGATCCTGAAGTGAAATTCTATGGCTTCCAAAGGCACGCAGACACCGCAGTCTAAGAAGCAACTACTCTCCCTGTAATAACC:1 - chr3R 851746 3' - F-element 267 1 68.49 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTCTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAGATT:1 - chr2L 16360553 3' + hobo 2892 1 50.00 GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTGGTCGGGCGGTATTGAAGTCAAAACATTTCATTAAAGGCAGCAGCGAATGC:1 - 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pogo 59 1 60.27 TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTCCGCTGCTGATGCATTTTCCGGCTGGA:1 + chr2L 2722422 3' - flea 23 2 69.62 TTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCAATTATCAATCAAATTATCAAATCAACGTGATGGTACATGCAAT:1 + chr3L 24916724 3' - Porto1 149 1 38.36 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGGACCGGACACTTGAGAGAGAGAGAATTCTCCGGCTCGGTTTCGGATTCGGGTTCGAGTCTGC:1 + chrX 13642123 3' - P-element 33 1 55.83 GTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGCAACGGGTTCACCGGCCAGGAGTGGCCAGC:1 + chr3L 9944717 3' - Doc 4557 1 75.21 ATATACTGATCAGATCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGTTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAAAGTGCATATTTATATAAAATTAAAAAAAAAATTGT:1 + chr2L 20596079 3' - invader4 375 1 60.27 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGAATTTAGCATAACTAATAGTACAGTTCAGTGCACATGAGTATCT:1 + chr3L 19938554 3' - 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I-element 5090 1 68.57 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTAATCGTAATTAATGAACATGTAGGTATAGGTAGGATAGTAGGTTCCTTTAACTTATTTGAAAAAGAAGCGAATACATAGAT:1 - chr3R 25052974 3' - pogo 35 1 60.27 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATAC:1 - chr3R 26031682 3' + pogo 2047 1 56.16 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAACTCTTATTTAATTATTTTTCTTTTCCATTTGTTTAACAATTGCTTCAAATGCGAATTCCATTTTATTCATTCGGAGCG:1 - chrX 19091015 3' + jockey 4949 1 53.42 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCCGCCTACGGTTGCAGTTGCTCCGGGTGCGATGCACTAGCAAATTGCAGCTAATGGAATCTGCAATTGAAATGAGGTCCTGCAAGGACGACGAAACATTCCCAAGCT:1 - chr2R 21105661 3' - Stalker2 7265 2 73.97 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCAG:1 + chr3R 13572112 3' + 412 448 2 54.76 GATCGGCATTACAATGTCATAGGTCCACCTTTAAGGCAGTTTTGGCATAAAGCCAACCTTTTTGCATCCTGTAAGAATTGTGGATGGCTTTCCTAGTTTATGCCTCAAGTTTTTTGAGGATTTTCGCCTCGATTCTTTGGCCAGCT:1 - 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pogo 73 1 66.44 AATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGCCGCTGAAAATGTCATTACTGAAGGGCCAGCAAAACGGATGTCGAGTTGTTGTTTTGGTTGTTTGTGCAGCCATTGTGATTT:1 + chr3L 19431747 3' - Juan 42 1 56.85 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATTTCGTGTTTTATTGTATATGCGTTTATATATTTACTAATTTATTACCACGCCAACGATAAATTTCTATTGAA:1 - chr3R 7136525 3' + roo 394 1 74.66 GCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGAAGTTAAATAGAGTTTGTGGTGAACAATAA:2 - chr2R 22616868 3' - BS 5068 1 59.59 TGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAATTGCTACGAAGCAATACATTAACAAATCAAATACTTAAATGTCAGAATATTAGTTTCTTGTTAAGCTGGGAAAAACGAATGAATCTTAATGCGAAGAAAGAGTTGCTAGTT:1 - chr3L 16753287 3' - gypsy 48 2 64.38 ATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACA:1 + chr3L 23456269 3' + 1360 3327 1 62.33 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTATGGGTGGTTGGTTCTACATCGGTGTGAGTTTAGTATCGTGTGTGCATT:2 - 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chrX 19591126 3' - roo 40 2 56.85 ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTCTGTATCCA:1 - chr2L 2336218 3' + 297 334 2 65.75 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGGTCTTGAATTGTTCATTGTTTGC:1 - chr2L 20327622 3' + roo 9047 1 58.43 ATCGGTTTATTCGAATGAATTCATATTGCTGTTCTTGGGTACAGCCACCCGCACAAGACGTGCTTAAGACTATGTGTTTGTTATATTATATACATATATTGCTCAATCCGAATTAACTCAAAACTGAACCCCATGATGCAATTTAC:1 + chrX 14490120 3' - Stalker3T 283 1 64.38 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATAGCTCATAAACAGGAATTAAAAGCATACCGTAAGCTTTCTAAAAAATTCG:1 + chr3L 8704589 3' - blood 71 2 65.75 GATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTTGGTTTACTTTTCGAATGATTTTAAACGATACCCCACATCCATCCCAGTCCTGCCC:1 - chr2R 7343241 3' - flea 57 2 59.72 AGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATACATATATACTTTCATGCCAAAAGAGAATTCTATAGGGGAAAAGGAAAATATTAGAAAACTCTGGTGATGCCCAGCTATGATTTTGAACAGCTTTAG:1 + chr3R 12952991 3' - micropia 4972 2 73.33 GGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTTCAGGCGCTCCACTTCACGGCCTGGCGTCAGGACAATGATGTGGATACGTAAAAGCTGACCCTTC:1 - chr3R 509495 3' + R2-element 3198 1 58.90 CTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATGTATTTACCTAATTGTGAGCCATGCCAAACTAAATACTTTCTCTACTTCAATTTAGTCTTTCACAATCAGCAATTGAAGACTTCCCTTAATC:2 + chr2L 19217744 3' + gypsy6 357 4 63.70 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTGAAAAGAATCCAAAAGGATTCTGGCGCGATAATTAAATGCGCACAGGAAGCGAAACTTTTTCACCCAAGTTGCGGTGTGTTGCGACTAATTGCATTAAAGTGTAATGGATAAAG:1 + chr3R 26139567 3' - mdg1 7045 2 80.82 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTGGCATATGCAAAGTGTTTGTTTGAGTGCGTTTTCCATTAATTTATTTATGTACAATTATTTACAAGCAATTA:1 - chr2R 20117238 3' - mdg3 5264 1 78.08 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAGTGGTAAAGGTAATAGGTAATAAAAGGTAATCGTTTGTTAAATTAGCCTTGAAAATTGCAAAACAACTTGTTCGGTCCACTTTGAAACCCCAAAACTCCCCCACAGATGCCA:1 - chr3R 19466622 3' - jockey 15 1 76.03 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTTAAGTTCAATTTGTCGGAAAATTCAGCAAAATTCTTCTGATTTGAATCTCCCAA:1 - 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chr2L 15057166 3' + hobo 2921 1 61.76 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAGATATGTATATAAAGTATCGTGTGTCGTAGGACAGAAGCAGTCATGCCAAAAGGGTGAGCGTTTTGCGCTATGCTCC:1 - chr2R 17937103 3' - 297 6620 2 53.42 GTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCGTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCGCTGGAAAGTATGC:1 + chr2R 5899287 3' - jockey 4577 1 66.44 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCCAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGACTGAGGTGCATTACCACATGCCTTTATAGCTTATGAGTT:1 + chrX 20369449 3' - roo 8746 2 71.92 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTACCAAC:1 + chr2L 12696235 3' + pogo 2047 1 56.55 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAGTTTGAGTTTTTGATTGATATGACATTGATGCCATTTTGGTGGCTCATT:1 + chr3R 22266526 3' - roo 70 2 64.38 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATACAATATGCAATTATACATGTTGACCGATGAAATTTAAATTTTTGCGGCGGAGGTTTGACTGTACGACAGAGTCTATTGAACGGTGGC:1 + chr2R 11296862 3' + flea 5007 2 68.29 ACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGGAAAAATTCATGAGAGCCACAAAGTGTGCGAGCG:1 + chr2R 5899274 3' - 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chr3L 21405393 3' + mdg1 352 2 63.70 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTT:3 + chrX 18193834 3' - hopper 37 1 56.16 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGACAAATATGAAAGCGTCAGGGGAATGGGGAAAACTCTGAATTTTGAATGGTTAGGGGTTGGTGGAAGTGG:1 + chr3R 12781599 3' - pogo 49 1 53.42 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATCTGTTGTACTTTTGAATGTCAAGATAAAGAACTCCAGAACTACCAGATCTGATTGTGGTTGTAATTATACAA:1 - chr3R 12540470 3' + roo 356 2 52.74 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATTGCATTCCGCGGAGTCGTTCGCT:2 - chr3L 10068883 3' - 412 53 2 54.11 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACACCCTACCCCATAACTTCCTAATACCGGCCGTTGTCAAGGAGTACA:1 - chr3L 25496760 3' - mdg3 5330 2 69.18 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCATACGCGATGATTGGTCCAAACTCTCCGGGCAACCCATTTCGAAATTCGCCGTAAACAACAC:1 + chr3R 25094733 3' - P-element 25 1 65.41 CGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATACATATATATATATTCATGACTTTTTTAGACTG:1 + chrX 19766792 3' + copia 5036 2 80.82 TTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAGCTATTTATGGACGCCGATCGACAGGTTCGATCACAAAAGATTCGAAATGGAATCGAATGAATGGAAGGAGGAATGGAAAATCGTGGGCAGCCAGGGGAAAA:1 - chrX 8610175 3' + mdg3 5482 2 73.94 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCAAAGTACAGCTCAAGTGAGGGCTCCTCCTTTGTAGAATAATTCTGTT:1 - chr3L 1728463 3' - blood 74 2 66.44 AATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACATGAATCTTTTCTTGGCCAAGTTTTCATTTGAACTTTCAGCTAAGTTGCGGTGGAA:1 + chr3R 27051264 3' - 1360 244 1 63.01 GTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAATTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAATAGTGGGATATAATTGTAACAAAAATTCGACTTCAGTTATGCAATAACGATATTTACACGGTAATTTAT:1 - chr2L 22685345 3' - Cr1a 4111 1 52.74 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGTCCATTTGGGTAACTAAATAGCTTATGGTTAGTTTCCGCGAATTTTAAGATTGCCTTTTGAGTTGAAAGCATTTGGCTCATTAAAAATTTTTC:1 - chr3L 5425417 3' + blood 7362 2 65.07 AAATTATCTACCATACAAACTGAAACTAATTGTACAAGATGAACATGGTATTTGCTCAGGCTCACTGCTCAGGATCACTAACAGAGTGGGTGTATTGATCCTGGTCAAGAATATATACACTTTTATGAAAGTTTTACTTTAAACAA:1 + chr3L 24757225 3' - Chouto 5887 1 67.81 CTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCGACTGCACTTGAACCCAAGAGAAACGTAAGGCTTTCTCTCTTCAATAGATGGCACATTCGAGAGCCTACCGTCGCCCATTCATTGTCAATCTGCGGGGTTTCATCGAGGAGATGTAGCTGAC:1 - chr3R 23810289 3' + Idefix 7139 2 49.32 AATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCCACAACTGCAGTGGCTTGGGAAGCCGAAGCCT:1 - chr2L 16202595 3' + copia 5070 2 57.93 ACAACACACGCAAACACACATACAACAGCAATTGCCCGGGTGTTAACACCCACACAAGCATGCACACACAGATTACATAATGGAGATGGACAAGTAATGAATGAATGAATGAATGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTGAG:1 + chrX 2368042 3' + gypsy3 423 1 69.66 CCCACTTGCTGCACAAGCAACTTTTTGTTACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAAATACACTTTACGAGATGTAACCTCTTACACGCACTCA:1 + chr2L 13763551 3' - Bari1 57 1 64.10 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCCCTTTGGTGCACGCCCCGTATGTTTGTACATAT:1 + chr2L 15601662 3' - Doc 31 1 61.59 GTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATTTGCTTTTGCGCTTTTGCGCACGCCTTCCCCAATTGATAAAGTGACAATTT:1 - chr3L 780668 3' + Burdock 189 2 64.38 GTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCCGAGCAGGCCAAAAGTGTAAGCGAAACATCTAAAGGGTCAGCCACGTGCAAAATTCTAACATCTCTCATTTCCGATGC:1 + chr2L 16554977 3' - F-element 287 1 49.32 ACTACAAGTGCAAAACAAACTAAAAACCTAACTACAAGTTAATCAGACTCAGCCGCATTAACCACCGAGGGACCTGGAACCGTTATCAAAGTGACCACGGATGCACCACCAAAGCCCAGCGAGACCTCACCCACCATCCAAACCG:1 - chr2L 10773823 3' + gypsy2 451 1 58.62 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAG:1 - chr2L 16360556 3' + hobo 2900 1 51.11 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGTATTTAGGGATTCGACGCTCGA:1 + chr3R 11550296 3' - F-element 67 1 57.53 CAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTGACAGGGGCCGAAGTCGATGGGGCAGA:1 + chr3L 13380499 3' + hobo 2882 1 73.15 TTTGTGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGTTATTGTTCATTTTAACTTTTTAATTGCTTATGATTTTTAAGATTTTATTTTGGTAAATTATAATGTATATAAAAAAAATCGATTTTACAATACATTTCCGATGTGTTGT:1 - chr2R 11263722 3' - X-element 4666 1 54.11 AAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTGAATAAAACACAA:1 - chrY 2346857 3' + micropia 5388 2 50.68 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAATCTTTGTTGCTCAAAGTGAGAGACAGGGAGAGAGAGAGAGTACACGGCGTATGTGAAAGATTCACTTTTACA:1 - chr3R 7109119 3' + P-element 2841 1 54.11 ATAAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTA:1 + chr3L 10068982 3' + 412 422 2 63.01 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACCGCCGTGCAGTCTGGCGAAAAATTTTAATTAATGCAATTGCAGCGTATAACTACTATAACTAACAAGGAGCAGCAAAATCCATTGAATTTCGCT:1 + chr2R 13052892 3' - Doc 65 1 64.38 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATACATATAGGCGGAAAAGCGACAGCAGCAATACTAAGAAAAAGAAAAGTGGCACAAACTTTCCTCTTACCCTGC:1 + chr2L 9109962 3' + opus 7458 2 51.37 TCCCGTGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTATGGCGCATGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTATATTTAAATGATCTGCGACATATATATTCTTCTAAGAAAGTTAAACATAAAACACAACAA:1 + chr3R 3953135 3' - invader1 113 2 69.86 CGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGTGAAACACACAGAAATAGCACAG:1 + chr3R 15157729 3' + invader3 262 2 71.92 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGTACTTTTCTGGCCTTTCCAAATTTCGTTATTAATAGACTTCAAACTGCTGGCAAAGACGAACTACAAATTGACTCTGGTACTGCGCTATC:1 - chr3R 11072406 3' + roo 9041 1 64.38 CCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTTTGATGTAAATACAAATCGATCTATCTTAATCTAGCATATCCCAATT:1 - chrX 16090538 3' + 1360 32 1 67.81 AGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTCCATTTGGTGGCCGCCAGTTGGTAATGGCTGCCAAAGGTTAAATGCGAATAGAATTCGCCCATACACATT:1 - chr3L 1983434 3' + Transpac 5224 2 74.76 CATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCGTATATCGATTACAA:1 + chr3R 29997671 3' + P-element 2781 1 13.70 CGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGTAATAAAGTAAAATCAAATCGAATTCGACTGTATGT:3 - chr3R 6171097 3' + 297 6934 2 58.22 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATAATCATAAATACTTTTCGTGGGGGGACTTAGGTGTGCGTTTTGTGTGTGGGTTTCTCTACCTGGTGGGATTAGACCTGCCAATGCGAAATTATACAACTTTTATGTCT:1 + chr2L 1411822 3' + I-element 5340 1 73.97 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACACGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTAGTTGTAAAGTTTGTAACAGGTAGAATATTCTCAGATAATCTTGGCCATGTCAGTCTGCTC:2 - chrX 22714997 3' - opus 21 2 71.23 ACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATGAAATGCGAGTATAAGAGCTAAGGTATTGTTTTGTAAAGATCGAAATATGCGTCAAATTGTTTCGATAGTAAGCTAAA:1 + chr3R 20840692 3' - BS 5038 1 47.26 AAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTATGTATATAGTAATACATCAACAACGTGTAAAAGCGTTGAAATA:1 - chr3R 4570251 3' - Juan 77 1 68.53 AAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTATCATTATAGACTACATACCCATCGATGTGGTGGTCAATGGCATCATAACCACTGGCTATTATGTCAACTCGCTGCAGGCGAAGAACGGAGGAC:1 - chr2R 16590379 3' - mdg1 85 2 63.01 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGCACCCGCCTGAGAGGAAAATTAAAGCCAAGGGTTTG:1 + chr2L 2622796 3' - roo 8673 2 79.45 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGATATAGTGATGTATATTCTTGTGTTGTTTTTTTTCGGTGCCGCTTTAGTTTGGCCGCAGTTGCTGCTCATCAGGAGTTTTGCCTGGAT:1 + chr2R 10936772 3' - copia 4903 2 58.22 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGAGGCCGGAACACCGGTTTTCCATCGTGTAGATACTCCGGTTTCAGATAGAGTCCCTTGCAAGATCGTTTGCAGCATTTGTAAAAATGAAATGCGCACAC:1 - chr2R 12872842 3' - P-element 23 1 69.86 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACAGTAGACTATGTAGTAGTAAATGTTACCAATTTCGTTTCGGTTTTATG:1 - chr2R 21244870 3' - roo 8737 2 69.86 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGNCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACACACAGGGAATTCAATAAATATATTTGGCTTAAAACAAAAGAACGTTGTGCCCCGTTAAGCAC:1 + chr3R 18539916 3' + roo 9044 1 65.07 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACGAACCCAGCGAAGCGGGCGAACCCCATCTCAGTTCCCATCTCGGTTCATGACATTTGACTG:1 + chr3L 9240532 3' + 412 7536 2 75.34 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGGAACTTAAGGCTGAAAATGATTTTCTTCGTAAGCATGATTGTGCGAACTGAGAGCTGGCTTCA:1 - chr3L 4440286 3' - jockey 4745 1 56.85 TGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAACAGAAGAAAATCGATGGCAGGTAAAAAGCGGAACAGAATTCCTAAAATT:1 - chrX 12131130 3' - F-element 340 1 63.01 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAAGAGTCCATATATATATTTAATGAAGCTTTTTTGGTGGTCCGTCGCATATAAATATGTTTTTAT:1 + chr3L 20910100 3' - F-element 71 1 59.59 AGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGAAAAAGGGAGCCATGTTAAATGGGAAATTAGCAGCGACAACTTCTCCTGGTCACATGCATAACGTA:1 + chr3L 7293176 3' + opus 7305 2 56.56 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCACCAAGCCCAATCCAT:1 + chrX 12003970 3' - P-element 103 1 13.70 CGAACTGAATTGCGTCGCAGATTCGAAGCCGCAGGTGACATTGAATTCCATTCTGCCACCCTGAACTGGAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTATCCCTAGAATAACACAAATGTAGTTATCTGCATGTGATAAATTCTACAA:1 + chr2L 13692200 3' + R2-element 3127 1 66.44 GGTCACTATTTGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCCAGCCGGGAAAGTGCGTCAAAAAATCAACTGCTA:1 + chrX 11280803 3' - X-element 104 1 78.77 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGTGCCTTAAATATCACTTATCACCTGGGACATCGCAAGCTAATTACAAAACTATTGC:1 - chr2R 18785947 3' - roo 66 2 64.38 GCAGAGAGCGCGGCAAGCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAAT:1 - chr3L 3540146 3' + mdg3 5409 2 73.29 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAAGAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACGAACCCAGCGAAGCGGGCGAACCC:1 + chr3L 9240497 3' + 412 450 2 52.82 CTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAATAAATTACACGG:1 + chr3R 19500698 3' - jockey 119 1 69.86 ATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGAAAAGTCGGGTGGGCGTGGCACGTCACCGAGCTCACTGCGCCGTGAAATGGCCGACAACTTTTATCTGCCAAGAGGAATTTAGTGTGCTGGATCTGTTCCGGTTTTTATTT:1 + chr2L 7168604 3' + flea 413 1 78.08 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTCCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCA:1 - chr3L 12775968 3' + roo 9017 2 59.26 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACTAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTAACAGCGTAATGATATAAATTGAAAACTGATTACTCCTTGATTTCGTGTTTTATTGTATATGCGTTTATATATTTACTA:1 - chr3R 7136560 3' + roo 359 2 51.03 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCATACGCGATGATTGGTCCAAACTCTC:1 + chr3R 25094697 3' - P-element 74 1 34.93 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAAAAACCGCCCAAAACACAAGTCTGCATTTATGCAGGCAACAGCCAATTCACTTGAAGGATACCCTGAAATTAACCAATAAACATTTTGTAATAAAAAGTTCAAA:1 - chr2L 16536463 3' - pogo 14 1 70.55 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGAGACTTTTGCGCACTCTTATACAGAACGACTAGTCT:1 + chr3R 9158297 3' - P-element 80 1 29.37 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAA:1 - chrX 3637779 3' + roo 334 2 66.44 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGGAACGCCTTTGGAAATAAAATGTATCCCTTGTGAAAGTGGCAGACAACCTTAAAAATAAATATGTTCTGGCTTCCAAATTCTGG:1 + chr2L 5732851 3' + hobo 2903 1 55.48 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGAAATATTGAGATTTAAATTTCATCAAAGACTGTTTATAATAATAGAAGTCTAGACTTTTTGTAAGCAAGTTCAAGCAAAATACTTTCGCTTTTTATATCGAAATATTTGTATTG:1 - chr2R 10189205 3' - Doc 11 1 73.29 GCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAACAGAAGAAAATCG:1 - chrX 12131166 3' - F-element 376 1 60.27 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATG:1 + chr3R 24301927 3' + Tabor 7282 2 55.71 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTAAGCATGCAACAAAAATGCGAGACGCCCCTCTGGA:1 - chr2R 18265961 3' - roo 8680 2 74.66 ACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTG:1 + chrX 21667956 3' - gypsy2 6534 2 66.44 CAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCTTGCCATTGATTAAGCTGCGCCAAGCCGCCTGTGCCTTAA:1 + chr2L 15251079 3' - Doc 384 1 68.75 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATATTTTCTTAATATTTTGTATTCCTTTTTGTATTCATCGACAAAGGTGGACAAC:1 + chr3L 107594 3' - roo 67 2 64.38 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGCTTGTTTGCCTACACTTTCCATGGCCCTGTTTTCCGAATGTGACTCTCTGCCCTT:1 + chrX 22715185 3' + opus 7486 2 75.34 GGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATAACTTTTAAAATGGTAATGAACTTTTCGCCAAGTAATTGTCGAGTTGATTTCCTATAAAACATGAAGATGAAAATGAGTCTGGTGGGTGG:1 - chr3L 13015861 3' - hobo 29 1 63.01 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTT:1 + chrX 8610327 3' - mdg3 51 2 50.00 GAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATTAAAAGGTCTCAACTTGTTTTCTCAGCACAATCA:1 + chrX 5687085 3' + Bica 4922 1 76.71 CTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATAATGCCATACAATCTGAAATAGTCTGTTGTGTGGCAAATTAGATCTAGAAACTG:1 - chrX 18318156 3' + copia 190 2 63.01 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCATTCTGGTTT:1 - chr2R 15529679 3' + roo 362 1 54.11 GAGTTATTGTGAGGGCAGATACACTACAGATCAATTCAATCTTATTTGTACATTATTGTGCCGATTATCAAACTATGCCTTAT:1 - chr3R 8293539 3' - Stalker2 7255 2 56.63 GGGGTGGAGTGGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTTCTGGGGGCATGTGTAACCCATTAAAAAAAATCATCCAAATATCTCCCGTAGTTTAGGAGTTATTAATTTTTCATTTACGAGCTTGTGTCTCTGCATAATTGAGCCAG:1 + chrX 11785443 3' - hopper 121 1 75.34 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTACATAATGAGCCGACCGAAACGCAGATCTTGATAGAGATCGACTGGATCTCCGCCGCCAAAACACTGGCGTTTT:1 - chr3R 15346849 3' - hobo 50 1 50.68 AAACAAAAACAACAAAATTATTGATTTAAGACCATGGCTTCTTTCCAATTAGTTGGAGCAGCAACGACTCAAGGGCGAGCAGCAAAAGGTGGAACGCCTGCTGAAGATTGCCAAGCCCACTGCGCTGCCATTTACCACAAGCCTTG:1 + chr3R 18679479 3' + gypsy11 3935 1 69.86 GAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATAAGTGCAAGTTCTTTAGG:1 + chr3R 3905858 3' - GATE 34 2 59.50 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTATACTGAAAGCTTAATTATACTCTATATTCAATTTTGTTTTATTAATGAGATGCAGGTTATTGTGCGAAAAAAAAGCTTGCCAGTCGTGTATTTTTGTGGAAAGATAG:1 + chr3L 11856009 3' + Transpac 299 2 78.77 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTTTGACCGCACAGTCAATTTAATTTTAATTTACACTTCATGCATAAAAAATTAAACGCGCGTTG:1 + chr3L 19434171 3' - Doc 63 1 68.06 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGAGCAAAGAAGTCAAATATTAGCACAAACACATTTGTGCACATGCATACATACATATTTGTATCTAC:1 + chrX 19506181 3' + P-element 2834 1 49.32 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCATGACGTTTTTCTCGCTTTTTCTCGACCAATCGGAGCAAAGCGCCACTCTCACCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCGCGCGCACCCACCACCCACCAGTGCAAC:1 - chr3R 25137909 3' - P-element 18 1 73.29 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTTATGCTTTTGAATTTATTTCATTTATGCGTAGCATCATTCCGACGACCGCATTTTTAATTTATGGCAGTGTCAGCTTTTCAAAATGTGCACATCAATCAGGAAAATGA:1 - chr3R 13231716 3' - F-element 52 1 56.16 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATTGCATTCCGCGGAGTCGTTCGCTTCG:1 - chr3L 10068880 3' - 412 38 2 55.97 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGGGTGAGGACTTTCAACTGCTGCTTTAGCCGTTACTGCTGCTGATTCTCCTGGTTCAAGTATAGCCACTTACACCCT:1 - chr3R 12781464 3' + pogo 2059 1 52.05 TCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAACAAAGTACTGGGAGTAAAATGCCCAACGGAAGG:1 + chr3R 13212793 3' + 297 6878 2 77.08 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCCAA:1 + chr3R 18935161 3' - jockey 4748 1 72.06 TCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTTTCTGCTGCAATTGTTGCCGGCGTGTCTGATACCGCCCGGGCTGTCATAAATTGCGCTTTGCAGCTCGAGTCCCGTATGTTGCCT:1 + chr3R 7229828 3' - Porto1 4490 1 60.27 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGACTTCTCCTGTTGCAAGTGCAATTTCCGTGCTAAATATTTGCACACAAAAGCAGGAAA:1 - chr3R 26139413 3' + mdg1 359 2 58.90 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCGAACGTCATCCTGCAGCAACCTTCGGGTGGTTTGCCACCCGCGCCCCCCTCAGATAGTGCTGAAAACTTTTGCAACAATGACATTATCAAAGCCAGAAACAA:1 + chr3L 939769 3' - hobo 18 1 73.10 AATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTATAACTGG:1 - chr3R 9657670 3' - BS 52 1 55.48 GAGTCGAGAGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGTTATAACTGCCAAGCACACAGATACACGAATACTCGGGTACACAGATGCACAGCAACACAGATACA:1 + chr2L 20269030 3' - hobo 19 1 64.60 ATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAATTTTATGTTTATTTACCTCTCCACTTGTGCCGTTT:1 + chr3R 31942548 3' - Doc 270 1 76.03 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGAAACCTCATCGAACTGAAGACAAGGCGTTTTGACTTTTTTTTATGCTGACGCTAACTCGAAAATAATTTGATATTTTCAATTAAAGTTT:1 + chr2L 16360693 3' - hobo 15 1 67.44 GTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAA:1 + chrX 8610290 3' - mdg3 88 2 75.34 ATGGGGATGATACCGAGCTTCCACTGCGTAGGGAAGTATGGCAGCCCTCTCTATGGTTGTATGCGTATAAAATTGTTTCTATTCTTGTTTTTTTTCTGTATTATTTTAATACCTTCTTGCGCAGCTCCTTTTGACGCCGCTCCTG:1 - chr3L 17020101 3' - BS3 372 1 75.17 CCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATATGCGACGGGGGCGTGTTCAATTTGCTTGATGGATGCCTGCCATTGTGGCGGG:1 - chr3R 20720513 3' + 1731 4596 1 52.73 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACAGTCAAAGAATTTCAAAAAAAAA:1 + chr2R 18922637 3' + opus 7466 2 61.64 AGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATTGACGAATTCGGACCGAAAGTTTTATAAAAAAAAGAACACAAGTAGCTTTTTTATGTATTATTAAACGTTTTTATTAATTCCAATAAAGGAAGAACTAGAGCTTT:1 + chr2R 4103362 3' + invader1 3999 2 63.70 TAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGGAGGATACAAAAGCATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAGCGGAAAATAAGTTAAAATATTAAGAGATAATAAGTAACCAAGGAAGTAACATGGGAAGAA:1 - chr3R 12314443 3' + 297 393 2 61.54 TGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCACTACCCAATCCCGCCCATTGTTCTGTTAGTGCA:1 + chr2R 9132847 3' - blood 464 1 77.24 TTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACTCCAACATGTCAATAAAAGTGTATAATGCCTAAAAACAACACATAT:1 + chrX 18055806 3' + 297 6903 2 70.55 CCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCTTATATCTCCCCATTTACTCGCATTTTGTGTCTAAACTTCTTATATTAATAG:1 + chr2L 15524012 3' - opus 67 4 66.44 GCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCGTGTCGGGAATTATGGCCCTAGGTTTTCTAGAATCCCACTGTTTGACCCA:1 + chr2R 11379866 3' + hobo 2869 1 65.07 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTCAGCAATGCTGTCTAGTCTAGAAATTAGGATCAACACATCATTCCTCAGCTATTTATTGTCATTTATTTATTGCCAACTATAAATTGTATGCCATAATCAGTG:1 - chr3L 13380392 3' - hobo 18 1 73.29 TGTTATTTTTTTTTTTCATATTCCAGCTAATCCCATCTAATCTAATCTAATATACAATGGAGCGTTACAAATATGACTTCATACTCATGCGAAATATCTTAATTGTTTAACATTTGGATGACCAACCAACCCCCTTTTCTGC:1 - chr3R 28996212 3' + S2 1580 3 77.46 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAGCGGAAAAGCGAGTGCGAAAATTGCAAATGGTGTCCACTCACGCACGCT:1 - chr2R 17348406 3' + hobo 2887 1 59.68 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCAGGTACATAGAAGTCAAGGCGGGAATAGATCATAAACAACTCTTCCGTCTTACAGAGCACCTTCGCTACATATAA:1 + chr3L 22445299 3' + Transpac 267 2 54.79 AACCGCCCTGCCTCCCAGTGACAGAGGAACCCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCCATACATTTAATTAATTTATACACACATTTTCGCATTCGAGGACTGATGCCTGAGTTTTCGACCGA:1 - chr2L 15934559 3' + springer 309 2 67.12 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCAAACGACTTGGACTAACACTTGGGATTTCTCTG:1 + chr2L 20327714 3' - roo 49 2 50.00 CTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTATACAATATGTGGCGCTTTAGGGGGTTTCTTAAAAAGCGAAATTTAGATATTTTATCCCCAAAGTATGCTTCAAAATCAGTTTTTTTT:1 - chr2R 12403765 3' - pogo 1680 1 64.04 GCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGAAGTTAAATAGAGTTTGTGGTGAACAATAAGAAATTTTTCCCAGTGCAGAGTGTATATTTGTACAAGTGC:1 - chr2R 22616828 3' - BS 5028 1 67.81 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCAT:1 + chr3L 10068986 3' + 412 481 2 62.64 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCCAAAACATCATCCCGCAAAACATCAGGTACGTGAGAGCCATTCAAATGAGCGAGTGCCGATA:1 + chr2R 8467828 3' - roo 8721 2 57.24 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAG:1 - chr3R 26031679 3' + pogo 2050 1 54.11 GAATTCAAATTTAAATATTAAGACCTTTTTAATGCGTGTAAAGTTATCAACTTTTCTTAGTGTACCCTTATTACTGCCCTGCGAGTGTCTCCGCTCATCCAGGACAGCGATAAACAAGTGCTATACAAACAAAGACGGCGCTGTAC:1 + chr2R 9660448 3' - TART-A 13179 1 64.38 TAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAAAATAAGAGCTTGAGGGAAAAAATTCGTACTTTGGAGTACGAAATGCGTCGTTTAGAGCAGCAGCTGAGGGAGTCTCTCAGTCCAGGCAGCTGACGGCCGGAATGGCTGG:1 + chrX 12008334 3' + P-element 498 1 28.36 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCTTTGTTAATGAAATTTTAATCAAGCTGGAAGCGAAAAAGAGTTTGCCAACCAAGTTTGGCAAGCACACATGC:2 - chr3L 6014922 3' - jockey 57 1 50.68 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCAACTTATCCATATAGCAAACCACGCATGACAATATGCCCACTAACAACCAGTAAATTGGAGGCCAGAAAGCTATTAAAAGTCGAG:1 - chr3R 26969244 3' + copia 5087 2 59.59 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGCACCCGCCTGAGAGGAAAATTAAAGCCA:1 + chr2L 2622788 3' - roo 17 2 73.97 ATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACAAACATTTATAACTTTGAAATCATTTAGAGTTTATTTGCACCAACATGA:2 + chr3L 11754761 3' - Doc 155 1 66.44 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGATTTATTTGCCGGAAAAGATTACTTACTCTGGACTGCG:1 - chr3L 13546536 3' - hobo 44 1 54.11 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATAGCCTAACACCAGGAGCAGCGTGGCGGAAAAGCGTTTTGTCCCGGCGACAAGGCAACAACGGCAATAAGGCCCCATTTT:1 - chr3R 25094593 3' + P-element 2845 1 56.85 TAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAAGGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTAATTTAACATTATG:1 + chr2L 19841594 3' - BS 44 1 50.00 AGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCCGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCTTAGACTAAGGAATTTTAATAGCAAAAACATGACTA:1 + chr2L 3327044 3' - jockey 4755 1 72.60 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATGCCATTAATTGAAATGATAACGATTAATG:1 - chr3L 11887175 3' - Doc 43 1 56.85 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATTCAAGAGGCTGCAGCATTTAACCGAACGCAAAGTA:1 + chr3R 6149841 3' - jockey 95 1 76.39 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTGGGAAACCAACGCCATCGTCTGGATAGGATTTGCGACCTTATCAATAGTGACATGCACAGGTGCTGGGTTTGATGTTGCGTCACTATCTTGGTTGTTGCCCCCTGGCGC:1 + chr3R 26969416 3' - copia 13 2 77.40 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATAATGCCATACAATCTGAAATAGTCTGTTGTGTGGCAAATTAGATCTAGAAACTGATTGATATATTGTTC:1 - chrX 18318141 3' + copia 5074 2 52.74 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTGTTATTTTTCGCGCTTTTCGCAGGGCTAATTAAGACGT:1 - chr2R 17872448 3' - Tirant 8145 2 58.22 GACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCG:1 - chr2L 20360643 3' - micropia 13 2 67.42 ATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAAATCCTTTAAAGCTGCGGCAAATGACAATTTTCGCGTATCCTCCGCGGAAGTTCCAGGT:1 - chr3R 31265861 3' + jockey 4864 1 59.59 TTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGCGTGACGCTTCTGGGCCGCCGTCTGCTTCGTATTTCTCGGATTCGTTCGTGTG:1 + chrX 12762021 3' - X-element 4545 1 62.94 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGGAATAAAGTGTGAAAAAATTAATTTATTTCAATTACATTTCATTAAACACTGCCACACGTTGCGAT:1 - chr3L 21405379 3' + mdg1 7406 2 53.47 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGGAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGATATGCAGATCGA:1 + chr3R 4352156 3' - Doc 44 1 60.27 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAGTTAAGTGAACTTTTGCCGGCCAGGTGAATGCAGGCAGAATATCAATTGTTGATTGGTTATTTGATGGGAAAAGATGACAGGCTGT:1 - 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chr2R 21107954 3' + Stalker2 305 2 71.23 AATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAGTACATATACGCCTGTGCTGTTGCCACATGGCCTTCTCCTTT:1 - chr3L 12829621 3' + mdg1 7378 2 73.97 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTAATTTCGCTTGTATCCGGTTATCCGGCTTTTATTACGAGTTGCGCAACCACAGCGCCCCCGCATACCAAAATGTCGAGGGAGAAATACTTTCGCTTTCAAAT:1 + chr2R 18786111 3' + roo 9053 2 72.60 GCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAAAATAAAAATAGCAACATAGTTTTGGGACTCTAAATTAAGTATTATTAAGTATTAATTTTTGTTCTGAAACCAAATTTTCAGCTTGCTAGCTGTAAATGAAATCC:1 + chr2L 16567014 3' - F-element 481 1 65.75 AAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGAAAATACACTGGGAAAATCTCTTACTATCATTTAGTTTAATGGAAAACGATGTCACTAATGTTTAATAACTCCAAGTCAT:1 - chr2L 8615170 3' - 17.6 235 2 58.22 GGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATACTGCATAGTAGTAAAAGCGACTAAGTAACCTAAAACTACATATGAATCAACCCCTCAAGTTTATCAATTATAACTCATATATCA:1 - chr2L 14678710 3' - Quasimodo 28 2 65.75 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGAATTTAGCATAACTAATAGTACAGTTCAGTGCACATGAGTATCTTCTTTTGAATTATGGCTGTAAGT:1 + chr3L 19938577 3' - roo 8717 2 56.85 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATCGATCGTACATCTTAAAACGAAAATAATTACATTCGAAAAATGAAACTACAA:1 - chr2L 615235 3' - F-element 76 1 62.86 GAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTAATTTTCAATAACAAGTATATGGGTAATTTGCGTTTTTGTAGCTTTAAAAATTTTCGTAAATTAATTACCGAATAAAACATAATATAAA:1 + chr2L 20265916 3' + hobo 340 1 66.44 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAACTTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAG:1 + chr3R 4352140 3' - Doc 60 1 59.59 ACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCAGCGTAGCACAGAGGCGTCAGTGGAGGAACGGAGAAACGGAGGATTGGAG:1 + chr3R 13572160 3' + 412 7532 2 76.92 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGATCGGTGCACGGAGAGAGAGAGAGTGGGGAGAGCGAGCTGGGGAGAGCGGATCGAGAGAACGGTATCTGTATCCGTAAGATAGTATTAAA:1 + chr3L 13477315 3' + P-element 2857 1 63.70 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATGAAGCTCCTATTAAAGAGGTGTTTCCCGTGGCCGATTTAAGCTGCCGCTTGTTGGCATTTTGG:1 + chr3R 26658243 3' - 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chr3R 11483750 3' + pogo 2050 1 53.10 TGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGTAAATAAAAAATCGAATATACTTTATAATTAATTACCTGAGAAATCCA:1 - chr3L 18574834 3' - I-element 64 1 69.77 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCCAGCTTCAT:1 + chrX 7624143 3' + roo 9002 2 69.18 CCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACAGCCACATGAGAAGAAATAATTATTGTAGCATCAAGTGGGCAAAGTGTGTAAGTTTGA:1 + chr3R 29736859 3' - hobo 2558 1 60.96 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAAAAACCGCCCAAAACACAAGTCTGCATTTATGCAGGCAACAGCCAATTCACTTG:1 - chr2L 16536513 3' - pogo 64 1 65.07 GTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTG:1 - chr2L 16360591 3' + hobo 2854 1 77.40 CCTTGCCACCGACGGGACCGAGATTCCGTCACCATGGGTCGGGTTACCGACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGGAAAACCACAATGCACCCACGCCGACGAAAAGAGAAGGGCATAG:1 - 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3S18 54 2 52.05 TTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCACGTTCATTCATTTCATTTCA:1 + chrX 8610318 3' - mdg3 59 2 55.86 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATCATGTAGCACGCGTAGATCACGCTTCAAACTATATTTCAATATCTTAACTTCTTA:1 + chr2L 12696230 3' + pogo 2041 1 60.27 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAACTTTTCACGCGTTTTTTGATGTTTCTCCTTGGTACAAGTGCAAAAATAACAAGGAAAAATGGCGTAGAAATATTTAATGAGGCCAAAGTGCAAAAGGAACT:1 - chr3L 18435385 3' - I-element 21 1 69.86 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATACCGTTTCATTCATTTTCAT:1 + chrX 1831289 3' - P-element 84 1 19.55 AAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGTGAAACACACAGAAATAGCACAGTGT:2 + chr3R 15157732 3' + invader3 265 2 73.97 GGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCCGGAGTGGGAGGAATCAAAAGCCCAAACCGA:1 - chr3R 19989213 3' - hobo 26 1 65.47 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATCGCCTATGTGTAACTATGTGTACTTTATAA:2 + chr3R 17747385 3' - 297 6629 2 54.79 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTTGACGATCGAAGACGAATGAAAGTGAAACTAAAGCGAAACAGAAACAGAAACATACACGAAAGGAGGAGAGGAGGAACACAAAACGTGCGTGCTGCGTGG:1 - chrX 19506035 3' - P-element 21 1 72.60 CNTCTCCTTTTGGTTATGGCGGCAGCTTGCACAAATAATTCACTGATTTATTGTTCGCTTTTTGTTTGTCTATTAAATGTTTGTATCGTCGCGGTTCAAACTTTTCGGCCGGACGACGATTTTAATTTTTTATTTTTCAA:1 - chr3R 22132427 3' - TAHRE 272 1 70.71 TCAAGAGAGAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCATGAGATACACGTTACTTAGCTAGTGGAAAGGCGATCGCAAAATTTCATCAGTTTTCTGGGGGAAAAAATTTTAAATTTATTTAAAGGAGGGATGTGGCCAGAGTGTTTTTG:1 - chr3L 22848526 3' - INE-1 579 1 80.14 AAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATATATACATACATCCAGCGATTTCAAGGTTAGCCCGGCAAAAACTGACTTGTGCGGTAGCGCCATGTG:1 - chr3R 15453654 3' - Transpac 50 2 56.85 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATGTTGAATTCAGTTGAGAGCCTTGCGATTTTGTTGGTCCGTTTTACTTTTCGATTTTTTGCTTTTGCCACTTTTTTCGCCGAGTTTT:1 - chrX 3743728 3' - Tirant 13 2 73.23 ATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACAGGAAAATGTGTGCTTCTATGTTTTCGCCTCAA:1 + chr3L 5425525 3' - blood 88 2 80.14 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCCACAACTGCAGTGGCT:1 - chr2L 16202611 3' + copia 5053 2 69.18 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTGACGGTCGTTTGCGTAGGAAGCAAGACACGCGACGGGTCTCGAGTGC:1 + chr2L 14263063 3' + P-element 2844 1 57.53 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTCCAGTCATTTCCTTTCAATTTAATATTTATGAAATATATATATTCCATTCC:1 + chrX 10344868 3' - roo 8730 2 66.44 CTAATGATATTATAAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGCTGCGAACAAGGGGTACCAGGGTATGCGAAAAAT:1 - chr3R 31887728 3' + HB 1543 1 69.86 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTACAATATTTATCAATATATGAACCTAATTCATA:1 - chrX 3637727 3' + roo 387 2 70.55 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGCCATACATTAAGCAGCAGTTTAAAGAGGCAGCGAGGAAATGGGAAAAGCAATAGG:1 + chr2L 18848846 3' - blood 7039 2 66.44 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTATACATACATATGATTCTTTATGAAATATGTGATGGAAATTCTTCCGAGCCTTCGAGGCCTTAATAAATTTGTAAAGTGGATACTTAAAAAT:1 - chr2L 20253810 3' - roo 27 2 65.75 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAAGTCGTTTTGTAGCTTGTCATATGCAAATTG:1 - chr2R 14921441 3' - pogo 27 1 67.12 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGTCGCCACAAAACGAAACAAATAACACAGAAA:1 - chr2R 14450116 3' + roo 9038 1 62.33 AAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTGTGTTCCGGGTACAGCAGCCATTTTGTTGGGCTGATGCTGTT:1 - chrX 21183306 3' - S-element 76 1 71.92 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAATTTAAGCTGTTAAT:2 + chrX 10838594 3' + roo 8997 2 73.97 CTTAGGGGAGAGCGAACGTTTAGTGTAGATCCCTTGCTTTTAGTCTGAGGTGCGTCGTCTTGGCCTCTATGTGTTTCCGCCAGTAATTTGTTGGATGTTTCTAGTAAGGCAATGTTCTCTTGTTATGGTCAGTTTCAAAGCAATTT:1 + chr3R 26158217 3' - Doc3-element 4253 1 56.85 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCCAAGCAGCTAAAATACGGATAGGTTTGGAGAGTAAAGTTACTAGCTTTTATGACATTCTAGTATTCCAGTTCTTAAGTGATCTTCATTTACCAAAAATATTGATAATTCGGGGCCT:2 + chr3R 31264303 3' + jockey 4985 1 77.40 GGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTGGAATGTGTTTAGCGGCCTTTGATTTGAAGCGATTTTCGCGGAGGAGG:1 - chrX 9949503 3' + hobo 2877 1 66.42 TGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAATATTTAAAATACTTAATAGTCATGTTCAAAGACGAATCAAAATAAGAGCTTCCGACTTTCGTTCAACAGCAAATTTTCA:1 - chr3R 4869398 3' - I-element 5164 1 56.16 AACTTTGATTTATTTTTGGTTGTCTCAAGATCTTGGCTAGAGTTTAACTTTGCTATTTGCTGTGATCATCTCAACAGAACGTTCAAAAAATGGAGTCTCAATCTTTATAAGGAGCTGTGTATTGAAAACACATTCCTCAATACGTA:1 - chr3L 12861040 3' + frogger 2178 1 69.18 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAA:1 - chr2R 14450154 3' + roo 9000 2 66.44 AAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATGCGAGTACCGCAGGAGGAGTGTGGCAAATATTGGCTGTGGGTGTTGCATACCCCCGGGCGTGCCGCTACTTGGTCGCTCATCAAGCCTACGCCGCGTT:1 + chr3R 23968708 3' + HMS-Beagle 237 2 72.52 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACACACAGGGAATTCAATAAATATATTTGGCTTAAAACAAAAGAACGTTGTGCCC:2 + chr3R 18539906 3' + roo 9034 1 58.22 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACTTTTTATACATCAAAAAGTCACATTGAAAAATATTTACATATATTTCACTCAATCCTTTCAAGATTTTTGCGCTTTATTAGCATAAGCAAATTTGTCTCG:1 - chr3L 4355381 3' - FB 22 1 70.55 CGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATTGCAGACATCTGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTAAATTTGACAACGGGAAGTCTAGCTTTCTTAGCCTGACTGTCCAGAAAGTT:1 + chr3R 4540338 3' + 1360 112 1 71.23 CAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCAT:1 + chrX 8610314 3' - mdg3 64 2 58.22 ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTG:1 + chr2R 18922610 3' + opus 7439 2 63.01 AATGTAGATAATCAAATTTAATAATGATGCTATGATGATGCTAATGCTATCCCTTTAATTGAAATAAGAGCTTTGTCTTCAGACTTCAATTTGTTTTGAATTTCAATCAGATAGATTACCTTTTGAACCACTGTACCCAAACGGGC:1 - chr3L 2869101 3' + Penelope 353 1 30.82 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACT:1 - chrX 18193664 3' + hopper 1399 1 73.97 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATTATGTGTTTAACATGTTTTAATGAACAGAAACTAACACGAGTCCGGCACAAAAGGATGCA:1 - 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chr2L 20985795 3' - F-element 100 1 75.34 ATGACTTTAAAATACAGAAGTAGGGCGCAGGTAGAAGGGTCTTTATCTTGCATAATAATCCAACATGCCATACTTTGTCAAAGGCTTGTCATAACAGTGGTTCGAAAAAACCATATCCATCCATATTTGTTAATCAGAGAATTTAA:1 - chr2R 4089690 3' - Helena 472 1 60.96 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACCATTCATCCTGCTAGATGCAAGCCCTTTAGTGTTCCAGTAATGGTTCCATAATCATCATCATTTTTGAGAATATCATATGTTGGTATT:2 + chrX 6053049 3' - roo 8696 2 56.16 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAATTTAAGCTGTTAATGGCCCATTTGGTTTTTTTAAATGAACCAAAGGAA:1 + chrX 10838628 3' + roo 9031 1 57.53 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATCAAAAGCGAATCGCATATCGATTGCAGCTGTCAGTTGCACTTGCACTGCGGATTCAGTTACGGATTGGGATTGTTGGGAATGATGATGAATGGATCC:1 - chr3R 18940474 3' - mdg1 7062 2 67.59 TCATAATACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTAGTGTTTTTCTTTTTTGATTAGCCTCCACAACTG:1 - chr2L 16202619 3' + copia 203 2 63.87 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGCACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCAGCG:1 + chr3R 13572114 3' + 412 448 2 52.34 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTTGCAGGAGCCGTCATTCCGTCGGGTTCAGTCTGCAGGA:1 + chr3R 5767479 3' + roo 359 2 51.37 AGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGATAACTTATATGTATACATATAGGCGGAAAAGCGACAGCAGCAATACTAAGAAAAAGAAAAGTGGCACAAACTTTCCTCTTACCCTGCCTTGAGGGTTGCTTTGCCACCATAGCCACGT:1 + chr2L 9109993 3' + opus 7489 2 68.49 GGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGATAACGTAGGAAAGTAGTGCCGCCAAAGGATGAAGATCACGCTTCAATTGGTGTTTGTGAAAGACTAAATTGAAGTAGAGAAAGGATTTAGTTTG:1 - chr2L 19217699 3' - springer 7159 2 39.02 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATT:1 + chr2R 18056879 3' - blood 76 2 69.86 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCTGTAGGCTCACCTACTCCTCCTGCAATCGAAAAACAAAATCAACAGGTGGCGCGCATATTTCAACATGCGGCTGCCAAGCGAACCGAGC:1 + chr3L 5948142 3' + P-element 2858 1 65.07 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATACGAATTGCAGGCACTGTGCGATGTTATGGGTTTTGATTAATTGGAAGTGTTGTTTGACTTGGCC:1 - chr3L 5329084 3' + 412 7490 2 55.48 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATAACAA:1 + chrX 10429858 3' + roo 8994 2 71.92 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATATATGTACAATATTTATCAATATATGAACCTAATTCAT:1 - chrX 3637728 3' + roo 9049 2 69.86 GTTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAATATGGAAAATAACTTAAATTACCAGATGCGGCG:1 + chr3R 29381625 3' - hobo 31 1 64.14 GGCGCCCAACCAGTGGTATTTGACAGTGCGTTAGTCATTACCCACGAACAAAAAAAAAACAAAACTACACAAGCCCTAACTGTGATTGATTTATTGTTTTATTGTGCTAAAAAAGAGAAAATGAAAGAACTGAGATGGAAGCTGAG:1 + chr3L 14601521 3' + gypsy2 354 1 60.96 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTAGCATTGCATTCCGC:1 - chr3L 10068896 3' - 412 63 2 62.24 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGTTTCATATTAAGTTGCTTTAAGTTTTGCATTTGTTGCGTTCATAATTAGACAATCTTTTTAGCA:2 - chrX 2821856 3' + roo 9016 2 58.22 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATAACATTTAACAAAAAACAAAAAAAA:1 - chr3R 26031685 3' + pogo 2063 1 52.76 GCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCA:1 - chr2R 14767363 3' - Tirant 8172 2 61.64 GGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCTGCCATAAAACAGAGACTGTAAAATGTGCATAACTAGCTGGGGCAATTTTTTAAATTTAATGGCTGATTGAAATTCAAGTTGATTACATTTTCTAGAGCAGT:1 + chr3L 19398261 3' + gypsy5 389 2 71.23 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGGCTACCTGACACTGCAACACTGGCGCATCAGAAGCATCTTCTGCAATTATTTGTGCATTAGA:1 + chr3R 21734620 3' + copia 5065 2 56.85 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGC:1 - chr3R 19537451 3' + hopper 1382 1 63.01 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATCGAATGGGTAAATAAATGGAAAAGTTAAATTGGAAATGTGTGTGCGGCGAGTGGCGC:1 + chrX 17531938 3' + blood 7340 1 58.33 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTAGTCTCCTTAATAATACCACAGGTACTCTTCTCCCCTCGCATTTGAGCCACCACCAGACTGGACCCATTCTATATGTACAGTGTCG:1 + chr2L 20253972 3' + roo 9038 1 63.01 GCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTATGCCATATATACAAACTTGAGCACTTAATAGTTATAAA:1 - chrX 13558198 3' + mdg3 166 2 71.92 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGTACTTACAATGTTTTCATTCGGCAATGACTTATTATTTAGCACACTGATAGCTGATAACACAGTGCTAATGTGAGCTGGAGCACTTTTCTGAGTCGGG:1 + chr3L 1324393 3' - 412 22 2 70.55 AGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAAC:2 - chr3R 21276545 3' - BS 5069 1 65.75 GAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGGAAACAACAAGCCTGGCC:1 + chr3R 18935159 3' - jockey 4760 1 74.66 TTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAGATAAAAAAATTAGTAACAGATCTAATGGATAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACGGGGTGTGTAATCTCGGGCACCCACTGCAAA:1 - chrX 19698300 3' - Tc1 1546 1 74.45 AGCCCATCCACCAGGGCGATGCGATCCTGCCTTGGTGCAAGGGCATCGTGGAGGAGATCTACAGCAGAGCAGATTGAGTTGTCAGACGCGCTAATACCAAGGTGACTCATACCATGACCGAGGCGACT:1 - chr3L 17139644 3' + aurora-element 3823 1 73.44 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTGTAGTATGCCCCTCGTCATAAGGCAAACAAATGACATCGACTGACATCCTGTTCTGCTCGCCAGGATTTT:1 + chr2L 2336336 3' - 297 46 2 54.79 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAGGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCCAGCTTCATAGCCACTCAAGTAACCGAGTTACGTGAGGTTACTCCATACGGG:1 + chrX 7624186 3' + roo 9045 1 70.55 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAA:1 - chr3R 19589933 3' - BS 5071 1 70.21 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAGGCCAAGCCTTTGCTTAATGCACAGCAAAACATTATGATATGTTTCAAATAATAGTTTACATA:2 - chrX 3637765 3' + roo 348 2 56.85 ATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATTTAATTAATTTAATGGACGGCCAATAAAAGTGGGCAGTTATTAATGAGCATTAAAGTGTGAGCTGCAAATGAAAGCAGTAAATAATAAATACATCAAG:1 - chr3L 20042370 3' + flea 233 2 71.23 TCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATGTATCTTTTGACTCGTAGTTATACGGCTATGTATCTGTC:1 - chr2L 2336226 3' + 297 6907 2 71.23 AGCGAGATAGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTTCTTAGTTTGT:1 - chr3R 15157601 3' - invader3 5272 2 67.86 AAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTTTCCTTTTTGATTAGCCTCCACAACTGCAGTGGCTTGGGAA:1 - chr2L 16202605 3' + copia 5062 2 64.34 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTCTGACTCATGTTGTACCGCCTTATTGT:1 - chr2R 9408142 3' - FB 40 1 58.22 TAATAACAATAATAAAAATAACAACTCGTGGGCAGCGTCGATAAAGTAATAAACATGGAATATATTGAAATGCGAACGCTTAGAA:1 + chrX 18302768 3' + mdg1 30 2 88.24 ATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAAAAGGGAATTTTAATTGGCTGTCT:1 + chr2R 10760498 3' - Tabor 67 2 65.07 AAATATTGTATTGACTGAAAATCGCTCTCTATAAGAAGTTGCACCTCCACTTTTTCGAGATTCGGGTGGACTCACTGCGGCATCTCTGGTTCCCGCATGGGGACTCCTTTATCAGCCTTGTCTTCATCGATCGCGTCGGAGATTT:1 - chr2L 12112979 3' + TART-C 403 2 73.79 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGTTGTTCGTGGCAGGAAGAGCAAAAAGCACAAGAAGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGTCGCCACAAAACGAAACAAATAACACAGAAAAAGCATTCGAAATGGCACTAGAG:1 - chr2R 14450093 3' + roo 398 1 76.71 GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCAAAGTACAGCTCAAGTGAGGGCTCCTCCTTTGTAGAATAATTCTGTTTATATAAAGCGGGAA:1 - chr3L 1728448 3' - blood 7070 2 56.16 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTTAAGTTCAATTTGTCGGAAAATTCAGCAAAATTCTTCTGATTTGAATCTCCCAAAGGAGAAA:2 - chr2L 12766935 3' - hobo 24 1 67.81 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAA:1 + chr3L 23456280 3' + 1360 3338 1 56.16 AAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCACACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAAATACACTTTACGAGATGTAACCTCTTACACGCACTCATTC:1 + chr2L 13763554 3' - Bari1 83 1 70.55 ACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTA:1 + chr3R 13198278 3' - Doc 71 1 63.01 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAGTAAAAAAACACCCAACTGCCCATCCTGTCAAATACAATTTCTTTATTGAATGGCTTTACTTGAAATTTTTGTTCAACACAAGAGCACGTT:1 - chr2L 15096849 3' + jockey 4967 1 54.79 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCGCATTAAAACGAACGTCAGCTGGGGCCAGCTTATCACGCTTCGAGCATTAGAAAGTGTAGCACGCCTTTAAGCGCAACTAAAA:1 - chr3L 939606 3' + hobo 2937 1 81.82 ACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAA:1 + chr2L 6716375 3' - hobo 86 1 75.34 TTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCAAAAGGCATTTACACTTAACATTTTCGTAGTTATGTCTGATTGAAACAAGACATATA:1 + chr3L 22845983 3' + 297 340 2 60.96 CGTTGATACGGACAGACGGACATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTTACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGATATGACCAAATTAA:1 + chrX 21587782 3' - INE-1 124 1 43.84 GGAACTATAAAATCTAGAAAGTTAAAACTAAGCATACCGATTTTAGAGCCGTGGACCCAGAACACCATACCATTTAAATTGACAAATTTGATATTTTTAAACAGCACAATCGACCCTCGGGAGCCGACATCACGCCGGTGGGCGAA:1 - chr3L 16999506 3' + INE-1 157 1 47.95 CATTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAGGAGCTGCAGACAAACTCTTATATTAAACTCAATGGCTCGG:1 - chr2L 8807851 3' - HMS-Beagle 45 2 60.68 CTTGACACTTCGGCAATAGGCCGCTGCAATCGTACTTATCAGTTTGCCACTTATGCTGTCCAGTGACATGTTTATTGCTGCCCATAAATATAACATATTTATAGTTTGTCTAAACTGGTGAAGGTAAATTGATGAAAGTAGCTTAA:1 - chr2R 5019738 3' - rooA 122 2 71.92 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACAGTAGACTATGTAGTAGTAAATGTTACCAATTTCGTTTCGGTTTTATGCCTCTGACTTGGCGTGTAATATTATATTGTAGT:1 - chr2R 21244837 3' - roo 8704 2 56.85 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGTATAATTTTAGCTCTCCGCTCGCAGAACACAGAGTATTGTATCTAGTGTGTAT:1 - chr3L 18237344 3' - S-element 69 1 65.07 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATGCACCGGGAGAAAATACA:1 - chrX 19162543 3' + pogo 2077 1 66.44 GAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGCTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCAATGCTGTGAAATGGCCT:1 - chrX 17690449 3' - Doc 286 1 63.72 GTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACATATATTTGTTGGAAAGGGAATAAAAATAAAGTTGGCAGCGAAAGGAAAATAAACTAATGATGCCAGCACCCAGATA:2 + chr2L 8615454 3' - 17.6 40 2 58.90 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAGATTGCAGTGAGCGTAGTGGGGGCCAAAAGAAAG:1 - chr2L 16360523 3' + hobo 2922 1 71.92 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATTGTCATATAAATAGACTTTATTGCTTTTAACCCAGTTGTGCTATTTTTGTGT:1 - chr3R 23714035 3' + I-element 5284 1 67.81 TTTTTATTTATTTTTTTTTTTGTGCAACAAAGGCGGGCGAAAATATTCATCAAATTCCTGCAGACGGGCTATAATTTGGCGAAAATAAACTATCTACCATACCTGTTGCACAGCTCCAATCCAGGTTCCACTGCCATGATTACGGT:1 + chr2L 3794998 3' - G2 3077 10 54.11 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAGTGGTATCCTTCTAATCCCAGTTTACAAGCTTATTTCCATACATGTATGAATTTCTCCGAGGCATAACTCAATTTGAGTCCGCTCACA:1 + chr2L 2523009 3' + mdg1 385 2 60.27 TACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGAGAGTAAGGTAGATAGGGAGCTTTTGGAGCTGCTCTAGAGTTGCCAGGTGG:1 + chr2R 16031434 3' - hobo 70 1 65.07 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAAGGGATAGGAAGCGTTTTGATATGATGGATACGGGGCTGCCGTGTGTAATGGGCACTTAGGTCGCTGCCACATGACT:1 - chr3R 5767351 3' - roo 45 2 54.79 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAG:1 - chr2R 5485061 3' - 1360 71 1 67.12 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAATAATACTACGACATTTTTGATAAAGATTGCTCTATTACATTGGCAAATGATAGCCCCACATTTGGCTTCGGGTTGGCTGTCGTTACT:1 - chr3L 11228040 3' - pogo 27 1 66.90 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAACAGAGAATGGAAAGATATTAAAAACAGTGACAAACTATTTGGCGAAACTCTGTTGGTCCTTTCAGGTGATTTCAGACAA:1 + chr2R 4854032 3' - copia 43 2 55.86 TCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACTCCAACATGTCAATAAAAGTGTATAATGCCTAAAAACAACACATATTACG:1 + chrX 18055810 3' + 297 6907 2 67.81 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATAACAAGAACACACTTATTCAATTTGTGATTTTATCAAGGCTTGTGCCGTTTCTTATATTCACAATT:1 + chrX 10429919 3' + roo 392 2 73.97 GATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTTGGTTTACTTTTCGAATGATTTTAAACGATACCCCACATCCATCCCAGC:1 - chr2R 7343248 3' - flea 4823 1 66.44 GCATTCGCGACTCCCACCAGAGGACTTAGCCAGAAGACTTAGTCCTTGGTCCAGCTTTTGGACAAGGACTTCGACGATAATGCCCAATCCGCGTGGAGTG:1 - chr3L 26350085 3' + Quasimodo 323 2 65.00 TACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTT:1 + chr3L 25508750 3' - 1360 338 1 61.64 TTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCGTACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATATTGTTCGGCTTTCGCTCGCTTTCC:1 + chr2R 12872978 3' + P-element 2826 1 43.84 ATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTAATCTCTAGATTCGAACTCACCTCGTAGAACATATACCCACTGAGGGC:1 - chr3R 22572559 3' + HMS-Beagle 6984 2 63.70 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGGTAGATGAAACGTATTGCCTTTTTGCGCTGAGCTGGGAGGAGACCCGATCCCGTATGTCTGCTAGTTGCAATGAGAGAGTAGTGGATCAGGCTATAGG:1 + chrX 13808132 3' + pogo 2082 1 71.72 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCAGGTGTATAGTCCTTGTCCAAAAAGTAGGCTACGATTTCTACAGGAGGCCGAGGACCAGGTATTTGAATGGTC:1 - chr2L 6716290 3' + hobo 2890 1 52.05 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTCTGACTCATG:1 - chr2R 9408159 3' - FB 48 1 54.01 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGACTGGTTGGCGTAA:1 + chr3R 4352118 3' - Doc 82 1 76.71 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAAAGAGAG:1 - chrX 1831252 3' + P-element 2861 1 45.35 CAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAAATACACTTTACGAGATGTAACCTCTTACACGCACTCATT:1 + chr2L 13763553 3' - Bari1 84 1 72.60 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTCTGCACTCATAAGTTTCCTGCTTAGATTGTATCTCACTGGTTGTCCCTC:1 - chrX 16857021 3' - pogo 28 1 63.01 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTG:1 - chr2R 20117309 3' - mdg3 5335 2 75.34 TCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCG:1 - chr3L 25232767 3' + accord2 131 2 65.73 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTA:1 + chr3L 22635782 3' + hopper2 1554 1 51.37 CAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGTATTTAGGGATTCGACGCTCGAATCCTTTCAACCCATCCAAC:1 + chr3R 11550316 3' - F-element 47 1 58.90 TTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATATGGAGTTGTA:1 + chrX 22517693 3' + 1360 3329 1 60.69 TGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGCCCTGGAATATCATTTAAATTTCCATTTAAAGTCGACCACAGCCCCCGCGAGTATAACCATATGCTGCGGGCCAAAGTTGCGATAAAATCAAAATTTT:1 - chr3R 6578617 3' - F-element 35 1 65.75 GGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATAATTTTATTTTTTATTTACTATTGATATTAGCAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAG:1 - chr3R 19449885 3' + opus 438 2 60.96 ATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCGTTGTGATTGCAATACAATTATTGAAAGATTGTGATTAAAATAGATCATGGTT:1 + chr3R 8293625 3' + Stalker2 336 2 60.96 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCGTCGACTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGCCTCTAATACCCAAAGCATA:1 - chr2R 11818235 3' - P-element 95 1 16.43 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCAGGGCATTGTTTTTGCTACCAATCTATGTGTGTCTGTGTGTGTGGGCCAAGTTATTAGATTCATTTCAAGT:1 - chr3L 17142797 3' + hobo 2889 1 51.37 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGTTATAATTTTGTTTGTTTATTAGTTGCAGCAAGCCGAC:1 + chrX 13558259 3' - mdg3 5333 2 74.48 GAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAACAGAAGAAAATCGATGGCAG:1 - chrX 12131159 3' - F-element 369 1 55.48 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCATACAAAATCTGGCAGCTTCCTGCCGCC:1 + chr2L 19628470 3' + hobo 2909 1 66.27 AATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTAAGAACCACGCTGCTGCTGTAAATTATACCACCGAACTAATAGTTAATGGTACACC:1 - chr2R 7337865 3' + flea 296 1 62.07 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAATCG:1 - chr2R 20931651 3' - blood 7092 2 73.79 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAAATTGAATTTATCACTTGAACATGCCAAGCAAACGTTTGTTCCTCCTGTACTGCTTGCTAAATTTTCCCGGCCGACTTTCAGTGGAAATT:1 - chr3R 27411660 3' - I-element 30 1 61.64 CACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGAACTTTGAACATGTTGTTGCGACCAGAAGGTTGCAGCGAACCTGTTGCTCGGTAGTAGCAAA:1 - chr3R 2628972 3' - 1360 58 1 57.53 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGAGACGAGCGC:1 + chr3R 5087155 3' + P-element 2828 1 42.34 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTA:1 - chr2L 20327619 3' + roo 329 2 71.23 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTATTCCGCACTCATATGTTTGTGTACACAAATAGGGTAATGGGATTTTAAAGGTACTTTAGTTGTTCAGCATGCACATTGCAATCTTTAATATGCTT:1 - chr2L 2722312 3' + flea 4991 2 71.92 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCACCTTATCTTTACATATGTATTAATATAATATAGTTCTATATTTTTGTTGCGCTCCTATGTGGTAAGTATTTTACCGGTATGTATTATAA:1 - chr2L 12814683 3' - hobo 29 1 64.38 AAATTAAACGCAAATTTAAATAAATTAAATTAAACTTCGTTCCATACGTACGTTAAACTTTAATGGTAAATTTAAAGAAATATTTGTTAGCTACTTTCCAAACCACATCTCTATCGGAAACCAGGGCTGCCTTAACCAGCACATGT:1 + chr3L 8198205 3' + HeT-A 326 1 66.44 GNCTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAATGTGCGTGGAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATGTTGCATACTTTTTGGGGTAATTTATGATTTCCAAGCACATGCCCGTGGGGCGGG:1 - chr2L 12861672 3' - jockey 32 1 50.00 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGGCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGGAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTGCAAATGTCAGTTTCGAAGTGCCACG:1 + chr3L 9240474 3' + 412 424 2 62.76 GCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGGAGTCGGGG:1 + chr3L 23678166 3' - Osvaldo 14 2 63.89 TCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATAAGTGAACTCAAAAAAGCAGTGCAAATTCAATTAAATTTTTTCTGTTGCTGCTC:1 + chr3L 780761 3' - Burdock 64 2 63.70 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGATGTTGTTGTTGTTGATGTTGTTTCTACTACTCTACTGCTACTACTACATACTCATAAGCCTCTCTACATACCGCAAG:1 - chr3L 13778524 3' - I-element 39 1 55.71 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCGTGTGTGTGTTTGCTACCCGGGAATATTAATTTCTCGACCCCATCCCGCCATCGTGGCCAATCAATTT:1 + chr3L 13568282 3' + hobo 2903 1 54.20 TCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCAAAGTGGTCTTATTTTAGTGAGAAATAGGAAAAAACCCACCTGTGGGATGTGAGTGTGATTTGGGTTGGGTTCCTCATGGCC:1 + chr3L 6282922 3' + Cr1a 355 1 53.62 ATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGACAGTATGCTTGGGA:1 - chr3R 19144402 3' - Juan 53 1 56.92 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCTGCGATCGATTTATATACGAATATTATACAAATTATAATGGCATATAAATGAAGTAACAAACATTGTTTTCCTGTGACATAACTCAT:1 - chr2R 10915631 3' - F-element 62 1 52.74 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACAAAAAAAATATACATTCCACTATATCGTTGTTTAAGAGAAAATGTACTTCTACATAGGAAAAGCGAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTTCA:1 + chr3R 19450021 3' - opus 7026 2 69.86 GCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTTGTTGATTTCCTAGGTGTATAAATTATACT:1 + chr3L 9905806 3' - Juan 4117 1 77.40 GTATGCTTCTTGGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATGAAAGAAAGAATCATTCACTTACCAATCCCTTAAGTTTAATATATAGTGTATAATTCATTTATAATTACAGTATATTTTACTAATTTTTATC:1 + chr3L 20893906 3' - invader3 5228 4 67.81 TCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACAGTAGACCGGCATTATGTTTGTGCCCCATTTTGTGGAAGCCCACTTGCTCTCTTTCCGCCATTAATGGGCGCGGGCGGCGGGTGGTGG:1 + chr2L 3393870 3' + Stalker2 7621 2 58.22 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGTGTATCCTGGCAAGCGCACA:1 - chr3R 23565264 3' - jockey 87 1 71.92 TTCTTGATCAGAATCACTAGCCCAGTCATTCTGTCAATGTCCGTCTGTCTGTCCGTATAAACGCTGTGATCTGATTTATAAAATTGTACTATTAAAACTAAATTCATTGGGATGCTAAGAAATTCATTCAATTATAGCGTTCTACC:1 - chr2R 12391726 3' + INE-1 87 1 67.81 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACCCTTTGACAATTTTCGGCATGCTTTTTATACCTTCCACGTCTATTAGGGGTCTTTCTTGCGGTTCATTTTAAAATTCTA:1 + chr3L 3580986 3' - copia 4910 2 54.79 AATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATCTGTCATGTAATAACGTTAATAATTATAACTTTCGTAGGTATTTCCAATAATACAATCAGATTGAAATCGAAGCAGGGCACCTGACACAAATAGGACGAAAGGA:1 - chr2L 8852722 3' + Burdock 6377 2 70.55 GGGGGAGGATGTTGGCTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGAATCCATCAGCATCAGAACTTTTCTCCTCCTGCCTTCAACCCATTCCAGCCAGTCAAACAAACTCAAATGTGCAAAGTTCTGTAAAGGACTCTCCGTAGTAA:1 + chr3R 12824943 3' + diver2 4524 1 72.60 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATTCAAGAGGCTGCAGCATTTAACCGAACGCAAAGGAGG:1 + chr3R 6149843 3' - jockey 95 1 75.34 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTCTCATTACAACAGAAGGTTTTTGGCCTGGGAAAAAGTG:1 + chr3L 9240449 3' + 412 420 2 78.23 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATTTTTAATGCGATGAAAGGAATGCGAGCGTATTTGCGAGTGTTTATTATTATTAGACCATGAATACATATATAAATGAATAAATGTTGGC:1 - chr3L 16523155 3' - jockey 35 1 66.44 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAGATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTAGAATTGATTTTCTATATTGCACCCAAGATCAAGCCTTTAAAAGTTTATTAAATTT:1 + chr2R 21244954 3' + roo 342 2 65.75 ATCTTAGGCTTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTT:1 + chr3L 25322744 3' + Transib5 2936 1 64.95 ATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGCCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACACGCGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 51 1 69.18 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACG:1 + chr3R 13572107 3' + 412 459 2 52.73 ATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATGAAGTATATTAACCTACAATCTATTAACTGGTTAATGGTCAATCATATAT:1 - chr2R 14424036 3' - hobo 357 1 65.75 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAAT:1 + chrX 10838581 3' + roo 8984 2 82.88 TCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGTTAGCGTTTGCAGGAGCCGTCATTCCGTCGGGTTCAGTCTGCAGGATTGCTGATGGATTTCAC:1 + chr3R 5767496 3' + roo 376 1 63.01 TTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAGCTATTTATGGACGCCGATCGACAGGTTCGATCACAAAAGATTCGAAATGGAATCGAATGAATGGAAGGAGGAATGGAAAATCGTGGGCAGCCAGGGGAAAAGTG:1 - chrX 8610172 3' + mdg3 5482 2 74.48 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCGAATATTTAAACACGTGTATATTTATATTTACACACGCATAGTTTTTG:1 - chrX 20369381 3' + roo 336 2 67.12 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTATTGAACAAAACTTGAGCTATTAATCCGTTTAATGATTTTAAGCCTTATATAAGAAG:1 + chr3R 7136671 3' - roo 8727 2 65.07 TTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGTTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTTGAGCCCCTGCTGAATTTACCATTTTCATTTCCTGATTTGTCCGGGCCTCCAGTCCTGCGG:1 + chr2R 24211643 3' - flea 54 2 56.85 ATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATGTGTTAATTCGGGCAAAGATTTAAATATATATATTTTTATAGGTCTGCAATCGTACTAAAATTAGTCAGTGGAAA:2 - chr2L 13763453 3' + Bari1 1664 1 56.16 ATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAATCCCGGCGGCGTCGCACATGAGCGGGGCGTGGCGTTCAGCGAGCGGGAACTGTGCGTCATGGAGCGGGGCTG:1 + chr3L 9844303 3' - R1A1-element 270 1 54.14 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGCAGAATTTATCTTTAGCT:1 + chr2L 6716405 3' - hobo 32 1 54.92 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAACTTTTCACGCGTTTTTTGATGTTTCTCCTTGGTACAAGTGCAAAAATAACAAGGAAAAATGGCGTAGAAATATTTAATGAG:2 - chr3L 18435405 3' - I-element 41 1 56.16 TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATAGATATATTTCTCTTTATTTTCTTGCTTTGTGCATAAAACTGTCTGGGGTAACTTGATACTGGAAGTAAAAACTGTCGCGACAATTGTTTGG:1 - chr3R 8884268 3' - HMS-Beagle 26 2 66.44 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATTTGTATACGCGTAATAACTTGATTCCAAGCTCTGGCTGTTACGCCTGCTTTAATGCAAATGGAAAAAGCCAAC:1 + chr2R 11394220 3' + pogo 2060 1 54.11 CATAAAATGATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAATTTATTTACTGGCTTTCCATCCGAGTGGAATCTGGCAGTCAGG:1 + chr2R 22501058 3' + Doc3-element 4639 1 54.79 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTGATATTGGGCGATAAAGAAACCGCTAAGAAGCCGCTCTCA:1 + chr2L 11043639 3' + roo 9030 1 56.85 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATAGCCTAACACCAGGAGCAGCGTGGCGGAAAAGCGTTTTGTCCCGGCGACAAGGCAACAACGGCAATAAGGCCCCATTTTTTTCCCAT:1 - chr3R 25094585 3' + P-element 2853 1 62.33 AAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTAGAACTCGACGCTAAATTAGAATTATGCAATTACGGCTCATTT:1 + chr3R 26405088 3' + hobo 2883 1 65.04 CTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGATATTAGATTAGATCTGAAACCAGCTTAAGCCAATTGAAAATTAAAGGCGCATCACAAGTGGGCATAACAA:1 - chrX 16325110 3' + Transpac 5182 2 52.05 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATTCAGCACCAGAATGCTGGATACTTCAATTCGCCC:1 - chr3L 12775937 3' + roo 9037 1 62.33 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTAAAAATCATTTAAGCTTGCTAACTCCACCGAGAGTCTTTTGAGTCAGAAAAGTTGACCAAAAAATAT:1 - chr2L 15596907 3' + roo 9021 2 58.22 TTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATTGACCCCGTTTCCGTTTTCGATTGCAATTCGTTTCAGTTTCATGCACTTTGCACTCTCCACAGCGGCAACCCCCACCACAACCCGCCTGACCCATGTTGC:1 + chr3L 1983593 3' - Transpac 4936 2 73.97 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAACAAAGGAGTACAGTCAACTGCAGTTCCTCCTTACTTAGCTAGTTCCTTTTTTACAAAAAAAAT:1 + chr3R 6523302 3' + I-element 5303 1 54.79 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTGGAATGTGTTTAGCGGCCTTTGATTTGAAGCGATTTTCGCGGAGAAGGTATTTGTTGAACGTATAATTATTTGCATACAATTATTGGCATATCAGAAATATTTGAAACCTT:1 - chrX 9949440 3' + hobo 2928 1 76.71 CTATCATATACCCGTTACTCAACTAGAGGGAGGTGCCAGGAAGATGTCTCTAAAAATTTGTTGGCATAGCAACGAATATTGTAAAATAGTAATAGTAAAATGACTGCTTTTTGCGGTTAAAGTAACAATGTTTTAAAACAACTAAG:1 - chr2R 16193768 3' - INE-1 547 1 52.74 TGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATTCCCCAGGCTAACACTATTCAGATTCGATCTATATTTGG:1 + chr2R 15892211 3' - hobo 76 1 71.23 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATAAATAAATTTTTATGGAAACATTTGCAAATACCTCGACCATTTCAATCTTGCCAGCTGACAGCTGCGGTTGTCCAGCCAAACACAGAAAT:1 + chr3R 26643426 3' + 412 7518 2 64.38 CGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCGTTGTGATTGCAATACAATTATTGAAAGATTGTGATTAAAATAGATCATGGTTTTACAAGAAGTTTTTGTTTTACGAGACTTTTAAA:1 + chr3R 8293659 3' + Stalker2 7618 2 60.96 AAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAACTTTAAA:1 - chr3L 3540090 3' + mdg3 214 2 63.70 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACGATAGAGAGACGATGGAGACCGGCACACAGAAATATATTGGGTCTATAAATCAAGGAATTACTGCGGATATTGAAAACATAATGGCAGCATTCTGTAACTGTAAGTTA:1 + chr2R 18467275 3' + roo 397 1 74.66 AACAAATATTTGTTCTTAAAAAGCATAACGGTTATATGTGGGCTGTTTGAAACTATAAATACTGGAATATACTGCCTAATTTCTTGACCACAACTGTTCTTAATTATGCTCCTACAATCTTGTTATCGTAAAAAATCCATAAACTA:1 + chr3R 29070076 3' + NOF 3905 1 67.81 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGATCGGTGCACGGAGAGAGAGAGAGTGGGGAGAGCGAGCTGGGGAGAGCGGATCGAGAGAACGGTATCTGTATCCGTAAGATAGTATTAAACATTTACCAAT:1 + chr3L 13477326 3' + P-element 2868 1 71.23 ATAGTTCCTAAGATCTTGACGTTCATACGTTCATACGGACAGATGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGACCAAAAATATATATACTTTATACGATCGGAAACGTTTCCTTCTGGGTGTTACATACTTTTCAACGAA:1 - chrX 124083 3' - INE-1 143 1 81.51 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTAATCCTAATCTTTTGTAAGAGGTTTTTAAGCT:1 - chr2L 3151005 3' + blood 7333 1 56.16 CTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAATATCTGAAATAATCAAATTACTGCCGAAACATAAA:1 - chrY 200393 3' - F-element 99 1 79.45 CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGA:1 + chr2L 15601610 3' - Doc 91 1 79.45 TTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTGTCATCATATGTCTAACACTCGTCTCACTCGTTGGCCCG:1 + chr2L 16202682 3' - copia 80 2 72.60 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATTGCATTCCGCGGAGTCGTTCGCTTCGTTTT:1 - chr3L 10068876 3' - 412 7099 2 54.11 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGCCAAATAACAAACCATATTTTTGAAGAGTGTTCTTCGGCCAGCTGCCAAGACACACGAAATTCTGTTTTCCAAGTAGCCCAGCAACGAAATT:1 - chr3L 21108458 3' + roo 9043 1 64.14 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCTG:1 + chr2R 12642760 3' - pogo 39 1 58.90 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTTCTTTCATACTCAACTAGCGACTCAACTCGACTAAACTTTCCTTCTTCCTTTTCCCG:1 + chr3L 2240499 3' - roo 60 2 60.96 GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAGATTACTTTAAGATCAGTAAAGTGTCAGACTGGGATAATGGGAT:1 - chr2R 2052581 3' - opus 7178 4 68.22 TTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTTACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATTTATTGTTTTGGTAGGGTAGATTGCTACAATATTACACTCTTTATATATCCCCTTTCCCCGTAGTTGGCCCTCTGTCTGC:1 - chr3L 4203202 3' - Stalker 6933 4 70.55 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCCAAAACATCATCCCGCAAAACATCAGGTACGTGAGAGCCATTCAAATGAGCGAGTGCCGATAACCCGTTGG:1 + chr2R 8467837 3' - roo 8713 2 54.79 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGTTTTGTTTTGTTTCGCCGATTCGGCGGCTCTGCGCTTGCATTT:1 + chr2R 18266090 3' + roo 9004 2 68.61 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACATATGTGTATGCAGATTGACATTTGACGTGCATAGAATTTGTCTAACTGTAGTTTTCCCTTTGCCAGAATGTTTGCCTCTTGTCTCGGCTT:1 - chr3R 8965102 3' + HMS-Beagle 219 2 67.12 ATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAG:1 + chr3R 8965221 3' - HMS-Beagle 69 2 70.80 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTTAAGTTCAATTTGTCGGAAAATTCAGCAAAATTCTTCTGATTTGAATCTCCCAAAGGAGAAAC:1 - chr2L 12766934 3' - hobo 23 1 68.49 TTAAAGCAATCGATTTTAACGTTTTTATTACATAACTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAAAATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCATGTAATTATTATAAACAATTCTGCTACTTAGTAGGTAAACTGACGCTATATCAG:1 + chrX 144297 3' + Cr1a 4256 1 62.33 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATATTGTGTGTGGGTAATCGCATACGCGATGATTGGTC:2 + chr3R 25094688 3' - P-element 83 1 28.77 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTTTTGTGAATACATGCATACCTACCCGAATAAACATAGGCGCAGCAAGTCTGCGTTAGCAA:1 - chr3R 24760528 3' + pogo 2043 1 60.96 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATAGCTCATAAACAGGAATTAAAAGCATACCGTAAGCTTTC:1 + chr3L 8704578 3' - blood 7093 2 73.29 CTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATTGACCCCGTTTCCGTTTTCGATTGCAATTCGTTTCAGTTTCATGCACTTTGCACTCTCC:1 + chr3L 1983552 3' - Transpac 4977 2 56.85 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAACAGAGAATGGAAAGATATTAAAAACAGTGACAAACTATTTGGCGAAACTCTGTTGGTCCTTTCAGGTGATTTCAGACAAAC:1 + chr2R 4854034 3' - copia 42 2 56.85 TCACAAAGAATCACTCGCGCAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTAAAAATATATGATAATTATAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAGGTTATTGCTTGCATTCTTTGTTGCACAGCACATTTCCGTATGAAATATATTATTAA:1 - chr3R 19449829 3' - Cr1a 134 1 60.27 ATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTAAGGTGCTAAAATAACAGCAAAAGGCAGCTCAATCAAAATGCACTTATAGTGCTTTCTTAGAGACTAAGCTGGAATTAGAGAAACTAGTA:1 + chr2L 20282840 3' + hobo 2490 1 38.36 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTATG:1 - chr3R 26405003 3' - hobo 50 1 53.57 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGAT:1 - chr2R 15529711 3' + roo 330 2 71.23 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACAAATAAACTTAGCTATGCTTGTAGTATATACGTAAAACCGCCGACACAGCTTTTTACTGAAAACTGAAGCATTCTCCCCCAAAAAATTGTTGGGA:1 - chr2L 42462 3' - copia 25 2 68.49 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCA:1 - chr2L 5656550 3' - hobo 69 1 62.33 TCGGGAACAATAAAAGCTAGAAGGTTGAGGTTAATCATACAGATTCTATAGATTTGTTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCTTAGCCGCCAAACCGTCACGCCCACACTTTTTAGCAATTTTTAAATTTTTTTTTCAT:1 - chrX 19807762 3' + INE-1 154 1 60.96 GCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAA:1 + chr2R 10760475 3' - Tabor 90 2 80.82 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGAGCAAAGAAGTCAAATATTAGCACAAACACATTTGTGCACATGCATACATACATATTTGTA:1 + chrX 19506176 3' + P-element 2829 1 45.89 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTGAATGCTTTCAGGTGGCTGCAATAGTTCACAGCATACTTTCGCACAGGGCCAAAAAG:1 - chr2L 5656545 3' - hobo 62 1 58.33 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACTTGTACACGTCGATCTGGAAGCTTGCGGGCTCTTTAAGACCATAATGATA:1 + chrX 22760401 3' - roo 71 2 67.12 AGCTGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGTAGATAAATTTCAGTCGTCTTGCGCTTTAAAAATGGCACCCTGTTTGCATCAGCAGTAACGTTTCCAGAATTCTTAGCAACCAGTTTAACAGCAGCAACAACGAAGA:1 - chr2L 22340251 3' - HMS-Beagle2 6895 2 76.03 TCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATAGCTCATAAACAGGAATTAAAAGCATACCGTAAGCTTTCTA:1 + chr3L 8704580 3' - blood 80 2 71.92 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATTATGTGTTTAACATGTTTTAATGAACAGAAACTAACACGAGTCCGGCACAAAAGGATGCATGTTCGAATGGAAAATCGCTGATTAA:1 - chr3R 12885958 3' - 412 34 2 60.69 GTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATTTACTAAAATGATAATTTATACATACATACAGTTCATGTGTATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATA:1 + chrX 21534511 3' + Burdock 189 2 69.18 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAACTTCCATGAGATTTTTAACCCCTTCACCCCGTAGTTATCCATT:1 + chr3R 31663321 3' - jockey 85 1 68.49 GAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATAAGTGCAAGTTCTTTAGGAA:1 + chr3R 3905860 3' - GATE 8293 2 50.68 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAACATAAATAATAGTTGTCGAATTTTGATGAGCTCCAGCATTTCGCCTGCTTCATTTTGGATTCCTGGCGCTTATACATGGTG:1 + chr2L 18671744 3' + mdg1 7419 2 57.53 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAAAGTTTATATTTATTACTAT:1 - chr2R 11609893 3' + roo 336 2 69.86 GGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTATATAATCCGATTTTTAGGGTGGGATTAATAGATGATTAGTAATCTAAAATGAGCAAATGGCTGCATTAATATCAATTTACAATGCATAGCATTGAAAATCC:1 + chrX 17270421 3' - 3S18 5785 2 68.49 AAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTATGTATATAGTAATACATCAACAACGTGTAAAAGCGTTGAAATAAGGCAG:1 - chr3R 4570245 3' - Juan 69 1 63.83 ACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATCCGACCGGAACTCCTCCATCGTTATCCAATCTATTA:1 + chr3L 17728675 3' + roo 8 2 68.97 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGTGCCTTAAATATCACTTATCACCTGGGACATCGCAAGCTAATTACAAAACTATTGCCAC:1 - chr2R 18785944 3' - roo 62 2 62.07 TTTTAAAAAATATAATTAAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAAT:1 - chr3L 16973382 3' - S-element 1618 2 70.55 TAAACACATGAAACCAATTTACATTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCTATACCGTTCTTTTTCCGGGAAACAGGCCAATAACAATGATATCCCGAACGCTAAAAGAAAGGGAATTAATATAACTCCCTATAT:1 - chr3L 12858172 3' + rover 72 2 54.11 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATTAACCGCAAGCGCCAGCAGATGTTGTCAACAATTAAGCTGACACCTGACAGA:1 - chr2R 10666805 3' + hobo 2910 1 66.44 AGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACATGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATGTTTAAGTTGGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGGAGTTGGGGTTTTTTTTTCGCCCCTGCTGCGAATCGCGATCTGCCAAATG:1 - chr2R 14492930 3' - Idefix 249 2 75.34 GTTTAACGTATTTCCAATGTACTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTTTGTTGCGTTTCGGGTTATATGTATAGCAAACATAGTTT:1 + chr2L 20939589 3' + hopper 1335 1 69.86 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGCAGGTGAGTTTCCATTGTC:1 + chr3R 15363492 3' - 412 66 2 63.01 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGGCGATGCCAGCAATCTGGAGGCCAACAATCCGATGTCGAGCGGCGGAGGAGGCGGAACTGCCAATGGCCCTGTTAGCCCTAGCATTTC:1 - chr3L 16520945 3' - roo 8697 2 63.01 GCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTTGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGCTGGCTAAAAGGGAATTTTA:1 + chr2R 10760487 3' - Tabor 6886 2 63.48 GGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGCATTAATTTTATTTTCGCCGTGCAGTTGCTGTTGTCAACAAACGGGATCGAGCTCAATGAAATTAATGCTGC:1 + chr2L 20913981 3' - roo 449 1 45.89 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCGAATATTTAAACACGTGTATATTTATATTTACACACGCATAGTTTTTGAGGTGACAGCTAAAATGAGGTATGTTTGTACATACAAATACTTTACAATA:1 - chrX 20369331 3' + roo 9049 2 71.23 CACACACTTACACACACACACACAGATCAATTGTATTAAATTGGATTCGTAGAGTTTGTGTAAACAACATTTTATTTGTGTTTGCCTCGCATTATTTTCGTTATAAATGATTTCATTGTTGTT:1 - chr3R 17701670 3' + Quasimodo 30 2 49.59 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATATTGTTCGGCTTTCGCTCGCTTTCCACACAGCAGCAGA:1 + chr2R 12872991 3' + P-element 2851 1 57.46 ATTTAATTAATAATAAATAATATTAATAATTTTAAATCGTTTATGCAAACAACACTGCGTTTTTGGGGTAGGTGGTAGGTACGTGGTAGGTACGTGGTAGCCCAAGGAGAAACCACTGAACTTCGCTGGGGTCTACTTGGATTACC:1 + chr3R 5124344 3' + flea 4995 2 58.90 TGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAAT:1 - chr3R 26693362 3' - Stalker2 7328 2 72.60 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTGTTATTTTTCGCGCTTTTCGCAGGGCTAATTAAGACGTTC:3 - chr2R 17872446 3' - Tirant 36 2 59.59 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTACGTGTGTGCAAGGGTGACAGCTGTCGCCCCAGGGAGAGCAATGTAAGTGAGTAATATTTGTTTATGTGAAAGCAAAGTTCAACGGTACCTGCA:1 - chr3R 17079376 3' - 1360 29 1 65.75 GAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAACAGAAGAAAATCGATGGCAGGTAAAAAG:1 - chrX 12131151 3' - F-element 361 1 50.00 TTCTATTCACACAAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAATATTTTATTTGTAAATAATTCGTTTAAATAGTAATCATGGGTGTTTTTTGC:1 + chrX 5938374 3' - pogo 64 1 63.01 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTATCTCAAGAATTCTCGAAGGACC:1 + chr2R 18056930 3' - blood 7029 2 71.22 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTA:1 - chr2R 15529705 3' + roo 336 2 67.12 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTATGATTTATTAAACATTTATTTGGCTTAATGAATTAATTTGATTTGATTTCGACAGCGTAACGGAAATGCCTGCGAGTG:1 + chr3R 21591452 3' + Juan 4174 1 55.48 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCAAACGACTTGGACTAACACTTGGGATTTCTCTGTGGGAATG:1 + chr2L 20327722 3' - roo 41 2 55.48 CTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATAGATACGATGTGTTGTTGCAACAGGACGTGACTTGGGCGACTAAGAATGCAGG:1 - chr3L 9317467 3' + HMS-Beagle 6980 2 63.70 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCAGGGGTATAGTCCTTGTCCAAAAAGTAGGCTACGATTTCTACAGGAGGTCGAGG:1 - chr2L 6716309 3' + hobo 2897 1 54.17 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCTAAGCCATAGCCAGCATTTAATCAAAAATGAATTTTCCTTTTTTTTGCCATTCCAGATTGAATTCCAAGAAAGAAACTAAAAACTAAAGTGTTG:1 + chr2R 16503521 3' - jockey 33 1 65.07 ATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCAATTCACAGATTTCGAAAATTGGCAATCGAACAATTTGGCAA:1 + chrX 8610874 3' + mdg3 5300 2 71.92 GCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' - R1A1-element 4934 1 68.75 CAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCTAAAAGGGAATTTTAATTGGCTGTCTGTCGTTGTGTGCT:2 + chr2R 10760511 3' - Tabor 6893 2 56.16 GAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACT:1 - chr2L 16360593 3' + hobo 2852 1 77.40 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTAGAATTGATTTTCTATATTGCACCCAAGATCAAGCCTTTAAAAGTTTATTAAATTTCTGTTGAATATGCATAAATACGAGGTCAAGTATGTAATATTTCATC:1 + chr2R 21245000 3' + roo 389 2 71.92 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATCGCCTATGTGTAACTATGTGTA:1 + chr3R 17747377 3' - 297 56 2 60.27 ATGTATATAAATAAGTAAATAATTTTTGTTTAAACATTTTGTTAGCATAATTTAAGCAAGAAGCAAAATACAAGCAATTTGAATATGGAAATATTCTTCGACCAACTCATATTACTACATGTACATGCAGAATGTGTATAATACAT:1 - chr3R 7410450 3' + 1731 4419 1 45.21 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAACTTGAACTTGGTCGTAATATTTATGTGCATCGTAAAGGCCGAAAGTT:1 + chr3R 6603850 3' + pogo 2032 1 68.49 CAACTTGCCAAATCTGAGCCTTAGACGTCGGGGACTTCTTCGACACTTAAGGTCAAGCGTAGAGACGCACGTAGTATAAACTTGCTGGGGACAGCTCTGAAGGTTACACTTTCAAAAAGAAACCTGAAC:1 + chr3L 24253571 3' - HB 1216 1 68.99 TGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATT:1 - chr2L 16360566 3' + hobo 2879 1 60.27 CACACACACACACATACATACGCGGATACGCACACACACACATCCCTTGGACGTAATTACGTTTGGCAAGCTCGTTATGCGTAAGAATATGGTTAATTTATGTCATGATTCCGCACATAAATTCCAAAGGAAT:1 - chr3L 21112465 3' + Quasimodo 40 2 66.92 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATACTCAATCCCAACTACGTGCTGCAATGCCACA:1 + chr2L 11045602 3' - Burdock 6193 2 73.04 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGA:1 + chr2R 12642754 3' - pogo 45 1 54.79 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATACGAATATTATACAAATAATAATGGCATATAAATGAAGTAACAAACATTGTTTTCCTTTGACATAACTCATTAACCATCGGAGACGAAACGGCACTGGGAATGCAG:1 - chr2R 10915596 3' - F-element 27 1 63.70 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCATTTAAATGCAAAATGAAGTAAAT:1 + chrX 12995415 3' - blood 53 2 53.79 GTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCCCTTTTTGCAGATATATTTATTATCATTTTCTATAGCATTTTCTTTTTTTGCCAATTGTAATTTATTGCGTTCATTTTGAGTGAGCCATGTTTATTATTGTTTAACAA:1 + chr3L 20042565 3' - flea 10 2 74.66 AGTATATTCTTGATCGGGATCAGTCTGTCTGTCTGTGCTTATGAACGTAGTGGCACTGCCCGGAGATGACACATCCAGCGCCATTGTGGGATCTCCGCCTGGACTGCGCGAGTAGATCACATCGTACAGGGCGGCCACGAACAGAG:1 + chr3L 18089596 3' + INE-1 81 1 71.92 TAGGCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGACTTCTCCTGTTGCAAGTGCAATTTCCGTGCTAAATATTTGCA:1 - chr3R 26139428 3' + mdg1 7382 2 67.81 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACTTCTCTTTAAATTAATTTCTGTAGCCTACTTTTGTGGGTCAAAAGGGAAAGTCCGTGGCGCGTTTAAATCA:1 - chr3L 9993893 3' - hobo 29 1 60.63 AATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTGAAAATATAAATGAAACCATATTATTGATATGAGAGATTTGCAGATACAAAGATCTAAAATATATGAATTAATTTTAAGTTCAACGTTTCTA:1 + chrX 21322867 3' - Juan 4055 1 64.38 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGAGCAAAGAAGTCAAATATTAGCACAAACACATTTGTGCACATGCATACATACATA:1 + chrX 19506170 3' + P-element 2823 1 41.78 CTGATCACTTTTAAGTTCTGTTTAAAAATAAAGTACAATTTAGATATTTATTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACTTCTCTCGCCACAACGTCCAGACTGCTAACGTTAGTTGTTTGGTTAGTTGTCGCCGCCCTCCTGTGGCTC:1 - chr2R 10107596 3' - gypsy9 5259 2 35.62 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAGGAAACTGATCTGACAGATCTGATTGTAAGCATGCAACAAAAATGCGAGACGCCCCTCTGGATC:2 - chr2R 18265959 3' - roo 8678 2 76.03 CTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGAAATATTAAATGCCTGCTGTAAGCGAAAATTCTAAACCTACAAGCAAAC:1 + chr2L 22032049 3' + Tabor 7252 2 65.75 TTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGTGCAACTGCTGCAAACTCTGTCTCCACTTGCAAATCTGCTGTTTGTTATTTTAATTTGATGGCAGAGTTGTTCGGATAGTT:1 + chr2L 7906008 3' + Quasimodo 7334 2 60.27 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGAAATATTGAGATTTAAATTTCATCAAAGACTGTTTATAATAATAGAAGTCTAGACTTTTTGTAAGCGAGTTCAAGCAA:1 - chr2R 10189241 3' - Doc 47 1 51.37 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTACGTGTGTGCAAGGGTGACAGCTGTCGCCCCAGGGAGAGCAATGTAAGTGAGTAATATTTGTTTATGTGAAAGCAAAGTTCAACGGTACCTGCAAACACACA:1 - chr3R 17079368 3' - 1360 21 1 71.23 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGATAGCGAAATCAAAGTCGAGTTTACTGAATCCACAATACACATCTCCAATAACCGCAACGCCTTGGCGAGGCAACAAAGCACATTTG:1 + chr3L 1728609 3' + blood 342 2 41.10 TAAGAGCGAGATAGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTAGTTTGTTT:1 - chr3R 15157599 3' - invader3 90 2 67.81 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGATTA:2 - chr3R 19589877 3' - BS 5020 1 65.07 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACCTATTTATTCTATATTTGATTAAACCCTACACACAGGGAATTCAATAAATATATTTGGC:1 + chr3R 18539882 3' + roo 346 2 61.64 AAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCGCTACCTTTCCCTTTTCCGTTTGGCAACACTCCACCAAAGTAGTCGAGTGGATGG:1 + chr2R 21965419 3' + Stalker 6842 2 62.33 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCTGATGTC:1 + chr2R 12642765 3' - pogo 31 1 63.64 TAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCAATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTTAGCTTGGGTAAATAAATTACTTGAAGTGGGT:1 + chr2L 3682059 3' - BS 4738 1 78.08 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGACTATTGAAGTCTATCCACTCTATATGAAGTTCGGAAGTTTGTGGCTTTTATCGACTACAAATCCATA:1 - chr2L 11043510 3' - roo 52 2 55.48 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTAGAACTCGACGCTAAATTAGAATTATGCAATTACGGCTCATTTGCGCTGCACAC:1 + chr3R 26405099 3' + hobo 2927 1 65.56 ACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATTCTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGTTTGTTATGGTTAATTT:1 + chr3L 19951259 3' + Ivk 5299 1 70.55 GTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTACTCAGCCGCGATACGGGCCGAAGCGACCGAAAAAAGGGG:1 + chr3R 902597 3' + R1A1-element 5275 1 68.00 AGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTATGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTTAATTATTATCACTTGCCTTGTGGCGATAGCGATTTGATTGTAAATAAGAATTGTTTGGGGCGTCTTGGCTAAGGTGAATTAACTAAT:1 + chr2L 21212982 3' - gypsy 389 2 73.29 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGTTTGTTTTGGATCAACAGCAGCGTTTTGATGGCTTTCTAA:1 + chr3L 12776045 3' - roo 81 2 76.03 GTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCAATGCTGTGAAATGGCCTGAAA:1 - chrX 17690445 3' - Doc 315 1 52.05 GGTGCGGTTAAAATAATAACACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCTAAAAAAAATTATTAAATGTTTATTTTTTTTAAGTCAGATTGCATGAATAATAAGTACCATATGTATGATGCCTTACAATTTCGACCTAAATCTATTAT:3 - chr4 1165859 3' + Tc1 5 1 76.71 AGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACACTTACTTGCCCTCGGCTGTATGTGCTGAACAGATATTGGAAACATTCTAACAAAGCCCATCTAT:1 - chr2L 3393740 3' - Stalker2 7261 2 65.05 CTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATACTCAATCCCAACTACGTGCTGCAATGCCACACGAAGTGGTGATTAGAGGGGGAGGGGGTTAAGGCGTGCTGAAATCGCCTGCATTCTAGGGTTAACCACAAAATAGG:1 + chr2L 11045678 3' - Burdock 12 2 76.03 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGGCGCAGGAGACGAGCGCAGAG:1 + chr3R 5087159 3' + P-element 2843 1 47.62 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAGGCGAATTATACTGTAAAAAATGCTAGCGTACTCTATAATTTAGCCACTCGAGTTAGCAGATTTATGGCATTTGGATTTTGACAGTCATTTTGGAACTTCTCAAGTGCTTAGCTG:2 - chr2R 12642597 3' + pogo 2077 1 69.18 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAAT:1 - chrX 13642065 3' + P-element 2784 1 15.07 ACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCTTCTCCGTAAAGCTCAATTTCTTTATCGACGGATTGCTTGACAATTCCTTTCTT:1 + chr2L 22177455 3' - Doc 71 1 65.52 GACGATATCAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAATGTATTTTAAATATCTTTATTAAATTTTATGAGCTGTTGATAACGAAAT:1 - chr2L 20928069 3' - Chimpo 74 1 69.18 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGTTGCATATAGATGGGCTGGCC:1 - chr3R 28937809 3' - jockey 4745 1 63.89 TTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCCAAGCAGCTAAAATACGGATAGGTTTGGAGAGTAAAGTT:1 + chr3R 31264226 3' + jockey 4908 1 76.03 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTAACCTATTAGGTCTTTATCTATAGCGAAGCTAATGGATGAATTAGGATAATTGCAATTGCAT:1 - chr2R 15529687 3' + roo 9018 2 54.79 TGGCTGGCTTCCTTATTTGTTCAGCCTGTTTACACTTGTATTGTTTTTAAATCATCATAGATTAAGTCTCCACGTTCTTAGCTCCCAAATGACAAACTAAGAAGGAAAATAGAAAGAATTTAATAAACTTTACGGCCAGAACTACG:1 + chr3R 26544403 3' - Transpac 350 1 67.81 GCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCTATCTCGGTTTTAGATTCTTCAAATGAGCATTTACACATTTGTTGGCGTAACCGCAAAACAAAACAAA:1 + chr3L 25730828 3' + Quasimodo 7045 2 57.53 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAATTGCTTTTGATTGACTCATTCAATGCGATTTGTTTTGACGGCTTACGTTTCATTTATCAGGCCATAAAAGGAGCAGATCATAATTCAAAAGAATTATGTGTGA:1 + chr3L 13475651 3' - HMS-Beagle 15 2 73.97 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGACATCAGACTTATAAATAGAAAGTTGGCCAAGAGAGCGGCTCTCTAAAACGCATTCCTCGGCAGTCGCATGGCTTCTA:1 - chr3L 13477166 3' + P-element 2859 1 63.16 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAGACAAATGTCGCTGGCAGCCGC:1 - chr2R 24021521 3' - pogo 29 1 64.38 ATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCAAGACTAATCAAAAGTGTCTTTTCTACACTACAAGTAAAGGGTATAAAT:1 + chr2R 7024474 3' - diver 72 2 67.12 CCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGCTCGTTTACTTTTGTGCACAAAAGCCGAGACGCATAAATAACCGGCAAC:1 - chr2L 1892283 3' + hobo 2867 1 65.07 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATGTTTATACTTGAATATATGCAAACGCTTTTTTGGCTTCGATTTTCGGTTCTT:1 - chr2R 6713838 3' + 297 6914 2 68.49 TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAAGAGTCCATATATATATTTAATGAAGCTTTTTTGGTGGTCCGTCGCATATAAATATGTTTTTATATGACACGACCCACAAGCAAATTGTTATTCAA:1 + chr3L 20910132 3' - F-element 39 1 58.22 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCGGAGTTGATGAAGGAATACGACAGTAAATCGAAGGTGTTGCAATCGCACCAGTTTCCATAAATTGCCCATCACTTACGATTCATTTATAAACATCATTGATCTATCTTC:1 - chr2L 19343875 3' - FB 12 1 74.48 AGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGAACACTAGGCAATAGCTGAGCGATCTGGCAGCCTTGCTCTAGCTGTCACC:1 - chrX 19744369 3' - P-element 10 2 76.30 ATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCGGCATGTTCTGGGCATTATGTGTATTTAAAGATCATTAGTGCGCAATTTATATGTAGATATTCCGAGTATACGTCCGTAAATGCGTATC:1 - chr3L 21765383 3' - gypsy 29 2 65.75 GGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCCGAGCAGGCCAAAAGTGTAAGCGAAACATCTAAAGGGTCAGCCACGTGCAAAATTCTAA:2 + chr2L 16554958 3' - F-element 306 1 59.59 TGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGTCCATTTGGGTAACTAAATAGCTTATGGTTAGTTTCCGCGAATTTTAAGATTGCCTTTTGAGTTGAAAGCATTTGGCTCATTAAAAATTTTTCCAACTTTTAAATTA:1 - chr3L 5425403 3' + blood 364 2 74.66 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGTTTTGTTTTGTTTCGCCGATTCGGCGGCTCTGCGCTGGCATTTATTTAATCCGACCCATCCCCAACGATCCGGCAGATCCGGGGGCATCATG:1 + chr2R 18266140 3' + roo 390 2 69.85 AAAGTTTTGGGATAGCCGATAATTTAGAGATTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGAAAAAATGAAATGACAATCGGCTAGGGTCCAGACTATGATAAGGGCCAGCGGCACAGCCGACCAGACTAT:1 + chr2L 21304265 3' - Q-element 127 2 51.37 TGATCTGCGAGAAAACGTACGCTTCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTACGCTTGGCTGAAACATATTTTGTTTGCCAGTTT:1 + chr2R 18927839 3' + 3S18 6017 2 75.34 ACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAAATACACTTTACGAGATGTAACCTCTTACACGCACTCATTCCCTGTTCCTTTGTCACTTTCAGACTTTGACGAACTCTCACAGAAAATAAAAGGGA:1 + chr2L 13763609 3' - Bari1 28 1 67.12 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGTTTTGGCAATTAAGTGAGCTAATCAGCAGAATTTCCAGCTATTTCATTAGCAATGCAACAATGCGGCA:1 - chrX 13351586 3' - roo 53 2 54.11 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTGTAATCGATATACATACAGGATATACCGAAGATTGTTTTCGTTAAAGAGGTGAAAATAATGCAACAATGAATAAATTTTGATTTTAACATTTACGAGCATGAAACG:1 - chrX 10344714 3' + roo 393 1 46.58 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGTAAATAAAAAATCGAATATACTTTATAATTAATTACCTGAGAAATCCA:1 - chr3L 18574834 3' - I-element 69 1 70.90 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAG:1 + chrX 8610300 3' - mdg3 78 2 68.49 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTGTGACTTGTT:1 - chrX 13484111 3' + hobo 2906 1 55.74 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACGATAGAGAGACGATGGAGACCGGCACACAGAAATATATTGGGTCTATAAATCAAGGAATTACTGCGGA:1 + chr2R 18467235 3' + roo 356 2 52.74 GTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATACTTTATATAGTCGCAAACGCATGTTACATTCTTTTCAACGAATCTAGTATACCCCTTTA:1 + chr2R 2957715 3' - 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pogo 22 1 70.55 ATTGAGTTTTGCAATAGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTAGTTTAGCTCAGCCTCCGTCCCCCTTTTCTTTTAGTTTTTACCCCCATTCTCGATTCTTGTTC:1 - chr2L 12953548 3' + S2 417 1 56.85 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGGGTTCTCTATAATTAATGTAAAGAAATAACGTTTATATTTATTACTATTAA:1 - chr2R 11609890 3' + roo 340 2 67.59 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATAAATATTTTATGGCCCGTGTAAGTTATGAATAGCAAAGGTAACCCATAAGTATGCAACAGTCGCTGGAATTTTTCTGAAATCGAATCCCTTTGATGTTGGTTGATTCAATTTCGAT:1 - chr2R 22040848 3' - jockey 11 1 78.77 CTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGTTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCATATATTGAAATAAAACTGAAATATTATTTTAAA:1 - chr3L 24050778 3' - flea 4866 1 76.03 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAATTAAAAATTACCAAATGCATCTATGAAATTTATCGCACGACAGCCAGACTGACTAAAAAGACACAATGGAGCTGAAGGGACGCAACGGCAAGGAATTAATTT:1 + chr3L 1397127 3' + Juan 4191 1 65.75 ATTCCCATTAGCTGAGTAACGGCTATCTGATAGTCTCTTGTCTGGAAAATATAAATAGATTTCCAAACAGTTTGGTAGATATTAGAATGTTTTTTTTTCTCTTCTTAAATAAACATGTATGTAAATGTAAGGCCAGCTTATGTTCG:1 - chr2L 12156842 3' + INE-1 536 1 47.95 GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTGTGACAGTCAAA:1 + chr2R 18922621 3' + opus 447 2 55.48 TGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGTCCGCAATTTGCGCGGACTGCGG:1 - chr2L 19907564 3' - hobo 76 1 69.86 GTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATATAATCGAGATGCCCTCTGA:1 + chr2L 10685882 3' - Quasimodo 61 2 63.01 ATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGTACATACTTCCCCCATCCGAACCGACCTTATAGACCAGAAGTCTCTCTTTCCGGCACTTTTTGTAATGCCCCGCTCTGAGTCTCACATTTCGAGTGTTTCACCTGC:1 - chr2L 9228617 3' + Burdock 6378 2 73.97 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGACAGGAGCCGAAGTCGATGGGGCAGACTCCTCCATCTTCATGGGTTCCACTGCCAGAGTCTCCTTTT:1 + chr3L 13380540 3' + hobo 2913 1 60.17 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCATTTCATTTCAGTTATACTTACTTTGCTGTTTTTTCTAT:1 + chrX 8610346 3' - mdg3 32 2 63.01 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTCCCAAATTCGGAAATTTCGGATCAGTTCCACTGTCAACTATACTGTAAAGAAATTATTTTGAATCTATACT:1 - chrX 22760300 3' + roo 358 2 53.42 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGCCCTGGAATATCATTTAAATTTCCATTTAAAGTCGACCACAGCCCCCGCGAGTATAACCATATGCTGCGGGCCAAAGTTGC:1 - chr3R 6578634 3' - F-element 52 1 54.11 GGAGACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 78 2 63.89 CAATTTAAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTCGCACTTGCACGTTATTATTTTTCAATACGCTTTATCCAATTTCACCACTCACTAATAAAATCCACACAACCACTGCCGCCACCAGCGAGAATTCCCGAGGGGAGAA:1 + chr3R 3904674 3' + accord2 7241 1 74.66 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTTTTCCGAAATTCAAATGGAGCCCCTTTCTAACACTTTTTCTGCCTCATGAATTGAAATTGCAAAATTATATAATTTTCTGCGA:1 + chr3R 12540599 3' - roo 8698 2 64.38 GGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAAGCAT:1 + chrX 22824259 3' + Gypsy12A_LTR 2239 1 53.42 GTTCATACGGATAGACGGACATGGCCAGATCCTATTCAAGAATATATATACTTTATGTGGTTGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTCCATATTTTTACACGTATATTTACATATAATAAACAACATTTTGTTTAGCTATCCTTATAC:1 - chr2R 5780167 3' - INE-1 123 1 67.81 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCGTTCTACAAAGTAACTTAAGGCTCCCCAGTTTACATTGACCGAACTGATGATACTGCGTTCTATTTGAAACGCAAGATTGTAAATTACGACATACTATTGTCA:1 - chr2L 20067933 3' - roo 19 2 72.60 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGACTATTGAAGTCTATCCACTCTATATGAAGTTCGGAAGTTTGTGGCTTTTATCGACT:1 - chr2L 11043521 3' - roo 63 2 63.01 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGAAACCTCATCGAACTGAAGACAAGGCGTTTTGACTTTTTTTTATGCTGACGCTAACTCGAAAATAATTTGATATTTTCAATTAAAGTTTTCAATGGCTTTT:1 + chr2L 16360705 3' - hobo 12 1 71.74 CTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTCCCTGTTGGCTAGAGACCTGGCCCCACAGCTGAATTCTGATTCATGCCGACTAGCAACCGCTTCTGGGCTAACCATAAATCCTCTACTGACCCTCACCAA:1 - chr2L 17333580 3' - 1360 3249 1 68.49 TACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTCAAAACCGAGTATGCGGAGTATGTGGATGAGTACAATCT:1 - chr2R 18056812 3' + blood 298 2 71.92 TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATACAGGTATGAACTGCTTCAACTGCGTGCTTCTTGTGTATGCATTGCTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGGGTGTGGGG:1 + chr3R 10925017 3' + I-element 5304 1 58.22 AATGATTTAATATTAGGGGTATGCAGTTTCAAGTGGTATTAACACAAAAAAACAGTTAATACGTTATTAAATGTTGATGCCGTATTGGCGCGTCTCGACTTTACATATGCGGACAATATTTTGAATTAATTAATGAGTTTGATAAA:1 - chrX 10981377 3' - Cr1a 4136 1 79.45 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACACCCTACCCCATAACTTCCTAATACCGGCCGTTGTCA:1 - chr3L 25496769 3' - mdg3 5331 2 73.91 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGAGACGAGCGCAGAGTTATTGGTATTGTTGCT:1 + chr3R 5087176 3' + P-element 2840 1 52.74 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCCTTTGCAATGAAACATGGTATGCATTTTGCAGAATTGAGTAAAATGCAGTAAAGTTAATTATAAATCTTTAATT:2 + chr2L 15597034 3' - roo 8709 2 54.11 ATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGATAAGCAGGAGAGGTACAGTGCGTTTCAATACTGTAAA:1 - chr3L 9947436 3' - Doc 4553 1 73.97 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCCCCATATCGTGAACATTTAATTAACAGCACACTCTGGTTATAATACCATAGCTTATGAGGTACTTGAAAACAT:1 + chr3R 13198296 3' - Doc 53 1 52.74 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAGTTAAGTGAACTTTTGCCGGCCAGGTGAATGCAGGCAGAATATCAATTGTTGATTGGTTATTTGATG:1 - chr3L 19702736 3' - pogo 48 1 55.48 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACACACAGCACGCTCTCGGTGGTACAGCCGCTGGCAGCTTAAATGTTTTTTGAATTTAAACTTAT:1 - chr2L 19680981 3' - hobo 56 1 57.53 AAAATTTCCAATAATTTATTGTCAATTACTTCCAAACCGCTTGTTTTTAATTCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAATATAGTATGTATCCTTTTTGACTGATAGCGATAGCATAACTTTTTCGGTTAGTCTCCGAGGTGC:1 + chr2R 9361801 3' - R1A1-element 147 1 56.16 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTTATGAATATTAAATAAAATCTCTCAATCGAAAAGGTTGTTTTTAAGCATGCTTCTATTTGACATAAAAGAGTTGACATTTCTTCGTAAGTCAAAATAGTGTCGCCG:1 - chr3R 19447626 3' + roo 393 1 45.21 TTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGAAACAAATATGAG:1 - chr3L 13475499 3' + HMS-Beagle 189 2 61.64 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAATCGCAACTATTCTTGTTTTCTAGGCAGTGAAGCTAACCGTAATCCA:1 - chr2R 20931608 3' - blood 7050 2 53.42 AAAAGAAGAAATGGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGA:1 + chr3R 13572108 3' + 412 425 2 62.07 ATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTAATTTAACATTATGCGGCAGACAGAGCAAA:1 + chr2L 19841610 3' - BS 28 1 62.33 CCAGTGTATGGCTGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAGTATACCTAGACGACATCATAGTTTTCTCCACATCTTAAATTAATAGTGTTTTTCTTCTTTTTTTTACATATTTTAAGTAATTGGATTTTTTACAATTTTGG:1 - chr2R 4122322 3' + 1360 3367 1 55.48 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGGCTTTTGGGGTTAGGCTTTAAGAGCGGACTGCAAAAGGACCGGCGAACAACAAATCCGTACAAATTGAATAAG:1 + chrX 20379403 3' - hobo 44 1 56.85 GTCTTTTAAATTTCTGTCGATTTACCAAAAAACTTTTTATCACGGCAACTCTAACGCCTTAAAATCGCGCAAAGCTGCCACGCCCACATTTTTGAACAATATTAAGTTTTTTCTCAATTTATTCCCCAATATCTATCGATATCCCA:1 + chrX 23078697 3' + INE-1 301 1 79.45 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATACGAATTGCAGGCACTGTGCGATGTTATGGGTTTTGATTAATTGGAAGTGT:1 - chr3L 5329098 3' + 412 424 2 64.83 GGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCAGAACTTTCTTTTTCCACAATATTACTTTGTTTTGTTTAGAAAGCGTAATTCCATAAGTTTGTTCAAAGAGTGGCTC:1 + chr2L 8852893 3' - Burdock 2 2 73.39 AGGGGAATAGTACGCTAGTCAATTAACTTAAATAATTTCGAAGTTCGTGTACCTTAGTGTTCCCAGTTAGATACCCGTTTGCTCTCATTCTGGATTATGGTTTGATCATCCATTTTGTTGCTTACCTATGCGATTTTCTAGCAGAG:1 - 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chr2L 10177968 3' - mdg3 42 2 57.53 ACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATATCGCAGGCTGATGCGTTTAACGAGCTGGACAAGCTG:1 + chr2R 6044104 3' + jockey 4764 1 74.65 TATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAG:2 - chr2R 20117317 3' - mdg3 5343 2 80.82 GTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACGAGGAGAAATGAAGCCGCTCTAGAATATAAATAAACAATTCATTAATTAAAATAGCGACATGGTCAACTGGAG:1 + chr3R 4434053 3' - 17.6 7199 2 49.66 GCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATTCGACGTTAATTGATCTGTTTTTAATTTAGCTGCTTAAACAGGCGATAGGAAAACTTTCTCATCAACTTTGATAACATTTTTCGCATTCAATATCGAGTA:1 - chr2R 7540952 3' - F-element 34 1 65.07 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCGAACGTCATCCTGCAGCAACCTTCGGGTGGTTTGCCACCCGCGCCCCCCTCAGATAGTGCTGAAAACTTTTG:1 + chr3L 939739 3' - hobo 49 1 52.05 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTGTTGAGGCAATGTAATAACTATCCCCAATTATATTTATATCCCAACTGAGAATATCAATTAAAAGAT:1 + chr3L 19510602 3' - pogo 51 1 54.79 ACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCCGAGCAGGCCAAAAGTGTAAGCGAAACATCTAAAGGGTCAGCCACGTGCAAAATTCTAACATCTCTCA:1 + chr2L 16554967 3' - F-element 297 1 53.42 AAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCTGAAAGCCAGCTGTTGCCAAAAATTGCAGGCTAATTGACTTTTCTAGCAGC:1 - chr2L 3677592 3' - BS 53 1 62.96 GCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGTATTTCTGTAGGTGGCTTGGTTTGTTTATTTTGTTGTGCACTGGCCGCAATTGAGAATTTCTATGGAAAATAGGACCAGTAACAGGAACAATGGACGAGA:1 - chrX 17508768 3' + Burdock 238 2 73.97 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCATCAATCAAACTGTCACCAATCGCAGCCTTAGTTTAAGTTGCCTGCATCCTTCTCCTCATCCGGATCCCCTCGATGTTATGGACATC:1 + chrX 998252 3' + copia 221 1 61.64 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTCAAGTCAATTGAGAATGAATACGTTTTCTTTGGGTTTTCTACGCGATT:1 - chr2L 8009062 3' - roo 71 2 65.07 AAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCTGCCACTCCCTCCCATGACATCCTTCTTCGCCCGTCTAGCCCACACAGCGGGGCAAACCGC:2 + chrX 19992669 3' + copia 5063 2 60.27 TACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGCTGGACTTTAACCTCGTATTTAGAATGTTTAAT:1 + chrX 127039 3' - hobo 87 1 76.03 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAATATGGAAAATAACTTAAATTACCAGATGCGGCG:1 + chr3R 29381625 3' - hobo 19 1 69.92 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACCATTTTCGCCATTCGCCGCCTCGGGCGTAATTTGTAAATCTCTGCAGGCGCAATT:1 - chr2R 18467129 3' - roo 8725 2 59.86 ATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAATTGCTTTTGATTGACTCATTCAATGCGATTTGTTTTGACGGCTTACGTTTCATTTATCAGGCCATAAAAGGAGCAGATCATAATTCAAAAGAATTATGTGTGAGATAC:1 + chr3L 13475656 3' - HMS-Beagle 6806 2 77.40 GACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGCCCCTTACACCAGTGCGCGAAGTTCGACGAAACTCGCAGCTTTACTAAAAATAAACAC:1 - chr3R 18539948 3' + blood 432 1 70.50 GAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGAATAATGCTGAAATATTTATGAGACTGACACACACAGAAACAGGCGATTCATGTGTGCCCGTGTTAATGTATGTGTAATGAGTTGGGCAAGTGTTGAAATCTGCATTTAAGACATCCTTT:1 - chr2L 13031717 3' + X-element 4484 1 79.45 GGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGAACTTATTGATATAGTAAAGTAATGATAAAAATATAAATTGAAATAAAATATAAATTCCTGACAGAGATCAAGGAAATCCATTTC:1 - chr3R 27948194 3' - Juan 3889 1 58.22 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGCTCGTTTACTTTTGTGCACAAAAGCCGAGACGCATAAATAACCGGCAACGGGCATTTTGCCGATGACAATGACGAAC:1 - chr2L 1892255 3' + hobo 2897 1 55.56 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATCATTAGGTATGGATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCGAATGCGATGCCT:1 + chr3L 3540189 3' - mdg3 75 2 74.13 GCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTACCAACGAATTTATGTTTTCAGCCATAAATTGCCAAACATATACGCCCACCTGGGCGCCGCTTGTTT:1 - chr2R 18927760 3' - 3S18 55 2 60.27 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCAGGAAGAATCCTTTTCTTCGGACTCGCACGGATATTGTTCGGCTTTCGCTCGCTTTCCACACAGCAGCAGAGGAGGAAGCTCAGTGGCACTGCCTCG:1 + chr2R 12873017 3' + P-element 2876 1 76.30 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACCTCAGGGGATGTCATTTGACGGCGGCAAGTGTAAAAATTAAGCAGCT:1 - chr2L 9109854 3' - opus 7160 4 60.33 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGCCGCTGATGATGGGAAGCAATTATC:1 + chrX 19744526 3' - P-element 16 1 69.17 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTTTGACCGCACAGTCAATTTAATTTTAATTTACACTTCATGCATAAAAAATTAAACGCGCGTTGCCGTGTCAATTG:1 + chr3L 19434183 3' - Doc 35 1 56.25 CGTCTAACCTTCTGGGAACACCTACCACGACTTAGGCAGTCGATTAAGTCAGTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATACCGGATTGTAGTATTTGACAGTATTGTGGACTGTTTCTTTAGCTT:1 + chr2R 3108278 3' + baggins 5011 1 68.49 GGGCATTGCCTATATTCAACATATATTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGCGCAGGCCGAGGCAATTGC:1 + chr3R 20720610 3' - 1731 4312 1 76.14 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGCCAAGTCGCGCGCAACACGCATGCGCA:1 + chrX 19162725 3' - pogo 20 1 71.92 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGAAATGCTTATCATTGCCCAAACCGGATGTGCACAGTGTCAAGCAGCAGGAGCAAAGCGTTTTTATATC:1 + chr3L 10069041 3' + 412 7534 2 76.71 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTGAAAATCTTTAGAGATTTCGAGTGTTCTGGAAAGTAGGAAGTTTCCGGCTTCAGTGGGTTTTATGAGTAATT:1 - chrX 7624037 3' - roo 47 2 54.11 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGTGTATGCGTAATACGAGCACCCACGTGCACATATATAT:1 - chr2R 4937722 3' - mdg3 5335 2 73.29 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCTAAGCCATAGCCAGCATTTAATCAAAAATGAATTTTCCTTTTTTTTGCCATTCCAGATTGAATTCCA:1 + chr2R 16503494 3' - jockey 61 1 53.42 AGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGACCATTGAAAATGTAAAATACAGATTTGTGGCATGTAGGGCACAATCGAGAAGGTAATCATAAAAACATTTCGGATAGTCCGAGA:1 - chr2L 12813049 3' - Rt1b 5000 1 60.96 TTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATTTCCTGGCCAGCATTCTGGCCTACCAGCGTGATCGCTGGCAGCTGGACGACTTTCGGCGAGCGGAGAGGATGCAGAGCTGCCAGCTGGCCAAGGC:1 - chrX 7932140 3' - P-element 444 1 69.93 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACGATAGAGAGACGATGGAGACCGGCACACAGAAATATATTGGGTCTATAAATCAAGGAATTACTGC:1 + chr2R 18467232 3' + roo 357 2 53.52 GTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCTGTCAGATTGAATTCCGTTTCCACTGCACAGGAAATAAAGCCAAGTTCATTCAT:1 + chrX 8610309 3' - mdg3 69 2 62.33 CACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCAATGCTGTGAAATGGCCTGAAATGAAATTTGTGAAAT:1 - chrX 17690430 3' - Doc 300 1 62.33 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATTTCAAGCTT:1 - chr2R 8375033 3' - roo 8737 2 76.03 TTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTTTCATTGTTTGCTCCTTCATTCAGAAAATCGTCAAGCAATTACTAGTATAA:1 + chr2R 18807905 3' + BS 5026 1 65.75 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTAGGCAGCAACAATATTTACAGCTTTAGCGGCCAAAAGCACAGTGGGGCAAA:1 - chr3L 11296536 3' + P-element 2816 1 34.93 CGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCACGCATATTCGTATGTGTGCGCGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 5656613 3' + hobo 2851 1 76.71 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGA:1 - chr3R 26405016 3' - hobo 69 1 64.38 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAGTGCACGCGATTTGGGCGTAAGATTAATTGGCTCAAATTCGGGTCGTTGAAATCATATACTCGTATAACTTTACCCTGGAGATTATTGACCAGGCTAATTAAATTGTGTC:1 + chr3L 9994052 3' + hobo 2926 1 77.40 TGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAATGGCAGGCTGGCTGAACTACTACAA:1 + chr3R 22572677 3' - HMS-Beagle 24 2 66.17 CCGAAAACACGAGAACCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTGCCAGATCTTTGCTTCAAATATAAATAATCAGTGCTACTGGGAATTCAAGATGTATTTCATCGCAAGTCTTTTGTTGATAGT:1 - chr2L 12448082 3' - opus 44 4 53.15 AAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGAGTACACGGCTGAGTACAGTAATGACGCCCTGCAGACAGACAGAAGGAGTAGTTTATTCTCGCTAGAGCCCTAG:1 - chr3R 902520 3' - R1A1-element 24 1 50.00 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTAATGAGATTAGGTGTTTGTATCATTTGTTACTAGCTGCCAATAATGAAGTTGTGATTGTGATTATTT:1 + chrX 16857171 3' + pogo 2052 1 54.11 ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCATATAACTTGATTTGTTTTTATTTCCAAGTATGTTCGTTATTGTTTACAATTTGTCCGAAATCTACATATTATGGAGAGGTAATATGTTAAATCATA:1 - chr2L 22031924 3' - Tabor 6865 2 67.81 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGGGTGAGGACTTTCAACTGCTGCTTTAGCCGTTACTGCTGCTGATTCTCCTGGTTCAAGTATAG:1 - chr3R 12781477 3' + pogo 2046 1 56.85 GGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATACCCTTTTCGTTGGCATTTGATTTCGGCCATCGCATTCTAAATCATCCAGCACGTGCGCCATCCAGCGGATTTGGCCAAAAGTGGCAG:1 - chr2R 23420664 3' - G2 2759 1 57.53 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAGCGGAAAAGCGAGTGCGAAAATTGCAAATGGTGTCCACTCACGCACGCT:1 - chr2R 17348406 3' + hobo 2899 1 55.36 CCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTACTCAGCCGTGATACGGGCCGAAGCGACCGAAAAAAGGGGTTACATAAGGGGGTCTGAAATTAACGCACAG:1 + chr3R 902628 3' + R1A1-element 5285 1 51.37 AGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGTGCGTGCGATCAACGCATTTTTCGCGAACTACATCGGCAAAAATTCGAATAGTTCAGAA:1 - chrX 22652703 3' - ZAM 64 2 62.33 AAACTTACAAGCTCAAATATAATCCAAATATAATTCGTAGGCCATAGACACGACATCCATAAAAACACAAATCTATTAACTGGCGCCCAACATTCAGGAGTGACGCAATGGAATGGCGCTGCGTTCCCACTGCTTTAAGTAAGGCA:1 + chr2R 4898889 3' + gypsy7 171 2 65.75 CAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAA:1 - chrX 18193714 3' + hopper 1349 1 64.38 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGATCGGCTTGGATCGTTCGGATCCGCTTGGATCGCTTTGGATCGCCGCG:1 + chr2L 8700044 3' - P-element 63 1 33.33 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCCTTACCCCATATCCTATATCCTTTATCCTCCATTGCTCCTGCTCCTGTTCCAACTGTAATTGGCATTTA:1 - chr3R 15700317 3' + Transpac 5178 2 52.05 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGAAAAAGCCAGCAGTGCGGCTCATTTGCATGCCACATGACAAAAAGCTCGTAGCAAATGCAAATTGAATCCAACTTAAATGCCCGACCATCGCG:1 + chrX 10698746 3' - mdg1 26 2 67.36 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATTTAATTAATTTAATGGACGGCCAATAAAAGTGGGCAGTTATTAATGAGTATTAAAGTGTGAGCTGCAAATGAAAGCAGTAAATAATAAATACATCA:1 - chr3L 20042372 3' + flea 231 2 68.49 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAAATAAAAATGTTTTGCATAATATAAGTCTCGAATACCTCTAACTAACCATTGAAAATGAGCTGCAAAAAATCCTTTGGAT:1 + chr2L 10858483 3' + Burdock 6354 2 60.27 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGTACTTACAATGTTTTCATTCGGCAATGACTTATTATTTAGCACACTGATAGCTGATAAC:1 + chr3L 1324354 3' - 412 61 2 60.27 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATAAATATTTTATGGCCCGTGTAAGTTATGAATAGCAAAGGTAACCCATAAGTATGCAACAGTCGCTGGAATTTTTCTGAAATCGAATCCCTTTGATG:1 - chr2R 22040868 3' - jockey 31 1 65.07 CGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGCAAATGAAAACTCAAGTGCAAAATGCAACAGTTGCGTA:1 + chrX 17508960 3' - Burdock 6151 2 75.34 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCCTTCGAT:1 + chr3R 18860887 3' + roo 357 2 52.74 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGCTATTAGTGGGTTCGGTTTTTACCATCGCAGCTGCAGGTGAGTTTCCATTGTCCGCTGGTTCG:1 + chr3R 15363502 3' - 412 7109 2 56.16 TTCACACGTCGGCGATCGAAATGCTTCAGTGGTCGGCAACTGACGGTGCCACTGTAAACGTGACGCTAGAGGTAGACGACCGGGCGATGGCGAAACTTGATGTAGGACGTGTTTACATAGATGTGGAAATCGTGGCGGGACTCTCG:1 - chr2R 23597870 3' - F-element 13 1 61.64 AACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGGACTCATTCAATAGTCTAAAATTTCCCCAAAACTAG:1 + chr2R 24247734 3' + roo 9038 1 79.45 GAAACCGTGTGCAAATACTTCTGACAACTGATAAAGATCTCTTCATTTGCCTCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTTATTTTTTCAATTCTTCTTTCATCTGACTCTGCATAGTTTTGGACACCTACTGTCATCTGTGTCATTCCAGA:1 - chr2L 13767898 3' - Bari1 212 1 78.08 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTCTTGATAGACCAAGCAGGAACTTAAGCCTAAGTCGAGTCCC:1 + chrX 7624135 3' + roo 8994 2 74.66 ATACGGGAGTACTCCTTATCTATAGTTCCGATTGGCCATCTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGGTGACGATGATCATCTTTAAAAGGGCCTAAGGAAACAGGATAGTATACAGCAGAGCTCTGGCAAAAAGGTTGCTGAAAT:1 + chr2L 5864736 3' - Rt1a 4777 1 54.79 GTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCTACGTCTACTGCATTGAAAGTTGAAAAAATCTGATAAATGTGGGATGCATTCGATATGGTGGGCGGATCGATCTTT:1 + chrX 10535211 3' + flea 498 1 60.53 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTGGAGCCTGAAAATTGGCTGAATTTTGTATTGAGCTCTACGTATGAAAAAACATAATATTATCAGGCCTATACGCAAGTAAATAGTTGAATTGAAAAATTTGT:1 + chr3R 15154701 3' + mdg1 403 2 72.60 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAACTCTTGATTTAAATCATAATTTAATTTAAACTCAATCTCTCAAAAACAAACACTTGGTCTTTGTGATGATGCACATAATCACAATCATTTGCTGGCCAG:1 + chr2R 15190538 3' - pogo 19 1 66.44 TATGTGTGAGTGTGTGTGTGTGAAGAGGGAGAGACAGAGAGAGAGACGACAAAAAAAAAAACTAAGGAAAAACACTGAATAGTGGGAGGGTTGCCTAAATACGAACACTCTAA:1 - chrX 7758368 3' - accord 7038 2 49.56 ACTTGCCAGTCTCGGTCGTCTTTTCGTCGAACAACGCGTTGGGCAGCCTCGTCTCTCTTCCCTGCGTTATGAATGCCGCCCGTATCCTCTGGAACACCTCCTTCAAGTTGCGCCTGTGTTCC:1 - chr3L 25232870 3' - Osvaldo 1147 2 68.03 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAGGCACGTACTTAAAAGAAAAAAAAATAAGAAAAAAAAACTTCCCCATCAAGTGGGTCCAATAAAAGTTTTATGAGTCAGCCGCAATCT:1 - chr2L 10128052 3' - hobo 34 1 60.96 ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATGTACATATGTGTCTATCACACTGTCTACCCACTTCAAAGGTCATCGGAGCTTGTCCAAGTCGTAACAGCAAATTCATAAAG:1 - chr3R 22275233 3' + flea 224 2 58.22 CGGACTTGTGTTCTGAATTGGGGTTCATCATTACAAACTAAACACAGCGTTTGTTTTAGCAGCTTCCGTTTCCTGTTGGCAGCCAGACGAGCAGCGTAGCACAGAGGCGTCAGTGGAGGAACGGAGAAACGGAGGATTGGAGGAGC:1 + chr3R 13572164 3' + 412 480 2 78.08 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATGGTAGGCGAAGG:1 - chrX 16995031 3' - jockey 72 1 60.27 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGAATTTATGTTTCTATAAGTGGACAAAACTAAACTATTGCATATGCTTATGATCACAAGTTATCCTTAAACACCTTGATTA:1 + chr2R 11610004 3' - roo 8704 2 56.16 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAGTTTTGCTTCAGTGTGAGTGTGTGTATCCTGGCAAGCGC:1 - chr3R 23565267 3' - jockey 89 1 72.60 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAATGGCAGGCTGGCGGAACTACTACAATCTGAAGTGCCAACC:1 + chr3R 22572692 3' - HMS-Beagle 6812 2 72.14 ATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCATTCGCTGCCAGTTTTCTCCTACACCTAAAGCGATTTATATACA:1 + chr3L 21043123 3' - Quasimodo 69 2 69.86 TTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCCTTCGATTGTTTCCTTATCCATTAGATACTCTATTTTCTCTCTGTGCATTGCTATGTG:1 + chr3R 18860938 3' + roo 410 1 55.86 CTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAAGAAACATTGTCATAAAATACTAAGATCTCTCAATAAAAGATTGATCAAT:1 - chr3R 1047925 3' + Stalker2 7622 2 65.07 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTAT:2 + chr2L 2622731 3' - roo 8738 2 73.97 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAATGAATTTATTAAATAGCTTAATCAATAGCTTAAATAGCTAAAATGAGAAACGTAAAACTACATGTAAATAGCACTTATTTCAAAA:1 + chrX 19591278 3' + roo 9041 1 63.01 CGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTATTTGGAGCATTTTATGTGACATTTTATTCCTCCTGCGAGTTTTAAGCTGCCAAGACTTTTCGCTCATTAAA:1 + chr3L 2335895 3' + hobo 473 1 69.18 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTCTTCTCCGTAAAGCTCAATTTCTTTATCGACGGATTGCTTGACA:2 + chr2L 22177444 3' - Doc 83 1 73.29 CTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGGTTCGAATTGCGAAAGAGTT:1 + chr3R 9863014 3' - Stalker2 26 2 67.81 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATCGCCTATGTGTAACTATGTGTACTTTATAAATGTTCACCT:1 + chr3R 17747395 3' - 297 6619 2 60.27 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGCATTTACTAGTCGGCAGCGGAGTCATATGTTGAAAAACCCTGTCATTAGATTGACACTAAGAAGAAATCTTCTTTGCTTTGACGGAAGTTGGGATTTATGTTCC:1 - chr2L 20223088 3' - P-element 16 1 59.59 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATATTATTGCGTTCT:1 - chr2R 24021548 3' - pogo 36 1 53.17 ACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTGTCAATGGGTTGAATCCATTTTAGTTGCACTTAACTGGCAACTGAATTGCAGCTGCCAGTTTGCCATGCACATGGTTCGAATTGCGAA:1 + chr3R 9863008 3' - Stalker2 32 2 63.70 CACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTTGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGAGGCTATAT:1 - chr3R 15035034 3' - Stalker2 7292 2 55.48 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACAGATCAAAGTTGTAATACAAAACGAGAAGAATCTTTCAGGCAGCGCTCAAATT:4 - chr3L 12775970 3' + roo 9004 2 65.07 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATATAATCTGCAATTCAATTTAGCTATCAAAGAACTTTGAATAATTACATTACTTACGTTCTTCT:1 - chr2R 14082388 3' + pogo 2052 1 56.85 CAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAATCTTTCCCAAGAGGGTTTTGATGGGGTTAGGTTCTGTTACTGGT:1 + chr3R 10736845 3' + copia 178 2 71.92 TGGGCATAAGTTTTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATGCAATAATGAATGAAACAAGTTAGTCATGATTATACCATAAATTAATATTTATTCTCTT:1 - chr2R 12313801 3' + Tc1-2 7 1 60.27 TGCGCCAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGTAGTTTGAGGTGTGAAATGAGAATAATAATGAATTCTTCAAGTGATTGGCAGTGACTTTTCCGCCATGAGTTTGGAGTTCAAGCAGTGTG:1 + chr3R 6264048 3' + accord2 7431 1 63.01 ATTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCTTTAAGAAACAATAATGATAATTGTAACAGTATAACATTTCATCG:1 - chr2R 10936659 3' + copia 5048 2 71.92 AAATGGAGCATTAACAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGGTAGCGTTGAAGAATCTCAATATTTCTGCAACAAATTGAACATTTTTGTAGCAGCTCCCACTCGGGTTCAATACATTAAGCTGCACTCGTCGGATGGAAATGGAAGG:2 - chrX 10992819 3' - G4 3512 1 56.16 AATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACCATTTTCGCCATTCGCCGCCTCGGGCGTAATTTGTAAATCTCTGCAGGCGCAATTTATCTAAACATCCTTCGCTTCTCCATTTATCCCAGGAACGCCCAC:1 - chr2R 18467084 3' - roo 8684 2 69.18 TTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGTTTAAATAACTA:1 - chr2R 5674643 3' - S-element 67 1 66.44 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAACTTGTGAGGAGCGCATACAAAACTAATTGA:1 + chr3R 8965264 3' - HMS-Beagle 35 2 61.64 TGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCACAG:1 + chr2L 6716376 3' - hobo 76 1 71.53 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTTTTCCGAAATTCAAATGGAGCCCCTTTCTAACACTTTTTCTGCCTCATGAATTGAAATTGCAAAATTATATAATTTTCTGCGAAACTCTATTTGCTGT:1 + chr3R 12540614 3' - roo 8683 2 74.66 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCCGAACAGCAGGAAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGGTTCGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCTTGCG:1 - chr3R 5087041 3' + P-element 2881 2 68.42 TCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGAGCAAAGAAGTCAAATA:2 + chrX 19506132 3' + P-element 2785 1 15.75 GCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTAGATTTAAAGCGTATTGCGTGGGATACTGGCATC:1 - chr3R 30092221 3' + I-element 5291 1 66.42 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATACATTTTATCAATAATTAGCATAAAGTTATTGCATAAAGTTACCGGCACGAATTC:1 - chrX 18055714 3' - 297 6641 2 64.38 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAACTCTGTCCAATATGCAAAGTATATGATGCCTTTCTTATACAACATATCTTATCTAAAAGG:1 + chr3R 26031798 3' - pogo 56 1 56.85 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCGAATATTTAAACACGTGTATATTTATATTTACACACGC:1 - chrX 20369391 3' + roo 8998 2 72.46 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATAATTTTATTTTTTATTTACTATTGATATTAGCAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAGGGT:1 - chr3R 19449882 3' + opus 441 2 59.59 GTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGGATCGGGAGGTGTCTTCCCTGGGGGATTGGCGTGGCATATAAGGTTCGGAATAGGTTCGGTTAGGAATATGGTCTAAGGTTTTTTATAGCCACATCCAAATTTTGTTTTCCTT:1 + chrX 751720 3' - transib4 2399 1 51.37 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATCGCCTATGTGTAACTATGTGTACTTTATAAATG:1 + chr3R 17747388 3' - 297 6626 2 55.48 GTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTTGAGGAAATCGACTACAACGTACTCCCTTACTAAATTCTCAAATTGCAATTGAACTAGTAATGTAATTGAGATAATTCGTTTTGCGAAATGCGCTCCTAAACTCTATTGTATGTTTACA:1 - chr2L 18176997 3' + INE-1 543 1 76.71 TGCGCAGCCGGCAAACACAGCATATTTGTTAGCTCTAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTAGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGCGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAG:1 - chrX 22398534 3' + Gypsy6A_LTR 90 1 39.73 AACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGTTGCCGACTTCAATTCATTCAATTCGATCGGCACATTCCGAAACGAACGAAGTGA:1 - chrX 21177084 3' + Tirant 8442 2 63.01 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTAGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGGTGCAAATTTTATAAAACAGTTTCAACTCGATAATCGGGTCA:1 - chr2L 246593 3' + P-element 2810 1 33.56 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACTATTAAT:1 - chr2L 16360567 3' + hobo 2915 1 54.13 AGGCCGCTGCAATCGTACTTATCTGTAGTTGCCATTAAAGGTCCAGACAATATCGGGTTCAGGCACGGCCACCAGTCGGCACTCAAGAATCACATTTGTATTCTCGTCGACATATTGAGCCTTGGGTTTCTTGG:1 + chr3L 2045732 3' - rooA 105 2 76.12 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTTTGACCGCACAGTCAATTTAATTTTAATTTACACTTCATGCA:1 + chr3L 19434150 3' - Doc 86 1 79.45 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGATTATACATTTCCCACACAGATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCTCTGAAA:1 + chr3L 3540250 3' - mdg3 5263 1 68.25 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAATGAATTTATTAAATAGCTTAATCAATAGCTTAAATAGCTAAAATGA:1 + chrX 19591239 3' + roo 339 2 66.90 CAAGCTAAAGTATCTTTTGCTTACCCCTTTAAATTTAATTCTTCAAGGACATCAACATTTTTGGGTACTTTTTAAGCAAACAATTTTAAAAAGACAAGATCTAGGCAACTTAATATTATAATTACATAAATCGACAAAAGAATGCC:1 + chr3L 10908893 3' + Fw3 387 1 76.71 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATTATGTGTTTAACATGTTTTAATGAACAGAAACTAACA:1 - chr3R 12886007 3' - 412 84 2 77.40 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATTTTTAATGCGATGAAAGGAATGCGAGCGTATTTGCGAGT:1 - chr3L 16523205 3' - jockey 86 1 71.23 AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTACTAAAGCAAAAAATTCGGAGCTATCAAAACAAACTGGACTTTCATTGAGCCAAGCAAACA:1 - chr2L 17387423 3' + mdg1 360 2 60.27 ATGCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAACAACCTTTTGGCCATCATCAGTGGTTGGCT:1 + chr2R 10760473 3' - Tabor 6931 2 82.19 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGGGTGAGGACTTTCAACTGCTGCTTTAGCCGTTACTGCTG:1 - chr3R 12781501 3' + pogo 2062 1 63.21 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTATATAATCCGATTTTTAGGGTGGGATTAATAGATGATTAGTAATCTAAAATGAGCAAATGGCTGCATTAATATCAATTTACAATGCATAGCATTGAAAAT:1 + chrX 17270419 3' - 3S18 5787 2 67.12 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGACTCCTTTTGAAAAACTCCCTTGCGTTCGCATTCCTCTCTTTGTGGCTCATTTTTTCGGGG:1 + chr2L 21082260 3' - mdg3 5273 2 71.92 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACACAGAGCCTCAGCTTCAGACGGAATCAATCTTGGCATTAAAGAAGTTCGGCAAAACTTGTGAGGAGCGCATACAAAAC:1 + chr3R 8965257 3' - HMS-Beagle 6838 2 56.85 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGCGGACTGAGTAATGCACGGCAGACGCGCGCTTTATATAGACCCCGACTGGGATTAGTGTGCCCG:1 - 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chr3R 26405031 3' - hobo 84 1 74.66 TTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCA:1 - chr2R 4673562 3' + Quasimodo 7308 2 64.38 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAATCCTCGAATGTGCAACGAATTTCTGTGGACTTGATTGATATTGGGCG:1 + chr2L 11043610 3' + roo 359 2 62.90 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGC:1 + chr2L 18848792 3' - blood 82 2 73.97 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAAGGGATAGGAAGCGTTTTGATATGATGGATACGGGGCTGCCGTGTGTAATGGGC:1 - chr3R 5767374 3' - roo 8732 2 65.07 CATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCGTCTCTGTCCGTCGGCCGGCGACTCCCATAAGTATGCAACAGTTTGGCATCTGGCTTTAAAATATTTACGGTCTCTTCGGCATGCATGCTAA:1 + chr3R 28255852 3' - X-element 4690 1 43.15 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGGCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTCTGCTTATTTAACTCATAACGACCAAA:1 + chr2R 8375103 3' + roo 329 2 68.28 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAAGAGAAAAACAT:1 - 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mdg3 5261 1 76.69 AACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGAAGTAAATGTGGTTCATATGAGTATCCGAACGTAGCTGAGATGATTAGACAACATTCA:1 + chr2L 8009197 3' + roo 392 2 71.92 ATTTTTTTTTTTAAATTTTAAATTAAAGGAAAAAGGAAGCCAATCCCTTGAGGGCTGGTGATGGCCTTAAAATATTCTGGGTTTTTATTTCAGTGGGCGCCAAATCC:1 + chrX 5437316 3' - TART-C 11093 1 54.21 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTACTATTGTAATATAAGCTTAACAAGGTATTAAATGCAAATTTAAATTAAGAATGGCATAAAGATTATTTTTGTAATTCAGCTTAGTAATT:1 - chr3L 19938436 3' + roo 9043 1 65.75 CATGCGATCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATAGTTGGACCTGAGGAGCTGCGGGAAACAGAACAGGCAGGCTCCTCCAATTTAGCGCATCAATTATC:1 + chr3L 1756803 3' + R2-element 417 1 52.54 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCACACTACAAGCGCAGCCCCGCTCTCTCGCACGCACACACGGACAGGTACACCTGCCGAGGAGCTGC:1 - chr2L 15057159 3' + hobo 2919 1 63.06 GTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTTTCTACTTCCTGTTTGCCTTGCAAAAGTAAAGTAAATTGCTCTGGACATGCCAGCTTCCTGCTAAAATCATTTTCAGATTGCCAGCCAGGC:1 + chr2L 8807975 3' + HMS-Beagle 220 2 67.81 AAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATAGATATATTTCTCTTTATTTTCTTGCTTTGTGCATAAA:1 - chr3R 8884322 3' - HMS-Beagle 77 2 73.43 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACAAGTGTGCTGGCTTTTCATATCTGGTTGCTGAGATGGATCTTATTTTAGCACCCC:1 - chr2L 5333389 3' - mdg3 54 2 61.38 CTATTGATCCTGATAAGGAATATAAATATTTATAAATTTCGGAAGCCCTTCCCCTTCTGCCTGTTACATATGTTTTAACGAATCTAGTTTACCAGTTTACAACGAGGCTGACAACAGCGACGTGGAGTACGACAATGGGAACAC:1 - chr3R 21086399 3' - INE-1 85 1 72.22 GAAAGTACAAATTATTAAAAATGCATAGTTAACTTCTCAAGTTATCTACATGGGTGTTACGGAGGTGGATACTATTTTCTTTAATTTGATTTTAATTCATCTTATGCTTAAAGTAATTTTTCCACCAAGTTCTACAAAATTTCTAG:1 + chr3R 9379253 3' + P-element 2678 1 56.85 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGCATACAACTCAATCATTTCGTTGTTGTTCGCCGTTGTGCAATTGTCTCGACCAATTTGTTTGTTCGTCAGTT:1 + chr3L 11228193 3' + pogo 2056 1 54.79 CCATTCGTTGGCATTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAGGAGCTGCAGACAAACTCTTATATTAAACTCAATGGCTCGGGCCCGACCCCGAATATTT:1 - chr2L 8807833 3' - HMS-Beagle 6852 2 54.79 ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTGTATCTTATTTTCACAGCTATCAAAATACACAATGAACTTTGACTTTTTC:1 - 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chr3R 9657688 3' - BS 70 1 67.81 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTT:1 + chr2R 24021663 3' + pogo 2046 1 58.90 ACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGC:1 + chr2L 19841556 3' - BS 82 1 74.66 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAAGTCGTTTTGTAGCTTGTCATATGCAAAT:1 - chr2R 14921443 3' - pogo 29 1 65.75 TATGCATTCTTCCTTGGAGGCAGTGCGTTTTCATGGACTTCAGCTAAGCAGAGCGTCGTCGCCATGAGCAGCACAGAAGCAGAGTACGTTGCTTTATCCACGGCTGCAAAAGAATTATGCAAAGGGCAAACAAAAATAGCAACCGT:1 + chr3R 31869167 3' + Copia1_DM 3890 1 78.08 AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAACTAATTATTTTATATTATATATAAAGTACATAAACTACCGGGAAATCATATATAAATAATAGCT:1 + chrX 18318256 3' - copia 57 2 59.59 CATCATTTTTGATTTAACAAAAATTACTTTTTTTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTATTAAAATGTTATAAAATGTTATTTAAATGTTATAAATTGAAAAGAAAAAAAGTCAACTAAAAAATTATAACAAATTAATAAAAA:1 - 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P-element 44 1 54.79 AAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAACAAGGCATGTCTGTTATGGATTTTCGTTCAGTGTGAGACTCGGCTTGATGG:1 - chr2R 8346571 3' - invader1 4006 2 73.60 GACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTATGCTAATGATTGTATGGCGCAGCATTATGGCACTTTTGCACGTTGCCGCCATATTCGAGTGGCGAGCTCTAGCACGATTCCGCATT:3 - chr3R 9862852 3' + Stalker2 7616 2 63.01 ACCCACTGCTTCAGTCGCCTCTACAATTACACGAAGACTACGAGGTCTCCTACTGCCAACAGTTATGTCAATGTAAACAAAAATCAATTCAAATATTATCGATTCAACAGAGACGTTTTTATATCAAAATGTTTCAGCATTTACTA:1 - chr3L 20509430 3' - gypsy12 4 2 27.40 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGTTGCATATAGATGGGCTGGCCC:1 - chr3R 28937808 3' - jockey 4746 1 63.70 TATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTCAGATTAAGCATACCCATCCATACAAACCGATGTTTCCACGCCTACTTTAACGAACACAAACCGACCAAACTGCCAAGCCCACACTTTTGCAAAATGTTTTGAT:1 - chrX 22902355 3' + INE-1 138 1 77.40 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATAAATAAATTTTTATGGAAACATTTGCAAATACCTCGACCATTTCAATCTTGCCAGCTGACAGCTGCGGTTGTCCAGCCAAACACA:1 + chr3R 26643421 3' + 412 7513 2 60.96 TTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCAATTTAATCTTATTTGGACATTATTGTGCCGATTATCAAACTTTGCCTTAT:1 - chr3R 8293539 3' - Stalker2 7317 2 62.76 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCTGTAACCAATCG:1 - chr3L 19510483 3' + pogo 2045 1 58.22 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATATCACAAGCTGATGCCAAAACACAAAAACCTATACCTCCGATCCGAATGCACATATATACGCGTACAGAGAGGTATGAATGCACCATATTGGATGAAAATAAGTAAACA:1 - chr3L 18420866 3' - jockey 4683 1 73.97 CACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTATGTATATAGTAATACATCAACAACGTGTAAAAGCGTTGA:1 - chr3R 4570255 3' - Juan 84 1 71.92 ATCCCAAATTTTTTAATTTTTTAAACAAAGCTTTCCTGTTGGTTTATTAATACTCAACATGTATATGTAAGTACTCGTACTTTATAATCGTAATTCCCAGTGATTTTTTGCCTTGGTGTAACCATCCAAAAATCAACTA:1 - chr3R 12787867 3' - S-element 1461 1 78.42 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGAATTTATGTTTCTATAAGTGGACAAAACTAAACTATTGCATATGCTTATGATCACAAGTTATCCTTAAACACCTTGATTACCTGCCACAAATATA:1 + chr2R 11610019 3' - roo 24 2 66.90 AGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAATAAAGCTATTTTC:1 - 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chr3L 4355395 3' - FB 36 1 60.96 TCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAGTACATATACGCCTGTGCTGTTGCCACATGGCCTTCTCCTTTTTCCAGCTG:1 - chr3L 12829612 3' + mdg1 349 2 67.81 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGGCACGCGATCCCTGATGTCTGGAAATTTGGAGTGCAGCT:2 + chr2R 12642785 3' - pogo 14 1 76.03 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTGGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACTAAAACTTTAATTTAAATAATGTAAATAGGCATATTTTG:1 + chr2L 20910369 3' + roo 327 2 73.29 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACATAGTTTATTTTTTCAGGTCGATCTACTTCATCCAGGCGCGCTAATGAGCTACAGC:1 - chr2L 7905869 3' - Quasimodo 31 2 62.10 AATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACAAACATTTATAACTTTGAAATCATTTAGAGTTTATTTGCACCAACATGAAAGAAGCAAATAAACACTGATTGGTTGACAATAAGTA:1 + chr3L 11754798 3' - Doc 115 1 55.24 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCAAACGACTTGGACTAACACTTGGGATTT:3 + chr2L 20327709 3' - roo 8718 2 53.42 TGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATAATCGCATTTTACTCAGCTGCCCCAAGCCATAACTACGCAGTTTGATGAGTTACTTCTTCCGGTGCCG:1 + chr2R 5800584 3' - HMS-Beagle 48 2 54.79 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAATTTACATAAAAGAATGTCCGAGTGTGGGAGTGGTTGTGGC:2 - chr2R 20117307 3' - mdg3 81 2 73.97 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTATTTCTATTTGAACATATATGC:1 + chr2L 2622751 3' - roo 54 2 60.27 GCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACACATCATAGCGAGAAATGAATGTGTTTCAATAAAT:1 + chr3R 19500691 3' - jockey 126 1 74.66 GATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATTTGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATA:1 + chr3R 29952775 3' + invader4 323 2 60.00 CAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCTTGGTTGCACAACTTTGTGTGAAAATAAAAAGTTTTATTTCGGGGAGAGATGCGCAG:1 - chr2L 17795133 3' + hopper 1349 1 63.01 GGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGCTATTTGCTATTTGCTATTTTGTTATTCCAGTGCAGCCGCCTACAATGTCAGAGTCACGTTTGTGTGATTCGCCTTGCTGGCTATGGTGACGATGACGAGGCTTCGATGCGGGG:1 + chr2R 23721359 3' - 17.6 7040 2 72.60 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACACAGTCGAATGTTTGTTTGTGCGAAAGTATGCCTTAATTTAGAAAATGGGATCAAAGCAGG:1 + chr3R 8810750 3' - 297 39 2 55.04 TGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7182 2 74.07 TATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGAGGCTATATCAAACTTGCCAAATGGTCGTTGAATG:1 - chr3R 15035008 3' - Stalker2 18 2 73.29 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTTGGAGAAGGACACTTGAGCTGGTAGGATATGAGAGCGTATTATTTTGGCATAAAAACATGCATTTGGGT:1 + chr3R 25929451 3' + 297 6929 2 54.79 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAACAATATTGTTTTTTAACTCAAAAGGAATAGATGATAATGATATTCAGAACACAGCAGCTAGCGCAGAACTCTCTGTT:2 - chr3R 10800483 3' - roo 45 2 53.42 GATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATGTACATACACACAAAACGAGACAGCTTGTCGTGTTGGCATTTTTTTTTGTCATTCGTTATCGACAAATGCGAATGCGATTGCAGGCCAGCCGGAGGAGCAATCGATGTAATTT:1 + chr3R 14688634 3' - FB 8 1 72.60 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATTGACCCCGTTTCCGTTTTCGATTGCAATTCGTTTCAGTTTCATGCACTTTGCACTCTCCACAGC:1 + chr3L 1983557 3' - Transpac 4972 2 53.42 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCACACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATC:1 + chr3R 17747356 3' - 297 54 2 69.92 GAAGAAGTCCCCGACGTCTAAGGCTCAGATTTGGCAAGTTGTACAGGATGCATGGGCAAAAATTCCTCCCAAACGTTGCCAGGACCTGGTGGACTCCATAAGAACGTGCTGGAAATACAAGCACAATGTTGAGCAGCAGTTTTCCC:1 + chr2L 17725007 3' + HB 1197 1 67.81 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCGGGGTAGATTTAATGCGAACTTCTGCTAGGTTATTCGAGTGCTGTAAGAGCATTAAT:1 - chr3L 6541988 3' - hobo 63 1 60.27 GGGTCGCGGGGGGGCTTGCCAGTCCATGTTGTCCCGGAGTAGGGAAGGAGGGGAGGAGGGCACGGTAGGGATTTTGCACGCAGTTTCTAAGGAAATGAATAGCACTAAAGCAACATTGTGTCGACTTGCGATGATTCATTCATTTT:1 - chr3R 19003592 3' - G-element 327 1 52.05 ACTTTAAAAAGAACCTAAAGTATAAACAATAGCAGGAGGAGTAGCCGCATCATTTAAATATTTCGAGAATTTCTACCAGAGAAAGGCTTAGTAGGAATTTATTATGAACACGTGAAATTGTTTGAAAAATCCCACGTGTGCTTTTG:1 + chr3L 24301302 3' + looper1 257 1 79.45 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGAATTTATGTTTCTATAAGTGGACAAAACTAAACTATTGCATATGCTTATGATCACAAGTTATCCTTAAACACCTTGATTACCTGCCACAAAT:1 + chr2R 11610016 3' - roo 28 2 64.38 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGCATACAACTCAATCATTTCGTTGTTGTTCGCCGTTGTGCAATTGTCTCGACCAATTTGTTTGTTCGTCAGTTCGTTAGTTACTTTGTCTTGTGCGGCTTCATTTG:1 + chr3L 11228226 3' + pogo 2089 1 77.40 TCTCTCGCTCTCGGACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATAGTGTGCCAAACCAATGTATGGCTGTTAACCATCTTTTTATTCTAGTGTCTTTGCTCGAACTGTGCGGTCATTTGCGATGT:1 + chr2R 5637642 3' - 1360 97 1 68.49 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGCCAAGTCGCGCGCAACACGCATGCGCAGCTGCA:1 + chrX 19162731 3' - pogo 14 1 76.03 GTTTTTTCTTCTGTGTTTCTTACCACTGGTGGAGGAAAACAACAGAATTTCTCGAAAGGACGAAAATGTTCACATTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAAAACGAATAAGAGTTAATTACAAGCGTCATGCGTATGCAA:1 + chrX 180762 3' - rooA 431 1 73.97 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAATTGCTTTTGATTGACTCATTCAATGCGATTTGTTTTGACGGCTTACGTTTCATTT:1 + chr3L 13475603 3' - HMS-Beagle 35 2 52.54 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCAGGTACATAGAAGTCAAGGCGGGAATAGATCATAAACAAC:1 + chr3L 22445264 3' + Transpac 232 2 73.97 ACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATGATATATGTAGCATTTCAACAGGTTGGGGCACAAGAATAGTTCCACAAAAGTGGCAC:1 + chr3R 29952793 3' + invader4 265 2 63.70 AGGTGGACGGACGTGGCCATATATGTATACTGGGCTAGGGATCATAGATATACTAAATGTACAGAACTACCTGCTACACACTCCTTAGCGAATCTACGAGTAACGGAAAGAGAAACGTAAACATTTTGTTTGATTTTCTTTTATAC:2 + chr2L 21135250 3' - TAHRE 451 1 72.60 TTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATAATCGCATTTTACTCAGCTGCCCCAAGCCATAACTACGCAGTTTGATGAGTTACTT:2 + chr2R 5800572 3' - HMS-Beagle 6856 2 59.59 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTTAAAATAAATTGATAACAAGAAATGTGCTTTAAAAATGTTGATATTAAACAAAACAATGATCACAAACTTGCTTTATTTGTGTAATTTT:1 - chr2R 5909805 3' + jockey 4956 1 69.86 TAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAGGACGAAGACGGCCCAGATTCCCAGGCTGTCTTCGATGCGGAGTGGAGTACCGAATGAACTCATCTTCTGCGGCTTCTT:1 - chr2R 20303824 3' + mdg1 7443 2 65.81 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTATTTATTATACCAGCTGTTCTTCTTCGTTTCATTAATTTTGTTGCTGTTGTGCTTCTTT:1 - chr2L 13102863 3' + roo 9011 2 60.27 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGGCACAGCAAATGCACGCAAGTAATCCACCTGCTGCTGCTGGAAGAGAAAAACATCTATGGGGAATGCAAAGCATCAATTCTGTCAACATCATAGG:1 - chr3R 30524419 3' - roo 25 2 68.49 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACCATTTTCGATAAGGTACCGATTGTTTGTTCGTAATCCTAATCTTTTGGAAGAGGTTTTTAAGCTAGTTTTGGTAATCAAAATGGTTGTGTGA:1 - chr2L 3150977 3' + blood 350 2 66.21 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGACATCAATTTCGCAAATATTCGCAAAGGTTTCTTGAAATAGTTTTCGTTTCTTTTTGTGTAACTGAATGAATTGAGCAAATGACACA:1 + chr3L 10733776 3' - 412 7086 2 52.05 TAAAATAAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTGCTCCTTGCGTGCCCATGCCCAGCGATAAATTCCGTGCAATG:1 + chr3L 10068978 3' + 412 418 2 64.38 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATAATATTACAATATCAAATTGGGTTTGCAGCCAACCGATTAATCACATCCGACAAGGGACAACA:1 + chrX 12458993 3' + pogo 2048 1 55.48 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCAATGCTCTGGATGCATTTAGCCGCAG:1 - chr3R 22266466 3' + roo 339 2 77.87 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGCTCGTTTACTTTTGTGCACAAAAGCCGAGACGCATAAATAACCGGCAACGGTCATTTTGCCG:1 - chr2L 1892270 3' + hobo 2909 1 57.26 AACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCAGGTACATAGAAGTCAAGGCGGGAATAGATCATAAACAAATCTT:1 + chr3L 22445268 3' + Transpac 5207 2 55.32 GGGTGGGGTTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTCGCTGATGTGCTTCCTCTTGCTACTTGCTAAGTACTACTTGGCTCCGCGATTTGGCGCGATTAATCAATTGTAATTGT:1 - chr2L 5944007 3' - I-element 4888 1 58.22 CGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATGAAGCTCCTATTAAAGAGGTGTTTCCCGTGGCCGATT:1 + chr3R 26658217 3' - hobo 84 1 72.60 TAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGATCGCTTTGATGGTGTGCGATACGGCTGTAAC:1 - chr3R 19537502 3' + hopper2 1550 1 67.50 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACCAATGGATGATCGGTGACTTGGACTTTCCGAGAAACATTTGCTTGATTTACGCAATGTTTTGG:1 + chr2R 12642747 3' - pogo 52 1 55.48 AATAATAAACAATCATAATAAATAAATAAAGACTTGTGCCAACTCCCGCCGAAAGAACTTATAACGATAATTGCGTATACGCCATGTGTGCTTCGTTCTTTATTTGTGCTCCATCGTTCACACTTCCCTTCCGCTCCGTAAGTGTT:1 + chr2R 18999243 3' + flea 244 2 77.40 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGCCTTTCATATGGTGCAGATACACTTCCGCTGGCTAACGATAATGGGAATGGCTTTTAATTGATTTGGTCGACATGAGTAATCGTTCGCCGTGGCCCATTGA:1 + chr2L 20068117 3' + roo 389 2 72.60 GTGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATACTGATCGAAAAAATGAATTTACATTGTACATATTATAACAATCATTCCAAGGATCTTTTCCATCTGCTCCTCGTTCACCTGAGGACCTTGCT:1 - chr2L 9390952 3' - 1360 3209 1 64.03 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGATATTAGATTAGATCTGAAACCAGCTTAAGCCAATTGAAAATTAAAGGCGCATCACAAGCGGGCATA:1 - chrX 16325114 3' + Transpac 5178 2 54.79 TGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGAGTTAATCATTACAACACACTAGATTGCAATTGCCTCCACCGCCACTATTGTGT:1 - chr3L 1324276 3' + 412 409 2 70.55 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATTCGACGTTAATTGATCTGTTTTTAATTTAGCTGCTTAAACAGGCGATAGGAAAACTTTCTCAT:1 - chr2R 7540989 3' - F-element 71 1 60.27 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGAATATTCGTACACAAAAACCAGGTTTGTGCAAATAGGTTTTTCATGAAAACGCTGCTGTTGTGGCTCGGTTTTCGTGGCCGGGAAACGGAATTTACGCAAGTTTGTTTAA:1 - chr3R 29381447 3' + hobo 2930 1 77.93 TTCTCCGACAAAAGGCAATTAAAGGAAATTACTATCTATTATCCATTTTCACGGGCGCCGCCATATTAACCACCGTTCTATGGTTGTTTGGTCTAATTAGAGCATAACTGTATGGTGGCATATGAATAGATGTGGCATGGTGGTGT:1 + chr3R 11827837 3' + GATE 443 1 54.79 GCGCCGGCGGCTCAGGAGACTTCGAGGAATAAACAAGAAAAAAAAAACCCAAACGTTGGGGAGGAAGGGGGGAAGACGATACAAGGTATCGATACGGATTAGAAGTCAACAACACAATGGGGGCTTTGTATGTGTTGTTGTTTTCG:1 - chr2L 7220011 3' + Osvaldo 1496 1 78.08 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGAGGGGGTGTGTGTTTAAATGGCGCCTGGAGAATATCGATTAAATGCTTGTTTTTTCGG:1 - chr3L 5731247 3' - 297 56 2 58.90 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATAGCCTAACACCAGGAGCAGCGTGGCGGAAAAGCGTTTTGTCCCGGCGACAAGGCAACAACGGCAATAAGGCCCCATTTTTTTCCCATCGCCATT:1 - chr3R 25094578 3' + P-element 2860 1 67.12 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAGATTGCA:2 - chr2L 16360550 3' + hobo 2895 1 53.42 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAATTTGAATTATTGTCTACG:1 + chr2L 42604 3' + copia 233 1 61.06 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAGCCTAGTTATGTAATGATCCTGAAAAATGCTTTAAAAAATTATCCACAGATTTCCAGAAATCTGCTTCACAGGGAAGGAGTTTAAATTTATTTAATAATGACGCCTTCTCTAGTACAA:1 + chr2L 16224630 3' + 1360 3387 2 67.12 ACAAACAGCTGGTCAAACATATGAATTTGATATCGCATAAAAAATGCAGTGTTGCAACTTAAATGTTTTTAAATATATTTATGGTGTCCCTCGAAAATAAAAAACGCATTTTAAGACTCGGATGTGTAACAACAAATTGAGGTTTG:1 + chr3L 6382335 3' - transib3 166 1 62.33 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACATATATGAAGACTGGCACTTGAGCGGATAGAAGGGAC:1 - chr2R 15892147 3' + hobo 2910 1 57.89 TAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTATAACT:1 - chr3R 9657672 3' - BS 31 1 50.41 GTAAAATTGTTGTTTTTTTTTTGTGGTTTCTTGCGG:1 + chrX 7968027 3' - 297 6973 2 83.33 CGGTGAGCTCGTCCCAGCATAGTTGGCATGTTGGTAACGCCGTTTTCATCAGTAATCGGGTGCCGCAAAAACTAAAAAAAAAACACAAAAAAAAAACAAACTTCTGCCAAGAGAAACATTGTTGATGCGGACGGCAGTCAAATATT:1 + chrX 16201237 3' - Ivk 5117 1 60.27 ACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGAGATATTTTGAGGATGTTTGTTCCGATGAATATTTTGTCGAAATTAAACGTAAACGTAATGGAATTGTTGTAGTTCCTTATG:1 - chr2L 20262694 3' + roo 8884 2 63.36 GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAGGACGAAGACGGCCCAGATTCCCAGGCTGTCTTCGATGCGG:1 - chr2R 20303862 3' + mdg1 338 2 71.92 GTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCACATGCAGTCGACTCTATGAACCAAGAGAATGGCTTAGAACCCACCAAAGGAA:1 + chr3R 29719416 3' + hobo 2878 1 61.87 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATTAAAAATCCCTATGTACGCACGCTAAGGGTGAGAAAT:1 - chr2R 20931653 3' - blood 84 2 75.34 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCAGATGAGAGTCGGAAGATAATGCACAAAGGTTGCCAAGGATGCGGGCTGTAAAAGATGAATACG:1 + chrX 10501365 3' - F-element 71 1 55.48 CTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTAAGGTTCGTCCAACTGATATCATTCCCTTTTCGGTTTCTCACAAATAGCACCTAAT:1 + chr3R 22572653 3' - HMS-Beagle 6857 2 58.90 GGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTTAATATTATTATTTTACTTTACCTTGGTTTCCAACTGGGAATTTCG:1 + chr2L 8010137 3' - roo 479 1 68.49 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGAGTTAATCATTACAACACACTAGATTGCAATTGCCTCCACCGCCACTATTGTGTGTTTCCATCCACTCTGCGCCACTTG:1 - chr3L 1324251 3' + 412 7487 2 53.42 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCAAGGAAGTTGTGCGATATAGCCAAAGATACACTTGTGTGTGTGTATATAAACCATTAATTACTTGGCCAGATTGCAGTGAGCGTAGTGGGGGCCAAAAGAAAGGTGCCGCATAGTC:1 - chr2L 16360510 3' + hobo 2935 1 79.45 GTCCGTATGAACGTCGATATCTTAGGAACTATAGAAGCTAGAGCGGTCAGATTAAGCATACAGTTTCTAGAGACACAGACGTGTCGCACAAAAGTGTCACGGTCACTCTTTTGAAAAATGATTTGATATTTTTATTAGTCTTGTAA:1 - chr2R 5324616 3' + INE-1 133 1 56.16 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATGTTACATTATAAGATATTATCGGAACACAAGCCATTTCAAGCTTATTAATATCAGATTGACAATCCTCAAATGTAGATTAGAAGTATTCTAATGGTATGCTAATATACATT:2 - chr2R 8374966 3' - roo 6 2 78.77 TCTGCCGGCTATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTACACATGAGTTGCTGCACCAAGCACATTTATATTTTGGATCTCGAGTTAC:1 + chr4 39243 3' - springer 74 2 69.18 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATGTCACTATATATAAGAAAAAGACATTTTTCAGCATTCAACTCACTTTTTATTCATCATTGCTAACGAACG:1 + chr3R 443313 3' - Quasimodo 45 2 58.22 AGGGACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCACACAGATTCTACCCATCTTGTCACGCCCACTCTAACGCCTACAAACCGCACAAAACTGCCACGCCCAAACTATTAAAAATGTTTTCGATA:1 - chrX 22680663 3' + INE-1 156 1 40.00 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAATTTGCAGTTCCACAATAATAGGTATGAATAGAGGGAGATAAATAATAGATGATATTCACAGTAACTATATATGTACAT:1 - chr3R 14213600 3' + mdg1 378 2 47.26 ACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATCCTGTGCATACCAACATAATTTAATTA:1 + chr3L 12729153 3' - opus 186 4 79.23 CCGTATTGTTGTACGTCTTTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTCGAGAAAATGCTACCAAAACTTAAAGAAACGGTTGCTCGTGTTGTGGACAGTTGTGTGGAGTGTATTGTATTTAATTCGAAAGCTGGGAAGAAA:1 + chrY 2330602 3' - Bica 244 2 56.85 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCTATGATTAATTTTAATTGCTGTATAAGACTTT:1 + chrX 6213592 3' + roo 8985 2 78.08 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGACGTTTCGCACACACAGAGATACAAAAATTCAACGCTTGACAAAAAAAAGCGCAGCCTGAGCGAGCACCGCAAGGATGCACA:2 - 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P-element 62 1 43.15 AACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGATCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGTTTGGTTACTTGCATCCGTTATTATGATGAGCCGCTTATCAAATAATAATTTATATTTACAATGGGTTT:1 + chr3R 30564803 3' - F-element 4598 1 54.11 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGTCAAAAATAGATTACAATTTAGAAGCATCTTAAAGATTTATCGATTGATATGAAATAATAAGATAAGATCTCGACTCTTTCATCAGTGTACATATACACTATGTTG:1 - chr3R 18860717 3' - roo 8670 2 71.01 TTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTTGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTCATTATGCATATTGTGTTATTTTTAAATTCAACGCCATCATTACAGTAATCTTTTCATTGGGATTGTTTGCGTAAAA:1 + chr3R 14174812 3' + 297 355 2 58.90 TGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTA:1 + chrX 21667967 3' - gypsy2 35 2 61.64 TTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATAGTTGAATGGAGATATATCCGTATATGTACATATTGTGCACATGTGTATCTAGCCACACC:1 + chr2R 9214127 3' - F-element 74 1 59.59 AGCTTCAGGTGGGGTTGGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTTTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAACAAGCAGGTGTACCCTTTCGACAACACCCAGTTGCACTTCTTTA:1 - 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chr2L 5724296 3' + 1360 3364 1 49.32 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAAACACACGCTTCAATGAGAAGGTTTTACCAGAAGAAGTTACCAGAATAAACCTTAATTTTGTCAATAGAACTTTTAT:1 - chr3L 18954103 3' + roo 9033 1 59.59 TGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAATATTTAAAATACTTAATAGTCATGTTCAAAGACGAATCAAAATAAGAGCTTCCGACTTTCGTTCAACAGCAAATTTT:1 - chr3R 4869400 3' - I-element 5166 1 54.79 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACGTCCAAACGATGGGCGAGCAACAAAAACGGTGCA:1 - chr3R 28937825 3' - jockey 4747 1 72.31 CGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGC:1 - chr2R 12185322 3' + accord 401 2 60.69 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGTTATAACTGCCAAGCACACAGATACACGAATACTCGGGTACACAGATGCACAGCAACACAGATACACCGTTACACAGATACTAACACGCACAC:1 + chr2L 20269057 3' - hobo 14 1 74.07 ACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGAGTACACGGCTGAGTACAGTAATGACGCCCTGCAGACAGACAGAAGGAGTAGTTT:1 - 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hobo 30 1 62.33 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTCCACCCCATCAAAGTCCAGCCTGGTAGGCGCTCTCGCAAAGGTGCTTTCCCACGCACGCATGCGCCGCGTGAGAGCGAGAGAGGCAAAACAAAACAAGCGCAGA:1 - chr2R 16031302 3' + hobo 2922 1 69.86 CATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTCCCTTCCCAGGACTCACATCCTTGTGT:2 + chr3R 5767434 3' + roo 8978 2 80.82 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTGCACTTGGGCCTCTCCATGTGGAAGCCGCAGACAAAACGTGAGATCGCTGAGTCGGCCGGCCGACTGCTG:1 + chr2L 20716445 3' - P-element 49 1 52.74 TCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTAATTTTTGAAATTTAATCTGTTCCGAGTTTTGTTTTCCATACGATGAAATAATTGTACAAATTTGAATTATAAAAACCAAAAAAAAGTTCTGTTTC:1 + chr3R 12363528 3' - 1360 418 1 56.16 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACTGCATAGTAGTAAAAGCGACTAAGTAACCTAAAACTACATATGAATCAACCCCTCAAGTTTATCAATT:1 - chr2L 14678725 3' - Quasimodo 45 2 55.48 GAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACCTCAGGGGATGTCATTTGAAGGCGGCAAG:1 - chr2L 9109872 3' - opus 7090 2 79.45 GAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACCACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAGGACGAAGACGGCCCAGATTCCCAGGCTGTCTTCGATGCGGA:1 - chr2R 20303861 3' + mdg1 7377 2 69.86 AATTAGATGATAAGAACCTATGTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCCATTATCACAAAAGAAATAATTACAGATTTTTAAAATAACGTATGTGGATTTATTCTTGCGGGCTAGTTTTCTCAACCCAGTTATGATTATTACGTG:1 - chr2R 5019285 3' + rooA 263 2 50.68 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTTCTTTCATACTCAACTAGCGACTCAACTCGACTAAACTTTCCTTCTTCCTT:1 + chr3L 2240493 3' - roo 8730 2 65.07 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAATACATTAGAGCAGCTACACAGGATATGGAAATTATTCGAGGCTACAACCCACTTCCTTGC:1 - chr3L 13631254 3' - hobo 60 1 57.53 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTCAACGTCGATGGCCATCAGATCGAAGTGAGTGCCATTCGCCCACGCAGAGGCACACACAGAGGCA:1 - chr3R 11730668 3' - hobo 56 1 55.48 AGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGGGTGAGGACTTTCAACTGCTGCTTTAGCCGTTACTGCTGCTGATTCTC:1 - chr3R 12781492 3' + pogo 2031 1 67.12 ACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATATTACGTACGCCCAGCTCTTTACCCTTTTTATTCACTTATTTTTGAGCAGGCCGAGGCAATTGCAAATCCCACGCATGGCGTCCATAGACTGCGCGGTGCCCC:1 + chr3R 20720649 3' - 1731 8 2 80.00 AGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCCGAGCAGGCCAAAAGTGTAAGCGAAACATCTAAAGGGTCAGCCACGTGCAAAATTCTAACATCTCTCATTTCCGATGCGTAAGCCAATTGAAATGGAAAATTATAGCAAA:1 + chr2L 16555009 3' - F-element 255 1 71.23 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCTGAATGCGTTTCTATGACTCTTATAGCTGCTCAAAGGATAGGAAAAGTAGAATTTATCTTTAGCTCTGAGC:1 + chr2L 6716411 3' - hobo 50 1 51.37 GCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTAGTAATAATCAACCGTATACCGAGATGAAATTGATTCCGCATGGGACATAAACTGCGTATTGCATAATAAACTTTGGCA:1 + chr3R 22275375 3' - flea 38 2 59.59 TGGTGCTGGTGTTGCAGTTTAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACGATTTTCGCATTTGTCCTTTTTGATT:1 - chr2L 16202633 3' + copia 5033 2 82.64 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGAAAAAGCCAGCAGTGCGGCTCATTTGCATGCCACATGACAAAAAGCTCGTAGCAAATGCAAATTGAATCAAACTAAAATGCCCGACCATCGCGGGC:1 + chrX 10698749 3' - mdg1 25 2 65.75 TTTAGTCGAGTTCCCCGACTATCCCGTTTATTTTTTGCAAGTACATACTTTTTAACGAATCTAGTATGCTCTTTAACTCTACGGGTATAATTACGTGAGCAGTAGTGTATGGGAGGATTTAAAGCCTGAATGGTCAATATTAACCG:1 + chr3R 20126134 3' - INE-1 565 1 48.63 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGACTCCTTTTGAAAAACTCCCTTGCGTTCGCATTCCTCTCTTTGTGGC:1 + chr2L 21082246 3' - mdg3 5257 1 78.45 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGG:1 - chrX 19744441 3' + P-element 2855 1 38.82 AAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAATATGGGTACATAATTTAAAAAAAATTTTAGTGGAAAATATACAACACCAACACCA:1 - chrX 17690466 3' - Doc 336 1 61.64 GTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGATAGAAAGATGAATGGATGGATGGATGGATGGGTGTAAGGGTGTCTGAACAAGCCGACAGTAATTCGATGCGTACTAAATGGAATGAATGACAAAAGCGGTCGAGGATGATAAATTTGTT:1 + chr2L 7596160 3' - mdg3 5253 1 66.44 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACAGTAGACTATGTAGTAGTAAATGTTATCAATTTCGTTTCG:1 - chr2R 21244878 3' - roo 8745 2 75.34 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCTATTGCTCATCGCCCTGGCGAATGAGAACATACAACAGCATCTTGCAATTAGTGCTACTGTCAACAG:1 - chrX 16995048 3' - jockey 70 1 61.42 CCCTTAACCAAGAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGCACTATATCAACTTAAAACTAAAGGATAATCCAGATTCGTAAACATCCGTGCTGTTGTATCCATGCTCATAC:1 - chr3L 6212454 3' + I-element 171 1 50.68 TTCAAACGGATGTTCGGTTATCAAGAGCGTGCTGTTCGGAATCGCTTTAATTAAGCCCCGTTGGCCTTCGCCCCAGACTGCTACAGTACATCGAGTCTTATGCCTTATGTGAACTGCACTGTGCACTTTGATATTTTATTTTATAC:1 - chr2R 2947603 3' + mariner2 181 1 55.48 ATTAATAACTATAAAAAATTTTGGATTGGCTAATATACAGTTCTAAAAATAATATATGTTCGTATTTTGTAATTCTAAAAGCTTTTTTTTTCTGGTGACTTTCTTAGCCAAAACTCA:1 + chr3R 22866626 3' + G5 4705 1 41.88 AGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGTCTGTCGATGTATGTTTGTGTGTGCGCATGTCCTTGTTGCATTGTCTAAGTTTTTG:1 + chr3R 13114630 3' + BS 4891 1 53.33 GCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCTTATATCTCCCCATTTACTCGCATTTTGTGTCTACACTTCTTATATTAATAGCA:1 + chr2L 15524014 3' - opus 7062 4 63.57 ATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAAGAAACATTGTCATAA:1 - chr3R 1047959 3' + Stalker2 340 2 56.16 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATTTTTCTCCCCCCTACCACAAAATGGGTTTAAT:1 - chr3R 26643318 3' - 412 7140 2 78.77 GTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTATATAATCCGATTTTTAGGGTGGGATTAATAGATGATTAGTAATCTAAAATGAGCAAATGGCTGCATTAATATCAATTTACAATGCATAGCATTGAAAATCCA:1 + chrX 17270422 3' - 3S18 5784 2 69.18 CTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTTAATTTAAATATCCCATATTATTTAAGTTCATTTAATATTTTCCTTCTTTTA:1 - chrX 16538098 3' + mdg3 5432 2 63.01 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGAAATATTAAATGCCTGCTGTAAGCGAAAATTCTAAACCTACAAGCAAACAAACTGCGGCACAAAACAAGCAAACAGAGGGA:1 + chr2L 22032081 3' + Tabor 7284 2 57.53 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATTAACCGCAAGCGCCAGCAGATGTTGTCAACAATTAAGCTGACACCTGACAGACGAATGGAGAGTGGATTA:1 - chr2R 10666787 3' + hobo 2928 1 78.77 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTTATTGGCAGTCTGCAATCACAGTCCGCAATTTGCGCGGA:1 - chr2L 19907570 3' - hobo 81 1 73.79 AGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGC:1 - chrX 21087570 3' - mdg3 5298 2 54.11 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGCCGCTGATGATGGGAAGCAATTATCCC:1 + chrX 19744528 3' - P-element 40 1 58.22 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTCCTTGTGGATTTTGGGTTCTTGAATTGTTCATTGTTTGCCTAACGGTCAGCGACGAGGAGGAGGTGGAGCGGCCTCAGGCGTCAAATATTGACGTGCATTCAATTCAG:1 - chr2L 20327553 3' + roo 396 1 73.29 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGTATGAATTTTTATAGCAGGAATAGTGTCCAGGCTACAGAACAATATGCTTTGG:1 - chr3R 25929332 3' - 297 6636 2 66.90 AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATGCCAAGTGGCAAAGTCCAACGTACGCTCCGTGCGCCGCCAGAAGAAGCTGACTTGTTGC:1 + chr2R 13382062 3' + jockey 4932 1 58.90 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCACAAGGAAACGAAAGGAGGTGGCGAAAAAGTGTTGCATACTTCACCGGGCAGCGGGAAAATGTGGAATATTTTAAATTAATTCGTCGTCGCTGGCTGCCAAAATTTCAA:1 + chrX 9949638 3' - hobo 11 1 75.34 AATTAAATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATGTATATAAATATACATTTTTTGTGCTCTCTTTCCTGCGGCGGGAAAGTTTTTTAAAGCGC:1 - chr3R 12952858 3' + micropia 394 2 64.83 TGAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGC:1 - chr3L 13546583 3' - hobo 74 1 79.07 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACGCACATTTCGCCTCGTGTAGTTCAAGCGGTTTCTAATTTGCTTGCCGCTGGCTGTGGCAAATTCTAATTTAT:1 - chr2L 20268911 3' + hobo 2903 1 55.64 CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAACAAACAACAGCATTTTGCAATTAGTGCAACTGTCAACAGGACATGGTAG:1 - chrX 16995038 3' - jockey 79 1 65.07 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATTTT:1 + chr2R 8375131 3' + roo 356 2 50.68 AGCGACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATT:1 + chrX 21205076 3' - 1360 61 1 60.99 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGCCCTGGAATATCATTTAAATTTCCATTTAAAGTCGACCACAGCCCCCGCGAGTATAACCATATGCTGCGGGCCAAAGTTGCGATAAAATCAAAATTTTAATT:1 - chr3R 6578613 3' - F-element 31 1 68.49 ACTGCGCACAGCTGCTTAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGGAC:1 + chr3R 1977614 3' + micropia 5360 2 67.12 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATCATAAGAGGCTTTGACAACTGGTTAACTTTATTGACGGATCTTACCTATTGGTTTCAAAGGCCTTCAGACAATAGCCCGGCATCACT:1 - chr3R 17068859 3' + mdg1 390 2 63.70 GGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGGTTCTTGTTAAATTCTTGAATTCATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTGGTGTGAAAAGTTTGCAATGGCTTTTTTTTGGCATCGGTGTGAGTGTGTCGAAATTT:1 - chrX 5174433 3' - Quasimodo 151 2 64.38 TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGT:1 - chr3L 11887211 3' - Doc 79 1 69.86 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAACAAAATAGAAACAACACAAACAACACAATGATCCGAAGCAAAACGACAAAATCGCAGGGACAACAATGAAC:2 - 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chr3R 25929284 3' - 297 6591 2 77.93 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCATTGCATTCCGCGGAGTCGTTCGCTTCGTTTTTTCCACTTTGCTGCAAGTTTA:2 - chr3L 10068855 3' - 412 7078 2 68.49 GGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGAGTCGGTAGGGGGATTTAAGTCCCATTCCTTGCAATAAAGAACTCTATATAGCATTTACGCAGACAATAAAACTCCATGCAGTTAGAAGTTATA:1 + chr2R 3091712 3' - F-element 272 1 60.96 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGTTTCATATTAAGTTGCTTTAAGTTTTGCATTTGTTGCGTTCATAATTAGACAATCTTTTTAGCATTGCAACATAATGTGTG:1 - chrX 2821839 3' + roo 9033 1 58.90 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGATCGAAAATAAATAAAATATGAAATACAGTTTAATTTCCTGAACTTCTTTCAAGTAGGCATTTTTCAATAACAAATTGTTTTCATTCAG:1 - chr3R 15154528 3' - mdg1 32 2 63.70 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAATTAGTTAAAAGCTCTATATAAGGGTGCCCAATTTAAGCTGTTAATGGCCCATTTGGTTTTTTTAAATGAACCAAAGGAAGATCATAGCACACAATCCTCTTGGAAGGA:1 + chrX 10838657 3' + roo 397 1 77.40 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACCTCTGGTTGGCGAAAATCGGAGATTGCATTATAAAAATCCAAGACATATTGCACAGTATGCGATAAGGAAAACAGCATT:1 - chr2L 9499229 3' - Transpac 38 2 54.11 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCGACTCCATTCCGAATCGCACGCTGGCCAACACTGGCCAACTCTAGCGAACACTAGGCAATAGCTGAGCGATCTGGCAGCCTGGCTCTAGCTGTCACCGT:1 - chrX 19744367 3' - P-element 10 2 78.10 AGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATCCTGTGCATACCAACATAATTTAATTAAAGCTCTCAATTGAGCCATCTCATCAGCAGCACGAAGGGTTGGCCAAACATCGAGG:1 + chr3L 12729209 3' - opus 7149 4 60.27 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGAAGTTAAATAGAGTTTGTGGTGAACAATAAGAAATTTTTCCCAGTGCAGAGTGTATATTTGTACAAGTGCGAGCA:1 - chr2R 22616823 3' - BS 5023 1 71.23 AAATATATATATAATATGTATGTTCCGTTGCTAGCTATAGCACCATTTATAATGAGATCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTTGGTCACCGAATCGATGAGACGCACGAAAATGTCCTGCTCCTGGCGAGC:1 + chr2R 14793534 3' + Dm88 4367 2 84.25 TTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTTCGTCGTTTTGCCAAGGAGACGCTCCGCTCAAAGGGAGGAAGCGTTTAAT:1 - chr2L 20985779 3' - F-element 84 1 64.38 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATTTTTCGCAGTTATGTCTTTCACTTGTCCGACAAGTTT:2 + chr2R 8375165 3' + roo 9054 2 73.29 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAAATTGAATTTATCACTTGAACATGCCAAGCAAACGTTTGTTCCTCCTGTACTGCTTGCTAAATTTTCCCGG:1 - 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chr2L 10177950 3' - mdg3 5276 2 69.86 GGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTTATTTAAATAGTTTAGTGGTAATATAATTG:1 - chrX 23338848 3' - P-element 2865 1 21.92 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATATTTATGTATTTTCGCCCATTTCGATTGATTCAAAAC:1 + chr3R 15453750 3' + Transpac 5151 2 74.66 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTTAAGTTCAATTTGTCGGAAAATTCAGCAAAATTCTTCTGATTTGAA:1 - chr2L 12766951 3' - hobo 40 1 56.85 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAGTTTGAGTTTTTGATTGATATGACATTGATGCCATTTTGGTGGCTCATTTGAA:1 + chr3R 22266530 3' - roo 8730 2 61.64 CTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTGCATGCGTATATAGGGAGTTTAAGCCAAAAAAAATAATAGCCACAAGGCGTTGACAGACGAGGCAAATGAAAACTCAAGTGCAAAATGCAACAGTTG:1 + chrX 17508956 3' - Burdock 6155 2 72.60 AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGGTGACTGTACTGTTTGGCTAGCGTGTGTGACCGATAAGTGCTATCGGCTAA:1 + chrX 11236480 3' + copia 5054 2 66.44 TCATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCATAGCCAAGTCTATTATATCAACTTCAAAAATACCGTATAACCTTGAACCTATTACACCTTACAACAACCTTCCTTGCAAAGAGAAATAATGATGGCCCGCTGGATATTGGCCGATG:1 - chr3L 18306935 3' + Stalker3T 287 1 67.12 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAATGTATTTAGCCAATTAAGAGGCGGGACACATTCGTTTAACTGCGGCATCGTCATCAGTTCAAGTC:1 - chr2R 14921468 3' - pogo 54 1 56.85 AATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGTCATGATCTATAATTTAGTGTTGCTTGAAGTTAAATAGAGTTTGTGGAGAACAATAAGAA:1 - chr2R 22616865 3' - BS 5058 1 55.40 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTGCCCGCTGAGGTGGCAT:1 - chr3L 10068906 3' - 412 7129 2 69.86 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTGGTCCTTGGTGGAGGCCCGTTCTCAATCCGTTGGCGAGGACCAAGTGCATCTTGTTACGCCGCACAATGAATACCAAAA:1 + chr2R 10666954 3' - hobo 42 1 56.85 GAAGCTGGCATTTTTATTTTACTCCTAATTCGTTGCCGGTTAGGCATTGAGCGAGTCACCTAATACCGATATGAGAATCAATAAATATTTCAGT:1 + chr2L 324909 3' - TART-C 11062 1 82.98 CTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGCGGCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAGTGGAAAACACAAGTCGC:1 + chrX 19744493 3' - P-element 66 1 29.93 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTATAGTTTAATATTTGGTCGATGTTGCTTATAAATCTTACTATTTGTAAGCTGTA:1 - chr3L 19510491 3' + pogo 2037 1 63.70 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACCAAGTACTCCGGCCGATTGATTAATCATATGGATGGCTAATTAACCGCAAGCGCC:1 - chr2R 10666843 3' + hobo 2889 1 55.81 TTCTTCCTTAGTGGCTCAAAATCTCGGAGCAGATTTTGTGTTCATGGCCACTGCCGTCATCAATATTTAAAATAAATCAGGATCTTGGGTTCCTTGGCTCGACTCGCACAAGATAGAAGCCTTGAAAATGTATACTTGAAGTGGGT:1 - chr3L 26020489 3' + G3 380 1 69.86 AGTGACAGAAGAACCCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGGAGACCAACCAGGGGTTGGACCTTCCTCG:1 - chr2L 19219359 3' + springer 7462 2 59.15 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATCGCCTATGTGTAACTATGTGTACTTTATAAATGTTCACCTGAAATGGATCTCTGTAAGGAACCTATC:1 + chr3R 17747422 3' - 297 11 2 78.77 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACCATACCCAATTATATCTGTAACCCTGTGTATGTATCGCCTATGTGTAACTATGTGGACTTTATAAATGTTCACCTGAAATGGATCTCTGTAAG:1 + chr3R 17747413 3' - 297 6601 2 71.23 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGGGAAGCCGTATTTGGTACTCCCGGCACCGGTTGCTA:1 + chrX 18336402 3' + mdg1 7429 2 75.34 ACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATTTGCTTTTGCGCTTTTGCGCACGCCTTCCCCAATTG:1 - chr3L 780683 3' + Burdock 6310 2 74.66 AGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACACACCAACTTCAAAAGGACCGACAGAAAGTATTATGTACGTAGGTACGTACGTACGAGTTGCTACGAGAGAAGGAGCCCCCAAAAAAGCAGCGAATCCAGCCGG:1 - chrX 21405919 3' - flea 370 1 71.92 CCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACCTCAGGGGATGTCATTTGAAGGCGGCAAGTGTAAAAATTAAGCAGCTA:1 - chr2L 9109853 3' - opus 68 4 66.44 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGAAGGGTAGAGGGTATGAGCACAA:1 - chr3R 4739734 3' - P-element 63 1 27.27 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCATCTTTAATAAATATCTTATCATAAGTGATGAAATAAATCTTCAAACCCCTTACTCAATGCTAATTTAAGCTATCGCCTAGCTACATATTACCATCTGCTCGGAGAAAC:1 + chr3R 11163165 3' - mdg1 12 2 77.40 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCG:1 + chr3L 10111844 3' + copia 214 2 59.09 ACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTAATTCTTTTATTTAATACTCTTTATTATAAGGAACAGTGATGATTTTTTTTTTTAACTGCAGCTACACAGAATAATAAGCTTACATTTTAAGTAGCCAAATCTACCGAAA:1 - chr3R 23451532 3' - Juan 1 1 64.39 ACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGAGTTGATCCATTTATTCCCTATCAATGTGATGACATATCCAGTTTGATTTCTTCAGTTAATCCTTCGATTGTTTCCTTATCCATTAGATACTCTATTTTCTCTCTGTGC:1 + chr3R 18860927 3' + roo 398 1 47.95 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATGCAAACATGCATTTCACATGGGGATACATTTCTGTCCCAACTAGCCCGGCTGCTAACTGCTGAAGGGGAATGGGGATGGCTGTTTTTAGGGGGGGTGGAGGGTGG:1 + chr3L 5329234 3' - 412 7070 2 73.97 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATATTTATGTTACTATATGCTAAGCGCTTCGCCTAACTTCGTTTCGCATAAATTTCAACGAGATACCCAGTGGGTATGG:1 - chr2L 9831213 3' + Transpac 5191 2 47.26 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAGAAA:1 - chr3R 26031674 3' + pogo 2055 1 54.79 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGCGACATATGCGGCAAAGCGTAAACAACAAGCCTGGCCAAAAACAAAAGCGACGTTTTACTCGGCTCTGCGAGCAAGAAACACAAAAAA:1 + chr3R 18935210 3' - jockey 4709 1 60.27 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGACCTAAACCGGATCGAATGGATATAGAGCCGCCCATTGTGAATCTAGCAACAATAAAACAGAGAGAA:2 + chr2L 246684 3' - P-element 52 1 50.00 TACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTTCATATTAATTATTACTTA:1 + chr3L 13365129 3' - Juan 50 1 48.63 GAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCAT:2 + chr3L 23839707 3' - McClintock 76 2 73.29 TAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCA:1 + chr3L 22635778 3' + hopper2 1550 1 54.11 AGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACAAACATTTATAACTTTGAAATCATTTAGAGTTTATTTGCAC:2 + chr3L 11754753 3' - Doc 163 1 71.92 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATAGCTCATAAACATGAATTAATAGCATACCGTAAGCTTTCTAAAA:1 + chr3L 8704583 3' - blood 7057 2 61.74 GTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGACTATCCTTGAAAGCGAATCGCAGCCCGATGATTTGGTAGACAAAAGTGCGGCGAACAATGGCAACTCTCTCTCAGCCAGACATCTCAGCTCTTCCC:1 - chrX 8357899 3' - Doc 4534 1 73.29 CTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATGCCCCTGAAACCATTATGCATTTTACCTTTAAGCTAATGACGCTACAGCTTTAAAGGCCAGCAACAAAGTAAATTTACCCGCTCAGCACGAAATGCCAGC:1 + chr3R 18006223 3' + F-element 284 1 70.55 AGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCGAATATTTAAACACGTGTATATTTATATTTACACACGCATAGTTTTTGAGGTGACAGCTAAAATGAGGTATGTTTGTACATACAAATACT:1 - chrX 20369339 3' + roo 378 1 65.75 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGCCATACAT:1 + chr2L 18848799 3' - blood 7086 2 69.18 ACGTGAGGGTAGATACACTACACTATGTATCATGTAACTACTTTCTAAACAAGATAATTTTCTAAATTCCAGTTACTCTTACTCATTGCTTCCGCTTCGGCAGCAGAATTGGGCTATAATTACCAAGCTGCTGCTGGCGACCGTCG:1 - chr3R 26693283 3' - Stalker2 1 2 78.08 TTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGGGGTACTGTGTTATTATTAATTTATTAGTCTATCTATTTGTAGAACTACCTAAAT:1 + chr2L 9317758 3' - I-element 76 1 69.44 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTACATTTCCGATATTTGGACAGTGTGAAAGCAATACGTTTTGTTACAAACATTTTAATTACGCAAAATATTTCTTATTTTACGCAAAACATTTACAATAAATAA:1 - chr3R 11873297 3' - 412 7071 2 71.23 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTCATTATAGTAGTCAAAACATTCTACGGTCAGTTGTGGATTATTACGCTGGATATCACTGGTGGCGCTCATTATCTCAAGAATTCGCGAAGGACCAGAGATGAG:1 + chr2R 18056939 3' - blood 15 2 75.86 GCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAG:1 + chr3L 16973487 3' + S-element 1678 2 57.53 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAGCTATGATGTGGGCAATAGCAACAACAACAAAGGGCAAAAAACGACCGCCATCAGAAACACGCCCACTTTATTTAGCCAGTTGTTGTTGCTCGTCT:1 - chr3R 19500592 3' + jockey 4966 1 65.75 AAAGTTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTGCTCCCATCATGAAAAAACCTCAGGACAAAAACGAACCGAACAAGTAAATTTTATGGTAATTATAAACTTTTTGGTTTCATTAAAAAATATTGAAGAGA:1 - chr3L 5711387 3' - HMS-Beagle2 491 1 64.00 ACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAAATACACTTTACGAGATGTAACCTCTTACACGCACTCATTCCCTGTTCCTTTGTCACTTTCAGACTTTGA:1 + chr2L 13763583 3' - Bari1 54 1 52.05 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATATAATACCGAATATTGAATAATTTCTTTGGAAATAAATTCTCAATTTAACAAGCATGTTCGAAATGTATTTTT:1 + chr3R 23714140 3' - I-element 47 1 56.16 ATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAGGGGACAACAAAAGTTTAAATACTCTTGGCGAGGCTATATCAAACTTG:1 - chr3R 15035026 3' - Stalker2 36 2 60.96 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTGGCATTGGTAATTATGCGACACAAAACAGAAGTGGGGCCATACATTAAGCAGCAGTTTAAAGAGGCAGCGAGGAAATGGGAAAA:1 + chr2L 18848838 3' - blood 36 2 60.96 AAGACTCATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGTTCGAAGAGAACTTAACAACGCTGAGCTTTTAAATCTGAGTAAAAAATTAACAATTGAAAGGATTGTGTAAATAGGAGCGGGAGCTCCTTACCCCAAAGTTGAGCTACTTATTTGCT:1 + chrX 12301174 3' + X-element 4313 1 78.08 ATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGAAACAAATATGAGTTTCAAATTTGGTATTTCAATGTGATAGTCTAGCAATCTAT:1 - chr3L 13475458 3' + HMS-Beagle 7026 2 74.66 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCGTTAACGGAGTCCCGCCACAAAAAATCCGGAAATTTACGTACTAT:1 + chr3L 13546670 3' + hobo 2897 1 55.48 ACAAAAAAAAACAAAAAACAAACTAGAATCATCTGGGAACTGAGAAGGCAGCGCTTAGAACGGGGAACACAAGCAAATTGCATGTAGCGAAACTTTTCCTTATTACGCAGGCGAAAGAAAAACAACGTGCCCATGACGCTCTCAGT:1 - chr3R 12898912 3' + gypsy7 5005 4 70.55 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATTTGCTTTTGCGCTTTTGCGCACGCCTTCCCCAATTGATAAAGTGACAATTTATAGTCCCTTTTAATTGATATCGTCATGCGTCGAGAGCCCCGCG:1 - chr3L 780624 3' + Burdock 6368 2 69.86 ATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATATTTATTATAATCAGCCAACAATGGAGAAATAATGTTCATATTAATT:1 + chr3L 13365121 3' - Juan 58 1 54.11 AAAAAAAAAACATACAAATTTACAGGAAAAACATGGCATCATTTCTAAATAAATTTCTATATACTATTATATTTCTATAAATACTCATTATATCCTTCCTAATGTTACTATATCCTTAAAATGGCACGCCTCTGTCCTGTGAAACT:1 + chr2L 13744499 3' - Tc1 1464 1 69.86 AACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTTCCACCGCTGCCGC:1 - chr3L 19782216 3' + R1A1-element 146 1 71.00 TGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTATATAATCCGATTTTTAGGGTGGGATTAATAGATGATTAGTAATCTAAAATGAGCAAATGGCTGCATTAATATCAATTTACAATGCATAGCATTGAAAATCCAT:1 + chrX 17270423 3' - 3S18 18 2 69.86 TTCGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTA:1 - chr3L 19951190 3' - Ivk 67 1 60.96 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGGAAGGAGGGCAGCAACCTCAAGCACTAATTGCAAAACGTTTTTGGGCCACTAATTACGATGCATTGTGCTTGGCAAAATGGGGCAA:1 + chr3R 26845674 3' - mdg1 36 2 39.73 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGGCAAACTTCTGGATATAATCGAGATGCCCTCTGAAAGCGTATAAAAAGTC:1 + chr2L 10685898 3' - Quasimodo 45 2 55.48 TTTTTTTTCTTTTTTTTTTGTATCTTCCTTGTTCCTTGACAATATTTCAGCTAAGCCTCTTTAACCCCCTCAAAAACTAAAAGTAATGTATAGTTTAACA:1 - chr3R 26540982 3' - G2 3075 1 65.00 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCCCCTCAAGTGGGGGCCACACTCGAAATTAGAATAAATGCAAACGACTTGGACTAACACTTGGGATTTCTCTGTGGGAATGAAGCCATAATTCGTGGCTCTCGCTG:1 + chr2L 20327747 3' - roo 8680 2 72.60 GGAGCGCCACAGAAATCGGCGGGCTAACGCTCTAAACAGACCTCGCCCCCCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAATTCTTGGGTACATTTGTCAGACTGTTCTGCAGTCACACTAATTTAGGCACAA:1 + chr3L 3224970 3' + X-element 4430 1 56.80 ACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGCCGAGATTGATATGAATGGTTAGGTTTGCCTCGAGTGCCTCCTGGAATATCTCC:1 + chr2L 15601630 3' - Doc 71 1 65.75 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAGGCACGTACTTAAAAGAAAAAAAAATAAGAAAAAAAAACTTCCCCATCAAGTGGGTCCAATAAAAGTTTTATGAGTCAGCCGCAATCTCGGGTCCAGAT:1 - chr2L 10128041 3' - hobo 23 1 68.49 AAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAGGTAATATACGGTTTGCATCCCCATTTAGGCGCCGCACGGCAAAAAGTAAGAATTTTTTTTGG:1 + chr2R 2007459 3' - Cr1a 4256 1 56.16 TTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAAGGAATGCCGTTCATATACATTATTGTATTACACTATCGAAAACAATAAACCAAAATAATA:1 - chr3R 11142189 3' - Max-element 62 2 61.64 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGAACGACGTCGACGTCGCTGCGAAAAGAGAGCGGCGAGAAGAGAGCGCCGACAAAAAAACCAAA:1 - chr3L 25442075 3' + P-element 2834 1 39.04 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACGTGGTGAGCGAGAGAGCGAGC:1 - chrX 13642018 3' + P-element 2831 1 47.26 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATAACTCAACAAATTTAATTTAGATCGAAATGTGGTGCAGTT:1 - chrX 19591163 3' - roo 8741 2 73.97 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAACTTTCATAGCACAGCCAATCCCATTTTTCACCCATTTTTTTCTGCACTCATAAGTTTCCTGCTTAGATTGTATCTCACTGG:1 - chrX 16857030 3' - pogo 25 1 62.96 GGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAAGGAATGCCGTTCATATACATTATTGTATTACACTATCGAAAACAATAAACCAAAA:1 - chr3R 11142194 3' - Max-element 67 2 65.07 TAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAA:1 - chr3R 19589897 3' - BS 5040 1 51.37 TTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTGAAAAGAATCCAAAAGGATTCTGGCGCGATAATTAAATGCGCACAGGAAGCGAAACTTTTTCACCCAAGTTGCGGTGTGT:1 + chr3R 26139533 3' - mdg1 41 2 57.53 ACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTAAAAGCCGGGATACTCAACTATAGCATTCTTTCTTGTATAAATTCCCTATATAATCGTAAAATCCAGTTCTCACACTTACGCAAAAAAGCAACAGACTCATTTCGACAGTTGATTCAACGTA:1 + chrX 17767091 3' + INE-1 540 1 43.84 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGTTTTTGCACAATGCATAAGAGGT:1 + chr2R 5674771 3' - S-element 35 2 65.07 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCCGGGCGAAAAGAACGAATCGAATCGAATGATGCTGAATGAAGACGTGGTGAGCGAGAGAGCGAGCAGAGGGGCATGTAT:1 - chrX 13642004 3' + P-element 2845 1 56.85 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGGAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGCCGCTGAT:1 + chrX 19744509 3' - P-element 56 1 44.76 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTATATAAACTCATATATGTACATGCATATGTGCTTTGAATCGAAAAAGAAACTTCTTCATTTTTTATTGTCTAACCTTATTTTGACTTTCACTTG:1 + chr2L 21687734 3' - pogo 20 1 69.29 TACTGTTGTAGTTTTTGGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGTTTCTGATGTTCTAGGGTAATAGTAC:1 + chr3L 23871339 3' - Doc 61 1 52.74 GTTCGCACTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCATTCTCTCCTGTTTTTTTTTATAATTTAAAAAAAAAATCCTTTT:1 + chr3L 12110736 3' + INE-1 530 1 68.93 AGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAAATTTGATTTAAAACAGTAAAAATGGTAAATCCAATAAAACTAAGTGATAACAAACTAACCGATTAAGCAAA:1 + chr3R 20097704 3' + mdg3 5449 2 52.74 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCATCAATCAAACTGTCACCAATCGCAGCCTTAGTTTAAGTTGCCTGCATCCTTCTCCTCATCCGGATCCCCT:1 + chrX 998236 3' + copia 5074 2 52.74 TAGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGAAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGTCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAATTATTTGGCGTGCCTCGATTAAGTGGCACCAATTGAAAGCCGATTGTTGGAA:1 - chr2R 14767310 3' - Tirant 12 2 76.03 AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATAACTTTTAAAATGGTAATGAACTTTTCGCCAAGTAATTGTCG:1 - chr3L 13015909 3' - hobo 73 1 73.94 GTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGTGCGTGCGATCAACGCATTTTTCGCGAACTACATCGGCAAAAATTCGAATAGTTCAGAATATTGAACGAAATTTGCCTATTTTCCAGCTTCGTT:1 - chrX 22652668 3' - ZAM 7991 2 65.75 GTTGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCACTCGACCGTTTTCATTCTGATGCTACAGAATAAGCAGAATGTACGTAAAACAGAAGA:1 - chrX 12131172 3' - F-element 382 1 63.01 TAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATGCAGTGTAAAATCCGAAATGCAAAATGCACTGGCAGAG:1 + chr3R 24301964 3' + Tabor 474 2 78.77 GTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTGTTGACACACTGCTTTATATATGAAAACTATTTTATGCAT:1 - chr3L 15374595 3' - 3S18 36 2 62.33 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATACTGATAATCTTCCTTTTGCTTATTTAACTCAAAACGACCAAAATATTTTCATTATATAGACATATATTTTTCGC:1 + chr2R 8375135 3' + roo 360 2 52.74 CAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAAGAGTCCATATATATATTTAATGAAGCTTTTTTGGTGGTCCGTCGCATATAAATATGTTTTTATATGACACGACCCACAAGC:1 + chr3L 20910118 3' - F-element 47 1 50.71 TCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAGAACCAGGTGTCATCTCCATTTAA:1 - chr2R 11394125 3' + pogo 1946 1 65.07 TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGACGTTTCGCACACACAGAGATACAAAAATTCAACGCTTGACAAAAAAAAGCGCAGCCTGA:1 - chrX 7441024 3' - jockey 4822 1 58.22 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGACCGAATCTGAATTCGAATATTCACCATGTGTCGACTGGCGACTGCAGCAACAACAAC:1 - chr3R 17794529 3' + P-element 2839 1 45.11 CCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAATACATTAGAGCAGCTACACAGGATATGGCAATTAT:1 - chr3L 13631279 3' - hobo 68 1 71.32 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGTGCCTACACACAACTGCGGTCACAATAATAGCAGCGATAATAAAATGAGCTGAAACATTCTGCAGTTATTAAACATGTAAAAA:1 - chr3R 24301790 3' - Tabor 37 2 60.00 ATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACAAATTTTGGAATTCTATCCAATTTCATATTGCTGTGAAGAAGTTGTTCTCTGCCGATATTACTATTTAACCAGTTTGTGAATATACTATTTTCTTGGTATGAATACAATCCAA:1 + chr2L 2621639 3' - BS 5052 1 76.71 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTTAAGTTCAATTTGTCGGAAAATT:1 - chr2L 12766974 3' - hobo 63 1 59.59 TTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGAGGCCGGAACACCGGTTTTCCATCGTGTAGATACTCCGGTTTCAGATAGA:1 - chr2R 12872891 3' - P-element 72 1 36.30 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTATTTATTATACCAGCTGTTCTTCTTCGTTTCATTAATTTTGTTGCTGTTGTGCTTCTTTAAAGCCTTTCTTTAATTTTTCGACAGTCTTTATTAATACGCTAA:1 - chr2L 13102819 3' + roo 9055 2 74.66 GCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATAGTTATGTCCATTAGTGTATGTACATGTTACACTGGGATGCGCTATATTTTTATCGCCATACTAAGAAGAACAAGCCCGTTGACATTTTTATGAATAAAATGCACGCACGATC:1 - chr4 703370 3' - Tc1-2 23 1 73.57 GGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATGATTCTTGAAGAACGATATCACCTTCTTGGACTGTGGAGCCCGCATCCGTCTCTTGACCGTCATCGTTGGTCATCTTGG:1 - chrX 15696669 3' - jockey 4707 1 58.04 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGGAGTTGATCATTATTCAGTAAAGGCATTCGTAAATTGCTTGCGTTATATATGCCATTAATTGAAATGATAACGATTAATGATAGCGAAAAGA:1 - chr3L 11887163 3' - Doc 31 1 65.07 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGAGTCCGAAACTGCGACACGCGCAGGTAAATGGAAAACACAAGTCGCCTCCTCCGCCGCTGATGATGGGAAGCAATT:1 + chrX 19744523 3' - P-element 45 1 54.79 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACCCTTGCATACACTCATACCTACCTAGGCGTCTTTTCTAGGTTATCAAACGGTAAAAACGCGGCGAC:1 + chr2R 14486587 3' - 297 6632 2 59.59 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCATTGGTAAATACTTTTTTGGTAAATACTTTTTTTTTCAGTTGGGGCCGGTGGTCGGAACTTTTGGAGTTAGGACAATTCAAACGAGGTT:1 - chr2L 232330 3' - Doc 35 1 51.37 TGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCGCACATACATATCAGAATGTATATTCCGAGAATTTTTCAG:1 - chr3R 15035073 3' - Stalker2 7331 2 72.60 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATTATGTGTTTAACATGTTTTAATGAACAGAAACTAACACGAGTCCGGCACAAAAGGATGCATGTTCGAATGGAAAATCGCTGATTAACTATTACTAATTGGATGAGTAAGCA:2 - chr3R 12885933 3' - 412 10 2 77.40 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTATGGGTGGTTGGTTCTACATCGGTGTGAGTTTAGTATCGTGTGTGCATTC:1 - chr3R 26404956 3' - hobo 9 1 78.08 TATAACATACATACATACATATTTGTAAGAATAACCCATTAATAGTTTCAAAAGCTGCAGTCTCACATTTCCCAAGCTAATCCCCTATGTTTATCAGCAGCATCAAATTCGGATTATATCTGCACAATGGTACGCAAAGCTTCGTT:1 - chr2R 10546235 3' + 412 224 2 71.92 AAAAACAAGAAGAAAAAAAAACGAACAAAAAAAATAATAAAGAAGCAAACAGCTCATGTCAGGAAAATTTGTCTGATGGCAAGTTTCGTTTGGATTTTGCCAATATCAGCGATAAATCTACATTATT:1 - chr3R 13019150 3' + mdg3 5095 1 85.04 AAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAGCTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATTTAAGTTGGCGCACTTTCCTCTTGCT:1 + chrX 22578067 3' + 297 307 2 80.82 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTTTTCCGAAATTCAAATGGAGCCCCTTTCTAACACTTTGTCTGCCTCATGAAT:1 + chr3R 12540568 3' - roo 62 2 63.64 AAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATAAATACTTCTGTTTGTTGTCTCTACTTCCAATTTTGCGAGACGCATGCTT:1 + chrX 15110887 3' - R2-element 3331 1 66.44 CAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAAGAAACATTGTCATAAAATACTAAGATCTCTCAATAAAAGAT:1 - chr3R 1047933 3' + Stalker2 7614 2 59.59 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAATGCTAGCGTACTCTATAATTTCGCCACTCGAGTTAGCAGATTTATGGCATTTGGATTTTGACAGTCATTTTGGAACTTCTCAAGTG:1 - chr2R 12642605 3' + pogo 2069 1 62.33 ACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAGAAAAACCGCACGAGCGCATTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTAGAGATAGAGAGATAGTGATGTCTCCTTTTGAAATTTATTTTTCATAGAAGAAGTGTGCAAAAGTTCTAA:1 + chr2R 10393027 3' - Cr1a 379 1 65.07 GTCCTTGCTTGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTCCATCCTTTAGTAGCCTTTTACCCCAACCCATTTTCCACCCCTTTGCCGAACGATTTTCCTTGGCATGC:1 + chr3R 21689348 3' - Rt1b 4999 1 67.81 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATACTGCATAGTAGTAAAAGCGACTAAGTAACCTAAAACTACATATGAATCAACCCCTCAAGTTTATCAATTATAACTCATATATCAACC:1 - chr2L 14678707 3' - Quasimodo 25 2 65.75 CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACACGCAATGGGAAATAAAAAG:1 - chr3R 9158144 3' + P-element 2786 1 16.44 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTAATCGTAATTAATGAACATGTAGGTATAGGTAGGATAGTAGGTTCCTTTAACTTATTTGAAAAAGAAGC:1 - chr3R 25052986 3' - pogo 47 1 53.42 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCTGTTCTCTGGGCTTTGTTTTAGTTGTCAGACACACACCCT:1 + chr2R 22795204 3' - hobo 81 1 72.60 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGATTCAAATGCAGCCGAACTACAACAACATAAACTGCATGTCGTAATACTGTTGGTGTAATAAAAAAAAG:1 + chr3R 7109243 3' - P-element 50 1 52.05 CTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAAATATAGAAAAAGGCACTATTGATAACGATTCGATTACAATTTCGATGAAATAAGAACACACTAT:1 + chrX 8037769 3' + Quasimodo 7313 2 58.22 AATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATGAAGGAAAAGGGGTCGCCGCGTGGCTTTTGGGCTCTGGCTTCTGGGTTCAGGAGGTCCCCGGCTGGATATTAATGC:1 + chr2R 16030421 3' - hobo 2538 1 52.05 GATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGAAGTTAAAGTCGGAGTTGGTCCTTCCTGCTCTCTGACC:1 - chrX 19991002 3' + copia 59 2 73.97 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTTACTCTCTTAATTTTACGCGAGAGGAGTGAGAGCATAGCCACCAGGACTACGGGCTGTATTATACCTTCTTTTAACCATTCCCGCATCTGCTCATCTACAAAGTTTTGGTCACTATACG:1 - chr3L 25627050 3' + 1360 3387 2 57.53 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATTTCCAGTCATTTCCTTTCAATTTAATATTTATGA:1 + chrX 10344849 3' - roo 8749 2 79.45 GCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTGATAATAATTCTTCACTTTCGGACTGAATGTTATGGTGG:1 - chr3R 19449582 3' - Burdock 6239 2 73.29 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATATATTGTAGTATGCCCCTCGTCATAAGGCAAACAAATGACATCGACTGACATCCTGTTCTG:1 + chr2L 2336322 3' - 297 6600 2 62.86 TGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAGTGAAATGCTCCTAAATTCTATTATCGAAGGACTTGCGTTAGTGTATTTAGGGATTCGACGCTCGAATCCTTTCAACCCATCCAACTGCCGTTGTTG:1 + chr3R 11550327 3' - F-element 35 1 66.90 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCGAAGTGAAGAGAGAGCGGCCCGGTAGTAGGACACTTGTGTGGATAATTTGAATTATTGTCTAC:1 + chr2L 42603 3' + copia 5077 2 54.01 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGAAATATTGAGATTTAAATTTCATCAAAGACTGTTTATAATAATAGAAGTCTAGACTTTTTGTAAGCG:1 - chr2R 10189252 3' - Doc 58 1 56.85 AGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACAAACATTTATAACTTTGAAATCATTTAGAGTTTATTTGCACCAACATGAAAGAAGCAAATAAACACTG:1 + chr3L 11754780 3' - Doc 135 1 53.10 GCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACAT:1 + chr3L 3540206 3' - mdg3 5313 2 65.75 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTACACACACAGACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACACCCATTCTACAAACGAACTGTATGCGTGGCCATTTTGTTAGAAAAACCGGAAAGTGGGA:1 + chr2R 21453650 3' + hobo 2928 1 60.27 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATACACACATTGCGGTGTCTGTGAAAAAGTCAACGAGTTTTTGCCGGGTTGTGTAATATGGAAAATAACT:1 + chr3R 29381606 3' - hobo 51 1 52.05 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGCGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATACGTATGTATGTATGTGCAAAAGTGGAAAAAAAGCACCGTCTAGGCGAAAAGTTTGTGACTTGTTT:1 - chrX 13484110 3' + hobo 2894 1 51.11 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGATATAGTGATGTATATTCTTGTGTTGTTTTTTTTCGGTGCCGCTTTAGTTTGGCCGCAGTTGCTGCTCATCAGGAGTTTTGCCTGGATGACGG:1 + chr2R 10936777 3' - copia 29 2 61.64 AATCGATCAGTTCCTTCTGAAGTTAACCTAATGTGTAGCTTAAAAGATATTATGGATTCTGTTCCTTAATTATAGTGTATACATCGCAGCGCAGGCTTTTGTATTCTTTGCGGCT:1 - chr2R 14885942 3' - G5A 2802 1 72.17 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAAACACACGCTTCAATGAGAAGGTTTTACCAGAAGAAGTTACCAGAATAAACCTTAATTTTGTCAATAGAACTTTTATCTTGACTGTATCAACCTGGGGTTGCAT:1 - chr3L 18954076 3' + roo 397 1 78.08 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTGTGTTTCCGAGTGTGTTTCGGGTTTATGCTGCTTGAATAAACTCTTTCTTCCCAAGACCACATTTTTTGTTGTTAAAACAAATCTCACAGAGCAGCAAGTGACA:1 - chr2R 22372438 3' - I-element 18 1 69.18 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCACATTGTTGGCTCGTTTTAGGCTGACTCAGAGCCAAATGGCGTTGGATTCATG:1 - chr3R 29719330 3' - hobo 66 1 66.44 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGCTATCTAACCGAGTTCCCTGTGGCAACGAGGCGTGGCAGGGGCCGGGCACACGGTCAACAGCTGCAGTTGGCCGCAAAAGGCTTTC:1 + chr3R 12886112 3' + 412 7512 2 59.59 CTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAA:1 + chr2R 18922593 3' + opus 7422 2 74.66 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGCCCTGGAATATCATTTAAATTTCCATTTAAAGTCGACCACAGCCCCC:1 - 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chrX 1831236 3' + P-element 2823 1 39.29 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCCAAAAAGGCAACCGAAACAGGCAATCCTCTGCCGCGAGAAGAG:1 - chr2R 18266022 3' - roo 8727 2 70.45 GTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGATTAAATTGAAATGCCTGGATGCGGCATAAAAACTCGAATTTATGAATGTCTTAAAAAGTCTC:1 + chr3R 20039019 3' - R1A1-element 4947 1 57.53 CTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGTAATGCCAATTTTGTGCAAATGGCTGTGAAGCCGGCATGTCTGGAATTCCACAGCCTTGGCATCATTTAAACTTCTGGTCTATTCATTTAAACTTTGTTTATTTACATAGA:1 - chr3L 18655926 3' - baggins 5202 1 50.68 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGGACCGGACACTTGAGAGAGAGAGAATTCTCCGGCTCG:1 + chrX 13642098 3' - P-element 52 1 36.84 GATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCAAGACTAATCAAAAGTGTCTTTTCTACACTACAAGTAAAGGGTATAAATTAGCCACAAAACTCGAAT:1 + chr2R 7024492 3' - diver 48 2 52.86 AAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACGATATATGTATGGGAAGAACAAG:1 - chr3R 29997655 3' - P-element 98 1 18.49 TGTTCATGTGTGAACATAGTGCCTTAAATATCACTTATCACCTGGGACATCGCAAGCTAATTACAAAACTATTGCCACAGTCGTCGTCGCCACTGAGCCGCAGAAAAGTGTCCCAACACAATGTGACAATTGCAACAGA:1 - chr2R 18785883 3' - roo 8659 1 58.99 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATCATTTCGCAAATTACGTGACTTGCTACCCCCACCACATCATTTTTTTGATAGAGGCGGCGAAAAATCTCCATGGAAAACTCCGCATTTGGACCACTG:1 + chr3R 12953314 3' - jockey 32 1 61.64 TTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATACTTAAAGGTACTTCATACCTAACCAGCATGACTTCTAATCAAGATCACCCGATTGGCCTACTTAGTTTCTGGCCAA:1 + chr3R 29901163 3' - flea 4797 2 47.95 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTTGCTCACAGCACATTTGAATGCATTTTCATGAAATAACAAGAACACACTTATTCAATTTGTGATTTTATCAAGGCT:1 + chrX 10429894 3' + roo 9030 1 56.85 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGACAGGAGCCGAAGTCGATGGGGCAGACTCCTCCATCTTCATGGGTTCCACTGCCAGAGTCTCCTTTTCGGAAACGACAGCAGGGACCTCAACTTCCGGGATCTT:1 + chr3L 13380577 3' + hobo 2922 1 73.97 GCATACATCCCCATGAAGTCCTTACACGTAAGATAGCATAATCTCCCCACGGTACATTTGTATACACTATAATTAAGGAACATGGTTGTTAAAATGAAGTCCTCAAGTGGTTGGTTCCCTTGAATTTTGTTTAGATTGGGAATTTT:1 - 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P-element 89 1 19.26 ACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTATAACGCTATCGTCACTCGATCCAAATTTTCGCTCAGTGTGTTGAAGTAAATGTGGTTCATATGAGTATCCGAACGTAGCTGAGATGATTAGACAACATTCAA:1 + chr2L 8009198 3' + roo 393 1 72.60 GTGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCAAACTTTATTTTTTTGCCATAGAGCATTTCTCAGCCGTTCTGTGAGCAAAATTTCTCTAGGTCTCCTTCTTTTATGCTCCTTATTTAACTTGCGGTCGCTTTTGGTCCTTGGG:1 + chr2L 12814866 3' + hobo 2931 1 79.45 AAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATGTACATACTTCCCCCATCCGAACCGACCTTATAGACCAGAAGTCTCTCTTTCCGGCACTTTTTGTAATGCCCCGCTCTGAGTCTCACATTTCGAGTGTTTCACCTGCCG:1 - chr2L 9228615 3' + Burdock 6380 2 75.34 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAAGTGCATTTCATTGCTATAATCAGAAATTGATGCTGCGGAATGTCGTTCACCCTGCAAATGGATATTTAGAAAAAAAAACTTGTGAGTGTTTTAGTTTC:1 + chr2L 11559853 3' + roo 391 2 73.97 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATAGCTCATAAACAGGAATTAAAAGCATACCGTAAGCTTTCTAAAAAATTCGAATTGGGTTGTAAGATATATTAATATAGAGATTAAAGT:1 + chr3L 8704627 3' - blood 7044 2 63.01 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATTTGCTTTTGCGCTTTTGCGC:1 - chr3L 780699 3' - Burdock 57 2 55.48 GTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGAGTAATCTCTTAAAG:1 + chr2R 11691254 3' - P-element 104 1 13.79 AACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTTTTGCGGAGTTGCAGGGGACATGGGGCAACTTGGCA:1 - chr3R 14039654 3' + F-element 238 1 75.34 GCCAGCCTTGTGGTCTGGCAGAGTAATTAATACAAATATATTTACGACGTTCAGTCGGAGCAATAAGATTGACGAGCGCAAGTTACTTTCCTTTCCGATTCTGATTCTCGAACAGTCGCTTTGTTTTGCTGGTACAAAAGTTGAAA:1 + chr2R 1861426 3' - Gypsy6A_LTR 250 1 53.42 TAAGCTCCGATGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTGCTTATTTAAACAAATTAAGGTTTGAATCCTTAGCACACACTGTGTGTTGACA:1 - chr3L 15374628 3' - 3S18 5834 2 61.64 CGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATTTGCTTTTGCGCTTTTGCGCACGCCTTCCCCAATTGA:1 - chr3L 780682 3' + Burdock 6311 2 73.97 CGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGGTAAGTCTATTAAAAATCTATATATTGTTCTAGGAAGACGT:1 - 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Doc 115 1 56.94 AATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCGAATATTTAAACACGTGTATATTTATATTTACACACGCATAGTTTTTGAGGTGACAGCTAAAATGAGGTATGTTTGTACATACAAA:1 - chrX 20369343 3' + roo 374 1 63.01 ATCTCAACGTTCTAGCTTTTATAATTCCTGAGATCGAGACGTTCGGACGGACAGACGAACAGGGTAGCTGTATTTAAAGCGGGAAGAAGACAAATGCAAGGATAGTAATAGTGAGGACACCGATGGGGCCCTGCAGCAGTGCA:1 + chrX 133050 3' - INE-1 163 1 65.73 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAGTTTTCAATCTATAAAAGCATTAGTAATTATAATATCATTTAACAAAAAACAAAAAAAATACAAGAGA:1 - chr3R 26031676 3' + pogo 2053 1 53.42 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGTAATAAAGTAAAATCAAA:1 - chr3R 6171115 3' + 297 337 2 62.50 CAGTACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGTTTAATCGTATGGCGTGAGTATGCACCAGCACGCGCACAGAGCTGCGCTCGTGATCCAACCGCTGTGGCTAACCCTATAAATCTTG:1 - chr3R 20532286 3' + 3S18 143 2 55.48 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTAATCGTAATTAATGAACATGTAGGTATAGGTAGGATAGTAGGTTCCTTTAACTTATTTGAAAA:1 - chr3R 25052992 3' - pogo 53 1 54.11 ACTACTTCCCCACCCCCCTAAACCTCCAAGACAATGAAAGCAACTACAACTACAACTACGCAGCCTTGCTTTTCCTGGCTTCGGCTGCGTG:1 - chr3L 19397651 3' + gypsy5 7037 2 75.82 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACTTCATCTTATATCAACAGCCACACAGAGGAAAACGCTATATTGCTCTTCTATGATAAATAATGTACTCATTCGCTTATTCACTCAT:1 + chr2R 6713980 3' - 297 6602 2 71.92 CTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCCGCGTGTCCATTTGCAAACAAAAGCCTTTGCTCATGTCTATGGTCTGAAATATTATTTGCTTTGCTGCGTTCCGTGCCGATTCTGCATAT:1 + chr3L 14848639 3' + Quasimodo 7350 2 57.53 AATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGATGGATATGACTGAGATAATTATATGACCGCACTCAACGTGGCCCAAAGTGACTGAAAAGTGAATAATAAAGATCTGGCCAAAGCACTGTTTAACTTTA:1 - chr2R 20302122 3' - mdg1 156 2 71.92 ATACCTGTCCGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTCCTTCTTTATTTAGAATTTAAATAGTTTCGATCTCTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTAGCTTAAAACTAACATTAGTAGAAA:1 - chr2L 8776810 3' - G4 3704 1 67.12 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATCATAAGAGGCTTTGACAACTGGTTAACTTTATTGACGGATCTTACCTATTGGTTTCAAAGGC:1 - chr3R 17068884 3' + mdg1 7403 2 55.48 AATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAGCGTTGAAAAAAACGAGCGTTAGAAGTAGGCGGCCAGGGATGCGGG:1 + chr3L 10111846 3' + copia 5070 2 62.40 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCAAAGTACAGCTCAAGTGAGGGCTCCTCCTTTGTAGAATA:1 - chr3L 1728471 3' - blood 82 2 71.92 AGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTACCTGTATATATAGATATATATTGTGAGGCAACCGCCGATCCATCAC:1 - chr3R 24396717 3' - I-element 5172 1 67.81 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACATTCCCAGTATTGAATTCGAGCCAATTAATTATTTTTGT:1 + chr3R 11873419 3' + 412 410 2 73.29 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCAGACTCCTTTTGAAAAACTCCCTTGCGTTCGCATTCCTCTCTTTGTGGCT:1 + chr2L 21082247 3' - mdg3 34 2 63.01 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTTCTTTCATACTCAACTAGCGACTCAACTCGACTAAACTTTCCTTCTTCCTTTTCCCGAATTTAACCATTTCAAC:1 + chr3L 2240516 3' - roo 43 2 56.16 ACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATGCACCAAACGCTCCTGTCAAACGACAGAGAGAAAGTGCTAGT:1 - chrY 388278 3' + blood 7310 2 70.55 GTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAA:4 + chr2R 12185414 3' - accord 6911 2 63.01 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTCCACCCCATCAAAGTCCAGCCTGGTAGGCGCTCTCGCAAAGGTGCTTTCCCACGCACGCATGCGCCGCG:1 - chr2R 16031337 3' + hobo 2888 1 53.10 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAACCAAGTAATAATAAAACGTGGAAGCTTGCATCCATTACTTTGAGTATTTTCAATAGATATACGAAAGTAAGGATTACTTGGTTGCCAGCAGTTGATTACA:1 - chr3R 18492845 3' - Juan 4045 1 69.86 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACTTCTCTTTAAATTAATTTCTGTAGCCTACTTTTGTGGGTCAAAAGGGAAAGTCCGTGGCGCGTTTAAATCAATCAAGTTCAGGCATTCAAACAATGTACCAATG:1 - chr3L 9993860 3' - hobo 10 1 76.60 AGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATGTATATAAATATACATTTTTTGTGCTCTCTTTC:1 - chr3R 12952885 3' + micropia 402 2 78.18 GCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTGATTTAATTCTTTTTCAAAGGCTTTTTAATTCATCATCAATTTGTTTAATTGCAAATTAAACACTTGAATCGCTTATTTGTCACTGATTGC:1 - chr2R 18922473 3' - opus 25 4 68.49 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCCATTCC:1 - chr3L 22518990 3' + pogo 2036 1 63.01 GAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGAGTCGGTAGGGGGATTTAAGTCCCATTCCTTGCAATAAA:1 + chr2R 3091657 3' - F-element 327 1 73.29 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTCCACCCCAGCAAAGTCCAGCCTGGTAGGCGCTCTCGC:1 - chr2R 16031368 3' + hobo 2928 1 53.42 AATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACGCCAATTGACTAAGGGACCAAATGAAAAGGAAGGCGCTGCGTTGAGGGGGAGGCGTATTAATTTA:1 + chr2L 19841586 3' - BS 52 1 54.11 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTGCGAATCATTCACATACCCAAATGGTAAATGCTCAAAAATGCATTTAAATGCAAAATGAAGTAAATTCCAACCATTGTGTTTCCCTGCTTAGTTTAGCTTCATTCCATA:1 + chrX 12995458 3' - blood 11 2 78.08 AATAATATTAATTAATAATAATAATGTAGGTGTACATGAATTAGAGTACAATAACCTATTATTATTCAGAGATATGCATCACAGTATCTTAGTAAAATGGTAATTTGATTTATTACAGTGTAAGCCGTTTTGTGAAGGAAATGCAC:1 - chr3R 14750411 3' - Tc3 269 1 58.90 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTCTCTTTTTGGTTTTTTTTTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGA:1 + chr2L 2622754 3' - roo 51 2 58.22 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAAATAAAAATGTTTTGCATAATATAAGTCTCGAATACCTCTAACTAACCATTGAAAATGAGCTGCAAAAAATCCTTTGGATTTCCCGACTATTCGC:1 + chr2L 10858498 3' + Burdock 233 2 70.55 ATGTTAAACATGAGTGTTGTGTATATAAACGTTACATCTAATGCTAAAGTTACATTTTGTTTACTTAATTTCTATCTTATATTATTATTTTATATCATGTACACTCCAAAATTATGACTTGAGGTTTCGTGTTTTGTTAGAAACTA:1 - chr2R 3599974 3' + accord2 380 1 61.64 AATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTAATCTCTAGATTCGAACTCACCTCGTAGAACATATACCCACTGAGGGCCACCTGGAAGGCATTGTAGACGACCAGGG:1 - chr3R 22572530 3' + HMS-Beagle 206 2 58.22 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCGTACCGCAAAAATCCACTGCTTTTCGTTGCACATTTTTCTTTTTT:1 - chrX 9864932 3' - hobo 75 1 68.28 AACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAAAAATAACAACTGAACTTTAGATCATATTTTGCATTCTTGAACA:1 - chr3R 6583270 3' + I-element 5272 1 75.34 CGGTGAGCGAGATGAAGAAGGTCGTCGCGAACAAGTAGCTTGCCGAGATTGGTCTCAAAGTTCAGCCGAAGAAGAGCCAACGACCCAAAGTCCAGGTGTTCGACGTCGACATTTTCGATTTCAGCGAGCAGCAAATTCACAACTGT:1 - chr2R 12372042 3' + R1-2 151 1 76.03 GAATCGTGCATGCCATCCAAGGACGTCAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATAAAATTAAAAAAAAAACGTCATATAGATAATTTGTTTTCAAAACCTTCAAAAATATCAGAAAACCCGTTTAAATGACCGCC:1 - chrX 14903829 3' + Rt1a 5009 1 56.85 CCTCGGCCACAGGTTTGTAACTCCCACCCTATAATGTAATTCATATTGGGGAATGGTCGGAAGAGAGGTCTAGGCATGATTTTATTGTTAGGTTCTCCGAAAGACTCTGCTGAATTTTGGCAATTTCTTTTTTAAGCTGCTTTGGC:1 - chr3R 19448943 3' - accord2 6 2 66.44 GGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAAGCAAATAAATCCACCGACCCAAGGAA:1 + chr3R 7004450 3' - R1A1-element 5077 1 76.52 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAACACTTAGTTACACCGATATTAGTATGCAGTAGTTTACCCACTATTCGTGCTCCTCCGC:1 + chr3R 24760675 3' - pogo 12 1 75.91 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTAACGGAGTCCCGCCACAAAAAATCCGGAAATTTACGTACTATGCGAAAAGGTAC:1 + chr3L 13546682 3' + hobo 2909 1 63.70 CGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCATATTTTTGAATCTTAGGTAATATCTGGCTATATAGAGCA:1 + chr2L 21082198 3' - mdg3 5335 2 71.92 TATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCACGTTGGTATTGCACTCGGTGCGGCATTGTTTTTCGCATATGCTGACGCTGATTAGTCATACCAACAGAATGCA:1 + chr3R 24301929 3' + Tabor 439 2 54.79 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTGGGCA:1 + chr2R 24021673 3' + pogo 2056 1 54.79 AAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGTACCAACGAATTTATGTTTTCAGCCATAAATTGCCAAACATATACGCCCACCTGGGCGCCGCTTGTTTATGGCCAGCTTGGCCAGGTTGGCAAATAATGA:2 - chr2R 18927728 3' - 3S18 23 2 68.49 TAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATAGCTAAATGTGCTGAAATCGAAGAACCCCCGATTCTCATAACAAAGTGAAACAAATA:1 - chr3L 13475503 3' + HMS-Beagle 6981 2 64.38 GTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGTTGGGTGTTAAACTTTGCTATAGCCTCGTGGAAATTAAAGAAGCATAC:1 + chr2L 15096950 3' - jockey 4744 1 67.12 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGTCTGCAATATCTACCAGAACCCTGGTAGCCAAATATGGTGCAGATGCAGTTCCGTAAGTGACTGTGGTTAATTTATATG:1 - chr3R 19445486 3' + roo 9030 1 62.33 ACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCGGTGGGTAGCGGT:1 - chr3R 19537438 3' + hopper 1395 1 71.92 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCAAAAGGCATTTACACTTAACATTTTCGTAGTTATGTCTGATTGAAACAAGACATATATGAAGTG:1 + chr3L 22845990 3' + 297 347 2 56.16 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGAGGGGGTGTGTGTTTAAATGGCGCCTGGAGAATATCGATTAAATGCTCGTTTTTTCGGTTATTT:1 - chr3L 5731241 3' - 297 6631 2 54.79 TTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGCTGTAATTATATATATGTGTGCAACTGCTGCAAACTCTGTCTCCACTTGCAAATCTGCTGGTTTGTTATTTTAATTTGATGGCAGAGTTGTTCGGATA:1 + chr2L 7906005 3' + Quasimodo 7332 2 59.59 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTAATCATGTATAGTAAAATCATAGTACATAGTAAACCATTCTTTTCAACAGTGAAAACCCC:1 + chr2L 10843076 3' + I-element 5296 1 63.01 TAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGTATTTCTGTAGGTGGCTTGGTTTGTTTATTTTGTTGTGCACTGGCCGCAATTGAGAATTTCTATGGAAAATAGGACCAGTAACAGGAACAATGGACGAGAAA:1 - chrX 17508766 3' + Burdock 6376 2 75.34 CTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATACTTTATATAGTCGCAAACGCATGTTACATTCTTTTCAACGAATCTAGTATACCCCTTTACTCTACGAGTAA:1 - chr2R 5802020 3' - Quasimodo 47 2 54.79 CCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTTTTGGGAGGTTTCCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGTACCCGAAATGGTTAAAATCGGAATAAT:1 + chrX 22386823 3' - hobo 68 1 63.70 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAATATTTTATTTGTAAATAATTCGTTTAAATAGTAATCATGGGTGCTTTTTGCGC:1 + chrX 5938376 3' - pogo 63 1 63.01 TCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGCCATGTAAACGATGATGAGCACGATAATGATGGCATTTCAATGAGCTCACACACACACACACACATAGAGCCCCGAACACGAATTTTCCTCGCTTTTCCATCG:1 - chr2L 1327848 3' - opus 263 2 76.03 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTTGACTTCGCAGCGTAAAATAAGCAAGCTTATGCTACTTTGTTCTGTTATTTTTCGCGCTTTTCGCAGGGCTAATTAAGACGTTCGTCCTTGGAAACGGTAATCGTATATATCCTC:1 - chr2R 17872415 3' - Tirant 8112 2 78.08 GCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGATTTAATTTAATTTAATAGCCTAGAAAATTTTCCTTTTCAAGTCGTAAATTTTCGAAAAACATTTCAATTGGACTGCGGTCTGTGTGTGGCGCTGCGGCATTCGTTTTCATCAT:1 - chr3R 18087870 3' - F-element 499 1 72.60 CTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTAGGGCCTGGTAGTTAACCCCGTTTTCATGGCCGTCGCAGAACATTATTGTATGCAAATGAAAAGTGAAATGTCCAGAAAGT:1 + chr3R 10187902 3' + R1A1-element 20 1 58.22 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCCACTTCAGCTGGCTTGCACTCATTTCTGGGGCTTTTGCGCATTTCATGTGCTGCAATTATTTGGCGTGCCTCGATTAATTGGCATCAATTGAAAGCCGATTGTTGGAAGT:1 - chr2R 14767308 3' - Tirant 10 2 78.77 TCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGTAAATAAGGACTTAATCATTATATTCTTCAGTTAAAAGCATATGTAATATTTGGGGTCTGGAAAAAGTCAAATTGCCATTCTACGCTAAGTCTGTTGGGAATAGTGGAGTGGAGTCATAAACC:1 + chr3R 26349485 3' + mdg3 249 1 52.05 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAATTAATTAATTCCCAGCAGTCTTTTCTGAGCTCTTTCCAC:1 + chr3R 5684148 3' + pogo 2034 1 72.59