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HMS-Beagle2 294 2 67.33 AGTTAAGTGTCCATGAAGATTGAAAGATAAACACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAACCGCCGTTGGAAAAAACGAAACTGGCGACCACGG:1 - chr2R 17679484 5' - Max-element 408 1 67.33 TTATGGAATTACCACTGTATAAATTTGGAATATACATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 - chr3L 13356136 5' - hobo 2903 1 62.50 GGCTGGCGCCCGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:4 - chr2R 17348643 5' + jockey 9 1 71.29 AAAACGACGAAGACGATGGCACAACAAGAAAGGCAGAGGCGAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 + chr3R 28326431 5' + P-element 35 1 45.54 GCTACAGCTAGGGATTCAGTGCTGCTACCAACAGCAGTTGCAATGCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGA:1 + chr3R 8499409 5' - Tabor 453 2 53.47 AAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGCAAAAAGAATTCAACCGAATTCAACAGAACTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr3R 4604452 5' - 1360 3378 1 71.29 CTCATCAGTTGACACCTCATATCCTTGGAGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 1530388 5' - roo 394 1 62.38 CTGCGCTTATCGCGGCGATATTTGTGTCCCATGTTGTGTGGATTGTGCCGCCAAATGTTCCGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACTCACCAACAC:1 + chr2R 3037082 5' + I-element 4961 1 60.61 TCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAG:1 - chr3R 934258 5' - Rt1b 4752 1 55.45 CCAATGAAAAATTGGTTCTACACGCCATTCTCACTGCCAAGATGATAATGATTATTGGGATAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTA:1 - chrX 10296714 5' - Quasimodo 6963 2 60.40 CGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 + chr3R 4504085 5' - blood 7342 2 73.27 ATTCACAAATCGTTGGCACGCATCGGGCATTGTAGAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 12217360 5' - roo 358 2 70.30 AAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:4 + chrX 17492882 5' + Tirant 8135 2 54.46 GTCTGCAGAGTTTGGGCTCTATTACAGCTGCTTTGGGTGGAACAGGAGGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGG:1 - chr2R 11588990 5' - hobo 2681 1 52.48 TTTTCAAGAGAGCACGTTGCAAAGACGTTCAGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 - chrX 14953640 5' - P-element 2842 1 35.64 GACCAATAAAAGGAAACTCAGTTATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr3R 19515891 5' + 412 12 2 67.33 CTTGACTTACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:3 - chrX 21945947 5' + F-element 24 1 63.37 GAATGTCAAAGAGAGAATAACATTCGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 - chr2R 19164144 5' + P-element 51 1 34.65 GCACCGGTTCCAATTTCCTGTCAATACCTTCCGAACGGAACCTAAAGAAAGCCGGTATACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr2R 12247386 5' - hobo 2921 1 60.40 ATTTTGCGTAAATATTTATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAA:1 - chr2L 16379028 5' - HMS-Beagle 7029 2 66.34 ACAGTTTGGAATTGATAATATATTGTTGGTTATTGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAA:1 - 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I-element 5129 1 63.37 TATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chrX 5178850 5' + hobo 51 1 78.22 TAGAGAAAAGCTAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chrX 12866435 5' - hobo 2924 1 64.36 GATAGGTTTTCATTAGAGTTGTTCAGGCATTGATTGGTATTCTTTGGATATTCCTAATTGGAAATCTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 - chr3R 28333614 5' + pogo 5 1 73.47 ATCCTGATGGATATTTCTTGCAGTGTGCTCACATTATTCCCTTTTGCCATATAGTGCAAAATCTTGACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAA:1 - chr2R 17253124 5' - hobo 25 1 64.36 TTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTTGCCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTTAAGATAT:1 - chrY 917822 5' + 1360 477 1 80.20 CTCCAGCGAGTGGTGAATGGGGCGACTTTTGCGATTCACAAATCGTTGGCACGCATCGGGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 27705355 5' - roo 392 2 59.41 AAAACTAGTTCTTGTTCAAGTGGTTTTTCAAAGATTAAATCTGCCGAAGACAGGTTATAAAATATAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chr3L 21410177 5' - opus 7494 2 70.30 CAACCGTCTTAAATTGAAATAGAGGTCAGTTCATCTTCAAATCTCGCTTTATGATTCTTCATTTGGATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 + chr3L 10305294 5' - 412 7539 2 71.29 TACCAGCAAACTGATTTATATAGTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTA:1 - chrX 21564136 5' + invader4 56 2 77.23 GAGAATACTGAGGAGTAGCTTGGAAGCACTGATTGCCTCGTCTTCTGTAGTTATTGCCAGGCCTACTATTTCAACGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACCTC:1 - chrX 19820788 5' - Rt1b 4978 1 79.21 GCGAAGTAGGCAATGGACAGACTCACTAACTTGTGTCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chr3R 11183335 5' + hobo 38 1 61.39 ATTGAAGCTATTCCTACTTTATAATGAATAAGTGTTATTTCTTGTTAATGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATT:1 + chr3R 3121108 5' - accord2 7304 1 52.48 CGGGCCATTCCGTTTATGCGGGCCGAGTGTGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACA:1 - chr2L 10119492 5' + flea 42 2 70.30 TACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 19450169 5' + roo 8702 2 66.34 TAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCTCTCAAATCTCTTTTT:1 + chr2L 23295812 5' - micropia 5390 2 71.29 AACTTTTCACATCAACTTCTTTGGTGGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chr3L 10576807 5' - roo 9027 1 76.60 CGTGCATAATACAAATAAATCAAACCCAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTT:2 + chr2R 2144957 5' + Stalker2 51 2 71.29 AGTGCACCCATTTGGCTGCCATGGATTAAAACGAACCGCCGCTGATAAACGCACCCAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGAGTTCGACTA:1 - chr3L 27728831 5' + I-element 4934 1 61.39 AAGGCAACTAAAAGATGTGTCTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:2 + chrX 5130963 5' + I-element 7 1 72.28 GTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACT:3 - chr3L 23678148 5' + Osvaldo 25 1 77.23 CGAATTGAGTGTGCCTGTGGTAAGGAAAGGGGTGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 + chr3L 18796144 5' - P-element 2845 1 33.66 GCACAAAGCGCCGCGGTTAAAGTGGAATGACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr2L 11073779 5' + roo 46 2 72.28 ATACACTTGTACTTTAACATTTCATCGACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCT:1 + chr3R 26698242 5' + HMS-Beagle2 6997 2 77.23 AATTGAATTAATTATCATTGCATGAATTTAAAAATATGCTGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGAT:1 - chrX 9816348 5' - BS 5085 1 68.32 AGCCTGCGTGGCATATATGTTTATCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCCCTATATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGT:1 - chr2R 4287885 5' - rover 7276 2 57.43 ATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:2 + chr3R 9616604 5' - roo 356 2 76.24 ATGTGTAGAAAACCAGGTCCTGTATGCCCTTAGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGT:1 - chr2L 17213907 5' + hobo 44 1 65.35 TAAAGCTGTTTTCCATCTCTGAAATTGTATCTTTTATCTTGTATCTGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGT:1 + chr2L 2790158 5' - accord 213 2 55.45 GCAATAATAAGAAATTTTAGTAAACGGCTAAGTACTAAAAATAAAGTACGGGTATTTACTTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr3R 6104461 5' + pogo 14 1 63.37 TATAAGCCGCTTAAAGCGTTATTCGTGACACATCCCTACACAACACAACACCCTACACATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGG:1 + chr2R 10166267 5' + Idefix 129 2 63.37 AAGTATTTAGGTAAACTTTTCCATTTGTAATATTTCTGTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr3R 2556101 5' + 412 7093 2 64.36 AACGGCGCAAAAGTTTCAATTGTCGGGCGCCGCTGGGAGCCAATTCTCGAGGATTGAGAAGATCAGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr3L 12025685 5' + blood 7023 2 67.33 CGGGTAAGGAGTTAGAAGTTATGAAAAAGTACATTGACTTCGCTGACACTTGTCAGCGGCACTTGTAACTTGTAAGCAAAGATAAAGGGTGCCTTGTTCGC:2 - chrX 19820355 5' - 3S18 5793 2 54.46 GAAACGTAAGTCAACCACCCCAGAAAGAAATGAGAACAAATGCCTCATATAACCAGAATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGAT:1 + chr2L 22780837 5' - HMS-Beagle2 294 2 61.39 TTATGACCACTTCAAAAGCACGTTTAAGCCAAAGGGATGCACACTTAATGCATGTTAAAATTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chrX 12166500 5' + pogo 13 1 66.34 CGGATCTGAACAAGCCATGCATTGTAAGTTCATTAGCGGCCCAAGTGCACGATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAA:1 - chr3L 19172885 5' + transib2 33 1 56.44 GTTTTGGTTTGGAAACCTCATTAGTTTGACATTCCAATATGTCAGATTGTGGCTACTGGCAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTTCTTTCTTAATAAAT:1 + chr2L 15194682 5' - copia 238 1 61.39 CACCAACCTTACTCGTTGAATGTCAAAGAGAGAATAACATTCGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chr2R 19164161 5' + P-element 34 1 51.49 CCGCCCCTGGGAAAATCAAAGGATATTCAGGCGGAACAATGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 16569478 5' + roo 35 2 62.38 GTTTTAAATAGTATGTATGTTTAACAAATTGGTTTAAAAATGCATTTATCATAATATATAATTCTAGCTTTATGTATGTTTATTTATTTAAATTAATAATA:1 + chr3L 6989395 5' - 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roo 389 2 60.40 TTCGCTTTATTTATTTGGAAATCTTTTCTTATTCCGTTCTTCTCTACCCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGT:1 + chrX 5168228 5' - hobo 189 1 78.38 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCT:4 - chrX 706056 5' - Juan 14 1 77.23 TTGGCTAGTTGGCTCTCTCGCTTCGAACCTGTTTGCTGGTCGCCTTTAGATTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chr3L 14205326 5' - P-element 2863 1 55.45 CAACACAAATATTAGCAATGCCATAAAACAATAAACCCGAACGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr3L 18642244 5' - pogo 2069 1 60.40 TCTCCTCCAGCCCTCCTGTTGTTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2L 11073808 5' - roo 9014 2 79.21 ATACCCTGTGAATATTTTGTACATCTAAGTAAAGACATGTGTAGTATGTGCATGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:2 + chrX 6162152 5' + blood 41 2 64.36 AAAAAACCCACGCACACATCTCAAAAAATGTGTAATTTCATATATATAACTCACGCAAATCTCCACATCTATACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAG:1 - chrX 11960969 5' + INE-1 547 1 76.24 ATGTTATTTGAATCTTCTAGTTCCCATCCTGTAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTTGACTAGGACACACAAACATAGCCCACCAACACTACCTA:1 - chr4 140481 5' + I-element 4967 1 68.32 GTGGGCGGCAATAGTGAAAAGAGAAAGAGAGCGGCGGCATAATTTCCCTGACTACCAGAAATTAAGTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCG:1 + chr2L 16536112 5' + Doc 361 1 68.32 GCACTTTCGCCACCACACACACGCACACATAGTCGCAAGTAAGAAAAACAGGCATCTTTGCTTCCCACTTTATCTCCTGAGTTTGTTGTTGTTGTTGTTTT:1 - chr3R 6392800 5' - gypsy9 458 1 81.19 GTTTACTCTTGTTTTGTTTCTAGATTATTTGTATACTTTTGTTTTCGGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:2 - chr2L 8898963 5' - roo 397 1 68.32 CAATTATAAGAAAACTGAACTTAAAACTGGACATGTTTTTGAAACATATACTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr3L 18206822 5' + pogo 19 1 59.79 AATAGTTTTGAAAATTGGGATTTAACAATGGCAACCGGAGGCATATCACCAACCTTTTCTGGAATTGGGTGAAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGC:1 - chr3L 25840675 5' + McClintock 8 2 77.23 AAGCAAGAAAAAGAAAAACAATTTTGGGGGTACCACATAAAACAAAATATACCTCGTGTTGATTCTTTCAAATCCGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTT:1 - chrX 17490877 5' + rover 297 2 58.42 GTTCCCAGTCACTGTTGTAGGATAATTTAATTTTACCCCAGAAAAGAAAATAATATACGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - 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roo 401 1 70.71 TTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2L 1530421 5' - roo 9024 2 73.27 TTCAGATCAACTATCAATATATCACATGACCATCTCCTTACCTCCACGAAGTAGTAATGAAAACGGTGAGTTTTGAAACTATTTTTGTTTTTTTTTTTCTT:1 - chrX 8666724 5' - Doc2-element 248 6 38.61 ATTTACAGATTTTATTGAACACACATCTTCTACGGAATAATACATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATT:1 - chr2L 9284428 5' - flea 4982 2 58.42 CTGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chr3R 11080688 5' + I-element 28 1 53.00 AATGAGTTAACACGCGCAAGTCCTCTTTGCGCACGCACCGTTACCGTTCGACCCTGTTTGCCCTTGGCCCGCTGAAGTCCAAGGTCCAGAGCGATACCGTT:1 + chr3L 24568120 5' - gypsy8 4834 2 77.23 TGTAAAAATTTATGCCAAGACGGATCATTTATATGGGGTATGCTCGCTCGATTGGCAGGACATGGACGTGGAAGTGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCA:1 - chrX 7670797 5' + Rt1a 4966 1 75.25 TTTTGACCTCAGTTAATGACAAAAATCTTTCTTTTACTGGCCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTG:1 + chr3R 2472645 5' - 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chr2R 12998378 5' + roo 8684 2 59.41 TCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3L 3535449 5' - roo 9040 1 56.44 AATTAGGAGAGAGTTTTTAGTGTGGAGGGGCAGTGACCATTTGGCTGGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATATAGCTAGCGACTTAGTTGCAGTCGGGCTGA:1 + chrX 1626495 5' - gypsy4 65 2 73.27 CTCTTTTGCTAAAAACTAAATGCAAAAAAAAAATAAGTTTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr3L 4909392 5' + hobo 8 1 60.81 GAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGG:2 - chr3L 23678154 5' + Osvaldo 16 2 72.45 AAGATCATGATTTTTCACAAAACCAACGGCTACATAGTCGCTACACACATCACGAATCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAGCTTAGAATAAGATTTGAA:1 + chrX 13643806 5' + Doc3-element 4656 1 57.43 CTCATTTGGAACGAAATTGGCCTGATTAGCGGAAATTGGCCTTGCAGGATTCGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCATAGTAGATTCACTAGAAACTATATACC:1 - chr2R 6282523 5' + Cr1a 4119 1 53.47 CATCTGCGTAACCCTTTAACAAAACCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3L 4087225 5' + roo 51 2 79.21 GTGCACTGCTTTTGATTTCTTTCAATAGCTTTTTGATTTTCTCACTTTTTTTTGCGCTTTCCATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1 - chrX 7608245 5' - jockey 4975 1 59.41 AACAAAACAAAAAAATAAAACACAAAAGTTAAAAATTTTACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGAC:1 + chr2R 21451708 5' + I-element 174 1 69.31 CACGGTTTTGCCGTTTCAAGGGAATCGAAATATTACTTATAATGCAAGACACCTATTCCTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTT:1 + chr2R 14518818 5' - G2 2821 1 60.40 GAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTA:1 + chrX 9816284 5' + BS 5046 1 83.17 TCATCAGTTGACACCTCATATCCTTGGAGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2L 1530389 5' - roo 393 1 61.39 TATTTTGTACATCTAAGTAAAGACATGTGTAGTATGTGCATGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:2 + chrX 6162164 5' + blood 7064 2 76.24 CTTTTTGTTTTCTTTGCTAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTACGTAATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATC:1 + chr2R 17262449 5' + Stalker4 6955 2 48.48 TATGCTTTGGCTTTGCCGTGTGTGTGGCTGAGCTCTGCCATTGGGTGCGTGGGATGAGCGGGTTGTCATAAATGGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGGGG:1 - chr3L 24059035 5' + invader4 2919 2 61.39 CCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTG:1 + chr2R 5617508 5' - invader1 3984 2 58.42 ATTGACTTACATTTCCAAATCTTAGGTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2R 12998292 5' - roo 9045 1 51.49 ACAGCGGGGAAAGGTGGCAATTGAAAGAAAGTGCCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGG:1 - chr3L 3070704 5' + 1360 41 1 67.33 ATGTAATTTTATAAGGAATATACATAGTGACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 - chr3L 27395482 5' + Transpac 4964 2 70.30 TTAGCACTGAATTCAGTATTCGATCTGACCGATATGCTGTGCTGGCAATTGAGTTTATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCGCTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 - chr3R 10876370 5' - opus 483 2 64.36 AACTTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGA:1 + chr2L 23286582 5' + Tirant 414 1 57.43 TGCGCTGCTTTTTGGTTTACCCTTCTTGATTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACAAATTGTTGATAATAGTGGTTCCGAGGAATCAATCGCT:1 + chr3L 6683782 5' - transib2 2384 1 71.29 GCGGCAGTAGAGATTTTAGTTAATATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chr3R 6138307 5' + 297 45 2 76.24 AAACTTGTGCCTTTTCTCCCCTACAATGGGATGAACCTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 + chrX 22664363 5' + opus 36 4 62.38 ATATAACATATTAAATGTCTATTAATTCAATTGTTGATGCAGATGAGGCTTGCCATGGTCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGAT:1 - chr2R 16937401 5' + pogo 1648 1 69.31 CCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACAT:1 - chr3R 15790067 5' + flea 4743 1 66.34 CCGAGATTGGAGGGGAATGCTACGAATAAAATTTCATTAAATACACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr2L 12888808 5' - 412 461 2 63.37 AATCTAATCGCTGGGTAATTTCAAAGATGTACATACACATATATTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACA:1 - chrX 14121211 5' - F-element 4643 1 60.40 TTTTTTTTGGCCGAGTGGCATATTGGATTTCTCTGTGTATATTCTAGTTCCGAAAATACCATGGAGCTCCAGTAATGATTCTCAGAATCCTAGACTGTGCT:1 - chr3R 2999480 5' - Doc3-element 4383 1 71.29 TTGTTGGCAGATTTTCCGCCTGCCATACATACGTACATAATAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 12243849 5' + Rt1a 5070 1 74.55 GATTCAAAATTAGCAAAATAGGTTCAAAACAATACTGGCTATGCATAACTTTCCTAGCTAATTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATAC:1 + chr3R 21710539 5' - mdg3 232 2 64.36 CGAGGGTACCTCAAGTCGACACACACTTTTTCAAAGTGACACAACTCTTTTGACGGACAAGCTGCAAACTGATATATGCATTTTATTAGTTCAAGTATTTT:1 + chr3R 30255569 5' - G7 1162 1 42.57 CTAGACCCAGCAGCCATGATAGGGTATATATATTCATGATCAGGATCAATCCCGTCGTCCGTCGGGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAATGTTGAGATT:1 + chr3R 4376497 5' + INE-1 164 1 77.23 CTGCCCGCTAACTGTTAAGAAAATAATAGCAAAACACCGGGCCAAGAGATAAAATCGCCATTACTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chrX 17581326 5' - roo 397 1 67.33 GCTCAAGACTTACATAACTAGCTAAATTGGGAAATTTCGGGTATTCGGGGCTGGGCTCTATGGACGGCACAGCAGTTATACTCGGATATGGTTTTCGGAGA:1 - chr3R 11048277 5' - Ivk 357 1 55.45 CGCTGCTTCGCCACTCCTTGAAAACCAGTTGCCACAAAGGAAAAGAAGCCCACAATAACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 - chr3L 12229433 5' - mdg1 7442 2 61.39 ACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACGTTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTG:1 + chr3L 26371358 5' + Tabor 54 2 80.20 AATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCGCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 + chrX 17492897 5' + Tirant 8150 2 67.33 AATGTTTCGTTCCCACAAGCCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3R 16398982 5' - roo 9016 2 77.23 ATCAGTTGACACCTCATATCCTTGGAGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2L 1530391 5' - roo 9054 2 59.41 GTGCTGGGGAATAATGAGTTTACGTAACACAAAGTACATATACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAGTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3L 4539223 5' + roo 33 2 61.39 CAGCCTTTCGTAATTGCAGCTTGTCAAGAGATCTCACTCTCTTTTTTGACTCAGCTTCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTCTAGCTTGT:1 - chr2R 652576 5' - I-element 408 1 57.43 GTCTTTTTAAAATATCGCTCTACTCACAAATTTGTACTTAAGAAGCGTCGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chrY 131421 5' + Doc 32 1 50.50 CTTTTGCGATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAATAATAATAAACAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 8037617 5' + roo 24 2 56.44 CTGCCGGCGGTCATAAATGTAAATAGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACGCCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chrX 7019236 5' + hobo 50 1 77.23 AAATTTAAGGAATATGCAGTGGATATTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 - chr2R 12007258 5' + mdg3 5304 2 75.25 AGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGC:1 - chr2R 17402773 5' - invader4 284 2 70.71 CAGGCATTGATTGGTATTCTTTGGATATTCCTAATTGGAAATCTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr3R 28333591 5' + pogo 31 1 59.41 TACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTT:1 - chr2L 16379010 5' - HMS-Beagle 215 2 57.43 GGTTGCGTTGACTTTTGACTTGCCACGAGCCGGAAGTGCGACATTATTCTGAGTGTTAACATATTCAACAATTATTTCATTTTTGTTAATTTTGTCCCTTA:1 + chrX 9643234 5' + frogger 349 1 64.36 CCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:2 + chr3L 8044332 5' - mdg1 7409 2 73.27 TTTAAGTTGGTAGGTGTTTTGTAGTCTAAACTTTTGCCTCGATTTTATATATATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 - chr3L 14854771 5' - mdg3 224 2 57.43 ATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTG:1 - chr2R 1005988 5' + invader2 53 2 80.20 TCTATATGAAAAAGAAAATTAAGTAAATGATTTATTAATGCAGAAACTATTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 21581106 5' + roo 28 2 61.39 CGCCCACTCTCTCATGTACTTATTCACCACCCACCCACTTATGCACACACAAGCACTCAATCTGTACAGTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGA:1 - chr2R 9258681 5' - blood 369 2 70.30 CTGGCATGACTGATAAATGGTTTGGGGCAGCCACAGGATGGCGGCAGGACTAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTG:1 - chr2L 10831265 5' - Quasimodo 7046 2 56.44 CAGCAATTCCAACGCCATAAAGTATGCCATAAAAAGCCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr3R 30326354 5' + pogo 37 1 67.33 GTGGCCCCACTCAAATTGGAAGCCCAAATATGAAGTCGAAAAGTGTGTGTTGTATGTGTTTAAAAGGGTTTGGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr2R 16384273 5' - roo 407 1 77.23 GTACAATTGGGTGGTGTGACCAGAAAAATTGAAGGGATAGAAGGGCAGTTGAACGATAGAATAAATAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATG:1 - chr2R 649394 5' + Bica 4870 1 72.28 TGCATAAAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chrX 10196087 5' + 297 6608 2 58.42 AATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 - chrX 21668076 5' + Tabor 6864 2 51.58 TCCTTTATTTTGTGATGGTTTAACAACAAACTCGCATAAAGCAGACAGGCGGACCAGTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTT:2 + chr2L 19681401 5' - hopper 1393 1 51.49 ACAATCAAAAATCCAGAGCTTAACTTAGAAAGCATAGCCAAAATATTAAAAGTTCTTCTAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAGAAGTATCTCCA:1 + chr2R 993936 5' + mdg3 5131 1 72.00 AGCGTGCTGCGAAAACTAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 - chr2R 1725958 5' + Doc 14 1 70.71 CATTCTGCTGCAGCTTACAGTTATCAATCAAATACCCACCTGTTGATATGAACTCCATCCATCAATCAAAATGCTATATAATTCTCCCTATCATTTTTAGG:1 - chr2R 20423568 5' + jockey 4869 1 74.26 GCAAATAATAATGTCGTCGCTTAAGAGGATCTATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr3R 7102477 5' + pogo 41 1 69.31 AATTTCATTTCATTTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chrX 12866519 5' + hobo 31 1 59.41 ACTTACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chrX 21945943 5' + F-element 26 1 60.61 TAAACTGTTTATGGAACGGATCAACAATGTGCTCTTAAGAAATTCAATCAAATATATTTCCCGAAATTAAAAACGCGCGG:1 + chr3R 15129835 5' - Max-element 8473 2 71.25 CTGGCGCCCGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2R 17348641 5' + jockey 10 1 70.00 AATGCACTAGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTT:1 - chr2R 4261976 5' - invader4 276 2 64.36 AACCACTTTTCTTTAAGCACCCGGTTGGAAAAACAACAAAGATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 23870079 5' + roo 34 2 67.33 TGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAGCAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 + chr3R 15130489 5' + Max-element 8288 2 77.23 TGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAG:1 - chr3R 934250 5' - Rt1b 4744 1 47.52 GCAGGGTCTTGGAGTAGTGCTTGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGA:1 - chr2R 2144984 5' - Stalker2 356 2 72.00 ATGTTTTAGTTGGTATTTCCCTGCATGGGCTTTGCGATAATGTTAATGAGAAATGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3R 7102398 5' - pogo 2085 1 58.42 TCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTT:1 - chr2L 16378999 5' - HMS-Beagle 7001 2 68.00 TAACTTGAAAATGCCAAATCAAATAACTCACACATTCGCACGGCTACAAGCACACTGGGAAATATCTTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGT:1 - chr3R 21590543 5' + Bari1 1707 1 71.29 AAATTCCCCAATATATTGCCACTTAAATCTGGGCCAGTTTGGTTTATTATTGTACTGGCACGCGATGTCATTAGAAATAATAATAAATAATAAAATAATGA:1 + chr2L 2917933 5' - INE-1 415 1 71.29 GTCCAAAGGCAACTGGCAAGAATGCTTTTAAATTTGACACACACACCGCACACACACACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3L 17691406 5' - 1360 3370 1 58.42 ACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTCGCCTTAGATAACAAAATC:1 + chr3R 19449994 5' - roo 8761 2 74.32 CAATACATTCTAACTCTGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:2 - chr3L 14504292 5' + 297 6616 2 62.38 ATCACTACTGAGCCCAAGCCGGACTTTCCCAACCTATGTGCCTTGGTTGTACATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 - chr3L 14558339 5' - 297 6957 2 61.39 CGTCCAACCCAAAACAAATAAATTATCATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 + chr2R 22825425 5' - opus 450 2 76.24 TCGGGCGCCGCTGGGAGCCAATTCTCGAGGATTGAGAAGATCAGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3L 12025663 5' + blood 34 2 58.42 CACTAACTGAGTAGCTGCCAGTTAAGGAGCTCGTATATAAATATATATGTCGAAGAGTCAGGAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTC:1 + chr3L 18122303 5' - invader1 3988 2 53.26 CTTTCGTTCGCGGACATTTTGTCTAGCACTTGCATCCTTTTGTGCTCCATTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 + chr3R 19513348 5' - jockey 4974 1 51.49 TTCTATACTGATATTTAATAATTTGCCATGGCATTTTATCAAGTTTACCCCAAGTTTTAACCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAA:1 - chrX 12885787 5' - transib2 2810 1 65.35 AATACCCAGTTTGCTCTCTCTCTCTTTCGCTCGCACACTAAGTATGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:3 + chr3L 3070646 5' - 1360 3357 1 58.42 CTTCCATATTTTACTGCATACTTCTAGGCTGGTTGAAAAGTAAAGTTTGAACTGCATTCACACACTTATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr2R 13934366 5' + jockey 12 1 75.76 TTGAGGATGAAGTAAAAAATGCTAAACGCATTGTTAGTAGAGACGCTCAGTTGCAAAACCAGCTGGAGCTGCAACGCATAAATGAGAGACGACTACTGGCC:1 + chr2R 1368069 5' + rooA 7200 1 61.39 CCACCTCGGCTGGCCACTGACCCCACTGACCCTTACGACACGTCAGATCCTCTTTGCGCACGCACCGTTACCGTGAGGACAGAGGAGAACGGAGAAGGATA:1 + chr3L 26023459 5' + gypsy8 4473 1 73.27 AACACCGACCCAGCAACGAAAAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAGATACATTTATTATA:1 - chrY 3288292 5' - accord2 107 1 81.19 TTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTT:1 - chr2R 22746080 5' - hobo 2888 1 72.28 GGATGGTAATGTGTGTGTGCGAATGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAA:1 + chrX 7499917 5' + invader2 4745 1 77.23 TTTTAATCCGATTTTATTTGGATTTGGATGTGTTATGTGTATGTGTGTTGACTTTAATTGTCTTTGCATTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTCACTCTTGGA:1 + chrX 16522981 5' - Idefix 337 2 55.45 AAACATTCCACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:2 - chrX 22664435 5' - opus 472 2 57.43 GGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:4 + chr3R 11080691 5' + I-element 32 1 56.44 AGAGGCTGGGTAGATCGCGACATTTAATGGAGAAAACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCCTCGACATATACATATGTGTGCAGAA:1 - chr3L 27392321 5' - Stalker4 7194 6 66.34 GGGGCTAATAAAGATACCACAATAGAGGTACAACAGGTAAGATGAAAACCAAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTA:1 - chr3R 25215009 5' + Burdock 17 2 62.38 AAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:2 + chr3R 11080680 5' + I-element 21 1 57.43 GAAGCGACCGACGACCCTTTTTTATTTTCCTCGCTTTTCCCTCAGCCGCCTTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCC:1 - chrX 7458691 5' - micropia 254 2 55.45 AATTGATATATGACAGATAAAGTGAGAAGATTTTCACTTTTTACTACCAGTCCTTTTTATTCCCCTTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAA:1 + chr2R 25216517 5' - 3S18 6093 2 69.31 AAAATAAAATGCAAGTCGGGTAATGAGGAAAATGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr2L 13868715 5' - roo 366 1 67.33 CTCCATTGCAATGTAATGATATCTGAGAGATATCTGTGAACAAATGCAAGAAATGCTGTACGAATAATATACATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGG:1 - chrX 5170458 5' + hobo 2558 1 75.25 ATTGCATTCAATATTTCTTTGTACTGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTT:1 - chr3R 17615990 5' - HMS-Beagle 6994 2 75.25 AGATTTTCCATTTACTTCCTTCATCATTTTCATATTCCATTATTCGGTGTTTGTTTTTGTAGGAGAACACCGACCTTTTACAATTAGGTCCCAAACTGAAC:1 + chr2L 18899918 5' - Idefix 476 2 64.36 GAAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTC:1 + chr2R 17402700 5' + invader4 2776 2 62.38 GCTATCTGAAAAGTGGACTAGTGACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr3L 14286079 5' + 412 21 2 58.42 GGTTCTCGTTGTAAATACCAGCAAACTGATTTATATAGTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAAT:1 - chrX 21564151 5' + invader4 2800 2 62.38 ATGCCAAATGGGTGGGGAATGGGTGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 - chr3L 18793048 5' - P-element 2836 1 28.71 CTTCGTATAACTGAAATGAATCCATTCTTTCTCTCTTAAGACAAATACAGCATCTGAGATAAGTGAGTGAGTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 + chrX 9649877 5' + blood 7 2 73.27 CGCTTAATTTCTTTGGGGGATTGCTGGCCAACGCGGCGGATGCGTAACAATCTTGTTGCCGCCACTCACTCACTTAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chr2R 15781384 5' + jockey 8 1 77.23 ACTTTTACTTTACACACTACAAGTGTTTAAGTTGTTTGGGCGGTTTTGGGGCGTTGGAGAGCGCAAAACTATTTTAGCAAATCGATAGAAATTTACAAGA:1 - chr2R 2856404 5' - INE-1 302 1 66.00 AGATGCTTTGTGTGGGTCGTCTGCCGCATTTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGAT:1 - chr2L 19623135 5' + Burdock 46 2 72.28 AAAGCCGCAAAAAGGTAAAGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:2 + chr3R 13995953 5' - 1360 3335 1 85.15 TGATAGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - chr3L 22231382 5' + Doc 36 1 64.36 GCATAAGCCATCGGGAAAATGCCTAAAATTATGCCACAGCCCGAGCAAGAAGCTCACACATCTTGTACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAG:2 + chrX 4248796 5' + jockey 4615 1 65.35 AATGACAATATTGAGTTTTAACAAATATTATATTTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGA:1 + chr4 299925 5' + 17.6 7174 2 67.33 CAGCGTGTTCGCTCACCATCTACCTCTCTTTTCAAGAGAGCACGTTGCAAAGACGTTCAGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chrX 14953668 5' - P-element 2870 1 63.37 CAATTATTAGAACCCCAACTTCTTGGTGACAATAACAAATTCGTCCGATGTAAAAAATTTAACAACAAAAACAGCAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCC:1 - chrX 22000014 5' + I-element 152 1 63.37 TTTCTGGCAGCCGCCTTTGTGGGATATACATATAAAAAACCAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCTTTACTCAGCTAATGTGA:1 + chrX 10445557 5' - INE-1 538 1 78.22 AATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGCAACGTGATACGTGTGTTCTAGAAAATTCACATGTAGCAAAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chr3L 23746964 5' + Tirant 6 2 73.27 CGCGCTTTTTTGCAGCAGAAATTAAATGGAGGATTAACAATTTGTCTTAATACTTTTGATTGGTAGCGTTGTAGAATCTTAATATTTAAGTTGCTGGCAGT:1 + chr3R 28382664 5' - G4 3456 1 71.29 TAAAGAAATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACAC:1 - chr3L 27395599 5' + invader4 165 2 66.34 TGCTGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCG:1 - chrX 9816312 5' - BS 5049 1 64.36 CTTTTCTAATTAGAAGTATTTTAATTTAACTTTTGAAAAAAGTGATGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr2R 22751145 5' + Doc 32 1 52.04 ATATGTTGGCGACACTCGAATGGGCGAGTTGCAGTTGCACCAGCAGTTGGACTCGTGATTACTTTGACATCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3R 11478485 5' - roo 403 1 72.28 CAACGAGAAAAATGAAAAAAATGCAGCTCGAGTCGAGTAATAACAATAACAACCCAAATTACGCGCCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAAT:1 - chrX 8916672 5' + invader4 3054 2 68.32 GTCGTAGATTGGGCATTGATTGTTTTCAATACCGCAACAATAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACA:1 + chr2L 19683196 5' + hopper2 1293 1 57.43 TCTTAATTGAAAATTAACAGCCACAGAACAGATGTCATTGTGGTTTTGGTCTGATAGCGTCTGCCAATTGGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATT:1 + chr3R 24509090 5' - HMS-Beagle 7039 2 74.26 TCACTCTATCTCCCTATGTGTGCCTAAGTGTTGCGTGTGTGTGTGCGATTCGTACCAATCTATTAATACGAATCCCTCACACACATGCGATTACCTCAAAC:1 - chrX 12660122 5' + I-element 4878 1 49.50 ATACGACCGCGTCGGACGAACAAACTTGACAGCGCCAAGTTCCGATAGCGACTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr3R 23669603 5' - P-element 2864 1 54.46 AACCCTACACGGGGACACGACATCACGGAGCGCCACACAGGCGTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTA:2 + chr3L 13652177 5' - mdg3 212 2 58.42 TATTCATTTAATTTTAAAATCATATAAATTTTAAAAGAGGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chrX 11300034 5' - roo 9034 1 66.34 TTGCGGCTGCTGTTGTTACTGCTACCTCTGCGGTGTTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGCTTTTG:1 + chr2L 21024065 5' - I-element 84 1 67.33 TGTTTCCCTCAATTTTGTGTAGCATATTTTTTGGCATATTTGCGCGCTTGTATGTACCAAGCACTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr2L 19616714 5' + jockey 17 1 58.00 ATATTGGCTTTGGGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGAT:1 + chr2R 17942097 5' - mdg3 5456 2 66.34 TACGTGTAGTTTTATCCTTGTGCCAGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:2 + chr2R 14135421 5' - roo 9020 2 75.25 AGGATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGA:1 + chr2L 22092963 5' + INE-1 544 1 53.47 AGCCAAAGGCAATTTTTTTAATAAAATTAAAGTTGAAGCGGACTCCTTATAAAGGTTACCATGTTTATGCACGCAGTTAGACCAGGGCAGATGTAACATG:1 - chr3R 2553616 5' + 412 7159 2 63.00 ATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTG:1 - chr2R 5531188 5' + 1360 73 1 54.46 TTGCGCCGCAGCTTCCGCGTGGTTAATTTGTATTGCAATGTTTGTTTATTTGCTTATCAGTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACA:1 - chr2L 19935764 5' + 297 358 2 64.36 TACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCCATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 + chr3L 8044324 5' - mdg1 7417 2 63.37 TAAGCTAATGAATTAGCGGAAATGCCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGC:1 - chrX 13794905 5' + FB 53 1 77.23 AATCAATATTAAAAGACTTACTTTCTGAAGTGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCA:1 - chr2R 2770526 5' + 1360 482 1 71.29 CGTCTTTGTCAATTTGTTTAACTCAAATGTATAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 + chr2L 21777928 5' - mdg1 7417 2 70.30 AGGTGCTTTGTTTTAGGGCAGCAAAAAGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 13167335 5' - roo 9025 2 72.28 GCCGTTTAAAAGCCCTGGTTATTAGACTAATGTCGAACTTAAAATCCAATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 + chr2R 20593337 5' - copia 228 1 52.48 TAAACGATGATGAAGAAAAGACCAAAAGATTACGAACGTTGAACGCTGAGCACAAAAGGGAGAGACAAATGGTTGAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTG:1 - chrX 5178686 5' - hobo 1 1 79.21 GTATAAGGTTTTTCAAGTAAACTTAAAAATTAAATAGAAAATGTATAGAAATTATTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chrX 3213897 5' + pogo 18 1 55.45 CGCAAAGAAGAATTAGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCAC:1 - chr3L 24210995 5' + HMS-Beagle2 8 2 69.00 TTTGTCTATTTTCTTTTGATATATTAGATATTCGCTGGAGATCTTTTGGTTGTGTTGTTTTCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACTCGACTATA:1 - chr2R 3931677 5' + INE-1 565 1 64.36 CTGCGCCTTTTCGGCGAAATTGCTGTTCTACGTTTTGCTTTTGTGTGCTCAAAATGCTGACCAGAGGTCTGCATAGTCTCCGCTGCCATTAACGCCAACGA:1 + chr2R 7779843 5' + HMS-Beagle 6848 2 56.44 CCAAATGCTGAGCGACAGGCGGAGAAAAGGGGGTCTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 - 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chr3L 3535442 5' - roo 9033 1 63.37 TTTTGCGAAAAATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:2 + chr3R 13620267 5' + Doc 36 1 61.39 TGTTCCGAGGCACAAACATTCCACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chrX 22664448 5' - opus 7488 2 66.34 TGTGTCATCAGCCGGACGGCGGACAGGAAAGCCCAAAACCCGTATAATCAAAATCATGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACATAACA:1 + chrX 16505700 5' + I-element 115 1 68.32 ATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGT:1 + chr3L 27356120 5' - Tc3 1624 1 79.21 CGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chrX 17492889 5' + Tirant 8141 2 61.00 CAAAACTCTAGTTTATTTGTTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACTGAGGGGCT:1 - chrX 7685279 5' - Cr1a 4416 1 77.92 TCGGGAGAAGAGCTAAGCTTTGCTGAAGAACGTAGGGTTATCTTAAGAGATATAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGCGTCGGTCATC:1 - chrX 22576491 5' + Burdock 149 2 78.22 ATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - 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INE-1 580 1 79.21 TTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:3 + chrX 5168856 5' + hobo 42 1 63.37 AGCGTTTCCGACCATATAAAGTATTTGTATATACTTTTGATCAATAGCCGAGTCGATCGGGAAATGTCCGTCTATCGGTATGAACGTTGAGATCTGAGGAA:1 + chr2L 22758839 5' + INE-1 139 1 94.06 GTGGTATTTGTCATTCCATAAAATGGGGTGAGCTTGAACTGACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:2 + chr3L 26315773 5' + Tabor 13 2 66.34 GTACGGCAAGAACCGACGATAAAATTCTAGTTGCCCACCATAACATTCAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTG:1 + chr3R 19449548 5' - roo 8660 1 52.48 ATCTGAGGGGTTTTAGGGGCCTGCAGGGGGTTAAGGGTTAGATGTTAGGTGTTAAGTGTTAAGTGTTAAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 - chrX 3333495 5' + pogo 5 1 63.37 ATTACATTTCGTGCGATTCTCACGAATACTGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chrX 11503539 5' + roo 8690 2 56.44 ACTTTTCTGAGCAGGGTCTCCCGCTTGTCTGCGTTTTTTTTCTCATATTACGTTTACATTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATAC:1 - chr3L 3645386 5' + rover 116 2 61.39 TAATTAACCCAGCGAAAAGTTGTTTGCCCAAAGAACGGTGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr3L 1276703 5' + hobo 33 1 60.40 GGCGGCGGCGGTCATAAAAAACCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2R 14575819 5' + pogo 51 1 77.00 AGTGTGGATACAATAATTAACACTCTACCGTCAGTTCAAAGTGTACATACTGTTGGACCGGCTGAGTCGATCTGGACATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGT:1 - chr4 167776 5' + INE-1 125 1 63.37 CCGACAGGTTAAGAATTGTATAATTTTGCGAAAAATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGA:1 + chr3R 13620244 5' + Doc 12 1 64.00 CGTTGTAAATACCAGCAAACTGATTTATATAGTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAAT:1 - chrX 21564145 5' + invader4 47 2 68.32 TAGTTAACCTTTAGTTAAGTTTAAAATGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATNTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2L 18977956 5' + roo 8708 2 77.32 AAGTCCATTGCCGCACTAAATTATGTTGTTAGTTTCACTTCATCTGCGGACCGAATGCGAAAGATCGGACATACATTGATTTATTTGTTACTTCCCGTGTT:1 + chrX 22786412 5' - invader2 180 2 75.25 GCACGCCTTGAAGAAATGGGTTAAAGCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chrX 3333419 5' - pogo 2053 1 77.23 TTCATTTCATTTGTGTAATGAAAATGAAAGCGAATGGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACGACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chrX 12866516 5' + hobo 34 1 59.41 AAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:2 + chr3R 11080673 5' + I-element 14 1 64.36 CGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chrX 3446534 5' + I-element 43 1 72.28 CACTCGAATGGGCGAGTTGCAGTTGCACCAGCAGTTGGACTCGTGATTACTTTGACATCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 11478473 5' - roo 391 2 60.40 AATAGCAAGTGATGAGGATGATGAGCTTATATAGTGCCGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGC:1 - chr3L 25730306 5' - Quasimodo 232 2 62.38 TATTTTCTATTCTATTTTCGATAATTTTTCGCTGTTTCCTCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATTGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGG:1 - chr3R 2211755 5' + 1360 3382 2 58.42 TTTATTTATTTATTTACTCTGGCTCAAATGTAGGAAAAAGCGGGTCAAAACAAGAGAGAATGGTATAGTTGATTTCCCCGACCATCAGATACTCGTTACTC:1 + chrX 22741631 5' - INE-1 549 1 67.33 GAAACCAGAGGAGTTGCTCCACTCGAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTC:1 + chr3R 19863538 5' + hobo 2656 1 75.25 ATAAAAGGAAACTCAGTTATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr3R 19515886 5' + 412 7070 2 62.38 CTAATCGAAAGCCAAACAAATCGGAAATCGATCGCTGTAGAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 31418627 5' - roo 9027 1 67.33 GGGGTTAGTAAATTGGGCTTGTCCACCGTGTATACATTACTCATAATTTCTTATCTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACG:1 - chr3L 17424427 5' + P-element 2860 1 59.41 CACAATATATTTCAAAGCCAACAACTGCACTTAACGAGGGGCTTTGCTGGTGGAGGTACTGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTG:1 - chr3R 6916329 5' - TAHRE 10385 1 57.43 AGTGTGAATGTGTGATTTTAGTGGCTCTTTCTGTTGTTGTTGTTGTTGTGGCTGTTGTTGTTGGTGGTAGCGG:1 - chr3L 10509098 5' - F-element 411 1 84.93 GCCAAGCGCCATCCAAAACTGTTGTCATTGGGTAAATAGCCGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTT:1 - chr3R 9607047 5' - roo 8942 2 64.36 ACGGTCTAAGGGGCAACTGTCACGCCCAGGACTCGCTCGATCTAGGTGATGCCGTTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGTGTAATATGTG:1 + chr2R 557238 5' - 1360 2935 1 54.46 CCTTTGGCTCCATAGGAAATGCGAAATAGTTTTATTATTTAAGAAAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTT:1 + chr3L 9154510 5' - F-element 118 1 75.25 TTTGGAAACCTCATTAGTTTGACATTCCAATATGTCAGATTGTGGCTACTGGCAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTTCTTTCTTAATAAATAAATAAA:1 + chr2L 15194689 5' - copia 231 1 54.46 AACTACAACTGCCGAAACGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:2 + chrX 3446513 5' + I-element 22 1 55.45 ATTGAAATAATATCTTTGGGATTACATTTCGTGCGATTCTCACGAATACTGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chrX 11503559 5' + roo 6 2 74.26 GCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAAT:1 + chrX 17492878 5' + Tirant 24 2 57.43 TTTTAGGTTTCTTACGCTCTAAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATGCAGTTGTCTGC:1 - chrX 1396228 5' - 1360 166 1 52.48 GCAATTGTATTTTTGTTATATCAAATTGATTTTTTATAGCTTTTTCCTTCAATTCAGTTTGGCATGGGCATGAATGAGTCCGGTAAAACTCACCACAGTGT:1 - chrX 18566156 5' + invader5 164 2 58.42 ATTTCTTCTTTCTCCACATTTCATCACATTTATTATATAAGTTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 - chr3R 22043596 5' - Burdock 214 2 65.35 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGACACATACAAACACCATTCAATGTCAGATGGCTAGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chrX 12649915 5' - hobo 2932 1 66.34 GAAACTCCAAGTATCCTGTAGCCATTAGGGTATTTTTCGCCGCAGTCAATTCTCACACACTAAGGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr3L 8256153 5' + jockey 22 1 60.40 TATATTTTTACATATGCACAGTAATCAATGGATTGATTATTATTGTTTATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 8037700 5' - roo 9046 1 60.40 TTTAGAAAAATAGACTTGGAAATGCCTTTTTTTTATTCTGAATAAAATTCTTTGGTCCCCAAATTACTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chr2L 21631796 5' + pogo 7 1 76.24 TTTTCCCAAACAAAAAAATAAAGTATAAACCCATTAGACTTTAGTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATA:1 + chr3R 11912102 5' + I-element 75 1 56.44 GCGGGCGCCGGAAAGTAGGCAACACGCTTTTTTTGGCAAAACGGGTCGCCGTAATTGATTGCCTCATTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 - chr2R 18983748 5' - jockey 4987 1 64.36 ATATACTAAATAATTAAATAGGATAACTGTTTAGTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGATCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCT:1 - chr2L 9590694 5' + Rt1a 10 1 94.06 GTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 - chrX 3295657 5' - hobo 2886 1 77.23 TGGTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chrX 15227345 5' - roo 9041 1 57.43 ATATGTAAGAGCTGTAAATCACAAGAAGCATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr3L 10305373 5' + 412 47 2 70.30 AATTGTGAATAAATAGGCAAATAGAAAGTATGTATGCTTGTTTGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTT:2 - chr3R 20240974 5' - Tabor 486 1 65.35 GATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr2L 17729374 5' + hobo 33 1 54.46 ACTTTGGTTTTATGTCATAGCTTCTTTAGTTTTATTATTGCGTTTTATTAGCAGATATCAATTTAATTCAATACAAGAGAGAAGGCTATAGTCGAGTTCCC:1 + chr2L 21784361 5' - INE-1 572 1 79.21 TTTTGGTGTTTGCATTATGATTATTTTTATCATGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 - chrX 17492948 5' - Tirant 357 2 71.29 AAGCCGAAACGACGGAGATTTCACAAGCCTGCCCAATCCCCGTCCAACCTGTTGATGATTCAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGA:1 + chr3R 11904881 5' + I-element 428 1 63.37 CCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGA:1 - chrX 21668084 5' + Tabor 6861 2 57.00 AGAAATTGAGCGTGCTGCGAAAACTAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 - chr2R 1725966 5' + Doc 8 1 77.23 AAAATACAGAATTATGAAAATAACCACACCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCA:1 - chr2R 18664425 5' + mdg3 150 2 72.28 CCTACATGCTGTATTTTATCTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAAACCTTCATACATTTACACATCAT:1 + chr2L 21586366 5' + Tirant 8465 2 78.22 ACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chrX 21945933 5' + F-element 36 1 53.54 TAATAAATTACTCTCATTAAAAGTGACTTTATGGGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1 - chr3R 16110229 5' + mdg3 43 2 66.34 GATGCGCCACTTTCTGTTCAACGTCCATGCGAGCCAAACTTTATTACGCTTCACCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAA:1 - chr2R 5537518 5' + I-element 93 1 60.40 AGACAAATACAGCATCTGAGATAAGTGAGTGAGTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chrX 9649915 5' + blood 45 2 72.28 TTGAGCTTTTGCTTTGAACACCTCTCAACGGATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr2L 21018802 5' + 412 7096 2 65.35 GCCCAAAATATGAAGGATACGCTCAAAGGGATACTAGCACATAAAAAAATTAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 943993 5' + BS 5103 9 64.52 ATACATGCTAAGCTTTACGATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chr2L 17729398 5' + hobo 9 1 70.30 CAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTCACATTTAAATGATCTGCGACATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATA:1 + chr3R 3985683 5' + gtwin 21 2 58.42 ATTGTAATCTTTAAATATTCATTCCTTTCACCAAAGAGAGAGAGAGTAACCAGTTCTCGTCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 8133905 5' - roo 393 1 64.36 ATTTCCTTTCGACATCGAGGATACAAAAGAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 14711438 5' + G2 3075 1 72.09 ATCCTTTTATTCATCAAACACTTTACAGTACCATTAGGAAATTGTTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGC:1 + chr3R 22043532 5' + Burdock 29 2 55.45 ACTGCCGTCGCCAAGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTC:1 + chr2R 6482653 5' - gtwin 7374 2 62.38 CGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGATCCCTCT:2 - chr3L 25232908 5' + GATE 8270 2 50.50 AACGATAATAAAAATATAAAACGGAACTCGCGCTACCTGAAACTATGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCA:1 - chr3L 25841251 5' + accord 186 2 67.01 CTAGTTTATATTCACGTTTAGTTTATATTCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 + chr3R 5561970 5' - pogo 2056 1 81.19 CTGTAACTACCATGATGGATGAATGCCTGTTATATCCACAAGCACTCATAAAACATCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCA:1 - chr2L 9134026 5' - accord 182 2 62.38 TATATTGACTTTAACTATAGTTGACGTTAAACCGTCTAATACAGGCACTATCAGACGATGCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCA:1 - chr3L 27391455 5' + Bica 4563 1 71.29 GAGGATCGAATTCCCGCTCATCCAGAGCTGCCACCAGCCCCACAGTGATCCACAGCAGCAGCAAGCGGAATAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTA:1 - chr2R 11235911 5' + 412 7396 2 67.33 CATGGCATAAACTTTTGCTGCCCCGTTTCGCCAGTTGCAAATAGATTTCACGCTTTGTTTTATATTCCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3L 21998503 5' - roo 401 1 71.29 AAAATACTCACAAATATTTATGGCTATGCGGATAAGAGGGAAACATTTGTTGTAATTTTTATTGATTATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCT:1 + chr3L 5282143 5' - Transpac 5224 2 72.28 TGTGAGTTCTCCAATGCAGAACACATCCCTGCAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAA:1 - chr2R 142821 5' - HMS-Beagle2 6854 1 68.32 TAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGT:1 - chr2L 23295885 5' + micropia 4965 2 66.34 AGTGCATTTTTCTCTGTAATTAATCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr3L 4639242 5' + 297 49 2 80.20 TTGTAGTTTCAAATCAGGGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3L 12565685 5' - roo 9015 2 77.23 ATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:5 + chr3R 11080686 5' + I-element 27 1 51.49 ACTTACCCTTGTTAGTCAACAAATTATTGGCTATTTTTAATGCGATTTCACAGAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAAA:1 + chr3L 5194028 5' + 17.6 401 2 56.44 GGGCACTATACGCTAATGACGCCTTTCAGTTTTGAGAGGATATGCCAATTTTGGTAAAACCAAATATTTTATAGCTTGTAAAATCAATTTCAAAAATTGCT:1 + chr3R 23407966 5' + 1360 371 1 61.39 ATTAGTACTCAGGCACGAAGTAACGGTGGGTAATATGGCGGCGCTCGTGAAAATGGATAATAGATAGTAATTTCCTTTAATTGCCTTTTGTCG:1 + chr3R 8114165 5' - GATE 448 1 77.42 AGTGGGATCCTAGTCCTGCGGTCCCAACAACCACCGATGACGAGCGGCAACTTTTCATGCCTGGGCCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 - chr3R 5980446 5' + hopper 12 2 67.33 CAAATGAAAATATGGTCAAAGTTTCAAAACAGCAAAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACA:1 - chr3L 3570927 5' + Stalker 82 4 71.29 TTTTAAGGTAGCCCTAGTTCTCGCCAGACTTGAGAATACCCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chr3R 5368380 5' + P-element 34 1 47.52 ATACAACACTCGGAAAATGTTAATCAATTTGCCGGCAGCAAATACATTTTGATTAATAGCCATAAACATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 12258287 5' - roo 400 1 69.31 GCACTTCAGATGTCAAACATCCTATCTTCATGCACAGTTACCAGATTATTAACCCAAATTGCATCATGTCTAAGCCAACACCGAACGAACATAAACGGGAA:1 + chr2R 4716709 5' + Ivk 5008 1 74.26 CAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCA:1 - chr3L 24210976 5' + HMS-Beagle2 27 2 58.00 GCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 + chr2L 13598209 5' + pogo 53 1 79.21 ATATTGCATTGCACACACTGCACCTGAGCAAATTGACTTCTGCAATCGTGTTTTCTTTTCAGCATGAAACAAATGAAACCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCA:1 - chr3L 1985399 5' + Max-element 8235 1 77.23 ACTAAGCGCCTGAGGAACGATAGAGCCGCCCCTCAATAGTATCATCCATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:2 - chr2R 16384379 5' + roo 8689 2 52.48 TTCGAGCCTTCGCATCGCTTCTCGCGCGCACTCTTCCGTCAACCTAAGACTATGCTACTACATGGTACAGTGGGTCTTATGAATGTTCATCCTACCACAAC:1 - chr2R 2214000 5' - invader3 5185 1 59.41 ATCTCTCGCTGCACAAATCCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chr3L 18793025 5' + P-element 56 1 26.73 AAACATATGAAGGCATCCTGCGGTTGTCCAACGGTAGCGCTATTACTAAAGAGATGGAATTTCTAGACTTTATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGG:1 + chr2L 21646339 5' - 1360 231 1 70.00 TTTATTAAACATTTAAATGCTGCTCCCTCTTTTATGTTTCTTAAAATATATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr2R 16939064 5' - pogo 2076 1 55.45 CAGAGAAAAATGAAAATGAAGAAACCATCAGGATTCAGTTTTGCATAGCGAAGTAAATTATGTTTGATTCGTTCAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGC:1 + chrX 15434334 5' + INE-1 29 1 68.32 GTAATCAAAAACGGAACATTAGTTTAGGATGTTCTCCTAAATATTACTCATACCACACGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chrX 12404596 5' + jockey 26 1 58.42 TTGATTTAGCTTGGTTCGATTTCAGTTTTCCTATGAAATGGCACAAATCTATCATGGTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 10187443 5' - roo 9051 2 58.42 AGTAACGAGAACTGCAGTCGTTCTTTGTAAATAACGAATACTATAGTGTTGTAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr3R 21587229 5' - pogo 2082 1 58.00 TTTTATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr3R 19515798 5' - 412 465 2 53.47 AGAGAGAGAGACAGATAGGAGAAAGAGCGAATTTCAGGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:2 - chrX 4927547 5' + hobo 41 1 62.38 CCTTAGAGCCAAATCGATTGCCATGTACATTCAAAATGTGTATAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 + chr2R 14648305 5' + blood 32 2 58.42 ACGCACAAACAAATACACTCGCAGAAACACCCACACGGATGCCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGAT:1 + chr3R 12854763 5' + Idefix 6965 2 62.38 ATAAGTTGTGAAAAAAAAATGAAAAATATATAAAAGTATATGGTATAAGAATGTCACAGTTGCTAAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGT:1 - chr2R 10552399 5' + INE-1 564 1 57.43 GCCAGGTACTGGGGGCCATGGGATTCGAATGGTCGTTCATCTGGTTTATTGGCCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACA:1 + chr3R 6034128 5' + hopper 1096 1 65.35 TGTTCAGGCATTGATTGGTATTCTTTGGATATTCCTAATTGGAAATCTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr3R 28333595 5' + pogo 27 1 55.45 GGACGGGTCCTGCACAAAAGCGGCTCAACAGTTGCCGCCCCTGGGAAAATCAAAGGATATTCAGGCGGAACAATGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr2L 16569444 5' + roo 1 2 77.23 GCCTCGCATGGCAATGACGGCCACATTCTCAGCACCAGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCA:1 + chr2R 11258254 5' - 412 126 2 63.37 AGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGACGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGC:1 + chr3L 26852650 5' + 1360 48 1 67.33 TTTTATGGAAGAGCATTTATTTCCCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAT:1 - chr2R 3522026 5' - copia 202 2 84.16 TTTTTGGCCAACATCATCAGCATCGAGTGCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 + chr3L 5321137 5' - mdg1 7417 2 67.33 CTATTTCCTATTTGTTACATCGGTCATATAGCTCTTATATCAGAATATCTCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGC:1 + chrX 22761121 5' + mdg3 5381 2 50.50 TTAGGTAATGCGCTAGAAACTTGACAACTTAACTGGCTTATTAATTACAACTCTCCCCTTAGTCTAGAATACAAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTGAA:1 - chr3R 19448213 5' + Doc2-element 4334 1 69.31 AGGTGAAAGGAAAATTTCTAGGACCTTACAAAATTGTTAAGCTAAACAAGTTCGGAAGGATGCGAAAAGCATACATTGTCCGTATGAACGCCGAGATCTCT:1 - chr3L 25398358 5' + INE-1 135 1 57.43 CCTTGCCCTCAGCACGTGGAGACGCACTTTGGCAAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr3R 17557384 5' - mdg1 380 2 65.35 GCAATACTATACTACTACTATCTTGACTATCTTTAATTCAAGAGTATGATCCTCTTCGCCTTATAATGCATTTTCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAG:1 - chr3L 494729 5' - Transpac 310 1 77.23 AGGGTATGCTTAAATATGCATTGCAAAAATGTAAGCTGCTTTCATTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 5654903 5' + roo 8695 2 57.43 TATTTCTGCAATTTATTGATTTATTACAGTGCATATAGAGCGCATAATTTATTACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 - chr2L 3483586 5' + I-element 21 1 59.41 GTGATATTGGTGCACTAAAGCAGCACTCGGAAAACATCAACGAGGCAACATACAAAATTAAAATATAACCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAA:1 + chr3L 23002190 5' + FB 462 1 59.41 AATAGTTTGCTTCGGTTGTGAGGTAAGAATGAGAATTGTGCAGAAATAGGGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACATATATTCATTTTTCGGCGTCCACAAC:1 + chr3R 2185591 5' + invader3 279 1 55.45 AACTCTGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 - chr3L 14504281 5' + 297 6627 2 73.27 GGCTATAGCTATCGGGTTCAAGAGGGCGCGTTTCTCAATTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGACGATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCT:1 - chrX 719159 5' + INE-1 133 1 73.27 TGCTTGAATTTTTTCGCCTTCTTCAATCAATGAGTGTAGCTGTTTCGTAATCATAAAGAATTTTATTGATTCCTTATAATTACTCCATGTTACATTCGGCC:1 - chr3R 19448862 5' - flea 4750 1 78.22 TAAAAGTGGAAATTTAATCTTCGCTTGGCGCAGGCATCGCCAATCGATAGTGAATATCGAGGGAAAAGTGATCTGTTAGTTGACGCGAAGGATCTTACTTT:1 - chr2R 12205534 5' + Gypsy12A_LTR 477 1 53.47 TGCGTGTTATTTTCTCATTGTTAAGGTCAGTTCTGTTTACTCACAAAACAATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCAAGAGAAACTAAAGAT:1 - chrX 7339972 5' + G2 2608 1 53.47 GGGCGGGAACAATTCCAGTTTTTTTTTGTCAAATTTATGTTTGGCCCTCCATAAAGACCTCAATATTCACACAGTTGAGACACAAATTGGGAGAAATACAA:1 - chr3R 7475892 5' + Helena 1225 1 54.46 CTTGGAATCGGAACCACCACCACCAGCCTCTTAGCCATCTCCTCCTGCTGCAGTAGCTCCTTCTCCTCGCCCTTTTCGCCGCTGTTGTTGTTGTTGCTGCT:1 + chr3R 21497742 5' - TART-A 123 5 61.39 CGGGTGGGATTCGTTGACATATTTTACAAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCAT:1 + chr2R 19568503 5' - F-element 4285 1 72.28 CGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:2 + chrX 5168865 5' + hobo 51 1 72.28 CACACACACACACACTCATCCGTGCTTCCGTAGCAATCAGCTTATGTCATTCGCCTTGTCGTCCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr2R 9284798 5' + blood 14 2 63.37 TCCTCCCTCTCTTGCTGACCACTCATCACCGCGTCTCTCCCTCGCTGCAGTCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTT:1 + chr2R 1378594 5' - Gypsy6A_LTR 263 1 62.63 TCTCCGTGTGAAATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:3 - chr3L 17635595 5' + 297 20 2 60.40 TCACTAAGTGTCTGCAAAACAATCAAAATCCTGCATGAACTATGTTACGGTGAAACTTAGTGTAGTTAATTAAAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chr3R 13191420 5' - mdg1 7440 2 62.38 AGACCCCCAAAAAAGTATACTCTACTTTTTGCCCCGTTTGCCATCGTTGACATCATTAAATCTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chrX 14617732 5' + hobo 13 1 66.34 AGAAACCCTCCTGATTTTGTTGATGTTGTGGTAGCATTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCC:1 + chr2L 16331119 5' - Doc 482 1 77.78 ATATGGACATAGAAGGAATCTAGATTCGGCAATCCGAGCTTATTTAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr3L 15869729 5' + pogo 27 1 55.45 AACATAATCCGCATAGAAGGACTTCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAG:2 + chr3R 16110192 5' - mdg3 193 2 80.20 CATTAATAACGATCATACCAAAAGCGTATTTATAGTTAACCTTTAGTTAAGTTTAAAATGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2L 18977988 5' + roo 8680 2 63.37 CATTCTGGGTAAATCGATACCGAGATCCGCAGCCTGGCAGCCTGGCAGATTCGCAGCTGACGCACATTTTCACATCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAA:1 - chr3R 18820054 5' + Tirant 8219 2 68.32 TACAATTGTGTTTGGTTCTAAGTAGTTTATTTGTCTGTTTTTTGCTGCTTTTTTAAAATAGTTTCGTTAACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATCTATATC:1 + chr3L 27282756 5' - Porto1 4389 1 75.25 CAAGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTG:1 + chr2R 6482664 5' - gtwin 7363 2 53.47 AATCACTAAGTGTCTGCAAAACAATCAAAATCCTGCATGAACTATGTTACGGTGAAACTTAGTGTAGTTAATTAAAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 + chr3R 13191418 5' - mdg1 7442 2 64.36 CATACTTATAATTATAAAAATCATAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGT:1 + chr2R 5582160 5' + Cr1a 433 1 73.00 TTTTGATTTGGTTTAATAATTAAAATTATTTAAAATTATTTTCATACATCTTGCTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCCGTCCAAGAGCCCTACAAGATTTG:1 - chr2R 4425826 5' + mariner2 640 1 55.45 GCAGGACCTTTGCAAAAAGCGACGAACTTGCAGGAGTGAAGAAAGTCACCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2R 15402922 5' - roo 9045 1 52.48 AATCTTAGGTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 12998309 5' - roo 9028 1 66.34 ATGTATTGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTA:2 + chr3L 24210879 5' - HMS-Beagle2 7187 2 71.29 GGATAAAGTTAATTTTTTTTTTAGTTAGCACTTTGTGTATATTGGCTTTGGGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAAT:2 - chr3L 21766630 5' - mdg3 242 2 72.28 GAGAGATAGAGAGAGTTAGCTAGATGCGGTGCGAAAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGA:1 + chr3R 27657788 5' - Cr1a 289 1 76.79 CAAACATCTTTTGAAATAGATAGAAATCGGTATGAATGAAATTAAAAAACTGAGCGCACATTACATTACACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAAC:1 - chr3R 11080419 5' + I-element 161 1 67.33 TTTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAGGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chrX 5168841 5' + hobo 25 1 53.54 AAAATATTGTCATAGTCCTGCGACCAGGCATCCTGGATCTACAGCCATACTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chrX 14371362 5' + jockey 34 1 56.44 CTTTTCAAAAATGTTGTTCCGATTTGCGAAACCTCGTTCCTGCTCAATGAAGCGTCGGTTTAATTAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCC:1 - chr2L 18977463 5' - roo 311 2 68.32 CGAGAAGCATGTACTTATGTACCTCAATGCAGCTACTAAGGTCTTAATTATTTATTTGGCACAGTAAAAATAATCGATAAGCCTAGATATATAAGATATAT:1 + chrX 22732139 5' + 412 7314 2 70.30 ACGAAAAAAAATGAACGACAAAATCGCAAGGTGGGTGGTAATAGAGCCCTAGTGTCGCACATTTTTGCGCGACGCTGCATTTTTTATTTTTTTTATTTTGA:1 - chr3R 4546138 5' - R2-element 3584 1 78.22 TTTTTGCATAATATTTGATTTTATTAGGCAGTGGGTCAGACCATTTTCGCAACTATTCGCCAAAATGTAGTTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3L 4602037 5' + hobo 3 1 56.44 TTTCTTTATTTTCTATGCAAAGCGAAGACGGAAAAATCGGTGAAAAGTGTGTGTTGTGTGTGTTACAATGTTAAAATTCTTAGAAATAAAGTATCTGACAC:1 + chr2L 17189860 5' - ZAM 233 2 57.43 GTTCATATAAGATTAACGAAAATTTCGAAATTAAGATAACTATTGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chr4 306492 5' + blood 7043 2 55.45 AGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 + chrX 12866449 5' - hobo 2910 1 57.43 GACTTGAACATGCAATTCATGCGAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATG:1 - chrX 8027511 5' + Juan 13 1 66.00 TAGAACGAGGGGAGGGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr2R 15921346 5' + 1360 46 1 86.52 ATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTTTAATTTATCACAAAAATAAATTTCAAAAGTGACTTT:1 + chr3R 28666930 5' + 1360 373 1 68.32 TCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:2 + chr3R 11080687 5' + I-element 28 1 52.48 GAAATGTTATAAAACTTTTATTGAATGGTTCTATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:2 - chr3R 11549899 5' - opus 459 2 69.31 TGGGCAGAGGGCGAAGTGCAGAGGGGCGGGGCAAAAGGACGATGAAGCTCAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr2R 18374854 5' + 412 25 2 54.46 AACATTGTAACCTGGTTAACAGTGGCCAATTAACAGTAGTAACTGGTTTGAGTGCAGACTGTTTTAAGATCAAAGCTGCAAGAGAAACTAAAGATTCTCGT:1 + chrX 7340696 5' + G2 2614 1 74.26 TTATGTAGTATTGTAAAGTAAACGGCTGCCTTGGCTTGGCTCAGTGTTGAGAATCGCACGTCGCCTGCAAGTAGGTCAAAATAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 16476308 5' - blood 7180 2 72.28 AGTTTAATAAATATTACTAAATTGCTGTAATGATGAACTTCCCGTTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:4 - chr2L 21018838 5' - 412 440 2 67.33 ACGAAATATAATTTTGTGCATTCAAACCAGGATCGACAAATATATTTAAAGGAATAACATTTATAGTTCCTGAAATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGA:1 + chr3R 4654522 5' - INE-1 126 1 63.37 GGGTAAGGAGTTAGAAGTTATGAAAAAGTACATTGACTTCGCTGACACTTGTCAGCGGCACTTGTAACTTGTAAGCAAAGATAAAGGGTGCCTTGTTC:1 - chrX 19820354 5' - 3S18 30 2 55.10 ATTTTCACTTCCAACTGACACAGTATTATTTATATTTGTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 + chrX 23035740 5' + HMS-Beagle2 6916 2 59.18 GTGTCTAAATGTGTATGTGTGTGTTGATTGATAACCAACCGTCCAACCCAAAACAAATAAATTATCATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 + chr2R 22825386 5' - opus 489 2 68.32 ATAATATTATAATGACCCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAA:1 + chr3R 15130443 5' + Max-element 8236 2 70.00 ACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr2L 18417312 5' - roo 9029 1 67.33 ATTCAAGTATGCATTTGGGAGCAAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACA:1 + chrX 18975541 5' + diver 26 2 53.47 CTCGGCAAACTCAAGTTTATTGCCATCTTCTCAGTCTTAGTCTTTCCAGGAGTTCGGTGAAAAAAGTTACTTTTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr2L 15798595 5' - roo 408 1 78.22 GCAAATTGTGCTTTGGCCTTTTTGAGTGGCTCAAGTGGTGCAGTGGATCTGTATCTGTGCGCAATCCACTCAACAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAA:1 + chrX 2843773 5' + Quasimodo 7167 2 59.41 TCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2R 22746051 5' + hobo 40 1 70.33 TAATATAGCACACGCATATTTGATTTTAAATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 - chr3L 1687559 5' - copia 242 1 71.29 GTTTTACCCCTTTGAGAACCAATCGAATTTATGTGTGAAGCCATGGAGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2L 13038761 5' + hobo 29 1 58.00 TATTATCTAATTTGAGCGACATGTCAATGCGGATTAGGGTCACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 30263618 5' + roo 33 2 58.42 CTTACCCTCTAGTTCCTCCATGTTTTCTGTTTGTCTTTCATGTGTGTTCTCTAAATCATACATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 - chr3L 17688241 5' - flea 5002 2 67.33 CACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGTTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATGC:1 - chrX 22913198 5' + gypsy7 5253 2 64.36 CGCTGGTGTGACACTTAAAGGCCACGGTAAATTTAAAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:1 - chr2R 14434336 5' - invader4 3060 2 61.96 ATGCAGCGCGAAATTTGTTACGTGTTTTTAAATAATGAACTGGATAATTTAGATTCACGATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2L 18417386 5' + roo 8680 2 63.37 CAGGTTATTATTTATCAAATATGAAGATGAAATACTGTGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chr2L 14993455 5' - 412 455 2 60.40 AAACAATAAAGTAGTTCTTAATCTAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:2 + chr2L 18977922 5' - roo 357 2 78.22 AACTCCAGTTTATTCCATTTGGTTGTGTTTTCGGTTGTGGTGATTTTTATCCCCTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr3L 9306873 5' + jockey 33 1 47.52 GGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:2 - chr2L 8898917 5' - roo 350 2 80.20 GAGAGTCTGTGTTTTTTAATGCCTCTAAAAACTTTTGGCACTGTCGGCACACCGAAATGGGCAATCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACA:1 - chrX 22760830 5' + I-element 4943 1 65.35 ATATTTCACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATA:1 - chr2R 2092807 5' + Doc3-element 68 1 57.43 TACTTATATGTTATATCCTGTACTTCGGTGGAAACCATACTTAATAAGATAATCACTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 4539141 5' - roo 9054 2 60.40 TTTGTTTGGGAGCACTTTTCGAACTAAAGTGGGGGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 + chr3R 26853863 5' - copia 244 1 66.00 GAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCATGATTAGTCATATACCATGGAGCACCTGTGATTGTTCTTAGCGTCATAGACTGGTATCTCTGG:1 - chrX 292409 5' - G3 4252 1 68.32 TCAGATTGTTTGAGATTTCACTATTCAGCTTAATTCATTCAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chrX 12152723 5' - roo 9037 1 60.40 GAATTGAAAGCGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 - chr3R 19513421 5' + jockey 4686 1 61.39 TTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chrX 3295667 5' - hobo 2897 1 67.00 AGCATTCGAAACGAAAGGGACGGCGGACGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCT:1 + chr2L 19684617 5' + mdg3 51 2 77.23 TCTCTGTTTGCCAGATAAACGAACTTTAAATACTATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 9616570 5' - roo 391 2 62.38 TTAATCGTTCAAGTTCAATCGCAAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAA:1 + chrX 6204684 5' + jockey 464 1 77.23 ATTCACACAGAATGCAATTCGTTGACAAGGGCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr3L 2690951 5' + Doc 55 1 69.31 AGTGAGAGGGAGAGAGAGAGACAGATAGGAGAAAGAGCGAATTTCAGGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:2 - chr2L 7701803 5' + hobo 31 1 52.48 CTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAG:2 - chr3R 15790085 5' + flea 4725 1 62.38 AAGCCCCTGCAATGCCCAACTCAAAATCCAAGTGATTGTGTGTGCTCGTGTGTATGTGTGTGTGTGGG:1 - chr3L 10559465 5' - accord 7101 2 70.59 ATTATTGATTTAGATAAAATATGAAGGGGAAGAGGGCGATTATCAGACAGTGCGCTTAGTAGAAGAGTATTATTATTTATCAAAACATCATAAAAATAAAA:1 + chr3L 14602937 5' + jockey 4996 1 30.69 CTACGAATATGCCCAGAAGCAGACTTTTGTTTTAGTTTCCGCTCAACACCCACACCCACAGACACACACACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 - chr2L 11534443 5' - copia 247 1 56.44 GCCGGTTCGGAATGACGTAATATTGTTTTTTAAAGAAATAAATATCTGCAGAAAAAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 9199843 5' - roo 9052 2 55.45 GAGCTCGAATGAAACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTT:1 - chr2R 4339520 5' - G5A 2800 1 77.32 GAACACGTAGAGGAACAAGCAGTGTGGGCACCTATAAGGATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3L 3535385 5' + roo 8701 2 63.37 CAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATAT:1 + chr3R 19589921 5' + BS 5019 1 52.48 GCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATTCGGGG:1 + chr2L 22092972 5' + INE-1 553 1 55.45 AAAGGAGAAAAGTATGTGTGAAGGGGGAGTTATTCTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2R 10974137 5' + hobo 41 1 68.32 TTTGAAATTTACAATACATTCTAACTCTGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:2 - chr3L 14504303 5' + 297 6605 2 56.44 ACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:2 + chrX 21668011 5' - Tabor 448 2 59.41 GCGATCGTTTTTGGATATTCGCTTTTGGGTGGTTGGTGGCTGTTGTTGGTGTTGCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr3R 13639097 5' + hobo 22 1 45.54 CAAATAATACACTTAAAGTGAAGGTGCGCTGGCATCAGCAAAATATTGTCATAGTCCTGCGACCAGGCATCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTT:1 - chrX 14371401 5' - jockey 400 1 74.26 CCATGAGCTGTTTTTGTATCAGAAATATTTGTCTGACACTTGTGATGGATGGGTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3L 4087280 5' - roo 9045 1 53.47 TTCGAACCTGTTTGCTGGTCGCCTTTAGATTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr3L 14205347 5' - P-element 2842 1 35.64 TTGTGATGGTTTAACAACAAACTCGCATAAAGCAGACAGGCGGACCAGTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chr2L 19681410 5' - hopper 1384 1 56.44 AATTGTGTCGGTTGTTGTTAAAATTCCACTGGCTGTTATTATTCAGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCAG:1 - chr3L 23777732 5' - Porto1 4269 1 57.43 GAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGAC:1 - chr2R 4261967 5' - invader4 3026 2 55.45 TTAGCGGCCCTTGCACGCGATGTTGTGTTTGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr3L 9190445 5' - 412 469 2 54.46 TAGCGAGACTGCCCGCTTGGGATTCTATACAATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTATGTTCTGACCATAATAGACGTTATCCTATTATCTGTAATCTTGA:1 + chr3R 2472839 5' + Cr1a 4221 1 69.31 AGCAACTATTTTTGATTTTAGCAAATTGTGCTGTTTCTCAAAAAGTGTTTTTTACAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 13988358 5' + G2 3076 1 66.67 GGACCACAGGACCAAGGCGAAGATGCTTGTGTGGGCGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGT:1 + chrX 20260649 5' - gypsy3 418 1 72.00 ATATATGTGAGTATATATATACATATAGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chr3L 8843611 5' + I-element 50 1 72.28 TAATCACTTAATCCACAAGCACCATGTTTAATCAACATAATCAAGCAGAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chrX 12166601 5' - pogo 2079 1 55.45 AAAATATAAAATTAAATTGGGCACTCTCTTACCGAAGATTGTCCTTATNGAATAGAACTCTGGGGAACTGTCAGTAAATNCCACTTACAGCTA:1 + chr3L 23524262 5' + Porto1 4301 1 53.76 CCCATGACTTCGATCACATTTGGCACACTTACATCAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr3R 11153561 5' - 1360 3352 1 69.31 TTTGTAATACATTTTTGTTTTTGGTTAATGGGAGATGATGTGGATAGATATTATTATTAGTAGGCCTTTAAGAAATGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGA:1 + chr3R 13192478 5' - diver2 4726 2 34.65 GCAGGATAACGGTAAAACCGTGGCCTTTTGTCTTGTAGTCTTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 - chr2R 554274 5' + 1360 34 1 68.32 ACAAGAAAGTGGAGCTTTCAGTAGGGAAATTGTGGCTTTAATTAAAGTCAATATCGTATTAAGTTTTATTTATTTTTTTTTTTAACTTATTGCGTTATTTA:1 - chr2R 13754577 5' - Doc2-element 4761 1 65.35 CCGCCCATTTTCCATTTTGTCTAACCGCCTTCGTCGGTATTTTATTGCTTGGCTCGATCTTGCTTTTGGGGGCGTGGGAGCGGGGACACAGCATTATCATT:1 - chr2L 20255518 5' + Rt1b 4751 1 76.24 TAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 + chr3L 25884077 5' + Doc 28 1 47.52 TGTTCTATATTATATTAAAATAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACCCAAGCAAGCAAATTCT:1 + chr2R 1266308 5' + 1360 3257 1 79.00 TTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTA:1 + chr3R 15130461 5' + Max-element 20 2 53.47 GCACTAAACAAGTCATGAATTTCAAACAGTCGCCGGAGATCCCGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr3L 17767658 5' - hobo 2905 1 55.45 CCCAGAATGCACTAGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGC:1 - chr2R 4261981 5' - invader4 281 2 69.31 TAAGAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCGAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTTTTTAATTTATAAGTGAAATAAATATTGTTTA:1 + chr3R 19449981 5' + S-element 1602 2 68.32 ATTGCAACACGGCAATACAAAATACAAAGACAGCTATTGCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATAT:1 + chrX 12885704 5' + transib2 36 1 61.39 GACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2R 981624 5' + 1360 63 1 70.30 AAAGAAAACCGAATAATAAAAAATGACATTTGTGTAGACATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 + chrX 8551197 5' + mdg3 38 2 62.38 ATGAATCCATTCTTTCTCTCTTAAGACAAATACAGCATCTGAGATAAGTGAGTGAGTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 + chrX 9649892 5' + blood 22 2 58.42 GTTCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 + chr3R 11080685 5' + I-element 26 1 50.50 CTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 + chrX 17492874 5' + Tirant 8127 2 61.39 AAGCTGCCAGCGACGCCTAAAAAGCGGCAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAAT:1 - chr2R 17277656 5' + jockey 8 1 58.42 AAATCGATAAACAGTTTGGCATTTAATAAAATCAACATCAACCCGCTCCGATTTCCCGCTCTCATTTTCTTCTTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGAT:1 + chrX 21560781 5' + invader4 2782 2 76.24 AAGAACAGTGCTACAATTGCCTATATTTTTTTTCAACTCGTATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr2L 22342244 5' + F-element 56 1 70.00 TCGTCCTTACAGCCGCATTTGTGTGGGTGTGAGCCACTCAACTTCAGCCTGTCATGGTGCACATCAGAGAACTGCAGACCGCCACT:1 + chr3R 29438685 5' - hobo 2938 1 70.93 TGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 - chr3R 20240933 5' - Tabor 445 2 65.00 ATAACTTTATAATACCGCTAGCGAATTAAGTCCTAAACAAGAGGGTACAGTTCGGGAGTGGAGAGCTTTACAGCCAGCAGCTCTCTTCTACGCATACAGTA:1 - chrX 20770622 5' + 1360 141 1 58.42 GTGCGTGTCCATGGAGCATTTCCAAGATCGCGAGACGACATAAATTGTCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chr2R 11399168 5' - 412 464 2 52.48 CCTCATCTAAAATTGATTTTGCTCGGGAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:2 - chr3R 20384489 5' - roo 358 2 76.24 TTTCTTTGCAACGAGCATAATAACTCTGCGTTCCATCCTGTTTTATCAACATCGCCACGTTCCCACGCTCAAAGCTCGGACTCGCAATCCCGAAAAACAAA:1 - chr2R 3182611 5' + Idefix 268 2 54.46 GAAGGACTAGCGGCTGGGGGATAGGACAATGTTCAGCTTGGCATTGTTACTTAATGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 12217299 5' + roo 8686 2 57.43 TGCCAAAAAAGGACTTAACTTTATTGTAACTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chrX 8326302 5' + opus 7045 4 70.30 TCAATCTCGCATCATTCTTCACAGCGTTTAAGAATCAATTTCCAACACAATACAACCGACAAGGATCAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAG:1 + chrX 16194748 5' + Quasimodo 81 2 71.00 TTTTTGCAGTGTCAGGTGAAAATAGAAGGGCCAGCTTTGTTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chrX 11503442 5' - roo 399 1 70.30 TACCAGATGCGTCTGGCTTCTTAAGCAAGAAAGGAGCATGTAAGCGAATCGAACGAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chrX 21050027 5' + 297 6600 2 61.39 ACAACTTGTCTGTTCCATTATACATATATACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAA:1 - chr2R 18078756 5' - Quasimodo 7326 2 78.22 ATTAAGTGGTTTCTCTGTGGTATGAATATTGTCGTTTGGTTGTTCTAAATGAAAGGTAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACAT:1 + chr2L 23381999 5' + Idefix 6991 2 63.37 CGGTTTTGTTTTCTGCACTTCTCTTGTTAATTAAACGTGGTCAACACTCCGACACAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTAT:1 + chr3R 21708781 5' + mdg3 5188 1 59.41 TAGGGTTTATTTCGATTGGTCCTGCTTTAGTTTGTGTCATCATTAAGATCATTATAAATATTATGACAGTACCACTCCAACCTCCGAA:1 + chr2R 2009386 5' + I-element 1 1 75.00 ATCCTTTATAACCCCTTGAAATTTAGATAAAACAAAAAAATTGATTGGCGAACATGTCTGAATAGTCTGGTTCTTCATTCATATCATAACAAAATACACTT:1 + chr2L 5748476 5' + 1360 360 1 27.72 AGCTCCGATCCGTAGAGTGACTTGCAGCTCTTTTGGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGG:1 + chrX 19034118 5' + hopper 37 1 64.36 TAGCCACCAATCGTTTTTTTACGTTTTGGTTATTGTTAGCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 + chrX 157194 5' + I-element 13 1 64.36 TCTCGCTTTATGATTCTTCATTTGGATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 + chr3L 10305335 5' - 412 445 2 72.28 CTGCCCGCAACTGAACCACGTTTGGGCCTCATCTAAAATTGATTTTGCTCGGGAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 20384515 5' - roo 385 2 55.45 GGCCCCACTCAAATTGGAAGCCCAAATATGAAGTCGAAAAGTGTGTGTTGTATGTGTTTAAAAGGGTTTGGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 16384275 5' - roo 405 1 75.25 AAATGGGAGGTGCAGAGGTGTGAGCTCAGGGGGAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:3 + chr3L 14558229 5' + 297 6 2 74.26 GACTGCAAAGTGCCCATATTAACACATTTCGCATTGCAGCAGGATTTACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2L 16569549 5' - roo 9045 1 52.48 ATTGCAAGCCCAGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTAA:1 + chr3L 13944795 5' + hopper 151 5 69.44 AGAGAGTAGTTTGGATGACTGGAGGTCAGTCTTCTGGACCCAGGGAGATCATATTATTTTGCACCTTGGGCGCTAATAATTCAGCCCTTTAAGGGGCGCCG:1 + chr2R 5603364 5' - BS3 1697 1 62.38 GGGTTAGTATTTACTGTTTAAGTCAAATAAAAGTGCCCGCACATTGGAAATAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chr2L 12835897 5' - 412 7522 2 54.46 CATGGGGAAAGCTTAATATCTAACAGTTTGTTTAAATCTACGAATTTTCAGACATTATTAGCCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1 - chr3L 920565 5' - mdg3 233 2 67.33 TGGGTGGGGAATGGGTGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr3L 18793040 5' - P-element 2828 1 20.79 AAATGAAGCATTTACATCAAAGTAAATAGAGCATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCT:1 + chr3R 25214935 5' - Burdock 212 2 68.32 ATGCACATAAACAGCCCCACATAGACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 6097643 5' - roo 9020 2 77.23 GAAGAATTAGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTT:1 - chr3L 24210989 5' + HMS-Beagle2 6896 2 63.64 ACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATTTGTGGCGAGTACTTACAACAACGTCATTTCTCTAAAAAGGGAGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTA:1 + chrX 23439054 5' + Stalker2 9 2 53.47 GCAGCAGCATCAATAACGGGAAAGTTTTAGCCAGAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATCG:1 + chr3R 26422556 5' + I-element 5119 1 64.36 ATATATGACAGATAAAGTGAGAAGATTTTCACTTTTTACTACCAGTCCTTTTTATTCCCCTTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTC:1 + chr2R 25216522 5' - 3S18 6088 2 64.36 GTGGCGCCTTGCCCTCAGCACGTGGAGACGCACTTTGGCAAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr3R 17557378 5' - mdg1 386 2 59.41 TTCTGTGCAAATGAAAACCATACATTTCATCACCCTTATTACGGTTTTCGATGGTCTAGGGATGACTGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr3R 9328764 5' + hobo 8 1 67.33 TGGATAATATTATAATGACCCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATCATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGC:1 + chr3R 15130440 5' + Max-element 8234 1 72.28 TCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTC:1 + chr3R 23020811 5' - INE-1 580 1 60.40 AATCCTTTCCACTTCTTACGTATTTTCAACAAACAATTGTTGATTTTTAACAGTGCATCGACCGAGACGATGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3R 29438796 5' + hobo 3 1 75.25 CGAAATCAATATGCAGACTGGGCAAACAACTGTTATTAGACATGATATGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGTACCTAAATA:1 + chr2R 16433752 5' - flea 4570 1 58.89 ATTTGGCAAGCAACGTAGCCCACTATATATGCTATATATATATAATAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 - chrX 10196155 5' - 297 6959 2 65.00 CTTTTGATTATATTTCAGGCGAGCGAGGAAAAATATTTATATACCACCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 - chrX 13547244 5' + I-element 31 1 58.42 AGTGTATGTATTGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGAT:1 + chr3L 24210874 5' - HMS-Beagle2 7192 2 76.24 GACAGCGGGGAAAGGTGGCAATTGAAAGAAAGTGCCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 - chr3L 3070705 5' + 1360 40 1 66.34 ATTTTGCGAAAAATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:2 + chr3R 13620266 5' + Doc 35 1 60.40 GATAGAGCCGCCCCTCAATAGTATCATCCATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2R 16384361 5' + roo 8707 2 69.31 ATACAACTGTTTTATCAATGTCACACACTTCCATCAATAGATCAAATGAATGCACTATCGATTTTATGTCACCTGCTCCCTGGAGAAAAGAATGTTAATTC:1 + chr2R 4757389 5' + HB 375 1 76.24 GCTGGCGCCCGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:2 - chr2R 17348642 5' + jockey 10 1 70.30 GATTTATTACAGTGCATATAGAGCGCATAATTTATTACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 - chr2L 3483569 5' + I-element 38 1 60.40 GTAGCACTTGCATACTTTTGTGCTCCATTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGA:1 + chr3R 19513370 5' - jockey 4952 1 73.27 AAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 + chr3R 11080678 5' + I-element 19 1 59.41 ATTTGTTGTGTTTGATTTGCTGCCTCGCCGTCCTGTTCCATCCTGTTGAGTCCATATCAGCGTCTCTCAAATCTCTTTTTTTTTTATATAATTTTATGCAG:1 - chrX 18263417 5' - micropia 386 2 53.47 TGTAAGGCAACTAAAAGATGTGTCTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAG:1 + chrX 5130960 5' + I-element 4 1 75.25 CCAAAAAGCATCAGACTTTTGTGGATGTGCAGTCGGTAAGTAGTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 - chr3L 7733895 5' - flea 4985 2 57.43 TGGATCCCCAACTTTTATGTGGTCTCCCCATGTAGATAATAAAAATAAATTTTGCTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr2R 12625361 5' - pogo 2081 1 58.42 CTTGACTTTGAAATAGTATTTTGCGTAAATATTTATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTT:1 - chr2L 16379045 5' - HMS-Beagle2 7199 1 81.19 TATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1 - chrX 21668073 5' + Tabor 34 2 57.43 CTTAGACGTTGAAAAGAAGGATATGTCAAATTTATTAAATATATTGTAAATAACCGCTCGATTTAGCAAAAGCAAAACGAATTTATGGCCGTTACGCATCT:1 - chr3L 24030611 5' + 1360 3369 1 48.51 AACATCTATAAGCCTAAAATAATGCCAAAAAAGGACTTAACTTTATTGTAACTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chrX 8326280 5' + opus 7023 2 55.45 TTAATATTCAGTAGTTTGAGAAGCACATTAATAAATAAGGGTAAATAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAAATGCTGTACTACAAAATTTTCTGTTTGTGGA:1 - chr2R 2118166 5' + Doc3-element 144 1 50.50 AATAAAACTGCTGAAATAATTACAAAGAGTGGAGCAGACGAAGGAGGAAGGAATTGTGGCCAGAGTTGTCTCTCACTCATAATTATTATTATTATTATTAG:1 - chr2R 17288854 5' - mdg1 44 2 67.33 CTATAAGCCTAAAATAATGCCAAAAAAGGACTTAACTTTATTGTAACTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chrX 8326285 5' + opus 7028 4 53.47 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGCTCGAAGAGTGAGCTTTCCGGGGTGGCTTTTCGTTCGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chrX 12649915 5' - P-element 2872 1 64.36 CTAGCAAATTGATGTTCACGCTGGGAATGGCTTGCGGTTGCCTTTGGTGGCATAAAATGCTTACATATACATATTGTAATAAGTAATAAGTAATA:1 - chr3R 25859459 5' - Stalker2 404 1 78.95 TTTTATCCATTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr2L 13598173 5' + pogo 17 1 62.38 ACACGGATGTTGATGCATCCAATTAGGCGGGCAATTACCGAGCACCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAT:1 - chrX 19034184 5' - hopper 1399 1 57.47 GTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAG:1 + chr2R 5532371 5' + Doc4-element 16 1 59.00 CACTCTTGCTCTTTCGGAAACTCAAGTAGGTGGCACATGGTGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 + chr2R 22745995 5' + hobo 3 1 71.29 ATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGA:1 - chr2R 4261940 5' - invader4 240 2 64.36 AAATATGTATATTCAAACAAGTGTGTACATAAACCTTTTGCTCAGTTTGCAACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr3R 12055032 5' + Doc 30 1 54.46 TTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCATTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCT:1 - 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chrX 3308673 5' - P-element 2603 1 69.31 TATTAGCACTTTATCTTCGTTGACTATGACTACGGGGGCTTTCTTTGTGTGGGAGTGAAAGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAA:1 - chr3L 5565927 5' - mdg3 5357 2 72.53 GCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTT:1 - chr3R 19449493 5' + roo 360 2 69.31 ATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCATTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAG:1 - chr3R 2689421 5' - diver2 4475 1 57.61 TAAGGTCAGTTCTGTTTACTCACAAAACAATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCAAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATT:1 - chrX 7339951 5' + G2 2627 1 66.67 CGTGAAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 + chr3R 11080669 5' + I-element 1 1 75.00 ATTTGATGAATTTTCTTTTGGCCTTGGCTTCAAGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGG:1 + chrX 22593966 5' - 412 7268 2 67.33 AGAAGCAAATAGAAAAAGCTTTAAATTTAATGGAAAATGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr3L 18523597 5' - 412 456 2 60.40 GAGGAAAAGAACAACAAAAAAAAAAAGGAA:1 - chr2L 15242270 5' + Doc2-element 244 1 83.33 TGTATATTCAAACAAGTGTGTACATAAACCTTTTGCTCAGTTTGCAACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:2 + chr3R 12055037 5' + Doc 35 1 59.41 AAAAAAACCAAAAAACCCATATCCTTACACACACACACACACACACACACGATTTTTGTTAGTGTAACCCGCACAAATATTTTAAATGTTATAAACTTTAT:1 - chr2R 2701895 5' - gypsy3 488 1 49.50 AATTTATTGATTTATTACAGTGCATATAGAGCGCATAATTTATTACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr2L 3483577 5' + I-element 30 1 52.48 AACAAACTTGCAACAGTATGGGCAGCGTATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTG:1 + chr2R 1953739 5' - blood 234 2 53.47 TTCTAAAAAAAATTAAAATTGGTCAAAATGCGCACGGTGTTTTACCTGGGTGTCATTGAGGTCTTGAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTT:1 + chr2R 20584942 5' - baggins 5053 1 77.23 ATCGTGGCTAATATACAAATATTTGTATAGAGACGTGCAGATATTAGTATTTCACTGTCTGATGGTATGCATAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATT:1 + chr3R 23173070 5' - Burdock 256 1 78.22 ACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr2R 22746086 5' - hobo 2894 1 66.34 GAAGGATGCGAAGGACTAGCGGCTGGGGGATAGGACAATGTTCAGCTTGGCATTGTTACTTAATGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 12217290 5' + roo 8677 2 66.34 AAATCACAGGATGTCCATAAGTCAAGCCAACCCGTATTCATTCCCCTTCGACTTCCAATCAATTGACATCACCCATAACTCGACAAGTTTACCATTGCCAA:1 - chr3L 10805861 5' + Doc2-element 417 1 63.37 TCCAAGTCGTTCAGCCAAAATCATAAAAATGGACCAAAAGCACAGAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGAC:1 + chr3L 11075146 5' + Ivk 356 1 55.45 GCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 + chrX 5130992 5' + I-element 36 1 56.44 TTTGTGTGGGTGTGAGCCACTCAACTTCAGCCTGTCATGGTGCACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr3R 29438702 5' - hobo 2912 1 56.84 TACCTGCAATGATACTTGGATTAATATATGTATTGTGCGGAATATATTTCATTTGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 + chr3R 3920655 5' + I-element 22 1 52.53 AAAGCTAGAAGGTTAAGATTTAGTATACAGATTCTAGAGACACGCATACACGCAGCTCTAGTTTGTTGACCCATGCTGTCACGCCCACTCTAACGCCCACA:1 - chr2R 5492220 5' + INE-1 215 1 91.09 CCTTTGTCAATCCTACGTTTTTTATGCCTTCCCCAATGTTTGATGTATGTATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 5429670 5' - roo 9054 2 55.56 TATCGCTGTATCTTTGTATCTTTTTCAGCGGGGACAACCTTTTGGTGTTTGCATTATGATTATTTTTATCATGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGG:1 - chrX 17492987 5' - Tirant 8503 2 76.24 GACGGGATTATGCAAGAATCAGGTGTTAACGTTTGCAAGTATAAACATACTCATCGAAATAGAAAACATCAAAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATG:1 - chr2L 22322358 5' + invader2 4830 1 74.26 GCCCACAACAACAAAGGCCGTTTTACCAATTTTCATTTCAAGTCCATTGTTGCCGGCCCGTTCCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAAC:1 + chr2L 16378915 5' + HMS-Beagle 6804 2 69.31 AACTGCCGAAACGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chrX 3446519 5' + I-element 27 1 57.00 CATGACGTGGGGAACACGTAGAGGAACAAGCAGTGTGGGCACCTATAAGGATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3L 3535374 5' + roo 26 2 52.48 AGATGCCATGAAAAGTATGCAAATCAATCCTATGAATTATGCGTTGTCCGTTGGTCAGCTTGTCCGTCTGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAACTACAAAA:1 - 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Tabor 435 2 72.28 GCTGCTGCGCCACTCCTTGAAAACTAGTTGCCACAAAGGAAAAGAAGCCCACAATAACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 - chr3L 12229432 5' - mdg1 403 2 56.44 GAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chrX 21945927 5' + F-element 44 1 60.40 GCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chrX 10196100 5' + 297 39 2 71.00 TAATTTTGGGCCTGGCTTGTTTAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACC:1 + chr3L 8844016 5' + I-element 493 1 78.22 CAGCGACATAAATAAATAACATTCATTTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chrX 21219517 5' - roo 401 1 73.27 CTTGCTCTTTCGCAAACTCAATTAGGTGGCACATGGTGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 + chr2R 22745999 5' + hobo 7 1 71.29 TATTGTGTTATATTTTCTTCGTACAAAATATAACCACGAACCATTTAAAGGCTTTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTA:2 + chr3R 25859349 5' + Stalker2 7276 2 52.48 GACGAATGAATACCCCACTTGCTACGCACACACTTAAAAAAAAAATGGTGAACTACATGCTGATTTAAAATCTTAACTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAG:1 + chr2L 12860807 5' - 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S-element 1594 2 74.26 AAGGGTAGTTGGTTTAATTCATGGTCCACTTTATTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 - chr3L 735091 5' - mdg1 7416 2 65.35 TGATAATTGAAAACCAAAGATTTTTGTAACAATTTTTTTTTATTATACTATCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chr3R 30562293 5' - mdg1 7432 2 52.48 GTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTG:1 - chr2R 17348632 5' + jockey 20 1 62.38 CTGTTTCCCAACACCGTAAAATGCACGAAGCCAACGTATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 3842896 5' + roo 39 2 65.35 TGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 + chr3R 11080700 5' + I-element 40 1 65.00 AAGTCGTCGGGAGTTTCGAAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGC:1 + chr2R 17402683 5' + invader4 2759 1 79.21 GAGGAGGACCGGACGGACCCAAACAAATTGACGTGCCGACACATCGACAAATGGACATGACTACGCCTATCGATTACACCGTTCGATCCGCGACATCCCCG:1 - chr3R 22203510 5' - aurora-element 4040 1 59.41 GTGAATTGCAATTTCAAAAGCATAGGAGGAGGAAAATAAGAAAATTCTAACTACCGTACCAACTACCGTGGGTGGCATGCACGATTCATAAACCCTAATGG:1 - chrX 1624911 5' - Rt1b 5065 1 71.29 TTTGTAGTTTTATTAAATATTGCTGACGATAGTTGTTCTTTTTGTCCCCGTTCGCATTGCGTATACGCCGCGTATTCCAAACACACACATACACACATTTT:1 + chr3R 18355572 5' + accord 7030 2 65.35 ATTCATGTTGAGCTTTTGCTTTGAACACCTCTCAACGGATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr2L 21018795 5' + 412 7089 2 58.42 ATTTCAATTTCAATTTTGCAATTTTGGCAGCTGCCAGGTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 + chr3L 17110710 5' - hopper 1381 1 59.41 TATCGGGTGAGATTGTTCTATGTACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACA:1 + chrX 2661394 5' + accord 245 2 77.23 ATAAAATCCCTTGTTTTCCGCAGTGTTCTTTCCATGATTTCTATTTCTAGGTGCTTTGTTTTAGGGCAGCAAAAAGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr3R 13167287 5' - roo 410 1 76.24 TAAACGACAAGCACACGCACAGGCCTTTGGCTAATCCTTGGGCAAGGACCCTTGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGAC:1 + chr3L 18395225 5' + F-element 271 1 53.47 CAACCGCAGGAAAGCAGGCTCTGAGGAGCTGCCGAGATTGGAGGGGAATGCTACGAATAAAATTTCATTAAATACACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAG:1 + chr2L 12888777 5' - 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roo 9037 1 58.42 TTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr3L 25884076 5' + Doc 27 1 47.52 AGTGGGCCTCGTATACGCAATATTGCGTAGCCGCCGTGTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGG:1 + chrX 9816237 5' + BS 4999 1 68.32 CGACCATTTGCGTGGCGAAATTCAAAGTCAAAAACGAGTTGCCAGGCCACGCCCGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGT:1 - chr2L 8299888 5' + Transpac 4938 2 60.40 TCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr2R 17348615 5' + jockey 37 1 58.42 GACTGATGTCCTTTTGCAGCGGCATCAGTGATGCCATATACCGTTCCAATGGGAGTTCCAAAGTGTTTATTATTTTTTTTTTTATATAAATACAAAACAAA:1 + chrX 5327731 5' - Bari1 1395 1 50.50 ATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTT:2 - chr2L 16379011 5' - HMS-Beagle 7012 2 56.44 AAATTTAATGTATAGTTGTTGATGTCACGAGTATCGTCCAAATACTGGTGTACATATTCTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr2R 3120855 5' - 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chrX 3293650 5' + hobo 2676 1 76.24 GCGATAAGGAAGCCAATTAATTTGGCTTGGCCACAAAAATTTACGTTGACATGTTTAGGATTTGATGTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr2L 14007379 5' - hobo 2936 1 75.51 GGTTCGGAATGACGTAATATTGTTTTTTAAAGAAATAAATATCTGCAGAAAAAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 9199840 5' - roo 9049 2 52.48 AAATTAATGTGTTTAGGGTTAGTATTTACTGTTTAAGTCAAATAAAAGTGCCCGCACATTGGAAATAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chr2L 12835912 5' - 412 484 2 69.31 GTTCGCTCATCCAGGGATTTTCATAATTCCCGGTCTATTTTACTATTTGTACTCCAAGGAATTGGGTGATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCC:1 + chrX 5969757 5' - accord 178 2 78.95 TCTACCCTCCCCCATCTCTCTCTCTCTCTTATTTTTTTTTCTTTTTTTTGTGG:1 - chrX 12256446 5' - G2 3074 2 73.58 AAAAATATATCCAAAAAATTTTCAAAAATATGGTCGTCAATTCAACAAATGTTTAACTTTTATTTATTCAATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACAACA:1 - chr3L 20853192 5' - HB 1465 1 69.00 TAACTTATTAATTTGACTGAAAATATTAAAAAGCTAATAATGTAAATACACCGCTGCGCTTTAAAAATTTTTAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 16056466 5' + TART-B 10626 3 68.67 TCTCACTTTTACTTCTTTACCTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1 + chr3L 21051610 5' + transib2 52 1 78.22 AAAAAATTGTATGTACTTATGTCTATATGAAAAAGAAAATTAAGTAAATGATTTATTAATGCAGAAACTATTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3R 21581085 5' + roo 8671 2 76.24 TAGCGATACCGCATAAACCACATATTCTTCACCATCACATAATTATATAGTCTCTGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr2R 14604637 5' - P-element 2864 1 54.46 TTTCTGGTTTATACTTCCGCGGTACAGTTCTCCTTTCCTTGACATCCAGATTAGGTACACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 + chr3L 14285986 5' - 412 474 2 60.40 AAACGGAAACACTCGCACAATGACAGAAGATAAATGGACCTGCACTTGTACGTGTGTCTCCTGCTCTCAATCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTT:1 - chr3R 13585682 5' + jockey 4770 1 73.27 CAAAAATATTGAAACAATTCAGCAACAGCCTTGTTTAACCTTGTTTTAGCTAAGATTACTCCAAATTTGTAAATTCGTTTCTTAGATCAAAATTGATTTCG:1 - chrX 20782549 5' + 1360 3173 1 68.32 GAACTTGACAAGCTTTCTAGATCGCATGGCCGGAATGGCATTTGATGTTCACAGGTAACCAGGTCATTTCATTACCATCACAATAATAATATTAATATTAT:1 + chr2R 18073541 5' + mdg1 7073 3 75.25 TTATTGTTTGTTTGAATTTTGAGATGAGTTCGTTGTTTAGTAATGAATTGTTGTTAAGCAGTTTGTTGTATTTTTGTTTTGTTTTTTTTTGTCTTTTTTTT:1 + chrX 11969661 5' - gypsy7 5008 1 66.34 AGCATCAACAAAGCCATTGTAGTCGTTGTAGTCAAAAAGAATAATGATGATTTTATCAAAGACACTAGAATAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr2R 947005 5' - 1360 3361 1 62.38 TGCCTGGCTTGTGGTTTGCGTTTAAAGTTTAAGTGGCGCAAAATCAGCGCTCATGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAA:1 - chr2L 9624623 5' + transib2 20 1 59.41 TGTATCCCCCATCTGCAGCGCGGAACTTTCGCTGCAAACTTTGAGGGCCCAAGACAAGGGCTGACAGTTTGAACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATAC:1 - 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X-element 364 1 77.23 ACAGTTGAATTGGTTTGTTTCTTCTCTCTCTTGTGTTGTTGTTGTAAGCACGCTCAATTTCTTAATCTTATTAATTGTTGTCTGTAACGAAAAGAGATCTG:1 - chr3L 1468367 5' + gypsy12 10104 2 65.35 CAAAAATTGGAATATTGGAAAAAAATGTGGGCTAGTGTAATCCAATACAAAAAACACATGCTAAATAACTTTTTTTCGTTTTGAAGTTATTAATTTTGGCC:1 - chrX 22728996 5' - Transib-N1_DM 29 1 73.27 TTAAAAAAATAGGGTGTCGGGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3L 21998434 5' + roo 8720 2 84.16 CACTTTACGGTAATCCACTTGCGATGCTGGCGGTGGTTGGGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGCGGATTTGGATGTG:1 + chrX 17961855 5' - Doc3-element 4523 1 70.00 GAGCGATTTTTGTGTAGCATATTTTTTGGCATATTTGCGCGCTTGTATGTACCAAGCACTTTGCATTCTCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chr2L 19618762 5' + jockey 9 1 74.71 GCTGGGTCTTGGAGTAGTGCTTGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGCAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAA:1 - chr2R 2144984 5' - Stalker2 355 2 70.30 CTCGGAAAATGTTAATCAATTTGCCGGCAGCAAATACATTTTGATTAATAGCCATAAACATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 12258279 5' - 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opus 7462 2 67.33 ACGCAAATTATGATGTCGGCTGATGCGAGCAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTA:1 + chr3L 19437236 5' + jockey 4715 1 70.30 GAACTATGTTACGGTGAAACTTAGTGTAGTTAATTAAAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr3R 13191456 5' - mdg1 366 2 78.22 TAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTGT:1 + chr3R 7261313 5' - Porto1 4435 1 70.30 GGGCTCCGGATGATCGACAGTTCAGAGTATTGTTCAAACATACATAAATATGTACATATATATATAT:1 - chr3L 12178789 5' + G3 4505 2 85.07 TTGCTGTAAACCGTTTGACGCTTTGCTCGCCGATGCCAGCCAGCTCAACTTTAAAATTTAATGCCATCCTTTTGTGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 + chr3L 19456994 5' + jockey 8 1 78.00 CGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2R 17348633 5' + jockey 14 1 65.62 GTGCCCCCCAGATTCAATATAAATGTATCTATATATTGCCAATTTCGTACCCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCAAAAACCCTTATCAGCAAAATC:1 - chrX 16518409 5' + I-element 69 1 54.46 ATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - 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pogo 2071 1 59.41 TCAGTGCGGAGAGCTTAATTACATTTTTTGCTTCTTTGGCGCAAACAATGCGGATGGGTGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 6097580 5' + roo 8681 2 63.00 GTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGACGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTC:1 + chr3L 26852652 5' + 1360 50 1 69.31 AAATCAACGGAATGTGTCGTATATTAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 22162710 5' - roo 359 2 77.23 GCGTTGGTGTTGTACAATGCGATATTATAATGTCCTATAACCGAGAACGGTATGGATGCACAACAAATGTAAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGAAA:1 + chrX 840662 5' - rover 61 2 46.53 CGTCTGGAGATTACAGATATAAGGGTCTCTCGGGGGTCTCGCAGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTTAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAG:1 + chr3L 7775871 5' - Idefix 181 1 57.43 TCCTTCTATTTCCCTTAGTTGATTAATAATTCGTTGGGCTATCCTCCCCACTTTTTCTCCATGTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTGTTTTTTTTTTTA:1 - chrX 10315320 5' - gypsy11 3932 1 40.00 AGAGAGCACGCGCACACCTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 - chrX 13640284 5' - P-element 2831 1 24.75 CACTAGTGTTTTTGGTAGAATGGTGGCTGGTGAATAGATTTAAACATGAAAAGTGTATCCAAGGGATGGGTTTAAACTAACAAAAATGTATTTTGATTTTG:1 - chr2R 2953263 5' + Dm88 4285 1 76.24 AATTTGCCGGCAGCAAATACATTTTGATTAATAGCCATAAACATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3L 12258262 5' - roo 9038 1 64.36 CGTAAATATTTATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1 - chr2L 16379022 5' - HMS-Beagle 227 2 60.40 AATTGACTTCTGCAATCGTGTTTTCTTTTCAGCATGAAACAAATGAAACCTGTTCACGCAAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAA:1 - chr3L 1985369 5' + Max-element 8256 2 54.35 TACAAGAACATAACTAATAAAACCGTTTTTAAAACCCGTGAAACTTGAGTACTGTTTTTACACTTTTATTTCAAACAATGTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr3L 19066180 5' + roo 8664 1 75.25 ATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr2L 17729376 5' + hobo 31 1 52.48 TTTTTTTTATAGAATTTATTTTAAGATTTAAAAATTTAATACACTTGTACTTTAACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTC:1 + chr3R 3322698 5' + HMS-Beagle2 6970 2 56.44 TTCTTTCTTCGAAATCTTAAAGTTTAAACAATACCTGTAAGCTAATATCCTCGCAATTCCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 10776240 5' - roo 392 2 54.46 TGCTCATTCCGAACTCTTTTGCTAAAAACTAAATGCAAAAAAAAAATAAGTTTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3L 4909405 5' + hobo 18 1 59.79 TTAGCCCCATAATCCCCCCTTTTTTTTTTACCTGTCTCACCTGTGTTTTTTCCTTATTATTTTCTTCTTTTTTTTTT:1 + chrX 6912231 5' - gypsy11 3934 1 74.03 GAAATCAATTTGCGGAGGGGGGGAGAGGAATTTTCCCAATGTCCGAAAACCAATCGCATTTAGACGGTTTGCATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 11936863 5' - roo 405 1 76.24 CATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCA:1 - chrX 23108318 5' + BS3 1430 1 51.49 TGTAACCTTGCCTCCATCTTATAATATCAAATGAAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 - chr3R 3920715 5' - I-element 5316 1 62.38 AGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACA:1 - chr3L 24210981 5' + HMS-Beagle2 24 2 55.45 GCTAAGCTTTACGATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:2 - chr2L 17729392 5' + hobo 15 1 64.36 GGTTTCAATAAGTCTGTCAATTTATTTGGCCCCACAAGCGCCACGAGCACCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCATAATGTAAACATTAACATCCGCTGC:1 - chr3R 4161887 5' + Quasimodo 177 2 51.49 TTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCAACTCGCACTCTACG:1 - chrX 3295655 5' - hobo 2927 1 60.34 AAACTATATCAGGCTGTTGATACTGATCAAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr3L 15869663 5' - pogo 2058 1 72.28 ATGGCAATGAGTGCATTTTTCTCTGTAATTAATCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 - chr3L 4639251 5' + 297 40 2 71.29 TTTCATCAAAGTATTTTATTATAATATATTCTTTTTATGGAAGAGCATTTATTTCCCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:2 - chr2R 3522058 5' - copia 234 1 57.43 TATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr2R 17348627 5' + jockey 24 1 58.00 AACAAACAGGAAAATGTAAATCTTTTCCCAAACAAAAAAATAAAGTATAAACCCATTAGACTTTAGTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 + chr3R 11912080 5' + I-element 53 1 57.43 GGCCACCCTTCCGAAAACCAAAAAAAAAAGAAAAAGTTACACAAAATTCTCACTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACC:1 - chr2R 19532097 5' + Doc 289 1 57.45 CCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTA:1 + chrX 21668015 5' - Tabor 7283 2 63.37 TCAGTTCTGTTTACTCACAAAACAATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCAAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGC:1 - chrX 7339946 5' + G2 2634 1 72.28 GACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTA:1 + chr2L 23372505 5' + gtwin 6920 2 75.25 CTGTATAACAATTAGCTTGCTCAGTTAGGAATCAAAAAAATAGTACGAACTATAAGTACAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr2L 20270055 5' - pogo 2085 1 61.39 ATACATTCTAACTCTGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3L 14504290 5' + 297 6618 2 64.36 TAAATCTGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATA:1 - chrX 10298062 5' + Quasimodo 30 2 61.39 AATGAGATACAGCGAGCATATATCTCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTT:1 - chr3R 17554486 5' - F-element 4384 1 75.25 GCGCGCGCAGAAAGTTGCAAGAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chrX 15219389 5' + hobo 54 1 81.19 CCGAAAACGGAATCTTGGCCTCCAAAATTGCTAGAATGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTC:1 + chr3L 3727185 5' - 297 4 2 71.58 GATGCGAAGCATTAAATATTTATTTATGGACAGAAATCTCTCAAGTCTAAGCAAAGTGCGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 - chrX 157291 5' - I-element 5337 1 62.38 TTTTGTTTCACATTCTTTGTTTAATTAAATTTTATTTGAGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGT:1 + chrX 3309507 5' - accord 272 2 61.39 TTTTGGATCAGTGATTGTTTGGTGATTAAGGTACCAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chr3L 4909336 5' - hobo 2897 1 66.34 AATTTGGCCCAAAAACTCTTACGTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr2L 9129175 5' - 412 440 2 76.24 GTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3L 3535423 5' - roo 351 2 75.25 TGTTGGCTGGGTCACCAAAGAGATGCATCGGCAAAGGGAAGGACAAGGGGGGGACCAACAAAGCCGTAAATCTCAAAACCAACAACAAAAACAACAATACC:1 - chrX 5126170 5' + I-element 132 1 71.29 TTATTTATTTTATTAATCATCTTGCATGGAATATCACACGATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTGCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAA:1 - chr2L 21646991 5' - 1360 104 1 58.42 CACTTCAAAATGAGATCCAAGCGGGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTCGTTCACATTGTCGCTGAGA:1 + chr3R 13619920 5' - Doc 234 1 74.26 GTGATGTGGAGACACTATGACAGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAG:1 - chr3L 6553587 5' - G2 2796 1 78.22 GCTGTTGGTGTGGTTTCTTGGTGCTCTAACTCCGGGCGTAAGTTTATTCGCTGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCA:1 + chr3R 31899920 5' - GATE 105 2 69.31 GCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr2R 17348624 5' + jockey 22 1 57.89 TTTTATTGGTTTCAATGTCGATATATAAAATAAGCTTTCTAAATATTTTGTTTTGTTATTAAAACGTTTTTAAATTATTTAAACTTTTTTTTCTATTCTA:1 - chrX 7395675 5' + Tc3 382 1 46.00 ATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAAT:1 + chr3L 5267223 5' + Juan 4009 1 59.41 TTTACAAATTTTTTGAATACGAAAACTAGATTGCTTTTAAAAGGCGAAACCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACACCTGAATTGAACTCATTAA:1 + chr3L 5179912 5' + rooA 337 2 63.37 CCTACACTCGAATAAAATAATTGCTGGAGAGCGGCAGTAGAGATTTTAGTTAATATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - 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chr3L 25525518 5' - Rt1b 4991 1 62.38 AATAAATAAGCAAAACATGGAAAAAAAAAACTTTGGATTTGGTTCGCAGGGTCTTGGAGTAGTGCTTGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTC:1 + chr3L 25929322 5' - Stalker2 400 2 68.32 GCAGTGTATGTATTGTATATATAGCTAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTG:1 + chr3L 24210872 5' - HMS-Beagle2 311 2 76.24 AGGAACTGTACGCAAACAAAGAAAACCAAAGCCTTGTCCGCCCTATAAAGTAGTGGAGGGTACATCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTAC:1 + chr3R 5555890 5' + mdg3 5266 1 65.35 TTCAGCTTGGCATTGTTACTTAATGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 12217330 5' + roo 53 2 81.19 GTTAAAAGAGAGAGATTCGCAAATTGAATTGGAATTATTTGGCAAGCAACGTAGCCCACTATATATGCTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTT:1 - chrX 10196191 5' - 297 394 1 82.00 GAAATGCGGAAGACGCTGTTCGAGTTCATCGACCAGGCCATCAGCGGAAATCACGATCAGCTGAAAGTCAATCTATTTACGATAACCAAATTATCCAAAAA:1 - chr3L 23768482 5' - Gypsy12A_LTR 166 1 66.34 AGCGGATGGGCTGTGGGAAAGTCGGCGAGGAAAATCAATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - 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micropia 5191 1 52.48 TAAGTTAGTTTTGAGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:3 - chr3L 3535478 5' - roo 406 1 74.26 CGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3L 19349919 5' + 1360 4 2 71.29 AAACACTTTGCTCGCTCGCATACTGGAGATTATTTTGTTCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATATGCTCGA:1 + chr3L 25143380 5' - X-element 4407 1 57.14 ACTCGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr3L 8044296 5' - mdg1 7445 2 64.36 ACAAAAAAAAACTAAAACTTGCCTACCATTTGACTTAGGGACCGAAAATAAAGGCATATTCAAAAAATCACACAAAAACACACAACAACAACAACAAAAAA:1 + chr2R 17353550 5' + gypsy9 456 1 61.39 AGCTCTTTTAGCATTCTATAGATTATTTATTTTTTTTACGAAATCTGAGACTGACAATGATAGGGAAATTAAAGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr4 295784 5' + 1360 1 2 58.42 TCCTAGGCTTAGGATAGAGAGATTCCCAATGTTCTCAGGTGATCTAACGGGTCGAGGGACTCCAGCTCTTCGCTTTGTCGCACTTGCAGTTCGCCTGAATG:1 + chr2R 2110049 5' - mariner2 291 1 74.26 TTCAATTGTCGGGCGCCGCTGGGAGCCAATTCTCGAGGATTGAGAAGATCAGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - 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Chouto 437 1 79.21 ATTTTAATTTAACTTTTGAAAAAAGTGATGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 + chr2R 22751162 5' + Doc 52 1 70.30 TACTATCACTGTTATACTATTTATACATGATAAAACTTGCTAATTATACCCTTTACTCAGCTAGTTTAAATTCGAACGGGAAATTTCATAATTTTTCTGGG:1 - chr2R 6609672 5' - INE-1 512 1 54.46 CCCGATCTCTCATCCCATCACCGCTGACAAGACGCAGAGTATTCATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATC:1 - chr2R 8249551 5' + 297 6516 1 58.42 CGATCCGGCCAGTTATGACTTATATACGAAGTAGAAAGAAGAAGACGGTTGAGTAAAATGTCCGGACGGACGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrX 21166382 5' - 1360 3384 2 78.22 ATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTT:1 + chr2R 5260087 5' - 1360 3218 1 77.23 TTTATTGCCCTCATATGTGGCATGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 + chrX 14617666 5' - hobo 2896 1 74.19 GCCCTTCCTTTCACCTACAAAACGGCCACGTCCACAATTTTACTCAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCTTAATATCTACCGATATTCCAGAAAAA:2 + chr2L 21580876 5' + INE-1 500 1 67.33 CATTCCTTTCACCAAAGAGAGAGAGAGTAACCAGTTCTCGTCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr3R 8133924 5' - roo 9037 1 57.43 ACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCACATACCTC:1 - chrX 22664426 5' - opus 7466 2 64.36 TTATGCTTTTTTATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:2 + chr3R 19515790 5' - 412 7526 2 58.42 CACACACACACACACACACATACATTACCACATCTGCCATCCTCTGGCTCGAGAAAGCCGGGAACGCTGAGGTAGAATTCTTCGCCAGCCGTCACCAAG:1 + chrX 7978953 5' - Rt1b 4842 1 62.63 GCTTTGCACATGCAAGCAGGCTTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGA:1 - chr2R 2980259 5' + 1360 54 1 76.24 ATAAGATGCGTCCACCGAGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGGGATAAGTCGTGC:1 + chrX 20812400 5' + I-element 15 1 45.54 TATTTGATAAGCTGACAGCCAAGGATAAACCTCTAGACAAGATAAAAAAGAAAAAAAA:1 - chrX 5173747 5' + Porto1 158 1 72.41 GACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGA:7 - chrX 21945914 5' + F-element 57 1 73.27 AGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 + chr3L 8044335 5' - mdg1 368 2 76.24 CTGCAAAGAACAAAAATACGAAAGACACCCAAATAAGCCAGAGCTACAAAGTACACCTACACAAGTGAAGACATCGAACCGGGAAGCGTTGCGATACAAAG:1 - chr2R 360879 5' + ZAM 77 2 62.38 TTAACAATTGGAAACCCTCAGGAGCGGAAGAGCAATTTAAAAATCGAAAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAAAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATG:1 - chr2R 20592734 5' - copia 85 2 50.50 TAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr3R 13620285 5' + Doc 53 1 77.00 GGCTTATGTGGATAAGAATACCTCTAAGTAAACCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGC:1 + chr2L 148293 5' + 1360 3293 1 67.33 TAGTTGTCTTTACATAACATTAAACTAAAACTTTTCGTTTTCACCGTTATTATGTTTTAGCCATCGATTAGTGTATAAGTTAACACAATCACAACACACCC:1 + chr3R 6136462 5' + Burdock 6139 2 76.24 TTTTAGTGTGCGCCCCGTGGCAGCTTAACGAGGACTGACTCTTCATTTATTCAGCACGTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATT:1 - chr2L 23180122 5' - Burdock 6377 2 65.35 GTAAGGCAACTAAAAGATGTGTCTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 + chrX 5130961 5' + I-element 5 1 74.26 AAGCGAGGGACGCCGCAATAAACGGAGAAGCCAAAATACGGAGGGCACAAAAACCGAATTAATCGCGAGGCTGCAAGACATCCCAACGGCAGTTCGG:1 - chrX 3304986 5' + mdg3 409 1 70.10 ATACACTTCAAGTGCACTTGCCGCCAGTTGCCAAAAAAAAAAGGAGAAAAGTATGTGTGAAGGGGGAGTTATTCTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr2R 10974097 5' + hobo 2 1 77.23 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTAATACTATGTATATATGTACATCACACGTATATACAATATTTTATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGT:2 + chr2R 1982173 5' - Tabor 482 2 75.25 GAAAAGTGGACTAGTGACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr3L 14286072 5' + 412 28 2 52.48 GACTTACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:3 - chrX 21945944 5' + F-element 27 1 60.40 ATTGAAGACTATAGATAAAGGTCAAAAATGAAATATTGTATGTAAATTCAATTCACAGTTGCTAAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACT:1 + chr2R 10552690 5' + INE-1 557 1 89.25 GTTCCAATTCCTCAGTATGATTTAATATTGATAGTTTCAGCGGCTAGCACAGAGAGTTTTTTTCTTCGCATCTCCTCCAACCACCTACATCCCTGCTGCTC:1 - chr3R 19449691 5' - Osvaldo 313 1 68.32 ACCACAGAACTGCATCCACTCTTATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCGCTCGATCGGACCTCAC:1 - chr3L 27391904 5' - invader4 127 2 80.20 TACAATTTTTAAGAATTGCGAATAGTTTTTTACACTTAAAAAGGTCATATCATATCTCGAAAACCAAAAGAGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2L 7004268 5' - roo 404 1 62.38 ATCCCAGAATCTCATTCGGTAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr2L 12995234 5' + 1360 56 1 80.20 GTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTTAGACTTACAATCCGATCT:2 - chr2R 1234690 5' + Q-element 626 1 75.25 ACATATCTACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 + chrX 17492857 5' + Tirant 8109 2 79.00 TTCAATTTATTACAGGGTATTTTTAGATGTACGAGTGGGTGCTGTTGGGCGCTCTGGAAAGTGTTAATGCTCTTAAAGTGCACCGTCTGGTTGAAACCAAG:1 + chrX 3480968 5' - mariner2 453 1 53.47 ATTTTTAATAAAGAAATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATG:1 - chr3L 27395607 5' + invader4 2916 2 58.42 TTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTATTCC:1 + chr4 1294993 5' - TAHRE 10404 1 63.37 GCTTTTAACATATCGTTATTTTTACTTTGAATTATTTGTGCTTTAGTTTTCTTATCTTCTTATTTCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGT:1 + chr3L 25508399 5' - Porto1 4500 1 71.29 AAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCAGTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTT:1 + chr3R 178121 5' + BS 34 1 63.83 GTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATT:1 + chr3L 24210907 5' - HMS-Beagle 212 4 59.41 AAATATTTGAGGGCCAAACTGCTCACACTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGCCGG:1 + chr3L 18447428 5' - gypsy12 10146 2 72.28 ATTCGTGAAAATTTTGATGAATTACACTTCGTAATATATATGGAATGTTTCGTTCCCACAAGCCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 16399025 5' - roo 9059 1 62.38 GCGAGAAGAACATGTCGAAAATCAAATAAAATGTTTAACAAAATACAAAGAACAACAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAAC:1 + chr2R 12271539 5' + Doc 4456 1 61.39 GCGAACAAGCAAAAATGACAAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACC:1 - chrX 16491438 5' + F-element 397 1 80.20 AAATTGGGTATTAACTTTACAAAGTGTGCTTTCTGACGACGGTGGTGGTGTAAGTTCTTAAACTTTGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2L 18976575 5' - roo 393 1 74.26 TTTTTAGTTTTACGTTATTATTCCACACACAGTTCTTATTTATATTTTTTTCTTCTTTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTCTGTGTATA:1 - chr3R 836740 5' - Doc3-element 4445 1 56.44 GTACGATTCCGTTTGATTTTCCGCTGCCTTGAATGCACTATCCCCACTCAATAAGCACTAATTACACTAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr2L 479301 5' + P-element 8 2 71.29 GCAGAAAAAACAAAGTGCCCATAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2L 1535700 5' + roo 54 2 80.20 TCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGAT:1 + chr2L 23300001 5' + invader4 367 1 80.00 GCATCGTATGTGCGTATGTACAAGTGCGTATGTCAGTGCATGAAACACTGGCCGGAAACCCGTGTGCAGCCGGCAAAAACACCATATTTGCGTGGCCGCTG:1 - chr3L 24510183 5' + Gypsy6A_LTR 107 1 68.32 ATATTATAATGACCCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAG:1 + chr3R 15130446 5' + Max-element 8240 2 66.34 CGATGATGTCGTTTTAGTAAAAGACGAAAACCTGCCATTCGTCAAATGGCCACTAGCTCAGTAATCTGTCACTATATCGACTTGTATGTCTCCCAATTT:1 + chr3L 25442555 5' - Helena 1229 1 65.66 CTATTACAATGGCCGCCGGTCAACTGCCAACGGCCAACTTATTGCGCTTCAATCAAAAACTGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAG:1 - chrX 21778551 5' - 297 175 2 62.38 CTGTTTGTACACACATACAAAGCAGAACAAAAGTAAGCAGAAAGACAATCTCCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCAT:1 + chr2L 21151532 5' - 1360 221 1 57.43 AGTTGACATGTTTAGGATTTGATGTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 + chr2L 14007422 5' - hobo 2890 1 75.25 CTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr2R 981626 5' + 1360 4 2 59.41 GGGCTTTTATGTCGTTTCCTTCATTAAGCGCGTATCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1 + chr2L 6115134 5' + jockey 4677 1 66.34 CCGCCAACTACAACTGCCGAAACGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 + chrX 3446508 5' + I-element 17 1 60.40 TGTTGGTATTAAGAATGGTTCAGTTGCAAAAAATAATAAATCACTCATATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCAC:1 - chr3L 17762848 5' - invader3 5434 2 56.44 AAAGTACATTTCCCCTTAGGGCGCGGTTACGAACTAATGTCACACTTTATATTGTCGGCAACGCTTCTTTATGCCTATACATACTTTTCAACGAATCTAGT:1 + chr2L 23025767 5' - INE-1 11 1 57.43 GCAGCCAGATCAAAAGTAGAGCTTGTCATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1 + chr3R 13231158 5' + Quasimodo 43 2 73.27 AAATCTGTTTGTAAAACCACATGACCAACTTCTTCGACTTGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chrX 20835276 5' - roo 9038 1 59.41 CAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGCATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCTTGCTCCGCACAAAAT:1 - chrX 21945922 5' + F-element 41 1 60.22 GTCGTAAATGGCACAGAGCAACAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGC:1 - chrX 8886355 5' - F-element 4506 1 79.21 CGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 - chrX 21668087 5' + Tabor 20 2 59.41 ACCTCTGACCCCGCTGCCTGCCGCTGATAAAGTTTTGCCAACGCTGCAGTTCGCCTATGTAAGTCGGTTGTTTGTTTACGCATACACACACACACACACAC:1 + chrX 6417707 5' + accord 179 2 77.23 GAAGGGAGTTGAGGTCCCTGATGGTTTCGTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr2L 20269979 5' + pogo 44 1 75.25 GCATTGCAAAAATGTAAGCTGCTTTCATTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2L 5654886 5' + roo 48 2 74.26 GATTTTCACTTTTTACTACCAGTCCTTTTTATTCCCCTTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACAC:1 + chr2R 25216545 5' - 3S18 6065 2 62.38 TAAAAAACAGATTGATTTAGCCATTTTCAACATTTCTTTTGGGTGTTGGTTGCCCTTCCACATTTAGCCACCTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCAGAGG:1 + chrX 22766816 5' + INE-1 137 1 71.29 TATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCC:1 + chr3R 15130485 5' + Max-element 8283 2 75.00 TTAAGATATTAATCAACTGTGTAATTAACTAATCAACAAAGCGAGTTACCACCCTACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chr2L 13642748 5' + Tirant 8146 2 60.40 TTTTGGTCGCTTGACAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3R 29361001 5' + 412 16 2 59.41 GAGCAGACTGAGGAGACCGGCGTTGGCGGTTGCCAGGATGGCTGTCAGAGCCAGAAGACATACGAATACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCG:1 + chr3R 6285026 5' + accord 157 2 71.29 GGTTGAGTAAAATGTCCGGACGGACGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTG:1 - 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pogo 2069 1 60.40 CCGTCACCTGAATAGCTTTGAGTTCGGGAGACCCAAGAATAAACACATGGGCAATGGATATTGAGCCAGTCGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCTACTGA:1 + chr3R 20789318 5' - baggins 4993 1 42.57 TTTACTACCAGTCCTTTTTATTCCCCTTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAAT:1 + chr2R 25216556 5' - 3S18 289 2 73.27 ATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTT:1 - chr3R 10736131 5' + McClintock 14 2 64.36 ATTTACATGGGCGGTGGACACCGTTTCACTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATT:1 + chr3L 4806996 5' + 1360 317 1 71.29 ACACACACAGACGCACACACACACACCCAAACATCTTGGTCATAAAGTGCAGCACTGACCGTTTTAATCTCCAACTTCTCGATCTCAGGAACTATAAAATC:1 + chr3L 13420631 5' + INE-1 149 1 77.23 GAGCATTGCTGTTTGCTGTAGTATTGTTGTTCTATTGACGCAACATCATACCGACAGTCAAATGTGGCAATTTGGATAGTGCTCTTAGATTCTTGTAATTT:1 + chrX 10781282 5' - Idefix 309 2 63.37 TGAGTTTTGCTCCTGTGTGGAGTTGTGCTCCAAATAACACTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAA:1 - chr3R 31948745 5' - hobo 481 1 75.25 TTCGTTTTTATTTGCCTTATTTTCCTAGCTTAGAGAGCTACGTTATTTATTATCTTAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACAC:1 - chrX 2844917 5' + roo 134 2 49.50 GCTGCAGTTTCCCAAAAGGTGGAGTACCCCCACAAAAATTATGCAGGCAATTTGGCCCAAAAACTCTTACGTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 - chr2L 9129224 5' - 412 7541 2 70.30 GCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAA:3 + chrX 17492873 5' + Tirant 8126 2 62.38 ATTCTCACGAATACTGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chrX 11503524 5' + roo 41 2 71.29 AACTTTGCGTTCGTTCAAATTAACTCAGGCAAATCAAACTGAAATTGTTAATTTGCCCATCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 - chr2L 22747359 5' - transib2 2806 1 61.39 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTT:2 - chr3L 11720529 5' + Tabor 6917 2 54.46 AGAACATTTCTCGTGTTCTTTCTGCTCGTCGGCTTGGTAAGTTCGCAAAACAAATGCACAAGTGCAAAAAAAGGAAATTGGAAAAGCAAAAGGCAAGGAAT:1 + chr3R 24675765 5' + Bica 467 1 69.31 AATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTAC:2 + chrX 21667991 5' - Tabor 7307 2 57.43 CGTAGAGTGACTTGCAGCTCTTTTGGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1 + chrX 19034128 5' + hopper 44 1 73.47 CGTTCTAGGCGGTGGGCAGGAAGGTGAGCTTTTCGTTAAGCTGCAGCTGGGTTTTGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTG:1 + chr3R 4713239 5' + flea 4762 1 59.41 GTGGTGAATGGGGCGACTTTTGCGATTCACAAATCGTTGGCACGCATCGGGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3L 12217384 5' - roo 9046 1 52.48 TTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAGCTTTGCTTTATTTTATTAATTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 - chr3R 28959226 5' - HeT-A 6057 2 69.31 AATGTCACTTGATGTTTGTGGGCCCTTCGCTTCCTGGCTACACTCGGAAAATTGTTGCACCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chrX 4278411 5' + blood 18 2 61.39 GTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 + chr3R 11080711 5' + I-element 52 1 76.24 AAAGCAAAATTTCAGTTTTGAATGGCATTTGTTTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCAACTT:1 + chr2R 2832922 5' - 1360 3346 1 69.31 GCCGACTTCTAAAAGTAAAAAACTATTGAAATATTTTCTATTGTGTTCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCATCTATATCCAGGT:1 + chr3R 23270275 5' - Bica 4877 1 53.47 TTTATTTTCTTCATTAAATTTAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGAT:2 + chr2L 13053209 5' + G2 335 1 79.21 TCGTCAGTTCAATTTGGTTCAATTCAATTAGTTATGCCATAGGCTCCTTGGCTCGTTCGTTAGTCCGTTTGGTTCTTATTGGATACATGATTTT:1 - chrX 10298530 5' - Quasimodo 115 2 77.66 AAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTC:2 + chr3L 24210917 5' - HMS-Beagle2 266 2 69.31 CCTTTGCGTTGCACCGAAAAGAAATATCAAAGAAAAACCAGTGGTTTATCAAAATAAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chrX 15227262 5' + roo 19 2 66.34 GACGGGTGTAAAAATAAAGACAAGATCCAAAACATGAATTGATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTATGGAATT:1 + chr3R 19720392 5' + 1360 3111 1 62.38 TATTTTTAATAAAGAAATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAAT:1 - chr3L 27395608 5' + invader4 2915 2 57.43 TACGCAATATTGCGTAGCCGCCGTGTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCT:1 + chrX 9816250 5' + BS 5012 1 56.44 ACTCCACACAAAACTTTCTGCCCAAAGAGCCCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTATGCAGTTTT:1 - chrX 1073564 5' - Quasimodo 7077 2 72.28 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCACGCGGCCAGC:1 - chrX 12649915 5' - blood 7151 2 93.22 GCGCCGTTAAGTATGCTATAGTTTTTTCTTAGGTTTGGAAGGTCTATTTTGTAGGTTTCTAAGCCAAATATTAAAGCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCC:2 + chr2L 12246541 5' + hobo 2709 1 48.51 TGCCAGGCACCAAAAAGTGTGCTACACATGTTGACATTGCCCGTGCGTGCATGTGTAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr3L 917193 5' + hobo 20 1 57.43 GTATTGTGAAAATATATTTATGTAAAACGCATTGTAATATATTTTGTAATATTTTGTAATCCATAAATCGTTACAAATCATAAAAATAAAAAAAAA:1 - chr2R 10927214 5' + Doc 4690 3 54.17 CGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 + chr3R 19515820 5' - 412 7496 2 75.25 CCTCTTCGCCTTATAATGCATTTTCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 - chr3L 494679 5' - Transpac 5179 2 78.22 CTGCGTGTTGTTCCTTTTATCGTTCTCACCAAAGACACTAGAATTATTCTGGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAAAGCGGACACAAGCAC:1 + chr2R 2498406 5' - 1360 466 1 65.35 GTATTGTGTTAAGTCTCTTTAAGTTTTTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACA:1 + chrX 7086591 5' + I-element 127 1 73.27 GACTTCAATTCTAAGTTGTAGTTTCAAATCAGGGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGG:1 - chr3L 12565700 5' - roo 9030 1 62.38 AAACTGCACACACAAATGAATACAATGGGGCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATG:1 - chrX 15958637 5' + 17.6 63 1 70.30 ATGTTTAATCAACATAATCAAGCAGAATGGTTATACAGTATAATTCGATTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGAAACTTAAAAA:1 - chrX 12166578 5' - pogo 2058 1 68.69 CCGGCGTGATGTTTTTTCCTTTTTTTTGAACAACTATACCGGAGCCCATCCTCTCGTACTACATTTTGTTGTTCGAGCAAGTCAGAGGGGTGCAACGACCA:1 + chr2R 2872972 5' + gypsy10 5657 2 72.28 CTGCGAAAACTAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:2 - chr2R 1725952 5' + Doc 22 1 63.37 TTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCTCAGCTCCCA:1 - chr2R 2868550 5' - Rt1b 4746 1 30.77 ATTTTCGCCAATTAGCGCGCATAAAATTCAATTTATAACTGCAGTTTCATTAGTGTCATCAATGTGGACATGTGTGTACAAGTTAACACAATCACAAACCA:1 - chr3R 23173205 5' + Burdock 6136 1 77.23 CCTGGCACTGTTTGCGCAGCTCCTGATACTCATTCTGCGGAACAATATAAATATTAACTACATATAACACAGTCTTCGGGTGGAGACGTCTTTCTTTCAAG:1 + chr2L 16668585 5' + Doc 27 1 60.40 TGGACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATT:1 + chrX 22726189 5' - Helena 1279 1 53.47 ACAGCACAAACCTTATCTAAGCTACGAAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGT:1 - chr3R 3374273 5' + invader2 4843 1 73.00 ATTTGATAGCACTGAAACAGTTCCAAGCAATTAATTTATCCACTTAACACGCAAACTTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAA:1 + chr2L 20271078 5' + pogo 1654 1 58.42 CTTATTAGTGCGAAACTAAAAATAATTCCTAAGTTTATATATAAATACAAAAAAAGTCATGAAAATAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTG:1 - chr3R 3916212 5' + I-element 445 1 62.38 ACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chrX 17492893 5' + Tirant 39 2 65.35 ACAGAATGCAATTCGTTGACAAGGGCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 + chr3L 2690957 5' + Doc 61 1 75.25 CAGTTTGCTCTCTCTCTCTTTCGCTCGCACACTAAGTATGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr3L 3070652 5' + 1360 38 1 66.34 AACTCGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 + chr3L 8044295 5' - mdg1 409 2 66.00 ATTATAATATCTACCATACATACTTCAATATTTGTGAGTAAATCCAAGCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTCATTACCTACCAGTACAGCAATCACGATAT:1 + chrX 5380853 5' + Doc3-element 488 1 56.44 TTATTATTGTTATTATTATTATTGTTGTATCCTGCCATTCAGATAGCTTGAAATCCAATTTAGAAGATCAACCTAAAATATCAAGTTTTCTTATTAGAAGG:1 + chr3R 9485824 5' - Q-element 351 2 76.24 ACATCTTCAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAAGATGAACACTCATAAGGCCC:1 - chr2R 4677364 5' + invader3 5193 2 73.27 CGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACAT:4 - chr3L 24210979 5' + HMS-Beagle2 25 2 55.45 TAAATCAAAAATGACTTCCTCGATTTGTAGATCTTTTAGAAGTATTTCTGTTGCTTGAAAATTAATTTTAATTAATTTATTT:1 + chr3L 7832907 5' + HeT-A 379 1 58.54 TCTTCATTTCAGTGCTAATGAAAGTCTGCAGCACAAATATTTGTAGTCGAGGGAGTTGCAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr3R 9328660 5' - hobo 2921 1 56.44 ATACATATCTACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTA:3 + chrX 17492855 5' + Tirant 1 2 80.20 GAACACCAGATCTCATTATCATTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCA:1 + chr2L 5662080 5' + hobo 2702 1 79.21 CTGTGCTGAATCAGAAATTCAATGGGTGACCGGTGGTGGTGACCAAGAAGTGATCGAAACTAATTTTACCCTCACAGCATTTCTTGCAGCGTTAAGCAACA:1 - chrX 3429549 5' - gypsy 7123 2 55.45 AATAGGTTCAAAACAATACTGGCTATGCATAACTTTCCTAGCTAATTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCT:1 + chr3R 21710555 5' - mdg3 216 2 51.49 CCCCGGCGACCATCGAAGCCACCGTTTCCTGGTGGAGCGTTTTTCTGGGGGTGCTCCGGTGGACAATCGCCCCGAACTGCCGTTGGGATGTCTTGCAGCCT:1 - chr2L 9193927 5' - mdg3 401 1 78.22 ATCGATACCAAGACGACAAATATCGATAACTTTCCATGTTCACTCTTCTACTCTTTTAACATTAATGTTATGAGCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr2R 19164076 5' - P-element 2886 2 65.35 TAGCATTCGAAACGAAAGGGACGGCGGACGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAAATAGCCAA:1 + chr2L 19684616 5' + mdg3 48 2 73.74 TAAACGTTAAAAATAATCCCTATGATATGAAGCAAATAGTTCGACATACATAGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr2R 17697193 5' + pogo 23 1 52.48 TGTGTGTTGTGTAAGATTTTTTTTCATTTACAAATACAATTCGTTTAATACCTACAAACTTTAGACGATGATAATGATGATAAACCTATTGAAACGGACAC:1 + chrX 8048506 5' + Juan 288 1 57.43 AGTAGACGGCGCTACATTTAATCTAATCTTGAGCAAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr2L 9672387 5' + 297 2 2 75.25 GTACTTTCTGTGCAAATGAAAACCATACATTTCATCACCCTTATTACGGTTTTCGATGGTCTAGGGATGACTGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3R 9328769 5' + hobo 3 1 72.28 TGATCGGAATCGATTCTTTAACGCTGGAAAATAAGCCCCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAG:1 + chr2R 3333945 5' - Quasimodo 6978 2 52.70 TCACATTACCTACATCAAGTGTCACTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAAC:1 - chr3R 13619977 5' + Doc 326 1 76.24 TTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCT:1 + chr3L 25804308 5' + gypsy 140 2 83.33 CGATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr2L 17729381 5' + hobo 26 1 53.47 GCCCGATGCGAATATGGGTTAACCACTCCGCACTTCCACACGCAGAAAAAACAAAGTGCCCATAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2L 1535741 5' + roo 8677 2 66.34 GCCTTTCGAAATGATAGATATATATATTTACATTCATTCTGACTGGTACTCATGAATGGCCAAGACATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr2L 10104357 5' + roo 11 2 54.46 ATAGTTAAGAAGATTCATTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 + chr3L 25884059 5' + Doc 10 1 64.36 GATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2R 17348629 5' + jockey 12 1 66.67 GAAATAAGGATTATTGGATAAATATAAGAAGAGCGGAAGAGTTGAGAGCGGGAGAGTTGAGGGTATTTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTAC:1 + chr2R 10334658 5' - Porto1 434 1 71.29 TTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTC:1 - chr2L 23295881 5' + micropia 4969 2 62.38 GTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chrX 5168844 5' + hobo 30 1 51.49 AAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCC:6 - chr3L 24210956 5' + HMS-Beagle2 49 2 75.25 ATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr2L 9672423 5' + 297 37 2 67.00 CGTTGTCGCGGTCGCGAGCGCGCTCGCGTCGCCAACCGGAGCCATCCTACGGCAAGCTGCAGGCACCGGACATGATCCACCCAAACACGGTCTTTTGAGCG:1 - chrY 2708382 5' - GATE 8141 1 61.39 GACGAACTTGCAGGAGTGAAGAAAGTCACCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2R 15402902 5' - roo 361 2 71.29 GCTTTTAATTGATCAAATTGTTTAAATATACGGTATGCATATATGCAAATACGTATATGTGTTCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAA:1 + chr3L 17684614 5' - 1360 298 1 66.34 TGGGCAGAGGGCGAAGTGCAGAGGGGCGGGGCAAAAGGACGATGAAGCTCAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 - chr2R 18374854 5' + 412 7075 2 56.12 ACTTTATAATCCACATTCAACCGAACGGTTATCCATTAAAAAATCAACGGAATGTGTCGTATATTAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTCTACTC:1 - chr3L 22162750 5' - roo 400 1 70.30 GTTATGTCGAAAGAGTTATGCTCAAAAGTTGTAGGAGGAGTGCTGCTCGGTGCCTAAGCTTGAATTCAAAGCACTGATTAAATGGTAGTAGCGCGTGTTAT:1 - chr3R 9216988 5' - Chimpo 433 1 68.32 GAAGACTCATCTCGAATCTCCCAGGACAGCACTACAGCAGAATCTGACCAGCAATAAACGGGCATGGTCACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAAC:1 - chr2R 3480874 5' + Juan 6 1 66.67 CATGTACAGTGCAGGTCAAAATATCTGTCGCATTTGAACTTGGAACAAATTTCCTTTTTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTGAAGCTTTTC:1 + chr3R 25387610 5' - pogo 379 1 76.24 CTAATTTGGTGGACTAATAAAAATCGTTATAGGCTATACCCACAAATGTAGGGTTTGGCTAGAGCTTCTTTCCTTTTTCCATTCTGACAAGGCAGTTTTTG:1 + chr2R 3119949 5' - jockey2 483 1 57.43 CAAATAGCTTCAAGCTAATTTACAAGATTGTAAATTAAATTGGCATAAAATTATACAGTAAATTGGTTCAAAAAAGATCCTTGTTCACACATGAACACGAA:1 + chrX 11299938 5' + roo 8663 1 78.22 TAACACATTTCGCATTGCAGCAGGATTTACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 16569530 5' - roo 9026 1 70.30 GATGGAGGAATTGGGCAGCCGTGCGCAGGACCTTTGCAAAAAGCGACGAACTTGCAGGAGTGAAGAAAGACACCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr2R 15402946 5' - roo 407 1 75.00 TACAATCACCGTAGTGTCCGTCTTTCCTCAGAAAAAACCCATTCCTGGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3R 11153629 5' - 1360 3388 2 71.05 GGTGTCTTCATGGGACCTCATGCACAGCTTTTTTTTCCCTTTTGGAGCTAACTTCCTTCGTAATACTGGGCTTCAAAAATAATCTTCAAACAGATGCCATC:1 - chr3L 25808479 5' + Q-element 288 2 63.37 CTATATCTATTGAATTCAAAGCACATCAGTTTCTACAGTTATGTTGCCATTTTTCCTCTCCGCTTGTGTGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAT:1 + chr2R 13645319 5' - accord 181 2 61.39 TCATTCCTTTCACCAAAGAGAGAGAGAGTAACCAGTTCTCGTCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:2 + chr3R 8133923 5' - roo 9038 1 59.41 TTTGCCGATTTGTTTCTGGATAATTCTGCACTTTGCCCGGTTAGTTTACATGTGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGA:1 + chr2R 10602550 5' - Quasimodo 251 2 60.40 CAATAGAACATTTGATAAAATGTATTCACTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 14835258 5' - roo 9026 1 76.00 TCAATGGGAGGTGATCAGAGATGGAGAGACACCTACTCAAATTCCTTGTAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACA:1 + chr3L 23979434 5' + F-element 335 1 51.49 AACGCGAAGAACGCGTTGCAGAATAATCACATCGCAAATACGGCGAAGGCAGGAAAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGC:1 + chrX 14955875 5' - accord2 7287 1 66.34 CATTTTGTTAGACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTAT:3 + chrX 21564073 5' - invader4 311 2 63.37 TAAATATTCATTCCTTTCACCAAAGAGAGAGAGAGTAACCAGTTCTCGTCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 8133916 5' - roo 9045 1 55.45 CAGGGGGAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3L 14558255 5' + 297 6612 2 60.00 ACATTTAAGCGCTCAAAATTATGGCAAATTGCTGCAGATTGAATTGGTTTGTGTGCCTTTCCTGTGTGTGTGTGTGTATTTCTGTGTTTTTGTTTCTTG:1 - chr3L 8038692 5' + pogo 300 1 95.96 CCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 - chrX 21945907 5' + F-element 63 1 80.00 AAAACGATTTAGCTGCACGAGAAAGAGTATTAGATCGTTAGCCCGATTAAGAATGGTTAATTGTTTGAGAAAAGCAGCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTG:1 - chrX 9128689 5' - Idefix 6976 2 71.29 CGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2R 17277626 5' + jockey 36 1 52.53 GATATCTGTTTTATAGCCATTTAGTGAAAATATCGTTAAGAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACCTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2L 10104271 5' - roo 9037 1 57.43 GAATGAATACCCCACTTGCTACGCACACACTTAAAAAAAAAATGGTGAACTACATGCTGATTTAAAATCTTAACTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACT:1 + chr2L 12860810 5' - roo 9069 1 73.27 TAACATGCAATCCACGAATGAGGAATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTAC:1 + chr2R 3357792 5' - Burdock 6312 2 76.24 TGCAGCGACATAAATAAATAACATTCATTTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:2 - chrX 21219519 5' - roo 403 1 75.25 CGTGTAGCTACACAAGTGACTTCTTCTGCAATATAAGTTCATACTGCCTCACGTCGACATTAAGGCTTCATATTAGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAAT:1 - chr2R 3168739 5' - 1360 209 1 70.30 AAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTCACATTTAAATGATCTGCGACATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATA:1 + chr3R 3985684 5' + gtwin 21 2 58.00 GAAAACTAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 - chr2R 1725948 5' + Doc 14 1 67.42 TTAAAATCATATAAATTTTAAAAGAGGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chrX 11300021 5' - roo 357 2 79.21 ATAGATTTAAACTAAACCCAAGCTGAGGCGGGAAACCGCTGCTTGGAAAAACTGACAACAAAACTGTCAGGCTATAAGATAACTAAGTTAACCGGGTGACG:1 - chr2R 17373248 5' + gypsy6 4 2 73.27 TATTCAACTATATTTTATATAGCCAATAAGGGTTAAGGGCTTTAGAGGGTTACAAGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTA:1 + chrX 7275056 5' - Idefix 226 2 45.54 CTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTG:1 + chrX 21564089 5' - invader4 295 2 57.43 ATGCAAACGAATACAGCAACGTATCCTTTAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTT:1 - chr3R 19447292 5' + Stalker 7161 4 72.28 GCACATAAACAGCCCCACATAGACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 6097641 5' - roo 354 2 79.21 AGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATT:1 - chr3R 10736127 5' + McClintock 18 2 60.40 GTTGTGGGTATTTGAGTTTTGGTTGCAGAGTATACTCTTCATCTCCATTTTTTGAAGGACGTTGATATTTGTGTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTG:1 - chr3R 21972855 5' - I-element 69 1 67.33 GATCAGACAGATACATAGAAGTATATTCGTTTCTATACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:2 + chrX 21184569 5' - 297 6938 2 69.31 AAGGGGCATACTGGAAAAAACATAAATAAGGGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTAT:1 - chr2R 25216589 5' + 3S18 44 2 74.23 GAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1 - chrX 21668081 5' + Tabor 18 2 58.06 TAATAGGTGGCCAGTAGATTTCAGTGAAATGGGGAATTTTAGAAGCGTAGATATTACATCTAAATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1 + chr3L 920458 5' + mdg3 5262 1 60.20 CGGTTCCGCGCATATAATACTTAAATTGTGTATGTGTGTGTGTGTGCGTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTG:1 - chrX 16145449 5' - Tirant 81 2 56.44 ATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTCTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr3L 17635583 5' + 297 6613 2 64.36 GTGACAGATTTGGGCGGTTCTCGTTGTAAATACCAGCAAACTGATTTATATAGTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTC:1 - chrX 21564166 5' + invader4 26 2 54.46 TTAAATTGTATGTTTTGAATTAAAATATTATGTAATAAAACTCAGCTTGGACATTTTCGCATTTGTTGCGACTCAATCTTTGTGTTAAGAGATTAAAAATA:1 + chr2L 10323374 5' - Doc 4654 1 74.26 AAGTGCTAACATTAAATGGCCGTAATTGTTGGAACTGCATATAAAAATTTGTATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGT:1 - chrX 22590226 5' - Burdock 6368 2 54.46 ATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGA:1 + chr3L 24210888 5' - HMS-Beagle2 7178 2 62.38 GGGCGCGACGCTGTTGCAATGCGACAGCTAGAAATAGCAGGCACTTATCCGCCGAACAATAAGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 - chr2R 7307934 5' - 412 7531 2 61.39 CCTTAATTAAAGACGCATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAG:1 + chr2R 17934967 5' + P-element 221 1 22.77 TGGGGCGACTTTTGCGATTCACAAATCGTTGGCACGCATCGGGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3L 12217376 5' - roo 9038 1 55.45 AGCAGGGTCTTGGAGTAGTGCTTGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGA:1 - chr2R 2144985 5' - Stalker2 356 2 71.29 GGGTACATAGCTACATGCACTATTATCTCCCCTTGTTAATGACTTAATTAAACGCCTTTTATGTAAACAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTC:1 - chr2L 3483284 5' + I-element 467 1 77.23 CGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 + chr3L 8044299 5' - mdg1 404 2 61.39 CCCAAAACGTAGTCAAGTGCAAAACGGGCAATGCTACAGAGGAGATTTAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr3R 25566850 5' + hobo 28 1 53.47 TCGCAAATTGAATTGGAATTATTTGGCAAGCAACGTAGCCCACTATATATGCTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 - chrX 10196175 5' - 297 6958 2 67.33 TTATCTTACCCTAGCCTAGTGTATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 + chr3R 10957293 5' - hobo 2896 1 80.00 ATACTTATAATTATAAAAATCATAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCT:1 + chr2R 5582161 5' + Cr1a 435 1 71.29 CAAACTCAAGTTTATTGCCATCTTCTCAGTCTTAGTCTTTCCAGGAGTTCGGTGAAAAAAGTTACTTTTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr2L 15798600 5' - roo 403 1 73.27 GACTATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGACCATATTTATCGATTCAATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAGATCT:1 - chr3L 12364634 5' + INE-1 133 1 75.76 GCTTACAATTTCTGACGGCGCAGACAACGAGGCGCGCAAAATAAATATTATGCCAAAGTAAGCATTTATTATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCC:1 - chr3R 24601360 5' + I-element 5040 1 77.23 CCTGGTTTGTCTGGTGTCTGGGATGCCTCCTAATGATACAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 - chr3R 12546869 5' - hobo 2906 1 62.89 GCTTTACAGAATTTACTGCCATACTGGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTT:2 - chr3R 8499465 5' + Tabor 6891 2 78.22 CTTTAATGATCATTTGACTTCAATTCAAGATTTACGTTTTGTACCGTAAAAAATAATGGTAAACGCTATAATCAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTAC:1 + chr2R 9236990 5' - INE-1 551 1 71.29 GTGATGAAAATGTAGCATACATTTGGGCGCCGCTAATAGGAAAAACCAGAGCGCGTCGCGATGGTTGCGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:2 + chr3R 13623624 5' + jockey 14 1 69.31 TTCTTTAAGTTAGTTTTGAGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGA:2 - chr3L 3535483 5' - roo 411 1 79.21 GTTGCTTTTCCTTCCTCGACTTCCCCAACCCCCCTCCCCACCCAATTTTGCCTGGGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCCGTTGTTTTTACAATAATGTG:1 + chrX 14615596 5' - hopper 1396 1 56.44 AGCACTTTGTGTATATTGGCTTTGGGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1 + chr2R 17942085 5' - mdg3 216 2 54.46 AATATTCGATGCTTCCGTTAAGGACAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chr3R 25377444 5' + jockey 56 1 71.29 TTAATACTTTTTGAAAAAGAGAATAAAAAAAAAAACAAATATGCAACAGTAAAGAAAGTAAAAAGAAATACACAATGTAAATCCTAAATCGTAAAATCAAG:1 + chr3L 5749437 5' + TART-B 10300 1 75.25 CAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCGCACGC:1 + chrX 17492866 5' + Tirant 8119 2 69.31 TATGTGTGCTTGGATCTCGCTGGGGCTATCGCTCTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAATGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCG:1 - chr2R 20617863 5' - 1360 3198 1 68.32 CATCTGTGGAACGTGAAATGCCAAAAAGTTTTGGGATTGCCGACAATTTAGAGATTCCTCTGTAATTGCATGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGA:1 - chr2L 17735755 5' - Q-element 72 2 79.21 GGGAAAGGGTGGGGGGTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 + chr3R 11080691 5' + I-element 32 1 56.44 GAAATGAAGGACCGTATAGCTTTGAGCAATGAGAATAGGAACCAACCAGAAACTATCAAGGTAGGTAAAACAGTCTTTAAAAACCAGGGTATTTATACCTC:1 - chr3R 1720838 5' + TAHRE 399 2 78.22 GGCGGCAGACACGCCCACTCCCCGGCATCCCACACACACACACACACATACATTACCACATAGCAACAGCCATACACCAAATCATAGAATGTCTTAGGATA:1 + chr2L 17010116 5' + Quasimodo 85 2 65.35 GGGAACAGGGGCAAGGGCGGATCAGGAAAGAAAACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTGTAAGGGTCATGCAACTCAAA:1 - chr3R 14968958 5' - Cr1a 4169 1 73.27 CTGTGGTTAACCCATTAAGATGCATGACTCGAAATAAGCTGGCTGTGGCCTATAAATCACGGACAGCTTTCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGC:1 - chr2R 14402342 5' + Tabor 6 2 73.27 ATTGTTAATAAAATTCAGAAATACTATATTTGTAACCAAACAATAACGGCCAGAACTAGAATAAACCGAATACTGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGT:1 + chr2L 23296021 5' + micropia 5191 1 75.25 AGGAGCGTATTTTGGTCGCCAAGGGAGAGGGGATGGGGTTGGGGGATTTTGGGGGCGGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3L 17767735 5' + hobo 19 1 61.39 AGCACAGCATTCGGGGCTTTGGGCGGGAAAGAGATAGAACGAGGGGAGGGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 + chr2R 15921312 5' + 1360 24 1 55.45 GAAATGCGGAGCGAGAGAAAGAGAGAGTAGCATTCGAAACGAAAGGGACGGCGGACGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:2 + chr2L 19684589 5' + mdg3 23 2 57.43 AGCGTAGAAATCAATGGCTCACCTGGGAAGTAGTCGAGGTGCATAATTGGGTTAGCGTAGCAGCAGAACGGCCTGCATTATCGCGTCTATCTCTTCTCGCG:1 - chr3L 16937108 5' + Cr1a 4369 1 76.24 TTTGCGCGCTTGTATGTACCAAGCACTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr2L 19618795 5' + jockey 57 1 71.29 AATACACCGCTACATATACAAATGCAAATTAATTAATTTGCCAAAAGCAAAACCTGTTTGCTCCGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTG:1 + chr3R 13231049 5' - Quasimodo 7010 2 70.30 GTGCGAGTGCAAGTTTTATGGCTTCTTCACATACACATTTCACTTTATTTCCTTGCAAAATAAAGAAACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chr3R 14991779 5' + hopper 6 2 73.27 GAAATGCCTTTCTCTGCGCTTCTCAAAACATTCATTTGCATGGCGAGTTTCGTGTACCACATACATACATATGTATGTACATGAATAGTTGTGATGCCTCA:1 - chrX 18975672 5' - diver 226 1 44.55 TGTATTGTAATTTTTGTAGACATTCTCCTAGAAATTTTTCCATTCTCTCCACCTGACCATTTCCTCGTGGTACACCTGTTTTAATTACATTGTGAGAAACA:1 - chr3R 3480986 5' - TLD2_LTR 197 1 50.50 TCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCC:2 - chr2L 23295856 5' + micropia 5080 4 64.36 TGTTTAAAATATTCAACAAATTCTTTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - 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Tabor 478 2 71.29 TGTATGGTGGTTTAACCATTCCACCGGGTCCTACTTGTAATCCTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATTAAAGCAACTCATAGTTAAATCTACAAAGATT:1 - chr2L 22340661 5' - Cr1a 4151 1 68.32 TGTACTTCGGTGGAAACCATACTTAATAAGATAATCACTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:2 + chr3L 4539159 5' - roo 9036 1 61.39 CACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGAAATTGTGATCC:1 - chr2R 17348590 5' + jockey 63 1 81.19 GCCGCATGGTACACAAGAGGCAAAAGCAACTAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACTGAGAGGGAGTCAGTCGAATGGTAAAGCTGAACACGGAAAGTAA:1 + chr3L 7823281 5' + invader2 5030 2 69.31 TCTCCCCAAGGCAAGTCTCCACGAATTTTATCTTGAACTCAAATTGAAAACAAGAAGGCTATAGTCGAGTTCCCAGACTATCAGATAGCCGTTACTCAGC:1 - chr3R 4132767 5' - INE-1 546 1 69.00 GGCGGCGGCGGGTGTGCGACTTCAGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 - chr3R 13995981 5' + 1360 49 1 75.25 GACTTGGAAATGCCTTTTTTTTATTCTGAATAAAATTCTTTGGTCCCCAAATTACTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr2L 21631808 5' + pogo 19 1 64.36 ATTTTAATCACTATCACAAAGTTTGCAAGCCCACGAATTTGAAGCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chrX 3330435 5' - pogo 2071 1 53.47 TGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chrX 17492875 5' + Tirant 8128 2 60.40 AATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTT:1 - chrX 21668055 5' + Tabor 6891 2 75.25 CAGCGGACAGCAAACAAAATCCAAAACAAAGCTGCAAAAAGGAGGGAAAAAAGGTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2R 21902135 5' - roo 386 2 60.40 GTTTTCCGCAGTGTTCTTTCCATGATTTCTATTTCTAGGTGCTTTGTTTTAGGGCAGCAAAAAGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 13167299 5' - roo 398 1 66.34 ATCCAAAACAAAGCTGCAAAAAGGAGGGAAAAAAGGTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr2R 21902117 5' - roo 9031 1 78.22 GTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACAAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGG:1 - chr3R 15790103 5' + flea 4707 1 78.22 GGTGCAGAGGTGTGAGCTCAGGGGGAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:2 + chr3L 14558237 5' + 297 6595 2 66.34 CCTTGTTTTCCGCAGTGTTCTTTCCATGATTTCTATTTCTAGGTGCTTTGTTTTAGGGCAGCAAAAAGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:2 + chr3R 13167295 5' - 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P-element 2876 1 68.32 ACCTGTAAGCTAATATGCTCGCAATTCCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chrX 10776208 5' - roo 9023 2 76.24 TTTTACATATGCACAGTAATCAATGGATTGATTATTATTGTTTATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chrX 8037695 5' - roo 9041 1 65.35 TGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:4 + chr3L 8044320 5' - mdg1 7421 2 61.39 AGCTATTGCAATACATTGTATACGCTAATAAATTACTCTCATTAAAAGTGACTTTATGGGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTT:1 - chr3R 16110254 5' + mdg3 5270 2 65.35 CCAAGACAATATATAACTTTTTTATATCGCGTTTATATCTTCTCAGAATCTATTCGCGAGAAGATATAAACGCGATATAAAAAAGAGAACAGAAACGAGGA:1 + chr3L 24191824 5' - Cr1a 4344 1 65.35 GGTAGGTGGTATGTAACCCTACACGGGGACACGACATCACGGAGCGCCACACAGGCGTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1 + chr3L 13652163 5' - mdg3 226 2 57.43 ATTTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chrX 21219493 5' - 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gtwin 7381 2 69.31 CCAACCCACCGCCTTGCTGCCACAGCAAAAGATGCATGGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCT:1 + chr3R 17980746 5' + HMS-Beagle 35 2 64.36 AACACGGCAATACAAAATACAAAGACAGCTATTGCAATGCACTATGGGCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCG:1 + chrX 12885709 5' + transib2 40 1 64.00 GGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTA:1 + chrX 17492872 5' + Tirant 8108 2 76.19 AAGTCAACTTTCCAGTTAAATATAATGTGGCTAAGCGCTTTAAAGATTCTGCGACTAGCCAGCTTAAGTCAAAATTGCAAAAATAAAATGAAAAAAAAAAT:1 - chrX 3291986 5' - INE-1 476 1 68.32 CCACTCCTCACTGTTTGCGCTACGTTTTCAGTTGAAAGGCAAAATTAACAATATGCAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTGTTTGAGAAAAAAAC:1 - chr2L 12752651 5' + HMS-Beagle 426 1 63.37 AGAAAATAATAGCAAAACACCGGGCCAAGAGATAAAATCGCCATTACTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAAC:1 - chrX 17581309 5' - roo 380 2 52.48 GTAGGCGTGGCACCAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGT:1 + chrX 21667977 5' - Tabor 482 2 69.31 CAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTTT:1 - 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roo 341 2 60.40 TTTTGCTGCCCCGTTTCGCCAGTTGCAAATAGATTTCACGCTTTGTTTTATATTCCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 21998491 5' - roo 9052 2 59.41 ATAGAAGGGCCAGCTTTGTTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTC:2 + chrX 11503463 5' - roo 9041 1 57.43 TTAAGTCAATTGCGACTGCAAAGTGCCCATATTAACACATTTCGCATTGCAGCAGGATTTACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:2 - chr2L 16569562 5' - roo 395 1 63.37 TTCTGGCAAGTACTTTATATTTCCGAAGCATTGTGTCGTGTTTTAGAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:2 + chr3L 12258191 5' + roo 30 2 57.43 TTAGGACGTTGAACCACAGCCGGCAGAAATGCAGAAATGCACGCAACTGAGTGGCAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCA:1 + chr2L 19574452 5' + P-element 237 1 60.40 GGGCGGTCCGGCAGCTTACGCTTGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCC:1 + chr2R 594120 5' - gypsy5 7296 2 79.59 GTTGCTTACTATATCCCCCCCTCCACTCTGTTTTTTTTTTACTTTTTTTT:1 + chrX 12292375 5' - gypsy7 5008 1 86.00 ATACTTTTGTTTTCGGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr2L 8898931 5' - roo 9028 1 66.34 TTTTATTCCTCCGTTTATTTTCATTTTCCTTTTTTTTTTTG:1 - chr3R 21939176 5' - Doc2-element 231 2 78.05 GTTAAATTCCTTGACAACAGATACATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAA:2 + chr2R 21249467 5' + gypsy 7038 2 76.24 GAACTGAACGTTTAGCTGGCGGTTCGGCTGCTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chr3L 16661602 5' + P-element 47 1 32.67 GTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chrX 5168866 5' + hobo 47 1 71.88 CGGCAATTAGGACCTTTAACGAGCGTTTCAACATAATCTTAAGAGTCCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr2L 2010130 5' - P-element 2858 1 50.50 CTAAGTTGGGCAAATGCATATTAATATGATTAAGATTGAAATACTAGTCAAAATAAGAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 + chr2R 12007196 5' - mdg3 5479 2 59.41 GGGATCTTTTCTGGGATTTAGATTGCCACACGATGGTCGTGTGAAATGAGCACTTTTGAGTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chr3R 21587332 5' + pogo 13 1 64.36 TACAGTGCATATAGAGCGCATAATTTATTACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - chr2L 3483562 5' + I-element 45 1 67.33 CGACCACCCAGCATTGTCGATGCACTTCTGATAGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCATAGTCTTCGGGTG:1 - chr3L 22231410 5' + Doc 8 1 73.27 GGCACGCCAGATCCTTCTCCTTCTCCTCTCCTTCGGGCCTCTTGCCGCCCGACGCTTCCACTGTTTATTATTTCCGACTTGACCGCGCGTTCTCACTCCCG:2 - chrX 23470418 5' - gypsy8 443 1 72.28 AACGGGTTAACGCTATGCTGAAGACTGAAATTCGGCTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 + chr2L 13142117 5' - copia 5084 2 66.34 CGAATAGATGAGGAAAGTGAACGTCTTTGTCAATTTGTTTAACTCAAATGTATAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAA:2 + chr2L 21777907 5' - mdg1 400 2 57.43 ACGGCAACCGGCTAAAAAGGCAGCGGCGTCGCGTAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAA:1 - chrX 2469744 5' + I-element 460 1 66.34 ACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr3R 19515856 5' + 412 7100 2 71.29 AAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:2 - chr2R 1725941 5' + Doc 33 1 53.47 TTCACTTCTCATCTGACCAATTTTCTTTTTGCTAATCGATAGAAATTTCGCGTCTTTGTCTCTGGAATCTTTATGCTAAATCTCAACCGTCTAGCTTTTAT:1 - chr3R 2472962 5' - INE-1 163 1 82.18 ATTACTACATTCTATTGGTAGTAATATGCAGAATAGTAACAGGCAGAAGGAAGTGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGATCAATAGC:1 - chr2R 5515956 5' + INE-1 86 1 67.33 ATTGCTATCAAGTAAGCTTTCATTCATGGAACTAATAATCGGAAAAACAAAAAAAA:1 + chr2L 14833188 5' - Tc1 1479 1 66.07 GTCATCAAGGTCCTGATTTCTACTCCTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCG:1 + chrX 4767601 5' + Doc 440 1 74.26 CAAACCCACAAAAAAAGGGAATTTTCTAAAAGAAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 + chr2L 11559937 5' + copia 44 2 69.31 TCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:2 + chr3L 14558266 5' + 297 43 2 71.29 AAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGCACGCATAACATAGCACGTTTTCACATGTTTTTATGAACTCTATTAGATGCCTAAAACTAAATCTTAGGCTTCTAG:1 - chr3R 29588500 5' + Transib5 2929 1 47.52 GTGTGGGGGGTTAAGTATTAAATTCAGCAACACAGGTTATTATTTATCAAATATGAAGATGAAATACTGTGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACA:1 - chr2L 14993487 5' - 412 486 2 71.29 GGTGCAGTAGTCTTAGATATAGGAGTTGGACGAAGAGCGTAAGCAGATGCTTGAGGAAGCTAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGT:1 + chr2R 4974885 5' + 3S18 16 2 61.39 ACCCTGTACATAAATCTAAAATTATAATGCGCCCCGCTCTTCAATATTCATTTTCACCCGAGCACACGCTGCAACACACACACACACACACACATACATAT:1 - chr3L 9122697 5' + Quasimodo 39 2 60.40 ATGGGGTGTGGTGAATGTGGTGGGGAATATATGATATATGATTGGAGAAAAACGTGAAAGATCGAAAGATAAGCCTAAAGAAAATTTGTGGGTTTATTTGA:1 + chrX 12246934 5' + S2 1249 1 69.31 TATAAATTTTGGTTAAGGTTTTAGACAATATTTATTTGTGTAAGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACGCTTCTT:1 + chrX 22576304 5' - Burdock 6290 2 42.57 ATATGACAGATAAAGTGAGAAGATTTTCACTTTTTACTACCAGTCCTTTTTATTACCCTTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTCCTGTTAATTTTCAT:1 + chr2R 25216524 5' - 3S18 6086 2 60.40 ACTTACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:2 - chrX 21945943 5' + F-element 28 1 59.41 TTGGCGTAAATATTTATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1 - chr2L 16379026 5' - HMS-Beagle 7027 2 62.38 TTTTAAACGATTAAATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2L 18417291 5' - roo 387 2 57.43 GAAACAATAATCGCAAGACCCCATATTAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 17581253 5' + roo 48 2 75.25 TATGCCGAAGCGGCTGTAGTCGTAATGTTAATAGCAAGCGGCTTCTTACTGTAAAGTTTTGTTCCGACACGGTTCAGTCGCCATCATGCGTT:1 - chr4 646523 5' + mariner2 119 1 56.52 GCTGTCACATTACCTACATCAAGTGTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAAC:1 - chr3R 13619981 5' + Doc 322 1 75.25 TGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:2 - chr3L 10576854 5' + roo 34 2 64.36 ATAATAGATTCAAAATTAGCAAAATAGGTTCAAAACAATACTGGCTATGCATAACTTTCCTAGCTAATTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTC:1 + chr3R 21710533 5' - mdg3 5490 2 70.30 AAAATAAAAAATGCTCTCGACTTGTTGATAATTATTTATTTATTTCCTTTGTTATCATTGCCTTTTGGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chrX 6200199 5' + jockey 16 1 69.31 CAATGATACTTGGATTAATATATGTATTGTGCGGAATATATTTCATTTGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:2 + chr3R 3920661 5' + I-element 30 1 59.41 AGTCAGCCGCCCACACACATGGCGATGTCAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTC:1 - chrX 5130741 5' + I-element 146 1 71.29 AAACAGTGCAACAATTATTTCTATTACAAACTTCAAAACACCCGGGCAAACTAAGAGAGATAGAATCACCCCACTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTT:1 + chr3L 6869248 5' - roo 9068 1 74.26 CCATAGCCAAAAAGTATGCTACGCATCCCATAGACGCAAATTATGATGTCGGCTGATGCGAGCAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAA:1 + chr3L 19437203 5' + jockey 4682 1 64.36 ACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCAC:1 - chrX 10298053 5' + Quasimodo 43 2 71.29 AATGTGTGTATTTGATTGTTTACAATAGTGTGTGTGGTTGGGGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCAC:1 - chr3L 26003375 5' + roo 152 2 58.42 ATTTGTATAGAGACGTGCAGATATTAGTATTTCACTGTCTGATGGTATGCATAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1 + chr3R 23173090 5' - Burdock 237 2 56.00 ATTTCGTATTTAGTCTGCCGCACAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA:1 + chrX 9123643 5' + R2-element 3585 4 90.91 CAGGATTCGGTAGTCCTTGGGGGTGCTAAAGGTGTAGTTGCAGTCGATATCGTGATTGCTGTGCTGGTAGCTGAAGAGCTTGACACCGTTTGGAACGGGGA:1 + chr2R 14658501 5' - Doc3-element 455 1 77.23 TTTAGTTTTAAGCCTAGCGTGGCATTAATAGGGATTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr3R 7879882 5' - 1360 3348 1 67.33 ATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGA:1 + chrX 18975569 5' + diver 5938 2 72.16 AAGGAGAAACGGAGCCATGTTAATCTAATAACGAGCTAATCTGATAACGAGCAGTGAATTTAAGGCACCTGTATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACA:1 + chr3L 23342524 5' + Max-element 8239 2 75.25 TACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAA:1 + chr3R 19449959 5' - R2-element 3272 1 66.34 CAAACCGAACCGCCAGCCCCTTCCACTTTTCACCCCCCTCTAAAAACGAAAATGGAAGCGAAAACAAGAGGACGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTAAT:1 + chrX 18146945 5' - INE-1 550 1 62.38 GTCACTCCAGCATTTCTTTAATCATTTGCTATTTAAGGAGTTAATTGTATATTTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 + chr2R 11835606 5' + I-element 26 1 58.42 AAATGACACACGATGAACTCATTTAGACAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr3R 29361034 5' + 412 49 2 72.28 AAGATCTATCATTCTGTCTACTAACTGTATTTAGCTTTCTTATGAAGAACTAAGTATCATTTATATATGTATAAATTATATAAGTTCCAATGGATCCAGAG:1 - 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chr3R 934254 5' - mdg1 484 1 75.25 AAAAGGGAAGGCTTTCGTGGGTGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGTGAGAGAGAGAGGAGCTTTAATCTAATTGCCGCACAAAAGGGAGAGCAAACAAAAC:1 - chrX 3096326 5' - Cr1a 210 1 70.30 GTCAGTTCATCTTCAAATCTCGCTTTATGATTCTTCATTTGGATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3L 10305318 5' - 412 7515 2 55.45 TGTAAATTGGTAGTTTTCTGACTCCTGAATATTCGCCAAAAATAAGAAACTGCTACCGTCTGAAGAAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTC:1 + chr2R 1995236 5' + Porto1 4509 1 73.27 ACTTTTCACATCAACTTCTTTGGTGGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:2 + chr3L 10576808 5' - roo 9019 2 79.21 GGTAAGACTGCGGAATGCAGATGGCAGACACTAGCGGTGGCCAGGAAGTCCTCGATGACATCCTTGCGAGCACTCCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTT:2 + chr3L 13360913 5' + hopper 5 2 74.26 CATTTTCATTAGGAAACACACATTCATTCGCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr3L 10576885 5' + roo 8667 2 76.24 ACGGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGAGGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTTACATCCTGCTCATCGAGGTCATACCT:1 + chrX 19820624 5' + Rt1b 4968 1 63.37 CCAAACCGAACCGCCAGCCCCTTCCACTTTTCACCCCCCTCTAAAAACGAAAATGGAAGCGAAAACAAGAGGACGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTAA:1 + chrX 18146944 5' - INE-1 551 1 63.37 GCTCCTCGTTGATGGCGAAATCGCCACCTCGCTAATTCGCCTTTTTTTCATATGTAGTCTTTGCTCTTCTTCTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACAT:1 + chr3L 24208396 5' + HMS-Beagle2 25 2 79.21 ACGACAAGCAACAAAAAGCAACGAAGGTGAAACCAAAAATGGCGAATGGCAGGGTCTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTGTA:2 + chrX 5128845 5' - G2 3075 2 72.28 CGCCGTTAAGTATGCTATAGTTTTTTCTTAGGTTTGGAAGGTCTATTTTGTAGGTTTCTAAGCCAAATATTAAAGCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCA:1 + chr2L 12246542 5' + hobo 2710 1 70.30 AACAGACGGCAGCGGCAAACTTTACCGAAAGTGTTAATTACATGCACAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACACGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATG:1 + chr2R 17951066 5' + mdg3 5105 1 51.49 ATGAAGGATGCGAAGGACTAGCGGCTGGGGGATAGGACAATGTTCAGCTTGGCATTGTTACTTAATGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3L 12217288 5' + roo 11 2 68.32 GATTTCACTATTCAGCTTAATTCATTCAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 12152710 5' - roo 9024 2 74.26 AATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:2 + chr3L 14558268 5' + 297 45 2 73.27 CTGCTTTTCTTCCTTTTTCTTCTGATTCGTTCTAACTGCAACGGAAAGGTTTTTATATTATTCTTAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAA:1 - chr2R 4974989 5' - 3S18 328 2 66.34 GAGCTGCCACTCCGTAATCTCAATTGTCGGCTTTGCATTGCTCGACGATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 30263544 5' - roo 9046 1 56.44 ATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCG:1 + chr2R 4860116 5' - micropia 34 2 65.00 TAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGC:1 - chr2L 23295878 5' + micropia 15 2 60.00 ACCATTTGGAATGGATAATAAATTTTTGTTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACCGCCATGCCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCTCTGCCGTGTATCGTA:1 - chr2R 3550649 5' - Cr1a 4401 1 64.36 TAGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTTTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACG:1 - chr3L 11826427 5' - INE-1 128 1 58.42 TTCCACTTCTTACGTATTTTCAACAAACAATTGTTGATTTTTAACAGTGCATCGACCGAGACGATGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chr3R 29438790 5' + hobo 9 1 69.31 CGTAGTCAAGTGCAAAACGGGCAATGCTACAGAGGAGATTTAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:2 - chr3R 25566843 5' + hobo 35 1 59.41 TAACACTTGGGTATGGAGTACGTATGTTGTAATTCGAGGGAAGACACAATAGTGTTTACAACTAAGCTAAAACTAACAAAATCAATTAAAATTAAGTGGTT:1 + chr2R 7382509 5' - HeT-A 374 1 69.31 CTATAAGCCTAAAATAATGCCAAAAAAGGACTTAACTTTATTGTAACTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chrX 8326285 5' + opus 24 4 53.00 GGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:2 + chr3R 11080697 5' + I-element 38 1 62.38 AAACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATGTAG:1 - chr2R 4339509 5' - G5A 2786 1 78.00 CGGCGACACGTGATTGTTTCATCATTTAGGTCGCCAAAAAATAATTGCGTGCTGTCGATTTCATTGTAGTGTAAACTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:2 - chr3R 5285023 5' - roo 398 1 69.31 GCTCGCAACCAGATTTCACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAAGAAAAAAAGAATAAAAAAAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAA:1 - chr3R 26854731 5' - copia 78 2 75.25 ATTGAAGACTATAGATAAAGGTCAAAAATGAAATATTGTATGTAAATTCTATTCACAGTTGCTAAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGTA:1 + chr2R 10552690 5' + INE-1 565 1 87.13 TGAAGACCTCAACTAAAAGTGCACGGATACATAAGCTCATGTTGGACATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:2 + chr3R 2556039 5' - 412 7515 2 56.44 TTACTTTATCGTTTCTTTTAAACGATTAAATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2L 18417276 5' - roo 402 1 72.28 CATATTTCAGCACATTTTCGCAATGGACGTCATCAGTTTGGCTGCATTTGTGTTTGTGTGCCGCCAACGCAAAAAAAACGAAAACAATGAAA:1 + chr3L 2531065 5' + transib2 2642 1 54.35 ACACCGAGAAGCAAACACAAACGTACATATATGTACGTTTGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGGTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - chr3L 17257232 5' + Doc 47 1 64.36 TTTACCCCAGACATGAAATCTAATTTGAGACAAAAGAAAAATAAACAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chrX 20835206 5' + roo 8693 2 59.41 CATCTATAAGCCTAAAATAATGCCAAAAAAGGACTTAACTTTATTGTAACTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 + chrX 8326282 5' + opus 7025 2 53.47 CTACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:2 + chrX 17492863 5' + Tirant 8 2 73.00 CCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 3535437 5' - roo 9028 1 68.32 ATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTTAGACTTACAATCCGAT:1 - chr2R 1234692 5' + Q-element 624 1 73.27 ACATTAAAGAGTGCGGGCTTAAAGCTGCGGAATATTCATATTTATGCTTAATTTTTGGCTGTTTGTTTGTATTCCTACGTTGTTGTTTTTTTTTTTATTAT:1 - chr3R 22192883 5' - gypsy7 5012 4 58.42 TGTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chrX 5178875 5' + hobo 32 1 59.41 TTTCTGGTTTATACTTCCGCGGTACAGTTCTCCTTTCCTTGACATCCAGATTAGGTACACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 + chr3L 14285986 5' - 412 7535 2 65.59 GCATTTTGTTAGACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATT:1 + chrX 21564072 5' - invader4 3073 2 65.66 ACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAAT:1 - chr2R 2092800 5' + Doc3-element 75 1 50.50 CTGTGGAGAAAAGAAACAAAAGATACACCTTTGACCAACAAAGCATATAAGATCTTTAGCCCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3L 21393437 5' - roo 401 1 69.47 AGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGACACATACAAACACCATTCAATGTCAGATGGCTAGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chrX 12649915 5' - hobo 2927 1 66.00 AATAATGTTCTTTCTTCGAAATCTTAAAGTTTAAACAATACCTGTAAGCTAATATCCTCGCAATTCCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chrX 10776247 5' - roo 399 1 61.39 TTTGTCTAGCACTTGCATACTTTTGTGCTCCATTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAA:1 + chr3R 19513365 5' - jockey 4957 1 68.32 AGATATATATATTTACATTCATTCTGACTGGTACTCATGAATGGCCAAGACATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr2L 10104342 5' + roo 8689 2 52.00 CGTGCTGCGAAAACTAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 - chr2R 1725956 5' + Doc 18 1 67.33 AAGACCCCAAGCTTAAATCAGTTTACAGAACCAAGGTTGGTCGTTAAAAAAATAGGGTGTCGGGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 21998391 5' + roo 13 2 66.34 ATCGATCATCGAAATCAACTATTTAGGGTGGACCTAAAAAGCACAATTTAACGTAGTTCAGTCTACGTAAATATATTCTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAA:1 - chr2L 19547424 5' + Max-element 1 2 75.25 AACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAG:1 - chr3R 15790059 5' + flea 4751 1 74.26 ACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:3 + chr3L 25884083 5' + Doc 34 1 53.47 CTTTTATAGCGCCTAAGGCTTGAACTTCAATTAGTTAAAAAAAAAAAGCAAAAAAA:1 + chrX 3322362 5' + Doc 4702 4 66.07 AGGATTTCATTACATTTTGGGTGGGACGTAACGGTAACGTTGAAGTGTAACGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr2R 15921397 5' - 1360 3367 1 58.42 AAAAAAGGTTCCACGGGAGGACTTGACATAGGTATTGGTAAGTGAGTGATTCTTTCTTTCATTTGTGGTAGGATGAACAATCATAAGGCCCACGAAGCA:1 - chr3L 20895190 5' + invader3 15 2 64.65 ATTCAAGAGCCGTCAGTGATCCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCC:1 + chr2R 2645484 5' + HMS-Beagle2 50 2 80.20 CACGACATCACGGAGCGCCACACAGGCGTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCT:1 + chr3L 13652192 5' - mdg3 197 2 73.27 ATAATCTTGTAAAGATTTTTATTTGTAGGATACGGTTTCAGGGGTCTCCGATTTCGTAGAGATTGCCATTGAAAGTATCTTTTTTTTTAGAAATTTTCAGT:1 - chr3L 10439478 5' - TART-B 10624 2 66.34 GCCCTGTGTGTGTGAAACAAAAACGTTTGTTTCAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:2 + chr2L 3842845 5' - roo 9029 1 68.32 ACAGGAAACTCATTTGTCTCCGTGTGAAATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chr3L 17635611 5' + 297 6585 2 76.24 GTTTTTTCGTGAAATAAATTTCGCAGTGACCAAGCAGCGATGATTAACTTTTTCGATTAACTGAAAACGCACACAGGCAAAGGACACACACACACACACAT:1 + chrX 5197713 5' + accord 7027 2 60.40 GCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCT:1 + chrX 21852441 5' - gtwin 457 2 65.35 AGAGTTGGAGTTGAAACGGGTCCCATCCGGTGATAAACTCTGGCTCAACATACCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTG:1 + chr2L 13666811 5' - jockey 4615 1 54.46 TGCCAACGTTTTTTTTTCTGTCCTTTCTTCGTGCGACTGTGTGTGCGTAGAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGA:1 - chr2L 19617685 5' + jockey 152 1 55.45 AAAGGTTACGTGAAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 + chr3R 11080661 5' + I-element 1 1 77.00 CCTGGACACTAGATGTCTTCGTTGACTCTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTT:1 + chr3L 11748744 5' + Stalker2 7299 2 72.28 CGCCGCAGTCAATTCTCACACACTAAGGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr3L 8256116 5' + jockey 60 1 79.21 GCGACAAATCGCCAACTACGACAAAGTATCTCTACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACTCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTAC:1 - chr3L 26308172 5' + mdg3 5198 1 78.22 CATTTGGGAGCAAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAAC:1 + chrX 18975552 5' + diver 5924 2 56.00 AATTGAGAAGCCCAGTCCCTTGCCGCCCTTGACCAGATCGATTTCGACTAGGACACACAAAAAATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTACC:1 - chrX 11395635 5' + I-element 4984 1 54.46 GCAAACTCAATTAGGTGGCACATGGTGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:2 + chr2R 22746010 5' + hobo 18 1 60.40 AACAATACCTGTAAGCTAATATCCTCGCAATTCCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chrX 10776214 5' - roo 9029 1 70.30 AGTGTTAAGAACTCGTGTAAATTCCATTAGGGCCAAAAAGTTTCAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATT:1 - chr3R 30086332 5' - hobo 2706 1 57.43 AATATTATTGCCGGGCTTCAATTTAATTCAATTCAAGAGAGAACGCTATAGTTGAGTTCATCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCT:1 - chr3L 3990666 5' - INE-1 545 1 69.32 GAGGTTTAATGAGCAAAATCGGCAGGATAAAGTTTGCTTTTGATTTCCTATTGTGTTAGACTTAAGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATA:1 + chr2L 10832184 5' - Quasimodo 7358 2 68.32 GTGAGGATTTCGCACGGAGCCTCGACATTTACGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 6187672 5' + 412 7100 2 72.28 TTTAACTTTTCACATTCTTACTTCCACTATCAGATAGCCGGGAAACTCGACTATAGCACACTAGAACGCCCAGAACTGCCACGCCCACACTTTTGAACAAT:1 + chr2R 5246671 5' + INE-1 253 1 57.43 AATTGCTTGGAATAGTAAATTGTCTAGTGAATTTTTAACCACTGTTCATTGTGCGATTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 12546793 5' + hobo 17 1 64.36 CAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3R 29361033 5' + 412 7101 2 71.29 GGTGGAAACCATACTTAATAAGATAATCACTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:2 + chr3L 4539167 5' - roo 9028 1 69.31 AAAATTTCAGTTTTGAATGGCATTTGTTTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:2 + chr2R 2832927 5' - 1360 3341 1 76.24 CCTGCAATGATACTTGGATTAATATATGTATTGTGCGGAATATATTTCATTTGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:2 + chr3R 3920657 5' + I-element 26 1 55.45 ATTTTGCTATTTACTCGCGGCTTTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTA:1 - chr3R 31678123 5' + jockey 4528 1 77.23 GAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr3R 19515814 5' - 412 454 2 67.71 GTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCACATACCTCACCTTGATATG:1 - chrX 22664415 5' - opus 7455 2 75.25 AAAGTAAACTTGAACTGACCGCGAGTGTGAATGTAGAAACACAAATCTCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chrX 21042740 5' - 1360 3362 1 53.00 TTCATGGCGGTTATGCATTGGAATGAGATGCCGGGCAGATTGATGGGCAGTATATGTTACTTTACTTTACTTTAATTTACTTTACTTTACTTTACTTTACT:1 - chr2L 9217554 5' - TART-A 13139 7 57.43 TTTTGGTTTTTTAATATTGCACTTTTGTTGCGAGTCCCTCATTTGTGTTTGTTTTGCACTTTTTTTTGTGTTCGTGGGTAATGACTAACGCACTGTCAAAT:1 + chrX 21247144 5' - gypsy2 371 1 54.46 GTAAGCTCTGCTCTTTTACTATTCATGTTGAGCTTTTGCTTTGAACACCTCTCAACGGATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:2 + chr2L 21018775 5' + 412 7069 2 68.32 GTTTTAGGGCAGCAAAAAGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 13167344 5' - roo 9016 2 81.19 CATTAATAGGCTTTCACTAATCATTTTGTTTGGCCAGAATCGGAAACTAAGCCAACACTTTTATATTTTTTTTTATTTTTAGTTTATTTGTGCTTTATCCC:1 - chr3L 16155304 5' - Juan 4205 1 65.35 AAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGC:1 + chrX 21564100 5' - invader4 3043 2 66.34 TGGGCTTGTGAAAAATTAAAATTTTTGCCAAAGTGTTAAAATATTATTATTTAAGCGATACACGCAGCGTTTGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCTG:1 + chr3L 6811399 5' - McClintock 5978 2 78.22 CAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3L 10576851 5' + roo 37 2 67.33 CCATTCCATGCTGCAGAAGCGATGCACGCACAAGGAGTACGCCTCGGCGGAGGAACACCTGGAATTGACCGAACATAAATCATCGAAGGGAAGGCAGCTCT:1 + chr2L 4795353 5' - Burdock 5987 1 74.26 TATGGGGATGTTATATTTACTTTGAATTGATATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCGAA:1 - chr3R 15130522 5' - Max-element 8489 2 65.35 GCGGCAGACTGGAGAAAAAACCAAATGCTGAGCGACAGGCGGAGAAAAGGGGGTCTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr3R 30076505 5' - hobo 2919 1 46.53 CTGTGTCTATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGG:1 - chr2L 22780918 5' + HMS-Beagle2 35 2 61.39 ACTTTGTGTATATTGGCTTTGGGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTT:1 + chr2R 17942088 5' - mdg3 213 2 57.43 GCATAAAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chrX 10196088 5' + 297 6609 2 59.41 TGCGAACACAAGTTCTCCATAGACTGGTGTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3R 19198522 5' - hobo 2893 1 74.26 CAACAACGAGGGGGCCTTTTCAAACGATAGAAAGACGAAAGAGAGACAGATAGGAGAAAGAGCGAATTTCAGGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chrX 3299127 5' + hobo 6 1 52.48 ATAGATTTGTGACTCGGGCATACTGGAATAATGCCAATGAAGAGTAAAGTAGATCGATAGATAGCCCATGCTCACACACACACACACACACATGCACACA:1 + chrX 19827172 5' + accord 7036 2 69.00 CTTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:3 - chrX 3295668 5' - hobo 2897 1 66.34 AAAAATATGTATAAAGCATTTAGAAGAGCAAAAATAAAAAAACATACTACAAAAGACGGGATAACACATTTCCACCAGCTGTGTAACGGGTATCTGATAGT:1 - chr2L 21691261 5' + INE-1 548 1 51.49 TGTCGCCAAATAGATCACTAACTCGCTATGACATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 + chrX 3233902 5' - 297 6939 2 69.31 AAAAAACTATTTGAATTTAATTGGGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACA:1 + chr2R 3522000 5' + copia 53 2 80.20 AACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAACCTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3L 3535460 5' - roo 396 1 61.29 CACGGACAGACAGTGCGTTTCACTGTCATAAGGCAGTATGGCAGACAACGAGCGGCCAATAACCCATAACCCAACGAACCTTCTTGTACCAACAAATCAT:1 + chrX 17492114 5' + F-element 341 1 60.00 ATATAAAACAAAACAATACAGGACCTTCGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTG:1 + chrX 12428090 5' - 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hobo 2923 1 59.41 CTTTCCAATTGCCTGCGTATGTGTGCGTGTGCATATACATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chrX 5178809 5' - hobo 2901 1 63.37 AAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 + chr3R 11080688 5' + I-element 29 1 53.47 GTTGGCCCTGGAATTCAGCGAATGATAATGCATGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATA:1 + chr3R 19449305 5' - roo 8608 1 66.67 ACTTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGA:2 + chr2L 23286583 5' + Tirant 414 1 58.00 GCGGTAGAGCTCTACTAACTGGGGAGCTCTACCCACTCCACTACCGAGTCTAAGACCTTCTTACGGGGCATTGCCGTCTCACAGCCATTTTCACAAGATTG:1 - chr2L 22298945 5' + baggins 5161 1 53.47 TCGCTTGCATGTGTTGGTGAGCGTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTC:1 - chr3R 21592007 5' - Bari1 1656 1 73.27 GAGACAAAAGAAAAATAAACAACGGAGTTCACACATGAACACGAAGATATTAAAAGACTTACAA:1 + chrX 20835232 5' + roo 8682 2 68.75 CAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:3 + chr3L 8044302 5' - 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I-element 5031 1 54.46 GCAAATCAAACTGAAATTGTTAATTTGCCCATCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTT:1 - chr2L 22747331 5' - transib2 2778 1 72.28 TTAGGTCACAACGCTACTTTTTACAGCTTATTGTCTAAATCTAAGCAATCATTGCCTCATTAATTTTTCACACGTTGCAAGCT:1 + chr2L 22551432 5' - 1360 424 1 51.81 GAATATAATTTACTAATTACTAATTTAGCTAAATTAGTTAGTTTCAAAAATATAAATAAACCTACCAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATG:1 + chr2L 10191543 5' - roo 8718 2 60.40 GAAGTGGCTATCTGAAAAGTGGACTAGTGACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr3L 14286085 5' + 412 15 2 64.36 AAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:2 + chr3R 19515809 5' - 412 454 2 64.36 CAACCGCATATTTGTTGTTCATAATGGGTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 - chr3R 11912137 5' - I-element 5310 1 72.00 CGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 + chrX 5130989 5' + I-element 33 1 53.47 AACTGCGCCCACAACAACAAAGGCCGTTTTACCAATTTTCATTTCAAGTCCATTGTTGCCGGCCCGTTCCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTC:1 + chr2L 16378909 5' + HMS-Beagle 6798 2 75.25 AGTTGTTCGTTCTTAAAACTATATTTGCTTAAATCCTTTAAAGCCGCCTGAATGAAGGCTGAAGAACTTGAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chrX 2917283 5' + jockey 16 1 68.32 TCATTTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:2 + chrX 5168838 5' + hobo 24 1 55.45 CCCAGTGTATGTATTGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATT:1 + chr3L 24210871 5' - 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Tabor 471 2 64.00 AACGACGACATTTCGTTTAGAGCATCAGCAAACATACATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACT:1 - chr3L 3820414 5' - invader4 154 2 64.36 ATTAGTATTTCACTGTCTGATGGTATGCATAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 + chr3R 23173112 5' - Burdock 6350 2 70.30 TATGAATTAAATTAATATTCTGTCTGTTTGAATAACCTGCGCGGTTTTTTTTTTTAATAATTTTTTTTTAAGGTTTATTTTTAATTT:1 - chr2R 994035 5' + hopper 181 1 44.83 AGTTTTCGATGCGTTTTGAGCTGTTTTTACCTTTATCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGA:1 - chr3L 25107202 5' - F-element 62 1 65.35 CTCCACTCTCTCTCGCGCGCTCTAGTACTCTCGTACTTACACCTTTGTTTATCGTTCTGCTGTTCGCTCTGCATTTAATTCAGCCCATTTGGGAGCGCCGG:1 + chr2R 4559306 5' - X-element 4642 1 75.25 GTGGTTTATCGCTCATTCTCGCAAAATATTATGGCTTCGCTTCTCGCGCGCACTCTGCCGTCACTAGAATATAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTC:1 - chr3R 3620760 5' + 1360 25 1 61.39 AATGTATTATTTTTATTTTCTTCATTAAATTTAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAG:2 + chr2L 13053198 5' + G2 324 1 68.32 GCTGGAGACTTCGGCAAGCTCAACAAGAATAGGCATCTGATTAATAAGAGTTATGTGTCGGCTTGGCAAATTGCCAGCAGTGCGTATACTTAATGAGCTCA:1 - chr3L 22248526 5' - rooA 347 2 58.42 AAGATGTGTCTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 + chrX 5130974 5' + I-element 18 1 61.39 ATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGAGTACATATATTCATTTTTCGGCGTCCACAACATCAGAAGTGGTCATTACCCACTATGCCTGACACTA:1 + chr2R 6085998 5' + invader3 315 1 70.30 TTGTTGGAACAATGCAAAAATATTTCGCTCAATTACTTAAATGGAGATGACACCTGGTTCTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr2R 11394089 5' + pogo 13 1 62.38 CCTCTCCCACACACACTTGTTCGCTCTTTTGAGCCGCCTGCTCCAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 + chr3L 14205269 5' + P-element 32 1 36.63 ATTTTCGGGTGCTAAGTGGCAAACTTTTACCGCAGCCAGATCAAAAGTAGAGCTTGTCATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATA:1 + chr3R 13231127 5' + Quasimodo 12 2 72.28 CACGGATCTGCATCATCTGGAACACCAGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 - chr2R 14604696 5' + P-element 48 1 31.68 GCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:3 - chr2R 17348592 5' + jockey 61 1 81.19 TTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCATTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCAC:1 - chr3R 2689420 5' - diver2 4466 1 52.00 ATTGCCGCTCGTCAATTCCTTAACCACTTTTCTTTAAGCACCCGGTTGGAAAAACAACAAAGATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 23870058 5' + roo 8677 2 65.35 CATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAAAGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAG:1 + chrX 22633266 5' + INE-1 76 1 69.31 TACAAAAATTAACCAATTTCATGTGTTTCTATAGCTCTCATATTCTATTCTGTTTTTTTTTTAATACCAACTAAGGGGCGCTGCTGTGTATCGTACGGCTT:1 - chrX 14575918 5' - Cr1a 4395 1 65.35 GAGATCATTATGAAAACCGAACCGCCGATAACCCAGGCGATCTGGAAGCCGCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGCGCTCAAGCCCTTAACCA:1 + chrX 17378231 5' + I-element 159 1 66.00 ATATTGTCATAGTCCTGCGACCAGGCATCCTGGATCTACAGCCATACTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chrX 14371359 5' + jockey 37 1 53.47 GCGGTTCTCGTTGTAAATACCAGCAAACTGATTTATATAGTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAA:1 - chrX 21564153 5' + invader4 2798 2 60.40 TGGCTAGGGGTATCTAATTGCTGATGATGTTGAGGCTGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGC:1 - chr2L 9291322 5' - Doc 466 1 72.28 GATCATGCATCTTGGTATTTAAGTGTATATATTAAGAGCACGTCCATCTTAACTCAAGCCTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTT:1 + chrX 3434673 5' - I-element 85 1 64.36 AAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAG:1 + chr3L 5267218 5' + Juan 4004 1 54.46 TAAAACTTTAAATAACCTGAAATATCCACAAGAGGGTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 - chr3L 18767237 5' - jockey 4954 1 62.38 GAGGTGTGAGCTCAGGGGGAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chr3L 14558243 5' + 297 6601 2 60.40 GTGTGTATTTTTCTAGTTTTGCTCTTTGTGTATGTGTGTTTCAGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTTTGTG:1 - chrX 13954342 5' - gypsy3 421 3 91.18 CCCTCCGTCGACCGCCTGCATGATGAATGCCTTTTTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2R 15057616 5' + hobo 42 1 66.34 CAATCGTTTTTTTACGTTTTGGTTATTGTTAGCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:3 + chrX 157201 5' + I-element 20 1 57.43 ACTTATTTGTAGCAATAAATTTTGAATGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGTTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATT:1 + chr3R 3625627 5' - Max-element 8485 2 70.30 TACTATGCAACAATTGTCGTTAAATGTAAAAATAAAAAACCAAAAAACAGCAATTTCTTGACAGTGTCGAATCTGTGCAAACTTGGATTTAGTAGTTTTTC:1 - chrX 7665746 5' - S2 175 2 52.48 ACATTTGCAATATTTATTGCCTTTTGATTATATTTCAGGCGAGCGAGGAAAAATATTTATATACCACCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 - chrX 13547264 5' + I-element 11 1 62.38 TTCTCGATATTTACTACATTTAAACACCCCACTGATGATACAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGT:1 + chr4 306426 5' - blood 7354 2 58.42 TCGCCTCTCGACTTCTTTTTGGTACTGAAGACAGTATATCATTCCGAGTACCGTCAAAGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCCAGTG:1 + chr2R 3174854 5' + opus 7485 2 61.39 TCAAGTATGCATTTGGGAGCAAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGC:1 + chrX 18975543 5' + diver 28 2 51.49 AGGCAACTAAAAGATGTGTCTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:2 + chrX 5130964 5' + I-element 8 1 71.29 AACCGCACGGCCATGGTCTTTGATTACTGCTCCAGAGGATCGCTGCAAGATGTGCTTATCATGGATGATTTCTACGTTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATA:1 - chr3R 4497047 5' - Fw2 3567 1 67.33 AGGGGGGGAGAGGAATTTTCCCAATGTCCGAAAACCAATCGCATTTAGACGGTTTGCATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 11936878 5' - roo 390 2 61.39 ATCTTCTGTCTTGTGAACATATATGATTTGAGTTCATATAAGATTAACGAAAATTTCGAAATTAAGATAACTATTGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 - chr4 306523 5' + blood 7012 2 79.21 TGATAACTTAAGCTTTCATTTGATTGGCGTGTCCTTATTATGAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTT:1 - chr3L 26002866 5' + roo 9053 2 58.42 TATGCTAGGGTTTATTTCGATTGGTCCTGCTTTAGTTTGTGCCATCATTAAGATCATTATAAATATTATGACAGTACCACTCCAACCTCCGAAGAGATAA:1 + chr2R 2009381 5' + I-element 8 1 80.00 AGGGGCGGAGGTGTAGGTAATTCCTAGCTTAGGTAATGATAACGTCGAACGCGTTGCTCTTATTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chr3L 15353609 5' - mdg1 7448 2 68.32 CTGAAGTCAAATAATTCAGACTGCCCCAATGATACAAATTGCAAATGCAATCAATGTCAAACACTCGAAGCCCGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr3L 22642354 5' - hobo 2936 1 76.24 TGTTGTGTGATTTCAACTTATTTAGTTGTTTTTGTTACTTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chrX 3295707 5' - hobo 2934 1 71.29 AGCGCTCTCCTCAGTTTCAGATATATGTGAGTATATATATACATATAGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr3L 8843631 5' + I-element 30 1 52.48 GGACATTTTGTCTAGCACTTGCATACTTTTGTGCTCCATTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:4 + chr3R 19513359 5' - jockey 4963 1 62.38 AAATGTACTAAAAAAGTTTACACATACAAAACACACATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGACATATTTAGTCAAATTTACAATGCACGAGCATA:1 - chrX 10790918 5' - 1360 191 1 66.34 ATTAACGAAAATTTCGAAATTAAGATAACTATTGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr4 306481 5' + blood 7054 2 66.34 CCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:1 + chrX 21668013 5' - Tabor 446 2 61.39 TATTAAATGTGTATTTATGTTTTAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr2R 9972736 5' + Doc 58 1 75.25 ATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chrX 15227325 5' - 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mdg3 202 2 68.32 GTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTA:1 + chr3R 19515822 5' - 412 7495 2 76.00 GAAACATAAGAATAATATTTATAAGCAGTTATTGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACG:2 + chr2R 577810 5' - invader1 3970 2 71.29 TCTATTTGGAATGTTTGGATAATTATGTTATATTGAATTTGAGATCTAAAGTGAATGTATCATTTGTTGTTGCTGCTGGTTGATGTTGGTTGTTGTTGTTG:1 + chr2L 524173 5' - gypsy7 326 1 69.31 TCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chrX 21219468 5' - roo 351 2 81.19 TTTTAACTGCTTAGAAAGCATTAAAGCATTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCT:1 - chr3R 26642740 5' + F-element 228 1 72.28 AGTTGAGTTTCAGAATTTAAATAATTGCTTTCGTTGGAGTTTAAATCAGAGTGAATTTTATTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAATA:1 - chr2L 23286564 5' - gypsy4 469 1 66.34 AAATGTAGCATACATTTGGGCGCCGCTAATAGGAAAAACCAGAGCGCGTCGCGATGGTTGCGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3R 13623631 5' + jockey 21 1 62.38 TCAATTGTCGGCTTTGCATTGCTCGACGATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chr3R 30263563 5' - 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chr2R 16384363 5' + roo 8704 2 67.00 GTGGGGCAAGAAGTGTAGTGCATATACACACCTACCAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATA:1 + chr2R 982058 5' + Doc 4554 1 64.36 GGGAAGGGCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3L 14558259 5' + 297 6617 2 64.36 AAAACCAGCACAAAGCGCCGCGGTTAAAGTGGAATGACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2L 11073772 5' + roo 8703 2 65.35 TTTCAAATAGTATTTTGCGTAAATATTTATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGAT:1 - chr2L 16379039 5' - HMS-Beagle 7040 2 77.23 GCCGACTTGGCAGTTGGAAAATGAAAACATAGGCGAGACCACAAGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 + chr3L 494625 5' + Transpac 4947 2 60.61 TGATTTGCATAAAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chrX 10196082 5' + 297 22 2 53.47 GTGGCCGCCGGCAGACCTTTAGATTTTCATGTTAACTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCC:1 + chr3R 17615942 5' + HMS-Beagle 6834 2 64.36 CACATCCAGTTACTGGACTGCCAGTCCATAAAGCTCACAGAGGGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 17529528 5' + roo 8698 2 62.38 CCGGCTCGGATGGGATATCTTAGACTATTCGTTTCCACTGCCGTTGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCC:1 + chr3L 13657441 5' - 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chr3L 14205403 5' + P-element 29 1 50.50 GTATCACCTTTTCTTATAGATATATAGATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 - chrX 8326346 5' - opus 450 2 77.23 ATCATATTTGACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAA:1 - chr2R 2092810 5' + Doc3-element 65 1 58.42 CTCGGTGTCGCTTATCACCTCTACAATTTTGAGGCAAAATTAAAGGGTGTTTCGTGCCTCTAACGCGTTCGGACATTTTATTTTAATTATTTTAATTGAAA:1 - chr2R 5627651 5' - TLD2_LTR 97 1 76.24 CTAGCAAATTGATGTTCACGCTGGGAATGGCTTGCGGTTGCCTTTGGGGGCATAAAATGCTTACATATACATATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTC:1 - chr3R 25859459 5' - Stalker2 7648 2 73.74 TCACTACTGAGCCCAAGCCGGACTTTCCCAACCTATGTGCCTTGGTTGTACATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 - chr3L 14558338 5' - 297 6956 2 60.40 ACTAATGGCGTGCCGCCTGGCGGGTCGCGTTTCGTCCTTTTGGGCCTATCCTTGTCTATTTTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chr3R 30326266 5' - pogo 2090 1 69.31 AGTAAAGGTTCTCATGAAATATAATGGGAAAAAAGAAATGTATGTAATTTAATGTAATGTTAGATCTACAATGATTTAAGATATGGGGTATATAATTTCTA:1 + chr2R 3521938 5' - Cr1a 4126 1 66.34 AGCTAGTAATAAAGTGTTTTGTAATAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGACACCATGAAAAAAATTCTTGATTTGCATTGCCTTAAGGTTTTTATTATT:1 + chr2L 23021774 5' + 1360 305 1 65.35 AATAAAAATAAGGGTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAA:1 - chr3L 17427234 5' + P-element 2755 1 28.71 GGAGCGAGAGAAAGAGAGAGTAGCATTCGAAACGAAAGGGACGGCGGACGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1 + chr2L 19684596 5' + mdg3 5282 2 56.44 CAATCGTGTTTTCTTTTCAGCATGAAACAAATGAAACCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGCTGAGCAGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGA:1 - chr3L 1985357 5' + Max-element 8277 2 60.40 TAAACGATTAAATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 18417294 5' - roo 9047 1 54.46 TGTGTGATAGCAAATAATAATGTCGTCGCTTAAGAGGATCTATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chr3R 7102486 5' + pogo 32 1 60.40 GTCCAACCCAAAACAAATAAATTATCATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 + chr2R 22825426 5' - opus 465 2 72.94 AGGAACGATTCAGTTATATCTTCTCTCTATACATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAACAACCTCCGCGTGCTCTTCAGTCCTTGCTCG:1 + chr2R 4544313 5' - 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HMS-Beagle2 268 2 67.33 CCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 + chrX 17492907 5' + Tirant 8160 2 79.21 GATTCGGTAGCCAGCTGAGGGCTTAGTTAATGATAAAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGCTTTCATCAT:1 - chr2L 4305519 5' - accord 167 2 62.38 ATGACAACACCAGAAGTCAAATTTGGTGGCATGTCAGAAATAATTGAGGGAAAAGCTAAGCAAAATAAATACACAAGGGATATACATACATACATTTAGTT:1 - chr3L 551941 5' - 1731 4409 1 74.26 ATTTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCG:4 - chr3R 15021691 5' + invader4 2746 1 44.55 CATATACTACATTCATATATGTGTAGCATATGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACATGCATAACCACATAAGAACA:1 - chr3L 19999536 5' + Quasimodo 52 2 80.20 TAGAAGGGCCAGCTTTGTTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCA:1 + chrX 11503464 5' - roo 9040 1 58.42 CTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTC:1 - chr3L 24210973 5' + HMS-Beagle2 6914 2 61.39 AGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3R 19450162 5' + roo 8695 2 73.27 GTCTTAAATTGAAATAGAGGTCAGTTCATCTTCAAATCTCGCTTTATGATTCTTCATTTGGATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 + chr3L 10305299 5' - 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roo 388 2 60.40 TTCCAATTGATCATGAATTAAGAATTCAAGCCAAGCATCCAAAATAATTATATGAAATATAATACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAACTGTGTTA:1 - chrX 13860437 5' + INE-1 259 1 66.34 CACGTGGAGACGCACTTTGGCAAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr3R 17557396 5' - mdg1 7407 2 77.00 TTTTTGGGTTTCTTTCTGTTCGGCTTTTGTTTTTACTCACACAAACAAGCAAATTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGA:1 + chrX 6455768 5' + 1360 3300 1 75.00 CTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGA:1 - chr3L 3535455 5' - roo 9046 1 51.49 GTGGGGCAGCCACAAGATATAGAACTTGGCCGGCCTGCCGAGGCGAATCTGTCGGGAAGCCAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATC:1 + chrX 13949300 5' + Doc 303 1 64.36 TATATTGTGCAAAGGGTATAAAAGGTATAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2L 5654851 5' - roo 9022 2 73.27 GGTGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2R 22746042 5' + hobo 41 1 64.36 TCCTGCTGCAACTGTTGCCGGTGGCCGGTGCGTTGTTGCTGCCGGCTGCCATTGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTTCTA:1 + chr3L 5842753 5' + I-element 5051 1 53.47 CGGAGACATATTATATGAAAATGTATTTAAGCTGCTGAATATAAACTTTTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr2L 12835814 5' + 412 26 2 53.47 ATTAGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTA:1 - chr3L 24210984 5' + HMS-Beagle2 14 2 61.05 ATTGAATTGCGAAATTCAGTGGAAATCTTTTGAATTGCATCATGGTCAAACCACCAACGAA:1 + chr2L 9201716 5' + Ivk 4992 1 63.93 TATCACCTTTTCTTATAGATATATAGATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 - chrX 8326345 5' - opus 7452 2 78.22 GAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr3R 19515819 5' - 412 7497 2 74.26 GAAATTACCACCACTAACTGAGTAGCTGCCAGTTAAGGAGCTCGTATATAAATATATATGTCGAAGAGTCATGAGAATGCCCTTCTTCCTCTTC:1 + chr3L 18122292 5' - invader1 388 2 60.64 ATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCA:2 - chrX 23108304 5' + BS3 1444 1 64.36 GCGTCCATTTCCAGATTATTAATAATGATTTGAAAAATATTTAAATTCAATCAAACAAAAAATATCTAAATAAACGACTTTTAATTAATGAAACAATTAAA:1 + chr3L 10364790 5' + TAHRE 56 1 60.40 CGATCCAAAAGTAATGCTGCACGCTTGGGAACCACCATCTAAAAGTGTATAAAAGAGAAAAATAGGGACCCAACATATTGTAATAAACCAATATATGCCAC:1 + chr2L 11084310 5' - blood 376 2 61.39 CAGAAAAGTGAATTGCCTCGGCATGCCGACTTGGCAGTTGGAAAATGAAAACATAGGCGAGACCACAAGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCT:1 + chr3L 494601 5' + Transpac 6 2 73.27 TTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chrX 5168842 5' + hobo 28 1 51.49 TCCAACTTGGAGAGGTGATTGGGATTGTCAATGGCCGAGTCGATCTTGCGATATCCGTCTGTCCGTCTATCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAGA:1 - 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chr3L 13644700 5' + hobo 5 1 74.26 ACGAAGTGTAAATAAATCGAGCTGGCAGTTGAATGGAGATATATCCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 + chr2R 9214063 5' + Transpac 28 2 58.42 AGCGAGTAACGAGAACTGCAGTCGTTCTTTGTAAATAACGAATACTATAGTGTTGTAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3R 21587225 5' - pogo 2085 1 59.41 GGACTGACGTTTCACGTAGCGTATTGCGCATTCTCGTAGGTAGGTCTAGGTAGGTCAGCAGTATATAAAGAATAGAGCAGCGGGCCAAGGACGCTGCCCTG:1 + chr3R 4584779 5' - BS4 82 1 80.20 AGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:2 - chrX 21945920 5' + F-element 50 1 67.00 TGATCGCAGCGGTGATCATCATTATAGCAATGGCTAATCATTAAGTCGGCTATCAACGACCGTCTGTGTCTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3R 12717081 5' + P-element 5 2 70.30 TAATGACCCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGA:1 + chr3R 15130452 5' + Max-element 9 2 61.62 CTACGAGTAACGTCGTGTATCGTGTAAATAAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGATCCAGACAAAAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTGAGATATCGATAGT:1 - chr2L 22928440 5' - INE-1 501 1 59.41 CGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGAACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACA:1 - chr3L 24210979 5' + HMS-Beagle2 6907 2 55.00 AATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATG:1 + chr2R 4260433 5' + micropia 5134 2 82.18 TTAGTTTTGAGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3L 3535474 5' - roo 405 1 72.45 CTTAATCCACAAGCACCATGTTTAATCAACATAATCAAGCAGAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chrX 12166595 5' - pogo 2073 1 56.44 ATTTGCACTTCTTGTTTTTATTGCCCTCATATGTGGCATGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 + chrX 14617650 5' - hobo 2904 1 60.40 TACAGGTTCTGGAGGGTGACAGGTACACTTTAAAGTCCTTAATAAATAAAAATAGGCCTGCTGATGCTAACCTGGGAGTTCGTTGTTAACTACTCCCCCCT:1 + chrY 3069826 5' - gypsy 6978 1 61.39 TGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAAC:2 - chrX 10298056 5' + Quasimodo 40 2 68.32 ATAAATCTGTTTGTAAAACCACATGACCAACTTCTTCGACTTGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chrX 20835278 5' - roo 9040 1 57.43 TTTTGATAGAAAATAATCCAAACATCATCAGCATCCACCAATCCAGCACACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGG:1 + chr3R 9442035 5' + Porto1 323 1 57.43 TTTACACTGACTAAAGAGGAGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTTTTCGATCATAATTGATTTCGGCCCGAAAA:1 - chr2R 4692325 5' + 1360 3182 1 78.95 CTGCAAAGTGCCCATATTAACACATTTCGCATTGCAGCAGGATTTACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2L 16569547 5' - roo 9043 1 53.47 TTGATGAATCATTAAATAATGAACACAATAAATGTTAGCAGAGCATGAACGCGGCAACAGCGCAGGCACCGTTATTCCTGT:1 + chrX 13084107 5' + Chimpo 304 1 58.02 TATAGTACCTAACATATTTATTTTACTTACTTATTTTAACATATATACTATATAAATATACTGTCTGGTAGTCAAGCACCACAGAGTACGGGGCTTACTAA:1 - chr3L 23927232 5' + baggins 4969 1 61.39 TATACTTTTGTTTTCGGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr2L 8898932 5' - roo 9029 1 65.35 AGTTGGCAGCTGACAACAGAACACAGCGAAAAAAAAGAATATATATATATGTGTATGTACGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr2L 9854107 5' + hobo 17 1 60.40 AAAGGATCGAACATCTATCCTGAAATACGCTGCAAAGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3R 13166623 5' - roo 8998 2 64.36 TCTAGTGAATTTTTAACCACTGTTCATTGTGCGATTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr3R 12546815 5' + hobo 39 1 62.38 TTGAGAAAGGTATCCATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATT:1 + chr3R 7639798 5' - HMS-Beagle2 263 2 79.17 ATAATAAGAAATTTTAGTAAACGGCTAAGTACTAAAAATAAAGTACGGGTATTTACTTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr3R 6104458 5' + pogo 17 1 60.40 ACACGAAAAACTCAAAAAAATTACCTCTAAACACGACTCAGTTTTGCTCGAGCAAAACCAGTGGAAAATCCTTGGCCCACGTGGGAACCCCTTTTTAAAGC:1 + chr3L 27600973 5' + Rt1b 321 1 55.45 AAATAATTAACCCAGCGAAAAGTTGTTTGCCCAAAGAACGGTGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr3L 1276706 5' + hobo 30 1 57.43 CTGCCAGCGACGCCTAAAAAGCGGCAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2R 17277653 5' + jockey 10 1 56.00 TTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:2 + chr3L 8044318 5' - mdg1 7423 2 59.41 AATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:2 + chr3R 13620277 5' + Doc 46 1 71.29 CATTATGCTTTTTTATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAAACAAGTCCGTTTTA:1 + chr3R 19515788 5' - 412 7528 2 60.40 ACCTGCAATGATACTTGGATTAATATATGTATTGTGCGGAATATATTTCATTTGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 + chr3R 3920656 5' + I-element 25 1 54.46 AGTTGGCATAAAATTATACAGTAAATTGGTTCAAAAAAGATCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chrX 11299975 5' + roo 36 2 61.39 TGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCATTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 3535427 5' - roo 354 2 75.25 TTTTCAAGTGCCTTTATTATTAAGGGGTGTTAAAAAAACGCAAAGGTCAATTGTATTGGTACATATAGAATTATTCTTCAAATTAAGCATAGTTTAAAGAT:2 - chr3L 10784234 5' + Transib5 438 1 77.23 AAATGAAAACCATACATTTCATCACCCTTATTACGGTTTTCGATGGTCTAGGGATGACTGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chr3R 9328756 5' + hobo 16 1 60.40 CTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 - chrX 21945911 5' + F-element 59 1 76.00 AAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGG:1 - chr3L 23678153 5' + Osvaldo 16 2 73.20 ACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTTTTGTCATCCGGGTCGGAT:1 - chr3R 15790097 5' + flea 4713 1 74.26 AAATAATAAATTTCTTAAAATAATTTCATCGCTGGATTCCTGCGCCACCACAAATTACTTTTAGAATACACTTAAAAACTGTACCCACTAATGCTAAAAAA:1 - chr3L 18377029 5' + TART-B 10165 1 81.19 ACGGCGCTACATTTAATCTAATCTTGAGCAAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chr2L 9672392 5' + 297 6588 2 70.30 TTTGCACTAATTTTGCAATGCCAAATGGGTGGGGAATGGGTGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chr3L 18793065 5' - P-element 2853 1 45.54 TATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 9616605 5' - roo 9019 2 77.23 AATTTTGATGAATTACACTTCGTAATATATATGGAATGTTTCGTTCCCACAAGCCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 16399016 5' - roo 388 2 54.00 TATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3R 19450190 5' + roo 59 2 55.45 TTTGTTAATTGTATTAATTATTGTTTTTGTATTTCAGGTACATTAGGTTTTTAACACATATAAATATGTGTAAGCGTTATTTCGCTTTTATATGATGGTTG:1 + chrY 3567717 5' - Porto1 86 1 56.44 TGCTTCGCCACTCCTTGAAAACCAGTTGCCACAAAGGAAAAGAAGCCCACAATAACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 - chr3L 12229430 5' - mdg1 7439 2 58.42 ATACGCGAGTTTTTAACTGCTTAGAAAGCATTAAAGCATTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAA:2 - chr3R 26642750 5' + F-element 218 1 62.38 ATCATATAGGGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGAC:1 + chr3L 24210899 5' - HMS-Beagle2 284 2 51.49 GACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTC:1 - chr3R 15790101 5' + flea 4709 1 78.22 AGTTTAATGCGGAAATATTGCCATGAAGCCAATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCC:1 - chr3L 15400115 5' - 297 415 1 69.31 CCATCTCTTTCGTTCGCGGACATTTTGTCTAGCACTTGCATACTTTTGTGCTCCATTTTTTTTTACGATTACGATGAAGTTTTTATTATTTGATCAACGCA:1 + chr3R 19513342 5' - jockey 4980 1 51.49 CTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAG:1 - chr3R 1977620 5' - micropia 5410 2 54.00 CAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2R 22746085 5' - hobo 2893 1 67.33 ACGCAATATTGCGTAGCCGCCGTGTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTT:1 + chrX 9816251 5' + BS 5013 1 55.45 AATACTGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chrX 11503515 5' + roo 8714 2 80.20 AACAAATTTTACTATAACTTTTTTTTTT:1 - chr2L 15949153 5' + Tc3 79 1 75.00 CCCAAAACAAAGGTAAGAATGAAAAATTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chr2L 13598246 5' - pogo 2055 1 74.26 GAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 + chr3L 9190475 5' - 412 7492 2 78.22 AAAAAGGAGAAAAGTATGTGTGAAGGGGGAGTTATTCTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr2R 10974135 5' + hobo 39 1 66.34 GTGAATCAATTCAAGGAGAAATGTGTAGACCATAAGATACCCTGTGAATATTTTGTACATCTAAGTAAAGACATGTGTAGTATGTGCATGTATCGAGGGTA:1 + chrX 6162116 5' + blood 5 2 74.26 TCTTTTCAATAGTCTGCATCTAGTTTTCAATGCCTCTGATTTTCCCTTTTGTACTGTATTCTGTTCTACCCTCTCTTCAGCTTCAAAAAAAAAAACAAAAA:1 - chr3R 18003231 5' + G2 3073 1 72.28 GGGGTCACTCTCTGCCCCCCACATCCTTCCGCATCCTCGTGCTCCTATCCTGCTCTCTTTGGGCCAGTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr3R 28135246 5' + hopper 11 2 68.32 CTAGCTGGCCTACATTTCGAGCTGGTAACAGATCTAGACAGCTTTCAAATATGGTGACGTGATAACGTATTAAACTTAAATGGCCCCAATTGTAAAGTTAT:1 - chr3L 25727044 5' + Q-element 663 2 70.30 CATAGAAGGAATCTAGATTCGGCAATCCGAGCTTATTTAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:3 - chr3L 15869722 5' + pogo 34 1 62.38 CACTGGCCGAAATCAGGCATGAGTTTGAATGTATAGAGGAAAATCGAAACTAGAATGACGTCAGCGGTGGACCACCAACCAACACACACACACACACATAC:1 - chr3L 1995549 5' + accord 183 3 57.43 GACATGGACCGCCATAATCGTTTTTTTCATTTGTAAACGTAATAGCTGTCCAGTGACATGTTTATTGCAGCCCATAATTAGAACATATTTATAGTTTGCCT:1 + chr2R 3938686 5' - rooA 7266 2 56.44 AATTAAAAAATTTTACACTCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTGGGATTAATAATCCAAAATGGACGATAAAATCATCCTGAACGACTTTTCGCTGACAAC:1 - chr3L 10905783 5' + mdg3 315 1 64.36 CGTGGCCTTCTTCCAGGGAGAGCAGCTGAAGCAAAGAATCAAGTTAGCTCTAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGCGCTGACACG:1 + chr2L 11742222 5' - Q-element 203 2 65.00 TAATAGATTCAAAATTAGCAAAATAGGTTCAAAACAATACTGGCTATGCATAACTTTCCTAGCTAATTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCT:1 + chr3R 21710534 5' - mdg3 237 2 69.31 CAAATATATCTGACAAAATACACGACACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGAC:1 - chr3L 10710286 5' + accord 7053 2 73.12 GTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTAT:2 + chrX 9816274 5' + BS 5036 1 73.27 TTTAATGTCTTCATTTATTGGTGTCGTTTGCGTTTCCAGATTTTATGACAATTGATTTGGCAGTTATGTAATTATTTGGCAAGTACAATTTTTGGATATTT:1 + chrX 8659632 5' - TART-B 10252 1 59.41 ACAAAACTAAATGAAATTGAGAGGCAATGCATAATGTGCGAAAAAGAGAGGGCGGACATTGTGCGAAAGAGAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCA:1 - chr3L 10675115 5' + invader2 4999 2 75.25 AGTACCAGAATTAGGCAGGAAAATTTCTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 + chr2L 17213870 5' - hobo 2890 1 72.28 ATTGCAAATTGTATGGGGATGTTATATTTACTTTGAATTGATATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAA:1 - chr3R 15130533 5' - Max-element 265 2 57.43 ACATCAGTTCGTGGATAATATTTAGTCAAATATTTCTTAACTTGAGAAAGGTATCCATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTG:1 + chr3R 7639757 5' - HMS-Beagle2 7182 2 69.31 CACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAA:1 - chr3R 7660513 5' + F-element 4676 1 75.25 ACTTGGGTTGACTCTTCGCTGATTGATTATTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2L 1535668 5' - roo 9025 2 70.30 ACTTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 - chrX 3295669 5' - hobo 2898 1 65.35 TTATGCACTTTCGTGCATCCATCATACGCAGCGTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAA:1 - chr3R 26207105 5' + hobo 479 1 66.67 GTTATCCAACTCCATAAATTTGAAACTCCAATCTGAGCGCCTCGAGTATTGCCAAGAATCCAATTAATCACAAGCGTACAAAACACATTGATGTCAG:1 + chr2L 22306751 5' - frogger 382 1 77.32 GACTGCGGAATGCAGATGGCAGACACTAGCGGTGGCCAGGAAGTCCTCGATGACATCCTTGCGAGCACTCCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTAC:1 + chr3L 13360918 5' + hopper 10 2 69.31 GGTCAAACCCACAAAAAAAGGGAATTTTCTAAAAGAAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 + chr2L 11559934 5' + copia 41 2 66.34 AGAAAATTGGTTAAATACAATTTAAGATGGTAGTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 - chr3R 10480408 5' - mdg1 375 2 68.32 CAACTTATTTCTATATCTTCTCCCTTTGTGCCCTGTGTGTGTGAAACAAAAACGTTTGTTTCAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2L 3842816 5' - roo 395 1 65.35 TTTGCTGACACAGTTTGTGGCAATGGCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGA:1 + chr3R 11082062 5' - I-element 5132 1 77.23 AGTAATAAGAGTACAGGATGTCAGTCTTTTAGGCTATATTAAAGCAGTAAAAGCCATAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTT:1 + chr3R 8576835 5' + BS 5015 1 56.44 TTTGATTTTACAACTTTAAAATTATCGGATGTCAAAATTACACATACACTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGT:1 + chr3R 15920717 5' + G-element 35 1 51.49 AGAGAGAGAAGCGGACAGAAATGCGTTTTCTATTTGTGCAAACTATCTATACACACACACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCG:1 - chr2L 1656336 5' + Idefix 72 2 61.39 TTTTGGCATATGTTCTATTTTTGTAAACATTTCGGTTCCTGTTCATGAGTCATCGATTTGGTTTTTTCTTCTTTTCCTTAAGTTCCTTGATTGCGTTGGTA:1 + chr3R 8113728 5' - F-element 4417 1 74.26 ATTTCGCAAGAGAGTGTAACTTGTAATTTTGTACGTTGTAGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCA:1 - chr2L 12301046 5' - I-element 4914 1 60.40 GTCATTGTGCGCATTAATGTGCTTCACAAGGATTTGCGTAATTTGCACAATGTTGCAGCACAATATTCCCCCATCGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2R 20973099 5' + roo 6 2 73.27 CGGAAGTAGTGCACTTGGTCGCTAATCTATGGCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTTGAA:1 - chr3R 17529583 5' - roo 9028 1 67.33 ATTAACAACGTTTTGAAACAAGTCGAAGATAATGGACAGAGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3R 8133985 5' + roo 37 2 64.36 GATTTGGGCGAAATCTTTCTTAGGTGCCCTAGCAAAACATTTCGAGGCAAATCGATAAAAATTTCCATGACTAATATGATTATGAAAAAAATTTCCAAAAA:1 + chr2R 5524191 5' - INE-1 391 1 54.46 GAGAGACTCTCTTAAGGAGGAGTTAAGTGCGTTCAAGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCT:1 + chr3L 24150096 5' - Quasimodo 6968 2 63.64 TATTCTGGCACCACTGTGGTGGTGTCATCAAATATCGCCTCCGTCGTGGTTGGCGTTTCTGTGGTTGTTGTCGTTGTTGTGGGTTTCCTTAGTGGGGCGCC:1 - chrX 10044578 5' - gypsy3 399 1 77.23 TAATTTCTTTGGGGGATTGCTGGCCAACGCGGCGGATGCGTAACAATCTTGTTGCCGCCACTCACTCACTTAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2R 15781380 5' + jockey 12 1 72.28 TTGCGAATCGCAGCGCTAATGAGGCGTCTGGGCCGCCATTGAATGCATTGAACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATTAATAC:1 - chr3L 20862902 5' + hopper 22 1 58.42 CATTTTCGATAGGCCATTATTTTTTATTAAATCTGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAA:2 - chrX 10298089 5' + Quasimodo 3 2 73.27 CCCAGAGCCTACTGTGAAAGTTATTTAAATCAATACCACTTAAACGTTTGAACTCCTTAGGCGAAATAAATCTTATATAATAAAACTATAAGTCAGAACGA:1 + chr3L 25108117 5' + F-element 184 1 75.25 AAGGGCAAAAACGAGCTCTCTCTTTCGCCTGAAATGTTATAAAACTTTTATTGAATGGTTCTATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGT:1 - chr3R 11549929 5' - opus 7492 2 70.30 AAACCCAACCAAAAACCAAACTCGAAACGTAGTCCTGCCACGCCCACACCAGCCCCACTTCCACACCCACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chrX 20585921 5' + jockey 12 1 72.00 AAACGAACAATGCCAAACACTCAGATGTCCAAGTCCATGAATAAAATTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGA:1 - chr3L 20272810 5' - flea 4843 2 54.46 TAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:4 - chr2R 17348631 5' + jockey 21 1 61.39 TTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATG:1 - chr3R 15790093 5' + flea 4717 1 70.30 CGGGGTATCACTCATCCGTGGATTTGCCACTGAAGCGACAGCTAACTGAATTCGAACAATCCGAACTTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAA:1 - chr3L 18543776 5' - 412 7132 2 72.00 CCTGTCGCTAGTTTCCTGCTGGAAAGCTGGCAGCACTGTTCATTGCTCTGTTCCCTTGGCTTTTGTTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATG:1 - chrX 7990843 5' - Copia1_DM 90 1 65.66 TAATTCTAAAGCAAACAAAATGCTCGAATAAACATAGAAACTAATAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr2R 7480466 5' + BS 5098 2 45.00 TATGACAAGCTCGGACACCTTTTCACATCCCCGCCCAAACCACCAAGCCATTTTTTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATAATGTAGGGG:1 - chr3L 7430652 5' - invader2 259 1 53.00 ATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGAT:1 + chrX 292415 5' - G3 4555 1 61.22 GGGTTTTCGAATATTGACTTACATTTCCAAATCTTAGGTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 12998280 5' - roo 394 1 62.38 AGAGATCTTGTTTACATGGATGTTGTTATGGTGGTTACAGTAGGTCCAGGGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTC:1 - chr3L 5617903 5' - gypsy 405 2 58.42 CTGCAGTTTCATTAGTGTCATCAATGTGGACATGTGTGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCAT:1 - chr3R 23173167 5' + Burdock 6174 2 65.35 ACATTGAAGACTATAGATAAAGGTCAAAAATGAAATATTGTATGTAAATTCAATTCACAGTTGCTAAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTG:1 + chr2R 10552688 5' + INE-1 563 1 90.10 GATGCGATTGCAACGATGGTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAATCAGAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr3R 12949475 5' + jockey 65 1 78.22 AACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAA:2 + chr3L 24210924 5' - HMS-Beagle2 259 2 76.24 CACATGGAAAATATGTGTGTGTATGCGTATGGGCCCACACATATGTATAAATTTAGGTATATATACTATATATACTGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:2 - chr3L 13644704 5' + hobo 1 1 76.24 TAGATATTTAATATGGATACACCTAGTTCATGTAAACCTCAAAGTCAAAGTCAAATGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAG:1 - chr2L 17593507 5' + Tc3 316 2 64.36 AAGCTAACATCTTACAACTATTGAAAACCTTAACGACAGAATGCCGGAGTTGTTGGTTAATGAGCGATGGCTCTTTATTTTATGAGTGTCCAAAACGAACT:1 + chr2R 5582125 5' - gypsy3 128 2 71.29 CGGCAACACACATATGCAAAATTATAATTTAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr2R 13738619 5' + hobo 46 1 67.33 ATTGGAGTGGGTCGATATGAATATCACAGCATAATAATTTGCAGAGTCGCTTTCATATCAAGGGAGGCCGAAAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTC:1 + chr3R 17335664 5' - hopper2 1269 2 76.24 AGGAAACTCATTTGTCTCCGTGTGAAATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr3L 17635609 5' + 297 6 2 74.26 GAATCGATGGGAAATCGGTATTCACCACCTGGAAAATGGAGAGTTGGTTAAATTGTGCCGAAGAAACTCCCGCGAGTTATTAACAAACAAAATTCACGGTC:1 - chr2L 12752921 5' + HMS-Beagle 394 1 58.42 CCTAGGAAACCAAGGAAAACTTCAAGTTACTCTTGGGACTATTGTTGAAGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2R 12998370 5' + roo 8692 2 56.44 TATGCAAAGGAAGTTGGCCCTGGAATTCAGCGAATGATAATGCATGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGC:1 + chr3R 19449293 5' - roo 8615 1 56.44 TGTAGCTTTTACATATTTACACAAATATAACAAAAACGAAGATCTCGAAATGGTAATTGAAGACAGCGCAAGTGATTCTGCTAAGCCCCCACCTATCATTC:1 + chr3R 3696445 5' + G4 158 1 80.20 GTTTGTGGGCCCTTCGCTTCCTGGCTACACTCGGAAAATTGTTGCACCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 - 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INE-1 574 1 54.46 TCTGGATATGCAACAGTTATCTTACCCTAGCCTAGTGTATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr3R 10957277 5' - hobo 2901 1 66.34 GGCGGGATGGTGAGTTATGGCTTAAACAAATATACTTGCTGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 - chr3R 31463194 5' - pogo 2068 1 63.37 GTAACAACAATCACGATGACGAAGAAGTGGAAAACGAAATAGAGACAGCTGTGCCTGCTTCAGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAGTAGAATTTGCTTGC:1 + chr2R 2950885 5' - 1360 3266 1 56.44 ATTTACATGGCATAAACTTTTGCTGCCCCGTTTCGCCAGTTGCAAATAGATTTCACGCTTTGTTTTATATTCCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr3L 21998508 5' - roo 406 1 76.24 AGCCAATATAAAAACTCCACATTATGGATTACAATTAATCATAAATATCCTATATTTCAATCCCTTCTTCAACATATTCTCTAATATCTATACACACTGGC:1 + chr2R 25254478 5' - invader4 2946 2 62.38 AGAACGCATTAACGACATACTCCTAAATTAACGTAGGAATGCCTGCACCGCCCACTTCGCCTGACTCTGGTGAAATTCAACGCGGCAACAGCGCAGGCACC:1 + chr2R 4878305 5' + Chimpo 293 1 61.39 TTCCACCTGAAAATTACCGGGAAAGCGAGATGAACACACACTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 - chrX 9649966 5' - blood 7352 2 62.38 AGCGCTGCTTTGCACTAATTTTGCAATGCCAAATGGGTGGGGAATGGGTGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3L 18793073 5' - P-element 2861 1 53.47 CGGTTCTACCAGCCACCAATCAACGCAAGAAAACCAACAGCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATCCTTATGATGACCGCTCGAGGACAAGCGTCAATT:1 + chrX 4988044 5' + HMS-Beagle 6764 1 60.40 GTCTCCTCGCATTGGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATCATTCTGAGCATTTTCGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGG:1 - chr2R 979637 5' - Porto1 4309 1 84.16 CAAACATTAAGTAAGGGGAAAGAAACTTTAAATAGCTTTTTTTTTCGCATGGTTCCCACGGCTACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGT:1 + chr2R 10796042 5' - Cr1a 4407 1 64.36 GTTTTCACTTTTTCTACGCATTTTCCCGCCGGGCTCAAAATCAATCGAATTGTATTGATCATAAATGTATTTTACACGATTTTTTTTTTGAATTTCTTCAA:1 + chrX 3103646 5' - TART-A 13400 1 79.21 CTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:4 - chrX 21945917 5' + F-element 54 1 70.30 TGCTAGGGTTTATTTCGATTGGTCCTGCTTTAGATTGTGTCATCATTAAGATCATTATAACTATTATAACAGGACCACTCCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 + chr2R 2009383 5' + I-element 10 1 76.00 ACTTTCCCCTTAACTTTGGCTGATTGGCAGATAGAGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - 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chr3L 24210995 5' + HMS-Beagle2 6892 2 68.32 ATTTACTGTTTAAGTCAAATAAAAGTGCCCGCACATTGGAAATAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr2L 12835889 5' - 412 461 2 56.44 CCAAAGACGACACCTGTTTCCGGCCTTATCTTCTGGTTTCGATCGGGCATCTTTTTGAGTCCACTCCGCCGTTGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAG:1 - chr2L 3106587 5' + invader2 119 2 73.27 AGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGACTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 + chr3L 24210906 5' - HMS-Beagle2 277 2 58.42 TTTATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGC:1 + chr2L 23299980 5' + invader4 347 1 59.41 AGAGGGAAACATTTGTTGTAATTTTTATTGATTATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTT:3 + chr3L 5282177 5' - Transpac 271 2 68.32 CCTGTCTGCTAATTGAAAATCAATTAATGTGACTGCATCCTATAGCTGCTCATGTCAAAGTCAGATATCATCCAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGC:1 + chr2R 23596385 5' + 1360 4 2 75.25 GTTATGTTTTGAGGGGATTCAAATTCATAACATAATCTCAAATGTTGGTTATACTCAGCGTCTAATTGAAAATATATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGT:1 - 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pogo 2066 1 62.38 CATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chrX 21219471 5' - roo 9018 2 78.22 GGGGCTGATACTGCTGTCCCCTTTTTTGCCTTAATTATACCCGTCAATCGTGGATAAAAAGAGTAATCTAGATTCGTTGAAAAGAATGTAACAGGCAGAAG:1 + chrX 155391 5' + INE-1 24 1 76.24 TCCACTATTATACATTTCAGTGCCCGACGTACTTTTGTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGG:1 - chr3R 13620076 5' + jockey 327 1 63.37 TACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAG:1 + chr2L 23295815 5' - micropia 457 1 55.56 AAGGACAAGGGAAATGCTGCTAAGATTGGAGTTTGAAGTTTGTTTATCAACTGGGGCAGAGTGCTATATTATCGCCTTGTATATTGCAATTTTATTATGTA:1 - chr2R 3514902 5' - Porto1 4225 1 69.31 ACCAATTGGGCGGTTTTATTGCGCGACAGACCAGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chr2L 7056401 5' + P-element 44 1 35.64 ATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTC:1 - chr2R 545172 5' + F-element 442 1 57.43 GAGTTAAGCAAACGAGGTCCCAGAGATTCAAAGCTTCCCAAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTAT:1 - chrX 21207358 5' - roo 8909 2 60.40 AAAATGGTGGGCGTGACAGATTTGGGCGGTTCTCGTTGTAAATACCAGCAAACTGATTTATATAGTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCC:1 - chrX 21564178 5' + invader4 14 2 64.36 TGAAATAGAGGTCAGTTCATCTTCAAATCTCGCTTTATGATTCTTCATTTGGATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3L 10305308 5' - 412 7525 2 57.43 TGTTTCGTATTAGAACTAATTCACTCATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 19066097 5' - roo 358 2 73.27 AAAATAGTAAATAAAACCGTTTGTTCGAAAAGATGCACGCCTTGAAGAAATGGGTTAAAGCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chrX 3333385 5' + pogo 14 1 65.35 TCGTTAACTGGCGGAAGTAGTGCACTTGGTCGCTAATCTATGGCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr3R 17529594 5' - roo 9039 1 57.43 TAGGAGATTATATGTAAAAAGTTTAACTTTGGCAGCGCGGCCGTTCTTGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAA:1 - chr4 868325 5' + 297 6741 2 75.26 CTGGGGTGTGTCACATCACAAAATGCATTGTAAGTAGCTGTCTGGTTCTTTACCGTTTGGTTAACGTTTTGCATCTATCGCATCTCTGTTTACAGTATTG:1 - chr3L 26022640 5' + Circe 98 1 62.00 CAAAGAATAAGGTAACCCAAAAACACGACACAGAGATATCAGTTCAGATTGTGGCCAAAACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCT:1 - chr3R 9435836 5' + Doc2-element 345 2 58.42 GGTGGCGCCTTGCCCTCAGCACGTGGAGACGCACTTTGGCAAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chr3R 17557377 5' - mdg1 387 2 58.42 GGAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr3L 14558260 5' + 297 6618 2 65.35 AGTTAGTTCGTTTTCGTGGTCATAAATCTTTAGGGGGTTGTCATTTGTTAGTGCCGTGACCCGTCCAAACAGTCAGTTCACCTTTTAAAACTAAATAATTT:1 - chr3R 26544922 5' + FB 938 3 79.21 CATTTATGAGAGGTCCACATCGTATCCTATTGTTGAAGCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCC:1 + chr2L 9546922 5' + Idefix 7033 2 62.38 GCCATAGAAAACAACGGGACCGAAGCGCGGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTAAACCCAACCAAGGCAAAAACCATTAGTAGCT:1 - chr2L 493081 5' - hopper 401 1 79.21 GGGGCGGGGGTATGGTGGATTCAGGGTTCGCTGGATAGGGAAAGGAGCAGTCGACGAGGGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGT:1 - chrX 14509514 5' - Rt1b 4933 1 61.39 GCACTGCTTCCTCCTGAGCAAGGAAATGTACTGGAAATGCAATGGAAGTGAATATACGATTTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTT:1 - chrX 2742064 5' + hobo 2483 1 73.27 ATGGGTTCCAGTGCAACATTATAACATAATCCGCATAGAAGGACTTCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 + chr3R 16110170 5' - mdg3 5476 2 56.52 ACAAAATACATACTTGAGTACATAACCACTAACCACTTTAAAAAGAACATCACCATTTATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGCGGAGGAGAAGTTG:1 - chr3R 4141278 5' + I-element 331 1 61.39 CGGGAGGCGGATGGCGCTGTGCGGCGGGGGGGGTCTTTTATTAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTG:1 - chrX 16147928 5' - 1360 185 1 58.42 CTCCTATATCTCCTATATCCCTCAGTTCTAGGTTGATCTGCTTCAGTTGGTATGGTCCATCCGGTCTTGGATGGCATTTCGGCGGGTCGTCGCACCCCTCT:1 + chrX 10793821 5' - gypsy10 5661 2 53.47 GGTAGCGACTGGCGCTGTGACTCCATAGATGTCGCTGGTGTGACACTTAAAGGCCACGGTAAATTTAAAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCAT:1 - chr2R 14434368 5' - invader4 324 2 70.30 AATACATTCTAACTCTGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chr3L 14504291 5' + 297 6617 2 63.37 ATTAGGAAACACACATTCATTCGCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:2 - chr3L 10576878 5' + roo 8674 2 69.31 TATGCTACGCATCCCATAGACGCAAATTATGATGTCGGCTGATGCGAGCAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:2 + chr3L 19437217 5' + jockey 4696 1 51.49 CTCGCTTACATCTGATTCGGCCCTTTGCAAGTAAAATTGCATTTCAAAACAAAAACAATCAAATCGAATGTCACACACACAACTAACAATTATTGACTATA:1 - chr3L 13885558 5' + Doc 122 1 72.28 AGTGACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr3L 14286060 5' + 412 40 2 64.36 AGAGGAATCTTTTTAAGTTAAAGCTGTGGAATTTCTCGACAATTGTTTGAGAAAGTTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr2R 11770259 5' + pogo 17 1 59.41 CGGGAACTGCTCATGGTTATCCGGAGCAGCATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 - chr2R 22825466 5' + opus 7048 4 70.30 CCTGTCCAGTCCCTTTGGCATGGCAAATGCGTGTTTGGTCCGTGTCCCGCGGGCGGACGAGTATATCGCACTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGG:1 + chr3R 20486318 5' - accord 7376 2 71.29 TGGCCCGTTACGGCGACCGCAGGCCAACAACAGCTACAGCTAGGGATTCAGTGCTGCTACCAACAGCAGTTGCAATGCCTGTAATAATTGTAATGCATTTT:1 + chr3R 8499377 5' - Tabor 7324 2 79.21 GGGGAAGGGGGAGTTGTAAGGCCACTCTCGACACACACTCACACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCT:1 + chr2L 12896059 5' + 412 7371 2 58.42 CATGGAGGCGTCCAGCGGAGTGGATGCGGCAATCGAGCAAGCATGTGTAAAGGTTCCGAAGCAGAGGACACACATTGGTTCCCGAAAGAAAGGGCAGACTA:1 - chr2L 14540296 5' - aurora-element 40 1 72.28 CTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr2R 17348618 5' + jockey 29 1 53.12 ATCTCTTACTCGCCCGCTCCACAAGTCGATTCCGCTCCGCAGGCGAGCTTTAAAAGCATTTTTGGGTTGGGTTGCGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACAT:1 - chr2L 11226874 5' - G2 82 1 80.20 TTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCT:2 - chr3L 24210972 5' + HMS-Beagle2 32 2 62.38 GAAGTTCGGTATAATTAGACTCGCTATGGGTCTGATAACTTATCATAAATGTGTCTATCTGTTACTTAATACTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 - chr2R 11245069 5' - 412 7541 2 73.27 ATGGAATTGAAAGCGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:3 - chr3R 19513424 5' + jockey 4683 1 64.36 TATTCTATCCCAGCAATATGTCAAAGGTGCAAGAACGCGAAGTGGGTGGGTTAGTCGGTGTTTGGGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTC:1 + chr3L 6663246 5' - I-element 4926 1 67.33 AAAACCATACATTTCATCACCCTTATTACGGTTTTCGATGGTCTAGGGATGACTGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr3R 9328751 5' + hobo 21 1 56.44 CACGTGAGCCGACGCTTGAGTGCGATGCATTTCGCACCCTTTTATAAGCATACATAACTATATATATTTATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCT:1 + chr3R 17173006 5' - invader1 4008 2 76.24 ATAATTGCGTGCACTTGTCTGTTGTTGGTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr2L 12888859 5' + 412 50 2 72.28 GGTCAGTCACAATTAGGCGGGAAACGCATAAGCAGACTTTTTAGGTAAATAAACTTTTTCCTCGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGT:1 - chr2R 3033007 5' - F-element 426 1 67.33 GACCTGCAAATAATTTCTTAATCGATAAAGGTAAAGAGAATGTATAAACATTGAATATGTGTGCTTATAACGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr2R 12625474 5' + pogo 3 1 70.30 TAAGTGCTTATTATCGGGCATCTATTTCAATTTCCCCCTGGCAATTACGAGGCAGTCGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3L 15729691 5' + hobo 18 1 61.39 GTAGAAAACCAGGTCCTGTATGCCCTTAGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr2L 17213903 5' + hobo 48 1 69.31 TAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAG:1 - chr2R 2092784 5' + Doc3-element 91 1 64.36 CATCGTTGACATCATTAAATCTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chrX 14617691 5' + hobo 54 1 79.21 CGCCCGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2R 17348637 5' + jockey 12 1 67.35 GCAAAAACATTATTTTGGGAACCATAATTTCATTGCATTTCATTGTTTATTTCGATCATAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCA:1 + chr2R 4707527 5' + 1360 3204 1 62.38 ATAAGCTGTAGTAATATATTTTATACTAAATAAAATCGAATAGGATAGGAATAAGATAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 10189428 5' - roo 390 2 58.42 GCTGGGAATGGCTTGCGGTTGCCTTTGGTGGCATAAAATGCTTACATATACATATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATAATGAATAG:1 - chr3R 25859440 5' - Stalker2 7627 2 55.45 TATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACA:1 - chr2L 22780911 5' + HMS-Beagle2 6924 2 68.00 TTATTAGTTATAAAGGCATAGTGGCCAATGCAGTACATAGTATATTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGC:1 + chr2L 8086348 5' - Cr1a 4261 1 62.38 GCACTGGCGGTATTGCAGTAGAAGTATTGCCACTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCC:1 + chr3L 27264806 5' + Doc 4502 1 68.32 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGGGATTGAGAGCGGGACGGGGGCACACGCATGCCAGAGTTGCCTTTGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 12649915 5' - accord 7032 2 72.45 ACAAAAGTAGGCAACAAAGACGGCAGCGATGCGATGTGATGCGATTGCAACGATGGTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr3R 12949438 5' + jockey 27 1 59.41 GCTTAATATCTAACAGTTTGTTTAAATCTACGAATTTTCAGACATTATTAGCCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1 - chr3L 920555 5' - mdg3 5475 2 57.43 TAATAAAGTTGCAGCTCGTATTGCAGCTACTGTATTTTGTTGCAGTTTTCATACCCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 - chrX 21494691 5' - transib2 2802 1 57.43 ACGCCCCTCTTTTCGGAAAACTCCGGGTAATTAAAATACTTTTGGCAGTCACTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2R 7105328 5' - roo 9048 2 52.48 TGGCAGCTTAACGAGGACTGACTCTTCATTTATTCAGCACGTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAAT:1 - chr2L 23180105 5' - Burdock 224 2 57.43 AGTTCGTGTTGAATTTTAAAAGAATTTATTTGTCCCGTTTTCGGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTGGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGG:1 - chr3L 26309570 5' - mdg3 5247 1 57.43 ACTTTGAGCTTTGTGTGTGGAAAGCAACTAACCTGGAATTTGTCATAAGACAAGGGAGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAGC:1 - chr3R 11079927 5' + I-element 381 1 63.37 AATCAAAATTAATGAGTTAGGCACTGTTTGCACAGTGGTTCCGCTTGTATGGAGCAGAGGCCATAAATACTTCCAATATAGCTACAAGCCTAAGATTTTGT:1 - chr3L 25322743 5' - Transib5 2931 1 65.35 TATGTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chrX 5178877 5' + hobo 29 1 57.00 ACATTTAATTAGTTCTCTAACAGAATTAGCTATATTTAAAGTTACTTTTCTGATGCGTAAATCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACA:1 + chr3R 7879809 5' + 1360 17 1 61.39 TGGCATTGTCATTTGGCTATTTATAGGCAGCTGTCATATTGCAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAAT:1 - chr2R 17339418 5' - jockey 4870 1 62.38 GATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGT:2 - chr3R 10736132 5' + McClintock 5965 2 65.35 CTAGTACATTCATAGTTTACCAACTCAAATGCAAAATAATGTGATTGAAACCATTACTTATGTTGGAATAATTTTTTATTTTAGTAAATAGCTACTATAGT:1 - chr2L 21659443 5' - Doc 138 1 71.29 TTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCT:1 + chr4 1294988 5' - TAHRE 10409 1 77.23 AGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAG:1 - chr3L 23678152 5' + Osvaldo 18 1 72.45 ATAATTTTGCGAAAAATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr3R 13620263 5' + Doc 32 1 57.43 AATGTGCCCACACACACACACACTCACAAAAAGAGAAAGCACTCTCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr2L 16492952 5' - hobo 2931 1 59.49 AAAGAAATTACAGCTTAATTCTGTTTTTAAGAAATTATACACTGTTTAAAAATATTTTTATTAACACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chrX 12152634 5' + roo 9 2 70.30 GTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chrX 5178874 5' + hobo 33 1 60.40 ATATACTTTCACTTTCTTCACACGCATGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTT:1 + chr3R 21198621 5' - Tirant 347 2 77.23 CAAATTTCATTGAATGTTTTTTCGAGTGTAACAGCCACTAAGCAGATCATACGCGATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr2L 10029173 5' + 297 6596 2 57.43 CAGATATTAGTATTTCACTGTCTGATGGTATGCATAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAA:1 + chr3R 23173107 5' - Burdock 219 2 65.35 GGAAAATACGATCTTTCATTAAATAGGAAGAAACAAAAATTCCTAAGAGATCAAAATAATTTCAAGAAATATATCCAACCGAAATAAAGTTATGTTATCTT:1 + chr3L 2818426 5' + Chouto 150 1 63.37 AGAAAATGTAGAAATGTCACTCCAGCATTTCTTTAATCATTTGCTATTTAAGGAGTTAATTGTATATTTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 + chr2R 11835591 5' + I-element 11 1 73.27 GATGCATGACTCGAAATAAGCTGGCTGTGGCCTATAAATCACGGACAGCTTTCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1 - chr2R 14402324 5' + Tabor 6863 2 55.45 TTACAAGATTGTAAATTAAATTGGCATAAAATTATACAGTAAATTGGTTCAAAAAAGATCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chrX 11299957 5' + roo 8682 2 59.41 CACAAACACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGCGACTCTTTGCATTCCAGAAATTCTGTCGAGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCG:1 - chrX 21852436 5' + invader4 76 2 66.34 GATGTTCGAACTAAAACCGAATACCACATTCCGACTTTTGAGCCGCCTGCTCCAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:2 - chr3L 14205409 5' + P-element 23 1 56.44 TTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 19450174 5' + roo 8707 2 61.39 GAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3R 19515864 5' + 412 39 2 63.37 TTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTATGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr3L 25884102 5' + Doc 53 1 70.30 TTTGTATTTGATTTGTTTTAAACTTATCACTTGCTTTGATAATTACAAACGATCTTACAAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chrX 18181750 5' + pogo 13 1 66.34 GCTTTGTCACATTTGCAATATTTATTGCCTTTTGATTATATTTCAGGCGAGCGAGGAAAAATATTTATATACCACCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGA:1 - chrX 13547272 5' + I-element 3 1 70.30 TCCTGATGATGACTCAGTGTTAATGTTTGCGGATTATAACGCGCCCAGGCTTGAGAAATGAGAGTAAAGATATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGC:1 + chr3L 3739047 5' + invader4 2759 1 80.20 GGAATGGGTTTTGTGCGGCTTGCTCGGGTGTGCGATGGTGTTAGTGCGAACTACCGTTAGGTACGTTGGCTGGGCCAATCAAAACGCGCGACAAGATCACG:1 + chr2R 8996955 5' - G6 104 1 78.22 CCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 - chrX 21668069 5' + Tabor 35 2 60.20 ACGCCTAAAAAGCGGCAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2R 17277644 5' + jockey 20 1 46.53 AATGAAATTTCTGCTGATTATGTAACAAACTGAAAGCGAGTGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:2 - chr3R 23870160 5' - roo 391 2 61.39 ATCAATTGTGAATAAATAGGCAAATAGAAAGTATGTATGCTTGTTTGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCA:2 - chr3R 20240977 5' - Tabor 489 1 68.32 AGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:2 - chrX 15227329 5' - roo 361 2 73.27 ATGCTGCATGTAAATCGAAAAGGGCAGGATGTGAGTACCTAAAATAAATAAAAAACAAGGAAGGAAGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGT:1 + chr3L 23027553 5' - INE-1 554 1 48.51 GAGAGATAGAATCACCCCACTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 6869302 5' - roo 9014 2 80.20 GATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 + chrX 3446531 5' + I-element 40 1 69.31 GTTAGAGTGGGCGTGGCAATTTTTTTTTTGCGAAAGCATAGAAATCAACAAGACTAATAAAAATGTGACAACATATCAACTCATTTTTCAAAAGTGCGGGC:1 + chr2L 18111231 5' - INE-1 256 1 70.30 CTTTCCTTGACATCCAGATTAGGTACACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr3L 14286018 5' - 412 7495 2 77.23 ATAAATAGGCAAATAGAAAGTATGTATGCTTGTTTGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTC:3 - chr3R 20240966 5' - Tabor 478 2 57.43 TACGACTACGACAACCTGCAGTCGCAGCTGGACAAGGCCTTGGGCCAGGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGGGCCTTCTTGAGTGGATAA:1 + chr2R 9532859 5' - Quasimodo 7001 2 53.00 TTAAAAGCAACGGCTTATTTTTCATCCACACTTGTTTGTTTTTTTTAATTAAGCTGACATGATAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 - chr2L 8231389 5' - mdg1 7446 2 61.39 AAAGAAAACCGAATAATAAACAATGACATTTGTGTAGACATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 + chrX 8551197 5' + mdg3 5290 2 62.38 AGAAAAATGATTCTTTTTTGTATAATAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGAT:1 - chr3L 8903507 5' + diver 51 2 79.21 CGACCACCCAGCATTGTCGATGCACTTCTGATAGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 - chr3L 22231410 5' + Doc 8 1 73.27 TAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGA:1 + chr2R 5284560 5' - Doc4-element 2616 1 49.50 TGTGCCGTCATTAAAAAGCTGAAGTGTGAGGATTTCGCACGGAGCCTCGACATTTACGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr3R 6187647 5' + 412 22 2 57.43 ATAGGCCATTATTTTTTATTAAATCTGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACAT:1 - chrX 10298081 5' + Quasimodo 11 2 65.35 CTTACTAAATTTAATGAAAACCAAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGA:1 + chr3R 25214044 5' + Burdock 6181 2 75.25 GAAACTCGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 + chr3L 8044293 5' - mdg1 410 2 67.33 TTTTTCGTTAATTAAGGCGAATTCTCGCAGCTAAAGCGCAAAAAGCGCTTTCTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 - chr3R 8487340 5' + Doc 33 1 48.51 AAACTTCAAAACACCCGGGCAAACTAAGAGAGATAGAATCACCCCACTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3L 6869275 5' - roo 9041 1 57.43 TATCTTACCCTAGCCTAGTGTATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr3R 10957294 5' - hobo 2901 1 79.76 AGCCCCATCCTCCTCCAACTGGCCAACACACTCACAGACACACACACACACACACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTAC:1 - chr2L 11210491 5' + Tirant 436 1 64.89 CAATTTATCGGATTTTTTCTTATTTTGATAGCTTTTGTTTTTATCTATTACATTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTTTACAATTGCATCTTAAATTATACTTT:1 - chrX 14889504 5' - mdg3 5058 1 59.41 ACTTGGGCACTTGTCTCCTTGTTTATGAATGATGTGTAGAAAACCAGGTCCTGTATGCCCTTAGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr2L 17231493 5' + hobo 13 1 39.60 AGTGTTTGTGATGCAAATAAGACTTACCAACAAGAAAGAAAGATAGATTTGCCATGCCGAGGTTATATAGAAAAATAGTTGTTATATTTGTGAGTCGAACT:1 - chrX 22577188 5' - 297 6963 2 34.65 AATAGTTAAGAAGATTCATTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chr3L 25884058 5' + Doc 9 1 65.35 ATTGTTGCTGCAGATTTAATTTTCCTCCAGTCCAGACATATAAGATACATGTATACTCTGCTTGGTGATCGCGAATCTGCTGACCCATCAGATTTGG:1 + chr3R 2473004 5' - gypsy5 7142 2 54.64 GGTATTTGTCATTCCATAAAATGGGGTGAGCTTGAACTGACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCA:2 + chr3L 26315775 5' + Tabor 6854 2 64.36 TCTTTTTCGCTCGCTTTTATCAGCGCTCCCGCACACAAATACACATACACCTGCTTCGCCGCTCTCTCTTCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTG:1 + chrX 13990927 5' + blood 169 2 69.31 TGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr3L 14286054 5' + 412 46 2 70.30 AAAGATTTGTTTATGACTTCTTCAATTTGATACCCTCTAGAGTTACATAAGTGGGATTCCCACATTTTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACC:1 - chr2R 1986299 5' - INE-1 176 1 68.32 TAATAGTTAAGAAGATTCATTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3L 25884057 5' + Doc 8 1 66.34 TTCGAATATTGACTTACATTTCCAAATCTTAGGTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 12998285 5' - roo 389 2 57.43 TTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGT:1 + chrX 21668025 5' - Tabor 434 2 73.27 CTATTAAGTTCCGCTTAAATTGTTTTCACATTTACCTTATGCCCGCCCGTGCGCCAATGCTACAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTG:1 + chr3R 21591932 5' + Bari1 11 1 69.31 CGAAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCT:1 + chr2R 17402699 5' + invader4 15 2 64.00 CTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTACCCATGTCCGCCTGACCGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAACTAAAATGCTAGAATGTTGAGATTCAGCAT:1 + chr2R 5250067 5' + INE-1 170 1 82.18 CTTTTATTATGGGTTCAATACCTGCAATGATAATTGGATTAATATATGTATTGTGCGGAATATATTTTATTTGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 + chr3R 3920637 5' + I-element 6 1 63.37 ATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr3L 17635583 5' + 297 32 2 64.36 ATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 19450189 5' + roo 8722 2 54.46 CGAACATTAGGGGCCAATTACATGCAGATTTGTACGCTCGGGGTAAAACATTCGCGATAACACATGAAAGCCAAAACAAGAAAAACAACAATACCGCTAAC:1 + chrX 17487498 5' + I-element 138 1 69.31 TTTTAGAATGCTCCTTTTTAATTTTATTCATAACTTTATTTTCAAGATCTTTTATTTGATTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAA:1 + chr3R 1927190 5' + copia 18 2 61.39 GCGCAACAATTATTTCTATTCCAAACTTCAAAACACCCGGGCAAACTAAGAGAGATAGAATCACCCCACTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 6869253 5' - roo 9063 1 69.31 AAACACAAACGTACATATATGTACGTTTGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 - chr3L 17257220 5' + Doc 59 1 78.22 ACCAAAAGAGGGACTTCGAGTAGAATGGTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAAT:1 - chr3R 2455241 5' + accord 7001 2 72.28 AGATAAAGGTCAAAAATGAAATATTGTATGTAAATTCAATTCACAGTTGCTAAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGTAGCATTCTCTCTT:2 + chr2R 10552702 5' + INE-1 577 1 86.14 AATTGGGTGGGGGAAAAGTGGTAGGCAAATGAAGTGGCGTTTTGATCGCACGGCATTTAATATTACTTATGTTTCTAACAACATGGCCTTTT:1 - chr3L 5580536 5' - G4 448 1 65.22 GAACCAAACGAAGAAAGGTCTTTTGTAAAGTTCAATAATCAGGACCTTGTTTAATTTGACCGACAACAATTCGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGG:1 - chr2R 3144130 5' - Transpac 309 2 78.22 TGAGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCAAAATAAGTAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 3535467 5' - roo 395 1 63.37 TATTAAGTGATTATGCTAAGAATATCAATATAAATATCAATATAAAGCAAAAAAGAATGCTATAGACGACTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTGAGC:1 - chrX 22485105 5' - INE-1 546 1 76.24 ATACCCAGTTTGCTCTCTCTCTCTTTCGCTCGCACACTAAGTATGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr3L 3070647 5' - 1360 3356 1 61.39 AGAAGGAATAAGTAACAGCTTGATATCTGTTTTATAGCCATTTAGTGAAAATATCGTTAAGAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACCTTACTCGTTGA:1 + chr2L 10104250 5' - roo 395 1 61.39 AGTTACGATTTAGCATCCAGATTTATGAGGCGCCTACGCAAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTG:1 - chr3R 17549552 5' - F-element 4499 1 60.40 ACTCGGAAAAGCTGAAGCTGGAAAAGGCCAATGCCAAAAAGCCCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCG:1 + chr2R 9970320 5' - Doc 409 1 57.43 AATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:3 + chr2L 9672426 5' + 297 41 2 70.30 AGTATTAGAATGTAAGAACTAATTATAAGAGTCGCGAATGTAAATAGTATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGT:1 + chr2L 23180029 5' + Burdock 6163 2 53.47 CAAAATTAGCAAAATAGGTTCAAAACAATACTGGCTATGCATAACTTTCCTAGCTAATTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 + chr3R 21710543 5' - mdg3 228 2 60.40 TGACAAGGCAAAGACTCAGGCCCAGAACTTTGGTACTTTTGGAGAACTAAAATGTTTGGGAGTTGAGATCCTGGAGGCAATGTGTGTGTATGTGTGTGTGT:1 + chrX 12256719 5' - accord 191 2 81.19 AATTAAGTAAATGATTTATTAATGCAGAAACTATTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 21581122 5' + roo 8708 2 73.27 CTAGCACATTAGCGCTGTGACCACCACCAACGGCGATGACCAATTGTTTTTTACTATGAACTCGCCAGCGCGTTAGGATTCAGTATGATTTGGAAGCCAAA:1 - chr3R 7637373 5' + hobo 425 1 55.45 TGGAATTATTTGGCAAGCAACGTAGCCCACTATATATGCTATATATATATAGTAAAATTGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTC:1 - chrX 10196162 5' - 17.6 7385 2 58.59 TGCGATTCTGCCGACTTCTGCAGCGCTGCTTTGCACTAATTTTGCAATGCCAAATGGGTGGGGAATGGGTGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3L 18793094 5' + P-element 5 2 72.28 GGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chr3R 11080689 5' + I-element 30 1 54.46 CTCCTTCGTCATTTAAGACAGATCATCCCAAAATAAAAACAACTCCTACCTCTCATTTACCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAACCTTATA:1 - chr3L 14963855 5' + Porto1 308 1 71.72 ATATTTACTACATTTAAACACCCCACTGATGATACAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 + chr4 306432 5' - blood 7348 2 64.36 AATCAATATCCCAAGCGGGAGATCTCGTTCCCGAAATAATGTAAACAAAAGGGCAGTACAAATACGATTTGTTTGTCTTAAGCTAAGATCAAAAGAATAAA:1 + chr4 970228 5' + 297 288 2 49.50 TACCTCAATCAAAGCATGTGCCACACACATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAAAAACACACACATACATA:1 + chr2R 18078701 5' + Quasimodo 38 2 68.32 TCGTTCTTTTGTTTGTTGTGGTTGCTGATGGGCTTGAATTTGTTGGTTTGCATCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATG:1 + chr3R 17673838 5' - I-element 309 1 59.41 TGTTGTTCATTTCTCTTTTCATTCTCTTTTTATACCCGTTACTTGTAGAGTAAAGAGGTTTACTAGATTAGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGC:1 + chr3R 4160308 5' + INE-1 29 1 74.26 TCATCATGGCCAGCTTGTTGTTGGTCTGGCGACTATATCAAATAACGACTATTGACTACGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAG:1 - chr3L 13652256 5' + mdg3 5272 2 59.41 TAGCAGCGGCGGCAATAGAGCTATAGAGATCGGGGGAAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTATAAGCATTG:1 + chr3L 10453934 5' - Max-element 48 2 69.00 GTTGCATTTATTGATGTCCACTAAACATAGTATACAAACATGAGTAAGAGATATTTACGTTATACTTTTTATACATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 - chr2L 21631923 5' - pogo 2099 1 77.23 TCTGCATTTATGTGCCCGCCAATCGTAAAGAGTGGGGTATATTGTGCAAAGGGTATAAAAGGTATAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 5654814 5' - roo 9059 1 64.36 CGCAGCCAGATCAAAAGTAGAGCTTGCCATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCA:1 + chr3R 13231157 5' + Quasimodo 42 2 72.28 AATTGATGGCAGTGGCTGTATATCGGTGGCTAATATGCAATCGAATGTGGTCGAGGAGGATGAGGAGGATGATCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACT:1 - chr2L 10189076 5' - roo 8813 2 66.34 ATGCACTTCTGATAGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 - chr3L 22231391 5' + Doc 27 1 55.45 GCCATTTTCAATTAATGGCAAAATATAATTTACAAACCAATTCTGATAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCC:1 - chr3L 12021322 5' - blood 143 2 51.49 TGTTATGCACGAATTTTTTATATTTTCCCTTATATTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACA:1 + chr3L 25912680 5' - I-element 5010 1 66.34 GGACGACGACAAGGACGAGGATGAGTCCGGGAATGGGGAGAGCTTGAAAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCATTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTG:1 - chrX 18335076 5' - Doc3-element 393 1 71.29 TATTGATGTCCACTAAACATAGTATACAAACATGAGTAAGAGATATTTACGTTATACTTTTTATACATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr2L 21631915 5' - pogo 2091 1 69.31 GTTTTGTGCTCCGTTCCTGTTCTGTTTTCTGTTTTTCTTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGG:1 - chr3R 30285287 5' - F-element 444 1 62.38 GGTTTTCATTAGAGTTGTTCAGGCATTGATTGGTATTCTTTGGATATTCCTAATTGGAAATCTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr3R 28333610 5' + pogo 12 1 67.33 TGCCGGCGGTCATAAAGGTAAATAGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chrX 7019235 5' + hobo 51 1 80.20 ATTCGTGCCTAGTTATGGATAGAAGAAATCATATCCGACCGATGTAGATGAGGCTTGCCATGGTCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTC:1 + chr2R 6507975 5' + pogo 1643 1 58.42 TTGAATTTCTTTTTTGGTTTTTATAAGCAGGT:1 - chr2L 8581658 5' - I-element 380 1 59.38 GCGCTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTT:1 - chr3R 23215554 5' - gypsy7 5010 1 83.33 CGTGAAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 + chr3R 11080669 5' + I-element 10 1 68.32 CAAGCGAGTGAATGAACAAACTACTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr2R 10334794 5' - pogo 2051 1 76.24 TACCGATGGGAACGGGTCAAGGAACCGGACAGCTACTTACAATGCATTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGAGTCACAGCTACAATACTGTAAACAGAG:1 + chr3L 26022593 5' - Circe 103 1 50.52 GTTTGTGAGAGAGCTGGTCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 + chr2R 6501178 5' + P-element 55 1 24.00 GACGGAGTTGCTCTGATCGTTGCCCAAATAAGGAACATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTATTTA:1 - chrX 5225904 5' - Porto1 4205 1 65.35 TATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAA:1 - chr3L 23456267 5' + Idefix 261 2 77.23 TATTGTAGTGACTTCTGTTGGTATTAAGAATGGTTCAGTTGCAAAAAATAATAAATCACTCATATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTC:1 - chr3L 17762863 5' - invader3 264 2 66.00 CTGTATTTAGCTTTCTTATGAAGAACTAAGTATCATTTATATATGTATAAATTATATAAGTTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAG:1 - chr2R 21249528 5' - gypsy 431 2 51.49 TTGTTTGTTTTTGGGAACTTTTCACATCAACTTCTTTGGTGGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chr3L 10576792 5' - roo 9035 1 63.37 GTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:4 + chrX 17492870 5' + Tirant 8123 2 65.35 TTTAATACTTTCAACGCCCGCAGCTCGAAATCCGAGCAGCCAAACTATAATATTCAGCGACGCCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCAC:1 - chr2L 9672558 5' + 297 6508 1 73.00 TGATGGAAATGGGGGTGTCGGTCTCCGTCTCCAACAAGTGGCAGTTGAACGGTTGCTAAGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTC:1 + chrX 7617525 5' - accord 402 2 62.38 AAGTTAGAGTGAGACAAACAGACATACAGAGCGAGAAAATCTAACTACTACAGTATAGGTATAGTATATGTCAAAGAAGTGATATTCATTGACATTGGCTA:1 + chrX 20794444 5' - pogo 167 1 58.42 GGGGGAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:3 + chr3L 14558257 5' + 297 6615 2 62.38 ACGACTAAAGGACAAGGCGATAAACTCAGGGTAGTCACGGTTAAAACAAACGATGGGGAGGTAAAAAGATCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGTGCCC:1 + chr2R 2692679 5' + Stalker4 7084 4 69.31 AAAATAAGATATACATAAATTTCACAATATATAGATACAGTTCTAGCGTGAAAGAGAGTGATGTCCTGGAAATTGCACCAAAGAAAAACTCAAAAAAGAAA:1 - chrX 12624787 5' - Tc3 43 1 52.48 TTATTGTGTTATATTTTCTTCGTACAAAATATAACCACGAACCATTTAAAGGCTTTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGT:1 + chr3R 25859348 5' + Stalker2 27 2 53.47 CATCGCAATCTCTTCGTTTTTTTTTGTTGTTTTGTTGGTTTTTTCTGTGTCCCGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACAC:1 + chrX 13859749 5' - blood 496 1 64.36 AATAGTATTTTGCGTAAATATTTATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGAT:1 - chr2L 16379034 5' - HMS-Beagle 239 2 72.28 AGGGTATGTGTTTGGTTTTATCTATTTTGCGTTGCATGCGTGGGTGTACGCGTGTGTGTCTGTTTGTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTCGTTTCTAA:1 + chrX 9449588 5' - Porto1 4378 1 63.37 CTAGAAAATTGGTTAAATACAATTTAAGATGGTAGTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 - chr3R 10480410 5' - mdg1 377 2 66.34 GTATACGCGAGTTTTTAACTGCTTAGAAAGCATTAAAGCATTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGAC:1 - chr3R 26642752 5' + F-element 215 1 60.00 GCACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTT:1 - chr2R 2875214 5' - TLD2_LTR 125 1 75.25 ATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr2L 17729361 5' + hobo 46 1 67.33 AAGGTGGCAATTGAAAGAAAGTGCCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr3L 3070694 5' + 1360 51 1 77.23 GTAAGTGCTGTAAACAACGCGTCAGGCGAGGCTATATATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAAT:1 - chr3R 12949119 5' - jockey 4820 1 62.24 GACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTGGTTTTG:1 - chrX 21945919 5' + F-element 52 1 66.34 TATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chr2R 17348627 5' + jockey 9 1 68.24 ATTCAGGCATCATCATACCTTAACTCGCCGATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTG:1 + chrX 20374514 5' + Bari1 44 1 70.30 TATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTT:2 + chr3L 24210903 5' - HMS-Beagle2 280 2 55.45 AGGTCCAATTCCACTTATTTTCGAGTCAAACTGCGCAGTTTCCATTTTTTTCTCTCGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACG:1 - chr3R 30276275 5' + invader1 3914 2 62.38 AGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:2 - chr3L 22231367 5' + Doc 51 1 79.21 TTTTAAATAATGAACTGGATAATTTAGATTCACGATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr2L 18417361 5' + roo 41 2 64.36 AATTTTGTATATCTTGGTATTCTGGCAGCAACATTCTCCTACATTTCCCGAGACAACAAAACTACGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTCTTTCAACA:1 + chr2R 4895765 5' + gypsy7 309 1 70.30 TTGTGATGGTTTAACAACAAACTCGCATAAAGCAGACAGGCGGACCAGTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAG:1 + chr2L 19681410 5' - hopper 1385 1 56.00 ACATTATGCTTTTTTATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr3R 19515787 5' - 412 7529 2 61.39 AAATATGCCCTACCTCTTCGCTGAGCGATGAAATAAAAACCAGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - chr2R 20075432 5' - mdg1 386 2 58.42 CGAAATCCTCGCCAGAACTCAACAAGCAACCCGCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAAT:1 - chrX 3669541 5' + I-element 5111 1 67.33 TTCCGAACTCTTTTGCTAAAAACTAAATGCAAAAAAAAAATAAGTTTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr3L 4909399 5' + hobo 28 1 53.47 GCAAAAATACATGTATATTTCTATTGCATCTTTGGGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 + chrX 4278338 5' - blood 7347 2 65.35 CACCTGCGGGAGCACCGGTTCCAATTTCCTGTCAATACCTTCCGAACGGAACCTAAAGAAAGCCGGTATACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chr2R 12247375 5' - hobo 2932 1 70.30 TTAGAAAAATATTAATTGAATAATTAAGGTAATTTATGGCAATGAGTGCATTTTTCTCTGTAATTAATCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 - chr3L 4639286 5' + 297 6586 2 74.26 TTAAGGCATATTCAAAGAGTTCATATCTGGCAAGAAGGTCTTGGGAACTTTGGGACCAATGTAAGCCAAAGACATTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3R 18719979 5' - 1360 3375 1 66.34 CGGCTGGGGGATAGGACAATGTTCAGCTTGGCATTGTTACTTAATGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3L 12217309 5' + roo 8696 2 60.40 CTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGA:2 - chr3R 19513395 5' + jockey 4712 1 70.30 ACAGACGGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGAGGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTTACATCCTGCTCATCGAGGTCAT:1 + chrX 19820620 5' + Rt1b 4964 1 67.33 CTCGTACTTGTATGTCCATAACCGAACAACTAAATCCACATTGTCGGCGGAAACAGCTCAGCAAATCGGAGACATTCCCCAAATCTGATGGGTCAGCAGAT:1 - chrX 15120582 5' + gypsy5 7143 2 63.37 CAAATCGAATAGATGAGGAAAGTGAACGTCTTTGTCAATTTGTTTAACTCAAATGTATAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTA:1 + chr2L 21777902 5' - mdg1 7443 2 62.38 AGCACACAAGCAATGCATGTATATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACAATGAAAATAAATTGTATTTTCTGCCTTTCGATGCAAAAATATAAAGGCCT:1 + chr3R 2474637 5' - S2 1661 1 78.22 TATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGT:2 + chr3R 4504056 5' - blood 7371 2 60.40 TGTCAGTTGATTTGCATAAAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:3 + chrX 10196075 5' + 297 15 2 55.45 ACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAA:5 - chrX 21945913 5' + F-element 58 1 74.26 AACAGTGCTACAATTGCCTATATTTTTTTTCAACTCGTATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCCCAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr2L 22342247 5' + F-element 59 1 71.00 TGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chrX 12866505 5' + hobo 45 1 72.28 AAAAAGGATAACATAGTAAACATCAGCAACAGCAGCAGCTACTAAATGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr2L 13867536 5' - roo 9007 2 54.46 TTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATC:1 + chrX 11503481 5' - roo 359 2 75.25 CTTTTAAACATAAGATAAACCGATACATCTTTGCACCCTGTACTGTTGCACACCATGATGCTCCGTCTGAACCAGTGCGGTCGGGGTTAAATTTTGGAAGC:1 + chr2R 3287798 5' - invader5 493 1 68.32 TCTAGAATCTAAAAAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chr2R 11247049 5' + 1360 28 1 53.47 GTATCCCAACCCACCGCCTTGCTGCCACAGCAAAAGATGCATGGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCT:2 + chr3R 17980741 5' + HMS-Beagle 6826 2 59.41 CAAAAATCAAAACATTTTTCAAAAGACTCACCGCGGCCACGCGAATATGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGGCCCAATGCTGGGTCAGCACTT:1 - chr4 749453 5' - Gypsy6A_LTR 58 1 79.21 ATCTGTGAGTAAAATTTGGAATAAATGTGTGATAAAGTCGTATGAATACCAAGCTATCTATGCATTCATACAATAGTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr2L 156549 5' + 1360 1 2 79.21 GCTGTGACTCCATAGATGTCGCTGGTGTGACACTTAAAGGCCACGGTAAATTTAAAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTAT:1 - chr2R 14434355 5' - invader4 311 2 57.43 AGGATTGTATTCCATCCAAATGGGCATGTGCGACAGAGACCTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr2R 22746084 5' - hobo 2908 1 60.00 TGGATTAATATATGTATTGTGCGGAATATATTTCATTTGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 + chr3R 3920671 5' + I-element 40 1 69.31 GTTAGCAAAAGCCATAAGAACATTAAAAGAACTAAACAAATTCAATATAAGATCAGTTTGAAAGATGAAATACCTATTTCAATTATTCAATGGATAATAAA:1 + chr2R 11653106 5' + Fw2 61 1 42.57 GCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCA:1 - chr3L 24210977 5' + HMS-Beagle2 21 2 53.68 AAAGTGTGCTACACATGTTGACATTGCCCGTGCGTGCATGTGTAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr3L 917180 5' + hobo 33 1 59.41 AGGCGAGATATTGCAAGTCGGATAACAACAGCAAAAACAACTACGTGGGTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTA:1 - chr2R 14768246 5' + P-element 24 1 53.47 TTCGTTCTTTAAGACTTTTTGCACATACCCAGAATGCAATTTGCAATCAGTTTTGTAGTAGGCTAGAGGTACATATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAA:1 - chr3R 2216806 5' + invader2 27 2 48.51 AAAAAAAAACAAAAAAAAACGCCAAACCGGAACGCCCACACCTTTGAACAATTTTTTACATTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCC:1 + chrX 19473139 5' - Cr1a 4436 1 80.41 CTGTTTGTCTGGCCGACTCAGGCAGCCATACCATCGCGATGGAACACACTACAACATGGATATAAGCACATACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGC:1 - chr3R 11200304 5' + hopper2 1207 2 57.43 TTCGCTTGCATGTGTTGGTGAGCGTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTT:2 - chr3R 21592008 5' - Bari1 1657 1 72.28 TGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3R 23870120 5' - roo 350 2 82.18 ATGTGTCAGTGTCTGAGCGTGGGCTACCTAGCCTGTCAACAGAATGACAGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr3L 13644602 5' - hobo 2913 1 53.00 TCATATTTCACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAA:2 - chr2R 2092809 5' + Doc3-element 66 1 59.41 TAATGTGGTTAAATGACGTTGTGGATTTCAATTGATTGGGTGGATGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:1 + chr2L 15151869 5' - Tabor 7294 2 52.48 AATTTGTATTGATAAAAACATAAGAAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 + chr2R 20506830 5' - mdg1 373 2 73.27 AGATTGCCACACGATGGTCGTGTGAAATGAGCACTTTTGAGTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chr3R 21587313 5' + pogo 32 1 60.40 CTTATTGTCACCCATATTTGGGATGGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGT:1 - chr2R 20008522 5' - Ivk 5036 1 60.71 GGGTAGAGCGATGGATAATGAAAGGGGGCTAATGAAATTTTAGTCTGTGTCGATCCATAACTGTAGTTATTAATTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTA:1 + chr3R 2474272 5' - Juan 4209 1 67.33 CCATATTATTATTTAAATATAGCTTACAAATAGTAATAGCCGAATCATAATATCACAAAATAAATCTCAAAAATTAACAAATTTGTCTAAAAAGCTCAGTT:1 - chr2L 9008695 5' + Ivk 5259 1 71.29 TTCTTGATCAGGATCAATAGCCTAGTTGATCTAGCCATGTCCGTCTTTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATGTCAGGAACTATAACAGCTAAAA:1 - chr2L 21738001 5' + INE-1 154 1 85.57 CTTTGCGATAATGTTAATGAGAAATGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 + chr3R 7102427 5' - pogo 2056 1 74.26 TTTTTCGCACGGGTCCCACCGCCATGCCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCTCTGCCGTGTATCGTACGGCTC:1 + chr3R 1135322 5' - Cr1a 4395 1 83.56 AAATATAAATCTAATATAGAGTCTAGCTTACTGTATGTGACGAAAGAAATGTAACGCAAATTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACT:1 - chrX 10276716 5' + Porto1 4198 1 61.39 CAAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGG:1 + chr3R 178120 5' + BS 2 1 52.38 CAGAGAACTAATCGTGATTCCATATCAAATGAAAACTGAAATCACAAGAGGACAGATCGGGAGGGCGTACCGGCCATTCCAAATCGCCTCTAATTGGGATA:1 - chr3L 25485155 5' - mariner2 535 1 66.34 TATAATTTTTTAAAATTCAGTGCCCCATAGAGCACGATACTAATCTGCCATGGCAACGGACCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATAC:1 + chr3L 5573507 5' - mdg3 5484 2 62.38 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGACACATACAAACACCATTCAATGTCAGATGGCTAGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chrX 12649914 5' - hobo 2931 1 68.32 GAAAGCATAAAATCAAGTATGTTCCTCTAATTTGGTTTGTAGAGAAACGGAAGAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 - chrX 21452825 5' - INE-1 548 1 55.45 GAATGTCCTGGTTTGTCTGGTGTCTGGGATGCCTCCTAATGATACAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr3R 12546875 5' - hobo 2908 1 58.42 ATTTTGTTAAAAAATATATATTTCCCAGTATTAGCTTGTGTTTCCTTTTTCAGTTTCTGCGGTCTTGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGG:1 + chr3L 12085571 5' - F-element 351 1 63.37 TGCCACAAAGGAAAAGAAGCCCACAATAACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 - chr3L 12229404 5' - mdg1 7413 2 70.30 TGAGCGACAGGCGGAGAAAAGGGGGTCTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:2 - chr3R 30076477 5' - hobo 2891 1 73.27 TGCTGGGGGGTAGATCCTCATCGTTATCTGCTAGTATTCCAAATCTATTTGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTGGAAGG:1 - chr3L 25552459 5' - mdg3 5267 2 53.47 AGTCAAGAATAATACATGTGTACATATGTGTACATACATATATGCAAATATAGTAAAATTAGTTTTAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTA:1 - chr2R 1365141 5' - 17.6 7294 2 72.28 GTATAAACAGCTTATTGCTTCCTCGAATTCGTGTGTTCCTTAAGCAGAATGTGGTGATTCAGATGCGGATTTTCAATATGTTTACTCTACATTATGTGGTT:1 - chr3R 9992687 5' - 17.6 6948 1 73.27 CCAATAAGCCAAATTTATGAATACCAATTAGGCAGTCCAATCACATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATACAGATC:1 - chr3R 11470024 5' - Quasimodo 405 2 57.43 CAGAAAATTTACATTTTAACCATTAACAATGGAAGCAATAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAAGCG:1 - chr3R 19508231 5' + invader2 438 1 69.12 ATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTC:1 - chr2R 4261950 5' - invader4 250 2 54.46 AGTGCCGCCACAGCAGCCGATGAACACATCCAGGTAAGCTGGCGAGGAATACCCCGAATTTAGGAGCCAAAATGTAAAAAAAAAAGAAGAAAAAAA:1 + chrX 12678024 5' - hopper 150 12 71.88 GCAGAGAAAATTAAAAAAAAAAACAAAAAAA:1 - chrX 3328518 5' - hopper 152 2 83.87 TACACTAATTTTAAAACGAGATAGAACTCTTGTTCTGGAATCGACGCATCCGGAATATGCATGCTTAATCTAAAATTTAAAGCTTTTATAGTTTCTGAGAT:1 - chr3L 22016848 5' - INE-1 151 1 57.43 AACATTTGATAAAATGTATTCACTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3R 14835252 5' - roo 9030 1 80.00 TCAATATACCACCAAAGACACTAGTGTCTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATAAAATATTGCAAATT:1 + chr3L 22232700 5' + P-element 148 1 28.71 AACACAAATGTCGGTTTAACTGTTAAATTGTCAATAAAAATGTATTATTTAAATGCACATAAACAGCCCCACATAGACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - 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roo 405 1 75.76 ATTGTGGGTTCACTTATGCCAGTCCCAAATTCGGATCATCGCTTTTTTCATTAATAAATAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAG:1 - chr3R 3625701 5' + Max-element 10 2 66.30 ATTTCAGGTGCCAACTTCCCAAATAAATTAGAAGACCAACGTTATTTGCTCGTGTCCAAACTGGAACTGAATCTTACTTTGTGGTCTAGGCTGAGGGGAG:1 - chr2L 23048352 5' - F-element 4209 1 80.00 TTTACTATTCATGTTGAGCTTTTGCTTTGAACACCTCTCAACGGATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr2L 21018789 5' + 412 7082 2 55.00 CAAAAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGGTTTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCATTTAAGACGCCG:1 - chr2L 23390135 5' - rooA 236 2 50.50 GTGTCTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:2 + chrX 5130979 5' + I-element 23 1 56.44 CATACTTCTAGGCTGGTTGAAAAGTAAAGTTTGAACTGCATTCACACACTTATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2R 13934382 5' + jockey 30 1 58.42 AAAGATTTCTAGTTGATTTCCATCACCAAAAATTCCATTCAAGAGCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTT:1 + chr3R 3697477 5' - G4 40 1 55.45 CATGCAGATAACACACAAAACAATCCGAATTAGTAGAAAGCAAAACAAGGCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTT:1 - chr3R 27993409 5' + transib2 25 1 56.44 ATATTAATACGTCACTATATATATATAAATTGGTCAGATGAGAAGTGGACACGGTTGCTTTCACAGCTATCTGTAGCGCTTTGGACATGAAGAGGCGGATG:1 + chr3R 2472935 5' + Rt1c 5047 1 57.43 AAGAAATATCAAAGAAAAACCAGTGGTTTATCAAAATAAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chrX 15227280 5' + roo 8701 2 66.34 ATAACATAAAATGCATACACACACCCGAAATTCCAAACTCACGTAATGTCAAGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTA:1 + chr2L 14041665 5' - jockey 4827 1 64.36 CTTTTAATTAAAATAGTAAATAAAACCGTTTGTTCGAAAAGATGCACGCCTTGAAGAAATGGGTTAAAGCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 + chrX 3333376 5' - pogo 2096 1 74.26 CAAAAACCAAACTCGAAACGTAGTCCTGCCACGCCCACACCAGCCCCACTTCCACACCCACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chrX 20585930 5' + jockey 22 1 62.38 AAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAG:1 + chr3R 11080688 5' + I-element 28 1 52.00 CCCGCAACTGAACCACGTTTGGGCCTCATCTAAAATTGATTTTGCTCGGGAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - 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I-element 5054 1 59.60 TGGTGTAGTTGTGCGGCTGTTGTTGTACAATTGTTGTACTGTTGTTGAGTTTATGCATTTGCAGCGTTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chrX 4778648 5' + hopper 6 2 73.27 TGTCCCTAGCATCGTATCTATAATATGTGGGGCACATTTAATGCTCGTACGTGTAGTTTTATCCTTGTGCCAGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTT:1 + chr2R 14135374 5' - roo 9067 1 70.30 CTTAACGGTTGTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAG:1 - chr3L 18183204 5' - Tirant 401 1 81.19 AAATCAGCAAATAGACCGGAAGTCCTCGAAAGGACCTACCTAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAG:1 + chrX 12947813 5' + F-element 4627 1 74.26 AATAAATAACATTCATTTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 21219507 5' - roo 9054 2 63.37 GAAATATGGACATAGAAGGAATCTAGATTCGGCAATCCGAGCTTATTTAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3L 15869732 5' + pogo 23 1 56.00 CTCGCAGCTAAAGCGCAAAAAGCGCTTTCTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 - chr3R 8487317 5' + Doc 56 1 71.29 CAAAATAAAAATTTTGCAAAAAAAATTCGTTAGTTAAATTAGTGCCGAAGAAACTCCAGTGAGTTAATAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGG:1 - 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chr2L 13038784 5' + hobo 7 1 72.28 CTGGGGGTCTAATCCGCTTTTGCCAGAACACACACACACACACA:1 - chr3R 30539315 5' + accord 180 2 63.64 TGTTCCTTACTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAG:1 + chr3L 15099551 5' - G4 3817 1 73.00 ATAACAAAACAAATAACAAGAGCGAACGATTTTTGTAATAAAGGAATTGAACGAAGAGCGCGCAATTTTTCTAATGGAGCTTGTTCACACATGAACACGA:1 - chr2L 1530507 5' + roo 8662 1 79.00 CTATAATAATTCTTACATTCCATTTTCAATGCTTATACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACC:1 - chrX 11944453 5' + I-element 139 1 64.36 AAATCTGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 - chrX 10298061 5' + Quasimodo 28 2 63.27 TCATGCACTTAAAAAATAAACGTGTAAGCTTTAAAAGAAACTATAAGCAAGTACATACTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCC:1 + chrX 8303387 5' + flea 15 2 60.40 TATGGTTGTGTGATTTCAACTTATTTAGTTGTTTTTGTTACTTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chrX 3295710 5' - hobo 2937 1 72.28 TTAAGATCAAAGCTCTTCGAACCCCGAAAAAAAAAAAGTATGTAAAAGGCTGAAGGAATCGTTTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGA:1 + chrX 13840386 5' + INE-1 94 1 73.47 GTAGACGGCGCTACATTTAATCTAATCTTGAGCAAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACCTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr2L 9672388 5' + 297 6583 2 75.00 GTGTGATAAAGTCGTATGAATACCAAGCTATCTATGCATTCATACAATAGTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr2L 156575 5' - 1360 3362 1 55.45 CGCAGCAAAATGCCCTGCCTTGCTTATCATCTTTCTCGTGTCAGGGTTCGTACAAAGACACTAGAATAATTCTATTCTTTCTATTATTCTAGTGTCTTTGG:1 - chr3R 7451620 5' - Tc3 242 1 50.50 CGTGTACCTGTGTTTACTCTTCGAGGGACGTGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGAT:1 + chrX 22590161 5' + Burdock 6182 2 73.27 CCACAATTTGTTGGAACAATGCAAAAATATTTCGCTCAATTACTTAAATGGAGATGACACCTGGTTCTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr2R 11394082 5' + pogo 6 1 69.31 TATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACA:1 + chr2R 4577086 5' - Chouto 479 1 63.37 AGGGAGTTTCGAAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAG:1 + chr2R 17402690 5' + invader4 7 2 71.29 CTATTTTTTCCCCTAGTAAATAAGATCTGATTTGATATAAAACATGAGAGAATGATGTAGTCGAGTTCCCCGATTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTG:1 - chr2L 22575944 5' - INE-1 541 1 72.28 AAATAATATCTTTGGGATTACATTTCGTGCGATTCTCACGAATACTGGTTATAAATTATATTAACTTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chrX 11503555 5' + roo 10 2 68.32 TCTGATAGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr3L 22231384 5' + Doc 32 1 61.62 CAAGGCATTTTGTTAGACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTA:1 + chrX 21564068 5' - invader4 3075 2 68.32 AAGCGCCTGAGGAACGATAGAGCCGCCCCTCAATAGTATCATCCATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2R 16384376 5' + roo 8679 2 56.82 GCATTAGGGCACTGCACCTCCGGCAAAACTAAAGACGGAAGTCGGCAGACATTAGTGCCAAAAGTGCGTCACAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 - chr3L 13570488 5' + hobo 4 1 75.25 TCATCAATATTCGCATCTTGTGACCTATTATGTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chrX 5178905 5' + hobo 2 1 76.24 AACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:2 - chr3L 10576850 5' + roo 38 2 68.32 GCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 + chrX 157232 5' + I-element 51 1 74.26 AAACACCCCACTGATGATACAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 + chr4 306447 5' - blood 7347 2 75.86 AGAATTAGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATAT:2 - chr3L 24210987 5' + HMS-Beagle2 17 2 60.40 TCTGGTTTATACTTCCGCGGTACAGTTCTCCTTTCCTTGACATCCAGATTAGGTACACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr3L 14285988 5' - 412 476 2 60.82 AATAAAATGTTGCGGTGAAGCTAATACGACTTGGGTACGGTCCAGTTCCATTGGCTAGTACAAAAAATATGTATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAA:1 + chr2R 16433156 5' + flea 4757 1 63.37 GTGTATGTATTGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTACATAATTACAATTTATTGATT:1 + chr3L 24210875 5' - HMS-Beagle2 308 2 75.25 GAAAATAGAGCAATAAGTTGGTAAGGCATTGGGTCCATGTCTACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chr2R 11921757 5' - P-element 2853 1 49.50 GGTAGCTCAGCCTGAAGAAGGGATACACCATACCCTTGCTCCGGCTTTTATGTTTGCTATTTCGGACTGACAACGCGATAATTTCTACGCAGCTGTTACTG:1 - chr3L 12057169 5' - Fw2 3580 1 80.20 TAAATTGTCAATAAAAATGTATTATTTAAATGCACATAAACAGCCCCACATAGACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 6097672 5' - roo 386 2 56.44 AAAGGTTACGTGAAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGGAATTACAATAATTGCACAGTACCACTTCACCCTCCGAAG:1 + chr3R 11080661 5' + I-element 2 1 70.30 TTCAAGATTTTAGCAATATTATCGAAATCGAAGGAAAGCTGTGAATATTTTTTCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTAT:1 + chr2L 2573425 5' - Quasimodo 57 2 55.00 CAGCGCTAATGAGGCGTCTGGGCCGCCATTGAATGCATTGAACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTA:1 - chr3L 20862892 5' - hopper 1383 1 57.43 GGCCGTGTTTCTCGTGCTGCGGAGTATCTATGGAACCGTCATATATCTGAATTTTTGTGTGTGCCCGTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAA:1 - chr2L 3959719 5' - mdg3 5068 1 69.31 GACAGGATATCGGCGGAGAAACGGTCTTTAGATAAAGCAAAGTGGCGACAGCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGG:1 + chr3R 13619859 5' - Doc 394 1 57.61 CTTTGGTGTCTAAATGTGTATGTGTGTGTTGATTGATAACCAACCGTCCAACCCAAAACAAATAAATTATCATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1 + chr2R 22825381 5' - opus 7497 2 73.27 AGTGTCAGGTGAAAATAGAAGGGCCAGCTTTGTTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chrX 11503449 5' - roo 392 2 63.37 ATTCATAGAAATTATGACGCGAGAGCAGAAAGTTGCAAGAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chrX 15219371 5' + hobo 33 1 62.24 GCTACTTTCCCCTTATATTTCTTCAAGCAGTCAATATCTTTTCCTCTTGAATCGTGGACTTCTCCTCAATCCGATTTACATTTGATCTTTAGTCTTAAGCT:1 - chr2R 1366109 5' + 297 271 2 61.39 AACACACATTCATTCGCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - 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chr2L 4307189 5' - G2 337 1 69.31 GCAGCCAGATCAAAAGTAGAGCTTGTCATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAA:1 + chr3R 13231158 5' + Quasimodo 3 2 68.85 TTCTCATTGTTAAGGTCAGTTCTGTTTACTCACAAAACAATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCAAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACA:1 - chrX 7339961 5' + G2 2619 1 57.43 TGTGGATGACATACTCAATCCGGTGAGTTTAAGGATCGAAATGGATACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chrX 2742561 5' - hobo 2911 1 53.47 AAGATGGAAATACTAGTCAAAATAAGAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTT:1 + chr2R 12007227 5' - mdg3 196 2 76.24 TGATGCAAGTTTTTAAATGATTTGAGATACATATATATATGTCGCCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTG:1 - chrX 16906737 5' - invader4 295 2 73.63 AGCGAGGAAAAATATTTATATACCACCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 - chrX 13547223 5' + I-element 49 1 78.57 GAGGAAAGCGGAGAGTGCGAAGTGAGAGCGGTGCCAGTTAAACAACATTAACGTGACATTATTTGGACCTTGTACCCAAACGGGCCGTGCGCAAAAGGGGA:1 - chr3R 17900599 5' + gypsy8 301 1 57.43 AACTTGTACACTAGAAAAAACCAAGACATTGAATAAAATATATAGATCGCTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTG:1 - chr3R 29361100 5' - 412 475 2 54.35 ATATTCAAGGGTAGTTGGTTTAATTCATGGTCCACTTTATTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 - chr3L 735097 5' - mdg1 384 2 59.41 AACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr2R 17348622 5' + jockey 29 1 52.48 TGTTTGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr3L 9190470 5' - 412 7497 2 73.27 TTGGCGCTGATTCACAATAGCACCTTATGAAAGCCATAGCCATCATAGTGCAGGCAATTGCTAGAATAAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr3R 20182948 5' + roo 5 2 73.00 GTAGGCTTACTTGACAGTTTTCGTATTTTCAGCTGGCATAGGCATTTATGACTCCAACTGTATATAGATATCCATTTCAAATTATAGTCTCCTTCTTCTTC:1 - chr3R 11282641 5' + hopper 1170 1 64.36 ATTCGTAGCGCCAAATCAAAAATTCTCGACTGCCGCTAGAAAGAGACGGCTGCGCGTTTAATCGGACTCATGATGAGTTTAAAAATAAAACTTTAAAAATA:1 + chr2L 2010041 5' + P-element 2693 1 68.32 CTTGCCCTCAGCACGTGGAGACGCACTTTGGCAAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr3R 17557385 5' - mdg1 380 2 66.00 ATATCTTTGGGATTACATTTCGTGCGATTCTCACGAATACTGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chrX 11503550 5' + roo 8679 2 65.35 TTGGCTTTGGGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTG:1 + chr2R 17942100 5' - mdg3 201 2 69.31 TTAAAGGGAAAAAATAAAAATGTGAAAGGGTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACT:1 - chrX 17486000 5' + pogo 2075 1 68.75 ATGTGCAGGGGTCACTCTCTGCCCCCCACATCCTTCCGCATCCTCGTGCTCCTATCCTGCTCTCTTTGGGACAGTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 + chr3R 28135239 5' + hopper 4 2 73.27 AAAGATGTTCAAGAACTACAAATTCATTTGCGCCCAAAAATGTGACGATATAGGCTCTCATACACGGCACTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2L 156672 5' + 1360 7 2 72.28 TAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGAC:1 - chrX 23108331 5' + BS3 1417 1 58.42 GAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:3 + chrX 17492876 5' + Tirant 8129 2 59.41 AAACATAGGCGAGACCACAAGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTATGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTC:1 + chr3L 494649 5' + Transpac 4973 2 82.18 TCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGTTTTTAAACAATTACATATAGAACACCTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1 + chr3R 15130462 5' + Max-element 16 2 67.00 GTGCTCTCCTTTCTAGCCAGGTTAGCGGCCCTTGCACGCGATGTTGTGTTTGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 + chr3L 9190424 5' - 412 490 2 75.25 TTAGACAGTTGGCACCATAAATTGATTAAGCCAAAGTGGGTGGAAAAGTCGAATGGCTGGTAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAA:1 + chr2L 20043790 5' + I-element 182 1 64.95 TAGCGAGTAACGAGAACTGCAGTCGTTCTTTGTAAATAACGAATACTATAGTGTTGTAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr3R 21587224 5' - pogo 2086 1 60.40 AAATATGCGAAATTTGTAATCCAAGCCACAAGGCCGAAGTTGTATGGACTCTGTGAGCACAAACGTCGATATGGCCATGTCCATCTGTCCGTATGAACGTC:1 + chr3R 4554549 5' + INE-1 126 1 67.33 CGGGGTTATCCTCAAACGTGTTACTACAAACATCAATAACCGAGTGGATCTGGTCTGTCTGTCTTCGTTGATAAATACCGGTACCTTGGCATTACAGTTGG:1 - chr3L 24159541 5' + R1-2 2904 1 64.36 TTTTTTTCTTTAAATTAAAATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTC:1 - chr2L 12636389 5' - Porto1 4596 1 78.26 CACCTCATATCCTTGGAGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 1530400 5' - roo 9045 1 54.46 AATTGAATTTGAATAATACATAGACACAGCAGTTGGCCAACAAGGCAACTTGGCTCGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAT:1 + chr3R 6030263 5' - hopper 1399 1 62.24 CTCCTGTCCGATGGAAAGCTAGGTCCCATAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGC:1 - chr3L 18381174 5' + P-element 199 1 35.64 AAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTT:1 + chr3L 24210916 5' - HMS-Beagle2 7150 2 68.32 AAGTGTTTAGTTTTTGTCAGTGTATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr2R 12247445 5' + hobo 53 1 82.18 CACATTTGCAATATTTATTGCCTTTTGATTATATTTCAGGCGAGCGAGGAAAAATATTTATATACCACCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:2 - chrX 13547265 5' + I-element 10 1 63.37 AATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:1 + chrX 21668002 5' - Tabor 458 2 50.00 TCGTTGTTGTGGCAACACTGAAATTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACAT:1 - chrX 7975462 5' - Dm88 11 2 77.23 AAAGATGCACGCCTTGAAGAAATGGGTTAAAGCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chrX 3333413 5' - pogo 2059 1 71.29 TGGCAGGTTGCGACCCTTTTGCGATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAATAATAATAAACAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chrX 8037602 5' + roo 9 2 71.29 TCGCAGCGCTAATGAGGCGTCTGGGCCGCCATTGAATGCATTGAACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 - chr3L 20862895 5' - hopper 1387 1 54.00 AAGTGGAAATGGAATTGAAAGCGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:2 - chr3R 19513432 5' + jockey 4675 1 72.28 ATAATATCCTTTTATTCATCAAACACTTTACAGTACCATTAGGAAATTGTTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 + chr3R 22043527 5' + Burdock 6160 2 55.45 TCTTTCCCTTGCCTTATGACATATTTGTTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTGTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACTGTAAATAACTCCCTTAGAGA:1 - chr3L 20757165 5' - I-element 485 1 77.23 AAGGGGAGAGAAAAGGGAAAAACCGGAAAGCTAGACGCGATAAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTAAATTAAATATTA:1 + chr3L 12265427 5' - Cr1a 4308 1 66.34 GTGTGAAATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr3L 17635590 5' + 297 25 2 57.43 TCGCACGCTCTCCTCAGTTTTTCCCCACCTTTCCTCGCCCAGCGTCTTAATTAGTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 - chr3L 9293745 5' - mdg1 7437 2 56.44 TTGCAATACATTGTATACGCTAATAAATTACTCTCATTAAAAGTGACTTTATGGGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1 - chr3R 16110249 5' + mdg3 23 2 62.38 ACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 - chr3R 19513398 5' + jockey 4709 1 67.33 TTATCCTTATTCTTCGTCGCCCTTTGACAACAGCCCCCCTCAACCAACCACCCAAAATACCACCCTTTTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTGTTTT:1 - chrX 8203471 5' - gypsy7 5002 4 73.27 TCTACAGATACAGATTTCTTAACTTCCTAAAAGTTTTTGTGCTTATACCAAATACCCAAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCG:1 + chr3L 23942100 5' - 1360 2994 1 57.43 TCGGGGGGAAACTTTCTATGAAGCAGTACCATCTTTTCATTTCTACGTTCGGGTTTTTAGCTGATACAAAAAAATACAGAGACGCTCTATGCCATGCAAGA:1 - chrY 3572881 5' + F-element 127 1 66.34 TTGCCGGCAGCAAATACATTTTGATTAATAGCCATAAACATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr3L 12258259 5' - roo 9035 1 67.33 TACCAGCAAACTGATTTATATAGGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTA:1 - chrX 21564136 5' + invader4 56 2 77.23 CAAGGAAACATGGGGAAAGCTTAATATCTAACAGTTTGTTTAAATCTACGAATTTTCAGACATTATTAGCCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATA:1 - chr3L 920573 5' - mdg3 5493 2 75.25 GTTTACATACATAATCTTTTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATTGTAATAAACCAATATATGCC:1 + chr3R 4504037 5' - blood 378 1 79.21 GTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 + chrX 5130990 5' + I-element 34 1 54.46 CGCTTCCTGGCTACACTCGGAAAATTGTTGCACCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGAACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 - chrX 4278384 5' + blood 7056 2 65.35 CTTTCCAGGAGTTCGGTGAAAAAAGTTACTTTTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr2L 15798636 5' - roo 9030 1 67.33 GTTTGTTGTTGCTGCTGTTGTGCCGCATTTTTTATTTTTTTTT:1 + chr2L 240860 5' + hopper 138 1 60.47 TTAGCCGAGACCTTTACATGCTTGATACATATATGTATATGCATATGATGTACGTGTATTAATGCTTCGTGAAGTTACAAAAAAAAAGAAAAAAAAACAAT:1 + chrX 13590508 5' - hopper 143 6 82.18 AACTTGAGAAAGGTATCCATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTG:1 + chr3R 7639795 5' - HMS-Beagle2 7144 2 77.23 TAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATT:1 - chrX 9816307 5' - BS 5044 1 69.31 AGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAAC:1 + chr2R 5532367 5' + Doc4-element 13 1 55.45 CTTGACTTTTAGTAACCTTTCAGTTACTTTTTGTGGTTTTAGTTCTTGTAGAATTCGCCGTCTCTTGTTCGCTTGCATCCCTCACCTTCTCCTCCACAGGC:1 - chr3L 18032029 5' - I-element 334 1 42.57 TAAGGCAACTAAAAGATGTGTCTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:2 + chrX 5130962 5' + I-element 6 1 73.27 GTAAGGCAAATGAAGCGCTATTATCGTCCGGTACTCCACTTGTGTGGCACGACATCAAACAAACCCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTAT:1 - chr2L 23389651 5' + mdg3 65 2 74.00 GCTATCAATAGGAAGATCGAGAGGTAGGCTAAACAAATACTCTAACTCTAGGCAAACGATATAAGTAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAA:1 + chr3L 22246429 5' + P-element 425 1 70.30 TGTATAACGTATTGTTGGATGATAGTATTCAGAGTACTACACAATCCACGACACAGAACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAGG:1 + chr2L 16244644 5' + Idefix 6914 2 62.38 GTTAGCGGCCCTTGCACGCGATGTTGTGTTTGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr3L 9190444 5' - 412 7523 2 55.45 ATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGCGACTCTTTGCATTCCAGAAATTCTGTCGAGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCT:1 - chrX 21852439 5' + invader4 2832 2 71.29 ACTGTGTAATTAACTAATCAACAAAGCGAGTTACCACCCTACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 - chr2L 13642733 5' + Tirant 8161 2 75.25 AGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTC:1 - chr3R 1977615 5' - micropia 5406 2 58.59 GAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 - chr3R 19513391 5' + jockey 4716 1 74.26 GCCAGGCCAAAAGCACAAACCATTCTGATTTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATG:1 - chr2R 10085079 5' - 17.6 7253 2 71.29 ATAATGCCAAAAAAGGACTTAACTTTATTGTAACTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chrX 8326298 5' + opus 151 4 66.34 CGATGGGTGAGGGGGGAAAATGGTGGGCAAAGTGGGCGTGGCGCTCGTGAAAATGGATAATAGATAGTAATTTCCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAATTC:1 - chrX 7483441 5' - GATE 440 1 61.39 GACCCAAAACTATTTCGCGTAGGGCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAC:1 + chrX 10793907 5' - jockey 4670 1 76.24 CGATAAGAAATTTAAATCATAATTCCAGCTTCTTGTTTTAATTAATACGTTCAATATGTATACATTCTATGTATGTAATATAAGTTATATAATAAGATTTG:1 - chr2R 8642985 5' + Doc2-element 4701 1 67.33 AATTTGCGGAGGGGGGGAGAGGAATTTTCCCAATGTCCGAAAACCAATCGCATTTAGACGGTTTGCATAGTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 + chr3R 11936869 5' - roo 411 1 79.78 GGGGCGGAGGTGTAGGTAATTCCTAGCTTAGGTAATGATAACGTCGAACGCGTTGCTCTTATTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 - chr3L 15353608 5' - mdg1 7447 2 67.33 GGTAAGGAGTTAGAAGTTATGAAAAAGTACATTGACTTCGCTGACACTTGTCAGCGGCACTTGTAACTTGTAAGCAAAGATAAAGGGTGCCTTGTTCGCGC:1 - chrX 19820353 5' - 3S18 26 2 52.48 TTATTAATTTTTTTTTTCGCCAAGTGCGTGCTTGGGTGTGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr3L 17691332 5' + 1360 11 1 52.70 GCACGTCACAGAATATGTGAGGCAACTCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chrX 22259779 5' + 297 6623 2 74.26 CTCATGTACTTATTCACCACCCACCCACTTATGCACACACAAGCACTCAATCTGTACAGTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr2R 9258671 5' - blood 363 2 62.89 ATTAAATATTTATTTATGGACAGAAATCTCTCAAGTCTAAGCAAAGTGCGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1 - chrX 157281 5' - I-element 5327 1 56.44 GAAAGAAAACAAATAAAATAAAGAAAACCGAATAATAAACAATGACATTTGTGTAGACATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:3 + chrX 8551178 5' + mdg3 5271 2 60.40 GCTCCAGTTCGTCCCACTTCTGCCTCCTGTCGACTTAACGGCGTTTTCCTCCGCTCCCGGTTTTCGCACCTAAGGCACACTTCATAGGCTAAGAGGAAT:1 - chr2R 7372189 5' + gypsy11 4297 2 71.72 GTGTGTGTGAAACAAAAACGTTTGTTTCAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2L 3842850 5' - roo 9024 2 74.26 TGGGCTGCGGTTTTCCACTCAACGAACTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 16398952 5' + roo 15 2 59.42 TTCCGCGGTACAGTTCTCCTTTCCTTGACATCCAGATTAGGTACACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr3L 14286000 5' - 412 460 2 59.41 CTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACGTTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:2 + chr3L 26371359 5' + Tabor 6894 2 81.19 ACGTGAAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:2 + chr3R 11080668 5' + I-element 9 1 69.31 TGTCCGTCTGTTTCATGGCGCACAGCCAGTTTTCCGCTCTATCCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCT:1 - chr2L 66780 5' + X-element 4429 1 62.67 CATTCATCTCTCACCCATGCCGCACCCCTCTAACTCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr3R 11389800 5' - hobo 2907 1 59.79 ACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTG:1 + chr3R 178127 5' + BS 47 1 74.26 CTCAACGTAAATGAAATGTGTTTTGCGTGCCGCTGCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCACAT:1 - chr2L 20228199 5' - hopper 1376 1 61.39 GAAATTAGTGAAAGAGCTCTTTAGTGTGTTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3R 4788330 5' + 1360 46 1 71.29 GAGCTTCAGTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTT:1 + chrX 2741039 5' - gypsy7 5008 1 87.10 ATGTAAGAGCTGTAAATCACAAGAAGCATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3L 10305371 5' + 412 49 2 72.28 GATGAATTACACTTCGTAATATATATGGAATGTTTCGTTCCCACAAGCCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 16399010 5' - roo 9045 1 50.00 CATTGAATAAAATATATAGATCGCTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3R 29361074 5' - 412 7493 2 77.23 CGTAAATTGCACAAATCTGTTAAAAAGCTTTAACTTTAATATTTCGCTTAAATCGGATTGCATATAACTAAGTTAGAACGTTTTAAACCTAAACAAATAGT:1 + chr3R 3058428 5' + Tc3 1696 1 61.39 TTTGTTAGACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCA:1 + chrX 21564076 5' - invader4 3067 2 60.40 ATTGGAGAGAGTGACAGATATAGTCGAAGAAACAGCCAGTGAGTGTCGAAGAGGACATACAAGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chrX 18110861 5' - roo 9058 1 72.28 AGTATTTAGGTAAACTTTTCCATTTGTAATATTTCTGTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3R 2556100 5' + 412 41 2 65.35 CGATTGAATTAAGGGAAGCGAATCAAACATATTTGAATGGATTGCGCCATTTCCATGCCAATTCAGTTGGATACACTGCAAATTATAGATTAAAAAAAAAA:1 - chr2L 2084331 5' + BS4 729 1 78.22 GTAGAGCTCTACTAACTGGGGAGCTCTACCCACTCCACTACCGAGTCTAAGACCTTCTTACGGGGCATTGCCGTCTCACAGCCATTTTCACAAGATTGGCA:1 - chr2L 22298942 5' + baggins 5164 1 50.50 GAACTTATGTCCTTTGCAGGTTCTTCAAAGCATTCCTGTTTTCCCGTTTCCCTTAATGTGTCCCATTTGATGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGT:1 - chrX 3447293 5' - Tirant 8161 2 75.25 TTTTGTTGACATTTCGAAAAATATGTTCAAAAGTATGTTCAAGCCGTCATATGGAAGTAAGAGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGT:1 - chr3R 12371234 5' + Burdock 13 2 66.34 TTTTTCCCGACAACTACAATGTGTAGTTTCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr3L 15729626 5' - hobo 2892 1 72.28 AGAAGTGATATAAAACCCTATTATTATATGAAAATTTCTGCTGCCGCCTGTTAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAG:1 - chr3L 10314574 5' - hobo 2643 1 60.40 TAGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAA:2 - chr3L 24210982 5' + HMS-Beagle2 6905 2 55.45 AAAGAAAAACCACAAAAAAAAGAAAAGTGAAAAAAAGGCGACAACAACTCAGCCTATGTTGCACCAACCCACCAGCCAAAAAAAAAACAACAACAAAAAAA:1 - chrX 5950293 5' + gypsy11 3933 2 77.23 CTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 19450168 5' + roo 37 2 67.33 CCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCATCCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGG:1 - chr3R 15790099 5' + flea 4711 1 74.26 TAGAAGCCGTTCAAAAATGTTTTGTATATAACTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3L 18978466 5' + roo 8708 2 72.28 CATCTGAGGGGTTTTAGGGGCCTGCAGGGGGTTAAGGGTTAGATGTTAGGTGTTAAGTGTTAAGTGTTAAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chrX 3333496 5' + pogo 4 1 64.36 ATGTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:2 - chrX 5178876 5' + hobo 31 1 58.42 ACTTAGGGCCAAAACAGGGCATTAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 25520691 5' + Doc 4584 1 78.38 AAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAA:1 - chr2R 2092788 5' + Doc3-element 77 1 56.04 CAATTGGGAAATGAAAGTGATTTCAAAAACATACCAATCTCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAA:1 - chrX 157003 5' + I-element 277 1 77.23 CCGATGCAGATTGTCTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTG:1 + chr2R 5617508 5' - invader1 375 2 58.42 AAATTAACGAAATATAAATTAAAAAATATGCCCTACCTCTTCGCTGAGCGATGAAATAAAAACCAGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 - chr2R 20075455 5' - mdg1 409 2 64.36 TGATAACGTCGAACGCGTTGCTCTTATTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 - chr3L 15353573 5' - mdg1 7412 2 73.27 CTTAATTTCTTTGGGGGATTGCTGGCCAACGCGGCGGATGCGTAACAATCTTGTTGCCGCCACTCACTCACTTAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2R 15781382 5' + jockey 10 1 75.25 TTTCGTGCATAATACAAATAAATCAAACCCAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACA:1 + chr2R 2144954 5' + Stalker2 7295 2 68.00 CAAGTGCAAAACGGGCAATGCTACAGAGGAGATTTAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr3R 25566837 5' + hobo 41 1 65.35 AATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACA:3 + chr2R 4260436 5' + micropia 182 2 80.20 AGCGAGAGAGAGTGTTGGCCATCGATCTTCCCAGCATTATCACACATTAAGTCAAATGACTTGTAGGGTGAAGGGCATATTTTGTCCCATTTACAATGCAT:1 + chr3L 25806215 5' - 1360 198 1 46.53 AGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:2 - chr3L 3535465 5' - roo 393 1 61.39 TATGAAAAATATTTTAAAACGCTTTTATTGGCTTTATGAGAAGTCTTTTTAGGCACTTTATGCGTTTTTTGCCCACCACTATTATTCTGACCACAGCTGTA:1 + chr2L 13261987 5' + HB 1629 1 69.31 ATTTAAATCATAATTCCAGCTTCTTGTTTTAATTAATACGTTCAATATGTATACATTCTATGTATGTAATATAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTAT:1 - chr2R 8642976 5' + Doc2-element 4710 1 58.42 AGGAAAGGCGGGGAAAAGCCACGCAGCCAGTTTCCTTTCAGCAAACCCTACACCATCAAGCACCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCAT:1 - chrX 20830926 5' + G2 62 1 63.37 TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGGAGGTAGCGGGGCTT:1 - chr3R 21907535 5' - F-element 406 1 24.00 ACATAACATTAAACTAAAACTTTTCGTTTTCACCGTTATTATGTTTTAGCCATCGATTAGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTC:1 + chr3R 6136473 5' + Burdock 14 2 65.35 TGCTGTTAACGTACTTTTATTCACTGTTGCATGAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTC:1 + chr4 1172468 5' - Cr1a 4082 1 67.33 AGTTGGCGAAGTTTAAAGAAGTGCTTGATATGTAAGAGCTGTAAATCACAAGAAGCATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:2 - chr3L 10305400 5' + 412 7073 2 53.47 TCAAGCGAGTGAATGAACAAACTACTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 - chr2R 10334795 5' - pogo 2052 1 75.25 GTTACTTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chrX 3295672 5' - hobo 2901 1 62.38 GTCTTGTAAATATCTATCGATTTCCCATGCCCACTCAAAAGCACTTTATGGAGTGTCGAGTTGCGTATATGTATTCCAGGGACAGTTGTTTATTTGTCGTA:1 - chrX 15231530 5' - Helena 1148 1 46.53 CAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 + chr3R 11080688 5' + I-element 23 1 52.63 CCGACGAGCAGGAAGACCCCAGGACACACACACACACACACACACACATATATAACCACATAGGAACAGCCATACACTAAATCATAGAATGCCTTAGGATA:1 - chr3R 28935173 5' + Quasimodo 85 2 77.23 CCCACATTCCCCAATATCTATCGAAATCCTAGAAAATTTATGATATTTCTCGTTTTCATTCACACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAACTC:1 + chrX 23078688 5' + INE-1 558 1 80.20 GAGGGGGTGTGGTGTATAGAGGGGGTTTCCAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGAT:1 - chr2R 18348945 5' - FB 27 1 70.30 ACTGCTTGATAAAGTTAATTTTTTATACTTTTTGAATCGTTGATGTTTTTTTCTCTTTTTCCTTT:1 + chr3R 11281509 5' - Doc2-element 240 1 61.54 TCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:3 - chr3L 24210971 5' + HMS-Beagle2 33 2 63.37 CCGCAGGAAAGCAGGCTCTGAGGAGCTGCCGAGATTGGAGGGGAATGCTACGAATAAAATTTCATTAAATACACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 + chr2L 12888780 5' - 412 491 2 75.76 ATAATATACATATATAACAAATACTCGAATATGTTCTACCTACTAACCCCATGCAATGTTAAACTCTAAAACTCAAATTATTGTACCTATATATTACAAAA:1 - chrX 16521293 5' + TAHRE 10349 1 54.46 GATTTAGCTTGGTTCGATTTCAGTTTTCCTATGAAATGGCACAAATCTATCATGGTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 10187441 5' - roo 9049 2 56.44 ACGTACATATATCCGCCATAACTATCCAACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTG:1 + chr3L 21916752 5' + Doc 380 1 72.28 CAGTATTCTTTTTGGATGACATTTTTGCGAACTCTTTGTTTTTGGAACCGTAAAGAAGTAACACCCACATATCAAACTACAGAAACAATTATCAAAGCT:1 - chrX 20800065 5' + Porto1 304 1 68.69 GAGGGGAAGAAGATAAAGCCATAAATGCACGAAAATGAAAATAAATAGCAGCCGGTACCAGGACACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 - chrX 12193551 5' - hobo 2929 1 67.33 TTTTTCGTTACGAAACGAGTTGTGCTCTGGACGAGCTCTGAAAGCAAACTGAATATATTTCGAATCGGGCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chrX 11920440 5' + P-element 6 2 67.33 TAAAATAAATAGCGAAATATGCAGGCTGTATGCTGTAGACACAAGATGTAAAAAGCCAAATAATGTAAAATGAACCCAAGCATTTATTAAAAAAAGAAAAA:1 + chr2L 7129034 5' + HMS-Beagle2 477 1 73.27 GCATAAAATTCAATTTATAACTGCAGTTTCATTAGTGTCATCAATGTGGACATGTGTGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAA:1 - chr3R 23173187 5' + Burdock 6154 2 59.41 TTAATAAAATGATGAACTGCATCTTGCCGAAACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCT:1 - chr3L 2661772 5' + Doc 383 1 69.31 TATCGATGCTTACACACTAAATTGAAGTTTCATATTCGCTAAGAAGAGCATATCGGCTTTGAAGCATTGCAAACTGTATCACGCTCTTCCATCACTTTGAA:1 - chrX 12948932 5' - Porto1 332 1 69.31 GCACCAAAAAGTGTGCTACACATGTTGACATTGCCCGTGCGTGCATGTGTAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr3L 917187 5' + hobo 23 1 53.06 AACTTTTCCATTTGTAATATTTCTGTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr3R 2556088 5' + 412 7106 2 77.23 CCTTTTGGGCCTATCCTTGTCTATTTTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chr3R 30326301 5' - pogo 2055 1 75.25 AAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 + chr3R 19515815 5' - 412 448 2 69.31 GGATGCGGAATATAAACAATTGAGATGTGAGCCAGATATGGGAGTTTAAGGCACTCTGCACTACAAAAAAAAAAACATTTAAAT:1 + chrX 9009868 5' - Tc1 1467 1 89.29 GGGTATGGGGGTTGTTTTCTTAGCTTCTTCGCGTTGGCCTTCTGAAATTCTAATATGTTTTATGTTTTTATATTTCGGCTGTCCGTTTAGAACTAAGTAAT:1 - chr2R 4581085 5' - Chouto 126 1 75.25 GGGTAACCACTTTAGGAAAACTAGGATGACTACAAATTTCTGCCTTGCTAATTATTATGTTGAATCATAAATTGCACACACTTACACACACCCACACACAC:1 + chr3L 6044555 5' + Quasimodo 35 2 56.44 CGGTTGCAGCGCTCTCCTCAGTTTCAGATATATGTGAGTATATATATACATATAGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 - chr3L 8843638 5' + I-element 23 1 56.44 AATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:2 + chrX 5131009 5' + I-element 53 1 73.27 AAATGGGAGGTGCAGAGGTGTGAGCTCAGGGGGAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chr3L 14558229 5' + 297 5 2 75.00 AAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3R 19515804 5' - 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Tabor 469 2 60.40 ACTTTCACCCCGCTTGGATCTCATTTTGAAGTGTTGCTCAGAGCTGTCGCCACTTTGCTTTATCTAAAGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAAC:1 - chr3R 13619931 5' + Doc 484 1 67.33 TGCACATCGGTTTGCCGTAGCGTCTGTCTCTTTTTACCATTATTAATACACACAGAAGATTGGTACTTCTAGTAAAACAAAAAAATGCAATAAAAACCTTT:2 - chrX 8659243 5' - Tc1 309 1 66.34 CCCGTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 3535437 5' - roo 9028 1 68.32 TGCACACTTAATGCATGTTAAAATTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chrX 12166537 5' + pogo 50 1 79.21 TCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 23456282 5' - 1360 3385 2 71.29 TGCACTACAAAATTTTGGGTTTCGGAGTCTAGAAGTAGACAGATGTATATAGTTAAATAGTTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTA:1 + chrY 424991 5' - McClintock 6336 4 57.00 GGTAACAAATGGAGATCATATAGAGGAACAGAATGTTTATAGATCCAATTCACCATGTACATTCAAAATGTGTATAATATTGTAGTATGTGCATATATCGA:2 - chr2R 14647593 5' + blood 7011 1 73.27 TTTGCGGTCAGGAAGTGGGGAAAGCCCAAACAGCTCAAGAACACCTATTGATCTCCATCTCCGCCCGGCCACCAGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCG:1 + chrX 21351761 5' + Doc 456 1 45.00 ATAATGGCTACAAATCAGGTGAGTAATGTGTACTAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACCTGAAAAAATAAAATAAAAACAAATTA:1 + chr3R 27381989 5' - 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mdg3 5471 2 56.44 GTAAGCCGGCTGCTGCCCTTTAAAGCGGATAATGTGGATAGACGCTTGCACACACACACACACACACACACACACAGATAC:1 - chrX 10823031 5' + accord 185 2 64.20 AAGATTGTAAATTAAATTGGCATAAAATTATACAGTAAATTGGTTCAAAAAAGATCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTATAATTTT:1 + chrX 11299961 5' + roo 8686 2 55.45 GAAAATCGTCGCTGAAGTTCTATCGCGAATTCCCACACACGCGAACTGCTCTTCTCGCGAATCGAGCCGGACGGGAAGTGTGGCCGTGGGACTCGTGCGAA:1 + chr2R 2901585 5' + Cr1a 4443 1 50.50 CTATCGTGTTGGACGCATCTCGGCAGCAGGAGAAGGAGAAGAAACCGAATGGCTAGGACATGGTGTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr2R 11921843 5' + P-element 10 2 67.33 ATAATTATAAAAATCATAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTT:1 + chr2R 5582167 5' + Cr1a 441 1 65.35 GTTCTGTTGATAATAATAATAGTAAAGATTAGCAGACATTTGAAGAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGT:1 - chrX 3293461 5' + hobo 253 1 55.45 GTGTAGGTAATTCCTAGCTTAGGTAATGATAACGTCGAACGCGTTGCTCTTATTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - chr3L 15353599 5' - mdg1 7438 2 58.42 TTCGGCAGACACTGCCAAGCTCGCTCACCAAAAAAAAAAAGGAAAATAAAA:1 + chr3R 21939137 5' + Doc2-element 251 1 88.24 TCGGCCTGGGACCAACTCGGCTGGCCACTGACTTCACTGACCCTTACGACACGCCAGATCCTACTCTCTTGTAGTGATCTTCCTTCCGTGCCCTTCGGGCT:1 + chr3L 26023448 5' - gypsy8 497 1 53.47 TAATGACCCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAG:1 + chr3R 15130452 5' + Max-element 5 2 64.21 TTATGCGAGAGCGAGCCGCAAACAAACTGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 + chr2L 12911262 5' - mdg1 7412 2 72.28 TATTTAATGGATTTTCCCTAATTAAGCAAAACTCGTAAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTTTAGTGAATATACT:1 + chr3R 3609771 5' - Cr1a 4115 1 69.15 TGAACATTTTTTATCGATAAACTAGTAGTTTGGGATAAGTTGGTTGGTTGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTG:1 + chrX 17950296 5' - accord 7044 2 54.46 CGGGCACTGTGCAGATCGTCGGGAACTGCTCATGGTTATCCGGAGCAGCATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr2R 22825485 5' + opus 7028 4 54.00 AGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr3R 19515863 5' + 412 7093 2 64.36 TTTTCGTAAATTAATGTGTTTAGGGTTAGTATTTACTGTTTAAGTCAAATAAAAGTGCCCGCACATTGGAAATAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 - chr2L 12835919 5' - 412 491 2 76.24 TTTCATTGAATTGAAAGCCTGTCAAAATACTTATGCCGAACAAAAGTTTCACCGACAAATGTGCAGCTTTTATTTTGTCCAAATACTCATGCCGACTAGTG:1 - chr2L 21249248 5' + Tc1-2 1623 1 59.41 CGTTATTATGTTTTAGCCATCGATTAGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 + chr3R 6136506 5' + Burdock 47 2 75.25 GACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGC:2 - chr3L 23678162 5' + Osvaldo 11 2 65.35 TTTCGAAATGATAGATATATATATTTACATTCATTCTGACTGGTACTCATGAATGGCCAAGACATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTTAAGACTT:1 - chr2L 10104354 5' + roo 8678 2 51.49 AAGTTGTAGTTTCAAATCAGGGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 12565688 5' - roo 354 2 74.26 ATCAATGAGTCCATTTCGTCTGTTTCCCAACACCGTAAAATGCACGAAGCCAACGCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2L 3842915 5' + roo 8677 2 61.70 GAGGAGTAGCTTGGAAGCACTGATTGCCTCGTCTTCTGTAGTTATTGCCAGGCCTACTATTTCAACGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACCTCGATGAGCAG:1 - chrX 19820779 5' - Rt1b 4969 1 70.30 TCGGGAGTGCGTGTGTGGAAAAATCAAACATCTTTTGAAATAGATAGAAATCGGTATGAATGAAATTAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAACACCGCTA:1 - chr3R 11080443 5' + I-element 136 1 70.30 CTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 3535434 5' - roo 9025 2 70.30 AAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTC:1 - chr3L 19350001 5' + 1360 3224 1 49.50 GAATACTGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGGAAATG:1 - chrX 11503516 5' + roo 8713 2 77.23 CTTCTTTTGTTCCGCGTTCTAACACTCGTTAAACAAATTTAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 14309231 5' + gypsy2 424 1 58.82 GAGCAACTCGAGCTGCCACTCCGTAATCTCAATTGTCGGCTTTGCATTGCTCGACGATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:2 + chr3R 30263535 5' - roo 9055 2 62.38 CGATAGGCCATTATTTTTTATTAAATCTGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCAC:2 - chrX 10298083 5' + Quasimodo 9 2 67.33 AATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 + chrX 17492904 5' + Tirant 49 2 76.00 TTTGGACTTATGTATTACGTGTTCCAAATATCATATAATCGAAAAACTAATTTTGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr2R 5773496 5' + pogo 19 1 69.31 ATATGGAATGTTTCGTTCCCACAAGCCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 16398988 5' - roo 358 2 71.29 CTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2L 13598207 5' + pogo 51 1 77.23 AAGGTGTCAATGCCAATGAACCGCAGCAAATGAATGAAGATATCGCAGAGTTCAATAGAGTTGGGCACTTTTATGTGGCTGAAAGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 9213698 5' - accord 186 2 71.29 TTTTTAGAAAAATATGTATATTCAAACAAGTGTGTACATAAACCTTTTGCTCAGTTTGCAACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr3R 12055023 5' + Doc 21 1 61.39 GACTAGTGACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3L 14286064 5' + 412 7089 2 60.40 ATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGT:2 + chr3L 24210902 5' - HMS-Beagle2 7164 2 54.46 CCGGCTGGAGTGGGCGGGGCAGACGGCAAGAAGTAAAAAAAAAATAAACAAATCATTTGCATCTCATTAATGCAAATCACACACACACACACACATACCCA:1 + chr2R 16061619 5' + accord 186 4 64.36 CTTTTAAACGATTAAATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 18417290 5' - roo 388 2 58.42 TCTCTTTTCAAGAGAGCACGTTGCAAAGACGTTCAGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chrX 14953644 5' - P-element 2846 1 39.60 CGCAGGCCAACAACAGCTACAGCTAGGGATTCAGTGCTGCTACCAACAGCAGTTGCAATGCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTAC:1 + chr3R 8499394 5' - Tabor 468 2 62.38 AAATGGAATTGAAAGCGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:2 - chr3R 19513426 5' + jockey 4681 1 66.34 TCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chr3R 11080687 5' + I-element 27 1 52.00 TCAGGATAACTAGAAATACTACACAAGATCGAACAAAAATGATTTGGGTAGATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGC:1 + chr3R 4600792 5' + Burdock 20 2 59.41 AAAGCAAATATTAATGTGTATATAGCTGTGTGTGCCAGCAGACACTTTATGAACACACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2L 8898860 5' + roo 8682 2 61.39 CAGCCATTAATTGCAATTGACAAGCACACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCA:1 + chr3R 12717507 5' + Bari1 48 1 71.29 GATCGCCCAGTTTCTGTTCGGATCGTGCGAATGCCTTGACGTTGCCACCGAAACTGTCGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chr3L 5351486 5' - P-element 2868 1 60.40 CAATTCAAGGAGAAATGTGTAGACCATAAGATACCCTGTGAATATTTTGTACATCTAAGTAAAGACATGTGTAGTATGTGCATGTATCGAGGGTACACTGT:1 + chrX 6162122 5' + blood 7022 2 68.32 GGCTTTCTCTGACCTGGAAAGGAACAGTCTTTGAATAAAGATCTAAAGTAAAAATACCTCGTGTTGATTCTTTCAAATCCGAAACTTCTTTAAAGGCGTTG:1 - chr3L 27863364 5' + rover 7243 2 67.33 ATGTGCCGTCATTAAAAAGCTGAAGTGTGAGGATTTCGCACGGAGCCTCGACATTTACGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3R 6187646 5' + 412 21 2 58.42 TTGGATGTCTGTCTGTGCAATTCGATGCGATGTCATGTCCTCATGATGAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chrX 5131052 5' - I-element 5328 1 51.49 AAAATTGATGAAAGTTAAAATTTTTGTTAATACTGAGGATTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 + chr4 227590 5' - Transpac 275 2 60.40 GAGCGTGCTGCGAAAACTAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 - chr2R 1725959 5' + Doc 15 1 70.30 AATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGT:1 - chr3L 27395593 5' + invader4 2930 2 72.28 TTGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:2 - chr3R 20240934 5' - Tabor 445 2 64.36 CTATTTCATATATTGCATATTGCATATTGGTTACGTTAAGGGCTTGGTTAATAATCTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAAAGTTTCTTTTCT:1 + chr2R 2878960 5' - Ivk 4927 1 57.43 TTGACTTACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 - chrX 21945946 5' + F-element 25 1 62.38 GTCGGGAAATGGGAGAACTAGTGGATAAATTGACAAGCAGACACAGATACACACCAGCCCACCCCAAATTATTCAAAAACACACACATACATAACCACATA:1 + chrX 20830848 5' + Quasimodo 46 2 53.47 TCTTAAAACTATATTTGCTTAAATCCTTTAAAGCCGCCTGAATGAAGGCTGAAGAACTTGAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:2 + chrX 2917293 5' + jockey 26 1 58.42 GTAAACGAAACAAAAACATAAATTGAAATGATAGTTTACAACGGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGA:1 + chrX 11795698 5' + I-element 98 1 57.43 CGTACCACACACAATGGGCCACAATACTGCTCGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCAAGGAATCG:1 + chr3L 15768613 5' + Bica 452 1 72.28 AATGCATATTAATATGATTAAGATTGAAATACTAGTCAAAATAAGAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTT:1 + chr2R 12007208 5' - mdg3 215 2 59.41 GTTGCAGCTGCAGTTAACCCAAATCGCTTCTTGGCCAACTGGGCTGGCCAGTCCATGGATCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr3R 23675423 5' + jockey 23 1 62.38 ATGGGGCATTCACGACAACGATGGCTCTGAACTTTTTAATTTAATTAATAGACGCTGCCGCACCAACAAAAACAACAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTG:1 - chr3L 3574427 5' - Cr1a 182 1 84.16 CTGGTTTGGCCTTTTATTCACAAGCCCTCAAAATGAAACGCCATTCACAGCCGGCAATCGTCCTGGCGATTTTGGTTTGGGCAGCCTGAATGCGACAAATT:1 + chr2R 5606847 5' - BS3 1348 1 58.42 TTTTGAGGGTTTAGTCGGTTCTACTAAGTTGGCTTAGTCATCTTAAGTGTATGACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 21582696 5' + roo 8704 2 55.45 TAGCGCGCATAAAATTCAATTTATAACTGCAGTTTCATTAGTGTCATCAATGTGGACATGTGTGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAG:1 - chr3R 23173193 5' + Burdock 6148 2 65.35 CTTTGTACGCATCTGAGTCCGAAGACAGGATTGAAATGGATTTGTCTGAGTGGCATTTGATGGAGCACCTGTGATTGTTCTAAGCATCATAGACTGGTATC:1 - chr3L 27361584 5' - G3 4257 1 63.37 CGTATTTATAGTTAACCTTTAGTTAAGTTTAAAATGCTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 18977964 5' + roo 8704 2 69.31 AATAGTTTTTATTGAAAATTATATCAACTTTCGATCATAAGAACACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 + chr3R 18144461 5' - blood 7356 2 59.41 TGAGGAGTAGCTTGGAAGCACTGATTGCCTCGTCTTCTGTAGTTATTGCCAGGCCTACTATTTCAACGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACCTCGATGAGCA:1 - chrX 19820780 5' - Rt1b 4970 1 71.29 TGAACTTAAAACTGGACATGTTTTTGAAACATATACTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:2 - chr3L 18206807 5' + pogo 38 1 69.31 AAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1 - chrX 21668061 5' + Tabor 46 2 69.31 GAATCACTCCTTGGCTCAGTGTCCTGCCATTTGGGTTTGCCACCACCTTGGCCCTTAAACTTCCAGTCACTGACTTGCCCAACAAATTTTCCAGCTTTTCC:1 - chr3R 17907914 5' + Gypsy12A_LTR 2008 1 65.35 AAATAGACTTGGAAATGCCTTTTTTTATTCTGAATAAAATTCTTTGGTCCCCAAATTACTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr2L 21631803 5' + pogo 15 1 67.33 CGTGTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGT:2 + chrX 9816271 5' + BS 5033 1 70.30 AATGGGGAATGTTTGGTGCAGGCAATATCCATATACCCCAATTCAGACCGAGGCAAAGGAAACGCATTCAGCAAAGATAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCC:1 + chrX 719842 5' - INE-1 571 1 75.25 CGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCACGTAAGCCCAAAACTCT:1 + chr3R 11080715 5' + I-element 56 1 78.22 GACCAGGCCAGAAGAGAACAGTCAACATGAAGCGGCTGAAGGCAAACGAAATAAGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAAACTTACAATTT:1 - chr2R 7105416 5' + roo 8685 2 58.42 TATTTAGGTAAACTTTTCCATTTGTAATATTTCTGTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr3R 2556098 5' + 412 7096 2 67.33 TTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3R 19515866 5' + 412 37 2 61.39 GCCCATCTCTTTCGTTCGCGGACATTTTGTCTAGCACTTGCATACTTTTGTGCTCCATTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACG:1 + chr3R 19513340 5' - jockey 4982 1 53.47 GTGCAAATGAAAACCATACATTTCATCACCCTTATTACGGTTTTCGATGGTCTAGGGATGACTGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3R 9328760 5' + hobo 12 1 58.42 GCCCTTGGCTTTAATATTACGTTTGTAGCCATTAAATTCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr2R 9433681 5' + 297 6613 2 65.35 GCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAA:3 - chr3L 14390182 5' + HMS-Beagle2 6927 2 74.26 ACTCTTGCTCTTTCGCAAACTCAATTAGGTGGCACATGGTGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr2R 22745996 5' + hobo 4 1 74.26 ATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGAT:3 - chr3R 15790094 5' + flea 4716 1 71.29 TGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chrX 12866498 5' + hobo 52 1 79.21 GATGGGGATAGATTTTCGGGTGCTAAGTGGCAAACTTTTACCGCAGCCAGATCAAAAGTAGAGCTTGTCATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTAT:2 + chr3R 13231116 5' + Quasimodo 1 2 83.17 GCGGCAATTTAAATTCGTGAAAATTTTGATGAATTACACTTCGTAATATATATGGAATGTTTCGTTCCCACAAGCCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGA:1 - chr3R 16399037 5' - roo 9071 1 72.28 CTCCCAAACATTGCCATCACCATTATCATCAAGCCTCGAAAATGTGAATACTTGGGTTGACTCTTCGCTGATTGATTATTTATGTAAAATCCCAAATAAGA:2 + chr2L 1535619 5' - roo 411 1 83.17 GTGTGTGTTTATACACTGTTATCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCT:1 - 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chr3R 26197998 5' + jockey 4795 1 57.43 AGAGGTGCGGTGCGGCCGGTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAA:1 + chr3R 5773156 5' + Stalker4 32 4 58.42 ACCTTTGACCAACAAAGCATATAAGATCTTTAGCCCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3L 21393463 5' - roo 9032 1 65.35 AAGTAATATGTGCATCGTATGTGCGTATGTACAAGTGCGTATGTCAGTGCATGAAACACTGGCCGGAAACCCGTGTGCAGCCGGCAAAAACACCATATTTG:1 - chr3L 24510194 5' + Gypsy6A_LTR 96 1 57.43 GTCTGGGTGTTTTTTGTTAGTATTCTATTTTTTAGGGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATACTAGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCT:1 - chrX 7499160 5' - Doc3-element 4518 1 64.36 ACAACTGCCGAAACGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGACGTGCCTCTCAGTCTA:1 + chrX 3446517 5' + I-element 26 1 53.47 GGGGCCGCTGCGTCAAGTTTGTTGTAACTGGAGATAGATGTGGATGGAGTAAGGGGTTGTCAATATAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTT:1 + chrX 21557368 5' - 17.6 7028 2 53.00 CAGATAAAGTGAGAAGATTTTCACTTTTTACTACCAGTCCTTTTTATTCCCCTTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATT:1 + chr2R 25216530 5' - 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mdg1 7404 2 79.21 GGACTAACCACCCACCCACCTGTGTGTAGCACCTGTCGCGCGGTGTGCCGCGAGTGTTGTTGTTGACGTCGTCCGTTTCAGATTTTTTTTTTATTAAATAT:1 + chr3R 6278604 5' - TART-B 10510 1 71.29 CCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:1 - chrX 21668084 5' + Tabor 23 2 56.44 TTACGGCTGCTCATTAAACATTTATCTAATTGATTGAGCGGTTATGTGATGTCACATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCAACTTGGCAAAACGG:1 - chr2L 3482065 5' - I-element 5013 1 56.44 GGCTTTAATGACATCGGACGACAGCAAAAGTTTACGATTACACGACCGGCGTCGTTTCTCGGCCATAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGC:1 + chr3R 19067242 5' + Stalker 6973 4 71.29 CTTAAAAGAAATCAACCAATATTGTATGTATTATCTATATCTACATATATTGTATATCTATTACAATCCAGCTTGCTATTATAATAAATATAAATATCCAA:1 - chr3L 17933721 5' + Stalker 6932 4 78.22 AAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTAT:1 + chr3R 23020826 5' - INE-1 565 1 48.51 AAATGCTGAGCGACAGGCGGAGAAAAGGGGGTCTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGAACTCTAGGC:1 - chr3R 30076483 5' - 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chrX 17492978 5' - Tirant 387 2 67.33 ACGCAGGGAATTCCCCTCGAGGCAAATGCAATAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATAC:1 + chr3R 18453020 5' + I-element 4983 1 73.27 AACAAATAAAAAGAGCGAACGATTTTTGTAATAAAGGAATTGAACGAAGAGCGCGCAATTTTTCTAATGGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2L 1530500 5' + roo 6 2 73.27 GCGGATGATGCCACAGGTTTGTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCATCTATATCCAGG:1 + chrX 12177528 5' - Bica 4878 1 78.35 TGTGTGTTGTATGTGTTTAAAAGGGTTTGGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr2R 16384316 5' - roo 9027 1 72.28 ACGTGAGCCGACGCTTGAGTGCGATGCATTTCGCACCCTTTTATAAGCATACATAACTATATATATTTATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTT:1 + chr3R 17173007 5' - invader1 4007 2 75.25 AAAGTATATATATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAAAG:1 - chr4 156605 5' + INE-1 148 1 83.17 GAGAAATGAGTAAACCACAAAAAAAAAATGCAAACGAACAAGACACGGCAACCTGTTAATAAAAACCAAAAATGAATTAGAAGCCAGAAAACTCTTAAAAC:1 - 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chr3R 12546859 5' - hobo 2892 1 74.26 TGGAAAATGAAAACATAGGCGAGACCACAAGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 + chr3L 494639 5' + Transpac 4963 2 75.25 TGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTA:1 - chr3R 20240933 5' - Tabor 7283 2 65.35 CCAGGTGTAAAGATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTT:1 - chr3L 19274900 5' - transib2 2818 1 70.30 CAAAATAATACTATGTCCATGCATTTCTTTCGAAAGATATAAGTATCTCAGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTTGTTTGTATTATGTTAATAACCATTC:1 + chr2R 3600102 5' - Doc2-element 74 1 57.43 TAGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCA:1 - chr3L 24210982 5' + HMS-Beagle2 21 2 56.00 CAATGCAAATACGGTACTGCAAATAGGTTTCACTTCACCGACGAGTTTACAGCTTCTGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCTGTTTAACCCTTCACCTTTAA:1 - chr2L 22322543 5' - transib2 158 1 61.39 GAGCGGCAGTAGAGATTTTAGTTAATATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - 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chr3R 15790091 5' + flea 4719 1 68.32 TATAAAAATCATAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAA:1 + chr2R 5582172 5' + Cr1a 446 1 60.40 AAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3R 19515810 5' - 412 453 2 65.35 GTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr3L 14558265 5' + 297 42 2 70.30 GGGTGTGGGGTTTTTAGGGGTTCTGTGAGAGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTG:1 + chrX 7554666 5' - G6 1839 1 70.30 TAAAATAATCTGCATGCGAAATATTTGGATTTATCTAACGGAATCTGAAATGTTTATGCACAATAAGGGAGAATGCTATAGTCGAGTTGCCCGAATATCAG:1 - chr2R 4695174 5' - INE-1 562 1 71.29 GCAGTAGACGGCGCTACATTTAATCTAATCTTGAGCAAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 + chr2L 9672385 5' + 297 6581 1 77.23 GCCATAACTGTCTTTTATTGAAACTAACACGCACATAGTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 + chrX 21176983 5' - 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jockey 4675 1 64.36 AAAACCTCCCATAGGGCGGATACATTCTGCTAGCCGGGCCATTATGCGAATTATGCATGGCACATAGCCAGTAAAACAATAACAATAACAGTAACAATAAT:1 + chr2L 7863787 5' + mdg1 7059 2 68.32 CAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:4 - chrX 21945922 5' + F-element 49 1 65.35 ATGTAGCATACATTTGGGCGCCGCTAATAGGAAAAACCAGAGCGCGTCGCGATGGTTGCGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 13623633 5' + jockey 23 1 60.40 GCTCGGTCGACGCTTATAAATCTTAATTAATTAAAATACACAAAAAAAGGGCAGCATCCACGAAATTAAGGTCCAAGTAAAAACCGAAGAGAGCTTTAG:1 - chrX 2995716 5' + Fw3 111 1 63.64 GTATCCTGTAGCCATTAGGGTATTTTTCGCCGCAGTCAATTCTCACACACTAAGGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr3L 8256143 5' + jockey 32 1 52.48 GGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAA:1 - chr2R 2092778 5' + Doc3-element 83 1 65.52 GTCGGCAGAAGTGACAACTAAATGCTACGAGAGTGCCACTCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:1 - chr2R 10513622 5' + I-element 80 1 68.32 AAGCTTGCATTTTTCCCACTTCACTGTGCTCGACCTCGCTGAGGAGCAAAAGAGCTGTGCTTTCCAACTGCATCGTACCGATGTGGGTATACGGGATCCAG:1 - chrX 18319961 5' + Helena 1065 1 92.08 TCTTCTGATAAGCCGTACAATATGAACGTACATCCTGCGGTTTTTTCATTTCACAACGTAATCAGTTCAAATTATTCACACCCAAATTGGACCAGACTCGA:1 - chr2L 7860026 5' + I-element 4906 1 79.21 ACCTTTTAAGTGCCTGCAAAACGGATTGGTTTTAAAGGCGAAGATTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 - chr2R 17697305 5' - pogo 2075 1 57.43 CGTTCCTTCCCTTCTCCGAGCTGTTATTAGCATTGGTAGTTAGGTTAGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGC:1 - chr2L 260819 5' + jockey 471 1 56.44 ACGAGAGAGATCAATAAACCTTCAAATATGACATATATAATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1 + chr2L 16756745 5' - flea 217 2 69.31 TATTGTTAAGGCAATTCTTCCTTATTATTTATTGATTAGTTAGCTGTTTGTATTTATTTTAGTTAACTTGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTATAAGTTATCG:1 - chr3L 24208991 5' + HMS-Beagle2 2 2 68.32 CACCAGAAAACACAACCGGAAAAGCATAGAGAGTGGGAAAATAGTGCCAACTGGACAGAGAAAAGTTATGAGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACA:1 + chr2L 17246727 5' - hobo 57 1 79.21 ATTGCAATGCATTGGAAATGCACCAATTAAGAGCCTGAAAGTATGCTACGAAATATTGCGCATCACATGGAAATTTTCACCACACTCATGACCTCCCTAAC:1 - chrX 5513412 5' + jockey 4762 1 73.27 GTGGCATTCTCCTTCCGGTTGCCACTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3R 25360928 5' + jockey 57 1 74.26 TGCAGTTCGATTTGGTGCTGCTTCTTTTTTCCGATTCGCGAGAGCGCCTCTTGCGTATGCTTATGTGCATACATATGAAAAAGAATTCTTATGTGCTACGT:1 - chr3R 22011693 5' - Tom1 158 1 64.36 CCCCAAGTAGATTTAGCTCAGAATTAAACCTGAAGTTATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 - chr3R 26542283 5' + FB 40 1 65.35 GCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGAGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2R 17348611 5' + jockey 30 1 56.04 CGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTAATCTCGTTGT:1 + chr2R 5617509 5' - invader1 3983 2 57.43 CTTACCAACTGGAATAAATCAATTCAAGTATGCATTTGGGAGCAAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCACC:1 + chrX 18975520 5' + diver 5892 2 75.00 CGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 + chr3R 11080709 5' + I-element 50 1 74.26 TCCCCATCATTTTCCCTTTGGCTAGGGCCCCCTACCCACCTCTTGTACCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTA:1 + chr3L 19173533 5' + transib2 27 1 56.44 GGTCGTTAAAAAAATAGGGTGTCGGGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3L 21998429 5' + roo 51 2 80.20 TTAGAAGCTACAAACAAGTAGGCAACAAAGAGAGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCC:1 + chr2L 1304596 5' + roo 8831 2 67.33 ATTCACCTACGCGATGTCCCGCTGAGAAATTTCCTTCCCGTTCAATCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:3 + chr3R 30076409 5' + hobo 28 1 51.49 ATCTAATTTGAGACAAAAGAAAAATAAACAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chrX 20835223 5' + roo 46 2 76.24 TCAACAGTTGCCGCCCCTGGGAAAATCAAAGGATATTCAGGCGGAACAATGGTGGTGCTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2L 16569468 5' + roo 21 2 55.67 TGTTTATGTTAAATGCGCGGTATTCATGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGGTGTATGTGTATTGGTATGTAGGCATGTGCTTAAGTCTT:1 + chr3R 10967558 5' - Idefix 22 2 43.56 AGGACACTGTATTCGATTCCGTTATATCTGATACTACTCGTACTCAACACCAATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGT:1 - chr3R 13227850 5' - Quasimodo 6964 2 52.48 AGAACAACCTACAGCCAGTCTCCAATCCCATCAGTCCAACTACCAAACACCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGAC:1 - chr2R 6598261 5' + I-element 4932 1 55.45 TTCAACATTGCAAGGGTGTTCTATTATCCAAATAACCCAACAAAGATTATGGGCCTAGACTTTTGCCTCCACCCCTCCTTCCCTACTCCGAGACAACATGG:1 - chrX 22398557 5' + G-element 304 1 70.30 AACTTATCATAAATGTGTCTATCTGTTACTTAATACTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr2R 11245033 5' - 412 452 2 71.29 CATGATGATGATTCAGGTGGTCAAGAAATTTTAAAAAAAAAAATAAATAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTA:1 - chr2R 3600682 5' + F-element 134 1 62.38 TCTGCGAGTTGTGTCAAGATACCAGCTATTGTGGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chr3R 30641837 5' - hobo 2897 1 65.35 GTTTCTTTTAAACGATTAAATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2L 18417286 5' - roo 392 2 62.38 AGAAAACGACATTAGCTGGCTTTATTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAG:1 + chr3R 31431509 5' - Tabor 7274 2 72.00 ATGATGACTCAGTGTTAATGTTTGCGGATTATAACGCGCCCAGGCTTGAGAAATGAGAGTAAAGATATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCC:1 + chr3L 3739052 5' + invader4 2764 2 75.25 TTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:2 - chr2R 17348616 5' + jockey 36 1 57.43 ATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr3L 3535444 5' - roo 9036 1 61.00 TATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGAT:1 + chr3L 24210889 5' - HMS-Beagle2 294 2 61.39 TTAACTCAGGCAAATCAAACTGAAATTGTTAATTTGCCCATCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 - chr2L 22747340 5' - transib2 2787 1 63.37 GCGGGGTCGCTGGCGACAGGGGGGTGACAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCG:1 - chr3R 6918362 5' - Doc 451 1 73.27 GGGAGAGCGATGGGTTCCAGTGCAACATTATAACATAATCCGCATAGAAGGACTTCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 + chr3R 16110161 5' - mdg3 224 2 56.44 TGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGTAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr2R 17348593 5' + jockey 57 1 77.55 TACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 12998318 5' - roo 355 2 75.25 AGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:2 + chr3L 24210906 5' - HMS-Beagle2 7160 2 58.42 CGAGTGCATAGTGAGATCCGCAGTTAGTTTACAACATCCGTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGC:1 - chrX 5118801 5' - I-element 359 1 66.34 TATCAGTGTGCCATTGTGTTGCCATAACTGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGACACGCGGCTCAAGACTTTTTATTTCGC:1 + chrX 6709120 5' + 1731 4516 2 71.72 CAAATTTGTACTTAAGAAGCGTCGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGTACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr3R 3921296 5' + Doc 58 1 74.26 GTGCACTTGCCGCCAGTTGCCAAAAAAAAAAGGAGAAAAGTATGTGTGAAGGGGGAGTTATTCTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr2R 10974108 5' + hobo 13 1 66.34 TTTAGTTTAATAAATATTACTAAATTGCTGTAATGATGAACTTCCCGTTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - 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mdg3 5490 2 71.29 AGGTTTTACGTTGATAAAATATACCCATTGTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATT:1 - chrX 2764890 5' + FB 47 1 72.28 ACCCGGACATATTCCGAGATGATCTAATAAAAAGGCAAAGGCACAGCAAGCCCCCAAACCCAGACCGGCCACCCCTTTCAGCAAACCCTACACCATCAAG:1 - chrX 20831076 5' + G2 21 1 72.00 TTCGTGCATAATACAAATAAATCAAACCCAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACT:1 + chr2R 2144955 5' + Stalker2 49 2 69.31 CTTACCTATAAATAAGAAAAATATAAGTAAACCTAATTCCCGCATTGAGGCTTTTGTGATTATTCTGACCATTTTTGATTGCCTTCGCTGAATAAGCTGTA:1 + chrX 17949916 5' - Porto1 4315 1 53.47 ACAAAGCGCCGCGGTTAAAGTGGAATGACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 11073781 5' + roo 48 2 74.26 ATTAAAATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATA:1 - chrX 14395049 5' - Porto1 4574 1 80.20 GTGCATATAGATAAATTTTCCTCTGCAGGAAAAGCGCTTCTCATTTCCACCGCATCTGTAGTCATGTTTATGCACTCCACATTTTTTCCCTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 4035163 5' - Bica 341 1 56.44 GTCGATGCACTTCTGATAGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 - chr3L 22231395 5' + Doc 23 1 58.42 AAGCACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTT:1 - chr2R 2875216 5' - TLD2_LTR 127 1 76.24 CCTTATGCGAGAGCGAGCCGCAAACAAACTGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chr2L 12911260 5' - mdg1 376 2 70.30 AAGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGG:1 + chr2R 6482665 5' - gtwin 7362 2 54.46 GGCTGGCTAACATGCGAGGGAAAATGGCTCGGAATGGAGTGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCG:1 - chr3R 20486405 5' + accord 39 2 66.34 GCGTGTTATTTTCTCATTGTTAAGGTCAGTTCTGTTTACTCACAAAACAATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCAAGAGAAACTAAAGATT:1 - chrX 7339971 5' + G2 2609 1 52.48 TGCATTGCAAAAATGTAAGCTGCTTTCATTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr2L 5654887 5' + roo 8711 2 73.27 AGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTT:1 + chr3R 11080696 5' + I-element 37 1 61.39 CCAGCGACGCCTAAAAAGCGGCAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2R 17277650 5' + jockey 14 1 52.48 AGTTCTTTTTCCCTGCGATTGCGAATGCAGTGCATTTTGAAAATAGGCTACTCTGAAAGTAATTACTTTCACAATTCATACTTTTTTTTTGTTTTGTATTT:2 + chrX 14442477 5' + S2 233 1 74.26 GCATTTGGGAGCAAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAAC:1 + chrX 18975551 5' + diver 5924 2 55.45 CTCCTCGGGGTCTTGAGCATAAACTGTCGCTCCGCTCTCAGTT:1 + chrX 11252277 5' + accord2 165 2 55.81 GATTAACGAAAATTTCGAAATTAAGATAACTATTGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chr4 306482 5' + blood 32 2 61.54 GGCGCCGTTAAGTATGCTATAGTTTTTTCTTAGGTTTGGAAGGTCTATTTTGTAGGTTTCTAAGCCAAATATTAAAGCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 + chr2L 12246540 5' + hobo 2708 1 49.50 GATTGCTGCAGATATCGATGTTTGGTCTGTGTATTTAAATTAAAAAGATTTAATTGTCCCAATATCATAAATCTATAATGTGTTGTAGTATGTGCATATAT:1 - chr3R 18144564 5' + blood 7008 1 73.27 TCTTCACCCACCTTCGCATCGGCCAACTCAATTCTGGCAAGATTGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCAC:1 + chr2R 1780061 5' - I-element 325 1 56.44 GATTGGGTGTCTGTCTGTGCAATTCGATGCGATGTCATGTCCTCATGATGAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGA:1 - chrX 5131054 5' - I-element 5331 1 52.00 TTTGTCATTCCATAAAATGGGGTGAGCTTGAACTGACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:1 + chr3L 26315779 5' + Tabor 6858 2 60.40 ATCAATTGTGAATAAATAGGCAAATAGAAAGTATGTATGCTTGTTTGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGC:1 - chr3R 20240977 5' - Tabor 490 1 69.00 AATAAATAGGCAAATAGAAAGTATGTATGCTTGTTTGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTT:3 - chr3R 20240967 5' - Tabor 7318 2 58.42 TATGTTTATTGCATCCACTAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 + chr3R 22494701 5' - 1360 3357 1 62.38 CCAAGAAAGTGTTTAGTTTTTGTCAGTGTATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr2R 12247451 5' + hobo 47 1 76.24 ACTCTGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr3L 14504280 5' + 297 6628 2 74.26 AGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGACACATACAAACACCATTCAATGTCAGATGGCTAGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chrX 12649915 5' - hobo 2921 1 60.00 GCGCTTACCAACTGGAATAAATCAATTCAAGTATGCATTTGGGAGCAAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCA:1 + chrX 18975517 5' + diver 2 2 77.23 AATGGAGAGCCTATTTAATGAATATCTTATCGATGATGAAACTGAACATGAAGACAATGATTGTGATGATGATTTCGTTGAAAATAAAATTAACAATGGAA:1 - chrX 5166278 5' + hobo 487 1 72.28 GGAAAAACAGAAACGTAAAAGCATAAAAAAAAAACCCTCAAAAAAAGAAACAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGG:1 + chrX 12734787 5' + Bica 442 1 51.49 TGACAGATAAAGTGAGAAGATTTTCACTTTTTACTACCAGTCCTTTTTATTCCCCTTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTA:1 + chr2R 25216527 5' - 3S18 318 2 59.41 GTGTATGGTGTATACAATGTATGTACAAGAGCACCGACCGGTTTGTTTGCTACGCAGAGTTTTCGGGCTTCCATTCATATTTAATGGCATTGGATACCATT:1 - chr3L 22742036 5' - HB 461 1 63.37 ACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATAC:1 - chr3R 11151896 5' + mdg3 26 2 53.00 GCCATTTCATTTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chrX 5168832 5' + hobo 18 1 61.39 TAACCGAACTTTCGTTTCTATTCAACTTCACTCCGTGTTATTTTTTTCCCCCGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAA:1 + chrX 2844099 5' - Quasimodo 234 2 51.49 GTGAAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 + chr3R 11080670 5' + I-element 10 1 68.00 AGTTCATAGATGCCATGAAAAGTATGCAAATCAATCCTATGAATTATGCGTTGTCCGTTGGTCAGCTTGTCCGTCTGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAAC:1 - chr2R 11575194 5' + INE-1 140 1 72.28 AAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATAT:1 - chr3R 20240927 5' - Tabor 438 2 71.29 TTTTGCGCATTTCACTGTTTGCCAGATAAACGAACTTTAAATACTATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 9616559 5' - roo 402 1 71.29 ACGCTTGAAGGAAGGGTGGGAAAGTATGTCGGGTATGGGTGTTCGAGTGCCTATTAATACAAACATACAATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAA:1 - chr3R 16197137 5' + Quasimodo 466 2 65.35 AGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 - chrX 21668091 5' + Tabor 6855 2 63.37 AACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2R 17277628 5' + jockey 36 1 42.57 CACATGACCAACTTCTTCGACTTGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chrX 20835259 5' - roo 9021 2 76.24 TTGGGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTT:1 + chr2R 17942106 5' - mdg3 5447 2 75.25 CAAGATCTTTAAGAATGCAAATATCTTAAATTTAATCTCTTCATTTTGGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGG:1 + chr3R 20240870 5' + Tabor 6869 2 52.48 TTATAGCTTTAGAATGTTGATACGAAACCAGATATTTGGTAGGCTTACAAATAATCCGATAAATACTATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTG:1 - chr3R 23870680 5' + roo 103 2 70.30 TCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chrX 17492906 5' + Tirant 8159 2 78.22 GCCGCTGGGAGCCAATTCTCGAGGATTGAGAAGATCAGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr3L 12025657 5' + blood 40 2 64.36 ATTAGCGCGCATAAAATTCAATTTATAACTGCAGTTTCATTAGTGTCATCAATGTGGACATGTGTGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATAT:1 - chr3R 23173195 5' + Burdock 6146 2 67.33 AACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGAT:1 + chr3R 11151832 5' - mdg3 5456 2 65.35 GCTTTGGTGTCTAAATGTGTATGTGTGTGTTGATTGATAACCAACCGTCCAACCCAAAACAAATAAATTATCATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 + chr2R 22825380 5' - opus 495 2 74.26 CAGATGGACACATGTGATGTCATTAAAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:2 - chr2R 15057654 5' - hobo 2889 1 76.24 AAAAAATCATAATAAAAAAAAAATCAAAAA:1 + chr2L 4804994 5' + Rt1a 5076 3 90.00 GGAGAGGGGATTATTGAGAACTATGCTCGGCAAAAGACAAATGAAAAAAGAAAGTGAAAAACAGGCCAACAACGTTCGGGGAATTAAAAAAGAAAAAAAAA:1 + chr2L 14073261 5' + Osvaldo 1521 1 67.33 ACACTTGAGTTATGGTGAAACATTTTTGTTTCGGCCTTTTTGTTTCCCCCTGGCAATTACGAGGCAGTCGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr3L 15733402 5' + hobo 6 1 43.56 CCGTGTGAAATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:2 - chr3L 17635592 5' + 297 23 2 57.43 AAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:2 + chrX 17492895 5' + Tirant 8148 2 67.33 ACATCTGATTCGGCCCTTTGCAAGTAAAATTGCATTTCAAAACAAAAACAATCAAATCGAATGTCACACACACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTA:1 - chr3L 13885551 5' + Doc 129 1 65.35 GCACGCGGTTACAGCGATGTTCGAACTAAAACCGAATACCACATTCCGACTTTTGAGCCGCCTGCTCCAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3L 14205424 5' - P-element 2882 2 73.47 TCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3L 3535447 5' - roo 9038 1 58.42 GTCCACTGCAAAGAGCGAGCAGTGTAATGTTAATTTTGAGCTTCAAGTTAACAGTGTCAGTTAAAAAAACGAGAGAAGTAAATTCTTTATTTTTTCGTAAA:1 + chr3R 20308768 5' + pogo 2014 1 38.61 ATTTATTGCCTTTTGATTATATTTCAGGCGAGCGAGGAAAAATATTAATATACCACCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chrX 13547253 5' + I-element 9 1 56.82 CAAAAAAGAAAAATGATTCTTTTTTGTATAATAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATAT:1 - chr3L 8903513 5' + diver 5933 2 73.27 GAGAACGACTAATAAAATGGGAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 + chr3R 6774904 5' + Tirant 8135 2 54.46 AGATTATTTGTATACTTTTGTTTTCGGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr2L 8898942 5' - roo 9039 1 55.45 AATGCTATGCAGTTAAGAAATTAAAGTGTCATTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2R 15402861 5' + roo 8709 2 73.27 GAAACCGCGACTAAATGGGTCGAAAGACTTTCACCAAGCGAGCAACTTAGTCAAGTGCTTGCTGGCCGTTTGATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATT:1 - chr2R 11297133 5' + gypsy 6988 2 78.22 ATGGTTAAAAAACAATTTGAAAAACAGGAAAATTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTT:1 + chr2R 1727521 5' + 17.6 346 2 67.33 TTTGTCAGTCAGGTGGAAGTCAGCTGGAAATGTTATGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGT:1 + chr3L 14320990 5' - Doc 435 1 68.32 TTGGGGCATGCGATTTCCCTCGTCTTTGAAATGCCTCACAAACTCTCCTCATACAAATGGGGACCTGTGTATTTGTATTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTT:1 + chr3R 21859185 5' - I-element 5148 1 60.40 GGTTTGCGTTTAAAGTTTAAGTGGCGCAAAATCAGCGCTCATGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCA:1 - chr2L 9624611 5' + transib2 32 1 55.45 AAACCGAACCGCCAGCCCCTTCCACTTTTCACCCCCCTCTAAAAACGAAAATGGAAGCGAAAACAAGAGGACGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTAATC:1 + chrX 18146946 5' - INE-1 549 1 61.39 ATGTTTCTGCCCGCAACTGAACCACGTTTGGGCCTCATCTAAAATTGATTTTGCTCGGGAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 20384521 5' - roo 9054 2 61.39 ATACCTCCGAAAGATAAATACCCTATCCCATCCATTTCGACTATATTGTAGCATATTGGACTAGTCTACCCTAAAAATACAATAAATTATTGGGTATAACA:1 - chr2L 9448355 5' + Stalker4 34 4 75.25 ATTTCAACCGCATATTTGTTGTTCATAATGGGTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:1 - chr3R 11912141 5' - I-element 5313 1 68.32 TGGCATCAGCAAAATATTGTCATAGTCCTGCGACCAGGCATCCTGGATCTACAGCCATACTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chrX 14371372 5' + jockey 24 1 66.34 TAACAGATCCCATTTTAACCAGCTACGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAACACCGCTAATCCGGGCTC:1 - chr2L 16331668 5' + I-element 146 1 72.28 CTTTCGAGACGGCCCACGGCATGTTGTGCTCCAGAAGCAAATAGAAAAAGCTTTAAATTTAATGGAAAATGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 + chr3L 18523565 5' - 412 7543 2 76.77 CACAGCAGTTAGGACGGACAAGGCTCGTGTGTCTGTGTGCAAGGATATTCACCTTGCCACAACAAAAAAAAAAAGGATACAAAAAAAACCACCTTCAAATT:1 - chrX 13592202 5' - Tc1 1466 1 61.39 AACTAAAACTTTTCGTTTTCACCGTTATTATGTTTTAGCCATCGATTAGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAA:1 + chr3R 6136484 5' + Burdock 6161 2 54.46 AGGGATTCAGTGCTGCTACCAACAGCAGTTGCAATGCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTA:1 + chr3R 8499418 5' - Tabor 7283 2 62.38 CCACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCACATACC:1 - chrX 22664428 5' - opus 7468 2 62.38 GAAAATACGATCTTTCATTAAATAGGAAGAAACAAAAATTCCTAAGAGATCAAAATAATTTCAAGAAATATATCCAACCGAAATAAAGTTATGTTATCTT:1 + chr3L 2818427 5' + Chouto 150 1 63.00 GTTTAGGGACCGCAGACTTATACCTTCGCCAACCAACTTAACCAAGAAGGGTTTTTTGTAAAGTTAAATAATCAGGACCTTGTTTAATTTGGCCAACAACA:1 - chr2R 3393388 5' - G3 418 1 46.53 GCAGAATGTTTCTGGTTTATACTTCCGCGGTACAGTTCTCCTTTCCTTGACATCCAGATTAGGTACACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 + chr3L 14285978 5' - 412 7535 2 68.32 TTTTAAATGGAACGTAAACACACATGCCAGTGTATGGGTAGTACCCACACACTCATAAGCAGTAACACACATACATACACACACACACAC:1 + chr2R 14443529 5' + Quasimodo 31 2 80.00 GATCGTATGGCTGGCGATAGCTCCTTCAGCTCGCGTTCGTTGCCAGGTGCGTCCCATCTGATTAATCCGTCCAGCAAAATAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr2R 19140122 5' + F-element 4687 4 51.02 TCTGCCCCCCACATCCTTCCGCATCCTCGTGCTCCTATCCTGCTCTCTTTGGGCCAGTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1 + chr3R 28135256 5' - hopper 1394 1 58.42 AGCGAATCGTTATGCGATATATCTTTCACTTTATTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTT:1 + chr2L 16636122 5' - 297 446 1 76.24 GTATTGCGAAACAGGGCGTGTTTTGATTCCGCATTTTGATTGCGTTTGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAATTCCCCAGAGTTCCATTCCAT:1 - chr3R 23640386 5' - Porto1 4276 1 78.22 TATAGGTATGATAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1 + chrX 21668544 5' + Tabor 40 2 63.37 GTGGGGGGTTAAGTATTAAATTCAGCAACACAGGTTATTATTTATCAAATATGAAGATGAAATACTGTGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAG:2 - chr2L 14993485 5' - 412 484 2 69.31 GCGAGAGCGAGCCGCAAACAAACTGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 + chr2L 12911266 5' - mdg1 7408 2 76.24 ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTTCTATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr2R 15616423 5' + 297 12 2 69.31 TTAAATCTATATATATGTAAAAAATTCTTGTTTCGCTTGCGGCGTGTAAAAAATGAATAAGACACTGATTGTTGAATGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTC:1 + chr3L 23334829 5' + 1360 470 1 58.42 TTGCGAAAAATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 + chr3R 13620269 5' + Doc 38 1 63.37 TTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:2 - chr3L 3535450 5' - roo 9041 1 56.44 CTCTGCATTTTGGTTTAAAAATATCCACTCAGTATGGGGGTGTCAATATAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCA:1 - chr3R 9947371 5' - 17.6 83 2 71.29 GAAACTCAGTTATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:2 - chr3R 19515879 5' + 412 7077 2 55.45 GAGCTTAATTACATTTTTTGCTTCTTTGGCGCAAACAATGCGGATGGGTGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 6097590 5' + roo 28 2 53.47 TTTTAATAAAGAAATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTG:1 - chr3L 27395605 5' + invader4 2918 2 60.40 CAATACATTGTATACGCTAATAAATTACTCTCATTAAAAGTGACTTTATGGGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATAC:1 - chr3R 16110246 5' + mdg3 26 2 59.41 AAATGGTATATAAATATATATCTTATATTAATAGAATTAAAACAAGAGAGACTGCTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACGCAGCTAGTGTGAAAGCGAA:1 - chrX 14770749 5' - INE-1 531 1 89.11 AATCAAGCGGCTAGCAAATGTTGCAGCTAAACTATTTAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAA:1 + chrX 3340327 5' + Porto1 4476 1 72.28 GGTTCGCCGTAATTGATTGCCTCATTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTT:2 - chr2R 18983706 5' - jockey 4945 1 77.23 CTGTTAAGAGGAAAGGAAGCAGAATGCTAAACGAAGGATGTCGGATTGGTATTATTTTGGGGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTG:1 + chr2R 640550 5' - I-element 179 1 58.42 TATTTATTGCCTTTTGATTATATTTCAGGCGAGCGAGGAAAAATATTTATATACCACCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 - chrX 13547254 5' + I-element 21 1 52.48 ATATATTCAAGGGTAGTTGGTTTAATTCATGGTCCACTTTATTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - chr3L 735099 5' - mdg1 386 2 57.43 CAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:2 - chr2R 5531195 5' + 1360 66 1 61.39 AAGTGCTTATTATCGGGCATCTATTTCAATTTCCCCCTGGCAATTACGAGGCAGTCGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3L 15729690 5' + hobo 19 1 60.40 ACGTCGAACGCGTTGCTCTTATTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 - chr3L 15353568 5' - mdg1 369 2 78.22 TCCCAAATGGCGTAATGTCTCTCAAGTGTATTTAGCACATCGGTTCGCATTGCCAAACCCAGATGTTTAGTATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATA:1 - chr3R 10027735 5' + FB 249 1 75.25 ACTGAGTTAACTATTTTTTCCCCTAGTAAATAAGATCTGATTTGATATAAAACATGAGAGAATGATGTAGTCGAGTTCCCCGATTATCAGATACCCGTT:1 + chr4 959199 5' - INE-1 553 1 67.68 GAGTGGTGAATGGGGCGACTTTTGCGATTCACAAATCGTTGGCACGCATCGGGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:3 - chr3L 12217386 5' - roo 9048 2 54.46 AACATAGCAATCCAAATTGTCCGAAGCGCAGGTTCTCTTGCAGCCAGTCATTCCAGTACACTAAAAGTATTAAATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGT:1 + chr2L 15648961 5' + Juan 4031 1 69.31 ATTTGTTAGGCGTCCATTTTAGTTTGTTGGTTTATTCATTCACGTAGTATTTTGTTTTTGTTTTATTTTTTTATTTATACCTTATTAAGGCATACGGGTTA:1 + chr3L 23953560 5' - BS3 1754 1 66.34 CGAATGTCACTTGATGTTTGTGGGCCCTTCGCTTCCTGGCTACACTCGGAAAATTGTTGCACCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chrX 4278413 5' + blood 16 2 63.37 GTTGTGTGATTTCAACTTATTTAGTTGTTTTTGTTACTTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:2 - chrX 3295706 5' - hobo 2933 1 70.30 AATGGGATAGCCTTTCGAAATGATAGATATATATATTTACATTCATTCTGACTGGTACTCATGAATGGCCAAGACATTTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chr2L 10104366 5' + roo 2 2 63.37 AGGTTTTATCCATTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTGTAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr2L 13598170 5' + pogo 14 1 65.35 TCTGGTTTTTACTGTTAATTAACGCCTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTC:1 + chr3R 17981768 5' - HMS-Beagle 138 2 74.26 GTCATGCACTTAAAAAATAAACGTGTAAGCTTTAAAAGAAACTATAAGCAAGTACATACTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 + chrX 8303386 5' + flea 14 2 61.39 TTTCCCTATATGGGCCTGGGAAACTCATAAGGCCATTAACTGATTAACACTAAGCGCAAGTTATTTAGAGGCCAAATATTTTTACTTACTCTGCCAGACCA:1 + chr3L 27180199 5' + Gypsy6A_LTR 240 1 80.20 ATTAAGAATTAAAACAAGTAATTGGAAAACGAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCT:1 + chr2L 3980080 5' - McClintock 139 2 73.27 AATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3R 13620280 5' + Doc 49 1 74.26 ATATTCAACCAACCATAGTTAATAAAACTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 + chr2R 1727728 5' + Doc 11 1 51.49 ATCAGAATAAATTGAAAAAAATAGTAATGTAGAACAGCCAACAAATAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGACACAAACATAACCCACCAACACTGCCTAAATCCC:1 - chr2R 17367667 5' + I-element 4973 1 65.35 ATCTGAAAAGTGGACTAGTGACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr3L 14286076 5' + 412 7077 2 55.45 AGGCAATCTACTAGTAGCGAGTAACGAGAACTGCAGTCGTTCTTTGTAAATAACGAATACTATAGTGTTGTAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 + chr3R 21587210 5' - pogo 2100 1 74.26 TAATCATTTGCTATTTAAGGAGTTAATTGTATATTTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 + chr2R 11835624 5' + I-element 44 1 68.32 GGGCCATTTCATTTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 + chrX 5168830 5' + hobo 16 1 63.37 GTGAATAAATAGGCAAATAGAAAGTATGTATGCTTGTTTGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTG:1 - chr3R 20240970 5' - Tabor 7322 2 62.00 GTTACTCCGGCTAAAAGCAGCTACCTAAACTTCTTCCCTGTGTAATACCCAATAAAAAATATAACACTCACCAGGACACACAAACATAACCCACCAACAC:1 + chr3R 7752168 5' + I-element 4961 1 76.00 TAAATAAGTGCATATAAAACAAAATTATATACACTCAAAGAAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 + chr2L 11340910 5' + opus 145 4 63.37 AAAAATACTTATTAGCTCAACAGGTGTCAGTTTTGGGTGGTTGTAGGGCGTTATAGTGAGTGTGTGAAATAGTTTTTTTTTTCAA:1 - chr3L 25846000 5' + copia 369 1 68.24 CTCTCCCTCTCACTCAATTAGCCGCTGGGCTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr2L 12421957 5' + pogo 41 1 69.31 GGGCACATGGTTAGCAATTCGCCGTTTGCCGTTCGCATAACGGTGCATTTTGCTATGCGGCCCGCGAAAACTTAACAACAAAAACAGCAATACCGCTAATC:1 - chrX 7597494 5' + I-element 139 1 85.15 AGTCCGTACTCACCAGAAGAAGCCAAAGCCCACACCTATATACATTCGAGAGAAAAGCTCGAATGTTTTTGTAAACAAAATAATTGAACTTGTTGGAAAAG:1 + chr2R 2591447 5' + Fw3 32 1 72.28 ATTCCCTTGAATTTGAGCCCTCTTAATTTGATCGCAATGAAAAAACACTGCATTTGTTTAACCATATTTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAA:1 - chr3R 28045206 5' + Idefix 7297 2 70.30 AATTAAAGAAGAAGGAATAAGTAACAGCTTGATATCTGTTTTATAGCCATTTAGTGAAAATATCGTTAAGAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACCTT:1 + chr2L 10104241 5' - roo 404 1 70.30 CAGAGGGGCGGGGCAAAAGGACGATGAAGCTCAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr2R 18374836 5' + 412 7096 2 71.29 GACTGTGTGTATGTGAATATCGTTGGATGACAATGGATATGTCGTAATGTATGTATATGGCTATGTATATTTGTGTGTATGCTCTTTTCTACGCATACAGT:2 - chr2R 21300479 5' + 1360 140 1 80.20 AAAACATCTAATCCCTAGAGATTTGTTTCTTACCCAAAGGCAAATTTAGTATCTATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2L 1136515 5' + jockey 30 1 53.47 AGAAGTCGCACCTATTTTGGCATTGAGTGGGCGTGACCCAAAAGACTAATAATAATGTGAAAAAATATGAACAGATTTCTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGT:1 + chr3L 23019070 5' - INE-1 248 1 77.23 AATTAGTAAAGGGGTAAAAAAAACAACAACATTCCTCCAAGTGCACTTGTCAAACAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGA:1 - chr2R 16581251 5' + Porto1 324 1 51.49 TCTGTTTGTTTTTGTTGCGAATTCAGAAAACAAGGTTTATGACGTTATTCAATAATGTATGTAACGAAAAGCTATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCCA:1 - chr2R 2260705 5' + Gypsy12A_LTR 2169 1 59.41 CATTTCTCCTACATTTCTCTTCTATCTGCCCACACATCGTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTA:1 - chr3R 30283814 5' + Copia1_DM 179 1 61.00 GATGCACTTCTGATAGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:2 - chr3L 22231392 5' + Doc 26 1 55.45 ACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 - chr3R 19513400 5' + jockey 4707 1 65.35 AAATTAACCATATTTCAATGAAGTGGGTGCATTCACTTTAACTTTCAACTTGGATATGTTCCTTTATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAG:1 + chr3R 5770464 5' - Stalker4 7124 6 69.39 TTCCTGCTAACTCTCCCCCATTTCTTTTCACTTAAGCAAGCAGCTTTCAGTGTCCAAATTAAATTGAGTTTACAATTTGTAGATAACTCAAAATACATTTT:1 + chrX 22706275 5' - invader5 3621 1 65.35 CGTGTGGACAAATGTGAAGGAGCGAGTGGTGGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTG:1 - chr3L 17941696 5' - Quasimodo 318 2 69.31 GCCGAATATTTTCCCACACCAAACACGAACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGACCCTCGAGAATGGAAAAA:1 - chr3L 10622281 5' + Idefix 6950 2 72.28 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTTTAATAAAGAAATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTC:1 - chr3L 23730764 5' + invader4 2885 2 72.28 GTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 3535428 5' - roo 359 2 75.26 TAGCCGATCGCCAACCCACCGATCTCCTCCAGCCCTCCTGTTGTTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr2L 11073830 5' - roo 9036 1 57.43 TCTCAAAAATAAAACCAAACAACAAGGACGAACTCAGACCAGCACTGGCTCCTTACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGAC:1 + chrX 12635766 5' + I-element 4902 1 52.48 TGTTGAGCTTTTGCTTTGAACACCTCTCAACGGATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr2L 21018800 5' + 412 41 2 63.37 TTTGGTGTCTAAATGTGTATGTGTGTGTTGATTGATAACCAACCGTCCAACCCAAAACAAATAAATTATCATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 + chr2R 22825382 5' - opus 7496 2 72.28 ATACTGACGCAAGTTGTATTGGGTTTTATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGTATGCT:1 - chr3L 25768165 5' - Circe 7384 1 77.23 ATTTGTTTAATATTTATTTAGCTTTGCTTTATTTTATTAATTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTC:1 + chr3L 9874739 5' - TAHRE 10410 1 80.20 TGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACAACTTCACCCTCCGAAGAGGTAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAACACTCTT:1 + chrX 157238 5' + I-element 57 1 71.29 AAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCAAATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGC:1 - chr3L 24210957 5' + HMS-Beagle2 48 2 72.28 GGGTAAGGAGTTAGAAGTTATGAAAAAGTACATTGACTTCGCTGACACTTGTCAGCGGCACTTGTAACTTGTAAGCAAAGATAAAGGGTGCCTTGTTCGCG:1 - chrX 19820354 5' - 3S18 27 2 53.47 GTGGCGTATTTGCCTTGTTCTGCGTTTATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTTCGATTCGCGGGAAGATAGACGCGATATAGAAAAGAGAACAGAAACG:1 - chr2L 12891243 5' - Cr1a 4348 1 46.53 GCCGGACTTTCCCAACCTATGTGCCTTGGTTGTACATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGG:1 - chr3L 14558322 5' - 297 6940 2 69.31 AAAACGTGGCAAAAGTCAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTT:1 + chr3L 5267201 5' + Juan 3987 1 61.39 TGCCAGTATGTGTCAGTGTCTGAGCGTGGGCTACCTAGCCTGTCAACAGAATAACAGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chr3L 13644595 5' - hobo 2938 1 70.73 CATGCCGCACCCCTCTAACTCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACCCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTT:1 - chr3R 11389785 5' - hobo 2888 1 74.26 TTGATATCTGTTTTATAGCCATTTAGTGAAAATATCGTTAAGAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACCTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTAAT:1 + chr2L 10104269 5' - roo 9039 1 53.47 CAATTGATAAATCATGAGCGTGTTAGGGAAGGAATATTCGATGCTTCCGTTAAGGACAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr3R 25377476 5' + jockey 23 1 61.39 GTGTTTTGGCCCCATCTCCGCATCGCTAGCATCCCAGAAATGAGGAGTAGAAGAAACACGGACGAACGAAGCACCGGGGCGGCTACAAAAAAAAAACAAAA:1 + chr2R 10914156 5' + G2 3071 1 72.28 TGTGTATATTGGCTTTGGGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTT:1 + chr2R 17942092 5' - mdg3 209 2 61.39 ACAAATATATACATAATACCTTACACTGAAAAAATTAAAAATTCACTATGTACTTATTAGTAGTTCTTATAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:2 + chr3L 12187723 5' + blood 7017 2 64.36 AGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAA:1 + chr3L 24210894 5' - HMS-Beagle2 7172 2 56.44 TATTGTGGGTTCACTTATGCCAGTCCCAAATTCGGATCATCGCTTTTTTCATTAATAAATAATGTTCACGCCAGGAGGGCGCAAACAGTTGAGAGGCAGTG:1 - chr3R 3625702 5' + Max-element 18 2 61.39 ATGTATAAACATTGAATATGTGTGCTTATAACGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr2R 12625435 5' + pogo 42 1 70.30 ACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chr3R 19513396 5' + jockey 4711 1 69.31 AATTAAAGTTGAGTCGATTGGATGTCTGTCTGTGCAATTCGATGCGATGTCATGTCCTCATGATGAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAG:1 - chrX 5131069 5' - I-element 5345 1 66.34 TGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:2 + chr3L 9190474 5' - 412 7493 2 77.23 ACATTATTATTAATTTTTTTTTTATTTGCCTTTGCTATATCGTGCCGTTTTTTCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTT:1 - chr3R 8040740 5' - Bica 261 1 80.20 GGAATGGAAATGTGTGTGCAAGTCTGTGATTTACTTGCGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 - chr2L 16276181 5' + 1360 40 1 66.34 CCAAACTCGGCCACCGGACCCAATCCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATAT:1 - chr2R 10532460 5' + accord 76 2 76.00 CCACAGCAGGATGTCGCTGTCGATTTGGCAAACAGCGGAAGTGGCATTCTCCTTCCGGTTGCCACTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3R 25360888 5' + jockey 15 1 73.00 GAGCAAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chr2L 9672417 5' + 297 30 2 60.61 GGGGTTAGGGTTAGCCATTCGTGGAATTGGTTGAAATATATACATTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTA:1 - chrX 14405190 5' - G2 2968 1 56.44 AAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:4 + chr3R 11080681 5' + I-element 22 1 56.44 ACCTGCGGGAGCACCGGTTCCAATTTCCTGTCAATACCTTCCGAACGGAACCTAAAGAAAGCCGGTATACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr2R 12247376 5' - hobo 2931 1 69.31 CAAACAATGGAAGTGACACAAAAATTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 - chr2L 21387894 5' - I-element 5305 1 77.23 GGGCGCCGCTAATAGGAAAAACCAGAGCGCGTCGCGATGGTTGCGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3R 13623648 5' + jockey 36 1 56.57 TTAGAGGTAATACTCTATAGATGCTGTAATGACCCGATTATTCAGTAACATAAATCTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGAATTAA:1 + chr3L 25481604 5' - Cr1a 4148 1 61.39 ATTTCAGTTTTCCTATGAAATGGCACAAATCTATCATGGTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 10187425 5' - roo 9033 1 64.36 AATGGCAGTGAGGAAAAAACTATTTGAATTTAATTGGGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 + chr2R 3521987 5' + copia 40 2 67.33 ACAGTGCAACAATTATTTCTATTCCAAACTTCAAAACACCCGGGCAAACTAAGAGAGATAGAATCACCCCACTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTA:1 + chr3L 6869250 5' - roo 9066 1 74.26 CTTATCAACACAATTTGTTATATTCGAAAGAGAAGACAAATATGATAATTATTGCTTTGCGTTAATGTAGAATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTC:1 + chr2R 7009398 5' + McClintock 1 2 79.21 AAAGGATTTTTTAAATATATGTGGAACATTTATATTTTTATACCATGCAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAA:1 - chr3R 13227531 5' + Bica 456 1 53.00 GTAATATGTGCATCGTATGTGCGTATGTACAAGTGCGTATGTCAGTGCATGAAACACTGGCCGGAAACCCGTGTGCAGCCGGCAAAAACACCATATTTGCG:1 - chr3L 24510192 5' + Gypsy6A_LTR 98 1 59.41 ACATAAATAAATAACATTCATTTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:2 - chrX 21219512 5' - roo 396 1 68.32 TCTGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATA:2 - chrX 10298058 5' + Quasimodo 34 2 66.34 ACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 - chr3R 19513406 5' + jockey 4687 1 54.02 ATAAAAAATTCAACACCAAGAAGAAAGGAAGAGCTGAGGGCAATCCCCCGTCACAGCTTAATACAAAAAATTAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTC:1 + chr3L 24204202 5' - 17.6 7241 2 74.26 GGGGGAATATAAGGGGAAAGCAGGGAGAAAATAGAAAAGAAAAACAAGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAA:1 + chr3R 16525061 5' + I-element 4917 1 53.47 AATCAACGGAATGTGTCGTATATTAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 22162709 5' - roo 358 2 76.24 CATTTTGAAGTGTTGCTCAGAGCTGTCGCCACTTTGCTTTATCTAAAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCG:1 - chr3R 13619910 5' + Doc 408 1 54.46 AAAAAAATGTTGGCTACAAATGGATTGCATTTCCTGCAGCTACTCACAACTAATCGAATTAACTTCGGCCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chrX 9544145 5' + roo 8 2 71.29 GACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGGTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCA:1 - chr3R 1977622 5' - micropia 426 2 50.50 TCGAATGAAACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAA:1 - chr2R 4339516 5' - G5A 2791 1 80.20 AGAAACACTTGAAACTCGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:5 + chr3L 8044283 5' - mdg1 7458 2 77.23 TCTCAGTGTTCAGTCTTGTAGCTCGCTCGCTTAATCCTCGAGTGCCCGAGGGGCTACAATGGGTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 21219409 5' + roo 17 2 63.37 GTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGC:2 + chrX 21564098 5' - invader4 3045 2 62.38 TGCCTTTTCTCCCCTACAATGGGATGAACCTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chrX 22664370 5' + opus 7040 4 67.37 AATATTGACTTACATTTCCAAATCTTAGGTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2R 12998289 5' - roo 385 2 53.47 ATCGTATATGATTTGTTGATTCTTTCGCTATCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCC:1 - chr2L 8430834 5' - accord 7168 2 70.30 TTTCTTCGAAATCTTAAAGTTTAAACAATACCTGTAAGCTAATATCCTCGCAATTACAATTGTATAATCCCAAATACGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 10776237 5' - roo 396 1 55.32 GGCAAATGTTTATTTGCACTTTGCATTGTTGTCACCAAATGCAGAGCTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAG:1 - chr2R 21532470 5' + HMS-Beagle 6823 2 53.47 GAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr3R 29361029 5' + 412 44 2 67.33 AGTATTTCTTGCTAATTAAAACGAGTTGTTAAAAAAATTTAAAAAAAATAAAAAAAAA:1 + chr3L 5663309 5' + TART-B 10633 2 55.17 CCTTCGCTTCCTGGCTACACTCGGAAAATTGTTGCACCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:2 - chrX 4278388 5' + blood 7052 2 63.37 CAGAGCTAAGTCCGAAAACAAAACTTCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr3L 4692264 5' - P-element 2837 1 29.70 TTAGCCTTAAAGCCAAGGTCAGCTGCCATACTGAATTTTAACAAGTCAAACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCT:1 - chr3R 19143633 5' + hopper 24 1 54.46 TAAAGCGAGAAATGAAAACGTGGCAAAAGTCAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGT:1 + chr3L 5267187 5' + Juan 3973 1 75.25 AAGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr3L 22231379 5' + Doc 39 1 67.33 ATAAAATGTATTTAGTTTAATAAATATTACTAAATTGCTGTAATGATGAACTTCCCGTTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 - chr2L 21018851 5' - 412 453 2 54.46 TCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chr3L 8044308 5' - mdg1 7433 2 52.48 TGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTT:1 + chr2R 2666326 5' + Rt1a 12 1 59.14 CGCCCCTGGGAAAATCAAAGGATATTCAGGCGGAACAATGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr2L 16569479 5' + roo 34 2 62.63 GTATAGAGACGTGCAGATATTAGTATTTCACTGTCTGATGGTATGCATAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGT:1 + chr3R 23173094 5' - Burdock 232 2 55.45 TATTTTTTATTAAATCTGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACA:1 - chrX 10298072 5' + Quasimodo 20 2 58.42 TGGCTTCTCCGGCTCCCCTTCTGCAGAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAA:1 - chr3R 20430798 5' + hopper 1019 1 75.25 AGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATT:1 - chrX 21668080 5' + Tabor 6866 2 52.48 ACCAGGCATCCTGGATCTACAGCCATACTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chrX 14371340 5' + jockey 57 1 70.30 ATATAAATCCATGAATAGTTGAGATGATATCGACGAATATATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr2R 5773412 5' - pogo 2069 1 61.00 ATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 + chr3R 19450176 5' + roo 8709 2 59.41 CCATCTAAAAAAACACTTCTCACCGAAGCATAACTCAACGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATA:1 + chr2R 2943551 5' + 1360 3210 1 62.38 TATGCTTAATGTGGTTAAATGACGTTGTGGATTTCAATTGATTGGGTGGATGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 + chr2L 15151863 5' - Tabor 7300 2 54.46 AGACTGATTACCTGATACAGGCAGAGCTTTTTCCCTAGTCAACTTGTAACAAATTGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr2L 9129116 5' + 412 7074 2 58.42 CGTTTTTCTGCTCGACGAACTGTTTAGTTGTCGATGCTCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAATG:1 - chr3R 19734581 5' - accord 7026 2 71.83 AGGTTACGTGAAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAG:2 + chr3R 11080663 5' + I-element 4 1 74.26 ATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:3 + chr3R 19450158 5' + roo 8691 2 77.23 CCTTTGCAAAAAGCGACGAACTTGCAGGAGTGAAGAAAGTCACCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAGAT:1 - chr2R 15402916 5' - roo 381 1 52.08 CTGCTCCTCCGCCCACTCTCTCATGTACTTATTCACCACCCACCCACTTATGCACACACAAGCACTCAATCTGTACAGTCTGTAATAAACCAATATATGCC:1 - chr2R 9258690 5' - blood 378 1 79.21 CCGTCTTAAATTGAAATAGAGGTCAGTTCATCTTCAAATCTCGCTTTATGATTCTTCATTTGGATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 + chr3L 10305297 5' - 412 7537 2 69.00 CCATCTTCGTTAAATTCCTTGACAACAGATACATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACG:1 + chr2R 21249459 5' + gypsy 7030 2 68.32 GTAATGTGTGACTCCCTCTATTTCCCCAAACTGAAAGCCGTCGACGCAGAAGGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1 - chr3R 5555986 5' - mdg3 5475 2 56.44 TGTTTTCATTTCTATCAATTTTAATCCCAACAAAGTATCAAATATCGTTTAAATCCGCCATATTAAATTTTGTTGAAAACGTATTGTTAGTCTCTAAAGTA:1 + chr3R 778479 5' + Doc3-element 4680 1 77.23 TGCAGTCAAAAAGAACAGTGCTACAATTGCCTATATTTTTTTTCAACTCGTATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 + chr2L 22342234 5' + F-element 47 1 60.40 ACCAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATAT:4 + chrX 21667988 5' - Tabor 7310 2 60.40 ATCGATATTGCCGATAATTTGGATCGGTATCATAATATTTTTTGTATGTATTTGAATGCGAACACGAAATTTGTTCATTCTTCTGGGATATCGATAGATAT:1 - chr3L 25872631 5' - INE-1 498 1 57.43 GATTGTCGGAGGTCAACTTCCTTTCCGACTTTCCACTTTGTGCCCCCATTTATGACGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:2 - chr3R 21198684 5' + Tirant 21 2 60.40 CAGACGCGAGCGCACGAGGCGGATGAGATGAGATGAACGCGCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 + chrX 9650711 5' - blood 169 2 59.00 GCCACTTACCGAACTGATTGCCCGCCATTTGTTGGTGGCTTGTTTCGTCTCTATGGATTTTCTTTTCCTTTTGGTTATGGCGG:1 + chr3R 20429938 5' - TAHRE 272 1 57.83 GTCAGTTGATTTGCATAAAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chrX 10196076 5' + 297 6596 2 55.00 CGGAATGACGTAATATTGTTTTTTAAAGAAATAAATATCTGCAGAAAAAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 9199836 5' - roo 9045 1 54.46 AAGCATCCGTACAACCTGAAGAATAAGTATTCATTTCAAATTTGATGGTTAAAAATACAAATTTTCGACGGCGTTGTTCAGTATTGTCCAGTAGGGAGATG:1 - chr2R 3338856 5' - G7 1004 1 61.39 GTTTTGGCCATGTTTCCATATCGCCCATTTGCCTACGCCCAACTCAATGCCAATCAATGTCACGCTGTAATGATGAACTCCCCTTAAGAACACAAGTCCGT:1 + chr3L 15056904 5' - 412 479 2 64.36 AATTATTGAGTTATTATACAAAATAAATAAGTGCAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTT:1 - chr2R 20010148 5' + Ivk 44 1 66.34 TGGGTTAATTCATGGTCCACTTTATTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 - chr3L 735082 5' - mdg1 369 2 74.26 AAGAAAGTATATTAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATA:1 - chrX 21668104 5' + Tabor 3 2 76.24 AGTGGTGAATGGGGCGACTTTTGCGATTCACAAATCGTTGGCACGCATCGGGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAG:1 - chr3L 12217385 5' - roo 9047 1 53.47 AGTCGCTTTTAATGTGCGCCCAAGCATTTGTTTGTCTGCGTCTCAGCCTCCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATATA:1 - chrX 2841725 5' + accord 186 4 79.00 CAAACAAGCTTTTAAATGAAATTTCTGCTGATTATGTAACAAACTGAAAGCGAGTGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTT:2 - chr3R 23870174 5' - roo 9068 1 75.25 CAATCTCACTATACCGATAAGAGTGTCGTGGGCCGCGGGGAAATAATAAAGAAAAACCATTAACCTTCCAGCTCATATACAGGGTGCGGCAGCATAACTTC:1 + chrX 22680885 5' + mariner2 1 1 55.45 TGTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTA:1 + chrX 9816273 5' + BS 5035 1 72.28 ACCTAGTGGAAATCGCAACAAACAAAACAAAACCTAAACTCCACCACAGATACAGAGGCGACAACGAGGTGACTCTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAAC:1 - chr3R 7302812 5' + Chouto 480 1 59.41 TAATTATTACCGATATATTTTTAACTTGGGCAAATAGCAACAAAAATAAGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3R 7015440 5' + roo 8689 2 54.00 TAGCAAATTAAACTGAAATAATAACGGACGAGAAACAAAAATAGGGGCCCTATGCATTTATATACTTAGTATACTTATATACTACACAGAATAGGTATTCG:1 - chr2R 4023838 5' - Doc2-element 146 1 60.40 CCAAACAATAAAGTAGTTCTTAATCTAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 18977920 5' - roo 359 2 76.24 TTTTGAAGTGTTGCTCAGAGCTGTCGCCACTTTGCTTTATCTAAAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAA:1 - chr3R 13619908 5' + Doc 410 1 56.44 TAGTATCCCAACCCACCGCCTTGCTGCCACAGCAAAAGATGCATGGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:2 + chr3R 17980739 5' + HMS-Beagle 28 2 57.43 CGCTACATTTAATCTAATCTTGAGCAAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr2L 9672396 5' + 297 6592 2 66.34 CCATCCATGAAACAAACCCAAGCGACGGTGCAATTTTCCACTTAATCATATACTAGAGACACTATTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr2R 5753393 5' + P-element 9 2 66.34 GAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGACACATACAAACACCATTCAATGTCAGATGGCTAGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:3 - chrX 12649914 5' - hobo 2921 1 60.40 TTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:2 - chr3R 19513394 5' + jockey 4713 1 71.29 ATAGTGAATATATGAGCAATCGGCAAATTTCTCTTTTTTTATTTTATAATACAAATAAAACAAAAGAAACGAACAAAATCAAGTACAAATTGCTTCACAGG:1 - chr3R 2941546 5' - accord2 7232 1 52.48 TTAATGATATAATCCATTGAGGAATTTAATATATAATTATTTTAAGGTGGACTGAATACTTAATACAAATAAGAAGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chr2R 3532646 5' + F-element 86 1 71.29 AGGGTTTCACTCCTTTCTGCTGATCAATAAAACGGAAGCTAAATCAATTAGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 + chr3R 25514103 5' - hopper 1392 1 56.44 GCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCA:1 + chrX 21668023 5' - Tabor 436 2 71.29 TGTTTGACTTTTGCAGTACAGGCAGGTACACAGAGAATAACATTTGGATTTTTTTTGTCGACTTCCACTTCTTTCATATATATTTTAATATGATTTTATTT:1 + chr2L 4086691 5' + transib1 1887 1 66.34 GATGGGCCCAAAGGAGCACCCAGTTGGAAACGGCCGATGACCTGCGTTCCAACTCCGAAAGTCCTCGGAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAG:1 + chr2L 1936502 5' + blood 295 2 72.28 ACGGGCAATTAAAAAAAAAAACAAAGCCATGTCCGTCCGGTACGGACCGCTGCTGGCCTGGCAACAAGTTAAAAATAACAAAAAAAAAAGGAAAA:1 - chrX 12056917 5' + Bica 337 1 72.63 AAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCT:1 + chrX 14317415 5' + 1360 51 1 69.31 AGCACTCTAAAACTTGCACTACATGTATGTATCTCCAATTTAATGGATGGCGCAAGAGAAAGGACTTATTTTTCTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 12953160 5' - BS 5119 111 49.48 ATTAGCGGCAATGAGCTGTTGCCTCTGCTGCCTCCAAAGTTTCGGTTTCAGTTCCAGAATTCTAGACACTACTTGTACTTGTATGTACATATATATATATA:1 + chr3R 30301744 5' + invader3 5087 1 79.21 AAGGAAACTCAGTTATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr3R 19515882 5' + 412 7074 2 58.42 TGGGGCAATACCAGGAAAAAGAGGACGACAGTAGTGGCGACGAACTGATAGCCCAACCATCATATAATAGCGAAAAGGCACTAACACATATTTATCTGTGT:1 + chr3L 24871364 5' + Porto1 112 1 51.49 CGGGGACACGACATCACGGAGCGCCACACAGGCGTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATC:1 + chr3L 13652186 5' - mdg3 5455 2 67.33 GTAGGCAACACGCTTTTTTTGGCAAAACGGTTCGCCGTAATTGATTGCCTCATTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 - chr2R 18983734 5' - jockey 4973 1 52.48 GTAAATTTCTATCGATTTGCAAAAAAAAAATTTTGCTGTGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAG:1 - chr2R 5667271 5' - gypsy5 6960 2 66.00 CATTAATTATTTGGAATTGTTTTGTCACAGTCATTTGAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 - chr3R 25526399 5' + transib2 39 1 63.37 GCCAGCGACGCCTAAAAAGCGGCAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2R 17277651 5' + jockey 12 1 54.00 CTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGT:1 - chrX 21945911 5' + F-element 60 1 76.24 ATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr2R 17348595 5' + jockey 57 1 78.00 TATATGAACACTTCATTTTCCATTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 23283825 5' + roo 48 2 76.24 CTGTATGTGTATACAACAAACACAAGTGAAAATCGATTCGCGACAAGATAGATGCGATATAGAAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATTAATATAATGTAAAA:1 + chr2L 17382596 5' - Cr1a 4326 1 68.32 GATGTGACTTGGATTTCAATATCTTCCTCTCAGGTACTCCACACATACATCTGATAACAGTAATTTGCGTTCGCATTTTCACTAGTTGAGTATCGGGTATC:1 - chrX 22634374 5' + INE-1 541 1 74.26 CAGCAAGGATATTTCAAGGAAAGATGTGGGGACCGTGTGTGCTGCTGCGGGCGGCACTGGCTACGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCAT:1 - chr3L 24208780 5' - HMS-Beagle2 6958 2 67.33 GGTTCACTGTCTGCCTGCATATGTATGTGTGTGTTACAATGCTAAAGTTCTTAGAATTAAAGTATCTGACATAGCAGAAAGTATGAGTATGTTTATAAGTA:1 - chr3R 5103656 5' - ZAM 204 2 82.18 GTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTATGTGCTTA:1 - chr2R 3341938 5' - Dm88 4123 2 67.33 ACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:5 + chrX 17492886 5' + Tirant 32 2 58.42 GGCAATTTAAATTCGTGAAAATTTTGATGAATTACACTTCGTAATATATATGGAATGTTTCGTTCCCACAAGCCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACT:1 - chr3R 16399035 5' - roo 9069 1 70.30 GCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr2L 18417315 5' - roo 9028 1 69.70 TACTTCTTCATTTCAGTGCTAATGAAAGTCTGCAGCACAAATATTTGTAGTCGAGGGAGTTGCAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr3R 9328656 5' - hobo 2925 1 60.40 CAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCATGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 + chrX 17492908 5' + Tirant 8161 2 78.22 CTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCACATACCTCACCTTG:1 - chrX 22664420 5' - opus 457 2 70.30 AACTCAATTTAAGCATTGCCGCCCACTAGAGAACATCCGTATCCAGTTCCATTTCCAGTTCCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCA:1 - chr2L 15151957 5' + Tabor 15 2 64.36 CACTAGAGCATAACACATTATGCTTTTTTATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:2 + chr3R 19515773 5' - 412 7543 2 75.25 TTTCAATTGAATAATAAAAGTAGTAATGAAAACGGTGAGTTTTGAAACTATTTTTGTTTTTTTTTTTCTT:1 - chrX 8668613 5' - Doc2-element 248 6 77.14 TGTAAAACACATCTCCCTTTAGCTTGTATCATGCGATCAGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 + chr3L 23288139 5' + I-element 15 1 47.00 CGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTCACATTTAAATGATCTGCGACATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACAC:1 + chr3R 3985678 5' + gtwin 16 2 63.37 GAGAGCAAAAAATGTTCCAAATAGCTATTAAAGTTATGGATTTACTTGTAAGATAGGACTCGAAGATAATATATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chr3L 3862556 5' - hobo 2935 1 53.47 ATATATGGAAAAAGTGTCCAGAAAAGTCGTGTGTAGAAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2L 15798688 5' + roo 8697 2 64.21 GCTTAATCCTCGAGTGCCCGAGGGGCTACAATGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 + chrX 21219437 5' + roo 45 2 72.28 TCGGTGGAAACCATACTTAATAAGATAATCACTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3L 4539165 5' - roo 9030 1 67.33 AAAAATGTGACGATATAGGCTCTCATACACGGCACTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGC:1 - chr2L 156637 5' + 1360 42 1 67.33 TCACCGTTATTATGTTTTAGCCATCGATTAGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:1 + chr3R 6136502 5' + Burdock 6179 2 71.29 AAGAAATTGAGCGTGCTGCGAAAACTAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGT:1 - chr2R 1725967 5' + Doc 7 1 78.22 AAGAAAAGCTCGAACATAATGGCAGTGAGGAAAAAACTATTTGAATTTAATTGGGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAAC:1 + chr2R 3521970 5' + copia 4892 2 56.44 GTAGAGAAAGCAGAAAGCCAATTTTTAATTATAGTGTTAGTTCTTCGTGACAAAAACACTCTCACACACACACACACACATATTCACACATACTGCG:1 + chrX 5251518 5' + accord 197 2 78.35 TCTCTGTATATTTTTATACCCATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATG:1 + chrX 15408720 5' + INE-1 505 1 88.12 AACAATATCAATAATTTTATTGTTTTTAACATTTGAAATATCTTATAAATATGTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chr2L 20823376 5' - opus 479 2 58.42 TCTGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr3L 14504278 5' + 297 49 2 76.24 ACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTTCTTTGT:1 - chr3R 2533951 5' - gypsy8 160 2 51.49 GGAAAATGTAAATCTTTTCCCAAACAAAAAAATAAAGTATAAACCCATTAGACTTTAGTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCA:2 + chr3R 11912088 5' + I-element 61 1 49.50 ATGAAGTGGAAATGGAATTGAAAGCGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGG:1 - chr3R 19513435 5' + jockey 4672 1 75.25 ATTGTCCGTAAGCTAAGCGAACTTTAAGCTAATTGCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr3R 20183034 5' - roo 9031 1 67.00 GCAAAATAATATAAACACACATTTATATATGTATTCCATATGAATGCTATGCTATAATCGAGTACCCCGAGTACCCGTTACTCAGCAAGTGTGAATGCGAA:1 - chr4 869978 5' - INE-1 531 1 59.41 AAGCGAGTGAATGAACAAACTACTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 - chr2R 10334793 5' - pogo 2050 1 77.23 ACGGGAAAAATTAAATTAAATTGCGAAATGCGGAGCGAGAGAAAGAGAGAGTAGCATTCGAAACGAAAGGGACGGCGGACGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCT:1 + chr2L 19684565 5' + mdg3 5251 1 81.19 AATCCTGCATTCCTCTGTATTTTCCTCACCCAACTGATTGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAAT:1 - chr2L 16379273 5' + HMS-Beagle 6646 1 61.39 TAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATG:1 - chr3R 15790092 5' + flea 4717 1 70.00 TTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGT:1 - chr3L 27395589 5' + invader4 175 2 76.24 CCATCAACAGACTTCTATAATTGTAGCCCAACGTAGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAG:1 + chr3L 23876759 5' + F-element 285 1 65.35 TAAGTAACAGCTTGATATCTGTTTTATAGCCATTTAGTGAAAATATCGTTAAGAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACCTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2L 10104258 5' - roo 387 2 53.47 GGCAACAACCTCTGAAGTTTGAGTTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTCCTCAATTCTCACTCACATTTGTAATTAGTCTTAAG:1 + chr3L 24863190 5' + McClintock 6215 2 78.22 CTCATGATTGATTTTTTTTACAGACTTAATTACAAAGATATTTGGACTTGATTGGTGGACTAGACACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGT:1 - chr2L 23232636 5' + invader4 2741 1 59.00 CTTATGCCCGCCCGTGCGCCAATGCTACAAACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATAT:1 + chr3R 21591967 5' - Bari1 1662 1 70.30 AAGTATTAATTTTGGTTGCCTTTTTTATTGGAAAAGAAAGTTGTACCCCCAAAAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCT:1 + chrX 157679 5' - I-element 5205 1 67.33 CAACACGCAATGTGTAATAGTTATTTGATAATCTACCTGTTATTGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACG:1 - chrX 5121955 5' - accord 7083 2 56.00 GAATTCTTTTAATTGAAATATGGACATAGAAGGAATCTAGATTCGGCAATCCGAGCTTATTTAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chr3L 15869746 5' + pogo 10 1 69.31 GTGGGGAACACGTAGAGGAACAACAAGTGCGGTCACCTATAAGGATGCTGTACACACATGAACACGAATATATTTCAAGACTTACAATT:1 + chr3L 3535380 5' + roo 8684 2 48.31 ATTAATCTCAAGAATGCAGGGAGTTATTTGGAAGTTGTATTCGTATCTTCCTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTA:1 + chr3L 27863835 5' + rover 19 2 61.39 AAGCTAGCTGTCACACTCACACACACACACACACACACACACTGGG:1 + chrX 5107986 5' + accord 7104 2 69.57 GGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAATCTAAAGC:1 + chr3R 11080689 5' + I-element 30 1 52.48 GATGACAGTGGAAAACATCAACATAAAATTTGTGTATTCTCATTTATTGTCTTCTCCAAAAAGTAGATCGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3L 25412156 5' + 1360 4 2 69.31 CCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTA:1 + chrX 21564091 5' - invader4 293 2 58.42 AAGTGTGATGAAGCAACAGAGAAAACGACATTAGCTGGCTTTATTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGA:1 + chr3R 31431490 5' - Tabor 7292 2 53.47 AATGTCAGAGGTCTTGGGCGGCTGGAAAATACGTAGTTTTTCCCGACAACTACAATGTGTAGTTTCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr3L 15729590 5' - hobo 2937 1 75.00 AGAGAGAGTAGCATTCGAAACGAAAGGGACGGCGGACGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATATAT:1 + chr2L 19684608 5' + mdg3 42 2 66.34 GATACCAAATGAGCCAGCCAAATGAGCAACTATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAAT:1 - chrX 7619727 5' + I-element 5111 1 69.31 TATAAAACAAATTTAAGGGATCAGAAACTTTTTAAGATTTACGACACGACTGATCTATTCATACATA:1 + chr2L 22077553 5' + Tc3 1628 1 94.03 TGACTTACTTAAACAAGTGAATGCATGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chrX 21945945 5' + F-element 26 1 59.41 TTTCCCAATTGCTGATCAGAGACCCATTCTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGC:1 + chrX 157014 5' - I-element 460 1 73.27 TAACTCTGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:2 - chr3L 14504282 5' + 297 45 2 72.28 CAGGTTAGCGGCCCTTGCACGCGATGTTGTGTTTGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr3L 9190441 5' - 412 7526 2 58.42 CATGGGACTATACTAGTAACCCATATCGGACACTTTGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGT:1 + chrX 7088245 5' - Doc 471 1 66.34 TACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 19450159 5' + roo 8692 2 76.24 GTAAACACAATTAGTATATAACATATTCTAGTTTTACAAGATGACAATTGTTTATAACTGGTTGATAAAATAAAAAAAATTTAAACAAATTTTATAAAATT:1 + chr2L 16256712 5' + gypsy3 483 1 53.47 TCACATTTTATATAATCTAATCTCTATAACGTCGTTAACCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAAC:1 + chr2R 3514754 5' + F-element 4402 1 61.39 GAAGGGAGGGTAAGTGGTGGGGAGGCTAGAAGGACCTTGAGGAGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAACTCCTAGAAGTAACAAAAATTGCAGA:1 + chrX 14318629 5' + I-element 425 1 57.43 GTTGTACGGCATTGGTGTGGTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 15227362 5' - roo 395 1 64.36 ATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAAT:1 + chrX 21668003 5' - Tabor 456 2 51.49 TCGCTCACCATCTACCTCTCTTTTCAAGAGAGCACGTTGCAAAGACGTTCAGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chrX 14953660 5' - P-element 2862 1 55.45 GAATGACTAACTGCATGACAGTTTAGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTAT:1 - chr3R 24494424 5' - hopper2 1560 1 70.30 AGAGTTCGTTAGCCACCAATCGTTTTTTTACGTTTTGGTTATTGTTAGCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAG:2 + chrX 157185 5' + I-element 4 1 73.27 AAAAGTTGTACGGCATTGGTGTGGTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chrX 15227366 5' - roo 399 1 68.32 AGATTGAAAGGAGTCAGGAATCTCGCAAGATGGTTAGCGTAGGTTGTCCTTGTGGAACACCCTCCCCTTTATTAGAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGC:1 - chr3L 25882605 5' + Doc 490 1 80.20 CTAAAAGATGTGTCTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 + chrX 5130970 5' + I-element 14 1 64.36 AGACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGG:1 - chr2R 2994307 5' + gypsy8 4768 2 46.53 AAAAACTTATACAGATAGCGCGGTAGGCAATTAGTTTGTGGAGTGCAAAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTC:1 - chrX 13845662 5' + Doc 376 1 54.46 AAAGATGCACGGAGCCTTTCCGTGATAGCTCGCTAGCTCAACCTTTTGACGGTTACATTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGC:1 - chr3R 2136300 5' - I-element 412 1 70.33 CCGGTTCGGAATGACGTAATATTGTTTTTTAAAGAAATAAATATCTGCAGAAAAAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:2 - chr3R 9199842 5' - roo 388 2 54.46 CCACTCCTTGCCAGCGGAAAATCTAGCGAAAATAAGATGTAAGCGAGGGCAAGGAAAAGTCAAACCACTAGTGGAGCGCCAGAACGAACGGGGCTCCAAGC:1 + chrX 8028173 5' + Juan 215 1 64.36 CGCGCAGTGTATGTATTGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGGTGCAAGTAAATAATTACAATTTA:1 + chr3L 24210869 5' - HMS-Beagle2 314 1 79.21 GAGAATGTTTTGGAGAACCGCTGCTGGGGGAGCAGCAGAACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 + chr3R 20430762 5' - hopper 1375 1 66.34 GGGGCTGGGTTCTATCCGAGGGATTGATGGACTGTTACGGATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGG:1 - chrX 9182039 5' - I-element 5069 1 70.83 CATCCTCTTTTCCACAGCCATCAAGAGCACAGCCCTCTTTCTCCTTGGCTATATTGCAATTTTTACTGGCAATTCCCCAGAGTTCCATTCCATACGTCCAT:1 - chr3L 10814438 5' - Porto1 4268 1 63.37 AGCTTATGTCATTCGCCTTGTCGTCCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr2L 4868545 5' + blood 7063 2 78.22 CGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 + chrX 5130997 5' + I-element 41 1 61.39 CTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGC:1 - chr3R 15790057 5' + flea 4753 1 76.24 ATTACTTAGCGATCATTATCTAGGACGCCTTTCAATGAGTTTCAATCAGAAAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATAT:1 + chr3R 19515989 5' + 412 7481 2 58.42 ATAATACAAATAAATCAAACCCAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATGCATTGTGACACTTTGTTGC:1 + chr2R 2144962 5' + Stalker2 56 2 74.26 TTTGTTTGTTTTTGGGAACTTTTCACATCAACTTCTTTGGTGGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr3L 10576791 5' - roo 9036 1 62.38 TTTCAAAAACAAGAAGAGTTGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTC:1 - chr2R 17402795 5' - invader4 3063 2 58.42 TAAGTACCTTCCGACCTACGACGGTAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGAT:1 + chr2R 964830 5' + I-element 337 1 75.25 AGAGGACCGTCATTTAACACTCTTCTTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCCAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACA:1 + chr3L 26309917 5' + mdg3 5341 2 73.27 GCTGCTTGCTATTTCATATTTGAACAAGGTGAGGCTGTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr3L 9190514 5' + 412 40 2 64.36 TTTTAACTTCATAAGAAACTCCAAGTATCCTGTAGCCATTAGGGTATTTTTCGCCGCAGTCAATTCTCACACACTAAGGATTCGCTTGGGAGATGAGCAAT:2 - chr3L 8256167 5' + jockey 8 1 74.26 CTTTAAGTTAGTTTTGAGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATCGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr3L 3535481 5' - roo 409 1 75.25 TTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTG:1 + chr3L 24210922 5' - HMS-Beagle2 261 2 74.26 AGCAGCAACAACAACGACATCAGCTAAGTCAAAACAAGAATTTTCTGTTTATCCAAAGACACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr3R 8165793 5' + 297 6595 2 97.03 ATGTTATATCCTGTACTTCGGTGGAAACCATACTTAATAAGATAATCACTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 4539148 5' - roo 9047 1 53.47 TATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr3L 3535445 5' - roo 9036 1 60.40 TTGACCAACAAAGCATATAAGATCTTTAGCCCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 21393467 5' - roo 9028 1 69.31 CGTGGCAAAAGTCAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTA:2 + chr3L 5267205 5' + Juan 3991 1 57.43 TGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAA:1 - chrX 9816309 5' - BS 5046 1 67.33 GGTATATTATACTTCTTTTTTTTATGCATTTCTCCAATTTCATATAGAACACCTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGG:1 - chr2R 3822255 5' + Max-element 8260 2 62.38 GTCAAGATACCAGCTATTGTGGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTAGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGAACCCCGTTTTTT:1 - chr3R 30641825 5' - hobo 2885 1 71.29 AGAGCGGGAGACACAAACCGATTATCTGCCACAAAAATATGGCCGCTTCCGTAAAAATTGGCATGAAAAGGATATGTATGTGTATATGTATGTGTGTGTGT:1 - chrX 9435558 5' - Quasimodo 43 4 70.30 TTAAAAGTTGTACGGCATTGGTGTGGTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chrX 15227368 5' - roo 401 1 70.30 GGGCATTAAAGGGAATTACTCGAAAAGTCCTCTCACATGCATTCTTTGTTGAAATTCAGATGTACTCTTTTGATTATGTAACTATAAAAGCTAGAAGGTTG:1 - chrX 20806524 5' + INE-1 159 1 67.33 AAAGAAATAACTTTCTATTACATATGTATTTATTTCCCAGTAGCATAGTGGAAACCTTAACTCACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAA:1 - chr3L 17698216 5' + flea 4607 1 54.46 ACATATTGACCATTTGTTTATGCTCTTATTAATTTATTAGCGAGTAATATATGCGACACACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 11276613 5' - roo 9055 2 60.40 AGGGCCAGCTTTGTTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTT:1 + chrX 11503468 5' - roo 9036 1 62.38 TGGATGCCTGTTATTGTTGGTGCGGCATACCTCAATCAAAGCATGTGCCACACACATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACAT:2 + chr2R 18078674 5' + Quasimodo 11 2 69.31 ATGTGAGGTACGTATTTTCTTTGAAGCGAAATATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATA:1 - chr3R 19131980 5' - diver 180 2 69.31 AAATATTGCATAATCTCCAGCTATACTTCCTTCAATCCGTTTACGTTTTAATTACAAAATTAATATCAATTCTGATCGATGAAATGAATTTACATTGTACA:1 - chrX 6911387 5' - 1360 3154 1 70.30 ACTTGGCAAAATATTAGGACACAGGAAAAATATATTTTCAAAATATAGAACACACACACTCCAGTGTGTATAGACATTAGATAATATGATGAAGAAGGGAC:1 + chr3L 8038929 5' + invader4 2966 2 53.47 CTCCCATGACTTCGATCACATTTGGCACACTTACATCAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr3R 11153559 5' + 1360 10 2 61.84 TTCTGTAGTTTGCTTCCTGCTTGCCTTTAAAAATAACTCATTTAACAGAAATCGTTTTGTTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACGTTTTTATTACAT:1 + chr3L 2787796 5' + Cr1a 4267 1 66.34 ATAGTTTTTATTGAAAATTATATCAACTTTCGATCATAAGAACACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:1 + chr3R 18144462 5' - blood 7355 2 60.40 GGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGC:1 + chr2R 17942109 5' - mdg3 5444 2 78.22 ATCCGGTGAGTTTAAGGATCGAAATGGATACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTCGGC:1 - chrX 2742544 5' - hobo 2897 1 67.35 ATATTTATTTTGGTAACAAAATTAAATATAAGGGGCGGTGCCACGCCCACAATTTTTGGTATCATATAATTTTGATGATGTTATTAATTTTGGCCACAAAA:1 + chr2L 15332530 5' - Transib-N1_DM 23 1 63.37 GCTATGCATAACTTTCCTAGCTAATTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTA:2 + chr3R 21710576 5' - mdg3 5446 2 72.28 TCTCGAGGATTGAGAAGATCAGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 - chr3L 12025641 5' + blood 7066 2 80.00 AAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 - chrX 21945935 5' + F-element 27 1 56.52 CTTATGATTTTGAACTTTATTTATCGTTTTACTTAATTGACCATGGCTTCCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTG:1 + chr3L 8047788 5' + mdg1 479 1 55.45 AGAAGATAAAGCCATAAATGCACGAAAATGAAAATAAATAGCAGCCGGTACCAGGACACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chrX 12193544 5' - hobo 2922 1 60.40 GGCCAGCCTGCGTGGCATATATGTTTATCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCCCTATATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCG:2 + chr3R 3673417 5' - rover 7280 2 61.39 CGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGA:1 - chr3R 20240930 5' - Tabor 441 2 68.32 ATTATAATGTGGAAATTATTGAAATTACCACCACTAACTGAGTAGCTGCCAGTTAAGGAGCTCGTATATAAATATATATGTCGAAGAGTCATGAGAATGCC:1 + chr3L 18122272 5' - invader1 4010 2 76.24 CCGCATCCTCGTGCTCCTATCCTGCTCTCTTTGGGCCAGTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chr3R 28135274 5' - hopper 1376 1 63.37 CAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chrX 5168858 5' + hobo 43 1 65.00 TAGGCAAAATTATTTAGTTCCTATTTAGTTTTTTTTAGTAATCTTAGTATTTCTAATTGTACTTTAAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTTCTTGTGTGAGT:1 + chr4 142884 5' - 1360 3256 1 61.39 GCAATCAGAAAAACGACAGTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGGCGAATGCTAAAGCTGAACAC:1 - chr3R 2459584 5' + invader2 5021 2 79.21 GGTCAACTTCCTTTCCGACTTTCCACTTTGTGCCCCCATTTATGACGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:2 - chr3R 21198674 5' + Tirant 8138 2 53.47 ATGCACGCTCTAATGGACTTTGAAAGGAAAAGGGAAATAGCCGGACAACGTCGAGTTAATAATGCATGCTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGG:1 - chr3R 26198027 5' + jockey 4766 1 69.31 AGCGAGTGAATGAACAAACTACTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chr2R 10334792 5' - pogo 2049 1 78.22 TCCTTTTTAATTTTATTCATAACTTTATTTTCAAGATCTTTTATTTGATTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACT:1 + chr3R 1927201 5' + copia 4898 2 55.45 CTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr2R 17348614 5' + jockey 31 1 56.38 TGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTG:1 + chr3L 24210908 5' - HMS-Beagle2 7158 4 60.40 GAATATTGACTTACATTTCCAAATCTTAGGTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2R 12998288 5' - roo 386 2 54.46 ATAACCAAGCTGGCTTGGATTTGCAATAAGTGGGAAGTACATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTATAC:1 - chr2L 16758324 5' + Max-element 8273 2 61.39 AACATTCATTTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chrX 21219500 5' - roo 9051 2 58.76 CAAAACAATAAGGCAGGTAATCAACCCAAAATCAATCGAACCAACAACGGCAATGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCA:1 + chr3R 7598809 5' + I-element 441 1 61.39 AAATACAGGTAAAACCCTTCGTTAAAATGTTAAATGCATCTAATAAAATACAAAAAAAAAGGTATGTTTTATGGTCTAAATAAATATTGT:1 + chr3L 20023632 5' - Transib5 2735 1 66.67 TTTACTACCGAGTATATAGGGAGGCAGGGGTAGCTGATGTATTCCTACAGTAGTTGACCCTAAGTAACTCGATTTCTGCTACCGGCTTATTCCAGTTGGTC:1 - chrX 7628389 5' + Chouto 214 1 77.23 GTATTTCTGCAATTTATTGATTTATTACAGTGCATATAGAGCGCATAATTTATTACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 - chr2L 3483587 5' + I-element 20 1 60.40 GCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 + chr2L 9672430 5' + 297 45 2 74.26 TAAATCTGTTTGTAAAACCACATGACCAACTTCTTCGACTTGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chrX 20835277 5' - roo 9039 1 58.42 ATGGGTATGCTTAAATATGCATTGCAAAAATGTAAGCTGCTTTCATTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr2L 5654904 5' + roo 29 2 56.00 GCCAGTTGCAAATAGATTTCACGCTTTGTTTTATATTCCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTT:1 - chr3L 21998474 5' - roo 372 1 58.42 CCATACATTTCATCACCCTTATTACGGTTTTCGATGGTCTAGGGATGACTGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3R 9328747 5' + hobo 25 1 52.48 CTTCGACAGAAGTTGTCTCTTTCCATCTACATATTTATGTACATATATATAGTATAGCTCTATCTCCACTAAGGAGAATAAAATAAGAAACAGGACCATTA:1 + chr3L 13646402 5' + mdg3 5164 1 63.37 GAACGTGAGTGTTTTGTTATGGCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 + chr2R 7307871 5' + 412 55 2 78.22 GTTCACGCTGGGAATGGCTTGCGGTTGCCTTTGGTGGCATAAAATGCTTACATATACATATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATT:1 - chr3R 25859446 5' - Stalker2 7633 2 61.39 TTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCA:2 + chrX 21564104 5' - invader4 3039 2 70.30 GTCTATTTTGTAGGTTTCTAAGCCAAATATTAAAGCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:2 + chr2L 12246582 5' - hobo 2900 1 64.36 AAACAAGTCGGTAACAAACAGGAAAATGTAAATCTTTTCCCAAACAAAAAAATAAAGTATAAACCCATTAGACTTTAGTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 + chr3R 11912068 5' + I-element 41 1 69.31 CAGATTCCGTTTTTCCAAAATTTTCTTTGTTTCGCACTGCTTCGCCTCCTACAACACTTCCTCTTAAGCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGT:1 - chr2R 441138 5' - 297 388 2 57.43 TGAGTGAGTTAGAGGGGTGCGGCATGGGTGAGAGATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAA:1 + chr3R 11389781 5' - hobo 2590 1 66.34 GTACAAAAGTCAGGCTGCTGCTGATTGCAAAAAAATAAGAACTTACAAGTCTCGGGTGCCTGAAAAGAGGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGAAGAGA:1 + chr3L 25479255 5' - Cr1a 4244 1 69.31 GTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chrX 12866504 5' + hobo 46 1 73.27 CTATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 9616602 5' - roo 358 2 74.26 CCGGCCCTTTACTTGCGAAAATCGGAGGAAGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGGGCAGTTCTAGAATGGGAGGAAAGTTTGAGAATTTTTTGCCTGCGAA:1 - chr3L 21049189 5' - Gypsy12A_LTR 2000 3 81.00 TGTATCACCTTTTCTTATAGATATATAGATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 - chrX 8326347 5' - opus 7454 2 76.24 TATTTTCTTCGTACAAAATATAACCACGAACCATTTAAAGGCTTTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATAC:1 + chr3R 25859359 5' + Stalker2 38 2 56.44 CCGTTAAGTATGCTATAGTTTTTTCTTAGGTTTGGAAGGTCTATTTTGTAGGTTTCTAAGCCAAATATTAAAGCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chr2L 12246544 5' - hobo 2938 1 45.54 ATTGTCGGGCGCCGCTGGGAGCCAATTCTCGAGGATTGAGAAGATCAGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 - chr3L 12025667 5' + blood 7041 2 54.46 GATTGGCGATGCTCATGGTTTACTCCGGTTTGTGCTCGAAGTCTTCAGATTTTTGTGAGATCTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTAC:1 + chr3R 851534 5' - F-element 269 1 66.34 TCTGTACGCTAAAAGTGTCCGCCGAAATAAAAATGCTAGTGCGAAATGGGCAAACCGCCCAAAACTGCCACGACCACACTTTTGAAAAATGTGTTGATATT:1 - chr2R 9747987 5' + INE-1 264 1 52.48 ATTGAAATATGGACATAGAAGGAATCTAGATTCGGCAATCCGAGCTTATTTAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 15869735 5' + pogo 20 1 59.00 GGTTCCAGTGCAACATTATAACATAATCCGCATAGAAGGACTTCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTA:1 + chr3R 16110173 5' - mdg3 212 2 63.37 GAAAGTTTATTTGTGACTGAATATCTTCTAGTCTTCTTACACTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr2R 4166422 5' + jockey 37 1 57.43 AATGCAACTTTAACATAAAATTAACCTTCATATCATCCAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGAT:1 + chrX 21559252 5' + invader4 2795 2 56.44 GCTGTGCAAAATATGGATTTATTATTGCTTATGGCAACCGAGGCAGTAAATGAATTTTCGGGAGATACATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 + chr2L 18300678 5' + Tirant 5 2 76.24 AATTGGTATGATAACTTTGGTATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 - chr2R 21833953 5' - 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chr3L 15353572 5' - mdg1 7411 2 74.26 ATGGACATAGAAGGAATCTAGATTCGGCAATCCGAGCTTATTTAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3L 15869727 5' + pogo 29 1 57.43 TATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACGTTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCA:2 + chr3L 26371360 5' + Tabor 56 2 82.18 TAATCTTGAGAACTATGTCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGC:1 + chrX 22726197 5' - Helena 1271 1 44.55 GTCTACAAAATAAAAATAAGCACTGTTCAAAGAAATAAGAATAGCAAGGTGGCGAAATCCACATAATCCACACAAAGAACGCGTGCCAACGCCTACACAAC:1 + chr3L 25008179 5' - R1-2 2981 1 71.29 GCAAGTATCGGTAAAAAAAATTAATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGAC:1 - chrX 21801646 5' + gtwin 6966 2 72.28 CCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:2 + chr3R 19450165 5' + roo 8698 2 70.30 CATATCTGCCTCTTAAGTTGGTTTTGTATTTCTATTCGCAATTCGCGATTCTCCTGTTGCCAAGCAAAGTTATAGAAAGAAAAAAAAAAACAAGAAACTCA:1 - chr2R 11626454 5' + gypsy7 5017 1 79.21 TTTATCGTTTCTTTTAAACGATTAAATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:2 + chr2L 18417280 5' - roo 398 1 68.32 GGCTGCCTGGTTTATTGGCCTGTGGCATTTGAACTTCAACCCCGACGGACGTGTTTTTAACAGAGCTACAGTTAATATCGAAGTTTAAGTGAAAAATTCAA:1 + chr2R 300078 5' + Porto1 55 1 77.23 ATTGGCTCTGGCCAACGACACCAGTTTACGGAACTTGTTATCAGGATTTTCGAAGCTATTTACATCCAAGCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr3R 22699016 5' - roo 404 1 74.00 TGCAGAGTTTAACTGTCTCCAAAATGGGCATATTTAAAATTTTGTCCCTTAGCTAGGTCATATATATTCTTGAACAGGATCAATAGCCGAGTCGACCTTGT:1 + chr2R 4328764 5' + INE-1 100 1 70.30 TACACATTGATATAGTCGTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr3L 11257423 5' + 1360 8 2 69.31 AAAATACAAATAAGATGAAGCTTAGCTGCAAATGAGCGACTCCCACCAGAGGGTCATAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTC:1 - chr3R 3292619 5' + Quasimodo 373 2 63.37 ATTCTTAATTGAAAATGAATTTGGTTTTCGGCCAAGTGCTGCGTTCTGTCGGCCAAATCTTTTTTCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGC:1 + chr3R 27993310 5' - transib2 2815 1 71.29 TAAATGGCCGTAATTGTTGGAACTGCATATAAAAATTTGTATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 - chrX 22590214 5' - Burdock 220 2 63.37 TGGCAGTGAGGAAAAAACTATTTGAATTTAATTGGGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 + chr2R 3521989 5' + copia 42 2 69.31 TAATTATTTATAAACATATCTACATATATGTGTACATTCATACCTATGTTTGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTT:1 + chr2R 17953070 5' - Burdock 6367 2 57.43 TGGTTGAGTTGCTTCCGCGTATTAGTCAAATGAACAACATTTATATTTGATTTTTTTTTGGGCTTTTTGTGCATAGTAGTCTGATTTTAGACAAACATGGA:1 + chrX 13850062 5' + Cr1a 418 1 68.32 GCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:2 - chr3R 19513410 5' + jockey 4697 1 55.45 TCAGTGCTGCTACCAACAGCAGTTGCAATGCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATAT:1 + chr3R 8499424 5' - Tabor 438 2 68.32 CTGATAATCGTATTTGCTGTGGCATGTGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 - chr3L 27414918 5' - Transpac 285 2 53.00 TACAAACAAGTAGGAAGACTAAGTAAGGATCGGGTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAA:1 - chr3R 21590374 5' - roo 9028 1 69.31 AACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGG:1 - chr3R 15790065 5' + flea 4745 1 68.32 TGTGGCCTATAAATCACGGACAGCTTTCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCAC:2 - chr2R 14402299 5' + Tabor 49 2 70.30 GTTGGTAGGTGTTTTGTAGTCTAAACTTTTGCCTCGATTTTATATATATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTC:1 - chr3L 14854766 5' - mdg3 219 2 57.43 AAATACCCCCTCAGTACTAGTTACCTTTTCAAAGTTTTTGCTGACTCATAAAAACTCCCTGCCAACAAAACGCAACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTT:1 + chrX 12242165 5' + TAHRE 10308 1 73.27 AAAAATAACGAATTCGTGATGGCGTGTGAGTAATGTTTCTCTAAATTTCTCAGCGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTT:1 - chrX 2860407 5' + Cr1a 369 1 61.39 GACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACGTTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:2 + chr3L 26371357 5' + Tabor 6892 2 79.21 TTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 10576842 5' + roo 8709 2 76.00 ATGTTTACTCTTGTTTTGTTTCTAGATTATTTGTATACTTTTGTTTTCGGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr2L 8898965 5' - roo 399 1 70.30 AAAGTACAGTCACAGTATTTAAGCTTAATATATTTCTAATATATATTATCAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAA:1 + chrX 16881231 5' + I-element 346 1 53.47 GTAAATGGTCTAAGTGCGTGTTTCTGGCCAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTT:1 - chr2L 11534088 5' + copia 488 1 72.28 AACAAACAATTGTTGATTTTTAACAGTGCATCGACCGAGACGATGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr3R 29438769 5' + hobo 29 1 60.00 ACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGA:1 - chr3R 15790089 5' + flea 4721 1 66.34 TTACTCGTTGAATGTCAAAGAGAGAATAACATTCGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 - chr2R 19164153 5' + P-element 41 1 44.00 ATTTGAGCTTCTTTTGCTCTTTCGGGTTTTTGAAGGGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGG:1 + chrX 3430783 5' - I-element 152 1 73.27 TTTGTTGTTTGCCGTGTGCTGTGTGTGTGGGGGTAATCTTTGTGATTGGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGAC:1 - chr3L 6457153 5' - Doc 477 1 52.48 GCTGGGGGATAGGACAATGTTCAGCTTGGCATTGTTACTTAATGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:2 + chr3L 12217311 5' + roo 34 2 62.38 TGTCAGTGTCTGAGCGTGGGCTACCTAGCCTGTCAACAGAATGACAGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCNACCCGATAAACACT:1 + chr3L 13644605 5' - hobo 2910 1 53.00 TAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr2R 1725929 5' + Doc 44 1 65.00 CTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 - chr3R 11151876 5' + mdg3 5299 2 71.29 GTAAGAGGGAGCGAGTTAATAATTAAATGCATAAATGCGAGCTGTTTTCTTTTATATATATATATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTA:1 - chr3L 3739169 5' - invader4 3071 2 66.34 ACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:3 - chrX 21668063 5' + Tabor 44 2 67.33 GCGAAAACTAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 - chr2R 1725950 5' + Doc 24 1 61.39 GCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr2R 17348592 5' + jockey 58 1 78.57 CTGAGGAGTAGCTTGGAAGCACTGATTGCCTCGTCTTCTGTAGTTATTGCCAGGCCTACTATTTCAACGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACCTCGATGAGC:2 - chrX 19820781 5' - Rt1b 4971 1 72.28 ATTGATTCCACCGGTGATCGCGTTGCTCCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTCTTGTTTTATAGTTCCTGAGTTGTCGCCGTTCATACGGACAGACGGACAT:1 - chr3L 24566699 5' - INE-1 123 1 72.28 CAGTTAAGTTAGGTTGCTCCTTCGACAGGATCGACAAAAGAAACAAGGATAACACTTACGGAGCGGAAGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAA:1 - chr2R 18999293 5' - rover 154 2 72.28 TCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 3535453 5' - roo 9044 1 54.46 CCACAGACTGGGTCAAGGGTACACTAAGTCCTGGCACCGTTTTTGAGGAATTTTGGTCCATGAATCCTTGACAACACCCCAAAGATCCTCGTTATTATTGG:1 + chr3R 5169491 5' - Tc1 1212 1 77.23 GGCGGAGGTGTAGGTAATTCCTAGCTTAGGTAATGATAACGTCGAACGCGTTGCTCTTATTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 - chr3L 15353606 5' - 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chr2L 1638926 5' - pogo 299 1 57.43 CGGGGATGAAGGGGGCCAGAACGGTCCCAGTTCATTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGG:1 - chrX 20914459 5' - I-element 304 1 64.36 TTGTAGTCTAAACTTTTGCCTCGATTTTATATATATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTG:1 - chr3L 14854753 5' - mdg3 5458 2 70.30 GGCATTGAGAGCAAAACAAAAATTTTCGTGGCGCGCAAGCAAAAAAAGAAAAAAAAAATGGGAAAAAA:1 - chrX 3761497 5' + Tc3 138 1 51.47 CTAATGGAATAGGCAATTACCTTGCATTTTTACGATAAAGACCTTTATTGTGTTATTGCTGTATCCACAAACTTGTTTATTTTTGATTAATAAAAATAATT:1 - chr2R 16743621 5' + Quasimodo 7331 2 56.44 GTTGGAGTTAATCAATAACTATAGTAACGTGTAATAAAACAAATAATGTAAGAAAATATCAAATGTATACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGAC:1 + chr3L 27261797 5' + Ivk 11 1 65.35 GCCGCGGTTAAAGTGGAATGACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr2L 11073788 5' + roo 55 2 80.20 CCGGGGATAAGTCAGAAAGTGAGCATCATTTTTGTACAGTAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAAT:1 + chr3L 14348842 5' + Quasimodo 98 2 64.36 TCTTTCGCAAACTCAATTAGGTGGCACATGGTGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:3 + chr2R 22746004 5' + hobo 12 1 66.34 GGCATAGTTACAGTTTCAAGAAAAATGATTCAAGAAAAATACGGAGGGCACAAAAACCGAATTAATCGCGAGGCTGCAAGACATCCCAACGGCAGTTCGGG:1 + chrX 8544258 5' + mdg3 410 1 65.35 TTAAACTTTTCTTTTCCTTATTTTTTCTTTATTTTGTTGTGCAATAAATGGCTCTTTTTGATTTTAAGTAAAATATGTACATACATATTTTCTTTTTCTTT:1 + chr3L 11556801 5' + Bari1 1528 1 51.49 CAGTTTGCTCTCTCTCTCTTTCGCTCGCACACTAAGTATGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr3L 3070652 5' - 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invader1 388 2 63.37 AAAAATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 + chr3R 13620274 5' + Doc 43 1 68.32 CTTGTGACCTATTATGTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chrX 5178889 5' + hobo 18 1 60.40 TCAACTTGACTTTTTCGTTAGAGAGTTATTCGCCCATTTACCTCTTATCTTAAATAATTGTACATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTATTAT:1 - chr2R 3600067 5' + Cr1a 4178 1 62.38 CTGCCGGCGGTCATAAATGTAAATAGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chrX 7019236 5' + hobo 50 1 79.21 CAACATAAATTGCAACACGGCAATACAAAATACAAAGACAGCTATTGCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTAT:1 + chrX 12885696 5' + transib2 28 1 53.47 AGTAAATTGTCTAGTGAATTTTTAACCACTGTTCATTGTGCGATTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr3R 12546806 5' + hobo 30 1 53.47 TGCAAGGCGTTCGTCTTCCTCGGTCTGCGTTGAAGGGATGGTGGTATTTATAGTCTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chr3R 12597196 5' - copia 233 1 56.44 AAGTAGAAAGAAGAAGACGGTTGAGTAAAATGTCCGGACGGACGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chrX 21166354 5' - 1360 3356 1 59.41 GCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3L 10576852 5' + roo 36 2 66.34 TATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3L 23456267 5' - 1360 3370 1 56.44 CGCTCAAAAATTTGAAAATCCAATGGGTACTTCAAAAACTGATATTGTCCTCGGTGTGTCACAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGTTTTTTTGCTA:1 + chr3L 27656340 5' - transib2 2447 1 68.32 GGGAACACGTGAAAATATTTGGTAGAAATTTGTATTGATAAAAACATAAGAAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:2 + chr2R 20506804 5' - mdg1 399 2 55.45 GATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:2 - chrX 21668079 5' + Tabor 28 2 51.49 GAACCAGACACGATGCTAAAGACAAGATTTATATTGCAGGCAAATTAAAATTGTTATTAAAGAAGATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTT:1 - chr2R 3523730 5' + Cr1a 129 1 63.37 CCGCCAATCGTAAAGAGGGGGGTATATTGTGCAAAGGGTATAAAAGGTATAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 5654829 5' - roo 9045 1 53.00 AAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:2 + chrX 17492884 5' + Tirant 8137 2 56.44 TGCGAAGGACTAGCGGCTGGGGGATAGGACAATGTTCAGCTTGGCATTGTTACTTAATGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 12217296 5' + roo 19 2 60.40 ACAAAATTGTAATCTTTAAATATTCATTCCTTTCACCAAAGAGAGAGAGAGTAACCAGTTCTCGTCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 8133900 5' - roo 398 1 69.31 AATTTAAAAAGTGCGAAATTACTTTTCTCCTTTGAACGGCGGCAAGTATTAGCTGCCTTTAAGGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 11478372 5' + roo 8678 2 68.32 CAATGGCTCTGAGCTTTGGCATTAGGCAACTTGGACGTGGCTGCCGCCAGACGTTTCCACTGTTCGTTATTTCCCACTTGACCGCGCGTTCTCACTCCCG:1 + chr3R 11082082 5' - gypsy8 443 1 57.00 CGAGTATCGGCAAAACTATCTGGTTAACTTCATGTTTTTATGCGACAAAATGTTCGTTGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGAT:1 + chrX 3456913 5' - I-element 5063 1 63.37 TATAGGATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATC:1 + chr2L 22092960 5' + INE-1 541 1 56.44 TGAATCCCGAGCAACTCGAGCTGCCACTCCGTAATCTCAATTGTCGGCTTTGCATTGCTCGACGATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr3R 30263527 5' - roo 404 1 73.20 TTATATGAAAATGTATTTAAGCTGCTGAATATAAACTTTTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr2L 12835824 5' + 412 7089 2 58.42 CAAAGTTGCAGCCGATACCAGAAAATCGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCC:1 - chr2R 594150 5' + gypsy5 48 2 70.30 CCACCCCCGCAAGCAGCGTGTTCGCTCACCATCTACCTCTCTTTTCAAGAGAGCACGTTGCAAAGACGTTCAGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chrX 14953681 5' + P-element 4 2 76.24 GCACAACATCTTCAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAAGATGAACACTCATAA:1 - chr2R 4677369 5' + invader3 5188 2 76.24 TAAGTTAAATATAATACACACACTGGTGTATTGTGGTGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 - chr3R 4600868 5' - Burdock 217 2 63.37 CAACTGCTGTTGACACTCTGCAAATCCCGGTCGATTACTGACAGGCTTCACTGTACTCCTGCATTCATTACATTATTCAGGTGTAATAAACCAATATATGC:1 - chr2L 4868628 5' - blood 379 1 78.22 ACACGGTGGGTTTCCGATTGTGTGAACGAGTTGAGTGTGTGTATAGTGCTTTTTTGACAGTTGAATGAACCCAAGCATTTATTAAAAAAAGAAAAACAAAA:1 - chr3R 6425715 5' - hopper 153 1 66.34 ATCATTGATGTGGCATTGATGGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCG:1 - chrX 14300223 5' - accord 182 2 60.29 ATTGGCTTAACACGGCGATCTTATTGACTTATTTTGACCCCCTTACCTTATCCCATGCATATACATATACGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAG:1 + chrX 16279603 5' - I-element 5115 1 76.24 CAACTACAACTGCCGAAACGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chrX 3446512 5' + I-element 20 1 57.00 CGCTACGCGTGAATGCTTATGTGAGTAAGCAAAGAAACACTCAAACTCTCCCAAGACCAGAGAGCGCACTCTTGCTCTCCGTCGTTGCCGAGCACAGTTCC:1 + chr3L 24870645 5' + Doc4-element 140 1 68.32 AACACCCCACTGATGATACAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTT:1 + chr4 306448 5' - blood 7332 1 80.20 CTTGTTGGAAAAGACAACTTCCACATAATACCTCAAAAAAAGGGCACCATCCACGAAACTAAGGTCCAAGTAAAAACC:1 + chrY 826632 5' + Fw3 97 1 87.18 GCTCCTAGGAAACCAAGGAAAACTTCAAGTTACTCTTGGGACTATTGTTGAAGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr2R 12998373 5' + roo 25 2 54.46 GAACATTTCGAAATTAAGATAACTATTGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr4 306475 5' + blood 49 2 72.28 ATTTTTCCTGGTTTAAACCAGCCATTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 + chr3L 4601938 5' - hobo 2890 1 72.28 TCACCAAAATAGACCAAAAACTGTAGTGAATAAAATATAACATTATTTTCAAAATAAAACTGCAATGATAACTTTTTTAATAACATAATGTATACGTTTTT:1 + chr3L 18265189 5' - S2 1388 1 33.66 TTTTGCTTTGAACACCTCTCAACGGATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr2L 21018808 5' + 412 7102 2 71.29 GCGAAGTCCTGGCACTGTTTGCGCAGCTCCTGATACTCATTCTGCGGAACAATATAAATATTAACTACATATAACACAGTCTTCGGGTGGAGACGTCTTTC:1 + chr2L 16668578 5' + Doc 20 1 67.33 GAGAAAGAGGGCTGTGCTCTTGATGGCTGTGGAAAAGACAGAAGTGCGGTGGGCAGAGAAGAGGTCACCAGAGGGTCACCAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 10814417 5' + R2-element 3585 5 64.36 CTTGGATTTGCAATAAGTGGGAAGTACATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTATACTCGAAGCTCCTC:1 - chr2L 16758311 5' + Max-element 8285 2 72.00 TTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:2 + chrX 5130994 5' + I-element 38 1 58.42 TCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - 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jockey 183 1 80.20 ATTCACTTAACTCGAAATTCTTCAAATTTATTTTAAAGTTAATGGCCGAAATACTGAGATTGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATAC:1 - chr2R 14522943 5' + G2 2935 1 66.34 AAAAATATGTAACCTTATGCGAGAGCGAGCCGCAAACAAACTGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 + chr2L 12911248 5' - mdg1 388 2 58.42 GATTGCAGCTCTCACTGCTCTCACTCGAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chr3L 4692295 5' + P-element 49 1 30.69 GCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGATCCCTCTA:1 - chr3L 25232907 5' + GATE 8271 2 49.50 AAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGA:1 - chr3R 15790082 5' + flea 4727 1 60.00 AACTGTACGCAAACAAAGAAAACCAAAGCCTTGTCCGCCCTATAAAGTAGTGGAGGGTACATCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTT:1 + chr3R 5555893 5' + mdg3 5264 1 65.62 TTCATTTGCATTTCGCATAATTGTTATAATCTAAGGGCCGAGGTTTATGGAATGGCGATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTAGATCTCAGGAACTATAAAA:1 + chrX 20805122 5' + INE-1 147 1 59.41 AGGCAAATAGAAAGTATGTATGCTTGTTTGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATA:2 - chr3R 20240960 5' - Tabor 472 2 51.49 AAGCTCATCACCTCCCTGCTTGATGCACTGAAGACCTCAACTAAAAGTGCACGGATACATAAGCTCATGTTGGACATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 + chr3R 2556011 5' - 412 7543 2 75.25 TTAGATTGTGTTTGTGAGAGAGCTGGTCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCGAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 + chr2R 6501169 5' - P-element 2840 1 32.67 TGACCTATTATGTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chrX 5178885 5' + hobo 21 1 57.00 GCTTACCCTCTAGTTCCTCCATGTTTTCTGTTTGTCTTTCATGTGTGTTCTCTAAATCATACATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATT:1 - chr3L 17688242 5' - flea 244 2 68.32 CACACATTCATTCGCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:4 - chr3L 10576869 5' + roo 19 2 60.40 TGTTTCCCGCCGCAGAATTTTTTTGCTTAAGTGTTGGCGAAGCGGTAGCGTTTGGTTCTAGTGTTTTTGTTTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATT:1 - chr3R 2399638 5' - Porto1 232 1 73.27 AAAAATTGCATCAGAAAATTTGAACATTCGATCGCTGATTATGTGAGGTACGTATTTTCTTTGAAGCGAAATATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTT:1 - chr3R 19132020 5' - diver 220 1 72.28 AAGGCTTTGGGACCCGAAGAACATACATTTTTTTAAGCCGATTTCTAGCGTTTGTCGTGACTCTTGTTAGCATAGCAGGTGTTGGCAATTTCTTCTTGGAT:1 + chrX 22786732 5' - mariner2 671 1 69.31 ACCGCCAACTACAACTGCCGAAACGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 + chrX 3446507 5' + I-element 16 1 61.39 GAATAGGATAGGAATAAGATAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2L 10189465 5' - roo 9016 2 78.22 CTAATTAGAAGTATTTTAATTTAACTTTTGAAAAAAGTGATGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr2R 22751150 5' + Doc 40 1 58.42 CGATTTAGCACTGAATTCAGTATTCGATCTGACCGATATGCTGTGCTGGCAATTGAGTTTATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 - chr3R 10876374 5' - opus 487 2 68.32 CGTTGCTTTGTCAAGTGCATTCATCTCTCACCCATGCCGCACCCCTCTAACTCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3R 11389817 5' - hobo 2920 1 56.44 CGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3L 3535429 5' - roo 356 2 75.25 TCCGGCGCTCTTTTTCTTCAACTTTGGCGGCGGCGGCGGCGGGGGTGCGACTTCAGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 - chr3R 13996009 5' + 1360 18 1 55.45 TAACTTTGCTTTTATTTTATTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATT:1 - chr3L 15927237 5' - TAHRE 10392 1 86.14 ACAGTCCAAATAGAGAAAAGCTAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chrX 12866425 5' - hobo 2935 1 73.00 CTCAGTGCTGGCAAAGCTTAATATGATGGGTATGCTTAAATATGCATTGCAAAAATGTAAGCTGCTTTCATTATATGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr2L 5654929 5' + roo 8669 2 74.26 CTTGCGTGCTCGCATTAATTTCATTACGCTGCATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGC:1 - chr2L 13868758 5' + roo 292 2 68.32 GCATTGTAACATATTTTTATGGCCTCACATTTTTCTGCTTTCATACAGTTTCGTGTTGGCTTCTCCGGCTCCCCTTCTGCAGAACACACTACAACATGGAT:1 - chr3R 20430854 5' + hopper2 1167 2 77.23 TTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:2 + chr3R 4504058 5' - blood 357 2 58.42 AAGTAGGCAACGAAAATGGTTACAACAAATTGCAAGGCACATACACAGACAGGGCCAACCAACTCGCACACACACACACACACACATT:1 - chrX 16532031 5' + accord 184 2 80.68 ACATGAAACCTAGAAAATTGGTTAAATACAATTTAAGATGGTAGTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - chr3R 10480419 5' - mdg1 386 2 57.43 AGCACACATGCAATGTCTTAACTCATTTGCGCTGCTGTAGCAGCGCTGCGTAAACCGCTATTTTATTTGCCTGACGTGCAAGGACTTTTCATCTGACGTCG:1 + chr3L 24059422 5' - invader4 465 1 75.25 GGTGAAAGGAAAATTTCTAGGACCTTACAAAATTGTTAAGCTAAACAAGTTCGGAAGGATGCGAAAAGCATACATTGTCCGTATGAACGCCGAGATCTCTG:1 - chr3L 25398357 5' + INE-1 136 1 58.42 AATACAGTACGAAAGAAGAAAAGCGAGGAAAACCAAAAAGGCACTAAAGACACCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAG:1 - chr3L 14328871 5' + Porto1 317 1 55.45 ATTGTTAAAATATTATGTTAAAGCACAATGTGGCACCTTACTTATTTTGTTTTTTTCTTTCCAAGCTGTTGGAATTATTTTAAATTTATTTATTTAAAAAT:1 + chr2L 8745202 5' - G7 1143 1 91.09 ATGACATTTTAGGCGAAACCCTTTGCGTTGCACCGAAAAGAAATATCAAAGAAAAACCAGTGGTTTATCAAAATAAATACTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chrX 15227243 5' + roo 8664 1 78.22 GTGCGTGAGAAAGTAATGTGTGACTCCCTCTATTTCCCCAAACTGAAAGCCGTCGACGCAGAAGGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAA:1 - chr3R 5555998 5' - mdg3 5487 2 68.32 TTCAGCCATTAATTGCAATTGACAAGCACACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATAT:1 + chr3R 12717505 5' - Bari1 1662 1 69.31 CCGAAACTCATATTGGAAAAACGTTTACGCGAAACTGCTTAACTAGCTGCCAACAACAACAACAATAAACAAAAGAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCA:1 + chr3L 15211909 5' + Porto1 209 1 67.33 TACCAGCTCTCAGAAATGAGCTAATTAACTAGTAGCGTAATGATTTGCGTGATTTACAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAA:1 - chr2R 11095358 5' + I-element 234 1 62.38 GGCAGCTTAACGAGGACTGACTCTTCATTTATTCAGCACGTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATT:1 - chr2L 23180104 5' - Burdock 223 2 58.42 GGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 + chrX 17492900 5' + Tirant 8153 2 72.28 GCTAGCCCACTTCAACTTCGAAGTCCATTATCCAGCCTAGTGATAATCCAAAGTACTAGATATTTATTGGTATTGTTTCAAAGATGTGGAAGGTTTTCAGT:1 + chr3R 935310 5' + invader2 4641 1 53.47 ATATTAGTTAACCATTAAGCGCTCAAATAAACGTATATTGTTTGAAGAACACTTATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chrX 3233988 5' + 297 14 2 64.36 ATGTGCGAAGTTGCGTTTTTCGCCATTATTTGCCATGCATTAATAATTTGTTGGTCGTAATTATTATATGACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCT:1 - chrX 5129451 5' + I-element 4873 1 76.24 ATGGAGCAGTGAAACGGTTATTAGTGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTC:1 + chr3R 1685392 5' - Idefix 7143 2 75.25 GAAGAGAGATCGGTATCACCCACACAAATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 - chr2L 19421689 5' + FB 50 1 75.25 GACTTATTTTGTTCCAGGGCATTCCAGACTTACCCACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTC:1 - chr3L 544018 5' - McClintock 240 2 70.30 ACAGAACAAGTTTTAATCTACAAAAGTTATGTAGGTAGATGCATGAATGAGCTACCTACCTACCTTTTGAACGATAATTAGTTCGCATTGATCTGTTGTTC:1 + chr4 341879 5' + Tc1-2 236 1 74.26 TTTATAATTTATATAGCGTTATGCATGCTTATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGT:1 + chrX 10790154 5' - Quasimodo 49 2 70.30 CAGTGTCTGAGCGTGGGCTACCTAGCCTGTCAACAGAATGACAGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr3L 13644608 5' - hobo 2907 1 57.00 CGAGCGACGTTTCCGAGAAAGAGGTACACGGTACGATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 - chr2R 21646148 5' + P-element 42 1 37.62 CAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAC:1 - chrX 21945906 5' + F-element 64 1 81.00 ATCAGCAGCCTTGATAGCTTCACTTCGGTTGAAGACATTTAAACTATGTAAGTTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTT:1 + chr2L 23174097 5' - 1360 3138 1 52.00 CTGATTATGTAACAAACTGAAAGCGAGTGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 23870147 5' - roo 9058 1 58.33 AGGCGGACTCAACTCAAACTTGTTAATTGGAAACAAAGCTATGAGGAGCGTCTTATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr2L 262051 5' + jockey 33 1 51.49 TCTGATAGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr3L 22231384 5' + Doc 34 1 62.38 ACAAAAACATTACGAAACCTGAAGTTTTGCGCGCCAAAAATCGGTGTGTAAAATAGCAAAATAAACAAAGAGTGTAAAACAAAAACAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 18249718 5' + G2 3077 6 55.45 ACTCATATTTCCTAGCATTTTATCACTTTGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATC:1 + chr3L 9190713 5' + 412 109 2 75.25 ACTAAAAGATGTGTCTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATGATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 + chrX 5130969 5' + I-element 13 1 64.36 TTACGAGTTTTTTCTAAACTAACCATGAGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 - chr4 227644 5' + Transpac 45 2 70.30 ATCTAGATTCGGCAATCCGAGCTTATTTAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr3L 15869712 5' + pogo 44 1 72.28 CACCAATCGTTTTTTTACGTTTTGGTTATTGTTAGCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:3 + chrX 157198 5' + I-element 17 1 60.40 TAAATCGATATGTTGGCGACACTCGAATGGGCGAGTTGCAGTTGCACCAGCAGTTGGACTCGTGATTACTTTGACATCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 - chr3R 11478492 5' - roo 410 1 79.21 TGTTCACTTATTAATTTAATTCACTTATAATGTTTGTTATTCACTTAGTTATAGTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr2L 22362034 5' + Doc 30 1 56.44 TTGGCGGCAAATCGGTGAGCATTCATAAAACTTCACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAG:1 + chrX 13536752 5' + F-element 4394 1 66.34 TTTTTTAAATTTTATCCAAACTATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATA:1 - chr3L 11070177 5' + mdg1 484 1 78.22 TATAAAAGAAAAAGAAACGAGGGGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACACGTCCGTTTT:1 + chr3R 19515801 5' - 412 476 2 52.87 CAGTGCCCCATAGAGCACGATACTAATCTGCCATGGCAACGGACCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTT:1 + chr3L 5573524 5' - mdg3 5467 2 52.48 AATCCAATTTTTTACAGCTCCATAACTTATTCCTATTTGCCTTTTTTTGGATCCACTTACTGTCCACAGTAAAACACAAGAGCGAATGCTATAGTCGAGAT:1 + chr2R 25133742 5' - INE-1 575 1 61.39 GACTGTCATGCTCGATGTCTGACATTATTCTATAGCAAACTTTACATTAAATATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGG:1 - chr3R 17173111 5' + invader1 25 2 55.45 GGTCCAAAGGAAAAGGCAAGGCGATAAGCACGCACCATTTTTGGTGGTTTTTGAATTCAAATTGAGTTTTGGATTTTGTTTATTTTTTGATCTGACAACGC:1 - chr2L 11340731 5' - transib4 2526 1 72.28 TTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:2 - chr2R 17348594 5' + jockey 57 1 78.79 TTTGACTCGAAACGAACGGCTATCATCGACAAAATTAGTCGTCGTCGGCGGCGGCGGTCATAAAAAACCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr2R 14575773 5' + pogo 6 1 75.25 TAAATTGTAGTTAGGTTCAAAAAATGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 18978505 5' - roo 9023 2 74.26 TTCATTACATTTTGGGTGGGACGTAACGGTAACGTTGAAGTGTAACGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr2R 15921392 5' - 1360 3362 1 58.42 TTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 10576843 5' + roo 8709 2 75.25 ACACAGACATAGACCACCCCTTCATTCCGCCATGATTGATGATTGATGACAGAGCCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATA:1 + chr2R 11403844 5' + 412 7480 2 53.47 TTCTTCATTGCATATTACTTAATTAAACTTGGCTCTGCTCGCTACTAGTTGCAGCTCAAAAACGACTGAGTAGTTTGAGGTGTGAAATGAGAATGATAATG:1 - chr2R 1862171 5' + accord2 65 2 61.39 ATAACCATCCATGAAACAAACCCAAGCGAAGGTGCAATTTTCCACTTAATCATATACTAGAGACACTATTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr2R 5753389 5' + P-element 5 2 72.28 CCTTGCGCCGTTTAAAAGCCCTGGTTATTAGACTAATGTCGAACTTAAAATCCAATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 + chr2R 20593331 5' - copia 235 1 56.00 GGAAGAGCAGAGGGCAATCCCCCGTCACAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTT:1 + chr3L 24226072 5' - 17.6 284 2 73.27 AAAGAAAAGATCTATAAGAATGCATTGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTT:1 - chrX 20830631 5' + G2 263 1 74.26 TATTATAAGCAGGTATAATTTATATTATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr2L 7190168 5' + pogo 46 1 76.24 CATTGAAATAATATCTTTGGGATTACATTTCGTGCGATTCTCACGAATACTGGTTATAAATTATATAAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chrX 11503560 5' + roo 8669 2 73.27 GCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAA:1 + chr3L 24210895 5' - HMS-Beagle2 7172 2 56.00 CGCTTTGCTTTCTTACTTTCCTTAGCCGCTATTTGTTACACTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATG:1 - chrX 13436794 5' - invader2 4710 1 78.22 GCAATAATCAGCCATAATATATTTATATGCCAGGTCGTTTCGGTATTAGGGGGATTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATG:1 - chrX 12887276 5' + transib2 29 1 77.23 TGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:4 - chrX 21945928 5' + F-element 43 1 59.41 CTGTCACCTGTGCAAGGACTTTTGGGCGTTCCAAAAACGCGATCAAGTTCCGCTCCCATTGGTTTTTAGCTGGTGAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATA:1 - chr2R 11399271 5' + 412 1 2 78.22 AGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAAGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAACATACGAAGAAGCATACGATCATATC:1 - chr2R 2248341 5' + invader3 51 2 71.29 CCAAGCTGCGCTTTTTTTGGGTTTGGGTGAGTTGCCATATCAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCA:1 - chr2R 14130150 5' - roo 43 2 60.40 GTTCGGCACACGTGTGTGCGCAAAGCTGCATAATCCGGATCCTTGTGTCGAGAATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCACT:1 - chr3L 5265485 5' - invader1 385 2 58.42 GACGTATTAATATAATTAGCACTGTTCAAAGAAAAGAATAATTGTTGCTGCAGATTTAATTTTCCTCCAGTCCAGACATATAAGATACCCGTTACTCGGCT:1 - chr3R 2472926 5' - INE-1 545 1 66.34 AAAAAAACAAAAATTGTAAAATTGAGCGGAAATATTTCGTCCCGATGAGCCGTATATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGT:2 - chrX 12685343 5' + McClintock 13 2 49.50 AGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr2L 13598199 5' + pogo 43 1 69.31 GCTATAAACCACTTGCCAGAGTTCCCAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTTCCACGGTGATATTTCAATAAGCCCCACATATTAAACTCATGCCCATCCC:1 + chr2L 3368805 5' + I-element 5046 1 79.21 ATTGGCTACTTAGACGGGGCTTTTATGTCGTTTCCTTCATTAAGCGCGTATCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACA:1 + chr2L 6115118 5' + jockey 4661 1 50.50 CAAAATTTTACAACTCACAGATAACCATCGCTAGTGTACGTATGTGTAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCG:1 + chrX 21939050 5' - HMS-Beagle2 7165 2 58.59 TGGGCGGAAAGCGGGGCGTGGCAGAGGGCGTCGGATGCTGAGGTCTTGGAAAAGTCCTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAAGTCAACTATA:1 - chr3R 12820020 5' + INE-1 565 1 44.00 CTCGGCCCTACCAAATCACATTCGGAGTTTAACGCTACAACGAGGTTCTCTGGGATAGTTTTCGTGCAGCCTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGAT:1 - chr2R 670530 5' - flea 413 1 73.27 GACATTATTACATAATTTTAAGTATTAACGAACTAACTACATGGGACTTTTCTAAATTTAAAAATGGTACATATTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTT:1 - chr2R 1206315 5' - Doc3-element 4702 2 82.18 GGTAAGTATATATAGATATAGTAACAGCAAATCCCAACCAGTCTGCCTTGCCTGTGAAAGCAACAATTTGATGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTAA:1 + chr2R 14424996 5' + R1A1-element 5282 1 67.33 GCATTTCCTGCAGCTACTCACAACTAATCGAATTAACTTCGGCCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chrX 9544171 5' + roo 8698 2 59.41 AGTGCATCTCTCGCTGCACAAATCCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 + chr3L 18793020 5' + P-element 51 1 31.68 TCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr3L 3535449 5' - roo 9041 1 57.00 CCAACTGGGATATCATCTTTACATACATACATATATGAGTTATCGTTCAACTCATATAGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAA:1 - chr2R 7940224 5' - Juan 297 1 51.49 TTCTATATTTATATATATTTTTACATATGCACAGTAATCAATGGATTGATTATTATTGTTTATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 8037713 5' - roo 396 1 66.34 GGAAACTCCTGACGAGGAGTCGTGTAATGGGACTGAGGGCGGGAAGGAGGCTCCAGAACAATCAGCCTACATATCTAGGTATCACACTGAATAAACGGCTC:1 - chr2R 4005365 5' + Helena 909 1 76.24 TGTTAGACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACT:1 + chrX 21564078 5' - invader4 3065 2 58.42 ATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAACC:1 + chr3R 1418287 5' + BS3 224 1 64.36 TTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGC:1 - chr3R 15790077 5' + flea 4731 1 55.56 CAGCGAAATTAAATTTAGCCTAATTGTATTGCCTTTAGGATTCGTATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTACGTTTCTCTTGGATTCAGGTGCATTTGCTCTTGG:1 - chr2L 16166653 5' - Idefix 338 2 68.32 AGACCGTCGACGGCTGATGTATTACGCTAATGGACAGCTTAAAGCAGCCAATCTTCACTGGCTTATTAATTACAACTCTCCCCTTAGTCTAGAATACAAAG:1 - chr3L 12095332 5' + Doc2-element 4309 1 65.35 GGCTTTGCATTGCTCGACGATATGTGTGTAAAATTCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3R 30263572 5' - roo 9018 2 80.20 GAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTATT:1 - chr2R 2092774 5' + Doc3-element 101 1 74.26 GAATATAAGCTACGAATTCAAAGTACATTGAAATATATCTGATCCAAAATAACTGATAAGCTCAGGCTGAGTCGAAAAATGAATAAAAAAAAAAAGG:1 - chr2R 23005067 5' + Doc2-element 223 1 55.67 TTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:2 - chrX 21945937 5' + F-element 34 1 53.47 GTTAGTATTGAAAATTGTTGTGTTTATTTGTATGTTTGTATTTCTTGAATGTTTTATATTCATATTTTGTAATACAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTC:1 + chr3R 1712534 5' - Bica 215 1 77.23 AAATGAGTACAAAAATGATATTTTGCCAGGATTGCTTAAAGGTTATAATGTTGATGCAGATGAGGCTTGCCATGGTCAATTAGATGATGATGAAA:1 - chr2R 6866322 5' + pogo 1625 1 51.58 GCTTGAGTGCGATGCATTTCGCACCCTTTTATAAGCATACATAACTATATATATTTATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCAC:1 + chr3R 17173019 5' - invader1 3995 2 63.37 CCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGG:3 - chr3L 24210970 5' + HMS-Beagle2 34 2 64.36 TATCACTGTGTATTTGTATCTTTAACGGCATGTGCAGCCGTTCTTGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACC:1 + chrX 9879715 5' + 297 167 2 67.33 TAAGTACTAAGTGCAACCGAGTCCAAATATTCAGCTCGACATCCATCACTTTTTCGGAACATGTGAAATTCCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chrX 7019161 5' - hobo 2934 1 74.26 TCAACATATTTTTACCTTTGTGCGACATTGAGGGCGTGCCTAAAATAAGGGGCATACTGGAAAAAACATAAATAAGGGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGT:1 - chr2R 25216635 5' + 3S18 2 2 77.23 ATGTTAAACAAGGAGTGTGAGTGGAATTTACCAAATACCTAGAGTTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGCATGCGGCT:1 - chr2L 7140940 5' - 17.6 52 1 54.46 TTTATTATCACTTTTATTGTTTTGCCAATTAAAAAGTTGGGACATTTATGGTTTCCATATTTATCTGAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACACGAGATCA:1 + chr2R 8525292 5' - Cr1a 392 1 53.47 GCAATGCATACAAAACACATGACAAATCTTCACCCAAACTCAGCGAATTGAGAGCAAAGGCTGAAAGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGCGTG:1 + chr2L 9122741 5' - 1731 199 1 76.24 AAAGCAGATGAGTACCACCAACTTGGAAACAACTAAAGAAAGAGCCCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCG:1 + chr3R 10244485 5' + Doc2-element 489 1 69.31 AGTTGCCACAAAGGAAAAGAAGCCCACAATAACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 - chr3L 12229407 5' - mdg1 7416 2 67.33 CAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACATCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 + chr3R 11080688 5' + I-element 25 1 51.55 GGGCAAGGACATGTGACTATGCAAATGATAATTGGCGGAAAAAAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGAC:1 - chr2R 11186452 5' - 1360 3243 1 57.43 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGATGTAAAACGAAAATTAATTTAATCCAAGCAACTTAGTAAAATTCTGTTGCTTTTGCTTACACAAGCC:1 - chr3R 846554 5' - Copia1_DM 4235 1 80.20 GTAGTGGTTTATCGCTCATTCTCGCAAAATATTATGGCTTCGCTTCTCGCGCGCACTCTGCCGTCACTAGAATATAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:3 - chr3R 3620763 5' + 1360 22 1 64.36 CCAGTAGTTTAAATTTTTTTTTGAATATACATATGTACATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTG:1 - chrX 23035801 5' - HMS-Beagle2 275 4 65.35 ATACTTTACACGAAGGTCTTTATGGTCGCAGCTTGTAAAAGTTAACAACATTTCAACTTGGCCACTGATAAGTCGGCCCAAAAAGAGCACATAAACAAAAC:1 + chr2L 20498181 5' - transib1 354 1 72.28 TTCTGCTACAAAACGCTATTTTAAAATCCTATAATGTTATGTTTTTGTGTAGTTGTATCGTGTTTTGTTTATGTGCCTTTTTTACAGTCAACTTAACAAAT:1 + chr3L 24241198 5' + transib1 372 1 67.33 AAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCG:4 + chr3L 24210897 5' - HMS-Beagle2 7169 2 53.47 TTTATTGTAGTGACTTCTGTTGGTATTAAGAATGGTTCAGTTGCAAAAAATAATAAATCACTCATATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTT:1 - chr3L 17762865 5' - invader3 265 2 67.33 ATATAAAAGAGAAACACGATTGTCGGAGGTCAACTTCCTTTCCGACTTTCCACTTTGTGCCCCCATTTATGACGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 - chr3R 21198701 5' + Tirant 4 2 77.23 GTTGACTCCCAATCATTAGAAACTGATTAAACCGACATTGCTTGTTCAGGGCGAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAAT:1 + chr3L 26570386 5' - 1360 274 1 64.36 GGGTGAAAAAATGTAGGCACTTGCTTTTCACTTTGAGGAACGACCACTAAAACCATGAAAAAAATAGCCTAGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATT:1 + chr3L 2528551 5' + frogger 2313 2 74.26 ACACGGATGTTGATGCATCCAATTAGGCGGGCAATTACCGAGCACCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1 - chrX 19034184 5' - hopper 1385 1 53.47 ACTAATTTCAATTGGTGCCGAGCCCCAACAACTCTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 10187371 5' + roo 40 2 66.34 TTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTACGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 - chrX 21945910 5' + F-element 59 1 74.75 CGTTCGTGTGTGACAATCAGTTTGATATTTTAGGTTAGGTTTCTGTGTTTTTATTACTTTTTCCCTGTTTTCTCTATTATTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr4 866614 5' + roo 8664 1 57.43 TTAACAACCTGAAAAACAACACCCATGACGTGGGGAACACGTAGAGGAACAAGCAGTGTGGGCACCTATAAGGATGCTGTTCACACATGAACACGAATATA:2 + chr3L 3535351 5' + roo 8667 2 74.26 AAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCACGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTA:1 + chr3L 24210897 5' - HMS-Beagle2 297 2 60.00 CAGTCCTCCTCCACGGAATATATATGTATATACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 5429611 5' + roo 45 2 75.25 GCAGATCATTTAAATAACGTATGTAAAAATGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 + chr3L 23421504 5' - copia 242 1 73.27 GAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGACACATACAAACACCATTCAATGTCAGATGGCTAGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 - chrX 12649914 5' - hobo 2929 1 64.84 GGGCAGTAATATGAAAAAATAGATAAACCTACCATTTTTATGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chrX 18161446 5' - roo 9037 1 61.39 CTCTTCCTCTTCCTCTTGTTTCAGATCGTTGGTAGCGCCGTTCTCTTCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGGCGGATGAAGGT:1 - chr2L 8536017 5' - Ivk 5036 1 69.31 GAAGGAGCACAAGGCGATTCATGCTTTAGCAGGTCAGTTTTAGAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTAC:1 - chr3R 24719138 5' + P-element 412 1 48.48 TTGCGAAAATAGTTAAATTACTTTTCGTTTATGGAAAACGGCTTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTGATTGCTTCTATTAAAATTCTG:1 - chr3L 12383871 5' - HMS-Beagle 6590 1 57.43 CCGGCACTCGACTGTCATGCTCGATGTCTGACATTATTCTATAGCAAACTTTACATTAAATATATGTCGCAGATCTTTTAAATGAAACGAAATT:1 - chr3R 17173120 5' + invader1 9 2 69.15 AACTTTGTTGCACAAAATTTATTAATTTTTTTTTTCGCCAAGTGCGTGCTTGGGTGTGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:2 + chr3L 17691314 5' + 1360 20 1 56.44 GAAAAATATGTATATTCAAACAAGTGTGTACATAAACCTTCTGCTCAGTTTGCAACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr3R 12055029 5' + Doc 27 1 53.47 AAAATGTTGGCTACAAATGGATTGCATTTCCTGCAGCTACTCACAACTAATCGAATTAACTTCGGCCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chrX 9544148 5' + roo 11 2 68.32 AAAATAAATTTATACATTAGTTAAAATAAATATTTCCCGCGAAAAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAAAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTA:1 - chr3L 20885077 5' + 1360 110 1 57.43 ACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAA:1 + chr3L 24210925 5' - HMS-Beagle2 258 2 77.23 AAATTAAATTAAATTGCGAAATGCGGAGCGAGAGAAAGAGAGAGTAGCATTCGAAACGAAAGGGACGGCGGACGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCT:1 + chr2L 19684572 5' + mdg3 5258 1 74.26 ATGTTGTGTTTGAGTTCTGACGTCAATAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGTACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr3L 9190464 5' - 412 7503 2 65.35 CTGGGAGCCAATTCTCGAGGATTGAGAAGATCAGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATG:1 - chr3L 12025653 5' + blood 7055 2 67.33 TTTACGAGCGCATTTCTGGGGGCGGCCAGGTAATGGTATTAGTACCAGAATTAGGCAGGAAAATTTCTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr2L 17213830 5' - hobo 2930 1 68.32 TTTTTTAAAACTTTATTGTAGTGACTTCTGTTGGTATTAAGAATGGTTCAGTTGCAAAAAATAATAAATCACTCATATTGTGGACGCCGAAAAATGAATAC:1 - chr3L 17762876 5' - invader3 276 2 76.24 CCACCCAGCATTGTCGATGCACTTCTGATAGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 - 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chrX 157127 5' + I-element 478 1 59.41 CGAAATGTTTACGCAAAATACGCGCACTCGTAATGCAGGCAAACTCACAGATTTGTACATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 + chr2R 19077912 5' + opus 7 2 70.30 ACGCACTCGAATGAACCAGACAAGACTCGAGTTCATTGTTCAATTATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1 - chr3L 1259891 5' - mdg3 5468 2 52.48 GACTGAGATTCGAGTGAGATACTTCCTCCGTTATGGCCGTCGCTCCAAACCTGGGGGAGGATTTACCGACCCATCGGTACAATTCACCACCCCTCCCTCTA:1 + chrX 18601571 5' + ZAM 20 2 78.22 GTTCAGATTATCGTCGTCAGTGTACTAACACTTATACCTACAGATGTTCCAAACGATAGGCCAGGGGCCTCGTCGTTCGTCCGTCCATCCATATCGGCGTC:1 - chr2L 23372863 5' - micropia 421 2 52.48 CTGCAATTTATTGATTTATTACAGTGCATATAGAGCGCATAATTTATTACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 - chr2L 3483581 5' + I-element 26 1 54.46 TTTTGTGGTATTTGTCATTCCATAAAATGGGGTGAGCTTGAACTGACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACT:1 + chr3L 26315769 5' + Tabor 6848 2 70.30 ACGACTTTTGCAGAGCCTAGTAGTTCCGTGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGTTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCG:1 + chr2L 15211152 5' - 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chrX 10196173 5' - 297 6956 2 65.35 CGAAACGATCTGGAGAAGTAAGTATTGAAGACAGATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 - chr2L 8492962 5' - blood 7350 2 66.34 GAAATGGCACAAATCTATCATGGTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3R 10187409 5' - roo 9017 2 80.20 CATACTCGCTTTTTCTTCACATTACATTGCTTTCGCTTTTAATTAATTTATCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAG:1 - chr2L 22179423 5' + Cr1a 4033 1 65.35 AGTTAATTTCATTTGATCGTTTGCACTGGACAAGAGTCCATGCCAAGCGGCTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGC:1 - chrX 7733640 5' - blood 350 2 51.49 CCACATATGCAGTTTTAATATTACAAAGCCAAAAGCATGTGTAGACATTGGCGCAGTGGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCT:1 + chr3L 23912359 5' + Cr1a 438 1 53.47 TCCCAGTTTGCACTGGACTGAAGTTAATCTTGGGGTGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATA:1 + chrX 16478783 5' - I-element 5089 1 65.35 ATATCTTGATATAGTGGTTATAGTTGGTTTTCCTAGTTCCAATTATTTTCACTTTGCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAGTAACCGCCGTTGGAAAAAA:1 + chr3R 15554400 5' - 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roo 379 1 54.46 GAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGTTATTCTAG:1 - chr3L 11257377 5' - 1360 9 2 47.52 ATACTATGTACGTACAACGGAAAACGGAGTTTAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 2992613 5' + hobo 42 1 70.71 AGTCTTGTAGCTCGCTCGCTTAATCCTCGAGTGCCCGAGGGGCTACAATGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chrX 21219420 5' + roo 28 2 55.45 CACCCAGCGAGAAACCAAACGAATGTGACACTGAGTCGCTGGAAAACCTTTAAAGTTCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCC:1 + chr2L 15001454 5' + Quasimodo 7044 2 67.33 AGGAGTCCTCCTCCTCGCATAGGAAATCATCGCGCCATCGGCATCGACCGCTCCACCGGCGGCTGATCACGTATCTGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGG:1 - chrX 11246836 5' - Quasimodo 6899 2 80.20 TTACGTAAGAGGGAGCGAGTTAATAATTAAATGCATAAATGCGAGCTGTTTTCTTTTATATATATATATATGTCGGCGAAACGGGCGTCTCATCCATATT:1 - chr3L 3739173 5' - invader4 317 2 69.00 CACTGATTCGTATTTTTCTGTAAATATTACAAGTATCTTGATAAGAAGAACAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAA:1 - chr3R 21702357 5' + mdg3 5192 1 63.37 CAATTCCCGAGTCGGGCAAAATGTCCCCCAAGAATTTAGCGTTTTTGTTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGATGGGCGCTG:1 + chr3L 25729311 5' - Cr1a 4413 1 58.42 ATACACACACACACAGAAAACACACGCACCCACACTGTCACGCACACATTCAAACGAAGTGTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3L 6338261 5' + hobo 14 1 63.37 AGGTATGAAACAGCAAAAAAGAAAAATGATTCTTTTTTGTATAATAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGAT:1 - chr3L 8903526 5' + diver 5920 2 60.40 AATTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chr3R 19513396 5' + jockey 4711 1 69.31 TTTTTATTTTTTGTTTTACGTTTTTACGATTTTTACCGTTATTTTGTTTGTCGGGAATCCACCGTAACCGCAAATTTCGCTGATTTATCATAATAGATTCG:1 - chrX 10852488 5' - gypsy9 5070 2 24.75 TCGGAATCCAGTCAACACCTTGCATTTTCACTTGGGTCAAACCCACAAAAAAAGGGAATTTTCTAAAAGAAACTGTTGGAATATACTATTCAAACTACAAA:1 + chr2L 11559900 5' + copia 4876 2 70.30 TACGGCATTGGTGTGGTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 15227358 5' - roo 391 2 60.40 AATTTTGCGAAAAATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:2 + chr3R 13620265 5' + Doc 34 1 59.41 GTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCG:1 + chr3L 25232765 5' - accord2 175 2 51.49 AAACGTAGTCCTGCCACGCCCACACCAGCCCCACTTCCACACCCACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chrX 20585945 5' + jockey 37 1 52.48 GTTTTATGGCTTCTTCACATACACATTTCACTTTATTTCCTTGCAAAATAAAGAAACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGT:1 - chr3R 14991767 5' - hopper 1397 1 61.39 CGTTTTTTTACGTTTTGGTTATTGTTAGCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chrX 157205 5' + I-element 24 1 53.47 TACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:2 + chr3L 8044324 5' - mdg1 7417 2 65.35 GTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGTCGAGCG:1 + chr2R 5206899 5' + Doc4-element 23 1 64.00 AGCTTGTCGAGTTGTTTCTGTTCACCTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACATTCGATTTCGTAC:1 + chr3R 13761340 5' - mdg3 5047 1 74.26 TTTTAGATTTTGCGTTGCAAAAATACATGTATATTTCTATTGCATCTTTGGGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 + chrX 4278322 5' - blood 351 2 52.48 GTTTTATCTCGATAAACAGTTTGGAATTGATAATATATTGTTGGTTATTGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTC:1 - chr2R 3522381 5' + copia 4866 1 59.41 TGGGATGATCTAGCTTATGTACCGCGCTCGTCTCGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTAC:1 + chr3R 13618021 5' - Doc 186 1 75.25 AAAAGGTCGAATATCCAGCATTTAATTTAAAAGACACGAATATTTCGACGGACTAATAGGTCTTGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCT:1 + chr2R 965784 5' + I-element 4966 1 38.61 ATTCGACTATCATTAAATTTATGTGGCGTTTCAATCTTCTTCTCGTTCTTGTCCGATGGCTCTGGGCTGCGATACTTAGTCGTCTAGCTAAACTATTAGGA:1 - chr4 1181508 5' - jockey2 3107 1 78.22 ACACGGACTCACTTAATGCTCCAGATTAAGACTATGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGGGTCAGCTGTG:1 + chr2L 20840223 5' + gypsy12 46 2 66.34 AATTTAAATGCAATAATTATGTTAATCATTTACGTAACGTTTTATTAATTAGTTAGTTTCGCAGATTATAAACAGCTAGAAATTGTAACGAACATTTTATA:1 + chr2L 11591741 5' + invader5 25 2 87.13 ATATGTGTGCTTTTGGCCCACTTTTGTATGATTTCTGCGAGGGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGG:1 + chrX 3452186 5' - I-element 5101 1 57.58 GCGAGCGAACGAGACGGGAAAGGACCTTTCTCGTTAGCCGTCTCACTCGCAGCCTATACCTGTCTCTATCTGTGTCTGTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCGCT:1 - chr3L 10811439 5' + Cr1a 294 1 79.21 CTCGTTTGCTCAAAGACTTTTACTCTCTAGCCCAGCGCAATTACGATTGCAGCTCTCACTGCTCTCACTCGAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3L 4692339 5' + P-element 5 2 74.26 GCTTCCATATTTTACTGCATACTTCTAGGCTGGTTGAAAAGTAAAGTTTGAACTGCATTCACACACTTATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr2R 13934365 5' + jockey 12 1 76.00 GGCCGATGAGAATTTTTCCGACTTGCATGTAGGCGTATCGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGTTAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTATGTA:1 - chrX 7616751 5' - Cr1a 4187 1 59.00 GGTAGGTGTTTTGTAGTCTAAACTTTTGCCTCGATTTTATATATATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1 - chr3L 14854763 5' - mdg3 5468 2 60.40 GTTTGGTAGCGACTGGCGCTGTGACTCCATAGATGTCGCTGGTGTGACACTTAAAGGCCACGGTAAATTTAAAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTC:2 - chr2R 14434372 5' - invader4 328 1 74.26 GGTGCATCCAGTAGTTTAAATTTTTTTTTGAATATACATATGTACATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCG:1 - chrX 23035808 5' - HMS-Beagle2 282 2 58.42 ACAGAAGTTGTTTGCAGCTGAGTTTTTACCCCAGACATGAAATCTAATTTGAGACAAAAGAAAAATAAACAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chrX 20835182 5' + roo 8669 2 72.28 ACAATTAATAAAATGTATTTAGTTTAATAAATATTACTAAATTGCTGTAATGATGAACTTCCCGTTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr2L 21018858 5' - 412 460 2 51.49 AATTTAATTTAATAATTTTCTTTTATTATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGTTTCGCGGGTGATT:1 + chr2L 21362554 5' + Cr1a 126 1 67.33 TTTGAGATTTCACTATTCAGCTTAATTCATTCAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chrX 12152715 5' - roo 9029 1 69.31 AACCGAAACAAAGCCACAAAACGACATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTT:1 + chr3R 5974798 5' - hopper 1364 1 75.25 AAATCGAAACGAGATATCAAAAGGCAGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATT:1 + chr3L 10711636 5' - I-element 4940 1 75.25 CGCATCGATTTCAAAGTTTCTTTCTCTCGAATCGTGTGTTTTTCTCAGTGTACTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAAACTGAGTGGCACGACTTAT:1 - chr2L 9211292 5' - I-element 26 1 56.44 AGGTGAAAATAGAAGGGCCAGCTTTGTTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:2 + chrX 11503455 5' - roo 9049 2 57.43 CGTTCATCATCGTCGTTTCTGGGGTGTTTGTGTGTTTTTATGCTAAACGGTGCTCCCGGCTCAATTATTTATAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chrX 5892425 5' + I-element 20 1 71.29 AGCCCAAATATGAAGTCGAAAAGTGTGTGTTGTATGTGTTTAAAAGGGTTTGGCTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2R 16384293 5' - roo 9050 2 57.43 CAGAAAATGGATTCATGTAATCAAAGTTTACGCAAAACTTTAACAAAAGACTCGCTGAACCACATCCTCCGTCCAATTCCTCCAACTCTTCTGCTGCTGA:1 + chr3L 18101125 5' - invader3 480 1 72.00 CTTAGACATTAATGTGTATGTGTGATTGTTTACTTATTCCTAATTTTTCATTTTCAATTCCTCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGAGAC:1 - chr3L 26007756 5' - G5 4759 1 51.49 TAACCATCCATGAAACAAACCCAAGCGAAGGTGCAATTTTCCACTTAATCATATACTAGAGACACTATTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr2R 5753390 5' + P-element 6 2 71.29 AGACGGCCCACGGCATGTTGTGCTCCAGAAGCAAATAGAAAAAGCTTTAAATTTAATGGAAAATGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:2 + chr3L 18523571 5' - 412 482 2 69.31 ACTTCTATTCTTTCGCATTATCCATACCTGAATGGCTTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAG:1 - chr2R 992498 5' - mdg3 5304 2 64.36 CTCAGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGC:1 - chr2R 5303138 5' - FB 227 1 51.49 CCTATAGCTGCTCATGTCAAAGTCAGATATCATCCAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGC:1 + chr2R 23596423 5' + 1360 42 1 65.35 CAAAGGCAAGACGCATGCCTCGTAAATATGCAAGGCAGCAAAAACTTAGACAGACAGACGCCCCTACAAAGGATGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 - chr3R 7242067 5' + jockey 83 1 72.28 ATATGGATTTAGATGGCTATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGTGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTC:1 + chr3R 15130486 5' + Max-element 50 2 74.26 CTAATAGAAAATACAATCCTAATAACTGATATAACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTAAATTTTTAGATTTCT:1 - chr3R 6107989 5' + 1360 3271 1 67.33 CATCCAATTAGGCGGGCAATTACCGAGCACCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 - chrX 19034169 5' - hopper 1370 1 68.32 GAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:2 - chr3L 22231368 5' + Doc 50 1 78.22 GAACTGACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACGTTGGGAACAA:1 + chr3L 26315808 5' + Tabor 6874 2 70.45 ATTCAAAACGAAAGTAACAGAAACTATTTCGCATGGAACCGTNGCTTCTGTACTTCCTTCGATCCATTCCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTG:1 + chr3R 25526316 5' - transib2 2817 1 68.04 CTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3L 10576848 5' + roo 40 2 70.30 AAACGCATTTTGTAGACGCGCGTGTTTGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr3R 11183292 5' - hobo 2895 1 70.83 AATTGGGTGGGGGAAAAGTGGTAGGCAAATGAAGTGGCGTTTTGATCGCACGGCATTTAATATTACTTATGTTTCTAACAACATGGCCTTTTGACTCTACA:1 - chr3L 5580536 5' - G4 439 1 68.32 TGTCATTTTTGAAATTGTATCTTTTAAAATTCTCGATATTTACTACATTTAAACACCCCACTGATGATACAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:1 + chr4 306397 5' - blood 7383 2 72.28 GGCTCCATGGCATCCGAACTCCTCGAAGCAGTTGTACCGCACCTTCTTGCTCTCGCCCGTGCAGCAGTGTTCTGATTTCAGATAAACATGGAAACCGTATT:1 - chr3R 20927402 5' + Cr1a 427 1 67.33 CGCGGGCTGAGTGCCAGTTAGAGTGTGTTTAAGCAAATAGGTCGGCACACACAGTCACATTGCCACACCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 + chr2L 10933321 5' + hobo 7 1 71.29 ATGTCAAGAAGCATTTACACACAACGCCAGCCGTTGGTGAGGCAATAATTTATGCGTTTTTGACTTGGTTTCTTGTTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCAT:1 - chr3R 29351609 5' - Doc2-element 4383 1 80.00 CTAAACAAAATATAAGCTAATGCGAAGTAGTGCTATGCAAATAGATGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGT:1 + chr2R 2591507 5' - hopper 1134 1 54.46 TATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTC:1 - chr3R 934262 5' - Rt1b 4756 1 59.41 GTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGTC:1 + chr2R 5206899 5' + Doc4-element 18 1 62.11 GACTTACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chrX 21945944 5' + F-element 26 1 61.00 GCGGCTGTTGTTGTACAATTGTTGTACTGTTGTTGAGTTTATGCATTTGCAGCGTTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGT:1 - chrX 4778636 5' - hopper 1397 1 61.39 TACAATTGACAAATTATCCTATAACATTGAAAATGAATTAAAAACTAACAGTTTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATGTTT:1 + chr3L 25869495 5' - G5 4605 1 61.39 TCCAGCCAGCCACAAATTGGCGCAAAAAATGGGCATAAAAAAAGACGATCACGTTTTAGTAACGGTTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTTGCTCCAGGCTC:1 - chr4 40756 5' + 1360 69 1 74.26 GAACTGGATAATTTAGATTCACGATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2L 18417350 5' + roo 8716 2 75.25 ACCTTATAATTTTCTATAAAATTTAAAATGTTATGAACTGCAGAATTGAAACTATATAAAGTATTTATATTCTTGATCAGGGTCAATAACCGAGTCGATCT:1 - chr4 855466 5' + INE-1 97 1 55.45 CTAATCTTGAGCAAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr2L 9672409 5' + 297 6605 2 53.47 ATTTTTATTCGAGATAACGCGTCAGCTACGATATTTGTTGTTCCGGGTAAATATATTATTTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAA:1 - chr2L 21607618 5' + F-element 88 1 63.37 TCGAATGAACCAGACAAGACTCGAGTTCATTGTTCAATTATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTAAT:1 - chr3L 1259885 5' - mdg3 210 2 56.44 AAAAAAGCCAGTTCACTTTTTTTGCAGTAACTGACACAGCTGCTGCTCTCACATGAATGAATATTGAGTACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 + chr3R 22341096 5' + hobo 5 1 74.26 TTTGTTACTTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - chrX 3295675 5' - hobo 2904 1 59.41 ATGCCCGCCCGTGCGCCAATGCTACAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAG:1 + chr3R 21591970 5' + Bari1 49 1 75.25 CACTTTTAATTAAAATAGTAAATAAAACCGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCA:1 + chrX 3333374 5' + pogo 157 1 72.28 GTATTGGCTAATAGACCATTAAACTGGCCAAGGGTATAACTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTTTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCG:1 - chr2L 6693309 5' + diver2 279 2 61.22 CTCCTGGAATGATGGTCCTGTCTGCATATTGTATAAATACCTGGGCAGAAAGTTCTGCCACCGCTGTCAAACATTAATTTAGCCCTGTTGGCTCCCGTCCC:1 + chr3R 3468494 5' + mariner2 237 1 75.25 AAGACTATAGATAAAGGTCAAAAATGAAATATTGTATGTAAATTCAATTCACAGTTGCTAAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGTAGCAT:2 + chr2R 10552694 5' + INE-1 569 1 88.12 GAATGTGTGATTTTAGTGGCTCTTTCTGTTGTTGTTGTTGTTGTGGCTGTTGTTGTTGGTGGTAGCGG:1 - chr3L 10509093 5' - F-element 411 1 83.82 GATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAATTATTAAATGTTT:1 - chr3L 19339404 5' + Tc1 53 1 69.31 TTCTCACGAATACTGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chrX 11503523 5' + roo 42 2 72.28 AGAACACACACTCACACCACATTCCCCCCCCCCTCCTCCAAGGCACTACCGAACCCCCTTATCTACAACTTTAAAGGGCCACGCCCACTTTTCCAAA:1 + chrX 5254496 5' - hopper 110 1 62.89 TCGGTTTTGGTTTCAGATTGGGTTAAGTTTCGGGTTAGTGAATATCGGAGGAAAAGTGATCTGTTAGTTGACGCGAAGGCTCTAACTTTTTAGGCGGGCAG:1 - chr2R 9508283 5' + Gypsy12A_LTR 489 1 68.32 GCAAGTTATATCAAAATTGCAATGCTAATAAAACAATGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 22162664 5' + roo 38 2 64.36 CTTCCCGCGGTTTATAGAAAAAACAAAATGGATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAAATAAAAGGGTGGATGAGTGAAGTAAAAGAACCA:1 - chr3L 16050407 5' + invader2 350 1 80.00 CAAAAAGTAGGCAACGATTTTTGGGCTGCTGCTGTTGAGTTTTTATACCCTCTTGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGT:1 + chr2R 20410927 5' + jockey 4692 1 52.48 GTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 + chr3R 4504086 5' - blood 329 2 74.26 TGTGCCTTTTCTCCCCTACAATGGGATGAACCTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 + chrX 22664368 5' + opus 154 4 67.33 TGTTCCAGTCCCCCAAAGTGGCTAAGACCCAGAGAATTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAA:1 - chrX 5177992 5' - hobo 407 1 64.36 ATACTAAATAAAATCGAATAGGATAGGAATAAGATAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTG:1 + chr2L 10189450 5' - roo 9031 1 63.37 TTCGATATGATGTTCTGTGGAGAAAAGAAACAAAAGATACACCTTTGACCAACAAAGCATATAAGATCTTTAGCCCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3L 21393423 5' - roo 409 1 79.21 TTCACTTTTTACTACCAGTCCTTTTTATTCCCCTTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAA:2 + chr2R 25216549 5' - 3S18 6061 2 66.34 TAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCA:1 + chr3L 24210893 5' - HMS-Beagle2 290 2 57.43 CACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGC:3 - chrX 10298042 5' + Quasimodo 54 2 82.18 CGAAGGCGAGCCAGGCGCCAACAGATGGGAGTGCGAGCGAGAGACAGATAGGAGAAAGAGCGAATTTCAGGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - 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chr3L 24208845 5' - HMS-Beagle2 205 2 73.63 TATCCCTCGCCGTTTGTTTGACCAGAGTTCAGTAAAAATAAGTTTTGCTTGTTTTTTTTTTGTTTGGCTT:1 + chrX 16204762 5' - Porto1 251 1 71.43 AAATAAAGCGAGAAATGAAAACGTGGCAAAAGTCAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTT:1 + chr3L 5267184 5' + Juan 3970 1 78.22 TTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTT:3 + chrX 21564087 5' - invader4 3056 2 55.45 GGAATGTTGTGACTTCAATTCTAAGTTGTAGTTTCAAATCAGGGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:2 - chr3L 12565710 5' - roo 9040 1 54.46 TGTGTTATGCATAAAGTTTATGCGAACATAATACGCTGTAATATAAGTATATGTATATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr2R 20689863 5' + hobo 20 1 57.43 GTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chrX 17492870 5' + Tirant 15 2 66.00 ACACTGCACCTGAGCAAATTGACTTCTGCAATCGTGTTTTCTTTTCAGCATGAAACAAATGAAACCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGG:1 - chr3L 1985385 5' + Max-element 13 2 64.00 CGTCAAATAATGAAGCCAACATACTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGAACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chrX 5168865 5' + hobo 31 1 62.96 ACAGCAGCTCTGTTCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - 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transib1 2086 1 58.42 AGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGG:1 - chr3R 15790080 5' + flea 4730 1 57.43 CATCGCTAGCATCCCAGAAATGAGGAGTAGAAGAAACACGGACGAACGAAGCACCGGGGCGGCTACAAAAAAAAAACAAAA:1 + chr2R 10914176 5' + G2 3071 1 65.43 AAAGTATATAAAATTCATAGAAATTATGACGCGAGCGCAGAAAGTTGCAAGAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chrX 15219359 5' + hobo 24 1 55.45 GGGGGGCGAAGGAGGGGCAAACTCAACTTGGAACTTCGAACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGAACACACTAAGATCAGTGATAAATCAGGAAT:1 + chr2L 12910254 5' + mdg1 7348 2 57.00 ATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1 + chrX 17492905 5' + Tirant 8158 2 77.23 CTGGCAGCCGCCTTTGTGGGATATACATATAAAAAACCAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCTTTACTCAGCTAATGTGAATG:1 + chrX 10445560 5' - INE-1 535 1 75.25 ACGTTTTAAATCAAAAAGTTTTTCTATGGGATTGTTTCAGTTGGATGATTTTTACGCTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGGAGGCATAGGTTCAG:1 - chrX 14455816 5' - Fw2 3547 1 61.39 TTGAATCTCATTACAATTGCAAAGGCACAGCAAGCCCCCAAACCCAGACCGGCCACCCCTTTCAGCAAACCCTACACCATCAAGCACCCAAGTATCTCCAA:1 - 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chr3R 20183059 5' - roo 9055 2 63.37 ATTAGCCGAGACCTTTACATGCTTGATACATATATGTATATGCATATGATGTACGTGTATTAATGCTTCGTGAAGTTACAAAAAAAAAGAAAAAAAAACAA:1 + chrX 13590507 5' - hopper 144 110 80.20 CTGCTGATTATGTAACAAACTGAAAGCGAGTGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3R 23870150 5' - roo 9044 1 53.47 TTTGGCCAGCACTTTAGTTTCGTTAGGCCATAAAAGTTTTGCAGTCTTTTTGACTTTTGAAAGCCATGATTTTGCTATTTAGGATTTACATTGTGTTAGAA:1 - chr3R 17461333 5' - TART-B 10285 1 74.26 GCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr2L 23372626 5' + 1360 7 2 55.45 TTCTCGCAAAATATTATGGCTTCGCTTCTCGCGCGCACTCTGCCGTCACTAGAATATAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAA:1 - chr3R 3620745 5' + 1360 55 1 53.47 TATTTAAATTTTTAGATATTTATTTCCCGTTCTGTTTTCGTAGGTAATTAGTAATAACAAGGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 + chr2L 5393556 5' - blood 363 2 62.38 ATATTTGAAAGGATAATAAACTTTAAATTAGTTGTTAATAACTACCGTTTTTTTCGCCATTCGCGCCCAAAAACACAAACAAAGTTTAAAA:1 - chr2R 16700373 5' - Tc3 1545 1 52.75 TTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGATACAAGTCTAACTATAAAATAAGCGGAGCTATGCTTCAGAAA:1 + chr3R 19045995 5' + gypsy11 404 2 64.29 AGCCATCCAACATGACTTCATTTCGCATTTCTCCGCCCCCTCCGTCGACCGCCTGCATGATGAATGCCTTTTTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 + chr2R 15057579 5' + hobo 5 1 72.28 CTGCCAATGCAACTTGCAACACATTGCACACAGGCAGAAGCAGCAACAGCAATAGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chrX 7429439 5' - hobo 2918 1 58.42 ACGGATCAACACATTAATACAATGTAACCTTGCCTCCATCTTATAATATCAAATGAAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAA:1 - chr3L 27389120 5' - I-element 5338 1 54.46 CGAACTGCCAAAATGGCAAATCCAACTGGCATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2R 13720422 5' + hobo 42 1 65.35 ATACTGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chrX 11503514 5' + roo 8715 2 81.19 ATCTACAGTGTGGCTTAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chrX 17492861 5' + Tirant 8114 2 72.28 AATCAAATTAAAGATTTATGATCCCCAAGCAAAAAAAAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCC:1 + chrX 9457571 5' + I-element 315 1 66.34 CTCATCTAAAATTGATTTTGCTCGGGAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3R 20384488 5' - roo 357 2 77.23 TGGAGATTGCCTGCAGGAATACCCGGAAAACTTGTGCCTTTTCTCCCCTACAATGGGATGAACCTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCG:1 + chrX 22664336 5' + opus 8 2 71.00 CATCTTCTCAGTCTTAGTCTTTCCAGGAGTTCGGTGAAAAAAGTTACTTTTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2L 15798618 5' - roo 386 2 56.00 AATAGTATAACCGACTTAATTAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGATTAAAAA:1 + chr2R 3522327 5' - copia 115 2 57.41 CTGGATCAGATTCAATAGCAGAGTCAGTCTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCC:1 + chr3L 23494813 5' + 1360 61 1 64.36 CTCATTAGACTTGTTTTCTACTAACACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAA:1 + chr3L 18734323 5' + I-element 205 1 75.25 AGATGTTGAGATTGTGAGTACTTCTTGGAATTTGGTTATCTATTATAAAATGGATCCATATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGC:1 + chr3R 19448304 5' - Porto1 4196 1 64.36 ACGTGTAATTGTGGCGCCGAATTAACGCGGCTCACTCTCCATTTTAAGCCGAAATGTCACCATTAAGTTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCC:1 - chr2R 17350166 5' - jockey 482 1 57.00 ATAGCACACCAGCATTTCTTCGCTCCAGGCACTCGACTCTAAATCTGTTTATGCACAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr3L 18523672 5' + 412 21 2 58.42 TGTGTTCTAGAAAATTCACATGTAGCAAAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 - chrX 22713226 5' + Tirant 46 2 73.27 AATAGGTACATTTCGATCAATTTAGGCAAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr3R 7015504 5' - roo 9029 1 68.32 GGAACACGTAGAGGAACAAGCAGTGTGGGCACCTATAAGGATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 3535384 5' + roo 36 2 62.38 GAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:5 + chr3R 11080693 5' + I-element 34 1 58.42 GACAGATTTGGGCGGTTCTCGTTGTAAATACCAGCAAACTGATTTATATAGTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCAT:2 - chrX 21564164 5' + invader4 28 2 52.48 AGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:2 - chr2R 17348630 5' + jockey 22 1 60.40 AAACTAATGAAACCTATTCTCTTGATATTGACCAACTTGATCATGTCTTTGAACTATTTAAAGTAAAAACCAAATTCTAGATAAGTCAACCACTGGTAGAC:1 + chr3R 2208336 5' + Idefix 6984 2 71.29 TACTATATCATATAGTAGTCCCACAAATTGTATAGTAATTTTCTATGCATGTGTGTGTGTGGGAGGACTGGGTATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTAC:1 - chr2R 20593438 5' + copia 4 2 75.25 TGGCGGTGGTGCAGCCCCTCTTGGTGATCGTCGATTCGTTAACTGTGGAGCAGGTGGGTATTTGAATAAATCATAACGATAATAATAATACTAATAATATT:1 - chr2L 8344092 5' + mdg1 7071 4 82.18 TTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:2 + chr2L 18417320 5' - roo 357 2 75.25 GGAATTTGTATCTGTGATAATCCTGTACTTGTTTTTATATATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTG:1 - chr2L 23310033 5' - invader4 295 2 66.34 ATATTAACAACGTTTTGAAACAAGTCGAAGATAATGGACAGAGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 8133987 5' + roo 8699 2 62.38 TGGTGCCGAGCCCCAACAACTCTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 10187383 5' + roo 52 2 78.22 GTATATAGCTGTGTGTGCCAGCAGACACTTTATGAACACACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 8898877 5' + roo 35 2 62.38 GTGAGAAAGTAATGTGTGACTCCCTCTATTTCCCCAAACTGAAAGCCGTCGACGCAGAAGGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:1 - chr3R 5555994 5' - mdg3 5483 2 64.36 AAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 - chr3L 17635580 5' + 297 6614 2 66.67 CATTTGGAATTGATAATAAATTTTTGTTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACCGCCATGCCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCTCTGCCGTGTATCGTACG:1 - chr2R 3550647 5' - Cr1a 4399 1 66.34 CTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr3L 8044328 5' - mdg1 375 2 69.31 AAATGCATATTAATATGATTAAGATTGAAATACTAGTCAAAATAAGAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1 + chr2R 12007207 5' - mdg3 5468 2 58.42 CGCACGCTCTCCTCAGTTTTTCCCCACCTTTCCTCGCCCAGCGTCTTAATTAGTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 - chr3L 9293744 5' - mdg1 398 2 55.45 CCTTTATAACCCCTTGAAATTTAGATAAAACAAAAAAATTGATTGGCGAACATGTCTGAATAGTCTGGTTCTTCATTCATATCATAACAAAATACACTTCA:1 + chr2L 5748478 5' + 1360 362 1 22.77 CAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACG:2 + chrX 15408750 5' + INE-1 535 1 82.18 TTGCATATGTTTTGCATGCATATGTAATACATAATATATATGTACATACATATATCATATTCATATGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGA:1 - chr3R 12468339 5' + invader1 3614 2 64.36 CAAAACTTAAGTACATAAAGTATAGTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGC:1 - chr2L 20840257 5' - gypsy12 10149 2 71.88 GTTAAGTATTAAATTCAGCAACACAGGTTATTATTTATCAAATATGAAGATGAAATACTGTGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGT:1 - chr2L 14993478 5' - 412 7532 2 63.64 CTGAAGTTGTGTCTTTAAATTGTAGTTAGGTTCAAAAAATGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATT:1 - chr3L 18978520 5' - roo 374 1 59.41 ATACTAAAGCCAAAAGGTGAGAGCGGAAAAAATAGAGAGAGCAGCGCCGCATTCGTGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 - chr2R 14575885 5' - pogo 2083 1 61.39 AAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAATTGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAG:1 - chr3R 15790083 5' + flea 4725 1 51.52 GGAGTGTAGGCGTGGCACCAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATT:1 + chrX 21667972 5' - Tabor 487 1 74.26 GAGAGAGAGACACATGCAAACACCATTCAATGTCAGATGGCTAGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chrX 16943524 5' - hobo 2920 1 50.00 AAAAGAAGCATATGCCCACTCTTCTTACTCGTGATTGGTTATCACACTTGCAAACTCGGCCAAAGTGGTGCCAAATCAAAGATAATCTTAGCATCAACGAC:1 - chrX 18972751 5' + diver 5628 1 73.27 CTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATT:2 - chrX 21668065 5' + Tabor 6881 2 65.35 TTAAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGGCAGAAAATAGAGAAACGCCTCATTTCGCGCACTTTTGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGAACCGTTACATT:1 + chr3R 13945961 5' - Tc1 151 1 56.44 TGATAAATCAGAAGTCACGCCAAAATACGCAGCGAAAATGAAAACATTAAGGATCAGGTGAAACGGAAATATAAATATCAAAATGAAGATTGTGAAACCTA:1 + chr3L 17179021 5' + Transpac 4817 1 53.47 TCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:3 - chr3L 3535440 5' - roo 9031 1 65.35 AAAGGGTATAAAAGGTATAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr2L 5654861 5' - roo 9012 2 83.17 TTAAACGTATGCAGAGCAGAAAATTTTATCTGGCCATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 - chr3L 3537902 5' + Doc 69 1 65.35 TTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATT:1 - chr2L 16379007 5' - HMS-Beagle 212 4 60.40 GCGATTATCATGGAAAGTAGTTTATTGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3L 21393507 5' + roo 49 2 76.24 CTACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:6 + chrX 17492863 5' + Tirant 9 2 72.28 GCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:2 - chr2R 17348624 5' + jockey 28 1 54.46 GTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:2 - chrX 15227343 5' - roo 9039 1 59.41 ATAAATAAATCAAGGCATTTTGTTAGACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTC:3 + chrX 21564058 5' - invader4 326 1 78.22 TGTTAAGGTCAGTTCTGTTTACTCACAAAACAATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCAAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTAT:1 - chrX 7339954 5' + G2 2626 1 64.36 GATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAATAATAATAAACAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chrX 8037624 5' + roo 8695 2 59.41 TAGGTATGCTCCATGTTCTTTTCTTCGAGTGTTCGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAA:1 + chr2L 1010195 5' - I-element 5036 1 66.34 ATTCTAACTATGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 - chr3L 14504286 5' + 297 41 2 68.32 ACCATTTCAAATCAATTAGACATGGCCACCAAGAAGAAAAAGAGCAAAAAGGCTCTGAGAACACGCAAGAGCAGCTCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCA:1 + chr2L 2746108 5' + G6 407 1 57.43 CGTTTATTTGGATTGATTAAATGAAACTGAAACTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAATCTTTATTTG:1 + chr3L 4681581 5' + Cr1a 4029 1 64.36 TTTATTTTTTCATTAATGTTTGGGAAATATAACTCTCTTTTGAGTTTTAGTGTCACTTCATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACC:1 + chr2L 23374392 5' + Idefix 7032 2 67.33 AAAGCTGTTGTCAAATTTGAGCAAGTTTTCAAACAATTACATATAGAACACCTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGC:1 - chr2R 3823484 5' + Max-element 26 2 72.28 GGTAAATCACCGCCAACTACAACTGCCGAAACGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 + chrX 3446499 5' + I-element 8 1 69.31 GAAAATGAAAATAAATAGCAGCCGGTACCAGGACACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 - chrX 12193521 5' - 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chr2R 25216596 5' + 3S18 5806 2 68.32 CACTAAGTGTCTGCAAAACAATCAAAATCCTGCATGAACTATGTTACGGTGAAACTTAGTGTAGTTAATTAAAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 + chr3R 13191421 5' - mdg1 7439 2 61.39 GTTTTAACGTGTGCTGCTGTTTTACTGTAAAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGA:1 + chr3L 7854819 5' - blood 178 2 70.00 AGTAACATTTGTTTTACCAAGAAGCACAAATATATGCTTCATCGTCTACTACGAGGCATCTTGTAGTCCGAAACTTTAACAATTTGTACTTGATTTTGTTT:1 - chr3L 947650 5' + accord2 7241 1 78.22 AATCATGTCGCAGAGGGTAAGCTTTAAAGGAAAACCAGAATTATTTCTTTATAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAG:1 - chr2L 12484807 5' - pogo 1955 1 73.27 AGCCCAGCGCAATTACGATTGCAGCTCTCACTGCTCTCACTCGAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 - chr3L 4692311 5' + P-element 33 1 46.53 TAATTCGAAAATGTTATCTTTCCATAACATAACTTCGAAGCAGCTCGATTGAAACTTAACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 4304338 5' - roo 389 2 59.41 GTATAGGAAATGCGGCAGACTGGAGAAAAAACCAAATGCTGAGCGACAGGCGGAGAAAAGGGGGTCTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - 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Doc 371 1 70.30 ATCAAATTCAAAATGTCATTCCAAGTGCACAGCGAAAAAAAAAAGGAAAACAATAA:1 - chr3L 2820533 5' + Doc2-element 252 1 76.79 TTTTATGGAAGAGCATTTATTTCCCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAACAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAT:1 - chr2R 3522026 5' - copia 5071 2 82.18 ATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTC:1 - chr2L 23295857 5' + micropia 4993 2 63.37 GCAGGTTGTTCGGATAGCTCCTAGGAAACCAAGGAAAACTTCAAGTTACTCTTGGGACTATTGTTGAAGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2R 12998389 5' + roo 9 2 70.30 GCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr2R 5531206 5' + 1360 55 1 72.28 GGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:2 - chr3R 19515862 5' + 412 41 2 65.35 ATTTACAGTTGTAAATTAAATTTCCAACTCAAACAAATCAGCCAAAATACCTTTCAATATCTCAGCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGC:1 - chrX 7462695 5' + F-element 4486 1 67.33 TGATTTATTTGATATTGATAACACCAGAAATATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTC:1 - 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chrX 13640322 5' - P-element 2869 1 62.38 GGCTTATTTTTACCTTACGATTGTCAAGGAATTAAGAGATGCTTGTTGATGTTCTAAAAAGGAAAGGAAAACATAGAGAAAAAAATGTATTTTGAGTTATC:1 + chrX 22708348 5' + invader5 3619 1 70.30 TGTACTATCGCAGTGCTGGTTTGGTTTTTTGGTTTTGTTGTAGTCGAGGATATGTATAAGTTAACACGCGCAGGGACAAAATCGCTAACTCCACGATAAG:1 + chr2R 18061900 5' + gypsy4 6591 2 47.00 GCTGGTGTGACACTTAAAGGCCACGGTAAATTTAAAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACG:1 - chr2R 14434335 5' - invader4 3050 2 64.36 AACTTTGTAATGAGATATCGCAGCATTTTGAAAGCTAACAAAAATGTATATTAACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr2R 16149790 5' - 1360 3368 1 58.42 CCAAGTTTGTGGTGGTATGAGTAGAGTATGAGATAAATAGTTTCTTTTGTTATTATAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGAC:1 + chr3L 17690924 5' - flea 4934 1 63.37 AACTGATTAATCATTTCGTGATAGGATCAGCTTATTAAAGATCTCTAGAACTTTACTTAAAACCAGTGTGTAGAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chrX 12510390 5' - roo 9060 1 66.34 AAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTAAACA:1 + chr3L 19038312 5' + HMS-Beagle2 24 2 62.82 TTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAATCGGTACTCTAGGC:1 - 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roo 399 1 67.33 AATGCAGCCGGTGCGAGCCGCCGTCGCCAGGTGGCGCGCTGACCTTAGTGCGCCATGGGCGCCATCTTTCGGCAATATGGACGAATGGAACAGAACTCTGG:1 - chr2R 12274451 5' + Porto1 4271 1 76.24 TTGGCGAAGTGGTAGCTCCTCCAAAACGGCGTCCAACATGACCTACATTCCGGATCCGGGCGACGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2R 12249689 5' + jockey 18 1 67.00 TGACAATGCAATAAAAACCAGATTGAACAGTAGACAGAGAAAAAAAAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 10572449 5' - roo 9027 1 54.46 ATTGCGTGGCAAACATTTAATTAGTTCTCTAACAGAATTAGCTATATTTAAAGTTACTTTTCTGATGCGTAAATCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3R 7879797 5' + 1360 5 2 75.25 ACGCATAGTTCCAGTGTGTAATTGCTCTGACTGCTATCCCAGTACTGCCACCGACATCACCCTCAAAGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCT:1 - chr2R 6253324 5' + accord 68 2 76.24 ATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3L 19349927 5' - 1360 3380 2 65.31 CAAGGATAAACGTAATTCAACAATGAAATTTTGCGCAACACCAAACAATAAAGTAGTTCTTAATCTAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:2 + chr2L 18977880 5' - roo 400 1 70.30 GCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 - chr3L 22231375 5' + Doc 43 1 71.29 CATTGGAATTTCTTCCTTTCATCATTTTTCTTCACCACGCTTATCACCTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAAT:1 + chr3L 10660736 5' + Max-element 8265 2 54.46 GAACTAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr3L 22231364 5' + Doc 53 1 82.00 TATGTTCTAGAGCTTTAATATTTCTCCATCTGCAGACAACGGGAGCGTGTATTTCTCCAAAATCTGTATGTACACTTCCTGAGATCTCGACGTTCATATGG:1 + chr3L 27157638 5' - INE-1 135 1 56.44 AGTTGCACCAGCAGTTGGACTCGTGATTACTTTGACATCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3R 11478453 5' - roo 9041 1 62.77 ACAAAATTATCAAACTAATCCAAAGAAAATCGACGAGAAACAATAAACAAAACGAAAATATCAGCGTATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAA:1 + chrX 16503297 5' + Porto1 231 1 63.37 CTGATTTTCTATTTTCGCTCGCTACGGATTGCAGCGGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCAAAGACACTAGAATAATAGAATAGAATATTCTAGTGTCTTTGGT:1 + chr2R 601790 5' + Tc3 312 1 72.28 AAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:2 + chr3R 11080679 5' + I-element 20 1 58.42 CGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - 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1360 3353 1 56.44 ACGACACCAGTTTACGGAACTTGTTATCAGGATTTTCGAAGCTATTTACATCCAAGCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 22699002 5' - roo 389 2 59.41 CTTTGGGCCATTTCATTTGTGNCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chrX 5168826 5' + hobo 12 1 66.34 CCGCATGACCAACTTCTTCGACTTGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 20835260 5' - roo 358 2 75.25 AAGGATTTGCGTAATTTGCACAATGTTGCAGCACAATATTCCCCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2R 20973072 5' + roo 33 2 59.41 TCATTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCTCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 + chr3L 25884073 5' + Doc 24 1 50.50 TGGATGGAGGAATTGGGCAGCCGTGCGCAGGACCTTTGCAAAAAGCGACGAACTTGCAGGAGTGAAGAAAGTCACCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chr2R 15402948 5' - roo 408 1 78.22 TTGGTGTCTAAATGTGTATGTGTGTGTTGATTGATAACCAACCGTCCAACCCAAAACAAATAAATTATCATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 + chr2R 22825383 5' - opus 492 2 71.29 GTGCGTGAGCTTTTGTGTGTGAAACCTGTTTTCACACACAAAAGCTCACGCACGCCAAGCTTAGGCGCACACAATTAAAACAAAAAAAAACAAA:1 - chrX 9474260 5' + Doc 4700 1 68.09 CACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 - chrX 21668068 5' + Tabor 39 2 62.38 GTCTTAAAATTCCCCACAAATCTCGTGTAGGGGAGTGGCCTAGCAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTT:1 + chr4 249150 5' + F-element 4215 1 57.00 GTAAATAAAACCGTTTGTTCGAAAAGATGCACGCCTTGAAGAAATGGGTTAAAGCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:2 + chrX 3333391 5' - pogo 2081 1 59.41 TTGTGCCCTGTGTGTGTGAAACAAAAACGTTTGTTTCAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2L 3842841 5' - roo 9033 1 65.35 ATTTCGTTAGGGGTTGAAAGGGCGAAAAGAAGTACTTCCTAGATCCTGGCCGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGT:1 - chrX 12940581 5' - I-element 329 1 52.48 GTCGGACGAACAAACTTGACAGCGCCAAGTTCCGATAGCGACTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr3R 23669613 5' - P-element 2874 1 55.56 AGGACCTTTGCAAAAAGCGACGAACTTGCAGGAGTGAAGAAAGTCACCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2R 15402920 5' - roo 9043 1 54.46 TGCAATGCGACAGCTAGAAATAGCAGGCACTTATCCGCCGAACAATAAGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 - chr2R 7307920 5' - 412 464 2 53.47 AGGCCTACGGATAGTCCGGCGCTCTTTTTCTTCAACTTTGGCGGCGGCGGCGGCGGGTGTGCGACTTCAGTTTTACCATAGACCCTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3R 13996023 5' + 1360 4 2 71.29 GCATCCAGTAGTTTAAATTTTTTTTTGAATATACATATGTACATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTT:1 - chrX 23035805 5' - HMS-Beagle2 279 2 61.39 AACTCAGTTATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:2 - chr3R 19515877 5' + 412 7079 2 53.47 GATGCATGACTCGAAATAAGCTGGCTGTGGCCTATAAATCACGGACAGCTTTCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:1 - chr2R 14402324 5' + Tabor 6862 2 56.00 CATATCTACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:2 + chrX 17492858 5' + Tirant 8111 2 77.23 TTTTTTATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3R 19515796 5' - 412 7520 2 52.48 CGCGGAAGTTTTTGTTATTTCAGTTGGACTCTTTGGTTTATTTGATACTTCCCGTGTTCAGTTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGC:1 - chr3L 26744358 5' - invader2 137 2 79.21 CCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCACATACCTCACCTTGATATGACA:1 - chrX 22664412 5' - opus 7452 2 78.22 TTAGTCAAATATTTCTTAACTTGAGAAAGGAATCCATATAAATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGC:1 + chr3R 7639778 5' - HMS-Beagle2 7174 2 56.82 ATATTCCTCATCAGGATAACTAGAAATACTACACAAGATCGAACAAAAATGATTTGGGTAGATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAA:1 + chr3R 4600782 5' + Burdock 6 2 72.16 CCAAAAGTATGCGGCCAGGTAGCGAGTCCTTTGTCTGCCACCGGATATCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2R 13724822 5' + roo 26 2 53.47 CATTATAAAATCTGACAGAAAGCCATTAAATACACACACACATATATAACCACATAGGAACAGCCATACACTAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTC:1 - chr3L 19938341 5' + Quasimodo 91 2 69.31 GAAGAGTTGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGGCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGA:1 - chr2R 17402783 5' - invader4 300 2 56.99 CAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAG:1 - chr3R 15790062 5' + flea 4747 1 71.00 TAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGCGACTCTTTGCATTCCAGAAATTCTGTCGAGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAA:1 - chrX 21852423 5' + invader4 89 2 55.45 GCAGATGGCAGACACTAGCGGTGGCCAGGAAGTCCTCGATGACATCCTTGCGAGCACTCCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTT:1 + chr3L 13360929 5' - hopper 1394 1 58.42 AATCTGCCATGGCAACGGACCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTT:1 + chr3L 5573548 5' - mdg3 5442 2 76.24 GCGATGTTGTGTTTGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3L 9190461 5' - 412 453 2 64.36 CTAGTAGCGAGTAACGAGAACTGCAGTCGTTCTTTGTAAATAACGAATACTATAGTGTTGTAAAATATACAGTATACTTCGCTTAGCTGCGTCGAGTACTT:1 + chr3R 21587220 5' - pogo 2090 1 68.32 CCCATAGACGACATCTTTGAACGGTCTCTCGCCTCCTGACCAACTGATATTTCCGATAAACCAGCGTCAGCGATTAGCCTCAGGCACTTGTTCTGGAAGCG:1 - chr2R 557003 5' - G-element 3971 1 67.33 TATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACAC:1 - chr2L 22780911 5' + HMS-Beagle2 6925 2 68.32 TTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGA:1 - chrX 20678115 5' - Porto1 4560 1 80.20 GATGTGATGCGATTGCAACGATGGTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAATCAGAAACGTAATTGTGA:1 + chr3R 12949470 5' + jockey 60 1 73.27 ATAGATGTCGCTGGTGTGACACTTAAAGGCCACGGTAAATTTAAAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGA:1 - chr2R 14434344 5' - invader4 3059 2 57.43 TAGCCCAGCTCCGGCGATCTGTTTGCTTCGTTTTTGAGAGCAACTGACGCAAGGGAGGAGAGCGGGAGAAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCG:1 - chr3R 6112789 5' - Max-element 8314 2 54.46 TAAATAAATCAAGGCATTTTGTTAGACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCA:2 + chrX 21564059 5' - invader4 3084 2 77.23 ATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:5 - chr2R 17348626 5' + jockey 26 1 56.44 TACAGCGAAAGCACGTCCGTTCACGACCGAAGTTGCTCGCGATTTGAGAACATAAACAGAGCAGACAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3R 24720081 5' + P-element 10 2 69.31 TAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTAT:1 + chr2R 9870986 5' - roo 9034 1 60.40 ATGAAGGGAGTTGAGGTCCCTGATGGTTTCGTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr2L 20269977 5' + pogo 42 1 73.27 ACTTTGCGTCTGTCGCAACATCGAAGCCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAAC:1 + chrX 16469119 5' + I-element 448 1 74.26 ATACCCTCTAGAGTTACATAAGTGGGATTCCCACATTTTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCG:1 - chr2R 1986270 5' - INE-1 147 1 60.40 TAATTTTTCCCCTTGCCTTCGGATCTCAGATGCATATTTTATGGTGGCCACCTGCCGCCCATTGCCACCCACTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAA:1 - chr3L 18757010 5' - F-element 4461 1 75.25 AAGGTGCGCTGGCATCAGCAAAATATTGTCATAGTACTGCGACCAGGCATCCTGGATCTACAGCCATACTCCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 - chrX 14371381 5' + jockey 6 1 80.43 AAAAAACTATCATCAATAGTTGTTGTTGTTCTTGATAACACGGCCTGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCTGAAGCTTACCG:1 + chrX 13640235 5' + P-element 27 1 50.00 GTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATT:1 + chrX 21564086 5' - invader4 3057 2 54.46 CGACCTACTACAATTTTTGGCATGTCTTCGTATTCTCATCATCGTTAATTCCGCCTGCTTCTCTTGAATCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCTTTG:1 - chr3L 24508849 5' - X-element 4378 1 70.30 GTGTGAAACAAAAACGTTTGTTTCAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:2 + chr2L 3842854 5' - roo 356 2 77.23 AGCGACGCCTAAAAAGCGGCAACGGAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chr2R 17277648 5' + jockey 16 1 48.51 GCTTAAATATGCATTGCAAAAATGTAAGCTGCTTTCATTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr2L 5654896 5' + roo 8702 2 64.36 AGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr2R 1725922 5' + Doc 46 1 70.53 GAAACCTAGAAAATTGGTTAAATACAATTTAAGATGGTAGTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 - chr3R 10480415 5' - mdg1 7420 2 61.39 TTTATTAATTATTTATTTATTGTTAGTTAATATTTGTTTAATTTATTTTATTTATTAACTTTGCTGGTGGAGGTACTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 - chr2R 24463227 5' - TAHRE 10431 2 48.51 CGTCTGCAGCGCTGCTTTGCACTAATTTTGCAATGCCAAATGGGTGGGGAATGGGTGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chr3L 18793080 5' - P-element 2868 1 60.40 AAAGAGAAGACAAATATGATAATTATTGCTTTGCGTTAATGTAGAATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAGTATTCG:1 + chr2R 7009424 5' + McClintock 5979 2 54.46 TAGTTAAGAAGATTCATTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 + chr3L 25884060 5' + Doc 11 1 63.37 GCGTGGAAGAAGATAGTGAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAAGAATTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr2R 1009291 5' + 1360 55 1 80.61 CTACACGGGGACACGACATCACGGAGCGCCACACAGGCGTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTT:1 + chr3L 13652181 5' - mdg3 5460 2 62.38 TATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGTAAGCGACCGTT:1 + chr3L 24210903 5' - HMS-Beagle2 280 2 53.47 TTGAATAACGCTAACTTGAATTCATGTTCAAGTTATTCTCCGTCAAATGCATGTACATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAA:1 + chr3R 13236370 5' - Quasimodo 7352 2 51.00 AGAAATTTCCTTCCCGTTCAATCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTGCAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 + chr3R 30076433 5' + hobo 52 1 73.27 ATATCACCAAAATAGACCAAAAACTGTAGTGAATAAAATATAACATTATTTTCAAAATAAAACTGCAATGATAACTTTTTTAATAACATAATGTATACGTT:1 + chr3L 18265186 5' - S2 1391 1 36.63 CAGCAGATCGAAAATTGCTATGACGAAACATATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCTAAATGCGCACGGTGTTTTT:1 + chr3L 10630751 5' - baggins 5110 1 69.31 TTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 - chr2L 17729352 5' + hobo 55 1 76.24 TCAGCAGAATGCTGTGTATATTGATCTAAGCTAGATTGTTCTATATCGCTGTTTGTCAGCTACATTATTTGTTGTTCCGGACAACAACAATTACAACATGG:1 - chr4 296981 5' - transib3 335 1 79.21 CTAAAAATAAAGGCCATGACGAAGTCGATGAGACATGTGTACCCATAGCGGGTACATGCGATATATATATGAATATATATATAGACATATACATATGTATG:1 + chr2L 7087558 5' - Stalker2 7499 2 81.19 ACGACATTTAAGCGCTCAAAATTATGGCAAATTGCTGCAGATTGAATTGGTTTGTGTGCCTTTCCTGTGGGTGTGTGTGTATTTCTGTGTTTTTGTTTCTT:1 - chr3L 8038695 5' + pogo 299 1 61.39 GGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCA:2 - chr2R 2868557 5' - Rt1b 4729 1 44.55 TAAAAGAAACTATAAGCAAGTACATACTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGAT:1 + chrX 8303418 5' + flea 4803 2 75.25 AATACCCGTTAGTGATGCAAGTTTTTAAATGATTTGAGATACATATATATATGTCGCCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTT:2 - chrX 16906749 5' - invader4 3056 2 64.36 CTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 - chr2R 1725936 5' + Doc 38 1 58.42 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGACACATACAAACACCATTCAATGTCAGATGGCTAGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chrX 12649914 5' - hobo 2935 1 68.32 CATACTTCCGTGGGCCTCGTATACGCAATATTGCGTAGCCGCCGTGTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTA:1 + chrX 9816229 5' + BS 4991 1 75.25 CGCAAACGGCGGCAGAGAAATAAAATTGTAGCACACTTTCGCGGGCCATTCCGTTTATGCGGGCCGAGTGTGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAG:1 - chr2L 10119533 5' + flea 4758 1 77.23 AAAGAAACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATT:1 + chr3L 11257350 5' + 1360 3376 1 48.51 AACAGGTTGATGCCAGGTATCACAAAGCGCAGAGTTGCTCTACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAAAAATAACCCACCAACACTAC:1 - chr2R 990855 5' + I-element 4964 1 55.45 CATGCATGGCGAGAGTTGGAGGTAGGGTTAGGTTAGACAGGGGTCATCAAGCATTTTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr2L 21810711 5' + pogo 17 1 46.53 AAGGTGGGTGGTAATAGAGCCCTAGTGTCGCACATTTTTGCGCGACGCTGCATTTTTTATTTTTTTTATTTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTG:1 - chr3R 4546111 5' - jockey 4977 1 51.49 TTCTGACTTTTGATGACCTTTTCTTGTAAAGTAAAAAAAAAAAGTATGTAAAAGGCTGAAGGAATCGTTTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGT:1 + chrX 20804952 5' + INE-1 91 1 74.26 GATGCGGCCCTTAGGAATGTCGCAGAAGGAGACGCTGGCGAGAATAAGGCATATGTACGCATGTTCTCACTCCCGAACTCCTCC:1 - chr3L 23311671 5' - gypsy8 434 1 71.43 TGGTTGCGGGGAAGCGGCCTAGTAACTGTTTATTTCAAGATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAGG:1 + chr3R 2446829 5' - 1360 481 1 78.00 GCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGAGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 - chr2R 17348592 5' + jockey 61 1 79.21 GCATAAAATTATACAGTAAATTGGTTCAAAAAAGATCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chrX 11299980 5' + roo 8705 2 66.34 GTGCATCGTATGTGCGTATGTACAAGTGCGTATGTCAGTGCATGAAACACTGGCCGGAAACCCGTGTGCAGCCGGCAAAAACACCATATTTGCGTGGCCGC:2 - chr3L 24510185 5' + Gypsy6A_LTR 105 1 66.34 TTTTTGGCGTATTCTATGGCATATTTTCACTGCCTTGGTCCATTGGCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:2 - chrX 17416977 5' - roo 9041 1 55.45 ATGGAGAGTAATATAAATATAACAACCAAGAATGCAGAAAAAGTTTGTCAATCCTTTCTCTTAATACTTGAAACTGTTATGTTACAGCCCGAAAAAGTTAA:1 - chr2L 19682866 5' - hopper2 1501 1 68.32 TGACAGAGCTGAAAAAAAGTGGGCAGAACGTTGGACTTCTCTCAATAGGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATT:1 - chr3L 21810514 5' + Quasimodo 165 2 56.44 GAGCATTTCCAAGATCGCGAGACGACATAAATTGTCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr2R 11399181 5' - 412 452 2 65.00 CAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:3 + chrX 17492894 5' + Tirant 8147 2 66.34 TGGTGTGGTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 15227350 5' - roo 9046 1 53.47 TATATTTTGTAATATTTTGTAATCCATAAATCGTTACAAATCATAAAAATAAAAAAAAA:1 - chr3R 5240641 5' + BS 5098 3 44.07 GTAATGGGGATCTTTTCTGGGATTTAGATTGCCACACGATGGTCGTGTGAAATGAGCACTTTTGAGTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr3R 21587338 5' + pogo 7 1 70.30 TGTTTTATTTTTTTTTTAATCGGGAATTTGAAATCTAATTAGAGTGAGTGCGCTATACTGTTATTATGCCGTTTTGGAAGATTAGAAGCGTCGGTCATCGC:1 - chr2R 2533556 5' + Burdock 6287 2 76.24 AGATTTGGGCGGTTCTCGTTGTAAATACCAGCAAACTGATTTATATAGTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATAT:1 - chrX 21564161 5' + invader4 30 2 54.00 TTTATCTGCCGCTACTTTCCCCTTATATTTCTTCAAGCAGATTTGACTGCTCTCTTTGAACCTTTTCCTAATCTTAAGAATCCAAGAGCGATGCTCTCCCG:1 - chr2R 1366119 5' + 17.6 7188 4 66.34 CTAAACGACAAGCAACAAAAAGCAACGAAGGTGAAACCAAAAATGGCGAATGGCAGGGTCTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTT:2 + chrX 5128841 5' - Doc2-element 231 4 74.26 TTTTTACCTTTGTGCGACATTGAGGGCGTGCCTAAAATAAGGGGCATACTGGAAAAAACATAAATAAGGGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGA:1 - chr2R 25216627 5' + 3S18 5775 2 69.31 AAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:3 + chr3R 11080694 5' + I-element 35 1 59.41 TAGGATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTG:1 + chr2L 22092962 5' + INE-1 543 1 54.46 GGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr3L 25884079 5' + Doc 30 1 45.54 AAGGACTTTTGGGCGTTCCAAAAACGCGATCAAGTTCCGCTCCCATTGGTTTTTAGCTGGTGAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 - chr2R 11399258 5' + 412 14 2 65.35 CACGTTGCAGCGACATAAATAAATAACATTCATTTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chrX 21219524 5' - roo 408 1 80.20 TATTTACTGAATAAAATTAATAGCAGTGCAATCACTCCTATTAATTTTATTCAGTAAATAAGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCA:1 - chr3R 17635028 5' - Tc1 193 1 73.00 CAAGTTCATTGACCTGCCAAATAGTGGGCGAGAAGAGTGCGAAGTGGCGAGTGCAAAAGAGAGGAGAGCGCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr2L 16276096 5' + 1360 6 2 73.27 TTATTGCCATGTTCGCAAACACGGTCTTCAATTTTCATTAGGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1 + chrX 17432394 5' - hopper 1385 1 57.43 GTACATGTAGGTCGATGTGAAGAAGGAAAAGCATTAAGGACATTCAAAAAACTCTTGAATGTGCTGCCAAAATGGTATCCAATACCATTAAATATGAATG:1 + chr3R 5365249 5' + HB 469 1 79.00 AATAAATCAAGGCATTTTGTTAGACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATC:1 + chrX 21564061 5' - invader4 323 2 75.25 ATGCAGTTTAATGAAACATCATAATTTATAGCTTATTATCGGATGATTGATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAG:1 - chr4 304711 5' + 1360 3162 1 57.43 TACAAAAAAGTACATCATATTTTTACTGCAACACACATTTCCCAGTCCCAACTCTTTCCTTCACTCTTCCAGTTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGA:1 - chr2R 9726634 5' + INE-1 554 1 44.55 CCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGTGCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCT:1 + chr2R 11247001 5' - 1360 110 1 62.38 TTGCATAAAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chrX 10196086 5' + 297 26 2 57.43 CTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAA:1 + chr2L 21737998 5' - invader4 279 2 74.26 TTTCCTTGACATCCAGATTAGGTACACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 + chr3L 14286019 5' - 412 7494 2 78.22 AATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAA:1 + chrX 21668002 5' - Tabor 7296 2 50.50 TAATATGATGGGTATGCTTAAATATGCATTGCAAAAATGTAAGCTGCTTTCATTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2L 5654911 5' + roo 23 2 56.44 CCCACTCTGCGATTAAGGGTTATTTATTTTAATATCGTTAACACGTCGGTCATGCATACAGCCTTTCATTTTCATTGTGCAAGCAATTTCTTGGCAAACTG:1 - chr3L 26640368 5' - S2 1 2 72.28 CCTCTGGAAATATCCGAGTGTATTCTCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATG:1 + chr3L 26019374 5' - Stalker 6818 2 73.27 GCTTAGGTAATGATAACGTCGAACGCGTTGCTCTTATTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 - chr3L 15353583 5' - mdg1 7422 2 63.37 TTATCACATTTGAATGGAGATTATAAGAAAATTCTATTTTTAGATTTTTTACGCTCTCAGCGTGAGCAAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAA:1 - chr3R 2457889 5' + 1360 3323 1 72.28 GTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTA:1 - chr2L 23295892 5' + micropia 2 2 73.27 ATGGTGGTGGTGGCTGTGAATGGCGAATGGTGACTATGCGACTATGCGAGATTAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCT:1 - chr2L 1346617 5' - 297 6608 2 57.43 CTCTTGCAGCCTGCCACCAGCTGCCCAGAATGTCCTGGTTTGTCTGGTGTCTGGGATGCCTCCTAATGATACAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr3R 12546902 5' - hobo 2935 1 74.26 TTCTTGTTCAAGTGGTTTTTCAAAGATTAAATCTGCCGAAGACAGGTTATAAAATATAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 - chr3L 21410169 5' - opus 483 2 62.38 AGATTGTGAAAACTTTTTTGTAATTTTTGTATAAATTTAGAAGCCGTTCAAAAATGTTTTGTATATAACTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3L 18978429 5' + roo 8671 2 70.30 TATCCAAATTTCTTCTTTCTCCACATTTCATCACATTTATTATATAAGTTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTAC:1 - chr3R 22043603 5' - Burdock 221 2 58.42 CTACGCATACAGTGACAGCACACGTATTGTTCATGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGG:1 + chrX 3464221 5' + hopper 37 1 74.00 CACATAAAACAGAAACAGGAGAAGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTC:1 + chrX 20796875 5' - G2 2793 1 77.23 CTGGACGGGTCCTGCACAAAAGCGGCTCAACAGTTGCCGCCCCTGGGAAAATCAAAGGATATTCAGGCGGAACAATGGTGGTGTTCACACATGAACACGAA:1 + chr2L 16569442 5' + roo 8663 1 79.21 CCATAGAGCACGATACTAATCTGCCATGGCAACGGACCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTT:1 + chr3L 5573531 5' - mdg3 208 2 59.41 CGAAGGCGCCCCGAGAATGCCTCTTGATGTGCTATTTTTACAAATTTTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATG:1 + chr3L 5266893 5' - Juan 4110 1 54.46 CAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCA:1 - chr2R 17277629 5' + jockey 35 1 49.50 CTCTACACAGACGGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGAGGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTTACATCCTGCTCATCGA:1 + chrX 19820614 5' + Rt1b 4958 1 73.27 ATTTGTAATGATATCCACTTGATTACTCCAATCATGAATTTTTTCTGTTCAAAGACAAAAAGCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACTTAT:1 - chr3L 26540504 5' + Tc1 214 1 66.34 TATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCT:2 + chr3R 15130485 5' + Max-element 49 2 75.25 GGCTGCAGTTTCCCAAAAGGTGGAGTACCCCCACAAAAATTATGCAGGCAATTTGGCCCAAAAACTCTTACGTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 - chr2L 9129225 5' - 412 7542 2 71.29 TGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTA:2 + chrX 22726203 5' - Helena 1265 1 50.50 TATTTACAAATGAATCTCTATACTTTTCTTGTTATTTACTTTATTTATTTAGCTTTTGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr3L 16138176 5' - opus 483 2 64.36 CAAAGTACAAAGCAAGCCATAAACGAAAAACGAAAGATGAAAACAATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAA:1 + chrX 7599962 5' + micropia 5282 1 63.37 CAAGTTGCCACAAAAGAGCACTCTTGCCATAAATCATAAAACCCACGCTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 19983005 5' - roo 9044 1 55.45 CTTTGTGCCCTGTGTGTGTGAAACAAAAACGTTTGTTTCAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2L 3842839 5' - roo 9035 1 63.37 ACAATGCGGCACATCGGCAGCGGATGGGCTGTGGGAAAGTCGGCGAGGAAAATCAATGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 14135482 5' + roo 17 2 57.00 ATTTATTAAGACCACCCATATTAAACTACTTATTAAGCTATTTCTAGGTGTTTGACCCTACTTTTCAAGCGGATATTGGTTATTAAAACACAGAGTGCATT:1 + chr3L 25851572 5' + mariner2 198 1 65.35 ATATGTGCATCGTATGTGCGTATGTACAAGTGCGTATGTCAGTGCATGAAACACTGGCCGGAAACCCGTGTGCAGCCGGCAAAAACACCATATTTGCGTGG:1 - chr3L 24510189 5' + Gypsy6A_LTR 101 1 62.38 GCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGA:1 + chr2R 5532365 5' + Doc4-element 11 1 53.47 GCTTGCCTCTGGATGGTGTGGCTAGATACACATGTGCACAATATGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 - chr2R 9214141 5' - Transpac 294 2 59.55 TATATGTGAGTATATATATACATATAGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 - chr3L 8843610 5' + I-element 51 1 73.27 TTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCC:1 - chr2R 2868549 5' - Rt1b 4721 1 52.48 TAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCA:1 + chr3R 15130469 5' + Max-element 28 2 54.46 CTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 + chrX 3446536 5' + I-element 45 1 74.26 TTTTGTTTTATTTTTTTATTTATACCTTATTAAGGCATACGGGTTAGCTGAAAACCCCTTTGTCACCTTGGTATCTATTAATTCAGCCCTTGCAGGCGCGC:1 - chrX 8509937 5' - BS3 1699 1 82.18 TGTGACCTATTATGTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chrX 5178887 5' + hobo 14 1 62.11 CTTCACTGTATCCTTTTTTTATGTTGCGTTGTAAAACCAGTTGTTGTTATGCCCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr3R 28326505 5' - P-element 2866 1 58.42 AATTATATCAGAAGTTAAATGTAAGTTAAATATAATACACACACTGGTGTATTGTGGTGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGC:2 - chr3R 4600889 5' - Burdock 238 2 62.38 ACAACATGAGGCACTGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCAT:1 + chr3L 19274784 5' + transib2 11 1 68.32 GAGGGGCGGGGCAAAAGGACGATGAAGCTCAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr2R 18374834 5' + 412 45 2 73.27 ATGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAACGAACTTGTTCTGCGTCATTCTCTGTAGAATCTGTCGCATCCGCTGCATATCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCT:1 - chrX 14770555 5' - INE-1 156 1 88.12 TAAAATAAAATTGACGTATCAATTTTTGCCAGTATAATTGTATTAATTATGTTTTGCTATTTCTACTTTAACATAAGGGATTCCTAAGTCTTTGTGGATAC:1 - chr3L 24230887 5' - G4 3550 1 55.45 TTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATAC:1 - chrX 10298037 5' + Quasimodo 59 2 87.13 TGACGGCATCGAGCAATGCTTTTCTTTTTTTTTTTGGCCAACATCATCAGCATCGAGTGCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 + chr3L 5321105 5' - mdg1 412 2 65.31 AAGTGCGCTTGTTGATGGTAGTTCCGGACGTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTCCTCAGAATCTTTGATTGTGCTC:1 - chr2R 3032005 5' - F-element 4326 1 70.30 GAGCATCGGGAATCCGCCCATCGACCTGCTCACTTGTTTACTTCGACTTGCCATAAGTTCTTTGTGATTGAGTATGTTATTGTTATTGTTATTATTATTG:1 + chr3R 9423896 5' - mdg1 7062 2 71.00 CATGATTGCGTGCACTTGTCTGTTGTTGGTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr2L 12888860 5' + 412 7102 2 71.29 CAAAGAAGAATTAGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACAT:1 - chr3L 24210993 5' + HMS-Beagle2 10 2 67.00 CAGTTGATTTGCATAAAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chrX 10196078 5' + 297 6599 2 52.48 CATATCCTTGGAGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr2L 1530405 5' - roo 9040 1 57.43 GTGTTTACTCTTCGAGGGACGTGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTA:1 + chrX 22590170 5' + Burdock 6191 2 82.18 CTAACCAGCACTTGACCAAGTCAAGTCAAGTTTAGTTAGTTTCTAGTTTAAGTTCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAAT:1 + chr2R 23598980 5' - 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3S18 321 2 62.38 GTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:2 + chrX 17492868 5' + Tirant 13 2 68.00 TGACAGCTCCTTTGGGCCATTTCATTTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 + chrX 5168817 5' + hobo 3 1 76.24 GACGGCCCACGGCATGTTGTGCTCCAGAAGCAAATAGAAAAAGCTTTAAATTTAATGGAAAATGTTGTGTAATGTTGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 + chr3L 18523572 5' - 412 7534 2 68.32 ATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr2L 18417308 5' - roo 9033 1 63.37 CGCCAGCACTTAAGATCATAATTAGTGTTTCTTGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1 - chr2R 24555701 5' - hopper 1391 1 54.46 CAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAGAA:1 + chrX 7480770 5' + Doc2-element 231 2 59.34 CACGACCGTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTAT:2 - chr2R 3341945 5' - Dm88 4130 1 60.40 GGAAAAAAGAAAAGCTCGAACATAATGGCAGTGAGGAAAAAACTATTTGAATTTAATTGGGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 + chr2R 3521964 5' + copia 4886 2 62.38 ACAGGCCTACACTCGAATAAAATAATTGCTGGAGAGCGGCAGTAGAGATTTTAGTTAATATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chr3R 6138342 5' + 297 10 2 56.44 ATTTATATCTAGTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGGGTTATTAACAATATCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATT:1 - chr2R 17350600 5' - jockey 344 1 72.28 TTTTTTGTGGTATTTGTCATTCCATAAAATGGGGTGAGCTTGAACTGACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 + chr3L 26315767 5' + Tabor 7 2 72.28 ACTAATAACTAACAAACCAAACTCGTTGTGTTTCGTATTAGAACTAATTCACTCATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 19066069 5' - roo 9050 2 63.37 AATTACCGCGCAACACCCACTTGGCTTCGAGCTCCGTTCCCTTGCATATTTAACGTGCTCTGCTTTTTCGATCCGTCCACTTCCGCACCATGGGCAATCAT:1 - chr3R 2206769 5' - Rt1c 5066 1 72.28 ATTAAAATAAATTTGATGATCTAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCT:1 - chrX 17530986 5' - mdg3 5259 1 79.00 AATGTTTGCCTTGTTCCGAGGCACAAACATTCCACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCA:2 - chrX 22664459 5' - opus 496 2 77.23 TTCTGCCTTGCGGAAAACAATCAAAAGCTAATTTACAATGCATTCATAAATCCCACGCAGATCAAAAGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCG:1 - chr2L 10778249 5' + G5A 2596 1 41.58 TCCTTTTACCAATAGAACAAAACCAGCACAAAGCGCCGCGGTTAAAGTGGAATGACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2L 11073754 5' + roo 8685 2 58.42 GTGGGCGTGACAGATTTGGGCGGTTCTCGTTGTAAATACCAGCAAACTGATTTATATAGTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGT:2 - 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hopper 1367 1 58.42 TATTTACTTTGATGTAAATGCTTCATTTAGGTACCTACTAAGTTCGAAGCTATCTCGGAAAACTCACAAGATGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTT:1 - chr3R 25214941 5' - Burdock 6152 2 77.23 GTGGACCCGTTCACAACAACATTAAAGCCAGTTTTGAGAATGCTGTTTAAGTTTATGCCGCATCTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAG:1 - chrX 3293805 5' - hobo 480 1 65.35 TGTATAACTTGATAAAAAAAAGAAAATAAAAAAAAA:1 + chrX 9736117 5' + Doc2-element 256 105 86.11 AAATATTTCTTTGATTTATTTGATATTGATAACACCAGAAATATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCAT:1 - chr2R 577867 5' + invader1 35 2 60.40 TATTCAAGGGTAGTTGGTTTAATTCATGGTCCACTTTATTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 - chr3L 735096 5' - mdg1 7421 2 60.40 ACGATAAAAAAAAAAACAACAACA:1 + chrX 9600118 5' + gypsy11 3930 1 91.67 GAAAATCAAAAATAAAAAAAATGTTTACGTCTAATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 - chr3R 21894822 5' + F-element 20 1 71.29 AATAAATTACTCTCATTAAAAGTGACTTTATGGGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAG:1 - chr3R 16110228 5' + mdg3 44 2 67.33 TCTGCACTGCCCGATTGTCTGCTACCTCACAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATG:1 - chrX 21657057 5' + Stalker2 7342 2 70.30 GCACTAGAGCATAACACATTATGCTTTTTTATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 + chr3R 19515772 5' - 412 491 2 76.24 ATTTGGCTAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAA:1 - chr3L 24210965 5' + HMS-Beagle2 39 2 70.00 TATTCCTCTTATCGCAGCCGCTTTCGACACTTGGGCGAAAAAGTTCTTGCCCCTTCTAAGCCAGCGAGAAATAATTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAG:1 + chr2R 8186178 5' - Ivk 383 1 73.27 GAAAACCAGTTGCCACAAAGGAAAAGAAGCCCACAATAACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 - chr3L 12229414 5' - mdg1 385 2 60.40 AACATGACTGGAGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTT:1 + chr2R 4577066 5' - Chouto 499 1 60.40 TGTTTACTCTTGTTTTGTTTCTAGATTATTTGTATACTTTTGTTTTCGGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - 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chrX 21945924 5' + F-element 47 1 63.37 AGGGATTTTATGTTGCTTAAGATCGGGTCATATTTTTTGGTTATGAGGAACAGACACAATTATACCCAAATTCGACCGGACTCGATCAAATATAAATAATA:1 - chr2R 1345122 5' + I-element 4922 1 59.41 GATATAAGGCAATGGTCCCTTGCGATTAAAGCGCGTATTTCAGCTGGCGGTTTACCAGCGTTTTCATCTATCAGCATGATGTTTTCCTTTCCATTTTTGAA:1 - chrX 22643453 5' - invader5 3590 1 72.28 ATACCAAGACGACAAATATCGATAACTTTCCATGTTCACTCTTCTACTCTTTTAACATTAATGTTATGAGCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr2R 19164080 5' + P-element 5 2 61.39 ATTTATGATATTCAGTCTTAGACAGATAATACATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAAT:1 + chrX 16906685 5' + invader4 41 2 68.32 TTTTAAGATGAAATACAAATTCTAACATAAGCCCAAAATATTTCGGATATGGATATGTTTTTGAATTGCATATTAAGATAATTTATAAGCAAATTAAATAT:1 - chr2R 15001663 5' + S-element 1596 2 88.12 AACACAATAAAATCCAAAAGGAGTGGACGGAGAAGGAGAAAAAGGAAGTTGTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGTTTGCTGTAATGGTAGCT:1 - chrX 12358252 5' - Doc3-element 484 1 53.47 GGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chr3R 11080690 5' + I-element 30 1 55.00 AACATCAAAATTTCGTGCATAATACAAATAAATCAAACCCAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATAC:1 + chr2R 2144944 5' + Stalker2 7286 2 58.42 CTCAGTTAATGACAAAAATCTTTCTTTTACTGGCCTTTTGTTTAGATTATTTCTGAAAATTCCTTAACAGATTTTCCCAAATGGTGATTATAAAAAATCAG:1 + chr3R 2472652 5' - S2 439 1 54.46 TTCAAATGGCATATTAACTTACTTAGGCAAGCATGAAGGCAGCAGGCGAAGGATTCCAGCCGCCCAGTGTTTGGTCAGTTATTATTATTATTGCAATTATT:3 + chr3R 11076944 5' - mdg1 28 3 58.42 AAGGCAGGGCACTAAGGTCGCAAGAATGCTTTAAAAAATTCTTCACATCTTGCCACCGTTTTATTTATACACACGTACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 - chr2L 9854222 5' - hobo 2938 1 76.24 GACAAGCAGGCCCTGGGTATTGTAGTGGAATCGCTCTTCTCTGGCATTTTGGGCCACCAGACCAAAACTCACACACACACACACACACACATATAGACACA:1 - chrX 12329506 5' + accord 7036 2 62.38 ATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGG:1 + chrX 22726196 5' - Helena 1272 1 46.53 GTTGAGAAATAGAAGAAGGGACAACACGCAGGCGACTTGCTGTGCTGATATTATGTTTCATACACTGAGCCAACTGTTCTACTTCGTTGGTTTGTGTTAAC:1 + chr2R 2190238 5' - Gypsy6A_LTR 2 1 51.49 ATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGA:1 + chr2R 4860116 5' - micropia 33 2 65.35 GTTATAAATTTTGGTTAAGGTTTTAGACAATATTTATTTGTGTAAGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACGCTTC:1 + chrX 22576302 5' - Burdock 156 2 44.55 TTGCATATAATTCGTATCCTGATTTGTGAGTAAATTAATGTACTAGACATATAAGGATACGAATTATATGCAAAATGTATTTTATTTTGTAATTTATTTT:1 + chr2L 11810145 5' - HeT-A 309 1 80.00 CTGCTCTTTTACTATTCATGTTGAGCTTTTGCTTTGAACACCTCTCAACGGATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr2L 21018782 5' + 412 23 2 61.39 GACTCGACTTCAATGAGAGTTGAACGACTCCCGCAAAAAACCGTAGAAAAGTTTCCTCCGAGAGGTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 - chr3L 19115932 5' - hobo 2929 1 67.33 ATAATGACCCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAG:1 + chr3R 15130451 5' + Max-element 8245 2 61.39 TTGCAATTAATTTAAGTTGGTAGGTGTTTTGTAGTCTAAACTTTTGCCTCGATTTTATATATATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1 - chr3L 14854781 5' - mdg3 234 2 67.33 AAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATC:1 + chrX 18975563 5' + diver 5936 2 67.33 TAAAACTAGACGAGTAAAGCGTATCTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr3R 5594967 5' + 1360 49 1 75.25 GGCAATCTCGGAATTATTGAATATTTCCGAGACAAGTTACGAGAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2L 6047850 5' + P-element 27 1 51.52 TTTTGAGAAAGCTTTCAGAAACTCGCTTACATCTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - 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Doc3-element 4336 1 72.28 TTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1 - chr3L 24210972 5' + HMS-Beagle2 6913 2 61.62 AGGAGAATGTGTGTGTAAAGAATGCCTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGT:1 + chr3R 8970947 5' - I-element 4891 1 74.26 TGTTCAGTCTTGTAGCTCGCTCGCTTAATCCTCGAGTGCCCGAGGGGCTACAATGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chrX 21219415 5' + roo 8687 2 57.43 CCCCAGTCCCGACAGATTCCCCACAGGACGTAAAGCAATATGGGTAAGCCGCAGACACACACACACACACACACACACACACATATA:1 - chr3L 9178141 5' + accord 184 2 48.28 CTATTTCTAGGTGCTTTGTTTTAGGGCAGCAAAAAGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr3R 13167327 5' - roo 9033 1 64.36 TGTATTGGTAGGCTCGCTTTCTGCTTGTATGAGTGTATGTATGTATATTTGCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAAT:1 - chr3R 30270655 5' - Ivk 103 1 54.46 ATATTCTGTGCTGGGGAATAATGAGTTTACGTAACACAAAGTACATATACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3L 4539230 5' + roo 26 2 56.44 ATAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGCACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAG:1 - chr2R 21226386 5' - Copia1_DM 133 1 67.33 ACCGATTTATATGACTGATAACCGGAAACAAACAATAAATTCACAGACAGGACCCCAAAGGCAGCATTGGTAATATAAAGCAAAAGACTTATTACTGCCTT:1 - chr2L 9620540 5' - transib2 2466 1 47.52 TTTGTAGCCGGGGAATTGCTTGCGATCTATTTCCGCAATAGTGCTGTGAAACCTTTCGACTTGACTGTTTCAAACCAAAGACGCTAGAATAACAAGATGCG:1 + chrX 11975421 5' + 1360 5 2 72.28 CTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAACCTAAT:1 - chr3L 3535446 5' - roo 9039 1 54.55 CGTGAAAATATTTGGTAGAAATTTGTATTGATAAAAACATAAGAAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATTTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr2R 20506811 5' - mdg1 7430 2 52.48 CCCTTTGGCATGGCAAATGCGTGTTTGGTCCGTGTCCCGCGGGCGGACGAGTATATCGCACTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTT:1 + chr3R 20486328 5' - accord 7368 2 62.63 TTATTGATGTCCACTAAACATAGTATACAAACATGAGTAAGAGATATTTACGTTATACTTTTTATACATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 - chr2L 21631916 5' - pogo 2092 1 70.30 TGCCTGGTCCACCAGCTTTGTCATGAAGCCTCTGGGCAGAAAGAATTCCTGGAAGATCTGTACGAAAACGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGCATAA:1 + chr3L 23535717 5' + invader1 181 2 61.39 AAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTC:1 + chr3R 19450132 5' + jockey 4886 1 65.35 TGCTGGCATTCTGCAGCCAACTTTAGCCTTTGGGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 31768640 5' + roo 43 2 68.32 ATCATCTCCCCATTCTTGTACGCGACAAGACGGTGCGATCAATCATTAGATTAATTGGCGCCCTACTAAGGAAACCCACAACAACACACACGAACACACAG:1 + chr2R 21852363 5' + gypsy3 422 1 73.27 GTTGTTACATTTTGTTTGTTTTTGGGAACTTTTCACATCAAATTCTTTGGTGGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3L 10576781 5' - roo 9046 1 54.46 GTACATAATTGCTTAGGGAGACAGGCGGTAAATTTTAGTAACCCATTCAGGATTGTGTCGGACCGTGGTGCAGCTTCCTAAAGTTTGTCTATCTGGAGCTT:1 - chr3L 25484836 5' - Gypsy12A_LTR 31 1 75.25 GTTGTAGTTTCAAATCAGGGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 12565686 5' - roo 9016 2 76.24 CACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATG:1 + chr3R 178126 5' + BS 18 1 63.01 GCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGATCCGTT:1 - chr3L 10576856 5' + roo 32 2 60.40 TGTGTGAAACAAAAACGTTTGTTTCAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2L 3842853 5' - roo 357 2 76.24 ATATTAACACATTTCGCATTGCAGCAGGATTTACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr2L 16569534 5' - roo 9030 1 66.34 GGCACAAACATTCCACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chrX 22664440 5' - opus 484 2 62.77 AATAAAGAACGTCCTGAATTTTGAGATTTTTGAGCCTTGAGTGATTGAGCTTGACTTTCGTGGTATTTGCTTTAAAATACACATAAATTGGATGTTACACA:1 + chr2R 2118785 5' - transib2 346 1 70.30 CAAATGTTTGCCTTGTTCCGAGGCACAAACATTCCACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTG:2 - chrX 22664461 5' - opus 498 1 79.21 ACACCCATGACGTGGGGAACACGTAGAGGAACAAGCAGTGTGGGCACCTATAAGGATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3L 3535369 5' + roo 21 2 56.44 AAGGATTGTAAGTCCAGTTTTCTTCTCGAACTTGTCCGATGTCTTTGGGCTGCGATACTTAGTCGTCTAGCTAGACTATTAGGATGAGATTCTAG:1 - chr3L 28006975 5' - jockey2 3096 1 78.95 GATTTACTTTATCGTTTCTTTTAAACGATTAAATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2L 18417273 5' - roo 405 1 75.25 TTTTAAATACTTTTTTTTCATCAAAGTATTTTGTGGGCGTGGTAAAAAAAATTGTTGGCAAATCGATAAAAATTTACACAACTAATAAATTTATTAAAAAA:1 - chr2R 3522073 5' - INE-1 402 1 68.32 AGAAGGGCCAGCTTTGTTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCAT:2 + chrX 11503465 5' - roo 9039 1 59.41 TTTATACCCGCAAAAAAACATGCTTGTATCACTGCAAAACAAGAATTAAGTCCAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr2R 6076727 5' - 1360 3365 1 53.47 CCCCGTGAATGGCTAAACATTTGGCCACGACACTTTGGTCCCATCAAAAAACACTCTCCGAAAACCATATCCGACTATAACTGCTTTGCAGTCCATAGAGC:1 + chr2L 10083825 5' + Ivk 382 1 65.35 TTCTGCCCGCAACTGAACCACGTTTGGGCCTCATCTAAAATTGATTTTGCTCGGGAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 20384517 5' - roo 9050 2 57.43 AAGAATAAGGGAAAACATCAAAATTTCGTGCATAATACAAATAAATCAAACCCAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAA:1 + chr2R 2144931 5' + Stalker2 7273 2 54.46 AGCGGTGGCCAGGAAGTCCTCGATGACATCCTTGCGAGCACTCCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 + chr3L 13360945 5' - hopper 1378 1 56.44 AGCAGAATGTTTCTGGTTTATACTTCCGCGGTACAGTTCTCCTTTCCTTGACATCCAGATTAGGTACACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGT:2 + chr3L 14285977 5' - 412 483 2 69.31 GTTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATAT:1 + chrX 11503480 5' - roo 9024 2 74.26 AATATATTCTTTTTATGGAAGAGCATTTATTTCCCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGA:1 - chr2R 3522036 5' - copia 212 2 74.26 AAAGGACTCCAAAAAACCAGACTCGTTTTACTAGTACACATGTGCAGATTAAGGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 13167399 5' + roo 8686 2 57.43 CGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:3 - chrX 21945915 5' + F-element 56 1 72.28 CTCTGCATTTATGTGCCCGCCAATCGTAAAGAGTGGGGTATATTGTGCAAAGGGTATAAAAGGTATAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 5654813 5' - roo 9060 1 65.35 CGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGT:2 + chr2R 5617509 5' - invader1 374 2 59.41 CTAACTCTGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr3L 14504283 5' + 297 44 2 71.29 CCAGCTTGTTGTTGGTCTGGCGACTATATCAAATAACGACTATTGACTACGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATA:1 - chr3L 13652247 5' + mdg3 29 2 55.45 TTTTTCCTGGTTTAAACCAGCCATTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 + chr3L 4601939 5' - hobo 2889 1 73.27 TGTTTATGACTTCTTCAATTTGATACCCTCTAGAGTTACATAAGTGGGATTCCCACATTTTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGC:1 - chr2R 1986292 5' - INE-1 169 1 61.39 GTGTGTGTTTAATGCAGCGCGAAATTTGTTACGTGTTTTTAAATAATGAACTGGATAATTTAGATTCACGATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr2L 18417397 5' + roo 8669 2 74.26 AAACACTTGAAACTCGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1 + chr3L 8044285 5' - mdg1 7456 2 75.25 CGTGTTTTTAAATAATGAACTGGATAATTTAGATTCACGATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr2L 18417366 5' + roo 36 2 59.41 TTCAAATAGTATTTTGCGTAAATATTTATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATT:1 - chr2L 16379038 5' - HMS-Beagle 7039 2 76.24 GTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 - chrX 21945929 5' + F-element 41 1 58.00 GAACGTGTGTGGATATGTCCACACCACATTCTGGGCACAAATAAATGTCTCAGTCACGTTTGCGAGTGGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACC:1 - chr3R 24602374 5' + I-element 4898 1 77.23 AAAAATGTAGAGTAGAGTAGTAATTGATTATAGAAAACTCAAAACGCAAAATCCTTGATAAACTGGCAAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGC:1 + chr2R 2125569 5' + F-element 118 1 64.36 TAAATCACCGCCAACTACAACTGCCGAAACGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 + chrX 3446501 5' + I-element 9 1 68.00 TGTGTCTATCTGTTACTTAATACTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 - chr2R 11245020 5' - 412 7492 2 78.22 TAATATAAAACAAATTTTGTCTAGTTTTGAAGTTTTTTGTAGCTTCATTATCATCTTCGTTTACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCT:1 - chr3R 24230261 5' + jockey 495 1 66.34 GTGTGATTTCAACTTATTTAGTTGTTTTTGTTACTTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:3 - chrX 3295703 5' - hobo 2930 1 67.33 AATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3L 23456272 5' - 1360 3380 2 64.58 GAGTTGGCGAAGTTTAAAGAAGTGCTTGATATGTAAGAGCTGTAAATCACAAGAAGCATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:2 - chr3L 10305401 5' + 412 19 2 54.46 TTTTAAGACATTGTGTCAGAGGTTTTGCTATGTCAGCGTAATTAGGGATAAATTTTCTTATACAATTTTACTTTAAAGCTAAAACTACTTAAACTATGGCG:1 + chr3L 25684975 5' + TART-B 10213 1 54.46 CGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATC:1 + chrX 17492879 5' + Tirant 25 2 56.44 TATAGCGAGATGTGGCTCCTGTGTCTATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATAT:1 - chr2L 22780936 5' + HMS-Beagle2 17 2 62.38 GACAATAAGCCGCAGAGAATGGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 20973029 5' - roo 353 2 77.78 AATATTTTTAATGAATGTAGTGCGTTTCGTATCAACAGAGCCAAAATATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACG:1 + chr3L 17762775 5' + invader3 5217 2 53.47 CACGTCCGATTTGTATAAATCTCCGTCTCCTCCTAATCGAAAGCCAAACAAATCGGAAATCGATCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 31418659 5' - roo 398 1 65.66 GGACTTTGACTATTACAACTTGGTTGTTTCGTCTCTCGCCAAAATTGTTAAAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCA:1 - chr3L 21912478 5' - Porto1 339 1 56.44 GTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr3L 25884090 5' + Doc 41 1 60.40 GGCTGAGGAATGGAAATGTGTGTGCAAGTCTGTGATTTACTTGCGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:2 - chr2L 16276187 5' + 1360 34 1 60.40 TAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCTCTCCAATCTCTTTTT:1 + chr2L 23295812 5' - micropia 5390 2 69.31 CTACGAGTATTCCTTAACGTGCATTATATAGTTGATGAAATAGCGGAGCACTAGTGGTTCCGTTCAAGAGATCGTCAATATTGTGATATCCACGGCGTTCT:1 - chr3R 834602 5' + mariner2 385 1 72.28 TATGCATAACTTTCCTAGCTAATTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGC:1 + chr3R 21710578 5' - mdg3 5444 2 74.26 CGAAACCCTTTGCGTTGCACCGAAAAGAAATATCAAAGAAAAACCAGTGGTTTATCAAAATAAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 15227256 5' + roo 8677 2 72.28 TAATAAGTTAACAAAAATTCGGAAAGTACAACTGAAAATCAAACACTTTCTTTTACTTAGCTCTTGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAAT:1 + chr3R 11212647 5' - I-element 5031 1 67.33 CTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:2 + chr3L 8044322 5' - mdg1 381 2 63.37 TCTGTAATTATTTTGTTTATTATGTATGATATGGACGGGTGCGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAATTAAATATATGGTGCAGATCCCTCGCCGCG:1 + chr3L 27396714 5' - gypsy6 370 4 56.44 GTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:2 + chrX 5168866 5' + hobo 52 1 73.27 TTTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGC:4 - 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chr2R 9972558 5' + Doc 273 1 67.33 GGCGTGCCTAAAATAAGGGGCATACTGGAAAAAACATAAATAAGGGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTT:3 - chr2R 25216603 5' + 3S18 34 2 61.39 AACCGAATACCACATTCCGACTTTTGAGCCGCCTGCTCCAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 - chr3L 14205395 5' + P-element 37 1 42.57 TGATGGAGATGGATAGAGACGATCAGCTTAAATTGTTACAAGATTAGCTAAAGGAGAATAAAATTATTGTACATCATTATGAGTGACGCCGATATGGACGG:1 - chr3L 25675311 5' + micropia 416 2 70.30 CTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:4 - chrX 21945938 5' + F-element 33 1 54.46 CCATCGAATTTACCCTACCCTGGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr2R 23596457 5' - 1360 3334 1 83.17 TGTGGAAATGTCCCCGATGAGTCCAACCGATCCAGAGGAACCCGACCTGGACAAGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTT:1 - chr2L 7643566 5' + McClintock 6066 2 58.42 TCTTTTAACATATAAGAAAGTAATTGCCAAGAATCTTATCTTAATCTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - 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gypsy8 4542 1 68.32 AATAATAGAAGTAATATTTAAGTTTAAAGGAACACAGACAGAAGCAGAACGTTCTAGCACATAGTATGTACATATGTATAGA:1 + chrX 7335615 5' + invader3 5085 1 85.37 TTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTATCGCGAATCGAGCCGTACGGTACACG:1 - chr3L 10526464 5' + Cr1a 4390 1 81.19 TTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr2L 18417309 5' - roo 9032 1 64.36 CGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chrX 3446530 5' + I-element 39 1 68.32 GTTTGCCTTGTTCCGAGGCACAAACATTCCACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCA:1 - chrX 22664456 5' - opus 7496 2 74.26 AAATCCAATCTTGAAAGAATTGCTTGAAAGTTTAAGACGGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 - chr2R 5342698 5' + 1360 37 1 82.18 ATATAGTTTTAAAATCTCCGCCTCACTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 20384456 5' + roo 8714 2 77.23 TTATCGTTTCTTTTAAACGATTAAATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 18417281 5' - roo 397 1 67.33 CGGAAAGTATGCAGCATCCTTTGACTGTAATTCCGGCTTACTAACCTCATGCCCTATACAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2L 13670269 5' + jockey 18 1 52.75 ATAAAAGTGGAAATTTAATCTTCGCTTGGCGCAGGCATCGCCAATCGATAGTGAATATCGAGGGAAAAGTGATCTGTTAGTTGACGCGAAGGATCTTACTT:1 - chr2R 12205535 5' + Gypsy12A_LTR 476 1 52.48 CTCTCCGGGCAAAAGGGTTTCAGTTTCGGCATCGCTTTCGATTTCTTTGTCGTCACAGTCATCATCAACAGCTCAACACACACACACACATACACACATAC:1 - chrX 7469311 5' + accord 193 2 51.49 TGGCAAATGCGTGTTTGGTCCGTGTCCCGCGGGCGGACGAGTATATCGCACTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTA:1 + chr3R 20486338 5' - accord 7356 2 51.49 TTACCGCAGCCAGATCAAAAGTAGAGCTTGTCATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATA:2 + chr3R 13231153 5' + Quasimodo 38 2 68.32 GTGGCAAAAGTCAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAA:1 + chr3L 5267206 5' + Juan 3992 1 56.44 AAAAACGGAACATTAGTTTAGGATGTTCTCCTAAATATTACTCATACCACACGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chrX 12404590 5' + jockey 32 1 52.48 CTTGCCGAAAAAAGACACTGCCTTGTCAACAAATTGTTATTCAAGAGCCGTCAGTGATCCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCT:1 + chr2R 2645446 5' + HMS-Beagle2 6895 2 67.33 ACTGGCAAGAATGCTTTTAAATTTGACACACACACCGCACACACACACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - 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HMS-Beagle 88 2 75.25 TCTGATAGTGCAAAAAAAATGTTTAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1 - chr3R 15924660 5' + Quasimodo 43 2 81.19 AAATCTTTTACGATTGTGGGGTTTACCAGGTGTCGACTTCTAGATTTTAAGTGTAGTATTTCACCATAGTTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAA:1 - chrX 14903318 5' - accord2 7274 1 74.26 AACACTTGAAACTCGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:1 + chr3L 8044286 5' - mdg1 417 2 74.26 CAAAGAAAACAAAATAAACAAAATAAATAATGAAGTCGAAGTCGACACAAGATACAGAAAAGGTCCACTACAGAAAGGCAAATTAGTAATCGAAGTAATAG:1 - chr2R 17289134 5' + Doc 4433 1 83.17 ACGCTAATAAATTACTCTCATTAAAAGTGACTTTATGGGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATA:1 - chr3R 16110233 5' + mdg3 5291 2 62.38 CCGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 - chr2R 17348634 5' + jockey 6 1 70.79 GGCATCGAGCAATGCTTTTCTTTTTTTTTTTGGCCAACATCATCAGCATCGAGTGCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 + chr3L 5321109 5' - mdg1 405 2 59.41 TTCCAACGCCATAAAGTATGCCATAAAAAGCCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr3R 30326348 5' + pogo 43 1 73.27 AGGTGCAGAGGTGTGAGCTCAGGGGGAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:2 + chr3L 14558236 5' + 297 6594 2 67.33 TCGAAAGGATAACGACTGAGAAATACCCGTTAGTGATGCAAGTTTTTAAATGATTTGAGATACATATATATATGTCGCCGAAACAGGAGTCTCATCCATAT:1 - chrX 16906770 5' - invader4 318 2 70.30 AGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACTTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGA:1 + chr2R 6482666 5' - gtwin 7361 2 55.45 CAATTGTATTTCGCTTGGCTCAATAAAACCAAAAAAAAAACAAGAATACATATAAAAACACCCACACCAGCGCAGCGAAATAATGAAAAATAAATAACAAA:1 + chr2R 11205636 5' + Burdock 312 1 77.23 ATTATTGTGTTATATTTTCTTCGTACAAAATATAACCACGAACCATTTAAAGGCTTTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAG:1 + chr3R 25859347 5' + Stalker2 26 2 54.46 ATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:3 - chrX 3295665 5' - hobo 2894 1 69.31 AAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGAATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1 - chrX 21668061 5' + Tabor 6885 2 67.33 CACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCACATACCT:1 - chrX 22664427 5' - opus 7467 2 63.37 GCCAGGTTAGCGGCCCTTGCACGCGATGTTGTGTTTGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chr3L 9190439 5' - 412 7528 2 60.40 TTGATAAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATAAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAACC:1 - chr3L 22821869 5' - diver2 4530 1 55.45 CAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:2 + chrX 5131003 5' + I-element 47 1 67.33 AATCATATAAAAAAATTTAAAAAATTCCTGAATGTTTTGCCAAAATGGCCAATGCCATCAAATATTACCTCCTTATTCCAGAAGACTACTTTTAATTAATT:1 - chr3L 14482313 5' + Cr1a 3980 1 64.36 GCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACACCAAGCACTACTCCAAGACCCTGCGAACCAAATCCAAAGTTTTTTTTTTCCATGTTTTGCTTATTTATTGA:1 + chr3R 16611515 5' - Doc3-element 4713 1 70.30 GCGAAAGGTGCAAATAATGCCAGGCACCAAAAAGTGTGCTACACATGTTGACATTGCCCGTGCGTGCATGTGTAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3L 917210 5' + hobo 3 1 74.26 TAAGATGTTAAAAAATGTTAGTATCGATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGACCTAATGTCCTGTCAGTTGACT:1 - chr2R 10945076 5' - 297 363 2 69.51 TCATCAATAGTTGTTGTTGTTCTTGATAACACGGCCTGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chrX 13640244 5' + P-element 39 1 39.60 GCTAGCTCAGGTAAAGTTCTCCCCGTGCCACACAGCTCGCAACATAAGCATCGATAACAATATTCGATCCGCGACATCCCCGACCCCGTGAAGAACCGCT:1 + chr3L 25708459 5' - aurora-element 4022 1 58.00 CGTATCTACTTGTTATATTAGAAAGGGTATAAGTATAGGGTATTCTAGATTCGTGCTTTGTCCGTATATCCGCCCGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAACT:1 - chrX 18031449 5' + INE-1 141 1 67.33 CGTTATTTACATGTGTAAATTTTCACTTCCAACTGACACAGTATTATTTATATTTGTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1 + chrX 23035722 5' + HMS-Beagle2 6901 2 61.39 CCCTACACGGGGACACGACATCACGGAGCGCCACACAGGCGTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATT:1 + chr3L 13652179 5' - mdg3 210 2 60.40 AAAGTTGTAAATTGTATTTTATGAATATCCCCAAGTAGATTTAGCTCAGAATTAAACCTGAAGTTATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 - chr3R 26542311 5' + FB 12 1 67.33 AACAATACAAACATACATAATTAACAAGAAAGAATAATATAGTCGGATTCTCCGACTGTCAAATACGCGAAATTTCATCATTCTTCTGTGATATCGATAGA:1 - chr3R 3696297 5' - INE-1 501 1 76.24 TCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chrX 10196107 5' + 297 47 2 78.22 CCGCGGTACAGTTCTCCTTTCCTTGACATCCAGATTAGGTACACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr3L 14286002 5' - 412 7511 2 61.39 CGACAAGCAACAAAAAGCAACGAAGGTGAAACCAAAAATGGCGAATGGCAGGGTCTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTGTAG:1 + chrX 5128846 5' - G2 3074 1 71.29 ATTTTACTGGTTAGAACTGAATATATTCATAGACATGATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chr2L 20823456 5' + opus 35 4 63.37 ACGACTGAGAAATACCCGTTAGTGATGCAAGTTTTTAAATGATTTGAGATACATATATATATGTCGCCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCAC:1 - chrX 16906759 5' - invader4 3066 2 59.41 CTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr2L 18417313 5' - 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chr3L 3535458 5' - roo 9049 2 54.46 CAATAAGAGGACCAAAAAACATAACCAATATGGACGTATGGAATAGCACTCTGGGGAAATGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATC:1 + chr3L 5333034 5' + Porto1 4318 1 75.25 CATCAAAAGCATGCTACAATTTGATGCTGCACTTCGTAGGCCACAAAAACGAAAATGGAAGCGAAAACAAGAGGACGTTTCTCGACTATCAGATACCCGT:1 - chrX 18144771 5' - INE-1 554 1 53.00 AATCTACAAAATTGTAATCTTTAAATATTCATTCCTTTCACCAAAGAGAGAGAGAGTAACCAGTTCTCGTCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr3R 8133895 5' - roo 403 1 74.26 TTAATTTAATTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTATTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAA:1 + chr3L 25443680 5' - HeT-A 6044 1 59.41 CTGCTCCTCGGCTCGGCCACAAATAAAAATGATAAAAAAA:1 + chrX 7631799 5' + Tc3 1570 1 90.00 CGACATAAATAAATAACATTCATTTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chrX 21219514 5' - roo 398 1 70.30 TGTCTTGTGAACATATATGATTTGAGTTCATATAAGATTAACGAAAATTTCGAAATTAAGATAACTATTGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 - chr4 306517 5' + blood 7018 2 73.27 AGCTTTGTTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGG:1 + chrX 11503474 5' - roo 9030 1 68.32 CGTGGCAACATGGGTCAACAATTTTGCGCTGCGTCTTTGTATCTAGAATACGTTGGCTGAATCTCAGCCTTCTAGCTTTTATAGTTCCAGAGATCTCGAAG:1 + chr3L 23702893 5' - INE-1 144 1 80.20 GACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr3L 14286057 5' + 412 7096 2 67.33 ACTCAAACTGTTTACTTCTTCATTTCAGTGCTAATGAAAGTCTGCAGCACAAATATTTGTAGTCGAGGGAGTTGCAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:2 + chr3R 9328644 5' - hobo 2937 1 72.28 ACAGTAACTATCTATCGCTTCGCAATTGAACTGGAAGTTGGTTATACAAGAACATACATACACACACACACACACAGATGCACAC:1 - chr2R 10511185 5' + accord 7035 2 76.47 CGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1 - chr3R 19513411 5' + jockey 4696 1 54.46 GCTTTGCACTAATTTTGCAATGCCAAATGGGTGGGGAATGGGTGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chr3L 18793067 5' - P-element 2855 1 47.52 CCGTCGCCAAGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCA:1 + chr2R 6482657 5' - gtwin 454 2 58.42 CATGTTGAGCTTTTGCTTTGAACACCTCTCAACGGATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr2L 21018798 5' + 412 39 2 61.39 ACATCAAAATTTCGTGCATAATACAAATAAATCAAACCCAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACA:1 + chr2R 2144945 5' + Stalker2 7287 2 59.41 CATCTGCAGCGCGGAACTTTCGCTGCAAACTTTGAGGGCCCAAGACAAGGGCTGACAGTTTGAACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chr3L 21982728 5' - mdg1 7448 2 67.33 ATACCAGCAAACTGATTTATATAGTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGG:1 - chrX 21564137 5' + invader4 54 2 76.00 CAAATAGATTTCACGCTTTGTTTTATATTCCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTGGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 21998466 5' - roo 364 1 65.35 ACTGGGTAGTGTGATTGTTACATATTTTCCTAACTTTTAAACTTTACTAAACAAAACAAAAAAAAATATAG:1 - chr2L 14059472 5' - Tc3 84 1 73.24 TCGTGCAATGTGTGTTCATATTAGTAGTTAATTAATTTAAAGTAAACTAATTTATTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAC:1 + chrX 5128426 5' - I-element 3 1 57.43 TAAAACAATAAAATATTCCCTTCGAATGCAAGACTCCTACTTCAAATATTTTCATTGGATCCCCAGATTGTTTGGACCTTTTATTTTATTTTTTTTTTTGT:1 - chrX 8971443 5' - G2 3076 4 47.52 CGGACAGACGGACATGGCTAGATTATTATCAATTGTTTATTGATCCTTATCAATAATATATACACTTTATATAGTCGGAAACACTTCCTTCTGCCTGTTAC:1 - chr3R 8005045 5' - INE-1 32 1 75.25 ACCACAACCGCCCCTCGCCGCCACTTTTAATATGAACACAATGATAAATCTAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTC:1 + chrX 5394387 5' + F-element 327 1 54.46 TCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGT:1 - chrX 21945916 5' + F-element 55 1 71.29 AACTGGCGGACCGGAGCAGGAGGACCAGTGCGGAACTCAGTGTCGCCGAAGTAGAAGCCTCGCTGGGGTCGCTGCTGCGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTG:1 + chr2R 9022173 5' - I-element 210 1 81.19 GTATACGCCCCGACTGCCAGCACTGCGTATGCATACGCAATAAAACTAAGGCGATATACAAAAACAAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAG:1 - chrX 2838607 5' + I-element 475 1 71.29 CCACAGCCCGAGCAAGAAGCTCACACATCTTGTACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAAT:1 + chrX 4248829 5' + jockey 4648 1 67.33 TTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:4 - chrX 21945910 5' + F-element 61 1 77.23 TTTGGTGCAAGTGTCGCCCTTAGGCGGAAAAAATAAATAGTTGGGAAAGTGGAAAAGCCATCCGCTAATTTGCAAACAAGTAATTTTTGTTAAATCAACAA:1 + chr2L 12525935 5' + Tc1-2 1472 1 73.27 ATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 19450180 5' + roo 49 2 55.45 AGATCATATAGAGGAACAGAATGTTTATAGATCCAATTCACCATGTACATTCAAAATGTGTATAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:2 - chr2R 14647581 5' + blood 7023 2 61.39 AACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:2 - chr2R 17348622 5' + jockey 30 1 52.48 GCTTTGTTTTAGGGCAGCAAAAAGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 13167339 5' - roo 9021 2 76.24 AATTTAATAAATTGATTTAAATAAATGATGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 7004188 5' + roo 8712 2 82.18 ACGTTGACTGATTTTTGGAAATATCCCGGTTGAGCCCCCAAAATTGTGTCCTTAGGGTTTTGTTTCATGAGAAACGAGGAAATGAATACAATGTAAAATAA:1 - chr3R 2469702 5' - Cr1a 4323 1 73.27 TATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chr2R 17348627 5' + jockey 16 1 63.04 GAGCTGGCAGTTGAATGGAGATATATCCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:2 + chr2R 9214081 5' + Transpac 46 2 76.24 AAACTCAAGAGAATCAACCAAAGGAAAAAAGTATGGCTTTTTTTCGGCGAAAAAAAAAAACAAACAATGGAA:1 - chrX 12296872 5' + transib2 2642 1 75.00 ACACTAAATAAGCTGATGAAATGTATTTCAAATTTAAGGAATATGCAGTGGATATTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1 - chr2R 12007287 5' + mdg3 23 2 57.43 GCTCTTTCGCAAACTCAATTAGGTGGCACATGGTGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 + chr2R 22746002 5' + hobo 10 1 68.32 GAACGAGGAAAAGCTCATCAGTTGACACCTCATATCCTTGGAGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr2L 1530375 5' - roo 407 1 75.25 CGGTTCGCCGTAATTGATTGCCTCATTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCT:1 - chr2R 18983707 5' - jockey 4946 1 76.24 TTTTACAGCCATCCTCCTTCATTTTTCCACTTTGCTGCCATTTTGGAACGCAACTTAATTAGCCAACGAACGTACATTAACGGGAATGCGCGACCTTCATC:1 + chr3L 11314778 5' + Ivk 5023 1 66.34 AAAGCAAAAGAGGTGTGTACGTCGATTCCAACTGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr2R 16217656 5' + 412 7096 2 66.34 GCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCA:1 + chr2R 6482688 5' - gtwin 423 2 77.23 AAACCAGAGCGCGTCGCGATGGTTGCGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3R 13623666 5' + jockey 57 1 75.25 TTAGGAAACACACATTCATTCGCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3L 10576877 5' + roo 8674 2 69.00 GCTGGGCAGAGGGCGAAGTGCAGAGGGGCGGGGCAAAAGGACGATGAAGCTCAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr2R 18374856 5' + 412 23 2 56.44 ATTACTCAAGGTTCCACCGCCGGAGTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA:1 - chrX 18566646 5' - accord 7028 2 81.25 CCAGAGATATTGACGACGCCATCGGGCATCTCACAAGGGAAATACAAAACAATGCGGAATTCGCAGTCCCACCGCAGAAAGGGAAATAACGGGATCC:1 - chrY 198024 5' + gypsy8 314 1 80.41 CCCAACCCACATGTCTGCTGTTTGACCTTTTTTCGCAAATTTTCGTATTGCTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTT:1 + chr3L 8039289 5' - I-element 168 1 59.41 TCGGGTTCTCAACGTGTGGTATTAACTGCGAAAAACGCGCTTTGCTTTCAAAGTTTGCTTTGAGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAA:1 + chr3R 1717397 5' + Cr1a 156 1 70.30 ACACGATGCCTAATGTCAAGTGTGGAAAGTAAGGGACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCT:1 - chr2R 18977499 5' + jockey 4747 1 65.35 ACAGCTGAGAAACTAGGAAAATTGAAGTCTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAAT:1 - chr3L 5267263 5' - Juan 4172 1 68.32 ATGGAGCTTTTGTTTGTGGCCCATCAAATATGTCAAACTCCGTGGATAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACC:1 - chrX 10298719 5' - Quasimodo 222 2 57.00 GAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:2 + chrX 17492890 5' + Tirant 8143 2 62.38 CTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 18417318 5' - roo 9023 2 73.27 TGGACACGAGCAAATAACGTTGGTCTTCTAATTTATTTGGGAAGTTGGCACCTGAAATCCACCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAG:1 + chr2L 23048316 5' - McClintock 157 2 60.40 AACACCACGGCAATTAGGACCTTTAACGAGCGTTTCAACATAATCTTAAGAGTCCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr2L 2010137 5' - P-element 2865 1 57.43 AAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTCGGCGGTGTATGTCCGACGCTTCTCATTTGGAGTATCGCGCTGCGTCGCAAGGAATGCTGAGTCGGCT:1 - chr3R 4604452 5' + gypsy 149 2 57.00 GACACCTTTAAGTCGTAGACACCTGAAACCCTACTTATACAAAACTATTATCACCCGCCCTGGAGAAAGGGTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:2 - chr3R 10957367 5' + hobo 2 1 78.22 GTATACGCAATATTGCGTAGCCGCCGTGTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTA:1 + chrX 9816247 5' + BS 5009 1 59.41 AGTGTGCGCCCCGTGGCAGCTTAACGAGGACTGACTCTTCATTTATTCAGCACGTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1 - chr2L 23180118 5' - Burdock 6373 2 61.39 TTATACAGTAAATTGGTTCAAAAAAGATCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:2 + chrX 11299988 5' + roo 49 2 74.26 GATCACCCAAATACGTCACTATTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGC:1 - chr2R 1355079 5' + rover 7059 2 77.23 AGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCACAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 - chr3R 19513392 5' + jockey 4703 1 67.42 ATCTTTCGTTTTTGCAGCCGAGAAAAATTTTGAGCAGTAACAATTATCTCATTTTCCATCTGTCCGAGGAGCACCCACTTAGAGTTTAAGTCATGCGTATT:1 + chr3R 1225664 5' - Q-element 706 1 57.43 GCATTAGAGCGCGCAACTAAATGTATGCTACAGCTGAGAAACTAGGAAAATTGAAGTCTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAT:1 - chr3L 5267292 5' - Juan 4201 1 63.37 GAAAATCTGTCAGTTGATTTGCATAAAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:2 + chrX 10196068 5' + 297 8 2 62.38 GGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:2 + chr3R 11080702 5' + I-element 43 1 67.33 ATTGTTCAATACTCCTAAAAGACAAGTAAGAATGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCAC:1 + chrX 22664896 5' - opus 7473 2 57.43 TCATAAAAATTTCGAATTTATTTCAAAAGAAGATAAAAATTCAAATGCATCGACGGCGCAAATAAAAGGGTGGATGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGG:1 + chr2L 1973986 5' + invader2 357 1 57.43 ATAAATAGGCAAATAGAAAGTATGTATGCTTGTTTGCCGGAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTC:1 - chr3R 20240966 5' - Tabor 478 2 55.45 TTACAATACCCCACCAATTGGAGTGGGGGTACGGCAAATGTGCGGCGACGTTTATGTCTCACAAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGG:1 + chr3R 15130144 5' - Max-element 8511 2 71.29 CCCAATAACATTACTAAAACATGTTGAAAATACAATAGGGAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTAAGAGCAAGTGAACATAACACATTAAACTTCTC:1 - chr3R 6428594 5' + I-element 467 1 61.39 GACTGAGAAATACCCGTTAGTGATGCAAGTTTTTAAATGATTTGAGATACATATATATATGTCGCCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTT:1 - chrX 16906757 5' - invader4 305 2 57.43 GAATGCTACGAATAAAATTTCATTAAATACACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chr2L 12888822 5' - 412 447 2 77.23 TCAAGTGCATTCATCTCTCACCCATGCCGCACCCCTCTAACTCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 - chr3R 11389807 5' - hobo 2910 1 54.46 CAGAAGACTATATTATTGATGGCGACTCATTACATGGCGATAATAAAACCAATATGAACATATGGAATAAAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTT:1 + chr2L 23423798 5' + Porto1 4294 1 64.36 GAAGAATCATTACGGATGTAAAACAATGGCTAAATGAGACAACAAAAACACAAGATCAAAGCTGATCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGA:1 - chr3R 9828120 5' - Cr1a 355 1 57.29 CTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:2 + chrX 5130983 5' + I-element 27 1 52.48 GGTGGGTGGCATAAAGCAGGCTGAGGAATGGAAATGTGTGTGCAAGTCTGTGATTTACTTGCGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr2L 16276205 5' + 1360 16 1 63.37 GCCACGTTGTTTTATGGGCGGAAAAAATGGCCACTTTCCCAGCGGATTCAATGAAATTAATGCACTCACCGAAGGAATATATCTAGGCTTATCGGGAGAG:1 - chr3R 20240269 5' - 412 7303 2 82.00 CAGATAAGAAAGAGGTCTTTCATTTGAAGTTACATACAGGTTTATCAAACCTCTTCGAACGTTCAATAAATGATCCTTAAGTTTTATCATTTTTATTTTAA:1 + chr2L 680712 5' - copia 5060 2 46.53 AAGCTGGCTTGGATTTGCAATAAGTGGGAAGTACATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTATACTCGAAG:1 - chr2L 16758318 5' + Max-element 44 2 65.35 GAAATGTACAAGACTAATAAAAATGTGTAAAAATCTCAACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGGGGCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGG:1 + chr3R 1845256 5' + 1360 47 1 66.34 AACTGTCAAATAAAGTTTTGACGCCCCTCTTTTCGGAAAACTCCGGGCAATTAAAATACTTTTGGCAGTCACTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 7105308 5' - roo 405 1 74.26 CCGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:3 - chr2R 17348634 5' + jockey 18 1 62.38 CGTAGATTCCATCAAATTGCCCGCATTTCTACTTGAGGAGATCGGAAAGTGTTTTGGCATAGACATATCAGAGGGTCATGCCCGGAGCGTGTGAAGCGC:1 + chr3R 17661867 5' + gypsy4 6689 2 78.79 TTTTGTCTTTAGTTGTCGGCGGCGTGTGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCAT:1 + chrX 17351148 5' - HMS-Beagle2 75 2 80.20 TTATGGTTATGACCACTTCAAAAGCACGTTTAAGCCAAAGGGATGCACACTTAATGCATGTTAAAATTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chrX 12166494 5' + pogo 7 1 72.28 AATTCAGCAGGAAACAAAATGACCAACGTTATCCAGTGCCTAAAAACTAGTTTATTTCTGGCTGTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1 - chr2L 5825910 5' + copia 4883 2 63.37 GTGAGCGAGGGAATCTCGCTCTGCTGAAAAACACCTCCATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr2L 19572655 5' - P-element 2848 1 38.61 GTTATAAAACTTTTATTGAATGGTTCTATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 - chr3R 11549894 5' - opus 454 2 74.26 TTTTTCATTGCTGTTTTATTTTTTTCATACGCGCACCACTCAAATTTAATATTTTCAAGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTCCTCTTCTCCCTTTTTTT:1 + chr3R 1707340 5' - Bica 345 1 64.36 CAATTTAAAGCTAGCAAGAAATGTTTTAAATTTTACTGTTTAAAACAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3R 8058435 5' + TART-C 11100 1 60.00 GATGCGATGTCATGTCCTCATGATGAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 - chrX 5131029 5' - I-element 5305 1 73.27 GACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTT:1 + chrX 9816277 5' + BS 5039 1 76.24 AGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chrX 21219482 5' - roo 9036 1 64.89 GAGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2 - chr3L 3535466 5' - roo 394 1 62.38 GAAAATCGGAAGAGTGCAGCAACACAAATGATGCACATATGAATGAAAAGAGAAAATCAAAACAAAAAAAAAATGCTCAGAACAATCACAAAAGCCGAATG:1 + chrX 5089538 5' + Porto1 4351 1 66.34 CGGTAATGATACCCATTTGCTAAAAGATTGTAGGAAGAAAGATTTCGTTTGTTTTAAGTGTAACCAACCAGGACATCGCGCGTATTGGGTTGACACGACAA:1 + chr3R 1326617 5' - Q-element 691 2 78.22 ACTCCAGCATTTCTTTAATCATTTGCTATTTAAGGAGTTAATTGTATATTTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 + chr2R 11835609 5' + I-element 26 1 57.14 AGATTCAAAATTAGCAAAATAGGTTCAAAACAATACTGGCTATGCATAACTTTCCTAGCTAATTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1 + chr3R 21710538 5' - mdg3 5485 2 65.35 AATGCTTATCAAAGTATATAAAATTCATAGAAATTATGACGCGAGCGCAGAAAGTTGCAAGAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chrX 15219349 5' + hobo 14 1 65.35 CTACAACTGCCGAAACGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chrX 3446515 5' + I-element 24 1 53.47 GCATGTGTACATATTTACAGTTTTCCAAATGTTATATGTATGTTGTTTACCTCTAAGAATTTTTTCCAGTGCTTTGCCCTTTTAAATATACGAATTAACTA:1 + chrX 17355987 5' - HB 291 1 73.27 TAAGTATGCTATAGTTTTTTCTTAGGTTTGGAAGGTCTATTTTGTAGGTTTCTAAGCCAAATATTAAAGCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chr2L 12246548 5' - hobo 2934 1 41.58 GCGGGGAAGCGGCCTAGTAACAGCGAAGACGGCTGGAATGCAATCGCGAGCGGCACGACGTGCATCTGGGCTACCCTGGTATGTGAGCAACTGAGTTATT:1 + chr3R 2446834 5' + G5A 2532 1 60.00 GAGCTGAGTGTCACTGACATTGGTTGGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - 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micropia 5408 2 56.00 ATATACATGCTAAGCTTTACGATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr2L 17729400 5' + hobo 7 1 72.28 GTTGACACCTCATATCCTTGGAGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2L 1530395 5' - roo 387 2 55.45 CTCGGTGGGCGTGGAAGTAGCTGGAAGTGTTAATTAGTTGTTAGTGTCTCCGCCTGCCCGTCGAGGATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCT:2 + chr2L 8469556 5' + Transpac 6 2 74.26 CAACAGGTAAGATGAAAACCAAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 - chr3R 25214979 5' + Burdock 6183 2 77.23 ACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 - chrX 21945939 5' + F-element 30 1 56.57 GTAGAGGAACAAGCAGTGTGGGCACCTATAAGGATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 3535391 5' + roo 8707 2 69.31 TTTTAAAGTATTTAACTTTTCAAGGGTGATTACCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAGTG:1 - chr3L 15694737 5' - Chouto 430 1 68.32 TCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr3L 25884093 5' + Doc 41 1 62.24 AATAAAATATATAGATCGCTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1 - chr3R 29361069 5' - 412 435 2 82.18 TAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGCGACTCTTTGCATTCCAGAAATTCTGTCGAGCGGTAAAATTCTGTCGAGCG:1 - chrX 21852441 5' + invader4 2830 2 73.27 TTTGTTTGTGCTTATTGGCGCCATTGGCAGTAATTTAATGCTTGGATTGAGTTTATTCAACAACAGCCAACGTTTTCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTA:1 - chr2R 17349208 5' - jockey 315 1 79.21 TATATGAGCAGTCACGTTGGAAGTGATAGCTTAAGAAATGATAAAAGGCTGAAGGAATCGTTTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGT:1 + chrX 20814432 5' + INE-1 91 1 56.38 ATTTTTGTTTTGTATTGTTGTTGTTGCTATTTCTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCA:1 + chr3L 16466995 5' + Cr1a 276 1 67.33 GCTGGCTTCTGGACAGGATTAGCAGGCGGGCAACATGCAACACACAGTCATCTGACTACCAGTCTGCCTTTCTTGGTGTGTATATGTGTTTGTGTGTGTG:1 + chr3R 21951407 5' - accord 7032 2 66.00 GGGAAAAATTTTTGAAAAATATTTAGAAAAAAAAAAA:1 - 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Cr1a 4378 1 60.40 AGTTCGGGTTAGTTTCTACAGCTCCAAGGGCAGAGCTCTTGAACTCATTCCATTTTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCT:1 + chrX 10226015 5' - I-element 370 1 56.44 TAAGGAAATAAATATAAGACAAAGGCTCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGAT:1 + chr3L 8044814 5' + mdg1 483 1 72.46 CGGCTTGAGCTGGGTGTGTGACACATGTAACGCTTGCAGCGTCGCGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTT:1 + chr3R 4546047 5' + jockey 4791 1 56.44 AATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAG:1 - chr3L 27395593 5' + invader4 2929 2 72.00 TTTGCGTTGCCTTTTCGCAGGATCCGCATGCTTTTCCCTCCGGTTTTTCCTTCGCCTTTTTTTTCACATATTTTTTTTTT:1 - chr3R 11041110 5' + FB 174 1 72.50 CAGTTATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chr3R 19515873 5' + 412 7083 2 54.46 TGCCTTGTTTATAGTGAGTCAGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 - chr3R 15197746 5' - 1360 3333 1 84.16 ATGAAATATTATAATAGTAATCGGAGACATATTATATGAAAATGTATTTAAGCTGCTGAATATAAACTTTTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 + chr2L 12835793 5' + 412 5 2 74.26 GAGCAATGCTAACTGAAACGCACTCGATATTTGGTTTTAATTTAATTTCATATCGAAAATGTATTTGTAGTTGGTTTCTTTGTTTTTTTTTTTGTAATTTT:1 + chr2R 12276073 5' - 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INE-1 543 1 55.45 AAGGGAAACAAGAGCAATAATGGTAACAAGGGAAAATCAGGCGGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGG:1 - chr3R 25355668 5' + jockey 139 1 57.43 GCAATGATATCTGACATGAAACCTAGAAAATTGGTTAAATACAATTTAAGATGGTAGTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 - chr3R 10480432 5' - mdg1 399 2 58.42 TTTAAGAGTTGCTTTGCGCCGTGGTTCCCCACTATAATTCCCCAATTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 21914702 5' + hopper 142 7 43.75 GTGGCGCTAGGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAGCCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 + chr3R 11080711 5' + I-element 52 1 74.26 GGAGGCACTAGAGAGGTAGTACAGAAGGAGGCCGACCGATTGACCGAGAGGTCAAAGTCATCGACGTTCATACGGAGAGACGGAAA:1 + chr3R 1141199 5' - INE-1 124 1 76.74 TTTTGGGTGGGACGTAACGGTAACGTTGAAGTGTAACGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 - chr2R 15921383 5' - 1360 3353 1 67.33 AGATTATCGCGATTGAGAGCGTACTCAAAACTGAACTACTGTATGGGGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTACATGAGTCA:1 - chr3L 26003782 5' + roo 8811 2 53.47 CAGAACAGATGTCATTGTGGTTTTGGTCTGATAGCGTCTGCCAATTGGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAC:1 + chr3R 24509113 5' - 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chrX 21452824 5' - INE-1 547 1 56.44 GATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATA:1 + chr2L 22092965 5' + INE-1 546 1 51.49 AGACCAAAAGATACCCTGTGAATAATTTGTACATCTAAGTAAAGACATGTGTAGTATGTGCATGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chrX 6162142 5' + blood 31 2 63.37 CATTTAATTTTAGTTCAGATCTTTACTTAGTTTAAGTATCTCACCGTATCCGTATCTTTGTGCACCTTCACTATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 16547802 5' - accord 185 2 44.44 GAACTGATACAACTTCATTTGAGAAATCGTATAAAGTATTTAATTATCGAAAATCTGGAGCAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTT:1 + chr3R 11088561 5' + I-element 312 1 63.37 TTTCAAGAGAGCACGTTGCAAAGACGTTCAGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chrX 14953639 5' - P-element 2841 1 34.65 TACCCAATGTGCAAAGAAGGAAGCTGATGGGAGCAAAACATTCAACCGAGAAAAGCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAAAATAAGGCCAATAAC:1 + chr2R 4161842 5' + Circe 7208 1 61.39 TTCAAGAGAGCACGTTGCAAAGACGTTCAGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chrX 14953638 5' - P-element 2841 1 34.00 AAGCGAGTGAATGAACAAACTACTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr2R 10334793 5' - pogo 2051 1 77.00 CTTCGAACTTAGTAGGTACCTAAATGAAGCATTTACATCAAAGTAAATAGAGCATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 + chr3R 25214914 5' - Burdock 233 2 57.43 AAGGCATTTTGTTAGACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTAT:1 + chrX 21564069 5' - invader4 315 2 67.33 GTTTTGGTTATTGTTAGCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chrX 157216 5' + I-element 27 1 53.76 TGCCACTCCGTAATCTCAATTGTCGGCTTTGCATTGCTCGACGATATGTGTGTAAAATCCCAAATATGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3R 30263548 5' - roo 9042 1 58.42 CATTTGTACGTGCACTCTCATTAGTGTCAGTGCCATGTCGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACA:1 + chrX 6127139 5' - accord 7002 2 62.38 AAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGC:1 - chr3L 24210956 5' + HMS-Beagle2 48 2 75.00 GAAAAGTATGTGTGAAGGGGGAGTTATTCTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr2R 10974143 5' + hobo 47 1 74.26 AATACCTTACACTGAAAAAATTAAAAATTCACTATGTACTTATTAGTAGTTCTTATAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3L 12187737 5' + blood 7031 2 52.48 TAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTGCTATGCTAACAAGAGTCACGACAAACGCCAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGGA:1 - chr3L 23583092 5' + mariner2 735 1 68.32 CCTGACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACA:1 + chr2L 23372502 5' + gtwin 6917 2 78.22 AGATTGTGTTTGTGAGAGAGCTGGTCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr2R 6501171 5' + P-element 49 1 30.69 GGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATC:1 - chr3L 24210978 5' + HMS-Beagle2 26 2 52.48 TTTGAGAGGGTTGAGCTTCTCTTCTTCTTTAATGCTAATATTCTATATTTGTGCTCATCCAAAAAAATAGAAAAATCTATAAGGATCAGGTGAAACGGAAA:1 + chr2R 670634 5' + Transpac 4785 1 67.33 CACCAATTCCAATCCCAAAAGAAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTA:1 - chrX 10741440 5' - hopper 1112 1 82.18 AATTAGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTT:2 - chr3L 24210985 5' + HMS-Beagle2 19 2 58.42 TTATCGAATCTAGTATACCCTTTTACTTTTACCCTGTAACGGGTATAAAAAGTTAGAATTGATTGCTTTAAGAGCGGCAAAGAGTCAAGATTACAGATAA:1 - chr2L 20491470 5' - Cr1a 4227 1 50.00 TTTATATTCACTCAATACAAATACTTTACGCTAAAAAAAAAACAAACTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACACAT:1 - chr2R 17942158 5' + mdg3 30 2 52.48 AGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGACACATACAAACACCATTCAATGTCAGATGGCTAGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:2 - chrX 12649915 5' - hobo 2918 1 57.43 TTGATGGTAAATGGTTGAGTGAGATAATATCTAATCGGAGCACACAAGCAATGCATGTATATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACAATGAAAATA:1 - chr3R 2476390 5' + S2 14 2 66.33 AAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr3L 14286046 5' + 412 7107 2 78.22 ACCTAGTTTCCTTTATATTTTTCCTGGTTTAAACCAGCCATTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 + chr3L 4601922 5' - hobo 2906 1 56.44 GAGTGGTATTCGCAACTCCACATATTCATATGATTAATGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGG:1 + chr3R 2472770 5' - accord 146 2 63.37 GCTAGAGTAAATGAAAACTTTTGGCCTGCAGCACTTTCGGGCGCCGGCATAAAGAGCGAGAGAGTTAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAA:1 + chr3R 10286982 5' - Cr1a 261 1 54.46 TCGTTCACTGTTTGAGTAATCATTTCTGACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACTCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTG:1 + chr2R 3037166 5' + I-element 4982 1 72.00 TCTAGTTTTAAAAATTTTAGTTAAAACGCGAAATTTCAATCAATTAATTTCAATCAATAGATACAGGGGAATAAAATGAGAAAAAAATTAAAAA:1 + chrX 1818611 5' - INE-1 471 1 87.23 TCGGTTTTGGTTTCAGATTGGGTTAAGTTTCGGGTTAGTGAATATCGGAGGAAAAGTGATCTGTTAGTTGACGCGAAGGCTCTAACTTTTTAGGC:1 - chr2R 9508283 5' + Gypsy12A_LTR 483 1 66.32 GTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGTAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTA:1 + chrX 21667996 5' - Tabor 7302 2 46.53 CACTTTTTACTACCAGTCCTTTTTATTCCCCTTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATA:1 + chr2R 25216551 5' - 3S18 294 2 68.32 TGTTTCTCGAGCTTAGCTACACTTTCAGCCCGAAAGTCAGGATCATTTGTCATAATTCAATTGACAAAAGGAAATGAACATGAGCATGCAAAAAACAAAAC:1 + chr3R 26183206 5' - Cr1a 255 1 57.43 ATATACTTTCGAGCTTAATAAATAATTGAACAATTATTAATCTTATGATCACAATATATGTATCAATATTAAGGAAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTC:1 - chr3R 13621130 5' + Doc 4540 1 76.24 AAAACAACACCCATGACGTGGGGAACACGTAGAGGAACAAGCAGTGTGGGCACCTATAAGGATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 3535363 5' + roo 15 2 62.38 CATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAGAATA:1 + chrX 7480765 5' + Bica 342 2 60.20 AATTTAGAAAGAAAACAAATAAAATAAAGAAAACCGAATAATAAACAATGACATTTGTGTAGACATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTA:1 + chrX 8551172 5' + mdg3 5265 1 66.34 GCCCTGTTATATTTCATTGAGTTTTTATATTGTTCGACTGTCGATCAACATTTATTACAGGCTTTCGACTCGAGTACTCCATCGCTGTCTTTATAGATATG:1 + chrX 22736887 5' + Helena 381 1 54.46 TAATCTTGAGCAAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr2L 9672410 5' + 297 6606 2 54.46 GATAAGCAAGGCATTTAAATGTCGCATTTATTGTAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 - chr3R 11080739 5' - I-element 5316 1 70.30 CTTATGTCTATATGAAAAAGAAAATTAAGTAAATGATTTATTAATGCAGAAACTATTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 21581100 5' + roo 22 2 61.39 GGTAGTTGGTTTAATTCATGGTCCACTTTATTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 - chr3L 735088 5' - mdg1 7413 2 68.32 CCAAAATGGAAATATATAAACAGCATAAAAAAAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATG:1 + chrX 2520401 5' + accord 231 2 68.32 GGCGACACGTGATTGTTTCATCATTTAGGTCGCCAAAAAATAATTGCGTGCTGTCGATTTCATTGTAGTGTAAACTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 5285022 5' - roo 397 1 68.32 ATATGAAGGATGCGAAGGACTAGCGGCTGGGGGATAGGACAATGTTCAGCTTGGCATTGTTACTTAATGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chr3L 12217286 5' + roo 8670 2 72.45 TTTGTATACTTTTGTTTTCGGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr2L 8898936 5' - roo 9033 1 61.39 TGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGAAATACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 - chr3L 9762256 5' + jockey 4699 1 54.46 TCGTGATGAAAATGTAGCATACATTTGGGCGCCGCTAATAGGAAAAACCAGAGCGCGTCGCGATGGTTGCGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3R 13623622 5' + jockey 12 1 71.29 CGGGCATCTATTTCAATTTCCCCCTGGCAATTACGAGGCAGTCGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr3L 15729677 5' + hobo 32 1 55.45 AGTCACCTTCGGATTTTCTCATGCTAGCAACAAAATAAAATCCGATAGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCA:1 + chr2L 9206134 5' + 1360 3348 1 54.46 AATTTCTGCTGATTATGTAACAAACTGAAAGCGAGTGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:2 - chr3R 23870155 5' - roo 9049 2 56.44 AACTCACAGATAACCATCGCTAGTGTACGTATGTGTAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTG:1 + chrX 21939061 5' - HMS-Beagle2 7152 2 70.30 ATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:3 - chrX 21219479 5' - roo 9026 1 70.30 TTTCCACTTTGTGCCCCCATTTATGACGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 - chr3R 21198655 5' + Tirant 50 2 72.28 AAGGTGTAAGCTCTGCTCTTTTACTATTCATGTTGAGCTTTTGCTTTGAACACCTCTCAACGGATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:2 + chr2L 21018770 5' + 412 11 2 73.27 GCCCGCAAAAGGAAAGGAAAATTTTAAAATAAAAACACGACCACTGTTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTTTCGAGCCTTTTCAGGTATCTCTCGCTGAGCC:1 + chrX 9403126 5' - G6 1787 1 53.47 AGTCAACTTTCCAGTTAAATATAATGTGGCTAAGCGCTTTAAAGATTCTGCGACTAGCCAGCTTAAGTCAAAATTGCAAAAATAAAATGAAAAAAAAAATT:1 - chrX 3291985 5' - INE-1 475 1 67.33 GTCGCCAAGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGG:1 + chr2R 6482659 5' - gtwin 7368 2 56.44 CGATTCACAAATCGTTGGCACGCATCGGGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3L 12217362 5' - roo 9024 2 69.31 GCCTTGCCCTCAGCACGTGGAGACGCACTTTGGCAAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr3R 17557383 5' - mdg1 7419 2 64.36 AGGATTAGATGGAAACAATTGTACTTCTATATCAGATTGTTTGAGATTTCACTATTCAGCTTAATTCATTCAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chrX 12152754 5' - roo 405 1 74.26 AGTTAGTTTTGAGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr3L 3535476 5' - roo 404 1 72.28 TACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:3 - chrX 21945940 5' + F-element 31 1 56.44 AGGACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATAT:2 - chr3R 1977624 5' - micropia 428 2 50.50 TATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGA:1 - chr3L 15452919 5' - accord 489 2 70.30 GTGTTGCTTCGACATTAAATGGAGCGGCGAGAGAGCTTAGGGTGGGGGTTGCAAGTGGAAATAGCCGAGGGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACG:1 - chr3R 11346018 5' + invader4 166 2 72.28 GCTGGCGCTTTCGCTTGCATGTGTTGGTGAGCGTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTT:1 - chr3R 21592017 5' - Bari1 1666 1 63.37 AAAACCAACACAAACGCACGACAGGTAAATCAGTCCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTA:1 + chrX 22051563 5' - I-element 260 1 66.00 GACCATTTGCGTGGCGAAATTCAAAGTCAAAAACGAGTTGCCAGGCCACGCCCGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1 - chr2L 8299887 5' + Transpac 4939 2 59.41 ACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTAT:1 - chr2L 22684577 5' + transib3 49 1 60.40 CAAAGGCCAACTGCCAGCCATGACATTTCGAGAATTTCGCACTCATTTATCAGCGATGGCGAATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCC:1 + chrX 9008721 5' - 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P-element 2838 1 24.47 ACCATACTTAATAAGATAATCACTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 4539174 5' - roo 9021 2 74.26 GAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr3L 14558261 5' + 297 38 2 66.34 TGCAGACATTGACACTGACTTCTGAGCTGAGTGTCACTGACATTGGTTGGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr2R 22199239 5' + 412 7081 2 51.49 GTCTTGGAATTTATTCAATTTATTCAAACCTAGTTTCCTTTATATTTTTCCTGGTTTAAACCAGCCATTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr3L 4601895 5' - hobo 2933 1 71.29 ATTAATTTTTTTTTTCGCCAAGTGCGTGCTTGGGTGTGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTG:1 - chr2L 3655118 5' + 1360 40 1 67.33 CATCAGTTGACACCTCATATCCTTGGAGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2L 1530390 5' - roo 392 2 60.40 AACCACACACAGAGTATCAACAATGCCGAGCGTTAAATGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGGGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGC:1 + chr2L 17730119 5' + hobo 156 1 61.00 TTGCATTAGAGCGCGCAACTAAATGTATGCTACAGCTGAGAAACTAGGAAAATTGAAGTCTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 - chr3L 5267294 5' - Juan 4203 1 65.35 AACACAACAACAGAAAATATAAATACAGTACTTGATACTAATCCTGTATTGTATCCTAGAATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCT:1 + chr3L 2896940 5' - Quasimodo 67 2 65.35 GGCAGCTTTACGCTTTTACGACGAACTCAAGGTATCAAAGAGCCGGCATCAAACCTGATTTTCCACCTTCGTTGTGGTTTAATTAAATTGAAAATACAATT:1 - chr2R 19214112 5' - transib3 52 1 73.27 CATGAAAAGTTATGATGGCACAAAAAGGTTATGAAAAATTTGAAGAAACCTAAAGTTAACTCTGTAATTGCTTGCATCCTGTTTGCTACCTTTTTTATGAA:1 + chr3L 5197287 5' - Q-element 74 2 58.42 CCAGTTTGGGAAACTCGTGAGCTAATAGAAGAGCTTGACGATGGTAAGGGAGAAGAAAATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTAGATGCTTAAGT:1 + chr2R 3029833 5' - 17.6 7180 2 60.40 TTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chrX 15227338 5' - roo 9034 1 64.36 CTTAAAACTGGACATGTTTTTGAAACATATACTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr3L 18206803 5' + pogo 42 1 73.27 TGTCATTCCATAAAATGGGGTGAGCTTGAACTGACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:3 + chr3L 26315781 5' + Tabor 21 2 58.42 GAAAATGTAGCATACATTTGGGCGCCGCTAATAGGAAAAACCAGAGCGCGTCGCGATGGTTGCGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3R 13623629 5' + jockey 18 1 65.00 CTTTGTATCTTTTTCAGCGGGGACAACCTTTTGGTGTTTGCATTATGATTATTTTTATCATGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 - chrX 17492976 5' - Tirant 8492 2 65.35 CATGTGCACTAAACAAGTCATGAATTTCAAACAGTCGCCGGAGATCCCGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 + chr3L 17767653 5' - hobo 2910 1 51.49 CAACGATAGTCACACAGGGCGTATGCTTAATGTGGTTAAATGACGTTGTGGATTTCAATTGATTGGGTGGATGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGT:1 + chr2L 15151842 5' - Tabor 7321 2 75.25 TTTGGTCGTAAGGCTTGAATCTCTAATCACTGCCTGGTGCGGTAAAAAATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATG:1 - chr3R 19445226 5' + roo 8784 2 53.47 TACAAAATTTTGGGTTTCGGAGTCTAGAAGTAGACAGATGTATATAGTTAAATAGTTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCA:1 + chrY 424996 5' - McClintock 445 2 62.38 TCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 9616607 5' - roo 353 2 79.21 GAAAAATGGTGGGCGTGACAGATTTGGGCGGTTCTCGTTGTAAATACCAGCAAACTGATTTATATAGTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATT:1 - chrX 21564180 5' + invader4 2771 2 66.34 CATGAGCATCCTAAATCGTATTATTTGTATTTGTGCTCAATTTAAATGTCTTTCTGGCTACTCCTTTGTGTGTTGACTGCAACAATGAAGTTTTCTATATG:1 + chr2L 91955 5' + Tc1-2 1488 1 59.41 GTCGTCAGCAAATGTGGCCAACATTGACGTCCCGGGTAGGCTAACGTCTGGCCGAGGCATGGTTGTCAGATGTGGGGCTTGTCTTGCGACAGTCAAATT:1 - chr3R 5302294 5' + BS3 1330 1 61.62 CATAGATGTCGCTGGTGTGACACTTAAAGGCCACGGTAAATTTAAAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:1 - chr2R 14434345 5' - invader4 301 2 56.44 TTTTTTATTAAATCTGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACA:1 - chrX 10298070 5' + Quasimodo 22 2 56.44 CACGACACGGACAGCGGGGAAAGGTGGCAATTGAAAGAAAGTGCCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 - chr3L 3070714 5' + 1360 31 1 59.41 TCCATTTATTCCTTTGCTGGAGCGTATGCAAATATGAACGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTTATTCAGCGAAGGC:1 - chr3R 19447894 5' + Porto1 4314 1 70.30 AAAGAAAAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 19449426 5' - roo 9049 2 69.31 CATCGATCATCGAAATCAACTATTTAGGGTGGACCTAAAAAGCACAATTTAACGTAGTTCAGTCTACGTAAATATATTCTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCA:1 - chr2L 19547425 5' + Max-element 8235 1 76.24 ATAATGCTCGGCTAACTAGCCAAGGATTGCGGGGCTCTGGGGGAACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACC:1 + chr3L 1259819 5' + mdg3 5283 2 55.45 AATCGCACTTCCCATTCCAACATTAGATGTGTTACTAATTTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAG:1 + chrX 22641696 5' + Tc1 1572 1 76.24 ATAACTTCTTCGGCAATCTCGGTGCTCCTGCGGCCTCTAAAGGGTCAGCGCAAGCACGGATGAGGGTCATTCAGTCAGCCAGCCAGATCGCGAGTGGAAGG:1 + chr2R 4297033 5' + gypsy8 388 1 74.26 CTTGATGGGTTGAGATAAAGCAAACATTAAAGTCCCTTTATTTAGATGATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAAT:1 - chr3R 15076310 5' + I-element 419 1 54.46 GGTCTATTTTGTAGGTTTCTAAGCCAAATATTAAAGCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr2L 12246581 5' - hobo 2901 1 63.37 ACCCGCAGCAACCAAATAGCCCCTTCCCAACCCATCGCCATCCTACCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCCCTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3L 13671896 5' - hobo 2911 1 53.47 GGTATATTTCGATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGC:1 + chr2R 11246983 5' - 1360 128 1 46.53 GTTATGCCTTACACAATTAATAAAATGTATTTAGTTTAATAAATATTACTAAATTGCTGTAATGATGAACTTCCCGTTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr2L 21018870 5' - 412 7525 2 63.37 GGCCATTTTTGATGCGATATAATCCACTTGATGCCGGCATTTTGTTGCTGTGTGTTGCACTTATTTTCCGCTTGTTGTTGTAGCTGTCAATTGTTTTGCAT:2 + chr2R 18007109 5' - Doc4-element 389 1 50.50 GCGGCATTCGCTGGGCAGAGGGCGAAGTGCAGAGGGGCGGGGCAAAAGGACGATGAAGCTCAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 - chr2R 18374865 5' + 412 14 2 65.35 CATTTATTTCAACGCAAACTAATTATCCCGAACCCACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCA:1 - chr3R 24596783 5' + I-element 5023 1 65.35 AAAAAAAAAGAATCTGCCACCACAATGCGGCACATCGGCAGCGGATGGGCTGTGGGAAAGTCGGCGAGGAAAATCAATCTGTGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr2R 14135503 5' + roo 8663 1 80.20 TGTACATATATATATATATATTGTATATGTATTTGGATGTATAGTGATTCGATATATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 + chrX 5393392 5' - opus 478 2 71.29 TACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCTCTC:1 - chr3R 1977613 5' - micropia 5402 2 59.41 CTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCC:1 + chr2R 5284576 5' - Doc4-element 2600 1 66.34 AATTTGTACTTAAGAAGCGTCGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr3R 3921298 5' + Doc 59 1 78.00 GCTGTCACTTTAGTCGGGTTTGTTTATACTCTAATACCAATGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTC:1 - chr3L 25305803 5' + 1360 40 1 72.45 GGAAACCCAGTAAAACCTAATCAGATTATTAAAAAATTAGTAATGAGTTTAAAACAGGATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAG:1 - chr3L 28056354 5' + Stalker3T 41 1 55.45 ATTAACACATTTCGCTTTGCAGCAGGATTTACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr2L 16569532 5' - roo 9028 1 68.32 TTGACCAATAAAAGGAAACTCAGTTATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:2 - chr3R 19515893 5' + 412 10 2 69.31 ACATACTCAATCCGGTGAGTTTAAGGATCGAAATGGATACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 - chrX 2742553 5' - hobo 2903 1 61.39 GTATACTAGATTCGTTGAAAAAAGCACAAAGACACAAAGACGCAGCGTCAGTTTGTTGACCCATGTTGTCAAGCCCACTATAACGCCCTAAAACCGCCCAA:1 - chr2L 21794174 5' + INE-1 342 1 63.37 TAGCTGCTCTTGATTTAGTTTATTGTTGTTTGATGCTTTATTGTGTTTGTTCGGATCTGGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGA:1 + chr2R 6143018 5' - Stalker4 161 6 52.48 ATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCG:1 + chrX 292409 5' - G3 4558 1 65.35 CTTTCAAAAGGACTCCCCACTATTCCGGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAAC:1 + chrX 21196396 5' + Doc 451 1 71.58 CAATTTCAATTTTGCAATTTTGGCAGCTGCCAGGTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 + chr3L 17110714 5' - hopper 1378 1 63.00 GTCGACCGGCACGGCAGAACAACCTCGGGGCCGAACGACATTTAGATCCACAACGAAGTCATTCACCGCCTGGAGAACTTAACTTAAATACTACAATGATT:1 + chr2R 5086487 5' - Tc1 1550 1 78.22 AAACAGAGCGAATTCAGAGCTAAGTCCGAAAACAAAACTTCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr3L 4692250 5' - P-element 2851 1 43.56 TTGGCAAACATATCGCTAACAATGTGGGTAAGATACATAGGAACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 + chr3R 12338266 5' + HMS-Beagle 31 2 61.39 TGGAACTTTTTAAAAGGGGTTTTCGAATATTGACTTACATTTCCAAATCTTAGGTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr2R 12998264 5' - roo 410 1 78.22 AATATTATTGTGTTATATTTTCTTCGTACAAAATATAACCACGAACCATTTAAAGGCTTTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATAT:1 + chr3R 25859344 5' + Stalker2 7271 2 57.43 TCGGCACTCGAAAACAGCACACTGTCGCAAAAAGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chrX 21220344 5' - roo 360 2 69.00 TAAAAGCAGCAAGACCACACTCATTTTCAAGACCCATTTCCGATAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGG:1 + chr3L 19435393 5' - jockey 4765 1 53.26 AAATCTATTCGCGCCATTCAAAGCCAGAAATTGAACATTAATAACATACTAGAAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTA:1 + chr3R 7112391 5' + pogo 1718 1 61.39 ACGTGCCTGGCATGCTGAGCACTTTATTCGCCATGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAGTAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACT:1 - chr3R 17982922 5' + HMS-Beagle 6686 1 65.35 GGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAGGCTGACCC:1 - chr3R 19513383 5' + jockey 4707 1 76.19 GAAAGTCGAGAGAGTATCAATATCAATAAAAATCACACTTTGCAACTTGAGCGATAAATTCAAACTGCCATTTCGATACTGTGGACGCCGAAAAATGAATA:1 - chr3R 27814275 5' - invader3 5463 2 79.21 ATCTAACCGAAATAAGTCTTTGAGCTATAAAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAAAGAGAGCTTTCCTCCCTCGGCCGCAGGATTG:1 + chr3L 24870931 5' - accord2 11 2 71.29 GGTTTTATTGATTTTATAAAATGGTTATATCTATGACTCCAACTGGGAACGCTGCTTGATCAGGCGGTCTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 - chrX 2755552 5' - opus 499 1 78.22 GGTGCATTTTGTAGAACACCGTCACCATAAGAAGTTCATATCATCTCTGTATCGCTTTTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATG:1 - chrX 1641774 5' + micropia 5043 1 68.32 CAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 19450161 5' + roo 8694 2 74.26 CAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAG:1 - chr2R 2994303 5' + gypsy8 114 2 45.74 TCGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTG:1 + chr3L 24210884 5' - HMS-Beagle2 299 2 64.36 TTTAAAGTTACTTTTCTGATGCGTAAATCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 + chr3R 7879843 5' + 1360 43 1 74.19 TGAAACAGGCCTACACTCGAATAAAATAATTGCTGGAGAGCGGCAGTAGAGATTTTAGTTAATATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr3R 6138346 5' + 297 6587 2 60.40 GATGGTAAGTAAAATATGTATAGTCATACATATAACATATACTTAACTTTTAATAACCTCCCTTTTGGTGCTAGTATACATATTTATTTATTTGTTAATAA:1 + chr3R 14042493 5' - Tc1-2 472 1 74.26 AGAATTGAAAATTGAAAATTGAGAAAACCTCTGCAGGAGACGAGCCGCACAGTGAGTGTTAAGGACGATTATAAAATAAGAGAGCAGCACGGATGCAGGTG:1 + chr3L 10858710 5' + Osvaldo 311 1 80.20 TTACAGTTTTTCGAACTTTTACAACTGTTCGAAAAGTGATGTGAATGTGAAAAAATAAGCAAGTGAAAAGACGCTAACACATATTTATATGTGTTAAAAAC:1 - chrX 5085214 5' + Porto1 119 1 65.35 GGGGGAGAGGAATTTTCCCAATGTCCGAAAACCAATCGCATTTAGACGGTTTGCATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 11936881 5' - roo 387 2 58.42 TTAACTGGGGACTGAGATGGAGTTTTTCCCATTACCGGACAATGGGAGGTCCAACCGAAAACGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTAC:1 + chr3L 21999317 5' - roo 150 2 66.34 TTGCAATATTTATTGCCTTTTGATTATATTTCAGGCGAGCGAGGAAAAATATTTATATACCACCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 - chrX 13547260 5' + I-element 15 1 58.42 TGCAAAAAGGAGGGAAAAAAGGTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2R 21902103 5' - roo 9017 2 86.14 CATAACAAAACCAAAGAAGTACTGTCTGCTACAATTTATACCAACCATATGTGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1 + chr3R 6030943 5' + hopper 44 1 60.40 TTTGAACGCCGATTTAGCACTGAATTCAGTATTCGATCTGACCGATATGCTGTGCTGGCAATTGAGTTTATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 - chr3R 10876383 5' - opus 496 2 77.23 TAATCAAATAAAACACTTACCTCACTGACAGCAGCCAATTGCTGACCCATAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCC:1 - chr3R 5371500 5' + TAHRE 10405 1 55.45 CTTGAAACTCGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGA:1 + chr3L 8044290 5' - 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HMS-Beagle2 265 2 70.30 AACAAGGTTTATGACGTTATTCATGAAAGATATAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr2R 2260677 5' - 1360 3350 1 79.21 AAATAGGCAAATAGAAAGTATGTATGCTTGTTTGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTT:3 - chr3R 20240964 5' - Tabor 7315 2 55.45 TGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr2R 17348593 5' + jockey 60 1 80.20 ATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTG:2 - chr3L 27395590 5' + invader4 174 2 75.25 TTAGAATGCTCCTTTTTAATTTTATTCATAACTTTATTTTCAAGATCTTTTATTTGATTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:1 + chr3R 1927192 5' + copia 4889 2 59.41 AATTGTTTGCAATCAGCCGGACTTTATGGCTGTTGCTTCTACGGTTAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 - chr3R 22494770 5' + 1360 30 1 56.44 GATGCTGGTACCTGCAGCTGGAATTTATTTTAGATGGCTTACATCTCTTAGTAGTGTCCTACCTCCCGTTAAACTCACCACAGTGTGTATGTGTAGTGGTG:1 - chr2R 3292603 5' + invader5 3865 2 66.34 AAGTTAAATGTAAGTTAAATATAATACACACACTGGTGTATTGTGGTGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATT:1 - 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chr3R 4600900 5' - Burdock 6385 2 73.27 GATACCCTCTAGAGTTACATAAGTGGGATTCCCACATTTTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTC:1 - chr2R 1986271 5' - INE-1 148 1 59.41 GATAAAACATATCGTGTTTATAATATATATATCACTTAAGGCTTAATAATTTTATTGCGCCTGTTTTTATCGGGTATACTTTAGAATTTTTTTTTTATTTT:1 - chr2L 21721019 5' - Transib5 24 1 55.45 GAGCAATTATGATTTCAAAACTTTATCAATGAAGTGAGCTAGTTTATGAAGTAATCCGAGTCAATAAAATTAAACTTGACTTAGAACGAACTTAGTTTTTC:1 - chr2L 21672804 5' - HB 1373 1 76.24 TGCGTGCACTTGTCTGTTGTTGGTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr2L 12888854 5' + 412 7107 2 77.00 GGAGAGTGCTCCTTAACCTCACTGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr3L 17766483 5' + P-element 63 1 28.71 ATCATTGCATGAATTTAAAAATATGCTGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAAT:1 - chrX 9816335 5' - BS 5072 1 60.40 CTCTTTGCAAACAAGTGAAATAGCTACTCAACTTTTAATATAGTTAAAAACAAGAGAAAATACTATAGTCAAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTC:1 + chr2R 4428045 5' - INE-1 549 1 73.27 GAAGAAAGGTCTTTTGTAAAGTTCAATAATCAGGACCTTGTTTAATTTGACCGACAACAATTCGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:1 - chr2R 3144121 5' - Transpac 300 2 69.31 AAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGC:2 - chr3L 24210957 5' + HMS-Beagle2 48 2 74.26 TGGTTACTTTCATATCAACGCTGTTTAAGATTGTTCTTCCTAAAATCGAATCAAAACCCATATCCAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGC:1 + chr3R 2458072 5' + 1360 3114 1 64.36 GCTAATTCCTCCAGAAATTAAACGCCCGGGATCGCCTTCAATTGTTGCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 - chr3L 25186347 5' + copia 31 2 55.45 ATTTCTTTATTTTCGTTATTGTAAACTTTATTTTCTCTTTCAAAATATGATTGTGTGTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCTAACTCTGTCATCGGTATTT:1 + chr3L 18125005 5' - Porto1 4496 1 60.40 TAGATAAAGGTCAAAAATGAAATATTGTATGTAAATTCAATTCACAGTTGCTAAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGTAGCATTCTCTCT:1 + chr2R 10552701 5' + INE-1 576 1 86.14 CGGGGTGGCTTTTCGTTCGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGATA:1 - chr3L 17421541 5' - P-element 2832 1 24.75 TTTGGTTCATTTGGTCGGACATTTTGTCTAGTTTATATTCACGTTTAGTTTATATTCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr3R 5561943 5' - pogo 2084 1 60.00 ACCCACCGCCTTGCTGCCACAGCAAAAGATGCATGGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCC:1 + chr3R 17980749 5' + HMS-Beagle 38 2 67.33 AAATACCCGTTAGTGATGCAAGTTTTTAAATGATTTGAGATACATATATATATGTCGCCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATT:1 - chrX 16906750 5' - invader4 298 2 63.37 TGCTAAATTATAAACTAATTATTACCGATATATTTTTAACTTGGGCAAATAGCAACAAAAATAAGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3R 7015425 5' + roo 8675 2 67.33 AACTCGTTGTGTTTCGTATTAGAACTAATTCACTCATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3L 19066088 5' - roo 9031 1 64.36 CAAAACATATGTCGCAGTGGGCTGCGGTTTTCCACTCAACGAACTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 16398935 5' + roo 30 2 55.45 CAACTAAACACTCGAAAAAGAAAACAAGCAATTTAACAATTTTCTAATATTATCGAACTGTGTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTT:1 - chrX 19373060 5' - Doc2-element 234 2 67.86 GATGAAAATGTAGCATACATTTGGGCGCCGCTAATAGGAAAAACCAGAGCGCGTCGCGATGGTTGCGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGT:1 + chr3R 13623626 5' + jockey 13 1 69.39 ATCTCGAGTTGTTCTTTTCTGGCCTGTGGCCGCCGGCAGACCTTTAGATTTTCATGTTAACTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTT:1 + chr3R 17615917 5' + HMS-Beagle 13 2 66.34 TTTTTGATATAGCGAGATGTGGCTCCTGTGTCTATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACAT:2 - 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roo 360 2 74.26 GTATTGTCCGTTATGTTGGACCAAAGGTCTCCCCAGAACCACTTTTGCAAGCACCCATGTTTTTAACAGTAAAGCCATAAGTGTTTTTGTTACTCATCCCT:1 - chr3L 25847466 5' - hobo 204 1 56.44 CCCTTTGCGTTGCACCGAAAAGAAATATCAAAGAAAAACCAGTGGTTTATCAAAATAAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chrX 15227261 5' + roo 8682 2 67.33 GCATACCTCAATCAAAGCATGTGCCACACACATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAAAAACACACACATAC:1 + chr2R 18078698 5' + Quasimodo 35 2 65.35 TTCGCGGGTAAATCACCGCCAACTACAACTGCCGAAACGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAG:1 + chrX 3446493 5' + I-element 2 1 75.25 ATATTCGCAGTTTTCTTGTGGTTAAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTT:1 - chrX 5199430 5' - Doc 4409 1 79.21 TCATTTGCCAGCGAATGCAAATGAATATTAAACGAGTGGAAGGAGAACGTGCATCAGAACGTTAACTGAAGGAGTTCGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAG:1 - chr2R 16710050 5' + gypsy8 445 1 68.00 AACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:3 - chrX 21668089 5' + Tabor 18 2 61.39 AAACATATAAACAAATAAATGTAAATAAAAAAATCTATAAAGGTAAACAAAGAGCCCTTAATTTTGTAATTAAATACCATTTATTTTCATTGTGCAAACA:1 + chr2L 20623343 5' + S2 1698 2 79.00 CATGAGCATAGACGGCCACATCGCCACCGCCGTGTGTCTCCTCGGTCATGGGTCGCATAAAGCATTGTACCGTCGAAAAAAGAAATTTGATTAAAAACATG:1 + chr3L 21442632 5' + Tc1 391 1 56.44 TGATGGTTTAACAACAAACTCGCATAAAGCAGACAGGCGGACCAGTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 + chr2L 19681413 5' - hopper 1381 1 59.41 CTTTTTTCGTTTTGTTGTTTATCGTGCCAATGCTTACTGGTATACCTACTATGTGATAATCGGGGAACTTGACAAATGTAGCTGTGTTTCGTGGAATATAA:1 - chr3L 24736953 5' + transib1 396 1 72.28 GAATGATAATAGTGTTAATTACAGCAATTTGGCCATGATGTATTAGCTAGTTTTTTTTCTGTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 6427888 5' - Doc2-element 233 4 88.16 CGAGACATGGAACTTAATAGATAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCT:1 - chr2R 2095221 5' + Stalker4 182 4 78.22 GTTATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr3R 19515871 5' + 412 7085 2 56.44 GCTGGGGACATCTTTCCCGAAAGAGAGATACTTCTGAACGGTCTTAAACATTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCGTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTT:1 - chr2L 14964409 5' - mdg3 5073 1 72.28 CTAAGACATTAGTTTAACCTCTAGGTAAAATGCACTCAAGCGATTACATTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTTACTAAACTTAAATACTA:1 + chr3R 5169639 5' - Tc1 1558 1 52.48 TAGCACACACACACACGCACACACAAGCTGCATGGCAATTAGCAATGCGAAGGGAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chrX 8487526 5' + hobo 21 1 55.45 CGGGCAAAGTGTTGCATACTTTTGGGGCGGCCGATCGCATGGGTGTATTGGTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - 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chr2R 1986261 5' - INE-1 138 1 69.31 CAACATTGAGCGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGAAATACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 - chr3L 9762246 5' + jockey 4709 1 56.44 CACAGCAGGATGTCGCTGTCGATTTGGCAAACAGCGGAAGTGGCATTCTCCTTCCGGTTGCCACTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr3R 25360889 5' + jockey 17 1 71.29 TTTCATTGAATGTTTTTTCGAGTGTAACAGCCACTAAGCAGATCATACGCGATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr2L 10029169 5' + 297 19 2 53.47 ACAAGTATCTGATGGTTGAGCATCTTAACATAGAAGTGGGGAAATGTATTTCAAATTTAAGGAATATGCAGTGGATATTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTA:1 + chr2R 12008328 5' + mdg3 5252 1 46.53 AACAAAAGGCTCTCGACGCACTCGAATGAACCAGACAAGACTCGAGTTCATTGTTCAATTATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:1 - chr3L 1259906 5' - mdg3 231 2 65.35 GACATTAATTCCTATTTCCTATTCCTATATTTATGGCTGCGTCAATGTCTCTATAATCTGTATGCTGAATCTCAATCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGA:1 + chr4 176177 5' - INE-1 152 1 63.37 GATCATTTGACGGGTATACGAATATACACATATGCATGTACATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATC:1 - chr3R 13231218 5' - Quasimodo 7336 2 59.41 TATAATGACCCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGA:1 + chr3R 15130450 5' + Max-element 8244 2 62.38 ATTTATTGCACCGGGACTTTGTTTGTTAATCCTTGTTCGGCCCCTAAAGCCGGCGACTTAGTGTGCATCATTTTATCATAGACAACAAGTCATTTTTGGCT:1 + chr3R 902937 5' - Cr1a 496 1 69.31 ACAAACACACAATGGTGACAAACAAAAAAAAAGCAAGAGCCAGATTATCCTTTTGTATGGATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 - chrX 22708758 5' + copia 4885 2 55.45 CAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:2 - chrX 21668062 5' + Tabor 6884 2 68.32 CGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chr3R 19513411 5' + jockey 4688 1 55.91 CCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:6 - chr3L 3535431 5' - roo 9022 2 73.27 TATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:2 - chr3R 19515869 5' + 412 7087 2 58.42 GGAAATGGAATTGAAAGCGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 - chr3R 19513428 5' + jockey 4679 1 68.32 ATACATAAATAAATCATAGATATTGGACTGTTTTAATCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTAGATTTTTATTAAATTGAGCTACAGACTATAAACTTTGTACA:1 - chr2R 2119210 5' - transib2 2773 1 80.20 AATGGAATTGAAAGCGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 - chr3R 19513425 5' + jockey 4681 1 66.00 CTTCGTCAGGTTTTATCCATTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:2 + chr2L 13598163 5' + pogo 7 1 70.30 AATAAATCAATTCAAGTATGCATTTGGGAGCAAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCT:1 + chrX 18975532 5' + diver 17 2 62.38 GAAATAGATAGAAATCGGTATGAATGAAATTAAAAAACTGAGCGCACATTACATTACATACATTACTGCCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAA:1 - chr3R 11080407 5' + I-element 4916 1 68.69 TCAACCCCTCACCTGTGCACTGCGCAAAATATTGTGTCCTAGAAAAAAAAACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 - 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Quasimodo 7038 2 71.29 CTGCAATTACCTGCATTGATAATTTCGAATGTATTTCCAATCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 - chr2R 20124607 5' + Doc 42 1 59.41 TTTACTTTATCGTTTCTTTTAAACGATTAAATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2L 18417275 5' - roo 404 1 74.00 ACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGA:1 - chr3R 15790097 5' + flea 4712 1 75.00 CTTTTTGTCTCTGCTCGAATGTCACTTGATGTTTGTGGGCCCTTCGCTTCCTGGCTACACTCGGAAAATTGTTGCACCCTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 - chrX 4278428 5' + blood 1 2 78.22 CAGCTGAATCCCGAGCAACTCGAGCTGCCACTCCGTAATCTCAATTGTCGGCTTTGCATTGCTCGACGATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 30263523 5' - roo 405 1 75.00 TGTTCGCAAACACGGTCTTCAATTTTCATTAGGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCACAT:1 + chrX 17432403 5' - hopper 1376 1 64.36 TATGCAACATTTCACAGTAATAAATCTGCCCCACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3L 7839448 5' + roo 18 2 69.31 GCACATTATGGTTTTAAGTTAAAGCGTTTTTTGCAAATTGTTTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAA:1 - 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chr3L 24731967 5' + INE-1 543 1 79.79 CCCATCCCGAGAATCCTGATCCATCCTCCCCCAAAGCTAAGAAAAAAGACCCTTTCAGAAATTACCAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACACAGTGCA:1 + chr3L 5672154 5' + Ivk 300 1 72.28 CAACATTATAACATAATCCGCATAGAAGGACTTCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCT:1 + chr3R 16110183 5' - mdg3 5454 2 71.29 GAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAA:1 + chr2R 17402722 5' + invader4 39 2 62.38 CCAGATCAAAAGTAGAGCTTGTCATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAA:2 + chr3R 13231162 5' + Quasimodo 47 2 76.24 TGAAACAAGTCGAAGATAATGGACAGAGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 8133972 5' + roo 8714 2 77.23 ACCACGTTTGGGCCTCATCTAAAATTGATTTTGCTCGGGAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3R 20384501 5' - roo 9034 1 64.36 ACAACCGATGCGAAAGAGTCGCGCGGCTTGACTGGGAGCACCAGCCCGAACTCCAACGGCTGGCGCATGATGAAATAAAATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 + chr3L 17421481 5' + P-element 15 1 64.36 TAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:4 + chr3L 8044329 5' - mdg1 374 2 70.30 GCCGCCCACTAGAGAACATCCGTATCCAGTTCCATTTCCAGTTCCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGA:1 - chr2L 15151940 5' + Tabor 6870 2 53.00 AAATAGAGTCTGGAGTGTTATATCCGTTACTCGATTCCGACCATATAAAGTATGTATATTCGTGATGATATTCGTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCAATC:1 - chrX 158241 5' + INE-1 96 1 75.25 AGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr3L 8044304 5' - mdg1 399 2 56.44 TACATAGTCTTTGGCCGAGTTTGCCAGTATGTTCTTATCAACATCGTCGCAGAATGAAGGAAGTTGACATCAACTCCTATGAAAAACGTCTCTCATTTGCC:1 + chr4 888333 5' + Bari2 591 1 56.44 CCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 - chr2R 1725925 5' + Doc 49 1 69.31 GTGTATGTATTGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATT:3 + chr3L 24210875 5' - HMS-Beagle2 7191 2 75.25 TTTCCCGTTTTTTTTTTTCGAGGGAACAATGGCTACTTAGACGGGGCTTTTATGTCGTTTCCTTCATTAAGCGCGTATCCAGAACATCGCCCAAAAATATA:1 + chr2L 6115091 5' + jockey 4634 1 73.27 CTGCTACCAACAGCAGTTGCAATGCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAA:1 + chr3R 8499430 5' - Tabor 7271 2 74.26 ACAAAATTATCAAACTAATCCAAAGAAAATCGACGAGAAACAATAAACAAAACGAAAATATCAGCGTATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTAAA:1 + chrX 16503297 5' + Porto1 231 1 61.39 GAGCACAACATCTTCAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAAGATGAACACTCAT:1 - chr2R 4677371 5' + invader3 5186 1 78.22 TGTTTCTAGGAATATTATATATTCAAGGGTAGTTGGTTTAATTCATGGTCCACTTTATTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chr3L 735115 5' - mdg1 7440 2 55.45 GCTTACCAACTGGAATAAATCAATTCAAGTATGCATTTGGGAGCAAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCACC:2 + chrX 18975519 5' + diver 4 2 75.25 TTCTCTGCCGGCCATAGCTGACTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAA:1 - chr2L 19962656 5' - 297 6923 2 77.23 GTTGCAAAAAATAATAAATCACTCATATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCA:1 - chr3L 17762826 5' - invader3 5412 2 78.22 ACTATCTCCATGGATCCAGATCCAGATACGCATCCACATCCACCCATTTCCCCTCTTCTCTGACTGACTGACTGTGGGCAAGCTCGCGGACAATTACAGCG:1 - chrX 20888939 5' - 3S18 5883 2 72.28 CAACTTTGGCGGCGGCGGGGGCGGGTGTGCGACTTCAGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 - chr3R 13995991 5' + 1360 36 1 64.36 ACCGTTTGTTCGAAAAGATGCACGCCTTGAAGAAATGGGTTAAAGCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chrX 3333400 5' - pogo 2072 1 58.42 GAATGAAACAGCGGAACGCGTGGAAAACGCAAGCGATTCGCAACAACTAAATGTACAAGAAATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAG:1 - chrX 10791168 5' + I-element 97 1 68.32 CCTTTTATGATGCTACATGTGGTCCTACGCAGTGCAGGCAATGGGCCGGCTTATTGTTGTTTTTGCACTCCGCTACCAAAAACACTAGAACAACAAGATGC:1 + chr2R 401153 5' + 1360 4 2 67.33 CTGGCTTATTTGGGTGTCTTTCCTATTTTTGATCAACTGGCACCATGGGAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAATAG:1 + chr2R 356118 5' + 1360 319 1 77.23 AATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:2 + chr2L 18417304 5' - roo 9037 1 56.44 ACAAGAGGATAAAGTTAATTTTTTTTTTAGTTAGCACTTTGGGTATATTGGCTTTGGGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAA:1 + chr2R 17942055 5' - mdg3 248 1 76.24 TAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr2R 1725942 5' + Doc 32 1 53.47 AGAGGGATAACTTGTTAAATTCTTCTTGGGATCCAGTTGATTAATTACTAAAATTAATAACATATAAATTACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAG:1 - chr3L 18339460 5' + flea 4612 1 76.00 GTTTGTCTTGCTGGGGGGACTTGATTTATTATTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGG:1 + chr3L 15213164 5' - Doc 4502 1 74.00 CGAAATAAACCCTAGCATAAACAATCAAGGATTCATTTCGTTTGAATCAGGAACAATAAACTACAAAAATGTAATGGACATAGCAATCCCAATTAGGCGAA:1 - chr2R 2009378 5' + I-element 228 1 79.21 GAAAAACATTGTCAATCTTGAAATTAAGATTGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGC:1 + chr3L 23295949 5' + X-element 93 1 69.31 ATTTTCGATAGGCCATTATTTTTTATTAAATCTGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAG:1 - chrX 10298088 5' + Quasimodo 4 2 72.28 ACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:2 - chrX 3295661 5' - hobo 2890 1 73.27 GCGTGGCAACATGGGTCAACAATTTTGCGCTGCGTCTTTGTATCTAGAATACGTTGGCTGAATCTCAGCCTTCTAGCTTTTATAGTTCCAGAGATCTCGAA:1 + chr3L 23702892 5' - INE-1 145 1 81.19 CTGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAA:1 - chrX 10298057 5' + Quasimodo 39 4 67.33 AATCAACGGTAATCCAAATAAACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGT:1 - chr2R 17358666 5' - Quasimodo 45 2 79.21 ATTGGTGTGGTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:2 - chrX 15227352 5' - roo 9048 2 54.46 AACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3L 3535460 5' - roo 9051 2 56.44 TTGAAAGCGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 - chr3R 19513418 5' + jockey 4686 1 60.20 AAAAAAATAAAGTATAAACCCATTAGACTTTAGTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCA:1 + chr3R 11912113 5' + I-element 86 1 67.33 TGTTTCTAGATTATTTGTATACTTTTGTTTTCGGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2L 8898949 5' - roo 9046 1 56.44 GACTCCAACTGGGAACGCTGCTTGATCAGGCGGTCTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 - chrX 2755518 5' - opus 465 2 65.35 ACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr2R 1725926 5' + Doc 48 1 68.32 CTTCCGTAGAAGGAACTGCTAGTGGAAGCCGGGCTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACAT:1 + chr3R 6186299 5' - 412 118 2 66.34 AATATATATGGAATGTTTCGTTCCCACAAGCCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 16398993 5' - roo 9027 1 66.34 AAAGGTGCAAGAACGCGAAGTGGGTGGGTTAGTCGGTGTTTGGGTGGCAGAGTTGGTAAAGGTGGGCCAAACAAGAGGTTAAATTAACAATTAAAATTAAA:1 + chr3L 6663268 5' + HeT-A 313 1 78.22 TATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCG:1 + chr3L 24210891 5' - HMS-Beagle2 292 2 59.41 CGCATACGATGCACACTTTCACTTCAATACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGA:1 + chr3L 3547635 5' - McClintock 6165 2 78.22 CCTTTTGAAGCCCGCAATAATAAGAAATTTTAGTAAACGGCTAAGTACTAAAAATAAAGTACGGGTATTTACTTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr3R 6104474 5' + pogo 1 1 74.26 CAACGTAAAAACGGCGACACTTCATCGAAAAAAAAAAATATACACATATATATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATAC:2 + chr3L 14854688 5' + mdg3 5278 2 49.50 CTCTCAGCTGCACGCAGCGGCTTCATCGCCACCTCAGCGAAATTGCTGATCTGGCCCCAGAATAGCTGGTCCGACATCATGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 + chr3R 4514788 5' + blood 7012 2 34.65 TTATGTTATGCCTTACACAATTAATAAAATGTATTTAGTTTAATAAATATTACTAAATTGCTGTAATGATGAACTTCCCGTTGAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chr2L 21018874 5' - 412 7529 2 67.33 AGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGT:1 + chr2R 4577101 5' - Chouto 464 1 78.22 TTTCCAATGGTGGTCTTAAAAGATAGTAAATGGCAAAAAGGATGGTAGAGCAATAACATTTAAAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chr2L 14599356 5' - mdg1 410 2 61.39 TGATTAATGTAAACGAGCCAACCATTATCGCAACTCTTTCAGCGAAAATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAAT:1 + chrX 13544338 5' + I-element 4892 1 53.47 TTCGTCAGGTTTTATCCATTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 + chr2L 13598164 5' + pogo 8 1 69.31 TTTTCCCTAGTCAACTTGTAACAAATTGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr2L 9129144 5' + 412 49 2 72.28 CCTTAATGTACACACACACACACACACAAAACTCCGGCGGTGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATC:1 + chrX 18566618 5' + Quasimodo 106 2 64.36 CACGACATCACGGAGCGCCACACAGGCGTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCT:1 + chr3L 13652192 5' - mdg3 202 2 71.88 TTATCAAAGTATATAAAATTGATAGAAATTATGACGCGAGCGCAGAAAGTTGCAAGAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chrX 15219354 5' + hobo 19 1 58.42 ATCACTTCTGCCTCATTTTTTGTTGTTGTTGTTGTCACAGTACTAGTCACCGTAGGTAAGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGGTTTTG:1 + chr2L 2388560 5' - Doc2-element 483 1 76.24 CACACAGGGCGTATGCTTAATGTGGTTAAATGACGTTGTGGATTTCAATTGATTGGGTGGATGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATA:1 + chr2L 15151852 5' - Tabor 472 2 65.35 CTGTTTCTCTTTTCTAGCCAAAGTCAGCGTACTTTATGTGTGTGTTACAATGCTAAAGTTCTTAGAATTAAAGTATCTGACATAGCAGAAAGTATGAGTAT:1 - chr3L 27671018 5' - ZAM 215 2 66.34 TACGCCCCATTTTTCACTGAAAATGTTATATATATATTGGCTCACTCTCTGATTTGGTCTTATCAATGCTAAAAGGATCATATTTTTCTAAAACGGGCCGC:1 + chr4 736636 5' + Tc3 425 1 55.45 AAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:2 + chr3R 11080677 5' + I-element 18 1 60.40 TATATAGTTTACAAATCCGAATAGTCAGTGTTTGAAACGCGTAGAGAATACCGAGTTGAGCCTCTCCTTCTCTCAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGC:1 - chr2R 14768631 5' - P-element 209 1 78.22 ATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr3R 13620281 5' + Doc 50 1 75.25 GCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGC:1 + chr2R 4577081 5' - Chouto 484 1 58.42 ACCAAGATGGGCAAGAATGCATTGTGTCTGTGTAGAGTCCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTTTGTCTCTTTCTCCCCCTTTGGACCAGACTCGACCAAATA:1 - chr3R 17893842 5' + I-element 4913 1 80.20 TATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCC:1 + chr3R 15130487 5' + Max-element 8286 2 77.23 TTTGCTTACCCTAACCCAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr3L 8044318 5' - mdg1 7423 2 59.41 AGGACCACAGGACCAAGGCGAAGATGCTTGTGTGGGCGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTG:1 + chrX 20260648 5' - gypsy3 419 1 73.00 ATTATCATTGCATGAATTTAAAAATATGCTGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGAGATGAATCAATA:1 - chrX 9816338 5' - BS 5076 1 64.00 CCAATTGCAAACAAAACTGAAATTGCACTCGCCCGGTCCCCTCCCCCTCTCTCATGATTTGGGCACTTTCTCACGTCATCCTTGTGAGGTCCTTTGTGTTT:1 + chr3R 22175051 5' - gypsy5 380 2 61.39 GATTTTTATTCGATTTTACATTTTTAAAGACTCGCATAAGAAAGGCTTTTCCTTAATTTTATTCCTTATTAGACCAATTTAAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 - chrX 16172427 5' + TART-C 11099 2 58.16 TTCCTCCTGCCAACTTATTTCTATATCTTCTCCCTTTGTGCCCTGTGTGTGTGAAACAAAAACGTTTGTTTCAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2L 3842806 5' - roo 405 1 75.25 GGACTTTCCCAACCTATGTGCCTTGGTTGTACATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1 - chr3L 14558319 5' - 297 356 2 72.28 TTGTGTTTTTAACTTCATCACTTGAACTAACTTTCTTTAGTTTGACTTTTAATCACGTTAAAGTTGCATGCCACAAATGCACACACACACACACACA:1 + chrX 14986754 5' + accord 7026 2 73.20 CAAATATTAATGTGTATATAGCTGTGTGTGCCAGCAGACACTTTATGAACACACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 8898864 5' + roo 8686 2 57.43 CATTCCGGATCCGGGCGACGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr2R 12249734 5' + jockey 65 1 79.21 GATTACCATTATAATACGAATTATACCGATGAGACAAAAATGTTGACTTATAGTACACATCTACAAGCCATTTGGTTCTATTTGTTGTATTATTTTTGTAT:1 + chr2L 11401832 5' + Tc1 1388 1 90.10 AATGGAATTACTTACCTTTGAGGAGTACGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTT:1 + chr2L 34543 5' - Idefix 14 2 77.23 TATTCAAACCTAGTTTCCTTTATATTTTTCCTGGTTTAAACCAGCCATTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr3L 4601915 5' - hobo 2913 1 51.49 AAACGGGTTAAAAAAAAGGGACGTAGAAGGTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAACGGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAG:1 + chrX 18131283 5' + 1360 319 1 72.28 CAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAAT:2 - chr3R 15790074 5' + flea 4736 1 59.41 TCACCTACTTTCTAGCCGAGCCCGAAAGGTAGCCACCCCACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCACAGCAGTTA:1 + chr3L 22140744 5' + Porto1 478 1 62.38 GGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chrX 5168846 5' + hobo 32 1 53.47 GCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:2 - chrX 3295663 5' - hobo 2892 1 71.29 GACAAAAAAGGCGGGAGGTTTAAAATTGGAGCTGGTGACAGAGAACATACGGCAACAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCA:1 + chr2R 979448 5' + Porto1 4306 1 57.43 TCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:2 - chrX 21668071 5' + Tabor 36 2 59.41 ATGTTCATTTTAGGGAAATTTCTCAGGTACAGAAAATAGTTTTTATTGAAAATTATATCAACTTTCGATCATAAGAACACTGTAATAAACCAATATATGCC:1 + chr3R 18144427 5' - blood 378 1 69.31 AGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chrX 3295658 5' - hobo 2894 1 74.47 AGGGAGGTCAATTTCCATTGTACAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGATGCACAACAAATTATGCGCTTAAGTGTAAGTAAAAATGTAAACTGGTTT:1 - chr2L 7130284 5' - rover 82 2 82.18 TTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTG:2 + chr3L 24210914 5' - HMS-Beagle2 269 2 66.34 CAAACTCCCTGCCGCAAAGGACGACGACTGCTTATCAATTGCCCATGAAAGTATGCTACGAAATTCCTGCTTGCTCCTGTGCGTATACATTAAGAATAAAG:1 - chrX 18150351 5' + accord 349 2 82.18 CACATATTAACACATTTCGCATTGCAGCAGGATTTACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr2L 16569537 5' - roo 9033 1 63.37 ATTTTTGTATAGATAATTGTAATTACAAATTGCAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCC:1 + chr3L 26552292 5' - invader4 2755 1 68.32 ACACATGTACGAGTATGAGCTCTGTTTTGCCAAGAGATATCAGGCATGTGGATCGTAAGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:2 + chr3R 14835189 5' + roo 17 2 62.38 CATAAATTCATGTGAGAGTGAGTAATGAGTTCGCGTGGGTGTGAGTGTGGGGTTAAGAGTGTGCAATTCAAAAAATTCG:1 + chr3R 27376753 5' - Chimpo 3802 1 77.22 CATTGCACACACTGCACCTGAGCAAATTGACTTCTGCAATCGTGTTTTCTTTTCAGCATGAAACAAATGAAACCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGT:1 - chr3L 1985393 5' + Max-element 8241 2 71.29 GATTGACCAATAAAGGGAAACTCAGTTATTTGAGGTTAAACATTATTGGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGA:1 - chr3R 19515895 5' + 412 7 2 68.00 TCTGGTTGTTGCTTTCATTCTTGCTTTGGATGTTGTTCTGGTTGTTCTGATTCTTGCTTTCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGG:1 + chrX 18607445 5' - Tirant 11 2 70.00 TTATAAACCAGTTAGTCCCACCGAAAAAAAATTAAAAAAAAAAGAGAAAAAAAACCA:1 + chrX 12672882 5' + gypsy7 5008 2 82.46 GACCCATGTTGCCACGCCCACAATATTAATAAATGTGTTAATATATTATTCACATTTTAATTAGTCTTCTAAATTTATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCC:1 + chrX 14770554 5' - F-element 4287 1 75.25 TGTGACTCCATAGATGTCGCTGGTGTGACACTTAAAGGCCACGGTAAATTTAAAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTC:1 - chr2R 14434353 5' - invader4 309 2 55.45 AATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 + chrX 17492904 5' + Tirant 50 2 76.24 AGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1 - chrX 21668080 5' + Tabor 6865 2 53.00 CGATAGCCTTCATTTAGTTATAGTTATGTATAACTGGTTAACGCTATGCTGAAGACTGAAATTCGGCTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 + chr2L 13142086 5' - copia 246 1 70.30 ACTAAGAGGTCATGGGGGTGAAGTGGTTTTTTTCCCGTGTGTCATTATGGTCTTGAATTTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCATAGACTGCCTAA:1 - chr2L 11932074 5' - baggins 5042 1 77.23 ATATATAAATATACCATATACCATATGAGCTTAATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGA:1 - chr2L 8146463 5' - opus 274 2 45.54 ACCGTAAAGAAGTAACACCCACTAAAGACAAAGAAGCAGAAGAGATGAAAACCTAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCTACTAAGAAGAATAA:1 - chrX 20800019 5' + mdg3 5144 1 68.32 GCAGCAGCAACAGCAGCGGCGCTAGCGACAGCAGCAGCAGGGAAAGGTTCTGCCGCAGTCGCTTATTGCTGCCTATAAAGAGCATTCCTTGCCAAT:1 - chr3R 14390413 5' + TART-B 231 2 33.33 GCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr2R 22746045 5' + hobo 43 1 67.00 ACAAACTGAAAGCGAGTGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3R 23870136 5' - roo 9030 1 66.34 TGCAATGATACTTGGATTAATATATGTATTGTGCGGAATATATTTCATTTGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chr3R 3920659 5' + I-element 28 1 57.43 AAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATAGTCCCACATCTTATATTTAAACATCATTTCTGG:1 - chr3L 24210957 5' + HMS-Beagle2 34 2 65.52 TCCAGTCGCATTTCGCATCTGAAAGCGCCCGCAAGTAGGTTACACATTATGTATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chrX 2582444 5' - opus 7482 2 50.50 CTAAACAAGTCATGAATTTCAAACAGTCGCCGGAGATCCCGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr3L 17767661 5' - hobo 2902 1 58.42 TTGCAAAAGTTCGCAGTCATACGGCGAACCGAACCGAAATACATAAGAAAGCTGTCGACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATAT:1 + chr3R 812995 5' - blood 194 2 64.36 AAGGTTACGTGAAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAG:1 + chr3R 11080662 5' + I-element 2 1 76.00 TTTCGCTTGCATGTGTTGGTGAGCGTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCT:1 - chr3R 21592009 5' - Bari1 1658 1 71.29 GCACGTTTCATCATGGCCAGCTTGTTGTTGGTCTGGCGACTATATCAAATAACGACTATTGACTACGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTA:1 - chr3L 13652263 5' + mdg3 5265 1 66.34 GTCGTCTCGTATATCACCAATGTAAGGTTATTTCTTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTT:1 + chr3R 3920915 5' - Doc 220 1 66.34 ATAGTATTTTGCGTAAATATTTATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATT:1 - chr2L 16379033 5' - HMS-Beagle 238 2 71.29 TAGCGACTGGCGCTGTGACTCCATAGATGTCGCTGGTGTGACACTTAAAGGCCACGGTAAATTTAAAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATC:1 - chr2R 14434366 5' - invader4 323 2 69.00 AAATTGTAATCTTTAAATATTCATTCCTTTCACCAAAGAGAGAGAGAGTAACCAGTTCTCGTCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 8133903 5' - roo 395 1 62.38 TATCATTGCATGAATTTAAAAATATGCTGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAA:1 - chrX 9816336 5' - BS 5073 1 61.39 GACTTACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 - chrX 21945944 5' + F-element 25 1 61.62 GTTATTGTTAGCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 + chrX 157222 5' + I-element 41 1 64.36 AGAGATTTAGTACCAAAAGGGTAACTGATGAGAAAATAATACCATATAAATAGAAGGAAACACAATAGGTACGGGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATG:1 + chr3L 9170185 5' - accord 7095 2 74.26 ACCACACTTTTGATAAGTTTCGAATTACATCATTAATTATTATAATTTTTTCGCATTAAGCGCTTCATTTAAATAGTAAATATCCGATCAAAATACTCCCA:1 + chrX 16237113 5' + ZAM 8328 2 67.33 ACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 - chrX 21945908 5' + F-element 63 1 79.21 CGTATTATAGGAGGGTCTCATTGGTTGTCCATCGTACGGCTCAATTCGCGAGAAGATAGACGCGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATACAATGTAAAATAA:1 - chr3R 2470000 5' - Cr1a 4323 1 71.29 ATGAAAAATTCATTAAGAAAATATTTAATAATCAACGTATTCGCCTTTTTTTTTATTTGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGG:1 + chr2L 8628360 5' - I-element 5065 1 67.00 GTGGCGATGGCTGGGGAAGGACTGGACTTGCACTTACAAAATTTTATTGAATTTTCTCTTGGTATATGGAGACTAACAATAAGTTTACAAATCTTAATCTA:1 - chr2L 11377801 5' - Doc3-element 4662 2 62.38 AATTTGATACCCTCTAGAGTTACATAAGTGGGATTCCCACATTTTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAG:2 - chr2R 1986276 5' - INE-1 153 1 54.46 TAATACGACATGTGGTGAGTGGTCAATGCAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTT:1 + chr2L 9625897 5' + transib2 2741 1 71.29 CTTCACTTAATAAGCTTAACATTTTTCTATTAACTATAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCAGCCCGAAAATCGTCTTCTA:1 + chr3L 4806091 5' + 1360 3192 1 66.34 CAAACAAAATCCAAAACAAAGCTGCAAAAAGGAGGGAAAAAAGGTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr2R 21902125 5' - roo 9039 1 70.30 GTTTGCAGCTGAGTTTTTACCCCAGACATGAAATCTAATTTGAGACAAAACAAAAATAAACAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chrX 20835191 5' + roo 8 2 65.26 GAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATA:1 + chr2R 981617 5' + Tc3 237 1 73.27 ACTGACATCTTTGTCACCTGAACATCCTTTCGCTTCCTTTTACCTTCTTACTATTCCATTTCAGATTACGCGGCACACACACACACACACACACAGATCC:1 + chr3L 19028492 5' + accord 7031 3 47.00 AGCCGATCAGCCAACAGCTAGCGACGGTTTTAGCCCCCTCACAAGAAACGCCAAGAAACAATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAA:1 - chr3L 14131238 5' - F-element 66 1 60.40 TTATGCAATGTTTATAGGAGCAGAAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 + chr2R 3144046 5' + Transpac 4968 2 75.25 CTTTTGGTATCATATAAGATATGGCATAGTGTAATTCAATACAAAAAAAACAGAATTGTTGATGTTATTAATTTTGGCCACAAAAA:1 + chrX 7118664 5' - Transib-N1_DM 22 1 73.26 CCCGTACTCGGTCCCGTACTCGATCCTGGCAATCGTCTTGCGACTTCCCAAGTGTCACGCAATTGGCACGTCGTTGTTTTCGGTCATGACGCGCTGCCTCT:1 + chr3L 16047628 5' - Osvaldo 479 1 68.32 TTTATGGACAGAAATCTCTCAAGTCTAAGCAAAGTGCGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1 - chrX 157269 5' - I-element 5315 1 68.32 GGTTTTATACAATGGGTGCATTCACCTACGCGATGTCCCGCTGAGAAATTTCCTTCCCGTTCAATCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr3R 30076390 5' + hobo 9 1 70.30 GTGCTCGTTTATTAAGTATATAGTTTTAATTTTTATGTTTCTTGTAATACTGTAGCAGCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTG:1 + chrX 516863 5' - I-element 409 1 61.39 TATTTCTGGTGAATGATAAATCTTTCAATGAGCTGGGAGTCGGGCAATAAGGACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 - chr3R 17335981 5' - hopper 1393 1 57.43 AAATCTGTCAGTTGATTTGCATAAAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:3 + chrX 10196070 5' + 297 10 2 60.40 GAACGAAACGAACACCAACCTTACTCGTTGAATGTCAAAGAGAGAATAACATTCGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1 - chr2R 19164173 5' + P-element 22 1 63.37 GTATGCATTTGGGAGCAAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGAT:1 + chrX 18975547 5' + diver 5920 2 51.49 CTTTCCACTTCTTACGTATTTTCAACAAACAATTGTTGATTTTTAACAGTGCATCGACCGAGACGATGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr3R 29438792 5' + hobo 7 1 71.29 TAATGATATGCTCGATGCTCTTTAGCAGTTAGGGTATTCAATAACTTCTTGGACTGGGCAATGCTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCG:1 + chr3R 11362178 5' - Tirant 109 2 66.34 GAATTCAAGTCGAGAATCAACTCATTCGATTTTCCGCTCCAAACAACCCCACTTTCGGAAAATTGTTTACATGTTAATCGTAGTTTTTTGCAAATATCGCA:1 + chrX 6925350 5' - Juan 102 1 78.22 AGCACGTGGAGACGCACTTTGGCAAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 + chr3R 17557394 5' - mdg1 7408 2 75.25 ACAGTGGTTTACCTACTTATTCTTCTACTGTGCTTTAAATAAACGTAATCTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2L 14007478 5' + hobo 25 1 50.50 GCTGCCTTCAGTCCTTGGAGTCCTCCGATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGC:1 + chr2L 22747294 5' + transib2 49 1 75.00 ACGACTTTAGCTCGTTAGTGTTTAGTAAATTAAACGTCTGTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTG:1 - chrX 3703725 5' - I-element 69 1 58.76 GCTCACTAAGACTGACGTTAACTAGCACACAAAATTGAAACTAAAGCAAACAAAGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCC:1 - chr3L 22345657 5' + jockey 4624 1 56.44 AAAAATTATAATTTGCCTTACCTATTTTTATGTCAGCAAGCAAGAACAGGAATCAATAGGCGATTTTCTCAACTATCAGATACGCGTTACTCAGCTAGTGG:1 + chr3R 19718714 5' - INE-1 540 1 80.20 TTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGT:1 + chrX 22726202 5' - Helena 1266 1 49.50 TGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2R 17348606 5' + jockey 30 1 61.18 CTCAATTTAAGCATTGCCGCCCACTAGAGAACATCCGTATCCAGTTCCATTTCCAGTTCCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:1 - chr2L 15151955 5' + Tabor 17 2 62.38 CGTATTGCAGTATTAGAATGTAAGAACTAATTATAAGAGTCGCGAATGTAAATAGTATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 + chr2L 23180021 5' + Burdock 6155 2 58.42 AGTTACTGCAAGTGGCGCAGTTGTCTTCTTTTTGGAACAATAATGTTTTAAATTACAGTAGTTATAATACTTCCTTTAATAGTGTAGTTCTGTTGGAGTTC:1 + chr2R 399467 5' - Porto1 4538 1 79.21 CTTACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:4 - chrX 21945942 5' + F-element 29 1 58.42 CACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGA:1 - chr3R 15790098 5' + flea 4712 1 75.25 AAGACCCTAGAATAACAAGATGCGCAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTA:2 + chrX 14317416 5' + 1360 52 1 67.33 GAAACTCATTTGTCTCCGTGTGAAATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 - chr3L 17635607 5' + 297 8 2 72.28 TTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCC:2 + chr3R 15130484 5' + Max-element 8283 2 74.26 GCAACATTATGCGGCATGTGCACTAAACAAGTCATGAATTTCAAACAGTCGCCGGAGATCCCGCCCAGAGAACTGCAGCCCTCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3L 17767639 5' - hobo 2924 1 65.35 CTTAACAATTGGAGAAGAGCTTCGCGACGAGTCGGGCTTTTTTTTTTTGGATTTTTTTTTTATTTTTTTTTT:1 - chrX 11509573 5' + hopper 143 6 52.78 TATTATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTT:1 + chr3L 18183077 5' - Tirant 389 2 69.00 TATGAATGAGCACCCAAATGCTGTAACCTCAAAAGAACACCACGACACTCGCTGACGAGCTAGAACCGGATTCCTTCCATCAATTTATTTCGTTTCACGTT:1 + chr2R 5603009 5' + Gypsy12A_LTR 2256 1 67.33 AAGAGCGTTCGAACCAATTAGTCAGCATTAAATTCACCAAATAAAAAAAAATAAACAATTATATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGC:1 + chr3L 25108279 5' + F-element 34 1 76.24 ATTATGTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:2 - chrX 5178879 5' + hobo 28 1 55.45 CGAAATGCGCGCAGCACTCACACACAAACACATACGCGAAGCAGACAAAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACA:1 - chr3L 2823876 5' + blood 340 2 55.00 TATAGTTTTTTCTTAGGTTTGGAAGGTCTATTTTGTAGGTTTCTAAGCCAAATATTAAAGCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr2L 12246557 5' - hobo 2925 1 55.45 GGGGCATACTGGAAAAAACATAAATAAGGGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCT:1 - chr2R 25216587 5' + 3S18 5815 2 77.23 CAGCTTTGACAAGCAAATGCAATATAACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCATCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAG:1 - chr2L 8964560 5' + Doc 345 1 78.22 AAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chrX 21945935 5' + F-element 36 1 52.48 GTGTATGTATTGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATT:1 + chr3L 24210875 5' - HMS-Beagle2 7195 1 78.35 TGGTGCGGCATACCTCAATCAAAGCATGTGCCACACACATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAAAAACACA:1 + chr2R 18078691 5' + Quasimodo 28 2 57.43 AGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 - chr2R 1725922 5' + Doc 41 1 68.89 ATTTAATCACTTAATCCACAAGCACCATGTTTAATCAACATAATCAAGCAGAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chrX 12166604 5' - pogo 2082 1 58.42 ACAAAAACAAACAAACAAAACGAATAGAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCAAAGG:1 + chrX 768953 5' + I-element 472 1 68.82 TGCTTAAGGAAACTTTTCCAATTTATAAATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTA:1 - chr3L 10330034 5' + I-element 238 1 72.28 AAAACCAAAGATTTTTGTAACAATTTTTTTTTATTATACTATCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr3R 30562302 5' - mdg1 7423 2 61.39 TACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:4 - chrX 21945909 5' + F-element 62 1 78.22 GCTGGAGAGCGGCAGTAGAGATTTTAGTTAATATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3R 6138315 5' + 297 37 2 68.32 ACGATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr2L 17729382 5' + hobo 20 1 57.29 CTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACA:3 - chrX 10298052 5' + Quasimodo 44 2 72.28 ATTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr2L 13598181 5' + pogo 25 1 54.46 TCAATAGTTGTTGTTGTTCTTGATAACACGGCCTGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 + chrX 13640247 5' + P-element 40 1 37.37 AAGGAAACATAAGAATAATATTTATAAGCAGTTATTGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCG:1 + chr2R 577807 5' - invader1 364 2 68.32 AACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chrX 5168850 5' + hobo 36 1 57.43 CAGTTTCTGCTTTGATAATTTCTAAAGCATACTTTTTCGGGGCCGAAGACAGCAAGCAGATGAAGTCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACGTCTTTTGG:1 + chrX 9523692 5' - hopper 494 1 60.40 TCATCACCCTTATTACGGTTTTCGATGGTCTAGGGATGACTGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3R 9328738 5' + hobo 34 1 58.42 GAGGTAAGTATTGAATAGGATTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTA:1 + chr2R 22745437 5' - hobo 408 1 80.20 TAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCG:1 + chr2R 5617505 5' - invader1 378 2 55.45 TTTCTAGATTATTTGTATACTTTTGTTTTCGGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr2L 8898947 5' - roo 9044 1 54.46 TGCAGGAGTGAAGAAAGTCACCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:2 - chr2R 15402894 5' - roo 9017 2 79.21 GTGGCGAAGTCCTGGCACTGTTTGCGCAGCTCCTGATACTCATTCTGCGGAACAATATAAATATTAACTACATATAACACAGTCTTCGGGTGGAGACGTCT:1 + chr2L 16668575 5' + Doc 17 1 70.30 TACTAACTGGGGAGCTCTACCCACTCCACTACCGAGTCTAAGACCTTCTTACGGGGCATTGCCGTCTCACAGCCATTTTCACAAGATTGGCATTGCAGACA:1 - chr2L 22298933 5' + baggins 5173 1 58.42 ATTTAACTTACATAGTATGCTAGATGTATATGACTGAAACATTGTCCGTAAGCTAAGCGAACTTTAAGCTAATTGCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr3R 20183074 5' - roo 407 1 78.22 GGGGAGGGAAAGAGGGGTAGGAGGTTCGCACGTTTGCATATTCATGGCATTTCGCGTTATTAATTCATTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATT:1 - chr3R 9950938 5' - I-element 4900 1 71.29 CATTAAAAAATCAACGGAATGTGTCGTATATTAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3L 22162717 5' - roo 9030 1 68.32 GCATAATACAAATAAATCAAACCCAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTT:1 + chr2R 2144960 5' + Stalker2 7302 2 74.26 CATAAATAAATAACATTCATTTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:3 - chrX 21219511 5' - roo 395 1 67.33 CATGCTGCCTGTTAACCCTATGGCCAATACCCTTTAGAGTTCTTATGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGC:1 + chrX 7430187 5' + hobo 383 1 62.38 CCGAGAACCTGCTATTTCTGGTGAATGATAAATCTTTCAATGAGCTGGGAGTCGGGCAATAAGGACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 - chr3R 17335993 5' + hopper 10 2 69.31 TTCCTCCACAACAAATTCATAATCTTTCGTAGAATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTA:1 + chr3L 5349691 5' + P-element 2871 1 37.62 TAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGTGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr2R 17348631 5' + jockey 21 1 61.39 TTTCTCTCTTAAGACAAATACAGCATCTGAGATAAGTGAGTGAGTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:2 + chrX 9649904 5' + blood 7045 2 61.39 GGCTATCTGAAAAGTGGACTAGTGACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3L 14286080 5' + 412 20 2 59.41 GACTGAAAACTATGAAAGTATGAACTATTCAGGCACTGGTTCCAAAACGGGTATCAGTTGATGGACAAGGGCAAGGGAGAAACCTGTACTTGCGGGTGCAC:1 + chrX 19596067 5' - gypsy12 10160 3 55.45 GAGGGGGAGGACAGCCCGAGTAAGTCGAAAAACCTCAAGTTGGCCCAAAGAGATCCGAGATGGCGGGCCACGTTTTGCATTTAAAATAAATCAAATAAAAT:1 - chr2R 11560084 5' + G7 1145 1 81.19 AGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTCACATTTAAATGATCTGCGACATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAAC:2 + chr3R 3985685 5' + gtwin 6939 2 56.44 GATTACAATTATCGATCCGCGACATTAGTTAAAAACAAGAAAAATGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCG:1 - chr3L 24402219 5' - INE-1 533 1 61.39 GATGTGTTATGCCAAAGACGGAAGTTGTGCTTGGGGCCCAGCAGCTCCTCCTTTCGAGGGAGAACAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTT:1 + chr2R 22750743 5' - Doc 352 1 64.36 GATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 + chr3L 25884095 5' + Doc 38 1 62.37 TTTGTTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAA:1 + chrX 11503477 5' - roo 9027 1 71.29 ACCAGCGACCCTGAAAAATGGCTACGAGAGTGCTAAGGTTCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCCTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAATT:1 + chr2R 4638824 5' + 1360 36 1 59.41 ATAACTACGTCAAACCAAGTTATATCAAAATTGCAATGCTAATAAAACAATGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3L 22162290 5' + roo 8688 2 50.50 TGATCAAAAGAGATTGATGGGATGAAGCAGAACAAATTTAAAGAATCAAAAGCAAAAGGTATCCATACTGATTTGCATTGTTATTATAAATTTTTAAAA:1 + chr3R 24523885 5' + TART-C 11027 1 58.59 TATTGGGTGAAGGAAAGGAGGATCTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3L 19028590 5' - accord 7031 3 82.93 TTCACCTACGCGATGTCCCGCTGAGAAATTTCCTTCCCGTTCAATCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 + chr3R 30076410 5' + hobo 10 1 62.20 TACCACAGAGAAACCACTTAATGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCA:1 - chr2L 23381999 5' + Ivk 348 1 79.21 ATCATTAAATTGCGTCCTCTTGGAAACAATTCAGACATATGTATGTGCACTGGGAAAAATTATAAACATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGT:1 + chrX 22668662 5' + opus 7495 2 71.29 AGAACTGGTTGCTAAATAAGGAAGCTCACAATTTATATATATGATATTTATGTTTTTATGTAAATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 + chr2R 10334716 5' + pogo 8 1 73.27 ACAACTGTGTTCTTGTTTTTATTAAACTTTCGGTCTGAATTCGTAAATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCAC:1 + chr3R 935426 5' + HMS-Beagle 23 2 56.44 GAGAGGGAGAGAGAGAGACAGATAGGAGAAAGAGCGAATTTCAGGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:2 + chrX 13874136 5' + hobo 34 1 55.45 TACATATCTACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 + chrX 17492856 5' + Tirant 2 2 79.21 CGGCACTCGACTGTCATGCTCGATGTCTGACATTATTCTATAGCAAACTTTACATTAAATATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTT:1 - 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invader4 313 2 65.35 AAATGAATCAAGAGTAGACCACCCAACAGCCAAGTCTATTACATCAACTACCTAAATACCGTATTACTTCTTGAACCTATTACATGGCGACCGTGACTCGG:1 - chr3L 28078581 5' + Stalker 403 1 73.27 AACGACAAGCAACAAAAAGCAACGAAGGTGAAACCAAAAATGGCGAATGGCAGGGTCTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTGT:1 + chrX 5128844 5' - G2 3076 3 73.27 CAAGCAGACCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCAC:1 + chr2L 22699415 5' - INE-1 571 1 79.21 AAGTATGCTACAATAAATGCCATATTGTATATGTGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chrX 12696098 5' - hobo 2897 1 67.33 AGGTGTAATCCTAGGTATCGCACTTTTTTTTTCTGCGACTCACCCTGACGACATTGGACACATTTTTCGGGATTACATAACACACCAACACTACCTAAATC:1 + chr3R 18446212 5' + I-element 4971 1 81.19 ATAAAAGAGAAACACGATTGTCGGAGGTCAACTTCCTTTCCGACTTTCCACTTTGTGCCCCCATTTATGACGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTACACCC:1 - chr3R 21198699 5' + Tirant 6 2 75.25 TGTCAAGTGCATTCATCTCTCACCCATGCCGCACCCCTCTAACTCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr3R 11389809 5' - hobo 2912 1 52.48 TTTATATGTCCGTATACAGATAAAAAGAGGGTGTGCCAGGGAATATATTTCTGTATACGGACATATAAAGTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTAT:1 - chrX 17172003 5' - mdg3 85 2 53.47 AAAACCACAACTGTGTTCTTGTTTTTATTAAACTTTCGGTCTGAATTCGTAAATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTG:1 + chr3R 935420 5' + HMS-Beagle 6812 2 63.00 CACACACTGCACCTGAGCAAATTGACTTCTGCAATCGTGTTTTCTTTTCAGCATGAAACAAATGAAACCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGC:1 - chr3L 1985388 5' + Max-element 8246 2 62.38 ATTTGGAAACACCATTACATTCTCTGGTTTTGCATATATGTACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 + chr2L 10029089 5' - 297 6942 2 67.33 CCACATTCAACCGAACGGTTATCCATTAAAAAATCAACGGAATGTGTCGTATATTAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 22162740 5' - roo 390 2 60.40 CATATACTCGGTTTGTTATTATCCAAACTTCCAATACGTTTTTGCCATTCATAGCTAAACAAAACAAAAACAACTCCAACCTCCCATTCGCCCACATATCA:1 + chr3L 14378768 5' + Porto1 279 1 61.39 GGTGTAAGAGAACTAGAGAGAGCGTGAGAAAGGGCAGCTTAGATAACGGAGATATTGATATTGCTTCACTACTTTGAGTGGCAAATGAGAGCAAGAGAAGC:1 + chr2L 22319274 5' + frogger 2402 2 64.36 GTAGCGAGTAACGAGAACTGCAGTCGTTCTTTGTAAATAACGAATACTATAGTGTTGTAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr3R 21587223 5' - pogo 2087 1 61.39 CATAACACATTATGCTTTTTTATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:3 + chr3R 19515781 5' - 412 7535 2 67.33 CTTTCTTGTATGAGTTGCATAACTTTAGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGG:1 + chrX 7847827 5' + opus 7182 4 71.58 CAGTCCACTACTGTTATAAATGCAAGTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 19450161 5' + roo 8694 2 72.28 ATCCTCGAGTGCCCGAGGGGCTACAATGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 21219442 5' + roo 50 2 77.23 AGCAACTCGAGCTGCCACTCCGTAATCTCAATTGTCGGCTTTGCATTGCTCGACGATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 30263536 5' - roo 391 2 61.39 AACACGAGACCAAAGCCAAATCAAAACACAAAAAACGGAGCAACGGTAGAATGGAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGG:1 + chr2L 16524432 5' + R2-element 3221 1 49.50 GGCCTACGGATAGTCCGGCGCTCTTTTTCTTCAACTTTGGCGGCGGCGGCGGCGGGGGTGCGACTTCAGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3R 13996022 5' - 1360 3384 2 68.32 GGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:3 + chr3R 11080710 5' + I-element 51 1 75.25 GGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:3 + chrX 5168862 5' + hobo 48 1 69.31 ATTTTTCGTTACGAAACGAGTTGTGCTCTGGACGAGCTCTGAAAGCAAACTGAATATATTTCGAATCGGGCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 11920439 5' + P-element 5 2 70.30 AAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAG:1 - chr3L 23678153 5' + Osvaldo 20 1 72.28 TGCAAATTGTCATTAGACATGCCGAATTTATGATTTTCGACTGTGATTTCGCTCTCTTTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGC:1 - chrX 20737007 5' + Doc 307 1 58.42 AGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:2 + chr3R 11080682 5' + I-element 23 1 55.45 ATGGTATGCTCCGCGCTAATTTGGCGCCTTAGTGTGTGATTTTATTTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:1 + chr3L 8256084 5' - jockey 4963 1 59.41 GCGCCGTCAGAAATTGTAAGCCGTTTTTTGAGTGATAACAATGGGGCAAAAAGCAAATGGCAAATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTT:1 + chr3R 24601361 5' - I-element 4965 1 70.30 CAACTTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGG:2 + chr2L 23286581 5' + Tirant 413 1 56.44 TTCAGCACTCTATGCTGAGACCGTTCGGCGGTAGAAGTCCGACGCTTCCGCCGCATGGTACACAATTCAGTTTTTTTGTTTTTATGAATGTCGTGGCTATG:1 + chr2R 1276180 5' - gypsy7 213 2 77.23 GTGGGATGGGTTGGTTTGGCAGTAGGTGGTATGTAACCCTACACGGGGACACGACATCACGGAGCGCCACACAGGCGTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGT:2 + chr3L 13652143 5' - mdg3 246 2 76.24 AAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr2R 1725928 5' + Doc 46 1 66.34 AACAGTGCTAATTATATTAATACGTCACTATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTT:1 + chr3R 2472922 5' - accord 30 2 72.28 TCCATTAAAAAATCAACGGAATGTGTCGTATATTAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr3L 22162719 5' - roo 9032 1 66.34 ATTTAGGCCCACAGCAGGATGTCGCTGTCGATTTGGCAAACAGCGGAAGTGGCATTCTCCTTCCGGTTGCCACTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:2 + chr3R 25360880 5' + jockey 8 1 80.20 TGTCATGTCCTCATGATGAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGC:1 - chrX 5131022 5' - I-element 5298 1 80.20 TAACCCAGCGAAAAGTTGTTTGCCCAAAGAACGGTGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr3L 1276699 5' + hobo 32 1 62.50 ATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCACATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCTATA:1 - chr2R 4802889 5' - mariner2 279 1 37.62 TAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGCCGTTTTTATCGTG:1 - chrX 21945936 5' + F-element 28 1 56.38 GGGTTGGATAACTTGCACGCTTGCTAATTAAATTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:2 + chr2R 4160341 5' + pogo 40 1 70.30 TTGTCCACAAATTAACACAAAGCGTGCGGACGGGCCTTTTTTATACTTCGTCGAATTTGCCGTTTTTGTATACGGGTTTTTGATAGTCGGGGAACTCGACT:1 - chrX 22749945 5' + INE-1 562 1 45.54 CCAAAGAAATAACAAGCCTATCATCTGTACAAACTTAACTTCCCGATCTTGATGAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGG:1 - chr2L 10213796 5' + flea 17 2 50.50 AGCTGCACGCTTTTGTGCAGCGGTTCAGAGCACCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAA:1 - chr3R 801671 5' - 1360 210 1 69.31 GCTGCAAAAAGGAGGGAAAAAAGGTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2R 21902105 5' - roo 9019 2 84.16 ACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACTATTTTTTAGAGAGCGTTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCA:1 - chr2R 1982173 5' + 1360 129 1 56.44 ATATTATTATATTATATACATTTTTATTCTTGATCAGGATAAATACCCGAGTATGTCCTTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTAAGGAACTATAAAAGCT:1 + chr3L 743848 5' + INE-1 150 1 67.33 GAGACAGTGACGTTGGAATTATTGTTTTGGCGAGAGCGTCAAGGTGAAATCCATTTATTCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCC:1 + chr3R 24260272 5' + P-element 16 1 64.36 AGGCTATGCCTCCCGTTTTAGTTTCACTGCCTGATACGGAAATATTGTTTGTGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr3L 13570388 5' - hobo 2913 1 54.46 GAATATTAACTACTTCTTAATAGAAAACCACTAGGGTACTGATCGGAGCTGCAACCACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAAT:1 + chr2R 694361 5' - Bica 243 2 61.39 ACTATCATCAATAGTTGTTGTTGTTCTTGATAACACGGCCTGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 + chrX 13640240 5' + P-element 35 1 43.56 ATCAGCAAAATATTGTCATAGTCCTGCGACCAGGCATCCTGGATCTACAGCCATACTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:2 - chrX 14371368 5' + jockey 28 1 62.38 CCCTATATGCGTTTACTTTTTACAAAAAAGTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chrX 13048264 5' + jockey 58 1 72.28 TGAAACATTTGTTAAATTATTTGAAATTTAATACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCT:2 - chr3L 9501187 5' - HB 7 1 72.28 CCAAAACGGCGCAAAAGTTTCAATTGTCGGGCGCCGCTGGGAGCCAATTCTCGAGGATTGAGAAGATCAGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 - chr3L 12025689 5' + blood 8 2 71.29 CAGGGTGGACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGA:2 + chrX 22726184 5' - Helena 1284 1 58.42 TAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr2L 13598185 5' + pogo 29 1 55.45 TAATAGCAAATAAATTGATGTTGAAATGGCGATTACCGAAGAAGGACGACGAAGGATGAACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGAC:1 + chr3R 30658093 5' + Circe 7216 2 59.41 ATGGGAAATATTGGTGGTCTGGAGACCTTGTTTTATGGCCTGCCACTGTTGTTGCTTTTGCTGCTTTTAATTCAACGTAAATTTTATTTTATTTTAATTTC:1 - chrX 7377555 5' + transib1 1899 1 60.40 ACTAATCGGATGCACTCGGAAAATCAGTCGTTCTTTAAGTCGTTCATATGCAGTGCAGTCATTTACGGTAACTAACCAAAATTAAATAATATAAAATATTT:1 + chr2L 2256461 5' + G7 1149 1 44.55 ATGGTGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr2R 22746040 5' + hobo 39 1 62.38 AGCTTGGGTCATTATGATGGCGGAAGTGTCGCCTCCGTCTTGGAATTTTCGTTTTTCCAGGGTTGCCACAAATTGTCACTATATATTTTTAAGCAAAAATC:1 - chr2L 10515870 5' + TART-A 13347 1 65.35 ATGGGAAATTCGGTTGAAAATGATTGGTATTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTT:1 - chr3L 17986007 5' - I-element 64 1 70.30 TTGCCAAAAAAAAAAGGAGAAAAGTATGTGTGAAGGGGGAGTTATTCTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr3L 8856455 5' + hobo 29 1 56.44 CGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:3 - chr2R 1725924 5' + Doc 50 1 70.30 GAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGT:1 - chrX 23108314 5' + BS3 1434 1 54.46 ATTAAAGAAGAAGGAATAAGTAACAGCTTGATATCTGTTTTATAGCCATTTAGTGAAAATATCGTTAAGAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACCT:1 + chr2L 10104242 5' - roo 405 1 70.71 TTTCGTTCGCGGACATTTTGTCTAGCACTTGCATACTTTTGTGCTCCATTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 + chr3R 19513349 5' - jockey 4973 1 52.48 ATTGAGCCATTTTCGTGCCCCAAAAAGTCTGAAGTCTGGCAAAGATCGAGAAAACCCACCGACCATAAACGTCGTTTCAAGTATTTATTGTGACTGATCTA:1 + chrX 5394586 5' - Dm88 4526 2 76.24 AACAATTAAATTAAAATGTTTTCATTGTGGGACATTTAATTTAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chrX 17754487 5' + 412 7088 2 59.41 AAATGAAATGAGTATTTTTTTCGGGGTGAGTACATTTTTCGACGCCGACGGCGGAACGGAAATGCTTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTA:1 + chrX 7606983 5' - INE-1 13 1 56.44 GTACCGAATCCGAAATAAAGCCTCAAATTAGCGCGAGCGCTTTACAGAATTTACTGCCATACTGGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:1 - chr3R 8499503 5' + Tabor 14 2 65.35 AATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGT:1 - chr2L 22780907 5' + HMS-Beagle2 6929 2 72.28 TTAACTTCATAAGAAACTCCAAGTATCCTGTAGCCATTAGGGTATTTTTCGCCGCAGTCAATTCTCACACACTAAGGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr3L 8256165 5' + jockey 10 1 72.28 ATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTGAGTAACTTTTAATTTTAATAACTACGATGAAGGTTACAAAGGTTATGAAGGTTCGGAAAAATAGAATTTTTG:1 - chr2R 4122891 5' + FB 17 1 78.22 CCAATTGCCTGCGTATGTGTGCGTGTGCATATACATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chrX 5178813 5' - hobo 2897 1 67.33 ATACTGAAAACTCCCATCCAAATAAACGAATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTC:1 - chr2L 21019391 5' + 412 7230 2 71.29 TTCTTCGTACAAAATATAACCACGAACCATTTAAAGGCTTTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTG:1 + chr3R 25859363 5' + Stalker2 7290 2 60.40 TAAATGGCTTTTTTGTTACACGTAGCAAAATACTTTGTTGTCTGTCCGTGGCAAAGCGGGCAAGTTGGTATTGAATTAGGAGTTAGGTAGTGTTGGTGGGT:1 + chr3R 11081396 5' - I-element 4971 1 54.46 ATTATAATGACCCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTT:1 + chr3R 15130448 5' + Max-element 8242 2 64.36 TTTCATCCGCGAACGAAACGAACACCAACCTTACTCGTTGAATGTCAAAGAGAGAATAACATTCGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAA:1 - chr2R 19164183 5' + P-element 12 1 73.27 AAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chrX 10196093 5' + 297 33 2 64.36 CGTTACCAGAATTTTCAGAAGGCATTGGCAACAGGAACAATAACAAAACAGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGAT:1 - chr3L 24211088 5' - HMS-Beagle2 129 2 53.47 TGACTGGGAGCACCAGCCCGAACTCCAACGGCTGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 + chr3L 17421509 5' + P-element 43 1 36.63 TTGCTATTTCATATTTGAACAAGGTGAGGCTGTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr3L 9190509 5' + 412 45 2 69.31 ATTAAACTAAAACTTTTCGTTTTCACCGTTATTATGTTTTAGCCATCGATTAGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCC:1 + chr3R 6136480 5' + Burdock 21 2 58.42 GCCCCTTCGCACAACCGAGAACAATCGCGCTTAGGTGCTAGCCGATACCTGCGCAACAACAAAAACAACACCACATACTAAAACAAAAACCTCCGTGTGCT:1 + chrX 18783789 5' - Rt1b 5026 1 57.43 TGCACAGTGCAGTTCACATAAGGCATAAGACTCGATGTACTGTAGCAGTCTGTGAACAAAAACATTAACCCGCTCTTGATAACCGAACATCCGTTTGAAAA:1 + chr2R 2947624 5' - mariner2 179 1 74.26 GGTGCATCGTATGTGCGTATGTACAAGTGCGTATGTCAGTGCATGAAACACTGGCCGGAAACCCGTGTGCAGCCGGCAAAAACACCATATTTGCGTGGCCG:1 - chr3L 24510186 5' + Gypsy6A_LTR 104 1 65.35 TGTTCGCTCACCATCTACCTCTCTTTTCAAGAGAGCACGTTGCAAAGACGTTCAGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chrX 14953663 5' - P-element 2865 1 58.42 GCAGGGGGGGGGAGGGGGTCAAAACGGAAGTTCACACGGAAATACAGAAAAAAAATACAAGAATATAAAATTAAACAAACAAAAAAAA:1 + chr2L 8720910 5' + Doc 4698 1 79.55 GGAAGAACTGCAATTAGGAGAGAGTTTTTAGTGTGGAGGGGCAGGGGCAAAATGGGGAATGGTGAGTGGGTACTGATCGGCCGAGAACTTGAGCTGCATAG:1 + chrX 1626484 5' - Quasimodo 6962 2 69.31 TAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGG:3 - chr3R 15790084 5' + flea 4726 1 61.39 ATCGAAATATATAATCGCCATGTTAATCAGATTCCAATAGCATACTTTAAATACTTCACCGTCGTGTCAGACGCCCG:1 + chr3R 21974980 5' + Doc3-element 303 1 68.83 ATTTACGAGCGCATTTCTGGGGGCGGCCAGGTAATGGTATTAGTACCAGAATTAGGCAGGAAAATTTCTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr2L 17213829 5' - hobo 2931 1 69.31 TTTTCATAATTTTATTAGTTGTGTAAATTTCTATCGATTTGCCAAAAAACAGTTTTGAACAATGGCGAAATTTCGCGATCGCATTCACACTAGCTGAGTAA:1 - chr3L 26663339 5' + INE-1 533 1 62.38 GTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 15227328 5' - roo 9024 2 74.26 ACTATGAAATGAGTTAATTAATTGAAATTTGTCAAGCCAACGGACGTTGGTTCAATAAACCCTACAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAG:1 - chrX 5128965 5' - S2 234 1 77.23 AACCGCAGGAAAGCAGGCTCTGAGGAGCTGCCGAGATTGGAGGGGAATGCTACGAATAAAATTTCATTAAATACACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 + chr2L 12888778 5' - 412 7544 2 76.24 TAATTAAAAGGCGTCCAAATAGGCTAAGAATGAGAATCGGAATGATAGTCGGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACGTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chr3R 11109011 5' - mdg1 7433 2 48.51 ACCGTTTTTGTATTTTGAGGTTACCAGGTTAAGTTTATGACTTTGCACGCACTACCCTGCAACAACAATGGACTGCAGCCCCTGCTGTTGTTGCTGCTGGC:1 + chrX 4696804 5' - TART-B 153 2 75.25 ATTTTTTAAAATTCAGTGCCCCATAGAGCACGATACTAATCTGCCATGGCAACGGACCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 + chr3L 5573511 5' - mdg3 5480 2 58.42 CTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3L 17635577 5' + 297 6619 2 70.30 AAACTTCAATAATTCGTTAACAGTGGTTTACCTACTTATTCTTCTACTGTGCTTTAAATAAACGTAATCTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2L 14007497 5' + hobo 6 1 69.31 TGAGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:2 - chr3L 3535467 5' - roo 395 1 63.37 CTAGTGCATTAGCATATTTTAAGAAGTTCCCGCAGTCCACTTATTTCCATTAGACTACCTACCATATTATGCAAATTCTGACAAAGACATTAAGAAGACCC:1 - chr3R 19428556 5' + Fw2 182 1 73.27 CTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 3535451 5' - roo 9042 1 54.46 GTATCCTGGCCCCCATTTCCCAGGACCTCCTCTTCAGATTTCCCACCACTCAGCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGAT:1 + chr3L 6671789 5' + blood 448 1 58.33 ACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 19450160 5' + roo 29 2 75.25 GGGGTGGAATTCGGGCGCAAGATACAAATAGTGCCGAATAGTGCTTCTAATGACGACTGTCGCTACTTGGCAAAATGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGAT:1 + chr2L 1008168 5' - I-element 4990 1 78.22 GACGGGTATACGAATATACACATATGCATGTACATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTT:1 - chr3R 13231210 5' - Quasimodo 7328 2 67.33 TACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:6 + chrX 17492864 5' + Tirant 8117 2 71.29 GTAGGCGTCCTGCGGTTTTCATTACATTTTCGATTTTGTTTTTCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAG:1 + chr3L 13765664 5' - F-element 489 1 74.26 GGAGGGAAAAAGGCACCATTAACCTAGCGAGCGCTGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr3R 24260345 5' - P-element 2846 1 38.61 GGAAAATGTCTGAATAAGCGAATCAGACTCTGAACAGCCAAGTTAAAGTAGTTTAAAGACATAATCTAAGTCTTGTGCATTTTTTGTCTTTGTGTCTTGTT:1 + chr3R 19546968 5' + Cr1a 196 1 56.44 TTAAAAATGGATGTAGTGGTTTATCGCTCATTCTCGCAAAATATTATGGCTTCGCTTCTCGCGCGCACTCTGCCGTCACTAGAATATAAAGATGCGTAACG:1 - chr3R 3620775 5' + 1360 10 2 76.24 GGATTTAGATTGCCACACGATGGTCGTGTGAAATGAGCACTTTTGAGTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3R 21587319 5' + pogo 26 1 54.46 TTTCATGAGATTTCAATCGAGATTTTCGATTTATGTGTTTTTTCTTTTCTTTTACACTCTGAATTCAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGA:1 + chr3R 9328351 5' + hobo 110 1 72.28 GTTCTTAAAACTATATTTGCTTAAATCCTTTAAAGCCGCCTGAATGAAGGCTGAAGAACTTGAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chrX 2917291 5' + jockey 24 1 60.40 CAAGTGTGTACATAAACCTTTTGCTCAGTTTGCAACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3R 12055049 5' + Doc 36 1 67.78 TTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATCATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chrX 5168842 5' + hobo 27 1 50.00 ATTCCTAGCTTAGGTAATGATAACGTCGAACGCGTTGCTCTTATTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 - chr3L 15353590 5' - mdg1 7429 2 56.44 ATACGCCAAAACGGCGCAAAAGTTTCAATTGTCGGGCGCCGCTGGGAGCCAATTCTCGAGGATTGAGAAGATCAGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr3L 12025694 5' + blood 3 2 76.24 TTTGCAGAAAGTGCACTTGCAGTCAAAAAGAACAGTGCTACAATTGCCTATATTTTTTTTCAACTCGTATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 + chr2L 22342217 5' + F-element 30 1 57.43 CTCTTCCAAGCTCACTGCTGTGGCCTATTGTTTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCG:2 - chr3R 10434937 5' + 1360 44 1 69.31 GTAATTATACAAGTTTGATCTGATAGGATAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 - chr2R 18975854 5' - mdg1 7372 2 79.21 AGGGTATGAAGGGAGTTGAGGTCCCTGATGGTTTCGTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 + chr2L 20269972 5' + pogo 37 1 68.32 CGGCTAATCCAAATGAGTGTTTCGTGTTGATTTGTTTCGATTTTTCTCCGATGTTTACTGATGTGTGTGTTGCGTGCGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTG:1 + chrX 13839824 5' - accord 7029 3 69.31 CAAAATATTATGGCTTCGCTTCTCGCGCGCACTCTGCCGTCACTAGAATATAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTCGCC:1 - chr3R 3620739 5' + 1360 28 1 50.60 TGAAAGGACTGGGCCAAGATAAACCAACCCGGACAGGATGAGGCTGAGGATGATTACAGGCGCTCCTTGCTACATGAGGACCAGAGATATCGAACTCGATC:1 - chr3R 24441195 5' + jockey2 3015 1 52.48 GCAACCGTCTTAAATTGAAATAGAGGTCAGTTCATCTTCAAATCTCGCTTTATGATTCTTCATTTGGATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 + chr3L 10305293 5' - 412 487 2 72.28 CAGGAGTTCGGTGAAAAAAGTTACTTTTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2L 15798641 5' - roo 361 2 72.28 GGAGAACACAATTTCTGGGCTGTAATGGGGTCAACATTAACCGACTTTATAGTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGC:1 - chr2L 3907004 5' - jockey 4599 1 56.44 TGGAAAAGAAAAATCTGCGAGTATTTGTCCCTACTTTATTCTCTGAGTAGACCGAGGTAAACTTATATGTCATATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTACA:1 + chr3L 24762762 5' - FB 244 1 67.33 GGCGATTCCGCCGCCCCTCGCCGATATGTGAGCAGAAAAGAGTTTTAAAAAGATAAAATAGCACCCATACACACACACACAAGGAAACAGATCGGGAGAGC:1 + chrX 21570398 5' - mariner2 570 1 78.22 CACACCCCCGGATTAAACGGGAATCAGCGGGAACAGTCAACCAGCCAAGTCGGAAAAACTTGTCATGTTTATATGGATGATATAATAATCTTTTCTAATAC:1 - chr3L 26508325 5' + TLD2_LTR 53 1 55.45 TTTAGAAAAATGCCACCTAACAAGCTTATTAATAAAAAATGCTCATAAGGAAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 19446975 5' - roo 9054 2 60.40 AAACAAAAGATACACCTTTGACCAACAAAGCATATAAGATCTTTAGCCCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3L 21393450 5' - roo 9045 1 54.46 CCCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCA:1 + chr3R 15130458 5' + Max-element 8250 2 55.56 GTTAAATGACGTTGTGGATTTCAATTGATTGGGTGGATGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGA:1 + chr2L 15151876 5' - Tabor 451 2 58.16 TTTTTTTTTCGTAAAAAATTTTATTTGCTCCCCGACTTAGAGTTTTGTCTGTCGTACTCGTT:1 + chrX 2854657 5' - HMS-Beagle2 358 1 33.87 AGGGTAGTTGGTTTAATTCATGGTCCACTTTATTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 - chr3L 735090 5' - mdg1 7415 2 66.34 GTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2R 12998317 5' - roo 9020 2 74.26 CAGAGCATTTCAGGGAATTCTTAGAATGGCATTTCAGGAAGTGAATCCCGAAAAATTTAAGGGAATGAAAAATTAATACGGCAATGATTGTTGAGTGCTTG:1 - chr2R 4025144 5' + 1360 451 1 60.40 ACTTGAGACAGGTGGTCAATAGACAGGATGTTAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCG:1 - chr4 503616 5' + invader3 5457 2 68.32 AATCAATTCAAGTATGCATTTGGGAGCAAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCT:1 + chrX 18975536 5' + diver 5909 2 58.42 CTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGCTCTGTCTGTCTGTCCGTATGATCGTCGAGATCGTAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATCCAGC:1 - chr2L 21737999 5' + INE-1 168 1 92.08 ATCGAAAATGTTTCCTTTGTATACATTTTTTAAAATTAAATCTGCTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATA:1 + chrX 10298101 5' + I-element 4982 1 56.44 TTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACAT:2 - chrX 10298051 5' + Quasimodo 45 2 73.27 CAGATGCGTCTGGCTTCTTAAGCAAGAAAGGAGCATGTAAGCGAATCGAACGAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chrX 21050024 5' + 297 6603 2 58.42 ATTGCTCCATTGATAAGGTAAAACTTATCATGCAAGCAGGCATTCAAAACATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACAGATCACCCCACCAACAATGCGTTTC:1 + chr2R 3293743 5' + HMS-Beagle2 6804 1 62.38 TTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAAGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACT:1 + chrX 21564087 5' - invader4 306 2 56.52 TTATTTAACATAGTTAAAATCACAGTTTTACTAACAAAAAGGTAAGATGTTTGTTTTCCTTCAAAAGCTTAAGTAAACATAAAA:1 - chrX 7805180 5' - Transib5 396 1 73.81 AGATTGAAATACTAGTCAAAATAAGAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTT:1 + chr2R 12007228 5' - mdg3 5447 2 77.23 CAAAGAGAGAGAGAGTAACCAGTTCTCGTCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 8133936 5' - roo 9026 1 72.00 GGCTCATAGGAAGTGGCTATCTGAAAAGTGGACTAGTGACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 - chr3L 14286094 5' + 412 6 2 73.27 CTATACTGATATTTAATAATTTGCCATGGCATTTTATCAAGTTTACCCCAAGTTTTAACCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGT:1 - chrX 12885785 5' - transib2 2808 1 63.37 TGCGCTGCGCCCTGCTTTTTATCATGTCATTGAAAGATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr2L 2231481 5' + pogo 37 1 64.36 TTGTACTGTTGTTGAGTTTATGCATTTGCAGCGTTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 - chrX 4778615 5' - hopper 1378 1 65.66 AACCAAAACAGTGACGAACAAAAATAAGTAAGCCAAAGCCAAAGGATGAAGAATAAACAGAGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAA:1 + chrX 13547413 5' + I-element 342 1 66.34 GCTATAGTTTTTTCTTAGGTTTGGAAGGTCTATTTTGTAGGTTTCTAAGCCAAATATTAAAGCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2L 12246555 5' - hobo 2927 1 37.62 TGTAGGCGTGGCACCAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTG:1 + chrX 21667976 5' - Tabor 483 2 70.30 CTATTAAAGTTATGGATTTACTTGTAAGATAGGACTCGAAGATAATATATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3L 3862580 5' - hobo 2911 1 55.45 TTGCATAATCGCGGCATGTTTTGTGTGTTTGTGTGTTTATGCGATGGGGTTTAAGGTTTTGTGTGTGTTTGTTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATA:1 + chrX 12885345 5' - transib2 74 1 73.27 TTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 - chr2R 5531204 5' + 1360 57 1 70.30 AGCGAGCGGAGAGAAATTACAAAGTAACATTGAACGATACAAAAAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTC:1 + chr3R 30371388 5' + I-element 5132 1 56.44 GGAGAGTGATAAGATTGGGAGGATCATGTAAGAGAGAACGCGCTCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3L 24515407 5' + pogo 33 1 58.42 AGCTAAACCCAAGAGGGGGGTAAAAGCGGAAGTCGCATCGTCAGGCACGAGAGAACCGCTCAAGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGG:1 - chr3R 13601102 5' - roo 204 2 65.35 AGCCGCAAAAAGGTAAAGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 + chr3R 13995955 5' - 1360 3333 1 87.13 AAAGATTGCCCAGATATCGGCTCCGGTTGTTTTTTTCTTTCTTTTTT:1 - chr2R 23023767 5' - gypsy7 5010 1 51.06 GTCTTGTAAATATCTATCGATTTCCCATGCCCACTCAAAAGCACTTTATGGAGTGTCGAGTTGCGTATATGTATTCCAGGGACAGTTGTTTATTTGT:1 - chrX 15231530 5' - Helena 1152 1 48.45 CATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:3 - chr2R 17348596 5' + jockey 57 1 77.23 GTCTAGTGCTCTAATTGAACCTATCACAAAACTTGTGCAGTTATCTAGGTAACGAGTTAATTGGAAATTAAAATAAGCAAAGTGTGAAAACTATTTGTTG:1 + chr2R 11710832 5' + NOF 3898 1 75.00 GCATACAGAATTGTAGGAATAGAACCCAGCTTAAATATGTTGGATACAAATATTTTATTTCAAACTAAATTACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCT:1 - chr3R 16902596 5' + I-element 145 1 71.29 GCATCTCTCGCTGCACAAATCCCACCCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chr3L 18793023 5' + P-element 42 1 32.58 CTTTAATATTACGTTTGTAGCCATTAAATTCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr2R 9433689 5' + 297 6620 2 73.00 CTGAGACGAAATTTGTGCACTTTTAATAAGGCGGGCAGTGAACAAGCTGTGTCTGCTTCCCCTTGAGGACTCTGTTGGAAGCCAAGCTTCCAACGGGGGG:1 + chr3R 2691173 5' + diver2 4507 1 78.00 CGTGTCCCGCGGGCGGACGAGTATATCGCACTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTT:1 + chr3R 20486358 5' - 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chr2L 18417383 5' + roo 19 2 60.40 AAGCGCCATATTAAATGTGTATTTATGTTTTAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr2R 9972728 5' + Doc 50 1 67.33 TCTTATAATATCAAATGAAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:1 - chr3R 3920699 5' - I-element 5300 1 78.22 GCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3L 10576856 5' + roo 32 2 62.38 GCCAATATTGATTTATGCGAAAAATATCGGGTGGGATGGAGTAAGGCGAGAGAGTTAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAA:1 + chr2R 20215288 5' - Cr1a 251 1 55.45 TTTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCAATCTGATCATGTCCGTCTGTCTTTACGTCCATATAAGCGTTGTTATTTCAGGAACTATAGAAGCTAGAAGGTTG:1 - chr2L 21738000 5' + INE-1 159 1 66.34 AAACCTAAAATTTATTTTAAAGTATTTAACTTTTCAAGGGTGATTACCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGTAGCTGTGG:1 - chr3L 15694751 5' - Chouto 444 1 54.46 GTGGGTGGCGCGATTTATTTCCGTGGGCTTTTTACTTTCCGTGGGGTAGGCTTAAGCAATGTATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTG:1 - chr3L 18781359 5' - Idefix 179 2 54.46 TTCCCGTTCGATTTGGCCGCCCTTGACTCCTCTTGCATTCCACCCGTCTTCGCTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCT:1 - chr3R 892439 5' - Doc2-element 393 1 57.43 GAAATTAAGATTTCCCTCGCACAAATCTCACTTCAATTTTAAGTAGATTTAATGAAAAATCGATAATTAACCTATTGGTAATATGTTTTAATTTGTTTCTT:1 + chr2L 12275130 5' - HeT-A 5765 1 61.39 GTGTTCAAAGCAAAAGCTCAACATGAATAGTAAAAGAGCAGAGCTTACACCTTCTAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCA:1 - chr2L 21018801 5' + 412 7503 2 58.42 GTTGCGGCTGCTACTCCTGCTGTTTCTTCGACTCCGGTTTCCTCTCCAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCAG:1 + chr3R 28334527 5' - pogo 1881 1 53.47 GGTTGAGGGCAGGCAAAAAATAGTACTACGAGTTTTTGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCG:1 - chr2R 9529377 5' - Doc2-element 348 1 64.36 GGGTATACGAATATACACATATGCATGTACATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAG:1 - chr3R 13231207 5' - Quasimodo 7325 2 70.30 TTGTATTTTTTCGAGTCATCGAAGAAGACGTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAA:1 - chr2R 3036743 5' - F-element 41 1 70.30 TTTTCATTAACTTTAGATTGTTTTGTGTAACATTTCTGCTACACCCCATGAACACTTTTCATTAGCTTTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:2 - chr3L 4805757 5' + 1360 9 2 47.52 TTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTC:1 - chr2R 2868547 5' - Rt1b 4733 1 40.59 ATAAGTGGGATTCCCACATTTTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGATGTTCATACGGACAGA:1 - chr2R 1986253 5' - INE-1 130 1 77.23 AATTCAAGCGAGTGAATGAACAAACTACTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:2 - chr2R 10334798 5' - pogo 2055 1 72.28 CAAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr2L 9672420 5' + 297 34 2 64.00 ATGACATGCAATCCACGAATGAGGAATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGACTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTA:1 + chr2R 3357791 5' - Burdock 177 2 73.27 ACTGGTTAACGCTATGCTGAAGACTGAAATTCGGCTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 + chr2L 13142118 5' - copia 5083 2 67.33 TTTCTTTGATTTATTTGATATTGATAACACCAGAAATATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGA:1 - chr2R 577862 5' + invader1 40 2 65.35 AATAGGTGCGGAACGCAAAGAGGAAAATATTTATTTCCGCTGCATCTTTATCTCTTAAATCTGTATGCTTCATCTTCTAGCTCTTATGGTTCCTGAGATCT:1 + chr3L 22773133 5' - INE-1 149 1 58.42 AGAATATATACATGCTAAGCTTTACGATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chr2L 17729405 5' + hobo 2 1 77.23 GCCGTAATTGTTGGAACTGCATATAAAAATTTGTATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 - chrX 22590208 5' - Burdock 214 2 69.31 GAACGAGACGGGAAAGGACCTTTCTCGTTAGCCGTCTCACTCGCAGCCTATACCTGTCTCTATCTGTGTCTGTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCGCT:1 - chr3L 10811433 5' + Cr1a 294 1 77.89 CAAATATTTGTAGTCGAGGGAGTTGCAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr3R 9328693 5' - hobo 2902 1 68.97 CAACCGGGCAAACTAAGAGAGATAGAATCACCCCACTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr3L 6869286 5' - roo 9030 1 66.34 GGTTGGTTTGGCAGTAGGTGGTATGTAACCCTACACGGGGACACGACATCACGGAGCGCCACACAGGCGTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTC:1 + chr3L 13652151 5' - mdg3 238 2 68.32 CGTTAATTAAGGCGAATTCTCGCAGCTAAAGCGCAAAAAGCGCTTTCTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 - chr3R 8487335 5' + Doc 38 1 53.47 TACAAAATATATGAATATGCTAACTTGTGATAACTAAATAACTAACTGGTAATTTCTGAAAGGGTCTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAATGCTGAGGCTGG:1 - chr2L 15515903 5' - Ivk 232 1 57.43 CACTCTGACATATTGACCATTTGTTTATGCTCTTATTAATTTATTAGCGAGTAATATATGCGACACACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2R 11276606 5' - roo 399 1 67.33 TGTTTGCCTTGTTCCGAGGCACAAACATTCCACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATC:1 - chrX 22664457 5' - opus 7497 2 75.25 CCAGTTTATTCCATTTGGTTGTGTTTTCGGTTGTGGTGATTTTTATCCCCTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr3L 9306877 5' + jockey 34 1 47.96 ACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:5 - chrX 21945918 5' + F-element 53 1 69.31 AATACTATACTACTACTATCTTGACTATCTTTAATTCAAGAGTATGATCCTCTTCGCCTTATAATGCATTTTCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGG:1 - chr3L 494727 5' - Transpac 5227 2 75.25 CCATTTCATTTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chrX 5168833 5' + hobo 19 1 60.40 GTCACGAATTGCGAACATAGTTTTTGCCCCTGCTGGTTTGCCGAGTGCATCGGGTTGATGAAACGAATTGTTGGTGGGGGGATCTGTGGTGGTTTGGGCAC:1 - chr3R 31293991 5' - HMS-Beagle2 6784 1 68.32 AATGTGCATGGGCTCATAACGAAATTAAGCGGCAGCATTACAGCCACTTTTTCAACACTTCCTGGAAAAGTGGTAATGTAATGTGCACACATATCGAATAA:1 - chr3R 31431587 5' + Tabor 4 2 72.28 TGTACCGCATAAGCCATCGGGAAAATGCCTAAAATTATGCCACAGCCCGAGCAAGAAGCTCACACATCTTGTACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAG:1 + chrX 4248790 5' + jockey 4609 1 71.29 GCAGTGTATGTATTGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGTTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTG:1 + chr3L 24210872 5' - HMS-Beagle2 7194 2 76.24 CATTGTCGATGCACTTCTGATAGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 - chr3L 22231399 5' + Doc 19 1 62.38 TGAAACTCGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:3 + chr3L 8044292 5' - mdg1 411 2 68.32 TCAGCAACAAAAACGGCTAAGAAGTTTTCCTTTTTCCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 26736851 5' - Doc2-element 231 1 91.84 TTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCC:1 - chr3R 934259 5' - Rt1b 4755 1 57.58 ACCCGTGCTCCGACTGAAGCGGCCAAAACATATGTCGCAGTGGGCTGCGGTTTTCCACTCAACGAACTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3R 16398912 5' + roo 8671 2 68.32 TAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTA:2 + chr3L 24210905 5' - HMS-Beagle2 7161 2 57.43 ACTGCTTTTTTTATGCCAGTCAAGCCAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAAT:1 - chrX 6149201 5' + F-element 232 1 74.26 GTAGATCACAACAACAACACGATAAATGATATGGAAGGAAACAGAGGCATATATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAG:1 + chrX 13873892 5' + Quasimodo 145 2 58.42 TTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAA:1 - chr2L 23069852 5' + Stalker4 7293 4 67.33 ATCATCGCTTTTTTCATTAATAAATAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 - chr3R 3625667 5' + Max-element 8288 2 77.23 GTGACCTATTATGTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:2 - chrX 5178886 5' + hobo 21 1 57.43 AATTACCGGGAAAGCGAGATGAACACACACTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chrX 9649955 5' - blood 7341 2 73.27 GATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAAC:1 - chr3R 10736106 5' + McClintock 39 2 71.29 GATAAGCGTGTGTACGTTGTGTATGGGAAATTTGGCAACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGT:1 + chr2R 19164306 5' + P-element 476 1 40.59 ACAGTCCAAATAGAGAAAAGCTAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chrX 12866425 5' - hobo 2934 1 72.28 TAAAAGAGAAACACGATTGTCGGAGGTCAACTTCCTTTCCGACTTTCCACTTTGTGCCCCCATTTATGACGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr3R 21198698 5' + Tirant 7 2 74.26 TTTGATAATTTCTAAAGCATACTTTTTCGGGGCCGAAAGTGAAAGCCACTGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACA:1 + chrX 9523702 5' - hopper 1387 1 51.00 AAACTCGACAAGTTTCTTACTTAATTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 + chr3L 8044294 5' - mdg1 414 2 67.71 TCATGGAAAGTAGTTTATTGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3L 21393500 5' + roo 56 2 83.17 ATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:3 + chr3L 8044316 5' - mdg1 387 2 57.43 AGTGTGATTGTGTGCGTTAGTTTAAAGTTTTTCCTGGCTTGGGCTGGAAAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTC:1 + chr2L 1619928 5' - I-element 4951 1 54.46 GAAATTTCCTTCCCGTTCAATCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr3R 30076434 5' + hobo 53 1 76.24 TTTTCGTTAAAATGTATTAAAATATATGTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3R 6104383 5' + pogo 44 1 76.24 AATAAACTTGAATGCCACTTTTTGCCGGAAAAAGAGAGCACCGACCTGACACCTGCCATCGGAACGGAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTA:1 - chr3R 6132885 5' + Doc 4420 1 68.32 TAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 18417321 5' - roo 9020 2 76.24 AATGTTCTTTCTTCGAAATCTTAAAGTTTAAACAATACCTGTAAGCTAATATCCTCGCAATTCCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 10776244 5' - roo 396 1 58.42 ATGAGCAATGCGTCTGGAGCCAATTCCAAACTGGTAAGGTGCCACACACACACACACACACACATAT:1 + chrX 7035311 5' + Quasimodo 39 4 62.69 TATTTAGTTTAATAAATATTACTAAATTGCTGTAATGATGAACTTCCCGTTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:2 - chr2L 21018843 5' - 412 7498 2 62.38 AAATTAACAACCCATAAGCTGGTAATTAGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAG:1 - chr3R 7639833 5' + HMS-Beagle2 6928 2 71.29 TATATGACTGAAACATTGTCCGTAAGCTAAGCGAACTTTAAGCTAATTGCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 20183048 5' - roo 385 2 54.64 TATTGCCATGCTGGAGGCAACTCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 + chr2L 13038715 5' - hobo 2885 1 76.24 CAAACTCAATTAGGTGGCACATGGTGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr2R 22746011 5' + hobo 19 1 59.41 TAAATCAAGGCATTTTGTTAGACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCA:2 + chrX 21564063 5' - invader4 321 2 73.27 TTGTTAAATAGCACTTCTTAGAGACTCTGAATGCATCCAAGCTTGTAATATGGAGGTGATCGGTTGCATAAGCAAGTCCATTTGGAGCGCTTGGGACAGC:1 - chr3L 23953955 5' - BS3 163 1 50.00 CGAGTGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 23870124 5' - roo 9018 2 78.22 AGACATTGAATAAAATATATAGATCGCTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chr3R 29361077 5' - 412 443 2 74.26 TATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr3L 25884100 5' + Doc 51 1 70.30 CTTATGCGACTTTCTGCAAGGCGGTACAGTGGTCACTCGATGAGGTAGAAGTGTCATTTACAACTCATGATGTTTGACTTTATATACATACATATGCATG:1 - chr2L 11221088 5' - Stalker 243 4 76.00 ATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 - chr2R 17348628 5' + jockey 7 1 70.24 TTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGCG:3 - chr3R 15021689 5' + invader4 2748 1 45.54 AATGTCCTCCATTTTTATCCATTCCATTACTGTAAGAGTTGTGTCTATGCATACCCAGTCCAGATAACATACAAAACTCATACTTCTCCTCAAAAAAAGTA:1 + chr3R 2554921 5' + I-element 5154 1 64.36 TAATAATATTAAGAAAAAATATATACACATTTTCTGTGGCGCTCGTGTCGCTTCTGTTCCATGTTACCGGCTGGAGTGCATGATTATTGCCTCGAAGACAG:1 - chr2R 930304 5' - BS3 1452 1 63.37 TAGGAAACACACATTCATTCGCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3L 10576876 5' + roo 8675 2 68.00 TGTGTGTCATTCAAATAATTACTATTATTAAAAAAGAAATAAATACGCAGAAAGAGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGA:1 - chr3L 7832833 5' + F-element 146 1 58.42 AGATGTATTATATTGTAACCAAACAAAAACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATG:1 + chr2R 3523217 5' - copia 92 2 72.28 GGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTA:2 + chr3R 10736058 5' - McClintock 6384 2 76.24 TGAAACTCGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTGACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 + chr3L 8044292 5' - mdg1 7449 2 66.34 TGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCT:1 - chr3R 15790056 5' + flea 4754 1 77.23 CGTTTTAGTTTCACTGCCTGATACGGAAATATTGTTTGTGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr3L 13570401 5' - hobo 2900 1 60.40 AAAAGAGCGAACGATTTTTGTAATAAAGGAATTGAACGAAGAGCGCGCAATTTTTCTAATGGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2L 1530492 5' + roo 14 2 65.35 CGTTGGGCGCGTTGGGTGGCTGTTGGTGGTTGGGCGTAGAAAGTTGACTGGAGTGATGATGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGG:1 - chr3L 9761206 5' - jockey 4727 1 68.32 AGAGAGTCATAGCACTAATTGAAATGGGAAGAGGCCTTAAGGGATTTTATTGGGTTACAGCCAAGACTGTAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTC:1 + chr2R 14402222 5' - Tabor 7317 2 69.31 CTTTTTAAAATATCGCTCTACTCACAAATTTGTACTTAAGAAGCGTCGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGATGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chrY 131419 5' + Doc 34 1 50.50 ATGTGATAGCAAATAATAATGTCGTCGCTTAAGAGGATCTATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3R 7102485 5' + pogo 33 1 61.39 TATAACAATATGCATAAGTAAGTATGCGTGGGAGTCGCACAATTAGCAGCATCGAGTTGAGTCAATCAATGAAAGCGAAAAATGAAAAAAAAAATAAAAAA:1 + chrX 16476842 5' + Doc 4699 4 74.26 ATTGATTGATTGACCAATAAAAGGAAACTCAGTTATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATA:2 - chr3R 19515902 5' + 412 1 2 78.22 GAATAAAATATATAGATCGCTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 - chr3R 29361070 5' - 412 437 2 81.00 GCTGTAGTGCTGTCCTGGGAGATTCGAGATGAGTCTTCACGCTTTCAAACTTTAGACGATGATAATGATGATAAACCTATTGAAACGGACACTCTTGATGA:1 + chr2R 3480858 5' + Juan 297 1 53.47 AGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr2L 1530416 5' - roo 9029 1 68.32 ATTGATTGCCTTTTGTGAAGGAGCAAACGAACCTGCCTGCAAATCAACGCGGCCACAGTCGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTA:1 + chr3L 13360769 5' + hopper 9 2 38.95 TTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCT:2 + chr2L 23299997 5' + invader4 364 1 76.24 AGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTTCTATATATATATATATAGTGACGTATTTGTGTGGTCCAAACCA:1 - chr3R 8176875 5' + 297 6 2 71.59 TTCTAGCCAGGTTAGCGGCCCTTGCACGCGATGTTGTGTTTGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:2 + chr3L 9190434 5' - 412 7533 2 65.35 GTTTAATTTGACCGACAACAATTCGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 - chr2R 3144082 5' - Transpac 261 2 76.24 TCGCTTTAGATACGAAGCGGCACTCGCCCTTTCATGTGGAGGCACAACTTTGGACGCAATTAAACAATTAAAGATTCCCGGTTCGATGTCTCCTACTTG:1 - 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pogo 2084 1 59.41 TGGAATTGAAAGCGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGA:1 - chr3R 19513423 5' + jockey 4673 1 71.11 GCAAAGAAGAATTAGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACAT:2 - chr3L 24210994 5' + HMS-Beagle2 10 2 67.33 TTTTGTTTAATTAAAAAATACAATAATTGAAAATAATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATT:1 - chrX 8551251 5' - mdg3 210 2 65.62 GAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAAC:1 - chr2R 6482729 5' + gtwin 6957 2 67.33 TTCCTGGCTACACTCGGAAAATTGTTGCACCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 - chrX 4278381 5' + blood 48 2 70.30 GCAAAAACGAGCTCTCTCTTTCGCCTGAAATGTTATAAAACTTTTATTGAATGGTTCTATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chr3R 11549925 5' - opus 7488 2 66.34 GACGCGAAATGCCTTGTTCGCACTTGAAATTGAATATCGAGCCACACACAGTGCAAGCAATTCTTTAGTTTTACTTGTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGG:1 + chrX 13881381 5' - gypsy7 5006 2 64.36 AAATACTTTTTTTTCATCAAAGTATTTTATTATAATATATTCTTTTTATGGAAGAGCATTTATTTCCCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 - chr2R 3522069 5' - copia 245 1 68.32 TTTATTTTATTATATTTTTAAACTTTTAAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTGCTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 + chr3R 10831616 5' - TAHRE 10427 2 69.89 CATTTGAAACAAAGAACTAACATATATGTAGATCTTTAGATCTTAACATATTATAGTACTTAGCAGATATAATTTATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTC:1 + chrX 9576336 5' - invader4 326 1 78.22 ATAATTAGAAATTCGGCAATCATTAGGCGGTCGATCTAGCTATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAG:1 - chr2L 21871471 5' + INE-1 161 1 71.29 ATGCACAACCCGAGATGCATTTAAAGGCGACTTAACCCCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGA:1 + chrX 2854913 5' - Quasimodo 224 2 58.42 AATAATAACGTTCTTTTCCCTATACTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACAT:1 - chr3L 13643346 5' + hobo 308 1 75.25 GCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:2 - chrX 21945923 5' + F-element 48 1 64.36 TTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:2 + chr3L 14558270 5' + 297 47 2 75.25 TGCCGCCTGTGCTGCCAATTCCGAGTTGATGCGAGGTATCTCGGGTGCGAGTTTCGGTCCATGTGTGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGAG:1 - chr3R 19503961 5' - I-element 4874 1 67.00 TAAACTTCAATTATACAATTTAAATTGAAAAAAAATAAAAAAA:1 + chrX 9030759 5' + Doc 4699 4 90.70 GCTTAATGTGGTTAAATGACGTTGTGGATTTCAATTGATTGGGTGGATGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:2 + chr2L 15151866 5' - Tabor 458 2 51.49 TATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:2 + chr3L 8044315 5' - mdg1 388 2 56.44 TTTATTGCGCGACAGACCAGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 - chr2L 7056387 5' + P-element 58 1 21.78 CTGGCATCAGCAAAATATTGTCATAGTCCTGCGACCAGGCATCCTGGATCTACAGCCATACTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chrX 14371373 5' + jockey 9 1 78.16 CAACGACTTTAGCTGTTCCCGTTGCTGGGTAAATTTGCAATTAAATTTAAATAGATATCATCCAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr2R 23599671 5' + 1360 14 1 53.47 GCAAGTCGGGTAATGAGGAAAATGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 13868725 5' - roo 9020 2 77.23 TTTGTTTGGGGTATTTAATGCTTATTTTGAATTCAAATGTACCCACTTATAGAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATG:1 + chr2L 16444554 5' + BS 5020 1 50.50 AATCAAAAAATATATTATCTTTGTCTTTTAAACAATTCAAATAAAAAGTGCAAATACGATGACGTTTCACAAAAAATGTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGG:1 + chr2L 12513203 5' - I-element 5101 1 78.79 AGCAGCTTGGCCACTTCGTGAGCACCTTCGTTTCGCTGTCGTTGCATAATGGCCAAGAGGCGACAAGTGTTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 19887048 5' + P-element 5 2 76.24 GGTGGACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGA:1 + chrX 22726187 5' - Helena 1281 1 55.45 GGGTAACACTCCTCTGTGAAAAACTTGCCACATCCAAATAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGCGCTCAAGCCCT:1 + chr3L 14281848 5' + I-element 153 1 59.41 TGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTTAGACTTACAATCCGATC:2 - chr2R 1234691 5' + Q-element 625 1 74.26 ACACGACGAGAAAACTTTTTTTTTTTGAACAGACAAACCCCAGCCATAAAGGTTATACTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAA:1 - chr3R 8856365 5' - hopper 150 12 90.00 CGGCACAAAATATGTCTCTGTTTCGGAGAAGTCTCCTCTAACTCTGTCGGACACCGAACCGGGAAGACGAACAACTGGAACACCGCATCCGGCCAAACGCT:1 - chr3L 25824645 5' + Tirant 80 2 66.34 GTGGATATATGCAGTGTACGCTAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr2L 479369 5' - P-element 2835 1 24.24 ACGCCTCTGGATATGCAACAGTTATCTTACCCTAGCCTAGTGTATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 + chr3R 10957272 5' - hobo 2906 1 61.39 ATAGTTTACTACCTCTACCAAGCTCTGTCCTGACACTACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGT:1 + chr3L 27412374 5' + Transpac 53 2 64.36 GAATCAATTGATTTTTCTATGTGTATGGCTTTTGCTGTTGTTGTTGTTGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACA:1 + chrX 5154690 5' - Doc 489 1 60.40 AAACAAGCTTTTAAATGAAATTTCTGCTGATTATGTAACAAACTGAAAGCGAGTGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTT:1 - chr3R 23870173 5' - roo 9067 1 74.26 TTGTTCGAAATGTTTAAAGCTCGATGATGTCCGCAAACTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3R 11936955 5' + roo 8702 2 64.36 CTTCCATATTTTACTGCATACTTCTAGGCTGGTTGAAAAGTAAAGTTTGAACTGCATTCACACACTTATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr2R 13934366 5' + jockey 14 1 74.26 GGAGAGCGGCCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACA:1 + chr3L 25272523 5' + 1360 13 1 71.29 AAAACGAGCTCTCTCTTTCGCCTGAAATGTTATAAAACTTTTATTGAATGGTTCTATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 - chr3R 11549922 5' - opus 7485 2 63.37 AGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCG:1 - chr2L 23295887 5' + micropia 4962 2 69.00 TGCTTTGCACTAATTTTGCAATGCCAAATGGGTGGGGAATGGGTGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr3L 18793068 5' - P-element 2856 1 48.51 GTGAATAAATAGGCAAATAGAAAGTATGTATGCTTGTTTGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGT:2 - chr3R 20240970 5' - Tabor 482 2 61.39 TAAATTTATGTGGTGTCTGTGATCATCTTCTTTCTGTCTGTCTGTCTTTGCTTGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGAG:1 - chr3L 21925971 5' - mdg3 146 2 60.40 ACTTTAAAAACAGTGCTGTAAAATATGCTCCTTTTGCCGGCATGTAATGTAACGGTCCTTTAATTACAGTATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr2R 16149895 5' + 1360 5 2 74.26 ACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGG:1 - chr3R 15790097 5' + flea 4707 1 78.95 CATATAGTTGGCGTGATTACAGCTTTTTAAGCAAACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCG:1 + chr3L 17768178 5' + hobo 132 1 60.92 GTTGTGGTTGTTGTAGTTGTAAGAATCGCAGTTGAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTAATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACG:1 - 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chrX 10852486 5' - gypsy9 55 2 27.72 CGTGCTTAGAATTTTTATTTCTGGATTGAACAGTTTAATCTCAGATACACTTTTTTCTCTAAACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACC:1 - chr3L 27178014 5' + I-element 211 1 69.31 GATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCT:1 - chr2R 2092777 5' + Doc3-element 98 2 71.29 AGGTGGCTATGTGCGGGAGAGAACGATTAGAGTGGCAATAATTCTCGCCTCTCCTAACCAGCGACCAGACTTCGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTG:1 - chr2L 22761597 5' - invader1 3699 2 59.41 TTCTCAGCATGGATCCTTGAACAATATCTTATTTATTATGTAGTAATCCTCATGTCCCTTTGTTTGAGCTAAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATT:1 - chr3R 2468836 5' + invader2 221 2 80.20 ATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGACATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGAGCTTTTTGTAA:1 - chr2R 2875204 5' - TLD2_LTR 120 1 68.75 TTGTTGGTCTGGCGACTATATCAAATAACGACTATTGACTACGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 - chr3L 13652239 5' + mdg3 37 2 63.37 AAAAACATTTTACCATGCCCACTGTCATGTCTACAAACTGGCGTCCTGAGTGACGGCGGG:1 - chr2L 22642283 5' + Rt1b 4835 1 56.67 GGCGGAGGTGGCCAAGGAGGTTGGCAGAAGAATGGAGGAGGAGGAGGAGGAAATGCTTGAGAATTTGTTGCCTGCGAAACACCGGTGTAATCGTGTTCGCG:1 + chr3L 20905920 5' - Gypsy12A_LTR 1977 1 57.43 ATGATGGTACTTAAAATAATAGTAAAGCAAATGCTCGCATAAACAACAAAAAAAAAAGGGAAAAGA:1 + chr3R 9174799 5' + Bica 339 2 74.24 AAATATTTATTTATGGACAGAAATCTCTCAAGTCTAAGCAAAGTGCGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 - chrX 157278 5' - I-element 5324 1 59.41 TGTCTCTTACCATCTCGTTTGAGCCCAAAGTTGCACAACCGTGGCTGGGCGCATGTACTTATATATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGA:1 + chr3R 15126954 5' - Max-element 446 1 60.40 GAGGCAGACTGGAGAAAAAACCAAATGCTGAGCGACAGGCGGAGAAAAGGGGGTCTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr3R 30076505 5' - hobo 2919 1 45.54 TTGATAATACTCCCAATTATAATAAGGTAATGGGCTCCTGGCTCCTTGCGGAAAATTCAAGATAAGTACGGCTTTAAATCCTATTCCGTCCGTGGTCGCCA:1 - chr2R 20316455 5' + Max-element 398 1 60.40 GTTTATCTATCAGTGCGGAGAGCTTAATTACATTTTTTGCTTCTTTGGCGCAAACAATGCGGATGGGTGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr3R 6097571 5' + roo 9 2 71.29 AAACGCTTCCTTCTGTCTGTTAAATACTTTTCAACAGCAGTATACCCTTTTACACCTGTAACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr4 626592 5' + 1360 4 2 67.33 GTCGTATATAAGACGGGACGCGACGGGAGTGGTTAACTTTTATAATAATTTAGTTTGTTTCAATGTTGTCTAAATATGTGTTTAGACATGATAAGTAGGCA:1 + chr4 289764 5' + rooA 7249 2 76.24 AAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 - 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roo 9028 1 69.31 ACCCAGTCAGCCGCCCACACACATGGCGATGTCAAATAAATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAA:1 - chrX 5130745 5' + I-element 397 1 61.39 GAGATGTTCCAATTAGGAAACCCATTATCCAACCAGAAAACGCAAAACGAAACGGGGGAAAAAAGCTGCACCACCCACATACACACACACACACACACAGC:1 + chr3R 9228899 5' + accord 257 2 68.32 AGGGGTTTTAGGGGCCTGCAGGGGGTTAAGGGTTAGATGTTAGGTGTTAAGTGTTAAGTGTTAAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:2 - chrX 3333490 5' + pogo 10 1 58.42 GAGGGTCCGAGGGTTCGTCAGCCACATCCTGCGGCGAATTCACACACAAGCACACACCGAGACACAGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCGA:1 + chr3R 11256470 5' - blood 165 2 74.23 ACAATTATTAAATGATTCTGGGCAGCACAACATTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGC:1 - chrX 17387873 5' - flea 120 1 68.32 TTTGGGTGAAGATGCCGTTAATTTTAAGGTAGCCCTAGTTCTCGCCAGACTTGAGAATACCCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAA:1 - chr3R 5368401 5' + P-element 13 1 68.32 AAAAGGACATTGGAGTCTGTGGGAAAACCGCACTCATGCACAGCCCAAAATGGTCAATTTCCTGGTTTTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAC:1 - chrX 19034553 5' + hopper 1394 1 68.32 CTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACC:1 + chr2L 23299996 5' + invader4 358 1 73.96 TTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAATGGCGCAAAC:1 + chr3R 15130493 5' + Max-element 8238 2 51.06 TAAGAAGATTCATTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTACACAGTCTTC:1 + chr3L 25884064 5' + Doc 3 1 67.42 CAGCCGTTCTGCAAAAGTGATCGCCTGGGCAAGATCTGCGACCCACATTCTGCGTGTTGCTTAGTTTATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAGAAT:1 - chr3R 12194838 5' - Cr1a 145 1 41.58 AGTGGACTAGTGACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr3L 14286068 5' + 412 25 2 56.38 ATAAGGCAATTTATCATAGTACTGTCTAAGTACAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAAT:1 + chr3R 10577219 5' - rover 7045 2 70.71 TATTTGTCATTCCATAAAATGGGGTGAGCTTGAACTGACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:1 + chr3L 26315777 5' + Tabor 6856 2 62.38 AATCAATTAAAGTTATTCAAGCAAAATAAAACTCCAACCAAACTCGCTAAGAAACTGGGAAACAAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGA:1 + chr3R 13603363 5' + Doc 4351 1 69.31 TAGAATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGAT:1 - chr2R 5321194 5' - INE-1 510 1 55.00 CCATTCATCAATATGCTTTAACTAGAGTTTGATAAATTTAAAGTCTGAAAGCGCACAGTCGCACATACATGCACATCGCTACATAAATTATAGTAAAAAAT:1 + chr2L 18207769 5' + transib2 251 1 54.46 ACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 - chrX 21945908 5' + F-element 62 1 79.00 GATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTT:1 - chr2L 23295853 5' + micropia 41 4 67.33 GACTTTGCCAAAGGCCCCAAGGGCAAAAGGCACCATCAAAGGTGGCCGAAAAGATGTTGAAGGTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGA:1 + chr2L 12392027 5' + invader2 4671 1 53.47 AAAACTTGTGCCTTTTCTCCCCTACAATGGGATGAACCTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chrX 22664362 5' + opus 7151 4 61.39 TTTTCTATTTTCGCTCGCTACGGATTGCAGCGGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCAAAGACACTAGAATAATAGAATAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTTGT:1 + chr2R 601794 5' + Tc3 316 2 68.32 TCTTAGTCTTTCCAGGAGTTCGGTGAAAAAAGTTACTTTTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2L 15798629 5' - roo 9037 1 57.43 AGATGTGGCTCCTGTGTCTATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACA:1 - chr2L 22780929 5' + HMS-Beagle2 24 2 55.45 CAGGGCCATATTTGCGGACTAAAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAA:1 + chr3L 3730912 5' + I-element 4920 1 78.22 CGCTCTCTCTATCTCTCTCTCTTAGCGAGTGCATCTCTCGCTGCACAAATCCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGC:1 - chrX 3408721 5' + P-element 21 1 57.14 GGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:4 + chr3R 11080704 5' + I-element 45 1 69.31 GAATGAAGTGGAAATGGAATTGAAAGCGCAAACACACACACACTTAGAAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAA:3 - chr3R 19513437 5' + jockey 4670 1 77.23 GATATTGCCTGGCAAAAGCCGTCTAAATACATTTGTATGGGACATTCCGGATTACATTCACCTTGATAATCACAGTTGTCAAATTTAAATTTAAATTCGAA:1 - chr3R 6131481 5' - Rt1a 312 2 72.28 TGCCGATCCGTACAATCCGTTGTGCTTCAATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAA:1 - chr3L 5573578 5' + mdg3 48 2 68.32 ATCTCACACGATGGCAAATGGCTAATGGCTAATGGCAATCCATGTGGCAAAGCACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTC:1 + chr3L 9296717 5' + I-element 4992 1 58.42 CCACTTTGGCATTTAATCACTTAATCCACAAGCACCATGTTTAATCAACATAATCAAGCAGAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 - chrX 12166614 5' - pogo 2092 1 68.32 CAAGTGCAAGTGACAACAACAACAAAAGCAATTGCTGCAATTGTCGGCTCTCCGCCGGCAGACAATGTTCCAAAGAAAAAGTAAAAGAAAAAGAAAAAAAA:1 - chrX 5042405 5' + F-element 4683 2 51.49 GCTTCAGTCGGTCGTTTTGGTTTCTTTTTCGCAGCGCTTTCTATTTCGTTTTTTTTTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACT:1 + chrX 2844661 5' + 297 369 2 57.43 GCGTTGATGCGAATTTGTTGATCCGTGTTCCGTGATGCCACATTTGGAGCGCTCATGATGGCATTCCAGTCCACTGGAGCTCCATGGTATATTCGGAACGA:1 + chr2R 5111520 5' + Doc3-element 4418 1 75.25 AAACAACCGTCGGGCGAGGGGTATGGAGGCGGTAACAATGAAAGCATTGAAATAAATAGAAATAGAAATAAAAATGTAACTTTAGCATTTGATGTAACGTT:1 - chr3R 11031798 5' - accord2 407 1 76.24 AAGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGA:2 - chr3R 19513390 5' + jockey 4717 1 75.25 AGATGATGAATGACAATTCCCCTGTATGACAATACCGACAAATGCTGTCAGCCAAAGACTACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTT:1 + chr3R 12053867 5' - Doc 469 1 63.37 TTTTTGCCACGACCACTCTAACGCCCCAAAGCAGCCAAACTGTTCACGGCCACACTTGTATCTTATTTTATTCCCAAATATCTATCGATATCCCAGAAATG:1 - chr3L 26710196 5' + INE-1 500 1 62.38 CAGGCCAACAACAGCTACAGCTAGGGATTCAGTGCTGCTACCAACAGCAGTTGCAATGCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTT:1 + chr3R 8499396 5' - Tabor 466 2 60.40 CGGCATGCCGACTTGGCAGTTGGAAAATGAAAACATAGGCGAGACCACAAGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 + chr3L 494619 5' + Transpac 24 2 55.45 GATTATTGATTTAGATAAAATATGAAGGGGAAGAGGGCGATTATCAGACAGTGCGCTTAGTAGAAGAGTATTATTATTTATCAAAACATCATAAAAATAAA:1 + chr3L 14602936 5' + jockey 4995 1 31.68 TAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr2L 17729360 5' + hobo 47 1 68.32 ATTGTATCTTTTAAAATTCTCGATATTTACTACATTTAAACACCCCACTGATGATACAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 + chr4 306410 5' - blood 7375 2 62.50 AGAAAAGTATGTGTGAAGGGGGAGTTATTCTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:2 + chr2R 10974142 5' + hobo 46 1 73.27 GAAAATTTTTCGCTTCCGCAATGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTACATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTC:1 - chr2L 2317594 5' - 1360 3183 1 83.17 TTGGCTCCTGCTCCATCTAGCCGATCGCCAACCCACCGATCTCCTCCAGCCCTCCTGTTGTTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 11073847 5' - roo 9053 2 60.40 AAAAAGATGACAAAGATGGCTGCAACATCCGGTTGGCTATGTGTGCAAATGAAACCGTATGCCAACACTATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - 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chr2R 11399244 5' + 412 28 2 51.49 CTAGGGATTCAGTGCTGCTACCAACAGCAGTTGCAATGCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:2 + chr3R 8499416 5' - Tabor 7285 2 60.40 CCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCTCTCAAAT:2 - chr3R 1977609 5' - micropia 413 2 63.37 TATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAG:1 + chr3L 24210887 5' - HMS-Beagle2 7179 2 63.37 GTGCTGTTGCTGCTGCTTCGGCTCCGTGTTGTTCTCTTTGTGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCG:1 - chr3R 22339611 5' - hobo 268 1 60.40 AAGGGTGTTAGCCTGGTTGTTCATGCACCCATACCGTTCGACCTCTTTGCTATTGTACTGTGAGGAGTCTTTAAACTCCCCACAAATCTCGTGTAGGGGAG:1 - chr3L 10496000 5' + gypsy8 20 2 56.44 GCATCCTATAAGCTCAGTTCAGATCATGGATCATTTAATAAAGGAAAGGGGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCT:1 - chr4 1174469 5' - 1360 334 1 59.00 TGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTT:1 + chrX 9816283 5' + BS 5045 1 82.18 TTGCTATATTGGCGCACTGAGAAAAACTTCTTTTTTTTTGTATCACACATTTATAGTTTGGAAACAAAAATGTTGGATTCTTGCACTGTGTTTCAGGGAGG:1 + chrX 7348422 5' - Ivk 302 1 68.32 CTCAATCATTTAAAATTCAAGCGAGTGAATGAACAAACTACTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr2R 10334811 5' - pogo 2069 1 59.00 TATGTGCATCGTATGTGCGTATGTACAAGTGCGTATGTCAGTGCATGAAACACTGGCCGGAAACCCGTGTGCAGCCGGCAAAAACACCATATTTGCGTGGC:1 - chr3L 24510188 5' + Gypsy6A_LTR 102 1 63.37 CTCCAGAAAGAATCTAAACAAAAGGCCAGTAAAAGATAGAGTTTTGAAGTAGTTCAACTGATTTTTTATAATCACCATTTGGGAAAATCTGTTAAGGAATT:1 - chr3R 2472688 5' + S2 461 1 70.30 CCAGTTACTGTTTGTTATTGTGATAATATCCTTTTATTCATCAAACACTTTACAGTACCATTAGGAAATTGTTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACC:1 + chr3R 22043505 5' + Burdock 6138 2 77.23 AACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chr3R 19515816 5' - 412 7500 2 70.30 GTTGCAAATAGATTTCACGCTTTGTTTTATATTCCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTT:1 - chr3L 21998470 5' - roo 368 1 63.37 CCCAAACAAAAAAATAAAGTATAAACCCATTAGACTTTAGTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAA:1 + chr3R 11912106 5' + I-element 76 1 59.18 CTTCCTTTGTGCCCTTTCAACTTATATGAAGTAGCCCGTCTTCTGAAGCAGCGCTCACGGCAGAATGCTGACATTGCGCTTCACACGCTCCGGGCAGTAGA:1 - chr3L 27865102 5' - gypsy4 115 2 78.22 GATATGTAAATGTATTCTTAAATGTACCGTTGTTACTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCT:1 - chr3R 16397247 5' + roo 8838 2 65.35 TTATAAAACTTTTATTGAATGGTTCTATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATAT:1 - chr3R 11549893 5' - opus 7456 2 75.25 CTACCCCGCCTCGTTGGCCATTTTCTTGGGCTTTTCTTGCATTTCACTTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGTCTTTTCAGTTATTTATTTTTCCTTTTTGAA:1 + chr3R 23273058 5' - invader2 496 1 55.45 TTATCTTTATTTCAGTATCTATGTCAAATCAACATCAAGCGCATAGCAAATCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 - chr3R 8673919 5' - Tabor 461 2 54.46 GTATATGACTGAAACATTGTCCGTAAGCTAAGCGAACTTTAAGCTAATTGCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 20183049 5' - roo 9045 1 54.46 TTTTCTGGCCTGTGGCCGCCGGCAGACCTTTAGATTTTCATGTTAACTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAG:1 + chr3R 17615931 5' + HMS-Beagle 27 2 53.47 TAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAG:1 + chr3L 19038311 5' + HMS-Beagle2 6928 2 72.00 GAAATTTCTTTTAATGGGATTTACAAAACGAAATGTCTACACAGATGCTTTGTGTGGGTCGTCTGCCGCATTTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCG:1 - chr2L 19623177 5' + Burdock 6140 2 75.25 GCACTGATGAAGGGGACAAAAAGAAGCCAAAGCCCACACCTATATACATTCGAGAGAAAAGCTCGAATGTTTTTGTAAACAAAATAATTGAACTTGTTGGA:1 + chr3L 25552478 5' + Fw3 28 1 84.16 TATTTAAGGAATATGCAGTGGATATTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAG:1 - chr2R 12007257 5' + mdg3 5305 2 76.24 AATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCATTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAG:1 - chr3R 2689430 5' - diver2 4475 1 61.39 CCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 3535436 5' - roo 9027 1 68.32 ATCAGCCAGCGAGCTAAATCAGTATTCGAGCAACTCTCGACGCGAATGCAAGTGAGGTAAATTGCCAGCTTAAAGCAGGTGATCAAAAAAAAAAATAAAAA:1 - chr2R 21571451 5' + R2-element 3581 1 68.32 GTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3R 9616653 5' + roo 32 2 57.43 GGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 - chr3L 22231377 5' + Doc 41 1 69.31 ATTAGATTTTAAAATTAATCATACTATATACATATAAAAGAAAATACACAAGATGCATAATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTC:1 - chr2R 11639151 5' + Burdock 6150 2 65.35 TGGTTATTGTTAGCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGACTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chrX 157220 5' + I-element 39 1 60.40 ACCTCTCTTTTCAAGAGAGCACGTTGCAAAGACGTTCAGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chrX 14953647 5' - P-element 2849 1 42.57 AACTCTGTGTGTGGGTTGCCGTGGGTGGGCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGG:1 + chrX 10822195 5' - Doc 402 1 71.29 TGTTTGCCTTCTCTATCCTTCGTTACGAGTAGCGAGTATGATCGGCGCCCGAGACCCAGTGTTTAGCGGGTGGACGTAGAGTGCCAGTGGCGGG:1 - chr3R 2637721 5' + hobo 2925 1 62.77 ATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1 + chr3R 4504057 5' - blood 7370 2 59.41 GATATACAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2R 17348629 5' + jockey 14 1 63.04 GCAGCTCTCAGTGTTCAGTCTTGTAGCTCGCTCGCTTAATCCTCGAGTGCCCGAGGGGCTACAATGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chrX 21219404 5' + roo 12 2 68.32 GATAATATTATAATGACCCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAA:2 + chr3R 15130442 5' + Max-element 8236 2 70.30 TAGGGATTCAGTGCTGCTACCAACAGCAGTTGCAATGCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:2 + chr3R 8499417 5' - Tabor 7284 2 61.39 GTGATCTGCTGTTGTTAGGTTTCTGTTGCTGTGTGTTTTTATCTTCGTTCTTTAAGACTTCTTTAATTATCATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCC:1 - chr3R 2216849 5' + Cr1a 107 1 62.38 TAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 - chrX 3295659 5' - hobo 2890 1 74.75 TGTCTGGGAATCTATGTATATCCCGCCGACACTCACGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCAC:1 + chrX 16502992 5' + I-element 5165 1 64.36 CCCATATCCTTAAGAAGTAGTTCTGGTAGCAATATACATATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAATGTAGAGTAAACATATTGAAAA:1 + chrX 15366111 5' + 17.6 6958 1 69.31 GTGAACATTGTCAAGGTCGCCATGTAATGAGTGCTAGTTGATTAAATAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAGCGGGTTATTCGAA:1 + chr3L 27411725 5' - Stalker3T 290 1 64.36 CGGGTGGGGGATAGGACAATGTTCAGCTTGGCATTGTTACTTAATGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 12217309 5' + roo 31 2 60.00 CATCACCTCCCTGCTTGATGCACTGAAGACCTCAACTAAAAGTGCACGGATACATAAGCTCATGTTGGACATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:2 + chr3R 2556016 5' - 412 7538 2 70.30 CTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:2 + chrX 10196106 5' + 297 46 2 77.23 TATTGTTTTATTATTGTTTTTATAGTAGTAGTTTTACCACAATTTATTTTGGCTCTGTTAACTGTTGTGTGTTGCAGACTCCATTTACGTCTTACAAAAAC:1 + chrX 11294327 5' - Doc4-element 490 1 68.32 CAAAATAAGAGTGGTAATCAAAGCTGATGCGTCAGAACTTTTGGCAGCGGGAAGCTGACACTTCTTATTCGTAGTGTTGCTTAACGCTGCAAGAAATGCTG:1 + chrX 3429116 5' + gypsy 141 2 65.35 AGTGGAGGGGGATAGGGAATCCACACCTGCCCGCTCCTAAATGCACGCATAGTTCCTTTATAGGAAAGATACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCA:1 - chr2L 1421640 5' + Quasimodo 56 2 73.27 CAATATTGCGTAGCCGCCGTGTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTA:1 + chrX 9816254 5' + BS 5016 1 53.47 ACACGATTGTCGGAGGTCAACTTCCTTTCCGACTTTCCACTTTGTGCCCCCATTTATGACGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 - chr3R 21198688 5' + Tirant 17 2 64.36 TAGACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCG:2 + chrX 21564081 5' - invader4 3062 2 57.43 GTATAATTTTGCGAAAAATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:3 + chr3R 13620261 5' + Doc 30 1 55.45 GAGATTTTTGGAATTTATGAAGCTTATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAGGTATAGCTTG:1 - chr2L 11604963 5' - Ivk 4912 1 75.25 ATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 + chrX 5130987 5' + I-element 31 1 51.49 CCCGGTCTGCTGTTTTTTGTTTCGTTGTCATAACAAAATAAACAGAAAAGAAAGAAAAAAAAAATTAATTCCACGCTTCCTTTAGTGTTAGTCCAACGACA:1 - chrX 15382911 5' - pogo 357 1 79.21 TACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chr3R 19450192 5' + roo 61 2 57.43 TACGCTAATAAATTACTCTCATTAAAAGTGACTTTATGGGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 - chr3R 16110234 5' + mdg3 38 2 61.39 TAATTATCATTGCATGAATTTAAAAATATGCTGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAAT:1 - chrX 9816340 5' - BS 5077 1 65.35 GCCAGATGCGTCTGGCTTCTTAAGCCAGAAAGGAGCATGTAAGCGAATCGAACGAAATATAGTGACGTTTTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chrX 21050026 5' + 297 20 2 57.43 TGACTTACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:4 - chrX 21945945 5' + F-element 26 1 61.39 TTTATACGGGGAGGATCTGTAACTGGAAACTAGCTATTTCGCCTCTGTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3R 5562035 5' + pogo 26 1 52.48 CATTCCATTCTATCGTCGCGAAGAGAGGCCCTTAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAA:1 - chrX 17492665 5' + Tirant 333 2 67.33 CACACACACGCACACAAGCAGCCACCCACACACGCGCGCACACAAACACAGAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCC:1 - chr3R 19983795 5' + Quasimodo 119 2 55.45 TTGCAATTCTTCCATACTTCATCGCCCACACACACACACACACACACACACATACGC:1 + chrX 17982376 5' + accord 185 2 77.19 GTGTGAGTTCGCCAATGCAGAACACATCCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCGAC:1 - chr2R 142822 5' - HMS-Beagle2 6866 1 73.27 CACATTCAACCGAACGGTTATCCATTAAAAAATCAACGGAATGTGTCGTATATTAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 22162739 5' - roo 389 2 59.41 CAATTTGAACGTGTTTTTTTATAAACATAGGAGTAAAGTTACTTATTTATTTGAGTGTACTATGAAAAGCATAGTCCGGCAGTTGGAAGCTAATGCTGTCT:1 + chr2R 1658923 5' - Tc1-2 22 1 60.40 GCCTGCAGGAATACCCGGAAAACTTGTGCCTTTTCTCCCCTACAATGGGATGAACCTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTC:1 + chrX 22664344 5' + opus 17 2 62.38 CGCCTAAAAAGCGGCAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr2R 17277643 5' + jockey 21 1 45.54 TATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr3L 23456279 5' + 1360 7 2 68.32 TATTATTAATTTTAATGCTATTTGTTTTATAAATTGATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGCCTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGA:1 - chrX 5090596 5' - mdg3 28 2 62.38 GAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTC:2 - chr3R 10736144 5' + McClintock 5953 2 76.24 TCGCCATTAACTGTCCCACCGACGCCGTCGGCGACGCCTCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCA:1 + chr3L 10804617 5' + Doc 4527 1 60.42 AGTTTTGAGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:2 - chr3L 3535472 5' - roo 400 1 68.32 GGCAAAAACCAAACAATAACAAAACAGCAAGGCAGCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr2R 6501213 5' - P-element 2849 1 43.00 CAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTC:1 + chrX 14317414 5' + 1360 50 1 69.31 TAGACGGCGCTACATTTAATCTAATCTTGAGCAAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr2L 9672389 5' + 297 4 2 73.27 ATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCC:1 - chr3R 934261 5' - Rt1b 4755 1 58.42 ACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATC:1 - chr3R 1977621 5' - micropia 5412 2 52.53 AAATAAAAGTGCCCGCACATTGGAAATAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr2L 12835873 5' - 412 445 2 72.28 CAATAAAATATTCCCTTCGAATGCAAGATTCCTACTTCAAATATTTTCATTGGATCCCCAGATTGTTTGGACCTTTTATTTTTTTTTTATTTTTGTTTTT:1 - chrX 8971438 5' - Rt1a 5084 110 50.00 CTTGCCCTCAGCACGTGGAGACGCACTTTGGCAAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 + chr3R 17557385 5' - mdg1 7417 2 66.34 ATAAGATACCCTGTGAATATTTTGTACATCTAAGTAAAGACATGTGTAGTATGTGCATGTATCGAGGATACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chrX 6162147 5' + blood 7047 2 57.43 GACGTTCTCCTACAGGTAAACTTTATTGAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:2 + chrX 21564083 5' - invader4 301 2 55.45 CAATTATGAGTTGGATTAAGTTGGCGGCTTTATTACTGTGTGCATTGTTGGTAGTCTTTTAAGTACTTGAATGTTTTGTTTATTATGACAAAGTGTCACAA:1 - chr2L 13483396 5' - Stalker 6918 4 60.40 CCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chrX 5168864 5' + hobo 50 1 71.29 GTTACGCCAGTTTTGTTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGG:1 + chr3L 3821093 5' - Rt1b 4703 1 70.30 GATAATATTTTTTAAAATGCACTTTCTTTTTGCACATTGCATACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAACGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGC:1 - chrX 12646286 5' - Tirant 8265 2 57.43 TTAACAAAATTTCAGATCAGCTTAGTCGTCTATCGGTAGAGGGCAAATCTAATACATGTACAGACTCCAGTTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCA:1 + chr3L 25996651 5' + Stalker3T 290 1 70.30 GTTTATTTATAACGCTTGGCGACCGAAACCGAACCGAAGACACTAGAGTAACAGATGCGTAGTGCCATACTCTCAAATTTTTGTTCGAGAGCGAGAGAGCG:1 - chr3L 10852642 5' + 1360 100 1 73.27 CTTGTTTCCCGACAGGTTAAGAATTGTATAATTTTGCGAAAAATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:2 + chr3R 13620236 5' + Doc 5 1 71.29 CGATTCTGCCGACGTCTGCAGCGCTGCTTTGCACTAATTTTGCAATGCCAAATGGGTGGGGAATGGGTGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr3L 18793092 5' + P-element 7 2 72.28 TATGTAACAAACTGAAAGCGAGTGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr3R 23870142 5' - roo 9036 1 60.40 TATGTTGCGTTGTAAAACCAGTTGTTGTTATGCCCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr3R 28326486 5' - P-element 2847 1 39.60 TTCATTAGTGTCATCAATGTGGACATGTGTGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGA:1 - chr3R 23173160 5' + Burdock 6181 2 72.28 TGGAGAGCGGCAGTAGAGATTTTAGTTAATATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:2 - chr3R 6138313 5' + 297 6620 2 70.30 GTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTTTAATAAAGAAATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATA:1 + chrX 15019096 5' + invader4 2892 2 65.35 CTCGATATTTACTACATTTAAACACCCCACTGATGATACAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 + chr4 306428 5' - blood 7352 2 60.40 CTCTTAATTGAAAATTAACAGCCACAGAACAGATGTCATTGTGGTTTTGGTCTGATAGCGTCTGCCAATTGGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGAT:1 + chr3R 24509089 5' - HMS-Beagle 244 2 75.25 GTATGTACTTATGTCTATATGAAAAAGAAAATTAAGTAAATGATTTATTAATGCAGAAACTATTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 21581093 5' + roo 8679 2 68.32 AGGCTTGTAATATCGCTAGTGGCATTGTAATACCAAAGACACTAAAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAAATTCGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr2R 4193336 5' - 1360 3342 1 69.31 CAATTCATTGACCCGCTGACAAAATAACGCATCCCCGTCCGCCTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTA:1 - chrX 5132278 5' + I-element 4875 1 58.42 CCACCGCCTTGCTGCCACAGCAAAAGATGCATGGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCAT:2 + chr3R 17980751 5' + HMS-Beagle 6836 2 69.31 GCAAATAGATTTCACGCTTTGTTTTATATTCCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3L 21998467 5' - roo 365 1 66.34 ACAGTCAACTGACAGCCAGACAGAGCTTGTGTGCGCAAGTGAAAACAATAAACAAACTAAAATATGAGCGCATCTGACGATCAAAATCAGAAGCGAGAGCT:1 + chr3R 20175941 5' + Porto1 227 1 65.35 TAGTTTTGAGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:2 - chr3L 3535473 5' - roo 401 1 69.31 CTAGTTGTGCGTTGTCCTTTGGTTTTGTCTATGAAAAGGACGATGTCTTGCCATTCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACG:1 - chrX 15238394 5' - F-element 463 1 63.00 CCTAGCTTAGGTAATGATAACGTCGAACGCGTTGCTCTTATTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 - chr3L 15353587 5' - mdg1 7426 2 59.41 TTTAGATTGTGTTTGTGAGAGAGCTGGTCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr2R 6501168 5' + P-element 46 1 33.66 GAACGCCGATTTAGCACTGAATTCAGTATTCGATCTGACCGATATGCTGTGCTGGCAATTGAGTTTATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 - chr3R 10876380 5' - opus 7496 2 74.26 ACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3R 13620287 5' + Doc 39 1 75.00 GGCGGAGAAACGGTCTTTAGATAAAGCAAAGTGGCGACAGCTCTGAGCAACACTTCAAAATGAGATCCAAGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTT:1 + chr3R 13619870 5' - Doc 282 1 78.22 GTGAGGAGAGCGATCGAAACCAAGGGTTATAAGTTAATACTATAAGTGGGTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACA:1 + chr2L 16456765 5' - BS 5063 1 52.48 ATTCACATCTTGTGACCTATTATGTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chrX 5178897 5' + hobo 9 1 64.00 ACAAAAATATATCCAAAAAATTTTCAAAAATATGGTCGTCAATTCAACAAATGTTTAACTTTTATTTATTCAATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACAAC:1 - chr3L 20853194 5' - HB 1466 1 67.33 CCGACTCTGCATATTCTTTTCTTTGAACAGTGCTAATTATACCCGTCAATCGTGGATAAAAAGAGTAATCTAGATTCGTTGAAAAGAATGTAACAGGCAGA:1 + chr3R 2472897 5' + INE-1 22 1 65.35 TAGTTAAGAAGATTCATTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 + chr3L 25884060 5' + Doc 10 1 64.00 TCCGTGGGCCTCGTATACGCAATATTGCGTAGCCGCCGTGTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAG:1 + chrX 9816235 5' + BS 4996 1 70.00 GGAAAAGCTCATCAGTTGACACCTCATATCCTTGGAGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2L 1530381 5' - roo 401 1 69.31 ATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:2 + chr2L 9672432 5' + 297 47 2 76.24 ACGACGAGCGAGTGGTGAAAACCATCACGGATCTGCATCATCTGGAACACCAGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 - chr2R 14604721 5' + P-element 23 1 56.44 AGGTTGCGACCCTTTTGCGATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAATAATAATAAACAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:2 + chrX 8037606 5' + roo 13 2 67.33 CTGGTGTCCGCTTGCCTGGCTTGTGGTTTGCGTTTAAAGTTTAAGTGGCGCAAAATCAGCGCTCATGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGG:1 - chr2L 9624635 5' + transib2 8 1 71.29 AATTTAAAAATATGCTGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGT:1 - chrX 9816324 5' - BS 5061 1 52.48 AAATAGATAAGCTGTAGTAATATATTTTATACTAAATAAAATCGAATAGGATAGGAATAAGATAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 10189422 5' - roo 396 1 64.36 GCTCATTCTCGCAAAATATTATGGCTTCGCTTCTCGCGCGCACTCTGCCGTCACTAGAATATAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTCGCCGTGGCT:1 - chr3R 3620750 5' + 1360 49 1 52.00 ATTATGCTTCCCGGTTGCAGCGCTCTCCTCAGTTTCAGATATATGTGAGTATATATATACATATAGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr3L 8843649 5' + I-element 12 1 67.33 AGCTCCACCTGCGGGAGCACCGGTTCCAATTTCCTGTCAATACCTTCCGAACGGAACCTAAAGAAAGCCGGTATACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr2R 12247370 5' - 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Quasimodo 7355 2 67.33 ATTCATTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 + chr3L 25884071 5' + Doc 22 1 52.48 TAAATTATTTTTATAATTGTTTATTAAGTTTTAGCAAAGAGTAAACTAGACAGTGATATAGTCAAACTTAGTTAATAGTGAATAACAAGTAAGTAAATAAT:1 - chr3R 4517052 5' + looper1 343 1 71.29 TGCAATATTTCATTTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTG:1 - chr2L 16922774 5' - P-element 66 1 26.73 GATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2R 17348629 5' + jockey 15 1 64.52 AACCGAGCTCATATATGTATATTTACTATCTTCATGCTAATACCATTCAGAAATAATAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:2 + chr2R 15244912 5' + pogo 14 1 63.37 AAAGAACTCAAACACATGTTTTGATATTTAAATTTTTTTAAAAAAAA:1 - chr2R 11602912 5' - HeT-A 5804 1 78.72 CAGATAAAGCACCTGTTTAAAATATTCAACAAATTCTTTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2L 12860905 5' + roo 23 2 61.63 TTAGAAGGTGTAAGCTCTGCTCTTTTACTATTCATGTTGAGCTTTTGCTTTGAACACCTCTCAACGGATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGA:1 + chr2L 21018766 5' + 412 7 2 77.23 CGGCAGTAGAGATTTTAGTTAATATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 - 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roo 9049 2 56.44 AAGATGTTTGTAAATGATCAACAAAAGACAAAAAATAAAAGGAAAAAAAAA:1 + chrX 20806551 5' + Doc2-element 251 4 64.71 GCTGGAGAAGGAGAAGAAACCGAATGGCTAGGACATGGTGTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chr2R 11921818 5' + P-element 35 1 42.57 ATTTGCCTACGCCCAACTCAATGCCAATCAATGTCACGCTGTAATGATGAACTCCCCTTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3L 15056930 5' - 412 7506 2 63.37 AGATTTCATTTCATTTCATTTCGTTTCGTTTCATTTAAAACGGCCAGCACACAAAAGTCAAATTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chrX 18523068 5' + jockey 22 1 60.40 TTAATCATATACTAGAGACACTATTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGAATACACTTAAATTCAGTGC:1 + chr2R 5753434 5' + P-element 50 1 29.70 ACTCAGTCTGCTTGGCTAGACCATAAGAAGATCAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2R 11244985 5' + 412 7095 2 66.67 GTGCGCATAATTTTCCTTTATTTAACCGAACTTTCGTTTCTATTCAACTTCACTCCGTGTTATTTTTTTCCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATC:1 + chrX 2844077 5' - Quasimodo 257 2 74.26 GGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chrX 5168846 5' + hobo 30 1 52.53 GATGGGCTGTGGGAAAGTCGGCGAGGAAAATCAATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - 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jockey 4995 1 69.31 GGGTGATGAATGATGTCATTGGATGATGTCGGAGCAAAGGAGTAGATGGATATATGACTGAATAGTATTAGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGT:1 - chr3L 911192 5' + mdg3 5214 1 71.29 TCCCATAGACGCAAATTATGATGTCGGCTGATGCGAGCAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 + chr3L 19437228 5' + jockey 4707 1 62.38 AAAATCCCTTGTTTTCCGCAGTGTTCTTTCCATGATTTCTATTTCTAGGTGCTTTGTTTTAGGGCAGCAAAAAGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3R 13167289 5' - roo 408 1 74.26 CGACTCCCTTTTTTCCAGTACATAATGTTTATATATGTAAAGCGTATATAGTCATTGCGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTTCGTG:1 + chrX 8640862 5' - accord 7026 2 56.44 GTGGAAGTTGGGGCTTTTAGGGGGCGGTTAGAATATGTAAGTCTCCAAAATGTATTGGTATTGCGTGTAGAGTTAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGT:1 + chr2R 15330449 5' + invader1 3877 2 70.30 TATATTAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:3 - chrX 21668097 5' + Tabor 6849 2 69.31 AAAATGTCATCGATCAGCTCTAATCCCACACAAAGACAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTACCATTCGACTGACTCC:1 - chr3L 24211239 5' - 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chrX 157277 5' - I-element 5323 1 60.40 CACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGCGACTCTTTGCATTCCAGAAATTCTGTCGAGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCG:1 - chrX 21852436 5' + invader4 76 2 68.32 GTGGAGGGGTGGCTGTGTAGTGTTTTATTAATATTTTTTTCACTTGCCCCAAACAACATGGTGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTC:1 - chr2R 7104539 5' - roo 77 2 66.00 AGAGCACGTCCATCTTAACTCAAGCCTTGTTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGG:1 + chrX 3434707 5' - I-element 51 1 71.29 CTTTTTAAAATATCGCTCTACTCACAAATTTGTACTTAAGAAGCGTCGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chrY 131419 5' + Doc 34 1 52.48 GACACAGGAAACTCATTTGTCTCCGTGTGAAATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 - chr3L 17635614 5' + 297 6582 2 79.21 TTTGAATTTTGCATGAAATGTTTCTGCCCGCAACTGAACCACGTTTGGGCCTCATCTAAAATTGATTTTGCTCGGGAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chr3R 20384538 5' - roo 408 1 78.22 GAGTAACGAGAACTGCAGTCGTTCTTTGTAAATAACGAATACTATAGTGTTGTAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr3R 21587228 5' - 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chr2L 16276183 5' + 1360 38 1 64.36 TTTCGCGGGTAAATCACCGCCAACTACAACTGCCGAAACGATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 + chrX 3446492 5' + I-element 1 1 76.24 GGAAAACATCAAAATTTCGTGCATAATACAAATAAATCAAACCCAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTAC:1 + chr2R 2144940 5' + Stalker2 7282 2 54.46 TCTGGAGAAGTAAGTATTGAAGACAGATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:2 - chr2L 8492954 5' - blood 330 2 74.26 CATTGACCTGCCAAATAGTGGGCGAGAAGAGTGCGAAGTGGCGAGGGCAAAAGAGAGGAGAGCGCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr2L 16276102 5' - 1360 3377 1 65.35 AACAGATTTATTTGAAAACAAATATATGCCAATTATTTTTGTTCATTAAATATAATCGCCCTAGTTTTATACTCTTTCATCATTAATATGATGAAGCGTGT:1 + chr2R 21834007 5' + Rt1b 4768 1 74.26 TAAATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGGGAACAAGTTATCATAAGAAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTA:1 - chr2R 16660293 5' + gypsy9 5033 2 48.94 AGCTGCTGAATATAAACTTTTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 + chr2L 12835843 5' + 412 55 2 77.23 ACTAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 - chr2R 1725944 5' + Doc 30 1 55.45 ATTTTGATGCTTTGGAATATTTCATGTCTAATTAACTAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATA:1 - chr3R 21710619 5' + mdg3 5291 2 61.39 TTAGTTGCCAACGCAGGGATGGCTGAAGAGAGGGCGTGGCAAAAAGTTTTTACTGCACTCGAGCAGGTACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGC:1 - chr3L 22975249 5' + X-element 4428 1 49.50 AGCAGAATGTGGTGGAATAGCACACCAGCATTTCTTCGCTCCAGGCACTCGACTCTAAATCTGTTTATGCACAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 - chr3L 18523688 5' + 412 5 2 74.26 CAAATGTGCAAAATACTACAGAGTATCAAAATCAACAACAAATAACAACACATCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCAT:1 - chr3L 21025144 5' + FB 46 1 56.44 ATAATCACTAATGTATATGTTTAAAGGATTCCAATCTCTAGTAGTTTAATCAAATATACTACATTAGAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr3L 12565616 5' + roo 8673 2 52.48 ACGAAAGACAAAAAGCCGAGCGCCGAAAAAGCACCGACAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chr3L 5351557 5' + P-element 40 1 37.62 CTCCTTCCTGCTGCTGCGGCTGCCGCTTTCTTCTTTCAAATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCG:1 - chr3R 28121171 5' + micropia 5049 1 66.34 GAGGGGAAAGAGGGGAAAGTCATCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCG:1 - chr3R 1301462 5' + F-element 248 1 73.49 AAGTTGTTTGCCCAAAGAACGGTGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chr3L 1276687 5' + hobo 49 1 76.24 ATGTTTCCATATCGCCCATTTGCCTACGCCCAACTCAATGCCAATCAATGTCACGCTGTAATGATGAACTCCCCTTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr3L 15056913 5' - 412 470 2 55.45 ATATTGACTTACATTTCCAAATCTTAGGTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATACCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 12998290 5' - roo 9053 2 55.79 TGTGATTCATCATAGACTTGTCATCTTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTT:1 + chr2R 21833916 5' + Transpac 4967 2 75.25 ACGAGTATTGTTATTTTGGTTATTCTTACTTTCATTTGGTTCCCAAATAAATATCTATCTACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCG:1 + chrX 20805092 5' + INE-1 550 1 61.96 AATCATCGAAATAATTGATTATTGTTTCATTATTTAGACTGTTCTGCATTCTGCACGGTAACTTTTCAACATTCACCACTTAATTATTTAAATCGGAGCTC:1 + chr3R 20276672 5' - Transib5 249 1 62.38 ATCGGTTGCACTTGGGCCGGACTGTTTGTCTTCTCAATTTTTGTCATTCCCTTTTCATTATGACGCTTTCTCATTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACG:1 + chr3L 28092898 5' - micropia 5210 1 80.20 GAATACTGAGGAGTAGCTTGGAAGCACTGATTGCCTCGTCTTCTGTAGTTATTGCCAGGCCTACTATTTCAACGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACCTCGA:1 - chrX 19820786 5' - Rt1b 4976 1 77.23 TAGGTTTAAGTGAGTCTTAATTTACAAGTGCAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 + chr3L 25186278 5' - copia 5078 2 73.27 GACAGCAAACAAAATCCAAAACAAAGCTGCAAAAAGGAGGGAAAAAAGGTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr2R 21902130 5' - roo 9044 1 65.35 GAGAGATTCGCAAATTGAATTGGAATTATTTGGCAAGCAACGTAGCCCACTATATATGCTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAA:1 - chrX 10196182 5' - 297 384 2 73.27 CAAATAAAAGTGCCCGCACATTGGAAATAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 - chr2L 12835874 5' - 412 446 2 71.29 CATAAAATTCAATTTATAACTGCAGTTTCATTAGTGTCATCAATGTGGACATGTGTGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 - chr3R 23173186 5' + Burdock 19 2 58.42 TTATGGACAAGAGATAGCTGAAATGTTTCTTGTTCAGATAAAGCACCTGTTTAAAATATTCAACAAATTCTTTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2L 12860939 5' + roo 4 2 76.24 TATTGCGTAGCCGCCGTGTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATAT:1 + chrX 9816257 5' + BS 5019 1 56.44 CTTTATATTCCTCTTTCCTTTATCCATGTCTTTTTTTTTTTCGCACTGGTCCCACGGCCACACCTGCCGCCCAATCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCG:1 - chrY 685003 5' - Cr1a 4403 1 63.37 AAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr2L 9672421 5' + 297 36 2 65.35 TGATATTGACCAACTTGATCATGTCTTTGGAATGGGGGAGCTTGAAAGAGACGCTCTCAGTGCGTTAGGGTTCACTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAG:1 + chr3R 2208358 5' - Doc3-element 391 1 81.19 AGAACCCTCAAGGATAAACGTAATTCAACAATGAAATTTTGCGCAACACCAAACAATAAAGTAGTTCTTAATCTAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr2L 18977872 5' - roo 408 1 78.22 ATTGAATGTCAGAAACCAGTAAACAAGCTAACATGCAAATACCGATTTGTTTAAAATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGG:1 + chr3L 4647939 5' - 297 6768 2 65.00 CCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:2 - chr3L 3535436 5' - roo 9028 1 69.00 CTCAAGGATAAACGTAATTCAACAATGAAATTTTGCGCAACACCAAACAATAAAGTAGTTCTTAATCTAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2L 18977878 5' - roo 402 1 72.28 CTCTCTTTCGCTCGCACACTAAGTATGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 + chr3L 3070665 5' - 1360 3338 1 77.23 AAAAAGGTGTAAACTATTTCAAAGGATTTCAAATTAGTTTAAAGTTCAAAGAAAAATTAAGAGTCTACAAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTAC:1 + chr3L 13665161 5' + mdg3 5029 1 57.43 AAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGCACTCAGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAATGCGTATATGTGT:1 + chr2R 5260084 5' - 1360 3225 1 63.37 TTACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 - chrX 21945941 5' + F-element 30 1 57.43 AACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:3 - chrX 21945934 5' + F-element 37 1 53.47 TGTACCGAATCCGAAATAAAGCCTCAAATTAGCGCGAGCGCTTTACAGAATTTACTGCCATACTGGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:2 - chr3R 8499504 5' + Tabor 6852 2 66.34 GAAAGGGGGCTAATGAAATTTTAGTCTGTGTCGATCCATAACTGTAGTTATTAATTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:1 + chr3R 2474291 5' - Juan 4190 1 51.49 GACGCGCATGACAGGCGGAGAAACGGATACCCTGTACAAACTATATCAGGCTGTTGATACTGATCAAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr3L 15869626 5' - pogo 2095 1 71.29 GCACCATCATTACGCAATGTCAGTTGGCGCTTTTATCAATGTTTCCAGTCAGTTTTCGATCGTTACTCGTAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAA:1 + chr3R 17172414 5' + invader1 3948 2 55.45 TATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCTACAAGTAACCACTATTTTAATATATAAGTTATGCTACATGCAAAAAACAACACCAAATAGCACTGCGAA:1 - chr3L 21484241 5' - Cr1a 239 1 37.89 TAACTTTTAGATTTTGCGTTGCAAAAATACATGTATATTTCTATTGCATCTTTGGGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 + chrX 4278318 5' - blood 355 2 56.44 TAGGGGCGAAAGGGAAAATCAAGTCGGAAGCGACTTTTTATTCCACTTATTTTTGTTAAATGGAATGTGTATATAGGGAAAAAAAGAAAATCCGGTTAGTT:1 - chr2L 4677757 5' + HB 132 1 75.25 ACAAAAAAAAAACTATTTCATTACTTTACCTAGTTTCAGCCCTATATGCGTTTACTTTTTACAAAAAAGTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 13048231 5' + jockey 18 1 61.39 CTATAAATAATGTTCTTTCTTCGAAATCTTAAAGTTTAAACAATACCTGTAAGCTAATATCCTCGCAATTCCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chrX 10776252 5' - roo 404 1 65.35 CTTGCAGCATATTTCTTTCATTAAGAGACATTCCAGTTCCCGACTATCAAATACCTGTTACTCAGCTACAAAAATGTGATAATTTTTCTAGGATATCGATA:1 + chr2R 4378978 5' - INE-1 503 1 79.21 ACATAGAAGGAATCTAGATTCGGCAATCCGAGCTTATTTAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3L 15869723 5' + pogo 33 1 61.39 CACCAACCGTCCAACCCAAAACAAATAAATTATCATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chr2R 22825418 5' - opus 7460 2 69.31 TTAATGGGATTTACAAAACGAAATGTCTACACAGATGCTTTGTGTGGGTCGTCTGCCGCATTTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTC:1 - chr2L 19623167 5' + Burdock 14 2 65.35 ATTTGTCTCCGTGTGAAATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3L 17635600 5' + 297 15 2 65.35 TCTAGCTTTGCTTGTCTATTACATATAGAACACCTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCAAAG:1 + chr2R 10509759 5' + Max-element 8279 2 81.19 TTGATAATAAATTTTTGTTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACCGCCATGCCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCTCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTC:1 - chr3R 4583048 5' - Cr1a 4390 1 75.25 TTTGCAGTTTTTTTCCCAGAAAATTTCAATTGATACTTGTTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAC:1 + chr2L 16636156 5' - 297 6945 2 63.37 GGAACAATATAAATATTAACTACATATAACACAGTCTTCGGGTGGAGACGTCTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGT:1 + chr2L 16668623 5' + Doc 65 1 74.26 AAAAGTTTGTTCGTGTTGTGGACAGTTGTGTGGAGTGTATTATATTTAATTCGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGA:1 + chr2R 2004844 5' + flea 485 1 58.42 CTATTAAGAAGGGATCCCACACTGGGAGCCGACCAGCAGTCCATAGAATTAAATGAAAGAATTCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAA:1 - chr3L 15705934 5' + I-element 4920 1 63.37 GAAAATGCAGATAAAGTAGATATTTGTATGTTCCACAAATGAAGAGCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACA:1 - chrX 159398 5' + I-element 4941 1 54.46 AATGATCAATTTATCGTCGATGAATAAACCCCTGGCTGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGA:1 - chr3R 19449072 5' - Quasimodo 126 2 64.36 GGGTTGCAAAGTGTTATATAAGTAAAAAAAAGTGCTTACCTGACCTTGGCCTAATAACCATTTTTAAAACAATAATTTTCCTTTTTTTTTTGCATTT:1 + chr3L 14819045 5' - Doc2-element 246 2 46.39 AGCTCTGTTCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr2R 22746106 5' - hobo 2914 1 54.46 AATTTGTACTTAAGAAGCGTCGGCTTCGTGGGTTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chr3R 3921298 5' + Doc 57 1 73.47 CTGGCACCGATGCCCATTATTTCTGCCGCACTCTCAACTGTCTTCGTCTAACAAATGGAAATCATTGTCCCAGTGATTGAGCTAGTATATATACATACATA:1 + chrX 20803858 5' - 1731 102 1 48.51 GAAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:2 + chr3R 11080672 5' + I-element 13 1 65.35 TTTTGCTCTGTTGAAGAATAGGTACATTTCGATCAATTTAGGCAAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 7015520 5' - roo 9045 1 54.46 TTTGTGTTTTGTGCTCCGTTGTTACATTTTGTTTGTTTTTGGGAACTTTTCACATCAACTTCTTTGGTGGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 10576764 5' - roo 9063 1 66.34 CGTAGGGGGTAGCATCACTTCACTCGAACTTTCTTTATTCCCGGGGTAATGAATTGTAAATAAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCA:1 - chr2R 2124624 5' + F-element 124 1 67.33 TGGCGTGCCGCCTGGCGGGTCGCGTTTCGTCCTTTTGGGCCTATCCTTGTCTATTTTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3R 30326271 5' - pogo 2085 1 64.36 CCGCCGGAAACAGGGGGGAAATGTAAAAAAGCAACAAATAACACACAAATAAACTACTTAGCCACCAATACTTAATGTATTAGCGTATCCTTGCACTGGAA:1 + chr2R 979673 5' + Porto1 4576 1 76.24 AATACCGACAACTGCGGAGCGTCCGGCGGACAATTAGCGAATTTCCGCGGACCACTTCGCATCAGGGAAAAATGGTCGTATGTAATGATGAACTCTCATTA:1 - chr3R 6187759 5' - 412 494 1 79.21 GTTGGTGCTGTTGTTGGTGTTGCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr3R 15899502 5' + hobo 54 1 77.23 GGCAAAACTAAAGACGGAAGTCGGCAGACATTAGTGCCAAAAGTGCGTCACAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3L 13570467 5' + hobo 25 1 54.46 ATGGTGTTCAAAAAATCGTATGGAAGAAATACTTAATAGGACTTGAAGGGTATCTTTGCTTATTGACACTAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATA:1 + chr2L 18736144 5' + Doc3-element 191 1 73.27 AAGTTGCTCCAGCGAGTGGTGAATGGGGCGACTTTTGCGATTCACAAATCGTTGGCACGCATCGGGCATTGTAAAATACCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 12217399 5' - roo 398 1 65.35 TTCCAGGAGTTCGGTGAAAAAAGTTACTTTTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr2L 15798638 5' - roo 9028 1 69.31 GCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACA:1 - chr3R 15790068 5' + flea 4742 1 65.35 TTTCCATATCGCCCATTTGCCTACGCCCAACTCAATGCCAATCAATGTCACGCTGTAATGATGAACTCCCCTTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3L 15056916 5' - 412 7520 2 52.48 CGAAATAAGCTGGCTGTGGCCTATAAATCACGGACAGCTTTCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 - chr2R 14402313 5' + Tabor 6874 2 56.44 ATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:2 + chr2L 9672427 5' + 297 42 2 71.29 AGCGCTTACCAACTGGAATAAATCAATTCAAGTATGCATTTGGGAGCAAATACATGCATACCCTTCAATTATCTTTGCAAGTACGGATTATGAGCGGAGTC:1 + chrX 18975516 5' + diver 1 2 78.22 AGAAGGTTACGTGAAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 + chr3R 11080660 5' + I-element 1 1 75.25 CACTCGGAAAATGTTAATCAATTTGCCGGCAGCAAATACATTTTGATTAATAGCCATAAACATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3L 12258281 5' - roo 394 1 63.37 TTAATAAAGAAATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGC:1 - chr3L 27395603 5' + invader4 2920 2 62.38 GAATTAGCTATATTTGAAGTTACTTTTCTGATGCGTAAATCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr3R 7879831 5' + 1360 39 1 64.36 CGAGAGTTCGTTAGCCACCAATCGTTTTTTTACGTTTTGGTTATTGTTAGCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAG:1 + chrX 157183 5' + I-element 2 1 75.25 GCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 + chr3L 8044321 5' - mdg1 7420 2 62.38 AGAATGTGGTGGAATAGCACACCAGCATTTCTTCGCTCCAGGCACTCGACTCTAAATCTGTTTATGCACAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:2 - chr3L 18523685 5' + 412 8 2 71.29 TGAGGAGCTGCCGAGATTGGAGGGGAATGCTACGAATAAAATTTCATTAAATACACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chr2L 12888798 5' - 412 7524 2 56.44 CCGAGGCATGTGAGTCACAGCAGCAATCATTTCCAATGCAAAATAAAATTTCATTTTGTTTACTTACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTG:1 + chr3R 6116505 5' - Max-element 288 2 68.32 AATGAGATTGGAAAAGGAATGGGTTCGCATTGGCAGTGGTAAAGAATGTTCAGGCTGAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAG:1 - chr2L 19683925 5' + mdg3 217 2 60.40 GAGTGTAGGCGTGGCACCAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTT:1 + chrX 21667973 5' - Tabor 486 1 73.27 AGCTGGGATTTCTGATATGTTTATTCAGTGATTCTCGTATTTGACATGACCCAACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTT:1 - chrX 21558619 5' + invader4 2756 1 55.45 CCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGT:1 + chr3R 15130459 5' + Max-element 8252 2 54.00 CGGCTTTTCTGCCTCGCCGTTTCATGTTTTTGAGCACTGCACTCATTTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTAC:1 + chr2L 13578481 5' - roo 8728 2 78.00 TTTTTGTGTTTTGTGCTCCGTTGTTACATTTTGTTTGTTTTTGGGAACTTTTCACATCAACTTCTTTGGTGGCTGTAAAATCCCGAATGAGAAGACTTTAC:1 + chr3L 10576762 5' - roo 9065 1 68.32 AAAGGCAACTGGCAAGAATGCTTTTAAATTTGACACACACACCGCACACACACACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:2 - chr3L 17691402 5' - 1360 3366 1 54.46 AATTGGCATAAAATTATACAGTAAATTGGTTCAAAAAAGATCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:2 + chrX 11299975 5' + roo 8700 2 61.39 TTACTCTTGTTTTGTTTCTAGATTATTTGTATACTTTTGTTTTCGGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2L 8898961 5' - roo 395 1 66.34 CACCATCCAGAATGTTCCAATTAGATAAAGACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATAT:1 - chrX 14894736 5' + I-element 5011 1 72.28 GAAATCTGTGGTTTGTCGACTTGGAAATAGGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 + chr2L 13642696 5' - Tirant 8461 2 70.30 CAATTCAAAATACCTTTTTGTCTCACTAAACTGGTTATTTATTCAGGGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGA:1 + chr3R 11078069 5' - I-element 322 1 54.46 AAAAAAAAAGAGCCAACCAACTTAACGCCTACTGTTGTCAAATGTTCACTAACCTATAAAAAAATACACTCTATTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAG:1 - chr3R 9890896 5' + Max-element 8240 2 74.26 AGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 + chrX 17492877 5' + Tirant 8129 2 59.00 AAACTCCGCGTCTCTTGGCTCACGTGCTCTTCTGGCTTGTTTACGATTCCTACATGCCCAGGAATCTGTTCCTGATGGAAAGCGCCATGCAGTCACATATA:1 + chr3L 24155305 5' - baggins 5244 1 50.50 TCTTTCGCCATTCGCCTCCCTGGACACTAGATGTCTTCGTTGACTCTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTA:1 + chr3L 11748726 5' + Stalker2 33 2 54.46 CAGGATATTACAGAGTGCGGCATATCTACATCCCCAATCGATGAATGATGGAGGGCCATTTTTCTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACA:1 - chr2R 18501005 5' + I-element 4939 1 59.41 CGCCCACAAAAGCCCGAATGCATTCGCAATCAGATTGAATGGGTAAAATAATAGAGGTAAGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAAATTGGGGGTTTT:1 - chr3R 30285786 5' - Doc2-element 484 1 54.46 TTCAATCAATGAGTGTAGCTGTTTCGTAATCATAAAGAACAAGGAACGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAGCAGCGGTTTGCACTATGGGCATCG:1 - chr3R 19448841 5' - diver2 90 2 67.33 AGGGAGTGTGAGTGGAAAACATACACATTCATGGATCGGACTGCTTATGTACAATAAAAGTAACAACAACAGTAAACACAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAA:1 + chr3L 10679074 5' + Bica 429 1 81.19 TCTCAGCTTGCCGGCCCTTTGGCAGGATGTTCACACATGAACTCGTATATATTTAAAGA:1 + chr3R 19450204 5' + roo 11 2 86.44 TCGAGAAAATGTGTACAGCAAGGAGAAAATGGTTTTTTAGTTTTAAGCCTAGCGTGGCATTAATAGGGATTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr3R 7879917 5' + 1360 6 2 73.27 GTACAATTTTTGGATATTTTTGACGGCCGTTTTACGAGCCATAGTTTAAGTACTTTTAGCTTTAAAGTAACATTGTATGAGAAATTTTTTAGCATTAGTGG:1 + chr3R 28536939 5' - TART-B 10170 1 82.18 AAGCGCAGAGCATGAAACGGAAATGAATCAATTTCCGTGCTGCAGAAAATAAAAAACATAACAACAAGACAAGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGAC:1 + chr3L 10624505 5' + I-element 170 1 57.43 GCAGGGTGTATATAAAAGGAATTATAAATATGTGTATTTGTACTCAGGTAAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAA:1 + chr2L 23173754 5' - 1360 3092 1 51.49 CCAGCCTGCGTGGCATATATGTTTATCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCCCTATATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATC:1 - chr2R 4287887 5' - rover 7282 2 61.86 TAAGAAACTCCAAGTATCCTGTAGCCATTAGGGTATTTTTCGCCGCAGTCAATTCTCACACACTAAGGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:2 - chr3L 8256156 5' + jockey 19 1 63.37 AAATAATGATTTGATGAGCTGTAACCATTTGTAGTCTCGGTATATTTTTGACTTTAATGGCCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr2L 14993377 5' + 412 15 2 60.40 TAGTTGTTTTTGTTACTTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chrX 3295683 5' - hobo 2913 1 51.00 AAAATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:2 + chr3R 13620275 5' + Doc 44 1 69.31 TCACATCTTGCCACCGTTTTATTTATACACACGTACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:2 - chr2L 9854180 5' - hobo 2896 1 67.33 GTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:5 - chr2R 17348632 5' + jockey 20 1 62.38 TTCATAATTTGCCAGTGTCTGCCGGATGGAGTAAAATAAAAGACAACGAGAAGAACGCTATAGTCTACTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTA:1 + chr2L 21744090 5' - INE-1 544 1 60.40 AGCTGGCCAAGATGACAACACGGATGTTGATGCATCCAATTAGGCGGGCAATTACCGAGCACCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1 - chrX 19034201 5' - hopper 1402 1 66.34 GATTAGGTATGCTGATCAGAAGCGGTACTGAATAGTTGAGTCAAATTAGTTAGTGGTGGATTTCAATAACACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTT:1 - chr3R 15565285 5' - Max-element 8528 2 71.29 GCGAGCCATTGAAATGATAAGCACACATTGTAGGATATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chr3L 13356085 5' + hobo 38 1 61.39 CATTTAGAATGAGGCGACGTGGTGATTGATGCTGTTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCTCATGGGTACTGATCGGCCGAGAACTTGAGCTGCATA:1 - chr3R 9441863 5' - Quasimodo 6963 2 69.31 TCTGCAATTTATTGATTTATTACAGTGCATATAGAGCGCATAATTTATTACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr2L 3483582 5' + I-element 25 1 55.45 CACGTGTATGCGTGTTTTACCCCTTTGAGAACCAATCGAATTTATGTGTGAAGCCATGGAGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chr2L 13038774 5' + hobo 17 1 62.38 GCCTTCATCAGCCATATCTAAAAATTAACAACCCATAAGCTGGTAATTAGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACA:1 - chr3R 7639854 5' + HMS-Beagle2 24 2 53.47 TCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGA:1 - chr3R 15790076 5' + flea 4734 1 57.43 CGATACCAAATCCCCTTTCTGTGCAATCAGTTAAGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 - chr3R 12544414 5' + hobo 55 1 66.34 CTATCATCAATAGTTGTTGTTGTTCTTGATAACACGGCCTGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 + chrX 13640241 5' + P-element 35 1 43.00 GGCAAAAGTCAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGT:1 + chr3L 5267208 5' + Juan 3994 1 54.46 ATGTGGAGTTTTGCATAAGCCAGCCGAGTTAGCCGGTTAGCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr3R 31768694 5' - roo 9036 1 63.37 AACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chr2R 22746087 5' - hobo 2895 1 65.35 TTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 + chr3L 25884102 5' + Doc 52 1 72.00 TAAAGTTTTATTGTGGCAGCGCCGTAGTTCTTTCTTTTTCCCTCCACCTCCATATCTACCTCTCACCAAATGCACCTGAAAAAATAAAATAAAAACAAATT:1 + chr3R 20292041 5' + HeT-A 320 2 63.37 CGGTGATGGGAAGATGCTGGGCGACACGGAGGCCGATGATGGCGCCGATTGTATGATTGTCCAGTGGTCAAGTAAGGAGTCGGAAAAACAATGATCAGCAG:1 - chrX 9695141 5' - TART-B 325 2 53.47 GCCTGTTTAGCTTGTTTGTAGGTTAGTTAAAACTTCAATGTTCTGGGCATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTAT:1 + chrX 13852909 5' + Stalker4 30 4 63.37 AAAGATTAGTGCCAAATTTATTATTCTTATTTTTAATTTTTATCAAATAGAATTTTCACTTATTTATTTATTATTCTTCATTTTAATTCGTTTTATTTTG:1 + chrX 4430336 5' + 17.6 7323 2 78.00 TGCTCTTTTACTATTCATGTTGAGCTTTTGCTTTGAACACCTCTCAACGGATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr2L 21018783 5' + 412 7077 2 60.40 AGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chrX 21219482 5' - roo 9029 1 67.33 TGGTCGCTTGACAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr3R 29361004 5' + 412 7072 2 56.44 GAAAAACAACACCCATGACGTGGGGAACACGTAGAGGAACAAGCAGTGTGGGCACCTATAAGGATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 3535361 5' + roo 8677 2 64.36 CTTATCACGCTCCAAGATAATAAAAGTTAAATAAGATAAAAATTGTGTAAAAACGATGAGAGAAAAAGAGAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGA:1 + chr3R 19514946 5' + 412 379 2 76.24 GAACAAATATTCGAGGAGATACAAATACTGACATAGCATAGGGATATTGTTTGCTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 + chr4 294588 5' + 1360 25 1 74.26 TTGCCTTGTTCCGAGGCACAAACATTCCACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCA:1 - chrX 22664454 5' - opus 493 2 73.74 GATGAAGGGGACAAAAAGAAGCCAAAGCCCACACCTATATACATTCGAGAGAAAAGCTCGAATGTTTTTGTAAACAAAATAATTGAACTTGTTGGAAAAGA:1 + chr3L 25552483 5' + Fw3 33 1 85.15 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTTTAATAAAGAAATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCAT:1 - chr3L 23730762 5' + invader4 2887 2 70.30 GGCTTTTCGATACCCTTCTAAGACGTCGGTAAGATGTTAAAAAATGTTAGTATCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCG:1 - 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chrX 22590219 5' - Burdock 225 2 58.42 GCAATTAAAATTTCTTACGGCTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3R 13376297 5' - 1360 3385 2 55.45 ATCATGCACAAACAGCCGAGTGCAGAGTAGAAAGAGACGGGTAGCGGTGGACGAAAGAGACGGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGC:1 + chrX 21565883 5' + invader4 2939 2 69.31 TTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCA:1 - chr3L 11257391 5' - 1360 23 1 47.52 TTGCCAACTTCCGGTGTCCAATCGCCTGCCAACTCTTATTTTCAAATTAATTTCCAAGCCATGCCAACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr3R 14991660 5' - hopper 1407 2 71.29 TTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chrX 5168854 5' + hobo 40 1 61.39 AGCGCTTCAATAAAAGATTATCGAAAAGTGCCACTTTGTATGGAAAAGAAATAGTTTCAACAATTAACATTTTTTACTTTACTTTTTTTTACTTTACTTTA:1 - chr2L 13079401 5' - TART-A 13136 1 31.68 ACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2L 18417323 5' - roo 9018 2 78.22 ATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr2R 1725934 5' + Doc 40 1 60.40 GAGTACGAGTACTACGAAAAGAGCGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGA:1 + chr2L 14277855 5' - Tirant 8433 2 74.00 CATAGGAACTTATCTATTCTATGGTCAGTGTAGTGCTTCTGTTATGGTCAGTCCAGTACAATTATCCTGGTTGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAA:1 + chr2R 20593621 5' + copia 303 1 76.24 TAATTGCGTGCACTTGTCTGTTGTTGGTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr2L 12888858 5' + 412 7104 2 73.27 CATTCGAAAGGATAACGACTGAGAAATACCCGTTAGTGATGCAAGTTTTTAAATGATTTGAGATACATATATATATGTCGCCGAAACAGGAGTCTCATCCA:1 - chrX 16906773 5' - invader4 321 2 73.27 AAAAAAGATACTAGGGACTTGAAACTATTTTTTGTATGCCAAGACAGAACTAATTAAACAATCCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 - chr3L 7266602 5' - mdg1 408 2 61.39 GAGCAGTGAATTTAAGGCACCTGTATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCC:1 + chr3L 23342572 5' + Max-element 51 2 80.00 GATCGGAACAGACCAGATGATCATAGGATCACAGGATGAAACGACCTACCATAGACCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACAT:1 - chr2L 1011195 5' + I-element 4948 1 52.48 ATATCTTCTCCCTTTGTGCCCTGTGTGTGTGAAACAAAAACGTTTGTTTCAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr2L 3842828 5' - roo 9046 1 53.47 AAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATA:4 - chr3R 20240928 5' - Tabor 439 2 70.30 GAATTTGAACGATTGAATAATGAAATTAAATTTATGAAAGAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACC:1 + chr3R 19449703 5' + I-element 230 1 60.00 TCTCAATTTTCACATTGAAAACTAAGCGCCTGAGGAACGATAGAGCCGCCCCTCAATAGTATCATCCATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr2R 16384399 5' + roo 5 2 72.28 GCAGAGTCTGCAATCGTAAATTTCACAAATAATTTAAGCTCAATTAGTTGAACCAAAGACCCTAGAATAACGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCT:1 - chr3L 24162188 5' + 1360 3007 1 73.27 TGTGGGCTATTGACCATGAACTTGTCTTATTTTATGGATTCAACATTAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGG:1 + chr3R 31941403 5' + I-element 4936 1 71.62 ATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 + chrX 10196095 5' + 297 35 2 66.34 CAGCGTGAGCGAGGGAATCTCGCTCTGCTGAAAAACACCTCCATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chr2L 19572659 5' + P-element 35 1 42.57 GGAAAAGAATGAAGACTTATCCAAGGAAAAGAGGAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGTATAGCAAAACAGTTGTACAAG:1 + chr3L 5585437 5' + Bica 407 1 76.00 AGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 - chrX 21945930 5' + F-element 41 1 57.43 GGGTGAAGCAGGCTGACATATTTGATGAGGTTGATTTATCACATTTGAGTAGTGTGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTC:1 + chr2R 3603576 5' - Doc2-element 390 1 58.42 TTATTCTATACAATGTACGTATAAGGATAGCTAAACAAAATGTTGTTTATTATATGTAAATATACGTGTAAAAATATGGAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTC:1 + chr2R 5780149 5' + INE-1 34 1 51.49 GTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGC:1 - chr3R 934249 5' - Rt1b 4743 1 46.53 AATCTGTACTTTTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACA:3 - chrX 10298060 5' + Quasimodo 32 2 63.37 ATTAACGCGCCTTGAATCATCCTCAAGTTGGCACTTGTTTCGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTTGCTCGCGTTGTCGCTGAACGCGAGTGTCGTTCC:1 + chrX 9039196 5' - Doc2-element 289 1 66.34 TTTTGCTATTATATATATATTAAAAAGATTATCAATTTGCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 - chr3R 25692802 5' + jockey 4708 1 65.35 CCTAAGTCGAGGAGCAGCGCTGCCGGCATAGCCTGCAGCGCAGCAACGCTTATATGCGTATCTTATATATATGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTG:1 - chr2R 2308852 5' - Quasimodo 7365 2 78.22 TGCTAATGATATGTTTAAACATACATTTAAGATGCTATCTTAATAGTTTATAAAAGTTGCTAATGTGCTAAAACCAAAATTGTTCATTTGAAACTAAAGC:1 + chr3L 12037129 5' - HMS-Beagle2 251 2 77.00 AATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 18417304 5' - roo 394 1 55.56 TGGAGAGAAAAAAGAAAATTAAAGAAAGTTAAAACATTTTTCAAAATTATTGACTTGCCAACATTTAAAAGTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGG:1 - chr4 488124 5' - jockey 4778 1 77.23 CTTTTAATCTCGGCATTTATCTGAGTGAAGTTGCCCGGCCATCAATGTTAGTGTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr3R 11186867 5' + hobo 6 1 65.88 CAGCTTGGCATTGTTACTTAATGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:2 + chr3L 12217332 5' + roo 8719 2 83.17 AGGAATCTAGATTCGGCAATCCGAGCTTATTTAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr3L 15869716 5' + pogo 40 1 68.32 TTAACGAAATATAAATTAAAAAATATGCCCTACCTCTTCGCTGAGCGATGAAATAAAAACCAGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 - chr2R 20075452 5' - mdg1 7444 2 61.39 TAAAATTCTTTGGTCCCCAAATTACTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr2L 21631838 5' + pogo 43 1 73.68 CACAACCTTCAACAACGACACCACAATCCCCACCAACAACAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACATAACAACAAGACAAGGCTCAAGCCCTTAACCAACAA:1 - chrX 4244906 5' + I-element 163 1 59.41 CAAAACAACGACGAAACCAGTGCTTCGATTGCAACGTGTGCGACCTTCCTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTG:1 - chr3L 20687024 5' - Quasimodo 244 2 56.44 AGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAG:1 - chr3R 15790061 5' + flea 4747 1 71.72 TAGCACTTGCATACTTTTGTGCTCCATTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCATCGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 + chr3R 19513371 5' - jockey 4951 1 72.28 TGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chrX 10196099 5' + 297 39 2 70.30 GGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chrY 311346 5' + 1360 70 1 77.23 ATGTGCTTCTGGGCTCGATATTGTTTATACACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCCAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACA:1 + chr3L 25484566 5' - invader2 4842 1 79.21 GAGCGCGGAGGTGGCGGGTCTGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chrX 14953611 5' + P-element 56 1 24.75 GAGGGCAGCATCAAAAAAGAGGCGTGCATTCAGTCCGATTACGGTTACGGTTACTTTCTCCTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACC:1 - chr2L 13484847 5' - invader2 4683 1 59.41 GTGCCTTTTCTCCCCTACAATGGGATGAACCTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chrX 22664369 5' + opus 7045 4 68.32 ACTAGACCCCACTACCTATCAAGATATGTTGATAAAACCCGTTATAAAAAATAACTCGAGTCCAAGGTCCAGAGCGGTACCGTTAGTTCACGGTGCGTCTT:1 - chr3L 25502524 5' - gypsy8 166 2 56.44 TGCAGTCAAAAAGAACAGAGCTACAATTGCCTATATTTTTTTTCAACTCGTATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chr2L 22342234 5' + F-element 42 1 58.33 AATAAAATGTATTTAGTTTAATAAATATTACTAAATTGCTGTAATGATGAACTTCCCGTTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 - chr2L 21018852 5' - 412 454 2 53.47 AGAGAAATCTGCGGTGCCACACACACACACACACACATTCACA:1 + chr3L 6015074 5' + accord 7034 2 72.09 TCGACTCTACGGTTAAGCACAGTACAGTTTTCTTTGGCCAAGTACTTTTATTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTAC:1 + chr3L 25255298 5' - GATE 415 1 61.39 ATTCCTGCTGGGAGAGCGATGGGTTCCAGTGCAACATTATAACATAATCCGCATAGAAGGACTTCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1 + chr3R 16110152 5' - mdg3 233 2 65.35 GATAATAAATTTTTGTTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACCGCCATGCCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCTCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATT:1 - chr3R 4583046 5' - Cr1a 4391 1 76.53 CGCTGGGTAATTTCAAAGATGTACATACACATATATTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTT:1 - chrX 14121203 5' - F-element 4635 1 68.32 GGAAATATATTATTATTAATAATACAACTAAAAAGTTAAGAATGATACTAAATAGATTGCTGAAATTTAATATTTAAAATAATAAACCTTTAACAAACTTT:1 - chr3R 19496135 5' + FB 399 1 72.28 TGCGGTTGCCTTTGGTGGCATAAAATGCTTACATATACATATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTG:1 - chr3R 25859427 5' - Stalker2 366 2 66.34 AACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 19450184 5' + roo 8717 2 51.49 AAGCCCTGGTTATTAGACTAATGTCGAACTTAAAATCCAATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTA:1 + chr2R 20593346 5' - copia 5088 2 61.39 ACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTA:1 - chr2L 16379009 5' - HMS-Beagle 214 2 58.42 GCTTTTGTGCAGCGGTTCAGAGCACCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAAT:1 - chr3R 801663 5' - 1360 202 1 77.23 CGTCTCCGTGTGAGTGAGCATCTGTGTGCGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3L 15056974 5' + 412 7102 2 75.25 TTCAACAGTTGTATATTCTGTGCTGGGGAATAATGAGTTTACGTAACACAAAGTACATATACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3L 4539242 5' + roo 14 2 63.37 CAAACACACACTGTCGTCAGGCAGAACAGATACATACACACGCACGCATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACCCAAGCAAGCAAATTCTATTT:1 + chr3R 7123083 5' + 1360 3261 1 61.39 CTCGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chr3L 8044297 5' - mdg1 7444 2 63.37 GTCGTCTCTCCTTCATGTACTCATCCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCATTTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACA:1 - chr2R 965350 5' - Bica 4861 1 73.27 TTGTAAGGCAACTAAAAGATGTGTCTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGA:1 + chrX 5130959 5' + I-element 3 1 76.24 GAGTTATCTCAAGAATCTCACTTCAGTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTT:1 - chr3L 3555830 5' - Doc 253 1 74.00 CTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTC:1 + chr3L 5267239 5' + Juan 4025 1 75.25 CACTGCACCTGAGCAAATTGACTTCTGCAATCGTGTTTTCTTTTCAGCATGAAACAAATGAAACCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCA:1 - chr3L 1985384 5' + Max-element 15 2 63.37 AACCAAAATATAACAAAATAAACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCA:1 + chr2R 3545513 5' + F-element 340 1 77.17 GGGCGGGGCAGCTCTCAGTGTTCAGTCTTGTAGCTCGCTCGCTTAATCCTCGAGTGCCCGAGGGGCTACAATGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chrX 21219397 5' + roo 5 2 75.25 ACATATGCACAGTAATCAATGGATTGATTATTATTGTTTATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTT:1 - chrX 8037691 5' - roo 9037 1 67.33 ATTTTAATCACTATCACAAAGTTTGCAAGCCCACTAATTTGAAGCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chrX 3330435 5' - pogo 2071 1 64.36 GTGGGGCTCTGTGGAAAACTCAACGTAAATGAAATGTGTTTTGCGGGCCGCTGCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1 - chr2L 20228217 5' - hopper 1394 1 56.44 CAGCATGCGTGGGGATGTAATAAATTTATTAGTATCCCAACCCACCGCCTTGCTGCCACAGCAAAAGATGCATGGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGA:1 + chr3R 17980710 5' + HMS-Beagle 6795 1 70.30 GGAGATTGCCTGCAGGAATACCCGGAAAACTTGTGCCTTTTCTCCCCTACAATGGGATGAACCTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:2 + chrX 22664337 5' + opus 10 2 69.31 ATCTGTTTGTAAAACCACATGACCAACTTCTTCGACTTGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chrX 20835274 5' - roo 9036 1 61.39 GGTAACAAATGGAGATCATATAGAGGAACAGAATGTTTATAGATCCAATTCACCATGTACATTCAAAATGTGTATAATATTGTAGTATGTGCATATATCG:1 - chr2R 14647593 5' + blood 7010 1 74.00 TTTATACAACGTGTTTGTAAGTTGTAAATAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr3R 1142132 5' - 1360 3343 1 74.26 CGGAATGTGTCGTATATTAATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:2 - chr3L 22162703 5' - roo 352 2 82.18 CTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAA:1 + chrX 21668027 5' - Tabor 7271 2 75.25 GTATTTGCCAGTATGTGTCAGTGTCTGAGCGTGGGCTACCTAGCCTGTCAACAGAATGACAGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3L 13644590 5' - hobo 2924 1 64.36 GTTTTCACATTTACCTTATGCCCGCCCGTGCGCCAATGCTACAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACA:1 + chr3R 21591953 5' + Bari1 32 1 58.42 CTTGCAACACATTGCACACAGGCAGAAGCAGCAACAGCAATAGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chrX 7429427 5' - hobo 2907 1 56.00 TTAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:1 - chrX 21668093 5' + Tabor 6853 2 65.35 CTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:2 - chr2L 16379008 5' - HMS-Beagle 7009 2 59.41 ATTGGAAATTTCCTTGGAATAATGTTTGTTGTGTTTTTCTTTGCCACTCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTAC:1 + chr3L 3070541 5' + 1360 3236 1 53.47 ATTTATTCGCAAGCCGAAACATTGCAGGTGAGTAATTGTTGTATTCTGGCTGGGGCTTGTTGTGGACTTTGGATGCGTGCCACTTCCAACATGCATGTCCG:1 + chr2L 17207315 5' - TAHRE 9991 1 77.23 GTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 + chr3L 8044305 5' - mdg1 398 2 55.45 AATCACACTTATGCAGAGATGCGTGTATGTGGAGAGTGATAAGATTGGGAGGATCATGTAAGAGAGAACGCGCTCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr3L 24515437 5' + pogo 3 1 76.24 CCCCTGAACCTCCCCCTTTTGCGTATACATGACTAATAGCAGAACTAAACGATTTGATGGACGCCGAAAAATGAATATATGTGCTCCTTCCTTTAAAT:1 - chrX 5532347 5' - invader3 5442 2 71.43 GGAAGGTGGGGGGTTTGCATTTTTCGGGTCGCATGGGTTTCGGAGGGGGGAGGGGGGAGAAGGGGGTGTGTGTGTGTGGATTGGTTGTGCCCGG:1 - chrX 12701208 5' - Ivk 5055 1 81.91 GAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:2 - chrX 21668081 5' + Tabor 26 2 53.47 AATATTTAAGGGCAGTAACAATTATTAAATGATTCTGGGCAGCACAACTTCATGTTGTCACCGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTT:1 - chrX 17387890 5' - flea 4636 1 53.68 GTGGAAGTAGCTGGAAGTGTTAATTAGTTGTTAGTGTCTCCGCCTGCCCGTCGAGGATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 + chr2L 8469566 5' + Transpac 4935 2 64.36 CTGTCTCAGTGCTGGCAAAGCTTAATATGATGGGTATGCTTAAATATGCATTGCAAAAATGTAAGCTGCTTTCATTATATGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr2L 5654933 5' + roo 8665 2 78.22 GAGCGTGGGCTACCTAGCCTGTCAACAGAATGACAGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 + chr3L 13644616 5' - hobo 2898 1 65.35 TCGTGCATAATACAAATAAATCAAACCCAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTT:2 + chr2R 2144956 5' + Stalker2 7298 2 70.30 GAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAA:1 - chr3R 15790060 5' + flea 4750 1 73.27 GCCCGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:2 - chr2R 17348636 5' + jockey 16 1 64.36 TTAAGCCAAAGGGATGCACACTTAATGCATGTTAAAATTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chrX 12166523 5' + pogo 36 1 65.35 GGAGTAGTTCAGAGCAGGGACCCAAAATGAGAGTGAGAGATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTAT:1 - chr2R 14004407 5' - Cr1a 4319 1 63.00 GGGGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:2 - chr3L 22231378 5' + Doc 40 1 68.32 TAGCTCGCTCGCTTAATCCTCGAGTGCCCGAGGGGCTACAATGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chrX 21219427 5' + roo 8698 2 62.00 GACATGCAATCCACGAATGAGGAATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACG:1 + chr2R 3357793 5' - Burdock 6311 2 77.23 AGCAAAAATCAAAACAATAAAAAACTAGAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAATGTTTAAGACCGCTCAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAA:1 + chr3R 1966452 5' + mdg3 5153 1 71.29 ATCGCTCACGTAGATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 + chrX 3446532 5' + I-element 41 1 70.30 GCTGGGTCATCTAACTGTGTTGTAATTTTTGAGATATTTTCACAAGAGGGGTTACTTAAGAATTTTAAAAGACTATGTGTACCAAATAATAGAGATCTAAT:1 - chr2R 2880104 5' - Ivk 5177 1 78.22 AAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 + chr3R 11080675 5' + I-element 16 1 62.38 AGGTGGGGGTACCCAGGTGAGAGCAGGTGGGGTACACACACACACACACACACATAT:1 - chr3L 14284894 5' + accord 183 4 94.74 ACATTTTACAGTGAAACATTTGAAAATTACATGGTTTACATGGTTTGTTGTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCT:1 + chr3R 9069994 5' - I-element 65 1 56.44 GGAGGTGTAGGTAATTCCTAGCTTAGGTAATGATAACGTCGAACGCGTTGCTCTTATTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 - chr3L 15353603 5' - mdg1 404 2 62.38 AAACCGAATACCACATTCCGACTTTTGAGCCGCCTGCTCCAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 - chr3L 14205396 5' + P-element 36 1 43.56 ATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTATTC:1 + chr4 1294992 5' - TAHRE 10405 1 68.32 GCCTAAAATAATGCCAAAAAAGGACTTAACTTTATTGTAACTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chrX 8326291 5' + opus 31 4 59.41 GAGGCACAAACATTCCACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:3 - chrX 22664442 5' - opus 479 2 60.40 AGCACCTTATGAAAGCCATAGCCATCATAGTGCAGGCAATTGCTAGAATAAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 20182966 5' + roo 24 2 54.46 GTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGG:2 - chr3R 15790103 5' + flea 4707 1 80.20 TAAGATACCCTGTGAATATTTTGTACATCTAAGTAAAGACATGTGTAGTATGTGCATGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chrX 6162148 5' + blood 37 2 60.40 GTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTT:1 - chr2L 23295875 5' + micropia 4975 2 56.44 GACATCGCCCGTCCAAAGGCAACTGGCAAGAATGCTTTTAAATTTGACACACACACCGCACACACACACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3L 17691416 5' + 1360 9 2 66.34 TTGCCATGCTGGAGGCAACTCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 + chr2L 13038717 5' - hobo 2883 1 78.22 GCTCCGACTGAAGCGGCCAAAACATATGTCGCAGTGGGCTGCGGTTTTCCACTCAACGAACTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 16398918 5' + roo 13 2 62.38 TTAGCTTAAAACTTGCACAGTTTCTTCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGT:1 + chr2L 9624558 5' - transib2 2776 1 73.27 TATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATTCGGGGAA:2 + chr2L 22092974 5' + INE-1 555 1 57.43 GTCCCAAGGGGGTAGGTAAGCCTGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAG:1 - chrX 22713786 5' - Tirant 141 2 77.23 TTTTGGCCAACATCATCAGCATCGAGTGCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr3L 5321138 5' - mdg1 7416 2 68.32 TTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAGAA:1 + chrX 7480761 5' + Bica 340 2 63.00 AAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 + chr3R 19515804 5' - 412 7512 2 58.42 CTAAAAAGCGGCAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr2R 17277640 5' + jockey 24 1 42.57 TAAGTGTAGATTCATGGGCGGCGCACCGATCATAGCCGATCCCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACA:1 + chrX 21519589 5' + G6 1868 1 59.41 CTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr2R 981626 5' + 1360 3 2 60.00 AAAGAGAGCACGCGCACACCTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 - chrX 13640286 5' - P-element 2833 1 26.73 ATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCA:1 - chr3R 2424350 5' + Ivk 5051 1 57.43 ATTTTGCAGTGACTGCTAAGCCTTTGTCGGACCTTTTAAGGCAAAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCGTTCGACTCGAGA:1 - chr3L 23866784 5' - Ivk 5308 1 57.43 GTTGCAGCCGATACCAGAAAATCGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACA:1 - chr2R 594146 5' + gypsy5 6990 2 74.00 TGTGTGTGCCAGCAGACACTTTATGAACACACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr2L 8898886 5' + roo 44 2 69.31 AATGTCCGAAAACCAATCGCATTTAGACGGTTTGCATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr3R 11936900 5' - roo 9031 1 65.35 AAAAATATATGCATCGCAGTGCATCGGTACTCGCTTCTAAGTTGTTGTTGTTGGAGATTATTGGTCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCA:1 + chr3R 1292587 5' - 1360 45 1 67.33 TCGGGTAAGGAGTTAGAAGTTATGAAAAAGTACATTGACTTCGCTGACACTTGTCAGCGGCACTTGTAACTTGTAAGCAAAGATAAAGGGTGCCTTGTTCG:1 - chrX 19820356 5' - 3S18 29 2 56.44 CATTGAGGGCGTGCCTAAAATAAGGGGCATACTGGAAAAAACATAAATAAGGGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATC:2 - chr2R 25216610 5' + 3S18 27 2 54.46 TAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTC:1 + chr2R 4577094 5' - Chouto 471 1 71.29 AGGTAATAGCTATTCGAGTGGCCCCTCAATTTGCCCGCTTCCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTT:1 + chr3R 22514470 5' - Quasimodo 6954 2 57.43 GGCATCTATTTCAATTTCCCCCTGGCAATTACGAGGCAGTCGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3L 15729675 5' + hobo 34 1 57.43 TCTGTTCTCCCTAAGTTTTTTTTTTTAATTTTATTTTCTGTAATCATCTCCAAACTATAACCGCTCAATACGCCCACATTTTTTGGCAAATCGATAGAAAT:1 + chr3L 25255906 5' - INE-1 310 1 60.40 ACAATTTTTTTTTATTATACTATCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr3R 30562321 5' - mdg1 366 2 80.20 CGTGCATTTCTTTCGCCATTCGCCTCCCTGGACACTAGATGTCTTCGTTGACTCTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAA:1 + chr3L 11748718 5' + Stalker2 7273 2 54.46 TTATCTTCGTAACTCGAAGGACGAAGCGACGGCCCAGGAATCAAGCATTTATTGCATTTTGTACGCCCTCCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCC:1 - chrX 5133062 5' + I-element 4883 1 65.35 TATTATCGGGCATCTATTTCAATTTCCCCCTGGCAATTACGAGGCAGTCGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr3L 15729683 5' + hobo 21 1 56.25 CTGGTTGCTAAATAAGGAAGCTCACAATTTATATATATGATATTTATGTTTTTATGTAAATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:2 + chr2R 10334720 5' + pogo 12 1 69.31 TGTTACTTATATTGTATTTACTTATATGTTATATCCTGTACTTCGGTGGAAACCATACTTAATAAGATAATCACTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3L 4539123 5' - roo 409 1 78.22 AATGTGTAGACCATAAGATACCCTGTGAATATTTTGTACATCTAAGTAAAGACATGTGTAGTATGTGCATGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chrX 6162135 5' + blood 24 2 55.45 AAACAAGTCGAAGATAATGGACAGAGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 8133970 5' + roo 51 2 79.00 TATACATATCTACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCT:1 + chrX 17492854 5' + Tirant 8107 1 81.19 CTCGCAGTGTATGTATTGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTA:1 + chr3L 24210869 5' - HMS-Beagle2 314 1 79.21 CCCTTGGCTTTAATATTACGTTTGTAGCCATTAAATTCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chr2R 9433682 5' + 297 6614 2 66.34 AATATGGTCACTACTGGTAACGATGCCCCTGGCAATAGTTGTATTCTTTTACTTCACTCATCCACCCTTTTATTTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATCC:1 - chr2R 8711218 5' - invader2 311 1 57.43 TTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAA:1 - chr2R 2868559 5' - Rt1b 4745 1 34.65 TTTCCATTTGCATTATAGCAGGCGTAACAGCCAGAGCTTGGAATCAAGTTATTACGCGTATACAAATATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr2R 11394212 5' - pogo 2097 1 68.32 GTCGCCTTTAGATTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 + chr3L 14205364 5' - P-element 2825 1 19.80 CCAATATGCAATATGCAATATATGAAATAGTAGAGAGTATTGTGAACCAAATAATAGAGATCTAATTGTGTGCAATCGATTGCAGGCGTCGAGAATATG:1 - chr2R 2878968 5' - Ivk 5144 1 57.58 ATTTCGGTAAGCGAGACAGTGACGTTGGAATTATTGTTTTGGCGAGAGCGTCAAGGTGAAATCCATTTATTCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr3R 24260260 5' - P-element 2883 2 76.24 TAAAGGCAGCTTGCAAAAAGAGACAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chrX 14960046 5' + Doc2-element 218 1 74.36 TTTGCCTTGTTCCGAGGCACAAACATTCCACTACTCTTTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAG:2 - chrX 22664455 5' - opus 7495 2 73.27 ACCGGAGTCACTTTTTTGAATTTAACCTCGATTTGGCCACTACGCGAACTTTCCCTTTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGCCAGAGTAAGTAATAAAA:1 - chr3L 25850902 5' - Gypsy6A_LTR 237 1 57.00 GCCTGAAATGTTATAAAACTTTTATTGAATGGTTCTATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chr3R 11549903 5' - opus 463 2 65.35 CTCTCCTTTCTAGCCAGGTTAGCGGCCCTTGCACGCGATGTTGTGTTTGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:2 + chr3L 9190427 5' - 412 487 2 72.28 TTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGATTGGACGTGTTCACAGAATTTGCGGATAAAACAAAAATGTAATTGTAATCCATCACAA:1 - chrX 9834667 5' + jockey 70 1 81.00 TAAGCGAACAATAATAATAACAGTGTAACTAAGTGAAAACTAAATAAACTTAATTACAACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGA:1 + chr3R 2302102 5' - Ivk 5164 1 61.39 ACTAATCTGCCATGGCAACGGACCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 + chr3L 5573545 5' - mdg3 227 2 61.76 GCTCATTCTCGCAAAATATTATGGCTTCGCTTCTCGCGCGCACTCTGCCGTCACTAGAATATAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTC:3 - chr3R 3620750 5' + 1360 50 1 51.49 CGTTGCAGCGACATAAATAAATAACATTCATTTCCGCCCCAACATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chrX 21219522 5' - roo 406 1 76.24 ATATTTGTTGAAGCTCATTGATCAGCTCCAACCTCACATGAAGAACGAATTTATTAAACGAAATTAACGGAAATGGCCAGATGGAGTCGGCTATTGATCCT:1 + chr2R 925330 5' - INE-1 96 1 70.30 TATCAAATAACTATCAATGACGTCCAAGGCCCGTAAACGCATGCATAAATTTGCACGCATAAAATCAAATCAAAATTCAACG:1 + chr3L 17159290 5' - Rt1b 119 1 65.85 ATAATTTTTTCCTCCACTCTCTCGCTTTGCTAATCCACTGTTGACATGCAATTTGATTCAATTATCATGATTTTGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCC:1 - chrX 9444355 5' - Doc 4382 1 76.53 AGTACACTGGCCCCACACTGGGACCCAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCC:1 + chr3R 20174507 5' + F-element 4389 1 74.00 CAAGATCGCGAGACGACATAAATTGTCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr2R 11399190 5' - 412 442 2 74.26 TTGGTCTAATTATGTGAAGCCCTCAAAACTTAAGTACATAAAGTATAGTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCG:1 - chr2L 20840280 5' - gypsy12 10167 2 50.50 TACTCTCATTAAAAGTGACTTTATGGGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCT:1 - chr3R 16110221 5' + mdg3 51 2 74.26 ATTGTTGGAAATGATTGCTATACAAGTAACATATGTTTTCGGAAATGCAATTATAACGATTTAACATTTTTTAAATATATTCTTGTATATATCTTATATAT:1 - chrX 10438199 5' - 412 268 2 61.39 ATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3R 19515802 5' - 412 7514 2 57.43 TTATGGGAAAAAATGTATTATTTTTATTTTCTTCATTAAATTTAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCT:1 + chr2L 13053187 5' + G2 313 1 57.43 TATATTTCGATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCGC:1 + chr2R 11246985 5' - 1360 126 1 48.51 TGGCGCCCGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:4 - chr2R 17348640 5' + jockey 12 1 68.32 GTCACACAGGGCGTATGCTTAATGTGGTTAAATGACGTTGTGGATTTCAATTGATTGGGTGGATGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTA:1 + chr2L 15151850 5' - Tabor 474 2 67.33 GGCTTCGCTTCTCGCGCGCACTCTGCCGTCACTAGAATATAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAACAGCTCTTTTCTACGCA:2 - chr3R 3620728 5' + 1360 134 1 70.30 AAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAG:2 - chr2R 5531208 5' + 1360 53 1 74.26 TTAAGAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCGAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTTTTTAATTTATAAGTGAAATAAATATTGTTT:1 + chr3R 19449980 5' + S-element 1601 2 69.31 CGCCCAAAAATGTGACGATATAGGCTCTCATACACGGCACTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1 - 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chrX 12649914 5' - hobo 2935 1 68.32 TAATAAAAGCGTGCTTCGCAAGAAAGAAAGCAAGAAAAAGGGTAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 27500495 5' - hopper 150 11 78.12 CTCATTTCTGACCTTGTTTCTAGGAATATTATATATTCAAGGGTAGTTGGTTTAATTCATGGTCCACTTTATTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 - chr3L 735129 5' - mdg1 7454 2 69.31 AGTAATATGAAAAAATAGATAAACCTACCATTTTTATGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chrX 18161450 5' - roo 9033 1 65.35 ACTGGGGGATAGGACAATGTTCAGCTTGGCATTGTTACTTAATGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3L 12217311 5' + roo 34 2 62.38 AAAAAAAAAAATTAAAAACTTTCCTCAAAAATGTAGGTGTGACAGTTTTGGGCATTTCTTCTAGACAATGCTAGATCGACTGAGCTATTGATCCTGATCAA:1 + chr2R 4743342 5' - INE-1 90 1 34.65 AGTTAAGAAAACCAAACCAATTTTAAGTATATCATAATTTATCTGTTTTGTTAACTCCTCAATACTATGGAATTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACC:1 - chr3L 13873138 5' + McClintock 6166 2 28.71 ATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGC:1 + chrX 21852447 5' - gtwin 7367 2 59.41 GCCCCGTTTCGCCAGTTGCAAATAGATTTCACGCTTTGTTTTATATTCCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:3 - chr3L 21998484 5' - roo 9045 1 53.47 ACCCGTACTCGTAATTTATGTTATTATTACGAAAATGCCTTTAAAATATGAATTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCG:1 + chr3L 14933642 5' - micropia 5222 2 64.36 ACTTTCACTTTCTTCACACGCATGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGC:1 + chr3R 21198625 5' - Tirant 8450 2 81.19 GATGGCAGCATCTGGCAGGTAAGCTGTGTCACATTTCTAGTGGTCCACTGGCGCCCGATGAGCAACTTCCATGCTAAGAGTCCCTGTTCGGGCGCCATGTA:1 - chrX 6124753 5' - HMS-Beagle 262 2 80.20 AAGTGGTAGCTCCTCCAAAACGGCGTCCAACATGACCTACATTCCGGATCCGGGCGACGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2R 12249695 5' + jockey 25 1 60.40 CTATACAAAAAACTCATCTCATATCAACGATAGAGGAGGCAATAGAGAAGGAGACGGACAGACGGCTGGATTGACTCGGATATTGATCCTGATCAAGAATA:1 + chrX 20796661 5' - INE-1 85 1 55.45 CGAATCGAAATTGCTCCACACAATAACAGCAACAACAACTGCTACGTATGCAGTCTACGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - chr2R 22514561 5' + P-element 18 1 53.47 GGAAATTAACCAGATCAGGGAACTAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACTCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTGCCAACTTG:1 - chr2R 3051858 5' + I-element 4990 1 72.28 CCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTG:1 + chr3R 15130459 5' + Max-element 18 2 53.47 GATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGA:1 - chr2R 2092781 5' + Doc2-element 100 2 67.33 TGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chrX 12866452 5' - hobo 2907 1 60.40 TCATGTATAATAGATTCAAAATTAGCAAAATAGGTTCAAAACAATACTGGCTATGCATAACTTTCCTAGCTAATTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTA:1 + chr3R 21710527 5' - mdg3 244 2 76.24 TGTGGTATTTGTCATTCCATAAAATGGGGTGAGCTTGAACTGACTATGCTTAATACTTGTAAATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTA:1 + chr3L 26315772 5' + Tabor 6851 2 65.35 CCAATGCAACTTGCAACACATTGCACACAGGCAGAAGCAGCAACAGCAATAGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chrX 7429436 5' - hobo 2915 1 55.45 ACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr3R 13620287 5' + Doc 56 1 79.21 GTTGCCATTATTATAGTTCTGTTGTTGTGGTATGTAGCGATTGTTGTAGTCGCTATTGGTTGGTTGTCCTTTTGCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGAT:1 - chr3R 15141275 5' - F-element 4406 1 74.26 TTTGATGAATTACACTTCGTAATATATATGGAATGTTTCGTTCCCACAAGCCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 16399013 5' - roo 9047 1 50.50 GCTAAGCTGAAGAAAATATATATTAATATAAATGTGCCTGCGACAAAAAAGAGAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCAACTATCAGATACCCGTTAC:1 - chrX 15440772 5' - INE-1 551 1 54.46 CTGGATTTCTGTGCTATCCACCTAAACACCTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTCCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATA:1 - chr3R 24702260 5' - F-element 4309 1 71.29 ATCACCCGCCCTGGAGAAAGGGTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3R 10957318 5' + hobo 37 1 75.86 ATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3L 23456276 5' - 1360 3379 2 65.35 TACGCACACACTTAAAAAAAAAATGGTGAACTACATGCTGATTTAAAATCTTAACTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 12860829 5' - roo 9052 2 55.56 TTAGAAAGTGAACTTTTTTGACGAGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGG:1 - chr2L 11600215 5' + 1360 121 1 83.00 AACTAAAAGTGCACGGATACATAAGCTCATGTTGGACATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 2556049 5' - 412 7505 2 66.34 TAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACAC:1 - chrX 21555999 5' + invader4 326 1 75.25 TGGCTCTCTCGCTTCGAACCTGTTTGCTGGTCGCCTTTAGATTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr3L 14205335 5' - P-element 2854 1 46.53 CGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:2 - chr2R 17348633 5' + jockey 18 1 63.00 GTTTATCAAGGTTGTTCTGGTTATCTAACAAATTCTTCATATTTTCTTCTAATTGCTCTCTATCATCTTCATCCAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3R 19448644 5' - roo 9062 1 74.26 GGGAGAAGAGCTAAGCTTTGCTGAAGAACGTAGGGTTATCTTAAGAGATATAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGCGTCGGTCATCGC:1 - chrX 22576489 5' + Burdock 151 2 76.24 AAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr3L 25884081 5' + Doc 32 1 51.49 TAATAATATTAAAAGTTGTACGGCATTGGTGTGGTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAGATAAGAAG:1 - chrX 15227376 5' - roo 409 1 78.22 ATGCGTCAACGAGATGGCTGCATTTAAGATATTAATCAACTGTGTAATTAACTAATCAACAAAGCGAGTTACCACCCTACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr2L 13642771 5' + Tirant 8123 2 65.35 AATTAAATATTTTTGACAAACAACAGGCGTCAAATTTCATGTTGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGC:1 + chrX 7474719 5' - F-element 4486 1 57.00 TAGCTCCTCCAAAACGGCGTCCAACATGACCTACATTCCGGATCCGGGCGACGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr2R 12249701 5' + jockey 29 1 55.56 CACAACCGTTCTCAAGCGCAACTTTCTTACGGACAGACGGACATGGCCAGAACGCCTCGGCTATTGATCCTGATCGCAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACC:1 - chr2L 21363609 5' - INE-1 31 1 73.27 ATTTTCATTAGGAAACACACATTCATTCGCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3L 10576884 5' + roo 4 2 75.25 AGGAGTCCTCTTCGTCCAGTTCATCCTCTATTTCTTTGACATTTTCTGCCTTTGTGTTTTGTTTACTCACCTTTCGTGCGTTGTTCGCAATGCTATTTGGT:1 + chr3R 1585023 5' + Cr1a 235 1 69.31 AAATGCAGACAACAAAAGCCACAGTGAACAGAAAATATTTAAGAAAAAAAAAACCAAAAAACCCATATCCTTACACACACACACACACACACACACATATA:1 - chrX 11644942 5' + accord 7030 2 67.33 GTGGAGAAAAGAAACAAAAGATACACCTTTGACCAACAAAGCATATAAGATCTTTAGCCCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 21393439 5' - roo 393 1 63.37 ACCAGATGCGTCTGGCTTCTTAAGCAAGAAAGGAGCATGTAAGCGAATCGAACGAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chrX 21050026 5' + 297 20 2 60.40 TTCTAGTTAGGCAAAGCTAGAGAGATACAAGTGAAACTGGTGTTCTACTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACT:1 - chr3L 8043687 5' - invader4 2692 1 53.47 ATAGGCATTTTACAATGATCCAAACTTCAAGAAGGCTTTTTTTACTGTTGCCCCATTTATGGATTTGGGTTTATTTTATTTTTTTAAAAA:1 - chr2L 10389556 5' - G7 1144 1 56.67 CAGGACTCTGGATGTAGGAGCCCTTGTTCCATTTTTGGCCATTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chrX 21256444 5' - hopper 1379 1 61.39 ATCAAATAAATTGCTTGGAATAGTAAATTGTCTAGTGAATTTTTAACCACTGTTCATTGTGCGATTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr3R 12546785 5' + hobo 9 1 72.28 GTTGGAGGGGAATGCTACGAATAAAATTTCATTAAATACACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr2L 12888813 5' - 412 456 2 68.32 TTCGTGCACGTATGGCCCACCGCGTGTACTAACTTACTGGTCAAGTACTTTTATTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCT:1 + chr3L 25255122 5' - GATE 418 1 58.42 ATCTACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:5 + chrX 17492861 5' + Tirant 8114 2 74.26 TTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:4 + chr3L 8044307 5' - mdg1 396 2 53.47 AAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:2 - chr3L 3535462 5' - roo 390 2 58.42 TTGCACTAATTTTGCAATGCCAAATGGGTGGGGAATGGGTGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr3L 18793064 5' - P-element 2852 1 44.55 ATTTCAGTTTTGAATGGCATTTGTTTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr2R 2832930 5' - 1360 3342 1 78.35 GATGAGTAGGGCTTATATTAAATTATTTACCTACTTTACCTATGTTCTTGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGC:1 - chr2R 4688315 5' + 297 6744 2 57.43 AATAAAATTTAGCAGGAAACAAAATGACCAACGTTATCCAGTGCCTAAAAACTAGTTTATTTCTGGCTGTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAA:1 - chr2L 5825915 5' + copia 4878 2 70.30 AGAGCGACGAGGAGCGATCTCCGCCCGCTTTACCAGGGAATTTATAACTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTA:1 - chr3R 11912657 5' + I-element 5018 1 55.45 TGTTCATTTGCCTGCAAGTCAACGGCTGCAGGGGTAGGTGCAGGTCCTTGGGATTGCTCTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGCATA:1 + chr2L 15150212 5' + Tabor 6932 2 67.33 TTCTCTTCTAAGGTCACTTGGTGGGATGGGTACTCTACTAGACGGCCTGACTCGGTTCATTCCTCTCTTTCTGTCCGTCTAAAAAGTTAGAGC:1 + chr3R 14304670 5' - Gypsy12A_LTR 488 1 48.39 GGTGGAGGTAGATGGTATAGACATGCAAGTTGAATTTCACGTAGTTCCTGATGAGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACG:1 + chr2R 3603335 5' - Doc2-element 371 1 65.35 GGCAACTGGCAAGAATGCTTTTAAATTTGACACACACACCGCACACACACACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr3L 17691399 5' - 1360 3367 1 54.64 TTGCGACTGCAAAGTGCCCATATTAACACATTTCGCATTGCAGCAGGATTTACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2L 16569553 5' - roo 386 2 56.44 TGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATCAACACGAATATATTTAAAGACTCACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chrX 11503510 5' + roo 55 2 81.19 TGATGATGCTGATTGTCTGGAACATAATTCAAAGAGCTATGCCATTGGCTTAGCGTTTGATTTTGACTTTGATTGTAGAGGGAGTCAGGCGAATGCTAAAG:1 - chr2L 17800022 5' + invader2 155 2 31.68 CATGAAATACACGGGCCTTCATCAGCCATATCTAAAAATTAACAACCCATAAGCTGGTAATTAGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACAT:1 - chr3R 7639868 5' + HMS-Beagle2 10 2 65.35 AATAGCTATGGAAGTGATGGAAGATCTAACAATCACATTTCATAAGCCAGTAGAAGTAAAACTCAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGC:1 + chr3R 23234525 5' + Stalker 6975 4 68.32 AAACCCCTTTTTCTTTTAATAAATCTGTTTGTAAAACCACATGACCAACTTCTTCGACTTGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 20835296 5' - roo 395 1 63.37 GATGTATATATTCTGGCAAAAGTATGTAACAGTTATGTATATGTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGTCAACCAATGTCCGTATGAAAGTCGAGATCTC:1 + chrX 12249756 5' + INE-1 134 1 80.20 ATCGGGAACACTTGAGCTTGCCCCTCCTTCTGACGAATTTACAGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCG:1 - chr2L 22712227 5' + Doc2-element 436 1 57.43 ATTTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chrX 5168840 5' + hobo 6 1 66.67 TTTTTCAATTGATAAATCATGAGCGTGTTAGGGAAGGAATATTCGATGCTTCCGTTAAGGACAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 25377481 5' + jockey 18 1 66.34 CTAGTGTCTTTGTTAATACTATGTATATATGTACATCACACGTATATACAATATTTTATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACT:1 + chr2R 19502073 5' - Tabor 467 2 60.40 TCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGAT:1 - chrX 22824230 5' - Gypsy12A_LTR 2255 1 48.51 CGCACAAAAGTAGGCAACAAAGACGGCAGCGATGCGATGTGATGCGATTGCAACGATGGTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr3R 12949435 5' + jockey 24 1 62.38 TTCATTTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:2 + chrX 5168837 5' + hobo 23 1 56.44 TCATCTTCGTGCAGACATTGACACTGACTTCTGAGCTGAGTGTCACTGACATTGGTTGGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - 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roo 9068 1 76.24 TTTGGGTGGCAGGTAGCAAAACATTAGCTACACTTCTTCGCTCTTTTCTGGCTTGGGTTTGCCGAAATGAAGCCGTAAAATTATATATGTACGCATGCCAC:1 + chr2L 9197570 5' - gypsy11 3978 2 68.32 CGCGGAGGTGGCGGGTCTGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chrX 14953614 5' + P-element 59 1 21.78 CCTCACAAATGTATTGTATGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGATCATTCCTTCGAAGCGAGCAAACATTTGTTCCATGTTAC:1 + chrX 20830578 5' - G2 155 1 79.00 AAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:2 - chr3L 3535461 5' - roo 389 2 57.43 TGACTTACGTTTTCGAGTGACTTGAATTTCATTTAGCTGATCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTGGCACAACACGCACAC:1 - chr2R 1439144 5' + 1360 3207 1 63.37 GGGCAAACTAAGAGAGATAGAATCACCCCACTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 6869291 5' - roo 9025 2 71.29 AATAGTGCTGTAACGAACTGATTTTCTTATTGCCCTCGCTATGGATTGCATCGGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCGTCGGAGCGTTACTAGAAGGAGTTCGG:1 + chr2R 677131 5' + gypsy8 424 1 75.25 TCTTAGGTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 12998311 5' - 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Doc 478 1 63.00 ATTTGACGACCCTCGTGTACGTGCAAATTGCCAAGGACAATTCGAAAGACTATGTGTACCAAATAATTGAGATCTAACTGAGTGC:1 + chr2L 21614653 5' - Ivk 5170 1 57.65 TGGGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTA:1 + chr2R 17942107 5' - mdg3 5446 2 76.24 ATAACAAATGAAGGCTGGCTGCGGCACAGACAAAACCTGAGCGGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAACCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAG:1 + chrX 18972609 5' + F-element 342 1 57.43 AGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 - chr3L 22231369 5' + Doc 49 1 77.23 GCAAGTGTGTGTGTGAGCTATAGAGGCAGAGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chr2R 8666068 5' + P-element 47 1 32.00 CAGTTCATCTTCAAATCTCGCTTTATGATTCTTCATTTGGATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr3L 10305320 5' - 412 7513 2 57.43 CATTTCATTTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 - chrX 12866514 5' + hobo 36 1 63.37 CGGCTTGTCGCCCACATAAGTATGCTACAATAAATGCCATATTGTATATGTGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - 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chr3R 29438746 5' + hobo 53 1 80.20 CCACTTTATCCACCCGAAAAAAAGACGAAAACTATTCAGTATTGAACCTAACCCAACAAAAAACGAAACCAAAAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATAG:1 + chr3L 18786526 5' - Tc1 1379 1 54.46 CTATAATTTTTTAAAATTCAGTGCCCCATAGAGCACGATACTAATCTGCCATGGCAACGGACCATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1 + chr3L 5573506 5' - mdg3 233 2 63.37 AACGATTAAATAATTCACTGCTCTTTAACTTAAAAAAAGGAAATAATGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 18417296 5' - roo 9045 1 53.47 CAAGCAGATAAACAGAAAAAAAAAACGAATTATTTTTACAAAAACAACATAATCTTATTCTTTCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTG:1 - chr2L 23368702 5' - Idefix 77 2 51.49 AATCATTTAAAATTCAAGCGAGTGAATGAACAAACTACTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr2R 10334808 5' - pogo 2070 1 60.42 CTTAATGTGGTTAAATGACGTTGTGGATTTCAATTGATTGGGTGGATGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAA:1 + chr2L 15151867 5' - Tabor 457 2 50.50 GAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGA:1 - chr3L 23678154 5' + Osvaldo 19 1 71.29 CCCAGAATGTCCTGGTTTGTCTGGTGTCTGGGATGCCTCCTAATGATACAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr3R 12546879 5' - hobo 2912 1 54.46 CAGCATCAGCGCAGGAGAAAAGAGTGATTCAGCATCGACGCCAACGGATGTTTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGACGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGA:1 + chr2R 25009723 5' + FB 25 1 54.46 TGTCTGACCCCTTTTTTGCTCCTCAATTTGTATACTACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 5284942 5' + roo 45 2 68.04 CCAGTCAGCTAATGGAATAATTATAGCTGTACGATTTTTCTAGATCGACTATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 + chr3L 7733809 5' + flea 4775 2 61.39 ACAAGACTCGAGTTCATTGTTCAATTATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTAATTTTGATCTGTCCT:1 - chr3L 1259872 5' - mdg3 5449 2 69.31 TCATTCGCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3L 10576862 5' + roo 26 2 56.44 AGCAGCAGAATGTTTCTGGTTTATACTTCCGCGGTACAGTTCTCCTTTCCTTGACATCCAGATTAGGTACACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:3 + chr3L 14285974 5' - 412 486 2 72.28 CTTACCATTTCTCTTCTTTTCAACCATTTGTCTCTCCCTTTTGTGCTCAGCGTTCAACGTTCGTAATCTTTTGGTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCAT:1 + chrX 5178613 5' + hobo 2663 1 77.23 ACTCTATGACTAATTAGCTTAGCGGCATCATGGCATCATGGGTCAACAAACTTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTT:1 - chrX 22967672 5' - INE-1 167 1 77.23 TACTATATCCGCCGATATCGCATAGCTCGAAATCAAGTCGAATGCTCTAATTAATTTCGCTACGATCACATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCC:1 + chr3R 15924852 5' - Quasimodo 6981 2 70.30 GAAAATACGTAGTTTTTCCCGACAACTACAATGTGTAGTTTCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chr3L 15729614 5' - hobo 2908 1 58.76 TTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chrX 10196098 5' + 297 38 2 69.31 AAAAAATAGAATTGAGATACCGTCAACAAGTAGGGCACTTTAAATCAAAGCCATACTTGCTCCAACG:1 + chr3R 805015 5' + G5 4362 1 52.24 AAATTGTTGTGAAATAAATAATTTTAAATAATTTTCACTCTCCATGACTGCGTGTGTACATGTGTGAGCCAAGTGTACGTGTGGATATGTGTGTGTGTGT:1 + chr3L 6620556 5' - accord 189 2 65.00 CTATTCCAAATTTACAAACCATTAATAAAATTTTTTT:1 + chr2L 17294540 5' + FB 403 1 70.27 GATATGGGTTAAGTAATATTCTGTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 + chrX 3446544 5' + I-element 46 1 80.85 TATACATAGATAGTTGTTTCTTTTTGGTGGTTTGGGTTTTCGGTTGAGGTCTGTTATACTATGTATAACGATAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCTAAGAGAGC:1 + chrX 10795693 5' - F-element 387 1 79.21 GCATAACACATTATGCTTTTTTATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGT:2 + chr3R 19515780 5' - 412 483 2 68.32 TATGTCACTTATTGACCATTTGTTTATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTC:1 + chr3R 2472813 5' - accord 7081 2 75.25 AAAACAAGCCCCCACTCCTATCGAACCACCAAATATTGTAAACTTAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTT:1 + chr3L 23698031 5' + Doc 4230 1 62.38 AAATAAGGGACTTCTAAAACTAAAACAAACTGGAATCTTCATTACCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGG:1 + chr2R 3032255 5' - Quasimodo 7026 2 58.44 TTTCAATTTCAATTTTGCAATTTTGGCAGCTGCCAGGTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 + chr3L 17110711 5' - hopper 1380 1 60.40 TTTGTGGCTTATGTGTGGAGTGCCCGAAAATATTGTTTGTCTGTGTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 + chr2L 11534360 5' + copia 4902 2 57.43 CAACACGGCAATACAAAATACAAAGACAGCTATTGCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCG:1 + chrX 12885708 5' + transib2 40 1 65.35 AACTGAATATCCACTTTGGCCAGAAGCAGTCGCACTGTCCCGTTCCGATTTAGTTGGGTTTTGGTTTGGCTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTT:1 + chr3L 15185380 5' - I-element 369 1 78.00 AAAAGAAGATAAAGCGTGAAATCAAAATTTTAATCGTCTTAACATAGAAAGAAAAATAAGTAATAATAAAAAAAA:1 + chr3L 23102469 5' + BS 5094 1 60.00 TTTGGTGTTTGCATTATGATTATTTTTATCATGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTT:1 - chrX 17492947 5' - Tirant 356 2 72.28 ATTCATTCGCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:3 - chr3L 10576864 5' + roo 8688 2 55.45 TTTTTGCATTAGAGCGCGCAACTAAATGTATGCTACAGCTGAGAAACTAGGAAAATTGAAGTCTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCC:1 - chr3L 5267297 5' - Juan 4206 1 68.32 ACCGGTCGAAACGGAGTCTGAAGGCGGAGGAGTAGTGATCAGTCAGCCAACCGCGCGTGGAAGAAGATAGTGAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGC:1 - chr2L 21645249 5' + 1360 4 2 74.26 CATTTGGGCGCCGCTAATAGGAAAAACCAGAGCGCGTCGCGATGGTTGCGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr3R 13623643 5' + jockey 33 1 52.48 GACTAATGGCGTGCCGCCTGGCGGGTCGCGTTTCGTCCTTTTGGGCCTATCCTTGTCTATTTTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr3R 30326265 5' - pogo 2091 1 70.30 AAATATATTGCAAAAGTAAACAAATTGTGTAGTGGTGTATGAATGAGAATGAGAAAGGGAAACGCTTGTTTTGGTCATTCTTGGTGATGAAATAAAGAGGG:1 - chrX 4361880 5' + invader5 244 2 75.25 TTATTTGCGATTTCCACCTCTCATATTTTACATATTTCACACCCCTAACCGATGGAAAGGATGATGGAGCACATGTTCACCCAGATGACACAGCTGGTGGC:1 + chr3L 1078721 5' + G6 1562 1 52.48 ATTTTGTTTGAGTGTGTGCAGTCTCCTTCCCTCAGTTTTCTTTTTTTTTTTCTGTCGCAGTTTTTCCTCGGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTTT:1 - chrX 9444286 5' - BS 5119 114 83.16 CAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:2 - chr2R 17277629 5' + jockey 35 1 50.50 AGCCAAAGTGGAAGCCTGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGAAATACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 - chr3L 9762272 5' + jockey 4681 1 71.72 GACTTGGATTAGTTTCCATTCACTACGATTGCCTACTGTGAATGCGGGCAAATACACATTCAAGCTAGCATCTGTATCCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC:1 - chrX 3091014 5' - accord 7029 2 51.49 GAGCGTGTTAGGGAAGGAATATTCGATGCTTCCGTTAAGGACAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr3R 25377461 5' + jockey 37 1 54.00 GGTAGATATAGATAGGAAAAGCACCAATACAATAAAGCGATGCAAAACTCAGTTAAAGACAAAAACCAAAAAAATGTACTGGCTCTTAGGACCCCGCTCTC:1 + chr3L 539526 5' + G3 4121 1 67.33 TCCACCAGCAGCAGCAACAGCAGCGGCGCTAGCGACAGCAGCAGCAGGGAATGGTTCTGCCGCAGGCGCTTATTGCTGCCTATAAAGAGCATTCCTTGCCA:1 - chr3L 13430796 5' + TART-B 229 2 33.66 ATGTTCATAACTAGGCTTGTTTCTTGTTTTCTTTTTGAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAG:1 - chr3R 973997 5' - blood 7065 2 66.34 TTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:2 - chrX 21219491 5' - roo 9038 1 58.42 ATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGA:1 - chr2R 5321190 5' - INE-1 505 1 50.50 AATGGGGTTTTCGAATATTGACTTACATTTCCAAATCTTAGGTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2R 12998276 5' - roo 398 1 64.36 TACATTCAAAGCCACAAACAGAAGCTAGTTTGATGGCGATTATCATGGAAAGTAGTTTATTGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3L 21393542 5' + roo 8678 2 65.35 CTGAAAATTACCGGGAAAGCGAGATGAACACACACTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGT:1 - chrX 9649960 5' - blood 334 2 68.32 TTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAAT:1 - chr2R 2092796 5' + Doc3-element 79 1 52.48 CGACTTTCCACTTTGTGCCCCCATTTATGACGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 - chr3R 21198659 5' + Tirant 46 2 68.32 TTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGG:1 - chr2R 5531204 5' + 1360 56 1 71.00 ATAGGCAAATAGAAAGTATGTATGCTTGTTTGCCGAAAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTA:1 - chr3R 20240962 5' - Tabor 474 2 53.47 AGGGGAGGAAGGACTTCAGCACAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 - chr3R 19513389 5' + jockey 4718 1 76.24 TATTGACTTACATTTCCAAATCTTAGGTACACTAATTGTTACACACAAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr2R 12998291 5' - roo 9046 1 51.49 TAGCATAAAGCAGGCTGAGGAATGGAAATGTGTGTGCAAGTCTGTGATTTACTTGCGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 - chr2L 16276199 5' + 1360 22 1 55.45 TACAGCGATGTTCGAACTAAAACCGAATACCACATTCCGACTTTTGAGCCGCCTGCTCCAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 - chr3L 14205415 5' + P-element 17 1 62.38 ACAATGAAATTTTGCGCAACACCAAACAATAAAGTAGTTCTTAATCTAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 18977899 5' - roo 9044 1 57.43 CGCTTTTGCAGCTTAACTTTGACTGCCACAGCCATTTGTTGAAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTG:1 + chr2R 14728863 5' - mdg3 96 2 58.42 CGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:5 + chrX 17492889 5' + Tirant 35 2 61.39 TAAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr3L 17635572 5' + 297 43 2 75.25 CTCGCCATCCTGCAGCTCCCGTCGGGCACTGTGCAGATCGTCGGGAACTGCTCATGGTTATCCGGAGCAGCATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTC:1 - chr2R 22825507 5' + opus 4 2 75.25 CTGGCGGGTCGCGTTTCGTCCTTTTGGGCCTATCCTTGTCTATTTTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr3R 30326282 5' - pogo 2074 1 56.44 GTGTGAGGAACCATAACAGTTAATTATCGATAAAGATATGAGGAGCAACGCATATTTCTGCCTTTTTATTGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTC:1 - chr2R 14781328 5' - P-element 190 1 75.25 AGAGGGCGAAGTGCAGAGGGGCGGGGCAAAAGGACGATGAAGCTCAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chr2R 18374849 5' + 412 30 2 58.42 ATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1 - chrX 21668075 5' + Tabor 6871 2 55.45 TAGGAGCAGAGGCAGATGCGAAACTGCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTA:1 - chr2L 1561040 5' + F-element 4462 1 74.26 GAATAGAGCGCATTGGTAAACTGATAAATCACATATAATTGTTAACAGTCATAGTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 - chr2L 10534013 5' - blood 352 2 53.47 AAGAAAGAGGTCGCACGTTAATTTGGAAATTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAA:1 + chr2R 2009131 5' - 1360 380 1 70.30 TTTGTTTTGCATTTCTTTTTTTTTGTGCGTTAGTCATTACCCACGAACAAAAAAAAAGAAATGCAAAACAAACTTAAAAAAAAAAACAAA:1 + chr2R 17078800 5' + TAHRE 10440 1 71.11 CCTACGCGATGTCCCGCTGAGAAATTTCCTTCCCGTTCAATCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr3R 30076414 5' + hobo 33 1 56.44 TGGAGGGGAATGCTACGAATAAAATTTCATTAAATACACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr2L 12888815 5' - 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chr3L 3070702 5' + 1360 43 1 69.31 TAGGATTTACGAGCGCATTTCTGGGGGCGGCCAGGTAATGGTATTAGTACCAGAATTAGGCAGGAAAATTTCTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chr2L 17213825 5' - hobo 2935 1 73.27 GGGCCATTTCATTTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chrX 5168830 5' + hobo 15 1 64.00 CCGCAAAACGAGAACTTGGGAGCGAATAACAATTGGAATTTTAATAATACAACGAGCATAATAAAACATCCTGCGAACAATAACTGGTGCACCTTGGTACA:1 + chr3L 25801437 5' + Doc4-element 2686 1 61.39 GGTCTTGGGCGGCTGGAAAATACGTAGTTTTTCCCGACAACTACAATGTGTAGTTTCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 + chr3L 15729599 5' - hobo 2919 1 59.41 AATCTGCGATTTGCACTTCTTGTTTTTATTGCCCTCATATGTGGCATGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chrX 14617642 5' - hobo 2912 1 52.48 ATTTTTCAAATCCTGCATCCCCATCGTGCAGCAGCTAAATAAAAATGTCAAGAGCACAAAGTTCCTGGAAGAAGGCAACTAACAAAAAAAAAAGAAAGAAG:1 + chr2R 9516884 5' + gypsy2 399 1 71.29 CGCATTTGTGTGGGTGTGAGCCACTCAACTTCAGCCTGTCATGGTGCACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr3R 29438698 5' - hobo 2915 1 53.12 ATAGTAGTCCCACAAATTGTATAGTAATTTTCTATGCATGTGTGTGTGTGGGAGGACTGGGTATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 - chr2R 20593427 5' + copia 4884 2 64.36 TTATCATAAATGTGTCTATCTGTTACTTAATACTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 - chr2R 11245030 5' - 412 449 2 74.26 AAGATAAGTAGATATTATCTTCCAAAAGCCTTTTTATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGGTACCATGGT:1 + chr2L 22557834 5' - Doc2-element 4461 1 65.35 GGCGACTTTTGCGATTCACAAATCGTTGGCACGCATCGGGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:2 - chr3L 12217373 5' - roo 9035 1 58.42 CGCTCGTCAATTCCTTAACCACTTTTCTTTAAGCACCCGGTTGGAAAAACAACAAAGATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 23870063 5' + roo 17 2 61.00 AGCCGGCCAAGTTGAGCGAGACGGCGACCAAATAAAAATAATACGA:1 + chrX 5139354 5' + I-element 4925 1 52.17 AGGGTGACAGGTACACTTTAAAGTCCTTAATAAATAAAAATAGGCCTGCTGATGCTAACCTGGGAGTTCGTTGTTAACTACTCCCCCCTTAAAT:1 + chrY 3069838 5' - gypsy 6973 1 71.28 GCACTGAACGACGTTTGACCCCAAAACAAAGGTAAGAATGAAAAATTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 - 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chr2L 13642746 5' + Tirant 8148 2 62.38 GTGTGTCCGTGTATGTGCGAGGGTCATTGAACATCGCTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATA:1 - chrY 418176 5' + Stalker 7106 4 63.37 AAACTGGCGCCTGTCTTGCCGGCATTTTGCGATAATTCCCCCTCGACAAGTTGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAG:1 - chrX 3446437 5' + I-element 471 1 56.70 GTGAAAAAAAAAAGTGATCAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 + chr3R 11080670 5' + I-element 11 1 67.33 GTTAAATACTCACCTTTTCGTACGTATCTAACATCTCTAACAAGACGGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGG:1 + chr3L 13886350 5' + Doc 298 1 59.77 ATGCCGCAGATGCTCCGGCCAGCGACTTTCCTGGGCTCCCCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTC:1 - chr2L 610914 5' + roo 9038 1 60.40 TTTAGCTTTGCGTGCAGCGATGTAATTGTGTAGTTTGTTTGATATGTGGGCGAATGGGAGGTTGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCT:1 - chr2R 15004417 5' - Porto1 239 1 75.25 ACCGGTCGGCTGCACTGCCGTCGCCAAGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGAT:1 + chr2R 6482640 5' - gtwin 471 2 75.25 AAAATTATACAGTAAATTGGTTCAAAAAAGATCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chrX 11299984 5' + roo 8709 2 70.30 GTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr2R 1725921 5' + Doc 53 1 73.27 TTGACACAGGAAACTCATTTGTCTCCGTGTGAAATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 - chr3L 17635616 5' + 297 6580 1 81.19 CTCGACATCCATCACTTTTTCGGAACATGTGAAATTCCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chrX 7019195 5' - hobo 2900 1 62.38 TGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCT:1 - chr2L 23295854 5' + micropia 40 4 66.34 AACTGACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACGTTGGGAACAATCACATTGTAGCAC:2 + chr3L 26315809 5' + Tabor 49 2 75.25 GATCTGACCGATATGCTGTGCTGGCAATTGAGTTTATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 - chr3R 10876349 5' - opus 7465 2 66.34 TTTGACGGGTATACGAATATACACATATGCATGTACATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAA:1 - chr3R 13231213 5' - Quasimodo 7331 2 64.36 GGCGAGAAGAGTGCGAAGTGGCGAGTGCAAAAGAGAGGAGAGCGCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 + chr2L 16276122 5' - 1360 3357 1 62.38 CAGCACCTTCGGCCAGGCAGCCAGGACACGGACTCAACACCGGTGTCCGGAAAAATTGGGGAACATGGAAATGTTTAAATAATCAACATAAATATAAATAT:1 - chr2R 3464339 5' + 1360 2955 1 54.46 GATTCATTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr3L 25884070 5' + Doc 21 1 53.47 GGAGGCAAGACAATAATTAGAGATGCTAGACATCTCAAGAAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTT:1 + chr2R 3031930 5' + F-element 4441 1 60.40 AGAAGATTCATTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 + chr3L 25884066 5' + Doc 17 1 57.43 TTCCATATTTTACTGCATACTTCTAGGCTGGTTGAAAAGTAAAGTTTGAACTGCATTCACACACTTATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr2R 13934367 5' + jockey 15 1 73.27 CTCGGGGGAATCGGCGAAAGGCATGGCAGACTGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCC:1 + chr3L 4608226 5' - hobo 2582 1 68.32 GAATACTGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:3 - chrX 11503516 5' + roo 8713 2 79.21 AAGGTCTTTTGTAAAGTTCAATAATCAGGACCTTGTTTAATTTGACCGACAACAATTCGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 - chr2R 3144116 5' - Transpac 295 2 64.36 AAGCTGAACTACAGAAAAAGATTCAGAAGAGGAGCTATAGGTAAATTCCAACCTAGAATCTTGCCGACAAACGAAGAAGTGTCAATTGGCGGGACAGGCAG:1 - chr3L 24860709 5' - diver2 4730 2 67.33 TCCCCCAAGAGCTGGGAATCCGCCTCTGAGGACACGTCGACCTTTACGCCGGACATTACGCCCCTGATCCTGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCC:1 - chr2L 16669001 5' + Doc 4547 1 80.20 TATTAGGAATTTCCTTTTTCCATTTCAGTTTTCCTATGAAATGGCACAAATCTATCATGGTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 19447912 5' - roo 9054 2 43.56 AACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCAACGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2R 17348622 5' + jockey 30 1 51.49 GATATGTTGGCGACACTCGAATGGGCGAGTTGCAGTTGCACCAGCAGTTGGACTCGTGATTACTTTGACATCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3R 11478486 5' - roo 405 1 74.00 TTCATCGCAAATTAGTCACTTAATTATAGAAATTTACTCATTTGCGAACATTGCTGGGGCTGCGTTATTTGAGTTTTCAAATTTATTCTAAACTAACTAAA:1 + chr3R 4161495 5' - Doc3-element 4651 1 74.26 AAAATAAACGTGTAAGCTTTAAAAGAAACTATAAGCAAGTACATACTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGC:1 + chrX 8303399 5' + flea 27 2 56.44 AAATTTTGATGAATTACACTTCGTAATATATATGGAATGTTTCGTTCCCACAAGCCAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 16399017 5' - roo 388 2 54.46 AGTATACTTTAGTAAAAGGTTTGTAATAATTTCATTTTTTAAAAATTCGCTCAGTTTCTTTGTTTCCCCCATGTTTAACAAATTTATGAATGAAATAAAAG:1 - chr4 350599 5' - Tc1-2 327 1 66.34 AAGAAATGATTTTATTTCCTTAGTGGACTTTGGTATAGGGAAATTCACTACGGCTTTAATTTTTGCGGGATTTGGTTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr3R 18009771 5' + roo 3 2 77.23 TAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGA:1 - chr3R 15790092 5' + flea 4718 1 69.31 GAAGGGCTTTCTGCACGACGATGTGACATTGGTGACCCCGACGTGATCGTGTTAATTTGCATGCTTTAATTAATGTACTTATCCCATTTATAAATAAATAT:1 - chr2L 23052970 5' + diver2 437 1 69.31 CACCTGTCGATGCCAGGCGAAAGGTCGGAGTGCCTGGGCAAAGTCAAAGATGCGATGACAGAGATCGATGGTTATCGAGTATGAACCTCATACATACATAT:1 + chr3R 24387557 5' + mdg1 227 2 70.30 CAAATCCACAAGCGCTGAGCGGTCTACTCAGTCTGCTTGGCTAGACCATAAGAAGATCAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr2R 11244960 5' + 412 19 2 60.40 ACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:3 - 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chrX 22694472 5' - Burdock 249 2 72.28 TGCTAAAAGAAAAGATCTATAAGAATGCATTGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAA:1 - chrX 20830636 5' + G2 257 1 69.00 TTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3L 23456274 5' - 1360 3377 1 63.37 GTCTTAGTCTTTCCAGGAGTTCGGTGAAAAAAGTTACTTTTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr2L 15798628 5' - roo 9038 1 59.41 AGGACTCTGGTTTTCGCACAATTAGTTTAATTGAGGTAAAAATTTTTGTGGCTATATACGCGAAATTCGGAAACCGCAATTTTTAATTTTTAATTTATTAA:1 + chr2L 2596964 5' - HeT-A 457 1 92.08 AAGATACCCTGTGAATATTTTGTACATCTAAGTAAAGACATGTGTAGTATGTGCATGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chrX 6162149 5' + blood 7049 2 61.39 TTTGTCAATTTGTTTAACTCAAATGTATAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr2L 21777932 5' - mdg1 375 2 74.26 GATGGGTTTGCAGATGGGAGGGATGGTGGGTTCAAGGCTTTTGGCAATTGGGCGTTTGTATAATCCGTGAGCAGTCTTCACTGTAACGACTCGGACCTTGT:1 + chr3L 11893708 5' - 3S18 5657 1 62.38 TAATTAAAATAGTAAATAAAACCGTTTGTTCGAAAAGATGCACGCCTTGAAGAAATGGGTTAAAGCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chrX 3333380 5' - pogo 2092 1 70.30 TGAATCAATTCAAGGAGAAATGTGTAGACCATAAGATACCCTGTGAATATTTTGTACATCTAAGTAAAGACATGTGTAGTATGTGCATGTATC:1 + chrX 6162117 5' + blood 7009 1 79.57 ATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGAAATACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 - chr3L 9762234 5' + jockey 4721 1 68.32 TGCCAATGCAACTTGCAACACATTGCACACAGGCAGAAGCAGCAACAGCAATAGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chrX 7429438 5' - hobo 2918 1 58.00 ATAGCGATATAGGCCAGTAAAGAAAGATGCAATTCATTGGAACAATTAATAAAGTACAGTTTGTTCAAAAAATTCCAACTTTACTTTACTTTACTTTGGAT:1 + chr3R 19336717 5' - TART-A 13128 1 68.32 GCCCGCCAATCGTAAAGAGTGGGGTATATTGTGCAAAGGGTATAAAAGGTATAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr2L 5654827 5' - roo 9046 1 53.47 ACAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chr3R 11080687 5' + I-element 28 1 52.48 ATTGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTT:5 + chr3L 24210883 5' - HMS-Beagle2 7183 2 67.33 ATATTTTTAAAATTGTAATCTTTCTGTTCTTTTTTAATATTCTTATACATTTTTCTATCCATTTGCCAAACAACTCTTTTCGGGTATCTGATAGTCGGGGA:1 - chrX 16551567 5' + INE-1 554 1 55.45 ACAGATTTATTTGAAAACAAATATATGCCAATTATTTTTGTTCATTAAATATAATCGCCCTAGTTTTATACTCTTTCATCATTAATATGATGAAGCGTGTC:1 + chr2R 21834008 5' + Rt1b 4769 1 73.27 CGACGCCTAAAAAGCGGCAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:2 - chr2R 17277646 5' + jockey 18 1 48.51 AATTCTGGTATTCGTTGTTCGAAATGTTTAAAGCTCGATGATGTCCGCAAACTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3R 11936969 5' + roo 24 2 50.50 ATAGTTATGTATAACTGGTTAACGCTATGCTGAAGACTGAAATTCGGCTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGT:1 + chr2L 13142105 5' - copia 227 1 54.46 TGCACTAGAGCATAACACATTATGCTTTTTTATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 + chr3R 19515771 5' - 412 7546 2 78.00 TTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTA:1 - chr2L 23295848 5' + micropia 133 4 72.28 ATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 + chrX 5168871 5' + hobo 56 1 78.00 ATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACA:1 - chr2R 17348626 5' + jockey 26 1 56.44 AATGCTGCCCAATGCAGATATAAATCATAATTAGACATAACCCACCAACACTACCTAAATCTCAATTCATTGCCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTAATAT:1 - chrX 9450137 5' + I-element 5011 1 68.32 CTCGTGATGAAAATGTAGCATACATTTGGGCGCCGCTAATAGGAAAAACCAGAGCGCGTCGCGATGGTTGCGACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr3R 13623621 5' + jockey 11 1 72.28 TAACGAATACTATAGTGTTGTAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 + chr3R 21587260 5' - pogo 2050 1 80.20 GCCCTCGACCCTCTCTATTTTAGCATTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGT:1 - chrX 21091856 5' - roo 8618 1 75.25 AGGTTCTGGAGGGTGACAGGTACACTTTAAAGTCCTTAATAAATAAAAATAGGCCTGCTGATGCTAACCTGGGAGTTCGTTGTTAACTACTCCCCCCTTAA:1 + chrY 3069829 5' - gypsy 6975 2 64.36 CTCTACTTTTTGCCCCGTTTGCCATCGTTGACATCATTAAATCTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chrX 14617713 5' + hobo 32 1 57.43 TTCAATGGCGGACTTGTTCCAAATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATTCTTCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAATCTC:1 - chr3L 23771205 5' + Q-element 101 2 76.24 GTAAGTTAAAATAGTTAAAACCAAAGCATATAAGCACATTAATCATCCCAACAAATTTCTATAGATACTAGATTTATTTAATTATAATATTTTTACCAATT:1 - chr2L 3731291 5' + Juan 433 1 77.23 TGCAGAGCACACAATCTGCGATTTGCACTTCTTGTTTTTATTGCCCTCATATGTGGCATGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chrX 14617630 5' - hobo 2924 1 64.36 AATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 + chrX 5131004 5' + I-element 42 1 66.32 TTCTAACTCTGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr3L 14504285 5' + 297 6623 2 69.31 TGCCGAAAACTTTCGTCTCGTTCGTCGATTGCATTTCCCCCCAGGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTT:1 - chr2R 18077525 5' - Quasimodo 226 2 56.44 CATCAAAAGGTCAAGAGTTTGATTGAAAAGTATGCAAGTGTGGCCTTACAAATTTAACTCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGC:1 - chr2L 22322292 5' - Doc3-element 4562 1 63.00 ATAATCGAGAAAGACAGTCCAGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCT:1 + chr2L 20126697 5' + invader4 15 2 79.21 TTGAAACTCGACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:2 + chr3L 8044291 5' - mdg1 412 2 69.31 TTGAATCCAAAAATTCAGTGTAATGAGCTCTAAGGCACTTTAAATCAAAGCCATACTTGCTCCAACGTGGAGTTATGCCGTCCAGGTGTGGGGAACTGCCG:1 + chr3R 805206 5' + G5 4396 1 74.26 GCCACTGATAAATATTATTAGCGCACGGCCAGTCGCAGTGGCAGTTGCACCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAGCACGGTTTTATGAAACGC:1 - chr3L 7598648 5' + Q-element 207 2 56.44 GAAAACTAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:2 - chr2R 1725948 5' + Doc 26 1 59.41 ACATATCTACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:3 + chrX 17492857 5' + Tirant 3 2 78.22 AAAAAAATCATAAATTTGGCGGGACGAACGCACAAACTTTCTGAGCTAGCCGCTGCAATCCGTGCTCGCGCCTACCCTTTATAGGCCGCAGGAATCCCGTT:1 + chr2L 22407569 5' - gypsy8 326 1 56.44 TGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTG:1 + chr2R 4577080 5' - Chouto 485 1 57.43 TTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTT:1 + chr2L 17188862 5' - I-element 315 1 65.35 GTGGATTCGCGTTAACACATCTTAGAGAAGTATGCATTGTTCCGCCTAGAAGAGAGTCTTGGTCTTTTTGACGGTGAGCGCGCAATTCGCGTTGGCTTATT:1 - chr3R 802097 5' - Doc3-element 220 1 74.26 GATCGACTTGCTTGATCTAGAATCTAAAAAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 - chr2R 11247064 5' + 1360 13 1 67.33 GTCGGACATTTTGTCTAGTTTATATTCACGTTTAGTTTATATTCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr3R 5561956 5' - pogo 2070 1 73.27 AGTCTGTGTCGATCCATAACTGTAGTTATTAATTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTA:1 + chr3R 2474313 5' - Juan 4168 1 73.27 AAATCCAAGACTCTAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTTTCTAATGAAGAGAGGTATTACTATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTA:1 - chrX 13134943 5' + BS 5009 1 68.32 GGCTCTGATATTTTTGCTGGCGCTCCCCTATCTAAAACGAAAGAGTCGTGTATATCCGGAGACTGACAGGAAAAATCCAAATCAAGTATCGGCAAACAAGG:1 - chr3L 23784199 5' + X-element 467 1 64.36 CATGTTACTGCCTTGTTTATAGTGAGTCAGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3R 15197754 5' - 1360 3341 1 76.24 ACTCAGTTATTTGAGGTTAAACATTATTTGTAAGATTGGGTAAGAATCTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr3R 19515876 5' + 412 27 2 52.48 GTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCTGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCTCT:1 - chr3R 1977614 5' - micropia 5403 2 56.44 ATATTTATCTGAAACCAGACCACTGTGCACGAAAACACAACGCACAAAAGGGAGGGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTT:2 - chr3R 15198189 5' - Cr1a 175 1 63.37 AGAGAGATAGAATCACCCCACTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 6869301 5' - roo 9015 2 78.22 GAGCTTTCTCTTTCTGCATTTGTTGGTCGACCTTTCCTTTTTTGAGGAAAAGTATCAGTTTTTGTATGTTATTTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAG:1 - chr3L 25911970 5' - I-element 5109 1 59.00 GAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGACGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chrX 21945927 5' + F-element 43 1 58.00 CTGATAGTCAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGCAAAGCTAAGATAACATCTAAGCTAGTAAATGAAGTGAGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTG:1 + chr2R 4330779 5' + baggins 5230 1 72.28 AAGTAATGGAACTACACGCATTCTGAATACCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTTTTTATATTACTTTTTTT:1 - chr3R 20240927 5' - Tabor 461 2 57.69 CGAAAAATGTCAAAATTAAAAAAAAAACTATCATCAATAGTTGTTGTTGTTCTTGATAACACGGCCTGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chrX 13640215 5' - P-element 2881 2 69.39 CAAGAAATTGAGCGTGCTGCGAAAACTAAAAGCTATAATTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTC:1 - chr2R 1725968 5' + Doc 3 1 79.59 TAAGTATTAAATTCAGCAACACAGGTTATTATTTATCAAATATGAAGATGAAATACTGTGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTT:1 - chr2L 14993476 5' - 412 475 2 60.40 AAAAAGAATCTGCCACCACAATGCGGCACATCGGCAGCGGATGGGCTGTGGGAAAGTCGGCGAGGAAAATCAATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr2R 14135499 5' + roo 3 2 76.24 AATTATTGTTTTATTATGACGTGCAAGCCAATTTTAATGTCATAAAACTATCAGAGGACTTCATGGAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATACGAT:1 - chr2R 4032574 5' + F-element 121 1 73.27 AAAAGGAAGCGACGCGAAATGCCTTGTTCGCACTTGAAATTGAATATCGAGCCACACACAGTGCAAGCAATTCTTTAGTTTTACTTGTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 13881371 5' - Porto1 169 1 56.00 AACAGTCACACACACACACACACACACTCATCCGTGCTTCCGTAGCAATCAGCTTATGTCATTCGCCTTGTCGTCCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - chr3R 20190441 5' + blood 7013 2 75.25 TCCCTAAATGCTGACAAAGGCCACTAATCCCAAATGATGGCCGTTCTGCCCAGACTAACTGTCGTCGTTGTCCTCCGCGAACACACACACACACACACAC:1 - chrX 8672127 5' + accord 7029 2 78.00 CAGCATATATGTTATGCTATGCTCACTTATACATTCCCATGATCGGAGCACACAAGCAATGCATGTATATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACAATGA:3 - chr3R 2476324 5' + S2 9 2 68.32 ATAGCCATCATAGTGCAGGCAATTGCTAGAATAAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 20182983 5' + roo 8705 2 70.30 TATGTATTGTGAAAATATATTTATGTAAAACGCATTGTAATATATTTTGTAATATTTTGTAATCCATAAATCGTTACAAATCATAAAAATAAAAAAAAA:1 - chr2R 10927217 5' + Doc 4690 3 55.56 AAACCAAATATAATCCCAGCCAAATTCAATTTCATTTGCCATCCATTGTTCGTGCGTTGTTTGCGTTTTGCCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGT:1 - chr3R 25378131 5' - jockey 495 1 76.24 ATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTT:2 - chrX 21945925 5' + F-element 46 1 62.38 TTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTAATTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAA:1 + chr3L 24996100 5' - 1360 462 1 64.36 TTTGTTTTAGGGCAGCAAAAAGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 13167341 5' - roo 355 2 78.22 TAAGGTGGGTGGCATAAAGCAGGCTGAGGAATGGAAATGTGTGTGCAAGTCTGTGATTTACTTGCGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 - chr2L 16276208 5' + 1360 13 1 66.34 TGGGATGCCTCCTAATGATACAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 - chr3R 12546851 5' - hobo 2884 1 82.18 CTGTTGAAGAATAGGTACATTTCGATCAATTTAGGCAAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr3R 7015513 5' - roo 9038 1 59.41 GGCTTTGGGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTC:1 + chr2R 17942102 5' - mdg3 5451 2 71.29 AGGTGGTATGTAACCCTACACGGGGACACGACATCACGGAGCGCCACACAGGCGTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1 + chr3L 13652166 5' - mdg3 223 2 55.45 AAGCGCCTGAGGAACGATAGAGCCGCCCCTCAATAGTATCATCCATCCCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2R 16384376 5' + roo 28 2 54.46 CTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGAT:1 - chr3L 18183176 5' - Tirant 375 2 54.55 TGTAGTGGTTTATCGCTCATTCTCGCAAAATATTATGGCTTCGCTTCTCGCGCGCACTCTGCCGTCACTAGAATATAAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chr3R 3620764 5' + 1360 21 1 65.35 TCGATTGCAAACTGCTGAATGATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAA:1 - chrX 11957154 5' + I-element 4891 1 79.21 TTTTGCTAATCGATAGAAATTTCGCGTCTTTGTTTCTAGATCTGTACGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTAAATAGTTCCTGAGATCTTGACGTTCATACG:1 + chr2R 5667269 5' - INE-1 136 1 77.23 TGAAAGTATTTTCTTTTTTTTTTTGGGGGCGCGGCTCCAACTGCCCCACGCCCACGCACGCCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAAC:1 - chrX 20829251 5' + G2 2843 1 66.34 CAAAAATATATCCAAAAAATTTTCAAAAATATGGTCGTCAATTCAACAAATGTTTAACTTTTATTTATTCAATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACAACA:1 - chr3L 20853193 5' - HB 1465 1 68.32 AGACCATAAGATACCCTGTGAATATTTTGTACATCTAAGTAAAGACATGTGTAGTATGTGCATGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chrX 6162142 5' + blood 31 2 54.46 TGCGTAAATATTTATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATC:1 - chr2L 16379024 5' - HMS-Beagle 7025 2 62.38 ACGGCGCAAAAGTTTCAATTGTCGGGCGCCGCTGGGAGCCAATTCTCGAGGATTGAGAAGATCAGGGTGTAGTATGTGAATATATCGAGGGTA:1 - chr3L 12025684 5' + blood 5 2 72.04 TGAATAAATATGCGATGTAATTGCATTGGCTGCCGCCTACCGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAG:1 + chrX 10298433 5' + Quasimodo 7051 2 59.41 TTTGTCCCCAGTTTTTGGGATTATATACATACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCACATACCTCACCTTGAT:2 - chrX 22664418 5' - opus 455 2 72.28 AACATACTTTTACCTTTGTGCGACATTGAGGGCGTGCCTAAAATAAGGGGCATACTGGAAAAAACATAAATAAGGGTGTTTGGGAACGAGACACCCTG:1 - chr2R 25216633 5' + 3S18 5766 2 75.51 GATTGCAATCGTGACATAGGTAAGCATTTACTATGCAAATATTTCGGCATTATGAAATTCCTATTAAATATATATTATTTTCCGTTTTTTTTTT:1 + chrX 8304289 5' - Doc2-element 251 1 50.00 AATTGAAATAGAGGTCAGTTCATCTTCAAATCTCGCTTTATGATTCTTCATTTGGATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chr3L 10305305 5' - 412 475 2 60.40 AATTTGTACTTAAGAAGCGTCGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 + chr3R 3921298 5' + Doc 60 1 78.22 CAATGAAATTTTGCGCAACACCAAACAATAAAGTAGTTCTTAATCTAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:2 + chr2L 18977900 5' - roo 9043 1 58.42 TATCGTCGATGAATAAACCCCTGGCTGTTAATAGTGTATACACCTCCTTAAGTTCCGTACCTGAGCGGGTTTTCCCGAGATTGGACTTAGCTAAATCGTTT:1 - chr3R 19449061 5' + R2-element 3344 1 67.33 AGCAAAAATCTTCCTCGTGGCGGCTTGTAAAAACAAAAAAATATTTAAAAACCTCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAAT:1 - chr3L 14500993 5' + I-element 157 1 56.44 TGCAGTATACAACACTCGGAAAATGTTAATCAATTTGCCGGCAGCAAATACATTTTGATTAATAGCCATAAACATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr3L 12258293 5' - roo 406 1 75.25 TGATGAGACACGCTGGCGGCAAGCTGAATGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTAAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTT:1 - chrX 9573256 5' - invader4 2608 1 69.31 ATGTTGGCGGATTATAACGCGCCCAGGCTTGAGAAATGAGAGTAAAGATATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGA:1 + chr3L 3739069 5' + invader4 2781 2 56.44 AAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCA:1 - chrX 21945935 5' + F-element 35 1 52.00 CTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chrX 3295660 5' - hobo 2889 1 74.26 GTTATTGTTTTGGTTTTATTCACACTCTTCACCTTCGTTTGCTCTTCCTTGTCACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACA:1 + chr2L 8950738 5' + Doc 256 1 58.42 GGTCGGCTGCACTGCCGTCGCCAAGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTG:1 + chr2R 6482643 5' - 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I-element 48 1 52.48 GCCAGGACATCGCCCGTCCAAAGGCAACTGGCAAGAATGCTTTTAAATTTGACACACACACCGCACACACACACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 17691421 5' + 1360 4 2 71.29 GTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 - chrX 21945929 5' + F-element 39 1 57.14 AACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATG:1 - chr3R 15790090 5' + flea 4720 1 67.33 TTGGCGTGTCCTTTTGGCTTTTTGCAGTTGCAGTAGCTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGG:1 + chr2R 14655712 5' - blood 7156 2 56.67 ACACAAGCACTCAATCTGTACAGTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 - chr2R 9258635 5' - blood 7335 1 77.23 GAATCTGAGTCGTTGAGTCTTGAATTCCTTCTCTGGTTTTCATTCCCTCATTCCATCGAATTTACCCTACCCTGGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr2R 23596509 5' + 1360 3 2 72.28 TCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTA:1 + chrX 21668026 5' - Tabor 433 2 74.26 TAGTAGCGAGTAACGAGAACTGCAGTCGTTCTTTGTAAATAACGAATACTATAGTGTTGTAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr3R 21587221 5' - 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invader1 4008 2 72.92 ACAAGAAAGGCAGAGGCGAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 + chr3R 28326454 5' + P-element 58 1 22.77 TCAGGCGAGCGAGGAAAAATATTTATATACCACCACAGTACAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chrX 13547230 5' + I-element 41 1 69.07 GATGGGTATGCTTAAATATGCATTGCAAAAATGTAAGCTGCTTTCATTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr2L 5654905 5' + roo 8693 2 55.45 GTGATATATTGTAGAAATATAATTTTAAAATGAAATAAAAAAATTAAAAATTACTATTTCAATAAACCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTA:1 + chr3L 6164726 5' - hopper 1407 2 69.31 CATAATAAAAGCATTCATCACACCAAACCACACTGTATATTAAGATTATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCA:1 + chr2R 964554 5' + I-element 289 1 66.34 CATTGGCATCAACATTAAGTTCAATTTGATGTTTGATAACTACAATATATTTTATTATTTAGCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAAT:1 - chrX 157867 5' + I-element 5170 1 66.34 AATAGCCATTCCTGTAGTTTCATTGTCAGCAGTAAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGTCTATACACACT:1 - chr2L 21903545 5' - invader4 2949 2 76.24 CTGTTTAATGTTTACTCTTGTTTTGTTTCTAGATTATTTGTATACTTTTGTTTTCGGCACAGAAAAGTGTGTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:3 - chr2L 8898972 5' - roo 406 1 77.23 TAGTATTTTGCGTAAATATTTATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTT:1 - chr2L 16379032 5' - HMS-Beagle 237 2 70.30 TTTTTTTATTCTGAATAAAATTCTTTGGTCCCCAAATTACTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chr2L 21631823 5' + pogo 34 1 66.34 ACGTTTTGGTTATTGTTAGCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 + chrX 157214 5' + I-element 33 1 57.43 GAGAACCCTCAAGGATAAACGTAATTCAACAATGAAATTTTGCGCAACACCAAACAATAAAGTAGTTCTTAATCTAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr2L 18977871 5' - roo 409 1 79.21 AAGTGTCTGCAAAACAATCAAAATCCTGCATGAACTATGTTACGGTGAAACTTAGTGTAGTTAATTAAAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 + chr3R 13191425 5' - mdg1 7435 2 57.43 TTCTAGTGTCTTTGTTAATACTATGTATATATGTACATCACACGTATATACAATATTTTATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTA:1 + chr2R 19502071 5' - 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chr2R 17735208 5' + hobo 48 1 72.28 CATTTCATTTGTGGCAAACTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chrX 5168834 5' + hobo 20 1 59.41 GGAAAATTAATAAACTTTAATATTTAAGGACGTTAAAATGCCAAAACGGTGAGCCAAAATTTTAAAAAGTAATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGG:1 - chrX 15959829 5' - Quasimodo 61 2 71.29 ATGAATGTAGTGCGTTTCGTATCAACAGAGCCAAAATATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATA:1 + chr3L 17762785 5' + invader3 41 2 62.38 GGAGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr2L 1530414 5' - roo 9031 1 66.34 GTTGCTTTTGGTTGAACAGCTGTGCGATCATTCGATGGGCAAACAAAACAAAAGCAAAAACAGATGACACGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr2L 19865796 5' + P-element 6 2 75.25 TTTGTCTGACACTTGTGATGGATGGGTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 4087253 5' - roo 9018 2 74.26 TTCAAGGTGCATCTGTATCTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAG:1 + chr3R 17059413 5' - Quasimodo 36 2 68.09 ACAGCTGCTGCTCTCACATGAATGAATATTGAGTACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3R 22341131 5' + hobo 40 1 67.33 AAATTGCATTTCAAAACAAAAACAATCAAATCGAATGTCACACACACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCAT:1 - 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roo 401 1 70.30 TGGATCGAAAGGCCTTCAGAACAGCTTAGCTATGCGAGCCATTGAAATGATAAGCACACATTGTAGGATATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 + chr3L 13356052 5' + hobo 5 1 74.26 AATGGAGATCATATAGAGGAACAGAATGTTTATAGATCCAATTCACCATGTACATTCAAAATGTGTATAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:2 - chr2R 14647586 5' + blood 7018 2 66.34 TGAGCGTGTTAGGGAAGGAATATTCGATGCTTCCGTTAAGGACAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 25377462 5' + jockey 36 1 53.00 AAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr3L 8044303 5' - mdg1 400 2 57.43 GACATTCTCTTCATCTCGTAAATTTTCATTCTGTTTTGAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACC:1 - chr3R 31674703 5' + jockey 4583 1 62.38 AATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 + chrX 17492897 5' + Tirant 8150 2 69.31 TATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr2R 17348627 5' + jockey 25 1 57.43 TGAGTCTGCCCATGGTAATTGCGTGCAAGAGAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAG:1 - 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INE-1 342 1 64.36 ACAACACCCATGACGTGGGGAACACGTAGAGGAACAAGCAGTGTGGGCACCTATAAGGATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3L 3535366 5' + roo 8682 2 59.41 AAAATGTCAGAGGTCTTGGGCGGCTGGAAAATACGTAGTTTTTCCCGACAACTACAATGTGTAGTTTCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr3L 15729588 5' - hobo 2930 1 70.30 GAGTGCTCGAAGAGTGAGCTTTCCGGGGTGGCTTTTCGTTCGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 + chr2L 431978 5' - P-element 2855 1 47.52 ATGTGTGATACAACTAAATTGTTAAATCACGTGTTGTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAG:1 - chrX 7707424 5' + blood 410 1 70.71 GACTTTCCACTTTGTGCCCCCATTTATGACGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chr3R 21198658 5' + Tirant 43 2 68.04 GTCCATTGGAATCAATGAGTCCATTTCGTCTGTTTCCCAACACCGTAAAATGCACGAAGCCAACGTATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 3842925 5' + roo 8674 2 67.33 AGTCACACAGGGCGTATGCTTAATGTGGTTAAATGACGTTGTGGATTTCAATTGATTGGGTGGATGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTT:1 + chr2L 15151849 5' - Tabor 7314 2 68.32 TTGTTTTAGGGCAGCAAAAAGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 13167342 5' - 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Burdock 5917 1 73.27 GTGGCTATCTGAAAAGTGGACTAGTGACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3L 14286082 5' + 412 7071 2 61.39 CCTACGCGTGGTAAAGGCAAACATTTTTTCAGTAAAGTTCCAGGAAATTAGTGAAAGAGCTCTTTAGTGTGTTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr3R 4788287 5' + 1360 3 2 77.23 AGTGATCTAATCTGGCGAGATTCGCCAGCGAAACATCCGTCCCCTAATTAAAACAATTCCTTTGTTCAAAGCTCGGACCCGCAATCCCGAAAAACAAAAG:1 + chrX 1950940 5' + Idefix 7087 2 37.00 TCTCTCTTTCGCTCGCACACTAAGTATGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 + chr3L 3070664 5' - 1360 3339 1 76.24 GGTTAGCGGCCCTTGCACGCGATGTTGTGTTTGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chr3L 9190443 5' - 412 471 2 56.44 GGCACCTGTTTCTCAAAATTAACACCGGCAATGCTCTGGTTTTCATTTTGCGGAGTAATATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTG:1 + chr2R 14613124 5' + P-element 492 1 65.35 AGTTTTCTAGAGCCTAAGTGCTATTAATACATACATACATATATATATTAATAGCACTTAGGCTCTAGAAAACTATATTTTTTTGTTTTTTTTTTAGATCG:1 - chrX 7674760 5' - R2-element 3581 1 67.33 CTGTAAAATTGGCTTAAAAAATATGTAACCTTATGCGAGAGCGAGCCGCAAACAAACTGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 + chr2L 12911232 5' - mdg1 7442 2 61.39 CGAGCGCCGAAAAAGCACCGACAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chr3L 5351541 5' + P-element 56 1 23.76 CAAGAAGAGTTGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATCTTG:1 - chr2R 17402786 5' - invader4 3054 2 57.43 CGCAGTATGGCTCGAATGTGGATGACATACTCAATCCGGTGAGTTTAAGGATCGAAATGGATACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 - chrX 2742577 5' + hobo 2708 1 73.26 TACCTTATGCCCGCCCGTGCGCCAATGCTACAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTG:1 + chr3R 21591964 5' + Bari1 40 1 68.37 GAAAACACTGCAGAGGCAAATATAACTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCC:2 + chrX 21564110 5' - invader4 274 2 76.24 ACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCTCTC:1 - chr3R 1977612 5' - micropia 5402 2 60.00 AAACAACACCCATGACGTGGGGAACACGTAGAGGAACAAGCAGTGTGGGCACCTATAAGGATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3L 3535364 5' + roo 16 2 61.39 ATATTTATACTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCG:1 - chr2L 16379017 5' - HMS-Beagle 222 2 55.45 GGACTTATCCGCACCTGTAGCGCGCTTGTCTTAAACTCTATCTTATATTATTATTTGTTCCTTATGAAATAACAGTTTAGGGATAATGTTTAGTTTACTG:1 - chr2R 2306013 5' + accord2 492 1 64.00 CAAACCATTAAACGATATGAAGGGACATAAGAAGGGAAGGAAACATAAGAATAATATTTATAAGCAGTTATTGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCC:1 + chr2R 577771 5' - invader1 400 2 75.25 CTGTCGGTCTTCGTTCTGCTGCCAGGATCCTCCGCCTACCTACCCGCTGGCCCCCTATCCTGTTTTCCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTC:1 + chr3R 26764295 5' + micropia 5100 4 69.31 CAGAGATGGAGAGACACCTACTCAAATTCCTTGTAGACATCAAAGTCAATGTCTGATGGTGTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTT:1 + chr3L 23979449 5' - F-element 300 1 64.36 TGGCCTCTTCCAAGCTCACTGCTGTGGCCTATTGTTTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 - chr3R 10434941 5' + 1360 40 1 65.35 AATCAAACAATGGACAAGTACTTTCAATTTATTTTCCGCCATCATTGCTTGAGAATCAATTTAACTGAAATAGACACCTGTAATGTGCACACATATCGAAT:1 + chr2L 17078707 5' + Tabor 2 2 45.54 CAGTTCGTGGCAAAGTAATGAATCCACCGCATTGAGCAGACACTTTTACAACTAGCCTGGATCTAGTTATGTAATAAAAACGTTAAAATCGATTGCTTTAA:1 - chr3L 12699240 5' - Cr1a 4256 1 61.39 CAATTTACTGGGTCCCGGAATATCAGCATAAGGTTTGGCCTCTTCCAAGCTCACTGCTGTGGCCTATTGTTTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3R 10434976 5' + 1360 5 2 70.30 CTAGATATAAAAATAAACCTACTTTTAAAAGAGATACAGAAAGAGCGGACAGTTGACTGTCTTCTTAAGCAATTGCTGGCGCGTGCCCAAAAGAGATACGG:1 + chr3R 896466 5' + G5 470 1 75.25 ATAGCTGAGATCCCGTAATTTCCTCTTTTGCGCACGGCCCGTACTACGTTTGGCAGAAACTCTAACGGTTGTCTGCCGCGCATCAGAAGAATAAAAAGAGG:1 - chr3L 23544649 5' - invader1 64 2 58.42 AGGAGGGACAACATCATTATTAACAAAGTCAACGAGCAGCAGAGCAACAGAAGTCCGGAGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3L 4859586 5' - hobo 2922 1 64.36 CCACAAAAACCAAATAATAGTTTTTTTATAATTTCCTACATAATAAATTTTTTTCATTATAGTTTTCTGATATTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCA:1 + chr3L 16956566 5' - invader2 4720 1 46.53 CATAGGCAACCGTCTTAAATTGAAATAGAGGTCAGTTCATCTTCAAATCTCGCTTTATGATTCTTCATTTGGATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAG:1 + chr3L 10305288 5' - 412 492 2 77.23 CATTTTCTGCACATTTAGGCACATACATAAAGCAAATCGCAAACACACACAGGCACGGCCAACGCACACTTACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chr3R 19691198 5' - hobo 2934 1 50.50 GTTCGTGTGTGTTTGTGAGCGTGTGATCTAAATGACGAATGTTAGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTG:1 - chr3L 4583436 5' - Doc2-element 345 2 56.44 CTTGTTGAAAGGCAGGCAGGCGTTGCTTTGTCAAGTGCATTCATCTCTCACCCATGCCGCACCCCTCTAACTCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCA:1 - chr3R 11389837 5' + hobo 2710 1 76.24 TTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 + chrX 157234 5' + I-element 53 1 76.24 GGTTATTGCTTTCAATTAAATCATTTATTTTATTTTGTATTGTAATGAAATCATCGTGATCCGTAGTTCCATCAACACCAATAGAAGGAGTGGAAGCATAA:1 - chr3L 27865745 5' + rover 6908 1 72.28 AAAGATGTTTTAAAATATGTGATAGCAAATAATAATGTCGTCGCTTAAGAGGATCTATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr3R 7102501 5' + pogo 17 1 62.38 GTAAATATGTTAATAAGTAGGGTAAACTACTAAAAGACGTACAATAATAAAAATAATTGTAATGGAAATATAAATTACAACTTCGCGGTTTATTGATTTAT:1 + chr3L 6065522 5' - Quasimodo 7359 2 72.28 CTTGCCCCACTTAAATACATCATACATTTGAATTACACATATAATAAATATATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACT:1 - chr2R 3822183 5' + Doc3-element 123 1 64.36 ATTAGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTT:1 - chr3L 24210984 5' + HMS-Beagle2 6902 2 58.00 GCTGGCAGGTTGCGACCCTTTTGCGATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAATAATAATAAACAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chrX 8037600 5' + roo 7 2 73.27 AGCAGGTGGGCAAGGTAAGTTCGCGAAATATGTATTCCAACCGATATGCCAATCCGTACAATCCGTTGTGCTTCAATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACC:2 - chr3L 5573624 5' + mdg3 5254 1 75.25 AACCCAACCAAAAACCAAACTCGAAACGTAGTCCTGCCACGCCCACACCAGCCCCACTTCCACACCCACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chrX 20585922 5' + jockey 14 1 70.30 AGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:2 - chr3L 10576837 5' + roo 51 2 81.19 TCGGTGCCCGGCGAGTTCCCGTTTTATTTTGACGAAATCCGTAAGCTTTAAAAGACGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAG:1 - chr2R 17675929 5' + Max-element 22 2 50.50 ACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:2 + chrX 10196105 5' + 297 45 2 76.24 CTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3L 3535448 5' - roo 9040 1 57.00 CTGCAGCTTTATTCTGCTGCCTGCCGGCGGTCATAAATGTAAATAGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chrX 7019256 5' + hobo 30 1 59.41 CCACAACTGTGTTCTTGTTTTTATTAAACTTTCGGTCTGAATTCGTAAATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCC:1 + chr3R 935424 5' + HMS-Beagle 6817 2 58.42 GGCAGGAAGAGGGAAATAAGGGAAAATATGTTACTTACGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 - chr3L 22231376 5' + Doc 42 1 70.30 GCTCGCAGTGTTGGTCAAATAAATCAGCAGATGAGGCTTGCCATGGTCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGC:1 - chrX 8210875 5' + pogo 1660 1 74.26 TAGATTTCATTTCATTTCATTTCGTTTCGTTTCATTTAAAACGGCCAGCACACAAAAGTCAAATTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr3R 5020537 5' + jockey 21 1 61.39 AGAGGGTTTTGGCCATGTTTCCATATCGCCCATTTGCCTACGCCCAACTCAATGCCAATCAATGTCACGCTGTAATGATGAACTCCCCTTAAGAACACAAG:1 + chr3L 15056899 5' - 412 7537 2 69.31 GTGTAATTAACTAATCAACAAAGCGAGTTACCACCCTACCCCCCAAACCCACACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr2L 13642730 5' + Tirant 40 2 69.05 TTGATCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 - chrX 3295655 5' - hobo 2884 1 79.21 ATCATTTTGTAAAATGGATCTGGAATAATAAATCGCAATACCCAAAAGCCTTATCTGTTAATTGGCGCCCACGGAACTCTTATAGAACTCACAATATTTGT:1 - chr3L 27866113 5' + gypsy4 299 1 72.28 CTGGCTTGTGGTTTGCGTTTAAAGTTTAAGTGGCGCAAAATCAGCGCTCATGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATT:1 - chr2L 9624620 5' + transib2 23 1 56.44 TACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCATT:1 + chr3L 27356117 5' - Tc3 1627 1 80.20 TGGGTGGGGTTTGTGGGTAGGACAGGAAGACGAAGCTGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTA:1 - chr3L 12331945 5' - Doc 4240 1 66.34 GGGAGCGATGGGTTCCAGTGCAACATTATAACATAATCCGCATAGAAGGACTTCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 + chr3R 16110163 5' - mdg3 5474 2 53.47 TGATAGTCAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGCAAAGCTAAGATAACATCTAAGCTAGTAAATGAAGTGAGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGG:1 + chr2R 4330780 5' + baggins 5231 1 71.29 ATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTAAATTGACAATTCATCTCATGACTGAT:1 - chr3L 8044324 5' - invader4 2615 1 65.35 AGATTACCAAACTAGTGGTTTATCATTCTACTTGAGTTCAACTTACAAAAGTTCTACTGTAGCTGGGAAAAACTGTTAGCTCACCACCCTCATGACCTCCC:1 - chr3R 25388689 5' + jockey 4758 1 73.27 CTTTCGCAAACTCAATTAGGTGGCACATGGTGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr2R 22746005 5' + hobo 13 1 65.35 ACACTAATTTTAAAACGAGATAGAACTCTTGTTCTGGAATCGACGCATCCGGAATATGCATGCTTAATCTAAAATTTAAAGCTTTTATAGTTTCTGAGATA:1 - chr3L 22016847 5' - INE-1 150 1 56.44 CTTTTCGTTCGAAATCAATACATAAAAATCGTCTTTGCATTTCTCGAAAATAGCTAATAAAAACCTTAATAGGTGCACCAAATGTAGAACATATTAATAAC:1 - chr3L 23688809 5' + transib3 2502 1 73.27 TTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCG:1 - chr3R 15790077 5' + flea 4733 1 56.44 CTTTGGGATTACATTTCGTGCGATTCTCACGAATACTGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chrX 11503546 5' + roo 8683 2 61.39 AACAAACAAAAAAATATACAATTAAATTAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAAT:1 - chr3L 14543398 5' + I-element 220 1 72.28 GATTTGTTTTGAAAACAAATGGGTAAGTGAGTTAATGTCGTTCTCAATTGTGATTTTACCAGATCTCTTTTCGTTACAGACAACAATTAATAAGATTAAGA:1 - chr2R 3823700 5' - gypsy12 10084 2 64.36 GATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:2 + chr3L 8044336 5' - mdg1 7405 2 77.23 AGATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGT:1 - chr3L 19274890 5' - transib2 2808 1 60.40 AAGGAAGCAGAAAGAAATGCACACACACACACACACATA:1 - chr3L 18410765 5' + accord 7028 2 64.10 CAGCATCTGAGATAAGTGAGTGAGTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chrX 9649924 5' + blood 54 2 81.19 AAAATGAAAAAAAGTTTAAAAATTTTTCAAAACTGTGTGCGTGACAGGTTTGGGCGTTTTTTGGGCGTTATAGTGAGTGTGTGAAATAGTTTTTTTTTTCA:1 + chr3R 12792497 5' + copia 368 1 74.26 AACATGCAATTCATGCGAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAAT:1 - chrX 8027505 5' + Juan 20 1 59.41 CCAAAACAATTGGAAAATGCATGATACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGAGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAAT:1 - chr3R 21950352 5' - accord2 7294 1 73.27 TGTACATTTCATTTTAAATAGTTATCGTAATAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGG:1 - chr2R 17402909 5' + invader4 2836 2 67.33 TCTTTAGCCAAGAAAGTGTTTAGTTTTTGTCAGTGTATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2R 12247458 5' + hobo 40 1 69.31 TAATTATTGCTTTGCGTTAATGTAGAATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAGTATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCG:1 + chr2R 7009443 5' + McClintock 46 2 73.27 ATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 - chrX 21668078 5' + Tabor 6868 2 52.48 ACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 + chrX 17492865 5' + Tirant 8117 2 71.00 GCAAAAGGGGCGGGGTCCGCTAATGTCCTCGTCCCAGTCAGTCATGTGCGTATGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCC:1 - chrX 21570073 5' + invader4 2940 2 56.44 AAAAAAAGAGCCAACCAACTTAACGCCTACTGTTGTCAAATGTTCACTAACCTATAAAAAAATACACTCTATTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTT:1 - 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chr2L 13642760 5' + Tirant 27 2 54.46 GAAAACTTGTGCCTTTTCTCCCCTACAATGGGATGAACCTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chrX 22664361 5' + opus 7037 4 60.40 ATTTCACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAA:1 - chr2R 2092805 5' + Doc3-element 70 1 55.45 CTGGCAGGTTGCGACCCTTTTGCGATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAATAATAATAAACAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:2 + chrX 8037601 5' + roo 8 2 72.28 TTAGGGGAAAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chr3R 11080687 5' + I-element 28 1 52.48 AGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTA:1 - chr3R 15790071 5' + flea 4739 1 62.38 TCATCTGTAAATTGTACAAGAGGGTAGCGATTGATTGGAGTGAGAGTTTAGTATTCGTATAAATACAGGGTGCGGCAGGATAATTTCCTTTTTTCATAACT:1 + chr2R 2969124 5' - mariner2 877 1 79.21 GTTTAATGCAGCGCGAAATTTGTTACGTGTTTTTAAATAATGAACTGGATAATTTAGATTCACGATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - 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Doc2-element 4381 1 67.33 GCTGGGATCTCTAACTCAACCCTTTTCCAAAAGGAGGGAGATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 + chr3R 31428660 5' + Tabor 6878 2 78.22 GGAGGCGAGAAGACAAAAGTCACAGAAACCAAAGTGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAG:1 + chr2L 1632603 5' - Doc 337 1 65.35 TTCAGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAGTTTTTGGAGAAAGAAGACGTTGCAGACTGTGCAAAACTGCAACGCCG:1 + chr3L 26696868 5' + looper1 1556 1 88.12 AAAGATAAAAGTAAACAAAGTTATGGCAAAAACCAAACAATAACAAAACAGCAAGGCAGCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr2R 6501237 5' - P-element 2872 1 66.34 ACATATTATATGAAAATGTATTTAAGCTGCTGAATATAAACTTTTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:2 + chr2L 12835819 5' + 412 7084 2 53.47 AATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACA:1 + chr2R 5617480 5' - invader1 403 1 69.31 GTTCTCAGTCATGCCCAAACGGAGTAATTTCGGCCATTAAATTAATTATGGCCAACTGTGTAAGAAGCATTTGCAGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCT:1 + chr2R 14079100 5' + copia 4871 2 77.23 TGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:2 + chr3R 11080707 5' + I-element 48 1 72.28 TTGTATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATG:1 - 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chr2R 2092776 5' + Doc3-element 92 1 70.21 CACGATGGTCGTGTGAAATGAGCACTTTTGAGTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr3R 21587304 5' + pogo 41 1 69.31 GCCGAGGTAATGGGGATCTTTTCTGGGATTTAGATTGCCACACGATGGTCGTGTGAAATGAGCACTTTTGAGTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr3R 21587344 5' + pogo 1 1 76.24 CATTCATTTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 21219498 5' - roo 9045 1 54.46 TCTTGGGCGGCTGGAAAATACGTAGTTTTTCCCGACAACTACAATGTGTAGTTTCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr3L 15729601 5' - hobo 2920 1 59.18 TTAAGATTTTATGTAGTATTTTAGCAATCAATACATAATACATAAAACTGGACTTACACCGAATTAGAATCCTTCATTCGACTCTGCTATTGATCCTGATC:1 - chr2L 12286073 5' - INE-1 92 1 68.32 GAAGTTAAATGTAAGTTAAATATAATACACACACTGGTGTATTGTGGTGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:2 - chr3R 4600879 5' - Burdock 6364 2 52.48 AGATTTTCGGGTGCTAAGTGGCAAACTTTTACCGCAGCCAGATCAAAAGTAGAGCTTGTCATATACATATAGTAGCATATGTGCCATACTATAAGACCACA:1 + chr3R 13231125 5' + Quasimodo 10 2 74.26 TTATGCCTTACACAATTAATAAAATGTATTTAGTTTAATAAATATTACTAAATTGCTGTAATGATGAACTTCCCGTTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:2 - chr2L 21018869 5' - 412 7524 2 62.38 GCCGTGCGCAGGACCTTTGCAAAAAGCGACGAACTTGCAGGAGTGAAGAAAGTCACCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2R 15402929 5' - roo 389 2 59.41 CGGTAATAAAACACTTTAAGATTGGTTGGGTTTGTTTCTGTTTTTTATTATACCCATTACTCGTAGAGTAAAAGGGTAGACTAGATTCGTTGAAAGGTATG:1 + chrX 16541436 5' + INE-1 11 1 88.12 TATGTGTACCTCTAGCCTACTACATTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTTAGACTTACAATCCGATCTA:1 - chr2R 1234689 5' + Q-element 627 1 76.24 TAATAATATTAAAAGTTGTACGGCATTGGTGTGGTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chrX 15227376 5' - roo 409 1 78.22 AAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTTTAATAAAGAAATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGT:1 + chrX 15019098 5' + invader4 135 2 63.37 ATACTTAATAAGATAATCACTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3L 4539177 5' - roo 354 2 77.23 AGGCACTACACTAAGCTACCCAGCCACAGAGCCGCCCACCCACAGGACACACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAA:1 - chrX 3731778 5' + Doc 4443 1 57.43 GGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 + chr3R 11080701 5' + I-element 42 1 66.34 ATAAGAGTATCCACTTAAAGACCAAGAAAACATAACTCCGCTGACCGCATACCATGTGTGCATATAGCACTCCAGAACCCCCGCGGTATGGCCGTGAGGCA:1 - chr3R 1142086 5' - Rt1c 5336 1 72.28 CGTTACGGCGACCGCAGGCCAACAACAGCTACAGCTAGGGATTCAGTGCTGCTACCAACAGCAGTTGCAATGCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGT:1 + chr3R 8499382 5' - Tabor 480 2 74.26 AGGGGGAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:2 + chr3L 14558256 5' + 297 33 2 61.39 TTAGATGGAAACAATTGTACTTCTATATCAGATTGTTTGAGATTTCACTATTCAGCTTAATTCATTCAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chrX 12152750 5' - roo 401 1 70.30 ATAGATTTCACGCTTTGTTTTATATTCCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATT:1 - chr3L 21998463 5' - roo 369 1 67.74 TGCTGGCTAAAAACATCATAAAAAAAAA:1 + chr3L 9124518 5' + jockey 4995 1 75.00 TGAAGGTGCGCTGGCATCAGCAAAATATTGTCATAGTCCTGCGACCAGGCATCCTGGATCTACAGCCATACTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - 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chr2L 20109817 5' - accord 193 2 79.21 GGCGGAGATATGTATGTATATTGGAAATGAGTTATGTTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATG:1 - chrX 3477428 5' - hopper 1163 1 62.38 TTCCTTGCCAACAATATGTTAACTAAATACATATTTTTTCGAAAGAAAAACAAAAAAAA:1 + chr2L 10678859 5' + Doc2-element 215 1 66.10 CATATACTTTCACTTTCTTCACACGCATGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTT:1 + chr3R 21198620 5' - Tirant 348 2 76.24 TATGTGCATCGTATGTGCGTATGTACAAGTGAGTATGTCAGTGCATGAAACACTGGCCGGAAACCCGTGTGCAGCCGGCAAAAACACCATATTTGCGTGGC:1 - chr3L 24510188 5' + Gypsy6A_LTR 102 1 63.37 CGACGACGTCAGTGAGCGACGCGACTGGCGTCAGGTGAAAAAAAGAAAGAAAAACGGATTGAGATTTGAAAATCTATAAGGATCAGGTGAAACGGAAATAT:1 + chr3L 1569384 5' + Transpac 4788 1 73.27 TCTTAAGCATTTGATCTTTAGCCAAGAAAGTGTTTAGTTTTTGTCAGTGTATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr2R 12247472 5' + hobo 26 1 55.45 AAAGGGGCGGCAGGAAACTGCAGGATATGCCGCAAGGGCAAGCGGATGTGTTGCCGCTTTTCCACTAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAAT:1 - chrX 5127807 5' + I-element 214 1 69.31 ATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGC:3 + chr3L 24210892 5' - HMS-Beagle2 291 2 58.42 CTCCGTTGTTACATTTTGTTTGTTTTTGTATCAGAAATATTTGTCTGACACTTGTGATGGATGGGTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 10576777 5' - roo 9057 1 45.54 GGAGACATATTATATGAAAATGTATTTAAGCTGCTGAATATAAACTTTTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr2L 12835815 5' + 412 7080 2 52.48 TTCGTCGATCCAATTCATTCTGGTTCGAATAAAACTTCATTTTAGTTCAAAAGATAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1 - chr3R 7477481 5' + BS 5017 1 52.48 GGCTATGCGGATAAGAGGGAAACATTTGTTGTAATTTTTATTGATTATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 + chr3L 5282164 5' - Transpac 5204 2 55.00 AGCCACCAATCGTTTTTTTACGTTTTGGTTATTGTTAGCTTTATGTTGCCATTTTTAACGCACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:2 + chrX 157195 5' + I-element 14 1 63.37 TATTTTTACCTTTGTGCGACATTGAGGGCGTGCCTAAAATAAGGGGCATACTGGAAAAAACATAAATAAGGGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGC:1 - chr2R 25216629 5' + 3S18 8 2 71.29 ATATAAATATACATTATACATAACTATATAGAACGCCCCGGGATTGTGTTAATTAGCTATAAATAGCTAAAAAACTAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGA:1 - chrX 14262269 5' - roo 9071 1 74.26 TCTATCCAAACCGAACCGCCAGCCCCTTCCACTTTTCACCCCCCTCTAAAAACGAAAATGGAAGCGAAAACAAGAGGACGTTTCTCGACTATCAGATACCC:1 + chrX 18146939 5' - INE-1 556 1 68.32 ATTTACCTTATGCCCGCCCGTGCGCCAATGCTACAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTG:2 + chr3R 21591961 5' + Bari1 40 1 66.34 TTTATTTTCCGTATTCTATGCTTTTTTCTTCTTATTTTTTTTACTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 15964935 5' + hopper 143 8 61.82 TGTATTTGTTAGGTTCATTTTATTTATTTTGCCATTTTTTAAATTTAATTTTATCTTTCTTAGCGTTTAACGTGTAACGAAATAAATTTATGGAAGGCAAG:1 + chr2L 21665114 5' - Gypsy12A_LTR 2245 1 67.33 CGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2R 17348633 5' + jockey 15 1 64.95 ATATATATTTATATGTGTATGTAGCATAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chrX 5907852 5' - 1360 3341 1 75.25 AAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 - chr3L 17635580 5' + 297 35 2 67.33 AACATCAGACAAGAGGCCCGAAATAATAAAATACATTAAAAACTTCATGAGCAACAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACG:1 - chr3L 9172399 5' + Doc 4535 1 45.54 TATTGTATTATTTCGGTATCATAACTGATTAATTTAACTTTTTCTAGTTTACAATAATTTAACTACAATTACATAACAAACACATATAACAAATTGGATTT:1 - chr3R 3170805 5' - X-element 4564 1 67.33 CCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCTCTCAA:2 - chr3R 1977611 5' - micropia 415 2 60.40 TTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGA:1 + chrX 21852453 5' - gtwin 7361 2 55.45 GTCCCTTAATGCATTATATTGGATAGCTGTTTGAGTATGACATTATTAATAATTCGCTGCATACTCTTGCGCAGCAGGCCTCGGGTGGTTTTTTTACTC:1 - chr3R 11391203 5' + hobo 2799 1 66.67 GAATGGTAATTGCGGACCGTTATAATACAACCGCGCATAATAAGATCGAGAAATGTATAAATGCGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCC:1 + chrX 154356 5' + I-element 4972 1 72.28 CCTGATCCACGAGAGCCTGATTGAAGGTTAGCCATGTGTGAACGTGAGTGTTTTGTTATGGCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr2R 7307832 5' + 412 16 2 63.37 GCTCATAGGAAGTGGCTATCTGAAAAGTGGACTAGTGACTGCTAGCCAAGCCTTCAAGTGAGTACTTAAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 - chr3L 14286093 5' + 412 5 2 73.74 CTAGAGTTACGGCAGTAAGAAATTACAGTTGCCGGGATTTCATTACATGAGCTCCAGTTAATATCGAAGTTTAAAAGCAAAATTCAAGCCCAAGTGCAACC:2 - chrX 4148742 5' + Porto1 69 1 52.48 CTTTTCAAGTGCCTTTATTATTAAGGGGTGTTAAAAAAACGCAAAGGTCAATTGTATTGGTACATATAGAATTATTCTTCAAATTAAGCATAGTTTAAAGA:1 - chr3L 10784235 5' + Transib5 437 1 77.23 GCTCTGTTGAAGAATAGGTACATTTCGATCAATTTAGGCAAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3R 7015516 5' - roo 9041 1 58.42 TTACTTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 - chrX 3295671 5' - hobo 2900 1 63.37 TTTTTGTTACTTATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chrX 3295677 5' - hobo 2907 1 57.00 TAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr2R 17348631 5' + jockey 22 1 61.39 GTCAGTTGATTTGCATAAAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chrX 10196076 5' + 297 16 2 54.46 TGTATAATTTTGCGAAAAATAATGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr3R 13620260 5' + Doc 29 1 54.46 TATGGTGTAAACGGTGTAAGCAATTGGTGTTGTGCTGGTTGTTGTTGTTGATGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTG:1 + chrX 4244518 5' - jockey 4627 1 53.47 GGGCATCTATTTCAATTTCCCCCTGGCAATTACGAGGCAGTCGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr3L 15729676 5' + hobo 33 1 56.44 GACGCAATAAGGCAACATTCAAAACAAAAGAAAACAAAACGCAATAAGGCGGTTGCAATAAGGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCA:1 - chr2L 23390014 5' + Doc 4568 1 62.38 GCAGAATAGCTGAGGATGTGGAGTTTTGCATAAGCCAGCCGAGTTAGCCGGTTAGCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 31768709 5' - roo 388 2 56.44 TTTTAATTGAAATATGGACATAGAAGGAATCTAGATTCGGCAATCCGAGCTTATTTAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr3L 15869740 5' + pogo 16 1 63.37 AAGGTTCCTCTTTCTGGGTGCACTGCAGCAAACAAGTTCCGGTCACCATTAAATAACATTTAAAATGTCAAAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTC:1 - chrX 5126362 5' + I-element 467 1 72.28 ATTTGTATTGATAAAAACATAAGAAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1 + chr2R 20506831 5' - mdg1 7410 2 74.26 TGAAAAAGGCACAAGCAGCGGACAGCAAACAAAATCCAAAACAAAGCTGCAAAAAGGAGGGAAAAAAGGTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACT:1 - chr2R 21902150 5' - roo 9064 1 70.30 CTATGAAGAATGTATTTTCCCGCCACCGCTCTACGTGAACATACAAAACTCCAGAGTTTAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTC:1 - chr3R 7635585 5' - HMS-Beagle2 6875 1 58.42 GATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCT:1 + chr2R 11246993 5' - 1360 118 1 56.44 ATCGTATAAAATCATATTTCACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTA:1 - chr2R 2092820 5' + Doc3-element 55 1 70.30 TCATTGACCTGCCAAATAGTGGGCGAGAAGAGTGCGAAGTGGCGAGTGCAAAAGAGAGGAGAGCGCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chr2L 16276101 5' - 1360 3378 1 68.32 AAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTA:1 - chr2R 5531209 5' + 1360 52 1 75.25 CGCCGATGCCAGCCAGCTCAACTTTAAAATTTAATGCCATCCTTTTGTGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACGGAAGTCGCGG:1 + chr3L 19457021 5' + jockey 36 1 50.50 TGATTACCTGATACAGGCAGAGCTTTTTCCCTAGTCAACTTGTAACAAATTGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 + chr2L 9129120 5' + 412 7078 2 54.46 CAGAGGTGAAAATCTGTCAGTTGATTTGCATAAAATGTTGCCACACTCCATTGCGCTTTATGTGTGTTTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:2 + chrX 10196061 5' + 297 1 2 69.31 GAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTT:2 - chrX 21668056 5' + Tabor 6890 2 74.26 GATTCACAAATCGTTGGCACGCATCGGGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 12217361 5' - roo 359 2 70.30 ATCTATAAGCCTAAAATAATGCCAAAAAAGGACTTAACTTTATTGTAACTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chrX 8326283 5' + opus 7026 2 52.48 TCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCAT:1 - chrY 3648862 5' - HMS-Beagle2 264 2 82.18 TGTATGTATTGTATATATAGCAAATCATATAGTGCTGTTTAAAGCTTTAACTTTAATTGTATGGCTGTTGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTT:2 + chr3L 24210876 5' - HMS-Beagle2 307 2 74.26 GAGGGAAACATTTGTTGTAATTTTTATTGATTATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 + chr3L 5282178 5' - Transpac 5189 2 69.31 GACTTGAAACTATTTTTTGTATGCCAAGACAGAACTAATTAAACAATCCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 - chr3L 7266587 5' - mdg1 393 2 52.48 AGTTAAGTGTATTTCAAGAAAGTTAACTGTAAAATTAATTATAAAAGGCAATTGTGCATGTGTATGTGAGTCTGGCCATAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2R 8375609 5' - accord 184 2 75.25 AACCGTTTCGCCCCCAACCGATTTGCGTCCCTCTGGGTCGCTCGTGTTTGTAAACAATTCGAGGGACATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAA:1 - chr3R 13619786 5' + Doc 4649 1 72.28 GTTCACTTATTAATTTAATTCACTTATAATGTTTGTTATTCACTTAGTTATAGTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:2 + chr2L 22362035 5' + Doc 31 1 55.45 AGAAGACGAAAGACAAAAAGCCGAGCGCCGAAAAAGCACCGACAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chr3L 5351562 5' + P-element 35 1 42.57 AATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAT:1 + chrX 18193741 5' - hopper 1367 1 75.25 TTTAAATTCGTGAAAATTTTGATGAATTACACTTCGTAATATATATGGAATGTTTCGTTCCCACAAGCCAGGTCTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 16399030 5' - roo 9064 1 66.34 ACATTTACCTTATGCCCGCCCGTGCGCCAATGCTACAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGT:1 + chr3R 21591959 5' + Bari1 38 1 64.36 ATTTATCAAATATGAAGATGAAATACTGTGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 - chr2L 14993446 5' - 412 7499 2 69.31 AAAAAAAAAAACCCAACTTAACGCCTACTGTTGTCACATGTTCAATACCTCTTTAGAATTAGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGT:1 + chr2L 22543606 5' + accord2 7401 1 68.32 CAAAGCATAGAACCCGAGCCCGAGCCCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATT:1 - chr3L 15730821 5' - hobo 282 1 75.25 TAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAA:1 - chr2R 2092791 5' + Doc3-element 84 1 57.43 TTGGCACCACCCTGGCCAGCCCCCAACCACTCACAAGCAACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAG:1 + chrX 8795869 5' + F-element 4510 1 61.39 CATCGAATACTTTCTAAATAGATCATTATTTAAGATTAAAATAAGCTTTATACCTTCCATACATAAAAGCTGGAGTCGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTT:1 + chr3L 27381109 5' - gypsy6 182 2 71.29 GGCCCACAGCAGGATGTCGCTGTCGATTTGGCAAACAGCGGAAGTGGCATTCTCCTTCCGGTTGCCACTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3R 25360885 5' + jockey 12 1 76.00 TGAGGGCGTGCCTAAAATAAGGGGCATACTGGAAAAAACATAAATAAGGGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCT:1 - chr2R 25216607 5' + 3S18 5793 2 56.57 CTAGATTCGGCAATCCGAGCTTATTTAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3L 15869710 5' + pogo 46 1 74.26 AATCATAAAATATTGTCATTGAATCCATTTTTGGACAAGGATGGGGTTCTAAGAGTTGGAGGAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCGTA:1 + chr3R 19446865 5' + Stalker4 7106 4 63.00 ATGACGTTGTGGATTTCAATTGATTGGGTGGATGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTAT:1 + chr2L 15151881 5' - Tabor 7282 2 64.36 TTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 + chrX 5131001 5' + I-element 45 1 65.35 ATGTGTACCTCTAGCCTACTACATTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTTAGACTTACAATCCGATCTAG:1 - chr2R 1234688 5' + Q-element 628 1 77.23 GTGGTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chrX 15227346 5' - roo 9042 1 56.44 TGGCTGGCGCCCGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chr2R 17348644 5' + jockey 8 1 72.28 AATCACTTAATCCACAAGCACCATGTTTAATCAACATAATCAAGCAGAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:2 - chrX 12166600 5' - pogo 2078 1 54.46 CCGCAGTGTTCTTTCCATGATTTCTATTTCTAGGTGCTTTGTTTTAGGGCAGCAAAAAGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 13167304 5' - roo 393 1 61.39 TGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAA:2 - chr2R 5531185 5' + 1360 76 1 51.49 TGCTATAGTTTTTTCTTAGGTTTGGAAGGTCTATTTTGTAGGTTTCTAAGCCAAATATTAAAGCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chr2L 12246554 5' - hobo 2928 1 58.42 AGAAACGGATACCCTGTACAAACTATATCAGGCTGTTGATACTGATCAAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr3L 15869644 5' - pogo 2077 1 55.45 TTGAGCGTGCTGCGAAAACTAAAAGCTATAACTAAACCGAGTCAGTAAAAATACAGGGACTTAAGAGTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAC:1 - chr2R 1725961 5' + Doc 13 1 72.28 TGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:2 + chrX 17492871 5' + Tirant 8124 2 64.36 CTTTTTCAATGGCCGTCAAATAATGCAGCCAACATCCTAGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chrX 5168852 5' + hobo 38 1 59.41 CTGTACTCCTGCATTCATTACATTATTCAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr2L 4868578 5' - blood 329 2 74.26 CCTCGGAAAGAGACGATTAAGAGAAACAGGACACCCCAGGAGATGGGAATCCTCAGGTCGTGATGGAGGGTCTGGACGGGAGCCAACGGGGCTAAATTAAA:1 + chr2R 640792 5' - mariner2 230 1 75.25 GTAGGTAATTCCTAGCTTAGGTAATGATAACGTCGAACGCGTTGCTCTTATTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 - chr3L 15353597 5' - mdg1 7436 2 56.44 AAAATAGGTTCAAAACAATACTGGCTATGCATAACTTTCCTAGCTAATTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACT:2 + chr3R 21710553 5' - mdg3 218 2 50.50 AAAGAATTAGAATTCAACGCAAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTC:1 + chr3L 18794274 5' - P-element 2736 1 25.74 TTTTCTTCTTGCTTTATTTTCAGGTGTGTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGC:1 - chr3L 8037451 5' + invader4 2747 1 72.28 AATAATACAATTAATACAAAAAAGACCAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGT:1 + chrX 8478336 5' - F-element 4302 1 76.24 CATTCTGACTGGTACTCATGAATGGCCAAGACATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2L 10104323 5' + roo 45 2 71.29 GAGGAGCTGCCGAGATTGGAGGGGAATGCTACGAATAAAATTTCATTAAATACACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr2L 12888799 5' - 412 470 2 55.45 GTTAATTCATCCTGTCAACGGTGTGGAGCTCGTTAACTGGCGGAAGTAGTGCACTTGGTCGCTAATCTATGGCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3R 17529623 5' - roo 405 1 74.26 TAATACCTCGTACTGTTGCATATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACAC:1 - chrX 7618445 5' + F-element 4446 1 79.21 TTTTGTCTGTTAAAAAAAATATATATATTTTCACTTTTTGTATAGATTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTT:1 - chr2R 1333506 5' + Cr1a 244 1 70.30 TACTAAGGGTATGCCATTTTTCTCATGTCACACGAATGGTTACAAATTTATAAATATTTTAAGTTTTTTTAAATAGTAAAAACAAAGACACTAGAA:1 - chr3L 11314524 5' - Tc3 318 1 42.71 TATCGAATCTGTAAATCATTAAAATTCCATTTGCATCAAAACAGCTTCAAAGAATTATCAACAGTTTAGAAACAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTA:1 - chr2R 4671845 5' - Quasimodo 169 2 76.24 TAAGTGCAACCGAGTCCAAATATTCAGCTCGACATCCATCACTTTTTCGGAACATGTGAAATTCCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chrX 7019168 5' - hobo 2927 1 67.33 CTTCCACCGTTTATATGGCGCATAAAATTAATAATAACAACAAATGGCGCGGATGTTGGATGGAGTTGGGTTGCCGCCGAGGTAAAATGATTGAGACAATG:1 + chrX 18182222 5' + frogger 23 2 76.24 CCCAAATGAATTGCGGCATATGCAAAACGTAAGACGACATATGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGAGCCACACACATACACTACTCCGGATGTAC:1 - chrX 13863020 5' + Idefix 79 2 79.21 ACGATAGTGTAATATTGTAGCAATCTACCCAGAGTCAGTCGAGTTTTACAACTGATAGGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGATCTATGCTCCAGAAAAAC:1 - chrX 21790169 5' + gypsy11 407 2 68.32 CAATGCTTTTCTTTTTTTTTTTGGCCAACATCATCAGCATCGAGTGCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 + chr2L 13874046 5' - mdg1 397 2 51.00 GGGAAGAAGATAAAGCCATAAATGCACGAAAATGAAAATAAATAGCAGCCGGTACCAGGACACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 - chrX 12193548 5' - hobo 2926 1 64.36 CGTTTTTCTTTTTTTTCTTCGTCTCTCATTTTTCTGGCTTTTTTCAGCCCTTTTAAAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 20708188 5' + FB 877 1 55.07 CATTTGGCTCCGTCTGGTTTTTGTTCGTCTTGCAGTATATCTTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr2R 12779966 5' + hobo 33 1 61.39 GTTCCATTAGTCCTGATATGGAAATGCGACAACGGTACAACCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 + chrX 7145005 5' - hopper 1381 1 57.43 AGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTTCTATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr3R 8176875 5' + 297 6600 2 61.39 CTAATTCCTCGCTGGGCTTCTTAAACGCAAGCGAAAATATCAGCGTATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTTAACAAAATAAAAACAAC:1 + chr3L 26345386 5' + Porto1 252 1 69.31 CTGGCATCAGCAAAATATTGTCATAGTCCTGCGACCAGGCATCCTGGATCTACAGCCATACTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chrX 14371373 5' + jockey 23 1 67.33 GTATTCTTGTTAAGTTTTTTATGCTAAAAAGGAGTTCAACAAACTTGTGTCTGTCTCTAGAATCTGTCTGCTGCATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTC:1 + chr2L 21330124 5' - INE-1 158 1 65.35 ACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2R 17348621 5' + jockey 30 1 52.00 GGCGCTACATTTAATCTAATCTTGAGCAAATAAATGGCATCATACACCGGCACACAGACGGGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:2 + chr2L 9672394 5' + 297 6590 2 68.32 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTC:1 - chr3L 11720528 5' + Tabor 6918 2 53.47 TAATTCAACAATGAAATTTTGCGCAACACCAAACAATAAAGTAGTTCTTAATCTAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 18977892 5' - roo 9051 2 58.42 AGAACCTGTCTTAATAAATACGGTATTAAATGACAAAATAGATGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCC:1 + chr3R 19446594 5' - roo 8949 2 63.37 CAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:2 - chrX 21668083 5' + Tabor 6863 2 55.45 GTTCTTTCTGCGCCCCATACCATGACACCCCCCACCAGACTGTGAAAGCGATTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTA:1 - chr2R 5517574 5' + I-element 247 1 55.45 GAAATGAATCCATTCTTTCTCTCTTAAGACAAATACAGCATCTGAGATAAGTGAGTGAGTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chrX 9649889 5' + blood 7030 2 61.39 TAATTAAAACTTTAATTTCACTTAACTTTGTTTTACAATAGAACATTTGATAAAATGTATTCACTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 14835288 5' - roo 397 1 60.40 TAACACGCCACAACAAACATTCGACTTCGACTAGGACACACAAAAAATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTACCAACTTGTCCGTTTTGCC:1 - chrX 17935366 5' + I-element 5001 1 75.25 ATGTTTTAATGATGATATACTTACTTATAAAGTGATCAGTGGATCGTCTTGTTTTTTGAGTTGGCAGAGATTCCGGCAAATCTAACGGAAT:1 + chrX 18975397 5' - diver 457 1 51.65 CAGCTGCGTATTATGGCAACATGACTTTGGCATTTCCCTCCCTCCTTCCAGCTCATATACAGGGTGCGGCAGCATAACTTCCTTTTTTTAAAATGCGCGCC:1 + chrX 22679088 5' + mariner2 20 1 57.43 AGCAGCAAAACAGCCGAGAAGAAAACTGGTGTGAGAAAATCGTAGATGTACTGGGTTAGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr3L 10821699 5' - 1360 3370 1 74.26 CTTACCACCAACCCCCCCCCCCACTCCCCTCACCACACACTGACAATAAGCCGCAGAGAATGGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3R 29611013 5' - roo 9056 1 49.50 ACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3L 3535456 5' - roo 9048 2 53.00 GAACGTCTTTGTCAATTTGTTTAACTCAAATGTATAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 + chr2L 21777925 5' - mdg1 382 2 67.33 TATATTCAAACAAGTGTGTACATAAACCTTTTGCTCAGTTTGCAACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 + chr3R 12055039 5' + Doc 37 1 61.39 AGAATAGGTACATTTCGATCAATTTAGGCAAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 7015506 5' - roo 9031 1 66.34 CATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATA:1 - chr2R 2875205 5' - TLD2_LTR 116 1 67.33 GTATATCCGTGGCCCACATGCTTCTTTTTTCTTGTCGCTCTTTTGCTGAGGTTCATGTGTTTTGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGA:1 - chr3R 11392535 5' - Doc2-element 480 1 68.32 AAACACCCCAATTCAACATGCTGACAAAATAATACTCCTACAACTTATAACGGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGA:1 + chr2R 20512410 5' - mdg1 7451 2 60.00 ATTTATTGATGTCCACTAAACATAGTATACAAACATGAGTAAGAGATATTTACGTTATACTTTTTATACATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 - chr2L 21631918 5' - pogo 2094 1 72.28 GGGTTCACTTATGCCAGTCCCAAATTCGGATCATCGCTTTTTTCATTAATAAATAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCG:1 - chr3R 3625696 5' + Max-element 24 2 55.45 CAGTGTCAGGTGAAAATAGAAGGGCCAGCTTTGTTTATAAGGGATAAGGCAACAGTACAGTGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chrX 11503448 5' - roo 393 1 64.36 GTTGGCTTATTAGCAAAAAAGCGCAAACTATGTGAAGAAAAAGGTGGAGAGAGTAATACAATCACGAGCGGCACGACATGCATTTGGGCTACCCTGGTATG:1 + chr2R 2950833 5' + G5A 2515 1 63.37 TTTCACCGTTATTATGTTTTAGCCATCGATTAGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 + chr3R 6136500 5' + Burdock 6177 2 69.31 AAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAGTCTCAATCATTTAAAATTCAAGCGAGTGAATGAACAAACTACTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 + chr3L 15288233 5' - 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hobo 44 1 60.00 ATTATGTTATATTTACGACCTTAATTTACATATTGTTTGCGTGTTTTTCCATTCTCGAGGATCGTATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTA:1 + chr3R 4104872 5' - Idefix 6914 2 57.43 TGGTATGGCGACACTTTTCCAGATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGC:1 + chr3R 30312087 5' - blood 296 2 78.22 CGAGAGAGAGAGTCATAGAACTAATTGAAATGGGAAGAGGCCTTAAGGGATTTTATTGGGTTACAGCCAAGACTGTAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTT:1 + chr2R 14402216 5' - Tabor 7323 2 77.23 GAATTCGCTTCCCCGGGTGTCCGTCATTCTGATGCTGTCGCACTCTCTTTCTCCCTCTCTCACTCTCTTTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCGC:1 - chrX 14971301 5' + Cr1a 293 1 74.75 TATGAAGGGAGTTGAGGTCCCTGATGGTTTCGTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr2L 20269976 5' + pogo 41 1 72.28 GGTTTAACAAGGGTGTGGGAGTACTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCG:1 - chr2R 17276070 5' - jockey 4642 1 76.24 AATTGTATTGTATTTTAGCACAATTATTAACTGTAGTCCCAAGCACATCAATATTATTATTTATTTTTGTATATTTTTATTAAGGCAAACGGGGTAGCTTA:1 + chrX 22729106 5' - BS3 1749 1 60.40 AATAGTGTTAACATTTTCTGTCTTAACCAAAATGACCATTGGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chr3R 13620277 5' + Doc 6 1 52.46 ATTACCATATTTGCATCGATTTTAATCGATTGAGTTATTCTCTAAAACTAAACCTAAATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAA:1 - chr2R 4156296 5' - pogo 1749 1 64.36 ATTTAGTTGTTCGTTCTTAAAACTATATTTGCTTAAATCCTTTAAAGCCGCCTGAATGAAGGCTGAAGAACTTGAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chrX 2917279 5' + jockey 12 1 72.28 GGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTT:1 + chr3R 11080698 5' + I-element 37 1 62.63 ATTAAAATAAAATGCAAGTCGGGTAATGAGGAAAATGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATT:2 + chr2L 13868712 5' - roo 369 1 64.36 GGAATAGTAAATTGTCTAGTGAATTTTTAACCACTGTTCATTGAGCGATTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAATTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3R 12546801 5' + hobo 25 1 54.46 ATATTGTATTTACTTATATGTTATATCCTGTACTTCGGTGGAAACCATACTTAATAAGATAATCACTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3L 4539131 5' - roo 409 1 76.34 GCAGCCAGCAAGAATAGTTGCAAACAAAAAATAAATTCAACGAAAATGAATTAGAAGCCAGAAAACTCTTAAAACTCTTAAATTTCTCTAAGGGAGTTATT:1 + chrX 4181153 5' + I-element 480 1 58.42 TTTGACGCTTTGCTCGCCGATGCCAGCCAGCTCAACTTTAAAATTTAATGCCATCCTTTTGTGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr3L 19457007 5' + jockey 22 1 64.36 AATCTTGAGAACTATATCAAANACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCT:1 + chrX 22726198 5' - Helena 1270 1 45.54 AAAAAAAGCCACGTCCGATTTGTATAAATCTCCGTCTCCTCCTAATCGAAAGCCAAACAAATCGGAAATCGATCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3R 31418668 5' - roo 405 1 72.28 TCTCAACTTTATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGC:1 - chr3L 15452928 5' - accord 498 2 61.39 CTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:3 + chr3L 11257357 5' + 1360 3383 2 48.51 TAATAAAGAAATATTTTCGTTGCAAAGAATAAGCGCACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCA:2 - chr3L 27395602 5' + invader4 2921 2 63.37 CCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCTCTCAAA:4 - chr3R 1977610 5' - micropia 414 2 62.38 CTCTTATTAATTTATTAGCGAGTAATATATGCGACACACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTAT:1 + chr2R 11276635 5' - roo 370 1 63.37 AGGATAGGTTTTCATTAGAGTTGTTCAGGCATTGATTGGTATTCTTTGGATATTCCTAATTGGAAATCTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chr3R 28333616 5' + pogo 6 1 73.27 GTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTANNNNNTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 3535428 5' - roo 9025 2 69.47 GCTTTTTTATAAAAGAAAAAGAAACGAGGTGATGAAACATCAAGGAGGTACAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr3R 19515794 5' - 412 7522 2 54.46 GAAATAAATTATAAGAAAACACGGGCGATCAGAGCACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGCGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGAC:1 - chr3L 6844064 5' + I-element 174 1 63.37 AGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCTGAG:1 + chr3L 25804311 5' + gypsy 7130 2 83.33 TTCGCACGGAGCCTCGACATTTACGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 + chr3R 6187680 5' + 412 55 2 80.20 AAACTTTCGGTCTGAATTCGTAAATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGC:1 + chr3R 935449 5' + HMS-Beagle 6842 2 73.27 TAGGCGTGGCACCAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTG:1 + chrX 21667978 5' - Tabor 481 2 68.32 CACGGCCACGCAAACCACCAACTCCACCAGCATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATG:1 - chr3R 18426651 5' + I-element 5038 1 76.24 AGGTAGGAATTTTAAAATTAGAGAATAAAACCGAAAATCGCAGGCAAAGTTAAAGCTAAAAGACAGGCACATAACGACCATCTCCCTACTGGACAATACTG:1 + chrX 5253828 5' + G7 1005 1 70.30 GTTAGTTTTGAGTAAAACCACTTCCTTCTCTATTTTCTCCCCTCCCCGTGTGGTCGACCCCTTAACATTGCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:2 - chr3L 3535475 5' - roo 403 1 71.29 CCCTTTGGCTAGGGCCCCCTACCCACCTCTTGTACCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCG:1 + chr3L 19173546 5' + transib2 40 1 69.31 CAAGCTTTTAAATGAAATTTCTGCTGATTATGTAACAAACTGAAAGCGAGTGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 23870170 5' - roo 9064 1 71.29 TTTCTTTTGGTTGGGCTGCCATGGTGCTATTCTTCGTTCGTTTTGAAATGTATGCGAAATGAGTAAAAAAAAATCATTGAGAAGAAAACAAAACGAAAAAA:1 + chrX 8421068 5' + mdg3 5102 1 61.39 CAGATGCTTTGTGTGGGTCGTCTGCCGCATTTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGA:1 - chr2L 19623136 5' + Burdock 6181 2 71.29 GACAAGTTTCTTACTTATTTTGCTTACCCTAACCAAGATCCAAGATATTAATGGAATGCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chr3L 8044300 5' - mdg1 403 2 60.40 AGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:9 + chrX 17492867 5' + Tirant 8120 2 68.32 AAACAACTCAATTTAAGCATTGCCGCCCACTAGAGAACATCCGTATCCAGTTCCATTTCCAGTTCCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGT:1 - chr2L 15151961 5' + Tabor 11 2 68.32 AACATGGGGAAAGCTTAATATCTAACAGTTTGTTTAAATCTACGAATTTTCAGACATTATTAGCCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAA:1 - chr3L 920567 5' - mdg3 5487 2 69.31 TACCGCATAAGCCATCGGGAAAATGCCTAAAATTATGCCACAGCCCGAGCAAGAAGCTCACACATCTTGTACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGC:1 + chrX 4248792 5' + jockey 4610 1 70.00 TGATCGGCATTTGTAATTGCACACACTCCTGTAATTGCACAAACATTGACCTCGAGCGAACAGCAATTAAAACAAAGTGAGAAAATAAAAAAAAAGGAAAA:1 + chrX 5063427 5' + Doc2-element 227 1 64.36 GTTCGAACTAAAACCGAATACCACATTCCGACTTTTGAGCCGCCTGCTCCAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr3L 14205406 5' + P-element 26 1 53.47 GTGTTTGTGTGTTTTTATGCTAAACGGTGCTCCCGGCTCAATTATTTATAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chrX 5892448 5' + I-element 43 1 51.49 CGATTTACGATTTACGATTTACTCTCTAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAAATAATATCAACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTATTA:1 - chrX 8569499 5' + FB 361 1 69.31 AACATTTTGACGATTTCGATTTTCAAAAGTCAATATTTACACAACGTCATCGTCTCTCCTCCGCTTTTCTCCCTTAAGCTCACGCCACCGCATGCCGCGTC:1 - chr3L 20891562 5' - invader3 5382 2 68.32 CTCCAAATCGGCTAATAAATGTGAAATATTCGAGGTTTCAGTAAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATAAAAATCCCCTC:1 - chrX 7833005 5' + Doc 4486 1 55.45 GCCATAATTGGTTTATCTATCAGTGCGGAGAGCTTAATTACATTTTTTGCTTCTTTGGCGCAAACAATGCGGATGGGTGTCTGTTCACACATGAACACGAA:1 + chr3R 6097561 5' + roo 8663 1 81.19 TATTTGGAATTGTTTTGTCACAGGCATTTGAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAGCGTCCTCT:1 - chr3R 25526392 5' + transib2 46 1 68.32 CCCGTAGATATGCAACACTTTCTTGCTGCTGCCGCTTGACATTGCCACCGCGATTTCATTTTTTTTTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2R 17348635 5' + jockey 15 1 64.65 TAACAAGCAGACCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTT:1 + chr2L 22699412 5' - INE-1 574 1 79.21 AGCCAGGTTAGCGGCCCTTGCACGCGATGTTGTGTTTGAGTTATGACGTCATTAAAACGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAG:1 + chr3L 9190438 5' - 412 492 2 72.94 TTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAGCTTTGCTTTATTTTATTAATTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAG:1 - chr3R 23429887 5' - TAHRE 10423 2 65.00 CATTGGTGTGGTATCTTACTGAAAAGTAATATACGTTCATATTAAATATAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chrX 15227353 5' - roo 386 2 55.45 CATATAAGAAAGTAATTGCCAAGAATCTTATCTTAATCTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chrX 17754547 5' - 412 455 2 63.37 GGGAGGTGCAGAGGTGTGAGCTCAGGGGGAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 + chr3L 14558233 5' + 297 10 2 70.30 CTTAAATTAAAAACTTACAAATAAGTGAATAACAGAAATATTACGAACAAATAACGGTATGGATGCACAACAAATTATGCGCTTAAGTGTAAGTAAAAATG:1 + chr3L 8259592 5' - rover 93 2 53.47 ATCCACTAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 + chr3R 22494713 5' - 1360 3345 1 74.26 GTTCCTTCAACCTTAAGGGTAACACTAATACCAACTCGAAACACTTTCCGTCTGTTCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAAAGCTAGAAGGTTG:1 - chr2R 556928 5' + INE-1 159 1 54.46 GTTAGGGATATTAATATATAATTCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATC:1 + chrX 21218854 5' - roo 252 2 77.23 CTCTTTTTCTTCAACTTTGGCGGCGGCGGCGGCGGGTGTGCGACTTCAGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 - chr3R 13996002 5' + 1360 24 1 53.00 CAAATTTTAGTAATGGGTCTAGTGATATATCCTTCCTGCATCTTTACTTTAGCCACTCGGACCTTATCATCATTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGT:1 - chr3R 19448075 5' + roo 190 2 77.23 ATAACTTTCCTAGCTAATTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCATTTATTTTGATCTGTCCTTTATCTTGGT:1 + chr3R 21710583 5' - mdg3 5439 2 75.25 GTTGTAAAGTTGATTATGTTAATGCGATTTAATTCGCATTGGAGTCGCAAAATATGACTCCTGCATTCCAACAGTCTACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCA:2 - chr2R 10700456 5' + gypsy4 6690 2 55.45 ATCACAAACTAAAAGTTGGAAAGGCCACAAGCAACAGCTCTTTGTTAAGTCTCGAACAAGAATAATTTGCACACGGAGAATATGAATTATATTTTAAGTTA:1 - chr2L 3532838 5' - copia 187 2 79.21 AACTAAAAGATGTGTCTACATCGTGCTTTCGTTTTCAATTCAATCTGCTTGAATAATTCATCATGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:2 + chrX 5130968 5' + I-element 12 1 67.33 TACTTTCATTTGCATTTCGCATAATTGTTATAATCTAAGGGCCGAGTCGATCTAGCGATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTAGATCTCAGGAACTATAAAA:1 + chrX 20805118 5' + INE-1 147 1 57.43 AAATATAAAGAAAATTTATTATGGTTTGTTCAAGTTACGGCGTTTGGACTGTCAGCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGT:1 + chr3R 19446043 5' + GATE 8298 2 92.08 GGAATAGTAAATTGTCTAGTGAATTTTTAACCACTGTTCATTGTGCGATTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr3R 12546801 5' + hobo 24 1 57.00 ATCTACAGTGTGGCTGAGCGGAAAAACTCGAGACAAAATGGCAAATCCAAAGAGTTTTGACGCCGACAATGCGCGAGTTACAACCCCACCCCCTAAACC:1 + chrX 17492861 5' + Tirant 8112 2 75.76 TCTCACGAATACTGGTTATAAATTATATTAAATTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chrX 11503522 5' + roo 8707 2 73.27 AATCAGACTTCTGTCTATCCACACAAATCCGTACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGCCTG:1 + chr2R 15049364 5' - invader2 5019 2 66.34 GACCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCACGACTAT:1 + chr2L 22699421 5' - INE-1 565 1 79.21 GTCGTGTGAAATGAGCACTTTTGAGTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr3R 21587297 5' + pogo 48 1 76.24 AAATTCATAGAAATTATGACGCGAGCGCAGAAAGTTGCAAGAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chrX 15219369 5' + hobo 34 1 61.39 TGCAAATAATTTCTTAATCGATAAAGGTAAAGAGAATGTATAAACATTGAATATGTGTGCTTATAACGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr2R 12625470 5' + pogo 7 1 68.32 ATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTACGATCTCGACGATCATACGGACAGACAGACAGAGCCAAATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAA:1 + chr2R 1751255 5' - INE-1 87 1 91.84 ACATTCATTTCCGCCCCAGCATCACCGCCATTCCCACTGCCATTTCATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 21219499 5' - 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chr3R 30263643 5' + roo 8672 2 69.31 TTTTTTCAGTAAATTACTTTTAAAGGACACACATGCAAGTAGTTTCATTAGAAACTATATACCCCTTATCTATAATCATTGTCTGACTATAATAGACTTTA:1 + chr3L 23269395 5' + Cr1a 4200 1 65.35 TTAGTTTGACATTCCAATATGTCAGATTGTGGCTACTGGCAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTTCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTAT:1 + chr2L 15194702 5' - copia 218 2 60.40 CACATTCATTCGCTGGCAACTCAATTTCTCAGTTTCAGTTAGTTTCAGTTTTTGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:2 - chr3L 10576867 5' + roo 21 2 58.42 ATTTCGGTCAAAATGGAGGCTGTCGGAACGCTTGAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAG:1 - chr2R 4672122 5' - Quasimodo 168 2 67.33 GAAAGTGCACTTGCAGTCAAAAAGAACAGTGCTACAATTGCCTATATTTTTTTTCAACTCGTATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 + chr2L 22342223 5' + F-element 36 1 51.49 ATGATCCTCTTCGCCTTATAATGCATTTTCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 - chr3L 494684 5' - Transpac 5184 2 73.27 AGTGTGTACATAAACCTTTTGCTCAGTTTGCAACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3R 12055051 5' + Doc 49 1 73.27 ATCTCGAATCTCCCAGGACAGCACTACAGCAGAATCTGACCAGCAATAAACGGGCATGGTCACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAA:1 - 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chr3L 16140965 5' - opus 7247 2 62.38 GATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTCATGTCCATCTGTCCGTCTGCCCTGTCCGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACA:1 + chr2R 5250069 5' + INE-1 173 1 95.79 CAATGACACCACGACACCATAAAAATAGCATTGAAATGCTATTGAAATAATCAAAGCATTTAAAGTAGTGAGTGACATGTAAGAAAATATATTTTAAATGT:1 + chr3L 4517119 5' - Transib5 2727 1 73.27 AGAAGGAAAAGCAACCCAAATATTGAGTCAATAACCAAGCTGGCTTGGATTTGCAATAAGTGGGAAGTACATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTT:1 - chr2L 16758354 5' + Max-element 8242 2 72.00 AAGAAGATTCATTAGGAAACCTGCTGTCTCGATATTATTTTTCCCACACTGCAGTGTGCCGAATGAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr3L 25884065 5' + Doc 16 1 58.42 TTTTACTAGTACACATGTGCAGATTAAGGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3R 13167374 5' + roo 47 2 74.26 AATAGCTATTAAAGTTATGGATTTACTTGTAAGATAGGACTCGAAGATAATATATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr3L 3862575 5' - hobo 2916 1 50.50 AGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTTTT:1 - 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copia 243 1 68.32 TCAGTTGACACCTCATATCCTTGGAGCATTTTCCAATCGAAAGACTCATCTTGCCTAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 1530392 5' - roo 390 2 58.42 TGCCGGAAAGTATGCAGCATCCTTTGACTGTAATTCCGGCTTACTAACCTCATGCCCTATACAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2L 13670266 5' + jockey 25 1 50.50 TATTTGTAGTCGAGGGAGTTGCAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3R 9328697 5' - hobo 2893 1 75.00 TAAATCTGTTAGAAAGAAAGTCTTAAATAAGTTGGCTTGTGAAATTGGTATGATAACTTTTGTATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 - chr2R 21833995 5' - Transpac 303 2 70.30 ATTTGCTAAATTATAAACTAATTATTACCGATATATTTTTAACTTGGGCAAATAGCAACAAAAATAAGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3R 7015422 5' + roo 8 2 70.30 ACCCTTCCAGCGTAAACTTTTAGATGGCTATATTATATGGATTTAGATGGATATATAAAATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1 + chr3R 15130457 5' + Max-element 8251 2 55.45 TTATTAATTAATTTCTATGTCTCCCTCCCTGTCTGTCGGCATATCGACTGCTGTGGAAGTTTATTGGTCTCCCAGTGGGAAAACTTTTAAGTCCCTTTCGA:1 - chr3L 25878350 5' - 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Juan 4196 1 58.42 AAACATGGGGAAAGCTTAATATCTAACAGTTTGTTTAAATCTACGAATTTTCAGACATTATTAGCCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTA:1 - chr3L 920568 5' - mdg3 5488 2 70.30 ACTTCAATGAGAGTTGAACGACTCCCGCAAAAAACCGTAGAAAAGTTTCCTCCGAGAGGTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - chr3L 19115926 5' - hobo 2924 1 62.00 ATGGAAAAAGGGTCACAGAGCATAGGTGCAGAGGTGCGGTGCGGCCGGTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACC:1 + chr3R 5773127 5' + Stalker 6852 4 77.23 TAGATACTTAAAATTGTTAGTTTTCATGAGAGCACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTAT:1 + chr3L 17123553 5' + hopper2 1358 2 68.32 AACCCTCAAGGATAAACGTAATTCAACAATGAAATTTTGCGCAACACCAAACAATAAAGTAGTTCTTAATCTAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr2L 18977874 5' - roo 406 1 76.24 AGTGTCTGAGCGTGGGCTACCTAGCCTGTCAACAGAATGACAGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr3L 13644609 5' - hobo 2905 1 58.42 AATTGGCTTAAAAAATATGTAACCTTATGCGAGAGCGAGCCGCAAACAAACTGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 + chr2L 12911238 5' - mdg1 398 2 55.45 TTGTCAAGTGCATTCATCTCTCACCCATGCCGCACCCCTCTAACTCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chr3R 11389810 5' - hobo 2913 1 51.49 TAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:1 + chrX 21668001 5' - Tabor 458 2 49.50 ATGGCCGTAATTGTTGGAACTGCATATAAAAATTTGTATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 - chrX 22590211 5' - Burdock 217 2 66.34 GCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr2R 9870979 5' - roo 9041 1 56.44 GAGCAAATAAAACCATTTCGCCATCAACCATGTCGGTATCCAGCTATGGAAGCAGCCGCGTTGATAAATATCGACGTCCAACTCTACTCTTCATATATATA:1 + chr3L 25499946 5' + Stalker2 24 2 56.44 CACAAAAAATGCAAGGAAATGGCCACCGGCCATATAGAGTATGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACC:1 - chr3R 24599286 5' + I-element 4887 1 58.42 GATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chr2L 17729380 5' + hobo 27 1 52.48 ATATTTTATACTAAATAAAATCGAATAGGATAGGAATAAGATAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATT:1 + chr2L 10189443 5' - roo 9038 1 56.44 AGCGAGTGTGGGACAAAGAAAGAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 23870126 5' - roo 356 2 76.24 TGATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAA:1 + chr3R 1418285 5' + BS3 222 1 62.38 TTCAAGTTACTCTTGGGACTATTGTTGAAGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr2R 12998350 5' + roo 47 2 76.00 ATTGCTGGCAGGTTGCGACCCTTTTGCGATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAATAATAATAAACAATAATGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chrX 8037597 5' + roo 8668 2 76.24 TGAACTGACTATGCTTAATACTTGTATATGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACGTTGGGAACAATCACATTGTAGC:1 + chr3L 26315807 5' + Tabor 6886 2 73.27 TTTTAAATTTTTTCAACAGTTGTATATTCTGTGCTGGGGAATAATGAGTTTACGTAACACAAAGTACATATACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr3L 4539253 5' + roo 3 2 74.26 AGAAGAAGGAATAAGTAACAGCTTGATATCTGTTTTATAGCCATTTAGTGAAAATATCGTTAAGAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACCTTACTCGT:1 + chr2L 10104247 5' - roo 398 1 64.36 CTTATTTTGTAACTTTTAGATTTTGCGTTGCAAAAATACATGTATATTTCTATTGCATCTTTGGGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1 + chrX 4278309 5' - blood 7376 2 65.35 GCCTTAAGGGATTTTATTGGGTTACAGCCAAGACTGTAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:1 + chr2R 14402255 5' - Tabor 446 2 70.00 CCCATATTAACACATTTCGCATTGCAGCAGGATTTACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr2L 16569537 5' - roo 9033 1 63.37 AATTTGCCGGCAGCAAATACATTTTGATTAATAGCCATAAACATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3L 12258262 5' - roo 9038 1 62.38 ATACCTTTTAGTATACCGTTTTACCAAAGACACTAGAATAAAAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCT:1 + chr2L 22113022 5' - 1360 3333 1 79.21 ACGTATACTCGGCAAGCTGACTTGGCTGAAAAACAAAGTAAGAGGTGGAATTAAGCCTTTCTGACCATATTAAATAATTATATTCTTGATCAGGTTCGATA:1 + chrX 7545356 5' + INE-1 84 1 69.31 TGTGTTATATTTTCTTCGTACAAAATATAACCACGAACCATTTAAAGGCTTTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACG:1 + chr3R 25859352 5' + Stalker2 31 2 49.50 CGCTCATATAAAGACGTGAAATAGAGTATCGATTATAACCCCGGGCGCCTCTATTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAAT:1 - chr2R 2980415 5' + 1360 3081 1 55.45 ACCGCGAAAAAACAGCTTTCTCCATAAATGGAGGAAAGTACGAATTTTTCACTTAAACTTCGATATTAACTGTAGCTCTGTTAAAAACACGTCCGTCGGGG:1 - chr3L 15871154 5' - Porto1 15 1 59.41 TTGTTGTCACTATTAGCCAGCCATAAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAG:1 - chrX 10298049 5' + Quasimodo 47 2 75.25 AATGGATGTAGTGGTTTATCGCTCATTCTCGCAAAATATTATGGCTTCGCTTCTCGCGCGCACTCTGCCGTCACTAGAATATAAAGATGCGTAACGCCATA:1 - chr3R 3620770 5' + 1360 15 1 71.29 AGTATTTAACTTTTCAAGGGTGATTACCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAGTGTGGATC:1 - chr3L 15694731 5' - Chouto 424 1 74.26 GTTGATTGGTTGATTGGTTGGCGGGCGTTGGCAGCGGATAGCAAAAGTGGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGG:1 - chr2R 17353867 5' - accord 292 2 57.58 TATTTTTATTTTCTTCATTAAATTTAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCAT:1 + chr2L 13053205 5' + G2 331 1 75.25 GTGAAATGAAACTATATGAATGTAGGGCTTTTTTCCAATGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:2 - chr3L 17635588 5' + 297 27 2 59.41 CCTCCGCCCTCACAACCGCAAAAGCTATTAATGAAATCTTTGCCAAAACGACACGCACACTGAAACTTAAATAAACATATGCACAACCTTGGGAGCTATTC:1 + chr3R 30283991 5' + McClintock 183 2 82.18 CGTGATTCCCACAATCAAAAACTTAACTATCTTACCATAATTGCGTGCACTTGTCTGTTGTTGGTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 - chr2L 12888895 5' + 412 14 2 66.34 TTTATACGCCGGAGAGTTATTCTGCATTCGCCTTCTGTATGTTTTTCTCGTTCAGAAAATTTGTGGGTTCATTTGAAGAAAAAG:1 - chrX 22595311 5' + S2 1257 1 53.57 TTTAGTTAGCACTTTGTGTATATTGGCTTTGGGTTGAAAAGTATTAAAGGTAAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1 + chr2R 17942078 5' - mdg3 5475 2 56.44 TGTGACCTATTATGTTGAACGCACATGTACGTATATTTGTTAAATGTGGAGTACATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chrX 5178887 5' + hobo 20 1 58.42 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTAATACTATGTATATATGTACATCACACGTATATACAATATTTTATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTG:1 + chr2R 1982172 5' - Tabor 483 2 76.24 CGAGTGGTGAATGGGGCGACTTTTGCGATTCACAAATCGTTGGCACGCATCGGGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3L 12217387 5' - roo 386 2 55.45 TCAGTGAAATGGGGAATTTTAGAAGCGTAGATATTACATCTAAATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTA:1 + chr3L 920478 5' + mdg3 33 2 57.43 AAATGGTTATATCTATGACTCCAACTGGGAACGCTGCTTGATCAGGCGGTCTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chrX 2755534 5' - opus 484 2 62.24 GGACAGCGGGGAAAGGTGGCAATTGAAAGAAAGGGCCATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGACGCGTAACGCCCTACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 - chr3L 3070706 5' + 1360 39 1 67.33 AAGGGTGGGGGTTGCGGTGGCGCTATGTAATTACAATAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:3 + chr3R 11080695 5' + I-element 36 1 60.40 ATTAGCGGCAACTTCCGTTATTTGGCTAAAAAAAAAAACTATTGTACAACGCACTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTC:2 - chr3L 24210984 5' + HMS-Beagle2 20 2 57.43 AAACATCGTAATTTAGGGGTGGCGCTTGCAGCAATATCATATCACTGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCC:1 + chr3R 19966818 5' + hopper 26 1 51.49 CCATCGATTGATTCACACAAATGCCCTGCAGAGCATCAGCTTCCCGCATGTTTGTCACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCC:1 + chr3R 24083418 5' + I-element 217 1 65.35 ATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTTATGGCTGGCTAATAGTGACAACAAAAGTACAGATTTAATAAAAAATAATGGCCTATCGAAAATGTT:1 + chrX 10298091 3' - Quasimodo 1 2 75.25 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGG:1 + chrX 21945912 3' - F-element 59 1 75.25 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCGGAGATCGATCATTGGAGTGCATAAACAAGGACCTGGCGTGGCGACCAGTGGTCGGCAAGG:1 + chr3R 2533817 3' + roo 9002 2 69.31 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTC:1 + chr3R 19513391 3' - 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Ivk 284 1 77.23 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACTGAAGTCGCACACCCGCCGCCGC:1 + chr3R 13995980 3' - 1360 48 1 75.76 GATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACTAATTACCAGCTTATGGGTTGTTAATTTTTAGATATGGCTGATGAAG:1 + chr3R 7639852 3' - HMS-Beagle2 6909 2 52.48 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGGATCTCCGGCGACTGTTTGAAATTCATGACTTGTTTAGTGCACATGCC:1 - chr3L 17767651 3' + hobo 2920 1 58.06 TTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTTGCAAAGATAATTGAAGGGTATGCATGTATTTGCTCCCAAATGCATACTTGAATTG:1 - chrX 18975539 3' - diver 5912 2 55.45 CCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTGCTGGTGTCAGCACTTTGCTGGATGAGCGGTCGGCTTGCCGGTCGCAGTTAGCTCTAGTACAGGTGGATAAGTTTTTAAG:1 - chr3L 27180765 3' + Cr1a 4345 1 82.18 ACCCCTCCCCCCTCCCCCCCCCACACACACACACACAGGAACACACAAGCCTGAAACATTAAA:1 - chr2R 18316483 3' + accord2 222 1 58.73 AAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGG:1 - chr3R 178119 3' - BS 39 1 66.34 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCAGTTTGTTACA:1 + chr3R 23870140 3' + roo 9034 1 62.38 AATCTACTAAAATGATAATTTACATATTTATGCATACCATCAGACAGTGAAATACTAATATCTGCACGTCTCTATACAAATATTTGTATATTAGCCACGAT:1 - 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P-element 16 1 63.37 TGATTTCTTTGAAATTATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTT:1 - chrX 10196093 3' - 297 33 2 62.38 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGTGGGGTGATTCTATCTCTCTTAGTTT:1 - chr3L 6869295 3' + roo 9021 2 73.27 ATTACTGATTTCTTCGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAATAAGTCACTATATATAGTATATTAACTAAAATCTCTACTGCCGCTCTCC:1 + chr3R 6138312 3' - 297 38 2 62.63 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCACCCATTCCCCACCCATTTGGCATTGCA:1 + chr3L 18793052 3' + P-element 2840 1 32.67 GGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATAAAGGATAATGAGGCAATCCTGCGACGACAATTAGCGCTGTGATAGAGCAGGTCATAAAATATGCTGCTTAAT:1 + chr2L 13229669 3' - hobo 2661 1 72.28 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGCCATAGATTAGCGACCAAGTGCACTACTTCCGCCAGTTAACGAGCTCCACACCGTTGACAGGATGA:1 + chr3R 17529617 3' + roo 399 1 68.32 AAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTACGGCTAAAAGGCATTAAAGTCTTGACAAGGCTATTAAATGCTTAA:1 + chr3L 22203685 3' - 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I-element 4926 1 57.43 TTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAGAAGAGAGCTGGATATATTTTTTTATGACTAAATAATTTA:1 - chrX 17164791 3' - hopper 367 1 61.39 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACACCCATCCGCATTGTTTGCGCCAAAGAAGCAAA:1 - chr3R 6097606 3' - roo 8708 2 69.31 ATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTGACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGG:1 - chr3R 3985682 3' - gtwin 20 2 59.41 AAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGCGTATACGA:1 - chrX 9816245 3' - BS 5007 1 61.39 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAATAAGTTGCCAAGTGGCGGCGACCTGGTGGAGATGAAAAAAAAGCGATGTT:1 - chr2R 13724738 3' + roo 386 2 55.45 CAAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCACATAGGCTTCTCCTCACGTGCCGTGACTGCTTATTAGCCATGAAGGTTACCAGCACCAGCTGAGTTAAGTTTT:1 - chrX 18010792 3' + 17.6 7207 2 65.35 CACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGTTGTCCCCGCTGAAAAAGATACAAAGATACAGCGATAC:1 + chrX 17492988 3' + Tirant 397 2 77.23 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGTATATGTTTCAAAAACATGTCCAGTTTTAAGTTCAGTTTTCTT:1 + chr3L 18206815 3' - pogo 29 1 61.00 TTGTTGTTTTTTTTTTTCTTGCTGATGCAACCGTGGGCCAAAAATGTGTAAAATTT:1 + chr2R 11004564 3' - gypsy7 5012 1 91.07 TTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACCTCACTGAAGGGATTCGGTACTTGGTTTCTCTGAATAA:1 - chr3L 8036338 3' - invader4 294 2 74.26 ATTTTCTTTTTTTTTTAATTTTATTTGTTCAAAATTGTATTTTGAAACTGTTTATAAAAATCACATGACACATAAATCACAAAAGTCACAACACATTTTGG:1 + chr3L 10307797 3' - Doc 4698 1 78.22 GCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATT:1 + chr3R 7477470 3' - BS 5028 1 56.44 GGCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAG:1 - chrX 3446515 3' - I-element 24 1 53.47 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGCTAGCAGTCACTAGTCCACTTTTCAGATAGCCACTTC:1 + chr3L 14286085 3' - 412 12 2 66.33 GTATTACTGGGGCACTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGATCTTTTTACCTCCCCATCGTTTGTTTTAACCGTGACTACCCTGAGTTTATCGCCTTGTC:1 - chr2R 2692689 3' - Stalker4 7093 4 60.00 TCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAAAATTTATGAAACGGATTGTGATGGATCGGATCAGTAGTAGTTGTTGTAGTTTGGAAAGTTGCACTTGGTTGT:1 + chr3L 19894817 3' + 17.6 432 2 76.24 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCGTCGTGTAGGTGTAGGTGCC:1 + chr3L 10154909 3' - 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chr3R 23870098 3' - roo 8717 2 86.14 AAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGT:1 - chr3L 5267204 3' - Juan 3990 1 58.42 GTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGT:1 - chr3R 13231155 3' - Quasimodo 40 2 70.30 AACAATTACTTAATGTTTATACACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCCAGCCTACTACGACTTAACTTTGGCACTCGCGTTGGA:1 + chr2R 3335818 3' - invader2 55 2 74.26 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCCGTTGGAGTTCGGGCTGGTGCTCCCAGTCAAGCCGCGCGACTCTTTCGCATCGGTTGTCGCCTGT:1 - chr3L 17421474 3' + P-element 2879 2 71.29 AAAAAAAAACATATAGAAAAAAATCAAACCAGATGTCAGTCGTCAGTCTGCTGAAATACAATATACCCCGTGAAATGTGCAAGTACCAGGTACGAAAACT:1 + chr3R 21827726 3' - Tc3 78 2 81.00 TAATTATGTAATAAAAAAGTTGAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGCCAAGATTACAGATAATCTAAAGCTCAAGCGTGTATCAAAGTTTAATAGA:1 - chr4 889125 3' - Cr1a 4272 1 67.33 GTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTATGGAAATGCAAATGCCAAAA:1 - chr3R 25509774 3' - 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F-element 29 1 56.70 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCT:2 + chr3L 24210981 3' - HMS-Beagle2 6906 2 54.46 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCTTTTAGAAAATTCCCTTTTTTTGTGGGTTTGACCCAAGTGAAAATGCAAGGTGTTGACT:1 - chr2L 11559909 3' - copia 16 2 63.37 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAAAATTAGTTTTTCGATTATATGATATTTGGAACACGTAATACATAAGTCCAAA:1 + chr2R 5773496 3' - pogo 19 1 69.31 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGGAACGGGCCGGCAACAATGGACTTGAAATGAAAATTGGTAAAACGGCCTTTGTTGT:1 - chr2L 16378922 3' - HMS-Beagle 15 2 62.38 TAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAAAGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCT:1 + chr3L 24210990 3' - HMS-Beagle2 6897 2 61.39 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTGTTAATAAAAATATTTTTAAACAG:1 - chrX 12152675 3' - roo 50 2 82.18 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGCTCATAACATTAATGTTAAAAG:1 - 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chr2L 18977906 3' + roo 9037 1 59.41 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAA:3 + chrX 21945910 3' - F-element 61 1 77.23 GAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGGCTGCACGAAAACTATCCCAGAGAACCTCGTTGTAGCGTTAAACTCCGAATGTGATTTGGTAGGG:1 + chr2R 670525 3' + flea 408 1 68.32 ACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGTGAAGTTTAAAGTAAATACGTAGCACTCTGTTCAAATTCAGCTGAAACCGATAGCATCTAAACATATC:1 + chr3R 6097119 3' + roo 294 2 73.27 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTACAACACTATAGTATTCGTTATTTACAAAGAAC:2 - chr3R 21587248 3' + pogo 2062 1 68.32 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTCAAATGACTGTGACAAAACAATTCCAAATA:1 + chr3R 25526392 3' - transib2 43 1 69.39 TATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGAAATCCTACAACTCTTCTTGTTTTTGAAATGAAACTCAAAACTC:1 + chr2R 17402810 3' + invader4 3078 2 73.27 TTTTTTTTTTATAATTTTAATTTATTTATTCAATCCTCTCCATCACCATCTCTCTATTTAGAAATTCCAATGACCTAAAAAAAAGCTCCCAACCTCCTAAT:1 + chr3L 10583998 3' - Doc 4694 1 70.30 GATTTATACGGTATGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAG:1 + chrX 22386751 3' - hobo 93 1 70.41 ATATGTGGTCTTATAGTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGTAAAAGTTTGCCACTTAGCACCCGAAAA:1 - chr3R 13231128 3' - Quasimodo 13 2 71.29 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATTTTCTGAATTTAATTTTTTTATTAACTAACAATTTGTAGCAAATATT:1 + chr2R 15301158 3' - FB 30 1 56.44 GTTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCTTCCTTCCTTGTTTTTTATTTATTTTAGGTACTCACATCCTGCCCTTTTCGATTTACA:1 - chr3L 23027561 3' + INE-1 546 1 52.48 CCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGCTGAGTGGTGGGAAATCTGAAGAGGAGGTCCTGGGAAATGGGGGCCAGGATACA:1 - chr3L 6671788 3' - blood 452 1 55.45 GTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAAGTTCGCGTTTAATGGTATTCTTTTGTGGCTCTTAATATTTGCGTTGCCACAGCCGCAGC:1 - chr2R 17943807 3' - P-element 2814 1 67.68 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTGCGTCTATGGGATGCGTAGCATA:1 - chr3L 19437217 3' - jockey 4693 1 52.04 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTAGTGTAATTAGTGCTTATTGAGTGGGGATAGTGCATTCAAGGCAGCGGAAAATCAAACG:1 - 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hopper 56 1 80.20 GGTTCTAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGCGTTTCGGTGCCTAAGTAGTTTGTGTGTCTTGGCGAGTGTTTGCGCTTTTGATATATCGGATAA:1 - chr2R 17360242 3' - Porto1 4499 1 58.42 GTCGTTTTGATTCATTGTTTTAAGTCCACATTTGGGTCCACTTGGGGTCTGCGACAAGGCGACGGTGCAATGGCTGCGCCACACGACGATCTTTTCGGCTA:1 - chrY 858885 3' - Doc 206 1 61.39 CAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGTTCCTGTGATGCCATTTACGTTGCATCATCTCAATGTATGATGACAAATTCTATTCACGTATT:1 - chrX 17493115 3' + Tirant 41 2 64.36 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATGGATAACCGTTCGGTTGAATGTGGATTATAAAGT:1 + chr3L 22162750 3' + roo 403 1 72.45 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTGAATAATGTAATGAATGCAGGA:1 + chr2L 4868572 3' + blood 7335 1 80.20 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCTTTGCTCTGCCGAGAGCCTCTGCCGCTGGCGACTGCGACTGCGCTGCCTT:1 + chrX 13640333 3' + P-element 2881 2 74.00 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTATTTTGATAAACCACTGGTTTTTCTTTGATATTTCTTTTCGGTGCAACGCAAAGGG:1 - chrX 15227261 3' - roo 18 2 67.33 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCC:1 - chr3L 9190450 3' + 412 7517 2 53.47 GAAATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCATGAGCGCTGATTTTGCGCCACTTAAACTTTAAAC:1 + chr2L 9624604 3' - transib2 39 1 60.40 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCTATTGCTGTTGCTGCTTCTGCCTGTGTGCAATGTGTTGCAAGTTGCATTGG:1 + chrX 7429436 3' + hobo 2917 1 56.57 GTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATATGAGTGATTTATTATTTTTTGCAACTGAACCATTCTTAATACCAACAGAAGTCACTACAATAAAGTTTTAAAAAA:2 + chr3L 17762876 3' + invader3 5462 2 76.24 GTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAATTTTTTTTTTGCGAAAGCATAGAAATCAACAAGACTAATAAAAATGTGACAACATATCAACTCATTTTTCAAAAGT:1 - chr2R 5212082 3' - INE-1 214 1 69.31 CTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTCATCATGAGGACATGACATCGCATCGAATTGCACAGACAGACATCCAATCGACTCAACTTTAATT:1 + chrX 5131069 3' + I-element 5345 1 66.34 CATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAGAGAAGCCAAATGAGGGAAAATGAAGTGCCAAAGTGTTGAAAATAAAGCGAAAGCCAAGAG:1 + chrX 5175016 3' + I-element 186 1 65.35 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCAAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTGTA:1 - chrX 17492864 3' - Tirant 8117 2 69.31 TTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGACCATGCCCGTTTATTGCTGGTCAGATTCTGCTGTAGTGCTGTCCTG:1 + chr2R 3480853 3' - Juan 18 1 51.72 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTGCGTCTATGGGATG:1 - chr3L 19437226 3' - jockey 4705 1 60.40 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACTGGAAAGTAACCAAAAGTAACAAAATGATAATAGGTCCGAGTTTGCCTGAAAATGCTTCCTATAGCCGTA:1 - chr3R 31463097 3' + pogo 2095 1 73.27 TCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCAGTTTGTTACATAATCAGCAGAAATTTCATTTAAAAGCTTGTTTGGC:1 + chr3R 23870176 3' + roo 9071 1 78.00 TGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCTTTGGGGAAGAGAACGTAAAAGGTTTATATTCCGAAAGTCTACTTAAATATGGATGAGAAAATTCACTGTGAAC:1 + chr2R 18074774 3' + Quasimodo 6984 2 73.27 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGTATATGCACACGCACACATACGCAGGCAATTGGAAAGAGGG:1 - chrX 5178805 3' + hobo 2907 1 58.59 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGCTAGCAGTCACTAGTCCACTTTTCAGATAGCCACTTCCT:1 + chr3L 14286087 3' - 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Rt1a 4694 1 92.08 TTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATAATCAAGTTGTTAACAATTTCGATGCTTTCGATCATAAAGTGTATACACATGAATTTTCTTTAATATGTATAA:1 + chr4 717004 3' - INE-1 145 1 76.24 CAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAACAAAAGCGGCGTATCCCCGAGCCCATGCCCATAC:1 - chr3L 22231106 3' + P-element 397 1 39.60 GTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTGAGATTCATAAACTTGCGTGCG:1 + chrX 5128660 3' - I-element 374 1 78.22 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATGCTGCACTCGATGCTGATGATGTTGGCCAAAA:1 - chr3L 5321138 3' + mdg1 7421 2 66.67 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATCGTCGAGCAATGCAAAGCCGACAAT:1 - chr3R 30263566 3' + roo 360 2 76.24 TGGGGGTTTAGGGGGTAGGGTGGTAACTCGCTTTGTTGATTAGTTAATTACACAGTTGATTAATATATTAAATGCAGCCATCTCGTTGACGCATATA:1 + chr2L 13642774 3' - Tirant 8116 2 69.07 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTACCATCTTAAATTGTATTTAACCAATTT:1 + chr3R 10480405 3' + mdg1 372 2 71.29 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTAGTCGTGCGTGAATTTAGTTTTTTT:1 - chr2L 8965435 3' - Doc 56 1 74.26 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAGTTAAGATTTTAAATCAGCATGTAGTTCACCATT:1 - chr2L 12860853 3' + roo 9029 1 65.35 CACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATATATATATATAAAAGAAAACAGCTCGCATTTATGCATTTAATTA:1 + chr3L 3739150 3' + invader4 3052 2 62.38 TCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGT:1 + chr3R 15790064 3' - flea 4746 1 69.31 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGTGTCATCTGTTTTTGCTTTTGTTTTGTTTGCCCATCGAATGATCGCACAGCTGTTCAACCA:1 - chr2L 19865804 3' + P-element 2873 1 67.33 GAGTGTTTAGCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCACAAACAATATTTCCGTATCAGGCAGTGAAACTAAAACGGGAGGCATA:1 - chr3L 13570392 3' + hobo 2909 1 50.50 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAATTTCCATGTGATGCGCAATATTTCGTAGCATACTTTCAGGCTCTTAATTGGTGCATTTCCAATGCATTGC:1 + chrX 5513409 3' - jockey 4765 1 70.30 CAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTTGGTTGGCCCTGTCTGTGTATGTGCCTTGCAATTTGTTGTAACCATTTTCGTTGCCTACTTTTCCGGGCACTT:2 + chrX 16532043 3' - accord 185 2 82.18 TTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTA:1 - chr2R 4260435 3' - micropia 5128 2 82.80 AGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGT:1 + chr2R 5531193 3' - 1360 68 1 59.41 GATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAAAAACGGAAGTTGC:1 + chr3L 24210977 3' - HMS-Beagle2 6884 2 65.33 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGGCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGCGTTTTTCCGCTCAGCCACACT:1 - chrX 17492867 3' - Tirant 8107 1 73.86 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCA:1 + chr3L 5267258 3' + Juan 4174 1 71.28 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATTTGCTAAGCACCTGTAAATAATAATTACAGTATTACAGCATAAAC:1 + chr3R 7508693 3' - jockey 36 1 51.49 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTT:5 + chr3L 3535460 3' + roo 388 2 56.44 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTAAGTGAGTGAGTGGCGGCAACAAGATTGTTACGCATCCGCCGCGTTGGCC:1 + chr2R 15781359 3' - jockey 32 1 53.00 TATGAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCACCATACAGGTTCTAGAGTTATAGACGCAGTTTGATCCATGCTCACTTTAATTACCACAAACCGCACAAAACAACC:1 - chr2R 4387454 3' + INE-1 162 1 64.36 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAAGGCGCACCATGTGCCACCTAATTGAGTTTG:1 - chr2R 22746011 3' - hobo 19 1 59.41 ACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGAATTTATGGCTGCATAAATCACACATGTGTACTT:1 + chrX 3294395 3' - hobo 207 1 66.34 CCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCAGTCCTTCATCCTCTCCTCCTCTAACA:1 + chr2L 11916610 3' - X-element 4478 1 74.26 GGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGATATGTTTGTGTGGCCTAGTCGAAGTCGTTTTATTTCATTTCTTCATGCTCT:1 + chr2L 7862054 3' - I-element 4993 1 76.84 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCAGGCCGTGTTATCAAGAACAACAACAACTATTGATGATAGTTTTTTTTTTAATTTTGACATTTTTCGGTTT:1 - chrX 13640211 3' - P-element 5 2 71.29 AGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGACGTCCACAATATGAGTGATTTATTATTTTTTGCAACTGAACCATTCTTAATAC:1 + chr3L 17762843 3' + invader3 5429 2 59.41 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTCTGTGAGCTTTATGGACTGGCAGTCCAGTAACTGGA:1 - chr3R 17529532 3' - roo 38 2 66.34 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGCATTGCAACTGCTGTTGGTAGCAGCACTGAATCCCTAGCTGTAGCTGTTGTTGGCCTGCGGT:2 - chr3R 8499392 3' + Tabor 7309 2 64.36 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGTACCTAATCTGGATGTCAAGGAAAGGAGAACTGT:1 - chr3L 14286009 3' + 412 451 2 68.32 TAGGTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCTTTTTGCTGCCCTAAAACAAAGCACCTAGAAATAGAAATCATG:1 - chr3R 13167319 3' + roo 9041 1 54.46 TGGACACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTT:1 + chr3L 24210954 3' - HMS-Beagle2 6934 2 79.21 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAAGTTTTGTTTTCGGACTTAGCT:1 - chr3L 4692267 3' + P-element 2834 1 26.73 TAGTCAATAATTGTTAGTTGTGTGTGTGACATTCGATTTGATTGTTTTTGTTTTGAAATGCAATTTTACTTGCAAAGGGCCGAATCAGATGTAAGCG:1 + chr3L 13885556 3' - Doc 120 1 73.20 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGAATGTTATTCTCTCTTTGACA:1 + chr2R 19164141 3' - P-element 54 1 31.68 GAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACACGGTCGCCATATGATAGGTGCTATTTTAAAGGGTGCTATTTTGATGTTTAATGGAAAAAGAGCTTAGCTTC:1 + chr2L 16200984 3' - Stalker2 7 2 68.32 TAACTGTAATTATTAACTGGCCTGGTCTCTGTTCGGGCCAAAGTGAATAAACGCAAACGACAGACAAAAAAAACAGGAAAGAGGGGCAGCCACAAGGAAAG:1 - chrX 16508227 3' + HMS-Beagle 249 1 70.30 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATAAGTGTGTGAATGCAGTTCAAAC:2 - chr2R 13934410 3' - jockey 59 1 76.24 GACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATAATTTTTTTTTGTTTGTTGGTCTGATTTCTGTTATTTGTTGGTTTTTGCACTGTCGAAGGGAGAGCGAC:1 + chr2L 16636259 3' - 297 6580 1 81.19 GTATACATTAACATCCGCTGCCGCATTCACGACTCCCACCAGCGGATCTTAGCCTTTTGCTGATTAGTCGATCAATGTTCGGTTTGAACGGAATCAAGCTT:1 - chr3R 10551317 3' + Quasimodo 178 2 64.36 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTAAACTCCGTTTTCCGTTGTACGTACATAGTATATCATTTCTCTAACCCATTTC:1 - chr3L 2992592 3' - hobo 23 1 53.47 CACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCTGATAAAGTATACCTTACTTTTACAAAAATCACA:1 - chr2R 2014764 3' + Doc 4378 1 66.34 TTTATAAAAAAAAAACAATAAAGTTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGCCGTGGCAACGTTCCGAAACAACCTCG:1 + chr2R 2122309 3' + HMS-Beagle2 480 1 77.23 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCCCAGGCAAAATTGGGTGGGGAGGGGGGTTGGGGAAGTCGAGGAAGGAAAAGCAACTTTTCGTGGAGTGTCGCG:1 - chrX 14615578 3' - hopper 1 2 74.26 AGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGCCCCTTACACCAGTGCGGGAGACCTAGAGACGGGACACAGAAAAAACCAACAAAACAACAAAAAAAAACGAAG:1 - chrX 13859760 3' + blood 485 1 75.25 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAGAGATTAAGCTTGCAGCTTCCAGAGTTAGAATGTATT:1 + chr3L 14504291 3' - 297 35 2 63.00 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCAGTTTG:1 + chr3R 23870135 3' + roo 9029 1 67.33 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCCGTTGGAGTTCGGGCTGGTGCTCCCAGTCAAGCCGCGCG:1 - chr3L 17421500 3' - P-element 33 1 46.00 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACCAGCTCTCTCACAAACACAATCTA:1 - chr2R 6501170 3' - P-element 48 1 31.68 TTACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTGTATCGATTTCCTAAAAACCTTTTTGGATTGTAAGGAGTACTAAAGTTTGGATACGGACAAGAGTTAAGAGAAA:1 + chr3L 23184693 3' + hopper 235 1 76.24 GTATGATCGTCGAGATCTCAGGAACTATACAAGCTAGAAGGTTGGTATTCAGCATACAAATTCTAAAGACAATGTCCACAAAGTTCAAAGGGTTGTGCCAA:1 + chr2R 4345204 3' + INE-1 137 1 71.29 CTCTCTTATATATATATATATATATATATCTATTTATATATTTATTTATATGTGTACATAAAATTTGCTAAACATTTCGCTTGAATTTACTTGCAG:1 + chr2R 17351072 3' + blood 181 2 53.12 CAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCCGGAAGAGAGCGTGAGAAAGTCGG:1 - chrX 2648711 3' - 297 6806 2 76.24 AGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTCAAATGACTGTGACAAAACAATTCCA:1 + chr3R 25526388 3' - transib2 50 1 73.27 ATTTAGTTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTGTGTTGTGTAACATCCAATTTATGTGTATTTTAAAGCAAATACCACGAAAGTCAAGCTCAATCACTC:1 - chr2R 2118823 3' + transib2 308 1 67.33 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTACATTTCTCATTAACATTATCGCAAAGCCCATGCAGGGAAATACCAACTAAAACATTTTTATTTGCGTCA:1 - chr3R 7102384 3' + pogo 2099 1 72.28 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAATCTTCGCCTTTAAAACCAATCCGTTTTGCAGGCACTTAAAAGGTAATTTCCCAAAGCCACTTTGGGT:1 + chr2R 17697328 3' + pogo 2098 1 65.35 GCACAACACAACAACAGTACAACTACACATATATAAACAACATACATACGTTAAAAGAATTATTGCCTGCGGCATGTAAAAATGTTCAATACGACTTTTCG:1 + chr2L 16186558 3' - transib2 329 1 58.42 GTTCTTGTTCTTGCTGCTGCTGCGTTGGCGCAAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGCGCGTGTGAGTTTTGATAAGGGGGAGTGGTGCGGAATTTTT:1 - chr3L 16659990 3' - TART-A 119 3 59.41 GTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGTATGAGCAATATAATTCTCTTTTAGAATGGCTTTCTATGGTTTTTTGTGGTAGTTTCCACTGTTTAGCTGTGCCACA:1 - chr2R 23514399 3' - I-element 1 1 80.20 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCTGGCACAAGGATAAAACTACACGTACGAGCATTAAATGTGCCCCACATA:1 - chr2R 14135397 3' + roo 9044 1 52.48 ATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTATTCCTTCTTTCCTACCCAAGGTGTACATATATACAA:1 - chrX 7684456 3' + copia 55 2 77.23 GGTGGCGCGAATACTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATTCTACATTAACGCAAAGCAATAATTATCATATTTGTCT:1 - chr2R 7009431 3' - McClintock 5986 2 61.39 GGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATATAAAAGATCTCAAGTTGATTGCAATGGCAAAAGTCACACACATATATGGTAATTACGCGCGG:1 - chr2L 18560287 3' - Ivk 64 1 72.28 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTCTCACCAGCTAAAAACCAATGGGAGCGGAACTTGATCG:1 + chr2R 11399232 3' - 412 7093 2 63.37 AGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCA:1 + chr2L 23295854 3' - micropia 40 4 66.34 TAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGAATAAACCAGAATATCGGCCGAACAGCTACAACAACAATTGCTGTGACAA:1 + chr3L 3709023 3' + I-element 4895 1 52.48 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAGAATAACTCCCCCTTCACACATACTTT:1 - chr2R 10974145 3' - hobo 49 1 76.24 TAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGGAACGGGCCGGCAACAATGGACTTGAAATGAAAATTGGTAAAACGGCCTTTGTTGTTGTGGGCGC:2 - chr2L 16378913 3' - HMS-Beagle 6802 2 71.29 TTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAGAGTCAACGAAGACATCTAGTGTCCAGGGAGGCGAATGGCGAAAGAAATG:1 - chr3L 11748722 3' - Stalker2 29 2 50.50 GCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTAAAGACGTTTAAAAGGTGGTTCGGAGGCACTTAGTGCTGATACGCAACTTACCATGCACATATT:1 + chr2R 576378 3' - F-element 123 1 68.32 ACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAAATTCATTCCTTTTTTATTTATTAT:1 - chr3R 31945420 3' - hobo 2919 1 76.24 ATGAAAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCCTGCAAGAGGATGGGTGTGTCTTTGTGTGCTTGATTTTAGAGTGCTGACAGTG:1 + chr3L 7801177 3' + Dm88 354 1 53.47 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATGGATAA:1 + chr3L 22162722 3' + roo 9035 1 65.35 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAAT:1 + chr3R 19515851 3' - 412 52 2 76.24 ACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCCATGCATCTTTTGCTGTGGCAGCAAGGCGGTGGGTTGGGATACTAATAAATTTAT:1 - chr3R 17980729 3' - HMS-Beagle 6814 2 53.47 GCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATGAAGAATGAAGAAGGAAAAATAAGGGACGCAAATAGAGCGA:2 + chrX 5256755 3' - INE-1 19 1 79.21 TGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAGAAGGGGTTAGACTCGATTCGAATCTTGCTTTTCTGGACACCAAA:1 + chr3R 11495495 3' - hobo 2662 1 55.45 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAGCGATCTATATATTTTATTCAATGTCTTGGTTTTTTC:1 + chr3R 29361087 3' + 412 453 2 64.36 AGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTAAATTTAATGAAGAAAATAAAAATAATACATTTTTTCCCA:1 - chr2L 13053190 3' - G2 316 1 60.40 GTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCATCATACCGGTGTAAGCTAAGTCGCATTCAATGGGTCTATCCTGA:1 - chr3L 24860583 3' + invader4 2886 2 56.44 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAA:1 + chr3R 7477464 3' - BS 5034 1 62.38 AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTAACCAAA:1 + chr3L 24210964 3' - HMS-Beagle2 18 2 62.82 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAGTAGTTTGTTCATTCACTCGCTTGAATTTTAAATGATTGAGACTCAAACACACACACACACACACTCT:2 - chr2L 18644467 3' + pogo 2095 1 70.30 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTGGGTCCCTATTTTTCTCTTTTATACACTTTTAGATGGTGGTT:1 - chr2L 11084339 3' + blood 347 2 55.45 GTGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTG:2 - chrX 17492866 3' - Tirant 12 2 69.31 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTCATTTTGGTTAAGACAGAAAATGTTAACATTATTTTTCGCAA:1 - chr3R 13620269 3' - Doc 38 1 63.37 ATCAATTTATTTCGTTACACGTTACACTGCCAGGCCACCTTTCTCCAGGACGCGCGGTTCTTCGCTTCCGCCATCTGCAGTTCTTCCTGCCTCTGCCTCTC:1 + chrX 21175420 3' + Gypsy12A_LTR 2255 1 90.10 ATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGATAGTCCTCTCTTTTGAGGATCAATTGAGTGAGAGCTTGAACAAAAATACACGGA:1 - chr3L 18202015 3' - I-element 5228 1 59.41 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTGTTTACAGTCATTGCTACAAATTGACAAATTCGCTGTCGCCTGTC:2 + chr3R 28135339 3' - hopper 29 1 52.48 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGGGCTAAAGATCTTATATGCTTT:1 - chr3L 21393476 3' + roo 355 2 76.24 TGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAAAATTTAATTAAGACATTCATTAGAGTTTATAG:1 - chr2L 9284366 3' - flea 39 2 69.31 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAGAGATTAAGCTTGCAGCTTCCAGAG:1 + chr3L 14504279 3' - 297 6629 2 75.25 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCATTGTTCCGCCTGAATATCCTTTGATTTTCCCAGGGGCGGCAACTGTTGAGCCGCTTTTGTGCAGG:1 - chr2L 16569452 3' - roo 8673 2 69.31 TCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGA:1 + chr3R 15790076 3' - flea 4734 1 57.43 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCCTGATCTTCTCAATCCTCGAGAATTG:1 + chr3L 12025645 3' - blood 7063 2 76.24 TCTTTCGCTTTCGATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTT:1 + chr2R 2092783 3' - Doc3-element 92 1 65.35 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCTTGATATATGGAACAGTATTTAGTGGATGCAATAAACATAGTATTTATT:1 - chr3R 22494692 3' + 1360 3366 1 54.46 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTCGAGTGAGAGCAGTGAGAGCTGCA:1 + chr3L 4692292 3' - P-element 52 1 27.72 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCATGATAGATTTGTGCCATTTCATAGGAAAACTGAAATCGA:1 + chr3R 10187428 3' + roo 9036 1 61.39 AATAGAAAAAGAAAACAAAAAATGCGGCTATCTAGTATGGCAACTGGGAATGTGCAAAGGTTGTTTTATTCAAAGGGTTTTAAGAAGAAACAAAAAAAA:1 - chrX 10794431 3' + Doc2-element 218 1 76.77 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGTCGAGTTTCA:1 - chr3L 8044292 3' + mdg1 7450 2 69.00 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTATATGTATATATATACTCACATATATCTGAAA:1 + chr3L 8843617 3' - I-element 44 1 66.34 CTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTACC:1 - chrX 21564097 3' + invader4 3046 2 61.39 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAACTATTCATATTTTAAAGTCATGAAAT:1 + chr2R 17195053 3' - roo 8715 2 83.17 GTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCCATTCCAGTCTGCCAGGTCGACCCAGCTTTTTTGTTTACGTTTTCGTTTT:2 + chr3L 1307195 3' + F-element 269 1 56.44 CACCAAGGTGACAAAGGGGTTTTCAGCTACTCCGTATGCCTTAAAAAAAGTGACTTTAGTAACTGGTTTTAAATGATCCTTTATATACATTCTCGTTGCCC:1 - chr4 353435 3' + BS3 1727 1 51.49 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTT:1 - chrX 10196092 3' - 297 32 2 63.37 TCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTCCGTAGTTGCCATGACCATAACCACGAGCATCTCGCACTCCGCTTTCGGCATGTTCTGCTCCTAGATT:1 - chr2R 11246275 3' - 412 7300 2 69.31 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTTTTTTTTTTCACG:1 - chr3R 11080669 3' - I-element 10 1 68.32 GAAGAAGGGCGTCCTGATGACGCTTCGACATATATATATTATTGATCAGGATCAACAGGGGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:2 - chr2R 1982172 3' + invader1 394 2 56.44 ATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAATTTGATATGTGTCTGAAACCCCGCCCACTGCCCTGCTA:1 + chr3L 19435147 3' + jockey 4850 1 62.38 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGCGCCCCCGCAAAATTTATGAAGCATACTTGCAGG:1 + chr2L 17694317 3' + hopper 1378 1 63.27 CAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAA:1 + chr3R 10736125 3' - McClintock 5971 2 59.00 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGG:1 - chrX 21668006 3' + Tabor 455 2 53.54 GACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACGTCCTCTTGTTTTCGCTTCCATTTTCGTTTTTAGAGGGGGGTGAAAAGTGGAAGGGGCTGGCGGTTCGGTTTGGAT:1 - chrX 18146942 3' + INE-1 553 1 65.35 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCCACTTTAGTTCGAAAAGTGCTCCCAAACAAACCTATTGTTGTTTTCCAAACCCCTTTAAAAA:1 - chr3R 26853832 3' + copia 240 1 68.32 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAGAATAACTCCCCCTTCACACATACTTTTCTCCTT:1 - chr2R 10974138 3' - hobo 42 1 69.31 ATGACTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGACCAAACTATGTGGTATTTCAATCAAGTCAGGTGGTCTGCCTCGTATTTTCCA:1 - chr3R 5368305 3' + P-element 2866 1 58.42 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAACACTTGTCGCCTCTTGGCC:1 - chrX 19887098 3' + P-element 2832 1 26.73 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCCATATTTCAATTAAAAGAATTCAAGGCGAA:1 + chr3L 15869754 3' - pogo 2 1 77.23 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACATATTGTGCACATGTGTATCTAGCCACACCATCCAGAGGCAAGCAGATCAAGTGCATTTTT:1 + chr2R 9214158 3' + Transpac 5218 2 69.31 ACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTTACTTGCGCGCTCCACAGGAGCAACGCGAAATTCCCCC:1 - chr3L 8044870 3' - mdg1 399 2 62.38 GTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTTTATTAGCTACTGTAAGGATT:1 - chrX 11300420 3' + roo 8919 2 79.21 ACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGTATTCAGAATGCGTGTAGTTCCATTACTTTCGGCAAACAAGCATACATACTTTCTATTTGCCTATTTATTCAC:1 + chr3R 20240970 3' + Tabor 482 2 61.39 TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCCAGTATGGCAGTAAATTCTGTAAAGCGCTCGCGCTAATTTGAGGCTTTATTTCGGATTCGGTA:1 + chr3R 8499502 3' - Tabor 15 2 64.36 GATAAATAGCCGAGTCGATCTGGATATATCTGGATATATGTATCTATCGATATACCAGAAAAATTAAGAAATTTCGCCTTCGCACTAATTCGTGAGTAATT:1 - chr3R 7041146 3' + INE-1 98 1 77.23 TAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTCAGCAGTAATTCATATTATATTGTATATTAGTATAAATCTGAATATTCTTTAAACGCCACCTGGCGG:2 + chr2R 13805761 3' - Ivk 5322 1 67.33 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAA:2 - chrX 5168853 3' - hobo 39 1 60.40 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTCTGCTGCTCCCCCAGCAGCGGTTCTCCAAAACATTCTCGAAATTCCAAAGCAGATATGAGTTTTGA:1 - chr3R 20430734 3' + hopper 1403 2 67.33 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCA:1 + chr3R 23870130 3' + roo 360 2 72.28 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAACACTTGTCGCCTCTTGGCCATTATGCAACGACAGCGAAACGAAG:1 - chrX 19887073 3' + P-element 2857 1 51.49 TAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTAACAATTAAATATGAAGGTAAGAGCAGGCGAGGGACAAAAAAGCGAAGGACAAAGTTGAAGC:1 - chrX 10297963 3' + Quasimodo 7360 2 69.31 ATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACACATGTCCACATTGATGACACTAATGAAACTGCAGTTATAAATTGAATTTTATGCGCGCTAATTG:1 + chr3R 23173197 3' - Burdock 8 2 69.31 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTACGGATTGGCATATCGGTTGGAAT:1 + chr3L 5573591 3' - mdg3 35 2 55.45 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTATATACATATATATTCCGTGGAGGAGGACTGCTTAACAATTCCTGT:1 - chr3R 5429596 3' - roo 8694 2 60.40 ATGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGCGGC:1 - chrX 8531800 3' - accord 7033 2 83.72 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACATCCACCCAATCAATTGAAATCCACAACGTCATTTAAC:1 - chr2L 15151876 3' + Tabor 448 2 59.41 TTTATATTTAATTTATTTATTATTGAATTTGTGTTTATAACATTTTTAACTTTATTTTAAAATTAGTTTTAGTTGGCTTTTTATCTTATTTGCACTGGATT:1 + chr2L 7595476 3' - X-element 4715 1 65.35 TAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCAGATCAACGTATGGTGCGCCAATTCAATTACAAAGGGTGTCATCAAACAGGATTTCCCTTGGAAAGTCA:1 - chrX 5385004 3' + gypsy4 198 2 68.32 TATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGAAGTCCTTCTATGCGGATTATGTTATAATGTTGCACTGGAACCCATCGCTCTCCCAGCAGGAATTAGCCCAT:2 - chr3R 16110144 3' + mdg3 5493 2 73.27 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGTGATTATCTTATTAAGTATG:2 - chr3L 4539176 3' + roo 9019 2 76.24 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTACAACACTATAGTATTCGTTATTTACAAAGAACGACTGCAGTTCTCGT:1 - chr3R 21587233 3' + pogo 2077 1 53.47 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTTCATTTGATATTATAAGATGGAGGCA:1 + chr3R 3920707 3' + I-element 5308 1 70.30 GTGCTTGCAACAAAAGAATATAGGAGCTAGTAATATTTTCGGAAGAAGACAGCTCTAGAAGAGGAGAAAATGCTTACTTCCGTATTTTATGTGCTATTCGC:1 + chr3R 3322820 3' - Gypsy12A_LTR 2097 1 70.30 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACGACCCACAACAATCAAAACGATTGAGCCGAAGTCGAAGCC:1 + chr2L 19865884 3' - P-element 36 1 46.53 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAGCAAATTAGCCTCGTAAATTAGCAGCGCGCACAAGAATAGGCAAC:1 - chrX 10117304 3' - FB 33 1 58.42 TGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACATATACAAGTATTAAGCATAGTCAGTTCAAGCTCACCCCATTTTATGGAATGACAAATACCACAAAAAA:1 - chr3L 26315767 3' - Tabor 6846 2 72.28 ATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAATATACACAAAGTGCTAACTAAAAAAAAAATTAACTTTATCC:1 + chr3L 21766630 3' + mdg3 5494 2 72.28 GGGTATCTGATAGTCGAGAAACGTCCTCTTGTTTTCGCTTCCATTTTCGTTTTTAGAGGGGGGTGAAAAGTGGAAGGGGCTGGCGGTTCGGTTTGGATAG:1 - 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1360 51 1 77.23 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTCATATCTGATTATTGCTAACCAAAAGTCTAGACGAAGTGTTAATACCCT:1 - chr3L 18953382 3' - mdg1 7065 2 54.46 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGCGCCCCCGCAAAATTTATGAAGCATACTTGCAGGCGTCACACACACACACAAGC:1 + chr2L 17694337 3' + hopper 1395 1 59.41 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTA:3 + chr2R 1725933 3' - Doc 41 1 61.39 GAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGAAAAAAAAAATCAGCAAGCAGACGAAAGCACAGTTGCCAAACTTCACGGGGCGAGAAAAAAGAATAAAGAGGCA:1 + chrX 12734497 3' + invader2 478 1 74.26 AAAATAAAAAAAAAAATTTAAAAAACACGAATGGCAAAATGAAAAGGGACAGTTCGGAAAATTCAGGGCGAATCGGGTTCCGTTCC:1 - chrX 4766682 3' + Transib5 24 3 72.09 GACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCCTTCTGCGTCGACGGCTTTCAGTTTGGG:1 + chr3R 5555962 3' + mdg3 5451 2 69.31 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTTGTGGTCTCGCCTATGTTTTCATTTTCCAACTGCCAAGTCGGCATGC:1 - chr3L 494621 3' - Transpac 26 2 57.43 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTTGC:4 + chr3L 24210994 3' - HMS-Beagle2 6893 2 67.33 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTGTCTGCTCTGTTTATGTTCTCAAATCGCGAGCAACTTCGGT:1 + chr3R 24720056 3' + P-element 2852 1 44.55 TGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCT:1 - chrX 17492891 3' - Tirant 33 2 61.86 ATTGTAGTATTTAAGTTTAGTAAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATGTAATCGCTTGAGTGCATTTTACCTAGAGGTTAAACTAATGTC:1 - chr3R 5169643 3' + Tc1 1554 1 56.44 TATCCGTTTTTTTTTTTGCTTTTTTTTTTTACTTTTGCCTGTGAAAGTCTGCTCTCGTTGCCGTTTTGGGACACCATTTTATGCTCGAAACACAAAAGAA:1 + chr2R 14549403 3' + pogo 271 1 82.00 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCCATTAGAAAAATTGCGCGCTCTTCGTTCAATTCCTTTATTACAAA:1 + chr2L 1530476 3' - roo 8694 2 58.42 GTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCACTGACGGCTCTTGAATAACAATTT:1 - chr2R 2645476 3' - HMS-Beagle2 42 2 72.28 GCTATTACTTATTACTTATTACAATATGTATATGTAAGCATTTTATGCCACCAAAGGCAACCGCAAGCCATTCCCAGCGTGAACATCAATTTGCTAGCATT:1 + chr3R 25859463 3' + Stalker2 7650 2 78.22 TCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTGCTATATAT:1 - chr3L 24210888 3' + HMS-Beagle2 295 2 62.38 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGACTAGAATGGATAAAACCT:1 - chr2L 13598170 3' - pogo 14 1 65.35 AAACAAAAAAAAATTTTAAAAATAATGATACGGTTATTATTAATCATAAGTCATTTGTTAACAAAATTATTTAATTTTTTGATTTCGTTCATAAGATTCTA:1 + chr3R 16713157 3' - FB 175 1 61.39 GGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGAT:4 + chr3R 10736110 3' - McClintock 5987 2 67.33 TTATTAAAAACAAAAAAAAAGACAATTAAATTCTAACATACATGTTAGAATAATACCTTTAATTTTATACCTCTCCCATTTTTGAACAACCTCTGGAAAAA:1 - chr3L 15430648 3' - hopper 154 1 70.30 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGCCATTAAAGTCAAAAATATACCGAGACTACAAATGGTTACAGCTCATCAAATCATTATTTTATTT:1 - chr2L 14993372 3' - 412 10 2 64.36 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGACGCATATTCTAGAACCATTTAAAAATTACGCCTAAAAGCATGCAAGGAAAATGCAGCCACACC:1 + chr2L 478775 3' - jockey 4778 1 61.00 AAAAAATTAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATCGTAAAAATTGAATCGAGGGC:1 + chrX 8958633 3' + Doc 4696 2 77.23 AACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCACCCACCCGCATTCCCTTGGCACAACAACAATGCCAATCTGCCGCCAGCCAGCTAC:1 + chrX 3318529 3' + Doc 4515 1 55.45 CTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGAGG:1 - chr3L 5651634 3' + McClintock 427 2 81.19 TCAACTGATGGGACATTAGTTCGACTCTGTGTCTTCTGTATCTTATCCTCCCTCCCTGTCTCGGTGGAGCAACTGTTAATTGTGGCCATAATTA:1 - chrX 5256881 3' + 297 365 2 60.64 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCATAATTAGTGTGCGAGCGAAAGAGAGAGAGAGCAAACTGGG:1 - chr3L 3070650 3' + 1360 3367 1 58.62 AAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACACATCCCCCAACCCCCGGCAGGTTGCAGCTGGGGGG:1 + chr2L 3901748 3' + I-element 141 1 65.00 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATGTACTCCACATTTAACAAATAT:2 + chrX 5178849 3' - hobo 52 1 79.21 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTGCGTCTATGG:1 - chr3L 19437230 3' - jockey 4709 1 64.36 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGATTGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAG:1 - chr3L 25884092 3' - Doc 43 1 60.40 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATGGATAACCGT:2 + chr3L 22162726 3' + roo 9039 1 59.41 TCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGTCCTAGCCATCTGACATTGAATGGTGTTTGTATGTGTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' + hobo 2918 1 57.00 GAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTTGCCCATCCGTTCGAGTTTATGTGTCGCACCTTTGCTGACCGCGGGTCGTCGGGGCTGCGACCCCAAAACG:1 + chr3R 28105191 3' - Gypsy6A_LTR 341 1 77.32 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTGCAACAATTTTCCGAGTGT:1 + chrX 4278372 3' - blood 56 2 79.00 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCCATTGTTTGCCATTATCCCGCTAAATGGAAAGAGTTCTGTTAATGCCTTTCGA:1 - chrX 17416898 3' - roo 8682 2 57.29 TTAAGAAACGTTAATTGTTATAAATTCCTACGAATCTTAGCCAACTAAGAACTCTAATTAAAGTCAGACGAAAGCACAACTACAAAGGGTTAAAAACTCTG:1 - chr3L 5272684 3' + mdg3 5189 1 79.21 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTA:1 - chrX 157213 3' - I-element 25 1 51.06 AAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGAAGTGCAGTAAATGAAGTTGACCGAAAAAGAAACTACGAAAAACCATTCAG:1 + chr3L 8044263 3' - mdg1 7371 2 52.48 TCTCGGCTGATAAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCACTCCAATGGCATCCTGAATGGAAATTAAATTTGAAATAACGAAATCGGCAGAAG:1 - chrX 15177652 3' + Quasimodo 249 2 55.45 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACAGTTTGTTTGCGGCTCGCTCTCGCATAAGGTTACATATTTTTTAAGCCAATTTT:1 - chr2L 12911236 3' + mdg1 7443 2 60.42 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATCGTCGAGCAATGCAAAGCCGACAATTGAGATTACGGAGTGGCAGCTC:1 - chr3R 30263544 3' + roo 9046 1 56.44 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCTATTGCTGTTGCTGCTTCTGCCTGTGTGCAATGTGTTGCAAGTTG:1 + chrX 7429430 3' + hobo 2909 1 53.47 GGGGAACTCGACTATAGCATTCTATGTTGTTAACTTTGAGTGTCATAATTGTAGGCAACAGGAAAAGTTTTCATGTTGGTCGGTTAGTGCTTTTTTTTTTG:1 + chr3R 4546771 3' + INE-1 571 1 76.24 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAATTAGGCATCAAAATTGCTAGTATTTTTCACTGTACTCCCA:1 - chr2R 7769623 3' + pogo 2070 1 58.42 GATTATTCTGAGCATTTTTCGTTCGCTGAATTAGCTGTATGTGGGATTTACTGGATCAAATCTTAGGTTGTTTCCCTGACTTTTATTTTCATTACTAAATC:1 - chr2R 3515060 3' - Porto1 4337 1 57.43 ATCCAGATGCGTTCAGTGTTGGTGCACGCATGTTTGTGGAAGGTGGTTTCAGGAGAGTGGGATACACAAACAATGAAAGAGCGTCTACCCTATTATAACCC:1 + chr2R 3335553 3' + 1731 488 1 57.43 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACATTTTCCATTAAATTTAAAGCTTTTTCTATTTGCTTCTGGAGCACAACATGCC:1 - chr3L 18523582 3' + 412 7524 2 58.42 CGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTAATGAAAAAACCAAAAAGG:1 + chr3R 1329867 3' - Quasimodo 6907 2 79.55 CACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTTTTTTATATCGGATCCCGCTGCACGTTCATTTGCTG:1 - chr2R 20385940 3' + Doc 334 1 64.36 CGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGACTGAACTTTAACGGATCGGTGACATTTGACACAAAGAA:1 - chr3R 1715491 3' + accord 177 2 61.39 TGGGACAACTTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCCGTTGGTCACATTCCCCACACTTGGATGGCGTAGGTCAGTGTTGAATCTATAATAATAAATATAATAAA:1 - chr3R 11267322 3' - G5A 2556 1 54.46 TTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTATCGTGTTGCGCGGGGACTTTGGACGTAGGACGTCCGTGCACGGAAGGTGCACGTGTATT:1 + chr3R 6137403 3' - Doc 4533 1 64.36 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATGGATAACCGTTCGGTTGA:1 + chr3L 22162734 3' + roo 9047 1 54.46 TAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCT:1 + chr3L 24210990 3' - HMS-Beagle2 6897 2 63.37 CAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCACAGCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTA:1 - chr4 868711 3' + 297 26 2 77.23 TTAAATTTTTTTTATTTTATCAACCAGTTATAAACAATTGTCATCTTGTAAAACTAGAATATGTTATAAACTAATTGTGTTTACGTTTTTTATAAATATGA:1 - chr2L 16256695 3' + 1360 3096 1 72.28 AAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGACTTGTTTGGCTGCGTGGCAAGAAATTTTTTTGGCACACAGACTTCGATGCTCAGACTTGATTCATCGACGACTTCT:1 - chr2R 5949565 3' - INE-1 255 1 59.41 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGA:3 + chrX 21219478 3' + roo 361 2 71.29 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTAGTGTAATTAGTGCTTATTGAGTGGGGATAGTGCATTCAAGGCAGCGGAAAATCAAACGGAAT:1 - chr2L 479306 3' - P-element 13 1 66.34 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCTGGCTTGTGGGAACGAAACATTCCATATATATTACGAAGTGTAATT:1 + chr3R 16399006 3' + roo 9040 1 53.47 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCACAGCCTCACCTTGTTCAAATATGAAATAGCAAGCAGCCACGGCCGAAATGGAA:1 + chr3L 9190530 3' - 412 23 2 56.00 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGAATGTTATTCTCTCTTTG:1 + chr2R 19164138 3' - P-element 57 1 28.71 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATGGAAAAAAAAACGGGAAACTCCATCAACCCATTTGGGTCCTTGGCAGCTATTAATT:1 + chr4 412815 3' + jockey 4969 1 55.45 ACCCTCGATACATGCACATACTACACATGTCTTTACTTAGATGTACAAAATATTCACAGGGTATCTAGTTCAATTTGAATTTTAATTGATTATAAGTGCTT:1 + chrX 6160530 3' - blood 7015 2 40.59 TGAGATGTCAAAATACTTTTGCCACCGCCAAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGTATAAGCAATAATAACAAGAAGGTGCACAAGAAAAAGA:1 - chr2R 3170148 3' - Tc1-2 207 1 62.38 TAATATGCTCTTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGCATAATCAGATTTAGAGTCGAGTGCCTG:1 + chr3L 18523647 3' - 412 7084 2 66.28 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAATTGTGGTGGAAAACTACAAATATATATATAGTTCGAAGTTAATGGACAACCATAACT:2 - chrX 10776135 3' - roo 8683 2 54.46 GCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATAGTCGATCTAGAAAAATCGTACAGCTATAATTATTCCATTAGCTGACTGGCACGCCTTTGCAAGG:1 - chr3L 7733794 3' - flea 4760 1 76.24 TTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTCGATCCGGTCCTTGTATGAATTTTAATAAGTGTTGGATTGCGCAACGTGTGATGTTCACCAAGGT:1 + chr3L 12317178 3' + I-element 307 1 69.39 ACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATAAAATATTGTATATACGTGTGATGTACATATATACATAGTATTAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:2 - chr2R 1982173 3' + Tabor 482 2 75.25 TTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGACTTCACT:3 + chr3R 435947 3' + 1360 3018 1 52.48 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGC:1 + chrX 21219473 3' + roo 9023 2 75.51 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTCCATTGGAAAAAAGCCCTACATTCATATAGTTTCATTTCACACGGAGACAAATG:1 + chr3L 17635601 3' - 297 14 2 66.34 ATTGAAATATTGCAGAGATACCAGTCTATGATGCTTAGAACAATCACAGGTGCTCCATGGTATATGACCAATCGCAACACCGACGAAAGCAACAAAAACT:1 + chr3L 27361370 3' + G3 4241 1 71.00 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTATGGCGACACTGTCGATACAGATACAGATACAAACATCTGAAAGCCAGCAGTCGTGG:1 - chr2R 22761538 3' + blood 352 2 55.45 AGAGACAAGAACGCGTATAAGTTATGTGTTTCCTCTTCTGTTGGGGTCTTCCTTCAATAGGCTTGTCTTAATTATTTT:1 + chr2R 1918519 3' - 1360 3227 1 57.69 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGTTGGCGGTGATTTAC:1 - chrX 3446500 3' - I-element 9 1 68.32 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACATTTTCCATTAAATTTAAAGCTTTTTCTATTTGCTTCT:2 - chr3L 18523597 3' + 412 7509 2 60.40 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCTGCCTTGCTGTTTTGTTATTGTTTGG:1 + chr2R 6501205 3' + P-element 2840 1 34.65 TTTTTTTTTGTTTCTTTTTTTTGCCTAAATGCAATATTTAGTGGCTTCAATTGAAGGCAGCGCTGCTTTTCTTAGAAGAGATCCTTGGAAAATCGGCC:1 + chrX 3120159 3' - Doc2-element 220 108 51.02 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAATCATATTTGAAGCAAAATGCATAGACGCGCTTTGCAGCATGGCAG:1 + chr3L 18523003 3' + 412 463 2 55.45 GCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTATG:1 - chr2R 5582181 3' - Cr1a 455 1 51.49 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTTGCAAAGATAATTGAAGGGTATGCATGTATTTGCTCCCAAATGCATACTTGAATT:1 - chrX 18975540 3' - diver 5913 2 54.46 ATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAATGAAATAAAATTGAAAAACCGCGAAACGCAAAACCCAA:1 - chr3R 20386031 3' + I-element 79 1 62.38 TTACTATATGTATTTAAAAAAGTTTGTATTCTAAAAAAAATCTTTGGAATGCAATGTTTTGGTTTGTGTGTAAAAAGAGAGGAGCCAACCGGCCACGCAGC:1 + chrX 4602066 3' + TART-C 11030 1 52.48 TGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACCTTCGCCCACTTTCTCTCCCTTACTTTATTAATTACACAAGTTGTCTCTGCAAATATTTTTCACTCAAATTA:1 - chr3L 21982610 3' - mdg1 7042 2 76.24 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATACATATGTATATAATATATTCGGCCTAAGATATGATTGTTTGTTGTGGGCGTCGATGAATATTAT:1 + chr2L 9672512 3' + 297 6968 2 65.35 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGGGAATATTGTGCTGCAACATTGTGCAAATTACGCAAATCCT:1 + chr2R 20973071 3' - roo 33 2 60.00 ATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATATATATAAAATCGAGGCAAAAGTTTAGACTA:1 + chr3L 14854750 3' + mdg3 204 2 73.00 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCATGATAGATTTGTGCCATTTCATAGGAAAACTGAAATCGAACCAAGCTAAATCAAAAAATGAA:1 + chr3R 10187451 3' + roo 9059 1 66.34 ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGTAAAAGTT:2 - chr3R 13231148 3' - Quasimodo 33 2 63.37 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGCATTGCAACTGCTGTTGGTAGCAGCACTGAATCCCTAGCTGTAGCT:1 - chr3R 8499408 3' + Tabor 7293 2 52.48 TACATTTAAACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGCTCACGGACTTAACTCGCGAATGATAAAAATAATCATA:1 + chrX 17492933 3' + Tirant 364 2 75.95 CACAGCTGCGGTTAAAATACTAGCTATCGTAAAGTGAATATATAAGGTTTAAATTAAAATACCAGTTTATTATTATTTTATGTTTTCGATGATTCACTCAA:1 + chr2L 4855703 3' + Tc1 1 1 68.32 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAG:1 + chrX 21668065 3' - Tabor 42 2 65.35 AAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTGCTATATATACAATACATACA:2 - chr3L 24210876 3' + HMS-Beagle2 7190 2 74.26 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACATTGTTTTATTAGCATTGCAATTTTGATATAACTTGCTTT:1 - chr3L 22162661 3' - roo 8699 2 61.39 CCATATCTTAAATCATTGTAGATCTAACATTACATTAAATTACATACATTTCCTCTTTTCTCCTTTAACCCAACGCTTCCTAAACCATCAACGTGACTTCG:1 + chrX 2498943 3' + Cr1a 4141 1 60.40 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCAT:1 - chr3R 4504071 3' + blood 344 2 59.41 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGCCATTAAACCAAGCAAAGACGAAAAATACACGGCGATCGCTGATACAAACATACATACATATATGTATG:2 - chrX 19716957 3' + P-element 2882 2 72.28 AGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCCTTCTGCGTCGACGGCTTTCAGTTTGGGGAAATAGAGGGAGTCACACATTACTTTCT:1 + chr3R 5555991 3' + mdg3 237 2 67.39 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTGTATTTAATGAAATTTTATTCGTAGCATTCC:2 - chr2L 12888821 3' + 412 448 2 76.24 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGGCGGAAATGAATGTTATTTATTTATGTCGCT:1 + chrX 21219516 3' + roo 400 1 72.28 GCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGACTTAAAAACGAAATCAAAAGATTTGGCCACGATTTGCTACGATTAACGCAGCAT:1 + chr2L 21624928 3' - 297 163 2 63.74 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATGTTTATGGCTATTAATCAAAATGTATTTGCTGCCGGCAAATTGATTAACATTTTCCGAG:1 + chr3L 12258279 3' + roo 393 1 62.00 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTTTAAATTAAGTGGAAATGGAACTCAACATCCCAGAGCTCGAGTATAACATATAAA:1 + chr2R 20506895 3' - mdg1 19 2 61.00 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGTAGCCCCTCGGGCACTCGAGGATTAAGCGA:1 - chrX 21219435 3' - roo 43 2 70.30 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACGTAAGAGTTTTTGGGCCAAATTGCCTGCATAATT:2 + chr2L 9129187 3' + 412 7505 2 64.36 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAATCTAAAGGCGACCAGCA:1 - chr3L 14205359 3' + P-element 2830 1 24.75 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGCTCATAACATTAATGT:1 - chr2R 19164124 3' + P-element 2828 1 20.79 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGCATAAACAGATTTAGAGTCGAGTGCCTGGAGCG:1 + chr3L 18523652 3' - 412 7094 2 72.28 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGGCTTTTTATGGCATACTTTATGGCGTTG:1 + chr3R 30326345 3' - pogo 45 1 76.00 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGCCATAGATTAGCGACCAAGTGCACTACTTCCGCCAGTTAACGAGCTCCACACCGTTG:1 + chr3R 17529608 3' + roo 9053 2 59.41 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTGTCCAAATGAGTTCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAAC:1 - chr3R 29361017 3' - 412 32 2 55.45 TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATACGCCTGTGTGGCGCTCCGTGATGTCGTGTCCCCGTGTAGGGTTACATACCACCTACTGCCAAACCAACCCATCCC:1 - chr3L 13652145 3' + mdg3 5496 2 74.26 CAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGTACAAGAGGTGGGTAGGGGGCCCTAGCCAAAGGGAAA:1 - chr3L 19173543 3' - transib2 7 1 60.56 TAATGTTTTATGTTCACTTGCTCTTACATCTACATCTGCAATTTTTGTTACTTCTAGGAGTTTTTTTGGGTCTTAGGAATTTTACTACGACGTAGTAGACA:1 - chr2L 16533748 3' - I-element 459 1 67.33 AATGGGTATCTGATAGTCGAGAAAATCGACTATAGCGTTCTATTTGGTTTTTCCCCTGTATTTACTGTGGAACCACTGTATTGCCAAGATTGAAATCCGAG:1 + chrX 12248386 3' + INE-1 553 1 58.42 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTCAGATAAGGAGCGCGCACAAAAGTATGCTATGAAAACCGTAATCATAATCGTAAAG:1 + chr2L 17729386 3' - hobo 21 1 58.42 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGGC:2 + chr3R 21587308 3' - pogo 37 1 65.35 ATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATGCCAAGGGCAAACACAGTGACAAGCTCGGTGAGCCCGACTTCATATCGAGGCTATGCATTTAATGGATT:1 + chr3R 6136587 3' + Burdock 250 2 74.00 TCCTTGCTAGGCTGTGGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTGCGTCTATGGGATGCGTAGCATACTTTTTGGCTATGGGCTCGGTGC:1 - chr3L 19437194 3' - jockey 4673 1 73.27 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTCTCGATATATTTATAGGCTGGCAGGGCATAAAAAGCGA:1 + chr2R 14046411 3' - jockey 4710 1 63.37 ACGAAAACACAAGATCAAAACTTTTAAGCGAGCTGTAAAAAGAACCGTTATGGATGATGATATATGGGCATTGTGGAATAGATCGGCAGCATCACTGACC:1 - chr3R 8710042 3' - Cr1a 387 1 61.00 GTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTACATATATATTATTTACTGCCTAACGTTCTTCAGACAAATGGTTATGCAAAGCGAAGATATTTGGGTATGT:1 + chrX 20374603 3' + Bari1 1703 1 77.23 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAATGAGGCAATCAATTACGGCGAACCGTTT:1 + chr2R 18983710 3' + jockey 4949 1 73.27 CGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTATATATAGGGACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTG:1 + chr2R 4287886 3' + rover 7277 2 58.42 TATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTATCTTATTCCTATCCTATTCGATTTTATT:1 - chr2L 10189456 3' + roo 361 2 69.31 TTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCTAACAAACGAGATGGGGAATGGGAAAGTGGACGGTAACAGGTAAACAAACATGTCT:1 - chrX 5129663 3' + I-element 10 1 62.24 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATCTGAGGGAGGGGTGAGTTGGGATCAGCCAAGTTGA:1 - chrX 2755451 3' - opus 7039 4 66.34 TAATTAAAAAAATTAAAAAAATACATTACATTACATTTTATGTTTTGGGCGGATTAACGGCGTGGCAACATCAGTTGCAAGACCAGCTATCACAGGAAAAA:1 + chr2R 1368124 3' + HB 320 1 74.26 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCCTAGCCCTCTGACATTGAATGGTGTTTGTATGTGTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' + hobo 2925 1 62.38 CTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACAGGATTCATCGTCTTGAGCCTGCTGATCCTCCGTCTTGGCACGGTCCTCGGACTCGC:1 - chr2L 19045970 3' - R1A1-element 5103 1 71.28 TCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTCCTTTGTCGAACATCTCGGCGAGAAAGTGGTCCAGCAACAGCGTTCACTAAAGAATAGGGCACCCTCTTAAGCTAC:1 + chr3R 3466763 3' + INE-1 578 1 64.36 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTTGGTTGGCCCTGTCTGTGTATGTGCCTTGCAATTTGTTGTAACCATTTTCGTTGCCTACTTTTCCGGGCACTTT:2 + chrX 16532044 3' - accord 7030 2 83.17 TTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGACGCATATTCTAGAACCATTTAA:1 + chr2L 478734 3' - jockey 4820 1 76.24 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAG:1 + chrX 19887116 3' - P-element 57 1 23.76 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGAGTGAATTAGTTCTAATACGAAACACAACGAGTTTG:1 - chr3L 19066086 3' + roo 9033 1 62.38 TGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAAAAAAAAAGAAAATACAAAACTCGAACTGAAACTGCTAATTAAAATAATGTCAATAAAATTGTT:1 + chrX 7599777 3' + Porto1 4194 1 64.36 GTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACTACTAAAAATGTTGGATTCCTATCACATAATGACGGAAGCCACATTAAATCAATGTCAGAAATGGCAACTAAATA:1 + chr3R 19449265 3' - Ivk 346 1 60.40 CAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTCTGGGCGTTCTAGTGTGCTATAGTCGAGTTTCCCGGCTATCTGATAGTGGAAGTAAGAATGTGAAAAGTTAAAAAAAAG:1 - chr2R 5246665 3' - INE-1 247 1 63.37 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTA:1 + chr3R 13376018 3' + 1360 3340 1 77.23 GTGAATTCATTTTTCGGCGTCCACAATATGAGTGATTTATTATTTTTTGCAACTGAACCATTCTTAATACCAACAGAAGTCACTACAATAAA:1 + chr3L 17762865 3' + invader3 5460 2 73.91 CACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACTGGTCTAATCTCGGGATCTGTGCACAGCTTTACTTTGACGCCTTTACACC:1 + chr3L 25729959 3' + Quasimodo 7065 2 50.50 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAAATGCCTCAACTTCGTTTGATTTATGCATCAT:1 - chr2L 17311086 3' + S-element 1675 1 73.27 TCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACGATTGGTGGCTAACGAACTC:2 - chrX 157186 3' - I-element 5 1 72.28 AATAAAACTTAAAAAAAAGAAAAAAACAACCTCATTCTCCTATTTCCCAGCCATGAAATAAAACCAGGCAACAATGAAACCCAAAGCGTCTCCCAAGCGAT:1 + chr3L 10815253 3' + Doc 4694 1 74.26 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAA:1 + chrX 21945910 3' - F-element 59 1 76.77 GGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTATTTACATTCGCGACTCTTATAATTAGTTCTTACATTCTAATACTGCAATACGGTTTATACTACTATACT:1 - chr2L 23180004 3' - Burdock 6138 2 77.23 AAGAAAAAGTAAAAAAAAAAATAAGAAAACGAAAAATTACCTTTAGATGAACTTAGCGCAATTGATATAATGAATAGTTATTCGGTAGTTTAAGTTTTACC:1 + chr2L 17652552 3' + Doc2-element 220 1 70.30 TGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGA:1 - chrX 17492906 3' - Tirant 8159 2 78.22 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTAGATTAAGAACTACTTTATTGTTTGGTGTTGCGCAAAATTTC:1 - chr2L 18977904 3' + roo 9039 1 60.40 TCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTAAGAGGGACCCAGAAACTCAATACTAAATGTTGCCAAGCGATACGAAGGTCAATATTATTGCTTTATTAA:1 - chrX 12871313 3' - hobo 269 1 73.27 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGG:4 - chr3L 25884084 3' - Doc 35 1 54.46 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATGTACTCCACATTTAACAAATATACGTACATGTGCGTTCAACATAATAGG:1 + chrX 5178882 3' - hobo 24 1 54.00 GCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTGCTAT:1 - chr3L 24210892 3' + HMS-Beagle2 291 2 58.42 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGACTGCTTGCAAATACAAATTTACGGTCCTTACTCCAAATGATTCTCTTCGGCGTCACTTAACCGAA:2 + chr2L 21778010 3' - mdg1 9 2 71.29 ACCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGGGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGA:1 + chr2R 17348615 3' - jockey 37 1 57.43 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGAGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTC:1 - chrX 17492890 3' - Tirant 36 2 60.40 CAGTTTAGGGGTAATGTTTAATAGTTTTAATTTATGAATCTAGAATTTATCGAAAGAGAACACCCAAGACTCTTGCCGAAGCCAAGACAAACACAAATCAG:1 - chr2R 3339184 3' + accord2 486 1 61.39 ACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATACGCCTGTGTGGCGCTCCGTGGTGTCGTGTC:1 - chr3L 13652190 3' + mdg3 200 2 71.00 CATACACACACACACATATACAAGCACTAACACACACAAACAGGATAGTCCGCTGTCTAGTATCTGTGTGAATGTCTCTTCCTTTTGGGCTCCCCAGCGGA:1 + chr2R 13628659 3' + accord 7032 4 82.18 TTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTGCGCTTTCAATTCCATT:1 + chr3R 19513425 3' - jockey 4682 1 65.35 TGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTT:1 + chr3L 24210991 3' - HMS-Beagle2 6892 2 67.01 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACGATTGGTGGCTAAC:3 - chrX 157192 3' - I-element 11 1 66.34 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTGAATGAATTAAGCTGAATAGTG:1 + chrX 12152705 3' + roo 9019 2 79.21 AAGGAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATAACTGTAGTTGAAACCCATTTTTCGT:1 + chr3R 2474334 3' - Juan 4022 1 70.30 TTTGAGAGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGG:3 + chr3R 1977610 3' + micropia 414 2 62.38 AATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGGCACTTCGATTGCATAAGGAGTTGAAAATGATTTAT:1 + chr3R 26096952 3' - roo 410 1 63.37 CAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACCAAAATGAAGAGATTAAATTTAAGATATTTGCATTCTTAAAGATCTTGTT:1 - chr3R 20240868 3' - Tabor 28 2 50.50 TTTGATTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTAGGGGGTAACCAGATTGGAATCATCAAGTTTTGCCGCTCTAACAATTGTGTTTC:1 + chr4 862465 3' - 1360 2996 1 55.45 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTG:1 - chr3L 8044302 3' + mdg1 7439 2 58.42 AGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGTAGTGGGAAACTTCTTGGCACTTTCATGAACTTCTGGCCGGTAATTAAAATC:1 + chr3R 25514196 3' - hopper 17 1 62.38 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGGGCATAACAACAACTGGTTTTACAACGCAACATAAAAAAAGGATACAGTGAAGCTTCG:1 + chr3R 28326510 3' + P-element 2871 1 63.37 AGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGAAGCTATGAATAAATTTTGTGATGCAAAAACGGACCGAGGAAACA:1 + chr3R 25568587 3' + hobo 420 1 55.45 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTAGTCAATAGTCGTTATTTGATATAGTCGCCAGACCAACAACAAGCTGGCCATGATGAAACGTGCCTGGG:1 + chr3L 13652268 3' - mdg3 5260 1 69.31 ATCGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAATCCAAATGAAGAATCATAAAGCGAGATTTGAAGATGAACTGACCTCTATTTCAATTTAA:1 - chr3L 10305302 3' + 412 7531 2 63.37 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTATACCTTTTATACCCTTTGCACAATATACCC:1 - chr2L 5654848 3' + roo 9029 1 69.07 GAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGTTTTTTTTTTCGGTTTTGTTTTTGGCTATAAATTTCGCTTTCCACGGAA:1 + chr3L 14205746 3' + P-element 190 1 56.12 AAAAAATTCAAAAAAAAAAGAAAGGGTACTGTAGATACTTGGGCTACCAGAAACCATTAAGTTTCTAAACTTCCTTAAATGTAGGATCCCTGGCAACTGCT:1 + chrX 12250650 3' + TART-A 13403 1 64.36 AGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATCTGTATTTTGGTTTCGAGATCCGCCATCCTTAACTCGTGTATTCCCAACTCTTGCGTTGTCCTGTTCTTT:1 + chr3L 27392120 3' + invader4 2683 1 74.26 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACAAGCAAATCGTTTAGTGCGCCCAACTTCCGTTTGGTGAAAGGCAACGGAAACGCTGCCAGTTGGCCCACACAC:1 + chr3R 29359808 3' - 412 84 2 76.24 AATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTATACAGTGGTTTATAAAGAAATATTTTTGCTGGAAATACTTAACATACTCATTTAATTGCGTGCTTTGGGATC:1 - chr2R 15372450 3' + 1360 3326 1 57.43 GCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTATTTATTAATGAAAAAAGCGAT:1 + chr3R 3625664 3' - Max-element 8291 2 80.20 TCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACAATCTTGCCAGAATTGAGTTGGCCGATGCGAAGGTGGGTG:1 - chr2R 1780065 3' + I-element 322 1 60.00 TTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTTGGTTTTCATCTTACCTGTTGTACCTCTATTGTGGTATCTTTATTAGCCCCGGTTCCCAAC:1 + chr3R 25215019 3' - Burdock 6143 2 72.28 CTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACATATGTTATTGTATTCTTTTATTATTATCTT:1 + chr3R 1048029 3' - Quasimodo 71 2 75.25 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTAGAAATTTTCCTGCCTAATTCTGGTACTAATACCATTACC:1 - chr2L 17213858 3' + hobo 2902 1 60.40 GGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGTAAA:1 - chr3R 13231152 3' - Quasimodo 28 2 63.04 CTATGGCGCACAGCTATGGGGCAACGCCAGCAACAGCAATACCACACTGCTCTTACACTACATCTTACAAACTAATCAAGTTCAGATTCCGCCATCTGA:1 + chr3R 2463453 3' + F-element 4270 1 60.61 GGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCTCTACCCATTTAATCTGTCCGCTGCCACGCCCCTTGGTGTT:1 - chr3L 13890464 3' - Doc 4483 1 59.41 AGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGTAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTT:1 + chr3L 15099624 3' - G4 3809 1 38.55 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACAAATG:2 - chrX 5168839 3' - hobo 25 1 54.46 TTTTTTTTATTTTTATGATTTGTAACGATTTATGGATTACAAAATATTACAAAATATATTACAATGCGTTTTACATAAATATATTTTCACAATACATATTC:1 + chr2R 10927220 3' - Rt1b 5147 1 57.43 ATTATTATTATTATTATTATTTTCCGTATAAAAACGAGAGTTTTGTAATGTATCAATTGATGTTTTATTTATGTGTATATATGTGTTTATATTTAAATACA:1 + chr3L 10206415 3' - mdg1 7068 17 69.31 AACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATCTCGACGTTAATACTGACGGACAGGGCCAGATCGACTTGTACTATTACGTTTACTTTATGGAATCGCCACGA:1 + chr2R 5259870 3' - INE-1 158 1 65.35 ATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCTAAATCCTTGCGAGGATGTAATGGGCTATCAATG:1 + chr3R 17731350 3' + 1360 3114 1 66.34 ATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTGCTATATATACAATACA:2 - chr3L 24210880 3' + HMS-Beagle2 303 2 70.30 CAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACATATACAAGTATTAAGCATAGTCAGTTCAAGCTCACCCCATTTTATGGAATGACAAATACCACAAA:1 - 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HMS-Beagle2 8 2 68.69 GTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTACCTGTAG:1 - chrX 21564092 3' + invader4 292 2 58.42 AAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGAAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAATAAAAAAAAAGGGAGAGGAGATGGCGTTAGCCGATTGAGA:1 + chrX 17508563 3' + Bica 278 1 78.22 ACGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCCAATGGACCAAGGCAGTGAAAA:1 + chrX 17416954 3' + roo 354 2 75.25 ATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCACTAGTTTGCTCTGCCGCTCTCTTCCTGAA:1 - chrX 3295653 3' + hobo 334 1 73.27 GCTAGGCTGTTGGGGTGTACTCTCGATATATTTATAGGCTGGCAGGGCATAAAAAGCGATTCCAACTGAAGCCGAAGCTTGCCAAAAAGATTTACAAAATG:1 + chr2R 14046453 3' - jockey 4668 1 67.33 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGT:1 - chrX 157214 3' - I-element 33 1 57.43 CCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGG:1 - chr2R 6482690 3' + gtwin 7337 2 79.21 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATGTATGCAGAAAAGGCGTTGAGGACGGAAGAGTTTTTCAAGTGGAAAAGCG:1 - 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Quasimodo 44 2 76.24 ATCGGATTGTAAGTCTAAATGGCACGAAGTGTCCTTGTACTGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACAT:1 + chr2R 1234692 3' - Q-element 624 1 73.27 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCT:1 - chr3L 9190447 3' + 412 7520 2 52.48 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCACTTTCTTTCAATTGCCA:1 + chr3L 3070690 3' - 1360 55 1 81.19 CTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGTGTGCTTAAGTAACTGCAAATCAAGTAAATAAAATTTCAACTTAAATAAGTGTTCAGTGTTTAGCCAATAT:1 - chr3L 5272290 3' + I-element 421 1 76.24 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGCTTCTTGTGATTTACAGCTCTTACATATCAAGCACTTCTTTAAACTTCGCCAACTCTTT:1 + chr3L 10305404 3' - 412 16 2 57.43 GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - Tabor 8 2 30.61 TTTTTTGTTTTTAATATTTTCACCGCTTTAAGTGTTAAAAGGATTATAGAAAATTGCCAGCAACATGAGCATGGGTTAAGGGTTGGGCGTTTTGATGTTTG:1 + chr3L 10825145 3' - TART-A 13401 3 64.36 GAAGAGATAAGTCGTGCCACGCAGTTTAAATGGTAAACTGAGTTTGACATCAAGTCCTTAAATATAAACAAGGAGTTTTAAAGCTACTAGAAATAACCGGC:1 - chr3L 13240884 3' + I-element 20 1 80.20 TTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTA:1 - chrX 21668001 3' + Tabor 458 2 49.50 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATACAAAAGTTATCATACCAATTTCACAAGCCAACTTATTTAAGACTTTCTTTC:1 + chr2R 21833984 3' + Transpac 5211 2 59.41 CTAACGATATCCCAGAAAAATTTTTAAATTTCTCGTTCATTTCCACGAGCCGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGACCGGTACTATCTGATATTGTTTT:1 - chr2L 22538978 3' + INE-1 502 1 76.00 GTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATTATATGCAAGTCGATTCTGTTCTATTCTATATTCTATTCTATTC:1 + chr3L 20857081 3' - Doc 263 1 56.44 GTAGTTGCCACTTATGCTGTCCAGTGACACGCCTCCCATTGAAAACCCCTTGCACAAAGACAACAAATACCAATTTTCATGCCTCACTGAGCATTCAAATA:1 + chr3L 3552259 3' - rooA 81 2 71.29 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTCGTTCGATTCGCTTACATGCTCCTTTCTTGCTTAAGAAGCCAGACGCATCTGGTACACTTGAGAC:1 + chrX 21050037 3' - 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chr2L 1535669 3' + roo 9024 2 71.29 ATCACTTCGGAGGTTGGAGTGGTACTGTCATAATATTTATAATGATCTTAATGATGACACAAAGTAAAGCAGGACCAATCGAAATAAACCCTAGCATAAA:1 - chr2R 2009379 3' - I-element 6 1 71.00 CCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCCACCAGGAAGCATTTGCCCGGTACAGGCAGTGGAATTG:1 - chr2L 14186365 3' + F-element 410 1 62.38 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGCTAACCGGCTAACTCGGCTGGCTTATGCAAAACTCCACATCCTCAGCTATTCTGCGACGAT:1 + chr3R 31768715 3' + roo 394 1 62.38 TAATCAATTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATACTTCTACGGCTTCTCGTTCCCGTCGTAA:1 - chr3R 1433425 3' - Cr1a 4070 1 81.72 TCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGATGCCTGTGCGTGTATGTGTGGCAG:1 - chr2L 17694273 3' - hopper 48 1 70.00 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCTGGTGTTCCAGATGATGCAGATCCGTGATGGTTTTCACCACTCGCTCGTCGTTGA:1 + chr2R 14604724 3' - P-element 19 1 60.00 TGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGTGGGCATTGTGGGTGTAAGTTTGTAGCACTATTAGCTATTGTTTGCGTTGAAATGGAGCTGCGGATG:1 - chr3R 26500054 3' + 1360 435 1 76.24 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACTGAAGTCGCACACCCGCCGCCGCCGCCGCCAAAGTTGAAGAAAAAGAGCGCCGGACTA:1 + chr3R 13996012 3' - 1360 14 1 61.00 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTTACTCAAAACTAACT:2 + chr3L 3535476 3' + roo 404 1 72.28 AAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGTGTTTATAGCTATGGGGGGCAGGTATATGGCGCGGATCTGACTGCGCAGGCGTACGAT:1 + chr2L 2225857 3' - ZAM 8027 2 63.37 AAAGCTAGAAGGTTAAGATTTAGTATACAGATTCTAGAGACACGCATACACGCAGCTCTAGTTTGTTGACCCATGCTGTCACGCCCACTCTAACGCCCACA:1 + chr3L 22511715 3' + INE-1 166 1 91.09 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATCCGTTGAGAGGTGTTCAAAGCAAAAG:1 - chr2L 21018807 3' - 412 48 2 70.30 TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGTAAAAGTTTGCCACTTAGCACCCGAAAAT:2 - chr3R 13231127 3' - Quasimodo 12 2 72.28 AGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGTGTGTGACATTCGATTTGATTGTTTTTGTTTTGAAA:1 + chr3L 13885517 3' - Doc 163 1 64.36 GTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCGCCGAATCTTGATATCAATATTTTGAAGGAAACTACTTGAAACCAAGCGTAAAGAATATAGTTTTTTAAATG:1 - chr3L 7266485 3' - mdg1 3 2 76.24 GAGAGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGT:1 + chr3R 1977612 3' + micropia 5402 2 60.00 ATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACCCAGATATTTAGCTGGATGGAATCGAGTGAAATCCAGACGAAAATTGGAAAGGCAC:1 - chrX 8302708 3' + flea 4823 1 57.00 ACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACAATAGAATACATCTGTTAGTTTTATATTGCACAGTAAACAC:1 + chrX 19768657 3' + I-element 4906 1 59.79 TCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACTTCTGGCCAACTGGCCAACTGGCCAACTGTCACTCAAGGACCCAGAAAGTCC:1 + chrX 12768313 3' - FB 25 1 54.46 GATCAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTG:1 - chr3L 5267235 3' - Juan 4020 1 67.00 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCGCAACCATCGCGACGCGCTCTGGTTTTTCCTATTAGCGGCGCCC:1 - chr3R 13623648 3' - jockey 28 1 52.75 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCGGGCGTGGCCTGGCAACTCGTTTTTGACTTTGAATTTCGCCAC:1 + chr2L 8299877 3' - Transpac 4949 2 55.45 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTCTATGTGGGGCTGTTTATGTGCATTTAAATAATACATTTTTATTGACAATTTAACAGTTAAACCGACA:1 + chr3R 6097687 3' + roo 401 1 71.29 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGCCATAGATTAGCGACCAAGTGCACTACTTCCGCCAGTTAACGAGCTC:1 + chr3R 17529598 3' + roo 9043 1 56.44 GCATTTATTAAAAACAAAAAAAAAGACAATTAAATTCTAACATACATGTTAGAATAATACCTTTAATTTTATACCTCTCCCATTTTTGAACAACCTCTGGA:1 - chr3L 15430652 3' + HMS-Beagle2 477 1 72.28 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACACCAACAACAGACAAGTGCACGC:1 + chr2L 12888853 3' - 412 56 2 78.22 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATGGAT:1 + chr3L 22162720 3' + roo 9033 1 65.35 AAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAATGGTGATCTATGTCCGAAAAA:1 + chr3R 3784436 3' + F-element 155 1 79.21 GGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTCGCCATTTAATCTTTTGGTTTTGTGATATTATTTATTGTGATTGA:1 + chrX 17938592 3' - I-element 315 1 55.45 CGTATGAACGTTGATATCTCAGGAACTATAAAGGAAGATCTCAACCTCAACCTAAGCATAATCTAAAAACCGAATATAACCCGTCCACAACATGGCAT:1 + chr3R 31045886 3' + INE-1 136 1 80.61 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGGATTTGTGCAGCGAGA:1 - chr3L 18793028 3' - P-element 59 1 23.76 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATACACTGACAAAAACTAAACACTTTCTTGGCTAAAGATCAAATGCTTAAGAAGTGAAAATTAATCAA:1 + chr2R 12247488 3' - hobo 10 1 68.32 ACTTAAAAAAAAAAACAAAAAAACATAATAAACTAATGCAAAATGCCTTGA:1 + chrX 12287107 3' + Doc 4700 4 76.47 GCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCACCTCTTCTTTCTGCTTGACAAGCTCCTGCTGT:1 + chrX 3961200 3' - F-element 481 1 68.32 GTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGTAAAAGTTTGCCACTTAGCACC:2 - chr3R 13231134 3' - Quasimodo 19 2 65.35 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAACCAATAACTTTTTATATTTTCACAACCACAACTATTGCACCCGTGCAGTCCTTTTCTGATTTCTGT:1 - chr3R 17492646 3' + copia 246 1 62.38 ATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGGCGACATATATATATGTATCTCAAATCATTTAAAAACTTGCATCACTAACGGGTATTTC:1 + chrX 16906751 3' + invader4 3058 2 62.38 GTGAATGAGCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAAT:1 + chr3R 2689421 3' + diver2 4466 1 56.44 AAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGGTGTAATTGGTGTAAATTAAATGAGACGAATAGCAGGGACTGATTTTTGGCTGATTGTACAG:1 + chr2R 1780236 3' + F-element 4606 1 66.34 TTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGAGTCTTTGCCAAAATAACCGTTATGCCTATTTTGCGATGCGAGGAATCATTATTTGCCAAAATGTTCTCG:1 + chr3L 24761010 3' + 1360 44 1 72.28 GAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAACACGAAGATTATTAAATAAAGTGTTAGG:1 - chr3R 15565210 3' - Max-element 50 2 78.22 TTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAGTTTAGTTTTGTTGTTTGGTTTTTGTTATGTGTGTTTGAAAAGCGAAGGTTTTCCTCT:1 + chr3L 17619213 3' + invader2 224 2 55.45 TTTTTTTTTTTATTATTATGTACGTATGTATGGCAGGGGGAAAA:1 + chrX 12243838 3' - Rt1a 5070 1 63.64 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATTTTATATATCCATCTAAATCCATATAATATAGCCATCTAAAAGTTTACGCTG:3 - chr3R 15130464 3' - Max-element 23 2 50.50 TAATTTGCTTGCTTGTGTGAGGATAAAAAAAGGTACTGGGTAGAACTTTTATCTTTGCAATTCTGCTTTGTTTTACTTTCGGCGAAATATTGGGGACGTAA:1 - chr3L 25807420 3' - 1360 3256 1 75.25 TTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGAAGAATACATATAGGTATTTTGTATATATACAT:1 - chrX 7562314 3' + Tirant 8432 2 67.33 TTTTAATTTAATTTCCTTTTAATTAAAATTTTTTTGGGTGGTGGGTTTTGTTTTATTTTTTTTTT:1 - chrX 7525366 3' - HB 307 1 49.23 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTGGGTGTGGAAGTGGGGCTGGTGTGGGCGTGGCAGGACTACGTTTCGAGTTTGGTTTTTGGTTGGG:1 - chrX 20585924 3' - jockey 16 1 68.32 TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACATATACAAGTATTAAGCATAGTCAGTTCAAGCTCACCCCATTTTATGGAATGACAAATACC:2 - chr3L 26315775 3' - Tabor 15 2 64.36 CAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCTTCCGGTTCCTACTTTCTATTGGGGGAAATTCGTGTAGCTGCCGGCACCT:1 + chr2R 4704337 3' + Bica 4 1 53.47 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTATCCATTTCGATCCTTAAACTCACCGGATTGAGTATGTCA:1 + chrX 2742555 3' + hobo 2905 1 59.41 ACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACTCCAAGAGGGAAAATGTATTTAAGAGCGATCAG:1 - chr3L 27387205 3' + I-element 137 1 67.33 TGTTTAACCAATTATTTTTAAAATATCCATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTATTTTAAGGGAAAAGTCTATATGACTAAATCCTTATGATTAACTTATTA:1 + chr4 122176 3' + Tc1 1486 1 54.46 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGTAGCCCCTCGGGCACTCGAGGATTAAGCGAGCGAGCTACAAGACTGAACACTGAGAGCTGCCCCGCCCAC:1 - chrX 21219395 3' - roo 3 2 77.23 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCTCTGTCCATTATCTTCGACTTGTTTCAAAACGTTGTTAATATTTTCACATACTTTGGTGGGATTTCCTTTCCC:1 + chr3R 8134018 3' - roo 4 2 75.25 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAAGTATACTGTAATACGTTCGGGTTTATTGTTTTATGGCATTGCTAATATTTGTGTTGCATTTTCCGTAGAATCAAAC:1 - chr3L 18642224 3' + pogo 2089 1 67.33 TGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCAGGAATGGGTTTTTTCTGAGGAAAGACGGACACTACGGTG:1 + chr3R 11153623 3' - 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chr3R 21591940 3' - Bari1 19 1 61.39 CTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTATATTTTCTTTACGTGATTAACATTAAGCTACATTGGTTGTTTATTTTTAAA:1 - chrX 21577754 3' - invader4 200 2 52.48 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAGATGATAATTTATTTGTTTTGGGTTGGA:1 - chr2R 22825427 3' + opus 449 2 78.00 TTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGTTTAATGGCCACAAAGCGGAAAGTGGAGCGTGGCTGGTTCTTCGTCTTCGGCT:1 + chrX 8326587 3' - opus 7329 2 70.89 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTGATCAGTATCAACAGCCTGATATAGTTTG:2 - chr3L 15869662 3' + pogo 2059 1 71.29 CACCAACAACAACTTCCGCTATACCAAAGACGCTAGAATACTTAATTGGCGCCCAACCAGTGGTAATTACACCACGACTCGAAAATAAAAAAGAACAGATC:1 + chr2R 963365 3' + Porto1 437 1 68.32 ACTCTCTCCCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTTATTCGGTCCATGTTTTAAGGGCTTTACGTGCCTGTCTTGCTCGTTTGGTAATACGTTTT:1 + chrX 9023527 3' + Cr1a 297 1 76.24 AAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGTCTGCAATTTGCCAACACTT:1 + chrX 13482585 3' + S-element 1662 1 80.20 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACACCCATCCATCACAAGTGTCAGACAAATATTTC:1 + chr3L 4087259 3' + roo 9024 2 70.30 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTGATGTGTGAACACTGGCTTACGATCCACATGCCTGATATCTCT:1 - chr3R 14835221 3' - roo 8713 2 75.25 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATTGATTTTCCTCGCCGACTTTCCCACAGCCCATCCGCTGCCGATGTGCTGCATTG:1 + chr2R 14135481 3' - roo 8684 2 52.00 TGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTTGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATTGTTTTGTGAGTAAACAGAACTGACCT:1 + chrX 7339949 3' - G2 2631 1 69.31 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGGGGATAAAAATCACCACAACCGAAAACACAACCAAATGGAATAAACTGGAGTTGGGCACTCTTCATGAGGTATAT:1 - chr3L 9306851 3' - jockey 11 1 67.33 GAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCTGCTGCCTGCGCTTTTCATACTTTTCCATTTCACATTTGCATGGGACGCAT:1 + chr3L 4631447 3' + 297 221 2 49.50 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGGCAATCTAAAT:1 + chr3R 21587317 3' - pogo 28 1 56.44 ATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGGGGGGACAGGGTGAAATGCTGACACTGCACACAGTTGCCA:1 - chrX 8814372 3' - I-element 5011 1 60.40 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTG:1 - chrX 17492866 3' - Tirant 9 2 71.43 TACCCTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTCTGGCTGGAAAATGATGTTTACTCTGTCTTCTAACTTTGTGCTCCTCCCGTTTCCTTGGAGCACAGTC:1 + chr3L 11748817 3' + Stalker2 394 2 70.30 CGTACGGAATTCAGCTGTGGGTTTTTCATTAGAGTTGTGAGCGGGATTCGCTTCAATTTTTAGTCGTTACGCCATTTCAATTACTGGCCAAGTGCCAGGAC:1 - chr2L 8570123 3' + G2 2665 1 79.21 ATCCCACTTACAGCTTATTCAGCGAAGACAATGAAATTTATCACCCAACCGCAAAGCCACAAAACTACAGAAACAACAACAAACACGTGACATCTAATAAA:1 + chr3R 28095104 3' + Porto1 4307 1 80.20 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAAGTGCTTGGTACATACAAGCGCGCAAATATGCCAAAAAATATGCTAC:1 - chr2L 19618775 3' - jockey 36 1 51.49 CTGGCGCAGCCGGGAAACTGGAATGGAAAATACTCTATTAAACCTTCAATCAGTTATCAGATACTATCAGTGTTGTAGTTCTTGGAAAACTTGTATACACA:1 + chr3R 24684659 3' + ZAM 472 1 61.39 GGACTGGCTTTTCCTCTCAAGCAAACTCAATCTGTCAAAAGCTTAAAATCTCATTTAAGGCTCCTCGTGTGTTTCATTGCCGATTTAATTGGCTTCCAGCA:1 - chr2L 16213964 3' + G5A 2352 1 74.26 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAATACCAAATCCAACTTAATACGATATGTTAGTTTGCGCCAACATGTT:1 - chr3L 2170947 3' - 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Quasimodo 14 2 58.42 GCGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCAGGCCGTGTTATCAAGAACAACAACAACTATTGATGATA:1 - chrX 13640242 3' - P-element 37 1 41.58 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGAAAGTGGCGAGAGACTGATTTATGTAAATTGGCCAAGACGCTCGGCAGCAGCAGCAGCAGGGCTTCTT:1 + chrX 3213615 3' + hopper 1411 2 75.25 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACACCCATCCATCACAAGTGTCAGACAAATATTTCTGATACAAAAACAGCTCA:1 + chr3L 4087277 3' + roo 9042 1 54.46 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGTGGGGTGATTCTATCTCTCTTAGTTTG:1 - chr3L 6869294 3' + roo 9022 2 74.26 TATTATTTAAAAAAAAAAACAACAACTAAAATGCCATTTTGGCCACATATGTTCTCTTTTGATGGTAAATATTCCATTTACTTTTCGAGACGAAAACCATC:1 - chrX 16370389 3' + transib2 2633 2 57.43 GGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCA:1 - chrX 3446522 3' - I-element 31 1 60.40 AAAAAAAGAAAAAAAAAACAACAAGTAAAACTGAAGAATTGCTTGCACTGTGTGTGGCTCGATATTCAATTTCAAGTGCGAACAAGGCATTTCGCGTCGCT:1 - chrX 13881378 3' + HMS-Beagle2 488 7 61.39 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCTTTTTGCTGCCCTAAAACAAAGCACC:1 - 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Tabor 52 2 78.22 GACTCGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATATACTTTATATAGTGCGAAAGATATGTAGATATACCTGTGTAGAATATAGTCAATACGCCCCTACAAAG:1 - chr3L 18846457 3' - INE-1 92 1 55.45 CAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTGGGGAACTCGGGGAGTCTATCAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGACAGTTACTTT:1 + chrX 15946710 3' - INE-1 578 1 68.32 TTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGAAATAAAATGAGAAACAAGGACCTGGCGTGGTTAAAAGGGGCACTGGAGTCAGTGGTTGGCAAAGGTGGTTCC:1 - chr3R 2473645 3' - INE-1 500 1 57.43 CCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTATTCCGAGCAGTATTGTGGCCCATTGTGTGTGGTACGTGCCGCAGGCTAATGCTCCTTTTTG:1 - chr3L 15768588 3' - Bica 427 1 58.42 TGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTCTGGCTGGAAAATGATGTTTACTCTGTCTTCTAACTTTGTGCTCCTCCCGTTTCCTTGGAGCACAGTCACACG:1 + chr3L 11748822 3' + Stalker2 399 2 75.25 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGCCCAAAGAGAGCAGGATAGGAGCACGAGGATGCGGAAGGATGTGGGGGGCAGAGAGTGACCCCTGCACA:2 - chr3R 28135240 3' + hopper 1410 2 74.26 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTCAGGAAGAGAGCGGCAGAGCAAACTAGTGCATAAGTAACAAAA:1 + chrX 3295676 3' + hobo 2905 1 58.42 TCTGGTCCAATTTGTGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGTATGTGTGTGAGCAATTTTTAGAGCAAAACATAACTCTAGCATTAAAGATTTCAAAGCTTTTTT:1 + chr2R 1444202 3' - I-element 4901 1 56.44 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCAACTGACAGATTTTCACCT:1 - chrX 10196064 3' - 297 6585 2 66.34 CTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATA:1 - chr3R 3920681 3' - I-element 50 1 78.22 ATGAAGAAGAAGAAGTGGAAGTGGAAAGGGGGGATGGGGGTAAGCTGATGACTGATTAGAAACTAGATAGTAACAATTTGATACAACAATTGTTTATGTTG:1 + chr3R 11325973 3' + transib4 2196 1 80.20 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCACCATCGTTGCAATCGCATCACATCGCATCGCTGCCGTCTTTGTTGCCTAC:1 - chr3R 12949444 3' - jockey 33 1 53.47 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGTACCCTCCACTACTTTATAGGGCGGACAAGGCTTTGGTTTTCTTTGTTTG:1 - chr3R 5555902 3' - mdg3 5278 2 53.47 GTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTACATTTCTCATTAACATTATCGCAAAGCCCATGCAGGGAAATACCAACTAA:1 - chr3R 7102403 3' + pogo 2080 1 53.47 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAACTTATATAATAAATGTGATGAAATGTGGAGAAAGAAGAAATTTGGATATT:1 + chr3R 22043605 3' + Burdock 223 2 56.44 CAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCCTCCATTTCCGAATTGACACCCAATGAGTCCTGCTGCAGCATGGTAATCACATCCTCGAGA:1 + chrX 4301346 3' + 17.6 6945 1 61.39 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATTCTTAACGATATTTTCACTAAATGGCTATAAAACAGATATCAAGCTGTT:1 - chr2L 10104263 3' + roo 9045 1 50.50 TTCTTTCTTTTTTTTTTGTTGGGCAGGAAATGAAGCGCGGCTCGTC:1 - chr2L 18900668 3' - gypsy2 398 1 82.61 TGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTT:1 + chrX 21945934 3' - F-element 37 1 53.47 CTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAATGAAAACAAAATTGTAAAATCCAATAAAACAACACACGTACTCCGCTGCACATAGA:1 + chrX 3007705 3' + Rt1b 5115 1 54.46 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATATGATTAATTACAGAGAAAAATGCACTCATTGCCATAA:1 + chr3L 4639253 3' - 297 18 2 56.79 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGGGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGT:1 - chr3L 25884083 3' - Doc 34 1 53.47 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGCTCATAACATTAATGTTAAAAGAGTAGA:1 - chr2R 19164112 3' + P-element 2840 1 32.67 CGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATGTACATATGTATATACTGTATATGGTCGGAAACGCTTTCTTCAGCCTTTTATATACCTTTCAACGAATCGAGT:1 + chr2L 21071994 3' - INE-1 88 1 89.11 TGGTGGGCCTGTCATAATTGTTGGTTTAGATACGCTCCACGGCATTGTTGTGTTGTCTTTTTTTTTGCAGACTTCTGGCGGAGTTAATGAACCACTGATGA:1 + chr3L 18247431 3' - I-element 180 1 71.29 ATTAATTTACCATCCCTAGCTAACGATGCTTTGAACAGATGATATGCAATCTTAAATTTCCAACAGGACCACCTTGGGACTTACCTTGTGCATGGTGTATT:1 + chr2L 22318172 3' + Cr1a 3995 1 65.35 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAG:1 - chr3L 25884088 3' - Doc 38 1 58.00 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGAGCTAGACAAAATGTC:1 - chr3R 19513360 3' + jockey 4977 1 56.98 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 24210957 3' - HMS-Beagle2 6891 2 57.38 AAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTATGAATTTCCGTGTGTAAAGTGTATGCTTATCGAAATGTAGG:1 + chr3L 4420540 3' + flea 374 1 61.39 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTGAATGAATTAAGCTGAATAGTGAAATCTCAAACA:1 + chrX 12152717 3' + roo 9031 1 67.33 GTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTGTAGATATGTA:1 - chrX 17492856 3' - Tirant 8109 2 79.21 TACCTCTCATTCAGCCACATATCAAACTACACAAAAAATTATCAAAGCTTACACCCTCAACCGAGAATCGTTACGGATAATAATTTCTCTAGAGCAATTAT:1 + chr2R 965472 3' + Porto1 277 1 59.41 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATGTACTCCACATTTAACAAATATACGTACATGTGCGTTCAACATA:1 + chrX 5178877 3' - hobo 30 1 57.43 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACTCCATGGCTTCACACATAAATTCGATTGGTTC:1 + chr2L 13038746 3' - hobo 44 1 73.00 AAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTGGAGACATAAAATGTGGGAATCCCACTTATGTAACTCTAGAGGGTATCAAATTGAAGAAGTCATAA:1 + chr2R 1986289 3' + INE-1 166 1 58.42 CTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGAAAATGGCTGTGAGACGGCAATGCCCCGTAAGAAGGTCTTAGACTCGGTAGTGGAGTGGGTAGAGCTCCCCAGTTAGT:1 + chr2L 22298932 3' - baggins 5174 1 59.41 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATGTTTATGGCTATTAATCAAAATGTATTTGCTGCCGGCAAATTGATTAACAT:1 + chr3L 12258271 3' + roo 9047 1 57.43 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGCAATAGCTGTCTTTGTATTTTGT:1 - chrX 12885720 3' - transib2 52 1 77.23 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGATGTCAAAGTAATCACGAGTCCAACTGCTGGT:1 + chr3R 11478447 3' + roo 9028 1 69.31 GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGAATGTTATTCTCTCTTTGACATTCAACGAGTAAGGTTGGTGTTCGTTTCGTTCGCGGATG:1 + chr2R 19164180 3' - P-element 15 1 70.30 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCTTTGCTCTGCCGAGAGCCTCTGCCGCTGGCGACTGCGACTGCGCTGCC:1 + chrX 13640331 3' + P-element 2878 2 71.29 TTTCGATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTA:1 + chr2R 2092791 3' - Doc3-element 84 1 57.43 TGTTTTCACTATTTTTTTTTTTGGACTTGGAAAAAACCCAAAAAAAAATCGAATTTTTT:1 - chr3L 12636724 3' - Porto1 172 1 44.07 AATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCCTAATGAAAATTGAAGACCGTGTTTGCGAAC:1 - chrX 17432404 3' + hopper 1375 1 65.35 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTGTAGA:1 - chrX 17492862 3' - Tirant 5 2 75.51 AAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGACCCTGCCATTCACCATTTTTGGTTTCACCTTCGTTG:1 - chrX 5128863 3' + Doc2-element 237 3 67.12 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACAAATGAAATGGC:1 - chrX 5168832 3' - hobo 18 1 61.39 TGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTATTTATTAATGAAAAAAGCGATGATC:2 + chr3R 3625668 3' - Max-element 52 2 76.24 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACGACCCACAACAATCAAAACGATTGAGCCGAAGTCGA:1 + chr2L 19865880 3' - P-element 40 1 42.57 ATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATATTTGATGAAACTTACCAATTGTAGGGTAATTCATTCGATTTAACTCCCCGACTTTGCCTTGAA:1 + chrX 3238162 3' - roo 8602 1 70.30 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTTTTTTTTTTC:1 - chr3R 11080672 3' - I-element 11 1 66.67 AAAAAAAAAATAGGAAAAAGTATAGAAAAATTGTTAGTACCGCGGAGGCAGAAGCCACGCCCACGGAAGAAGGTCCTGCCACCTTCGACAAGGCGATCGAA:1 - chr3R 10758712 3' + Doc2-element 231 1 64.36 AAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTAGCAATACGAAAATTTGCGAAAA:1 - chr3L 8039318 3' + I-element 139 1 76.24 ATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCAAAGCAAGCTAAGCTCAGCATTCTATATCACAAATAAAAAAATTAGCGATATATAAATAATTGACGACT:1 + chr2R 4402683 3' + 1360 495 1 62.38 ATATATAACATATAAATAATTTTACATCTATAGACGAGACAATATCTTATAATGTAGATACAATTTCTTAGTTCTATATATATTTTTTTGAGCCATAAAAA:1 + chr3R 11081967 3' + Tc1-2 1414 1 65.35 AGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAATGGATAGAAGGAAGTAGAGAAGCCACGGTTCCATGCGAAATAGTTTCTGTTACTTTCGT:1 - chr3R 25526323 3' + transib2 2806 1 63.37 CAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTGTGTCGCATATATTACTCGCTAATAAATTAATAA:1 - chr2R 11276638 3' + roo 367 1 66.34 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCCTGATCTTCTCAATCCTCGAGAATTGGCTCCCAGCGGCGCCCGACAATTGAAACTTTTGCGCCGTTTT:1 + chr3L 12025687 3' - blood 10 2 69.31 ACTATAGCATTCTCTCTTCTTTAAGCCCAGTTTGTTTGCCTGTGATGACAGAAAACGGCGACAGCGATGACGACAGTGGCACAAATCCTGTGTCGCAAGCG:1 + chrX 20814191 3' + INE-1 581 1 58.42 GTTTTGTTTGGCGATGACCTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTAGCATTCCATAGCGAGTGCGTCGCATC:2 - chr3R 1418286 3' - BS3 223 1 63.37 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGCAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCGATGCGTGCCAACGATTTG:1 + chr3L 12217355 3' + roo 9036 1 71.95 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACGGTATTGTATATACGAAATAGTTTATAACTGGCATGCTTTTTAAGCTAG:1 + chrX 3213982 3' + pogo 2072 1 58.76 ATACCCGTTACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCAACATCCTATAT:1 - chr2L 22092959 3' - INE-1 540 1 57.43 CTTAATGTTTATATACTATGCTGCAGAAAATATGATTAACTTATTTGTGGGTGGAAATATGGTTGAAATAAAGCAATTTTGTGGAATTTTGTTACATATGG:1 + chr3R 3618945 3' - invader2 4905 2 68.32 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACGACCCACAACAATCAAAACGATTGAGCCGAAGTCGAAGCCGAAGTCAGCA:1 + chr2L 19865894 3' - P-element 26 1 56.44 ATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAAACCAGCTGGAGCTGCAACGCCATCTATAACGGAGTCAATGCAGCTACGCAAGGACAAGAAG:1 + chr3R 3617152 3' + 1360 3231 1 67.33 AGGGAGGTCATCAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCCGCAACCCGCTGTCCGTGAAGGA:1 - chr3R 4546015 3' - jockey 4759 1 76.24 TCACAATTACGTTTGTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGTATGGCTGTAGATCCAGGATGCC:1 + chrX 14371336 3' - jockey 60 1 72.00 TATAGTTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTAAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTGTTGGGGTGATGGGTGGTGC:1 - chr3L 17542284 3' - 1360 3018 1 80.20 TATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATAT:2 - chrX 9816256 3' - BS 5018 1 55.45 TGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGT:1 - chr3R 4504041 3' + blood 7386 2 75.25 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGTACCTAATCTGGATGTCAAGGAAAGGA:1 - chr3L 14286016 3' + 412 444 2 75.25 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGTTGTCCCCGCTGAAAA:1 + chrX 17492966 3' + Tirant 375 2 55.45 TAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGTACTTTAACACAGAGGCCACGGAGTTACTGTTCCAATGTAATCATGGGGATGCGTTCGGACTATTGAGT:1 - chr3L 19485960 3' + Stalker 281 4 72.28 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGA:1 + chr3L 3535453 3' + roo 9045 1 54.00 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTGTAGATATGTAT:1 - chrX 17492855 3' - Tirant 8107 1 81.00 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAGAATAACTCCCCCTTCACACATACTTTTCTCCTTTTTTTTTCGAGTCGCCTTTGTTT:1 + chr2R 10964034 3' - hobo 19 1 46.53 TGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCA:2 - chrX 17492875 3' - Tirant 8128 2 60.40 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTTTTTTTTTTCACGTA:1 - chr3R 11080667 3' - I-element 8 1 70.30 TGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGTGTGTGTGCGGTGTGTGTGTCAAATTTAAAAGCATTCTTGCCAG:1 + chr3L 17691394 3' + 1360 3358 1 60.40 GAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAG:1 - chr3L 5267239 3' - Juan 4025 1 75.25 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATAAGTGTGTGAATGCAGTTCAAACTTTACTTTTCAACCAGCCTAGAAGTATG:1 - chr2R 13934382 3' - jockey 30 1 58.42 GACCTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTAGCATTCCATAGCGAGTGCGTCGCATCACATTCGTTACCAGT:1 - chr3R 1418271 3' - BS3 208 1 46.53 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTCGCCTCTGCCTTTCTTGTTGTGCCATCGTCTTCGTCGT:1 - chr3R 28326434 3' - P-element 38 1 42.57 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAG:3 + chr3L 3535448 3' + roo 9039 1 57.43 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAGGGGAGTTCATCATTACAGCGTGACATTGATTGGCATTGAGTTGGG:1 - chr3L 15056941 3' + 412 442 2 74.26 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATGCTGCACTCGATGCTGATGATGTTGGCCAAAAAAAAAAAGAAAAGCATTGCTCGATGCCGTCAATA:1 - chr3L 5321102 3' + mdg1 7450 2 66.34 GATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATCCGGAAATTAATACTCTACGATCAGTATTCTGCGACGTTAAGGTCATCTGC:1 + chr3L 24185618 3' + INE-1 15 1 55.45 TTTATCAAAAGTGTGGGCGTGGCATCTTTGTGCGGTTTGAAGCGTTAGAGTGGGCCTGGCAACATGGGTCATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAG:1 + chr2R 1751257 3' - INE-1 252 1 72.28 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTA:2 - chr3L 25884064 3' - Doc 15 1 59.41 GACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTTTGTAGCATTGGCGCACGGGCGGGCATAAGGTAAATGTGAAAACAAT:1 - chr3R 21591950 3' - Bari1 29 1 55.45 AGACGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACGACCACAGATGGCTCATTAGTGCAAGAGGAAAATTAGGGAAAATTGGCGAAAGTGCGAGAGCAA:1 - chr2R 9531535 3' - F-element 4506 1 73.27 GGCACTATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGGTTTTGCCTCAGTGTTCGTGTGATATTCCATGCAAGATGAT:1 + chr2L 21646976 3' + 1360 277 1 60.40 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGAGCAGGCGGCTCAAAAGTCGGAATGTGGTATTCGGTTTTAGTTCGAACATCGCTGTAACC:1 + chr3L 14205418 3' - P-element 14 1 65.35 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACAATTTAAAATTGAATGTAGATATGAATAGAGGATA:1 + chr3R 29668679 3' - 412 41 2 67.33 GGAGTTCGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTTGGAGAAGCAAAAGAACGAGTTATATATGTGGGGAAATGTTGGTGATGCCGATTAGCTGGACAAAAAGAA:1 + chr3L 24492493 3' + gypsy8 437 1 67.33 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCC:1 - chr3R 11080690 3' - I-element 28 1 54.08 GCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAG:1 + chr3R 15790057 3' - flea 4753 1 76.24 TTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAAATGCTTTGTTTCACGGCAATGGGAGGGCATAATTGATTGGGGAATGGGT:1 + chr2L 1673755 3' - Juan 4051 1 49.50 CAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACCAACTGACTGATGGTACTAAACTACATAGTA:1 - chr2L 8097263 3' + F-element 334 1 69.31 GTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATGACCACGGAAAGTCTATAACAGCTAAATTTTTGGCAATCTCAGTCACAATA:1 + chr3R 2557498 3' + 412 387 2 62.38 TCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTGCGTCTATGGGATGC:1 - chr3L 19437225 3' - jockey 4704 1 59.41 GTTATACCAAAGACACTAGAATATTCTATATTCTTGGTTATACTTTAAATGCCCAAATTTAGTTGCTAATATGCAACATATTGCGATTCTATATTCTTGGG:1 + chr2R 14312406 3' + Tc3 236 2 61.39 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGAGTGAATTAGTTCTAATACGAAACACAACGAGTTTGGTTTGTTAGTTAT:1 - chr3L 19066073 3' + roo 9046 1 59.41 GAGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACT:4 + chr3R 1977615 3' + micropia 5404 2 57.43 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATT:2 - chrX 17492897 3' - Tirant 43 2 69.31 ACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTATTTATTAATGAAAAAAGCGATGATCCGAATTTGGGACTGGCATAAGTGAACCCACAATATGATAAACCTTG:1 + chr3R 3625714 3' - Max-element 8241 2 73.27 TGATCAGAATTGATATCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACACACACTCACATGCACTGCAACACACACACTCACACACACACACGTGCGGGGC:1 + chrX 1599404 3' + 1360 3177 1 59.60 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTAGATTAAGAACTACTTTATTGTTTGGTGTTGCGCAAAATTTCATTGTTGAATTACGTTTATCCTTG:2 - chr2L 18977880 3' + roo 400 1 70.30 CTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGAGGCCGTTCTCTGGAAACTTTCAGAATCTTCTCTGCCTGTTTT:1 + chrX 13858556 3' - I-element 5101 1 58.42 AAATACGCGTTTTTTTTTATTGAAGAGAGCTTACGCTCGACTTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGCGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTG:1 - chr3L 16995274 3' - Doc4-element 56 1 78.22 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAATCGCAAAAGTCGCC:1 + chr3L 12217373 3' + roo 9035 1 58.42 CACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTACTGTTCTTTTGGCCATCGTTGTCCGCCGCCTGTCCCCCAGTGGGACATGTTTGTTTAC:1 + chr3R 6116607 3' - Max-element 18 2 60.40 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGTCGAGTTTCAAGT:2 - chr3L 8044289 3' + mdg1 7452 2 71.29 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGCAAACCGTCTAAATGCGATTGGTTTTCGGACATTGGGAAAATTCCTCTCCCCCC:1 - chr3R 11936880 3' + roo 388 2 59.41 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCACCCATTCCCCACCCATTTGG:1 + chr3L 18793045 3' + P-element 2833 1 25.74 TCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACGCGCAGCCGAAAATCGGCAACAACAAAAGCG:1 + chr2L 7056597 3' + P-element 203 1 35.64 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACATTTTCCATTAAATTTAAAGCTTTTTCTATTTGCTTCTG:1 - chr3L 18523596 3' + 412 457 2 59.41 AATTAAGTTGCCGCAAGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGACA:1 - chr3R 19513367 3' + jockey 4955 1 68.32 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACACACACTTTTCTGTGCCGAA:3 + chr2L 8898920 3' + roo 353 2 77.23 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGTCGAGTTTCAAGT:1 - chr3L 8044289 3' + mdg1 7453 2 72.00 CTTATGTCTCTCTGTGAACATGATAACCAAAAAAAAAATAGAAATTTCCATCGTCGTCGAGCCGCATTCATATGCAAATACACAAAAGACGTTCGCTGGG:1 - chr3L 15397956 3' + Porto1 141 1 71.00 CCTCTCCTACCCCGCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGTTTTCG:1 + chr2R 1725949 3' + Doc 439 1 60.40 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAGTAAAAAAAAAAACGAAACAAAAAGTGAAAGTTTAGTTCCCGAA:1 - chr3L 7820936 3' + jockey 4958 1 72.28 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTTTTTTTTT:3 - chr3R 11080674 3' - I-element 15 1 63.37 GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACACCACAATACACCAGTGTGTGTATTATATTTAA:1 + chr3R 4600864 3' + Burdock 213 2 67.33 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGAGAATGTTATTCTGGTTGGGATTGAGTTGGAAATGGGCCGGTTACGGTTACAAAGTTGCTGCTAAAGT:1 + chr2L 20371301 3' - roo 4 2 77.08 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATACACTAGGCTAGGGGAAGATAACTGTTGCATATCCAGAGGCGTCGGAAGCCGACATGCAAT:1 - chr3R 10957254 3' + hobo 2936 1 67.42 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCATTGTTCCGCCTGAATATCCTTTGATTTTCCCAGGGGCGGCAACTGTT:1 - chr2L 16569470 3' - roo 8691 2 54.46 AAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGCTCGTGTGCTTATCTCACAACAACAACTACCACAAGTCGCCCAACGACG:1 + chr2L 4940595 3' + jockey 61 1 66.30 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACACCAACAACAGACAAGTGCACGCAATTATGGTAAGATAGTTAAGT:2 + chr2L 12888875 3' - 412 7087 2 56.44 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTCGACTGCCTCGTAATTGCCAGGGGGAAATTGAAATAGATGCCCG:1 + chr3L 15729677 3' - hobo 32 1 55.45 GGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACATGTGCACGGCAACCAATAC:1 + chr3R 22341175 3' + hobo 2893 1 80.20 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCTACTAGCCCAGTGCTTAGTTCTTTTGTCAATTGTCATTTATCGAGGTGGACAGCTTG:1 - chr3R 30641754 3' - hobo 18 1 42.57 TACACATACACACACACACACACACACACACACACACACATACACACAAAGTCAAACACACTCTCGCGCAGTCGGAAACTTTCACAATAATGCTGCCTTGG:2 + chr3R 6419128 3' + Quasimodo 32 2 77.23 GGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCCGCAACCC:1 - chr3R 4546030 3' - jockey 4774 1 62.38 GTTTTCTTACAAAAACTCAAGGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATTTTCCTCATTACCCGACTTGCATTTTATTTTAATGAACTGTACA:1 - chr2L 13868702 3' + roo 379 1 52.48 TAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATAACAATTTCCTAATGGTACTGTAAAGTGTTTGAT:1 - chr3R 22043544 3' - Burdock 6177 2 67.33 CCGGAGTAGTGTATGTTGTATTATGTTGATGATGCATGTTGTAATGTTGTTTAGGCTGAAGGCTTGGATTTCGTGGAGGGAGGGAGGGGGGGTGGTTATAC:1 - chr2R 22014318 3' - Idefix 73 2 47.52 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAA:1 - chr3L 10576800 3' + roo 9027 1 71.29 TCTTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATC:1 - chr3R 13231165 3' - Quasimodo 49 2 78.00 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTC:1 - chr3L 25884080 3' - Doc 31 1 50.50 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCTTTTTGCTGCCCTAAAACAAAGCACCTAGAAATAGAAATCATGGAAAGAACACTGCGGAAAACAAG:1 - chr3R 13167296 3' + roo 401 1 69.31 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCACCTCGTTTCTTTTTCTTTTATAAAAAAGCATAATGTGTTAT:1 - chr3R 19515782 3' + 412 7534 2 66.34 TAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACACAGACGCAGCGCAAGTTGCCACAAGGAGCCTTATATTGCTACGGCAATTTAATTTAATTTAATT:1 - chr3R 7739991 3' + INE-1 171 1 55.45 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAGGCCAGACAAGCAGCTCTGAAGGAATATTGCATACTTATGGGAACGGATGATGTAGCGGTTTTTA:1 + chr2L 5707354 3' + jockey 4976 1 65.35 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGACAGAAATATTACAAATGGAAAAGTTTACCTAAATA:1 + chr3R 2556098 3' - 412 7096 2 67.33 TGAAAGAGAATGAGAAAGGAAAACGCCTTGGTAAAATAAAGAGGGATAGGTGGGGGCAAGGACAGGAAATGGCCTTTATGCCGCAATGAGTTTTGATGCAG:1 - chr2R 21209372 3' + invader5 203 2 54.46 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCCTTGTCAACGAATTGCATTCTGTGTGAATGACTTGGCCAAAGTTTGCAACT:1 - chr3L 2690929 3' - Doc 33 1 53.47 CATCCACTATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGGGTGTGTGTGTTACTTTTTGTTTTTCCTATGAGTTGGCTTTTTTTCGGGGTGGGCGAAGCGGAGTTTT:1 + chrX 15622518 3' - HeT-A 6012 2 64.36 CACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGC:1 - chr2R 5532365 3' - Doc4-element 10 1 53.00 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGGCAATCTAAATCCCAG:1 + chr3R 21587322 3' + pogo 2078 1 56.44 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAAAACGTCCCTATATATATAAAAAAACACATAAAACGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCAACT:1 - chrX 10196079 3' - 297 6599 2 48.00 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACGTAAGTAACATATTTTCCCTTAT:1 + chr3L 22231361 3' - Doc 57 1 85.15 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGT:2 + chr3L 15353568 3' + mdg1 7407 2 78.22 TACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACCCTTATTTATGTTTTTTCCAGTATGCCCCTTATTTTAGGCACGCCCTCAATGTCGCACAAAGGTAAAAATATGTTG:1 + chr2R 25216634 3' - 3S18 3 2 76.24 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCTTGCACATCAGCATGTTTTTGCACTTCGCCTTCTGTCTGCCTGCC:1 + chr2R 12780030 3' + hobo 2917 1 52.22 AATAATTGCAATAATAATAATAACTGACCAAACACTGGGCGGCTGGAATCCTTCGCCTGCTGCCTTCATGCTTGCCTAAGTAAGTTAATATGCCATTTGAA:5 - chr3R 11076944 3' + mdg1 7066 3 58.42 TGATCAGGATCAATAGCAGAATCGTATTAGATGGGCAATCAATCAACTCTAATCTGGATAACCATCTCATTGTTGCTTATGAGGTTCTAATTTAAGAGATG:1 + chr2R 3382261 3' + INE-1 91 1 79.21 TACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGCCCAAAGAGAGCAGGATAG:1 - chr3R 28135290 3' + hopper 1360 1 79.21 GAATATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCAAC:1 - chr2L 22092968 3' - INE-1 549 1 51.49 AGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTTGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATTGTTTTGTGAGTAAACAGAACTGACCTTAACAAT:1 + chrX 7339956 3' - G2 2624 1 62.38 AAAACTTTCGCTTTGTTCAAATCGTTTTTATATATACTTCAATTATATTTTAGAGTCTCCATTAATTGGAATCGTTTTTGAGAAGTTGACCACAATTTACA:1 + chr3R 19489615 3' + FB 163 1 74.26 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATGTACTCCACATTTAACAAATATACGTACATGTGCGTTCAACATAATAGG:1 + chrX 5178882 3' - hobo 25 1 53.47 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAGGCCAGACAAGCAGCTCTGAAGGAATATTGCATAC:1 + chr2L 5707324 3' + jockey 4949 1 64.29 TTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTAATCAATTATGAGTATTAAGCCAAGGGGCCAACCGTCCATATGGGGATCGCT:1 - chrX 7534817 3' - Idefix 7121 2 61.86 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATGTGTGTGGCACATGCTTTGATTGAGGTATGCCGCACCAACAATAACAGGC:1 - chr2R 18078679 3' - Quasimodo 16 2 64.36 TGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCTCATAACTTTTCTCTGTCCAGTT:1 - chr2L 17246775 3' + hobo 9 1 77.23 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATACGTTGGCTTCGTGCATTTTACGGTGTTGGGAAACAGACGAAATGGACTCATTGATTCCAATTGACTGATTTCA:1 + chr2L 3842933 3' - roo 1 2 78.00 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACAGTTTGTTTGCGCCTCAGCTCTCCCATCGCCCCATGCAACACATTCATGCAATATTTAAGCCAACTTG:1 + chr2L 12910469 3' + mdg1 7452 2 57.43 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCAATCAATGCCTGAACAACTCTAATGAAAACCTATCCTAA:1 + chr3R 28333618 3' - pogo 4 1 75.25 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACACTGGTTTTAAGTAAAGTTCTAGAGATCTTTAATAAGCTGATCCTATCACGAAATG:1 + chrX 12510379 3' + roo 9049 2 58.42 CCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATT:1 - chrX 17492904 3' - Tirant 50 2 76.24 ACACACACACACACACAGATACGAAAAACACACACACACACACACA:1 + chrX 7978949 3' + accord 185 2 71.74 GGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCAAGAACATCCATTAGACACACCATAGCAAAAC:1 - chr3R 22699106 3' - roo 167 2 69.31 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGAAAAAATTAATGATGAAATATTAAACAGGG:1 - chr3L 5286174 3' + hobo 2908 1 62.35 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACAATTTAAAATTGAATGTAGATATGAATAGA:1 + chr3R 29668674 3' - 412 7099 2 72.28 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGC:4 - chr3L 9190461 3' + 412 453 2 64.36 CTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCAGGATGCTGGAGAACAGGGCACGATGCGGATGGCAGGACCACG:1 - chrX 15289077 3' + F-element 4436 1 57.43 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTTATTCTAGCAATTGCCTGCACTATGATGGCTATGGCTTTCATAAGGTGCTATTGTGAATCAGCGCCAAA:1 - chr3R 20182947 3' - roo 5 2 73.27 AAAAAGAGATTTGAGAGACGCTGATATGGACGGACGGAAGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGG:1 - chr2L 23295817 3' + micropia 405 2 72.92 CGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGTCATAAATGGGGGCACAAAGTGGAAAGTCGGAAAGGAAGTTGACCTCCGACAATCGTGTTTCTCTTTTATATTTTT:1 + chr3R 21198705 3' - Tirant 8107 1 81.19 TCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGG:1 + chr3R 15790075 3' - flea 4734 1 58.00 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTGCACCATGACAGGCTGAAGTTGAGTGGCTCACACCCACACAAATGCGGCTGTAAGG:1 - chr3R 29438689 3' + hobo 2923 1 57.73 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGACGCATATTCTAGAACCATTTAAAAATTACGCCTAAAAGCA:1 + chr2L 478752 3' - jockey 4802 1 58.42 TATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGTCGAGTTTCAAGTGTTTCT:1 - chr3L 8044283 3' + mdg1 7458 2 77.23 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTA:2 - chr3L 9190446 3' + 412 468 2 53.47 TTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGCGCCGATCTGTGTATATATGCCGCC:1 - chrX 15791663 3' - opus 7223 2 79.21 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCAC:1 - chr3R 11080711 3' - I-element 15 1 62.50 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCCATGCATCTTTTGCTGTGGCAGCAAGGCGGTGGGTTG:1 - chr3R 17980747 3' - HMS-Beagle 6832 2 65.35 AATAAATAAGCAAAACATGGAAAAAAAAAACTTTGGATTTGGTTCGCAGGGTCTTGGAGTAGTGCTTGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTC:1 - chr3R 16611513 3' + Doc3-element 4715 1 68.32 GGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATAATTCTAGGAGTGGGTGCGGTGCAGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 17867475 3' - Idefix 50 2 64.36 AACTATAATAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATAGTTGGCGGCGACAAAAATACCTATATGAAGTCATATTTATTATTTTACATTTTATCACTATTGAGTA:1 - chr3R 4104674 3' + INE-1 159 1 62.38 TTTTCTTTTTTTTTTAATTTTATTTGTTCAAATTTGTATTTTGAAACTGTTTATAAAAATCACATGTCACATAAATCACAAAAGTCACAACACATTTTG:1 + chr3L 10307796 3' - Doc 4697 2 76.77 TTTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAAGTGGTATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTGTGAAAACTTTGGCTCCAAATCGTATT:1 - chr2R 5204812 3' - Rt1b 5100 1 76.24 CTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGCACTTAACGCTTGCGGAAGGTGTTGTGCCCCACCAGTGTAGTGGTCCTCAAACGCAGC:1 - chr3R 1922117 3' - diver2 4689 2 61.39 CAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTTCAGTTTTTTCCCACTTCGTTTGTTTTTTTT:1 + chrX 19019428 3' - F-element 4462 1 68.32 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTAGTGTAATTAGTGCTTATTGAGTGGGGATAGTGCATTCAAGGC:1 - chr2L 479326 3' - P-element 33 1 46.53 GAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCCATGCATCTTTTGCTGTGGCAGCAAGGCGGTGGGTTGGGATACTAATAAATTT:1 - chr3R 17980731 3' - HMS-Beagle 20 2 51.49 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTGATCAGTATCAACAGCCTGATATAGTTTGTACAGGGTATCCGTTTCT:2 - chr3L 15869644 3' + pogo 2077 1 55.45 TTGTGTTTTGTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGGTTTCAGATAAATATGGAAACCCTAAATGTTGTCTGCTGTTATAAA:1 - chrX 21504669 3' + Cr1a 206 1 60.40 TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCCAAGCCAACGCGGCGTATACTTGATGCAGGTTTTCAACTAATTTGTTAAACTTCATCTTAAACTCCTTGCTTAAGCCC:2 + chrX 8312129 3' - blood 167 2 76.24 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAA:1 - chr3L 8044323 3' + mdg1 7418 2 64.36 AAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATACTAAACATCTGGGTTTGGCAATGCGAACCGATGTGCTAAATACACTTGAGAGACATTACG:1 + chr3R 10027725 3' - FB 259 1 65.35 AGCTTGTTTAATTTCAAAACTTATATTACACACGAGGACGTGTAGTTGGTGCAGGGCGTAATGGAGCCCACGCCCTCGTTGTACTGGCCGCACATGTGGCA:1 + chr3R 9326789 3' + invader6 4433 1 61.39 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACACCCATCCATCACAAGTGTCAGACAAA:1 + chr3L 4087253 3' + roo 354 2 74.26 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCC:1 - chr3L 10576804 3' + roo 359 2 75.25 GAAATATAAATTATAAATTACAACAATAGCCGAATTTCAGTCTTCAGCATAGCGTTAACCAGTTATACATAACTATAACTAAATGAAGGCTATCGAGAGAA:1 - chr2L 13142080 3' + copia 252 1 76.24 AGGTAGTGTTGGTGAGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTAAAATAGCTTCTTCTATAGGGATGACATCCAGTACTATCACCT:1 - chr3L 19205959 3' - I-element 4966 1 57.43 ATATAAATTATCAATATAATTATTAAACTGAAATAAGAGAACTAAACCTTATAAAAATAAGTAAACAATACTAATTGTAATTATTAATTCCATTCGTCGAT:1 - chrX 14510531 3' - rooA 7163 1 64.36 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAATTTTTCATTCTTACCTTTGTTTTGGGGTCAAACG:1 + chr2L 13598254 3' + pogo 2063 1 66.34 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAATAATGTTTA:1 + chr3R 19515859 3' - 412 7097 2 68.32 ACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCATGCTTATGCAACAAGGACCTCCCGATG:1 + chr3L 18927994 3' - Rt1b 5002 1 73.27 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGGCAATCTAAATCCCAGAAAAGATCCCCATTA:1 + chr3R 21587337 3' - pogo 8 1 69.31 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTCAAATGACTGTGACAAAACAATTCCAAATAATTAATGTCAAG:1 + chr3R 25526404 3' - transib2 34 1 58.42 TAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTCTCGTTACTTTCTGTATGTATGTATGTAT:1 + chr3L 27390830 3' - I-element 5031 1 71.29 AAACAAAGGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTTTCATTTCTCGCTT:1 - chr3L 5267189 3' - Juan 3975 1 73.27 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAGTGAATTATTTAATCGTTTAAAAGAAACGATAAAGTA:2 - chr2L 18417277 3' + roo 401 1 71.29 GCAAAAAGGGAAATAACGGAATCCCTGCGGCCAGACAAAGCGATGAGCAAAAGTTGCACAAAAATTGACAAAACATAAATAAAATATGGCGCAAACAATAA:1 - chrX 5168663 3' + gypsy8 312 1 74.26 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGA:2 + chr3L 3535433 3' + roo 360 2 71.29 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCACCCATTCCCCACCCATTTGGCATTGCAAAATTAGTGCAAAGCAGCGCTGCAGACGTCGGCAGAATCGCAA:1 + chr3L 18793095 3' + P-element 2883 2 75.25 CCGCACTCAAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACCCTTGCCGAAGCCAACACACACACACGCCTCCCACCGACCGACCAATGTGGGCGTGTTTGTGGGCAGCA:1 - chr3R 22248756 3' - Ivk 9 1 54.46 AAAGCGAAATGAATTGAAACTAATGCCGAAATGGCAATCAATGCAACATGAGCAACATGAGCGACTTGCACTTGCGACAGCTGTTGTTCGCTTGCTTTCCC:1 + chrX 6906190 3' + invader2 425 1 55.45 AGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGTGTGTGACATTCGATTTGATTGTTTTTGTTTTGAAATGCAATTTTACTTGCAAAGGGCCGAATC:1 + chr3L 13885545 3' - Doc 135 1 59.41 TGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAGACTCTTTGGA:1 - chrX 17492906 3' - Tirant 8159 2 78.22 AGAGCGCACTCTTGCTCTTCGTCGTTGACAAGCTCCAAAATCTTAGAGCGAAGAGTGCGCTTCCCCAATGCCGCAACCAACAACAAATTACACACAACAT:1 + chr2R 18885049 3' + Doc4-element 121 1 84.00 TCGGTTGTTATCGCTGCGGCGAAGCTGTTTTACGCAATATTCCCCAAATGTGATGTGAAACCTGCACCACGGTCTGACACAATGCTGAATGGCTTACCAAA:1 - chr3R 2469111 3' - Rt1c 5246 1 77.23 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACAGTTTCGGTGGCAACGTCAAGGCATTCGCACGATCCGAACAGAAACTGGGCGATCGGGCTAAGAGA:1 - chr3L 5351475 3' - P-element 8 2 71.29 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCCCATAAAGTCACTTTTAATGAGAGTAATTTATTAGCGTATACAATGTATTGCAATAGCTTAG:1 + chr3R 16110257 3' - mdg3 15 2 70.30 GAATCTTTAGTTTCTCTTGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATTGTTTTGTGAGTAAACAGAACTGACCTTAACAATGAGAAAATAACACG:1 + chrX 7339970 3' - G2 2610 1 51.49 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATGGCTTTTACTGCTTTAATATAGCCTAAAAGACTGACATCCTGTACTCTT:1 - chr3R 8576841 3' - BS 5021 1 50.50 CTCAGGAACTTTAAAAGCTATAAGGCTGAGATTACGCACACAGATTCTGCGACGTATATGTAGGGCATATATGTATGTACGGAAGCTACAGGCCTACGATT:1 + chr3R 4556659 3' + INE-1 153 1 56.44 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCG:1 - chrX 3446525 3' - I-element 30 1 61.86 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACAGGG:1 + chrX 19887142 3' - P-element 31 1 49.50 ACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCTGCGTCGCAAAACATTTAATCAACTGGCATCCTTGCCAAACATCGAAAGGACCTTCT:1 + chrX 10298271 3' + Quasimodo 6916 2 62.38 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGTGTGTGTGCGGTGTGTGTGTCAAATTTAAAAGC:1 - chr3L 15486718 3' + 1360 3347 1 72.28 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACAAATGAAA:2 - chrX 5168836 3' - hobo 22 1 57.43 CTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACCAAAAACAAGGACGATAAGTCTGTGAAGAAATGCAGTAACTGCGGGGAAAAACATACTGCAAACTA:1 - chr3R 7738258 3' - Doc 123 1 74.26 TTTTTTTTGTTTTTTTTTTTAAGGGATCTGGGTTCTCGGTTCTCGGTTCTGGGTTCTGGGTTACGGGGCCATAATGAAGCAACCGCAGCATCGAAGTCTGT:1 + chrX 18345773 3' - Doc 4702 4 77.23 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATCGTGAATCTAAATTATCCAGTTCATTATTTAAAAACACG:2 + chr2L 18417366 3' - roo 8700 2 59.41 TGGTAACCTTCTCTTGCTGGTTAACTCCAGGGAAATTACCGCATCGCTCGCTGCACCAGCTTCACAACTGAGTGGTAGATATCTGGTCGTGATGTCAACGC:1 - chr3R 2696764 3' + Ivk 452 1 67.33 ATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATGTGTGTGGCACATGCTTTGATTGAGGTATGCCGCACCAACAATAACAGGCATCCA:1 - chr2R 18078674 3' - Quasimodo 11 2 69.31 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATCCGTTGAGAGGTGTTCAAAGCAAAAGCTCAACATGAATAGTAA:1 - chr2L 21018790 3' - 412 31 2 53.47 AGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTTAGCTTCCTGAAGCATCTGCTTACGCTC:1 - chr2R 4974919 3' - 3S18 5815 2 70.30 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAGATAAG:1 - chr3L 8044313 3' + mdg1 7428 2 54.46 GTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATAGTAATCCATTCCATCATATCACCGTACCGGC:1 - chr3R 5773170 3' - Stalker4 7002 4 72.28 CGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTACGGATTGGCATATCGGTTGGAATACATATTTCGCGAACTTACCTTGCC:1 + chr3L 5573616 3' - mdg3 5262 1 67.33 ATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGACTTGGCGATGATTGGCAAAGCCGGGACAATACATCAGATATATTTTCCTTTCCTTTTTTATAGATTACTTTA:1 + chr3R 1013843 3' - Doc 4573 1 77.23 CATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTT:1 + chr3R 15790073 3' - flea 4737 1 60.40 ATTAAGAAAGAAAATATAAATTATAAATTACAACATTGCCAGTAGCCACAATCTGACATATTGGAATGTCAAACTAATGAGGTTTCCAAACCAAAACGTAC:1 - chr2L 15194678 3' + copia 242 1 65.35 TGATCCAAGAAAGGAATTTACATATTTGGAGTTTTGGCCAATTTCGTATCAATAATCAATGAAATAAAATAAAATGAATAATCTGTTTCCGAGTTCCGAGT:1 - chr2R 4024259 3' - 1360 3161 1 71.29 TGTTTGGCGATGACGTCAGCAATCTCGCTGGGAGTGATCGGTTGCATCGGCAAGACCATTTGTCCCGCAGCAGCACAGTCTTGTTGAGATTCCGCTGGACC:1 + chr3L 23315723 3' - BS3 219 1 56.44 CTCCTCGTTACAAGAGTCTTTCTCTGTTTCCTTAACGAAACGAGGAGTCTACAGACCCTGGATCGCCATATACATTCCAAGAATTCCTATGATTCCCAAAG:1 + chr2R 2009046 3' - invader5 310 2 62.38 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCCATATTTCA:1 + chr3L 15869733 3' - pogo 23 1 56.44 CTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCGAAATTTCAAAACACATGAACCTCAGCAAAAGA:1 + chr3R 11392497 3' + Doc2-element 442 1 75.25 CGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACCAGTAGAGGTAGGGCTTCTCACGTTCAATATTCACCGAATTGATGGGATCCAGGCGGAACCA:1 - chrX 5223979 3' + I-element 4925 1 64.36 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCCAATGGACCAAGGCAGTGAAAATATGCCATAGAA:1 + chrX 17416966 3' + roo 9030 1 64.36 TTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTACCAGCCATTCGACTTTTCCACCCACTTTGGCTTAATCAATTTATGGTGCCAAC:1 - chr2L 20043797 3' - I-element 193 1 55.45 TTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAAAAGAATTCAACTGAATTGAACAGA:1 - chrY 1076852 3' + R1A1-element 32 1 76.00 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGGTGACTTTCTTCACTCCTGCAAGTTCGTCGCTTTTTGCAAAGGTCCTGCGCACGGCTGCCCAATTCCTCCATCCA:1 + chr2R 15402948 3' + roo 408 1 78.22 CAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGAACATGTATGTTCTAACTTTT:1 + chr3L 19456396 3' + jockey 427 1 79.21 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCAATAGTTATCTTAATTTCGAAATT:1 + chr4 306472 3' - 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G2 198 1 60.40 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAAATAAAATCACACACTAAGGCGCCAAATTA:1 - chr3L 8256100 3' + jockey 4956 1 72.83 TGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTAAAGCCTTTAAATGGTTCGTGGTTATATTTTGTACGAAGAAAATATAA:1 - chr3R 25859356 3' - Stalker2 7283 2 53.47 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACT:7 - chrX 17492867 3' - Tirant 8120 2 68.32 CAATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGTATCTAGATAACTTTCCAAAAAGTGGTAGAGCTAACCTAGCTTCGGTAATAGTCGGAACTGGAATTATTG:1 + chr2L 22326882 3' + invader1 3981 2 59.41 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATT:1 - chrX 9816255 3' - BS 5008 1 56.52 GGTGAAAGTGATGCCACTGCTTCGATTTAGCTTGTCGGGGTTTTGGTGGCCGAAAGGAAGTGAAATCGGGACCAAAACCCCGACAAGCTAAATCGAAGCTC:1 - chr3R 30348094 3' - gypsy9 4870 1 58.42 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACTTTGTCCTTAACGGAAGCATCGAA:1 + chr3R 25377440 3' - jockey 60 1 75.25 AAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAATAAATTTAATTAAGTCGATTTTGTAAGACCCATTTCCTTTAGTTTGGTCTCCTT:1 + chr2R 7940830 3' + Juan 4185 1 54.46 GCTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCT:1 - 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412 7103 2 81.19 GAGAAATAAAATAAAAAAAAAAGCAAATTGTTTGGGGATGCGTCATAAAATTTGTATTTGGGCCATATGATTTATGCCCCTCCAGTTGGCCTGTACCCGGA:1 + chrX 12263391 3' + Osvaldo 1519 1 78.22 AATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAAT:1 + chr2R 21020034 3' - Porto1 4630 1 83.17 TTTTTTTTTTTGTATTGCCAATATTTTTTGCCATTATCTGCTGAAAATTGGCACACCGCATGGGACAACACACACAAAAGCCGAAAAAGTCAAGGG:1 + chrX 16133197 3' + Tc1 1476 1 73.96 AAAAGTAGTCTACTGGAATAAGTAGAATATAAGAATATACGGTTTGCATCTCTATTCTCCCACGCTCTCTTGTGGCCTTATTAGAACCGTCGACCACTCCG:1 - chr3R 2469454 3' - Cr1a 3972 1 51.49 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACG:1 + chr3L 3535429 3' + roo 356 2 73.27 CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTTATTGTGGGCTTCTTTTCCTTTGTGGCAACTGGTT:2 + chr3L 12229411 3' + mdg1 382 2 63.37 TTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGACTAAAGTCTAATGGGTTTATACTTTATTTTTTTGTTTGGGAAAAGATTTACATT:1 - chr3R 11912092 3' - I-element 65 1 46.53 CGCCCACACTTTTGAAAAATTGTTCTCACATATTTCTCATGTTTATCTTCCACTGTTATAAACTTCGCCGTTACTCCAATCAACAAGATATTCACCAATTC:1 - chr2L 22133023 3' + INE-1 255 1 79.21 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTACCATCTTAAATTGTATTTAACCAATTTTCTAGGTTTCATGTCAGATATCATTGCCCTAAA:1 + chr3R 10480438 3' + mdg1 7443 2 64.36 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATCCGTTGAGAGGTGTTCAAAGCAAAA:1 - chr2L 21018808 3' - 412 49 2 71.29 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGG:3 - chrX 3446524 3' - I-element 33 1 62.38 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAATAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGGGAAACCGAAACAGCAACAGGAGCGGCAAAGTGGTTGGGGGGAGA:1 - chr3R 17335897 3' - hopper 27 1 52.48 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCCCCAATTAAATTCAAATAGTTTTTGCCTCACTGCCATTATGTTCGAGCTTTTCTTTTTTC:1 - chr2R 3521965 3' - copia 4887 2 59.41 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCCCTGATTTGAAACTACAACTTAGAATTGAAGTCACAACATTCCACCAAGGATTTCCACATCTACATCTCAG:1 + chr3L 12565738 3' + roo 405 1 73.27 TATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCAACATC:1 - chr2L 22092965 3' - INE-1 546 1 51.49 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTA:2 - chr3L 8044324 3' + mdg1 379 2 65.35 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGGCGGAAATGAAT:1 + chrX 21219497 3' + roo 9044 1 54.46 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCCATATTTCAATTAAAAGAATTCAAG:1 + chr3L 15869749 3' - pogo 7 1 72.28 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGCCATAGATTAGCGACCAAGTGCACTACTTCCGCCAGTTAACGAGCTCCACACCGTT:1 + chr3R 17529607 3' + roo 389 2 58.42 TTATTTATTAAGAAAGAAAATATAAATTATATGTGCTAGATTTCAGCACTGCCTGTGATTACATTTCCGTATGCATTGCACAAATTACAACTGGCTGCGCT:1 - chr2L 15189741 3' + copia 236 1 77.23 ATATAAATTATAAATTACAACATTGCCAGTAGCCACAATCTGACATATTGGAATGTCAAACTAATGAGGTTTCCAAACCAAAACGTACTTACCCCCATTTG:2 - chr2L 15194665 3' + copia 255 1 78.22 GTATGTGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATGTATATAATCCCAAAAACTGGGGACAAAAGAGTAGTGGA:1 + chrX 22664429 3' + opus 466 2 57.43 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTTATGGCTGGCTAATAGTGACAACAAAAGTACAGATTTAATAAAAAATAA:1 + chrX 10298073 3' - Quasimodo 13 2 62.11 CACATTCTTGTGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTTTAAACGGACGGCGGCAATCAATAGGCCATGATAATTTATGACGATTATGCTGGCCAAAATC:1 - chr2L 11533995 3' + copia 388 1 59.41 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCTATTGCTGTTGCTGCTTCTGCCT:1 - chr3R 30778964 3' + hobo 2888 1 75.00 CTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAA:1 - chr2R 5284559 3' + Doc4-element 2617 1 49.50 GACTTGTGAGCCGAAGCAGGGGCCGTGGGAGTAGTTCATGGAGATCTGGAGGATGAGTCGAGTAAGCCTCTGCTGGCGG:1 + chr3L 3506911 3' - Doc 400 1 82.28 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACT:2 - chr3L 8044304 3' + mdg1 399 2 56.44 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTGCGCTTTCAATTCCAT:1 + chr3R 19513424 3' - jockey 4683 1 64.36 TTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGAAATTCTTTGCAACATAGATAAGATGGGAGTAATGAAGTTCGCCATAAATAGAGTGCAAAAGAGCAGTTTTG:1 + chrX 696674 3' - FB 4 1 73.27 AAAGCTTTGAGCTCACAAACAGTTGCTTGTGCGATCGCGCGGCAACTGCGCAGCGGAGCCCCAAATCGAGTAAATTAACTTTGTCTTTTTTTTTAATGAAA:1 - chr3R 6768245 3' - X-element 244 1 70.30 CGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGAGAGCTTGTCCAGGTCGGGTTCCTCTGG:1 + chr2L 7643535 3' - McClintock 6097 2 80.20 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCCTTAATCTGCACATGTGTACTAGTAAAACGAGTCTGGTTTTT:1 + chr3R 13167388 3' - roo 33 2 60.40 CCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGAAATGACGAGGGAAAATAAGTTTTC:1 - chrX 20767635 3' - I-element 4895 1 75.25 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTT:1 + chr3L 6630130 3' + blood 375 2 76.24 AATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACCCTTATTTATGTTTTTTCCAGTATGCCCCTTATT:1 + chr2R 25216592 3' - 3S18 5810 2 72.28 ATGGGATGGTTCGACAAGGGGCCATTGAAACTACTATGCGACAATCTGAGCGCCACGAATTGCTCTCTTCCGCCCTGCCCTCTGCCCCCCGTTCACCAACC:1 - chr3R 24601245 3' - frogger 470 1 53.47 TAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCAT:2 + chr3R 435936 3' + 1360 3007 1 56.44 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCATATCTA:1 + chr2R 17348631 3' - jockey 21 1 61.39 CATTTTTGGCACTTGCGTTTACCCAAAGACATGCAAGGACCACAAGGACTAAACACATTGTACCACCAGATAAGTGTTGTAGCCATTACTT:1 + chr2R 19017655 3' - HMS-Beagle2 6939 2 72.53 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTG:1 + chrX 21219477 3' + roo 9024 2 72.28 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTCAGATAAGGAGCGCGCACAAAAGTATGCTATGAAAACCGTAATCATAAT:1 + chr2L 17729379 3' - hobo 28 1 51.49 ACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATGGACGGGATTTAGGAAGTTGCACTTATTGGAAAATAAATA:1 + chr2R 5520663 3' + I-element 203 1 60.40 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCAACTGACAGATTTT:2 - chrX 10196069 3' - 297 6590 2 61.39 CTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATCATCTAAATAAAGGGACTTTAATG:1 + chr3R 15076286 3' - I-element 443 1 76.24 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCT:5 + chrX 21945920 3' - F-element 51 1 67.33 TAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTTGCAAAGATAATTGAAGGGTATGCATGTATTTGCTCCCAAATGCATACTTGAATTGA:1 - chrX 18975538 3' - diver 23 2 56.44 ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTT:2 + chr3L 24210957 3' - HMS-Beagle2 25 2 66.67 AGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCACAGATACCCAAGGTTTTGAAGTCCTTTGAGTCCAGGGTAAGAAGAGCTCCGCCCTCCACGTTATTCTCCTTG:1 + chr3L 2508502 3' - Max-element 8316 2 75.25 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTACAACACTATAGTATTCGTTA:1 - chr3R 21587260 3' + pogo 2050 1 80.20 CGGTACCTGTTGCAAAGATTCCTATTTCCTTCAACGAAATCAGAAGGGGGTCCTTTGATATAAAGTGCGAAATGAACCATAATCTTGTGTGTGTAATATGG:1 + chr3L 25911556 3' - looper1 1480 1 58.42 TTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCAGGCTATATAGTTCGATTGATCAAGTGCAGGATAGTATCGTGTTGGGCAGTATGAAATTGATCTCTCTTTTTT:1 - chrX 3060099 3' - FB 5 1 74.26 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCCGC:1 - chr3R 4546035 3' - jockey 4779 1 57.43 ACACATACCAGCTTAAGGAAAACAGAGCATTTAGAGTTTATAAAAGACGATAATAATAACGTAGAAACTAAAAGATACTTTCATAAAACAAAAATTAAAAT:1 - chrX 13055716 3' + G4 351 1 67.33 CACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTCTGGCTGGAAAATGATGTTTACTCTGTCTTCTAACTTTGTGCTCCTCCCGTTTCCTTGGAGCACAGTCAC:1 + chr3L 11748819 3' + Stalker2 7644 2 72.28 TGTCCGTATGAACATCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCAAGAGATTGAGCATTAAGATACTGGACAAATGCATCGTATTCCGTTTTATTCTGTTATAGCC:1 + chr3L 26010291 3' + INE-1 132 1 58.42 TTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAGTCCGAATTCCAAAGTCTAGACTCTGTGGCGAGACATAACCACGTCCCCTAAATATCCGATCCTT:1 + chr2R 2650298 3' + Ivk 289 1 73.27 GATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTTTAAATTTACCGTGGCCTTTAAGTGTCACACCAGCGAC:1 + chr2R 14434338 3' + invader4 3082 2 56.94 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACACACACTTTTCTGTGCCGAAAACAAAAGT:1 + chr2L 8898929 3' + roo 9026 1 68.32 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACAAATCGCACAATGAACAGTGGTTAAAAATTCACTAGACAATTTACTATTCCAAGCAATTTATTT:1 - chr3R 12546788 3' - hobo 12 1 69.31 GGCCTAAGGACTACAATCACTATCAAATCAAAATTTGTATTGGACTGGACTGGAAAGACGGGGGAAAAGGAGACCTCAACGCCTAATGCAACTGCAGTGAA:1 + chr2L 12971258 3' + gypsy11 496 1 48.51 GATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTGGACTAGGACACACAGACAGATATGAGCTGGGAGTAT:1 + chr2L 15208475 3' + I-element 4887 1 82.00 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTATTTTGATAAACCACTGGTTTTTCTTTGATATTTCTTTTCGGTGCAACGCAAAGGGTTTCGCCTAAAATG:1 - 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Doc 58 1 84.16 AAGTTATTGTTTTATCAGTCTTCTATGATGTATGGTCATGTTATATTTGATTTTAAAAAATGTTGCATACTTCTACGGGGGGATTTTTTTATTTTTTTTAT:1 - chr2R 6222216 3' + Transib5 2755 1 71.29 GTGTGTGTGTGTGTATGTGTATGTGTGTGTGTACGTGCCTGTGTTTAGTGTGCATGTGTGCTAAAACAAATGCCTAAATTGCAACAAAGAAAATTGTATGA:1 + chr3R 6407241 3' - Quasimodo 31 2 73.27 TTTTTTTTGTTTTTTTTTTCGTTTTAATTTTCTCTGATAACAGCAGGAATTATGGTGTGTAAAAAATCATGACTTGGCAATTATGCGGCAAATGTGCGCAC:1 - chr3L 8247061 3' - G2 3076 3 55.45 ACTATTCTATCTATCATAATAAAATAAAATAAAATAAAATTCCTTAATGTTTTCGTTTCTATTTTGCTTTCGATGGGAGATGAGAGTTATTTTGAATTTCA:1 + chr2L 18626687 3' + I-element 5344 1 62.38 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCAATCTTCTAAACAGGATAAATGTAATTGCGCATGAATTTCTACGCATATTTCGGCGTCGCTGTCT:1 + chr3R 17557466 3' - mdg1 7048 2 71.29 GTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATGTCAGGCAAATGGAGCACTACGACCAAGAG:1 + chr2L 23371778 3' + Idefix 6989 2 72.45 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTTGGCATTAAAAGTTATTGAAAAAATTGCTGACAAAAGAAG:1 + chr2L 16379008 3' + HMS-Beagle 7009 2 59.41 GCATTCCTTGCAGCGTGCAGCAACACTCGGAATAAGAAGCGTCAGCTTTTCACTGCCAGACGTTGTTTGCGCAGAGCGCTGAACCAAAGACACTAGAATAA:1 - chr3L 11474690 3' - gypsy 139 2 69.31 TCCAATAAATAACGCAATAAGTTAAAAAAAAAAATAAATAAAACTTAATACGATATTGACTTTAATTAAAGCCACAATTTCCCTACTGAAAGCTCCACTTT:1 + chr2R 13754572 3' + Doc2-element 4756 1 70.30 GAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAGGTGAATAAATAGAACATGGCATAGAAAAGGCGAACTAGAATCAAATCGAATT:1 - chr3L 17653940 3' + mdg3 5051 1 62.38 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTGGGTCCCTATTTTTCTCTTTTATACACTTTTAGATGGTGGTTCCCAAGCGTGCAGCATTAC:1 - chr2L 11084320 3' + blood 368 2 52.53 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACAC:3 - chr3L 9190469 3' + 412 445 2 72.28 TGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTTG:1 - chr3R 30486950 3' + Cr1a 158 1 63.37 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAACTTTCTCAAACAATTGTCGAGAAATT:1 - chr2R 11770288 3' - pogo 46 1 77.23 GGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCTTGCGATTTTCTGGTATCGGCTGCAACTTTGTCGC:1 + chr2R 594154 3' - gypsy5 6951 2 52.17 TATTGACCGCTCGATGTGTGCGTTTGGGGTCGTCGTGCCGTTCAACTTTGGGTTGCGAAAAGATGGTTAGCCTGACAGGGGAAACCACACACATCTAGGTT:1 - 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chr2L 10104238 3' + roo 407 1 73.27 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGAGTGAATTAGTTCTAATACGAAACACA:1 - chr3L 19066095 3' + roo 360 2 71.29 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGACGAAACCATCAGGGACCTCAACTCCCTTCATACCCTACTCTCTTCGTAGGGTATCCGAA:1 - chr2L 20269949 3' - pogo 14 1 63.37 AAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTGCTATATATACAATACATA:2 - chr3L 24210878 3' + HMS-Beagle2 7188 2 72.28 CATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATGGGTATAAAAATATACAGAGA:2 - chrX 15408720 3' - INE-1 505 1 88.12 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATGTACTCCACATTTAACAAATATACG:1 + chrX 5178852 3' - hobo 49 1 76.24 AGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGCTTATTATCCGGCGATGGCCATTAGATTG:1 + chr2L 9673570 3' - 297 6889 2 71.29 CTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCACTGATCCTGAAGTTTGGTGTCTTCTTACACATTTCACATCCTCGAACGAACTTCCTCACCTG:1 + chr3L 23750105 3' - F-element 4374 1 68.32 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCAAAAACTGAAACTAACTGAAA:1 + chr3L 10576835 3' - roo 53 2 83.17 ACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGCGTATACGAGGCCCACGGAAGTA:1 - chrX 9816231 3' - BS 4993 1 69.31 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTTCAATGCATTCAATGGCGGCCCAGACGCCTCATTAGCGCTGCGATTCGCAAGCCAAAA:1 + chr3L 20862909 3' - hopper 12 2 67.35 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATTTATTTTTATTATCTACATGGGGAGACCACATAAAAGTTG:1 - chr2R 12625369 3' + pogo 2076 1 57.14 TGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTANTACATTCCCATAAAGTCACTTTTAATGAGAGTAATTTAT:1 + chr3R 16110227 3' - mdg3 41 2 65.98 TTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTAGTTATTTTTCATTATTTCCTTTGCCTTTTCATTCCCTTTAGTCATGGCTTTTGTCATTTTCC:1 + chr3R 6431999 3' - Doc2-element 4370 1 66.34 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAG:1 - chr3R 19450168 3' - roo 8701 2 67.33 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAAT:1 - chr3L 25884075 3' - Doc 26 1 48.51 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCACATATGGTTGGTATAAATTGTAGCAGACAGTACTTCTTTG:1 - chr3R 6030954 3' - hopper 55 1 59.41 AAATAGCAGTGCGAAGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTCCTCTAGCCACTAAAATATATTTTTTTTATTTTTTTTTAATGTATA:1 - chr3L 16166759 3' + HB 21 1 54.46 CACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTTAAGTAAG:1 + chrX 21945942 3' - F-element 28 1 59.00 GTATTCGTGAAGTGATCAAAGTGAAGTAATCAAAAATAAAACAAAGTTAAGAGAAAATTTGGCACATTATGTACTAAATCATTATGAAAACATCTCTAAAG:1 + chr3L 3723490 3' - frogger 2204 1 58.42 GAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCAGCTCGTGTAGATAGATATTTATTTGGGAACCAAATGAGAAAACATTTAAAATTGT:1 + chrX 20806220 3' - INE-1 571 1 92.00 TGAACGACGAGATCACAGGAACTAGAAAATCTAGAAGAGAGAGACTTAGATGCAGCGAAGTGTGGGCTTTTCCTCATTTGCGAAGTTTGCGAAGTGACAAC:1 + chrX 19327885 3' + INE-1 140 1 51.49 GTCCGTACGAACGTCGAGATCTCAGGATGAATAAGAAGCTAGAAAATTGAGATTACGGAAAGCCCCCAAAAGTAAATCATGGGAAAAAAAGATAGTGAGTT:1 + chr3L 15554208 3' + INE-1 133 1 70.30 CGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCTTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTG:1 + chr2R 4677352 3' - 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chr3L 10830492 3' - INE-1 501 1 62.24 CTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATAATCAAGTTGTTAACAATTTCGATGCTTTCGATCATAAAGTGTATACACATGAATTTTCTTTAATA:1 + chr4 716997 3' - INE-1 152 1 76.24 TAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACACATGTCCACATTGATGACACTAATGAAACTG:1 + chr3R 23173164 3' - Burdock 6177 2 68.32 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTTTGACTTGTTAAAATTCAGTATGGCAGCTGACCTTGGCTTTAAGGCTAACGAGAGG:1 + chr3R 19143640 3' - hopper 17 1 60.40 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAATCGCAAAAGTCGCCCCATTCACCACT:1 + chr3L 12217385 3' + roo 9047 1 53.47 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAGGTTCATCCCATTGTAGGGGAGAAAAGGCACAAGTTTTCCGGGTAT:1 - chrX 22664354 3' - opus 7143 4 53.47 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTATACCTTTTATACCCTTTGCACAATATACCCCACTCTTTACGATT:1 - chr2L 5654834 3' + roo 9039 1 56.44 TACAGTGTACCCTCGATACATGCACATACTACACATGTCTTTACTTAGATGTACAAAATATTCACAGGGTATCTTATGGTCTACACATTTCTCCTTGAATT:2 - 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Juan 4030 1 55.45 TAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCGGTAGGCGGCAGCCAATGCAATTACA:1 - chrX 10298448 3' - Quasimodo 7065 2 74.00 GGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGCGGGGGGTGAATTCGAGGCAACGACGACAACGAGACGACAACAAAAGGTGGAAAAAAAGAGAAGTGAGCCGAAAGGGG:1 + chrX 7459622 3' - Quasimodo 40 3 63.00 TATTACATACATATTTTCAACATTATGCATACAGATACAAGAGATATAGACGCAGCGCAAGTTTCTTTACCTATGTTGTTGTTGATTATCTTTCGTACCAA:1 - chr2L 21667245 3' - Dm88 1 2 79.21 CGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAA:4 + chr3R 1977619 3' + micropia 423 2 55.45 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATC:1 - chr3L 9190463 3' + 412 7505 2 66.00 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACGAT:2 - chrX 157203 3' - I-element 22 1 55.45 GCCAAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGG:1 + chr3L 24566085 3' + gypsy8 211 2 76.24 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGTGACTGCCAAAAGTATTTTAATTGCCCGGAGTTTTCCGAAAAGAGGG:1 - chr2R 7105332 3' + roo 9044 1 56.44 ATTAGATCCTACTAACATTAATATTAAATATAGTTATTTTACATTGTATTCATTTCCTCGTTTCTATTCTCCCACGCTCTCTTGTGGCCTTATTAGAACCG:1 - chr3R 2469466 3' + Cr1a 4290 1 65.35 TGTGCGTGTGTGTGTGTTTATGTGTGTGAGCCCATTCAGCCTGCAATCAACACAACGCATCCTGCAATTATCATAATATGCTCGCAGCGCCATCAAAATTG:1 + chrX 3312933 3' - accord 180 2 64.36 ATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACCAATTGGCAGACGCTATCAGACCAAAACCA:1 - chr3R 24509130 3' + HMS-Beagle 203 2 69.31 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTGATCTTCTTATGGTCTAGCCAAGCAGACTGAGTAGAC:1 - chr2R 11244981 3' - 412 31 2 59.78 AATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCCCTCCCTCTCACCCCCTTGTCCACCAACTAATTAGCCTAGGCTGCTCTGATTGATTACAGTTACCTAACTGTTGCTC:1 + chr2R 14132283 3' + F-element 357 1 75.25 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAAAATAGACAAGGATAGGCCCAAAAGGACGAAACGCGACCCGCCA:1 - chr3R 30326283 3' + pogo 2073 1 57.43 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGCAATAGCTGTCTTTGTATTTTGTATTGCCGTGTTGCAATTTATGTTGGTGTTGCCGCTTGTGTC:1 - chrX 12885679 3' - transib2 11 1 68.32 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGC:2 - chrX 10196088 3' - 297 28 2 59.41 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGAATATAAACTAAACGTGAATATAAACTAGACAAAATGTCCGAC:1 - chr3R 5561956 3' + pogo 2070 1 73.27 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCCTAGCCATCTGACATTGAATGGTGTTTGTATGTGTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:2 + chrX 12649914 3' + hobo 2928 1 67.00 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCTTATTGTTCGGCGGATAAGTGCCTGCTATTTCTAG:1 + chr2R 7307907 3' + 412 7511 2 63.83 GGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGCGGATGAAGTGACACTAAAACTCAAAAGAGAGTTATATTTCCCAAACATTAATGAAAAAATAAAACAGAT:1 - chr2L 23374386 3' - Idefix 210 2 74.26 GCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTAAGTGCGTGTTTTTTCCGCTCGCGTTTTCGATTTATTGTTAGATGA:1 + chrX 19399545 3' + pogo 203 1 54.46 TGGCAGCGGAGACTTTGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCCATGCATCTTTTGCTGTGGCAG:1 - chr3R 17980762 3' - HMS-Beagle 39 2 75.28 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGTGTGTGTTCATCTCGCTTTCCCGGTAATTTTCAGG:1 + chrX 9649961 3' + blood 7348 2 67.00 GGTGAGGTATGTGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATGTATATAATCCCAAAAACTGGGGACAAAAGAG:1 + chrX 22664422 3' + opus 7463 2 68.00 ATCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCTTTCTGTATTGCTATTTAGTTGTGTA:1 - chr2R 4312826 3' - invader4 362 1 73.27 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTGTAGCTAATTACTAGTTTATCTTTGCAATGGTCGGCTTGT:1 + chr3L 27661070 3' - I-element 33 1 57.43 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGTGTGTGTTCATCTCGCTTTCCCGGTAATTTTCAGGTGGAAAGAAGCCAACTTCGCAGAAG:1 + chrX 9649986 3' + blood 7372 2 61.39 AAGGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATTCTTAACGATATTTTCACTAAATGGCTATAAAACAGATATCAAGCTGTTACTTATTCCTTCTTCTTTAATT:3 - chr2L 10104241 3' + roo 404 1 70.30 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCC:1 - chr2L 13598205 3' - pogo 49 1 75.25 ATAAAGCTTAATTAAATTTTAAGTCTACCTGAACTCTAAGTGACAAGGAATACCTTTAAAGGAAATATGCCAACACCTAATTTAAATGTATAATTTACGCA:1 - chr3R 20601118 3' - Copia1_DM 14 1 56.44 GGGCCGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGGGTTGTACAATAGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 24210957 3' - HMS-Beagle2 6889 2 52.54 CGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAACGTCTATTATGGTCAGAACATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATTGTATAGAATCCCAAGCGGGC:1 - chr3R 2472849 3' - Cr1a 4231 1 79.21 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGCGCTCTCCTCTCTTTTGCACTCGCCACTTCGCACTCTTCTCGCCCACTATTTGGCAGGTCAATGAACTTGCTC:1 - chr2L 16276093 3' + 1360 3386 2 76.24 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTGATCAAATTTGTGACAGCATAAAAAATTACGTTTTTGAAATTTTACGTTGCC:1 + chr2R 17277631 3' - jockey 33 1 48.51 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTGTATTTAATGAAATTTTATTCGTAGCATTCCCCTCCAATC:2 - chr2L 12888812 3' + 412 7510 2 67.33 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAATGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACTTTACCTTTTTGCGGCTTTC:1 - chr3R 13995952 3' + 1360 3336 1 82.18 CAGAAATGTTTTCTGCATCGCGGAAAACAATTTATAATGTTATTAATCGCGCAATAACCATGTCGTTACCACGGCAGATCGCAGGTCCATACTTCGAATTG:1 + chr2L 21397063 3' + S2 485 1 53.47 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGCCGCTTGGCATGGACTCTTGTCCAGTGCAAACGATCAAATGAAATTAACT:1 + chrX 7733640 3' + blood 350 2 51.49 ATTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTGTTCCATTCGTCCATATTACTACTCGTACATTGCGTTTGTTCACATACATATATAACTCGTGTATGGCTTCTGAGGCAT:1 + chr2R 17368759 3' - Porto1 4283 1 65.35 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCTTGATATATGGAACAGTATTTAGTGGA:1 - chr3R 22494714 3' + 1360 3344 1 75.25 GTTTCAAAGCGAACGGTCGTTCCTTTCATTTCCTCCGAATTATACATAATTATTATTTTCTTAAATACTTTAAGAAAATCTTTTACTTTTCTGTCTTTATG:1 + chr3L 24796698 3' + Cr1a 5 1 53.47 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGC:3 - chr3R 19513373 3' + jockey 4949 1 76.24 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTTGCCAAAGTGCGTCTCCAC:1 - chr3R 17557399 3' + mdg1 7403 2 80.20 ACATATACATATACATATGCATATACATATACATATACATATACATACGGTTCTGAATCAGATTGCGAATCTGAATCTG:1 + chr3R 27870557 3' - Stalker 7093 4 70.89 ATAGGTATTCGAGCGATGTTGCATCGCACAGAGCGTCTCTTTCGCTTTAGATGCTGGCTACGGGAGAGCAGGATTGGTGGAAGAAGTTTCATTTGAGAAAT:1 - chr2R 4026548 3' - Doc2-element 135 1 52.48 CAAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCAGGTTCAGATGAACATATCCTTCTA:1 - chr2L 18887381 3' - hopper 47 1 69.31 ATCGAGGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTCAGTATT:3 + chrX 19820785 3' + Rt1b 4975 1 76.24 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGT:1 - chrX 3446514 3' - I-element 22 1 55.00 AAGGTGAGGTATGTGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATGTATATAATCCCAAAAACTGGGGACAAAAGA:1 + chrX 22664421 3' + opus 7461 2 69.31 GGAGGAGAAGGTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGTTAAAAAAAACAAATGAAAGGAAGTCGTTTAAAAGTACAAACGGACATTATTTATC:1 - chr3R 17634640 3' + I-element 340 1 55.45 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCATTGTTCCGCCTGAATATCCTTTGATT:1 - chr2L 16569491 3' - roo 48 2 75.25 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCCTTAATCTGCACATGTGTACTAGTAAAACGAGTCTGG:1 + chr3R 13167383 3' - roo 8702 2 65.35 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCTCTGCCTCTATAGCTCACACACACACTTGCGACTTGCTCGAATGCC:1 - chr2R 8666052 3' - P-element 22 1 52.75 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATACCCAGTCCTCCCACACACACACATGCATAGAAAATTACTATACAATTTGTGGG:1 + chr2R 20593419 3' - copia 23 2 56.44 CCGGGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATAAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAA:1 + chr2R 17348616 3' - jockey 36 1 58.42 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGATGTCAAAGTAATCACGAGTCCAACTGCTGGTGCAACTGCAACTCGCCCATTCGAGTGTCGCCAACA:1 + chr3R 11478482 3' + roo 400 1 69.31 AACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTATGATTTTTATAATTATAA:1 - chr2R 5582165 3' - Cr1a 439 1 67.33 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAAAAAAAAAACAAATGTTTAAATTGTTGCAAACAAGAAGCGACAGTGTTGCTGCCTTTTGTTCGCCGAAT:1 - chr3L 12879816 3' + jockey 4986 1 73.27 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCATTGTTCCGCCTGAATATCCTTTGATTTTCCCAGGGGCGGCAACTG:1 - chr2L 16569472 3' - roo 8693 2 56.44 AGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGTGGGGTGATTCTATCTCTCTTAGTTTGCCCGGGTGTTTTGAAGTTTGGAATAGAAATAATTGTTGCACTGTTTT:1 - chr3L 6869247 3' + roo 9069 1 77.23 AGAGAAGGCTATACTCGAGTTTCTCGACTATTAGATACCCACTACTCAGAATGTCAGAATTTATTTATTTGCTAATATTCTTTCTACGAACATTTACTTTA:1 - chr2L 19688006 3' - INE-1 574 1 52.48 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCAAGTCGAAGAAGTTGGTCATGTGGTTTTACAAACAGATTTATTAAAAGAAAAAGGGGTTTTCTA:1 + chrX 20835300 3' + roo 399 1 67.33 CAAAAGACGTTACTTACATCAATTTATTGTAATAACAGTTTTGAGTAAACCAATCTAATAAGTACAATTTTTGGCACAAAGAACTGAAAAGGAATCGTTTT:1 + chr3R 9360396 3' - transib3 483 1 50.50 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATCTTTGTTGTTTTTCCAACCGGGTGCTTAA:1 - chr3R 23870091 3' - roo 8709 2 79.00 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGTTATCATTACCTAAGCTAGGAATTACCTACACCTCCGCCC:1 + chr3L 15353607 3' + mdg1 7446 2 66.34 GGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTCGAATCATTTATGGTTATATTCACTTTCGGACTGAATGTTATGGTGGGCAACTAGAATTTTATCGTCGGTT:1 - chr3R 19449558 3' - baggins 5097 1 53.00 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATACATATGTATATAATATATTCGGCCTAAGATATGATTGTTTGATGTGGGCGT:1 + chr2L 9672499 3' + 297 374 2 60.40 CAGCAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTG:1 - chrX 22726193 3' + Helena 1275 1 49.50 ACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTATATATAGGGACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTGGC:1 + chr2R 4287888 3' + rover 328 2 60.40 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTG:1 - chr3R 19450183 3' - roo 8716 2 52.48 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTCTATGTGGGGCTGTTTATGTGCATTTAA:1 + chr3R 6097647 3' + roo 360 2 73.27 ACACCTGGCATTCAAAATATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCAGTCCACCGGCGGGGGAAGGAGACAGCTGACGCCTTGCTGCACTGC:1 + chr3R 11147052 3' + HMS-Beagle 6670 1 50.51 CAGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTTTCGGAAAAGACTAAACTTGTGCATTCCATATAGCTCTTTGATCGCCCCACGACCTAAAATAAA:1 - chr3R 2694801 3' + diver2 4726 2 75.25 TTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGATGTCAAAGTAATCACGAGTCCAACTGCTGGTGCAACTGCAACTCGCCCATTCGAGTGTCGCCAACATATCGATTTA:2 + chr3R 11478492 3' + roo 410 1 79.21 ACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTATGATTTAGAGAACACACATGAAAGACAAACAGAAAACATGGAGGAACTAGAGGGTAAGCCCGGCCGA:1 + chr3L 17688250 3' + flea 252 2 76.24 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTGAAGAGATTTTGGTCACGATGATACGGACATATCTAAAAGTCGTTTTGAAGCAATGATTGCA:1 + chr3L 8044400 3' - mdg1 7053 2 64.36 GGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGTGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTT:1 + chr3L 24210991 3' - HMS-Beagle2 6888 2 67.74 TATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTTTTTTTTTTCACGTAA:1 - chr3R 11080666 3' - I-element 7 1 71.29 CTATAATAATAAACAATCTTACATGTATAAGTATGTACATGTATATGTATGTATGCTTGTATGCTGTGTGTGTTGTTGACGAAAGCCTACGAATAGTCCTC:1 - chr2L 10119403 3' + flea 253 2 62.38 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACAAGAGGGTATAAAAACTCAACAGCAGC:1 - chr2R 20410954 3' - jockey 4719 1 71.29 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCAC:3 - chrX 17492870 3' - Tirant 8123 2 65.35 CCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCTCGCCCCTCGCTCCTTTACCTTATACCCCCTACGATTCTCCTTCACCCTCC:1 - chr3R 9201434 3' + HMS-Beagle 6673 1 54.46 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACTCGCAAACGCCGTCAGCGTTAAGACCAAAAGAAATGCATAAACAAAAACCTAAAACGAAACCACAT:1 + chr3R 8133470 3' + roo 9028 1 70.30 TCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGTAAAAGTTTGCCACTTAGCACCCGAAAATCTATCCC:2 - chr3R 13231120 3' - Quasimodo 5 2 79.21 AGCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAATGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAA:1 + chr3R 2689428 3' + diver2 4473 1 59.41 GCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTTTTTGTTTCTTTTATGGCACCGGCTTTCACTTCTCGCCTGTCTTGCTCAACGTTTTTTCGTATTCTTCAGATGCAC:1 - chrX 22693312 3' - INE-1 168 1 75.25 GTTGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACCGATCGCTGCTTTCTTCTTTATCAGTATTTTTTATTTATTTTTTAATG:1 + chr3L 25846028 3' - hobo 2711 1 63.01 GTATGACGAAGGAAGTTAGCTCCAAAAGGTTGTCTGCAATTTATAATTAAGTGGACCATTTAGCGGACTCGTTATCGTTTGATGAGTTCGTTCTTCGTGAG:1 - chr2R 5612269 3' - Q-element 253 2 69.31 AGCGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTGCAATTTGTTTGGAATTTGGTGAAGGATTATCAAAAATGCTAAAGGGTGCTTTCACTGGGGCGC:1 - chrX 13482513 3' - S-element 10 1 72.28 GGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATT:1 + chr3R 934254 3' + Rt1b 4748 1 51.49 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTG:1 - chr3L 8044333 3' + mdg1 7409 2 74.00 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATCATACTGTATATATTACATTTCTCATTAACATTATCGCAAAGCC:1 - chr3R 7102425 3' + pogo 2058 1 70.30 AGAGAGAACGCTGTAGTCGAGTCCTCGACTGTCAGATACCCATTACTGAGTGGGATTACTAAAACTGAGTGGGAGAAACTAAAAATATTGTGGGCATATCA:1 + chr2L 13558509 3' - INE-1 576 1 75.25 AAAAAGAGATTTGAGAGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTA:1 - chr2L 23295812 3' + micropia 405 2 71.29 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACAATAAACTACTTTCCATGATAATCGCCATCAAACTAGCTTCTGTTTGTGGCTTTG:1 + chr3L 21393536 3' - roo 8684 2 59.41 AGAATTAAGTACTTCAACAAAAATGGAGCAAGAATGGGGGTTATGATTTATATGAAGCTCTACATGAAACCCCGAAAGAAAATATATTC:1 - chr3L 14201679 3' + P-element 2620 1 76.40 CTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGAAATTTTAATAGCCGTTCCCCCACTAGCATCCATGTACAAATCTCCAA:1 - chrX 21632360 3' + Ivk 19 1 55.45 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGTGTGTGTTCATCTCGCTTTCCC:2 + chrX 9649948 3' + blood 7334 1 80.20 AAAAACAAAAAAAAAAACAATGCAATCGTTTACACTTTTATGGAGAGGAGAGCAGACAGGAAGGGGGGGGGGAGGGGCTATCATTCCGATCATGATTATTT:1 - chr3R 6426433 3' - hopper 142 2 57.43 ATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATCTATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAG:1 - chr3R 19450205 3' - roo 350 2 76.24 GGACGGTCGTTTGGCGCTGCGTGTGGGCAGGGTAGGGAATCCAGGCGAAAGAGCGATGGAGAGAGCGAGAGACAATGGCGACAATAAAAATGCGATCGCA:1 - chr3L 20950050 3' - Doc 459 1 78.00 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGTCTTGGCCATTCATGAGTACCAGTCAGAATGAATGTAAATATATATAT:1 + chr2L 10104340 3' - roo 28 2 54.46 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTGAAACAAACGTTTTTGTTTCACAC:1 - chr2L 3842854 3' + roo 9020 2 77.23 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATTTTCCTCATTACCCGACTTGCATT:1 - chr2L 13868722 3' + roo 9023 2 74.26 TGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATAAATTATATCTGCTAAGTACTATAATATGTTA:1 - chrX 9576379 3' + invader4 3042 2 70.30 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCGAGCCAAGTTGCCTTGTTGGCCAACTGCTGTGTCTATGT:1 - chr3R 6030280 3' + hopper 1379 1 61.39 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTGGGTGTTGCATGTTCCTATGGAGAACATTTTCGAAATCCCCCCTATGCGGCTGCCACTGC:1 + chr3R 26853931 3' - copia 18 2 62.38 ATGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCACTCCATTCCGAGCCATTTTCCCTCGCATGTTAGCCAGCCATTTTTCCCGCCACCGGGCAGCCCCCTTTTC:1 + chr3R 20486436 3' - accord 8 2 67.33 GGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGTCATAAATGGGGGCACAAAGTGGAAAGTCGGAAAGGAAGTTGACCTCCGACAATCGTGTTTCTCTTTTATATTTTTGG:1 + chr3R 21198707 3' - Tirant 8105 1 83.17 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACA:1 - chrX 5168843 3' - hobo 29 1 50.50 GCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGA:1 + chr3L 23678158 3' - Osvaldo 11 2 68.04 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGCATTATTCATGCTTGTTAAATTTATTAATTGACCT:1 - chr3L 14558263 3' - 297 40 2 68.32 TACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGCTAATTGGGTTAGGCAGCAAATGTGTAAACTGTTAGCAGATGGCCATTGAACAAGACAAG:1 + chr2R 21756336 3' - G2 136 1 40.59 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCATATCTACGGGCGCC:1 + chr2R 17348639 3' - jockey 12 1 68.00 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCCATTAGAAAAATTGCGCGCTCTTCGTTCAATTCCTTTATTACAAAAATCGTTCGCTCTTTTTATTTGTTTT:2 + chr2L 1530502 3' - roo 8668 2 75.25 AAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGTTTGCGTTGAAATAAATGCACATCAATAGTAATCATGATCATACTTTTATTAGGGTAATTTGCTT:1 + chr3R 24596830 3' - I-element 4998 1 71.72 GATACTTGTGAGGTATAAATACCCTGGTTTTTAAAGACTGTTTTACCTACCTTGATAGTTTCTGGTTGGTTCCTATTCTCATTGCTCAAAGCTATACGGTC:1 + chr3R 1720829 3' - TAHRE 408 1 69.31 AAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAAGTTAACAAAAACAGTGGCACAGACAGAGAAATAAGGGGATATTGTGGCAGAGGGGCCAGAGGAATTGG:1 + chr3L 13317429 3' + R2-element 3225 1 73.74 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCTGGCACAAGGATAAAACTACACGTACGAGCATTAAATGTGCCCCAC:1 - chr2R 14135400 3' + roo 9041 1 54.46 GCTTGCACACACACACACACACACACACACACAGATACAGATACGAGTACAGACACAGATACAGAGACAAATATGCCAAGGAGCAGGGTCAGCCATTTTGG:2 - chrX 10822931 3' + accord 179 2 71.29 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCCCTGATTTGAAACTACAACTTAGAATTGAAGTCACAACATTCCACCAAGGATTTCCACATCTACATCTCA:1 + chr3L 12565737 3' + roo 404 1 72.28 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTTCTTGCAACTTTCTGCGCTCG:1 - chrX 15219390 3' - hobo 55 1 82.18 TGACTTTAAGGGTAAAAATTAAGGGTTCCATGCTTAATTAAACGGAATTTTTTTATTTTCCTACTTTGTTTTGCTTTTGTGTATATGTGAGATTTGAATGA:1 - chr3L 23746773 3' - S-element 1668 1 74.26 GTCGTGAAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTATACTGCCGGGAAAAACAAGTTTTGGGCGCCAGATGGAACAAACTGATTTTAATTGGTCTGC:1 - chr2L 22699418 3' + INE-1 568 1 79.21 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCACCTGGCAGCTGCCAAAATTGCAAAATTGAAATTGAAAT:1 - chr3L 17110710 3' + hopper 1381 1 59.41 TTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACTTTGTCCTTAACGGAAGCATCGAATATTCCTTCCCTAACACGCTCATGATTTATCAATTGAAAAAAGATTCACTGA:1 + chr3R 25377492 3' - jockey 7 1 75.25 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACACTGGTTTTAAGTAAAGTTCTAGAGATCTTTAATAAGCTGATCCTATCACGAAATGAT:1 + chrX 12510381 3' + roo 9051 2 60.40 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGC:1 - chrX 10196100 3' - 297 40 2 71.29 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACTGGACCATATATCAAGGGCTCCAAGAGCTGTGGCCTTTTTTTTTAT:1 + chr3R 17980818 3' + HMS-Beagle 219 2 53.47 ATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAATACAAATACACAGGTCCCCATTTGTATGAGGAGAGTTTGTGAGGCATTTCAAAGACGAGGGAAATC:1 - chr3R 21859196 3' + I-element 5137 1 49.50 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACCAGCTCTCTCACAAACACAATCTAAAGTCGCAACTGTTTTTAAAGACCAAAGAAAGGGAGGGA:1 - chr2R 6501131 3' + P-element 2878 2 70.30 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACAAATCGCACAATGAACAGTGGTTAA:1 - chr3R 12546827 3' - hobo 51 1 74.26 CCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAT:1 - chr3L 16973353 3' - S-element 1525 1 68.00 AGCGTGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCTCAAAAGTATGCAAGTGCTAGACAAAATGTCCGCG:1 - chr3R 19513356 3' + jockey 4966 1 57.43 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTAGTCAATAGTCGTTATTTGATATAGTCGCCAGACCAACAACAAGCTGGCCATGATGAAA:1 + chr3L 13652258 3' - mdg3 5261 1 67.39 TGACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAAACC:1 - chr3R 11080703 3' - I-element 44 1 66.34 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGAAAGTGGCGAGAGACTGATTTATGTAAATTGGCCAAGACGCT:1 + chrX 3213589 3' - hopper 30 1 54.46 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGACCACGCCGGGAACGACTACGGA:1 - chr3R 17154446 3' + roo 9019 2 76.24 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATAGTTCAGCCCTCTTCTTTCTTTTGAAAGATAGAAAAA:1 + chr2L 5089653 3' - FB 40 1 67.33 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCACCAAAGAGCTCCAAAGAGCATTGGAGAGCACCCACAAAG:1 + chr3R 11569129 3' - P-element 35 1 33.66 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGCCCAAAGAGAGCAGGATAGGAGCACG:1 - chr3R 28135283 3' + hopper 1367 1 72.28 CGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGTGTTTTCAATTTGTGTTTTTGGCTTTATTTTTGGGTTCCAGAGTGGGGAGA:1 + chrX 9514858 3' - G6 1960 1 54.46 TCTGCAATTTTTGTTACTTCTAGGAGTTTTTTTGCTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCCTTTGCATGCCGCAGTGGCGGATAATGCAGC:1 - chrX 19411695 3' - I-element 425 1 75.00 TTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATTAGAAGAAAATATGAAGAATTTGTTAGATAACCAGAACAACCTTGATAAACTAATTCA:1 + chr3R 19448651 3' + roo 8705 2 64.36 GGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGC:1 + chr2R 1725937 3' + Doc 483 1 50.50 TCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACCAATAACTACGCCAAAGAGTGAAAAATTTAAATAAAGCTCAAATAAATTGCAA:1 - chr3R 17900415 3' + Juan 4043 1 61.39 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCTTTG:1 + chrX 13640287 3' + P-element 2834 1 27.72 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTGGGTGTTGCATGTTCCTATGGAGAACATTTTCGAA:1 + chr3R 26853906 3' - copia 4912 2 66.34 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTACTCAATATTCATTCATGTGAGAGCAGCAGCTGTGTCAGTTACTG:1 - chr3R 22341120 3' - hobo 29 1 56.44 TAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTCCGCCGTCCCTTTCGTTTCGAATGCTACTCTCTCTTTCTCTCGCTCCGCATTTCGCAATTTAATTTAATTTTTCCCG:1 - chr2L 19684566 3' - mdg3 5252 1 80.20 CGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCATGAGCGCTGATTTTGCGCCACTTAAACTTTAAA:1 + chr2L 9624603 3' - transib2 40 1 63.37 CATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCATGGCTCCACAACCAGCCCCGCTCATCTTTCCTCGCCAAAACAACATTAATTTTGGACAGTACTACCCA:1 - chr2R 1574968 3' - 1360 478 1 69.31 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTT:2 + chr3L 3535462 3' + roo 390 2 58.42 GTGAATGAGCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAATGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAAT:2 + chr3R 2689421 3' + diver2 4466 1 52.48 AATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCGAGTCCCGTCCCGCTGGGCTGTGAACTAAGCCGATTGATTGTCCAAATCTCACCA:1 - chr2L 19574114 3' + P-element 2771 1 57.43 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCCTTGTCAACGAATTGCATTCTGTGTGAATGACTTGG:1 - chr3L 2690944 3' - Doc 48 1 62.38 TTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACCAATTGGCAGACGCTATCAGACCAAAACCACAATG:1 - chr3R 24509125 3' + HMS-Beagle 7004 2 64.36 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAATCTAAAGGCGACCAGCAAACAGGTTCGAAG:1 - chr3L 14205346 3' + P-element 2843 1 35.64 AACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAA:1 + chr3L 23909056 3' + 1360 3218 1 56.44 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAGACTATAAATACCACCATCCCTTCAACGC:1 + chr3R 12597170 3' + copia 207 2 77.23 TGTTAAAGTCGGCTGTTGCGAGCATATACCATGTGGTAGGAAAATAATAGAAAAAATAGAGAATGCTATGTTCGAGTTCCTGACTATCAGATACCCGTTAC:1 - chrX 15903345 3' - hopper 1258 1 71.29 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGTGGGGTGATTCTATCTCTCTTA:1 - chr3L 6869299 3' + roo 353 2 77.23 TGTGTGTGTGTATGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGT:1 - chrX 7978948 3' - Quasimodo 28 2 68.32 TTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTAATAGTTCTTTTGTCTTGATGACTCGGCCAAAAATGGTGCTA:1 + chr3R 21714735 3' - mdg3 245 2 58.42 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACACACACTTTTCTGTGCCGAAAACAAAAG:1 + chr2L 8898928 3' + roo 361 2 69.31 TTTTTTTTGTTTTTATTTTTTATTTTCGTTTTTTCTCGATCTATCTTTAGTTTAAAGCATAGAAGTTTAGAATTAAGTTACGTTTTACGTTGAGAGAGCGC:1 - chr2R 13947795 3' + hopper 150 12 53.47 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTGTTTACAGTCATTGCTACAAATTGACAAATTCGCTGTCGCCTGTCACCCGCTTTGGATACTC:1 + chr3R 28135356 3' + hopper 1403 2 67.33 ATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGTATGTGTGCCCGTTTGTTTGATGT:1 - chr3R 14020537 3' - I-element 255 1 76.24 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGTACCTAATCTGGATGTCAAGGAAAGGAGAACTGTACCGCGGAAG:1 - chr3L 14285999 3' + 412 462 2 58.00 ATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAGAGTCAACGAAGACATCTAGTGTCCAGGGAGGCGAATGGCGA:1 - chr3L 11748730 3' - Stalker2 36 2 58.00 GATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGGTCATATCATGTGTAACGAACTGATTTTCCCGTTTCTGCTCGGTACGAATTGCAGCGGCTAGG:1 + chr3R 2975299 3' - Porto1 4288 1 61.00 CGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCTTGGATCTCATTTTGAAGTGTTGCTCAGAGCTGTCGCCACTTTGCTTTATCT:1 - chr3R 13619888 3' + Doc 264 1 62.38 GTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCT:1 + chr3R 10736139 3' - McClintock 6 2 72.28 TTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACATATACAAGTATTAAGCATAGTCAGTTCAAGCTCACCCCATTTTATGGAATGACAAATACCACAAAAAATCA:2 - chr3L 26315764 3' - Tabor 4 2 75.25 CACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGAAAATGCATTATAAGGCGAAGAGGATCATACTCTTGAATTAAAGATAG:1 + chr3L 494703 3' + Transpac 285 2 54.00 AGTAACGGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACCATAGCATTCTCTCTTCCGTTTCTCTACAAACCAAATTAGAGGAACATACTTGATTTTATGCTTTCAA:1 + chrX 21452827 3' + INE-1 550 1 55.45 TATGTGTTATTGACCGCTCGATGTCATCATTCCAAACGATACCAAGTTAATATTTTATTCAATTTTTTGTAATTACCTAAAATATTAACTTGGTATCGTTT:1 - chrX 20362091 3' - F-element 309 1 46.53 TTGAAATGGGAGGCACCCATTTAGTGCCCCCAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 7106307 3' + hobo 2571 1 50.00 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCG:1 + chrX 19034181 3' + hopper 1382 1 56.44 ACGATCGTACTACGTGCAAAAGTAAACAAATAATTTGGCGGGAATTGGACTGTGGCATTGAAAGAGG:1 + chr3R 14276111 3' - transib2 220 1 70.15 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAATATACACAAAGTGCTAACTAAAA:1 - chr2R 17942077 3' + mdg3 224 2 57.43 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCCGAATGCAAACACAGACACCCAGATATAATAACAACAAAAACATTCCAATGCAATTAG:1 + chr3L 22642462 3' - hobo 19 1 60.40 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGCAAACCGTCTAAATGCGATTGGTTTTCG:1 - chr3R 11936906 3' + roo 9025 2 71.29 AGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGGGATATTGCCAAAAAGGTCGTCAGC:1 + chrX 7724470 3' - blood 7256 2 75.25 TTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCCTCTTGGGCTGCACAACTAGAAGCTTTCAGCTTCCAG:1 - 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chr3L 1570617 3' - hopper 161 1 74.19 TGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAGCGGGGGCTTTGATTTGAAGGGGGTTTTCCAAGTGGATGCGGGGG:1 - chrX 7655682 3' - I-element 358 1 63.44 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATGGCTTTTACTGCTTTAATATAGCCTAAAAGACTGACATCCTGTACTCTTATTACTAAGTCCCAACAT:1 - chr3R 8576823 3' - BS 5003 1 68.32 GAGATGAGCCGACCAACAGGCTGCAAACGGTTAATTGTACCCCATTCCATGGGTATGGTTATCTTCCAGCTTCCACTTCCAGCTTAAAATTTAACTTCGGC:1 + chr3L 15695247 3' - Chouto 6019 1 52.48 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCACTTTCTTTCAATTGCCACCTTTC:2 + chr3L 3070696 3' - 1360 49 1 75.25 TGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTTCATGTCGCCGCAGGATAAGTACGCGAATATGGGGTAGAATCTACTCTTCCAA:1 - chrX 8632655 3' - Quasimodo 317 2 56.70 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTGATCTTCTTATGGTCTAGCCAAGC:1 - chr2R 11244994 3' - 412 53 2 76.24 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCCTTAATCTGCACATGTGTACTAGTAAAACGAGTCTGGTTTTTTGGAGTCCTTTCTCAAAACACCTAGGGGCGTG:1 + chr3R 13167420 3' - roo 1 2 78.22 GCAATGTATGAAGAATGGGAGACTCCACCTATCAGATTTCATCTTCAAAAAATATAAATAAACAGAAATACAAAAAAAAACTAAACTTATTAGTTGACACA:1 - chr3R 2650817 3' + mariner2 745 1 61.39 AAAGAGATTTGAGAGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATA:3 - chr2L 23295810 3' + micropia 407 2 69.31 TGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGCTATGGTTTTTTGTGG:1 + chrX 8080048 3' - McClintock 230 2 81.19 ATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCAACTCTACCTGTTAAATACTTTTCAACGACACCTTTATCTTACAAACTTATATATTGAGTTATCTATT:1 + chr3L 25480684 3' + Porto1 457 1 64.36 GATGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGTCTTAAATGAAAACCGGACAGTTTTTAATGAGGAAGTACGTTTGGCAGGTGCGAGATAACTAA:1 - chr3R 6057669 3' + Bica 170 1 65.35 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGTACCTAATCTGGATGTCAAGGAAAGGAGAAC:1 - chr3L 14286012 3' + 412 7501 2 71.29 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTACCATCTTAAATTGTATTTAACCAATTTTCTAGGTTTCATGTCAGATAT:1 + chr3R 10480426 3' + mdg1 393 2 52.48 AGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGCTGATTCGCAGACAAAGCTTTCGGTTACTCG:1 + chr2L 1009571 3' - I-element 4966 1 69.31 GGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTAAATGCTCGACAGTTGCAACAAACGGCAAACAAAGAGGAGAGGCAGAGGGGGGG:1 + chr3L 7305141 3' + hopper 9 2 56.57 ATTATTGTTGGTTAAGAGCTTGAGTCCTTATCGAAAATTTATTTTATTGCTTCAAAATATACATTACTTTTTTTTAGGAATTTAAATATCCGTTTTAAGT:1 - chr2L 5271467 3' - I-element 167 1 64.00 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGGAACGGGCCGGCAACAATGGACTTGAAATGAAAATTGGTAAAACGGCCT:1 - chr2L 16378929 3' - HMS-Beagle 19 2 57.14 CCAGTCGCTAACGGAGAGTCCGTGCAAGTGGCTTGGTAAAGTTAATTTTTTGGTGAATGAGAACTTTTAGAACTATCTTTTTTATGTTAGCTGTCTCTTGT:1 + chr3L 24191345 3' + baggins 281 1 73.27 TAATGACTTAAACATACAAACAGTCAAGGAAACTATTAAAAAAAAGCAGCAAAATAGATGATCCTATTTACGAATTAATAGAAAGGTATTCCAGTATAGAA:1 + chr3R 19446657 3' + Porto1 4397 1 51.49 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATGTAGAAAATATGTAGAAAATTCTTTACCGTGTAGTTAACCCACTA:1 + chr3R 30562363 3' - mdg1 7061 2 52.17 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCACTTTCTTTCAATTGCCACCTTTCCCC:1 + chr3L 3070699 3' - 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chr3R 3757379 3' + Cr1a 4009 1 63.37 ATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTTGTACATACAATGAAAGCACGTTTAATAGCAATTTTTCGA:1 + chr3R 27035174 3' + 1360 202 1 60.40 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAACACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTC:1 + chrX 21945919 3' - F-element 52 1 66.34 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGCAACAATTGAAGGCGATCCCGGGCGTTTAATTTCTGGAGGAATTAGCCGCAACAACAAG:1 - chr2R 2338613 3' - copia 4888 2 60.40 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGT:1 - chr3R 4504082 3' + blood 333 2 70.30 AGCAAGAACCCAAAAACAAAAAGAAAAAGGAAAAGGAGCAAGCGAACGAAAGACAGATATGCGTAGAGGATCCAGAGGACTTACAAGGATTAAATCTCGC:1 + chr2L 4308986 3' - Tc1 164 1 82.00 ATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGTCTGAGTTGGGTGTGCTACATGCGCCATCCATTGGATCTGTTG:1 - chr3R 9183453 3' - I-element 167 1 60.00 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATACGTTGGCTTCGTGCATTTTACGGTGTTGGGAAACAGACGAAATGGACTC:1 + chr2L 3842909 3' - roo 8690 2 53.47 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGACCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCA:1 - chr2L 23372625 3' + 1360 3353 1 64.36 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAACGGGAAGTTCATCATTACAGCAATTTAGTAATATTTATTAAAC:2 + chr2L 21018837 3' + 412 7492 2 68.32 GGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAAACTAAATAATTTAGGCAAACGGGGTACCAGGTTGAAGGTGAAATGGGCGGACTTCAGG:1 + chr3R 15177242 3' + I-element 376 1 78.89 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAACTTTGAATACGGACTCGGATCGGATGACGAAAGCGTCGCTT:1 + chr3R 12717174 3' + P-element 2855 1 47.52 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATA:1 - chr3R 3920679 3' - I-element 48 1 77.23 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCA:1 - chrX 10196099 3' - 297 6620 2 68.32 AATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAACAAAACGAATAGAACGAATTTAATATTTGTGGCTTATGACTTTTAAAA:1 - chrX 156735 3' + I-element 101 1 67.42 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTACAACACTATAGTATTCGTTATTTA:1 - chr3R 21587256 3' + pogo 2056 1 75.76 TGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCCGAAGAAGAGAGCTGACTTTGTTGTACCAAATCGTTTAATTTTTTTAGTT:1 + chr3L 10575231 3' + roo 8969 2 54.46 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATAAACTCAATTGCCAGCACAGCATATCGGTCAGATCGAATACTGAATTCAGTGCTA:1 + chr3R 10876369 3' + opus 7485 2 63.37 GTATGGAATCGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAATTCAGCAAATATAAAAAAAAAGAGATCCAAAAGCTTTTATTGAATGCAAATTTAATTTAATATTAAGT:1 + chr3L 25878569 3' + Porto1 4274 1 65.35 TGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATACGCTCACCAACACATGCAAGCGAAAGCGCCAGCGGCAAAAACAACGACAGCGA:2 - chr3L 195566 3' + Bari1 1686 1 58.42 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGATGTCAAAGTAATCACGAGTCCAACTGCTGGTGCAACTGCAACTCGCCCATTCGA:2 + chr3R 11478470 3' + roo 9051 2 57.43 CGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCTTTTTGCCGGTCTAAAGATTTTCCCACAGAACCCATGAAAATCCTGTAACAAATTGCTCGCATTTAGCG:1 + chr3L 14420304 3' - FB 9 1 70.30 TGGATTTTCAGAATTGTGAAATTAACACCGATCACGTAAGTGTGAATAGCAATTAAATGGGCAAACTGTGACAGACCCCTGCCAAATGC:1 - chr3L 18796350 3' + mdg3 495 1 53.93 TTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTC:1 + chr2R 5531184 3' - 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I-element 152 1 80.23 AATTTATAATTTTTTTTTCCTTAGTGAAACCTTGTGGATATTGTCCATTGCCCCTCAGTCACGAAGGGCGTACACATACGTTTTGTGGTTCTGCTCCTTTT:1 - chr3R 16839592 3' - copia 249 1 56.44 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTTGTGCTATTTTATGCACTAAATAAACCAGTTAATAGCATTGCTGCTATAATGA:1 + chr2R 8479717 3' - flea 4776 2 61.39 CTGGCGGTTTTATTTATAAACAAAGGGGAATAAAAAGGACTGGTAGTAAAAAGTGAAAATCTTCTCACTTTATCTGTCATATATCAATTCCATAGTCTTAG:1 - chr2R 25216505 3' + 3S18 340 2 81.19 CAAGACGGTGCGATTCATCTTTAAATAATTGGCGCTCAACTAGTGGTGCTCAGAAGGTAAAATTAGGGATACATAGATATTTGATCGTCAGGTGAATGATG:1 + chr2R 4192826 3' + Gypsy6A_LTR 391 1 57.43 AAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCA:1 - chr3L 19274798 3' - transib2 24 1 55.00 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGTTTGTGTTAATTGAGTTTATGTTATCAAAGATGTGCTTTGTTGTGGTTTT:1 - chrX 12881926 3' - hopper 25 1 54.46 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGTTGGCGGTGATTT:1 - chrX 3446502 3' - I-element 11 1 66.34 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTACAACACTATAGTATTCGTTATTTACAAAGAACGACTGCAGTTCTCGTTACTCGCTACTA:1 - chr3R 21587221 3' + pogo 2089 1 63.37 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTT:2 - chrX 11503486 3' + roo 9018 2 80.20 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGCACACAGATGCTCACTCACACGGAGACGGCCACAAGACTCATTCGTAGGGACTTTCACGC:1 + chr3L 15057006 3' - 412 7070 2 62.38 TTTTCTTGCGAGGGGATTTTTATGGGTGGTCAGCTTTTCAATGGTAAATGCAGCTGCCACTTTGGCCAACTTGTTGTTGACTTGTTGCCACTCTGACCGCT:1 + chr2L 17703488 3' - Doc 4495 1 70.30 TCCCTCAACTTCTCCTCCGCAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATAAATGGTGATGTTCTTTTGAAAGAGGATGATGTCCATGATGTTGTTGATGAG:1 + chr2L 3988687 3' - I-element 336 1 71.00 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACAAATGAAATGGCCCAAAGGAG:1 - chrX 5168823 3' - hobo 9 1 70.30 GGGGAGTAGTTAACAACGAACTCCCAGGTTAGCATCAGCAGGCCTATTTTTATTTATTAAGGACTTTAAAGTGTACCTGTCACCCTCCAGAACCTGTATTA:1 - chrY 3069823 3' + gypsy 6981 1 58.42 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAG:1 - chrX 3446536 3' - I-element 44 1 74.00 GTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAACTAAAATGCTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTCCGGAGTCAAAGACCAAGCGCAAGTTTGTTGACCCATTTT:2 + chr2R 5296381 3' + INE-1 137 1 79.21 AAACTAAAATATGAGCGCATCTGACGATCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACGACGGGAATTTAGTTGTAGTTTAGGCCGAAATTGAAAGACCC:1 + chrX 5086948 3' + Porto1 201 1 58.42 CCTTCAGTGTAGTCCATGAGGGCTCCTCCTTTCACCCTTTAGCTGCGGTCCTGGCACTGTTTGGGATGCCCAGATGCAGGCCTGTAATCATGCGTGGGCAG:1 - chr3R 17156304 3' - Rt1b 4921 1 67.33 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTG:1 - chrX 5168858 3' - hobo 44 1 65.35 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTTCTTATGTTTTTATCAATACAAATTTCTACCAAATATTTTCACGTGTTCCCACCATCGACGCAAAA:3 - chr2R 20506789 3' + mdg1 414 2 70.30 ACGCGATATAGAAAAGAGAACAGAAACGATGGAAAAAATATAATAAATATAAATACAAGTGGAACTCACACATAGCCTAAATAAATACCGCTCTCTCAAAG:1 + chr2R 4330274 3' - Cr1a 4354 1 54.46 TGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCTTTTAGAAAATTCCCTTTTTTTGTGGGTTTGACCCAAGTGAAAATGCAAGGTGTTGACTGGATTCCGACA:1 - chr2L 11559898 3' - copia 4874 2 72.28 CACATACACACACACATACACACACACACACACACAAACACACACACACACACACACACACACACACACATACACACACACATACACATACACACACAC:1 + chrX 4939759 3' + accord 7099 2 64.65 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGA:1 - chr3L 25884093 3' - Doc 44 1 63.37 CTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTTTCCTCTCGCTCTCCTCCCTACAATTCCCAAATTATTAGGATTGTTGTTATTTGTTGTTGTTAATTGTG:1 - chr3R 2533356 3' + Max-element 8312 2 51.49 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATGGATAACCGTTCGGTTGAATGTGGATTATAA:1 + chr3L 22162747 3' + roo 397 1 67.33 CGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTAACTATTAACGA:1 - chr3L 25884053 3' - Doc 4 1 70.30 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATATAGTTACAATAAAGTTAAGTCCTTTTTTGGCATTATTTTAGGCTTATAGAT:2 - chrX 8326283 3' - opus 23 2 52.48 GCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTTCAAGTGGCTTCTCAAAGCAAGTAAGGGAAGCAGAGGAGCGACAACAAGGCGAT:1 - chr3L 24408797 3' + Quasimodo 6925 2 57.43 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTCAGCTATGGCCGGCAGAGAACAATCAGT:2 + chr2L 19962664 3' + 297 350 2 69.31 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAATCCCTATTAATGCCACGCTAGGCTTAAAACTAAACCAAGGAAATGGG:1 - chr3R 7873480 3' - 1360 28 1 54.46 GGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTCTGCTAAGGTTGCTTCGCTTTCGGTTTTGGCCCCTAGGATTAAC:1 + chr3L 7778314 3' - I-element 211 1 56.44 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGATGTCAAAGTAATCACGAGTCCAACTGCTGGTGCAAC:1 + chr3R 11478452 3' + roo 9033 1 64.36 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGTCGAGTT:1 - chr3L 8044295 3' + mdg1 7446 2 65.35 CTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTAACACTGCGGTCAGTGTTGATTAAACTTGTATTTTTAGCAATATTATAATAAAATATTCAACAATAAGTATA:1 - chr3L 17690489 3' + flea 4950 1 77.23 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGTACCTAATCTGGATGTCAAGGAAAGGAGAACTGTACCGCGGAAGTATAAACCAGAAAC:1 - chr3L 14285985 3' + 412 7528 2 61.39 GATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAGCAGACGCAAAAGAAAGCAAACAGTCAGAAAAAGGAAAGTGCGCAAGCAGAGATGAGTTACAAATCATACAGTTA:1 - chr3L 24153720 3' + BS3 217 1 53.47 TAATTTTGCATTGAAAGGCAGAAAATACAATTTACTTTTCATTACGCAAACAAAGAATGGGCCGCCGACTTTTAGAGTTTGCTTTTGGTTGATCTTGGATT:1 - chrX 3404976 3' - S2 46 1 58.42 GAATGATAATGAATTCTTTATTACAAATATGTATAATGTATATATCTCCACGCCAGTTATTTGGGAAATATCTTCCCATTTATCACTATTTCAGTACACCC:1 + chr3R 21617334 3' + accord2 76 2 59.41 ACCAAAGACACTAGAATATTCTATTCTATTATTCTAGTGTCTTTGCACAAACTCTCTGAGCTAGCCGCTGCAATCCGTAGCGAGCGAAAATAGAAAATCAG:1 - chr2R 601790 3' - Tc3 312 1 72.28 AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAATATACACAAAGTGCTAACTAAAAAAAAAATTAACTTTA:2 + chr2L 14506221 3' + mdg3 239 2 69.31 CTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGAAAACCAAAGACGTCCGGAACTACCATCAACAAGCGCACTTC:1 + chr2R 3032006 3' + F-element 278 1 68.32 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTG:2 - chr3R 4504077 3' + blood 7350 2 65.35 CCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGT:1 + chr3L 23678156 3' - Osvaldo 16 2 71.00 TATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTT:1 + chr3L 24210988 3' - HMS-Beagle2 6899 2 61.39 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGAATAAATGGATTTCACCTT:1 - chr3R 24260312 3' - P-element 56 1 24.75 GCGCTGCTTGATTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAATTCATATTTTAAAGGCATTTTCGTAATAATAACATAAATTACGAGTACGGG:1 - chr3L 14933643 3' + micropia 5221 2 63.37 TGTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCACAGCTGGCCAAGTTTTCCGAGTTTCCTTTTTCTTGCCAAGGCCTCAATTAAATGTTAATGGCAATATTTTA:1 - chr2R 19579859 3' - I-element 353 1 72.28 TTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGAATGAAATGGGATGAGCCTGATCCGCCCTGAGCCACAACTCAGGCAAAGTC:1 + chr3R 22268968 3' - I-element 5129 1 57.43 TGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTGACCATTTTTGATTGCCTTCGCTGAATAAGCTGTAAGTGGCCTTTTTTCGGACAATAAGGTGGGCTTTGTCAG:1 + chr3L 18270350 3' - Porto1 4356 1 67.33 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGTCGCCCGGATCCGGAATGTAGGTCATGTTGGACGCCGTTTTGGAGGAGCTACCACTTCGCC:1 - chr2R 12249691 3' - jockey 21 1 64.36 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATGTATATGATATGAAGACGAATTTCCTAGGTAGTCAG:1 - chrX 2581690 3' - opus 35 4 70.30 TTTAAATTTTAAATTAAAACTTTCCTACAAGTCGCCCGACGGACACAGCGGCGGATTGTTAAAGGTCTTGCAGCTGTCCGTCTTTCCGAAACGAATGTTCT:1 + chr2L 20873843 3' + 1360 3044 1 72.28 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGCCAAAACGCCCTCGCATATGCAACACAATTTAAAGCCACACGAACACAAATGCAATT:1 - chr3L 20862806 3' - hopper 15 1 62.38 GAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATACGCTCACCAACACATGCAAGCGAAAG:2 + chr3R 21592010 3' + Bari1 1659 1 70.30 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTA:2 - chr3L 8044311 3' + mdg1 7430 2 52.48 CTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGTGTGTGACATTCGATTTGATTGTTTTTGTTTTGAAATGCAATTTTACTTGCAAAGGGCCGAATCAGATGTAAGCG:1 + chr3L 13885556 3' - Doc 123 1 71.00 AAACAAGGGAGAAGAAAAACAAATTTATTATTGATCGATTTTTGTGCTCCTAATTTTTTTTAGTTTTATTACATTATGGCCCAACAACACATGTTCGTATG:1 + chr3L 12614642 3' - Juan 4033 1 76.24 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCATTGTTCCGCCTGAATATCCTTTGATTTTCCCAGGGGCGGCAACT:1 - chr2L 16569473 3' - roo 8694 2 57.43 GTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATATGAGTGATTTATTATTTTTTGCAACTGAACC:1 + chr3L 17762832 3' + invader3 232 2 72.28 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAATCCAAATGAAGAATCATAAAGCGAGATTTGAAGATGAACTGACCTCTATTTCAATTTAAGACGGTTGCCT:1 - chr3L 10305291 3' + 412 7542 2 74.26 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTTGCCTAAATTGATCGAAATGTACCTATTCTTCAACAGAGCAAAATAGTTTAAGGCTTTTAATGTCTTCTA:1 + chr3R 7015546 3' + roo 408 1 79.21 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAGATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGCAATAGCTGTCTTTGTATTTTGTATTG:1 - chrX 12885716 3' - transib2 48 1 71.29 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCTGGCACAAGGATAAAACTACACGTACGAGCATTA:1 - chr2R 14135412 3' + roo 9029 1 66.34 TCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGA:1 + chrX 21668085 3' - Tabor 6861 2 57.43 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAAT:1 + chr3L 3535444 3' + roo 9036 1 61.00 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGTTTTCGC:1 + chr2R 1725950 3' - Doc 24 1 61.39 GTATGGCGTTACGCATCTTTATATTCTAGTGACGGCAGAGTGCGCGCGAGAAGCGAAGCCATAATATTTTGCGAGAATGAGCGATAAACCACTACATCCAT:1 + chr3R 3620769 3' - 1360 16 1 70.30 GGAAAGGCTTAATGTACAACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGTCCTTCAGTATAAGAAAAATTTAAATCAAATACTTTTTCCCAC:1 + chr2R 17284561 3' + jockey 4657 1 55.45 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATGTATGCAGAAAAGGCGTTGAGGACGGAAGAGTTTTTCAAGTGGA:1 - chr2L 12489535 3' + pogo 2076 1 57.43 ATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAATAGATGGGTTCTTGTTTTTTGCGCAAGTGTATTACTCG:1 + chrX 2751782 3' - hobo 476 1 62.38 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATCCGTTGAGAGGTGTTCAAAGCAAAAGCTCAACATGAATAGTAAAAGAGCAGAGCTTACA:1 - chr2L 21018774 3' - 412 7068 2 69.31 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTCGGGTTTATTGTTTTATGGCATTGCTAATATTTGTGTTGCATTTTCC:1 - chr3L 18642236 3' + pogo 2077 1 55.45 ATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAGGAAGATACGAATACAACTTCCAAATAACTCCCTGCATTCTTGAGATTAATTGGTA:1 - chr3L 27863830 3' - rover 6965 2 66.34 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGACGAAACCATCAGGGACCTCAACTCCCTTCATA:1 - chr2L 20269976 3' - pogo 41 1 72.28 TGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAG:1 - chrX 17492887 3' - Tirant 8140 2 59.41 GAAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGCGGGAATATAAAGATAAATAAATAAGCAAGGACATTTTTGTTTGTTGCTTTGTTTGCCC:1 - chr3L 13636899 3' - accord 185 2 67.44 CAGAAAATAGAGAAACACTGGGACAAACAAGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTATGTAAAAATGTCTATGTTATGTATATATTGC:1 + chr3L 26567312 3' + Tc1 1597 1 79.21 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGACTGTACAGATTGAGTGCTTGTGTGTGCATAAGTGGGTGGGTGGTGAATAAGTACATGAGAGAG:1 + chr2R 9258675 3' + blood 363 2 64.36 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTG:1 + chr3L 22162706 3' + roo 9019 2 79.21 CTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCTCATTGCTACTGCGTAATGAATCCCATCATGCGCACAAAAAAATTAAGGAAC:1 - chrX 6127568 3' + Quasimodo 145 2 48.51 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTAGTCGTGCGTGAATTTAGTTTTTTTTCCC:1 - chr2L 8965431 3' - Doc 51 1 70.00 TTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCAT:1 - chr3L 19437245 3' - jockey 4724 1 78.22 AGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCAAACAATCCAAGAGAAATGGGATTCGGGGGGC:1 + chr3R 7022178 3' - roo 171 2 69.31 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACATCCACCCAATCAATTGAAATCCACAACGTCATTTAACCA:1 - chr2L 15151874 3' + Tabor 7289 2 57.43 AATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTGTCCA:1 - chrX 22726189 3' + Helena 1279 1 53.47 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGACTGTGGCCGCGTTGATTTGCAGGCAGGTTCGTTTGCTTTGGCTGCCGTTTTGCATGAATATGCATGAGC:1 + chr3L 13361056 3' + hopper 1411 2 43.56 ATGCACACACACACACACACACATAGACAGGCGGG:1 - chrX 6147640 3' + accord 7027 2 74.29 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTG:8 + chrX 21945906 3' - F-element 65 1 81.19 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCTTATTGTTCGGCGGATAAGTGCCTGCTATTTCTAGCTGTCGCATTGCAACAG:1 + chr2R 7307924 3' + 412 468 2 51.49 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGTCTGTCGCGCAATAAAACCGCCCAATTGGTGCCGAAATTACGGCACAGATAATGCGCG:1 + chr2L 7056429 3' - P-element 16 1 63.37 GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTGGCTAGAAAG:1 - chr3L 9190432 3' + 412 482 2 67.33 TTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATCTGTATCTGTTTCGGTTTCAGGTCGGGATTAGCTGCTAGTCCGGAGATAGATGTGCGTATATACAG:1 + chr2L 1011028 3' - I-element 5155 1 62.38 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAG:2 - chrX 5168852 3' - hobo 38 1 59.41 CTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGT:1 + chr3R 15790058 3' - flea 4751 1 75.00 TACGCATCTTTATATTCTAGTGACGGCAGAGTGCGCGCGAGAAGCGAAGCCATAATATTTTGCGAGAATGAGCGATAAACCACTACATCCATTTTTAAGTG:1 + chr3R 3620778 3' + 1360 3382 2 79.21 TATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTCCGACCTTTTATTAACAAATTTTACTTTGCCCACGCCGCACGTTATGCTATAATTAATAAT:1 - chr3L 14563702 3' - 297 465 1 71.29 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATGAAAAAACCAATTGAATGTGTATATAATGAATCA:1 + chrX 10779965 3' - roo 69 2 66.34 ATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGGCTTTAAAACAAGCACTTCTTTTTTATCTCTCTCCGTCAACTCCGAACCGTTCC:1 + chr3L 21922324 3' + I-element 357 1 65.35 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATTTACGAATTCAGACCGAAAGTTTAATAAAAACAAGAAC:1 - chr3R 935434 3' - HMS-Beagle 6827 2 58.42 TTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTTACTCAAAACTAACTTAAAGA:3 + chr3L 3535482 3' + roo 410 1 78.22 CTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGTCGGTGCTTTTTCGGCGCTCGGCTTTTTGTCTTTCGTCTTCTGTCGGGTTTTTCTAGCCACGC:1 + chr3L 5351583 3' - P-element 14 1 61.39 CACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAGGTATGGTTATTGTAAGTCATAATAAATACATTTATCCCCCTGCGAAAAAAGTGGAACTA:1 + chr2L 8898561 3' + roo 8660 1 59.41 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCCA:1 + chr3L 15869726 3' - 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HMS-Beagle 183 2 77.23 AAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGCAATAGCTGTCTTTGTATTTTGTATTGCCGTGTTGCAATTTATGTTGGTGTTGCCGCTTGTGTCTGTTGCATTG:1 - chrX 12885669 3' - transib2 1 1 78.22 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGAGGCAATCTAAATCCCAGAAAAGATCCCC:1 + chr3R 21587333 3' - pogo 12 1 63.37 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGTTGCTATTGCTGTTGCTGCTTCTGCCTGTGTGCAATGTGTTGCAAGTTGC:1 + chrX 7429431 3' + hobo 2911 1 51.00 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATACATACATCAAACATTGGGGAAGGCATAAAAAACG:1 + chr3R 5429655 3' + roo 9028 1 68.32 GATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCTTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACT:2 + chr2R 2248341 3' - invader3 5237 2 71.29 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATCCTCGACGGGCAGGCGGAGACACTAACAACTAATTAACACTTCCAGCT:1 - chr2L 8469574 3' - Transpac 4943 2 56.44 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGTATTATTCCGTAGAAGATGTGTGTTCAATAAAATCTGTAAATATTTTACCCAACATAAAATAG:1 + chr2L 9284449 3' + flea 245 2 64.00 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTAGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCTTCTGC:1 - chr2L 11884635 3' - 297 6590 2 97.03 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATAATTTTTTTTTGTTTGTTGGTCTGATTTCTGTTATTTGTTGGTTTTTGCACTGTCG:1 + chr2L 16636246 3' - 297 6592 2 69.00 TTGGGAGCTGGGTCACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAA:1 + chr3R 934251 3' + Rt1b 4745 1 48.51 ATCTTCTTCCATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGTTCCATAGACGGTGCAAGATTCGCACTCGCACTGCAGACATGCTGGAAGCTCTTGAATGAC:1 - chr3L 3398437 3' - invader4 2978 2 61.39 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATAATGAAAGCAGCTTACATTTTTGCAATGCATATTTAAGCATACCCATCATATTAAGCTTTGCCAG:1 + chr2L 5654922 3' - roo 8676 2 67.33 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGTATAAAAAGTATAACGTAAATATCTCTTA:1 + chr2L 21631879 3' + pogo 2055 1 75.25 GGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTCCATTGGAAAAAAGCCCTACATTCATATAGTTTCATTTCACACGGAGACAAATGAGTTTCCTGTGTCA:1 + chr3L 17635615 3' - 297 6581 1 80.20 GGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAAGCAGTGTATGCGAAATTTGAAATGAAAATAATTAAATCAGCGAAAAGCATGGGGAGAAATCTGAAATT:1 + chrX 3449886 3' - hopper 120 1 71.29 GGCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCAC:1 - chr3R 11080683 3' - I-element 24 1 54.46 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGTGTGTGTTCATCTCGCTTTCCCGGTAATTTTCAGGTGGAAAGAAGCCAACT:1 + chrX 9649977 3' + blood 351 2 52.48 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTTGCCTAAATTGATCGAAATGTACCTATTCTTCAACAGAGCAAAATAGTTTAAGGCTTTTAATGTC:1 + chr3R 7015541 3' + roo 403 1 74.26 AGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGCTGATTGTACAGCAGCTGTCCAAAAGCCTCCAAGTCTCAATCGTAAATGGGGATGATGACTCTGTCCAACCAA:1 + chr2R 1780297 3' - I-element 401 1 77.23 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGGGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCA:1 + chr2R 17348612 3' - jockey 37 1 60.20 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGATTAAAGACCACAGTTGCGGATCCATTTCACTGGAT:1 + chrX 17432458 3' - hopper 39 1 63.37 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCTGGCACAAGGATAAAACTACACGTAC:1 - chr2R 14135420 3' + roo 9021 2 74.26 TTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACGTAAGAGTTTTTGGGCCAAATTGCCTGCATAATTTTTGTGGGGGTACTCCACCTTTTGGGA:1 + chr2L 9129215 3' + 412 485 2 65.26 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATCAAATAAAAGATCTTGAAAATAAAGTTATGAATAAAATTAAAAAGGAGCA:1 - chr3R 1927198 3' - copia 4895 2 53.47 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGCATTATTCATGCTTGTTAAATTTATTAATTGACCTTCCCCCTGAGCTCACACCTCTGCACCT:1 - chr3L 14558236 3' - 297 6594 2 67.33 ATAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGCCGTGCAACTCGACTTTAGCATTCTCTTATGTTTTAAAATACATTTGACATTCACAGTTCATTTTGTGACGCTGT:1 + chrX 21421877 3' + INE-1 543 1 87.13 TACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTTAATTTGAATTGATTACCAAGTGTCCGGGATTGACTTG:1 + chr3L 18522149 3' + 412 7466 2 62.38 AATCAACTAATAAAATTATGAAAAAATATACAAAAATTTTCCGAATCACTCCCTCAGTTTAGAAGATTTTATTAAATGATTGTCTAGCCATAAATGTAA:1 - chr3R 3625120 3' - INE-1 406 1 70.71 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGG:2 + chr3L 3535437 3' + roo 9028 1 68.32 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACAGG:1 + chrX 19887141 3' - P-element 32 1 48.51 ACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATGTACATGCATATGTGTATATTCGTATACCCGTCAAATGATCGATTGGGGAGATAGCTGCATTAA:1 + chr3R 13231241 3' + Quasimodo 7363 2 74.23 GGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGTGTGTGTGCGGTGTGTGTGTCAAATTTAAAAGC:1 - chr3L 15486718 3' + 1360 3347 1 71.29 CATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTTTACAGAATTTGGATTAAGTGGACTTTGCTGTCGACATGCTA:1 - chr3L 20867315 3' - hopper 1041 1 54.84 AAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCG:1 + chr3R 435939 3' + 1360 3011 1 53.00 TCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATATATACAATCATTTTCGGCATTTTATGACCTTATT:1 - chr2R 2014992 3' - Rt1b 5103 1 65.35 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGTATTATTCCGTAGAAGATGTGTGTTCAATAAAATCTGTAAATATTTTACCCAACATAAA:1 + chr2L 9284445 3' + flea 240 2 59.41 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACAGTTTCGGTGGCAACGTCAAGGCATTCGCACGATCCGAACAGAAACTGGGCGATCGGGCTAAGAGATTG:1 - chr3L 5351472 3' + P-element 2882 2 74.26 GATTTTATCAGTCTTGTATGATGTATGGTCATTTGATTTAAAAAATGCTGCATACTTCTACGGGGGGAAGAATATATTGTTTGCCAAAAAAATTGGGTTGG:1 - chr2L 22983957 3' + Transib5 2762 1 88.12 CAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTACCTGTAGGAG:1 - chrX 21564089 3' + invader4 295 2 57.43 CTCTTCTTCTAGTTCTACATTATAAATTTCCGAATCTGAAGTGCCTGCGAGCAACTATTCTGCCTCCAATTCTAATAATGCCCTCGTTGCATACAATCG:1 - chr2R 4716654 3' - transib2 2576 1 66.67 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAATCGCAAAAGTCG:1 + chr3L 12217371 3' + roo 9033 1 60.40 GTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATATTTTGGCTCTGTTGATACGAAACGCACTACATTCATTAAAAATATTG:1 - chr3L 17762774 3' - invader3 30 2 52.48 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACGTAAGAGTTTTTGGGCCAAATTGCCTG:1 + chr2L 9129180 3' + 412 7498 2 71.29 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCATACTTAGTGTGCGAGCGAAAGAGAGAG:1 - chr3L 3070663 3' + 1360 3341 1 75.00 CAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAAAACGGCCTTGGGGTAATAAGCTTTTGCTTG:1 - chr2L 62521 3' + X-element 4466 1 70.30 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAAATGGCAGGCGGCAAGTGTTGTGGGAAGAG:1 + chr2L 12422009 3' + pogo 2058 1 71.29 TATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAAAACTATATGAACTGTAATGAAAGCACCCATTTTTCTTCTTACCATATATGAAT:1 - chrX 7697803 3' + copia 14 2 58.42 GCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACAGGACCGAGTAGGGAACCAGTACGGGACCGAGTACGGGACCGAGTACGGG:1 - chr3L 16047628 3' + Cr1a 4417 1 64.36 AATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTGACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGC:1 - chr3R 3985681 3' - gtwin 6935 2 60.40 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAATGGATAGAAGGAAGTAGAGAAGCCACGGTTCCATGCGAAAT:1 - chr3R 25526341 3' + transib2 2788 1 57.43 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCTGCCTTGCTGTTTTGTTATTGTTTGGTTTTTGC:1 + chr2R 6501212 3' + P-element 2847 1 41.58 ATATATGTACATATTTATATATTTTTTTTCATCCGTTTTATGCATTTTTGCCTTGCAGTTGCTGCTGCCGAAAATTGCATTCTTGGCTGGCAGCGATGAAG:1 - chr2R 18967159 3' - G3 4507 1 57.43 TGTTGAAGGTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTTTGGAGTAGTCAAAATAATAAACATTGGATGGGGAGATTTGTCAGTTGACAGCTGTCAA:1 + chrX 13015670 3' + invader2 4646 1 71.29 TGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCAAGGAGGATTTCAAATGAAATATTTAATTATGCGCCAACGGAA:1 - chr3R 17979855 3' + HMS-Beagle 432 1 57.43 GCAAAATACACACAAATAAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATATCGATGACAGAATTGAAAACCACGGACTTGAATTGGTTTTCATTG:1 - chr2L 23041084 3' + Porto1 4445 1 73.27 TTGAGCCCGGGCTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGGTGAGTTTTCTTTTTTCTTTTTGGTACTGTAATACGTACGGCTATTCCCAATTTCAGTATGCAATT:1 + chr3L 5263495 3' - I-element 148 1 59.41 GTAAGCATAAGCAAGAAGCGCTCTCGCGCAGATCAAGTAAACGACCCAGTACATCTAAGATTTTCTCACACCAACTTTATAATACTAAGTTATTTTTCAAA:1 - chr2R 3594257 3' + Tom1 195 1 73.27 CAACTGTATATGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACGCACAGCGGTGATTAGCTTCTTAAAACGAAAACGCCTACGATATACTTAACGATCA:1 - chr2L 22992543 3' + 1360 171 1 64.36 TAGTTAGCTTTTTCTAGTTTACAATAATAATACAGTACATACAACACATATGAGCTAGCGACACGAACACACACGCTCGCGTGTGTCCTGAGGGTCCTG:1 - chrX 18220948 3' - X-element 4613 1 73.74 TTTCTTTTTTTTTTTGTAAATGCGCGGAAATTGTATGTGAAAGGAGGCTAAAAGCCCTCAGAAAGAGAGGGGCATAGCGGGCGGGAAAGAGACGGGCTGAG:1 + chrX 17383093 3' - HMS-Beagle2 478 2 71.29 CATACTTTTCAACGAATCTAGTATAACCTTTTACCATACAAGTATCGGTTATAAAAACAACTAAAAATGGGGATGGAGGCTGGG:1 - chrX 21175653 3' - INE-1 11 1 64.29 TGGTGATATTATTGTTACCGCAACTGTACGTGAGAAAACCTCAAGTGCGCTGGTTAACAAACTAACAAAACCATATAACGAAAAATCTGCCAAACGAGCG:1 + chr2R 1295739 3' + Tc1 1639 1 64.00 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGGCTATCGAAAACTCCAGCTGGGCTCTGTTCTGGCCAAAAGGCCAACTGATAAACGTTAGCCGG:1 + chr2R 16433280 3' + flea 246 2 65.35 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCAGTTT:1 + chr3R 23870134 3' + roo 9028 1 68.32 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCACTTTCTTTCAATTGCCACCTTTCCCCACTGACCAGTCATAGTTCACTTTGCG:1 - chr3L 3071278 3' - 1360 20 1 48.51 ATGCATACCCTTAGTATTAATAACATATTGTAGGCGTTTTTCAAAGTGAAAACCATCTTTTCAAGCTCGTTCCATTGCCCAAAATCCCAATATTGCCCCAC:1 + chr2L 16112697 3' - S2 1407 1 66.34 CTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCAAATCTCTGAATCTTCTCGGCAACATTTGGCAAATCACTTGCCCAGATTG:1 + chr2L 7570370 3' - FB 28 1 63.37 AGAGATATATAAGGTTTTTAACACATATAAATATGTGTAAGCGTTATTTCGCTTTTATATGATGGTTGTAATTGATCGGCATTGTGGGAATGGGGTACGAT:1 - chrX 5388141 3' - Porto1 132 1 67.33 CATGAGTTATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAAAGTGCAAATTCCGCTCATGTTAAAT:1 + chrX 10296977 3' + Quasimodo 267 2 72.28 GAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCCCGCG:1 - chr3L 26852642 3' - 1360 40 1 61.39 GAAAAATAATAATAATAAAAACTCCCATTTGGCGTCCGACAAGCGGTGAAAAATGTTTAAAAAGCGTCAATCTTTATTGATTTATCGGCGGTAGCAGCCAC:1 + chrX 11375694 3' + invader6 4387 1 71.29 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACCAAAATGAAGAGATTAAATTTAAGATATTTGCATTCTTAAAGATCTTGTTTAATTCCCC:1 - chr3R 20240859 3' - Tabor 6858 2 56.44 CACACACACACACATTTACACACAAACAAGCAGTATGTGTGTATTAGTGGTAGCCAACGGCAGCACCCTAATTGCTAA:1 + chr3R 14355608 3' + accord 7034 4 55.13 ACGATTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTGGGCCAAGTTTGCCACCGCACTTCACAGTCCGTTTGCCGTTTGTTATATTTATTGTTGCCCCTGATTTG:1 - chrX 22756825 3' - INE-1 31 1 71.43 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTACTGGTCCGCCTGTCTGCTTTATGCGAGTTTGTTGTTAAACCA:1 - chr2L 19681416 3' + hopper 1378 1 62.38 TGGGGGTTTAGGGGGTAGGGTGGTAACTCGCTTTGTTGATTAGTTAATTACACAGTTGATTAATATCTTAAATGCAGCCATCTCGTTGACGCATATAAGAT:2 + chr2L 13642778 3' - Tirant 8116 2 72.28 ATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGCTTGTTTTTACCACTTTCCTTTGAGTTGACAGCTGTGCAACTGGGGTTGGGTTTTTGGTTACACGACTTG:1 - chr3R 20239904 3' - Porto1 321 1 74.26 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAAATATACAATTAACTCCTTAAATAGCAAA:1 - chr2R 11835630 3' - I-element 50 1 74.26 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTCATTCCACTTTAACCGCGGCGCTTTGTGCTGGTTTTGTTCTATTGGTAAAAGGAAGTT:1 - chr2L 11073750 3' - roo 8681 2 62.38 CCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGACAGCTAGCTTTTAGCCATACACGTAAAGAAAAAATAAATGTAAATGACAAGGGTGCCCCAAGGTA:1 - chrX 5107931 3' - accord 258 2 72.28 ATCGCGCTCTTCTATCACTTTGAGGGTATAAGGTTTGATAATTGTTTGCTTTGCAAGAGTCCCGCCAACTCCTTCCAAAAATCCCGTTGAGTGGGGAACAT:1 + chr3L 18407621 3' - Porto1 334 1 57.43 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTGATCAGTATCAACAGCCTGATA:2 - chr3L 15869669 3' + pogo 2052 1 78.22 GTTTAAAAGAAACAGAGAAAAATAGAGAAGGTAAAGAGATAGTCCGAGAGAGATAGAGATATAGTGATGGAAATGTTGGATGGACAATGTTTATTAATGG:1 + chrX 20804759 3' + transib2 2422 1 64.00 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTT:1 + chr3L 14286046 3' - 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chr3L 14854684 3' - mdg3 5274 2 52.48 TGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGA:1 - chr3R 10736045 3' + McClintock 6397 2 64.36 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAGAATAACTCCCCCTTCACACATAC:1 - chr2R 10974148 3' - hobo 52 1 79.21 AGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGCGCAGCTAAATGCCTTTGCCAACATGC:1 - chr3L 10813505 3' - accord 7030 2 92.45 TCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAAC:1 - chr3R 19449441 3' + roo 58 2 65.35 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAAGGCGCACCATGTGCCACCTAATTGAGTTTGCGAAAGAGCAAGAGT:1 - chr2R 22745996 3' - hobo 4 1 74.26 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGAAACTACACATTGTAGTTGTCGGGAAAAACTACGTATTTTCCAGCCGCCCAAG:1 - chr3L 15729602 3' + hobo 2917 1 57.00 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTACTGGTCCGCCTGTCTGCTTTATGCGAGTTTGTTGTTAAACCATCACAAAATAAA:1 - chr2L 19681404 3' + hopper 1390 1 50.50 GAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCGATTTGGGTGGCATACAGTGACTGGTGTTCTTCAAGTGCTCGATGGT:1 - chr3R 15124243 3' - F-element 363 1 53.47 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATGGCTTTTACTGCTTTAATATAGCCTAAAAGACTGACATCCTGTACTCTTA:1 - chr3R 8576840 3' - BS 5020 1 51.49 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGGATCTCCGGCGACTGTTTGAAATTCATGACTTGTTTAGTGCACATGCCGCATAA:1 - chr3L 17767645 3' + hobo 2937 1 73.17 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATTATTTTCAATTATTGTATTTTTTAATTAAACAAAAATGCATGCCAGAG:1 + chrX 8551264 3' + mdg3 218 2 54.46 TGACATCTTGACGTTCATACGGACAGACAGGGTCCAATCGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAGAATACATATACATCTTGAGGGTCCGCCTTCTCGGGAC:1 + chr2L 3812041 3' - INE-1 135 1 75.25 CACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTAAGGGTTTTGAAATCGAATAATTTAATAGCGTCTGAATGGTGCATCTTATAGAGTTATGGGCGCACCA:1 + chr3R 13239358 3' + Quasimodo 7065 2 72.73 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGTTGTCCCCGCTGAAAAAGATA:3 + chrX 17492971 3' + Tirant 8487 2 60.40 GGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTT:1 + chr3L 24210988 3' - HMS-Beagle2 6888 2 68.89 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTCAAAGGCGGAATGGCGGCGACCTAGCTAGCGTGG:1 + chr2L 13628145 3' - Tirant 69 2 66.34 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATC:1 + chr3R 21587301 3' - pogo 44 1 72.28 TTAAAATTCATTTCTAACATTTTAGCCCGCTCTGCTCATCACCAACACATCGATTACTGCAGCAGTTGAATGCAGTCTGGAAAATTAGATAATCATAGTTA:1 - chr3L 19182395 3' + FB 666 2 55.45 ACGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACTTTGCTACATGTGAATTTTCTAGAACACACGTATCACGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATAC:1 - chr3L 25245594 3' - Tirant 12 2 67.33 AATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAA:1 + chr3R 435930 3' + 1360 3002 1 61.00 GTCTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGGTCTTCAATTTGTTTCAGCCTCACAATCAGAGCTGGATCATCAAATCGAAACATTCGATTTGGGTTTATT:1 - chr2R 4557686 3' + Doc2-element 4600 1 74.26 GATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGGTGAGGAAAGCATTTCACTGGCACTGAGTTTCCT:1 - chr3L 20271764 3' - flea 4703 1 66.34 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGCCCGTCTGTGTGCCGGTGTATGATGCCATTTATTTGCTCAAGATTA:1 - chr2L 9672410 3' - 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I-element 5115 1 74.26 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAG:1 + chr3L 3535455 3' + roo 9047 1 52.00 TACCGCGGGAGGTTCTGGATTTGGGCTCCTTACTTTTACATTGTTACTCACTTTAATATCCCAACCTGCATTTGCAGGTTTTTCAAGATCTTTGCTTCGAG:1 + chr3R 2470986 3' + Rt1c 5349 1 56.44 TTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACATGTAGTATAATCTGCATACACATGTAAGTACACATGTGTGATTTATGCA:1 - chrX 3294393 3' + hobo 54 1 59.41 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCATTCGTGCTAACGTGACCAATATGCTTGTCATTGCCATAATAATC:1 - chr2R 20762159 3' - hopper 27 1 52.48 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTCGCCTCTGCCTTTCTTGTTGTGCCATCGTCTTCGTCGTTTTTGCTCACGT:1 - chr3R 28326422 3' - P-element 26 1 54.46 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGTTTTCGCAGCACGCTCAATT:3 + chr2R 1725963 3' - Doc 11 1 74.26 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACGTAAGTAACATATTTTCCCTTATTTCCC:1 + chr3L 22231366 3' - Doc 52 1 80.20 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATC:1 + chrY 311344 3' - 1360 11 1 53.47 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAA:3 + chr3L 3535454 3' + roo 9045 1 53.47 TGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTACAGTCTTGGCTGTAACCCAATAAAATCCCTTAAGGCCT:1 - chr2R 14402253 3' + Tabor 447 2 68.32 CGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTCCGCCGTCCCTTTCGTTTCGAATGCTACTCTCTCTTTCTCTCGCTCCGCATTTCGCAATTTAATTTAATTTTTC:1 - chr2L 19684569 3' - mdg3 5255 1 77.23 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGCATTATTCATGCTTGTTAAATTTATTAATTGACCTTCCCCCTGAGCTC:1 - chr3L 14558250 3' - 297 6608 2 55.45 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAGGGGAGTTCATCATTACAGCGTGACATTGATTGGCATTGAGTTGGGCGTAGGCAAATGGG:1 - chr3L 15056927 3' + 412 456 2 60.40 CTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACAATTTATGTCGTCTCGCGATCTTGGAAATGCTCCATGGACACGCACACCTTTAAGGAAACATGAAAAAATGAGG:1 - chr2R 11399140 3' + 412 492 2 77.23 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGTTTTTTCCTAATTACTGCGGATATAGTATTTAAAGTTCGTTTAT:1 - chr3R 9616584 3' + roo 9040 1 56.44 CTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATACATCTGTCTACTTCTAGACTCC:1 - chrY 425014 3' + McClintock 6379 2 80.20 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACTGAAGTCGCACACCCGCCGCCGCC:1 + chr3R 13995981 3' - 1360 49 1 75.25 GAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGCTAATAATGTCTGAAAATTCGTAGATTTAAACAAACTGTTAGATATTAAGCTTT:1 + chr3L 920558 3' + mdg3 5478 2 60.40 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACACGTGTGTCATTAATGCAGATACATCGGTATAGATACATCGATTCAGATGAAGATACATTTCATTATCGCTTCA:1 + chr2L 11894872 3' - roo 4 2 75.25 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATA:1 - chr3R 19450190 3' - roo 8723 2 55.45 CAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCCTTCTGCGTCGACGGCTTTCAGTTTGGGG:1 + chr3R 5555963 3' + mdg3 201 2 68.00 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATATATATGTGTATATTTTTTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCA:1 - chr3L 14854671 3' - mdg3 5261 1 65.35 GTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAAGGGGAATAAAAAGGACTGGTAGTAAAAAGTGAAAATCTT:1 - chr2R 25216543 3' + 3S18 6067 2 60.40 TTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATCAGTCACAATGGAAACAGTTGAACCATAAGATTTCATAATATTTTCGTCT:1 + chr3R 10733237 3' + McClintock 6340 4 53.47 CTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCATCGGGCAAGTACTGCGAAAAGAACTGGC:1 + chrX 21564956 3' + invader4 16 2 65.35 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTGGATGATATCTGACTTTGACATGAGCAGCTATAGGATGCAGTCAC:1 - chr2R 23596413 3' - 1360 32 1 55.45 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGCCCAAAGAGAGCAGGATAGGAGCACGAGGATGCGGAAGGATGTGGGGGGCAGAGAGTGACCCCTGCAC:1 - chr3R 28135241 3' + hopper 1409 2 73.27 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTAATAAATTATGCGCTCTATATGCACTGTAATAAATCAATAAATTGCAGAAA:1 + chr2L 3483584 3' - I-element 23 1 57.43 AGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTATAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACA:1 - chr3L 20224148 3' + Chimpo 157 1 56.44 CCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCAGAATGTCCTGATAGGCGGCCGTCAAGGGTTGCTGCACTGGCGCTTTGTACACATAGTTCTCGCCCTAAAACA:1 + chr3R 21132931 3' + copia 4992 2 76.24 CGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCGCGTGTCTCTCTCTGCGCGAGTATGCGTGCCTGTGTGGGTGTGCGTGCTTCAATAAT:1 + chrX 2634785 3' - 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chr3R 7079750 3' + INE-1 156 1 74.26 ATAACGGAGTTTTAATGGTATGGGGCAGGCGTATCGTAGACGGGTTGAGGCAACGCTCGGCCTGGGACCACCTATCCCGACCACTGACTCCACTATCCCTT:1 + chr2R 4584500 3' - G-element 4013 1 82.18 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACACCCATCCGCATTGTTTGCGCCAAAGAAGCAAAAAATGTAATTAAGCTCTCAGCACTGATAGATAAA:1 - chr3R 6097572 3' - roo 10 2 68.32 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGC:1 + chrX 13640279 3' + P-element 2830 1 20.62 TGAGCACTGCACCCATATCGCCTTAGATAACATAAATCTACCTTACAATTTTCTCAAAATAAAACTAGTTTAAACCCTGAAACTGTTTGAAGCCAACCCAA:1 - chr3L 15428930 3' - roo 8776 2 43.56 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGA:1 - chrX 10196107 3' - 297 6619 2 73.91 CTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTACAACCAAGGCACATAGGTTGGGAAAGTCCGGCTTGGGCTCAG:1 + chr3L 14558332 3' + 297 369 2 59.41 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCAATCTTCTAAACAGGATAAATGTAATTGCGCATGAATTTCTACGCATATTT:1 + chr3R 17557452 3' - mdg1 24 2 57.43 GCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGCAATAGCTGTCTTTGTATTTTGTATTGCCGTGTTGCAATTTATGTTGGTGTTGCCGCTTGTG:1 - chrX 12885681 3' - transib2 9 1 69.07 AGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATTTACGAATTCAGACCGAAAGTTTAATAAAAACAAGAACACAGTTGTGGTTTTTTATGTTAATACAT:1 - chr3R 935406 3' - HMS-Beagle 6799 2 76.24 GAACACACACACACACACACAGGGAAACAAAAGCGTGTGTTAGGAGGGTGTGCACACCCTCCCACCACACGTGTGGTGGGAATGAAACTCGAGTGAGACAC:1 + chr3L 939415 3' + accord 7029 3 74.26 AAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTTTCATTTCTCGCTTTATTT:1 - chr3L 5267184 3' - Juan 3970 1 78.22 TACCACATCTCCCTCCTTTTTAAAAAATAAAGTAATTTATGGAGGTATTTTTAATTGTTTAATTGATCAGAAATATTAACGTCGTTTTCACTGCTCTGCTG:1 + chrX 13616344 3' - gypsy11 3962 1 66.34 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATTTTCCTCATTACCCGACTTGCATTTTATTTTAATGAACTGTACAAGTCGCGTGTCCTGCGC:1 - chr2L 13868685 3' + roo 396 1 67.33 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCGCGACTTGAAAAATTACATTCAAAATAAACGACAGAG:1 - chr3L 4858984 3' - hobo 40 1 63.37 AAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCATGATAGATTTGTGCCATTTCATAGGAAAACTGAAATCGAACCAAGCTAAATCAAAAAATGAAACCAAAAC:1 + chr3R 10187459 3' + roo 9067 1 74.26 TTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGT:2 + chrX 21945908 3' - F-element 63 1 79.21 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTGTCCTGGTACCGGCTGCTATTTATTTTCATTTTCGTGCATTTATGGCTTTATCTTCTT:1 + chrX 12193545 3' + hobo 2924 1 62.00 GTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGCACGCTTCCCCGGCCATGTTTACGTTTCGTTTATTGTGCGTTTTACGACATCATGTGCGCCATATAA:1 + chr3R 31448376 3' - Tabor 425 2 69.31 CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGGGTATGAAAACTGCAACAAAATACAGTAGCTGCAATACGAGCTGCAACTTT:1 + chrX 21494687 3' + transib2 2798 1 57.43 AATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGAAATCCTACAACTCTTCTTGTTT:1 + chr2R 17402789 3' + invader4 3057 2 56.44 TGATTCTTATAGCCAACAAAGAATTGCAACGGCAATGCTAATATGCTGTGTTTGCCGGCAGCGCTGCTCCTGGATTTAGGCTAATAACCCTTTATACTGTA:1 - chr3L 28092549 3' - Gypsy6A_LTR 133 1 59.41 GTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGCCCCTCTGACCATTAAATACTTTTTAATGCCACT:1 + chr3R 30145154 3' + Quasimodo 2 2 66.34 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTACTTAGAAATTTTCCTGCCTAATTCTGGTACTAATACCATTACCTGGCCGCCCCCAGAAATGCGCTCGTA:1 - chr2L 17213832 3' + hobo 2928 1 66.34 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTGGGTCCCTATTTTTCTCTTTTATACACTTTTAGATGGTGGTTCCCAAGCGTGCAGCATTACTTTT:1 - chr2L 11084316 3' + blood 7382 2 55.45 AGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCCTTCTGCGTCGACGGCTTTCAGTTTGGGGAAATAGAGGGAGTCACACATT:1 + chr3R 5555984 3' + mdg3 221 2 54.46 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGTGTCATCTGTATTTGCTTTTGTTTTGTTTGCCCATCGAATGATCGCACAGCTGTTCA:1 - chr2L 19865808 3' + P-element 2870 1 62.00 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTCGGGTTTATTGTTTTATGGCATTGCTAATA:1 - chr3L 18642253 3' + pogo 2060 1 69.31 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTGCGCTTT:1 + chr3R 19513415 3' - jockey 4692 1 55.45 TGTTTGCCCACCCATTAGTTATTATTAAAGGCGGATATTTATGTGGTCGACACAGGCTGATATTAAATGACTTACCTCAAATCCTTTTTAATAAAATACAC:1 + chr2L 5693626 3' + FB 78 1 80.20 GCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTTTTCGCCACAGAGTCTAGACTTTGGAATTCGGACACTTTGCTTGCGCGTAAA:1 + chr3R 2171109 3' + GATE 8276 2 62.38 CAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTGCACTTATTTATTTTGTATAATAACTCAATAATTTCGAATTGGCAGAC:1 + chr2R 20010162 3' - Ivk 30 1 52.48 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTACATATATATTATTTACTGCCT:1 + chrX 20374554 3' + Bari1 1654 1 77.23 TTGTGAGGTATAAATACCCTGGTTTTTAAAGACTGTTTTACCTACCTTGATAGTTTCTGGTTGGTTCCTATTCTCATTGCTCAAAGCTATACGGTCCTTCA:1 + chr3R 1720834 3' - TAHRE 403 1 74.26 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGGGCTAAAGATCTTATATGCTTTGTTGGTCAAAGGTG:2 - chr3L 21393462 3' + roo 9033 1 64.36 TCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAAATAAAATCACACACTAAGGCGCCAAATTAGCGCGGAGCATACCATTTTTTTCCGCTTGGCTTGG:1 - chr3L 8256065 3' + jockey 4988 1 58.95 ACAAAATAAATTTCAATAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATCCAGCTTGTGACGTGTGAAAAACCGGGCAATTGGTAAGTGCTCGCTGT:1 + chr3L 14514532 3' + 1360 369 1 74.26 AGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTAATCTCGCATAGTCGCATAGTC:1 + chr2L 1346586 3' + 297 6577 1 78.22 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAGAAAGCGCTTTTTGCGCTTTAGCTGCGA:1 + chr3R 8487316 3' - Doc 57 1 72.28 AAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAAGCGAAAGTGAAAGTGATGGCTAGCGGAATGAGAAAGAATGAGTCGATGGGGAAAAAACAAAACA:1 + chrX 9523798 3' + hopper 1407 2 71.29 CGCACACACACACACACATACACACAAATTTTGACGTGCTAAAGGAAGAGGATTAGCTACTCCGAGCGATGTTACAATTCCTTTTCATTAACTTTATTGTT:1 + chr3R 26654099 3' + Quasimodo 36 2 72.28 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGCTAGCAGTCACTA:1 + chr3L 14286061 3' - 412 39 2 63.37 TAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACA:1 - chrX 9816273 3' - BS 5035 1 72.28 TTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCGTAAAAAATACAACTGTCAATTGTAGGATT:1 + chr2R 10978657 3' - hobo 2555 1 76.24 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTCTATGCTGCTCCGGATAACCATGAGCAGTTCCCGACGA:1 + chr2R 22825470 3' - opus 154 4 66.34 GTGAGGTATGTGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATGTATATAATCCCAAAAACTGGGGACAAAAGAGTA:1 + chrX 22664424 3' + opus 7464 2 66.34 GGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTATCACAGCTCCCCGGAGGCATCAATTATGCGCCGATGTCAGAGCGGGAAACTCCTTCTCGGTGGTAGCA:1 - chr2L 12252314 3' - Doc 4472 1 74.26 TTAATTTAAAAAAAAAAATAAATAAATAACATAACATATAGCCATACTATAACATTTTTTTATCTACCATATTTTGTTCAGTGCACATAGCCCACTATGCA:1 - chrX 20861363 3' + transib2 2634 1 33.66 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGTCTGTCGCGCAATAAAACCGCCCAATTGGTGCCGAAATTACG:1 + chr2L 7056413 3' - P-element 32 1 47.52 GGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAAATGCTTTGTTTCACGGCAATGGGAGGGCATAATTGATTGGGGAATGGGTTACCGGTCTAAATGAGCTTAAAGAA:1 + chr2L 1673779 3' - Juan 4026 1 71.29 CTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTCTTCACCACTCCGCGGTCTGGAGGAATTAGCCGCAACAACAAACAATCCCGCCCACTCCAC:1 - chr2L 23506306 3' + Max-element 101 2 57.00 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTATTTTGATAAACCACTGGTTTTTCTTTGATATTTCTTTTCGGTGCAACGCAAAGG:1 - chrX 15227262 3' - roo 19 2 66.34 ACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCAAATATTCCCCTTTCCCATAAAAATGCGACTTTAACTC:1 - chr2L 13091776 3' + Ivk 284 1 63.37 CCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTA:1 - chr3L 5267228 3' - Juan 4014 1 64.36 AAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGGTCCGTTGCCATGGCAGATTAGTATCGTGCTCTATGGGGCACTG:1 - chr3L 5573524 3' + mdg3 215 2 52.48 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTACCATCTTAAATTGTATTTAACCAATTTTCTAGGTTTCATGTCAGA:1 + chr3R 10480423 3' + mdg1 390 2 53.47 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATCCGTTGAGAGGTGTTCAAAGCAAAAGCTCAACATGAATAGTAAA:1 - chr2L 21018789 3' - 412 7083 2 54.46 TTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGT:1 - chr3L 25272561 3' - 1360 76 1 65.35 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCC:1 - chr2L 23372628 3' + 1360 3350 1 69.31 GAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTTATTATCACCGATCCGTTTATGCAGGTCTCATTGCCTTCTGGTGTTTTTACTTCAATTTC:1 + chrX 21668216 3' + mdg1 224 2 69.31 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATAATCAATAAAAATTACAACAAATGTTTCCCTCTTATCCGCATAGCCATAAATATTT:1 - chr3L 5282154 3' + Transpac 5213 2 61.39 GTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTGCACGCAATTACCATGGGCAG:1 + chr2R 6482754 3' - gtwin 6932 2 63.37 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGAGCAGGCGGCTCAAAAGTCGGAATGTGGTATTCGGTTTTAGTTCGAACATCGCTGTAACCGCGT:1 + chr3L 14205422 3' - P-element 4 2 73.68 TATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTCCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAAGACGTGTTTTAATAAATGCATATTTATACAT:1 - chr3R 2247474 3' - invader2 149 2 69.31 CCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCGATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGT:1 + chr3R 10736103 3' - McClintock 42 2 72.28 AAATATTTTCAAATAAAATGGAATATAAAGGTCAACGTATGTTTAATATAGATATCGATACCGTATGCGGTTCGCTCAGTAATCGCTCTCTTACTTCGGCA:1 - chr2R 2516772 3' + transib3 254 1 54.46 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCATGCAACGCCGAAAGCGGCAGAGACAAAGCGAATGGAATGGAAAGCATCTGGAGACGCCT:1 + chr3L 7153973 3' - transib2 14 1 64.36 AAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAAGCATTTCAGCAGGCTCTCCGCAATT:1 + chr3L 14213879 3' + P-element 122 1 27.72 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTTACTATATCCTAACATAGTAGCTGCAAATTATTTATGAAGACACCAAGCGAATGGCATTCATTCATT:1 - chrX 8304017 3' + flea 250 2 62.38 GTTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAATTAATAAAATAACTGAGGAGGAAGCTGCTAATT:1 - chr2L 12888145 3' - 412 7487 2 65.35 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTCCGTTGCGTGAGCTTAGTGTGACCGCAGCACAACTATTTAAATATACCTTAGGCGGCG:1 - chr2R 17005430 3' + P-element 2873 1 73.74 GTATGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTTTATTTGTCCCTTAGCGCTTTTTTTCATTTTTTCATTCATTGTGTTCAATTACTATCAAGTGGTTATGGCTTCT:1 - chr3R 13528711 3' - 297 6510 1 73.27 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCTGGCTTGTGGGAACGAAACATTCCATATATATTACGAAGTGTAATTCATCAAAATTTTC:1 + chr3R 16399019 3' + roo 390 2 56.44 CACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTCAGGAAGAGAGCGGCAGAGCAAACTAG:1 + chrX 3295660 3' + hobo 2889 1 73.27 TGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATATGAGTGATTTATTATTTTTTGCAACTGAACCATTCTTAATACCAACAG:1 + chr3L 17762849 3' + invader3 5435 2 55.45 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATA:2 - chr3L 25884097 3' - Doc 48 1 67.33 ATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAATGCGAAAAAAAACAAAAATTTATTATCAATTCCAAATGG:1 + chr2R 3550648 3' + Doc2-element 4718 1 71.43 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGCTTCTTGTGATTTACAGCTCTTACAT:2 + chr3L 10305371 3' - 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I-element 138 1 66.34 CACACACAAACACATATACACACCAAGAAAGGCAGACTGGTAGTCAGATGACTGTGTGTTGCATGTTGCCCGCCTGCTAATCCTGTCCAGAAGCCAGCGGC:1 - chr3R 21951404 3' + accord 188 2 65.35 GCCATAACCAAAAGGAGAAGAAACTAAAAGAGAGAAGAAAGCAGAAGAAAGCAAACCAGGAGAACACACACACACACGGACAAAAAAAAGGAGGAAGAAAG:1 + chrX 18930979 3' + TAHRE 274 1 63.37 AATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAGGAAGATACGAATACAACTTCCAAATAACTCCCTGCATTCTTGAGATTAATTGGTATCAAGAAAA:1 - chr3L 27863821 3' - rover 4 2 76.00 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGACTGTACAGATTGAGTGCTTGTGTGTGCATAAG:1 + chr2R 9258644 3' + blood 332 2 68.32 TTCCTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTTATAAACAAAGCTGGCCCTTCTATTTTC:1 - chrX 11503459 3' + roo 9045 1 53.47 TACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAACTTATATAATTTATACATATATAAATGATACTTAGTTCTTCATAAGAAAGCTAAATACAGTTAGTAG:1 + chr2R 21249535 3' + gypsy 7425 2 52.48 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAATCTAAAGGCGACCAGCAAACAGGTTCGAAGCGAGAGAGCCAACTAGCCAAATA:1 - chr3L 14205323 3' + P-element 2866 1 58.42 AAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGG:1 - chr2R 982342 3' + rooA 305 2 66.34 AGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACAATAGCGTTGGCAGCAAGCAGCTCCTGCAGAAGAG:1 + chrX 12679113 3' + flea 44 2 65.35 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTTGTAGGTACTTTTCAACGGACCTAGTA:1 - chr3L 223395 3' + P-element 2837 1 29.70 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTGCAACAATTTTCCGAGTGTA:1 + chrX 4278373 3' - blood 7067 2 78.22 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTTCCGTTTAAGGTTATATTTATTCAACTTTTATTGCAGTCGCCGCGTGCGACAAATGAAAATAAACGGA:1 + chrX 18932970 3' - jockey 4768 1 76.24 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGT:2 - chr3L 8044325 3' + mdg1 7416 2 66.34 TGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGCGCTCGCGTCGAGAACATCGTGTCGGGAATGCGATGCAGTCCATCCTCC:1 + chr3R 11374490 3' - hobo 2692 1 60.44 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTTAAATCTCCTCTGTAGCATTGCC:1 + chr3R 25566824 3' - hobo 54 1 78.22 GTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTATAATAGTTGATGTACTGGAGGAAAAACTAAATTAACAAAAATCTAGAGTTTTTTTTCGTGTGACCAGCGATTGCC:1 - chr3R 31680046 3' + jockey 4905 1 73.27 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTAGCCAGCGAACAGCATCTACATATTAACGTTACGGATATTTTCCTACC:1 + chrX 22597233 3' - hopper 28 1 52.48 GAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGAGATTAAATGAAATCTTGAAATAACATTTTAGTTCTTATATATAATCAAGCCAGTAGTTTTGAGTGTTGACCAAA:1 + chr2L 15174199 3' - Juan 4029 1 73.27 TTTATTTTTTTTATTTATTTTAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAAACTCGACTAAAGCATTCTCTTTTGTTTTAATTTCCTTGTCCGCTCACTTGCA:1 - chrX 22637992 3' - F-element 4685 1 76.24 AGCGTCTCTCAAATCTCTTTTTTTTTTATAAATTTT:1 - chr3L 17446184 3' - micropia 405 2 86.11 TGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTATATAACTATATATATAGTAGCATACAAAAAGAATGAAGAAGTTATACAATGATCATGTGTTTTACTTTGT:1 - chr2R 6271538 3' + rover 7289 2 50.50 GGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTACAAGATGTGTGAGCTTCTTGCTC:2 - chrX 4248838 3' - jockey 4657 1 76.24 CGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTAAAGGATTCTTTGGTAACAGCTAGAAATGTGAATGTAACTTAGTGAAGTGAAAACAGATCCAA:1 + chr3L 13378104 3' - mdg3 103 2 64.36 TAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTTGTGGTCTCGCCTATGTTTTCATTTTCCAACTGCCAAGTCGGCATGCCGAGGCAATTCACTTTTC:1 - chr3L 494603 3' - Transpac 4927 2 71.29 GCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTCCATTTATTTGACATCGCCATGTGTGTGGGCGGCTGACTGGGTGGCTG:1 + chrX 5130750 3' - I-element 392 1 52.48 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGCAAACCGTCTAAATGCGATTGGTTTTCGGACATTGGG:1 - chr3R 11936897 3' + roo 9034 1 62.38 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTT:1 + chr3L 24210991 3' - HMS-Beagle2 11 2 65.66 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAATTGTGGTGGAAAACTACAAATATATATATAGTTCGAAGTTAATGGACAACCATAACTGGATTATCCAATAG:1 - chrX 10776121 3' - roo 8669 2 66.34 TTCCCCACACTTGGATGGCGTAGGTCAGTGTTGGACCTAATATGGCCCCGGAGTCCTGGTCCATCTTGACCTGAGGAACAACCAGCGGCTCCATGGC:1 + chr3R 16045537 3' - G5A 2434 1 59.79 AGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTACGGATTGGCATATCGGTTGGAATACATATTTCGCGAACTT:1 + chr3L 5573608 3' - 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pogo 6 1 65.35 AATAAAACTATTAAGTTTATTTGGTAGTTACGTGCCCTTTTATTGGTGTTTCCCGATAAAGATAAGGGTAATATTATGTGGCATTTGTTGTAAAATTTACA:1 + chr2R 13170835 3' + TAHRE 63 1 50.50 CAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCACCCCAGGGGGCACTGGCAACTCGTGCAGAACCGTGAACTGTAAAACAGCATTGCAGCTATTCACTTCTTG:1 + chr3R 2465443 3' + F-element 4322 1 71.29 CAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTTTCAAAAAATAAAGAGATTCTTGGCGAGGCGCTTAGAAAAGCCGTCAATCAACATGTGACGATGAACGGCGCAGCCGAG:1 - chr3R 1994902 3' + X-element 388 1 75.25 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCCATTGTTTGCCATTATCCCGCTAAATGGAAAGAGTTCTGTTAATGCCTTTCGAAAC:1 - chrX 17416895 3' - roo 19 2 58.00 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGCAATTAGCTTAAAGTTCGCTTAGCTTACGGACAATGTTTCAGTCATATACATCTA:1 + chr3R 20183054 3' + roo 9050 2 58.42 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCAGTTTGT:1 + chr3R 23870136 3' + roo 9031 1 64.36 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTATGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCT:1 + chrX 13640284 3' + P-element 2831 1 24.75 TTAATGGGATTTTTTTTTTTATTTGGGGAAACTTTTGAAAATTAAGCCGGTAAATAATGTAGGGTAATTTTGGGATTGATAACTTGTATGTTTATCTTGTT:1 + chrX 13582659 3' - 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roo 40 2 66.34 GTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCGCTGTGTCTAAGTTAGCGCACCTGAAACTGCATACTTAT:1 - chr3L 15452835 3' - accord 1 2 76.24 TCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATACATATGTATATAATATATTCAGCCTAAGATATGATTGTTTGTTGTGGGCGTCGCTGAATATT:1 + chr2L 9672510 3' + 297 6966 2 63.37 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACTGACTCACTATAAACAAGGCAGT:1 + chr3R 15197748 3' + 1360 3335 1 82.18 CAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCCACTTAATCCTAAAAATCAGAAATTAAAATGGGATTGTTAAGTTAAAATGTCAATAGGATCGGTGGCGT:1 + chr2L 13598614 3' - pogo 1795 1 70.30 TTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATGTGTGTGGCACATGCTTTGATTGAGGTATGCCGCACCAACAA:1 - chr2R 18078687 3' - Quasimodo 24 2 56.44 CAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCAAACGAGGATACAAAGTTGTTGCTCTGTACGCTTGAAAAGTTTGCCGTATCCTTTTAGCGTTAACTGTACTTTT:1 - chr2L 9282284 3' + flea 440 1 76.24 CTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGTGTGTGACATTCGATTTGATTGTTTTTGTTTTGAAATGCAATTTTACTTGCAAAGGGCCGAATCAGAT:1 + chr3L 13885549 3' - Doc 123 1 68.82 AAAATAAATGTAAAAACATTGTGTTTAATGCTGGGTCTTAGTGAAGGAAATGCTGGAGGTGCTGGAGGTGCTGGCGAGATGAGCCGATGGTAATCGTGGTT:1 - chr3L 3390460 3' + looper1 1812 1 78.22 GGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCAACTGACAGATTTTCACCTCTGG:1 - chrX 10196060 3' - 297 6581 1 70.30 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGATTTACGCATCAGAAAAGTAACTTTAAATATAGCTAATTC:1 - chr3R 7879831 3' + 1360 3349 1 66.34 TGAAAGCTTCCCTCCCTCGGCCAATCCAGAAGAAGTTGCTCCGTGTTACGTGGATGTGTGGCCTCCTGGGTGTGAGAACCCAATTAAGACGCGCTTATTGC:1 + chr2L 3386331 3' - accord2 20 2 76.24 CAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGAAGTATTTATAAACTGATTAACGCTCGACAATAGCTGATATGGGTCGCCAAGCAAACGGCGAACTTGGGATG:1 + chrX 5554682 3' + Idefix 7090 2 77.08 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACAATTTAAAATTGAATGTAGATATGAATAGAGGATAAACCACA:1 + chr3R 29668686 3' - 412 34 2 60.40 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAATTTCCATGTGATGCGCAATATTTCGTAGCATACT:2 + chrX 5513373 3' - jockey 4801 1 68.32 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGCCCAAAGAGAGCAGGATAGGAGCACGAGGATGCGG:1 - chr3R 28135274 3' + hopper 1376 1 63.37 GCTCTCGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCAACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAACCGTTACTAAAACGTGATCGTCTTTTTTTATGCCCATTTTTTG:1 + chr4 40734 3' - 1360 91 1 55.45 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTGTCTGCTCTGTTTATGTTCTCAA:1 + chr3R 24720038 3' + P-element 2834 1 26.73 CATGCCAGACTGCGCTGACAGAAACTATTTCTGCATCGCTTTATAAATACAGAATAAATACTACTAAAAACAGTGCGGGAAAGTGCTTGTAATTTGAAAA:1 + chr3R 8925182 3' - invader5 3805 2 61.00 CTGCTTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTGTTTTTTACTTCGTTACTTTTGCATTTGTCGCGCTTTATGGCCT:1 + chrX 19809489 3' + INE-1 547 1 76.24 AACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAATATACACAAAGTGCTAACTAAAAAAAAAATTAACTTTATCCTCT:1 - chr2R 17942058 3' + mdg3 245 2 75.25 AAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAATTCATTCGGAACCACAGTAAGCTGTTCTTATGTAATTTAAGTCCGAAATTACAAGAACAGATAGAAGACAT:1 + chr2R 3141412 3' + Transpac 354 1 77.23 TATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAGATGTAAAAAAGA:1 + chr2R 2868552 3' + Rt1b 4724 1 49.50 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTTCACTTTCGGCCCCGAAAAAGTATGCTTTAGAAATT:1 - chrX 9523708 3' - 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chr3L 24210871 3' + HMS-Beagle2 7195 1 75.25 CACACACACACACATATTTATAGCACGTATACGAATAAAAAGGAAGCAAAGAACCTTTAGAAAAAATAAATGTAACGAAATAAATACATTTTAGTACTCAT:1 - chr2L 14303383 3' + accord 188 2 61.39 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGTGATTATCTTATTAAGTATGGTTTCCACCGAAGTACAGGATA:1 - chr3L 4539154 3' + roo 9041 1 57.43 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCACCCATTCCCCACCCATTTGGCATTGCAAAATTAGTGCAAAGCAGCGCTGCAGACGTC:1 + chr3L 18793082 3' + P-element 2870 1 62.38 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTAAAACATAAATACACATTTAATATGGCGCTTGCTTGCGTGATTTCTTCT:1 - chr2R 9972710 3' - Doc 32 1 52.48 GTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAATTACTGCTGAATGTACATATGTATTGTACG:1 - chr2R 13805695 3' + Ivk 5334 1 73.27 TGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTTATGGCTGGCTAATAGTGACAACAAAAGTACAGATTTAATAAAA:1 + chrX 10298068 3' - Quasimodo 24 2 57.43 TTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTTGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATTGTTTTGTGAGTAAACAGAACTGACC:1 + chrX 7339948 3' - 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chr2L 19572622 3' + P-element 2829 1 21.78 CATACACACACACACACAAACACACACCAATACCAAAGGCAGAGACAATGGAAAAGACGGACGAGAAGAGCGCGGAGGGGCAGAGGAAAAAAGCAAAGGCA:1 + chrX 10814982 3' + Quasimodo 36 2 75.25 TCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACTCCAG:1 - chr2R 4577073 3' + Chouto 492 1 53.47 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCAGGAATGGGTTTTTTCTGAGGAAAGACGGACACTACGGTGATTGTATGCCCAGCCT:2 + chr3R 11153639 3' - 1360 16 1 63.37 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGTACCTAATCTGGATGTCAAGGAAAGGAGAACTGTACCGCGGAAGTATAAACCA:1 - chr3L 14285990 3' + 412 470 2 56.44 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGTGACCCTAATCCGCATTGACATGTCGCTCAAATTAGATAATAAAGTTGTCCCCGCCT:1 + chr3R 30263633 3' - roo 8682 2 59.41 AATTCATCCATATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTGTTTACAGTCATTGCTACAA:1 + chr3R 28135314 3' - hopper 54 1 75.25 TTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCCATGCATCTTTTGCTGTGGCAGCAAGGCGGTGGGTTGGGATACTAATAAATTTATTACATCCCCA:1 - chr3R 17980719 3' - HMS-Beagle 7 2 62.00 AGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACT:1 + chr3R 1977615 3' + micropia 5405 2 58.00 CCCTTATCAGCAAAGTCTTGATCACAAAATCACACGCATAATATCTAATCACCATTGGCTATAAAATCAGAATTAGCTATGATAAGCAACGATTATGATCC:1 - chr2R 15024115 3' + I-element 74 1 80.20 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATT:1 + chr2R 22746091 3' + hobo 2924 1 52.63 TGACGTCCAAAGCACTGTATAAATGCCAGAACTTCATTGTGGGAATTGTCATCATTAGTACATCTAAGAGTATTCTTGAGTAAGGGTGCCATGAAAGCTTT:1 - chr2L 11696894 3' - baggins 5351 1 43.56 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTT:2 - chr3L 10576807 3' + roo 9020 2 78.22 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTCAGTGATATGATATTGCTGCAAGCGCCACCCCTAAATTACGATGT:1 - chr3R 19966820 3' + hopper 1387 1 52.48 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCCG:1 - chr3R 4546036 3' - jockey 4780 1 56.44 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCCCCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAACGCAATGGAGTGTGGCAACATT:1 - chrX 10196094 3' - 297 6615 2 61.39 GCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGCATTTTTCTTGTTTTTAACTAATGTCGCGGATCGATAATTGTAATCG:1 + chr3L 24402220 3' + INE-1 534 1 60.40 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACGTACATACACATATATATATATTCTTTTTTTTCGCTGTGTTCTGTTGTCAGCTGCCAACTATTTG:1 - chr2L 9854102 3' - hobo 12 1 65.35 CTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATAGATGTGAAGATCTCAGGAACTTTAAAAGCTAGAAGCTTGATATTCAGCATACAATGTCCTATAACAACTTTTGGCT:1 + chr3R 3626748 3' + INE-1 117 1 79.21 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGCAATAGCTGTCTTTGTATTTTGTATTGCCGTGTTGCAATTTATGTTGGTGTTG:1 - chrX 12885690 3' - transib2 22 1 57.43 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACT:3 + chrX 21945930 3' - F-element 41 1 57.43 GAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGAC:1 - chr3L 26852652 3' - 1360 50 1 69.31 TAGTCGAAGAGTGTGAAAAGATCCCGTTTGAATATGACCCGCAAAAACAAAGCCAAACTTTTTAATCAGGCAAAGTTGAAGCGAATGTAAATGAGCAATAA:1 - chr2R 9951892 3' + S-element 1326 1 62.38 GGGTTGGGTTGGGTTTGGTTTGTTTCAGTTTCAGTTTCTGGTGGCGTGTCTGTGGTGGTGGCTGTGTCTGACTGTGTGCTGGGTGGTGCTGGTGATGGTGG:1 - chr2R 7695024 3' - G2 103 1 79.21 GGACCACCTTATGTTGTTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACAGGGAAAACAAGGGAAAAGCACGAAAAAT:1 + chrX 19887167 3' - P-element 5 2 75.00 GCCCACCAAGAAGGCTCCACAGAAGACAGCTGAAGGACCTTATCATACGGCCCCCCTTGTTCCCCCATTGTTGATTCTTTTTTATATGCATATTTGAGCAG:1 - chr2L 18871218 3' + BS3 1545 1 58.42 TCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTGCGTCTATGGGATGCGTAGCATACTTTTTGGCTATGGG:1 - chr3L 19437202 3' - jockey 4681 1 65.35 GTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGATCAATCAGCGCTGAACAAAAAG:1 + chr3R 15924682 3' - Quasimodo 21 2 59.41 TGGACAATAATTAAATTTTATGGAGGGAAACAGTAACATTTCCCTGCACTTCCTTTTGCTATATCAATTTTCCCCTTTGCTTCAATCAATTTATGACCTGC:1 + chr3L 3537652 3' - G2 3021 1 68.32 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTACAACACTATAGTATTCGTTATTTACAAAGAACGACTGCAGTTCTCGTTACTCGCTACTAG:1 - chr3R 21587220 3' + pogo 2090 1 64.36 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACACTCACTCACTTATCTCAGATGCTGTATTTG:1 - chrX 9649918 3' - blood 48 2 75.25 GTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTCTCTGCCCGTCAGCAGCTGCTGGTACTGATTCCCCCGCCACTGCGGTTATCATTGCGCAATAA:1 + chr3R 22513755 3' - Quasimodo 6 2 73.27 TCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGTGGGGTGATTCTATCTCTCTTAGTTTGCCCGGGTGTTTTGAAGTTTGGAATAGAAATAATTGTTGCACTGTTTTC:1 - chr3L 6869246 3' + roo 9071 1 79.00 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATTCTTAACGATATTTTCACTAAATGGCTATAAAACAGATATCAAGCT:1 - chr2L 10104266 3' + roo 9042 1 53.47 TGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTT:1 + chr3L 24210992 3' - HMS-Beagle2 12 2 65.35 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATTTGTATACGCGTAATAACTTGATTCCAAGCTC:1 + chr2R 11394179 3' + pogo 2064 1 67.33 CGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTCAGGGGTAGCTCCAACTGATCCAGATTCCTGGAGACTTCAACCAAACAGCGGGTGACCAGCTG:1 - chr2R 22825988 3' + opus 7073 4 63.37 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATGTTTATGGCTATTAATCAAAATGTATTTGCTGCCGGCAAATTGATTAACATTTTCCGAGTGTTGTAT:2 + chr3L 12258287 3' + roo 400 1 69.31 ATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGC:1 - chr3L 24210919 3' + HMS-Beagle2 264 2 71.29 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGTCATAAATGGGGGCACAAAGTGGAAAGTCGGAAAGGAAGTTGACCTCCGACAATCGTGTTTCTCTTTTATAT:1 + chr3R 21198701 3' - Tirant 8111 2 77.23 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTGAAACAAACGTTTTTGTTTCACACACACAGGGCACAAAGGGA:1 - chr2L 3842836 3' + roo 9038 1 60.40 ATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTGTTTAAATCGAGCAGTATGTTTATATGTTCTCCGAGAGCTTCGGGCGGGCAGG:1 - chr3R 20266338 3' - G5 4794 1 58.42 TAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAGGAAGATACGAATACAACTTCCAAATAACTCCCTGCATTCTTGAGA:1 - chr3L 27863840 3' - rover 24 2 56.44 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCATCTTGGC:1 + chrX 19034196 3' + hopper 1397 1 61.39 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCCTGATCTTCTCAATCCTCGAGAATTGGCTCCCAGC:1 + chr3L 12025654 3' - blood 43 2 67.33 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTCGCCTCTGCCTTTCTTGTTGTGCCAT:1 - chr3R 28326446 3' - P-element 50 1 30.69 TGCATTACAATTATTACATGGTATTCAGAATGCGTGTAGTTCCATTACTTTCGGCAAACAAGCATACATACTTTCTATTTGCCTATTTATTCACAATTGAT:1 + chr3R 20240977 3' + Tabor 489 1 68.32 GCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCATTGTAGCGCTTCGCTTTTCATATTGCCGCTCATAGAAGCATAAACCTA:1 - chrX 2764837 3' - FB 29 1 53.47 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGGGCATAACAACAACTGGTTTTACAACGCAACATAAAAAAAGGATACAGTGAAGCTTCGACTGTC:1 + chr3R 28326516 3' + P-element 2877 2 69.31 TTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTAAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTTGAATAGCGGATTCACACACCATTTTCGTTTGCATTGCTTATTTAGATAGA:1 + chr3L 9169508 3' - Idefix 7056 2 54.46 GAGGCATCACAACTATTCATGTACATACATATGTATGTATGTGGTACACGAAACTCGCCATGCAAATGAATGTTTTGAGAAGCGCAGAGAAAGGCATTTCA:1 + chrX 18975673 3' + diver 227 1 44.55 AGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTGGGCGCTCAACTACTACCAACCTAGCTACTCTTCCCTTGCGC:1 - chr2R 4138377 3' + G2 2791 1 58.42 TACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAATGAAAACCCCACAGTTGACATGAACATATCTATACCGTATACTACCAATATACCGCAT:1 - chrX 20799264 3' + I-element 229 1 57.43 ACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAACATGGCAACATAAAGCTAACAATA:1 - chrX 157224 3' - I-element 42 1 65.00 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACGATTGGTG:1 - chrX 157198 3' - I-element 17 1 60.40 AGATAAAATGACCAATTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGTTA:1 + chr3L 15353570 3' + mdg1 7409 2 74.26 GACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACCAATTCTGGACCATAGTGCCCTGGCGGGAATGTGGCAACTAATTGGTGGCATTC:1 - chrX 21494624 3' - transib2 42 1 65.66 TGTTAGTCTTAAATTCCAATGTTTCTTGTTAAAAAATCTCTAATCAAATTATCCGCATTATCTGCAATCGAGTCGACCAAGCCGAGGAAAACTTTTAACC:1 - chr3L 3424458 3' + TAHRE 10148 1 68.00 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACTGTCATTCTGTTGACAGGCTAGGTAGCCCACGCTCAGACACTGACACATACTGG:1 - chr3L 13644597 3' + hobo 2922 1 60.42 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCATTGTAAATTTGGCTTAGTGTG:1 + chrX 3465611 3' - hopper 54 1 94.06 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGTTGGCGGTGATTTACC:1 - chrX 3446499 3' - I-element 8 1 69.31 CATACTTTTCAACGAATCTAGTAAACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATGAAGAATGAAGAAGGAAAAATAAGGGACGCAAATAGAGCGAGGGAAATG:1 + chrX 5256763 3' - INE-1 11 1 77.23 TCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGCATATATTCATACTTTTATGACACGTTCTCCGGAAAATGTGTAACACAAAATAGTCATGGCTAACACG:1 + chr3L 7563561 3' - FB 10 1 67.33 AAACCCATAAATTCCAATAATTTAGATTCAGTTAGCATAACTGTGACAAATGCGAACTGAATCTAAATTATTGGAATTTATGGGTTTGAAAATTTAAAATG:1 - chr2L 8560214 3' + HeT-A 5961 1 67.33 AGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCAGACACAGACACACTTACAGGACCACCCATACACGTTCAGTTAC:1 + chr2R 9521967 3' + Porto1 236 1 57.43 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCTTGATATATGGAACAGTATTTAGTGGATGCAATAAACAT:1 - chr3R 22494702 3' + 1360 3356 1 63.37 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGAGTTCGTTGAGTGGAAAACCGCAGCCCACTGCGACATATGTTTTGGCCG:1 - chr3R 16398931 3' - roo 26 2 51.49 GCGGCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAA:2 + chr3R 435926 3' + 1360 2997 1 64.36 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTAAAACATAAATACACATTTAATATGGCGCTTGCTTGCGTGAT:1 - chr2R 9972717 3' - Doc 39 1 56.44 TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATAATTGAACAATGAACTCGAGTCTTGTCTGGTTCATTCGAGTGCGTCGAGAGCCTTTTGTTCTCGTTTCGAAGG:1 + chr3L 1259919 3' + mdg3 5496 2 78.22 AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGTTGTCCCCGCTGAAAAAGATACAAAGATACA:1 + chrX 17492981 3' + Tirant 8497 2 70.30 CTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAATCGGTTATTGGGGCGTTTGAAAGGGGCTCGAAAGGTTTG:1 + chr3L 15706937 3' + I-element 5318 1 61.39 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTACATATATGCAAAACCAGAGAATGTAAT:1 - chr2L 10029102 3' + 297 6929 2 80.20 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCACCATCGTTGCAATCGCATCACATCGCATCGCTGCCGTCTTTGTTGCCTACTTTTG:1 - chr3R 12949439 3' - jockey 28 1 58.42 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTTATGGCTGGCTAATAGTGACAACAAAAGTACAGATTTAATA:1 + chrX 10298065 3' - Quasimodo 27 2 60.40 GACAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCCATAACCCCAACTACGCACATAAATCAGCT:1 + chrX 13890350 3' + I-element 4907 1 68.32 GGGGGAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCAACCAATCTATACACTCACCTCTTTCAGACTCAGATACGCGACGACTATTGCAATCTGAGTCTGAAAGAGGTGA:1 + chr3L 7351710 3' - X-element 4685 1 43.56 CAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGT:1 - chr3R 178127 3' - BS 44 1 73.47 TTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTTGTGCTATTTTATGCACTAAATAAACCAGTTAATAGCATTGCTGCTATAATGAACCAGGTTAT:1 + chr2R 8479727 3' - flea 9 2 71.29 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATCGTCGAGCAATGCAAAGCCGACAATTGAGATTACGGAGTGGCAGCTCGAGTTGCTCGGGATTCAGCT:1 - chr3R 30263524 3' + roo 403 1 73.27 GAGAGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTA:4 + chr3R 1977613 3' + micropia 5402 2 59.41 ACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCACCCACCCACCTCTGCGCAACTCCGCGTTATGGGCTGAATATATGAACGCACC:1 - chr3L 21921535 3' + F-element 287 1 57.43 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAAAAATACCTTTAATATTATATGTTCCTAGATGGCATTGTATGTAGCACTTTTCAGATAGCTTAGCTAG:1 - chrX 17388649 3' + flea 5009 2 70.00 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATT:2 - chr2L 13598194 3' - pogo 38 1 64.36 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATATGCATGAGATTAATGCATATAACTACGAAGTTCTTGTGGGTAATAGTTATTTTT:1 - chrX 905823 3' + I-element 5335 1 45.54 GAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTACTCGGCTCTCGATTTTTTCGTTTGCTGGATCGGTGTTATTTCCCGACAACGGAGAGAGGGGACATG:1 + chr3R 2891748 3' + 1360 12 1 73.27 AAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCT:1 + chr2R 2875215 3' + TLD2_LTR 126 1 76.24 AGTGGGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGAGTTAGAGGGGGGCGGCATGGGTGAGAGATGAATGCACTTGACAAAGCAACGCCTGCCTGCCTT:1 + chr3R 11389829 3' + hobo 2932 1 66.34 CCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGGAACTGGAAATGGAACTGGATACGGATGTTCTCTAGTGGGCGGCAAT:1 + chr2L 15151943 3' - Tabor 29 2 50.50 TGAGTTGAAGAGACTGCTGCGGTTGTTGTTGTTGCCGATGCACTTGCTACCTTTAGTTCATTTACTGTAAGGTATGTAGAAAAATATTTGTTTTTTTTTAT:1 - chr2R 4369476 3' - Doc4-element 329 1 63.37 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATACATATATTTTAATACATTTTAACGAAAACGTTCGTTTCTGTTAAGCATAAGTAATACATA:1 - chr3R 6104351 3' + pogo 2089 1 67.33 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTG:1 - chr3L 19437239 3' - jockey 4718 1 73.27 GAGGGATGCAAACGAACAAGACACGGCAACCTGTTAATAAAAACCAAAAGACCCCTAAAAACATTTATGGGATTAAGTACAATTAATTGGGGTTGGCCAAT:1 - chr3R 20795395 3' + I-element 352 1 49.50 CTCTCTAGCTTTATAATTTGACTTTATGCCAAACAAAAAAGGAAATCTGGGGCAGGATGTATCGTCCAGGGGTTGAGGCAACGCTCGGCCCACCTTTGCCG:1 - chr3R 1143833 3' + transib3 2827 1 60.40 AAAGGTTGAAGTCCACCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCAACAACCGCAAATTGTGGCTCCAGCAAAACAACCCATAATCCTACAAC:1 + chr2L 198684 3' + Max-element 221 2 56.44 AAGAAAATATAAATTATAAATTACAACATTGCCAGTAGCCACAATCTGACATATTGGAATGTCAAACTAATGAGGTTTCCAAACCAAAACGTACTTACCCC:1 - chr2L 15194671 3' + copia 249 1 72.28 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTTCTTATGATCGAAAGTTGATATAATTTTCAATAAAACCTATTTT:1 - chr3R 18144459 3' + blood 346 2 57.43 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGTACCTAATCTGGATGTCAAGGAAAGGAGAACTGTACCGCGGAAGTATAAACCAGAAACAT:2 - chr3L 14285983 3' + 412 477 2 63.37 TCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGCTATTTATAAGCATACAGTAAGTTTCTTGATTGCCAAACCCATTGTAAATATAAATTATTATTT:1 - chr3R 30564796 3' - mdg1 7415 2 66.00 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGAT:1 - chrX 3446532 3' - I-element 41 1 70.30 ACGGATATAAAAACCTGCGATTACAGAAAATAAAATTAAAAAAAAAAACTTAGGG:1 - chr3L 25255914 3' + Burdock 285 1 67.27 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCAAACGTACATATATGTACGTTTGTGTTTGCTTCTCGG:1 + chr3L 17257229 3' - Doc 49 1 69.00 CCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATAT:1 + chr3L 11257375 3' + 1360 7 2 47.52 ATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCGATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGAT:4 - chr2R 1751255 3' + INE-1 82 1 97.03 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCCGTTGGAGTTCGGGCTGGTGCTCCCAGTCAAGCCGCGCGACTCTTTCGCATCGGT:1 - chr3L 17421484 3' - P-element 18 1 61.39 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTA:1 - chrX 157230 3' - I-element 49 1 72.28 AAGTGTTGTTGTTAATTTGTTTGGCTGTGGCGCGCATTTTTCACACACTACTAAACAGGGGGAAAATGAAAATTGCAAAAACAAGAAAATTAAGTGACAGC:1 + chrX 9455585 3' - Penelope 630 1 71.29 AATTTTAATATTTTTTCTCATTTTATTCGATATCCCAGAATAATGATGAAATTTTACGTTCACAAGTGTGATCACTATAAAACTGTAGGTGTTTGAGCTGA:1 + chr2L 23025923 3' + INE-1 469 1 60.40 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACCAGCTCTCTCACAAACACAATCTAAAGTCGCAACTGTTTTTAAAGACCA:1 - chr2R 6501145 3' - P-element 23 1 56.44 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCGCAACCATCGCGACGCGCTCTGGTTTTTCCTATTAGCGGCGCCCAAATGT:1 - chr3R 13623642 3' - jockey 32 1 51.49 AAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGCAATAGCTGTCTTTGTATTTTGTATTGCCGTGTTGCAATTTATGTTGGTGTTGCCGCTTGTGTCTGTTGCATT:1 - chrX 12885670 3' - transib2 2 1 77.23 TTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTTTTAAGAAGGTCTAGAGCGTGCGAATGTGTAGATTTGCATTGGTATTGGTATCTGTATCCGTGTGCTTGCGATTCTT:1 - chrX 13960902 3' - I-element 5126 1 63.37 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTG:1 - chrX 3446518 3' - I-element 22 1 54.17 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTA:1 + chr3R 19513393 3' - jockey 4713 1 72.00 CCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAACACGAAGATTATTAAATAAAGTGTTAGGATTGTAGAATATTTAGCGAATTAT:1 - chr3R 15565186 3' - Max-element 25 2 54.00 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTGTATTTAATGAAATTTTATTCGTAGC:2 - chr2L 12888826 3' + 412 7496 2 81.19 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCGGGCGTGGCCTGGCAACTCGTTTTTGACTTTGAATTTCGCCACGCAAA:1 + chr2L 8299882 3' - Transpac 4944 2 54.46 GTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGTTAACATGAAAATCTAAAGGTCTGCCGGCGGCCACAGGCCAGAAAAGAACAACTCGAGATTTTTG:1 - chr3R 17615912 3' - HMS-Beagle 8 2 71.29 ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAAACAAACAAAATGTAACAACGGAGCACAAAACACA:1 - chr3L 10576766 3' + roo 9061 1 64.36 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAAATATACAATTAACTCCTTAAATAGCAAATGATTAAAGAAA:2 - chr2R 11835618 3' - I-element 38 1 62.38 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCCCCAATTAAATTCAAATAGTTTTTTCCTCACTGCCA:1 - chr2R 3521989 3' - copia 4911 2 69.31 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCA:1 - chr3R 11080707 3' - I-element 47 1 72.00 GACTTAGCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGTTGGCGGTGATTT:1 - chrX 3446502 3' - I-element 11 1 66.34 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAAT:2 + chr2R 17348595 3' - jockey 58 1 78.22 CCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAGATGACCCATTTGTAAAGTGCAAAAAGTTGTAAAGTTTTAAATAAAAAGTTTGTGAAATTTCGCAAG:1 - chrX 22426150 3' + 1731 305 1 71.29 ATGTATCTGTGTGTGTGTGGAAGTGCTCGTGCCATTTCAAAAGTGTTATTTGTTGCTTTGACCGTAGAGAAAAGTGAAAGAGAATCAAAAGGGGCGAGTCG:1 + chr2L 13112700 3' - Quasimodo 37 2 76.24 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTAGCGTACACTGCATATATCCACTTTGTAGG:1 + chr2L 479377 3' + P-element 2841 1 31.68 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTATGGCGACACTGTCGATACAGATACAGATACAAACATCTGAAAG:1 - chr2R 22761551 3' + blood 339 2 63.37 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGTATGAGCAATATAATTCTCTTTTAGAATGGC:1 - chr2R 23514445 3' - I-element 47 1 67.33 ATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTCATAATAAGGACACGCCAATCAAATGAA:1 + chr3L 26002852 3' - roo 9067 1 69.31 TTTAATAAAATTAAACGCGCTTCGTCGGCAAAAAACTCTCACGCGCAAATTTAATTAAATTCGCCTTTCAAGTTGAACAATTAAAAGTTAAAATTGTATTC:1 - chr2R 8557307 3' + TAHRE 82 1 69.31 CGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGG:1 + chr3R 15790075 3' - flea 4733 1 57.58 GGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGC:1 - chr3R 11080714 3' - I-element 55 1 77.23 ATGAAATGCTTCGTGCTGTGTGGCCGGGTGTTTTTAATATACTGAAAGGAATTGGCAAGACAAACAGTAAAACGTAGAAAAATAAACACATTTTTCAAACG:1 - chr3R 10189439 3' - Doc3-element 4620 1 79.21 TTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATG:2 - chrX 10196089 3' - 297 6610 2 60.40 AACAGCAATAATAATAACAATAACAATAACATACCCAATTGAACATACAGTCCCCAATCCACCAGTTCCCCACAACGAGCAACATATGTATGTGCCCCCTC:1 + chr3L 7825089 3' + mdg1 19 4 36.63 ATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATGGTGAGTTTCGTAAATGTTCATAAATTTGTGGGCAATTAACACAGAATTGAAAGAAATACGACTAAA:1 + chr3R 20179549 3' + roo 8703 2 64.36 AAACGAAGACATACATAATAATTTAAACATTGAAACAGTCAACGAAACGTAACGAAACGGAACGGAAGTGAACGCGCGATACCGATTAAAACTGAACGGAA:1 - chrX 5175067 3' + Porto1 4382 1 60.40 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCTGCCTTGCTGTTTTGTTATTGTTTGGTTTTTGCCATAAC:1 + chr2R 6501218 3' + P-element 2853 1 47.52 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTTCAATGCATTCAATGGCGGCCCAGACGCCTCATTAGCGCTGCGATTCGCAAGCCAA:1 + chr3L 20862907 3' + hopper 1398 1 63.37 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAAAATAGACAAGGATAGGCCCAAAAGGACGAAACGCGACCCGCCAGGCGGCACGCCA:1 - chr3R 30326271 3' + pogo 2085 1 64.36 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCAT:1 + chr2R 17348626 3' - jockey 25 1 57.00 CGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGAACTATATGTAGGGGTACTATA:1 + chr3R 1977618 3' + micropia 5408 2 56.00 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGACAAAATGTCCGCGAACGAAAGAGA:1 - chr3R 19513345 3' + jockey 4977 1 48.51 ACACACACACACACACACATATCCATATAAGTAGGTACCAATACCATGCACGTTGCGACTGCCCAGTGGATTCAATTAAGTTCA:1 - chrX 12139340 3' + accord 7029 4 91.67 GGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTATCCATTTCGATCCTTAAACTCACCGGATTGAGTATGTCATCCACATTCGAGCCATACTGCGTCATCTTTGAACTG:1 + chrX 2742591 3' - hobo 2709 1 76.24 CGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATGTATATAATCCCAAAAACTGGGGACAAAAGAGTAGTGGAATGTTTGTGCC:1 + chrX 22664440 3' + opus 477 2 58.42 CTGCTCCCCGGACTCCACGGAGCAGCCAGCGAAGGAAGCCCTTAGGAATGAGGCATGCCAAGGCATGCACAAAAATACAGCATATATCAGGTCATTCTGAA:1 - chr2L 22320681 3' + Gypsy6A_LTR 314 1 62.38 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGTCCAACATGAGCTTATGTATCCGTGCA:1 - chr3R 2556058 3' + 412 7496 2 75.25 GAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAATATCAGAAAACTATAATGAAAAAAATTTATTATGTAGGAAATTATAAAAAAACTATTATTTGGTTTTTGTGGA:1 - chr3L 16956565 3' + invader2 4721 1 46.53 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAACAACAGGCAACACACCCATATTAAAGCCAAAAAAAAAAGGAATCTAAGAAAGGC:1 - chrX 10821645 3' + hopper 1365 1 55.45 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGG:1 + chrX 21668070 3' - Tabor 37 2 60.40 TCATAGTTGGAACTACAATGATTTAAGATTAGGGGTAGTAGTTTCAAGTGAATCTGATGGGAACAGAGAGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAATTTCC:1 - chr2L 3964498 3' - Cr1a 4152 1 64.36 GTTCAGCGACAACGCGAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAACAATGAGGGAGACTAATTTTGTTAAACATAAAATACAGACTACAGACGA:1 + chr2L 23050489 3' + Doc2-element 303 1 57.58 GTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTTAATCCCATACAATGGGAACTGGAACTGGTCGTCCTGCTGTTTCCA:1 - chr3R 13230919 3' - Quasimodo 7040 2 54.46 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCTTTTTGCTGCCCTAAAACAAAGCACCTAGAAATAGAAATCATGGAAAGA:1 - chr3R 13167313 3' + roo 9047 1 52.48 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCG:1 - chr3R 4546047 3' - jockey 4791 1 56.44 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTGTAGATATGTAT:5 - chrX 17492855 3' - Tirant 8108 2 80.20 TTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGAT:1 + chrX 21668072 3' - Tabor 35 2 58.42 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCC:4 - chr3R 11080703 3' - I-element 44 1 68.32 TATTTGGAAATATCTTCGGTTGAGGGGTGCGGGAACTGCTTAACTTGCCACACGTTCTAATCAGTGAATGCAACTGCAAACATTTTGTTTGCCTGCTGCCC:1 - chr3L 3537166 3' - roo 351 2 68.32 CTAACACATATTTATATGTGTTAAAAACCTGTGAACAAGATAAACGAAAGAGTTACAGCGGCGACGCCGACTGCGACGCGGCAGCGCTGCAGCAGC:1 + chrX 19827893 3' + Porto1 113 1 55.21 CAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTCAATACCCGCCTAGAAATATCTGCGCACTGTGAGAAGCCTTGCAGTTTGAATCCTTTGCTCGTCG:1 - chr3L 8904303 3' - diver 69 2 69.31 TAATTTAATTTTTTTTTTTAATAATTTTTCGCTGTTATACGTCAATATATGCACTTTTTTAGTGCACATTGTGGCTTTAATATGCAATCTTGTCTATAATT:1 + chr2R 18759773 3' - pogo 2030 1 78.22 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGT:1 - chrX 3446514 3' - I-element 19 1 56.70 AACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATATATATAAAATCGAGGCAAAAGTTTAGACTACAAAACACCTAC:1 + chr3L 14854762 3' + mdg3 221 2 57.89 CTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTCCTAGCACAAAGAGTGGAAGCATAAGAAGAATTCTCTGCTTTGACAGCTTTCAGACTCT:1 - chr2R 9950675 3' + S-element 1704 1 69.31 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGTGGTATATAAATATTTTTCCTCGCTCGCCTGAAATATAATCAA:1 + chrX 13547241 3' - I-element 34 1 61.39 TCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCAAATACGGTCCAAAAAGGCTGTTTTCT:1 - chr4 302646 3' + 1360 3337 1 75.25 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAGAACCAGGTGTCATCTCCATTTAAGTAATTGAGCGAAAT:1 - chr2R 11394110 3' - 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I-element 5030 1 64.00 CCCACTTACAGCTTATTCAGCGAACGCAATCGAAAATGGTCAGAATAATCACAAAAGCAGAATGGCAAAATGGCAAAAGCACGCAATGACAAAATGGGCGC:1 + chr3R 18705128 3' + Porto1 4309 1 64.36 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGCTTCTTGTGATTTACAGCTCTTACATATCAAGCA:1 + chr3L 10305379 3' - 412 7094 2 64.36 GAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGTGACTTGGCTTAGCTGTTATGTGTGTGTTTAATGCAGCGCGAAATTTGT:1 - chr2L 18417390 3' + roo 491 1 56.44 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAATTTAATATAATTTATAACCAGTATTCGTGAGAATCGCACGAAATGTAATCCCAAAGATATTATTTCAA:1 + chrX 11503558 3' - roo 8671 2 73.27 AACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCCACTTCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCAAAATATTATAAATAATAGCTCAGATAC:1 + chr2L 7365497 3' + Doc2-element 346 1 72.28 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCTGGCACAAGGATAAAACTACACGTACGAGCATTAAATGTGCC:1 - chr2R 14135404 3' + roo 9037 1 58.42 CGCTGTAGCGCTCTCCACTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGTGATAAGCAATGAAAACACATCCGAAAA:1 - chr3L 21463878 3' - 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I-element 13 1 66.34 AGCTGAGTTATGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTAAAGCTTTCCCTCTTGTTTAAGTAAATTAACTTTACTATCATGTCCAGTTAACCCAGGCTAA:1 - chr3R 14576788 3' + INE-1 545 1 76.24 ATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGTTGTCGTGTAAATCGTTTTTTATGCACACGCGCTCTATTT:1 + chr3R 13419602 3' - I-element 4921 1 60.40 AAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGAAATTAAAAATCA:1 + chr2L 3953335 3' + P-element 149 1 20.79 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAATCTTCGCCTTTAAAACCAATCCGTTTTGCAGGCACTTAAAAGGTAA:1 + chr2R 17697307 3' + pogo 2077 1 55.45 CTTCCAGATTTTATAGTTCCTGAGATCGAGACGTTCATACGGACAGACGAACATGGCCACATCGACTCGGTTAGATCAAGAATATATATACTTTATATAG:1 - chr2L 17268903 3' - INE-1 155 1 81.00 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAATAGTTTCTGCATTAATAAATCATTTACTTAATTTTCTTTTTCATATAGACATAAGTACATACAA:1 - chr3R 21581091 3' - roo 13 2 70.30 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTGTTTATTTTTCTTTTGTCTCAAATTAGATTTCATGTCTGGGGTAAAAACTCAGCTGCAAACAACTTC:1 - chrX 20835185 3' - 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chrX 157222 3' - I-element 41 1 64.36 AATAGTTTAGGAGGTGTTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCC:1 - chrX 19034116 3' - hopper 35 1 60.40 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGTATATGTTTCAAAAACATGTCCAGTTTTAAGTTCAGTTTTCTTATA:1 + chr3L 18206818 3' - pogo 27 1 58.42 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTG:2 - chr3L 9190441 3' + 412 473 2 58.42 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTATTTTGATAAACCACTGGTTTTTCTTTGATATTTCTTTTCGGTGCAACGCAAAGGGTTTCGCCTAAAATG:1 - chrX 15227247 3' - roo 8668 2 74.26 TCACCGTGTCAGCACGGTTTTGTGAAACGCAGATCAACAACCACTAACCTCTAGAATCTCAATTTTTTCTTTTAAAGATCATTACTTTACCCATCACATTA:1 + chr3R 4138252 3' + Q-element 199 2 51.49 AAATTAAAATATATTTTAGCATGGCATCATAGCTGGGCATATTTATTATTCATTGTCTCATTGTTAATGAGGATTTAATAATATTGAAGTACTTAATAATT:1 + chrX 3308673 3' + P-element 2603 1 69.31 TAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTG:2 - chr3L 5267210 3' - Juan 3996 1 52.48 GATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATATTTTGGCTCTGTTGATACGAAACGCA:1 - chr3L 17762795 3' - invader3 5237 2 72.28 TTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTTTCTGCTCCTATAAACATTGCATAAACGGA:1 - chr2R 3144041 3' - Transpac 4963 2 70.30 AAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCAATACGCAAAAAGAGATTATACAACAACCTTGACATTGTCTTAATGTCAAATC:1 - chr2L 12489267 3' - pogo 1893 1 54.46 CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCCACTTTAGTTCGAAAAGTGCTCCCAAACAAACCTATTGTTGTTTTCCAAACCCCTTTAAAAAA:1 - chr3R 26853831 3' + copia 241 1 69.31 GTTACGCATCTTTATATTCTAGTGACGGCAGAGTGCGCGCGAGAAGCGAAGCCATAATATTTTGCGAGAATGAGCGATAAACCACTACATCCATTTTTAAG:1 + chr3R 3620776 3' - 1360 9 2 77.23 ATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATGCCAAGGGCAAACACAGTGACAAGCTCGGTGAGCCCGACTTCATATCGAGGCTATGCATTTAATGG:2 + chr3R 6136584 3' + Burdock 246 2 70.30 TCTAGAATTGGGGTTTTTTTAACAATCTTATTCTTTCTGGTCCCTTCATGATCGATTAGATTTAGTGAAGTATTGCCAGTATAAGTGATTTTATTACCCCT:1 - chr3R 23638964 3' - Idefix 6964 2 63.37 TATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGTAA:2 - chr3R 13231153 3' - Quasimodo 38 2 68.32 GAGAAATACGCGTTTTTTTTTATTGAAGAGAGCTTACGCTCGACTTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTT:1 - chr3L 16995277 3' - Doc4-element 59 1 80.20 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAGAGGCGAAATAGCTAGTTTCCAGTTACAGATC:1 + chr3R 5562022 3' - pogo 37 1 64.65 AGTGGGCTTAAAAAGCATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTACTTTCACATTTTTAGGATTTCATTAATGAGTATTTCGGCGGCCGAGGCGTTGCTCAAA:1 + chr3R 13430433 3' - hobo 2468 1 60.40 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTACAGTCTTGGCTGTAACCCAATAAAATCCCTTAAGGCCTCTT:1 - chr2R 14402250 3' + Tabor 7289 2 65.35 AAAGAGGAATCCGCGAGACGCGGCATTGGGTGGCGTGTGACAGGAAAAGGATGCTAAAGAGCATCAGCAGGCAAATGCGGAAAATACATTTTTCCCTCTTC:1 - chr3R 4608959 3' + invader3 5366 2 67.33 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTAATATATTTAATAATTGAAAACCAAAGATTTTTGTAACAATT:1 + chr3R 30562305 3' - mdg1 7066 2 63.37 AAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTAGGATTTAGGTAGGCTGGGTGGCTCAAATTAAATTAAAGCTGTTTAGTTGTAATTGGTCGTTGAGAGGGGTCCAGA:1 + chr3R 26335645 3' - I-element 4998 1 69.31 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATC:1 - chr3R 11151807 3' + mdg3 5481 2 62.38 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTGTTTACAGTCATTGCTACAAATTGACAAATTCGCTGTCGCCTGTGACCCGCTTTGGATACT:1 + chr3R 28135355 3' - hopper 13 1 64.36 GGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACACATGTCCACATTGATGACACTAATGAAACTGCAGTTATAAATTGAATTTTATGCGCGCTAATTGGCGA:1 + chr3R 23173201 3' - Burdock 6140 2 73.27 TTCGCTTAAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACA:1 - chr3L 27356085 3' + Tc3 1659 1 59.41 GGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGTTGTCCCCGCTGAAAAAGATACAAAGATACAGC:2 + chrX 17492983 3' + Tirant 392 2 72.28 GTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTTAAACCTTGCATCCGAAAGGGGAAATAAAGTGATCCCCCGGCAATCGCAG:1 + chr2R 979762 3' + Doc 4390 1 55.45 TTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGACTAAAGTCTAATGGGTTTATACTTTATTTTTTTGTTTG:1 - chr3R 11912108 3' - I-element 81 1 62.38 TTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACAAATGAAATGGCCCAAAGGAGCTGTCAAAT:1 - chrX 5168814 3' + hobo 392 1 62.00 GTCTTCTCATTTAGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCAGTTTGTTACATAATCAGCAGAAATTTCATTTAAAAGCTTGTTTGGC:1 + chr3R 23870176 3' + roo 9070 1 77.23 CGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATGTATATAATCCCAAAAACTGGGGACAAAAGAGTAGTGGAATGTTTGTGCCTCGGAAC:1 + chrX 22664447 3' + opus 7487 2 65.35 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTAATCCAAG:1 - chr3R 3920669 3' - I-element 38 1 67.33 TAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCG:1 - chr3L 26852654 3' - 1360 52 1 70.30 GGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATCGCGCCTTTTGCTGTTTGTTTTTGATGTTGATGTTGATGAATGTCG:1 - chr3L 3884064 3' - I-element 5086 1 56.70 TCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGAGCATTATGGGGGGAAAGGTATATCTTGGATGCGGGAAGAGAAAAGCCGCGTTGAGCTCTAGTTGGTAATGG:1 - chr3R 3859995 3' + 1360 143 1 71.72 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATGTATGCAGAAAAGGCGTTGAGGACGGAAGA:1 - chr2L 12489549 3' + pogo 2062 1 71.29 GTAAATATGTATAAGAAAATTTTAATATTTTTTGTTGACAACTGTTTACTTGTAAGATTTTATTTTTGTCGTACATAATCAGGTTAACAAATTTTAGGTTA:1 + chr3R 31976554 3' - TART-B 10183 1 63.37 GTTGTTATTGTTATTATTATTGTTGTTAAGCAGATTCTTGCTGTTTAGGAGACCGACGTCTACAATGAGCAGCTCAAAACCGATGCCACGTGCAATGGCAA:1 + chrX 5235389 3' - mdg1 24 4 55.45 TATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATCTGATACATTCAATCACACCTCCCACCCTGCCAACTTATGGAAGCTTTTAA:1 - chrX 5983977 3' + accord 46 2 54.46 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTGCAACAATTTTCCGAGTGTAGCCAGGAAGC:1 + chrX 4278383 3' - blood 46 2 68.32 TGAACTAAAATTTGAAATATAATACAGAACAAGTATAATTAAATAAATCCTTTGATTAACACCCCAATTTCTAACTTGATGGATTGGATAAATATAATAGC:1 + chr2R 3194764 3' + Rt1a 345 1 65.35 CTAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGACAGCACTGTAGGAAAAAGGGGGCAATATGATCATATTCCAAATAATATGAATATTGATCATTTTAATTTCA:1 + chr2R 6991358 3' - HB 1329 1 73.27 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGGCGG:1 + chrX 21219489 3' + roo 9038 1 59.60 GAGAGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGGACTATATGTAGGGGTA:1 + chr3R 1977613 3' + micropia 417 2 59.41 CCCTAAAGCCGCCCAAAACTGCCACGCCCACATTACCAAAAATGTGTTGATATTTTTAAACATTTTTAATTGTTTTGTAAATTTCTTTCTTTCTTTCGCCG:1 - chr3R 15117594 3' + INE-1 348 1 59.41 AACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAAAAATACCTTTAATATTATATGTTCCTAGATGGCATTGTATGTAGCACTTTTCAGATAGCTTAGCTAGTC:1 - chrX 17388647 3' + flea 251 2 71.29 ACACACACACACACACACATTCTGGGGCAGTGGCGTACGCAGGGGTGGTGGACAACGGCCAGGCGCAGCCACTTCCTGCTCCTCGGGCGCCTTTTTTAAAG:1 + chrX 1766068 3' + accord 185 2 58.42 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAGAAATGCATATTGAGAACGTGCAAAAG:1 - chr2R 7174828 3' + mdg1 7396 2 72.28 GCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTT:2 + chrX 21945905 3' - F-element 66 1 76.24 TGAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTTCCGTTGTCTGGGACTGACCGAAGACGATGCTGCCGTTTCATTCGCTGTGATAGACAAGAACGG:1 + chrX 7341671 3' - G2 2938 1 66.34 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTTTTTCTGCAGATATTTATTTCTTTAAAAA:1 + chr3R 9199817 3' + roo 9026 1 72.28 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACCCAAAGATGCAATAGAAATATACATGTATTTTTGCAACGCAAAATCTA:1 - chrX 4278325 3' + blood 348 2 52.48 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCCCGACACCCTATTTTTTTAACGACCAACCTTGGTTCTGTAAACTGATTTA:1 - chr3L 21998404 3' - roo 8690 2 55.45 ATGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATACATTTAGTTGCGCGCTCTAATGCAA:1 + chr3L 5267294 3' + Juan 4203 1 65.35 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTAGTTAATTAGACATGAAATATTCCAAA:1 + chr3R 21710609 3' - mdg3 5301 2 71.29 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGTCAATCTAA:1 + chr3R 21587315 3' - pogo 29 1 58.00 TCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTGCTTACCCTCGTCTAGGCACCCAGTTTATGCCAGCATTA:1 - chr3L 25272294 3' + Cr1a 4254 1 61.39 CAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGCTAATAATGTCTGAAAATTCGTAGATTTA:1 + chr3L 920533 3' + mdg3 5453 2 70.30 TTAAACATATACATATGTATGCAGAAGGCATAAAAAAAGATGTGTGACTGAAGCGGTTAATGGATCATATGGTGCTTGTGATAAAGATGTAAACAAGTTAA:1 + chr3L 25200391 3' - Stalker4 7198 4 59.41 ATCCAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGACAAAATGTCCGCGAACGAAAGAGATGGGCTTCAA:1 - chr3R 19513335 3' + jockey 4987 1 58.42 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTG:1 - chr3L 9190458 3' + 412 7509 2 61.39 CCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTCCCGGTGTAACCGCTATCAGTCAGTCGATGAC:1 - chrX 9646018 3' - blood 306 2 61.84 AGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAATATACACAAAGTGC:1 - chr2R 17942086 3' + mdg3 5468 2 55.00 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCAAACGTACATATATGTACGTTTGTGTTTGCTTCTCGGTGTCCTTGGCACAGGCATTG:1 + chr3L 17257249 3' - Doc 30 1 51.49 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACAAATGAA:2 - chrX 5168837 3' - hobo 23 1 56.44 TTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCCTATTTTCCATCTCTCAGCATCCGTT:1 - chr3R 25571614 3' - 297 6522 1 79.21 TGTGAACCGTCCAAGAACCCTACAAGATTTGAAAACCAACATCCAAGAAGAAATTTCCAACATACACACTTGCCGGGCCACCCAGTCGATCATTTGTTTGA:1 - chr3L 751237 3' + mariner2 631 1 72.28 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGAGCAGGCGGCTCAAAAGTCGGAATGTGGTATTCGGTTTTAGTTCGAACATCGCTGTAACCGCGTGCGGATG:1 + chr3L 14205429 3' + P-element 2884 2 76.24 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGAC:1 - chr3R 19513368 3' + jockey 4954 1 71.29 AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTT:2 + chr3L 24210975 3' - HMS-Beagle2 6912 2 59.41 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTTATAAACAAAGCTGGCCCTTCTATTTTC:1 - chrX 11503459 3' + roo 9046 1 54.00 CATATACTTACACACACACACACATACATAAGCGCAGATTGCGGACGATCAATAATGATTATGTATGTATGTGGGCGGTTCTGAAAAAGTCATCCAAGGCA:1 + chr3R 13229855 3' + Quasimodo 30 2 71.29 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGTACTTATAGTTCGTACTATTTTTTAGATTCCTAACTGAGCAAGCTAATTGTTATACAGGCACATTCC:1 + chr2L 20270064 3' + pogo 2094 1 72.28 ACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTT:1 - chr3L 5267219 3' - Juan 4005 1 55.45 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTAATGGTCCACATGTGCAGTGGCAAGTTCAAAAAGGCTTCTC:1 + chrX 21255306 3' - hopper 38 1 77.23 AATAAAACAACAATTTTACTATATAGATACATATGTATATAATATATTCGGCCTAAGATATGATCGTTTGTTGTGGGCGTCGCTGAATATTATAGTTTGGC:1 + chr2L 9672520 3' + 297 395 1 73.27 AAGATCACCTAATCTTGTCGAAATTTTCAACTTATAACTAGCGAGAACGAAAAAAGTGGAAAAAGAGCGACTTAAAAAATAACTATTTACTTAGGACCTAG:1 - chrX 9504837 3' - invader2 4817 1 67.33 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTT:1 + chr2R 17348622 3' - jockey 30 1 52.48 ATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAATGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGTTTCATTACAGTGATGTTCAGAGCCAA:1 + chr2L 1009495 3' - I-element 5026 1 71.29 TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTT:1 + chr3L 24210956 3' - HMS-Beagle2 27 2 68.35 TCGATTCATTTACATACGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTA:1 - chr3R 19450187 3' - 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chr2L 19684620 3' - mdg3 5306 2 78.22 AAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAAGCGAAAGTGAAAGTGATGGCTAGCGGAATGAGAAAGAATGAGTCGATGGGGAAAAAACAAAACAAA:1 + chrX 9523800 3' - hopper 6 2 73.27 TTCAGTCGCCATCATGCGTTGAAATAGTGAGGAGCGTGCCTCTGCCGTTGAGGCATACTTTTCAAACGGATACCTATGAAGTAAAAACTACTGATTCACTT:1 - chr2R 2947490 3' + mariner2 121 1 70.30 ATAATAATAAACAATCTTACATACATATAGCAATTAACTAATATAAATTAAAGCATACGCCCTCTGTTCTCTCCTTTGTATTTTTTCAGAAATGGAGCGTC:1 - chrX 21425173 3' + flea 255 1 80.20 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCGCCGAATCTTGATATCAATATTTTGAAGGAAACTACTTGAAACCAAGCGTAAAGAATATAG:1 - chr3L 7266496 3' - mdg1 7052 2 65.35 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCCCCAATTAAATTCAAATAGTTTTTTC:1 - chr2R 3521999 3' - copia 52 2 79.21 TGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAA:1 + chr3L 24210972 3' - HMS-Beagle2 6907 2 59.14 TATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTG:1 + chr2R 6482734 3' - gtwin 36 2 62.38 TTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTTCGATATATTCCATTGTTATCGGTTGGCAGGCCATCCGAAAAGGGCGGAAGTCGTGGGGGTTGGGCATGGCGCCCCA:1 + chrX 7138165 3' + hopper 322 1 80.20 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATAATTTTTTTTTGTTTGTTGGTCTGATTTCTGTTATTTGTTGGTTTTTGCACTGTCGAAGGGAGAGCG:1 + chr2L 16636257 3' - 297 6582 2 79.21 GTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAG:2 + chr3R 10736112 3' - McClintock 33 2 65.35 TGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATATATATGTGTATATTTTTTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGT:1 - chr3L 14854690 3' - mdg3 5279 2 51.00 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCACCCATTCCCCACCCATTCGGCAATGTCATCGTGCATCGAG:1 - chr3L 18796184 3' - P-element 32 1 27.27 GTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGCATTGCAACTGCTGTTGGTAGCAGCACTGAATCCCTAGCTGTAGCTGTTGTTGGCCTGCG:1 - chr3R 8499394 3' + Tabor 7307 2 62.38 TCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGTTTTCGCAGCACGCTCAATTT:1 + chr2R 1725964 3' - Doc 10 1 75.25 CGTTACTTAGCTAGTGCGAATGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTG:1 - chrX 15408750 3' - INE-1 535 1 82.18 TTTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTACCCTCCTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTTTTGTTTGGTGTTGTTGTTTTT:1 + chr3R 23295169 3' + Cr1a 168 1 83.17 AGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGTATTCAGAATGCGTGTAGTTCCATTACTTTCGGCAAACAAGCATACATACTTTCTATTTGCCTATTTA:1 + chr3R 20240965 3' + Tabor 7316 2 56.44 ATACATATACATATATACATATACATAAAAAATATATGTCCTTATTTTGAACTACTTATTGAGCAGTACTGCACCCACTGTACGAACACAAGTTTCCGAAT:1 + chr2L 12250136 3' - G3 4507 1 73.27 TGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGAAAACGTTGGCTGTTGTTGAATAAACTCAATCCAAGCATTAAATTACTGCCAATGGCGCCAATAAGCAC:1 + chr2R 17349201 3' + jockey 308 1 72.28 TTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAGGGGAGCCTTGCTAAATGAAGCCCTGACTTTGGAATTGAAATATAAATGGATTAATCGGAGGCCAGAGTGCATTTGA:1 + chr3R 5183365 3' - I-element 5020 1 76.24 AGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTCTTTAAGCCCAGTTTGTTTGCCTGTGATCGGTCCCTACACAATAAACATAAATAAAATAAGGATACAAA:1 + chrX 20806585 3' + INE-1 567 1 73.27 TGGCGCAGCCGGTAGGATGTACTACCACACTATAATCGTTTGTTTCGAAATATGATAAACCACATTGCATGTATACGTACTCGTCGTCAGTGTGGTGATCA:1 - chr2L 23281122 3' + Tirant 419 1 63.37 ACGGACTTGTGATCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTGGCTAGA:1 - chr3L 9190435 3' + 412 479 2 64.36 GTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAATTTAAGAGTTTTAAGAGTTTTCTTCGCGGTGGCGATTGATCTACATCCTTGGGTTTTCTTGGCGG:1 + chr3R 24584000 3' - I-element 492 1 56.25 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTT:2 - chr3R 11080681 3' - I-element 22 1 56.44 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATTTACATAAAAACATAAATATCATATATATAAATTGTGAGCTTCCTTATTTAGCAACC:1 - chr2R 10334722 3' - pogo 14 1 67.33 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCG:2 - chrX 17492889 3' - Tirant 34 2 61.00 AAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGAACTGTTGGGCATCCACTGTGTCAGTTTGGGCGGGAATCGTGGGGTCTATG:1 - chr3L 7515678 3' - I-element 5013 1 54.46 TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAATGAGGCAATCAATTACGGCGA:1 + chr2R 18983703 3' + jockey 4942 1 80.20 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGGTGACTTTCTTCACTCCTGCAAGTTCGTCGCTTTTTGCAAAG:1 + chr2R 15402915 3' + roo 9038 1 58.42 CGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCTTGGGTGTGAGGTGTTCGTGTCTGTGTCTAAACATGTACCCAAGAAAACGCTAGTTCGG:1 - 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FB 6 1 73.27 ACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACCAAATTGTTGGGAGGGTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAG:1 + chrX 22386762 3' - hobo 69 1 52.94 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACT:1 - chr3L 24210906 3' + HMS-Beagle2 277 2 58.42 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACATGTATCTCCCGAAAATTCATTTACTGCCTCGGTTGCCATAAGCAATAATAAATCCATATTTTGCACAGC:1 - chr2L 18300678 3' - Tirant 5 2 76.24 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCA:1 - chrX 10196082 3' - 297 22 2 53.47 CTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAAAAGCCGCGAGTAAATAGCAAAATTTGCGA:1 + chr3R 31678129 3' - jockey 4522 1 71.29 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGAGCTGCTGTCTGCTAGCTGCTCCATTT:1 + chr2R 22746129 3' + hobo 2937 1 77.23 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGCCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTGT:1 - chrX 17492865 3' - Tirant 11 2 68.32 CGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCAAGTCGAGTCTC:1 + chrX 8027518 3' - Juan 7 1 72.28 GAATCTTTAGTTTCTCTTGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATTGTTTTGTGAGTAAACAGAACTGACCTTAACATTATCATAAAGCCCGC:1 - chrX 7339392 3' - G2 2610 1 48.51 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCAGGTTCAGATGAACATATCCTTCTATGGCCGAAAGGCCCTCGACTTAAAGGAAGCTAAAATATAGCCCTT:1 - chr2L 18887336 3' + hopper 1413 2 69.31 TCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATAGCCTGGCTATTGTTTATATTTAATTTTCATTATTCTCGATTGACCTCGTTAATCATTCTAACCATTTGCTATGAA:1 + chrX 3060221 3' - FB 2 1 76.24 CGAGATCTAAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATACAGGTTCTAGAGACATAGACCCAGCGCAAGTTTCTTATAATACAAATCATAATTT:1 + chr3L 19631923 3' + INE-1 147 1 81.19 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAAT:2 + chr3L 12217360 3' + roo 9022 2 71.29 CTTCAAAAAAATATAAATAAGAACTGTGTGTGGAATAATAACGTAAAACTAAAAAAAAA:1 + chr3R 836744 3' + mariner2 787 1 79.66 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAGCATGCATTATTAACTCGACGTTGTCCGGCTATTTCCCTTTTCCTTTCAAAGTCCATTAGAGCGTGCATGTGA:1 + chr3R 26198031 3' - jockey 4759 1 75.51 AACCGAAGATATTTCAAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGCCATAGATTAGCGACCAAGT:1 + chr3R 17529571 3' + roo 9016 2 79.21 AAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGAAGGGCATTTTAATAGACAAGGAAAAAGTTATTATTGTATATCCGCAGGCTTAAG:1 - chr3L 20058950 3' + invader2 4775 1 68.32 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACCAGCTCTCTCACAAACACAATCTAAAGTCGCAACTGTTTTTAAAGACCAAAGAAAGGGAGGGAGC:1 - chr2R 6501129 3' + P-element 2880 2 72.28 CCGTGCAGATGAATTTGGCGCGCAGAACGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGTCATGTCTTTACCTCGTTTAGAGTTAGAAGC:1 - chr3L 26345172 3' - Porto1 414 1 68.32 ACTGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGTTATCATTA:1 + chr3L 15353576 3' + mdg1 377 2 68.32 AAGAGCAAAGACATGAGCACAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGCTAATAATGTCTGAAAA:1 + chr3L 920521 3' + hobo 2602 1 62.38 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTATATAATCATTGCATTTAGAATCATCTGG:1 - chr3R 29668635 3' + 412 7506 2 73.12 AAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATCCATTTACCATAATATTTTCGGATTCCAGAACAGCAAAATTCGTTTCATCT:1 + chr3L 18785760 3' + Bica 136 1 54.46 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTT:1 - 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chr3L 9190454 3' + 412 7513 2 57.43 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTGTTTACAGTCATTGCTACAAATTGACAAATTCGCTGTCGCCTGTCACCCGCTTTGG:1 + chr3R 28135350 3' - hopper 18 1 61.39 GTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTGAAGAGATTTTGGTCACGATGATACGGACATATCTAAAAGTCGTTTTGAAGCAATGATTGCAAGCGAGCAGATA:1 + chr3L 8044412 3' - mdg1 7041 2 74.26 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCCTAGCCATCTGACATTGAATGGTGTTTGTATGTGTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' + hobo 2931 1 68.32 AAAAAAAAAACAAACAATGGAAATAGATATTATTTTCGGGTTTCTTTCTTTTGCGCTGGAAGTAGTCATCATCAGCGTCTGATTCTTCGCATTGGCTTGGC:1 - chrX 12296761 3' + transib2 2642 1 74.26 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTACGGATTGGCATATCGGTTGGAATAC:1 + chr3L 5573593 3' - mdg3 33 2 53.47 AAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGACCCTGCCATTCGCCATTTTTGGTTTCACCTTCGTTGCTTTTTGTTGCTTGTCG:1 - chrX 5128846 3' + Doc2-element 237 4 74.23 AAAATATTTAAAAAAAACAAACTTTAACACAATCATTCAAAAAATAACTTAATTTTCTAAATCTTCGAAATGGCAGTTATATTTTCAAATACGCTGATCT:1 + chr3L 18852954 3' + TART-B 10507 2 49.00 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTTCACTTTCGGCCCCGAAAAAGTATGCTTTAGAAATTATCAAAG:1 - 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HMS-Beagle 6813 2 54.46 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCAGGAATGGGTTTTTTCTGAGGAAAGACGGACACTACG:1 + chr3R 11153620 3' - 1360 35 1 61.39 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGAACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAAAATAGACAAGGATAGGCCC:1 - chr3R 30326307 3' + pogo 2055 1 77.89 TTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATATGTACCTCTAGCCTACTACAAAACTGATTGCAAATTGCATTCTGGGTATGTGCAAAAAGTCTTAAAGAACGAA:1 + chr3R 2216806 3' - invader2 4885 2 48.51 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTAGTCATTAATTAATATGCCCTCAAATGTAAGTCGCTGAAAATGTCTTGCTTTTCATATAATCGAGA:1 + chr3R 13191522 3' - mdg1 7050 2 65.35 GGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTCCGCCGTCCCTTTCGTTTCGAATGCTACTCTCTCTTTCTCTCGCTCCGCATTTCGCAATTTAATTTAATTTTTC:1 - chr2L 19684569 3' - mdg3 5255 1 77.23 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTGGGTGTGGAAGTGGGGCTGGT:1 - chrX 20585968 3' - jockey 61 1 75.25 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGTAGCCCCTCGGGCACTCGAGGATTAAGCGAGCGAGCTACAAGACTGAACACTGA:1 - chrX 21219411 3' - roo 8683 2 61.39 TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGC:1 + chr3L 24210977 3' - HMS-Beagle2 27 2 53.47 TTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTTTAACGATCTATTTATTAATTTAAAATCTGTCCATCTGGACAATAATTACATGTTTGGGCGTTAGATATATACATG:1 - chr3L 25515879 3' + hopper 146 107 77.23 GATACCCGTTACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCAACATCCTATA:1 - chr2L 22092960 3' - INE-1 541 1 56.44 TATACGGGATCCAGATTTGGGGAATTGCAGCCAAATCTAATTATAAACGTATCCAGGTGATGCAAAATCGCGCGACTTTAGAGAAATTATACTTAAACAGA:1 + chr2R 4132267 3' + Helena 1073 1 73.27 TTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTATTTATTAATGAAAAAAGCGATGATCCGAATTTGG:1 + chr3R 3625677 3' - Max-element 8278 2 67.33 GCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCATGAGCGCTGATTTTGCGCCACTTAAACTTTAAACGCAAACCACAAGCCAGGCAAGCGGACACCA:1 + chr2L 9624634 3' - transib2 9 1 70.30 TGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCACAAGAAAGAGAGACGCCTTCGAGAGCCCAGAGCTCGGTCGCACTTTAATTGGCATATCAGGCC:1 - chr3R 25525959 3' - transib2 2726 1 70.30 TTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTAC:1 + chr3R 10736129 3' - McClintock 16 2 62.38 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAG:4 + chr3L 3535446 3' + roo 9037 1 56.44 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGCCACAATAGCTGGTATATTGACACAA:1 + chr3R 30641829 3' + hobo 2889 1 73.27 TGCGTAGAAAAGAGCTGTTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTATATTCTAGTGACGGCAGAGTGCGCGCGAGAAGCGAAGCC:1 + chr3R 3620728 3' - 1360 134 1 70.30 CTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCTATTTCGTTTTGTTTTATGTATATCCTATATCTTATACTGATACTGATACTGAT:1 + chrX 16906085 3' - mdg3 5082 1 54.46 AGGATTAAGGCTGCAGGTGCAAGTTGACGAAGAGTAGTTGGCCGCTGCTTCTCCAATGTATAAAATATGTCTATATATGCGACTTCAACAATGCCTGAAAG:1 - chr2R 4576881 3' - Chouto 6089 1 60.40 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGACAGTATATATAGTATATATACCTAAATTTATACATATGTGTGGGCCCATACGCATACACA:1 + chr3L 13644687 3' - hobo 18 1 61.39 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGACGAGAACTGGTTACTCTCTCTCTCTTTGGTG:1 - chr3R 8133933 3' + roo 9028 1 69.31 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTA:1 + chr3L 24210982 3' - HMS-Beagle2 23 2 56.44 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCATTGTTCCGCCTGAATATCCTTTGATTTTCCCAGGGGCGGCAACTGTTGAGCCGCT:1 - chr2L 16569462 3' - roo 19 2 59.41 TTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAG:3 - chrX 21668027 3' + Tabor 7271 2 75.25 CTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGGTTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAGTTAAGTTAATTCTAAC:1 - chr3L 9148965 3' + Doc 4613 1 67.33 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACTCCATGGCTTCACACATAAATTCGATTGGTTCTCAAAGGGGTAAAACACGC:1 + chr2L 13038765 3' - hobo 26 1 54.46 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTGAAACAAACGTTTTTGTTTCACACACACA:1 - chr2L 3842849 3' + roo 9025 2 73.27 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTGGCTAG:1 - chr3L 9190436 3' + 412 478 2 63.37 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACAAATGAAATGGCCCAAA:2 - chrX 5168827 3' - hobo 13 1 66.34 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTAGGGTGGTAACTCGCTTTGTTGATTAGTTAATTACACAGTTGATTAATATCTTAAATGCAGCCATCTCGTTGACGCATATA:1 + chr2L 13642774 3' - Tirant 13 2 68.32 TATCTGATACCCGTTACTCAGCTCTCGATAGTTTATGACGTAAGAGTGGGCGAGACATCAGAGTACGTAATCATGGAATTATTTTATTGTCTAGATATAGA:1 - chr3R 17120279 3' - INE-1 546 1 59.41 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCTGGCTTGTGGGAACGAAACATTCCATATATATTACGAAGTGTAATTCATCAAAA:1 + chr3R 16399014 3' + roo 9048 2 51.49 AGATTAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGAATAAAAAGAATGCCACGCCAAGCAACAGAGATTAAGA:1 - chrX 16457814 3' + Burdock 150 2 61.62 CGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCACTCGTTCCGCATGTGCAACTACCAAAAA:1 - chr2L 15360018 3' + F-element 289 1 72.28 ATAAATAATGTAAAAGAATTCATCAAGACAACAATTAGGATCAAGCCACAAACGGCTTAGGTTGACGGAAGAGTGCGCGCGAGAAGCGATGCGAAGGCTCG:1 + chr2R 2213998 3' + invader3 5102 1 80.20 TGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTGCTA:3 - chr3L 24210893 3' + HMS-Beagle2 7173 2 57.43 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCCTAGCCATCTGACATTGAATGGTGTTTGTATGTGTCTCTCTCTCTCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' + hobo 2936 1 49.00 TCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATAATCAAGTTGTTAACAATTTCGATGCTTTCGATCATAAAGTGTATACACATGAATT:1 + chr4 716987 3' - INE-1 162 1 76.24 GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACATCCACCCAATCAATTGAAATCCACAA:1 - chr2L 15151887 3' + Tabor 7276 2 70.30 TCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGTCATAAATGGGGGCACAAAGTGGAAAGTCGGA:1 + chr3R 21198661 3' - Tirant 8151 2 66.34 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACACCAACAACAGACAAGTGCACG:2 + chr2L 12888852 3' - 412 57 2 79.21 CCTCTGATATTCTTAACTCGACAAATACATAAAAAATTTTACAATTTGCAACGATAATAAATATAACTGGCATCCAATTAAAACTCCTATTGGGAAGCTAA:1 + chr3L 27864843 3' + micropia 5439 2 82.18 AACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTCATGACTCTTCGACATATATATTTATATACGAGCTCCTTAACTGGCAGCTACTCAGTTAGTGGTGGTA:1 - chr3L 18122297 3' + invader1 3985 2 53.47 CAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGTCCCTTCTGACCACGCCAGGTCCTTGTGTTCCAATGCCTCGATGATCTCTGCGTTGCTCCGTTTTTC:1 - chr3R 2541718 3' + roo 8616 1 69.31 AAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCCAACGCCCGCCAACCAATCAACCAATCAACTGATACTGATACCAAAACCGATACCGATGTGC:1 + chr2R 17353899 3' + 1360 3317 1 66.34 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCCAGTATGGCAGTAAATTCTGTAAAGCGCTCGCGCTAATTTGAGGCTTTATT:1 + chr3R 8499490 3' - Tabor 6866 2 53.47 ACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCACAGGATCAGGGATTCATTAGCCTTCGACAGCGGAGCTAAGGCCAAACTGCTGGCACGTGCCGCACTGTATATGCCCA:1 - chr3L 8959044 3' - 1360 278 1 72.28 ATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTCGATTTTTATATGTTGACTTCATCATCGCTATTTTTTTCCTGCGCGCTTAACCCTACTCGATTTTTTTTGGC:1 - chr3R 4718166 3' + flea 255 1 76.24 TGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAACACGAAGATTATTAAATAAAGTGTTAGGATTGTAGAATATTTAGCGAATT:1 - chr3R 15565188 3' - Max-element 28 2 56.44 ATTTTATTAAATGAAATAAATATACAATGCAAAGACTATTAACATGTGTTAACGTTTAATAATAAAACATATATATACGATTTGCCTAAAATTTTAATTTA:1 - chr2R 12227249 3' + Ivk 5379 1 22.77 AATAGGCATGAACACACACACACAACCAAACTTTGCATAAATTTTCATGCATCCTTCGCGGCATTTAAGCTGTGCGAAAAGCACTGCTTAACCCATTAACT:1 + chr3L 4653635 3' + accord 174 2 81.19 CCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTAACTATT:2 - chr3L 25884058 3' - Doc 9 1 65.35 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACGAGCGTGTATATGAGCTCTGTCAAATGTATCGACCG:1 + chr2L 17311140 3' + S-element 1675 1 70.30 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACGACCCACAACAATCAAAACGATTGAGCCGAAGTCGAAGCCGAAGTCAGCACG:1 + chr2L 19865896 3' + P-element 2864 1 59.00 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGAGCTGCTGT:1 + chr2R 22746111 3' + hobo 2919 1 59.41 CCCATAGTTGGATGCCATACGTCCAGATACGTCCGTCCGAGAGATTCTCGTTGTCATCATCAGAGAAAAGGGATTCACGTGTACATCCTATAGGACAAGCT:1 - chr2R 3335909 3' - G7 858 1 71.29 TTCATACATTTACACATCATANCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGT:1 + chrX 17492951 3' + Tirant 8467 2 67.33 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATCTGTCTTCAATACTTACTTCTCCAGATCGTTTCGAGCCCGTATGATGGTGCGTCCAAAGCGAGT:1 + chr2L 8492992 3' + blood 7380 2 71.29 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATGTACTCCACATTTAACAAATATAC:1 + chrX 5178851 3' - hobo 50 1 77.23 TGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGAAGCAGTGAATAAATCACGAGTCCAGCGGCATTGGATTTGCCAAAGAACGTGGAGTGTTG:1 - chr3R 11098035 3' - I-element 201 1 66.34 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAAAAATCCAGAAGATTTAGAAGTGCACCGGAATAGAATTAGGTACATTTGCATTGACAAAAATTAGT:1 - chr3R 28333492 3' + pogo 2095 1 73.27 TCAAGGAATAAAATAAAAAAAAAAGGGAACTTCTAGGGGCACTTTCC:1 - chr3R 27789332 3' + Osvaldo 1517 1 91.49 TAATTATTTATGCTTTATCCCTTCTATTCGCTTACTCGCACATAAAAAATGGGCGATATTTAACAACTTCAAACGGACAAGGTCACTTGACTCCAAACAGT:1 + chr3R 21159401 3' - Juan 4204 1 60.40 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGG:1 + chr2R 1725925 3' - Doc 49 1 69.31 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGTTATCATTACCTAAGCTAGGAATTACCTACACCTCCGCCCCTTCCAGCA:1 + chr3L 15353616 3' + mdg1 417 2 75.25 TCGACTTTAGCATTCTCTCTTGTTGCTTTTCCTTTCAACGTGCGTAGTTTCCTAGAGAGAGGAAATGAAATATGGCGGAATGGTAAAAATGGCGAACTAG:1 - chr3R 17839576 3' + INE-1 578 1 65.00 CGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAAACAAAAATTTATTATCAATTCCAAATG:1 + chr2R 3550647 3' + Cr1a 4399 1 66.34 CAAGTGATTTCAAAAAGCCACAATGCTTTTGCTTTGGTTAGTATATCTGCGACATCATCATCGTGCATATTTATTCATTTTTTCATTTACACATTTTTAAT:1 + chrX 5567947 3' + frogger 259 1 54.46 ATGTACACAGTTCAGTTCTAATAAAGCATTCACCCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACTAGGCTATTTTTTTCATGGTTTTAGTGGTCGTTCC:1 - chr3L 2528587 3' - frogger 69 1 65.35 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGAGCTGCTGT:1 + chr2R 22746111 3' + hobo 2920 1 60.00 TTCTGGCGCTTGAGCGAAGCATGTCTGTTCTGCTCAACGATCGATCACTAACTGACCCAATCTCTCTTCACAATATCCACCCATGCAAACTCAACAACGA:1 - chr3R 1102244 3' - invader1 3946 2 76.00 ACTTCACCATTAATCATAAAGAAATTGGTGGACTTTGCCTATCCACAGACAAGACAAATCACACAAATTGACAAACGTTTAACATAATTTACACAGCAAAG:1 - chrX 7374873 3' + I-element 298 1 67.33 CCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAATAAGTTTTAAATTTCATGACAAACTGGAAGATCATAGTTAAAAACGCAAACAATTTATCCA:1 + chr2R 1092065 3' + pogo 1926 1 69.31 AAAAATGCATTACAATTATTACAGGCATTGCAACTGCTGTTGGTAGCAGCACTGAATCCCTAGCTGTAGCTGTTGTTGGCCTGCGGTCGCCGTA:1 - chr3R 8499385 3' + Tabor 484 2 76.60 GCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATC:1 + chr3R 15790079 3' - flea 4731 1 56.44 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGAATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCCATATTTC:1 + chr3L 15869732 3' - pogo 24 1 60.40 CAATATGGACGTATGGAATAGCACTCATAAAAAAGAATAAGGCACAAGAAAGCAAACTATTTTCAAACTCTCACACAACTTGGTCAGCCAACA:1 + chrX 18145604 3' + Porto1 4264 1 70.97 AGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTT:2 - chrX 9816286 3' - BS 5048 1 83.17 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTGGGTGTGGAAGTGGGGCTGGTGTGGGCGTGGCAGGACTACGTTTCGAGTTTGGTTTTTGG:1 - chrX 20585929 3' - jockey 21 1 63.37 TGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTT:1 + chr3L 24210992 3' - HMS-Beagle2 7 2 68.75 TTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATTNATTTTTATTTAGTTAGTGTTTTTTGTTTATTTTT:1 + chr2L 18676935 3' - I-element 5019 1 63.64 CGACCCGTTAGATCACCTGAGAACATTGATGCAGTGAGAGCATCTGTGGAATGGTGATCGGATCGGGATGTGGGTTCCGGAACAGAGGAACGCGCCGA:1 - chr2L 22011643 3' + mariner2 338 1 54.08 ATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAATGCGAAAAAAAACAAAAATTTATTATCAATTCCAAATGGTTT:1 + chr2R 3550651 3' + Doc2-element 4718 1 69.31 GTTTTCTGGCTTCTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAACAGGTTGCCGTGTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTGAAAGGGAAGAGATTTATATTTTA:1 - chr3R 13635217 3' - I-element 400 1 76.24 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCACCT:1 - chr3R 19515820 3' + 412 443 2 75.25 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAATGGATAGAAGGAAGTAGAGAAGCCACGGTTCCATGCGAAATA:1 - chr3R 25526340 3' + transib2 2789 1 56.44 TGTTAGAGAGTCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGGAACGGGCCGGCAACAATGGACTTGAAATGAAAATTGGTAAAACGGCCTTTGTTGTTGTGGG:1 - chr2L 16378916 3' - HMS-Beagle 9 2 68.32 TGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTC:4 + chr3R 1977622 3' + micropia 426 2 52.48 CAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAATTCTGTT:2 + chr2R 21020040 3' - Porto1 4624 1 83.17 AAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGAAAAGGGGCAGGGACGGTGAAAAGGGAACAGGGGGCAGATGGCTGTATTTATTTGGATCGGACATACGTA:1 + chr3L 10823166 3' - I-element 5030 1 67.33 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCACCTGGCAGCTGCCAAAATTGCAAAATTGAAAT:1 - chr3L 17110716 3' + hopper 1375 1 65.35 TTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTGTAGATATGTA:3 - chrX 17492856 3' - Tirant 2 2 79.21 ATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGCACTCCGTTAGGGTGTCTCTGTAGCTCCTGCTTGTGGTGACGGTTGGGGATGTCGCGGGAGTTAACAT:1 - chr3R 2891767 3' - 1360 3274 1 67.33 TAAGAGTAATACAATCGCGAGCGGCACGAGAGATGGTAAGGTTCAGAACGGAAGGCGGGAAGTTCAAATACCGAGCTGGTGGAGAGGAGCAGACGGCTGC:1 + chr3R 2451551 3' + G5A 2483 1 78.00 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACAGTTTCGGGGGCAACGTCAAGGCATTCGCACGATCCGAACAGAAACTG:1 - chr3L 5351493 3' + P-element 2868 1 55.32 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAAT:1 - chr3R 4504067 3' + blood 7361 2 55.00 AAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATACATTTAG:1 + chr3L 5267276 3' + Juan 4185 1 55.45 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTA:2 + chr3L 15869709 3' - pogo 47 1 75.25 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTTCTTGCAACTTTCTGCGCTCGCGTCATAATTTCTATGAATTTTATATACTTTGATAAGCATTCCA:1 - chrX 15219346 3' - hobo 11 1 66.34 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAAGACGTCTCCACCCGAAGACTGTGTTATATGTAGTTAATATTTATATTGTTCCGCAGAATGAGTATCAGGAGCTGCG:2 - chr2L 16668599 3' - Doc 41 1 50.50 CAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAATTTCCATGTGATGCGCAATATTTCGTAGCATACTTTCAGGCTCTTAATTGGTGCATTTCCAATGCATTGCAATGC:1 + chrX 5513414 3' - jockey 4760 1 75.25 TATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTATGAGTTCTGGTATGAGTTCG:1 - chr3L 10771213 3' - accord 6925 2 79.21 CTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTGGTTTGAATGTTGATATGATGTCACTCAAATGTCCGCAAGTCAATCCAATTATACAAA:1 - chr2R 25221640 3' - INE-1 566 1 52.48 TAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACATCCACCCAATCAATTGAAATCCACAACGTCATTTAACCACATTAAGCATACGCCCTGTGTGAC:1 - chr2L 15151850 3' + Tabor 7313 2 67.33 CTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACAGAGAGCTGGTGCGCGTAAGAGCTTCCGAAAACATAAAACAGTTGCAGACAGAAAATAAAAGGGGTTTCGATTTA:1 - chr2R 3860931 3' + I-element 4893 1 78.22 ATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGCTGGTCCTAGCTGGCGAAGATGGGGGCACAGATTCTGCAGGAAACCGGAAGCCAGACAAGGACTGCTTGC:1 - chr2R 8277435 3' - F-element 4432 1 72.28 ACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAAGACAATTGAATGGAACACGAGGTCGTGTTAGAATCAC:1 - chr3R 2108546 3' - 1360 3135 1 66.34 GTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGTAGTTAGTAGTATATATGGATTTTCGTTTCTGCCTGCGTGGTGCAT:1 - chr3L 1114148 3' - Tirant 60 2 54.46 TATTGATCCTAATCACGAATATCATCACGAATATACATACTTTATATGGTCGGAATCGAGTAACGGATATAACACTCCAGACTCTATTTTCCCAAAAATCA:1 + chrX 158253 3' - INE-1 84 1 75.25 GGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGTGTTGGAATTAAGGGATGAGAGGCCACGGGCTGCGGACGACTCTGATAAACTGCGTTAGAAG:1 - chr3L 14328245 3' + 297 6560 1 65.35 GGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACCCTTATTTATGTTTTTTCCAGTATGCCCCTTATTTTAGGCACGCCCTCAATGTCGCACA:1 + chr2R 25216617 3' - 3S18 20 2 59.41 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTTG:3 + chr3L 24210993 3' - HMS-Beagle2 11 2 66.34 GCTTCGAGTATAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTACTGTTCTTTTGGCCATCGTTG:1 + chr3R 6116570 3' - Max-element 8280 2 71.43 GAAGATAAGATGATAAAGATAAATGTAACGGCAAACAAAAACAAAAACAGAAACCGAAACAGATGTGCGGAAAAAGAAAACGAAAGAAGTCAACAAATGCA:1 - chrX 8197747 3' - Ivk 105 1 65.35 TTTAATTTTATTTTATAAAATTGAAAATCAGGGGAAAGATGTCAAAGAGCCCCCCCCCAAAGATATATTTCTTTAACCATTTAAGCCAAACGTACAAGAGA:1 - chr3L 14323418 3' - TAHRE 75 2 60.40 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCATAAAAATGGTAGGTTTATC:1 - chrX 18161467 3' + roo 352 2 82.18 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGTAGCCCCTCGGGCACTCGAGGATTAAGCGAGCG:1 - chrX 21219432 3' - roo 39 2 67.00 GTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATTTTATATATCCATCTAAATCCATATAATATAGCCATCTAAAAGTTTACGCTGGAAGGGTCATTATAATAT:1 - chr3R 15130446 3' - Max-element 8238 2 67.68 GATAATATCTTCTTATGAAGTTTATGTCGGAGGGCGTGACTTTGCCCTCTTTGTCGATCGCTGGCCATGACAACTGCATGTGTCTTTTTCAATTCTACGCC:1 + chr2L 12523320 3' - gtwin 391 2 65.35 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTTAAG:1 + chrX 21945938 3' - F-element 33 1 54.46 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTAATTCCTTGTGAACTAAGATTGCCTAATTTAATTTATAAACGGGCTTAAATATCATAATT:1 - chr3L 735005 3' - mdg1 7055 2 39.60 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTTTTTTTT:1 - chr3R 11080675 3' - I-element 11 1 65.62 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAATTAGCTAGGAAAGTTATGCATAGCCAGTATTGTTTTGAACCTATTTTGCT:1 - chr3R 21710550 3' + mdg3 221 2 53.47 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGATATATCTCCATTCAACTGCCAGCTCGATTTATTTACACTTCGTGATGA:1 - chr2R 9214058 3' - Transpac 23 2 56.44 TTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGCGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAATGCCCGTCGCTGCTAAATGTCAATTAATGTCATCA:1 + chr3R 22180779 3' + invader2 4922 2 63.00 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTCCTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAGTAGTTTGTTCATTCACTCGCT:1 + chr2R 10334792 3' + pogo 2050 1 76.00 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTGCGTCTATGGGAT:1 - chr3L 19437227 3' - jockey 4706 1 61.39 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTT:3 - chr3R 11080695 3' - I-element 36 1 60.40 ACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATGGCTTTTACTGCTTTAATATAGCCTAAAAGACTGACATCCTGTACTCTTATTACTAAGTCCCAACATCAA:1 - chr3R 8576820 3' - BS 5000 1 71.29 TGTGAGGCGAGTGGTAAAAAAGTGACACCCTTGCAGTTCTCTGGCTTAAATCTCCTCTGTAGCATTGCCCGTTTTGCACTTGACTACGTTTTGGGTCAAGT:1 + chr3R 25566856 3' - hobo 22 1 59.41 TCAGGATCAATAGCAGAGTCGAATGAAGGATTCTAATTCGGTGTAAGTCCAGTTTTATGTATTATGTATTGATTGCTAAAATACTACATAAAATCTTAAAC:2 + chr2L 12286075 3' + INE-1 94 1 66.34 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCAAAACCACAAAAGTAAAAACGGTACAACAGCAAGAACAACGTGAAAAACTCG:1 - chr3R 7103313 3' + pogo 2033 1 50.50 CTTCTGGGATATCGATAGATATTGGAGAAAAAATAAGAAAAAATTTAGAAAGTGTTGGCGTATCTGGTTTTACCTTAAAGAAAGATTAAGCTTGGTGGGCA:1 - chr3L 25872547 3' - INE-1 498 1 63.37 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCACCCATTCCCCACCCATTTGGCATTGCAAAATTAGTGCAAAGCAGCGCTGCAGACGTCGGCAGAA:1 + chr3L 18793089 3' + P-element 2877 2 69.31 CCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTA:2 + chrX 21668077 3' - Tabor 6869 2 53.47 AAAAAAAAAAACAACAAACAAACAAACAAAAAAAAACATGGAGAAAAAGTGGGGAGGATAGCCCAACGAATTATTAATCAACTAAGGGAAATAGAAGGAA:1 + chrX 10315321 3' + gypsy7 5017 3 40.00 GTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCACCACCCACTTTAGCACTTCGAATTTAAACCGCTGTCTTACGCTTTTCC:1 - chr3L 18333594 3' + Idefix 199 1 54.46 TAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGCCTTGTTTTGCTTTCTACTAATTCGGATTGTTTTGTGTGTTATCTGCA:1 + chr3R 27993407 3' - transib2 27 1 58.42 AAACATCATAAAAATAAAATAAAGTTAAATAATTCAGCTATTAAAAACAGGACACTAATAAATTTTACATTTACGTAAATTGGTAGAGCCGAACACATCGC:1 + chr3L 14603157 3' + jockey 4999 1 42.57 TCTCTTCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTATTCACCCACTTGTGAGACATAAACGTCGCCGCACATTTGCCGTACCCCCACTCCAATTGGTGGGG:1 - chr3R 15130152 3' + Max-element 106 2 65.00 GTCAGCTGTGACACACTAAAGTGAGGTCTTACTAGCTGGTCGACTAACTCGGATACCGTATCGTAGAAACTATCAAAAGTTTCATTTGGTTTTTGTTTTGT:1 - chr3R 16304319 3' + gypsy12 58 2 69.31 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGCATTATTCATGCTTGTTAAATTTATTAATTGACCTTCCCCCTGAGCTCAC:1 - chr3L 14558248 3' - 297 6606 2 55.45 AAAATTGTTTTTCTTTTTTTGTGTTAAAAAATTCTATGTTGAGTGGATTAGGATTTAGATTTAGAAAATCAGTCCGGACGAGATTGTGAACATTTTCAAAT:1 + chr2L 21657268 3' + Penelope 103 1 70.30 AGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATATGTTCATGGATTCTTACCCTTGAAGATGTGCACCAGAACGCTGGC:1 + chr2R 17977436 3' + invader4 3065 2 57.14 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGATGATTAGAGCGGGACGACCGCTGGCACCTCGACACTTGTTCGCCCGCGCATCGGCTGTCTGTGGG:1 - chr2R 21646069 3' - P-element 9 2 71.29 TCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATACATATAAAGAAAACTATTCAAATACACTTCT:1 - chr2L 16758276 3' + Max-element 254 2 70.30 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTCGCCTCTGCCTTTCTTGTTGTGCCATCGTCTTCGTCGTTTTTGCTCACGTAGCCAACGCGTGGACAGCG:1 - chr3R 28326403 3' + P-element 2880 2 73.27 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCACTTTCTTTCAATTGCCACCTTTCCCCGCTGTCCGT:1 + chr3L 3070708 3' - 1360 37 1 63.37 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAAAATAGACAAGGATAGGCCCAAAAGGACGAAACGCGACCCGC:1 - chr3R 30326285 3' + pogo 2071 1 59.41 AGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATTTATTTGACATCGCCATGTGTGTGGGCGGCTG:1 + chrX 5130738 3' - I-element 404 1 68.32 TTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGTT:1 + chr2R 5674750 3' + S-element 1705 1 73.27 CGCATTTACACTAGCTAAGTAACGCGTATCTGATAGTCTTGGAACTCGACTATGGCATTCTATCTTGTTTTTGTTACTCGATACAGTTCACCCAGACATCG:1 - chr2R 5108509 3' + INE-1 533 1 70.30 TACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAGAGTCAACGAAGACATCTAGTGTCCAGGGAGGCGAATGGCGAAAGA:1 - chr3L 11748726 3' - Stalker2 7281 2 54.46 TTTAATAATATTTTTTTAAAATCGTATTTCAGGGATTATGATTTATTAAAATATTATTAAATTACCTTGTTTATCTTTTTCAGAATGCTGTCCACTTAGGC:1 + chr2L 1909665 3' + hopper 168 1 78.22 AATAAAATTAGTTTCTAACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAA:1 + chr3L 3535442 3' + roo 9033 1 61.39 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCAACTGACAGA:1 - chrX 10196073 3' - 297 13 2 57.43 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTGTAGA:3 - chrX 17492862 3' - Tirant 8115 2 73.27 CAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTTGGCATTAAAAGTTATTGAAAAAATTGCTGACAAAAGAAGTATAAATATTTACGCAAAATACTATTTG:1 + chr2L 16379036 3' + HMS-Beagle 7037 2 74.26 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATCTTTGTTGTTTTTCCAACCGGGTGCTTAAAGAAAAGTGGTTAAGGAATTGACGAGCGGCAATTTG:1 - chr3R 23870055 3' - roo 8674 2 68.32 AGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTAACTATTAACGAACC:1 - chr3L 25884050 3' - Doc 1 1 73.27 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTTAAGTAAGTCAA:2 + chrX 21945946 3' - F-element 25 1 62.38 AAATAATAAAATAAAAAACAAACCATTTATTATAACCCAACTAAGAAATAGAATTTACAATGAATTCAGAAAGATTAAAGTACAGCAAAGATTAAAGTATT:1 - chr3L 22098312 3' + BS 5098 2 71.29 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTACGATCGATTCTTCTACTGCTCAATGACGCCGCGGGTGAG:1 + chr3R 25675839 3' + jockey 4949 1 60.40 GTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTGTTTAAGCGAGCTAGCATTACATATATACATACATACATTGCTACATACATCGTCACTCTATATTTTGGCAAGTTACC:1 - chr3R 19447171 3' + diver2 496 1 76.24 ATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCGTTCGTTTTCATATTCAGATTTTCAGATGCACAAGTGTGTGAGTGTTAATGAGCCTTAGACCAAAGGA:1 - chrX 17783115 3' - I-element 129 1 54.46 CCAAAAAAAACTTTTTGCCATCCCCACTCACACGCCCTAAAGCCGCCCTTGCCAATTACTAACCAAAAACCAGCCACAACAATGTTAGATGCTTAAAATG:1 + chr2L 16150251 3' + INE-1 325 1 61.00 TCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTCACTAATAAAATCCCCACAACCACTGCCGTATATTCTGCTTGGTTTGAGCGATTAGTTCGCTG:1 + chr3L 4634595 3' + accord2 7302 1 67.33 GATGTTGGGTCATACAGCCGCCTAAACTGTGCAGTAGACTTATCTCATACTCTTTAATATTGTAAGCGAGTAACCAGTGGAAGTGGCAGCTGATCCGTCAA:1 - chrX 3515290 3' + diver2 4531 1 66.34 TATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGTTGTCCCCGCTGAAGAAGAT:1 + chrX 17492970 3' + Tirant 379 2 57.43 TGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTCTTTTCCCAACTTTAGCTGGTTACCTTTGCTTGTGCCCATTCCTCCTTCTGCAAGTGGTTGAAATGT:1 + chrX 157099 3' - I-element 423 1 71.29 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATACGCCTGTGTGGCGCTCCGTGATGTCGTGTCCCCGTGTAGGGTTACATAC:1 - chr3L 13652171 3' + mdg3 218 2 52.48 ATGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTT:1 - chr3R 11080681 3' - I-element 22 1 56.44 GCCACGCCCACTCTAACGCCCACAAACCGCAAAAAAATCAATTATAGATACAGACAGACAGTGAGACCCACAAACTTCCGTGGAAAACTTCTCGGGCACTT:1 - chr3L 19421645 3' + INE-1 213 1 63.37 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAAATATACAATTAACTCCTTAAATAGCAAATGATT:1 - chr2R 11835625 3' - I-element 45 1 69.31 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCTTTGCTCTGCCGAGAGCCTCTG:3 + chrX 13640305 3' + P-element 2852 1 45.54 GTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTGGTTGTTTTGTCCTCTTTTTTTTTCTC:1 + chrX 1571967 3' - I-element 489 1 77.23 TATATATATATTTATATATTTTAACACCTATTACTTCTTTTTGATAAAACCCTTTGCGTTGCCAAGGCTTAGACATATTTTTCGCGTGTGACTTCGTGCGT:1 + chr3L 6819383 3' - G3 4504 1 81.19 ATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTGACAGGAGAGCAGGTGCACGATGAATATGCCTGG:1 + chr2R 1717275 3' + 17.6 58 1 69.31 GTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGAAAAGACGGATGGAGGAGCTGAAAAAGCGCTCTGGGATAAATAAAATAGCTC:1 + chr3R 1281025 3' - 17.6 172 2 56.44 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTACTGGTCCGCCTGTCTGCTTTATGCGAGTTTGTTGT:1 - chr2L 19681423 3' + hopper2 1564 1 69.31 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGACGAGAACTGGTTACTCTCTCTCTCTTTGGTGAAAGGAATGAATATTTAAAGATTACAATTTT:1 - chr3R 8133902 3' + roo 396 1 67.33 CCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCATCACATCTGATAGCGAAATGAGCGTTTTCCAT:1 - chr3L 22205319 3' + Idefix 178 2 68.32 TCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCCGCCTCCTTTATCCCGAACATCGCATCTTTATGAAGCTGAA:1 + chrX 7851130 3' - HMS-Beagle 261 2 59.00 ATTCCTCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCTAGCAATTACAGAAGAATCTCTAAATACTTTGACACGCGGTCTGCTAATCGACTGATTGCAGTGCC:1 + chr3L 24937491 3' + Q-element 67 2 62.38 CGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGGACCAACACCACAGAAAATATTGGGACGATAGATAGTGGAAACTTTCGAAAACAAGGCGACTTGAAAATTGTTGTTG:1 - chr2R 3124294 3' - baggins 5124 1 60.40 CCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTG:2 - chrX 17492866 3' - Tirant 12 2 69.31 TGTATTATGTTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCAAAATAATACTATGTCCATGCATTTCTTTCGAAAGATATAAGTATCTCAGCAATGTTCGCT:1 + chr2R 3600142 3' - Doc2-element 74 1 69.31 TGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTC:2 - chr3L 5267221 3' - Juan 4007 1 57.43 TAGCTGAGTAACGCGTATCTGATAGTTGAGAAAATCGCCTATTGATTCCTGTTCTTGCTTGCTGACATAAAAATAGGTAAGGCAAATTATAATTTTTAGCC:1 - chr3R 19718710 3' + INE-1 544 1 80.20 AAAAATTGCCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGATATTGACCAACTTGATCATGTCTTTGAACTATTTAAAGTAAAAACCACCG:1 + chr3R 2208389 3' + 1360 3343 1 60.40 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGGGCTTATGTACACACACATGCACATGTGAGAGTTGGCGGCTCCTAATTAAGTCCA:1 + chrX 7154262 3' - hopper 20 1 57.43 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGGCGGAAATGAATGTTATTTATTT:1 + chrX 21219508 3' + roo 392 2 64.36 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGAC:2 - chr3L 25884090 3' - Doc 41 1 60.40 TGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTACGGATTGGCA:1 + chr3L 5573578 3' - mdg3 47 2 68.00 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGACTGTACAGATTGAGTGCTTGTGTGTGCATAAGTGGGTGGGTGGTGAATAAGTACATGAGAGAGTGGGCGG:2 + chr2R 9258682 3' + blood 370 2 71.29 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTT:1 - chr3L 25884065 3' - Doc 13 1 60.20 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGGTGACTTTCTTCACTCCTGCAAGTTCGTCGCTTTTT:1 + chr2R 15402909 3' + roo 9032 1 64.36 CGGCCTCTAAAGCGTGCACCAGCAAGTACAGGTACTCTCGTCTTCCATCCCTTTATTTTGTTACACGTTACAAATCGGCTGCTTTGCTAGAGGATTTCTAC:1 - chr2R 1530586 3' + gypsy12 10147 2 71.29 TTTTCCCTTTTTTTTTTGTTTTTGGAAAATTAGCTCTCACCCCATGCGAACATGCCATAAAA:1 - chrX 14643625 3' - Doc2-element 246 3 59.68 CGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAACTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGACAAAATATGTATGTTGGTAAAAGGGACGGGGACGAGGAATAG:1 - chr4 853391 3' + 1360 112 1 64.36 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTTAAGTAAGTC:6 + chrX 21945944 3' - F-element 27 1 60.40 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACATGTGCACGGCAACCAATACACCCATGCGATCGG:1 + chr3R 22341189 3' + hobo 2915 1 63.44 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCA:5 - chr3L 9190456 3' + 412 7511 2 59.41 ATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTTTTTGGTTTGTAGGAGGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGA:1 + chrX 13231968 3' - I-element 5117 1 72.28 TTAGCTTCTATAGTTCCTGAGAAACGGGCGGACATACGGACGGACAGACGGACATGGTCAGACCGACTCGGCTATTGATACTGGTCAAGAATATATATACT:1 - chr2R 8443980 3' - INE-1 152 1 74.26 CGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGATTTACGCATCAGAAAAGTAACTTTAAATATAGCT:2 - chr3R 7879836 3' - 1360 44 1 69.31 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAATATCCACTGCATATTCCTTAAATTTG:1 + chr2R 12007259 3' - mdg3 51 2 74.26 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAAGGCGCAC:1 - chr2R 22746043 3' - hobo 42 1 65.35 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGTATATGCACACGCACACATACGCAGGCAATTGGAAAGAGGG:1 - chrX 5178805 3' + hobo 2923 1 55.42 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGTGTGTGTTCATCTCGCTTTCCCGGTAATTTTCAGGTGGAAAGAAGCCAAC:1 + chrX 9649976 3' + blood 350 2 52.48 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGATATATCTCCATTCAACTGCCAGCTCGATTTATTTACACT:1 - chr2R 9214067 3' - Transpac 32 2 62.38 TTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCCCTGATTTGAAACTACAACTTAGAATTGAAG:1 + chr3L 12565698 3' + roo 9028 1 64.36 ATGTTAATGTTACCAGTCCACGTTACTGTCTAAAAGCTAAGACTACTACCACAAAAATAAAATACCAATCATAATTTTTAAGCCAACAACCAATTTTCAAA:1 + chr3R 24682547 3' + HeT-A 5852 1 61.39 GTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAGAGTCAACGAAGACATCTAGTGTCCAGGGAGGCGAATGGCG:1 - chr3L 11748731 3' - Stalker2 7286 2 59.41 TACTGGACCTGCCATATAGATACACAAATAGGTAAAAGAGACGTGTGTTTGTGTATGCGTGGAGTAAACAATCGGCGACAAAAGGGGGAGAAGTAAAATAA:1 + chr3R 31059412 3' + G3 4470 1 73.27 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACGATTGGTGGCT:1 - chrX 157195 3' - I-element 14 1 63.37 GGACCACCCAAATACGTCACTATATTTATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCAACTGACAGATTTTCACCTCTGG:1 - chrX 10196060 3' - 297 6581 1 70.30 CAATTTCACCACTCACTAATAAAATCCCCACAACAGTAGGCGTTAAGTTGGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGGTTCTTTTTTTGCTTTTTCGGCTGCTTCG:1 + chr3R 30295335 3' + accord2 7327 1 48.51 GGAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATACCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGGGCG:1 - chr2R 6482687 3' + gtwin 425 2 72.00 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACG:1 + chr3R 21587295 3' - pogo 49 1 78.00 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGGGCTAAAGATCTTATATGCTTTGTTG:1 - chr3L 21393472 3' + roo 359 2 74.26 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCATTAAGTAACAATGCCAAGCTGAACATTGTCCTATCCCCCAGCCGCTAGTCCTTCGCA:1 - chr3L 12217296 3' - roo 19 2 60.40 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGTCGGTAGTCTTTAATTCTAAAAGCTTAACTTTGTGCACTTGCAGATAATATGATA:1 - chr2L 14599253 3' - mdg1 21 2 50.50 TTTGATTTTCGAAAATTTTTGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAACATTTCGGACGATGAGTCAGTAGCAACTGCACCAATTATGACAAACGAA:1 + chr2R 3595819 3' - FB 144 1 55.10 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACTGAAGTCGCACACCCGCCGCCGCCGCCGCCAAAGTTGAAGAAAAAGAGCGCCGG:1 + chr3R 13996008 3' - 1360 19 1 56.44 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTCTGCTGCTCCCCCAGCAGCGGTTCTCCAAAACATTCTCGA:1 - chr3R 20430760 3' + hopper 1377 1 64.36 GGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTTAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCAA:2 + chr3R 23947649 3' - Tirant 8115 2 68.32 TGGGGATGTAATCTCTTCAGACTGCAATTGCAATCCTGTACGTTGATTAATGACCAGCTTTGCATTCCTCTGGGCAGAACGAAAGTCTGTGGTGATATGAA:1 + chr2R 11310316 3' - G5A 2681 1 79.21 GATATTTGCAAAAAACTACGATTAACATGTAAACAATTTTCCGAAAGTGGGGTTGTTTGGAGCGGAAAATCGAATGAGTTGACTCTCGACTTGAATTCGGC:1 - chrX 6925347 3' + Juan 105 1 78.22 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTAAT:1 - chr3R 3920674 3' - I-element 43 1 72.28 ACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAG:1 - chr3R 19450186 3' + roo 8780 2 56.44 CTGGGTGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGGAGTGGTACTGTCATAATATTTATAATGATCTTAATGATGACACAAACTAAAGCAGGACAAATCGAAA:1 - chr2R 2009395 3' - I-element 22 1 80.00 GTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGTTAACATGAAAATCTAAAGGTCTGCCGGCGGCCACAGGCCAGAAAAGAA:1 - chr3R 17615928 3' - HMS-Beagle 23 2 56.00 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGCGTTCTCAACGGGAAGTTCATCATTACAGCAATTTAGTAATATTTATTAAACTAAATA:1 + chr2L 21018843 3' + 412 445 2 60.40 GTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCATT:1 - chrX 21667991 3' + Tabor 7307 2 57.43 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTCAGCTATGGCCGGCAGAGAA:1 + chr2L 19962656 3' + 297 6924 2 77.00 GACATCCCCGACCCCGTAAATAACCAACACACAAAACTAACTTAAAGAAGCATATAGGATTTGAAGAGAACATTTACTACAAAAAATCATTTTAGTATTTC:1 + chr3L 3535535 3' - aurora-element 4028 1 65.35 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCTCTCCAACTGTCTGCCATCCCTTTCCCTCTCG:2 + chr3L 17110768 3' - hopper 41 1 65.35 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAA:1 + chr3L 3535441 3' + roo 389 2 58.02 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGCATATATTCATACTTTTATGACACGTTCTCCGGAAAATGTGTAACAC:1 + chr3L 7563540 3' - FB 31 1 54.46 TAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTACCTGTAGGAGAACGTCTAACAAAATGCCTTG:1 - chrX 21564068 3' + invader4 3075 2 68.32 TGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGTAACTTCACGAAGCATTAATACACGTACATCATATGCATATACATATATGTATCAAGCATGTAAAGGTCTCGGCTAATA:3 - chrX 13590506 3' - gypsy7 5006 1 81.19 AAGGTGAAGGGCACATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATAAGTGTGCACACATACAGTTGTTGCTGTCGCCATGGCTGCTGAAAATTCGGAAAACGT:1 + chr2R 4676505 3' - 1360 213 1 68.32 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAACGACTATATCAATGTGTAT:1 + chr3L 11257424 3' + 1360 3382 2 70.30 GAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGGCCATATCGGGTATACTCTTCATGGGCTATTGC:1 - chr3R 10735784 3' - McClintock 73 2 67.33 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTACGTGTGTATAAATAAAACGGTGGCAAGATGTGAAGAATTTTTTAAAGCATTCTTGCGACCTTAGTGC:1 + chr2L 9854214 3' + hobo 2930 1 70.30 TTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTTGGCATTAAAAGTTATTGAAAAAATTGCTGACAAAAGAAGTATAAATATTTA:1 + chr2L 16379020 3' + HMS-Beagle 225 2 58.42 GACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGGTAAAGAAGTAAAAGTGAGAAAGTCGTTAAATAATCCCACGACTTTCAACTACTG:1 - chr3L 21051575 3' - transib2 17 1 62.38 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGG:2 + chr3L 3535458 3' + roo 9049 2 54.46 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCAT:2 + chr2R 17348626 3' - jockey 26 1 56.44 GGAGGTATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACTCTCATTATGTTGGAGTCGGACGTCGTACCCCATATTTGGACGCAATAGGTCATTGAAGGGA:1 + chr3L 23854308 3' - Q-element 583 2 66.34 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGTACTTATAGTTCGTACTATTTTTTAGATTCCTAACTGAGCAAGCTAATTG:1 + chr2L 20270047 3' + pogo 2077 1 58.42 AAACGGGATCCCTGCGGCCTATAAAGCGTCGGCGCAAGCACAGATGGAAGAAGATAGGAGTCGAAGCGTTAAAGGAAGGAGATCGGGAGTGAGAACGCGCG:1 + chr2R 2016659 3' + gypsy8 325 1 49.50 ATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 24210957 3' - HMS-Beagle2 6900 2 62.86 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTT:1 - chrX 5168869 3' - hobo 34 1 70.00 TAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGTATTCTCTCTTGTTTTTCTTTAATTTTATGATTGGAAACGGACCGCAAGATGAAAATCTCC:1 + chr3R 24125897 3' + INE-1 548 1 71.29 CACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCTTTCCATTCGGCTTATATTGTTCGTC:1 - chrX 12867303 3' - hobo 175 1 74.26 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAATCGCAAAAGTCGCCCCA:1 + chr3L 12217376 3' + roo 9038 1 55.45 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATACATTTAGTTGCGCGCTCTAATGCAA:1 + chr3L 5267294 3' + Juan 4203 1 65.35 ACCCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATACATTGCTTAAGCCTACCCCACGGAAAGTAAAAAGCCC:1 + chr3L 18781335 3' + Idefix 6971 2 76.24 TTAGACACCATCAGCTTGCAACTGTCGTGCAATGCTTTTCATAATTTATCTTGCCCAAATAAAAGATAATGGAGTCGAAGACATGAAAGGTGGATCGAGTC:1 - chr3R 4510469 3' + Tc1-2 20 1 67.33 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACGAAGAGCTAACAAAACCAAACGATTCGGAAAATAAATGCAGACCATGCA:1 + chr2L 11560000 3' + copia 243 1 60.23 AGGGGTGGGCATGAGTTTAATATGTGTCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGGATTGGGAGCAGTATTGGTGAGACAGCAAGA:1 + chr3L 24492550 3' - I-element 5047 1 77.23 AATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCT:1 + chr2R 5531183 3' - 1360 78 1 53.47 GAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTGGATGATATCTGACTTTGACATGAGCA:1 - chr2R 23596431 3' - 1360 50 1 73.27 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAAACATCCGTTGGCGTCGATGCTGAATCACTCTTTTCTCCTGCGCTGATGCTGAATTA:1 - chr2R 25009718 3' - FB 20 1 59.41 GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAATCCAAATGAAGAATCATAAAGCGAGATTTGAAGATGAACTGACCTCTATTTCAATTTAAGACG:1 - chr3L 10305298 3' + 412 482 2 67.33 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCA:2 + chr3L 3535425 3' + roo 352 2 79.21 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTT:1 - chrX 3446528 3' - I-element 37 1 66.34 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACACACACTTTTCTGTGCCGA:1 + chr2L 8898919 3' + roo 352 2 78.22 AAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCTGTCTATGCGGAATTCCACACACCTGTAGCTTCTCCTGCTGATCTACTTTTA:1 + chr3R 3626818 3' + 1360 385 1 60.40 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACACTACAATGAAATCGACAGCACGCAATTATTTT:1 + chr3R 5284986 3' + roo 9041 1 72.62 CGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTG:1 + chr3R 10736115 3' - McClintock 5981 2 62.00 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACAGTTTCGGTGGCAACGTCAAGGCATTCGCACGATCCGAACAGAAACTGG:1 - chr3L 5351492 3' + P-element 2867 1 57.29 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACACTCACTCACTTATCTCAGATGCTGTATTT:1 - chrX 9649919 3' - blood 7060 2 76.24 GGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACG:1 - chr3L 25232764 3' + accord2 7603 2 50.50 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATCCGTTGAGAGGTGTTCAAAG:1 - chr2L 21018813 3' - 412 7107 2 76.24 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACCCAAAGGCTAAAGTTGGCTGCAGAATGCCAGCATGAA:1 - chr3R 31768636 3' - roo 39 2 64.36 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTG:1 - chr3R 19450166 3' - roo 8699 2 69.31 CAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAATATATGCCTTCAGAATTAAATTA:1 + chr2L 23381789 3' + Ivk 320 1 58.42 CGCAAAGCAGACACGTGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATTGTCCCACATCTTATATTTCAACATCCATAACGTGGATTCAGTGACGACCTTAGCAAG:1 + chr2R 1277090 3' + hopper 1234 1 68.32 AAACATATCTGAAATAAAATCATGTATTGTAGGTTTAGATGTAGTTTACATATTATACATTTTTTCCACCTGAAATTTTCAAAACATAATAGGTGATCCCG:1 - chr2R 2054507 3' - transib1 1749 1 64.36 CAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGG:1 + chr3R 10736102 3' - McClintock 41 2 74.75 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGCAATTAGCTTAAAGTTCGCTTAGCTTACGGACAATGTTTCAGTCATATACATCTAGCATACTATGT:1 + chr3R 20183065 3' + roo 398 1 69.31 CACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCCGCAACCCGCTGTC:1 - chr3R 4546024 3' - jockey 4768 1 68.32 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTGGGTGTGGAAGTGGGGCTGGTGTGGGCGTGGCAGGACTACGTTTCGAGTTTG:1 - chrX 20585937 3' - jockey 29 1 55.45 GTAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGCGCTGCCGGAGCGTCTTCTATTGAACCCGAATTTTCCGTGGTTCCCAGGAAAAATTCGTGGTCGCGGT:1 - chr2L 4308725 3' + pogo 1683 1 71.29 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGCCCGTCTGTGTGCCGGTGTATGATGCCATTTATTTGCTCAAGATTAGATTAAAT:1 - chr2L 9672402 3' - 297 6596 2 61.62 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACAGTATTTCATCTTCATATTTGATAA:1 + chr2L 14993444 3' + 412 7497 2 71.29 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATCTTTGTTGTTTTTCCAACCGGGTGCTTAAAGAAAAGTGGTTAAGGAATTGACGAGCGGCAATTTGC:1 - chr3R 23870054 3' - roo 8 2 70.00 TATTGCAAGCATACGGTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGCTCATAACATTAATGTTAAAAGAGTAGAAG:1 - chr2R 19164110 3' + P-element 2843 1 35.00 GGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCATAAAAATGGTAGGTTTATCTAT:1 - chrX 18161464 3' + roo 9019 2 78.22 ATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCGAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGG:1 - chrX 21668015 3' + Tabor 7312 2 48.61 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTGAGTTCTATGCATTTTCCACCACCACCAGCAAGTAGCGAAGAATTGGCCAGGGAAAAACTGTAACCG:1 - chr3L 9293644 3' - mdg1 7048 2 68.32 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTGAAGAGATTTTGGTCACGATGATACGGACATATCTAAAAGTCGTTT:1 + chr3L 8044384 3' - mdg1 6 2 64.47 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATTATGCATCTTGTGTATTTTCTTTTATATGTATA:1 + chr2R 11639125 3' - Burdock 6176 2 67.33 ATGACTGATCTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAA:1 - chr3L 27356116 3' + Tc3 1628 1 80.20 GAACGCAATCAAAAATGCTCTGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGACATACATAAATAAATTTAAACTCGTTTGACCACAAACTTA:1 + chr2L 7601837 3' + Porto1 4330 1 76.24 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGTACAAGAGGTGGGTAGGGGGCCCTAG:1 - chr3L 19173554 3' - transib2 46 1 76.77 GGCTTGGTTTCTCTTTTTTAGGATATTTAAGTCATAGGGTCGATAGTGACAACGCGCATACAGTCGGAAGAAACTAGGTCAGTTGGTGAGAACAGTGCCAG:1 + chr3L 25847242 3' - G7 737 1 71.29 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTATTTATTAATGAAAAAAGCGATGATCCGAATTTGGGACTGGCATAAG:1 + chr3R 3625689 3' - Max-element 8266 2 55.45 AGAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCT:1 + chrX 21945920 3' - F-element 51 1 65.35 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGTATATGTTTCAAAAACATGTCCAGTTTTAAGTTCAGTTTTCTTATAATTGTGAAATA:1 + chr3L 18206829 3' - pogo 16 1 64.36 CAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAGTATGTACTTGCTTATAGTTTCTTTTAAAGCTTACACGTTTATT:1 - chrX 8303401 3' - flea 4786 2 58.42 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCAGTTTGTTACATAATCAGCAGA:1 + chr3R 23870151 3' + roo 9045 1 52.48 CGTGGAGGTTTAGGGGGGTGGTTACGGACAACGTCTGGGAATTGCAGACGACGGCGGCCCTGGCGATTTAATCTTTGCAGACATTTTTATTCAAATTTATT:1 - chrX 21563205 3' - gypsy5 7045 2 88.12 TATTTTACTTAATTTATTTATTTTCTTTACTGATGCATATGCTTAAAAACACATATGTATATGACTCACACTCGTTTTTGTTTCCATGCTTATGAGTCGA:1 + chr2L 963365 3' - X-element 4716 1 75.00 GTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTG:1 + chr2R 2879475 3' + Stalker 132 4 60.40 TGGTGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGTTTCATTTGTTTCATGCTGAAAAGAA:1 + chr3L 1985347 3' - Max-element 52 2 71.29 TCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACCGCGGGAGTCTGCTGCTGGTGGTCAGC:1 + chr2L 7879002 3' - copia 4951 2 72.28 TGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAGATGATAATTTATTTGTTTTGGGTTGGACGGTTGGTTATCAATCAACACACACATACACATTTAGACACCAAAGCG:1 - chr2R 22825379 3' + opus 496 2 75.25 ATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAGATGACCCATTTGTAAAGTGCAAAAAGTTGTAAAGTTTTAAATAAAA:1 - chrX 22426170 3' + 1731 4602 1 54.17 GGAAAGAGAGCAATTTAGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATATAGCCGGCACTATAAGGG:1 + chr2L 16276829 3' + 1360 3315 1 79.21 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCGCAACCATCGCGACGCGCTCTGGTTTTTCCTATTAGCGGCGCCCAAATGTATGCT:1 - chr3R 13623637 3' - jockey 27 1 56.44 ATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGGAGTGCTCGCAAGGATGTCATCGA:1 - chr3L 13360964 3' + hopper2 1552 1 74.26 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTTCAATGCATTCAATGGCGGCCCAGACGCCTCATTAGCGCTGCGATTCGCAAGCCAAAATGCCAAATGAT:1 + chr3L 20862920 3' + hopper 1411 2 76.24 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTAGTCGTGCGTGAATTTAGTTTTTTTTCCC:1 - chr2L 8965431 3' - Doc 47 1 68.75 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAATGCCAAAGAAATAACGCAATCAACCTGCAGGAAAATCGTTTGTAAAGCTCATGGAACTACCCTCGAACATGAA:1 - chrX 13794832 3' - FB 3 1 76.24 CAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACCGCTCTTTTCCGGTGTAAAGCTATGTTATGTTGGTCTTTGATATT:1 + chr2L 158736 3' + 1360 84 1 65.35 TGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATTTAGATGTAATATCTACGCTTCTAAAATT:1 - chr3L 920492 3' - mdg3 47 2 71.29 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATT:1 + chr3L 22162709 3' + roo 358 2 76.24 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTATTTCCAATGTGCGGGCACTTTTATTTGACTTAAACAGTAAAT:1 + chr2L 12835889 3' + 412 461 2 56.44 AGAGGAAACTTTAATGCTGCCTCAGTATACTGCCCTCCGACTTTTAGCGAGAAAGTGGAGATGCACGGGGACGAGATGGTTGAACTTGATGATGTTATTGT:1 + chrX 22712741 3' + G5A 310 1 60.40 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAATCCCTATTAATGCCACGCTAGGCTT:1 + chr3R 7879873 3' + 1360 3339 1 74.26 GCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAG:1 + chr3R 10736117 3' - McClintock 28 2 60.40 CCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTT:1 + chr3R 15790081 3' - flea 4729 1 58.42 ATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGGTCTCGTCTGTGGGCAGAAGGGCCTCGGATGTTTATGTTTGTTTTCGAGTGCTCAA:1 - chr3R 27148931 3' - I-element 214 1 61.39 CTTTGTACATTTTATAGTTAAAACTTACATAGAACATATATATTTTCCTACGATATATTCATTTGGTTTTGGATATAGAGAGTAATACCCTTAAGCTTTTC:1 - chr3L 6869902 3' - transib2 2760 1 54.46 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCT:2 - chr3R 13231160 3' - Quasimodo 45 2 75.25 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAATATCCACTGCATATTCCTTAAATTTGAAATACATTTCATCAGCTTATTTAGTGTT:1 + chr2R 12007288 3' - mdg3 22 2 58.42 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCTACATCTATTATTGCATTCATACAAAACCCACTCACCCCAGTTGTAGTTGTAA:1 + chr2R 17735234 3' - hobo 22 1 57.43 CCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGTTATATTATCGCCTTGTATATTGTTGGTTATTGTTTTTAATTAAGTCGGTTATACTATTTTGTATTGTAAT:1 - chr2R 3522315 3' - Porto1 4272 1 54.46 TGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTTGC:2 + chr3L 24210994 3' - HMS-Beagle2 6892 2 68.00 CTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGTCAATTAATAAATTTAACAAGCATGAATAATGCATATA:1 + chr3L 14558282 3' + 297 6517 1 63.37 ATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTACCCACACCGGGGAAAGCGGCTTTTACAAGCAGTAAATTTAAGTTGCTGCTGCTCCTTGCTACTTCC:1 - chr3R 28413363 3' + 17.6 7089 2 64.36 TATTATGTTCGTATATACTACACCACCGCCGAATCTTGATATCAATATTTTGAAGGAAACTACTTGAAACCAAGCGTAAAGAATATAGTTTTTTAAATGT:1 - chr3L 7266484 3' - mdg1 1 2 78.00 AACCCTAAAAGATTGGCTACGTATTCTGGGCCAAAATACGGGGCATTGGGGATATCTGCGAGAATACCTTAGACTCTGGAGAGAGAGATATTATTATAGAT:1 - chr2R 3681705 3' + mdg3 334 1 67.33 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGAAGTCCTTCTATGCGGATTATGTTATAATGTTGCACTGGAACCCATCGCTCTCCCAGCAGGAA:1 - chr3R 16110153 3' + mdg3 232 2 64.36 TTTTTAAATTTCACAAAACTATCTTTCGTGAGCATTGTTCCTCACTTTGGCAAATTTCACAACGAACTGCAACTTGTCATTTGCATTGAAAAGAGAAACAA:1 - chrX 10802154 3' - S2 382 1 62.38 ACCCCCAATCTCCAAACACTTGCGAAATTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGTGATAAATCAACCTCATCAAATATGTCAGCCTGCTTCACCCCCAACGTG:1 - chr2R 3603568 3' + Doc2-element 487 1 71.29 GCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACACTCATTCTCCACATTCATTCCCTTGGGTTAAAT:1 + chrX 7428561 3' - hobo 393 1 67.33 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGG:1 + chrX 21219486 3' + roo 9034 1 63.00 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGTCATAAATGGGGGCACAAAGTGGAAAGTCGGAAAGGAAGTT:1 + chr3R 21198670 3' - Tirant 8139 2 56.12 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTCATTTTGGTTAAGACAGAAAATGTTAACATTATTTTTCGCAAAATTATACA:1 - chr3R 13620260 3' - Doc 29 1 54.46 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACGGATGGCCTCCTGGATCCGCTTTCCTCCATTTTAAT:1 - chr3L 10161829 3' + hobo 2904 1 62.50 CATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCCTATTTCCAAGTCGACAAACCACAGATTTCATGCTTTAGTTA:1 - chr2L 13642684 3' + Tirant 366 2 58.42 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGCATAAACAGATTTAGAGTCGAGTGCCTGGAGCGAAGAAAT:1 + chr3L 18523659 3' - 412 34 2 65.35 TTGGCAAAAAGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTAGTGGGTTATGTTTGGCTTAATTTCGATATGTGTGTTTGTTGTGTTTTTAATCCT:1 + chrX 840403 3' - I-element 5003 1 60.40 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATAATCAATAAAAATTACAACAAATGTTTCCC:1 - chr3L 5282180 3' + Transpac 5187 2 71.29 ATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCAAGTCGA:1 + chrX 8027513 3' - Juan 12 1 67.33 CATACATATGTATATGTCTATATATATATTCATATATATATCGCATGTACCCGCTATGGGTACACATGTCTCATCGACTTCGTCATGGCCTTTATTTTTAG:1 - chr2L 7087558 3' + Stalker2 7499 2 81.19 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAG:3 + chr2R 1725930 3' - Doc 44 1 64.36 AATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGAAGAAAGATGAAAAAAAAAAATTGACAAAAAAAGCAAAAAAATAGAATCAAATAAAA:1 - chr3L 19888801 3' - Cr1a 169 1 65.35 AAAATACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCCTAATGAAAATTGAAGACCG:1 - chrX 17432415 3' + hopper 1364 1 74.26 TAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATACATTTAGTTGCGCGCTCTAATGCA:1 + chr3L 5267293 3' + Juan 4202 1 64.36 ACTGATCTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATT:1 - 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flea 10 2 70.30 TTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAATACTATACATTTGAGTTAAACAAATTGACAAAGACGTTCACTTTCCTCATCTATTCG:1 - chr2L 21777907 3' + mdg1 7438 2 57.43 AATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCCAAAAATGATAAACCGCAAACCACTTAAAAAAGTTGC:1 + chr3R 29435867 3' + hobo 2556 1 69.31 GTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCCGTTGTACGTGGTCCAAGTCAATGATATGGACAATTCTCGTTGTTC:1 - chr3L 26386158 3' - I-element 4959 1 60.40 TTTATTTATCTTTTTTTTTGTTTTAGCCTGCAAGTTTTTTGTTTTGTTTTTATTTTCCCAAGAAATGGGGCGTTGGGTGTCCTTGGTGGTTTTTGTTGCGC:1 + chr2L 2895997 3' - gypsy7 5004 1 76.24 AATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGTGTGTGACATTCGATTTGATTGTTTTTGT:1 + chr3L 13885510 3' - Doc 170 1 71.29 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGTTATAAGCACACATATTCAATGT:1 + chr2R 12625427 3' - pogo 50 1 78.22 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACAATTTGTTACAAGTTGACTAGGGAAAAAGCT:1 - chr2L 9129140 3' - 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roo 8703 2 69.31 CAAAATAGAATTTACAAAATTTTTTGACTTAATGCGAAAGGGAAAAGGGGAATCTGGCCCAGTGTGCAGTGGTCAAAATTAATTCACAATGCGACACGGCC:1 + chr3R 1146200 3' - transib3 42 1 78.22 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGATTTACGCATCAGAAAAGTAACTTTAAATATAGCTAATTCTGTTAGAGAACTAATTAAATGTTTGC:2 - chr3R 7879805 3' - 1360 13 1 65.35 AATTCCAGTTCTTTTTCTTTATTGGGTTTTTGTTGGTTTTTGAAGGTTGTGAGGGGTTTTTGGTCGCTGGGTGCGGGATTTTTCATTTAATAATTAGTGAT:1 - chr3L 13245916 3' - transib4 2196 1 76.24 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGGGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTA:1 + chr3L 5573568 3' - mdg3 51 2 74.47 TCGTGGCATACACCAACAACAACGTCGCTTTCCACATATCCTTTGCCATATCTTTCTAAGTTTACGCGGGAGTTTAATGTGATAATTTGTATAGATGGTGT:1 - chr2L 23039354 3' - accord2 305 1 77.23 CCCGACTATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGAAAGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCGTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGACA:1 + chr3L 23871826 3' - INE-1 552 1 66.32 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAACTTTAATATTTGGCTTAGAAACCTACAAAATAGACCTTCCAAACCTAAGAAAAAACTATAGCA:1 - chr2L 12246554 3' + hobo 2928 1 38.61 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAATTTAATATAATTTATAACCAGTATTCGTGAGAATCGCACGAAATGTAATCCCAAAGATATTATTTCAAT:1 + chrX 11503559 3' - 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chr3L 25884068 3' - Doc 19 1 55.45 ATTCGAGAGAGCCTGGAGCGACCTCTAAAACCACGACCAAAAAATTATGGGCCAAAAAATCGAAGTCACGTTGATGGTTTAGGAAGCGTTGGGTTAAGTAA:1 - chrX 2498924 3' - 1360 77 1 61.39 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGAAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTG:1 - chrX 10196104 3' - 297 44 2 73.27 TTTTGGTTTTTATTAGCAGGTAGGATCGGCGATGACGTCGCAGTCGCAGAAATTTTTTGCGCCAAAGCCAAACCAAAAAGGACGAGGACAATTCGG:1 + chr3R 11328144 3' - I-element 379 1 78.12 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGAGTTAGAGGGGTGCGGCATGGGTGAGAGATGAATGCACTTGACAAAGCAACGCCTGCCT:1 + chr3R 11389824 3' + hobo 2927 1 63.37 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGAGTTAGAGGGGTGCGGCATGGGTGAGAGATGAA:1 + chr3R 11389798 3' + hobo 2902 1 63.00 TAATGTGCATACATATGGAAAAAGATTTCTTATGTACTACGTGCCTACCTGCCGAGTGACTGGGTATAAAAGTAGATTTTTTATAAGTTTAATCTTCAATA:1 + chr3L 23960790 3' - Tom1 177 1 64.36 GGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTT:1 + chr3L 24210992 3' - 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chr3R 24252301 3' - G6 1706 1 64.36 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCACCTCGTTTCTTTTTCTTTTATAAAAAAGCATAATGTGTTATGCTCTA:1 - chr3R 19515776 3' + 412 7540 2 72.28 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAGTGAATTATTTAATCGTTTAAAAG:1 - chr2L 18417290 3' + roo 388 2 58.42 ACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGTTGTCCCCGCTGAAAAAGATACAAAGATACAGC:1 + chrX 17492983 3' + Tirant 398 2 76.84 TGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGTACCCTCCACTACTTTATAGGGCGGACAAGGCTTTGGTTTTCTTTGTTTGCGTACAGTTCCTTTTTTAGAGT:1 - chr3R 5555880 3' - mdg3 5256 1 75.25 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAGAAAGCGCTTTTTGCGCTTTAGCTGCGAGAATTCG:1 + chr3R 8487323 3' - Doc 50 1 65.35 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTAGTCATTAATTAATATGCCCTCAAATGTAAGTCGCTGAAAATGTCTTGCTTTTCATATAATCG:1 + chr3R 13191519 3' - mdg1 7053 2 62.38 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGCAATAGCTGTCTTTGTATTTTG:1 - chrX 12885721 3' - transib2 52 1 78.00 TCGCTTACGCGAGTCTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGATTCTCCAGCCCAGCAAAGAAAGCAAAGAAATGGAGACGGGGGACAAACAAAGAAAT:1 + chrX 7469271 3' + Doc2-element 4588 1 65.00 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATACAAAAGTTATCATACCAATTTCACA:1 + chr2R 21833958 3' + Transpac 5185 2 74.26 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGGAACTGGAAATGGAACTGGATACGGATGTTC:1 + chr2L 15151927 3' - Tabor 45 2 66.34 GGGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATGTATATAATCCCAAAAACTGGGGACAAAAGAGTAGTGGAATGTTTGTGCCTCGGAACA:1 + chrX 22664448 3' + opus 7488 2 66.34 GCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTGGGTGTGGAAGTGGGGCTGGTGTGGGCGTGGCAGGACTACGTTTCGAGTTTGGTTTTTGGTTGGGTTTTTGTGT:1 - chrX 20585915 3' - jockey 5 1 78.79 GTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATACATCTGTCTACTTCTAGACTCCGAAACCCAAAATTTTG:1 - chrY 424998 3' + McClintock 6395 2 64.36 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGG:1 + chr3L 3535437 3' + roo 9035 1 65.96 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCGCCGAATCTTGATATCAATATTTTGAAGGAAACTACTTGAAACCAAGCGTAAAGAATATAGTTTTT:1 - chr3L 7266491 3' - mdg1 9 2 70.30 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGGATTGTTTAATTAGTTCTGTCTTGGCATACAAAAAATAGTTTCAAGTCCCTAGTATCTTT:1 + chr3L 7266599 3' + mdg1 7443 2 58.42 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGTTTGTTTTTTTTTTAGCGTAAAGTATTTGTTTTGAGTGAATATAAATTTTAATTATTTTTAAAGGTAC:1 + chr2R 17942180 3' - mdg3 5260 1 68.32 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGGTTTCTTAAGATACAAGTGCAACTTTTGC:1 + chr2L 10189496 3' - roo 8710 2 72.28 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCATACTTAGTGTGCGAGCGAAAGAGAGAGAGAGCAAACTGGGTATTGCT:1 - chr3L 3070643 3' + 1360 3360 1 57.43 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTCGTTCGATTCGCTTACATGCTCCTTT:1 + chrX 21049998 3' - 297 6625 2 73.20 TTGACTCCCCGGAGGTAACTGGTGCAGCCGGAAAACTGTAATGGAAAACCTTTTAAAGAAGGAGTGGAACAGTGCGCTGGGAGGAAATTGGCGCTGTGGAA:1 - chr2R 2751259 3' + ZAM 454 1 56.44 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCA:1 - chr3R 11080684 3' - I-element 24 1 54.00 ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTTAAGTAAGTCAAG:3 + chrX 21945947 3' - F-element 24 1 63.37 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTACAACCAAGGCACATAGGTTGG:1 + chr3L 14558311 3' + 297 348 2 80.20 TCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTAAATTTAATGAAGAAAATAAAAATAATACATTTTTTCCCATAAAAATATTTGACATAATA:1 - chr2L 13053170 3' - G2 296 1 59.41 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTCTCGATATATTTATAGGCTGGCAGGGCA:1 + chr2R 14046401 3' - jockey 4713 1 71.28 GTTTCAAGTATTTATTGTGACTGATTGGAGTACAATATTACTGCACGCAGGCAGCCTTTCTTAGTTTGGGCCCGTCGCACTTGCACGGTGAATATTGCCTT:1 - chr2R 503358 3' - Dm88 4532 2 55.45 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAGTGAATTATTTAATCGTTTAAAAGAAACGATAAAGTAAATCGT:1 - chr2L 18417271 3' + roo 407 1 77.23 CAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGCACACGTAACAAAACGATAATAAAATCCAACGAATGTGAGTATCTGCGTGCCA:1 - chr2R 17942591 3' + mdg3 170 2 54.46 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGG:1 + chr3L 3535435 3' + roo 9026 1 69.31 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATACGTTGGCTTCGTGCATTTTACGGTGTTGGGAAACAGACGAAATGGACTCATTGATTCCAATTGACTGATTTC:1 + chr2L 3842932 3' - roo 8667 2 76.24 CAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAACAACAGGAGGGCTGGAGGAGATCGGTGGGTTGGCGATCGGCTAGATGGAGCAGGAGCCAACCGGTG:1 + chr2L 11073853 3' + roo 9059 1 66.34 TCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTCGCACCCACACCAGTTGGGTGTCCTCCAACATTTTGCGCACTGCAAAGGGGAAACAGAAAAAAAAAAC:1 + chr3R 24259256 3' - P-element 373 1 75.25 TTTTTACAGCTCGCTTAAAAGTTTTGATCTTGTGTTTGTTTGTGATTTCTTAAATGCTCTGTGCAACGTTTCGTTCAATTAGTTGTTTTATATCTAAGAAG:1 + chrX 4193058 3' + Cr1a 368 1 69.31 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGAAGTCCTTATATGCGGATTATGTTATAATGTTGCACTGGAACCCATCGCTCTCC:1 - chr3R 16110162 3' + mdg3 223 2 53.47 ACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTCTGCTGCTCCCCCAGCAGCGGTTC:1 - chr3R 20430776 3' + hopper 1361 1 80.20 TTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGGGTGTCGCTCTTAGTGTGGGAG:1 + chr2R 20426286 3' - Quasimodo 96 2 78.00 ATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAAATGCTTTGTTTCACGGCAATGGGAGGGCATAATTGATTGGGGAATGGGT:1 + chr2L 1673755 3' - 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chr3L 24242263 3' - Idefix 183 1 62.38 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAGTAATTTGGGGACCAAAGAATTTTATT:1 - chr2L 21631836 3' - pogo 46 1 79.00 CAAAACAAAACAAAAAAAAAAAGAAGTGGGCGGGGGGCC:1 + chr2L 9874657 3' + R2-element 3585 8 66.67 CTGAATTTCCTCATTTATAAGATTTAAATGTAGGTACTTAGCTGCTTTTGGGATATGTATAGTTTATATTTGAGCTAAATCCTGGACTATAATCCTTAAGC:1 + chr3L 9955257 3' - Doc2-element 4509 1 79.21 GGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATA:3 + chr3R 10736111 3' - McClintock 5986 2 66.34 GTGTGTGTGTGTGTGTATGTATGTGTGTTACTGCTTATGAGTGTGTGGGTACTACCCATACACTGGCATGTGTGTTTACGTTCCATTTAAAACATGG:1 - chr2R 14443524 3' - Quasimodo 33 2 79.38 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGCACACAGATGCTCACTCACACGGAGACGGCCACAAGACTCATTCGTAGGGACTTTC:1 + chr3L 15057002 3' - 412 21 2 58.42 GTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAAT:1 + chrX 8027466 3' - Juan 39 1 61.39 GAAAGAGAATGAGAAAGAGAAAGATAGTGAGAAGGAGAGGGAGTTGGGAGTGTGGGTCGATTTGGGAGGCCAAGGGCCAGTTGAAAGGAAGCAAAACAAAG:1 - chrX 8674976 3' + invader5 204 2 82.18 TACACATACACACACACACACACACACACACACACACACATACACACAAAGACAAACACACTCTCGCGCAGTCGGAAACTTTCACAATA:1 + chr3R 6419116 3' + Quasimodo 32 2 71.91 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGCGCAAGTAAATCACAGACTTGCACACACA:1 + chr2L 16276171 3' + 1360 3342 1 75.25 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCGCACATGCACAATTGGATGG:1 + chr2R 22746073 3' + hobo 2900 1 74.39 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGTGTGTGTTCATCTCGCTTTCCCGGTAATTTTCAGGTGGAAAGA:1 + chrX 9649969 3' + blood 7355 2 59.41 TATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATATATACGTGTGTGTATACTATATGTGCCCGCT:1 - chrX 11262826 3' - Quasimodo 34 2 74.26 AATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATGTGGGAAAGAAAGAGAGAGGAGCAGCGGTGTGAGGGAGACAGAGAGTTGCCAGCACTTGGCGGTCATTGT:1 - chrX 9450986 3' + I-element 121 1 74.00 TCTGTTCTACATAGCCTCGGTTCGACGATGCGTTAGAGTGAGACAAATGCTTGTCCTGTGGTGAGTTCGGACTCACTGCTGGTACGTGACCGGTACCAAAG:1 + chr3R 26077759 3' + invader6 158 2 71.29 ACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGAGTGTATGTGTAATTTTGACATCCGATAATTTTAAAGTTGTAAAATCAAA:1 - chr3R 15920717 3' - G-element 35 1 51.49 GTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAACTAGGGGAACGAGAAAAAAAAAGAACGAGAC:1 + chr2R 10360786 3' + I-element 338 1 71.29 GAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGACACGGCAAGGTACCAAAAATTACAAAGACGACGGCCCACCGGAGCCTATGGAGGTCGATCCCTCACTTTCTA:1 - chr3L 25783636 3' + I-element 344 1 67.33 TCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATTGGCGGAAAGCATGGAAAATAAACCGAGAAAGAGGCGGAAAATTATAATTAGTCATT:1 + chr3L 2689978 3' + Doc 172 1 56.00 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACG:1 + chr3L 24210969 3' - HMS-Beagle2 6891 2 58.11 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCCGCCCCCAAAATCCCCCAACCCCA:1 + chr3L 17767702 3' - hobo 51 1 75.00 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTTACTCAAAACTAACTTAAAG:1 + chr3L 3535481 3' + roo 409 1 77.23 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAGTAATTTGGGGACCAAAGAATTTTATTCAGAATAAAAAAAAGGCATTTCCAAGTCTATTTT:1 - chr2L 21631802 3' - pogo 13 1 70.30 ATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACATTTTTTGAACCTAACTACAATTTAAAGACACAACT:1 + chr3L 18978516 3' + roo 370 1 63.37 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTCCGCCGTCCCTTTCGTTTCGAATGCTACTCTCTCTTTCTCTCGCTCCGCATTTCGCAATTTAATTTAAT:2 - chr2L 19684574 3' - mdg3 5260 1 72.28 GCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTT:1 - chrX 17492885 3' - Tirant 31 2 56.44 TCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGAGTTAGAGGGGTGCGGCATGGGTGAGAGATGAATGCACTTGACAAAGCAA:1 + chr3R 11389815 3' + hobo 2918 1 54.46 CTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCATTGGTGCCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGT:1 - chrX 21667950 3' - Tabor 81 2 68.32 CATCGAGGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTCAGTAT:1 + chrX 19820784 3' + Rt1b 4974 1 75.25 TATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCGTCTG:1 - chrX 19820621 3' - Rt1b 4965 1 66.34 AGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCAACGAAAAATCGAATAACACTCTGTTTCTTTTGAAATTTAGAGCAACTGGCATGGTGGCAACTCTGGG:1 + chr3L 23024034 3' - INE-1 557 1 75.25 GGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTGCCAGTGGGTGACTTATCTAGATGTGGGGTTTGGATTTGGAGGGACTA:1 + chrX 10789909 3' - Idefix 7034 2 78.22 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATA:1 - chr3L 8044315 3' + mdg1 7426 2 56.44 GGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGATCATTTCGAGGACCGCAAAACAAAATGTTATCTG:1 + chrX 20585446 3' - jockey 241 1 66.34 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTA:1 - chrX 9816264 3' - BS 5008 1 55.42 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCAAAAACTGAAACTAACTGAAACTGAGAAATTGAGTTGCCAGCGA:1 + chr3L 10576858 3' - roo 8694 2 60.40 CAAATACTAATCCAGGTTTCTTTCTTCCAGATGTGAAAAGCCGGTGATTGTATGATTGTCCAGTGGTCAAGTAAGGAGTCGGAAAAACAAAAACAAAAAT:1 - chr3L 14988305 3' - TART-B 403 2 21.00 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTCTGCTTGATTATGTTGATTAAACATGGTGCTTGTG:1 + chrX 12166588 3' + pogo 2066 1 63.37 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAACAACAGGAGGGCTGGAGGAGATCGGTGGGTTG:1 + chr2L 11073819 3' + roo 9027 1 67.68 AGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCA:1 + chr3R 15790056 3' - flea 4754 1 77.23 TTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATA:1 + chr3L 5267269 3' + Juan 4178 1 62.38 GGTATCTGATAGTCGAGAAACGTCCTCTTGTTTTCGCTTCCATTTTCGTTTTTAGAGGGGGGCGAAAAGTGGAAGGGGCTGGCGGTTCGGTTTGGATAGAG:1 - chrX 18146938 3' + INE-1 557 1 68.32 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGTTTTCGCAG:1 + chr2R 1725952 3' - Doc 22 1 63.37 GTTTGTAGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAACATGAGTTACCAATTGCAGACTTTTATAGTCTAGTCCATTGTCTAGCTTATGTATCTCAAACACAATCG:1 + chrX 22680715 3' - INE-1 218 1 43.88 GTACATAGGTTCTTAAATGTAAACATAAACATAATTTTCTCCTTCGGACGGTTTAGCATCCACCTTTAGACTGCGTTCCTTTTCGTCCGGTACTCTTCTCG:1 + chr3R 3797317 3' - Tirant 197 2 67.33 AGCTCCGTTCCCTTGCGTATTTTTCGCACGAGAAAAATGGGGTAACACGAGATTTAGCGCAGAAAAGATGAGCTCTTCTTGACTTTGAGACATGTAGACTA:1 - chr2L 22227949 3' - Rt1c 5131 1 65.35 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAGACCCCCCTTTTCTCCGCCTGTCGCTCAGCATTTGGTTTTTTCTCCAGTCTGCCGCATTTCCTT:1 + chr3R 30076513 3' + hobo 2928 1 55.45 ATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTT:1 + chr3R 15790091 3' - flea 4719 1 68.32 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGTCGCCCGGATCCGGAATGTAGGTCATGTTGGACGCCGTTTTGGAGGAGCTACCACTTCGCCAAG:1 - chr2R 12249688 3' - jockey 17 1 68.00 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCCAACGCCCAAAAGTATGCAATGCAATTAATGCGATGCCCCCAAGCGGGAGACATCATGG:1 + chr2L 7904587 3' + hopper 1403 2 69.00 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGCTAGCAGTCACTAGTCCACTT:1 + chr3L 14286069 3' - 412 7084 2 55.45 AATAGAATTTTGGTTTTTTTTTTATATGTGAAAGCAAACGTGTTAACTTATACTAACAAGCGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGAC:1 + chrX 19038388 3' - transib4 2546 1 49.50 CAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAAGGCAGCATTTTCCACCACACCCAATCACTTC:1 - chr3R 11081472 3' + I-element 5134 1 73.27 GAGTATGTGTGTGTGTGTGTGCTGGCCAAGTTGTTTTCATTGTTAACAAGCTTTCTGTTGTTGTAGGTCGCAAAATCAACAGCAACTGCAAC:1 + chr2L 16458281 3' - accord 7031 2 79.35 GGATCAACGCGCCACCAACGGTGGTACGTGCCGTAATCCACGTAAGGGCGGCTTCCTTGGGACAATTTTTCATAAGGTTGAGCATTCCGCTGGTTACAGAT:1 + chr2R 5212423 3' + baggins 29 1 53.47 GCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTAC:1 - chrX 21564098 3' + invader4 3045 2 62.38 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGT:3 - chrX 17492886 3' - Tirant 8139 2 58.42 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCATTGCCTTTACCGCAACTTCGTACTCG:1 + chr2R 12780430 3' - P-element 49 1 30.00 CTTAGTTCATATTCGGAACGCTCCATTTTGAGTCCAATTCACGCACCGCCCGCTTCAGCATATCATGCAGACCGGGCGGTGCGTGAATTGGACTCAAAATG:1 - chrX 3281039 3' + 17.6 443 2 51.49 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAA:1 - chr3L 25884102 3' - Doc 52 1 72.00 TTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGT:1 - chr3L 25232772 3' + accord2 168 2 56.44 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAGTATGTACTTGCTTATAGTTTCTTTTAAAGCTTACACGTTT:1 - chrX 8303404 3' - flea 32 2 61.39 GGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCCTTCGATGGGTTCGATAGGTTGGATACTACGCTCGACATGGGCTTGTTTGGCTAATGGA:1 + chr2L 1009701 3' - I-element 5142 1 59.41 TTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCATGGCATGGAGTGGAGTGTGGTGGGCTGATGTGGTAGGATCGGG:1 - chrX 2843667 3' - Quasimodo 109 2 56.44 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAAAAATCCAGAAGATTTAGAAGTGCACCG:1 - chr3R 28333530 3' + pogo 2057 1 71.29 CTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAAAGGAGTCTCATCCAAATCTAAAACACACTATATACACATACATACAT:1 - chr3R 7381387 3' - invader4 360 1 64.89 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTCGAGTGAGAGCAGTGAGAGCTGCAATCGTAATTGCGCTGGGCTAGAGAGTAAAA:1 + chr3L 4692322 3' - P-element 22 1 57.43 CTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATTTGTGCATACCATCAGACAGTGAAATACTAATAT:1 - chr3R 23173110 3' + Burdock 6352 2 68.32 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTTTTTCTGCAGATATTTATTTCTTTAAAAAACAATATTACGTCATTCCGAA:1 + chr3R 9199838 3' + roo 9047 1 52.48 CAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGGATCTCCGGCGACTGTTT:1 - chr3L 17767681 3' + hobo 2882 1 78.22 ATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACTAAGTAAATATGTAGAATTGTGCATAATAATGCTAATTAGCTGGGAAGACCAGGAAAGCGAAGACT:1 + chr2R 20128935 3' + Doc 245 1 71.29 AGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCTATAGTCTTCAATGTAGCATT:1 - chr2R 10552682 3' - INE-1 557 1 90.10 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTAGCCAGCGAACAGCATCTACATATTAACGTTACGGATATTTTCCTACCAAATTGCAAACACGGAGAGCGAA:1 + chrX 22597256 3' + hopper 1410 2 72.28 AAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGAATTGTTCGCCGATTGGGTTTTCATTTACGGAGAATTTCCTCCGCAACT:1 - chrX 5900703 3' - I-element 4997 1 55.45 AAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAATTGCTTGTTGTTGCGGCTGCTGCGGCTATATTTAAACATAGTTTATTAGTTGTTGTTTGCAGCGATTAAACGCG:1 - chrX 19070872 3' - Max-element 308 1 54.46 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGGCTTTTTATGGCATACTTTATGGCGTTGGAATTGCTGCGCTTAA:1 + chr3R 30326361 3' - pogo 30 1 60.40 GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCATGT:1 + chr4 202882 3' - 1360 67 1 75.25 GAGTAACGGGTATCTAATAGACGAGGAAGTTGATTTTTTGTTATTGTCATCTGTCTGACCAATTTCTATCTGTTTACCAATTTTGACGACTCCAAAATTTT:1 + chr2R 5743857 3' + INE-1 549 1 57.43 CACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGCGTGTGTGTGTGTGTGGGTGAGCTAAGGGTGGAACAGAATGATGTGTGTGGGTTTAAG:1 + chr3R 24460564 3' + hobo 20 1 58.42 CCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAGACCACTAGAAAGCCCGTGGGTGGAGTAAACAACAAGCTGGACAAGTCCCCCAAAATCACTTTAAACATC:1 + chr3R 24782149 3' + I-element 109 1 73.27 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTGCGCTTTCA:1 + chr3R 19513417 3' - jockey 4689 1 58.00 AAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTTTCATTTCTCGCTT:1 - chr3L 5267189 3' - Juan 3975 1 73.27 AACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATATAAGGCAACCGAGGGATCTTTGAGCTCCAAAACACACATTTTACAGGAGCCTTAATGCTCGCCTCAGGCT:1 - chr3L 25146375 3' + X-element 4464 1 59.41 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATATATTATCTTCGAGTCCTATCTTACAAGTAAATCCATAACTTTAA:1 - chr3L 3862583 3' + hobo 2908 1 58.42 TAATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCAACCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAA:1 + chr3R 9236178 3' - 297 6600 2 71.43 GTGGTTATGTATGTGTGTGTTTTTGCAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATGTGTGTGGCACATGCTTTGATTG:1 - chr2R 18078706 3' - Quasimodo 43 2 71.29 CTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGAAGCTGGGGCGGAAATGAATG:1 + chrX 21219498 3' + roo 394 1 59.55 CGCCCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCCCTTTGACTTCCTATAAGTGACCAGCACTTCGAGGCTCATTGCAATCATAGATTGTATCAATTCCATATT:1 + chrX 987045 3' + F-element 453 1 73.27 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACCAATTCTGGACCATAGTGCCCTGGCGGGAATGTGGCAACTAATTGGTGGC:1 - chrX 21494628 3' - transib2 48 1 70.30 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCT:1 + chr3L 15869719 3' - pogo 37 1 65.35 GTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGTCGAGTTTCAAGTGTTTC:2 - chr3L 8044284 3' + mdg1 419 2 76.24 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGA:1 - chrX 3446533 3' - I-element 41 1 71.00 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTT:3 + chr3L 24210992 3' - HMS-Beagle2 8 2 68.04 CGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTCCGAGGACTTTCGGAGTTGGAACGCAGGTCATCGGCC:1 - chr2L 1936533 3' - blood 7337 1 62.38 AAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATCGAAACGAAAGGAAATGAAGGAAAC:1 - chrX 7630605 3' - hopper 143 7 87.23 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTGGTACCTTAATCACCAAACAATCACTGATCCAAAAACAGAATAAGAACCATTCTTT:1 - chr3L 4909315 3' + hobo 2922 1 61.86 CGGTTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTCGAGTGAGAGCAGTGAGAGCTGCAATCGTAATTGCGCTGGGCTAGAGAGTAAAAGTCTT:1 + chr3L 4692327 3' - P-element 17 1 62.38 CTCGCTTTATGAATACAAAAGAAATACACACACACACACAGGAAAGGCACACAAACCAATTCAATCTGCAGCAATTTGCCATAATTTTGAGCGCTTAAATG:1 + chr3L 8038691 3' - invader5 3771 2 77.23 AGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTACGGATTGGCATATCGGTTGGAATACA:1 + chr3L 5573594 3' - mdg3 5284 2 52.48 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACAAATCGCACAATGAACAGTGGTTAAA:1 - chr3R 12546826 3' - hobo 50 1 73.27 GAGGATACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCACCATCATTAAACGCCAAATCTTGAGCTTTGCGGAGCTGAACTCCTAGCTCGACTAACAGCTG:1 + chr2L 22320929 3' + mariner2 90 1 62.38 ATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGAGATTAAATGAAATCTTGAACTAACATTTTAGTTCTTATATATA:1 + chr2L 15174162 3' - Juan 4048 1 49.44 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCAAAAACTGAAACTAACTGAAACTGAGAAA:1 + chr3L 10576843 3' - roo 45 2 75.25 GAGGAGTTAACACGAGCAAGTTAGAGGGTGCCCAATTTAATTTTATATTTTGTATACATTTTTTTAAATGATCACCTTTTTGTACTTTGGTGACGTTTGTT:1 - chr3L 23524212 3' + gypsy10 5639 1 72.28 TTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGTGATAAAAATGGCCAAGAAATTACTTATAGATTGAATGGAATCGTCAGGCGCTCCAAGACTCCAGGTCTTTTG:1 + chr3R 28422935 3' - Doc 4670 1 73.27 GGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGATGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATACCAGTTTATCAAACCAGTTTAGACGCAATGCGAAAAGCCAAA:1 - chr2L 3484571 3' - I-element 140 1 62.38 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCAATCTTCTAAACAGGATAAATGTAATTGCGCATGAATTTCTACGCATATTTCGGCGTCGCTGTCTGAGCTG:2 + chr3R 17557472 3' - mdg1 7042 2 77.23 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACTTTGCTACATGTGAATTTTCTAGAACACACGTATCACGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATAC:2 - chr3L 25245594 3' - Tirant 8119 2 67.33 TACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGA:1 + chrX 19034167 3' + hopper 1368 1 70.30 GACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACCCTTATTTATGTTTTTTCCAGTATGCCCCTTATTTTAGGCACGCCCTCAATGTCGCACAAAG:1 + chr2R 25216620 3' - 3S18 17 2 62.38 CAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCCACTTCTTTCTTCAACGAGCAAACAACAACTCTCCTGCCGTCGTGCAAAAAACCTCTCCCGTTGCGTTCTTGCT:1 + chr2R 4023468 3' + Doc2-element 353 1 72.28 GTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCC:3 + chr3R 15790069 3' - flea 4741 1 64.36 TACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACG:1 - chrX 157205 3' - I-element 24 1 53.47 ACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCCGCAACCCGCTGTCC:1 - chr3R 4546023 3' - jockey 4767 1 69.31 ATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGCTGTTGTTGTCATTGGCGCCTCGGGGTCCTTTGATTAGATTTTGTAGCTAATTTT:1 - chr3L 14504005 3' - 297 6519 1 61.39 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAGATGATGACCGATTTTCAGAAAAAGATCGTTCAAATGATAGAGATTCGGAAAATTATTGCTCAAAT:1 - chr2R 5237645 3' + hopper 1378 1 65.35 GAGGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTCAGTATTCTC:2 + chrX 19820788 3' + Rt1b 4978 1 79.21 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAAACCCCAAACGAAAGCTCCCATACAACATAAAAAAAAAAATAACCGA:1 - chr3L 1447999 3' + roo 8985 2 54.46 TCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTATGTCCTAGTAGTTTCAATTTCAATGGAGAAGTAACAGATACTTGA:1 - chr2L 19703563 3' + mdg3 18 2 55.45 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTAATCCAAGTATCATTGCAGGTATTGAACCCATAATAAAAG:1 - chr3R 3920637 3' - I-element 6 1 67.33 TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATTATTTGGAAAATGCGTCTTGCTTATAATTGATAAGTGAGCTT:1 + chr2L 11084396 3' - blood 7041 2 60.40 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGCTAGCAG:1 + chr3L 14286055 3' - 412 7098 2 69.31 ATCAACATAAATATAAATATGTAAAAAGTGTTGTCACTCCAACGCCCACAAACCGCTCAAAACTGCCACGCCCACACTTATAAAAATATTTTGTTATTTTT:1 + chr2L 20795289 3' + 1360 2957 1 72.28 TTGATATAACATAGTAATTATTATTTTAAATATTAAATATTTATGCCTATTTTTTTACATTTTCACTACACTTCAGTTTATTGTTTTCAAAAAATATAAAT:1 - chr2L 3921281 3' - jockey 4840 1 71.29 ATAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGGGCAGAAATAATAGAAAAGAAGAACACAAAGGGGCTTGAGTGTTAATTATGGGTAACGCGTCTTAAGCCCAATCACT:1 - chr3R 16806952 3' + X-element 4634 1 57.43 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACAGTTTGTTTGCGGCTCGCTCT:1 - chr2L 12911269 3' + mdg1 7422 2 75.00 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAATAATGTTTAACCTCAAATAACTGAGTTTCCTTTTATTGGTC:2 + chr3R 19515891 3' - 412 12 2 67.33 GCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAACGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACATATACAAGTATTAAGCATAG:1 - chr3L 26371359 3' - Tabor 6894 2 81.19 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGT:1 + chrX 19034187 3' + hopper 1388 1 52.48 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTC:1 + chr3L 15869718 3' - pogo 38 1 66.34 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGGTGACTTTCTTCACTCCTGCAAGTTCGTCGCTTTTTGCAAAGGTCCTGC:1 + chr2R 15402922 3' + roo 9045 1 52.48 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCATCACTTTTTTCAAAAGTTAAATTAAAA:1 - chr2R 22751163 3' - Doc 51 1 70.71 TGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCATATACCCTATATCTATAACGCCACCAGACATTGCGAATCCTTGACTCCTTTGCACTCTTCTACATTGACACC:1 + chr3R 11378030 3' + hobo 2633 1 76.00 GTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAATAAGCATTGACATCCAATTGGTGCAGCTCCTTGCTTTGTTTCATTTCAACATTGAATAGCCCACGTA:1 + chrX 7628277 3' + Cr1a 453 1 71.29 TATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATATATATACGTGTGTGTATACTATATGTGCCCGCTGA:1 - chrX 11262824 3' - Quasimodo 30 2 69.31 CTTCAGAAGACGGGCTACTTCATATTAAGCTTAAGTTCTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCAAAGTTCTGTGAACTTTGAATGTTATATTCTGTCGGAT:1 - chr2R 1277197 3' + gypsy4 167 2 63.37 ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCATATCTACGGGCGCCAGCC:1 + chr2R 17348643 3' - jockey 8 1 72.00 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTGTCCAAATGAGTTCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAACTGTC:1 - chr3R 29361013 3' - 412 28 2 51.49 ATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGACCTTGAATGGGAATGGGGAATGCACTTTCACTGGTGAAGTACAAGAAT:1 - chr2L 18234043 3' - I-element 5111 1 69.31 ACTAATTGCTGGCTTTTTATGTGCAATTGTTTGTTTTTAGCCATATTTGAGATAAGTTGATCGAGCCGGCGTATGAAATATTGTCTCCTATCGGCAATGAA:1 + chr3R 834871 3' - I-element 5215 1 64.36 ATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTATCTTTGCTGGTGGAGGTACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 + chr4 1294994 3' - HeT-A 6 1 47.52 CTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCGAAATTTCTTTACGCTTACCTACAACAAGAAGCGATTTAATGTCACTCGCTAGAGAAGCCG:1 - chr2R 3609535 3' + Doc2-element 470 1 62.38 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAGGTTCATCCCATTGTAGGGGAGAAAAGGCACAAGTTTTCCGGGTATTCC:1 - chrX 22664351 3' - opus 7140 4 55.45 AATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATACAAGGTATCAGTTGGAAATTAAAGTAAATTTAATTTAATTTAAAA:1 + chr3R 26830636 3' + 1360 442 1 57.43 ATTGATGGATATAGTATGGGAAATTAGAAGAAATATAGGCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATATTTCTTCTAATTTCTTCTATTTCTATTTGTTG:1 - chr2L 7697942 3' - 297 6523 1 58.51 CTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACATATTGTGCACATGTGTATCTAGCC:1 + chr2R 9214122 3' + Transpac 5182 2 81.19 TTTATATTAAAATATTTGTCATTAGAGTATCAGCTTGCGACGTGTGAAAATGGCAAAACAAAGGGTGCGGGGGTGGCGGTAAGGAGGAAAATCCGCAGTAA:1 - chrX 12264042 3' + 1360 392 1 55.45 CAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCGAATTGTTGTCGGTCAAATTAAACAAGGTCCTGATTATTGAACTTTACAA:1 + chr2R 3144108 3' + Transpac 5206 2 56.44 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATC:2 - chr3R 4504070 3' + blood 345 2 58.42 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGGGCTAAAGATCTTATATGCTTTGTTGGTCAAAGGTGTATCTTTTGTTTCTT:1 - chr3L 21393447 3' + roo 9048 2 55.45 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAAGCGAAAGTGAAAGTGATGGCTAGCGGAATGAGAAAGAATGAGTCGATG:1 + chrX 9523782 3' + hopper 1391 1 55.45 CATTTTATTTTTATTTTTTTTTTGTGCCCCCCGAGCTTCCCATCCCCC:1 - chr3R 20130700 3' + hopper 142 3 91.67 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTGTCCTGGTACCGGCTGCTATTTATTTT:1 + chrX 12193514 3' + hobo 2894 1 71.72 TTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCAC:1 - chr3L 5267206 3' - Juan 3992 1 56.44 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGGGCTAAAGATCTTATATGCTTTGTTGGTCAAAGGTGTATC:1 - chr3L 21393458 3' + roo 9037 1 57.43 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTGATCAAATTTGTGACAGCATAAAAAATTACGTTTTTGAAATTTTACGTTGCCGCTTTTTA:1 + chr2R 17277639 3' - jockey 25 1 41.58 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCA:1 - chr3L 8044320 3' + mdg1 7421 2 61.39 AGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATATCTTTACTCTCATTTCTCAAGCCTGGGCGCGTTATAATCCGCAAACATTAACACT:1 - chr3L 3739062 3' - invader4 2774 2 65.35 TACGCATCTTGTTATTCTATCGTCTTTGGTACGATGTTGTATACTGTGCTTTTATTACCGTTTCGAAATAAGCATGTGGATACAAATATTTTAATAGCCAC:1 + chr4 331435 3' - 1360 7 2 62.38 ATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTGTTCAATATAACCAAAGTATTTAACTTG:1 + chr2R 8275683 3' + F-element 4574 1 75.25 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTTTT:2 - chr3R 11080679 3' - I-element 20 1 58.42 TTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTAGAAGTTTCGCTGCAGCAGCATCAGCAGCAGCAGCACAACAAAATCA:1 + chr2R 10716641 3' - hobo 2588 1 53.47 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAAACAAACAAAATGTAACA:1 - chr3L 10576783 3' + roo 9044 1 56.44 CCTTGTGCCCAAATTTGCCTATGCTCTTTATATTTTGCCGTTTAAGACAAGTTTGAGATTAGCTGATGAATTCTGATCTATATGTATATCGCGTTTGAAAT:1 + chrX 5182199 3' + transib3 498 1 72.28 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGCTTCTTGTGATTTACAGCTCTTACATATCAAGCACTTCTTTAAACTT:1 + chr3L 10305392 3' - 412 7081 2 51.49 AACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGCGTATACGAGGCCCA:1 - chrX 9816239 3' - BS 5001 1 67.33 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACAGTATTTCATCTTCATATTTGATAAATAATAA:2 + chr2L 14993451 3' + 412 7504 2 64.36 TTTAATTTTTTTAATTTTTAGTAATTTTATTTATCTACTATTTTCGTCTATTTGCAGCTAATTATGACGCACTTTTTTCTCAGTGAACGCATCCCTTTTTC:1 - chrX 8941219 3' - HB 315 1 71.29 TTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGACAAATGCCCCATAGTGCTTTGGCGCCCCCGCAAAATTTATGAAGCATA:1 + chr2L 17694309 3' + hopper 1371 1 67.01 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTTTTTATGACCGCCGCCGCC:1 - chr2R 14575819 3' - pogo 52 1 77.23 GCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCACACTACTCAAATGTGATAAATCAACCTCATCAAATATGTCAGCCTGCTT:1 - chr2R 3603581 3' + Doc2-element 387 1 54.55 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTTACTCAAAACTAACTT:1 + chr3L 3535477 3' + roo 405 1 73.27 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTTGCCTAAATTGATCGAAATG:1 + chr3R 7015496 3' + roo 358 2 76.00 AACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCGTAATATCCGTCCAAAAAACTTTTTGAAGCGCACTTCCCG:1 - chrX 20770431 3' + F-element 300 1 60.40 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGCATAAACAGATTTAGAGTCGAGTGCC:1 + chr3L 18523645 3' - 412 7101 2 79.21 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAGTATATTAACTAAAATCTCTACTGCCGCTCT:1 + chr3R 6138310 3' - 297 42 2 73.27 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACTTTGTCCTTAACGGAAGCATC:1 + chr3R 25377437 3' - jockey 63 1 78.22 GGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCGCAGACACCCCGGAAAATCCTCGGAAAAG:1 + chrX 2765239 3' + opus 7194 2 71.29 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGCCCGATTCGAAATATATTCAGTTTGCTTTCAGAGCTCGTCCAGAGCACAACTCGTTTCGTAACGAAAAATGT:1 - chrX 11920437 3' + P-element 2884 2 72.28 ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACCCTTATTTATGTTTTTTCCAGTATGCCCCTT:1 + chr2R 25216589 3' - 3S18 5813 2 75.25 TACCGGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAGAATAGATAAGCAAATGCAAATTAGATAAGACAGTGTGGTGG:1 - chrX 14119853 3' - invader1 114 2 65.35 AACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCACGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACACACGCAAATCTCATTAAAGTTGTGAACATGTTTCAAA:1 - chrX 12341498 3' + Quasimodo 300 2 61.39 TATGGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCAATCTTCTAAACAGGATAAATGTAATTGCGCATGAATTTCTACGCATATTTCGGCG:1 + chr3R 17557457 3' - mdg1 19 2 62.38 AGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTGCACTGAGAGAAATGCCCATGATGATTATGTATTAAATGTATTAATAATGCAGTAATTTCCTGTAATTTTGCACACG:1 - chrX 8972705 3' + blood 7178 2 74.26 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGGGCATAACAACAACTGGTTTTACAACGCAACATAAAAAAAGGATACAGTGAAGCTTCGA:1 + chr3R 28326511 3' + P-element 2879 2 69.15 TATTATGTTCGTATATACTACAATATCTCATCTTTGGCTATCACTTTGTGGGTGCATTGTTCAAACTTAAAATTGATAGTTTTATGGCTCTTGCCCCCATT:1 + chr3L 5321227 3' - mdg1 1 2 78.22 GAAAAAAATAATAAAAAAAAAACTAATGAGAAAATGCAAGGGGGCGGCGCTGTTTTGCAGTTGCTGTTTGTTTAATTGAAATTTATTGACTGCG:1 + chrX 11628164 3' + BS 5093 4 59.57 CGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCCCATTCCCATGGGTGTGCATCATAGA:1 + chr2L 8343861 3' - Max-element 8331 2 75.25 CAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGATCAATACATGCGGCGGGCGTAAGTTTTAATAACTCTCAGCTGAGATAC:1 - chr2R 10620086 3' + S-element 1688 1 54.46 CCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGG:2 + chr3R 10736102 3' - McClintock 5995 2 75.25 AATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTTAAACTTTTAAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTGCTTTT:1 + chr2R 25286864 3' - TAHRE 57 1 67.33 AGAGAGAAACCAAGGAAGATCGGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAGCAGATTTCGACATTCACGATGATGGTCACATGATACGCGAAA:1 - chr2R 13567366 3' + Bica 434 1 57.43 TTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGTGTTTTTCTTTTTTGTGAGTGGAGCGTTGCGGAGCCAACGAAAAATAACAATCGGAGCGGTAATAAAGCCAGCGCAGGG:1 - chrX 19371445 3' - gypsy7 5006 1 87.13 CGACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGG:1 + chr2R 2994304 3' - gypsy8 120 2 45.54 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCATATGCTTTTGCATGCTCACGGGCGTCTCAGTGAAATTGTG:1 - chr3R 11186792 3' + hobo 2906 1 61.39 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGTCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGG:1 - chrX 10196108 3' - 297 6629 2 77.23 AAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATATCTTTACTCTCATTTCTCAAGCCTGGGCGCGTTATAATCCGCAAACATTAACAC:1 - chr3L 3739063 3' - invader4 16 2 64.36 TTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGGGGGGTGGGTATGGGAGTGTGGGAGCAACAGCAGTAAAATGA:1 + chr3L 4698717 3' - P-element 2829 1 43.56 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATTTAGATGTAATATCTACGCTTCTAAAATTCCCCATTTCAC:1 - chr3L 920481 3' - mdg3 36 2 60.40 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTCAGATAAGGAGCGCGCACAAAAGTATGC:1 + chr2L 17729358 3' - hobo 49 1 70.30 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCACAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGCTAGCAGT:1 + chr3L 14286056 3' - 412 44 2 66.34 ATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTCTATATTGATTCTATGCTTTTTTATGCGCCATACGCGCATTTTTTGTGTATTCCAAC:1 + chr3R 11912933 3' - I-element 5223 1 60.40 ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCCATGCATCTTTTGCTGTGGCAGCAAGGCGGTGGGTTGGGATACTA:1 - chr3R 17980739 3' - HMS-Beagle 6824 2 57.43 ATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAAAGTTCTGACGCTGAGCAGTTCAAGGGATTGTCGAGCGGTAAAAGAATCTCAGATCG:1 - chr2R 13932734 3' + jockey 4826 1 62.38 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACAATTTATGTCGTCTCGCGATCTT:1 - chr2R 11399191 3' + 412 441 2 75.25 GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGTACCTAATCTGGATGTCAAGGAAAGGAGAACTGTACCGCGGAAGTATAAACCAGAAACATTCTGC:1 - chr3L 14285978 3' + 412 7535 2 68.32 TCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTTCAAACTGTCAGCCCTTTTATTTATTAATTTCCTGTCCGCATGTGGTGCACCTCCAGCCAGGGAAA:1 - chr3L 21988893 3' + mdg1 7451 2 56.44 CCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCT:1 + chr3L 23678152 3' - Osvaldo 21 1 73.27 AGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATCAGAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACT:1 + chr3R 1977615 3' + micropia 5403 2 67.33 GACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTGCGCTT:1 + chr3R 19513414 3' - 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Doc 55 1 72.28 TGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACAC:1 - chrX 17492868 3' - gypsy5 6966 4 67.33 GCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTGAGAGTGCTTTCTCTTTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGGGCACATTATTTCTTATGGCATCCCGCTTTAGCCGCTGCTT:1 - chr2L 17727860 3' - hobo 2708 1 46.53 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATT:2 + chrX 21945926 3' - F-element 45 1 61.39 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAATCCCTATTAATGCCACGCTAGGCTTAAAACTAAAAAACCATT:1 + chr3R 7879890 3' + 1360 3356 1 59.41 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTCATTCCACTTTAACCGCGGCGCTTTGTGCTGGTTTTGTTCTATTGGTAAAAGGAAGTTAG:1 - chr2L 11073748 3' - roo 8679 2 64.36 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACACACACTTTTCTGTGCCGAAAAC:1 + chr2L 8898923 3' + roo 9020 2 74.26 AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCC:1 + chr3L 24210978 3' - HMS-Beagle2 6901 2 55.91 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCCATCTTCAGAACCAATTTTGTTGTTG:1 - 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chr3R 4141198 3' + I-element 330 1 69.07 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAGACCCCCTTTTCTCCGCCTGTCGCTCAGCATTTGGTTTTTTCTCCAGTCTGCCGCATTTC:1 + chr3R 30076510 3' + hobo 2925 1 52.00 AATCTTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACAAAAACCTAAGCTTACTTTTTGGGCCATGCGTGCTTGGGACCGTTTGTCATGC:1 + chr3L 9190781 3' + 412 7072 2 64.36 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACA:2 + chr3R 19515848 3' - 412 7108 2 79.21 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGTGTGGTATGAGTAATATTTAGGAGAACATCCTAAACTAATGTTCCGTTTTT:1 + chrX 12404590 3' - jockey 30 1 53.54 TTTTTTTTATTTATTTTAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAAACTCGACTAAAGCATTCTCTTTTGTTTTAATTTCCTTGTCCGCTCACTTGCATTT:1 - chrX 22637989 3' - TART-B 10632 1 80.00 GTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGGGCCTGATGATCCGTGGCGGCGTGGAGTACGGCCTGGGG:1 - chr3L 13886840 3' - Doc 4456 1 61.00 CAGGCTTATGGTCCACCCGAAGGTGTCCAAATCCCATGCCCCACCACGCCAACCTTTCAACCCAACGGACCAACGGGAGTGCGTCCCCCAATGTAGATATT:1 + chrX 10992272 3' + G5 4575 1 59.41 CCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGTTTTCGCAGCACGCTCAATTT:1 + chr2R 1725964 3' - Doc 9 1 76.00 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTGTATCATTAGGAGGCATCCCAGACACCAGACAAACCAGG:1 + chr3R 12546869 3' + hobo 2903 1 64.00 CCGCTTACACTGGCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTATTTATTAATGAAAAAAGCGATGATCCGAATTTGGGACTGGCATAAGTGAACC:1 + chr3R 3625695 3' - Max-element 8260 2 54.46 GCGCGAACAAGGCACCCTTTATCTTTGCTTACAAGTTACAAGTGCCGCTGACAAGTGTCAGCGAAGTCAATGTACTTTTTCATAACTTCTAACTCCTTACC:1 + chrX 19820353 3' + 3S18 5791 2 52.48 CACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTTTTTTCCGCCAATTATCATTTGCATA:1 + chr2R 11186435 3' + 1360 3226 1 74.26 AAGCTTTACACGCACCCCAACCAATTGCACCAGGTCGGCAATCTGCAGATTGGACTTCTCCAAATAAGCCGGCAGCTCCTTCGTCTCGATGGCCTCCTCC:1 - chr3L 4873763 3' + F-element 4457 1 81.00 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATAGATCCTCTTAAGCGACGACATTATTATTTGCGTCATAAGTAC:1 - chr3R 7102377 3' - pogo 30 1 58.42 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCAGGGGTACATGGATTTGACAGCTCCGTTTGTTCGATGAAATTAGTTCCAAGGACAATGTGATCAGT:1 + chrX 11920554 3' - P-element 10 2 69.31 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCCGCAACCCGCTGTCCGTGAAGG:1 - chr3R 4546016 3' - jockey 4760 1 76.24 TTCGATATGTGTGCACATTACAACCAAAATGAAGAGATTAAATTTAAGATATTTGCATTCTTAAAGATCTTGTTTAATTCCCCAAGGAATGTCCTCTTTGC:1 - chr3R 20240841 3' - Tabor 1 2 72.28 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTAA:1 - chr3R 3920675 3' - I-element 44 1 73.27 TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGGTCCGTTGCCATGGCAGATTAGTATCGTGCTCTATGGGGCACTGAATTTTAAAAAATTATAG:1 - chr3L 5573506 3' + mdg3 5485 2 63.37 TTAGTTCGACTCACAAATATAACAACTATTTTTCTATATAACCTCGGCATGGCAAATCTATCTTTCTTTCTTGTTGGTAAGTCTTATTTGCATCACAAACA:1 + chrX 22577186 3' + 297 380 2 36.63 AAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACTGTGACGATTTACAACGGGATAGGA:1 + chr3L 26386123 3' + Ivk 350 1 75.25 GCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTTAA:2 + chrX 21945937 3' - F-element 34 1 53.47 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTATGATTTAGAGAACACACATGAAAGACAAACAGAAAACATGGAGGAACTAG:1 + chr3L 17688233 3' + flea 235 2 59.41 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTGCAACAATTTTCCGAGTGTAGCCAGGAAGCGAAGGGCCCACAAACATCAAGTGACAT:1 + chrX 4278410 3' - blood 7030 2 60.40 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCTTTTATGATTATACACATGGAACGAGGAGGAGACGCACATGCACGCACTAGCACACATCATTTTCAA:2 - chr3L 15353497 3' - mdg1 7048 2 67.33 CAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTC:2 + chr3R 15790055 3' - flea 4755 1 78.22 GAACACACTACAACATGGATATAAACACATACTGAACAAATTGACCATTGACTCTGCCCATAAACTCTGCAAGTCGCAAAACTTTGGTGCCTCCTTTTCCA:1 + chr3R 28138333 3' + hopper 965 2 66.34 ATTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCACCCATTCCCCACCCATTTGGCATTGCAAAATTAGTGCAAAGCA:1 + chr3L 18793068 3' + P-element 2856 1 48.51 ATATAAATTATAAATTACAACATTGCCAGTAGCCACAATCTGACATATTGGAATGT:1 - chr2L 15194710 3' + copia 255 1 60.71 GCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAA:1 + chrX 21668052 3' - 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INE-1 533 1 64.36 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACAATTTAAAATTGAATGTAGATATGAATAGAGGATAAACCACAAACCTCTCCAAG:1 + chr3R 29668698 3' - 412 7075 2 57.43 ATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGAAGTTCATACGGTAACGCTTCCTTCTCCCTGTTACATAAGAATATTACTAAAAGAATATAACA:1 - chrX 22545313 3' - INE-1 163 1 73.27 ATAAGTCTCGAGTCGAACGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTTTGCCTTAAAAGGTCCGACAAAGGCTTAGCAGTCACTGC:1 + chr3L 23866779 3' + Ivk 5303 1 59.41 GTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGATTACAATTACAATTATAATGCTGCACTATGCATGTGTAAGAGTCTGTGTCGTGTTTATAGGTATGTGTTATG:1 + chr2L 9491431 3' - Quasimodo 341 2 73.27 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTTGTGGTCTCGCCTATGTTTTCA:1 - chr3L 494646 3' - Transpac 4970 2 82.18 TCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCTGCAGAAGGGGAGCCGGAGAAGCCAACACGAAACTGTATGAAAGCAGAAAAATGTGAGGCCATAAA:1 + chr3R 20430839 3' - hopper2 1182 2 62.38 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAAAAATACCTTTAATATTATATGTTCCTAGATGGCATTGTATGTAGCACTTTTCAGATAGCTTAGC:1 - chrX 17388652 3' + flea 5005 2 66.34 GAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAATATACACAAAGTGCTAACTAAAAAA:1 - 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Osvaldo 18 1 70.30 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCTGGCGGAGCGCGGATGGGGATCTTTCGGCAGGCACTTGTTCACCACTGTCCCCATT:1 + chrX 7145087 3' - hopper 17 1 60.40 TGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCC:1 + chr3R 19513386 3' - jockey 4721 1 77.23 TGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTGAGTGGTTGGGTTTTATGTGGGCAGTGGGCGTGGCAGTGCTTTACAATGCGTGGGAGTCGCTCT:1 - chr3L 5278955 3' - I-element 5125 1 68.00 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTTTTTTTTTTCAC:2 - chr3R 11080670 3' - I-element 11 1 67.33 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTG:1 + chr3R 19513409 3' - jockey 4683 1 58.14 AAAAACTCAACGAGTAAGGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATTCTTAACGATATTTTCACTAAATGGCTATAAAACAGATATCAAGCTGTTACTTATT:1 - chr2L 10104256 3' + roo 389 2 55.45 AAATATAAAGTAAAGTAAAGTAAAGAGTTTTAGGTGTCCAGAAGGTATCTTTTTGACAGAATTGTAATTGGAATAAATACTGTATGTATTTCAAATATTTA:1 + chr3R 13543960 3' + TART-A 13106 2 81.19 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTGTTACATGTAATTAATTTCAAATTATTTATACATGAACGCCCAGACAGTGCAAGCTGAAAAAGCAG:1 + chr2L 19681512 3' - 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I-element 47 1 71.29 GGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGG:2 - chr3R 13231156 3' - Quasimodo 41 2 71.29 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTTCTTGCAACTTTCTGCGCTCGCGTCA:1 - chrX 15219385 3' - hobo 50 1 77.23 GTCCGAATCTATTATGATAAATCAGCGAAATTTGCGGTTACGGTGGATTCGCGACAAACAAAATAACGGTAAAAATCGTAAAAACGTAAAACAAAAAATAA:1 - chrX 16574456 3' + gypsy9 5067 2 27.72 AAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTTGTCACTCTTCTCATATTTAAATAAACAAGAA:1 - chr3L 18789875 3' + P-element 33 1 37.62 ACTTAACAAGAAAAACAATAATTAGAAATTTAAGTTTTATAATAAGATTGGTACACTTTTTTTTAGAATTTATTATAACTACAAAATTAATTTGGTAATTA:1 - chr2L 16223012 3' + I-element 129 1 47.52 GTCCAGGTTATGAGAGGCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATT:1 - chr3L 23635037 3' + R2-element 3277 1 63.54 AACTGACGGGACATTAGTTCGACGCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATAGAAACGAATATACTTCTATGTATCTGTCTGATCGCTACTAGTT:1 - 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chrX 157205 3' - I-element 24 1 53.47 TTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTTACGGGTATTTCTTATTGTGCGAGTGGAAAATTATGTTGTATCATGGCAATAAATAGTGTGATTAT:1 - chr3L 18331537 3' - I-element 5148 1 68.32 CAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGTGGCAGTGTGCTGTATGGCAACCGTACCCGGAAAAGGCAAATGACAAAGTGGATAAATA:1 - chr2R 3032680 3' - F-element 4564 1 63.37 GTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACAGTTTGTTTGCGGCTCGCTCTCGCATAAGGGTACATATTTTTTAAGCCAATTTTACAGGCCACTGCCTAACAA:1 - chr2L 12911217 3' + mdg1 7457 2 74.26 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTAGTAACAAAGCATAGCATAGTTTTTAGCGCAAATCAAAATGATTGATGATGATGGCTGCTCTAGATCTT:1 - chrX 4778526 3' + hopper 1410 2 76.24 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAATCGGTTATTGGGGCGTTTGAAAGGGGCTCGAAAGGTTTGTT:1 + chr3L 15706939 3' + I-element 5320 1 59.41 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCAAAAACTGAAACTAACTGAAACTGAGAAATTGAGTTGCCAGC:1 + chr3L 10576856 3' - roo 32 2 62.38 TGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACCAAAATGAAGAGATTAAATTTAAGATATTTGCATTCTTAAAGATCTTGTTTAATTCCCCAAGGAATGTCCT:1 - chr3R 20240847 3' - Tabor 6846 2 68.32 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCAGGTTCAGATGAACATATCCTTCTATGGCCGAAAGGCCCTCGACTTAAAGGCAGCT:1 - chr2L 18887350 3' - hopper 16 1 57.43 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAGTATATTAACTAAAATCTCTACTGCCGCTCTCCAGCAATTATTTTATTCGAGTGTAGGCCTGTTTCAG:1 + chr3R 6138347 3' - 297 5 2 61.39 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAATCGCAAAAGTCGCCCCATTCACCACTCGCTGG:1 - chr3R 27705357 3' + roo 390 2 57.43 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATGTCTACACAAATGTCATTGTTTATTATTCGGTTTTCTTTATTTTATTTGTTTTCTTT:1 - chrX 8551179 3' - mdg3 20 2 59.41 ATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTACCTGTAGGAGAACGTCTAACAAAATGCCTTGAT:2 - chrX 21564066 3' + invader4 318 2 70.30 AGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGGAAGAGAAAGGAATGGCTGGGGAAGAAACTGACTGTGGAGAGACTGCTAAAG:1 - chr3R 4133944 3' - Cr1a 3990 1 78.21 GGTGGGTCTGTCATTATTGTTGGTTAAGAGCTTGAGTCCTTATCGAAAATTTGTTTGTGGACAGCAAAAGCGTCAAAGTGCCTTACACAATGGCTCTGCAC:1 + chr3R 4540477 3' - I-element 179 1 36.63 TGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGGTAGACCTGATCGGCCTCTTAAACTTTTCTTACTTTGGTGGACCTGACCAGCCTCTCAAAC:1 - chr2R 2094403 3' - Quasimodo 320 2 62.38 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGTCATCACATTATGAAATTTTGGTGTTGGTTTTGCATTAAGTATCTC:1 - chr2R 9258588 3' - blood 7043 2 53.47 TTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAATACTATACATTTGAGTTAAACAAATTGACAAAGACGTTCACTTTCCTCATCTATTCGA:1 - chr2L 21777906 3' + mdg1 7439 2 58.42 GACTTGTGTTCTTAAGTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTGGCTAGAAAG:1 - chr3L 9190432 3' + 412 482 2 67.33 CACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCAATGCTACCACAACATCAAGCTTCAGGCCACGGAACGGGCACTTTTTTACTATGAAAGAGC:1 - chr2L 21579036 3' + Doc 494 1 59.41 AACAAGAGAGAATGCTACAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTA:1 - chr2R 10552705 3' - INE-1 580 1 84.16 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGGCGGAAATGA:1 + chrX 21219495 3' + roo 9042 1 56.44 TAGAAGAGAATGATTAACAGAGTGAAGTGCTGTACTGAAGAGTGTAGATGACATCTGTTTGTGCAGGGGCAGGTTGGGGACTTCGATA:1 - chr3R 3458466 3' - Q-element 336 2 69.32 GGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGAGTGGAGTACTATGTGTGTGTGTGTTTATGGAGGATGGGGCTTCAAAGCCAGAGAAAGA:1 - chrX 7621073 3' - I-element 5085 1 62.38 ATTATTATTATTACTGTTACTAGTATTATTATTATTATTGTTGTTGTTGATCAGTGTATTAAATAATACATGGTGTCCTGGAGGCAACAGCATCTTGCGCA:1 + chrX 2659956 3' - mdg1 7068 2 60.40 TTTTTTTTTTTGTTTTTTTTATTTTTTATGTTTTTTAAAAGCTGCCCTTTTGGGTAATGATTAAATT:1 - chr3L 23965539 3' - Rt1a 5079 6 88.06 TAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACACTACAATGAAATCGACAGCACGCAATTATTTTTTGGCGACCTAAATGATGAAACAATCACGTGTCGCCGGGTAT:1 + chr3R 5285028 3' + roo 403 1 74.26 TAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAGCATATATAGTGGGCTACGTTGCTTGCCAAATAATTCCAATTCAATTTGCGAATCT:1 + chrX 10196179 3' + 297 381 2 71.29 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCAATCA:1 + chr3R 28333584 3' - pogo 38 1 66.34 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATTTGTATACGCGTAATAACTTGATTCCAAGCTCTGGCTGTTACGCCTGCTTTAATGCAAATGGAAAAA:1 + chr2R 11394214 3' + pogo 2099 1 72.28 GTTTGTAGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAACATGAGTTACCAATTGCAGACTTTTATAGTCTAGTCCATTGTCTAGCTTATGTATCTCAAACACAATCGATG:1 + chrX 22680718 3' - INE-1 218 1 45.54 GCTGAGTAACGCGTATCTGATAGTTGAGAAAATCGCCTATTGATTCCTGTTCTTGCTTGCTGACATAAAAATAGGTAAGGCAAATTATAATTTTTAGCCTA:1 - chr3R 19718708 3' + INE-1 546 1 80.20 CCTGCTCATCGAGGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCT:1 + chrX 19820778 3' + Rt1b 4968 1 69.31 GTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGCGGCTTACCCATTTTGCTTTACGTGCCAAAA:1 - chr3L 9183573 3' - accord 185 2 69.12 GTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTACTGTTCTTTTGGCCATCGTTGTCCGCCGCCTGTCCGCCAGTGGGACATGTTTGTTTACGCTTCATCATGTCG:1 + chr3R 6116621 3' - Max-element 3 2 77.00 ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTG:1 + chr3L 24210976 3' - HMS-Beagle2 28 2 58.42 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGATTGGAAATACACTCGAAATTATCATTGCAGGTAATTGC:1 + chr2R 20124605 3' - Doc 41 1 60.20 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAAACAAATGCCATTCAAAACTGAA:1 - chr2R 2832932 3' + 1360 3336 1 81.19 TTAGTTGACGCGAAGGTTCTAACTGTTTAGGGGGGCAGAAAGAGAGAAAAGAACCGAAACAGGAAGAAGCAAATATACATGCTCTTTGTTTAAGACTGGGC:1 + chr2L 22923871 3' + Gypsy12A_LTR 473 1 61.39 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAACGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACATATACAAGTATTAAGCATAGT:1 - 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chrX 17492866 3' - Tirant 10 2 68.69 AGATATCTTGCCGAGGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGG:1 + chr3R 21587307 3' - pogo 31 1 61.70 TTTTATTTATTACCCACTGAATTTCGGGCTGCAGATATAAGGCTGCTTGTTATAAAACAGCAGATGATCGTCACTTTAGATGATTGCTCATGGAAAACTTA:1 - chr3L 7201143 3' - Fw2 66 1 74.26 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGATCTTTTTTGAACCAATTTACTGTATAATTTTATGCCAATTTAATTTACAATC:1 - chrX 11299963 3' - roo 24 2 53.47 GACTATCAGATACCCGTTACTAAGCTTGAGAGAAGGGTTTGCGGCAATTTACCCTGTTGTTGTTTATAGGGCCCTGCGGCAAAAAAGCGGGTGGCAAAAAG:1 - chr2L 179408 3' - INE-1 549 1 43.56 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCATGATAGATTTGTGCCATTTCATAGGAAAACTGAAATCGAACCAAGCTAAATCAAAAAA:1 + chr3R 10187447 3' + roo 9055 2 62.38 AAGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACGACCGAGCATAAACGAGCAATTCATTCGAA:1 - chr2L 1612663 3' + Quasimodo 67 2 70.30 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTTACTCAAAAC:1 + chr3L 3535471 3' + roo 400 1 68.00 ATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATTAATAACTACAGTTATGGATCGACACAGACTAAAATTTCATTAGCCCCCTTTCATT:1 - chr3R 2474288 3' + Juan 4193 1 51.49 TGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTTGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATTGTTTTGTGAGTAAACAGAACTG:1 + chrX 7339945 3' - G2 2631 1 72.16 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCCATTAGAAAAATTGCGCGCTCTTCGTTCAATTCCTTTATTAC:1 + chr2L 1530473 3' - roo 33 2 61.39 GATAAGGCGCTCTGGAAAGTGTTAATGCTCTTAAAGTGCACGTATGGCCCACCGCGTGTACTAACTTACTGGTCACATGGTTATTTCTCTCTTTTGCGACC:1 + chr3L 25255169 3' - mariner2 517 1 65.35 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAGTTAAGATTTTAAATCAGCATGTAGTTCACCATTTTTTTTTTAAGTGTGTGCGTAGCAAGTGGGG:1 - chr2L 12860819 3' + roo 9063 1 66.33 AAGGGGGGAGTAGTTAACAACGAACTCCCAGGTTAGCATCAGCAGGCCTATTTTTATTTATTAAGGACTTTAAAGTGTACCTGTCACCCTCCAGAACCTG:1 - chrY 3069828 3' + gypsy 6977 2 63.00 CCCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTAACAGTACATAAAAACGAAGCACAGCACGAACAAAGTGGAATTTAAAAATGCTTCACTCTCTATATA:1 + chr2L 1923935 3' + diver2 4627 2 70.30 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGAATATAAACTAAACGTGAATATAAACTAGACAAAATGTCC:1 - chr3R 5561959 3' + pogo 2067 1 77.23 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGCAAACCGTCTAAATGCGATTGGTTTTCGGACATTGGGAAAATTCCTCTCCCCCCCTCC:1 - chr3R 11936876 3' + roo 9055 2 63.37 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAATATACACAAAGTGCTA:1 - chr2R 17942084 3' + mdg3 5469 2 53.47 TATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGAGGG:1 - chr3L 5651633 3' + McClintock 6380 2 80.20 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTGTATTTAATGAAATTTTATTCGTAGCATTCCC:1 - chr2L 12888820 3' + 412 7502 2 75.25 TAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATATGAGTGATTTATTATTTTTTGCAACTGAACCATTCTT:1 + chr3L 17762838 3' + invader3 238 2 66.34 TCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTAACT:2 - chr3L 25884061 3' - Doc 12 1 62.38 ACCTACATTTCCCGAGACAACAAAACAAAAGATCCCCCACACCAACAAAGAGGCCACAACAACAACAACAGTAATTGGGATCGAAATGGAAACAGCACGCT:1 - chr2R 10555480 3' + gypsy7 266 1 79.21 CAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTTCCTATTCTTTCTTCCGTTCCCATTTGGTACTGTGTAAACAAAGGCATTCAACAAATTTGTAGGCGTA:1 - chrX 7648061 3' + McClintock 6139 2 63.83 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTACAACACTATAGTATTCGTTATTTACAAAGAACGACTGCAGTTCTCGTTACTCGCTACTAGT:1 - chr3R 21587219 3' + pogo 2091 1 65.35 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACACCATGTCCTAGCCATTCGGTTTCTTCTCCTTC:1 + chr2R 11921812 3' - P-element 41 1 38.61 GTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATAC:1 + chr2R 1234690 3' + invader2 4863 2 79.21 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTTTAAATTAAGTGGAAATGGAACTCAACATCCCAGAGCTCGAGTATAACATATAAATAGTGGTAATACAA:1 + chr2R 20506909 3' - mdg1 7044 2 74.26 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGTATATGCACACGCACACATACGCAGGCA:1 - chrX 5178818 3' + hobo 2892 1 72.28 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTTGGCATGGCTTGGAAATTAATTTGAAAATAAGAGTTGGCAGGCGATTGGACACCGGAAGTTGGCAA:1 - chr3R 14991660 3' + hopper 1407 2 71.29 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTAATAAATTATGCGCTCTATATGCACTGTAATAAATCAATAAATTGCAGAAATACGCAACTTT:1 + chr2L 3483595 3' - I-element 12 1 68.32 AAAAAAATAAGAAAAAAAATGTTTATATATCCTTAGGTCAGGGTAACAGTAGCCACAGACAGCGAGGGGAGTGGGGATGGATGGAATGTTAGGGGGTTGGC:1 - chr3L 10826965 3' + Stalker2 7175 1 51.49 TACTTGTGTAGGCGTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGAAGATGGAAGGAATTGGGGATTCGGGAGCAGAGATTACGCCGTGTTAGCTGCTGTTGTTTCTTTTTT:1 + chrX 2662926 3' - ZAM 42 2 69.31 AATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCACAGCATTCGTTTATCTTTGGAGTGATGATATGCGGTGTAGGAATCATTGGAAATTGTGGC:1 + chr4 863546 3' + 297 57 2 58.00 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACATCGTCTCGGTCGATGCACTGTTAAAAATCAACAATTGTTTGTTGAAAATACG:1 + chr3R 29438778 3' - hobo 21 1 57.43 ATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTT:1 + chr3L 25350812 3' + baggins 5405 1 53.47 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGAATATAAAACAAAGCGTGAAATCTATTTGCAACTGGCGAAACGGGGCAGCAAAAGTTTATGCCATGTAAATAAC:1 + chr3L 21998511 3' + roo 409 1 79.21 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTT:3 + chr3L 3535461 3' + roo 389 2 57.43 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAATTTGACTTTTGTGTGCTGGCCGTTTTAAATGAAACGAAACGAAATGAAATGAAATGAA:1 - chr3R 5034708 3' - jockey 26 1 56.44 ATGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTATCGGAGGTGGGGTCTAACACACAAG:1 + chr3R 2137225 3' + Quasimodo 7214 2 74.26 AGGAGAAGTTGAGAGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACACCGCCAAATCCAGATGAGGGCGCAGTGGTGGCACCAACTACTAGCACTACCAAGCGGC:1 + chr3R 13769687 3' + I-element 342 1 64.65 CGCAAGTGTTCGGAGATTGGGGGTTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - Doc2-element 489 1 40.00 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAAACAAACAAAATGTAACAACGGAGCACAAAACACAAA:2 - chr3L 10576764 3' + roo 9063 1 66.34 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACC:1 - chr3R 11080710 3' - I-element 51 1 75.25 TTACGCATCTTTATATTCTAGTGACGGCAGAGTGCGCGCGAGAAGCGAAGCCATAATATTTTGCGAGAATGAGCGATAAACCACTACATCCATTTTTAAGT:1 + chr3R 3620777 3' + 1360 3381 2 78.22 GTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCTTGTTTTTCTTTTCTATTTTCTCCCTGCTTTCCCCTTATAT:1 - chr3R 16525067 3' - I-element 4923 1 59.41 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTGTTACATGTAATTAATTTCAAATTATTTATACATGAACGCCCAGACA:1 + chr2L 19681493 3' - hopper 23 1 55.45 TACGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTTAAATTCGGCATGCAAATTCTAGAGACAAAGACGCAAGCTTGGACTATGATACGAAGCATCCGCTACTTTTAACAA:1 + chr3L 24790090 3' + INE-1 155 1 59.41 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCACACACCCAAGCACGCACTTGGCGAAAAAAAAAATTAATA:1 - chr3L 17691333 3' - 1360 39 1 66.34 GTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAAGGCTCTTCCTCGAATCAGGGATCATCTTCAAATCAAAGTTCTTCGTCTAACCAATCGTCCTCGAATCAATCC:1 - chr3R 17157088 3' + Quasimodo 178 2 75.25 ATCTTTTAAGCTACACAGTAGTTTAAGTTTAGAAGGAACTAAACGATTCCTAATTTCCGTTTTAATTTTGCTCGTTTTATTCAAAACTTTTTCTCCGCCAT:1 - chrX 22725914 3' + G5A 2776 1 52.48 AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATAGAAACGAATATACTTCTATGTATCTGTCTGATCGCTACTAGTTGCAGCGGCCAGCTCT:1 - chrX 21184544 3' + 297 6963 2 60.40 GTGGAGGAGCTTCGAGTATAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGTACTTCCCACTTATTGCAAATCCA:1 + chr2L 16758309 3' - Max-element 53 2 74.26 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTC:1 + chr3L 15869724 3' - pogo 32 1 60.40 AGGTATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCG:1 - chrX 19820625 3' - Rt1b 4968 1 63.00 ATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCATGAGCGCTGATTTTGCGCCACTTAAACTTTAAACGCAAACCACAAGCCAGG:1 + chr2L 9624621 3' - transib2 22 1 57.43 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCCACTTTAGTTCGAAAAGTGCTCCCAAACAAA:1 - chr3R 26853863 3' + copia 243 1 67.33 ATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACAGTACAAAGAAATATTGAATGCAATTTGTTATTTGAGCGGGAGGCATCGACTGTGGCCGGAGCTAGAGTTT:1 + chr3R 17616036 3' + HMS-Beagle 244 2 78.22 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATCGTCGAGCAATGCAAAGCCGAC:1 - chr3R 30263569 3' + roo 357 2 79.21 TTTTTTATTTTTTTTTTACTTTTTGATAAGTTGCATCCAACTGGTAAAATAAAAGCTATGGCCTTTGCCATTAAGCCGATGAGAAGGGCAAAGGTTAGGAA:1 - chrX 4692749 3' - F-element 4686 5 69.31 AATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATTCTGGTTATATGAGGCATTTGTTCTC:1 - chr2L 22780868 3' + HMS-Beagle2 263 2 74.26 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTA:1 - chr3R 3920676 3' - I-element 45 1 68.32 ACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATG:1 + chr3L 27458167 3' + X-element 4518 1 50.50 GGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGTGCGCTTATTCTTTGCAACGAAAATATTTCT:1 + chr3L 27395596 3' - invader4 2927 2 69.31 TGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGAAATGGCACCCTATATTTCATTACAAAGAATAAAGCCAAATATCATAGTT:1 - chrX 1822993 3' - HMS-Beagle2 6907 2 55.45 TTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTGTGTGCATATATGTGTGCGTGTCGTCATTGTGGCAGCAAACGGAAATAAAGTGTGTTTTTTGTTGCTATA:1 - chrX 7843193 3' - HMS-Beagle2 52 2 70.30 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGTTTTTTCCTAATTACTGCGGATATAGTATTTAAAGTTCGTTTATCTGGCAAACAGAGAAATGCGCAAAA:1 - chr3R 9616559 3' + roo 402 1 73.27 GTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTGACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCT:1 - chr3R 3985685 3' - gtwin 23 2 56.44 GTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTATTCTCGGTTTTCTGATGCTAACAACATTTAATAAATA:1 + chr2R 19523944 3' - I-element 5120 1 62.38 GATTTTTCCTTAAATATATATATTTAACTATTATATTTCGCCAATTAAGTGATCATAGAAACTCTTAAAAGTTCTTCCTAAAAACCTATGAAATTCTTTGT:1 + chr2R 10556019 3' - TART-A 13347 1 47.52 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGCCACAATAGCTGGGATCTTGACAC:1 + chr3R 30641827 3' + hobo 2905 1 69.88 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACACACTCGGCCCGCATAAACGGAATGGCCCGCGAAAGTGTGCTACAATTTTAATTCTCTG:1 + chr2L 10119521 3' - flea 13 2 63.37 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGCAGTCATCCCTAGACCATCGAAAACCGTAATAAGGGTGATGAAATGTATGGTTTTCATTTGCACA:1 + chr3R 9328761 3' - hobo 10 1 65.00 CCACAAAGAGAAAATAAAAAACATAACAACAAGACAAGGCTCAACCACAAAAAGAAACGAAAACAAACTTCTTGCTATGTTTTGTCTTCTTTTTCTACTAC:1 + chr2L 18388220 3' + I-element 109 1 62.38 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTCCATTGGAAAAAAGCCCTACATTCATATAGTTTCATTTCACACGGAGACAAATGAGTTTCCTGTGT:2 + chr3L 17635613 3' - 297 2 2 78.22 TGTGGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACGTAAGTAACATATTTTCCCTTATTT:1 + chr3L 22231363 3' - Doc 55 1 81.19 CCTACATATAAAAGCAGGTGTACAAAAAGTTTAACTAGTCGTATACGCAATATTGTTTCCCATATTAATCATTCAATGTCAATTCTCGTTTAAGGCTTG:1 + chrX 8023659 3' + Juan 3932 1 69.70 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGTCATAAATGGGGGCACAAAGTGGAAAGTCGGAAAGGAAGTTGACCTCCGACAATCGTGTTTCTCTTTTATATTTTT:1 + chr3R 21198705 3' - Tirant 8107 1 81.19 TTGAGAGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGG:1 + chr3R 1977611 3' + micropia 415 2 60.40 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACATTTTCCATTAAATTTAAAGCTTTTTCTATTTGCTTCTGGAGCACAACATG:1 - chr3L 18523584 3' + 412 469 2 56.44 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCACCTGGCAGCTGCCAAAATTGCAAAATTGAAATTGA:1 - chr3L 17110713 3' + hopper 1378 1 62.38 CCAGGTGCGTCGATTTGAAGGACCACCTTTTTTCCTCTCCGGCGCACCTGTTTTCGGCCCCGACTTGCGTGAGGAAGTTTCATATCAGCACAAACGCATCC:1 + chr2R 3550975 3' - HMS-Beagle2 6743 1 62.38 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACAT:1 - chrX 157237 3' - I-element 37 1 74.39 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAG:1 - chr2R 981626 3' - 1360 4 2 59.41 ATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTGGCTGTAAGATTCATTTTTTATATTCAGTTTATGTTTGTCTATATAGCAAATTCTACACATTCGGTTATT:1 - chr3R 24018795 3' + Gypsy6A_LTR 111 1 66.34 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGACAAAATGTCCG:1 - chr3R 19513358 3' + jockey 4964 1 61.39 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAATA:1 + chr3R 19515852 3' - 412 7104 2 75.25 ACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCATGAGCGCTGATTTTGCGCCACTTAAACTTTAAACGCAAACCACAAGCCAGGCAAGCG:2 + chr2L 9624627 3' - transib2 16 1 63.37 AGTTTTTTCTTTTTTTTTTTGTCTTTTGCAGTCACAGAAACGGCGCTGGATAGCTCCTTAA:1 + chr3R 16939382 3' - HMS-Beagle2 489 1 86.89 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACACATGTCCACATTGATGACACTAATGA:1 + chr3R 23173159 3' - Burdock 46 2 73.27 CTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGAGAGAGTAAGAGAGTTGGCCGTCAATCTTCGCTCAGCATCGTGGTGCTGGTTCCCACAAT:1 - chr3R 1301379 3' + F-element 190 1 59.41 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGCCCAAAGAGAGCAGGATAGGAGCACGAGGATGCGGAAGGATGTGGGGGGCAGAGAGTGACCCCTGCACATGCG:1 - chr3R 28135236 3' + hopper 1414 2 78.22 CATTCGGCTTTTGTGATTATTCAGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGGCAGTTGTGTTGAGTGCATTTTAGTAAACTCAAAACCAGGTAGACAGGAGGGAT:1 + chr2R 4613716 3' - Porto1 4351 1 51.49 AGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAAC:1 + chr3L 23678148 3' - Osvaldo 25 1 77.23 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGGCAATCTAAATC:1 + chr3R 21587318 3' - pogo 27 1 55.45 ATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAGATGATAATTTATTTGTTTTGGGTTGGACGGTTGGTTATCAATCAACACACACATACACATTTAGACACCAAAGC:1 - chr2R 22825380 3' + opus 495 2 74.26 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAA:1 - chr3L 10576811 3' + roo 9016 2 82.18 TACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTAATA:1 + chrX 21668095 3' - Tabor 12 2 67.33 GTTATGTTACTATTACTGCATTGTATGGATTCACCGATCAGCATACAATGCAATTCGATATATCGATATCGATTGTATTGGCAGTAAATGTCGGTTAACTT:1 + chr3R 28448462 3' + BS 5053 1 63.37 ATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTGACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCA:1 - chr3R 3985680 3' - gtwin 6934 2 61.39 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTGCGCTTTCAAT:1 + chr3R 19513419 3' - jockey 4688 1 59.41 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATTTTCCTCATTACCCGACTTG:1 - chr2L 13868726 3' + roo 355 2 78.22 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCATATCTACGGG:1 + chr2R 17348635 3' - jockey 12 1 66.67 TAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGATTTGGTTTTGGCTTTTGATTACCAGTTTTGTAATCGCCTGC:1 - chrX 5137241 3' - I-element 5031 1 58.42 AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGC:3 - chrX 9816253 3' - BS 5015 1 53.47 TAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGAAAAGCTGTAAGTACAAAAATATAAATTAAAATAATGAC:1 + chr3L 19588065 3' + Idefix 205 2 61.39 AAATCAGTTTCTCACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGCTTGGATGTAAATAGCTTCGAAAATCCTGATAACAAGTTCC:1 + chr3R 22698987 3' + roo 9037 1 57.43 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATATACGAAATAGTTTATAACTGGCATGCT:1 + chrX 3213971 3' + pogo 2057 1 76.24 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCAGGTTCAGATGAACATATCCTTCTATGGCCGAAAGGCCCTCG:1 - chr2L 18887364 3' - hopper 30 1 54.46 ATAAAAAAAAAATAAAAAAAATACATATTTGAAATTAATTCAAATATTTTTTCAAAGTTTAAAACATTGACTAATTTCCAAATTATTTTCTCCCTCTACTT:1 + chr3L 8677579 3' + Rt1a 5079 13 81.19 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAACAACAGGAGGGCTGGAGGAGATCGGTGGGTTGGCGATCGG:1 + chr2L 11073827 3' + roo 9033 1 60.40 GAGGGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTCTACATTTTATTGTATTACAAAGGAATAA:1 - chr2R 10945036 3' - 297 6625 2 74.26 CCACTATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGGGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTGAGTGTTACATTACATGGGGATAGCATATATCTTATA:1 - chrX 4985028 3' - TAHRE 10378 2 77.23 GCAAAAATCGAATTCAAATTCAGATATTGACAAAACACCAATGAACAACGTTTACTAAGCCTAATAATATGTAATAATAATTAGTTAAAATCTCTGTGCCC:1 - chrX 16823024 3' + Rt1a 306 1 34.65 TATCGGGTGGACGTAGGGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTGCATGCCACATATGAGGGCAATAAAAACAAGAAGTGCAAA:1 - chrX 14617651 3' + hobo 2916 1 53.41 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCAATCAAT:1 + chr3R 28333586 3' - pogo 36 1 64.36 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACATCCACCCAATCAATTGAAATCCACAACGTCATTTAACCACATTAAGCATACGCCCTGTG:1 - chr2L 15151854 3' + Tabor 7309 2 63.37 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCC:1 + chr3R 19513388 3' - jockey 4719 1 76.24 TTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCC:1 + chr3R 15790070 3' - flea 4740 1 63.37 GAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGAAATCCTACAACTCTTCTTGTTTTTGAAATGAAA:1 + chr2R 17402800 3' + invader4 3068 2 63.37 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTGGCTAGAAA:1 - chr3L 9190433 3' + 412 481 2 66.34 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTTTTTCTGCAGATATTTATTTCTTTAAAAAACAATATTACGTCATTCCGAACCGGCA:1 + chr3R 9199844 3' + roo 390 2 56.44 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAGTAGTTTGTTCATTCACTCGCTTGAATTTT:1 + chr2R 10334800 3' + pogo 2076 1 63.41 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCAAAAACTGAAACTAACTGAAACTGAGAAATTGAGTTGCCAGCGAATGAATGTGTGTTTCCTAATGAA:2 + chr3L 10576881 3' - roo 7 2 72.28 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGCTAGCAG:1 + chr3L 14286055 3' - 412 7091 2 67.02 GCAATGCAAGTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTATAAGAACTACTAATAAGTACATAGTGAAT:1 - chr3L 12187764 3' - blood 46 2 68.32 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACACCATTCACTTTCATTTTCATTACACAAA:1 + chrX 12866507 3' - hobo 43 1 70.30 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCACAGCCTCACCTTGTTCAAATATGAAATAGCAAGCAGCCACGGCC:1 + chr3L 9190521 3' - 412 7086 2 57.43 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATCGTGAATCTAAATTATCCAGTTCATTATTTAAA:1 + chr2L 18417360 3' - roo 8706 2 65.35 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGGGAAATAAATGCTCTTCCATAAAAAGAATATAT:1 + chr2R 3522035 3' + copia 5082 2 74.75 TCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGC:1 - chrX 17492901 3' - Tirant 47 2 73.27 CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACAGTTTGTTTGCGGCTCGCTCT:1 - chr2L 12911269 3' + mdg1 7420 2 75.58 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTGG:1 + chr3R 7477472 3' - BS 5026 1 54.46 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGACTAAAGTCTAATGGGTTTATACTTTATTTTTTTGTTTGGGAAAAGATTTACATTTTCCTGTTTGTTACCGACT:1 - chr3R 11912073 3' - I-element 46 1 64.36 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTGCAACAATTTTCCGAGTGTAGCCAGGAAGCGA:1 + chrX 4278385 3' - blood 7055 2 66.34 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACGAAGAGCTAACAAAACCAAACGATTCGGAAAATAAATGCAGACCATGCATGCT:1 + chr2L 11560004 3' + copia 234 1 56.44 ATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTTGGAGGTTCTGCAGCGACAGCTCATGTAATAGAGGGAGGCTTAGTCGGTCCTGGTGTGAAGTGACATTCAC:1 - chr2R 4155811 3' - gypsy4 6378 1 58.42 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTAACTATTAA:3 - chr3L 25884056 3' - Doc 7 1 67.33 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATCAATTTGCGTTTTCTGGTTGGATAATGGGTTTCCTAATTGGAACAT:1 - chr3R 9228902 3' + jockey 4972 1 53.47 ATAGTAGTTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACCCTGTCATATTTGATCAGCTGCCTTTATATTTTTTCCACCTGCCGTGGGCATTTTTT:1 + chr2R 20409825 3' - jockey 4830 1 62.38 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACGTAAGTAACATATTTTCCCTTATTT:1 + chr3L 22231363 3' - Doc 55 1 83.17 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTAACTA:4 - chr3L 25884060 3' - Doc 11 1 63.37 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGATTGAAGTGGTACTGTGGTGGTATATAAATATTTTTCCTCGCTCGCCTGAAATA:1 + chrX 13547234 3' - I-element 41 1 66.34 AAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTCCGCCGTCCCTTTCGTTTCGAATGCTACTCTCTCTTTCTCTCGCTCCGCATTTCGCAATTTAATTTAATT:2 - chr2L 19684573 3' - mdg3 5259 1 73.27 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACACCATTCACTTTCATTTTCAT:1 + chrX 12866499 3' - hobo 51 1 78.22 GCATAGTGCAAAACCAATATATGGCCGTTACGCAATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCATCTCGTCCCCTTCCGCACCATGGGCATTTATCCGCC:1 - chr2R 2555248 3' + 1360 3354 1 74.26 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTG:1 - chr3R 11080688 3' - I-element 29 1 53.47 AAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCAAGTCAAGATCAACCCCTTCAAAATAAAGAACCCACAACCACATCCACATCCCTCCATTAACACATGCAGCA:1 - chr2R 22935745 3' + F-element 299 1 75.25 ATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATACAAATATAAATAATACTGTGTCAGTTGGAAGTGAAAATTTACACATGTAAATAACGT:1 - chrX 23035721 3' - HMS-Beagle2 17 2 62.38 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTATGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAAT:1 + chr3L 3535444 3' + roo 9036 1 62.00 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCGCAACCATCGCGACGCGCTCTGGTTTTTCCTATTAGCGGCGCCCAAATGTATGCTACATTTTCATCAC:1 - chr3R 13623624 3' - jockey 14 1 69.31 GTCAGCATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATATTAATTTTTTTTACCGATACTTGC:1 + chrX 21801646 3' - gtwin 6966 2 72.28 CCGATTTTGTATAATAGCTCCTCCATTTTGTTGTTATTGTAAGCACGCTCAATTTCTTGATCTTATTCGTTCTTCCGCCGTCCCTCGGTTCTTCTTCTTTT:1 + chr2L 19163696 3' + Gypsy12A_LTR 2076 1 67.33 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCATAAATCTTCAAATGTGATTCACGCGCTATATTAAGACTTAGGAATTTGCC:1 + chr2R 11770355 3' + pogo 2078 1 50.50 GTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCAGTTTGTTACATAATCAGCAGAAATTTCATTTAAAAGCTTGTTTGGC:1 + chr3R 23870176 3' + roo 9070 1 77.23 CAAGAGATGGGATGGTTCGACAAGGGGGGAGATGAGTGAAAAGAAGAATTAGCGGTAGAATCGTTATTTGGCTACGTTCGATTACAAATATAACTCTTCAT:1 - chr2L 22319673 3' - frogger 476 1 79.21 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGCTAATAATGTCTGAAAATTCGTAGATTTAAACAAACTGTTAGATATTAAGCTTTCCCCATGTTTCCTT:1 + chr3L 920572 3' + mdg3 5492 2 74.26 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTTGGTTTTCATCTTACCTGTTGTACCTCTATTGTGGTATCT:1 + chr3R 25214998 3' - Burdock 28 2 58.42 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCTAAGGGCATACAGGACCTGGTTTTCTACACATCAT:1 + chr2L 17213910 3' - hobo 41 1 62.38 GTTCTTAGCCGCTATTTGTTACACTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATAAATTTGCCTATATGTCGC:1 - chrX 18294756 3' - invader2 4770 1 79.38 TCGTGTTCATGTGTGAACACTAGGGATGGATGATACTATTGAGGGGCGGCTCTATCGTTCCTCAGGCGCTTAGTTTTCAATGTGAAAATTGAGAAAAATTG:1 + chr2R 16384406 3' - roo 8662 1 79.21 CTATCAGACACCCGTTACTGAGCTAGTTGGAGTGCATGCACGAAATTGCAACATTTTAATTAGCCAGTGGCTATTGCATAAATGTCTTTCTGCTAGATTAC:1 + chr2R 6176458 3' - INE-1 547 1 56.44 TTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCGTCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTCCAACATCTTTGAGAGTAAG:1 + chr2R 2946019 3' + 1360 3330 1 71.29 CTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACT:1 + chr3R 1977615 3' + micropia 5410 2 56.84 TCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTAACTAT:3 - chr3L 25884059 3' - Doc 10 1 64.36 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACACGAATGCGGCGCTGCTCT:1 + chr2R 14575848 3' + pogo 2047 1 81.00 AATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 1982173 3' + 1360 3273 1 65.35 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGTAGCCCCTCGGGCACTCG:1 - chrX 21219447 3' - roo 8711 2 80.65 AAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACAGTATTTCATCTTCATATTTGATAAATAATAACCTGTGTTGCTGAATTTAATACTTA:1 + chr2L 14993476 3' + 412 475 2 60.40 TAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTA:1 - chr3L 24210905 3' + HMS-Beagle2 7161 2 57.43 TCAAGAAAGAGCCCGCTCCTGCTCTCCCGCTTGTTGTTTGCTCCTAATCTGGCTTTGGTGGCTTTGCGATTGTAGGTGGTCTTACGCACAGAAGTCTGTTA:1 + chr2L 17803867 3' + F-element 359 1 73.27 AACCGTTACATTGAGAGACTAAACATTTCTTGCTCAGAGAGCCAACATATGGTACTTATTATTCATGCAATCACAGCAAAAATCAATTAAATAGCTTCAAC:1 - chr4 301427 3' - Tc1 141 1 69.31 AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATAAAATATTGTATATACGTGTGATGTACATATATACATAGTATTAACAAAGACACTAG:2 - chr2R 19502073 3' + Tabor 7306 2 60.40 GGCGAAGGAGGTGTGGGTGTTAATTTGACTGTTGTTCAACCGATGGAGCCGGTGGTGAGATAAGGGAAATAAAATTAGCATGTACCAGGCGATCGATTAGT:1 + chrX 12945016 3' - transib4 2411 1 49.50 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTGTGTTCATAAAGTGTCTGCTGGCACACACAGCTATATACACATTAATATTTGCTTT:1 - chr2L 8898860 3' - roo 18 2 61.39 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCTGGCGGAGCGCGGATGGGGATCTTTCGGCAGGCACTTGTTCACCACTGTCCCCATTCCAAGCAA:1 + chrX 7145095 3' + hopper 1406 2 68.32 AATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTGCTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCCATCGCGATGGTATGGCTGCCTGAGTCGGCCAGACAAACAGAGAGG:1 + chr3R 11200309 3' - hopper2 1199 2 51.02 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGT:2 + chr2R 17348621 3' - jockey 31 1 52.48 TTCGTACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGCCTAACCGACCGAGGGAAAAGCGACAATAAACACGCCCACACGAAATTTTCGGACGAAATTGTCTT:1 + chr3L 14323796 3' - Cr1a 4443 1 58.33 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACACCCATCCGCATTGTTTGCGCCAAAGAAGCAAAAAATGTAATTAAGCTCTCCGCACTGATAGATAAA:1 - chr3R 6097572 3' - roo 10 2 70.30 ACACCCTGTACACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTGTTTACATTATCATTTGTCTGCAGCAAGAGGAGTCAAAAGTAATTTGGAATTGGCATATCTGAT:1 + chr2R 7333643 3' + 3S18 15 2 61.39 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCACC:1 - chr3R 19515821 3' + 412 7495 2 76.24 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGGCCACCCAAATACGTCACTATATATGATTAATTACAGAGAAAAA:1 + chr3L 4639236 3' - 297 32 2 78.21 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTAGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCTTCTG:2 + chr3R 16933805 3' - 297 10 2 97.03 TATTTATTTTTTTTCTTTTTCTTGACAAATTTGCTGGCCACAAGCGTGAACGACAGATGACGGACCAAACCGGACTGTTGGATTGTGGGGGACATTGACGT:1 + chr2R 18937426 3' - Doc2-element 221 1 72.28 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATC:2 - chr3R 11080685 3' - I-element 26 1 52.48 TGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAAATGCTTTGTTTCACGGCAATGGGAGGGCATAATTGATTGGGGAATGGGTTACCGGTCTAAATGAGCTTAAAG:1 + chr2L 1673777 3' - Juan 4028 1 69.31 TCAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAGCGACGACAACTGTCCGACAAAACAGCTTAATTATATTTCAAGTTTTTTTTTTACCAATTCTGTTTGCCAA:1 - chrX 6156722 3' + Doc2-element 216 2 70.00 TAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATGCCTTTTGTTTGTACTTTGTCGATCGATCGTCTGCGCTTT:1 + chr3L 19173608 3' + transib2 2793 1 56.44 CTGTGGTGGTTTGGGCACCGCGTCAATGTTTTGATTACCTTCCATAATTTAAAAGGTACGCACTCAGAGACAACAGCGAATTAATTAATTATTTTTAAACA:1 - chr3L 24210642 3' - HMS-Beagle2 6780 1 73.27 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTG:1 + chr3R 19513401 3' - jockey 4706 1 64.36 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCCATTGTTTGCCATTATCCCGCTAAATGGAAAGAGTTCTGTTAATGCCTTTCGAAA:1 - chrX 17416896 3' - roo 8685 2 56.44 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAAGTGCTTGGTACATACAAGCGCGCAAATATGCCAAAAAATATGCTACACAAAAATCGCTCAAGTGCAAAGTTTT:1 - chr2L 19618748 3' - jockey 9 1 78.22 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCAACT:1 - chrX 10196079 3' - 297 19 2 51.49 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCATTTCCCCTGATCAC:1 - chr3R 11080683 3' - I-element 24 1 52.48 TAAAGGTTTTCCGCGGCCCATTTTAGAAGACTCCATTTTTTATATAACATAAGTCCCTTTAGGACCTTTTTGCATGGAATAAGCCTTAACATGTCATATTA:1 - chr3R 17433797 3' - Tc3 437 1 77.23 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCATATATGTGTTATATATGTGTT:2 + chr3R 27847158 3' - hobo 52 1 77.23 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATAGTTCAGCCCTCTTCTTTCTTTTGAAAGATAGAAAAATACCTC:1 + chr2L 5089659 3' - FB 34 1 61.39 CCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACT:1 + chr3R 15790104 3' - flea 4706 1 81.19 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGGCTTTTTATGGCATACTTTATGGCGTTGGAATTGCTGCGCTTAACATC:1 + chr3R 30326365 3' - pogo 26 1 56.44 TGGGAGTATTTTGATCGGATATTTACTATTTAAATGAAGCGCTTAATGCGAAAAAATTATAATAATTAATGATGTAATTCGAAACTTATCAAAAGTGTGGT:1 - chrX 16237113 3' - ZAM 8328 2 67.33 ATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCCCGTTCGAATTTAAACTAGCTGAGTAAAGGGTATAATTAGCAAGTTTTATCATGTATAAATAGTATAACAGTGATAG:1 + chr2R 6609670 3' + INE-1 510 1 55.45 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAGATGATAATTTATTTGTTTTGGGTTGGAC:1 - chr2R 22825426 3' + opus 7452 2 77.23 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTG:3 - chrX 17492894 3' - Tirant 8147 2 66.34 AACGCCTTTAAAGAAGTTTCGGATTTGAAATTCTGTCGATATATTCTAATCTATAAATCCTCATGTCTTCTTCTATAAATGACCTACTTATCCCATTATTA:1 + chr3R 1848870 3' - rover 7242 2 72.28 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTGTTTACAGTCATTGCTACAAATTGACAAATTCGCTGTCGCCTGTCACCCGCTTTGGATACTCTTTAAT:1 + chr3R 28135362 3' - hopper 6 2 73.27 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATACGTTGGCTTCGTGCATTTTACGGTGTTGGGAAACAGACGAAATGGACTCATTGATTC:1 + chr2L 3842917 3' - roo 18 2 61.39 CAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAGCGACGACAACTGTCCGACAAAACAGCTTAATTATATTTCAAGTTTTTTTTTTACCAATTCTGTTTGCCAA:1 - chrX 6156722 3' + R2-element 3585 6 69.70 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCG:2 - chrX 3446525 3' - I-element 34 1 63.37 GGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACTATACTGCTAATGAGTATAATCTTATAATGTATCCAAGTTA:1 - 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I-element 9 1 69.00 GGGGCAGGTGCAATGCAAAAAAGAATAAGTACCAACAACACCACCACCAGCACCACCGATGTGGGCAGCAAAGTTAGCGAAGCAGTTAGCTTTAGTTCCGA:1 + chrX 10044428 3' + Bari1 77 1 65.35 GAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTACTATTTATTTATTTATTACTACGAGTAATATTTTGCTAATCGCACAAGATAAACCTACATATATAACCCAATTCTT:1 + chr3R 4130094 3' + INE-1 148 1 79.21 ATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAAGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTCGGCCGATTCAAAATTGGGTTGATTTTTTGAAT:1 + chrX 16484277 3' - F-element 4225 1 68.32 GAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGGGCTTACTTCTCGAGAGGTCATTGTTTCTCAAGT:1 + chr3R 24599370 3' - I-element 4978 1 66.34 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGTCGCCCGGATCCGGAATGT:1 - chr2R 12249733 3' - jockey 64 1 78.22 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACACTACAATGAAATCGACAGCACGCAATTATTTTTTGGCGACCTAAATGATGAAACAATCACGTGTCGCCGGGTA:1 + chr3R 5285027 3' + roo 402 1 73.27 CCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTCATCAAGCTGAACGCGACTAGTTATTGCTCGGTTGTCTGGTCAAA:1 + chr2L 16119738 3' - I-element 142 1 55.45 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGCCGCTTGGCATGGACTCTTGTCCAGTGCAAACGATCAAAT:1 + chrX 7733630 3' + blood 7352 2 61.39 CTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGTTAACATGAAAATCTAAAGGTCTGCCGGCGGCCACAGGCCAGAAAA:1 - chr3R 17615931 3' - HMS-Beagle 6823 2 53.47 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGC:1 - chrX 157232 3' - I-element 50 1 74.00 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGAAACTACACATTGTAGTTGTCGGGAAAAA:1 - chr3L 15729626 3' + hobo 2900 1 69.89 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGTATAGGGCATGAGGTTAGTAAGCCGGAATTACAGTCAAAGGATGCTGCATACTTTCCGGCAGCAGCTGAAATT:1 - chr2L 13670254 3' - jockey 13 1 62.38 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGATCCATGGACTGGCCAGCCCAGTTGGCCAAGAAGCGATTTGGGTTAACTGCAGCTGCAACACGCCGACGATCG:1 + chr3R 23675436 3' - jockey 10 1 75.25 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTGAAACAAACGTTTTTGTTTCACACACACAGGGCACAAAGGGAGAAGATATAGAAATAAGTTGGCAGG:1 - chr2L 3842811 3' + roo 400 1 70.30 AGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATTTTATATATCCATCTAAATCCATATA:1 - 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chrX 22576309 3' + Burdock 6285 2 43.56 AGATACCCGTTACTCAGAAAGTCAAGTGCTAGGTATATAGAGAACATGAACTAAACAGCTGGGGCATACCCTGCACCTTGGACATAGACTGGGCTAATCCG:1 - chr2R 16456251 3' - INE-1 542 1 74.26 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATGTACTCCACATTTAACAAATATACGTACATGTGCGTTCAACATAATAGGTCACAAG:2 + chrX 5178889 3' - hobo 18 1 60.40 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTACCATCTTAAATTGTATTTAAC:1 + chr3R 10480399 3' + mdg1 7404 2 77.23 CAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAAGGGGAATAAAAAGGACTGGTAGTAAAAAGTGAAAATCTTCTCACTTTATCTGTCATATATCAATTCCAT:2 - chr2R 25216513 3' + 3S18 332 2 73.27 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTGCAACAATTTTCCGAGTGTAGCCAGGAAGCGAAGGGCCCACAAACATCAAGTGACATTCGAGCAGAGAC:1 + chrX 4278422 3' - blood 7018 2 72.28 TTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGAATATAAAACAAAGAGTGAAATCTATTT:1 + chr3L 21998465 3' + roo 363 1 68.32 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGACTAAAGTCTAATGGGTTTATACTTTATTTTTTTGTTTGGGAAAAGATTTACATTTTCCT:1 - chr3R 11912087 3' - I-element 60 1 50.50 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTCTGTGAGCTTTATGGACTGGCAGTCC:1 - chr3R 17529542 3' - roo 48 2 76.24 AACACACACACACACACACATTCACATACACACACACAGCTGCTGTGGTTGTTGCACTCGTTTTTCGTTGTCGTCGATGCATTTGCATGCAACACTTTTTT:1 + chr2L 12897052 3' + accord 7030 2 76.24 GGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTGTTCTTTATTTTCCGGTTCTGGTGGGCTGGGCTCGAGTTCACTATACTTGGTACTT:1 + chrX 180707 3' - I-element 393 1 60.40 TCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCATACTTAGTGTGCGAGCGAAAGAGA:1 - chr3L 3070666 3' + 1360 3337 1 78.22 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATATATATGTGTATATTTTTTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTA:1 - chr3L 14854693 3' - mdg3 5283 2 54.46 AAATAATATAATAATATTTTACTTGTTCATATGCTTCCTTATTGCAATCATGCTAAATTATAAAACAATAATAGTCGAATAGTTTTGAATATTGTTGTTTC:1 + chr3L 18490633 3' - gtwin 303 2 60.40 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTGATCAAATTTGTGACAGCATAAAAAATTACGTTTTTGAAATTTTACGTT:1 + chr2R 17277628 3' - jockey 36 1 42.57 CCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTGCGCTTTCAATTCCATTTCCACTTCAT:2 + chr3R 19513435 3' - jockey 4672 1 75.25 ATCGATTTCAATAAACAATTTCAATGGTCTGGGCGGAGAGACGCACAATACCTCGTCTATTGTGTGGGGTGTGGGGATTACTCGCACTCGCCTCGAACTCG:1 - chr3R 21678310 3' + Idefix 7110 2 80.20 TATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTGACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGC:1 - chr3R 3985686 3' - gtwin 6935 2 58.33 CTTCGAGATCTCTGGAACTATAAAAGCTAGAAGGCTGAGATTCAGCCAACGTATTCTAGATACAAAGACGCAGCGCAAAATTGTTGACCCATGTTGCCACG:1 - chr3L 23702893 3' + INE-1 144 1 80.20 TAAATAAAATTTGCTTTATTTTCTCAGCCACTCTCTTTAATATTCGTTGCTCTCCCAATTCTGCTGTGGTCAAAGCGCGTGCCTATTGGAAATAAAGCAA:1 + chr2L 21616570 3' - TAHRE 38 1 83.00 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTAGTAACAAAGAATAGCATAGTTTTTAGCGCAAATCAAAATGATT:1 - chrX 4778551 3' - hopper 22 1 53.76 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCG:4 + chrX 21945915 3' - F-element 56 1 72.28 GAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTACCTGTAGGAGAACGTCTAACAAAA:1 - chrX 21564075 3' + invader4 3068 2 61.39 CTAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGGAACGGGCCGGCAACAATGGACTTGAAATGAAAATTGGTAAAACGGCCTTTGTTGTT:1 - chr2L 16378921 3' - HMS-Beagle 6810 2 63.37 GCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGAGGGTGGTAAAGAAAACCTGCCACATATGCAAATAAGCTGAGTAAGAGTATGTGC:1 - chrX 2843616 3' + Quasimodo 238 2 53.47 AAACGTCTTCACACGTCGGCGATACGAGTTGAAAAAAAATATAGGCAATTGTAGCACTGTTCTTTTTGACTGCAAGTGCACTTTCTGCAAACAGAAAGATG:2 - chr2L 22342207 3' - F-element 20 1 67.33 CCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGG:1 + chr3L 24210970 3' - HMS-Beagle2 34 2 64.36 CATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTTGCAAAGATAATTGAAGGGTATGCATGT:1 - chrX 18975567 3' - diver 5940 2 71.29 CACTAACACACACACACACACACGTACATTTATATCACTGACCATGAAGGGGGTTAAATGGGGGCGTGGCTGCAACCTGTGTTCAACTTTGTTTAATGTAA:1 - chrX 6934141 3' + accord 180 2 48.51 TAAGAGCGGAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTGCTCATTCCCCTCCCATATTTCAAGCATTT:1 + chr3R 7983339 3' - Cr1a 4237 1 70.30 AATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTATCGATTTGCAAAAACATCTTGCATCTATCCCGCCCACACATTAGAGCAATAAAATTAATTTTTTTC:1 + chr2L 21704147 3' + FB 955 3 73.27 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAATCGCAAAAGTCGC:1 + chr3L 12217372 3' + roo 9034 1 59.41 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGATGTCAAAGTAATCACGAGTCCAAC:1 + chr3R 11478440 3' + roo 9021 2 76.24 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGAGCAGGCGGCTCAAAAGTCGGAATGTGGTATTCGGTTTTAGTTCGAAC:1 + chr3L 14205406 3' - P-element 26 1 53.47 AAAAGTGTGGGCGTGGGAGTTTTGTGCGGCTTCTTTTGGAGTCGTTCAAAGCGATTTCCCTTCACCTGCAACACCTTCAAAGCCTCCATTGGCACTGCCCA:1 - chr3L 7939918 3' - INE-1 246 1 75.25 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTAATTTTAACATGCATTAAGTGTGCATCCCTTTGGCTTAAACGTGCTTTTGAAGTGG:1 - chrX 12166506 3' - pogo 19 1 60.40 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGTGATTATCTTATTAAGTATGGTTTCCACCGA:1 - chr3L 4539165 3' + roo 9030 1 67.33 CAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTGCACTTATTTATTTTGTATAATAACTCAATAATTTCG:1 + chr2R 20010151 3' - Ivk 41 1 63.37 ATTCATAAAGCGAGGCAGAAATTGTTTTTGTCAAACTCGACTTGAGTTGTGTGTGAGTGGGAATTATGTGGCTGGATTTTTATGATTTTATTTTCGCCCTC:1 + chr2L 9192775 3' + invader5 93 2 67.33 CTCTTAATCATATAATCTTTGTAAAAAACAACAAATATTAAGCAATGCAAACTGTCACCTTGGCTTTATCTGTGAATTTGTACTGGTTATTTAAGTAGGTT:1 - chrX 22980669 3' + jockey2 3280 1 74.26 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCAGGAATGGGTTTTTTCTGAGGAAAGACGGACACTACGGTGATTGTATGCCCAG:1 + chr3R 11153636 3' - 1360 19 1 60.40 TTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAACGCAGCGGCGCCACCCGGTTTAGCCCCCCCCCCTACCCCCTCAAAA:1 - chr3L 10179317 3' + TAHRE 10417 1 51.22 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTAGATTAAGAACTACTTTATTGTTTGGTGTTGCGCAAAATTTCATTGTTGAATTACGTTTATCCTTGAGGGTT:1 - chr2L 18977874 3' + roo 406 1 76.24 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTGCGCTTTCAATTCCATTTCCACTTCA:1 + chr3R 19513434 3' - jockey 4673 1 74.26 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGCATAAACAGATTTAGAGTCGAGTGCCTGGAGCGAAGAAATGCTGGTGTGCTATT:1 + chr3L 18523673 3' - 412 20 2 59.41 TATGGGTGGAAGCGTGACAGGCTGAAGTTGAGTGGCTCACACCCACACAAATGCG:1 - chr3R 29438698 3' - hobo 2664 1 74.55 TGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTT:1 + chr3L 24210992 3' - HMS-Beagle2 6892 2 67.35 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGTTAAAACTTGGGGTAAACTTGATAAAATGCCATGGCAAATTATTAAATATCAG:1 + chrX 12885780 3' + transib2 2803 2 60.40 GTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACTAGCCATTGAGCATAGATGGTAGCAGTTCCCCCACTGCAGCCTGCACGGCGAAACGAAGCCACC:1 + chr2R 8276892 3' + F-element 4415 1 70.00 AACATCTTCTCCATCATCCTTTCGATCATTTTTTTTCACGTGCTCCTTTTTTCGCTTGCCTCGTTTCTGCGTAATGCGAACTCGTTGCGGCAGTTAAAG:1 + chrX 20830748 3' - G2 197 1 71.72 AGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 24210957 3' - HMS-Beagle2 12 2 60.00 AAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAACCCCACCTTACTCTTTATATTTCAAGCCCGAACCACTTTT:1 + chr2L 395674 3' + I-element 4930 1 63.37 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCCCAGGCAAAATTGGGTGGGGAGGGGGGTTGGGGAAGTCGAGGAAGGAAAAGCAA:1 - chrX 14615597 3' + hopper 1395 1 55.45 ATACATAGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGCAAAAACTAAACTACCTCTCACCAAATGCACCTGAAAAAATAAAA:1 + chr2R 18483982 3' + TAHRE 10389 2 55.45 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCAACTGACAGATTTTCACCTCT:1 - chrX 10196062 3' - 297 2 2 68.32 TCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACATTCAAATTCCTTGCCGGAACACAGCTTCGATCGAAAGTCAATGCCAAATTAAGCAAATAAACAAGCCAGG:1 - chr3L 16757329 3' + I-element 5349 1 66.34 GATCCTGATCAAGAATATATAAACTTTATGCGGTCGGAAACGCTGCTGTATAAAAGCGCAATGTCTCTTGGTAGACCCGAGTGGGCCGTGTAGCTTGATGA:1 + chr3R 2768366 3' - INE-1 80 1 62.38 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGA:1 + chr3L 12217358 3' + roo 356 2 73.27 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTAGCCAAACCCTTTTAAACACATACAAC:1 - chr2R 16384321 3' + roo 358 2 77.23 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTCATTCCACTTTAACCGCGGCGCTTTGTGCTGGTTTTGTTCTATTGGTA:1 - chr2L 11073760 3' - roo 27 2 53.47 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACTTCAACAATAGTCCCAAGAGTAACTTGAAGTTTTCCTTGGTTTCCTAGG:1 + chr2R 12998370 3' - roo 28 2 56.44 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAATCGCAAAAGTCGCCCC:2 + chr3L 12217375 3' + roo 9037 1 56.44 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATGTATGCAGAAAAGGCGTTGAGGACGGAAGAGTTTTTCAAGTGGAAA:1 - chr2L 12489533 3' + pogo 2087 1 58.70 AGTTGAGTAACGAGTATCTGATGGTCGGGGAAATCAACTATACCATTCTCTCTTGTTTTGACCCGCTTTTTCCTACATTTGAGCCAGAGTAAATAAATAAA:2 - chrX 22741635 3' + INE-1 545 1 63.37 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGGGCCGCAATAAAATACACACAGCTCGTACA:1 - chr2R 22199181 3' + 412 7499 2 75.25 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGA:1 - chrX 10196107 3' - 297 42 2 77.08 GTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTTCTCAAACCAAGTTTCTTGAACGACTTGTGTGCACACAACCAACAGCCTAATCAATCT:1 - chr3R 11915379 3' + I-element 5026 1 63.37 ATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCATATCATATTAAACGAAACTAAAATTAATTTGGGAGAAAGTTTACTTTATGA:1 - chr2R 7074057 3' + Doc 4520 1 56.44 TTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTTGTGCTGCATCACCATCAGGTGCAGGAGCGAATTGCGAGGA:1 - chr3R 8498035 3' - Doc 138 1 59.41 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATGTACTCCACATTTAACAAATATACGTACATGTGCGTTCAACATAATAGGTCACAAGATGCGAATATT:1 + chrX 5178900 3' - hobo 7 1 71.29 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGGCGGAAATGAATGTTATTTATTTAT:2 + chrX 21219510 3' + roo 394 1 66.34 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGG:1 + chrX 21219475 3' + roo 9022 2 74.26 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTGTATTTAATGAAATTTTATTCGTAGCATTCCCCTCCAATCTCGGAAGCTCCTCA:1 - chr2L 12888798 3' + 412 472 2 55.00 ATCAGATACCAGTTACTCAGCGAGTGGAAACGTAAGGCAATAAGAAGTTTCCGTGTGTTTTCTCCGCGTAACAAACCCACCCCGGACAAGAGGAGCTAAGC:1 - chr2R 4131711 3' - INE-1 545 1 77.23 ATCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGT:5 - chr2L 23286583 3' - Tirant 415 1 58.42 AGTCCAAGAATCCGAGATATTTAGTTGTTTCACCAAAAACCATATCCGACTATAACTGCTTATATAAAGTAATGGTTTAATCCTTACCTTGCAGGCACCAC:1 + chr3R 9445240 3' + Ivk 316 1 60.40 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGTAGCCCCTCGGGCACTCGAGGATTAAGCGAGCGAG:1 - chrX 21219430 3' - roo 30 2 62.37 TCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTGCTATATATACAATACATACACTG:1 - 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transib2 43 1 74.26 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCATGCGTCATAAATGGGGGCACAAAGTGGAAAGTCGGAAAGG:1 + chr3R 21198665 3' - Tirant 40 2 60.40 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCCAATGGACCAAGGCAGTGAAAATATGCCATAGAATACGCCAAAAAAATGATTGTAAGTCAAA:1 + chrX 17416994 3' + roo 395 1 65.35 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAGTAATTTGGGGACCAAAGAATTTTATTCAGAATAAAAAAAA:1 - chr2L 21631822 3' - pogo 33 1 65.35 CGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCTACGTCTACTGCATTGAAAGCTTGTAACAGATTTAAAGTTAACAGAATATTGTATTTT:1 + chr2R 673096 3' + flea 495 1 61.62 ATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCTGGGCGACAAGTGCCAGCATGACATGGACTGCACGGATTT:1 + chr3L 8379209 3' - accord 7027 2 60.40 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACAATAAACTACTTTCCATGATAATCGCCATCAAACTAGCTTCTGTTT:1 + chr3L 21393527 3' - roo 8693 2 56.44 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCAATCAATGCCTGAACA:1 + chr3R 28333595 3' - pogo 27 1 55.45 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTCGGGTTTATTGTTTTATGGCATTGCTAATATTTGTGTTGCATTTTCCGTAGA:1 - chr3L 18642231 3' + pogo 2082 1 60.40 GATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGGAACGGGCCGGCAACAATGGACTTGAAATGAAAATTGGTAAAACGGCCTTTGTTGTTGTG:1 - chr2L 16378918 3' - HMS-Beagle 11 2 66.34 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAAATAAAATCACACACTAAGGCGCCAAATTAGCGCGGAGCATACCATTTTTTTCCGCTTGGCTTGG:1 - chr3L 8256065 3' + jockey 4983 1 56.00 TGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTGCGCAGATTAACATATTTAATAGTAACTGAGAAAAGATATCATTAAA:1 + chr3L 13795564 3' - Doc 4511 1 53.00 TGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCCCCAATTAAATTCAAATAGTTTTTTCCTCACTGCCATTATGTTCGAGCTTTTCT:1 - chr2R 3521971 3' - copia 4893 2 55.45 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCATATCT:1 + chr2R 17348630 3' - jockey 21 1 61.00 TGTTCTGGGATATAGATAGATATTGGGGAATAAAATTAAAAATTGTTCAAAAATGTGGGCGTGACCGTTTTGTGCGGTTTGTGGGCGCTAGAATGGGCGTG:1 - chrX 7332398 3' - 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Doc 11 1 63.00 GTGTGTGTGTGTGTGTGAGTATCGAAAATTGTTATTGGGAATCGGGAATCGGGAATCGGGAATTGGACCCACATCAAGGCGACCGCCATTATCTAGCTGCG:2 + chrX 8669093 3' - Quasimodo 33 2 80.20 CGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 24210957 3' - HMS-Beagle2 6885 2 58.18 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAA:5 + chr2R 17348594 3' - jockey 59 1 79.21 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTGGACTTAATTCTTGTTTTGCAGTGATACAAGCATGTTTTTTTGCGGGTATAAAGACCACAACGT:1 + chr2R 6076738 3' + 1360 3376 1 64.36 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTACATTTCTCATTAACATTATCGCAAAGCCCATG:1 - chr3R 7102421 3' + pogo 2062 1 68.32 AGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTT:2 + chrX 706056 3' + Juan 14 1 77.23 GTATGTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATGTGTGTGGCACATGCTTTGATTGAGGTATGC:2 - chr2R 18078698 3' - Quasimodo 35 2 65.35 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAAAAGTAACTTTTTTCACCGAACTCCTGGAA:1 - chr2L 15798638 3' + roo 9032 1 68.04 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTGGGTGTGGAAGTGGGGCTGGTGTGGGCGTGGCAGGACTACGTTTCGAGTTTGGTTTTTGGTTGGG:2 - chrX 20585924 3' - jockey 14 1 69.70 TTGCCAATTTCGTAGCAATAAGACCATAATCACCTTTTGGGTAAATATTAAAATGACACAAATGAGTGCACACAGTCACACTCAGAAATCTGTATTTCTAT:1 - chr3R 13995527 3' - 1360 3116 1 76.24 TTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAAACACAAGTTCTTAAACCCACTAACAACCACCAG:1 + chr2L 18390785 3' + mdg3 5269 2 66.34 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATGGATAACCGTTC:1 + chr3L 22162728 3' + roo 9041 1 58.42 ACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGTTTCATTTGTTTCATGCTGAAAAGAAAACACGATTGCAGAAGTCAATTTGCTCAGGTGCAGTGTGTGCAATG:1 + chr3L 1985393 3' - Max-element 6 2 71.29 AATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGCCGGCTCAACTGATTTTGGTTACTGGTCTAGCAACCCTCTTCTT:1 + chr3R 11250046 3' - I-element 243 1 55.56 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTCAGGAAGAGAGCGGCAGAGCA:1 + chrX 3295654 3' + hobo 2892 1 78.26 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATCGTCGAGCAATGCAAAGCCGACAATTGAGATTACGGAGTGGC:1 - 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chr3R 11912115 3' - I-element 88 1 69.31 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTCCGCCGTCCCTTTCGTTTCGAATGCTACTCTCTCT:1 - chr2L 19684608 3' - mdg3 42 2 68.32 CGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCGATATCGCACGCTTTCACGAGATCGGGATCCAGTTTCGTAGTGAGCAGATGAATGTGATCCCG:1 + chr2R 22413265 3' - Doc2-element 479 1 66.34 AAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATTGGGTTTGATTTATTTGTATTATGCACGA:1 - chr2R 2144956 3' - Stalker2 7298 2 70.30 TGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATTTTATATATCCATCTAAATCCATATAATATAGCCATCTAAAAGTTTACGCTGGAAGGGTCATTATAATATTATCC:1 - chr3R 15130441 3' - Max-element 8235 1 71.29 CCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTTATAAACAAAGCT:1 - chrX 11503474 3' + roo 9030 1 68.32 AGTGTGGGCGTGGTAGTTTTGTGCGGTTTGTGGGCGTTACAGTGGGCGTGGCTACAATGCTGCGGTTTGAGGGCTGCTGAGCAATTTTCATAACTTCATTT:1 - chr3R 22261594 3' - INE-1 243 1 51.49 CAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCCAAAAATCTCAAATCGAGAAAAGCGCCTGAAAACTGAAAAAAAAACAAAAACATTAC:1 - 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Fw2 3899 2 87.13 ATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCC:1 - chr3R 19589919 3' - BS 5017 1 54.46 TTTGTTGAATAAAATTAATAGGGGTGATTGCTTTGGTTTTTTTTCGACAAATTTTGAAAAAATTAGTTTCATTAAAGGTTTTTTTTAATTTGTTCCAAAA:1 - chr2R 4608375 3' + Tc1 235 1 84.00 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCT:1 - chr3L 25884069 3' - Doc 20 1 54.46 TAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTAACCCTCTCCTGTCCATCGATGACCTGTAGATTGGTTAGGTTATTACGCCCATTTTTATTGGCTTTCAATTCGG:1 + chrX 846514 3' - I-element 366 1 80.20 CGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATATGTATATGTAAGCATTTTATGCCACCAAAGGCAA:1 + chr3R 25859422 3' + Stalker2 361 2 71.29 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTGTGTCGCATATATTACTCGCTAATAAATT:1 - chr2R 11276643 3' + roo 362 1 71.29 GATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGCTCTGTCTGTCTGTCCGTATGATCGTCGAGATCGTAGGAACTATAAAAGCTAGAAG:1 - chr4 829450 3' + INE-1 92 1 92.94 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAATTGTGGTGGAAAACTACAAATATATATATAGTTCGAAGTTAATGGACAACCATAACTGGAT:2 - 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HMS-Beagle2 6887 2 56.14 AGCAGACATCTGTATGTGTGCACACGTATTCACATGGTGTGTTGATTTTTAGAGCC:1 - chr3R 5594395 3' + 1360 165 1 64.29 TTTTTTTTTTTAATTTTGATTAAAAATTGTTGGCACTCACCGTTGTACAAGTTTCCTTTTAGGCTGTCTACTCCTCTTAAATTTGAAATAATCTGACAAGG:1 + chr2R 1691250 3' - Doc 4693 1 79.21 ACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCATTTTTAAGAAACTGTAGAAAATTGGTGATCGCATTTTATGAAATGTGCATTCGCTTGGATCTGTATCTGTG:1 + chr2R 4015405 3' - Idefix 7052 2 76.00 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGTTGGCGGTGATTTA:1 - chrX 3446501 3' - I-element 10 1 67.33 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGAGCTTCATCGTCCTTTTGCCC:1 + chr2R 18374826 3' - 412 7106 2 81.19 CCACGGGAAACAATTGCAGCCTCTATACATTGCCTCCTACTCCTACTCGCCTCTAATGGGCTAATCAAGAGTATTACAAAACCCACAACAAACTGGCGCCA:1 - chr2L 3840356 3' + baggins 5305 1 75.25 GGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTTTAATGACATCACATGTGTCCATCTGTGTGCGGGGGTGGTTGTAATTGTGTTGCCACGTTCTTTGTGGT:1 + chr2R 15057697 3' + hobo 2932 1 68.32 GATCGAAGAGCAATTTCAATGCAGCCGCATTTCTTCAGATAACACGCGCTACTACCATTTAATCAGTGCTTTGAATTCAAGCTTAGGCACCGAGCAGCACT:1 + chr3R 9216950 3' + Chimpo 395 1 70.30 TCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTGGAGACATAAAATGTGGGAATCCCACTTATGTAACTCTAGAGGGTA:1 + chr2R 1986269 3' + INE-1 146 1 61.39 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATTCTTAACGATATTTTCACTAAATGGCTATAAAACAGATATC:1 - chr2L 10104271 3' + roo 9037 1 57.43 ATTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTGCTTTTTATGCATAAAAAGTGCTTAGCATAAAGTCGTAAAAAACGTATTTGCCGGGATGTGACAACGATGACGACAGC:1 + chr2R 19032137 3' + hopper 143 10 72.28 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACATTTTCCATTAAATTTAAAGCTTTTTCTATTTGCTTCTGGAGCACAAC:1 - chr3L 18523587 3' + 412 7519 2 53.47 AAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTACTTTCACATTTTTGGAATTTAACCAATGTTCAGCCAGTCGGAGAAATGTTT:1 + chr3L 13558661 3' - hobo 2475 1 62.38 AGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGGTCCGTTGCCATGGCAGATTAGTATCGTGCTCTATGGGGCACTGAATTTTAAAAAATTATAGAGTT:1 - chr3L 5573502 3' + mdg3 237 2 67.33 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCT:1 - chrX 11503487 3' + roo 353 2 81.19 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGG:1 + chr3L 3535431 3' + roo 9022 2 73.27 AATAATAATAATAATAATTATGAGTGAGAGACAACTCTGGCCACAATTCCTTCCTCCTTCGTCTGCTCCACTCTTTGTAATTATTTCAGCAGTTTTATTAG:1 + chr2R 17288856 3' + mdg1 46 3 67.33 GATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCC:4 + chr3R 1977623 3' + micropia 427 2 51.49 TTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGATACGCGCTTAATGAAGGAAACGACATAAAAGCCCCGTCTAAGTAGCCATTGTTCCCTCGAAAAAAAAAAAC:1 - chr2L 6115097 3' - jockey 4640 1 67.33 TAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTGGAGACATAAAATGTGGGAATCCCACTTATGTAACTCTAGAGGGTATCAAATTGAAGAAGTCATAAACAAA:1 + chr2R 1986294 3' + INE-1 171 1 63.37 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGATCCATGGACTGGCCAGCCCAGTTGGCCAAGTAGCGATTTGGGTTAACTGCAGCTGCAA:1 + chr3R 23675422 3' - jockey 24 1 59.41 GATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAATAATTCAAATTGGAATCCTTCAACTATTTAATG:1 + chr2R 17359145 3' - 17.6 350 2 67.33 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGTCGGTGCTTTTTCGGCGCTCGGCTTTTTGTCTTTCGTCTTCTGTCGGGTTTTTCTAGCCACGCCGAT:1 + chr3L 5351587 3' + P-element 2877 2 65.35 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAGGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCTTTTTGCTGCCCTAAAACAAAGCACCTAGAAATAGAAATC:1 - chr3R 13167322 3' + roo 9038 1 57.43 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTGCTATTGCTGTTGCTGCTTTTGCCTGTGTGCAATGTGTTGCAAGTTGCATTGGC:1 + chrX 7429437 3' + hobo 2921 1 55.21 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTGCGTCTATGGGATGCGTAGCATACTTTTT:1 - chr3L 19437211 3' - jockey 4690 1 56.44 CACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGAAACATACAAATTTCAGATCAGTCTACACAAACTGGTGAAAAACTACAACTTAGAAATGATCA:1 - chr3L 27390391 3' + I-element 5099 1 61.39 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATGCCTTTTGTTTGTACTTTGTCGATCGATCGTCTA:1 + chr3L 19173602 3' + transib2 2787 1 62.38 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAAGACGTCTCCACCCGAAGACTGTGTTATATGTAGTTAATATTTATATTGTTCCGCAGAATGAG:1 - chr2L 16668613 3' - Doc 55 1 64.36 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTAATCCAAGTA:1 - chr3R 3920667 3' - I-element 36 1 65.35 AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATACAAATATAAATAATACTGTGTCAGTTGGAAGTGAAAATTTACACA:2 - chrX 23035733 3' - HMS-Beagle2 6912 2 53.47 GCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTT:1 + chrX 21945935 3' - F-element 34 1 52.53 TGGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTT:1 + chr3L 24210992 3' - HMS-Beagle2 8 2 68.04 GTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGAGCATGATGGAATTTATGACATTTATGAAGACCACCTATAACACAGCCAGAATTTTCGGCAGCGCTAAACACACTAA:1 + chr2R 3680417 3' - mdg3 5253 1 59.41 AATGCAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAATGAATTCGATCCGTTTTTAAAAGGAATAATAATAAAACAATAATTTAACAACCATA:1 + chr2R 2753794 3' + HMS-Beagle 6620 1 56.00 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGTATATGCACACGCACACATACGCAGGCAATTGGAA:1 - chrX 5178811 3' + hobo 2899 1 65.35 GGATATTGGTCCTGATCAAGAATATATATACCTTACATGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTATCATACTTTTCAACAAGTCTAGTATACC:1 + chr2R 15412122 3' - INE-1 87 1 82.80 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGACCAAACTATGTGGTATTTCAATCAAGTCAGGTGGTCTGCC:1 - chr3R 5368317 3' + P-element 2854 1 46.53 CGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGAATATAAACTAAACGTGAATATAAACTAGACAAAATGTCCGACCAAATGAACCAAAA:1 - chr3R 5561942 3' + pogo 2084 1 60.40 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGTAAAAGTTTGCCACTTAGCACCCGA:1 - chr3R 13231131 3' - Quasimodo 16 2 68.32 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACAGTATTTCATCTTCATATTTGATAAATAATAACCTGTGTT:1 + chr2L 14993459 3' + 412 7512 2 56.44 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAAC:1 - chr3R 11080705 3' - I-element 46 1 70.30 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTCCCTTCGCATTGCTAATTGCCATGCAGCTTGTGTGTGCGTGTG:1 - chrX 12749339 3' - hobo 32 1 55.45 CTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGACTTATAGACTTTCATCCGCCTCGCATATCGCGATGCCCACAGTTTTGCTTTGCACAGGACACCT:1 + chr2L 12081023 3' - Bica 458 1 70.30 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTGATCAGTATCAACAGCCTGATATAGTTTGTACAGG:2 - chr3L 15869656 3' + pogo 2065 1 65.35 GGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTTTAATGACATCACATGTGTCCATCTGTGTGCGGGGGGGGTTGTAATTGTGTTGCCACGTTCTTTGTGGT:1 + chr2R 15057697 3' + hobo 2932 1 68.32 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACAACAGTCTTACAGATTTGTTGATAAATACAAATCTT:1 + chr3L 13472368 3' - jockey 4800 1 63.37 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTAGGCAAGATGAGTCTTTCGATTGGAAAATGCTCCAAGGATATGAGGTGTCAACTGATGAGCTTTTCCTCGTTCTC:1 - chr2L 1530373 3' + roo 409 1 77.23 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACA:2 - chr3L 9190470 3' + 412 7497 2 73.27 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTT:2 - chrX 17492882 3' - Tirant 8135 2 54.46 GCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAGGTTCATCCCATTGTAGGGGAGAAAAGGCACAAGTTTTCCG:1 - chrX 22664359 3' - opus 25 4 55.32 CACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGAGGTCGGTGCTCTCTTTCTTTATTTTAAGCTCAAACGCTC:1 + chr2L 2944958 3' - opus 442 2 60.40 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCTTGTGTGAACACAATACGTTGGCTTCGTGCATTTTACGGTGTTGGGAAACAGACGAAATGGACTCAGTGA:1 + chr2L 3842914 3' - roo 8685 2 56.44 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATCTTTGTTGTTTTTCCAACCGGGTGCTTAAAGA:1 - chr3R 23870088 3' - roo 43 2 76.24 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAAAAATCCAGAAGATTTAGAAGTGCACCGGAATAGAATTAGG:2 - chr3R 28333517 3' + pogo 2070 1 58.42 TGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACAACTACGACAACCACGACTACCACAACCACCACAACTACT:1 - chr3R 25399372 3' + 1360 3161 1 61.00 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCAATCAATGCCTGAACAACTCTAATGAA:1 + chr3R 28333606 3' - pogo 16 1 63.37 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAATTTCCATGTGATGCGCAATATTTCGTAGCATACTTTCAGGCTCTTAATTGGTGCATTTCCAATGCATTGCA:1 + chrX 5513410 3' - jockey 4763 1 72.00 AAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGGCGACATATATATATGTATCTCAAATCATTTAAAAACTTGCATCACTAACGGGTAT:1 + chrX 16906748 3' + invader4 296 2 65.35 GTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTTGTTGCTGTTGCACATCGGCAATAACTATTTATTAGATACATAGATACATTG:1 - chr3R 9144129 3' - Idefix 84 2 57.43 GTCGGGGAACTGGACTATAGCACTCTCCTTTGTTTTGTTTTTATTTCCTCTTGTTAATGGGAAAAGCTCACTCACATAATAAATATGAATTTGATACGAAA:1 + chrX 22789984 3' + INE-1 568 1 65.35 GCCTGTGGAGGAGAAGGTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGTGATAGTCATTTTTAAATAGCCAAAGCCAACGCAAGTAAACTCGTTAACTGCGCATAGTCT:1 - chr3R 2161182 3' + I-element 334 1 60.40 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTT:1 - chrX 17492882 3' - Tirant 12 2 63.53 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTCTATGTGGGGCTGTTTATGTGCATTTAAATAATACATTTTTATTGACAATTTAACA:1 + chr3R 6097675 3' + roo 9052 2 59.41 AGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTGTATCATCAGTGGGGTGTTTAAATGTAGTAAATATCGAGAATTTTAAAAGAT:1 - chr4 306415 3' + blood 7365 2 54.46 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCA:1 - chr3L 9190474 3' + 412 7493 2 77.23 GGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTAGTTCCGTTTAGTTGAGTTCGGTTTGGCTTGGCTT:1 - chrX 19394872 3' - I-element 230 1 60.32 GAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAACAAAAGCCAACAACTTCACATTTTTGTGTAATTACGCGATCACTTTAACAGACATTTACTT:1 - chr2R 25009034 3' + FB 121 1 67.33 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCC:1 - chr3L 10576805 3' + roo 9029 1 74.47 ATAATTGCAATAATAATAATAACTGACCAAACACTGGGCGGCTGGAATCCTTCGCCTGCTGCCTTCATGCTTGCCTAAGTAAGTTAATATGCCATTTGAA:1 - chr3R 11076944 3' + mdg1 29 3 59.00 TTTTTGCAAAAACAAAAAAAAATTACGCAATAAAACGTCAGCTTTCAAGTTTAATTGGCCCGAAGGCGGAATTGGGTTAAGAACTACATGTCAACTGTATT:1 - chr2L 18631791 3' - Tc3 1553 1 80.20 TCTTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCT:3 - chr3R 13231164 3' - Quasimodo 49 2 77.23 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTTATTGTGGGCTTCTTTTCCTTTGTGGCAACTGG:1 + chr3L 12229409 3' + mdg1 380 2 65.35 GAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGTAGCGTGGCTTCTGTCGGAGCTAATAGAG:1 - chr3R 24050054 3' + Stalker4 7330 4 66.67 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGACAGATAAACCGAGTCCAAGTCCAAACTGTTCCCACCAAG:1 - chr3R 24719999 3' - P-element 33 1 43.75 GTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTTGTCTGTCTAGTAGTCCGAGTTAAATTAGG:1 - chr2R 964660 3' - I-element 5024 1 70.30 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAGCATATATAGTGGGCTACGTTGCTTGCCAAATAATTCCAATTCAATTTG:1 + chrX 10196172 3' + 297 374 2 64.36 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTATATTTTATAACCTGTCTTCGGCAGATTTAATCTT:1 + chr3L 21410147 3' + opus 461 2 73.27 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGCAATAGCTGTCTTTGTATTTTGTATTGCCGTGTTGCAATTTATGTTGGTGTTGCCGCTTGT:1 - 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Transib5 95 1 52.48 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGTGGGGTGATTCTATCTCTCTAAGTTTGCCCGGGTGTTTTGAAGTTTGGAATAGAAATAATTGTT:1 - chr3L 6869257 3' + roo 9059 1 65.35 TCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAATATAGGCTTCGTCTCCTTCTTTACATTCGTTATCCAAAAGCAGATTCGGTAGTCGTCGCAAATTATGATCTCTT:1 + chr2L 21266672 3' - FB 2 1 78.22 CTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGA:1 + chr3R 934258 3' + Rt1b 4752 1 55.45 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTAATAAATTATGCGCTCTATATGCACTGTAATAAATCAATAAA:1 + chr2L 3483575 3' - I-element 32 1 54.46 AAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTACAATGGGTATATTTTATCAACGTAAA:1 + chrX 2764886 3' - FB 51 1 76.24 CTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTGATTTGTGGTGGGTGACATCATTCATTTGGACAGGGGTGGAAGTTCTGTGTTTCAGTCTCCCTTG:1 + chr3L 3576952 3' - I-element 223 1 74.26 GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACATATACAAGTATTAAGCATAGTCAGTTCAAGCTCACCCCATTTTATGGAATGACAAATACCACAAAAA:2 - chr3L 26315768 3' - Tabor 6847 2 71.29 GGCCTCTGCGTAGGCCATTTACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTTTAGCAGTCAGCCAGTGGTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 18058159 3' + roo 8963 2 47.37 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTGCGCCTATGGGATG:1 - chr3L 19437226 3' - jockey 4702 1 59.18 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCCTAGCCATCTGACATTGAATGGTGTTTGTATGTGTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCT:1 + chrX 12649915 3' + hobo 2922 1 59.79 TTGGGCGGTTTTAGGGCGTTATAGTGGGCTTGACAACATGGGTCAACAAACTGACGCTGCGTCTTTGTGTCTTTGTGCTTTTTTCAACGAATCTAGTATAC:1 + chr2L 21794174 3' - INE-1 342 1 63.37 GTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTTGATGGGCGTTCACCTTGGCGAAAGATGAGTTTTTCGATTAGCGCGTCTGCTGCATCTGACTTCTATTT:1 - chr2R 10473535 3' - I-element 5084 1 74.26 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGTGATTATCTTATTAAGTATGGTTTCCACCGAAGTA:1 - chr3L 4539161 3' + roo 9034 1 63.37 TAGAATATAAAATAAAATAATATTTCCTTAATTTTTTTGATTTTTTCCCAAAACTAAAGACACCAAATCTAATGTATTTCCTTGCGAGACCTTTGATTG:1 - chr3L 10295020 3' - transib1 1901 1 84.85 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACATCCACCCAATCAATTGAAATCCACAACGTCATTTAACCACATTAAGCAT:1 - chr2L 15151864 3' + Tabor 7299 2 53.47 AGAAAAAAGTGGCAAAAAGGTCACAAAACAACCAAGCAGCACTGAAAGCTGCTATACTAGAAGAGCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATATACTAGAAAG:1 - chr3R 2473804 3' + S2 1271 1 64.36 GTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTGAGAAATTTATTGATAGTGGGCGTGGGCTTCCTAATTGAATTAGTGTGCCACGAAAGTTCATGTGCTCAAGACG:1 + chr2R 24820819 3' - I-element 131 1 78.22 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTG:1 + chrX 21668062 3' - Tabor 6884 2 68.32 AACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGGAAACTTTTCGCATAAAATCCCTGTTGGAGACAGCGCACTGGAGAAGGCAGAGAAGGACATTTTCTTT:2 + chr3R 11368261 3' + F-element 4348 1 75.25 CCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACCAAAATGAAGAGATTAAATTTAAGATATTTGCATTCTTAAAGATCTTG:1 - chr3R 20240870 3' - Tabor 30 2 52.48 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTGCAAACTGAGCAAAAGGTTTATGTACACACTTGTTTGAATATACA:1 - chr3R 12055037 3' - Doc 35 1 59.41 TGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCAGATTAGTTTTCTTGCGAAGGAACAACATGCACAAGCTATCATTACCTTATCCGAATCAC:1 - chrX 12639062 3' - Doc 4543 1 58.42 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGATCTTTTTTGAACCAATTTACTGTATAATTTTATGCCAATTTAATTTACAATCTTGTAAATTAGCTTGAAG:1 - chrX 11299945 3' - roo 6 2 71.29 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGTTTTCGCAGCACGCTCAA:1 + chr2R 1725961 3' - Doc 13 1 72.28 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAA:3 - chr3L 25884104 3' - Doc 55 1 74.26 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAATTAGCTAGGAAAGTTATGCATAGCCAGTATTGTTTTGAACCTATTTTGCTAATTTT:1 - chr3R 21710544 3' + mdg3 227 2 59.41 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCGCGTTCGTTGATATGCACAGAGTAG:1 + chrY 311463 3' + 1360 3387 2 67.33 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGGGATGGATGATACTATTGAGGGGCGGCTCTATC:1 + chr2R 16384361 3' - roo 8707 2 69.31 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGCTAGCAGTCACTAGTCCAC:3 + chr3L 14286067 3' - 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chr2L 8898874 3' - roo 32 2 59.41 CACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTCTCGGGGCAATTTCTTTCTTGTGGCTGG:1 - chr2R 17348659 3' - jockey 441 1 69.23 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACGGACAAATAAACATAAATAACGACATCTGAGTATTCTATAAATAATACGGGCAACTAGCGC:1 + chr2R 17005529 3' - P-element 15 1 64.36 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTGATCAGTATCAACAGCCTGATAT:2 - chr3L 15869668 3' + pogo 2053 1 77.23 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAG:1 + chr2R 17348618 3' - jockey 22 1 55.06 ATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACACGTCCCTCGAAGAGTAAACACAGGTACACGACTTTTGC:1 - chrX 22590153 3' - Burdock 38 2 65.35 GCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTACCTGTAGGAGAACGTCT:1 - chrX 21564082 3' + invader4 3061 2 56.44 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACTTCAACAATAGTCCCAAGAGTAACTTGAAGTTTTCCTTGGTTTCCTAGGA:1 + chr2R 12998371 3' - roo 8691 2 55.45 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAACGACTATATCA:1 + chr3L 11257416 3' + 1360 3374 1 62.38 CTGCGGAATTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCAAACGCAATCAAAATGCGGAATCAAAACCATAAGAGTATTAGAGTAGATGCGTGTGAATG:1 - chr3R 24684697 3' + Porto1 4289 1 70.30 AATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAATTTCCAATAAAAATTTCTTTTCTTTAACATAATTCGTTTTCTTCTTTTTCATATGTAATGCGCAACA:1 - chr3R 2585732 3' + 1360 2990 1 72.28 CGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCG:1 + chr3L 23678163 3' - Osvaldo 10 2 64.36 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGC:3 + chrX 21945923 3' - F-element 48 1 64.36 CAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTAGGGTGGTAACTCGCTTTGTTGATTAGTTAATTACACA:1 + chr2L 13642731 3' - Tirant 8163 2 77.23 ACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCACGTAATTAAAACTTGAAACGCATATGAAT:1 + chr3R 13607688 3' - Doc 4506 1 71.29 GTTATTAACAAACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTGTGTGAGAGCCGGAGACCAAAAACAGAACCAGAGACAATAAAGATTCCAGAACAAGAA:1 - chrX 2983037 3' + HMS-Beagle 390 1 60.40 TATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACACATGTCCACATTGATGACACTAATGAAACTGCAGTTATAAATTGAATTTTATGCGCGCTAA:2 + chr3R 23173194 3' - Burdock 6147 2 66.34 TAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTTCATTTGATATTATAAGATGGAGGCAAGGTTACATTGTATTAATGT:1 + chr3L 27389110 3' + I-element 5328 1 52.48 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCC:1 + chrX 19887136 3' - P-element 37 1 43.56 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACATTGTTTTATTAGCATTGCAATTT:2 - chr3L 22162677 3' - roo 8715 2 77.23 CATAAGTTAATATGTTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCGACAAATTAAAATAGATAATAATGATCAAAAATATCA:1 + chr3R 19445423 3' - 412 38 2 59.41 CTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAG:1 - chrX 21668024 3' + Tabor 435 2 72.28 GGATTGCCCGACAAAACAGGAAACAAATATAACAAAAAAAATTTTTCAAATGTATTAAAAAAATTAAGAAGGAAGGAAGAGCTGAAGGCAATCCCTCGCTA:1 + chr3R 4064576 3' + G4 77 1 70.30 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCGTACCGTGTACCTCTTTCTCGGAAACGTCGCTCGCGTCGT:1 + chr2R 21646154 3' - P-element 36 1 43.56 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTCTAATGTAGTATATTTGATTAAACTACTAGAGATTGGAATCCTTTAAACATATACATTAGTGATTATCGACATT:1 - chr3L 12565609 3' - roo 2 2 59.41 AAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAATAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGGGAAACCGAAACAGC:1 - chr3R 17335927 3' - hopper 57 1 75.25 ATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTTGCAAAGATAATTGAAGGGTATGCATGTATTTGCTCCCAAAT:1 - chrX 18975553 3' - diver 38 2 57.43 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTTGCAAAGATAATTGAAGGGTATGCATGTATTTGCTCCCAAATGCATACTTGAATTGATTTATT:1 - chrX 18975532 3' - diver 17 2 62.38 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGTATAAAAAGTATAACGTAAATATCTCTTACTCATGTTTGTATACTATGTTTAGTGGACATCAATAAATG:1 + chr2L 21631919 3' + pogo 2095 1 73.27 ATTAAGGAAAGTGGTCATAGGTAGGGAGGACCTTCGCATTCGCTTTCATCAACAGTAAACAGCTACACTAGTACTCGCGATGAAATGTATAACACAATTAG:1 + chr2R 5600432 3' + Gypsy12A_LTR 1941 1 77.23 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATACATACATCAAACATTGGGGAAGGCATAAAAAACGTAGGATTGACAAAGGCAAACCAAGTGATGCCA:1 + chr3R 5429687 3' + roo 9060 1 66.34 AGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGTTATGTATTAAACATATTCATTGTATAAAATGTGATTGTGTCTC:1 + chr2R 5520710 3' - 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Max-element 52 2 78.22 GGAAAAGCTGGAAAATTTGTTGGGCAAGTCAGTGACTGGAAGTTTAAGGGCCAAGGTGGTGGCAAACCCAAATGGCAGGACACTGAGCCAAGGAGTGATTC:1 + chr3R 17907914 3' - Gypsy12A_LTR 2008 1 65.35 TGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGCATGTCTTTAAGTAGGCTATAATTTTAATATATTTGTAGTGTAAT:1 + chr2L 10832279 3' - Quasimodo 30 2 62.38 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATTGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACGATTGGTGGCTAAC:1 - chrX 157192 3' - I-element 10 1 65.00 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTGCAACAATTTTCCGAGTGTAGCCAGGAAGCGAAGGGCCCACAAAC:1 + chrX 4278398 3' - blood 31 2 53.47 TTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTGTATGCGCTTGGTCGCTAAGGTATCTCAGCTGCAATGAAATGTAGGTTGTTTGTTC:1 + chr2R 4260475 3' - invader2 4732 1 60.40 CCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGATGCCTTCGGTGACAGCTTGTCGTGCATATTTCTCC:1 - chr3R 11391550 3' - hobo 143 1 62.16 ACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTA:1 + chr2L 23373502 3' + Tc1-2 1582 1 65.35 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTGTTTACAGTCATTGCTACAAATTGACAAATTCGCTGTCGCCTGTCACCCGCTTTGGATACTCTTTAATCTC:1 + chr3R 28135365 3' - hopper 3 2 76.24 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGTCCAACATGAGCTTATGTAT:1 - chr3R 2556065 3' + 412 7511 2 77.22 AACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCATCCAAAGTTCCTTCATTCAAAAGTTTATCTGGCACATTAATCCGTTTAGACTGAAAGCAAAACTTTCATTTG:1 + chr3R 22512139 3' + Quasimodo 6915 2 75.25 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTGGCTAGAAAGGA:1 - chr3L 9190430 3' + 412 7537 2 69.31 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTCCCGAGCAAAATCAATTTTAGATGAGGCCCAAACGTGGTTCAGTTGCG:1 + chr3R 20384510 3' + roo 9043 1 57.43 GCATACGTTAAGGGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACAGTTTCGGTGGCAACGTCAAGGCATTCG:1 - chr3L 5351513 3' + P-element 2851 1 37.36 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTG:1 - chr3R 13375978 3' - 1360 42 1 69.31 ACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATATAACATGTAACGTACAAATTATTAGATTGCATTACAGCATATTTTTAAATTCATGCA:1 + chrX 9816330 3' + BS 5067 1 55.45 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGTTATCATTACCTAAGCTAGGAATTACC:1 + chr3L 15353594 3' + mdg1 7433 2 53.47 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCCGCAACCCGCTGTC:1 - chr3R 4546024 3' - jockey 4768 1 68.32 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGA:1 + chr3L 3535438 3' + roo 9029 1 67.33 ATTTAATATAAATACAATACTTTCCGTTTTTTAAAAAGAATTTAAATCAATTAAAGCCAAATAAAAATTAAATGTAAAATACATTGTAAAAACTGCGTTAA:1 + chr3R 18433620 3' - Bari1 1396 1 89.11 TCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATACATCTGTCTACTTCTAGACTCCGAAACCCAAAA:1 - chrY 425003 3' + McClintock 6390 2 69.31 TTTTTTTTGCGCCCCCCTTTTTTTCCCAGTTCCTGCCAAGTATGTCATTGCGAATGTCATACAAATTGTGGAATGTCTTCAGTGTCAGAGACTCTGGTTTG:1 + chrX 4758935 3' + Cr1a 25 1 75.25 GGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGTCAAAGTTCAGTTTCAGTGATGGGGGAGATGATTGCACATAAGAACTATAAAAAAAATCAATACCT:1 + chr3L 25396875 3' - Doc 374 1 69.31 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGACTAAAGTCTAATGGGTTTATACTTTATTTTTTTGTTTGGGAAAAGATTTACATTTTCCTGTTTGTT:1 - chr3R 11912080 3' - I-element 53 1 57.43 CTTACAGCTAATTCAGCAAACGCAATCAAAATGCGGAATCAAAACAAAAAAAAAATGCTCAGAACAATCACAAAAGCCGATGTGAATCTGCATAAAAGCA:1 - chr2L 19618454 3' + Porto1 4313 1 75.00 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAGTGAATTATTTAATCGTTT:1 - chr2L 18417295 3' + roo 9046 1 53.47 ATTAACAATTTGTCGTAATATATTTGATTGGTAGCGTTGTAGAATCTCAATAATTTCGGACGGAAAATGTAAATATGAGAAGTGAATCGAGGCGGGACAAA:1 - chrX 8985070 3' - G4 3503 1 51.49 ACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCATCGTGAACCGACAGCTTCTGTTCCTCTTGCGTTGAATTCCCACTCTGACTT:1 + chrX 4175789 3' + G6 1829 1 62.35 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGTCCAACATGAGCTTATGTATCCGTGCACTTTTAGTTGAGGTC:1 - chr3R 2556043 3' + 412 458 2 60.40 ATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGCCATAATTTGTTTGTCTAGCTAACGTGGCCAGGATGAGGTGAAGGGGTGGTCTTCGCTGAAGTCGAGTGGC:1 - chr3L 14286250 3' - 412 420 2 73.27 AAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGAGAGACGAGAACGCGTATGTGTTTGTTGTATGTGGTTAAATATGCTTCGTTTTTGTTTAATTGGTTTTTGTTT:1 + chr3L 9103179 3' - 1360 3263 1 55.45 AAAAAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATCGAGAGAGATAGATCGACAAAGAGAGGAAG:1 + chr3R 25516021 3' + hopper 1050 1 68.00 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCGAAATATTATTGTGGCGCATGTACTTCAAAATGAATATGGCCGGGGGACAAATAAGCGAGCATTCCGA:1 - chr2R 21572734 3' - pogo 6 1 73.27 TTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTT:1 + chrX 21945931 3' - F-element 40 1 56.44 CTTGATTTTTTTTTTATTTTTATTCCGTTTATGACCCCGAAAGCCAAATGATCATCACTGTTGCTCGGAGCGG:1 - chrX 4380466 3' - transib4 2579 2 56.16 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTCCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGGGGTCCTAAAAGAGAGTCCTAATCTCAATCTCTCGCTGATA:1 - chrX 15076776 3' + S-element 1683 2 92.08 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTCATTCCACTTTAACCGCGGCGCTTTGTGCTGGTTTTGTTCTAT:1 - chr2L 11073765 3' - roo 8696 2 58.42 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTTGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAA:1 - chrX 5168855 3' - hobo 7 1 55.22 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAA:2 - chrX 157209 3' - I-element 28 1 50.50 AGTGAGGCATCACAACTATTCATGTACATACATATGTATGTATGTGGTACACGAAACTCGCCATGCAAATGAATGTTTTGAGAAGCGCAGAGAAAGGCATT:1 + chrX 18975670 3' + diver 224 1 44.55 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAGTGAATTATTTAATCGTTTAAAAGA:1 - chr2L 18417289 3' + roo 389 2 59.41 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCTTTTAGAAAATTCCCTTTTTTTGTGGGT:1 - chr2L 11559940 3' - copia 47 2 72.28 GTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAATTAGCTAGGAAAGTTATGCATAGCCAGTATTGTTTTGAACCTATTTTG:1 - chr3R 21710552 3' + mdg3 219 2 51.49 AAGATAACATAACTTTATTTCGGTTGGATATATTTCTTGAAATTATTTTGATCTCTTAGGAATTTTTGTTTCTTCCTATTTAATGAAAGATCGTATTTTCC:1 - chr3L 2818426 3' - Chouto 150 1 63.37 TTCGGCGTTGATCTTAATTCGACTCAAAATAAAAACTATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAAGGTATCCGAAAAAAAGAACTGCGAGTGAAATA:1 + chr2R 23761312 3' + Tom1 347 1 72.28 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACATGCACATACTACACATGTCTTTACTTAGATGTACAAAATATTCACAGGGTATCTT:1 - chrX 6162149 3' - blood 38 2 61.39 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAATAATCAATCAGCGAAGAGTCAACCCAAGTATTCACATTTTCGAGGCT:1 - chr2L 1535650 3' + roo 9043 1 54.46 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATACAAATTTTTATATGCAGTTCCAACAATTACGGCCATTTAATGTTA:1 + chrX 22590220 3' + Burdock 6362 2 57.43 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCACTTTCTTTCAATTGCCACCTTTCCCCGCTG:2 + chr3L 3070703 3' - 1360 42 1 68.32 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAATTTAATATAATTTATAACCAGT:2 + chrX 11503512 3' - roo 8717 2 83.17 TCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATAATCAAGTTGTTAACAATTTCGATGCTTTCGATCATAAAGTGTATACACATGATTTTTCTTTA:1 + chr4 716994 3' - INE-1 153 1 73.74 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGCAAACCGTCTAAATGCGATTGGTTTTCGGACATTGGGAAAATTCCTCTCCCC:1 - chr3R 11936882 3' + roo 9049 2 57.43 ATCAATTCTGATCAAAGAAACGAATTTACATATTTGGAGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGCAATATGAATCTGGAGAAAAAACTAAAAAGAAATGAAAAACT:1 + chr3R 19445099 3' - 1360 3169 1 67.33 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGTTGGCGGTGATTTACCCGCGAAA:1 - chrX 3446492 3' - I-element 1 1 76.24 GCCGTGGAGGAGCTTCGAGTATAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTACTGTTCTTTTGGCCATCGTT:1 + chr3R 6116569 3' - Max-element 56 2 75.25 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTATATGTATATATATACTCACATATATCTGAAACTGAGGAGAGC:1 + chr3L 8843628 3' - I-element 33 1 55.45 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTTAAATCTCCTCTGTAGCATTGCCCGTTTTGCACTTGACTACGTTTTGGGTCAAGTTGCGTAGAATTGGTGAT:1 + chr3R 25566873 3' - hobo 5 1 76.24 GACCTACTCACAGCAAAAAACAGGGGAGAGAGGGGTGTTACAAAAGTTCCAAGCACTCACCTGGCCGAGCAACTTAAATTATTGTCGTTTATTGTTGCTGT:1 + chr2R 20592322 3' - copia 141 2 82.18 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACACCATTCACTTTCATTTTCATTACACAAATGAAATGAAATTT:1 + chrX 12866520 3' - hobo 30 1 57.43 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAAATGCGGCAGACGACCCACACAAAGCATC:1 + chr2L 19623134 3' - Burdock 6179 2 70.10 CTTCTTATTTGGGATTTTACACTTCCCGAGCAAAATCAATTTTAGATGAGGCCCAAACGTGGTTCAGTTGCGGGCAGAAACATTTCATGCAAAATTCAAAG:1 + chr3R 20384539 3' + roo 409 1 79.21 CACATAGCCACGTAGCACATAAGAATTCTTTTTCATATGTATGCACATAAGCATACGCAAGAGGCGCTCTCGCGAATCGGAAAAAAGAAGCAGCACCAAAT:1 + chr3R 22011684 3' + Tom1 149 1 73.27 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATTTTCCTCATTACCCGACTTGCATTTTATTTTAATGAACTGTACAAGTCGCGT:1 - chr2L 13868694 3' + roo 9050 2 58.42 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGACCAAACTATGTGGTATTTCAATCAAGTCAGGTGGTCTGCCTCGTATTTTCCACAGTTATATGTACG:1 - chr3R 5368291 3' + P-element 2880 2 72.28 CAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCGGCCTAGGACTGAGCATAAAAGGCGGCGCCGAGCATAAACTACCCATTTT:1 + chr2R 16555032 3' + X-element 4378 1 51.49 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCC:2 - chr3R 11080697 3' - I-element 38 1 62.38 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAACAAAAAATGGTGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGACAAAATGTCCG:1 - chr3R 19513358 3' + jockey 4973 1 55.43 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGTAATGGCGATTTTATCTCTTGGCCCGGTGTTTTGCTATTATTTTCTTAACAGTTAGCGGGCAGC:1 + chrX 17581327 3' + roo 398 1 68.32 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGGGACGCTTTTGTGGCCGGGGCACGCTGCTCTTTTGGCCATCATCGCCTGCGGCTGGGGTGTCTT:1 - chr3L 10029613 3' - hobo 12 1 65.35 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCC:1 - chrX 11503488 3' + roo 9016 2 82.18 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTCGTTCGATTCGCTTACATGCTCCTTTCTTGCTTAAGAAGCCAGACGCATCTGGTAC:1 + chrX 21050028 3' - 297 18 2 62.38 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTATGGCGACACTGTCGATACAGATACAGATACAAACATCTGAAAGCCAGCAGTCGTGGCCA:1 - chr2R 22761535 3' + blood 7367 2 58.42 TTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTGTCATGATTGTTGGGTGGAAGCTGGCAAATGGGCCAAGGCTCAGGACCAAGGACCTAGGC:1 + chrX 9431103 3' - I-element 213 1 57.43 CTGGTAGACTAAACATCCGTTCCCTAATTTAAACATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCATCACGTTCCCACGATCTCGTCCCAATTCAGACTGATCTT:1 + chr3R 1207422 3' + Idefix 6997 1 78.22 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACA:2 - chrX 17492869 3' - Tirant 15 2 66.34 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACATTTTCCATTAAATTTAAAG:1 - chr3L 18523615 3' + 412 438 2 78.22 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATAGCAATTAACTAATATAAATTAAAGCATACGCCCTCTGTTCTCTCCTTTGTATTTTTTCAGAAA:1 - chrX 21425182 3' + flea 246 2 71.29 AGCTTCGAGTATAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGTACTTCCCACTTATTGCAAATCCAAGCCAG:1 + chr2L 16758315 3' - Max-element 46 2 68.00 ACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGACCATGCCCGTTTATTGCTGGTCAGATTCTGCTGTAGTGCTGTCCTGGGAGATTCGAGAT:1 + chr2R 3480866 3' - Juan 11 1 60.22 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAATTTAATATAATTTATAACCAGTATTCGTGAGAATCGCACGAAATGTAATCC:1 + chrX 11503541 3' - roo 23 2 57.00 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGC:1 - chrX 10196088 3' - 297 28 2 57.43 TGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGATACACATATAGAGTCTGCGTGCTCGGGCAGCAAGAGTGCCAACAAGTAGGTCATCAAAGAGGGTCCACCAGTG:1 - chr2R 10460328 3' - Doc 4489 1 80.20 GTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCATAATGGAAACGCCGCCTTAGCCTGCCTGCACTTAATGCGAGTTAATTTGATTTCACTTTGG:1 - chrX 3213496 3' + hopper 1405 2 69.31 GTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATA:1 - chr2R 5284564 3' + Doc4-element 2612 1 54.46 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGCATTTTACACACACACACACTTTTCTGTGCCGAA:1 + chr2L 8898920 3' + roo 353 2 75.25 CGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGGCGACATATATATATGTATCTCAAATCATTTAAAAACTTGCATCA:1 + chrX 16906737 3' + invader4 3044 2 74.26 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGCCAAAACGCCCTCGCATATGCAACACAATTTAAAGC:1 - 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chr3R 19131938 3' - diver 46 2 68.32 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTTTTTT:1 - chr3R 11080677 3' - I-element 18 1 60.40 GATCTGCGCGAGAGCGCTTCTTGCTCATGCTTATGTGCAAGTTATCAAACCAATAAATATAGCACTCTGCCCCATTTGATAATCAAATTTCAAACTCCAAT:1 + chr2L 22778784 3' - Tom1 207 1 65.35 TGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTACCT:1 - chrX 21564096 3' + invader4 3047 2 60.40 CGGCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACGACCCACAACAATCAAAACGATTGAGCCGAAGTCGAAGCCGAAGTCAGCACGATCGATGATCTTTT:1 + chr2L 19865910 3' - P-element 10 2 72.28 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTAGTCGTGCGTGAATTTAGTTTTTTTTCCCATCT:2 - chr2L 8965427 3' - Doc 48 1 66.34 TAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGCAGGGCGGAAGAGAGCAATTCGTGGCGCTATCATTAAACAAATA:1 + chr3R 24601291 3' - I-element 5100 1 56.44 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCAGTTTGTTAC:1 + chr3R 23870139 3' + roo 9033 1 63.37 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCAGACCCGCCACCTCCGCGCTCCATGGC:1 - chrX 14953605 3' - P-element 49 1 29.00 TCCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGAATCGAGACGAGCCAAGCCGAATGAGGCAATCGAATTTATTTTGCTTCTGCCTCTCTAATTTTCGCCCATTT:1 + chr3R 21990193 3' + rover 7134 2 77.23 TAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTGGCTAGAAAGGAGAGCACTCGA:1 - chr3L 9190420 3' + 412 494 1 79.21 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCAATCTTCTAAACAGGATAAATGTAATTGCGCATGAATTTCTACGCATATTTCGGCGTCGCTGTCTGAG:1 + chr3R 17557469 3' - mdg1 7 2 74.26 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGTGTGTGTGCGGTGTGTGTGTCAAATTTAAAAGCATTCTTGCCAGTTGCCTTTGGACGGGCGATGTC:1 + chr3L 17691416 3' + 1360 3380 2 66.34 GTTGAGTGCTTATGTCCGCACTTCCTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGATGAAGAGGGAGCAAGCGATACCAACAGAGGTTGCAGAGCGGG:1 + chr3L 14489042 3' + 1360 461 1 56.44 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCAC:1 - chr3L 24210907 3' + HMS-Beagle 7008 4 59.41 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACAGTTTGTTTGCGGCTCGCTCTC:1 - chr2L 12911268 3' + mdg1 369 2 78.00 ACATACACACACACATACACATACACACACACACACACACACACACACACACACATACACACAAAGTCAAACACACTCTCGCGCAGTCGGAAACTTTCA:1 + chr3R 6419111 3' + accord 7100 2 61.62 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGGCAATCTAAATCCCAGAAAAGATCC:1 + chr3R 21587331 3' - pogo 14 1 63.37 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTCCTTATTGCCCGACTCCCAGCTCATTGAAAGATTT:1 + chr3R 17335964 3' + hopper 1380 1 60.82 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCAACTGCGGCAAAACCAATAAAAGAGCACCAACGAATTCCGGGAG:1 + chr2L 15194764 3' - copia 4897 2 61.46 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAATAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGGGAAACCGAAACAGCAACAGGAGCGGCAAAGTGGTTGGGGGG:1 - chr3R 17335900 3' - hopper 29 1 50.00 ATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTTGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATTGTTTTGTGAGTAAACAGAA:1 + chrX 7339942 3' - G2 2638 1 76.24 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCCTTCTGCGTCGACGGCTTTCAGTTTGGGGAAATAGAGGGAGTCACACATTACTTTCTCACGCA:1 + chr3R 5555997 3' + mdg3 5486 2 67.33 GAATTAATATAAAATAAAGAAAATTGTGTAATAGATAATAAATGAGCTGAGTGGAGTAGAGCATGTGCAGCATTCATGGCCCACCGATCAGATTTGTCGAT:1 - chr3L 9558561 3' + Bari1 1403 1 75.25 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTACTGGTCCGCCTGTCTGCTTTATGCGAGTTTGTTGTTAAACCATCACAAAATAAAGGAGAGAGAATAAAAAACAA:1 - chr2L 19681384 3' + hopper 1411 2 68.32 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGGATTGTTTAATTAGTTCTGTCTTGGCATACAAAAAATAGTTTCAAGTCCCT:1 + chr3L 7266590 3' + mdg1 396 2 49.50 AAAAACTAAATTATACCACAAAATCTACACTAAAATGCTTAACAATGCAAATAAAGCATTGAACTTTCGGTTGCATTGGAAATTTAATTAAATATGAGGCA:1 - chr3R 11083031 3' + I-element 5168 1 81.19 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACACACACTTTTCTGTGCCGAAAACAAAAGTATACAAAT:1 + chr2L 8898937 3' + roo 9044 1 56.04 TGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGAAGTGACACTAAAACTCAAAAGAGAGTTATATTTCCCAAACATTAAT:1 - chr2L 23374403 3' - Idefix 7043 2 56.44 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAGAGTTGTTGGGGCTCGGCACCAATTGAAATTAGTTCAAGTCTGGATTAGGCCGAAC:1 - chr3R 10187349 3' - roo 8682 2 63.37 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATACCCAGTCCTCCCACACACACACATGCATAGAAAATTACTATACAATTTGTGGGACTACTATATGATATAGTA:1 + chr2R 20593438 3' - copia 4873 2 75.25 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACCCAAAGATGCAATAGAAATATA:1 - chrX 4278351 3' + blood 7334 1 78.22 AATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAGATTGAGCCCAAATGTCTCCGGCTCG:1 + chr3R 4713591 3' - S-element 399 1 80.20 AAACACATAATACAAGCCACACTGAATAAAACTCATCGCCGAACCGCTACGAAAACTAATCCCCAAAAATGTCAAGTTCGAATGGGAGCAGCAGCAGAAAG:1 - chrX 22914739 3' + Transib-N1_DM 225 1 64.36 CTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGTTGTCCCCGCTGAAAAAGATACAAAGATACAGCGA:2 + chrX 17492985 3' + Tirant 394 2 74.26 GGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTACAAGATGTGTGAGCTTCTTGCTCGGGCTGTGGCATAATTTTAGGCATTTTCCCGA:1 - chrX 4248806 3' - jockey 4625 1 55.45 ATGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTATTATGTGTGT:1 + chr3L 26740869 3' - accord 254 2 76.14 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGT:1 - chrX 3446514 3' - I-element 15 1 59.14 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGACTGTACAGATTGAGTGCTTGTGTGTGC:1 + chr2R 9258639 3' + blood 7339 1 73.27 TAAAATGATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAAATAAAAAAA:1 - chr2R 23724917 3' + Doc3-element 4641 1 73.27 GCGTTTCTCTATTTTCTGCCACTTTTTCATCATTTTACTCACTTAACTTAAATACTACAATGATTTTCTGGGGGAATAAGCATCATAATCTCTTGATATGT:1 + chr2R 5076110 3' - Tc1 1593 1 67.33 AACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGTCTTTTAAAGCTTACGGATTTCGTCAAAATAAAACGGGAACTCGCCGGGCACCGAGCAGTTGAGTCGCGC:1 + chr2R 17675944 3' - Max-element 8242 2 65.35 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCAACCCTATAAGTATAAATATAAACAATGTGAAAACAACTCTGATACTG:1 + chr3L 25876110 3' - 1360 28 1 73.27 ATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATATGAGTGATTTATTATTTTTTGCAACTGAACCATTCT:1 + chr3L 17762837 3' + invader3 237 2 67.33 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCCTTCTGCGTCGACGGCTTTCAGTTTGGGGAAATAGAGGGAGTCACACATTACTTTCTCACGC:1 + chr3R 5555996 3' + mdg3 234 2 67.00 ACATACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAACACACACACACACACACA:1 + chrX 7978949 3' + accord 7100 2 68.32 CTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACAGTATCGAATATTTGCTCTCAAAACATCGAAAATATAGAATATCGATAGTTACCCAGCACTAACGCTTTGG:1 - chrX 22387539 3' + Stalker4 400 1 70.30 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTGCAAACTGAGCAAAAGGTTTATGTACACACTTGTTTGAATATACATAT:1 - chr3R 12055034 3' - Doc 32 1 56.44 CCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTCATCATGAGGACATGACAT:1 + chrX 5131023 3' + I-element 5299 1 79.21 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGGGCTAAAGATCTTATATGCTTTGTTGGTCAAAGGTGTATCTTTTGTTTCTTTTCTCCA:1 - chr3L 21393440 3' + roo 392 2 62.38 CAAGTTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCAT:1 + chrX 19034172 3' + hopper 1373 2 63.37 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCACCCATTCCCCACCCATTTGGCATTGCAAAATTAGTGCAAAGCAGC:1 + chr3L 18793070 3' + P-element 2858 1 50.50 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTCATTTTGGTTAAGACAGAAAATGTTAACATTATTTTTCGCAAAATTATAC:1 - chr3R 13620261 3' - Doc 30 1 55.45 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGATTAAAGACCACAGTTGCGGATCCATTTCACTGGATGATGGCGGAGTGGAAGCTGAACG:1 + chrX 17432481 3' - hopper 15 1 64.00 GCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAGCGATCTATATATTTTATTCAATGTCTTGGTTTTTTCTAGTGTACAAGT:1 + chr3R 29361099 3' + 412 7518 2 52.48 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAATTTCCATGTGATGCGCAATATTTCGTAGCATACTTTCAGGCTCTTAATTGGTGCATTTC:1 + chrX 5513398 3' - jockey 4765 1 66.67 TACAACCGCTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAGACATCAGAAAAAAGCTAAAAAAAGAGCTTAAAAAACTTCAATTTCGATTTGCTGCTTTGTGAC:1 - chr2L 1530764 3' - Circe 7149 1 62.38 ATGTACATATATATATAAGGGATAACGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAACGGGCATGAAAATAAGCCAAGCTCCAGGACTTTCAGCATTAGTTGGGAC:1 - chr2R 3480789 3' + Juan 4187 1 50.50 AAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTGTTGTTGTTATTGTTCAAAATTTTTTATTTCATTTTCTCCCCA:1 - chr3R 23656341 3' - I-element 187 1 79.21 ACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTAGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGCATCCTTCGCTGCCAGTCAGTCATCCATTCGCAT:1 - chr3R 11080967 3' - I-element 5006 1 64.36 GAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTGAATTATGATGAATATTTAGCAGCTGAGTAGTTTGATGCCTTTCAAAACTCTTCAAATGTG:1 - chr3L 10674526 3' + Doc 258 1 69.31 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTGCACTTATTTATTTTGTATAATAACTCAATAATTTCGAATTGGCAGACATACTAATTAAAAAT:1 + chr2R 20010177 3' - Ivk 15 1 60.40 TTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTGGA:1 - chr3R 460081 3' - F-element 97 1 68.32 AATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACACGAAGAAAAGAAAACCAAAAATGAGTGAATGAAAAGAAAATTATTATGGAAATGTCAACGTGAA:1 + chrX 5210683 3' + mdg3 5065 1 55.45 ATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGTCGAGTTTCAAGTGTTTCTG:2 - chr3L 8044282 3' + mdg1 7459 2 78.22 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACTGAAGTCGCACACCCGCCGCCG:1 + chr3R 13995979 3' - 1360 51 1 77.23 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATGTTTATGGCTATTAATCAAAATGTATTTGCTGCCGGCAAATTGATTAACATTTTCCGAGTGTTGTA:1 + chr3L 12258286 3' + roo 399 1 68.32 GTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGCGGTATTGCGTTGAAGGGGGAGTGGCAGCGTGCTATAGGAGCCAGACGCCCCAGACATTGCG:1 + chr3L 18793236 3' - Doc 451 1 70.33 CTTGATCAGGATCAATAGCAGAGTCGAATGAAGGATTCTAATTCGGTGTAAGTCCAGTTTTATGTATTATGTATTGATTGCTAAAATACTACATAAAATCT:1 + chr2L 12286070 3' + INE-1 89 1 71.29 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGAGCAGGCGGCTCAAAAGTCGGAATGTGGTATTCGGTTTTAGTTCGAACATCGCTGTAACCGCGTGCGGA:2 + chr3L 14205427 3' - P-element 5 2 74.26 GAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGCGAAACAAAAAAAAAAGGGGGGGTTTAGTATGAAC:1 + chr2R 1949129 3' + Cr1a 4395 1 77.23 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGCGCTCTCCTCTCTTTTGCACTCGCCACTTCGC:1 - chr2L 16276134 3' + 1360 3345 1 74.26 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACAAGAGGGTATAAAAACTCAACAGCAGCAGCCCAAAAATCGTTGCCTACTTTTTGGGGCCCGCTTAAT:1 - chr2R 20410914 3' - jockey 4679 1 65.35 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTACAACTTTTCCAGGAAGTGTTGAAAAAGTGGCTGTAATGCTGCCGCTTAATT:1 + chr3R 31431565 3' - Tabor 19 2 52.13 TAAACGATAGCTAATTCGAGCGGCGATTTATACAAACGAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAATCAGGGAACAGGAAAAAGCGACTAAAAAATACATT:1 + chr3R 821125 3' + 1360 2978 1 71.29 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTCGACTGCCTCGTAATTGCCAGGGGGAAATTGAAATAGATGCCCGATA:1 + chr3L 15729680 3' - hobo 29 1 52.48 AGCTGTGGTGTAACGCATCCAGATGTAACATAGACATTATTCAGCGAGGACAGTCAACAATCCAAAATCATACACCTAACTTTTATGATTAGCAGAGGCT:1 - chr3L 17940443 3' + Doc 4305 1 61.00 GTTGAGGTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGTATGGAGATGGATTGGTTAAGTTTGTTGCAAGCTATGATGCGTTGGTTGATGGCC:1 - chrX 19820408 3' - I-element 114 1 61.39 AAAGCCAAGGTATGTTGTTTTTAACGTATGTAGCTAATATGTGTGTAGTTGTACTGTTTATGTGTTGTGAACATATTGGAGTACTTCTTTTCCAAGGGACT:1 + chr2L 23007727 3' + transib2 281 1 73.27 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGTATTCAGAATGCGTGTAGTTCCATTACTTTCGGCAAACAAGCATACATACTTTCTAT:1 + chr3R 20240954 3' + Tabor 466 2 45.54 TATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCAAAGCAAGCTAAGCTCAGCATTCTATATCACAAATAAAAAAATTAGCGATATATAAATAATTGACGACTG:1 + chr2R 4402684 3' + 1360 496 1 63.37 TATTGTTATTATTGCTGTTATTGTTCTTTTGATTTTGCTTTTGATTCGATCAGTTACATGCGGTGTATCTGCAAGTGGAAAGAAAACAGATACAATATCCG:1 - chr3L 9552869 3' - mdg1 19 2 57.43 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACTTTGTCCTTAACGGAAGCATCGAATATTCCTTCCCTAACACGCTCATGATTTATCAATTGAAAAAAGATTCACT:1 + chr3R 25377490 3' - jockey 9 1 73.27 ATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAAACAAAAATTTATTATCAAT:1 + chr3R 4583049 3' + Cr1a 4392 1 74.00 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATCGTCGAGCAATGCAAAGCCGACAATTGAGATTACGGAGTGGCAGCTCGGGTTG:1 - chr3R 30263538 3' + roo 389 2 57.43 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCAATCTTCTAAACAGGATAAATGTAATTGCGCATGAATTTCTACGCATATTTCGGCGTCGCTGTCTGAGCT:1 + chr3R 17557471 3' - mdg1 7043 2 76.24 ATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTCGTTCGATTCGCTTACATGCTCCTTT:1 + chrX 21049998 3' - 297 6601 2 61.64 ATATAATAAAACTATAAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGAGGGGGGGACTTTAACGGGAGGGGAGTGGCGAATTTATGAAGCATAAGC:1 - chrX 15268118 3' + F-element 179 1 51.49 TTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATGCCTTTTGTTTGTACTTTGTCGATCGATC:1 + chr3L 19173597 3' + transib2 2782 1 67.33 CGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGA:1 + chr2L 23295880 3' - micropia 14 2 61.39 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACACTACAATGAAATCGACAGCACGCAATTATTTTTTGGCGACCTAAATGATGAAACAATCAC:1 + chr3R 5285014 3' + roo 389 2 60.40 TAGTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGTAGTCCGGCTGCGCCAGTTACAATCCTGTGGCCAGGGATATGCTTGTATTTTTGCTCGGCTCTCAGTTTTTTT:1 + chr3L 24895580 3' + accord2 7395 1 64.00 CTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGAACGAAAGACGTGTTTTAATAAATGCATTTATTAAAACACGTCTTTC:1 + chr3R 2247487 3' - invader2 47 2 53.47 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTCTGTGAGCTTTATGGACTGGCAGTC:1 - chr3R 17529543 3' - roo 8713 2 77.23 ATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTT:2 + chrX 21668089 3' - Tabor 6857 2 61.39 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGGGGGAATGGCGGTGATGCTGGGG:1 + chrX 21219486 3' + roo 9038 1 61.46 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAA:1 - chrX 5168854 3' - hobo 20 1 51.85 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTAGCCAGCGAACAGCATCTACATATTAACGTTACGGATATTTTC:1 + chrX 22597228 3' - hopper 33 1 57.43 CTGGAATACAAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTTGGTATACATACATATATCTATTTGTTTGATTTTTATTTTCATCGCATTTCAGGTGCGGTTAACAA:1 + chr2L 9473062 3' + Doc2-element 4318 1 76.24 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATATACGAAATAGTTTATAACTGGC:1 + chrX 3213966 3' + pogo 2052 1 81.19 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCCAATGGACCAAGGCAGTGAAAATATGCCATAGAATACGCCAAAAA:1 + chrX 17416977 3' + roo 393 1 56.98 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGTGACCCTAATCCGCATTGAC:1 + chr3R 30263596 3' - roo 8719 2 80.20 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACT:2 + chr2R 1725918 3' - Doc 56 1 76.24 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCAGATTTAATGATGTCAACGATGGCAAACGGGGCAAAAAGTAGAGTATACTTTTTTG:1 + chrX 14617725 3' - hobo 20 1 59.41 ACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGTATCTAGATAACTTTCCAAAAAGTGGTAGAGCTAACCTAGCTTCGGTAATAGTCGGAACTGGAATTATTGCG:1 + chr2L 22326884 3' + invader1 377 2 63.27 CCCCGACTATCAGATACCCGTTACACAGCTGGTGGAAATGTGTTATCCCGTCTTTTGTAGTATGTTTTTTTATTTTTGCTCTTCTAAATGCTTTATACATA:1 + chr2L 21691256 3' - INE-1 553 1 56.44 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGTATTCAGAATGCGTGTAGTTCCATTACTTTCGGCAAACAAGCATACATACTTTCTATTTGC:1 + chr3R 20240958 3' + Tabor 470 2 49.50 AAAAATAATAATATTTTTCATTTACTTCTATTACCTTGTCTTTGTGATAGCCAACCAAATAGCCAACTGTTTCAGCTCTGTTTGCCAAGTTAGCTGCCTTT:1 - chrX 10250348 3' - Burdock 499 1 73.27 CGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATG:1 - chr2R 4860115 3' + micropia 4990 2 64.36 AAATCAATAATAAAAAAAAAAACTGAGGCGAAAAAAAAAATAATGAAAAGCAAAAGGAAAGGTGTCCCGATTGTTCGCAGTGAATCAAAGGTAAGCCAGGA:1 + chr2L 12543588 3' + BS 5094 1 56.44 AATAGTTTAGAAAATATAAATTAAAACAACATATTAGGCAGAAATTCTGATGTTCACTGAAAAAAAGTTGTGAAAACCCGAGCAAATCGTTGATTCAAAGG:1 + chr2R 5517325 3' - HB 1474 1 65.35 GCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTG:2 - chr3L 24210896 3' + HMS-Beagle2 7170 2 54.46 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAAACAAATGCCATTCAAAACTGAAATTTTGCT:1 - chr2R 2832924 3' + 1360 3344 1 73.27 CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTTGGATTGTCGCCGAGCTGTGCTCTGG:1 + chr3L 21051643 3' + transib2 2777 1 73.00 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGACGAGAACTGGTTACTCTCTCTCTCTTTGGTGAAAGGAATGAATATTTAAAGATTA:1 - chr3R 8133909 3' + roo 396 1 67.02 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATCCTCGACGGGCAGGCGGAGACACTAACAACTAATTAAC:1 - chr2L 8469584 3' - Transpac 4953 2 61.39 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGATGCCTGTGCGTGTATGTGTGGCAGGATTAAACGTGA:1 - chr2L 17694261 3' - hopper 37 1 58.42 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCATATCTACGGGCGCCAG:1 + chr2R 17348641 3' - jockey 11 1 69.31 AAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGTCATCCTAATAAGTTGTTTAAACTTAATTATTATTTCTAAGCCGATTTCTAGTACAGCTTCTTGA:1 + chr3R 11072572 3' + I-element 369 1 79.00 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGTTTGCGGACATCATCGAGCTTTAAACATTTCGAACAACGAATACCAGAATTTCGAACATTGGTCTGCCTGAA:1 + chr3R 11936990 3' - roo 3 2 71.29 TATGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAGCGGTCAGAGGCAGAGTAGGGTTGTATGTATGTATGTACATGTATGTATATGGTAACCGAGATTATACAGGTACGTG:1 + chr3L 11324529 3' - accord 7028 4 68.00 TTAATAATAAAACATTCGCGTGTACCCGTCTTCCGCGGCCACTCGGAACGGCCAGTCTTCCACCGGCACTTTCTTCCACCGCTGATCGTCCAGCGACGCCT:1 - chr3R 3908168 3' + Q-element 547 2 47.52 TAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATCCTCTTCTCTTCTGCATCCGATTTGGCCTTCCTCTTAATCGTTTTCCCCC:1 + chr3R 11379255 3' - hobo 2497 1 50.50 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTCGCCTCTGCCTTTCTTGTTGTGCCATCGTCTTCGTCGTTTTTGCTCACGTAGCCAACGCGTGG:1 - chr3R 28326409 3' - P-element 13 1 67.33 AAAAAGAAAAAAAAAAAGGAAAAATAAGTTCACATTATAAGACTTAAGG:1 + chr2R 4025901 3' + Doc2-element 245 1 63.27 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTTACTC:2 + chr3L 3535466 3' + roo 394 1 62.38 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGA:1 + chr3L 3535449 3' + roo 9048 2 54.84 CAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTATGTACATATGTATATTCAAAAAAAAATTTAAACTACTGGATGCACCATTATATTTTTTTTTAA:1 + chrX 23035825 3' + HMS-Beagle2 299 2 72.28 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGGGCATAACAACAACTGGTTTTACAACGCAACATAAAAAAA:1 + chr3R 28326492 3' + P-element 2853 1 45.54 TGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGAAAGCTGTCCGTGATTTATAGGCCACAG:1 + chr2R 14402300 3' - 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Stalker2 7499 2 58.42 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTTCATCTCTTGAACAGCTGTGGCTGATGGCGATTGCGTCATTTTCATTCGACATTTCTGCCGCTTTGCG:1 + chrX 8520756 3' - FB 7 1 71.00 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAAACAAACAAAATGTAAC:1 - chr3L 10576784 3' + roo 9043 1 57.43 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAATATACACAAAGTGCTAACTAAAAAAAAAATTAACTT:1 - chrX 15171025 3' + mdg3 247 1 74.73 CGATTTAAAAAAAAAAACGTTTTGCCGCGACAAACGATGCTGCTGCGCTTTTTTACTCGATTTTTTCCCTTGTACAAGTACTTTGCTAAGCCGCAGTGATC:1 - chr2L 16644425 3' - FB 181 1 78.22 CAAAAATATCCAAAAATTGTACTTGCCAAATAATTACATAACTGCCAAATCAATTGTCATAAAATCTGGAAACGCAAACGACACCAATAAATGAAGACATT:1 - chrX 8659635 3' + TART-B 10249 1 56.44 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAA:2 + chr2R 17348616 3' - jockey 36 1 57.43 ACCGTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACCTTCATACTAGCCGAGTAACGGGTATCTTATATGTCTGGACTGGAGGAAAATTAAATCTGCAGCAA:1 - chr3R 2473008 3' - INE-1 157 1 63.00 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCCATATTTCAATTAAAAGA:1 + chr3L 15869742 3' - 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chrX 22576307 3' + Burdock 6289 2 43.43 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAACTAATTAAGACGCTGGGCGAGGAAAGGTGGGG:1 + chr3L 9293723 3' + mdg1 377 2 69.31 AAGAGTAATGGTTAAAAGTATTGAAGAATTCAGAAAATTAGTCAAAGCACCCTCCCTTGACTCCCGTAAACTCCTTGCCTAGTCTGAAGGCGGTGACCGCC:1 + chr3L 23693238 3' + G4 277 1 54.46 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGCTTCTTGTGATTTACAGCTCTTACATATCAAGCACTTCTTTA:1 + chr3L 10305387 3' - 412 7086 2 56.44 GCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGTTGTCCCCGCTGAAAAAGATACAAAGATACAGCG:1 + chrX 17492984 3' + Tirant 8500 2 73.27 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGCATTATTCATGCTTGTTAAATTTATTAA:1 - chr3L 14558270 3' - 297 47 2 75.25 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTAATCCAAGTATCATTGCAGGTATTG:1 - chr3R 3920652 3' - I-element 21 1 54.46 GAGAATCTTTAGTTTCTCTTGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATTGTTTTGTGAGTAAACAGAACTGACCTTAACAATGAGAAAATAACA:3 + chrX 7339968 3' - 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mdg1 7057 2 61.39 AGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTCTGTATGTATGTT:1 - chrX 13076749 3' + P-element 388 1 18.81 ATTTTGTTTTCTATTCAAACTTGACCATTTCTAAAAGAAAATATTATCCGGCATCACAACTATTGTGCAAATTTTGGACACAATTTTTTTGTTGCATACTT:1 - chr2R 11778439 3' - P-element 445 1 78.22 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTCCCGAGCAAAATCAATTTTAGATGAGGCCCAAACGTGGTTCAGTTGCGGGCAGA:1 + chr3R 20384516 3' + roo 9049 2 56.44 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGACAAAATGTCCGCGAACGAAAG:1 - chr3R 19513348 3' + jockey 4975 1 51.00 AAAAAAAAAAAGGAAAATGAAAATAAACGGAGGAATAAAATTGCAACAAATAATAAAGAAAAGAAAAGCGCGTTTTGATGCATTTGAGGCACAGGG:1 - chr3R 21934006 3' + Doc2-element 251 2 54.17 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGATGATTAGAGCGGGACGACCGCTGGCACCTCGACACTTGTTCGCC:1 - chr2R 21646090 3' + P-element 2857 1 50.50 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGCCCGTCTGTGTGCCGGTGTATGATGCCATTTATTTG:1 - 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I-element 5152 1 55.68 CGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGGGGAGCCCAGGAAAGTCGCTGGCCGGAGCATCTGCG:1 + chr2L 610910 3' - roo 9042 1 64.36 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGATTGAACGGGAAGGAAATTTCTCAGCGGGA:1 - chr3R 30076425 3' - hobo 44 1 67.33 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCACAGCCTCACCTTGTTCAAATATGAAATAGCAAGCAGCCACGGCCGAA:2 + chr3L 9190524 3' - 412 7083 2 54.46 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCAATCTTCTAAACAGGATAAATGTAATTGCGCATGAATTTCTACGCATATTTCGGCGTCGC:1 + chr3R 17557461 3' - mdg1 15 2 66.34 GCCACGGCGAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTATATTCTAGTGACGGCAGAGGGCGCGCGAGAAGCGAAGCCATAATATTTTGCGAGAATGAGCGA:1 + chr3R 3620752 3' - 1360 48 1 51.49 AAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGTACAATGGGAATTTGCATACAAA:1 - chr3R 11926167 3' - I-element 187 1 65.67 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAATCCCTATTAATGCCACGCTAGGCTTAAAACTAAAAAACCATTTTCTCCTTGCTGTACACATTTTC:1 + chr3R 7879913 3' + 1360 3379 2 69.31 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTGGGTGTTGCATGTTCCCATGGAGAACATTTTCGAA:1 + chr3R 26853906 3' - copia 43 2 66.34 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGAGAAA:1 - chr3R 19513365 3' + jockey 4966 1 65.22 TTTTTCTTTTTTTTTTCCTTTTTTTCTTCTATTTGTTCACTTTGTTATTTCATTTGTCAGCAAAATTTTTATTGGCCATCTTTGGCTCATCGAAAGAGCTG:2 + chrX 5377035 3' - Doc2-element 246 3 55.45 TTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATGTACATGCATATGTGTATATTCGTATACCCGTCAAATGATCGATTGGGGAGATAGCTGCATT:1 + chr3R 13231239 3' + Quasimodo 7357 2 69.31 CTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGTACTTCCCACTTATTGCAAATCCAAGCCAGCTTGGTTATTGACTCAATATTTGGGTTGCTTTTCCTT:1 + chr2L 16758352 3' - Max-element 10 2 69.31 TTTGTTTACTCTCCCTCGTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTCGCTGTGATCTAGTATCCATAAGGCCGATAACACTTCAACCTCTAGTTTGACAATAATCT:1 + chr3L 23932745 3' + Cr1a 212 1 64.36 AACTAACAAAAATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGATAAAAATATTATCCGAAAGGGTGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATA:1 - chr2R 16731986 3' + Dm88 4280 1 57.43 CGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTGGCATGGTTTTCGTAATGGAATATGTCTTATATAGGGTTTTT:1 - chr3R 13995612 3' - 1360 3202 1 62.38 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACACCAACAACAGACAAGTGCACGCAATTATGGTAAGATA:1 + chr2L 12888868 3' - 412 41 2 63.37 GTGGCGATGACCGACGCTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTATATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTC:1 + chrX 22576485 3' - Burdock 154 2 73.00 ATCATAATAATAATAATAATAATAATTACAATAAATGCGACATTTAAATGCCTTGCTTATCGGACGCGCAATTACAATGACAACGATGCCGACCGACGGAC:1 + chr3R 11080779 3' + mdg1 7067 8 78.22 GAATTTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATGTTTTTAGTGTTCTTGTTTTTCAAATGATGTGTTCTTGTTGTTGGCACTTTTCGATGCCCTACAAA:1 + chr3R 8928614 3' + 1360 3368 1 76.84 GTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCAATTGTTTGCCCTGCATTCGTCGTAACTCTTGTCATATC:1 - chrX 9486884 3' - Tirant 102 2 61.39 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGACGCATATTCTAGAACCATTTAAAAATTACGCCTAAAAGCATGCAAGGAAAATGCAGCCACACCA:1 + chr2L 478776 3' - jockey 4778 1 61.39 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCTGGCTTGTGGGAACGAAACATTCCATATATATTACGAAGTGTAATTCATCAAAATTTTCACGAAT:1 + chr3R 16399025 3' + roo 9059 1 62.38 TTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCAT:1 + chr3L 5267268 3' + Juan 4178 1 63.00 CAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAGCTCATGAGCAAACAACAAACAACGCGGCGACGGAAACGGAGGCCGCTCCGCCGGCAAGGGG:1 + chr3L 8696615 3' + Bari1 1634 1 78.22 GTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTACGGATTGGCATATCGGTTGGAATACATATTTCGCGAACTTACCTTGCCCACCTGCTG:1 + chr3L 5573625 3' - mdg3 5253 1 76.24 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGGCAATCTAAATCCCAGAAAAGATCCCCATTACCTCGG:1 + chr3R 21587343 3' - pogo 2 1 75.25 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAAC:1 - chr3L 9190444 3' + 412 7523 2 55.45 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTTGTTCGATTCGCTTACATGCTCCTTT:1 + chrX 21049998 3' - 297 39 2 69.57 GTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATCTTATTATATAACTTATATTACATACATAGAATGTATACATATTGAACGT:1 + chr2R 8642939 3' - Doc2-element 4747 1 71.29 GTGTATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGGCAGGAAACGGAAGTGTTACACTAAGCCATTTTGT:1 - chrX 6913135 3' - accord 187 2 77.14 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATATATATAAAATCGAGGCAAAAGTTTAGACTACAAAACACCTACCAACTTA:1 + chr3L 14854769 3' + mdg3 5474 2 55.45 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATAGAACCATTCAATAAAAGTTTTATAACATTT:1 + chr3R 11549898 3' + opus 7461 2 70.30 GGCTATAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCA:1 - chrX 3446522 3' - I-element 31 1 58.42 CAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAATGCAAGTTTTCATATATTTTGGTATTTTTTGTAAAATTTAGTAAATTAATCCTAT:1 + chr2R 5521079 3' - I-element 313 1 63.37 CTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATTATGCATCTTGTGTATTTTCTTTTATATGTATATAGTATGATTAATT:1 + chr2R 11639139 3' - Burdock 6162 2 53.47 GGTCGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATCTATATATCTATAAGAAAAGGT:1 + chrX 8326341 3' + opus 7449 2 80.00 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTTATTGTGGGCTTCTTTTCCTTTGTGGCAACTGGTTTTCAAGGAGTGGCGAAGCAGCGGGGCGGTGGA:1 + chr3L 12229443 3' + mdg1 414 2 71.29 GGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATAAATATATATAGTTATGTATGCTTATAAAAGGGTGCGAAATGCATCGCACTCAAGCGTCGGCT:1 - chr3R 17173012 3' + invader1 393 2 70.30 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGCTCATAACATTAATGTTAAAAGAGTAGAA:1 - chr2R 19164111 3' + P-element 2841 1 33.66 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAATAATGTTTAACCTCAAATAACTGAGTTTCCTTT:1 + chr3R 19515883 3' - 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Doc 34 1 62.38 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGGAACGGGCCGGCAACAATGGACTTGAAATGAAAATTGGTA:1 - chr2L 16378938 3' - HMS-Beagle 6827 2 56.44 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTAGGCAAGATGAGTCTTTCGATTGGAAAATGCTCCAAGGATATGAGGTGTCAA:1 - chr2L 1530396 3' + roo 386 2 54.46 GGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACAAATGAAATGGCCCAAAG:1 - chrX 5168826 3' - hobo 12 1 67.33 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCGGCCACACTGTAGATATGTAT:1 - chrX 17492855 3' - Tirant 1 2 78.22 ATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTTTCGATTGTCGGCTCAACTTAACGCCCGCCGCCGAGGGGCGTGGCACAT:1 + chr2R 20506361 3' + mdg1 245 2 51.49 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATACGCCTGTGTGGCGCTCCGTGATGTCGTGTCCCCGTGTAGGGTTACATACCACCTACTGCCAAACC:1 - chr3L 13652155 3' + mdg3 5486 2 66.34 AAAAAAAAACAATTTTAAAAAAATAAAATGGAAAAAATTTAAATT:1 + chrX 10347768 3' - FB 174 2 57.78 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTAGATTAAGAACTACTTTATTGTTTGGTGTTGCGCAAAATTTCATTGTTGAAT:1 - chr2L 18977894 3' + roo 386 2 56.44 GCCCGCCTAAAAAGTTAGAGCCTTCGCGTCAACTAACAGATCACTTTTCCTCCGATATTCACTAACCCGAAACTTAACCCAATCTGAAACCAAAACCGAAG:1 + chr2R 9508285 3' - Gypsy12A_LTR 487 1 66.34 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCTTT:1 + chrX 13640286 3' + P-element 2833 1 26.73 GGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTGTTGTCGCGTCTAATCAAGGAGCGGAGTTTGAAGTCGATGCCTTGGT:1 - chr3L 10429197 3' + jockey 417 1 53.47 GACAGCGCCACTCGGTCGGTTGCGCGAGTACCTTCTTCAACCCGTGGACCATCCGCTCGCATACGCCTCCTGCCCGGCATTGAAATTTTCATTCCATTTAA:1 - chr3L 25119979 3' + Cr1a 4411 1 80.20 TAACTAAGAGGATATATAGTACCCCTACAAATAGAAGCCGAATCGAAAAGAGTTATATCTGTTCCGACGCGACTAAAGGATGGGGATTTCCTAATAAACAG:1 + chr2R 1324146 3' + invader2 238 2 59.41 AGGTAATCGCATGTGTGTGAGGGATTCGTATTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTCTCTCTTTATTTTTCACTTTTTTTTATGCCTTCC:1 - chr2R 17259949 3' - I-element 4873 1 76.24 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGAGCTTCATCGTCCTTTTGCCCCGCCCCTCTGCACT:1 + chr2R 18374840 3' - 412 39 2 67.33 AAATATAAGATGTGGGACGAAAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATT:1 + chr3L 24210985 3' - HMS-Beagle2 6902 2 58.42 CCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTACATTTGTCTAAGGTCCATTTATACAACTAG:1 - chrX 11968255 3' + pogo 407 1 72.28 ATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGGCTATCGAAAACTCCAGCTGGGCTCTGTTCTGGCCAAAAGGCCAACTGATAAACGTTAGCCGGAAAGTGCAG:1 + chr2R 16433289 3' + flea 255 1 74.26 TTTATATATTTATTTATATGTGTACATAAAATTTGCTAAACATTTCGCTTGAATTTACTTGCAGGGCCGCTGTAATCGTGATAAACCGCCGTGCAAATACT:4 + chr2R 17351109 3' - Juan 4214 1 70.30 ATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATACATT:1 + chr3L 5267273 3' + Juan 4182 1 58.42 TTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGCAGTATGTCCATCCATCTACGTTGTCTGTCCGTCCAGGACAG:1 - chrX 2843525 3' - Quasimodo 7326 2 63.37 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATCGTCGAGCAATGCAAAGCCGACAATTGAGATTACGG:1 - chr3R 30263555 3' + roo 9046 1 63.33 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCCTTAATCTGCACATGTGTACTAGTAACACGAG:1 + chr3R 13167378 3' - roo 25 2 63.86 AGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCCCCTTATTGGAACCGAGCGATAGAAGAGATAGTAGTCGGTAAGATTCAATTGTTTTTTGTCTGCTCCTT:1 + chr3R 852197 3' - F-element 132 1 72.28 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTTGCCTAAATTGATCGAAATGTACCTATTCTTCAACAGAGCAAAATAGTTTAAGGCTTTTAAT:1 + chr3R 7015538 3' + roo 400 1 71.29 TAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAAAAGAAAGGAAAGGAAAAGCGTGAGCAACAAATG:1 - chrX 6149438 3' + invader2 361 1 66.34 CGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCACAAAAGGATGGCATTAAATTTTAAAGTTGAGCTGGCTGGCATCGGCGAGCAAAGCGT:1 - chr3L 19457011 3' - jockey 26 1 60.40 CAAATAACGGATCAGCAGCAGAAGAGTTGGAGGAATTGGACGGAGGATGTGGTTCAGCGAGTCTTTTGTTAAAGTTTTGCGTAAACTTTGATTACATGAA:1 - chr3L 18101136 3' + invader3 469 1 61.00 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTCGACTGCCTCGTAATTGCCAGGGGGAAATTGAAATAGATGCCCGATAATAAGCACT:1 + chr3L 15729689 3' - hobo 20 1 59.41 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGAATATAAAACAAAGCGTGAAATCTATTTGCAACTGGCGAAACGGGGCAGCAAAAGTTTATGCC:1 + chr3L 21998500 3' + roo 398 1 68.32 GTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGTGTGTGACATTCGATTTGATTGTTTTTGTTTTGAAATGCAATTTTACTTGCAAAGGGCCGAATCA:1 + chr3L 13885546 3' - Doc 134 1 60.40 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCAT:1 - chrX 17492898 3' - Tirant 8146 2 68.75 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTCAGATAAGGAGCGCGCACAAAAGTATGCTATGAAAACCGTA:1 + chr2L 17729371 3' - hobo 36 1 57.43 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCC:1 - chrX 5168846 3' - hobo 32 1 53.47 TTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCATAATGGAAACGCCGCCTTAGCCTGCCTGCACTTAATGCGAGTTAATTTGATTTCACTT:1 - chrX 3213499 3' + hopper 1403 2 67.00 GGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCACTCCATTCCGAGCCATTTTCCCTCGCATGTTAGCCAGCCATTTTT:1 + chr3R 20486411 3' - accord 33 2 60.40 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAATATACACAAAGTGCTAACTAAAAAAAAAATTAACTTTATCCTCTTG:1 - chr2R 17942056 3' + mdg3 247 1 77.23 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTACGTGTGTATAAATAAAACGGTGGCAAGATGTGAAGAATTTTTTAAAGCATTCTTGCGACCTTAGTGCCCTG:1 + chr2L 9854218 3' + hobo 2934 1 74.26 AGAATCTTTAGTTTCTCTTGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATTGTTTTGTGAGTAAACAGAACTGACCTTAACAATGAGAAAATAACAC:1 + chrX 7339969 3' - 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chr2L 3181988 3' + INE-1 549 1 84.16 TAGTTCAAGGTGCGTCCTCTTTGTGCATGTACCGTTACCGGTCGTCCTCTGCGCCCTTGGCCAACTCGAGTCCAAGGTCCAGCGCGGTACCGTTAATTCAC:1 - chr4 249256 3' - gypsy8 250 2 79.21 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAAAGAGTTAAACAACTATCGTCTCAATAGGCATTCCACGGTGGCGTTCCATCTCCAGGATTGCCACAAG:1 + chr2R 674395 3' + copia 248 1 77.00 CGATTATTTGAAGCTTTTCCTTTAGTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATAACTTTGTGGCAGCACAGAATTTAGTTCACAAATATT:1 - chr2L 20291945 3' - pogo 376 1 72.28 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATACCCAGTCCTCCCACACACACA:1 + chr2R 20593387 3' - copia 4924 2 79.21 GCTAAAATAAAAAAAAAATAAAAATGCTGTAAATTTACAATTCCCCCGGATCCCTCTCCACGCTCCTTATTTATTGCTGCTGACAGGGGGCAGTTAATGAG:1 + chrX 18955691 3' + G-element 4325 1 66.34 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACGTAAGTAACATATTTTCCCTTATTTCCCTCTTCC:1 + chr3L 22231372 3' - Doc 46 1 74.26 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTG:1 - chrX 17492902 3' - Tirant 40 2 72.04 GAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGACTTAATTTCTGGTAGTCAGGGAAATTATGCCGCCGCTCTCTTTCTCTTT:1 - chr2L 16536129 3' - Doc 378 1 51.49 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGC:1 - chrX 157232 3' - I-element 51 1 74.26 TCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTT:1 + chr3R 15790083 3' - flea 4727 1 60.40 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGTAGACTGCATACGTAGCAGTTGTTGTTGCTGTTATTGTGTGGAGCAATTTCGATTCGT:1 + chr2R 22514562 3' - P-element 17 1 54.46 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAGGGGAGTTCATCATTACAGCGTGACATTGATTGGCATTGAGTTGGGCGTAGGCAAATGGGCGATATGGAAACA:1 - chr3L 15056914 3' + 412 469 2 54.46 TCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATCGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACAATAATAGCAGCAATAGCAGCGGCCAAA:1 + chrX 3777226 3' + I-element 4875 1 72.28 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAAAAAGGCATTCATCATGCAGGCGG:1 - chr2R 15057627 3' - hobo 52 1 77.00 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAATTTAATATAATTTATAACCAGTATTCGTGAGAATCGCACGAAATGTAATCCCAAAGATATTA:2 + chrX 11503552 3' - roo 8677 2 67.33 TCTGACGTCGATGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTTTGTTGATAGTTATCCTTGATTTTGATGTCCTCAGCTGGCTTGTCGTTGTTTCCTCTGACAGCGACCT:1 + chr3L 15870661 3' - invader4 453 1 73.27 AGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTTAAATTACTTATTGTAAGTAACCTTGACTAGCGCCAATTTCATTCCCGCTGCGAACCCT:1 - chr2L 18977357 3' - roo 9027 1 71.29 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATACATACATCAAACATTGGGGAAGGCATAAAAAACGTA:1 + chr3R 5429657 3' + roo 9030 1 66.34 CAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATACGCCTGTGTGGCGCTCCGTGATGTCGTGTCCCCGTG:1 - chr3L 13652184 3' + mdg3 5458 2 65.00 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGTGAATACATTTTATCAAATGTTC:1 + chr3R 14835253 3' + roo 356 2 81.19 GTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGC:1 - chr3R 10736048 3' + McClintock 443 2 67.00 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAATCGCAAAAGTCGCCCCATTCAC:1 + chr3L 12217381 3' + roo 9043 1 52.48 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTCTCACCAGCTAAAAACCAATGGGAGCGGAACTTGATCGCG:1 + chr2R 11399234 3' - 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copia 4912 2 67.33 GAAAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGGAAGGGTGGGACAAAAAGGATGGTAAAGGGTCCAAAGAAGACGAACATTTAAGTAATTTATGCA:1 - chr2L 12906018 3' - Cr1a 291 1 74.26 ATATATATTCTTGATAAGGATCAATAGCCACGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGGCGACAACGAAGACAAGGCGTTTCAGGAGAAACGC:1 + chr3L 24566666 3' + INE-1 80 1 71.29 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGA:1 - chrX 17492888 3' - Tirant 8141 2 60.40 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTCTATGCTGCTCCGGATAACCATGAGCAGTTCCCGACGAT:1 + chr2R 22825471 3' - opus 7043 4 65.35 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCAC:1 + chrX 19887138 3' - P-element 35 1 45.54 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCTTTTTGCTGCCCTAAAACAAAGCACCTAGAAATAGAAATCATGGAAAGAACACTGCGGAA:1 - chr3R 13167302 3' + roo 395 1 63.37 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAATTTAATATAATTTATAACCAGTATTCGTGAGAATCGCACGAAATGTAATC:1 + chrX 11503540 3' - roo 25 2 55.45 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGTGATTATCTTATTAAGTATGGTTTCCACCGAAG:1 - chr3L 4539163 3' + roo 9034 1 64.65 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGCAAACCGTCTAAATGCGATTGGTTTTCGGACATTGGGAAAATTCCTCT:1 - chr3R 11936886 3' + roo 9045 1 53.47 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGAGTTAGAGGGGTGCGGCATGGGTGAGAGATGAATGCACTTGACAAAGCAACGCCTGCCTGCCTT:1 + chr3R 11389829 3' + hobo 2932 1 68.32 AAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTTGTTTGTGCGTGTTGCTTTTGCTGTTGAAGTGACCGTTGCTGTTGCCACATTTGTTGTTGTTGGTAATGG:1 - chrX 19359065 3' - 1360 3269 1 60.61 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAA:1 - chr3L 8044317 3' + mdg1 386 2 58.42 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAGTAGTTTGTTCATTCACTCGCTTGAATTTTAAATGATT:1 + chr2R 10334808 3' + pogo 2070 1 60.42 CAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGAGGAATCACAAAGGACTCCTTCCATATATAGTGAATTATATTTCCACAATAATGCATGTTCAACTTAAATGTAACAA:1 + chr2R 4349954 3' - Q-element 75 2 57.43 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCT:1 - chrX 17492877 3' - Tirant 11 2 66.29 ATCATGTCTAAACACATATTTAGACACAGGGCCTAGTTTCATTAATCAACGAAGTACCTAGCGATGATTCCCACGAAGTCAACAGGC:1 + chr2R 1775980 3' - rooA 7240 2 78.16 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGTATGGCTGTAGATCCAGGATGCCTGGTCGCAGGACTATGACAATATTTTG:1 + chrX 14371363 3' - jockey 31 1 58.59 CACGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAAGAGGATAACACAAAAAGAGAAAAAATGTAAAATAAATAAATATACAAAAAAAAACAAAAATGAGTGAATGAAA:1 + chrX 5210653 3' - Dm88 128 2 52.48 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTCGACTGCTTCGTAATTGCCAGGGGGAAATTGA:1 + chr3L 15729665 3' - hobo 44 1 67.33 CACATATATATACACACACACATACATACATACGCCACACCGACCAGTCAGGCAATGAATGAAAATTTAATTAAATTTCACCTTAAAATGATGGGCAAATT:1 - chr2R 16520982 3' + Quasimodo 28 2 56.44 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTATATACATATATATTCCGTGGAGGA:1 - chr3R 5429617 3' - roo 8715 2 81.19 AAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATAAACATAAACAACCCGCAATCGATCCATAAAAATCAATTGAAAACCA:1 + chr3L 14430623 3' + FB 39 1 53.47 AATCAAAGGCACAAAAAATTGTTAAAAAAAAAACACTGAATGCTCACAAGGAAGTCCAAATTGTAGTGGTTATTGAGGGGGCGGGCCGGGGGGAATGTGGG:1 + chr3L 14456105 3' + TAHRE 10376 1 80.20 CTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACATATACAAGTATTAAGCATAGTCAGTTCAAGCTCACCCCATTTTATGGAATGACAAATACCACAAAAAATC:1 - chr3L 26315765 3' - Tabor 5 2 74.26 ATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCGCGGGTTACTAGAATTTAAATCCTGCAAGCATCGTTTTTCCGGAATAAAAATAAATGT:1 + chr3R 4821803 3' - I-element 185 1 56.44 AACTCTTTCGAAAGAATTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGTTTTGTTCGCACACCCCAATGAGATATACGTATATAAATCGTAATCAAACATTATGATT:1 - chr2R 17288010 3' + I-element 283 1 63.37 GTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAAAAGCCGCGAGTAAATAGCAAAATT:1 + chr3R 31678124 3' - jockey 4524 1 75.51 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTG:4 - chrX 17492866 3' - Tirant 12 2 69.31 CACATAGATATCAAATATCATTTTACCAGAGAACAAATTGAAAACAAACTAATTTGTGTTAAGTTGTGTCATATATCATTTGGCTTTCAAAGCGAACGGTC:1 + chr2R 3341942 3' + Dm88 4127 2 63.37 CTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGGGGAACTGCTGGCTTCACTGTTACTACACTCTGCTAC:1 - chr3L 17106465 3' - hopper 1219 1 63.37 TATCTATCGATGTCCCAGAAAAATTATAAAATTTCGCGTTCGTATTCACACTAACTGAGTAACGGGTAGTTATGAAAAGTAAGCAAAAGCAAATGCCAGGG:1 + chrX 14773498 3' + INE-1 499 1 61.39 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACAC:3 + chr3L 3535428 3' + roo 9019 2 76.24 GTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCTAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAACCACATTAAACAAGAAAATAATAAATAGACATCC:1 - 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chr3R 15565213 3' - Max-element 8288 2 81.19 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCA:1 - chr3L 25884086 3' - Doc 37 1 56.44 GTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTATTCTTTCTTTAGTTGCCCAATATAAGCAATCGATAAATCATTGGGTA:1 + chr3R 12717573 3' + Bari1 1683 1 55.45 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCT:3 + chr3R 23870126 3' + roo 356 2 76.24 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGACTAGAATGGATAAAAC:1 - chr2L 13598172 3' - pogo 16 1 63.37 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGAAACTACACATTGTAGTTGTCGGGAAAAACTACGTATTTTCCAGC:1 - chr3L 15729610 3' + hobo 2908 1 56.44 TATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGGAACTGGAAATGGAACTGGATACGGATGTTCTCTAGTGGGCGGCAATGCTTAAATTGAGTTGTTTGCCTATTT:2 + chr2L 15151969 3' - Tabor 3 2 76.24 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATACATTTAGTTGCGCGCTCTAATGCAAA:2 + chr3L 5267295 3' + Juan 4204 1 66.34 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTAAAACATAAATACACATTTAA:1 - chr2R 9972738 3' - Doc 59 1 77.00 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGATTGGAAATACATTCGAAATTAT:1 + chr2R 20124589 3' - Doc 60 1 77.23 AACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATGTATATAATCCCAAAAACTGGGGACAAAAGAGTAGT:1 + chrX 22664426 3' + opus 7491 2 59.21 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAA:1 + chr2R 17348594 3' - jockey 58 1 79.00 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTA:4 + chrX 21945909 3' - F-element 62 1 78.22 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTC:2 + chr3L 24210989 3' - HMS-Beagle2 6898 2 62.38 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGCCCGTCTGTGTGCCGGTGTATGATGCCATTTATTTGCTCAAGATTAGAT:1 - chr2L 9672407 3' - 297 22 2 55.45 TTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAACAATATTTTGATATTGATTTTTCTTATTAATTATTAGCAAAGGGTTTAATGGATTTGCCGTTGG:1 + chr2L 15952702 3' - Stalker4 6897 2 76.24 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCGGTGTCGCAATGCGTTGCACGCGTAACTTTGTCTCTTCTTTGTCATGCCCATAAATACCCTAT:1 - chr2L 20371191 3' + roo 398 1 67.35 ATCAGTTTAGGGGTAATGTTTAATAGTTTTAATTTATGAATCTAGAATTTATCGAAAGAGAACACCCAAGACTCTTGCCGAAGCCAAGACAAACACAAATC:1 - chr2R 3339186 3' + accord2 484 1 59.41 CAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCTGATCTTGGCTTACTGGAGGAGACT:1 + chr2L 16687598 3' + G2 2834 1 75.25 CCTTATCTTAAATCATTGTAGACTATGAGTTGCATGACCCTTATAGAGTTTTATGTTCTGACTGTTCCGGGTTTATGTATTATTTTTAGGGTGAAGCTTTC:1 - chr3L 25208238 3' + Cr1a 4141 1 66.34 TTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTTCTGGGACCCATCTTTGTCAACATGCAAAACGAGTCCGTGCGCTCCTACTTCGGTAATAGTTAAAG:1 + chr3L 5564258 3' + mdg3 5252 1 70.53 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTCCATTGGAAAAAAGCCCTACATTCATATAGTTTCATTTCACACGGAGACAAATGAGTTTCCTG:1 + chr3L 17635610 3' - 297 5 2 75.25 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAATTTAATATAATTTATAACCAGTATTCGTGAGAATCGCACGAAATGT:1 + chrX 11503536 3' - roo 29 2 59.41 GAAGAGAGGGAGAGCGCGCGCATGAGCGGGAGAGGTGGGGAGTGTTTACTTTGTGTGTAAGTGTGAGGGTTAAGGCTCAACTGTACTTGTATGCACGTACA:1 - chr2L 11804179 3' - Max-element 91 2 58.42 TTCTATTATCTGTAATCTTGACTCTTTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTCTAACTTTTTATACCCGTTACAGGGTAAAAGTAAAAGGGTATACTAGATTCG:1 + chr2R 4618504 3' + Cr1a 4222 1 52.48 AAACGTGCAATGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTCGCCTCTGCCTTTCTTGTTG:1 - chr3R 28326452 3' - P-element 56 1 24.75 TTTAGATTCTGATAATTTGTTTGTGGTGCGGATAACACGGATAGAGGGGTAAGTCAGGGTTCCTCGCCACCTTATCGCCAAGTTATTTACAAGCTGTTGAC:1 - chr3L 884748 3' - Idefix 7122 2 74.26 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGAGTTCGTTGAGTGGAAAACCGCAGCCCACTGC:1 - chr3R 16398948 3' - roo 8707 2 68.32 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTACAACACTATAGTATTCGTTATTTACAAAG:2 - chr3R 21587251 3' + pogo 2059 1 71.29 ACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATAGAAACGAATATACTTCTATGTATCTGTCTGATCGCTACTAGTTG:1 - chrX 21184558 3' + 297 6949 2 58.42 TGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCAGCAGAAGCGACAGAAGCGGCAGAAGCAGCGACACTGGCAAAT:1 - chr3R 13512736 3' + F-element 394 1 57.43 GTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTGAGATTTACGGCTTTGTTGGTCC:1 + chrX 5126119 3' - I-element 183 1 77.23 CAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGAT:1 - chr3L 23456282 3' + gtwin 7349 2 63.37 GGATCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATA:1 + chr3L 25232912 3' - GATE 8266 2 54.46 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTATCCATTTCGATCCTTAAACTCACCGGATTGAGTATGTCATCCACATTCGAGCCATACTGC:1 + chrX 2742576 3' + hobo 2930 1 63.92 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTATATTCTAGTGACGGCAGAGTGCGCGCGAGAAGCGAAGCCATAATATTTTGCGAGAATGAGCGATAAACCACTA:2 + chr3R 3620762 3' - 1360 23 1 63.37 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGGGAAATAAATGCTCTTCCATAAAAAGAATATATTATAATAAAATACTT:1 + chr2R 3522050 3' + copia 226 1 60.40 ACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGTCGCCCGGATCCGGAATGTAGGTCATGTTGGACGCCGTTTTGGAGGAGCTACCACTTCGCCAAGTAAGC:1 - chr2R 12249683 3' - jockey 13 1 72.28 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTTATAAACAAAGCTGGCCCTTCTATTTTCACCTGACACTGCAAAAACAAAAAG:1 - chrX 11503435 3' + roo 406 1 77.23 ACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTTTC:1 - chr3L 5267200 3' - Juan 3986 1 62.38 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCCATCTTCAGAACCAATTTTGTTGTTGTTCGGCATTCGGTTTTCGAATCTTTGG:1 - chr2L 19572587 3' + P-element 2864 1 56.44 TAAAACCAATATGAACGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTTATTCAGCGAATTTTTCAACCCGAAAATCCAATACTT:1 - chr3R 19447072 3' + Porto1 4258 1 70.30 GGGCTTCATAGGCGGAGGAGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCGCTGTG:1 - chr3L 15452868 3' - accord 34 2 55.45 TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGCGCACATTACAATACATATACAAGTATTAAGCATAGTCAGTTCAAGCTCACCCCATTTTATGGAATGACAAATACC:1 - chr3L 26315775 3' - Tabor 15 2 64.36 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGGCA:2 + chr3R 21587309 3' - pogo 36 1 64.36 CAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTAATATA:1 + chrX 21668097 3' - Tabor 10 2 69.31 AAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTATGATTTTTATAATTAT:1 - chr2R 5582167 3' - Cr1a 441 1 65.35 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTAAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTAGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTC:1 - chr3L 10576806 3' + roo 9021 2 73.27 AATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTGCTATATATACAATACATACAC:3 - chr3L 24210875 3' + HMS-Beagle2 7191 2 75.25 AAAATGGGCAAACGATTCCTGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAATGCCAAAGAAATAACGCAATCAACCTG:1 - chrX 13794878 3' - FB 49 1 72.28 GTCTGTATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATATTTAATGTAAAGTTTGCTATAGAATAATGTCAGAC:2 + chr3R 17173095 3' - invader1 41 2 64.36 CAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTAACCTCACAGAAGGGCATGGGCACGGG:1 + chrX 5173668 3' + Doc 284 1 73.27 AACTTTTCAAGATCATATTGATGTGGGATCTTATATTCTTTGGGTCAACAACTTTAAACAAAATTAAAAAGACAAAAGAA:1 - chr3R 18917399 3' - S2 1352 1 87.50 AAAAAAGGAAAAAGTTTTCTAGCCGCAAACGTTAAACGCGAATGAATGTAATTGAATATGGGTCTAGTGGATAGAAAGTAGCTTAATACTCTACTATGGAG:1 + chr2R 20135387 3' - G5 4713 1 60.40 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTGCGTCTATG:1 - chr3L 19437231 3' - jockey 4706 1 63.92 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTCTATGTGGGGCTGTTTATGTGCATTTAAATAATACATTTTTATTGACAATTT:1 + chr3R 6097671 3' + roo 385 2 55.45 GTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCAATAACCTTTAGTGCTGTCCCAATGAAGTTAATACTCCTAGCAGCCCTATGGTGAAACTTTAAGG:1 - chr2R 4341789 3' + Doc 232 1 69.31 CATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACAATCTTGCCAGAATTGAGTTGGCCGATGCGA:1 - chr2R 1780074 3' + I-element 312 1 69.31 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAGAATTTAATGGCTACAAACGTAATATTAAAGCCAAGGGCGCTGCGCCACTCGCTCCCCGCAAAATCTAAC:1 - chr2R 9433650 3' - 297 6582 2 78.22 TAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGTACATACATATGTATGTATGTGGTACACGAAACTCGCCATGCAAATGAATGTTTTGAGAAGCGCAGAGAAA:1 + chrX 18975664 3' + diver 218 1 44.55 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTTAAATCTCCTCTGTAGCATTGCCCGTTTTGCACTTGACTACGTTTTGGGTCAAGTTGCGTAGAAT:1 + chr3R 25566866 3' - hobo 12 1 69.31 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCGTATTGAATGGGCAGGAGTCGAAACGGAAAATCAAATATCTGACTGACACGCA:1 + chr3L 10161896 3' - hobo 23 1 52.48 GTAAAACAAAAAAAAAAACAAATTGTAAAACAAGCAAAGAAAAGAAAACAAGCGAAGCTCACCTAGTGAAGGAAAAACTTTTGCGGACCCGCACTTGTTC:1 - chr3R 15749583 3' + F-element 4684 2 65.00 AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAGGAAGATACGAATACAACTTCCAAATAACTCCCTGCATTCTTGAGAT:2 - chr3L 27863839 3' - rover 6974 2 57.43 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTCGAGTGAGAGCAGTGAGAG:1 + chr3L 4692287 3' - P-element 57 1 22.77 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCTTTGCTCTGCCGAGAGCCTCTGCCGCTGGCGACTGCGA:2 + chrX 13640321 3' + P-element 2868 1 61.39 CAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAATATATGTGTATGTACATCTTTGAAATTACCCAGCGATTAGATTAGTTATGCTTGGCTAAGCAAAGAC:1 + chrX 14121235 3' + F-element 4667 1 65.35 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGACCAAACTATGTGGTATTTCAATCAAGTCAGGTGGTCTGCCT:1 - chr3R 5368316 3' + P-element 2855 1 47.52 TTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATTTTATATATCCATCTAAATCCATATAATATAGCCATCTAAAAGTTTACGCTGGAAGGGTCATTATAATATTAT:1 - chr3R 15130443 3' - Max-element 2 2 69.31 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAACGGGCATGAAAATAAGCCAAGCTCCAGGACT:1 - chr2R 3480807 3' + Juan 4169 1 70.30 TCCGTTGCAAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAG:1 + chr3L 23678114 3' - Osvaldo 38 1 75.25 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGTATTCAGAATGCGTGTAGTTCCATTACTTTCGGC:2 + chr3R 20240932 3' + Tabor 443 2 66.34 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTTACTCA:3 + chr3L 3535467 3' + roo 395 1 63.37 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGACTAAAGTCTAATGGGTTTATACTTTATTTTTTTGTTTGGGAAAAGATTTACATTTTCCTG:1 - chr3R 11912086 3' - I-element 59 1 51.49 TTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTGGGTCCCTATTTTTCTCTTTTATACACTTTTAGATGGTGGTTC:1 - chr2L 11084338 3' + blood 348 2 53.47 ATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCAGGCGATAGTTAACGATAGTACACGATA:1 + chrX 10237953 3' - I-element 214 1 79.21 GCCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTAATCCAAGTATCATTGC:1 - chr3R 3920660 3' - I-element 24 1 54.17 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCG:1 - chrX 21667998 3' + Tabor 7301 2 51.00 ATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACCTATTATACAAAAAAGAATCATTTTT:1 + chr3L 8903505 3' - diver 5939 2 80.81 TTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTCATTGCATTGTCAATTAGGTCATTGTATTAAAGTATTACTTAATAAGCAATTTCTAATTTTAAT:1 - chrX 696560 3' - FB 11 1 68.32 TTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCCCTGATTTGAAACTACAACTTAGAATTGAA:3 + chr3L 12565697 3' + roo 9027 1 65.35 CCCTCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGCGAAACAAAAAAAAAAAGGGGGAGTTTAGTATGAACCGAAATATGCGGTATTCTACTCT:2 + chr2R 1949152 3' + Cr1a 4419 1 81.19 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATGTATATAATCCCAAAAACTGGGGACAAAAGAGTAGTGGAATGTTTGTGCCTCG:1 + chrX 22664443 3' + opus 7483 2 61.39 AATAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACCGGGAATG:1 - chrX 20671010 3' + Rt1b 5149 8 70.27 AAATTTTAATTTAATTTTTAAGCACTCGCAACGATTACGCGTAATTCAATCGAAATGAATGGGCAGGAACGAAGGGAAGTCGGTAGTCATGGACTGGCCTT:1 + chr3R 18833111 3' - 1360 3044 1 69.31 CTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGCGGCGAGAGAGAGAGACGGCGAAATAGTAGGCGAAAAACGACGAGCG:1 + chr3L 7854496 3' - copia 4828 1 53.47 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGACTGTGGCCGCGTTGATTTGCAGGCAG:1 + chr3L 13360994 3' - hopper 16 1 62.86 TGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATTACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAGTTGTTTCTTATTTTGATATTTTTTTGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTG:1 + chr2R 16395904 3' - Porto1 345 1 63.37 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCATGATAGATTTGTGCCATTTCATAGGAAAACTGAAATCGAACCAAGCTAAATC:1 + chr3R 10187441 3' + roo 9049 2 56.44 GAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAAATTTTGGCGCCAAAATGCAAGTTGATAAACCAGTTGCGTTGCATATTTCTGTGTTCAAATCTTTTCCTTT:1 + chr3R 29283007 3' - Doc2-element 451 1 72.28 GCTCCTTTTTACCTTACTTATTACCGTCCTTCCCTCAGACAGAAATCGAGGATCATATAGCACTTGAATTGAAGTCCAGCGTTTATATGCGCACTGCAAGA:1 + chr2R 1778125 3' + Q-element 513 1 64.36 TGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTT:1 + chr3L 24210955 3' - HMS-Beagle2 6892 2 66.67 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGT:2 + chrX 21945918 3' - F-element 53 1 69.31 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTCCCGAGCAAAATCAATTTTAGATGAGGCCCAAACGTGGTTCAGTT:1 + chr3R 20384507 3' + roo 9040 1 57.43 TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACATCCACCCAATCAATTGAAATCCACAACGTCATTTAACCAC:2 - chr2L 15151873 3' + Tabor 7290 2 56.44 GCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGCTTTAATATTTGGCTTAGAAACCTACAAAATAGACCTTCCAAACCTAAGAAAAAACTATAGCATACTTAACGGCGCC:1 - chr2L 12246540 3' - hobo 2708 1 49.50 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCCATCTTCAGAACCAATT:1 - chr2L 19572623 3' + P-element 2828 1 20.79 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTGGCTAGAAAGGAG:1 - chr3L 9190429 3' + 412 7540 2 71.72 AGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACCCTTATTTATGTTTTTTCCAGTATGCCCC:1 + chr2R 25216587 3' - 3S18 5815 2 77.23 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTAAAGAATTTGTTGAATATTTTAAACAGGTGCT:1 + chr2L 12860898 3' - roo 45 2 72.28 TAATAAATAAAAAAATAATTCATTACTAGTTTCGCTTCCTGTTTAATTTTCATAAATTTCCTTGCCCCTTCATACAATAAAACCCTTGAAATTGTCTGGAC:1 - chr3L 10753689 3' - Tc1 1394 1 80.20 AGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCAAGAGCGAGAGAACGGAGAGCTCTACATCGAACAGCTCTTTTCTAATTTAGGATTTTAATCTCTATGGG:1 + chr3L 24762001 3' + 1360 75 1 74.26 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGGCACTTTCTTTCAATTGCCACCTTTCCC:1 + chr3L 3070698 3' - 1360 19 1 64.38 TGGTGGGTCTGCCATGATTGTTGGTTAAGGTCTTGAGCCCGGGCTAGCGGTATTGTTGTTTATGGGCGCCAGAAGGTTCGCTTGACAAAAAGCCTAGCAAA:1 - chr3R 18451302 3' - I-element 180 1 60.40 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGTCCAACATGAGCTTATGTATCCGTGCAC:2 - chr3R 2556057 3' + 412 444 2 74.26 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATAAGTGTGTGAATGCAGTTCAAACTTTACTTTTCAACCAGCCTAGAAGTATGCAGTAAA:1 - chr2R 13934375 3' - jockey 11 1 74.16 ATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAAAAAATAAAAAAATCGTGAAGTTGGAAGGAGGCGGAGCGGCCAAACGGTATATGTTGTAAAATAAATCCAAATAT:1 - chr3L 15466534 3' + F-element 4664 1 64.36 CTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACACCACAATACACCAGTGTGTGTATTATATTTAACTT:1 + chr3R 4600867 3' + Burdock 6352 2 64.36 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCG:1 - chrX 19034123 3' - hopper 42 1 69.31 TAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATGTAGGTATACACGTTGCTATATAATTCTCATAAATAATTGTAGCATGTTTATG:1 + chr2L 1010109 3' + I-element 5333 1 56.44 GGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCTTAGCTTAGCTTAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCTTAAGAACAAAATTTTTAGGAACCGA:1 - chrX 7733585 3' - blood 116 2 37.62 CCCAGTTCGAAGTGACGGCCATAGCGAAGGTATGGATGACGCGTAGATTGGTACGTGATTGGATATTGGATATGTGTAAATAAGTACGGAGCACTTTCCGC:1 - chr3R 21197936 3' - Tirant 8080 1 58.42 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTGTATTTAATGAAATTTTATTCGTAGCATTC:1 - chr2L 12888822 3' + 412 447 2 77.23 TTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTTGTAATTTCAAAATTAGTGAAAGAAAGTGTTTAATCGATAGTGAAAAG:1 - chr3R 24263348 3' - P-element 2558 1 33.66 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGACACAGACGGTCGTTGATAGCCGACTTAATGATTAGCCATTGCTATAATGATGATCAC:1 - chr3R 12717092 3' - P-element 16 1 61.39 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAATAATCAATCAGCGAAGAGTCAACCCAAGTATTCACATTTTCGAGGCTTGATGATAATGGTGATGGCAATGTTT:1 - chr2L 1535624 3' + roo 406 1 78.22 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAGTGAATTATTTAATCGTTTAAAAGAAACGATAAAGTAAATC:2 - chr2L 18417273 3' + roo 405 1 75.25 TTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATGGATACCTTTCTCAAGTTAAGAAATATTT:1 - chr3R 7639784 3' + HMS-Beagle2 272 2 66.34 TTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGAATTTGCAGGGTATCCTTTAGTCGGAAGAT:1 - chrX 2820975 3' - Quasimodo 6889 2 71.29 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTGTATCATTAGGAGGCATCCCAGACACCAGACAAACCAGGACATTCT:1 + chr3R 12546876 3' + hobo 2909 1 57.43 AAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAAAGATATAAACCGAAATTAGAACAAAGTCGCTAAGC:1 + chr2R 9438704 3' - 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chr2R 10552704 3' - INE-1 579 1 82.18 TTCTAAATAAATAAATAAATATAACATGTAACGTACAAATTATTAGATTGCATTACAGCATATTTTTAAATTCATGCAATGATAATTAATTCAATTAGGAT:1 + chrX 9816353 3' - copia 228 1 76.24 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATACTAACATTTTTTAACATCTTACCGACGTCTTAGAAG:1 + chr2R 10945091 3' + 297 359 2 65.35 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAACTAATTAAGACGCTGGGCGAGGAAAGGTGGGGAAAAACT:1 + chr3L 9293730 3' + mdg1 384 2 62.38 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCG:1 - chr2R 981623 3' + 1360 3388 2 67.33 AATGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGT:1 - chrX 3446514 3' - I-element 23 1 54.46 CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTGCGGTGAAGA:2 + chr3R 19503367 3' - jockey 4691 1 49.50 AGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTGTACCGTGCTGCGGCGTATGGACCGTGCGCCTCGTGACCTTCTTCGCCGGCTGCTC:1 - chr3L 24242099 3' - HB 1312 1 69.14 CATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAATGTAAAGCGGGTGCTGTATGTCAAACA:1 + chrX 12646170 3' + Quasimodo 189 2 72.28 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCATGAGCGCTGATTTTGCGCCACTTAAAC:1 + chr2L 9624597 3' - transib2 46 1 69.31 TGCTAATAAAAACCAAAAATGAATGACAATCCAACAAAACGCACACTAAACACGATAACCGTTGCGTTGGTGTGCAGGCGAAAAACAGGTGAATCGATTTT:1 + chrX 20792705 3' + I-element 383 1 46.53 GCAAACCTTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTCTGAGAATATCGGACAGCCTATGTAGTACGTG:1 - chr3R 5261863 3' - Quasimodo 495 2 68.32 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATACACTAGGCTAGGGGAAGATAACTGTTGCATATCCAGAGGCGTCGGAAGCCGACATGCAAT:1 - chr3R 10957254 3' + hobo 2924 1 59.41 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACGCGATTCAATTGAAAGGCAAAACTTGTTTTA:1 - chr3R 21589336 3' - pogo 22 1 50.50 AGGTATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCGT:1 - chrX 19820624 3' - Rt1b 4968 1 63.37 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTGCAACAATTTTCCGAGTGTAGCCAGG:1 + chrX 4278379 3' - blood 7061 2 72.28 TGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATATTTTGGCTCTGTTGATACGAAACGCACTACATTCATTAAAAATATTGTGTCCCGAGCAAAATGAAGTCC:1 - chr3L 17762752 3' - invader3 5194 2 71.29 TAATAAGATTAAGAAATTGAGCGTGCTTGCAACAACAAACAAAACTCTGGAGTAGCAACTCGTACCCCCATTGAATTTACCCAAAAACCGCAACACTTCCG:1 - chrX 7406095 3' - gypsy12 10076 2 67.33 CCTGTCTCCAATTTTTGGCACCTTTTGATCACGTTCGATATCTCTGGTCCTCATGTACCAAGGAGATTTTGGTGGAAACTCGCCAGGCAGACACTTGTGCA:1 - chr2L 1557424 3' - jockey2 3041 1 64.36 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATCCGTTGAGAGGTGTTCAAAGCAAAAGCTCAACATG:1 - chr2L 21018798 3' - 412 7092 2 61.39 TATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATACGCTCACCAACACATGCAAGCGAAAGCGCC:1 + chr3R 21592014 3' + Bari1 1663 1 66.34 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCAC:1 - chrX 17492870 3' - Tirant 8122 2 66.00 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAGATGATAATTTATTTGTTTTGGGTTGGACGGTTGGTTATC:1 - chr2R 22825415 3' + opus 7463 2 66.34 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAGCGATCTATATATTTTATTCAATGTCTTG:1 + chr3R 29361079 3' + 412 445 2 72.28 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATATATTTCTTCCTTTTATCATTGTTAGTGTATCTATTGTTGTGATATTGACTCAAAAA:1 + chrX 9524129 3' - hopper 27 1 58.42 TAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGAGTCGTATAGATCGCTGGATCGCAGTAATTATTCGTGTGACACTAATGCTAAGTTGCTCGAGCTAACT:1 - chr2R 19162658 3' - P-element 2670 1 65.35 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTGAAACAAACGTTTTTGTTTCACACACACAGGG:1 - chr2L 3842846 3' + roo 9028 1 70.30 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACAC:4 - chrX 17492868 3' - Tirant 8121 2 67.33 TATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCGATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGA:4 - chr2R 1751256 3' + INE-1 81 1 97.03 CAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATTGGGTTTGATTTATTTGTATTATGCAC:1 - chr2R 2144958 3' - Stalker2 52 2 72.28 GATTCGGCTTTTGATCCTGATCAAGAATATATATAGTTTATATAGTCGGAAGCGCTTCAGTATGTCGAGTCTTATGTCTTTGCACTTATTGTTATTATATT:1 - chr2R 4134887 3' - INE-1 92 1 57.43 CCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGTTTTCGCAGCACGCTCAATTTC:1 + chr2R 1725965 3' - Doc 9 1 76.24 AAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGT:7 + chr3L 24210974 3' - HMS-Beagle2 6913 2 60.40 TAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAGGAAGATACGAATACAACTTCCAAATAACTCCCTGCATTCTTGAGATTAAT:1 - chr3L 27863835 3' - rover 6970 2 61.39 TTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTTTGTTGCTATTTTTGCTGTCGTTTTT:1 - chrX 12634551 3' - mdg3 5078 1 80.20 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTCAGGAAGAGAGCGGCAGAGCAAACTAGT:1 + chrX 3295661 3' + hobo 2892 1 72.73 TTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAAC:1 + chr2L 23373494 3' + Tc1-2 1574 1 73.27 CTTAGTTGTATGCAATCCAATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATATTTAAACTGTATTGTAAGAAAGATCTCCTAGATCCTACGAACTTTGTAT:1 - chr2R 11694575 3' - Tc3 1667 1 60.00 CGGCGTTGTTCAGTATTGTCCAGTAGGGAGATGGTCGTTATGTGCCTGTCTTTTAGCTTTAACTTTGCCTGCGATTTTCGGTTTTATTCTCTAATTTTAAA:1 - chrX 5253838 3' - G7 1015 1 60.40 AGACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGAAGAGGCGTTTTAGAGGATACAAGGGGACAAGAGGAAGGCAAAAACGCAAGTGCATCAA:1 + chr3L 23611386 3' - McClintock 295 2 65.35 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCCTGATCTTCTCAATCCTCGAGAATTGGCTCCCAGCGGCGCCCGACAATTGAAACTTTTGCGCC:1 + chr3L 12025682 3' - blood 15 2 64.36 CATCATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGAAATAAAATGACCGATTCGGAAATCGAAATATTGTATGCAATACAGTGGCATAGATTAAAACAATACA:1 + chr2L 21914325 3' - INE-1 505 1 67.33 AAAAACAAAAAAAAAGAAGTGCTTGGAAAAGTGGAAATCTTTCAGCAAAAGCTTACAAAGTGCATTGGATTGGGATGACGCACACAATGGCGGCGCGGGG:1 + chrX 11502917 3' + gypsy2 402 1 64.00 ATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTGCACTTATTTATTTTGTATAATAA:1 + chr2R 20010138 3' - Ivk 54 1 76.24 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCCGTTGGAGTTCGGGCTGGTGCTCCCAGTCAAGCCGCGCGA:1 - 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Doc 44 1 74.49 ACGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGTGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGATGCAGGCAGGCGATCCTAGTTAGTTGACGGGTGCTGTACATCGAAC:1 + chrX 982630 3' - Doc 441 1 60.40 TTTTTTTGTTTTATTTTTATTCATAGACAAATTATGTTTATATCTTAACCGCAGTCCCAGTTTGTGAAATCTAACAATCTAATATATGTATATATATCT:1 - chr3L 13491009 3' - Osvaldo 1522 1 75.76 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTATATTCTAGTGACGGCAGAGTGCGCGCGAGAAGCGAAGCCATAATATTTTGCGAGAATGAGCGATAAACCACT:1 + chr3R 3620761 3' - 1360 24 1 62.38 AATTTCTGCCTCGCTTTATGAATACAAAAGAAATACCCAAGCATATCAATATGTCCAGCTTTTAGCAAATATAAAATGTATGTTATAATTTGAAATTAAAA:1 + chr2R 21998648 3' - invader5 94 2 81.19 GCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTTGAAAATAGATTACAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAATAAATTTCAAAAATGACT:1 + chr2R 5260084 3' + 1360 429 1 65.35 TTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACACATGTCCACATTGATGACACTAATGAAACTGCAGTTATAAATTGAATTTTATGCGCGCTAATTGGC:1 + chr3R 23173199 3' - Burdock 6 2 71.29 AATCGGTTGTTTTTAGTGAAGTGAATGGTTATTAACATAATACAAACAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCAGAGAATCGCAACTGAAAATTTATTGTA:1 + chr2L 9313259 3' + Doc2-element 52 1 72.28 CTGTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAAACAAAAAT:1 + chr2L 11254960 3' + Cr1a 4380 1 81.19 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGTTATCATTACCTAAGCTAGGAATTACCTACACCTCCGCCCCT:1 + chr3L 15353609 3' + mdg1 7449 2 69.00 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAACGGCTTGCACTCGTAAATCCC:1 + chr2R 11247023 3' - 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chr3L 18798120 3' + P-element 2838 1 23.76 AGAGGGATCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCG:1 + chr3L 25232908 3' - GATE 35 2 50.50 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGTGATTATCTTATTAAGTATGGTTTCCACCGAAGTACAGGATATAACATATA:1 - chr3L 4539145 3' + roo 9050 2 56.44 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTTCACTTTCGGCCCCGAAAAAGGATGCTTTAGAAATTATCAAAGCAGAAACTGGCGCAA:1 - chrX 9523686 3' + hopper 1403 2 65.00 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCCTTGTCAACGAATTGCATTCTGTGTGAATGACTTGGCCAAAGTTTGCAACTT:1 - chr3L 2690928 3' - Doc 32 1 54.46 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGC:1 + chr3L 24210977 3' - HMS-Beagle2 6893 2 60.71 CTTCTGATCGAAGAAATGAATTCGTGAGGTACAAGAGCATTATCAAATGTCACTCTGATCTGAAATAAATCATTTGCTAATTTTGTTAAATAGCACTTCTT:1 - chr3L 23953958 3' - 1360 3165 1 77.23 GTGGAGTGAGAAATGATTTGTGCCAAAAACAACAATAAGCCGGCCCATTGCCTGCACTGCGTAGGACCACATGTAGCATCATAAAAGGGTTGGACAATTTT:1 - chr2R 401140 3' + transib3 407 1 80.20 AGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATATCTATTTAGATACAATAGATATAATCATATAGCATCCTGTTTCCAGGGTTCAGATCCAC:1 + chrX 15790734 3' - opus 3 2 68.42 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACATGCACATACTACACATGTCTTTACTTAGATGTACAAAATATTCACAGGGTATCTTATGGTCT:1 - chrX 6162142 3' - blood 31 2 54.46 TAAACACAGGAACGTAGTGGTGCAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATGGGAATTTCACAATGACTTCATCTCGAACGAAAGTCACTTCCCTTTTGG:1 + chr3R 19737729 3' - Copia1_DM 121 1 71.29 AAATGCGGTGTGCGTTAGTATTGATGTGTGTGGACTGGAGTGGGTGACATGTTAAAAGCCTAAATAATTGCCAACATTTTATTTATTTATTTTGCTCTTTT:1 - chr3L 5229242 3' + invader1 3795 2 53.47 ATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCT:3 + chr3L 24210987 3' - HMS-Beagle2 17 2 60.40 CAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAA:1 - chr2R 17942100 3' + mdg3 5453 2 69.31 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTATCATGTCAGCTTAATTAAAAAAAACAAACAAGTGTGGATGAAAAATAAGCCGTTGCTTTTAATTTCAGTAT:1 + chr2L 8231398 3' + mdg1 418 2 71.00 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTTATAAACAAAGCTGGCCCTTCTATTTTCACCTGACACTGCAAAA:1 - chrX 11503443 3' + roo 398 1 69.31 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGT:1 + chr2R 17348619 3' - jockey 32 1 54.00 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTGATCTTCTTATGGTCTAGCCAAGCAGACTG:1 - chr2R 11244988 3' - 412 7073 2 59.46 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTTCTACACACGACTTTTCTGGACACTTTTTCCATATATATAAATATATGTATTGCAAAGTTTTTA:1 + chr2L 15798715 3' - roo 8676 2 67.33 CTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTCAACGTAAACATCAAATCCTATTACGTCGAATAAAAAACTCTGGCCACCGATTTCACTGGGAGTTCGTTGTG:1 + chr3R 10736596 3' + McClintock 68 2 57.43 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCATCCTTATAGGTGCCCACACTGCTTGTTCCTCTA:1 - chr3L 3535392 3' - roo 8708 2 70.30 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACACCAACAACAGACAAGTGCACGCAATTATGG:2 + chr2L 12888861 3' - 412 7101 2 70.30 GGACCTATGGCGCACAGCTATGGGGCAACGCCAGCAACAGCAACACGACACCCAAACATTAAAAAGCACATGGACGATGAAATGAAGGACCGTATAGCTTT:1 - chr3R 1720837 3' + Fw2 3549 2 61.39 TGAGCGTGATGAGGTGGCGTGAATACGTCACTATATATTTAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATC:1 + chr3R 10736106 3' - McClintock 5963 2 54.79 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGTGTGTGTTCATCTCGCTTTCCCGGTAATTTTCAGGTGGAAAGAAGCCA:1 + chrX 9649974 3' + blood 348 2 54.46 AAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTATACCTTTTATACCCTTTGCACAATATACCCCACTCTTTACGATTGGCGGGCACATAAATGCAGAGTCCAGAG:1 - chr2L 5654806 3' + roo 9067 1 70.30 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGCATTATTCATGCTTGTTAAATTTATTAATTGACCTTCCCCCTGAGCTCACACCTCTGCACCTCCCATT:1 - chr3L 14558230 3' - 297 6588 2 73.27 GTATGGATGACGCGTAGATTGGTACGTGATGATCCTCGTGGGTGTGGCAAGCCGATGCTAAAGAAGAAGAGCAATAAGAGTGAACGATGATGAAGAGACT:1 - chrX 17508639 3' - Tirant 8051 1 59.00 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACTTCGTTTGAATGTGTGCGTGACAGTGTGGGTGCGTGTGTTTTCTGTGTGTGTGT:1 - chrX 2775634 3' - hobo 18 1 59.41 CTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATTTTATATATCCATCTAAATCCATATAATATAGCCATCTAAAAGTTTACGCTGGAAGGGTCATTATAATAT:1 - chr3R 15130446 3' - Max-element 5 2 66.34 ATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTG:1 + chr3R 15790074 3' - flea 4736 1 59.41 TATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGCCACGCAACTCATAGACATGGACAACTTCAAGGTAAAGCTCTTAAAATTCAATAATTTAGTTAAGA:1 + chr2R 17276791 3' + jockey 4856 1 72.28 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTC:3 - chr3R 11080693 3' - I-element 34 1 58.42 GACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTGGTGGAAAACTGCGCAGTCGTTTTACATGCAACACCACAAGCACGAAAAAAAGAAGACTTGCAGACAGCTAAACT:1 + chr3L 34644 3' - INE-1 549 1 77.23 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTGCAAACTGAGCAAAAGGTTTATGTACACACTTGTTTGAATATACATATTTTTCTAAAA:1 - chr3R 12055024 3' - Doc 22 1 60.40 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGTATTATTCCGTAGAAGATGTGTGTTCAATAAAATCTGTAAATATTTTACCCAACATAAAAT:1 + chr2L 9284447 3' + flea 242 2 61.39 AATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATGGGTATAAAAATATACAGAGATAG:1 - chrX 15408717 3' - INE-1 502 1 88.12 GTAAAGTAAAGTAAAAAAAAGTAAAGTAAAAAATGTTAATTGTTGAAACTATTTCTTTTCCATACAAAGTGGCACTTTTCGATAATCTTTTATTGAAGCGC:1 + chr2L 13079400 3' + TART-A 13135 1 31.68 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATACGAGTTGAAAAAAAATATAGGCAATTGTAGCACTGTTCTTTTTGACTGC:1 - chr2L 22342235 3' - F-element 48 1 61.39 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAGACCCCCTTTTCTCCGCCTGTCGCTCAGCATTTGGTTTT:1 + chr3R 30076489 3' + hobo 2903 1 61.39 TGACTATAGTAATTATTTACTAAAAAAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGATTATGTAAGCCGGCAGCTCGGAATAGACTTTAAGCAGATGGCT:1 + chr3R 17303528 3' + Doc 136 1 57.43 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTTATAAACAAAGCTGGCCCTTCTATTTTCACCTGACACTGCAAAAACAA:1 - chrX 11503439 3' + roo 402 1 73.27 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCC:1 + chr3L 15869725 3' - pogo 31 1 59.41 CAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATACAGGTGCCTTAAATTCACTGCTCGTTATCAGATTAGCTCG:1 - chr3L 23342555 3' - Max-element 8270 2 63.37 TGCAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCGAAGAAGGAAGGACGAGTAATACAAAGTGGAGATCGAACCTTGGAGGAACAAGGACCTGGCGTTGAAAGGGTCAGT:1 + chr3R 2452361 3' + gypsy8 4683 2 76.24 AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCATCTCGCTCTAGTCAAACACAAAACCATGGCATGTGCAATTTTCATAGTAGTAATGACAGCGAATTTGTATTGGT:1 - chr3R 9184696 3' + blood 7332 1 76.24 ATGAAAACGGAGGACTCGAGTTTTGGCTTATATATATTCTTTGCTATAATTATTTGTTGTGGATCCTAAATGATTCAACTGACCGGTTAATTTGATATCAA:1 - chrX 17489227 3' + Tirant 230 2 36.63 TTTGCATTCATACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTTGGGGAAAACGACTATCACATCATTAATTTTTTGTACAATAAAAAATAAAGATATTTTTTTC:1 - chr2L 22312819 3' + INE-1 531 1 54.46 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATACATACTTAATGAGCGCCACTGCAGCTCCAATGTCAATCGTGAGTGCCTCTGCCCAGTGCGCCCAG:1 + chr2L 8469678 3' + Transpac 307 2 76.53 GAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGAAAATGGAGCTCAAATAGGCGACAGACGGCAGCTGGTGGAACAG:1 + chr3R 13958899 3' + 1360 401 1 58.42 TTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAGTCAGGAGTTGGCTCCTGTTGACTCAGCACCTTTTTTCGTCCGCACCAAG:1 - 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hopper 43 1 66.34 TACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATTCGACCACACTATCGTTAAGTACCACGATGTTGGGTTTGATCGACGTGGGAGG:1 - chr2L 18975980 3' + I-element 407 1 60.00 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCCCGCGG:1 - chr3L 26852641 3' - 1360 39 1 60.40 TGCGTTTCATAAAACCGTACTGACACGGTGATATGATTGATCTACAAAGGTGCTGCAATAGAGGAGCTGATCCTTTCACATGGCCTTGATATCTGGTCGTC:1 - chr2R 1653817 3' - Q-element 208 2 68.32 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTGAAACAAACGTTTTTGTTTCACACACACAG:1 - chr2L 3842848 3' + roo 9026 1 72.28 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGACCAAACTATGTGGTATTTCAATCAAGTCAGGTGGTCTGCCTCGTATTTTCCACAGTTATAT:1 - chr3R 5368296 3' + P-element 2875 1 67.33 CGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGGCGACATATATATATGTATCTCAAATCATTTAAAAACTTGCATCACTAACGGGTATTTCTCAG:1 + chrX 16906755 3' + invader4 3062 2 58.42 GAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACCCTTATTTATGTTTTTTCCAGTATGTCCCTTATTTTA:1 + chr2R 25216595 3' - 3S18 40 2 68.69 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGTGATTATCTTATTAAGTATGGTTTCCACCGAAGTACAGGATATAACATATAAGTAAATAC:1 - chr3L 4539136 3' + roo 396 1 65.35 CACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGACTGTACAGATTGAGTGCTTGTGTGTGCATAAGTGG:1 + chr2R 9258647 3' + blood 341 2 63.16 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTAGGGTGGTAACTCGCTTTGTTGATTAGTTAATTACACAGTTGATTAATATCTTA:1 + chr2L 13642747 3' - Tirant 40 2 61.39 GTCTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTATGTGTGTGTATGTGTTTGGTAGAAGTGCTTATAAAAATTAGGGTTAATTACTCT:1 - chrX 14933668 3' - Quasimodo 39 3 55.56 ATGGCTGGTTTCCTTATTTTTTCGTATTTACTCTCGTCGCCGCGCAAACGAAAGTGTTTTGTTTTTGTTGCGTTACCCGTTGCGTCTGCCCCCTCCAATTG:1 - chr2L 8300622 3' - Transpac 351 1 79.21 CGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATTTTATATATCCATCTAAATCC:1 - chr3R 15130490 3' - Max-element 54 2 80.20 GGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGCGATTTGTGTGTGCCAGTTGTAGAAGAGAACGTTTATTTTTCAGCTGTTGCT:1 + chrX 11255979 3' - Quasimodo 55 2 72.28 GTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTT:1 + chrX 21945935 3' - F-element 36 1 52.48 TAAAAAAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACAGGGTGAGTTCGCCAATGCAGAA:1 - chr2R 142822 3' + diver2 316 2 95.65 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCG:1 + chr3R 23870124 3' + roo 9019 2 78.00 ATTTCTCAAAAGTGTGGCCGTGAACGTTTTCGGCGTTTTGTAGTTGTGGGGCGTATTTGTTGAAGGAGTTGGGATTAATTATCGACAGATAATGACATCTT:1 - chr2R 2947757 3' - INE-1 253 1 53.47 GGACGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTCCGCCGTCCCTTTCGTTTCGAATGCTACTCTCTCTTTCTCTCGCTCCGCATTTCGCAATTTAATTTAA:1 - chr2L 19684575 3' - mdg3 5261 1 71.29 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTCGACTGCCTCGTAATTGCCAGGGGGAAATTGAAATAGATGCCCGATAATAAG:1 + chr3L 15729685 3' - hobo 23 1 56.00 CTACAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGACCCTGCCATTCGCCATTTTTGGTTTCACCTTCGTTGCTTTTTGTTGCTTGTC:1 - chrX 5128847 3' + G2 3074 1 71.00 TCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAAATTCGTTTATATATAGAACTGTTTATTTGCATTCTTGCGAGTGGCGGATGCTGTTGAAAAATACGATTAT:1 + chr3L 3728798 3' + I-element 5349 1 71.29 CCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACACACTCGGCCCGCATAAACGGAATGGCCCGCGAAAGTGGGCTACAATTTTATTTCTCTGCCGCCGTTTGC:1 + chr2L 10119532 3' - flea 4759 1 74.26 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGC:1 - chrX 9816269 3' - BS 5020 1 64.44 TTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGTGTGTGACATTCGATTGGATTGTTTTTGTTTTGAAATGCAATTTTACTTGCAAAGGG:1 + chr3L 13885538 3' - Doc 142 1 50.50 AAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTGGAGACATAAAATGTGGGAATCCCACTTATGTAACTCTAGAGGGTATCAAATTGAAGAAGTCATA:1 + chr2R 1986288 3' + INE-1 165 1 57.43 CTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGATGTCAAAGTAATCACGAGTCCAACTGCTGGTGCAACTGCAACTCGCCCATTCGAGTGTCGCCAACATATCGATTT:1 + chr3R 11478491 3' + roo 409 1 78.22 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCCATGCCCGGATTTTACATTGGCTCTCGGCATTG:1 + chr2L 19983068 3' - roo 42 2 68.32 AGGGAGTTATTTATTGTAACGACCTTAGACATCGACGAAGGCACGATTCTACAAGAACTAAAACCACAAAAAGAGAAAATAAAAAACACAAAAACAAAA:1 + chr4 76141 3' + I-element 491 1 73.74 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAA:1 - chr3L 9190467 3' + 412 447 2 70.30 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTTCTTATGTTTTTATCAATACAAATTTCTACCAA:1 - chr2R 20506822 3' + mdg1 381 2 65.35 ATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATTAAAAATATAGACAGGTGTGATAT:1 - chrX 19188687 3' + mdg3 5146 1 76.24 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGAGCAGGCGGCTCAAAAGTCGGAATGTGGTATTCGGTTTTAGTTCGAACATCGCT:1 + chr3L 14205412 3' - P-element 7 2 68.18 ATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGAAAAATACGATTATTGGCTGTAAATTTTATAATTTTTATAATTTTAAAAATCTGATAT:1 + chr3L 3728860 3' - I-element 5117 1 43.56 AGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCACGCCTCCCTCCTCCCCTCAGCCTCAAGACACACCACACCCCACACTTGCGGAGGCGACT:1 + chr2R 8078397 3' + accord 78 2 62.38 TGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGTACTTCCCACTTATTGCAAATCCAAGCCAGCTTGGTTATTGACTCAATATTTGGGTTGCTTT:1 + chr2L 16758347 3' - Max-element 15 2 64.36 ATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTT:1 + chr3R 10736142 3' - McClintock 3 2 75.25 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGTGTGTGTTCATCTCGCTTTCCCGGTAGTTT:1 + chrX 9649956 3' + blood 333 2 71.43 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATGTAAATGTAATTTCTAGAAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCA:1 - chr3R 3985680 3' - copia 37 2 67.33 TAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTTTAAATTTACCGTGGCCTTTAAGTGTCACACCAGCGACATCTATGGAGTCACAGCG:1 + chr2R 14434356 3' + invader4 3071 2 58.42 TGACTCTCCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTGAATGTGTGTGTTTTGTGTCGTTTGAAAGGCTGCGAGG:1 - chr3R 9511233 3' - Bica 4692 1 74.26 GTGCGTTGATCGAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATCAATTTGCTCCATACTACACTTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTT:1 - chr3R 25692748 3' + jockey 4979 1 50.00 ACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGAATTGATTTGGTTTGGTTTTTCAGTCGCACAAGCTAAGGCCACCTTTTCAC:1 + chrX 20803596 3' + I-element 278 1 56.44 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCTCTGTCCATTATCTTCGACTTGTTTCAAA:1 + chr3R 8133974 3' - roo 8712 2 75.25 AATATAAAAAATACTAAATATATTACTTACTCTTAAGCTTCTTTATTTAAAGTATTTCATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAAT:1 - chrX 20880638 3' + HeT-A 5893 1 73.27 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATGCTGCACTCGATGCTGATGATGTTGGCCAA:1 - chr3L 5321140 3' + mdg1 7414 2 70.30 TAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGGGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGCGTGCGTGTGTATGTATCTGTTCTGCCTGACGAC:1 - chr3R 7123095 3' - 1360 3273 1 73.27 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTAATTTTAACATGCATTAAGTGTGCATCCCTTTGGCTTA:1 - chrX 12166524 3' - pogo 37 1 66.34 AGTTTCGTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTATCTTATTCCTATCCTATTAGATTTTATTTAGTATAAAATATATTA:1 - chr2L 10189439 3' + roo 9042 1 52.48 AAGGTATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCG:1 - chrX 19820625 3' - Rt1b 4969 1 62.38 CCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACATCATCTTCGCCTACGCCTACTAAATCGCGTTCAATTGCTAA:1 + chr3L 13877191 3' + Doc 480 1 66.34 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGTGACTGCCAAAAGTATTTTAATTGCCCGGAGT:1 - chr2R 7105347 3' + roo 9029 1 68.32 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGTT:1 - chrX 3446513 3' - I-element 21 1 56.00 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAAAATAGACAAGGATAGGCCCAAAAGGACGAAACGCGACCC:1 - chr3R 30326287 3' + pogo 2069 1 61.39 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTGAAGAGATTTTGGTCACGATGATACGGACATATCTAAAAGTCGTTTTGAAGCAATGATTGCAAGCG:1 + chr3L 8044404 3' - mdg1 11 2 68.32 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTAAAACATAAATACACATTTAATATGGCGCTT:1 - chr2R 9972728 3' - Doc 49 1 67.00 GAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTACATATATATTATTTACTGCCTAACGTTCTTCAGACAAATGG:1 + chrX 20374574 3' + Bari1 1674 1 57.43 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGGGCATAACAACAACTGGTTTTACAACGCAACATAAAAAAAGGATA:1 + chr3R 28326497 3' + P-element 2858 1 50.50 CTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGATACGCGCTTAATGAAGGAAACGACATAAAAGCCCCGTCTA:1 - chr2L 6115128 3' - jockey 4671 1 60.40 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTACCTCTCGGAGGAAACTTTTCTACGGTTTTTT:1 + chr3L 19115898 3' + hobo 2907 1 65.17 ATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATTTTCCTCATTACCCGACTTGCATTTTATTTTAATG:1 - chr2L 13868711 3' + roo 370 1 63.37 AAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAATAAGCCGATTTCAGGGCGAACTAACTAGAATTAAGTACTTAAAAATTGCAGATTTC:1 - chr3L 5282749 3' - Transpac 194 2 60.40 CTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGT:1 + chr3R 1977621 3' + micropia 5410 2 53.47 TAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACAGTATTTCATCTTCATATTTGATAAATAATAACCTGTGTTGCTGAATTTAATACTT:2 + chr2L 14993475 3' + 412 474 2 59.41 CTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTCTTGCTCGGGTTTTGGCGTAACTGATAAGCGGGCTAAGTCGTGG:1 + chr2R 15007512 3' - 297 6534 2 56.44 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCGGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGT:1 - chr3L 25884083 3' - Doc 34 1 53.47 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACAAGGG:1 + chr3L 3535431 3' + roo 400 1 60.00 AAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGTAAAAGTTTGCCACTTAGCACCCG:2 - chr3R 13231132 3' - Quasimodo 17 2 67.33 TGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTTG:1 + chr3L 24210993 3' - HMS-Beagle2 9 2 67.68 ATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGCGTGTGTGACATTCGATTTGATTGTTTTTGTTTTGAAATGCAATTTTACTTGCAAAGGGCCGAATCAGATG:1 + chr3L 13885550 3' - Doc 130 1 64.36 CTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTTAATAATAATACACCATCAACATTTTTCTTTA:1 + chr2R 19602745 3' + G6 1894 1 68.32 GATTTCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACAAAAAGCTACCACCTTTTAAGGTAAATGAATAGTTTAAGAATCTTATCTTTCAT:1 - chr2L 11183891 3' + 1360 3188 1 53.47 GCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTACAAGATGTGTGAGCTTCTTGCTCGGGCTGTGGCATAATTTTAGGCATTTTCCCGATG:1 - chrX 4248804 3' - jockey 4623 1 57.43 ATAATTTAATTTTTTTTTTTAATAATTTTTCGCTGTTATACGTCAATATATGCACTTTTTTAGTGCACATTGTGGCTTTAATATGCAATCTTGTCTATAAT:1 + chr2R 18759772 3' - pogo 2031 2 77.23 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGAAATGAGTAAATGAGGCGGCAGTCCAACAACAAAAA:1 + chr3R 23178433 3' - Quasimodo 37 2 70.91 ATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGAATATAAAACAAAGCGTGAAATCTATTTGCAACTG:2 + chr3L 21998472 3' + roo 370 1 61.39 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAA:1 - chr3L 8044307 3' + mdg1 7434 2 53.47 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGAGCTTCATCGTCCTTTTGCCCCGCCCCTCTGCACTTCGCCCTCTGC:1 + chr2R 18374851 3' - 412 28 2 56.44 TTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTACTTAAAAGTGAAATATGATTTTATA:1 + chr2R 2092816 3' - Doc3-element 59 1 66.34 ATAATAGCAAAGGGAACATGGAAAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGCCAAAGTAATTATGACTGATAATTAACCAAGCT:1 - chr3L 24354984 3' - micropia 5092 4 68.32 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATCGTGAATCTAAATTATCCAGTTCATTATTTAAAAACACGTAACAAATTTCGCGCTGCATTAAACACACACATA:1 + chr2L 18417400 3' - roo 2 2 77.23 TATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGCCCCAATACCCTTTCATCCTTCCCTTACACTTCCCTCCACATTTCGCCT:1 - chrX 13980529 3' - F-element 4572 1 51.49 AAAAAAAAAACAGAAAACTTAAATTATTTGTTAATATAAAGCTGTATTTTTAATATATCTCAAGATCTTGACTACGCCCATGGCAAGCTTATCAATA:1 + chr3L 9373587 3' + gypsy7 5018 2 87.63 ACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGAAGGATAATGTTTGGTATAACCTACCAATAACTGCCTGTGCCATGACATAT:1 - chr2R 22828091 3' - opus 7433 2 59.41 GAAAAATAAAAGTCAAATAAAAACAGTGCAAAAATGCCAAAAACTGTCGTAGAAAAATGCAGCGACGTTGACGCGGGCAGAGGTGCATTAGAGCCGAGGAG:1 - chr3R 11303534 3' - Tc1-2 1391 1 60.40 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGGGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATACACTAGGCTAGGGTAAGATAACTGTTGCATATCCAG:1 - chr3R 10957278 3' + hobo 2901 1 65.00 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTGCAAACTGAGCAAAAGGTTTATGTACACACTTGTTTG:1 - chr3R 12055045 3' - Doc 43 1 67.33 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACAATTTGTTACAAGTTGACTAGGGAAAAAGCTCTG:1 - chr2L 9129137 3' - 412 7095 2 65.35 ATATGTAGGTACAATTATTTGAATTTTTGAGGTGTACATTACGTGGGGTCATGTGGCAGCTTAACGAGCCACATAATGGGGAAGGAAGCGGAAAGTGGTGG:1 - chr3R 11533350 3' - HeT-A 5973 1 56.44 CTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTTCTCTGGCAGAGTAAGTAACAAGAAAAACGGTACTCTCAGACGGAGAAATTAAGCATGGTCCTAGTGTGGACAGTTAAA:1 + chr2R 2922911 3' - Gypsy6A_LTR 261 1 57.43 CAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGAT:1 - chr3R 13375976 3' - 1360 40 1 67.33 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGCCAAAACGCCCTCGCATATGCAACACAATTTAAAGCCA:1 - chr3L 20862825 3' - hopper 34 1 56.44 AGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAGTCAGTTTTCTTAATTTCCAGTGCCAAA:1 - chr2R 17948829 3' + mdg3 5250 1 72.00 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGA:2 + chr2R 17348615 3' - jockey 37 1 58.42 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTTACTCAA:1 + chr3L 3535468 3' + roo 396 1 64.36 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTCTATGTGGGGCTGTTTATGTGCATTTAAATAATACATTTTTATTGAC:1 + chr3R 6097666 3' + roo 9043 1 54.46 CACAGCAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATT:1 - chrX 22726195 3' + Helena 1273 1 47.52 GCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATGCCTTTTGTTTGTACTTTGTCGATCGATCGTCTGCGCTTTTGTTTGTTTCTCAGGGGGAATT:1 + chr3L 19173630 3' + transib2 2815 1 70.30 TAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGGTTGGGTGCCTTCGGTAGGCGGCAGCCAATGCAATTACAT:1 - chrX 10298447 3' - Quasimodo 337 2 71.29 AACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCATGTGTGAACAGTATTTATTTTGATAAACCAGTGGTTTATCAAAATAAA:1 + chrX 15227298 3' + roo 8617 1 52.48 ATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGTACATACATATGTATGTATGTGGTACACGAAACTCGCCATGCAAA:1 + chrX 18975625 3' + diver 6080 2 54.46 ACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTACATTAAATATATATTTCAATTTAAGTTCAGGATATT:1 + chr2L 14112968 3' - Ivk 5340 1 64.36 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTTCATTGGAAAAAAGCCCTACATT:1 + chr3L 17635570 3' - 297 6626 2 75.25 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCTCTCCAACTGTCTGCCATCCCTTTCCCTCTCGACGTT:1 + chr3L 17110773 3' - hopper 36 1 60.40 TGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACATATTGTGCACATGTGTATCTAGCCA:1 + chr2R 9214123 3' + Transpac 264 2 80.20 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTTTTTTAAATTCAACTACTCTTTTATTAGCAAAACT:1 - chr3L 21410087 3' - opus 149 4 67.00 GCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGGAAAGAAAAACGTGTAAATTTCGTTTGACA:1 - chr2R 16217862 3' + Doc 4387 1 76.24 TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGG:1 - chrX 21668008 3' + Tabor 451 2 56.44 TGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTG:1 - chr3R 28240015 3' + Cr1a 151 1 70.30 GCTTGCACACACACACACACACACACACACACAGATACAGATACGAGTACAGACACAGATACAGAGACAAATATGCCAAGGAGCAGGGTCAGCCATT:1 - chrX 10822935 3' + accord 179 2 70.10 GCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACTGAAGTCGCACACCCGCCGCCGCCGCCGCCAAAGTTGAAGAAAAAGAGCGCCGGACTATCCG:1 + chr3R 13996016 3' + 1360 3385 2 69.15 CTATTGAGCCTCCTTCGTGGGCGAGGTCTGTTTTTCGCTGTTTTTTATTACTGTCGAGCTACGTGTCGTTCTTTATTTATTTCGGTATATCTGTTCGCATT:1 + chr3R 21931874 3' - X-element 4474 1 70.30 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACAATTTGTTACAAGTTGACTAGGGAAAAAGCTCTGCCTGT:1 - chr2L 9129132 3' - 412 7090 2 60.40 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACATTTTCCATTAAATTTAAAGCTTTTTCTA:1 - chr3L 18523606 3' + 412 7500 2 69.31 AAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTACGGATTGGCATATCGGTTGGAATACATATTTCGCGAACTT:1 + chr3L 5573608 3' - mdg3 5270 2 60.40 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGATCTTTTTTGAACCAATTTACTGTATAATTTTATGCCAATTTAATTTACAATCTTGTAAATTAGCTTGAAGCTATTT:1 - chrX 11299939 3' - roo 8664 1 77.23 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTGAATAATGTAATGAATGCAGGAGTACAGTGAAGC:1 + chr2L 4868584 3' + blood 7347 2 68.32 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATATTTTAAGAAACAAAAAAGAGGGAGCAG:1 + chr2R 16939045 3' + pogo 2057 1 73.27 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTCTGCTGCTCCCCCAGCAGCGGTTCTCCAAAACATTCTCGAAATTCCAAAGCAGATATGAGTTTTGATACCGTCG:1 - chr3R 20430726 3' + hopper 1411 2 75.25 ATTTTATTATGTAATTATAGTTTTGTGCTGCTGATGTGGGTGTGTGGTGCGGGTTTTGGTGTTGTGCTTGGGTTGATTAAGACGCATCTATTGTCGAACAC:1 - chr2L 4722968 3' - Porto1 4216 1 55.45 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTCGTTCGATTCGCTTACATGCTCCT:1 + chrX 21049996 3' - 297 50 2 76.24 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCAATCTTCTAAACAGGATAAATGTAATTGCGCATGAATTTCTACGCATATTTCGGCGT:1 + chr3R 17557458 3' - mdg1 7056 2 63.37 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCAAAAACTGAAACTAACTGAAACTGAGAAATTGAG:3 + chr3L 10576848 3' - roo 8704 2 70.30 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGCCCGTCTGTGTGCCGGTGTATGATGCCATTTATTT:1 - chr2L 9672421 3' - 297 26 2 61.54 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGTTATCATTACCTAAGCTAGGAATTA:1 + chr3L 15353592 3' + mdg1 393 2 54.46 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCATAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTACTGACGTCATAACTCAAACACAA:1 - chr3L 9190467 3' + 412 7508 2 65.59 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCG:2 - chrX 17492889 3' - Tirant 8142 2 61.39 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGACAAAATGTCCGCGAAC:2 - chr3R 19513353 3' + jockey 4969 1 56.44 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGCCAAAACGCCCTCGCATATGCAACACAATTTAAAGCCACACGAACACAAATGCAATTTGTGTGCGTGTGC:1 - chr3L 20862793 3' + hopper 1413 2 75.25 CGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTTTTTTAAATTCAACTACTCTTT:1 - chr3L 21410100 3' - opus 7053 4 80.20 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGA:1 - chr2L 13598188 3' - pogo 32 1 58.42 TTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATATTTTGGCTCTGTTGATACGAAACGCACTACATTCATTAAAAATA:1 - chr3L 17762777 3' - invader3 5219 2 55.45 GTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGATTCATTGGATCGATATTCGTGGTTGCAGCGCACATCGGTATCGGTTTTGGTATCAGTATCAGTTGATTGGT:1 - chr2R 17353879 3' - I-element 409 1 75.25 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAGTTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCACCTCGTTTCTTTTTCTTTTATAAAAAAGCATAA:1 - chr3R 19515790 3' + 412 473 2 58.42 CGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTAACCGTAGAAGCAACAGCCATAAAGTCCGGCTGATTGCAAACAATTCCGATTGATTTATTGTGGCAATGGT:1 + chr3R 22494795 3' - 1360 5 2 75.25 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTTGTGGTCTCGCCTATGTTTTCATTTTCCAACTGCCAAGT:2 - chr3L 494629 3' - Transpac 4953 2 65.35 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGTAGCCCCTCGGGCACTCGAGGATTAAGCGAGCGAGCTACAAGAC:1 - chrX 21219421 3' - roo 27 2 55.56 TCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATT:1 - chr3L 24210898 3' + HMS-Beagle2 7168 2 52.48 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCCGCAACCCGCTGTCCGTGAAGGA:1 - chr3R 4546015 3' - jockey 4759 1 76.24 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGGCGGAAATGAATGTTATTTATTTAT:1 + chrX 21219510 3' + roo 395 1 67.00 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAGAAATAATA:1 - chr3L 25884097 3' - Doc 48 1 67.33 ATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAAT:1 - chr3L 5267223 3' - Juan 4009 1 59.41 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTTAAATCTCCTCTGTAGCATTGCCCGT:1 + chr3R 25566827 3' - hobo 51 1 75.25 TAAAAGTAAAGTAAAGTAAAAAAAAGTAAAGTAAAAAATGTTAATTGTTGAAACTATTTCTTTTCCATACAAAGTGGCACTTTTCGATAATCTTTTATTGA:1 + chr2L 13079395 3' + F-element 4674 1 31.68 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCTCTCCAACTGTCTGCCATCCCTTT:1 + chr3L 17110760 3' - hopper 49 1 73.27 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTAAACTCCGTTTTCCGTTGTACGTACA:1 - chr3L 2992619 3' - hobo 49 1 75.25 GAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTATTATGGACTGAGGTTTATCTTGTGA:1 - chr3R 23657687 3' - P-element 183 1 31.68 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACAAAGCCATTTAACACCATTTCCTCATACCATTTAATATTCTCCCTTTTCAACAGTACATTATGCTCCCTAGACGCAA:1 + chr3L 27413747 3' + Transpac 5220 2 79.21 ATTATATTAATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCTCAATACTTGTATTAACCAAGATAATATTAA:1 + chr4 857157 3' + Cr1a 4332 1 64.37 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGA:1 - chrX 10196107 3' - 297 6628 2 78.22 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGGCGGAAATGAATGTTATTTATTTATGT:1 + chrX 21219512 3' + roo 397 1 69.00 TTGCGTTTAATTAGGCGCAAAAATGCAGTAAAAAGCACGGCAAATCATGGAATTTGCAAATGTGGATGGGAACCCTGACTGAATTCGCAATGTCCTGTCAA:1 - chrX 14841185 3' + S-element 1643 1 58.42 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAAATATACAATTAACTCCTTAAATAGCAAATGATTAAAGAAATGCTGGAGTGACA:1 - chr2R 11835605 3' - I-element 25 1 59.41 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCCTTGTCAACGAATTGCATTCTGTGTGAATGACT:1 - chr3L 2690947 3' - Doc 51 1 65.35 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCAATAGTTATCTTAATTTCGAAATTTTCGTTAATC:1 + chr4 306482 3' - blood 42 2 65.35 AATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTGAATCAGGAACAATACAACTTTCTACTACTTTTATGCATCACTGTCTCACAAT:1 + chr3L 23729590 3' + 17.6 368 2 66.34 AACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGC:2 - chr3L 5267209 3' - Juan 3995 1 53.47 ATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGGGGTCACAAGGGTTATGGGTGAAAGG:1 - chrX 5168738 3' + hobo 401 1 74.26 TATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGTACATACATATGTATGTATGTGGTACACGAAACTCGCCATGCAA:1 + chrX 18975624 3' + diver 6079 2 55.45 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAA:1 + chr2R 17348616 3' - jockey 35 1 57.00 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTCGTTCGATTCGCTTACATGCTCCTTT:1 + chrX 21049998 3' - 297 6629 2 74.26 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGGGATGGATGATACTATTGAGGGGCGGCT:2 + chr2R 16384356 3' - roo 8712 2 74.26 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGTATTCAGAATGCGTGTAGTTCCATTACTTTCGGCAAACAAGCATACATACTTTCTATTTG:4 + chr3R 20240957 3' + Tabor 469 2 48.51 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAAATATACAATTAACTCCTTAAATAGCAAATGATTA:1 - chr2R 11835624 3' - I-element 44 1 68.32 CTTTGAAATAGTGGAAGTGGCTGGTTTTGGACCCCCCAATACGTCACTATATATAGTATATTAACTAAAATCTCTACTGCCGCTCTCCAGCAATTATT:1 + chr3R 6138322 3' - 297 27 2 53.06 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCAAAAACTGAAACTAACTGAAACTGAGA:1 + chr3L 10576841 3' - roo 8711 2 77.23 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGT:1 - chrX 3446520 3' - I-element 28 1 58.00 AAAATGCATTACAATTATTACAGGCATTGCAACTGCTGTTGGTAGCAGCACTGAATCCCTAGCTGTAGCTGTTGTTGGCCTGCGGTCGCCGTAACGGGCCA:1 - chr3R 8499377 3' + Tabor 485 2 79.21 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGGATTGTTTAATTAGTTCTGTCTTGGCATACAAAAAATAGTTTCAAGTCCCTAG:1 + chr3L 7266592 3' + mdg1 398 2 51.49 AAATGCATTACAATTATTACACAACATCCACCCAATCAATTGAAATCCACAACGTCATTTAACCACATTAAGCATACGCCCTGTGTGACTATCGTTGTGCC:1 - chr2L 15151838 3' + Tabor 486 1 79.21 GCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGGAACGGGCCGGCAACAATGGACTTGAAATGAAAATTG:1 - chr2L 16378941 3' - HMS-Beagle 6830 2 59.41 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAGGTTCATCCCATTGTAGGGGAGAAAAGGCACAAGTTTTCCGGGTATTCCTGC:1 - chrX 22664348 3' - opus 21 2 58.42 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTGGATTTTAAGTTCGACATTAGTCTAATAACCAGGGCTTTTAGGGGCCTGTAGTGCGGC:1 + chr2R 20594968 3' + copia 239 1 45.54 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGTGACTGCCAAAAGTATTTTAATTGCCCGGAGTTTTCCGAAA:1 - chr2R 7105338 3' + roo 9038 1 58.42 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTCACTATGTATATTCCTTATAAAATTACATTT:1 + chr3L 27395484 3' - Transpac 4962 2 70.30 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAGACTATAAATACCACCATCCCTTCAACGCAGACCGAGGAAGACGAACGCCTTGCAGCGTTTTTGACA:1 + chr3R 12597208 3' + copia 245 1 68.32 AAAGTTGATAAGGAGTGAGGAGGGGAGGGGAAGCTGGGCACCGTAAGCCGGTGAGCCAGGCAGCACGTGGCTGCTTCAAATTGAACTCTCCTCTCTGCTCG:1 - chrX 21225611 3' - G6 293 1 76.24 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTAATAAATTATGCGCTCTATATGCACTGTAATAAATCAATAAATTGCAGAAATA:2 + chr2L 3483586 3' - I-element 21 1 59.41 TGTATGCTGAATCTCAACCTTTCAGCTTTTAATTCAATTGAACCAATTGTAATTTAATGCCCACACTTACAACTAAACTACAACTTTAAAATGTTAACAGG:3 + chrX 19810410 3' - INE-1 173 1 69.31 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTCGGGTTTATTGTTTTATGGCATTGCTAATATTTGTGTTGCATTTTCCGTAGAATCAAACGCGCCGGAAT:1 - chr3L 18642214 3' + pogo 2099 1 77.23 AAACCAAATTATACCAAAAAATCTTTAAAACGATTCCACCGCTCTTGGTGGGCAACAAAAAGGTGCAGTTAAATTTTCGAAAATATATTTCGCTGGAATTC:1 - chr2L 19281611 3' + I-element 5170 1 78.22 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACATTTTCCATTAAATTTAAAGCTTTTTCTATTT:1 - chr3L 18523603 3' + 412 7503 2 66.34 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGCGAACGAAAAGCCACCCCGGAAA:1 + chr3L 17421545 3' + P-element 2836 1 28.71 GCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTAGTTTATCTTATGCATTTAGGTGTAAATGTATCTGTATCTCCGTATGTATCCACCCACAAAATTGTGTGTTCTCC:1 + chrX 18444007 3' + Tirant 8302 2 76.24 CCGTCTGCCCGTATGATCGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAATATTTAGCATACATATTTGAGTATGAATCCGCATCTGTAAAAAAAA:1 + chr2R 6612170 3' + INE-1 127 1 71.29 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCG:1 - 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chr3R 21596088 3' - Bari1 419 1 67.00 CCTTTGTATTACTTAGCTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATGTGCAATTTTTTTAATGGAAGATAATAAATGAATCGAAATTAAAAAT:1 - chr2R 25097868 3' - HB 35 1 58.42 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGGGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCATATCTACGGGCGCCAGC:1 + chr2R 17348642 3' - jockey 10 1 68.32 GTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGGATTGCTTTAGCCAAACAAAAATTAAGACAGCGCAGTCAACCAAAAACAATGA:1 - chr2L 21019296 3' + 412 103 2 62.38 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTTACT:3 + chr3L 3535465 3' + roo 393 1 61.39 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCCCATAAAGTCACTTTTAATGAGAGTAATTTATTAGCGTATACAATGTATTGCAATAG:1 + chr3R 16110252 3' - mdg3 20 2 65.35 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTGGATTTTAAGTTCGACATTAGTCTAATAACCAGGGCTTTTAAACGGCGCAAGGGGACTGCAGTT:1 - chr2R 20593320 3' + copia 245 1 66.34 CAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATACAGATCAGCCGAGTTTGTTCAGTGTAGCGGTTTATGTGTCTATGCATCTGTGTGTGCGTGTCGCCAT:1 - chr3L 10568911 3' - 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chr3L 18446973 3' - gypsy12 9768 3 61.39 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGATGTCAAAGTAATCACGAGTCCAACTGCTGGTGCAACTGCAACTC:2 + chr3R 11478460 3' + roo 9041 1 58.42 CCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAGCGATCTATATATTTTATTCAATGTCTTGGTTTTTTCTAG:1 + chr3R 29361090 3' + 412 7509 2 61.39 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGCATTGCAACTGCTGTTGGTAGCAGCACTGA:2 - chr3R 8499424 3' + Tabor 7277 2 68.32 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCAAAAACTGAAACTAACTGAAACTGAGAAATTGA:1 + chr3L 10576847 3' - roo 41 2 71.29 CCAAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGG:1 - chr3L 25497423 3' + gypsy8 4863 2 76.24 AGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACCAAAACAATCAAGGACGGGGTACTTGGAGTACTCAGTGTACTATATTCCCCAATAAAGT:1 + chr3L 23846575 3' + 1360 3182 1 59.00 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGTAGCCCCTCGGGCACTCGAGGATTAAGCGAGCGAGCTA:1 - 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roo 8686 2 58.42 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATCGTGAATCTAAATTATCCAGTTCATTAT:1 + chr2L 18417355 3' - roo 8711 2 70.30 TTCTAAGCTAACTAAATATCATTTTATGAAATGATCCGTTATGCCGTGTTTTGGCATTTATCCAGCACCGATTGGTTGAATTATTCCAAAACACGGCATA:1 + chr3R 817648 3' - Doc3-element 4645 1 50.00 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGAATATAAAACAAAGCGTGAAAT:1 + chr3L 21998459 3' + roo 357 2 74.26 GTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGTGAAGCAGGCAAAAATATGGAAAATATA:1 - chr3R 11150819 3' - mdg3 77 2 72.28 GTTATTATAAAGATAAATATTTTACATTTTTTACCAAAACGTATATGAAACAATTTACAATTTACAATTTTTTTAATATTTTCGTATATAATGCAAGTAAA:1 + chr3L 10167882 3' + looper1 1660 1 75.25 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGTCGAGTTT:1 - chr3L 8044294 3' + mdg1 7447 2 66.34 AAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATGGATTAAATGCTCGCCCAAATGCGCATGGAAAAATGACCGGGCAGTATTATGGGCGAATTTCCATGTTTCCT:1 + chr3R 28139850 3' + hopper 34 1 78.22 AATTTTCAAATTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGCAAGATGCCACAATTGGTAGAAAGCATTTTCGCAAACGCGATTGCATTACAA:1 - 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GATE 267 1 59.41 GTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACAGGAGCAAGCAGGAATTTCGTAGCATACTTTCATGGGCAATTGATAAGCAGTCGT:1 + chrX 18150328 3' - accord 372 2 59.41 ATGTATGTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTTCCCCATCCTCCCTCTGCTATTGACGGGTTGGCCTTGCCCGGA:1 - chr3L 10716093 3' - Quasimodo 37 2 63.37 GGCTGAATTATTAGCGCCCAAGGTGACAAAGCTACCAAGTGGCTCGTCGATACGTCCAACGTCAAGGTTGGAAGCATAGTATTGATGAAGGAGGACA:1 - chr2R 5621199 3' + BS3 1712 1 65.98 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAATAAAGTGGACCATGAATTAAACCAACTACCCTTGAATATATAATATTCCTAGAAACAAGGTCAGAAATG:1 + chr3L 735127 3' + mdg1 7452 2 67.33 CGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCATATCATATTAAACGAAACTAAAATTAATTTGGGAGAAAGTTTACTTTATGACATAGAAAGCCACAGAAACCC:1 - chr2R 7074036 3' + Doc 4541 1 77.23 GTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTCCATGGAAAATGATGAAACCAAAAGCC:1 - chr2L 16537997 3' + flea 4686 1 77.23 GTTATTATGTTCGTATATACTACAATTAATTCCTTGTGAACTAAGATTGCCTAATTTAATTTATAAACGGGCTTAAATATCATAATTACCGTGATTTCTAG:1 - chr3L 734991 3' - mdg1 3 2 42.57 ACTAGCTGAGTAACGCGTATCTGATAGTTGAGAAAATCGCCTATTGATTCCTGTTCTTGCTTGCTGACATAAAAATAGGTAAGGCAAATTATAATTTTTAG:3 - chr3R 19718712 3' + INE-1 542 1 80.20 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATGGATAACCGTTCGGTT:1 + chr3L 22162732 3' + roo 9045 1 57.43 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACACCAACAACAGACAAGTGCACGCAATTATGGTA:1 + chr2L 12888863 3' - 412 46 2 68.32 CCTTCACCTCTGGAGGAATCCTAACGACGACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCAATAATTAGATTAATTTATAAACAAAAACAGCAACGCCAA:1 + chr3R 27132008 3' + Gypsy6A_LTR 353 1 76.34 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACAGTTTCGGTGGCAACGTCAA:1 - chr3L 5351521 3' + P-element 2833 1 25.74 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCTCTGTCCATTATCTTCGACTTGTTTCAAAACGTTGTTAATATTTTCACATACTTTGGTGGGATTTCCTTT:1 + chr3R 8134015 3' - roo 7 2 72.28 TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTG:2 + chrX 21945932 3' - F-element 39 1 55.45 GAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTC:1 + chr3R 10736144 3' - McClintock 5953 2 76.24 AGAGTGCGAGTGGCAGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGAGTTAGAGGGGTGCGGCATGGGTGAGAGATGAATGCACTTGACAAAGCAACGCCTGCCTGCC:1 + chr3R 11389827 3' + hobo 2930 1 66.34 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTTTTTCTGCAGATATTTATTTCTTTAAAAAACAATATTACGTCAT:1 + chr3R 9199832 3' + roo 9041 1 57.43 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTAAAACATAAATACACATTTAATA:2 - chr2R 9972736 3' - Doc 58 1 75.25 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCTTTGCTCTGCCGAGAGCCTCTGCCGCTGGCGACTGCGACTGCGCTGCCTTTCA:1 + chrX 13640336 3' - P-element 4 2 76.24 ATTATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAATAGTTTCTGCATTAATAAATCATTTACTTAATTTTCTTTTTCATATAGACATAAGTACATACAATTTTTTTA:1 - chr3R 21581083 3' - roo 8669 2 78.22 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGT:2 - chr3L 8044301 3' + mdg1 402 2 59.41 TTTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCAATCTGATCATGTCCGTCTGTCTTTACGTCCATATAAGCGTTGTTATTTCAGGAACTATAGAAGCTAGAAGGTTG:1 - chr2R 1751259 3' + INE-1 88 1 66.34 GTGGACTTAAAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGGCAACAAAGGCATCTATGGTCATTGCTTTCGCACTATATTC:1 + chr3L 13886416 3' + Doc 199 1 57.43 AAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTAT:1 - chr3L 24210904 3' + HMS-Beagle2 7162 2 56.44 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTAATCCAAGTATCATTGCAGGTATT:1 - chr3R 3920653 3' - I-element 21 1 54.00 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTAATTTTAACATGCATTAAGTGTGCATCCCTTTGGCTTAAACGTG:1 - chrX 12166518 3' - pogo 30 1 60.00 GTTAGAGTTGATTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGTAAACTGTGAAACGACCTTGTGTTGATTTACTCAATCATGTTATGCTTCATCGTTATGATCTCCACTT:1 + chr2R 1775684 3' - Burdock 360 1 70.30 TCTGGATCAATAGCCGCGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCTTTTCACAGTTTTGTTAGTCGTGTAGTAATATTATTCCCGTTACTTGTAGGGTAACGT:1 - chr2L 21710290 3' + INE-1 94 1 67.33 AACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTGCCACGCGCTGGAAGACTGCTATCGTGAGACCTATGAGTATTTCAAGCCACTTTTCGGGTATATAGTTACAAAAAAC:1 + chr3R 4267430 3' + INE-1 344 1 75.25 CTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAAAATTTAATTAAGACATTCATTAGAGTTTATAGCCATA:1 - chr2L 9284361 3' - flea 34 2 64.36 ACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGGCGGTGGTGTGGTCCACGAGTATCCACAAGTAAGCAAGTATCTATCTATCTAAG:1 + chrX 16185904 3' - I-element 329 1 60.40 CGCTACCACCAACAACAACAGCCACAACAACAACAACAACAGAAAGAGCCACTAAAATCACACATTCACACTGAGCAGTGGCGTCATCTGGAAGAGG:1 - chr2L 4295153 3' + F-element 412 1 69.07 AAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATAGCAGCAACGAACGAGGAAGTGTTGAGATCTAGGCAACAGCGAAGATCCGAA:1 + chr2R 14044580 3' - jockey 4865 1 53.47 GCAAAAAAATCGTGTGCCACATAATCGTACGACGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAAAACAATAGGCCACAGCAGTGAGCTTGGAAGAGGC:1 + chr3R 10434939 3' - 1360 42 1 62.38 CCCTGAAGCTTTCACGATAAGAGTCCAGGTTTTGGCTTGGGATCAAAGGCGAGCTTTAGAAAGAACGGCAGAGCAAATTGGAGGAGTGAAATTGCAGACTG:1 + chr2R 657887 3' + gypsy7 43 2 79.21 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCAT:1 + chrX 19034190 3' + hopper 1392 1 56.00 AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCG:1 + chr3R 28797987 3' - BS 5002 1 66.33 GTAATGTTAAATTGCTATACTATAAAATTTTTGGTGTGTGAAATAATAAAGTAATATTAGTTCACGTTGATGGGGTTACATGGACGAGGTAAACAGCCAAG:1 - chr2L 164590 3' + Doc3-element 124 1 55.45 GGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGTAAAAGTTTGCCACTTAGCACCCGAAAATCTATC:1 - chr3R 13231122 3' - Quasimodo 7 2 77.23 AGCGAGAGAGCGAGAGAGAGAGACAGACACAGATAGAGACAGGTATAGGCTGCGAGTGAGACGGCTAACGAGAAAGGTCCTTTCCCGTCTCGTTCGCTCGC:2 + chr3L 10811439 3' - Cr1a 294 1 79.21 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCATATCTACGGG:1 + chr2R 17348635 3' - jockey 15 1 64.65 TATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATACGCCTGTGTGGCGCTCCGTGATGTCGTGTCCCCGTGTAGGGCTACATACCACCTACTGCCAAACCAACCCA:1 - chr3L 13652149 3' + mdg3 241 2 66.00 GATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCAAGGAGCCTATGGCATAACTAATTGAATTGAACCA:1 + chrX 10298516 3' + Quasimodo 103 2 65.35 GGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGAGATTAAATGAAATCTTGAAATAACATTTTAGTTCTTATATATAATCAAGCCAGTAGTTTTGAGTGTT:1 + chr2L 15174192 3' - Juan 4036 1 66.34 AAAGAAGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAATGATTCTGACACATTAATTAATCGTATTTTATGTGTCTCAAAGAAACTGCAT:1 + chrX 12878415 3' - hopper 318 1 56.44 TACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATGT:1 + chr4 872519 3' - 1360 338 1 55.45 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTTGTGGTCTCGCCTATGTTTTCATTTTCCAACTGCCAAGTCGGCATGCCGAGGCAATTCACTTTTCTGG:1 - chr3L 494600 3' - Transpac 5 2 74.26 CCGTAATTGTGACACACTACTGAAAGTGCAACGGACTGGCATTATGGTTGATTGCCACTCGCTTGGTGGAGCGGCTC:1 - chrX 15236924 3' + baggins 59 1 66.23 AATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTACTTAAAAGTGAAATATGATTTTATACGATA:1 + chr2R 2092821 3' - Doc3-element 54 1 71.29 AACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGAC:2 + chr3R 435941 3' + 1360 3012 1 51.49 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCAC:4 - chr3R 11080683 3' - I-element 24 1 54.46 TGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTCCAATGCATAGTGTAGAAGTTGTTTAATTGCC:1 + chr3R 11095100 3' - I-element 5053 1 68.32 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGC:1 + chr3L 14286049 3' - 412 7104 2 75.25 TCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGTGTTTCTTCGAAATTTTTCCTGGGAAACCATGATATAGCAAAGTGTGGGCTGTACTTATTAGGTTATTT:1 + chr3L 13462720 3' - pogo 5 1 69.31 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGGGAAATAAATGCTCTTCCATAAAAAGAATATATTATAATAAAATACTTTGATGAAAAAAA:1 + chr2R 3522062 3' + copia 238 1 61.39 TCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTACAACACTATAGTATTCGTTATTTACAAAGAACGACTGCAGTTCTCGTTACTCGCTACTAGTAGATT:1 - chr3R 21587214 3' + pogo 2096 1 70.30 AACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTT:1 - chr3L 5267213 3' - Juan 3999 1 49.50 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACG:1 - chrX 157205 3' - I-element 23 1 54.00 GGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTTGATTGCAGAAACCAGAAAATGGCTTAATTTATTAAGCTGGCAAAGTATG:1 + chrX 3294355 3' - hobo 339 1 58.42 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCT:2 + chrX 13640284 3' + P-element 2831 1 24.75 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGATGGCAAAAGCGCATATAATGCAATTTTATAATTAAGACTTATATAG:1 + chr3R 19966897 3' - hopper 28 1 55.45 CCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTAACTATTAACG:3 - chr3L 25884054 3' - Doc 5 1 69.31 GCAAACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAA:1 - chrX 5168854 3' - hobo 40 1 59.41 GTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGTTTAATATATTTATTTGATTAAATCCAGTATCCATCTTTGTGTAATCATTTAATCTTTTTGCC:1 - chr3R 13910550 3' - I-element 5021 1 62.38 AGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTAACTTTGAGTTTCGTTTTGAGTTACCCGCCAATCTAAATCGC:1 - chrX 16480811 3' - HeT-A 6028 1 59.41 AGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAGGTAGATATTTATTTGGGAACCAAATGAGAAAACATTTAAAA:1 + chrX 20806216 3' - INE-1 576 1 94.06 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTC:1 + chrX 21945914 3' - F-element 57 1 73.27 TACGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + 412 447 2 68.32 ACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTCCGGCCGGCAGAAGGTCCTTCAAAGGAAAGGCAAGACCGTGGCGTGTCGTAAGAGTCAGTGGAGT:1 - chr2L 23191437 3' - 1360 3372 1 60.40 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGTAGTGGGAAACTTCTTGGCACTTTCATGAACTTCTGGCCGGTAATTAAAATCCACCCACAAATACCA:1 + chr3R 25514211 3' + hopper 1413 2 77.23 AATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAAAAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCTAACTAATCAATAAATAAT:1 + chr3L 24208968 3' + HMS-Beagle2 263 2 70.30 GACGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCAAAGGGACCGGTGCGCAAGGTAGCGCTGTACAAG:1 + chr3L 26380640 3' - invader4 2752 1 68.32 ACTTGAATCCAAGAGAAATGCAAAGACAATTAAAGTCAGCTGTTTCAAAATAGCAAGTGATGAGGAAGAAGAGCTTATATACGGGCGGGTATCATCATCAG:1 + chr2R 658609 3' + Idefix 7169 2 63.37 ACACTTCTGCGCTGCGCCGCGGCCGACGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACGACTTCACTTGATTGCTAAGGGTCCCAGTGGTTCACACGACTTGACTTTACTT:1 - chr3R 934714 3' + HMS-Beagle 93 2 65.35 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGCTAGCAGTCACTAGTCCACTTTTCA:1 + chr3L 14286073 3' - 412 7080 2 52.48 GCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCACTTTCTTTCAATTGCCACCTTTCC:1 + chr3L 3070697 3' - 1360 48 1 74.26 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGA:3 - chr3R 19513369 3' + jockey 4953 1 72.28 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGGTTTTC:1 - chrX 17492881 3' - Tirant 27 2 53.47 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAAATAAAATCACACACTAAGGCGCCAAATTAGCGCGGAGCATACCATTTTTT:1 - chr3L 8256079 3' + jockey 4968 1 54.46 CATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTGCTGCAGACTGTATAGAAACAAACGGGCCTGGTTTTAAAGTCTAGAAATTC:1 - chr2L 21646395 3' + 1360 201 1 50.50 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCACCGCCGAATCTTGATATCAATATTTTGAAGGAAACTACTTGAAACCAAGCGT:1 - chr3L 7266507 3' - mdg1 25 2 54.46 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTT:1 - chrX 17492884 3' - Tirant 30 2 54.46 GGCTCCAGGCTCTCCCGAATTTTTGTTCAAGATCGAGAGAGCGGAGAGCGCCGATTCGCGTGGTTCAATCTTAAGCAGGGTTATGGCGATTGATAACGTAC:1 - chr2R 4189478 3' + 1360 79 1 50.50 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGACAAAATG:1 - chr3R 19513362 3' + jockey 4961 1 65.00 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTC:2 + chrX 21945919 3' - F-element 52 1 68.32 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCCAGACACGTTGCCAAGCCAATTGGCAAAG:1 - chr3R 19143567 3' + hopper2 1564 1 66.34 TATATCATCCATATAAACATGACAAGTTGGTCGAGGTGTTTATTCCACCATGAAACCAAAGACACTAGAATTCTAGTATATTCTAGTGTCTTTGATGAAAC:1 + chr4 836090 3' - TLD2_LTR 36 1 74.26 ATCCTACCGGCTGCACCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGT:1 - chr2L 23286583 3' - Tirant 415 1 56.44 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCACCTCGTTTCTTTTTCTTT:3 - chr3R 19515805 3' + 412 7511 2 59.41 AGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCTAACAATAGCCACACGGTAGATAAGGAATACGCTCAGCGTTTTGCTGA:1 - chr2R 5433142 3' - Cr1a 488 1 54.46 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCGGCCAGCGCTTTATTTTCTTTTAATTATGTACTCATCTCACAAATGTGGGTCAATTAACAAGCAGTCGATGGT:1 + chr3R 13191116 3' + mdg1 7394 2 65.35 TGTGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTACCTGTAGGAGAACGTCTAACAAAATGCCTTGATT:1 - chrX 21564065 3' + invader4 319 2 71.29 CCATCAGTTGACTAAGGACAAATCTAAGGAATAAACAATTTATTACTAGCTTATCTTTAATTTAAAGCTGTTCACGATCTCGTCCCTTTTCAGACTGATCT:1 - chr2L 22307045 3' - 297 354 2 66.34 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCTATTTACATTTATGACCGCCGGCAGGCAGCAGAATAAAGCTGCAGCAATTAAAGTGATC:1 + chrX 7019270 3' - hobo 16 1 63.37 CGCGAAGCGAGGCTTTAAACTGGATCGAGCATATATAAGTAGGGGTCGCCTATGATCCGTAACTTTCAGTGCTTCTATAAACCGCCGTAGGAACAGACATG:1 + chr2L 11136414 3' - I-element 41 1 74.26 TTTGATTTTAGAGTAGGCAGAGATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGAACCAGAAAAGAGATACA:1 - chrX 21668258 3' - 412 7459 2 80.20 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGC:1 - chrX 10196100 3' - 297 6616 2 69.79 CGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGACTTTGCGCATTTGTAACCCCTTGTTTAAAGAGATCCCTCTCTCTGAGTTAAGCGATTCCAGGCAG:1 - chr2R 11403958 3' - 412 7490 2 71.29 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACCAAAATGAAGAGATTAAATTTAAGATATTTGCATTCTTAAAGATC:1 - chr3R 20240873 3' - Tabor 33 2 55.45 ACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAAATGCGGCAGACGACCCACACAAAGCATCTGTGTAGACATTTCGTTTTGTAAAT:1 + chr2L 19623159 3' - Burdock 6152 2 61.05 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGTGTCATCTGTTTTTGCTTTTGTTTTGTTTGCCCATCGAATGATCGCACAGCTGTTCAACCAAAAGCAACAT:1 - chr2L 19865794 3' + P-element 2883 2 77.23 CAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGAGTATAACTGCTGTGCCGAAGAGTTGAAAAAAAACAGGAGGGAGTTGAAATTATTAAAAAAAAAA:1 + chr2R 2725130 3' + Ivk 349 1 56.52 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACAAATGA:3 - chrX 5168838 3' - hobo 24 1 55.45 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATATATACATATATACTATATGTATGTATATTGATGTGCATATAGCCCAGGTCTTTGGGC:1 - chr2L 8299787 3' + Transpac 5215 2 65.35 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCTATTGCTGTTGCTGCTTCTGCCTGTGTGCAATGTGTTGCAAGTTGCATTGGCAGCGTCATTCAA:2 + chrX 7429449 3' + hobo 2928 1 68.32 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGTTATATTATTTTATTGTTTATTTACTATTGATATTTATAGTACTGGCAAC:1 - chr3R 19449897 3' + roo 9032 1 63.37 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTTATAAACAAAGCTGGCCCTTCTATTTTCACCTGACAC:1 - chrX 11503450 3' + roo 9054 2 62.38 AATTAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGTAATGGCGATTTTATCTCTTGGCCCGGTGTTTTGCTATTAT:1 + chrX 17581304 3' + roo 9038 1 55.45 TATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAGGAAGATACGAATACAACTTCCAAATAACTCCCTGCATTCTTGAGATTAATTGGT:1 - chr3L 27863831 3' - rover 6966 2 65.35 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAAATATACAATTAACTCCTTAAATAGCAA:1 - chr2R 11835631 3' - I-element 51 1 75.25 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTAGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCT:1 + chr3R 8165793 3' - 297 14 2 97.03 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCGGAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAACAAAATAACAGATTTTCCGAAAGAGAA:1 + chr2L 22453420 3' + roo 9049 2 55.45 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGTACCCTCCACTACTTTATAGG:1 - chr3R 5555931 3' - mdg3 5307 2 76.24 TCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGAAAATGCATTATAAGGCGAAGAGGATCATACTCTTGAATTAAAGATAGTCAAGATAG:1 + chr3L 494712 3' + Transpac 5212 2 60.40 TTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGAAGTCCTTCTATGCGGATTATGTTATAATGTTGCACTGGAACCCATCGCTCTCCCAGCAGGAATTAGCCCATTT:1 - chr3R 16110142 3' + mdg3 243 2 75.25 GTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTCCCATTGTATTATTTATTATTGCAACTCGCCAACAATCTGCCGCACATTCCGCTAGAT:1 + chrX 18284334 3' + Quasimodo 6934 2 61.39 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGTTATCATTACCTAAGCTAGGAAT:1 + chr3L 15353590 3' + mdg1 391 2 56.44 GAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTTTAAATTTACCGTGGCCTTTAAGTGTCACACCAGCGACATCTATGGAGTCACA:1 + chr2R 14434353 3' + invader4 3068 2 55.45 AGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGTAGTCTAGTCTTAGATAATATGCAAAGTCAGTTATCGGAACTTGAAGAAAACAATAAATTGTTTATG:1 + chr3R 19448493 3' - roo 8801 2 74.26 GTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTGACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACG:1 - chr3R 3985678 3' - gtwin 6932 2 63.37 CAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGATAAATCTCAATCAAACAAATCGGTGGGCAAAGG:1 - chr2R 13817812 3' + TAHRE 10379 1 69.31 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCAACTGACAGATTTTCACCTC:1 - chrX 10196063 3' - 297 3 2 67.33 TGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACCCACTTATAGTATTAACTTATAACCCTTGGTTTCGATCGCTCTCCTCACATCACATTTTTTCACA:1 - chr2L 16456749 3' + BS 5079 1 64.36 CCGGCAAGTGCACCCAGACACCGGTGGAGAACGCGGAGAAATTGAAAGAAAAAGGAGAAGTATTCAATTGATATCATTAAAATAACTACAATATATATTTA:1 - chr3R 20072654 3' + Osvaldo 1160 1 50.50 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATGCTGCACTCGATGCTGATGATGTTGGCCAAAAAAAAAAAGAAAAGCATTGCTCGATGCCGTCAATAAT:1 - chr3L 5321100 3' + mdg1 418 2 71.13 AAGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGAATAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAAAAAGCTTAATTAAGTGAAGTTTCATTCGAGCTCTCA:1 + chr2R 4339523 3' + G5A 2800 1 78.00 TCGAGCGATGGTGCATCGCACAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTTGTTTTAATTTCATATTCCTGGTTTTTTCTTTTTTTTATTTGCCTTATTGGT:1 - chr2L 23049081 3' - Doc2-element 127 1 60.40 TTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCCATTGCTTAGTCACACACACACACACACTCACACATGCAGAAGCG:1 - chr2L 12752730 3' + HMS-Beagle 435 1 60.40 GGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGAATAATATATATAAACGAAACAGTAATACAGGAGGGAATATATAT:1 + chr2R 3009508 3' - Idefix 7048 2 55.00 ATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCAAATTCCTGGGATATTTTTTCACCT:1 + chr2R 13646396 3' - jockey 4633 1 76.24 CGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATTCGAGGTTCAGAGGCTAACGACTTTGTTGTGTATGCGTGTGTGTGCCT:1 + chr3R 7508854 3' + jockey 438 1 52.48 TTTGAGGGGTTCCTCCAGGAGTCTAAATGACTGCATCAGCAGGATGGACACAGCACAAGAAAAAAACAGTGTTCATAAAGTGTAGCAAATTTACTAGTCTT:1 - chr2R 4955214 3' - G7 110 1 63.37 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGCAATTAGCTTAAAGTTCGCTTAGCTTACGGACAATGTTTCAGTCATATACATCTAGCATACTATG:1 + chr3R 20183064 3' + roo 397 1 68.32 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTATATGTATATATATACTCACATATATCTGAAACTGAGGAGAGCGCTGCAACCGGG:1 + chr3L 8843640 3' - I-element 21 1 58.42 GCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGGGCAACGAGGCACATTTTTGAGATTCATAAACTTGCGTGCGTGTGTGCGAGTG:1 + chrX 5128672 3' - I-element 225 1 56.44 TGGGAATAACTGATTCGGCAACGGATGTGGGTGTGGACATGGACATGGACGTGGCCGAACATTTATCAAATGACATCTGGTCGAGGGTCGACATATGGCC:1 - chr3L 7787094 3' - Quasimodo 6922 2 56.00 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGGCTCTCCATTACACTAGACTCTTTGCCACTCTCTTTATATCGCTCTTTCATAGCACTACTCT:1 - chr3R 11569058 3' + P-element 2874 1 64.36 ACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTACAAGATGTGTGAGCTTCTTGCTCGGGCTGT:1 - chrX 4248831 3' - jockey 4650 1 69.31 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAACCAATAACTTTTTATATTTTCACAACCACAACTATTGCACCCGTGCAGTCCTTTTCTGATTTCTGTT:1 - chr3R 17492645 3' + copia 247 1 63.37 CATAAGCACACACACACACACACGCACGCACGCACTCGCACACGCACACACACACCTAGACAGTACCCTGTTTTCCCAAAATGGTCAAAACGGGCCATTTG:1 - chrX 13301036 3' + accord 180 2 52.48 CTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAA:1 - chr3L 5267227 3' - Juan 4013 1 63.37 ATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACTCACACACACACACACACACACACACTGGGGGTTATGTA:1 + chrX 5108001 3' + F-element 4406 1 61.39 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTATCATTAGGAGGCATCCCAGACACCAGACAAACCAGGACATTCTGGGCAGCTGGTGG:1 + chr3R 12546889 3' + hobo 2933 1 68.89 AAAAAGGGGGCGCAAAAAAAAAATAGAAAACTGAGGGGGAGTTCTTCGATGAGATGCGAGTCAATTGCACATGGTTTTCCATGCAGAGCGATTGTGCTGA:1 - 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invader1 3648 2 64.36 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTG:2 + chr2R 17348620 3' - jockey 32 1 53.47 ATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGTGTGTGACATTCGATTTGATTGTTTTTGTTTTGAAATGCAATTTTACTTGCAAAGGGCCGAATCAGATGTAAGCGAGT:1 + chr3L 13885559 3' - Doc 121 1 73.27 GCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTTAAGTAAG:2 + chrX 21945942 3' - F-element 29 1 58.42 AGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCCCCAATAACTCTGCACTCATATCTACCCCAGTTTTCCCCCACCATCATTTC:1 - chr3R 10480019 3' + mdg1 479 1 53.47 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTCATTTTGGTTAAGACAGAAAATGTTAACATTATTTTTCGCAAA:1 - chr3R 13620268 3' - Doc 37 1 62.38 CGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTTGGTTTTCATCTTACCTGTTGTACCTCTATTGTGGTATCTTTATTAGCCCCGGTTCCCAACATC:1 + chr3R 25215022 3' - Burdock 4 2 75.25 CGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGTTTCATTTGTTTCATGCTGAAAAGAAAACACGATTGCAGAAGTCAATTTGCTCAGGTGCAGTGTG:1 + chr3L 1985386 3' - Max-element 12 2 65.00 AAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATAACTGTAGTTGAAACCCATTTTTCGT:1 + chr3R 2474334 3' - Juan 4022 1 72.28 CGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGT:1 + chr3R 15790100 3' - flea 4710 1 77.23 GACAGCGAGCGGTCAATCACCCACTAACAGACACACTCATATCCTTTATTCTTTCCTCAACTGTCTACAGCAATTTTCGTTACAAAACTTTCGGCTAAGCA:1 - chr3L 13365676 3' + Doc2-element 390 1 69.31 CTGTTATTATAATGGTGCGCTGTTAAATATGGGGTACAAAACTGTAGTAAAAAAGTGGAGAATCGTGGGTGGAATTGATAAAAAAATATGGTGTTAGAGCG:1 + chr3L 17872232 3' + hopper2 1474 1 75.25 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCCCAGGCAAAATTGGGTGGGGAGGGGGGTTGGGG:1 - chrX 14615618 3' + hopper 1374 2 64.36 CCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCTTGAGCGGTTCTCTCGTGCCTGACGATGCGACTTCCGCTTTTAC:1 + chr3R 13601083 3' + roo 8849 2 56.44 CCCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCC:1 - chrX 15408752 3' - INE-1 537 1 82.18 TTTATTTTATTATATTTTTAAACTTTTAAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTGCTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 + chr4 1294994 3' - TAHRE 24 1 69.89 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTGTTTATTATTATTTTGTTTATCTCGAACCTCAGCTGAAATAATCGCAAAAGGGT:1 - chrX 8037614 3' - roo 21 2 59.41 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGTTTTTTCCTAATTACTGCGGATATAGTATTTAAAGTT:1 - chr3R 9616591 3' + roo 9033 1 63.37 GAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGGCGACATATATATATGTATCTCAAATCATTTAAAAACTTGCATCACTAACGGGTATTTCTCAGTCGTTA:1 + chrX 16906761 3' + invader4 309 2 61.39 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTGTGAGCTGGATTTGGAATGGGCATCGCTTATAGGACGTGTGAAAAGGATTTAAATTCTTTAAAATAAAGATTATT:1 + chr3R 3752290 3' - FB 12 1 70.30 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGACCAAACTATGTGGTATTTCAATCAAGTCAGGTGGTCTGCCTCGTATTTT:1 - chr3R 5368308 3' + P-element 2863 1 55.45 GCAACAACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTTCCGAAGTGTCAAGAGATATTACATTACCTCGCGGGAGCAAAAGTAAGCACATTAATATAGGTAGT:1 - chr3R 4419786 3' + rooA 95 2 70.30 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAATCGC:1 + chr3L 12217363 3' + roo 9026 1 68.00 AATTATTTAAAACAATTTTTTTTTTTGTGGGGAGACCCCGCCTGGTTGTTTTCAAATTCAGCTTTGTTTTT:1 + chr3L 9092947 3' - Stalker2 7186 1 90.14 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTT:1 - chrX 5168869 3' - hobo 55 1 76.24 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTCTGTGAGCTTTATGGACTGGCAGTCCAGTAACTGGATGTGCCCTGCTCCATCATTATCAGGTCCC:1 - chr3R 17529503 3' - roo 9 2 69.31 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCCATCTTCAGAACCAATTTT:1 - chr2L 19572621 3' + P-element 2830 1 22.77 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAATAATAATAATCTGAACTTAAGTTTCTTGGCTCTTAATTATGAACGCCACATCTAAA:1 + chr2R 10719271 3' + Juan 4186 1 50.50 ATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATACAAATTTTTATATGCAGTTCCAACAATTACGGCCATTTAATGTTAGC:1 + chrX 22590222 3' + Burdock 228 2 55.45 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGCTTGGATGTAAATAGCTTCGAAAATCCTGATAACAAGTTCCGTAAACTGGTGTCGTTG:1 + chr3R 22699004 3' + roo 391 2 61.39 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATCTGAGGGAGGGGTGAGTTGGGATCAGCCA:1 - chrX 2755457 3' - opus 154 4 72.00 CTCAGTTCGACAATGCGTTAGAACGATACAAATATAGTGTGAATAAGAACTGATGCGCCAATACCAAGTAACACCAATACCACAAGGCCACAAGGCTTGAA:1 - chr3L 25976327 3' + invader6 4665 2 76.24 TAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAAATGCTTTGTTTCACGGCAATGGGAGGGCATAATTGATTGG:1 + chr2L 1673746 3' - Juan 4059 1 57.00 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGT:2 - chr3L 8044331 3' + mdg1 7410 2 72.28 AATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCAATGTATGTGGACCAAGCGCACCAC:1 - chr4 545999 3' + 1360 3165 1 75.25 ATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACATCCACCCAATCAATTGAAATCCACAACGTCATTTAACCACATTAAGCATACGCCCTGTGTGA:1 - chr2L 15151851 3' + Tabor 7312 2 66.34 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTTTAAATTAAGTGGAAATGGAACTCAACATCCCAGAGCTCGAGTATAACATAT:1 + chr2R 20506892 3' - mdg1 7061 2 57.43 ACTTGAGGGGGAAATAGTTAACTAAGGTAAACGTCCGCGGACGGACAGATCACTATTAAGAATATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTA:1 - chr2L 22724112 3' + gypsy 6973 1 54.46 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATCTCATCTTTGGCTATCACTTTGTGGGTGCATTGTTCAAACTTAAAATTGATAGTTTTATG:1 + chr3L 5321212 3' - mdg1 16 2 63.37 TTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCACCTGGCAGCTGCCAAAATTGCAAAATTG:1 - chr3L 17110720 3' + hopper 1371 1 67.33 AGAGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTAC:3 + chr3R 1977614 3' + micropia 418 2 58.42 TTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGAAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCACCTTTTCCGTCCAGTCGTTGGCCGTAATGTGTGGC:1 + chr2R 21322301 3' + invader2 470 1 65.35 AACAAAACAAAACAAAAAAAAAAGCACAGGAAACCGCAG:1 - chrX 4333676 3' + gypsy7 5004 1 84.62 CAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTTATAAACAAAGCTG:1 - chrX 11503473 3' + roo 9031 1 67.33 ATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATGCCAAGGGCAAACACAGTGACAAGCTCGGTGAGCCCGACTTC:1 + chr3R 6136560 3' + Burdock 6378 2 58.02 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTGCGCTTTCAATTCCA:1 + chr3R 19513423 3' - jockey 4684 1 63.37 GTAGCATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTG:1 - chrX 9816279 3' - BS 5041 1 76.24 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAAC:1 - chr3L 9190471 3' + 412 443 2 74.26 AGTATAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTACTGTTCTTTTGGCCATCGTTGTCCGCCGCCTGTCCGC:1 + chr3R 6116586 3' - Max-element 39 2 60.40 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGAATGTTATTCTCTCTTTGACATTCAACGAGTAAGGTTGGTGT:1 + chr2R 19164162 3' - P-element 33 1 52.48 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACA:1 - chr3L 9190468 3' + 412 7500 2 71.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATGGATAACCGTTCGGTTGAATGTGGATTATAAAGTC:1 + chr3L 22162751 3' + roo 401 1 71.29 CACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGAGAGTCTACTATATATGTACTTACTTAGTGCTAACTGACCACGCATATTCCAATCATAAATTATCGTGATAAAAA:1 + chr2R 15401910 3' + roo 153 2 77.23 TCTTGATGAGGATCAATAGCCGATTTGATCTTTTCCTATATTCCTGTTAGTCTTGTAAATTTGTAAAGATTTACTAAGAGGAAGTCATATAAATCAATGGG:1 - chrX 11172955 3' + INE-1 88 1 69.31 ACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCACCTGGCAGCTGCCAAAATTGCAAAAT:1 - chr3L 17110722 3' + hopper 1369 1 69.31 AAGCCAAAGACACTAGATTATTCTAGTGTCTTTGCAAAAGCCCATTAAAATTTTACAGCCTTAGGCATGAGTTTTGTTTTGTTATGTATTATAAGCTGCAA:1 + chr2L 21628994 3' - Tc3 314 1 59.41 ATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATATATATATATAAAAGAAAACAGCTCGCATTTATGCATTTAATTATTAACTCGCTCCCTCTTACGTAATG:1 + chr3L 3739175 3' + invader4 318 2 70.30 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGACCAAACTATGTGGTATTTCAATCAAGTCAGGTGGTCTGCCTCGTATTTTCCACAGT:1 - chr3R 5368301 3' + P-element 2870 1 62.38 TCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCT:1 + chr2R 5531207 3' - 1360 54 1 73.27 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGTTTGTGTTAATTGAGTTTATGTTATCAAAGATGTGCTTTGTTGTGGTTTTGA:1 - chrX 12881924 3' - hopper 23 1 56.44 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGCCTTGTTTTGCTTTCTACTAATTCGGATTGTTTTGTGTGTTATCTGCATG:1 + chr3R 27993409 3' - transib2 15 1 60.44 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCCTAGCCATCTGACATTGAATGGTGTTTGTATGTGTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chrX 12649915 3' + hobo 2928 1 66.67 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAG:1 - chr2L 18417313 3' + roo 9029 1 68.00 TAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCCCCAATTAAATTCAAATAGTTTTTTCCTCACTGCCATTATGTTCGAGCTTTTCTTTTTTCCCATTATATTTCATG:1 - chr2R 3521950 3' - copia 4872 2 76.24 TAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTTCCCCCAGAGCCCCGCAATCCTTGGCTAGTTAGCCGAGCATTATGCGAGATAAATTACGTTC:1 - chr3L 1259801 3' - mdg3 5265 1 64.36 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGGCCGAAGTTAATTCGATTAGTTGTGAGTAGCTGCAGGAAATGCAATCCATTTGTAGCCAACATTT:1 - chrX 9544149 3' - roo 12 2 67.33 GCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATGAAGAATGAAGAAGGAAAAATAAGGGACGCAAATAGAGCG:1 + chrX 5256754 3' - INE-1 19 1 79.00 GCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACATGTGTCTGCCGCAGAAAGTGCTTTCAAGCCAATGAATTCCCATGAGGCGTTTAAAGTTCAAAATGC:1 - chr3L 17773557 3' - P-element 227 1 71.29 CTGGATACAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGATCCTTAAAGCTGTGTAAGCATTTTAAGGCCGATGGTGAAGCAAGACAAGAATCGTAA:1 + chr2R 4624289 3' - Quasimodo 396 2 66.34 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAAACAAACAAAATGTAACAACGGAG:3 - chr3L 10576777 3' + roo 387 2 55.45 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACG:1 - chrX 3446540 3' - I-element 49 1 78.22 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAA:1 - chr2R 1621924 3' - 1360 66 1 75.25 TGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATAGAACCATTCAATAAAAGTTTTATAACATTTCAGGCGAAAGAGAGAGCTCGT:1 + chr3R 11549919 3' + opus 479 2 60.40 AAAAACGAAAAAAAAAAATAACAGAAATGGGGAGCGAGGAGCAGCGCAAGAAGCGAAACACCACCGTGGCATCCAACTTGGCGGCCAGCGGAGCGGTGG:1 + chrX 2660595 3' + gypsy7 5010 1 69.70 GAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTAAGTGGGAATACGCACACTAAGTTGGAACAGCCAGCAGTTCCTGATCAACGGCAAGCCCGTTTACTTTCGTGGTT:1 - chr2R 19123695 3' + F-element 47 1 72.28 AATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAAATTAAGCAACAACAACGACAGCGACAACGGGCTTAAACTCTGCCCTGTACATATGTGCCGTGATATACTTGC:1 - chr3L 22839378 3' - flea 4976 2 75.25 TGCTAAGTCTATGTTAAAAAATTAAATGGTTAGTTATAGTTTTAAATAAATATTCAAATTCGGTAAATTGTCACAATTGTCAATTGAAAAGAATTTTCAGA:1 + chr3L 26377882 3' + G7 1102 1 57.43 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGTCGCTATCGGAACTTGGCGCTGTCAAGTTTGTTCGTCCGACGCGGT:1 - chr3R 23669608 3' + P-element 2860 1 50.00 TGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAGGTTCATCCCATTGTAGGGGAGAAAAGGCACAAGTTTTCCGGGTATTCCTGCAGG:1 - chrX 22664345 3' - opus 18 2 61.39 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATC:1 + chr3L 15869707 3' - pogo 49 1 77.23 TTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCAAAACGAATCCGAATCCGAACACGAACCGAATCACAGCAACCAATCAAACAATCACTCACCCACCAAAAGC:1 - chrX 10793930 3' - invader2 4661 1 76.24 ACTGGCAGTCCCGGTGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGACAGGCAAGAAGTCGCTCGCTGCCGAGTTTGCATAAGAGTGAGTGAAA:1 + chrX 20231598 3' + Rt1b 4992 1 66.34 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGT:1 - chrX 3446517 3' - I-element 26 1 55.45 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGAGTTAGAGGGGTGCGGCATGGGTGAGAGATGAATGCACTTGACAAAGCAACGCCTGCCTGCCT:1 + chr3R 11389828 3' + hobo 2931 1 67.33 GGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATAACAATTTCCTAATGGTACTGTAAAGTGTTTGATGAATAAAAGGATATTATCACAATAACAAACAGTAACTG:1 - chr3R 22043506 3' - Burdock 6139 2 76.24 TTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGCACCAAACACTCACACACACACACATAAGCACATACAC:1 + chr3R 28335238 3' + hopper 1378 1 56.44 TCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATGATTTGAATGTGAATTGGAGTGGCTTTGGTTAGTTACGTCTATTTTTGTGCCGAGTGGGTGTGGTTGTGTAGGTGT:1 - chrX 12648261 3' - accord 7052 2 56.44 ATTATATAACTTATATTACATACATAGAATGTATACATATTGAACGTATTAATTAAAACAAGAAGCTGGAATTATGATTTAAATTTCTTATCGTAACTTCC:1 + chr2R 8642993 3' - Doc2-element 4693 1 75.25 CCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACG:1 + chr3L 24210969 3' - HMS-Beagle2 35 2 61.39 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCTACTAGCCCAGTGCTTAGTTCTTTTGTCAATTGTCATTTATCGAGGTGGACAGCT:1 - chr3R 30641756 3' - hobo 20 1 44.55 ATCAATAATAACAAAAAAAAAAGCGAGCAATC:1 + chr2L 4085143 3' + BS 5096 1 90.62 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTGGGTCCCTATTTTTCTCTTTTATACACTTTTAGATGG:1 - chr2L 11084344 3' + blood 7354 2 60.40 AAAATGCATTACAATTATTACATGGTATTCAGAATGCGTGTAGTTCCATTACTTTCGGCAAACAAGCATACATACTTTCTATTTGCCTATTTATTCACAAT:1 + chr3R 20240973 3' + Tabor 7324 2 64.36 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGAGTGAATTAGTTCTAATACGAA:1 - chr3L 19066100 3' + roo 9019 2 76.24 ATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGTCCAAGCCAGCGCCATAGAAATAGAGGATGAACTGGACGAAGAGGACTCCTGCACTCCTGA:1 - chr3R 1585013 3' + Doc3-element 4552 1 60.20 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGCATAAACAGATTTAGAGTCGAGTGCCTGGAGCGAAGAAATGCTG:1 + chr3L 18523663 3' - 412 7083 2 61.39 GGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATACAGGTGCCTTAAATTCACTGCTCG:1 - chr3L 23342571 3' - Max-element 51 2 79.21 TTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTACGGATTGGCA:1 + chr3L 5573578 3' - mdg3 48 2 68.32 CATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACGTAAGAGTTTTTGGGCCAAATTGCCTGCA:1 + chr2L 9129182 3' + 412 447 2 68.32 CCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATATTTATTGGATGTGGAGGCTTTGTGGAGGTCGTTTTGGAGTGGTCATCTCAATAAGTGTCAGTACAG:1 + chr3L 3551817 3' - Quasimodo 7053 2 66.34 GTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCCATATTTCAATTAAAA:1 + chr3L 15869740 3' + pogo 2085 1 63.37 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTCGCCTCTGCCTTTCTTGTTGTGCCATCGTCT:1 - chr3R 28326441 3' - P-element 20 1 47.37 AAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAAACAAAAAAAATGTAACAACGGAGCACAAAACACAAAAAAA:1 - chr3L 10576760 3' + roo 9067 1 68.32 CCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGTAAAAACCAAGTTATTAGTGCAATAATTAGGAGTGATTTCT:1 + chr3R 19445590 3' - diver2 4695 2 59.41 AGGATCAATAGCCGAGTCAATGTAGCCATGTCCATATGTCCGTATGAACGTCGAGGTTTTTTCACATGATTGCGCATAGAGAGTTAAAGAGCCATCAAGTA:1 + chr4 873750 3' + INE-1 96 1 62.38 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGCCCGTCTGTGTGCCGGTGTATGATGCCATTTATT:1 - chr2L 9672422 3' - 297 37 2 66.34 CGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGA:2 + chr3R 10736116 3' - McClintock 29 2 61.39 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGAGCTTCATCGTCCTTTTGCCCCGCCCCTCTG:2 + chr2R 18374836 3' - 412 43 2 71.29 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATGTACTCCACATTTAACAAATATACGTACATGTGCGTTCAACATAATAGGTC:1 + chrX 5178884 3' - hobo 23 1 55.45 ATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCTTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAAC:1 + chr2R 4677355 3' - invader3 5202 2 64.36 TATCGATATTCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTGCGGCTGCTGGCCAGCGACAGCTCCATGGCCACGGTGCGTATACTTGACGCG:1 - chr2R 24206212 3' + INE-1 503 1 56.00 TTTTTTTATTTTTTTTTTTATTAGAGTACAAAATTGTTGGTTTCTTTTTTTCGCTGTTTTTTTGATATGCCCTTACATGGGGTAGTGTAAAACTAGAAACT:1 - chr3R 6583384 3' - Rt1a 5078 4 54.46 TACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCTGATTAATACATTTTCCGACAAACGCGACGAGATTGCACTCTTTATC:1 + chr2R 992304 3' + mdg3 49 2 56.57 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGAGCTGCTGTCTG:1 + chr2R 22746114 3' + hobo 2930 1 67.74 CCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCCGTTGGAGTTCGGGCTGGTGCTCCCAGTCAAGCCGCGCGACTCTTTCGCATCGGTTGTCGCCTGTCCGCG:1 - chr3L 17421469 3' + P-element 2885 2 77.00 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTGCATGCCCCATATGAGGGCAATAAAAACAAGAAGTGCAAA:1 - chrX 14617651 3' + hobo 2936 1 61.76 AGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGACCCTAATGCAAAAGGGGACCGCCTTTAAAGGCGACAAAAA:1 - chr3R 20189488 3' - TAHRE 10411 1 61.05 AAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAAACAAACAAAATGTAACAACGGAGCACAAAACACAAAAAAA:1 - chr3L 10576760 3' + roo 9067 1 70.30 AAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCACGATGTCAAGTGGTGGTTTAGAAGAAAAATAAGTAAAAGGGC:1 + chr2L 19848784 3' + 1360 376 1 59.41 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGGTGACTTTCTTCACTCCTGCAAGTTCGTCGCTTTTTGCAAAGGTCCTGCGCACGGCTGCCCAATTCCTCCAT:1 + chr2R 15402945 3' + roo 405 1 75.25 AATATCGGGATCCCTGCGGCCTCTAAAGCGTCAGCGGCAACGGAGGCTGTGGCGG:1 + chr3R 3382153 3' + gypsy8 323 1 61.82 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTGATCAGTATCAACAGCCTGATATAGT:1 - chr3L 15869665 3' + pogo 2059 1 73.47 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTCAGGAAGAGAGCGGCAGAGCAAACTAGTGCCTAAGTAACAAAAACAACTAAATAAGTTGAAATCACACAACA:1 + chrX 3295707 3' + hobo 2936 1 70.71 AAACAAATTAACAACAACACTTGGAAAACGAGAGGGGTGGCAACTCTGGCTGGGGGGGGAATCCACAAAGGGAATATGCACTAGACAATATGCAATGTTAG:1 - chrX 9449746 3' + Penelope 630 1 75.25 TCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATAATCAAGTTGTTAACAATTTCGATGCTTTCGATCATAAAGTGTATACACATGAATTTTCTTTAAT:1 + chr4 716996 3' - INE-1 153 1 76.24 ATCTAGACGTTCATACGGATAGACGGACAGTCGGACAGACGGACATGGTGAAGAATGGTGAAGAATGTATATACTTTTTATAGTTGGAAACGCTTCCTTCT:1 - chr4 836649 3' - INE-1 131 1 47.52 GCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATGACCCATGTTGCCAGGCCCACTCTAACGCTTCAAACCGCACAAAGATGCCACGCCCACACTTTTGATAAATGTGTTGA:1 + chr2R 5212080 3' + INE-1 169 1 64.36 GAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTTGCAAAGATAATTGAAGGGTATGCATGTATTTGCTCCCAAATGCATACTTGAATTGATTTATTCCAG:1 - chrX 18975528 3' - diver 5901 2 66.34 ATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGGCGACATATATATATGTATCTCAAATCATTTAAAAACTTGCATCACTAACGGGTATTTCTCAGTCGTTATC:1 + chrX 16906763 3' + invader4 3070 2 63.37 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAGTATATTAACTAAAATCTCTACTGCCGCTCTCCAGCAATTATTTTATTCGAGTGTAGGCCTGTTTCAGCTTT:1 + chr3R 6138351 3' - 297 6582 2 65.35 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTGTTTACAGTCATTGCTACAAATTGACAAATTCGCTGTC:1 + chr3R 28135332 3' - hopper 36 1 59.41 GAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCTACTACTATCACTCTTATAAGCGTAACTAATGGGTCAACCAAATACAAAGTACGAAA:1 - chrX 20805491 3' - INE-1 571 1 56.44 CTTTATTACATATTATTATATATATGTCGAAGAGTCATCAGGATGCAAGAGAGGTGCACCAAGAATGGTGGGTTGGAGGGTTTAGAACCTGTTCAACCAAC:1 - chrX 5008560 3' - Dm88 31 2 55.45 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTCTACATTTTATTGTATTACAAAGGAATAATCCTCC:1 - chr2R 10945030 3' - 297 38 2 70.30 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCATGAGCGCTGATTTTGCGCCACTTAAACTTTAAACGCAAA:1 + chr2L 9624609 3' - transib2 34 1 57.43 TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTT:1 + chrX 21945931 3' - F-element 39 1 56.00 GTTAAATTTGTTTTTATTATTGTAACGTTTTTCAATTGTACCTTGAGTGGAGCTTACAACTGTTTTCGTTGCATAGTTCTGGATGAAGAGCAGGTCCCAGT:1 + chr3R 23597599 3' + 1731 4266 1 54.46 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGATCGATTTCCGATTTGTTTGGCTTTCGATTAGGAGGAGACGGA:1 + chr3R 31418638 3' + roo 9038 1 58.42 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAGGAATTTCACATGTTCCGAAAAAGTGATGGATGTCGAGCTGAATATTTGGACTCGGTTGCACTT:1 - chrX 7019169 3' + hobo 2927 1 67.00 CATTGCCCCATAGTTAACATCCATATGTCCATATTGGTTTTATGTGTAATAAATAAACCTAGGCCATGAAGGTGTCGTGCGGAGCTGATCGTTTACAACGA:1 + chr2R 5537370 3' - Doc4-element 2608 1 59.41 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTGCAAACTGAGCAAAAGGTTTATGTACAC:1 - chr3R 12055054 3' - Doc 52 1 76.24 CGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGTTAAGTTTCAATCGAGCTGCTTCGAA:1 + chrX 4304305 3' + roo 9019 2 77.23 TTAAAACTATAAGCATTGAACTTATTTCCAAATTTCAATGCTTATAGTTTTAAAAGATATAACTATGTTCAAAACAACATATGTGGGTTTTTTTTGATAAT:1 + chr2L 18616653 3' - Bari2 1006 1 74.26 CCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTACATGCTACTTACAAGCCAAAGCGCCTATATG:1 + chr3R 11089215 3' + I-element 4881 1 68.32 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATATATATAAAATCGAGGCAAAAGTTTAGACTACAAAACACCTACCAACTTAAATTAATTGCAACG:1 + chr3L 14854783 3' + mdg3 236 2 69.31 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCG:2 - chrX 17492889 3' - Tirant 32 2 60.20 AAAGGTTTTTATTGCATTTTTTTGTTTTACTAGAAGTACCAATCTTCTGTGTGTATTAATAATGGTAAAAAGAGACAGACGCTACGGCAAACCGATGTGCA:2 + chrX 8659243 3' + Tc1 309 1 66.34 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTACGGATTGGCATA:1 + chr3L 5573580 3' - mdg3 5298 2 66.34 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACATTTTCCATTAAATTTAAAGCTTTTTCTATTTGCTTCTGGAGCACAACATGCCGTGGGCC:1 - chr3L 18523575 3' + 412 7531 2 65.35 TGTGTAATAGTCTGTACCCAGGGAACACCACGGGGAGGCCATTACAATTGTAATGGTTAGGGAAGGCCTCTATAAGCAGGCCGAGCGCTGGAAGCGGAGCA:1 - chr2R 554189 3' - 1360 2917 1 55.45 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGTCTGTCGCGCAATAAAACCGCCCAATTGGTGC:1 + chr2L 7056403 3' - P-element 42 1 37.62 GTAACGGGCATCTGATAGTCGGGCAACTCGACTATAGCATTCTTTCCCCATTAAGTCAATAGTGCGTTCTTTTTCCGCGAGAGTGCTGTGGATTCCAGTAC:1 + chr3L 23690240 3' + INE-1 551 1 65.35 TTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACTGAAGTCGCACACCCGCCGCCGCCGCCGCCAAAGTTGAAGAAAAAGAGCGCCGGACTATCCGTAGGCCTCTCTTTTT:1 + chr3R 13996031 3' - Tc3 238 1 79.21 TATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATTTGGTTGAACGAACACACAAGCTCTCTGAGCAAGCCGTTGCAACTCGTAGCGAGTCACTTCGTTACAT:1 + chr3R 3077303 3' + Juan 4196 1 78.22 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGGGCTAAAGATCTTATATGCTTTGTTGGTCAAA:1 - chr3L 21393466 3' + roo 9029 1 68.32 AAAATGTGGGCGTGGTAGTTTTGGTCGGTTGTAGGGCGTTTATTGGCAAAGCAATACAAATTTACAATTACCACTCTTAATAAAATCCAAATTGGAAAACT:1 + chr2L 11943369 3' - INE-1 245 1 48.51 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAG:1 - chr3L 25884085 3' - Doc 36 1 55.45 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGTATTATTCCGTAGAAGATGTGTGTTCAATAAAATCTGTAAATATTTTACCCAACATAAAATAGTCTCAT:1 + chr2L 9284455 3' + flea 5009 2 69.31 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGCATATACTACAATATCTCATCTTTGGCTATCACTTTGTGGGTGCATTGTTCAAACTTAAAATT:1 + chr3L 5321200 3' - mdg1 7066 2 51.49 GAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCGTATAGGTATGTGTGAGCCAAAAACCCTTTTTGGCCGAGCATCTTCGTCTTCGTTTGGCCTGCACCATTTTTATGT:1 + chr3R 28979086 3' - accord 185 2 80.20 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCTTTGCTCT:1 + chrX 13640291 3' + P-element 2838 1 31.68 CTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGAACTATAAG:1 + chr3R 1977620 3' + micropia 425 2 54.00 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAG:1 + chr2R 17348618 3' - jockey 32 1 54.55 TCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCTCCGATTTTTACTAGTTCGTGTTTGGTTTTTGAATTGGTGAAAATTTGCGTTTTCTCTGGGGTGAAGTGGA:1 - chr3L 8002279 3' + Cr1a 8 1 63.37 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTCATTGACCCGCTGACAAAATAACGC:1 - chrX 5132270 3' + I-element 5305 1 73.27 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAATACTATACATTTGAGTTAAACAAATTGACAAAGACGTTCACTTTCCTCATCTA:1 - chr2L 21777911 3' + mdg1 7434 2 53.47 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACCCACTTCGACTAGGGTGTTCCACTAACGTTGCCTTTGCTGTTGCCAGTGTCGCCATCACCATCGCAGTCATCG:1 - chr2R 22676442 3' + 412 491 2 72.28 CCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCCAGATCCGAACAAACACAATAAAGCATCAAACAACAATA:1 - chr2R 6143038 3' + Stalker4 141 4 61.39 ATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTATTTGATGTCTAATGAAGTTGAACCAA:1 - chr3L 8041287 3' - invader4 2806 2 67.33 TGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAGCATGGGTCAACAAACTAGAGCTGCTGCGATGTCCGTATAATATGTATGAAAATGAAATTAGTT:1 - chrX 20897731 3' - INE-1 215 1 51.69 AGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATAGTCGCTCTAGAAAAAT:1 - chr3L 7733842 3' - flea 4761 1 70.37 TTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACATATACAAGTATTAAGCATAGTCAGTTCAAGCTCACCCCATTTTATGGAATGACAAATAC:1 - chr3L 26315776 3' - Tabor 6855 2 63.37 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCGTATTGAATGGGCACGAGTCGAAACGGAAAATCAAATATCTGACTGACACGCAACATCAACTGTCAATTAA:1 + chr3L 10161914 3' - hobo 5 1 68.32 AATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTCAACCCACCGCAATAACATA:1 - chr3L 23796087 3' - Cr1a 74 1 78.22 TTAATAATATAACATAAATAAATCAATTTTTAAGTTGATTTTCTACGCATTATTAAAACTAATTGAAACTTAAGCTTTATAGTTACCAATTAAAAATGGCA:1 + chrX 14826769 3' + Doc3-element 74 1 35.64 AAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAATGAAAATGAAAAACCTCACACATACAAACAACAGCCACAGTTAAAAGTAACGGTGAGCAGAGGAGGAAGTCATTTT:1 + chr3L 9169875 3' + gypsy7 5009 2 65.35 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGCATAAACAGATTTAGAGTCGAGTGCCTGGAGCGAAGAAATGCT:1 + chr3L 18523662 3' - 412 7084 2 62.38 CAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCC:1 - 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HMS-Beagle2 6899 2 63.37 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATATATATGTGTATATTTTTTTTTTTCGATGAAGTGTAGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAAC:1 - chr3L 14854675 3' - mdg3 5262 1 61.22 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAGTGAATTATTTAATCGT:1 - chr2L 18417297 3' + roo 9044 1 54.46 GTTGAAGCCTTTTTTTCATGGATTGGACAAGTTTTTGCAGCAATTGAATAAAACTTTTTCTCACATTAACTTCAAAGATGTTTGTTCGCAGAAAAATTATG:1 + chr2R 9951994 3' - S-element 1382 1 66.34 TAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCTTCCTTATAATAAATTTCAACAAAAACACAAATACAAATTTCAA:1 + chr3L 15898639 3' + I-element 4895 1 56.00 GATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTTATTAAGCGAAACTCTAGGCACATATTGTGGATATTAAATCCAA:1 - chr2L 12904169 3' - mdg1 7431 2 64.36 CGATTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACGTCCTCTTGTTTTCGCTTCCATTTTCGTTTTTAGAGGGGGGTGAAAAGTGGAAGGGGCTGGCGGTTCGGTT:1 - chrX 18146947 3' + INE-1 548 1 60.40 AAGAAGGCGTTGTCAGATCAAAAAATAAACAAAATCCAAAACTCAATTTGAATTCAAAAACCACCAAAAATGGTGCGTGCTTATCGCCTTGCCTTTTCCTT:1 + chr2L 11340725 3' + transib4 2520 1 66.34 TCGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCA:1 - chr2R 4860117 3' + micropia 4989 2 66.00 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTCTATGTGGGGCTGTTTATGTGCATTTAAATAATACATTTTT:1 + chr3R 6097660 3' + roo 9037 1 60.40 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCTTACGATCCACATGCCTGATATCTCTTGGCAAAACAG:1 - chr3R 14835210 3' - roo 8702 2 66.34 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCATAATTTGCGTCTATGGGATGCGTAGCATA:1 - chr3L 19437217 3' - jockey 4696 1 51.49 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTACATTTCTCATTAACATTATCGCAAAGCCCATGCAGGGAAATACCAACTAAAAC:1 - chr3R 7102400 3' + pogo 2083 1 56.44 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTGAAACAAACGTTTTTGTTTCACACACACAGGGCACAAAGGGAGAAGATATAGAAA:1 - chr2L 3842823 3' + roo 388 2 58.42 ACACGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTATCAAGAGGGAAATGTATCTAAAGGGAAAAACGCGGGCAGATAGAGAGAAAGGGCAGATGACATTAGTGCTG:1 + chr3L 1405410 3' + mdg3 5099 1 70.30 CAGTGAGGCATCACAACTATTCATGTACATACATATGTATGTATGTGGTACACGAAACTCGCCATGCAAATGAATGTTTTGAGAAGCGCAGAGAAAGGCAT:2 + chrX 18975669 3' + diver 223 1 44.55 ATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGCAACCTTTTGTGGATTTACTACTCAGCGAATTCAAAGGCGTCTTCTTAAAATTTATTGTAATTTTAAGTTA:1 + chrX 22768643 3' + Idefix 7275 2 73.27 GAAAATAACTTCATGTCATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAAACGAGTCCCCGGGGAAGGAGCAGCTTGCAGCCT:1 + chr3R 30559203 3' + mdg1 6994 1 65.35 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGAAGTCCTTCTATGCGGATTATGTTATAATGTTGCACTGGAACCCATCGCTCTCCC:1 - chr3R 16110161 3' + mdg3 5476 2 56.44 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGTGATTATCTTATTAAGTATGGTTTCCACCGAA:1 - chr3L 4539164 3' + roo 9031 1 66.34 ACCGAAGATATTTCAAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGCCATAGATTAGCGACCAAGTG:1 + chr3R 17529572 3' + roo 9017 2 78.22 CGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGTGTGAAGAACCTGTTTTAAGGATTAATTGTAGAG:1 - chr3L 24206612 3' - F-element 4465 1 66.34 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAACTTTTATGAGTATGCCTAGAATAACGTCGCCCAGCGTAATATCGT:1 - chr2L 7190106 3' + pogo 2073 1 56.44 TGATGGGGTGAGGGTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGAGGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACAGTCAGTCAAAATGGTTTTCTCTTGGCCAGC:1 + chr2R 12092949 3' - Idefix 221 2 68.32 GTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTCTCTGCCCGTCAGCAGCTGCTGGTACTGATTCCCCCGCCACTGCGGTTATCATT:1 + chr3R 22513746 3' - Quasimodo 15 2 64.36 ATGCTGACATTACACAAAAGTCGAATTCATCCCTTTCGGCCAATTTAACAAACTGATAGAGCTCAGTGTATGAGATGTGATCTCCAGCGAGGCCTTTAAAA:1 - chr3L 18203191 3' + Tirant 8223 2 79.21 CGATTAAAGGCTCGATTGACCAAAAGTAAAACACCCAAAACTAAATATATAAACTATAAATGATAAACGAAATTGTACCTTGAGAAAGTCCAGGCAAAACT:1 - chr3L 19066424 3' - roo 432 1 77.23 GTGAAGCAATTTGTACTTGATTTTGTTGACTTCGCGTGAGGTTTTCTGTTTTATTTTAATTCTTTTTTTATTTTGTGTTGAAATATACCCCTTTTGCATAT:1 - chr2R 941027 3' + accord2 7235 1 82.18 TAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCCGTAAACAATTCGCAAAATAAACAAGATCATAAAATAAACAAACTTTCTTCGGGAATAAAAATGTTACAGACCCAGC:1 - chr2L 23068229 3' + diver2 262 2 76.24 AAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTGCTATATATACAATACATAC:2 - chr3L 24210877 3' + HMS-Beagle2 7189 2 73.27 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTT:2 + chr3R 19513390 3' - jockey 4717 1 75.25 TAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTTCAATGCATTCAATGGCGGCC:1 + chr3L 20862872 3' + hopper 1363 1 77.23 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGTGTGTGTGCGGTGTGTGTGTCAAATTTAAAAGCATTCTTGCCAGTTGCCTT:1 + chr3L 17691401 3' + 1360 3365 1 54.46 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTACATATATGCAAAACCAGAGAATGTAATGGTGTTTCCAAA:1 - chr2L 10029090 3' + 297 6941 2 68.32 TTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGATTTTGAATGTGTTGTCACATTCA:1 - chr2R 1727273 3' - Stalker2 146 6 76.24 GTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTCAGGG:1 - chr2L 23372501 3' - gtwin 6916 1 79.21 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTAATAAATTATGCGCTCTATATGCA:2 + chr2L 3483557 3' - I-element 50 1 72.28 TCCTTGAGTTGGTTACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATTGAGATGATTAACAGTCAGGCCGGAGTGCCTGATAC:1 - chr2R 3481231 3' - Juan 471 1 71.29 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACT:1 - chr3L 8044304 3' + mdg1 405 2 60.00 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTCATCATGAGGACATGACATCGCATCGA:1 + chrX 5131031 3' + I-element 5307 1 71.29 AGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCC:1 - chr3L 5267242 3' - Juan 4028 1 78.22 TTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAGGGGCAGAGGCAATTGGTCCCAATTCGACATAAATAATAATCAATTTGA:1 + chrX 7493504 3' - copia 175 2 55.45 CGGATCTATTGTACTACCCCTTCATAAATGTTATTGGGGTTCAGAGCTGCAATAGTTTCCCGTGAAATTTAACAACTCGCCGAGGAGCAAACTCGAATGGG:1 + chr2R 14710456 3' - baggins 5392 1 64.36 GGAGCGCGTTTTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTACAAGGAATTTGAGTAGGTGTCTCTCCA:1 - chr3L 23979455 3' - F-element 356 1 70.30 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCCATTGTTTGCCATTATCCCGCTAAATGGAAA:1 - chrX 17416920 3' - roo 8695 2 66.67 CGTTACGCATCTTTATATTCTAGTGACGGCAGAGTGCGCGCGAGAAGCGAAGCCATAATATTTTGCGAGAATGAGCGATAAACCACTACATCCATTTTTAA:1 + chr3R 3620775 3' - 1360 10 2 76.24 TATTCTAGTGTCTTTGGTAAAATTGTATACAAGATGGCTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCGCAACGCCCCTTCGTGCGTACACGTGGCG:1 + chr3R 4509767 3' - Tc3 237 1 62.38 ATACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAATATACACAAAGTGCTAACT:1 - chr2R 17942081 3' + mdg3 5472 2 53.47 AGCAATGTATGGCCCTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACTCAACTAATAAAAGCACGCGACTACTATCCCCGAATGGGATTTCCTCGTT:1 + chr2L 21388989 3' + 1360 3366 1 64.36 GAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTT:4 + chr3R 10736119 3' - McClintock 5978 2 58.42 AAAACAAAAAGAAAAAAAATATACCCTAAAAAAAAACATAGAATGATTTAAGAAGCATTCGGCCACATTTTCCACCAATCGCATTTGCCCAAATGCTCAAC:1 + chr2R 20377709 3' - Tc3 86 2 59.41 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATACTAAAAACATCATCGTAAAATAAAATAAAATCACACACTAAGGCGCCAAATTAGCGCGGAGCATACCATTTTTTTC:1 - chr3L 8256077 3' + jockey 4970 1 50.50 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTGAGTTCTATGCATTTTCCACCACCACCAGCAAGTAGCGAAGAATTGGCCAGGGAAAAACT:1 - chr3L 9293651 3' - mdg1 17 2 61.39 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTA:1 - chr3R 3920676 3' - I-element 45 1 74.26 GCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCT:1 + chrX 21668060 3' - Tabor 47 2 70.30 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTGATCAGTATCAACAGCCTGATATAGTTTGTAC:1 - chr3L 15869659 3' + pogo 2062 1 68.32 ATCGTCCTCCAGTAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTCCCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGTCACATATCTTTAAAGGTTTTAAAGCAT:1 + chr3L 20224195 3' - Chimpo 58 1 77.23 TTAAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCACAAACGCACAGTTGCACATTCGTGAAAATGGAAAAGAGAGAGTTGTCGTGTGACAGGAAAAGGATGC:1 - chr3R 4609006 3' + invader3 126 2 64.00 ACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGATGGGTGTTTTGGCCACGTGAAGGAAAGCCGCTTATGTGCTTGAAA:1 - chr3R 26855261 3' - copia 4832 1 54.46 ACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAGGAAGATACGAATACAACTTCCAAATAACTCCCTGCATTCTTGAGATTAATTGGTATCAAGA:1 - chr3L 27863824 3' - rover 8 2 72.28 CTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAAGGGACGAGAATACACAAAAATTACTGACTTGGCAGGCATATTTTTGCA:1 + chr2L 14718313 3' + mdg3 5043 1 52.48 CGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGCTCTCAAAATGCTGGCAGCAGCAACCAAAACCAAAGCTCTGGCAGC:1 - chr3R 17158924 3' + Quasimodo 193 2 57.43 TATTTATATTTATGTTGATTATTTAAACATTTCCATGTTCCCCAATTTTTCCGGACACCGGTGTTGAGTCCGTGTCCTGGCTGCCTGGCCGAAGGTGCTGG:1 + chr2R 3464340 3' - 1360 2954 1 55.45 ACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACACAGGCACAATAGCTCAATCAGTTCAAGTGCAATTTGTGAGGAAAGTCGGGGCAAGAAAGCAGCA:1 - chrX 4352747 3' + Quasimodo 47 2 68.32 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTCTGCTTGATTATGTTGATTAAACATGGTGCTTGTGGATTAAGTGATTAAATGCCAAAGT:1 + chrX 12166612 3' + pogo 2090 1 66.34 ACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACAAAGCACGGGGTATCAGAAAAAAAAATCAAAATGGTTGAAAATGAAACTTTGATGAGCTATTACTCATATTGACAAG:1 + chr2R 12248773 3' - jockey 249 1 66.34 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGGCGGAAATGAATGTTATTTATTTA:1 + chrX 21219509 3' + roo 393 1 65.35 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACTGAAGTCGCACACCCGCC:1 + chr3R 13995975 3' - 1360 55 1 81.19 AAAATCGTATGGCGTTNCGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTGGATGATATCTGACTTTGACATGAGCAGCTATAGGATGCAGTCACATTAATTGAT:1 - chr2R 23596403 3' - 1360 22 1 57.43 AGTTGATATAAAATATTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGCAATTTCTCCTGGCATTGAGCGGGTGTTTG:1 - chr3R 26200752 3' - jockey 4842 1 60.00 ACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGATTCATTTTTCATTAAAAATGTATATCCAGTCTTTTTACCTTCTGAATCTTTTTTGCAGGCATTT:1 + chr3L 18948973 3' - Juan 14 1 61.39 AACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCAGTGCCGCCCGCAGCAGCACACACGGTCCCCACATCTTTCCTTGAAATATCCT:1 + chr3L 24208775 3' + HMS-Beagle2 109 2 59.41 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCATATTTGGGATTTTACAGAAGCAATGTTAAGGGGTCGAC:1 + chr3L 3535423 3' + roo 350 2 79.21 TATTGCATAGGCACATACTACAGTACAATTTGTTACAAGTTGACTAGGGAAAAAGCTCTGCCTGTATCAGGTAATCAGTCTTGACTTGACTGCTGGCAAAG:1 - chr2L 9129096 3' - 412 1 2 78.22 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGG:1 + chrX 21219472 3' + roo 9041 1 72.15 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATAGAAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCA:1 + chrX 6485952 3' - 297 3 2 75.25 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGG:3 - chr3L 8044327 3' + mdg1 376 2 68.32 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATACACTAGGCTAGGGGAAGATAACTGTTGCATATCCAGAGGCGTCGGAAGCCGGCATGCAATTATA:1 - chr3R 10957250 3' + hobo 2928 1 61.39 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAAAAAATAATTTTTTGCTTTAAA:1 - chr3L 3402718 3' - S-element 75 1 86.67 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAACACTTGTCGCCTCTTGGCCATTATGCAACGACAGC:1 - chrX 19887082 3' + P-element 2848 1 42.57 TTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCCAGCCATGCCAGTCTGTCCGTATGAACGTAGAGATCTCAAGAAAGTGAAAGCAAGCAACGGTGGGATTAC:1 - chr2R 5439294 3' + INE-1 87 1 67.33 GAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAAATGCGGCAGACGACCCACACAAAGCATCTGTGTAGACATTTCGTTTTGTAAA:1 + chr2L 19623158 3' - Burdock 6159 2 56.44 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTT:2 - chrX 3446519 3' - I-element 28 1 57.43 AGCTGAGATTCAACGAATAAAGACTTGAAAACTATTTATCCGATAATTTTTTTTCTGGTGGCTAACTACTTCTGCCACTGCCATAACCGCATAAACGAATG:1 - chrX 22578695 3' + 297 6870 2 54.46 ATTGACGCTCTCACAGCTTCAATGTTCTCTCTCACAGGTCGAGGGACTGACATTTTCCCTCTAAGTTTGCTGCACTATTGCTATAACGACGCTTTTAATTG:1 - chr2R 6502991 3' - mariner2 363 1 54.46 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTTCTTTATTTTGCAAGGAAATAAAGTGAAATGTGTATGTGAAGAAGCCATAAAACTTG:1 + chr3R 14991770 3' + hopper 1400 1 64.36 AATGGAAAATCTATTAAAATGACTTATATTTCACTCGTAAATTTCAACAAAGATTTTTTTTGCGTGTACGATGAATGGAGCCGAAAGAAAGGGTGCAAAAG:1 + chrX 22694472 3' + Burdock 249 2 70.30 TAAGAAGGTCTAGAGGGTTGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGGTCGGGGGCCCTTCAATCAGCTGTCAAATGAAAATGTCAAAATATCAAAAGTGAAAA:1 + chr3L 11418016 3' - I-element 5100 1 67.33 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCTTACGATCCACATGCCTGATATCTCTTGGCAAAACAGAGCTCATACTC:1 - chr3R 14835199 3' - roo 8691 2 55.45 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGGTTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAAACAAACAAAAT:1 - chr3L 10576789 3' + roo 9038 1 58.42 GCAAAACAATTGACAGCTACAACAACAAGCGGAAAATAAGTGCAACACACAGCAACAAAATGCCGGCATCAAGTGGATTATATCGCATCAAAAATGGCCG:1 - chr2R 18007108 3' + Doc4-element 391 1 52.00 TTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGACTAAAGTCTAATGGGTTTATACTTTATTTTTTTGTTTGGGAA:1 - chr3R 11912104 3' - I-element 77 1 58.42 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGTAGCCCCTCGGGCACTCGAGGATTAAGCGAGCGAGCTACAAGACTGAACACTG:1 - chrX 21219412 3' - roo 8684 2 60.40 GCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACCAAAATGAAGAGATTAAATTTAAGATATTTGCATTCTTAAAGATCTTGTTTAATTCCCCAAGGAATGTCCTC:1 - chr3R 20240846 3' - Tabor 6 2 69.31 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAATCTTCGCCTTTAAAACCAATCCGTTTTGCAGGCACTTAAAAGGTAATTTCCCAAAGCCACTTTG:1 + chr2R 17697325 3' + pogo 2095 1 62.38 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAAGTTTTGTTTTCGGACT:1 - chr3L 4692272 3' + P-element 2829 1 24.75 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAAATGCGGCAGACGACCCACACA:1 + chr2L 19623127 3' - Burdock 6190 2 80.20 TATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGTTGGCGGTGATTTACCC:1 - chrX 3446498 3' - I-element 7 1 70.30 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGCATAAACAGATTTAGAGTCG:1 + chr3L 18523639 3' - 412 7107 2 85.15 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTC:1 - chr3L 25884067 3' - Doc 18 1 56.44 AAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAAATACAAATTTGAAGCTAGGCAAATGGAAAATCAT:2 + chrX 16502938 3' + Porto1 206 1 66.34 ATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTGCGATCGATGGGTTTGGAGGGGTTTGCGTG:1 + chr3R 17555684 3' - mdg1 201 2 70.30 GTGTTGGTGGGTTATGTCTGTGTGTCCTAGTCCAAGTCGTATTAGATTATATACGGTAATCAACTGGAGACTGAGCTACAACATATATTTAGTTACCGTTA:1 - chrX 10790348 3' - I-element 4961 1 58.42 CTAACTATGAGATGCATGACCCTTACATAGTATTATGTTCTGACTATATCTCATTATCCCATTATCTGTAAAAATTGAGTATGACAAGTATGATAACTTAT:1 - chr2L 22999417 3' + Cr1a 4164 1 70.30 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTA:1 - chr3R 3920676 3' - I-element 38 1 72.34 TTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACATTTTCCATTAAATTTAAAGCTTTTTCTATTTGCTTCTGGAGCACAACATGCCGTGGGCCGTCTCGA:2 - chr3L 18523568 3' + 412 7538 2 72.28 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCAGGCTATATAGTTCGATTGATCAAGTGCAGGATAGTATCGTGTT:1 - chrX 3060128 3' - FB 34 1 59.41 AGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTT:4 + chr3L 24210992 3' - HMS-Beagle2 6895 2 65.35 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAATCCCTATTAATGCCACGCTAGGCTTAAAACTAAAAAACCATTTTCTCCTTGCT:2 + chr3R 7879901 3' + 1360 3367 1 57.43 GCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATTTTATATATCCATCTAAATCCATATAATATAGCCATCTAAAAGTTTACGCTGGAAGGGTCATTATAATATTATCCA:1 - chr3R 15130440 3' - Max-element 8234 1 72.28 ATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAAAAGTTCAAATTAAAAATTCTCGAATCGTGTTCAATCGAGGAATTCCATCGCTCTGTCCGTGGATTCATT:1 + chr3R 15121100 3' - McClintock 289 2 76.24 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCAGGCCGTGTTATCAAGAACAACAACAACTATTGATGATAGTTTT:1 - chrX 13640237 3' - P-element 32 1 46.53 ATTTAATTTTATTTTATTTTTAAAACAGATCTCTCTGTTATTGGTACATATTTACCAATGCCTTTAAGCCTGTTTCTATCCCATTTCGGGCTGTTTATTCT:1 + chr2R 15153871 3' - NOF 3958 1 85.15 CAAGGTATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACC:1 - chrX 19820626 3' - Rt1b 4970 1 61.39 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGATATATCTCCATTCAACTGCCAGCTCGATTTATTTACACTTCGTGATGAGTACGTCCTCG:2 - chr2R 9214047 3' - Transpac 12 2 67.33 TCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTCATTTTGGTTAAGACAGAAAATGTTAACATTATTTTTCGCAAAATTATACAATTCTTAACCTGTCGGGAA:2 - chr3R 13620241 3' - Doc 10 1 66.34 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGTCCAACATGAGCTTATGTATCCGTGCACTTTTAGTTGAGG:1 - chr3R 2556045 3' + 412 457 2 62.00 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAATTTTTCATTCTTACCTTTGTTTTGGGG:1 + chr2L 13598247 3' + pogo 2056 1 73.27 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCAGGCCGTGTTATCAAGAACAACAACAACTATTGATGATAGTTTTTTTTT:1 - chrX 13640232 3' + P-element 2860 1 51.49 TCTTTTCCCTTTTTTTTTTGTCTGTCACATTAGCGACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGGGTTGTTGTAATGAAAATA:1 - chrX 7480759 3' - Bica 339 1 64.36 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAAACTTATTTTTTTTTTGCATTTAGTTTTTAGCAAAAGAGTTCGGAATGAGCATCTGATTC:1 + chr3L 4909413 3' - hobo 14 1 63.37 ACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCTCATGAATTATGCTAGCTCAGTTAGTAAATCCCTAGTAACTACAGCTGCATTGGCAGTTAATA:1 + chrX 12403623 3' + 17.6 7309 2 65.35 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGC:4 + chr2R 17348592 3' - jockey 61 1 81.19 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCA:2 - chrX 17492871 3' - Tirant 17 2 64.36 GGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGTGCAAACAAAAGGCAAAGTCAAACAAAACATAACAAAGTGCGGTGTGTACGGACTTTGGTCAAGGAAACGGGGGCG:1 + chr3R 17816605 3' + flea 4609 1 78.22 ACAGATTGTAATTTAAAGGAAAAAATAATAAAAAAAACAAGTAAAGCTGAGTAAACAGCGGCATTTCAATGGCTTAAATGAAATTCAAGCTCATTTCCATG:1 + chr3R 9489194 3' + Porto1 4660 1 77.23 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACGGATGTCCTCCTGGATCCGCTTTCCTCCATTTTAATGCTTCGCCAACAGTGGAATCTAATTAGCATTTCA:1 - chr3L 10161795 3' + hobo 2933 1 65.35 TGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTTTGTAGCATTGGCGCACGGGCGGGCATAAGGTAAATGTGAAAAC:1 - chr3R 21591953 3' - Bari1 32 1 58.42 TTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCAAAGAGAAAGCTGAAATCATGAGAACGCTTTGGTCGA:1 - chr3R 5369209 3' + P-element 2624 1 37.76 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTACGTGTGGATAAATAAAACGGTGGCAAGATGTGAAGAATTTTTTAAAGCATTCTTGCGACCTT:1 + chr2L 9854209 3' + hobo 2928 1 65.31 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGC:1 + chr2R 17348624 3' - jockey 28 1 54.46 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTCGATTTTTATATGTTGACTTCATCATCGCTATTTTTTCCTGCGCGCTTAACCCTACTCGATTTTTT:2 - chr3R 4718171 3' + flea 5008 2 72.28 ATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTGGCTAGAAAGGAGTGCA:1 - chr3L 9190425 3' + 412 496 1 77.66 ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTATACCTTTTATACCCTTTGCACAATATACCCCACTCTTTACGATTGGCGGGCACATAAATGCAGAGT:1 - chr2L 5654812 3' + roo 9061 1 66.34 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGTCATCACATTATGAAATTTTGGTGTTGGTTTTGCATTGAGTATCTCTCTAATCTGTA:1 - chr2R 9258577 3' - blood 21 2 56.44 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAATATAGGCTTCGTCTCCTTCTTTACATTCGTTATCCAAAAGCAGATTCGGTAGTCGTCGCA:1 + chr2L 21266658 3' - FB 16 1 64.36 GAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCTATAGTCTTCAATGTAGCAT:2 - chr2R 10552683 3' - INE-1 558 1 90.10 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCATCTTGGCCAGCTCG:1 + chrX 19034203 3' - hopper 11 2 68.32 TAATAATAATAAAAAAAAAAAGAGGGGAAAACCAATTTACAGATGGGGTCTCTTGG:1 + chr3R 23304703 3' + Rt1a 5074 1 50.00 AAAAAAAAAAACAATTAAAATTTTCAAAAATGTTTGACACGCGTACGCACACACCAACACACACGGAGACACATGCATGTGCATAAATGGCAATATGGAC:1 + chrX 5341459 3' + transib2 2645 1 65.00 GAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGGAAGTATCAAATAAACCAAAGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATATAGTACCCCTAC:1 - chr3R 1977611 3' + invader2 5015 2 79.21 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTAATCCAAGTATCATTGCAGGTATT:1 - chr3R 3920653 3' - I-element 22 1 53.47 CATTGGGTTGGCACTATGCAGCCAGTTCTGAACCTGCTCATTACTACCTTTAGCATAGTGAAAGCAATACGTCGAGCACGCACTGGTGTTTCGTCTGTAAG:1 + chr2R 4939458 3' - 1360 3351 1 40.59 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATTATTTGGAAAATGCGTCTTGCTTATAATT:1 + chr2L 11084383 3' - blood 7054 2 73.27 GGGTGCCGCTCACACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAGTTGAATTTAAGATTCATACCATCAAAATTTGTTTTATCATAAGAATCGAGTGCACACA:1 + chr3R 29439946 3' + hobo 178 1 62.38 TTTTTTTTCTTTTTTTGAATTTCTGTTCTAGGGGGCGAGGTCTGGTTTGTTTGGGGCTCGAGCAACCCAGCAATAAGAGAAGAACAC:1 + chr2L 16509183 3' - Doc 4699 3 90.80 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGTATATGCACACGCACACATACGCAGGCAAT:1 - chrX 5178816 3' + hobo 2894 1 70.30 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGC:1 - chrX 9816261 3' - BS 5023 1 60.40 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTG:1 + chr3L 19274871 3' + transib2 2790 1 61.00 GCGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTT:1 + chr3L 24210992 3' - HMS-Beagle2 6891 2 68.04 AAAAAAAGAAAAAAAGAAAAATCGTACACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 16487134 3' - hopper 143 9 75.00 GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGTGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATGTATATAATCCCAAAAACTG:1 + chrX 22664410 3' + opus 447 2 80.20 GTCCCTGTTCGGGCGCCATGTAACGTGTACTACATATAGAAGCCCGTACAATAAGTTCGCCATTCTATTTTCACAGGTTAATCTGCCGCAGACCATCGGCA:1 - chrX 6124577 3' - HMS-Beagle 262 2 72.28 AAATTCGAATTTTTAAAATTTGCCTAAGCGAACTCAGGACTTGCTTTTAGTTTCAGTTTCGGAAACTATGCATTTCACTAATAACTTAATTGTCAACCCCA:1 - chr2R 14214815 3' + FB 24 1 90.10 GGAAGAGGGCAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCAACAGCTAGTTTGTTATTTGTGATAAATTATTCAGTGATCCACATTTCGGATCCCGATC:1 + chr2R 14278622 3' - mdg3 5261 1 61.39 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCG:2 - chr3L 9190460 3' + 412 7507 2 63.37 TATTTGTGACTTAACAACAAAATGTACAAAGTTTATAGTCTGTAGCTCAATTTAATAAAAATGATAGGGTAAAAATTAACTGAGACATAGATCTAATTGCA:1 + chr2R 2127369 3' + transib2 2751 1 61.39 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTCGACTGCCTCGTAATTGCCAGGGGGAAATTGAAATAGATGCCCGATAAT:1 + chr3L 15729682 3' - hobo 27 1 52.48 GTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATATATGTATAATGGAACAGACAAGTTGTGAAC:1 + chr2R 18078760 3' + Quasimodo 7330 2 74.26 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAA:1 + chrY 3648875 3' + HMS-Beagle2 277 2 79.21 TTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCACCCACAAACAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACCATTCAAAATTTATTGCTACAAATAA:1 - chr3R 3625629 3' + Max-element 248 2 72.28 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGCCCAAAGAGAGCAGGATAGGAGCA:1 - chr3R 28135285 3' + hopper 1365 1 74.26 GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATTTTATATATCCATCTAAATCCA:2 - chr3R 15130489 3' - Max-element 8288 2 79.21 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCGGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACAAATGAAATGGCCCAAAGGAGC:1 - chrX 5168822 3' - hobo 8 1 71.29 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGCATAAACAGATTTAGAGTCGAGTGCCTGGAGCGAAGAAATGCTGG:1 + chr3L 18523664 3' - 412 7081 2 60.00 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATTTTGGTTTATATTATGTTGGCGCGTGCATGAAATAATGCA:1 - chr2R 3545480 3' + HMS-Beagle2 7160 2 62.38 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAGTGAATTATTTAATCGTTTAAAAGAAACG:1 - chr2L 18417285 3' + roo 393 1 63.37 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATGTAGAAAATATGTAGAAAATTCTTTACCGTGTAGTTAACCCACTAAAGCCCCCTTCACAAAT:1 + chr3R 30562380 3' - mdg1 15 2 56.44 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACACAGACAAACAATATTTTCGGGCACTCCACACATAA:1 - chr2L 11534368 3' - copia 41 2 65.35 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGGCGGAAATGAATGTTATTT:1 + chrX 21219504 3' + roo 9051 2 60.40 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCA:1 + chr3R 28333580 3' - pogo 42 1 70.30 CGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTAATAGCTTATCTCCATCGT:1 - chr2R 17402737 3' - invader4 2812 2 77.00 AGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGTGCGATATACTCGTCCGCCCGCGGGACACGGACCAAACAC:1 - chr3R 20486348 3' + accord 7346 2 61.39 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAAATAAAAAAAATAAAAAATGCAGCGTCGCGCAAAAATGTGCGACACTAGGGCTCTATTACC:1 + chr3R 4546102 3' + jockey 4968 1 55.45 ACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGCACTCTGCATCTAATCCAATCTAATCCGTTTCG:1 + chr3L 21920856 3' - Doc 4254 1 67.33 GTCCTTCCATGTCCTTCGGGCTTCTTGCCGCCAGACGTTTCCACTGTTCGTTATTTCTGGTTGTCCTCCTACCCCTGCCACCCCCCTCCACCTCCTTCTTA:1 - chr2R 11607153 3' - gypsy8 497 1 54.46 TAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAATATACCCTATGAATAATGTAAATGAAACCCAAAATAAACATCGAATAGCAGGTAATTTTGGCGGCGTTCAA:1 - chr3R 17896509 3' + Stalker 6934 4 72.28 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTAGGGTGGTAACTCGCTTTGTTGATTAGTTAATTACACAGTTGATTAATATCTTAAATGCAGC:1 + chr2L 13642755 3' - Tirant 32 2 53.47 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTTCTTATGTTTTTATCAATACAAATTTCTACCAAATATTTTCACG:1 - chr2R 20506811 3' + mdg1 7430 2 54.46 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTT:1 - chrX 17492896 3' - Tirant 42 2 68.32 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATACATACATCAAACATTGGGGAAGGCATAAAAA:1 + chr3R 5429652 3' + roo 361 2 71.29 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGC:1 - chrX 5168863 3' - hobo 49 1 70.30 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGTTATATACAAAACATTTTTGAACGGCTTCTAAATTTATACAAAAATTACAAAA:1 - chr3L 18978444 3' - roo 8686 2 55.45 TTCTTTTTTTTTTTCTTTTATTTTGTATTTGTTTTGGAATGAATTCTCGTTTACGCATCGAAGAATTATTAACAAGAACTG:1 - chrX 11836293 3' - gypsy7 5009 6 67.90 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCAAAAACTGAAACTAACTGAAACTGAGAAATTGAGTTGCCAGCGAA:1 + chr3L 10576859 3' - roo 8679 2 58.62 TAATAAACAGTGGAAGCGTCGGGCGGCAAGAGGCCCGAAGGAGAGGAGAAGGAGAAGGATCTGGCGTGCCTTAAAGGGTCAGTGG:1 - chr4 145868 3' + gypsy8 467 1 49.41 CATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGAAGGAACGGCGCAGTTTAACGAGCCGGCGAGAGTCTGGCCATGTTTATTGATTTACTCGCTAATT:1 + chr2L 14486115 3' + Quasimodo 7282 2 77.23 TTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTTGCTGGGTACCGTCGTCTCTCCTGCATGTACTCATCCCTCTCCTGAATGGCTATATCAAATGCTTCAT:1 - chr2R 965315 3' - I-element 398 1 68.32 AGGTTTCACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATCTGTTGACTCCGTTGACTCCTGTGCTTTCTGAGTTGAATTGGTTTCT:1 + chr3L 27413568 3' - Transpac 4816 1 53.47 TTAAAAAGCGTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGACTTCACTA:1 + chr3R 435948 3' + 1360 3019 1 53.47 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCCTTAATCTGCACATGTGTACTAGTAAAACGAGTCTGGTTTTTTGGAGT:1 + chr3R 13167394 3' - roo 27 2 54.46 TCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCCCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCGTAACTTTGAGCTTTGTGTGTGGAAAGCAACTAACCTGGAA:1 - chr3R 11079911 3' + I-element 17 1 57.43 CTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACGATTGGTGGCTAACGAACTCTCGT:1 - chrX 157182 3' - I-element 1 1 76.24 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGAGCTTCATCGTCCTTTTGCCCCGCCCCTC:1 + chr2R 18374834 3' - 412 45 2 73.27 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAATAATGTTTAACCTC:1 + chr3R 19515864 3' - 412 7092 2 63.37 AGTTTTAAGAGTTTTCTAGCTTGTAATTCGTTTTCGGTTTATATTAACAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATGTGTGGTGTTGGTGTCGTAGTCAACT:1 - chr2R 642118 3' - I-element 410 1 74.26 AGACGATTTTCGGGTCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACAGGTATGAAATATTAGTGGATATCGAATATTGTTTAAGCTAATCTGTGCGTGCACGTCCA:1 + chr3R 3748758 3' - 1360 3188 1 66.00 CTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTGATCAAATTTGTGACAGCATAAAAAATTACGTTTTTGAAATTTTACGTTGCCGCTTTTTAGGCGTCGCTGGCA:1 + chr2R 17277652 3' - jockey 12 1 54.46 GTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTTTAAATTTACCGTGGCCTTTAAGTGTCACACCAGCG:1 + chr2R 14434336 3' + invader4 3051 2 63.37 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAGGGGAGTTCATCATTACAGCGTGACATTGATTGGCATTGAGTTGGGCGTAGGCAAATGGGCG:1 - chr3L 15056925 3' + 412 458 2 58.42 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATCGTCGAGCAATGCAAAGCCGACAATTGAGATTACGGAGTGGCAGCTCGAGTTGCTCGGG:1 - chr3R 30263532 3' + roo 397 1 66.67 TATAGAAAAGAGAACAGAAACGATGCTAAGCTTTACAACAAACCATAAATACAAGTGGAACTCACACATAGCCTAAATAAATACCGCTCTCTCAAAGACGC:1 + chr2R 4330278 3' - Cr1a 4348 1 78.22 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATAGAAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACAT:1 + chr3L 13306248 3' - 297 8 2 70.30 AAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTATTTGGGGTTGGGGAGCAAAAGGACATGTGACACAAACAGATGCCAGG:1 - chrX 5168595 3' + hobo 494 1 58.42 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGACTGCTTGCAAATACAAATTTACGGTCCTTACTCCAAATGATTCTCTTCGGCGTCACTTAACCGAAGT:2 + chr2L 21778012 3' - mdg1 7045 2 73.27 GTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTGGTGAGTGTTATATTTTTTATTGGGTATTACACAGGGAAGAAGTTTAGGTA:1 - chr3R 7752189 3' - I-element 4983 1 54.46 ATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACCCTTATTTATGTTTTTTCCAGTATGCCCCTTATTTTAGGCACGCCCT:1 + chr2R 25216605 3' - 3S18 5797 2 59.41 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 19513405 3' - jockey 4702 1 60.40 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAATAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATTGAAGCACAACGGATTGTACGGATTGGCATATCGGT:1 + chr3L 5573585 3' - mdg3 40 2 59.00 GCTCAACTGTTTGCGCGCTTCTGGCGTGAACAATGTACTTCCCACTTATTGCAAATCCAAGCCAGCTTGGTTATTGACTCAATATTTGGGTTGCTTTTCCT:1 + chr2L 16758351 3' - Max-element 11 2 68.32 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCA:1 - chr3R 19515823 3' + 412 440 2 78.22 ACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAATAACTACGATCCATTAAGAGCTTTTTTTT:1 - chr2L 9459776 3' + Stalker4 7009 4 77.23 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAATAGTTTCTGCATTAATAAATCATTTACTTAATTTTCT:1 - chr3R 21581118 3' - roo 40 2 70.30 TAATGGAAGTGGCTGGGTTGGGCCCCCCCAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCA:1 - chrX 10196082 3' - 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hobo 17 1 60.40 AGATTATCAGATACCCGTTACTCAAAATGGAAAAAAATAGACGTGGTAAGTCGAAAGTGGAAAAAGTAGGAGTAAAGGAGCCGGCGCCATCTGTAGATATC:1 + chr3R 13468414 3' - INE-1 550 1 76.24 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAAT:3 - chr3L 25884098 3' - Doc 49 1 68.32 CCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGACAGCTAGCTTTTAGCCATACACGTAAAGAAAAAATAAATGTAAATGACAAGGGTGCCCCAAGG:1 - chrX 5107933 3' - accord 258 2 61.39 GGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTGGGAAATAACGAACAGTGGAAACGTCAGCGGCAACGGAGGCTGTGGCGGCGTTGG:1 + chr3R 3382159 3' + gypsy8 444 1 67.09 TGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTTCCGATGGGATCACAATCCGAGCTGCGATGCATCTTTAC:1 + chr2L 9670491 3' - 297 6788 2 61.39 GGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAATTACAAATGTTTATTAACGGTA:1 + chrX 23280962 3' + R1A1-element 5065 1 56.44 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCATCTT:1 + chrX 19034193 3' + hopper 1394 1 58.42 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCATAAAAATGGTAGGTTTATCTA:1 - chrX 18161465 3' + roo 9018 2 80.20 TGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACGATCAAAAAAAACAGGACAACGCAAGAGTTGGGAATACACGAGTTAAGGATGGAGGATCTCAAATTCAA:1 - chr3L 27415013 3' - Transpac 302 2 74.26 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAAGGCGC:1 - chr2R 22746045 3' - hobo 44 1 67.33 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTTGCAAAGATAATTGAAGGGTATGCATGTATTTGCTCCCAAATGCATA:1 - chrX 18975548 3' - diver 32 2 52.00 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGC:2 + chr3R 23870125 3' + roo 355 2 77.23 GTATACTTCGGTACGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGGTATTTCATCATGCGCTAGTGTAATTAGTGCTTATTGAGTGGGGATAGTGCATTCAAG:1 - chr2L 479328 3' - P-element 35 1 44.55 TTGACTATTGATCCTGATCAAGAATATATACATATACATAACTGTTACATACTTTTTCAGTTAACTAACGCAAACTTTTGCCAGAATATATACATCTATAT:1 - chrX 12249751 3' - INE-1 89 1 53.47 TAAAATCGCCGCTTGAATTAGCTACCGTTGCTTAAGATTGCATCAAAATATTATAATGTGGAGAACAGAAAAAACTTTCCGTTAACGTCTTAAATATTAAA:1 - chr3L 24759179 3' - 1360 2987 1 71.29 GTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAAACAAACAAAATGTAACAACGGAGCACAAAACACAAAAA:1 - chr3L 10576762 3' + roo 9065 1 68.32 CTTCGAGTATAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTACTGTTCTTTTGGCCATCGTTGTCCGCCGCCTG:1 + chr3R 6116581 3' - Max-element 44 2 63.37 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCATAAAAATGGTAGGTTTATCTATTT:1 - chrX 18161462 3' + roo 9021 2 77.23 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAATCTAAAGGCGACCAGCAAACAGGTTCGAAGCGAGAGAGCCAACTAGCCAAATAATAAACAAAACGGA:1 - chr3L 14205309 3' + P-element 2880 2 72.28 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCCAGGTGGCTGATTCTCTAGGGGGA:1 - chrX 19034093 3' - hopper 12 2 65.35 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCACCCATTCCCCACCCATTTGGCATTGCAAAATTAGTGCAAAGCAGCGCTGCAGACGTCGGCAGAATCGC:1 + chr3L 18793093 3' - P-element 6 2 73.27 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACAATTTGTTACAAGTTGACTAGGGAAAAAGCTCTGCCTGTATCAGGTAATCA:1 - chr2L 9129120 3' - 412 25 2 54.46 CTGCCGGCTACGTAACGACATCTGGTCTAATGTACGCCCAGAATTCATGGTATGGGCTCAC:1 + chr2R 4132128 3' - gypsy2 6569 2 63.93 TAGGTGGCAAGTACGATTCATAAACTATAATGGGATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCATATCGAAAAGAAGTGGGTGTTACAAACAAAATATTTGC:1 + chr2L 21585224 3' - Rt1b 5076 1 61.39 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTTATGGCTGGCTAATAGTGACAACAAAAGTACAGATTTA:1 + chrX 10298062 3' - Quasimodo 27 2 62.24 TATTGGAATTCTAATTAACTACATAATAAAGTGGACCATGAATTAAACCAACTACCCTTGAATATATAATATTCCTAGAAACAAGGTCAGAAATGAGCAAC:1 + chr3L 735133 3' + mdg1 7458 2 73.27 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGG:2 - chrX 21668006 3' + Tabor 7293 2 54.00 TTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTTGTGGTCTCGCCTATGTTTTCATTTTCCAACTGCCAAGTCGGCATGCCGAGGCAAT:1 - chr3L 494612 3' - Transpac 4936 2 62.38 AAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCCTTCTGCGTCGACGGCTTTCAGTTT:1 + chr3R 5555959 3' + mdg3 196 2 72.28 ACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAGTTTGCCATAGAGTAAACAATTTTATTTTTGTCTACCCCTTTTTTTT:1 + chr3R 19531139 3' + 412 98 2 54.64 GGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGATTAATTACAGAGAAAAATGCACTCATTGCCATAAATTACCTTAATTATTCAATTAATATTTTTCTA:1 + chr3L 4639285 3' - 297 6587 2 73.27 ATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTAGAAGTGGAAAAATAGAAAAGGGGAGCAGGATAGCGAAAAAGTAATCA:1 + chr2R 17348187 3' - jockey 4871 1 53.47 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTCTAAAACACGACACAATGCTTCGGAAATATAAAGTACTTGC:1 - chr3L 12258196 3' - roo 8699 2 62.38 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGG:1 + chrX 21219475 3' + roo 359 2 74.00 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTAACCGTAGAAGCAACAGCCATAAAGTCCGGCTGATTGCAAACAATTCCGATTGATTTATTGTGGCAA:1 + chr3R 22494791 3' + 1360 3380 2 71.29 CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTGCAACAGTTTCTTTTAGAAAATTCCCTTTTTTTGTGGG:1 - chr2L 11559941 3' - copia 4917 2 71.29 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCAGGCCGTGTTATCAAGAACAACAACAACTATTGATGATAGTTTTTTTTTTAATTTTGACATTTTTCGGTTTA:1 - chrX 13640210 3' + P-element 2884 2 73.00 CTGTGAGTAAAAACAAGAGACGTGCGTGTTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGAAGAAGCAGAGGCAGCGACGCCACCGTCGCCGTCGCAGCGGAGTAGCTGCC:1 - chr2L 16485678 3' - 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chr3R 6097604 3' - roo 42 2 67.33 GGCATGAACACACACACGCACATTACCATAAGAGCACAAACACACACTCACTCATACACACAAACACACACACACACATCGCGAATCGTGTATTTGTGCTA:1 + chr3L 9787620 3' + accord 7024 2 86.14 CGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAATCCCTATTAATGCCACGCTAGGCTTAAAACTAAAAAACCATTTTCTCCTTGCTGTACACATTTTCTCGAA:2 + chr3R 7879918 3' + 1360 3384 2 74.26 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGGATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTT:1 + chr3L 23871310 3' - Doc 45 1 60.40 CGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGCAAACGATCGCGGTCTTGCTCACCAATGCTTATGAATGCACGAAGTTTTCTAAAGCTTTATCGCTTTCACTCA:1 - chr3L 24080440 3' + Doc3-element 345 1 71.29 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGAAGAAACTGTGCAAGTTTTAAGCTAA:1 - chr2L 9624558 3' + transib2 2776 1 73.27 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAGTATGTACTTGCTTATAGTTTCTTTTAAAGCTTACACGTTTATTTTTTAAGTGCATGACTGAACTTAGCTGA:1 - chrX 8303373 3' - flea 4758 1 74.26 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGCTTTATCGCTATACTTAT:1 + chr3L 16661628 3' + P-element 2830 1 22.77 TAGCTTGAAAGAAACACGNCTNCACCNGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGT:1 + chr2R 1725944 3' - Doc 30 1 55.45 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCCATATTTCAATTAAAAGAATTCA:1 + chr3L 15869747 3' - pogo 9 1 70.30 GATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTT:1 + chr3R 10736141 3' - McClintock 4 2 74.26 TATATTCTTGGTCATGATCAATAGCCGAGATGATCTAACCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAG:1 - chr2R 1751257 3' + INE-1 83 1 87.00 TTTATGTTCACTTGCTCTTACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTCTAGGAGTTTTTGTTTTTTGGTTATTCTTTTTTGTTTGTTTTCCCTTTTTTTTG:1 + chr3L 9177402 3' - I-element 453 1 63.37 CTTGCTCTCCCTCTCTACCTGCTTCGGCTCTCAGTCACCCTTTCGGATATCCCGCTTCAGCTCAGGCTAAAGATCTTCGCTGCCTCGGTCGCCGCCGACTG:1 + chrX 13543543 3' + Doc 385 1 77.23 AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAAC:1 - chr3R 11151797 3' + mdg3 5491 2 72.28 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGCCCAAAGAGAGCAGGATAGGAGCACGAGGATGCG:1 - chr3R 28135275 3' + hopper 1375 1 64.36 AAAAAGGGGCCCCAAAACACGACAACAACTCATGGCTGCGATAGTCGAAGAGTGGGAATTCAATTAAATAAACGAGAGTTGCAGCCAAAGAAGCCGGGGT:1 + chrX 21092849 3' + S-element 1285 1 58.00 GGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTATCTGACCGGCATTCCGGCCAACTCGTACAGTCCGTACTACACAACGGGACAC:1 + chr2R 17352173 3' + jockey 429 1 57.43 GGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCA:1 - chr3L 5267240 3' - Juan 4026 1 76.24 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAA:1 + chr3L 3535441 3' + roo 9032 1 64.36 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGAAGTCCTTCTATGCGGATTATGTTATAATGTTGCACTGGAACCCATCGCTCTCCCAGCAGGAATTAGCCCATTTCACT:1 - chr3R 16110138 3' + mdg3 247 1 79.21 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCACCTCGTTTCTTTTTCTTTTATAAAAAAGCATAATGTGTTATGCTCTAGTGC:1 - chr3R 19515772 3' + 412 491 2 76.24 GTGAGGGTAGATACACTACATTGGATTTGAATTGTGTGTGTTATGCACGAAATTTTGATATTATTCTTATATTTGGAAGTTCGGGGTTGGGTTGTCGTATC:1 + chr3L 24238911 3' - Stalker2 7247 1 78.22 AACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGCATTGCAACTGCTGTTGGTAGCAGCACTGAATCCCTAGCTGTAGCTGTTGTTGGCCTGCGGTCGCCGTAAC:1 - chr3R 8499383 3' + Tabor 7318 2 73.27 CTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTTCCTTCCCGCCTATGTACAGACCTCTAACCTACCATACAGTTGGAGAAAAAAATTGCGCTTCGGATTTT:1 + chrX 13847935 3' + Max-element 8328 2 63.37 TACTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATTCTACATTAACGCAAAGCAATAATTATCATATTTGTCTTCTCTTTCGA:1 - chr2R 7009421 3' - McClintock 5975 2 57.00 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGTACAAGAGGTGGGTAGGGGGCCCTA:1 - chr3L 19173555 3' - transib2 49 1 78.22 GCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCAGTTTCGTCGTTTCTCTTCTATTCCTTCAATTTTTCTGCTCACTTCACCCAATTGTACA:1 - chr2R 3550132 3' + invader4 3051 2 46.53 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAAGCACCATATGACACCACCTTGACTCATTAATTATG:1 - chr3R 28297351 3' - hobo 41 1 68.32 TATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATATATATGTGTATATTTTTTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACG:1 - chr3L 14854691 3' - mdg3 5281 2 52.48 AAAGAGGCAGTCGCTTATGTTTTTGAAGTCTGCATAGATTTAATCAACTCCATGAAATTTTTGCTTTTCGATTCTAATAATGCTGATCACTCGAGAGGTCT:1 + chr3L 17874120 3' + hopper2 140 1 79.21 AGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCCTAGCCATCTGACATTGAAT:1 + chrX 5168886 3' + hobo 2891 1 75.82 TGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCT:3 - chr3L 24210918 3' + HMS-Beagle2 265 2 70.30 AAAGAAAAAAAACAAAAAAATGAAAGTATTTCGATCAGTTTTGCCCAATTTTGCCAAGCTAAGCTTTGTTTGAATTCAATTCAGTATTAATATCGTATTTT:1 + chrX 16461727 3' - hopper 142 2 69.31 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGTGTGTGTTCATCTCGCTTTCCCGGTAATTTTCAGGTGGAAAGAAG:1 + chrX 9649971 3' + blood 345 2 57.43 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGAATATAAAACAAAGCGTGAAATCTATTTGCAACTGGCGAAACGGGGCAGCAAAA:1 + chr3L 21998491 3' + roo 9052 2 59.41 TTTAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAGTTATACAATGATCATGTGTTTTACTTTGTCGCAGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTA:1 - chr2R 6271493 3' + rover 7180 2 78.22 AAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGAGGGACGTTTGTCGTGTGCGTGATGTGCATGAGCGAAGCGTCATTGCGCCTTAAATG:1 - chr3L 16758846 3' - I-element 4998 1 56.44 GTAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTTTGCTTTAGAAAGCGTTGACTATTAACTTGCCCTCAGCTG:1 - chrX 17491284 3' - Doc 114 1 64.00 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTATGTATATAATCCCAAAAACTGGGGACAAAAGAGTAGTGGAATGTTTGTGCCTCGGAA:1 + chrX 22664446 3' + opus 483 2 64.36 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGCTAATAATGTCTGAAAATTCGTAGATTTAAACAAAC:1 + chr3L 920540 3' + mdg3 5460 2 63.37 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAATTTCCCAAAAACAAACAAAAT:1 - chr3L 10576789 3' + roo 9038 1 60.40 ATATGTATGTATATATATTCATTTAATAGAATAAAATAGAAATGATACAAATAGCGATAGCTGGATAAACAGATAGATGGATGTTTGGAATTCGTGTGCAC:1 - chr3L 14446888 3' + 1731 4413 3 55.45 ACGGTGGTGCGGCGATCCTTGTTGGTTCAATCATCTCTCATCAACTGTGAAACCAACTAAAGAACCGAGGGCCTAGCCTACAACTCTGAAACCAAGTGAAG:1 + chrX 22731242 3' + G5A 206 1 63.37 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCAGTTTGTTACATAATCAGCAGAAATTTCAT:1 + chr3R 23870159 3' + roo 9053 2 60.40 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACGA:1 - chrX 157204 3' - I-element 22 1 55.00 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTTCTTATGATCGAAAGTTGATATAATTTTCAA:1 - chr3R 18144472 3' + blood 333 2 70.30 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTCAGCTATGGCCGGCAGAGAACAATCAGTTTTCGCTTGGCCCTTGCTAGTTGAACTCAGTCGGTTGGG:2 + chr2L 19962703 3' + 297 6970 2 76.24 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATTGATTTTCCTCGCCGACTTTCCCACAGCCCATCCGCTGCCGATGTGCCGCATTGTGGTGGCAGATTCTTTTTT:1 + chr2R 14135500 3' - roo 8666 2 77.23 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATA:2 + chr3L 23456277 3' + 1360 3380 2 66.34 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTTAGCTTCCTGAAGCATCTGCTTACGCTCTTCGTCCAACTCCTATATCTAAGACTAC:1 - chr2R 4974891 3' - 3S18 5787 2 57.43 CTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAATTTAAGAGTTTTAAGAGTTTTCTACTTCTGGTTGGTTTTGTTTGGTTACAAATATAATATATCTG:1 + chrY 308956 3' - I-element 497 1 67.33 GAGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGCAAAGGAAAGAACGAGAAATTTCAACATATATGGTTCCTTCTACCTGTTACATACTTTTCAA:1 - chr2L 21902497 3' - INE-1 558 1 64.36 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCACGGCATCCATTTACCCAATTTGTT:1 - chr3R 23582123 3' - jockey 4791 1 75.25 AGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTGTTGCTCATGAAGTTTTTAATGTATTTTATTATTTCGGGCCTCTTGTCTGA:1 + chr3L 9172395 3' - Doc 4539 1 49.50 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGG:1 + chrX 21219475 3' + roo 359 2 72.28 TCGACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGAATATAAAACAAAGCGTGAAATCTATTTGCAACTGGCGAAACGGGGCAGCAAAAGTTTAT:1 + chr3L 21998497 3' + roo 395 1 65.35 GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTAATATACT:2 + chrX 21668099 3' - Tabor 8 2 71.29 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCATCACTTTTTTCAAAAGTTAAATTAAAATACTT:1 - chr2R 22751158 3' - Doc 48 1 66.34 GCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGAACTATATGTAGGGGTACTATAA:1 + chr3R 1977619 3' + micropia 424 2 55.00 GCCTTATGAGTGTTCATCTTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACGAATTAGATCTTGGCAACAGTAGAACAAAGAGTATCGGCGAT:1 - chr2R 4675438 3' - invader3 5191 2 46.53 TCGTGGACCCTCCTGGCTCTCTCAGATCTTCTGAGCTCGGTTGTTATTGCAGCTTGCGAAGCAACGAAACAACGACAGTATGCGATACTGTCCTTGTC:1 - chr3R 2465676 3' - Rt1c 5282 1 53.06 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCATAAATTGCGAACTTTTTTTGAAATCATTCTCTCCAATC:1 - chrX 18181664 3' + pogo 2064 1 66.34 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTTTTTTTTTTCACGTAACCT:2 - chr3R 11080663 3' - I-element 4 1 74.26 ATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTGCTATATATACAATACATACACT:1 - chr3L 24210874 3' + HMS-Beagle2 7192 2 76.24 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGGTTTCTTAAGATACAAGTGCAACTTTTGCGGACTATAAATATGCAAAAAGTATGAGTTTAAA:1 + chr2L 10189529 3' - roo 13 2 63.37 CACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTAACTATTA:4 - chr3L 25884057 3' - Doc 8 1 66.34 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAA:5 - chrX 157219 3' - I-element 38 1 61.39 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGCATTGCAACTGCTGTTGGTAGCAGCACTGAATCCCTAGCTGTAGCTGTTGTTGGCCTG:1 - chr3R 8499396 3' + Tabor 466 2 60.40 CTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTTACTACAATGAAACCTTTTCCCTCTTTTCTATTCCCTTCCAGATCGTTTTGAACTCGATGC:1 + chr2L 5465891 3' - flea 4933 1 66.34 ATATTTCAAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGCCATAGATTAGCGACCAAGTGCACTACT:1 + chr3R 17529579 3' + roo 9024 2 71.29 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTAGCCAGCGAACAGCATCTACATATTAACGTTACGGATATTTTCC:1 + chrX 22597229 3' - hopper 32 1 56.44 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTA:1 + chr3R 19513393 3' - jockey 4714 1 72.28 TTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGCAACAATTGAAGGCGATCCCGGGCGTTTAATTTCTGGAGGAATTAGCCGCAACAACAAGCAATTCCGCC:1 - chr2R 2338603 3' - copia 9 2 70.30 GACGCTCTCGACGTTGAAATTAACTGACTGCCTGACTGACGTAACCTGGCAACCGAAACGTGAACGAATCGAGAAACACACTGCACTTGGAATTTACATAC:1 + chr2L 8106073 3' + accord 226 2 78.22 AATATTTAACAAAAAAGAAAAAAAAAACTTTCAGTTTTTGAAGGCATACAAAAGAAAACACAATATTGAGGTAGGTCGTAATTTGGGCATGTTAACCATAA:1 + chr2L 18418075 3' + TART-B 10630 2 49.50 CAGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACCAAAATGAAGAGATTAAATTTAAGATATTTGCATTCTTAAAGA:1 - chr3R 20240875 3' - Tabor 35 2 55.45 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACGAAGAGCTAACAAAACCAAACGATTCGGAAAATAAATGCAGACCATGCATGCTGGGGACAAGAAACC:1 + chr2L 11560018 3' + copia 248 1 70.30 GTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACG:3 + chr3L 23678149 3' - Osvaldo 24 1 76.24 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTT:1 + chr2R 1725932 3' - Doc 41 1 62.00 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAATCGCAAAAGTCGCCCCATTCACCACTCGCTGGAGCAACTTTC:2 + chr3L 12217401 3' + roo 400 1 67.33 CGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTA:2 - chrX 21564099 3' + invader4 3044 2 65.35 TTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGTGGGATATTTAATCCATCAATTAGTGATTTAGGTAGAGCCTATTTTAAAACGTTTTAAAGCCTGTCGGCACAATA:1 - chr2L 17693923 3' + hopper 445 1 77.23 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGTCCAACATGAGCTTATGTATCCGTGCACTTTTAGTTG:1 - chr3R 2556048 3' + 412 453 2 65.35 CCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACCAGACCATGCAAATTAAATATAAAGCCTACAAAATGATTCGATTTCACAGACCTGGCCTTGATCCCAAG:1 - chrX 15176901 3' + I-element 4892 1 74.26 GCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACGAGCGTGTATATGAGCTCTGTCAAATGTATCGACCGAGT:1 + chr2L 17311143 3' + S-element 1678 2 67.33 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGT:1 + chr3L 12217356 3' + roo 354 2 75.25 TAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAAACGGGCAATCCACATATGTAAAGCCAACT:1 - chr3R 12977942 3' + invader2 51 2 70.30 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTACATTTCTCATTAACATTATCGCAAAGCCCATGCAGGGAAATACCAAC:1 - chr3R 7102406 3' + pogo 2077 1 53.47 TACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGG:1 - chrX 21668015 3' + Tabor 7283 2 63.37 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTGTATTTAATGAAATTTTATTCGTAGCATTCCCCTCCAATCTCGGCAGCTCCTCAGAGCCTGCTTTCC:1 - chr2L 12888785 3' + 412 7537 2 69.31 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGCATTATTCATGCTTGTTAAATTTATTAATTGACCTTCCCCCTGAGCTCACACCTCTGCACCTCCCATTTG:2 - chr3L 14558228 3' - 297 5 2 75.25 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTATATGTACTTTGTGTTACGTAAACTCATTATTCCCCAGCACAGAA:1 + chr3L 4539227 3' - roo 29 2 59.41 AACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTGCGCCCAGGGTTGTTCCTGACTTGTCCAGGGTTGCCAGCTCTTTCTCTGGCCATTTGC:1 + chrX 20829026 3' - G2 219 1 63.37 TCTCTTTCGCTTTCGGATTTTCTATTTAGTTTATTTTTTTGTTGGGCTTTGACTTCATTTATGAACAGCTTTAGTTTATTTTAAGGATCCTAGCCTAGTTT:1 - chrX 5069835 3' - F-element 108 1 66.34 GGTGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACT:1 - chrX 17492867 3' - Tirant 8120 2 68.32 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTCGCCTCTGCCTTTCTTGTT:2 - chr3R 28326453 3' - P-element 57 1 23.76 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAA:2 - chrX 157211 3' - I-element 30 1 52.48 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTAGGCAAGATGAGTCTTTCGATTGGAAAATGCTCCAAGGATATGAGGT:1 - chr2L 1530401 3' + roo 9044 1 55.45 TAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAA:1 - chrX 12866461 3' + hobo 2909 1 56.67 TGTGTATATAAACGTTACATCAAATGCTAAAGTTACATTTTTATTTCTATTTCTATTTATTTCAATGCTTTCATTGTTACCGCCTCCATACCCCTCGCCCG:1 + chr3R 11031788 3' + accord2 397 1 66.34 TACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATACAAATTTTTATATGCAGTTCCAACAATTACGGCCATTTAATGTTAGCACTTAAT:1 + chrX 22590229 3' + Burdock 235 2 57.43 AAGGACAGATCAAAATTAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATAATTGAACAATGAACTCGAGTCTTG:2 + chr3L 1259871 3' + mdg3 196 2 70.30 ATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGATGGCAACACTCTTAAGCTCCAATTTTAAGAGTTGCTTGAGGCTCAGTGCAGCAGGCCCAGTGAC:1 + chr3R 4503574 3' + blood 156 2 69.31 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCCCGATGCGTGCCAACGATTTGTGAATCGCAAAAGTCGCCCCATTCACCACTCGCTGGAGCAAC:1 + chr3L 12217397 3' + roo 396 1 63.37 CCCACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATAGTGTCGAATAATATCAGGATGAGATATGAGTGGGTTTTATGGCGCGACAACAGATGTGTTCTAGAA:1 - chr2R 15903903 3' + HMS-Beagle2 7089 2 70.30 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACAGTTTGTTTGCGGCTCGCTCTCGCATAAGGTTACATATTTTTTAAGCCAATTTTACAGGCCACTGCCTA:2 - chr2L 12911221 3' + mdg1 415 2 72.28 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATCGCCTAAGCAACTATTTAACTATCTTCTGGTGTTGTTGTTGTCGCTCGATTACA:1 - chr2R 14768158 3' + P-element 2869 1 57.43 GAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGGGCATTACACACACGTTGACCAACGGATGTCCTGCTGCCTGATGGCATTAC:1 - chrX 5184586 3' + F-element 77 1 59.41 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCCTTAAAGGCAGCTAATACTTGCCGCCGTTCAAAGGAGAAAAGTAATTTCGCACTTTTTAAAT:1 - chr3R 11478373 3' - roo 15 2 67.33 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAA:1 - chrX 157229 3' - I-element 48 1 71.29 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGTATGGCTGTAGATCCAGGATGCCTGGTCGCAGGACTATGACAATATTTTGCTGATGCCAGCGCACCTTCACTT:1 + chrX 14371386 3' - jockey 10 1 80.20 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTCGCAACCATCGCGACGCGCTCTGGTTTTTCCTATTAGCGGCGCCCAAATGTAT:1 - chr3R 13623640 3' - jockey 30 1 53.47 AAGACGGAGTTGTATAGGAGAGCTTTGAACTCCAGGCTAAGTTGAAAGAACTCAGAGAGAGTCTGCCCCGGGAGCTGCAGGCGAACTTCATACCGCGGCGC:1 - chr2L 6068394 3' - Doc 4257 1 61.39 CGCCCGGTCTAGTTAACCTTACCCGGGTACTGCGGATCTCTGCCCGGACCAATAGACCAAAATGAACAATTTGAGACCATAAGACCCTGAGAATTCGCACT:1 + chr2R 3456869 3' + baggins 316 1 66.34 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGCATAAACAGATTTAGAGTCGAGTGCCTGGAGCGAAGAAATGCTGGTGTGC:1 + chr3L 18523669 3' - 412 7077 2 55.45 CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGGAACGGGCCGGCAACAATGGACTTGA:1 - chr2L 16378952 3' - HMS-Beagle 45 2 70.30 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAAAAGTAACTTTTTTCACCGAACTCCTGGAAAGACTAAGACTGAGAAGATGGCAATAAACTTG:1 - chr2L 15798606 3' + roo 397 1 67.33 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGCTCATAACATTAATGTTAAAA:1 - chr2R 19164119 3' + P-element 2833 1 25.74 GGTGTCCTGGATTTGCCCTCCTTAATGGAAAAATGTTTTTTTGAAAAAATTAGGCAATAAAAGAATTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 13687533 3' + Rt1c 5357 1 74.36 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTGTTTATTATTATTTTGTTTATCTCGAACCTCAGCTGAAATAATCGCAAAAGGGTCGCAACCTGCCA:1 - chrX 8037602 3' - roo 8673 2 71.29 AATTCCCATTAAAAATGTAAAATGTCATAACAAAACGAGAACAAGACAACAAGTCAGTGCTGGGGCGACAGGTGAGCGCAGCCAACAAGTGAGCCGAGACA:1 - chr3L 383761 3' + HB 1564 1 59.41 TCACATTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTGGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAA:1 - chrX 10445557 3' + INE-1 538 1 78.22 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCT:1 + chr3L 24210987 3' - HMS-Beagle2 10 2 64.89 ACATACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGACACACACACTCTCTCGC:1 + chr2R 22269240 3' + Quasimodo 29 2 72.86 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTAGCCAGCGAACAGCATCTACATATTAACGTTACGGATATTTTCCTACCAAATT:1 + chrX 22597238 3' - hopper 23 1 56.44 TAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTGCAC:1 + chr2R 6482737 3' - gtwin 33 2 59.41 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCATGAGCGCTGATTTTGCGCCACTTA:1 + chr2L 9624594 3' - transib2 49 1 72.28 AAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTTATAAACAAAGCTGGCCCTT:1 - chrX 11503467 3' + roo 9037 1 61.39 CGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTGTTCTTCTCAGTGGGTGTGTGTGTGCTGTGTATGGTGCCGAGAAGTATCTTGAAGGTTCGGTCAGC:1 - chr3R 21700865 3' - mdg3 5177 1 58.42 CAAGGGTTTTTTGAATGCCCTTTCATGTTATTCCTTCCTTAGCTTAAGAATTAACAATCTTTTCTGCCCTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr2R 1982173 3' - HB 426 1 74.26 ATAAAATGACCAACTGCGGTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTTGCCAAAGTGCGTCTCCACGTGCTGAG:1 - chr3R 17557391 3' + mdg1 373 2 70.30 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGGCAAT:1 + chr3R 21587311 3' - pogo 34 1 62.38 ATCATAATAATAATAATAATAATAATTACAATAAATGCGACATTTAAATGCCTTGCTTATCGGACGCGCAATTACAATGACAACGA:1 + chr3R 11080764 3' + mdg1 38 8 74.42 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTCGTTCGATTCGCTTACATGCTCCTTTCTTGCTTAAGAAGCCAGACGCATCTGGTACACTTG:2 + chrX 21050033 3' - 297 13 2 67.33 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTGCAACAATTTTCCGAGTGTAGCCAGGAAGCGAAGGGCC:1 + chrX 4278391 3' - blood 38 2 60.40 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCAAAAACTGAAACTAACTGAAACTGAGAAATTGAGTTGCCAGCGAATGAATGTGTGTTTCCTAATGAAAAT:1 + chr3L 10576884 3' - roo 2 2 76.77 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCA:1 - chr3L 10576803 3' + roo 360 2 74.26 AATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCG:1 - chr2L 23372507 3' - gtwin 6 2 73.27 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGGAATTGCGAGGATATTAGCTTACAGGTATTGTTTAAACTTTAAGATTTCGAAGAAA:1 + chrX 10776237 3' + roo 389 2 51.49 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAATATCCACTGCATATTCCTTAAATTTGAAATACATTTCATCAGCTTATTTAG:1 + chr2R 12007284 3' - mdg3 5278 2 54.46 ATTTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACCCAAGTTGATTGCCTTCACTGGCAATTTAAAGGAAGTGCCAATCCAAAAACTAAAGAACAAGATTTACAACTTC:1 + chr3L 16047735 3' - Tc3 241 1 30.69 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAAGGC:1 - chr2R 22746047 3' - hobo 46 1 69.31 TTTGGTTAGCTTTTTTTTTTTGTTGTTGATTGTGATTGCTTAAATTCCTTAGAGTCATTGCAAATGAATACTAAAAGAATGAAAAATTTAAATTCGAAAAA:1 - chr2R 14814284 3' + Circe 7280 1 28.71 AATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAAAAATAACCCACCAACAACCTAAGCCCATTCCAGCCGGAAGATGG:1 + chr2R 980034 3' + I-element 4911 1 73.00 TAAATGGAAAATCTATTAAAATGACTTATATTTCACTCGTAAATTTCAACAAAGATTTTTTTTGCGTGTACGATGAATGGAGTCGAAAGAAAGGGTGCAAA:1 + chrX 22694470 3' + Burdock 6383 2 70.30 GTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTAATAGCTTATCTCCATCGTGTATCTTCATGTTTCGCGAAAACAAAAAAGGGTTTTCGAAACTCCCGACGAC:1 - chr2R 17402685 3' - invader4 2 2 77.23 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATGGAGGTGTTTTTCAGCAGAGCGAGATTCCCTCG:1 + chr2L 19572650 3' - P-element 44 1 33.66 TAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGA:1 + chr2R 5532319 3' - G4 3782 1 63.37 TTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGATTATTCGGATTGGTATGGTATGGCTTGGTATGGTTGCGATCTT:1 - chrX 1575579 3' - I-element 5127 1 53.26 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGCTTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGG:1 + chr3L 3535432 3' + roo 9026 1 69.39 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTACCATCTTAAATTGTATTTAACCAATTTTCTAGGTTTCATGTCAGATATCAT:1 + chr3R 10480429 3' + mdg1 396 2 55.45 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACCCACTTCGACTTGGGAGTTCCACTAACGTTGCCTTT:1 - chr2R 22676479 3' + 412 7539 2 55.07 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCCAAAAGGCAATGATAACAAAGGAAATAAATAAATAATTATCAAC:1 + chrX 6200176 3' - jockey 37 1 53.54 GGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCTTGCGATTTTCTGGTATCGGCTGCAACTTTGTCGCGACGGCATCCGGCGTAGCAGCGTTGTCAGCAAACTCT:1 + chr2R 594191 3' - gypsy5 6943 2 74.49 CACTAAGATCAGTGATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGCACAGCTCACACACACACAGTAGTACATGTGCCGTTTATTTGTGCATTT:1 + chr3R 11108673 3' + mdg1 305 2 57.95 ACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATAGACTAAAATGTATTTGTATATGCTACCTAGTTATTCCC:1 - chrX 17538952 3' + Porto1 4184 1 62.38 TAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGATTGACCCACACGATTACATTACTTTCGCCACCATC:1 - chr2R 4015451 3' + 1360 105 1 67.33 ATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATCAATAAAGCTCACAGAACTCGCAGAACGCAGAACGCAATTGCACGAAGGCGATACAACGGGA:2 - chr3L 8842449 3' + I-element 4901 1 50.50 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACGATTGGTGGCTAACGAACT:1 - chrX 157187 3' - I-element 6 1 71.29 GTACGCAGACAATGTAAAATTATGGCTCCAGCATAAAGAAATTTCATGCCTAAAGACCATCAAACTAATCGTTTCTATGAACAAAGAAAATTCGAAAATTC:1 + chr2R 961132 3' + Q-element 576 2 55.45 TTTTATAAAAGCAGACAATAATACGGTTTCCATGTTTATCTTCTGGATGCCTAGTCCTTTGCCATATCTTTCTAAGTTTACGCGGGAGTTTAATGTGATAA:1 - chr2L 23039370 3' - Cr1a 447 1 66.34 GCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTAATCAAACTTACCACTTCAAATTTCCAACAATTTATTTTCCCCAAAAACCCTAATT:1 - chr2R 21878077 3' + I-element 164 1 56.44 GGGGGTTTAGGGGGTAGGGTGGTAACTCGCTTTGTTGATTAGTTAATTACACAGTTGATTAATATCTTAAATGCAGCCATCTCGTTGACGCATATAAGATT:1 + chr2L 13642779 3' - Tirant 8 2 73.27 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTACCTTTAATACTTTTCAACCCAAAGCCAATATACAC:1 - chr2R 17942093 3' + mdg3 5460 2 62.38 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGG:1 + chrX 21945912 3' - F-element 58 1 75.00 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTACAACACTATAGTATTCGTTATTTACAAAGAACGACTGCAGTTC:2 - chr3R 21587237 3' + pogo 2073 1 57.43 ACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTCTTGTAAGCTGAACTCTTTTTACAGGAAAAATCATCAGTTTCTATTGCAATGGTAT:1 - chrX 6133691 3' - Quasimodo 326 2 56.44 GGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTCTGTGCTTTTGGTCCATTTTTATGATTTTGGCTGAAC:1 - chr3L 11075154 3' - Ivk 363 1 62.00 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTGCGCTTTCA:1 + chr3R 19513417 3' - jockey 4690 1 57.43 TAGCATATGGTCCATAGTATAACACTTGACAACATAGACTTACACACACACACATAAAGTCTAACAATTCCTCTCGTTACAACAAGAAAAATAAGCGATAA:1 - chr2L 23436140 3' + Quasimodo 3 2 55.45 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAGCATATATAGTGGGCTACGTTGCTTGCCAAATAAT:1 + chrX 10196158 3' + 297 6941 2 71.29 GTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGTCAGTGGGCTTGCGTGCCACTGTGTGTGTGTGTATCACATAAATATGCATTTCCCA:1 + chrX 14984552 3' - I-element 4897 1 62.38 TTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTCATGGAATGGAGGCAGCATCTTCTTGGGTGCGACAATGTGAGGCACACCATTTTGTTGGCCGGGCTGCT:1 - chr2L 10981324 3' - I-element 4975 1 82.11 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCACCTCGTTTCTTTTTCTTTTATAAAAA:1 - chr3R 19515797 3' + 412 7519 2 52.48 AAAAAATTTAAACAAATTTTATAAAATTCTAATGCCAACATTATTTTTAAAACTATTTTTCGAATAAAAATAACTAAATCCAGTTAGAAATTGTTTAAACG:1 + chr2L 16256897 3' + HB 325 1 62.38 GAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTGGAGACATAAAATGTGGGAATCCCACTTATGTAACTCTAGAGGGTATC:1 + chr2R 1986271 3' + INE-1 148 1 59.41 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGACTGCTTGCAAATACAAATTTACGGTCCTTACTCCAAATGATTCTCTTCGGCGTCACTTAACCGAAGTCTA:1 + chr2L 21778015 3' - mdg1 7042 2 76.24 ATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACATTCCATCAAAACCTGCGTCGCAAAACATTTAATCAACTGGCATCCTTGCCAAACATCGA:1 + chrX 10298260 3' + Quasimodo 118 2 63.37 CACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCTCACTTCATTTACTAGCTTAGATGTTATCTTAGCTTTGCTGAGCGCCTTTATGGCTGCTTGACTATCAG:1 - chr2R 4330779 3' - baggins 5230 1 72.28 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACACACTCGGCCCGCATAAACGGAATGGCCCGCGAAAGTGTGC:2 + chr2L 10119503 3' - flea 4788 2 59.41 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGTCATCACATTATGAAATTTTGGTGTTGGTTTTGCATTAAGTATCTCTCTAATCTG:1 - chr2R 9258579 3' - blood 7034 2 56.44 TATTGTTATTATGTTCGTATATAGTACAGCTGAAGAGATTTTGGTCACGATGATACGGACATATCTAAAAGTCGTTTTGAAGCAATGATTGCAAGCGAGCA:1 + chr3L 8044408 3' - mdg1 7045 2 72.28 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGATGATTAGAGCGGGACGACCGCTGGCACCTCGACAC:1 - chr2R 21646099 3' + P-element 2848 1 41.58 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATGTGCTATTTTATTTAATTGTTATTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATCCGTTGAGAGGTGTTCAAAGCAAA:1 - chr2L 21018809 3' - 412 7102 2 68.00 ATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCTTTTTGGACTTAGCCTGCTGGCAGGACGAGGGCAACTTTGTTTTGCTTTTTAGTACT:1 - chr3L 22162961 3' - accord 424 2 60.40 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCACCTCGTTTCTTTTTCTTTTATA:1 - chr3R 19515801 3' + 412 462 2 56.44 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTTGCAAAGATAATTGAAGGGTATGCATGTATTTGCTCCCAAATGCATACTTGA:1 - chrX 18975543 3' - diver 5916 2 51.49 TAACACTGCAATAACAAGTGCAGTGACCTCCCTAGAAACTGTCACTGCTACCACACCACCAACTTCACCCCTTTTGGCCAGCGGCATTTGCAGGTGGCACG:1 + chrX 8312632 3' + Doc 491 1 61.39 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAATACCAAATCCAACTTAATACGATATGTTAGTTTGCGCCAACATGTTAAAGCA:1 - chr3L 2170941 3' - 1360 24 1 54.46 GTATGGCTGTTCTTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTTTGAGTGTGGCTCGAGTTGCCCAGGGCGAGAGCATTTTCCACTAAAGAAGCACACTTCG:1 - chr3R 25456672 3' - Quasimodo 59 2 76.24 AAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACCTTTGCATTGCCTAAACCCAAACAGTACAATATACCATGTGTTATACCATTTGATTCCCGAAAGAA:1 - chrX 13820343 3' + P-element 39 1 66.34 TGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTAATATACTT:1 + chrX 21668100 3' - Tabor 6846 2 72.28 TGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCAC:1 - chr2R 3133791 3' + micropia 5138 2 79.21 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACGAAGAGCTAACAAAACCAAACGATTCGGAAAATAAATGCAGACCATGCATGCTGG:1 + chr2L 11560006 3' + copia 236 1 58.42 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTCTGCTGCTCCCCCAGCAGCGGTTCTCCAAAACATTCTCGAAATTCCAAAG:1 - chr3R 20430750 3' + hopper 1387 1 54.46 AACCCAATACGCATGACTTAAACTCTAAGTGGGTGCTCCTCGGACAGATGGAAAATGAGATAATTGTTACTGCTCAAAATTTTTCTCGGCTGCAAAAACGA:1 - chr3R 1225669 3' + Q-element 701 1 52.48 GATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATAATGATGTTGTTTCTAATATTCACCACGGATCACAGTCAACAAATTCAAATAACCAACCCAGTTTCCGACCTTG:2 + chr3L 23930985 3' - HMS-Beagle2 6884 2 78.22 AAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAGTTGTTTGCGAACAAAAGCTCATTTAAAATACCTTTTCTCAAGATTTTCAAGACTCCAGTCACCACCCC:1 - chr3R 10437039 3' - 1360 3074 1 78.22 CAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 5214 1 57.00 TAACTACATAAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGTCGA:1 - chr3L 8044298 3' + mdg1 7443 2 62.38 ACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGCGTATACGAGGCCCAC:1 - chrX 9816238 3' - BS 5000 1 68.32 TATATCAATAAAATATTTCATTTCCTACTATATTTATTTGTAAAACAAATAATCTACTTTTCATTTAATTGCGGGCACGTGAACTAAGCCTACACACAAAT:1 - chr3R 26409924 3' + transib1 1928 1 82.18 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATCTACTTTGATAAAAATCATTTTGTGGCCTTCACACTTGGTTATTAAGCGACTGACATGTTTGGT:1 + chr3R 1940157 3' - pogo 7 1 74.26 CTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCGAATTGTTGTCGGTCAAATTAAACAAGGTCCTGATTATTG:1 + chr2R 3144098 3' + Transpac 5196 2 60.40 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAATAATGTTTAACCTCAA:2 + chr3R 19515866 3' - 412 7090 2 61.39 TCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGCGTATACGAGGCCCACGGA:3 - chrX 9816235 3' - BS 4997 1 69.31 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGTATGGCTGTAGATCCAGGATGCCTGGTCGCAGGACTATGACAATATTTTGCT:1 + chrX 14371365 3' - jockey 15 1 70.59 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGGACGACAAGGCGAATGACATAAGCTGATTGCTACGGAAGCA:1 - chr2L 4868529 3' - blood 7047 2 62.38 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTGTTTGAAATAAAAGTGTAAAAACAGTACTCAAGTTTCACGGGTTTTAAAAACGGTTTTATTAGTT:1 + chr3L 19066169 3' - roo 8675 2 64.36 CAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTTCAAAACCCAAGATAAGCCAAAGCAAAATAAGCACCCGTTGCAAAAGTTGCGACAAGAAAAG:1 - chr3L 1985287 3' + Max-element 282 2 57.58 TTTTTTTTTCATTTTTAATTTCAATGGATTCTGATTGACAACTTGTTTTCGAAATATATGAGATTCTAAATTCAGTTTAGTATATCAAATAAATGCTTTGT:1 - chr3L 13102220 3' - P-element 2647 1 83.17 TTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTA:1 - chrX 21668028 3' + Tabor 431 2 76.24 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGACTAAAGTCTAATGGGTTTATACTTTATTTTTTTG:1 - chr3R 11912112 3' - I-element 85 1 66.34 CTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCC:1 - chr3R 4546037 3' - jockey 4781 1 55.45 GACGGCTGCCTTCAAGTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACATTTTCCATTAAATTTAAAGCTTTTTCTATTTGCTTCTGG:1 - chr3L 18523595 3' + 412 458 2 56.44 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACTTCGTTTGAATGTGTGCGTGACAGTGTGGGTGCGTGTGTTTTCTGTGTGTGTGTGTAT:1 - chr3L 6338261 3' - hobo 14 1 63.37 TAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTAGTTGCCTCAAATGCTTCTTGTTCTTTTCATTTT:1 + chrX 5130502 3' - I-element 478 1 69.31 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTAAATCCCTATTAATGCCACGGTAGGCT:1 + chr3R 7879872 3' + 1360 3338 1 75.25 GTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTGCACGCAATTACCATGGGCAGACTCAATGGAAATG:3 + chr2R 6482768 3' - gtwin 6918 2 77.23 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAAACAAA:1 - chr3L 10576795 3' + roo 9032 1 66.34 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAAATATACAATTAACTCCTTAAATAGCAAATGATTAAAGAAATGCTGGAGTGACATTTCTACATTTTCTTTAGGGA:1 - chr2R 11835584 3' - I-element 4 1 80.20 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGCTTTAATATTTGGCTTAGAAACCTACAAAATAGACCT:1 - chr2L 12246580 3' + hobo 2903 1 62.00 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACCAGCTCTCTCACAAACACAATCTAAAGTCGCAACTGTTTTTAAAGACCAAAGAAAGGGAGGGAGCG:1 - chr2R 6501128 3' + P-element 2881 2 73.27 CTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGATTTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTTTTTAGAAACTTCGTCTAAGACGTGTAGTTCTGAA:1 + chrY 1926845 3' + R1A1-element 5134 1 65.35 ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGTACATAAGATACCCTGGGAGATAGATGCGCTGACCAACTCGCATGTGTGT:3 + chrX 8313264 3' - jockey 4782 1 50.50 AGGAAATAGACTGTTCTCCAAGAATGACTTGGAGAACTTGAATAAAATTACCTCTTGAATTTGCGCACAACTTGGTCCGGTCAAAGACACTAGAATATTC:1 - chr3L 22757139 3' + Bari2 889 1 60.00 ACGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGTCATAAATGGGGGCACAAAGTGGAAAGTCGGAAAGGAAGTTGACCTCCGACAATCGTGTTTCT:1 + chr3R 21198692 3' - Tirant 12 2 69.00 AATAAAATTTTATTTTCGATTGCCCAGTTTATTAGTGAATTGTGTGTAATCAAAAGCTGGTAAATGTGGTGTGCGCGGAAATGTATGACATCGCTGGCAGG:1 + chrX 16197424 3' + FB 411 1 61.39 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTCATTTTGGTTAAGACAGAAAATGTTAACATTATTTTTCG:2 - chr3R 13620272 3' - Doc 41 1 66.34 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGGCAATCTAAA:1 + chr3R 21587316 3' - pogo 29 1 57.43 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTAGGGTGGTAACTCGCTTTGTTGATTAGTTAATTACACAGTTGATTAATATCTTAAATGCAGCCATC:1 + chr2L 13642759 3' - Tirant 28 2 53.47 AAAGTGTAAGTATATATTTTATCTATCTACATATGTGAAAACTACATAACAATCGAACCTTCATTAAGAGATTAATACATAATAATATTAATACATAAAT:1 + chr2L 17759470 3' + TART-B 10561 2 49.00 TAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATGGCTTTTACTGCTTTAATATAGCCTAAAAG:1 - chr3R 8576860 3' - BS 5040 1 68.32 CGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATATTGATGA:1 + chr2R 3760474 3' - accord 35 2 59.41 GCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAGTCGTCTATAGCATTCTTTTTTGCTTTATATTGATATTGATATTGATATTCTTAGCATAATCACTTAATA:1 + chrX 22485105 3' + INE-1 546 1 80.20 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGCCCGTCTGTGTGCCGGTGTATGATGCCATTTATTTGCTCAAGATTAGATTAAATGTAGCGCCGTCTAC:1 - chr2L 9672388 3' - 297 3 2 74.26 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTG:1 + chrX 21219483 3' + roo 9030 1 66.34 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATGTTTATGGCTATTAATCAAAATGTATTTGCTGCCG:1 + chr3L 12258255 3' + roo 9031 1 71.29 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGGATCTCCGGCGACTGTTTGAAATTCATGACTTGTTTA:1 - chr3L 17767662 3' + hobo 2904 1 58.16 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCTTTTAGAAAATTCCCTTTTTTTGTGGGTTTGA:2 - chr2L 11559936 3' - copia 43 2 68.32 GGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTGCACATCAAATCCTAAACATGTCAACGTAAATTTTTGTGGCCAAGCCAAATTAATTGGCTTCCTTATCGCGATTATCA:1 - chr2L 14007371 3' - hobo 2709 1 81.19 TTTTAAAGTTTATTTTTAATTTCAATAATGTATAATTCATAACCGTCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr3L 11720528 3' + hopper 181 1 53.47 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTCTATGTATGTATGTATGTATGTATAGGGCTTCGTGTGTGTCTGGGCAACTGTTGAGC:1 - chrX 7851222 3' - opus 22 2 59.41 AATTGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGGCACTCTCTTCCGGCTGCTGGTGTAAAACAAAGTCAATGAACTTTGTACGCAT:1 + chrX 3695766 3' + 412 495 1 55.45 AACTCTGGATCCATTGGAACTTATATAATTTATACATATATAAATGATACTTAGTTCTTCATAAGAAAGCTAAATACAGTTAGTAGACAGAATGATAGAT:1 + chr2R 21249549 3' + gypsy 7440 2 65.00 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATAAAATATTGTATATACGTGTGATGTACATATATACATAGTATTAACAAAGACACTAGAA:1 - chr2R 19502071 3' + Tabor 7308 2 62.38 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAATTGTGGTGGAAAACTACAAATATATATATAGTTCGAAGTTAATGGACAACCATA:1 - chrX 10776138 3' - roo 22 2 51.49 AATTTAAATCACATAATAATTTTGTTTTCCTAATTATTAGCTGTGCCTTGTTTGGCTGAGGCATAAATAAA:1 + chr2L 8901382 3' + HeT-A 338 1 69.01 AGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCCGCACGCAAATGGAGGAGTGAGCGGACAGGACAACGGACAACGGACAGGATATCGGCGG:1 + chr3R 13619853 3' - Doc 476 1 75.82 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAATGAAATGAAAGAGAATTGAAGGA:1 + chr3R 21974046 3' + 297 6955 2 77.23 TGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGGATCTCCGGCGACTGTTTGAAATTCATG:1 - chr3L 17767671 3' + hobo 2896 1 67.01 TGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTAGGGTGGTAACTCGCTTTGTTGATTAGTTAATTACACAGTTGATTAATATCTTAAATGCAGCCATCTCGTTGA:1 + chr2L 13642766 3' - Tirant 21 2 60.40 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCACTTTATATGGCACACGTTTTATAAACAAACATGTTAGATACTTCGGAA:1 - chr3L 3049843 3' - 1360 24 1 52.48 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATT:1 + chr3L 24210985 3' - HMS-Beagle2 10 2 65.93 CAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACCCTTATTTATGTTTTTTCCAGTATGCCCCTTA:1 + chr2R 25216590 3' - 3S18 47 2 74.26 CCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAAGTGGTTGAAATGTGATGATGGGAAAATCTGTTTAACAGAATGCAAAA:1 + chrX 157133 3' - I-element 472 1 56.44 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTGTATCATTAGGAGGCATCCCAGACACCAGACAAACCAGGACATTCTGGGCAGCTGG:1 + chr3R 12546886 3' + hobo 2919 1 60.40 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAG:1 + chr3L 5267265 3' + Juan 4174 1 66.34 ATAATAAATAAATTTAATAAAAACTTTATTAAAAATGCTCTTATAACAACGCTATGAAATTTGCTCACACAAGTAACAGAACTTAATTAACAAAATACTGA:1 - chr3L 7882578 3' + X-element 4714 1 82.18 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAG:4 - chr3L 8044322 3' + mdg1 381 2 63.37 AATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTACCTGTAGGAGAACGTCTAACAAAATGCCT:1 - chrX 21564070 3' + invader4 3073 2 66.34 TGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGTTATATTTGCCTCTGCAGTGTTTTCAATAAAGTTTACCTGTAGGAGAACGTCTAACAAAATGCCTTGATTTATTTA:1 - chrX 21564059 3' + invader4 3084 2 77.23 AAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAGCATATATAGTGGGCTACGTTGCTTGCCAAATAATTCCAATTCAATTTGCGAATCTCTCTCTTTTAACT:2 + chrX 10196192 3' + 297 394 1 82.18 GTTGTCTGCTATCCCTGTTTGCGCTCTCTCGCTCTCGAACATAAATTCGAGAGCTGTGCGATGGCGAGCTGAAAGCTGGGGATCCTCGTGCTGCATGTCCT:1 + chr3R 13540635 3' - 1360 153 1 52.48 GTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTTATGGCTGGCTAATAGTGACAACAAAAGTACAGATTTAATAAAAAA:1 + chrX 10298070 3' - Quasimodo 21 2 57.00 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATGTACTCCACATTTAACAAATATACGTACATGTGCGTTCAACATAATAGGTCACAA:1 + chrX 5178888 3' - hobo 19 1 59.41 AAAAAAGTGCTACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTCGACTGCCTCGTAATTGCCAGGGGGAAATTGAAATAGATGCCCGATAATAAGCACTTAGCTAGAGACCA:1 + chr3L 15729702 3' - hobo 7 1 72.28 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTG:1 + chr2R 5531195 3' - 1360 66 1 61.39 AAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAGCGCAAATGGAAACCGTCAGAAGATTTTTCCACATACT:1 - chr2R 5238452 3' + Tirant 8341 2 62.38 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCT:1 - chrX 157231 3' - I-element 50 1 73.27 GCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCCGACGCCGCACGTATTTCATCAGCGTGGCATTATATGCATGGGTATATGCTTATAT:1 + chr3L 10626157 3' - Quasimodo 40 2 78.22 CCATTCACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGGAGAGCCGGATAATCTGACAAATCTGGGCATTTTGAATGAGTATTGAAGAATGC:1 - chr2L 19981950 3' + roo 313 2 60.40 ACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTTTCATTTCT:2 - chr3L 5267194 3' - Juan 3980 1 68.32 GGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAGTGTGAGCAGTTTGGCCCTCAAATATTTAC:1 - chr3L 18447426 3' + gypsy12 10148 2 70.30 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCT:1 + chr3R 19513389 3' - jockey 4718 1 76.24 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGTTTTCGCAGC:1 + chr2R 1725953 3' - Doc 21 1 64.36 AAACTAGCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAATTTGGACAACTACAGTATTAT:1 - chr2R 3637482 3' + 1360 3140 1 79.21 TGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATGTGTGTGGCACATGCTTTGATTGAGGTATGCCGCACCAACAATAAC:1 - chr2R 18078683 3' - Quasimodo 20 2 60.40 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCCCTGTCAACGAATTGCATTCTGTGTGAA:1 - chr3L 2690952 3' - Doc 56 1 70.30 AAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTCAGCTATGGCCGGCAGAGAACAATCAGTTTTCGCTTGGCCCTTGCTAGTTGAACTCAGTCGGTTGGGATGTT:1 + chr2L 19962708 3' + 297 394 1 81.19 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTAGATTAAGAACTACTTTATTGTTTGGTGTTGCG:4 - chr2L 18977913 3' + roo 9030 1 69.31 CACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCATTGGTGCCACGCCTA:1 - chrX 21667978 3' + Tabor 481 2 68.32 ATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCCATGCATCTTTTGCTGTGGCAGCAAGGCGGTGGGTTGGGATACTAATAAATTTATTACATCCCCACGCATGCT:2 - chr3R 17980711 3' - HMS-Beagle 6796 1 69.31 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTCTGTGAGCTTTATGGACTGGCAGTCCAGTAACTGGATGTGCCCTGCTCCATCATTATCAGGTCCCAGTATCA:1 - chr3R 17529496 3' - roo 8666 2 76.24 TGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTTGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATTGTTTTGTGAGTAAACAGAACTGACCTTAACAATGAGAA:1 + chrX 7339961 3' - G2 2619 1 57.43 TTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGATGCTGCGTTCAGTTTTGTGGTTAAC:1 + chr2R 19772666 3' + invader4 2657 1 75.25 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACCAGCTCTCTCACAAACACAATCTAAAGTCGCAACTGTTTTTAAAGACCAAAGAAAGGGAGGGAGCGAG:1 - chr2R 6501126 3' + P-element 2883 2 75.25 TCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAGAAAATGAAATTCTCAGCGAAAACTGTTTAACTTATTTGGTACACCATTGTTGGATGATGGAGTTATTGATCGCTC:1 - 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chr3L 23665735 3' - GATE 8277 2 73.27 CTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAG:1 + chrX 21945917 3' - F-element 54 1 70.30 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGG:1 + chr2R 17348591 3' - jockey 62 1 82.18 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATC:1 - chr3L 25884095 3' - Doc 39 1 62.77 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGGATCTCCGGCGACTGTTTGAAATTCATGACTTGTTT:1 - chr3L 17767663 3' + hobo 2930 1 59.15 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTT:2 - chrX 17492895 3' - Tirant 8147 2 67.00 ATTTTTCTAGAATATCGATAGATTTTGGGTAATAAGATGGGAGAACGGGTAATAAGATAGGACGTTAGAGTGGGCGTGGCAAATCGATAGAAATTTAAAA:1 - chrX 23005472 3' - INE-1 501 1 47.00 TATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGGTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACA:1 - chr2R 4673557 3' + Quasimodo 7358 2 71.29 GTTTTATTTTCTTTTTCCTTTTTTTCTGATGCGCCGTTGCCGCTTTTCTGGGGCCGCTTATAGCTTATGGTATATAGGGTATATAACCTGCTTGAAAAGTG:1 + chrX 12206471 3' - Doc2-element 239 1 48.51 AAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACAGATCTCGACCCTACGAAGATTAATTGCAGATAACGTTTCCATTTACGCATT:1 + chr3L 16741561 3' + I-element 4896 1 59.41 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAATAATGTTTAACCTCAAATAACTGAGTTT:2 + chr3R 19515878 3' - 412 25 2 54.46 TGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTTAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCA:2 + chr3R 23947648 3' - Tirant 8116 2 67.33 ACAAAAACTCAACGAGTAGAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATGGATAACCGTTCGGTTGAATG:1 + chr3L 22162737 3' + roo 9050 2 57.43 CTTGGACGGTTCACAAAAACACGGGATTTAAAAAAAACAGGCCGGAAAACAAAAACCAAGTCGCACACTCAAAGTGAAGTGAAAAAAAGCGGGGCAATTTT:1 - chrX 12353078 3' - mariner2 624 1 72.28 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTGCAACAATTTTCCGCACTTTTCCCAGTGCATA:1 - chrX 4280573 3' - blood 44 2 66.34 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATCGTGAATCTAAATTATCCAGTTCATT:1 + chr2L 18417353 3' - roo 49 2 72.28 AAGAAACAAATTAAAACATATTACCAATAGGTTAATTATCGATTTTTCATTAAATCTACTTAAAATTGAAGTGAGATTTGTGCGAGGGAAATCTTAATTTC:1 - chr2L 12275130 3' + HeT-A 5765 1 61.39 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCA:1 + chr2R 17348609 3' - jockey 26 1 57.65 CGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAAACAAAAATTTATTATCA:1 + chr3R 4583047 3' + Cr1a 4389 1 76.24 CAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGAAGTCCTTCTATGCGGATTATGTTATAATGTTGCACT:1 - chr3R 16110179 3' + mdg3 206 2 67.33 TGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAATTAAAGCAAAGCTTAGAAAGTAAA:1 + chrX 9650400 3' - blood 7225 2 73.27 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCTGGCACAAGGATAAAACTACACGTACGAGCATTAAATGTGCCC:1 - chr2R 14135403 3' + roo 9038 1 57.43 CATATTAAACTCATGCCCATCCCTTCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAAACCTTCTTATTTGGTTTTAAACTTCTATTCTTT:1 - chr2R 992507 3' + I-element 5045 1 74.26 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTGTTTATTTTTCTTTTGTCTCAAATTAGATTTCATGTCTGGGGTAAAAACTCAGCTGCAAACA:1 - chrX 20835190 3' - roo 13 2 64.36 GCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1 - chr3L 25232768 3' + accord2 172 2 54.46 CACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTCATTTTGGTTAAGACAGAAAATGTTAACATTATTTTTCGCAAAATTATACAATTCTTAACCTGTCGGGAAAC:1 - chr3R 13620239 3' - Doc 8 1 68.32 AGGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAAAAAGAGTGTATTAAAAAAACAAAAAAGGTTTACAAT:1 - chr3L 8047744 3' + invader4 251 2 62.38 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCCATATTTCAATT:1 + chr3L 15869736 3' - pogo 20 1 59.41 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTCACTATGTATATTCCTTATAAAATTACAT:1 + chr3L 27395482 3' - Transpac 45 2 72.28 GCAAAGACACTAGAATAATAATATAATTATTCTAGTGTCTTTGCCCTTAGGCTTGGTCCTTAGACCTTTCATATCATTTGTCAGTCTGACACTTGGCCTTC:1 - chr2R 13430169 3' - Tc3 311 1 57.43 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCCATATTTCAATTAAAA:1 + chr3L 15869740 3' - pogo 16 1 63.37 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTCGGCAGTTGTAGTTGGCGGTGATTTACCCGCG:1 - chrX 3446495 3' - I-element 4 1 73.27 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTGTATCATTAGGAGGCATCCCAGACACCAGACAAACCAGGACATTCTGGGCAGCTGGTGGCAGGCTGCAAGAGG:1 + chr3R 12546903 3' + hobo 2936 1 75.25 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGCTTTAACCCATTTCTTCAAGGCGTG:1 - chrX 3333420 3' + pogo 2052 1 78.22 AATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGTATATTCCAATTAAATGGAATACCCATTTCTCGATGAGGACTTTTGCGCCTAGCCCAATCTCTAATTGGAATTCT:1 + chr3L 3729019 3' - I-element 4977 1 79.21 TCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCCACAATGATAAGTGGCATTTTAAATGGTTTT:1 - chr3R 19516038 3' - 412 7533 2 70.30 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAATACGGCACTATATGCATTATTCATGCTTGTTAAATTTATTAATTGACCTTCCCCC:1 - chr3L 14558257 3' - 297 32 2 55.56 CAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCG:1 - chr3R 178124 3' - BS 44 1 71.29 TTCAACTCAAACGATTCTGTTAACGACCTCACCGGCGAGTTTTCGCCTGCGAAAGCATAGAAACGCGCTACGCTCTAATGAAGACGAGCATACTTCGACAT:1 - chr3R 1033048 3' + Doc4-element 342 1 64.36 ATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGTATCGTAAGGGTGAGGGTTCTTCTACTCTTCTCAGCTCCT:1 - chr3L 4130359 3' + Doc 290 1 60.40 TTAGTTGATTATTCTGATGAATGAGATTTTGAAGTTCCATTTTTTATAACTAAGTAGTGACATGTTTGCACATAGTGCTTCCAGCTGGAAGTATTCCCTCC:1 + chr3R 30924681 3' - jockey 4816 1 53.47 TCTAATTATGAGTTGCATGACTTTACCCTATTATCTGAGAGACAGTCAACTTGGTGAAAGACTGTGGACATAGATTCCTTAGATGCTTCTGGAAATATATG:1 + chr3L 25753382 3' + Cr1a 4163 1 70.30 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAACAACAGGAGGGCTGGAGGAGATCGGTGGGTTGGCGATCGGCTAGATGGAGCAGGAGCCA:1 + chr2L 11073846 3' + roo 9052 2 59.41 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGACGGAGGATAAGCAGCATGACGGAGTTGCTTTCCTCACTTCCACGCGATG:1 + chr2R 24545985 3' - jockey 4764 1 48.51 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAGTTAAGATTTTAAATCAGCATGTAGTTCACCATTTTTTTTT:1 - chr2L 12860846 3' + roo 9063 1 59.46 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGAGCAGGCCAAAAGAGCGAACAAGTGTGTGTGGGAGAG:1 - 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chr3L 25552470 3' - Fw3 20 1 84.16 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCCGCCCCCAAAATCCCCCAACCCCATCCCCTCTCCCTTGGGGACCAAAATACGCTCCTTGGTGGA:1 + chr3L 17767742 3' - hobo 12 1 66.34 GGCTATTAATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATACATACTGTCTGTTACATACTTACATGCTAGTACACCCTTTTACTCTACGAGAAACGGATATAAT:1 - chr2R 2749405 3' - INE-1 87 1 48.51 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCTCATGATGAATTATTCAAGCAGATTGAATTGAAAACGAAAGCACGATGTAGACACA:1 - chrX 5130978 3' - I-element 22 1 57.43 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAATCTAAAGGCGACCAGCAAACAGGTTCGAAGCGAGAGAGCCAACTAACCAAATAATAAACAAAACG:1 - chr3L 14205311 3' + P-element 2878 2 68.32 AAATATAACCAAGAAATGCTGTCTCTAATTTAAAGAATTTAGATTATTTCTCATATAAATTTTTGGATGTTAAGCGTTTTGGCGTATCGTAATCAGGGCAG:1 + chr2R 2879334 3' - TLD2_LTR 177 1 63.37 TGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGCTTATGTATAAGTTCTCTGTTTGTGTATGGTGTATTTGTATATTTGGAAATTCGGGAAGAGAATTTCGC:1 + chrX 22659947 3' + opus 493 2 74.26 ATTGGGGTTTTTTCTATTCTCGAGGATCGTATAACAGTCTTTTTCTTTGAAATCCTCTTGTAATTCATTTTGGGTTCATTTACTAAGATAGTTATTGGACT:1 + chr3R 3821166 3' - Idefix 6958 2 63.37 AAAATAAAATCATATTAAAATATATATGAAAGAAGTGGAAGTCGACAAAAAAAATCCAAATGTTATTCTCTGTGTACCTGCCTGTACTGCAAAAGTCAAA:1 - chr2L 4086693 3' - transib1 1888 1 65.00 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTGTTTATTTTTCTTTTGTCTCAAATTAGATTTCATGTCTGGGG:1 - chrX 20835210 3' - roo 33 2 63.37 AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGAAGTCCTTCTATGCGGATTATGTTATAATGTTGCACTGGAACCCATCGCTCTCCCAGCAGGAATTAGCCC:1 - chr3R 16110146 3' + mdg3 5491 2 71.29 AGTGTATGGCTGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAGTTTTGATGTTGAGAGCCTCCAGTGACTCCAATGACATGGACCTCCTCTATTTCCCGAA:1 - chr2R 4122449 3' + 1360 3369 1 57.43 TGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTCCAGCATTGGCATTGGGTTTTGGTTTGGTT:1 + chr2L 10112088 3' - flea 4827 1 73.27 AAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTTTTGGGGGTACAACTTTCTTTTC:1 - chrX 157709 3' + I-element 5175 1 77.23 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAAAATAGACAAGGATAGGCCCAAAAGGACGAAACGCGACCCGCCAGGCGG:1 - chr3R 30326278 3' + pogo 2078 1 57.43 TAAGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGTACCTAATCTGGATGTCAAGGAAAGGAGAACTGTACCGCGGAAGTATAAACCAGAAAC:1 - chr3L 14285985 3' + 412 478 2 63.27 GTACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTTAAGTAAG:1 + chrX 21945942 3' - F-element 29 1 58.42 CTGGTTTTCCTTAATAAAAAATGTTCGCTTTAAATTTCAAAATGTTTTTTGCACACTATTGTTTTCCCATATTTAAAGTCTTGCAAGCTATAAAAAAAGTG:1 + chr3R 21984809 3' + Juan 4048 1 88.12 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACTGGTGTATTTAATGAAATTTTATTCGTAGCATTC:1 - chr2L 12888822 3' + 412 447 2 70.30 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCAATAGTTATCTTAATTTCGACATTTTCGTTAATCTTATATGAACTCAAATCATATATGTTCACA:1 + chr4 306512 3' - blood 7023 2 66.34 TCCTACTAACACTAATATTTAAGATAGTTATTTTACATTATATTCAATGCCTCGTTCCTCGTTTTTTTTTTCTTATGGAGTGAGCGAGGTTATTGACTCAA:1 + chr2R 11595248 3' + Cr1a 4296 1 64.36 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGTTAACATGAAAATCTAAAGGTCTGCCGGCGGCCACAGGCCA:1 - chr3R 17615936 3' - HMS-Beagle 32 2 58.42 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTGTTAATAAAAATATTTTTAAACAGTGTATAATTTCTTAAAAACAGAATTAAGC:2 - chrX 12152646 3' - roo 21 2 58.42 AGAGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGG:1 + chr3R 1977610 3' + micropia 418 2 60.82 TGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAAATGAGCCGACAATAAATGTTGCAGGTCCGACTCAGAAATCTCTTCAGCGAGAGATGATTTTAGCCATTTGA:1 - chr3R 2207671 3' + Bica 4859 1 67.33 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAATTTGACTTTTGTGTGCTGGCCGTTT:1 - chr2R 19092382 3' - jockey 60 1 80.20 TTTTTTGGTGTTACCACCGAAGTAGGCCGCTCTCCGTCAAGGAGACGGTCCTCGAATTGTCTTGCGACATTTTTAATGTTTTTTGGTCTAT:1 + chr3L 9381154 3' - baggins 498 1 74.73 ATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTCAGCAGTAATTCATATTATATTGTATATTAGTATAAATCTGAATATT:1 + chr2R 13805741 3' - Ivk 5342 1 52.48 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGTATGGCTGTAGATCCAGGATGCCTGGTCGCAGGACTATGACAATATTTTGCTG:1 + chrX 14371366 3' - jockey 30 1 60.40 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGTTGTCCCCGCTGAAAAAGATACAAAGATA:1 + chrX 17492979 3' + Tirant 8495 2 68.32 TGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTCTCCTTGGGCACCGTTTTATACTTTATTTATCTGTCGTACCCGCCCACTCAGACTCA:1 - 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chrX 5128838 3' + Doc2-element 241 1 79.21 AAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGCCCGTCTGTGTGCCGGTGTATGATGCCATTTATTT:1 - chr2L 9672421 3' - 297 22 2 57.47 GGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCAACTGACA:1 - chrX 10196075 3' - 297 6596 2 55.45 AAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTTTCATTTCTCGCTTTATT:1 - chr3L 5267185 3' - Juan 3971 1 77.23 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGGTTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAA:1 - chr3L 10576800 3' + roo 9027 1 69.31 TGGAGCTGGGAAAGATGCAGCATTCCCCCAGGAAGAGTGCCCGGCTGAACGGAGGGGAAGCCACCCAATGGCAGAGCTCAGCCACACACACGGCAAAGCCA:1 + chr3L 24059028 3' + aurora-element 456 1 65.35 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACC:2 - chr3R 11080698 3' - I-element 39 1 63.37 TTTTTGATCAATAATGATACTTCTGAAGTGAGTTAGCTAGGGAAACATCCTGCAGATG:1 - chr2R 10257026 3' + Quasimodo 7331 2 74.14 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCAGAGACTATATAATTATGTGATGGTGAAGAATATGTGGTTTATGCGGTATCGCTAAACAAACCTGTG:1 - chr2R 14604625 3' + P-element 2876 1 64.36 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTT:1 - chrX 17492882 3' - Tirant 8124 2 60.00 AATTGTAACATGAGTCACTACATTCAGGCAAACTGCACTGTGCACTTTGATATTTTATTTTATACCTTATTAGCGGTCTCACTTTCGAAAGCGGGCGATTA:1 - chr2R 2947567 3' + mariner2 271 1 63.37 GGCTATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGACAAAAGTCAAAAGTCTAAAGAAAATGTAAAAA:1 + chr2R 2868549 3' + Rt1b 4721 1 52.48 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGCCATTAAACCAAGCAA:1 - chr2R 22570192 3' + P-element 2829 1 21.78 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGCGCTCTCCTCTCTTTTGCACTCGCCACTTCGCACTCTTCTCGCCCACTATTTGGCAGGTCAATGAACTT:1 - chr2L 16276097 3' - 1360 7 2 72.28 GGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACAGTATTTCATCTTCATATTTGATAAATAATAACCTGTGTTGCTGAATTTAATACTTAACCCCC:1 + chr2L 14993482 3' + 412 7534 2 66.34 AATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGAAGTGACACTAAAACTCAAAAGAGAGTTATATTTCCCAAACATTA:1 - chr2L 23374405 3' - Idefix 7045 2 55.45 CGATCTCAGGAACTATAAAATCTAGAATGTTGAGATTGTGATGATGGGTTTCGTTGGGCGGTGGGGTTCAGTGAACGCCTGCTTGGCCTTGACTCAGAAAG:1 + chrX 14767841 3' + INE-1 149 1 65.35 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTATATTTTATAACCTGTCTTCGGCAGATTTAATCTTTGAAAAACCACTTG:1 + chr3L 21410161 3' + opus 7478 2 59.41 TATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATATATATGTGTATATTTTTTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGT:1 - chr3L 14854698 3' - mdg3 5288 2 58.42 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTCTGCTTGATTATGTTGATTAAACATGG:1 + chrX 12166580 3' + pogo 2058 1 71.29 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAGCATATATAGTGGGCTACGTTGCTTGCCAAATAATTCCAATTCAATTTGC:1 + chrX 10196173 3' + 297 6960 2 68.04 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGCCCCTGTATTTTTACTGACTCG:1 + chr2R 1725924 3' - Doc 50 1 80.20 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGTGATTATCTTATTAAGTATGGTTTCCACC:1 - chr3L 4539167 3' + roo 9028 1 69.31 TATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACACCACAATACACCAGTGTGTGTATTATATTTAACTTACATTTAACTTCTGATATAATTATTGATACC:1 + chr3R 4600898 3' + Burdock 6383 2 71.29 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGCACCAAACACTCACACACACACACATAAGCACATACACACACACACATTCGCCATCGAGCATTTGTGTGTA:1 + chrX 12882021 3' + hopper 1412 2 61.39 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGTAGCCCCTCGGGCACTCGAGGATTAAGCGAGCGAGCTACAAGACTGAACACTGAGAGCTGC:1 - chrX 21219404 3' - roo 12 2 68.32 ACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATTTTATATATCCATCTAAATCCATATAATATAGCCATCTAAAAGTTTACGCTGGAAGGG:1 - chr3R 15130458 3' - Max-element 17 2 54.46 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTC:1 - chr2R 981624 3' - 1360 2 2 62.38 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATATATATGTGTATATTTTTTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACT:1 - chr3L 14854674 3' - mdg3 5264 1 62.38 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGGGCATAACAACAACTGGTTTTACAACGCAACATAAAAAAAGGATACAGTGAAGCTTCGACTG:1 + chr3R 28326514 3' + P-element 2875 1 67.33 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACACTACAATGAAATCGACAGCACGCAATTATTTTTTG:1 + chr3R 5284989 3' + roo 9027 1 74.26 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGAGTGAATTAGTTCTAATACGAAACACAACGAGTT:1 - chr3L 19066088 3' + roo 9032 1 64.00 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGCTTCTTGTGATTTACAGCTCTTACATATCAAGCACTTCTTTAAA:1 + chr3L 10305389 3' - 412 31 2 54.46 TCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGAAAGCTGTCCGTGATTTATAGGCCACAGCCAGCTTATTTCGAGTCATGCATCTT:1 + chr2R 14402326 3' - Tabor 6861 2 57.43 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGGGTCTCCGGCGACTGTTTGAAATTCATGACTTGTTTAGTGCACATGCCGCATAATGT:1 - chr3L 17767642 3' + hobo 2921 1 60.40 GCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTCCGTCGCCCAAACGCCAGGATCCCAAGCCCATCATCACCACGACCATCGTGCACTCACAAAAAAATTGCCCAGA:1 - chrX 2567574 3' + Rt1b 5086 1 62.38 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGG:1 + chr3L 3535452 3' + roo 9043 1 55.45 TTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGCATTTTTCTTGTTTTTAACTAATGTCGCGGATCGATAATTGTAA:1 + chr3L 24402217 3' + INE-1 531 1 63.37 CTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCTTAAAAAAAATGAAAAAAAAACCCCAAACGAAACCATAATTTAATAGCAGCT:1 - chr2L 9197502 3' + mdg3 52 2 58.42 CTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATACATCTGTCTACTTCTAGACTCCGAAACCCA:1 - chrY 425006 3' + McClintock 6387 2 72.28 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCATGATAGATTTGTGCCATTTCATAGGAAAACTGAAATCGAACCAAGCTAAATCAAAAAATGAAACCAA:1 + chr3R 10187456 3' + roo 9064 1 71.29 ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTCTTTCTTTGTCCCACACTCGCTTTCAGTTTGTTACATAATCAGCAGAAATTTCATTT:1 + chr3R 23870161 3' + roo 9061 1 66.32 ATATGCTATGTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAATAATGTTTAACCTCAAATAACTGA:1 + chr3R 19515874 3' - 412 29 2 51.49 TCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAAAAACCAAAAAAAAACAAAAAAACCCAAAAATACCCGAAAGTGAAAGTGAAGCGATTTTGCGACGCCTCCCGAAGC:1 + chrX 12948780 3' + 297 488 1 77.23 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCAGACCCGCCACCTCCGCGCTCCATGGCACCCTTTTTTTAGGACAGAGCATCAAGTT:1 - chrX 14953576 3' + P-element 2866 1 57.43 TTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATGGGTATAAAAATATACAGAGATAGAT:1 - chrX 15408715 3' - INE-1 500 1 90.10 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCTTTGCTCTGCCGAGAGCCTCTGCCGCTGGCGACTGCGACTGCGCTGCCTTT:1 + chrX 13640334 3' + P-element 2881 2 74.26 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATCGTCGAGCAATGCAAAGCCGACAATTAAGATTACGGA:1 - chr3R 30263554 3' + roo 9041 1 63.54 TGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGCAAGATGTGCTTAACGTTATCAATTTAATGAGCCAAGTTGGGAATT:1 + chr3L 9127599 3' + copia 464 1 68.32 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGCAAACCGTCTAAATGCGATTGGTTTTCGGACATTGGGAAAATTCCTC:1 - chr3R 11936887 3' + roo 9044 1 54.46 TCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + 297 178 2 51.49 ACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGAT:1 - chr3R 23020810 3' + INE-1 581 1 60.40 ACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACTTTAATCTAATCGTTCATTTTATATTGAAAAAAATGTGTATTTTGACAGACAATTTTCATCA:1 - chr3R 13641672 3' + invader2 24 2 67.33 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGT:2 + chr3R 19513398 3' - jockey 4709 1 67.33 GCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTGCACTTATTTATTTTGTATAATAACTCAATAATTTC:1 + chr2R 20010150 3' - Ivk 42 1 64.36 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAATCCCTATTAATGCCACGCTAGGCTTAAAACTAAAAAACCATTTTCTCCTTGCTGTA:1 + chr3R 7879904 3' + 1360 3370 1 60.40 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGTATAAAAAGTATAACGTAAATATCTCTT:1 + chr2L 21631878 3' + pogo 2054 1 76.24 TATATTCGTGTTCATGTGTGAAAAGTTCCCAAAAACAAACAAAATGTAACAACGGAGCACAAAACACAAAAAAACTAAAAGAAACTAAAACTTGAGGAATG:1 - chr3L 10576732 3' - roo 3 2 79.21 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTGGATTTTAAGTTCGACATTAGACTAATAACCAGGGCTTTT:1 - chr2R 20593344 3' + copia 249 1 58.90 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCACCTCGTTTCTTTTTCTTTTATAAAAAAGCA:2 - chr3R 19515793 3' + 412 470 2 55.45 AATATTGCATAGGCACATACTACAGTACAATTTGTTACAAGTTGACTAGGGAAAAAGCTCTGCCTGTATCAGGTAATCAGTCTTGACTTGACTGCTGGCAA:1 - chr2L 9129098 3' - 412 3 2 76.24 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAAGCGAAAGTGAAAGTGATGGCTAGCGGAATGAGAAAGAA:1 + chrX 9523772 3' + hopper 1381 1 56.44 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTAAAACATAAATACACATTTAATATGGCGCTTGCTTGCGTGATTTC:2 - chr2R 9972714 3' - Doc 36 1 53.47 GTCGTAATGATATGCCAACCCAACGAAGAACCCCAACAATTTTGCACACGTTGAGTATCCGGTAGTGTCCATCGAGCGATCAGATCGACATCGA:1 + chrX 1642146 3' + Fw2 3807 1 80.85 GTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTTCCTATTCTTTATTTGCCTTATTGGTTCTTGAACCACTGTACCATGTTG:1 - chr2L 23049058 3' + McClintock 6113 2 66.34 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGCAGAAAGGAGTGAAACCCTTG:1 - chr3R 25514101 3' + hopper 1394 1 58.42 GAAAAGTAGGCCTCAACGGCAATGGTACGCTCCCCACCTCTCACGCAATCCTGCACCACCTGAACCAGCACCACCAACATCATCATCACCATCATCATCGC:1 - chrX 7594077 3' - mariner2 162 1 69.31 AAGCGATCAGGCCAATCTGGACGTATGGCATCCAATCTCCATTATTCATCTGCCATTCCCACTTGGCAGATTTGGTCAAGCAGGGACGCGTCAAGCGGAGA:1 - chr2R 4932820 3' + G7 838 1 74.26 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTGCAACTCCCTCGACTACAAATATTTGTGCTGCAGACTTTCATTAGCACTGAAATGAAGAAGTAAA:1 - chr3R 9328654 3' + hobo 2937 1 69.23 CGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACCGGGGTCTAAAGAGAGCGGTGGCTGGGAAAAAGGAAGGAAGGATGGGAACTTGGATGCCCACTTCA:1 + chrX 22597372 3' + 412 256 2 71.29 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAAATATACAATTAACTCCTTAAATAGCAAATGATTAAAGAAATGCTGGAGTGACATTTC:1 - chr2R 11835601 3' - I-element 21 1 63.37 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATACATACATCAAACATTGGGGAAGGCATAAAAAACGT:1 + chr3R 5429656 3' + roo 9030 1 67.00 GCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAAACAAAAATTTATTATC:1 + chr3R 4583046 3' + Cr1a 4388 1 77.23 TCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTT:4 - chrX 17492885 3' - Tirant 31 2 57.43 GCACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTCACTAATGAAACCCCCCACAATTCAGTTATCGAGCACTTCCTGGCCGC:1 + chrX 21238822 3' + accord2 7287 1 65.35 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGTATGGCTGTAGATCCAGGATGCCTGGTCGCAGGACTATGACAATAT:1 + chrX 14371359 3' - jockey 37 1 53.47 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCG:1 - chr3L 25884094 3' - Doc 45 1 64.36 CAAGCACACACACACACACACACACGCACACACTTTGCGGCGGCGGTTTCATTTGCCCGCATTAAAAATACGGCTCAGTGTTTACTCTTTCCT:1 - chr2R 13306429 3' + accord 180 2 78.49 ATTCCTTGCAGCGTGCAGCAACACTCGGAATAAGAAGCGTCAGCTTTTCACTGCCAGACGTTGTTTGCGCAGAGCGCTGAACCAAAGACACTAGAATAA:1 - chr3L 11474690 3' - gypsy 137 2 68.69 TGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTCCGAGGACTTTCGGAGTTGGAA:1 - chr2L 1936548 3' - blood 331 2 76.09 TTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTATGGCGACATGTGCGCAATTTCCCCTTTTCCCAAGCCA:1 + chr2L 1528511 3' + roo 42 2 70.30 CATCAACTAACTAAATGGCGCATTTAAAAAAAGGAAGAAACTAGGTCAGTTGGTGAGAACAGTGCCAGTGAGCATCAGGAACGGCAATACGAGGTACATCA:1 + chr3L 25847275 3' - 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chr3L 7733834 3' - flea 43 2 76.24 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTGAAAGTGCCATTGTTCGTTCATTTGAGTCCGTCGCTC:1 + chr3L 13555629 3' - hobo 40 1 71.29 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGT:1 + chr3R 19513404 3' - jockey 4703 1 61.39 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTGGCT:1 - chr3L 9190438 3' + 412 7529 2 61.39 GTCGGGAAAGTGGACTATAGCATTCTTTATTATTTATTATGGGGCAGTGAAACACTCTGGGGCCCACTTCAGCGTCCGGAAATTAAAACTTTTTTATGGTC:1 - chr3L 22915462 3' + INE-1 568 1 60.40 AAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAGAAGGAGCGAGTTGAAAAGATCAAGGAGAAGGAACGAGAAGAAAAACTAAAGAAAGAAA:1 + chrX 11831299 3' + mdg3 5052 1 68.00 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTCTGCTTGATTATGTTGATTAAACATGGTGCTTGTGGATTAAGTGATTAAATGCCAAAGTGGTT:1 + chrX 12166616 3' + pogo 2094 1 70.30 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGC:2 - 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jockey 4789 1 58.42 TTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTTATAAACAAA:1 - chrX 11503477 3' + roo 9027 1 71.29 AGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTTTGGATTCCAAACCCCATTTGTGACAACAGGCGTACCTTCTCTATATGTGTACCTATAAGACATAAGATATGGCAG:1 + chr2R 13720501 3' + hobo 2938 1 65.35 AGCAAATGGAAAAATATCGCAACAAACTACGTGCACATCCGATTGAATAATAAACTATGAATGAGTAACAAACATCTCAGCACTCCTCACTTATCTAACGC:1 - chr3R 4956330 3' + Fw2 3717 1 67.33 GGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGCAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCC:1 - chrX 17492900 3' - Tirant 8118 2 56.06 CAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCA:2 + chrX 21945924 3' - F-element 47 1 63.37 GAGCTTCGAGTATAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGTACTTCCCACTTATTGCAAATCCAAGCCAG:1 + chr2L 16758315 3' - Max-element 8282 2 68.32 TGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGAAGGAATTAAAGCATAAAGATTTTTAAATTGTTTAAAAATATTATTGTTTTTATACTTATACTTAAC:1 - chr3R 11150984 3' - mdg3 47 2 73.27 GTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATAAAATATTGTATATACGTGTGATGTACATATATACATAGTATTAACAAAGACACTAGA:3 - chr2R 19502072 3' + Tabor 468 2 61.39 GAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATAACAATAGTAGTAGCGCCGGATGTGCACAATGATCCGGTGATCTGGACTGTGATCGGGATCTCTTC:1 + chrX 16119150 3' + mdg1 30 12 52.58 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGAAAATATAAATTATAAATTACAACATTGCCAGTAGCCACAATCTGACATATTGGAATGTCAAACTAATGAGG:1 - chr2L 15194697 3' + copia 223 1 55.45 GGTGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTTTAAATTTACCGTGGCCTTTAAGTGTCACACCAGCGACATCTATGGAGTCACAGCGCCAGTCGCTAC:1 + chr2R 14434367 3' + invader4 3082 2 69.31 GTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTTTGACCTGGTCATGGATATTCTTGTTTGCCGTTTGAAGCGATGTGCAGTTTACCCGCCCTTCTTTTGTTGTATT:1 - chrX 8998697 3' - Quasimodo 291 2 79.21 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGTCATAAATGGGGGCACAAAGTGGAAAGTCGGAAAGGAAGTTGACCTCCGACAATCGTGTTTCTCTT:2 + chr3R 21198695 3' - Tirant 10 2 71.29 GAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATATGAGTGATTTATTATTTTTTGCAACTGAACCATTCTTAATA:1 + chr3L 17762842 3' + invader3 5428 2 62.38 AATAATAATAATATAAAAATAAAACCGCGGGAGTATGCGTATCAATTTCCGAGCTGTGCAGACCAGCTGAAGCTCTTTATTGACTCAATCTTGGCAGCGTA:1 - 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chr3R 1586476 3' - Doc3-element 4608 1 59.41 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGCTTGGATGTAAATAGCTTCGAAAATCCTGATAACAAGTTCCGTAAACT:1 + chr3R 22698994 3' + roo 9044 1 53.47 AAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATA:1 + chr2R 5531173 3' - 1360 80 1 60.22 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGGGT:1 + chr2R 17348621 3' - jockey 28 1 51.52 TAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGACACGACATATAATTGAATATGACACGCCAGAAAACTTAATAGAAATATTAAGGAAGTTTCTAAAAC:1 - chr3L 24355923 3' - micropia 21 2 65.35 GAGGGTGCTCGATCATCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGGGTTTACTTAAAAAAATTGCAATATTTCGGAACAACAAAGTGCAAAC:1 - chr3R 12053675 3' - Doc 313 1 53.47 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCTGGCTTGTGGGAACGAAACATTCCATATATATTACGAAGTGTAATTCATCAAAATTTTCACGAATTTAAA:1 + chr3R 16399030 3' + roo 9064 1 66.34 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTAAAGCCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACA:1 - chr3R 4571527 3' - blood 7038 2 53.00 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTCTCGATATATTTATAGGCTGGCAGGGCATAAAAAGCGATTCCAAC:1 + chr2R 14046418 3' - jockey 4703 1 56.44 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGTGGTATATAAATATTTTTCCTCGCTCGCCTGAAATATA:1 + chrX 13547236 3' - I-element 38 1 66.00 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCTATTTACATTTATGACCGCCGGCAGGCAGCAGAA:1 + chrX 7019245 3' - hobo 41 1 70.30 TAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAATTAGCTAGGAAAGTTATGCATAGC:1 - chr3R 21710576 3' + mdg3 5446 2 72.28 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAGAAAAAGACGTTTGACGTTGACACAATGTT:1 + chrX 15219417 3' + hobo 2892 1 69.00 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAGAGCCTTTGTAGTTTCACGTATGGTTTCCTCCAGAGTTTTCACATC:1 - chr3L 27145333 3' - 1360 31 1 57.43 ACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCAATCAGCCGAGCCCCCACTAATT:1 + chrX 17798678 3' + G2 2831 1 77.23 GGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGAGAAGTGGCAGTGGCATTGTTGCCCGAGTGTGAGCCTCGATTGATTGGGTACAGTTATG:1 + chr3L 14152725 3' - Quasimodo 7026 2 61.39 CATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGTATTCAGAATGCGTGTAGTTCCATTACTTTCGG:1 + chr3R 20240931 3' + Tabor 442 2 67.33 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTTATTCTAGCAATTGCCTGCACTATGATGGCTATGGCTTTCATAAGGTGCT:1 - chr3R 20182966 3' - roo 8688 2 54.46 CCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGCCAATACTCCCGGGTGATCCGTTGGCTGATGGGTGGCTCCTCCAATTGTTGACAACTTGT:1 + chr3R 25693551 3' + jockey 4684 1 63.37 CACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAATCTTTTTATTGTTTTATCGGTTGAGCCCCCAAATGTAGGATATTTATTGTTTAACACAATTGTTTATCT:1 + chrX 22426262 3' - 1731 4321 2 68.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGAGTGAATTAGTTCTAATACGAAACACAACGAGTTTGGTTTGTTAGTTATTAGTGGCTTGTAAAA:1 - chr3L 19066058 3' + roo 401 1 76.53 ACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAAGGGGAATAAAAAGGACTGGTAGTAAAAAGTGAAAATCTTCTCACTTTATCTGTCATATATCAATTCC:1 - chr2R 25216515 3' + 3S18 339 2 78.26 TTGGTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGACTAAAGTCTAATGGGTTTATACTTTATTTTTTTGTTTGGGAAAAGATTTACATT:1 - chr3R 11912092 3' - I-element 65 1 45.54 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTCCATTGGAAAAAAGCCCTACATTCA:1 + chr3L 17635572 3' - 297 6624 2 75.25 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAAGGCGCACCA:1 - chr2R 22746041 3' - hobo 40 1 63.37 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTTAAAATCAAATATGCGTGTGCTAT:1 + chr3L 1687555 3' + copia 238 1 75.25 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAAATAAAATCACACACTAAGGCGCCAAATTAGCGCG:1 - chr3L 8256095 3' + jockey 4956 1 69.07 AATAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGGGAAACCGAAACAGCAACAGGAGCGGCAAAGTGGTTGGGGGGAGATCCATGGCAAACAAGCCAAGGAGCA:1 - chr3R 17335872 3' - hopper 2 2 75.25 ACGAACCATTCGCAACCGGTAATCATCCTGGAGATTCTGCTTTACACCTATGTAACAAACCGATTTAATTGGTCTGCTCGCTACAAGATACGCGAGGCTAG:1 + chr2R 552597 3' - BS3 1392 1 65.35 TGAGAGCCGGCGATCGTCATGCTCGCGTTGTCACTGATCGCGAGTGTCGTTCTGGCTCATGGTATTTTGTTTGAAGGGGACTAGGGGGTCAGAAGAGTATG:1 + chrX 13857263 3' - Doc2-element 320 1 74.26 GAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGAAGCTCAGCATTGTTCTTGTCCATGTCATTAGTAAATGATGTTTTAAAGTGTTCAGCAAGA:1 - chr2L 23039522 3' - McClintock 127 2 66.34 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGG:1 - chr3L 25884084 3' - Doc 32 1 53.06 AGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTTAAGTAA:2 + chrX 21945941 3' - F-element 30 1 57.43 GGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGTACCCTCCACTACTTTATAGGGCGGACAAGGCTTTGGTTTTCTTTGTTTGCGTACAGTTCCTTTTTTAGAGTTT:1 - chr3R 5555878 3' - mdg3 5254 1 77.23 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATCGGAGGACTCCAAGGACTGAAGGCAGCGCCATAGTC:1 - chr2L 22747285 3' - transib2 41 1 66.34 CATACACATACACACACACACACACACACAACAGGAGCCATCGAAACGATAGCGGGAGGAGGTGCTGAGTAGTCCTGCGACTCATTCT:1 + chrX 6914121 3' + Quasimodo 30 2 72.73 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAATAATGT:1 + chr3R 19515856 3' - 412 7100 2 71.29 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTCGTTCGATTCGCTTACATGCTCCTTTCTTGCTTAAGAAGCCAGACGCATCTGGT:1 + chrX 21050026 3' - 297 6601 2 60.40 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGTGTGTGTTCATCTCGCTTTCCCGGTAATTTTCAGGTGGAAAGAAGCCAACTTCGCAGAAGTCTTT:1 + chrX 9649991 3' + blood 7377 2 66.34 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCCGCAAC:1 - chr3R 4546032 3' - jockey 4776 1 60.40 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATT:1 - chrX 10196094 3' - 297 6615 2 63.37 CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTTCAATGCATTCAATGGCGGCCCAGACGCCTCATTAGCGCTGCGATTCGCAAGCC:1 + chr3L 20862905 3' + hopper 1396 1 61.39 TTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGT:1 - chr3L 24210925 3' + HMS-Beagle2 7141 2 77.23 TGTCTTCCTCCTTCGTACACTCTCCTGGACAAAAGTCCCCAAATGTTTTCATTAATGTTAACGAAATTGCTTAGTTACGGAGTTCTAGAGTCGGTTGGGCG:1 - chr3L 24242311 3' - Tc3 1278 1 58.42 ATATCAAATATAGAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATACCCAGTCCTCCCACACACACACATGCATAGAAAA:1 + chr2R 20593400 3' - copia 42 2 64.36 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAAGTTTTGTTTTCGGACTTAGCTCTGAATTCGCTCTGTTTACTCCGGAAATTACCACCTACTGC:1 - chr3L 4692226 3' + P-element 2878 2 67.35 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCCTGATCTTCTCAATCCTCGAGAATTGGCTCCCAGCGGCGCCCGA:1 + chr3L 12025663 3' - blood 7045 2 58.42 CAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCAGAGAAGCAGAGGGGCACTAAGCATTATGGACCGGCCCTTATCACGTAGCCCTAG:1 - chr3R 30525121 3' + P-element 422 1 60.40 CTACAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGACCCTGCCATTCGCCATTTTTGGTTTCACCTTCGTTGCTTTTTGTTGCTTGTCG:1 - chrX 5128846 3' + G2 3074 1 71.29 TATTCTATCTATCATAATAAAATAAAATAAAATAAAATTCCTTAATGTTTTCGTTTCTATTTTGCTTTCGATGGGAGATGAGAGTTATTTTGAATTTCAGA:1 + chr2L 18626689 3' + I-element 5346 1 64.36 AAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAAAGGGTCAAACTGCTGACGTGGTTACATCAAGCTACTTTTTCAGGATGCATCGGTGGTTCACGGAACT:1 + chr2R 2094982 3' + Quasimodo 309 2 58.42 GACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCACTCCCTTGCTCCGTCCCTCCGACTGTTTA:1 + chr3R 30563705 3' + mdg1 447 1 70.30 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCATATCTACGGGCGC:2 + chr2R 17348638 3' - jockey 14 1 66.34 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATTTACATAAAAACATAAATATCATATATATAAATTGTGAGCTTCCTTATTTAGCAACCAGTTCTTG:1 - chr2R 10334714 3' - pogo 6 1 75.25 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATAAGCTCGGATTGCCGAATCTAGATTCCTTCTATGTCCATA:1 + chr3L 15869728 3' - pogo 28 1 56.44 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAGATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCG:1 + chrX 21945915 3' - F-element 56 1 72.28 GCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATATGAGTGATTTATTATTTTTTGCAACTGAACCATTCTTAATACCAACAGAAGTCACTACAATAAAGTTTT:1 + chr3L 17762870 3' + invader3 5456 2 71.29 CTCTAAGGGAGTTATTTATTGTAACGACCTTAGACACATCTACGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAACGATAAAAAGAACATATTGTATAAGTCATAA:1 - chr3R 27562815 3' + I-element 486 1 75.25 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGCACACAGATGCTCACTCACACGGAGACG:1 + chr3L 15056974 3' - 412 49 2 75.25 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGTATGGCTGTAGATCCAGGATGCCTGGTCGCAGGACTATGACAATATTTTGCTGATGCCAGCGCA:1 + chrX 14371377 3' - jockey 19 1 71.29 TTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTC:1 + chrX 8027506 3' - Juan 19 1 60.40 AAGGAGCAGCCTACTACACGTCCGCCGTCCCTTTCGTTTCGAATGCTACTCTCTCTTTCTCTCGCTCCTTTGCTCATTTTCTTTTCGTTTATTTTCCCTTG:1 + chr2L 19684350 3' - mdg3 5249 1 50.50 TTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACCACTTCTACTTTTATTCGCTCCCCCATT:1 - chr3R 13612485 3' + Doc 299 1 72.28 GACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGTACAAGAGGTGGGTAGGGGGCCCTAGCCAAAGGGAAAATGATGGGGATCGGGGATGG:1 - chr3L 19173523 3' - transib2 17 1 62.38 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTA:1 - chr3R 19450177 3' - roo 46 2 58.42 GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGGGTATGAAAACTGCAACAAAATACAGTAGCTGCAATACGAGATGC:1 + chrX 21494681 3' + transib2 2795 1 62.24 ATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTG:2 + chr3R 15790088 3' - flea 4722 1 65.35 TATAAAAATATTAATTAATTATTTTTGTTATGTTGCTGTTACTCGGCAGGTCATTCAGTCATTTAGTCGGACTTTGAAAAATAATTAAAACTTGTCGCAAT:1 - chr3R 18691670 3' - Tc3 272 1 55.45 TTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACGAACGACCTTCTAGAATTGTTCGAACTGTACGACTGTCTGGA:1 + chr2R 5037396 3' - flea 4979 2 64.36 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACTCCATGGCTTCACACATAAATTCGATTGGTTCTCAAAGGGGTAAAACACGCATACACGTGTATTTTAC:1 + chr2L 13038782 3' - hobo 9 1 70.30 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCAT:3 + chrX 21945925 3' - F-element 46 1 62.38 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTTGACCACCCAAATACGTCACTATATATAGTATATTAACTAAAATCTCTACTGCCGCTCT:1 + chr3R 6138310 3' - 297 6623 2 71.29 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCAAATACTTACCGAAGACTATAACTACTAGATTCCTCATCTTCATTTGGTTCAATAA:1 + chr4 305040 3' - 1360 23 1 58.42 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTATAAATAATTGAGCCGGGAGCACCGTTTAGC:1 - chrX 5892466 3' - I-element 61 1 69.31 GTCCGATGATTCGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGT:1 - chrX 17492886 3' - Tirant 8139 2 56.44 CAATTGCAGGGCAATAACTTATACATATATGAATATTTCATATGAATTTCCTAAAGGTAAACCCTCAATTATCCCATGGATAACATCCACACAACCATCGA:1 + chrX 13188674 3' - HMS-Beagle 6794 1 38.61 CATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCAAGTCG:1 + chrX 8027512 3' - Juan 13 1 66.34 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACTTTGCTACATGTGAATTTTCTAGAACACACGTATCACGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATA:2 - chr3L 25245595 3' - Tirant 13 2 66.34 TCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTAGTGCTGAGCGAGCGAGCGAGAGAGCGCAACGACTCTCGCTCTCTTTCTGTCGTGAGAGAGCGAGAGAGTTTGCTGC:1 - chr3L 10737170 3' - 1360 216 1 78.22 AAAAAAAAATAAAAAAAAAAGTGTGGAGAAGAAAAA:1 - chr2L 8627487 3' + HMS-Beagle2 489 11 77.78 TGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGC:1 + chr3L 24210977 3' - HMS-Beagle2 6907 2 52.04 GTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAATAAGAAAAACGACGGAGACGCCAGAGGAAACCAAC:1 + chr2L 4045792 3' + F-element 4623 1 65.35 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTAGTGTAATTAGTGCTTATTGAGTGGGGATAGTGCATTCAAGGCAGCGGAAAATCAA:1 - chr2L 479313 3' - P-element 20 1 59.41 CAATCGCGAGCGGCACGACATGCATCTGGGCTACCCTGGTATGTGACCAACGGAGTTATTGAAAGGGACGTTGGCACCAGGGTGCTAGGCAGCTGCGGCAG:1 - chrX 2425499 3' + G5A 2494 1 66.34 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTTTTATTTATTCATATTTTTGACAGTCCTT:1 + chr2R 7769686 3' - pogo 44 1 74.26 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCATTAAGTAACAATGCCAAGCTGAACA:1 - chr3L 12217328 3' - roo 51 2 79.21 AAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGCGTAGGATACCAGTAGTCAGGATGAGCAGGACT:1 - chrX 2843238 3' + Quasimodo 218 2 64.36 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGATTAAAGACCACAGTTGCGGATCCATTTCACTGGATG:1 + chrX 17432459 3' - hopper 37 1 62.00 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAAACCTCGAGCGATGATCGCAGG:1 + chr3L 2992646 3' + hobo 2891 1 76.04 GAAAATAAATTGTTGGAAATTTGAAGTGGTAAGTTTGATTAAATGTTTGTTCGGTGAACTTTGGAATTCATTTCGTAACCCAATTTTTAAAGTGTGTATTT:1 + chr2R 21878172 3' + R1A1-element 146 1 88.12 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATG:1 + chrX 21219480 3' + roo 9027 1 69.31 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGTCCAACATGAGCTTATGTATCCGTGCACTTTTAGTTGAGGTCTTCAGTGCATCAAGCAGGGAGGTGATGA:1 - chr3R 2556015 3' + 412 7539 2 71.29 TTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGATAAAAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAA:1 - chr4 1294988 3' + TAHRE 10413 1 79.21 AAAAAAAAATAAAAAAAAATGGCAGTAGCAGCACTCCACCGCCATTTGCTCCTCCTTCTCTACATCCACGTTCACATCCTTCAGAATCCCCCTTGCTCAAC:1 - chrX 15190846 3' - hopper 141 1 68.32 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTT:7 + chrX 21945904 3' - F-element 67 1 77.23 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGCCCAAAGAGAGCAGGATAGGAGCACGAGGATGCGGA:1 - chr3R 28135273 3' + hopper 1377 1 62.38 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTGAAACAAACGTTTTTGTTTCACACAC:2 - chr2L 3842852 3' + roo 9022 2 76.24 TACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACATAAAACTCGTATTTTCATTGCGCAAAAATAGCTAATAAAAACAGTAATTAATAA:1 + chr2R 1994956 3' - Idefix 7132 2 65.35 AAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTT:3 + chr3L 24210991 3' - HMS-Beagle2 6896 2 64.36 GGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAGCCTACCGTGATTAATATCAATCAACAGGCTTATAATGCCTGCTTGAATTTTTTCGCCTTCTTCAATCAATGA:1 - chr3R 19448851 3' + roo 121 2 77.23 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAGCGTGGGTTTTATGATTTATGGCAAGAGTGCTCTTTTGTGGCAACTTGGCTGAAAA:1 - chr2L 19982997 3' + roo 389 2 59.41 ACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACCACTAACACCACACATACACCCACACATACACATAGCGTATCGATCGAGTAATTGCTAGGTTTGTTTT:1 + chr3R 20798762 3' + accord 162 2 77.23 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACATCCACCCAATCAATTGAAATCCACAACGTCATTTAACCACATTAAGCATACGC:1 - chr2L 15151860 3' + Tabor 7303 2 57.43 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTGTGTGTGTGTTTGCGCTTTCAATTCCATTTCCACT:1 + chr3R 19513431 3' - jockey 4676 1 71.29 CACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTGATCAAATTTGTGACAGCATAAAAAATTACGTTTTTGAAATTTTACGTTGCCGCTTTTTAGGCGTCGCTGG:1 + chr2R 17277650 3' - jockey 14 1 52.48 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAATACCAAATCCAACTTAATACGATATGTTAGTTTGCGCCAACATGTTAAAGCAGAAAGAC:1 - chr3L 2170934 3' - 1360 17 1 61.39 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATCTATGTATGTCGAACTATTTGCTTCATATCATAGGGATTATTTTTAACGTT:1 - chr2R 17697195 3' - pogo 25 1 54.46 TGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCCGCCTTCATCGTTCACGCAGCTCTCACGCACTCTTTCGGAATT:1 + chr2L 7537106 3' - Bica 126 1 78.22 GTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTTATGTATAGCATTGTACAATATGCTGGCGTTGATTGCGCATGCATTT:1 + chrX 9722844 3' - Idefix 193 1 53.47 CGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACACATGTCCACATTGATGACACTAAT:1 + chr3R 23173157 3' - Burdock 6184 2 75.25 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCG:1 + chr2R 1725924 3' - Doc 49 1 70.00 TATTAAATTCTTTTAAACTTTAAATGTGTAATTAAAAAAGATTCAAGAAATAAATAAATAACATCCGATCAACTTACGATTCAGTGATCTATCGTAACGGC:1 - chrX 7778548 3' + Tc3 1525 1 61.39 ATTATTCTAATGAATTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCAC:1 - chr3R 4546064 3' - jockey 4809 1 72.28 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACGTTGAAGTTTCTGGAGCAGAGTTCTTAACAGAAGTGGCCATCACTACTGGCTCCTCTGTTGT:1 + chrX 1822462 3' + roo 396 1 66.34 AATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGCGAACA:1 - chr3R 31887753 3' + HB 1563 1 74.26 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAATTATATTCCGCACAATACATATATTAATCCA:1 - chr3R 3920671 3' - I-element 38 1 65.66 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCATTAAGTAACAATGCCAAGCTGAACATTGTCCTATCCCCCAG:1 - chr3L 12217312 3' - roo 35 2 63.37 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTTCTTATGTTTTTATCAATACAAATTTC:1 - chr2R 20506828 3' + mdg1 7413 2 71.29 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGTTTTCGCAGCA:1 + chr2R 1725954 3' - Doc 19 1 66.00 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAACAACAGGAGGGCTGGAGGAGATCGGTGGGTTGGCGA:1 + chr2L 11073823 3' + roo 9029 1 64.36 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGACGCATATTCTAGAACCATTTAAAAATTGCGCCTAAAAGCATGCAAGGAAAATG:1 + chr2L 478765 3' - jockey 4787 1 53.54 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGTGGGGTGATTCTATCTCTCTTAGTT:1 - chr3L 6869296 3' + roo 356 2 74.26 ATACTGTTGTAGATTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAAGACGTCTCCACCCGAAGACTGTGTTATATGTAGTTAATATTTATATTGTTCCGC:1 - chr2L 16668621 3' - Doc 62 1 70.00 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACT:1 - chr3L 9190476 3' + 412 7491 2 79.21 TGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTT:1 - chrX 3446527 3' - I-element 36 1 64.36 CGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACTTCCCACACTACAGAGAACAAAAAAAAAATTGTTAAATATTTGTTAATAACGGATTGTATT:1 - chr3L 12255237 3' + roo 114 2 69.31 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACACGAATGCGGCGCTGCTCTCTCTATTTTTTCCGCTCTCACCTTTTGGCTTTAGTATTATTGTTGTTTC:1 + chr2R 14575897 3' + pogo 2095 1 73.27 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACAGTTTCGGTGGCAACGTCAAGGCATTCGCACGATCCGAACAGAAACTGGGCGATCGGGC:1 - chr3L 5351482 3' + P-element 2872 1 64.36 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGCTAGCAGTCACTAGTCCACTTTTCAGAT:1 + chr3L 14286076 3' - 412 7077 2 55.45 TCCCTTAGAGAAATTTAATCTTTTATGTTCACTTGCTGTAACACCCACATCTGCAATTATCGTTTTTTAACCGTTTTGTGTGTGTGTTGGGTATTTACAAT:1 + chrX 9667557 3' - I-element 474 1 57.43 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACACACACTTTTCTGTGCCGAAAACAAAAGTATAC:1 + chr2L 8898933 3' + roo 9030 1 64.36 GCGCATCATTATAATAACAGCTGTTAAAGTCAGCTGTTGCGAGCACACTGCGTGAAGCATTGTCGATAAGGAGCAGCAAAACACGAGAGTGTGAAAAATGG:1 + chrX 12882130 3' - hopper2 1472 1 52.48 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCGTTTTAATGACGTCATAACTCAAACACAACATCGCGTGCAAGGGCCGCTAACCTGGCTAGAAAGG:3 - chr3L 9190431 3' + 412 483 2 68.32 ATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGGGTGTTGACTTGAACAATTTATAACAATTTTACCCTATG:1 + chr3L 16765482 3' - I-element 5239 1 61.39 GAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGAAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGTGACAAAGCGGCCCAAATGAGTTTCATC:1 + chr2L 20369756 3' + invader2 478 1 77.23 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCA:1 - chr2L 13598196 3' - pogo 40 1 66.34 AAGAGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTGGCAACTTTATAATTGTTTC:1 + chrX 12051468 3' - I-element 154 1 78.22 ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTACCACTTTTCCAGGAAGTGTTGAAAAAGTGGCTGTAATGCTGCCGCTTAATT:1 + chr3R 31431565 3' - Tabor 26 2 50.50 ACGGCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGGGGCGGTCGAGTTCAGAGTGGGCGGCGCTCGCACCGTCATA:1 + chr3L 13887406 3' + Doc 370 1 59.41 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAGCATGCATTATTAACTCGACGTTGTCCGGCTATTTCCCTTTTCCTTTCAAAGTCCATTAGAGCGTGCATG:1 + chr3R 26198028 3' - jockey 4765 1 70.30 AAAAATGCATTACAATTATTACACTACAGTCTTGGCTGTAACCCAATAAAATCCCTTAAGGCCTCTTCCCATTTCAATTAGTTCTATGACTCTCTCTCTCG:1 - chr2R 14402216 3' + Tabor 484 2 77.23 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAGCATGCATTATTAACTCGACGTTGTCCGGCTATTTCCCTTTTCCTTTCAAAGTCCATT:2 + chr3R 26198016 3' - jockey 4777 1 58.42 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAACAGAATATTACTTAACCCATATCTACGTGAGCGATCGTTTC:1 - chrX 3446526 3' - I-element 28 1 61.70 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCCTTAATCTGCACATGTGTACTAGTAAAACGAGTCTGGTTTTTTGGAGTCCTTTCTCAAAACACCTAGGG:1 + chr3R 13167415 3' - roo 6 2 73.27 TCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCG:1 + chr3L 23678155 3' - Osvaldo 17 2 71.00 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGTACCCTCCACTACTTTATAGGGCGGACAAGGCTTTGGTTTTCTTTGTTTGCGTACA:1 - chr3R 5555896 3' - mdg3 5272 2 59.41 GTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTATGTATGGGGTAGTAAGAGGATTTTCCTCAGAT:1 - chr2R 618457 3' + F-element 282 1 68.32 TCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTTGTCGCCTATGATGGTGATGCAGCGCTCCTGCAACGAC:1 - chr3R 9445529 3' - I-element 383 1 62.38 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAACTTTTATGAGTATGCCTAGAATAACGTCGCCCAGCGTAATATCGTGCCAGCCACATGAAGCACCTGCAAG:1 - chr2L 7190081 3' + pogo 2098 1 81.19 TAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGGTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAA:1 - chr2R 4673573 3' + Quasimodo 7342 2 59.41 TTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGAAAAAAGATTTGGCCGACAGAACGCAGCACTTGGCCGAAAACCAAATTCATT:1 - chr3R 27993323 3' + transib2 2802 1 58.42 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTATACCTTTTATACCCTTTGCACAATATACCCCACTCTTTACGATTGGCGGGCAC:1 - chr2L 5654825 3' + roo 391 2 58.95 AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGCGACGCTGCAAGCGTTACATGTGTCACACACCCAGCTCAAGCCGCCCCTTTCCCGCAACC:1 - chr3R 4546031 3' - jockey 4775 1 61.39 TACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCCGCCTATGCAGCGTAATGAAATTAATGCGAGCACGCAAGGCC:1 + chr2L 13868761 3' - roo 289 2 63.37 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAACAACAGGAGGGCTGGAGGAGA:1 + chr2L 11073808 3' + roo 9014 2 79.21 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTCAGATAAGGAGCGCGCACAAAAGTATGCTATGAAAACCGTAATCATAATCGT:1 + chr2L 17729382 3' - hobo 25 1 54.46 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGC:1 + chr3L 24210980 3' - HMS-Beagle2 6906 2 54.00 CTATTCGTAGCTTGAAAGGAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGC:1 + chr2R 1725937 3' - Doc 37 1 55.45 CCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATGAAGAATGAAGAAGGAAAAATAAGGGACGCAAATAGAGCG:1 + chrX 5256754 3' - INE-1 18 1 78.79 TCGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTCGGAAATAATAAACAGTGGAAGCGTCGGGCGGCAAGAGGCCCGAAGGAGAGGAGAAGGAGAAGGATCTGGCGTGC:1 + chrX 23470417 3' + gypsy8 442 1 73.27 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACAATTTGTTACAAGTTGACTAGGGAAAAAGCTCTGCCTGTATCAGGTAA:1 - chr2L 9129123 3' - 412 28 2 51.49 TTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGTTACTGTTAGTTATAGTCCTTTAGCTGTTAATGCAGTCGTTGCTGTTGGTATTTTCTTTGTTT:1 + chrX 840031 3' - invader2 287 1 63.37 GCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGGGGTCTTGTTAATTTTAACGCCGCGAGCGTCGCCACACCGCACAGTGTGTGAGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 23569391 3' - accord 7111 2 49.50 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGCAAACCGTCTAAATGCGATTGGTTTTCGGACATTG:1 - chr3R 11936899 3' + roo 9032 1 64.36 GCAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAGTTTGTTTTTCTTTTGAGTCGAAAAAATGATTCGTATTCTACGGATGCACGCTGACACGTGCAAAT:1 - chrX 22643121 3' - Tc1 1438 1 62.38 CTACCCTAATATGTACAATTTAAATTCGTTTCATAAAGTACACAAATATGCGCCTAGATTTGTCATCGATGAATGTCAGGAAGAATTTCGACCCACCAAGC:1 - chr2R 4265514 3' + 1360 3143 1 73.27 GGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGGCAATTTTGGCTTTAAGCGGGTTGGC:1 - chrX 22758736 3' - Doc 261 1 62.50 GACAGAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACTTTGCAAGCTGAATACTCTAATAACATATATTCTAAAATAAAAAGATGCGTAACGGCC:1 - chrX 20783463 3' - 1360 455 1 82.18 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCATTAAGTAACAATGCCAAGCTGAACATTGTCCTATCCCCCAGCCGCTAGTCCTTCGCATCCTTCATATCCT:1 - chr3L 12217283 3' - roo 6 2 73.27 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGGTGTGCGCGTGCTCTCTTTGCTCTGCCG:1 + chrX 13640295 3' + P-element 2843 1 36.00 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTTGCAAAGATAATTGAAGGGTATGCATGTATTTGCT:1 - chrX 18975560 3' - diver 45 2 64.36 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTCTATGTATGTATGTATGTATGTATAGGGCTTCGTGTGTGTCTGGGCA:1 - chrX 7851232 3' - opus 140 4 67.71 TTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGACAAA:1 - chr3R 19513365 3' + jockey 4957 1 68.32 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCTGGTGTTCCAGATGATGCAGATCCGTGATG:1 + chr2R 14604699 3' - P-element 45 1 34.65 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGTATTCAGAATGCGTGTAGTTCCATTACTTTCGGCAA:1 + chr3R 20240934 3' + Tabor 7284 2 64.36 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATATATATGTGTATATTTTTTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTG:1 - chr3L 14854680 3' - mdg3 18 2 56.44 ACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTATTTGTTATAAAGTCTCTATTTAATCAATGAGGTTTATTATTTGTGGCATCTGTCATAATATAGCAGG:1 + chr3L 23615333 3' - McClintock 6385 2 71.29 AGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGAAAAAAGATTTGGCCGACAGAACGCAGCACTTGGCCGAAAACCAAATTCATTTTCA:1 - chr3R 27993319 3' + transib2 2806 1 62.38 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGGAGTGGTACTGTCATAATATTTATAATGATCTTAATGATGACACAAACTAAAGCAGGACCAATC:1 - chr2R 2009399 3' - I-element 14 1 79.55 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGACTAAAGTCTAATGGGTTTATACTTTATTTTTTTGTTTGGGAAAAG:1 - chr3R 11912101 3' - I-element 74 1 55.45 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCAGATTACGTTTATTTAAAGCACAGTAGAAGAATAAGTAGGTAAACCACTGTTAACGAATTATTGAAGT:1 + chr2L 14007495 3' - hobo 8 1 67.33 ATACATACATATAACATACATATATGTTCACAAAGATCTTATCGAAATAAACAGAACGCACCGTAGGCGCTCCAACTGCACTTTCCAACCACTCCTCGATC:1 + chrX 3563430 3' - Dm88 10 2 57.43 TTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCAGTCCGAAATAACAACCACTCCTGCACCGACGAGCAGCACTGAAACAACAACTACAACAACAACTGCTGGAAGCA:1 - chrX 4244577 3' + jockey 4619 1 81.19 CATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTACATTTTTAGTACCCACGTTCGTTGCATTCTTGCAGGACTTGGAAGCGCCAT:1 - chr4 860340 3' + Cr1a 4286 1 54.46 CTTGGTCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATGTC:1 + chr3L 26007752 3' + G5 4755 1 51.49 CAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCA:2 + chr2R 5532333 3' - G4 3768 1 51.49 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCAGTTCTCTGGTTGCTATTGCTGTTGCTGCTTCTGCCTG:1 - chr3R 30778963 3' + hobo 2911 1 64.10 GACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTTTCATTTC:2 - chr3L 5267195 3' - Juan 3981 1 67.33 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATGGAGCACAAAAGTATGCAAGTGCTAGACAAAATGTCCGCGA:2 - chr3R 19513355 3' + jockey 4967 1 58.42 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTGTAG:1 - chrX 17492863 3' - Tirant 9 2 72.28 CGTCTGCGCCGGCAGAGAGGCCGTCGGCTGAGACGAGGCATATCATCCCTTATAACATTTATGACA:1 - chr3R 31430813 3' - Tabor 7128 2 57.58 TTTTTTGCTTTTTTTTTTTAGCGACCAACAACCCCAGTTATTTGTAGAGGGCTAGGTAGAGCTTATTTTTGCATAATTGGGGATCAATCAATTTGCAGGAA:1 - chrX 9488236 3' - G-element 4325 1 91.09 ATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAATAATGTTTAACCTCAAATAACTGAGTTTCCTTTTATTGGTCAATCAATCA:1 + chr3R 19515900 3' - 412 2 2 77.00 TCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCGCGGGAACACAGCATTTGTACATTTCTCATTAGCAATGAATGAAGCCTTAGAAATAGATTAGCTATTTGTA:1 - chrX 8965017 3' - Porto1 4518 1 73.27 AGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCGATGCAAAAATGCTGATTGCCATTTATAGATTATGTGCATAAATCAGGAAAAAAGCTAGCTATTA:1 - chr2L 7862517 3' + I-element 348 1 71.00 AAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGCAGATGGCCTATAGTTTTGTTGTGTGTCCAATTTTATGTGTTCTTCATGTG:1 - chr3R 3566580 3' - I-element 5013 1 53.47 AAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAATTATGAAAAATATCGATTACTTTTTAAAAAATGTGCGCGTTTCACTTACTTTCTCATTACTCACTGACTG:1 + chr3L 25255043 3' - INE-1 302 1 68.32 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTACGTGTGTATAAATAAAACGGTGGCAAGATGTGAAGAATTTTTTAAAGCATTCT:1 + chr2L 9854200 3' + hobo 2916 1 56.44 TCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTCTCGTTGACATTTATGCGCAAATTGATTGGAATTGAGTTTTGGTTGTGGGTCTTTTGAAATTGTAAC:1 - chr2R 16795181 3' - I-element 5116 1 68.32 AGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATGTATATGATATGAAGACGAATTTCCTAGGTAGTCAGCATGACCTTGTCTCATCGTGAAGTCTAGACAGACACCA:1 - chrX 2581652 3' - opus 7113 2 72.28 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTATAAGAACTACTAATAAGTACATAGTGAATTTTTAATTTTTTCAGTGTAAGGTATTAT:1 - chr3L 12187735 3' - blood 18 2 53.47 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGAATATTTTCCATTTGAAACAGGTAATCGATTTTCATGCTTGTGGCGAAACGTACAA:1 + chr3R 12189251 3' - 297 17 2 63.37 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTATATGTATATATATACTCACATATATCTGAAACTGAGGAGAGCG:1 + chr3L 8843629 3' - I-element 32 1 54.46 GAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTTTAAATTTACCGTGGCCTTTAAGTGTCACACCAGCGACATCTATGGAGTCACAGCGCCAGTCGCTACCAA:1 + chr2R 14434370 3' + invader4 326 1 72.28 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAAACAAGTATCAATTGAAATTTTCTGGGAAAAAAACTGCAAA:1 - 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jockey 4711 1 69.31 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGCGTATACGAGGCC:1 - chrX 9816241 3' - BS 5003 1 65.35 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGGAATGGCGATTTTATCTCTTGGCCCGGTGTTTTGCTATTATTTTCTTAACAGTTA:1 + chrX 17581318 3' + roo 394 1 60.42 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGACGAGAACTGGTTACTCTCT:1 - chr3R 8133945 3' + roo 352 2 81.19 GAGGGATCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:2 + chr3L 25232909 3' - GATE 8269 2 51.49 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGGGGGAATGGCGGGGATGCTGGGGCGGAAATGAATGTT:1 + chrX 21219500 3' + roo 399 1 61.63 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATGAAATGGCAGTGGGAATGGCGGTGATGCTGGGGCGGAAATGAATGTTATTTATTTAT:1 + chrX 21219510 3' + roo 397 1 68.37 AAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCATGAGCGCTGATTTTGCGCCACTTAAACTTTAAACGCAAACCACAAGCCAGGCAAGCGGACACCAGAAAGAC:3 + chr2L 9624641 3' - transib2 2 1 77.23 CAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTCGATTTTTATATGTTGACTTCATCATCGCTATTTTTTCCTGCGCGCTTAACCCTACTCGATTTTTTTTGG:1 - chr3R 4718167 3' + flea 5012 2 76.24 GCAGTAGTTTAAAAAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTGAATTGAGACTAATGACATGTTGAGATGGATAGAGACCATTTCAATAG:1 - chrX 7651344 3' + Cr1a 161 1 60.40 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTACCTTTTTTCCCTCCTTTTTGCAGCTTTGTTTTGGATTTTGTT:1 + chr2R 21902123 3' + roo 9037 1 72.28 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAAATGGCAGGCGGCAAGTGTTGTGGGAAGAGCG:1 + chr2L 12422011 3' + pogo 2060 1 69.31 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACGA:1 - chrX 157204 3' - I-element 23 1 54.46 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGAGTGAATTAGTTCTAATACGAAACACAACGAGTTTGGATTGTT:1 - chr3L 19066079 3' + roo 9041 1 56.00 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGCATTATTCATGCTTGTTAAATTTATTAATTG:1 - chr3L 14558267 3' - 297 44 2 72.28 ACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCAACATCCTATATATAACTTGT:2 - chr2L 22092950 3' - 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Doc 4473 1 69.31 TTTAAATAAAAAATAAAAGGATATTTTAAAGGCCACAAGAGCCCTGTAATAATAATAATAATATATCTTATGTGTGTACTAACCATCATGATAGTACAAGT:1 - chr2R 13283141 3' + G2 3054 1 76.24 TGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCGTGTATGAGAGCCTATATCGTCACATTTTTGGGCGCAAAT:1 + chr2L 156647 3' - 1360 32 1 57.43 TAATTACTATAGTCAGTAATTGTTAGCTGTGTGGGTGACATTCGCTTTGATTGTTATTGTTATGAAACGCAATTTTACTTGCAAAGGGCCGAATCAG:1 + chr3L 13885547 3' - Doc 129 1 55.67 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGTACCTCCTTGATGTTTCATCACCTCGTTTCTTTTTCTTTTATAA:1 - chr3R 19515800 3' + 412 463 2 55.45 AATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCAACAGCCATACAATTAAAGTTAAAGCTTTAAACAGCACTATATGATTTGCTATATATACAATAC:1 - chr3L 24210881 3' + HMS-Beagle2 302 2 69.31 TCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCCGTTGGGGTATTTCCGCTTGCAAGGCTAAAACG:1 + chr3L 9762226 3' - jockey 4729 1 74.26 TCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACCCAAAGATGCAATAGAAATATACATGTATTTTTGCAACGCAAAATCTAAAAGTTACAAAATAAGAGG:1 - chrX 4278306 3' + blood 7379 2 68.32 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCATATC:2 + chr2R 17348629 3' - 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F-element 4418 1 63.37 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGTACTTATAGTTCGTACTATTTTTTAGATTCCTAACTGAGCAAGCTAATTGTTATACAGGCACA:1 + chr2L 20270060 3' + pogo 2090 1 68.32 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAAAAGTAACTTTTTTCACCGAACTCCTGGAAAGACTAAGACTGAGAA:1 - chr2L 15798622 3' + roo 9044 1 55.45 AGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCTCTTCAAATCCTATATGCTTCTTTAAG:1 - chr3L 3535496 3' + roo 8595 1 73.27 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTAGTCGTGCGTGAATTTAGTTTTTTTTCC:1 - chr2L 8965432 3' - Doc 53 1 71.29 TGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTGTGTGAGAATGAGAAGGAGAGTGGGGAAGGGGGTTGGTGAAAATGACACACATA:1 + chr2R 17356172 3' - blood 169 2 79.01 AAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTTGGCATTAAAAGTTATTGAAAAAATTGCTGACAAAAGAAGTATAAATATTTACGCAAAATACT:1 + chr2L 16379031 3' + HMS-Beagle 236 2 69.31 ACGAACGTACATTAACGGGAATGCGCGACCTTCATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAAAAACCAACTCAGTCTTTCTGTCTCTCACGTGAACTCACGAC:1 - chrX 20795207 3' + Ivk 5009 1 59.41 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCAGAGACTATATAATTATGTGATGGTGAAGAATATGTGGTTTATGCGGTATCGCTAAACAAACCTG:1 - 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F-element 55 1 71.29 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCAAATGAAATATATTCCGCACAATACATATATTAATCCAAGTATC:1 - chr3R 3920665 3' - I-element 34 1 63.37 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGCCCAAAGAGAGCAGGATAGGAGCACGAGGATGCGGAAGGATGTGGGG:1 - chr3R 28135262 3' + hopper 1393 1 55.21 AAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTCTTATTTTGACTAGTATTTCAATCTTAATCATATTAA:1 - chr2R 12007216 3' + mdg3 5459 2 66.34 AATATGTAAATATGTACATACATACAAACGAACATACATATTTCCAATTCAATTCCATCGTATGTTTATGGCAAATATTTAACTTTTTCCTTTCTGCTGTA:1 - chrX 12736523 3' + G3 4506 1 81.19 ATTGGATTCTCTCAATCAGCTGTTTAACACTTAACCTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGACAATTTTTTGTAGCTGACCATTAAAAT:1 - chr2R 2123836 3' - transib2 177 1 78.22 CAGCATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGA:1 + chr2R 6482722 3' - gtwin 6964 2 74.26 ATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAACGGGCGCATGCATTATTCATATAGCACAAGAACACCATCAG:1 - chr3L 23979501 3' + F-element 252 1 58.00 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGACGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCCGACTATCATTCCGATTCTCATTCTTAG:2 - chr3R 11109034 3' + mdg1 7410 2 69.31 GAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGCGCCCCCGCAAAATTTATGAAGCATACTTGCAG:1 + chr2L 17694316 3' + hopper 1374 2 64.36 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTGTCCTGGTACCGGCTGCTATTTATTTTCCTTTT:1 + chrX 12193520 3' + hobo 2933 1 53.03 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTTACTCAAAACTAACTTAA:2 + chr3L 3535479 3' + roo 407 1 75.25 CTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCA:1 - chr3R 19589898 3' - BS 4996 1 73.27 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTGAAGAGATTTTGGTCACGATGATACGGACATATCTAAAAGTCGTTTTGAAGCA:1 + chr3L 8044391 3' - mdg1 24 2 55.45 TTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTC:1 - chrX 17492881 3' - Tirant 8110 2 71.43 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGTATATGCACACGCACACATACGCAGGCAATTGGAAAG:1 - chrX 5178809 3' + hobo 2902 1 63.00 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATAGAACCATTCAATAAAAGTTTTATAACATTTC:1 + chr3R 11549899 3' + opus 7462 2 69.31 GAATGTACACACACACACACACACACACAGACACACAAAGGCACGGCTCACACCCACGGGCGCACTACAATTTTAATACAGCATACTTTCGGAGGTCTCAT:1 + chr2R 12100710 3' + accord 179 2 64.36 TAATAACATAAAATTAAGAAATATTAAGAGGATAAACAGAAAGTGAAGTCGCGCAGTTCAATGATGTAGGCAAAGTTGGTAAAACTCAAATACCCATTCGA:1 + chr3L 21915137 3' + Doc3-element 75 1 56.44 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAGATTCTTACCCAATCTTACAAATAATGTTTAACCTCAAATAACTG:1 + chr3R 19515873 3' - 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Idefix 220 2 55.45 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACC:1 - chrX 21667995 3' + Tabor 7303 2 53.47 AAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTAGTCAATAGTCGTTATTTGATATAGTCGCCAGACCAACAACAAGCTGGCCATGATGAAACGTGCCTGGGA:1 + chr3L 13652269 3' - mdg3 5259 1 70.30 AAAACAACAACAACAACAAACTCAGGAGATAAAGTGGGAAGCAAAGATGCCTGTTTTTCTTACTTGCGACCATGTGTGTTAAAACAAATGCCTAAATTGCA:1 + chr3R 6407223 3' + gypsy9 458 1 72.28 CAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATATTTAATGTAAAGTTTGCTATAGAATAATGTCAGACATCGAGCATGACAGTCG:1 + chr3R 17173112 3' - invader1 3633 2 56.44 ATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGCTCTCTCTCACCGGTTCCCACTTCCCTTCTTTGTTTATCAGCTTGAGCCAGCTTCAACCC:1 - chr2R 3032075 3' - F-element 4554 1 61.39 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAGTGAATTATTTAATCGTTTAAAAGAAACGATAAAG:1 - chr2L 18417279 3' + roo 400 1 70.00 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCA:1 + chr2R 17348625 3' - jockey 27 1 55.45 ATGGCTCGTTTCCTTATTTTTATAAAAGAAATCAATATGTTTTCTTTACGTACTCCACAAA:1 - chr3R 14008157 3' - Transpac 351 1 77.05 GGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGGAGAAAGTAACCGTAACCGTAATCGGACTGAATGCACGCCT:1 + chr2L 13484828 3' + invader2 4664 1 67.33 ACTCTGGATCCATTGGAACTTATATAATTTATACATATATAAATGATACTTAGTTCTTCATAAGAAAGCTAAATACAGTTAGTAGACAGAATGATAGATCT:1 + chr2R 21249551 3' + gypsy 7441 2 66.34 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAACCAATAACTTTTTATATTTTCACAACCAC:1 - chr3R 17492683 3' + copia 243 1 68.32 CAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATTTTATATATCCATCTAAATCCATATAATATAGCCATCTAAAAGTTTACGCTGGAAGGGTCATTATA:2 - chr3R 15130450 3' - Max-element 8243 2 63.00 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAATAAAATAAAATAAAATTCCTTAATGTTTTCGTTTCTATTTT:1 + chr2L 18626651 3' + I-element 5308 1 70.30 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAAAAGTAACTTTTTTCACCGAACTCCTGGAAAGACTAAGACT:1 - chr2L 15798627 3' + roo 9039 1 58.42 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACTTAAGTACTCACTTGAAGGCTTGGCTAG:2 + chr3L 14286052 3' - 412 48 2 72.28 TTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCAA:1 + chrX 8027508 3' - Juan 17 1 62.38 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACA:1 + chrX 19887139 3' - P-element 34 1 46.53 TATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGTCACGTCGCGCAGCAGTTCAAAGAGCTATTCGGTAAAGGATGAGACGTCCATTGAGATCATGGCGGT:1 - chr2R 9259708 3' + blood 7208 2 70.30 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGACGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCCGACTATCATTCCGATTCTCAT:1 - chr3R 11109040 3' + mdg1 7404 2 75.25 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTTGCCTAAATTGATCGAAATGTACCTATTCTTCAACAGAGCA:1 + chr3R 7015517 3' + roo 9042 1 57.43 ACTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAAAATTACATATGCACATTTGGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGT:1 - chr3R 20627938 3' - 1731 4413 2 77.23 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTGAATAATGTAATGAATGCAGGAGTACAGTGAA:1 + chr2L 4868582 3' + blood 333 2 70.30 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGTCCAACATGAGCTTATGTATCCGTGCACTTTTAGTTGAGGT:1 - chr3R 2556044 3' + 412 457 2 61.39 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCACTGTACTGTTGCCTTATCCCTTATAAACAAAGCTGGCCCTTCTATTTTCACCTGACACTGCAAAAACA:1 - chrX 11503440 3' + roo 401 1 72.28 AGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATAAGTCATTTGACTTGTATAAGGTTTGCATACACATAAAATATGCACGAATT:1 + chr3L 14854128 3' + mdg3 5259 1 49.50 AAGAATCCGAGATATTTAGTTGTCTCATCAAAAAACCATATCCTCCATCCTCAGTTCGTATATTCCTAACTCCTGGGTTGTCCTGTTTCTCCTAATCGTCT:1 + chr2R 3461377 3' + Ivk 321 1 65.35 AGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGGGCGTAG:1 - chr2R 6482684 3' + gtwin 7343 2 73.27 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCATACTTAGTGTGCGAGCGAAAGAGAGAGAGAGCAAACTGGG:1 - chr3L 3070650 3' + 1360 3353 1 64.36 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAATTTCCATGTGATGCGCAATATTTCGTAGCATACTTTCAGGCTCTTAATTGGTGCATTTCCAATGCATTGCAATGCC:1 + chrX 5513415 3' - jockey 4759 1 76.24 CACTAGCTGAATAACGGGTATCTGATAGTCCGGTAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGCATGTGTTTTTTTTTATACTTGGTTTTTAATCGTCAACATA:1 - chr2R 5505902 3' + INE-1 541 1 62.00 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTGTGCTGAAGTCCTTCCTCCCCTTCTAAGTG:1 + chr3R 19513397 3' - jockey 4710 1 68.32 GTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAGGAAGATACGAATACAACTTCCAAATAACTCCCTGCATTCTTGAGATT:1 - chr3L 27863838 3' - rover 22 2 58.42 TATTATGTTCGTATATACTACAGCTGAAGAGATTTTGGTCACGATGATACGGACATATCTAAAAGTCGTTTTGAAGCAATGATTGCAAGCGAGCAGATAAT:1 + chr3L 8044414 3' - mdg1 7039 2 73.27 AATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGCCGCCACACGAGTTCCTTGAGCGCGTCAAACTCGAGGGCAGTGGAGGAGCCA:1 + chr3L 3988023 3' - I-element 4977 1 55.45 TGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTAGTCAATAGTCGTTATTTGATATAGTCGCCAGACCAACAACAAGCTGGCC:1 + chr3L 13652249 3' - mdg3 27 2 53.47 AAAAAATAAAAAAATAAATGAAAACTGAAAACACAAGTGAGCTAGCTGCGCAAATAAAAATCCAACTCAACAAATTTCTCGCCATTAGTTATACAACTAAA:1 + chr2L 7486966 3' - Tc1 1393 1 78.22 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTCAACATTCTAAAGCTATAAATAAATATCTCG:1 + chr3R 23870692 3' - roo 61 2 75.00 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCATCGTGTGGCAATCTAAATCCC:1 + chr3R 21587320 3' - pogo 25 1 54.46 ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAACGGCTTGCACTCGTAAATCCCCAGTTGTTTACTTTTTAGAT:1 + chr2R 11247043 3' - 1360 34 1 59.41 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAATTTAATATAATTTATAACCAGTATTCGTGA:1 + chrX 11503520 3' - roo 45 2 75.25 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGAAAGTGGCGAGAGACTGATTTATGTAAATTGGCCAAGACGCTCGGCAGCAGCAGCAG:1 + chrX 3213604 3' - hopper 15 1 64.36 GAACATGAAACATTGAACTTCTTCTTCAACTTCTTGGCCAATTAAAAAATATATATACTCAATGGCCGCACTTTCCATCAAAAAATCAGATTCCCACCCTT:1 + chrX 10020812 3' + I-element 466 1 75.25 GCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATACGCTCACCAACACATGCAAGCGAAAGCGCCAGCGGCAAAAACAACGACAGCGAC:1 - chr3L 195565 3' + Bari1 1687 1 59.41 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTTAAAATCAAATATGCGTGTGCTATATTA:1 + chr3L 1687559 3' + copia 242 1 71.29 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCATAATGGAAACGCCGCCTTAGCCTGCCTGCACTTAATGCGAGT:1 - chrX 3213515 3' - hopper 29 1 52.48 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATATAAAAAATATATTATTTTTCTTCCGGGTTTGTCCTTTTCTTAAAGGT:1 + chr3L 5282246 3' - Transpac 25 2 59.41 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGTTTTTTTCCTAATTACTGCGGATATAGTATTTAAAGTTCGTTTA:1 - chr3R 9616585 3' + roo 9040 1 57.43 GTAAAGGGTATCTGATAGTTGGGGAAAACGACTATAATCATAGGCTTAGATTAAGTAATATAGTAATTCAATTAATATTTTACTAATGGTCATGCCACTAA:1 - chr2L 22312068 3' + INE-1 551 1 70.30 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGTATTCAGAATGCGTGTAGTTCCATTACTTTCGGCAAACAAGCATACATACTTTCTATTTGCCTATT:1 + chr3R 20240963 3' + Tabor 7314 2 54.46 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTT:1 - chrX 17492903 3' - Tirant 8156 2 75.25 ATACCCAAGCAAATCAATATGCTGATTTTCTCAAAAGTATAGCATTTGAGTTACAACACAGTTTCCAATTAGTCCAGCTTCTCCTTCATTTTTGGACTACT:1 + chr2L 11784643 3' - invader5 3748 2 53.47 CAGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAGTTTTTCCGCTCAGCCACACTG:1 - chrX 17492866 3' - Tirant 8119 2 69.31 GTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGTTGCCGAAAGGGGTGAAATCGGCCAGGCGTCTTGACTACTGACAACGGTCAAGGAATTTTTT:1 + chr4 421605 3' + S-element 3 2 68.32 ACACACACAAACACATATACACACCAAGAAAGGCAGACTGGTAGTCAGATGACTGTGTGTTGCATGTTGCCCGCCTGCTAATCCTGTCCAGAAGCCAGCGG:1 - 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chr3R 4600815 3' - Burdock 43 2 73.27 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACGGACAAATAAACATAAATAACGACATC:1 + chr2R 17005495 3' - P-element 49 1 30.69 CCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTGCCTATGTTTTGCGTTCGCAGCGTGCGGCGTTTGCGAGAAAGAGGCAGATGAACGCGAG:1 + chr2L 1884823 3' - Tirant 8479 2 69.31 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTTATTGTGGGCTTCTTTTCCTTTGTGGCAACTGGTTTTCAA:1 + chr3L 12229416 3' + mdg1 7434 2 54.35 AGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATTTTCCTCATTACCCGACTTGCATTTTATTTTAATGAACTGTAC:1 - chr2L 13868703 3' + roo 378 1 54.46 CAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACCGAAACGAAAAAAACCCAAATCCGGCTCGAGGATTCCCACAGAAACC:1 - chrX 9472473 3' + R2-element 3585 5 81.43 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACGTAAGTAACATATTTTCCCTTATTTC:1 + chr3L 22231364 3' - Doc 52 1 81.82 TTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTTGGCATTAAAAGTTATTGAAAAAATTGCTGACAAAAGAAGTATAAATATTT:1 + chr2L 16379019 3' + HMS-Beagle 7021 2 58.00 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTGAATAATGTAATGAATGCAGGAGTACAGTGAAGCCTGTCAGTAATCGACCGGGATTTGCAGAG:1 + chr2L 4868613 3' + blood 365 2 64.00 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATGATGTCTAAAAACGAACTAAAAAATAAGAGAGATGCTATA:1 + chr2L 20799478 3' - blood 7050 2 61.39 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATGGGCCGTTGCCATGGCAGATTAGTATCGGGCTCTATGGGGCACTGAATTTTAAAAAA:1 - chr3L 5573512 3' + mdg3 240 2 59.09 AAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTAACTATTAACGAAC:2 - chr3L 25884051 3' - Doc 2 1 72.28 GAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCCCGATTCCGATCCCGAGTAAAATAAAAACACATTTATGCATTTTATCTCAGAGCC:1 + chrX 7616133 3' - Doc 343 1 60.61 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACCAGCTCTCTCACAAACACAATCTAAAG:1 - chr2R 6501167 3' - P-element 45 1 34.65 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCAATCTTGTGATAGTGAAAATATGGAAACGAAAAGCCAAGCGAAACGGGAAT:1 + chr3L 18642326 3' - pogo 22 1 57.43 CTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAACACCATCAGACATTGACTTTGATGTCTACAAGGAATTTGAGTAGG:1 - chr3L 23979465 3' + F-element 284 1 58.42 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCCACCAAAGAAGTTGATGTGAAAAGTTCCCAAAAA:1 - chr3L 10576799 3' + roo 9043 1 67.44 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAGTATATTAACTAAAATCTCTACTGCCGCTCTCCAG:1 + chr3R 6138314 3' - 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chr3L 19038311 3' - HMS-Beagle2 6928 2 72.00 ACCATCCCGAAGATTAGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTATAATAAGTCAATAATTCTATTGAAATATAAAGATTTAGTAATATAAAATAAGT:1 + chr3R 14749174 3' - Ivk 434 1 64.36 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTAGGCAAGATGAGTCTTTCGATT:1 - chr2L 1530426 3' + roo 355 2 78.22 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCATACTTAGTGTGCGAGCGAAAGAGAGAGAGAGCAAACTGGGTAT:1 - chr3L 3070647 3' + 1360 3356 1 61.39 AGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTCCGCCGTCCCTTTCGTTTCGAATGCTACTCTCTCTTTCTCTCGCTCCGCATTTCGCAATTTAATTTAATTTTT:2 - chr2L 19684570 3' - mdg3 5256 1 76.24 CTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATGCATTTATTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATCAGTATAATCAGTAAAATTCGCAAATCGAT:1 + chr2L 22199585 3' + FB 664 2 74.26 AAAATTAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATAATTGAACAATGAACTCGAGTCTTGTCTGGTTCATT:1 + chr3L 1259882 3' + mdg3 207 2 59.41 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATTCTTAACGATATTTTCACTAAATGGCTATAAAACAGATATCAAGC:1 - chr2L 10104267 3' + roo 9041 1 53.47 GACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACAAACTGTGCCACCTAGTACATAACAAGAAATGGTTATATATCTGTATCTGCTATATAGACAC:1 - chr3L 13868232 3' + I-element 189 1 68.32 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCTGGTTTTTATTTCATCGCTCAGCGAAG:1 + chr2R 20075417 3' + mdg1 371 2 73.27 ATTCACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGTTATCATTACCTAAGCTAGGAATTACCTACACCTC:1 + chr3L 15353602 3' + mdg1 403 2 61.39 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACG:3 + chr3L 3535429 3' + roo 356 2 75.25 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGCATTATTCATGCTTGTTAAATTTATTAATTGAC:1 - chr3L 14558265 3' - 297 42 2 70.30 TATATTAACTACATACGTTAAAAACAACATACCTTGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCTGTTTAACCCTTCACCTTTATACGCAACTAAACAAAAAAAAGG:1 - chr3L 9177414 3' - transib2 300 1 77.23 ATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATAATGATGTTGTTTCTAATATTCACCACGGATCACAGTCAACAAATTCAAATAACCAACCCAGTTTCCGACCTTGG:1 + chr3L 23930986 3' - HMS-Beagle2 6883 1 79.21 CGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCGAGACAGCAGGTTTCCTAATGAATCTTCTTAA:1 - chr3L 25884063 3' - Doc 14 1 60.40 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTC:1 + chr2R 1725923 3' - Doc 51 1 71.29 CATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGTTGTGTTTTGTGGTTTTATTGGTTTGCGCCAGCACATTCCATTTGCAAAATGATTGGAATTTATGCTTAC:1 - chr2L 12912155 3' - mdg1 423 1 71.29 TATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGTGTGTGACATTCGATTTGATTGTTTTTGTTTTGA:1 + chr3L 13885515 3' - Doc 156 1 63.04 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAAACGTAAAAAAACGATTG:2 - chrX 157201 3' - I-element 20 1 57.43 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACTGTCATTCTGTTGACAGGCTAGGTAGCCCACGCTCAGACACTGACACATACTGGCAAATAC:1 - chr3L 13644590 3' + hobo 2926 1 65.66 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGGCCGAAGTTAATTCGATTAGTTGTGAGTAGCTGCAGGAAATGCAAT:1 - chrX 9544168 3' - roo 31 2 56.44 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAAATGCCTCAACTTCGTTTGATTTATGCATCATTCACGCGC:1 - 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297 6616 2 66.34 GATAAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACTTACACAAATAAATATTGTCTAAAACCTTAACCAAAATTT:1 - chrX 22576307 3' + Burdock 6287 2 44.55 TATACATATATATATTTATGTTTGGTCAATTAAATAAGAGTGGTAGGGAATTAAATGTAATTCCGAATTTTTGTGTCTTTCCCAGGTTTGTAAAACTGAAA:1 + chrX 14116413 3' - 1360 2960 1 64.36 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTAGCGTACACTGCATATATCCACTTTGTAGGTCACTTACGATTTCCAACTTGTTTTCCCTT:1 + chr2L 479407 3' + P-element 2871 1 61.39 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGCATTGCAACTGCTGTTGGTAGCAGCACTGAATCCCTA:1 - chr3R 8499417 3' + Tabor 445 2 61.39 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTCATTCCACTTTAACCGCGGCGCTTTGTGCTGGTTTTGTTCTATTGGTAAAAGGAAGTTAGAAAAATGC:1 - chr2L 11073740 3' - roo 8671 2 72.28 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTCCGCCGTCCCTTTCGTTTCGAATGCTACTCTCTCTTTCTCTCGCTCCGCATTTCG:1 - chr2L 19684588 3' - mdg3 5274 2 58.42 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGACTGTACAGATTGAGTGCTTGTGTGTGCA:1 + chr2R 9258640 3' + blood 7340 1 72.28 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCTTTTTGCTGCCCTAAAACAAAGCACCTAGAAATAGAAATCATGGAAAGAACACTGCGGAAA:1 - 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chr3R 3920670 3' - I-element 34 1 53.12 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACACCCATCCATCACAAGTGTCAGACAAATATTTCTGATACAAA:1 + chr3L 4087268 3' + roo 9033 1 57.43 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGTCCAACATGAGCTTATGTATCCGTGCACTT:1 - chr3R 2556055 3' + 412 7499 2 72.28 CAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTATGATTTTTATAATTATAAGTA:1 - chr2R 5582162 3' - Cr1a 436 1 70.30 TATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAAAAGTGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGAACTGGGACCGTTCTGGCCCCCTTCATCCCCGCTGACATATT:1 + chrX 20914469 3' + invader2 4739 1 58.42 GAGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTCGGTTTCGAATTCGAATCTTGCGTTGAGAACGATTTAGAAGGAAAACTTTTACAAA:1 - chrX 13846610 3' - 17.6 305 2 61.39 GCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCCTTATTGCAACCGCCTTATTGCGTTTTGTTTTCTTTTGTTTTGAATGTTGCCTTATTGCGTCA:1 + chr2L 23390015 3' - Doc 4567 1 62.38 CCAAGAGCAATGCTCTCTCAAAATACTTAAGCATCTAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATTTTCTTCTCCCTTACCATCGTCAAGCTCTTCTAT:1 - chr2R 3029857 3' + 17.6 263 2 70.30 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGTCGAGTTTC:1 - chr3L 8044293 3' + mdg1 7448 2 67.33 CATGCATATGTATGTATATAAAGTCAAACATCATGAGTTGTAAATGACACTTCTACCTCATCGAGTGACCACTGTACCGCCTTGCAGAAAGTCGCATAAGA:1 + chr2L 11221089 3' + Stalker4 7199 4 76.24 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGATGTCAAAGTAATCACGAGTCCAACTGCTGGTGCAACTGCAACTCGCCCATTCGAGTG:1 + chr3R 11478473 3' + roo 9054 2 60.40 TATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCGATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGA:2 - chr2R 1751256 3' + INE-1 83 1 96.97 GAACAAAAAACACACAAATCAAATTCTATCGATGTGTGGATATTTTTATCGAAGTGATCTGCTCCGGTCTCGACTCGACTTCGATAAAAATATCCACACAT:1 + chrX 7618952 3' + Porto1 4443 1 51.49 CCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGTTG:4 - chr2L 23286581 3' - Tirant 413 1 56.44 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTAAGTGAGTGAGTGGCGGCAACAAGATTGTTACGCATCCGCCGCGTTGGC:2 + chr2R 15781358 3' - jockey 34 1 51.49 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACAAGAGGGTATAAAAACTCAACAGCAGCAGCCCAAAAATCGTTGCC:1 - chr2R 20410936 3' - jockey 4701 1 53.47 TCACAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAGAAAAAGAAGGGAAATCCCCTGGCCCCACACACGGACTCCTCCTGCCAAGGGGACATATATCG:1 - chr2L 5506969 3' + gypsy7 5003 1 81.72 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGAGAGATTTAAAGAGAGAGCCGCGGCGAAGGAGAAAGAAAATAATATCGTGGCAAAAGCGAAACGGCGAAAAAG:1 + chr2R 8666148 3' + P-element 2885 2 73.27 ACAGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACCAAAATGAAGAGATTAAATTTAAGATATTTGCATTCTTAAAG:2 - chr3R 20240876 3' - Tabor 6875 2 55.45 CCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTAGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTGGGCAGAGAGCAGAGTC:1 + chr2R 635677 3' - 1360 59 1 83.17 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTGACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAGAGGCGAAATAGCTAGTTTCCAGTTACAGATCC:1 + chr3R 5562023 3' - pogo 33 1 60.42 CAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGA:2 + chr3L 24210971 3' - HMS-Beagle2 33 2 63.37 ACTGGATAGTTTAAATAATTAAAGGAACTGTTTTAGCATTTTTTAGTATTGTTTTTAATT:1 - chr3R 4577204 3' - Tc3 1465 1 90.00 AGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTCAGCAGTAATTCATATTATATTGTATATTAGTATAAATCTGAATATTCTTTAAACGCCACCTGGCGGTTACT:1 + chr2R 13805766 3' - Ivk 5317 1 72.28 TAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCCCCAATTAAATTCAAATAGTTTTTTCCTCACTGCCATTATGTTCGAGCTTTTCTTTTTTCC:1 - chr2R 3521964 3' - copia 4886 2 62.38 AAGAACTTCACCATTGATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATACAAACGAACAAAAAGGCATGGGGGATCCTTCTTCG:1 - chrX 16631565 3' + I-element 294 1 74.26 GTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTTATGGCTGGCTAATAGTGACAACAAAAGTACAGATTTAATAAAAAATAATGGCCTATCG:1 + chrX 10298083 3' - Quasimodo 9 2 67.33 ATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTCAGATTTTTATGGTTTGTGTCTTTAGTAATCTCAAACTAATCTCTGACCGCATC:1 + chrX 22743128 3' + INE-1 508 1 56.44 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAGAAAGCGCTTTTTGCGCTTTAGCTGCGAGAA:1 + chr3R 8487319 3' - Doc 54 1 69.31 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTGCAAACTGAGCAAAAGGTTTATGTACACACTTGTTTGAATATACATATTTTTCTAAAAATAAAATATCT:1 - chr3R 12055013 3' - Doc 11 1 69.31 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCTATTTTGTCTCG:1 - chrX 17492889 3' - Tirant 10 2 59.21 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAGTGAATT:2 - chr2L 18417307 3' + roo 9034 1 62.38 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATACGTTGGCTTCGTGCATTTTACGGTGTTGGGAAACAGACGAAATGGACTCATTGATTCCAATTGACTG:1 + chr2L 3842927 3' - roo 8 2 71.29 GCACACACACACACACACACATGTGGGCCACATTCTCGCGCCGGAACAGGGGACACCGGAGAAGCGGG:1 - chr2L 11538215 3' + accord 183 2 95.59 ACACACACACACACACATACATAATATATCTGTTAACAAATATATTATATAAATTCTATATGCAGGCCAGCACACAGAGACAT:1 + chrX 6417828 3' + Quasimodo 37 2 68.67 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGGTGAAAACCAGGTGAAATTCCGACGAAATATTGCGTTGTGTTTACTTCGCTGCGTGCCAGTG:1 - chr2L 7056327 3' + P-element 2875 1 67.33 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCATTATTTCCTTTTTTTAAGTTAAAGAGCAGTGAATTATTT:1 - chr2L 18417303 3' + roo 9038 1 58.42 CAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAAAGACGCCGGAGTGCGAGCGAGATGGCAAAACCGAGATAATTACAAAACTGATGAGATCCCCC:1 - chr2L 2936882 3' - blood 7180 2 74.00 ATTGTGTGTGTCTACTACTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAATTTTTGGTGTGTAAATTAAAATGCAACTCAAG:1 + chr3R 19962426 3' - hopper2 1295 1 69.31 GGCGATGACCGACGCTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTATATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTCTCC:3 + chrX 22576488 3' - Burdock 152 2 75.25 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGCAATTAGCTTAAAGTTCGCTTA:1 + chr3R 20183021 3' + roo 353 2 77.23 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACAGTTTCGGTGGCAACGTCAAGGCATTCGC:1 - chr3L 5351512 3' + P-element 2842 1 34.65 CTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATAGAATATAGCATAAAAAAGTCTTCAAAAACGTCTCTCAGCTTGGCATATATGTAATAC:1 + chr3R 15936885 3' + Quasimodo 168 2 56.44 GGGATCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCG:1 + chr3L 25232908 3' - GATE 32 2 52.04 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 19038312 3' - HMS-Beagle2 40 2 75.53 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGTCGCCCGGATCCGGAATGTA:1 - chr2R 12249732 3' - jockey 63 1 77.23 TCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTACAAGATGTGTGAGCTTCTTGCTCGGGCTGTGGCATAATTTTAGGCATTTTCCCGATGGCTTATG:1 - chrX 4248797 3' - jockey 4616 1 64.36 CCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCTCGCGCCTCCAACGTAACGATTCACCTGCCCAG:1 - chr2R 5284599 3' + accord 7339 2 73.00 AAAGTTGAATAATATATATAAAAACTAATGCAAAATCTACTATTTTCCTGAAAAATAAAATTGCTTAATAAATTTACAGTTTTAGTCAGTAAGAACTCTAC:1 + chr3L 9920734 3' - copia 4666 1 57.43 CCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAACTTTTGATCGGGTTGCTTTTGTTTTCCATTTAACGCTTTAATTACCAGGATGAATACTTCACGGACG:1 - chr3R 9194608 3' - jockey 222 1 74.00 AAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAATCCTAAACACGACATTAAAAACCTCCAATCCCCGACACCACAGACCCATTCCACTTTGTCCTTT:1 - chr3R 30351930 3' + Idefix 7179 2 58.42 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGTCCAACATGAGCTTATGTATCCGTGCACTTTTAGTTGAGGTCTTCAGTG:2 - 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roo 29 2 56.44 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTAGTCAATAGTCGTTATTTGATATAGTCGCCAGACCAACAACAAGCT:1 + chr3L 13652245 3' - mdg3 31 2 57.43 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGG:1 + chr3L 3535432 3' + roo 385 2 67.11 TATTTTTATATGTACATTTCATTTAGTTGCTGAAAACCAGTGTTCGTAGGTAATTAATCTTTGTGGGCTTTCCACATCTCTTCATTGCAGAAACCGCAGCG:1 - chr3L 18488944 3' - Juan 4182 1 75.25 ACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTCTCTAAGAAGGCGCGCACCAGATCCACCGCTCGGTCAACGCTCTCGCTTTGGT:1 - chr3R 5556435 3' - I-element 5193 1 55.45 CCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTGCACAGCTGTTGGATGTTTGGTTTTCCGTTCTTATCTGTTTTGATTTGAGATA:1 - chr2R 11297026 3' + gypsy 436 2 52.48 GATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTT:1 + chr3L 24210952 3' - HMS-Beagle2 6909 2 77.03 GTAACTAATTGTTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTATTTCGAGTGCAGTAAATTGCGATTGAGCAAATTCATTGGAAAAAACAATCAGCA:1 + chr2L 1008660 3' - I-element 5218 1 64.36 ATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAAT:1 + chr2R 5532317 3' - G4 3784 1 65.35 CCCACGAAAAAAAAAAACAAAATTGTCAT:1 - chr4 894437 3' + gypsy2 394 1 72.41 AAATTGTATTAGAATATTAACTAATATTAATATAATACTCTTTTATAAGTTATAACTGGTACATTTTTTTAAGGACACTTGCAACAAGCATTTAATATCCT:1 + chr2L 19684828 3' + mdg3 5479 2 51.49 ACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAAACTGGGTATCGTGTAAGCCCTGCAGTCAACTAACCAAA:1 - chr2L 16600413 3' + I-element 284 1 61.39 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGG:1 + chr3L 3535437 3' + roo 9029 1 68.00 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAA:1 - chrX 157226 3' - I-element 45 1 68.32 CTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCTCGCATCAGCCGACATCA:1 - chr3L 19437246 3' - jockey 4725 1 79.21 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACAGTTTCGGTGGCAACGTCAAGGCATTCGCACGATCCGAAC:1 - chr3L 5351501 3' + P-element 2853 1 45.54 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGGCTTTTTATGGCATACTTTATGGCGTTGGAATTGCTGCGCTTAACATCA:1 + chr3R 30326366 3' - pogo 25 1 55.45 GTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATATGCATGAGATTAATGCATATAACTACGAAGTTCTTGTGGGTAATAGTTA:1 - chrX 905828 3' + I-element 5330 1 50.50 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTGATCAGTATCAACAGCCTGATATAGTTTGTACA:1 - chr3L 15869658 3' + pogo 2063 1 67.33 CTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTTTCATTTCTC:1 - chr3L 5267193 3' - Juan 3979 1 69.31 ATTAAAAACAAGGGTGGCCATACCAAATACTAAATAATGCTAAAACAGTTGCCTTGGAAAACATGTGAGGAATCAGGCGGAGAGTTGAGTTCACTTGG:1 - chr3R 4360123 3' + Tc3 1412 1 57.14 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAAGACGTCTCCACCCGAAGACTGTGTTATATGTAGTTAATATTTATATTGTTC:1 - chr2L 16668624 3' - Doc 66 1 75.25 AAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGAGTAGTGGTCCGATGATTTCAGCAATAATAATGACAACAGCGACAACATTTCATAATAATCA:1 + chrX 18976172 3' - diver 5929 2 66.34 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTGAAACAAACGTTTTTGTTTCACACACACAGGGCACAAAGGGAGAAGATATAGAAATAAGTTGGC:1 - chr2L 3842814 3' + roo 397 1 67.33 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAAAATAGACAAGGATAGGCCCAAAAGGACGAAACG:1 - chr3R 30326293 3' + pogo 2063 1 67.33 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATACACTAGGCTAGGGTAAGATAACTGTTG:1 - chr3R 10957287 3' + hobo 2891 1 76.24 GATGTCTTGAGTAGTCAAAATATTAAAAATTGAATAGGAAATAGAAAATGAATTTTTATAATTCAGGATACGATACACACATTCAGCATGGGATATATGTA:1 + chr2R 17357638 3' + invader2 4683 1 69.31 ATCTAGAATTGGGGTTTTTTTTTAGAATTGGGGGTTAGTAGTAGATGGATACTATGTGACGGAGAAGCAGTGTTGACGATGGGAAGTAACGGAAATTTCTG:1 + chr2L 14409931 3' - Idefix 6965 2 74.26 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAA:3 - chr3L 25884099 3' - Doc 50 1 69.31 CTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGGTTTTGGGTGCATTATTCTTGAAGCTGCGGAGCCGAAG:1 + chrX 13383111 3' - Doc 398 1 55.95 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTAAAACATAAATACACATTTAATATGGCGCTTGCTTGCG:1 - chr2R 9972721 3' - Doc 43 1 60.40 TTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTCTGGCGTCGTTTCTGTGTA:1 - chr2R 21646503 3' - P-element 2727 1 24.75 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCAGGTTCAGATGAACATATCCTTCTATGGCCGAA:1 - chr2L 18887373 3' - hopper 38 1 63.00 TAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAACAACAGGAGGGCTGGAGGAGATCGGTGGGTTGGCGATCGGCTAGATGGAGCAGGAGCCAACCGGTGGCGACCC:1 + chr2L 11073860 3' + roo 9066 1 73.27 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAATCTAAAGGCGACCAG:2 - chr3L 14205361 3' + P-element 2828 1 22.77 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGACAAGCTCTACTTTTGATCTGGCTGCGGTAAAAGTTTGCCACTTAGCACCCGAAAA:1 - chr3R 13231128 3' - Quasimodo 13 2 71.29 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACAACAGTCTTACAGATTTGTTGATAAATACAAATCTTTAAAAATGAATTATACTTATAGGCGGAAAGAACCAAATA:1 + chr3L 13472407 3' - jockey 4760 1 75.00 CTTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGATAGACCGACGATAAGAAGAAGAGCAAAGACTACATATGAAAAAAAGGCGAAT:1 - chr3L 24208430 3' + F-element 392 1 57.00 AACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAATCGGTTATTGGGGCGTTTGAAAGGGGCTCGAAAGGTTTGTTAGCCTGTGAATGGCAGTTGAGTG:1 + chr3L 15706962 3' + I-element 5343 1 64.36 AAAATTTAAAAAATTAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATCGTAAAAATTGAAT:1 + chrX 8958626 3' + TART-C 11096 2 72.28 CCGCCCAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATTGCACTCTTTGTTTTATTATCAATAGTTTACAATAGTCTTCAAGGCGGCGGCTGTCTTCGTGGTCAGC:1 - 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hobo 28 1 53.47 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTAATTTTAACATGCATTAAGTGTGCATCCCTTTGGCTTAA:1 - chrX 12166523 3' - pogo 36 1 65.35 ATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAACACGTGTGTTTCTTTACAACTGGCTAACAG:1 - chr2R 17267374 3' + Stalker2 9 2 70.30 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATCAATTAAAATTATTTTCGAAAATACTTTAAAGAGATTTG:1 - chr3L 1687511 3' - copia 37 2 70.30 CCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATACAAATTTTTATATGCAGTTCCAACAATTACGGC:1 + chrX 22590208 3' + Burdock 6350 2 69.31 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGGGAAATAAATGCTCTTCCATAAAAAGAATATATTATAATAAAATACTTTGATGAAAAAAAAGTATTTAA:1 + chr2R 3522071 3' + copia 247 1 70.30 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGTGATTATCTTATTAAGTATGG:1 - chr3L 4539175 3' + roo 9020 2 75.25 GTACATACATACATGTATATGCACCAATGTATATCGACTTTTATGGCCTTTGACCCGCATAGCTGAACAAAGCTGCCATTAGTCTTTTTGAATCATTAAAA:1 - chrX 295836 3' + INE-1 68 1 71.29 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTCGCCTCTGCCTTTCTTGTTGTGCCATCGTCTTCGTCGTTTT:1 - chr3R 28326431 3' - P-element 35 1 45.54 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCAAACGTACATATATGTACGTTTGTGTTTGCTTCTCGGTGTCCTTGGCACAGGCATTGTATTATGTTG:1 + chr3L 17257259 3' - Doc 20 1 61.39 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGG:1 + chr2R 17348619 3' - jockey 33 1 54.46 ACTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGAAAATGGCTGTGAGACGGCAATGCCCCGTAAGAAGGTCTTAGACTCGGTAGTGGAGTGGGTAGAGCTCCCCAGTTAG:1 + chr2L 22298931 3' - baggins 5175 1 60.40 AAATAAATATATTAAATATATTCTGGCGTGTGTGTGAGTGAGCAGCATCGATAAAAAGCTCCCCGAAGAAATTATCTTCGCCGAGAAAAGCGCAGAGAAAG:1 + chr3L 3002083 3' + Tc1-2 1594 1 69.31 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTCGATTTTTATATGTTGACTTCATCATCGCTATTTTTTCCTGCGCGCTTAACCCTACTCGATTTT:1 - chr3R 4718173 3' + flea 247 2 70.30 TATAAAGTCATTTTTGAAATTTACTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAAAAATTATTGCTAGAAAGCATTTGGCAA:1 - chr3R 7983237 3' - 1360 376 1 73.27 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATGATAAAAATAATCATAATGCAAACACCAAAAGGTTGTCCCCGCTGAAAAAG:1 + chrX 17492968 3' + Tirant 377 2 57.43 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCATACTTAGTGTGCGAGCGAAAGAGAGAGAG:1 - chr3L 3070661 3' + 1360 3342 1 75.25 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTCATTGCATTGTCAATTAGGTCATTGTATTAAAGTATTACTTAATAAGCAATTTCTAATT:2 - chrX 696565 3' - FB 16 1 63.37 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCCATTAGAAAAATTGCGCGCTCTTCGTTCAATTCCTTTATTACAAAAATCGTT:1 + chr2L 1530483 3' - roo 22 2 57.00 TAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAGGCCAGACAAGCAGCTCTGAAGGAATATTGCATACTTATGGGAACGGATGATGTAGCGGTTTT:1 + chr2L 5707352 3' + jockey 4974 1 63.37 TACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCATTTTGCCAAGTAGCGACAGTCGTCATTAGAAGCACTATTCGGCACTATTTGTATCTTGCGCCCGAATT:1 - chr2L 1008175 3' + I-element 4983 1 71.29 CGAATAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGACGAGAACTAGTTACTCTCTCTCTCTTTGGTGAAAGGAATGAATATTTAAAGATTACAATTTTGTA:1 - chr3R 8133899 3' + roo 399 1 68.32 CAGATCAAAATTAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATAATTGAACAATGAACTCGAGT:1 + chr3L 1259867 3' + mdg3 201 2 71.74 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTAGGCAAGATGAGTCTTTCGATTGGAAAATGCTCCAAGGATATGAGGTGTCAACTG:1 - chr2L 1530393 3' + roo 9052 2 57.43 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACAATAAACTACTTTCCATGATAATCGCCATCAAACTAGCTTCTGTTTGTGGCTTTGAAT:1 + chr3L 21393539 3' - roo 17 2 62.38 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTATAAGAACTACTAATAAGTACATAGTGAATTTTTAATTTTTTCAGTGTAAGGTATTATGT:1 - chr3L 12187733 3' - blood 7027 2 54.46 GAGAGAGAGGGAGAGAGCTTCTGCACGTGTATAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTATTGTGTTATGTAATTAGCGAGTCTAAAAATAAGCTA:1 - chrX 2676440 3' - blood 7175 2 53.47 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTATTTCCGCTGGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTT:1 + chr3L 9762245 3' - jockey 4710 1 57.43 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACACTACAATGAAATCGACAGCACGCAATTATTTTTTGGCGACCTAAATGAT:1 + chr3R 5285003 3' + roo 9041 1 60.40 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTGAAACAAACGTTTTTGTTTCACACACA:2 - chr2L 3842851 3' + roo 359 2 75.25 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCCAGGGTAGGGTAAATTCGATGGAATGAGGGAATGAAAACCAGAGAAGGAATTCAAGACTCAACGACT:1 + chr2R 23596502 3' - 1360 10 2 65.35 TTATTGTTATTGTTATTATAATCTGTCTGCTCGGCCTACTATCCCATTAATGACTTTCTTATCACTCGACAGCCACCCTCCATTTTCCTCCCATATTTTCT:1 + chr3R 19498648 3' - mdg1 7064 4 68.32 TGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGAGGGTTCAACTTGATCCGAGGATTCGACTCGAGACGAACTCGTATGTGCAGCAAAGCACCACCAAT:1 - chr3R 29268769 3' + 412 7136 2 69.31 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTATTGTAATTACATAGCGCCACCGCAACCCCCACCCTTTCCCCTGATCACTTTTTTTTTTCA:1 - chr3R 11080671 3' - I-element 11 1 67.00 CGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACCAATTCTGGACCATAGTGCCCTGGCGGGAATGTGGCAACTAATTGGTGGCATTCGAGC:1 - chrX 21494620 3' - transib2 40 1 62.38 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGAGTTAGAGGGGTGCGGCATGGGG:1 + chr3R 11389788 3' + hobo 2891 1 73.27 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAAC:1 - chrX 10196097 3' - 297 36 2 68.00 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGCATAAACAGATTTAGAGTCGAGTGCCTGGAGCGAAGAAATGC:1 + chr3L 18523661 3' - 412 22 2 59.34 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGACTAGAATGGATA:2 - chr2L 13598176 3' - pogo 20 1 59.41 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGG:2 + chrX 21945907 3' - F-element 64 1 80.20 TCGGTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTCAATTAGGCCCGCGCTCAGGTTTTAGCCCGGCATTTTATTCATCTTTGCCAGCTTGCCAGTTTGCTTGTTGCCCG:1 + chr3R 23132215 3' - gypsy7 5012 1 79.21 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCATAAAAATGGTAGGTTTATCTATTTTTTCATA:1 - chrX 18161455 3' + roo 9028 1 70.30 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACA:3 + chr3L 3535427 3' + roo 9018 2 77.23 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCAACATTTTATGCAAATCAACTGACA:1 - chrX 10196075 3' - 297 6586 2 61.54 CGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGCAATAGCTGTCTTTGTATTTTGTATTGCCGTGTTG:1 - chrX 12885708 3' - transib2 40 1 65.35 CTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGGCGTCACTCGACGAAGCGTGTGCATGTATGTGTGG:1 + chr3R 14834779 3' - roo 472 1 65.35 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGA:3 + chr3L 3535453 3' + roo 9044 1 54.46 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAAGTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGTAGAATATGAGCCATTCATATTCCAGAGAA:1 - 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chrX 17492908 3' - Tirant 54 2 80.20 TTAGGAGAAATATTTTCCGGATCCTATCAAAGGTTATATGACTCTAATAAAATCGAACACATTTAATGTAGTATCGCTTATTAAGTTTTAATCACTTCTA:1 + chr3R 25179079 3' + S-element 482 1 49.00 AGAACCTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTCATTCGGCACACTGCAGTGTGGGAAAAATAATATCG:1 - chr3L 25884094 3' - Doc 45 1 62.38 ACAGCAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTT:1 - chrX 22726194 3' + Helena 1274 1 48.51 CTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAATATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTAT:1 + chr3L 16973461 3' + S-element 1699 1 60.61 ATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATG:1 + chr2R 5532321 3' - G4 3780 1 61.39 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATAGTGCGTTGTACAATAGTTTTTTTTTTTAGCCAAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTTG:1 + chr3L 24210993 3' - HMS-Beagle2 10 2 67.00 TGAGACTTTTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGCTTTCAACAACAGTTTTTCACTTGGGCACAGTTGCCATGGGAAAAAATATACATTTCATTCC:1 + chr2L 20239663 3' + 297 245 2 68.32 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATTTATGCATACCATCAGACAGTGAAATACTAATATC:1 - chr3R 23173109 3' + Burdock 6353 2 67.33 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGGTAAGCAAAATAAGTAAGAAACTTGTCGAGTTTCAA:1 - chr3L 8044291 3' + mdg1 7450 2 69.31 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAAAACACACATAAAGCGCAATGGAGTGTGGCA:1 - chrX 10196099 3' - 297 6620 2 70.30 TATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTACTGAAAAGTGAAATAT:1 + chr2R 2092807 3' - Doc3-element 68 1 55.45 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAGAATAACTCCCCCTTCACACATACTTTTCTCCTTTTTTTTTTGGCAACTGGCGGCAAGTGC:1 - chr2R 10974110 3' - hobo 15 1 64.36 GCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGGCGACATATATATATGTATCTCAAATCATTTAAAAACTTGCATC:1 + chrX 16906736 3' + invader4 284 2 75.25 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTACAACACTATAGTATTCGTTATTTACAAA:1 - chr3R 21587252 3' + pogo 2058 1 72.28 ATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATGCCAAGGGCAAACACAGTGACAAGCTCGGTGAGCCCGACTTCATATCGAGGCTATGCATTTAATGGAT:1 + chr3R 6136586 3' + Burdock 6384 2 72.28 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTTATGGCTGGCTAATAGTGACAACAAAA:1 + chrX 10298051 3' - Quasimodo 45 2 73.27 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGTATATGCACACGCACACATACGCAGGCAATTGGAAAGAGGG:1 - chrX 5178805 3' + hobo 2905 1 59.41 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTGATCAGTATCAACAGCCTGATATAGTTTGTACAGGGTAT:1 - chr3L 15869652 3' + pogo 2069 1 61.39 GTGTGTGTGTGTGTGTGTTAATCAGAGGGATGGATAAAAGGAAATAGATGTTGCTTAATTGCTAGTAAAGTTAATATACTTGTGTTTGCTGTTCTTGTTCA:1 - chr2R 17799755 3' - accord 7027 2 54.46 ATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACACCACAATACACCAGTGTGTGTATTATATTTAACTTACATTTAA:1 + chr3R 4600875 3' + Burdock 6360 2 56.44 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTGTCTGCTCTGTTTATGTTCTCAAATCGCGAGC:1 + chr3R 24720047 3' + P-element 2843 1 35.64 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTCTATGTGGGGCTGTTTATGTGCATTTAAATAAT:1 + chr3R 6097652 3' + roo 9029 1 68.32 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTG:2 + chr2R 1725919 3' - Doc 54 1 75.00 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATATATATTTCCATTGGAAAAAAGCCCTACATTCATATAGT:1 + chr3L 17635578 3' - 297 6618 2 65.35 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACAATTTATGTCGTCTCGCGATCTTGGAAATGCTCCATGGACACGCACACCTT:1 - chr2R 11399163 3' + 412 7522 2 54.46 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCT:2 - chr3L 8044335 3' + mdg1 7406 2 76.24 CAACAATGTGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCATTGGTTCTGGAGCACTGGCGCGAGTTTGCTGCTCGGCATTTCGCTGGCCGGATTGGCCTTGCTGCTTGT:1 + chr3R 2687756 3' + gypsy2 6630 2 73.27 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTA:2 + chr2R 1725942 3' - Doc 32 1 53.47 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGCCATTAAACCAAGCAAAGACGAAAA:1 - chr2R 22570183 3' + P-element 2838 1 30.69 AGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAGTGTGTGTTCATCTCGCTTTCCCGGTAATTTTCAGGTGGAAAGAAGC:1 + chrX 9649972 3' + blood 353 2 53.19 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAACAGAGGCGAAATAGCTAGTTTCCAGTTACAGATCCTC:1 + chr3R 5562025 3' - pogo 36 1 62.38 ATTTCTAATACAAAACGTTTTCTTCATGTGGAAAGGCACCTGGACAGTCCGTTAAATTACATAAGAGCTAAATTCTTTGAGATTGGGCGGTAGGCGGTCGA:1 - chr3R 18706552 3' + FB 484 1 90.10 AAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTGAGGCATACGAGGCAGTAAATTGAATTAACCTCCGCCAGGGAGGA:1 - chr3L 2986966 3' + hobo 2574 1 55.45 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATTGTCGGCGTCAAAACTCTTTGGATTTGCCATTTTGTCTCGAG:1 - chrX 17492887 3' - Tirant 8137 2 58.16 GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATACAGGTGCCTTAAATTCACTGCT:1 - chr3L 23342573 3' - Max-element 53 2 81.19 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAAATGCGGCAGACGACCCACACAAAGCATCTGTGTAGACATTTCGTTTTGTAAATCCCATTAAA:2 + chr2L 19623168 3' - Burdock 6149 2 66.34 AGGGGGGAGTAGTTAACAACGAACTCCCAGGTTAGCATCAGCAGGCCTATTTTTATTTATTAAGGACTTTAAAGTGTACCTGTCACCCTCCAGAACCTGTA:1 - chrY 3069826 3' + gypsy 6978 1 61.39 AAAGAAAAAAAAAAACAACAAGTAAAACTAAAAAATTGCTTGCACTGTGTGTGGCTC:1 - chrX 13881436 3' + gypsy7 5013 1 73.68 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACACTGGTTTTAAGTAAAGTTCTAGAGATCTTTAATAAGCTGATCCTATCACGAAATGATT:1 + chrX 12510382 3' + roo 389 2 61.39 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCGTATTGAATGGGCAGGAGTCGAAACGGAA:1 + chr3L 10161872 3' - hobo 47 1 69.31 TTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTTGCAAAGATAATTGAAGGGTATGC:1 - chrX 18975571 3' - diver 56 2 75.25 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTCCCGAGCAAAATCAATTTTAGATGAGGCCCAAACGTGGTTCAGTTGCGGGCAGAAACATTTCATGCAAAATTCAA:1 + chr3R 20384537 3' + roo 407 1 77.23 TGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAAATATAAAGAAAATTTATTATTGTTAG:1 + chr3R 19446049 3' - roo 416 1 73.27 ATTCTCAGAATCCTAGACTGTGCTCGCTGTACTATGTCGATGTGAATGATGATTATTTTGATAAGTTGCGCAACATGTTGCTGCCGCACCGCCTTGCTGCC:1 + chrX 13906483 3' - Doc3-element 4385 1 66.34 ATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAACAGGAAAAACGGAATAGCTCCCAAGGTTGTGCATATGTTTATTTAAGTTTCAGTGTGCGTGTC:1 - chr3R 30284040 3' - McClintock 6186 2 68.32 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAG:1 + chr3L 3535455 3' + roo 9046 1 52.48 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTA:1 + chr2R 1725929 3' - Doc 45 1 65.35 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTGAAGAGATTTTGGTCACGATGATACGGACATATCTAAAAGTCGTTTTGAAGCAATG:2 + chr3L 8044394 3' - mdg1 21 2 58.42 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACAATTTGTTACAAGTTGACTAGGGAAAAAGCTCTGCCTGTA:1 - chr2L 9129131 3' - 412 36 2 59.41 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTAGATTAAGAACTACTTTATTGTTTGGTGTTGCGCAAAATTTCATTGTTGAATTAC:1 - chr2L 18977891 3' + roo 9052 2 59.41 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTTTTTATGACCGCCGCCGCCGACGACGACTAATTTTGTCGA:1 - chr2R 14575798 3' - pogo 31 1 56.44 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAA:1 - chrX 9816259 3' - BS 5021 1 58.42 GGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAAGATCTTGAAGAATCTTTATTTTTTTTTACCACCGATGTATAAAATACAAGTGTATACATATTTCTGCGTCTTTTATCGA:1 - chr2L 16193145 3' - 17.6 7155 2 73.27 CTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATGAAGAATGAAGAAGGAAAAATAAGGGACGCAAATAGAGC:2 + chrX 5256753 3' - INE-1 21 1 79.21 GAGGTAATTCTAATATTTTGTATTCATTCCCTTAGCGTTACTCTTTACCTTATTTATTATTGACATTCGCAAATGTGGTTTTTCTCACTTAGCAATTTTTA:1 + chr2R 2052389 3' - S2 1428 1 65.35 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCCTTGTCAACGAATTGCATTCTGTGTGA:1 - chr3L 2690953 3' - Doc 57 1 71.29 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCTGGCACAAGGATAAAACTACACGTACGAGCATTAAATGTGCCCCACAT:1 - chr2R 14135398 3' + roo 9043 1 53.47 ACGCTCGGGCACATCTGCCTATGCAGCGTAATGAAATTAATGCGAGCACGCAAGGCCCACTAGGCGAGAGAGAGAGAGAGTTATGGCGGGGG:1 + chr2L 13868794 3' - roo 245 2 75.00 ACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCCAAAAATAACCGGGGAAAAAAGCGAATGGAAAACGCTAGTTGAGGGTGTGGAAAAATCCCCTTCGGTGGCTGCAA:1 - chr3R 28382524 3' - jockey 4892 1 71.29 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCATACTTAGTGTGCGAGCGAAAGAGAGAGAGA:1 - chr3L 3070660 3' + 1360 3343 1 74.26 TCTCCGACATCAGAAGTGGGATCACCACACCTACAAAACAATTCGGAACAAAGTTTACGCGCGATAGTCGAAAGGCAAAATAAAGTGATAGCTGAATTATT:1 + chr2R 3021385 3' + invader1 415 2 29.70 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACAATTTATGTCGTCTCGCGATCTTGGAAATGCTCCATGG:1 - chr2R 11399176 3' + 412 7509 2 60.40 AGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAACTGAAATGAGAATAATTATCTATAGCATATAAATGATAAACACACACATAACAAAATA:1 - chr3L 9145935 3' + invader2 467 1 68.32 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATG:1 + chr3L 22162717 3' + roo 9030 1 68.32 CACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCG:1 - chr3L 23456268 3' + gtwin 7363 2 49.50 GTGGGGGTTTAGGGGGTAGGGTGATAACTCGCTTTGTTGATTAGTTAATTACACAGTTGATTAATATCTTAAATGCAGCCATCTCGTTGACGCATATAAGA:1 + chr2L 13642777 3' - Tirant 10 2 71.29 AAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAAGGGGAATAAAAAGGACTGGTAGTAAAAAGTGAAA:1 - chr2R 25216548 3' + 3S18 298 2 65.00 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAAAATAGACAAGGATAGGCCCAAAAGGACGA:1 - chr3R 30326297 3' + pogo 2059 1 71.29 GTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGAGGAGTAAGAAAAAAAACTGATGAAATTATCGCTAAAAATTTGCTTTCATTTGGGAATATCACGTTGGATGCC:1 - chr3L 18401158 3' - F-element 403 1 76.24 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTGCATGCCACATATGAGGGCAATAAAAACAAGAAGTGCAAATCGCAGATTGTGTGCTCTGCAAATAATG:1 - chrX 14617623 3' + hobo 2932 1 72.00 TGTGTAAAAGACATCTGCGAAGCGGAAAAGTAAAAAAGAAAGAAGCGTGGAAATGGAAAATGATATGTTTCAACTCTCAGATGCAAATTATCGTTATTCG:1 - chr2R 10539119 3' + hopper 381 1 83.00 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAAAAGTAACTTTTTTCACCGAACT:1 - chr2L 15798645 3' + roo 357 2 76.24 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTAGATTAAGAACTACTTTATTGTTTGG:1 - chr2L 18977920 3' + roo 9023 2 76.24 ATACTCGGCCACGTGCATTGGTTAACGTATTGAAGCGTGTAATGTGTAGTTCCTTGAGACCTTGTGGAACTTGCCACTGAAAAGGGCTTTACATTCCTCTC:1 + chrX 13644400 3' - Transpac 447 1 72.28 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCTAGGATGTTGGCTGCATTATTTGACGGCCATTGAAAAAGTTTGCCACAAATGAAATGGCCCAA:2 - chrX 5168828 3' - hobo 14 1 65.35 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATTAATATACGACACATTCCGTTGATTTTTTAATGGATAACCGTTCGGTTGAATGTGGATTATAAAGTCA:1 + chr3L 22162752 3' + roo 402 1 72.28 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGTTATCATTACCTAAGCTAGGAATTACCTACACCTCCGCCCCTTCCAGC:2 + chr3L 15353615 3' + mdg1 416 2 74.26 ATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACAACCAAAATGAAGAGATTAAATTTAAG:1 - chr3R 20240894 3' - 412 7258 2 74.26 TGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCACTTTCTTTCAATTGCCACCTTTCCCCGCTGTCCGTGTCGT:1 + chr3L 3070713 3' - 1360 32 1 59.41 CGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATCGGAGGACTCCAAGGACTGAAGGCAGCGCCATAGTCT:1 - chr2L 22747284 3' - transib2 40 1 65.35 GTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGAAATAAAGAGGGACTTTTCCTGATGGCCGGCAAATGAAGGTAATCAAAGCCAGACTATTTGAATCAAAGACCATAAA:1 + chr3R 18571002 3' - I-element 4955 1 76.24 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTCGCCTCTGCCTTTCTTGTTGTGCCATCGTCTTCGTCGTTTTTGCTCA:1 - chr3R 28326425 3' - P-element 29 1 51.49 GGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGTCCGCCGTCCCTTTCGTTTCGAATGCTACTCTCTCTTTCTCTCGCTCCGCATTTCGCAATTTAATTTAATTTTTCC:1 - chr2L 19684568 3' - mdg3 5254 1 78.22 TTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGT:2 + chrX 21945933 3' - F-element 38 1 54.46 CACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAACTCTTAAGTCCCTGTATTTTTACTGACTCGGTTTAGTTATAGCTTTTAGTTTTCGCAGCACGCTCAATTTCT:3 + chr2R 1725966 3' - Doc 8 1 77.23 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTACAACCCAACATTTTGGTGCTTCGAGCCGGATCACC:1 + chrX 20491499 3' + 1360 3347 1 69.31 TTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGTGTGTGACATTCGATTTGATTGTTTTTGTTTTGAAATGCAATTTTACTTGCAAAGGGCCGAA:1 + chr3L 13885543 3' - Doc 137 1 57.43 TTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTTCTTATGATCGAAAGTTGATATAATTTTCAATAAAAACTATTTTCTGTACCTGAGAAATTTCCCTAAAATG:1 - chr3R 18144432 3' + blood 7385 2 64.36 AGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATATAGTTACAATAAAGTTAAGTCCTTTTTTGGCATTATTTTAGGCTTATAGATGTTTTTATCGGCATAAATTGATTTAC:2 - chrX 8326257 3' - opus 110 2 78.22 TTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGTCGTTTTGTGGCTTTGTTTCGGTTGTTGCGT:1 - chr3R 5974791 3' + hopper 1371 1 68.32 GTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAAACTCATCATGAGTCCGATTAAACGCGCAGCCGTC:1 - chr2L 2010085 3' - P-element 2737 1 24.75 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTGTTTATTATTATTTTGTTTATCTCGAACCTCAGCTGAAATAATCGCAAAAGGGTCGCAACCTGCCAGCAA:1 - chrX 8037598 3' - roo 5 2 75.25 GGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACACGTCCCTCGAAGAGTAAACACAGGTACACGACTTTTGCGTGTTAAAGATAGAAGTAAGCGTTTCCTACCAGTC:1 - chrX 22590118 3' - Burdock 6139 2 72.28 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACCAATTCTGGACCATAGTGCCCTGGCGGGAATGTGGCAACTAATTGGTGG:1 - chrX 21494629 3' - transib2 49 1 71.29 AGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTATTGGCAATGACATTGCTATGGCGGTGGCTATTACTATTAAAATTCATTGGCACGCTCCGTGCGTCGTCTGCCAACTAA:1 - chr4 814789 3' - Doc2-element 440 1 80.20 TTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTAACAATTAAATATGAAGGTAAGAGCAGGCGAGGGACAAAAAAGCGAAGGACAAAGT:1 - chrX 10297969 3' + Quasimodo 7354 2 63.37 TGAGAGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGT:2 + chr3R 1977612 3' + micropia 5401 2 59.41 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGCGTTAAAAATGGCAACATAAAGCTAACAATAACCAAA:2 - chrX 157218 3' - I-element 37 1 60.40 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTTTTATTTATTCATATTTTTGACA:1 + chr2R 7769680 3' - 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I-element 24 1 53.47 TATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAAATATACAATTAACTCCTTAAATAGCAAATGATTAAAGAAATGCTGGAGTGACATTTCTACATTTTCTTTAG:1 - chr2R 11835587 3' - I-element 7 1 77.23 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATAATTGAACAATGAACTCGAGTCTTGTCTGGTTCATTCGAGTGCGTCG:1 + chr3L 1259893 3' + mdg3 5470 2 52.48 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTACAGTCTTGGCTGTAACCCAATAAAATCCCTTAAGGCCTCTTCCCA:1 - chr2R 14402246 3' + Tabor 454 2 61.39 AAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATACGCTCACCAACACATGCAAGCGAAAGC:1 + chr3R 21592011 3' + Bari1 1660 1 69.31 AAAATCTAAATCTAATTTGTACTTACTTTCTCTCTCTTTTCAATAGTATAATTTTCTTCCAGATCAAATGTGACTACAGCTTGATTGATTTTACTCTGACT:1 + chr3R 17473409 3' - Quasimodo 7257 2 86.14 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGAGCAGGCGGCTCAAAAGTCGGAATGTGGTATTCGGTTTTAGTT:1 + chr3L 14205401 3' - P-element 31 1 48.51 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGTAATAAGAGCAACGCGTTCGACGTTATCATTACCTAAGCTAGGAATTACCTACACCTCCG:1 + chr3L 15353604 3' + mdg1 7443 2 63.37 ACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTGTTTATATCCATGAGCAGGATAAATGGGGAAACATAAGAAATATGCAATGAATCCTTTCCTCCGCTGTCGCCT:1 + chr2L 18889812 3' - 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HMS-Beagle2 6901 2 61.39 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGTATATACACACGCACACATACGCAGGCAATTGGAAAGAGG:1 - chrX 5178806 3' + hobo 2928 1 55.84 AAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAAGGGGAATAAAAAGGACCGGTAGTAAAAAGTGAAAA:1 - chr2R 25216547 3' + 3S18 6063 2 64.36 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAACAACAGGAGGGCTGGAGGAGATCGGTGGGTTGGCGATCGGCTAGATGGAGCAGGA:1 + chr2L 11073842 3' + roo 386 2 56.00 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGGGATGGATGATACTATTGAGGGGCGGCTCTATCGTTCCTCAGGCGCTTAGTTTTCAATGTGAAAATTGAGAAAAA:1 + chr2R 16384403 3' - roo 1 2 76.24 TTTTATTTTCCTTTTTTTCATTTCAACGCAAAAAGTTAACAATTTCCCCGTTCGAAACAGCTGAGAATGATTCAACTTACATAAATCAAGCAAAAACAACT:1 - chr2L 19183896 3' - Doc2-element 251 1 68.32 GTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTTCATTGTTTTGTTTCATAGTTGAATGC:1 - chr3R 19594681 3' + BS 4993 1 76.24 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGCAATGTTAAGGGGTCGACCACACGGGGAGGGGAGAAAATAGAGAAGGAAGTGGTTTTACTCAAAACTAACTTAAA:3 + chr3L 3535480 3' + roo 408 1 76.24 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATACTCAAAAGTGCTCATTTCACACGACCA:1 + chr3R 21587299 3' - 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diver 9 2 70.30 AAAAATATTTAAATTATTGAATATGCAATACGCTGCAAGATTTCAAGAGTTTAGCAAAACTGTCAAGTCATCCCTCACCTCTGGCAGCATTTTGCCTTTCC:1 + chr2L 4001807 3' + Bari1 313 1 72.28 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTCATTTTGGTTAAGACAGAAAATGTTAACATTATTTTTCGCAAAATTATACAATTCTTAACCTGTC:2 - chr3R 13620246 3' - Doc 15 1 61.39 TCCTGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAATGCCAAAGAAATAACGCAATCAACCTGCAGGAAAATCGTTTGT:1 - chrX 13794862 3' - FB 33 1 56.44 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGCATATCTACGGGCGCCAGC:3 + chr2R 17348642 3' - jockey 10 1 70.30 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGCATTCCATTAATATCTTGGATCTTGGTTAGGG:1 - chr3L 8044326 3' + mdg1 379 2 66.67 TTCTAATAATAAACTGATATTTAACAAATCGAGGATACATTTTTGTTTTAAATTATCATTGTTTTTTTTTCTGAGTGTGCAAGGTCCAGTGGCTCTTATGC:1 + chr3L 10371117 3' - gtwin 306 2 38.61 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTGAAGAGATTTTGGTCACGATGATACGGACATATCTAAAAGTCGTTTTGAAGCAATGATT:1 + chr3L 8044397 3' - mdg1 18 2 61.39 ATAACCACCAGTTGGGAAAATCTTTTCCAGAATTAGTATAAATGTTTCGTCAATGTACACCACCGTTACATTAAACGCAGCCTGCTTTGGGCGGCAGGACT:1 + chr2L 22151910 3' + S-element 450 1 55.45