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chr3L 5497727 5' + Doc 4440 1 59.41 TAAAAATGTCGCGCATTTGGCTTTGAAATGCAAAAAATATTCAAGCGCTTCCACTTCTCCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr3L 13779273 5' - transib2 2809 1 62.38 ATAGCACAGTTTGCAATCGAAAACGTCTTAGTCAGCAACGATTTTAGTCAGAATTAGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGTTGACC:1 + chrX 8508073 5' + accord2 7406 1 56.44 AATAAATCGCAGCCAACTTCTGACATTACAAAATGTTGTGGGGATGGGGAGCTGCTTTTAGAATTTCGGCAGCGAAAATGATTTTCTAAAAGAAAAATGCT:1 + chr2R 21244349 5' - G5 392 1 71.29 TTTGGAACTTGCACGTTCAACCGAATCGAAACGAAACGACTCTCATAATTTATTTTGATGATTTGGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATA:1 + chr2L 19594947 5' - Ivk 333 1 69.31 CAGTTTTGTCCAGTAAAGTGTGGATAATTTGTAGCGCTTTTTCTGGCCGACTAACTAACTTCGCTGTTTGCATTTCAATATAGTCATGTATACCCTTACAT:1 - chr2L 2694689 5' + Transpac 4918 1 78.22 GCCGTCATCAATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAG:1 - chr2R 3760478 5' + accord 31 2 55.45 CAATGCCGGCACAAAATAAAAACCAATTAATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCAT:1 + chr3R 26510281 5' - F-element 136 1 70.10 AAGGCAGCACGCAGCGAAATGATAAACAACAGGGGAAAAGTGCATGCTGCAAACTGCGAACTCCAAACTACGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chr2L 4057224 5' + hobo 5 1 70.30 TTTTAGATTTTCAGTATTGAAATATTTCCATTAAATCAGTTTCTCACTCCTCAAACCTTGTCATATTTCCACTCAACTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAG:1 + chr3L 3635383 5' - roo 409 1 79.21 ACTGCCCAACTAGTATCATGGATATAGTTTCCTATAGTTTGATAATACAGTATATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chrX 19850493 5' + pogo 34 1 60.40 AAAACCCCTTTCACTGCTCCCCTAGAACAATGTCAACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGC:1 + chr2L 1238172 5' + F-element 487 1 65.35 ACCGATCCACAATTGTATCTCCTCTGGTCCACAGCCCCAGCACCATCCATCCACCCAATGACCTAACACCTGCAGAATGCCAACGATCGCGGTCTTGCTCA:1 - chr2L 7296419 5' + Doc3-element 373 1 53.47 AATACAGGCATGGTCACAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAACATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 - chrX 21668282 5' + 412 57 2 79.21 ACAATTTGTTGAAATTGTAGCTAAAATGGCTTTTACCTAGAGTTTAAAATATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr3R 11073806 5' + pogo 21 1 60.40 CTGAACAGTTCCGCGACCAGTGATCTATTCGAGGGAATCGATACGACACCCAATCTGGCCGCCGTCTTGGTGGATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACA:1 - chrX 4546652 5' - mdg1 499 1 66.34 GTCTAAATATTCAACAAAGTAACTCTTACATTGACTGTGAACTTAGTTACAGTTTTTAATTGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2L 17887228 5' + hobo 14 1 55.45 ATGCTTTCATTCCGACTCTCACCGTTTGTACATATATCATTCGTTTGAAAGTTTAATTTAAGTTCGTTTCAATGCAGCTTGTAACCAACTCAAGGAACATA:1 - chr2L 13738334 5' + Juan 476 1 75.25 AAGCGAACAAAATCGAAAGCGAAAACGAATCTGAAACTTAAACAAACACGCAAGCGGCTGCTTATTTGCTAATATATATACATACATACAGTTCATGTATA:1 - chr3L 11549770 5' - 1731 89 1 47.52 GTCCCTCGATGTCCTCCGTGATCCTTCGTCTCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 10978709 5' - roo 9028 1 69.31 GTTGCCCGTTTTAAATGAAATTGCGAAAATTCATTTTAAATTGGATTTTATTTAATTTGACTGAGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAA:1 - chr3R 7600444 5' + F-element 485 1 66.34 AAGTGCACTGGATTTTTATATACAGACAACTAATTGGGCTAACTGTCCGACATAATNAGATTATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTCAACGGCAGAA:1 - chr3R 7620078 5' - Juan 163 1 68.75 TGTTGGTGGAGTTTGCAGTCGGGTCTGAAGATGGTACTCCTGAATCGGCTTACCATATTAAAAAGTATGAGATTAGTCTACTGCACATTTTTGGCGGCTGC:1 - chr3R 9996141 5' - diver2 12 2 54.46 GGCCAAGCCAAAACTGTTGCATACTCCCAGGAGCACAAACACAGCGAAAAGAGCACTAGAATGGCAAACTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 + chr3R 14832468 5' + hobo 7 1 74.26 GAACCCCAATCCGCAATAATTTGATACCCAAATTTAACGACCTTTGGACAGGCCAAATTCAAAGGTTGGGGGAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTT:1 + chr3L 21782430 5' + Idefix 7 2 77.23 AACTTTAGATCGTAGGTAATACAAAACCTTTCACCTTTTGGTTCTTCTATGCATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 + chrX 8447118 5' - opus 7488 2 60.22 ACATACTTATTAGCACTTTTTATAGGTAGCAGTGGCGGCATTCGTCTGATGGAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACG:1 - chrX 3551853 5' + invader4 2846 2 56.44 CAGCGCCTATTCCATTTTGTCTCTGCTCCCATATTTGGAGCACGCGCACACACACACACACCACAGAAGACATTGCAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:1 + chr2L 1590195 5' - mdg1 420 2 61.39 TAAAGGGTCGTCAAAGGTTGTACAAGGCTGAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACACCCTGCCCCATAAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAA:1 + chr2R 1599651 5' - 1360 3209 1 69.31 TGAGTTTGAATTCTTCCGTTTCCAAATCAAGTTTATTATCAATCCTACCTATTCTTAAAGATCACTCTTATCCACAGTGTTCACACTATAAACTTGTGCG:1 - chr2L 17749265 5' - rooA 7599 2 81.00 GATTGCCCAGATATCGGCTCCGGTTGTATTTTTCTTTCTTTTTT:1 - chr2R 23023764 5' - gypsy7 5010 1 65.91 AATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTG:1 + chr3L 17215729 5' + Ivk 41 1 61.39 GCTTCTAAAGTGCGTCGCAGCTGGAGCTGAACCCATTAGGTGTTTTTGTATTCATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2L 7504949 5' - roo 9049 2 53.47 TCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAG:1 - chr3R 934258 5' - Rt1b 4752 1 55.45 CAATTGATATTCAACCTATTCAAAATTTCTTCATACTTGTAATATAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 + chr2L 21266578 5' + FB 33 1 55.45 TACCCAGTTCATGATGAGTAGAAATCTTTAGAGCATCTGGGTTAGTGGATTGTTTACTTGATCTGAGCGAGAACGCCTCTTGCTTATGCTTATGTGCATAC:1 - chr2L 20801155 5' - Tom1 187 1 69.31 ATTAGCATGTTGATAATGGTGGAGATTTAAGTGGATTAAAATATATATTATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGC:1 - chr3R 8080207 5' + flea 4782 2 57.43 GGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCG:1 - chrX 20999589 5' + BS 14 1 56.44 ACAAAGCACACACAGTCGAGGTCAACAAAATAGTGGTATGTACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chrX 20982293 5' + 297 6606 2 61.39 AAAAAAAAAAATTTTAAAAAAATTAAAACAGAAAAAAAA:1 + chr4 337429 5' + Doc 4697 1 74.36 TCCACATCAAACATGCCCAAGTGCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCAAAAAAAAAA:1 + chr2L 595755 5' + Idefix 7085 2 58.18 TTCGATGAAAAGTATGTAACAGGCAGGAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTAT:1 + chrX 124083 5' - 297 6973 2 67.33 TTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTC:1 + chr2R 3293767 5' - 1731 4571 2 78.22 AAATTTGGCTCAGATCTACTGAAAGCCTGCAATAAACAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGCAATTTT:1 + chr2L 315810 5' + 1360 3310 1 64.36 ACGCATTTTTCTTTCATATTTATATTTTCTTTTTGAGGTGCGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chr3L 10565279 5' + pogo 34 1 62.38 AATGATTCACTAATCCATAAATCTTCCGCACCCATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr3R 6210238 5' + hobo 39 1 62.38 TTTGCTTAGTGTATCTTTGATTCTGGCTTTTGACTGGTGTCGGCTGAATGGACTTTAGACTTTAGGATTCGTATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTACGTTTCT:1 - chrX 7558741 5' - Idefix 365 2 55.45 TATAACAAGGCAAATACATCAAGGTGTTTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:2 + chrX 12276779 5' + hobo 47 1 72.28 CGAAGATTTTGCCAAATTTCAGTAAGAAATTTAGTTACAGCTTCACTCGCCTTAATACTTTCTACACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACT:1 + chr3R 6427120 5' + copia 4895 2 69.31 GCAGGCTATCTCTTTCCTACTACTACCCCGAGTTCTTTTGCCGGACCACTATAAATAAATGGTGCAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 + chr2L 16717932 5' + 1360 12 1 41.58 AATGCAGTCGACGTCGACGTCGCTGCCCGTTTGTCGTAATGTGTTACGTCAAAGCGACCGCACACCATTATAAATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTG:1 - chr2R 16160314 5' + gypsy 2 2 77.23 GGGGGAGTGATGAGGGCCTAGTACCAGTATATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGTTCCGCGATCG:1 + chrX 5199541 5' - Stalker 7030 4 70.30 AGAAGTTTACGCCTATCTTATGTAATCACTTACATATGTATGTACGTAAAAGCTGAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr2L 15907237 5' + pogo 15 1 64.36 AACCGGAGAACAGGAAAACAAGAACAGGAGTTCCTCCAACGTTCCACCTAGGGAGAACAACATCATCATCATCTGTGTCTTTAATTATTCAAAGTAATTAA:1 + chr2R 20727711 5' + Copia1_DM 240 1 72.28 TAAGTTCCCGAACTTTAAATGAACAGCAACGTATGACAAGTATTATATTAAGCCCCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3L 14886190 5' + 412 23 2 56.44 TAAATGGAAACTAAGCAGAAAACAGAGAAGACTTTACTCGTAGAAGAAGACTTACTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCGTCGGTTTAAATA:1 - 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chr2L 19629686 5' + hobo 34 1 60.40 CAACACCCAGATAAGAAGCGAAACGCGCAACGCGAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGTGACTCTTGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAAC:1 + chrX 18975792 5' + roo 466 2 66.34 TATATATTCTGACATTACAAATTTATACATATGTATTCTTTATTACATATATATATACACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTATGTATAGCTTGA:1 - chr2R 7759891 5' - Stalker2 7467 2 72.28 TTTTGCTGTCTTTTTGTTAATTGCTTAACATTTTGTTTGGCATTAAGATTTTGCAATACTCATTGTATTTTTGCTGATATAATTAAGGGCTCTATGGACGG:1 + chrX 20796309 5' - Ivk 391 1 75.25 CATAACAACAGAATGTAAATCCAAACTAATCCAAACTAATCCAACACTAAGTACCTACATATAAAAGCAGGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATA:1 - chrX 2914651 5' + Juan 3958 1 58.42 ACAGAGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGAGCAAGTTGAAAATCTGCATGAAATATGACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr3L 13121553 5' - hobo 2920 1 59.41 ATTACATAAATAAAGGTAAAAAACCATTTAAATCGATACGCATACACATAGAAATTAACGTTAATGAACTCTCCGCCCACACATATTGCAGAATTTGCTAG:1 + chr3L 10641091 5' + mdg1 242 2 81.19 CCAAAATGGCTGACCCTGCTCCTTGGCATATTTGTCTCTGTATCTGTGTCTGTACTCGTATCTGTATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAGC:1 + chrX 10822931 5' - accord 7025 2 71.29 ATATGGAATAAAATTATTTAAAGGACATCACTTTATTCCATATGGCCAACTACTAATTCAGAATATAATTGAATTAATTACTTAACAAAATTAAATATATT:1 + chr2L 2843725 5' - Ivk 5369 1 47.52 TGTTGGAAATCCATTTCCTTAAGTTGAACTTAGTTCCAACTTTCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAT:2 - chr3R 19445707 5' - Tabor 450 2 56.44 AAACGATGTTGAAGGATATTCTCCTGTGCGATAACCGCTTCAACTGTAATTGCTTTTATCATATGCTTCCGTTGGCTCACGTCCCAGACCGCAAATCAATT:1 - chr2L 21687947 5' + mariner2 253 1 73.27 GCACGAGGACCTGCCATACGAAATGTTTGGTTTGGGTCCGAGCTCGAATGACAATGGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTG:1 - chrX 15015454 5' - Quasimodo 7076 2 59.41 AGGGGGGCAATAGAAGGCGGTTGGATATCTGTAAGATCGCACGTGGAAGGAGATAGTGCGTCGGAGCGTTACCAGAAGGAGTTCGGGAGTGAGAACGCGCG:1 - chrX 19458908 5' + gypsy8 439 1 68.32 CATTTTTTATTCTTCTACTGCAGCACTTGTTTGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTAGATGCTTAAGTATTTTGAGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAA:1 - chr3R 19588634 5' - 17.6 7182 2 71.29 CACCTCACCCCCACCATCCACCTATTGTACATCCATCTTCGTCTTTGCCCCCATCAAGTCACTGTCCAGTTTAAGGAAGTACTGGCCAAAATAGGGTCGGC:1 - chr2L 15200824 5' + gypsy3 6524 1 72.28 ATCTGTGCCTTTAATTTCTGGCTTCTTCTCCCATTTTGCGTAGAGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr2L 17283462 5' + hobo 30 1 52.48 ACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 + chr4 311226 5' - 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micropia 5370 2 54.46 TTGCTGTCTTTGTGCCATGTTTATTTTTGTACGTATTTTTTGTTTTCTTGCCATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr3L 4637284 5' - hobo 2914 1 54.46 ATTTTAGATATGCCGAACTGTACACCTTTCGTTGCAGAAGAAACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 - chrX 9048715 5' + Tirant 33 2 58.42 AAGTAAGCATTAAATATTTACATAAAGCCTACCCATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 - chr3L 13608373 5' - mdg1 7418 2 64.36 CATCCATGCAAAGTTGACGCCACGAAAAAAAAGGATGAAAAAAGTAACACTTTTCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAA:1 - chr2L 9208466 5' + Doc 4444 1 63.54 GATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:1 - chrX 21668079 5' + Tabor 6867 2 51.49 CACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCT:2 + chr3R 11151845 5' - mdg3 5443 2 78.22 GTAGGAATGTTAGCTCGGCTATACGCTTGATGCACTGCGCAGAATATTCCGCCTTGGTGTCCACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACT:1 + chr2L 10190536 5' - Doc2-element 4430 1 69.31 GTTACGGAACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGT:2 + chr3L 17215707 5' + Ivk 19 1 60.40 AATACTGTTATATTTTGCGTTAAACCATTCAAGAGAAATAATTAGGGATAAAAGTCAAGAGGCATAACGTAAAGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATAT:1 - chr4 1234620 5' + 412 2 2 75.25 ATCCAGTCCAGATATTTCGTGACTCGGGTATACACTCCTGGATAATTGGGTCTAGCACAACCGTTACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGG:1 + chr3L 14674727 5' + Idefix 7063 2 71.72 ATACAGATACTTAGTTGCAAACATCGTTGCATACTTTTCGGTGCACTTGGACAAGGACACGGTACGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr3L 21852474 5' - 1360 3377 1 67.33 CGATGCAAAGTGACACGAGCTGCTGTGAGATCGGGAAAATGGAAAATGCTCTGCATCGTGTTATTTTCGGTGTTGCCAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAGG:1 + chr3R 10230211 5' + Doc2-element 223 1 65.00 ATTTTTTTTTCTTTTTTTGCTTGCGCGCCACGAAAATTTTTGTTTTGCTCTCAATGCCTTTTCTGCTCGTTTTGTTTTATCAGTATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 27187366 5' - accord 7032 2 77.23 ATTGACAAATATTACATAATAATAATGATGAATTCGATTTTGACAAGCGATTAATTTGTAAACTATAATTTGCTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGC:1 - chrX 20112307 5' + INE-1 19 1 70.30 GTCCACTTCTGGGTGTTCTTCTCTGATTGCTGGGTTGCTCGAGCCCCAAACAAACCAGACCTCGCCCCCTAGAACAGAAATTCAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - 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roo 9026 1 68.32 CCAATGTTGAATTATAATGTCGGCATCTTTAACCCTTCACTGGCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 + chr2R 17269715 5' - transib2 2793 1 54.46 AGTACCTCTCTCTATATCAAGCTGCACTCCTCGGCAGCACGAGAGCGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 - chr2L 128759 5' + P-element 23 1 54.74 TAACGCTACATGGGGACCACTCATTGTCCTTGATGTAGCTGTGTATAAGAAAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCA:1 - chr2L 21716341 5' + 297 6500 1 60.40 AGTGTAGGCGTGGCACCAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTT:1 + chrX 21667974 5' - Tabor 485 2 72.28 AATTCCGGAAATGCTGTCACAAATTGTTTCAGAACCACCATTTAATTTATTTTATTTACAGAAAATTCAAAGAGCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTG:1 - chr2R 17292564 5' - Tabor 7322 2 73.27 TTTTCTCGCTCTCTCGCTTGCTGTCTTTGTGCCATGTTTATTTTTGTACGTATTTTTTGTTTTCTTGCCATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr3L 4637267 5' - hobo 2931 1 69.31 CAATTTGTTGAAATTGTAGCTAAAATGGCTTTTACCTAGAGTTTAAAATATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr3R 11073805 5' + pogo 22 1 59.41 TACGATTAAATGTCTCTAACAAGATTTTACCATGAGTGTGTCACTTTTATATAAATCTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 + chr3R 31371713 5' - opus 7490 2 68.32 TGAAAATGTGTCCACCAGCCAGTTAACGCCCACCACTTTTGAACAATTTTAATTTTTTTTTCTCATTTTATTCTCCAATATCTATAGATATCCCAGAAAAA:1 - chr3L 15133506 5' + INE-1 500 1 73.27 ACAAGAGTTTCGAACCAACGACTACGCTTACACAATGGTATATAGTCCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 22690741 5' - roo 9043 1 54.46 TCCGATTCACGAAACATATCGTTAAACAGGACAACGGGTTGATGTTAATATCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTC:1 - chr3R 1726054 5' + 1360 3280 1 60.64 GCACATACATATTGTAGCTACCTCACCCCTATACCTTCATACGTTGGAGAAATGTTGCATATATATATTTTTTTTTCTTTGCTTTTATTTATTGAATCTT:1 - chr3R 21834885 5' - F-element 4661 1 74.00 CATCGATATTGAACAGGATTCGTTGGGAAGGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chrX 7768926 5' + hobo 42 1 69.31 CGGGTAAGGAGTTAGAAGTTATGAAAAAGTACATTGACTTCGCTGACACTTGTCAGCGGCACTTGTAACTTGTAAGCAAAGATAAAGGGTGCCTTGTTCGC:2 - chrX 19820355 5' - 3S18 5793 2 54.46 AGTAAAGTGCTGTGTTGGTCCCGCGTTTAGTTCTTGTCACAGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCATTTCGTGAA:1 + chr4 349354 5' - Doc3-element 409 1 63.37 ATTTGCTGTTGGTATTGAAACTTGGCATGTGCAATGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - 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chr2R 12828308 5' - springer 152 2 54.46 TTTTGCCCTTTTGCTTGCCACGTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTT:1 + chr2R 20170009 5' - Idefix 7028 2 78.22 GGGGAGCTGCTACATTTTATGCGAATCAAGTACGCAAAAAGAACAAGAAATATGAATATATATATGAATTTAGGTTGATTATGTTGGAGGGCTTGACTTCC:1 - chr3L 2743686 5' - gypsy 359 2 68.32 CCACTCCATACTCACAAACACACTCACATAAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTAT:1 - chr2R 20830499 5' + 1360 3259 1 67.74 CCAACGAAAAGTAATAATGCTTTTTGAGTAATGATCGCGGCTTGACCTTTGGCAATAGTCACACCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3R 9606290 5' + roo 13 2 62.00 GCCATTGATAAATAAATATAGCCGTGCGGTGCGCTCGATGACATCAAAAATTGAAAATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 + chr3L 21992723 5' - 412 474 2 60.40 GTTCTGAATATCTCGAGACTGGATCGTTATAGTCCAACGCGCACAGACAGCCTAAAACCAAAAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACTTCCATACATTGG:1 + chr3R 4051874 5' - 1360 3367 1 77.23 CACTTGAACCATCTGCCCTTCCGCATGTCCAACTGGACCTCTTTTCAGTGTGATAACCGGAGTGTTTTTGTCGTGCAGTCAAGTCGTGAAAAGTG:1 - chr3R 10090509 5' + Gypsy12A_LTR 282 1 74.74 TGGGAAATGAAAACTTCTTTGTAATGTGAATGACTCTCGGCCTTTTGCTGATCTGCCTCCGCTGCTGTTCCTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGT:1 - chr2L 18231870 5' - 1731 307 2 69.31 GGCCCGGCATTATAATAATGCTCTGGTAATAGTTCGATGGCCATAGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3L 14285074 5' + roo 29 2 58.00 ATACCAGCCAAAACATAAAAGGCCACAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAACAATGTATGGCCGTTAA:1 + chr3R 31102534 5' + 1360 3363 1 59.70 CTGCGGGACTCGGAGACTGGCTCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCCGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGGGCGTGTAAAGCTTGC:1 - chrX 18504558 5' - F-element 4455 1 77.78 CAGGACATGGCAATGGAGCCACAGGATAGAGGGTCCAAGCTAAGGCAGAACCACAAAATCCTGGTGTACAAGGCAATTCTCAAGCCCATCTGGACATACGG:1 - chrX 6155741 5' + G2 2650 1 71.29 CGCCGAAGATTATTTGGGATCCGCTGAAAGTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 19449650 5' - roo 358 2 70.30 GCGCGTGCGCTCCCATTCGATTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 + chr2L 16136622 5' - hobo 2886 1 76.24 ACACGAACGTACAAAACCCCCGCTCTGCAGAGACAATGCAAATGAATTAAAATTAAATGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAGAA:1 + chr3R 22271752 5' + Porto1 4215 1 66.00 AATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAAT:2 - 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Bica 281 1 69.31 CTCCAAATACTTTAAGGTTACTTACTATTGAAGAAAGTAATATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chrX 7741767 5' - roo 9038 1 61.39 TTTTTTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAACCTATTAACAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGAT:1 - chrX 1280901 5' - 1360 254 1 55.45 TTAATAAATTTATGCAAGTGATATTTTTATTGAACCAAATTGTCTCTAAAGTGATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 12729432 5' - roo 9050 2 57.43 ATTTGTTTTGTGGTGTATACAAAACATCCGTGCCTCGCACGCATATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr2R 10191700 5' + 297 6607 2 59.41 TCACTTTAATTGCTAAACGAAGAACAACAGGGCCTACCACTCCATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 + chr2L 16125015 5' - hobo 2906 1 56.44 TTTTCATATATATCTCTGCTGTTTACTGTTTTGCTGCTGGGGAATTTATCTTAGCAATAAACATATGCATGTACTTATATATTTTCACTTTTCACTTGATA:1 + chr3L 15632854 5' - Max-element 462 1 69.31 CCCATTTCATGTTTGGCTTGATGCGTGGCTGTTAATTAACACTAGACAGCACTTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 - chrX 13641427 5' - 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chr3R 23080914 5' - 412 477 2 62.38 CAAGTATATTTTTCGTATTGTCAACCTTGGGAGAGCGGAGTTAGAAATTGTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:2 - chr3R 21969130 5' + hobo 26 1 52.48 TTGGCGTTTGTTTGTGGCACAACGCTCATTGATTTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGG:1 + chr3R 28666446 5' - Doc 480 1 70.30 TTTCTCACATTTCATTATTTTCCAAAAGTTTATTTCAATACATTCATTAAACTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATCTTG:1 - chr3R 23941992 5' + roo 23 2 52.48 CATTGTCAATGGCCTCTAGGGCTTAAAATTTTCCAAAATGGCTTCAACAATGTCACTGTGTAGTTTATTATTATTATTATTATTAT:1 - chr3R 20396612 5' - mdg1 7067 8 79.07 ACAGAGGCAGCGACTTCGGCAGAGGCGCTACAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chrX 409641 5' + P-element 10 2 50.00 TGGCGATAGGAGGCGGATACAGTGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGG:1 + chrX 16122968 5' - HMS-Beagle2 165 2 65.15 GTAAAAGGCACAATACTCGAGAGCAGAGGTAAAAAACAAATTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAA:1 + chr2R 14117253 5' + Porto1 4214 1 70.10 GCACAATAACTCTGAATACTCTAGATAACTTTTATTTATAGTAAAAACTTTAAACATAAGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTT:1 - 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roo 9026 1 76.24 AAGAAGGCGGCCAACGAGTTGATCATCATGCCCCAGCCGAGAAAATGCCGAGCACCGTAGTATTTGATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chrX 4784601 5' - hobo 2928 1 68.32 CCCCGCATTTCCTGGCGAATTGCGATTTTTAATTGGACAAACCTCTTCTTCGGATGACATCTTGATTTTAAGCAGTATTATTATTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 13329790 5' - gypsy11 3934 3 68.37 AGTGAAAAGTGCCAGTGTTCGAGTCAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3R 24172995 5' + pogo 48 1 73.27 ACATATTGACTCCTTTCCAAAATACTGTCCCATCTTTGGCTTAATTAGCAATGACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3L 16449809 5' - roo 9050 2 57.43 TGCGGAAGCAGAGTGGGGCTTCCCGTTTCGTTGTGACCGTTGGTATGGGCTCAGCGTGCTCGAGGGGTTCCTCCAGGAGTATAAATGACTGCATCAGCAGG:1 + chr2R 4931988 5' - G7 89 1 67.33 CCTGACACCCCCGCTGACCGCCCACGAATGTAACATTTCAATTGAAAGGATTTGGATTTATTATTATTATTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATA:1 + chrX 2914598 5' - Juan 4198 1 56.44 GACGCGTTGCGAGTGTGCGGAATTCGTATGAAATTTATGCTGCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr3L 6942943 5' - P-element 2858 1 48.98 ATCTCTGTGCCGCTATTAATTAAGTATCACAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr2L 10687703 5' + hobo 47 1 68.32 AACTTTCGCCATGAATTTATAAATGAAAACGTTCGGCTGTCTAGTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGC:1 + chr3R 11249329 5' - HMS-Beagle 6809 2 56.44 GGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 - chrX 16217536 5' + P-element 16 1 63.37 CCATTAATCGGAAAAAGTGAAAACTGGTTTCACTAACTACCTCAGCTGCAATTTTTCCCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 + chr2L 2694569 5' - Transpac 294 2 56.44 AAGTGACGAGTGCGATTAGGTCGTATACTATGGGTGCTATTTTGAACAAAGAAGACGCATCGTGAACTAACTGTACAGCTGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGA:1 - chr3R 6950819 5' + gypsy8 121 2 65.35 CCCAAATACCCTTTGGCCTGATGATCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTTCAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chrX 4784532 5' + hobo 50 1 77.23 ATCCAGCATATGAATGATTTATCGCTGATATCGCTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:1 - chrX 20494898 5' - I-element 5313 1 72.28 AGTCATCCAATTGGCAATTGTGATAAATTGTACTTTTTAGCAATTTAAGCCCGAAGGAAAACCCATTTTATTCCAGAGCAGAAAAGAAAAGAAAAGGAAAA:1 + chrX 878155 5' + Doc2-element 227 2 59.41 GCTATGGTACTTGTAAGTATGATATTGTTGATCGATCCTACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGC:1 + chrX 462755 5' + hobo 2704 1 62.38 AACGTATTCCATGATGAAACATATGCATAAAGATTTCATATTTAAGCCCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2L 14886445 5' + jockey 36 1 53.47 CCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1 - chr3R 11151900 5' + mdg3 23 2 54.46 AAGGTGGTCTCCCACAAAATGGTAGATTTGACCGAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAAT:1 - chr3R 7000074 5' + I-element 4976 1 69.31 ACAGTGAGCAAATACTGCAAGCCCGGAAGAAATCTAACTGCAATTACCCGGAAATCCCACTTACAGCTTATTCAGCGAAGGCAATCAAAAATGGTCAGAAT:1 + chr2L 6645670 5' + Porto1 4333 1 56.44 AATTACTAAGCTTACCAGCCGCCCGGAGCGTATGGCATCCGATTTCATCATCGACTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 - chr2R 18036696 5' - blood 356 2 56.44 TTTAATCAAACCTAATAGCATAATCATCTATCGTCATGCTTTGTAATCGTATGAATAAACTGCACTTGCAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGCAAC:1 - chr3L 22724094 5' + INE-1 555 1 70.30 TACGGTGGCCGTTAAGCAAAACGAAAATTGAAGCAATTCCGCTTACGCTTGGCATACACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr3R 27386272 5' + hobo 19 1 60.40 GTTTTTGTTGTTTGGCCCGTTGTGTTTTTTCAACTGTTTCTATGTTTAAATCATTGCGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATT:1 - chrX 4378819 5' - Porto1 4352 1 64.36 GCAACCAAAAGCCGCCCACTATTTTCCGGCTAAGTTCGTATACGCCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 - chr3L 7742780 5' + Doc 37 1 55.45 GGGGGGCGTTTATTGTGTACTTCGAACCATTATCGCTGAAATAGAAAATAGACTTTGTTTGCCTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAA:1 + chr2R 10779143 5' - pogo 1735 1 74.16 TGCCAATAGATCTGAGCACTGTTTCTAAGATTTATTCATTGACTTTTTATCAATGCTCAGGTCTAATGGCATCTGTTTTTTCTTTTTTGTTTTTCT:1 - chrX 5198562 5' - Porto1 161 1 51.04 CACTTCGAGGCTGTAACCATCCATTCGCACCTCCGGTAATAGTTGTTGGCGTTGACGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGG:1 + chr4 652394 5' - 297 6606 2 72.04 GCGAAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chrX 19819992 5' + hobo 43 1 75.00 ATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATG:1 + chr2R 4260434 5' + micropia 5134 2 82.00 AGGGGCGATAAAAGTGGGAGTATTGTTATCTCAAAACTATACTCGTAGTAGGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chrX 1252775 5' - hobo 2914 1 55.45 TTTGTCGTAATGTGTTACGTCAAAGCGACCGCACACCATTATAAATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGA:2 - 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chr4 947238 5' + INE-1 151 1 59.41 TTGGTAAAATCCTCCAGGATACCGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTG:1 + chr3L 20854748 5' - Quasimodo 6988 2 77.23 CTCCACGATTACGAGCACACCGGCACCACCAATAACTTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAA:1 - chr2L 11818166 5' + jockey 4817 1 63.00 CGACCAGGAGAGCCCACGGATAAGACCTTCCTTGAGAAGCTCACCCAGAAGTTGGCCCAGCACCACCACTACGTTTGAATTTGCAAAAGCAAAAGTTTTTT:1 + chr3L 1327573 5' - Bari1 94 1 74.26 GTCAATTGGTGAGAGGTGAACGGTAACTGGGTGGCTAAGAGGATGGGGCTAACAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTG:1 - chr2R 19139661 5' + 1360 163 1 55.45 AAGGAGGGTCTTCCTTACATCCTAATAGGATTCATATACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chrX 3195630 5' - mdg1 7421 2 63.37 CGAACCTTTTCTAGGAGTAGCGAACTAGTCGAGATTCTCAACGAGCTACTGGTGCTGGAGAAGAATCACTTCAGTAAAGAAAGGAAATATAAATTATAAAT:1 - chr2L 1794578 5' + copia 248 1 74.26 ATGGGCGAGAGAAACAAATTTCACTTCGTTTATTTGCAGACAAAGGAAATTCTGAAATGGTTCTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTG:1 + chr2L 17642112 5' + 1360 408 1 70.30 GTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTT:1 + chr2L 23295814 5' - 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FB 29 1 72.28 GCCAACGCCCACTTGCCGCTCCCCCATTTGCCTTTGTATTGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGACCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGA:1 + chr3L 19349364 5' - 1360 3168 1 64.36 ATTCAATAAATGGCCATTTTAAACCTAACAATTTTTTAATTTTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATACAGCCCGCAAAAGTTAATTTAACAA:1 - chr2R 5308435 5' - hopper 1300 2 55.45 ATCCATCGTTGTTTTGCGCCAGTCCTTGCGTAAAGACATTTATATCTATGTGTATTATGAATGTAAAAAAAATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACA:1 + chr2L 17066780 5' + copia 4874 2 74.26 CTAGATAAAAAGAGAGATTGCGCAATCTCTTCTTTTTATCCCCTGAGCAAAGGACACGGTCTGCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr2R 5201017 5' - 1360 3374 1 64.36 AACTTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGA:1 + chr2L 23286582 5' + Tirant 414 1 57.43 AAACAAAAAAAAAAACACGTTTTTCAGACTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACATTAAATAGGAACAC:1 - chr2R 22787923 5' - micropia 5116 2 70.30 TAATTTGTGCAATTGTGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGGGACGATGGGCTGAGGCTTAAGCAATGTATTGTTTAAATTAGGGG:1 + chrX 10812567 5' - 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Idefix 7060 2 56.44 TATTGCTCTCTATTCAAAATCAAATACAACTGAAAGGCAAAGGAGCGCCAAGAAACCGCTGGCCAAAAGGCAAAATAAAAACAAAAAAATAATAAAATAAT:1 - chr2L 8253457 5' - Tc1 1397 1 68.32 CTCGTTGCTCCGCCATTCAGGGTCCTTCATCAAGTCCATTTTCTCCCCTTTTCCACCGCCTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr3R 25443021 5' + 297 6 2 70.00 TAAATGCGCGTCTTCTAGTCGGGGCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 - chr3R 17064181 5' - Transpac 261 2 75.25 AAGAAACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTC:1 + chr3L 11257351 5' + 1360 3377 1 48.51 AAAACAGCAATACTAACAACAAAATCAAAAAACAAAAATAAAAAAA:1 - chr3L 9751492 5' + R2-element 3584 1 69.57 GTTTGATTTGCCGGTTTGAATGGTGTTATGCAGCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chr3L 27262119 5' + P-element 44 1 35.64 CTCGCAATGCTTTTTCAGTGAACTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTAAAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAAC:1 - chr3L 2169430 5' + 1360 3120 1 78.22 TAGGTCGCACAGAGAAAAAAAATAATAATCATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTAT:1 - 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roo 400 1 68.32 TAAAGTTTGCTGCAAATTTTGCGACTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 - chr2L 20571431 5' + Doc 59 1 80.00 AACGGCTGGCAGCGCTGTATATGTGTACTAAGTGGGAGTGTGTACACGCTAATTCAGCGAACGCAATCGAAAATGCTCAGAATAATCACAAAAGCCGAATG:1 + chr2L 11517232 5' + Porto1 4351 1 57.43 TTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCC:1 - chr2R 12185428 5' + accord 6 2 69.31 ACTAAGCAACAAAAAATCATAGTTGTAAATAAAATAAGGGGAAAGCTCAACGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCC:1 + chr3L 17009595 5' + F-element 365 1 59.41 GAACTCGAACTCGGACTGGGGACCGGACAACCAGCAACTAACCGTGGATCTACCCTGGCTTCAATGCATCACGCCATAAACCCATGGTCGGCAAGCCGACT:1 + chr2R 11549337 5' - gtwin 7086 2 57.43 GTTGGGTTACGCAGCCAGCAGCAGCTCATCATAAATTTGAGTTATTTTATTAATCGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 - chr3L 25413281 5' + Doc 26 1 56.44 AACCAGAAGCTGAAGGAATCCACTCAATGAGTTGGCCATGGGTTTGCTAATAAGGCGACATGTGAGTTATGAGTACCGCTTTAGCCATTATAAGAGGTAGC:1 + chrX 4395077 5' + gypsy7 5141 1 73.27 GAGCTGGAAAGGAATCACCTGCTCCCTGGAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTTATAAAGGAAGGAAAAGCGTATAAGGACATTCAAAAAACTCTTGAAT:1 + chr3R 13637585 5' + HB 429 1 78.22 TAGATTGGCCAAACATGTTGCATGTGCTTAAGACTGCTTTAGGTTCTTGTATACTAGGTCTATAAAAATGTATAAATATTGTATCTATTTAATACACATCT:1 - 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INE-1 543 1 78.22 GCTAAGTAACGGGTATCTGATAGCACGCATAACATAGCACGTTTTCACATGTTTTTATGAACTCTATTAGATGCCTAAAACTAAATCTTAGGCTTCTAGCT:1 - chr3R 29588498 5' + Transib5 2931 1 49.50 CAAACGGCAATTGGATGGCACTCAGAATAGCCCGCTCAACGTTGAGTGAAGTTGGCCATTTCCAGATCGACTCGGATCTTGATCCTGATCAAGAATATATC:1 + chrX 686370 5' - INE-1 81 1 59.41 GCGAGGGGCGTAGAGCCCAGAAATTGACAGACCTCGTGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr2L 16396575 5' + 412 7093 2 63.37 TTTTATGCACGTCTTCCCAATTTATAAATCATTTTTGTTTGCCTGTTTGCATTTAGCCTGTTTGCTGCCGTCTGTGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGAT:1 + chr3R 20373253 5' + pogo 216 1 75.25 ACGTGGCAACGCTAATAAAGTCAACACTAAAAGCCTCGTTCAATATTCAATTAGACGCACAACACACACACACACACACACACACACACATACAT:1 + chr3L 9324615 5' + Quasimodo 37 2 75.79 CAAGTAAATTAAATGAGAAAAACTTCTGCCACGAGAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 3919324 5' + hobo 42 1 64.36 GTCTTCGAGGCCAGGCGGCACAGCAGCGTGGCCACGCCCTCGATGACCGCACCCAGATATGGGCTGACCTGCAGATCGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATT:1 + chr2R 13213094 5' - Ivk 210 1 78.22 CAAGCACCGTGCGCCACTTGCACATCTCACCTTTATACTTTTATGATTTAATATGGGAAAATGCTTGTAAAATAACTTTAATAAATATTACTGTTAGTAGG:1 - 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G-element 291 1 60.40 CAATCAAGTGACCTCGATAGCCCAATACCAAGTCAATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTT:1 - chr3L 9181969 5' + Ivk 5020 1 71.29 TGCCAATACAATACGACGACAAAATCGGTTGTTTTTAGTGAAGTGAATGGTTATTAATATAATACAAACAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTGTG:1 - chr2R 4023363 5' + Doc2-element 109 1 78.22 TACCACCTTCTGCAATTGATTGTAGAACCCGACTTGCGCCAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGG:1 - chr3L 8699308 5' + accord 40 2 65.35 TATTAATTAAGCATAAATTAAATATCTGACATTGCCACAGGAAGCACTGCGGGAAAGACGGAGCGTCGCAATTACACGGGTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr3L 11199785 5' + roo 8664 1 71.29 GACTCACTGACAGAAATCGGGGCTTCAAAGCAGGATATTCTTGGTAGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGAAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTC:1 + chr2L 700932 5' + flea 136 2 53.00 GCCACCAATTATACTGTTCACCTTTCAACGAATGTGTGCATTGTTCAATCTTTTTTTATTTTAATTTTTTT:1 + chrX 5139788 5' - Doc2-element 255 1 74.65 CTGGGTCGAGAAGACGAGGCCACTTTGTGTTCGTGGGTAATGACTAACGCACTGTCAAAT:1 - chr2L 16036776 5' - gypsy2 371 1 61.67 ATACATATAAGACATATAATGAAATATAAACTAAGACTACTTTTCTTTAATAATCTTGTTTGGTAACGAGACACCCTGTATA:1 + chr2L 11595981 5' + 3S18 5 2 57.32 TTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCACT:1 - chr3R 2689420 5' - diver2 4465 1 55.45 CCGAAGATATCCCACAAGTTGACAATGGATTCCTCATCGATATTGAACAGGATTCGTTGGGAAGGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chrX 7768892 5' + hobo 8 1 72.28 ATGGGAGATTGAGTATGCGCTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr2L 6324523 5' + hobo 53 1 78.22 CTGTAGCTTAATATTTCTATGGGAAATCCTTAAATAATGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTGCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCA:1 - chr3L 19601484 5' - I-element 333 1 60.40 AATAAACAAAATACTCGGCGCGTGGACCGGTGTTAAGGATAGAGAGTGATGTTGATGTTGTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGTTTGCTGTA:1 - chr3R 18526609 5' - Doc3-element 493 1 57.43 GGAGTAAGCGAATTCTGACGGCTACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTT:2 - chrX 18119547 5' - hopper2 1557 1 76.24 ACTCCAACTCATTAACCGGTTTTAAAGGTCCAACTTTATGCACACACGCACACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCA:1 + chr3R 11132976 5' + 412 7249 2 54.46 GGAGCAAAAAATAACAAACGAGCACAACATGAGCTGAAAATAAGATTTTTGAGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr3R 10428072 5' - 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X-element 95 1 78.22 CAGTTTCTGGCCACTGTTTTCATATTGCCATAGGTTCCTTTTAGGTTTCGATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGT:1 + chr3R 18239089 5' - Doc3-element 50 1 56.44 CCTTATTATTCGCCCATCGTAAACTGAAATTGAAAAAGATAATGGCAAATGACCCATTATCACTATCAGCACAAATGGCTCAACTATCAGATACCCGTTAC:1 + chr2R 11679792 5' - INE-1 551 1 78.22 TGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr2R 6074418 5' - 412 440 2 83.17 GTTGTTGGCAGTTGCCAGGAGATTGAGTTCAGAAAAGACCCTGGCAAAATGGGGGCGGAGATGGAAGAGAGGAATCAGCAACAATAATAACAATAAAAATA:1 - chrX 9400323 5' + mdg1 7063 2 67.33 CGACTCAGCCCTTAGCCCTCCGACACCACCATCTCCTTCATCCGCCCTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTG:1 + chr3R 17923992 5' - I-element 5073 1 53.47 AGGGTTCTGAGAGAAATATGAGAGTGCTTTCGCTCTTGGATGCAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGA:1 + chrX 725348 5' - Idefix 276 2 78.22 CGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 - chrX 20330553 5' + P-element 37 1 43.56 ACCGAGTACGAGTATTAAATGCATTAATTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATC:1 + chr3L 7412438 5' + invader3 5237 2 74.26 AGAGGCATGCTCCTACTACTACTCCTACATCCTGTGCAACTAATTTAGCCCAAAGTGCACTAAAATTAGTATACGATGGCAGTGCTATTAATCTGAACACA:1 + chr3R 25239200 5' + HB 1623 1 70.30 TTCAAATAAGCCCAAAATGAGTTAGGAATAACAGATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:2 - 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F-element 396 1 77.23 CACTAAGCAACACGACCAGTTCAAGACAATGACAGCCAAGAACACTCCCAGATAAGTCTCTGGTCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTA:1 - chr2R 6783254 5' + Tabor 6851 2 68.32 CTGGCACACAATGTCACAAAGTTGTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGA:1 - chr2L 4132666 5' - copia 108 2 75.25 GGAAAGGTGCAATAGAAATTATTATTGCATTAAATGCTAATCTCAGTCGCCATACATAGGGAACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCT:1 - chr3L 11241070 5' + G6 1769 1 55.45 GGCTGTCACTGTTCGCTGTTCGCGACCGTTATTCTTATATCTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGAGA:1 + chr2R 6611111 5' - Copia1_DM 144 1 60.40 AGCCAAGGGGAATTAGTCTTATCTCTTGGTCTTTTGTTCATTTAAAATTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCC:1 - chrX 12138764 5' - invader2 136 2 53.47 ATGCCAGTGAGACAACATGGAATAGATCACGTTTCTGCATTTCTCATACGGCCCAAGCACCCTACACCGCAAATCGATGATCGAGCACCCTCACCTTCAAC:1 + chrX 9595350 5' + Doc 322 1 67.33 CGATTCGATGGGAATTAATGGCTGGTTAACTACCGGGCATCCCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr3R 20170515 5' - hobo 2907 1 58.59 ATGGCAGCATCTGGCAGGTAAGCTGTGTCACATTTCTAGTGGTCCACTGGCGCCCGATGAGCACCTTCCGTGCTGAGAGTCCCTGTTCGGGCGCCATGTAA:1 - chrX 6124752 5' - HMS-Beagle 261 2 78.22 AAATTAAATTAAAAGGCCTAAAATACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTCTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAA:1 + chr2R 9869140 5' + roo 9013 2 96.04 ATATTTGTCTCTTTGCTGCTCCAGCCCCAAAAACTCTACCCACTACCCGCGCCATGTCTGATTCTTTGTTTTTCCAACTTTTTTTTTTACGCCCCGCTTTT:1 + chr2L 9868419 5' + Cr1a 24 1 33.66 AGCTTTTTTGGGTCGAACTCTGGCATTTTGGGTGTGTGCAGTGCAGCGGTGATAAGGATCTTCATTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATA:1 - chr3L 1692177 5' - TAHRE 10415 1 53.47 GGACTAGGTCCTGGTTGGAGGCCCAAAGGCTTCCCGGCTCTGTTCCTCGCTTTTCTCTTCACTCTACGTTGTATTTTTTTTTTTATTATTTTTTTTTAAAT:1 - chr3R 20138644 5' - TART-B 10633 2 53.47 ATGGGCCACTTATCCGTGCCCCCGCTTAATTATTCAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:2 + chr3L 11367479 5' - roo 393 1 61.39 AAATGCAAGGAGAGAGCTTTCAGAAAAAACCATTCCTCTTTTATTAAACCACTCTGATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTA:1 - chr2R 6735350 5' - Burdock 6376 2 64.36 AGAAGGTGGAGCCGCGGCGCTGGCAACCCAGCAGCAACATCAGCAGCAGCATCCCATCGCACCTACATGCATATGTGTACATATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 3353312 5' - accord 184 2 55.45 CCCCCCCAAAGACAGGCGACTTGTTTACATTCCCACGTCCCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAG:1 + chr2L 12607314 5' + Doc 413 1 61.39 CGAATCTATATGTGGAATGTGAAGTCCTGAATTTAAATCTAAACTGGTGCGTAGGATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAAT:1 + chr2L 12802177 5' - invader3 5442 2 55.45 TGTGGGGTCTCTTTTATGGCAGGTTGTTAAGGGCGAGAATTTTCCGATTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATG:1 - chr2L 17645225 5' - Tirant 183 2 56.44 CTGAGAACCTTTTAACCCCAAGCGACTTAACGCATTCGTGTCATGTGGCGGCATTTAAGACTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 - chr3R 23243953 5' + jockey 19 1 61.39 GTGCGCTCGATGACATCAAAAATTGAAAATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chr3L 21992751 5' - 412 446 2 69.31 CGCCGATCGAATGATCTCTACTGCAGCTGCAGCTGAGCTGGTGAGCTGGTGAGTTGGTGAGATGGGATTAGCTAGGATGTTTGCTAGTTGATTCGGGTGGA:1 - chrX 1627614 5' - G5 4586 1 64.36 ACATTGTATCTATAGTTTGGGCTTTTTTTAGACGACCAGCAGTGGATGCCGCACCATGCCCACCATCGAGCATGCCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGT:1 + chr2L 19456378 5' + Circe 7395 2 71.29 TAACGCTATTGCGGCTTTCCAATCCCCACATTGAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGA:1 + chrX 15277202 5' + F-element 4528 1 72.00 ATCACTTAGTTGACAGTCTGGCCGGGGGATGACAAATGCCCTTGGGCCATTGGGCTATTGGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:2 + chr3R 20170435 5' + hobo 16 1 61.39 AAATAAACCGAATAGCCACACAACCAACTGCGATGTATGGTTGAAGAATTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACATAACTAAACTATTAAAT:1 - chrX 15600427 5' + Porto1 4544 1 56.44 ACGCGATTTCCATTTGCATTTGCATTAGCTCCTTCTCCTCGGCATCGTTGTGTGTTGATGGTTTTGTTTGTGATTGCGAGATATGTATGTACGTATGTAAT:1 - chr3R 26910758 5' - 412 225 2 74.26 CACTCGAAGAAACTAGTGCTATAACTATCTATAGAAATCAAGAAAGTATTTGCTTAAAAGAAGAATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chr3R 27179258 5' - mdg1 7448 2 62.38 CAAATGTTTTCTTTTCTTTTTTCAACTCGCAGTGTTTGAGCAACCGACAATGCGACCAATTTCAGCGTAGGTTTTACCTTCAGAGATCACGTTTTTAATCA:1 - chr2L 4348020 5' - Tc1 399 1 68.32 GCGAGTGTGAAACAAGCGGAGACAACAATAAGCGGTTGTCTAAACATGTATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr2R 20396333 5' + blood 7031 2 61.22 ATGTGACAATAGTAGTATATGTTGTAGTATTAGTATGTCAAAACCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGG:1 - chr2R 5924408 5' - jockey 4727 1 51.49 TATTCCTTGTGAATCCTGTTAAGCTTTGATATCAAGGGTATTGGTTTCCCTACCCTTGAAGGGTATTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr3R 7883221 5' + roo 8672 2 71.29 TTCTTCTTCTGTTCGCCCTGTTCCGTTGTCTGCAGTTCCAAAATCTTGGAAATCCACAATGCCGCAACCAACAACAAATTACACACATACTCCGTTAACCA:1 - chr2R 5204952 5' + Doc4-element 214 1 68.32 AACGAGAACAATTAAACGAACAATTGCACGCACTAGCGCGCATTTCACTTGGCTGTTTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chr3L 13674614 5' - hobo 2923 1 58.42 ACAGGTCCGCACCACCATGGTGCGAGTGCTTCCAGGAGCGGAATGTAAGATCTCATATTCCGGATATGGTCATATTCTTGATCAGGATCAATAGATGAGTC:1 - chr3L 3203942 5' + INE-1 92 1 71.29 TAAGGTAGAAAAAGGTGCAAGTCAATTATTATTATGGCTCATTTTCTTAATCGCCACCAAGAACCACTCAACCACCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGT:1 - chr2R 19545313 5' + Idefix 6995 2 78.22 TGCTCATTTTTGCGAAGTATTCGAGCGCATTTTTTATGTTGTTTCGACGTGGTCGGCTTCATCCAGATAAATCACCGTGCCTACGTTTTCTATCGCGCTCG:1 + chr3L 12354030 5' + diver 356 1 53.47 CAATTGGCATTTGGCAATCGGTGCTGTGTTAGTGGAACACTTGGAGAAAATATTCATTAACCTGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chrX 15259113 5' + roo 8678 2 63.37 CTGTCCAAGTTGGAAACTCACTTAGAACGTGTAAAGAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCA:1 + chr3R 18182534 5' + P-element 2754 1 43.56 ATTTCAGAAGGAGAGAACGAGACTTCTGGCGTGATGGCTTAAGAACTATTGATGCTAACAATATTGAGTGAAATTACACTTAAACGCGAGAGGTATGATTT:1 - chr3R 31177874 5' + Tc1-2 119 1 57.43 AGCATATCAACAACCAAATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAG:1 + chr2L 15019888 5' - BS 5062 1 54.46 CACCCAACATTCAGCCTTCTAACCGCCCTCGCGTGGAGAGTGTAGTTGCACTACCAGTAGTGGGTCACAATTACGGCGCGTACCATCGTTGGTGGCGCGT:1 + chr2R 15851356 5' - baggins 35 1 78.00 GAAACAGAAGCAGCGTACGCAGCATAGGCCACGAGAAAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCA:1 - chr3L 17990082 5' - accord 7122 2 63.37 TACTAAAATTTTAAACTAAATAAACCTCGCTAAAAAATAAGTATAAGGTATAACATACCAATAATACTGTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr3L 10792271 5' + pogo 3 1 76.24 TAATGCACCACCACAGGCATCGCACCACCGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 + chr3R 28196711 5' - hopper2 1558 1 74.26 TTACTCTTAACAATGTAGGCAGTAAATCAAAACCCCTTTCACTGCTCCCCTAGAACAATGTCAACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCG:1 + chr2L 1238144 5' + F-element 459 1 64.36 GAGCAAACAACAACTCTCCTGCCGTCGTGCAAAAAACCTCTCCCGTTGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATTTCCAAACAC:1 + chr2R 4023432 5' + Doc2-element 484 1 60.20 GCGGGAAAAGGAATAGCGCCGGCTAAGTAAACCATGGCCACCAACCTTTGCCAGCCTCAGCATTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAGACCCTTTCAGAAATT:1 + chr3R 11509634 5' + Ivk 262 1 77.23 CTTTCATCCTCTCTGCAAGTAGAAAATATATTTACGTTTCATTGTTAGTACCAAACGAGTCATTTAACCGTACTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATA:1 + chrX 17951599 5' + rover 7100 2 67.33 TTTCGTCCCCCACCACGCCAACCAAATTGTACAACATGGAAATATTACATTAAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTAGATCAACAAAATTTCACAAG:1 + chrX 21238110 5' - S-element 349 1 58.42 CCTAATGACTGGAGCTGATTCGGTAGAAGAAGCTAATAAATTAATAACATTAATTTCCCATGAATTGCAGAAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 + chr3R 19445622 5' + Tabor 6846 2 72.28 GAAATGCAATTAGCAAATAGATGTGGCCGTGTGATGCGATAAACGGTCAAACAAGTAGACTTCTCTGTTTTGAAAAAAAAAAGGAAAAAGAAAATGAAAA:1 + chr3R 13542268 5' + Doc2-element 239 1 65.00 GATTTAACATTTATAGTAAGCACTTTCTAATGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 436893 5' - roo 359 2 73.27 GTTCAGTTCGATTCCAACGATGACAGTCCCCAGCTCTTCCGCCCTTAAGAACGCGCTGTTGCAATTACCTGGCTGCTTGGCCGAAAATCTGCAACCACTCT:1 - chr3R 1864527 5' + G4 3364 1 73.27 TCTTTGGAAAAGACAGGATGTGTGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:2 + chrX 10436544 5' + hobo 51 1 78.22 TTTATTGCACAATTATTTATTTTATCAAGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 + chrX 20982228 5' - 297 6931 2 75.25 TATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCACATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCA:1 - chr3R 22232288 5' + 1360 459 1 69.31 ACGTCTTTAGTACGCATTTTTGATTTGTTGCTGGAGATGCGGAGATGCGGAGATTTGCACAGATGCAGATAGAAGGTGAAAGAAGACCGCGAGGACAGAGG:1 - chr2L 19906045 5' + gypsy8 4457 1 68.32 TGTCAATGCATCGAGTGAAAATTGCTGGCCATGTCCGAGGACCTTATATGGCTGGCCGGCATAACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3L 14284976 5' - roo 397 1 65.35 GAAAAAATAATTTGGTTAAAGATGCTTTTAATGCATTAACTTTTTTTTTTATTAATGTGCCAACTGTATCAAACTTTTTTATTAAGTAGTGGACAGTTCTA:1 - chr3L 18799442 5' - Bari1 486 1 54.46 CCAGTGTATGTCTGTCAAATGTATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGT:1 + chr3L 21912239 5' + Bari1 10 1 70.30 ATAAGCCAGAGCTACTAAGCACACTACCATACACTACACATACCACAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 - chr2R 356105 5' - 1360 3360 1 57.43 CATTTAATGTAATTATTTCTTTAATTAAAATATTTAGCGCAACAGCAGGAGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAAC:1 - chr2L 14886678 5' - jockey 166 1 59.41 CTCACTCGGCTGCCAATCGGAATGTGCGACCGTCTGCTTGGAAGCGTGCTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACGTAGTACATAT:1 - chr3L 8912580 5' - 1360 3151 1 53.47 CAACCCAATGCTGCGTTTTTGACTGTCTGTGCTACACTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3L 10554830 5' + roo 37 2 62.38 AAACACAAATTAGGATAATATTGCAATGGGCATTTAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAAT:1 + chr3R 6910081 5' + roo 8610 1 65.35 ATAAATTTGCAGTTTAAATGCGAATTCGATTGACAAGCCAGCCAAGTGCACAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr3R 21969052 5' - hobo 2913 1 55.45 AAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAAGGGAAAAGAA:1 + chrX 7480779 5' + Doc2-element 231 2 54.22 GGCACAAACAAGACAACGATACAACCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTT:1 + chr2L 4234317 5' - hopper 1365 1 72.28 TTTGCTTCGGTGCCGTCATCAGTACGACCCCCGCCATAACAAGTCTCTTGGCTATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACT:1 + chr2R 2311482 5' + hopper 1350 1 51.49 GAAAACCATACTGCAGCTTAAGGGCACTTTTCGTAGGTAAGCTTATACAATATTTTCTTTTTTTCGCACGGGTCCCACGCCACACCTCCCGCCCAACCGAC:1 - chr2R 14693443 5' - Cr1a 4425 1 63.37 CACAGGTATTAAATTCCCTCCGAAGGCTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTATACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2L 10023695 5' - roo 358 2 70.30 AAGAAAGGACAAGAGCAACTTAATTGATAAGCATTTAAGGCAACGACTACGTATAATTAATTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTC:1 + chr3L 19927499 5' + jockey 488 1 60.40 AATATTGCCAACTTTTTTCAATAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2R 22521859 5' + roo 8718 2 84.16 CAATGCAATTTGGCTAGAAAATGCATTTGGAGATTGCAGAGGGACGGTGGGTTGGAAAATAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTT:1 - chrX 12800318 5' - invader3 260 2 59.41 CAAGGACTTGCAGCCTGCAACTGCCGAGAGGAATATCTGATTACACTGCGCAACAGAACAGAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTAC:1 - chr2L 11193800 5' - Cr1a 4158 1 62.38 GATATGGCTCCGCACACGCATATCACGCGAAGGACGAATGAGCCTGTTTCTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chrX 985157 5' + 1360 3378 1 56.44 AGAGTTTTGAGTTTCATTTCAAAAACAAGAAGAGTTGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCAT:1 - chr2R 17402811 5' - invader4 320 2 74.26 TGTGGATGTGTGTGTAAGTTAACACCATTTAACGCTAATGTAATGCAAACCAGAGAACTGCCGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chrX 12276832 5' - hobo 2909 1 54.46 ACTGGGTAATCGGTTTGAGTTGCAAACAAAATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAA:1 + chr3L 25210470 5' - Max-element 8487 2 68.32 CAAATTAATATATATTTCGAGATGTTGTCATTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:1 - chr2L 19990147 5' + Burdock 43 2 75.25 AGTAGAAATATATAAATCTTGAGATAAAAAGTATTAAATGCTTATAACATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 28804471 5' - roo 9045 1 64.36 CAGCAGGATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGT:1 + chr3R 4973096 5' - 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Stalker4 7323 2 64.36 ATCGCTGATCGCTGATCGGAGCTCCGACCCTAGGGAATCCAAGGACCTGATGGATGGTGACGTTGTCATTCAGCAGGTGAGCGCCGGTGGCTGTGCTATAG:1 + chr3R 15416735 5' - G7 873 1 65.35 GTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAA:1 + chr2L 14074958 5' + jockey 260 1 63.37 CAACCACCTTTCACCTCCCACATATTCGTAAGTAGGCCTTCACACTCAAATGCTTACAGAGGCTTGACCTTCTTGTCGGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTC:1 - chr3R 11032055 5' + Doc 423 1 74.26 TTCCTTCTTTCCTCCCCTGCAAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCAAGAGGTATGTTTTGCTTTTTACCTTTTCAAT:1 - chrX 17544226 5' + Tc1-2 137 1 77.23 CTGGGGAAATGAGCGGAGCGAATCAAAATCAAAAGCTTACCTGCAATGGAAAGAGGAAATTTGTTAGGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTA:1 + chr3L 17985712 5' - roo 350 2 68.32 TAAACTTTTTTATTTCTTTTTTTTTTAATTTCACTTTCTTTGTGGATTTTTTTTTATTTTTTTTTTT:1 - chrX 8382642 5' + hopper 143 6 88.06 TCATCCATATCCCAATATAGGCCCGCGGGAAGTCCACACCGCGCCTTGATGTTTCGTTCAATGTTGACAAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCA:1 + chr2R 4501430 5' + G-element 9 1 70.30 AAGCGGCGCATCCACAAAAGTATGCAACAGCATCTGGGCATCGGCGTGTGCATTTGTGCATTTGTGCATTTGTGCATCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 + chr2R 17960478 5' + jockey 7 1 78.22 TCTCTTTCCTACTACTACCCCATGTTCGGCCGAGCCCGTTCAAGCGTAATTTAATTTCTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 + chr2L 16717940 5' - 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copia 238 1 59.41 TTCCTGGTCTTAAAGGGTGCGAAACAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2R 10345625 5' + roo 51 2 76.24 TTGCGCTGTACATTGAAACGTCAAACTGTAAATTATAGTTATTAACATTTACTTGTAGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 - chr3R 13122922 5' - Transpac 290 2 62.38 ATGATTAGTTCCATGCTAGTGAAACTCTATCGATAAGCCTAGATATATAAGATATATATAAGAAAGCCGCTCCACCGCTGGCGTATCCGGCAGCGCAGCTA:1 + chr2L 9426065 5' + 412 305 2 74.26 GGCTATGGGCTAGGCTGCTGCAGGTTTTGTTCTTTATGTTTCTTCGTCTCCTTTTTGTTATGGCGG:1 + chrX 711677 5' - HeT-A 246 1 63.64 CTTCGTTTCAATCTTTATGAATTGCTCGGCTCTCACGGCGTTGGGTGTGCTGGTCATCCTTGCACAGATATATTTTCGTTACATACATTAATGAATAA:1 - chr3L 14878114 5' - Gypsy12A_LTR 2134 1 62.24 CATGGCCGTCCTGCGTACTATGAAATTTAAGGAGCGACTGGTCATCAGTCTGGGCGCCACCCTCGGCCACACCTCCCGCCCCACCGACCGAGGGGCGCTGC:1 - chr3R 23626809 5' - Cr1a 4412 1 60.40 CACAGCGATTAATGCATATATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCC:1 + chr3L 15452868 5' + accord 33 2 57.00 GTTTATTTTTACCGTGTGCAAATCGGATTTGGTGCGGGGTGTCTTTACACTCGACTGGGTCGTGAGAGTGTGTGTGGAATATGTTGAATATAGGCAATGCC:1 - 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gypsy4 6570 1 54.46 GACGTAGAGATTAATTAAGATAAAGCTGTTATAAGAGTCGAGCTCATAAAGGACTGGACGAAAATTACAAACAAATCAATTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr3L 27864667 5' + roo 8664 1 79.21 CCTTTTGTGTGTGCTTGCCACACGTTGTTACACTTTGTAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTTAGTAAGAATACAT:1 - chr3R 26583307 5' + Stalker 260 4 70.30 CTCTTTGCTCTCCTATGGCTTCGCTTTCGGAGCATTGTTATTGTCTCTTTTTTGGCTCATTTATCATGGCCAGCACATGTACACACACACACACACA:1 + chr2L 11875054 5' + accord 7026 2 54.64 TTTCTTTGAAGGCTTTTGATTAATAAAGAAGTTCTTTGGAAATACGTACGTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr3L 18580432 5' + 412 7081 2 54.46 GATTGTCCAAATGCCGCCGAGCATACGAAGACCGCTCAGGTTCGGCGGTTCGGCGGTTCGGTGGTTCGGTGGGTCGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chrX 15125733 5' + P-element 1 2 78.22 GGTGGAGCAGCTACATCGACGTCCAGTGGTGGTGGCGTCAGCAGCGTCGCAGCGGAGAAGTGCTGATGATCGCACTTTAACCGTTCGTTGACGTTGATGGC:1 + chr2R 18998265 5' - HMS-Beagle 6853 2 70.30 TTTGCATCCCCAAGAAGTAAGTCAATGATTTTGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chrX 12954184 5' + pogo 41 1 72.28 TGTATGTAATTAGAGAACTCCTGGTGCTTTGGAACAAGGGTCCCCCCATTGCAATCCTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 12215251 5' + hobo 17 1 62.38 GACATCTACATAAGTAGCTCCAAAACTCAATTGCCGAAAATTAAAATGCGTAATTTAAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGA:1 - chrX 7335160 5' - Tirant 8491 2 64.36 AAGCCGAAATCTTTTTTAATATCCCATCTATATAATATCAGAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACC:1 + chrX 18680771 5' + I-element 230 1 59.41 AGTGCTAGTCGTGGTGTGTATTAAAAAAGTTAAAATTGATTGCTTTGTAATCTTGACTCTCTGCCGATCTTAAAGCAATCAATTTTAACTTTTTTAGTACA:1 + chrX 5000044 5' + Cr1a 4266 1 54.46 CTCACGCCGTCAACAAAAGTGGATGCCTTGTACTATGACAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCT:1 - chr3L 11208169 5' + invader2 5060 2 62.38 GCGACGGGATAGAGGGCCTTGCATACGAAATATCCACGGCAGGTGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTCCCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGC:1 - chr3L 20224986 5' - Chimpo 5 1 53.47 CTGCATGCGCGAGGTGCTCAAGGCGCTGAAGTTCCTGCACGATCGCTCCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCCCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCA:1 + chrX 11550831 5' + Doc2-element 461 1 54.46 TTGGTAGATTGATTGTTTACACTGTCGAAAGCGTTCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 - chr2L 14743273 5' - 1360 3349 1 69.31 CCTCGTTGGACAAAGAGCAATAACCCTTAAAGTATCGGCGCTTTTAGAATTGAAAACAACAAACTTAACCAATTAGCACTGTGCATAGTTTCTTAATATAT:1 + chr3L 21993888 5' + gypsy7 5051 1 58.42 CACGTTGAGATCGCCCAGGTTGCCACTGCTCCCATTCTCAAATATTATGCTGTTCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATG:1 + chr3L 20790888 5' - accord 450 2 56.44 CATCAAGCCTCAAAGGACCGGGTATGCTTGCATAATTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGA:1 + chr2L 5659446 5' + jockey 4575 1 64.36 TTTTCACCAAAAAGCTCCGCCTATTGATAACCGATTAACATCGATGTAGGGTATAAAGCAAACTACAGACGCTGTCCAATTTATGTTGGGAAATGTTTCGA:1 - chr3R 21276301 5' - 297 496 1 57.43 AACAAATTATTACAAACCTAATGACCTAATATATAAATTTTAGCCCACAGTGAATGCCCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCGTGTTATTTT:1 - chr2R 13633918 5' + diver2 137 2 58.42 TTCAGCCCTTCAATCCACCTTCGTTCAATGATGAGTTGATTCCTACGATTCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chrX 1252855 5' + hobo 25 1 52.48 CAATCTCTTCTTTTTATCCCCTGAGCAAAGGACACGGTCTGCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr2R 5200995 5' - 1360 3359 1 59.57 GGAAAGAGAGAGAGTGAGTAAGCACCGGTTAGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 + chr2R 23520973 5' - 412 7459 2 68.32 GGAGCGGAGTGAAACGAAGAGGCCGAAGCTGAGCTTGGCGCACAACTGAATCTTCGGACGGACGCGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chr3R 15328756 5' - P-element 2875 1 67.33 CAGGATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTAT:2 + chr3R 4973099 5' - 1360 14 1 41.58 AACTACGCCACAATAACGAAAAAAGAAAATAATAAAACCCAAATATAACTCAAATAACTCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATA:1 - chr2R 4026434 5' + I-element 4949 1 63.37 TACATTAAGTATATTTTCCGGCACAAAAACATTGCAATGACTGAAACTCTTGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:2 + chr3L 3986377 5' + jockey 35 1 49.50 AAGAAGGGTGTCGACATGAAGTCGGTACAGTTGTTGGGATCGGCGTACAAGGAGAAAGTAAGTACTTTTATTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTA:1 - chr2L 2793363 5' - GATE 435 1 62.38 CGTGTTAATTAGTATCGAAGTTCTATGGCTTACAAGCAAGTTTTTATTTTGACGTGAACAACGGTATTTGGCTCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTG:1 - chr3L 19415982 5' - F-element 4331 1 77.23 CACTAAAAATAAACAGAAATAAAATAAAATACAAGGGCTACGGCGGCGGTACGAAAACAGAAAACAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCA:1 + chrX 17034096 5' + Idefix 319 2 35.64 TTTTTCACTTTCGCATAATTGTGGAACCTCGGTGTTTCGCTTGTCTCTTTCTGGGTCTGCGCTTCCACGCCCACTCTAACGCCCTTAAACCGCCAAAAACT:1 - chr3R 23428477 5' + INE-1 346 1 69.31 CGAATGCATGCACCAAGAGATACTTCAGATACTTGTTCAGATATGTGGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 + chr2R 11195605 5' - 1360 3363 1 58.42 ATAAAAAAATGTATTTTGCAACCACCAGCTAATCAAAACTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGG:1 - chr3L 15635131 5' - Max-element 276 2 54.12 ACACAGATACGGATACCGAATGCATGCACCAAGAGATACTTCAGATACTTGTTCAGATATGTGGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr2R 11195589 5' + 1360 10 2 63.37 CGCTGGCCGTATCTAAGCGATAAATATTTCCCGTAATTATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chr2R 16338086 5' - roo 9035 1 61.39 GGAATTTTATTAGGTCGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACC:2 + chr2L 14074939 5' + jockey 241 1 55.45 GGAAGTGGATGACGAAAAGGAGGATGAGTCCGATAAACAGGAACAGGAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCC:1 + chrX 12444178 5' + jockey 423 1 55.45 GTTAACTTTTCAAAATAAAAATTTTGGTCGGTTCTGCTACAAAACGCTATTTTAAAATCCTATAATGTTATTTTTATCTATAAACATTGTTATTAATTTTT:1 + chr3L 24241167 5' + gypsy12 9768 3 70.30 ATATTTCACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATA:1 - chr2R 2092807 5' + Doc3-element 68 1 57.43 GTGCTTACGCTTCATCGATTGACCGTTGTCTGCGGCTGTGTGAATATGTGTGTGGGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGGGCAACAGA:1 - chr3R 31915727 5' - accord 7000 2 57.45 CTACAAATTGAATATCATTTGCAGCAGCTGTGAGCTTTTCCCGGCAGTTTCCCCTTCCATGCGAACTAATTAAATGTGATGTCTAAATACTTTTGCCATCG:1 - chr2R 19193483 5' - Tc1-2 202 1 59.41 CGTTGAGTTATAAATACTCGCGTAAAGTTGTCTGACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chr2L 9330282 5' - hopper 1375 1 64.36 ATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCC:2 - chr3L 25232911 5' + GATE 32 2 53.47 TGATATAGAAAGTTATACAGTAACGTACTGAAAGCTATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACA:1 + chrX 812272 5' + Quasimodo 32 2 65.35 ACAAAAAAAAATTGATTAAAAGTCGTACAAAACTAATAATTATATGTGCTTTACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTT:1 + chrX 19080273 5' + Ivk 22 1 53.06 CCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTGTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:1 + chrX 21668013 5' - Tabor 446 2 61.39 CAACACGCATAGCCGTCGAGAGCTGGAGAGATGGAAAAGTGGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAAAGACACTAGAATA:1 - chrX 5134371 5' - Tc3 316 1 56.44 ATTCCATGCGCATAATTTATTTAAAGATTCTCTCAATATTGGACAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAA:1 + chr3R 26486917 5' + Quasimodo 487 2 56.44 TGGGGAAAGTTGATTAAATTCATAATCAAAACGCCTGATATATGATAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGC:1 + chr2L 6712685 5' - mdg1 7218 2 58.42 CATTTTTATTAGACGAGCGAGCGGGGATCGCTCCCTCTTGCTCCCAAGACATCCTGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGT:1 + chr3R 5441128 5' - accord 442 2 56.44 GAACTCCATTCGACAACTTTAATGGCTACTTCAGGAGCAAGTTCCTCTATAAAGTCGGGTCTGGTTCTAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGCG:1 - chr3R 20263343 5' - Porto1 4482 1 62.38 TCAGTTTCTCACTCCTCAAACCTTGTCATATTTCCACTCAACTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTT:1 + chr3L 3635418 5' - roo 9037 1 56.44 GCCACACAAGTATGTGGCTATTAGAGGGAACTGCCACTTTATTGCACTGGCGGCATGCAGCCTCATTACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTC:1 - chr2R 13701960 5' + Quasimodo 91 2 73.27 ATACAAAGTACGGAGGTTGGTAGTTGCATTAATAACTACGATGAAGGTTACAAAGGTTATGAAGGTTCGGAAAAATAGAATTTTTGAAATTTTAAATCTGG:1 + chr2L 20706990 5' + FB 32 1 72.28 ATCGGCTACATCTAACCGAATCAAATGGCTGATAGAGCCATCAAATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3R 24023381 5' - roo 9040 1 57.43 CGAAACCACAGCCACCGCAGCATCAGAGTTGAATCCGTGTTCAGCTTTACCATTCGACTGACTCCCTCTCAGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCT:1 + chr3R 17222226 5' - invader2 121 2 67.00 GTCAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGT:1 + chr3L 5267215 5' + Juan 4001 1 51.49 ATAGCATTGAAATCTACAATATATTTTCTCACATTTCATTATTTTCCAAAAGTTTATTTCAATACATTCATTAAACTTAGGTGTTCACACATGAACACGAA:1 + chrX 14500070 5' + roo 8663 1 65.35 CCATCTGATTTCATTCAATGCATTTCAAAGTAATGAATTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 - chrX 12954244 5' - pogo 2066 1 69.31 ATTTGAATGCGCAGCTGATTTTAATCGCAACCAAAAGCCGCCCACTATTTTCCGGCCAAGTTCGTATACGCCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 - chr3L 7742806 5' + Doc 11 1 69.31 TTTAATTATTTAGTATATTTTTTAAGTCATTTGACTTAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGACCGAACCTCGTGCTTCAAGATATGACCAAA:1 + chr3R 6343939 5' + 1360 484 1 53.47 TTCAACATTACACTAATTACGAGAACACAATAATAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAA:1 + chr3L 25722419 5' + F-element 4651 1 71.29 CAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATAT:1 + chr3R 19589921 5' + BS 5019 1 52.48 TAAGGCGAACTTGGGCAGGGTTATTTAAATATTTCGCAGGACCAGCCGGAGTAAGCGAATTCTGACGGCTACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chrX 18119594 5' + hopper 4 2 75.25 AACATTATCTTAAGTAAAAATTATTTTACCTCGGAAATAGACTTAACACCCTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr3R 2425646 5' - 1360 3366 1 65.35 TCTGCGTCAGTTTGTCCAGCTGGGCCTGGGCCAACTTCAGCTGTTTCTTGGACATTTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAA:1 - chr3R 22677424 5' - 1360 3229 1 60.40 GGGTGAATGTAGAAAGTTGAATGCAAATTTGCATATCCTTTGACCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 + chr3R 27357773 5' - jockey 4959 1 63.37 TATGAGCCTTTTAACCTGTTTTTCGATTTAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:2 + chr3R 6425848 5' + copia 4915 2 71.29 AAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGCTGTTGGTATTGAAACTTGGCATGTGCAATGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:2 - chrX 19820060 5' - hobo 2925 1 67.33 GAATTGACCCACAATGGCAATCCTTACCTTAAACTTACCTTGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTTATTAGTCGGCTTAACTTTTCGGTTCCAAGTAGAT:1 + chr3L 21490442 5' + Cr1a 4100 1 59.41 TGATTAAATTCAACCCCATCCTTATACCAAATTCGAACTTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGA:1 + chr3L 9174657 5' + 412 7 2 72.28 AAAAAAGAAAATAGAAAATAGAAAAGCAGAAAAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGA:1 + chr3L 17956622 5' - accord 7077 2 68.32 CCACCTCCTGGTTTTCCTGCTCCACATCCATTCCTGCAGCAGCAACAGTGTCCCCGGTGTGCGACGTGGCCAGTTGTAAGGACCTGAGAACTTGTACGCAC:1 - chrX 8734971 5' + Chimpo 3937 1 75.25 AGTTGTCGTATTCTCAGCCTGTTTATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3L 14260358 5' + 297 55 2 51.69 TTGACGAACGCCTACTCTCTTAGAAGCACTTTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATT:1 + chr2L 15807580 5' + 297 6571 1 70.30 GATTGAAAAACAATTCACCTACGAAAGTAAAGAAAAACAAAACAAAATGGATAAGGAATACGTTTGCTTGTTTTTCTTACTATTTCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 9156989 5' - Doc2-element 232 1 54.08 AGAATAAGAAAGTTTAATTGGTTCGTCTGGGAGGGATAGAGACACACTGGTATTGGTGTTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:2 + chr2L 16211299 5' + Tabor 19 2 61.39 ATCAGCTGTTGCGCATAAACAATTGATTGTGCGCCAATTGTGCGAGTGTTGGTGATGTTGGTGCAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGATGGT:1 + chr2L 21219827 5' - gypsy6 7767 4 61.39 CACCAATAGTCGAATTCAACTTTCATATTTCGCTTCACAGGGCATTTCCGTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACG:1 - chr3R 13977468 5' - micropia 5210 1 54.55 AGAAGAGTACGATTTTGGCCATCTTTACTTCGAGTGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCT:1 - chr2R 17502909 5' + F-element 360 1 67.33 AAATAGCTTTTTTGGACACTCTTAATTTAAACAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:2 + chr3L 10792179 5' - pogo 2060 1 68.32 ACACTGAACTTTGTTTTGTCACCAGGGTTTTTTGTGGGTTCTGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - chr2R 22404248 5' - hobo 2904 1 61.39 TAAACAGAGTGTAACTGCCGGGGTTGCCAAAGCTGAGAGTGCACGGTGACATTTCTGCAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACCAAAC:1 - chr3L 9179676 5' + Idefix 173 2 62.38 TTTTGTCTACACACACACACACCAAGATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 + chrX 14041143 5' - 297 352 2 88.12 AAGCAAAAATAATATATTGATTCACAAAAACAAAAAAAAAAACGATTTCATTGAATCTAATCAATCAACCTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chrX 13698853 5' + 1360 4 2 70.30 TGCATATTTCATTTCCTAAAACTTCTTTATTGTGTACGGCCCGTCAAATCTCGGGGCCAATTTTGCCACGAAACCTTCGGCTGCCTTTGACAGGTGGTGC:1 + chr3L 10183515 5' - Osvaldo 1326 2 79.00 GCCGTACAACGACAAATGTCATCAAGCAGTCCAAATAATAATAAAATATTGATGCTAACAATATTGAGTGAAATTACACTTAAACGCGAGAGGTATGATTT:1 + chr2L 18435059 5' + Tc1-2 119 1 69.31 ATCTGTACGCAGCGAAAAATGTTCTTAAATTTGGGCTTACGCGAAGCGGGGCTTTAACAGTTTAAAGGTGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGG:1 + chr3R 28231844 5' - I-element 6 1 71.29 TCATGACCGATTGGACAAACAACTATACCGAAATTTCTTAAAAAGGTTGAAACTGTACGTCTCACTTGGACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATGGTCGGG:1 - chr3L 15313551 5' + INE-1 552 1 73.27 TTTGAATATAAACAAATCTTATTAAAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 + chr3R 20369684 5' - pogo 2056 1 74.26 GTGATGCAAATAAGACTTACCAACAAGAAAGAAAGATAGATTTGCCATGCCGAGGTTATATAGAAAAATAGTTGTTATATTTGTGAGTCGAACTAATGTCC:1 - chrX 22577181 5' - 297 375 2 41.58 ATAGCGTCACCGCCGTGGGGTTAAGAGCGTGGGCATCAATGACGCAGGCAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTGAAATCAGACCACTGTCCACGAAAAC:1 - chrX 18364529 5' - Cr1a 401 1 57.43 GGCGAGATAGAGCGCTTAGTAGCTGACTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3L 3635469 5' + roo 8711 2 74.26 TGTGAGGGGCTGGGAATATGCATGGAAAAGATATTGAAATATGAGTAGGATGCACTGGGAGATATCAAGGGGGAATCATAATAAATAAATAAATCTGATC:1 + chr3R 19300062 5' + G3 347 1 78.00 CCTTTGGCAGAATTCCCGTCGCCGTTGAGTCCTACATTTCAAGCGGATGTTCGGTTATTAAAACACAGCGTGCATTTCGAAATCGCTTTAATTTAGCCCCG:1 + chr3R 14496002 5' + mariner2 223 1 75.25 CTTGATGGCACCTAATCATTGAGACTGTTAATTTGAACCATAATATACACTTTAGAGTAAAACTTTTACATTATTTTTCAAATATGATAAAATAAATCAAA:1 + chr3L 13174261 5' + TAHRE 29 1 48.51 TTTTTGCTGCTCGAATATTGCACTGTTTGGAAAATTCCAGGTTGGAAAACAATTTGAAAGCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2R 22521795 5' - roo 393 1 63.37 GTATTCAAGCAGTAACAGTCAAGGCAAGTGAACGAAGGAAAAGTAGAGAATACTACCACAGACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAA:1 + chr2R 544722 5' + R1A1-element 4890 1 51.49 ACTTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGAT:1 + chr2L 23286583 5' + Tirant 415 1 58.42 CAAAAATAGCAGGAGAATAGCAGAATAGCTGGCAGCGGGCAAAAAGTGACGTCCTGGGCCGACTGAAGGAATTGAACTCATTAAGTGTACGCAAAAGTTTA:1 - chr2R 19201572 5' + rooA 7589 2 71.29 CATTGCCGAGGCAATCAGCGACTGGAGACGGGGATAAGTGCATTAATTAATGCATGCAAATTAACACGATCACGTCGGGGTCACCAATGTTTAGCTATTGA:1 + chrX 14586795 5' - diver2 372 1 70.30 AGCATTATTCGGTAGATGTACAAATTAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGACGTGAATTTTTAATAATTATTTTATTTTATCATATTGCTAC:1 + chr2R 20607015 5' + 1360 3105 1 74.26 AATTATATAATGGCATAATTATCATTGATTTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATT:1 - chr2R 22194754 5' - R2-element 3170 1 70.00 GATAAATCTAATCAGTGTCGTGGCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr2L 17056531 5' + 412 53 2 78.22 AGCTATAACAAGGCAAATACATCAAGGTGTTTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGT:1 + chrX 12276776 5' + hobo 44 1 69.31 ATAAAGCAGTTTAGAATATAATAAATTATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACC:1 + chr3R 7632464 5' + 1360 261 1 75.25 CGAGTTTTGATTCACGTATTCACAGGCGAGTGGACTATTTACAGGACAAGATACCTGAAGATTTGCTAAAGATTTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGG:1 + chrX 16520046 5' - Quasimodo 7063 2 74.26 GTAATCTGCATAAATTTAACACATTTTTAGCAATCCAACTTGCGTCTTTCTCTCTAGAATATGTATGCTAAATATTAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTG:1 - chr2R 6608641 5' - INE-1 155 1 66.34 TTTAGCCCGCAACTTGGACAGGGGCATTAGCGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3L 21782058 5' + roo 44 2 67.33 ACCTGTAGGTGATAATAATAAACAATCGAAGCACGACGCCCACGACTGCCAATCGATGTGTTTTTGGGAGTTTATACGTATGTTTATACGTATGCATAGG:1 - chr3R 28569501 5' - ZAM 8158 2 70.00 AGCATTGTAAATTTTCTTAAGTTCTCCATTTTTGTTTGGGCCACGTAAGATAATCGCGCAGTGTCAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 15259013 5' - roo 390 2 56.44 CAAATCTGTGTATCCGTCAGATACATTTCGCTGTTGTTGTTGTATGTGTAGTTTGATATGTGGGGAAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTATTTT:1 - chrX 6855989 5' - Porto1 260 1 54.26 TACGAGTTCGTTTCATCGCGCCGATAGGAAATAACTTGATTTGGTTTAAAACAATGGAAATACAAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 - chr3R 27926661 5' + I-element 16 1 68.32 GTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTC:1 - chr3R 1844849 5' + Cr1a 127 1 58.42 TTGCTCATTTGGAACGAAATTGGCCTGATTAGCGGAAATTTTAGTTTTGGGTCCAGAAGAACGCCAAGATCATCAACTCGTGTTATTCTGCCCAAGGAGCA:1 - chr2R 6282526 5' - Q-element 734 2 65.35 TTAAGTGTAAAAGCCGCACGATAAATCAAAAGCATAAAATAAAAGCTGGCAATAAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCA:1 - chr2R 13536913 5' + Doc 269 1 60.40 TGTATGCTCCTTGCCTTTGCCCACATTTTCAGATATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAG:1 + chr3L 13264464 5' - Burdock 216 2 66.34 CGTGCGAAGATGACGAAGGTGGTTAACAAGCCGAAAGAGACGACACACACAAGGTGACTCGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:3 - chr3L 14152176 5' + blood 7030 2 60.40 ATTCTGCCTTCAATTGAACTCAATTGTGCGTTGCCCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 - chr2R 17269778 5' + transib2 39 1 63.37 AAAAACTGAGTGTATTCAAAGCGAAAACTTTTGCCGCTTAAGAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 17846940 5' + roo 8697 2 64.36 GCACTGCCGTCGCCAAGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGG:1 + chr2R 6482651 5' - gtwin 460 2 64.36 GATTCGTTTTATTTGTTATGCAAAAACTTGAAGTATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chr2L 3988514 5' + I-element 28 1 61.39 CAAAATGTGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 - chrX 6146714 5' - hobo 2896 1 68.32 ACTTTTGATGGATTGGACGAGGAGCCGCACTCGGGTTACAGTTATTCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGTGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCG:1 + chr3L 20589523 5' - Doc 428 1 67.33 CACCTGTGACTTGAGCATGTCGTCCACCTTTTTGGCCTCCAGGCGCAGCTTCTCCTCGCACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAA:1 - chrX 574666 5' - invader4 2804 2 58.42 GATATTCAATATAGCAATGGATACATTATATAGCTGCCTTGATCTGTATCTTTGCACTCTGGCTTTCCTCTCGGGAATCGAGCTGTACGATATACGGCAGC:1 + chr3L 11312166 5' + Cr1a 4395 1 68.32 TAGTTAAAGTTAAACAAGGAGGGTCTTCCTTACATCCTAATAGGATTCATATACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chrX 3195615 5' - mdg1 7437 2 56.00 GGTGTAGCGAATGAGAATTGCATCGATGGCTGTTTTGATGGAACACTTTCCAGAGCGCCTTATCTCAATTAGAGGCGATTTGGAATGGCCGGCACGCTCTC:1 + chr3L 23570412 5' + mariner2 554 1 81.19 GGCCATAAATGAGACTTACCATTTTGCACCCCCAACCACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGTCTAGTCCACCACTCAAGTCCAAGTCA:1 - chr3L 11314719 5' - invader4 2699 1 59.00 TGACTGTTGTCAACATGTTCAGAGCGTATTTGTTGTTCGAGTTGTTCGGTGTTCGGTGTTCGTTGTTGCTGTTGACTTAAAAGAAGAAATTGAATAAATAT:1 + chr3L 14890224 5' + 412 426 2 77.23 AGTTTAGACTAACGCCAGAGATGAAATTCGCATGTCCACGACCACTCTAACACCCACAAACCGCCAATATAACCATCCCCTCACTTTTGATAAATGTGTTG:1 - chr2R 5112190 5' + INE-1 259 1 69.31 AGCCGTGTATAATTACTTTATGCCCCGAATTGATTTATTAAACGGTCATTTACTACATAAATACTTTCTTTTAACTAGCTTTTATTTTATTTGTTAATTTA:1 + chr2R 6937534 5' - HeT-A 313 1 75.25 GTTATAGATTCTAATTCTTCTCAAAATTTTATACTCCGTCCTTTTCTACTGACGGAGTAGTTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3R 16041011 5' + jockey 20 1 64.36 AATTTGAAAAGCTGCCAGTTAATAGCTTCAAAAATAAACAGAAAATATATGCAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAA:1 - chrX 12151685 5' + diver 5912 2 55.45 GAAACAGACAACCCAATGCTGCGTTTTTGACTGTCTGTGCTACACTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3L 10554838 5' + roo 29 2 54.46 CGCTGATTGGTTCCTGATTGGCTGTTTTGGCAGGCCTTTTGAATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGA:1 - chr3L 13992914 5' - accord 297 2 65.28 TGCAGACTTTTGGCCATATCCTTTGGCCCTCCAGACTGCCGAAGCTCCACCACCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTCTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr3R 28940710 5' + hobo 26 1 54.46 CCCGCTTAATTATTCAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAAACTGATTT:1 + chr3L 11367499 5' - roo 373 1 58.42 CAATTTTTGAAATCTAGAAAACTACAAAACAATCTCCTAAATCTGGATCACGTTTTGCACGCTTATCTTAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chrX 14521618 5' - roo 407 1 71.29 AAATATGCGTTTTATTGAATTTTATGTGCTGGGCTCTCACAGCCGGCGCTTTTTCGCACCGTACCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCT:1 + chr3L 15797406 5' - F-element 404 1 70.30 CGGGCTACTGGCCGATGGTGTTTTGGCGGTAAGTAGAACATGGTTTTTTTTTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCA:1 + chr2L 18384866 5' + 1360 3195 1 59.00 TATTTGTGGTATTTATTTATAGACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 12818874 5' - roo 356 2 76.24 TAACAGCCACTGACAAAAAATACAAACATAAAAACCTACCAAGTGACAATGCCACGCCCCCTTGTCCCAGCCCACACACGCACACACACGCACACACATAT:1 - chr3R 16512632 5' + accord 183 2 66.34 CATTTCTATAACACCTGACGTTTTTTCCACTTTACTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTT:1 + chr2R 23725898 5' - Doc2-element 255 2 66.07 TACCAAATTCGAACTTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATCTTA:1 + chr3L 9174681 5' + 412 7084 2 52.48 GTGACATGCAGAATACAGGCATGGTCACAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAACATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chrX 21668293 5' + 412 46 2 68.32 ACGAGGGGCGTAGAGCCCAGAAATTGACAGACCTCGTGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:2 + chr2L 16396575 5' + 412 40 2 63.37 TCAAACCATCTCGAGCACTACTCAAGCACCACCGCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGAT:1 + chrX 10042866 5' + accord 86 2 71.29 GTTGTGCGTATTGACTGTATGGCAGCGCTCTTGCTGCCAATACAATACGACGACAAAATCGGTTGTTTTTAGTGAAGTGAATGGTTATTAATATAATACAA:1 - chr2R 4023397 5' + Doc2-element 75 1 57.43 ATGGTGCCCCAAAATGTATGCTACGCTTTCTTCACGCGACCAATTCGTGCGAAAGTGTTTATTATCATTATGATACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chrX 12135738 5' + jockey 11 1 72.28 GAAATAAAATGATATTTTAGAATGAAATATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCA:1 - chrX 23457227 5' - invader4 283 2 70.30 TTATGCTTTCACCCAGCGACTGATTAACACGGATTGGACACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTAT:1 - chrX 13192618 5' - invader2 26 2 62.38 CCGTTGGTGGGCTAAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:2 - chr2L 7971072 5' + blood 7 2 68.32 ATCCGCCTCTTCATCTTCTTCAAAAAACTAACAACGATTATCATTTATTGTAAACATAATTATAAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTTTGTGATT:1 - chrX 13710584 5' + Cr1a 136 1 71.29 CTGTGATGCCTTCACGTGCCCGGCCAACTCGGTTTGCGTAGCCCGTCAGCACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCA:1 - chr2L 4558678 5' - F-element 4312 1 55.56 AAATTGGCTTCCTTGGCTTGCGAGTATGTTTGGATGGGCGAGAGAAACAAATTTCACTTCGTTTATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTC:1 + chr2L 17642079 5' - Bari1 1656 1 70.30 AGTTTCTCCATGACGCTCAGTCGATCCGAAAGTGTGAGATGTCTCAAGTGTCTTGGTATCCATCTCGGGTTGGCACGACAAAAGGTCATAACTTTACACTT:1 + chr3R 6894244 5' - Q-element 671 2 73.27 AATCTATACGCACGTGCGTTGCTTTTTGTGAAAACTTGATGTATGTGTGTGGCTATGTGTGGGTGTGTGCGTGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chrX 6146629 5' + hobo 2 1 75.25 ATCACTGCGAACTGCGAGGAAACTCAAGGAAGTGATGGCACTTTGGCCACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTCATCACACAAGCAAGCAAATTATA:1 - chrX 8302151 5' + 1360 3258 1 51.49 ACAATAGCGAGTCGAAATGAACGAGTGACAAGTGTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATG:1 - chr3R 16285007 5' + Circe 7168 1 75.44 CGAAATGTTTCGAAGGCGTTTCCTACAATGCCCCCGCCCCCGCTGCTGAGCTCCAGAAGGAGTTCTTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGA:1 - chr2L 16542362 5' + Doc 346 1 49.50 TAACCCCTCAGTGGCCACGCCTCACCGAAAGGGTGTCAATGGCTTTCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAG:1 - chr3L 15410143 5' - 1360 9 2 54.00 TATTTTATTAGAAAACTGGTAGCTCCTCAACTCGAAAATGTTTCCGCACAAAGCTCTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAATTTTT:1 - chr3L 13779364 5' + transib2 25 1 53.54 GATTGACAAATCCATTAACATAGAAATGCTTTTCATATCATTCAATAAGATATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 - chr2L 18188470 5' + Doc 15 1 60.00 AACCAACTAACCGGCGACCTGCGGACCATGAATAGACAAAAAAAAAAGTTAAAATGAACAATAACAAATGGGCAGAAATAATAGAAAAGAAGGACACAAAT:1 - chr2L 19146758 5' + X-element 4667 1 50.50 TACCACCCCTTCGTTTTTTTTGTTTTTTCTGTTGTTTATCTAGCGTCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 8869170 5' + roo 8695 2 57.43 CGGTTCGAAAGTAAAACACAAAACAATTATCACACATAGCTGGCATTTTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chr3L 4051038 5' - pogo 2078 1 57.43 TTTGGGATTGCGGCTTTGTTTTAGCTTTGCAGCGGGAGTAAATTAAAGGTTTTTATTGAATTTTTTCCAAACGAAGACCAAAAATTCTCTAGTCATGGGTC:1 + chr2L 3857473 5' + Tc1 344 1 59.41 GCCCCTCCTAGAAATGGGAAGAAGAAGAAGAAGTTAGAGTCGTGCTCCACACACAGAAAACTTAATAGTATAGCAATTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTT:1 - chr2L 11813319 5' - Doc3-element 110 1 56.44 CACAACGAACTCTTGATTTGCATGCAACAGGTCCCTGCCAAAAATCAACAAATACTCACCTGCAACGTCTCCTGAAGTTTCCTGCGACTCGGTGCTTCCGT:1 + chrX 8864784 5' + TAHRE 10085 1 76.24 AGCTGTTTATATTGCAAAATGTCAAGGACTCGCCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 - chr3L 9174764 5' - 412 474 2 59.41 ACAGCCAGAAAGTGAAGAAGAAGCTGACATGTCGCCAATGGTCAGACGACAGCCAATAGTTTTGCAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGG:1 + chr2R 5400242 5' + I-element 224 1 65.00 CAACCGGAGGCATATCACCAACCTTTTCTGGAATTGGGTGACTGGCACACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGCATGCGTATAAAAGAGCTTTTCGCTGTAG:1 - chr3L 25840644 5' - 1360 129 1 65.35 AAAACATATAATGCAATATTTAACGATTACTGCATAATATAGCTTAGAAGTAGTAATAGCCGAATCCATGTACATAATGTCACATAATAAATTTCAAAAAT:1 + chr2R 4711711 5' + 1360 367 1 65.35 AACAGAGAAGATGGGGACCAGGCGGCAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 + chr2L 7970976 5' - blood 347 2 54.46 TACTCCGCTTTTTGGCGTTTTTTACGGCCTTTGTAATAAAATCAGCCCTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGG:1 - chr3R 10973289 5' - I-element 5069 1 74.26 CCAAATGCCGCCGAGCATACGAAGACCGCTCAGGTTCGGCGGTTCGGCGGTTCGGTGGTTCGGTGGGTCGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chrX 15125727 5' + P-element 7 2 72.28 TTATGCATTTTTCCAATGAAAACGAAAATTTTCCTATGCCATAGTTTTAGTTTGTTTTGCACTTTTTTTGTGTTCGTGGGTAATGACTAACGCACTGTCAA:1 + chr2L 8288695 5' - gypsy2 373 1 55.45 AGAATAGGCGCTGTAAGTCAATGCCAATTGCTGAAAGCGCTCGGCGAACAAATAGCGATCGTGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2R 16338168 5' + roo 13 2 66.00 ATGTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACTAAGTAATACAAAGGTAAATCACAATTTTTAGGCTGTTCATAAGAATAGCAGTGTCTGGT:2 + chrX 10801557 5' + HB 213 1 57.43 AATGTATTTGCAGTCGAGAATTATAGGCCATTGTGGCGTGGTGAGTTAGTTTTATAATTAGTATTTTTTGTATTCTTGGCTTTTAGACAGTAACATGGACT:1 + chr2L 16499003 5' - HeT-A 5866 1 64.36 TATCCTTGACGCAATAATTACAGGACAATCAGGCTGGTTCTGGTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr2R 9311816 5' + hobo 34 1 55.45 TTCCCCTATATATCAGATTTTCGTTCTGGCATCGGCTTAGCCCCCCTTGGGGTCGAAATCGTTCGACATCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGC:1 - chr3R 12557376 5' + 1360 3246 1 74.26 TTGTTGCATATCAAATGGCGCCTAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 - chr3R 20869711 5' - hobo 2886 1 79.21 CACCAATTCAAGTATAGACACTTCCTATTAGTGAGAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACA:1 + chr2R 21127204 5' + Idefix 194 1 64.29 TGTTGTATTTTTTGGATTATAAAGTTTTGTAATTAAAATTTGACAGCTTTACAATTCCCAGGACCCCCCGATATCGCGCATCCACTCAAGCTGTAACCAAA:1 - chrX 7655560 5' + Tom1 109 1 76.24 GAGAGATATGGCAAAAGTCTTAAATAAGAGAAAGGCAACTGGTGGTTATAGTTTATTTAATGGGTAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATT:1 + chr2L 7564230 5' - S-element 398 1 61.39 TTGTAGCATACATTTTAGGGCGACGTGTCAATGTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr2L 16968472 5' - 1360 3348 1 71.29 TACGAGCTCCGTAGAAACCTCTGACATTTTCGCCACCAAAGAGTGGCGAAATAGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCC:1 + chr2L 7463502 5' - blood 354 2 55.45 AAAGGGGTTTTGGTTTTTTGTCTTTTTTTACCATTCATTGAGTTTTTCCCGGCTCTGTTAACTGTTGTGTGTTGCAGACTCCATTTACGTCTTACAAAAAC:1 + chrX 3453695 5' - Doc4-element 490 1 52.48 TACTGTTGCGAGCTATCTCTGTGGCCCTGGAACCGTAAGTATATATATCTGTGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGT:1 + chr3L 11367637 5' + roo 102 2 53.47 CCAAGCCTCGAAACTCTGCAAGGCTATAAGCTTAATTCCAAATTACCGAACTTTGGGATCGTTTTCACCGGCGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAA:1 - chrX 21210701 5' + Doc 4413 1 52.48 CCACGTGATTAAAAACGTATTCCATGATGAAACATATGCATAAAGATTTCATATTTAAGCCCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr2L 14886458 5' + jockey 23 1 62.38 CATTTCCAAACTACCGGCCTGCAGGGATTTCCGCAGCGTCATGCTTGGCAGGTCCTTTGAGGAACTTTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr2L 7767098 5' + hobo 8 1 72.28 ACTTCAATATAAGATACCAAAATTATTTGGCAATCTTTCAAAGTCCGCAGCGGGTACTCGCGATGTTACCTTAACCACTTGAGTTGCTAAGTGCATGCTCA:1 - chr2R 16659658 5' - Stalker2 192 2 69.31 TTTTCGGTCTTTCCATCAGCAGTCGGGGCAGCATGTATTGTTTTTAATGGCAGCTACAAATTCTTTGTCCAATATGTTCAATTCTGGTGTTTGAATCTAAC:1 - chr2R 11846395 5' - rooA 7561 2 38.61 ATTTACTGTATCAGTTCATTAGCATAGAAGAAGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTT:1 - chr3L 22094318 5' - Stalker2 7606 2 68.32 TATTTTCTTAGATTTATTTGTTTGTGACGTTTCGTTTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGA:1 + chr3L 15635081 5' + Max-element 42 2 65.35 CTGGACAAGAGGAACCAGTTCACTCAATAAATAACGTATCTTTACTAGCAATAAAAAATATTTTAATATTGTATGACAATATATAAGAATATAATAACACT:2 - chrX 7746959 5' + mdg1 6 2 34.65 AATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGCGACTCTTTGCATTCCAGAAATTCTGTCGAGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGC:1 - chrX 21852440 5' + invader4 72 2 72.28 CCTTGAGATGATTTATAAATATAGTTAGCTGTGTTGTATTAACCGAACATCCGCTTAAAAAGTAGGCCTCAACGGCAAAGGCACGCTCCTCACTATTCCAA:1 + chr2L 7139050 5' - mariner2 139 1 73.27 ACGCTAAGACAAATAGCGCTTATAAATAAGCCACTGGGAAATGCGACAGAGACCAGAGCGGTTTGCACTGTGGGCATCGCAACTGCTACGACTGACTACTT:1 - chr2L 20586190 5' - diver2 4600 2 59.41 TAAGCTAAATACCACAACTGCTGGAATTTTCTTTTCAATATCTATCCATATAATGAAATTTCGCGTTCGCATTATTAATAGCTGAGTAACGGGTATCTGAT:1 + chrX 15108063 5' + INE-1 545 1 65.35 CTGGGAATACCTTCCAAAAAGTCACAAGTAATTTGAATGCAGCTTTTTAGAATTGATGTCTTGGTATCTGAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3R 7212414 5' + blood 7014 2 76.24 CAGGACTTTATAGGGTAGGCGAAAAGGAGAGGGAGAGCGACACAATGGGGCACCAGGACATCTGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTAAATTTG:1 - chr2L 15734092 5' + 1360 192 1 61.39 GTCGTTAATGGGTTAATTGAGGTACGATTTGCTGCCGGTGTCTGATAAGCCATCACATACATTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 24023294 5' + roo 14 2 63.37 AATGCAAATCAAAAGCCGGTTAGAAAAGTAGTTTTAAATTTAAAAGAGTATTAAATATACAAAATAGAGAAACGTTGAGACAAACACGAAATGTGCTTATG:1 + chr3R 4836721 5' + Tc1 1619 1 59.41 ATATCCCACAAGTTGACAATGGATTCCTCATCGATATTGAACAGGATTCGTTGGGAAGGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chrX 7768898 5' + hobo 14 1 66.34 TGTAAACACTATTTTGATAGATATTTATGTTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTC:1 + chrX 2351011 5' - Bica 455 1 70.30 TATTAGGTCGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAG:1 + chr2L 14074946 5' + jockey 248 1 51.49 ATAAGGATTTGATCTCGCCTTTCGCATTCAATTTTGCAAGGAAATCACCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTT:1 - chr3L 18731704 5' + jockey 4791 1 57.43 GATGCAGAATGCAGAGGCAGGGCGGTCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCAACC:1 + chr3L 14131778 5' + F-element 458 1 67.06 AATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATC:1 + chr2R 12185303 5' - accord 7381 2 72.28 CTTGCAGACTGCTCCTGCGGATCGAAAACGGTATCCGGTTACGAAACGGATGAAGAGAATAACACGCAGCTTTTCCTAATGTTACTTCTTAACTACTCCCC:1 - chr3R 23234172 5' - gypsy 6981 1 69.31 GCAACGTGGCAACGCTAATAAAGTCAACACTAAAAGCCTCGTTCAATATTCAATTAGACGCACAACACACACACACACACACACACACACACATACATGT:1 + chr3L 9324612 5' + Quasimodo 39 2 75.00 TCATCCTACACTCTCCAGAGTTCACTGTACCCCATTCGTTTGACAGCCGAGCTTCCGGTTAATAAACAATCCATCCACTTTTAGTTTCAGTTAGGTATTTC:1 - chr3R 30079489 5' + Circe 338 1 65.35 TGGCAGGGTCGCACGAAAAGAGCACCTGAAAACCGATATTGCATCGAGTTCGATTTCCCCGCCAAAAAAAAAATGAATATAAGCAATGCATCGACGGCG:1 + chr2R 13753961 5' + invader2 314 1 73.74 TAAAAACCCATTTAACAGGCTGGCCCAGTGGGAGGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGC:1 + chr3L 17292288 5' - P-element 350 1 39.60 TATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1 - chrX 21668073 5' + Tabor 34 2 57.43 ATTCTGGTTATACCTTACCCCCATAGACACAAATTATCTTAACGTTCTTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 - chr2R 8474989 5' - Transpac 285 2 56.44 ATATGCCGCACCAATCCAATCAAACTCATATAAATATGTACATACACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:3 - chr2L 2912103 5' + 297 25 2 62.38 AAAAATTGAGCAAACAATTTGAATATAAACAAATCTTATTAAAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr3R 20369667 5' - pogo 2073 1 57.43 ACGTGCGTGTTGAAAAAGTAATTACATCGTGGACTGCCAACTAACGGACAAATTAGTAGCGGCAAAGACACTAAAATAACAAGATGCGTAACGGCCATTCA:1 - chr2L 17846420 5' - 1360 3371 1 63.37 CTGAAACCCCTAAAGGGGGTGGATTTTGGAACACATTGATGTTGTGTTAGGGTGGATTCATCGATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 17846852 5' - roo 397 1 65.35 TAAGAGAGGAGATGCAGGGAGTCGCAGTAGGAAAAAAGAAATAAATAATGTATGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGA:1 + chr3R 20139097 5' - jockey 4716 1 60.40 ATCAGTGTCTTTGGCTGTGTGTGTGGTGTGCGTTCGAGTGGTGAATCCGGAGGTGTCTTTCCTGGGGGATTGGCGTGAGGACACAAGATGCAAAAACCATT:1 - chrX 12646404 5' - transib4 2319 1 59.41 GAAATGGATAGGAAGCTGGGGTGAGCAAAATAAAAAAAATTTAAGATAGAAGGAAGCATAGAATTTCAATTAAAATTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 - chr2L 10562863 5' + I-element 1 1 73.27 CGATGACCGAAGAACGAAGACTTGCCGGGCGTAAGGCCCGCCAGCTACTGCCCACAGAACTTCTGGCTGGCAGTTGTTTTACGATAACGTAACTTTATTTC:1 - chr3L 10306705 5' - Chouto 151 1 77.23 TTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCG:1 + chr2R 17402717 5' + invader4 2793 2 57.43 GAGCAGAAGAGGGAAGAGCTGCAGCTTTTAGTCAAATCTCTGGTTGTACATAAAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 2004985 5' - hopper 149 110 67.95 CGGGGCCTTCAGTTAGTCAGCCTTGTCAGCTCGTCAGTTTCAGGTTCCATCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCTTCAAAGTGA:1 + chrX 4601460 5' + Porto1 320 1 55.45 TCCTGCATTTTGTGTTTTAGCCGAAAAAAAGACGTTAGCCGGCGGAGGGCGGGCAGAGAAATAAAAGGTCCACCTGGGCAGAG:1 - chr2R 23630721 5' - baggins 353 1 73.49 TAAGAAAATGTATGTTCCCATATATTTGTATATATGTATTGCCCTTGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAAATTCGCGGTCGGCATTTATAAAAAAAAA:1 - chr2R 14652739 5' + HMS-Beagle2 472 1 55.45 GTTAGCATTAAAAATCGGCCGGCGTTGTCTGGCCGTCTGGCAGTTGCCACGCCCACAAACCGCACAAAACTGCCACGCCCACACTTTCGAAAAACG:1 - chr3L 17261385 5' + INE-1 254 1 55.21 ATCAATCAAATAAGCAAGGTTTTATTTTGAGCGACTCTCAGCTGAACGTGATTTCCTCTGATGGCCTAGACCCGGCTAGAGTTTCCGTTTTATTTCTTTTC:1 - chr3R 3844725 5' + Gypsy12A_LTR 246 1 72.28 CGTACTTTTGTAGCAAAGTTTGGCACTAGTTTCTTGTTTAGTCCGGATGTGACTAGGAGAATACAAGATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCG:1 - chrX 3102772 5' + Max-element 12 2 67.33 CTGAGAGCGGTTCTCGCTTTTTGTGACACAAAGAGGAGTGTCATGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 + chr3L 6942878 5' + P-element 33 1 46.53 TTTTATGCGAATCCGATGTTTATGCTTCGATATTGAAAAGTTACGATAATGTGACTGACTCTCAAGTCCCACATGCACGGTATGTGTGTGTGTGTGTCAGT:1 + chrX 4787974 5' - Quasimodo 35 2 56.44 AAACGTGGCAAAAGTCAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTT:1 + chr3L 5267202 5' + Juan 3988 1 60.40 TCAATTGAATTCAGTGCGCTTTATTTGCTCTCCTCAGTTTGTTTGTATTTTTTCTGGCTTAATTTTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGAG:1 - chr2L 4040057 5' - copia 5029 2 63.37 TGAACAGGAACGAGAGCAGCGAGGAGCTGACCACACAACCGATGACGATCAGCTAAGTGTAACTCTATTTACGATAACCAAATTATCCCAAAACTTTCCGG:1 + chr3R 17678054 5' - Gypsy12A_LTR 158 1 56.44 GAGAATTCGGTCGTGGCTCATGACCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 - chr2L 16396616 5' - 412 441 2 78.22 ATAGCAACCAAGTGGAGTGGGATTAAAGGGGAGGGGGGAGGGATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chrX 12818827 5' + roo 30 2 56.44 GCGTGCCACCAATGTGTAAGATTCCTTGTGTGTATTCGTTAGATATTTCATTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTCCTCCCCGCGTTAGGTTAAAGTCGTCCT:1 + chr2L 7544006 5' - gypsy4 6543 1 51.49 TTCGAATTTGGAATGCCATGTTGATTGAAATTGTTTTAAAAATATAATAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTC:1 + chr2L 10197593 5' - Stalker4 7337 2 68.00 CCATCGATGATGATATAAAATCAATATGTCTAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr2R 19658344 5' - 1360 3344 1 71.29 TATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3L 23456277 5' + 1360 9 2 66.34 AGCTGGAAGCTGTTAGGTGTTAAGTGAGTGATATGGGGCAGTAACTGGGATAATTTGTTGGGTTTGCTTGTTTCTGGTGGGGAATTCATTTTTGGTTTTTA:1 - chr3L 6872991 5' - I-element 389 1 84.16 GCGCTCCATGCTCATCACTGCACCATCATTCGTATATGTATATGTAGTGGTTTTCCCCCATCATTCCTACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAG:1 + chrX 2187520 5' - Stalker 162 6 62.38 TATTGTTAATGTTATTACCTACCGATACTTAACAACTCAGTTTTATATAGTCTGTTATTGTGCTGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCG:1 + chr2R 19476474 5' - 17.6 152 2 68.32 TTGGCAACAGCTCCTTTCATTTCCGCCCATGAAGTTTATTTTTAATTTCAATATTATATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGCAGAGTCTGAA:1 - chr3R 28195780 5' + hopper2 72 1 65.35 CCGCTCAGCTACGTCTCCGCACCCCATCGACATTGCCATCTCATACTATTCCATATACATACATACTTGTTAACATACTTTCTGCTGCGTCAGATACTTTA:1 - chr3R 17700871 5' + ZAM 8188 2 55.45 CGAGCGTGTTTTAAACTCATCCATGATTCCAGCACAACCCGAAAATCTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr2R 10777797 5' - pogo 2075 1 57.00 GTGTGTTGTGTGTACAAGCTCATTACGACTCTTGCTCGCCAGGTAGGTTGTTGTTTTAGTTGTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTT:1 - chr3L 20569479 5' - Porto1 230 1 71.28 GTCATTTACTTTTATTTTTTCTTTACGTGTATGGCTAAAAGCTAGCTGTCACACACACACACACACACACACACACACACACACTGGG:1 + chrX 5107948 5' + accord 258 2 70.45 GTTTTTTTTTTTGTGACAATGCAAATTCTTTGATTTTTGGAAAGGGTTTATTTGACTTTGGTTTGTTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAG:1 + chr3L 1851241 5' - accord 232 2 65.66 CCGTGCTGAAATTTAAAAATAAGTTAGATCGCTTTGTATTAGATACAATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCAC:1 - chr3L 7412491 5' - invader3 5434 2 51.49 AGGAACCCATAAAGACACGCCCAATTAGCCTTTTAAAGTTTTGTGCCATAAAGCAAATAATAAATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCA:1 + chrX 9526067 5' - invader4 3047 2 63.37 GATTTAACATTTATAGTAAGCACTTACTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 436893 5' - roo 9023 2 73.27 AGAGTCATTCCAGGTTCGCCCCATTTGCTGGGCCAAACTTCCTTTTATGGCTCCATAAAAGTGCCCTATCGCCATGCGATTCTATTTATTTATTTATTTAT:1 - chr2R 11058451 5' - Juan 4215 1 78.22 TCATATTGCTGCCATCATCCGACAGTGGTATCTGTGGCACGGTCGCGATCTGTTCGTTGTTGGTATTCCCATTCTAGAACTGTCCGCTTCCGAAAGTATTA:1 + chr2R 13820631 5' + gypsy12 9996 2 70.30 TATCCCCAGCTAGACCAGTTAGCTGACGAAGTTGATGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACC:1 - chr2L 20604012 5' - Doc 483 1 79.21 CCAGGAACTAATAATTGCTCCGCTAACCGACGACCAGTGTATTGCAAAAATCGAACTAGGAATCGCCTAGTGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATA:1 - chr3L 23652198 5' - 1360 394 1 66.34 ATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACA:1 + chr3L 21912261 5' + Bari1 32 1 64.36 TTTTTATTTATCATTCGATTTCTGTTGCGAAATTTGCATTGTTGACACCGTTTATAATTCGATTTGATACTTGGCGCCGTAATATAATGTTTATTGTATGC:1 - chr3L 12263857 5' - hopper2 1308 2 71.29 ACATCAATTGGATTGGTATTACGTTCGTATTAAATAAGCGATGACTGATCTGGACAAAAGGACCATAAGCCTGTAGGCATAACGGCTGCTGTGAAAATTAA:1 + chrX 13885239 5' - G5 4547 1 60.40 AAACTGTAGTAAAGAATAATGACATTTTGAATACCCTTTAATTGGATGTTAACTAGAAATGTGTACTTCATTAAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTT:1 - chr2R 21415701 5' - jockey 91 1 79.21 ATAGCATTTGTAATAGCCGTCTAAATTGAACGATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3L 21781502 5' + roo 86 2 68.32 GGCAGCGAGCCAGATCCCACTTCTGATGTCGGAGCACAATTATTATTTTGGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chrY 472536 5' + F-element 39 1 52.48 TGATTTTCACTCAGCGCTGCTTGGTTATTTCCCCGATATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 - chrX 7823253 5' - Transpac 5198 2 64.36 GTGGTACCCACCTCCATACTATACGGCTTGAAATCCGCCGCTGCGGACAGTGCCAAGACGAAACGACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTC:1 - chr2L 6575055 5' - jockey 172 1 71.29 AACAAGGCAAATACATCAAGGTGTTTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chrX 12276782 5' + hobo 50 1 75.25 CGGCGCGAGAAGCGAAAAGAGCACGTGAAATATTGGAGTCTTAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGG:1 - chr2L 17749819 5' + Bica 30 1 59.41 TGAACCAAGCAGACTTAATTTTTTTTGTAACAAAACTAATAGATCGGCTTAGATTGAATTTTTCCTTTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTCATTTTTTTTT:1 - chrX 17562093 5' - Doc2-element 253 1 56.44 ATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTTTTCCTGAAGCCAAACTGGTGATCGGGAATCAGGCCAGCTTCGTCCATAACTGGCAATGCTTTACTTAAAAATACTC:1 - chr3R 19445966 5' - G7 310 1 71.29 CATGCAGACAGACCAGCCCTTGAAACATATACTATGCAAATATAGCACAGATACGGAAAACTGCACTCCACTAACCCAGTACATCTAAGATTTTTTCACAC:1 + chr2R 19869090 5' + Tom1 252 1 71.29 GTGGGTATAAATATATATATACTTTTTTTTGGGTCCAAGGAGTCCGAGAATTCGGTCGTGGCTCATGACCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:2 - chr2L 16396660 5' - 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chr2L 19949769 5' - gypsy5 7299 2 63.37 CCGAGGCGGGTACTCACTTCGCAGTCGCCGGTATCGCTGTCTACAGTATTGTAACTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCC:1 + chrX 2488064 5' + Circe 7359 2 66.34 TTCACTTAATTATTGTGACTTTGGCCCGACCATCAAGGGCCAAGGAGTCGAGGGCCAGGACGCGGAAGCCAAAAGAAGACTTAAGCGACACCACCCTCAT:1 - chr2L 10900373 5' + jockey 4750 1 74.00 TGTTGCGTTAACAGCGCGTAACGGGACTGCCGCTCTCTTTGTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 + chrX 10629201 5' + P-element 32 1 48.51 AAGCAACGCATTTATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTT:1 - chr3L 21912325 5' - Bari1 1666 1 66.34 AAGGAAGTGAAGATGAAGCCCCACAAAGCTCCTGTGAACTCCCTAAACAGCCACACCCTTTCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCACA:1 + chrX 7356994 5' + Porto1 471 1 64.36 TCGTAAAATCTCAGATGCAGCGCCAGCTGTCAAAATAGCCAAAGACTCTAGAATAACAAGATTCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:1 - chr2R 11397985 5' + 1360 41 1 67.33 CTCATTTTTCTAGTAAATTTTTGGTACAACAGAGGTAGTTGTTTTGCTGAAGTACTCGATTAAATGGGTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTA:1 - 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chrX 13102218 5' - Doc2-element 246 1 78.18 CAAATTCGCATTAAATGCCTTTGGGCCTGGTTTTAAAAGCTTTAAATAATATTAATAATATATTGTTTACACATATATGAATAATAATTATAATATAAAT:1 + chr3R 17896402 5' + mdg1 7092 2 73.00 TCGCTTTTGTATATCAATTCTGGCAACATACTTGTCAACAAACTTGGGCTGTTTCTTTGTCTCTAGAATATGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTA:1 + chr2R 19190627 5' - INE-1 164 1 64.36 GCTTCTCATATTCGCATATCCTTGCATAAATACACTGACTTTAGTAAAGCATTTGACTCTGTTAATCATTACCTACTAGTAAGGAAACTTGATCTTTTAGG:1 + chr2L 17568049 5' + Q-element 359 2 70.30 TTTTCAACCCAGCTTTTTATTTAACTCTTCTTTTTGCGGGCCATGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTAT:1 + chr3R 22324415 5' - Bica 408 1 61.39 AATGTAATTAGAAAATTATTACTCTAATTGAATGTCGGGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAG:1 - chrX 14576684 5' - Doc 347 1 62.38 TTATGCAAAAACTTGAAGTATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chr2L 3988529 5' + I-element 43 1 56.44 CAAGCGAAAACTCTTATCCATTTCCATTTTGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAA:1 - chr2R 5154789 5' + F-element 58 1 77.23 GCTCAGCTGGAGCACAAATGCGGCGAGAAAAAGCAAGCGAGAGACCAAAACTGCCACGCCCACATGCGTGAAAAACAATTTTTAATTTTTTTCTCATTTTA:1 + chr3R 27476898 5' + INE-1 472 1 55.45 TTCAAACTGCAATCTAATCAGCCTTTCACTTTTCCAACCCTTTCAATTATCCATGGAGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr2R 4344522 5' - pogo 2085 1 63.37 AACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr2L 7971030 5' + blood 49 2 71.29 TTGCCCCCTTCCGATTGCTCGATTCTGCCCCAGCTCCTCGTACTTATGCTTTCAATATCAAATGCGAATTGTTTACAGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTA:1 - chrX 842358 5' - diver2 4794 2 74.26 GAGGCGTAAATTCTGTGACAACATGGTTCTTTTTTTGTTCCTATTCCGAGGAATTTCGATAATCAAACGGTACATAATCAGTCATTTACGCCTTATGCGTT:1 + chr3R 20563946 5' + S2 298 1 68.32 AATGAGTGGTCCATTATGGGTGCGAGATGGAAATGCAAGCCTATTTGTTGGTTTCCTGGGCTATGTGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGT:1 + chr3L 2005533 5' - F-element 291 1 55.45 TTTGTGTCATCATTAAGATCATTATAAATATTATGACAGTACCACTCCAACCTCCGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAAT:1 + chr2R 2009416 5' - 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chr3L 14037081 5' - Idefix 228 2 56.44 GTTTACAGCATTGATTACAAGAAATGCTATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTT:1 + chr3R 15714156 5' - jockey 4935 1 78.22 AAAACTTTATCAATGAAGTGAGCTAGTTTATGAAGTAATCCGAGTCAATAAAATTAAATTGATAAGGCTTAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGCCAG:1 - chr2L 21672788 5' - HB 1318 1 72.28 TCAAGTACACTTATCGTTAACATGCTTCAAAGCTGGCATATAATTATTTTCAATGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3L 17652686 5' - pogo 2085 1 69.31 TGTTTATTTACCAGAAGCTACAGATAAAATAGTTGCATGTCTTCAGTATACATCCGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGGCAT:1 + chrX 6806402 5' - Bica 43 1 69.31 TTTAAATTTTTTACTACATAATTAGGTCCTACTCACACTAATAATAATATTAATAATAGTTATTTTACCTTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTG:1 - chr2L 259003 5' + Cr1a 4343 1 75.25 AAACAAACCAAGGCAGCAGTACACAAAAACGATCTATTAATAGAAGCCCAAAGTACTTCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chr3L 13674718 5' + hobo 17 1 61.39 ATGTCACAGCGCATTGCATACTTATTGGCGCATGTGTTAATGCACCACCACAGGCATCGCACCACCGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chr3R 28196674 5' + hopper 13 1 64.36 AGTAGTAAGCACTAAGATCACATGCTTTTACATTCTTCTAGCAGAACTTTAACAATACCGCTATAACATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr2L 7504849 5' + roo 10 2 64.36 AATTTGGTAGTACCTGGTGGCAACAGTGGATTGCCCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAG:1 - 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chr3L 14886301 5' - 412 494 1 79.21 AAATCGAATTTCAAAAATTTTTAAATTTACTTGTATTATTTTCATTGGACATGTCGGTATGTTTTTTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 + chr3L 17650782 5' + F-element 21 1 43.56 GGGCTAAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 - chr2L 7971064 5' + blood 15 2 60.40 TTTTTAAAGGTCTTTGCTATTTGAAAATTTTATTTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATCCATTTTTTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGA:1 + chr2L 21064399 5' - invader2 270 1 73.27 ACAGCGTTTTGCTTTCACTGTTAAAAGTCTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr2R 12655892 5' + P-element 46 1 34.65 AATCACTGGGCAGATTAAGCCGAATCGAACTGCAATCCGCACTCTGCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGT:1 - chr2L 18012424 5' + Doc 493 1 57.43 GCTGCATTAGAAAGTGCAACCTGAACTCCTAGCAAGATCAAAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTT:1 - chr3R 4675876 5' - F-element 339 1 59.41 AGCCATGAAAGACATTTTTAAGCAAGCGGACAGTATATCCCCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 - chr2R 6041634 5' - opus 7472 2 60.40 TAGAAGGCGACATAAATTATTGCTTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr2R 10777856 5' + pogo 50 1 80.20 CTAAGACGGAAATTTACCACTAAATGACGACCAACCCCCGAAACGAGGATGCGGATGAATGCCCATGGTGCGAAAGTGGACGGTGCGAAACCCCAGAGCAC:1 + chr2L 11651132 5' + Rt1c 5091 1 58.42 GTATCTCTCTATCCGTGTATCTCGCTCCTGTTAAGCAGATTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGG:1 - chr3R 22201469 5' - Quasimodo 292 2 69.70 AACGTTGGATAGGACTTCTTAAATGGGAAAACGAGGGCGAGGATGGAGTATTAACCTGGCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAG:1 + chr3R 22989344 5' + I-element 443 1 66.00 CAACGCTGCGTATGCGTTATGTTTGCATTCCAATGAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAA:1 + chrX 1018380 5' - transib2 2783 1 71.29 AGATTTAGATTTCCATCATATTTCCGGACATGCTGGATTAATTATTGCTTTAATAATAATGGTAGTATTAAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chr3R 19449762 5' - pogo 2090 1 73.27 GTATGTAAATAGTGTAGAAAAGATCCAGATCTAAAATAGTATTGCATGACACCCAGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 - chr2R 11195692 5' + 1360 18 1 63.37 CAGATGCACGTTGATGTGGCACAGTGGAGTGGCCATCCCGGATTGATAGAGTCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3L 11367571 5' + roo 8689 2 52.48 TGTGGCCGTTGGTCGTATTTTGCCCGACCAATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCG:1 + chr2L 15374428 5' - 1360 152 1 70.30 AACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCA:1 + chr3L 17215714 5' + Ivk 26 1 53.47 CATCGTGATAATCAAGTTAATCGACAGCATTCCCCTGCAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGC:1 - chr3R 17178867 5' + Quasimodo 344 2 63.37 TATAATTAAACGCACGCATGCCTTCTTTTCATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 + chr3L 10035731 5' + jockey 78 1 70.30 GAACTTTACTCGGGTATATTTATCTTTTAATTGCGTTTTCTAATTGTTGTTCTTTTAAATTTGCTGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 + chr3R 31188716 5' + I-element 11 1 68.32 TTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTG:1 - chrY 3648867 5' - HMS-Beagle2 269 2 84.16 GTCGGCCAACTTTGCGTTGCGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATT:1 + chr2R 19929527 5' - 1360 13 1 72.28 GGAAACTTGTCTTGAAAGTACGTAACTTGGTCGTTTTGATTATATAAGGTGGTTATCTATATAAATGTTCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATAT:1 + chr2R 5401263 5' - Porto1 209 1 75.25 AAATTAGACAACAATAACGGGGCAGCAACAATAAAAACACATTTGCTATAGACACGCAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGC:1 - chrX 7610210 5' + I-element 440 1 58.42 GCTGATGAAAATAATCTGGGGATTCAGAAGACTACGCGATGTATGATAAAACAAGAGAAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTC:1 - chr2L 22315306 5' - INE-1 549 1 54.46 ATCAGGTCTGTTAAAAATATCTTGCATTTAACAAGTTTAGCAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 + chr2L 23374518 5' - flea 224 2 58.42 CAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAA:1 + chr3L 5267217 5' + Juan 4003 1 53.47 ATAAAAAGTTCCTGCAGTTTTCAACAAAGTTTCAACATAAATCTAAAGCGCGAAACACACGTAAACTGGTACACTCATCACAACCACACACACACACACAC:1 - chr3R 25350579 5' + gypsy3 420 1 59.41 TCATATTTCACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAA:1 - chr2R 2092809 5' + Doc3-element 66 1 59.41 AAAAAAATCAATCGGACTGGTAAATTTAACAGAATTGCCAATTCATTTGCATAAGTTACGGACTGACATTACATTTCAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCC:1 - chr3R 14906927 5' + hobo 2709 1 80.20 AGCGTCTGAACAAATTTCTCGTTGCCGGTCACCTTTTATTTATTATTATTAAGATGGGCTTGTAGGTGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCT:1 - chrX 7412987 5' - baggins 5393 1 57.43 GAAGTGAGCCTTCAGGTTCTCGTCGGTGGTACGGTAGTCCAAGCCACCGATGAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGAT:1 - chr3R 28600786 5' + Quasimodo 255 2 58.42 AAACGGGCTATAGTTGTTGCTGCCATCCGAGGCGATGTTGTTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTC:1 - chr2R 16379947 5' - accord 7248 2 60.40 ATTTCCCGGTTAGTTTCAATTAATGTGGTCTGTTTCACATCGATTTGATCAACACTTAAATGCGCGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGA:1 + chr3L 9533172 5' + micropia 322 2 69.31 TTACTCTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACC:1 - chr3R 433145 5' - 1731 4604 2 56.44 CACAAAGTATGCAATACATTTTGGCACGTGGCTTGCTCTTTGTCTCAACTTTTTCGAGAGTCGAGCGAGTCCGTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chr2L 4057103 5' - hobo 2935 1 75.25 CTCAGAACACTCCCCACTCCCTGTATTCCCGATCGAATTCATTGTTTCCACGCTTAAATGAGCAATTTTGGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGC:1 + chr2R 14379539 5' + 1360 3341 1 67.33 ATAGCAAACAATGAGCGGTTGTAAAATAAATCGTATAGGAACTATCAGAGAAGTTGCTATCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - chr3L 22418563 5' - hobo 2924 1 64.00 CTTAATTATTCAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAAACTGATTTTATT:1 + chr3L 11367503 5' - roo 369 1 62.38 TTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAGTAGAAATACCACGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGGGAGAAG:1 - chr2L 17599965 5' - Max-element 109 2 62.38 GATCCCACTTGGATTTGCTGCAGGACGAAGTCGAATTAACAAATGAATTCAATAAATAAGTTAACAACTAACAATGTATTG:1 + chr2R 9285522 5' + gypsy 2 2 71.60 ACAACGGAAATGACGCTTAGCACAACTTCCTGCCGCTCCGGCGGACAAACGGACGGACATGACCAGTTCGACCCGACTATTGATCCTGATCAAGAATATAT:1 + chr3R 28201021 5' - INE-1 82 1 58.42 TCCAGATATCAGATCTACGGATCCATTTGTTTAGCAAAACAATCGAGAGCTGAAACTTAAAAAACCTTCATACATTTACACACCATATCTTCACAAAAGGC:1 + chrX 9040420 5' + Tirant 373 2 58.42 ATAATAGCGTTAGCCATAGGGAATGCAGATAGTTTGAATTTTGATGACCCAATATAATCAGTAGTTGTAGAATATCCATATTTGAGTTGCTGGTAGTACCC:1 - chr3L 22023693 5' - G4 3452 1 66.34 GGCAACTGACAATGCATATAATGCAGCATCCATATTTTATACGTATATATAATTGAAAATGCAGCCTCCATCTCTCCCACACTCTCCTTCCCTTAAAGAGA:1 + chrX 12920862 5' - 297 6564 1 80.20 TTTTTCGTGTAATTGATTAACTGTTACTGCAACTTCTACTGGCAGTTCCGGTGAGCTCGACAAGGATAGGAGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTA:1 + chr3R 17886771 5' + Rt1a 4955 1 59.78 ATGCAGCACTATTTTGGTTCGGAAGATACAATGTTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr3R 5595008 5' - 1360 3359 1 65.56 AACAGGGGAAAAGTGCATGCTGCAAACTGCGAACTCCAAACTACGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr2L 4057197 5' + hobo 32 1 57.43 AATAAAAATTTATAAAATCAAAAAAAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAACGAGAGTATAATTAAATAAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCG:1 + chr2R 18466298 5' + 1360 3294 1 72.28 TTCTAAAATTGAAATGCATTTTCTAGGACCAATTTACCTCCTCCTACTACAAAGTTCAACCCTTTCGTATAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTG:1 + chr2R 18454880 5' + jockey 4591 1 61.39 CCTTTTTTCTGCGTTTTGTAGGCAGTATATATTCGCCGATTCTGCACATTATAACTTTCAGTTTTCAATTAACTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAA:1 - chr3R 31572054 5' + Porto1 4187 1 78.22 GCACAGAGCAACTTTTGCATGTCGGATGTGTTTGGCAATGTGAATGTGGGGCCCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCA:1 + chr3L 5490054 5' + 297 6597 2 58.42 AAGGTATTTCTACTGTTTTTTTTTTTCACCTCTTTCGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:3 + chrX 7335081 5' + Tirant 39 2 65.35 AGTCAAACTTTGATGAAATGTTCTCCAAAGCTGTAGCACATAAGAATTCTTTTTCATATGTATGCACATAAGCATAAGTAAGAGGCGCTCTCGCGCAGATC:1 + chr2R 6044163 5' + Tom1 207 1 68.32 ACTAAATTTGGTATCTGCTCAGTGCTTTCCTAATCAAACAGTCTTCTCTTCAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGG:1 - chr3L 11660008 5' - 412 7365 2 55.45 GGAGCGTATGGCATCCGATTTCATCATCGACTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1 - chr2R 18036672 5' - blood 7345 2 69.00 TTCTGCTGATCAATAAAACGGAAGCTAAATCAATTAGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 + chr3R 25514117 5' - hopper 1378 1 63.37 TTCATTTCGGGTATTAAAACTTTCTATGGCTAGAATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGGAATTTTCCC:1 + chr3R 11595297 5' - Max-element 257 2 63.37 CGCGAGACAGAAGTGAAGCGCGATTTTATGATGTCAGAACGTCAAAACAAGTTAAAAATCATTGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr2R 15451648 5' + roo 12 2 65.35 TAAATTAAATTTTACAATTCATAATCGGCATACAAAATATATTTGTTTTACAGGTATTTCCAAGACAGTTCAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAAT:1 - chr2L 18514463 5' + jockey 280 1 82.18 AGATCCAAAATGCCAATGGCTATCAAAAATATTGTTTGCCGGAAAAACGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 + chr2L 19698714 5' - hobo 2898 1 52.48 TACTGGGCAATGTTCGCATGGTAAGACACGTATGCAGTCATGCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAA:1 + chr2R 5200934 5' + 1360 33 1 58.42 TAAGTTATTTCCTCGTTGATACCAATGGGTTGCTTTGAATATATTACTATCTTCTTTTCAGATTCAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCAT:1 - chr3L 25114797 5' - Bica 81 1 74.26 GCCATTTCGTGTCTTTGGAGGATTGCTGCCCGCATTCCGCATCGTGGAAGTGGAACTGGTGTCCGTGTGTAGTTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAGTGCGG:1 - chr2R 12939900 5' - Chouto 427 1 76.24 TTTATTTTGCGACATTTAATTAGGCGAGATAGAGCGCTTAGTAGCTGACTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3L 3635491 5' + roo 8689 2 56.44 ATTTAAAGAGCTCTCAACAATATGTATGAAGAAATCTGCGTATATCAACTTATAATGAAATGCTGTTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAG:1 - chr2R 5706517 5' + blood 465 1 62.38 TGGCCGTTAAGCAAAACGAAAATTGAAGCAATTCCGCTTACGCTTGGCATACACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr3R 27386277 5' + hobo 24 1 55.45 GGGGTACATGGGCACTGGGATGGGGAAAAACGGGCGGATTGTCTCTGCTAAGAGTGCTGGCTAATCGTAGTTGGGCTGGAGCTGGTAACTCTAAAAAATTT:1 - chrX 19066214 5' + baggins 179 1 61.39 ATTTTCGCCACTCACTGTCCTTTCCACAGCTAACTCATTTCCCATTTTCCCATTAACTTGGGCAAATACTATGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTA:1 + chrX 17557891 5' - jockey 4698 1 75.25 ACCGCGGCGTGGGAATCCAACAGATTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGCGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGGGAAGTGAACGCCAAAT:1 - chr3L 8819759 5' + F-element 71 1 73.47 TTGCGTTTTCTAATTGTTGTTCTTTTAAATTTGCTGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 + chr3R 31188746 5' + I-element 41 1 67.33 CACCATTCCAAAATATTTATGTACACATTGATTACATTGTGGGACCAAAGACTCTAGGAGTAACTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCT:1 - chr2R 3594190 5' + gypsy12 15 2 64.00 CGAGATAGAGCGCTTAGTAGCTGACTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3L 3635467 5' + roo 49 2 76.24 TTTCTTTCCTTTTTTTCGTTTTTTTTTTTGTTTAATTTTTGGTTTTCTTACCTCTTTAAGTTGTTTTTTGTTTTTTTCTTTTT:1 + chr2R 17871134 5' - gypsy7 5011 3 85.54 TTCATAAAGCCAAGTACCAGATAAATGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr2L 5741360 5' + 412 7104 2 75.25 TTAGGCCAGATTCTACAGAACGGCGAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAA:1 - chr3R 31242366 5' - copia 77 2 73.68 TATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCT:1 + chr3L 11474691 5' + gypsy 140 2 70.30 TTGAACTCGGCCAGTGTGTCACCCCGCCTGCGGATCCAATTGTGCCACCATTAACTTCCTTCCTATGTAAATACTTACATATGTATGTATGTATGAAATAT:1 - chrX 14320768 5' - 412 223 2 62.38 TAGAGAACATAAGATGAAACGGAGGCATACAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTA:1 - chr3L 23270413 5' + invader2 214 2 72.53 TCGAAAAAAAAACTTTGAACGATTTGGTCGGGAAAACTCGGTTCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr2L 9699270 5' - P-element 2856 1 48.00 TGTCGTCAGAAGTCGAATGATTAATTGAGTGCGGAGATGGGAGCAGATGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGCTGACACGGTGATATGATTGATCTAAG:1 + chr2R 7421293 5' - Q-element 184 2 53.47 TGAAAAACTCTTGTTTCGCAAATTAATTGTCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr2L 19698263 5' + hobo 45 1 70.30 CGGCAACGGAACTCTTTTGGATGCCAATATGCCTGGCGGTATACCCACTCCCGGAACTCCTTCTTTCAATGCTCCGTCTCACTACCTCCTTCCACGCGCGA:1 - chr2L 8262339 5' - gypsy8 396 1 54.46 ACCCAGGACATCGTGCGGAGAGAGCAGGACATCTGCCAAGCGTTGAGAGCCTTTCGTGCTCATTAATTATAAAACATTATGTACGCAGACGATGTTAAAT:1 + chr2L 17165429 5' + Q-element 574 2 72.00 GAGAATAGCACCAAGTTACGGAACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGT:2 + chr3L 17215693 5' + Ivk 5 1 74.26 GCCGGTAAGTGGGCGTTAAAGGAGCATGGCCAAAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTC:1 - chr3L 24538180 5' - Tirant 295 2 65.35 TCTGAGTGCTGTTCAGCTACTGTAATTTTTCAGTTTCTGCTTTAAAGCGCTCCACGCTCAGCGATTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAAT:1 + chrX 7944658 5' - I-element 5048 1 74.26 AGTTGAACAAAAAATGAGAAATTACCAATTTGTGTAAAAAATGTGAGCTTCTCATGCGTGATAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAG:1 - chr2L 9064743 5' + F-element 107 1 70.30 CCTGCTTACGACTTTTGCAGAGCCTAGTAGTTCCTCTAACCATGATTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACG:1 + chr2L 15211145 5' + R1A1-element 4926 1 70.21 CCCCGTTTCCCGTACGCCTATCCGCACCCGTACTTCGGACACTCCGGTCGTTGTCGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 + chrX 2797063 5' + Doc 43 1 66.34 CCAGTAACTTTTTTCGGACGAGGTGCTGGCATTGATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAGTACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAAT:1 - 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roo 9033 1 61.39 GTTGATGATGTTTTGCTTGAGTTGAGTGTGCTTACAACAAAAAAATAGAGGAGCTAGTATACAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATATATTCGGAAGGGGAC:1 + chrX 16170594 5' - Gypsy12A_LTR 2045 1 77.23 AAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAAGAAATTCCAAGTTTACACACGTTTGAGACTGTCACACTATAACCTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATT:1 - chr3L 23583099 5' - rooA 344 2 92.08 GTCTGCACCATTCCAAAATATTTATGTACACATTGATTACATTGTGGGACCAAAGACTCTAGGAGTAACTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAA:1 - chr2R 3594195 5' + gypsy12 11 2 68.32 CAGCTGCTTCAGTGGCATTTTGCTCTTAGAAGTCTTCTAAGAAGCATCAGTAAGTGAAGACAAGACCGTAGATCACACGGAAGGGATTACAACCACGACAC:1 - chr3L 22794769 5' - R1A1-element 5282 1 75.25 AAAGTATGCAAGTAGATTTAAACAAGTTTGATTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 - chr3R 27071924 5' - jockey 4956 1 69.31 TCTGGTCACAAATTAACTTTCTTGACTTCGCGCTTCGCTACGTAAAATGTAATTTCAGTGTGGTTAGCAACTGTAAGTCAGCATTCCCACGCTGGCCGCTG:1 - chr2R 20396030 5' + blood 7140 2 73.27 GCGGATTTGTTCATTTGAATTTCGAGCGTGTTTTAAACTCATCCATGATTCCAGCACAACCCGAAAATCTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 + chr2R 10777775 5' - pogo 2096 1 68.32 CCGTGAAAAAGTGCACCACAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCAA:1 + chrX 14715726 5' + F-element 4444 1 80.20 TGACTCCTCGGCCTTTGTTTTGTTTGTTGTTTTGCGCGGCCATTCCCGGTCAAGTGGTTTTCTCTGTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGG:1 + chr3R 16035938 5' - 1360 476 1 74.26 TGGCCAAAACCACAACTGAAAGCAGCAGTTTCCACACTTACTTCCTGGATCTGTGGCCTGGGCTTAGACGGACAAGTTGGTAATGACTTGGGATTTAGGTA:1 - chr2L 9277197 5' - I-element 4983 1 46.53 ATATAAACAAATAAGTCTTCATGTACATATGTACGTAGTACGTACATACATACATATGTCAACAAATTTGAAAGTTGTGCTAAACAAAAATAATACGACTT:1 - chrX 19787394 5' + I-element 4928 1 57.43 AATTATTTACCCCAGCTGCACGTCAATCGAAAATCAGGTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr3R 9606211 5' - roo 9033 1 64.00 GCCTAGGGCAAAGTTGTTCAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCTCGAAAA:1 + chr2L 1205541 5' + 1360 3182 1 73.44 GTTGGTGGGCTAAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - chr2L 7971070 5' + blood 2 2 71.28 AGCGAGATGTAATCGCAAAATGTTGTTTTTTTGTCCCCACGTTTGACAAATTTTAGTTATCAAATGGAACGTTCATTTTTATAGGTGTACAAAAAAGAACG:1 - chr2R 20655667 5' - rover 149 2 50.50 AATTTGTATTCTGTTTAGGGAAATTAAGTTGTAAACATTTTCTTATTTTGATTTCATGACTTTTTTTGTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGC:1 + chr3L 27383367 5' - BS 5070 1 74.26 AACCATTTGGATGACAAGTCGCATTCAATTACTGCAAAATGTCCTAAAATGAATTCTTTTTCTGCCTTTTATGTTGCTTTAATCTATATTATCGAAACTAT:1 + chr2L 21908944 5' + HB 1473 1 61.39 TTGTGTTCTTTTTTTTATAAAACTTTCGGTCCGAATTCGTCAATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGG:1 + chr2R 4447998 5' - invader1 3981 2 58.42 AAAACCAATATCTGGACAAAGGGTTCGTGCATCATTTAGGATGTGAGCAGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATAATTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chrX 22690818 5' + roo 8691 2 52.48 CTCATAGCTAAAGAACCTTTCTGGGTGGTTTCGTAAGTCATTATATAAATTATTCGCCTTTTTCATTTCTATTGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTGAG:1 + chr2R 929703 5' - rooA 7444 2 77.23 TGCCATGTTTATTTTTGTACGTATTTTTTGTTTTCTTGCCATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr3L 4637296 5' - hobo 2902 1 58.42 ATATAAGAATTCATGCCCAAGCCAGTCTGTTTAAAGAGTATACAATAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATT:1 + chr2L 18004235 5' + flea 407 1 55.45 ATAAAAAATAAAATAAAAAAACACAAAACAGCCGAAACGGGCTGAGGCGAAAAAGAGCAAAAATTATGTGTGTCAGCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTT:1 + chr3L 16709879 5' + I-element 5016 1 76.00 GGCGGATGTCAACATGCTTTGTCAATTTTTACGGGGTTTCGATCAAGTTGACCAGCTTCTTGATTGGGGTCTAGGTAACATTGGTGTTACTACTAGTTGTT:1 + chr2R 3118542 5' - jockey2 250 1 65.35 GGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACT:1 - chr3L 15099642 5' + G4 3809 1 39.60 TACACACACCATCTTATTCGCTGTCGTCGCCGTAACATTTCCGCTTTCGGTTGCATGAGTATCTGTTCCCTTCTTTCGACTACCATGCGGAGTGTGATTCA:1 + chr3L 7295300 5' + 3S18 492 1 62.38 TTGGTTTTTTATGGCTGAAATTAAAGTTACATTTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chr3R 30216099 5' + opus 39 4 70.30 ATCTGTTTGTTTGTGCGGAGTGGTGCGGAGTTCGTCTTTGTCAGCTGCGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGG:1 + chr3L 742126 5' - I-element 4928 1 52.48 TTTTTTATTATATTTATTATTATAGATTCAACACTGACCTACGCCATCCAAGTGTGGGGAATGTGACCAACGGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTTGTC:1 + chrX 2425983 5' + G5A 2553 1 57.43 ATCGCTGTCACTTTAGTCGGGTTTGTTTATACTCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTC:1 - chr3L 25305806 5' + 1360 40 1 66.34 CATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3L 11257419 5' - 1360 3377 1 67.33 TAAAGTATAACCAATTATTCATAACACATTGGAATATGTTATATTTAAAATGCATTCCTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 14500173 5' - roo 9054 2 60.40 ATGAGCCAGCAAATCCAGAAGAGTACACAGAAAGAAGCATACAAATAAAGACTGTTCAAAGCATCGTTTTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAA:1 - chr3R 10472090 5' - Cr1a 3991 1 64.36 AGTGTGTTCAGCAGGATGTGCGCCCATGCCATCGTCATCGTCATTCGCCCTCTAAATGGATTCTTGGCCGCATCACCGCAGTGCACGCAGGAATCGACAAC:1 - chr3L 3428178 5' + 3S18 5637 1 55.45 CAAACAAACGTAAAAAATTGATGAAATACCAAGCCAAGCATCGATTACGTGAAAAGTGCCAGTGTTCGAGTCAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr3R 24172948 5' + pogo 1 1 78.22 CCGATTGTAGCAATTATATGTAAATTGTATATTGGGTGCACTTCGTTTTTCTTTAGTGCCTGGAGCTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATC:1 + chr3R 12269212 5' + Quasimodo 294 2 58.42 CTTCTTTTAAGAAAAACAAGGGAACTCCGAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACT:1 + chr3R 9229981 5' + X-element 60 1 71.29 AACGTTTACGTGGCTGGACATCGATTTATGGGATTTACTGGAAGTTCCCCAGAGTTCTATTCTATATTGATTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTT:1 + chr3L 7271085 5' - Porto1 4233 1 72.00 GGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTCAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAA:1 - chr3L 23583082 5' - S-element 1673 1 59.41 ACGATGTAGATCCCAGGGGGACAAGTAACCCAATTCCTGGTCTTAAAGGGTGCGAAACAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2R 10345592 5' + roo 18 2 61.39 ACTTAGTTGCAAACATCGTTGCATACTTTTCGGTGCACTTGGACAAGGACACGGTACGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3L 21852482 5' + 1360 20 1 59.41 TGTCATCTTTTTCCAAATGACGTGCTAACGAACCCATTAATATCACAACAGCTTGACGTATGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTCGAAATCAATTCTG:1 + chr3L 27971347 5' - 1360 3181 1 61.39 TTCTCCCTGGCCACGAATTTATGGCACTGGCAAGGCAAATTGTTGTTGTTGCTATTGCTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTATTATTATTATT:1 - chr2L 618945 5' - mdg1 7057 2 65.35 TCCTTACAGAAGTGTCTAAAAGTATGCAGCAAACACATAATATCAGGAATATTGTTCATACTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr2R 20196951 5' - pogo 2087 1 58.42 AATCGAACCTCCGAATCGCCACTTAACTGATATGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 - chrX 17282785 5' + roo 8755 2 67.33 TCACACTGCTGCTCAGCAAGCGGTACAACGAAAGGCTTTTAGGAGTTGTCTCATTTTTCGTTTGCCACCACACTCTGTTGACCATCTCGTCTGATCGGACT:1 + chr3L 5999642 5' - Rt1b 4787 1 58.42 TAACAATACAGGGTTGAAATTTTTTTCACTACCCATCACTCATTCCTTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTT:1 + chr3R 7872329 5' + jockey 4768 1 52.48 GAGTACTTAGGCGGATGGTGGCCAGAGCGGCGAGTTTAGACGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTAG:1 - chrX 1656377 5' - 17.6 263 2 59.41 TTCCAATGGAGTAGCAGTCGCAGGAAAGACAGGCGGTTTCGTTCGGCGGTTGGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCC:1 - chr2R 10712882 5' - blood 7366 2 55.45 CATATTTGTGCCACACTTATTTCGACATTTAACAAACATTTAACAAACGTTGTAAATTATAGATTTAAATGTAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 + chrX 12401777 5' + I-element 5 1 63.37 TTTCAGTCCAGGTTAAACCGGGATGACACCGCCGCCAAAACAAAGACACGCCTCGGGCAGCACAGTGATCCTCCACCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 + chr2L 10636468 5' - hopper 1413 2 77.23 TATAAATTTCTGGTTTCACCTATCGCTGTTTTCAAATAATGTTAGATAAGGGAAACAGCGATACAACCAATATAAGACGTTTTTCAAAACTGTGGGCGTGG:1 - chr3L 13260832 5' - INE-1 252 1 48.51 GGGGTAAAAATTGTGGTCGAGGATATGTATAAGTTAACACGCGCAGGGACAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGC:1 + chr2L 12765935 5' + gypsy4 6618 2 74.00 TACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATAT:1 - chr3R 1977613 5' - micropia 5413 2 56.67 ATCTATATGTGGAATGTGAAGTCCTGAATTTAAATCTAAACTGGTGCGTAGGATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAAC:1 + chr2L 12802180 5' - invader3 5439 2 52.48 CGACGACCAGCGGCGCATGCTAAGCGATTCGCCTGAGACAAAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:2 - chr2R 17346035 5' + hobo 6 1 71.29 CCGCTTAATTATTCAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAAACTGATTTT:1 + chr3L 11367500 5' - roo 372 1 59.41 GGGAGGTGATTGTGCAGCAGCCAAAGGCAAAAGGAGCTGGCCAGAAATAATGATTCCTAATGCTCGAGCGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCA:1 + chr3L 18477221 5' + hobo 303 1 70.30 TATGGCCAAGAGTCGCTATGGAAAGAATGCCGTGAGCCAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 - chr3R 31941073 5' + Burdock 6177 2 61.39 AGCTGACCAAATCCAAAAATCTACGAGCTCCGTAGAAACCTCTGACATTTTCGCCACCAAAGAGTGGCGAAATAGATTGTAATAAACCAATATATGCCACC:1 + chr2L 7463481 5' - blood 375 2 76.24 TAAATGTTGCTTAGGTTCCACATGTTGCTGTTAATGTTGCTCTTGTTCATATATCCGCTGTTACATTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATT:1 - chr3L 11284860 5' - invader2 4733 1 61.39 TAAGTTACTGACTTATGTATGTGCTAACAGTTTCATTTCCAACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTAC:1 - chr2L 12961688 5' + Tirant 436 1 57.43 GACCCCCGAAAGTATGTTAGCAAAATGTTACATCTGCAGTTGGGTTGATTTTTGTAAACTGTGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr2L 901741 5' + jockey 23 1 62.38 GCGAATCTATATGTGGAATGTGAAGTCCTGAATTTAAATCTAAACTGGTGCGTAGGATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAA:1 + chr2L 12802176 5' - invader3 257 2 56.44 AATCAAGAGATCCTGATGGAATAAAAATAGCTTTTTTGGACACTCTTAATTTAAACAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr3L 10792155 5' - pogo 2084 1 67.33 GCCTCTAAGTCACGATAAAATGCTATTTTAGATCCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 + chr3L 18034181 5' + Doc 47 1 63.37 ATTAGGCGTTCCGCAAGGATAGACTGCAATTATTATTAATAAGTCAAAAATTATATTTTCTTTAGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 - chr3L 14886288 5' - 412 7534 2 66.34 GTCGTAATGTGTTACGTCAAAGCGACCGCACACCATTATAAATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACA:1 - chr2R 16160282 5' + gypsy 34 2 58.42 TTTTATATTTGTTTTTTTTTTGTGGAACCGAGCTTTGAACGTGGGATTGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGTATTGTTTAAATTAGGGGACGGATG:1 + chr3R 31559429 5' - Idefix 194 1 76.24 CGAAACTCGCAGCAGATCGTTGTGAAATCGTACACATAGTCGATATATAGCGCAGTAATGGCTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr3L 3326575 5' - P-element 2874 1 64.36 GTCCTGTATCCGGCGGACAAAGCATCCACGGCTGTGGCTCCAACGCAGACGTCATAGGCCAATCCGCACATCAACACTTACTGATGAGATCGGCGCGACCA:1 - chr3R 19697842 5' + Ivk 5086 1 69.31 TTAGTTATGAAAGATACGATGAGAACAGAAATGTGATGCACTGAATGCAGGGTGTGGTTGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGA:1 + chr2L 19340959 5' + Doc 4488 1 58.42 TCGCATCCAGTGGACTAGAAAACATTTCTGACCCGGCTGGAAGCAATGGGAACAGAACAGCCTTAGCTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chr3R 29569994 5' - HMS-Beagle2 488 5 61.11 CAGTCAGCCCGAATGCAATTAAAATCGAACATTCATCGAGCTCAAAGTGTCCGCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 - chrX 7031719 5' + jockey 4699 1 52.48 ATCTATTTGTCATTCATTTCATTGAAAAACTAATTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr2R 24711938 5' + roo 8752 2 67.33 ACGGCTGGACTTCCTGCTTACGCGCTTTTTTTTTGGTCGCTCTGTTTGGTGTTTGCTGTTTGCTACACTTCAGTTTCATTTTGATCGAGGGGCAGTCTTGC:1 + chr2R 11940403 5' - Fw3 3105 1 78.22 GCGTTGTCATGATTTGGCACTCGAGTGCCACTCCACGCCCTGCTGGCGTCGGTTAATAAAAGTTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCA:1 + chr2R 11513536 5' - Doc 497 1 74.26 AATTATTAGTCACCAAAATTAATACAGAAATGAACATCTAAAAATTTAAATACTGAACTCGGCTAATGCTCCTTAACGAAATAGGTACGGTAGGGCAATCC:1 + chr2R 4774826 5' + Gypsy12A_LTR 1956 1 57.43 TTAAGAACTCAATTCATAATCCCTGTGAACAGCATCACTGTCGGCATAGTAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGC:1 - chrX 22448251 5' + F-element 4486 1 54.46 TGCGATGAGAATCAAACCCAGAACCAGAACCAGAACCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTTGTGTGTCTAATCCACCATGCAAGTCTAAGTCACACAACTTC:1 - chr2L 15157120 5' - invader4 2690 1 65.35 CCATTAAATGACCATGAATAGGCACCGTGGTCATGATACTCTGAATACTCAACACCTAGAGAGACAAATTAGAATTAAACATAAATATAAATGTTTAAACG:1 + chr4 914301 5' + 1360 2962 1 57.43 GTGGAATGGGGAAAAAGTTGTATAAATTTATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:2 - chrX 7698650 5' - pogo 2057 1 73.27 TGAGAACTTAAAATTTTTAAGATATTATTTGCTATTCAATTAAAAAAATCAATTTCAAAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACT:1 + chr3R 7306532 5' + Stalker4 6894 2 70.30 CTGGCATGAAACGAGGGGTATCGGGAATCGGAGGAGATGACAGCTACACTGGAAAAGGCTTACGTGATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCATAAGG:1 + chr2R 13673807 5' + Rt1a 4734 1 59.00 GTGAACACCAAAGCAAAGATCTACAGTATTATTTTGAATAAGAAATATATAAAACACACTCTAAGCTTTTTCAACTAATTTTTGGTTTTCTTTTCTTTTTA:1 - chr3L 5272619 5' - mdg3 5100 1 65.35 GCTGGTCTGCTCTTTGGCGGAAACGTGAAACGGAAATGTCAGATTTTCTGCTAAATTTTTTACACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAG:1 - chr2R 16608653 5' + 412 179 2 64.00 GTAACGGCTTAGACTTTGGACGAGCACAAAAAGGACGAACCGTTAACTAAAGGAACATTGTTGAGCCTAGAATTCAAATATGCTGAAAAGAAACACTCGAA:1 - chr3L 25255249 5' - GATE 213 2 72.28 TTTTAAGTGTTTCTCTTTCAAGTATTTTTTTTATTTTCGGTTTTTTTTT:1 + chr2R 16163941 5' - Doc2-element 252 1 71.43 TTAAGCTTTGATATCAAGGGTATTGGTTTCCCTACCCTTGAAGGGTATTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3R 7883203 5' + roo 8688 2 54.55 TGGGTGAGAAAAATTATTGACCACTCTCTCGGTCTTTTGGCTTAATTGATATGGGTTGCGAAGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGT:1 + chr2L 2912002 5' - 297 6969 2 71.72 TTGACTGTCCGGATTCACCGCCCACTGGTCACGTTTGATGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTT:1 - chr3L 17702812 5' + accord2 7255 1 69.31 CTAGTTTCCGACAGCTTTGTATGTTTTATATACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAA:1 + chr2L 5974479 5' + invader4 46 2 73.27 AGCTTTCTAGGGGACAAACTTAAATTTGTACAAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 + chr2L 22966996 5' - 1360 3331 1 68.32 TTGGCAACAGTTTGAAGTTCACACGTTGCCAATCTCGGTGTAAACCAAAAGCAAAATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATAGC:1 + chrX 17965070 5' + Idefix 416 2 62.38 ACCTCTGACCCCGCTGCCTGCCGCTGATAAAGTTTTGCCAACGCTGCAGTTCGCCTATGTAAGTCGGTTGTTTGTTTACGCATACACACACACACACACAC:1 + chrX 6417707 5' + accord 179 2 77.23 CAATCACAATTTTCTCAAATTCTTCGCATTTCGCATAGTGAAAAAAACCTAGTGAGCTATCTTCCGATTCCCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3L 3776441 5' + roo 8668 2 75.25 AAACAACAAAAAGGAAAAATTGCGCGGAGAACGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTT:1 - chr3L 10812196 5' - 412 180 2 73.27 TCTTGGGTTCGTTTCAAGGGTCTAAGCAAATGTACTTATATATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGA:1 + chr3R 29177178 5' - Max-element 423 1 71.29 GCCCAGAAAAAACATTTATTTCGGTCATTGAATTAATGCCACTTCAATGGCACAAAAATGAAGTGGCATTAATTCAATGACCGAAATAGATCGGAAGAGCA:1 + chr3R 12127773 5' + Penelope 75 1 58.42 TCCACCGGATCAACTCCAACCCCAATGAAGACAAAATGCGAACACAATACAACACCAATGACTACATAAGCATTCCAGCGTCCGAGTAATACGATCTAACG:1 + chr3R 12821253 5' + Stalker4 7102 4 54.46 CGATGAATTTGCCTCTTGCCAGTTTTTTTTCGCATTTTTTTTTAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 - chr2R 19616396 5' - copia 240 1 58.42 AACTTGTATGTACATATGCCGCACCAATCCAATCAAACTCATATAAATATGTACATACACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr2L 2912116 5' + 297 12 2 68.32 CACTTATCCGTGCCCCCGCTTAATTATTCAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:2 + chr3L 11367485 5' - roo 387 2 55.45 GAGGGTTGCCATACTGTTGATGAAACGAAACAGGCAGGTAAAAATACATATTTTTTTTTTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGT:1 + chr2R 23265736 5' - Juan 4191 1 50.50 AAAGTTAAACAAGGAGGGTCTTCCTTACATCCTAATAGGATTCATATACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:3 + chrX 3195620 5' - mdg1 7431 2 53.47 CCAGTGCCTCTGCCTCTGTTTACCATAAACAAAAACAATCAAATGGCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr3L 455641 5' + 1360 63 1 54.46 GTTCCGTGCTCGGAGCAGCCGGGCAGGCACTGGTACACCTGCGGCCAAAATAGCTGAAATATATCAAATTTCGCGTAGAACTGTCTACTACTTAATAAAAA:1 - chrX 12289089 5' + Bari1 490 1 69.31 GTATTATGAATGTAAAAAAAATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCT:1 + chr2L 17066831 5' + copia 56 2 82.18 TTGAGCCTTGTAACGATCGCTAGAGCGGACAGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATGTACATAGATTTGGCTATTTCC:1 + chr3L 23094735 5' - 1360 339 1 69.31 GCTACTATGGCAACATTCTTGCCAATCATGTCAAATCATAGACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACAGA:1 + chr3R 28102203 5' + Ivk 5006 1 56.44 GTTATGTTTAAAAAGATACACAAATTTTCCGAGCAGATTGCAAAAATTTAAGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTA:1 - chr2L 4094783 5' + transib2 2478 1 54.46 CGCGTCAAAGGGTAAAGGCCGTAAAGCTGTCGTTGCGGCCCATTGAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3R 23080827 5' + 412 29 2 51.49 CGCATTTCGCATAGTGAAAAAAACCTAGTGAGCTATCTTCCGATTCCCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:2 + chr3L 3776465 5' + roo 8692 2 52.48 TTTCAAGGCAAGGAAATAAAAGCCTTTTTTGCGGTAACCTCAGCTTTAACGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTC:1 + chr2L 7861420 5' - I-element 273 1 53.47 CTTAACCCACTCCACAAAGAGCTGGCGTTCCCGGTTGTCTATATTACAAAGAGCGTGTTTCCCCAAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCC:1 - chr3L 7183081 5' + jockey 491 1 61.39 CATCTGCGACGCGGCTGCTTCTCGGCGATTCTATCAAAACTATAATGTATACATATTTGTGTATTCTTACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAAG:1 + chr3L 19695709 5' - Transpac 4932 2 46.53 TGGCGTGAAAATTGCTTGCAATGCAAAATCAACATGCAAAATAAAAAAGTCGCTTTGCCGAAAGAAGTCATCAATCTTTTAAATGCACCAAATGTAGAACA:1 - chr2L 3905370 5' + transib3 2492 1 64.36 GTCTAGAAGTAGACAGATGTATATAGTTAAATAGTTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTT:1 + chrY 425017 5' - McClintock 6376 2 83.17 GCCTTACACCACATTTTGATTTACGAGAAAAATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTT:1 + chr2L 8374198 5' - invader1 359 2 78.22 AAATACTCTTCAGTAGAGCAACGTATTTAATCTAAATACTAAAAGAAGCGAACTTAAACATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 4056350 5' - roo 392 2 63.37 GAATTGCAGTTAAGGAAGTGAATGTATATGTATATATAGTAAGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 + chrX 3244580 5' + I-element 34 1 65.00 AACTACAAACTATATTTCATTTTATTACAAACGAACACTGACAACACAGCTATGCTTGCGTCCCACATGTCACCTATACCATCCAAATATGGGGAACAGCC:1 + chr2L 18603176 5' + G5A 2439 1 58.42 GTGGGTGGGGTTGTTTTTCTGGTAGTTCTTGTGCAGGTCAAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTGCATACGTGTGCACACATAAAG:1 - chrX 21077199 5' - 1360 174 1 60.40 CAACAATTGAAAATTCAATTAAAAGTCTTTATTAAAATAAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 + chr3R 6135224 5' + I-element 34 1 58.42 TCAAGTGCATAATAAACATTTGCAGGACACTCTAGGAAGTCGACAAAAACAATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr2R 6041549 5' + opus 7023 2 59.41 ACAAGAGTAAATTTAATTTCAAATTATGTGATTGCGATTCATAACCTAAACAAGAGAGAATGCTAAAGTTACGTTCCCCGACTATCAGGTACCCGTTAC:1 + chr3L 23942295 5' - INE-1 551 1 57.58 TTAACAGAAGATAAGAGGAAGAGAAAAAAAGGGTAAAGAAAAGCTGGCAGACTCTCGGCACGGGTCGAATGACACCTTAGACCGGCCCGGAGATGTGGAAA:1 + chrX 3725481 5' - baggins 198 1 57.43 CAACCAGGCGTGCTAAGTGAAAATCTGCTTTTACTTAACCTCATTCCCGCGAAATCCGCAGAATCGAGACTGAAACTGTAGTGATGCAATTGGCGATGCT:1 + chr2L 20401035 5' + Juan 136 1 70.00 TTGCAAAAAATAAATGAAGGTAAATTCACACTGGATACGGCATGGCCAAACTAGACTAAGGTTTCCAACTAAACAAAAAATATACAGAAAATAAAATAAAT:1 - chr3R 20841296 5' - transib1 1906 1 57.43 CTGCTGTGGGAGACAGGAAGGCCATGAGAATGGCCAAGACCACCAAGTAGAAACACACCGTTGTGGCAATCATCTTCTAGCACAACACGCACACATATACG:1 + chr2R 6050050 5' + 1360 3214 1 71.29 CCTCATCGATATTGAACAGGATTCGTTGGGAAGGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chrX 7768923 5' + hobo 39 1 66.34 GGTTGCATCCAGTCGACCACAATTGCACCGCAACTAACTGCAAGCCACATGACGCCACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 - chr3R 545274 5' - Transpac 5213 2 67.33 GAGAAAGCGAAAAAAGCAATGTGCAAGACAAATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTT:1 + chr3R 7063574 5' + I-element 5138 1 77.23 GGCGCCATGGAGAGCGGAAGGTAATTCAAAACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTAAAAAAA:1 - chrX 8041349 5' + I-element 5150 1 74.26 TAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGGTTTCAGATA:2 + chr2R 24795820 5' + Cr1a 410 1 68.32 ACAGTGTTTTTGTGGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGGTTGTTGTCATAAATTTTGCGTCGCAATGTTGTATGGATAATCGCACGTGTCACCTATTTAAACCGA:1 + chr2R 19568459 5' + roo 9000 2 64.36 ATATAAAATTGATTAAAAATATTAAGTGCTCTTTTTAATTTATCTTTACTTAATTACATCAATAATGATTTTCTTGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTT:1 + chr2R 20198009 5' + pogo 1746 1 74.26 CCACCTGCCGGTCGGTATGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr3R 2772201 5' + 1360 59 1 94.06 TATCCGGCTTGTGATATCCAGGTTCAATTTCCAAATAATCGGTATACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCAC:1 - chrX 21581177 5' + Bari1 31 1 56.44 ATAAAACTCCAATTAAAAGTACGCTGTGATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3L 5492355 5' + pogo 46 1 73.27 AACTAAAGTTCGACCATGGCACACATATGTATTTGTGTTTTCTTGTTGTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGATGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAA:1 - chrX 3018772 5' + Doc 325 1 54.46 GTTTTATGTACCACAAATGAAATTATAGTCGGCTCACACATACACACATACACACAGAGTGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1 + chr2L 315094 5' - hopper 1402 1 66.34 CACAGCGCATTGCATACTTATTGGCGCATGTGTTAATGCACCACCACAGGCATCGCACCACCGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATT:1 + chr3R 28196678 5' + hopper 17 1 60.40 ATGAGCAAGTTTTTCTCTGTTTTCCAAGTTTCAAACGAAAACGGAGGAAAACTACAGAGAAGTCACAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTC:1 - chrX 12416761 5' + 297 6498 1 46.53 GTTACTGGTTACTGGTTGTTCTTAGTCGGTAAAAAAACTTCACTTCAATACTACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTG:1 - chr2R 19260024 5' - gypsy4 325 2 76.19 CGGCCTGTTCGACGGGTGTTTTATGTAGTCGCAACGTGTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATTGCCGTTCGAA:1 + chr3R 18720118 5' - 1360 2992 1 60.40 AGGCGACATAAATTATTGCTTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 - chr2R 10777852 5' + pogo 54 1 84.16 GGCAGAATATCAATTGTTGATTGGTTATTTGATAGGAAAAAAACACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCC:1 - chr3L 19702748 5' + transib2 2494 1 69.31 CCATTTTGGTGGCTGTGTAGTATATTTGTGGTATTTATTTATAGACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chrX 12818896 5' - roo 9042 1 56.44 ATATTTTACTTATTTTTGTTCTCGTTGATTCTGCTGCTTTTTTTTGCTTTATTTTCATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTG:1 + chr2L 2924559 5' - I-element 81 1 64.65 TTATTACTTATACGCCTCGTATGCCAGGCGAGAGCAAAGCAAAGCAAAAGCGCCCAGCACATGTATATATTATGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGA:1 - chr3L 10747695 5' - Porto1 4299 1 73.27 TACAAAATTTTGGGTTTCGGAGTCTAGAAGTAGACAGATGTATATAGTTAAATAGTTTTTTAATTGACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACAGATTCCCA:1 + chrY 424996 5' + McClintock 66 2 43.56 CATTTTTACTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr2R 5651918 5' + Tirant 8122 2 66.34 GAAAGCGCACACGTACATGCAATTAACATCATGGCGACAGCACGAAGTCCATATGGGCTACCCTGGTATGTGAGCAACAGAGTTATTGAAAGGGATTTAAA:1 - chr3R 18868721 5' + G5A 2546 1 66.34 TTATGTGCTTTAAACTTTCACCAATATTTAGGTATTTCCTCCGGGTGTACCAAGGCGCATCAGCAGGATTTTTGATTGTGCTCGTTGTATTATTTCAATG:1 - chr3L 380953 5' - Doc4-element 2643 1 59.00 GTTCATATAAAACCATTACGGATCCAATAGTATCGGTAATGAAAGACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chrX 4056263 5' + roo 8694 2 56.44 AGCACAGGTGAATGGTGCGCAATGCCATCGGATATTCCTATATCTTAGATCCTCAGTTTCTGAACTGTAAGTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGC:1 - chr3R 23274112 5' - invader3 270 2 66.34 TTTCAGCACGACTGTTTGATTTGCCGGTTTGAATGGTGTTATGCAGCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTAACCGAA:1 - chr3L 27262132 5' + P-element 29 1 49.49 AAAGTGAAATGTTTGATTTTCGGAAATTTTCGTACTGGAGGTGGGCAAAATGAAAAATTAATTGGTGGGCAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTTAAAT:1 - chrX 3524586 5' - FB 41 1 59.41 TGGATTGCGTGAGAAGAGTAAGTAGCCAAGGTCGGAAACTGGGTTGGTTATTTGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGG:1 - chr3L 23931011 5' - 17.6 132 2 61.39 CATGGATATCTGCTCATTGTGCATGAAGTTTACACGATTTTTGCTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAATATCCGATTCTGAAATGGAATCGTCTTATAG:1 - chr2L 4058342 5' - Bica 4531 1 59.41 GCATCTTTAACCCTTCACTGGCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:1 + chr2R 17269737 5' - transib2 2771 1 76.24 CAGGGCGGATACGAGATCATAGACTGCATTTACCAACGCAGACTGCGGCGTCTTACAAGCGCTGCATTACAAATTAAATGATAAGAACCTATGTAAGAAAG:1 - chr2L 16260689 5' + rooA 7506 2 75.25 CCCATTTAGGCCCACAGCAGGCCAAATAGATAGAGCTCACCAACAAAAAAAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAACACAGAAACGCTGGGACAAACACAAA:1 + chr3L 9239928 5' + Tc1 1608 1 56.44 GATTTATTATATATAAATCTTGTATTTATACAAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 - chr2R 9957293 5' + Transpac 41 2 74.26 AAGCGTTCTTATCAATTTATTACGTTTTTCTGGTTGACTTTTTATACATCTGTTTTGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chrX 12890886 5' + pogo 18 1 61.39 CCCATAAGACAATTTGCTGCAAGCTTACTTTCGTGCACTGAAACAAACTGAGGTAAACAGCCATCGAGAATGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTC:1 + chr2L 3755228 5' + roo 8775 2 46.53 ATTTGCCTATTGCCCACACTCAATGCCGCACGTTAAAAAAAAAAACGTATCAAAATAAAAAAATCGCTTTGCCGAAAGAAGTCATCAATCTTTTAGATGCC:1 - chr2R 17835452 5' + transib3 2478 1 51.49 TTTAAAACCCCGAAGCAACGCATTTATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAA:1 - chr3L 21912337 5' - Bari1 1678 1 54.46 TCCATACAATATTTCTTTTCTTTCATTCATCTTCTATATAAAGTCAGTGTAAGTGTAAGAGTGTAAGAGAGTATACATCAATTTTGCTTATCAACGATA:1 + chrX 7794419 5' - Circe 6985 1 48.48 GTAGTTATAAGCGAAACAACCAACAACACACTGAAAAAAATGATACCCAACCAAATCCCAATCAAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chr2R 10523218 5' + R2-element 3583 1 90.24 GACTCATCTACATCCAGATCATCATTCACTTCGATTTCTTCAAAAAATAAAAACCAATTATATCACAAACTCTGAAAACAAAACAGGCAATTGAACATAAC:1 + chr3R 2999213 5' + I-element 5200 1 64.36 CATATAAGCCTGTACTCTTAGCGTCTGCAATTCGAGTCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCAC:1 + chr2L 19605827 5' - hobo 143 1 63.37 TTAAACATTTGCTAAGTGAACAGAGAAGATGGGGGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr2L 7970958 5' - blood 7377 2 65.35 TAAAACAAAGGACACAATCCATCATTACCATTTCATTGTTCGGGCTTACACAAAAGGCAAGAGAAGGGCGATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2R 14744198 5' + roo 8671 2 73.27 GACACAGGCCGTCGTTATTTAGGTATACCTTTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr2R 7242996 5' + 412 41 2 68.37 TGTGTGTGTAAGTTAACACCATTTAACGCTAATGTAATGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 - chrX 12276826 5' - hobo 2903 1 62.38 GTGTGTGTGTGTCCTGCAGCCAATAAGTTGCCAGCAGCCGTTGCCATTGCAGCGAATATCCTTTAGCTTATCCAGTATCCATGCGCGATCCACTCAAG:1 + chr2R 21772048 5' + Quasimodo 412 2 65.31 TTTATCTCTAAATAGGCTTCTATATATATTTAATTGAACGGATTTTTGTTTTGGCACCTACCAAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr3R 11073701 5' - pogo 2091 1 69.31 AATTGTATTATGAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 15440383 5' - hopper 156 1 88.89 CTATGGCAGAATATTTCCCAAGCCCAAGCAAGCCGACTTGGCTTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3L 18142012 5' + blood 34 2 59.41 AGCAGAAGAAGGAAATAAAAGTTCAAAGTTCTCAATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 7883134 5' - roo 9034 1 68.32 AAGTTATATATATCCGTGTATATACCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATA:1 - chr2R 15199192 5' - accord 202 2 75.25 CCATTTGATTGAGGTCCAGTTTGGACCTCATTACAAATAGCAATGGTGTAGACCACATAATCTTTGATTGCCCACAATTCAGAAAACTGACGCCTCAAGAT:1 - chr3R 3591247 5' + G3 107 1 61.39 TTTGTTGGCAGTTTGTTGTCATTTATTCGAATGGTTGATGAGAGATATTTAAACTAACAAGAATCGCCGCACCTTCGTGTTGGCTGTCATCCGGATAGTTG:1 + chrX 21668400 5' - G5A 183 1 71.29 TGTGCCTTTTCTCTTTTTAACTTTCGGTTGTTTGGCAGACTTAATCTAAGGGGTTCTAAGGTTTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATG:1 + chr2L 1795740 5' - copia 241 1 60.40 TATCTAAGTCAAATATATAAAACCAATAGTCAAATCCTTGTCTTCATCTCTCTGATTTCAAATTTTATGGCCTCATTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCG:1 + chr2R 5876139 5' - X-element 4457 1 72.28 ATTGGCCACGCTCGCACTTCTGAAATACCCTCGATTTGTGTTTTTATGGATGTCGTGGCTATGGCCTACGAATTAATTTTGAGCTTGTAAGTTTATTGAA:1 - chrX 3470629 5' - gypsy7 5400 2 68.00 TTGCGGTCTCTCCCGCCGGCACGCTGCCACCAATTTTTTCCCTTCGGCAGTGCATTTTCATTGTTCTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr2L 19629710 5' + hobo 10 1 70.30 AAAAGGCCATATAACTCATTGCAATCACCTAAGGCCAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGGTGTTACAGCAAGTGAACATAAAAGATTAA:1 + chr3R 14045091 5' + I-element 460 1 64.36 ACTGCTTTCGATTGCCAAACGGGCTAAGAGTTCAGCTGCAAGGATATCCAAAGCTATACCTCAAAGAAAAGAGAACTCTCCGAATGGGCACTCTTAATGCA:1 - chrX 4943567 5' + Ivk 4941 1 67.33 GTCAACGCTGCGTATACGCAACAATTATATGACACTGATCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATT:1 - chr3R 20395555 5' + I-element 236 1 61.39 CCGAAAATCGCTGGAAGCAAAACGAACTGCATCGAACGCGTTCTGCTGCATTATAAATACCGCAATTGCATTGAGTGCTGTAAAATCCCAAATGAAAAGAC:2 + chr2R 15451529 5' - roo 9070 1 77.23 AGCTTTGGCTCCCACACACATGCACACTCCGCCGACGCGTAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2L 6324480 5' - hobo 2907 1 63.64 ACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTC:1 - chr2R 2879459 5' - Stalker4 7072 4 53.47 ATCCTTATACCAAATTCGAACTTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:2 + chr3L 9174674 5' + 412 24 2 55.45 CTCGGCTACGACTCCAGGTGCGTCCTCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGAT:1 - chr3R 9081987 5' + hopper 49 1 71.29 TTTCAGTAAAAGCTAAGCCAGCTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chr3R 14882849 5' - pogo 2052 1 77.23 CTACCGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr2R 981626 5' + 1360 4 2 57.43 GGCACGTGGCTTGCTCTTTGTCTCAACTTTTTCGAGAGTCGAGCGAGTCCGTAGCAGAGAACTGCAGCCTGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr2L 4057125 5' - hobo 2915 1 54.55 CTTTGTTTAGTTGATCGAAATTGAGTACCACATAATCTTTTATATGGATTCGAACGCGTCGGTCGTCGCCATGCAGACACATATTATTCAATAAACTTACA:1 + chr2R 4896083 5' + gypsy7 5393 2 55.45 TCTCTTGATGGCACATCCGCTGGGTTGCCTGCTGATGATACCTGCCCCATTTAATTTTATACCCGTCTGTTCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAA:1 + chr2R 671740 5' + INE-1 144 1 61.39 TGCCAGCCAGCTGTTTATATTGCAAAATGTCAAGGACTCGCCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 - chr3L 9174772 5' - 412 7535 2 67.33 ATTTAGATATCGCATCGTTCATGCTGTTAAACGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTC:1 - chr2R 3293796 5' + 1731 4359 2 70.30 TCAAAACGTTTTCTAAAAAAATGGAAAAAATACGCTAAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTCAAACAAAATGATCCGCAGATCACTGCTGTTTGTCGAAAA:1 + chrX 8806174 5' + Tc1 480 1 74.26 TAATCGAAACTCGTCTGGCAAAAACAGCTCTATAAAATAAGACCCGAAACAGAGCACGCAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATC:1 - 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chr2L 16734485 5' + FB 79 1 73.27 CATATGGGGAAATATGAAAAGAACGGCCGCAGGATATGCTGGCCCAGTGAGAATGGATAAGTACTTTTAATTAAATAAATCCTTTTGTCGGAGAAATCCGT:1 - chr3L 14145435 5' - GATE 437 1 48.51 TCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGCATCAAATCAGA:1 - chrX 21668085 5' + Tabor 22 2 57.43 GTTGTTTATTTCAAAAGTTAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGGGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGC:1 + chr2L 910443 5' - Doc2-element 434 1 79.21 CGTTTTCCCTTTGCTGCTGTTGTTGGAATTCATTAGGCAACGCGCTTTCCACCTGAGCGAGGAGTTTTCCCACCCACTTACACACACACACACACACATGC:1 + chrX 8696159 5' + accord 185 3 78.22 TCACCATTTTGCAAAATCACAAAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACC:1 - chr3R 21081853 5' - flea 300 1 78.22 GATCCCGATCTCATGACCAACTGGTTCGAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 + chr3L 14152111 5' - blood 7340 1 72.28 TAATCTGCCGACATTGATTTTATGCAATGTGCCATTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTTTTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGC:1 - 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accord 181 2 78.38 TAGGTCGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAA:1 + chr2L 14074949 5' + jockey 251 1 54.46 TGGCGCCACTGTGACGCCTTGTGCGCTTCTCGATCTCATCCGGCGATTCAAAATGGCCAAAAACAATGTGCCCAGACACATATGGGCTTACAAATCCTTCC:1 + chrX 7104188 5' - aurora-element 4108 1 51.49 GGCCGACAGCGAGGCGTTGAGCAAACGAAAAACAAAAAATTAATTTTAGCTTTTCCCCCCACTCTCTCTCTCACCATCTCTCACACACACACACATTCACA:1 - chrX 5081886 5' + accord 7034 2 73.27 GGTCGGCTGATGACGCTTGCTCTGATGTTGATGATTGCACATTGCTAAGCCTTAAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATCGTTATTACTTCACTTCACAA:1 + chrX 7530030 5' + McClintock 168 2 61.39 TATACATTTATACTATATTTATACTATACATTTATACTAATTCTGGAAAAGATTTTCCCAACTGGGTAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTA:1 - chr3L 6488527 5' - S-element 400 1 63.37 GAGTTGCGGGTTTTCTAGCTTATGAAACTGAAAGCACTTTCCATCTTTGAAGAAATTGAGTGCTGGCAATCAACTAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr2L 5653503 5' + hobo 2 1 68.32 GGGAAAGGTTAAACAATCAATTCTGCCTTCAATTGAACTCAATTGTGCGTTGCCCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 - chr2R 17269797 5' + transib2 18 1 58.59 TGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTG:2 - 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chr3R 23305240 5' + Rt1a 5073 1 67.37 CCTAAAAAGTCTTTTGACCTTTTGCAAACGAATTGGAAATAATGGAATGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTT:1 - chr2L 318224 5' - hopper 1033 1 53.47 GTTCAGTTCACTTCGGTTTAGCACTGTTATCCTTTGGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2L 10023652 5' + roo 8704 2 68.32 CACACCATAACACGTGGCAAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTATTCGAAAAGCTCA:1 + chr2R 11718409 5' - R1A1-element 204 1 77.23 CCGACTTTCCACTTTCAGTTTCACGTAAAATGTCAATCACAACGCAGCCTGCTGCCTTCGACAGGTGGTGCTTTTTGGCCCATACTGTGTCCCCCACCCTG:1 + chr2L 1620487 5' - Osvaldo 1296 1 53.47 AACACGAAGTCCCACGAGAAGTATGATTTAATATGGAGTAAACAGAAACCATTGATTAGTATTTAATTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAACG:1 + chr3L 24054316 5' - 297 104 2 64.36 ACGTTTCCGAACGTAATGATTTACAGTTCCTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr3L 9763547 5' - P-element 2841 1 34.00 CAGGTTTTTTGGCCCAAAAAATAAAAGGGCGGTGCGATCCGTTTGCATTCTGTAGGTGCTAGGTCATTGACCGGGATGATAATTTGGCACTCGCGGGCGTC:1 - chrX 6455670 5' - Doc3-element 317 1 61.39 ATGAAATATTTCAAGTTGCCAACTCGCATATAACCGATGTGTGTATCTGCATTTGCATGAGCACCTATATCTCGGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1 + chr3L 9120409 5' - Tirant 399 1 28.00 TGGCTTTCGTTACGTGACTGTTTAGGTCCAAAACAGTCGAACGGATCCTCCCCACGATCCCGCAACGCACGCGAGTCCAGGTGTTCTAGTTCGTTGGCTTG:1 - chr2R 5266696 5' - Gypsy6A_LTR 9 1 70.30 GCCAGAAGTAATAAACTTGTATGTACATATGCCGCACCAATCCAATCAAACTCATATAAATATGTACATACACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:2 - chr2L 2912129 5' + 297 6580 1 81.19 CGTGCTATAGCGTCTTTCTCGCGCCCTTTTTTGTTCATCTCGACGTTCATACGGACAAACGGAAATGGCCAGATGGAGTCGGCTATTGATCCTGATCAAGA:1 + chr2R 927467 5' - INE-1 88 1 64.36 ATATTGACTCCTTTCCAAAATACTGTCCCATCTTTGGCTTAATTAGCAATGACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3L 16449807 5' - roo 385 2 55.45 TTCTTCGTGTAAAAGTAATGCACTTTACAAAATATCCTTACAGATGAATTACATATTTCTTCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAA:2 + chr3L 8012019 5' + transib2 13 1 64.36 GATTGGACAGGACTCCCGTTTCCTCTGACACTGCTGCAATTCGAAATCAATTGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2R 11372264 5' + roo 8687 2 56.44 CACATTCCACGGCTGGTGATTGATGGGCGCCGCAAAAAACCAAAAAGAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - chr3L 10565358 5' - pogo 2078 1 54.46 AATCGAAACCCTAACACCCTACTACCCGAAATTGAGTACTGCGTTGTTGTTGGAGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGA:1 - chr2L 4514351 5' - F-element 468 1 51.49 CATAAGATTACGGAAGTAACTGCTTGACAACCCTTGCATATTGACCTTACTTAATTGTTCCAGATTGGTTTTTGTTCACGCCAGAAGGACGCAAACAGTTG:1 - chr2L 15014479 5' + Max-element 8243 2 66.34 AAGTATGCAGAGAAATTAATTAAAATAACAAACGTCGATAATAAATAAAAAATCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGG:1 - chr3R 30797280 5' - F-element 214 1 53.61 CAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAA:1 + chr3R 14049356 5' - transib2 2783 1 71.29 GTATTGTCAACCTTGGGAGAGCGGAGTTAGAAATTGTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr3R 21969116 5' + hobo 40 1 65.35 TGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCC:1 + chr3L 5267240 5' + Juan 4026 1 76.24 GTATGATGTGGTGCCTGCCACTGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATT:1 - chrX 7570141 5' - F-element 4403 1 78.22 TGTGGGCGCAATTTTCCATTGAATTATAATTTTTTCGCAGCAGTTTTTCTTTTTTGCGAGGTTTTTTTTTGCTTTTTGTTTTTTTTTTTCGTG:1 + chrX 13945389 5' - gypsy2 396 1 67.74 AAAAAACTAAACTCCTTCAAGGCTTAAATGAATCGTATTTTCTTCTATTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 - chr3R 27892606 5' - copia 255 1 53.47 ATACATTTAGTTTAAAGTTAGTTAAAGTTAAACAAGGAGGGTCTTCCTTACATCCTAATAGGATTCATATACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 + chrX 3195597 5' - mdg1 7454 2 73.27 TATACACGATCAAATGAAGAAATATACAGCAATCGAAAGGTTTAGAAGAATAGCTTTGAAGTGTCTGGTTTTGACCAACGTAAAATCCCGAAATTATCAAT:1 - chr4 852262 5' + HB 245 1 63.37 CGTCTAGACATGTGCTAAATGAAATCAAACATCGCACACCGATTCCGCGGCGAACCGTCGACGGTTTAGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr2R 19658268 5' + 1360 10 2 71.29 AATTGCCTGTTTTCAATCTATTCAAGCAAATCAGCTTTCCTCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCATCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTG:1 - chr2L 18871910 5' + 1360 286 1 59.41 TACCGTACTACTTGTTGAACCCAATAAATTATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCACAATAAATATAAATATACAAATATACAAA:1 - chr3L 24104302 5' + Stalker 6941 4 75.25 TTTTGGTTGTACATTTGGTATTGTGTAAATTTTTATTGTGCATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATAT:1 + chrX 7709703 5' - S-element 107 2 65.35 GTATTCTGTTTGCTATTATAAAAGTTCACGAGTTCAGCTTTAGTATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCCATGCTTGTTGCTACAGAGCC:1 - chr2R 20584603 5' - invader2 4971 2 74.26 AGCTAATTGGGGAAATATTCAATTCATATAATAATTTTAGATACTAATAGGTCATATATAATGATAAAAGAAAATGAGTTAAATGTACAAAATGCTAGAAA:1 + chr2L 12584489 5' + hopper 1077 1 49.50 CTGTCATCATTTTAGTGGAATTTCCTAAAAGTATCGCACACAGGTGCATACCAAAAACTTTAGAAGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTT:1 + chrX 20357131 5' - INE-1 575 1 50.00 TTAATTAATGAGTTGTAATTAAATTAGCCACATCACTTGATAAGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTACTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGAAG:1 + chr3L 6907377 5' - Ivk 5263 1 52.48 TTATATATACCAGCAATATCTGTGAGTTTCTGTGTGAGCAGCCAGCCATTACCACGAAACTAAAATGCTGTCTCAATATTATTATTATTATTATTATTATC:1 - chr3L 3704590 5' - mdg1 25 11 57.43 CGGCGGTGGCCACCATGGCAACCAGCAGCGCAATTACCTGGGGAGCTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCC:1 - chr3R 11753431 5' + F-element 306 1 61.39 TTTCACGGCTATAATTTGATGTTCGGAAATCAACAAACTTGGCTGTTTGAAAGTTGGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 + chrX 21466657 5' - hobo 2919 1 44.55 ATTGCGTATAATTAAACGCACGCATGCCTTCTTTTCATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr3L 10035725 5' + jockey 72 1 64.36 ACAGAAGCTGGAATGGCTCCATTTGGAACGCATGTATAGTTTCCATATCCCAGAAAAATAATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAATAACGAG:1 + chr4 249810 5' + INE-1 537 1 59.41 TATGCAGCACATAATGTAATTGCGTTTCGTTTCTGTTTTCTTTGCTTCGATCTGGTTAATTTTATATTACGATGATGTTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 + chr2R 22619578 5' - jockey 4979 1 59.41 GGTTCTCTTCCGCTGCCAACCACAGTGGCAAGGTGAGCCAGGAAATAAATTAAATACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGAT:1 - chr2L 1563237 5' + Porto1 4234 1 50.50 GGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCACT:1 - chr3R 2689416 5' - diver2 4465 1 53.61 GACATGGAACCGCGCATGTATGCCAAACCCGTCGTTTTCTACGTTTTTATAATGGTAATATAGTTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAA:1 - chr2L 13444689 5' + blood 6977 1 56.44 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCTCTCTCTCTCGCTTTCCAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATTTTAGATAA:1 + chrX 12649914 5' + Cr1a 411 1 64.36 ACATAATCTTGACGCTATCCACCGATGCCTGCAGCCGCTCAAAGATCCGGAGATGTGACGAATCTGGCCCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCA:1 - chr3R 29797939 5' + F-element 4280 1 54.46 CACACAACATAGTTTTCCGTGACTGATTGGGATTTCGCCCCAGTTTGGCAATCACCAGGTGTTCAAAACATATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTT:1 - chr3L 21275849 5' - Quasimodo 7366 2 50.50 CGCGTGCTGCATGCCAGCCCAGCACCAAAATTGCACCCGTATATCTGTATCTGTATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATACTTCCTAAGAT:1 - chr3L 18196465 5' - INE-1 151 1 61.39 TTGTCAAGTTTGTAAATCACATTTATTTGAAGATATACTCTTTTTTATATTAAGCAATTAAGCCTTCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAA:1 + chr2R 12753022 5' + Juan 16 1 54.46 ACTCGGTGTCTGGGGGGGGGGATGAATGGGGGTTTTCCTTATTACACAAACACTAAGTACCTACATATAAAAGCAGGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAA:1 - chrX 12143594 5' + Juan 3951 1 64.00 GGCGAGAGGGGTGGGAGTTTAAGGCTTTTGTTAGCACAAAGCCAAAACAACAAGTGCAAAAAAACAACACCAAAAAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGG:1 + chr2L 9873501 5' - Cr1a 224 1 56.44 GAAAATTTCTGAGCTAGCCTCGCGTATCTTGTAGCGAGCAGACCAATTAAATCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTAC:1 - chr2R 552610 5' - roo 308 2 63.37 ATTTATTTATTATATTTTTTAAGTCATTTGACTTAAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACCTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAG:1 + chr3L 15436571 5' + 1360 485 1 66.00 AAATGTTCATTATACGGAATGGAAGTCATATAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACAT:1 + chr2L 20396990 5' + Quasimodo 6892 2 76.24 GTGCAAGCGAGACGGATGCAGTGGCCAGGTGCCGACTGACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACA:1 - chr3L 17159784 5' + Doc 4247 1 62.38 GAGGCCAAAAAGCGGTAAGCATGCATTTAATCTACTGTATTAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGGGTTATGT:1 - chr2R 9285595 5' - gypsy 449 2 45.54 AGTGGCACATTCAGCTGCGTCTACAGAAATAGTTAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCA:1 - chr3L 9119569 5' - Tirant 8386 2 66.34 ACATAGTTAGCCCAATTGTGTTGCATACTTTGTTGGGCATGCGTCAGATGAACATTTAAACTTGCCTATGTTAACTGCTCCTTGTCTTAAGATGAAGTCG:1 - chrX 19796983 5' - gypsy10 5619 1 71.00 ATGTTATATATCCGGTTTTGTTGGGCCTACAGGCTAGTTTACACATCGGACAGTTCTCACTTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2R 15605955 5' - roo 9056 1 77.23 GTAGAGCTTTGGTTGGGGTCACTACAATTTCCTCGGCCCTTAGTATGGCGTCCAAGCATTTCTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chr3R 20547744 5' - 1360 3375 1 67.33 AGCGCAGCATCTTTGTTTTGGTTGCAGTTGTTGTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTGTTGGTAGCTAAAGAACTTTACACCGTT:1 + chr3L 11599883 5' - Doc3-element 466 1 80.20 CCACCATTTCCCTTTTCCCGCTCACATATTTGCACATAGTACACATTTCATGCGGAACTGACGCTTGTGTGACGCTTCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCT:1 + chr3R 27435004 5' + jockey 4644 1 75.25 CAATTTATATACTATTAGAACACGCGCAGCCAATGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTCTAATTATCATATATTTTAAACATAATTA:1 + chrX 20809470 5' + Cr1a 97 1 65.35 TGTCGCCCGAGTGCAGCCAGCTGCAAGACGTGACGGCGGCTGCCAAAAAGCGGCAAACACACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCG:1 + chr3L 6906385 5' + Doc 417 1 76.19 GAGCGGGCGAAAATTCTCATGGGAGATTGAGTATGCGCTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - 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chr3L 23855342 5' + Doc 4296 1 70.30 AGATTATTGTTATTTTATTCACTATAATCAAGAAAATGTAAAAATGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCGGTTTTACGGCGTTAGAGTGGGCATGGCAACAT:1 + chr2R 673902 5' - INE-1 208 1 74.26 TCAGGAAAAAACGATGTCTTAAGATTTAGACCAGACATTTTTAATTCACGATATACTGTTCGGCACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAC:2 + chr3L 25608300 5' + Doc 13 1 58.42 ACTGACGACGGCAGCTACATCTGCAACATCTGCAGCGGCAACAACACGACAGCAACATCGACATCGGTTGCCGCTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:2 - chr3R 15666141 5' + P-element 2 2 75.25 ATATTCGCCCTACGAGAGCTGGAGAATCCGCTGGTGTTTATCAATATCGAATGCTAACAATGCCAATGTTAATAAATCGTAGGCGTTACGCATCTTGTTAT:1 + chr2L 9679241 5' + 1360 3375 2 74.26 ACACTCCAACACTGGAAGAAATACTCTCTATATAAAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATAAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCTAC:1 + chr2R 9521387 5' - Tirant 8356 2 63.37 ATGTCATGTTGGCTAAAAGGACTAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3R 24833436 5' + roo 8668 2 78.22 ATTAAACAAATTTAATCCAATAAATACTATGTTTATTGCATCCACTAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3R 22494674 5' + 1360 5 2 72.28 GAGCTATGTAGTCCAGACTTATGGGAGAAGAGTACGTGCTCTGGGGTTTCGCACCGTCCACTTTCGCACCATGGGCATTCATCCGCATCCTCGTGTCCAAA:1 - chr2R 2555448 5' - Rt1c 5047 1 76.24 TGTATGATTTGTTGCCGTACAATGCAAATTTGAACTCGCTTTTAATATCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCAACATCTTTA:1 - chr3R 3492425 5' - invader2 4640 1 59.00 ATTTCCAAACTACCGGCCTGCAGGGATTTCCGCAGCGTCATGCTTGGCAGGTCCTTTGAGGAACTTTGAGACAGAGAACTGCCAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr2L 7767099 5' + hobo 9 1 71.29 CGTGTAGGCCGGTCTAAAGTGTTGTTGCTGCCATCCAACCAAGCCAGCCAGTTAACCAGCCTTCCAACTAGATAACCATATAACGATGCTTGGAACAGTCT:1 + chr3L 9924596 5' + Cr1a 4022 1 77.23 ACAGAAGCTGGCCGGGAGTGGGTTCCCAAGGCAGGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCA:1 + chr2R 20420012 5' + Doc 292 1 66.34 GAGAGACTTCCCCAAAAAAAAACCCAAAAAAAA:1 - chrX 5082475 5' - transib1 9 2 66.67 CCACGCATCTGCGAGATACACACTACACATACATATCTACATATATACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCTATACATTGGTTTGGCACTA:1 + chr2R 11400328 5' - 1360 3357 1 61.39 CAAAAAGATACAAAAGAATCTTATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTC:1 + chr2R 12242943 5' + roo 183 2 78.22 AATTTAATTTTGGAAATGGTATTTCATGTGGGTCAAAACACTCAACAATAATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAGTGCTCTAATGACAAA:1 - chr3L 14132444 5' - 1360 406 1 60.40 GCCGACTGCGCTGCCTTGATCAGTCACTCACACAGATACAGATACTAAGCGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3R 18448930 5' + hobo 25 1 54.46 AGGGGCAAGGAGCTATTTGATCATCATGATAATTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:2 + chrX 3358712 5' + roo 44 2 73.27 TGCGTCTCGAGTCGAGTGTCCCTCGTTGTCCTCCGTGATCCTTCGTCTCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 10978692 5' - roo 9045 1 53.47 TGAACGAGTAAATAGGTCCTAGCCGCTTTCGGATTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGAT:1 - chr2R 3037151 5' - F-element 44 1 77.23 CTGGCATTGATCTGAAATTGTATTGCCTACTTTTTGGGGCCGGTCAAGATAAAACCCGGGCTGTCAGCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr2R 21415219 5' + jockey 17 1 67.33 TAAATGAAATCAAACATCGCACACCGATTCCGCGGCGAACCGTCGACGGTTTAGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 + chr2R 19658283 5' + 1360 25 1 56.44 CTCGATGGATGAACTTTTGGTATCGCCCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACAGTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGG:1 - chr2L 20723405 5' + F-element 4211 1 75.00 TCCCCAACGCAAGGAAGGGGGTGGAGGGTGTTAGCCTGCATTTGAGTCCGTTTTTTCGAGAGGGGTCTCTCTCGCTTTCTCACTCTCTCTCTCTCGCTCTT:1 - chrX 7628977 5' + Cr1a 289 1 79.21 AGAACTTTCTTTGTTATCAGTATATATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chrX 10283510 5' + roo 8714 2 78.22 ACCCACTGGGCTCCCCTTCCAGCCGAAACTCATTGTCATGGCCATGTGGCAGCCCCAAACACGAAAAAGAAACAAAAAAAAGGAACATCTCCCAAGGTTG:1 - chrX 4021033 5' - McClintock 187 2 67.00 TCGAGTGTTTTGACTGTTTCGGAGCTATGTTTCTATTTTGGCTTTGCGTTCCTGCATTTGGTATCCGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:2 + chr3R 29333686 5' + hobo 10 1 55.45 CGGTCAGACCTTGGGGACGTGGAGAGTGACGCGTGTCACCTGCGGAATCTGGAATCACTATCCTTGTGCTAACAAGCCCGTTGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr3L 12724283 5' + roo 8663 1 77.23 TAACGTTAAGGTGCAACAAATTGAATAGAAATCCGTTTGCTTCGGCCGAAATAATTGAGTAAAGCGAGCCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTG:1 - chrX 10210070 5' - 1360 215 1 75.25 ATTGCCCTCGTTAGATGCAATAAGAAGGGTTTTCCGCAGAAGAAGGAAATAAAAGTTCAAAGTTCTCAATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 7883100 5' - roo 405 1 75.25 GTTGCAATGCGTGTGAATATAATCGCATTTTAATTGGTCGAATTGTAGTAGGCTACAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATAT:1 + chr3L 18797028 5' + invader2 4895 2 66.34 ACCCACACAACCACCCCAGGGCACCCCAAGTACACACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTG:1 - chr2L 18892099 5' - Tabor 483 2 40.59 TGCAACGTCCATTGCAGTTCAATACGAGTTAACTAACTGACTGTGCGAACTAAATGGGTAACGCTTTTGCTGAGCATCGCGACTATTAGATACTCGTTACT:1 + chr2L 10912454 5' - INE-1 550 1 47.52 TATATATACATAAGTGAGTCAAAGACTATATAACTGTGTGTGATTCTCGCGACTATAATGTTTATATACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATACTGAA:1 - chrX 11978373 5' - invader2 36 2 65.35 TAATAGATCGTATGTAGAGTCGTGAGACGTCGATATTTATTGATGTGTATTAAAGGGCTGCACATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 + chr3L 27262051 5' - P-element 2869 1 59.41 ACGTTCTAGTCACCCAAATTCCTATAAATACATTTATCATGGTATTCTCCCTGCTTAATGACGCGAGGACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGA:1 - chrX 20779949 5' - 1360 3207 1 74.00 ATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTT:1 + chr2L 23295811 5' - micropia 406 2 72.28 AACGCGGCGTATGCGTAACCGCAATGAAAGGCCATGCGCCGTATTCAACTATGAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAA:1 + chr2R 10936439 5' + I-element 228 1 62.38 ATTACGGATCCAATAGTATCGGTAATGAAAGACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chrX 4056277 5' + roo 8708 2 70.30 GTGATGATGGAAACGATGGAACGTAGGCGAAAAGTGGGACACCAACAGCTGGCCACAGAGCAAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGT:1 - chr3L 18095751 5' - I-element 5344 1 65.35 TGATGAAAAAACCGAGGCTCTCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTATGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGG:1 - chr2L 9166247 5' - Idefix 360 2 76.60 TTCCCGTGCCGCACCACCTGCAAACTCCTCCTGGCGGCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATAATAGAACA:1 - chr2R 22499664 5' + F-element 4560 1 59.38 TTGGCCAACAAAATGACACTTAGTGCAAAAACAGGAGAACGAACACATGCCAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAAT:1 - chr3R 20374170 5' + I-element 220 1 53.47 TATGACTTTCATTGATCTCCTCCCCCCCTCCCCCCCCC:1 - chrX 8854391 5' + accord2 223 1 65.79 AATAAACCATGTCGAACCAGGCTCTCCCAATTCGCGGAGTTTCCACTGCGGCCCCCGCCTTCCCACTTCCCCCCGTTTTCCGACTTTATTTTCCAGAGTGG:1 + chr3L 20866372 5' - G4 3379 1 81.19 CCCGGCCTTTTGGTTCAGGTGTAGTTTGCCCACCGGGCTACGGTTTATTGCCCATCACCTGCTCTTTTCGCTCAGACAGGGCAACGCATACAATTCCATAT:1 - chr3R 24090741 5' + ZAM 179 2 72.28 GAAAAACAAACAGTGCGGCGGAGGTGGAATCCACATTCAGACGCTAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAATTTCTTTTCTTT:1 + chr3L 13177871 5' - Ivk 4925 1 55.21 ATTGTTCTTCACCTCGCATTTCTCATTTTGTCAAAACATCACGTAAACAATTGAGCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGG:1 - chr2L 7283431 5' - 1360 32 1 54.00 TACTATGATGAACTATTAATATTTTGTTGTCCTTGTGTAACCGGACGCATTAGTGACTGCTTCAAATGGTACTCAATCCCATAAAGTGACCACGAAGTGAA:1 - chr3R 3581740 5' + rover 499 1 69.31 ACAGGGCGCCAGTATGTTGGGAATGCAGGGTAGCTACCAAATTGATGGAAGATTAATTTAGCAATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTCCCTTACC:1 - chrX 1624763 5' - roo 478 1 52.48 AGACGACCCAATTGAAGAAAGACTCCAAAATAAATAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCAC:1 + chr3L 25800438 5' - 17.6 7000 2 66.67 CAATGGCCTTTTCCTCAAGAAATAGTTACCACAAACCGCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 - chr2L 4026688 5' - blood 340 2 61.39 GGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 + chr2R 17345968 5' - hobo 2926 1 68.42 TACCCATGATTGATAAGTATTTATTTACCGGTCGATTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3L 3776529 5' - roo 9031 1 66.34 CTCTTTCTCTCTCAGGCAATGAAAGTGATTACGGGGAGATATGCGAAACACAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3R 12058612 5' + roo 8689 2 54.46 AGTAGAAAGGTTGTGGTGTATTGATGTCTTATGCAACAGATTTAGTTTTAATTTGTTTTGCGGAGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATT:1 + chr2R 17636017 5' - G6 1939 1 59.41 AAGCGAAAGATTTACGCGGCTACTGGAGCGAACGATGTAAACTTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr3L 21782114 5' - roo 9039 1 57.43 CTCATCGCTAACGCTCGGCGTGAGTATGAGACTTTGCAGTCGGAGATGGCGCGAATCCAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGAC:1 - chr2R 16268819 5' + accord 268 2 61.39 CTTATTCGCAGCCCGCCCCCCGAATTCGAGCCAACACTGGGATGCCGTTGATTTAGTTCTCGTTCATTGTTAATAGTTTTTTTATTTTTTTACATATGGAT:1 - chrX 9927027 5' - S2 130 2 59.41 CATAGAAGTATGCAACAATTTATTCCGTCTGTGGTGCACATTCATTTTAATCTGTTTCTTTGCTATATTCATAGTCATTCGCATGGGAGATGAG:1 + chr3R 17495151 5' + jockey 4 1 61.70 GTGAGCAAAATAAAAATATATACTTACATACATACACAGCAGCATCTAAGTAAAAGTAGCAACGAAAAATAGGAAAAAAACACTTCCGAAGGCAGTAATAA:1 + chr3R 11911462 5' + transib2 2457 1 71.29 TGGGGAAAATGTTAAATATTATCAGTTGACTGCAGTCAAGCAAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCATTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTT:1 + chr2L 7161812 5' + Cr1a 178 1 61.39 TCAATTAGAAATTCATGATTCGTGGCGATTTCTTTATGCCCGTAACGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTT:1 + chrX 17551296 5' - Doc 4514 1 54.46 AACTCCAGAGCCAAGTCAAGTCAAGCCGAGTTGAGTTCAGATGGAGACCTCGGCAGCCATCGAAGATCGAACGTATCAAATGCGACAGATCCACAGTCAAC:1 + chr3R 17954417 5' + pogo 447 1 74.26 AGAATATAAGTATCTAGTTAAACACGATGTGCCATAGAAATATATACCCTGACCGTATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAG:1 + chr3R 25807782 5' + 17.6 6959 1 68.32 TTACCGGTGATAAGTAAAAGTTTTGATAGTTAGTTACCGCTGGGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTACGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCG:1 + chr2R 2110220 5' - Doc 437 1 55.45 ATGACTAGTACACACTTCGTAATTCACATCCTTTCCAAACCAAACCATTTAATTATTGTCCGCTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACA:1 + chr2L 22748789 5' + G6 2020 1 53.47 CACTCGCAGGCTCACATTCTCATGCATTTGGGTATTGGTCCACAGGGAAAAGCCGGCCGAAAATTGTCAAAGGGTTTTTAACAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 3583058 5' + TART-C 11100 1 59.18 TGATTCACTGTGGCGGCACATTCCACGAGTATTATTTGTTTTGATTCGCGATTGTGGGACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATC:1 + chr2L 7992857 5' - P-element 383 1 58.42 TGAGTAGGATTTTCCATGTCCCTTATCCATGTTCGCCTTAGAAAACAAAATCCTAAATATAAATTATCGGTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGA:1 - chr2R 9047635 5' - roo 48 2 68.32 GCATAAAGATTTCATATTTAAGCCCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 - chr2L 14886421 5' + jockey 61 1 77.23 AAAATAACTTAGAACCCCCAACATGTCAGACTCACACACACACAAACTACAGAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCGATCT:1 + chr3R 29445487 5' + Porto1 336 1 63.37 CAAAGCCGAGGTAGACCCCCGTTTTAACCCCTCTAAACCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACAAAGTTGCAACAT:1 - chrX 10020460 5' + ZAM 86 2 68.32 TTGCAAAAATTTGCTGCCTGCCATTGTCATTTTTGTTTTGCGCCGCGGCTGCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1 + chr2L 2624205 5' - hopper 1391 1 55.45 CGCGGGTGGCGCAAGATAGATTGTCTTGACTCTCAAATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAG:1 - chr3R 7005762 5' + I-element 5091 1 64.36 TTTTTAAATCATAAAGACCACAGTTATGATGGACATATATTAGTAATTGATTCCTAAGTAACATATTTGTTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAAC:1 + chr3L 10045206 5' + Stalker2 7253 2 65.35 CTTTTACCTAGAGTTTAAAATATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr3R 11073777 5' + pogo 50 1 82.18 CGGATCGGGATCAAGACATATGGCACAACTGCGCCCCATTCCCAGATGATAAATCGCAGGCTGACATCTCCATATTCCCCGCACCAGCTCGAAGATTTCTT:1 + chr2R 12727432 5' - Osvaldo 1205 1 37.62 GTACAAAGCACACACAGTCGAGGTCAACAAAATAGTGGTATGTACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 - chrX 20982295 5' + 297 6604 2 59.41 TTTTTATTGCATTACGCAGAGTTCCTTTGAGCATTCAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATA:1 - chr3R 8763124 5' - pogo 1780 1 64.36 TTCCTTCTTGGCGTTGATTTATTTTATTTTTGGAATATTTTTTGTTTATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTTACGCTATGT:1 - chr2L 21605759 5' - Stalker4 7009 4 64.36 AAGTGGCTCTGGGGTTTCGCTGGGGGCTAGCGTGAGGTCTTTATGCAGGGTTGTGTTCCTTACGTACCATTTGCAGCCGG:1 + chr3L 5270485 5' - BS3 1395 1 67.50 GTGTGCACAGCTTCCTGGCTGTTGTTTGTTGTGAGAAATGATTTGTGCCAACTTGTGCCAAAAAATAAAACATGATAAAACATCAGTTACTATTTTTTGGC:1 + chr2R 11228893 5' - transib3 438 1 39.60 ATTGAGAATACTTTGGCACGCGATGCGTTTTTTTTTCGAATTTGGAATGCCAAGTTGATTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGAT:1 + chr2L 10197555 5' - Stalker4 389 1 64.36 CTCCCCAGCACTGATGAAGGGGACAAAAAGAAGCCAAAGCCCACACCTATATACATTCGAGAGAAAAGCTCGAATGTTTTTGTAAACAAAATAATTGAACT:1 + chr3L 25552471 5' + Fw3 21 1 81.19 AAGACACTTTGGGTTTAGGAATGCCACATGATGGGGCACTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2R 15606025 5' - roo 9035 1 62.38 TTTCCGAACGTAATGATTTACAGTTCCTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 - chr3L 9763544 5' - P-element 2838 1 31.00 ATCAGACGTATGCCCTCCGGTCAGTTGTTATTTTCGACTTTGTTTTTTCGTAGATGATATGGTTTTTTGCTTACTCCCCCTGAACTCTGATAATTATTCTG:1 + chrX 6456812 5' - Idefix 7277 2 73.27 ACTCTACTTGTTGCAGGCATATGGTTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chr2L 13711406 5' + hobo 48 1 79.00 TTCGCACCTCCATAAAAACGTGTCCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTA:1 + chr3R 29297880 5' + Ivk 4996 1 76.24 GTAGCCGCGGTGACCCCGACAGTTGCACTCGAAACCATTGGTTCATGTAAAGTAATACATTACTCAATTCGAAACTTAATTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chrX 20314483 5' + roo 8664 1 77.23 AATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTT:1 - chrX 21668055 5' + Tabor 6891 2 75.25 ACGAAATTAAAAATAAAACGACAACGGACGAGGGGCGTAGAGCCCAGAAATTGACAGACCTCGTGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chr2L 16396548 5' + 412 13 2 67.33 CTGTATCATTCAAATGATTAATTTTTTTTTTAGTTTTTTGGGGTTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTCCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAG:1 + chr2R 10263204 5' - I-element 52 1 68.32 CGCACGGCCCGCCCGGGTACAAGGTCCACATATTGTGCCTTTAATTCACGGTGCGTCCTCTTTGCGCACGCACCGTTACCGTAGGAGTTCGGGAGTGAGAG:1 + chr3L 24290897 5' + gypsy8 433 1 81.19 CATGTGCTTGTGCCAGTCTTTGTGTTTGATATGTCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGG:1 - chr3R 4278479 5' - Quasimodo 7067 2 67.33 TTCGCTGTCAGTGGCTAGACGCACAATATCTTTACTACGTCTCGCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAAT:1 + chr3L 24348922 5' + micropia 5042 2 64.00 GGCAGTTTATAAAGTTCGGGATCCACAAATCCTGAGCACGCCGTCGTTGAAAGCTGTATCGACACATACCGCATCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCG:1 + chr3L 25802174 5' + Cr1a 4428 1 72.28 AAGGCTCGGCAAAAGTATAAATTGGCTAGTTAATTACGCCAAATGTAGCTGTTGTCCACATTGTTCTTCGCACGCTCCGGGCAGTAGAATGTTGGAATGCA:1 - chrX 16639105 5' - gypsy4 6672 2 70.30 ATAAATACTTATATGTTATTTTTCCACTTAAGCTGAATACGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAACTGGCGACCACGGACGGAATA:1 - chr2L 19126326 5' - Max-element 400 1 64.36 CAACGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGC:1 - chr3R 1844858 5' + Cr1a 118 1 67.33 GCCACCCACCAGCGAAACCAGCAACAACTACAACCCATCCGAAACTCAGTAAACTATGACAATGCTAGAAGTGTAAAGTTATGACATTTTGTCGTGTCAAC:1 - chr2R 7722183 5' + Q-element 682 2 70.30 CAACAGTACAATACACCTCCAGCGTTGACAACAAAGTCGCGCCTTCTTCAATGTGCTTCTTTTACTTCACTCATCCACCCTTTTATTTGCGCCGTCGATGC:1 - chr3L 8041767 5' - invader2 324 1 59.41 CAATACATTAAAAAAAAATAAAAAAAA:1 + chr3L 16166758 5' - hopper 153 5 92.59 TCTAAGACTTATCTCGTGGAACTTTGAGTTCGTTAGTTCTTAACTTTAAAACTTAAGACTGATTACAGATGTGAGTGAGAAGTGAAGTGAAGTAATAACGA:1 + chrX 7607826 5' - McClintock 168 2 54.46 AACCAGCGTAAGGGCAGCCACAAGTCATGGCCTGATAACTCCCGAAATGATAATTGAAATACCACTGGTTGGGCGCCAATTATGAAAAGGGTTGGCCGGCG:1 + chr2R 4913057 5' - gypsy2 6818 2 63.37 TGGCGACCAACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chrX 20330586 5' + P-element 4 2 76.24 AAATGTGATTCGATACTGTGCGATCTATGGATTTGAAGGATTTGAATCCTTGAGCGATGACATCGGTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTAGCAAATTA:1 + chr3R 25850664 5' + I-element 5225 1 73.27 TACGATTTGTTGATGCTTTCGCGCTTGAATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 6739617 5' + roo 48 2 73.27 CCATGGTTGCCACTTTTCATATGAACTAAATTAGGGAGTTAATAGCTTTTACATTTCATTCAGTGCCTCACTTGCTCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTG:1 + chrX 9048614 5' - Tirant 8504 2 77.23 ATTCTTTTGTATTCTAAATTTTCTAAAATGAGCCGCGAAAAACGGTAAAGGAAGGAGGAAGACAATTTAGTGACACTGGGACCCTAGTTGAAGCAATTAAA:1 + chr3R 4576756 5' + Tc3 1315 1 59.41 TTCATCCTGTATCCAAATGCAATTTGCATGGCAATGGCTCAGCGTGAATTATTTATGCGTTCGAAGTGATTAATCGAAGGGCAACGGGAATTAGCTCTGTC:1 + chr2R 10345325 5' - diver 430 1 72.28 TGTTCACCAAAGCGATTGAGTACGAACAACAATAATATTTGCCCCACAAACATGGGAGGGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr2R 7882041 5' + 412 7070 2 62.38 ATCGAGGGCGTTTATGTGATTTGATTCGTTTATTTGGGTTTTTCTTGTTAGGCTCAATATCTACATAGAACATGTTCAGTGGCGTTTTGGTCGCACGGCTA:1 - chr3L 14596651 5' - G4 484 1 62.38 CAGTCCGGGCGAGACAAGCCAAATAATGGCAAAAAAAAAATAAATGAAAAAGGAGAAACTTGTCATGTTGAATTTACATAAAATTTGTATGAAAATTCATT:1 + chr3L 10567150 5' + pogo 84 1 69.31 TTGCATTTATTTATCATATTCTTGCTTTTCTTTCGCGGGGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAAAATTTTGAAAAAAGC:1 - chr3L 14256155 5' - FB 172 1 61.39 AAATAAAATAAAAAAACACAAAACAGCCGAAACGGGCTGAGGCGAAAAAGAGCAAAAATTATGTGTGTCAGCGTTTTGCCTAGGTGATATTTCTTTAAACC:1 + chr2R 4369469 5' + I-element 5022 1 70.30 AACTCAAGTCGATTCACAGGAAGCGTAGCAATCCAAAGAGTTGGTCAAAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 13612838 5' - accord 188 2 52.48 TAATGGAATTCTAATATATATCCCTCCCATCGATGATGATATAAAATCAATATGTCTAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr2R 19658370 5' - 1360 3370 1 61.39 TCGGGGTCGCGAACTGCTGCGAACGACAAACGGAGGCGTCTTCGCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr3L 813880 5' - roo 9040 1 56.44 CTGTGCCTTTAATTTCTGGCTTCTTCTCCCATTTTGCGTAGAGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr2L 17283464 5' + hobo 32 1 54.46 GAAGAGTCGTCGCATCTGCAGATACTTCAGTATGTCAATGAGCACAAATGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTAT:1 - chr2R 20446100 5' + Ivk 392 1 53.47 GCTGCCAATACAATACGACGACAAAATCGGTTGTTTTTAGTGAAGTGAATGGTTATTAATATAATACAAACAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTG:1 - chr2R 4023365 5' + Doc2-element 107 1 77.23 AAAATGTATGCTACGCTTTCTTCACGCGACCAATTCGTGCGAAAGTGTTTATTATCATTATGATACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chrX 12135728 5' + jockey 21 1 62.38 CCAGCCCTGTTGACCATGCCCTCTCCCACTCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAAC:1 - chrX 5560905 5' - R1A1-element 5072 1 70.30 GCCAAAACTGTTGCATACTCCCAGGAGCACAAACACAGCGAAAAGAGCACTAGAATGGCAAACTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr3R 14832474 5' + hobo 13 1 68.32 CAGGACATGGATGCTGCCTCCATTCAAGAGCCTAATCAGGCATCGGGCTGGCCCCACGATGGCCGCCAATTATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGT:1 - chr3R 19634087 5' - Circe 217 2 72.28 CGACGATGAGCTGGAGCTGGAGAAAGAGTTCATGACGGTGGTCAATGCCATCAATGGACCTGAATCGGAACAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAA:1 + chr2L 914351 5' + F-element 135 1 75.25 TGCCAGGACATTTGAAAATTTGTCACACGGCAAAAAATCAATTTCAACTCGATATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3L 10041530 5' + 412 7076 2 56.44 GATGGGGTTTTTCGGGTGGACATTGGTCAGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chr3R 15054351 5' - hobo 2892 1 69.31 GCATTCCGTTTTATTATTTTTTGAACGTTCAATGTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 + chr2L 16968261 5' - 1360 3349 1 67.33 ATTATTTCGTAATTTTAATCATGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTAGCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCT:1 + chrX 6156188 5' + 3S18 56 2 75.25 AGCCCATGATGGTCACCTTGGACAGACTGCCTTGGACATCCTTAAGACTAAAGTCCATATCAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCA:1 + chr3L 16104911 5' + Idefix 440 2 55.45 GGGGTTATAGTTAGGGTTAAATATCAATTAAAACAAAAAATTAACAAAGCTTACCCCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGG:1 - chr3L 20867802 5' + Porto1 355 1 70.30 CACTTTTATATTATTCCAATTGAGAATATTACACATATTTTTTATTTTTACTCGTTGCTTTGTTTATTAAAGCTTCTCATTATGAGACTAACAACAAGTTT:1 + chr3R 11209969 5' - Fw2 3905 1 64.36 CAAAAAATAATAGAATACTTTGATGAAATCTTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGG:1 + chr3R 3353392 5' - Ivk 232 1 69.31 GTGGCTAGAAGCCAGCGAAGCAAAATGCTTTTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTNGTTTTCTTGCGAGGG:1 + chr2L 15844563 5' - Doc 4503 1 69.31 ATAAATACGAATTTGTTTTGTGGTGTATACAAAACATCCGTGCCTCGCACGCATATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:4 + chr2R 10191690 5' + 297 6597 2 65.35 AGACGGGCTCTACAGCGGCCACTCGTCAGGCGGCCGCCAAGCAGATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGC:1 + chr3R 15977335 5' + F-element 427 1 56.44 ATATTGGCCCGGCCGAGTGACGTACTCAAAGGTGAAACTGATTAATTAGAAGCGATGCCAAAGCCCACGGCTGTCTATCAAGCCGAATTGCATCATGTTCA:1 + chr3R 17760030 5' + Ivk 4979 1 75.25 AACTAACCCATGCAAACAGACAGGCAAGAGACCACCAACACTTACATAAACACTCCAGCTCTTGCAATACGATCGAGCGCTTAAACATAAGCCGATCGCGG:1 + chr3L 3504428 5' + Stalker3T 139 1 71.29 CCCCCGCTTAATTATTCAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAAACTGAT:1 + chr3L 11367497 5' - roo 375 1 56.44 CTTATCTAGAAAAGGAAAAAAAACCCATTTTTTGCAATTACACTAATGTGAAATATGTTATACTATCCTCCGGGTAGGGAGTTCG:1 + chr2L 8278731 5' - G5 4659 1 71.76 TCAAGTGCCCGGGATTCGCATTCGGTTTCCATAATTTTTACGACTCTGGACACTCCCATCCACTCCCGAGATGGTCAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAG:1 - chr3R 16892540 5' + I-element 2 1 78.22 TCTGATCTGCCTGTCCCTCCCTCTTCACTTTTTGTGCGTGTTTGTGGTTCTGTTTCTGCAGCCGTTGGAGGTGCAAGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATA:1 - chr2L 8218911 5' - Tirant 379 2 79.21 ATGCGTAAGAGAGTGACTGCCAGAGCGGGGCGGCATGTGGCCGACAGAGCGAGAGGGGGCGACAGATGAAGAGCGTGGCGCAGCTAACTTTGATGATATTC:1 - chr2L 8346520 5' - pogo 181 1 77.23 AACTTTGGCTCAGGTTACTGCCACACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTG:1 - chr3L 704900 5' - F-element 4291 1 77.23 CTTCAGTGCTAGCTTGTGGCCTCTCCACATCTCCATTTCCACATCTCCGGCTCCGTTGTATTCTTGATTGGCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr3L 813784 5' + roo 5 2 74.26 ATAGGCCCGCGGGAAGTCCACACCGCGCCTTAATGTTTCGTTCAATGTTGACAAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACC:1 + chr2R 4501446 5' + G-element 25 1 56.44 TTGGGTCCAAGGAGTCCGAGAATTCGGTCGTGGCTCATGACCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr2L 16396633 5' - 412 458 2 61.39 AGTTGTACAATAATCCGCAAAGGTGTTGCCAAATTGGAATAAAAAGTCCCTGTTCAATGTCATGTAAATGACTTCAATGTAAAACCAAAGACACGAGAATA:1 - chr2R 5952730 5' - Tc3 316 1 62.38 AGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTATTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCC:1 + chr2R 17402731 5' + invader4 33 2 65.12 TATTCAGTTAACGAGTCAGCAACCAACAACAATCATACTTTTCCTCAAAAAAAAACAAATTATACCACAAAATCTGAAAACAAAACAAGCAATTGTACATA:1 - chrX 16463414 5' + I-element 5198 1 66.34 TAAATCTTAATCGATTTGATACTTTGCTGAAAATATACTTACAATGGCCCATCGGCAATCATATTGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTG:1 + chrX 13832704 5' - Ivk 4999 1 62.38 ACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGT:1 - chr3L 15452916 5' - accord 7332 2 73.27 ACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:2 + chr2R 19209450 5' + Doc 48 1 66.34 GAACTTGCAGATTGTACTCACATATGGAAACCCTAAGAGCATTTCTCGTTTGCACTTTACGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCGTTCTGTCT:1 - chr2R 19188604 5' + INE-1 576 1 60.40 TTCTGTGCAACAGTATGTGTTTTTTTTTGCGGCAAGACTACAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATG:1 + chrX 5148855 5' + F-element 183 1 60.40 TGATGCCTCCAACTCCCACTCAAAAGGTATCGAATGACCAAAGTTCTCAGCCGACTGAGTTGAAAAATCCATAGTAGCTTAAACATCCCCAGAACATCACC:1 + chr2R 14074302 5' - Bari2 775 1 65.35 GGGAACTCTTGAGGTGTTTTCGGGTGAAACCGATACGACAAAGTTACGTACAAAGTGGAATCGGTACAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACT:1 + chr3L 2853532 5' + copia 5060 2 71.29 CGCTCAAATATTGGTTGCAAAAATATATAAAATCTTTTATACCTATATGTATATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTT:1 + chr3L 22998906 5' + HMS-Beagle 19 2 60.40 TGTTGAATTCAAAACTCATTTTTATTTTATTGGGTGAGGTTCGGGCACAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 1195040 5' + hobo 29 1 53.47 TGTTTCCCAATTAAATTTGTCACGTTTTGTTTGCTCGTTGTGTGGCAGTACCGTTTGGCTCTTGCTCGTTTGCTGACTCAGTAAGAGCGTGAGCGGGTGCA:1 - chrX 10307108 5' - F-element 473 1 80.20 ACGATGACAAGGGTTCCTGGAGTGCCCGATTCGGCAAGGAGACAATAGTTAACAATGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 23485647 5' - roo 388 2 54.46 CCGTTTTAAATGAAATTGCGAAAATTCATTTTAAATTGGATTTTATTTAATTTGACTGAGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAA:1 - chr3R 7600439 5' + F-element 490 1 61.39 GGAGGAGGAGATTACTGAGCAGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTG:1 + chrX 6763098 5' + I-element 331 1 79.21 TCAAGGCACCGCGCGTCGTAGACCAAAAACCAAATAATAGCAGTTAAATACGAACCTTATATGCCACGCCAATCTCCCAGGTAAGACACCTCCGGATCCAC:1 - chrX 6751925 5' + transib4 2369 1 78.22 AAAATTTCCTCATTTTCGGGGCGTAAAAGCTTTTAGCTTTTATAGTTAGCGAGAGTTCGACATTCATACGAGTTGTACTCGGATATTGATCCGGATCAAGA:1 - chr3R 18891810 5' - INE-1 88 1 69.31 TTGAGCGAGAATTGCAGTTAAGGAAGTGAATGTATATGTATATATAGTAAGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chrX 3244572 5' + I-element 27 1 57.43 TTTCTCTTAGTCGTCCATATACACTCTCACTCACACAAGATGTTCAGTTGCAACAAAAAAGTTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGA:1 + chr2R 2121307 5' + transib2 2682 1 61.39 ATCTGTGTAGCTTCGCTGAGTAAAATTCGTTTTTGCACTCGCGTCGAACCAGGCAATGGCGTGTGGAAGAGGGTCGTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3L 153680 5' + 1360 1 2 78.22 GTTGTGTGTGTGCTGGCATGCCGCTGAGAGCGGTTCTCGCTTTTTGTGACACAAAGAGGAGTGTCATGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr3L 6942855 5' + P-element 10 2 69.31 AGTATCATCCGATTCGTGTGATCGACAGCATAGCCGAATTTTTTTTCTTTTTTTTCTAATTCCTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAG:1 - chrX 18116754 5' - Doc 305 1 73.27 GCATCTGCTACCGTTGCTGTTAATTATCCTGCCGTCGTGCTTATTACCTTAATGACAGCCGCGCATCGTCCTCGCATGGAGTCCACCAAGTCCTGGCGCCG:1 + chr2R 12075408 5' - Tc1 1274 1 59.41 TTTTTTGCTCGCTATTTCGGCAGCGGACTCGCCGGTCGGAGGGGCTAAATCAAAAAAATGAACTGAAAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCA:1 + chrX 20607284 5' + invader2 354 1 52.48 TTTCCGTCAGGATCGCCTCATACTTTTTCTTTTTAATTTGTATGTTGTTTTAACCGTTTGTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGC:1 + chr3R 18480305 5' - gypsy4 491 1 77.23 AATTCCGGAAACTAGTCCAAGTCAAAACGGCAATGGAACTTTATTCCTGCCATGGAATAAATTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 - chrX 5152033 5' - 297 387 2 73.27 AAACATTTAATTTAAAAGCATTTCTTTGTTCATAAAAATAGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 16105202 5' + gypsy7 5006 1 50.00 GTTAATTGTACGGAGCTGGGACTGAAGTTGCCCTGAAAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGGCGATTTTAGCAAACAAAATTAAAAAGCTTTA:1 + chr2R 20093469 5' + 1360 3010 1 65.00 ATCCATTTTAATTTTAATTTTAATTTT:1 + chr3L 20834872 5' - Rt1b 97 1 77.78 TTGTATTGCCTACTTTTTGGGGCCGGTCAAGATAAAACCCGGGCTGTCAGCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chr2R 21415202 5' + jockey 34 1 50.50 CGGTCAGCTAGTTATCTGTTAACGTGCGGGCCGCTGTTCGGGCGCCAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTTTACG:1 - chr3L 25850831 5' - Gypsy6A_LTR 225 1 56.76 CCTATTCTGTAAGTTCAGCTAGAGTTCTAAGAAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACATCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAAGAT:1 + chr3L 14746168 5' - Cr1a 213 1 65.35 AGTTCAGTAATCATATATTGAATAAAAAAACCTATGCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr3L 17786298 5' - roo 9033 1 65.35 GCAGTATTTATTTTCCGATTTTTTCGCTTCTTTTCATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTA:1 + chr3R 31084657 5' - 412 7337 2 65.35 ACAACACAAAAAAAAATTGATTAAAAGTCGTACAAAACTAATAATTATATGTGCTTTACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTC:1 + chrX 19080268 5' + Ivk 20 1 53.47 ATTCGATTAGCAACCGGGCACGTAATCTTAGACAACGAACAAATCGAGCCAACGCGAATTGCGCGCCCAGCGGCAAAAAGACCAAGACGAGCGCCGACTCT:1 + chrX 4246204 5' + Doc3-element 257 1 72.28 ACAGTGCTAGTTATAGCCAAGAATCGCAGTCGCAATCGAAGTTGTCGTATTCTCAGCCTGTTTATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAGA:1 + chr3L 14260319 5' + 297 5 2 75.25 CAGTCATCCAGACACCCAGTCACCCTCCCCTAAACCTCCACGCTGAGCCGCTAGTTCGTTGTCCCCTCATGTTGCAACAGTGTAGGCGGAAACAGCTCAGC:1 + chrX 7628785 5' + gypsy5 165 2 69.31 TTGAAATTTAGCTGGCGTTCCTTTAAAATCCAATTCCTCCAACTCTTCTGCTGCTGATCCGTTATTTGGCGGTGAATCGCCACGCGTTTCTGGGGAAATG:1 - chr3L 10642896 5' - invader3 437 1 73.00 GTGTATATAAATGGGGTTTTGTATTTGTATGTTATTATAACTGCCGCTAGGTGGAGCTCGTGTGAAGTCTGAGCTACTGAGCTGAGTAGCGGGTATCTAAT:1 + chrX 18129415 5' + INE-1 545 1 67.33 TTTTATCCATAGTAACAAACTAGTTCTGAAATAATATGATTTTCCTATATCTGAACAAGATAAGCATTCGTAGTTGGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAA:1 - chr3L 14539379 5' - GATE 8357 2 78.22 TGACAAATCCATTAACATAGAAATGCTTTTCATATCATTCAATAAGATATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr2L 18188467 5' + Doc 34 1 53.47 CACTTTTGGTCGGTGGCCAAAGAATTGTTGAAGTTGCAGTTGCACAATTCTTTGGCCACCGACCAAAAGTGGAGCATTTACGTGTGCACACATACAGTTGT:2 - chr3L 3687378 5' - 1360 170 1 53.47 TCTCCTCCTCTTTCTTGGCCTCTGTGGTTTATCGGGGTAAAGGTGTTAGTTTTGAACTAGCTTGAACGCAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr2R 22856500 5' + 1360 6 2 56.44 TCCATGATGTGTACTATGTACGTATGTACATACATACAATACATGGTACAAGTAGAAGTGTATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr2R 22793320 5' - hobo 2924 1 66.34 ATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTG:1 + chr2R 17402727 5' + invader4 2802 2 67.00 AAATATGTATTTTTACTTTATCATCTTTTTGCACTCGTAGTTCTATTTTCTTTTTTTTTCAACTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTT:1 + chr2L 6596725 5' - Tabor 7315 2 58.42 TGTTCGCCCAGGAAATAAATGTCAGACGCCGACATCCGCCCAAAATGCTGACACCACATTCTTTTCGCTCAGACAGAACAACGCATACAATTCCATATACA:1 + chr3R 18859851 5' + ZAM 8144 2 80.20 TGCCTTAAATAAGCAACTCAAGGTTGGCTGCCAGTTTTCCCTGAAGACTCCACGCAAACACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCAC:1 + chr3L 5863489 5' + F-element 4450 1 63.37 CACAGTCGAGGTCAACAAAATAGTGGTATGTACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 - chrX 20982283 5' + 297 35 2 71.29 GCCCTTGAGTAAAGATTTATGTAAATAATAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAA:1 + chr3R 11146384 5' + mdg3 5073 1 74.26 TATAAATTTTGAGACAAGAAACAAATAACAAGAACAGCGTGAGAGTGCCGAGCATACACCTAGCAGCTCAAGTGATTAAGATAAGATAAGATAAGATAACA:1 - chr2L 8425579 5' + Stalker3T 205 1 65.35 TTCATATATACAAAAAGGGGTCTATTAAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAAAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTAT:1 - chr3L 19336727 5' + Tc1 1618 1 74.26 TGTATATAAAGCTGACACGAGAGCGAAACAAAAGTACAATGCAAACAAATAGCGAAACAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACAC:1 + chrX 20494835 5' + I-element 4961 1 52.48 TACTAATAAGTCAAAAATTATATTTTCTTTAGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 - chr3L 14886255 5' - 412 7501 2 72.28 TGTCTATGTGTTGGTCGATCGGAGGGGGGCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chrX 10629254 5' + P-element 45 1 34.65 ACTAATTTTCAAGCTGATGCAACAGCAGACGACGACGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr3L 13366422 5' - hopper 1376 1 64.36 TTGGAGAACACTGTACAAAGAGAAAAACTGTTGTAACAACTAGGTGCGGAACTTGACGCTCTTCGTCAAGCGGACGCCACTTGCCCGGACTCTCCGTTAGC:1 - chrX 5318998 5' - baggins 287 1 42.57 GTAGAGTTGTAGTTTGTTGTTTTTGAGAAAGTTAAGTTAAGGTTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTACGCT:1 - chr3L 3984059 5' + jockey 182 1 51.09 ACATATAGAGCACATGGCAGCCCCACACACTTTGGAGACACATTTTTTCAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTAT:1 - chr2R 17308133 5' - hobo 324 1 51.49 AAAAAAAATTGATTAAAAGTCGTACAAAACTAATAATTATATGTGCTTTACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAT:1 + chrX 19080276 5' + Ivk 28 1 57.43 ACGCCCTAAGATTAACCCAACTTAGTAGATGCTATTGCCTTGTAACTTACCTGCCTCAACTAAAATCAAATGCATGCAAAAAACAACTCCAAATAGCACTG:1 + chr2R 18528194 5' - Cr1a 243 1 61.39 CTTAGCAGTTAGCCACGCCTAAACTACACACATACATACATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chrX 8522926 5' + 297 29 2 64.36 CGTGTAGCCAAAATACCTACAAAACTTGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTAGAAGTAGACATCGAGCGGTCAATAACC:1 - chr3L 5664876 5' + F-element 305 1 47.52 AACGATTTACATACACAATCCACGACCCACCTTGTATTTGAAAGCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAAC:1 + chrX 18089265 5' + Doc 333 1 56.44 CGACTGGCTGATAAATCTAATCAGTGTCGTGGCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr2L 17056540 5' + 412 43 2 69.00 GGCTTTAACATCAGCTCCTCCCTGCCAGCTCCTGCCATGGCTACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 - chr2L 4134390 5' + copia 4905 2 58.42 AACTGAAATGGGGAGTGAAGTGGAGGGGAGTAGGAGAGGCGGTCTGTTCGCTCCACGACTTGTG:1 - chr3L 22218897 5' - Doc 414 1 51.56 TTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATTTGTGGCGAGTACTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 + chrX 23439049 5' - I-element 5324 1 56.44 TAATTTGTTTACTTTTCGGCAGAACCAAAAACGAGTGCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chr3R 29333755 5' - hobo 2901 1 63.37 ATAGAAGGGAGGCTGACCAAGGGCTTTTGAAAACATTAATGTGCTGGTGGAATATTTAAGTCTCTTTTGATCTTTTCGTGATGGTTGTCAGAATCTGTGAT:1 - chr3R 4688081 5' - F-element 4333 1 65.35 GAAATCGGGGTCCCTGGGTGTGAATGAAATCTCGCGTTCGCTTTCGCACTAGCTGAGTAGCGGGTATCTGTTAGTCGGGGAACTTGACTATAGCATTCTCT:1 - chr3R 21590651 5' + INE-1 574 1 80.20 ACTTTTCGATGCCAGGAACTGCAGGCAATTTCCTATGAATTTTCCAAATGGCAGAAGTGCAAGCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATCTTACTCGTT:1 - chr3R 8914567 5' - roo 397 1 70.30 ATTTTGATATTATTCTTATATTTGGAAGTTCGGGATTGCGAGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACAATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAGTTGTTT:1 + chr3L 24238883 5' - Idefix 211 2 72.28 TAAATTCAACCCCATCCTTATACCAAATTCGAACTTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 + chr3L 9174661 5' + 412 11 2 68.32 GAGCGCCAGCACTTAGTTTTCGGTCTTTCGTCTCAAATCTGGGTTTGGCAGTCGAACTAGGGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3R 24229171 5' - 1360 3377 1 67.33 TTGACATTTTGTCACTTCATTTGTTACCAGATCTGCTGCTGCGGCCACAGGTTGTCTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTA:1 - 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chr3L 21491617 5' + Q-element 334 2 47.52 GCTTTTCGACAACTCAGAGACTCCGTAGCGAGTGTATTAGAGAGCGCTGCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chrX 10437625 5' - hobo 2913 1 55.45 AATATTTTCTTCGTGTAAAAGTAATGCACTTTACAAAATATCCTTACAGATGAATTACATATTTCTTCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTG:1 + chr3L 8012013 5' + transib2 7 1 70.30 AAGCGGGCGGCGGACACGACCGACATGTTTCCACTGGTATTTTTCTGTTCTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTT:1 + chr2R 17359522 5' - hobo 494 1 59.79 AACGCAGCTTAGCACGACAATAAAATGAAGTGCAGCGCATAAAAAAGCGAAAGCCGCTTGTCACGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAAT:1 + chr3L 15615581 5' + 17.6 68 2 64.36 CTTATTGTACTGCACAAACTTTAGCTCTCTTATTATTCATGCAATCTGACTTTAAACATTTAATAATTTTTTTAGGAAATCAAATTTCCACCTGCAGTAGT:1 + chr2R 15648481 5' - Tc1 25 1 72.28 GCTTTTAAGCGGATTAGTTTTACTTTGCCAGCTGGCCAAGTGTGTTTTTTGTCTGGATGTTGTCGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATG:1 - chr2L 14249267 5' - 1360 33 1 65.35 AAAGCAAAATTTTCAAAAATTTCGAGTTCTTAAATAGCTCTTATCAACAGCGGAAAGAATGCAGACCTCTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCA:1 + chr3R 30746514 5' - HMS-Beagle2 6936 2 54.46 GGTCACAAAGGAGACGAGGGCAATATGGGATTCGGCCACGAGTATTGATTAAAGTCTGTTGTTTGTGAATGCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:1 - chr3R 4524277 5' - mdg1 417 2 74.26 AGTTCCAGTGACTTGTCTGGGCTTGCCCCCCTTGAGGCGTTCTTCGAAAAATTGATGCTGAATCTCAACCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATCTCAACGTT:1 + chr4 439923 5' - INE-1 142 1 61.39 TCATCAACTTGTTTTAACTCTTTTTTACTTAAAAGCAATGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACA:1 - chr3L 26377825 5' - 3S18 301 2 60.40 AGAAACGTCGAAGGCACTCTCCAAGTTTGTCTGCCTTATTTTTAGATCCCCAGCCTTATATGCCCCATTGCCCCACAATCCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 5964714 5' - accord 258 2 73.27 ACTTGAAGTTTATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 + chr2L 3988539 5' + I-element 53 1 66.34 CTGTTTGAACTTCCCGCCTTTTATTTAAACTTCACCATCTTTCGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3L 26132176 5' + Doc 39 1 58.42 GTATGGTGTCTTAGAAGGCGACATAAATTATTGCTTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCANCGGCAAGATATCTG:1 - chr2R 10777867 5' + pogo 32 1 65.96 GATGAAATGATGCATACAGTTGAAATATGAAATTAAATAGGTACCCAGCAATACAGATCAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr3R 29920611 5' + opus 7022 2 41.58 TTAAATTCACCAACAGCTACAACAAATTGGGCTGGCAAACAAGTGTGCCTGTGTGCGTTTGTGTTCCGCTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 - chr3R 18449025 5' - hobo 2929 1 67.33 TTCGGAGTGGTTTGCGTTTTGTCTTTGCCGGCTGAGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTC:1 + chr2L 777500 5' - Porto1 4413 1 65.35 TTCTCCATTTTTGTTTGGGCCAAGTAAGATAATCGAGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chrX 15259034 5' - roo 9032 1 71.29 TGAATTATAAATTTTAAAAGAAAAAATTGTCAGATGAGACACAAATTAGAATTAAACATAACAAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAACTTTAAAATTATA:1 + chr2L 22562007 5' + 1360 3018 1 78.22 TTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr2R 17345948 5' - hobo 2902 1 62.38 GAAGAATTGCTCGATTGATAAGGTAAAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATAT:1 + chr2R 3293738 5' - 1731 4600 1 51.49 CCAAAGTGCATTAAAACTAACAAAAAATCCTTTTCTCTGTCATTGCAGGTGAGTGCAGATTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTT:1 - chrX 21259576 5' - BS 4823 1 61.39 GGTGCTTGTTCGAATTGGGGGTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATG:1 + chr2R 21935515 5' - I-element 5045 1 81.19 CGATAAAATGCTATTTTAGATCCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:2 + chr3L 18034193 5' + Doc 59 1 75.25 TGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGC:1 - chrX 20999584 5' + BS 19 1 51.49 TGATTGATGTATGGACGTGTTAATTAGGTCCACTCGTGCCGCATTTACACTCCACTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chr2L 17283539 5' - hobo 2916 1 56.44 CGAAGCGGGAGCCCCGGCGACCAGCATTTTACGTATATTGACAAGTTATTAAAGTGATAGCCGAGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACACCCGAATT:1 + chr3L 15452694 5' + rooA 326 2 68.00 AAGTTAAACTCCTAAAGATACCCGTTAGCAAAGTAAAGGTATAATGAACATATATCCAAATTTTTATTTATTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATAT:1 - chr3L 4267247 5' - Juan 4199 1 60.40 TCTTTAAATTAGGGCCAATCTAGAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCA:2 - chr3L 18698328 5' - Idefix 7039 2 77.23 TAATCAAAACTAAGACAAAAATGCGGTATTTTATGTAATCTAGGTTTTATTGTAGCAACCTTTAGACATAGATCAACTGTGTAAAGAAAGATCACCTTGG:1 + chr3L 14282518 5' - I-element 5021 1 73.00 TGATCAATGGCGAGGGTATCAATGTGGAGCCGGTGGACAGATCTACTAGGGTGACCCTAATTCTTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAA:1 + chrX 13883722 5' + mdg1 7177 2 45.54 GACGTCGACGTCGCTGCCCGTTTGTCGTAATGTGTTACGTCAAAGCGACCGCACACCATTATAAATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAG:1 - chr2R 16160305 5' + gypsy 6997 2 69.00 TGTATATACCCAAACATTCATTTCGTGTGCTCAGCAACCACAAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAA:1 + chr3R 14466538 5' + I-element 107 1 58.42 TAATTGTAATTAGTCCTTATAAAAGAAGGCGAGCACGGGAACTTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACT:1 - chr2L 3770638 5' + micropia 5341 2 57.43 AATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 - chrX 21945926 5' + F-element 45 1 61.39 AAGGTTATAAATTTTGGTTAAGGTTTTAGACAATATTTATTTGTGTATGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACGC:1 + chrX 22576299 5' - Burdock 159 2 46.53 CATGGGAAGTCTTCTGGTGCGCTTCGTCACTACGAGGACTGCCGTTCATAGTGATACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr4 1234509 5' - 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roo 9044 1 54.46 GCATGTAAGCTCCCATCCGACCGCCTACCTCCTCATCCCTCCATCCCCGAGTGCCATTGTCGTCCACATCAATCACACGTACCAAAGACACTAGAATAACA:1 - chr3L 21852595 5' + Tc3 240 1 82.18 TAACAGCTGTTTTTCTTCGTGCTCTTGACCAGTGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCTAGTGACTTTAGCAAGCCCCGTACTCTGTGGTGTCCA:1 - chr3L 10679891 5' - baggins 4962 1 69.31 GGACATATATCACTCACGGTGCAACTGACCACGCCCCCAGTGGCGCCCACCACCTTCTGTTGTCACATCTGCAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chrX 8354456 5' + jockey 11 1 75.25 TTTCAGTATTGAAATATTTCCATTAAATCAGTTTCTCACTCCTCAAACCTTGTCATATTTCCACTCAACTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACT:1 + chr3L 3635391 5' - roo 9064 1 71.29 TGTCCTGCTACTGTGTCTGTTGCGTTGAGTGTGGATCAGCAATTGGCTGTTGTCAGTGAAGTAAGTGTTTTTTTTTTTACTTTGCTG:1 - chrX 11960276 5' - TAHRE 10437 1 64.37 GTCTTCTGGTGCGCTTCGTCACTACGAGGACTGCCGTTCATAGTGATACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr4 1234517 5' - 412 7519 2 51.00 ATTGTTTGTCCTAGGAATTCGCATTTCCATTACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCT:1 - chr2L 2048524 5' + mdg3 5387 2 70.30 CAGTCAAGCTCTTCCTTCGTAACACAGACAATGGGCTCGGCGAAACCAAATTCACTACAATACAACAATAGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 - chr3L 25310233 5' - blood 7352 2 74.26 GTAGGAAGGCAACCCACAAGAATGAAGAGTAATTCTAATCCAACGGGAGCTGGACGCGACGAAAAATGAGTCATTTTGCAGTCAACTGCAGCCCGCATACA:1 + chr2L 22760282 5' + hobo 2713 1 66.34 GCTAGGATCGGAAAACTTGATCGGGATACGGGAAGGAGCTAAGCGGCATAGACTAGTATCTTTTCAATATTTCTATATTAGAGTTGCTAGATGTTCCCCAC:1 + chrX 9179170 5' - G3 4216 1 57.43 AAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAA:1 + chr2R 3293763 5' - 1731 263 2 74.26 CGCTCGCCACACTCCACCCACTCGAAAAACCTGGCCAAAAACCACGCACACACATGCACAGGCCATGGGTGGAGGAGATCCCCAGCAGCAGCAACAGCAGC:1 - chr2R 14356990 5' + TART-B 152 2 67.33 GTAGCCAGGATCCGACCCCGTACCAACCCCTGTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chrX 409601 5' - P-element 2842 1 35.64 TTTAATTATTTAGTATATTTTTTAAGTCATTTGACTTAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGAACCTCGTGCTTCAAGATATGACC:1 + chr3R 6343939 5' + 1360 481 1 54.08 TATATAAAGCTGACACGAGAGCGAACCAAAAGTACAATGCAACCAAATAGCGAAACAATACGACTTCGACTAGGCACAACAAACATAACCCACCAACACT:1 + chrX 20494837 5' + I-element 4962 1 47.00 ACGTTGTACATTGCTGGTAAAAACGCGGCCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1 - 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hobo 2925 1 61.39 TGGGGACCATGACACTCACCTGGAAAGAAATAGAAAAGCAAAAGAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAA:1 - chrX 5140131 5' + Porto1 240 1 62.38 CTTACCCCCATAGACACAAATTATCTTAACGTTCTTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 - chr2R 8474976 5' - Transpac 272 2 69.31 CCGAACTTGGGCTTACCCCTAACCACATGACAGTTGTCATTCGACCCGTGCCGAGAGTCTGCCAGGCTGGCCCAGTCGCTAACGGAGAGTCCGGGCAAGTG:1 - chr3L 14723208 5' + baggins 289 1 66.34 AGATCGGCCACGTTATAACGACTTTTTCCAGTATACTACTTTTAATTAATTTACCTTAACTTTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTATTTATTTGTAA:1 + chr3L 14477862 5' + Cr1a 4032 1 79.21 TTCAGGTGCGCTAACTTAGACACAGCGATTAATGCATATATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAAC:1 + chr3L 15452848 5' + accord 14 2 63.37 TTTAATTTCCTTCGCATTAAAGATGAAGATGTATCTCTTTTCTGGTTCAAATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chrX 21668229 5' - 412 7523 2 55.45 TATATTCAGTTGGTGCTTTATAATGTCTTGAACATCTTGCCGGAGTGCAACGTCGTACTATCGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGCAGGGCTTCCTT:1 + chr3L 22836798 5' - Gypsy6A_LTR 345 1 57.43 GAGAAATTATCGTATTATTAATGTTAATAATAATTATTAAAGAATATGCTAAAAACGTTTATTTGCGATTTAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCAT:1 + chrX 12151584 5' - diver 211 1 65.35 AAACAAAATGCTGCTAGCGTCACACAATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 - chr3R 27435073 5' - jockey 4944 1 77.08 GCCTGCTCGTAGGTAGGAGGAGCTATAGAAAAAATGACATTATATTCATTCATCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCTAGCCGTA:1 - chr3R 7792879 5' + Cr1a 4381 1 64.36 ATGCCCCACTAATTAGTTGTTGTTTAAATACCCGTACGCATACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGA:1 - chr2L 1380460 5' + accord 304 2 59.41 ATATTTGTGGTATTTATTTATAGACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chrX 12818875 5' - roo 357 2 75.25 CAGAAAGGCAACAAAACATTTGCATTTATTATGGCGAACAGTAAAATCAGTCAACTGTTTTTGATATGTTTGTGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr2L 10687782 5' - hobo 2935 1 73.27 AATATAAATACAAATTCAAATATATAATATATTTGGGTATTAATTTAAAGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2R 12370640 5' - roo 9046 1 57.43 TACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGAAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 + chr2R 17345960 5' - hobo 2918 1 61.64 TGCATGTCGGATGTGTTTGGCAATGTGAATGTGGGGCCCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3L 5490069 5' + 297 31 2 62.38 ATAGCCTGAAATCTAATTACAGAATATTATTGGTGGTATTAAAACTATGTATATTAATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr2R 8271427 5' - pogo 2083 1 61.39 TAAACAATTTCTGAAACTAACACATTTCCTCGGGAGTTTATTGTCAATTTCTCGCATCCTCTATGGACCTATGGCTCCGAGCTATGGGGCAACGCATCGAG:1 - chr3L 3494079 5' + Doc3-element 4337 1 62.38 ATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGG:1 + chrX 21772495 5' - gypsy3 6545 1 69.31 CTAGCGGCCACTTTCAGCTTTTTGGGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGTTTGATATGTGGGCGAATGGGAGGTTGGAGTTGTTTTTGTTT:1 + chr3R 23543105 5' - Porto1 261 1 78.22 TAATGTTTCGTTCAATGTTGACAAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCAACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCC:1 + chr2R 4501476 5' + G-element 55 1 72.28 CATACACACACACACACACACACATACACACTCACAACCACACGCTCACATGAGATACACCTGAGTAACACACACACACATATACATAACCACATAGCAAC:1 + chrX 7978949 5' + Quasimodo 51 2 78.22 GAGCGGCGCTATCCGAAAATAAAGGGCATACAAATGCCCTTCCATCGATAAATCCGTATCTGGATCGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATT:1 - 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chr3L 25485330 5' - mariner2 617 1 75.25 AGCTTGGTTACGTTCCTCGGAGGTCAGTTCGGTTTTACGGTGATTTTTCCGCCTGCGTGGATCCTCTCCAGTTGGTCACTTCAGCTATAGTCACCGATCGT:1 + chr3L 196691 5' + Chouto 238 1 72.28 AACCCAATGGCTAGGACCCCCGCCGCCCACTGCCACGCCCGCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTT:1 + chrX 11025487 5' - I-element 315 1 59.00 GTTAAACAAGGAGGGTCTTCCTTACATCCTAATAGGATTCATATACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:2 + chrX 3195623 5' - mdg1 390 2 56.44 TTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTAATTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATT:1 - chr3R 26830636 5' - 1360 442 1 57.43 ACCTGGTCGCCACTAGAGAGTCCTTTTCCGGCGGCCAGAACAAAAGTGCAAGATCTGACCAAGCTGGCCGTGTATCGTACTGCTCGATTCGCGAGAAGATA:1 - chr3R 13079852 5' - Cr1a 4379 1 66.34 GGTTTCTGGTAGCCCAAGAATCTGAAGAGTGCACTTCTAGGCTGTTCTAACCGAAGCTCTATAGGCTGCTTTTCCTCTCCTTCTTCTTTTTTTT:1 - chrX 12250604 5' + hopper 1175 1 80.85 ATTAATATTGAGGCACAATGACTTGCACTTCAGTGGCGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTG:1 - 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F-element 4420 1 54.46 GAATTTTCCAAATGGCAGAAGTGCAAGCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATCTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3R 8914531 5' - roo 361 2 66.34 TTACGAAAAGAAAATTCTCGCTTTGTGGAGATTATGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTTAGTTATTATCACTAGCCTTGTGGCGATAGCGATTTAATTG:1 - chr2L 22208350 5' - gypsy 312 2 71.29 TGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGGTTTTAGTGAAGCAAATAGTTAATCACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGTAAGAGAA:1 - chr2R 2092779 5' + Doc3-element 95 2 69.00 CAATCAAAAGAAAGAGAGAGTGGGCTACTTAGGGGTGGTGCGAAAGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTG:1 + chr3R 14025348 5' + P-element 119 1 51.49 CAGGTCAATACATATTGATATGCCATCGCCAACCTCATCGCTATCGGTATATGTATTAATTGGCTTCCTCCGATTTTGTATACTAGCTCCTCTCTTCTTTT:1 + chr2R 9665944 5' + Gypsy12A_LTR 2086 1 55.45 CAGATCCAATGCGTATTCCTGTTGCTGTCTTAGCAAATGCTGAATTCCCGGATAGTCCACAAAGATGGGTGCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chrX 7769010 5' - hobo 2935 1 76.24 TGCAGTTTAAAATTTCGTTGTTCTTAGTGGTCTGCTAGTTGTTAATTGGAATACTGCACATTAAACGGTCCTCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGG:1 + chr3R 13429124 5' + HMS-Beagle2 6917 2 78.22 CTCGGCAGCCAGCGCCCAGTTTTAGGCGTTTGGGCAGGGCAGATCTGCAGTAAATACTGAGTAAAGCAGCGGGTCTAGTACGCTGCCCTGCGGAACTCCAG:1 + chrX 10637788 5' - 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mariner2 570 1 62.38 GAAGTAAATAATGTGTTAGGCGTATATATATATTAATTAAGATAATTTCCATTAAAGGACGCAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGT:1 + chr3L 12932586 5' + roo 387 2 66.34 GTTGCCCGGCTCCATTTTCGGCTAAAAGGAATGCAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTT:1 + chr3R 7389720 5' - mdg3 5380 2 66.34 TTTAAAAACAAATCCTCCTGTATTTGCTGATAAGTTTATTTTTAACAAATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACC:1 + chr2L 15957784 5' - Quasimodo 7100 2 52.48 TCCTCGTCGGACTCCTCCTTCTTGCTCTTCTTCGCCACCTTTTTCGCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACA:1 - chr2R 21715837 5' + F-element 410 1 54.46 AAGCGAACTGAAAACCAAACGAACCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr2L 9437476 5' - P-element 2837 1 30.00 GCCAGCTGTTTATATTGCAAAATGTCAAGGACTCGCCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 - chr3L 9174767 5' - 412 7530 2 62.38 ATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 + chr2R 17345959 5' - hobo 2891 1 73.27 GGAATACTTAATACAGATAAAATGGTATATAAGTAAGACACTTTTCCGATCGACGTCAGCAGTAAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCT:1 - chr3R 4690026 5' - invader4 2979 2 57.43 CCTGTTTCTGCTTTTGATTGTGGTCTGGAGTTCCGTTTTTCGCTATTATATGATGGTTGGGCTTGGGCTTGAATTTTGCACCTAAACTTCGATATTAACTG:1 - chr3R 11401890 5' - Porto1 44 1 64.36 ATACTCTACATCCGACTACATTAAGTATATTTTCCGGCACAAAAACATTGCAATGACTGAAACTCTTGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3L 3986361 5' + jockey 12 1 69.15 AGTTCAGGCCCGAACCGCCCCTGTGCGCATGTCGAGCGACCTACACACAAAAAGCACTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - chr2R 10158744 5' + P-element 18 1 60.40 TAATGAAATATTTCAAGTTGCCAACTCGCATATAACCGATGTGTGTATCTGCATTTGCATGAGCACCTATATCTCGGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGG:1 + chr3L 9120407 5' - Tirant 400 1 26.73 CAAGAATCCAATAACCAAGCCCAGTAACAAATTACCCAAACCAAATTATCGACCACCACCTGTGATGGTAACCAGCGGTACAATTCACCACCCCTCCCTCT:1 - chrX 17086887 5' + ZAM 19 2 77.23 AGCTTATTTATGGCTGCTTGGTTGTAAATGAAAATAACAAGCTCCGTTAAATGCTTAAATGCAATAAATAGTTTTTATTTTTCAAGTCGAACAAATGATCC:1 + chr2R 20169693 5' - McClintock 6348 2 69.31 ATTACCGTCTGCTGCCGTCCTCTCATCTATTCAATGTTTGTAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTGTAATTTATATT:1 + chr2L 4134329 5' - copia 254 1 55.45 AGCCTCAAATTAAAATTCGAGCAGCGTCAACAAAACTATTAAAAAAAAAGCTGCAAAAACGCACAAATAAACTACTTAAACATAGAAAAAGTCAACGAAAC:1 + chr2L 17749373 5' + Porto1 4408 1 71.29 AGGCATATTGATTACGTTTGATCACTTACAAAGCATAAGTTTATATTTTAGAGAATGAAAAAGCAGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAAC:1 - chr3R 13108944 5' + mdg1 7403 2 70.30 CAAAGTCTCAATCCCCAGCAGCAAACTCCGAAAGACAACTTCCACATAATACCTCAAAAAAAGGGCACCATCCACGAAACTAAGGTCCAAGTAAAAACCGA:1 - chr3R 19724844 5' + Fw3 99 1 62.38 AACCCAATCTTTCCAGCCAAACGTTCGCGGGCAAAAACATCTGGATAGTGTGTTCGTTCAAACTCTAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCT:1 - chr4 717696 5' + jockey 4853 1 67.33 CGAAAACATGATTGAAGGGCGGTGATGTGATAGCTATGATGTCTGTGATGGAGTGGGCGGTGGTTGGCTGGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAA:1 + chr2L 3379400 5' + flea 4812 2 74.00 GTGAAGCGCACTACAGAATGTGAGACATTAGAAATGGTGTTATACGAGTCAGAAGTTTCGTGTGGTATGACAAAAAACAGTTTTTATTGTTATTGCAGCAC:1 - chr3L 26695670 5' - looper1 1610 1 57.43 ACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCA:1 - chr3R 1977612 5' - micropia 5401 2 62.38 GCAATTTCAGTTGCAGATACAAATACAAATACTAAAGAGAATTCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAAC:1 + chr2L 5223356 5' - INE-1 530 1 65.35 CGATAGATTCCCCGCATACTTTTTGCGCCCTCTCATCACTCACCTCTTACCTATCGCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCG:1 - chrX 5639473 5' - jockey 386 1 58.42 TTTTATGTTGAGGCTGGCGTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAAAAAACAGATCTAATGGATATT:1 - chr3L 19338734 5' - Tc1 1507 1 80.20 TTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTATTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTG:1 - chr3L 19274859 5' - transib2 2777 1 71.29 GCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAA:1 - chr3L 20711665 5' + jockey 4722 1 73.27 TTTCCAAAGACTTGGGTCAGAGTGTCAAACTGGCCAAATGTGAGACTGAAACCACTTAGACGACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCAATCTTTAGTTAATT:1 + chr2L 7746526 5' + Gypsy6A_LTR 399 1 65.35 GTTGGCCAAAAACTGGGCATCCAAACGGAAACCCAGAACGCCGAAAAACAGAACGCAGGAAACATAACCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTG:1 + chrX 2564900 5' + jockey 4771 1 67.33 ATTTACAATTATCTATAATTATTTCTAGTTCACTGGTATACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGC:1 - chr3R 9582900 5' - F-element 4563 1 61.39 TTTATTAGGAAATCCCCATCCTTTAGTCGCGTCGGAACAGATATAACTCTTTTCGATTCGGCTTCTATTTGTAGGGGTACTATATATCCTCTTAGTTAACT:1 + chr3R 2819268 5' - invader2 5093 2 56.44 CAGTCGCAATCGAAGTTGTCGTATTCTCAGCCTGTTTATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 + chr3L 14260345 5' + 297 54 2 49.50 ACATTTCACCTGGGTTGAGGCCCATTTAAATGCAAAAATCTTCTGCTTTCCAAGGAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 10979792 5' - roo 401 1 60.40 AATTCAATTATGCATGCCATTTAATGTGTCAGGCTTGTGTGTTCCTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTG:1 + chr2R 18316464 5' - accord 7038 2 68.32 CACACATCCGAATGCAAATGACTACCCGAAAAGTATAATTTGATATACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 20369746 5' + pogo 29 1 58.42 AAAGAGCACTAGAATGGCAAACTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chr3R 14832515 5' + hobo 54 1 78.22 GCGTGGCTCAATATCCGCTCGACGTGAGCTTGTTGCTCTTACTACAGTGCTCCTGCTGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGG:1 + chr3R 17241490 5' - 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chr3R 28512700 5' + Doc 4577 1 68.32 GGTGGTATTTCTCAGCCATTCCATTCGAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGA:1 + chrX 8234304 5' - Quasimodo 162 2 73.27 TTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGCATTTTACGACTTGCGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGCCTTTATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1 + chrX 10824004 5' + jockey 4676 1 72.28 AATAAAAGCCAAAGCCTATCTACAGCAAAGCTGATTAAATAAAATATATTGTCTGACATAAACACAGTCATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTT:1 - chr2R 8185260 5' + 297 389 2 70.30 CCTCTCTCTCGGGAAGTTCATTTCCCCGAACTCTCTCTGGATTCGGCAGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 + chr3R 15666039 5' + P-element 28 1 52.48 TGTCCAATTAAGCATTTATTTTGCGACATTTAATTAGGCGAGATAGAGCGCTTAGTAGCTGACTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3L 3635505 5' + roo 8675 2 70.30 AAATTATGCTACTTTACTGTGACATCACTTCAGCTCTTTACTAAGCAAGCGAAAACTCTTATCCATTTCCATTTTGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAA:1 - chr2R 5154834 5' + F-element 13 1 70.30 AAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:3 + chr2R 19209484 5' + Doc 82 1 66.34 TGTTTATATTATTTCTTATAAAAAAAACTTTAAAATACTTATAAGTTTCACTATTTAGGGTAGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTG:1 + chr2L 17193849 5' - hobo 11 1 47.52 GGTACCGGCAAGAATTCGTACAGCGTGGTGGAGGATGCCGATGGAGATGACGATGAAGATTACCTGCGTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCCCCTGCT:1 + chr3L 17655513 5' + F-element 360 1 71.29 GATTGCGCAATCTCTTCTTTTTATCCCCTGAGCAAAGGACACGGTCTGCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr2R 5201002 5' - 1360 3359 1 55.45 GGCAAGACCTTGGGCAGCGCGGTTTCCAGGGAGATAAATGCTGGAAAGGATGTCCCTGAAAACCGGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCAT:1 - chrX 2564341 5' + jockey 4800 1 64.36 AAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATCG:1 - chr2R 2092794 5' + Doc3-element 81 1 54.46 GAAGGCGGCCCTCGAAAGTATGCAACAACATTGCGTATAATTAAACGCACGCATGCCTTCTTTTCATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3L 10035696 5' + jockey 36 1 67.37 CTAGTCGTTATTTTAAAAATATTATCATTTTGGTATGGTATGTTTACATTTTATAAATAAAATTATTTTACAAAAAACATTGACATTTAAGACTAACATTG:1 - chr3R 27416238 5' - TAHRE 10145 1 74.26 AGCAAACCCCTCTTCTAGCTACCAAAACCAACCAACAGAACACTTTCTACTGTAATTTCATACATTTTCCAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr3R 10582816 5' - 1360 3362 1 57.43 GTGTATGCAAAATAAGAAGTAGTCTACATAATTGTAATGGTTACGAAGTAACTGTCTGTAGTTCTTTTTAAAAAATTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACA:1 + chr2L 16382806 5' - hopper 1016 1 73.27 TAATCGAAAAGGAAAATAAAACTTCGTGTGGATTATGCAATTTCCATAACTCTGTTTTTGTGTGTGTGTAAGGATATGGGTTTTTTGGTTTTTTTTTTCTT:1 + chr3L 9164479 5' - gypsy7 5014 3 60.40 TTGCCCTCGTTAGATGCAATAAGAAGGGTTTTCCGCAGAAGAAGGAAATAAAAGTTCAAAGTTCTCAATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr3R 7883101 5' - roo 404 1 74.26 CGTGTAGTTCAATAGAGTTAGGTTTTGGTAACATAATGACGTGCAAGTGCAAATAAAACAAAAGAAACAAACAAAATCAAGTACAAATTGATTCACAGGCG:1 - chr2L 22143329 5' - accord2 7230 1 76.24 GGTTGGGTCCAACTCTTATAGGCAACTAAATCCATATTGTCAGGTTAAATCTAATCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTGATTTGTGTGTTTTTTG:1 - chr2R 19690788 5' - Porto1 4446 1 56.44 CATATACTATAGAAGAAGGCAACGCGGAGAATGAGGGACTCGTGCCTGTTTTTCTCTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 - chr3R 28373832 5' + jockey 4780 1 54.46 AATATGGCCAGTCTTAAAGATGAAGATCAGGCGGCAACTACAAGCAACTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAG:1 - chr3L 15093213 5' + F-element 316 1 53.47 ACTAGCGGTATAAATAACATTAATGTGACAGCAGAACATACTTAAACCAAAGACACTAGAATAACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTA:1 + chr3L 21714990 5' + 1360 496 1 44.55 TGCTGCTCGCAAGTGGTGCTCCGTAATGCTGGACGCGGATCGGGCGAGCTCCTGCCTCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - chr2L 852907 5' + P-element 18 1 59.41 GATAAAATGCTATTTTAGATCCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 + chr3L 18034194 5' + Doc 60 1 76.24 GTCATTGGAAAACTGAAATTTAAAAGATAATTTAAACATTAATATGAGTTTCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr2L 17887137 5' - hobo 2914 1 54.46 AGATGATGGGCCGCATTGGGCGTGATAAAAGTGGCGGTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTT:1 + chrX 22584745 5' - jockey 122 1 63.37 CCGCACTGTTCACAGCTATTAGACACTGTTTTATGTTACACAATTGTTTACTATTCCTCATTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTA:1 - chr2L 12485760 5' - Bica 179 1 58.42 GGGTTAGCCTAAATTATGGCCGGCAATTAAGCTGGCCGATATGAGCTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAAT:1 + chr3R 21792566 5' + I-element 4981 1 55.45 ATATTGCAAAATGTCAAGGACTCGCCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr3L 9174756 5' - 412 466 2 54.46 ATAGCTACTGTGCTATGCTGTTTATTGTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCA:1 + chr3R 3617219 5' + 1360 3161 1 79.21 GTTTGGTCCGTGTCCCGCGGGCGGACGAGTATATCGCACTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGC:1 + chr3R 20486350 5' - accord 498 2 63.37 AGTTGACAGTCTGGCCGGGGGATGACAAATGCCCTTGGGCCATTGGGCTATTGGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr3R 20170442 5' + hobo 23 1 54.46 CTACAAATTGTATTAGCTTGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAA:1 - chr2R 9323499 5' - jockey 137 1 81.19 CGTGATGAAGAGTTCATCTCTGCAGTGCAATATGTATTTATGGCTTAGATAAACGATTGATTAGGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 11625534 5' - roo 396 1 68.32 AAATGCAGCGCCAGCAATTTTCCACTTTAACCGTTCGTTGGCGTTAATGGCAGCGGAGACTATACAGACCTCTGGTCAGCATTTTGAGCACTTGTGTTTAC:1 + chr3R 12116885 5' - HMS-Beagle2 56 2 76.24 CCAACAGCTACAACAAATTGGGCTGGCAAACAAGTGTGCCTGTGTGCGTTTGTGTTCCGCTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3R 18449016 5' - hobo 2921 1 59.00 CGAGAAATATTTTCATGCAGGACCGCAGGCGTTGCTTGCTACATTACGGCACAGGCGGACAGACGGACATGGCTAGA:1 + chr3L 24790152 5' - INE-1 116 1 68.83 CAACGAAGTAAACAAAAAAATGACTTTACTCATAAATAAACCGAAAACGAATTACAAGCTAGAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGAAG:1 - chrY 97682 5' + I-element 433 1 60.00 GGCTGTTTGCATTATGCAAGCATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTT:1 - chr2L 5659470 5' - jockey 4936 1 82.18 AACAGCACTTTAATAACTTCCACAAGATTGCATCAAAGGCAGCGATGTACCGTGGAGAGATTATGCTATCTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTC:1 - chr3L 22975895 5' - G5A 2690 1 56.44 AAGAGAAGAAAAAATTAGTTTAATGGTGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCTTACATTGGTTTGGCGCTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3R 7570353 5' - 1360 3343 1 75.25 CCCAGGGGGACAAGTAACCCAATTCCTGGTCTTAAAGGGTGCGAAACAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr2R 10345603 5' + roo 29 2 54.46 AGCCCGAATAAATTTGTTTACTTTTCGGCAGAACCAAAAACGAGTGCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr3R 29333764 5' - hobo 2911 1 54.00 TGCCTTGTCAACAAATTGTTATTCAAGAGCCGTCAGTGATCCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1 + chr2R 2645464 5' + HMS-Beagle2 6913 2 60.40 ACGTATTCCATGATGAAACATATGCATAAAGATTTCATATTTAAGCCCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr2L 14886444 5' + jockey 37 1 54.46 CCGCCACTCCGGACATTGTGCAGAAAATTCTGCGGGCCAAGTGGCGACCGAGAAGATCAACAGGGAAACTTTATAGATCAAGTTTTCTTACTAGAAGGTAA:1 - chr3R 25476456 5' - Q-element 348 2 54.46 CTTGCAACGCATTCAAATTAATTGGGCAAATCACTTATAGAAGTGAATAATCACACGCACCTCTTGTCACATTTACGCTTAATAGGCGTAGCTGTCCCCCA:1 - chr3R 1027854 5' + Doc4-element 2364 1 63.37 CGCAACAGGGAAAATGAAATGAAAAACGCCAAAAAAATTGATTTAAAGTGAATCAGTGTGCGTGTGTGTGTGTGAGCTTTTCGAACAGCTGAGAGAAGCTT:1 - chrX 17789710 5' + R1A1-element 211 1 74.26 GCATTATTGCATTCCCGCAACGTTGTTGCTTTTTTCCCATTCGACAGATGGGTTTTAGTTTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCT:1 - chr3R 26488552 5' - flea 4575 1 72.73 AAAAAGCTGGCCTATCTGCCCTCGAACAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAA:1 + chrX 12512917 5' + F-element 405 1 74.26 CCACCATATAAAGCCATATGATATCTGTATATGTTATATATTTTTGCTTGCTCAAAAACAGATCCACACACTTACACTCTCATCAAAAAACTTTCCAAAAA:1 - chr2R 10525259 5' + Ivk 345 1 75.25 AAAAATCACGTTCCCTGATAAAAAAAAAATTGCAAGTAAAAAGAGGAATTGCCAGTTTGTTTCATATTTGATATGAAATATTTGATATATTTCAGATATTT:1 + chr3L 8080103 5' - Bari1 458 1 66.34 CTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:2 - chr2L 7971038 5' + blood 7052 2 63.37 CGCGGGTAAGAAATAAATAACGTTAAGGACAGTGAAAAAAAATTTAAACAAATAGCGACTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGAAAATTTCGACAAGA:1 - chr2R 25104805 5' + invader2 4805 1 70.30 CCATTGTCAAGTTTGTAAATCACATTTATTTGAAGATATACTCTTTTTTATATTAAGCAATTAAGCCTTCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTG:1 + chr2R 12753019 5' + Juan 13 1 57.43 CCCTTTAATTACGTACTCATTCTCGGCCTCGGTTATGTAGAACTGTGAAACGACTTTGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACC:1 + chr2R 7364296 5' + mdg1 94 2 74.26 TATATTACTTTTCCTGCTGAAACTTTTTCCTGATATTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGG:1 + chr3L 15203224 5' - I-element 67 1 65.35 GATGTAGATCCCAGGGGGACAAGTAACCCAATTCCTGGTCTTAAAGGGTGCGAAACAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2R 10345594 5' + roo 20 2 59.41 TTACAGTTATTCCAGTTGTTCCTTTTCCTTCTCTTTCTGCTGTTGTTGTTGTTGTTGCTATGGGGTCGTCGTAGAAATAACTTAAAATATAAATGATAAAA:1 - chr3R 16274728 5' + copia 5058 2 71.29 CAATAAAGGTTATATTATAGAGAGTTAAAAAGAAGTAGCATTCTTGTAGTGTTCCCCTTTTATAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAA:1 + chr3L 5252912 5' + hobo 2498 1 65.35 TCCTACGCCGCCGCCGCTCCCGTTCTGGCCACATCCTAGTTAATCCCATCTCCCATCGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCCAGCGATCTCCCTACCCGGAGG:1 - chr3L 16305416 5' + G5 4656 1 66.34 AGTCGAGTGTCCCTCGATGTCCTCCGTGATCCTTCGTCTCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:2 + chr3R 10978701 5' - roo 9036 1 61.39 TTTCAGACTGTACAAAAGGCATAAATTTGCAGTCCCCTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chr3R 9081941 5' - hopper 1376 1 62.38 AATTAAATTAAATTAAATTGCCGTAGCAATATAAGGCGCCTTGTGGCAACTTGTGCTGCGTCTGTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTA:1 + chr3R 7739991 5' - INE-1 171 1 53.47 GACGAATTGAAAATGCTCATGTTCTGCAATGCTCCCTATCATTCCGACCTTTTATTGAGCCGCGCTATGTCCTGGTTGGTTGCATGTTCAGATTTATACTG:1 - chr2R 18358273 5' - hobo 104 1 56.44 TGTGATGGTTCCGAATCAGCCCAAGTTGGCGATTCGGTTTTTGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGA:1 - chrX 7221764 5' - opus 7143 4 58.42 CTTTTTTTTTGTTTTGCTCCCATTGCCCACATTTTCAGATATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTA:1 - chr3L 13264955 5' - Burdock 6358 2 60.40 TTTTCACTATATTTGTTTGATCAAAAGTTAGCAAGTTAGTTATTTATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTG:1 - chr2R 19244574 5' + Burdock 28 2 56.44 ACTAGATGAAAGATGAGGTTTTTGTCACCAGAATTGGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGCGTATGG:1 + chrX 7611846 5' - Quasimodo 75 2 77.23 TGGTGTTTGGTTGTTTGGATGTTAGCTGGTGGCACACTTTTGGCTGAATGGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr3R 23080903 5' - 412 7519 2 52.48 TTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATT:1 + chr2L 15019906 5' - BS 5044 1 72.28 TTTTTTTTGTGCGGCGTTGCCACTCGATGATCTTAGTATTTCCGCAGTGTGACCCGTCATGTGGCGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAA:1 - chr3L 25479164 5' + Cr1a 4080 1 68.00 CAAGAGTTTCATCCTGACTAAAAATTTAAAAGTACATAGTACGGTTTCAAATAAGCCCAAAATGAGTTAGGAATAACAGATTTGTTGTAATTTATAATTTA:2 - chr3R 6425937 5' - copia 258 1 77.23 GGATCCGGGTTGCTACAGGATTCTGGGGCGACGGGTGAATTAATTTAAAAAGTTGAACTTAATGCCGATGGGTGGGTGAGACATTTATTTATGCAATGCAA:1 + chrX 3040868 5' - blood 7070 2 44.55 TTGGGTTTCGGAGTCTAGAAGTAGACAGATGTATATAGTTAAATAGTTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCAGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAA:1 + chrY 425005 5' - McClintock 6388 2 69.31 CTGAATATGAGGGTAAGGAGCTTTTCAGCTACGTTCTGGTTGTGTAATTTTCTTTCGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chr2L 13314064 5' + jockey 26 1 53.54 GCTCCCTTTATCATTTTTCCTGTTGGTTGGGTGAGCCCGGTTGTCTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATG:1 + chr3L 22964118 5' + roo 8655 1 56.44 AATTAGTTGGAGCACGGCAAGTTATGTTTGCATGTGACCCGGGGCGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACG:1 + chr2L 5880800 5' - Doc 421 1 63.37 CAGTTATAACTATAAATGCGGCATGATTGTTGTGGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTT:1 + chr2L 1190729 5' - I-element 490 1 71.29 AATTTAAAAGTACATAGTACGGTTTCAAATAAGCCCAAAATGAGTTAGGAATAACAGATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 - chr3R 6425915 5' - copia 236 1 57.43 TGACAGATTCCAAGGAGCACGGAGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATAACGTTGTGTCCCCGCTCCCAAGCCCCCCTGTTCGCC:1 + chr2L 13742136 5' - Rt1b 4730 1 75.25 GAGTGACAAGCCTTTGTTAGCAATTAACATTTGACGGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr3L 12724191 5' - roo 9030 1 64.36 TGACTGTATGGCAGCGCTCTTGCTGCCAATACAATACGACGACAAAATCGGTTGTTTTTAGTGAAGTGAATGGTTATTAATATAATACAAACAAATAAATC:1 - chr2R 4023386 5' + Doc2-element 86 1 57.43 GAGTCCGAGAATTCGGTCGTGGCTCATGACCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 - chr2L 16396622 5' - 412 447 2 72.28 ATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTAGTACAGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGAGTAAAAAAAC:1 + chr2L 15833019 5' - hobo 2809 1 59.41 AAACGACAACGGACGAGGGGCGTAGAGCCCAGAAATTGACAGACCTCGTGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr2L 16396563 5' + 412 28 2 52.48 CAGTTCATATAAAACCATTACGGATCCAATAGTATCGGTAATGAAAGACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chrX 4056261 5' + roo 8692 2 54.46 TAATTTTAAATCATATTTACTAACGAAAGGCAGGCTAAAATTTCAGTTAACTCGAATCGAAGAGTAGTCAGTCAATGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGC:1 + chr2L 3809777 5' + F-element 4435 1 79.21 GCTTTTTATGCCAAAAGAGCTAGCTTTGTATTCGTTTTTTCATTGAAAAAATAACTTTTTAAGATCATATTGTTGTGGGATCTTATGACACTCTTCTAGTA:1 + chr3R 21726446 5' - S2 1325 1 77.23 TACAAAAACATCAGAGCTTCTCATATGTACAGGCAAAAACGAAACGCAGCGAGAATGAGCTCCAAGGCTCTTTTAATCAAAGCCATACTTTCTCCAACGTG:1 + chr2L 10511277 5' + G5 4364 1 54.46 TAATGAGCAAATTACATGGTCACTGCATATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATT:1 - chr2L 18506799 5' - flea 196 2 72.28 ACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:3 + chrX 21668011 5' - Tabor 7287 2 59.41 TAATACTGGCGACTCCTTTACGCCGATACAACCTCTCTACTCGAACTCGTTAACACCAGCCATTCATTTCAAAGAAAAGAGCTTCATAGCGGCCTCTGCCA:1 - chrX 16477226 5' - gypsy3 6659 2 72.28 AAGGAAGTGATGGACGAACGAATCAACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAA:1 - chrX 7917581 5' - hobo 274 1 75.25 TCGAGAGCTGTAAACACAGTCAAGTGTGTGTGTGTGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 + chr3R 22276854 5' - hobo 2898 1 74.26 TATAACAACTGCTGTTATTTTTATTAACAAATAATCGTCGAGGTTTTCTGTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 20900253 5' - Porto1 171 1 92.19 CAAAAACAGGTGTCACATTGTTGTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTACGAAAAGTACGCGTTGTTTTGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTT:1 + chr2L 5700806 5' - Doc2-element 322 1 72.73 TTTTAATTTAATTTAATAATTTTCTTTTATTATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGTTTCGCGGGT:1 - chr2L 14713286 5' + Cr1a 122 1 67.33 TTTCTAAATGAGTTGTGTAAATCGTAATGTAAAGACATCGAATGACCACTTTAAAGGTGAAAACTCTCGTTCGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGAT:1 - chr3L 5077895 5' - INE-1 93 1 72.28 AGTATGACCACTGAATCGAACGGGACCTGGCTGTACAGCTGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGTGCACAAAGAGGACGCACCGTGAAT:1 - chr2R 24777646 5' + gypsy8 4899 2 70.00 TTCGGATTGCGTACAAATCAAGAAGTCTAAGAACCTCTAAGGTGAAGAGAGAGCCTGGAGCCACAGCGAAAAAATCGTTTGCCAAATAATCGTATGGCGTT:1 + chr2R 6713743 5' - 1360 28 1 78.22 GTGGTCGTTCGTTGGGGGTGCTGTGATTGTTTGTTTATGCGATGGAGTCGCGCTGTCTGCTCCGGGGAGTCCGGGGAGTCCGGGGAGCAGAAGATTATTAT:1 + chrX 12480685 5' - Gypsy6A_LTR 303 1 55.45 ATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr3R 14049331 5' + transib2 15 1 64.00 TAGGTTTAGAAACCGGTTAAGGTGTAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 - chrX 10449849 5' - mdg1 373 2 72.28 TTTGTCTGCCTTGTGTCGCTCGTGTAATTTGATTCGCCTTTGCCTTTGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTA:1 - chr3R 24082443 5' + Ivk 263 1 57.43 GTCGGCACCTTGGGTTCTGTAACTCATCGCATCTTCATAGCCAAAAAGCAACATCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 - chr2L 7463588 5' + blood 23 2 56.00 ATCCTTGTTAACGTGTTTTCTGTGCTAGATTATTTTTCGGCAGTATGTTCGTGTTTATGTTCCTGGTGGGCATGTTATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 + chr3L 9166741 5' - 412 7539 2 77.23 CAATTTGGTTGCTATTCTGTTTCATAATAGACTTTGTCAGTATATTCGTGGCGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAA:1 + chr2L 17373330 5' + Cr1a 4094 1 68.32 AGACCAGACATTTTTAATTCACGATATACTGTTCGGCACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr3L 25608327 5' + Doc 40 1 65.35 TTTGGGCGTGAAGTGGATTTTTGGGTCAGTCCGACTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACT:1 - chr3L 8869224 5' - roo 8595 1 66.34 CCCTCAAGACCTTGAGTGCCTCCTCGCAGACCTGCATGCCGCGCGATTCAAAGACCTCGACACATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTA:1 - chr2L 9460733 5' - Gypsy6A_LTR 275 1 72.28 ATTCCCTGAATCAAAAACCGAACCTGTACTAAATTTTCCTTTATCAAACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTA:1 + chr3R 17935949 5' + HeT-A 5968 1 56.44 TTTGTAAAATAAATCAATTAAATTCCCTTTAGAAATATGATACTGGTGAGGTGGAAGTCAGGTAGAAGGGTCTTTATCTTGCACAATAATCCAACATGCCA:1 + chr2L 16828971 5' - Helena 424 1 60.40 TTGCCGGTTGTTGTTGTATTCATTGTTGTATTCGTCGTTGTTGTATTCGTTGTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATC:1 + chrX 12702263 5' - I-element 4887 1 48.51 CCCCAATGTACGGTGCTATGTGTGTTCGGCTAGAAGATAAGACAAGAAAATTGCAATAATTAATTATAATGAAATAACTATATTAAATATTAGTGTTAGTA:1 - chr3L 13882032 5' - Cr1a 4299 1 58.42 GGCACTGACTCCGCTCGGTGTCACATTGCCGGCTACCTCTTATAATGGCTAAAGCGATGACCGTGCCTTATTGATTCATTACAAATTACAAACATT:1 - chrX 12706293 5' - gypsy7 5102 1 71.88 GCGAAAAGGAGCGATGCAGATGAAATGCAAGAACCTATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATA:1 + chrX 12800244 5' + invader3 5227 2 63.00 AAGTTCTGCTTCTTTTGCGGCTTCATTGTTGTGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 - chr3R 24505999 5' + 412 7097 2 71.29 AATGAGTTTGGTAGGTGAAATATGCATGAATCTGGGGATTGGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACT:1 - chr2L 16032348 5' - 297 6944 2 63.37 ACTGTACACCTTTCGTTGCAGAAGAAACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 - chrX 9048699 5' + Tirant 8156 2 74.26 CCTTTTATCCGCAGTTTCTGCGTTTCCGTCCGAGCAGCAGCACGTTTCCGAACGTAATGATTTACAGTTCCTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3L 9763588 5' + P-element 6 2 74.26 AGTAGCTCCAAAACTCAATTGCCGAAAATTAAAATGCGTAATTTAAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGGTGTG:1 - chrX 7335148 5' - Tirant 372 2 52.48 TTTCTTTCAAAATAATATAATACTGACATAGTTGGATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATAC:1 - chr3L 16825263 5' - diver 6065 2 71.29 AGTACAGAAATTATTTCTTTGTATTTTTCAGATTTTATGAGCCTTTTAACCTGTTTTTCGATTTAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 + chr3R 6425813 5' + copia 11 2 66.34 AACTAATCAGTTTTCACTATATTTGTTTGATCAAAAGTTAGCAAGTTAGTTATTTATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAA:1 - chr2R 19244584 5' + Burdock 18 2 51.49 TAAGTTCTCCATTTTTGTTTGGGCCAAGTAAGATAATCGAGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chrX 15259030 5' - roo 9036 1 67.33 GATGAACTTTACCAGGATTCGTCTTCACCCACCTTCGCATCGGCCAACTCAATTCTGGCAAGATTGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTC:1 + chr2R 1780040 5' - I-element 346 1 69.31 CAAGCCTTTGTTAGCAATTAACATTTGACGGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 12724197 5' - roo 9024 2 70.30 TCAAAAGGGTTTAACTAATTCGATTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACC:1 - chr2L 16223620 5' + I-element 230 1 77.23 GCAGCATCGATTCAATATTTATATTTCCAGTCTGTGCCGCTCAACACTCAATCCCCTCGGAAATCAGTCTTAAGTTGAAAGTTATACAGTAAAGTTCAATA:1 + chr3L 6335536 5' + McClintock 290 2 64.36 CGTGCGAAGATGACGAAGGTGGTTAACAAGCCGAAAGAGACGACACACACAAGGTGACTCGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chr3L 14152176 5' + blood 16 2 62.24 CACTACTGACACTTCCGGCTCACTCACACAAGCATAAGCGCACAAACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACA:1 - chr3R 20100074 5' + accord 229 2 58.42 TTGTGGATGCGCCGCTTGATTGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGTAATTGATATTTACTAAACA:1 - chr2R 17960473 5' - jockey 290 1 77.23 GAAATGCTGCTGAGATTAAAGTTTGAAATTTGTTTATCAACTGGGGCAGAGTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr2R 4344620 5' + pogo 22 1 57.43 AACGATGAGAGTTATTAGTTATTATACTTTATTCCTTAAAATTATATATCATTAATTAAACAATTTTGACTGGCCTTCTTGCGGGGCATTGCCGACTTCAC:1 - chr3L 24009336 5' + baggins 5142 1 65.35 TGCATCTGGAAATGAAAACAAACCGATGCGATGCGAGGCGAACTCAAGCGAAAATGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAG:1 + chr3L 12551480 5' + 3S18 60 2 57.43 TTTAAGTTTTCGGATTTAATAATAAAGTTGGGGCAACGGGGCGCAAGGACACAGAAGTGGGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACAGAGTCACCTCGTTGT:1 + chr3L 13614219 5' - Chouto 319 2 61.39 CCATTTGCTAAGACCCGGGTTCGCAGCAAACAATTTCCGAGCCGCAAAGGCGCAAAAAGCAACGCACCACGCCACATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATC:1 - chr3R 17508197 5' + jockey 9 1 76.24 TAAAAAATTGAAGAGCTTCGTGGTACAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTAC:1 - chr3L 8012089 5' - transib2 2774 1 75.25 GGGCTTACACGATACCCAGTTTCCTCCAACCTCCGTATTCTCTGACTGATACTGAGTCGTCGCCGTTACATTGATCTTTATAATCTTATCTTCTTGATCTT:1 + chr2L 16600431 5' + Ivk 113 1 63.37 AGATACTTTTCACACCTCCAGTTTATTTGTTTAGTATACACACACACGCACACACACACGCACAACACCAGTATGTGGCTGTTTGATTTATTTTATTCATT:1 - chr2R 11097997 5' - HeT-A 3 1 87.13 ACCTGGTTGCCTGGTTAACGGAAACGAAAGAGAACAAGCGGAGAAAATGCCAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAG:1 - chr2R 19277850 5' + Doc 4462 1 58.42 ATTTTCTCAAATTCTTCGCATTTCGCATAGTGAAAAAAACCTAGTGAGCTATCTTCCGATTCCCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3L 3776449 5' + roo 8676 2 67.33 AAACAAAATCTACTTTGTTACATTGTGAATTTGCTAAAATACATAACTTAATTAGGATGATGCCGCGGCTGCACCCGCTCACGCTCTGACTGAGTCAGCGA:1 + chr2L 10731480 5' + F-element 483 1 71.29 AACGCGCCGCGACAGAGGCAGCGACTTCGGCAGAGGAGCTACAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chrX 409652 5' + P-element 28 1 48.42 TGGGTGTGTATTTCTACTGGCGTCTGAGATGGGTCCTATATCGCAGATCCCACCTCTGACAGCTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAATGCGTAT:1 + chrX 2498134 5' - 1360 3231 1 56.44 TTCTATGGGCTCATCTTCCTGAATGTGTGTTGCGACACGTTGCTGCTCACAACACAGTCACCTCGTTGCCGCCTCTGCAGCGGCGGTGTGGTGCAGAGTGC:1 - chr3R 6404656 5' - Chouto 287 1 80.20 ACTTATTGATCAGGAAAAAACGATGTCTTAAGATTTAGACCAGACATTTTTAATTCACGATATACTGTTCGGCACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 + chr3L 25608291 5' + Doc 4 1 67.33 GCGGCTACTGGAGCGAACGATGTAAACTTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3L 21782099 5' - roo 360 2 72.28 TCAGCTCATTTAACCCTGAGCATCGAAGGGTGTAACACGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAG:1 + chrX 17234637 5' + F-element 486 1 63.00 GCGAGTATCCTGCCAAAGTGTAGCATCTGTGTGTGTGTGTGCTATGTTGTTGTTGATGCTTTTCCTCGCTTTCTTTACTTTTTTTTTTCTTTTGGCCTCTG:1 - chrX 18428309 5' - Transib5 15 1 53.47 AAACTTCGAGTTATAAATGCGCGTCTTCTAGTCGGGGCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATC:1 - 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mdg1 7404 2 75.25 ATTCTTTGAAGTAAGCTGTTTCACATGGAAAATGCATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 - chr3R 20868787 5' + Transpac 4955 2 61.39 GAGAATGTCGAACAAATTTATGCTTGAGTGCTAATAATGTTCAATCAATTGTTGTATAGAAAACCTTTGGAGCTCGATGAAAACACGTCATCACACGTCAG:1 - chr3L 15704957 5' - Doc2-element 13 1 72.28 CACATTAGCACACACACACACACGAACGCACGTACACATGCAAACGCACGAACACGCGTCCAGCGATTTTCTAACTTTTATAGTTCCTGAGATCTCTATGT:1 + chr2L 1810949 5' - INE-1 143 1 68.32 CGTGAATTGGAATGCGGAAGCTTTGTTCGAGTAAGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACC:1 + chr3R 9434393 5' + GATE 56 3 66.34 TCGCTGCCCGTTTGTCGTAATGTGTTACGTCAAAGCGACCGCACACCATTATAAATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAG:1 - chr2R 16160295 5' + gypsy 7008 2 58.42 GCCTGGCAGTTGAGCCTTTTAATTGCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr3L 5492313 5' - pogo 2053 1 76.24 TTATCATTTAGAGCGGTATTTCGAAGGGCTGTTCAGCCAAGAATTAAACTTTTAATCGTATATATCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 + chr2L 16032230 5' + 297 3 2 58.42 GCCTTGCGGAACGAGAACTTGAACAGGTGACCATTGAAGATTAGCTTGACACCGCCCCCTTAGTTATTATCACTAGCCTTGTGGCGATAGCGATTTGATTG:1 - 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INE-1 93 1 67.33 GTCGGATTGGGGATGGGCCACTTATCCGTGCCCCCGCTTAATTATTCAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3L 11367467 5' - roo 405 1 73.27 ACATCAGACCTGCGTTAATCAGTAGTACTACTATTATGTATTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTT:1 + chr3L 20532565 5' + micropia 151 4 59.30 AAATTAGCGCACAGAAAGTCAGCGGAAGTTGTGAGGAAATCTTTAGCGCAAACATTCAGATAAGGCTAAACAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 + chr2R 7881929 5' - 412 489 2 74.26 AGTAATTGGTGACATAGACATATACACATCTCTGCGAAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chrX 19819959 5' + hobo 15 1 64.36 GAAAAGTTTGCCAGAAACAGGAAATTATGTTTATTATTACTTTGGTCATATCTTGAAGCACGAGGTTCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTATTA:1 + chr3L 18458928 5' - 1360 445 1 63.37 GAAGAAACAAAGCGAGAATACTTCAAAAGCAATAAACCAAAAAGTGCAAAAATACCTAAAGTGTCAAAGGGCGTGTCAGTTTTGGGCGGTTGTAGGGCGTT:1 - chr3R 21855996 5' - INE-1 344 1 61.39 GTAGTTGCACACTGGAATTTAAATGTATTCTTGTTTTTGAGTGACGAAGGTAGTTCGAACTGATTAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGC:1 - chrX 3487393 5' + F-element 4489 1 68.32 CTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:2 + chr2R 19209451 5' + Doc 49 1 65.35 TGCCAATTGCTGAAAGCGCTCGGCGAACAAATAGCGATCGTGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - 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chr3R 26597216 5' + gtwin 7280 4 76.24 AACGGAGGACTCTGTGTGTGGTGCTGCCCATCACGAGACGAAATCCTTGAGAGAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACT:1 + chrX 12599620 5' + 297 6511 1 61.39 AAAGTATGCAATGCATTTTACGACTTGCGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGCCTTTATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 + chrX 10824017 5' + jockey 4689 1 59.41 CTCACCCGATGGACTATCGTAGTAACCCCAAATGGGTATGCCAATGGCCACAGATGCCAAGGCGAAGCCTTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACAC:1 + chr3L 18090443 5' + rooA 319 2 67.33 AATGTGAATCGGGACTCCTCATCGGAACGGGGACGAAACGGAGACAAGAACGGAATGGCAAAATAAAACAATTGGTGGGGTTTTTCGTTGTTGTTGTTGTT:1 + chrX 15949775 5' - gypsy9 457 1 76.24 TTTGCTGGCCGGTGGATAAGTGCTTAGCTATATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGA:1 + chr2R 21721352 5' - Idefix 7060 2 70.30 TATCCTATTCCCTTTTAATGGTTTGAATTTAATGATGAAAAGTACGATTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGT:1 - chr3R 30272663 5' - Doc 493 1 53.47 GGCCTTTTGAAATAATACAGGTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATA:1 + chrY 3069811 5' - Quasimodo 208 2 79.21 CAAGTTACGGAACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGA:1 + chr3L 17215704 5' + Ivk 3 1 72.73 ACTAAAAGAGTGTGATATTTGCTGTTGGTATTGAAACTTGGCATGTGCAATGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chrX 19820046 5' - hobo 2911 1 55.45 TGCCGATGATAATGGCACTACTATTTAGATGGCCATGTCCGCCGATCCATTGGCCGATAATGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACT:1 + chr2L 5235415 5' - invader2 67 2 59.41 GGTCAGTAGTTCGTACATGATCAAAAAATAAGTTTGAAAATTACCCAAGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACT:1 + chr2L 2185446 5' + Idefix 311 2 52.48 TTATAAGGCTCTTTTTAATTTTTCTTGTTTAACACAAAGCTACATTAGATTAAAATCCCTTATAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3L 21784620 5' + roo 8718 2 61.39 GCCCACCACCTTCTGTTGTCACATCTGCAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chrX 8354412 5' + jockey 56 1 70.30 CTGCGTTGGCCCGGAAAGTCGAGGAGGAGGCCAAAAAGCGGTAAGCATGCATTTAATCTACTGTATTAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGT:1 - chr2R 9285621 5' - gypsy 7436 2 66.34 ACTGGTTCAACTGTGATACTAACTATGTGATACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGG:1 + chr3L 3317160 5' + 1360 47 1 70.30 TTTTATTTTTTCTTTACGTGTATGGCTAAAAGCTAGCTGTCACACACACACACACACACACACACACACACACACTGGG:1 + chrX 5107957 5' + accord 7104 2 67.09 AGCATGTGTATCTTCAGCATGATTGATGGATTTGATTGACTGACGTTGTTTTGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAAT:1 + chr2L 7568799 5' + roo 8788 2 58.42 TCTATTGTATAAAGTTGTGGCTAGTAGGTGGTTTCCACATTTTCGTTCAAATGCATAGAAAATGGATCATCGTGATACGAATCCGAGTCGCTATCATCGCT:1 + chr3L 23690170 5' - transib3 2539 1 61.39 ACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAA:2 - chrX 21945913 5' + F-element 58 1 74.26 AAAATAAGTGTTTACAGCATTGATTACAAGAAATGCTATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 + chr3R 15714147 5' - jockey 4944 1 69.31 CTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAG:1 - chr3R 1977620 5' - micropia 5410 2 54.00 GCGCGGAGTCTGCTCCCCGCATTATTATAAACATAATCTAATCGTTTGCTGGCTTGGAGGAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTAG:1 + chr2L 832704 5' - I-element 134 1 62.38 TTGATCGAGTCGTGCTGCGCAGTCCCCGAGTTTGGACATGAGGAGGCGAATGATTGCCCATGGTGCAGAAGTGGACGGAGCGAAACAGCAGAGCACGTTC:1 - chr3R 3525387 5' + Rt1c 5095 1 68.00 ACTACCGGCCTGCAGGGATTTCCGCAGCGTCATGCTTGGCAGGTCCTTTGAGGAACTTTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr2L 7767107 5' + hobo 17 1 63.37 GTATAGAGAGTACAAAACTTCAAAAATGCAAATAAACATAATGGAAAATATATTGACAGACTAAGAACATATGAAAATAACTTAGCCTTAAGTTTGGCAAA:1 + chr2L 21701609 5' + G4 3643 1 56.44 TTCATATAAATTTTCCCTTTGTGCGGCTCCTTCATCCTCCTTCTCGTTTTCCCTCCCAAAGTCATCATCATCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCT:1 + chr2L 16554448 5' + Cr1a 4356 1 77.23 ATTGTGCGATGCACGCACTTTAGCCCGCAACTTGGACAGGGGCATTAGCGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3L 21782040 5' + roo 8690 2 53.47 TCGTTGATCCATTTTGCACGCACTGCTGCCTCGAAACTGAAATCGAACTGCACTCAACACAAACCGTATATATCAAAGACACTAGAATAACAAGATTC:1 - 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jockey 4987 1 61.39 ATATCCAAAACCAGATGCAATTTAATGTGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACA:1 - chr3L 8443388 5' + jockey 4661 1 72.28 TTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTA:1 + chr3L 19951220 5' + Ivk 52 1 76.24 AGGTATGCAACGTGTATATAAATATAATTTATATAGAAAAAGTTTCCAAGACACACACACACACACACACATAT:1 - chr4 1049167 5' + accord 7029 4 58.11 ACCCATATAAAAAACCAATTTATTAATTGTAATAAAAATTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACGT:1 - chr3L 7854622 5' - Bica 365 2 62.38 TACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTT:1 - chr3R 14049444 5' - transib2 2820 1 73.27 GGGTCGGGGCTTCACATTAATTGTTTCGATTTTCGTGGTTTAACCATAATTTTTATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCTTTCTGTG:1 + chrX 2293229 5' + invader4 2780 2 79.21 TTTAACCCCATTGCACCACCTCAACCCCTACCGGGGCCCACTCCTTTGTACATTTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGC:1 - chr3L 14730893 5' - transib2 2723 1 56.44 GTGTTTGGTCCGTGTCCCGCGGGCGGACGAGTATATCGCACTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCT:1 + chr3R 20486348 5' - 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Max-element 8530 2 73.27 TCCATTGTGCAACACTAACAAATACATTTCTCCCCTGGCTTTTACGGATGGAGGTTTGTACCGCCTCGACTCGGACACCAGAGCCTCTGCTTAGCCACCA:1 + chr4 994592 5' - Rt1b 237 1 73.00 TTTAGTTAACAGGCCTAAGTTAATTTACAATGTGTATATATATGAGTTGGAAAATGGTCTTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAA:1 - chr3R 20042828 5' - Circe 117 1 52.48 TTATCCGTGCCCCCGCTTAATTATTCAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 11367488 5' - roo 9047 1 52.48 AATAATTTTGGTTCAAGGTCTGGCCCATTGCTCCCCAAAGATCAAGCTAAAATCAGAGAATTCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTC:1 + chr3L 12705076 5' - INE-1 549 1 60.40 TATTGCAAATGTTTGTCTGTATGTCGTTTTATGAGGAATCGAGGTGGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCT:1 + chrX 13434629 5' - hobo 2605 1 54.46 TGAGAACCTTTTAACCCCAAGCGACTTAACGCATTCGTGTCATGTGGCGGCATTTAAGACTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 23243952 5' + jockey 20 1 60.40 TTCTGGCAGCACTGTCCCCTAATTGAAATGCAGTGAAGACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAG:1 + chr3R 27928279 5' + I-element 325 1 62.38 GTTGGAAGTTTACCGCGGTAAAAGTTCTTTGGAAAAGACAGGATGTGTGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chrX 10436519 5' + hobo 26 1 53.47 ACTGTCTTTTTAGACTATCTTAGATCACAATTTAACATGAAATAAAAATTAATAACTCTTTTCTATTTCTCCTTGTAAGCAATTACTTATTTTTATTATTT:1 + chr3L 18625682 5' + Porto1 4633 1 52.48 TTCTTTTTTTAGTGCGGCTGACCCTTGTCGACGAGACCCCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTA:1 + chr3R 24764025 5' - 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P-element 40 1 37.62 CCATCTACTCTTGTTCGTTAATCTTTGTTTATTTTTATGGCATTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGAC:1 + chrX 7709583 5' - invader2 4696 1 57.43 TGAAGCAAACAAAAATAGTCAACCGATGCAAATGCCAGAAAAAACAAAATGACAACAATTACTTTGCCCTTCGGAAAGGGCAAATCGATCGCCGACGTGTG:1 - chr2L 22921546 5' + F-element 11 1 63.37 ATCGCTATGTGGGCGTGATAGTGGGCGTGGCAACATGGGTGCGCTGCGTCTTTTCCCTAGAATCTCGTTGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTC:1 - chr3L 1471683 5' - INE-1 158 1 79.21 AAGTTGCCAGAGTTGAGAGAGTTCGTATGTGTGTGTGTGTGGGTAGTGTGTGGCCAAGCGCTTTGGCAAACACCCACACACACACACGCACACACATATTT:1 + chr3R 5422443 5' + accord 7031 2 51.49 CGCCTCGCGATCCGCTGGCCATCGTGATACCCGTAACGGTAGTCTACTCCCTGATTTTCATAACCGATGTGGTTATGCGGGATCCAGATTTGGGGAATTGC:1 - chr3R 14102662 5' + Helena 1079 1 55.45 TTTTTTAAAATTCTAAGAGGCTCTCTTTAAGGAAAGAGGAGTGACGTATTTGGGAGGTCGAAACCGGCACCTTCAATTATTTCTAAGAAAACAGTAATGCA:1 + chr2R 3502544 5' + 297 6622 2 82.18 TTCCTACATTGTTTATTTATTTTCTTCTGTATTGTTGCCAGCCATTTATAAACTACACAGTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 + chr3R 20396519 5' + I-element 18 1 61.39 GGAGTCGCATGGGAAGTCTTCTGGTGCGCTTCGTCACTACGAGGACTGCCGTTCATAGTGATACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr4 1234502 5' - 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chr3R 28341531 5' - INE-1 95 1 70.41 TATTAAAAACAATGACCTTTACAATATGTTCCTGTCGGCAAGAAAGCAAATCCAAATTACATATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGA:1 + chr3R 10826071 5' + X-element 4402 1 74.26 CGTCTTTACGCCGACGGCAGCTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGA:1 - chr3L 20070090 5' - Max-element 68 2 78.22 CAAAAAGCCAAGAGAAACAGATCCAACGAGCAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTAT:1 - chr3R 9142882 5' + mdg3 5188 1 70.30 TCATTGTGTGTTTTTTGTCTTTCCACTGGGTCTTGTGTCTTCGTCGATGTGTCTATGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAATTTAATGTTTTAT:1 + chr3L 2391440 5' - I-element 470 1 68.32 GCATTAAAACATTACACTATCTGTTCTGCGTAAAAGTATCTTAAGCTATAAAAATATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3L 11335431 5' - pogo 2085 1 60.40 TGGTGGGCTAAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 - chr2L 7971068 5' + blood 7022 2 64.36 GAGGGTGGTGCCTTTGGAGAGTTGGCCAAACACAGTTTGCTTGTACAGATCTCTTTTCGTTACAGACAACAATTAATAAGATTAAGAAATTGAGCGTGCTT:1 + chr3R 13577879 5' - gypsy12 10070 2 64.36 AATACTTTAAGGTTACTTACTATTGAAGAAAGTAATATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chrX 7741762 5' - roo 9033 1 66.34 TTTGTGTACCAAGAAATTGTCTCTTCGGCTTGTTGGCACTTGGATCCGCATAACCGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 + chr2R 10917523 5' + Tirant 8129 2 57.43 CGATCGAGAGAGAGAGAGAGACGGGTGAATTGAGAGAGACGGATGAATTTATGACTTATATCCCAAGGCATTCTATA:1 - chr2R 19200160 5' - Quasimodo 88 2 41.56 AAGTATTTATTTACCGGTCGATTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3L 3776515 5' - roo 353 2 80.20 AGAGAATAGCACCAAGTTACGGAACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAG:1 + chr3L 17215692 5' + Ivk 4 1 75.25 CAGCACGAGAGCGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 - chr2L 128725 5' + P-element 63 1 17.82 AAAGAGTATTTTCAAGTTGCCTTTGTGAATGTGGTATCTTTTTACCCCTTTCTTGTTTATGCATTTGATTATTTACTTTAATTAATCTTAATCTTAAATGT:1 - chr3L 18244174 5' + Rt1c 5399 1 65.35 AACTTGGAGCTTCTTCGATTACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGAC:1 + chr3L 27863505 5' + jockey 4730 1 57.45 CCTCCTGGTCTGGCCAATCTAATCAGTGAGAGTTTCGTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTTGGCT:1 + chr2L 12557164 5' - I-element 65 1 64.36 CCCTCGATGTCCTCCGTGATCCTTCGTCTCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 10978711 5' - roo 9026 1 71.29 TGTCGCGCATTTGGCGCGCCTCCGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTA:1 + chrX 11042298 5' - F-element 4401 1 76.29 GAGTCACAGTTTCGTGGGAATTTCTTTGAAGCCGCCAATGCGTCGTCCAGCATGAAGGCTCCTTGTTATTCTTGATCCGTGTGTTGATCATAATTATGTTG:1 - chr2R 18669478 5' - diver 5813 1 69.31 AAAGGTATAAAACAGGAGTACGAAAAATATATGTTATTTAAAAAAAAATAAATAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTAATTTTGCGGTC:1 - chr3L 8707946 5' + diver 102 2 50.50 ACCGGCCTGCAGGGATTTCCGCAGCGTCATGCTTGGCAGGTCCTTTGAGGAACTTTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr2L 7767110 5' + hobo 19 1 61.00 AAACGTTGTAAATTATAGATTTAAATGTAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 + chrX 12401810 5' + I-element 49 1 74.26 ATATATGTATCTGAATATGAGGGTAAGGAGCTTTTCAGCTACGTTCTGGTTGTGTAATTTTCTTTCGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2L 13314054 5' + jockey 18 1 60.40 ATCGCGTGTTGGTCTCGTATTACAGCATTGCATACTTGCAGGCGCGTGCGCTCCCATTCGATTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2L 16136581 5' - hobo 2927 1 63.37 AATCTGTCCACTCAGTTGTCCTGCTGCCGGCCAGAAGGGAATTGGAAAGGAGTGGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTG:1 - chr3R 16774763 5' - Quasimodo 6932 2 60.40 ACAGGATGTCTGTTTAAACGATAACATCTTGGCAAATCTGGTTACCGCATCAAGGAACTTTAACACTGATCACATCGACTGCGCCAATTGCAAATAAATGG:1 + chrX 22915281 5' - 17.6 497 1 72.28 CGTTGGTGGGTTGCTTTTGTTTTTTGTGGCTCTCTCTGCTTTGGCCAGGCTGCATCTCCATCCAATTCCTCCAACTCTTCTGCTGCTGATCCGTTATTTGG:1 + chrX 14844853 5' - invader3 468 1 76.24 TAGCTGCTGCTGTATGTAATTAGAGAACTCCTGGTGCTTTGGAACAAGGGTCCCCCCCATTGCAATCCTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr3R 12215241 5' + hobo 6 1 71.29 CCTCGTTGCTCCGCCATTCAGGGTCCTTCATCAAGTCCATTTTCTCCCCTTTTCCACCGCCTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr3R 25443020 5' + 297 6 2 70.30 GCAGCCCATGGATGTGTGGATGCGTTCCGAGACTGCGTCATGCTCGACAATTTTTCACGCTTTTCTCTCTCCTTTTTTTTCATTTTGTTATTTTTTTTTTT:1 + chr3R 15628643 5' - gypsy11 3933 2 69.31 AGAAAACGAACAGAAAGGAGGGATTAACAAAGAAACTAAATTAAAAACAAACTGTGTGTCGATTTTTTGCGTTTGCTTAAAAATATATAGTGACAATTTGT:1 + chrX 13865228 5' - 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roo 9027 1 68.32 GTGAGTGGGAAAACCCACTCCCCCATCCGACAAGCCCCTAAAACATTTTCCACCCCATCCTCTACTATCCAACCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCC:1 - chr3L 14711610 5' + I-element 5049 1 74.26 GGAGGCGATAAAGGCTGAGAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr2R 22856603 5' - 1360 3367 1 57.43 GTTGGTGGGCTAAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 - chr2L 7971070 5' + blood 9 2 66.34 GTTTATCGGTTCGGCTGACTCAGCATTATTGAAATTGAAATGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATTCACTTTGCTGTTCTTTG:1 - chr3R 21857400 5' - Stalker3T 267 1 57.43 TATTTCTAATTACAAATGTAATTTACAGTGTTATTCTGTCGGTGCTTACTTTAATAGTGGTTAGCTCAACACTTTACGACTGAGTCAAAAGAAGACTCAAG:1 - chr3R 23598308 5' + jockey 4735 1 76.24 CCATTTAAGCTCAAGTTCCTATGTTTGCTTTTCCGGTCCGGCCCCTTTGGAGATTCGGTTTCTTTGGCGATGAAGGAATTTTTATAATATATTTTTAAAGT:1 - chr3L 21357164 5' + hopper 168 1 54.46 TTGGCATAATTGCAAAATGCACTTTTCCATTGCCTATTTCGAAGGATTTCATGTGTGAGCCCTTGTGTTTCAGCGGAGCAATTAAAATCGGGAGAAAACAA:1 + chrX 10068064 5' + gypsy5 346 2 75.25 CCAAAGCCAAAAGTTGTTGCTGTAAACAAATTCTAACATAATGTAAATCCTAAATCGTAAAATCATGGCGAACATAACCGCCGCCAAGCAAATCAAAAAAT:1 - 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transib2 2782 1 68.32 GAGTCTCAACCCACAATTTCTTCGCACTGTACACCTGCAGCTTTTGCTTGACCTCTTCACGTCTAATCCTGTCTCCAATTTTTGGCACCTTCAGATCACGT:1 - chr3L 21570327 5' - jockey2 3029 1 57.43 AATTGAAGCAATTCCGCTTACGCTTGGCATACACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3R 27386297 5' + hobo 40 1 69.07 CTCTCGGGAAGTTCATTTCCCCGAACTCTCTCTGGATTCGGCAGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 + chr3R 15666044 5' + P-element 33 1 47.52 CGGATATAGCTGCGAGTGTCAGTGGGAGATAACTCGGCACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCG:1 + chr3R 7883621 5' - roo 8744 2 62.38 TTGCCAACATTTGTTGGCCAGTTAACAAATTTCACCGCAAATGCAGTTATTTTCTTTACGTTTGCGCCGCGTTTTTGAGCGTCACGGTGTCGTTTCGGAAT:1 - chr2L 7568117 5' + Rt1a 133 1 64.36 CCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 - chr3L 9174732 5' - 412 442 2 78.22 TGTCTGATTATGACAACAGATGGGGAAAAATAAGCGTAAAAAATTGAAGAGCTTCGTGGTACAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAA:1 - chr3L 8012125 5' - 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297 210 2 59.41 GTTCTAAACGGTACCGAAAACACGTTCATGCAGCGTTCCTCCGATTTTTGTATTCTAGCTCCTTCCTTTTGTTGTTGTTGCAAGCACGCTCAATTTCTTAA:1 - chr3R 18168939 5' + gypsy12 10068 2 63.37 TTGCTTATTGGAGAAGGGGGTGGACTGGAATGCAGCCCCGCACACGCAAACACACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:1 + chr2L 19083346 5' + Tirant 8130 2 56.00 TCAGGCGATGGCGTATGCATATTGTGAGGTGAACAGAACAGGATGTGTTCGAGTGGATGACACTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 8914459 5' + roo 8677 2 66.34 CAAATAAGCCCAAAATGAGTTAGGAATAACAGATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAG:1 - chr3R 6425890 5' - copia 5080 2 77.23 GGATCACGTTTTGCACGCTTATCTTAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACGAATTTTATTTGGAAAT:1 + chrX 14521662 5' - roo 9026 1 72.28 ATGACTGTGGGCGTTGTCACTTACTGGCCTGGTATTCACTGAGAGCGGAAGTGTTGAGAGTGGGAGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGGGAGAGTTG:1 - chr3L 25847176 5' - Porto1 476 1 62.38 CCTCTCATCTATTCAATGTTTGTAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 + chr2L 4134347 5' - copia 236 1 75.25 AGGTCTAACCTGACATTTTTTAAAGTGCCATATTTTAAAAGTGCAAAACATTTAACACCAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTAC:1 - chr3L 23785484 5' + Idefix 79 2 64.36 AAAAATAATCCCCCAAAATATATGCATACACATTGGTTTATAATGAAAATATTCGTTTTCCTCATAAACATAGTTGGCCAAAAAATACGAAAAAAAAAAAC:1 - chr3R 20272993 5' + gypsy7 5007 3 66.34 ATAAAGGCGCGGCGGCGCCCTTCAAAGAAAACGGAAAATGCCCCCAAAATGTATTTAATTTGTTTATCATATTTTATCGTTATTGACCGCTCGATGTCTGC:1 - chr3R 26552168 5' - F-element 303 1 80.20 TAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGC:1 + chrX 21772496 5' - gypsy3 6544 1 70.30 TGGAAATGTGATAAGCTATAATTAAGCGACCGAAAAGGATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCT:1 + chr2L 12637136 5' + 17.6 7110 2 62.38 TCGGTTTAGCACTGTTATCCTTTGGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2L 10023664 5' + roo 8716 2 80.20 CACTCGGACAACTCGGTGGACGAGAAGCACGTCCAGTTTGGCGGCAAAAAGAAGATCCCGCCCAGTTTGAGCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTC:1 + chr3L 9779786 5' - F-element 4548 1 77.23 GGGGGAGTTGAGTAAGGTTTGTCTTTGCAGTTAAGCAGACAAGTAAATGTTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTT:1 + chr3L 10814225 5' - I-element 4910 1 55.45 TCGGCGCTGCTCATATTGATAATCTTGCCCTCGAACGACCAGAGTATATGCCACGCAGGCTGGCCAGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTG:1 - chrX 3130990 5' + McClintock 41 2 57.43 GGCAAATCGGAGATTACAAAGCAACAAAATTGTTACAATACATTTTCATAATATTGGCATATATTTTTTAATCCCATATTCTGTTGTTTGTTGAAAAGGTG:2 + chr2L 9299600 5' - 1731 317 1 46.53 TTCATAGTGATTACAGAGCATGTTTCATAACCGACTTCAATTAAAAGACAAGAGAGAATTCTATAGTCGACTGGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTTAGGG:1 + chr2L 21362914 5' - INE-1 348 1 68.32 AGTCAATCAACCTACTAAATTGTGTTCTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGG:1 - chr3R 25447992 5' + 297 6575 1 73.27 GAGGTAATTTGTTGCGGCTACCATTGTTCGCATTGCCATTTATGTACGTTCGTTTGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTTATAGACTGG:1 - chr3R 12655754 5' - Ivk 4969 1 59.14 GCTAGTTGTTCGGGCTGTGCCATTATGTTTCTGTTTTGTTGGTGTGTTTCTTGTCTTGCGACTTGTCTGTGTTGTTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGG:1 + chr3L 25507533 5' - Doc 4323 1 80.00 ATATTCTTTAGTTTAGGATACAATTTGCAGTGTATTTATGGTGGTCTTTTGATATTATTTATGTTTATTATAATTTATGTGACAAAGTGTCACAATGTATA:1 - chr2R 19534592 5' - Stalker 6912 4 62.38 CACTTAGCTCCACTAATTTAAGGTACACCTGGAACAGATGCAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCTCG:1 + chr3L 11234683 5' + G6 1816 1 62.38 TCCGTGTCCCGCGGGCGGACGAGTATATCGCACTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGT:1 + chr3R 20486356 5' - accord 7338 2 69.31 CTACAAAAAATTAGAATTACCGTCGTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAA:1 - chr3R 21652201 5' - I-element 4913 1 75.25 TGGGCAGGCGCAACGAAAAGTGCGGAGTTCGTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAG:1 - chr2L 3988579 5' - I-element 5307 1 69.31 AAGATACTGCAATTTGTTCCTGAACTAATTATAAACTAACTCACCACGCCCAACCCCCAAACTCACCCCATGCCATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATT:1 - chr3L 1895472 5' + HeT-A 5961 1 75.25 GCAAACACGTGGAAGCATTCGGTGGTTACGGCAACAATTTTTTCCCACTTTCTCGTTGTTTCTTGCTTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTG:1 - chr3L 15421902 5' - 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P-element 2876 1 66.34 AAACAAAAAACAAAAAAAGAAGATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chr2L 11869576 5' + opus 7158 4 76.09 CTCACGCACGTTTATTTTTAATCAACGGCAGGACAAGACAACGCACCTCAGACTAAAAGGAAGGGATCTACAATGGCTTATAAACGTTCGCTCTCCCCT:1 + chr3L 19101009 5' + Doc3-element 4250 1 60.61 GTGTCGCTGTTCAATAGCAAAGTGTTGACTTGAGTTTATGTTTCATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAA:1 - chr3R 21565497 5' - copia 143 2 56.44 TACCCAGGTGCTGGACATGTCCGGTAATAAGCTGCAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATT:1 - chr2L 12821274 5' + I-element 236 1 66.34 ACGTGGTTACATCAAGCTACTTTTTCAGGTGATCTAACGGGTCGAGGAACTCCAGCTCTTCGCTTTGTCGCACTTGCAGTTCGCCTGAATGTAGTGACCC:1 + chr2R 2094952 5' - mariner2 282 1 74.00 TTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGCGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr3L 9174695 5' + 412 7098 2 66.34 TGTTGGTGCTGTTGCCATTTTGCTTTTGTTTTTCCCAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATA:1 - chr3L 4713828 5' + transib2 37 1 61.39 GCACTATGCATAGGCAAAAACTAAACATTTAATAATAACTAAATAACTTCTAGATATAGTGCTTAATAATTCTTAAGAATTGTTTATAAATAAAACCGCCA:1 - 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Fw2 3710 1 69.31 CAGAAAATTTGTCACAGGGCTTAGTTTTTGGCTGGAACCACCACCACCACCACCACCGACTGGCTCTGTAATAGATTTGCTTTCCGAGCTCAGAACCTCT:1 + chrX 14616668 5' - Stalker 7214 2 74.00 ACGGATGTTGAAGGGACTAATGTAATATCGAAAATAAAGGCGAAGGTATGTTCTTTTAACGTATGTATGTTGTTTATATATGTGTAGTTGTACTGTTGTT:1 + chr2R 99843 5' + transib2 320 1 77.00 CGCACCTTCCCACATCGCAGCACCGCCCTCCACTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATTGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACTCGCAATCCCGA:1 - chrX 14089289 5' + Idefix 260 2 68.37 TTTTTAAGTTTCCGTGTTAAGTTTAAAGTTTAAGAGCAGCTTATTTAACATAACATTTTGTTCACTGTACTGAATTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTAG:1 + chr2L 11176078 5' + hobo 2481 1 74.26 AAACACCAATACATATGGACGGCGAGTGGCAGTGGCAGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 + chr3R 27993128 5' - transib2 2787 1 61.39 AAAATGCAAATAGCAAAAATTGTTGCCAAACTGATTGTTCATATTTGCCAACTATTTTTGCTATTTGCATTTTCAATCAATGTGCTGACCCAGCATTGTG:1 - chr3R 17179006 5' + Gypsy6A_LTR 57 1 64.00 CGGCTAGGAAAATATGACCCTGAGCAAATCACCGAAACGTAACGAAAAGTGCTTTAAGATAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGT:1 - chr2L 5351768 5' + mdg3 5214 1 64.36 GTCTAGACATGTGCTAAATGAAATCAAACATCGCACACCGATTCCGCGGCGAACCGTCGACGGTTTAGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr2R 19658269 5' + 1360 6 2 73.96 TCATCTAAAGGCATGAATTTGACGGACGCTTTTCGTTTTGGCACGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGA:1 - 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chr2L 5211570 5' - gypsy12 344 2 72.28 TAGTATTAACTTTAAAGTAAAGTATGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATA:1 - chr2L 4750023 5' + Quasimodo 46 2 80.61 TTTTGGTCGGCGGTTGTCTCCACTAATTTTGGCTCGCATACAAAGTGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chrX 13881353 5' + jockey 36 1 49.50 CATTTTCCTCCCACCCTGAAGGTCTTTAAAAAGCAAAGCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr3L 8883515 5' - mdg1 7421 2 65.35 TACAAAACCTTTCACCTTTTGGTTCTTCTATGCATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chrX 8447142 5' - opus 458 2 69.31 CGCAACATACAGTGTGCACTCACTCACTCACTTACATTACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 - chr3L 3476410 5' + jockey 4679 1 62.38 AAGTTCCTGAGCGACGACCCAGAGTCGTACAAACCCTGCGATCCCGAGATCATTGTCTCGCGCGTCCAGCAACTGGAGGCAACGGACTCAGCAGAGCGC:1 + chrX 17662948 5' - gypsy10 219 2 77.78 GTCCATTCATTCATATACACGTGCCCTAAACATTTTCCCGCGACTGTCCACACACATTCACACGTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr2L 20085222 5' - P-element 2874 1 68.32 TAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCT:1 - chr2L 23295878 5' + micropia 16 2 59.41 ATTATTACTTCTCGCCAATTAAAATTTAAATTAAAATCCCAAATTATCACCGGTAACCGGCCTGTACTCGATAGTATCCCTTAAACAATCCCACCCAAATT:1 - chr2R 13618835 5' + I-element 4893 1 75.25 TTTTTCATAATATTATTAGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chr2L 9547550 5' + 412 58 2 79.21 ATCCAGGCACGGGAGCAGCTGATCTCGCAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3R 28879967 5' + roo 47 2 74.00 ATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr3L 11257418 5' - 1360 3376 1 66.34 TTGGGCAGGGGGAGAAGACTATCGCCTTGGGGCGAACGTTGGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGGGGTCGCTA:1 - chr2R 17362752 5' + R1A1-element 5175 1 57.00 GGTTGTCGTATTTTAATTGAGGTTACCGATCGCAAGTTCCTGGAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAA:1 + chrX 415592 5' + P-element 128 1 46.53 AATTCATCGAAACCAGTGAGCAAACTAACTGGCTTAGTGCACAAAGTAGCAAGAGAAATGGTTTTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chr2R 17649932 5' + 1360 13 1 62.38 CATGCAATTGACACGAAATTTGAGTGATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATGCATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGG:1 + chr2L 8314811 5' + Stalker4 7240 4 73.74 ACTTAGAAGCCCCATTGCTGTCCCTGACAGATCTGCAAAATAATAGATTTTTAATTAATTAATCTAGACTTAAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGAT:1 - chr2R 21774261 5' + X-element 4449 1 75.25 TGAGCCCAATCTAAAAATTCCCTAAACTCAGCGTAGCTTGACAATAAAAGTGTCATTTTAAAAATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGATCCAAACCAGC:1 - chr3L 5490164 5' + 297 8 2 71.29 TCGGCCCTTAGTATGGCGTCCAAGCATTTCTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr3R 20547776 5' - 1360 3343 1 77.23 AGATAAAACCCGGGCTGTCAGCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 - chr2R 21415173 5' + jockey 63 1 77.00 ATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 - chr3L 27415293 5' + transib2 38 1 62.38 AATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCT:1 + chr3L 21912271 5' + Bari1 42 1 74.26 GTTTCTTTCTGCTCTTCGTGGCGAGGGGGGAGCACAGGTGAGCTATGCTCGGTGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCAC:1 - chrX 13286132 5' + F-element 267 1 54.46 CTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATT:4 + chr3L 17215743 5' + Ivk 55 1 75.25 ATCAACAATTTTTTTTTTAATTTTATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACAT:1 + chr3R 28710018 5' + invader4 326 1 61.39 GTATATAAAGCTGACACGAGAGCGAAACAAAAGTACAATGCAAACAAATAGCGAAACAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACACACCAACAC:1 + chrX 20494836 5' + I-element 4961 1 52.00 ATATCGTTTTTAAACTAAGTAAACTTATATTGTTTGCCATTTAAAGTAATTAACCGAAATAAGGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCA:1 + chr2R 17292448 5' + Tabor 6854 2 65.35 TTTATTTTTATAGCCTGAAATCTAATTACAGAATATTATTGGTGGTATTAAAACTATGTATATTAATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chr2R 8271418 5' - pogo 2092 1 70.30 CTCGTGTGTATTCGGGTTAGTATTAAAGTAAATCGTGTGTAGGTCAGGAGGAAAGCCGTGTCGTATATTCCTTTTTCATTTTAAGTTATAACGTACATTTT:1 - chr3R 15952192 5' + invader5 3708 2 67.33 AAAAAGTTAACACCTAAGTAGTCCAGGCCTTTTGGGCCAAGCCGATCCCAGCCATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGC:1 + chr2L 9450001 5' + hopper 398 1 59.41 CGTCTGACTGATTCCGGCACATTTCGGATGGGATGTCGAAAAATATTTGCTGTGACAGTTTTTGTGTTGGTGTTCACTGTTGTAGTGCAGCGCGCGAGTCC:1 + chr2L 12765724 5' - gypsy10 463 1 63.37 ATTTCCAATTCGCTCTTATCGTGTAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chr2R 16289234 5' - P-element 2865 1 27.72 TGGTATCAGAATCGGAGCGCTTACCGCCCAACTCTCTCTCTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAA:1 - chr3R 17885373 5' + I-element 4986 1 61.00 TAAGAATTGTTACAGTGCCAATTAAATCTACCGAAAAATCCGTGCAATAGACAAATGGAATAACAAAATGAAACTTGACTTAGAACGAACTTAGTTTTTCT:1 + chr3R 19509884 5' - HB 1372 1 70.30 GGTGCTGATAGCCTTCTATGTGGACTTCTATTACAATGTGATTATTGCCTGGTCGTTGCGTTTCTTTTTTGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGA:1 - chr2R 16561160 5' - Idefix 249 2 70.30 CGGCGAAGGAGTGGCTTTTCCGATTCGAAAAGATGTTGTTGCACGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCAGTTTGCATTAGTATTGGTGTATGCGGACT:1 + chr3R 15758992 5' + invader1 200 2 65.35 CCAAAATTGAAGAAAAAAAATATCAGAAGATAAAGGGTGACTTGGTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATACCGGCCCCCCTGAACGGTTGTTC:1 + chr3L 26377954 5' - 3S18 5741 1 72.28 TCCCGCCTTTTATTTAAACTTCACCATCTTTCGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr3L 26132187 5' + Doc 50 1 69.31 TGGGTGAGGTTCAACTCAATTGAACAAGACCATATCTACGTTATGGATGTCATTTCACTTCTAGCTGTAGCAGTTACTGAGATCTCGACGTTCATACGGAC:1 - chr3L 3467983 5' - INE-1 133 1 62.38 GTGACGCGTGTCACCTGCGGAATCTGGAATCACTATCCTTGTGCTAACAAGCCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3L 12724258 5' + roo 8688 2 55.45 CTAAATATAATTTATTGATTCTGGTAAAATTTAAAGATCAAGAAGAGATTAGCTTTAGTCCTTATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGA:1 - chr3L 11012402 5' - Ivk 44 1 64.36 AAAGGGAGGCCACTCTTTTCCATCGATTCGATGGGAATTAATGGCTGGTTAACTACCGGGCATCCCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr3R 20170538 5' - hobo 2928 1 66.34 AAAGAACTTGCCGGACACGTGTTAAATAGTTGTCAATAGTTGTTGTTGTGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr2L 1195113 5' - hobo 2911 1 49.50 ACCATACGAGTACGCTTATATACAAACAGCACAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTG:1 - chr3L 22973352 5' - hobo 278 1 68.32 CGGTTAGTGTGTTAGTTCCCATTGTACTTCCCATCGCTTTGTTCTACGCCCGTCCTCCCCTTTTCTCTCAGTGTTGACAGAAATAACGGCAGG:1 + chr2L 10607387 5' + gypsy9 5192 2 70.97 TCGATCGGGAAAATCGGTCCCATTGGCGGAAAAGCCGGCTCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCA:1 + chrX 16501203 5' - Doc 200 1 66.34 AAAAATAAACTGGAAACACTAAAAACAAACTAAAGCAGAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATA:1 + chr2L 7154384 5' + F-element 165 1 65.35 ATTTAAAAGCAAGTGCCGAAATTTATTTTCACTGTCCAAAAAATAAATTGAGTGCCTGACCAGAAGTCCTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTC:2 + chr3L 9218410 5' + 1360 470 1 78.22 TAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTA:1 + chr2R 5582168 5' + Cr1a 442 1 66.34 CTTTTATTTTTTCTTTACGTGTATGGCTAAAAGCTAGCTGTCACACACACACACACACACACACACACACACACACTGGG:1 + chrX 5107956 5' + accord 258 2 67.50 TGTAGCAGTTTATTCCTCTTTTGCCTTGGCGATGTTACGTTCTCGACTTCGAGAAAAGATATAGACGCGATATGAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGA:1 + chr3L 25731043 5' - Cr1a 4339 1 55.45 TCAAGATTCGAAAATCTAGGGGGCTTGAAAAGCGAAAGATTTACGCGGCTACTGGAGCGAACGATGTAAACTTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTT:1 - chr3L 21782143 5' - roo 9068 1 73.27 GGACATATGGCAGAATATTTCCCAAGCCCAAGCAAGCCGACTTGGCTTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:2 - chr3L 18142016 5' + blood 30 2 55.45 ACTGTGGTACCCCCAGCTTGGATGCGAGCTGTCTCCACCCGCTTCCTGCTTGAGATTAGAACGCTTTGACTTTCTGCTTCTCGGTTCTGCACCAGCTACCA:1 + chr2R 4932023 5' - G7 1 1 62.38 GTTAAGCTTGGTGTACCACTTGATAATAACAATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAA:1 - chr3L 15168757 5' + 412 400 2 69.31 TGCCAAGACTCCAAATTATAAACACATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 6739650 5' - roo 9020 2 74.26 ATCAGGTGAGTGTGGGGGTAATGGTTATCAGTACGACCAGCAAGTACAGGTAAATATTTACCTGCAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAG:1 - chr2L 7459913 5' - blood 7196 2 68.32 TTCCTGTTCTTCCGGTTTTTGTTTTGCCTGCTTTCCTGTTTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACT:1 - chr3R 30272449 5' - mdg1 262 2 66.34 AGTGGGATTGAGTGGGAGTCAGTGAGTCAGTGGGAGAGAGGAGGGGAGCCAGAACCAACCCTTTTGCTGTACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGG:1 + chr3L 22202947 5' - G6 1845 1 79.21 ATCCTCGGTGTGTGCACTCAGCGAAACAAATGCACATGGTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2R 22793401 5' + hobo 34 1 62.38 AAAAGAGCACTAGAATGGCAAACTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAA:1 + chr3R 14832514 5' - hobo 274 1 52.48 TGTATGATTACAAACCCTTTCGAATTAACGAAAACTTCGAGTTATAAATGCGCGTCTTCTAGTCGGGGCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCT:1 - chr3R 17064225 5' - Transpac 305 2 76.24 AAAGATTTGTTTATGACTTCTTCAATTTGATACCCTCTAGAGTTACATAAGTGGGATTCCCACATTTTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACC:1 - chr2R 1986299 5' - INE-1 176 1 68.32 TATGGTGCCCCAAAATGTATGCTACGCTTTCTTCACGCGACCAATTCGTGCGAAAGTGTTTATTATCATTATGATACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCG:1 - chrX 12135739 5' + jockey 10 1 73.27 AAAAATTTCAAACTGCAATCTAATCAGCCTTTCACTTTTCCAACCCTTTCAATTATCCATGGAGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chr2R 4344516 5' - pogo 2093 1 70.71 GAAAAATTATTGACCACTCTCTCGGTCTTTTGGCTTAATTGATATGGGTTGCAAAGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 + chr2L 2912009 5' - 297 379 2 65.35 GCTTGGGAGAGCGGAGTTAGAAATTGTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr3R 21969106 5' + hobo 50 1 75.25 CACTAACTGTACTCGATTCAATTAGTATGCGAAATTAATCGAAGCGCGAATTTCGTCATATACGAGTCCGGTCAGCCGTAAACTGCAACATAAACCTGCAA:1 + chrX 2564111 5' + Rt1a 80 1 57.43 TTCTGTGGGTGTATGATGTCACGCGTTTAGTAAACCTTAACCATAAACTATGAGTCAGTAAAGATTGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCC:1 - chr2R 4004243 5' - X-element 4285 1 72.28 TAATTAAAGAATATCCGTGCTGAAATTTAAAAATAAGTTAGATCGCTTTGTATTAGATACAATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCT:1 - chr3L 7412505 5' - invader3 5448 2 57.43 ATCGTTATTAAACTAAGTAAACTTTTATTGTTTGCCATTTAAAGTAATTAACCGAAATAAGGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:1 + chr2R 17292450 5' + Tabor 17 2 54.46 CTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTACCCATGTCCGCCTGACCGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAACTAAAATGCTAGAATGTTGAGATTCAGCAT:1 + chr2R 5250067 5' + INE-1 170 1 82.18 ATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 19450189 5' + roo 8722 2 54.46 TCGAACCGGCTAGAACCGTTGGGATGCAGAGTCGCAGGATAGTCACATTGCCGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 + chr2R 17715899 5' - Transpac 5217 2 57.43 TGGAAAATTGCAGTCAGTCCAGAGCTTTACCCATTTATAAATTCGCTAATTTCCCTTGTTTGTCCCCTGTTTAAGTAATTTATTAATTAAATAAAAGTAGG:1 - chrX 22927614 5' - Tc1-2 323 1 67.33 AAGATTACACTTCTCCNTGGCTGAAGTGACCAAGTGGAATAAGCCGGTAGCAGGG:1 - chr3R 5038261 5' - Chouto 208 1 65.45 ATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATAAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCACATCTCTTTT:1 + chr2L 23295811 5' - micropia 406 2 68.32 CTGTGCCGCTATTAATTAAGTATCACAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr2L 10687707 5' + hobo 51 1 72.28 GCAATCAATGAGACATTTTTACTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 - chr2R 5651931 5' + Tirant 2 2 79.21 ATGCAGAAATACATTTTCCCCCCGCAGAACGATTCTAATCTATTTGATACCACCTCAACGCCCTGATTTCTGGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATAC:1 - chr3R 7832963 5' + 3S18 5771 2 71.29 TCTCTTTCTCCAATTCCCCCCTCTGAAACAAACCAAAAAAAAATTGATTTCTTGACCTTATTCAATAATGTATGTAACGAAAAGCTATCTGTACAAGCAAG:1 - chr2L 2791370 5' + Gypsy12A_LTR 2156 1 54.46 TTTTTACAGCTCCATAACTTATTCCTATTTGCCTTTGTCTTGGTCTTCTCTGTTCCACAGTAAAACACAAGAGCGAATGCTATAGTCGAGATCCCCGACTA:2 + chr2R 25133750 5' - INE-1 566 1 58.42 CCATCTGATTTCATTCAATGCATTTCAAAGTAATGAATTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 - chrX 12954244 5' - pogo 2067 1 69.00 TAAGATCGCTAGCTAGCCGAATATCCCACCTTTAGTCATAGTTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr2R 10311065 5' + pogo 30 1 59.00 AATGATCAAAAGAGATTGATGGGATGAAGCAGAACAAATTTAAAGAATCAAAAGCAAAAGGTATCCATACTGATTTGCATTGTTATTATAAATTTTTAAAA:1 + chr3R 24523883 5' + TART-C 11027 1 59.41 GCGCCGCGACAGAGGCAGCGACTTCGGCAGAGGAGCTACAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 - chrX 409649 5' + P-element 37 1 42.57 CCCAAAAACCCGCTGGATTCCAGGATCCCATCTGCCCGGTGTTTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGC:1 - chr2L 3940484 5' - 412 45 2 64.36 TCGAAATATTTTATTGATTTGTTAATACTCGTCTATGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTAGTCCCCCGCTACCTGAAACT:1 - chr3R 11520056 5' + accord 6979 2 63.37 ATAGTTATTAACATTTACTTGTAGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAC:1 - chr3R 13122888 5' - Transpac 5175 2 74.26 AACCTTTCACCTTTTGGTTCTTCTATGCATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATAT:1 + chrX 8447147 5' - opus 453 2 74.26 GGTTGGTGCCTCATCGCTGGCAGTTAAATTTTTGTTGGTTTTCCAACGTGACGCCTGTCAGCTGGCGTTGTTGGCAAAAAGATTTTTTTTTTTAAATCG:1 - chrX 4460711 5' + FB 181 1 69.70 GGCTTAAATTTTGAAACGAACTTCATACTTCTTATTAGCAATATTATTTTTTTTAACAGATGTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 - chr3R 7869770 5' - jockey 4971 1 49.50 GTGGCGAGGGCGGCGATCCCTTTGCACCGGATGTGAGTATTCCATAAAGATACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTACACGCGAACAAGTCACCCTTTAT:1 - chr2L 8284135 5' + 3S18 26 2 65.00 ACGCTACTCCTGATATCCCATAGAAAGCCAGGCAACATTGCACACTGTACAAATTTTAGGCGTACAGAAAATTACTTGCGGCCGATCGTTGCCTGTGCGTC:1 - chr3L 15419014 5' + hobo 2748 1 55.45 CGAAGGGAAATTCCATGCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTCACAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCTG:1 + chrX 2903903 5' - ZAM 8039 2 77.03 TGGGGCGGCCAGCGATGTCGATTGCGGTTCAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGA:1 - chrX 2895775 5' + Doc 4317 1 71.29 ATAACCGCCAAGTGCTCGGTGTTCTCGACCAACTTGTCCTTCTCGTTTCTCTATCATTGGCATCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTAAATGCCTT:1 + chr2R 6732948 5' + Stalker4 7174 4 53.47 AGTTGCCCTCGATATTTCGATTTGTTTTTAGTTGCTGGCGATTGTTATTGTCATATTGCCATTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGCTATCGAGCTTTTC:1 + chr3L 19697748 5' - Idefix 423 2 71.29 TTATGCCTCTAAGTCACGATAAAATGCTATTTTAGATCCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 + chr3L 18034177 5' + Doc 43 1 59.41 GCGAAAAAATCAGGCTCAAAGCGATTTAATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAAT:1 - chr2L 14668523 5' + accord 409 2 72.28 CTCTGGTAATAGTTCGATGGCCATAGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 14285054 5' + roo 8714 2 78.22 GAAATAAGTAATTGGTGACATAGACATATACACATCTCTGCGAAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chrX 19819953 5' + hobo 9 1 70.30 GTTTTCCCTTTCGTCTCAACATTCACGTGATGGCGTTCGCTTTTCTTTTGAAGGACTTTAGACTTTAGGGTTTTGATCATGAAGAGAAAAAGCTTTGTGTT:1 + chr3L 3925908 5' - Idefix 7185 2 64.36 TTTTATTTCTGCTATAACTTTTGAAGTCTTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTCAATTGATTTCGCTTTTCGTTTG:1 + chr3R 16888362 5' - invader2 418 1 83.17 TCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 - chr2R 5531196 5' + 1360 65 1 62.38 AGGAGGAGTGGGTGAGCCACTTCATCACCGCGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGACTTAGATAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCT:1 - 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opus 7469 2 66.34 ACTGAGGCGCATGTCGAGCCGTACATGAACGTTCTGACCGACTATCATTATTACCATGTTATTCATATGAATTGGACGCTCTCTTGAGTGTATCGCGCATG:1 + chr3L 3467542 5' - Quasimodo 415 2 60.40 TCAGTTGGACGGGCGTAGCGGGGGCGGGACTGTAGTGCTGTGTGCGTGTAGCCTGCGCTATTGATTGTGCGACTGTGTGTTGCCATTGTGGGCTGGCGCGC:1 + chr3L 1602069 5' + gypsy2 6379 1 71.29 CGCGCTTAAGTCGCAACGATTTCGATTTCGATTCCACAAATAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCA:1 + chr2L 9884940 5' + Doc 4551 1 59.41 CAGTAGGCGTGGCGGATTAGTGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 + chr2L 17056505 5' - 412 7492 2 76.24 CGGCTTCCACCTGCTATAAAAGCCCTGCCATTTACATAGAATTAGTTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr2L 14743211 5' - 1360 3361 1 57.43 TTTACAGCATTGATTACAAGAAATGCTATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTT:1 + chr3R 15714157 5' - jockey 4934 1 78.22 ATGTGAGTTTTATGGTTTATTTATTTATTTTACAATTGGCAAATCTATTTGAAAGCGGATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCACTAAGTTCCCATACTGC:1 - chr2R 22817253 5' - Burdock 6029 1 73.27 TTTAATCCAGTAGACTGCAGACAGAAAAATATATCAAATAGATTGAATAATAATTGGAATAGTATTTATTTGTAAGCCTATTCGTGGTGAAGTTGAGAGTC:1 + chr3R 1682884 5' + Cr1a 4058 1 63.37 AATGTATGCTACGCTTTCTTCACGGGACCAATTCGTGCGAAAGTGTTTATTATCATTATGATACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chrX 12135726 5' + jockey 22 1 59.00 TAGCAGCTAAAAACGCTGAGATCCGCCATGCATATCTCGCCTTTTATTTCAGAGAGTCAGCCCCAAAAGTTTAGTCAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCT:1 + chr2L 18215585 5' + 412 7426 2 72.28 CTCAAAAGTTTGCGTCTTTGCCGCCCATTTGTCTTAATAGAATCCCCTAGCAAGAAAACTAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGAAC:1 + chr2R 19563847 5' + Doc 4538 1 60.40 AGCGGATTATTGAATAACCCCAGTGCAGGGTCCACCAAATCTGGGTCACCACCACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACACTCTCAGCGTGAG:1 + chrX 13876299 5' + 1360 3288 1 63.37 ACTTATCCGTGCCCCCGCTTAATTATTCAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 11367486 5' - roo 9049 2 54.46 TCAAAAGATACATTTCTGAATCGGTAGCTGGTCAAGTACCACATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCG:1 - chr3L 154142 5' + 1360 3216 1 59.41 CGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 11367516 5' - 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chr2L 19254957 5' + gypsy4 6472 1 64.36 CTTAAGTTCTCCATTTTTGTTTGGGCCAAGTAAGATAATCGAGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chrX 15259028 5' - roo 9038 1 65.35 TCGCGAAAGTAACGGGATCTTGTGAAATGAATGTCAACAACCAAAACGACATCGAGCAAGTCAGAGGGGTGCAACGACCAGCCGAAATGCCATCCAACACC:1 + chr2R 2864819 5' + gypsy10 36 2 51.49 GAAAAATAATAGATTAAACGATGATAACGTTAGCACGGAGCTGGAAGTAATAAATAATTCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTTTTAGTTAACTAAGA:1 + chrX 10070149 5' + invader2 5083 2 58.42 GGCCAACTGGTGGCCCAAAAACAGCAAATAGACAGATAGATCTGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTA:1 + chr2L 14621724 5' - 1360 15 1 60.00 TTCGTATCTTTCGGTTAACGGTTGCCAAAAGCAGACAAAACATAAAGTTCGAAATAAAAACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 + chr3L 8079049 5' + copia 44 2 66.34 GGTCGTCTGGTCGACATCACTCCTTCCATATTTATCATTACCGTCTGCTGCCGTCCTCTCATCTATTCAATGTTTGTAGCTGTTGTAATTTATAATTTATA:1 + chr2L 4134293 5' - copia 256 1 77.23 AGGCAAAATGGAGAAGAACTGCCAAAGACATGCCCCCGAAAAACCAAATTCCCTTAAAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 + chrX 18346103 5' + TART-C 11102 10 76.32 GTCTGGCGAGGAGGGAGAGTGGTGGTGTTGCTGCTGCCTTAGGTGATTATAGAGCACTTTGAACTCGCGACTGCGTTAGTTCTTTTGTGGATAATAATTGA:1 + chr3L 17575238 5' - rover 423 1 70.30 CGCGCTCCATCCTCAATCCACTGCAAAATGGCTGAGCTTAATGAAAAATCAATATCAAAAAAAATTTGTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAAC:1 - chr3L 13889888 5' + Stalker 6786 2 58.42 GGTTTCATTTATGTGTATTTCGTATTTTGTTGCCCTGCCCGCCGCTGACACACATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACT:1 - chr3R 9940184 5' - I-element 5325 1 54.46 GCCAGTTTGTGGGACACTTTTCACTGTAGTTCACTGCCCTGTTTCCACATTTAAAGTGTCTTTTCACCGCTCGTCTTGTTCACGTTGTCGCTGAGAACGTA:1 + chr3R 6466404 5' - Doc 229 1 67.33 GTGTTGGCATAGTTTTATGTCTCAATTGAAGCGCTCTGCCTGTTCGGATGGGCACGTAATTTGTTGCGATATTTTTACATTTGTTTGGCTATTTCATCTCT:1 - chr2L 4691551 5' - Fw2 3701 1 59.41 TACTTTGCCATCTTTTTTGCAGCCACGTTTCAGTTTTATTTGCCCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAA:1 - chr3R 9082272 5' - hopper 445 1 56.44 AGATTACAAATTGTTGTAGATGTTCTGACATGTTCTGAAAACATCGGTTCAATATTTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAA:1 + chr3L 23419736 5' + FB 20 1 47.47 CGATCTGCCCAGACTAAGTGCAAAATGAGTTCTGAAAGCAATCAAAAGTTCGAAAAGTATTAAATAAAGATACACCTCAGAAATATAAATATAAAAATAAA:1 - chr3R 16688969 5' + Transpac 4803 1 49.50 ACCCCCTTTGCCACTGCCGTTCATTATGTGCAACTCGACTGGCTGATAAATCTAATCAGTGTCGTGGCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 - chr2L 17056575 5' + 412 8 2 71.00 GAGAATACTTTGGCACGCGATGCGTTTTTTTTTCGAATTTGGAATGCCAAGTTGATTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGCATAGATGTAAAAGATTTG:1 + chr2L 10197558 5' - Stalker4 386 1 61.39 TCAAACATAATTTGTGCCTTTNCTCTTTTTAACTTTCGGTTGTTTGGCAGACTTAATCTAAGGGGTTCTAAGGTTTATGTTGTAATTTATAATTTATATTT:1 + chr2L 1795728 5' - copia 253 1 71.29 GTGTCGAAATTTCGAATTCATAAAAGAAACATAAAACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGG:1 - chrX 5174423 5' - jockey 4677 1 64.65 ACTGAATACTGCTACAACCCATGCAACGGAGCATAACATTGGCTTTACATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAACATCAGTTTCT:1 + chr3R 29944443 5' + roo 9027 1 50.50 GTAAAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACC:1 + chr2R 3293760 5' - 1731 4578 2 71.29 CTTCGCGATAAATTAAGCGACGCCTTGACAAATCTAAAATGTTGTTTCTCAAATCTTCTCAAATTTATTTTATAAAATAACTAAAAACAGGTCAACTAGAC:1 - chr3L 26011897 5' + Juan 4089 1 46.53 TTGGTGTAGAAAAATATGGATTCGTTAAGTGATCAATTTGAATAGGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 - chr2R 9001707 5' - mdg1 389 2 56.44 GGATAGACTGCAATTATTATTAATAAGTCAAAAATTATATTTTCTTTAGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chr3L 14886272 5' - 412 465 2 55.45 GAACGATGTAGATCCCAGGGGGACAAGTAACCCAATTCCTGGTCTTAAAGGGTGCGAAACAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2R 10345590 5' + roo 16 2 63.37 CTTTAGATCGTAGGTAATACAAAACCTTTCACCTTTTGGTTCTTCTATGCATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chrX 8447120 5' - opus 475 2 53.47 GCCAGCGAAGCGTGGCGAAAGTGACAAGCATTAAAACCGAGTGAGATGGAGGAAGGAGAAAACTGCGAGGCTACCCAATGTGCTGCCCCGCAACGCTTTTA:1 + chr3R 11185011 5' + X-element 392 1 77.23 TGGGGATGACTTTATCTGGCCAGAAATCGTTATCATCCGTAAAATGTGGGGGTTGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTCGAAGGGAAATAGGGTCG:1 - chrX 13787097 5' - G5A 2661 1 54.46 TAGAATATAGAAAACTTAAGTAAACCATTATTCAACAACAGTCTATTAGAGCTAACTAAATTTATGTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTG:1 - chr3L 20857073 5' + hobo 499 1 71.29 CTTATATTTATACAAATTTAAACCACTTTCTAGGGATACCCACTCACCCATACGGCTCTTGCGCAGCAGGCCTCGGGTGGTTTTTTTACTCGTAACAAA:1 + chr3L 22337304 5' + hobo 2807 1 60.61 AGCGCATAAAGTGGCCTTAACATGGCATAAAAAACGCACTAGCAAGTGCTAACACAGTTGATGGGTTGGGTAAAATGGCTTAAAAAATAAAAACAAAAAAA:1 + chr3L 10807890 5' - hopper 151 4 60.40 GTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGG:1 + chr2L 14074958 5' + jockey 256 1 61.86 TTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTAGTACAGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTA:1 + chr2L 15832986 5' - hobo 2842 1 68.32 CAGAGCTTAACTATCACATTTAATGTAGTTATGTTTATTATTATGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGA:1 - chr2L 20152839 5' + Juan 35 1 62.38 TACGTCTAAAAGGCTGCGGTTAGATTGTTGTTTGTTGAACAGTTGGCTCAGTGCATGAAACACAATATCGATGTGCTGACTCAGCATTGGGCCGAAAACCC:1 + chr2R 2977558 5' + Gypsy6A_LTR 67 1 64.36 TACAGTCACTCCAAAATACAAAAGGTATTATCTCAACTTTATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTC:1 - chr3L 15452958 5' - accord 7374 2 67.33 TCAGCAAGGATTCCCCTTATTTTTGCATTTTTTACGTTGCCCTCCTGGACTTCTTTTTGTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCC:1 - chr3L 8822206 5' - I-element 376 1 65.35 GTCACACATTCCACGGCTGGTGATTGATGGGCGCCGCAAAAAACCAAAAAGAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGTTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr3L 10565362 5' - pogo 2082 1 58.42 CATATGGGTCTGCGATCCGTATCTGCAGATATGTATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATGTGGCCAGCGGCCAGCGTGGGAATGCTGACT:1 + chr3R 16892279 5' - blood 7136 2 70.30 ATAGTCGAGGCGATATTTCTGTGCATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2R 10345655 5' - roo 356 2 79.21 CGCCATTGTAGCCATTGCTATCATTTATGTACATTGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATA:1 + chrX 6664902 5' + 412 7187 2 76.24 AAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGA:2 + chr3L 17215723 5' + Ivk 35 1 56.44 GATGGGGGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 + chr2L 7970985 5' - blood 338 2 63.37 TGGGCAATAAGCCGGTGGAGATGTGAAGGTAGTGCTTCGGGAATCTACGGAAAGTGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCAT:1 - chr3L 13208619 5' - hobo 2614 1 61.39 TTTAAAGCTATTCTCATAATTAAGTGAAATTGGTAACAAAAATAAGAGAATTACTGCACTCTTCATACGTCTTTTCAAATGTTTTTTTTTT:1 - chrX 2415028 5' + FB 174 1 57.14 TTGATCGATATAGTTTAGATTCAATTGAATTTCCCTTAGCTTGGGGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGT:1 + chrX 7092182 5' - Doc 342 1 55.45 AGGAGTCCGAGAATTCGGTCGTGGCTCATGACCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 - chr2L 16396624 5' - 412 7502 2 70.30 GGCCATCCCGGATTGATAGAGTCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3L 11367541 5' + roo 55 2 81.19 CTTGAAGGGCTGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAG:1 + chr3L 14944570 5' + G5 4778 1 60.40 TCCGATTGTTGTTGCTGCGAGCGGACGGAAGCTATCGGCCTGGCGGAAGTGAACGGCCGCCGTTGGCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACA:1 - chrX 4388128 5' - Doc 191 1 72.28 TTTCGCCTGTCTGCAAGAAACCCCCGACAGATGCCAGTTAGCAATTTTTGCCGTCACCAAAAAGTGGCTGTATAGAGCCAAATCAATGTATGGCCGTTACG:1 - chr3R 8180411 5' + 1360 3364 1 60.40 TGCAGCAAAATGCCCTGCCTTGCTTATCATCTTTCTCGTGTCAGGGTTCATACAAAGACACTAGAATAATTCTATTCTTTCTATTATTCTAGTGTCTTTGG:1 - chr3R 7451620 5' - Tc3 242 1 48.51 GTCGACTTCTGGGGGTTAAAAGCAAATTAATTTGAAAACTGTTTATTACAAAAGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACAGAAGCACTCAACAATCATT:1 - chr3L 6505281 5' - 1360 454 1 70.30 GGGGGAGATTATGCTGCTTGTTCTAAGTTTGTAATGAAAATGATAATGGCGATTATACAATAATAAATCAGCTTAACTACTTCAAAACTCAATCGTTTGCC:1 + chr3R 834163 5' - S2 409 1 54.46 CAGCTGCCTAGCACCCTGGTGCCAACGTCCTGCTCTGTTCCTCCGTTGGTCACATACCAGGGTAGCCCAGATGCATGTCGTGCCGCTCGCGATTGTATTAC:1 + chrX 2425505 5' - G5A 2488 1 60.40 CCCCTACCCCGCACACCCCAGCGCATCATTAAATTAAACTTGTATCGAGCTGTTCTTGTCTTCGTTTCTTTTTGATCGCTGTTCGCTGTGTTCCGTTATGC:1 + chr2R 11077115 5' + invader6 118 2 67.33 GGGCTCAAGTACACTTATCGTTAACATGCTTCAAAGCTGGCATATAATTATTTTCAATGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr3L 17652682 5' - pogo 2089 1 73.27 CCCTTTACACAAAAAACTTGCTCAACTCGAGCCATCAAAAAAAGAAAAAAAA:1 - chr3L 13272311 5' + R2-element 3580 1 73.08 TGCGGGGCTGGAAACACACACATTTGTCTCTGATGGTATCAGCGTAGCTGTTCCTTGGTGTGCCCGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTAC:1 + chr2R 10998996 5' - accord2 190 1 79.21 TTCAAAAAACAAACCAACTGGCGTATATTTTGAAATCTGAGTAATACAGGCTGTTATATGTATATATCAAAATATATTTTAAATCAATAATATAAAATATT:1 - chr2R 13104376 5' + G7 1148 1 58.42 ATTGGTTTCCCTACCCTTGAAGGGTATTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3R 7883182 5' + roo 8709 2 73.74 AAATGAAGATTTAATTAAAAAAAAATAAAAAATCCACCAGCAAAGTTAAAACCAGCAAAGTTAAAAAGCAAAGTTTAAAAGTTTAAAAATATAATAAAATA:1 + chr2L 6589977 5' + TAHRE 22 1 53.47 TTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1 + chr2R 19209480 5' + Doc 78 1 62.38 TTTGTTTTTGTTTTTTAATTTTATGGCATTTTCAGGGTCTCTGCGTTAATGGAGTTGTTTTTATTTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGC:1 + chr3R 8924375 5' - Porto1 226 1 62.38 CATATTTGTCAGGGGTTTTGAGGGGAGTCAACCAGAGTGTTGCACTTTTCATTAATGCTAAATTAAACGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:2 - chr2R 21860583 5' - roo 400 1 71.29 ATTAGACACCTTTGAAACAAAAAAAGAGAGAAACCTATAGTCCATTAAACGTTATTATTATTATTAGTGGGTTTCTATGTGTACTGCGTCCCAGTCTGATC:1 + chr2R 5217723 5' - baggins 5408 1 60.40 GTGTTTAGCAATAGGATTAAGGTCAGCTTTAATCAGGTATATTCGCACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 - chr3R 26871096 5' - hobo 2906 1 57.43 TCAGCGGAACCGACTTGCAGCACCTTGGTTACCTTTGTCCACTCTTTATCCGTTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGG:1 - chr2L 3982651 5' + I-element 334 1 54.46 GAATTCGTAATGAAGCCACGATTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 - chr2R 11086451 5' + Doc 62 1 78.22 CTTTAATTTCTGGCTTCTTCTCCCATTTTGCGTAGAGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chr2L 17283470 5' + hobo 38 1 60.40 GAATGCCAAAATGGCTCCGGAAAATATGTATAAAAGCATAAATATTTAGGCGAATTGATGGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chr3L 4637373 5' + hobo 16 1 63.37 CAAAAGCAGCACAAAAAGTGGTTAAAAGGCATTAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCA:1 - 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Quasimodo 6965 2 53.47 CAGCACCTTGCTGCCCTAATCCGCAACTGTGCCGTGTGTATATGTGCGCGTTTGTGTCTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chr2R 16406522 5' + hobo 17 1 63.37 GAAGCATACGCTTTTATTCAATCAAGAAATCAATGGAATCACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAA:1 - chr2L 16674714 5' - X-element 4529 1 60.40 GGCGGCCTGATCCAGGAGGCGCATGTGGTCGCCAGTCAGTGCGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCC:1 + chr3R 30125915 5' - hobo 87 1 55.91 CTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:1 - chr2R 5651910 5' + Tirant 8130 2 58.42 AACTAATTTTCAAGCTGATGCAACAGCAGACGACGACGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:1 - chr3L 13366423 5' - hopper 1377 1 63.37 AAGTCCACACCGCGCCTTAATGTTTCGTTCAATGTTGACAAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTAT:2 + chr2R 4501459 5' + G-element 38 1 57.43 GCCACAAAGTATGCAATACATTTTGGCACGTGGCTTGCTCTTTGTCTCAACTTTTTCGAGAGTCGAGCGAGTCCGTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr2L 4057101 5' - hobo 2937 1 77.23 TGTTCGCTGTTGGTTTTTTGCGGCCAGTTCCCTTGGTGGTGGTACCAATAGTTGAGCGCCAATTATTTAAAGATTGATCGCACCGTCTTGCGATACTGTCG:1 + chr2R 19256412 5' - Gypsy6A_LTR 380 1 67.33 GGTTAGTGAGCGTGGCCAGCCACCAGCACGTGTACCAAGCTTGTTGGCTCTGCTGCTTTGGCCAGGCTGCAGCTCCATCCAATTCCTCCAACTCTTCTGCT:1 + chr3L 22349648 5' - invader3 485 1 56.44 GAATTGGTCACCGACTACAAGCCGTTAAAGACCACTTTTAAGCCAATTTCAAAACCTCCAGCTCCAGGGATGGCTCTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr2L 22726623 5' + roo 8667 2 30.69 CCCTGATCTTTGGTTTTGCGTTGAACATGTTTATTATTATTCATTAGTCAGTAGGAATCGTTCAGCTTATAAGATATTATGGATTCTGTTCCTTAATTATA:1 + chr3R 24720475 5' - G5A 2750 1 71.29 ACAGTTGAATATTGCCAACTTTTTTCAATAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr2R 22521866 5' + roo 47 2 77.23 CTGCAGTATGTCATACTCAATGCTTGGAACCCACATATCTCTTAGCTGTCGTATACGTAATATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr2R 18400613 5' - pogo 2091 1 67.33 AGTACTGGCAACGGACCTGCAAAGGTTATTGGCTTGCATTCTTTGTTGCACAGCACATTTCCGTATGAAATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr3R 19449887 5' + pogo 3 1 76.24 GTAAGAGTAGGCATGCATTTGGTGTGCAAGGACACACAACTTCCTTCGGTTTTTGTAATCTTGAAAGGGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTCAGGATGATTTTA:1 - chr2R 14441202 5' - mdg3 304 1 61.39 TTCGGGAGTATTATGTAAATGCAGATCAAACATGAAAAATTATATCGGCAAGATAGGACGCTTAGTCGAGCACCTTGACTATCAGATACCCGTTACTTAAC:1 + chr3L 4533822 5' - INE-1 546 1 79.21 ATCTTTAGCGCAAACATTCAGATAAGGCTAAACAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACGCAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 + chr2R 7881967 5' - 412 451 2 64.36 TAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTT:1 + chr3L 17215732 5' + Ivk 44 1 64.36 ACTGTAAGCGTTCTTGAGAGGTCCCCATTCTATCACATAGCCAACAAAACAATTTTTGGTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCAG:1 + chr2R 4745282 5' - Cr1a 455 1 76.24 TATAAGCAGTGAGCGGCCATTCCTAATGGGACCTGAAGAAAGTTGGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr2L 21871727 5' + 412 31 2 55.45 CGCGGGGTCGGCGGGTGGGTTGCCAGTCCATGTTGTCTCGGAGTAGTGAAGGAGGGGTGGAGGGCACGGAAAGTACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCGGC:1 - chr3R 10433536 5' - G-element 252 1 73.27 GACTTTGTTAGTAGTTTGCCTGGCGGGGAACAAAAAAAAACAATGCTTACACATCACTACTGCCCGACGTTGCTCACAAGAAAACTTTCGCTACCGCCCAA:1 + chr2L 20142008 5' + looper1 1748 1 69.31 CTTCAATTGAAGTTCGGCCATTTTGGTTTTCGCATTTCACACCCATCGCTTCCCAAATGTTTTAATGTTATTAATATGTTCTACATTTGGTGCACCTAAAA:1 - 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chrX 22630780 5' + INE-1 85 1 49.50 CTTCCCTTTAAAATTATGTTTATTTGTTTGCTTTGGGCTTAATTTAGATGCTCCCTCCCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCT:1 - chr2L 19362456 5' - Bica 4920 1 54.46 TCTAATCAACATCAAACGCTGCCACTCCTGCTTTTGATGTTAGAGGCACTGCCTCAACAACCACCGCCCATTTCTTGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAAT:1 - chr3R 15714238 5' + jockey 8 1 74.26 TGGATATTCTAGAGTTTATGTCTTGCTTGCTTTGTAAGCTTATTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGT:1 - chr3R 15823960 5' + Cr1a 4096 1 70.30 TATGTATGTATGTTTGTCAGTCACATTGCAATCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGTTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 + chr3L 5349108 5' + Doc 54 1 73.27 GCTAAATGAAATCAAACATCGCACACCGATTCCGCGGCGAACCGTCGACGGTTTAGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr2R 19658281 5' + 1360 23 1 58.42 GATTCAATATGGTTTCATATGAGTTCGTTCGTAAACACTGCGTATACTTGATGGTGGTTTTATGTACGATTCGCAATATTGTTAAATAATTTAAATTGTTC:1 - chr3L 18022457 5' + HeT-A 5809 1 86.14 AATTAGGGGTTTTGTGATAAGCAATTTGCATTAATAGCTTAGCACGTGTAAATACTATTGGCTGATTGTTATGCCACACATCACGAATCATTTCATAAAAT:1 + chr3R 23652426 5' + Doc3-element 4625 1 65.35 ATTTATGCCTCGTTGCTCCGCCATTCAGGGTCCTTCATCAAGTCCATTTTCTCCCCTTTTCCACCGCCTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 + chr3R 25443013 5' + 297 6580 1 77.23 CAATTGAAATAAAAACATCCTATAGTATATATCACATTTTGGAAATTCAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCT:1 - 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X-element 4703 1 61.39 CTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chrX 21945938 5' + F-element 33 1 54.46 CACACCCCGGGAAAAAGCAACAATAACACGGCGGCCGAAACAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA:1 - chr2L 8627532 5' + G2 3077 4 79.03 ACTGAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCA:1 + chr4 1301730 5' + 1731 4334 2 44.00 TTGTTGCTAAGCAATTTCAAGGCCAAGCCAGAGTTGTTGTTAGTTTTATTGTTGTGGCATGTGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCATACT:1 - chrX 17171016 5' + roo 8801 2 71.29 TGCTGCTACTGGTGCTGATAGCGGGCATTGGCGGCTTCACAGCCATTTGCACAAAATTGGCATTACAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGG:1 - chr2R 9042056 5' + baggins 5203 1 74.26 ACTTTCGGTTTTAATTTCGCAAATTGCATTTGCCAATGTTATTTATTCAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAAC:1 - chrX 10680734 5' - hobo 373 1 52.48 TGATAAATCTAATCAGTGTCGTGGCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 - chr2L 17056532 5' + 412 52 2 77.23 CGTCAAATGGACGCCGCTGCCCCGCATCCTGATTCTTTATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTC:1 - 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chr3R 12558308 5' + Transpac 205 2 71.29 CGTTCCAAGCTTAAAATCTTTATGCATATTTTATGCGACCACCCCAACAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGA:1 - chr3R 31101880 5' - P-element 2791 1 54.46 AGCCGACTGCAGCAACGTGTGAGATTGGCTCGATAGACAATGCGGCAAACAACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTCATGCAC:1 + chr2L 8381717 5' - invader1 3804 2 50.00 GCGATTCGGCGGCCAGTTCGCCGACCGGACGTGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAACATTCTACT:1 - chr3R 18434983 5' + gypsy4 99 2 76.24 ATTGTTTGGTAACAAAATGTTTGTTTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr2L 16968433 5' + 1360 51 1 78.22 GATGCACTGCCCCTTGTCTGCTGGATTTCGATTTCACTAGAACAAAACCCACACTAACATGCATACTCACTCCCACTCCCACACAACCACACACACACACA:1 - chr2L 12244884 5' + gypsy3 417 1 56.44 TCAACAAATTGTTATTCAAGAGCCGTCAGTGATCCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGCGTA:1 + chr2R 2645471 5' + HMS-Beagle2 6920 2 65.35 TGCCGGTGTCTGATAAGCCATCACATACATTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 24023326 5' + roo 46 2 73.27 CTTAGTCGAATGGTGTGACTATTAGATACCCGTTAGCCAGCTGAAGAAAGTTGGTAAGAATTGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2L 12547722 5' + roo 8699 2 74.26 TTATGTGTATTTCGTATTTTGTTGCCCTGCCCGCCGCTGACACACATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGT:1 - chr3R 9940176 5' - I-element 5317 1 55.45 GTTCGCATGGTAAGACACGTATGCAGTCATGCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCG:1 + chr2R 5200945 5' + 1360 44 1 69.31 TAAGTGAACAGAGAAGATGGGGGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:3 + chr2L 7970970 5' - blood 353 2 53.47 TACAATTGAAACTAATTTGATCCGAAGGCTTAATTTTTATTTATTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAAT:1 - chr2R 12753092 5' - Juan 4172 1 65.35 ATCCATTTGGAAAAATTGAACCAGGCCAGCTGAGCTGGGCGAAGAAACAATGGATTTTGCAGAAATACCCCAGACCTGTATTCCGTACGGCCAGATCGGGG:1 - chr3L 4349661 5' - BS 4661 1 54.46 GCCCATTGATGCCGAATCATTGCTCATGTCAAAGGTGTCTTCTTAAAATTTTTGTAATTTTAAGTTATTTCACTTCGTGGTCACTTTATGGGATTGAGTAC:1 - chr3L 16134626 5' - rover 488 1 70.30 TCACGTAAGGTTTTTCCAACCTTCTTTCAAATGAAGTGCATAAATGATGTGTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr2L 13711463 5' - hobo 2915 1 57.43 TTCTCTTAATTTCCCAGAAACACCTGGCCAGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr2L 19629636 5' - hobo 2893 1 69.31 TTCAAGGCTGCCCCAGTTACCGACCGAAATCTGTACAAGTATTAAAATGCATATCCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATT:1 + chr3R 17622273 5' + I-element 420 1 60.40 TCATATAATTCACATATATTTTTCTTTTCTTCTTTTAAGAAAAACAAGGGAACTCCGAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAA:1 + chr3R 9229953 5' + X-element 32 1 49.50 CAACTTTTTTGGCCATTGTGTTTTGACTGCCTTTGTTGCATGCATAAAATATTTATGCTCTGGAAAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGGCGTA:1 - chr3L 13654963 5' - Stalker 6825 2 71.29 TGCCTTTCCACTATTTGTACATTTTACATTAATTGTAAATTAGTAATCAAGGAATTTAAATTTCCGCTCTTCTTTGATTTTAATATTTTACAAAGAGCACG:1 + chr3R 7564383 5' + TLD2_LTR 112 1 90.10 GCTGTGGTTCCTCTCACACACATCCGAATGCAAATGACTACCCGAAAAGTATAATTTGATATACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chr3R 20369762 5' + pogo 13 1 60.40 ATGGGCAACCAAACTGTATAGTTTGGCCAAAAAGAGAATTTCTCGAAAGGACGAAAATGTTCACATTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAAATC:1 + chr2L 14282501 5' - rooA 343 2 66.34 CAGGCGCTTCAACAAGCCACCCACGCAGCCCCAGGGGAAGGTCCTGCGAAAAACAAGGAGGGTGGGGCCAACTTCAAGTGTATAAGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 21058433 5' - accord 186 2 66.00 TACATAAGTGCAAACTACAAACAAGCTATAACAAGGCAAATACATCAAGGTGTTTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chrX 12276753 5' + hobo 21 1 58.42 AAATGTGTTGCATACATTTGAGGTGATGTGTCTTCACGCCAATTAAAGGTAATTTATTGGGGCAGTAAACAACATTGGCGGACTGGGACAACTGTCATAAT:1 - chr3R 26023308 5' + invader1 217 2 78.22 GGCCATATCCTTTGGCCCTCCAGACTGCCGAAGCTCCACCACCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr3R 28940721 5' + hobo 37 1 58.42 AAGTAAACAAATACTCATCTCCCACTTCTGAGAGCAAATCATTCAAAAAACTCTTGAATGTGCTGCCAAAATGGTATCCAATACCATTAAATATGAATGGA:1 + chr3R 5364328 5' + HB 471 1 61.39 CAGTTAAAATGTAGATTTAAGTAAGTGGAAACGAGATCGTTACGTTGGCGCATAAAAATAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCT:1 - chr3R 16763749 5' - 17.6 308 2 66.34 GTCGACAACAATTGATTTCAAAATATTAATTGGGTAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTG:1 + chr3R 20947300 5' - S-element 368 1 77.23 GTTAGGGTAGAACCTCGCCCCGCTTTATATCGCTCCATAGATATATACCACCAGACCAACTGGTTCGAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 - chr3L 14151407 5' - blood 367 2 56.44 CAGTATCTGATCACTATATCCACAATAATTGTGAAAAAAAACCAGCAATAACACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAAT:1 - chr2R 18629437 5' - mdg3 5494 2 53.47 CTAAGTTTATAGCATACAACGACTATAAAATTGTACACCTTTCGAACAAATGACAACATACTACCAACTATCCGGATGACAGCCAACACGGAGGTGCGGCG:1 - chrX 21668449 5' + G5A 198 1 57.43 CGGGTGTTTTTGTGGTCGCCGGTCGTCATTGCGGACACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTCACGCTGAGAGCGTAAAAA:1 - chr3L 1068565 5' - 1360 3289 1 64.29 TCTGACCTAATATCCGTTTAATCGCCTATGGGTAGGGATTTTTAAGACAAAAATCCAAAAAGACAATAACAGCTGAAATTATTTAATTTAATTGACTAGCG:1 + chrX 21169860 5' - jockey2 3374 1 78.22 CTCAGCTGGAGCTTTTAACTTTCACTTATTCAAAATTGATAGATTTTTTTCGTCTCCGGAAATATTAACCAATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAG:1 + chr3R 29966614 5' - Quasimodo 255 2 72.28 TGCTAAAGGAAACACAGGGTTTTTTTACAATTACAAATCAACTACTCCAAAAACATAAACTCCTTATGAATGATGACAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTC:1 - chr2L 8463298 5' + Juan 2 1 64.36 ACGCACGTGCGTTGCTTTTTGTGAAAACTTGATGTATGTGTGTGGCTATGTGTGGGTGTGTGCGTGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chrX 6146636 5' + hobo 9 1 70.30 GTTAACATGCTTCAAAGCTGGCATATAATTATTTTCAATGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:2 + chr3L 17652701 5' - pogo 2070 1 61.39 ATAGGGGGAGTTGTAGGAAGCGCGAAAAAGCGCTTGTTCGACGGTCCGTCATCAATTAAATCACGCCAACTCATCACGTTTAATTGAATATTCGCGCCACC:1 - chr3R 9154611 5' + McClintock 5986 2 66.34 CCAAGGATAGCTGCTTTTCGACTGGAGTCACATGGAGCAGTCCTCGCCCTTGACAAGCCCTACCCAGATATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 + chr3R 5128993 5' - 1360 3340 1 70.30 GCTCTGTAATTCCACTATTGACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTAAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATC:1 - chrX 5157793 5' + F-element 4408 1 80.20 CAGCAGCCATTGACCTCGCACTGATCTCATTCCCATTGTTAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTA:1 - chr2L 7970491 5' - Doc 73 1 61.39 AGCGTTCAATCATCGGCGATTGTCTTTGAGGCCCGATTCCTTTATGATCAGAGCGCGCTTCACCAAATTTCACCGCAAACTTGCGACCCTTGAGGAAGGTC:1 - chrX 7529011 5' - G7 433 1 65.35 TAATTAAAAAGTTATGAGATTATATGTATGCCTTTTAGCTTTTATAGTTCCTGAGGTCTCGACTTTCATGTCCAGATTGACTCGGCTATGGATCCTGATCA:1 + chr2L 21336121 5' - INE-1 91 1 76.24 GGGACAAGTAACCCAATTCCTGGTCTTAAAGGGTGCGAAACAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2R 10345609 5' + roo 35 2 60.40 CATTACGACCAATGTAGTTTGTGTAGGTTTTTGTTTCGTTTTCTGCGTTTTTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATG:1 + chr3L 12055767 5' - Porto1 353 1 54.55 GCTAATTGAATCAAAGCAATGTCCTGGCACACGCGTCGGCTTAATTGCAAAATTGGAAAGCATACTTTTGGGCGGACGTGAAAAAAAGGTCTCTGAAGCCA:1 + chr3R 15562853 5' + Tc1 1187 1 73.27 AAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr3R 15054280 5' + hobo 12 1 67.33 AAAATACATATATAGCCATTGCTATAAGTTGCAAACAAACAAATGTGTCACCCCTTCAACCGGATAAAACCCATCCACTAGGCAGGCACATAGCCACGTAG:1 - chr3L 19018848 5' + Tom1 142 1 35.64 GGTACGCAGAACAGGGCAGCACGGTTAGCAACAGCTACAGATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGT:1 - chr3R 13750964 5' - Doc 4414 1 60.40 TAACAACACGCAGGGCGTTGCGGATTCGAAATGATATCATTGCCGTTGAGGCCTACTTTTCAAGCGGATATTGGTTATTAAAACACAGAGTGCATTTCGGA:1 + chr2L 12574183 5' + mariner2 203 1 63.37 TGTATGTATGGTTCATATTAAATTTTTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGT:1 - chr3R 6986051 5' + Tirant 203 2 75.25 GACAGATACAGATAGGAACAACGAGAATTGTCCATATCATTGACTTGGACCACGTACAACTGACCATGGGAAAACTAACTAAAACTAAAAAAAAAACTAAT:1 + chr3L 26386143 5' + rover 6829 1 78.22 GGTCATTTAAATCTGGCCATGGCTAACTTGCCAAGTCCGTTCGATCCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 + chr3L 14149846 5' + blood 7079 2 55.45 CAAATGTATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATG:1 + chr3L 21912254 5' + Bari1 25 1 57.43 CAAAATATTAACCACTGTGGAGGACACAGGGGACAATAAGGTTCTCAGAATCTTTGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAG:1 + chr3R 19445733 5' - F-element 4276 1 46.53 AGAGGAGGAGGCCAAAAAGCGGTAAGCATGCATTTAATCTACTGTATTAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGG:2 - chr2R 9285602 5' - gypsy 7417 2 46.53 CAAATTGGGCTGGCAAACAAGTGTGCCTGTGTGCGTTTGTGTTCCGCTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr3R 18449003 5' - hobo 2907 1 55.45 CCATCTTTGAAGAAATTGAGTGCTGGCAATCAACTAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2L 5653543 5' + hobo 42 1 68.32 CCGAAAACCCAAAAGGCAGAGACAATGGCACCAGAATAGAATAATAATAATATAACAGAGTGAAAAACCTAAACTCCAGATAAGTCACCCACTGGTAGACT:1 - chr3R 30356065 5' + Idefix 6985 2 71.29 AGTCGAAAAACTAAATGTTGCTTCTTGGTTAAAGCACGAAAACAACTACATTGAATTATGCGCCACATGGTGTACTTAATAATTTTAAAAAGTGTTTTAAG:1 - chr2R 18323868 5' + pogo 1897 1 93.07 ATACATATTTAATGATGCGGCCTACTTTGCAGCTGACAAAACTTGCAAAGTTGTCTGTTGCTTTTTAAAGGTTGCACCAAAGACACTAGAATAATAATAAT:2 + chr3L 22978520 5' - Tc3 308 1 76.24 GCCGGACGAGCACTAAATATAGTTTAGCATGGCGCACATTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 - chr2R 15911076 5' + FB 33 1 62.50 CCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATC:1 - chrX 21668070 5' + Tabor 6876 2 60.40 TGTGAATAAGCAAAAACGTTGCAAGGTTGCGTTTATTTAGTTTTTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCTAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTG:1 + chr2R 19152648 5' - Porto1 4484 1 60.40 CGAAGCCATCCTTCTGTCACGTCGTAATTCTGCATTTTTTGCCAAGAATTTGTATTGAAAAATCAATGCAACAAAGCTCGAATATCAGATACCCGTTACTC:1 - chr2L 16936495 5' - INE-1 549 1 79.21 CACAAAATATGTCTCTGTTTACATTAAAAACCTATGTACTCTTAAGACCTACACACTAATTTAGAAAACAAATGTAGTAAGCTAGAGGTACACAGACATAA:1 - chr3L 25824642 5' + invader2 4866 2 56.44 TTCAGCCACATACTATAATATATATTGTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr2R 12130652 5' + hobo 47 1 78.00 TATATCCCTCCCATCGATGATGATATAAAATCAATATGTCTAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr2R 19658354 5' - 1360 3354 1 63.37 GCTGACAGCTGCACTTACATTGTATATTGGCACGCATCATGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAA:1 - chr2L 21917426 5' + 17.6 7327 2 61.39 AGATTTGAAATGGGTTCGAAATTTAAATAACTTTTCTGTCTGCTCTCCCATTTTTTTTGTATTGTCTAACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - 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chr4 828353 5' + invader1 306 2 66.34 AAGAAACTCTATAATGGCATACACGGCATACACACTCACACTACACCCGTCCCACTCCCACACACATCAATACTAATGCACACCGCATTTTTCTGTACGAT:2 - chr2L 16017535 5' - invader1 3784 2 62.38 AGCAACAATAACGGACAAAGTACAACAAAAGAGGAAGTATAAGTCAAATCTTTAATAAATTAACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 + chr2L 17558839 5' + 1360 25 1 68.32 GTGGGGCTAAGCAAATAGCCAAAACTAAAGTTTAACTCGGCCGAAATGCTGTATATATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCC:1 - chr3L 5208165 5' - accord 7168 2 59.41 TGCCGTTCATTATGTGCAACTCGACTGGCTGATAAATCTAATCAGTGTCGTGGCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr2L 17056561 5' + 412 23 2 56.44 GTGTCTTATCGTCATTACTGTCGATATTAGAAAGAAGATTAGTAATTTTCTTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCG:1 + chr3R 2875029 5' - Doc 451 1 55.45 ATTTCAAGTGCGACGCAGTTGCAGACGATCGAAAAAAGGACTCCCCATATAAGTATGTATGTCCAATATATTAGGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACT:1 + chr3L 18346897 5' - Gypsy6A_LTR 272 1 63.37 TTCAGTTTGCCACCGACCAGAAATTGGTCGTCGTCGGACCAAAAAACCAAAAACAAAATTGACCGAAAGCTTCACTAAATCGTTTTATGAGCTTTTAAAGG:1 - chr3L 15186321 5' + transib2 143 1 60.40 GTCAATTCGACGGCCGGGAAACTCCTTCAACTCCGCACAGACAGACTTTCAACTATTTGCAAAATATTCTCGCCCCCGCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTT:1 - chr2R 22033956 5' + blood 7177 2 74.26 GTAATCTTGCACAATGTGAATAATCTCTGCTGGCCATTAGGGCAGCCAACAAGTTTTGCTTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACAT:1 + chrX 2838629 5' - 1360 178 1 63.37 TGTTATCCCTATTTTTAGCTCATAACAAGGTTTCCCCCCACATAATACAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAA:1 - chr3L 12648016 5' + jockey 4773 1 52.48 GGCGAAGGAAGATGGCATCATGTTCGTCATGTGCGAGTGTAATAAATTTTATTAAAAACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chrX 18991617 5' - pogo 2085 1 65.35 AAACTCAAACTCGAACAATTTCACGTTCTGCGGAAATATAAAATCAGTTCGTTACACTGTTTATTGCAAAAGTTATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACAC:1 + chr3L 5614520 5' - 1360 472 1 67.33 AACCAACGACTACGCTTACACAATGGTATATAGTCCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chrX 22690753 5' - roo 9031 1 64.36 GAGGTGAACAGAACAGGATGTGTTCGAGTGGATGACACTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:2 + chr3R 8914484 5' + roo 8702 2 66.34 GTTGGACGAAGCGGCTCTTATCGCTGAACTTGCGCTTCGCATTGCACTAGCTGCCAAACACCTTGATATGGATTTCGCGCTAATTGAAAACCTTCAACATC:1 + chrX 15703393 5' - invader2 4644 1 59.41 GCATGAGTTACTAATGCAAACATCTAAAGTCTAAATCACAAAGTAAGCATTAAATATTTACATAAAGCCTACCCATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:1 - chr3L 13608413 5' - mdg1 7458 2 74.26 ATTTCGACGCCCTGATTATCGCGCTCTCATTTCCTCGCACTAACGTAGCGGGCGCTACGTAACGTAGGGCTACGCATGATGAAATAACATAAGGTAGTCCC:1 - chr3R 28330943 5' - P-element 2881 2 73.27 GCTCGATTCGGTTTGGCTTGCTTTTGGCCCGGCATTATAATAATGCTCTGGTAATAGTTCGATGGCCATAGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3L 14285099 5' + roo 8669 2 75.25 TTAATGATGATCCATTTCTTAAGGCCCGTTATCCAAAGAAGACTTCATCAAGATACATACATTTGGCATTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 + chr2L 7600883 5' - 1360 3327 1 66.34 CATATATGAATTGCACGGTCTTGTTCCTTATTTTTTTTTGATTGCTTGTGGGTTTAACTAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGC:1 - chr2L 21031939 5' - I-element 50 1 64.36 AAGGGAAGAGAAACACAAAGGCGAGTGATGGGAAGCCTTAAAATAATTTGGAAGAACAAAAATAAAGTTAAATCTGTTATCAAAAGTGTGGGCGTGACAG:1 + chrX 8375836 5' - INE-1 249 1 76.00 GCATGGTGGTGACTACTGCCACTCTCAGCCCGAGAGGCTTGGTTGCTGCTATGATGGCGGACAAAATCGTTTGGGATGGGGCTCACGTGATCAT:1 + chr3R 7100507 5' + Rt1a 4705 1 77.66 GCGACAAATCGGCCGAAAACCCAAAGACAAGCCGCACACGCATTGCGGCGAGTGGCATATGCAAATCATCCTCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCAAG:1 + chr3R 14186072 5' + G6 1704 1 75.25 AGTGAAACGTATTGGTTTCCATTCTTTTATTTAGGGGTCCCTCGCTGCAGTCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGT:1 - 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baggins 5062 1 56.44 CGGGGAAGCGGCCTAGTAACAGCGAAGACGGCTGGAATGCAAGAAGAGTCAAGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTAC:1 + chr3R 2446835 5' - 1360 3155 1 54.74 CGTAGCGAGTGTATTAGAGAGCGCTGCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 - chrX 10437602 5' - hobo 2890 1 78.22 CAAAGAAGAAACTCTGGGAAATACGCAAAATGTGGGGATGGATAAGAGGTGGAGTCACGCTGTCGCTCACAGAAAAATACAAAAAATGTAAAAGAAGGAAA:1 + chr3R 22207496 5' - copia 128 2 79.21 TATCGAGGGAAATGGCGACTAGCTCAGCAGGGTCTAGAATAAAATATACATATAAATACGTATAATGCACCAAAAATGTGTATAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 10317347 5' + HMS-Beagle2 480 1 56.00 GAAAGTATGCAACAACATTGCGTATAATTAAACGCACGCATGCCTTCTTTTCATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3L 10035709 5' + jockey 56 1 50.50 TAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTA:1 + chr3L 19951221 5' + Ivk 52 1 77.00 AACAATGCATTCCACCTGCTTCCACTACGCAAAAGTTGGGCCAACATCATACTAATTGGGATTAGTATGATTTTGGGGTAATTTTGTAAACGTTTGGTGGG:1 + chr3L 5072154 5' - I-element 195 1 49.50 ATTCTTTTGCAGCGAACAGAATGTTTGAAAACAAAAAGTGTAATAAAATGTATTGGGAAAAGGGGATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTG:1 + chr2L 17284910 5' - hobo 2607 1 66.33 TAGTCATCATCCTGTGGAACCAGTTTCTTTAAACTTCTCTGATAAATTCCTCATTAATCTTTGGACCAATTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACC:1 + chr3L 526585 5' - FB 17 1 72.28 TTAGACATTAATGTGTATGTGTGATTGTTTACTTATTCCTAATTTTTCATTTTCAATTCCTCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGAGACC:1 - chr3L 26007755 5' - G5 4758 1 50.50 GCCGCAAATATTTTTTAGATACACTGCACTGAAACACAAAACCCGATGAAAATTTTTCTTCTACATAATCCATTTCAGAGCCAAGAATAAACATGAAGATC:1 - chr2L 12592998 5' + Bica 134 1 45.54 AGACAGAAAGTAATTGCATACTTTGTAGCAACTCAGTTAAATAATATGTTTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCG:1 - chr2L 18513536 5' - 297 6954 2 64.36 GTCCGCTCTTATATTTAATTATTAATGTTCATTCGGTCCGGCCAGCGTCTTGTGGCATTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGC:1 - chr3R 20409690 5' - hobo 176 1 63.37 GCAAGGGCTGTTTCCGCATTGCCAGTTCCGAGATCGGCGGTGGCTTCATGCCGCTAAGTGCCCCCTGGCCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCTG:1 + chr2R 5082168 5' - Bica 168 1 74.26 GCTAAACTCAACCACATATACTGAAAGCACTCACAAACACGCAAAAAAGAAATAAAAAAAAAA:1 - chr2L 12548862 5' + R2-element 3585 4 69.84 CCTGGGCCCAGCTCTGCATGGTGGTCCTTCAAATCGACGCACCTGGCATTCAAAACATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACAGATCACCCCACCAACAATG:1 + chr3R 29153016 5' + HMS-Beagle2 6798 1 81.19 TCACACACAGCTGCAGTGTCCTTTTTATATAGGAACCCAGTCGGCAGGCAGGCAGCATTTATTGGCTGACCGGACTCGTATATGTCGAAAATCG:1 - chr3R 28048398 5' - Rt1a 47 1 72.34 GATCTATATGTTGCTATGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCT:1 - chr3L 2440105 5' + opus 352 2 82.18 AAATGAGAACCAAGATATTAAGATGGAAAATCAGGTACCAAAAGATCTGGAAAAGCAAACTGATGAGTATCCCATATCAAATAATTGTACCTACATATTGC:1 + chrX 14836982 5' + HeT-A 5976 1 69.31 CAACTTTTTGCAGGCATTTTTATTACGAATTTGTGTTTTTGAAGCCCGCTCAATTCTCGATCTTATTTATTAATGTCTGTAGCGAAAACGTATCTGTACAA:1 + chr2L 1697214 5' + Gypsy12A_LTR 2151 1 59.41 CATCATTGCCCCACTGTTGGTCTAAAAGAAAAAAAACCAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGGGAAAAGGGG:1 + chrX 5173440 5' + Bica 341 1 87.14 AAATCGTTTTTTATTTTTTTTTTTGTTGCC:1 + chr3L 8041910 5' - G2 3072 2 93.33 TTTTCGAGAAAAGGGCATACGTGACAGCCTACCTCGAAAAGCAATTCGAAAAATTACGGTTCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGA:1 + chr2R 911250 5' - 297 390 2 66.34 GATGTCTTAAGATTTAGACCAGACATTTTTAATTCACGATATACTGTTCGGCACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 + chr3L 25608312 5' + Doc 25 1 50.50 GTGCTGGAGTAGGCGCAACTGGCGGAGCTGGAGTGGGAGCCAGAGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATG:1 - chrX 19067181 5' - G2 81 1 63.00 ACTATTTTCTTAGATTTATTTGTTTGTGACGTTTCGTTTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTC:1 + chr3L 15635079 5' + Max-element 8275 2 65.35 TCAGAAACCGACAGCACACAATCGAACGAATTGAAAGGCAGAGGGATATATGTGCATACATATATAAAGATTACATATTAGCAGATTTGACTGCTCTCTTT:1 + chr3R 9200136 5' + 297 6738 2 85.15 GATGGCGTATGCATATTGTGAGGTGAACAGAACAGGATGTGTTCGAGTGGATGACACTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:2 + chr3R 8914465 5' + roo 19 2 60.40 TCAACGTTCTTCAACGAAATAATAATTTTGACCGCTGCTGTAAATCAAATCTTAATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTGAT:1 - chr2R 8537925 5' - flea 4995 2 60.40 GATGAAAAGTATGTAACAGGCAGGAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAG:1 + chr3L 19471447 5' - 297 389 2 67.33 CTAATGGATTGAGGTGATTAGTGCACCCAGTTCATATAAAACCATTACGGATCCAATAGTATCGGTAATGAAAGACAATTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chrX 4056234 5' + roo 1 2 78.22 GCCCTTACAATAATTAAGCTTTGTTTAGCTTAAGTTAAATATATTAATGTCTAGTATACTAGTATACTTATTATTACTTATTACTTACTTACTTATTTTTC:1 - chr3R 6786894 5' - looper1 343 1 65.35 GACTGGATAGCTCGGAACCAGATGTTTTATTTGTAAGTCTGTGTATATTCTCGTTCCGAAGATACTATGGAGCTCCAGTAATGATTCTCAGAATCCTAGAC:1 - chr3R 5671868 5' - Doc3-element 4389 1 77.23 GCGCCAAAAATTTGCGGCTCACGAGCGCATCGCCAACGTGCCACAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGA:1 - chr3R 18506963 5' + I-element 425 1 56.44 TTGGGCGGCATATCATATATCCGTATACAGACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:2 + chrX 5151936 5' + 297 6617 2 78.22 ACATATTCCAAACAACCGAGTTTAATCGTGATGCGCTCACTGAAGGGGAATCTGTCACGACATAACCAAAGACATTAGAATAACAAGATGTGTAACGGCCA:1 - chr2L 22544962 5' - 1360 3375 1 62.38 ATGTTCTGGCAAGGGGAGAAATACACTTTTAAATTGTAACAAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTGGTTTTTCTTTTTAATATGTTAATTAGGGCCTA:1 + chr2L 20983058 5' - HB 1348 1 70.30 TTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr2L 13598182 5' + pogo 23 1 55.10 AGACAATGACAGCCAAGAACACTCCCAGATAAGTCTCTGGTCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:2 - chr2R 6783231 5' + Tabor 35 2 56.44 ATGAAAACTTGACTTGATTGTGACATTTAATTTATCGAACTAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 + chr3L 18141950 5' - blood 341 2 58.42 TGCCTGAAAGAGCAGGGAAATCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAAACGATTTTCGGGCCGAAATCA:1 - chr3L 12233917 5' - 1360 3187 1 77.23 TTATATTCCATTGTGAAAAAATCTCTTTTACTCACAGTTTGCAGATCACATCGATCAGCAGCGTGGTAATGGGCACCGCGTCAATGTTTTGAATGCCAGG:1 + chr2R 13419112 5' - HMS-Beagle2 6760 1 75.00 AATTTGTTATTGAATTTACACGCAAAAGCTGGAACAGGAACCCCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCAC:1 + chr3R 31376842 5' + Tirant 120 2 62.38 ACCGACTATATGAAAAATCCGCAATTACTTTTTGGGCAACCCAATATATTGTAGTTGAACTTTTGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAA:1 - chr2R 2753223 5' + R1A1-element 5304 1 73.00 TTTCTCGAGCAAATAATTCAGCAAACATCAAGGAGAGCGCAGAGCGGGAGAAAGGACACTAAAAAAAGGGCGCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr2L 11804987 5' + P-element 4 2 71.29 CGAGCAAATACCCAACCCCTAATCTCGGATAATACCAAATCTCCGATCAGACTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGC:1 + chr2L 17292629 5' + I-element 364 1 57.43 TTTTTTTGTATTTCAATTATATTTTGGGAAATTCCGATTTCTGATAACTCATAGAGGCCCCTCCTCAATCTCACTCACATTCGAAATCAGTCTTAAGTTGA:1 - 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chr2R 19244575 5' + Burdock 6163 2 55.45 CCATCATTACCATTTCATTGTTCGGGCTTACACAAAAGGCAAGAGAAGGGCGATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2R 14744216 5' + roo 24 2 56.00 TTATAAATACGAATTTGTTTTGTGGTGTATACAAAACATCCGTGCCTCGCACGCATATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr2R 10191688 5' + 297 6595 2 67.33 CGTGGGATTCGTTTATTTTGCTATTCTCTTGTTTGCTTGGTGCTCCTCTTCTTTTCCTATTTTTTCTCTCTTTTTCATTTAGACAAATTGTTGATAATAGT:1 - chr3L 5194764 5' - transib2 2405 1 58.42 TGGGGCAACAGTAATGGTGTCAAAAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACGACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTTTT:1 + chr3R 14016649 5' + 1360 3228 1 50.50 TTGGGGACTGTGACTATGGGGCGGAGGCTCCTCCCGTTGCCAAAACTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACGTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGCTCCAAGT:1 + chr2R 10290833 5' + Cr1a 4096 1 54.46 CTCGACTTTGAGCTGTCAAAGCCAGCTAACTAAACTGACCTAAACCAACAAAACTGTCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACGGCTACGACCG:1 - chr3R 10433982 5' + gypsy6 14 2 52.48 GTTCCAGCATTTCTGCAACACGCGAGCTGCTTGGCTGCGCAGCGGGCACCTGGGTAGCTGAAGATGGCTCTTGGTTAGCATAGCAGGTGTTAAGTTGTCAA:1 + chr3R 9332954 5' - mariner2 684 1 78.22 GGCATTCCCATTGTTGTAGTGTTGGAGGATTCAGGAAAATTGTCAGGCAATAAATCGATGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCA:1 + chr2L 22035477 5' - accord 7068 2 65.35 GACACTTGGCACACAAACACAGCGAGTGCAGAGAAGTAGACTGGCAGACCCCCCCGCGCACCCACAAGCTTGGAACAACACCACGCAAAAAGGCTCTGAGA:1 - chr3L 7408888 5' + G6 366 1 67.33 GCCACTTATCCGTGCCCCCGCTTAATTATTCAACGACAATGGGCAATTGTCAAGGGCGACTGAAAAACCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr3L 11367483 5' - roo 407 1 68.67 ACTTAATTGCACAGAAGAAAAATTAAGAGACAAATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr2R 3032558 5' + opus 7040 4 69.31 TCCATATTATTATTGATTACAGGCAACATTTGAAGCTTTTCCTTTAGTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTTCCCATTTTAATAACTTTGTGCCATAA:1 - chr3R 10109072 5' - pogo 319 1 71.29 TCCCATGTCCCTGGCCAATCTTAATCTGCTGGAGTTCCTCAACCTAAAGAACAACCTGCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGGTATCAGAAACCC:1 + chr3R 31659647 5' + G2 357 1 59.41 CAAGAACGCCCGCATCGCATCGGGAATTTGCCAGTGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAA:1 + chr2L 1019806 5' + 1360 330 1 68.32 GTTATTTAAATATTTCGCAGGACCAGCCGGAGGAAGCGAATTCTGAAGGCTACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTT:1 - 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chr3R 972120 5' - Quasimodo 7333 2 69.31 ATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCT:1 + chr3L 17215726 5' + Ivk 38 1 58.42 GCAGCACGTTTTTGCCGAAAGCCGAAGCTCCGGCCAGGATGTGGGTGAACTTGAACTGAGACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAA:1 + chr2R 11689714 5' + pogo 1740 1 63.37 GCAGAATATTTCCCAAGCCCAAGCAAGCCGACTTGGCTTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:2 - chr3L 18142007 5' + blood 7050 2 64.36 TATTACTTTTCCATGAGCCAGGCATTCAAGTTGAATTCTACAACAGTTAATGGGAATGTTCCTTTTTTTTTTTATTATTT:1 + chr3R 28985007 5' - Rt1b 5148 3 71.25 TGTGAAAGTTGGAAAGTGGAAAATACTAAATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGG:1 + chrX 17943975 5' - I-element 4993 1 71.29 GAGTGAAGCTTTCATCCGTTTTCCGTTTGCTATTCACTCGGCCCCCAAAAAAGAACAAAAAAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3L 13164660 5' + pogo 13 1 63.37 GCGGGTCTCCACTGAGGCGTCGATGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTTAACGTTATTTTTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACA:1 - chr3R 19991720 5' + copia 4890 2 52.48 ATGCCTCGTGTGTATACTTTGTGTATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTATTTTTGTTACCGCCTAAATTTGAAGGTTTTTTTTTTTGTTTT:1 - chr3R 29091436 5' + Tc1 1470 1 56.25 CTGTTTTCGGTCGCAAATTGCAGTTGGAGCTCGGTGACAACCACAAAAATAAGTGTTTACAGCATTGATTACAAGAAATGCTATGATGTTTTTATTATTTG:1 + chr3R 15714102 5' - jockey 4989 1 79.21 AAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAG:1 + chr2R 12185329 5' - accord 7355 2 55.45 CCGAATGCCAGAAAGTTGGCCCTGGATGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGG:1 - chr3L 8873929 5' - Quasimodo 7020 2 73.27 TGCCCCAAAATGTATGCTACGCTTTCTTCACGCGACCAATTCGTGCGAAAGTGTTTATTATCATTATGATACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chrX 12135734 5' + jockey 15 1 68.32 GAATAAGCCCAAAATGAGTTAGGAATAACAGATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGT:1 - chr3R 6425889 5' - copia 210 2 78.22 CAACTCAACTTATGAAGCAGTCAACAAAGTGAAAGTGAAATATATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 - chrX 11463698 5' - flea 4990 2 57.43 GCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAAC:1 + chr2R 2949038 5' + I-element 413 1 63.37 GCTCAGACGAAATTAAAAATAAAACGACAACGGACGAGGGGCGTAGAGCCCAGAAATTGACAGACCTCGTGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGA:1 + chr2L 16396542 5' + 412 7 2 73.27 GGTACTCGGCATTGTGCATATAATCAAAGAAAATTACTTTATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 - 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1360 151 1 61.39 CACCCACACCAGCATGGGGGACAGCAGACAGGCCCAAAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATA:1 + chr3R 11770895 5' + I-element 243 1 62.38 TGAGAAACAGCAAAATTGACAAGCGCAACATTGAAATTGCTACAATGACAAGTTCTACATCATCAGCATTCATGGACAAGAGAAGGCCATATCAGTCGATC:1 + chr2L 4045242 5' + Chimpo 4073 1 56.44 CTGCTTTGATAAGTTATCAGCTGATTATAAATGCATTCGTATTAAAAATAGTCCAAGTCATTAGTGATTATAGCTGGCAAATTACCTCACGAGATTAGAAA:1 + chr3L 14552078 5' + BS 420 1 74.26 AAAATGGTCATAAACTCACCTGCACAATCACACAATTTAGTTTTCGAGATTAATCAGCCAATAGTCAATTCTTCAATTATTATCCACAAAAGAACTAACGC:1 + chr3L 4878087 5' + rover 430 1 67.33 GATCTTTCTTAGCTTAGGTCAAATCGACCGCAAAATGTTCCATTAAATTGTTCGCTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATAT:1 + chrX 3690420 5' - invader2 4702 1 60.40 CTCGGGTATATTTATCTTTTAATTGCGTTTTCTAATTGTTGTTCTTTTAAATTTGCTGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 + chr3R 31188724 5' + I-element 19 1 60.40 CAGCGGAAGTTGTGAGGAAATCTTTAGCGCAAACATTCAGATAAGGCTAAACAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACGCAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chr2R 7881948 5' - 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chr2R 11699051 5' - 1360 37 1 56.44 TCATTTCATTAACTTCCGGTTAACTTTAAGAAGACATTCTGAGTGACTCCAACCAAGGACTTTTTGCTTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:1 - chr3R 12058711 5' - roo 9063 1 73.27 TTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAA:1 + chr2R 5879209 5' + gypsy4 440 1 83.17 CAATTAGAATTTAGTGGTTTTGGCAGCTTACTGGGGCAACAGAATATGACGAGTAATCAACCCGAAATCAATCGTATAAAGGTATATGAGACCAAGTGGTT:1 - chr3R 19982874 5' - G5 4750 1 58.42 GTACATATGCCGCACCAATCCAATCAAACTCATATAAATATGTACATACACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr2L 2912107 5' + 297 21 2 59.41 GGGATTTGAGTGTTGTCCTGCATGTCGTCTGCTGTTTCAGGCTGTCGTTAGGCATCAAGTCGGGGCATCTTGACCCTTCACATACCCTTCTCCGTCCTCCT:1 - chr3R 28199188 5' - gypsy8 4476 1 78.22 CAGGGGGACAAGTAACCCAATTCCTGGTCTTAAAGGGTGCGAAACAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr2R 10345605 5' + roo 31 2 56.44 CATAAAATTTTATAATTTATGACAATATGAGGTGTAGCCGGAGCGCCGACTTCACTCCACTCCATAACTTTCTAACTTTTATAGTTCCTGAGGTCTGGAC:1 - chr3R 4838974 5' - 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mariner2 462 1 68.32 TGCATTTCCTAACGGTCATAAGGTAGAAAATAAGTTCATTCGGACGTACAGAGGGACAAACAAATGGACCTAGCCAGATCGACTCGGCTAGTGATTCTGAT:1 - chr2R 558655 5' - INE-1 93 1 67.33 AATTGCAGGGTAATGAGAGTAGCCATCATAATTTGTTTATTGAAATCAATACTTTCGTTCTTCGGGATTGCGAGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACATGAC:1 - chrX 13635591 5' - Idefix 242 2 73.27 ACAGAGGCAGCGACTTCGGCAGAGGAGCTACAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chrX 409641 5' + P-element 45 1 34.65 TTGGCTGGGGAAAAGTTGAGGAATAAAGCCAGTTGCAGGATTGTTCCTCACACTTCAATACACTTCGAGAATGAGATGATAGCAGACATTATGACAAAGAA:1 + chr3L 19356720 5' + 1731 4208 1 71.29 AGATTTGGCATCGATGCAATATGTACAAAATAAAGAAAGCGAATGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAAT:1 + chr3L 25331162 5' + F-element 161 1 70.30 TCATGGAGAAACGCCGACGTGCCCGTATTAACAACTGTCCCAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTT:1 + chr3L 8677385 5' - Idefix 425 2 64.36 AGGAGAGTTTGCTATACTTAACGCGTGGCTGTAGTACGGTATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTG:1 - chr2R 24509896 5' - G2 2656 1 60.40 CAGCCATTTATAAACTACACAGTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 + chr3R 20396557 5' + I-element 56 1 76.24 AGAGTATCGTGTTTTATGCTGAGCGATACTGTTGTACATGGATTTGGCTATTTCTAATCTGTTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAA:1 - chrY 3605109 5' - 1360 293 1 68.32 GAATTATTCATAAAGCCAAGTACCAGATAAATACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr2L 5741366 5' + 412 7098 2 70.30 TATGTTATATTTAAAATGCATTCCTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:2 - chrX 14500139 5' - roo 9020 2 76.24 TTAATTATTTAGTATATTTTTTAAGTCATTTGACTTAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGAACCTCGTGCTTCAAGATATGACCAAAG:5 + chr3R 6343940 5' + 1360 485 1 56.44 GGCGAGAACAGAAAACAGAAAGCAGAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATAT:1 + chr2L 17712752 5' + accord 74 2 75.25 AACATTTTCCTGGACACCATGCTCTTTTTGTCCCGCTGCAATGTTTCCTGAGGCCTCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGACGGGGGTACCTGAAAA:1 - chr2L 15223231 5' + TAHRE 10109 2 65.35 TAAAAAACCAATTGCAACATGAGTAATGACTAACCACGAAGCAACCGCAAAAAAAGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGA:1 + chr3R 26033503 5' + Doc 4492 1 53.47 TTATAACTAAAAGATGTAACAAGGAACTTTTTGGCGCTCAAAAATACAATATAACTTACAAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATACACAGGTACCAGTT:1 + chr3R 24401129 5' + Ivk 4953 1 65.35 AGTCGAACCAAATAATGTCCAAAACCGCCCTCCGATTCCAGTTGGGAGCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTA:1 + chr3R 29453321 5' + I-element 112 1 52.48 TGTTAAAAACTCCAAACAAAAGCAGGCAGAAGCTCGAGGACTTCAAGGTGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTT:1 - 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F-element 4323 1 66.34 CGAGACCCAGTTATGATGGATAGATAGATGTCTTTTGGGGGCTATGCCCATGTAGGTGCAGCTAGTTTTAATCAGCAGCATTAATTTAATTTAATTTGATT:1 - chrX 2536759 5' - TAHRE 44 1 62.38 TTGATTTATTAATTCATGTAATTTGCTTTTCACGGAATGATTGACGTTCAAGCCTCGCTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTG:1 - chr2L 77750 5' - Idefix 394 2 61.00 TTTAGAGCGAATAAGTGTAAGAAGTATATTGTAGTAGCGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCG:1 - chr2L 18198027 5' - Doc 240 1 63.37 TACGTTTAATGTGTGTCACACATTCCACGGCTGGTGATTGATGGGCGCCGCAAAAAACCAAAAAGAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 - chr3L 10565376 5' - pogo 2096 1 72.28 AGAGTGTGATATTTGCTGTTGGTATTGAAACTTGGCATGTGCAATGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chrX 19820040 5' - hobo 2905 1 61.39 TCAAGGGGGAATTTGTATCGGCTGCAGGAGCAGGACGAGAATCCACCGCCCTTCCAGAATCTGTTCGAGGAGAAACCGAAGCAAACCAAACCCAACCCAAC:1 + chrX 4078309 5' + G2 101 1 75.25 ACACTAAACACAAATGCGCATGGAACTCACAAAAACATATAACATACACAAAAATGTTAGTGAACTACAAATCTACATACCTGTGCTACTGTTTTCCATGA:1 - chr2L 12260673 5' - transib1 268 1 76.24 ACAACCATTTGGCCAGAATGGTGTTTGAATTCATCGATGGGCACACAAACATGAACCACACTTGCCCCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 7037210 5' - 1360 3382 2 73.27 TATTATATCAAGTATATTTTTCGTATTGTCAACCTTGGGAGAGCGGAGTTAGAAATTGTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3R 21969138 5' + hobo 18 1 60.40 GTTTTGTTGCAATAGTAAAGTAGGGAAATATAAGCGCAAATAGTAAGTAAGTAGTAAAAAATAAACGCGAAAGTCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 + chr2R 4582641 5' + 297 1 2 79.21 TTCATTGGCATATTTCGCTGGCAGTCAAACAAAAGACTGCACAAATACTCGCATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr3L 8460334 5' - copia 248 1 57.43 CGGCAGCAACAACATAGCCATCACCAAAAAACAGATAAGGGGTATATGATTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCCAGTCGGG:1 + chr3L 14894725 5' - Cr1a 4079 1 68.32 CTCCGCAGTTGCAAGTTGCTGTAGTTTCCGGTCGAATTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTG:1 + chr3L 479759 5' - F-element 4331 1 63.37 GAATTTAGAACATATTGAAACCCAGTTGGTTGGTTTTCGGTTTTATTTTATTTATCTTTTCTTTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 - chr3R 22580402 5' + Doc 18 1 62.38 TGAGACAAAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr2R 17346002 5' + hobo 39 1 62.38 GATATATGTTTATTTATGTATTTTGAAATCTTAGTTGCAAAATACATAAATAAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAAT:1 - chrX 17254082 5' + roo 8602 1 72.28 AACGATATATATACATATAAGACATATAATGAAATATAAACTAAGTCTACTTTTCTTTAATAATCTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAA:1 + chr2L 11595971 5' + 3S18 14 2 58.42 GTGTTGATTGAGTGTGCGGTATATTTAAGAACTATCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3R 24764561 5' + jockey 56 1 71.29 TGATGCGACAACAAAAACTTTGTCTGTTTACGTTTTCGTTTTGTTTTGCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTCA:1 - chr3L 21917486 5' - F-element 494 1 76.24 AATAAATACTATGTTTATTGCATCCACTAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr3R 22494692 5' - 1360 3366 1 54.46 TTGACAGGCGTTCGCCGCCTTTCCCCTTTCTACATTTAACCTTCGAGCTTTGTTACTTTTTGGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:2 + chr3L 16449711 5' + roo 8677 2 66.34 ATTCCCAAAAGTCGCCGCAAAGTATGCTGTGGAAAACATCGTTTACGCACCTATTAGTTGTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:2 + chrX 5275499 5' + jockey 4693 1 59.41 GGTTAGTCTTCGCCCGCCGGATGAGTCATGTGAAATGTGAAACGTTTTTAAGGCCCTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACA:1 + chr2R 9001629 5' + mdg1 16 2 60.64 CATTTCCTCGGAGTAGTGAATATATTAATGTATTCATAAATAATGCGAATCAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGAT:1 - chr2L 21003314 5' + 297 6837 2 56.44 CTTTAGTTCCGAATAAACGCGGCTTAATCGTGTTCGATTTACAATTTTGGGTATATTGTTTAAATACAGATCATTTGCTCGACTCAAAACAAAAACCGTTT:1 + chr3R 24683775 5' + Tom1 385 1 65.35 GCAAGAGAATAGCACCAAGTTACGGAACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTC:1 + chr3L 17215689 5' + Ivk 1 1 78.22 TGTTAATGGTTTGATGGGTTTAAAGTCGTGTAGCTTCGTTTTTTAGTTGGAAGGGGGGTTTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGG:2 + chrX 7520129 5' + Doc 4278 1 65.00 ATATTCAGGTGGATTAAAGTGGCACGAATGCTATTTCTCTTGGCTTTAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTT:1 - chr3R 21603841 5' - Idefix 305 2 64.29 TTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 - chr3R 14049428 5' - transib2 2804 1 57.43 GCTTTGTGTCGCCTGACTATCGCACATACACTGCCACGCAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTAC:1 - chr3L 15450931 5' - accord 7361 2 44.55 GCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGT:2 + chr2L 14074955 5' + jockey 257 1 60.40 CATATTTATATTTTCTTTTTGAGGTGCGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3L 10565293 5' + pogo 48 1 76.24 AATGCCAGTTCTTTTTTTCGATTCCTACAAAACATGCGAAGAGGAAAAAAAATGTACAAATCGCCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2R 14744306 5' - roo 398 1 67.33 GTGCTCTTCTGCGGCATCTGCCAGGCTCACTACACGTTCAAAGCTCGGACTCGCAATCCCGAAAAACAAAAATATCGATTTCAATACACAAATTATAAGAA:1 - chr2L 6681634 5' + Idefix 299 2 68.32 AATGTGTAGGGTATCTGAGCTAAAAACCATTTACTTTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTAT:1 - chr3L 18752975 5' + copia 4729 1 65.35 CCCAGTCTTTGGCGAAAGTAAATAATTAATGCGTCTTAACCTTTCTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCA:1 - chrX 12880649 5' + micropia 78 2 55.45 GCATATTTTGTCAAATTTACAAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGTCGTTACGCATCTTGTTATT:1 - chr3R 4571526 5' + 1360 3376 1 51.49 GACTGAAATCGTGCTGAACTCCCCATGAACATATGAGATTGGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chr2L 16818779 5' + pogo 34 1 59.41 GTAGTATATTTGTGGTATTTATTTATAGACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chrX 12818880 5' - roo 9026 1 70.30 CAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAAAAAAA:1 - 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chrX 18985811 5' + Bica 4692 1 76.24 ATCGCCATAAATTGTTAGCTGTTTTGTACTTTATGGCCTTTTTGGCGGCGAAATAGGGGCGGTGGGGTGGTAACTCGGGCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAA:2 - chr2L 8292239 5' - invader2 447 1 62.38 CACAGATTCATACTAATGTCCGATACATGTGGCCAAAACTTAAAATAAGAAAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCA:1 + chr3R 11646410 5' + 297 6500 1 67.33 TTGCCAAAGTAACCGCCAGGTGGCGTTTAAAGAATATTCAGATTTATACTAATATACAATATAATATGAATTACTGCTGACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGC:1 - chr2R 13805773 5' + Ivk 5310 1 79.21 AATTCTCTGCAAGCGCTTTCTGTTGTTGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGTATAGATGAAAAGGTAAACGGCAAAACATACCTCTCGCGTTTA:1 - chrX 11512328 5' - Tc1-2 120 1 76.24 TTTGGTAAAAATAATTTTTTTTTTCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTAT:1 + chrX 6897380 5' + Ivk 46 1 74.19 ATGCAATAATGTGGTGCTTTTAATACAATACATCTCTAGATATAAGAACAGATCACGGCGCAGAAGAGTTCCTCGACTAACAGATACCCGTTACTTAGCTA:1 + chr2L 14381370 5' - INE-1 544 1 45.54 ATTCGGCGTTCGAAATTGCTGCGCTTCAAGTGTAATATCACTTAAGCTCTTAAGCAGTCAACACCAACCCGTAAAAATTGTGTGCAAAAAAATCGTATGGC:1 - chr3R 18891695 5' - 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Idefix 215 2 68.32 TCCATATTTTGTATCGTTTCTGAATTTCTATATATATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 - chr2L 17066866 5' - copia 214 2 70.30 AAAAAATATTTAACGATGTAGTCTACTTTCTCATTTTTAAGGAACATAACTAAAAGCTTAAGTAAACATGAAAATACCCACAAAAAAGACAATAAAAAGGC:1 + chr2R 1728022 5' - Transib5 368 1 69.31 ACCAACAGGGAAAGCCAAAAATGAAAGCCAGAAATGAGAGGAGGACCAAAGCCAGCCACTTACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATG:1 - chr3R 25436157 5' + P-element 2873 1 58.42 AGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCA:1 + chr2R 12185343 5' - accord 495 2 69.31 GAAGTTTAATTTTATTAGTTGTATCATTTTGATAATGTCTTTGAGCTGACAGTATATCCATTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chrX 20314601 5' - roo 394 1 62.38 AAGTCCTCAAATCCCTAAAGAGCCTACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 21998442 5' + 412 42 2 71.28 CTAATGAGAGGGGCGAGAGCGGCTAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACG:1 + chr2R 14801649 5' + HMS-Beagle 6692 1 71.76 ATATTGGCGAATCTATATGTGGAATGTGAAGTCCTGAATTTAAATCTAAACTGGTGCGTAGGATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCC:1 + chr2L 12802170 5' - invader3 263 2 62.38 GGAAAACTAAGTGATGGAAAGTAGTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGC:1 + chr3L 18046956 5' + Doc 381 1 71.08 TCGCTTGCTGTCTTTGTGCCATGTTTATTTTTGTACGTATTTTTTGTTTTCTTGCCATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 + chr3L 4637280 5' - hobo 2918 1 56.44 GATTTCACGTAAGGTTTTTCCAACCTTCTTTCAAATGAAGTGCATAAATGATGTGTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr2L 13711467 5' - hobo 2919 1 61.39 TTATTCGTATACTTTGCATTTGAACTCAGGTTGGGGTTTCTTTTCTGGTATCTCTTTTACGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGA:1 + chr3R 10583293 5' - rover 7082 2 67.33 AACGTGGCAAAAGTCAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTT:1 + chr3L 5267203 5' + Juan 3989 1 59.41 AAGGAAGATGGCATCATGTTCGTCATGTGCGAGTGTAATAAATTTTATTAAAAACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chrX 18991613 5' - pogo 2081 1 61.39 GCGAAATACCAAAAGCAAAATATGAGAGTGGAAAACTGTTGCCGTTGGTCAAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 + chr3R 20868711 5' - Transpac 288 2 57.43 AACCGGCGAAATAATGAATCATTTAAAGTGACTGAAAGGTTGGCAGTGCTATCAGCTGTATTGTCTGATGCAGCTGATCTGATTAATTACCAGTTTACTGG:1 + chr3R 22593369 5' - 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chr3L 11625610 5' + roo 8708 2 72.28 CTCTTCACAATAACAACAACGTCAGCAGCGTCGCAGCGGAGAAGTGCTGATGTCGCACTTTAACCGTTCGTTGGCGTTAATGGCAGCGGAGACTAT:1 - chrX 3522883 5' - HMS-Beagle 6841 2 80.21 CTCTGGCGCTTGGCACGTGACGTGGCAGTTCGAGTTGTTGTTGTTGGATGCTGCTAGTTCGTCGCACTCTCATGTTGCAACATTGTCGGCGGAAA:1 + chr3L 6539434 5' + gypsy5 156 2 51.58 TCCAGTGTACCAATTGGCTTAACACCCTTAAATAACAAATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAA:1 - chr2L 10265254 5' + 1360 270 1 51.49 TCTATCTCTCTTTCTCTCTCAGGCAATGAAAGTGATTACGGGGAGATATGCGAAACACAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 12058605 5' + roo 17 2 62.00 GAATTAAAGGGGCTGATATTATGAACAAATTGTGTAACTATACCAAGGCAAAGTAATTGGCTTTTGGCTGAACAGCGTCAAGATCTCGAAATAGTAAATGT:1 - chrX 14982825 5' + G4 117 1 54.46 CGTGTGGGCTTACGAGTACAATGCTGCGTATGCGCAATGTTCATTGTTACGGGTTACGGGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACA:1 + chr3L 9172483 5' - 412 7136 2 63.37 AAATACTGTCCCATCTTTGGCTTAATTAGCAATGACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3L 16449790 5' - roo 9031 1 67.33 ACTCACTCTCGTTGCTGGGTGTTCTATTCCATACGTTCATATTGGTTTTATTATCGTCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTT:1 - chr2R 18947413 5' - Porto1 4207 1 76.24 GCGGGGGGAGTAGTTAACAATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCACTGCGCCACGAA:1 + chr2R 23735349 5' + gtwin 85 2 78.22 TGCAATATTCGGAATTGAAATGTTAGTTAGTAAACTCCACTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 + chr3R 13122845 5' + Transpac 4958 2 60.40 GCCATCGTCCTTCTGCAATATAAATACAAATTCAAATATATAATATATTTGGGTATTAATTTAAAGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr2R 12370656 5' - roo 399 1 73.27 TTCATCGACATATATATATTTTTTTTTTCTGTTACCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 - chr2R 4009948 5' - blood 336 2 70.30 GACCACGCCCCCAGTGGCGCCCACCACCTTCTGTTGTCACATCTGCAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:2 - chrX 8354430 5' + jockey 37 1 52.48 AATTGAAAACAATCGATCGAGAGAGTTGTCCCAGCACAAAAATGACGTCAGAGGAAAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACA:1 + chr3L 5584915 5' + X-element 4419 1 66.00 CTCTCATTTCCTCGCACTAACGTAGCGGGCGCTACGTAACGTAGGGCTACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr3R 28330920 5' - P-element 2858 1 50.50 CTTGAATCTGTTCACGCACACAGACAGACGAAACCACAAGGGGTGTGTCGGGTGGGTGCCACCCGCTGGTAACAGAGAACTGCCAGGGGGGCACTTTTTT:1 - chr2R 22945485 5' + hobo 7 1 70.00 GCGGGATCTTCTTGGCCAGCTTGATGGCATTGTCCACTTGTTTCTTTAGGGACCACACCTTGCGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 17283925 5' + roo 8677 2 64.36 TTTTCCGAATGCCAGCATTTAGTGACACCAGTACGGGCTGGCTATCACATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTT:1 + chr2L 3986198 5' - Cr1a 467 1 59.41 ATTGACAAATCCATTAACATAGAAATGCTTTTCATATCATTCAATAAGATATTTCGGCATGCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr2L 18188469 5' + Doc 32 1 49.50 AAAAAACATATGAATATTATATTGTTTGGTAACAAAATGTTTGTTTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr2L 16968413 5' + 1360 31 1 58.42 AAAGCAAGCGTTGAGTTATAAATACTCGCGTAAAGTTGTCTGACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTA:1 - chr2L 9330290 5' - hopper 1383 1 56.44 CCACATCCATAGAACTTGCACAATTTGAGGCAAACGACGACAGCTTCCAATCATAATGCCAATGAAATGTAAGCGAATTTGAACCTGATAAAAATTCTTCA:1 + chrX 21256845 5' - hopper 252 1 68.32 AAAGGAAATGCTGCTGAGATTAAAGTTTGAAATTTGTTTATCAACTGGGGCAGAGTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2R 4344624 5' + pogo 18 1 61.39 TACGGAACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCT:1 + chr3L 17215709 5' + Ivk 21 1 58.42 TATTTTGTTTTGTCGTAATTTAGTTTAGTTATAGTTAGTGAATCGTGTTCACTTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAAT:1 - chr3L 2529273 5' - HMS-Beagle2 7099 2 58.42 CAAGTTGAGTCAAAAAGCGTCATCCAAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chr3R 14563136 5' + jockey 4713 1 73.00 AAAGCAACACTGTTCCTTGTTCCCTTACGAAAAAGACTGCCAATTATTACTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 - chr2L 13598329 5' + pogo 5 1 48.51 GTGAAGAATCTTAACATCACAGACTGGAGAATATTCTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTA:1 + chrX 6917094 5' + 3S18 5808 2 64.36 TTCACGTAAGGTTTTTCCAACCTTCTTTCAAATGAAGTGCATAAATGATGTGTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chr2L 13711464 5' - 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X-element 4700 1 75.25 ATATCAGTTGGTTGCAATTATTTATTATAAATGCAAAACGGGAACGGATCCGCGCGGATCTATGATTAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCC:1 + chr2R 12339608 5' + Burdock 6096 1 71.29 ACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTC:1 + chr3L 5267234 5' + Juan 4020 1 70.30 CAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCCGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGC:1 + chr3R 20683402 5' - 1360 31 1 76.24 GATTTTAAGCCTTGACACCAATAGTTGAATTCAACTTTCATATTTCGCTTCACAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCG:1 - chr3R 13977483 5' - Doc 317 1 63.00 GGCCAAGAACACAAAGGTCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2R 1597770 5' - 1360 3365 1 64.00 ATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCT:1 - chr2R 6947359 5' + 1360 68 1 72.28 AAACAGAAGGAAAAAGGAAAAATATTACAAGCTTTTAAGAAAGAACTGGGTAATCGGTTTGAGTTGCAAACAAAATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCC:1 + chr3L 25210426 5' - Max-element 296 2 74.26 GGAGCAAGGCGCGTTAGCATTGCATACTTTTAGGCGCTGATGCCACTGCCTCCTTGCGCTCCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTG:1 - chr3R 5907993 5' - jockey 4717 1 66.34 ATAGATCATTTTGCTTTGCCACTTTTTACAAGAAGTGCTTGTGTATCGTTTGCTGCTTTCCGCTATATATTTGAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGCCAT:1 + chr2L 11157450 5' - copia 466 1 72.28 TTTCGTCCAGGAACTGCCTGCACTCCTGGCACTTCAGACACGCCGCATGCCACTCCAGAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCC:1 + chr2L 18865525 5' + Doc 4483 1 58.42 GCGCTTTTGTTTCGCAAAAAAAATAAAACAGAAAAAGAAAATCGAACAGAATGGGGGAAAAAAAATCGTACGGCGTTACGCGTCTTGTTATTCTAGTGTCT:1 + chr3R 22268070 5' + 1360 3385 2 62.38 TTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 + chr2R 19209477 5' + Doc 75 1 59.41 TTTCGTCATTCTTCAAATAAAAGTCCGATCGGGACAATGAGTTTATTTAATAATTATTGTTTCGATATTCGGTGGAACTATTGAAATTAGTAATTTACTTT:1 - chr4 267989 5' + looper1 229 1 63.37 CTTTCTCATTAAATTGCACATGAAACATGAGACATACATTTTAAACAAAGCAACTAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTGCAATTT:1 + chr3R 12729341 5' + roo 8685 2 58.42 TAAATAAGTATTATATTTCCTCTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAAATG:1 - 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chr3R 31045891 5' - INE-1 138 1 79.21 CAAAAAACGCATCTAAGCGTTAAAATGCAAATCACAATAAATGCCATTTGCTCAAGTCCCACCCCGGTTTCCCAAAACAATAATAATAATAATAATAACAA:1 + chr3L 18327831 5' + mdg1 7055 2 70.30 CGTTCTCCATTTTGATTTGCCTATAGCCACGACGACGTCGACAACAACGACTATTCATAGGTGAGTCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chrX 2125545 5' + P-element 9 2 70.30 AGAGAGATAGCAGCATTCAAACAGTGGACAAGTGGCGTCGATTGGATTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTG:1 + chr3R 13657928 5' - Doc 4417 1 53.47 GGAGTCAGTGGTCGGCACAGGTGGTCCGTTGGATGTGTGATTAAAAACGAAAGTGATAGTGCTGAGCTAAAGGCTTTGTTCGACGCGAAGGACGAAAAAGC:1 + chr3L 23895209 5' + Dm88 477 1 71.29 AGCTACAGCTCCAAGTACACTGGCTCGGGCAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAAAACTTTTGA:1 + chr3R 31840366 5' + Bari1 1697 1 72.28 GTAAGCAAAAGCCGCTAACTGCATATGAATCCAATATTTGAAAAATATAGGGTCAGGAAACACAAGCACAGACTAGAATCTTATCCGAATAGTCTAGCTAG:1 - chr4 633957 5' + jockey2 3103 1 49.50 AGTTTTGAATGGCATTTGTTTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 + chr2R 2832935 5' - 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P-element 2850 1 43.56 GCCAGTTGGGGCAGCCAAAGGTGTTGGCCGTCTCCAGTTCCACCAGCTCCACCAGCTCCACAGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACATGTCCTCGT:1 - chrX 16205910 5' - invader1 3580 1 65.35 ACAAACGAACGGAGACACAGACACACGTATTACATATACATATTCGTACTTTAGCAATAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAACCAA:1 + chr3R 5864431 5' + transib2 92 1 58.42 CAATCAAACTGGTTTCAATTATTTTTTCATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGAT:1 + chr3L 14703860 5' + flea 4803 2 72.28 ACAAAGCGAATTAGTGAGAATCAATAAAGTCCTCAAATCCCTAAAGAGCCTACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3R 21998468 5' + 412 23 2 56.44 CAGGCGCGGGAGGTTCAAGATCCCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 + chr2L 128711 5' - P-element 2839 1 29.17 TTTAATTTAATTTAATAATTTTCTTTTATTATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGTTTCGCGGGTG:1 - chr2R 6164845 5' + Cr1a 123 1 67.33 GGCTTAACGCTTGGCTCAGTCGCTGAGCGGATCGGAGTGAAGCCAGTGAGGCATTACGCTGCCCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATT:1 + chr3L 21056758 5' + 1360 439 1 65.35 TAAATCAGTTTCTCACTCCTCAAACCTTGTCATATTTCCACTCAACTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3L 3635414 5' - roo 9041 1 56.44 CCACCAAATCTCTTTCTCTTTCCTGGCTTTCTGAGCTTTCCTTTTGCCCTCAGAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGA:1 - chr3L 18032121 5' - Doc 339 1 47.52 AAGTTCGTGGGAAGCAGAGTCCAACAAATTAGGTCGATTTCCCCTTATCATATGTCACTGCCCAAATCGAGCGAGATAAAGCGAAAACCGACAAAGAAAGC:1 + chr2R 17639991 5' + G6 449 1 66.34 GTAATGGTAGCAAACTGTGCACTCGAACAAATTGGGGTTCTGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCTTGATGG:1 + chr3R 13671596 5' - baggins 5267 1 70.30 CACAAACTTTTTATTTAAAACTTTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGCGGAACACTGACAAC:1 + chrX 22426162 5' - 1731 293 2 59.41 GAAGTATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTT:1 + chr2L 3988543 5' + I-element 57 1 70.30 TCCTCGTATATTTGGCAAGCAATGTCACAGAACTGCAAAGGTGGCATTTTTTGTCACTCGACTCACACCCGACAATTTTGTGGGCGGGTGCTACCCGCCAC:1 - chr3R 4568456 5' + hobo 56 1 72.28 GTATATCTATTAAAATCACCCATTCCATCTTTGCTTTCAGGTGGCGCATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCG:1 + chr3R 15799336 5' - P-element 2754 1 50.50 GACGAAGGTGGTTAACAAGCCGAAAGAGACGACACACACAAGGTGACTCGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 - chr3L 14152165 5' + blood 30 2 55.45 AGTAGTTTACAATTACTGCCAGTGAAAAAATGTTTCCAATGACTAAATAAATAGCGAGATTGGTCTCAGGTTTTCCAGGCTTAGGTATCACTACTACCTCG:1 + chr3R 8883974 5' - G7 231 1 54.46 CAACAAAATTGTTACAATACATTTTCATAATATTGGCATATATTTTTTAATCCCATATTCTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGAC:1 + chr2L 9299621 5' - 1731 296 1 45.54 GGGAATTGCGGAGTTGGATGGGGAATTTACCTTTTCCGGACAGACAGAAGATGGAGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGCTAG:1 - chr3R 12057195 5' - INE-1 502 1 61.39 CGACTCGAGCTGCTGGTCGGATGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCG:1 + chr2R 6438347 5' - Stalker4 379 4 56.00 GTTTTTTTTTCATTTTTGGTTTCTGTTTTGATTTAAGTGGAATTTATTTTTAGATATTTTATGTAAATTTTTTTGTGTCTTTTCCTTATGCTTTGTTTGTT:1 + chrX 13866970 5' - Penelope 533 1 59.41 TGGTGGGGAAATTGGGTGGCAAATCAAGGGAAAATGTTGGGCTCTGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:2 + chr3L 5085000 5' - 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chr3L 22207854 5' + Cr1a 267 1 67.33 GTCATGGATGGCCTTTCTGTACTCGTTTCCTTCCGACATGTCATCTAGTTTTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAG:1 - chr2L 5269407 5' - hobo 2651 1 58.42 AAAATTGCAGCTTTAATGACTTGCTTTTGTTGTTTGCTACCGTTTTTTTGTATTAATATTTTCAATGTGTATTGATGTTGGTTGTTGATGTTGAAGGAAAA:1 - chrX 3700977 5' - gypsy7 318 1 69.31 TGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTCCGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCTTTAAGAGCGGCA:1 - chrX 124082 5' - Cr1a 4248 1 73.27 ATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTAGTACAGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGAGTAAAAA:1 + chr2L 15833016 5' - hobo 2812 1 56.44 TACATCAAGGAACACCTTCAGGAGCGATGTTTTTTAATACCAACCTTTTTGCGTCCGTCATGGAGAAGAAGTAAATAGCGACTACACGCATACCCAATATT:1 - chr2R 502817 5' - micropia 4969 2 52.48 TTCGCACTCGACACCCACATGGAAACACTGGGAAATAACTTTGAGTAGGTACAATTATTTGAAATTTTGAGGTTTACATTGCGTGGGGTGAGTTTGGGGAT:1 - chr2R 7764023 5' - HeT-A 5934 1 52.48 TTAGCATGATTGCAATCCTACTAATAATCCTACCCATTAAGGAAAATGTATGTATGTATTATCTTTATCTTCAATTATATGGGGTCGAAAATGAACTAAT:1 - chr3L 18490588 5' + Circe 7103 1 64.00 CAGAACTGAGCTGCCTAATTGCATTTGGGCTTTCCGCTCTCTCGAATGTTTGTTTAAGAGCGAGAGAGCGGAAAGCTCAACAGCAAACAGCTCTTTTCTGC:1 + chr3R 8400174 5' + 1360 131 1 65.35 CCCATTGTTTCCGTGTAAGATTTTCGATACGCACGCACAAGGATTGTAATATGTCTGTCACTGCAGTGTTTGTAGAAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGT:1 + chrX 11798144 5' - I-element 5044 1 70.30 TACTTAATTGCACAGAAGAAAAATTAAGAGACAAATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 - chr2R 3032559 5' + opus 149 4 68.32 GCACGACTCTACCGGGTGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3R 3319672 5' + 1360 55 1 81.19 CAAAGCGCGAATGTGTCTGCTTTGATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACTCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCATTG:1 - chr3L 8267926 5' + 412 7196 2 74.26 GGCGGATGAGGAGGCGCGCCTCCAGGTGGCCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACAC:1 - chr3L 12277103 5' - micropia 5116 2 67.74 GTCATTGGAAAACTGAAATTTAAAAGATAATTTAAACATTAATATGAGTTTCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACCCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr2L 17887137 5' - hobo 2914 1 54.46 CCCTCCAGACTGCCGAAGCTCCACCACCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 + chr3R 28940736 5' + hobo 52 1 73.27 AAAGTTTTAATTTTGAATTACTTGAATTACTGATAGAATAAAACGTTGTCTACTACCATGGATTAGTCTGCCCTTTCTTTCGGGAACCAATGCGTGGGGTA:1 + chr2R 4918117 5' + aurora-element 56 1 65.35 CGCAATTGGCTGGCGTATAGTGTGCTCATTAGCTGGCGGTGCTGGCGATGCGGCAGCGAGAGGCAGTACAGCGATTTTGGCAATTGGGCGTTTGTATAATC:1 + chrX 13266638 5' - 3S18 5693 1 62.38 AGGCCAGCAAAGGCAATGCTAAGGCTAAGCAAATTGTAAATCTTAAACCTACTTCTCTAACTAAAGCGCGCACAACTGCCGCTGATCCGAAATTGTAAAA:1 + chr2R 7776875 5' + TART-B 10412 2 63.00 AAACTTGTATGTACATATGCCGCACCAATCCAATCAAACTCATATAAATATGTACATACACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr2L 2912117 5' + 297 6592 2 69.31 CCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTA:1 - chrX 11025552 5' - hopper 1363 1 78.22 CACCCATACTCCCACAGAATCACTTTCCTTTCGACGGCAGTGAAATCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTATACCTAACAAAGACTCGCAGCGT:2 + chr2R 8803286 5' - Gypsy6A_LTR 123 1 57.43 CACCACTTCCAGCTTACACGTTTATTGTCCTTTTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr2R 10311130 5' - pogo 2061 1 74.26 ACCCCATCCTTATACCAAATTCGAACTTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr3L 9174669 5' + 412 7072 2 60.40 AAGTCAAAAATTATATTTTCTTTAGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 - chr3L 14886248 5' - 412 7494 2 79.21 AGAATTTGCAAATGAAGAAGCTATTGGGTCATCTACCTCGTTAGGCATTAAACCATCAACTACTTTAAGCACATCTTGCTCGGCTAAAAGAGCCCTAATTC:1 - chr3L 14672113 5' - copia 496 1 73.27 GAAAGTAACTGAAGCCAGGAACGAGGACCCAGCCAGAAACTCTGGCAGTTAAGTGCAAATTATTGGTTCGGAATTAGCAGAGCTGCCTTCCCTTCGATGGT:1 + chr3L 13259162 5' + Burdock 5988 1 80.20 CCTGAAGGTTTTTCTAATTAACCAACTAAGTTAGTAAAAATCGTTGCAAAAGAGGAGTACAGGACCCATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATC:1 - chr2L 20229379 5' - hopper 982 2 70.30 TATACTAATATACAATATAATATGAATTACTGCTGACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATAT:1 - chr2R 13805729 5' + Ivk 5354 1 64.36 TCCAAATGAACTGGGAAACTTTTTCGAGGTTACAAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTGGCGCAGTCGGTAGGATAATAA:1 + chr2L 22348525 5' + rover 368 1 65.35 ATGTGAAAAGATGTGATGTGAGGAGAGCGATCGAAACCAAGGGTTATAAGTTAATACTATAAGTGGGTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATC:1 + chr2L 16456748 5' - BS 5080 1 63.37 AAAGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGACGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTG:1 + chr3L 26852648 5' + 1360 46 1 65.35 AAAAATGGTTCTTTCGCATGAATTGTTTGTTCACTTTGGGAAATATTTAAGATATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCC:1 - chrX 13031899 5' + flea 15 2 69.31 TGTGTTCGGCTCTACCAATTTACGTAAATGTAAAATTTATTAGTGTCCTGTTTTTAATAGCTGAATTATTTAACTTTATTTTATTTTTATGATGTTTTGAT:1 - chr3L 14603153 5' - jockey 4995 1 40.59 AAACCTAGTGAGCTATCTTCCGATTCCCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3L 3776485 5' + roo 48 2 72.28 CTACTCCTGTTATAGAGCAACCAAAGATCATTAAGCAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACG:1 - chrX 2347140 5' + F-element 465 1 61.96 ATTAGACCCTAATCAATGTAACTATTGTTTACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAAGCAGTTGG:1 + chr2L 10165005 5' - mdg1 7420 2 63.16 TCGTTTTGTTACACGCCCTGCTGGCTTTTCTTCGATTTGCTTAACAAATTTGTGAGCCATAGGTTTAGATTGGTTTCAAAATAGAATTGTAGAGCAAGACC:1 - chrX 14711679 5' - F-element 4231 1 55.45 AGGACGAGAAAGGCAATTCCTGTTGGCCATCACAATACCAGCTGCATTGTAAGACCGGCTTACATTTGCCCACCCAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTC:1 - 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Bica 408 1 70.30 TTCGTCTCGGCCACGATGACTGCCATTGATGATAATGATGACGAGCCAGCCAAATTTGCCGCATTCACGCTGCCCAAATCAAAATCGCCAGGACGATTACC:1 - chr2L 21872013 5' + BS3 1375 1 54.46 CATTGAATGGAATAATTAGGGTGCTCCACATTTTTATCAGAAAATTGTGGGTAAGAAATTTATTTACGCGTAATGATTTAAACATAGAAACAATCAACAA:1 - chrX 7366076 5' + Porto1 4405 1 70.00 CTAAACCAAGCCAAACAAGACCAGCAACTGAGCGCTGTCTATGTGTTGGTCGATCGGAGGGGGGCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chrX 10629289 5' + P-element 10 2 69.31 TACTTTAAATTAGGTTTAGAAACCGGTTAAGGTGTAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 - chrX 10449859 5' - mdg1 383 2 62.38 CTTTGGGGAATTCCCATTTCCACTTTGCTATCGCCTAATTTTCGAACAATTTCGATCAAATTACAAAACGTACATGGTGCGGCAGCATAATTTTCTCTTTT:1 + chr2R 16591983 5' - mariner2 884 1 69.31 ACATGTTTTGTGAGTTTCGCACGCCAACTTTATGCGGTTTTTGTATGGAAACACACGAGTGAGTCCATTTGAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAA:1 + chr3L 9741183 5' - TAHRE 10417 1 42.57 ATTGACTCGCGGCAATTGGCATTTGGCAATCGGTGCTGTGTTAGTGGAACACTTGGAGAAAATATTCATTAACCTGCTTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chrX 15259125 5' + roo 8666 2 75.25 AAAGTCCAGAGAGCCGTCAAGGTGCCGGACACAACTGACAGACCAGACGGTCAAGAAAAAAAAAAAGCGAAATAAAATAAAAAAAAAA:1 - 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chr3R 26161209 5' + rover 380 1 69.31 TGGCAGGCAACACACAATTCGGCAACACGAAAAAATACTTGTAAATTTTGCCTTCTCTGGCTTTGATGGACGTTTAAATATTTCAAATAATTCATATTTTA:1 + chr2L 9022367 5' + TLD2_LTR 101 1 65.35 GTGCTGTTGCCATTTTGCTTTTGTTTTTCCCAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:1 - chr3L 4713823 5' - transib2 2782 1 66.34 TCTGATTATAACAAACTGTATAATACAAAATAATTAACTAAACTATTTCCCCCACTCTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCA:1 + chr2R 20549234 5' + Tirant 8388 2 56.44 CAACAATTAGCGACATCTACCAGCTCGTCGCTGCAAGAGCCTCGATTTGATTCAGTTTCTTCAACACCAGCTTCGCCCCCCTCCTCACTCCTTA:1 + chr2R 12609159 5' + G6 285 1 74.47 TGAAGGGCATTATGACAAACTATTTCCTCCCAGAGCCAGGGATATACACTGGCTTATAAACGTTCGCTCTCCCATATGACTGGAGTACAAAGTCCTCTTAA:1 - chr2L 1419802 5' + Doc3-element 4276 1 63.37 TGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chrX 6146707 5' - hobo 2889 1 75.25 ATTTCATTTGCCCTCGCAGCTCGAAGGTGTAAGACGGTAGGAAACCATTCAACAGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 23485737 5' + roo 22 2 61.39 CTCCTCTACTTGCCACTTGATGCCATTCCCTTCTACGATTGTTTCTTGCAATGCCCAACAAAACCCATCAGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAG:1 - chr3L 22243424 5' + Porto1 232 1 78.22 TTATCGGACGCTTCTTGAGCGGGCAGCGGCTGTACTTGAGTTTATCCATGGTTGTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGT:1 + chr2L 15425382 5' - Quasimodo 6992 2 57.43 GCTTTTTGGAAAATGTTGTGTCAATGCGTAGACGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAGCACGGTTTTATGAAACGCAGATCAACATCCA:1 + chr3R 11141807 5' + Q-element 220 2 70.30 GTTGCCCGTTTTAAATGAAATTGCGAAAATTCATTTTAAATTGGATTTTATTTAATTTGACTGAGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCG:1 - chr3R 7600444 5' + F-element 482 1 68.37 CATTTTAATGCATTTTGATGTTGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCCTTCTGACTCATAG:1 + chrX 10790678 5' - F-element 190 1 78.22 GAATGCGTAATTACTTGGGTATGGAATAAAATGCTGAAATTTCGCGTTCACATTCACACTAGACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGTGAACTCG:1 - chr2R 25132037 5' + INE-1 559 1 73.27 GATCGCAATCTCGGCGATTTGCGACAAAAACTACCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAACCCACTGCACCGGA:1 - 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mdg1 7422 2 62.38 AGTGAAGCATATAAGTAGCAACTAATTTTCAAGCTGATGCAACAGCAGACGACGACGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 - chr3L 13366442 5' - hopper 1396 1 60.40 CGAAATCCCATCCAATTATGAGCGAAATGCACTTGCCCCACCAGGAATGTTACTTGCTTACATTTTTGTTCGTTTATTTAGATTCGCCAATCAGATAGCCA:1 + chr3L 22011357 5' - Fw3 3037 1 56.44 ATTAGCAAGGTCGGATGGATATAGCCAAAAACCAGCACCAAACACCAACCACCTAGAGCGAGATCTA:1 + chr2L 15809709 5' + F-element 4474 1 70.15 TGATGTATTGCACATCACTTTCATCCAAGTAATAAAATTGTTTTTGAAAATAAATCATTATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chrX 14521738 5' + roo 16 2 51.49 TGGCGGAGGCAGACGACGGGACAGCAGCCAAGTCCAAGTGGAGAGCGTGTGTTGATAAGCCAGTGAAACTACTTTCAGCTTGAAATGCGTTTTCTTGGCTT:1 + chr2L 20514166 5' - Doc4-element 2480 1 70.30 CTGTTTTTTTTTTTCACCTCTTTCGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAAGCCTCTAAA:1 + chr3R 26207475 5' + Tirant 8126 2 63.77 ACATGGATAGACTGGCATACCTATGTGGCGCCATCTACACTTCAAGAATATGTTCGGTCGAAAGCTCTGCCAATATTTAAAGTGAATTTCTAGTTGATTTT:1 + chr2R 22297939 5' + Bari2 159 1 76.24 TTGACCGTTCAAAAATCAATTAAATATAAACATACATTTCTTTCGGACATATGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAG:1 - chr2L 22208785 5' - gypsy 7424 2 54.46 ACAGATACTTAGTTGCAAACATCGTTGCATACTTTTCGGTGCACTTGGACAAGGACACGGTACGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3L 21852476 5' + 1360 14 1 65.35 ACTCTCGGTGGATTTTCACAAGAGGAGTTGTAGCCCCCTAACCGAAAACAGAAAACGACAGGATAAGTCGTGCCACTCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chr3L 10035595 5' + I-element 43 1 65.35 TTATGCACGTCGGGCGCACACACACATGTCGATTTGCATACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGG:1 - chr3R 20396899 5' + I-element 5005 1 66.00 GTGTGTCACACATTCCACGGCTGGTGATTGATGGGCGCCGCAAAAAACCAAAAAGAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 - chr3L 10565366 5' - pogo 2098 1 70.79 AACATTTTTGAAGCGCAAGGCGACTGTAATATATAATAGACTTTATCCTATTATCAGTAATCTTAACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTT:1 - chr3L 23855447 5' + Cr1a 4256 1 67.33 TCATTTAGAAACGTAAACCAGACGTCGGAATTTGAACACCATCAGGCACACGCAGACTCCATACCGAGACTCAACCTGATTTCTTTGTTGTGGCGCCATCT:1 + chr2L 17551824 5' + Transib-N1_DM 365 1 60.40 GGAATTTAGAACAAGAACTACACACGTATTTTATTAGCATTCGCTCTTGAATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCAATACTTTC:1 - 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chr3L 10792250 5' + pogo 24 1 60.40 ATGCTCTCATTGGGCTCTGGGAATAATTGCTGCCAAACTACAAATGAGCTCCAAGGCTCTTTTAATCAAAGCCATACTTTCTCCAACGTGGAATTATGCCA:1 - chr2R 20838426 5' + G5 4375 1 67.33 ATTAAATTTATTGCTCTTCTTCAACTTCCTCCTCTAAAAATATATTAAGGAAATTGAATTCGTCTTCCACTTCTTCTTCTTGTTCATTATTAGAATGATAA:1 - chr2L 9702376 5' - transib4 2182 1 87.13 GCCGATCGTTGTAGCGACTTGAATGGTGATTAATCAAAATTAAACCAAAGACACTCGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 + chr2R 5636503 5' - 1360 3354 1 72.28 CTCGGGGAGAAGCGCTACTACCTCGGCATCTTCTTCAAGGTGAGCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTC:1 + chr3L 1269136 5' + 412 7286 2 56.44 AAGCTCCCATCCGACCGCCTACCTCCTCATCCCTCCATCCCCGAGTGCCATTGTCGTCCACATCAATCACACGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 21852589 5' + 1360 4 2 76.24 CCGAGTTCTTTTGCCGGACCACTATAAATAAATGGTGCAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 - chr2L 16718016 5' + 1360 39 1 67.33 GAATGGTTTCTTGTTTATTTCAACTTTGGGTTTTTTTTCCTGTTTGTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGTTTTACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:1 - chrX 11906337 5' + INE-1 13 1 55.45 TTAGTTACCGCTCGAAAAAATAACACAAGCAATAATCGCCGATGAATATTTTTCTCTTTCGGAAAATCTGTTTTTTCTTTTTTATTAACTCACGGGAGTTT:1 + chrX 17389854 5' - HMS-Beagle2 443 1 62.38 GGCGATTGCCTGAACAAGAGGGTGGATATGTCGAAAGTCAAGCTGGACGTACTGCGTCCGTGGATCAGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGT:1 + chr3L 13037493 5' - opus 101 2 75.25 CCTTAAAAAAACGTTTTTATATGTTTTATTTCTTTAATACTCATAATGATATTATTTTTGTAAATAACTTAGATATTAAGAATCGTTTAAATGGATACCGA:1 + chr2R 1654147 5' + jockey2 3320 1 73.27 CAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 + chr2L 7970994 5' - blood 329 2 72.28 AGATTTGTTTATGACTTCTTCAATTTGATACCCTCTAGAGTTACATAAGTGGGATTCCCACATTTTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTT:1 - chr2R 1986297 5' - INE-1 174 1 66.34 AATTGCAGTTAAGGAAGTGAATGTATATGTATATATAGTAAGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 + chrX 3244581 5' + I-element 36 1 66.34 CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAGCTGCTGCACCTTCCACACACACACACACACA:1 + chr3R 9418241 5' + Quasimodo 36 2 59.65 GCATGTGCGCCATCCCTTTCTGGCGTTGAATTTCACCAGAGTCAGGCGAAGTGGGCGGTGCAGGCAAACAATCTCCGGTGTTCTGCATTTTGCTTATTGCG:1 - chr3L 16642034 5' - Chimpo 218 1 78.22 AGAGGCAACAAAAAAAAAACTGAAAAAGGGTTACGAGAAGCGAAAACAATAAAATGCACAAGACTTAGATTATGTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAAA:1 + chr3R 21916932 5' - Cr1a 149 1 54.46 GGCCCCAAATTGCGATATCAGAAAATTAAACTGATAGAAAATACAAGAATTCAAACTTAGGAGCTAGCATGAAAACGAAACACATTGTTGCGATCTCATAT:1 - chrX 2042813 5' - gypsy2 6619 2 75.25 ATGCTACTTTACTGTGACATCACTTCAGCTCTTTACTAAGCAAGCGAAAACTCTTATCCATTTCCATTTTGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:1 - chr2R 5154829 5' + F-element 18 1 65.35 CGCCCCATGTGCCCCGCCTTTGTTGCCTGTAAATCATCCCCCAAGCACACAAAGCCAAAAGGGAGAATACACACTGCCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC:1 - chr2R 15878603 5' - accord 183 2 58.00 TGGCATGAACATTGAAATGAAATCATGTCATCGATATAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGAACAAACCACTCGCAGCCG:1 + chr3R 14019717 5' - X-element 4325 1 63.37 ACCCCGACTATATGCCATGTTGTGGACGGGTTATATTCGGTTTTTAGATTATGCTTAGGTTGAGGTTGAGATCTTCCTTTATAGTTCCTGAGATATCAACG:1 - chr3R 31045897 5' - INE-1 144 1 79.21 CGTCAGCAGGATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCT:1 + chr3R 4973093 5' - 1360 20 1 47.52 ACTAATTTGTCTTATCATAACCTTTAATTTATTCCGTGCTTCTTCTGGGTGTACCTGAAAGTAAATCAATTAAACAATGTTAGTTTTAAATCTCAATGTTT:1 + chr3L 13496385 5' + TAHRE 10150 1 63.37 ATTGGCCATTCCCGAGAAGAGCATCAGGACGACGAAGAATCGGGTCTTTCGGCACCTGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACAT:1 - chrX 4784338 5' + hobo 227 1 60.40 GGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chr2R 17345951 5' - hobo 2899 1 65.35 AAACCAAAAAATACCTGACAACTAGCTATGGATGACATATTGAGAGAACAAGTCGGAAAAACTTGTCATGTTTATATGGATGATATAATAATCTTTTCTAA:1 - chr2L 11815814 5' + TLD2_LTR 50 1 82.18 CTATATTACAGAAAAGAACACCACAAACACTCACTAAATATAATCCAAGAACTGCAATTCTGTTTCCCACGGAGCGCTGGGGACCAACAAGCCATAGTCCC:1 - chr3R 2839474 5' + Rt1a 406 1 66.34 GACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 + chr3L 19951186 5' + Ivk 18 1 61.39 GAACTTTTTAAAGCTATTCTCATAATTAAGTGAAATTGGTAACAAAAATAAGAGAATTACTGCACTCTTCATACGTCTTTTCAAATGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 2415034 5' + FB 175 1 59.18 AGCCGTCAAAGCAATGACGAAGAATTGCTCGATTGATAAGGTAAAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTG:1 + chr2R 3293720 5' - 1731 306 1 69.31 AGGGTTATTTAAATATTTCGCAGGACCAGCCGGAGTAAGCGAATTCTGACGGCTACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGT:1 - chrX 18119578 5' - hopper 1395 1 59.41 GCCTAGGTAGAATTGAATATTTTTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 - chrX 21248171 5' + 1360 66 1 77.23 CACTGCCATGCCCCAGCAAACACTGCAAGAAATACATGCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr2R 20543985 5' + 297 37 2 68.32 TCACTACCAGGGTCTGGTCTCGATTGGTGGTGTAGCTAAGAAGTGTTTTTCTTATTGGACCTTAGTTTGGTGGATGCTGTCCTTTTTTTGGGGTATTATGC:1 - chr3L 23088126 5' - Fw3 63 1 61.39 ATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:2 + chr2R 19209486 5' + Doc 84 1 68.32 ATTTAAATCCCGAACTCATTAAAGCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2R 21860511 5' + roo 8716 2 79.21 GAAATGTAGCTATATTAATATTGTTGTTTCTAAGACGCCTTACACCACATTTTGATTTACGAGAAAAATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCT:1 + chr2L 8374162 5' - invader1 4008 2 72.16 TATCCTTCGAAAATTGCTGATATGTCATCATTTTGCGCTACGATAAGGTATTAAATATTAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAA:1 + chrX 3048259 5' - Cr1a 150 1 63.37 ACGCAGTTTTTCACTCCGTTTCCGACTCTACTTTTTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTGTGACAAAGTGTCACAATGTATTG:1 + chr2L 17230486 5' - Stalker4 7018 4 63.37 CAGCCTACTGCACTAAATAATATTTTTCCTTGTAAATCGAAACAACATCGACGGTGGTATAGAAGACAGAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGC:1 + chr3R 31973818 5' + Stalker2 95 2 78.22 AAAAAAAAAATAGCAAACAAAAAAAAAAAGGGGAAAA:1 - chr2L 16313663 5' + Bica 337 1 83.78 GACAGGGGCTTGATTTTGCATTTAAAAGTGAATTATTATATCGCATAACAAATTGCGACACAATTCAATTGAAACGAATTAAAAATGAAATAAAAAAAAAA:1 - chrX 6148567 5' + Doc 4696 2 70.30 GGGAAAATTCCTTCCTAGGAAAAGCTTGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGCTTAGTGCGAGGTTTGGTCTTATTATTTACTTGTTAATTGCGCTGTTA:1 - chr2R 4008982 5' + BS 5035 1 74.26 GGGAGATAACTCGGCATAAGTTAAGTGAACGTACACAGAGAACAATTTTATATTTAATTCACTCCACGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATA:1 + chr3R 7883644 5' - roo 105 2 66.34 AAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 + chr2R 19209484 5' + Doc 74 1 63.44 TTAGCTAACTATAATTAGCATAAATCAATACGATAACTGGCGGAAACATTGTTTACGTCATACACTTTTATAATTCCCAAGTTCTCGACGTTCATAGGGAC:1 - chr3R 24669455 5' - INE-1 133 1 66.34 AAGCCAAAAACTGCGATAACAAAACCGTGTGAAAAACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAG:1 - chr2L 9066588 5' + F-element 315 1 65.35 TTTTTTATTGATTTTCACTCAGCGCTGCTTGGTTATTTCCCCGATATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr2L 7475969 5' - Transpac 5206 2 59.41 CTGACCACGCCCCCAGTGGCGCCCACCACCTTCTGTTGTCACATCTGCAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chrX 8354432 5' + jockey 25 1 57.14 CCTTTTGGTCGGCGGTTGTCTCCACTAATTTTGGCTCGCATACAAAGTGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGTACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chrX 13881355 5' + jockey 34 1 49.50 CGCCTGGCAGTTGAGCCTTTTAATTGCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:2 + chr3L 5492312 5' - pogo 2054 1 75.25 CTACATAAGTAGCTCCAAAACTCAATTGCCGAAAATTAAAATGCGTAATTTAAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATA:1 - chrX 7335155 5' - Tirant 379 2 59.41 TTGCATTATTATTAATTTTTCCGCAATTAATATCGATATGACAGCATTTTTCCTTCGCACTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACT:1 + chr3L 17715405 5' + INE-1 557 1 48.51 ATAGACATATTTTATTGACGAAAAGTTTTGCGGAAAAGCGATGGGGTTTTTCGGGTGGACATTGGTCAGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr3R 15054390 5' - hobo 2931 1 69.31 TATACCTTCCCAAATAAATATCCCTCAAGTGTTTTATGATATTCTTTTGCATAAAATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTC:1 - chr3R 19350077 5' - HMS-Beagle 169 2 63.37 CTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTCCGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCTTTAAGAGCGGC:1 - chrX 124083 5' - Cr1a 4249 1 72.28 ATTTTCCGGCCAAGTTCGTATACGCCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 - chr3L 7742760 5' + Doc 57 1 75.25 TTAAAACTCTGCATGTCTAGCAATATTTTCACAACTAACACGACTAGGAATATTTATTCCAAAATAAATATAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATT:1 + chrX 6779315 5' - hopper 1138 1 73.27 TAAAAAATTCGCCACATTTAGAAGTGCACAGAAAGTACTTAGGATGTCTTTAAGTTAAGCATAAAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAA:1 + chr3L 5069299 5' + R2-element 3386 1 71.29 TTCCACTGGTCAGATCAATCTTCGCGATACAATTGGAATATATTGTTATATGAACGTTTGCGTTTGCCTAGTCTTTTTGTAGTGAAACATCAACTACTCTT:1 - chr3R 26966182 5' + jockey2 43 1 67.33 TCTATGTTGTATCCTACTTCTTTCTTAAGAAAAACGAATCTTTCCCATTTTTATTTGAATACTATTCATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTA:1 + chr3L 16709562 5' - Stalker 261 4 71.29 TGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGGTGTAAGGGGCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTA:1 - chr3L 10563914 5' - Ivk 337 1 64.36 ATAAGTATTTATTTACCGGTCGATTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 3776517 5' - roo 355 2 78.22 ACTATATTGGCAATCAAATTAATTAATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTAA:1 - chr3R 7476978 5' + 1360 232 1 75.25 CCACAATAGCATCCACAAATCAAGAAACCAAGAAACAGTAAACGGAAACGCTTCAAAAACCAACATTGAAATCATACAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGC:1 - chr2R 10503639 5' + Doc2-element 4423 1 57.43 TTTAAAATGAGACACAAAGTGTGTTCTTTTTTTTTTTGGGACAGTGTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATG:1 - chrX 4560718 5' - F-element 231 1 65.00 ACTTAAAGACGCGGACATAGGATTCCATCTGCTGGTTGTGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGGCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTT:1 - chr3R 25252203 5' - Doc 486 1 63.37 ATTTCACAAACTTTTTATTTAAAACTTTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGA:1 + chrX 22426158 5' - 1731 297 1 63.37 TAATGTTGAGTATCTTTTACAAAACAATATTGTAGCATACATTTTAGGGCGACGTGTCAATGTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr2L 16968501 5' + 1360 10 2 68.69 CATCTTCAAGGGTAAGAATCCATGAACATATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACG:1 - chr2R 17977419 5' - invader4 3050 2 67.71 AGTAAACCAATTTGTTAAACAAACAATTAGAATTGTGCAACCCAGACTATCGGCTTTACTATTTGATTCATGCCGTTTGTAACGTGTAAGGAAATAAATTG:1 + chr2L 5412453 5' - Gypsy12A_LTR 2257 1 69.31 ATCGGTATCAAAACGGTGTAAATACTTAAGTTAGTCGATTTTGGAAGATTAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGA:1 - chr2L 5214653 5' + Burdock 6320 2 79.21 TTGTGGTATAAATTTTTTACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATATATATACTATAATAGATTCGTTGAAAAGGTTTTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTT:1 + chr2L 21582260 5' + INE-1 33 1 69.31 AGCCAAGTTATTTGCATGCCCACGCCTTCAACTGGGCGCATCAGATCGCTCAGGTATGGAATGAGGGGTGATGATGATAGTAGAAGCAAAGACACTAGAAT:1 - chr3R 22733439 5' - Tc3 317 1 59.41 GATTTTGATAATATGTACGTCAAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAA:1 - chrX 16554772 5' + I-element 249 1 78.22 TCTCGGTTCATTTTGTTACGTTTTGATGGCTTTGTGTTTTGTTTACTCTTCCTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTTGTGTTGTTTTTTGCATGCACAT:1 - chr3R 22905838 5' + Cr1a 255 1 71.29 CGAGTGTATAGTAGCATTTCACATATAAGAGCCAGCATATTTGCGGCCGTATTGTGTTGGGGTTCAGGGCTGCAATTCTTTCCCGTGGGACTACATACATG:1 + chr2L 4237375 5' - baggins 5292 1 61.39 GGCAGTAATATGAAAAAATAGATAAACCTACCATTTTTATGCACATTTAATTAAAGTAAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCGGATACCTGCAAC:1 + chrX 18161447 5' + gypsy6 335 2 54.46 TGAGAGTGGGCTTTTCCTGTTTGCCAAGAGTTTTCCATGCTGCCAGCGTGGGAATGCTGACTTAGCTTGCTTGACTTAAATGGGTGATCTTATATCACGCT:1 + chrX 12192223 5' - blood 7099 2 59.41 TTATAGATTCTAATTCTTCTCAAAATTTTATACTCCGTCCTTTTCTACTGACGGAGTAGTTTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3R 16041012 5' + jockey 21 1 63.37 TATATTTTTCTTTTCTTCTTTTAAGAAAAACAAGGGAACTCCGAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTT:1 + chr3R 9229967 5' + X-element 46 1 57.43 GTTTCTCGCTCCATTTGCAAATGCCTGGGGCGCCTTTTCCTTTTTTATGTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTT:1 + chr2R 14085294 5' - Doc 4553 1 55.45 CTATTGTTTTTCAATGGAAAAACCAGTGTATTTTCCAGAGAACCTTACCTAAGTTTTTATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr3L 17652791 5' + pogo 15 1 64.36 AGTGGAGTGGCCATCCCGGATTGATAGAGTCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3L 11367549 5' + roo 47 2 73.27 GGCTATCTCTTTCCTACTACTACCCCATGTTCGGCCGAGCCCGTTCAAGCGTAATTTAATTTCTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chr2L 16717935 5' - 1360 3378 1 70.30 TCCTCTGACACTGCTGCAATTCGAAATCAATTGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2R 11372244 5' + roo 8707 2 70.30 TTTTTTTAACCACTGCAAATACCATATGTTTTGTTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAA:1 + chr3L 19045733 5' - hobo 53 1 66.00 TCCCGTTACAGTTACAGTACCCAGGCACAAGAGACAAAGAGAGGAGGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTT:1 - chrX 7082574 5' - 17.6 7097 2 54.46 GTACAGTGGAAACATGTTGAAACTGTCATAGGAACCAAAGACAGCAACATAGGATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATT:1 + chr2R 9399023 5' + Stalker2 362 2 66.34 TGGATGTTAGCTGGTGGCACACTTTTGGCTGAATGGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 - chr3R 23080888 5' - 412 7504 2 63.37 TGTGTATATGTATAAGTGTGTAGTGTATGGTGTATGGTGTATGGTGAATGCTTTATTAGAACTGAACTGTGTACATAACTTCGTATACATGCTTCACTACT:1 + chrX 14381980 5' + frogger 94 2 58.42 CATTCAGTTCTAATAGCTGTAATTAGAGGGTAGAGCAAGGTAGCTGTGGCTAGGGGAAAACTGTTCCCATTTGCGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGG:1 + chr2L 19629393 5' + P-element 290 1 73.27 TACGTTTCTTGTCTATACGCACAAAATGTGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chrX 6146735 5' - hobo 2917 1 57.43 TAAGGGCCTGATGAGTTGACTATTTGCAATGTTAGCAACAAATGTAGGCAGATCCTTTAAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAA:1 + chr2L 2925345 5' + I-element 4950 1 64.36 CACTAAACTGGAGAAAAAGGACTACAAAAGGTGATATATCCTAAACTAAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACTAATACCGATGACAGAGTTA:1 - chr3L 5661810 5' + Porto1 4494 1 54.46 CTCTGCTTTTGCTATCTCCGCCCCATTTATCTAAGTGCATGTTGCTCGTAATACCCTGTAATTACAGGCGTACACCTTTTGCATACGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 11210961 5' - accord 186 2 88.12 GTAAAATGTCGAAGGCAGAGCGCAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTT:1 - chrX 19017695 5' + hopper 1166 1 78.22 CCCGTTCCATTGCGAAACTTAATCCCTTAGCACTTCTGCCATGACACTGCATCCCCGTTCCCTGCCCAGTGAAAAGGGTGTCGGTACAACTGGCCGTCTTC:1 + chr2L 17641416 5' - Osvaldo 394 1 66.34 GTAACGGTCACTTGGTGGATCAGCTGCTCCTAAGCCAACATTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTCA:1 + chr2R 8235548 5' - 1360 3306 1 60.40 GCGGTTGTAAAATAAATCGTATAGGAACTATCAGAGAAGTTGCTATCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3L 22418549 5' - hobo 2909 1 53.47 CGTGAGCATGGCAAACAATGTGCCTTCTGGCGTTTTTCGATATTTGCGAATAGCGTGCTCACTTTGTGAGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGAT:1 - chr2L 18260703 5' - I-element 104 1 80.00 TTATTAAAAATGTCCAGCAACGAAAGGCAGTTTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:2 + chr3L 10554776 5' - roo 9031 1 64.36 TTCCGTTTCGCACAAATTAGAGGCCTTAAGTATTGCGTATATATATATATACGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 + chr2L 12022167 5' - 297 6957 2 63.37 AGCTTCTTACACATGCGTTCTGTATTAATGTGGGTTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTCGAT:1 + chr2R 5268427 5' + Cr1a 4142 1 66.34 TGTGCTTGCGATTTAGGAGCACATCGAAAACCTCGCTGAAGCCCGTCGGCACCTAAAAGACATGATGCCGTTTGTAACGTGTAAGGAAATAAATTGATGGA:1 - chr2L 21103342 5' - Gypsy12A_LTR 2252 1 72.28 CATACACTATGAGAACAACTAGAACAAATCAATTTGTTATTATCACCAGAATTGGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATACCCTAAGGCATT:1 + chr3L 6592496 5' - Quasimodo 93 2 65.35 CATCTCCAAGCCATTTCACATCGCCGTCTGGCGCTTTCGCTAAATTATACAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAGCAAGAGACGAGAACGCG:1 + chr3R 15570360 5' - 1360 3234 1 59.00 TAAAGTTAGTTAAAGTTAAACAAGGAGGGTCTTCCTTACATCCTAATAGGATTCATATACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 + chrX 3195609 5' - mdg1 404 2 61.39 TCGTAACGGATATCGCACAAAGCACACACTATGAACCACTATTGTACTCGGTAGGGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATATGTGCGTGTTGTGC:1 - chr2R 10111369 5' - 1360 3214 1 58.42 AGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGGTCAT:1 - chr4 184017 5' + 1360 178 1 66.34 TTGTCCAGCGGACGGAATACGCACGCACGCCAAAACGCCATCCCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACAGAATTCAACTATTAAAT:1 - chrX 19545380 5' + Porto1 4544 1 58.42 ACCCAAAGGTGCGGACCATTCGAAGAATTCGTAATGAAGCCACGATTTCGTGGATTGCATGTCGTCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 - chr2R 11086475 5' + Doc 38 1 52.48 TGCTCCCGCAGCTTTACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACC:1 + chr3R 22946161 5' + P-element 352 1 27.72 CCACTTTTTTTTGTTGTCTATGATTTATGTTGGTTCGCTGTGTGGGCGTGGCACGTCTGCATGTTCTGCGGTTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGT:1 - chr3L 22112104 5' - Quasimodo 7019 2 71.29 ATTACAGCCCATCTGATTTCATTCAATGCATTTCAAAGTAATGAATTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 - chrX 12954252 5' - pogo 2074 1 61.39 CTCATAACATAGCCGCAGCAAATGGCGCCGTGTGCTCATTTCGAGTGGCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACG:1 + chr3R 27378218 5' - BS 4798 1 57.43 TTTTATTGTCCCTCAAGCAGACGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAACG:1 + chr3L 14260704 5' - 297 104 2 77.55 CCCCTCCATCTTCATCAACCTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGG:1 + chr3L 21988965 5' + 412 441 2 80.20 ATTATGTCACGTTTAATGGCTTCCTCCAGCTAGCTGCAGCTCAGCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAG:1 + chr3L 25729835 5' + I-element 5091 1 56.44 GGTTAAACAAATTAACTGAGCCGCATAAAAGGCTGAAATGGAATTTTCCTTCGTGGCTTTTCCACTTGCTTTTTTCTGTTGCTTGTTTGTTTTCTTTGTT:1 + chr3L 10575790 5' - mdg3 5085 1 62.00 ACAAGAAGACGAATTTCCTACCGAAAGTTCTTTTATTTTTGTTTTACTTTATTTTTCCACACACAGAAAATTTTTTGGTATAGCAATTTAACATTGCCAAT:1 - chr2L 17873313 5' - Doc3-element 120 1 66.34 GCCGGCTCAAAAAAAACTCAAAATCCAAATATAACATTTCGTTTTTAAATTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr2R 10559201 5' - pogo 2079 1 52.48 CACACTCGGAGTCGCTCAAGGGAGCGTAGCGAGAGAGAACGGGATAGGGATTGTGAGCGAAACAAAGAGCGGGAGAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAG:1 + chrX 23083201 5' - Porto1 455 1 72.28 AAACATTTGCTAAGTGAACAGAGAAGATGGGGGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr2L 7970960 5' - blood 7377 2 64.65 TGAAGTGGCGCTGTTTATTTGCAAATGGCATGACAACTGGCGAACTCCAACAGGATTGACGAGGCGGGCAGAGACAGGCGCTCCTTGGTACATGAGGACCA:1 - chr3R 27038071 5' + jockey2 2997 1 54.46 CGGCGGCAACACTGTGACCTTTTTGGAAACACTTCACCATTTGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAGCTCGGTTTTATGAAACGCATAT:1 + chr3R 13105414 5' + Q-element 211 2 69.31 ATATGGCAGAATATTTCCCAAGCCCAAGCAAGCCGACTTGGCTTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3L 18142012 5' + blood 34 2 59.41 GAAAGAGGACTAAAAAACCGATGCCAATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAAT:1 + chr2L 7759135 5' - I-element 240 1 74.26 CCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGT:1 + chr2L 14074974 5' + jockey 276 1 79.21 CAAACATCATTTTTTGTAATAAATTATTTGTGCGCAGGTAAATAGAGCTTGTAAAGCAACCACCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chr2L 15907127 5' - pogo 2090 1 68.32 TCAAAGATTCACCTGCCTGACTCTTTGAATAAAATTTCAGCTGCTCTTTAATGGCAATGCACTTAAAAAAAAAGTAATCACGGTGGCTGGGCGCATGTACT:1 - chr2R 11830704 5' - Max-element 488 1 60.40 TAAGTTCATGAACAGTAGCTGTGCGAAAGAGGTTATCTAGATTATCTGGATTTTGATAAAATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACA:1 - chr2R 4757308 5' - invader2 5085 2 63.37 AATGCTAAAAAGCATAAAGAAATGCATAAAAACAAAAGCTGAAGAGAGGCGGAGAAAAGCTAGGATGTGGGTGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGG:1 - chr2R 20382168 5' - accord 180 2 86.14 GTACACCATAAGGAATTCTTTTGAAGTCATTCATTTTAAATTAGGTTCTCTATTTGTGGGCTGGCAGATATGACCAGATCGACTTGGCTATTGATCCTGAT:1 + chr4 629273 5' - INE-1 93 1 64.36 AATTCGTGGTTAAATCAATTTTGCACACTTGCCTCCTTTAGCAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCCA:1 + chr3L 13187978 5' - flea 406 1 62.38 TATTCAAACACTAGTATGTATTAGTTTTGCGAACCATGATCTCATCCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 + chr3R 17064124 5' + Transpac 4947 2 53.47 CGTTGAAGGAGAAGTGCTTGTTGAATACTCAGCGAACGAGTTGATTCTGAGCTCGGTGGTTAACGCTGCGGCGAAGCTGTTGACCGCTTGCCATTCCGCC:1 + chr2L 7744787 5' - Rt1c 5220 1 56.00 GCTATGTTGTGTTAAGGTAAAGAAACTAGGAAACTATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCA:1 + chr2L 18506752 5' + flea 39 2 68.32 TTTTGGCCATATCCTTTGGCCCTCCAGACTGCCGAAGCTCCACCACCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr3R 28940717 5' + hobo 33 1 54.46 CACTTGTTTCTTTAGGGACCACACCTTGCGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chrX 17283959 5' + roo 41 2 68.42 TTGCGTGTATAATAATACCATATGTTACTATTTATAGTTTAGCTTTTGTTTGAGTTTTAGTTTTAGTTTTAGTTTCGTACTTTGTACGCCTAAAATTTGTA:1 - chr2R 14278859 5' - hobo 2684 1 73.27 GCCACGCCCCCGCCCACGACAAGCCCCCTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGT:1 - chr3L 10807968 5' - I-element 329 1 72.00 TAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGA:2 - chrX 8027468 5' + Juan 37 1 59.41 TGTTAATGTTAATAAAAGGTCGTACTAAATTCCTTGACCGTGTCGATCTAGCTATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGC:1 - chr2L 21875251 5' + INE-1 149 1 65.35 ATATTCTCAAAAAGTATAAATTTTTAATTAGAATTTAAAATTGAGGAAGGCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCA:1 - chr2R 3191019 5' + 1731 4341 2 61.39 TCCAATCCTTTCAATATATGTATGTACCTACTCAAAGTTATTTCCCAGTGTTTCCATGTGGGTGTCGAGTGCGAAACCAGTGTATGGCTGTTACGCATCTT:1 + chr2R 7763970 5' + 1360 3370 1 75.25 TTTGGTCCCGGCAAAAGCCAGTGTCGATACAGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 - chr2R 19655048 5' + jockey 4762 1 69.31 GTTGTCAGTAAATGAAAGATTTGCTTTCTTCATTTTTTCTTCCTTTCTTCCGTCTACTCGAAGCTTAAATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTT:1 - chr2R 9520727 5' + 1360 281 1 72.28 GCTTCTCTATAAACCATAAAGTGCTTTTAATGATTAGAAAGCTTTTCATTTCCAATTCGCTCTTATCGTGTAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr2R 16289187 5' + P-element 5 2 74.26 TTTTAGAGTGCGTTTCTTTTATTTTTGGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCC:1 - chr2L 14134572 5' - F-element 441 1 77.23 TTTCGATTTTCCATTTCTTCTTCTTTGATCATTCCAATTTCAACACGAATTAGCATTTGGCAACTTAATTAAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCAT:1 + chrX 3200539 5' + Idefix 219 2 74.26 GGTGTCCTCCGTCTGCCAAAACCCAGTTCTTTTTTTGCCAGCAAGGATTTGCCTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 - chr3R 25509331 5' + Doc 37 1 50.51 AATTAGTTAAGGAAACACTCGCGTGTAAGCATTTGGGCTCAGGACCCAATCAACAACTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTAT:1 - chrX 10968202 5' - hobo 2468 1 65.35 TAAGGCAACGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGC:1 - chr3R 1844863 5' + Cr1a 113 1 72.28 AATGAAGAAATTCCTCGTGTCGCCCTGTTGTCTTCAGCTGTCTCGAACTCAGACTAGAGCTCAGACCCTCAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTTTTTGTT:1 - chr2R 10915110 5' + X-element 4556 1 79.00 TTCGTGATTATATTGATGACCGACTAGCTATCAGGAAACCTGCGATGTGGTGGTTCCGCCCATGCTGGACATTTTACAATTAGGTCTCAAACTGAACTCTG:1 + chr3L 11729271 5' - Idefix 7289 2 72.28 TTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGT:1 + chr3L 17215719 5' + Ivk 31 1 53.47 GTTATAAATGCGCGTCTTCTAGTCGGGGCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 - chr3R 17064185 5' - Transpac 265 2 71.29 TATTTTTATTGAACCAAATTGTCTCTAAAGTGATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:2 - chr3R 12729411 5' - roo 9029 1 74.26 GTTTGTTTGTTTGTTTCTTTGTTCAAGTGCCTTTCACTGGGGCACCATGGTCCCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAAT:1 - chr3R 27639854 5' + Doc2-element 4497 1 67.33 ACTTGGAGTTACTTTTGCTTTCAATGAGATTATAATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1 - chr2L 17168498 5' + flea 40 2 69.31 ATTTTCCAAATGGCAGAAGTGCAAGCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATCTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 8914529 5' - roo 9023 2 68.32 TTATATAACACAACAATACACCCAAATAAATATATCTATATATGTGTATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr3R 29408578 5' + jockey 37 1 52.48 GAAAAGGAGCGATGCAGATGAAATGCAAGAACCTATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGA:1 + chrX 12800246 5' + invader3 44 2 65.35 ATTCGATTGACAAGCCAGCCAAGTGCACAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 + chr3R 21969075 5' - hobo 2890 1 78.22 GTTTCGAAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAAT:1 + chr2R 17402695 5' + invader4 11 2 68.00 ATTGAGATACATTGTGGTACAGCTATCGATAAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 + chr2R 8474920 5' + Transpac 40 2 67.33 TCATTGTTGCTTTAGCCTAGCGCTGGTTGACTAGATGTGCAATATAAAAGAAGCGGCCTTTCCCACTGCAAGGATACGCTAACACAATAATAATTTAATAG:1 + chr3R 23186454 5' - Porto1 4557 1 77.23 GACGGCAAAAAACTTGGCAAGAAAGAGAGGGCAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATAC:1 + chrX 10546063 5' + 412 7254 2 68.00 TGCTGCTGCTTCGCCCAGCGTGTGGCCCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACC:1 + chr3L 4611595 5' - Quasimodo 7073 2 73.27 TGGCATGCCGCTGAGAGCGGTTCTCGCTTTTTGTGACACAAAGAGGAGTGTCATGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTT:1 + chr3L 6942868 5' + P-element 23 1 56.44 GTGACGAAGCTTTGGAACCTGAACAGTACTGGGCAATGTTCGCATGGTAAGACACGTATGCAGTCATGCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr2R 5200908 5' + 1360 7 2 69.31 TTTCATCGCCACAAAATGAGGGGAAAAAAAATAAAACGCCAAGGAAGCTACCCAAAACAAAAAAAAGAACAAAATGCAAAAATTGCAAAAACAAAAAAAAA:1 - 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INE-1 572 1 74.26 ATTTAGCGCTACGGAACCTCAGCTGTCCATTATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTGTACTATGAAAAGCATAGCCCAGCAGTTGGAAGCTAATGGTGT:1 - chr3R 3522845 5' - Tc1-2 24 1 72.28 GGCAGAGGAAAACGCGCCGCGACAGAGGCAGCGACTTCGGCAGAGGAGCTACAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:1 - chrX 409662 5' + P-element 24 1 53.47 TTTTTTTTGTCTGTTGAACAAAAGAATTTCCCGTACTGACAAGCCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATA:1 - chr3R 7005795 5' + I-element 5135 1 56.57 TGGTTGAACTATGTACCCAGCGGGCCGTCACAAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCAGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTCGATCTACAATGAT:1 + chr3L 27975136 5' - Cr1a 4152 1 68.32 GTGTGAATGGTGTTGATAGAAAAACATATTTAGATATTCACATGATAAACGATGGCCAATCAGAACTATAGATAAGGAGTACTCCCGTATGTTGGCGGGGC:1 + chr3L 3276848 5' + Rt1a 4788 1 52.48 CACTTTCATATCCTTCTCAAAATTTCACTCTCTTGATTTTGGGATTTTCTACACCGTATTTGCACCCATCCAAATCCCCTAGCAAGAAAACTAATCCTAGT:1 - chr3R 23319611 5' + Doc 4506 1 74.26 AAACAAAAGTACAATGCAAACAAATAGCGAAACAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCGACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAA:1 + chrX 20494860 5' + I-element 4986 1 73.27 GTTGAGCATACACAAGAACAGCAGCAATGTTTTTTTATTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1 - chr2L 13730790 5' - Juan 4166 1 73.27 AAAACGTGGCAAAAGTCAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTT:1 + chr3L 5267201 5' + Juan 3987 1 61.39 TTTTTTCCAGTGTCCACATTCAACACTTCCACACGCAAACACACACACACACACACATATG:1 - chrX 6429694 5' + accord 184 2 75.41 TGGCAGAATATTTCCCAAGCCCAAGCAAGCCGACTTGGCTTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr3L 18142009 5' + blood 7048 2 62.38 TATCGATAAAGTGCGAACGAATTCGAATTATTCTTTCAAGATATATTAGTCCGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTTTATTTTATCA:1 + chr2L 21236878 5' + 1360 3096 1 56.32 TGCATACCTTATAATTCAATTTCTTTCAAAATAATATAATACTGACATAGTTGGATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGC:1 + chr3L 8712534 5' - diver 196 2 52.48 TTTTCCGATCTCAAGAAATACACACACTCATATACACACAACCACCGCGGCCAGAACTCATTAAATCAAGTCATTACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTG:1 - chr2R 19573544 5' + I-element 5007 1 68.32 CACAAGCCGCCTGCCAAAGCCATCCGCCAGCCCCTAATCCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 - chrX 13893761 5' + Tirant 66 2 68.32 CCTATGTAGTACGCAACTAAGGTGCTAACATCCATATGTTATTTCGCCGCAACCGTAGACACAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGT:1 + chr3L 26014106 5' + invader4 171 2 65.35 GCAGACTTTACCTAAGACTGCCCAAAATGGGCAGTCAGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGGTTGTTGA:1 - 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chr3L 16479488 5' - INE-1 144 1 58.42 TTAGATATGCCGAACTGTACACCTTTCGTTGCAGAAGAAACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 - chrX 9048712 5' + Tirant 36 2 61.39 GGTTGCCGGCAAAATCTTGGAATACCGGGCAGAGAGCAATTTTGGCCGGCACCAAAAAAGTTGCTGCATAGTGCCAAACCCATGAATGGCCGTTACGCAT:1 - chrX 11648671 5' + 1360 3367 1 71.00 GCATACATTTTAGGGCGACGTGTCAATGTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr2L 16968467 5' - 1360 3345 1 75.76 TGACCGGTTTTTGTTTACCCCCGCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr2R 12655258 5' - P-element 2835 1 27.72 GGGAAATTATATACTTGTTATAAGGCTTTCTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTATAACTATAGCAATATGGACGTATGGAATAG:1 + chr2R 4563139 5' + Porto1 4263 1 70.30 ATCCAAGACTCTAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTTTCTAATGAAGAGAGGTATTACTATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTAT:1 - chrX 13134941 5' + BS 5010 1 67.00 GAATGGGAATCATAACAATTCCATACCTACGGCTTTTTGCCACCTCAGAAAATGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCA:1 + chr3R 27088426 5' + X-element 4260 1 54.46 CGGGGCATGAAACACCTACTGATGCTCTCCAAGCAATTTACAAATTATTTTCGTCCACTACAAACTTTAGACGATGATAATGATGATAAACCTATTGAAAC:1 + chr2L 9319854 5' + Juan 282 1 74.26 ATTTGCATTGAAAATGTACAAAGCACACACAGTCGAGGTCAACAAAATAGTGGTATGTACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 - 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mdg3 5314 2 59.41 TGTTGCTGCTGCTATGCTCATTGTTTTGTCGATTTCTCTGTTTTGCTTGATTCCAAATCAAAATTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAG:1 + chr2R 10223711 5' + hobo 290 1 75.25 TACTTATTCGAGTTCTACGAGCTCTGACTTTTCCGTTGCCTTTTCTATATTCTCCTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTG:1 - chr2R 11087692 5' - Doc 211 1 56.44 GACCGTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTATGTG:2 - chr2R 3341942 5' - Copia1_DM 4130 2 63.37 CCAATGATTTGCATTGAAACGAAAATCCATGTTTAAATTTGCATCCCCAAGAAGTAAGTCAATGATTTTGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chrX 12954147 5' + pogo 4 1 73.27 TTTTGAATATTTTAGACGTGTTAAAAAATTGAGCAAACAATTTGAATATAAACAAATCTTATTAAAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:2 + chr3R 20369643 5' - pogo 2096 1 71.29 CGCTTTTAAAAATAAAAAGGTTTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGC:1 - chr2L 6115363 5' - gypsy4 333 2 80.20 AAATGCATTGAAGGAATTCAATTTTAAACAAAATGCTGCTAGCGTCACACAATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGG:1 - chr3R 27435098 5' - 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chr2L 3988610 5' - I-element 5338 1 64.36 ACTTTGGCTGACATTTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACCTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCA:1 + chr2R 16980079 5' - opus 445 2 82.83 TTATATAAACTTTATTTGGCAAATACATTTTGTACAATTTGAGGCTACGATTTTCAATTGGTGTCTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGT:1 - chr2L 19598967 5' - I-element 5044 1 74.26 AGTGTGAAACAAGCGGAGACAACAATAAGCGGTTGTCTAAACATGTATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - chr2R 20396330 5' + blood 7037 2 56.44 TTCTTGGCTGGTTGGGCTCGGCAAATCCTTAGTCCCCATCAATGACTAAATAATGGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCC:1 + chr3R 7551793 5' - flea 135 2 62.50 CTTTATCTTTCCCAACCCCCACCCTGTGTCAACATATACTTGTATTGCGAGTTGGTGTCTGTGTCTGTGACTAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATT:1 - chr2L 8876151 5' + 1360 3166 1 74.26 TTAGACACAGCGATTAATGCATATATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGA:1 + chr3L 15452863 5' + accord 29 2 52.48 GTAAAATTCCAATTACACAACATTATGTGTTCCAAAAAGATCAAATTATTTCGTAATTTTAATCATGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAAC:1 + chrX 6156144 5' + 3S18 5777 2 65.35 TAAACAATCAATTCTGCCTTCAATTGAACTCAATTGTGCGTTGCCCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATG:1 - chr2R 17269788 5' + transib2 29 1 53.47 GAAGGTGGTTAACAAGCCGAAAGAGACGACACACACAAGGGGACTCGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTCCCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chr3L 14152162 5' + blood 32 2 56.00 TCGTCGCCGGGAGAATCCCTATCCTAGCAGGGAGGAGAAAATACAGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAAT:1 - chr2L 205823 5' - 1360 3237 1 62.50 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACA:1 + chrX 3538813 5' + F-element 410 1 67.33 TTTGGTGCGGGGTGTCTTTACACTCGACTGGGTCGTGAGAGTGTGTGTGGAATATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTT:1 - chr2L 9299728 5' + 1731 26 2 51.49 AACGTAGGCGAAAAGTGGGACACCAACAGCTGGCCACAGAGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 - chr3L 18095732 5' - I-element 5322 1 61.39 ACATCAATGAAACATTCCTACCTCACCACATTAAAAGTGGCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 - chr2L 11805076 5' + P-element 36 1 44.55 AGCCATATAGCCTTCGTTCTTGTCTTACGACTCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAGACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAAT:1 + chrX 19404883 5' - 412 7102 2 67.33 GCACATTGAAGGTCAAGAGCGCCTTTGCTTGGCGCAAATTTCAAATACATTACTAAAACAATTACAGTTACACGCGAGAGGTATGTTTTGCTTTTTACCTT:1 - chr4 965577 5' + Tc1-2 131 1 72.28 CCAAGTCGTGATACCTCTCCATTATTTTTTTTTTTGTATGGAAATTGTTTGCATGCCCAGCTGCTCCTGTTTGCTGTTGTTATTGTTATTATTGTTATTAT:1 + chr3L 9558132 5' - mdg1 29 2 67.33 CCTCATCGTCATCCAACTCCTTGCGACTGCTGATCTTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGC:1 - chr2L 6717957 5' - invader2 484 1 66.34 TCCTCCTCGATGTTTTCCTTTTTTTTCCTAGCCGTTTCTGTTTCTTGTTTATTGTTGTTATTGTAACTGCTGCTGTGTTTTTTTTTTATGATGTTTTTAGC:1 + chr2R 15412615 5' - jockey 4994 1 55.45 CAAAAGAATTCGCAGCTAATCTAGGGGACTATGAGGGGGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAAGCCCTCAGCTGAGGGTTATGAATCGTGCATGCCA:1 + chr2R 8184436 5' + Rt1a 5002 1 62.38 AAAGTATGCAATACATTTTGGCACGTGGCTTGCTCTTTGTCTCAACTTTTTCGAGAGTCGAGCGAGTCCGTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr2L 4057106 5' - hobo 2936 1 75.26 TTGCACTTCCTGTCCTGAAACCGATGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAATACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGC:1 + chr2R 19158070 5' - F-element 224 1 76.00 CATTACAATTTGTTGAAATTGTAGCTAAAATGGCTTTTACCTAGAGTTTAAAATATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr3R 11073810 5' + pogo 17 1 64.36 AAGCTGCCATCGAGATCGGTCTGCAATAAAGTGGTGTTGTATTTAGCGAGCTCTACGAGCTCTGGGCAGTGCTTGGCTAGGCGATTTCTGTGGCGCTCTAG:1 + chr3R 1424434 5' - BS3 1499 1 72.28 TAAACCAAATAATACAACATGCATGTAAACAAAATAAAACCAATATGAACGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTTAA:1 - chr2R 10294341 5' + Porto1 4303 1 67.33 CATTTATCGCCAGTTCGACGACCAAAATTGGCGAGTCAAGAGTTCAAACTTCAAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 + chr2L 18979382 5' + Doc 24 1 51.49 AACAGCTGGCAATCTGCCGTCTCCATGACCAGGAGCACCCCCTGCCCGCACCCTTAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCT:1 - chr2R 13702878 5' + F-element 354 1 57.43 AACCATATTTGTGCCACACTTATTTCGACATTTAACAAACATTTAACAAACGTTGTAAATTATAGATTTAAATGTAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAG:1 + chrX 12401774 5' + I-element 2 1 66.34 AGCCACAGAGGTGAGGCACCATAAAGCAAATGTGAGCCTTGGCCGAAGCATAAAAAATATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATA:1 - chr3L 13264554 5' + Burdock 9 2 67.33 ATACTTCTACACTTAGCAGTTAGCCACGCCTAAACTACACACATACATACATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:3 - chrX 8522937 5' + 297 18 2 62.38 TTGAGATTTGTACAACTAGCTCGAGCTAGCCTGCCGTCAATTAGGCGATCCCTCGATCAAATATAAATAATACGACATCGACTAGGACACACAAGCATACC:1 + chr3L 6812392 5' + I-element 4951 1 57.43 CAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTA:2 + chrX 21667990 5' - Tabor 469 2 58.42 AAAATGGCTCCGGAAAATATGTATAAAAGCATAAATATTTAGGCGAATTGATGGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr3L 4637366 5' + hobo 23 1 56.44 GAATACTTTTTATATGTTATTTCTATTTTCAACGATTTACAAGAAATTACCTCTGGCACAATTGAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTCCATGTCCCTTCTT:1 + chr3R 5838374 5' - invader4 2978 2 70.30 AAAACGAGAAAAAGACGCGAGGCAAGGAGTGCAAACACATATGTATGGACAGCGAAATAAATAAATTGTAATCAAGCAATTACAGACGAATCTCTAAATTG:1 + chr2R 18232921 5' + Q-element 108 2 61.39 AAAGCGCGAAAGAGGAGAGCTTAGATGTAAGAATTCTTTACAAATTTATGCGCACTTGCAGTTCGCCTGAATGTAGTGACCCATGTAACACTTGACTTGCG:1 + chr2R 2094907 5' - mariner2 263 1 50.50 ATAAAAGAAAAGTGTCTACGGTGGCCGTTAAGCAAAACGAAAATTGAAGCAATTCCGCTTACGCTTGGCATACACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 + chr3R 27386256 5' + hobo 3 1 76.24 TGCTGCTGTATGTAATTAGAGAACTCCTGGTGCTTTGGAACAAGGGTCCCCCCATTGCACTCCTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr3R 12215245 5' + hobo 2 1 72.83 AGCTGAACCCATTAGGTGTTTTTGTATTCATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2L 7504925 5' - roo 361 2 75.25 TTTGGAATTTTTTTTTAGTTCCATTTTCCTGCCATGTGTGTAAGGCCGGGCAATCTGTCGCACAGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGG:1 - chr2L 4373290 5' - Doc 4504 1 69.31 GACCCTCAAAATTGAGTTAATAAAATTCTATTCTACAGCGATGATACGATTTGGCTTGATATTTGTCTGATTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGG:1 - chr2L 378973 5' - Quasimodo 7049 2 74.26 ACTGCGTTGGCCCGGAAAGTCGAGGAGGAGGCCAAAAAGCGGTAAGCATGCATTTAATCTACTGTATTAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATG:1 - chr2R 9285622 5' - gypsy 450 2 67.33 TAACCTCTTAATTTGATTCGTTTTATTTGTTATGCAAAAACTTGAAGTATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 + chr2L 3988500 5' + I-element 14 1 75.25 GTTGGTGTTTTGGATTGTGGCGTGCTCACCAGTTCACTTTGCTTTTACTGATTTTGAGTGTGCTTGCAACAAAGGAATAAAGGAGTTAGTATACAAAATC:1 + chrX 13868331 5' - Gypsy12A_LTR 2078 1 62.00 TTTAGAGTGTAAATGGAAAAAGTGGAAACCGTTGGTCAAGTATATAAAATAATGAATTCTTTATTACAAATATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCT:1 - chrX 19906104 5' + accord2 112 1 57.43 AAAATATATAATTAAATCCGGCTAAATAAATATAAATAAAATACATTTTTCACATTATTTTCAAGAATTGCTTTTGTGGGCGGAGTTGAAGGCGTGGTCAG:1 - chr2L 22543845 5' + transib4 2514 1 62.38 CGGCGCAGATGATTTGCCCAAAAGTCAAGTGTTTGTGCGGTTTGTGTATGCTGATTCTCAAAATTCTAGCATTAATAGTCCTGAGATCTCGACGTTCATAC:1 + chr2R 24805369 5' - INE-1 137 1 69.31 TTGTTATTTTAGATATGCCGAACTGTACACCTTTCGTTGCAGAAGAAACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chrX 9048720 5' + Tirant 8135 2 53.47 ATTAAGTTAGAAAAATGCTTTAAAGATGTTGGTTTCCCACACGAATTAAAAAAAAATTGTTGAATTGTGAAAAAAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGG:1 + chr2L 4048836 5' + invader2 4791 1 84.16 CTGCTAATGCAAGGTAAATTTTTTCAGAATGCCTACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAA:1 - chr2R 4187698 5' + F-element 4224 1 66.34 ACTGAAATTCAGGACTGCCTGGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATAAATCTCATTAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGT:1 - chr3R 17838356 5' + Ivk 373 1 73.27 CACGACTCTAATGGAAATTTTGCATGATTTGATTTGATGTACGATAACATTACCATAATGCTTTCAAGAACGGAACAGAGCAGCTAGTATACAAAATCGGA:1 - chrX 19593450 5' - Gypsy12A_LTR 2075 1 68.32 ATATATTTAATTGAACGGATTTTTGTTTTGGCACCTACCAAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 + chr3R 11073724 5' - pogo 2068 1 60.40 TTCAACGCCACCCACATCATTTCACGCGGAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTA:1 - chrX 12401522 5' + I-element 136 1 71.29 CTGAAGTGTTTACGAATAAAGATCACGGGCAATGATCGAGTGTGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAAG:1 - chr3L 15219406 5' + jockey 73 1 62.38 AAGCGACTGTTTTGAAGCATAAAGATCTCGACGTTCATGCGAGCGGACAGACAGACAGATGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATTCT:1 + chr2R 5223425 5' - INE-1 96 1 63.37 AGACTTCAAAGTTCGTGGGAAGCAGAGTCCAACAAATTAGGTCGATTTCCCCTTATCATATGTCACTGCCCAAATCGAGCGAGATAAAGCGAAAACCGACA:1 + chr2R 17639983 5' + G6 441 1 74.26 AGCCAACTACTTAGCCGAAAAACACGACGACATCAGGTCAAGCAGTCAGCGAAAGAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAG:1 + chr3R 9323685 5' + I-element 5064 1 61.39 AGCCAGCTTTGAAATACATATGTATAACTTAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCAC:1 + chr2L 5267226 5' + hobo 2651 1 70.30 ATAGGTGCAGAGGTGCGGTGCGGCCGGTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATT:1 + chr3R 5773148 5' + Stalker4 6980 4 56.44 TTAAAAGTTCCATGGAATTTCCGGACTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTT:1 + chr3R 9601643 5' + roo 390 2 75.25 GAAATTAAGAATATATTTTCTACCAGGAAATCAATGCGTACAATATTAATCTGTTATTATATTAGTATTATTATTGTTTAATTGTGTCTTCGTTTATTTTT:1 + chr3L 10404917 5' - invader3 5022 1 62.38 TTTTTTGTGCTTATTCGGTATCTATGAGAATCGGTCAACACAAAAAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCATA:1 - chr2R 4427829 5' - 1360 3351 1 72.00 CCATTGTATGTCTTACTTTTACTGAATGAATAGAGGTGCCTTACAGAATGATTCATTGGCGTGGTGGTTTATGGTACCGATGGGTCGGT:1 + chr2L 12831709 5' - ZAM 7967 2 71.91 CATATACTCTACATCCGACTACATTAAGTATATTTTCCGGCACAAAAACATTGCAATGACTGAAACTCTTGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr3L 3986358 5' + jockey 16 1 67.33 GAAACAACCTCAGTGATTCCTTGATGACGCACTCCAAGTGGATCAGTTCGTTAAACTGGAACATACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 - chr2L 5269888 5' + hobo 4 1 73.68 ATTTAATTTCAATAATATTAATAAATTTATGCAAGTGATATTTTTATTGAACCAAATTGTCTCTAAAGTGATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr3R 12729449 5' - roo 404 1 72.28 GGATGACAGTGGGTAGTGGGGGGAGCTTTGTGGACAATCGCCCCGAACTGCCGTTGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCG:1 + chr3R 11649013 5' - mdg3 372 1 71.29 GGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCA:1 + chr2L 7970991 5' - blood 332 2 69.31 ATGAGAAACAAGCGAAGTAGGTTATACCCTCATGAGTTCTATATTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGG:1 + chr3L 10815576 5' - 297 6768 2 56.44 TTTTGAATGTCTAGGTCTTCCACTGAGTCCTGTCGCCAGAGAGCAGCTCCTTTTGCCCCTTTTAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2R 23501818 5' + hobo 14 1 66.34 GTACAGAAATTATTTCTTTGTATTTTTCAGATTTTATGAGCCTTTTAACCTGTTTTTCGATTTAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAA:1 + chr3R 6425814 5' + copia 4881 2 65.35 CGGCTGACGTTCAACGTACTTCCTTCGCGTGCTCCCTAATATGTACTATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTA:1 + chr3L 3239223 5' + 1360 3192 1 67.33 AAAATATAGAGTGACGATGACATTCCCGTTTCTTAATACTGGAATAGATTACGCAGGTCCTTATTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 19447182 5' - roo 9059 1 72.00 AGCGGCACGCCGCTGACCGAACTATTGGCCGAGTGCGGATCCTGGACTCGTGCGATCTTGCTCTCTCACTGACTGCCCCGCATCCGTGCTAGCGCCTACCT:1 + chr3R 5294751 5' - gypsy8 350 1 53.47 ATTGTCGTCGTAGTATCGCCCTGTCCAACTGTTCCGGCTCCAGCTTTCGATTGCTTTGTTCGTCACGTACCAGGGGAGCCCAGATGCGTGACGTGCAGCAG:1 - chr3R 12266497 5' - G5 4457 1 55.45 AATGAAAACTTCTTTGTAATGTGAATGACTCTCGGCCTTTTGCTGATCTGCCTCCGCTGCTGTTCCTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAAC:1 - chr2L 18231865 5' - 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Dm88 4110 1 57.43 TATTTCCATTAAATCAGTTTCTCACTCCTCAAACCTTGTCATATTTCCACTCAACTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 3635405 5' - roo 9050 2 57.43 TCCCCTCAATTTTGTTGTCAGAGTTGAGAGCCACATTAACCGAAAATATGCCTTCATTAATATTGCTTAAAGCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTATCAAC:1 + chr3R 26366829 5' + Ivk 122 1 78.22 ACTTCCTTCGGCCAAACAACAGCATCCCATTCACTTTAATTGCTAAACGAAGAACAACAGGGCCTACCACTCCATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr2L 16124985 5' - hobo 2936 1 58.42 ACTCGAACAGGAAGTGATGAAAACTTGACTTGATTGTGACATTTAATTTATCGAACTAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1 + chr3L 18141934 5' - blood 357 2 58.42 CAACTTGTAGCTACCGTCCATGTCTTGTTTGGTTATTGTTTTGCATCTATCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACA:1 + chr3L 3283660 5' + Circe 7338 2 74.26 CACTCCACGAGCTGTTAGTTTTCCCGTTCGGGCCCAGAGTTGATTGATTTCTGTTCTAGTCGGGCCAAAGAAGAAAGAGAAATTTGCCTTTAATTTATTTG:1 + chr3L 17712614 5' - HeT-A 321 1 70.30 TCGCACCCGAATGCTCCGTGGAGCTACCCCATCTCTCAGAGTTGCTGAATCTCAACCTTCTAGGCGGACAGACGGAAATGGCTAGATCGACTCGGCTATTG:1 - chr2L 6565615 5' - INE-1 101 1 56.44 TTTTTTTTGAAACACTTTTATTGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGACTTGGGTGGGTAATATGGCGGCGCCCGTGAGAATGGATAAGTACTTTT:1 + chr3R 29011381 5' - GATE 467 1 53.00 GGTAAATGGTAAATCTTGGATCAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 3358749 5' - roo 9020 2 77.23 TGTATTGTAAATACCCCATATGTATTGGTGTTTTGAGTGATCATAACCTGTTTTGTATTATTTTTGTAAATATATTAGAAAAAGCCAAATCCATGTAGA:1 + chr2R 21389185 5' + 1360 340 1 51.52 TGAACTTTTATGCATTGTCATTAACTTTTATTGTATATATCGCACATGGGCCACATAGATGGCTCACACAGACACAAACACACACACACACACACACATTG:1 - chr2L 929202 5' + accord 7031 2 62.38 GCGTCTCCTTTGCACCGCCCCCTCATCACCACCCACCATGTAAACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAA:1 + chr2L 17255931 5' + TAHRE 10366 1 68.32 TTAGTTTTCGATTAGCGGTCAGTTGAGTGCATATTTAATGCCCATAAATTGCGGAGCAACGCAGTGTTGGCCTAAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCC:1 + chrX 18193884 5' + BS 4952 1 79.21 CTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGT:1 - chrX 21945911 5' + F-element 60 1 76.24 GCAAATCAAGGGAAAATGTTGGGCTCTGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 + chr3L 5085018 5' - 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INE-1 87 1 91.53 AGCCCCGGCATTTTGCATTTTCCCTTGTATGCTCCTTGCCTTTGCCCACATTTTCAGATATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATT:1 + chr3L 13264439 5' - Burdock 6377 2 65.35 TGCAAAACAGTCAACGCCAGAAGAGCACAGCCCTTCAGTACCCTACGACCGGAGAAACATCAGCCGAGTCAGTATTGAAGATTTTAGAAATTCATATTTTC:1 + chrX 8363222 5' - gypsy12 9807 2 74.26 ATAACGCTTATGATCCTTCAGCCCTTCAATCCACCTTCGTTCAATGATGAGTTGATTCCTACGATTCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chrX 1252871 5' + hobo 9 1 68.32 TATTTATTTCTTTTGCACGCTTGGACGCTCTGCAAATTCGCCGCAATAATATCAAATAATAAACAACAAAATAATCATTGAATCACAAGATGCAAATCCAA:1 + chr2L 18562437 5' + rover 6855 1 72.28 TATTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCAGATAAACACTC:1 + chr2R 17345946 5' - hobo 2909 1 56.25 AACATTTATAGTAAGCACTTACTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2L 436898 5' - roo 354 2 78.22 AACAGTAACAGCAGCAATCGCAATACGAACATCTATTGGTTGTGCCTCCTTTAAACTGTTAAAGCCCCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAA:1 + chr3L 11495172 5' + I-element 66 1 57.43 TATTGTTGTTTTTTATTTTCGTAACGATGGCCGCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGACATTAATCACAAACACTACCACTAAGTGAAAGTAAACTAAG:1 + chr2R 4601333 5' + Doc 4611 1 72.28 TTCTTCAATTTGATACCCTCTAGAGTTACATAAGTGGGATTCCCACATTTTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTT:1 - 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Tc1 1273 1 57.43 GCGGAAAATTGAACAACGACGACCGCTTATGTATCATCCTATATTTGTTGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chrX 7698582 5' + pogo 24 1 55.45 TTTAAAGATTCTATAAATATTTGTTTAATTGACGCCGGCTGCACATAAAAGAGAATGCTATAGTTGAGTTCCCTGATACCCATTAATCAGCTAGTGTGAAT:1 + chr2L 21780721 5' - INE-1 536 1 52.48 GGCCAAGTAAGATAATCGAGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chrX 15259051 5' - roo 9015 2 88.12 GGAGAAAGGACACTAAAAAAAGGGCGCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:2 + chr2L 11805033 5' - P-element 2837 1 27.72 TCTAATGCAACTCATTTTTCTAGTAAATTTTTGGTACAACACGGTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCC:1 - chr3L 23276884 5' - invader2 247 1 56.44 ACCATACTAATTTACAAATCACTTAAATACCTTCAGCTGGCTGCGAAAATGGTTGCTCTCGACATGGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTAT:1 + chrX 12295154 5' + Bica 94 1 75.00 GATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGT:1 + chrX 15408753 5' + INE-1 538 1 82.18 GGGATTTTTTAGCATTAATTTTCACACGACCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTA:1 - chr2L 5096456 5' + Doc 4322 1 71.29 CATGCAGAATACAGGCATGGTCACAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAACATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chrX 21668289 5' + 412 7103 2 72.28 ATATTAATTCTTAGATATAATTGTGGACATCCTAGCCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGAG:1 + chrX 11615314 5' - Doc2-element 4360 1 64.36 TGGGAGTAGTGTGGCGAGCCAGCTTGGCAGCACTTTCAGATGCACTGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGG:1 + chr3L 14918988 5' - 297 442 1 54.00 AGAATTGCAGTTAAGGAAGTGAATGTATATGTATATATAGTAAGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 + chrX 3244579 5' + I-element 34 1 64.36 CATTTAAAAAAAAAACAAAAAAAGGAAAAAGGAAAAAAAAA:1 + chr3L 9410903 5' + Doc2-element 239 1 90.24 GATACGCATTAATGGCCGTAATTATAATTTGCCACAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 + chrX 10210958 5' + I-element 45 1 64.36 ATGTAAAACATTCCACTCGACTGAGACCGTCTACATGCCTCACCTTTGTGGAAAATAAATTAAATTAAAAACAAGAAGAAAGAATGCTATAGTCGAGTTCC:1 + chr3L 25485221 5' - INE-1 573 1 57.43 GCGGCTTGCCTCAACCAATTAAAACCAATGGGTTCGTCTATTGTGGAGTGAAAAATAATTTGTGCCAACTTGTGCCAAAAACTAATAACTAAAGTGTTTAC:1 + chr2L 3344253 5' + transib3 444 1 74.26 TGTATACATAAGTGCAAACTACAAACAAGCTATAACAAGGCAAATACATCAAGGTGTTTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chrX 12276749 5' + hobo 17 1 62.38 TAGAGGAGCCTACGCCACTATATAATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAAT:1 - chr3L 11364197 5' - hopper 1307 1 76.24 TTAGGGGAAGACATGCAATTCGAAATGAAATTATGGTCACTGGACAGCATAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGT:1 + chr3L 18363478 5' + rooA 118 2 65.00 CTTCGTCACATTTCAGTTTTTCTTGGCCGGAAATGCTGAATTTGCACAAAAACCGACGGAAAACTGGCATAAAAACAAAGGCAACAAAAAAAAAAATA:1 - chr3L 3436885 5' + G2 3069 1 77.55 AAAGTCGAGGAGGAGGCCAAAAAGCGGTAAGCATGCATTTAATCTACTGTATTAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGT:1 - chr2R 9285607 5' - gypsy 435 2 52.48 GCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chrX 20330555 5' + P-element 35 1 45.54 AAGAAACTCAGGGAGAGAAACACAACACAGGCCAAAACAAATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAA:1 + chr2L 16531886 5' + invader2 4743 1 60.40 TTGCCAAAACTAATAAAATTAAATTGAATTGCTTAAAAATTGCAATAAATGGTGTCGGCGTGGGCGCTTTTATTTATTTTTTTTTTTGTTTTTGGTCG:1 + chr3R 27448720 5' - R2-element 3581 1 58.16 CGAAAAGTTTTGCGGAAAAGCGATGGGGTTTTTCGGGTGGACATTGGTCAGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:2 - chr3R 15054372 5' - hobo 2913 1 53.47 TTCAGAATGACCCATCACGTGGTCAGCTTCAGGCGAAATTAGAGCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1 - chr2L 6596818 5' + Tabor 6871 2 53.47 TGCATCGAGTGAAAATTGCTGGCCATGTCCGAGGACCTTATATGGCTGGCCGGCATAACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 14284982 5' - roo 396 1 60.42 ATTCCTGTCTTTTGGTTTAGCTTTTATACTCTGACTTCGTTTCGTTTCTGCCTTTCTGCCCGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCA:1 - chr3L 14241714 5' + F-element 4443 1 73.40 ATGCGTTTGCTACCCACTGAAGGTCGTAGTTTCATTATAGAATGTTAAATATATTGATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATC:1 - chrX 17628258 5' + INE-1 541 1 59.41 CCTGCTGAGCTGGAGCCACCGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCT:1 - chr3R 19015828 5' - 297 427 1 80.20 CTGCGTTTCAATTGCGGCCAGGATATGCATAAGTGTTCTCGAACATTTTCAGAATTTTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGG:1 + chr3L 22431682 5' + hopper 284 1 56.44 AATGGATTCCTCATCGATATTGAACAGGATTCGTTGGGAAGGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chrX 7768915 5' + hobo 31 1 58.42 AATATCTAGTGTGCGCTATCTTCGCATAAAAATGGCATCCAAAACGAAAGCCAAATGAGAAACGTGTTTGTGACGTGCAAAAAAACAAAATACGCCTTGAA:1 - 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pogo 2069 1 60.40 AACTCAAAATGAAGAAGTCGAAGTGACAAGCACTTTGTGTGCTTTGCAATTGATTTGGCGGCTGGCTGAATTTGAGTGAAAAATGGACAAGGCTAAACGTA:1 + chr3R 30116608 5' + copia 429 1 70.30 GTTTTTTTTTTCTAATGTTACCTTATTGCAACCGCCTTATTGCGTTTTGTTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCC:1 - chr3R 545609 5' + Transpac 289 2 54.46 GCCAGCACTTAGTTTTCGGTCTTTCGTCTCAAATCTGGGTTTGGCAGTCGAACTAGGGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr3R 24229167 5' - 1360 3373 1 63.37 CGGATCATTTTTCTCGTTCTCCTCGATGAACGAGCGCATTCTGTGAAGAAATTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCC:1 - chr2L 9291074 5' - Doc 4418 1 55.45 AATTTGCGCAATTTGTCAAGTGAATTCCTTTGTAGCGCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAGAGGTGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAG:1 - chr3L 6846662 5' + 1360 86 1 62.38 ACCCTACGAGAGCGGGGTGTATTCTTATTTATATTTTCATTTTCGGCGGAGGAGTCCAGCGACAAGACTGCCAATCACAATAATAATAATAACAATAATAA:1 + chr3R 31039224 5' + mdg1 7061 3 56.44 ATTACATGTTCCGTTTGATCAAGTGGCTTGCATTAGACACTGTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTAGTTGTACGTCTCTAATCCA:1 + chr3R 17180584 5' - Bica 240 2 58.42 ATCAAACCATGGCCCAGGCAGGCACGACCCAAAACCAAATGGGCCAGAAGACCAGAAACAGACGAAGAACCGAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAA:1 + chr3R 22161152 5' + I-element 260 1 72.28 CTTTGACCCTGCTGCCGTTGTTGTTATTGTGAAGAGCGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAA:1 + chrX 3522869 5' + gypsy4 491 1 64.00 CAACCCGCAGCGAAATTAAAAAACAATCATGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGT:1 - chr2L 10197621 5' + Stalker 6900 4 76.24 CAGAAGATGGGCAACGCCCGCCATTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAA:1 - chr3L 3223308 5' + copia 247 1 77.23 ATAAATTCTCTATACACATATTTATAATTATCCGATGCCATAGTCGCCAGATTATTCAAAAAGGGCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 + chr2L 5741290 5' - 412 7534 2 65.35 GAAGATATCCCACAAGTTGACAATGGATTCCTCATCGATATTGAACAGGATTCGTTGGGAAGGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 + chrX 7768894 5' + hobo 10 1 70.30 CGAAGGCTTGCAGTCTGTCCACGTCCAGCGGCTGCTTCGGAGGACCGTTTTTGTCCTTTTCGCCACTCGCGTGTCAGACGCCAGCGAGTGCCAAATCATCC:1 - chr3L 22788938 5' + Doc3-element 320 1 77.23 TACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 19450159 5' + roo 8692 2 76.24 AAAGTCGGATAAAATCGATACCCACAAAAGAAAAGGAGAAAAAAAAAA:1 - chr3L 1077474 5' + Doc2-element 219 1 54.17 GTGGTGGTCTTCGCTGAAGTCGAGTGGCAATTGCCGACTAAGCGTCGTAAAACATATTTTTATTACTTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAG:1 - chr3L 14286256 5' + Gypsy6A_LTR 259 1 67.33 CCATTTGTGTCCAAACAACAAGAGTCTTCAACATGATCTGTATTTTCAAGTTTGGATAATATGTCTTGCGATTGCTTGCCAAATAAAATAAACTAAATAAA:1 + chr3R 460072 5' + F-element 88 1 76.24 CTGATGAAAATAATCTGGGGATTCAGAAGACTACGCGATGTATGATAAAACAAGAGAAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 - chr2L 22315305 5' - INE-1 548 1 55.45 ATAATTTACCCGCAGGCTAAACTGTCCTGCCTGTTGGCCCGAGTTCTTTTGCCGGACCACTATAAATAAATGGTGCAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 - chr2L 16718054 5' - 1360 3388 2 76.24 GGAAGTGAATGTATATGTATATATAGTAAGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chrX 3244593 5' + I-element 48 1 78.22 TAATATATTCTTACCAATATATTCGCCTTGTTTGGTATAGTTTTACTTTATTATTTCACACACCAAAAATTTTATAGTATAGCAATTTAACATTACCAATA:1 + chr3R 3322598 5' - Doc3-element 119 1 63.37 ACGACAACAACCGGCGAACAAGCAAGCAACAACCAAGAGCGTACAACAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAA:1 - chr2L 3877463 5' + invader2 399 1 53.47 ATTGCTTTGTTAACGGGGTTTTTAAAAGAGTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAA:1 - chr2L 18773355 5' - Max-element 252 2 71.29 CCGGAGTATAGATAGTAATCTTAATTGAGATCCTGGTGACGGGCAAAATTACCCTTTTTCCGCTCGCTTACGACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGA:1 + chr4 718866 5' - jockey 4988 1 42.57 CAGTCCTCCTTTGTTGTAGCTTAATGGGTTTTTAATACAAACTTTGTTTTTAAATAAACTTCGGCAATGGAAACTTTTAATTTACCTTCCCTAGCTATCCG:1 - chr2R 1983445 5' + Cr1a 3999 1 76.24 TGATGATCGTACTTCTGCGACACGGTAGATAAATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chr2R 19953949 5' - opus 457 2 70.30 CGGGGCAAGGAGCTATTTGATCATCATGATAATTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chrX 3358712 5' + roo 44 2 73.27 TTTTTCGCACGGGTCCCACGCCACACCTCCCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGTGGCGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr3R 1135322 5' - 1360 3371 1 73.27 AAAATAATCCCAACTATCTTTTAGGTAAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGA:1 + chr2R 17472469 5' + flea 138 1 72.45 ATGCAAGTCGCGTCCTTTGGCCAAGTGTTTCTATGGGATTAGAAATGGAAACAAAGATTAAAGATCAAGTTTTCTTACTAGAAGGTAATGATTAACAGAGT:1 - chr3L 7635882 5' - Q-element 335 2 61.39 CGTTGGGAAATAAATAAACTGAAGAAGACACTTGATTGGGAGATATGGTGGGAGAACGTCTCTCCGTTGTTGTCTTCCCTT:1 - chr3R 11377454 5' - springer 241 2 56.79 ATTCAGTTTGATCACAATGGAAATTGTTACAATTCAAACGACATTCACTTTATCGAGGTTGACATGCTAAAAGTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCC:1 - chr3L 14151326 5' - blood 7366 2 82.18 TGTGTATATGTGGGTATATCTCGGTGCTGGCCGTACTTGATATAGCCGTGGGTTTTATTTAAATTTAGTTGGGCAGAAATGGTTCTGCCAGTTCAACGTCT:1 - chr2L 1417280 5' - 412 383 2 57.43 GTGCCGGGTGGGTATTTGTTATATTGCCTCTCAATTTCCGCGGACTACAACAATTGGCCACTGCGAAATGGATACGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATT:1 + chrX 11461004 5' - jockey 4617 1 78.22 AAGAATTCGTAATGAAGCCACGATTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 - chr2R 11086453 5' + Doc 60 1 76.24 TCTGGAATTGTCGTCTTGACAATCAATTCACGTTTCTGACCCTAAAAATACCATAAATAATTGGGTATAACATGGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCA:1 + chr3L 23578638 5' + Stalker4 7019 4 60.40 TTTTTGGTATTTTGATCCGTCAACGAGTCCTTGGTGGTGGGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAA:1 - chr2R 18756544 5' - copia 4732 1 66.34 TCGAAATGTTTGTCAGCTTATAATGTCCACTTAAGAGCGCAAAAAGCTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGA:1 - chr3R 14064898 5' + Juan 120 1 55.45 AAAATAAAATTGATAGTTATATTAAGCAAATAAACTTGTGAAATTCAACCTTCTTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACG:1 - chr2L 18977775 5' - Stalker4 59 4 62.00 CGAAAATCCATGTTTAAATTTGCATCCCCAAGAAGTAAGTCAATGATTTTGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chrX 12954166 5' + pogo 23 1 54.46 TGGTGCGTTTTCTCAGACATGTTGAGATCATATGAAAATTGGAAGGCTAATTAAGAATAAGTAACCTACTTATTGGTGAATTGGTCTGGTATGATGGACC:1 - chr2R 5149305 5' + R1-2 3087 1 74.00 AGAGCAAGCGAGATATGTATATTCCGCAAATCCTAAAGGGCAAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 + chr3L 9505823 5' + P-element 34 1 46.53 ATTTCATTTTGGTAGATTGATTGTTTACACTGTCGAAAGCGTTCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr2L 14743281 5' - 1360 3357 1 61.39 TTTTAATCTAAGTAGCGTGGTTTTTTAAAAAAAAGTTTTCTTTTAATTTTT:1 - chr2L 14457653 5' - G4 226 1 68.63 GCACGAACTCGTACGAAAACTTCCTGATCCAGAAGCAAAAGCTGGGCATGGCCACGCCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTTCTCCCGCTCTCCTC:1 + chr2R 24910283 5' + Max-element 8339 2 60.20 GTACCTGCCAGCTTGGACTCGGGATGGATGTGGATGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGG:1 - chr3L 11237472 5' - G6 1841 1 66.34 TTTTTAAAAAATATGTAATTTGTAATTTCTGTTAATTGTTTTTAATTAATGAAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGAAGAGTAAACAAAACACAAA:1 - chr3R 3629456 5' - Cr1a 205 1 55.45 CCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 - chrX 20330544 5' + P-element 46 1 34.65 CCATGAATCCATGAACCCATGAACCACAGCTCCAGAAGTCCAGAAATAGCAGCGAAGTGAAGCCATTAATAAATGATAAACCTATTGAAACGGACACACTT:1 + chrX 18171978 5' + Juan 292 1 76.24 CTAATCGATTCATTTGGAATTCAATACACAAACACATCGAACAAAGACGGGTAGCTAGGTGCAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGT:1 - chr3L 10843928 5' + Bica 399 1 66.34 GCCAGATAAGAGTTGTTTGCATAAAACGTGAGTTTACCCATGATTGATAAGTATTTATTTACCGGTCGATTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3L 3776563 5' - roo 402 1 72.28 GATCAAGAGGCACGCGGCTATATTGCTTACAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCG:1 + chrX 2662768 5' + flea 4850 1 71.29 TCGTAAATAAATAACAAAGCCAAAGCAACGAAAATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGC:1 + chr2L 1570052 5' + Doc 4367 1 71.29 TTAGGTCGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAG:1 + chr2L 14074948 5' + jockey 248 1 52.53 TACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:2 + chr3R 19450169 5' + roo 38 2 66.34 ATGCCACATTGATGATGACTCCGAGTTTCCAAGCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr2R 10865691 5' - pogo 2061 1 71.29 TAGTTTTATTACACATTTATAAATTTCATTTGTTACCATTTTCGTTCGTTTATTTTGATTCGTCAATCAGATAGCCACTTCTCCACAGCCAATAAGTGACG:1 - chr3L 4553371 5' - Fw3 3013 1 67.33 CACACCGAGGAAAATATCAGTTTTTGAAGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGA:1 - chr3L 27656376 5' + Idefix 148 2 72.28 AAAGCACACACAGTCGAGGTCAACAAAATAGTGGTATGTACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chrX 20982291 5' + 297 26 2 63.00 TAAGATGGTTTCAACCAACTAGATTTAAGAATAGAAACAGTCAACGAAACTATTTAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCAACTATTTAGCCACCAA:1 - chr3L 18089162 5' + Porto1 4458 1 74.26 GGACAACCTGACCAGGACGCATACACTGAGAATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 + chr2L 17168447 5' - flea 4972 2 72.28 AAACAACAAACTAAACTAACACGACGCCATCCAAGCTGCACTCGATATCGCATAAGCCAGGTAAAGAAGTCACTTTGATAAATTTGTCACTAATTTCCCTG:1 + chrX 7212626 5' - Ivk 479 1 64.36 TTTTATTATTTGTACCATTATGTGTGGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chrX 19820183 5' + hobo 67 1 74.26 GGTCGATCGGAGGGGGGCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 - chrX 10629242 5' - P-element 2830 1 22.77 AAGAAAGCAAAGCCAAATTGCAAGCAACCACAAATTCAATAAATTTGAAAAGCAATTAATAACTGATTGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAGA:1 - chr3R 13541254 5' - McClintock 133 2 71.29 GTTTGCAATCAGCCGGACTTTATGGCTGTTGCTTCTACGGTTAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 - chr3R 22494766 5' + 1360 34 1 60.40 AGAAAGAAAATGCCAACATGTTATTGAATGATTGTAAGAAATTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCAGCTCTCTCGCTCTCT:1 - chrX 129972 5' - 1360 106 1 55.68 CATTGACCTGCGCATCCAGGCACGGGAGCAGCTGATCTCGCAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 28879980 5' + roo 8699 2 61.39 GGTAAATGGTTTAATGAGTTTTAATTGAGTCGACTGCTGCAACGAAGCGAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTA:1 - chr2L 15354357 5' - Ivk 337 1 51.49 GGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1 + chr3R 19589919 5' + BS 5017 1 54.46 AGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:1 - chrX 21945930 5' + F-element 40 1 57.00 ATAAAACTCCAATTAAAAGTACGCTGTGATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr3L 5492355 5' + pogo 43 1 72.45 TACCACCTCAACGCCCTGATTTCTGGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCA:1 - chr3R 7832917 5' + 3S18 53 2 74.26 CAACTGTTTTTGATATGTTTGTGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chr2L 10687731 5' - hobo 2892 1 78.49 TGGAAATTATTATTTCATTTATCAGTTTTGCTTAAAGGTTTACATTGGCGGCCAGGAAGTGCTCGATAACTGAATTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGC:1 - chrX 21238869 5' - Doc 288 1 76.24 TAAATAGGCTTCTATATATATTTAATTGAACGGATTTTTGTTTTGGCACCTACCAAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3R 11073709 5' - pogo 2083 1 61.39 GTATGCACCATTATTATCCGATCTTCATTTCGAATTCATGCGCGTCTTGAATCTTGACCCTTCACATATCCTTCTCCGTTCTCCTCTGTCCTCGCGGTCTT:1 - chr3R 19449170 5' - gypsy8 4460 1 50.50 TTGCTCACACTCGGTTTAGACTATTCATCAACTTTTCGCAGTCGGTGTTTGCACTTCCAGTGATATGTTTATTGCAGCCCATAAATAGAACATATTTATA:1 + chr3L 8084692 5' - 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hobo 2660 1 54.46 TATATTGTAACCAAAACCGAAAAAGGAAAATGGGTGCAAGACCACCACACCCAATGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAG:1 - chr3L 10589095 5' + gypsy12 10156 2 65.35 CCGGATAGTCCACAAAGATGGGTGCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTT:2 - chrX 7768963 5' - hobo 2888 1 77.23 CAACTCCTTGCGTTCGTTCGGCACCGAGTCACAGATCTGCGAGGCAATGCTCATCTCCGTACTTATGGAATGAAGTCGAATAACCTTGCTCTTTTTACTAC:1 + chr3R 3610591 5' - rooA 462 1 75.25 AAAATGTCACTATATATGCACTTTTGTAGGTTTTCCACACTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3R 12929028 5' + roo 36 2 64.36 TCGTGTAGTGATATTTGTATTGGGAATTAAAACTATGCCCCCGGGATTAGATTAATTTTCATAGCAGCCGTTATGCCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAAC:1 + chr3R 28962558 5' + G5 4575 1 58.42 TAGGCCGCTCTCCAACAACTATATTTTTACGCTATACGAGGTTGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTTAGTTATTATCACTAGCCTTGTGGCGATAGCGA:1 - chr2R 2122345 5' - gypsy 7307 2 57.43 TACCCGTGTATTAGTGGATTTTGCGCCATAAAAAGCCGTCGAAACGTGTGAAAAATTAACTAAGTAATGATTATTGAGTTCTTCTGTCCGCACTTCGTGCC:1 + chr2R 20421095 5' + 1360 468 1 56.44 CTGTGAAAATTTAATATCCAAGCTGTCTCTTGCTTGTCAATAGCCACAGACGAAACTAGTATGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTT:2 - chr3L 20286694 5' - mdg1 406 2 63.37 TCGCCATAATTATGTAGATACTTCTACACTTAGCAGTTAGCCACGCCTAAACTACACACATACATACATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 - chrX 8522954 5' + 297 6582 2 77.23 CTCTCACCAACACAGAGGCACGCAGCCGCAGAGATAGAAATTCATTTAATGGACAGAAGCAGAAGCAAGAGCAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAA:1 + chr2L 8691747 5' - Cr1a 189 1 73.27 TACTCCAGGTGGCTGAATAGTGGTCTCCTGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACC:1 + chr3R 24181789 5' - HMS-Beagle2 6970 2 79.21 GTGGCGGACAACAAAACATTTATCCATCTCTAACAAGAGAGAATTCTATAGTCGATTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTCCTCAGCTA:1 - chr2R 5439229 5' - INE-1 544 1 76.40 ATTGTTTTGTCATTAGCATGACCGCGGCGCTTTTTTTTTTTGGGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGG:1 + chrX 2936665 5' - G2 3017 1 74.26 AATCATTTTATCTAATTAACCTATATTAATAGCTATTTAAAGAGATAACACAGAAGAAGGCTATAGTAGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCTTTACTC:1 - chr2R 15724692 5' - INE-1 549 1 78.79 GTTGAAACTCAAAGAAAGACAATAGATACACATTGCAAACCGAAACAAAAAAACAAGTTATACTAAAAAAAAATGAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAA:1 + chr3R 13517126 5' + I-element 101 1 80.20 GCTACAAGTGCGGTGAACAGGGTCACATATCTACCCAATGTGCAAAGAAGGAAGCTGATGGGAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGA:1 - chr3L 26057534 5' + Ivk 434 1 71.29 ATTTGTGTGGTGTGCGTGTGTGTGTGTTTAGAATTTTGTGAAAAGAGATTGGGTCAGTCAGTGATCGATCGTTGAGCAGAACAGGCATGCCTCGCTCACGC:1 - chr2L 3599330 5' + invader1 3939 2 66.34 GGGGCGTAGAGCCCAGAAATTGACAGACCTCGTGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr2L 16396579 5' + 412 44 2 67.33 GTGTGTGCCTGCTAGCCGGTGGTTATGATTAGCCAAGCAAATATTTAGTATAATAATAAACAAAACGAAAATATCAGCGTATCCGACGCTCAAAATCAGAA:1 - chr3R 26491930 5' + Porto1 218 1 54.46 CGTGAGGAGAAGAAAAGGCAACGGCAGCTGAAGACAGCAGACAGGCGCGCTGTGGAAAATCTCACTTCTGAATTACAAGCAAATAAATAAATATGAAAGAA:1 + chr3L 9040887 5' + Tc1-2 479 1 73.27 CCGGCATTTTGCATTTTCCCTTGTATGCTCCTTGCCTTTGCCCACATTTTCAGATATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1 + chr3L 13264443 5' - Burdock 237 2 61.39 GCAACAGTTCTTTGTTGGCATTGCTGCAAGTGCATTTTGGGTGTGTGGGTGTGCGGGTGTGTGCGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTG:1 + chrX 3557780 5' - gypsy3 421 2 52.48 AAGTGTTGTTATGCGGATGGCTTGTTGTCCGTCCCCCAATGAATTTCAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTA:1 - chr3R 12123928 5' - roo 8961 2 54.46 TAAATCGGGTTCACTAGTAAAACTGGTAATATAGTTTAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr3L 21715051 5' - 1360 3350 1 69.00 GGCAGAATATTTCCCAAGCCCAAGCAAGCCGACTTGGCTTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:2 - chr3L 18142008 5' + blood 7049 2 63.37 AAATTTACTTGTATTATTTTCATTGGACATGTCGGTATGTTTTTTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:2 + chrX 10058237 5' + F-element 43 1 57.43 GCACGTGCGTTGCTTTTTGTGAAAACTTGATGTATGTGTGTGGCTATGTGTGGGTGTGTGCGTGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chrX 6146638 5' + hobo 11 1 68.32 ATCGCAGTCGCAATCGAAGTTGTCGTATTCTCAGCCTGTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3L 14260341 5' + 297 52 2 51.49 AGACAGCAGATACTGCAAGTATCATGACCGAAATACAGGGTGCGGCAGCATAATATTCTTTCTTCAGAACTCATTGAATACTATTTTAGGCATCGGAAAAT:1 - chr2L 21687118 5' - mariner2 847 1 64.36 TGCATCGAGTGAAAATTGCTGGCCAAGTCCGAGGACCTTATATGGCTGGCCGGCATAACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 14284982 5' - roo 391 2 55.45 GCAACACGCAACCAGCCAGCGTTCTGGTGCACATCTTCAAGGGTAAGAATCCATGAACATATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATT:1 - chr2R 17977450 5' - invader4 317 2 69.31 TCCCTTGGTCATTTTATGAGTTATGTCTTAGATCCAAGGATCACTGCCATCCATGTTTTTGGGGTCGTCAAGGCAGCTGTTTATGGAGATTAGGTTGGAGG:1 + chr3L 15280842 5' - gypsy 7357 2 80.20 GGTTAATGTGTTCGACTCCGAACACATCGACCATCAACTCAAACGTCTTAGATATAAAATGTTTTCTATTGTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGG:1 - chr3R 3663468 5' - F-element 4350 1 74.26 TAGCCACTTAGCGGCTACATTAATGGCAGTGCCAAATGACTCTATCTTCCACTGAGAGTGTGTGGGTGTGTCGCAAGACAATTTAAGGACCGTCTCCTTGA:1 - chr2L 19595772 5' + baggins 462 1 73.27 CAAATGAATTGTGAAAAGTTGGCCAAAACAAGAAAGCTTAACGATGCCACTTTAATGAATATTAGTATTAGAATATTTAAAAAAAATTACATTAAAACCAT:1 - chr3L 17206847 5' - transib4 26 1 79.21 GTTCTGGTTGTGTAATTTTCTTTCGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chr2L 13314096 5' + jockey 61 1 76.24 TTTCACTAAAAATAAGTGTTGAGCAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGG:1 - chr2R 23105827 5' + jockey 145 1 77.23 GATGAAAACCAACTGGAACTCAATTGAGCTGCCGCAGTCATTTAAATTGAACTTGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCC:1 - chr2L 5210458 5' + accord 21 2 58.42 CATATGGTGGGGAAATTGGGTGGCAAATCAAGGGAAAATGTTGGGCTCTGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3L 5084996 5' - 412 467 2 51.49 CCTCGTTGCTCCGCCATTCAGGGTCCTTCATCAAGTCCATTTTCTCCCCTTTTCCACCGCCTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCGAACCA:1 + chr3R 25443020 5' + 297 6587 2 70.30 GCCATCCAACTTGTTGAAAGAGTGAGGTGCCTAAAATGAAATTCGTTTTCCCAGGGTATCAATGGTTTCACGCTCAGCGATTTAAAAAAATAAAAAAAAAC:1 + chrX 5922485 5' + TART-B 10633 3 75.25 ATTTTTTGGCAGCCACCTGTCCCTGTTCGGGCGCCATCTGTGTCAGCGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr3L 4051122 5' + pogo 21 1 54.84 ATTTGGGCCGCGTTCATGGTGTACGTGTTATTTTCTGTCAGTGCTACTGGATTTCTGAGGGTCTCTTTTGGTTATCATGTTCACAGAGAGACATAAGGTTT:1 - chr2R 392482 5' - Porto1 137 1 65.35 CATCTGCATTGAACCCTCTAGGCCTGAAATCCGACTTTCGACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGC:1 + chr2L 7433754 5' + Tirant 8205 2 60.40 AAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGA:1 - chr3L 23678153 5' + Osvaldo 17 2 72.45 TCCCAACTTGGAGCATAAATTCGCCTTAGATTTATAGGTGTCGAGAACAAAGGAGAACTGGCGCACATACATAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATT:1 - chrX 14648872 5' - 297 395 1 75.25 GAGACCTCAGATCTTGAAAGCCTCCAAGCAGCAACAATTGCTGCAACAAATTTGTGGGTTTATTTGAAGAAAAAAGTGGCAAAAAGGTCACAAAACAACCA:1 + chr3R 9178095 5' + S2 1283 1 53.47 GTATGATTATTGCGAGTGTGAAACAAGCGGAGACAACAATAAGCGGTTGTCTAAACATGTATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:2 - chr2R 20396344 5' + blood 7023 2 70.30 TCATAACACATTGGAATATGTTATATTTAAAATGCATTCCTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chrX 14500155 5' - roo 9036 1 60.40 AGGCAAAAATCAATTGAGTACTTGGAGTTACTTTTGCTTTCAATGAGATTATAATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGG:1 - chr2L 17168517 5' + flea 4778 2 54.46 AATTTGCGAACCTAGACGATAGAGCAGATGTCGAACGTTGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr2R 18036621 5' + blood 36 2 61.00 CCAGTGGGTGCTGCGATGTGTACGTGGTTGGAGGAAATGTTGCTGAATGTGTGTTGCGGCACGTTGCTGCTCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTGTG:1 - chr3L 137758 5' - Chouto 311 2 62.38 GCAATCACTTCAACGTAAATGCAACTCGTTGTAACAATTAAAAGTAATTACTTTTAATGAGTAATATGTTATACTATCCTCTGGG:1 - chr3L 26002528 5' - G5 4670 1 63.53 AAAGTATCTTAAGCTATAAAAATATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr3L 11335463 5' - pogo 2053 1 77.23 GAACGGCTAAGAGGGTGGCGCCATTGATGACTCCATCATCCTTCTCATCGACCTAGCACGCATATCAAGGATCGGCCAACTACTCTTCGTCAACTTGCACC:1 - chr2R 17481419 5' + Chouto 6074 1 58.42 AAGTCGCTTTTAATGTGCGCCCAAGCATTTGTTTGTCTGCGTCTCAGCCTCCACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACA:1 - chrX 2841726 5' + accord 192 2 76.24 GTAACGGGACTGCCGCTCTCTTTGTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chrX 10629218 5' + P-element 49 1 31.68 GGGAAACGAACTTTACGCTAATCTCGGCCAGACTTTGCCTGTGGTGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCCTGTTAATAAAAACCAAAAA:1 + chr2L 6535031 5' + I-element 380 1 68.32 AGGCGCATGAGTAATACAAAATGATTTTCCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 - chr2R 23908413 5' + Transpac 41 2 70.30 ACGCCCACCCACCAAGTAGTCTATTGAATTTGAACAACTTAATTCATGCATTACAGTTAAATTCAAAATATCGTTGGAGTTCGTGGCATATACCACCAACA:1 + chr2L 7773999 5' - accord2 306 1 66.34 TTTTCTTCATCCACCAAAATTGGGAATATGTATGGTGTCTTAGAAGGCGACATAAATTATTGCTTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chr2R 10777896 5' + pogo 10 1 69.31 TGTCAGTTAACACCATTTAACGCTAATGTAATGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chrX 12276820 5' - hobo 2897 1 68.32 AGTATCTGCGACGCGTTGCGAGTGTGCGGAATTCGTATGAAATTTATGCTGCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chr3L 6942952 5' - P-element 2864 1 56.44 GGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCCGACTTTTCCCGCACTTGCGATGGCTTTTCCATTGAAAAGTCGGGCGAGAATGTGCCCGATGCGTAGGCGGATGAAGG:1 - chr3R 15072565 5' - Ivk 5037 1 58.42 ACAGCTGAGCTTGATTTTTGCGGCGCCAACTTTTGTTTACTTTGATTGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTG:1 + chrX 9510900 5' - F-element 206 1 56.00 ACAATTGTGCGCCCCCCATAGACCGTTTGTAGGATCTGCAGAGTCCTGTTTGCCTTTTGCAGTCTCTAAATTTGTGTCTCAACTGTGTGAATATTGAGGTC:1 - chr3R 16714013 5' - Helena 1201 1 75.25 CTTATGTCGCTCTGCTCGCGTTGGTAACCTTTTTTTTTTGTTTTTATTTTTTAAGCCATTTTACCCAACCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCA:1 + chr3L 10809005 5' - Stalker4 11 4 64.36 ATGCCTCTAAGTCACGATAAAATGCTATTTTAGATCCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr3L 18034179 5' + Doc 45 1 61.39 TTGACAAATCCATTAACATAGAAATGCTTTTCATATCATTCAATAAGATATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 - chr2L 18188468 5' + Doc 33 1 52.48 AAATGCTTTTCATATCATTCAATAAGATATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:2 - chr2L 18188447 5' + Doc 54 1 73.27 CTTTATAATACAGCAACATACACATATAGTAGACAAAAACTGAGTTTTCACATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTA:2 + chr2R 20827471 5' + Burdock 86 2 54.46 ATATTTAGTATTCAATAATTTGCAGTTTTATAGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATA:1 + chr3L 18407999 5' + X-element 56 1 64.36 GTTTTGCCTTTCCCAACATTGTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTA:1 + chr3R 27385523 5' - hobo 461 1 79.21 CCAAAATACCTACTTAGGACTAATAAAAAGTATCAAAATGGTTCAAGGCATAACAATGTGTCTTAATATTTTTGATTGGTAGCGTCGTAGAATCTTAATAT:1 + chr2L 8687582 5' - G4 3472 1 56.44 CAGAAGAAGGAAATAAAAGTTCAAAGTTCTCAATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 7883136 5' - roo 9032 1 70.30 TGCGATATATGTGTCTCTGTATATAAAGCTGACACGAGAGCGAAACAAAAGTACAATGCAAACAAATAGCGAAACAATACGACTTCGACTAGGACACACAA:1 + chrX 20494818 5' + I-element 4944 1 68.32 ATAAAGCTGACACGAGAGCGAAACAAAAGTACAATGCAAACAAATAGCGAAACAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCT:1 + chrX 20494840 5' + I-element 4966 1 55.45 TTCAAAGCTGGCATATCATTATTTTTAATGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr3L 17652711 5' - pogo 2060 1 68.32 CGAAATGATTGCCAATATCTGTCTGGGCTTCTACGAGCACCTCAAGTCACATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAG:1 - chr3L 7653324 5' - 1360 489 1 58.42 AGTGGTAAACAAATATGCGTGCCAAAAATGTGGGCTTTGAGTAAATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAAC:1 + chr2L 20521376 5' + flea 41 2 59.41 ATTTCCTTCATCGATCCGTAGGGTAGCTAATTACACGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAGTTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3L 11198425 5' + roo 41 2 64.36 GCAAATGGATGGAGGGTGCAGGGGATGCAACAAGTCCTCCTTAAAAATTCTCTATCTTGCATTCTCCGAGTCACATCCAGTGTCCCATAAGGAAGCCATCT:1 + chr2R 6529379 5' + Q-element 485 2 72.28 ATTCCTGGTTCCATCACCTGAGCAACAGTTGGTATTGCTGCGCCCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAG:1 - 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opus 7488 2 66.34 AATGGTAGTCGCTTGAGCGGAGCTACTCAATATAACCCCGAAAATGAAATGATGAAATATCGCGTTCGCATTCACAATAGCTGAGTAACGTGTATGTGATA:1 + chr3L 5859433 5' + INE-1 546 1 73.27 CCCTGCCATTCAATGGGCAACCGCTCCTCCAAGTCATTAAATTATTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGA:1 + chr2R 7694059 5' - I-element 5312 1 57.43 GCTGGAAACTGGTTACACTTGAACCTGGTATTTGTGTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTTCCTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTTGTG:1 + chrX 3474071 5' + Cr1a 236 1 69.31 ACAAACCCCACCACTGTTTCCCCACTCGTAGCACTCATTGTTCAGCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAA:1 + chr2L 13514817 5' + Idefix 7103 2 56.44 TTCACTCCGCTTTGCCAGGGGCAAAATGTAGCATCAACATCAACATCGGCATCATCATATCAACGAACTCCATTTTTTTTTTTCCTTTCTTTTTTTCGTTT:1 + chr2R 14126517 5' - Doc2-element 246 1 58.42 GTGGGGTCTAAAACCAGAGTTTCGGGACTCCAAGGCGTGTTTCATTAGTCGGATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAG:1 + chr2L 15428641 5' - micropia 5088 4 60.40 GTCCCACTGAAAAGTGAAAGTGCAGCGCGGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCA:1 + chr2R 17469868 5' + flea 4857 1 77.23 CAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3L 11367513 5' - roo 359 2 72.28 TGCTGCTCCTTGGCCCACTGATCCGGCCGGATGGCAGCTCGACGACGGTAGCAGGCCACCATGCCCGCCAGCCCGCAGCTAGGATAGCAGCAACATCAGCG:1 + chr3R 13675305 5' + TART-B 61 2 24.75 TCTGACGATCTGTGCCTTTAATTTCTGGCTTCTTCTCCCATTTTGCGTAGAGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr2L 17283455 5' + hobo 23 1 56.44 CACCTTTCTCTGTTTGCGGCTTTATGGTCTATGGCCACGTAATTTACCTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTCGTTTATAATGTACCATTCGG:1 - chr3R 8466566 5' - Porto1 4366 1 53.47 GCTGTTTGTTTTAATAAAGGATGTGTAAGCTTTATATGCTTTTGTTTGTGTTCTAGTAGTAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGC:1 - chrX 15487020 5' - BS 5050 1 60.40 AGCGTCATGCTTGGCAGGTCCTTTGAGGAACTTTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2L 7767132 5' + hobo 42 1 63.37 TTCGACGATATTATAACGCACTTTTTACCGGCAATACTTAAAAACAAATCGTAGGCCATGCGAACAAATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAG:1 + chr3R 13084724 5' - jockey 4848 1 69.00 TTCCGCATAATTAGGCTAGGCTTAAATTTCATCAATATAATTAGATGTGTAATTACACGCGTGTTTCTGCTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATC:1 - chr3R 20034288 5' + 297 484 1 74.26 GGGAGATGGAGATATGCTATCATAACAAATCGCAGATATATATAGGGAAATGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chrX 14041218 5' + 297 6598 2 61.39 TTTAAATACCCGGTAGTGGCAGAGGAAAACGCGCCGCGACAGAGGCAGCGACTTCGGCAGAGGAGCTACAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chrX 409679 5' + P-element 2 2 71.88 AGGCGGATCTGTTCAGTTTCATTTAATTAGCCATAAAGGCGCTTAAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chr2R 23501733 5' - hobo 2908 1 56.44 TTGCTAATAAGACATACAATAATATATATTTTCGGTGCCAATCCAATTTCACATATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 15606099 5' + roo 8686 2 59.41 GAAAATGGTGTACTGCGTAAAATAAGGGGCAAGAACTCTACGACTGGTACGCCCAGTTGGTCGTGAAAAGGCGCTGCTGTGCACCGCAAAAGAAGATGGTG:1 + chr3L 7774009 5' + Rt1a 4858 1 75.25 GACCAACTTAACTTAATTGTGCTGGGTAGGATATGGTATTTTGATATCTGAGCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCAC:1 + chr2R 2962102 5' - invader4 2937 2 57.43 AGTCGCCTCAATTAAGAGGAGGTCTGCGGCGGTCAGTTAAGCTCAAAGGATGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCA:1 - chr3L 21989062 5' - Doc 404 1 56.44 AAATATTTTAATTTTCTTAATTCACACATAAAATAATCTTTTAATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAAGGACTATATATATATTCCTGATCAGGATCAA:2 - chrX 14766991 5' + INE-1 82 1 61.39 TTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:1 + chr3R 5245594 5' + 1360 41 1 70.30 CTGCAGTTGCATACTTTTGGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:2 - chr2R 17345736 5' - hobo 2901 1 63.37 CAAATGTACATCTGTGCTCTGTGCAAAAATGTTGTAAAAGCCCACACAAAACACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGAT:1 + chr2L 19174083 5' + Doc 302 1 51.49 TTGATCCACTCTCGACGTATTTTTGGTGTATTTGTCAGCGGGTTTCTAGATGATTTATGACAGTGGATCTGACATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr2L 7507253 5' - roo 9008 2 74.26 AGAAGGGCAGAAAAACAGTAGTAACAATATGTAGGTGGAGGCGGGTGGGCAAGAACAGGAAGAGGGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACCTCG:1 + chr3R 19549510 5' + 1360 464 1 69.00 TCTGCGAAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chrX 19819989 5' + hobo 40 1 71.88 CTTTTCCCAATCACCTGCTGCATATGCAGTGGGCGGCACGTCACGCATCTGAGCTCCCCTGGTACGTGACGAACCAGGTAATCGAAAGAGATCTGAAAGT:1 + chr2R 18527163 5' + G5 4505 1 65.00 ACGTTGCGTCACGGTGACTCGACTGAAATCGTGCTGAACTCCCCATGAACATATGAGATTGGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:2 + chr2L 16818759 5' + pogo 14 1 60.40 GATATGGATTCGTTAAGTGATCAATTTGAATAGGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 - chr2R 9001695 5' - mdg1 7415 2 68.32 GAAGAGCAGTGGACCGCACGCAAGTGCTCGGTGGATCGTCCGTCGGAAAAGCTACTGTCCTTCCTTAGCAAGCATTCCTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chr3L 9418534 5' + mdg3 5292 2 73.27 CAATCGGGTAGCTCGGCGCTAGCCGAGTCCGTATCCGAAGTAGCCTCGTTGTCCTCTCGTGGCCGCTTGGCTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 + chrX 20330463 5' + P-element 3 2 72.28 ATTCATAAAGCCAAGTACCAGATAAATGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr2L 5741361 5' + 412 50 2 74.26 GCCACGAGTATTGATTAAAGTCTGTTGTTTGTGAATGCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 - chr3R 4524243 5' - mdg1 383 2 63.37 GCGATGTGCCATAAGAAAATCGAAAGCTGTGAAGAAACTGTCATAGAAACAAACACAAGTATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTAT:1 - chr3L 11844435 5' - Burdock 242 2 66.34 GTCGTAAAATGTTTGCCGATTTCTGTTCATCGTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTGTGAATTTTTTGTGTTCGTGGGTAATGGCTAACGCACTGTCAAATACCA:1 - chr2R 13719420 5' - gypsy2 367 1 58.42 GAAAGGTGCAATAGAAATTATTATTGCATTAAATGCTAATCTCAGTCGCCATACATAGGGAACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTC:1 - chr3L 11241069 5' + G6 1770 1 56.44 GTCCACATAATTAAATCAACTAAATATTTAACGGGACATTTGTTTGGCTCCCCTCGTTCATCGTCCTTTCGACCATTCCTTCGAAGCGAGCAAACATTTGT:1 + chr2L 14900434 5' - G2 165 1 68.32 ACCGAATTAGGCGTTCCGCAAGGATAGACTGCAATTATTATTAATAAGTCAAAAATTATATTTTCTTTAGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 - chr3L 14886293 5' - 412 7539 2 71.29 ATATCGCTACATAAATACCAACTACAGTCCAACCTGCCTTAGTCATAATCAATTATATTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCAC:1 - chr2R 11597473 5' - copia 152 2 66.34 AGGATTTGAATCTTAGGAATTTGGAGCTTTGGAGCTAAGGAAGCATTTTATGTTGTTGCTTTGTATGTTGATCTAGACAGTGATATAGTCAAACTTAGTTG:1 + chr2R 1656696 5' + looper1 316 1 77.23 CTCTTCGACCCCCTAAGCTGTTAAATGTGTAATTTTGTTTTGTTTTTTAACTTTGCTTTTATTTTATTTGTTAATTTATTTTAACTATGCTGGTGGATTTA:1 - chrX 9628077 5' - HeT-A 290 1 61.39 CTCACACACACACACACGTTTCGCGATGATGGCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAAT:1 - chr3R 9101361 5' + accord 7070 2 74.26 GTTGCATATAAAAGAATAACCATAAACGAAGTAAATCATAGACCGTCAACCCAAGACGTGACTAACAGACGCCAAACAAAAAAAAAGAAAATAAAAAGCAA:1 - chr3R 10829142 5' + gypsy7 5009 1 57.43 AAATTTTTCTACAGAGCTGGAAAAGACCATAAATTCTGAGAGCAATTTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTC:1 + chr2R 15202318 5' - micropia 417 2 57.43 TTTTTGTGTGAAAGTAACCCTACCTATTATCATAAAATCGGTCTAAGTCACATTATTTGAATTTTGAGGTTTACATTGCGTGGGGTGAGTTTGGGGATTGG:1 - chr2L 16772350 5' - HeT-A 5931 1 58.42 CCCTTCGAATATTCGTCGTAGTTTTCAATTTTCCCATCATTGGCGGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAA:1 + chr2R 7096516 5' + P-element 358 1 50.50 AAACATCGTTGCATACTTTTCGGTGCACTTGGACAAGGACACGGTACGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 + chr3L 21852492 5' + 1360 30 1 57.43 AGCCCAACTAATGATGTATGTCGCCCCAGGGGCTGGTCAGCAAGTTACTCCATAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATT:1 - chr3R 14962881 5' - G5 4742 1 55.45 ACGGGAGATAAGAGGGGAAATAAGAGTTTTAATAATGTCTGACGAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:1 + chr3R 11247430 5' + HMS-Beagle 28 2 56.44 CATCCGACTACATTAAGTATATTTTCCGGCACAAAAACATTGCAATGACTGAAACTCTTGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr3L 3986369 5' + jockey 27 1 56.44 ATCCACTCGTCCAGCTGTGTTTTTACCTAGATAAGTCGCCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCA:1 - chr3L 13619646 5' + Idefix 7035 2 72.28 GCCTGCCAAGTGAAAGATACTGAGATGTGAACGAGAGGAAAAAACAAGTCAGAGTATGTAAATTATTCGTAAATACACGTTTTCCGATAATTGTGTGTTGT:1 + chrX 22512117 5' + transib4 315 1 64.36 GTGTTGCATGTTGCAGCTGCAGTGGTGTTGCATGTTGTACGTGCACACGATTTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTTTTGGGTCTCTC:1 - chr3R 29790700 5' - Porto1 373 1 69.31 CATTAAATCAGTTTCTCACTCCTCAAACCTTGTCATATTTCCACTCAACTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 3635411 5' - roo 9044 1 54.46 ACCACTGATTGTAGATGTTCCTCCAGGTCAGCGAGCCTTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTA:1 + chr3L 5345660 5' + hobo 399 1 62.38 CATCAGCTGTTTGCTTTGTTGTTGTCATTCTTGGTTGAAATACGCATTAATGGCCGTAATTATAATTTGCCACAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 + chrX 10210920 5' + I-element 7 1 74.26 TATCCTGGCCCTAATTAAGGACGGGGTCTAACTTCTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAA:1 + chr2L 13314836 5' + jockey 4779 1 59.52 AGGTGCGGACCATTCGAAGAATTCGTAATGAAGCCACGATTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr2R 11086469 5' + Doc 44 1 60.40 AATGTCCACAATTTTTACCTCTGCATGAACATAATATGCGAAGGGTATGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACC:1 + chr2R 14787929 5' + Doc 455 1 53.47 CCAAAATAACATCCAAAGCCAGAATGAGAACAACAACCAAAATAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGG:1 - chrX 18607641 5' + F-element 4421 1 57.43 ACAAGAGGATCTACCATATAAATCCTAAAATGAAGAGCTCTCAAAACAAAATAATCGCTTTGCCGAAAGAAGTCATGAATCTTTTAGA:1 + chr3L 23155618 5' + transib3 2474 1 55.68 TAAGTAGCTCCAAAACTCAATTGCCGAAAATTAAAATGCGTAATTTAAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGGTG:1 - 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F-element 4280 1 58.00 CAATTGCCGAAAATTAAAATGCGTAATTTAAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGGGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 - chrX 7335133 5' - Tirant 8492 2 54.79 GGCAAAAAATCAATTTCAACTCGATATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3L 10041502 5' + 412 7104 2 76.24 CCACTATAAATAAATGGTGCAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 - chr2L 16717998 5' + 1360 56 1 82.00 ATTGAAGACTATAGATAAAGGTCAAAAATGAAATATTGTATGTAAATTCAATTCACAGTTGCTAAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGTA:1 + chr2R 10552690 5' + INE-1 565 1 89.11 CAATATTGTAGCATACATTTTAGGGCGACGTGTCAATGTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:2 - chr2L 16968477 5' - 1360 3353 1 66.34 ATGGGCCCACTTTAAACGTTAATCTTCGGCGTCTCCAATGTCCACGGTTTTTCCGTTTGTGCAGGTCAGTCTTTGTGTGTAAGCTTATTCGTGGTGATGTT:1 - chr4 277729 5' + Cr1a 4051 1 75.25 TAACTGGGCTAAAGAAGGGAAACAAAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGG:1 + chr3L 11206550 5' - roo 8923 2 75.25 ATAATACTGGAAACACCGAAATAAATCCGGGCAAGATATTGTCGAGTCCAATTGAAAGCGATATAGCTGCTTAAACTTGTTTTCCACTTTTTTTTTTT:1 - 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hobo 2801 1 67.33 CACTCACACAGATACAGATACTAAGCGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3R 18448954 5' + hobo 40 1 72.83 AGTATGTCATACTCAATGCTTGGAACCCACATATCTCTTAGCTGTCGTATACGTAATATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr2R 18400609 5' - pogo 2087 1 63.37 AAGCGAAGGAGAAATTAGCAAGCAAACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTGCCCTCCGGGGGTTTTTTTGCCACTCGACTCACACCCAACAATTTA:1 + chr2R 19582200 5' + hobo 34 1 74.26 ACCTCCACAAGGTCCAAGAGATTCGAATTCCCGTCTTAGCTAGCTGGCAAGCTCTTGTGTATTCCGAGACTTGAACGTCAATCAGATCAGAATAATTATCA:1 - chr2R 2795999 5' + Idefix 452 2 70.30 TTTGTGTTTTACAACTGAAAGACAGACTTGCCTGGTTTCTCTGCGAGTAGGACTTTTGGCACCCTGGTTGGGTTATGGGTTATTGGCCGCTCGTTGTCTGC:1 - chr3R 3610824 5' - F-element 303 1 73.27 ATGGGTGACCCGAGTGGTGACCCAAACAGGTCGAGTTATTTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTA:1 - chrX 20333758 5' - P-element 193 1 49.50 CGAAACTTTGAGATTGTTTTAAGCACAGTTCCATTAAAACTGCATTTTCCTTGTGCCCCTTCGACCATATAAAAAATATATATTCTTGATCAGGATCAATG:1 + chr3R 4690337 5' + INE-1 84 1 61.39 TTCGATCTGTCCGACTTTAGCCCATCGTTAAGTCGGCGGTCTCACATCATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACAC:1 - 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Porto1 423 1 72.63 GTTACATAAGTGGGATTCCCACATTTTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGATGTTCATACGG:1 - chr2R 1986258 5' - INE-1 135 1 72.28 GTTTTCTGACGCGTTTAATTCGGGAGCGAGGCATGTCTGTCTTTATTCTGATAAATGCAAATTCAAACTGAACTTAAGGCTAACAAAATATGAAACTCATA:1 + chr2L 22490488 5' - gypsy6 130 2 61.39 GGGGGGGGGGTGAATGGTAATCTCTGGTGCACAGTGTGGAAGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCTGGGCACATTGTTTTTGGCCATTGTAAATTGCCGGGA:1 + chr3R 27612415 5' + aurora-element 4150 1 68.32 AGTATACATATGGTTGGAAATGGAGGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTG:1 - chr3R 4676440 5' - Doc 414 1 61.54 TATTGCGATATTAATCCAGCATTAATATCAATTCAATTGCAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGG:1 - chr3R 15653458 5' + I-element 4936 1 60.40 TCGCTGCAAATTACACGTGACATGCTAAATGGTTGGGGTTCGTTTGGGGAAGGAAGATGTTCAGACGTCGGAGGAAAATGGGGTCGACAAGATCATT:1 - chr2R 9650477 5' - G5A 2650 1 63.92 TATTGCATCCACTAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr3R 22494707 5' - 1360 3351 1 68.32 TATTATCGCAGCGAGTTGTTGCTGCCGGCGACGATCTTCGTTTTGTCGGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chrX 10585472 5' - P-element 2860 1 53.00 CAGGCGACCTAAATAAACACAAACACACACACACACATACA:1 + chr3R 29326818 5' + Quasimodo 36 2 65.85 TTCAAGTGCAGTTTTAGCCGAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTC:1 - chr3L 13161792 5' + pogo 1752 1 80.20 CGCTGGCCGTATCTAAGCGATAAATATTTCCCGTAATTATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTAATTTTA:1 + chr2R 16338086 5' - roo 9035 1 59.41 AAAGACACTGGAATGTGAAACGTGGCCAACATGCTGTCGTCCTTTGGGTCCATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCC:1 + chrX 13477036 5' - jockey 318 1 56.00 GCAGTTCAGCAATCTCGCTTGAAAAATATCGTGTTAATATTTTCTGCAGCTCTGGCTCTGGCCCCACGAACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCT:1 + chr2R 13469331 5' - jockey 4580 1 74.26 ATTTAATATCTTAGACAATGCTTCATTATACTCTATATATTGGCTGTGACAATTTTATCTGACCCTCGTTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTC:1 - chr2L 18683420 5' + 297 6776 2 74.26 TTGGTAGGTGAAATATGCATGAATCTGGGGATTGGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:2 - chr2L 16032341 5' - 297 356 2 70.30 GTTTCGTTACTCCCTAAAAGCACCACACAATTTACACACAGACATACGCAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAA:1 - chr2L 14792005 5' - I-element 207 1 58.42 CAGTCTGCAGGATATGCAGGTATTAACTGGCCGACAGCTGAACCTATTGTTTAATCGAATATTGTAATTGCCATGATTAAAGTTTTTTTTTTATTTTTTAT:1 - chrX 7199385 5' - HMS-Beagle2 490 1 69.31 AATGAAGTGTGCATACCTTATAATTCAATTTCTTTCAAAATAATATAATACTGACATAGTTGGATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAAT:1 + chr3L 8712525 5' - diver 205 1 43.56 CCATGTTGCACATTGTGCGATGCACGCACTTTAGCCCGCAACTTGGACAGGGGCATTAGCGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 21782029 5' + roo 8679 2 64.36 AAACTGGTAGCTCCTCAACTCGAAAATGTTTCCGCACAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 - chr3L 13779352 5' + transib2 39 1 60.40 ATTTAATTGCCAATTTTCAATTGATATTAATGTGCGCGCGTTTTCTGAGCTCACTTCATTTGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTA:1 - chrX 5149026 5' + F-element 82 1 67.33 CGAGGGTGTGGTCAAGTCGAAGCTTCCCATATTCGATAAAAAGAAGCAACAGCAAGGCGGCTAGCTGTGGTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGG:1 - chr3R 19046659 5' - F-element 4471 1 71.00 GACTATCGCAAACTAAACGAAATTACTATTGATGACATTTCAACGTTGCACCAACAATCTATTAGAAGACCTAATTTATGTAGTAGGCTAGAGGTACACAT:1 + chrY 680454 5' + invader2 4860 2 64.36 ATTATATTTTTAAACTTTTAAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTTTATTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:1 - 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chr2R 3120853 5' - INE-1 346 1 76.24 TTGGTTTTCCTTCATCTCTTTGGTTTGCTGAAGCATTTTTTATGTGTTTTTTGTATAATTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCC:1 - chrX 10710659 5' - 412 7358 2 51.49 TCAGGGGCAGAGGGAGTGGGCTGGAAGGAGCTAGAAAGGCATGTAACTCCAGACGGCACGAGGCGCCGACTAAGCGCTCTGCTAAGTCCGTTGCCTCCAAC:1 + chr2R 11072770 5' + gypsy10 5867 2 65.35 ATAGTTGGGAGTGGTAAAATTCGAATACGATGTAACTGGAATGTGAAACGTAACTGCACTCAAGTTATAAAGCCTGAGGAGCCAAAAATGACTTGTTGGCT:1 + chrX 12094048 5' + Cr1a 496 1 65.35 CTTGCCTTATTCAGTGATTTCAATTTTAGCAATTTTGAATTGCATTACAACAAAGGTTCTTCCTCGCTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTT:1 + chrX 20098541 5' + 1360 3261 1 70.30 GACATTTTTACTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2R 5651920 5' + Tirant 13 2 68.32 GGCTTCGATAAGTTTTTAATCAGTCCAACGTATACATATATACGAATTTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGA:1 - chr3L 3485013 5' - jockey 4776 1 53.47 AATAACACTATAGTCCAAAAAGAATCGCTCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTA:1 + chr3L 6131171 5' + jockey 4786 1 70.30 GTTGAATGAGCCCTGGAGTGGCGACATACTGTCTGGCAGGATCCCGATCTCATGACCAACTGGTTCGAGTGTAATAAACCAATATATGCCAC:1 + chr3L 14152072 5' - blood 7388 2 71.74 AAAAAACAAAGAAAAAAAACAATACTTGGATAATTCAATAATAAAACTATGAGCCAG:1 + chrX 3107234 5' + F-element 179 1 89.47 TTTGAAGTTAAATCAAGACGGGATCATTAACTATTTTGGCTTTAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chrX 7741700 5' + roo 32 2 59.41 GCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCT:1 - chr3L 25232907 5' + GATE 8270 2 51.00 GGGGATGGTATTATCTCGGATGTGATGCGGGTATCTACGATATATGTCTGTCCGTATGAACGCCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGATAGAAGGTTGAGAT:1 - chr3L 8798231 5' + INE-1 163 1 57.43 CCTTAAAGCCATAAAGGTACCAGGACCTGATCAGACGCCAAACCTGAGACCAATCTCGCTATTTATCGTCCCATAAGCTTGCTGCCGAAAGAGTATTTTTA:1 - chr2R 4932750 5' + G7 299 1 59.41 CTTACACAATGGTATATAGTCCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chrX 22690767 5' - roo 9017 2 78.22 AACGCATGAAGGTAAAAAATCTAATTAATGCATAATGTTAAATGTAATCAAGTGTTTCGGGAAATGTATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTGGCGCCCA:1 + chr3L 13264801 5' + Burdock 262 1 74.26 TCCTTTAGTTTGGTGGTGGAAAAAAAGAAAAGTAGTAGTAGATTTTACCAGAAGTTGCCGTCGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCTTGATCTCAGGAACTA:1 - 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Porto1 4493 1 74.26 CATTGCCTTTGCCGTTTTCTTTGTCGCCAACACTTCGCCTGCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTA:1 + chr2L 23296245 5' + micropia 184 2 59.41 CCCTGTTCCTTTTCGCAGTGAAAGCTTTATTTTTTTACGTTGTTATTATGATTTACCAAACTTAAGGCTAAGTTAATTTCATGTGTTCTTAGTCTGTCTAT:1 - chr3R 25041181 5' - G4 3615 1 81.19 GCCGCCTGACTTTGCATATTAAATTGAGTAATGACACGATCCGAAACACTTAGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:1 - chr2R 9129727 5' + P-element 24 1 55.45 TAAATTTGTTTACTTTTCGGCAGAACCAAAAACGAGTGCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr3R 29333756 5' - hobo 2907 1 60.42 CTGCTGGAGCAGCGACAGGATGCGCTGCTGCTCGGTTCGCTGCCAGGCGGTGAGCTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCG:1 + chr2L 6418722 5' - F-element 469 1 59.38 CCTTCACTTTACTCTTAACAATGTAGGCAGTAAATCAAAACCCCTTTCACTGCTCCCCTAGAACAATGTCAACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGC:1 + chr2L 1238136 5' + F-element 451 1 72.28 ATTAAAAAGAAAAAAAAATGAATATAAACAAATGAATATAAACAATAATAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAAT:1 + chrX 4308755 5' + invader2 372 1 53.47 TGTTGATGGGTTTGCATTGTTTGCTGCGTCTGCTGGATGCGATACCTTTGTTGGCTTTGCTGGTTTATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATACGTAACG:1 + chr2R 1880992 5' - 1360 3379 2 64.36 TTTATATCGTTTTTAAACTAAGTAAACTTATATTGTTTGCCATTTAAAGTAATTAACCGAAATAAGGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTA:1 + chr2R 17292445 5' + Tabor 12 2 68.32 ACACCAAGATCCAGACGAAGACGAAGGAAAAGCCAAAAAAGTGCCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTT:1 + chr2L 16711760 5' + 1360 3387 2 68.32 GATGCGTTCAAACTGGTTTCTGATTGTGTGAAAATTCAATGCCGCACTCACTCAGAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:2 + chr2R 23106470 5' + jockey 31 1 56.44 TAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGG:1 - chrX 23108306 5' + BS3 1442 1 62.38 GTGTATACAAAACATCCGTGCCTCGCACGCATATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr2R 10191712 5' + 297 6619 2 71.29 GCTTCCTTTTGGTCGGCGGTTGTCTCCACTAATTTTGGCTCGCATACAAAGTGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:2 - chrX 13881359 5' + jockey 30 1 53.47 TCCAACCAAGGACTTTTTGCTTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3R 12058664 5' - roo 9016 2 78.22 AGATCGGAGGATCAGAGGATCTCGGTGGATCGGTGGATCGGGTCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGTCAAAGACAATG:1 - chr3R 22193305 5' + flea 4588 1 57.43 GATAATTTCCTTGCTAATGGTAAAAATCATTTGATTTAACATTTATAGTAAGCACTTACTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2L 436861 5' - roo 9055 2 60.40 CAACAATGTCAGCAATTGATGTTAGCATTAGCTTCAGCCCGCAGACAAATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 - chr3R 7004010 5' - I-element 5311 1 56.44 TTCGTTTACGAGGAACTCAACCGTGGTCACCTCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTG:1 - chr2R 12359871 5' - opus 7302 2 68.00 AACACGACAGGAAATACTCGGGCGGTTTCAAATTGGCTATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3R 23873480 5' + hopper 143 7 68.33 CTGTGTGTGCGTGAGTCTGTGTGTTCGCCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTG:1 - chr3L 10836273 5' + hopper 46 1 74.26 CAACAACAAGTCCCTCAACTTAGCCCTATGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAAAAG:1 + chr3L 19333275 5' + F-element 387 1 76.24 TGCCTACATTTCGAACACTAATTACAATATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr3R 5993127 5' + pogo 46 1 75.25 TCCCGGTTTTTCGAGGGCAGGTAGCCAGGATCCGACCCCGTACCAACCCCTGTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chrX 409581 5' - P-element 2862 1 55.45 GTTTATATGTAATTTCCAAATAAAGGTTTTAATGTTTTTGGCACAAGAGGGCACAAATCATTTCTCACTCCACAATAGACGAACACTTTGATTAGATTTTG:1 - chr3L 18389157 5' - transib3 379 1 67.33 CAATGGCAACACACGATGAGCAGAAACTTCCACTTCGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr2R 19215218 5' + hobo 58 1 64.36 GTTCAAAGAGAAAGGACCAAGGAGAAAGGGGGCAACACGTCCTGGAGAAAGGTGGAGCAGCAGGCCACAAATGCTAATGTAAACAAAGATAAAGGG:1 + chrX 21016448 5' - 3S18 40 2 79.17 TGTAGCTAAAACCCTTACACTTGTAGCCGTACAACGAAGCCAGTTGCCCCAAAAAAAATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAG:1 - chr2R 16980158 5' + opus 12 2 43.43 CTTTTGTGCCATTGCAGACGAGCTCGGCGGAGAATTACAATTGTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAA:1 + chr2R 13754069 5' - hobo 2464 1 57.43 AGGCGATGGCGTATGCATATTGTGAGGTGAACAGAACAGGATGTGTTCGAGTGGATGACACTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 8914461 5' + roo 8679 2 64.36 GCCGATGACACAGAAGTTTCACATTGGGCGGCATATCATATATCCGTATACAGACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chrX 5151913 5' + 297 6594 2 67.33 GTGGGGTGGCGGTGGTAAGTTGGGGAAACTCACCGACCAGTTGCCATAGACTGATTTCCCGTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCT:1 + chr2R 16396754 5' + X-element 17 1 60.20 GAGACTATACGCGTACGTGTGCGGGTGTATATCTTTATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3R 18887037 5' + 297 36 2 65.35 GGAGCCATGAAAGACATTTTTAAGCAAGCGGACAGTATATCCCCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr2R 6041636 5' - opus 7474 2 58.42 TGATTGTACTATTTTCTTAGATTTATTTGTTTGTGACGTTTCGTTTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCT:1 + chr3L 15635072 5' + Max-element 8268 2 58.42 CTTCCACCCTCCCCCTGCTATTGACGGGTTGGCCTTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGT:1 - chr3L 10716114 5' - F-element 4227 1 75.25 CTGCCCATGGTAATTGCGTGCAAGAGAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACAC:1 - chr2R 6482754 5' + gtwin 16 2 63.37 ATAAAATGGAATTCAAAGGAGAAAACTCGTTCTATTTATTTGGCTTATATTCATTTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATTGTAG:1 + chr3R 20220904 5' - invader2 262 1 58.42 GCTGCCGGTGTCTGATAAGCCATCACATACATTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 24023324 5' + roo 8707 2 71.00 ATTAGAAGCGATTGTTCGAACCCTTTTTGAATGCATTTCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAA:1 - chr3R 24568566 5' + micropia 5163 2 62.38 CGAAGGAAATGGCTGCGGAAATGAGCACTGTTTGGAAAATTCCAGGTTGGAAAACAATTTGAAAGCGTTTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr2R 22518861 5' - roo 403 1 46.88 GAACATGAAATGGGTGTGGTCTTCCACGGGGTTTCTTTGGGAGGAGAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCG:1 - chrX 11626012 5' - gypsy5 355 2 55.45 TACATCCAGATCATCATTCACTTCGATTTCTTCATTATCCGAATTCAAGCCAAAGTCGACTGCACCCGAACGACCAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAG:1 + chr3R 2999221 5' + Doc3-element 4596 1 53.47 TTTAATATGTGACCAAAAGCGCTCTGTATTGTAAAGCTTTAAAACGTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chr2R 18400514 5' + pogo 27 1 55.45 ATAGATGGAAGAAGCAATGTCTCCTATGTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTATAAGGATATATATACTAGATTCGTTGAACTTGACTATAGCATTCTCT:1 + chrX 5853595 5' + INE-1 574 1 78.22 CGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGTCGAGCG:1 + chr2R 5206898 5' + Doc4-element 23 1 63.37 TAGGCACTCGAGCATTTCGAGTGTGCTTCCAGGAGCGAATGCAGCTCGAAAACCCTCGAAACACACACAGGCACACACACCTCGCACATACACACACACAC:1 - chr3R 18960785 5' - Stalker 448 1 71.29 GACAAGGGTTCCTGGAGTGCCCGATTCGGCAAGGAGACAGTAGTTAACAATGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 23485652 5' - roo 9046 1 53.47 TTATGACTTTGTTGATTTTCGTCTTTCTATTCTGTGGCATGACTTATTAGCCAAATTATGTAGAGCAGAATGGTTCGTAAGGAACACAACCCTGCACAAAG:1 + chr2L 18633083 5' + BS3 1415 1 62.38 TAGCCGCAAAAGGTGGAAAATGAAAATAAACAAAGACTTGATTACTTACGTTTCGTTTTGTGTTAAGTGATTCTTTTATATTTTTCACTTTATGTTCAAAG:1 + chr3R 20538739 5' + transib4 2479 1 67.33 AGTTCGCTTTGATGCTGCTTTAATTAAAAACTGCGCGCTTCGCGTAACTAGCACTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 30655330 5' + roo 8688 2 55.45 TAAAAGTGCAAATAAAAATTAAGGAAGCACTGCAAATTCAAAAATACCAAATACTTTGGAAAAAAGAAAAACCTGTTGTCTAAATAGGTGTTTAGACGTGA:1 + chrX 3522907 5' + rooA 7239 2 76.24 TTTGAAGTGGCAACAATTTCGCCACGATTCTCTTGGTCTTTCTTCGGTTGCTGTTGCTGGAGGAGCCTCCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATG:1 - chrX 22790432 5' - Stalker4 456 1 72.73 ATGTGGCGAACCACCCCACATTCACCTTTGGCAACATGCGGCAATATATTTGTGCATCCGTATTATCTGATTATCTGCGTAACGGGTATCTGATAGTCGAG:1 - chrX 15362521 5' + INE-1 552 1 47.52 TTTTCTGCATACATATTTTTCACTTTTTTGCGCTTTTTGTTTGGCCGTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATGG:1 + chrX 7632972 5' - accord 7025 2 72.28 CTAATGCACCTGCACTGCACTCTGGCTATCTTATTTCATCTTTTATACTGTAATTCTTTGTTAAATGTTGATAACTGATTTCGGCTTAAAACTTTGTTCTA:1 - chrX 13278353 5' - Fw2 495 1 59.41 TCTACGGGCTCCCTGTTTCGTGGCATCTCTCTTGATTTTGAGGGGGGGGTTTGATTTTTGGTGTTTTGCTTTGCATGTTCAGATTTATACTGT:1 - chrX 6866618 5' - hobo 103 1 75.27 CAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGCCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTA:1 + chr2L 7970994 5' + blood 375 2 46.53 AAAGCATAACAACAGAATGTAAATCCAAACTAATCCAAACTAATCCAACACTAAGTACCTACATATAAAAGCAGGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATAC:1 - chrX 2914655 5' + Juan 3954 1 54.46 ACAGAATTGCCAATTCATTTGCATAAGTTACGGACTGACATTACATTTCAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chr3R 14906899 5' - hobo 2913 1 52.48 CAGTGAAGTGCGTGAAGCGGAGATAAATAATTTCATATTATATTATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1 - chr3R 7212513 5' - blood 7358 2 61.39 ATGTTTTGCTTTGGGCGTGAAGTGGATTTTTGGGTCAGTCCGACTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAG:1 - chr3L 8869233 5' - roo 8604 1 57.43 TTCTACATAGACAAGTCTTCTAGATTTTTTCGAGTGCCAGACACTACTGAGTAGTCGAAAAGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATA:1 + chr3L 5838633 5' - accord 6947 2 41.58 CTCTTTTCGGATTTCAAAATCGTTTTTCGTATCTTTCGGGTAAATGGTAAATCTTGGATCAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 3358787 5' - roo 395 1 62.38 TGAATTTCATAGATAAAAACCAAACACACAGGCGCTCACTGATACACAGATACAAGCACACACACACACACACACTCCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAG:1 - chr2L 527560 5' + accord 280 2 74.26 ACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chr2R 5651907 5' + Tirant 26 2 55.45 TCCTGCTGGTGGAGTGTGTGCGTGAGTGTGTGTAAGGCACCATGGGAAAAATTCATGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGA:1 - chr3R 19753311 5' + 1360 320 1 65.35 ATGCAACAACATTGCGTATAATTAAACGCACGCATGCCTTCTTTTCATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr3L 10035715 5' + jockey 62 1 54.46 GCTCGCTGGCCGTATCTAAGCGATAAATATTTCCCGTAATTATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr2R 16338083 5' - roo 9038 1 58.42 CTTTTTGGCCCAAGTAAATAAACAAGTATAAAAAGTACCACACTTCCGAAAAGTAAACAAAACACAAAACAGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTC:1 - chr3R 19543240 5' - INE-1 574 1 57.43 GCACTGAAAACAAAGGGGATCAGTTTGAAAAATTTGAAGTTCTTTGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 - chr3L 16755841 5' - pogo 2100 1 70.27 TCAACTTGGCATTCCAAATTCGAAAAAAAAACGCATCGCGTGCCAAAGTATTCTCAATGGGATGTATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAAT:1 - chr2L 10197595 5' - Stalker4 9 4 66.34 AAATCGAACCACTAAAGCACCTGCCAAGACTCCAAATTATAAACACATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chrX 6739671 5' - roo 9041 1 55.45 AAAATTAAACAAAAAACTAGTAACATAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chr2R 9865527 5' + jockey 58 1 72.28 AAAGTAACTCTTACATTGACTGTGAACTTAGTTACAGTTTTTAATTGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2L 17887213 5' + hobo 29 1 56.44 TGCAGCACTGAATAGAAACAACTTTTTGATAGAATCATGGGTTTTTTCCTAAAGTGCTATATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chr2R 10865632 5' + pogo 11 1 47.52 CTCATCCTTCCGCATCTATTCGTGCCCATTCTATACCACTTCTTGCTGTCTTCCGCCCATCCATTCAGCAAGATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAG:1 + chr2R 16782970 5' + I-element 95 1 64.36 GCGTACGTGTTGCGCCCCAACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCG:1 - chrX 7334497 5' + Tirant 8171 2 78.67 TGTTGCCAGTGAAAATCCATAAAAAGCGAACAAAGACTGCAACTCGGAGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGG:1 + chr3R 7009348 5' - gtwin 421 2 55.45 AAAGGGATGCTAATGGCGTAGAGGATATTAATGAACTACAGTCCATGGTACGAATTAATTAATACGAATACCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATC:1 - chr4 142067 5' + I-element 4882 1 70.30 TAAAGCAATGTTTAATATGTATTGGAGCAAGTGAATATATGTAGGAGGCATAGGCAATATAAATATAAGTAACTAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAG:1 - chr3L 20540723 5' - Cr1a 4031 1 74.26 ATTTTGCTTTTACTTAGCTCAGTTAGCGAACGGCCCCGCTTTAAGCTTTCAAAAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAAC:1 - chrX 10172613 5' + X-element 442 1 61.39 TGGCTTGATGCGTGGCTGTTAATTAACACTAGACAGCACTTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 - chrX 13641414 5' - jockey 4966 1 61.39 CCCCCGACGATTGTGTTTCGTGCTCGCTGGCCGTATCTAAGCGATAAATATTTCCCGTAATTATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2R 16338062 5' - roo 396 1 65.35 CGCGCCAAACAAATGTGTGTAGGCTGGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAATAGTGACCCCC:1 - chr2R 18186605 5' + X-element 107 1 74.26 GTGGCAATTGAGACTATACGCGTACGTGTGCGGGTGTATATCTTTATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chr3R 18887028 5' + 297 6608 2 56.44 GTGTTTTGTGTCGGGCTTAGCCTAAAAATACACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTC:1 + chr2L 12942211 5' + jockey 4720 1 69.31 CTCTATCCCTTAACACCTCAGCTGCAGTGTTGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1 + chr3R 24229097 5' + 1360 45 1 71.29 CCTCAGCCAGTGTTGCAAGCCTCTGCACAGCTGCCCACGACTTACGAGCACTGCAGATATAGCCCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr3L 22741412 5' - P-element 2876 1 68.32 CAAATGAAATTTATGGCAACTAAATCAAAGGCTACTAATCGAAGCGAAAAAGTTTCTGGCGAGTGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTC:1 + chrX 20909691 5' + Doc3-element 4534 1 71.29 TGTTCACCCACTGGCCACCCATACAGTAGCGGGTCACATTGCTGCCACATGCCTCGTTGCCCGCCCGATGCGGTATGTGCCGGTACAGCCTGCCGTCTTCC:1 - chrX 15031979 5' - Osvaldo 393 1 56.44 CCGAACCACCCCCACTTACCAAAAAACCCACCCACCACACCACCCCAAAAAAAAAGTTGATAAAAAGTTTTTATGAATAAATTATCGGAAAATGTGTAGTC:1 - 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opus 7292 2 71.29 GCCATTTCGAGTTTGTTACCCGATTTTGAATTTAACAATTTTTTTTTTAGAAATTGGTATCTTAATGTTAAA:1 + chrX 11979177 5' + accord2 366 1 68.06 ATTGCTTCTTGAATATACATATGTGAATCCCGTTAAGTATTTACTTGTTTGGCTTCTTCTCCTTTTGGTTATGGCGG:1 + chr3R 24065519 5' - TAHRE 272 1 66.23 ACACAAATGCAAACAAGAACGAGAACAAGAAAGGCAACAAAAAAAGCACGTTGACTGTTTATATTTTGGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGGTGCCAAG:1 - chrX 12868003 5' - Rt1a 4884 1 53.47 TTCCAAAAAGTCACAAGTAATTTGAATGCAGCTTTTTAGAATTGATGTCTTGGTATCTGAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr3R 7212425 5' + blood 7025 2 65.35 ATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGA:1 - chrX 22824231 5' - Gypsy12A_LTR 2256 1 49.50 AGCTGGGCAGGAAGCTGATGGACAAGCATGAAGTGCACACTCTTTATATTTGGAGATACATATAATGAATATTAATATATTTTTGTTAAAAAAAAGAGCAT:1 - chr3R 9816827 5' + Circe 469 1 76.24 TTTAGAGAAAGGCCCGAGATAAGGTGGTTCCTTTGAGATGGGACTTTTGACGGGAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGACCTCATCTTCAT:1 + chrX 15621924 5' + Circe 17 2 63.37 GCAACCAACTAACCATATTGCATATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGC:1 + chr3R 20797031 5' + 1360 432 1 52.48 GAGGGACAGACCGAAATGAATGGTAATATGGTAAAGGCACGTGAAGGCCTTGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTATATTATTTTATTTTACAATGTGTCT:1 + chr2L 17987026 5' - 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chr2L 14899949 5' + Doc4-element 276 1 57.00 ATCGCTCATTATCAATTCAGCGCCCCTTATTTGTGCGCCCATTCGTCACACACTTTGCAATGTTAAACTCTAAAACTCAAATTATTGTACCTATATATTAC:1 - chr3L 11042741 5' + TAHRE 10345 1 63.37 TCAATGCAGTTCTAACCCGACTTACCGATGTCGACGAAGAGGTCCAGGTCCGTGGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCGAGAAGGTTCAGATTCAGCATACA:1 + chr3R 7084518 5' + INE-1 173 1 53.47 TAAAAATGTGACGCAAACTTGTTACTTTTGTATGTAAGATATGATTTAAAGATGGACGCGGCAAGGTAGTTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAGTGCGGATC:1 + chr3R 5026653 5' - Chouto 424 2 69.31 TTTAAAGGGTTATAACGTTACTGTTTGGGTTAATAGTTTCATGATACTTTGAAAAAAGTTTTGAAGGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAACATATTCGT:1 - chr3L 25914121 5' - roo 16 2 64.36 GTAAGGATTGTTTTTAAATGTTTGGTTATAAAATTACTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTTATTTTTTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTG:1 - chrX 11300407 5' - I-element 84 1 63.37 AAGAAGGTTTGGGGCCGCCGTCTATATTCGGTTCCCAGAACTAAAATTGGGGCAGAACAAGAATTCTTCGGGTCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGA:1 + chr2L 22207828 5' - gypsy 456 2 75.25 CGCTGAAATGTTTAGTGTTTGTGTTTTTTTCTCCTTCTCTTCTCCCCTCTGAATGTGTGCTTGTGTGTTTGCTTTTGCAGCCGTGGATAAAGCAACGTACT:1 - chr3R 11947780 5' - Copia1_DM 3972 1 76.24 CTCGCTCGTATGCACGTTCGTTCAGGGAGAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGACCGCACTTCGTGCCTCAGGATATGAACAAA:1 + chr3L 314836 5' + 1360 484 1 68.09 TGGAGTTGGGGCCGTAAAAAGCCGAATTCTGATTTGATTTGTTTGGCGGCGCACGCCCAGCACTTAGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr3R 20869645 5' + hobo 8 1 70.41 TTCATATTTATATTTTCTTTTTGAGGTGCGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr3L 10565291 5' + pogo 46 1 74.26 TAAACTCCAAAATAACATTTTTATCATATACATGCCCCGTTCGGCAGAAACTCTAACTCTAAACTCAAAAGGATAGAAAAGGCGCCTGCATGACGCGTGCC:1 + chr2R 5617180 5' - invader1 45 2 51.49 GTTACTTACTATTGAAGAAAGTAATATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 7741751 5' - roo 358 2 76.24 GAGCCGCTGTTGGCGGAGAACGTTGAGTAGGAGGTGGGATAGTAGCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAA:1 - chrX 22458070 5' + I-element 416 1 55.45 CTTAATCCAGAAATAAAAATTCTGAGGGCGTTCCTCCTAATTGTTTTATTTTTGATTACTTCACTTTGATCACTTCACGAATACTTTGTAAACGAATCAAT:1 - chr2R 3205743 5' + frogger 2221 1 60.40 ATCGATGAGCTGATAAGTGGCAATTGAGACTATACGCGTACGTGTGCGGGTGTATATCTTTATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr3R 18887012 5' + 297 6592 2 67.33 TATTTAGTGGTGTTATATTTTATAAAAAAATGTATTTTGCAACCACCAGCTAATCAAAACTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTG:1 - 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chr3L 13366417 5' + hopper 44 1 63.37 ACAATCCGAATTAGTAGAAAGCAAAACAAGGCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCT:1 - chr3R 27993390 5' + transib2 44 1 75.25 CATTATGTTTAAGAAATAGTGGTACAAAATGATGACTTCCACATATTTGGCAAAATAAGTAAAAGAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCACGAC:1 + chrX 22508822 5' - INE-1 568 1 51.49 AAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTT:3 + chr3L 17215728 5' + Ivk 40 1 60.40 AATGTGAATGTGGGGCCCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3L 5490090 5' + 297 52 2 83.17 AGCTTAATTATGAATGTATTTAGATATATTTGTGTATTGGTGGTGGATGATATGTAAAAAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAATTGGCGATG:1 - chr3L 4266707 5' + Juan 134 1 60.40 TAGTTTATTGGCGTACGTTATCGATTGTTTATGTTTTATTTATTTATTTATTTTTATATTTTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAAT:1 + chr3L 2558425 5' + 297 285 2 48.51 GTATTTTAGTATTTATTTTGGATTAACTCCTGTTATTTTGGCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTTAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTAT:1 - chr2R 10584024 5' - invader2 409 1 59.41 GCTGAACAGAGGGGAAATGCTGAGTTGAATGTGCATAGTATTAACTTTAAAGTAAAGTATGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACA:1 - chr2L 4750058 5' + Quasimodo 10 2 67.33 ACCCGAGACCAAGACACATGGCTATAACCTCCCTCCCCCAGACGATTCGCTTGCCTGGCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGG:1 + chr2L 16428386 5' + 3S18 5828 2 67.33 ATTTTTTGGCTGTTGTACCTTTGCTTGTATGCGTGTTCGTTGGATTGTCGTTAGTCTTGTTTAAACATATATATTAATATATTTTGCATTTTTTGTCTTTG:1 + chr3R 18448299 5' + Cr1a 187 1 61.39 TTTTATAGACACAGACAAACACACCTACACGGCCACCAGGACCCATTGTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGA:1 - chr3L 21869727 5' + 1360 75 1 55.00 GCACTCTACTTTTTAGAACCAGCGTTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGT:1 + chr2L 5460010 5' + Circe 7185 1 75.25 TGGAAAACTGTTGCCGTTGGTCAAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 + chr3R 20868739 5' - Transpac 5179 2 79.21 TATTTCACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAA:1 - chr2R 2092806 5' + Doc3-element 69 1 56.44 GCCAAGTGCGCCTCCATTGCCGTTGACCCAAATTGGCAAATCTCTGAATCTTCTCGGCAACATTTGGCAAATCACTTGCCACTAAGTTCCCATACTGCCAA:1 + chr2L 7570305 5' - Burdock 6026 1 79.21 ACTATATATCGATTGTAGTCTTAATAAAATAATACCCCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTAT:1 - chr3R 16487387 5' - roo 370 1 65.35 CAGAAAGTTGGCGCGCTGCTCCATCGGCGTGCTCCCTGTATTGATTTTTACCCATGCACTCTCTCGCTCTTTGGGCCCTTTTCTTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr2L 21218399 5' + Tc3 79 1 69.70 TATTTTGATGGTTATTGTTTTAAAATCCAATTATCATTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAA:1 + chr3R 9069771 5' - I-element 10 1 63.37 AGCAATGACGAAGAATTGCTCGATTGATAAGGTAAAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGATCCAAGTGTGGAACACTGA:1 + chr2R 3293729 5' - 1731 297 1 60.40 TTCCCTTCATTTTCGCTTAGAAGCAGCATTTTGGCCAACACTAATTGGTGCCTGCCATCCAAATTCGCACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATC:1 - chr2L 17034809 5' + F-element 4477 1 70.30 AGGCCAAACGACTGTCTCCACACTGAATGGGATAGAAATTAAGCATAATATAACTTAATGGCCTCAGTTCCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 - chr3R 28678268 5' + I-element 16 1 62.38 GGTGTAGAGACAGCGGATCGAATGCGTTTTGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCT:1 - chr3L 17423426 5' - F-element 229 1 75.76 TCCGAGATGTTTCCCGAGCCTCATAAGATCGAGCATCTGCGCAAGGAGTTCCAGGACAAGCTAAATTTTCCCGGCAATTTACAATGGCCAAAAACAATGTG:1 - chr2L 252077 5' - aurora-element 4139 1 61.39 ATCCGCCGATTTGTTCAGCAGTGCTACGTGTGTGTGCGCGTGTGTTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGG:1 + chr3R 29352439 5' - accord 6984 2 60.40 GCAGTTGGCGCAGCACAATCGCCATCAAACCCTTTAAAAATAAATTATTTTGTTTGTCCACTTTTGTGGGTGGGACAAACGTTTTTTATTGATAATATTTC:1 - chr2L 17726982 5' - FB 333 1 75.25 ATTACCAGCACTGGAAAAAAAAAAATTCCCTTCAAATATATTATGTTTTATTTGAATACTCGTTTTAATTTTTCAAGTATTTTTTTTTTACTTTTTAATAA:1 + chrX 14501117 5' + hopper 154 1 75.25 AAGACCACAGTTATGATGGACATATATTAGTAATTGATTCCTAAGTAACATATTTGTTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATA:2 + chr3L 10045219 5' + Stalker2 18 2 52.48 TTATGAGGTTGCCAAGCCCCACACTAACTATATAAATAAAACCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTACGCTAG:1 - chrX 23291025 5' + HMS-Beagle 166 2 82.18 GTGCTATCTATCCATATCGGAAAAACAAGATAAAATAGAAAACTATAGCATTCTCTATAGTCGAGGTCCCCGACTATCAGATACACGTTACTCAGCTAGTG:1 + chr3R 893552 5' - INE-1 541 1 76.24 TAATAGACCCAAAAAAATGGTCATTCAACAAAACGGGATGCGGAAGTAATTTACAATTTGGTAGAAATAAAAGAGAATGCTATACTCGAGTTTCCCGACTA:1 + chr2L 22062339 5' - INE-1 566 1 69.31 GGGCAAAGTCAGCGGTTATGATTTGTGGATTGGTTTGGTTTGTTTTGGGGAAATAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCC:1 + chr2R 12371309 5' + roo 173 2 49.50 GGAAAATACGATCCTTCATTAAATAGGAAGAAACAAAAATTCCTAAGAGATCAAAAAATAATTTCAAGAAATATATCCAACCGAAATAAAGTTATGTTATC:1 + chr3L 2818426 5' + Chouto 148 1 50.50 CCACCTAGCTTAATTTATGACGAACAGCCAAGTCCATTTAAACCAATACCAATTAAATAATCAAATATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTG:1 + chr2R 19850182 5' - copia 4942 2 64.36 GCAGATAACACACAAAACAATCCGAATTAGTAGAAAGCAAAACAAGGCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTAT:1 - chr3R 27993406 5' + transib2 28 1 59.41 TATAAAATATCCAAGTGCTCAGTGTAGTTCACATAAGAGAATGTTATATTTGAGATCCCCGAATATCAGAAATTTGCATAACTAATAAAATTATGAAAATA:1 - chr3L 26662938 5' - INE-1 402 1 65.35 ATTGCTGTTAGCCAAGTCCTACTGTGCCTTGAATTTGTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTCAGGATGATTTTA:1 - chr3L 10682829 5' - mdg3 304 1 63.37 GAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr2R 981617 5' + 1360 56 1 68.32 CTCCCTATGCCTCCATAGTCCATCTCTTTCTATTCGAATGTGGCCATCTCTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGT:1 + chr2L 18743584 5' - Bica 254 2 56.44 ACTGCCTTTTAGCCGACTGGCGATAATTTGTCTGCCGGCTAACCCGCAATGGCACATCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTGTAAGCTATAAGAATA:1 + chrX 3456254 5' + Gypsy6A_LTR 132 1 65.35 AGCGAACTATTTTCTGGCCATAAATCGATTTTGAAATATGTTACCAATATTTAATCGCTCTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 - chr2L 7745981 5' + I-element 17 1 58.42 ATTTTAGGGCGACGTGTCAATGTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGAACTATGCAGCC:1 - chr2L 16968461 5' - 1360 3350 1 72.73 AATACATATATCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCAC:1 - chr3L 19339450 5' + Tc1 5 1 78.22 GTGGAGTGTTTTTTTTACGGGTTGTACGTTTTGTGGTTTTGGTTTTCGGTTTTTCGGTTTTTTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAGTC:1 - chr3L 2936979 5' - Porto1 4401 1 58.42 CACAGGGCACAGATCCTTGCACATGCACAGCGAACAAAAAAAAAATACAAACAGGAAAAGTGTTGGGCTTTCGTCATTGTTTCAATGTTTTATGTTCACTT:1 + chr3L 13237712 5' - I-element 462 1 53.47 GCTCTTCTACTTGCTTGCAACATTGTTTTTCGAGCCCATATAGTGGAAAACTTGGACCCCGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACTGC:1 - chr3L 10621145 5' + accord 7103 2 56.44 AAAACGACAGCGGACGAGGGGCGTAGAGCCCAGAAATTGACAGACCTCGTGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr2L 16396562 5' + 412 7071 2 56.52 CTTAGAACAAGAATATCCAGCTGAAAGAATGATATATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 + chr3L 11844346 5' + Burdock 6172 2 67.33 ACAGTACCACTCCAACCTCCGAAGAGCTAACTTCTTTAGTAAAGCATTTGACTCTGTTAATCATTACCTTCTAGTAAGGCAACTTGATCTTTTAGGTTTCC:1 + chr2R 2146569 5' + Q-element 364 2 67.33 TTCGAAGGGACCAACGAACTTAATTAAAGGATTAAAGAGAAGCCTGAGTATTTTAACAATACTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGAT:1 - chr3R 1011147 5' - 297 191 2 72.28 CCCACCATTTCCCTTTTCCCGCTCACATATTTGCACATAGTACACATTTCATGCGGAACTGACGCTTGTGTGACGCTTCGCCCAAAAATATATGGAAAGG:1 + chr3R 27435003 5' + jockey 4642 1 77.00 TTATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGTTTCGCGGGTGATTCGCAGTGCTGTTTGGAGTTGTTTTT:1 + chrX 21634156 5' + Cr1a 244 1 76.24 GAATAAATCGAATCCCCAAATGGAACAAAAAACAAGGAAAATGCTATCTTTTAAATTTGTTAAAAGAGCAAACAAAAAAAAGAAAAAAAAAACAAACAAA:1 - chrX 17707412 5' + gypsy7 5013 2 75.00 GTATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATC:1 + chr2L 3988546 5' + I-element 60 1 73.27 TTCGAAATGACGGTTAGTAGCAATATAATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2R 12370581 5' + roo 48 2 76.24 AAGCGAAAACTTTTGCCGCTTAAGAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 17846922 5' + roo 8715 2 82.18 GAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTATT:1 - chr2R 2092774 5' + Doc3-element 101 1 74.26 AAAAATCAGTGGCAGCATTAAAAAAATGACTCACTTACAATAATTAAATCAATGACCTACAGTTTTGCGGGCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTC:1 - chr3L 6552883 5' - 412 7485 2 65.35 TAATAAGTCAAAAATTATATTTTCTTTAGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr3L 14886252 5' - 412 7498 2 75.25 GCAGTTTAAATGCGAATTCGATTGACAAGCCAGCCAAGTGCACAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 + chr3R 21969060 5' - hobo 2906 1 63.00 AGATACTCAATTTGTATACTCAATAGAAAATGCGGAAAAGAAATGGATAGGGTGTCTGTGAAGAAAGAAAAAGATTTGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGG:1 - chr3L 16266165 5' - Ivk 5064 1 75.25 CTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3R 15054311 5' + hobo 43 1 66.34 GAGACAGAAGTGAAGCGCGATTTTATGATGTCAGAACGTCAAAACAAGTTAAAAATCATTGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2R 15451645 5' + roo 15 2 64.36 CGAGTAATCCCAGGCCGATGAACCCGAGCCAAAGGCACAACAAAGAGAACAACAAAGCACTCCAGCAGACCAAAGTTCGCCTGAATGTAGTGACCCATGTA:1 + chrX 6849306 5' - mariner2 277 1 77.23 GACATATACACATCTCTGCGAAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chrX 19819975 5' + hobo 31 1 59.41 TGTAACTTAATAAATACAAGAGACAACATTTACTTTCATAATATTCAGACTTATCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACA:1 + chr2R 16321042 5' + Idefix 64 2 58.42 GGTCTGTATTAAAACCAAAGATAGTCATAGCGATACTATTAAGATTACCCTTAAAAATTCATCCATCGCGACACACACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTC:1 - chr2L 9724206 5' + I-element 281 1 74.26 AGTCGGTATTGACCATTCCCTCACAAACACTCGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTA:1 - chrX 14300765 5' + accord 226 2 68.32 TTTAGATCAAACTACCTGGATTTTCTGTATGCATAAGTTTGTTCTAAAATTATCTTTAATACTTAATAAAAATTCTCACCTTTTTTTACTTTTTCCTTTTT:1 + chr2L 19648355 5' - Doc2-element 238 1 88.12 CCTAGAAATTCCATACCACCCCTTCGTTTTTTTTGTTTTTTCTGTTGTTTATCTAGCGTCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 8869157 5' + roo 8681 2 56.00 GAACAAAAAAAGTGCCCAAGAACAAGAGGAATTGCGGAACTTTCTTTTTTCCTCATTTACTTTTTGCAATTCGTTGTTGTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 21039433 5' - gypsy9 452 1 72.83 AAAGCATTTGCATAGCGTCTGCACGCCCTGTTTACTCATTAAAGTTAAAAAGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAA:1 + chrX 847588 5' + HeT-A 6061 2 47.52 TATTATATTTTTTAAGTCATTTGACTTAAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACCTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCAAAGACA:8 - chr2L 11362282 5' + 1360 493 1 73.27 GAGGGATGTCGCCGAGCAGGAAGCAGGCACAATCAAAAATCCTGCGAACAATAACTGGTGCTTTAGGTATTTATCCTTCTGCTGAACAATTTCAGTTTTTA:1 - chr3R 6364239 5' - Doc4-element 2750 1 44.55 GTCTAGCGACGTCATCAGTAACATTCCTCAGCTCACCGACACCTTTCCTCCCCCGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAA:1 + chr3L 13365460 5' - hopper 78 1 65.35 GACTCCCGATAACCCCTAAATAGGGGCGATAAAAGTGGGAGTATTGTTATCTCAAAACTATACTCGTAGTAGGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chrX 1252754 5' - hobo 2935 1 76.24 GTAGCCTTATAAGTGCCCAAGTGCCTCGCCACCTCCTACCATCTTTCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGC:1 - chr2R 22793700 5' - hobo 466 1 54.46 GGTGTGTATGGTGTATGGTGTGAGTGAATGGTGGGCTGTGCACATGCGTGTTTGTGAGGAGCGTGGCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAG:1 - chr3L 16115958 5' - F-element 272 1 68.32 TTTTCAGTATTGAAATATTTCCATTAAATCAGTTTCTCACTCCTCAAACCTTGTCATATTTCCACTCAACTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTAC:1 + chr3L 3635390 5' - roo 9065 1 72.28 AAAATTTTAATGCCTTCTATGCGCTTCTCAAACTTTTAAGTCCCATTCAATTTTTATAGTATCCCAAAGTTGACTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGT:1 + chr3L 6524816 5' - hobo 2685 1 71.00 GAAGTGCCTTCGGCGTTACGGACCAGCAGCCGGTCAACGGACAAGGGATTAACAATGCCCACTACGCTTAAAGAGGTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTT:1 - chr2L 14464546 5' - accord2 7358 1 75.25 TAACATGGGTGCCATGTGTTTTTGTGAAAACTTGATGTATGTGTGTGGCTATGTGTGGGTGTGTGCGTGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chrX 6147581 5' + hobo 6 1 55.45 ATTGCGGTGTAGTTGAAGCTGTGGGTTGCAGTGGTTGTTGTTGTCACAGTACTAGTCACCGTAGGGAAGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTG:1 + chrX 4244991 5' - Doc2-element 492 1 74.26 GAAACCCACAAGAAAAGGCGAGCGAAAAGGGCAACTAGGAAAAACCAACAAAGTCGAGGGAAACGTGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTATAAAAAAGAA:1 - chr2R 23146255 5' - rover 151 2 67.33 CGCAAACTTCTGCGTCTCGAGTCGAGTGTCCCTCGATGTCCTCCGTGATCCTTCGTCTCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 10978682 5' - roo 392 2 65.35 GTGCGGCAGCCAAAGATTAATTTACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 + chrX 18155857 5' - hobo 2885 1 77.23 TGTGTAATTCATAATTACCGTGTGAAGAGTAAATACTAGATAATAGCATGCGTTTACATAGGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAG:1 - chrX 19787481 5' - 1360 3208 1 60.40 GGAATGGAGACACTCAACGCACCTAAATAAAATAAATTAAAAAAAAA:1 + chrX 8515897 5' + Doc 4691 2 51.06 GCCTGCCAGCTGTTTATATTGCAAAATGTCAAGGACTCGCCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 - chr3L 9174771 5' - 412 7534 2 64.36 TTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCTTAATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCG:1 - chr3L 24731967 5' + INE-1 550 1 81.19 AGAAGCAGTAAGTGGACGCCTGGCCATTCAATTCCTGGAGGCAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAAG:1 - chr3R 15827175 5' - roo 126 2 62.38 GGTATATTTATCTTTTAATTGCGTTTTCTAATTGTTGTTCTTTTAAATTTGCTGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 + chr3R 31188728 5' + I-element 23 1 56.44 TCGGTCGTTGAATTCAAACTTCTGGGCGCCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCACAATAAACACACCCTCAACTCTCTCGCTCACAGCAG:1 + chr3L 10817836 5' + Porto1 475 1 75.25 TATTCCAACTTCTGCTGACCTGCACTTTGGACTATATCTGCGCTGCGAAACGGAATTGGTGTATCCAAGGGATGGGTTTAAACTAACAAAAATGTATTTTG:1 + chr3R 18381061 5' + Dm88 4279 1 64.36 CTGGGCCACACCCAATTTTCTGGTACTTCTACAACTTCTGATTCATCGATTGAGTTGCGGGGTTAAAGGGGTGGAGCCCGAATGGATTTCACGGGTAGGG:1 - chr2R 13726561 5' + Circe 7184 1 70.00 AATCCTCAGCCACAACATGGAGGTGCCACCTGCGAGGGCATCAGGTGTGTACAATTCTCTTATATAATGATATTTTATATCTATATGCTTACTA:1 - chr3L 12069940 5' - Dm88 4120 1 59.57 GTTTGTGAGTGTGTGTGTATGTGTCGTTGTATTGGTGGGTGCTTTGATATTATTTATGTTTATTATAATTTATGTGACAAAGTGTCACAATGTATATACTT:1 + chr3R 29287502 5' - Stalker2 50 2 63.37 AGTATCTGAAAAACAAAAAATTAACGCAATCAGTGAATTATTTGTGCAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGACGAAGAGGAGAAAG:1 + chrX 6548876 5' + TAHRE 297 1 52.00 AAGGTATTACAATTAGCATGTTGATAATGGTGGAGATTTAAGTGGATTAAAATATATATTATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 - chr3R 8080218 5' + flea 4771 2 55.45 ACAGCACTACGATCTGGTGAGCCAAGGATCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGAACGTTGAGATATCAGGAACTATAA:1 - chr2R 3384081 5' + INE-1 145 1 65.35 CGTAAATAATACGCATCCGCCCTGTTGACGACAACCAGAACAATTCGTTTGTGTCACAATCAGATTCGGCACAGGCACAAAAATGTTCGCTTTTCGCGTTT:1 + chr3R 7870417 5' - HeT-A 191 1 79.21 GCAATCGAAATTTAAGTAAAAAAGGCATTATAATTAATTAAAAAATAACCTACAATCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGA:1 - chr2L 12802266 5' + invader3 5209 2 54.46 AGGAAGTTCGTTCTGCTCCTGATTCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3R 29661720 5' + 412 49 2 78.57 TCGAAAAGAAATCAATGGCAATTAGTGCGGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCACAACTGCTACCACTGACTACTTCGG:1 - chr2R 1737836 5' - diver2 65 2 69.31 AATGTACAAAGCACACACAGTCGAGGTCAACAAAATAGTGGTATGTACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:2 - chrX 20982298 5' + 297 6601 2 60.40 ATGCTAATGTCGCGTAAGTAAATGTTACGTCAATTAATTGTGTTTAAAATAAATCTTAAGTGCAAAGGTAATAATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGC:1 + chrX 9388249 5' + gypsy4 407 1 56.44 TTCCCTGGGCAGTTTTCTCTTGAATGAGGGGAGGATGCTTTTCCTGGCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTT:1 - chr3R 25070465 5' - Stalker 313 4 55.45 AACAAACCGCCCAAAACTGCCAAGCTCAAACTTTTGAAAATTTATTTGATGGTTTATCTTATTTTTATTAGTCCTAATTAAAACAATTCCTTGCTTAAGCC:1 - chr2L 22017971 5' + Idefix 210 2 76.24 TGAGAGAATATTTTTTTATAAAAAAGGTTGAACCATAAAGCTCATAAGCGTCTATATATTATTTGTGATCTGTGTGGTGTGTGTTGTTGTGTGTTTCTTTC:1 - chr3L 3829041 5' - gypsy3 409 1 34.65 GTCGCTGGTTATATCGAAAAGTTTCGTTTTATTTCGGCTGCGTCTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCA:1 - chr2R 15163345 5' + P-element 223 1 46.53 ATATGTATATTATTTCTGCTTTTTATTAATCAAAAGTGTGTAACAAGCAGAAGAGAGCGTTTCCGACCATATAAAGTTGATATATTCTTGATCAGGATCAA:1 + chrX 686221 5' + INE-1 82 1 69.31 CGAAAGAGACGGGCAGTTGGATATGGGTGGAGATCGGGCGGAAAAGTGATATGTTAGTTGACGCGAAGGCTCTAACTGTTTAGGGGGGCAGAAAGAGAGA:1 + chr3R 22223655 5' + Gypsy12A_LTR 498 1 70.00 CAGTCCGTGTCGTGCGCAGGCCTTCAGTTGCAGGAAAGGCCGTTTCAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGAC:1 + chr2R 9515599 5' + G6 1852 1 54.46 AACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr2R 19209457 5' + Doc 55 1 59.41 AACGCATTTTTCTTTCATATTTATATTTTCTTTTTGAGGTGCGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr3L 10565278 5' + pogo 33 1 61.39 ATTGACGATTACAAAAGAATACACCTGGAAAAAATCGCATCCTGCGCCGAATCAAGTGTCCTTATACGAGTCTATATACAAAAAAAAAGAAAAAAAAGATC:1 + chrX 6144936 5' + gypsy7 5007 4 59.41 TGAGCGTGGGACAGATCGCCAACCGAAAGGATCGTCCTGTTCAGCAACTCTTTAAGATTCGAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTT:1 + chr3L 20534361 5' + P-element 2879 2 66.34 CGACACGAAGCAATCAATAGCTGATCAAATAAATGATTTATAATAATTGAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAAC:1 - chrX 3125885 5' + I-element 4959 1 60.00 CCAGCAATTTTCCTAATATTTCACCCGCTTTTGGCCAGACTTTGAGCCGCTGTAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGAC:1 - chr3R 8971075 5' - hobo 306 1 56.44 ATGACCGTAACAATAACCAACTTGTTAATAACGCTAGTTTCCGACAGCTTTGTATGTTTTATATACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTC:1 + chr2L 5974446 5' + invader4 13 2 67.33 TGTAGCAGTATTCGTTTTTGATATTTATGAGAATGCTGGGGTGCGATTGTTTCATAACTTATTCACTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGT:1 - chr3L 18047566 5' + Cr1a 211 1 74.26 CATGTCCTGGCAACGGTGATAAATGGCGCCAATGTGCCGCCTGGAGTCGCGACGCGTCGCAATCGCTTTTACTAATCAGGTGTCAGGCGGAGCCGTGACAA:1 + chr3R 14078333 5' - gypsy2 6768 2 69.31 GTGAAAATTGCTGGCCATGTCCGAGGACCTTATATGGCTGGCCGGCATAACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3L 14284990 5' - roo 9046 1 50.50 TAAACTATTTCCCATAAACAGTCGACCTTAACAGCACAAATTCTGTATGAATGCCAGCATCAACCAGCAGCCGAGCCATGAGAATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 15976351 5' - accord 187 4 50.50 AATCGAGAGACCACCCTCAAGGTTTTCCATCATTGGAGGACACATACATAAGTTCAGTTAATAATAGCAACATAGTATATAAACATGAAGTACTTGTTCGC:1 + chr2R 23662092 5' + invader2 58 2 64.36 CTCCGGATGTTCTAGGCGAAACAGCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGA:1 + chr3L 10042776 5' + 412 311 2 76.24 GGTGCGATGCGAGTTTTCTTGCCTACTTTTCGGGGCAAGCTCTTTGCGGCTGCTCAAATGTAGTCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAA:1 + chr2L 10898447 5' + jockey 4682 1 64.36 AATGTGAGCCTTGGCCGAAGCATAAAAAATATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCA:1 - chr3L 13264526 5' + Burdock 37 2 69.31 TTGGGAATAAATCCAAATCATGCGATCCAATGATCACATTGTGCCGCAACTTGAGTTAGAGTGTGGGGAAATTGAGCGTGCTTACAACAACAACAAAATGA:1 - chr3R 7021356 5' - gypsy12 10052 2 57.43 CCCCTTGACCAATGTCAATTGAGTGAAATTTACATACACAAACATGTCCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGA:1 + chr2L 19248842 5' - opus 47 4 67.33 AAATTTTCTGTCACCTTTTTTCCAGTAATCTGCAGTCCACCGGTATGGTGTATGCAACTCAGCGGCCAAGTGGAAAAGAAAAATAGGAAAAAAACACTTCC:1 - chr2L 11559216 5' + transib2 2443 1 75.25 TGCCAATCAATTTCTTGATGCCCCGAAAGTTTTGATACCACCTCAACGCCCTGATTTCTGGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCA:1 - chr3R 13994014 5' + 3S18 18 2 39.60 TCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 - chr3R 14049417 5' - transib2 2793 1 56.44 AGTATACGAATCAATTCTTGGCCAAATTAAGATGCGGGCGAAAAATACTATCTCAGCGTTCCCGGCTTGACGTAAAAGTCGACTAAAGGGTGGATGGA:1 + chr3R 4494717 5' + Rt1b 4895 1 67.35 ACTGATTTATCAAGAATTTTGGCATGTGCCTCCGTGTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTTAATCTTCTTCTCGAACTTGTCCGATGACTTTGGGC:1 + chr3R 6412956 5' - jockey2 3141 1 78.22 GGCCGAGACACTGAACTTTGTTTTGTCACCAGGGTTTTTTGTGGGTTCTGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCCCTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr2R 22404255 5' - hobo 2923 1 57.30 CACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTG:1 + chr2R 5582158 5' + Cr1a 432 1 76.24 ACAAAGTCATTAAAATTATGGCAGCTCACGATTGTTTAGGTATTTTGGATTGTGAGGGCGTGAAATTTTCGGTGGCTGGGCGCATGTACTTATATATTTTC:1 - chr2R 19296131 5' - Max-element 477 1 74.26 TAAAGTTAAACAAGGAGGGTCTTCCTTACATCCTAATAGGATTCATATACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chrX 3195619 5' - mdg1 394 2 52.48 AAATTGGCCCAATTGCCTAATTTCAAAAATATAGGATTGGGAGTGCAGTTTTATGGATGGAAATAACATCACTAAATTAAATTTTAATTCAATAAATTAAA:1 - chr2R 11480959 5' - Bari1 320 1 78.22 GTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAAAAATTTTGTGTGCAGGTGCTAC:1 - chrX 22386798 5' + hobo 49 1 67.33 AACTTGCGGGCACCATTGTACGTGACTAAACGTCAATTTCCAGTTCTTGCCGCTTCGGGCCACTATGCAAAATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCT:1 + chr2L 19899834 5' + 1360 206 1 77.23 CTGCCGATACTGTGTATTCACAACACAGGGTTTGGCTTGTACCCAAACGATTGTAAGAAAGCTTCACTAAATCGTTTTATGAGCTCTTAAAGGTGAAGTGT:1 + chr2L 20175428 5' + transib2 151 1 55.45 AAGTGCATAATAAACATTTGCAGGACACTCTAGGAAGTCGACAAAAACAATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAG:1 + chr2R 6041551 5' + opus 12 2 63.74 GTATGGACGTGTTAATTAGGTCCACTCGTGCCGCATTTACACTCCACTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr2L 17283531 5' - hobo 2908 1 52.48 GCCTTCCCTCCTGGTTTTTGGCTTCCACCTTGACTTGGATCTTGGATCTCGTTTATGCGTTTGTTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chrX 18991508 5' + pogo 11 1 66.34 TACTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 - chrX 21945940 5' + F-element 31 1 56.44 CTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGATGTTACAATTTACCTTACAAGTAAAC:1 + chr2L 14074965 5' + jockey 253 1 63.22 GCATAGACGATGTACAGGAAGCCGCTGATGTTGTTGTTGCTCCCGTTATTTCCCTTTTTGCGCACGTCCCGCCCGGGTACAAGGTCCACATATTGTGCC:1 - chrX 6154956 5' - gypsy8 4925 2 59.60 CATTTTAATTGAGTAACAAAATGCAGAACAAGCTCAAGGAAATAATTTCCCAAGGCGAGATGTGAGTTTATTTGTTTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTTAAAT:1 + chr3L 10543661 5' - Porto1 4430 1 72.28 AGGCACCATAAAGCAAATGTGAGCCTTGGCCGAAGCATAAAAAATATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCT:1 - chr3L 13264541 5' + Burdock 6158 2 54.46 GGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGCACCAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCAACACATTGTTGCGATCTCATATTCGTAGCGG:1 + chrX 21667947 5' - gypsy2 122 2 50.50 TTGCATCCTCACAAACATGGCTGAAACACAAAACATGCAATCTTTGAGTTATCCTACCGACTGCGCCAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGA:1 + chr3L 8577840 5' - McClintock 466 2 64.36 TCTCATCGCTCTCGCGTCGCGATTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGGTACCATGGTG:1 + chr2L 12587770 5' - Doc2-element 4460 1 78.22 ATCCTTCAGCCCTTCAATCCACCTTCGTTCAATGATGAGTTGATTCCTACGATTCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chrX 1252859 5' + hobo 21 1 56.44 AACGCTTATGATCCTTCAGCCCTTCAATCCACCTTCGTTCAATGATGAGTTGATTCCTACGATTCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chrX 1252869 5' + hobo 11 1 66.34 CAGGGATGGGGTGCTTTTTTCCTTAATCCTCTCAGCGTGCTCGAGGGGTTCCTCCAGGAGTATAAATGACTGCATCAGCAGGAGAGCAGCGGCAATAAGGG:1 - chr2R 4929826 5' - G7 70 1 68.32 GAGACTCCCCCAAAACTCTCTAAATAAATATGGGTTTGACATCCATCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGT:1 - chr2R 11478824 5' - invader2 125 2 55.45 GTTTAATTTTTGGCTGCTGGCCGTGCACTCGCACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGA:1 + chr2L 22208717 5' + gypsy 7028 2 68.32 GCTTCTCCTCCTCTTTCTTGGCCTCTGTGGTTTATCGGGGTAAAGGTGTTAGTTTTGAACTAGCTTGAACGCAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr2R 22856497 5' - 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Quasimodo 7353 2 64.36 TAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 - chr2L 7971031 5' + blood 7059 2 70.30 ATATATTGACCAAGCACTCAGATGTCGTCACTTGAAGGACCCTTCTCGTCCAGCCCCCGAGTGCACCAACCCCACTAACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTC:1 + chr3R 28740393 5' + Q-element 246 2 77.00 CGAAAGCATGCAGTAAATATGCGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGAATATAAACACATACTGAACAAATTTGA:1 - chr2L 17644898 5' + hopper 988 2 77.23 ACAAGAAAGGTTACACTACATTATTAACCCATTCGAGGGAGATTTGTAGGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATT:1 - chr2R 16902934 5' - flea 232 2 50.50 GTCTGCTCTCCCATTTTTTTTGTATTGTCTAACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr2L 10820647 5' - roo 9027 1 72.28 TCCGAATGCAAATGACTACCCGAAAAGTATAATTTGATATACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr3R 20369740 5' + pogo 35 1 64.36 GACGGGGGCAAGAGAATAGCACCAAGTTACGGAACATTTGGTAAAAATAATTTTTTTTTTCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 + chr3L 17215682 5' + Ivk 18 1 46.53 TCCCCGTCTTAACCACATAAGTCTTCCGCAAAACATTAGATGCGCTTATTAAAAGAGAACGTGATGGGGTAAAGGTATTGAAGAATTCAGAAAATTAATCA:1 + chr3L 13077176 5' + G4 299 1 53.47 CCGAAGTCGTACAATACATATGTACATTCAGCAGTAATTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAA:1 + chr2R 13805688 5' - Ivk 5341 1 66.34 TGCTTAATGCGTAATCGGAGCGCGGGGAACTTGAATTTCAGCAACTCAACAGCCAACTGGTATCGCTACTATCATATTGTAACTGGCGCAGTCGGAAACTG:1 + chr2L 14515939 5' + gypsy5 426 1 55.45 CATGATTGATAAGTATTTATTTACCGGTCGATTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 3776525 5' - roo 9027 1 70.30 TGAGGCGAAAAAGAGCAAAAATTATGTGTGTCAGCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAA:1 + chr3R 9940128 5' + I-element 5059 1 66.34 TGCGAATGGAAAAAATGAAAATGATGGCTTTCGTTTTGGTGTCGAAGTGAAAGGGTGGAGCAGTTTTGTTCTCAAATCAAAACTAAGCGCGCAAATTTATT:1 - chr3L 3233960 5' + Fw2 47 1 78.22 TTTCTGCTCGACGAACTGTTTAGTTGTCGATGCTCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3R 19734577 5' + hobo 14 1 46.53 TTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTG:3 + chr3L 17215718 5' + Ivk 30 1 52.48 CATCATTATTATAGGTAAAATCTTTACCATTTCTAAACCTACAATCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAG:1 + chr3R 24049377 5' + invader3 5220 2 57.43 TATGTGTGCGGTATACATGTACATATGTATGCATATGCTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGT:1 + chr3L 21346521 5' - 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F-element 458 1 58.42 CCCCCCGTGTATATCTTATTCAAGGGCTAAAACTGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAA:1 + chr3R 17247019 5' - 1360 3289 1 66.34 TATTATTAATAAGTCAAAAATTATATTTTCTTTAGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 - chr3L 14886258 5' - 412 7504 2 69.31 AAGGACACAATCCATCATTACCATTTCATTGTTCGGGCTTACACAAAAGGCAAGAGAAGGGCGATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:2 + chr2R 14744205 5' + roo 14 2 66.34 AACATGCCAAGTCACAGCGCTGGAAATCTTAACGTGATTTAAGCCACGAAACGGGTGAAGAGGAAGAAGAGTGTCCTAATGACTCTTCGACATCAGAAGTG:1 + chr2L 17609739 5' + invader1 411 1 60.40 CACTCATAGAAGGTCAATCAGGCGACCTGGAGAGGGCGAACGCAGGAGGAGATGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTT:1 - chr2R 23351399 5' - I-element 5052 1 55.45 ATAAATCAGTTTCCGGAAAGTATGCTACTAAATTTGTTGATATTAAGTTTAGTCTCTAGCATACATTTAAACACTTTGTTAAAATCGCTGCTCGAATTAGC:1 - chrX 20502996 5' - 1360 2987 1 75.25 CTGAAGGCAGGCAAGAGGGCACACGAAAGCACTCAACAATAATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAGTGCTCTAATGACAAATATTCTAAT:1 + chrX 10696452 5' - 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McClintock 5999 2 60.40 AGATGGTCTTGAGTTAAGTTATTATTATTAAGTTATTTCAGGAAATTTTTATTTTTTAGGTTAGAGTTGATTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGAT:1 + chr3L 15152244 5' - Burdock 340 1 63.37 AGGGGGCCACGTGATTAAAAACGTATTCCATGATGAAACATATGCATAAAGATTTCATATTTAAGCCCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr2L 14886464 5' + jockey 17 1 68.32 GATTGATGGGCGCCGCAAAAAACCAAAAAGAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr3L 10565341 5' - pogo 2061 1 69.31 ACGGCAGCAGCGAAAAAGGAAATCGGGAAGAGGAGGATAAGAACCAGCAGCGGCAGGAAAAAAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAACGTCTATTATG:1 - chrX 1607861 5' - Cr1a 4208 1 68.32 GCATGGCAAATGAGTTGCAACTGAAATTCAATTAGCTAACAAAATTCCATTTCGGACCAAAGCCACACACACACACACAAATAAAAAAATAGAAAAAAAAA:1 - chr3L 10384082 5' + gypsy7 5004 8 72.28 AATTTTTGAAATCTAGAAAACTACAAAACAATCTCCTAAATCTGGATCACGTTTTGCACGCTTATCTTAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chrX 14521619 5' - roo 406 1 70.30 CTATCCCCCTCTCGCTCGCTAACTCTAGCCATCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGCGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCCAGT:1 - chr3R 9184779 5' + 1360 3381 2 77.23 ACCTTTTAACCCCAAGCGACTTAACGCATTCGTGTCATGTGGCGGCATTTAAGACTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - 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accord 498 2 66.34 ATTTTAAACCCGAATTCAATGCAAAACAAGCCAAGCGATAAAGAAGGCATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATT:1 - chr3R 21937407 5' + P-element 449 1 51.49 TCCGAAGATATCCCACAAGTTGACAATGGATTCCTCATCGATATTGAACAGGATTCGTTGGGAAGGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 + chrX 7768891 5' + hobo 7 1 73.27 TGGAAAGGGAGATAAAATGGCAACGAGGGTTTAAGGAACAATATTTATTGTTTGGGTGACCTTTTTGCCACTTTTTCTTCAAATGAACCCACAAATTTTCT:1 + chr3L 27974174 5' - S2 1248 1 60.40 CAGCCAGTGTTGCAAGCCTCTGCACAGCTGCCCACGACTTACGAGCACTGCAGATATAGCCCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chr3L 22741409 5' - P-element 2873 1 65.35 CGATTTCAGACAATATTTCTTGCTATTTTTTGTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTA:1 - chr2R 16987651 5' - X-element 4669 1 76.24 GATTCCTTGATGACGCACTCCAAGTGGATCAGTTCGTTAAACTGGAACATACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:2 - chr2L 5269874 5' + hobo 24 1 55.45 TCCGCCAAGTACTAAAGCTGCTCCGCCTGCAACCACCATACCCTTTGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chr2R 5603932 5' + 297 61 2 57.43 GTTGACGAAGGTGCCGGTTGATCCCACTTGGATTTGCTGCAGGACGAAGTCGAATTAACAAATGAATTCAATAAATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGC:1 + chr2R 9285503 5' + gypsy 6990 2 76.24 AACGACATCAGCAGCAACACCATGCTATACCATGCCATACCATACCATACCACACTCGGGTGTGCGTGTTACCAGCGCAAAAAACCCAGTGCTCGAAGCAG:1 + chr3R 14463719 5' + G6 202 1 49.50 TTAGGTAAATGCATTGAAGGAATTCAATTTTAAACAAAATGCTGCTAGCGTCACACAATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1 - 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hobo 2917 1 55.45 TTTAAAAGATAATTTAAACATTAATATGAGTTTCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 + chr2L 17887155 5' - hobo 2896 1 67.33 TGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCAGTTAAG:1 - chr3R 19449981 5' - Porto1 4188 1 60.40 ATATTTGTGCCACACTTATTTCGACATTTAACAAACATTTAACAAACGTTGTAAATTATAGATTTAAATGTAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 + chrX 12401778 5' + I-element 6 1 62.38 ATCGCTGGAAGCAAAACGAACTGCATCGAACGCGTTCTGCTGCATTATAAATACCGCAATTGCATTGAGTGCTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACT:1 + chr2R 15451535 5' - roo 9064 1 71.29 CTTTAATTTCTGGCTTCTTCTCCCATTTTGCGTAGAGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr2L 17283470 5' + hobo 35 1 59.18 CAGTCTCGAATTTACTTCTTGATCACCACTTCCATTCTCCACGCGACTCCTATGATTACGCGACCCCTACCACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTC:1 - chr2L 18727680 5' + 297 234 2 76.24 AGCTAGTTAAGAAAATTGTTCCTGCTTCTGGACCAAGTGTTAGGATCGATCCTACTACCTTTCGCCTGACATCTTCTTCAGGTGACAGATCGGAAGAGCGT:1 + chrX 18844297 5' - mariner2 568 1 64.36 TTGCCAACCTCATCGATGAGCTGATAAGTGGCAATTGAGACTATACGCGTACGTGTGCGGGTGTATATCTTTATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 + chr3R 18887001 5' + 297 6580 1 79.00 AGGGTAGGGGATTCGAATTCTGTCAGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGAC:1 + chr3L 5090961 5' - opus 7096 2 75.25 AAAATTATTAAAAAATTTTACTTAATTATTATTTCATTTTGTATAAATTCGCTCAAATCCTTTTTCCCCATGTTTACAACAGATCCATGCGAACTAATTAA:1 + chr2L 4076886 5' - Tc1-2 230 1 69.31 GTCGGGCAGTGAGAAACGCGCAGGATACAGAAGAAAGGACGAGCAATACAAGTGGAGATCGACTCGTAGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTT:1 + chr2L 23299809 5' + micropia 4975 2 71.29 ATACTTGTTCTGGCATTGATCTGAAATTGTATTGCCTACTTTTTGGGGCCGGTCAAGATAAAACCCGGGCTGTCAGCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:2 - chr2R 21415228 5' + jockey 8 1 76.24 TAACGAGGAAGAATCCCCAAAGGGAAATTTAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr2L 1842957 5' + TART-C 11096 2 55.56 GGAGTTGCGGGTTTTCTAGCTTATGAAACTGAAAGCACTTTCCATCTTTGAAGAAATTGAGTGCTGGCAATCAACTAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chr2L 5653502 5' + hobo 1 1 69.31 ATATATCGTATAAAATCATATTTCACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATA:1 - 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chr3L 8712624 5' + diver 13 2 39.60 TTATGTGCATAATGTTCTTCTGAATATGCTTTTTACACCATGATGTGGGTCAGCTTTACCATTCGACTGACTCCCTCTCAGTTTGCGATCTGCCTCTATGC:1 - chr3L 18976533 5' - invader2 4987 2 55.45 TCCAACCCTTTCAATTATCCATGGAGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr2R 4344554 5' - pogo 2053 1 73.27 CAAATGGGGCAGCGTCATCGAGTTTTATGAGCAATTACAACATCTGTTGAATATCGCGAGTCTCGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr2R 13338184 5' + 1360 52 1 73.63 GAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCT:1 + chr2L 14074961 5' + jockey 263 1 66.34 TTGTAAGGCCTAACAAATGGCACACAAAAACAAATAAATAGGCGAATAAAACGAAAAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAA:1 - chr3R 26249585 5' - Cr1a 470 1 69.07 TTGGGATTATGCCCATTCGCTTATACCCCGGATTCAGCTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCT:1 + chrX 8776662 5' - I-element 49 1 62.38 AGAATTCCCTGAGGGTGGCTTAAGATTTGACCACGATTTTTGATCGATTGACACCATGAAAAAAATTCTTGATTTGCATTGCCTTAAGGTTTTTATTATTT:1 - chr2L 23033515 5' + 1360 306 1 69.31 CAGCTTGAAATATGAAACCCAGACGTAGCTCGATCTATAAATAGGAAACACACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGTCTGTTTGGTGATTGTGTTAACTCC:1 + chr3L 9305716 5' - Burdock 6135 1 75.25 GTAGTTATATATCCATTTCATAAAAGATTGGTTTTGAAGATTGGATTGCAGGACCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCAGAGCATTTTT:1 + chr3R 28923425 5' - Porto1 4340 1 59.41 CCAAAGAAACAAAGACGAACACACCGACAAAGTCATTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACC:1 - chr3R 4945300 5' + 412 7435 2 64.36 AAGAATCCTATACTAGCAACATGGTGTCGGTGAGTATTCTGCACTTTGGATATAACGTCAAATTAGTGAAAGATTGCATAAGAGGTTTGGTTTTATCTTTT:1 + chr3L 7130982 5' + BS 5015 1 80.20 GAAGTGGAGATGGGTATGCGCTTAAATATGCAACAATTTGTAGCAGACAAAGATGTTTGCCAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTAGGCTCCCAAC:1 + chr2L 4112750 5' + jockey 426 1 65.35 GACAAGGGTATAAGGAAAGCTTTGTAATAAAAATATATGGATCTGACTTGGACAACGGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGAT:1 + chr3R 9858116 5' + Doc 302 1 62.38 CTATTTATTTAAACAAGAGTTTCGAACCAACGACTACGCTTACACAATGGTATATAGTCCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chrX 22690729 5' - roo 392 2 60.40 AGTAACTAACGGTTTCTTTCCATCTTTGGCTTTGGTCAACTACGTTTCGTCCATTCCTTCGTTATGGCCGTCACTTCATTCTAGGG:1 + chrX 759267 5' + gypsy5 6911 1 61.63 AGTTAAAACTAAAGTGCCAGGGAAACTTACGCAGAGTTAGAGGGCTGATGAAGGCTCCTTGTGATTCTTGATCCGTGTGTTGATCATAATTATGTTGAAAT:1 + chr3R 11290244 5' - diver 5809 1 53.47 GTATAGATAGTAATCTTAATTGAGATCCTGGTGACGGGCAAAATTACCCTTTTTCCGCTCGCTTACGACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAAC:2 + chr4 718871 5' - jockey 4983 1 42.57 TTTCCCTACCCTTGAAGGGTATTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3R 7883177 5' + roo 52 2 79.21 CTGTGATCAATTTTGTTATTTTTGTATTTCGGTACGTAGGTGGTTAACACACACACACACACACAGTCGTTTCGTTACGGAAACAGAAGAAGACTCTTGTA:1 + chrX 9715173 5' + invader5 3988 2 76.24 CCCTTTGTTTGGCCGTGTTTTTGTTATGCCACAATAAGAAGAAAGTAGAAACAACAAACCCTCGCAGACACACTAGCGGAGTAACGGGTATCTGATAGTCG:1 - chr3L 1982108 5' + INE-1 550 1 72.28 TATTTCTCACTAGTTACCAATTGTATACGCAGCAAAAATATTTCAGGTTTACTTTAGCTGTCCTACTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTA:1 - chr2R 25166896 5' + roo 188 2 74.26 TGTGGAAAGACAATTTTGACCGTTCAAAAATCAATTAAATATAAACATACATTTCTTTCGGACATATGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTA:1 - chr2L 22208800 5' - gypsy 452 2 68.32 CTGGAGTTAATTTGGCGATCAACAGGAACGAAACGTTTTCCGATCTGTCCTAGTCATGAGTTGGTCAGTCGGAACTATAGATAATGAGTACTCCCGTATGT:1 - chr3R 3389555 5' + Rt1a 4779 1 58.42 CCGCACGCTGAAGCTTAAACTCGACTTGAAATTTATTCTCCCGATTATTACCGGTAGAACTGGTCTCGCGGTTAAAAACCCCATCGTCATGTTCCCACGTT:1 + chr3L 9134620 5' + Idefix 7053 2 76.24 AAGGAAATAGGAGCTGTGACATTACCCTACTGGGAAACCATAACAAACTGCAGTCAATCCAAAAAAAAGCTCCAGGACATGATACTATCTGCAACTCCATC:1 - chr2R 5787555 5' + BS3 265 1 64.36 CGACCGCACAATTTACAGCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGA:1 - chrX 3302594 5' + hobo 2696 1 78.05 GCGGGAGATTCAAAAAATTCGGGTACAATTCCGTTTGCAGCCTGTTGGTCGGCTCATCTCATCGACCTAGCACGCATATCAAGGATCGGCCAACTACTCTT:1 + chr2R 13848302 5' + Chouto 6060 1 77.23 TCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATT:1 + chr2R 5284550 5' - Doc4-element 2626 1 54.46 TCTCCAGCTGCTCCAGACTGCAGTTCGTGTGGCAAGTGTCTCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAG:1 - chrX 8669758 5' - F-element 4220 1 61.39 CCCCAAAATGAATGCTACGCTTTCTTCACGCGACCAATTCGTGCGAAAGTGTTTATTATCATTATGATACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCG:1 - chrX 12135732 5' + jockey 10 1 69.15 GGTGGTTGTACTTGTACCATTATTTGTGTGTCACGTCGTTGGGTCAAACAAAATAAATAATCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGA:1 - chr3L 11826691 5' - INE-1 134 1 59.41 TCTATCTATCTCCCCAGCTCGCTCGCGCCTTTGAGGAGCTTGTGCTCCAAGCCGTTGGCGTTTCGGTTTGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr2L 9437404 5' - P-element 2880 2 73.27 AATTGCCAATTCATTTGCATAAGTTACGGACTGACATTACATTTCAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3R 14906895 5' - hobo 2909 1 54.46 ACTTTGAGGGCGTGTCTAGTGTTCTGGTTCAAAAGGCTATGTTGTGTTAAGGTAAAGAAACTAGGAAACTATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCT:1 + chr2L 18506717 5' + flea 4761 1 75.25 CGACAAACTTAACAATCTCCACAAAAAACTGTATTTGCGATTTCGTTTCAAAGAGCTCAAAAAAAAAGTTAAAATTGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGT:1 + chr3L 12937231 5' - Cr1a 4242 1 61.39 GCTGCAAAACGATAAGGGCGACATTCAAAGCACAGGGGATGAAACGGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACG:1 - chr3L 23773549 5' + pogo 74 1 54.46 CCGGGAGAAAATGTTGTTCAATAATTTCGGTTCTGGCCACTTTTTCCCTTATGTTTATTGGCAACTGAGTAATTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAA:1 - chr2R 20939659 5' - hobo 481 1 63.37 ATCCCGATCCAATCTCCCTCGGTCAGAATCTTTTGATTTGAACTTTCAGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATT:1 - chr3R 4064024 5' - G4 57 1 52.48 GTTAAATTGAATAAAAGCCGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAA:1 - chr3R 8618368 5' + copia 225 1 81.19 CGGGAGACGGAAATGCAATCCCGAAAAAAGGACAACCTGACCAGGACGCATACACTGAGAATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 + chr2L 17168418 5' - flea 5002 2 66.00 ATTTTTGGGTTCACGGTATTTGTTCTTTTTACATGTATTATACACAACTCGACATTCGCACCAAACAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGT:1 + chr3L 3183841 5' - Quasimodo 7301 2 74.26 TAGTACATCCATTCGAAATTCGAAACGCCACCGTTTCAGAAACGCGGCACAAACCCCAGTGTGGATTTGCGGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCAG:1 - chr2R 24099534 5' - Rt1a 13 1 78.22 AATAGATTAGAAGTTGAATCAACCACAGATGTTTGTTTTTGAATTAGTTTATCAAGGTTGTTCTGGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAAC:1 - chr3R 19448690 5' + roo 117 2 73.27 TCAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 11367512 5' - roo 9024 2 71.29 GCAAAAAGCTCGTCACTAGATAATAGAAACATAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGTTTTCGGGTGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTA:1 - chr2R 16179859 5' + invader2 4958 2 79.21 GGAACGTTACGCTCCGATAACCAATTATCGCGGTCAGGTGAGTGCTGCCCCCACTGCCATGATTGCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAG:1 + chr3R 15999737 5' - Doc 399 1 68.32 GTGTGTGTATGTGTGTGTAAGTTAACACCATTTAACGCTAATGTAATGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chrX 12276835 5' - hobo 2912 1 53.47 AATGAAATTGGACACCAACATCGCCAGATACAGATACGACCCACAGATNCAGATAACAGGATAANGTCTATTATAGTCANAACATAAAACTCTG:1 + chr3R 12306569 5' - Cr1a 4189 1 57.45 CATTTAATTAGGAAAAACACATATACACAATTCGAATTTCAATTTTATAACCAAGCTGAGTAAGGGTATTTGATAGACTGGTAACTCGACTATGGCATTCT:1 - chr2L 9404312 5' + INE-1 572 1 58.42 GTCAGGTTTTATCCATTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chr2L 13598167 5' + pogo 11 1 68.32 AACATCAAATGATTCAAATTGATTAAATCGGGTTCACTAGTAAAACTGGTAATATAGTTTAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr3L 21715074 5' - 1360 3372 1 61.39 CCCCGATGCATCCCTGGCCTGTTGCCAAGCCACGTTGCGCTGACTGAGCCGAAAAATGCAAAAATTTCCTGCTGCTTGCAAAAAAGTAAAAACAAAAAAAA:1 - chr3R 10974577 5' + Doc2-element 237 1 70.30 GGAGTCCCGAGTCCGTGGAAGTCGGTCGTGGCTCATGACCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr3L 19414909 5' - 412 456 2 63.37 CTCTGCACAGCTGCCCACGACTTACGAGCACTGCAGATATAGCCCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr3L 22741392 5' - P-element 2856 1 48.51 CGCCTCAGGCCAATCTCATTTCTCGCCTTTATTTGTGACTCTTTTTGTACGATTTTGTCAGTGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATT:1 + chrX 17309345 5' - mdg1 7156 2 65.35 TTAGAGTTTAATACACTGTTTAATCGTGACTAGGAATTTTTAACAGTGGTGGGGGACAGCTACGCCTATTAAATGTGACTGTTTGCATTTCTGCTCGTTGA:1 + chr2R 16291306 5' - Doc4-element 2327 1 53.47 ATCCCAGCATCTCCATCTCAATGCTCCACACGCCCCCTTTCGCTCCGCATCTCTCTCTTTCTCTTTCGCGCGACTGTGTTTTTCCCGCGTGTCATTAAGGT:1 + chr2L 700767 5' - baggins 5092 1 78.22 TGCGCTGAAGATGGAATGTATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGG:1 - chr2L 3545855 5' - blood 7145 2 79.57 CGGGCAAGGAGGATTGCATTTTAGGTAAACATAGAGCCCGGCAAAGGAGCTGCTCTGGGAATTGGGAAACTGTTTGGTGGGTGTCATGATTGTTGGTTAAG:1 - chrX 20883280 5' - I-element 173 1 76.24 CATTCAAGTAGAGCGGGGACAAGATGATATTAATTAAGGAAAAAAAGGATTAACTTAACTTCTGTAAGTACAACGCATATTGGTTACCTAATAAAATCTCT:1 + chr3R 11531550 5' + gypsy7 411 1 74.26 GACGCTTTTGCATAATGCCAATGTTGAATTATAATGTCGGCATCTTTAACCCTTCACTGGCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAA:1 + chr2R 17269698 5' - transib2 2810 1 63.37 TAAAACATCGTTCCTGTTCTAAATTCTTTTCTAAGAAGGAATTGAACCATCCAATGCACGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 + chr3L 17898651 5' - 1360 3376 1 66.34 CATCCCGAGATCCGGAGTAAGTGGGTTTCGGCTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATAGCCTTGCTTTTCTGCAGGC:1 + chr2R 17657662 5' - G6 1645 1 81.00 AATGACAGTTTCTTCGGCTGCCCTGAGACTTTTGTCTTTGGGCATTTCCCTCAAATAACCATTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTC:1 + chr2R 18663657 5' - 1360 401 1 67.33 TAGAATGGTTGTTTACACGCAAACCAAGTAAAAAGATGAAAAAGTGTCAGAAAATACAGAAACGGTGGGACAAACACGAAATATGCTTATGGTGCTTTTAT:1 + chr2L 15024443 5' + Tc1 1629 1 74.26 ACTGGTTGGGGAATAGGCAAATATTAAATTATTCATAAAGCCAAGTACCAGATAAATGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 - chr2L 5741391 5' + 412 5 2 65.12 TGGTGATAGATGGGTTTGATGTTTTCACTCCGATCGTACCAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATTTCAATATT:1 - chrX 5381831 5' - Doc2-element 4405 1 74.26 TTTCCCGTTCAAACCTCTCCCCCACATCCCTCGCCGCCAACCCATATCCTATATTCTCGATTTTCCCTTTAAGGTTGTGATTTTATTTAGATCTCACTCTC:1 - chrX 4073382 5' - gypsy5 7237 2 64.36 AGATAAATTAGTGCTTAGCATTATAAATAAGCACAAGGTCCCCGGTTCGAACCCGGGCGGGAACAAGTCGAATTACTTTTTATTGTTTTCCTTTTTTTTTT:1 - chr3R 19787212 5' - Doc2-element 252 1 66.34 CTGTCCCTGTTCGGGCGCCATCTGTGTCAGCGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 - chr3L 4051106 5' + pogo 45 1 69.31 CGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGC:1 + chr3R 14049324 5' + transib2 9 1 70.30 CATGTTTCCTGAACATCAGGAAATGGTCTTCAATGAGATTAAGGAGCTAGTATACAAAATTGGAGGAAGCAAATTAATACCTTCGGAAGAGGACAGTTCTA:1 - chr3R 12235662 5' - gypsy12 9991 2 63.37 CTAAAATTCTCAGAAATCAATTAAATTCTCAACTGAAGAAACCATTTCAATATATTACGATTGCATCAAACTTGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGA:1 + chr3R 27071850 5' + jockey 4673 1 69.31 CATAAGGGCAAACTACAAACAAGCTATAACAAGGCAAATACATCAAGGTGTTTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chrX 12276755 5' + hobo 8 1 63.95 ATGGTTAAAAAGCATACAAATACAAACAACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGAT:1 + chr3L 26344902 5' + Quasimodo 84 2 67.06 ATAGTCGAGGTTCTTAAAAATAGAGTTTCCCCTATGCTCCAGTTAATATCGAAGTTTAAAAGCAAAATTCAAGCCCAAGTGCAACCATCATATAAAAGCGA:1 + chrX 304603 5' + Porto1 84 1 65.35 GTTATTCAAGAGCCGTCAGTGATCCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTG:1 + chr2R 2645481 5' + HMS-Beagle2 6930 2 77.23 TTAGGAACTAAATCATTTCCATGATACTTTAATTGTGATTGCATTTTGAAAAAAAAAACCATTCAGTTATTTGATGTCATAGCGGAGCGCTAGTGGTGCCG:1 + chrX 22820138 5' + mariner2 61 1 52.48 TTAAATGACCGCTTATTGCGTAATAGCATAACTATAAAGTTGCGATTTTCTGCACGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAATGCAC:1 - 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Stalker4 7325 2 65.35 CTTATAGATGTGTCGTGTTGTGATATTTATTATTTAAATTTAATTGTGCAAATTCGCTTACCGTTTTTATCAGAGCTCCAGTTAATATCGAAGTTTAAAAG:1 + chr3L 6472915 5' + Porto1 45 1 65.35 AAAAGGGTATACTTGATTCGCTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAAGCGCTTCCGAGTATATAAAGTATATATATTCATGATCAGGATCAATAGTCGAG:1 + chr2R 4618506 5' + INE-1 90 1 87.13 TTAGGTGTTTGTTTCACTTTATGTTAGAATATCTTAGTTTACTACTCACTTAACAACTATTTTCCATGTTAGATGTTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTG:1 - chr2L 3430827 5' - accord 7345 2 75.25 GCGGAGAAGAAAGCGGAGCAAAAGCAAAACAAAGACACGGAATGACATTGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAATCGGAACTATAGATAAGGA:1 + chrX 5114657 5' + Rt1a 4765 1 54.46 ACCATCGGCGGTAGAGCTCGTCGGCAGTGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTCGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAG:1 + chr2L 21673068 5' - F-element 272 1 72.73 AGTCCGGGTCACTCGTTTCTCGGAATCTCGCCTTTCTGTGGGAGGTCTCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr2L 7767193 5' - hobo 2912 1 52.48 CTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGCTGTTGGTATTGAAACTTGGCATGTGCAATGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:2 - chrX 19820051 5' - 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transib2 2813 1 66.34 TGTTCTCTAGAGAGTGCTTGGCCTTTTTCATTTTTTTTTACTTTCTTCTCTGCCATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTCTCTGTGTATATTCTC:1 - chr3R 31797063 5' - Doc3-element 4438 1 77.23 GGCGTAAATCAGCGCGCAGATAGCTGAACTTGAGTTAACTCAACGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chrX 13587989 5' - hobo 2905 1 55.45 AGCAATGACGAAGAATTGCTCGATTGATAAGGTAAAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGA:1 + chr2R 3293729 5' - 1731 297 1 60.40 TCTAATGCTAAATTCAAATTGAAGATTATATTGACTCTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGA:1 + chr2L 18773313 5' + Max-element 8277 2 66.34 ATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:3 + chr2L 23372624 5' - 1360 3354 1 65.35 TCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTAATATATATATTAGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTCAT:1 + chrX 22651470 5' + INE-1 103 1 65.35 CACTCGAAACACACGTTTAATCGATTCATAGATGCGATTCACGATGCTTCCCGATGCCGATGCACTGCTGCCGTTTATCGTTTATGCACGCAGTTAGGCCA:1 + chrX 11691788 5' + 412 90 2 80.20 CATGTTTGACCGTGGTGTATTCTTTTGATGCAGTGGATGTCGATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTTTAAGTTATTGTCCCACATCTTATATTTCAACA:1 + chr3L 23437524 5' + HMS-Beagle2 24 2 62.38 ACCTGACATGTAATTACTAAGCTTACCAGCCGCCCGGAGCGTATGGCATCCGATTTCATCATCGACTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 - chr2R 18036707 5' - blood 7379 2 67.33 CAGTTCAAGTGCAATAATAACACGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGG:1 - chrX 11981158 5' + P-element 74 1 29.00 TGGGGGACTGGCTTTGACTCTTGATTACGCCCTGTCGTCGCATATCAGTGTGCTACGTAATGCAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chrX 12890996 5' - pogo 2093 1 71.29 CTGCGTAGGTTTTAAGCTATTTTGTATATTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr2L 10073631 5' + pogo 44 1 77.23 AAGTCTACTTACAACCAAAAATCATGCTTCCATTTTCAATTAAAATCAAATGTAAATTGGATTAAAGAGAAGCCTGAGTATTTTAACAATACTTGTATTT:1 + chrX 2973109 5' - 297 222 2 59.00 ATATGTGTAAATATATGAAAATTGAAAATCTTACATCCACTGCATATCACCACCAGACAAGTGGTCAATGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAA:1 + chr2L 13051744 5' + Stalker4 252 4 57.43 TGGCTATAACCGTGGCGACTCGATAAGAGTCCGCCCTCCCATGCTACGCACATGAAGGTTTGGCTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTT:1 - chr3R 20962236 5' - I-element 5039 1 62.38 TTCAAATTGAAGATTATATTGACTCTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACG:1 + chr2L 18773325 5' + Max-element 8289 2 80.20 CATTTTGGCACGTGGCTTGCTCTTTGTCTCAACTTTTTCGAGAGTCGAGCGAGTCCGTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr2L 4057119 5' - hobo 2924 1 62.50 GAGAGCAAGGGGCAGGAGGTTGCGATTAGCATGGCTTTCGCCTTGAGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTTCTTCTCTGCTGTTGTCTCAATGACA:1 + chr2L 23298936 5' - Doc3-element 4470 1 50.50 GCTTGGTTGTTTCACTCAAAGAGCAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGC:1 + chr3R 13073274 5' - Max-element 8278 2 76.24 ATTCGCCTCGCCCGATTCTCGAACATTTTTCCGCTGTCTCTGTTTGAATCGGTTTATTCGAATGAATTCATATTGCTGTTCTTGGGTACAGCCACCCGCAC:1 + chr3L 10841976 5' - Stalker3T 251 1 61.39 CTAACGACCCATTACCTTTTTTAGATGATTTGGTAAAAATAATTTTTTTTTTCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCA:1 + chrX 6897352 5' + Ivk 26 1 49.50 CAAAACTCTAAACTGAACGGCGAAAAACTTCAAGCACAGGTACCAGATTATTAACCAAAATTGCATCATGTTCAAGCCACCTACATAAACGGGAATGCGCG:1 - chrX 4477992 5' + Ivk 5014 1 71.29 TTCCCATGCGTTTATATATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAGCTACTCAGTCGTTTTTTTGTAAGCTTTCCTCCC:1 + chr3L 17065282 5' - accord2 7457 2 80.20 CGACAGAGAATACCTACAATCGTGTTGTTACTTGACATTGTAAAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCAGTGGCTCTAGA:1 + chr3L 23093346 5' + 1360 54 1 57.43 CGTCTTTCAAATCAATGGGATAAACATTTGTCGCCCATATATATATGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 + chrX 10736175 5' + FB 32 1 62.38 GTTGGGTGGTTGAGTGGGGCGTAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGTGCGCGAGTATCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAG:1 - chr3L 6017265 5' - F-element 176 1 74.26 AGGACATAACATGCCCGCCATTCATCCTCATTCTTGGCTATGCAGGCGAGGAAGTCGAGGGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGT:1 - chr3L 9427650 5' - mdg1 7344 2 59.41 GCATTGCAGTCGAATCAAAGGGCCAAGGCCACCCAATTTAAAGCCCCGCTTTGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAGATCTTGATAAACAAATATCAC:1 + chrX 8524724 5' + I-element 87 1 72.28 ATATTCAAAGGTGAATTGCTTTCTCATTAAATTGCACATGAAACATGAGACATACATTTTAAACAAAGCAACTAACATGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr3R 12729323 5' + roo 8667 2 76.24 CTTCATACTTCTTATTAGCAATATTATTTTTTTTAACAGATGTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 - chr3R 7869750 5' - jockey 4951 1 69.31 CTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGC:1 + chr2L 15488476 5' - Doc 280 1 56.44 CACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr3R 15054309 5' + hobo 41 1 64.36 CACTAAAGCACCTGCCAAGACTCCAAATTATAAACACATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chrX 6739662 5' - roo 9032 1 64.36 GGACTGTCGCAGCATCCAAAGCGGCAAAGGAACACAAAAAAAAACAAACGATGCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCG:2 - chr3L 11559842 5' + F-element 43 1 55.45 TGTTGCTTGATCCTCTCTTGATTACAATTAGTCTCTTCACTTTTATTTCTAGTGAAAATCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCG:1 - chrX 11218401 5' + 1360 3216 1 63.37 AAAATTCTGATGGCGAAAGTGTTTTTTTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATT:1 + chr3R 22878485 5' - X-element 4663 1 78.22 GTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 - chr2R 5651889 5' + Tirant 8142 2 64.13 TTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr2L 15833074 5' + hobo 32 1 57.43 ACGTTTTGCTTGGTATGTAAACGTTTTTTTTTTAGTTTTACTTTATTATTTCACACACCAAAAATTTTATAGTATAGCAATTTAACATTACCAATAGCGCC:1 - chrX 17233306 5' - Doc3-element 114 1 77.23 TGATTGGATCTATAATGTTAATTTCGTCAAAAATATCAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr2R 12437188 5' + pogo 37 1 65.35 ACATGGAAATATGTATTTTTACTTTATCATCTTTTTGCACTCGTAGTTCTATTTTCTTTTTTTTTCAACTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGT:2 + chr2L 6596719 5' - Tabor 482 2 64.36 TACCGCTTTTTATGGGCCTTCGTCGTCGCGCCTATTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTC:1 + chr3L 5609077 5' - I-element 403 1 65.35 ACAGCGACTTCTCTGGGGCTTTTATTACACCTCCCGCTGCAGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACA:1 - chrX 7111715 5' + opus 7198 2 57.29 ATCTAACGTCAACATCACTGTTATGGATAAGATCAAATAAATATAATCAAACTTATAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATAGAG:1 + chr3L 21275744 5' + Quasimodo 15 2 64.36 AGTTTCCCACTACCCCGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAACTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATTTTT:1 - chr3R 25514156 5' + hopper 57 1 78.22 ACAAAATTTGCAACCAGCTTCGGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGACAGGAGTTGGACTCTTTG:1 - chr2L 11637964 5' - invader2 203 2 81.19 TGGTTATTCTCGGATCAACTGGTTAAGTCACTGATGGTTGTCAGAATCTGTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCGTTGCCCCA:1 - chr2R 5374624 5' - F-element 4286 1 69.31 GTGGGCGTGTGGGCGTGGCGAAAGGTTAGGCCAAGTGACCAGAAGATGGCGCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCGAGAGCGAGAGAGCGGAGATCGCTA:1 - chr3R 30294810 5' + 1360 110 1 53.00 CACCTGATAATGGTTATATATTGTACGCACTCCATTTCCCCAACCAAAATATGTCGAAGAAGTCCCCGACGTCTAAGGCTCAGATTTGGCAAGTTGTGCAG:1 + chrX 12429675 5' + HB 1221 1 57.43 TGTGGAAGCAATATAAATCTGAATTAAATGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGAT:1 + chr3R 14943467 5' - Quasimodo 313 2 71.29 GTTGTTTGGTTTCTTTGGCGTTCTGCTGTTTGGCAACGCGGGTAGAATTAAATTAGGCTGACTTTTGTTGCAAATTATTATTTTTATTTTTATTGTTATTA:1 + chr3L 3558147 5' - mdg1 30 4 43.56 AATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAG:2 - chr3R 2689430 5' - diver2 4475 1 65.35 GCCTTTTGGCTCCACGTCCTTTTTTGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGATGCAG:1 - chr3L 15166456 5' - jockey 4704 1 73.27 TTTCCAATTTGTTTTTTGATAGCTTCTATCCCAGCTATATTCGGTTACATTCAAATAATACGTTATAGATCTACTCAATCTCCGACACGGCCTTCCTGACA:1 - chr2R 1368511 5' - invader4 2746 1 65.35 GCCGTCGACAGCGGAATTGAGTCATGGACTCCGTCACTTTCTGTCTCTGATTCTCTCCCAATTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAG:1 - chrX 12844897 5' + jockey 465 1 61.39 AAATCATATTTGACATGATAAATAAGCACTGGCACCGAGGAAAAGCAACCGACAACCGACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTTTTATCGTT:1 + chr3R 4553581 5' + FB 366 1 69.31 GTTTGCTTTGTTGTTGTCATTCTTGGTTGAAATACGCATTAATGGCCGTAATTATAATTTGCCACAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 + chrX 10210928 5' + I-element 15 1 66.34 GGGTGGGTGGTTATATTCATCAACATTGCGACATGATATTATACTGTTATTCCTGTGTCTAGTGTTTCCATAGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAT:1 + chrX 690898 5' + F-element 289 1 70.30 ATAAATATACTAATTAATTAAAGGAAGTACAATAGAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATACATTTTCCAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:6 + chr2L 17599966 5' - 1360 3363 1 71.29 AGACGCGCCGAAGTTACACCCGGACTTTCGGCAAATCGGGTAAGCTTAGGTTGCCTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTA:1 + chr2L 5211023 5' - gypsy12 10173 2 54.46 ACTTGTTACATTTGTCATGCGATAATGTCAATTTTGACAGCTGCACAAAAGGGAGGGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATT:1 - chr3L 18361821 5' - Cr1a 176 1 56.44 CACCACACATTTTGGTGTCGCCTGTGAGCGGGAAGATAGCACCACCCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATAGCGTTACG:1 + chr2R 11564581 5' - 1360 25 1 55.45 TGGTGACATAGACATATACACATCTCTGCGAAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chrX 19819965 5' + hobo 21 1 58.42 ATGTATAAAAGCATAAATATTTAGGCGAATTGATGGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr3L 4637348 5' + hobo 41 1 62.38 TGGACGAAAAGTATGCTATACAAATCTCAGCATGGTGAATTCTTAGCGTTTACCATGAACATACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chr2L 11475205 5' + jockey 4689 1 59.41 GCAAAAGAGAGCGCGTTCTGTGTGTGTGCGTGCGTACCTGAAAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:1 - chr3L 20197856 5' - 297 6948 2 57.43 AAAAGCGATATATGTGTCTCTGTATATAAAGCTGACACGAGAGCGAAACAAAAGTACAATGCAAACAAATAGCGAAACAATACGACTTCGACTAGGACACA:1 + chrX 20494815 5' + I-element 4941 1 72.28 TTAGCAAAAAAAAACTCAAAAAGGAAAATCAGCAGAGAAACTTCAGTCTGAGATCGAAAACTGACTGACTGATCGCTTCTTCACAAAATCAGAATTATGCG:1 - chr3L 23547492 5' - invader1 271 2 59.41 CCTACAAAACATGCGAAGAGGAAAAAAAATGTACAAATCGCCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr2R 14744283 5' - roo 9038 1 65.35 ATCCGCTGCGATACCGCCGTATCAGATATGAATAGTAATCGAGTGACCTTGTCTGTGTGCGCAGTCCTGTCCGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTT:1 + chr2R 7026147 5' - opus 7116 2 74.26 TGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr3R 15054305 5' + hobo 37 1 60.40 CACAATCAGCAGTGGTAAGAGCCAGTGAGGGTGAAAAACAGCTGTGAGAGAAACACATGTCGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGC:1 + chr3L 17999911 5' - Stalker2 7619 2 69.15 TAGCATGCCTTTGATCCTATGGCTACTGTCTAGCCGCAAAAGATTTGCTAACTTTCTCATATTGCAATTGAAAACACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAC:1 - chr3R 6434648 5' - copia 142 2 76.24 TTCTACCTAGAAGTACAACTGTAACTCAAGCTCTTTGTTTGTGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTAAAAACG:1 + chr2R 23297122 5' - Max-element 243 2 58.42 AAAGCTGCAATTGAAATTATTCAACGAATCATGACAATATCATTGGCTGTTTGCATTATGCAAGCATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCA:1 - chr2L 5659514 5' - jockey 4980 1 63.37 GGAATCACAATCTATGCGCATCCGAATTTAATTTAAAAATAAAAAAAA:1 + chr3L 16289149 5' + transib2 2633 1 72.92 AAAATCAGTCAACTGTTTTTGATATGTTTGTGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2L 10687740 5' - hobo 2893 1 71.29 AACTTTGCCAACGTTTCGATTTTCAGTTCTTGAAGGAAGAACTACTTACTAGTTGTTAAAATTGCTTTTCGGATTAGGGATTACAACCACGGCACCCTATA:1 - chrX 6129560 5' - R1A1-element 5276 1 70.30 CCAAAAACGAAATGTTGACAAAATTCAATGGCACAACTATGAAAAGCCCAAAGCGCAAATTAACCCAAACACCCACTCGCACACACACACACACATATACA:1 - chr2L 17832740 5' + accord 7032 2 74.26 GTATGTCTGTCAAATGTATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATT:1 + chr3L 21912244 5' + Bari1 15 1 65.35 GTATGACAAAAGTGATCCGGGCTGTTCGGTACATCTATAAGGCTAATGTTAACCTAACCTTGGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGG:1 + chr3R 9769752 5' - Max-element 8366 1 56.44 TTTTTATGAGCCAGTCAACGACATTCAGGTGTGGCAATATGGCTTCTTGAAGTCAGACGAGTCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTA:1 + chr3R 5347544 5' - mdg1 158 2 68.32 CAGTTGTAGTGTTTATCTAGCCCACATACTTATAGTTTTGCTATTCCGTGGATTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTTTAATTC:1 - chr3L 17075087 5' - Bica 207 1 66.34 GGGCAAGGAGCTATTTGATCATCATGATAATTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTCGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chrX 3358714 5' + roo 46 2 73.27 AACTTATGAAGCAGTCAACAAAGTGAAAGTGAAATATATATGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAA:1 - chrX 11463692 5' - flea 225 2 63.37 TAGACACACAGGGGAAACAACAAATCAATTATTTGGGAATCTTTCACCCAAAACGGCGCACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACG:1 + chrX 9885132 5' + accord 217 2 54.46 ACGTCCTCGTCAACCGAAACTCTGTTCTACCTCAACGCACTCCTCACGAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAG:1 + chr3L 23455427 5' + Doc 4512 1 52.48 GCCGCATTGTTGTCCTTGCCGTATTGACACTGCCGAACACACACCCTTTCGGATAATATTTTTATCTTAATTCCAAAATCAAAATACATTTTTGTTAGTTT:1 - chr3L 12676971 5' - Dm88 4279 1 58.42 TGTGCAAATCGTGTGCCATAAATTTGCAGTTTAAATGCGAATTCGATTGACAAGCCAGCCAAGTGCACAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr3R 21969035 5' - hobo 2930 1 70.30 AATGACTACCCGAAAAGTATAATTTGATATACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr3R 20369730 5' + pogo 44 1 74.00 TTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - 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chr3L 153632 5' - 1360 3340 1 74.26 TGATCATCTCGGCGTCGTTGTTCTCCGGAAAGTCGGTCACCAGCTCCACGCGGTTCTTCTTTTGACGCTGATGGTTCACTATGGCATAAAAGGTATGGCCA:1 + chr3R 28818530 5' - copia 4936 3 66.34 CGAGCAGCTCATCTCATCTGGCATTATCAATTGCTCTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAG:1 - chrX 19018988 5' + F-element 316 1 65.35 AAGATTTTATGTAGTATTTTAGCAATCAATACATAATACATAAAACTGGACTTACACCGAATTAGAATCCTTCATTCGACTCTGCTATTGATCCTGATCAA:1 - chr2L 12286071 5' - INE-1 90 1 70.30 GTCAGAAATTTGCGATAAATTTGCGCCTCCTCGATCCTTTCCTCGATGGTACGCGGAGGCTTCTCCTCGGCGCTCTGGAAAGTGTTCCCTCAAAACAGCCA:1 - chr3L 205208 5' - mariner2 501 1 72.28 ATTTCATGTTTGGCTTGATGCGTGGCTGTTAATTAACACTAGACAGCACTTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGCTCAA:1 - chrX 13641424 5' - jockey 4984 1 52.69 CTTAATTGAAGTGTTAAAGCTTTAAACAGCTTTGCGAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTA:1 - chr2R 5129372 5' + G2 276 1 64.36 TGTAGCTTTTGTATCATCAACATTTAAATTGTGTTTAATGGAAAGGGTCTTCAATTCGTTCTTTATGTTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACATCACAG:1 - chr2L 1495926 5' + McClintock 102 2 74.26 CGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chr2R 19209459 5' + Doc 57 1 57.43 CAAAACAGCTACCAATACTTCAATTGATAGGCTAGATATAGATAGATAGATAGATAGATTAATAGATTAATACTTGTAAGTATGGCGCACATATCTGCGGC:1 - chr3L 24191760 5' + TART-A 13287 1 65.35 CTCCAATTGCTGACTCTTGTAGGTCTCGATGCTGTCCAATATATTAGGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTACCAGCCTTGTGGTCTGGTAGAGTAAT:1 + chr2L 13186721 5' - Gypsy6A_LTR 245 1 74.26 TGTTGGGGGATAAGTTGAGAAATGCAGCAATACGCCCTTCCCCGCTGGCCATGGTAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGAC:1 + chr2L 3214664 5' + TAHRE 284 2 75.61 CCTAACGATTATGGCTGGTGAAATTTGCCGATCCTTAATGGGTTGGGCCGCCCACTCGAACCCCCACAGTTTTGAAAAATGTTT:1 - chr3R 21252245 5' + INE-1 257 1 54.76 ATGCGATGGCAAAAACAATTGCAAAAAAAAAATGTTGCTTACGCAATGGCACATCCCTCGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAG:1 + chr2L 4749293 5' + Quasimodo 6995 2 63.37 TAAATATTTTCTTCGTGTAAAAGTAATGCACTTTACAAAATATCCTTACAGATGAATTACATATTTCTTCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTT:1 + chr3L 8012011 5' + transib2 5 1 72.28 AGAGAAGAGAATTAAATTAAATTACAGCCCATCTGATTTCATTCAATGCATTTCAAAGTAATGAATTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 - chrX 12954272 5' - pogo 2094 1 68.32 GTACAGTAGCAGCTTTGGCTCCCACACACATGCACACTCCGCCGACGCGTAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr2L 6324470 5' - hobo 2915 1 56.44 TGCTGTTCATGCAAGTGTCTGGCCATAATAGAGGGTTTCCTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGATCAGATCATTGT:1 - chrX 18121795 5' - copia 4712 1 61.39 TATCCTTTGTTTTGGATATTAAAAGTGGTATTTAAATGATGAACAGTTGAATATTGCCAACTTTTTTCAATAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr2R 22521908 5' + roo 8669 2 72.28 GTATGCTACGTTTCTTGTCTATACGCACAAAATGTGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chrX 6146741 5' - hobo 2923 1 63.37 AAACGCGGCCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAA:1 - chrX 11025560 5' - hopper 1371 1 70.30 CTCCCCCAAAAAAGTATGCTACGTTTCTTGTCTATACGCACAAAATGAGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chrX 6146754 5' - hobo 2936 1 74.26 ATTTAAACAAGAGTTTCGAACCAACGACTACGCTTACACAATGGTATATAGTCCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 22690735 5' - roo 386 2 54.46 CTTTCACCACCAAATGGTCTTAGATAAGAATATAACCCAATTTACTGTAAGTGGTCCAGATCATCACCACCAATGAGCTTACAAATAAAGACTAATCCAAG:1 + chrX 8066137 5' - Cr1a 4031 1 62.38 ACAATTGGCCAAAGTTCATCCCTCCGATGACGATAGAGACATCTGCCAGACGTCAAGACTAAAAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACAC:1 - chr3R 26244141 5' - 1360 434 1 70.30 CATCGCAAAGTGATGCAAAAGTTGCCAAAACCACATAATGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCAT:1 + chr2R 15492481 5' + 17.6 62 1 75.25 GATTCTGTTGAGGAAATTGCATATTATTAATCAGGCTTATTTGGGGACTTTACTGGACATCTAAGTAATTAACTTAGACGTGGGAGAGCGAAAGAGATAGA:1 + chrX 12481210 5' - Cr1a 301 1 73.27 GACGGATGTGGTCGAAATTCTTGATGTTCATCGCACACAGAGCGGAGGCGTCCAGGAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGA:1 - chr2L 4890507 5' - F-element 492 1 60.40 GGCGCAAACTGGGCCGCCACCTCGGCATCCTCGTCACTTTCCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCC:1 + chr2R 17475602 5' + Doc 435 1 59.41 AAATTCCTACATTGTTTATTTATTTTCTTCTGTATTGTTGCCAGCCATTTATAAACTACACAGTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 + chr3R 20396516 5' + I-element 15 1 64.36 CAATTCAACTCCATCTGAGAAATTCACCTTTTAATATCGTGTTTCCCGAGAGACCTGTTGTGAACATGAAATATATGTGTATTTTAACAGAAAATTTTAAC:1 - chr2L 23007904 5' + transib2 368 1 58.42 CATAATCTATTAAGAAGTTTAATTTTATTAGTTGTATCATTTTGATAATGTCTTTGAGCTGACAGTATATCCATTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chrX 20314614 5' - roo 407 1 73.27 GGTCCATTGATTACCGTTCGACCCTTGACTCTTCCTGCATCGGGGCCGTTTTCGCTGTTGCTAGACCACTCCTATGCATCCAGATTTGTGGGGAGTTTTAA:2 - chr2L 22524518 5' - gypsy8 10 2 74.26 ATACAAAAAGATCTTTTCGCAAATTTCAAAAAGTATAAAATGTTTTGTGCAGATAGCTGGATAAAAATACAAACGGGGCATATATATATATACATATGCAT:1 - chr2L 14868480 5' - Stalker 244 4 61.39 TCAATTTTCATTACAAACAAAAAGCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTGATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTT:1 + chr3L 18733778 5' - jockey 4814 1 74.00 ATGATAATGATAATGCACACGAAAAGGAGACGAGGGGCAAGGAGCTATTTGATCATCATGATAATTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chrX 3358680 5' + roo 8676 2 66.34 TCTCCATTTGGCCGCGGTTCATAAATTTAGCCGCTGCTCCGACTTTAACTCGTTCAACGCACCGCTGCCAGGGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAGA:1 + chr2R 18271021 5' + Gypsy6A_LTR 351 1 72.28 AACTTAAGATTTAATCCAGGAGATCCAAGCATTATAAAATTCTACAACACACAGGATGTTTGACCTGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATG:1 - chr3R 2651169 5' - F-element 308 1 56.44 AAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chr2R 5531191 5' + 1360 70 1 57.43 TAAAAGCAGCCCCTTGACACGACCTTTCCACTGCCCACCACCCACCCGCATCCGCACACAATTTCATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGCAAAAAAA:1 + chr4 401964 5' + INE-1 311 1 55.45 ATGGCGTATGCATATTGTGAGGTGAACAGAACAGGATGTGTTCGAGTGGATGACACTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:2 + chr3R 8914466 5' + roo 20 2 59.41 TATGTATTCATAATATACAAGAACAATGTAGCACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTCAAG:1 + chr3R 971880 5' + blood 7111 2 69.31 ATTCTTTAATAGATCCGTACAGAGATTATTTTATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTCGGGTTTTTTCCATTCTCGAG:1 + chr3L 27549340 5' - Idefix 6956 2 71.29 GGCAGAACGATGCTGTCTCTGCAAACTTGATATTATGGGGCTGCCATGTGTAAAATGCAGGCGAGCACGAAAATCCCAATCCCAATTAGGAGAACCTAAAT:1 + chr3L 9294654 5' + I-element 235 1 77.23 TTCAGTGTATACATAAGTGCAAACTACAAACAAGCTATAACAAGGCAAATACATCAAGGTGTTTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:2 + chrX 12276744 5' + hobo 12 1 67.33 TCAATCCGAAGACCTCTCGCTCGCACTCGTACTCCCCTTGGGCTCACTATTTGTCCTGCTTATTTGTCTGACTTGGCATGCGACAGCCAAATCAAAAGGAT:1 + chr3R 26291738 5' + X-element 4267 1 79.21 AGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTT:1 + chr2L 23295813 5' - micropia 404 2 73.27 CAGCTGCAGCGTCTTTACGCATCTTATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chrX 11475264 5' - 1360 3354 1 60.40 CGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGG:1 + chr2L 14074954 5' + jockey 256 1 59.41 TATGTTAAATAAATCCATACAAAGTCGTTGTTTCATTTTTAAAGCATTTCAAACCTTTGACTAAGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTA:1 + chr3L 18214496 5' - Doc 4495 1 68.32 TACGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGCGAGTATCTGTGTGAGGGTCGGTTGTGTGTTGCACCGTAGAAATTTTAATACCGTGATCTGAATCTTCATACA:1 - chr2L 5637768 5' + BS 4797 1 78.22 TTCTTTTATTTTTGCACATGCGCATGCGCGTCACACACTAAAATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACAC:1 + chrX 14602153 5' + accord 240 2 64.36 GGGCGAAGGAAGATGGCATCATGTTCGTCATGTGCGAGTGTAATAAATTTTATTAAAAACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chrX 18991618 5' - pogo 2086 1 66.34 CTTCAATTGAACTCAATTGTGCGTTGCCCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1 - chr2R 17269771 5' + transib2 46 1 70.30 CACTTCAGCTCTTTACTAAGCAAGCGAAAACTCTTATCCATTTCCATTTTGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 - chr2R 5154809 5' + F-element 38 1 57.43 TAACGACAGCCCACGCAAAAGAGCTCAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr2R 22404202 5' + hobo 49 1 73.27 AGGAGAAAAACCTTGGACACTGGGCTACAGAGAAATCATTACTAAATGAGCATGTTCAGAATGGAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGA:1 + chr3L 22354110 5' + Idefix 167 2 60.40 CGGCCAAATTGCAAATTACAAAGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGA:1 - chr2R 17637369 5' + G6 1894 1 78.22 GCTGTACTGATTGCTTTATTGTGGCTAAAATGGAACACTCTACATATTGCTTGAATTAAATTAATTTTCGTTTTACATCACATATATATAGCTTAAGAGGA:1 - chrX 12960707 5' + Copia1_DM 4304 1 52.48 CGTTTCTATATCTCTCGTTTTTTTTTTTCAGCCGGCGGATATGAGTGAAGCACGCTTTTGGGTTTTTGTTTCTTATGACACAAAGTTATTAAAATGGGTAA:1 - chr2L 8431022 5' + pogo 326 1 63.37 TCGATGCGTTTTAATTTTTGCTAAAGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACT:2 - chr4 184041 5' + 1360 154 1 46.53 GCGTTTATCGCCCCTGTGGAAGTTCCTGATTTGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACCAAACATCCGTCTCC:1 - chr3R 21860248 5' + Idefix 183 1 69.31 TTGTTTGTAGTATCCACAAAACCAAAAGTAGTGTATTCCAATGCCAAACTACGATTAGCCAGCACTCTTAGCAGAGACATGACCTAACTAAGAGCCTGTTT:1 + chr2R 8152110 5' - baggins 117 1 60.40 ATGTTTGAAAGTGCACTACAAAATTTTGGGTTTCGGAGTCTAGAAGTAGACAGATGTATATAGTTAAATAGTTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGT:1 + chrY 424980 5' - McClintock 461 2 59.41 GAAACTCAATTTGTAAAACGGAATTTTATTAGGTCGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGG:1 + chr2L 14074920 5' + jockey 222 1 74.26 AAGCGATGGAAAGGGGCGAGGAATGGAAAGCCAACACCTGCCAGCGGAGGGCGGAAGTGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGCAGTCGGATATGGTTTT:1 - chr3R 20105508 5' - Ivk 363 1 61.39 ACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGA:1 + chr2R 19209469 5' + Doc 67 1 51.49 TGTCTTGGTAAAGGAAATACATATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTT:1 + chr2R 6735284 5' + Burdock 53 2 81.19 AAGCCAAGCATCGATTACGTGAAAAGTGCCAGTGTTCGAGTCAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr3R 24172978 5' + pogo 30 1 56.00 CTTGGTCCCTGTTTCCTTTAGTGTCGTCTTTCGCTTTCAATGCATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATT:1 - chrX 10584451 5' + 17.6 157 2 60.40 AGAACAGGATGTGTTCGAGTGGATGACACTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3R 8914493 5' + roo 8711 2 75.25 GCGGTTTCTTTGTTGTTGTTGCTAACAAAACTGAAAATAATCAAGTTAAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3L 20197773 5' + 297 6605 2 55.45 AAGTTAATAAGTCAAGGCTGCCGTTTTTGATCGCCTGGCAGTTGAGCCTTTTAATTGCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3L 5492281 5' - pogo 2085 1 63.37 TCTTAAAAATATTGTTAGCTTGATTTTTTTAATAGTATAACACACCATGTAAAAATTTTAATTTAAATAAAGCAATTTTTTTTTAATTTTTATTAGTTTTT:1 + chr2L 16386311 5' - Doc 4687 1 86.14 GATGCGCTCACATTCGCATGGCTATTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 + chr2R 17345924 5' - hobo 2926 1 66.34 ACATCTAACCGAATCAAATGGCTGATAGAGCCATCAAATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3R 24023374 5' - roo 9033 1 64.36 TTTGTGTGGCATAAGGACAGGGTACTCGGCATTGTGCATATAATCAAAGAAAATTACTTTATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 - 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Stalker2 377 2 56.44 TTTTAGCGCTACACGTACACAGACACATCTACAGTTTACGTATGTGTAAATTATATAGATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGG:1 + chr2R 16160214 5' - gypsy 430 2 50.50 AGTTCTTCGGTTCTCCGGCCGGATTCCGGATCAGCCACCCAACCCTGTCCTCTTACGGTTGATTACTGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATC:1 - chr3R 26490658 5' - R1A1-element 384 1 69.31 CCCACCAGGACGCATTTGCGCCCATTTTCCCAAAACGCCGCTCAATTGACACGTTTTCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chrX 8919469 5' + hobo 21 1 64.36 CCCGATCTCATGACCAACTGGTTCGAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 + chr3L 14152114 5' - blood 7337 1 75.25 CTAATAGCTGAGACTGCAGTTCAAGAGTGAGTTCTATAAAAAGAAGCAGCACCTTTTATATTATTTATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 - chrX 20989483 5' - pogo 2095 1 73.27 CATGATTTAGATCAGCATATCGTAAAATTTTGTTTAAAAATCGTTCAGGGTCGTTCTGACCCTGTCCGTCCGTATAAACGTCGCGATCTCAGGAACTATAA:1 - chr2R 5211583 5' + INE-1 145 1 51.49 CACATCGTCTCAGAAAACCGAATAAGCGGACGGTGGACGGCGAGTGGCAGTGGCAGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 + chrX 9473974 5' - 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P-element 42 1 77.23 TGGCGTCGTCCTGCAGCCCCAAGTAGATCATATCCTTGACGCAATAATTACAGGACAATCAGGCTGGTTCTGGTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr2R 9311786 5' + hobo 4 1 75.25 TTACACTACTTATTAGGCCAATGGCTGAGTGGAGGCGTCAGCAGCGTCGCAGCGGAGAAGTGCTGATGTCGCACTTTAACCGTTCGTTGGCGTTAATGGCA:1 - chr3R 6231728 5' - HMS-Beagle 6852 2 72.28 CCCACACTGACGACCTTTTTCCGTCTTTAACTCGATTTCGAGGAGCGCAAACATAATTGGTTAACTTCTATTATATTGTTCTTATACAGTTCTCTTATATA:1 + chrX 22779920 5' - Dm88 4148 1 68.32 ATATTTGCACATAGTACACATTTCATGCGGAACTGACGCTTGTGTGACGCTTCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCA:1 + chr3R 27435029 5' + jockey 4669 1 50.50 ATCGAGTCGCCCGCCTCCTCCGTCACATCGTCGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr2L 6913143 5' + jockey 57 1 73.27 GTTCGAGATAAATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTTCAGAAGTTAATATTCTAA:1 + chr3R 11151801 5' - mdg3 5487 2 68.32 TTGGTATTTGTGGGTGGATTTTAATTACCGGCCAGAAGTTCATGAAAGTGCCAAGAAGTTTCCCACTACCCCGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 - chr3R 25514212 5' + hopper 1 2 78.22 CGAGAAATCTGCATGGGTCGAAGGAGCTGCCGGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGA:1 + chr3R 12820432 5' - 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gypsy2 6619 2 59.41 CCAGTTCCATGGGTATTTAGTGTGTTTGTCCTTTGTGCGGAACACGCAAGCCACCACATGCAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATC:1 - chr3L 20284827 5' + Doc 303 1 71.29 CATGCTTCTGCCCACCAATCTGTTTTCCAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTC:1 - chr2L 5321845 5' - 1360 3320 1 71.29 TGGTAATTGCGTGCAAGAGAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAAC:1 - chr2R 6482747 5' + gtwin 6939 2 56.44 TCACATTGGGCGGCATATCATATATCCGTATACAGACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:2 + chrX 5151931 5' + 297 31 2 73.27 CTCGCTGAGCACCTTCAGGACGTCCTTGGTTTCTCTCTTTGATCTTGTACAACTGTTTTGCTATTCCTTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGT:1 + chr3L 16405744 5' - Bica 371 2 78.22 ATCAAAATCATCGGCATAGAATGTAAACGAAGACACAATTAAACAATAATAATACTAATATAATAACAGATTAATATTGTATGTACATATGTATAAATAAG:1 + chr3L 4413242 5' + invader3 5089 1 77.23 AAAACATGTCCCCGGCCATGGGTTTTGTGGTATGTGGTTAGTTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 - chr3R 14832555 5' - 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diver 207 1 61.00 TGCCCATATCAATTATTTAAGGCAGTACAACTGACGTGTCTCAATGTAAATGAATGAGTTCTTTAAGATACTCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAG:1 - chr3R 23605157 5' + Tabor 5 2 60.40 ATCAATAAACATGACATAAAAACGCCAGGCGGAATAAAAATGAAATGGCCAAAAAGGATAAATAAGTCAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACG:1 - chr2L 10096609 5' + micropia 5323 2 73.27 CCAATTATGACCGTAACAATAACCAACTTGTTAATAACGCTAGTTTCCGACAGCTTTGTATGTTTTATATACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAG:1 + chr2L 5974440 5' + invader4 2766 2 73.27 GACCCAAGCCGTCAAAGCAATGACGAAGAATTGCTCGATTGATAAGGTAAAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCA:2 + chr2R 3293714 5' - 1731 312 1 75.25 CCAGGACGTATTCCCAAAAGTCGCCGCAAAGTATGCTGTGGAAAACATCGTTTACGCACCTATTAGTTGTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1 + chrX 5275490 5' + jockey 4684 1 68.32 TTGTGCCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGCTGTTGGTATTGAAACTTGGCATGTGCAATGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chrX 19820069 5' - hobo 2934 1 76.24 TAGATTAAAAATACCCGCATAGCCGCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr2L 9699221 5' + P-element 49 1 31.68 TAACCTTAAGAACGAAAACTAGTACGCATACTTGATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr2R 9559171 5' + opus 7041 4 64.36 GATAGAATTTTGGCAGTCGAGTACCCAGCGCAGCCAGTTCCGATCAACTCTACCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATTTCCCTTCTTCATC:1 - chr3L 23594009 5' - invader4 215 2 75.00 CGGAACCACTCACCACATCCCTCACCCACACAACCCTCCTCCAACCACTCTTATGGTAATTTAAGCGGTTGGAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGT:1 - chr3R 15817770 5' - Doc 373 1 70.00 AATAACAAGATGCGTAACGGCCATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGT:1 - chrX 20783463 5' - P-element 2834 1 35.00 CGATATTCGTTATTGCTCCGGTTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAAGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 + chr3R 2210587 5' + 1360 84 1 75.86 AGAAGTTAGAGTGGTGCTAACTGGGTTGACTGCATGTTCAAAGTCGGGCGTCTCGCGCGAAAGAAATCGCCTCACCGCTTGTAATTGTTTTAAAAATAAAT:1 + chr3R 25647091 5' - Stalker4 409 1 74.26 TACCGGCCTGCAGGGATTTCCGCAGCGTCATGCTTGGCAGGTCCTTTGAGGAACTTTGAGACAGAGAGCTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr2L 7767109 5' + hobo 19 1 61.39 TAACACGCTCGAATGTGCCGCTCATGTGTGGGTATTTGTATCTGTATCTGTGTCTGTTACGAACTAACTACAAATCGAATTTATTAAGGCCGCCAAGTCTT:1 - chr3L 17160859 5' - gypsy10 249 2 56.44 AAAGGAAGTAGACAGAAAGAGAGAATGAGAAGGCGGTAGAGAAACCAAAAAGCAATAACAAGACAAAACAGACGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAA:1 + chr2L 12521071 5' + I-element 454 1 72.28 AAAAGAGCAAAAATTATGTGTGTCAGCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGACA:1 + chr3R 9940136 5' + I-element 5067 1 72.28 CGAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTT:1 + chr3R 178120 5' + BS 40 1 67.33 ATACTAAAATTTTAAACTAAATAAACCTCGCTAAAAAATAAGTATAAGGTATAACATACCAATAATACTGTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:2 - chr3L 10792272 5' + pogo 2 1 77.23 TGTGCATGCACTTTTGCCAAGCGAAAAGCCTATTAAGACATACACCCACTCGCTCAAAAAAAAGGACAAAAAGGATGCCGAAAGGAAAACATAGACAATAA:1 - chr3R 19990790 5' + invader5 3600 1 79.21 GAGTGGGGGTGATAAAAAGTTTTTTGGCAGATCGATCGAAACACGAACAATTTCGGTGAACGTCTTTATTAAAGTAATGTCGGCTTAAGACTAAATGTACA:1 - chr2R 11528642 5' - rover 223 2 66.34 TAGCAATAGGATTAAGGTCAGCTTTAATCAGGTATATTCGCACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chr3R 26871091 5' - hobo 2901 1 62.38 AAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTA:1 + chr3R 19589925 5' + BS 5023 1 50.50 ATTAACGAGATTTATCCGAAATTTGCGAACCTAGACGATAGAGCAGATGTCGAACGTTGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr2R 18036602 5' + blood 7029 2 58.42 TCGGTGCGCTCCTTAATGTCAGCGGACATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 + chr2R 14204690 5' - opus 450 2 74.26 AAAAAGGCAATCAGGTGGCGCAGAGCGGAGGCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCT:1 + chr2L 1276873 5' - Stalker4 273 4 69.31 TTTTGTATTTTGTTGTTGTTTTTGTGTTTGATATTGTGGGCATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTC:1 - chr2L 15438863 5' - Ivk 4928 1 59.41 TCTACTTTATTTATTTTGAAGTGTGCAAGTTAATAATAAGCTTTGAAAGTGCGGAATTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr2R 19873047 5' + 412 7071 2 61.39 ATACCAAATTCGAACTTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr3L 9174680 5' + 412 7083 2 53.47 GGCGTGGCTACGCCCAAGCCCATTCGTAAGGCTATACAGAAATCGGAGAGCGGCGAGGACTTTTGGTCGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTCATC:1 + chrX 12444986 5' - roo 275 2 70.30 GTTTTTAAGCAAGACTTAAAAAAAAAGAAAAAAAA:1 + chr2L 16401631 5' + TART-B 10633 4 71.43 TACACGCGTGAATTGGGCGGACCACAGCACCATCATCACCACGAATAAGCTTAAATAAAGACTGTTCCAAGCAGAGTTCTACGGTTAGCTAGCGAAGGTAA:1 - chr2R 20607527 5' - Cr1a 4001 1 65.35 GCTTTCAACTTGTTTTCATCCGTTTTAATTAGATCTCCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTAGAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGA:1 + chrX 12635667 5' + 297 6561 1 61.39 ATGCGTGGCAATGGATTATACAGCCATATTATATATATGAAAAAAGATAGAATGCTATAGCCGAATTCCCCGACTATCAGGAACCCGTTACTCAGCTAGTG:1 - chr2L 9244710 5' - INE-1 541 1 77.23 CAGCAAATGTGGAAGGGGTATATTTCTATATAAACAAAGTTTTCATAAAGAATTTCCACGCCGCTAGTATTAAGGATGAAAAAATATGCAAAGCCAAAAAA:1 + chr3L 1117176 5' + G2 258 1 68.32 TTATGGCCCCTCACGAGCGACCTCTGACCCCTGATAATAAATAAGTGTGCCGTAGTTTTCGCCTCGCTGGCCGCCCTTTTATCGAGGCTCCACTTTGTCGC:1 + chr3L 2911840 5' - Chouto 6245 1 56.44 CCCTAATGCGGAGCCAAAATGACACAGAAATAAGGGTGCCCCTGGCAAAGTGGGTGCAGTTTTTTGGGGGGGCAAGACCCATCTGACTTGCTCGTGTTAAC:1 + chr2R 12803863 5' - gypsy10 5644 2 80.20 AAGGAGTCCGAGAATTCGGTCGTGGCTCATGACCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr2L 16396625 5' - 412 7516 2 64.77 TTTTCGATTCCTACAAAACATGCGAAGAGGAAAAAAAATGTACAAATCGCCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2R 14744292 5' - roo 9047 1 56.44 AATTCTATAAAAATTGATATATATGTACATAACTAAAATTCTTTATTACAAATATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTG:1 + chrX 20588740 5' + accord2 7557 2 64.36 GTGCCACAAGTGTCAAAAAGTGTGCGCACTCCAAGCTTTTCCTTTCACGTTGCCTTCCTGGAAAATGCTCACTCTTTTTTTGGTTTTTTTTTTCTTTTTTG:1 - chrX 9539771 5' - gypsy7 5009 2 62.38 CCAAACCGAGCGACACACAGGGAGGTTGGGCTGGATGGATTGGTCCTCGCAAATGATGCACCACCCATGGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCAC:1 - chr3L 19987860 5' + Stalker 192 4 73.27 TGCTCCATTTTCATTTTGCCCCGCCACGCCTTCTTTCTCTATATTTTTTGCATTTTCAGGCTTGAAATAAAGCGAGCATAAAGGAGAAAAAAAAAAAGGAA:1 + chrX 9913873 5' + Doc2-element 225 2 65.35 GGCCTGAGCGATGTGTACGAGAACAAGAAGTATTTGTATTTGATATTGGCGCCCACGGCACTCTTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTG:1 - chr3L 15909079 5' + gypsy4 415 2 56.44 TTTTTAATAGGCACTCTGACGGTGAACGTGAACGTGCTGCTCCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGGT:1 - chr3L 15867608 5' - F-element 4448 1 60.40 CAAGAGTTTCGAACCAACGACTACGCTTACACAATGGTATATAGTCCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chrX 22690742 5' - roo 9042 1 55.45 TTTAGTATTCAATAATTTGCAGTTTTATAGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAAC:1 + chr3L 18408002 5' + X-element 59 1 67.33 ATGCAGCATGTAGATTTTCAGACTTTGTTGTTGCTATAGTTGCTGCAGTTGCGGAAGAGTTCAGAGTGGGAGAGCTGAGACCGTAACTGCTGTGAGCGGGA:1 + chr2L 19362186 5' - Porto1 482 1 76.24 TCATACACATATGAAACAATAACTTTTCGTGATATTATGATTCGGCTATTACTATTTCTAAGCTTTATTTAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAAG:1 + chr4 670986 5' - 1360 297 1 77.23 GGGAAACTCTCGATTTGCTACTGAAACATCTTCATATTCCTAGAGCATGGGTAAGAGGTATCTGATAGTCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr3R 10078290 5' - roo 403 1 73.27 ACCAGCGGCGCATGCTAAGCGATTCGCCTGAGACAAAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chr2R 17346030 5' + hobo 11 1 66.34 CCGCACCCACGCAGCCATCGAAGCCCGAGGTGTACTTCATCAAATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCG:1 + chr3R 27050216 5' + Doc 4530 1 57.43 ATTAGGCGAGATAGAGCGCTTAGTAGCTGACTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 3635473 5' + roo 8707 2 70.30 TGTTTGCTACCGTTTTTTTGTATTAATATTTTCAATCGAAATAACAAAATTAGTAACAGATCTAATGTATATTTTAAAAACAATTGGTAAAACAAATAAAA:1 - chrX 3700947 5' - Tc1 1479 1 73.27 TACTGGTCACATGGTTATTTCTCTCTTTTGCGACCCGCTCGAATTCAAGGCTCAACAATGTTCCTTTAGTTAACGGTTCACCTGGATTTTCAAGTTTGTAG:1 + chr3L 25255156 5' + GATE 295 1 76.24 CGTTTTAGCCGCTAACTTTTCAGAATGACCCATCACGTGGTCAGCTTCAGGCGAAATTAGAGCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:1 - chr2L 6596836 5' + Tabor 6853 2 65.35 AAATCAATAAACTGTGTAAAATGGACCCATCAATTTTCATAAGGCGTTCATATTAATCTACATCAATTCAGGGGAATATTTGATTTTATTTTATTTGATTT:1 - chrX 12431284 5' + transib1 1897 1 73.27 TAGTTCTTCGGTTCCCTTTTCACCCAGGCGATATGAGATGCTCCAAGTTCCTTATTTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCGTGACCCTTACAGA:1 + chr2R 7289314 5' + Cr1a 4171 1 55.45 TCTGAGAACTAATTTCAGTTCGTAAGGTATATGTCTTATTTTTATTATTTATTTTACAGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACAC:1 + chr3R 9101766 5' + I-element 5080 1 58.42 TAACCCAATTCCTGGTCTTAAAGGGTGCGAAACAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr2R 10345617 5' + roo 43 2 68.32 CACAATAACAACGACGGCAGCAGGGTCAAAGTGCAAATAAAAATTAAGGAAGCATGAAATACATTTTATTGGCATAAAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCG:1 - chrX 3522878 5' - 1360 152 1 46.53 ACGCAAGGAGATTCAGCAAGTAAAAGGGAGTGAACCGTAGTTATGCTATGTTTAAACCTTCAATCAAAAACAACGCGTATTTCTCGTTCGTTTCTACGGAA:1 - chr2R 5532063 5' + Doc4-element 75 1 63.37 AGGTGCGAGTGTCAGGCGTATTATTAATTTCTAATTTGCATATATATATTTTTTTTTCTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACT:1 - chr3L 15391471 5' - F-element 4647 1 63.16 TCACCAAAATAGACCAAAAACTGTAGTGAATAAAATATAACATTATTTTCAAAATAAAACTGCAATGATAACTTTTTTAATAACATAATGTACACGTTTTT:1 + chr3L 18265189 5' - S2 1388 1 69.31 CACAGATTGTTATTTCCGCCCTTAAGCCTATTATTTGTCACAACAATATCAACACACACACACACATAGGCACACACACACACACACACACACATAGCCAC:1 - chrX 10441297 5' + accord 7033 4 62.38 GGAATATGTTATATTTAAAATGCATTCCTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 14500143 5' - roo 9024 2 72.28 ATATTGAACAATTATCGGAATCGAGGAGATTTATTTGTCGCAAAAGTTGCGTACAAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 + chr2R 14796162 5' - hobo 2918 1 58.00 ATATTTTCTTCGTGTAAAAGTAATGCACTTTACAAAATATCCTTACAGATGAATTACATATTTCTTCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGG:1 + chr3L 8012014 5' + transib2 8 1 69.31 AAGAACAAAATATGCATAATGCCAAAATGTATCCTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGCAGAAGTCGCGGAGACGTAA:1 - chr3L 24164963 5' - Doc2-element 368 1 66.34 TCGTGAATTGCGTGCGGTAATTAATTGACTTCACTTTTTAGCATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - 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X-element 451 1 81.19 TATTCAAATTTTAATATGTTTAACTCGTTTTGGTTGCCTTGGCTGCGCGGCTGGAAACAGGCTCTTAGTTAGGTCATGTCTCTGCTAAGGGTGCTGGCTAA:1 - chr2R 9322602 5' + baggins 142 1 53.47 ACCTCATGCCCCAACTCGTCCCCATCGATTGCAATAAAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr3R 9605933 5' - roo 9031 1 70.30 GCTCTTTTCTACGCATACAGTGACAACAGTCAACTGTATGTGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTC:1 + chrX 3464213 5' + Burdock 34 2 59.41 TTTAAATAACTAAGTACCTACTATACCTTACTATATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 - chrX 3244627 5' - I-element 5314 1 66.34 TTTTAGTTTAGCCTTTAACATATGTATATTTGTAGACCCATGTTGCCATACCCACAACCCCACAAAACAGCTACGCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTGAT:1 + chrX 21600317 5' + INE-1 261 1 72.28 AGCCGATGACACAGAAGTTTCACATTGGGCGGCATATCATATATCCGTATACAGACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chrX 5151912 5' + 297 12 2 68.32 AGAGAAGATGGGGGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 + chr2L 7970979 5' - blood 7356 2 57.43 TACCAACCACATCGTGTTCTCTTCGAGTTTCCTGACCATTAGATACCCAACCAATCTGGAATCTGCCTGCCTAGTCACAACGTTCTAGCTTTTATAGTGCC:1 - chr2L 21717970 5' - INE-1 157 1 50.50 AGGAGCAATTCCGGAAATGCTGTCACAAATTGTTTCAGAACCACCATTTAATTTATTTTATTTACAGAAAATTCAAAGAGCCTTGTAATAATTGTAATGCA:1 - chr2R 17292570 5' - Tabor 489 1 79.21 AAATGTACATATGAGCCGCAAGAAAAAGAATCATTTAAATTTTACACATTGATTGGATATTTTTATTGATGTATGGTTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTCTTT:1 + chrX 21061848 5' + pogo 300 3 65.35 CCAAAAGGTGCGGACCATTCGAAGAATTCGTAATGAAGCCACGATTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr2R 11086474 5' + Doc 39 1 55.45 CTGTTTGTTGCCAAAACTGACTGCTAAAGATGGCAAGAAGTCGAAGTTGAAAGTTAGACCGTAAAGTTCAATAAGTCTTAAACCGATATTTAATAAAAACC:1 + chr2R 12811674 5' + McClintock 6270 2 57.43 TTATGTAGATACTTCTACACTTAGCAGTTAGCCACGCCTAAACTACACACATACATACATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chrX 8522945 5' + 297 10 2 70.30 CAAAACTGCACACGAGGCGCTGCGCTTGTGCATTCAATTGCAATCGATATCCCAGAAATATGATGAAATTTCGCGTTCGCATTTACACTAGCTGAGTAACG:1 + chr2R 19822209 5' + INE-1 535 1 61.39 CTAGAGTTTAAAATATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCTGGGCTACCCTGGTATGTGAGCAACCGAGTTATTAAAA:1 - 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jockey 4941 1 77.23 TAAACACCTATAAATCATACTGGGGTCATCATCGCTGACCCTCGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTGTTGAGCCTCCTTGGTG:1 - chr2L 6714372 5' - X-element 4477 1 71.29 GTTTAGCCAGCTGCGTGTAAATTGAAAGATAATAACGAAGGCGGAACAGGATACGGAAACCAGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATA:1 + chr3L 20766844 5' + accord 77 2 64.36 GCAGTATATACATATATATATACATTTATATACATTTCACTTTGGATCCCCCGCATTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAG:1 - chr2R 21507996 5' + jockey 493 1 55.45 TTTTCGGGGCAAGCTCTTTGCGGCTGCTCAAATGTAGTCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 + chr2L 10898473 5' + jockey 4707 1 62.00 AACAATTCATTTCCGCGCTTTGGGCTCCATAAATTGCTTTTATTAGGCAGGCGCAACGAAAAGTGCGGAGTTCGTATTATTATTATTATTATGATAGATAG:1 - chr2L 3988622 5' - I-element 5350 1 76.24 AGCACACACAGTCGAGGTCAACAAAATAGTGGTATGTACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chrX 20982289 5' + 297 29 2 65.35 TTTGCATTTTCCCTTGTATGCTCCTTGCCTTTGCCCACATTTTCAGATATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:1 + chr3L 13264450 5' - 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chr4 1151509 5' + Doc3-element 150 1 62.38 GCATGCCGCTGAGAGCGGTTCTCGCTTTTTGTGACACAAAGAGGAGTGTCATGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr3L 6942870 5' + P-element 25 1 54.46 CACGAAATTTGGTTACTGAATAATATTTTCGGGCTGCCCTAAATTATATAGTCGAGGCGATATTTCTGTGCATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2R 10345702 5' - roo 404 1 75.25 GAATGACTCTCGGCCTTTTGCTGATCTGCCTCCGCTGCTGTTCCTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGA:1 - chr2L 18231843 5' - 1731 4592 1 58.42 AGAAACTCAATTTGTAAAACGGAATTTTATTAGGTCGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCG:1 + chr2L 14074919 5' + jockey 221 1 75.25 CCGGAAACTAGTCCAAGTCAAAACGGCAATGGAACTTTATTCCTGCCATGGAATAAATTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 - chrX 5152029 5' - 297 6964 2 69.31 AAAAAATGACAGTCCCTAACGAAACCCAAGCCGAGATGTAGGCTTTTTCCCCGATAACCGAATTATCCCAAACTTATCGGGTGCAACTTATAAGGG:1 + chr3R 19690417 5' - gypsy12 134 2 79.17 GAGTGTGGCGATTTGTTTTGATTTGATTTCAAATGCGTTTTCTTAGCTCCAATGTGCTTACGCCAAGCAAATCTTCTGTCTAGATGAGCTCCGAGGTAAAT:1 + chr3R 9940633 5' - Doc4-element 2428 1 73.27 GGGTTAATAAATAACAGTCAGCAAAGCCATTAAAGCATTAATAATAATTAAAAAAACAAAAAACTGCACAAATCACAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGG:1 - chr3L 2989022 5' - Cr1a 127 1 61.39 GGATTGCAATGAAAGAATGGAGTGCTGCTCCAAGGAACAGAATGCGGCAGATTATATATACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 - chr3R 25443137 5' - 297 383 2 67.33 TTATGGAGACATCATTTAATGACAAAGACTTATTAGATTTGCTACTTTCCCCCTTTCGAGGATATTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGAC:1 - chr3L 2471982 5' - G4 82 1 70.30 AACAATGTAGGCAGTAAATCAAAACCCCTTTCACTGCTCCCCTAGAACAATGTCAACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGT:1 + chr2L 1238152 5' + F-element 467 1 56.44 CATGTTTAATTTAAATCCCGAACTCATTAAAGCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr2R 21860503 5' + roo 43 2 71.00 ATAGCTCCGCATTTCGGCGGACTTGGACAGACGCATCAGTCGCTGGACATAGGCGCTGTCATTGGACTGTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 28879893 5' - roo 398 1 66.34 TTTTCGGTGCACTTGGACAAGGACACGGTACGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3L 21852508 5' + 1360 46 1 73.27 CTGTCTTTGTGCCATGTTTATTTTTGTACGTATTTTTTGTTTTCTTGCCATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3L 4637287 5' - 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hobo 2865 1 77.23 CTATCTATATGTATGTATATCAAACATTCTTCAAACCAAACATTAAACATTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAA:1 - chrX 10207912 5' + I-element 248 1 50.50 TCTCGTCACTGCCATTTGCATGTCCAACTGTCTGCATTTTGCAGTCCTTCATTTAAATGCAACGCTCGTTTCTCTCTTTGATCTTGTACAACTGTTTTGCT:1 - chr3L 17107297 5' - Bica 410 1 72.28 AGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAGTTTTTGGAGAAAGAAGACGTTGCAGACTGTGCAAAACTGCAACGCCGATG:1 + chr3L 26696871 5' + looper1 1559 1 87.13 CGTCAAAGGGTAAAGGCCGTAAAGCTGTCGTTGCGGCCCATTGAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3R 23080829 5' + 412 31 2 53.47 ATTTCGTACTGGTTCAACTGTGATACTAACTATGTGATACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 + chr3L 3317153 5' + 1360 40 1 63.37 GAACCACTCCGGTGGTTAAGAAGCATGTGCTCAACCCATCAGCCAAGCCATTTACACCCCGCTCTTCCGATCTGTTCGGACGCTCGGCTCAAGACTTTTTA:1 + chr3R 15414714 5' + 1731 4510 1 61.39 TTGCTTGCTAATTGCTCGGAAGTGACGACAAGGTTTTCAAGTGCTCCATAATAAATTTTGTTATTACAGCAGGATGGATGGAAAGAATAAACGCCGTTGGA:1 - chr3R 18299942 5' - Max-element 431 1 78.22 ATTCACCATTCATCCATTCAACTGGAATTTTGGTTGAATGCCGGAATTGTGTCCACAAATTGTGGATGGATGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGA:1 - chrX 15608254 5' - F-element 4514 1 73.27 CCTGCGTGCTGGCCAACTTCAGCCTTGAGGCATTGGGCTCGCTGCCCAATCTGCACACGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTC:1 - chr3L 1493959 5' + F-element 4213 1 64.36 CCCCAGCCGAGAAAATGCCGAGCACCGTAGTATTTGATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 - chrX 4784571 5' - hobo 2898 1 62.38 CAATAATTGTGCAACAACTGGAAGCGATTATGCAATTCCATCAGACCAAGAGAGACACACTGCCGCATTGAGACTGCCCATTCTATGTACGTGGCACTACC:1 + chr3R 14931081 5' + BS 4770 1 75.25 ATGGCCCCATCAAAGCCGGCGCAACAATTGAAAATTCAATTAAAAGTCTTTATTAAAATAAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 + chr3R 6135203 5' + I-element 13 1 66.34 ATCACTCACGGTGCAACTGACCACGCCCCCAGTGGCGCCCACCACCTTCTGTTGTCACATCTGCAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 - chrX 8354448 5' + jockey 19 1 67.33 AGTCACGATAAAATGCTATTTTAGATCCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 + chr3L 18034188 5' + Doc 54 1 70.30 TGGTAGAATGTGCTTTCGGCCAGATTCTCATTATAGGATGTCGCACTCGCCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTCACAACTTTGTATCGCAAAGCTTC:1 + chr3R 8386302 5' - ZAM 80 2 56.44 GAAGAAATGTGCCACTAAAGTATGCACTCCAATGGAAAGAAATTCTGGTTCTCAATTGCCATACTTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCAC:1 - chrX 4799681 5' + F-element 4335 1 59.41 CCCACAAATGCCCTACCGTTTTCAAGACCCTCGTTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAG:1 + chrX 7331112 5' - Tirant 260 2 65.62 GAGGCACCATAAAGCAAATGTGAGCCTTGGCCGAAGCATAAAAAATATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCC:1 - chr3L 13264542 5' + Burdock 6157 2 55.45 TGGTGATAGAGGAAGAGTTCTTCCATGGGGTCTTACTACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:2 + chr3R 15631112 5' - opus 465 2 62.38 ATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTAGTACAGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTACC:1 + chr2L 15832988 5' - hobo 2840 1 66.34 CACTCCAAAAGATTTTATATATTTGAAAATCAAAATTACAATAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTT:1 + chr3R 11143465 5' + mdg3 5108 1 58.42 TGACAACCCAACCTAACGACCCATTACCTTTTTTAGATGATTTGGTAAAAATAATTTTTTTTTTCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGT:1 + chrX 6897340 5' + Ivk 13 1 61.00 CATTCAGTGCCCCAAAGCTCCACGGTGCAAAGAGTCAAAAAATTAATAATTAAAAAAAAAA:1 + chr3R 29575518 5' + BS 5094 4 62.30 AGCGGGCTGAGCAGATACTACCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGA:1 - chr2R 15054127 5' - F-element 4247 1 79.21 CGAGCTCCGTAGAAACCTCTGACATTTTCGCCACCAAAGAGTGGCGAAATAGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 + chr2L 7463504 5' - blood 7364 2 53.47 AAAGTAGCGACAAGTGTTAGGGGGGGGCGGCATATCATATATCCGTATACAGACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr2L 12952638 5' + 297 14 2 56.44 GTATGCATGTGTGTGTAAGAGCTGGAGAAGAAGAGAGGGAGTGCAGGCGAATGCAAAATCAAAGTGCTGCGCTAGTGCTTGGCTTCTCTTCCAGCTCCTCT:1 - chr3L 11297203 5' - G6 477 1 67.33 AGTTTCGCTTTATTTAAACACAATCGCTGATGCATAATTAATTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAA:1 - chr3R 8214758 5' - R1A1-element 15 1 59.41 TTCAAATTCAAATTCGTGCCGCCATTTGGCCGGAAGCTCGAGCATAGCCGGTTAAGCTCTGCACTTTAAGCAGTTCGTTTTGGACACTCATAAAATAAAGA:1 - chr3R 6762552 5' + gypsy3 6711 2 78.22 CTCTACACAGACGGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGAGGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTTACATCCTGCTCATCGA:1 + chrX 19820614 5' + Rt1b 4958 1 73.27 ACCACGAGTTTGCTTTAGAAGATGCCTTTCCGTTGAACTAAAACTAGACGAGTAAAGCGTATCTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr3R 5594929 5' + 1360 11 1 66.34 TAAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chr2L 7971060 5' + blood 7030 2 56.44 AGTTCCCCTCGATGGCTGTGCGAAAAGTTTTGTCATCACAGACACCCCCCTATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTA:1 + chr2L 16502783 5' + P-element 2743 1 53.47 CTAGAGGGAAGGATTTATGGTTGGGAATTACAGAAAAAAGGGAACTCAAAAGTGGATGACAGTGAAGCGAAAATGGCGACCACGGACAGAATAGGATTTAA:1 - chr2L 17759718 5' - Max-element 392 1 74.26 TCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTT:1 - chr2R 5531180 5' + 1360 81 1 56.44 GTTAGTTAAAGTTAAACAAGGAGGGTCTTCCTTACATCCTAATAGGATTCATATACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chrX 3195613 5' - mdg1 7438 2 57.43 TGACTAAGTAGAGCTTATACAAATCGATTTCATTATTGATGGCCCCGATTGTTTGTTTGCTCTGTTTATTTTGCGAATTGTTTACAGCAGCTAGGGCCGAC:1 - chr3R 10192528 5' - diver2 271 2 73.27 TTTTCAGTAAGCAATACAGTTTGCCATTGGCAGGCAATTTCAACTCCATACCTTTCGCGTGGAAATGACCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATTT:1 - chrX 10963265 5' + Doc2-element 476 1 72.28 ATAAACAGTTCGTGTTTCACATAAAGGTACTAGTTCATTTGAGATTTTCTTCTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGAT:1 + chr3L 25397287 5' - F-element 309 1 52.48 ATCACAACTGAAGTCCAATCAATGGACACGCCCATCTACAATTGCTCGTTCAGTGAGCGTCTGCTGCGTCACATTGGCTTCGTGAGCTTTATTGATCTACA:1 + chr3L 18328957 5' - Gypsy12A_LTR 19 1 71.29 CAGTGTCAAAAAAGTGGAAATTAATTGTTAAAAATTGCAGGCAGACCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTATAAATCGCCGCTCGA:1 + chr2R 18141448 5' - 1360 2993 1 66.34 TTTCTTTCACTTTTCCCTGCAAAGCATTTGCAATGAGTGTGTCTTCGTCGATGTGTTTAAGGTCGTTACAATAAATAACTTTCTTAGAGAAGTTTAATGTT:1 + chr3R 24102972 5' - I-element 474 1 63.37 GCACACACCCGCACACATGTAAGCGCACACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGAT:1 - chr3R 5908564 5' + I-element 5009 1 72.28 TTTTTCCCATTATTTTTCGAACTAAGCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAATCGGAACTATAGATAAGGAGTACCCCCGTATGTTGG:1 - chr2R 3628207 5' + Rt1a 4782 1 74.26 TTTTGTTTTATTTTTTTATTTATACCTTATTAAGGCATACGGGTTAGCTGAAAACCCCTTTGTCACCTTGGTATCTATTAATTCAGCCCTTGCAGGCGCGC:1 - chrX 8509937 5' - BS3 1699 1 82.18 AAACTATTCGATAAAGTTTGCTGGTGGAGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTG:1 + chr3L 19016596 5' - TAHRE 10379 1 86.14 TATGAACTAAATTAGGGAGTTAATAGCTTTTACATTTCATTCAGTGCCTCACTTGCTCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATAT:1 + chrX 9048633 5' - Tirant 378 2 58.42 TGTATTCTCAGAAGCATTGTTTGTATGTCTGCTTGAAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGAATGATGTTGGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCT:1 + chr3L 15146036 5' - Q-element 229 2 73.27 GGGGTAACATTTTTGAAGGGCGGTCAATGAAAAGTTTATTATGCGCCGAAAAGAAGTCATAGTTTGTGGACCGAATGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGAC:1 - chr3L 14692121 5' - flea 151 1 74.26 ATTAGCAAAGTGCATTCTGCGCTATCTTTCTACCTTTCGAGGTCAGGTTTGAGTTTCCATTTTGGCCGCCCATCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCC:1 + chr2L 12253675 5' + Doc 340 1 78.22 GGGGATTGGGGTGAGAGGTTCGCCTCTCACGCTTATCGTTCTAATTCTAAAGAGGTGATGAACATGTGACGGCAGTGGATGTGGGGATTTT:1 - chr3R 20235556 5' - accord2 7347 1 69.23 GTTGAGGTGTAGTTGTGATTTTATCGGTCGTAGTTTTGGGAGTTGTTGTAGTTGTAGTTGTGGAAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTT:1 - chrX 12972012 5' - gypsy 7393 2 68.00 AACGACACACACCACAGAAGACATTGCAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chr3R 18026926 5' - mdg1 371 2 70.30 TTGATTTGCCTATAGCCACGACGACGTCGACAACAACGACTATTCATAGGTGAGTCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAG:1 + chrX 2125556 5' + P-element 20 1 59.41 TGCACGAAAACCCACACAAATATACCCGAAATCGGAGCAGCGGACGACAGGGGCGGGTGTCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGG:1 - chr2L 18932114 5' - hobo 381 1 59.41 AGTGCCCACGCGCAGGCCGAGGCCCTCAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCATCATTTACCATTTCGAGATCTTCGGTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGT:1 + chrX 11383050 5' - G4 87 1 73.27 TCGCTTGCAGTTGTTCCTGTCCCATCTATTCAGTTCTATTTCATCCCACATAGCACGCGATCCATTAGCCACACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATA:1 + chr3R 13448031 5' + roo 8890 2 78.00 CTTTGGCATAATGAACACTCCGCCCCATTTCGGGGTGGCGTGAGGTGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCATGAACGATGATGGCAAATGTATACT:1 + chr3R 7721797 5' + Bica 78 1 55.45 GTCACAAATTGTTTCAGAACCACCATTTAATTTATTTTATTTACAGAAAATTCAAAGAGCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTAC:1 - chr2R 17292549 5' - Tabor 7307 2 60.40 AACCTTCTAGCTTTTATAGTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCATCTGTCCGTCTGCCCTGTACGAACTATAAAAGCTAGAAGGT:1 + chr2R 1751260 5' + INE-1 157 1 80.20 TCCATCGCCCTGCTGTTCCCTTATTCAGCCGCATGCATGATTTCGTAATTTAAACGGCAATCACCTCTTTGGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATT:1 - chr3L 5085100 5' + 412 3 2 74.26 GTGTGCCATAAAGAGACGTGCTGCGTACGTGACAATAAAATGAAATGTGTAATAGCCGCTGACGGCTTTTACTAACCAAGTGTCAGGCG:1 + chr2R 22363441 5' - gypsy2 6780 2 70.79 CTTCGTGTAAAAGTAATGCACTTTACAAAATATCCTTACAGATGAATTACATATTTCTTCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr3L 8012021 5' + transib2 15 1 62.38 TCGCTGTTTTGCCTTAAAACTAATAATATTTACACTTATACAAAAGACCGACCGCGTTGGTCCGCCGTATTGATTCCTCGTTAAATAAACAAACATTTCTT:1 - chr3R 16259874 5' + Tom1 77 1 68.32 GTACAGGATATTAGAATGTTTGACAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTTGCTTC:1 + chr3L 18123493 5' + Cr1a 116 1 82.18 CATTGCTCGATGCTTAAGTGTTTTTAACACTCTAGATATTAAAAATGGAATAAACATTTTATAGATTGGTTTTTTTTGTTTTTTATATATATATTTCCAAT:1 - chrX 8822489 5' + copia 4664 1 78.22 GTTTGTTGTTGCGGCTAATTCCTCCAGAAATGAAACGCCCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGAC:1 + chr2L 23506323 5' - 412 196 2 61.39 TTTTGGAACCATCAATGAAGAGTATTTTTTTAACCAAATTGGTAGAAGATTTACAAACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCATTAGCTACAGGGCTTAGAG:1 - chr2R 11935926 5' - I-element 5292 1 55.45 CATGGCGGCAGGGGCCCGGCATTTAGCTTTATCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACC:1 - chr3L 11402675 5' + F-element 397 1 68.00 CTTGTACAAGGACTCCCAAATGCGAGTGTGTGTATGCGCATGTGTCAGTGTGGTAGTGTGGTGCTGTGGACGTGTGGTTAAAAACGAAAGTGATAGTGCTG:1 - chr3R 21256285 5' + Dm88 440 1 70.30 TGCTGAAATTTAAAAATAAGTTAGATCGCTTTGTATTAGATACAATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAAT:1 - chr3L 7412488 5' - invader3 245 2 54.46 TAGATCAGCATATCGTAAAATTTTGTTTAAAAATCGTTCAGGGTCGTTCTGACCCTGTCCGTCCGTATAAACGTCGCGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAG:1 - chr2R 5211576 5' + INE-1 152 1 58.42 TTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCG:1 + chr3L 19951170 5' + Ivk 2 1 77.23 CGTCAGCATCTGGGAAAATGCAGCAGAGCTAACAACAGCTGGAGATAGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGCTCTGACTG:1 + chr3R 8498733 5' + F-element 474 1 70.30 AGCGACAGGAGCAGCAGCAGAAACAGGAAGCTTAACATCCAGCGGAATCAGCAAGACAAACACAAGGACATCACGACAAAAAAAAAAATAAAATAAAATCA:1 - chr3R 20472756 5' - transib1 1898 1 69.31 GCCGAAAATGCTTCGAGCTTGGACACCAGACCGAAAACTGCAAACAAAAACTGACTGTCAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGC:1 + chr2R 9390612 5' + G2 2882 1 61.39 ATGACGAAGAATTGCTCGATTGATAAGGTAAAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAAC:2 + chr2R 3293733 5' - 1731 293 2 56.44 TGCGCCTGCGCAAAGGGGGTGAAAGCGAGAGCGGCACTTCTCTCTCAAAACCAACCCTAGTAAAACAAGATAGAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTAAG:1 - chr2L 3426988 5' - INE-1 564 1 60.40 GGAGACGAGGGCAATATGGGATTCGGCCACGAGTATTGATTAAAGTCTGTTGTTTGTGAATGCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 - chr3R 4524268 5' - mdg1 408 2 65.35 GCTTTCATATCCCTGGCGATGGCCACCTCAATTCCCATTCCCATTGCCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGACCTACCTCAATGAGCAGTCT:1 - chr3L 11235890 5' - R1A1-element 4965 1 58.42 GGCATCTTTAACCCTTCACTGGCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACAT:1 + chr2R 17269736 5' - transib2 2772 1 75.25 CGTGACCTAACGGAACCGCGCTAGAACTTATACTCGATCCAGATGTCCCGATGGCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAA:1 + chr3R 2449573 5' + Ivk 330 1 46.53 AGACGAGGGGCAAGGAGCTATTTGATCATCATGATAATTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chrX 3358707 5' + roo 39 2 68.32 GAGATTCCGCTGGATATCGCCCCCAACTAATAAAACTTCTACCATTCACAGTGGCTCTGGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATA:1 + chr3L 16498195 5' + Porto1 4223 1 66.34 TTGCCACGCTTATGAAAGCCGGTCTTAGATTTCGTCATCCAAAAGGTGGAGAAGGCCCTTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chr3L 9505902 5' - P-element 2870 1 61.39 GTAGAGATTAATTAAGATAAAGCTGTTATAAGAGTCGAGCTCATAAAGGACTGGACGAAAATTACAAACAAATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr3L 27864670 5' + roo 3 2 76.24 TTTCTAATGCTAAATTCAAATTGAAGATTATATTGACTCTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTC:1 + chr2L 18773311 5' + Max-element 8275 2 65.35 ATTTCCTATTACAGCGAGCTGTGGTGTCGTGAGCGATACATTATATAATTAGAGATAAGAATCCAAGTAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGTAG:1 - chr2R 23766543 5' + rooA 297 2 67.33 GGGTTTTGTGTCGGATTGCCTCGGTTGGGTGGTTTTGTCGGATCTGTTTGGGTTGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTA:1 + chr3R 20786140 5' - I-element 150 1 56.44 GTCCGGCGGAGCACAGCGTGGTGCGGTACACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATA:1 - chr2L 4738394 5' + flea 236 2 75.25 TTCCCTACTTCGCACTTTAAATTCCATTCCATTTCTATAAACAAATGTTGTCGCACTCTCGACTGGACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTCGCGGC:1 - chr3L 539112 5' - G5 4414 1 56.44 TATTTTTAATCTGCTTATTGTTTGCAGCACTTCGACGCTTTTCAGCTTCATTTTGGCTAATAGAATTGGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTA:1 + chrX 5280449 5' - Quasimodo 107 2 68.32 AATCGCCATAATTTCCGCTCAATTTACTGCTAAGTAAGCCAAATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTA:1 - chr3R 8874439 5' - 1360 398 1 59.41 ACCACGGTCTGACACAATGCTGAATGGCTTACCAAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTACAGACACCTTGATATGGATT:1 - chr3R 2469125 5' - invader2 4671 1 66.34 AAAAGCGAAATATTTTTTTTTAAACACTTTTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGACTTAATTAGCTACCGTTTATACATTTATATTTATGTT:5 + chr3R 18617734 5' - 1360 2960 1 69.31 GAAATGACGGTTAGTAGCAATATAATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2R 12370584 5' + roo 8715 2 79.21 AGGAAGCAAAACATTATGCAAAAGATCTTTTCTTTAAAAACTGAATATTAACTGAACTGAATGTTCATGTTGATGTTGATGTATAAATATGTATATATATG:1 - chrX 12854331 5' + G3 4508 1 55.45 ATAATAATAATGGAACAAGATTATAGAGAAGAAAACAGCACTGCTCCCTGGAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTTATAAAGGAAGGAAAAGCGTATAAG:1 - chrX 192777 5' + HB 407 1 66.34 GAAAGACATTTTTAAGCAAGCGGACAGTATATCCCCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCTTAC:1 - chr2R 6041628 5' - opus 466 2 63.27 AGTACCAACCTTCAACCTTCCATTAGCTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATAT:1 - chr2R 3554509 5' - jockey 4855 1 44.55 GCCAGATGACAGATACGAAGTGATGGTAGTCAGGGGGTGTGGGGGTGGTGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 - chr3R 28940790 5' - hobo 2910 1 50.50 CTGTTTTTCTATTATTTTTGTAGGCCGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAA:1 + chr3L 7424383 5' - 297 279 2 75.25 GGTCCAAGGAGTCCGAGAATTCGGTCGTGGCTCATGACCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chr2L 16396630 5' - 412 7508 2 64.36 ACATGCGAAATTGCCTTTTTCGTTGGGTGGAATGGGTCACCACCGCCTTATAGAGAAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGC:1 + chr2L 6111073 5' - roo 8853 2 53.47 AGTTTTCGGTCTTTCGTCTCAAATCTGGGTTTGGCAGTCGAACTAGGGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr3R 24229157 5' - 1360 3363 1 55.45 ATATAGTCGAGGCGATATTTCTGTGCATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2R 10345657 5' - roo 358 2 77.23 ATTTTTATCATATACATGCCCCGTTCGGCAGAAACTCTAACTCTAAACTCAAAAGGATAGAAAAGGCGCCTGCATGACGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAA:1 + chr2R 5617196 5' - invader1 3638 2 65.35 CCCCTGCACATTTCGCCCACCCATGTAACAATTGACTTGCGGTCTGGGACGGGAGCCAACGGGGCTAAATTAAAGTGATTCCGAAATGCACGCTGTGTTTT:1 - chr2R 498849 5' - mariner2 203 1 80.20 CCAGCAAATGCAGCGCCAGCAATTTTCCACTTTAAGCAATTTGTGTCGGGAGCAAGAGGCATTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACT:1 + chr3R 12116880 5' + transib2 2502 1 69.31 GTTCGAAATGCATGGAATATGGTTTACAATCTGATCGCAGCTTGTAGATTAGCCACGAGCTCAACACATTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCC:1 + chr2L 14698882 5' - flea 4746 1 74.26 CATTTACTGCCAAAAGCAGTACAACCGAATGCCAAAAACTGCCAGCAAGAGACGAAGCAGAGGCAGAGTAAACAGTTGTTTCGTGGAAAAACAAAACAACT:1 + chr3L 18762139 5' - NOF 419 1 55.45 GCTCTTTAGGACCGTTGCGTGGCCATCGTGTCATCGCTTTAGCCATTATAAGAGGTAGCCGGCAATGTTATCGTCACCACACATAAACCTTCTCAAGAAG:1 + chr3L 10918433 5' + gypsy7 5182 1 71.00 TGAAGGTCCAGAGGAACGAAGGGGTGGTCTCTACCTGTGCACCACACATTAACACTAACTGAACAGAACGGCGCTACCAACATGCCAACTATGCGGGGACG:1 + chrX 7423879 5' + Ivk 5108 1 59.41 TTTAAATGTATTAAGTGAAGAATCTTAACATCACAGACTGGAGAATATTCTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTT:1 + chrX 6917080 5' + 3S18 29 2 51.49 ACGCGCAAAATATATATAGATCGATAACATTTGTCTCTGCTGCTTTGTGAATGCCTCTGCTTCTTGTACTTTGGGATACTTTGACCAAAGACACTAGAATA:1 - chr3L 17660123 5' + Tc3 237 1 63.37 TCCAAATAACGATTAACCTATTACTAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAG:1 + chr3L 12852144 5' + 297 6534 2 75.25 AGCTATTCCAGAGGAGCCCAAAGTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 13540144 5' - HMS-Beagle2 493 1 87.18 TAATGGTAAAAATCATTTGATTTAACATTTATAGTAAGCACTTACTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr2L 436875 5' - roo 9041 1 56.44 CACTAGAATAATTCTAGTGTCTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTGTTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTT:1 + chr3R 4604451 5' - I-element 124 1 77.00 AAACTTTAATTTTGTCGAAAAATTCGACATAAATAATTATGATTAATTCTTTAAAGACTTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGG:1 - chrX 7620687 5' - I-element 172 1 64.36 CAAGCGAAAACTCTTATCCATTTCCATTTTGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAAGTTTTTACCGTGC:1 - chr2R 5154789 5' + F-element 29 1 62.50 GGACGAGGGGCGTAGAGCCCAGAAATTGACAGACCTCGTGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr2L 16396573 5' + 412 7091 2 61.39 CGCACGTGCGTTGCTTTTTGTGAAAACTTGATGTATGTGTGTGGCTATGTGTGGGTGTGTGCGTGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 + chrX 6146637 5' + hobo 10 1 69.31 TCGGCAGAACCAAAAACGAGTGCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 - chr3R 29333740 5' - hobo 2886 1 78.22 TCCATATCGCATATTCCCCTCCTTGATCCCGAGCGCATCTCATTGAATTCGTCGCACATCCCGCACACAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCC:1 + chrX 7622260 5' - Ivk 29 1 74.26 CCTGCGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGGGTGTGTGCGTGTGCGGATCCCTTTTGTGTAAATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chrX 3172416 5' + hobo 15 1 61.39 TTTATATACTTATTAAGCTATAGAATGAAGGGAAAAAAAGATTTTGGTTTGGAAGGAAGGAAAAAATAAATTTTGATTTAAATAAAAAAAAAA:1 - chr3L 19527478 5' + transib2 2633 1 26.88 TAATGCTCTGGTAATAGTTCGATGGCCATAGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 14285059 5' + roo 45 2 73.27 CTCGCAGAGCACGGCAGGACTTCCATGACGGTTGGTCAATGGGTATCCAGTCCAGGGCTGTACTTCCTATTGGGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTC:1 - chr3R 16029842 5' - Stalker2 376 2 79.21 ATTTCAGCTTGTGTTTATTTTGTCATTGCATTGTGTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATC:1 - chr2R 17274253 5' - F-element 4628 1 72.28 GGGGAGGATGAGGTTTGCCGCTTTTCTGCCTCGCTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGT:1 + chr2L 8435945 5' - Idefix 7186 2 71.29 TAAGCGAAAGTCCAAATGCAGCAAACAAGGTAAGAGTAAGGCTATTCTGCAGACAAGCATAGTCTTTAACATTTAATTTCTCTTTAAGTCAAACGATTCAG:1 + chr2R 13136829 5' + Doc4-element 339 1 53.47 CGCTACACGTACACAGACACATCTACAGTTTACGTATGTGTAAATTATATAGATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGGGTTATG:1 + chr2R 16160220 5' - gypsy 450 2 49.50 AGTATGTTAGCAAAATGTTACATCTGCAGTTGGGTTGATTTTTGTAAACTGTGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr2L 901751 5' + jockey 33 1 53.47 ACACACAGATTCAAAAAAAAACATCTATGTGTTGGCAAAGTCTGAAGGTTTAGTGCACTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGG:1 + chrX 2289181 5' - F-element 4350 1 65.35 AAGCACCATGCCTAAATACTGCTTTTCACTGGCAGACTATCATTACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 16487322 5' + roo 8694 2 63.37 GAGAAGGAATTAAATTTAGGTAAATGCATTGAAGGAATTCAATTTTAAACAAAATGCTGCTAGCGTCACACAATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 - chr3R 27435119 5' - jockey 4985 1 72.28 GGCGCATAACGCGGCATTTCCGATAGCAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGC:1 - chr3L 22518848 5' + accord 101 2 70.30 ATTACACAGCTCTGTAAGTTTTCCAATTTGGATTTTATTAAGAGTGGTAATTGTAAATTTGTATTGCTTTGCCAATAAACGCCCTACAACCGACCAAAACT:1 - chr2L 11943385 5' + INE-1 346 1 55.45 AGAACACAAAGCTTGGATTTCAAAGATTTTTCCTTAATTTCTGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAA:1 + chr2L 13055431 5' - roo 104 2 56.25 TAGTACGGTTTCAAATAAGCCCAAAATGAGTTAGGAATAACAGATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGT:1 - chr3R 6425901 5' - copia 222 1 66.34 TGAAACCCCTAAAGGGGGTGGATTTTGGAACACATTGATGTTGTGTTAGGGTGGATTCATCGATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 17846853 5' - roo 396 1 64.36 TTAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTAAGCCGTTTCTTAAACACGGCGCTTGCTGAGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAG:1 + chrX 19074845 5' - F-element 472 1 71.29 TTGATTACCACGCATCTGCGAGATACACACTACACATACATATCTACATATATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 + chr2R 11400321 5' - 1360 3364 1 56.44 GCCCACCCATTTTGGTGGCTGTGTAGTATATTTGTGGTATTTATTTATAGACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chrX 12818902 5' - roo 9048 2 55.45 TGAAAGTCGTTCAAAAGATTTATTAAGGAAAGTTATACCGTTGGTTAGCACTTTCCACTTAGCACGACGCGACTGCGTTAGTTCTTTTGTGGATAATAATT:1 + chr3L 5435850 5' - rover 425 1 70.30 TTTGTGAATTTTATGTTCATAGTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 + chr2L 15751364 5' - 1360 3337 1 81.19 AGAAAGTCAGCGGAAGTTGTGAGGAAATCTTTAGCGCAAACATTCAGATAAGGCTAAACAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACGCAAGTCCGTTT:1 + chr2R 7881941 5' - 412 7530 2 62.38 GTGAAAAAGACATAGACATGCCGCCATAAAAAGTGTTTATATTCTTAACCGGTATCAACAGCTGCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGA:1 + chr3R 4544286 5' + Quasimodo 7143 2 67.33 TGTAAAAGTAATGCACTTTACAAAATATCCTTACAGATGAATTACATATTTCTTCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 + chr3L 8012026 5' + transib2 20 1 57.43 TCTGATAAGGATTTACACGAACAGCTGTTTCCTGAAAAGCTTTGAATGGAATTGAATGGAGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGT:1 - chr2L 18395325 5' - I-element 4932 1 58.42 ACGCAACAAAACGAAATGGCTCAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 - chr3R 10428122 5' + hobo 55 1 78.22 TTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAGATGAGACACAAATTAGAATTAAACATAACAAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAACTTTAAA:1 - chr2L 17599966 5' + 1360 3012 1 63.37 GTAATCAAATGATTACTCCTCCTTAAATGAACTCTTTTATATTTTATAAGAATGGTCTGCCTGTTTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACAT:1 + chr2R 2562391 5' + Quasimodo 287 2 68.32 AACATAGACTTAGCAGGTGAATATTTCATTGTTGTTGATATTTATTTAGCGGCTCTCAAGCAGCGATCGGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACT:1 + chr3L 19483120 5' - hobo 2932 1 59.41 GGATCATTGGAAAAAGGAGCAGACTGGACAACTGGACCCACGAATATGCCCACGAAGGCACAAATGACAGCGATGTGTGATTATGTGTAGTTGCGAGCCGG:1 - chr3R 25900661 5' - G3 474 1 76.24 CCCCATCCTTATACCAAATTCGAACTTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3L 9174670 5' + 412 20 2 59.41 AGCGAGAGGACCTATGAATTGTGAGAGTATGCCAGTATTTACATTTTAGCAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCATATCGCCTTAGATAACAAAATC:1 + chrX 12632417 5' - roo 8761 2 60.40 TAAAGAAAAAACAAAATGTCTAATTCCAATCGTAAAGAAATTTACAAAACTAACAAGAGAGAATGCGAGAATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCG:1 + chr2L 21361364 5' - INE-1 555 1 65.35 TTCCTCCAGGGTATATAAAAATTCTGTTTCAATGGCCCCTGCAGTTTTTGCATTCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr2L 12908436 5' + hobo 20 1 59.41 CAATTAATATTGCATTGATATAGCCCAGTTTTACAAAAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chrX 20989386 5' + pogo 33 1 62.38 TAGTATTATTGGTAAAAAGGGTGAAATCTGTTGACAATTTCACCCTTTTTACCAATAATACTACCAACCTCCTGCAAAAAGAGAAAAAAAAAACGAAAAT:1 + chr3L 21914784 5' + invader2 295 1 75.00 CCGACGAATGGTCTTTTTTTTTTTAATTTTTTTTT:1 - chrX 11514389 5' + Tc3 77 109 80.00 TAGGGGACAAACTTAAATTTGTACAAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTA:1 + chr2L 22967003 5' - 1360 3325 1 75.00 CCAGCTGTGATTATGTCAGCCCCTGTATGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 - chr2L 19083415 5' - Tirant 354 2 75.25 CTTTAATTATTTAGTATATTTTTTAAGTCATTTGACTTAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGAACCTCGTGCTTTAAGATATGACCAA:1 + chr3R 6343938 5' + 1360 483 1 56.44 TGCTAATATTCATCGAATAAAGTGGAATTACTGTTTTTGCTGGTGGTGAACTCTTTTCTGGGGGATATACATCTCAATCTTTATAAAAAGAAAAGAAAAAA:1 - chr3R 10609945 5' + HMS-Beagle2 480 1 80.20 GAGGAGTGTTGTGTTGTTTCTAATGCCCCTTCACTCTCCCCATCCACAGCCCCCTCTCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTA:1 - chr3R 24768766 5' + F-element 497 1 65.35 GAAAAGCGAAAGATTTACGCGGCTACTGGAGCGAACGATGTAAACTTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 21782117 5' - roo 9042 1 54.46 GATGGTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGTTGATGGAGGGAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGCGCGCGCTCTTTCTT:1 + chr2L 13513154 5' - F-element 361 1 69.07 GCAACGCACAATGGGCTGCTCATCAAGTGCTCGTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCG:1 + chr3R 4541477 5' - GATE 8294 2 66.33 CACCAATCGAATATATCATTTCTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 6813823 5' + hopper 143 8 89.74 GCTAGATTGTATAGTTCTTTTCAAGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGC:1 + chr3L 18171881 5' + 1360 3313 1 79.21 TCGCTATATGGTTCCAGACATTTGGAAGTGAGAAACTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTTAGATATATTTACGCAGAAAGT:1 - chr3L 11321110 5' + Transib5 42 1 76.24 GAATACATAGGGCAAACTAAATCATACAGTACTTAATTGCACAGAAGAAAAATTAAGAGACAAATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 - chr2R 3032588 5' + opus 7 2 72.28 ACTTTTTACTCGTTGATTGGCTTTCTAAATAAATAAATATAAGTTTAACTAAATAAACTCCAACATAATTATTTCATTCATAAATTTGTTAAACATGGGAA:1 + chr4 962824 5' + Tc1-2 341 1 65.35 ATTTTCTCCGTTTTCAGTTGCATTTTACTCCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTA:1 - chr3R 9990573 5' - Tirant 415 1 70.30 AATGGCTTCTAAAGTGCGTCGCAGCTGGAGCTGAACCCATTAGGTGTTTTTGTATTCATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - 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chr3L 16800332 5' + P-element 1 2 76.24 CCCTCGTTAGATGCAATAAGAAGGGTTTTCCGCAGAAGAAGGAAATAAAAGTTCAAAGTTCTCAATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 7883104 5' - roo 401 1 71.29 ACACACATGCGAGTTGGTCAGCGCATCTATCTCCCAGTGGTCAATGCTGGCCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCT:1 - chrX 8313264 5' + jockey 4755 1 62.38 GTGCGAAAGAGAGCGGTTGTGGCATGCTGGAAAGGGACAGCAACAATTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTT:1 + chrX 20966559 5' - hobo 261 1 54.46 ATCATATGGTACATGTTCTGGATATGGTTGTGCTTCGAGAACCCGCGCAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGT:1 + chr2L 2406393 5' + Idefix 7039 2 56.44 TTAAATAACTTTTCTGTCTGCTCTCCCATTTTTTTTGTATTGTCTAACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr2L 10820662 5' - roo 9042 1 57.43 GAGGGAGCATATAAAAGGATTTATAATTATGATTGGATTTCAAGGGATTTATTAGGTGTATCCTTGCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAG:1 - chr3L 14148644 5' + Doc 4505 1 70.30 CTGGACATAGGCGCTGTCATTGGACTGTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 28879935 5' - roo 355 2 75.25 GGATGCACGTTTGTCCGGTCGGTGAGTTGCCATACTCCCCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCT:1 - chr3L 1198159 5' + F-element 328 1 62.00 CCAGTTCACTTAACCAATTTATGAACCTAAGGTTCAAGTTATGCCCCAATAAGGAAATAGAAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTT:1 + chrX 14965156 5' + FB 16 1 61.39 CTTCTCAGAAATGGTAATTTGAGCCCGTATTATAGTATTGGGTCGATGAGATGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACA:1 - chr2R 8039516 5' + P-element 117 1 55.45 TGAGGCACGCCGAAAGCTTAAAGAGGAGCGACAGCGCAAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCAGAGGCTGACGC:1 - chr3R 16312063 5' + X-element 4535 1 62.38 GCGCATAATAGGATTTTTATGACACCTTCTTCATTGGGGCAGCCGTTGCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCAC:1 + chrX 16256556 5' + Idefix 233 2 56.44 CTACTCTCGCTCAGGATGCATGATGATTACAATGTTTCTAATATATTTTCGTTGTTTTTTTTTTTGTTTGTTT:1 - chr3L 3810731 5' - gypsy7 5009 1 43.84 ATAATATAAGGGGTTGTCATTAAGATAGAGACGTGACGTATGAGTAGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAATTTGAATAAAT:1 - chrX 139905 5' + 412 424 2 50.52 GCGAATTAAGGTGTCGCCAGTTGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTAGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAA:1 + chrX 19377990 5' + F-element 79 1 76.24 CAGCCGCATGCATGATTTCGTAATTTAAACGGCAATCACCTCTTTGGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr3L 5085075 5' + 412 28 2 53.47 GACGGGTTTTCCCGTGTACGCAGCGCAGACGCTGCCACGCCCATTTAACATCCCAAGTTCTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCA:1 - chr3R 5424484 5' + roo 347 2 67.33 TACAGCCGCGATCAGTTTAATAGTAGTTTAAAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 + chr2R 19689025 5' + Doc 4702 4 55.10 CGTATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAAAGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAG:1 + chrX 22633266 5' + INE-1 76 1 69.31 AAAGGAAGCGGGCGTAACATCATTAAAAAACAGAATGAGAGACAAATTAGAATTAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGGGGCGATT:1 - chr3L 2837371 5' + 1360 2984 1 72.28 GTTTCTTTACATAAGAGTTGCGGCAAAACTCTGATATACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTG:1 - chrX 10736238 5' + FB 41 1 67.33 GACCAGCGGCGCATGCTAAGCGATTCGCCTGAGACAAAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:2 - chr2R 17346031 5' + hobo 10 1 67.33 GCAGTTGGAGGCGAGGTCGGGATTGGGATCGGAGCAGGGATCGGGGATGTCGCGGATCGAATATTGTTATCGATAGGCTCTAGTTAGTATTTTTGAGAAGT:1 - chr3R 18454216 5' + aurora-element 4078 1 60.40 ATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATAGGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 + chr2R 19209472 5' + Doc 70 1 54.46 AATCGGATAATCCAAGGCACTTTGTTTACGCTGCTCAATTGAGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTT:1 + chr2L 8953132 5' + Cr1a 267 1 65.00 ACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATAT:1 - chrX 21247572 5' + blood 170 2 71.88 TGTGTGTGTGGGCTGCAGATTCAGCCTGGGGTGGTAACTCGGGCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTTAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATT:1 + chr3L 721528 5' - invader2 411 1 57.43 AGCAAAGGTGGAAAATGGGTGGCTGCTTCTGTCTACGCTTATGGTAAACATTTCTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGATTCCTCTGTAATT:2 - chr3R 9118529 5' - Q-element 106 2 57.43 AAACACACACAAAATGCACCTGCACCTGCATTGTATATACATATGTATTTACTTTAAACCAAATAAAACTAGCAAAGCATACGTGTGCACACATACAGTTG:1 - chr3R 6420585 5' - 1360 171 1 79.21 GTATAAAATCATATTTCACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATA:1 - chr2R 2092817 5' + Doc3-element 58 1 67.33 AAGTTCTCCATTTTTGTTTGGGCCAAGTAAGATAATCGAGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chrX 15259031 5' - roo 9035 1 68.32 CCCGTGCATTCAGCCACATACTATAATATATATTGTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2R 12130660 5' + hobo 40 1 70.30 ACTTGATGATGATGTTACTCCGCCCTCCGACATCCCTTCGTTCAGTTTTCGGTTTGGACTGCCCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chrX 14572274 5' - roo 395 1 64.36 ATCATCGGTTAGCCAACTGATTGGATAAGTAGGTCCATGTTATAACTTACATAGGGATTTATTCATAATTCCGGTCAGAGATGAAATAGCCAAGCAAATG:1 + chr3R 13969347 5' + Fw2 3703 1 59.00 GAACAGTCCCAAAGATTCTCTTTAAATCTCGAACTTTTTCGAAATTTCAGATCTCGAAAACTAAACGAAGGCAAAAAAAAACTTATCGGTGGGCAAACATG:1 - chrX 22489726 5' - FB 76 1 72.28 TAAAAATACAATACCAGTTCACTTAACCAATTTATGAACCTAAGGTTCAAGTTATGCCCCAATAAGGAAATAGAAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAA:1 + chrX 14965143 5' + FB 3 1 74.26 TTCGGGAAATAGAGGAGGTCCATGTCCATGTCATATATATATAGTAGCATAATATGTTTCACATTTTTGCTTACACTCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAG:1 + chr2R 4122449 5' + rover 187 2 70.30 CTGGAGCTCTTTTTCACTTCGCTCCCAGTTACATAAAGTCGTTAGATCTAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 + chr2R 9129649 5' + P-element 28 1 51.49 GGTCTGAGTTGTGTACTAATGGATATCTTTGGCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGT:1 + chr3L 1572257 5' - accord 7202 2 74.26 TCGTGCGAAAGTGTTTATTATCATTATGATACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chrX 12135694 5' + jockey 56 1 71.29 ACACTTGCCCCCAAACGGACGACGAGGAGACGAAGGTCTCTGGCAGCTGCTTTGTTAAGACTCTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 17284032 5' - roo 396 1 66.34 ATGTGTGTGTAAGTTAACACCATTTAACGCTAATGTAATGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - chrX 12276827 5' - hobo 2904 1 61.39 TCTAGCCGATGGTTCTGCATACAACAAAGACTTGGCCCCCGGTGCGTATACATTGTAGATACATTGTTGACCCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGT:1 + chr2R 23794995 5' - Stalker2 397 2 50.50 GCTGCGTGAGCGTATGATTCGAGTGCATTTGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAA:1 - chr3R 24676677 5' + Idefix 377 2 70.30 TTGTATAAATTTCTTTTTTTTTTTCCCTTTTTT:1 - chr3L 10567180 5' - Doc2-element 256 3 72.73 CCAATCATGCGAATATTCTTAGCTTTACCGAAACGGAGGAAGTCCTGCAAATGATTCAGCCATTTACCTCGGAGCTCATCTAGACAGAAGATTTGCTTGGC:1 - chr3L 6737673 5' + Doc4-element 2446 1 52.48 TTCAATTTAAAATGTTAGTTGCGATAGGAATGAGGGTAGCAAAGTATTTTCCTTGAGTGGCAGTTGCAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1 - chr3R 13130343 5' - 412 7488 2 71.29 CACGAAATTTCCGCTTCGTCCTTAACTTTGCTAATTTTTGTTGCTGTTGTTTTGGGTTTCCTGCTCCCAATCATACACACACACACACACACATATCCATA:1 + chr2L 13047933 5' + accord 188 2 64.36 AATTTTAAATCTTTCTTCTCCGTCTCTAATGCAATAGTAATTTAAAAGACATTTGAAACGAAATGCGAACATAACCACTCACAAGCATTGCCTTATTAATT:1 - chr3R 31236440 5' - 1360 442 1 59.41 CGGAGAGAGGGGGCATGTTAACTTGCAAAAGTATTGGCTGGCGACTAACTCAGCTCTTTAGAATTTGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTT:1 + chr2R 5061563 5' + accord2 7395 1 49.00 CAATTTGTTAATGAGCAAATTACATGGTCACTGCATATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTCTAAATGCGGTAATTATAT:1 - chr2L 18506807 5' - flea 4963 2 64.36 TACTTGTCCCTTATTTATTTGCTGTACATGTCTGCCTCAGTAGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCG:1 + chr2R 20704716 5' - Porto1 4252 1 58.42 TTTTGAGGAATGACTAACCCTCTTTAATCCCCACCAGATCACCCAGCTAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTATACCCAGTACTGCAACGGAGAGCCGAGC:1 + chrX 10031526 5' - accord2 7599 2 62.38 CAAAACAAATTTAACAGATTAACGTACGTTAATGTATTTTAGCATATGAATTATGTTTTCGTGATGTGATTTCCGTATCTAAACCAAAGCTAACGTCGCTC:1 - chrX 16149549 5' + gypsy2 6491 2 79.21 GACGGACCCTACATGTCAAAGAGCATAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGGAACACCTACCAGGACTAAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCA:1 + chr2L 4446599 5' + baggins 5057 1 79.21 TATTTTTGATATAATTGCATTTTTCGCTCCAATGCCTCGTTGTCCACTGATTGCGTAATTTAATAGCCTTATTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATAC:1 - chr3L 12241005 5' + Juan 4062 1 71.29 TGCGGACCATTCGAAGAATTCGTAATGAAGCCACGATTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - chr2R 11086466 5' + Doc 47 1 63.37 GTTGTTTTCCTTTCTTTGATATTTTGGTCGGTTTTGGGCCGCGTTGGCAGCACCAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTT:1 + chr2R 10823314 5' + P-element 23 1 56.44 TTGAACGCATTTTTCTTTCATATTTATATTTTCTTTTTGAGGTGCGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:2 + chr3L 10565275 5' + pogo 30 1 58.42 TGCTTTGCGGTCTCTCCCGCCGGCACGCTGCCACCAATTTTTTCCCTTCGGCAGTGCATTTTCATTGTTCTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2L 19629714 5' + hobo 6 1 74.26 CTTTCTAGCTTCTTCTATGGCTATGTGATAACCCAAATACCCTTTGGCCTGATGATCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chrX 4784501 5' + hobo 19 1 60.40 TTTATTTATTATATTTTTTAAGTCATTTGACTTAAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACCTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCA:3 + chr3L 15436572 5' + 1360 487 1 67.33 CATACCCGCTCTCGTGGCTTGCATTCCATCAGCTTCTTACCACTTTATGTGTGAATATGGGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGG:1 + chr2L 1545336 5' - accord 163 2 64.58 AAAAGACACTGCCTTGTCAACAAATTGTTATTCAAGAGCCGTCAGTGATCCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCA:3 + chr2R 2645455 5' + HMS-Beagle2 6904 2 58.42 AGTTCTCAAATCTCCGGACTCCCCGAGTCCGATTCCGCTTCCTACCCAAATTGGATCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACA:1 - chr2L 20527416 5' + I-element 4947 1 61.00 CTGTTTGCCATTCTCACAGGCTTGTCTGTTGTTGTGAGTAAGAACAAAAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCC:1 + chrX 6136069 5' - 1360 3194 1 69.31 TGAACATAATATTATGTTTCTTAACATTGCTTCACAGAATAACGAACTTTGTCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAA:1 - chrX 10486749 5' + G6 1788 1 54.46 ATGAGCCTTTTAACCTGTTTTTCGATTTAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATG:1 + chr3R 6425849 5' + copia 4916 2 72.28 ATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATAT:1 - chr2R 2875204 5' - TLD2_LTR 115 1 67.33 ATCGGGTAGCTCGGCGCTAGCCGAGTCCGTATCCGAAGTAGCCTCGTTGTCCTCTCGTGGCCGCTTGGCTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 20330465 5' - P-element 2882 2 70.30 ATCACAAGCTGCTCGACTTATTGGCACAGCCCCAGGGCAGATCAGAGTAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAAT:1 + chr2R 6783162 5' - Tabor 456 2 53.47 TATTATCTGTTTGTTATTTTAGATATGCCGAACTGTACACCTTTCGTTGCAGAAGAAACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 - chrX 9048730 5' + Tirant 8125 2 61.39 TTCGAATTCGTCGTCGCGAGTTCATCGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGA:1 + chr2R 9558764 5' - opus 7065 4 75.25 GCTGCCACCAATTTTTTCCCTTCGGCAGTGCATTTTCATTGTTCTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr2L 19629688 5' + hobo 32 1 58.42 ATTTCGCACACTTTTTTTCTAAAGCAAGCTAAAAGTAACAGCTAAAGGTATTTACTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTT:1 + chr2R 2702001 5' + 17.6 7273 2 58.42 GACTATACGCGTACGTGTGCGGGTGTATATCTTTATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr3R 18887039 5' + 297 29 2 64.13 AAAGCCTAACTTTGATGACATATTTTATTATATATGATTATACCTGTTGCTCGTAGAGTAAAAGCAAGAATAAGACACTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAAG:1 + chr2R 5249847 5' - Tc3 236 1 64.36 AATGATTTTTAAACATTTGCTAAGTGAACAGAGAAGATGGGGGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAA:1 + chr2L 7970950 5' - blood 7385 2 73.27 AGACATGCGTGTGCTGGGAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGTAATTTTTTTTATAATATCATTAGG:1 + chr3R 31887775 5' - HB 1542 1 53.54 TCGGAAAAAGTGCATTAATAAATTATGCACAGTTTTTGAAATAATGGCATAAAAGTGGGTGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 - chr2L 15751428 5' + 1360 15 1 62.38 CAACAAACAAACGATCAATGTTGAAAACTCTGAGAAAGCGGACGCGTGAATATGTCGCAACCGAGGAAGTGTACGACTCGCGGGCGGAGCGCGGCAACAGA:1 + chrX 6718489 5' + invader6 4836 2 80.20 CTATCAAACCAATCGCCTATAAATATATTTATAATAATTAAAGCTTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAAGTAG:1 + chr3L 22094264 5' + Stalker2 7282 2 56.44 GATGCCACAATGCCGATCCATCTCCCCCAGTCCCTGGCCTCCGATTTTTGTATTCTAGCTCCTTCCTTTTGTTGTTGTTGCAAGCACGCTCAATTTCTTAA:1 + chr3R 15720631 5' + gypsy12 10068 2 61.39 TCGGCAAGGAGACAGTAGTTAACAATGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:2 + chr3R 23485677 5' - roo 358 2 72.28 CAACGAACTCAAGCTTAATGAAATTATCATTTTCATTTCATTCCAGCTTTGTTGTCTTGAGGCCAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGAT:1 + chr2L 4155633 5' - I-element 184 1 69.31 AACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGAA:1 + chr3R 11162683 5' - Copia1_DM 131 1 71.29 GATGTCGTCCTGGACACCGCCTTCTCGGCCGGCAAGTTTACCTCATCCGATCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTT:1 + chr2L 20115908 5' - X-element 4283 1 53.47 ATGTGTGTGAGCGAGCGAGCGAGTGATTGGTTGATTGATTGATTGAGAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAT:1 - chr3R 22667875 5' - I-element 4901 1 53.47 TGGCACAGTGGAGTGGCCATCCCGGATTGATAGAGTCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3L 11367555 5' + roo 39 2 66.67 TAAATCTTGAGTGGTTTCCTCGTCCTAGAATCTCAACTGTGCGTGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCTTTGGTGGGAATAACGGATTCGG:1 + chr3L 14474491 5' - Quasimodo 6926 2 56.44 GAATTAACATAAGCGATAAAGAGCCCATCGTTGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGG:1 + chr2L 10068275 5' - Quasimodo 292 2 68.04 CAAATAAGCTTTTAAGTTCTCGATTCAGCAGTAGTTCAGGCGGTCAATGGTTGGTTGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTT:1 + chr2R 3523791 5' - accord 7030 2 60.40 CACTGTAAGCCGATGTTGTGGTTTCTCCCCTTGGCTGGCTGCATTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAAT:1 - chr3R 9605171 5' + roo 8593 1 57.43 GCATGAGTAATACAAAATGATTTTCCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 - chr2R 23908409 5' + Transpac 4964 2 74.26 AGTTATTCATTTTTGGCTTTTGATTATTATTTTTTTTTTACCGATCTTCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTC:1 - chr3R 6354374 5' + accord 211 2 53.47 TATTTATCTTTTAATTGCGTTTTCTAATTGTTGTTCTTTTAAATTTGCTGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chr3R 31188732 5' + I-element 27 1 53.47 AAAGAAAAGAATATGCAGAGTCGGAAAACCACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCA:1 - chr3R 2472899 5' + accord 7153 2 73.27 TGGCAGCGAGTTGTTGCTGCCGGCGACGATCTTCGTTTTGTCGGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chrX 10585467 5' - P-element 2856 1 46.46 GGTTAAAAAGAAAGGACAAGAGCAACTTAATTGATAAGCATTTAAGGCAACGACTACGTATAATTAATTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAAT:1 + chr3L 19927492 5' + jockey 480 1 68.00 TTCCACGGCTGGTGATTGATGGGCGCCGCAAAAAACCAAAAAGAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 - chr3L 10565354 5' - pogo 2074 1 56.44 TATATTTACCAAAACGGAATTATCCAAGGGATGCATATTAAGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCC:1 + chr4 956536 5' - 1360 3350 1 60.40 GAACTGTTTAGTTGTCGATGCTCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr3R 19734565 5' + hobo 23 1 52.04 AAGGGATGCGCTCACATTCGCATGGCTATTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:2 + chr2R 17345920 5' - hobo 2930 1 70.30 AACTTTGTACATCATTGTAACTCAGAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAG:1 - chr3L 15452924 5' - accord 7340 2 65.35 ATTTTGCGCCACAATGACAATGGCAACTCCCAGCGACTATATTCCACACTCCAATCTAGGATGCCACGCCCCTGCATCCAGATTTTTGGGGAGTTTTAAGT:1 - chrX 17052438 5' - gypsy8 8 2 69.31 TAATAGCTGCTGCTGTATGTAATTAGAGAACTCCTGGTGCTTTGGAACAAGGGTCCCCCCATTGCAATCCTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr3R 12215238 5' + hobo 4 1 75.25 TGCCCCCTCTCAAGTAGGAAAATGTAGAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCAAGGCAAAAACTATTAGT:1 + chrX 19017263 5' - hopper 405 1 71.29 TTACTGGATTTGCGAATTTAGGAATAAACGTATCAAATAACATTTTTCTTGTTTGAATTAAACGGCAACAAGTTAATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAA:1 - chrX 1523573 5' + jockey 4670 1 77.23 ACTGTCCCATCTTTGGCTTAATTAGCAATGACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 16449786 5' - roo 9027 1 71.29 TTCGATTTTACTGCCGGCCAAGGGTTTCACTCCTTTCTGCTGATCAATAAAACGGAAGCTAAATCAATTAGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr3R 25514083 5' + hopper 3 2 76.24 TTTAAGCCAGCTTTATATTGCATTGCCTAAACCCAAACAGTACAATATACCATGTGTTATACCATTTGATTCCCGAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chrX 13819032 5' + Doc2-element 218 2 79.17 CACGACTGTCTCCACACTGAATGGGATAGAAATTAAGCATAATATAACTTAATGGCCTCAGTTCCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 - chr3R 28678262 5' + I-element 22 1 55.45 TCACATTTACGGTAACTGTCATACCAGTTGTTTACTGTACTACGCTCCGAAACAGATGTTTTTACTGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr2R 10823412 5' + P-element 9 2 70.30 GTCGTCAGGCGGCTGCAAAACAGCAATCAAAATCAGGGATGCTCCTCAGACCTGCCCAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGA:1 + chrX 3055432 5' + F-element 471 1 61.39 CGGCTTTGATTAAACCTCATTTGTAAGCTACATATAAAACTTATAGCGACTGCCAACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAA:1 + chrX 16177996 5' + Idefix 134 2 62.38 TTGAAATTGTTGGAAATCCATTTCCTTAAGTTGAACTTAGTTCCAACTTTCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAA:1 - 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17.6 176 2 61.39 AATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr3R 14049330 5' + transib2 15 1 64.36 CAAAGTTTGTGCACCACTGCGAGAAACTAAGGATTATATATAAGAAAAAAAATGTTTTAATTAATTAAATGACTACATATATTACGTCATTTCTCTAAAAA:1 - chr2R 18687027 5' + Stalker2 7221 1 63.37 ACTAGATTCATTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACAGCATAAAGGATACATATTCTTGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGT:1 - chr2L 22211545 5' + INE-1 113 1 79.38 TTATGTTTTATATGTATTTTTACCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAA:1 - chr2R 23265774 5' + Juan 38 1 57.43 AATGTTAATTTCGTCAAAAATATCAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr2R 12437175 5' + pogo 50 1 78.22 TATAGGAAATCATCTCCAATTCTGAAATCATTAAGCCTTTCCATAACAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTAAATTAAAGTAAAGTAAAGTAACGTAAAG:1 + chr3R 6396491 5' + TART-A 13154 1 53.47 AGCGAAGTACGCGCAACCTGTAAGTGCACCCAATTGGCTGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 + chr3L 24701105 5' + P-element 37 1 41.58 TTCTAGTCGAATTTTCTTACAATTACCCACAACAGACCATTTCTACGTTGCTTTACAGGAAAGAGAATGACAAAACTAGTGCATTCGATATAGCTCTTTGT:1 + chr2R 473537 5' + diver2 4783 2 71.29 CAGCTGTTTATATTGCAAAATGTCAAGGACTCGCCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 - 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Bari2 850 1 67.33 AAAGCAAAAAGAGGCTAAAAAGCACAACGCGATAACAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAAGATCCGCAACCCAGCAACATGGAACAAGTGTTTGCTCG:1 - chr2R 11203497 5' + G2 158 1 65.35 TATTGATCAGGAAAAAACGATGTCTTAAGATTTAGACCAGACATTTTTAATTCACGATATACTGTTCGGCACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGT:1 + chr3L 25608294 5' + Doc 7 1 64.36 TTTTTTTTGCCTCTCGTTTTTCGAGCTGCTGCTGCTCTTATGCAATTTTTTCATAGCATACCTTTAGGCTGACCCTCTCAACAATCATTGCCTTATTAATT:1 - chrX 13879488 5' - 1360 442 1 78.22 TATCATTGATTATTTAGAAATAATTATTATAGCCGCAAAAGCATTCATTCTACAACAAATCAAAGCAGGAAAACACAAAATCAAAACTTTCAAGCGAGCTG:1 + chr2R 976525 5' - Cr1a 374 1 63.37 GCACGCAGCGAAATGATAAACAACAGGGGAAAAGTGCATGCTGCAAACTGCGAACTCCAAACTACGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:2 - chr2L 4057218 5' + hobo 11 1 64.36 ATCATTGCTGATAAGTACTACAAATGATAATTGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATA:1 - chr2L 5148088 5' - Burdock 290 1 68.32 AGATTTTGAAGTTAAATCAAGACGGGATCATTAACTATTTTGGCTTTAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chrX 7741696 5' + roo 8692 2 55.45 TAGATGGGCGCCCAGGCCCGACTTTATCTTGTAGTATCTGAAAGTAGGTAAGAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCA:1 + chr3R 24562906 5' + Doc 4489 1 51.49 TTTTTGAAATCTAGAAAACTACAAAACAATCTCCTAAATCTGGATCACGTTTTGCACGCTTATCTTAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chrX 14521621 5' - roo 405 1 69.00 CTGAATTCCTTGAAAGATCACATCCAAAAGCGTTTGTTTTGTTAGCTCGAGCCTATCAGTATTCTATTTTGGCAAAGTTTTTTTTTTTGTTTTTCTATTGA:1 + chr3L 15538781 5' - Doc2-element 216 1 73.27 AAAATTGGCGAGTCAAGAGTTCAAACTTCAAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 + chr2L 18979405 5' + Doc 47 1 67.33 CACTTTTAAGTAAAAACTAAGATGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAA:2 - chr2R 2092801 5' + Doc3-element 74 1 51.49 TTTTTATTTAAAACTTTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTG:1 + chrX 22426169 5' - 1731 4598 1 52.48 ACCCAAGCCCGAGGAGATGCCATTCGGCCTGCTGGCCATCTTCTGTGCCGTCATACCGGGACTCTTCGTGGGCGCCACGCCAGTAGGTATCACAAGGGGAT:1 - chr2R 18147724 5' + baggins 11 1 77.23 ATTGCGCAATCTCTTCTTTTTATCCCCTGAGCAAAGGACACGGTCTGCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - chr2R 5201001 5' - 1360 3358 1 56.44 AGTTTTTGTCTGATTATGACAACAGATGGGGAAAAATAAGCGTAAAAAATTGAAGAGCTTCGTGGTACAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGG:1 - chr3L 8012131 5' - 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roo 9038 1 60.40 GTAAAATTTTCATATTAACTATTGTGAGGAAAACAATTTACAATGGGTAAAATAAATGTATTATTTCGCTTAAGAATGTAAATAAAAAAAGGAAAACATGA:1 + chr2R 5525015 5' - HB 156 1 69.31 CATAGACACAAATTATCTTAACGTTCTTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:2 - chr2R 8474968 5' - Transpac 264 2 77.23 GTTTTATAAATATGCTAGATATAAGAGGTAATACCTTATCTGGACCTCTGACTAATCTCATCTTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAA:1 + chr3L 26015065 5' - 1360 3329 1 62.38 TGTTAATTACTTTCTTAGAAGATGCATGTTGTTTTTATTTAATGAAATCAATCCCAATGAGATTCCCAATAACTAAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr2L 15134442 5' + 1360 15 1 64.36 AAATCTTTAGCGCAAACATTCAGATAAGGCTAAACAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACGCAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chr2R 7881965 5' - 412 7508 2 61.62 AAATCGGAGATTACAAAGCAACAAAATTGTTACAATACATTTTCATAATATTGGCATATATTTTTTAATCCCATATTCTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTC:1 + chr2L 9299603 5' - 1731 4626 2 43.56 ATGTAAGCTCCCATCCGACCGCCTACCTCCTCATCCCTCCATCCCCGAGTGCCATTGTCGTCCACATCAATCACACGTACCAAAGACACTAGAATAACAA:1 - chr3L 21852593 5' - Tc3 312 1 81.00 CGGAAGTCTCCACCTTCCCGCCCCCCCACCTTCTCCTATCTTCACTCTAGGAAACTACGCACGTTGAAAGGAAAAGCAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGA:1 + chr2L 12382744 5' - 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chr3L 5484846 5' - hopper 1414 2 61.39 ATTAAGTATATTTTCCGGCACAAAAACATTGCAATGACTGAAACTCTTGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr3L 3986380 5' + jockey 37 1 52.00 GTGGGATTGCGGTTAGCTACATGCGTGGCAAAGCAGTTGCAACAGCAGGAGCAGCAGAAGAGTTTAGAGTGGGGGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCG:1 + chr3L 4672693 5' - Porto1 485 1 52.48 TCAGGCTTTTCGGTTAGAAGTTGGAAGTTTACCGCGGTAAAAGTTCTTTGGAAAAGACAGGATGTGTGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 + chrX 10436500 5' + hobo 7 1 70.30 GCTGTAGCCGGCGATAAGCCGCAATTAAGCCTTTATGTCCGGCCGATTAACTACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAA:1 - chr3R 29512990 5' + mdg1 466 1 55.00 CCAGCCGAATTTATCGCGCCAGATTAAACAAACAGAAACAAAAAACAGAAGCCGCGACCAGTCCGCACACATCAATACTAATGCACATCGCATTTTTCT:1 + chr3R 24051891 5' - invader1 3791 2 65.66 TATTTAGGTAATTTATAGCTCTCACCGGAAAAATGTCTTACCAAACAAAATTAAAAAGCTTTAAAATTATAATATTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTAT:1 + chr2L 7876628 5' + 1360 3084 1 59.41 AACCTCACACGTTGTCATACACACACAGACACACCCTAGGTAGCTGTAAAAGTTGCGTGTCCATGGGGCGTGGCCCGCCCCCAAAGATCATCGTTATTATT:1 - chr3L 18493882 5' - Tc1 1214 1 76.24 TACAGCGCTTCGTGTCACGCAAATATATCATAATTAATATAAGTACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATA:1 - chrX 12399851 5' + Stalker 6985 4 68.32 TCCCATTCCATCTCTTTAATTGAATCAAATTAACCCCGCACACAACCTCCACCTCCAAAAGGGGGAGTGAATGGCTCGATTTGGTCGTTGTCTATTTGTTT:1 + chr3L 16475029 5' - Doc3-element 185 1 79.21 GCTGGAGCTGAACCCATTAGGTGTTTTTGTATTCATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr2L 7504930 5' - roo 9030 1 70.30 GTAATAGATCGTATGTAGAGTCGTGAGACGTCGATAGTTATTAATGTGTATTAAAGGGCTGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr3L 27262050 5' - P-element 2870 1 60.40 CGCTGTAACTGCCCACGACGAATGTGAAAGTGAAATTAGCATCGACACATAGAATGTTAATCCGCTGTTATGACAGCTGTAGCACCGGGTGACTCCGCTCA:1 - chr3R 25883101 5' - diver 5900 2 67.33 GGGGGTGTATTTTCTACTAATGTTTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATTATTATGTATGTCTTCG:1 - chrX 13705435 5' - Porto1 4385 1 77.23 TTGATTTATATTAAGGCAGTTAACTCCCATGAAATTATTATAGATATATGTAAATAGTCTGTAACTAGTTTTTTTTTTTAGTAGAGGCAAACAATAAACAA:1 + chr3L 11829206 5' + hopper2 1301 1 66.34 GACGACGAAAAAAATGATTTATGTTCAATTGTATTAGAAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCTCAATA:1 - chr2R 2897337 5' - TLD2_LTR 6 1 78.35 GTTCTGGACGGGGTGATCTAGTCGGGGTACACTGGTATGTGAGCAACTGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTTTTCCCATTGGGAGACCAAATAAACTCC:1 + chr2L 5727534 5' + G5A 2577 1 69.31 AAAGTTGCGGTCAGAATATTGGGACTAAATCACTGAATGATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGC:1 + chr2L 19162760 5' - roo 79 2 61.39 ATTTCTTTGCATTTTCTTGGTCGTTTTCCATAAAAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAGAT:1 - chr3R 6958973 5' + Porto1 4287 1 67.00 ACCACAGTTATGATGGACATATATTAGTAATTGATTCCTAAGTAACATATTTGTTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAT:1 + chr3L 10045222 5' + Stalker2 7269 2 49.50 TCACCAACAGCTACAACAAATTGGGCTGGCAAACAAGTGTGCCTGTGTGCGTTTGTGTTCCGCTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr3R 18449019 5' - hobo 2923 1 61.39 TCCACCCAATTTTTTCCAAACAACAATCAAAAATCGATAAAAAAATTCAACAAATGGATTATATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTTAAGATATAATC:1 + chr3L 16064793 5' + Tc1 1365 1 45.54 ACCAAAACTGCATTATGGCCAGTTTGAAAAAATTATTATTTAATATTTAATTACAATCTATGAGTACTCTCTTCAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAAC:1 + chr2L 17683443 5' - F-element 4617 1 78.22 TATTGTTGCCAGCCATTTATAAACTACACAGTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:1 + chr3R 20396548 5' + I-element 47 1 67.33 GTGCCCATGCCAGGTCCTGGAGAAACCCTTCAGCTTCCCGGCGTACCGGCCGCCATTACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGG:1 + chr2L 2949070 5' - jockey 426 1 63.37 AGCGGAGCTCACAGAGAAAGCTGTGCCCCAGAGCATTCAACTGAAGAGGGAACTCGACCTGGACAAACCTCTCTACCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAG:1 + chr3R 10251894 5' + Doc 406 1 70.30 TGAAGAAAACTACAGATTTACAGGCAAAACGGATAGTAGTTGAAAAATTGAAAACAAGAAATGGAAAAAAAAAGTGGGGAAAACATATGGAAAAAACAAAG:1 + chrX 20912717 5' + Penelope 540 1 82.18 AGTTGACCAATTTAAAGTTTATTGAATTGTACTCGTTAAGGAGTGTGGGCGAACCGAAATGTTCGCATTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACG:1 + chr2L 20131320 5' + micropia 5029 2 70.30 CCTTATGTGCAGGGAAAAGTTATTTTCGTATTAAACAATTGAATAAGAATAAGAAAGAATACTACAGTCGAGTTTACCGACTATCAGATACCCGTTACTTT:1 + chrX 19330567 5' - INE-1 548 1 71.29 GAGTTGAATTTATGAAGTTGTTTGCCATAGGTGTACAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATT:1 + chr3R 756899 5' + gypsy6 43 2 69.31 GAAAATGGAAAAGAGAGGGTTTTCCGCGAAAAGAAAAACTATACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATA:2 + chrX 7823181 5' + Transpac 31 2 61.39 CGAGTCGCCGGACCGTGTGACCAAAATGACAACAATTACTTTGCCCTTCGGAAAGGGCAAATCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 - chr3R 9124237 5' + F-element 34 1 45.54 TAGCTAAGACATCTAACGACGAGGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTG:1 + chr2R 544772 5' - I-element 409 1 77.23 TATATGTATATGTAAAATGCGCTTTTAACAAAGATTAAATGCAATTCAGTTTTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCAT:1 - chr2R 3906289 5' - 1360 497 1 58.42 TAACAACAGCACCGCAACTGGGGGCCAACAGCGATAAGGTATGCAAGCGCAAATACGCCATTCCCATCATAACGACCATCTCCCTACTGGACAATACTGAA:1 - chr3R 23815711 5' + G7 1007 1 69.31 GGCAGCTGCTTTGTTAAGACTCTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chrX 17283991 5' - roo 9018 2 77.23 ATGAAAAATGCCAGTTCTTTTTTTCGATTCCTACAAAACATGCGAAGAGGAAAAAAAATGTACAAATCGCCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2R 14744312 5' - roo 404 1 73.27 CACTAAGCGCACAAACACACTCGCAACAAACATACAAGTATAGAGCACCCCACTTGAGAACACTTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGT:1 + chr3R 22482755 5' + Transpac 5067 2 74.26 GCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGT:1 + chr3L 17215739 5' + Ivk 51 1 71.29 CGGACTGGTAAATTTAACAGAATTGCCAATTCATTTGCATAAGTTACGGACTGACATTACATTTCAATACCAGAGAACTGCAGACCGCCACTCGCACTCT:1 - chr3R 14906915 5' - hobo 2930 1 69.00 GCTTCGAGAGCTGTAAACACAGTCAAGTGTGTGTGTGTGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr3R 22276851 5' - hobo 2901 1 71.29 CGTGCTATTCGGCACCTGGGACGGAGTGTTCACCTCCTGCCTAATCAACGTGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGG:1 - chrX 1353147 5' - Quasimodo 265 2 55.56 GCAAATAATTCAGCAAACATCAAGGAGAGCGCAGAGCGGGAGAAAGGACACTAAAAAAAGGGCGCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chr2L 11804995 5' - P-element 2875 1 63.37 AACAATACTTTTCTAGGAAATTTTTTGAAAATTTAAGTACCTTAACATTTCCTATAGCTTAAAACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr3L 18140746 5' + blood 7055 2 66.34 CCAAAAAAGAAAAAAAAATGAATATAAACAAATGAATATAAACAATAATAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAAT:1 - chr3R 27187363 5' + invader2 372 1 53.47 TAATAAAGGCCCATTGAAAAGCTGAAATTCAGTGAATAACTATAAACAAAAGAAAAACAAAAACAATAATTACACAAACACACACACACACACATACGCAC:1 - chr3R 24063810 5' + accord 7033 2 79.21 ATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAAC:1 - chrX 8027466 5' + Juan 39 1 61.39 AAGTTTGAAAGTCCGGAAATTCGTAGAGAATGCAAGTCAAGAAAACATCAAGTACTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTT:1 + chr3R 30410029 5' - jockey 4910 1 52.48 CATTTAATCAATTCTCTGTCTGTTTTTTTTTTGCAATAAAACTCCAATTAAAAGTACGCTGTGATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3L 5492390 5' + pogo 11 1 68.32 CACGATAAAATGCTATTTTAGATCCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:2 + chr3L 18034191 5' + Doc 57 1 73.27 CTTGTACCATTATTTGTGTGTCACGTCGTTGGGTCAAACAAAATAAATAATCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACA:1 - chr3L 11826681 5' - INE-1 124 1 58.42 AGCAGACTCAAGTGTCCCGCATAAATTCGAAAAAAAAATTTATCATATATTCTGGTCCTGCAAAGTGATACCCAATCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGAT:1 + chr2R 13623749 5' - Stalker 6867 4 73.27 TGACGAAGAATTGCTCGATTGATAAGGTAAAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACT:1 + chr2R 3293734 5' - 1731 4604 2 55.45 GTCATTGGAAAACTGAAATTTAAAAGATAATTTAAACATTAATATGAGTTTCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr2L 17887137 5' - hobo 2915 1 55.00 CGGTTTCGTTTTTGTTACTCTTTTTTTTTAATGCTTGCTCACTTTCGCTGGTGGAGTTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAA:1 - chrX 5254736 5' - TAHRE 10413 1 54.46 CATGTTGGCCACCTGTCAATGCATCGAGTGAAAATTGCTGGCCATGTCCGAGGACCTTATATGGCTGGCCGGCATAACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr3L 14284963 5' - roo 410 1 78.22 GGCAGTGGCCACATATTTTTGGGCGTTCGCTTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCC:1 + chr2R 11632147 5' + Cr1a 4059 1 69.31 AAGCGTATGTAAACAGATGTAAACGTACTATATGTGAAAAGAACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATC:1 - chr2L 22315494 5' + Bica 134 1 64.36 TGCGTATAATTAAACGCACGCATGCCTTCTTTTCATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr3L 10035727 5' + jockey 74 1 66.34 TAAGATGGCTCTTTAAGGCTGGTCGTATTATGGACAATCACTTTGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACAAAAATAATAATCTTCTGCTCCCCGG:1 + chrX 22664695 5' + Gypsy6A_LTR 303 1 55.56 CCATTGGGTGTCGCAAAACCCGATTCAGCTTTGCTTGTGTGAGTAAAAACTAGAAAACGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGA:1 + chr3L 25926722 5' - 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chr3L 1047074 5' - hobo 2911 1 58.51 TTATTGAGATACATTGTTGTACAGCTATCGATAAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 + chr2R 8474918 5' + Transpac 4957 2 65.35 TGTGTATTTTTATTGTTTTTGTTGTGAGTACAGGGTACACCGCGTTTTGCTTTGTTGGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGA:1 + chr3R 9485852 5' + F-element 4528 1 64.36 AGCCGCAAAGAAATGGCCAATAAAAGTGATCAACTCTTTCTTTCTGTTATCGAAGAGTTTTCACGAATTTATTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTAT:1 + chr2R 13773975 5' - 297 484 1 49.50 AAATATTGGTATTTCAAAGGTAATGTTAAGAGTAGTCGAGCTGAACGGCCATACCAAAAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3L 19933730 5' - roo 393 1 63.37 CCACCAATTTTTTCCCTTCGGCAGTGCATTTTCATTGTTCTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 - chr2L 19629684 5' + hobo 36 1 62.38 CAGACCAGTTGCTAGTCAGCGGTCCACAAAAACTTAATGAAAAGCCCTCGACAAAAGTTTCGAGGAGCGTTGCGCATGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTC:1 - chr3L 7743253 5' - Doc 241 1 77.00 GTTGCGTGTGTGAGTTGCTGTGTTTAAACAGTTGGCGTCAAAATTATAATAGTCAGGACGTGAATTTTTAATAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGA:1 - 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micropia 4984 2 76.24 GTACTTAATTGATGTAATTGAACCTTTATGAATGTAAACTATGGGATAACTTTTTCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2R 21560432 5' + pogo 18 1 61.39 CCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTG:2 + chr3R 14049322 5' + transib2 7 1 72.28 ATCAGAGGCTTCGGGAAACTGATGGGAAGAAAGCGAAAAGGGGCGTCTGACACGACGGTGAAGTATTTTTTTTTTTAGTTTTACGTTATTATTCCACACAC:1 - chrX 21189173 5' - Doc3-element 157 1 50.50 TTCTCTTTGGGGCCGTAAAAAAAAGGGCGCAAATTTTATGAGCGCATCGTTTAACAAATGAATTTACAACCGTGCTCATTTTGACTGGCCTTCTTTCGGGG:1 - chr3R 13938247 5' + baggins 5127 1 74.26 TGTCTCCACACTGAATGGGATAGAAATTAAGCATAATATAACTTAATGGCCTCAGTTCCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 - chr3R 28678256 5' + I-element 28 1 50.50 CATCAGTTTTCTCCTTGTGTAGTGTTGTATGTCCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr2L 1590423 5' - mdg1 7416 2 73.27 ATACTCAAATAAGATAATTTTTTTAAGTTCTTGTAATTATATATTATAGTGTATACATTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCG:1 + chr3L 26719149 5' + Tc1-2 25 1 62.38 TTTACCCATGATTGATCAGTATTTATTTACCGGTCGATTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3L 3776531 5' - roo 9033 1 64.36 CAGTGCCGTTGGTGGGCTAAGAACGTCTCCTTCCGCCAACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - chr2L 7971077 5' + blood 2 2 71.29 CAGAACGGCGAGGATGACGAGTGTGTTGCCAACCACGGTGACCAGGATGATGACCAGGAAGACGGCCACTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAG:1 - chr3R 17740213 5' - Doc 496 1 72.28 TGCCACCGGGAGCACATGTCAATAGCAATTACCGACAGTGAGTTCAAGTGGAGTTCTGAAAGAATGCCGGACCGCTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAA:1 - chr2R 14714850 5' + 17.6 78 2 79.21 CTTGTCTATACGCACAAAATGTGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 - chrX 6146728 5' - hobo 2910 1 54.46 CCTACTCTGTGCAACACGGTCTGGAGAAGAGAATGACGAGATTGCGTTTGATACTTCAGGTGGCCAGTCTTTTTTTTTTACACATACACACACACACACAT:1 + chr2R 21305695 5' + Quasimodo 33 2 62.38 TGTGATTAGCAAAAACACAAAGCAGTTATTAATTCCAGGGAAATTTCAAATCTAACTTATTCGATTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 7134647 5' - roo 400 1 66.34 AAAACCAACGAGCCGCTCCAAAATAGGCTGCATGGAAACGCGCGAAAATAAAATAGCTGGCGGTGGGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 + chr2L 12908336 5' - hobo 2929 1 69.31 TTTTTTTGCAAATTGCATTATTCGGCATGGCTTGTTTTCAAAATGTTCGTCGTTCGTTCTTGTGTAAAGCGAAGAATATTGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 + chrX 3109915 5' - blood 360 2 51.49 TTGGCCAGTGTTTTTATTGAGGAGATTATGCTCAGATTGAACATGAGACCAATTCTCTGTTTTTGTGGCCTGGGCGATCTTTGCAACGAAACAACGCGTAC:1 - chr3L 14506785 5' + Doc2-element 341 1 77.23 AAATAAATGGAGTTGGGGCCGTAAAAAGCCGAATTCTGATTTGATTTGTTTGGCGGCGCACGCCCAGCACTTAGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr3R 20869638 5' + hobo 4 1 75.25 CCAAGCTTCAGTTTCCCCACTCCTTTCACGTCTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGA:1 + chr2L 7417172 5' - I-element 311 1 68.32 AATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3R 19450188 5' + roo 8721 2 53.47 CCATGTAGACGCCTTGGGCGTGCGTTTGTCTAATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCT:1 + chr3R 13543168 5' - Quasimodo 7071 2 68.32 ATGATGCATTCGGGAATTCATCTAATGCCCGGGATGACCGAGCATAAACAAATTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGG:1 - chr3R 15653965 5' - P-element 390 1 53.47 TTATTGATGTCCATACCGATTTCTTGTTGAATTCAAAACTCATTTTTATTTTATTGGGTGAGGTTCGGGCACAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 + chr2L 1195016 5' + hobo 5 1 64.36 GCAGGTTAAGTGCAAATCCTTGTAAGGATATGCCATCGATAGTCCCGTGCACGTACATATATATATACACATATATGTATATAAGTTAATAATTACAGTTA:1 - chrX 8995384 5' - HMS-Beagle2 7198 1 79.21 GGCGTCTTGTCTGATCTGCGACGGCGTTTAGTAATCCCAAAGAAAAAACGGGCGGGGGCAGCAAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACTGTT:1 + chrX 14814106 5' + HMS-Beagle2 492 1 70.53 TGATTTGCTAGTTTTAGTTCCCTCAGCAGACTAACAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGA:1 - chr3L 15635012 5' - Max-element 8346 2 65.35 CTTAAACAAGTGAATGCAAGACTCGACCTCACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chrX 21945938 5' + F-element 33 1 52.48 CTAGTGATTTGCAGTAACATTTCACACGACCACAGAAATCTTCGCCTCTCGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGTAACTCGACTATAGCATTCTCTC:1 + chrX 7366528 5' + INE-1 575 1 55.45 TGCAAAAAATAAAAAAACAACAAAGCCTAGGGCGCGTGCAGTCGTGAAAATGACCAAAACGTGTCTGTCTTTATCGTTTGCCCACCCTTTAAAAAACAG:1 - chr2L 9237385 5' + FB 387 1 78.79 CCTAATGGAAATTTTCAGCCAAGGAAAACGGAGCATAAAACACTGTTCGAAGTTGATCACCAATTGGTCGCAAAAGTTCCTGTTGGAATATACTATTCAAC:1 - chr3R 6190338 5' + copia 4869 1 79.21 CTCCATATTTTGTATCGTTTCTGAATTTCTATATATATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 - chr2L 17066867 5' - copia 5084 2 69.31 GTGGACAAATAATCTTGAGAACTATGTCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGAT:2 + chrX 22726188 5' - Helena 1280 1 52.48 GCATGCTAAGCGATTCGCCTGAGACAAAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:2 - chr2R 17346021 5' + hobo 20 1 57.43 CCATGCTAGAGCTCTGACCTTATCAGGGTTTGTCTTAGCTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 + chr4 715917 5' + jockey 4776 1 60.40 GCCCAACCGACTCTAGAACTCCGTAACTAAGCAATTTCGTTAACATTAAAGCGCTAATTCTTGAAATAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGG:1 + chr3L 24242312 5' + X-element 4406 1 74.26 CTTTATCTATCACTATTTCCATCTCTGTGAGAGGACTGTAACTATTGTATCTTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGA:1 - chr3L 16680752 5' + FB 25 1 52.48 CATCACTTGAGCACTGGCTTTGATTTAATGGCAGTGCCATAAGCTTCAATCTGCTCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCG:1 - chr3L 15452790 5' + accord 7043 2 60.82 CTCGGCAGCAGTCTGTAGAAGAACCTGTCTTAATAAATACGGTATTAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATG:1 + chr3R 19446575 5' + I-element 427 1 61.46 GCATTAGAGCGCGCAACTAAATGTATGCTACAGCTGAGAAACTAGGAAAATTGAAGTCTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAT:1 - chr3L 5267292 5' - Juan 4201 1 63.37 CTTTCTTATAGAGGCAACCGTCGCCTGTGCGTCGTCTATCGCTGATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTAT:1 - chr2L 7971164 5' - blood 7211 2 59.41 ACTGATCTGAACTGTTGACCGACGAATCGCTTTCCAAGTGTGTTTACTGTGCTCGCTGTACTATGTCGATGTTGCTTCTCGATGCGTTGCCCCATAGCTCG:1 + chr3L 10803485 5' - Doc3-element 4335 1 55.45 TCGATTTCCCCTTATCATATGTCACTGCCCAAATCGAGCGAGATAAAGCGAAAACCGACAAAGAAAGCACAGGGAGAGGAGCTGGAAGAGAAGCCAAGCAC:1 + chr2R 17640024 5' + G6 482 1 64.36 ATTTCATGCGGAACTGACGCTTGTGTGACGCTTCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAGGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 + chr3R 27435048 5' + jockey 4688 1 66.34 ATCAATTCAATTAGAATACTAAGGCAAAGCACTCTGCTTCTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAAC:1 - chr2L 18979222 5' + Doc 333 1 61.39 CATATTTTGTATCGTTTCTGAATTTCTATATATATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGA:1 - chr2L 17066864 5' - copia 5081 2 72.28 TATGAAATAGCACAAAAATATTATCCAGTCTGTGTATGGAAATATGGAAAAAAATAAAGGAATACATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAATTAATA:1 - chr3L 13281475 5' - Tc1-2 1612 1 61.39 CTTTAATATTATATATGTAGATAATAAAGTTGTAAGGAAATGAAAAGAAGAGAACATCAAGATTGGGTGTCTTTTTGCCGTTGAGAGCGCAATTCGCGTTG:1 - chr2R 17352744 5' - Doc3-element 227 1 73.27 ACTTAATTGATAAGCATTTAAGGCAACGACTACGTATAATTAATTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCAT:1 + chr3L 19927516 5' + F-element 4432 1 43.56 GTAGCACTAGCATTGGTGGCAGTGGAGGCATCTCCATGCTGATGGACATGAAGCGCATCTCGACGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGG:1 + chrX 10704352 5' + opus 7443 2 77.89 GAAATTGTTTTCGGTTATGTCAATTTATTTCAGGGCATAATGAATTTCGTGCCCTTGGCTAATTTATTTAATCCTTCGGTTTTGTTATATTTGTTTCCTGT:1 + chr2R 11145453 5' - G4 92 1 72.28 CTTTACTACACCATTGAGCCATTGGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAG:1 - chr3L 5150678 5' + X-element 4477 1 76.24 GATAGGCTCTTCGCAAATGGCTGGAAGGGGGGGTTGTGGGGACAGCTGCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTT:1 + chr2L 9131273 5' - F-element 353 1 52.48 AACGGACGAGGGGCGTAGAGCCCAGAAATTGACAGACCTCGTGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr2L 16396570 5' + 412 7088 2 58.42 TGAGCGCTGTCTATGTGTTGGTCGATCGGAGGGGGGCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chrX 10629261 5' - P-element 2849 1 41.58 CTACCATCGGCGATTGCATCAGTGACGACTTTTGGTAATAATACTTCGCACTCTTCACTTAAAGATTTTGGAACTGTGCTTGGCAACGACGGAAAGCACGA:1 + chrX 1537334 5' - Doc4-element 130 1 54.46 CTGCCTGCGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGGGTGTGTGCGTGTGCGGATCCCTTTTGTGTAAATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chrX 20356001 5' + hobo 12 1 64.36 CCAAAGTCGAGGAGCAGCGCTGCCGGCGTAGCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATC:1 - chr2R 2308852 5' + McClintock 4 2 62.38 AGTAGATCATATCCTTGACGCAATAATTACAGGACAATCAGGCTGGTTCTGGTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr2R 9311807 5' + hobo 25 1 54.46 AGTTTAACACTCAGAAGAGCTTAATTAATTAATTAGTTTGATGGGCTTTTGCAACTAGGATCTGTAATACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAA:1 - chrX 11967533 5' - R2-element 3336 1 66.34 TACACTCCAAGCACTTTATACACGGTGACCTGAAACCGGAGAACATAATGTTCGAGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGT:1 - chr3L 11082097 5' - jockey 124 1 61.39 GAGCTATCTTCCGATTCCCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3L 3776494 5' + roo 8721 2 81.19 CCTTCTGTTTTAAATGATAACAGCTGACAGCCCATAGTTTTCGCTCTCTGTGTAAATTAACTAAAGATTGGTCGCACCGTCTTGCGATACTGTCATCGTCA:1 - chr3R 18198271 5' - Gypsy6A_LTR 374 1 53.47 CCGGGTCACTCGTTTCTCGGAATCTCGCCTTTCTGTGGGAGGTCTCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr2L 7767190 5' - hobo 2909 1 55.45 GGAAAAAACTACACAGATTCTGAGATACAAAATTTTGGTTGGATTTCATTCAGTCTAATTAACTTTAACCTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATT:1 - chr2R 7162047 5' - Doc 54 1 74.26 TTAGCGGCAATTGAGAGACGGTGGACAAAGAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAA:1 + chr2L 23313683 5' - S-element 1675 1 70.10 TATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCAC:2 + chr3L 21912260 5' + Bari1 31 1 63.37 GTGAATTTAGAACATATTGAAACCCAGTTGGTTGGTTTTCGGTTTTATTTTATTTATCTTTTCTTTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 - chr3R 22580404 5' + Doc 16 1 64.36 TTTTCAAATTGTTTAGAAATGTGGGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGATGAAACGAATTTACATTTTACATATTAG:1 - chrX 13446911 5' - 1360 3148 1 80.20 AAACGTAAAAAGCAAAGGCGGATGAACCTGTGTCCATTTTGTATTGGGCACTAGGACTTTCTCTTTATCGTTTGACAGGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATG:1 + chr3R 9419574 5' - I-element 5087 1 57.43 GTGGTATCATTCGCGTGACATTTTCTCTTAATTTCCCAGAAACACCTGGCCAGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr2L 19629614 5' - hobo 2915 1 55.45 CAGGAATCGAAAAACCAGGAACGGGCCGGAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCCAAA:1 + chr3L 9297784 5' - 1360 3328 1 69.31 TAGAAGTTTTGGAGACAAAGGGTCATTGGAAAACTGAAATTTAAAAGATAATTTAAACATTAATATGAGTTTCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chr2L 17887116 5' - hobo 2935 1 73.27 TGACTGAGCTAATTCATATGCATATATAATATAACAGTAGGTGAAGTGAAGTAATCGACGATCGACACGTAGATAACGCAGAAAATAGCTTGAAACGGTAG:1 + chr2L 14208244 5' - McClintock 6080 2 58.42 GGGCCAGGATGAAAAATAGTGTGCTGTAAGGACAATACTGGCTGGGCATCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGCT:1 + chr3L 12868068 5' + Idefix 228 2 52.48 GCAGGCGAGCAGACAAAACAAAGACAGGCCCAAGTACAACAACTACTTACCTGCAACGTCTCCAGAGTCTTCCAGCAAATCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGC:1 - chr2L 9093191 5' + HeT-A 5730 1 67.33 CAGAAACCCAACGTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - chr3L 23871319 5' + Doc 36 1 53.47 GTACTTAATTGCACAGAAGAAAAATTAAGAGACAAATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chr2R 3032560 5' + opus 7151 4 67.33 CCCATTACCTTTTTTAGATGATTTGGTAAAAATAATTTTTTTTTTCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTG:1 + chrX 6897359 5' + Ivk 32 1 55.00 AGGGGGTCAGAGGTCGAAAGTGGTTGAGGGGTGTTCGAGAGTTGTGCATATAGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATT:1 - chr3R 16569391 5' - F-element 4403 1 55.45 CTGTATTGTTGCCAGCCATTTATAAACTACACAGTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 + chr3R 20396545 5' + I-element 44 1 64.36 GCTCCTCTCGAGAGCCTGATTGCGATGCATTTCATATTGATAGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCT:1 + chr2L 17124526 5' - invader2 272 1 58.42 CATGCCATAAATATTTTTGTACGACAACAAAACGCACAAGACTTAGCCCACAAAGGTATATATATTCTTGATCAGAATCAATAGCCGAGTCGATCCAGCCA:1 - 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chr3L 22418535 5' - hobo 2903 1 64.52 CATTCATAATAGGTTTTTTAATCACACTTTCCATGGCTAAAAGGGTCGTTGCGAGTTGTTGCCTTGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTC:1 - chr2R 20167339 5' - Quasimodo 304 2 75.25 ATTAATGGCCGTAATTATAATTTGCCACAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 + chrX 10210965 5' + I-element 52 1 71.29 ATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTA:1 + chr2R 19209475 5' + Doc 73 1 57.43 TAGGTTTATTTTAATCAGCGCATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCAT:1 + chr3R 14320202 5' - Stalker 7057 4 79.21 TGCCAAGTATCTGTTAAGTATGGTTAAACACGAATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAGA:1 - chr3L 813469 5' + roo 475 1 65.35 TGTCAAGGACTCGCCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chr3L 9174745 5' - 412 455 2 65.35 TAGATATCGCATCGTTCATGCTGTTAAACGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGT:1 - chr2R 3293793 5' + 1731 4362 2 73.27 CATGTAAATCATTGAATATTAATGTCTGAATTTATTAAATTCCACCAATCTACATACACATAATATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATAT:1 + chr2L 19990065 5' - Burdock 6384 2 62.38 ACTCATGCATGTGTCATTTTATATCCAGAAAAGTGTTGCACCACCAAAACGTTTTCATGCGGCTCCCTCTTTCTCTTCTCGTTTGCCTTTCTCCTTCTCTT:1 + chrX 721181 5' - invader5 206 2 55.45 TATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCG:1 - chr3R 1977618 5' - micropia 5408 2 56.00 ACTCAAATGGTTTAGCAGATATATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 19933666 5' + roo 53 2 78.22 TCTGCTTGACACCCGGCTGGAATTAGGGAACACGTTGTTTCGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTTGCTCGCGTTGTCGCTGAACG:1 - chr2R 488932 5' - Doc2-element 302 1 63.64 AATATTTCTGCGCCTACGCACAGATCTGGGGAGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAA:1 - chr2R 20058522 5' - Stalker 6927 4 73.27 AACTTAACTTGCATGCAAATTTCTCACAAATCCACGAAATCCGCAATATTTATCGCTTACATTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTT:1 - chrX 2389722 5' - invader2 4728 1 61.39 TTTGCTGGAGTGCCCAAGAAACATCTCAGAGCATCAGCCAAGGTCGTTCGTTGTAACCATGAGCAGTCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGG:1 + chr2R 14420981 5' - G2 2768 1 69.31 GGAATTTAAACATATAATTTAACCAACTGTCCACAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr3L 27391026 5' - 1360 3342 1 70.30 CAATGCTGCGTTTTTGACTGTCTGTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3L 10554825 5' + roo 8701 2 76.24 TTCTTATTTGGATTATTTTGAAAGTTACAGTGTTATTTCTTATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAG:1 + chrX 21006601 5' + 297 177 2 59.41 AACGTGTTTGAGCTTCGACCAGGAATGGAGTGTTGGAAGCCTTAAAATAATTTGGAAGAACAAAAATAAAGTTAAATCTGTTATCAAAAGTGTGGGCGTGA:1 + chr2R 16059679 5' - INE-1 252 1 71.29 ACGCCGCGTTCTGGTTGCTTTTTTGTTGTTCTTATCTTTAATTGTACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTACAGACAC:1 + chr2L 9884441 5' - invader2 4684 1 75.25 GACGAAGTCGAATTAACAAATGAATTCAATAAATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCG:2 + chr2R 9285545 5' + gypsy 45 2 68.32 TAACACTCCATTGGACCTCGCATCTAATCCTACCCCGCCGCCAACTTGGCCTCGGTTTAAATTTCCTCTTCGATGCAAGGGAGCCATCTTGGTCCGCTTCT:1 + chr3R 10490765 5' + Q-element 497 2 79.21 TACAGTGTGATGATTATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGT:1 - chr2L 19125683 5' + P-element 2848 1 18.81 GGAAAGGTGGGTGGGTGGTTCGATGAAGGGGGTTCGGGGGCTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAG:1 + chr3R 30629984 5' - FB 664 2 60.40 GGGTAAGAATCCATGAACATATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGT:1 - chr2R 17977410 5' - invader4 3036 2 78.22 TTAGCACTGTTATCCTTTGGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr2L 10023669 5' + roo 57 2 85.15 GCACAAGAAGCAAACAAATGCAAACTTTGCATAATGGCACACAAACGGATTTGAAAAGAAAATCAATTCAAAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAA:1 - chr3R 31243403 5' + copia 6 2 73.27 ACCAACAGCTACAACAAATTGGGCTGGCAAACAAGTGTGCCTGTGTGCGTTTGTGTTCCGCTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:2 - chr3R 18449017 5' - hobo 2921 1 59.41 CATGAAATGTTTTCTACGCTTCCACTACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGC:1 - chrX 11524854 5' + 1360 99 1 72.92 AAAAGCACAATCTTTCAAAGCTATTTAAAACAAATTTGTTCAGTGCGTTCGGTGTTCATTTCGTGCATTCATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTT:1 + chr2R 10577586 5' - Doc3-element 375 1 61.39 TTCTTTATCGGTTTATTAAGCTTCTTTGCTTAATGCCATTGAATTTTGCACTTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAG:1 + chrX 20454952 5' + Cr1a 224 1 54.46 TTTTTCGAATCTTTATAGATTGGTTCGTTCTTCATGATCAACCTGTGCCTGGTCGTCATCGCCACGCAATTCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTC:1 - chrX 6128616 5' + Doc 370 1 76.24 GGAAAAAAAAGGGCTGGAGGCCAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 - chr3L 5387841 5' - mdg1 368 2 77.23 CCGCTCTTATTTTAGCATGCCTTATGTTGTTTTTCTTTCGGCACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGGTTT:1 + chr3L 956482 5' + 1360 3269 1 58.00 CATACCGATTTCTTGTTGAATTCAAAACTCATTTTTATTTTATTGGGTGAGGTTCGGGCACAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 + chr2L 1195027 5' + hobo 16 1 50.50 AACAAGGGTCCCCCCATTGCAATCCTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:2 + chr3R 12215283 5' + hobo 49 1 72.28 ATCCTTATTTATTTAATATATATTTCATATTCATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATT:1 - chr3R 14696218 5' - mdg1 7066 10 64.06 TTTTAATTTTTTAATTTAATTTAATAATTTTCTTTTATTATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGTT:1 + chr2L 8541861 5' + Cr1a 114 1 67.33 TAGCTCCAAAACTCAATTGCCGAAAATTAAAATGCGTAATTTAAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGGTGTGTA:1 - chrX 7335146 5' - Tirant 8477 2 52.48 AAGGATTATACTATTTTCTTAATAAATTACCGTGGATCGCGGCGCATGGATACTGATCAGCCGAGAATTTGAGCTGCGTAAGTGGTTTTGGCCCTTTGGTG:1 - chr2L 2557199 5' - Quasimodo 214 2 69.31 GAACTATTTTCTGGCCATAAATCGATTTTGAAATATGTTACCAATATTTAATCGCTCTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 - chr2L 7745978 5' + I-element 20 1 55.45 TGTGGCAAGTGCAAAGAGTGCGTGTGAATGGATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTA:1 - chr2L 5564249 5' - Doc 161 1 69.00 GGTGTTTGGTTGTTTGGATGTTAGCTGGTGGCACACTTTTGGCTGAATGGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chr3R 23080902 5' - 412 465 2 53.47 GTCGATGCCTATCAGGTCTGTTAAAAATATCTTGCATTTAACAAGTTTAGCAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTA:1 + chr2L 23374508 5' - flea 4993 2 59.41 GCCATTGACAGCCAGTGTTGTAATGTACACAAACACACACTCGCACAAAAACACACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGG:1 - chr3L 6895480 5' + F-element 4211 1 57.43 GCTGATGAATAGAAAATTCGTAATTACTTACGTACGTATTACATAGAAATAAAATCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3R 25331686 5' - pogo 2083 1 61.39 GTGAAGCCGAAATCTTTTTTAATATCCCATCTATATAATATCAGAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGA:1 + chrX 18680768 5' + I-element 227 1 56.44 AGAGGCTGAATCTCACATGCATTATCATTCGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTT:1 - chr3R 19449332 5' - G2 2619 1 67.03 AGCAGATCGATGAAAATCCACATATAAAAGCGCAGCGATTGATACTGCAACTTATGAGTTACACTCGAACGGTCCACAGCAAAAATCTATCGACTACGAA:1 - chr2L 19913548 5' + G5 428 1 75.00 GACGACCAGCGGCGCATGCTAAGCGATTCGCCTGAGACAAAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr2R 17346034 5' + hobo 7 1 70.30 TCTTTTACCTGCATTTTCTGCATTTTGGCAATTGTTTTTTTTTTTATTTTTT:1 + chr3L 5409448 5' - gypsy7 5010 9 92.31 TACAAACATACTCCCGATTGGCCCGCAGGCCACCGGCAAAAAACTTCCTACCCTCTATCGGTACCATGTCTCCAAATCCAAAGTAGCTTAAACAGCCCCAG:1 - chr4 899263 5' - Bari2 784 1 52.48 CTTTGAAGTAAGCTGTTTCACATGGAAAATGCATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 - chr3R 20868784 5' + Transpac 39 2 64.36 GCGCGTACTCGTGCGGCGACGTGGAGGCCGGCGGCATCTGTGGCTGCGGGTGATTCGGTTAGGGAGATCGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGG:1 - chr2L 6822990 5' - G5 4628 1 57.43 AAAAAGTAATTTTTGTTAAATCAAAAATGATGTTATCCATATATTTTACCATATATTATACCTAATTTAACTACGATAGCCTACCTATTTCCTAAAATTAT:1 + chr2L 7298453 5' + Tc1-2 1538 1 72.28 TATGCTTCCATTGTTTTTATCAGTTCTTTGAAAGTGTGTTCTCACTCCCGAACTCCTTCCGTTAACGCTCCGACGCACTATCTTCTTCCACGCGCGATCTG:1 + chr2R 14009707 5' - gypsy8 392 1 63.37 TTAAGGCTTTAAATCAATGGCCGAAATGTTAAATATTGTACGTTGTTATGAATAATATTTACTTTTCACTTTTGTATTGATCTTGTGTTTTCGTGCATAGT:1 - chr2L 13483349 5' + Cr1a 394 1 76.24 TAATTATCGCTAGTACATGATATGGCATACTAAAGGGTGCCTTTTTCCAGAACTCAATGAAAACTATTGTAGGCATCGGAAAATATTTATTTATTTTTATA:1 + chrX 3709404 5' - mariner2 830 1 70.30 CATTGATCTCGTCCTTGTCCAGCATATTAAACTTGAGCGCCAGTTCCCTCTTGTCGTCCGCAATGATGGGATAGTCATGCCACGTGCCAGAAAGCGTTTCG:1 + chr2L 2877714 5' + invader5 3961 2 74.26 AATCATAAAGACCACAGTTATGATGGACATATATTAGTAATTGATTCCTAAGTAACATATTTGTTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACT:1 + chr3L 10045212 5' + Stalker2 7259 2 59.41 GCGAAAAAAATGTATTTGCTTTTTAAGTTAAGTTTAGAGCGCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTAC:1 - 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chr3L 10814959 5' - gypsy10 5658 2 61.39 ATGCCTCGTTGCTCCGCCATTCAGGGTCCTTCATCAAGTCCATTTTCTCCCCTTTTCCACCGCCTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 + chr3R 25443017 5' + 297 3 2 73.27 GGCCGTTAAGCAAAACGAAAATTGAAGCAATTCCGCTTACGCTTGGCATACACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3R 27386278 5' + hobo 25 1 54.46 AGCGAGGCGTTAAATTAGCTGCTAATTAATTAGTCCACTCCTCGTTACTCCGGACCACTCGACTCGAGTGGCGTTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chrX 13587895 5' + hobo 2 1 77.23 TTTAAAGTTGTTTTTGGTTCATTACAACAAGACAGCCTTAAATTATACATAGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATA:1 + chr2R 21748613 5' + Circe 7192 1 61.39 AAGGTTCAAGTTATGCCCCAATAAGGAAATAGAAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 + chrX 14965184 5' + FB 44 1 73.27 TTTATACGCACGTGCGTTGCTTTTTGTGAAAACTTGATGTATGTGTGTGGCTATGTGTGGGTGTGTGCGTGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chrX 6146631 5' + hobo 4 1 75.25 CGCACTCGATAATTCAATTATGCATGCCATTTAATGTGTCAGGCTTGTGTGTTCCTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGT:1 + chr2R 18316454 5' - accord 193 2 75.00 TCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCA:1 - chrX 21668051 5' + Tabor 6895 2 79.21 TAACTGGTCAGCCGGCCATTGACCTGCGCATCCAGGCACGGGAGCAGCTGATCTCGCAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 28879996 5' + roo 19 2 58.42 CACCCATTTTGGTGGCTGTGTAGTATATTTGTGGTATTTATTTATAGACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 12818899 5' - roo 9045 1 53.47 TACCAAGAAAGCCAACTCTTCAACCAACCCAAAAATAGCAAGAGGAAGTGGAATACGTTATTGAGCATGTTGCCATCAAGTAGGGCCGTTACGCATCTTGT:1 - chr2L 9790220 5' + 1360 3372 1 75.25 AAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3R 19450178 5' + roo 8711 2 57.43 TTCCAATTAGAAGTAATCTCGGACCCTTGATTCTCCTTTGTAATAAGTCAGTCTTAAGCTACACTCGATGAGAGTGAGATCTAAATAAAATCACAACCTTA:1 - chr3L 16303542 5' + gypsy5 7247 2 75.25 GCTGACCAAATCCAAAAATCTACGAGCTCCGTAGAAACCTCTGACATTTTCGCCACCAAAGAGTGGCGAAATAGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 + chr2L 7463482 5' - 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chr3L 12240994 5' + Juan 4073 1 60.40 CGCTTCGTTGTCCCACTAATAAGCCAGTCTCCTTGTCATTCGTGTAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAA:1 + chr3R 23147883 5' + G-element 33 1 52.48 CTCTGGAAATAATTAATATTTTGTAGCACAGTTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATG:1 + chr3R 7012703 5' - Stalker4 6962 4 68.32 GTCGCCGTTGCGTCAGTTCGTTCGACTCTCAGCTCACAGTTCGCAGTTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGCGAAAGAGACGCTA:1 - chrX 10822719 5' + Doc3-element 99 1 58.42 ATTGTTTCAGAACCACCATTTAATTTATTTTATTTACAGAAAATTCAAAGAGCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 - chr2R 17292542 5' - Tabor 461 2 53.47 AGAAACTGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATG:1 - chr2R 5424281 5' + 1360 3351 1 69.31 GTGTGGAATTAGGAAATTATTTAGGACTCTTGTGGGATCATCAATTGGTGGCATGACATGATTCGACTACTGACAGCATGTGGGCTGGGAGTTCGTTGCGG:1 + chr3L 12012267 5' - Doc 4549 1 65.35 CATTCTTTATAAACATTTTGATTAGTTTTATTATTGATTGATTATTGATTATTGATTAGTTTATTTTTACTATTACTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAA:1 + chr3L 15172628 5' + INE-1 555 1 31.68 CACGTGCAAGAGAGCTTGGGTTGCGATGGGTTAACTCTTGTGCCTTCGTTCATTTTTTTTTTGTATTTTTTTT:1 - chrX 7049214 5' + hopper 143 9 54.79 CAGCACATAATGTAATTGCGTTTCGTTTCTGTTTTCTTTGCTTCGATCTGGTTAATTTTATATTACGATGATGTTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1 + chr2R 22619582 5' - jockey 4975 1 55.45 AAATAAATAAAAATTTTTTAATACCCATAATAATTTTCATTGAGTTCTGAAAAAAAGAAAA:1 - chr3L 5157225 5' + mariner2 874 1 44.26 AGAAATGGCCATTTTGAAAAATGGAACATCCATTGGTGATGAAGTCTTTGGATTGTAACAAGCAGCAGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCCCTGAAGCTTTC:1 + chr3L 14309487 5' + gypsy7 5269 2 64.36 TTATAATCACCGCTAGGTGGAGCTACTGTTGACTCCTTAGCACTTCCGGTATCAGATAGTTGAGGCAATACAATAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:2 - chr2R 17650049 5' + 1360 1 2 78.22 CTTTGCCTCAGTTTCCCCGACTTTCCGCCACCTTTCCCGCCCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGT:1 + chr2L 1507152 5' + Doc 493 1 63.37 CGCGAACTGCTGCGAACGACAAACGGAGGCGTCTTCGCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3L 813873 5' - roo 9033 1 63.37 TATGGCCCATGTATACATGTATGTATGGTGAGGCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTC:1 - chr3R 21992289 5' - opus 81 2 73.00 GCGCACAGAAAGTCAGCGGAAGTTGTGAGGAAATCTTTAGCGCAAACATTCAGATAAGGCTAAACAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACGCAAGT:1 + chr2R 7881935 5' - 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Idefix 6984 2 67.33 CGTTGAACGCGTTGTCTCACTTGATTTAAATAATTGCCGCGTCTTCGCTTCAGAAGCAGTTTCGTTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCTA:1 - chr3L 15634696 5' + Max-element 441 1 59.41 GCAGAGACGCAGGACAGGCAACCAACGAGCATAATAATAATAATAATAATAACAATAACAATAA:1 + chr3L 3445649 5' + mdg1 7064 2 84.38 GTAGAGTGTACCGCCACACGCACACAAATCGCTCGCTTTTATGTGAATGAAAATAATTTTATGCAAAACCCAGATACGCACACACACACACACATACACAA:1 + chr3L 17533741 5' + Quasimodo 39 2 64.36 ACTTCATGCAAGTTATCCAACCCATAATCATAGCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCACTGTTAAATTGCTATA:1 + chr4 1163810 5' + Doc3-element 121 1 58.42 CTAGTTAATAACGCTAGTTTCCGACAGCTTTGTATGTTTTATATACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCT:1 + chr2L 5974466 5' + invader4 33 2 60.40 TTTGCGGCTGCTCAAATGTAGTCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAA:1 + chr2L 10898489 5' + jockey 4724 1 76.24 TTTCGTATCATACAATTTAATTAACTTCAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCT:1 + chr3L 23277572 5' - invader2 4787 1 73.27 CGACCAAAATTGGCGAGTCAAGAGTTCAAACTTCAAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr2L 18979400 5' + Doc 42 1 62.38 TTAATGTCTCAATAAATCCCAATTGCCAAGATTGCATTTTCAGCAAATTTACGATTATGTACAAATATATATGAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATT:1 - chr3L 22978758 5' - hobo 2467 1 77.23 GTGCAACCGCCGACTTTGGTCCACTCGTATTTAAATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCG:1 - chr3L 21494947 5' + Cr1a 4379 1 70.00 AGATCGAAGAGCTCGTCGGTTACCCGATAAGGTCGCTGCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCC:1 - chr2R 10119862 5' + accord 7377 2 62.38 AATCTAAATACAACGCATTGAATTCCACACCACCGTGACGCTCAGAAACGCGGCACAAACCCCAGTGTGGATTTGCAGTTTTTTGTAGCAGTTTACGGCTG:1 + chr2L 18677048 5' - Rt1a 73 1 74.26 ATGAAAACTGAACTGAACTGAACGAATCCAAACAAAGGAAGTCGGAGAAAAGGGGCGATTATTTTTAAAGCAACAATATACACACTTTTATAAAAAAAAA:1 + chr3L 3125581 5' + transib2 2626 1 57.00 GTATCTGGCAGATACTTTTAGCATACAAATCACAACAACGTCACAACAAATTGCCAGTATTTTGTGTAACAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCG:1 + chr3L 13674944 5' + hobo 453 1 73.27 TTCACTCAGCGCTGCTTGGTTATTTCCCCGATATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATC:1 - chrX 7823248 5' - Transpac 5193 2 69.31 ATATGTGGCCAACAGAAATGCACTTTGTCAACTTGGAGTCTGTCCTTGTTGCTGTGTCTGTGTCTGTGGCATTTCAAGTGAACAGACGTGTTTTCATCGAG:1 - chrX 8935659 5' + Doc3-element 14 1 64.36 ACAAAGGTTTTAACCGGCAACAATTACGAGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAG:1 - chr3R 17222971 5' + Cr1a 46 1 71.29 CTAAGTCACGATAAAATGCTATTTTAGATCCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr3L 18034185 5' + Doc 51 1 67.33 CTCGTTGCGCTACCCGCTCGTTTCCCAGTTCATATTGCACATTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTGTGAGTTCTATAA:1 + chr3L 22138919 5' - gypsy4 299 1 65.62 AGTCGACCACAATTGCACCGCAACTAACTGCAAGCCACATGACGCCAGTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 - chr3R 545264 5' - Transpac 295 2 62.22 GAGACCGAATCGACTGACGTGTTTGTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGGTTTCAGATAAATATGGAAACCCTAAATGTT:1 - chr2R 23932612 5' + Cr1a 431 1 50.50 AGTTAGGTTTTCCACAAACCACATGTCCTTGGAAGGTGTGTAACCATTGAAAGGGTATACAAAGAACGAAAGCAGGAGGAACTGTTGAATATAGGCAATGC:1 + chr2L 18231744 5' + 1731 4310 1 79.21 TTCCTGAACAACCCCTCAATATCCACGATATTTCTAATCTGACTAAACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCA:1 + chr2R 670422 5' + 17.6 286 2 54.46 GCATTGGAGCTCTCTTCCTGCCGGAGACCCTGCACTAATCACCTCCCGCGTGGTCATATCTCTTGACACTTCGGCAATAGGCCGCTACAATCGTACATATC:1 + chr3R 22303095 5' - rooA 7339 2 69.31 AATACCGTACTACTTGTTGAACCCAATAAATTATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCACAATAAATATAAATATACAAATATACA:1 - chr3L 24104304 5' + Stalker4 7046 4 73.27 TAACCACTCTTGCCCCTTTGACGTATGTATTCCCCAAGGTAATAAAGTATAATATTCATATTGTGGTTTATTTCGACACAAGATTTGAACTGAGTAGAAGA:1 - chr3L 4266998 5' - gypsy 7215 2 61.39 TCCGGAAATGCTGTCACAAATTGTTTCAGAACCACCATTTAATTTATTTTATTTACAGAAAATTCAAAGAGCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGT:1 - chr2R 17292561 5' - Tabor 7319 2 70.30 CCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:1 - chr3L 25232909 5' + GATE 34 2 51.49 TTAATACATTTTTAAGCTCTGGCGCAATGCATCTGATCCCCAAGAGGGGTAACTTTCAGATCTCTTTCGATTACCTGGTTCGTCACGTACCAGGGGAGCTC:1 - chr3L 26002173 5' - G5 4477 1 70.30 GCACAGCGGGTAAAAAGATTTCAAAGAAATTCCAAACAACTAGACTCACCCCACAACACTCATGCATTACACACAGATTATGTAAGTGAGCGCCTATCTCC:1 - chr2R 23760609 5' + gypsy3 447 1 75.25 AGCCAAAATGTTCATAAACAACTGTCACACATTTCGGGTCCTTGACTTTTCTAAAAAAAAAATTGGGGCGGAGTTGGGGCACACCCACTTTTCCAAAATAT:1 - chr2L 16837899 5' - hopper 106 1 60.40 AATAACTTTTCTGTCTGCTCTCCCATTTTTTTTGTATTGTCTAACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr2L 10820659 5' - roo 9039 1 60.40 TCAAGTGTCCGAAATTCAATTAGACTTCATTAGCATTACCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr2R 22945400 5' - hobo 2902 1 58.42 GACGCCCGCGCACGTTGATGGATCGCGACGCACGCGCGTCTCTCCTGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGC:1 - chr3L 6834514 5' - 412 114 2 55.45 TACTAAGCTTACCAGCCGCCCGGAGCGTATGGCATCCGATTTCATCATCGACTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1 - chr2R 18036693 5' - blood 7365 2 53.47 CCCCTCGGGAAAAGTGACAAAGCCACTTATTTCTCTTTTTGCGCACGGCCCGCTCGGGTATAATGTCCAACTATTGTACCGTTAGTTCACGGTGCGTCCTC:1 + chr2L 16389236 5' - gypsy8 4904 2 75.25 TGTCCAGCGAGGCCACCGCCCGCGAGGTGTTCTCCGTGACCAAGCGCGACTGCTCGATCTTTATGTCCACATGACTCTCTTAGACAGCGGCGCTCTCGCTG:1 + chrX 1224004 5' + Tabor 7064 2 57.43 AGATGGACTGAATACTTAAAACAAAGTACAAGGCACTCTTAATAACAAAAATCAGACTCAACAAGAAACAAAATAAAAACAACTCCTACCTCTCATTTACC:1 + chr2L 22296215 5' + Porto1 270 1 76.24 GGGATGCGCTCACATTCGCATGGCTATTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chr2R 17345922 5' - hobo 2928 1 68.32 ACATTAACCGAATTGATCTAACTGGGAAGTGCCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACA:1 - chr2R 20903261 5' + Doc 4247 1 68.32 CAAACAGATTAACAATTGAGTAATTAACTTTAAGAAAGTTGTTTGCATTTCGCTGTGTTTGAAATAGTATAAGCAAGTAGTTTTACACCTTCAAAAAAAAA:1 + chr3L 19932598 5' + Doc2-element 205 1 57.43 CGACGGATGTAACTGTAGCATCCCCGTTCTCTCAATTGCGCTCTCACTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAA:1 + chr3L 13920100 5' - Quasimodo 381 2 56.44 GCTGTTATAAAAAATAATTAATCTTTTGAATAATCTTTTAACTTACAGCCTTGTGGTCTGGCACAGTAAGTAATAAGAATATGTTTTACGACGCTTATTCG:1 - chr3R 3463727 5' - Gypsy6A_LTR 214 1 57.43 TAAGCTGATTTGGCCTGAGAATATTTGTATTTAGCCTACCCAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTT:1 - chr3R 19448935 5' - roo 29 2 59.41 CGTGGCTCCTTTGCGATGGTCTGCTTACTACGCTGTGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGC:1 + chr2L 10508302 5' - HMS-Beagle2 146 2 63.27 CTACTCAATGCCGTCGTCATCGTCGACTTCTCGCACATTTAAGCCTAATTAACTTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAAT:1 + chr3L 4713247 5' - transib2 2551 1 57.43 GGGGAGGCGATAAAGGCTGAGAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr2R 22856605 5' - 1360 3370 1 58.00 GTAACGCTCCACAGTTGTACACAGCCCGGAATGCACCAACACAGAGCGCATCTGTATTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATA:1 - chrX 22753471 5' - hopper 345 1 57.43 AATCCTGTCGTCCGCAAGTGCAGATGTTTAAGCCACCAACGAACGTGCATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCC:1 + chr3R 5902184 5' + Ivk 5050 1 73.27 AGAAAAAATAAACCAATCAAATCAATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAAC:1 + chr3L 15909258 5' + Idefix 287 2 55.45 AAATGGACGAGGGAGTGGTCACACGGTAAGTGCTGCTTTCAGGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3L 11625620 5' + roo 34 2 62.38 TGGCCATAAATCGATTTTGAAATATGTTACCAATATTTAATCGCTCTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 - chr2L 7745967 5' + I-element 31 1 53.47 TGCATATTTTTTGAGAGGCATAAAAGGAAAGACAACAGCTCTTTCGAAAGAATTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGAAGT:1 - chr3L 14383390 5' + I-element 326 1 73.27 TAAGGTGGGCGGCACTGCCACTAATTTGTAAGGAAGTAGCTTAATGACTTATTAGCCAAATTATGTAGAGCAGAATGGTTCGTAAGGAACACAACCCTGCA:1 + chr3R 18952407 5' + BS3 1410 1 76.24 TATAAGTTCTATTTGTAACCGCAACGATGTTGGGAGTCCCTACTTGTTTAGTCGGCTTAACTCCTCGGTTTCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGG:1 + chr4 1233370 5' + Cr1a 4088 1 73.27 CGGCACGCTGCCACCAATTTTTTCCCTTCGGCAGTGCATTTTCATTGTTCTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - 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chr3L 21484243 5' - 1360 3370 1 64.36 ATACCCAATCATTTATTGTTTTCTTAGGGTAGATACACTACACCTCCCTTTTTAGAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTTAATTAATTAAAACATTTT:1 - chr2R 545172 5' - Stalker2 7190 1 75.25 ATTTTTGAAATCTAGAAAACTACAAAACAATCTCCTAAATCTGGATCACGTTTTGCACGCTTATCTTAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chrX 14521620 5' - roo 405 1 69.31 TTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 - chr3L 23456283 5' + 1360 2 2 73.00 TAATTAAACGCACGCATGCCTTCTTTTCATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr3L 10035733 5' + jockey 80 1 72.28 AGCTGAGAAACTAGGAAAATTGAAGTCTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGG:1 - chr3L 5267261 5' - Juan 4170 1 70.30 TCAAAAAGCACACTGGAAATGAGACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAG:1 - chr3L 13903812 5' + blood 483 1 75.00 GTTTTACATGCTTAAAAGAACGAAAAAAAAACCATCCATAAACATGGAGAACCAACATCCCTCCCATCCATTCCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTG:1 - chrX 1018466 5' + transib2 7 1 69.31 ATTATCGCCGTTTCGCAATCATTCAAAGATTCATCGTAGCTTCGTCAATGGTCCTCGTATCTGTATCTCTTTTTCATATCGCGTCTATATCTTTTCGCGAA:1 + chr3R 26071030 5' + Cr1a 4371 1 72.28 TTACTCATTTATTCATTTTCCTCAAATTTTATCTGAATTCCAAAAAATGTCACTTTCCCCACTGCTCTGCTTTCTGGCGTGCGTATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 13867870 5' - 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INE-1 544 1 59.41 GTATGTACAACTAATGATTCGATAGATTTTAGATAGATGAGTGTTCTTTGAGAACTTGGTGTGGTCTACAGGCAGATAGCTCGTGACAGTCAAGTGCTGAC:1 - chr3R 16003628 5' - mdg1 265 2 55.45 ACTGTCACGCCAATTGAATTAATTCCACCGAGGAATTTAGGATTTAATTTGACATTTAATTATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCAT:1 - chr2L 5657987 5' + hobo 2569 1 70.30 GGACATTTAACGTTTGCGAAAGCACTTAAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACG:1 - chr3R 6636025 5' + G2 2649 1 72.28 CCCTTAAAAAACGACCCTGATGTAGTGTGAAAGTCAGCTTAAATCGATTGGCATTTGGTGTGGCTGGATTGTTGTTGTTATTATTATTATTATTGCTGTT:1 - chr3L 7825142 5' - mdg1 31 2 55.00 ATTAAAATAATATTGTAAAGCAATCATTAAAAACTAAAAATGGCATATAAACCATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGC:1 + chr2L 15740950 5' + opus 450 2 49.50 ATGTTGCCTTCTGTTTATTCTGGAAATCCTATAGCAACCTTTGTTTTGAGTTAAATCAATCCAAGTCAACGCAGAGGCGTCTTATAAGCGCTGCATTATAT:2 + chr3L 2595681 5' + rooA 241 2 74.26 TTATTGGTATTATTGCCATTTACAACTCGGCACCCGTTTTGTTTCCCCTTCTGCGACGCGTCGACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGA:1 - chrX 4249061 5' - blood 237 2 66.34 CGTTAGCAGAGAACAGCTCGTAAATCTTGGCACTTTTCACTTGGCACTGACCACAGGATACTCGCCGGCATTCATAACGCAGGGAAGGGAGCCGAGGCTGC:1 - 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F-element 197 1 62.38 TGCTGAGGCAGTAGCCACCACTGAAACTACTGCCGCCGAGCAACTGAAACCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACGTTTTTGCTGAATAAA:1 - chrX 2048648 5' + Tc1 226 1 56.44 CTGATTCACAAAAAACAAACAGTGCAAACTGTGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAAC:1 + chr2R 16939095 5' + hopper2 1173 2 77.23 CTTTCCAATCGAATCGAATTTGGTTGGAAGTGAGTTTTGTGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAA:1 + chr3L 12645497 5' + jockey 4640 1 60.40 GGGATGTTTGGGGTGTTAGGCCAGCACAGTTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGG:1 - chrX 11419706 5' - I-element 5060 1 71.29 GTCTGCCCATGGTAATTGCGTGCAAGAGAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCAC:1 - chr2R 6482756 5' + gtwin 14 2 65.35 GAGTACTACTAGCCAGGACCGGAAACAAAAGCTCTAGGGTGAGGTGAGAGCAGGCGCGGGAGGTTCAAGATCCCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr2L 128661 5' + P-element 2 2 78.00 AGCTGACATATTGACTCCTTTCCAAAATACTGTCCCATCTTTGGCTTAATTAGCAATGACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 16449814 5' - roo 9055 2 62.38 GAAAACTGTTTTGAAAGATGACGTTTCAGTTTATCACCATCCCAGGCGACAGTCGTATAGTGATCAAAACTTTGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGC:1 + chr2R 4192990 5' - hopper 379 1 76.24 ATTATTCATAAAGCCAAGTACCAGATAAATGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr2L 5741364 5' + 412 7100 2 71.29 GTGCGGACCATTCGAAGAATTCGTAATGAAGCCACGATTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr2R 11086467 5' + Doc 46 1 62.38 AAAGCGATTCGAAATTAACTTTAATGTGTATGCAAAACTTAAAATAAGAAAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCAT:1 - chr2L 21029633 5' + 297 6501 1 74.26 AGAACCTTAGTTAACTGCTATATTTCAGCCAATCAATCAAACTGGTTTCAATTATTTTTTCATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:1 + chr3L 14703827 5' + flea 13 2 66.34 AATATATTGTTTTATATTTAGTTAATTCACTAACATTACCATTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAA:1 + chr3R 15343322 5' - Doc 4590 1 65.35 TTTTAATTGATTTTATAGAAGGTGGTCTCCCACAAAATGGTAGATTTGACCGCAAAATTACAAGTTCCCTTTAGAAAGAATACAGTTGAGTTCAATTAGCA:1 - chr3R 7000092 5' - diver 72 2 56.44 TATGTATTACTAATGTATTTACGATCGAGCACCATCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTC:1 + chr2L 12644011 5' + Doc 378 1 76.24 ACCCCCGAAAGTATGCAGCGCGAAATGCGGAGGAAAATTCATATCAAGCAATTTTCAAATCTCCTCTATCTGAAATCAGAACACTGTGCACGAA:1 - chr2L 7110494 5' - Cr1a 404 1 70.21 CATATTATTATTTATGAATGCGAAATACTTTGGCTGACATTTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACCTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chr2R 16980053 5' - opus 472 2 56.12 GTTTGGTAGGTGAAATATGCATGAATCTGGGGATTGGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 - chr2L 16032343 5' - 297 6939 2 68.32 ACGAGTTTCCCCAAATGACTCAATTCGATGCTCTACTTTTTTTTTCGTACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCACCCAACCGGCTCGATTCACGAGAAGATA:1 - chrX 11464489 5' - Cr1a 4379 1 74.26 AACTATGCATTTCAAAACAAAAATGTAAAAGAAAAAGAGGAAAAAGCGTGCGTCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACC:1 - chr3R 2926899 5' + Doc 289 1 56.44 TTAGTAGCCCGCCAACTGGAGAATAGCGAATACACATTGTTGCGATCTCATATTCGTAGCGGCCACGCAAATCTGCAGCGTCTGCCGGCTACGTATCGACA:1 + chr3L 9404799 5' - gypsy2 6571 2 70.30 GCGACGCTGGCAGAGCGGCGACTTCACGCTTAGATCGGTGGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chrX 2125630 5' - P-element 2851 1 45.54 AAACAAAAAACAAAAAAAGAAGATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGT:1 + chr2L 11869576 5' + opus 7054 4 78.22 GGCTACATCTAACCGAATCAAATGGCTGATAGAGCCATCAAATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - 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McClintock 468 2 56.44 AAATAATAAAAAATAAAAAAAAAATAAAAAATAAAAAAAAGAAGATACCACGGAGCTCCAGTGATTCTCAGAATACTAGACTGTGCTCGCTGTACTATGTC:1 + chrX 4941889 5' - Doc3-element 4369 1 60.40 CAGTAGGCGTGGCGGATTAGTGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 + chr2L 17056505 5' - 412 7493 2 76.00 AAACCACCTCGAAAGTATAGGGTATGGTATTATTGCCGTCACAATGAAATTGTCTCATAGCTAAAGAGCAATATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 12913694 5' + 1360 4 2 76.24 GGCCAACTGCTTCTGGCAGATCTCCTCGATGGGCTGAGCATACAGGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGA:1 + chr3L 13861591 5' + Quasimodo 322 2 57.43 TTTGGAACACATTGATGTTGTGTTAGGGTGGATTCATCGATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr3R 17846876 5' - roo 9036 1 59.41 ATTCCCCTGAGTTATTTCAGTGTTCTGCTGAACGGGCAGAGTAACCGCATTTCTCATATTGGTTTTAGAACTGTGTTATCTAACAGCACCTTGTAGTCCAA:1 + chr2L 8878189 5' - Doc4-element 2554 1 63.37 CGTATTCCCAAAAGTCGCCGCAAAGTATGCTGTGGAAAACATCGTTTACGCACCTATTAGTTGTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCT:1 + chrX 5275496 5' + jockey 4690 1 62.38 CATTGGAAAACTGAAATTTAAAAGATAATTTAAACATTAATATGAGTTTCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr2L 17887139 5' - 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chr3L 11844425 5' - Burdock 232 2 56.44 CGTATCTGCATCTGTATCTGTAGTATATCAATGACCGTATCTGAAGGTGCGAGTTTTGATTGCGTTCGCTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCC:1 + chr3L 626873 5' - I-element 163 1 72.28 GTAAGACGGTAGGAAACCATTCAACAGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 23485709 5' + roo 50 2 77.23 TTCTGCCATTAGCATTCACAGTTCTTGTTAATAATTCTTCGATGCGTAAACCAGAATTCATTCCAAAACAAATACAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAT:1 + chrX 11836275 5' - hopper 143 8 73.27 TAAACGATATTTAATGTTGATCCCAAATTGTATTATTATCTTTTTATTTGAGAAGAACACCGACCTTTTACAATTAGATCCCAAACTGAACTCTGATAATT:1 - chr2R 25034433 5' - Idefix 466 2 63.37 AACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:2 - chr2R 17345989 5' + hobo 52 1 75.25 GAGCTCATAAAGGACTGGACGAAAATTACAAACAAATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 27864706 5' + roo 39 2 67.33 TAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:2 + chrX 21668001 5' - 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G7 36 1 59.41 GCCACACGCAGACGTACTCCCGTGAATTCCACATAAATCAACTCAGGAAATGCTCTCGCCACCTATTCAAACTCGACTCTAAGTCGCCAAAAACTTCGTCT:1 + chr2R 10289747 5' - gypsy7 496 1 53.47 CCTCGTCGTGGGTATAAATATATATATACTTTTTTTTGGGTCCAAGGAGTCCGAGAATTCGGTCGTGGCTCATGACCCATGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 - chr2L 16396667 5' - 412 493 2 74.26 AAAAGTTAATTTAAAAAAATTGGAATTTCACGTCCGGAACAAGCTTCTTTTTTGCAGCCAAATGTTTCTGCACCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGT:1 + chr3L 21966991 5' + Doc 7 1 73.27 CTTACAAGAACTATCTTACAGCCAGTGGTATCGATTGTCATTTGATTTAAAAAAAATGCTTCATACTTTTTCGGAGGAAGAATATTTTGTTTGCCGAAAAA:1 - chr3L 10462088 5' + Transib5 2839 1 58.42 GTGGCGAACTAAGGGTCGGGGGGGTTGGTTTAAAAACGGGAAGGGAGAGTGGTTGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGAC:1 + chrX 4042338 5' - Doc 419 1 61.39 TTTTCTACTATTATATCAAGTATATTTTTCGTATTGTCAACCTTGGGAGAGCGGAGTTAGAAATTGTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr3R 21969146 5' + hobo 10 1 68.32 AGTCGATAAATGTCTCTGTGTGCTGGCCTGCATATAGAATTTATATAATATTTTTGTTAACAGATATACTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGC:1 - chrX 6417837 5' - accord 7025 2 72.00 AATAGTGTAGTCGCATGGGAAGTCTTCTGGTGCGCTTCGTCACTACGAGGACTGCCGTTCATAGTGATACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACA:1 + chr4 1234496 5' - 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roo 139 2 65.35 GCCTATCAGGTCTGTTAAAAATATCTTGCATTTAACAAGTTTAGCAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:2 + chr2L 23374514 5' - flea 4987 2 54.46 ATTTATTTATTATATTTTTTAAGTCATTTGACTTAAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACCTCGTGCCTCAAGATATGACC:1 + chr3L 15436571 5' + 1360 481 1 64.58 CTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 19450171 5' + roo 8704 2 64.36 TCACATAATTAGCACTGTCCACAGAAAAAGGAATATGCTGAGTGGCAAAAACCGCACAATCCATATCAAGGTGTCTGTAGTAGTCAAAATATTAAACATTG:1 + chr2R 5226017 5' + invader2 4693 1 62.38 ACACATCTCTGCGAAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chrX 19819982 5' + hobo 38 1 66.34 ATGCGCCCAGCTCTCTGATTTCTTGGTCGGATCCAGCAGCATCAATAATAACAAGCAGCACTGCGAACGACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAA:1 - chrX 3046449 5' - Cr1a 205 1 57.43 ATAAGTCAAAAATTATATTTTCTTTAGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:2 - chr3L 14886250 5' - 412 7496 2 77.23 CAAATTGCATTGGTTTTCTTTGCATACTTTTTGGGGCAAAGTGTTGATTGAGTGTGCGGTATATTTAAGAACTATCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3R 24764521 5' + jockey 15 1 71.29 CGTTAATTGAACTTTTGCCGAGACAAACTGTTATGCGCCTGCAGACATATGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTT:1 + chr2L 12604613 5' + hobo 366 1 51.49 TTTTTATTTAATCATTTAAATTTTGTAATTAATAGTTTTTATAACTAATTTAACGTGTTGCCTTTCTCATAATTCACTTATACAAAAGACCGACCGCGTTG:1 - 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chr2L 7991762 5' - P-element 2850 1 42.57 ATGGCTGACCATAAATCTTTTATTTCTGTTGGTGCCTCAACCCCTCCCCTCCCCCCCCCC:1 - chr3L 15253396 5' + accord2 221 1 76.67 CGTATTTCCACGCTGACTTTTCGAGTCGAAAAGTCAGCGTGGAAATACGATCTCTACAGATTTGCTAAAACCCCAAATGAAACAAAAAAAAAACAACAAGA:1 + chrX 9731979 5' + Porto1 165 1 73.27 AATGTAGCTGTCTTTAGTTATTGCCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTT:1 - chr4 729445 5' - F-element 4384 1 76.00 ATGCAAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATTGGT:1 - chrX 21945925 5' + F-element 45 1 60.00 AGCTTTTTTGGACACTCTTAATTTAAACAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 + chr3L 10792183 5' - pogo 2056 1 72.28 TATATTTTACATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAG:1 - chr3L 20711716 5' + jockey 4671 1 74.26 AGCGAATCATATACTCTACATCCGACTACATTAAGTATATTTTCCGGCACAAAAACATTGCAATGACTGAAACTCTTGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATC:1 + chr3L 3986351 5' + jockey 9 1 74.26 GCTGTAGTCGAGCTTAAACAGGTATTCGCATTTTTTGGAGATGTCGTACTCCTAAAAGGAAAGGAAAAAGTTCACTGAAGGGATCTTCTTCCATGTCC:1 + chr2R 17434925 5' - 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I-element 341 1 64.36 TATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACT:1 + chr3L 27415242 5' - transib2 2780 1 70.30 GCCACGACGGGAACATTTGAGGGCGTGGCGGCTACCTTGGGTGTGGAGCTGTTGGGCGGCGTTCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGA:1 - chr2L 3864134 5' - Doc 4275 1 66.34 CCCAGAAACACAAGGAGCCGTGTATGCCAAAAGGATCGGATCGAAAAGGAAAGAATGAAGACCCTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAA:1 - chr3R 7615369 5' - HMS-Beagle2 49 2 58.42 GCAGATAGCTGAACTTGAGTTAACTCAACGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 - chrX 13587974 5' - hobo 2890 1 70.30 GTTTTTCCTCTAATGAAAGGGTTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 - chr2R 7161542 5' + Doc 59 1 78.22 CTGAATATGAGGGTAAGGAGCTTTTCAGCTACGTTCTGGTTGTGTAATTTTCTTTCGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr2L 13314064 5' + jockey 28 1 52.48 AGATATGTATATTCCGCAAATCCTAAAGGGCAAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 + chr3L 9505833 5' + P-element 44 1 36.63 CGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:2 - 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chr3L 27975782 5' + HMS-Beagle2 45 2 56.57 TTCGATTATAATGCCTACCACCAGAGTCTGCAGGATGTGGTGCCAAGTTGCACACCATCTTCTTTTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTACGACCAACTGA:1 + chr2L 5140271 5' - Rt1a 4831 1 71.29 TATTCATGAATCTTATTGGCATGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTAT:1 - chr3L 18811320 5' - R1A1-element 5208 1 78.22 TACACAATGGTATATAGTCCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chrX 22690769 5' - roo 9015 2 80.20 TAAAGGCATACTCGCATTTCTAAAAACACATGTAATGTAATAATATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 13943296 5' + Rt1a 5072 1 80.70 GCACGCTGCCACCAATTTTTTCCCTTCGGCAGTGCATTTTCATTGTTCTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr2L 19629692 5' + hobo 28 1 54.46 AAATTCAATTTCACAAAATGGGTTAAAAATCGAATCCAAAAACGGCCAAGACCAAGCGCCTAAGTTAATTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGC:1 + chr3R 29758692 5' + S-element 38 2 76.24 TAATCAACATCAAACGCTGCCACTCCTGCTTTTGATGTTAGAGGCACTGCCTCAACAACCACCGCCCATTTCTTGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr3R 15714236 5' + jockey 10 1 72.28 TGCGCTCACATTCGCATGGCTATTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGG:1 + chr2R 17345926 5' - 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F-element 464 1 77.23 ATCCTGTGATAATAAGACTCGTTTCAGTTGTCCTGCGTGAGGGGAGGTGTTACTTCAGGCTCTATACCCTTTAGAACGACTTGAAGGCCCTTCCTACTTTT:1 + chr2L 18232361 5' - Fw3 179 1 57.43 AAACCTACAAAAGGACCTCCACTATCTGGATAGCCTCACCTGCCGCCAGATTACCTGGCGAGGACCTCAAAAACAGATTGTGGTAGAATGAACACTCATAA:1 + chr3R 20481753 5' + invader3 5188 2 70.30 GCATTTACATGCGAAATATCTTAAGTCCCTGCCACCAATCCAACCACCCATATACACCAAACCCCCCCTCTCCCAGACCCTTCATTTCTTATAGCCAT:1 + chrX 13532551 5' + hobo 2648 1 60.20 GTACGAGCAGGAGTTTTCCATATTATTATTTATGAATGCGAAATACTTTGGCTGACATTTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACCTGCATCAGGGTT:1 + chr2R 16980035 5' - opus 7491 2 69.00 TGATAAGAACCACGGAAATGCAACCTAAAAAGCAACAAAAATATTAAGACAAATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAGACT:1 - chr2L 2917682 5' + G4 3543 1 65.35 TTTTGTGGGACGAACGCACAAACTCTCTGAGCTAGCCGATGCAATCCATAGCGAGGGTACAAGGTCCACATATTGTGCCGTTAATTCACGGTGCGTCCTCT:1 - chr2R 677198 5' - gypsy8 252 2 56.44 TTATAGCGTTCTAATTGAGGCGCCTCAACGGCACTCTTATAGAAGTTACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACACATAAACGAAAAAGTGCAAAGT:1 - chrX 9973822 5' + gypsy4 442 1 77.23 ATAAAGAGCTTAGAGATTATATATTCAACATGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATAT:1 - chrX 6156217 5' - 3S18 293 2 68.32 CTCGATGTCCTCCGTGATCCTTCGTCTCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 10978713 5' - roo 360 2 73.27 CGGTCTCCCATCTTGACACTTGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAAAACGCCACGTAA:1 + chr2L 9176227 5' + R1A1-element 5303 1 77.23 GGAAAAGTTGCTCCCTCCTTCGTCCTGATCACGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTGTGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTG:1 - chr3R 9088869 5' - accord 7026 2 48.94 TTCCGTTCATAATTCTTTATATACTGAAATAGTTTTCTGCTAATAAGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 + chr2R 9957227 5' - Transpac 5202 2 52.48 TTGTGGTTCTTCTGCCAGCTGTCTTTTCATGTCAAACTCAAAGCCGATAACGTGTTGTAAGTACAGTGAAGATTATTAATGACCCCTGTGACTTCGTATGG:1 - chrX 14898017 5' - flea 4579 1 69.31 GTCAATACCAAGTTTATTTCTCGTCTTCAATTGTTTATTTAGCTTTTAATTAACGGAGTGTTCAATTTTTTAATAGAGAAACGCTGGGACAAACACGAAAT:1 - chr2R 5070069 5' + Tc1 1610 1 74.26 GGACACTTTTGGAAAAGGAACAGCAATCCATAGAAAGAACTCATATAGAATTTATAAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAAT:1 + chr4 137222 5' - INE-1 16 1 62.38 AATAAAAATAGCTTTTTTGGACACTCTTAATTTAAACAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr3L 10792174 5' - pogo 2065 1 63.37 CATAAAAACAAAAGGAAAGAGTAAAGATGATCCAAGTCAGAGAGTTGCAACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCGGATGTGCCAACAACAACATCGAC:1 - chr2R 3918320 5' + gypsy10 5702 2 69.31 CCGAAGCAACGCATTTATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTT:1 - chr3L 21912328 5' - Bari1 1669 1 63.37 GACGAGCGTGAATCCCTTTGCCATTTTCCTCCCACCCTGAAGGTCTTTAAAAAGCAAAGCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 + chr3L 8883494 5' - mdg1 404 2 57.43 AGCTGAAGGCTGCCCAAGTTGAGGGTTTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGG:1 - chrX 12710837 5' - Quasimodo 6993 2 73.27 ATAAAGCTCAGAAAACAAACTTGCTAAGAATATTCATATTGGCCTATACTCTATTCGCCTTGACTTTGCCGCTGAGCACGCAATTCGAGTTGGCTCATTTT:1 + chrX 3032729 5' - Doc3-element 218 1 70.30 GACGTATTTAACAATAAAAAAAAAACGAAAAAACCTAAAGCGAGAGAGGCGAAACTAGGGGAACACAACAACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGT:1 + chr3L 628741 5' - Cr1a 173 1 71.29 TATTTCGTACTGGTTCAACTGTGATACTAACTATGTGATACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 + chr3L 3317152 5' + 1360 39 1 63.37 CGCGGATGTTTATGAGGAATCGTAATTGGATGGGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 - chr3R 6210286 5' - hobo 2896 1 69.31 AACGAGTTCATGTGCAACGACTGCCTAAGGGAGCATCGCAACAGTCCGCTGTCCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAG:1 - chr2R 7485604 5' + F-element 429 1 69.77 CCTTACCGCCGGCGGACGCCTTTTACCGTTTTAACGCCATTTTGGTAAGACCTCAAGGCGAACTTGTCTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTG:1 - chr3R 21969346 5' - hobo 278 1 73.27 CTTCCACCTGCTATAAAAGCCCTGCCATTTACATAGAATTAGTTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr2L 14743214 5' + 1360 29 1 58.59 GATTTTTGAATGACCCATTGTGAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATA:1 + chr2L 5927014 5' + Idefix 7101 2 78.22 TATCATAAACCTTACTATACATAATTATTAATATGCTACATATGTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTCTGTTTGGTTTTTTTTGAGGAAAAGTATGA:1 - chr3R 8720215 5' - I-element 5152 1 79.21 CCACCCCTCAAAATGTTTTTTTTCCCCGCTGAGTTTTCCTTCTTTTTGATTGTTTCTCTGTGGGTTTTAAGTTTGTGTAAGCGTAATATGAGAAGCATATT:1 + chr2L 9969724 5' - rover 6960 2 66.34 GTTGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr3R 15054303 5' + hobo 35 1 58.42 CCAGTTGCCATAGACTGATTTCCCGTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTC:1 + chr2R 16396790 5' + X-element 47 1 66.30 TATGGCTAGAAAATATATATCCATTCGTGTTTAAAATTAAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTTAAACAAAATGATCCGCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAA:1 - chr3L 23285554 5' + Tc1 478 1 61.39 CGATAAGTGTTCTGTTATGTCCCCTAGTCCCTGTTGGCAAACAAAGCTCCAAGTGCACTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAA:1 - chr3R 8079995 5' - flea 418 1 63.37 AGGCAAGTCCCATTTTGATGGATAGCGCGTAGACGTCAAGAAATCAATTTATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTAT:1 + chr3R 15924585 5' - Quasimodo 7347 2 60.40 GAATATGCATAAGTCGGTGCACCGGGAAGTCGGGATTAGTCCGATTAGCTTCCGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGC:1 - chr3R 25038096 5' + invader3 5456 2 57.43 GGGGAAATTGGGTGGCAAATCAAGGGAAAATGTTGGGCTCTGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3L 5085004 5' - 412 7514 2 57.58 TAGGGGCTGCCTATGCTCTATGTAGACAACCTCCTTACTCATAAGTTAGTTGCAATATGGACGAATGGAACAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCA:1 - chr2L 21125515 5' + Porto1 4291 1 52.48 CGGGATGACACCGCCGCCAAAACAAAGACACGCCTCGGGCAGCACAGTGATCCTCCACCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAAT:1 + chr2L 10636486 5' + hopper 20 1 59.41 TTCGAGTTTGGAATAAACACCGGAATATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGA:1 + chrX 6426963 5' - Doc 4261 1 75.25 ACTTTTCCAACCCTTTCAATTATCCATGGAGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr2R 4344549 5' - pogo 2058 1 68.32 CAGCGAAATGATAAACAACAGGGGAAAAGTGCATGCTGCAAACTGCGAACTCCAAACTACGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chr2L 4057213 5' + hobo 16 1 59.41 TTTTGCACGCTTATCTTAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 14521670 5' - roo 9018 2 82.18 ACGAGGACCTCGTCTATCGCAGGGATGTTGCCTTGAATGTTGTTTATGGTCCGATGTGTATTCTCTTCAGACGTCAGATGGAAATAGGGTCGACAAGAT:1 - chr3R 19406897 5' - G5A 2654 1 62.63 GTCCGTCAGTCTGTCTGTCCATTCGAACATTTTGCTATTTTATTATGTAATTATAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCA:1 - chr2L 20935327 5' - Porto1 4194 1 75.00 AGCACCAAGTTACGGAACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGAC:2 + chr3L 17215699 5' + Ivk 11 1 68.32 CGCTAGCCGAGTCCGTATCCGAAGTAGCCTCGTTGTCCTCTCGTGGCCGCTTGGCTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chrX 20330479 5' - P-element 2868 1 56.44 GTGTGTGAGTGCGTGTGTGTTGGTGTGTGCGTGGATGTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTATATATCGTGATTGTTGTGCTGGTAGCTAAAGAACTTGACAC:1 + chr3R 8464991 5' - Doc3-element 470 1 65.00 AGTGGTAGAATTTAAATATTCAGGCAATATCATTTACTTAGAGCCTAGAGCCAAATCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCG:1 - chr2L 21369759 5' - 1360 30 1 59.41 CACCTGCTCTGACTCTCTTTGTTTGAAATATCACGTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAGTTTGGATTTAGTTAGTGTAGGTGGATTATGTTTGTGTG:1 + chr3L 23906462 5' - I-element 4959 1 78.22 CGTTCTATCTCTCTTTCTCTCTCAGGCAATGAAAGTGATTACGGGGAGATATGCGAAACACAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 12058602 5' + roo 8679 2 64.36 TTTTAGGGATCCATCACGTTTTTTTGAATGGGTTTTCGGTGGGTTGTCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCG:1 - chr2L 18388280 5' - I-element 323 1 57.43 AACATCATGTATCTGTTCAATTGTACAACGCCCTGAAAAAAGAAAAACCAAAATAAAAAACCCAATGGCATTACTCAATAGAAAAACAAAAAAAAAAACTT:1 - chr2R 6160061 5' + HMS-Beagle2 490 1 63.37 CTTTTGGTCGGCGGTTGTCTCCACTAATTTTGGCTCGCATACAAAGTGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chrX 13881354 5' + jockey 35 1 48.51 ACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGA:1 - chrX 21945913 5' + F-element 57 1 74.00 TTTGACACTCTCCCTGAGCGAAAATGCACTCTTCAATGGACTGTGTGTGTGCGAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTGAATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 16087658 5' - accord 7034 2 76.24 TAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAA:2 + chrX 21668028 5' - Tabor 7270 2 76.24 CATTTGTATAAATAGAATACTACTAGCCTGATTTGGTTTTTTAATGGAAAATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:1 - chr3R 29964894 5' + Quasimodo 18 2 53.47 AGCTAAAATGGCTTTTACCTAGAGTTTAAAATATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr3R 11073788 5' + pogo 39 1 77.23 GTACTAGGAGCCATTAATAATAGACCTGGTGGAAATTATTCCGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTTTCTGCTATTGT:1 - chr2R 5038354 5' - Doc3-element 4480 1 56.00 GCAAGCTCTTTGCGGCTGCTCAAATGTAGTCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:2 + chr2L 10898481 5' + jockey 4716 1 70.30 GATACCCTCTAGAGTTACATAAGTGGGATTCCCACATTTTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTC:1 - chr2R 1986271 5' - INE-1 148 1 59.41 CGAAGAATTGCTCGATTGATAAGGTAAAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATA:1 + chr2R 3293737 5' - 1731 4601 1 52.48 TCTTCTTTTAAGAAAAACAAGGGAACTCCGAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAAC:1 + chr3R 9229980 5' + X-element 59 1 70.30 CAACTCAGACTGAAAAAAATTCCCAAACAGCGGACCCAGAGCCGCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr2R 12655945 5' - P-element 2856 1 44.55 AGCCAAAAATATCTTAACAAGCATGGCAACTACAATAGCACACACTCACGCAGATCAGATACACGAGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:2 + chr3L 7531320 5' + Tirant 8 2 32.67 GCAGTTAACTGTAATTTTTCCCTCTCTTTTTGCACTTTTCTTTGGTTTAAACTTAATACTTTTCTTATACGGTAATTCTACGGTGCAAAAGAAACTGTAGC:1 - chrX 12471972 5' - Fw3 390 1 65.35 TGCCGTAAGTTGCTCAGTTTGCCATTTATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTA:1 - chr2R 19189756 5' - Burdock 6313 2 74.26 TGCAGTGCCGTTGGTGGGCTAAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGA:1 - chr2L 7971079 5' + blood 7011 1 75.25 TGGCAGCGGAATAGAAAGAGATCCGTAACTTTCACATGCATATACATACATATGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3R 5392278 5' + 412 7076 2 61.39 ATTCGTTAAGTGATCAATTTGAATAGGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 - chr2R 9001688 5' - mdg1 7408 2 75.25 GTAGTACCATCGGCTATTAATACAATAACTATATAAAACTAATTATTTATCAACATTCAGTCTTAATAAAAATCCAAATAAAAAATTAGTAATAGATCAAA:1 + chrX 17010523 5' - Tc1 1515 1 68.32 GTAATAAGCAATCGAGAACCCCAATCCGCAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAGTAG:1 + chr3L 21782415 5' - roo 345 2 70.30 GGATTTTTAATGGCCAACACCAAGGGCTCAGGCTCGGTCTCGGTCTCGGTTTCGAGCTCTTAGATTTTTCGACAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAACTTC:1 - chr3L 5254401 5' - blood 7176 2 78.22 GAAATGTCAACGTGAAACTTTTGCACAAATGCGATGGTTTCGCTTAACCCTCTACTGCCGTTGGTACGCATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACC:1 + chrX 5210689 5' + G2 2853 1 78.22 CTTTCGAGTTCGTAATTAAACGAATTTTGGTTTTTTTTTTATATTTTTTGGTTTAAGATTTTTGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCA:1 + chrX 13599461 5' - BS 5047 1 64.36 CCAGTGGTAACCCATAACGGGAATCTTGCAACGTTACATAACCCATTCGCCCATCGCACAAAACTTTTTGCCCACTCTAACCCCCTAAAACCGCCCAAAAC:1 + chr3L 15410767 5' + INE-1 345 1 65.35 AAAGGACCTATTTTATGTCGAAAGACCGCATATCCTGGTTGAATAGGAAATGTACGAAATTCGGTATGAACTTCGAGATCTCTGGAACTATAAAAGCTAGA:1 + chrX 665194 5' + INE-1 153 1 54.46 TCGTGAAATGGGAGATGTGGCAGCTGCAGCGATAAACAAAAAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATATTAATTACTATGTTAT:1 + chr3R 24492890 5' + jockey 4835 1 57.43 AAACAAGGAAAAGCTGGAAAACCCACCCAGGGCAAAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGG:1 + chr3R 6584251 5' + Porto1 381 1 68.32 CTCGGTCTTCGAGTGATTCGTATGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGC:1 - chr3R 26002489 5' - Quasimodo 7045 2 69.84 ATTTTCATGATCATAATAGTTGACTGCATCCTGTGATCGGTGTTGGATGACCACGGGTTTTTTGCCCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - 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Transpac 5215 2 61.39 AGTATTCTCTTTATAAAAAACGCGAGTGATTAAAAACTAGCCATATCCAAATCTGCCTGTCTTTCCGTATGAACGTCGATATCTCAGGAACTATAAAACCT:1 + chr2L 22315402 5' + INE-1 150 1 64.36 GGGCGGCCAGTGGGCGTGATATCCTAGCGACCAAGCTTCGTCATAATTTGGCCCAAAATGTTGATGCTGAACCTTAACCTTTTAGCTGTTATAGTTCCTGA:1 + chrX 19058593 5' - INE-1 154 1 66.34 TTCAAACACTAGTATGTATTAGTTTTGCGAACCATGATCTCATCCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr3R 17064126 5' + Transpac 30 2 55.45 TAAAACTTATTTAGAGATACAAATTAAAAACGTGATCAGAACATTTCCAAATTGATGAATTTTCGCGTTCATCGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAA:1 - chr3R 32047561 5' + INE-1 555 1 52.48 GCTTAATTATAATTTACCAACACAATGAAATACATCGGTTGCACTTCCCCGAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTAT:1 + chr2L 13601184 5' + pogo 1921 1 49.50 CTGCCCAGTTGCAACACTTTCACACACATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGTGCGAAGCACCACACTACCACCCTTAACAGATCTCGCCCACCAAG:1 - chr3R 6239976 5' + X-element 4462 1 72.34 CGCTGTTCAGCGGGGTAGTGGGTTGACGTTTGTTCGCCACACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGA:1 - chrX 13654830 5' - Doc 363 1 61.39 CCTAGTTTTCTGCGTGGTAGCACTGATATCGGGTTTCTTGGCGCCCGACGTTTCCACTGATTATTATTTCCGACTTGACCGCGCGTTCTCACTCCCGAACT:1 - chr2R 4656976 5' - gypsy8 439 1 70.30 TATTGTTAATATACGGTAATATTTTATAATTGAGTATCCATGAACTGTAGATACTCTCTTGTTGTTGTGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGT:1 - chr3R 1683459 5' - I-element 98 1 61.39 GAACTAAAACTAGACGAGTAAAGCGTATCTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1 + chr3R 5594963 5' + 1360 45 1 71.29 TTTACTCGGGTAGATTTATCTTTTAATTGCGTTTTCTAATTGTTGTTCTTTTAAATTTGCTGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 + chr3R 31188720 5' + I-element 15 1 62.38 CTAAGCGATTCGCCTGAGACAAAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2R 17346016 5' + hobo 25 1 52.48 TTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGC:1 - chr3R 2689428 5' - diver2 4474 1 64.00 TCGATATAGATTAATTGGATATTACCATTAAATTTCTTAGCATACTAACTCATTTGCCTGTAGTTTTTATTCGACGTTTGCTATATCGT:1 - chrX 13244639 5' - Bica 319 1 75.28 CCAAAATTGGCGAGTCAAGAGTTCAAACTTCAAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr2L 18979403 5' + Doc 44 1 65.00 CAGTGCCGTTGGTGGGCTAAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - 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chr2R 9292059 5' - I-element 338 1 53.47 TTTCAACTTATACACCCAAAATTAATGCTCATTGGCTAAAACCTTTGGACAAACCATTTTCTTATTTAAATGGCACGCTCCTCACTATTCCAACACATGAT:1 + chr4 641539 5' - mariner2 131 1 77.23 ATAATTGTTTAATTTATATATTTTTTGTTCTTTGATTGCTAAATAGGAATGTTTCGGCTGGTGTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTGGACAAATTAT:1 + chr3L 13911878 5' - Tc1-2 1429 1 70.30 CATGAAACGCCCCCGTCTTTCCAGTCGCTCCGAGAACCTCTCCTCCGGCTATTGGTAGTGTTCTTCCTTCATTTAATTTTTGAATTTTGTTTAGTTTTT:1 - chr2L 6945804 5' - transib4 2539 2 58.59 TCGAGTCCCTTGGCTCAGTGATGATGGACAATAACATATTTTCTAATGAAGAGGCTAAGAAGGTCATTATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGA:1 - chrX 15930855 5' + blood 396 1 75.25 GTGTCTGAAAAAGGGGTTATACCAAGAATCACAGACCGAATTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATT:1 + chrX 7612463 5' - hobo 282 1 59.41 GCTGTTGTTGCCGGCGACATTCTGTCATGCCACGATCACGAACCATTCGTAACACATTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCA:1 - chr3L 13297210 5' - F-element 4294 1 59.41 TGGAGGCAAAAACATCGCCCACTATATCGATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAAATGAA:1 - chr2R 16786417 5' + invader2 292 1 70.11 TTGTTCTGCTTCGTCAATCCTTGGACTGCCGTGTACAATTATATATTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr2L 18040676 5' - pogo 2074 1 58.42 CGATCCATTGATAGAGAAGGGCTTTCTGCACGACGACGTGATCGTGTTAATTTGCATGCTTTAATTAATGTACTTATCCCATTTATAAATAAATATAAATA:1 - chr2L 23052985 5' + diver2 442 1 61.39 TGAAAAAGTATGCTATGGTGCCATTATAGCAACACCTCCCCTCCCCACTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 + chr3R 11770833 5' + jockey 4807 1 53.47 TAAAAATCCCAAATTGTGAAAAACGCTTCAGTGACAAAAATCCAATTAATCACAAGCGTACAAAACACATTAATGTCAAATATCATTTTATAAGGGACAAA:1 + chrX 8936330 5' - frogger 360 1 62.38 AGGATTTGGTTTTTGGCCTTGGGGCGAAGGGCTGTTCTTATGTGGTTATGCATGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTA:1 + chr3L 13281851 5' - Quasimodo 3 2 70.30 TTTCACTGTTAAAAGTCTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 + chr2R 12655904 5' + P-element 58 1 22.77 CCGCCGAGCATACGAAGACCGCTCAGGTTCGGCGGTTCGGCGGTTCGGTGGTTCGGTGGGTCGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chrX 15125720 5' - P-element 2873 1 65.35 CGAGCTTATAGTGGTGGAGCTGGCTAATGGCTGGCTCTCCCATTCCCAGCAGGACAATGGACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTT:1 + chr2L 14779322 5' + Bari1 1 1 68.32 ATGTCGTGGGCACAGGTCTTCGATGTCATCGCATCGGCTTCCTTTGCGTCTCTGCTCGCTGCTTTGCGCTTGACTTCCCTAGGCTCTGACTCCGAGGAGC:1 + chr3R 30182223 5' - G-element 431 1 62.00 GACATGTGCTAAATGAAATCAAACATCGCACACCGATTCCGCGGCGAACCGTCGACGGTTTAGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr2R 19658274 5' + 1360 16 1 65.35 GCGTGAATTTTTAATAATTATTAAAAATTCACGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATTGTAC:1 - chr4 1267799 5' - 1360 3155 1 52.08 ACAGCATCTAAACGGTGTCCTCCGTCTGCCAAAACCCAGTTCTTTTTTTGCCAGCAAGGATTTGCCTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 - chr3R 25509344 5' + Doc 26 1 62.38 AAACGCTGCCACTCCTGCTTTTGATGTTAGAGGCACTGCCTCAACAACCACCGCCCATTTCTTGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:2 - chr3R 15714225 5' + jockey 21 1 61.39 GACAGTTCTTAGCCGAAAGAATTACGCATTTGAGCTGGGGAATATTTCATAATTCCCCTAATATCCATCAGTTCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTT:1 - chr3L 15777782 5' - Tc1 1590 1 73.27 TTCGCAAATGTAAGTACTCGGCAGCGATGGCATCTATTGACGTGCAAAAAGTGGCTACATCGGTCTAGAAAATAAAAAGTAAAAAAAAAAAG:1 + chr3R 18846948 5' + Doc 4694 1 75.00 TACTCTAGCATAACCCTAACCCCACGCGGCCTAATTTGAATAAATTTCAAGTGTATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTGTTTGTTACGAGTAAAAAA:1 - chr3L 15199548 5' - hobo 2811 1 63.37 AATTTGCATTTATTATGGCGAACAGTAAAATCAGTCAACTGTTTTTGATATGTTTGTGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:2 - chr2L 10687766 5' - hobo 2919 1 59.41 TAAGTAAAAAAGGCATTATAATTAATTAAAAAATAACCTACAATCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGA:1 - chr2L 12802254 5' + invader3 35 2 58.42 TGATTTAAATTTTGGATTTATTACTATTTTGTAGTACAAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr2R 14796224 5' + hobo 53 1 62.38 TGAGGAACTGGGCAGCTATCTGGAGGGTGATATGCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGAGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCT:1 + chr3R 23285031 5' - 1360 20 1 66.34 TTGGCCTCAACTCAAACTCGATGACATTCAGCTACGAATGTCATCGATCGCCTGCACTTGACTGTTGCTTTGTTTATGAAAGCGTTTTATGGGCTTTTAA:1 + chr3R 29604202 5' + transib2 140 1 58.00 TAGTACAATATTGTAAACTACTACATTTTAAAGGCCTTTGTACTCACAAATACCCTGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGCAAACGATGGCGGTCTTGC:1 + chrX 16896642 5' + Doc3-element 370 1 53.47 TGCTTAACCGAACAAAAATAGCCGAAGACCAGGCGGCGTAGACGAAGTCTTTCGGCCCCATCAAGTAGTCTCTGCCTAGCCTTCGTTGCATACGGACGTTC:1 + chrX 264016 5' + jockey2 1 1 63.37 CACGCACAGTCCCTAATTAGAATCGATTTGGCTCGAGGGAGATCCTTTTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTG:1 + chr2R 11086765 5' + Doc 477 1 55.45 GGTGGGCTAAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr2L 7971067 5' + blood 12 2 63.37 CTCCCCCAAAAAAGTATGCTACGTTTCTTGTCTATACGCACAAAATGTGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:2 - chrX 6146754 5' - hobo 2936 1 76.24 GTTAACTGGCTGCTTAGGTGCACAAAACTGTAACCTCATGGTTCTTATTATCTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAG:1 + chr2R 11181240 5' - invader4 384 1 64.36 TGGAATATGTCCGTTTTAGGTCTGTGGCGTAATAGTGTATAGATGATAGCTTAGAAGTCCAGAAATCCCACGATAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGC:1 + chrX 9098778 5' - Cr1a 4030 1 73.27 GCTGGCCGGAGCTGCCGGGGTAGACAAGTTGCACATGTGCCAGAGTCCACAACAAGCCCCAGCCAGAATGCCACAATTACTCACCTGCAATGTTTCCTGAG:1 + chr3R 20606760 5' + TAHRE 10060 1 61.39 TCCCTTTGCCATTTTCCTCCCACCCTGAAGGTCTTTAAAAAGCAAAGCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr3L 8883506 5' - mdg1 7430 2 56.44 TATTCTTTCTCGGTTGAAAATGCCCAACCATTATTATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTTAAAAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGGCCAC:1 + chr2R 3587131 5' + FB 416 1 80.20 AGAAACCTCTGACATTTTCGCCACCAAAGAGTGGCGAAATAGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGT:1 + chr2L 7463514 5' - blood 342 2 58.42 GGTAAAGAAACTAGGAAACTATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGATGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAA:1 + chr2L 18506767 5' + flea 54 2 81.19 AGAGGGCAAAAAAAAAAATATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGT:1 - chr2R 12774728 5' - invader4 3036 2 82.00 CGACGACCAGCGGCGCATGCTAAGCGATTCGCCTGAGACAAAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTT:1 - chr2R 17346035 5' + hobo 6 1 71.29 CAGACACTGCAAGAAATAGTCCTGCCAATGTTCTATTCTATTCTATTCTTTAAACAAGAGAGAACGCTTTAGTCGATTGTCGCGACTATCAGATACCCGTT:1 - chrX 17816739 5' - INE-1 553 1 43.56 TTAGTGTTAATTGTATGTCATTCGTGTAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAA:2 + chr2R 2307571 5' + G-element 51 1 70.30 ACCACTCAGCTGGTTGCAAGGGTGCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTT:1 - chrX 10627542 5' + P-element 477 1 30.69 GCTAATACGTCTGTGTACATTGGCGAATAATATATAAAGTATGCAAATGTAGTTTTTTTTTTTATTTTTT:1 + chr3L 10677687 5' - gypsy7 5010 1 48.57 CCCTCCGCTTTCCCGAGGTCAACTGCAATCAGTCGGGCAGTCTGGCATTGCCGGAATTTTGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - 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opus 7499 2 77.23 ATACTTTTGTGCGGCAGCCAAAGATTAATTTACACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chrX 18155849 5' - hobo 2893 1 69.31 AAGATGAACAACTCACAAGATAAATGAAATATCTATAGTCGAAAATAGCGCGGGAGAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGT:1 + chr2L 15994135 5' - Porto1 436 1 54.46 AAAAAAATTTAACCATAGTAAGCAAGCATAAAACTGCCATGTCAAAAGCTTCAAAAAGAAAACAAAAAACAAGCCTAGTTATGAACATATAAATAAATAT:1 + chr3R 973931 5' + 1360 2955 1 92.00 TTTTTATCCTTTTGAGTGATATGTACATAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAAT:2 - chr2L 12416924 5' + Stalker4 7280 4 72.28 GTGCTATATCCTGGCCCTAATTAAGGACGGGGTCTAACTTCTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTT:1 + chr2L 13314830 5' + jockey 4790 1 60.40 ACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAAT:1 + chr3L 17215742 5' + Ivk 54 1 74.26 CAGCAAGGTTTGCAGCTTGGTCTTGTCCACATACACGAGGATCATCACGTACCAATCTACGCGTCATCCATACCTTCGCTATGGCCGTCACTTCGAACTGG:1 + chr3R 18174184 5' + Tirant 8079 1 74.26 AGGGGACTCGGCATTGGTGATTTGTTGTTTGATTATTCGTTTCTTTTGTTTTTCGGGATTGC:1 - chr2L 19622959 5' - Idefix 7089 2 77.42 AAAATGTCGCGCATTTGGCTTTGAAATGCAAAAAATATTCAAGCGCTTCCACTTCTCCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTC:1 + chr3L 13779275 5' - transib2 2807 1 60.40 AGAGCAGCTCCTTTTGCCCCTTTTAAGCAGAGAACTGCACGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr2R 23501779 5' + hobo 53 1 76.24 CTCGCCTGCCACACTTTCAATGCCAACGCGCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chr3R 10083312 5' + P-element 45 1 36.63 CGCTTTGCTGAACGTTTTTTCTCTGCCTGCAGGACCGAAGGACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr3R 29661672 5' - 412 460 2 57.43 TTTTCCCTTGTATGCTCCTTGCCTTTGCCCACATTTTCAGATATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATGTATTTATTAGCGTAAGTTTATTAAT:1 + chr3L 13264456 5' - Burdock 6360 2 56.44 GTGTGACAGACAGAGACACTGTGAAAGTGTGTTTTATTGATATAGATATAATTTTCTTTTTTTTTTTCTTTT:1 - chrX 7082521 5' - Doc2-element 246 9 59.72 ATCAAAGCCGGCGCAACAATTGAAAATTCAATTAAAAGTCTTTATTAAAATAAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 + chr3R 6135211 5' + I-element 21 1 58.42 TAATATATAAGAGAATAGCCCGTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23283797 5' - P-element 2495 1 74.26 GTTGCTACCGACTGCTGCGCCGCGGTACGCTATATATTTTCGATTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAG:1 + chr3R 28744674 5' - 297 253 2 56.44 ACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chrX 16217499 5' + P-element 53 1 26.73 GCCTCTGCAGAGTTCTTTTCGCTTTTTACCTTTTTCGCTTTTTTCCTCTTGTTTTTGCCTCTCCGCTTTAGTGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGATG:1 - chr3L 3992491 5' - accord 180 2 54.46 TCGCCTAAAAGGAAGGGAGAGGAAACTGCGTCAACACGTGACTGACAGGCCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 - chrX 6495295 5' + blood 27 2 55.45 CCGGCGTAGCACGGTTCAATGAATTACTTCATTAGTGCAGGCGTGTTCCGTGTTAGCTTATTAAACGGTGTAAATAAAAATATAATAATGTTAATTAACAA:1 - chr3R 14470152 5' - Tc3 273 1 53.47 ACCATATAAGTGTGGTTGGGTGCCTCTCCAGCGCTCCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTA:1 - chr3R 26003187 5' + jockey 4760 1 64.36 AACCGTTTCATTCTTTTCCCCATCGTTTTCAGTTTCCTTCAGATGTTCATCCATTGGCTTCTCTGGTCTTTTCGGTGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 9239530 5' - Quasimodo 40 2 78.57 TAAATAATCTTATGTCCCCTCTTGGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCCATGTCCAACTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAGC:1 + chrX 20344951 5' + INE-1 144 1 65.35 ACGAAACGGGGCGCACGAACCTACGGAATGGAGCTTCAACTACCCATTGGAGTGGCCGCTATGAGTTTCATATTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGATTT:1 - chr3R 22903397 5' + gypsy6 7569 2 62.38 TAAGTCACCGACACCCGTACTCATTCCGCTGGGAGACAAAGAAATCAAGGTCTCGTAATCGGGTTTTCTTTGAAAACACTTCGGACTCGCGCGCTGCACAA:1 + chr3L 15621703 5' + gypsy10 460 1 61.39 TGCTTCATTATTTTGTTTGTTAAACCCACTATCGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTC:1 - chr3L 10042668 5' - P-element 428 1 38.61 GTCCTCGGCGAACAACAGAAACGATAACGACAGCCCACGCAAAAGAGCTCAGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr2R 22404178 5' + hobo 25 1 54.46 AAACACACAAGCATACATATAAAAAGTCAGATATTCCTCAAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTAACTTATCTA:1 - chr2R 10654781 5' - Idefix 166 2 60.40 CAGCAGCTCAAAAATATGGACTTAATAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 + chrX 21254728 5' - hopper2 1558 1 74.26 GTTTTGTGGTGTATACAAAACATCCGTGCCTCGCACGCATATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:2 + chr2R 10191704 5' + 297 30 2 63.37 TTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTC:1 - chr3L 25232913 5' + GATE 30 2 55.45 CATAGCGGCAGTTGCACCATCGGTTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCT:1 - chr3L 25995883 5' - Stalker4 289 4 76.24 AAGCATTTATTTTGCGACATTTAATTAGGCGAGATAGAGCGCTTAGTAGCTGACTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTGAAGACTTACAATT:1 - chr3L 3635496 5' + roo 20 2 61.39 TCCTCCGTGATCCTTCGTCTCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 10978720 5' - roo 9017 2 80.20 AACATTTTATGCTGAAAAGAAAACTTTCTTGTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr3R 4509065 5' - 1360 3366 1 66.34 GACTCCAGAAAGTATGCAATGCATTTTACGACTTGCGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGCCTTTATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 + chrX 10824009 5' + jockey 4681 1 67.33 TCGTATGTAGAGTCGTGAGACGTCGATAGTTATTGATGTGTATTAAAGGGCTGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chr3L 27262058 5' - P-element 2862 1 54.46 AATCTCGCCTTTCTGTGGGAGGTCTCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chr2L 7767170 5' - hobo 2889 1 75.25 TACTCGGCTGGGAAGTACCCTCTAACGAGAGTGTCACCAAAATAGCTAAATTTGCATCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATGTATATTATTTTTG:1 + chr3L 10842298 5' + 1360 248 1 62.38 CAAACACACACACACACACTATCCCACAAACACACAGACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGC:1 - chr2L 11705654 5' + accord 312 2 69.31 AGTGCCCCCAATGTTTGCACTTTGAGAATATGGTCCATAATCCCTAATCCCCATAGGAGTTATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACAC:1 + chrX 3359196 5' + roo 8800 2 54.46 GTTTCCGTTTCCGTTTCGGTCTCCGTTGTGCTGGCTTTTTTGTCGACGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTT:1 + chrX 5636396 5' - I-element 270 1 54.46 AGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAG:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 5316 1 54.35 TTATTATGGCGAACAGTAAAATCAGTCAACTGTTTTTGATATGTTTGTGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr2L 10687757 5' - hobo 2911 1 54.00 ATCTTTACCAAATGTAATAATTGCTTCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAA:1 + chr2L 18277216 5' - Ivk 20 1 75.25 AAATCAACTGCATTTTGACCCTACTCAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAG:1 + chr3L 10555732 5' + roo 457 1 74.26 TTTTGGTTGTATCGTATTGCATTCACCATGTTTGGGTTATTTAGTTCCGTTAATAGTTTTGTTATTTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCT:1 + chr3R 545160 5' + Transpac 4923 2 82.18 ATGACGACCCTCTCATACACACACTGGGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTGCTTG:1 - chrX 1651865 5' - I-element 5078 1 71.29 TTGGCCCATGTCATCAATTTTGTTCTTTATCTCCGTTTAACTCTAAGGATCTCCAAAGTAGAATAAAGCTATAGCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGG:1 - chr3L 12118882 5' + Ivk 4927 1 66.34 TCCCAACGCCCGTGCAAGAAGACAGACAAGCCAACCTCATCCAATCCAATCCAATCCAATCCAATGACCTAACACCTGCAGAATGCCAACGATCGCGGTCT:1 + chr3L 1469971 5' + Doc3-element 367 1 62.38 ACGGGGGCGTCATTTGCATGTAAACTTATTGTTAGAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAA:1 - chr3L 5382843 5' + mdg1 364 2 66.34 CTTGGCCAATTGGACGCGACTGCGAGGCCTGCACTGGACGTGTGTAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGTATATTCCTTTTTAATTTCAAATTATAACGTACATT:1 + chrX 932461 5' + invader5 3706 2 66.34 ACGACGAGGAGACGAAGGTCTCTGGCAGCTGCTTTGTTAAGACTCTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chrX 17284014 5' - roo 9041 1 55.45 GAACCATGATTGCTCCTTAAACTAGAACACGTTGGCGAATAATCTTGTCGACCCTACTTCCCTCCGACATCTGAAGAGAATACATCCCCATGAACTCCTTA:1 + chrX 11381745 5' + G5A 2692 1 76.24 GGGAAACAAAGTTTGCCGCTGTTTTTCCAACTTGTACGATTTGTTGATGCTTTCGCGCTTGAATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chrX 6739583 5' + roo 8678 2 62.38 GAGTAGACGCCGTAAAGGGTTTGCCGAGGACATCAGGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTTCGTGATTGCGTTGGTAACTGATG:1 - chr2R 10871305 5' - F-element 4410 1 64.36 ACCGTGTTTCGTACGAGCAGGAGTTTTCCATATTATTATTTATGAATGCGAAATACTTTGGCTGACATTTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACCTGC:1 + chr2R 16980025 5' - opus 7500 2 78.22 AGCATATCGTAAAATTTTGTTTAAAAATCGTTCAGGGTCGTTCTGACCCTGTCCGTCCGTATAAACGTCGCGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGT:1 - chr2R 5211570 5' + INE-1 157 1 64.00 AATTCAAATATATAATATATTTGGGTATTAATTTAAAGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTA:1 - chr2R 12370628 5' - roo 371 1 68.32 AGCTGACATATTGACTCCTTTCCAAAATACTGTCCCATCTTTGGCTTAATTAGCAATGACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 16449814 5' - roo 395 1 64.29 AGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTAGTACAGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGAGT:1 + chr2L 15833011 5' - hobo 2817 1 51.49 CGCGTTAGCATGAGCCTGCGATACTTTTTCTGCTGCTTGGGCCCACCCTCCACGACAACCACACAGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAA:1 - chr3L 19912075 5' + Idefix 7103 2 73.27 ACATAGTATTCGAATTGACAGAACCGATTTATTGCCAACCGCCCACTTGCCACGCCTACTTGGCTTGCAGGGCACAAAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 + chrX 12968226 5' + G2 3076 1 58.95 GCCTTCTGGTGTTTTTACTTTAATTTCCTTCGCATTAAAGATGAAGATGTATCTCTTTTCTGGTTCAAATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 + chrX 21668211 5' - 412 488 2 73.27 AGTTTCGTTTTTATTCGACTTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTCTTTCTTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTT:1 - chr2R 9522413 5' - G6 1981 1 77.78 ATCCGGAGTACGAAGAGGGATCTTCTGATGGGGATGTGGGATTAGCTAGGATGTTTGCTAGTTGATTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTG:1 + chr3L 22447995 5' - G5 4560 1 64.36 ATATATAATATGTACACAAATCTAACAAACTTATGCGATACTCAACCTTCTCACTTCGTCTGAACCCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCAC:1 + chr2R 9514006 5' + G6 1916 1 74.26 CTGCAGACTGTTGGCCATATCCTTTGGCCCTCCAGACTGCCGAAGCTCCACCACCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3R 28940709 5' + hobo 25 1 53.47 AGACCGTGAAATGTATCCAAGAACTGCATAATTAAAGGCGATAGCAGGACATGGATACTTTACATTGCACAGTGGTTCCGTAAGAGGCCAAAAA:1 + chrX 20082941 5' + Transib5 6 1 56.38 TGAGTTTACCCATGATTGATAAGTATTTATTTACCGGTCGATTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3L 3776535 5' - roo 9037 1 60.40 GGCTGCCGGATCAGTGGTTCTCGAAAACCGCCTACCAAAACCAATGAAACCACCACGCCTACACAAGTGAAGACATCGAACCGGGAAGCGTTGCGATACAA:1 - chr3R 18057074 5' + ZAM 8037 2 54.46 CCGCACTCGATAATTCAATTATGCATGCCATTTAATGTGTCAGGCTTGTGTGTTCCTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGT:1 + chr2R 18316453 5' - accord 193 2 75.25 CTCAAAACTGAAGAGCTCGAGGACCTGGTCGAGTGGAGCGGTGGATCGGAGGTGTCGATTAGCTTTGATCATAAAGGAATTGGCCCCTG:1 + chrX 18508762 5' + G7 486 1 70.79 TGATTCCCTGACCATGGTCCACGACTTTCCCGCAGATAACAAATTGGGATGCAAACCGTATATTACCTCCGTATTTCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTA:1 - chr2L 12955298 5' + Cr1a 3982 1 58.42 AAGAATGGTTGGAAAAGTCATATAATAGAAATTTAATTTAATTCTAAATATCCAATAAGATCATAATTTTTAAAACAATTTTTAATCCAATATTAATGTAT:1 - chr2R 13302584 5' + Juan 3797 1 54.46 AGTTCAAAGTTCTCAATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 7883153 5' - roo 9015 2 81.19 GACCGTTGAACGCGTTGTCTCACTTGATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTTCATGGTCCTTCGAGCCGG:1 - chr3L 15634699 5' + Max-element 316 1 72.28 CAACTGCATTAAAGATTACCACATCAAAAATGCATGAGACGAGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGC:1 - chr2L 18175223 5' + micropia 5048 1 58.42 CTATCAGGTCTGTTAAAAATATCTTGCATTTAACAAGTTTAGCAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 + chr2L 23374516 5' - flea 226 2 56.44 CCTTGGCATTTGAGAAATTTACTTACTTGAAGTTCAAAATCAGTGTGAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATA:1 + chr2L 19081794 5' - Tirant 220 2 76.24 AGCGCGCAACTAAATGTATGCTACAGCTGAGAAACTAGGAAAATTGAAGTCTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATA:1 - chr3L 5267285 5' - Juan 4194 1 56.44 TTTATTGAACCAAATTGTCTCTAAAGTGATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 12729407 5' - roo 9027 1 76.77 TGGATTTTTCTACTATTATATCAAGTATATTTTTCGTATTGTCAACCTTGGGAGAGCGGAGTTAGAAATTGTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chr3R 21969151 5' + hobo 5 1 73.27 CAAAAGGTAAATATTTTATAGTCAACATAATCAAAATCAAATGCCCGAACGAAACGCACTTCCGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAATTTTTATGTTTATAA:1 - chr2R 16537235 5' - 3S18 353 1 72.28 ACAAAAGACCAGCGAAAAACTCGTCAGAGTTGTATTGGCTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAA:1 + chr2L 69717 5' + transib2 14 1 58.33 TGGTACGAGGTCCTGAGGCCTGATCCCCATTGGGTGCCGAAGAGTGGATCGAAGTGGTGCCTTGACGGAGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCA:1 + chr2L 3720971 5' - G2 2740 1 74.26 ACGCAATGCAATTCACTTCAATTCGTTTTGGCAACACTAAGCCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCT:1 - chr3R 11048339 5' - copia 101 2 59.41 ATTTCTGGCGAATTTTCCTCTATCGATACCGCAGTATGCTTTTCCTCCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAA:1 + chr3R 9479544 5' - I-element 350 1 56.44 GGCCAGGCCCACACAGAAGGAAGATACTTGTACTGCTCCAAATAGCCACACTTGATTGCTAGGGACTTATTTTATTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGTT:1 + chrX 20115769 5' + HMS-Beagle2 232 2 55.45 CACTTAACCAATTTATGAACCTAAGGTTCAAGTTATGCCCCAATAAGGAAATAGAAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 + chrX 14965162 5' + FB 22 1 55.45 CCACCGTGGTGCAGAATGAAGAGTCTATCCTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCAT:1 - chr2L 20835054 5' + Quasimodo 69 2 70.30 TTGGCGAATCTATATGTGGAATGTGAAGTCCTGAATTTAAATCTAAACTGGTGCGTAGGATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTT:1 + chr2L 12802173 5' - invader3 5446 2 59.41 ATGTTCCCGTGAACAGCGAGGCACCCTTCGGCAAGATTGAGTAGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGA:1 - chr3R 27020298 5' + 1360 33 1 64.36 CAACCTCATCGATGAGCTGATAAGTGGCAATTGAGACTATACGCGTACGTGTGCGGGTGTATATCTTTATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr3R 18887005 5' + 297 6585 2 74.26 CGATAAAGGCTGAGAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr2R 22856598 5' - 1360 3362 1 57.43 GAAAATTGGATACGAGAATGGTAAAAAATAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCACACCCAATCCACACATC:1 - chr2L 20533128 5' + Ivk 5057 1 70.30 CATTCTTCTAGCAGAACTTTAACAATACCGCTATAACATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2L 7504879 5' + roo 8704 2 70.30 GCACTTTGGTGGCATTGACCTTAATTGGTCTAAGCCTCGCAAGCCGATTAATTATGCAGCAAGCATTGGAACATGAAAGCTAAATTCCGAATTACCGTTGC:1 + chr2R 11861172 5' - Tc3 160 1 80.20 ACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:2 - chrX 21945918 5' + F-element 53 1 69.31 AATTTTATTAGGTCGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTT:1 + chr2L 14074941 5' + jockey 243 1 53.47 TGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chrX 20330562 5' + P-element 28 1 52.48 ATGGGAAACAAAGTTTGCCGCTGTTTTTCCAACTTGTACGATTTGTTGATGCTTTCGCGCTTGAATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chrX 6739581 5' + roo 8676 2 64.36 AAAGCGTATAAACCGAATGCTGCTACAAATGAAATCATTTAATAAATATGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGC:1 + chr2R 19203068 5' - rooA 7536 2 57.00 TCCATGTTGTGTTTGGGCGAGGACGAGGAGCCTGTTGTCCTTGCCTCGCCCGCCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGT:1 - chr3R 9372199 5' + F-element 477 1 59.41 GAGCAGTCTGACCGCCCAGAAAACCGATGTGGGCGTGGGCCATCATCCAAACATGACACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 + chr2L 9135192 5' - blood 335 2 62.00 AATGATGGCTCTTACTATGTATTATTTATTGCATTCATATAGCAACTTTATCTTTAAAAATTAGATATTAGGTAGAAAAAATGTAATATTCAAAAATGCAA:1 - chr2R 20379286 5' + TAHRE 10324 1 58.42 AAATAATTCAGCAAACATCAAGGAGAGCGCAGAGCGGGAGAAAGGACACTAAAAAAAGGGCGCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 + chr2L 11804997 5' - P-element 2873 1 61.39 GGCGCAAAAAGCAACGCACCACGCCACATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr3R 17508149 5' + jockey 58 1 72.28 AAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:2 + chrX 19819995 5' + hobo 51 1 79.21 GTTTTTTCGTGCTTATGATTATTTCGTGGTCCAAGTGGAGTTTTGTGGTTCGTGGGGTTTCAGGGAGGTCTTGGAAATCAACTTGTAATTTCTGAAAGGCT:1 + chrX 2269137 5' - Ivk 269 1 64.36 AGTCTAAATATCCTGAACTCCTCTTCAAATCAAAAGACTTAGGCAGAAAATCGCACTGAAGGCAAAGTACTCAGTCAGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATAT:1 + chr3L 8326433 5' + 412 330 2 70.30 AGCAATTTCGCTTCTGGTTTGTTGCTGTTTTCCTCCTTTTCTGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAA:1 - chr2L 16436350 5' - Doc 296 1 58.42 GCTTCAAGGAACCAGCTTACAAACGGTTTATTCACAATATCATATATAAGCATAATTAACAATATATCAAACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACA:1 - chrX 818122 5' + Quasimodo 60 2 76.24 CCACTAATTTTGGCTCGCATACAAAGTGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chrX 13881334 5' + jockey 56 1 68.32 AATGTAATACACGATTCGGTATTCGAACATTTCTGCGCAACAATAGAATAAGAACCTTTAATGATCAAAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAA:1 - chr2R 1076548 5' - FB 284 1 69.31 CCAACCAAGGACTTTTTGCTTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 12058663 5' - roo 351 2 79.21 CAAAGTCTACCGAAACTCTTCAAAACTGCCACGCCCACATTTTCAAATTTTTCCACGCCCACTAACCGCCCAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAACAAT:1 + chr2L 2932528 5' + INE-1 253 1 80.20 AACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATTATTATTATTCTAGTGTCTT:1 - 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hobo 2915 1 55.45 CAATCGGTGCTGTGTTAGTGGAACACTTGGAGAAAATATTCATTAACCTGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chrX 15259099 5' + roo 28 2 58.42 CATGACAATATCATTGGCTGTTTGCATTATGCAAGCATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 - chr2L 5659485 5' - jockey 4951 1 67.33 CCACATGGGACCCAGCCCTACCATTTTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACACAGCTTAAGTTCTCGGCTGATCAGTATCCATGCGCGGTCCACTCAAG:1 + chr3L 17933051 5' + Quasimodo 412 2 75.25 AATAAAAAAAAAACACTTTACCACCTAGTCTAAGAATTCTCGAATTCAAACATTCTTCAAATGGAGCACGGAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAG:1 + chr3R 19458716 5' + Porto1 317 1 77.32 GGTCGCACATTCTGGACACCATCCAGTCGAATCACTGCGGTGGGTATTTTGTGAGAAAAACACTTGTGGGGATACCGTTAAACACAT:1 - chr2L 3797376 5' + hobo 227 1 59.77 GCTTGAACTTTGAGTTCGAGCACGACAGACATTAAAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 - chr3L 4737506 5' + Doc 4701 2 86.54 GTGTCACATTCGATGATGGGAAAACAGCAGCTTTTTGAGGCCATGCTGAGCAATGGAGCCAAGACGTTTGCGGATTTTTTTGCCCAAAAATTAGTTTTTTT:1 + chr2L 12262242 5' + FB 81 1 69.31 TCGTTCAGTGTATACATAAGTGCAAACTACAAACAAGCTATAACAAGGCAAATACATCAAGGTGTTTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chrX 12276741 5' + hobo 9 1 70.30 GTCAGGAGGTCGGAGGTTAGCAAAGCACACTGGCACACGCATCGAACTATTGCTCCCCTAGGATAAATTAATAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCA:1 + chrX 10552547 5' + pogo 1651 1 73.27 TATGAAATTAAAATGCCATAATTCGATTATTTCGCGAGCGAACGGTCCTTTATGCTCCTTGCATGCCATCCAAGGACGTTAGATGGTATCTTTAGAAGATT:1 + chr3L 21159793 5' + Rt1a 5035 1 61.39 TTTCGATGTGCGTCAAGATAACGTCGATAAGTTGCCAACAATTAAGAAACTATGGAGAGAGAAACACGTATGTATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTAG:1 - chr3R 3750332 5' - S-element 1714 2 67.33 ATTTTAGCCCGTCTGCTGGGGAGGATAGCTGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTA:1 - chr3L 17215314 5' + jockey 239 1 70.30 TCACTAGATCACTGGGATTTCCGTGTGATCCTCCTATTTCATATAACAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAACGCG:1 + chr3R 3621151 5' + Porto1 332 1 60.40 TTATGCTTGACTTTTGCGCCTCAATGACTTTTGTTATCTAGTAGGCCTAGTGCTAGGACATTATCATGGTTGTGTAGTTTACTTATGTATCGCTCAGCATT:1 - chr3R 14478457 5' - G3 4367 1 63.37 TGCCAATTCAAATGTTGTATATGCTGGACAACTTGAAGAGCTTATGGATAAATTTCCATGGGTAAACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTA:1 - chr3L 16691393 5' + G2 2829 1 65.35 GTGGATCGGCAGTACTCGGATCGGAGCAACGCTGATGTTATATATGTGAATGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTCACG:1 + chr3L 21673172 5' - 1360 3304 1 57.43 TGATTATTGCGAGTGTGAAACAAGCGGAGACAACAATAAGCGGTTGTCTAAACATGTATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 - chr2R 20396341 5' + blood 15 2 67.33 ATCCTTAATGAATCGGGCTCCTTATAGAATGCCTTTCCAAGCTAGACCCACCTACAAGCTACATTAATACCTACCGTTGACTCCCCGGAGGTAACTGGTGC:1 + chrX 20762997 5' + ZAM 457 1 56.44 TTTCCAGCATTTTATTTACATTTCAATTGTGAAATGCTTTTTTTTTCAATAGGAAACCATACGAAAGAGTTCGACATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCC:1 + chr2R 21262987 5' - roo 8650 1 76.24 AGAAATGTTGTCTTTAGCTGGCGGTAGAAGATGCATCAGCAGACTCGCACCGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACT:1 + chr2L 21245625 5' - Cr1a 4076 1 56.44 TGTTGTCTGTACATCAACTGGATTGCCGCGGTCGTTATGCGGAGTGTGACTGATCTAGAGTACAATGTTACTGCACGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAA:1 + chr2R 4139266 5' - Dm88 122 2 56.44 AGATTGGAGTCCATATGCTCATCCTTACAGCAATTTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATT:1 + chr3L 18648991 5' + F-element 4233 1 71.00 CATTATGTGTTCCAAAAAGATCAAATTATTTCGTAATTTTAATCATGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTAT:1 + chrX 6156164 5' + 3S18 5797 2 53.47 TCAAAGGTGAATTGCTTTCTCATTAAATTGCACATGAAACATGAGACATACATTTTAAACAAAGCAACTAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3R 12729327 5' + roo 8671 2 72.28 AGCTTAGATAAAGAAGATTTCACTGCTGACGTGGTTACATCAAGCTACTTTTTCAGGATGCATCGGCGGTTCACATGAACACGGGATTTCAAAAAACACCA:1 + chr2R 2094924 5' - mariner2 605 1 71.29 ACTGGAGTGTCCGATACTCGAGGCGCGTACATATATTTTAATTAAAGTAACAACACAAATCAATTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACC:1 - chrX 16922159 5' + Porto1 4481 1 58.42 CTATCTGGCCCTCCATTCCAACCTAGCAGTTGCGATGCCCACAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTT:1 + chr2L 20286760 5' + diver2 137 2 77.23 CAGACCGGCAGTAAAAAATAAATGGTTCAACTTTGAAAAAAAAAGGTATTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTAC:1 - chrX 4975335 5' + F-element 4222 1 55.45 TGTGATATTTGCTGTTGGTATTGAAACTTGGCATGTGCAATGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chrX 19820036 5' - hobo 2901 1 65.35 TTAATGTAGTTTCGCATTTTATGGTTCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCCCA:1 - chr3R 3478643 5' + Doc2-element 452 1 72.28 CTGCGAAATGTGTGGAAACAATATAACTCTTGTTACAATTACTAGATTTATTTGTCCCGCTAAAAATAAAAACCTCAACAACAAAAACAACAATACCGCTA:1 + chr3R 29293336 5' + I-element 136 1 71.29 GTGTGTGGGTTAAATAGCTAGCATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGC:1 - chr3L 24803166 5' - 1360 3270 1 77.23 GGCTCGCGGCTTCGTCATCGTAGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGTTTGATATGTGGGCGAATGGGAGGTTGGAGTTGTTTTTGTTTTGTT:1 - chr3R 17922255 5' - Porto1 257 1 78.22 TATGATTACGACGAGTCAAATCGTAGCAAAAAAATAATCGAGTTAGTGACCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATC:1 - chr3L 23773624 5' + pogo 437 1 69.31 CGAGCGGAGAGTGTGAGTTGTGATTGAATTGGCAATCAGTGGACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTGACTCATTTTTTGTACGCCTAAAAT:1 + chr2R 7317153 5' - hobo 2689 1 45.54 CTGGGAGCCACAGATGCAGTTGGATCTAAAGATGGGAGTTTTGCGGACGGGTCGGCGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGG:1 + chrX 17566177 5' - jockey 4740 1 61.39 AGTGGGTGCGTTATCGTTCACATCCAGGATGTCTACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTT:1 - chr3R 14637062 5' - 1360 3141 1 66.34 CCTAAAGATACCCGTTAGCAAAGTAAAGGTATAATGAACATATATCCAAATTTTTATTTATTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTAC:1 - chr3L 4267237 5' - Juan 4189 1 50.50 GGCGCATGCTAAGCGATTCGCCTGAGACAAAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chr2R 17346024 5' + hobo 17 1 60.40 ATCAGATGAACATCAAGGTAGTGTAAGTTTGCCACCTGGGGACACGCTCCTTAAATCTAGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATAATTACAGTTATCGATTT:1 - chr2R 25138982 5' - HMS-Beagle 242 2 57.43 TTGCTAGTTTATTTTGTGTGGCATAAGGACAGGGTACTCGGCATTGTGCATATAATCAAAGAAAATTACTTTATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAAC:1 - chr2L 13314154 5' - jockey 4983 1 66.34 GTCAGTAAATGAGAAAAAGGTTAGTTGTGCCAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr3R 12215318 5' - hobo 2893 1 67.33 GCCCCGGCATTTTGCATTTTCCCTTGTATGCTCCTTGCCTTTGCCCACATTTTCAGATATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTA:2 + chr3L 13264440 5' - Burdock 6376 2 64.36 CATTCCTACCTCACCACATTAAAAGTGGCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 - chr2L 11805064 5' + P-element 48 1 32.67 AATGATTAGAATTTTCTTCGCTTTATTATTGCCAGCTCTATTTATGTGTTTCGAGAGGAGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGGGCGGACGTGTGCTC:1 + chr3L 24051843 5' + Bica 47 1 50.00 AAGGCAACTGTTCAAAATGATATAGTTACAGCTCGACTAACTTGTTTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTC:1 - chr3R 17142701 5' - Transpac 48 2 58.42 GCTAGGTGGAGCTACTGTTGACTCCTTAGCACTTCCGGTATCAGATAGTTGAGGCAATACAATAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr2R 17650038 5' - 1360 3377 1 69.31 TTAATGAAGCCCGAACAGACAATTTCATGGGCTTCGATTTTCGAGTATACCAATAGAAAAACTAAAAAAACTACTACACCTGTCAACTGAAAAGTAGCAAG:1 - chr3R 16675128 5' + Fw3 169 1 56.44 TTTCAGCTTCTAGTCGCTGCTTTCACCGCACTTTCTTATTCGAGCAACTTATGTTTTGAGCCTCTTTAAATTTCTTGATGATATTATGGGATCCAAAGTAT:1 + chr3R 10639363 5' + hopper 352 1 61.39 AGACAGAATGCAGAGGAACACAAGGCTGTCAGTGCCATAAATATTTCGACAGCCAAAACAGAGCCAAAACAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAA:1 - chr3L 5827513 5' + Doc 472 1 66.34 CTTCTGTAACTTCCATTATTACTAGTTGCCACTTATGCTGTCCAGTGACATGTTTATTGCAGCCCATAATTAGAACATATATAGTTTGCCTACTTATCATG:1 - chr3L 23455009 5' - rooA 7256 2 78.22 GTACAAATAGATCTCCAGTGCCTGCAGCGTGTAGCTGCAGCTGTCCCACAGTATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGACCTACC:1 + chrX 16958945 5' - R1A1-element 4979 1 62.00 ACATCTTCAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAAGATGAACACTCATAAG:1 - chr2R 4677364 5' + invader3 3 2 76.29 ATTGCAAAATGTCAAGGACTCGCCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 - chr3L 9174754 5' - 412 7517 2 56.44 AGAGATCCACATTGATTCTGGCGAAGCGCGCCCAGAACTAATTCGCTGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGC:1 + chr2L 3824684 5' - GATE 8335 2 60.40 GTCGAGCTGAACGGCCATACCAAAAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 19933696 5' - roo 9022 2 77.23 CTGCACTTTGCCTAAGCTCTAATGGGAAAATGGAGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTAG:1 + chr3R 11004039 5' + hobo 2626 1 67.68 TGATATTTTGGCAAAACGCATCATATTATTTTAAAAAGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGTAGGGTTTGCTGAAAGGGGTGGCCGGT:1 - chr3L 4061983 5' - G2 6 1 61.39 TTCGGCTCTTCGATGCATTTTCCTTAAAGTCGCCATGGAGTTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr2L 16136666 5' + hobo 33 1 57.43 GGGAAGTCCACACCGCGCCTTAATGTTTCGTTCAATGTTGACAAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGT:1 + chr2R 4501456 5' + G-element 35 1 54.46 TTTTTTTGGTGTTTGGTTGTTTGGATGTTAGCTGGTGGCACACTTTTGGCTGAATGGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr3R 23080909 5' - 412 7525 2 57.43 AGCCTGAAATCTAATTACAGAATATTATTGGTGGTATTAAAACTATGTATATTAATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr2R 8271429 5' - pogo 2081 1 59.41 AGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1 - chrX 21668080 5' + Tabor 6865 2 53.00 TGCGTTAACCAGGCCAATAAAACATGTCCCCGGCCATGGGTTTTGTGGTATGTGGTTAGTTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3R 14832573 5' - hobo 2921 1 61.39 TAAGGATGACGAAAAGATGATGATTTTCGACCAAAAGCTTTTTTTATTATCAGGTTGCCGTCTCTTGTTTGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGC:1 + chr2R 25159499 5' - I-element 334 1 59.41 CGTTGGTATTGAAACTTGGCATGTGCAATGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chrX 19820024 5' - hobo 2889 1 77.23 GTGAATGTTTTAAGGGCGTAGAGATCCGAAATGTTTGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATA:1 - chr3L 23747628 5' - Tirant 314 2 63.37 TCCCTGGGAGATCATTAAGGGAATCCATCTTGGTCTAGTTAAATGTGTCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACG:1 - chr2L 17582827 5' + opus 7102 2 55.45 CCATTTCTCGTCAAAAGCGTATACTTTGAACAGAATTGCAGAAAAGCTTTTATATATATATATATACACACACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCAT:1 + chr3R 22073747 5' + accord 450 2 71.29 AAATACTAAAAGAAGCGAACTTAAACATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 4056317 5' - roo 9022 2 76.24 CTTGCAGTTTTTTTGCCTTTTGAAATGTGTCAATGTGTTGAATATTGTCTGTAGGAGAGTCAATGTCTTCTTCGGCTCTGACTGTAGACTCGCGTAAGCGA:1 + chr2L 16702066 5' - Doc2-element 4588 1 75.25 CGCTGCCACTCCTGCTTTTGATGTTAGAGGCACTGCCTCAACAACCACCGCCCATTTCTTGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr3R 15714222 5' + jockey 24 1 58.42 GAGCTATTACTTATTACTTATTACATGGCTAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATG:1 + chr3R 16611513 5' + Stalker2 7342 2 71.29 CCTCGAAATCCCCAACTGCTCATCCCCCGTTTTGAAAACATGATTTGTTTGCCGAAGCGCGTGCAGTAGCCCAAGTACAACAACTACTTACCTGCAACGTC:1 + chr3L 10341650 5' + HeT-A 5689 1 73.27 CTACGAGTTCGTTTCATCGCGCCGATAGGAAATAACTTGATTTGGTTTAAAACAATGGAAATACAAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 - chr3R 27926662 5' + I-element 15 1 69.31 GATGGACACCGAAAAATCCGATTCAGATTCAGATTCGGTTTCTGTGTGCGCTCATATTTTTCTTTTGTTTATTGTTTTCACTTTTTTTGTTTATCTTGTTC:1 - chr2L 7674736 5' - Porto1 156 1 54.46 AAAAAATTGATGAAATACCAAGCCAAGCATCGATTACGTGAAAAGTGCCAGTGTTCGAGTCAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chr3R 24172959 5' + pogo 12 1 67.33 AATCTTCCTTAATCTCGTCTTTTATATCAGGCTTAGGCTGCTCTTTGATTTCAGGCTTAATTTCAGACACTTAATATTAATTAGTTCGACACCGATGCGTA:1 + chr3L 3512308 5' - 3S18 6034 2 63.37 TATATTTTTCGTATTGTCAACCTTGGGAGAGCGGAGTTAGAAATTGTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:2 - chr3R 21969126 5' + hobo 30 1 55.45 AAAATAGTAATTATTGATTTTCCTGGGGCTCCTTGCGTGTATTTGTGCATTAAGTAATGTGATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTTTCCA:1 - chr3L 17644736 5' + micropia 32 2 68.32 TTGAAATCTAGAAAACTACAAAACAATCTCCTAAATCTGGATCACGTTTTGCACGCTTATCTTAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chrX 14521624 5' - roo 401 1 65.35 CACTTTTTGTTCAGCGCTGATTGATCTGATAGTGCAAAAAAAATGTTTAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 - 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P-element 2846 1 36.63 CATTGTTGTGGCAGTTTTCAAGTTCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCA:1 - chr3L 6987729 5' + I-element 4974 1 76.24 AGCGGATAGCTTAGCGCTGGCAAAGGTAATGACAAAAACAAAGACGAAATAGAACTGCACTGTGATGCAAGCGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr2R 2281608 5' + 1360 8 2 62.38 AAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTTTCCATTTAACAAAGTCAGTTTCCAAATGCTTTCCAAAGTGTAACACGCATATTGCAAAATATTTTGCATATTTG:1 + chr3L 20289114 5' - Cr1a 174 1 79.21 GAACTGCTGCGAACGACAAACGGAGGCGTCTTCGCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr3L 813870 5' - roo 9030 1 66.34 TCAATGTCAACTAAGCTACAGGTGTTCAATGCACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3R 10078373 5' + roo 44 2 70.30 ATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAA:1 + chr2L 23299985 5' + invader4 352 1 64.36 TATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAA:1 - chr3L 17593058 5' - 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chr3L 7770537 5' + Tom1 312 1 57.43 TGGAGCACACTTATCTTGTTCTCGAGAAACTAGCCGATTTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTTCAATGCCAATCTTGTGCAAATGGCTGTG:1 + chr3R 25270700 5' - baggins 5161 1 61.39 GCGTTATGTTGCTGGCCCATCATTCTAAGAGCACCAGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCCTGATGGAAAGCGA:1 + chr3L 14023136 5' - baggins 5260 1 63.37 CGCGGCTACTGGAGCGAACGATGTAAACTTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 21782100 5' - roo 9025 2 71.29 CCTTCTTCAGTTGGAATAGGGGCTTCCCCAATAGGAATTTTAATAGGATGCCTTGTTGTTACTCATTGCAGCAATTAGTTTAGCAGTTTCTTCTTCTGTAG:1 + chr2R 2894985 5' - G7 154 1 60.40 AATCGTCACATCATTACTTATAGTCCGGCAAAATATAGTGTTTTGTGTCGGGCTTAGCCTAAAAATACACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 + chr2L 12942174 5' + jockey 4683 1 64.36 TTCCAAATGGCAGAAGTGCAAGCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATCTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 8914526 5' - roo 356 2 70.30 TTTTTGAAATCTAGAAAACTACAAAACAATCTCCTAAATCTGGATCACGTTTTGCACGCTTATCTTAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chrX 14521621 5' - roo 404 1 68.32 CGCACTCTTTACCTGATATGCCAATGTCCACCCCCACCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTGTCTGCCGCGCATCAGA:1 - chr3L 22459413 5' - invader1 78 2 70.30 CACCGGAAAACAACAGCAAACAGGATAGGACAAATAATCGCACCTTTGAATACCCTTTGAAGAATATGTAGCTGAGTTTCATTCTTAAATCTATGTTTGAG:1 + chr2L 16103674 5' - rooA 7419 2 70.30 TCAAGGGTATTGGTTTCCCTACCCTTGAAGGGTATTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 7883190 5' + roo 39 2 66.34 GTAGTTTTACTGATGCGCTTTCCAATCGAATCGAATTTGGTTGGAAGTGAGTTTTGTGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGC:1 + chr3L 12645480 5' + jockey 4623 1 43.56 CCAGGATAAAGAGTTGTGGATCCAATAACAAAAATT:1 + chr3R 29331935 5' + 17.6 7016 2 52.78 CTGCGTTTTTGACTGTCTGTGCTACACTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3L 10554820 5' + roo 8711 2 72.28 TGTCGCTGTGTGGCGTACATGTGAGGTCCTGTGTGTGCGCGCGTGTGCGTATGTGTTTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr3R 27386367 5' - hobo 2923 1 61.39 GGGTGAGAGAGCGAGCGAGAGAGTATCAAGAGAGCAAAAGCGAAAGAGCGGGCGAACGTGCGGTTGCCGCCATATCTAGGTTCTGTAGACGAAGGGTTTTC:1 + chrX 7608296 5' - X-element 490 1 61.39 TAGGCTACACGCCCATCCAACTTGTGACACTTTCATTGTGTAAAATGTCCTGCAAAGGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAAT:1 - chr3L 3531689 5' + G2 2638 1 59.41 TGTAGTTTTGAATTCCACGGGCAGAGCAAAAAAATTTTGTATTTTCCTAGGTATTTTTTTTCTATTTTTTTTTT:1 + chr2L 11037076 5' + hopper 143 9 81.08 CTTTCGTAATTGCAGCTTGTCAAGAGATCTCACTCTCTTTTTTTTACCGTTATCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCCTCGC:1 - chr2R 652572 5' - Bica 480 1 63.37 TAAGCCCGAAGTGTAAAATGTACCTATATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTT:1 - chr2L 7865172 5' - invader2 4812 1 74.26 TTGATTACCACGCATCTGCGAGATACACACTACACATACATATCTACATATATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 + chr2R 11400321 5' - 1360 3367 1 55.10 GAGTATAGATAGTAATCTTAATTGAGATCCTGGTGACGGGCAAAATTACCCTTTTTCCGCTCGCTTAAGACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 + chr4 718869 5' - jockey 4985 1 40.59 AAACTTATATTGTTTGCCATTTAAAGTAATTAACCGAAATAAGGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATAAAATCAGAACATTGGGAACA:1 + chr2R 17292468 5' + Tabor 34 2 55.00 TGGCTAAAAACTCTATAGGTAGCCGCCGCCAGTCATCATCATTTGACTGATTTAGTTGTCAGTAATTTTAGTAAAGCATTTGACTCTGTTAATCATTACCT:1 - chrX 13904292 5' + Q-element 332 2 65.35 AAGTTTTCATTAAATCTAGTTTATGATATTAGATGTATGTAATTATAACTTAGCAATATTCAAGTACCCAAGATCCCATAAATTTCAACAATTACTTTATT:1 + chr2L 6122432 5' + 1360 376 1 81.19 AGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGAGAGTAGAGAGAAAGAGACCTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGAGAATGCCATAGTCTAG:1 + chr3R 18346609 5' - INE-1 577 1 68.32 CAGTTTAGTTGGCTGCCTTTTGTCTACACACACACACACCAAGATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 + chrX 14041126 5' - 297 6950 2 71.29 GAAGCAATTTTAAGCAAAATGAAGAAAACCAGCGGCATTGGCTAATCAACTCTAACCTAAAAAATAAAAATTTCCTGATTACATAAAATATAATATTAATT:1 - chr3L 13868926 5' + Burdock 405 1 76.24 GTTCAGTGGTCCGGGGGGCAGCAAAGAACTAGCCAGAAATAATTTATTGCATATATAATAGCGCAATGTCAGCATTCTGCCGAGAGCGCTGCTTCAGAAGA:1 - chr3R 10577357 5' + gypsy4 6725 2 64.36 TACTGTTGACTCCTTAGCACTTCCGGTATCAGATAGTTGAGGCAATACAATAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr2R 17650026 5' - 1360 3365 1 57.43 CCTTTATCGATCTTTACTTTTGTCGTTCTTCTTTCAGTTTAGTTATGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAATTCTGTCATCGATATTTGTC:1 + chr3L 7814694 5' - Porto1 4493 1 65.35 CAGGCGTTCGCCGCCTTTCCCCTTTCTACATTTAACCTTCGAGCTTTGTTACTTTTTGGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 16449715 5' + roo 8681 2 62.38 CATTGGACCGCCAAGGAACAGCGGAAATGATGGGCTTGTTTGTAAAAGGCGATTAAAGGGTGGGAGGAGGAGTCATCATGGCCTACACTGAAGGAAGGGAG:1 + chr2L 17179279 5' + Rt1b 4928 1 62.38 CTGAAAATACACCCAGAACACCCCTCACTCAGCGGCTGAATCATTTGTCTTATGGCTTGGCATTTGTCCTCATCACTGTCGTTAAGTAAACCAAATACGTT:1 - chrX 10397939 5' - gypsy10 347 1 68.32 GTGTTGGTCGATCGGAGGGGGGCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chrX 10629247 5' - P-element 2835 1 27.72 CCGCTCGCTGGCCGGTTGATACTTTGCTGCCGCCACAGCGTTGAATATTCGTGTGCTCCATATCTCTTGACACTTCGGCAATGGGCCGCTGCAACCGTACT:1 - chr2R 9873051 5' - rooA 7343 2 65.35 TTAATTCGGAGTTTGCGGTCGGCGAAGGTGTTTTTTGCTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCAATGTTTAAATTATTATGTATGTCTTCGT:1 + chrX 16543820 5' - Porto1 4384 1 71.29 TAGTGGATAGGCAAAGGGGAAAATCTGTCTGGCATATCTCAGCGGAGAAAGGTCTCAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCC:1 + chr2R 21820383 5' - Idefix 440 2 53.47 AGTAAAACTAAAAAAAAAAACAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAATAAGCCAACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 + chr3R 21067174 5' + Tirant 8112 2 72.92 TTACTGCTCAAACAAGCACTTTACGCTTCGTTTGACTTTGCAAATATCGCCGAAACCCCTTAACCCCGCAACACACTCTGTCTACTATTTTGACCGGCATG:1 - chr3R 5869277 5' - Circe 7386 1 51.49 TCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTA:1 - chr3R 14049399 5' - transib2 2775 1 74.26 GAAGCATGTTCACTCACCTTTCAACTCGCTGCATAAATGCATGAGCTTCGTGGGCGAAGGTAATTTAGCCCCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATACTA:1 - chr2R 19204094 5' - mdg3 5482 2 53.47 GCTGCCGTCCTCTCATCTATTCAATGTTTGTAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 + chr2L 4134339 5' - copia 244 1 67.33 GAGAGAGAAGCCGAAGTTGTGTCCCCAATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCT:1 + chr2R 10190419 5' + 297 6909 2 73.27 TGATGTTGCTGCTGGAGTTGCACTAATTGCTGGCGGGTAAAGGTTGCTCATTCCAGTTTATGTAAGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGGTGCAATACGGATT:1 + chrX 12363764 5' - Ivk 4979 1 52.48 AAAAACATTGCAATGACTGAAACTCTTGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr3L 3986401 5' + jockey 60 1 73.27 ATTGCATTTAAATAATGAAAAAGACTGAAACAAAAGGCCTGTTAAACAAAGGCAAACTGCAGAATTAGATATCATTGTGACCCACGAAACATTTACTAAAT:1 - chrX 10663905 5' + I-element 194 1 61.39 TACAGATGAATTACATATTTCTTCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCA:1 + chr3L 8012057 5' + transib2 50 1 76.00 GATTACAATTATCGATCCGCGACATTAGTTAAAAACAAGAAAAATGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCG:1 - chr3L 24402219 5' - INE-1 533 1 61.39 AAGCTGGACTGCAGGATGCGAAATCGCTGAAAAAGGAAACCGACGAAAGGCGGCGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATA:1 - chr3R 24583723 5' - Dm88 4381 2 53.47 TTAACGCGTGTTTTGTTGCTGTTTGTGGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTAAATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGT:1 + chr3L 18059803 5' - I-element 5100 1 79.21 TCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGATGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTA:1 + chr2L 14074972 5' + jockey 274 1 75.25 CCACCTAAACCTTAAACGAGAGAAAAGAAATTTCAATAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCT:1 - 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chr3L 8074157 5' - Osvaldo 177 1 55.45 GGCCAGATAAAGCATTCGAAAATGCTGGGCTGGAAAAGGTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 + chrX 5133595 5' - HMS-Beagle2 492 2 58.93 AGAATTTCAAATGAGCGTCGTGAACGTAAGAAAGCTGGGAAAAAAGGATAAGTCAGCGTCATTTGAGTCTGTATATGCCTTACTAGAGGAGGGATAATACT:1 + chrX 9208399 5' + Transib5 2550 1 70.30 GTGGAATAGGGATCATGTAACCTGTGCCACTGGTCACACGCAGCGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCA:1 - chr3R 16028980 5' - jockey 359 1 56.44 GTAGAGTCGTGAGACGTCGATAGTTATTGATGTGTATTAAAGGGCTGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr3L 27262064 5' - P-element 2856 1 48.51 AAACTCAATTTGTAAAACGGAATTTTATTAGGTCGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGG:1 + chr2L 14074921 5' + jockey 223 1 73.27 CATAAGAACACTTTATGATCAAGAGCAACAAAAGCTTTTTAATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCAT:1 - chr2R 5957080 5' - I-element 4883 1 59.41 CTTCGATTTTCTGATTTTCTTTTGGCGCCAAAGATTGTTGCATATCAAATGGCGCCTAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3R 20869745 5' - hobo 2920 1 60.40 TTGGAGGGGCAGGCAAGGATCTCAAGGATTTGCACCTTGTGTGGGAAATTTTGGGGAAATGGCCTGCAGACGCACTATTAGTTCCGCTTTTGTGCCGGAAG:1 + chr3R 11288822 5' - invader3 397 1 55.45 GCAGGTCCTGCGCTGCGGTGTTTTTCATTTGCATTTCGATTCGATGCCGTCAGCAATATCGCTGGGGGTGATCGGTTGCATAAGCAAGTCCATTTGGAGCG:1 + chr2R 13601646 5' - BS3 174 1 57.43 AATCAATAAATAATAAGGAAGAATTGCCTTAACAATAAGTAACACAATATATAACAAGAATGCTATAATCGAGTTCACCGACTATCAGATACCCGTTACTC:2 + chr3L 24208976 5' - INE-1 549 1 55.45 CACAGCAGTACAAAACCAAAAAAGGACCAGAGCAACAGAGAAGAGGCCTACCTTTCAAGCCAGTGTTCGGTTATTAAAACACAGCGTGCAATTCGGAATCG:1 - chr2L 12767874 5' + mariner2 207 1 58.42 CATATTATTGATAAAGAGGAAAACGACACAAAAATTATTTACACATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAG:1 - chr2L 21268233 5' + X-element 4420 1 56.44 GGGTTTTTTGGGGTCAATTTTGAGTTCCATCACAAGCAATACATTTGACAATTCAACAACAACCACACACAATTATCGGAAAACATATATTCACGAATAAT:2 - chr2L 11255314 5' - transib4 297 1 71.29 CTCTTGTTTCGCAAATTAATTGTCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACACACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 + chr2L 19698270 5' + hobo 52 1 75.25 AAATAAATTTAAAAATTGACTTTATATAAGAATATTTATATCATTAGAGTATTCATCTTACGGCGTGTGAAAAATTATTTGGGCAATGATTGTTGAGTGCT:1 + chr2R 5260085 5' + 1360 449 1 87.13 AACTGATTAACACAGAGAATGCAGTAAATGCAGGCGCATTTAAGCCGAATAAAGCAGCGGAATTTGCGGGTACTGTAAATGGACACCCACGGTGGGAACTA:1 - chr2R 18064253 5' + gypsy9 101 2 64.36 TGAACTAAATTTTGCAACAATGAAAGGCATGGGAAAATATGAGATCTTACACAGGCACACACATGTGCGTGTCTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 16288747 5' - accord 7032 2 59.41 CGGAGGCGGTAATTCGATGCCGTCATTATTATTATATTGTACCGCAACCAAGGCCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAAC:1 + chr3L 88710 5' + I-element 5178 1 57.43 GGCGTTAGAATGGGCGTGGCAAAATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATG:1 + chrX 14148352 5' - Quasimodo 183 2 64.36 TTTTTGGAGTATTCAGTAATGTATTTTATTCAGAGAACATGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 + chr3R 27020232 5' - 1360 3357 1 63.37 GATTGGGGATGGGCCACTTATCCGTGCCCCCGCTTAATTATTCAACGACAATGGGCAATTGTCAATGGCGACTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3L 11367471 5' - roo 401 1 69.31 CATAAGGTTCTTAAGGATTCTCACTCGTATATTAATGTAACCGAGTACGAGTATTAAATGCATTAATTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAA:1 + chr3L 7412399 5' + invader3 12 2 61.39 CGGCTGTGCTTTATCGCTTATTTGCCATGGTGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCAGCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATA:1 - chr3L 15194148 5' + 1360 3351 1 69.31 GGTGGCCTGGTCGGCTCCCGCTGCACCTGAGGCAATGGAGCATTGGGCGCCTGTTGGCTTTTCTGCCGGTTGCAGGTAAGTAGTTGTGTACTTGGGCTGGG:1 + chr3R 28826696 5' - HeT-A 5675 1 70.30 TAATAGCCAGCACTCAACATAATATAACAAAGTATGTATACGTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTGGTATATGGCTGTTGCTATGTGGTAAT:1 - chrX 14515821 5' - Quasimodo 57 2 58.42 ATTATGTGGCATGGCCACACAAAAGAATATATTATGTAAGTTATTAAAATTATATCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCC:1 - chr3L 15335157 5' + R1A1-element 390 1 62.38 TCAAATGAATGCACAGGTAAATGAATTAGCTCATACTAAAACATGCACTTTTGACATGCAATAATTAAATAACTGTGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGG:1 - chrX 6339218 5' + hobo 336 1 74.26 GCATCCAGGCACGGGAGCAGCTGATCTCGCAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 28879969 5' + roo 8710 2 72.28 CGGTGCAATTAATACGGGCCCGATGATTGTTCGCCTTCTTGAAAGCGGATAGGGAGTGATCCTCCTTTGCAGTATTCCACTGTCGACGTCGAACACCTGGA:1 + chr3R 8391207 5' - R1-2 241 1 68.32 GCGTTAAACCATTCAAGAGAAATAATTAGGGATAAAAGTCAAGAGGCATAAGGTAAAGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr4 1234604 5' + 412 18 2 61.39 ACAAAAGCCACGTAATCCTGGCCACTCCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTACAACCGCTGCCTTACATACCATTTGGTGCCCAACAAG:1 - chr2R 23475575 5' - Circe 7132 1 72.00 TCAAAGTTGCCATCGTCCTTCTGCAATATAAATACAAATTCAAATATATAATATATTTGGGTATTAATTTAAAGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:3 - chr2R 12370664 5' - roo 407 1 81.19 TCGCGTGGTAGGCATGGAATTTATTGCATACTTTTAGGCGTTGCACAGTAAATTCTACGGATATTGGTATATGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:2 - chr2L 16125122 5' + hobo 4 1 71.29 GGAGGAAATGCTGCGCAAGGAAGTGGCGTGTCCATATCCTAGACCTATATATAGTATATCTTTACTGTACAGTAAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAATAA:1 + chr3L 21422891 5' + rover 7188 2 57.43 AAACACAACACATGTGATCAAGAGTTATTTTTGTCAAGACTCCTAAAAGTTCCAGCGCCCTCGTAAACAAATAATGGTCCTTATTGAGAAAGACAGTTTCC:1 - chr3R 4497799 5' + Fw2 269 1 56.44 CAATTATAAATCTTAAACACGATCGCCCAGAAGAACACCAAGTTCATCAACCCGTGTTATTTTGCCAAAGCGCACTTACTTAGAGTGTAAGTCGT:1 + chr2L 11044529 5' - Q-element 713 2 72.63 GAAATTGGTCTCACTTGGTCTCATCTATTTACTCTCACACATTAATGTTATATAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGA:1 + chr2R 4194274 5' - 1360 3246 1 51.49 AAACAACTCAGACCCAACCTAGCTAACATTAAACTGGTGATAGAGGAAGAGTTCTTCCATGGGGTCTTACTACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 + chr3R 15631078 5' - opus 499 1 76.24 AACCACTGAAGCAGGTGGCTCTTGGTCATTCATAATTATTTATCGCACTTTCAACTGCCTTCGATAGTGGGTGCTCTTTGGCCTTCTTTGGAGATTATAGT:1 + chrX 12976382 5' - Osvaldo 1265 1 56.44 AGGTACACTTAAATAAAATTGCTAGTGTCGATGCGTTTTAATTTTTGCTAAAGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTT:1 - chr4 184068 5' + 1360 127 1 72.28 GGGCAAGGAGCTATTTGATCATCATGATAATTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chrX 3358714 5' + roo 46 2 75.25 GATAGTAATCTTAATTGAGATCCTGGTGACGGGCAAAATTACCCTTTTTCCGCTCGCTTACGACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACT:1 + chr4 718876 5' - jockey 4978 1 42.57 TTATATATATTTATATCGGCGCGGTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTG:1 + chr3R 851708 5' - F-element 292 1 82.18 GTAGTCGAGCTGAACGGCCATACCAAAAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 19933699 5' - roo 9025 2 74.26 CCGTACAACTCATTATGAAGTCCTCGTCTTTTGGCTTCCATTTTTTTTTTATTTTTTTTT:1 - chr3L 22649243 5' + hopper 142 2 55.00 TATACAGATTTAAACAGCAATTACATTAGTTTAAGAAGCTAAATGCTATATTTTAGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3R 30485900 5' + pogo 20 1 56.44 GTGATCGAGTGATAACAACTCAGCTGAAAAATCAGGGCACAAAAATGGGTCATTAGCCAGCTGTCTCACGCAAACTGTTAGAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 13327063 5' - hopper 148 115 76.24 TCCACCTTGACTTGGATCTTGGATCTCGTTTATGCGTTTGTTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chrX 18991531 5' + pogo 34 1 63.37 CTCTTGCTGCCAATACAATACGACGACAAAATCGGTTGTTTTTAGTGAAGTGAATGGTTATTAATATAATACAAACAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACG:1 - chr2R 4023370 5' + Doc3-element 96 2 73.27 TGGTGCAGAAAAAACGGGAAAATGGGGAAAACGGGGTGGTGGCGAGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAG:1 - chr3R 25573595 5' + invader2 4702 1 59.00 GTGAAAAATGGTTGAGAGCTGTGCACTTTGTGACACGACAGATCCTTCTCCTCAACTCCCAGGATCTCTTCCCGTGATCGTCCTTCCGTGTCCTTCGGGCT:1 + chr2L 1777578 5' - gypsy8 497 1 73.27 GAGATCAACGGCCCAGAGATACACTACTCCGTCCACTTTTAAATAAGTTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAATTAAAACACACAAAGGCAGGAGT:1 + chrX 20643972 5' - invader2 214 2 76.24 TAACTATATATCGATTGTAGTCTTAATAAAATAATACCCCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTT:1 - chr3R 16487389 5' - roo 372 1 63.37 GATCTTTTAATTTTGTAAATACGGATTCCAACATTGTTTTGATCGCCGTTCATCTTTTGATCGATAAAAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGACA:1 + chr2R 4702281 5' + INE-1 102 1 69.00 TGGTGTATGTGCAAATATATATGGGGGAATGGTTCTCTTCCGCTGCCAACCACATCTAAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTG:1 - chr2L 1563267 5' - Quasimodo 7090 2 64.36 ATGCGATTTCTGGCGGGGATGGGCAGAGCTAATGGGTACGGTGGCGTCCAGGTGGACCAGACGTGGAGTACTCACCTGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTA:1 + chr3R 18602975 5' - Tirant 8144 2 73.27 TGGACATAGGCGCTGTCATTGGACTGTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3R 28879936 5' - roo 354 2 76.24 ACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGCATTTTACGACTTGCGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGCCTTTATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 + chrX 10824002 5' + jockey 4674 1 74.26 ATATCCTTCACTTTACTCTTAACAATGTAGGCAGTAAATCAAAACCCCTTTCACTGCTCCCCTAGAACAATGTCAACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCAT:1 + chr2L 1238132 5' + F-element 447 1 76.24 AACAAATTAGGTCGATTTCCCCTTATCATATGTCACTGCCCAAATCGAGCGAGATAAAGCGAAAACCGACAAAGAAAGCACAGGGAGAGGAGCTGGAAGAG:1 + chr2R 17640013 5' + G6 471 1 53.47 ACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGTCATGTATCGTACGGCTCGATTCGCG:1 + chrX 10295828 5' - Cr1a 4387 1 75.25 TATTGAAACATTTTTCATCCTTTAACGCTGATTAAAGTTCTTTGACCTCAAGGGTTGTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chrX 22443110 5' + jockey 25 1 56.44 TTGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGC:1 - chr2R 17402777 5' - invader4 286 2 67.33 TTTGGATTTTCATATTTTAACAATTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAA:1 + chr2L 6226989 5' + rover 7146 2 76.24 TCACAATCCATCCACGCACTCTCTTTTTCCGAGCGACTTAAAACATTGTAAGTTAATAGGTGTGAGTTTTTATGGATGTAGTGGCTATGGCCTACGAATTA:1 + chr2L 10493370 5' - gypsy7 201 2 80.20 GTGCTCAGAGGCCAGCGGGATTAAATGGTGATGTTCTTTTGAAAGAGTCGTTGTCTTTCCTTTTAATAATAATACATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTAG:1 - chr3L 18329419 5' - I-element 231 1 79.21 GCACAGCAAGTTGCGGAGTTTCCAAAAGGCACAAGAAAAGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGGCGC:1 + chrX 5831306 5' + HMS-Beagle 250 1 61.39 GTGCAAAGGACTTAGGTCCCGGTTTTTCGAGGGCAGGTAGCCAGGATCCGACCCCGTACCAACCCCTGTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chrX 409565 5' - P-element 2878 2 71.29 AAAGGGATGCGCTCACATTCGCATGGCTATTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr2R 17345919 5' - hobo 2931 1 71.29 AACCCATCAGCCTTGGAAACCCAAAAAATGAAACACATCCACATCCATATAAGTATATAAGCAAGCTATGTTTGAGGCAGCAGAATCGAGGAATAAAGTTT:1 - chr3L 9146186 5' - hopper2 290 1 75.25 GACGATTGTGTTTCGTGCTCGCTGGCCGTATCTAAGCGATAAATATTTCCCGTAATTATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2R 16338067 5' - roo 391 2 61.39 GCAGCGTTTTTCGTACTCCCTAGAGGATATTTTTAGTACCATAGAGTTGGTAGACGTTTAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAA:1 + chr2R 17353075 5' + hobo 2502 1 62.38 AGCAAACGCAATCGCAATCGAAGTAACTGAGAAGAGCCGGGAAAATTGGGTGACTACGCAAGAGGGCGGGAAAGCCGCATTTTGTGTTTTCTAAAATTTAA:1 - chr3L 3477785 5' + Tc3 390 1 73.27 CTCATTATGCTGAAGGGCGTCTCCGAGCAGCCGCGGGCGGACACGGTGCATTGACTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTC:1 - chr3R 5490179 5' - Dm88 5 2 61.39 TTCGTTTGGCTATTATTTGTAGTTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAT:1 + chr3R 12550608 5' - 1360 310 1 78.22 ACTTAGACACAGCGATTAATGCATATATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTA:1 + chr3L 15452861 5' + accord 26 2 53.00 GATGCCAGGAACTGCAGGCAATTTCCTATGAATTTTCCAAATGGCAGAAGTGCAAGCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATCTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 8914560 5' - roo 9053 2 63.37 TACCCCCAGCTTGGATGCGAGCTGTCTCCACCCGCTTCCTGCTTGAGATTAGAACGGCTCAGCGTGCTCGAGGGGTTCCTCCAGGAGCATAAATGA:1 + chr2R 4932030 5' - G7 102 1 57.29 GGTGGCTCCTGTAACTATTAATATTTTAAGTTGTCTTTTAGTTTTTCTGTATACCCTTTTATGACTCAAAGATCCCCCTGACGTCCAAAGCACTGTATAA:1 - chr3L 25724051 5' - baggins 5351 1 61.00 AGATTTATGGCTGAAACTTGGAGGACCCCTCTAACGCCTCCAACACACACACACACACATAGTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGGTGAA:1 - chr2R 14085480 5' + accord 222 2 55.45 CCGCGAAAAACACTCGCTTTCACTTTGATTTTAATTGTTGTTATAATTACTTCAACTTCTTGTGGGTGTTTGTTTCATGTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 18943647 5' + hopper 144 112 64.36 TCCCGGCTTGGTTCTGTTTGGTTCGGTCTTAGACCATTTCTTATACTAGTCACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAA:1 + chr3L 22167155 5' - diver 42 2 57.43 CCCCTCTGGATGCCCTCTGTATGGCCGACCCGATCCGCAGATGCCCAAATATTGATATATAGCGTAAGTGGCCACGTCCAGCAACAGCTCTATAGCTCTCA:1 + chr2L 20329094 5' - micropia 5185 1 64.36 TCGACGAACTGTTTAGTTGTCGATGCTCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr3R 19734570 5' + hobo 21 1 48.51 CCCGTCGTCCTTTCGTACCATCGTCCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAAT:1 + chr2L 13737304 5' + 17.6 490 2 75.25 GCTGCTGTTGAAACAGACAACCCAATGCTGCGTTTTTGACTGTCTGTGCTACACTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 10554847 5' + roo 8684 2 55.45 CCGTGTAACAAGCAACGGGCGACCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCATTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCA:1 + chrX 21001142 5' + 1360 3247 1 76.60 GAAGAGATGGAAAAGTGATGAGAAAAGGGGGGGAATGCCTGGCAACAGGGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAG:1 - chr3L 17448215 5' + micropia 5311 2 51.49 ACTCCCATTTTCCATTTCCGCCAAGTTCGGTTTGCAGCACGCAGCAAAACTGGACAGGATAAAAAAAGGAAGCATAATCGTATTTGTAGCTTCGCAGATGT:1 + chr3R 7297249 5' - hopper2 229 1 71.29 TATTTCTATTAAAGTATAACCAATTATTCATAACACATTGGAATATGTTATATTTAAAATGCATTCCTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chrX 14500182 5' - roo 400 1 69.31 TTGGAACACATTGATGTTGTGTTAGGGTGGATTCATCGATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 17846877 5' - roo 390 2 54.22 CAAATTTGAAAAGCTGCCAGTTAATAGCTTCAAAAATAAACAGAAAATATATGCAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTT:1 - chrX 12151687 5' + diver 22 2 57.43 AAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGTATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chr2L 15833089 5' + hobo 17 1 60.40 GACGTCGACGTCGCTGCCCGTTTGTCGTAATGTGTTACGTCAAAGCGACCGCACACCATTATAAATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGC:1 - chr2R 16160305 5' + gypsy 6998 2 68.32 TGCAAGTGACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATAT:1 - chrX 21247582 5' + blood 7179 4 73.68 GGAGCAACAAAAACTTGTTAACGTGTGTGCCATGTACTGGACCTGCCATATAGATAAACAAATTTGGTAGCGTTAAATAATTGTATCACCGGATGAATTGA:1 - chr3L 10544186 5' - G3 4548 1 47.52 CATGTGATGAACAAGTGCACAGTGGTGGCCAAACGAGAGCTCTTCTACGCCTGGCATTTATTGTCCTCTGATTTTTGCTTAAAAATATATAGTGACAAGAT:1 + chrX 12769932 5' - TART-A 13337 1 54.46 TAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTC:1 - chrX 20999594 5' + BS 9 1 60.40 GTATAAGTGAATTATGAGGAAGGCATAATTATAATGTACATTCTTGAACAGGATCAATAGCTGAGTCGATCTGGACATGTCCATCTGTCCGTATGAACGTC:1 - chrY 502470 5' + INE-1 126 1 69.31 AGAGCTCACAAGGATGCTTACATTTAAAATCACTGAAAAATTCCGCAGCAACAGAACAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr3R 27763705 5' - 1360 3371 1 59.41 CGGCTTCTCGCCCTCAACTCCCTCACCTGTTTCTCCACATTTGTCAGCCTTTTCTATTCTTTTGGTACGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACG:1 + chr3L 25493019 5' + invader1 97 2 54.46 GGCACCATTGTCAAGTTTGTAAATCACATTTATTTGAAGATATACTCTTTTTTATATTAAGCAATTAAGCCTTCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:1 + chr2R 12753015 5' + Juan 9 1 61.39 CAAAGAGATTTTATGCGCAAACGCGTTTTTTGTGTTTTTAGGATTTTCCTCCCGCTTTTTTCGAATTTTTTTTT:1 + chr3R 30828910 5' + FB 171 1 91.89 TGTTGCCCGTTTTAAATGAAATTGCGAAAATTCATTTTAAATTGGATTTTATTTAATTTGACTGAGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAA:1 - chr3R 7600445 5' + F-element 484 1 67.33 CTCTACCAGTAACGGGTATAAAACGAGGTATATATCGAGCATTCTAAACATATTTCGGCATACGATAATGGCAAAACGATCGAATTTATGGCAAAAAAAAA:1 + chr2R 5738920 5' + transib1 2127 1 71.29 AAAAGTATGCTACGTTTCTTGTCTATACGCACAAAATGTGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chrX 6146745 5' - hobo 2927 1 67.33 CAAATAAATAATAATTTTAGTAAATTGTTTTTTGTTACACAAAGCACCTGTATTATTACCTCTTTTTTATTGGTTGGTTATTTTTTGATGTGACC:1 + chrX 18207676 5' - transib4 2530 1 85.26 TAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr2L 13598185 5' + pogo 29 1 55.45 AACAACCGAATTAGGCGTTCCGCAAGGATAGACTGCAATTATTATTAATAAGTCAAAAATTATATTTTCTTTAGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 - chr3L 14886297 5' - 412 7543 2 75.25 CCAGCCGAGAAAATGCCGAGCACCGTAGTATTTGATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 - chrX 4784569 5' - hobo 2896 1 64.36 AACCACTGCAAGCACAAATAGCACCACAACATCCAAAGTAAGATCCAGCTTAAGGGGATAACAATAAAAATGTGAAGCTCATAGCGGCCACTCCAACGGG:1 + chr2R 13205878 5' - gypsy6 7532 2 79.00 ATAGGACTGGACGAAAATTACAAACAAATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3L 27864714 5' + roo 8711 2 75.25 CGAAACAACAATAAATATTTGTCACGGCATATGAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAACAA:1 - chr3R 9114006 5' + 1360 488 1 70.30 GTGGATTTTGGAACACATTGATGTTGTGTTAGGGTGGATTCATCGATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3R 17846870 5' - roo 9042 1 55.45 GAAATGCTAAGTGAATTCAAGGAGTTAGAGTTCGTAACAAGTGCAAATCTATTAAATAATAAAATATTGAAATATCAATTTTTGAATTTAATTATATATTA:1 - chr3L 11590171 5' + transib3 59 1 81.19 ATTGTAAATTTTCTTAAGTTCTCCATTTTTGTTTGGGCCAAGTAAGATAATCGAGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chrX 15259016 5' - roo 387 2 57.43 ATATATCGTGAAAACCACTCCTCCACTCCACTGCTGTCACATGTTCAATACCTCTTTAGAATTAGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCT:1 - chr3L 8038347 5' + accord2 7394 1 70.10 AGTCATAGCTATCAAACCAATCGCCTATAAATATATTTATAATAATTAAAGCTTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAG:1 + chr3L 22094256 5' + Stalker2 7274 2 53.47 CTAAACTTCGCTTTTAAAAAATAAGCGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAAT:1 - chrX 402065 5' - Doc 4343 1 74.26 GAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGT:1 - chrX 23108314 5' + BS3 1434 1 54.46 AACAGCGCGTAACGGGACTGCCGCTCTCTTTGTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:2 + chrX 10629210 5' + P-element 41 1 39.60 TGTGGCTTAGAAATTTCACTGTATGTTATTTGGTGACTTGACTTGACTTTTGGTTTGAATTTGATTGGCGGATAAGACACACGAGGACATGTGAAAGGTCA:1 + chrX 8826661 5' + invader1 3579 1 64.36 TTTCGAATCATAGTATTCAAATAAACTTAATTGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGCTTCAAATT:1 - chrX 7424053 5' + hopper 256 1 71.00 AAAAGCCAATAATTATGTAATCGTAGCCCCATATAACTTTTGACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATT:1 - chr2R 11008844 5' + I-element 246 1 58.42 TCAGAAGTCAGCAACTAATTCGGTATTCTTTACTAGTCTGGTGCCAAAATCAACATTTCGGATGGCTCCCTCTCGTTTTCTATTTTTATCAATAGTTCGTT:1 + chr3L 21914857 5' - Bari1 1238 1 67.33 TTCTAGTGCATCAGCAAATACGCATATCCGACTATAACTGCTTGGCCGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTT:1 + chrX 4948248 5' + Ivk 425 1 78.22 TTAGATGATTTGGTAAAAATAATTTTTTTTTTCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGCCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTAT:1 + chrX 6897372 5' + Ivk 46 1 66.34 GAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr2L 15833059 5' + hobo 47 1 72.28 CAGTTAGTGGCTTTGTGCTTTCTGGAATTTTTGCACGCAATTAATTCAATTTGTAAACTTTTTTGGCCATCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACC:1 - chr3L 22753449 5' + 1360 3347 1 65.35 GAGCCCATTGACTTTGAGATGCTCGTATCGTATCCGTAGCGCCTCGTGAGCGTCCTTGTCCTTGTGCAGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGC:1 - chr3L 18059461 5' - 1360 3303 1 52.48 ATCGAGTGAAAATTGCTGGCCATGTCCGAGGACCTTATATGGCTGGCCGGCATAACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 14284985 5' - roo 394 1 57.89 ATCGAAGAAACCCCTTCGTTCGTTTATGAATTGACAATTGAGACAACAGCACCTGGGTTGGGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATT:1 + chr3R 13888126 5' - F-element 4446 1 66.34 CAGTTCTACATATTCCGTTTGCATTTCCTTTTGCTTCCGATTGTGCTAATTCGTGGTGAAGTTGAGAGTACCGACTTCATTAGTCGGCATAACTTCTCTGT:1 - chr3R 14989423 5' + Cr1a 4089 1 52.48 CGCATAGAGTCATTAGCGGGCGAGCAATTAGCAGAAGTTGGCAGCGAAATGCAATTGCAGGTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 - chr3R 29711057 5' - mdg1 7441 2 58.42 ACAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 - chr2R 5651879 5' + Tirant 8161 2 77.23 TTTAATTTTATTAGTTGTATCATTTTGATAATGTCTTTGAGCTGACAGTATATCCATTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGTGTTTT:1 - chrX 20314597 5' - roo 9053 2 58.42 ATGTTGGCCACCTGTCAATGCATCGAGTGAAAATTGCTGGCCATGTCCGAGGACCTTATATGGCTGGCCGGCATAACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3L 14284964 5' - roo 409 1 77.23 CATTGTTTCAAATGGCACTGATTGTGTAGTTTAACTTATCCTATATATACATATATATACTCATTATAAACTACACAATCAGTGCCACTTCAACCTCCGAA:1 + chr3L 6455135 5' + I-element 1 1 68.32 CTCCCCCTGCAACAAAGTGGCTCCGGCAACATGATAATAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCCTTACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAA:1 - chr2L 958933 5' + I-element 461 1 75.00 ATTCAACCAACTTGGCGATGGAGCTTATCTATCTAACTTTGTTGCTATTTGTACTTTATTGTCGCGCAAAGGTACACACACACACACACACACACATAATA:1 - chr2L 14682694 5' + accord 7031 2 57.43 GCATTAAACGACACACACCACAGAAGACATTGCAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr3R 18026920 5' - mdg1 7415 2 64.36 GCCGTTAAGCAAAACGAAAATTGAAGCAATTCCGCTTACGCTTGGCATACACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr3R 27386279 5' + hobo 26 1 53.47 AATAAAGTAAAACACAAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACTCTCTTCGCAGCGGAACAAT:1 - chrX 16876075 5' + Doc3-element 274 1 58.06 CGTGATTTCACGTAAGGTTTTTCCAACCTTCTTTCAAATGAAGTGCATAAATGATGTGTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr2L 13711470 5' - hobo 2922 1 64.36 GGCCACGAGTATTGATTAAAGTCTGTTGTTTGTGAATGCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 - chr3R 4524244 5' - mdg1 384 2 62.38 CAGTAATCATATATTGAATAAAAAAACCTATGCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr3L 17786302 5' - roo 9029 1 69.31 CTTGTTGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:2 + chr3R 15054300 5' + hobo 32 1 55.45 AACACATCCCGCACAATTAGACCCTGCTGGTAGCCGTGTAGACGCACTTGGTCCAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCT:1 - chr3R 26971527 5' + roo 252 2 52.48 CTAACTGCAGCAAGTGCATTTTGGGTGTGTGGGTGTGCGGGTGTGTGCGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTGTGTG:1 + chr2L 11760009 5' - gypsy3 417 1 74.16 TTGATTGTGACATTTAATTTATCGAACTAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGTCGTC:1 + chr3L 18141963 5' - blood 333 2 67.71 ATGACGATGATGTTGGACTTGTTTAATGTCGTTGATTACTTTCCGTTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTT:1 + chr3R 10597934 5' - invader2 127 2 67.33 TTCTTGTCTATACGCACAAAATGTGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chrX 6146730 5' - hobo 2931 1 64.63 AAAATTCGGCTTGAGTTTAGCCTGTGTGTGTGTTTAGCAATAGGATTAAGGTCAGCTTTAATCAGGTATATTCGCACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr3R 26871125 5' - hobo 2935 1 75.25 TCTCAATATACCGGCGATATTCTTATCCTTCTCATTCTTAAAAGCTTTCGTTAGGGTGCAAGTTGTCGTCTTCAGCCGTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGG:1 - chr3R 3190501 5' + Cr1a 4044 1 73.27 TATTCCTCCGTTTATTTTCATTTTCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 21939173 5' - Doc2-element 251 2 70.27 TATAAGAAATATAAATATAAAAATTATGTATTAAAAAAGTTAGAATTGAGTGGTTTATGCCGCTCTCAAGAGTCAAGATTAGAGATAATAGGATAAAGTCC:1 - chr2L 22983127 5' - Cr1a 4214 1 29.70 TCTTAATTTGATTCGTTTTATTTGTTATGCAAAAACTTGAAGTATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:2 + chr2L 3988505 5' + I-element 19 1 70.30 TCAGTTTGAAAAATTTGAAGTTCTTTGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 - chr3L 16755822 5' - pogo 2054 1 76.24 GAAGACTCATCTCGAATCTCCCAGGACAGCACTACAGCAGAATCTGACCAGCAATAAACGGGCATGGTCACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGT:1 - chr2R 3480874 5' + Juan 11 1 63.37 GCGAATCATATACTCTACATCCGACTACATTAAGTATATTTTCCGGCACAAAAACATTGCAATGACTGAAACTCTTGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr3L 3986352 5' + jockey 10 1 73.27 GTTAGTTCTGTTTATTGTGGAGCCGTCACCCAGCACCACCCAAGGACACCCAGCACCACCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chr2R 16478527 5' + hobo 17 1 60.40 GCTGTTTGACGACGCCGATATGGAGCTGAATCTAAAGTTATATACCCGTACTTCAGTTAATGCGATCGCGAATTTTCATAATTTTTTTGGCATATCGATAG:1 - chrX 7433302 5' - INE-1 502 1 59.41 ACCGACTGGCGGGAACAGGAGCAGAACCACATATTATCTCTAGTCGATCGTTTCTAAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATATTTTATGTTCACTTG:1 - chr3R 8943093 5' - I-element 461 1 57.43 GCCTTTATTTAATTAAGCGCTCAATGCCCCGTTCGGCAGAAACTCTAACTCTAAACTCAAAAGGATAGAAAAGGCGCCTGCATGACGCGTGCCAAGCAGAA:1 - chr3R 15899974 5' - invader1 37 2 57.43 CTTTAAGAAGACATTCTGAGTGACTCCAACCAAGGACTTTTTGCTTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3R 12058688 5' - roo 9040 1 56.44 AAAGTTTACCGCACCGACACACACTGCGTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGCTCTCA:1 + chr2R 17996382 5' + 1360 3281 1 77.23 GTAATCGCATTTATTCTTCAATTCTAACCGTTTCGGCTTGGTGGGCTTTAGGTAAACTTCCTGGCAGCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCT:1 + chr2L 17531765 5' - rooA 7415 2 73.27 CCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATA:1 - chr2R 2529354 5' - 1360 3373 1 40.59 GAATTAAACGGCAACAAGTTAATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAA:1 - chrX 1523519 5' + jockey 4724 1 79.21 AAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTG:1 + chr2R 5582177 5' + Cr1a 451 1 57.43 CTATAAACTAAGTTTAAGTTACAAAATAGTAAAGTAGTATAGTATATTTGAAAATAGTATAGCTTGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGAC:1 - chrX 12523420 5' + Cr1a 4186 1 50.50 TGCTTTCCGCAGATTATACGTTTATATAATAAAGCTATTTGATGGCTTAGCGAAGCATTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAA:1 - chrX 12805606 5' - flea 418 1 59.41 GCCAAGGTGAAAAAATGTCAGAAAAAGAAGGAAATAGAGCAATGCATGAAGTGGTCATTACCCACTATGCCTGACACTAAATGGAATCAATTCTCAG:1 + chr3R 7062938 5' + invader3 333 1 57.73 GCCGTTAATTGCATTGGGAGGCTAGGTGCTACTACCATTTTTTTGTATAAGAGTACAAAATTGTGGGTTTTTTTTGTGTGTTTTTTT:1 + chr3R 6103787 5' + transib1 7 2 49.43 TCCACACTCTCTCCTCCACTCTCACTCTCAGTTCTCTGCCGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCC:1 - chr3R 30532391 5' - hobo 2695 1 61.39 TATATCTTAGATCCTCAGTTTCTGAACTGTAAGTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGAC:1 - chr3R 23274074 5' - invader3 5418 2 69.31 TCCCAGGAGCACAAACACAGCGAAAAGAGCACTAGAATGGCAAACTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3R 14832492 5' + hobo 29 1 54.55 ATTGTAGTTTCGATGTTAACCCAATAACCTTACCCTGTCCCATGAGCGCGAATGCGGATGAAAATGCTGGATTAGACCTCGCGCTATGTGGTTGGGGTGCG:1 - chr2L 5069514 5' - F-element 4467 1 72.28 CCATTATCTGCACAGCCGAGAAAAAATCTATAAGATCAAGAAATAGAGCGTGCTTAAAACAACAACAACATGGAGGAGCTAGTATACAAAATCTGAGGAAG:1 + chr3R 13445171 5' - Gypsy12A_LTR 2070 1 71.29 TGATTGGATCTATAATGTTAATTTCGTCAAAAATATCAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATAG:1 - chr2R 12437188 5' + pogo 37 1 63.37 AAATACTACATTTTTACTTTAAGGAATCTTACGTTTTTGGTCCGTCTGTCAGTCAGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGC:1 - chr2R 5069653 5' + INE-1 149 1 67.33 GTGAAATCGTACACATAGTCGATATATAGCGCAGTAATGGCTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr3L 3326596 5' - P-element 2854 1 44.00 TAAAACTTGTTTGTGTTTACTCCACGAAAGAACAAAAAAAAGTGAAAACGATGCATATTTGATGAGCAAAAAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAA:1 + chr3R 25599074 5' + FB 6 1 72.28 AGAACAGAACAGAACGGAACAGGACAGGCCAACAAAGACGACGGGAGGGGGAATAAAAAACGAAAACGAAAAATAATAAAGAAAAAAAAAAGGAAAA:1 + chr2R 14942475 5' + Doc2-element 227 1 78.35 CACTTTCCGCAACGAAGGACACTAGTCCATGGACCAACATGGTGAAGAGGGTAACAGCCTTTTCCACCTTTTCCTTTTCAGCCTTCTAGCTTTTATAGTTC:1 - chr2L 7060684 5' - INE-1 158 1 57.43 CAAAATCTACTAAAGAATAATCACAGTAATTGTGACATGCAGAATACAGGCATGGTCACAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAACATTAAGAACAATTAA:1 - chrX 21668324 5' + 412 15 2 62.38 TATTCATAAATTGAAAGTTTTTGCAACACAAACTGTCACCAGGTCGGCGGGAATTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGT:1 - chr3R 20170939 5' + hobo 2574 1 58.42 ACATTGCTCAACTATTATCCTACTGTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGT:1 - chr3L 11147430 5' - hobo 457 1 75.25 CTTTAATTATTTAGTATATTTTTTAAGTCATTTGACTTAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGAACCTCGTGCTTCAAGATATGACCAA:5 + chr3R 6343938 5' + 1360 483 1 54.46 GCCTGCCAACCCCCTTTGCCACTGCCGTTCATTATGTGCAACTCGACTGGCTGATAAATCTAATCAGTGTCGTGGCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATA:1 - chr2L 17056583 5' + 412 1 2 78.22 CTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATG:1 - chr2R 14518439 5' - 17.6 7377 2 78.22 TGTACATAAATCACAATTTCTTTATTTTGAATAAGAACTATTTTTATTTATGTATATCCTAAATCTCTGCACTTCCGGTGCTATTATTTTGACCGCAGCTG:1 - chr3R 24574244 5' - Tc1 3 1 83.17 ACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGAAAAGATCAGGGGATCTTAAATGTCAGGAT:1 + chrY 3631951 5' + invader2 4829 1 55.45 AAGATGGAAACGGATTTAAACTTCATCCGCGGAGGGTTTCGATTTCGTACAGTTTCCATTTATGTTTCGACACGATAATCAAAAGAAAAATAAAAAAAAT:1 + chr3R 27912622 5' + Doc2-element 216 1 79.00 GGATTTTAGCTGTATTCCGGATTCGCTTTCGTAAATATAATTGCACTTTTAATTGCTGCGCATAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAAATA:1 + chr3L 22752729 5' + FB 317 1 68.32 CAGCGAAAGTAAAAGCGTAAAGCCAAAACCAAGAAATGCCAAAGAAAACCCAGAAAGCCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGG:1 + chr3R 25518966 5' + I-element 5186 1 63.37 CAGCTGGCTGGCTATCCACTGTAACCGATGCACTGAAGAAAAGTTTAATCACTATTATTATATTGTAAGTATAACGCTTATTGAACGAATTAAAAATATT:1 + chr2L 18328826 5' + Burdock 490 1 56.00 AGCAGATTATGATTGCGATTATGTTGGCTCACTTTGAGTTTCGCCGGCAGCAAGGACATCCCTCTCGACTAAGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGTG:1 - 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Tc1 375 1 71.29 TTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 - chr3L 20711705 5' + jockey 4681 1 64.00 GGGGACAAAAAGAAGCCAAAGCCCACACCTATATACATTCGAGAGAAAAGCTCGAATGTTTTTGTAAACAAAATAATTGAACTTGTTGGAAAAGACAACT:1 + chr3L 25552489 5' + Fw3 38 1 86.00 CGGTGGAGTTTCTTTATTACAACCCAAGGAGAAGCATGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGGATCCGGAGGTGTCTTCCCTGGTGGACTGGCGTGGG:1 - chr3R 9175602 5' - transib4 2352 1 60.00 TCCACGAACGATTAAAGTCGCGTTAATTATTTACTTGGCACACGCGCCAAAATGATTGATTTGCTAACCGGCATTACCCTTTAGTTGCTTTGGGAAATGCA:1 - chr2L 9734460 5' - Bari2 710 1 57.43 GAAAAAAAACTGAGTGTATTCAAAGCGAAAACTTTTGCCGCTTAAGAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3R 17846944 5' + roo 29 2 60.40 GGGTGAAGTGTGGAGGGGGGATGGCACGGGACTCGGATTCGCGGGAAGTAAACTGTGACAAACAAATTATAAGTGCAAAGCTAATTATAGAACTCAGAATA:1 - chr3R 12175804 5' + gypsy4 394 1 54.46 AAAGGGAAAGTTCGGAACAAGCCAGACTAAATGAAGATTTACGTTACGCTGCCGACTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTC:1 - chr2L 14237411 5' - I-element 328 1 57.43 TGCAGGGACCTGGCGCCCAAAACGTACAACTGGGTTCCTCTTGAAACCACTGAGTTATAACAGGCATTTGACAGTGCGTTAGTCATTACCCACGAACACAA:1 + chr3L 6493757 5' + gypsy2 385 1 68.32 CGGGTGCGGCAATAATTGGTTGTGACATTTTTATTGTAAAATTTAAAATTTTGTGTTTCATTTTTTTTGTTTTGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATGGTGC:1 + chr2R 3913755 5' - Doc 327 1 69.31 CCCCCAGTCCGCCCTTGTCATTAGAAAGAACTGCCAACGGTAGCTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCG:1 - chrX 2928686 5' - G6 7 1 57.43 GTGGAGTTCCGAACTCATCCTCCTGATGCAAAGGAGCCACAGTGGATGCCAGCTCAGGCGGCAAAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGC:1 + chr2R 16759334 5' - Tabor 7143 2 69.00 GAGCTGTTTTAGCATTTAATGAACAGCTGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATGTTTAAATTAGGGAACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTGGAG:1 - chrX 8883456 5' - Idefix 163 2 72.28 AGCCAGCTTTCGTTTACATGTACATATCTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGC:1 - chr2L 9852417 5' - accord 125 2 72.28 TCTCAGCCGCAGAAATTCCGAATCGGAATCCGAATTCGAGGCACGACGACAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCT:1 - chrX 16533290 5' + X-element 4408 1 51.49 GTATAAACGATAGCATTTCGAAGTGGTATCATTCGCGTGACATTTTCTCTTAATTTCCCAGAAACACCTGGCCAGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr2L 19629592 5' - hobo 2937 1 77.23 ATAGATCACGCCGCCAATGTTACTCCTCATATAGTACCCCTACATTATCAGAAGTGGGCTGATCACGAGCCAAAGAAGAAAATGGATATAAGCAATGCATC:1 - chrX 3698827 5' + invader2 307 1 73.27 GTTTCAAATGTGCACGAAGTGAACGTGCTTTTCTTCTTAGCACAGTCAAGGATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACAT:1 + chr3R 28960061 5' + Doc 4392 1 62.38 TGCTTGTTTATATGTACGGCAAAGATTGCAATAAATTTAATATCTAACCTTCCTGTAATTTAAGCATCAAAACTGACACGACCACACTTTTGAAAAATGTG:1 + chrX 7508832 5' + INE-1 256 1 74.26 AATGGGGACACAAAAAATTCCCAATAAGCCGGCTTACCTAGATGACCTGAAAAGTATAATCCATTACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCC:1 + chr2L 8175513 5' + G2 2883 1 66.34 GTATAGTTGAATGAGCCCTGGAGTGGCGACATACTGTCTGGCAGGATCCCGATCTCATGACCAACTGGTTCGAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAAT:2 + chr3L 14152067 5' - blood 7384 2 70.30 GTCGTGCACTCAGAGAGGTCGTGCTTCCGATGCTATTTGCCATATCTTGGCATAACCACTTGCAAGGGGATTTGGACGTGAGGTTAGTTTTTCATTGTATT:1 + chr2R 6506042 5' - Doc3-element 4502 1 63.37 AGGGGAGATTTTGAAGTTAAATCAAGACGGGATCATTAACTATTTTGGCTTTAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chrX 7741691 5' + roo 8687 2 55.45 AAATCGAACTAAACTTTAAATAAATGATAGCAAATTCGTACGAGATGTCAAAATGCAGTTTTGCTTAATTAGCTTTGCATTTAAAATTCTAATTTTAATTT:1 + chrX 17978005 5' - 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chr2R 5154837 5' + F-element 10 1 73.27 CTTCACAATAACAACANCGGCAGCAGGGGGTCCTGGATTTGCCATCCTTACTGTTACATTGTTAATCTGTTAATCTTAAATAAACGAATTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 3522881 5' + jockey2 3406 1 75.25 GTATTTTTTGTTGCCGTAAAATGCGGCACAACCCAGTGTTATACAATCCTTTTGATATCGATAAAGAATACGATTTTTTGGCACACGAATTTTTCGCCGTG:1 - chrX 21562299 5' + 1360 46 1 60.40 AACAGTAAAACAGTGGACTTTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCG:1 - chr2R 4675374 5' - Quasimodo 199 2 80.20 CCAGAAAGTGCTTCCCAGTGACCCGTCGTACGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCA:1 + chrX 16506993 5' - accord 390 2 69.31 AAGTTTTAAATACATATTCTATGGAAATTGTACATGCAATATTCGGAATTGAAATGTTAGTTAGTAAACTCCACTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTC:1 + chr3R 13122811 5' + Transpac 4924 2 74.26 GGTTCTGTTCAGTTCACTTCGGTTTAGCACTGTTATCCTTTGGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr2L 10023646 5' + roo 8698 2 62.38 AAGCGGAAACAGTTGTTATTAAGAAACAACAAGAATACCAGTTTAGGCAAGAGATAAAGTGCGAAGTGAACTGTGACAAGCAAATTATAAGTGCAAAGCTA:1 + chr3R 19446776 5' + gypsy4 376 1 60.40 GCGTAAAATTGAGAGCGTAAAATCTAAAAATATAAGGCACTTGCTTGTGCGTGCTAAAACAATAAAGGAAATAGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGG:1 + chr3L 23491803 5' - gypsy 462 1 79.21 CGGTTAATTTTGGTGAAGGAACCGCTACGCCAATTAGTCTGGGTTCTGTCTGTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGC:1 - chr3L 977302 5' - hobo 475 1 57.43 TTGCGGAAAACTTTGCCGAAAAGTATCTGCGACGCGTTGCGAGTGTGCGGAATTCGTATGAAATTTATGCTGCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr3L 6942973 5' + P-element 2 2 76.24 AGCGGAGATAAATAATTTCATATTATATTATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr3R 7212498 5' - blood 7343 2 76.24 CGCCACCTTCCCAATCGGCTTCATCTTTCCCACTTGGAAAGTTACTTCATTTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAG:1 - chr3L 16143863 5' - F-element 4520 1 72.84 AACCCCTAAAGGGGGTGGATTTTGGAACACATTGATGTTGTGTTAGGGTGGATTCATCGATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:2 + chr3R 17846856 5' - roo 393 1 61.39 GGATTAACGGGGACTCTGGAGAGCAATAAGTATGTGTATGTGTATGTAGTTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATAT:1 + chrX 15113467 5' - Ivk 332 1 54.46 CCAAGAGATACTTCAGATACTTGTTCAGATATGTGGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr2R 11195617 5' + 1360 38 1 66.34 TTGTGCGATGCACGCACTTTAGCCCGCAACTTGGACAGGGGCATTAGCGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3L 21782041 5' + roo 27 2 52.48 TTCAGGATGTTCTGGTGCAGATATGGTGGCACCGTGCATATTAGATGAGTCTGCGGGCAGAATTGCAGTCAGTCGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATC:1 - chrX 13655879 5' - Doc 321 1 76.24 TCTGACACTGCTGCAATTCGAAATCAATTGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 11372241 5' + roo 8710 2 73.27 GGCTTGTAGTGGTCGTAGAAGTGGGAGTGCGCCGGGGATCCGGTGGGGTGGTAACTCCTCCCCCCCCAGTTCGAAGTGACGGCCATAGCGAAGGTATGGAT:1 - chr3L 19526648 5' - Tirant 8065 1 59.41 TTGTCTTGGTAAAGGAAATACATATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCT:1 + chr2R 6735283 5' + Burdock 6188 2 80.20 GGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chrY 311346 5' + 1360 53 1 72.62 TTTTAATATTTTAAGCCTTTAATGGGAGAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAAC:1 + chr3L 366529 5' + Quasimodo 428 2 72.28 CCCAACCACCCACTCAAATGCCCCACAGAGAGTTAAATTGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATAT:2 - chrX 5090971 5' + 1360 240 1 63.37 AGAGACCTTCGTCAAAGGCCCTGAAATTAGTTGTCAAGGTTTAGCCCCTCTCTCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTC:1 + chr3R 28683644 5' - I-element 296 1 59.41 TAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTT:1 + chr2L 22121347 5' - I-element 5342 1 67.33 AGTTCGTTAGTTGGCCAAAGCCAACGGCTATGTTAAGTGGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCGAGCAA:1 + chr2R 13477077 5' + 1360 3252 1 60.61 TCCTACCTCACCACATTAAAAGTGGCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 - chr2L 11805061 5' + P-element 51 1 29.70 TTTTTGAAATAATGGCATAAAAGTGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAACATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGGACACGATTTTTTCGCCGTGG:1 - chr2L 15751396 5' + 1360 47 1 71.29 GAGCGGAAATCGTATTTTCTTACAACAAATCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 18093820 5' + roo 8712 2 73.27 AATAGTTGAGTCTTTTGTAGATCTAGAGCTGTCAGTTCCCTACGTGTCTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGC:1 - chr3R 15484570 5' + jockey 4736 1 53.47 GTAAACAATAATCGGTCGCAAATGAAGTTCAGAGATTGTGGCAAATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chrX 10211008 5' - I-element 5328 1 52.48 AAATGAGGCAGATTAATGCCATAAGTAAAGCTTAAAAATCAGTCAGTTCGAAAATATAACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGG:1 - chr3L 10713703 5' - Quasimodo 137 2 59.41 CAGTAGGGCATTTTGTTGTAGCCCTTGTAGGTTTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACCGTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGC:1 + chr3L 16694208 5' - Quasimodo 7148 2 67.33 TTATCCCCTGAGCAAAGGACACGGTCTGCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 - chr2R 5200982 5' - 1360 3339 1 75.25 TACGGCGATACAGGGATGAGTGCTGGGATTTTTCTGCGCTGTTTGTACGGACGGACGGACAGATGGACTTGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATC:1 + chrX 13695967 5' - INE-1 92 1 59.41 ATCGGGTAAGGAGTTAGAAGTTATGAAAAAGTACATTGACTTCGCTGACACTTGTCAGCGGCACTTGTAACTTGTAAGCAAAGATAAAGGGTGCCTTGTTC:1 - chrX 19820357 5' - 3S18 30 2 57.43 TTTCCCAGATCCGCAGATGCAACCGTATCGGTGGTAATTCTGGAGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGAC:1 + chr3R 4982979 5' - hobo 2880 1 56.44 CCTGAATAACCTCTTAATTTGATTCGTTTTATTTGTTATGCAAAAACTTGAAGTATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 + chr2L 3988494 5' + I-element 8 1 76.24 TGCATTGTTAAACATCAAGGTAACACTTCAAAGCGATAAGGCCAAGGAATACTATTGTGCAAGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTG:1 - 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BS3 1562 1 76.24 TTTTCTTGTTTTTTGTCGTCTGGTGGGATTTACATTTTGACATTTAAACTTGTTTATGCACTTAAAAAAAAGAAGTAATCACGGTGGATGGGCGCATGTA:1 - chrX 22846067 5' - Max-element 490 1 59.00 AAGTTAGCAGCTGACAGTTTGCAGCAGTTGCTGGCAATTTCAAGCATACACACTTATTCATGCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATG:1 - chr2L 7167405 5' + 1360 3355 1 71.29 AGTTCGCCTCCGGCTTTATATACCGTTATTTAGCGGGGAATCGCCACGCGTTCCTGGGGAACGCCTGCAGATGCACTATTAGTTCCGCTTTTGTGCCGGA:1 + chrX 13281756 5' - invader3 399 1 73.00 AAAAAGTGTTGCATACCAACAGGCGCCGCCCAAATGCGAATAGCACACAAAGTCCTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 + chr3L 10865624 5' + jockey 4697 1 55.45 TTTAACACAAAGCTACATTAGATTAAAATCCCTTATAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3L 21784647 5' + roo 81 2 67.33 TCAATAAAACGGAAGCTAAATCAATTAGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 + chr3R 25514126 5' - hopper 1369 1 72.28 CATCCTTATACCAAATTCGAACTTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3L 9174673 5' + 412 23 2 56.44 CATTGCAACTAAAAATTAATCAATATTAGCTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTT:1 - 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Porto1 430 1 71.29 GTTGAGCGGTGAATGGTGAATGTGAGCAAGTGCCACCGTCAGCGGGTCTACATGGCGTTGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATATATTTTCGCTACA:1 - chr2L 4311129 5' - Gypsy12A_LTR 2149 1 56.00 CTTGCACTTTTCTGAGCTATCGAAAGCCAGAATTTTGGTAATATAGTCAACGCTAATGTTGGGACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCGACTT:1 + chr2L 10839400 5' + Doc2-element 363 1 64.36 ATGTCCTCCGTGATCCTTCGTCTCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 10978717 5' - roo 9020 2 77.23 TTCCGTCCGGTACCCTTTACCAACCCGCCTTGCCTTCTCTATCCTCAGCGGCTAATTAAGCTGCCCAAATATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCA:1 - chr2L 7533997 5' + G2 61 1 72.28 ACCAAGTTGCATTCGATTCGCCATGAGTAAGTAAACACTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAAT:1 + chr2L 17266427 5' - hobo 479 1 67.33 GAATACAGGCATGGTCACAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAACATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 - chrX 21668283 5' + 412 56 2 78.22 CAGGAAAATGTAACAATATATATATACAAAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGC:1 - chr3R 1292525 5' + I-element 440 1 71.29 GTGCCTCATTGTGACAACTCATGGGTTGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACA:1 + chrX 7311932 5' + roo 201 2 58.42 TATAGTCTATAGGTCTGTGTTCCCAAGCTCCCGGTGAACCGAAGATAACCCTTTGTCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGG:1 - chr3R 24727307 5' + I-element 335 1 54.46 CATAACTGCTAATGCAAGGCGATAGCAACCAAGTGGAGTGGGATTAAAGGGGAGGGGGGAGGGATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chrX 12818806 5' + roo 8673 2 58.42 TTTCTTCCCTACATCTTTCTGGCTTGCGAATCCTATGACCAATTTGCAAGCCAGAAAGATGTAGGGAAGAAAAAGGACAAAAAAAAAA:1 - chr3L 6682947 5' + Doc2-element 220 1 71.59 TAAAACATTTATTCCTTGAATCACAGAGGAGAAGCGACAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACGACGCACAATATTTG:1 + chrX 21581107 5' - Bari1 1688 1 51.19 AAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 - chrX 16217521 5' + P-element 30 1 49.00 ATATAACAAATAAGCTACGCGCTTAAGCACCAGTCATTAAAACTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGT:1 + chr3L 13278646 5' + 1360 389 1 62.38 AGCGGCGCATGCTAAGCGATTCGCCTGAGACAAAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2R 17346027 5' + hobo 14 1 63.37 AAAGACAAAAATCTGTATTGGGAATAATTAATACAAAAATAATATAAAAGAAGAGAGAATTCAATAGTCGAGTTCTCCGAGTATCAGATACCCGTTACTTA:1 - chr3L 27859867 5' - INE-1 548 1 63.37 TGAATAGTCCGGGTCACTCGTTTCTCGGAATCTCGCCTTTCTGTGGGAGGTCTCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr2L 7767198 5' - hobo 2917 1 57.43 ACATTCCTACCTCACCACATTAAAAGTGGCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chr2L 11805065 5' + P-element 47 1 33.66 GAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr2R 19209444 5' + Doc 42 1 72.28 ATTAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:2 - chrX 21668094 5' + Tabor 6852 2 66.34 CCTGTCGCTGTCCCTGAGTGTCACGGATGCCAGGCCAATACTTGTTGCTTTCTGTGGGGAACATCTAGGAACATTGAAAGAGATACCAGTCTATGACGCTA:1 + chr2R 12215656 5' + G3 4255 1 57.43 CGCTACCATCCACTTGAGTTCTGAATAACGGCGTCATGATTAGCTTGTTGTGCCTCTGTGTATTGTGATTATGTATCGTGTATTGTGTTTGTGTTAAAAAA:1 + chrX 14411860 5' + Stalker2 493 1 55.45 CCGACATTGTTGTTAAATGAAGAAAGTATTTTTCAAATGCGAATTTCCGTTATGCTCCTCGTTTAACAGCTGTTATTATAATGATGCGCTGTTAAATTAAC:1 - chr3R 28195594 5' + hopper2 1484 1 63.37 AGGGATGCGCTCACATTCGCATGGCTATTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr2R 17345921 5' - hobo 2937 1 75.27 GCCGACCTGTGAAGTGAAGTCCTGCCGCAGGACTCATCTGACCTGCTGGTCAAGACAGGGCACCAGACGGTCCACTACAAACTTTAGACGATGATAATGAT:1 + chrX 8654828 5' + Juan 265 1 73.27 AAGCTGGTCGTCCAAATATTATATTTGGTTTAAAAGGAGTAAGAGGGCAGAAAAAGCAAGCAGCCGACCATATAATCTACATTTATATTCTTGATCAGGA:1 - chr2R 1090960 5' + INE-1 78 1 69.00 CAAAGTAGACGCAGACACATGACGGAACTACTCTCCCCTTTCCCCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTG:1 - chr2R 17256258 5' + mdg3 5216 1 57.43 GCACTTTGCAAAGAACCTGTATCTAATTGATAAGCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAA:1 + chrX 13698822 5' - 1360 203 1 72.28 CTTCACTATCCACGGCTGGTCCTCCAGCAAGGATGAGTTCATCAACTACGGTGTCCGCGATGCCTGGTTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTA:1 - chr3R 27006647 5' + Idefix 185 1 75.25 CGAACATGTTGGTGTACTTGGCCGTGAAAGGCATATTTTTTCAAATTTCCAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACGGTATG:1 + chr3L 26002248 5' - 1360 154 1 69.31 GAATGTTTTTGTTTGCCGGTGTCAATCACAGTTGGCTTAATTAACATTGTGGAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTC:1 + chr3R 14176929 5' - accord 6957 2 61.39 GGCACGATTCTTGGCAGACGATACAAGTAATTAAAGTTGTGGGTGGCAGGGGAGATTCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCT:1 - chr3R 25280211 5' - Gypsy6A_LTR 279 1 73.27 ACAGGAAAAGTTGCTCCCTCCTTCGTCCTGATCACGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTGTGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTG:1 - chr3R 9088872 5' - accord 180 2 51.58 GCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGG:1 + chrX 21852441 5' - gtwin 7376 2 67.35 CGCAAACTTCTGCGTCTCGAGTCGAGTGTCCCTCGATGGCCTCCGTGATCCTTCGTCTCTGTGTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 10978682 5' - roo 392 2 63.37 TCGGAGCGCAGAGGAAACTCGTGTGCGATAACGGCACCCAGTTCCCCAGCAAGGCCCCATGGGGTCATTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCT:1 - chr2R 5271836 5' - roo 78 2 70.30 GACGAGGAGACGAAGGTCTCTGGCAGCTGCTTTGTTAAGACTCTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:2 - chrX 17284012 5' - roo 9039 1 57.43 CGTGTGAATCTGTTGTATATATCTACCTATGTTTCGTGTTTCTGTGTATTGATGTTGATTGTTGATGTTGAAGGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAAC:1 - chr3L 4140787 5' - gypsy7 295 1 61.39 CTAGCAAGAAACGAATATTCTACACTCCAGATACTTGACTATTGCGTTCCATCTTGTTGTGAAACTGGGGCAGCACGAGTTAAGTCCATGATCGAGGGTGG:1 + chr2R 5651800 5' - Tirant 396 2 76.24 GTGTGAGAATTTCAAAATACTTTTTTTTTTTATTTGTATACTGTCTTGTCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTG:1 - chr2L 19537354 5' - invader2 4698 1 65.35 AAATTTGGCTTTCAAATTAATATATATTTCGAGATGTTGTCATTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTT:2 - chr2L 19990159 5' + Burdock 31 2 63.37 CCAGTTCCCCTGCTGTTGAGCGAGAGAATGTTTGCACAGTGCAGCTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCG:1 - chr2L 20237538 5' - Cr1a 241 1 77.11 TCTTTTAAGAAAAACAAGGGAACTCCGAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTA:1 + chr3R 9229983 5' + X-element 62 1 73.27 CGCCAGCTGCATTGACTCAGGCGCATTCAGGCAGCAGGAAGTTCGTTCTGCTCCTGATTCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr3R 29661755 5' + 412 17 2 63.37 TATTAAAAATATTAAATAAAGTAAAATTAAACCATGTTATACGATCATAAAATAAAATTACATATTTCTTTAAAAACGTAATTATCTTTTTTTATCATATT:1 - chr2R 18983088 5' + 1360 3100 1 59.41 ACCCCAAAAAGCCATTCAACCAAAATAGCAAAATGAAGTCTTGAAATAACGAAAAACCCCCAATTGCGTGTGGAACTGCCCCCAATGCTTTTGCTTCGGTT:1 - chr2L 16480038 5' + frogger 276 1 70.30 CCGAACTGTACACCTTTCGTTGCAGAAGAAACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 - chrX 9048703 5' + Tirant 8152 2 70.30 AAGGAAAGCTTAGCTGCTCACGAAGCTTATCTGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTT:1 - chr3R 2689483 5' - diver2 4600 2 68.32 AAATATTTTCTCGCTCATCAAACAATTCAAAGCAGAGAAATGGAAGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAA:1 + chr3L 5266235 5' - Juan 3991 1 55.45 CTTTGAAGCAACAAGTGCAAGGTGCACAACTTTTAAAATTCACATCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chr3R 8670020 5' + hobo 80 1 58.42 GACACCGTTGGCGGCCACTCAACTTGGAGCGTTGAACCTTGGGCCAATCGGGGTCAGCGAACGCGCCCAAAAAAGTGGGTCAGCAGTTTGATATTATGTTT:1 - chr2L 15911607 5' - Gypsy6A_LTR 45 1 83.17 GCACAAGTTGAGGAGTGGCAGCAGCGAGCAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCG:1 + chr2R 20914833 5' + accord 46 2 70.00 GCTTTTTCCACTTCTTGTTGGCTTAGTTTCCTGCTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATC:1 + chr2R 21900370 5' - Stalker 159 6 67.33 TTTTTTTGTATGTAACTTAATCCGTATGACCTTGAACCTATTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCATGTAGGT:1 - chrX 4147010 5' + Stalker 442 1 77.23 TGATAAGGATGTGGCCAGAGGCAAGGCTTCTCTTCCAGCTCCTCTCCCTGTGCTTTCTTTGCCGGTTTTCGCTTTATCTCGTCCGGCTCTGTATGC:1 + chr3L 16585760 5' - G6 426 1 75.00 GTTGCTAAATATGTTCATGGTCTGGATATAGTATCAATAGATTTTGCTATTTCTTCTTTAACATCAGGGATTCCTAAGTCTTTGTGGATACTTGCATTTGA:1 + chr2L 12921968 5' - G4 3540 1 59.41 TAGACAAAATTAATCCAAATTTACAAGATTAATCAAAAAATCAAAAATATATATTTTTATGGCATATCGGCCAGATCGTTTATATGGCAGCTATATGAAAG:1 + chr2R 3138861 5' + transib1 2018 1 56.44 TTTCGCAATTAAATTGTACCACAATCTTTTCAGACACTTATTAATAAGTGTCAGAAAATACAGAAACGCTGGTACAAACACGGAATGTGCTTATGGTGCTT:1 - chr4 783257 5' + Tc1 1625 1 62.38 TATTTAATTTAATTCTGAAGGCATATATTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTGTGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGAT:1 - chr2L 23381793 5' - Ivk 325 1 61.39 TTTGTTTGTGTATGCAAAATCATTTGTTCGGTTGGCCTGGCAACAAACGATTGACTCCACTGCCAGTCTCAGCGCTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGAC:1 - chrX 8207148 5' + Ivk 249 1 63.37 GCCACTTTCACTGCCATAAGAACAGCTGCCAGAGAACCCATAAAAAAAACATGATTAATCAGCAAACAAAAAAAAAAGGAACGAGGAAATGAATATAATG:1 - chr2R 21878023 5' - Cr1a 4331 1 82.00 TGCGTGGGAATTTATAGTTTGATTGTGAAGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGT:1 - chr2R 20514619 5' + flea 400 1 71.29 TTATGAGCTTAAGTTTATGAGAATGCCTTTAAATTACTATAGAAACAGGAAATATATCTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr3L 11335535 5' + pogo 16 1 57.43 CTATCTATAGAAATAAGAAATTAAGGGGTTATTTCCCATCTTAGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAAC:1 + chr2R 15038089 5' + G6 2007 1 57.43 AAAATTGAAGCAATTCCGCTTACGCTTGGCATACACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3R 27386295 5' + hobo 42 1 68.32 ACCTTTCACCTTTTGGTTCTTCTATGCATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 + chrX 8447148 5' - opus 7455 2 77.23 TCTGGCATTGATCTGAAATTGTATTGCCTACTTTTTGGGGCCGGTCAAGATAAAACCCGGGCTGTCAGCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGC:1 - chr2R 21415220 5' + jockey 16 1 68.32 GCTTAAACCCTTAAAAAGAGCGATTAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:1 + chr2L 7745926 5' - I-element 5304 1 80.20 CCACTGGAGTTGAGTTTCTGGCTGAGGGGAGCAAAGGGGTGTGTAGAGTGGTTAAAAACGAAAGTGATAGTGCTGAGCTAAAGGCTTTGTTCGACGCGAAG:1 - chr2R 18346173 5' + Dm88 466 1 60.40 AGTTGTAGATACAAGTTGAGCAGTTGAATAAACTAGACCCACAAAAGGATGACAATGACAATGTCTATGTTTGCCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTA:1 + chr3L 14120259 5' - Stalker 21 4 76.24 TTTCCCCTTTCTACATTTAACCTTCGAGCTTTGTTACTTTTTGGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3L 16449730 5' + roo 32 2 57.43 ATTTAAGCTAAAATATATTATTAGTTTATTCATATCAAGAATTGATCAATAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTG:1 - chr3R 13857559 5' - 1360 215 1 61.39 TGCAACTATTCCCACCTTAGCCATATTTCGTGGATCCTTTCAACACCTTTTGGACTCGTTTTGGTACAGACTGTACCAAGCTGTGGGTATAATCTATTGTA:1 + chr3R 30357634 5' - Tc1-2 1288 1 55.45 TATTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 + chr2R 19209440 5' + Doc 38 1 76.24 GGAAACAAGATTCGAGTGCACCACTCGCTGTTGGTAGCTTCCATTGAGATGCGCCTTATTGATGGCGGACAAAATCGTTTGGGATGGGGCTCACGTGATCA:2 - chrX 15915893 5' + Rt1a 4704 1 64.36 CAATGTGCTGAAAGTTGTGAGTTTTATGAAGTCTTAAGCACGCCATGTGCGGGTGGCTGTACCCAAGAACAGCAATGTGAATTCATTCTAATAAACCGCTT:1 + chrX 9746581 5' + Stalker3T 284 1 71.29 GGTGTGTGGTGTGTTGTGTTTTAATCTCAAAAATGTCGTTTCCTGGTGGAGCGTTTTTCTGGGGGTGCTCCGGTGGACAATCGCCACGAACTGCCGTTGGG:1 - 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chr3R 5806654 5' + transib2 37 1 58.42 TGCATAGGAACAGGATATGTCATACCACTTTACTTCTTCGGCAAAACAGAATGTTACCTCCTTATTCTAGAAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTA:1 + chr4 151735 5' + Cr1a 3991 1 56.44 TTCAGCCGACGGCGAAGTTAATAAGTCAAGGCTGCCGTTTTTGATCGCCTGGCAGTTGAGCCTTTTAATTGCACAATACAGTATAATTCGCTTAGATGCCT:1 + chr3L 5492267 5' - pogo 2099 1 77.23 TCGGCAATTGTTCCCGGAAGATCCCCTGCCGTATGATCTAGAAGTGGCAAAAGACATCAAGATATTGCACCAATAAAAAAAAAAACCGAATT:1 + chrX 1755150 5' + McClintock 6281 2 82.61 AAGCATAGCCTTATAATTTCTTGAAAAGATGGTTTACCTTTTGTTGTTCTTGATTCTTACGCATCGCAGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGTTTC:1 + chr3R 31955773 5' + 297 232 2 77.23 TCCAAGTAATAAAATTGTTTTTGAAAATAAATCATTATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chrX 12925940 5' + roo 39 2 66.34 ATGTATTTTGGGGATTTGAATTTATTTTCCATAATTTTTGTTGCCCTTTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTAATTTCAGATAAAGATGGAAACCGTAGA:1 - chr3L 14163623 5' + Cr1a 427 1 54.46 TCTTCTCACTCACCCACACAAATTGTGTTTGAATTTAACCACGGTTGCCTGGAATGCGAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCT:1 + chr3L 10718804 5' + G6 1660 1 51.52 CAGTATATATATGTACACTTTTGCCGGCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr2L 20387833 5' + 297 6623 2 80.20 GGCACGCTGCCACCAATTTTTTCCCTTCGGCAGTGCATTTTCATTGTTCTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - 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chr3R 17849860 5' + Doc2-element 131 1 69.31 GATGTAAAGCTAACTGACACGTTAGCTAGCTATAACTTTTTCGAAGTCTATATAATTCTCTTAACAGCCAATATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGC:1 - chr3R 15973098 5' - Doc 4385 1 79.21 TGTAACAAACTCTTACTATTTTTTACATTTACTACATTTCGGCAAGTAAAATCTGTTACAGCCAAATTCATCGAACGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 + chr3L 153551 5' - 1360 3388 2 79.21 ACTTTCCCCTTTCCCCGCCGACCAACGCAGCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGG:1 + chr2L 3938886 5' + HeT-A 5994 1 70.30 CGAGAATTGCAGTTAAGGAAGTGAATGTATATGTATATATAGTAAGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 + chrX 3244577 5' + I-element 32 1 62.38 GTTCGGTGTGCTCGCATATCAGTCTATTTATACACCTGAGGTCAGAATATAAGTGATTTTTCTCTGGATTCTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr3R 28804368 5' + roo 8667 2 70.30 TTTTGCTTCCGCATAAAATGTCGCACAACAAGTTGTTGCCGTTGTTGCCATATAGACGTCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCC:1 - chr3R 21969444 5' - hobo 437 1 67.33 GTGTACCAAATTGCAAATTAGTTATTTATGTGTATGGTTTTACGAAAATACGAATAATCAATCCGTATGCTGGATCTTCTATCTTTTATATTTCCTGAGAT:1 - chr2R 18487379 5' - INE-1 151 1 45.54 GTTAAGCTTTGATATCAAGGGTATTGGTTTCCCTACCCTTGAAGGGTATTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3R 7883204 5' + roo 8689 2 54.46 TGATCAGGAAAAAACGATGTCTTAAGATTTAGACCAGACATTTTTAATTCACGATATACTGTTCGGCACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 + chr3L 25608297 5' + Doc 10 1 61.39 AGAGAGCCAGGTTGACCCCTATCCCTCCTCACTCTCTCTCTCACCTTTGCTGTTCGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTA:1 + chr3R 7107677 5' - 17.6 7145 2 60.40 AAATCAGCACAATATGCCAATGTTTGTTTACTTCCCTGCATCGCAGAGAACTTTGCCAGCAATTAACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTGTC:1 + chr3R 17657905 5' - invader1 92 2 71.29 ATTAGAATATTCAAATACAGTGCTCAACTGAATAGGTTCAACTGAATAGGTTTTCCATTTTTGATTTCACTTTTTGTTTGACCGCGTGATTGTAAAGAGTT:1 - chr3R 4577545 5' + Tc3 362 1 56.44 GCTGTCGTTGCGGCCCATTGAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr3R 23080852 5' + 412 7107 2 76.24 GCGATCAAGGATCGTCATATTTTCCACTTCCGGTCTCTTTGGATCGACAAAACTGTAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAG:1 - 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micropia 5138 2 79.21 TATTTATATTTTCTTTTTGAGGTGCGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3L 10565295 5' + pogo 50 1 78.22 GCCATTAATCGGAAAATGTGAAAACTGATTTCACTAACTACCTCAGCTGCAATTTTTCCCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 + chr2L 2694568 5' - Transpac 5214 2 61.39 AAGCTGGTGGGCGGACCTACAACTCTGGCGATCCCCACAGTTGCCGATTTAGCTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGG:1 + chrX 23070996 5' - ZAM 128 2 61.39 TCTCGGCCTTTTGCTGATCTGCCTCCGCTGCTGTTCCTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAAT:1 - chr2L 18231836 5' - 1731 4585 1 65.35 GATAACTGATTGTTATAATCTGCTTTTAGTTGGGCCGCTGACGAAGTTGATGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTG:1 + chr3R 13678506 5' - Doc 499 1 75.00 GGGAGTGAATTCGAGTGAATTAAAATGTGGCAAGTTGACTGTTTCGTGCATTTAGTTGCTGCTCGTTGAATGTGTTAACTCCTCCCTTTCTAAGACGAAGG:1 - chr3R 31940692 5' - Burdock 6116 1 64.36 CAACGACTACGCTTACACAATGGTATATAGTCCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chrX 22690756 5' - roo 9028 1 67.33 TAAAATAAACGAAATAAATTTTTTAAAGTGAGCGTTGCAGTAGGTTGATGTCATAGCGGAGCGCTAGTGGTCCCATTCAAGAGGGACTACTGTAAAGTTTT:1 - chr3R 21620312 5' + mariner2 87 1 57.43 GTACACTTGTACAAGTGTTGATCAAACAACAATTGACACAGTTAACCAACAACAAAAGCGGCGAACCTTACGGTATCGCTACCACTACCAACGCACTCGTA:1 + chrX 18557726 5' + G-element 160 1 63.37 TACTATTGAAGAAAGTAATATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chrX 7741745 5' - roo 352 2 82.18 GTTACCACCGCTGTTGATCGATATTTTAATTTTATTAAAATCTCGACGTTCATACGAATGGACGGACAGGGCCAGATCGACTAGGCTATTAATCCTGATCA:1 + chr2R 25240192 5' - INE-1 91 1 56.44 TAAATTTTGGTTAAGGTTTTAGACAATATTTATTTGTGTAAGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGGATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACGCTTCTTA:1 + chrX 22576306 5' - Burdock 6289 2 43.00 TTCAGCCGCATGCATGATTTCGTAATTTAAACGGCAATCACCTCTTTGGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr3L 5085077 5' + 412 26 2 53.47 TTAGATTTTCAGTATTGAAATATTTCCATTAAATCAGTTTCTCACTCCTCAAACCTTGTCATATTTCCACTCAACTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGAC:1 + chr3L 3635385 5' - roo 9070 1 77.23 AGGGGTTGGGCACCCGATCAATGGCTTAACGCCTGACTGCAAGTCTAAGGAGAATTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATC:1 + chr3L 15289290 5' - 297 429 1 58.00 AAATTCTGTTTCAATGGCCCCTGCAGTTTTTGCATTCCCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chr2L 12908418 5' + hobo 38 1 67.33 AAAAATCGGCAAAAATCTGGTCTGTTCAAGATTTGCATTTTGATAAGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTTCTGGAGGCATGTGTAACGC:1 - chr3L 3627662 5' - hopper 85 1 54.46 ATGGGGGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 + chr2L 7970986 5' - blood 337 2 64.36 AATAAAGAAACCTTACCGTTGAGCATACACAAGAACAGCAGCAATGTTTTTTTATTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCA:1 - chr2L 13730807 5' - Juan 4183 1 56.44 TGTTGGTCACTTGTCGTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr3R 15054302 5' + hobo 34 1 57.43 CCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAG:1 + chrX 21668007 5' - Tabor 452 2 55.45 CTTGGACAAGGACACGGTACGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 + chr3L 21852519 5' + 1360 57 1 84.16 TTAAAGAAATAAAATTTTACAACCAGCAAATATGAAAATCTGTTTTGAAAAATTTTATTTCTTTAAATTAAGGACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTC:1 - chr2R 6913767 5' + TLD2_LTR 183 1 70.30 GTTTCAAGTGTACATTGATTGAGCATTTTTATAATTTACACACTTTACTTTTTAGACTAACTTAAATAGTATAGCATTAGTTATGGGGCTTACAGCTATAT:1 - chr3R 20137460 5' - I-element 5286 1 60.40 ATCGCCCACCGCCCGCTGCGTCTTCAATGCGTTTGTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAA:1 + chr3R 11530962 5' - gypsy4 474 1 71.29 TAGTCACGCAAACTTCTGCGTCTCGAGTCGAGTGTCCCTCGATGTCCTCCGTGATCCTTCGTCTCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 10978676 5' - roo 398 1 71.29 CATACACACTTGAAAATCACAAAAAACACCCATATATACATATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATA:1 + chr3L 3546754 5' + accord 7095 2 59.41 ATATATGACGTTTACGACGGACGAGAACATAAAGCGAATTTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGA:1 - chr2L 7747932 5' - I-element 4924 1 60.40 TTTGCTTCCAATCAAAGTGACAAGCATAATCTTAATGAACGCTTAAATCTTTTGACTCGTCGTGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACTAGCAGATATAGTGA:1 + chr3L 15118522 5' + BS 4838 1 68.32 CGCCTTCAACAATTCCGTTTTCGGTTTAAGGATGGCATGCAGCGTTGCTGCTGATTGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCC:1 - chr3L 10035681 5' - jockey 482 1 57.43 CTAAGCCGTAAATTCCTACATTGTTTATTTATTTTCTTCTGTATTGTTGCCAGCCATTTATAAACTACACAGTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 + chr3R 20396507 5' + I-element 6 1 73.27 CTAATTATGCGTGGAATATGTATAAACATATATCTGCTGGATAATACATTCTTGCGTCTTTAGAATCTGCATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTAATAG:1 + chr2L 16640669 5' - INE-1 161 1 59.41 GCCTGCTAAAAGATCATCTGAATCACTCTCGTGACTTATGGGATTTGTACAATATGAAATATTAAAAATATAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 + chr3R 30215386 5' - opus 7500 2 76.24 GAGACGAGGGGCAAGGAGCTATTTGATCATCATGATAATTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chrX 3358706 5' + roo 8702 2 67.33 TTTAATTTTCATCTTGTTTACTTTAACGTCATTTTCAACTCTTCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAG:1 - chr3L 22493935 5' + F-element 99 1 58.42 AACAAACATTAAAAGCGAACAAAGGGAAACAAACTTTGATTTTTTGTACAATTTCCTTTTTTCTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCAT:1 - chr3L 13674094 5' + hobo 2578 1 63.37 CATCACAATAAGATTGTATTACTGAGAGAGAAAGTAGAAAACTATTAGGGTCGAAATGCTCTTTTAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCAC:1 + chr2L 16723022 5' + Stalker 6967 4 65.35 GGAGGGAGGTGGCTGATGTTGGGGTTGGGTGCTTGGATATTTGCCTACAATGGTTAACGGAGTTTGTGTGTAATTTGTTGTTGGTTGCGGCATTGGGGAAG:1 - chr3L 17199565 5' - Doc4-element 185 1 60.40 TAGTTCAATAAGCCGTATCTACCACGTATAATGTCCACATCCACCGCCACAACGAGCGTTATCTACGTGTCGATCGTGTATTACTTCACTTCACAACCTTG:1 + chr2R 17808381 5' + McClintock 173 2 65.35 GGTCGATTACAGCAAAGTCGCATTTCCATCCACAGTAGAGGCAAGAGCAGACTCTATAGCCGAAAATAATATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAAATACCCG:1 + chr2L 22751429 5' - INE-1 555 1 66.34 GCCTTTGAGGAGCTTGTGCTCCAAGCCGTTGGCGTTTCGGTTTGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 + chr2L 9437430 5' + P-element 33 1 47.52 TGGCTTAATTGATATGGGTTGCAAAGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 + chr2L 2912039 5' - 297 6930 2 79.21 GATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCT:1 - chr2R 2092777 5' + Doc3-element 98 2 71.29 TCGATGCAATATGTACAAAATAAAGAAAGCGAATGAGAATAATTACAGGCTTAGGTGCGAGAAAGGGGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGT:1 + chr3L 25331172 5' + F-element 249 1 70.30 CTAATTCAATAGCGGGTGATAAACTTCTGTGAAAAAAAGCTCAAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACA:1 - chr3R 1272031 5' + hopper 950 1 57.43 ATTACACTGCGACTAATTAGACCAGCTAACGCTACTCGAAAACATACTTCGACCACAACCACAATTCCACCAAAGGTCATCGCCACGTACTTACTATTCGT:1 - chr3R 17908814 5' + Burdock 169 2 81.19 TATGGGAAATTCTCGGGAAACCAACTCGTAAAAAAAATATTTAAAAGGGAAAACAAGAGCAGGGCTTAAAGAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCG:1 - chrX 4322901 5' - INE-1 570 1 65.00 TGGATGGTTTCCGGCGCACAGTGAAATAATGGGACTGCATCTGTGCATTAATCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAA:1 + chrX 14648927 5' - 297 267 2 56.44 TCCTGCTTTTGATGTTAGAGGCACTGCCTCAACAACCACCGCCCATTTCTTGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 15714213 5' + jockey 33 1 51.49 GTGGAGACATCCATGAAATTCGACTATGACATGCAGAAGATCCTGGACGAGATCCTCAACGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGCGC:1 - chr3L 1864664 5' - Tabor 7141 2 71.13 CTTCGTCAGGTTTTATCCATTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chr2L 13598163 5' + pogo 7 1 70.30 AAGCAACACCCAGCGAACTTAATACTTAATACTCCAAGTTTTTAAGTCATTCATAAAACTCATATATTTTATATAGGATAAAAAAATCTTTAAATTAATTA:1 - chr3L 15420470 5' + Stalker2 7187 1 55.45 GATGGAAGAAGCAATGTCTCCTATGTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTATAAGGATATATAGACTAGATTCGTTGAACTTGACTATAGCATTCTCTCTT:1 + chrX 5853598 5' + INE-1 577 1 76.24 TTGCCTGCAGGACTAAAAAAGGGACATTAAACATTTTTAACGGTGCACCTTTTAGTTTTTTTTTTGTGTCTCTCCTATCTGTGTATGTGTGTGTGGTGGTT:1 + chrX 11369939 5' - accord 7099 2 68.32 AGCAGCCAGCACAGGAATCGGGAAGGAAAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCT:1 - chr2L 14126105 5' - jockey 4708 1 72.28 AAAATCTTATAAATACGAATTTGTTTTGTGGTGTATACAAAACATCCGTGCCTCGCACGCATATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:2 + chr2R 10191682 5' + 297 6589 2 73.27 AGGACCGGCGCTTGTGCAAGCACTTAGCATACGATATACACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTG:1 + chr3R 27586040 5' + Burdock 6089 1 62.38 GCCAGAAGAACAGAGGAGTATGTAGATCTTTTTACTACGGATTTTACGGTTTTACGACACTTAAGCGTGTTGGGCGCCAATTAAACCAAATACGTTTGTAT:1 + chr3L 15840007 5' - gypsy10 342 2 76.24 CACAAGCACACAACGCACACTTTCGAACGAGCTCCCAGTGCACAGTGAATCAAGATGGTGTTAAAAATGCAAAACGAAATTCGTGAGCAACGTCAGCGTGA:1 - chr2L 20267494 5' + Doc4-element 11 1 70.30 AGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCAC:1 - chrX 21668058 5' + Tabor 6888 2 72.28 GAACCTTGCAAAAAATTGTATTTAATAAACCAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGA:1 - chr3R 6999773 5' + I-element 446 1 73.27 ACTCTTATAGCCACATCAATAAAACATCTCGTTCCAAATTCATAATTTAAGTAACGTTTTGAACTTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACAT:1 - chr2R 17425691 5' + Stalker 35 4 78.22 ACTTGGGCAGGGTTATTTAAATATTTCGCAGGACCAGCCGGAGTAAGCGAATTCTGACGGCTACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 - chrX 18119586 5' + hopper 12 2 67.33 TACCAAACTGATCGATGTGATGCAGTAGGGGATCCACACCTTGATTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATT:1 + chr2L 16832462 5' + BS 5026 1 56.44 GCGGGATGAGTTGGAGTCCAAGAACTTGGAAATTTAATCGCCGCCGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACAAGTATGCTCATGCATTGTAA:1 - chr3L 3535847 5' + 1360 187 1 56.44 CCCATAATTGCAGACGTAGAGCTTGTTTACAAGAATGGCTAAGAGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTAT:1 + chr3R 13210076 5' - 17.6 7062 2 76.24 TAGACCCTCCGCTAAGCTTTAGGTTTTGTTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCACTCTCC:1 - chr2L 8893879 5' - F-element 435 1 75.25 TATTTTATTACGCTCTGTTTGTACTGCATACAGTGGTACTTGGTGCTTAGTGAATTTAGAGATTGAATTATTTTTCACTTAAAAACTGCAACAATTTACCA:1 + chrX 14516137 5' + Transib5 2609 1 62.38 AAATAAGTAATTTATTATCTTGGGATTGTTGCAGCGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTTCAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAATCAAGG:1 - chr3L 25525514 5' - Rt1b 4987 1 66.34 TCATTTTGAGTTTCTTCGTTTCAATGAAAGCGAACCGCATACAGCCATTTGCACAAAATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGA:1 - chrX 3631254 5' + baggins 5201 1 60.40 GTGGATGAGCGAGGAAACACAATCTTTTTGACTGAGATTTGAACGGACAGTGGCCCCTCTTTGGTGGGTTCATGTATAGTTTTTTTTGTTTGTTTTTTTTT:1 + chr2L 637004 5' + hopper 148 111 70.30 CATACGAAATGCAAACAAATGGAAAACGTCGACGGCACACGCAGGTGCCGCACGCAAGTCCCAGTGGGTGGTGGGTGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr2R 16478416 5' - hobo 2937 1 77.23 TTTTTTTTTCGAATTTGGAATGCCAAGTTTATTGTAATTGTTTTAAAAATATAAC:1 + chr2L 10197586 5' - Stalker4 408 1 67.27 ACGCGGCATAGTTTCAACTTTTCAGGCCTCTACACTGTCAGAAATTTATATTTGTTTGTGTCCTAGATATTAAAATGCATAATAAATAAATAAATCTCATT:1 - chr2L 1615495 5' + G3 347 1 48.51 AAATTCACCAACAGCTACAACAAATTGGGCTGGCAAACAAGTGTGCCTGTGTGCGTTTGTGTTCCGCTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chr3R 18449023 5' - hobo 2927 1 65.35 ACAGTTATGATGGACATATATTAGTAATTGATTCCTAAGTAACATATTTGTTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATAT:1 + chr3L 10045225 5' + Stalker2 19 2 51.04 GAGATCTGCCATTCCCTGGCCCTCTCCTCGGGCTCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAG:1 + chr2L 11964248 5' - accord 39 2 67.33 TTTGGTCCAGTCGCGTGCTTGCCGTTTCGCTGAATATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGC:1 + chr3R 20031090 5' - 412 7149 2 65.35 CAGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAGTTTTTGGAGAAAGAAGACGTTGCAGACTGTGCAAAACTGCAACGCCG:1 + chr3L 26696870 5' + looper1 1556 1 87.88 GAAGTTCGATTACGACATTTCGTATGCGAAAAGATGGATGGAAACTTTCACTTGTCGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTGGTTTTTTTGAGGAAAAGTA:1 - chr3R 8878979 5' - I-element 5155 1 60.40 ACAGCAGAGGCAGCAGCCAACCATAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATT:1 + chr2R 6578461 5' + F-element 4233 1 76.24 GATATTTGAGCCTGTTCAACTTACGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr2R 7037134 5' - 1360 3341 1 76.24 TGACATGGAGTCTACCTGTCAACAAAACAATTAAAGTTTTAATTTAATTAAGCCGGCTCGAGTCGGAAGAGTGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTA:1 - chr3R 11659438 5' + roo 8791 2 78.22 CCGTGAAAAGCCGGCCGTCCCCCTCCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAAT:1 + chrX 9487318 5' + F-element 4288 1 75.25 GAATGTGGATGGGGGATGGGGAAGGGAAAGACGTTTCTTTCCACTTTTGATTCGATGCTGCCGATGCGAGGAGACGCCAGAGTGGAGGACCGCCGGGATCA:1 + chr3R 25659558 5' + gypsy8 4594 1 63.37 TTTGGTGCGTTTAACCGCAAATATTTAATGGTTTTATTTCCCTCAAGCTCTTATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTT:1 - chr3L 22549377 5' - P-element 477 1 41.58 GAATAATTCCTACATTTGCGATCCACTTTCACTGACATCGTATTGATACCAATAATTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2R 9007298 5' - roo 387 2 60.40 TTTGGCTTAATTAGCAATGACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:2 - chr3L 16449775 5' - roo 9016 2 82.18 GTACTTTAGGGCACTTTATTATTGGTTTTGATTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTTCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTT:1 - chrX 3295762 5' - Bica 449 1 69.31 ACCCATTGACAATTATTAGACCGACCACGCCCCTTGTCGTGCTCATAAATTTTGTTTTTTTCCCTCAGTGCGTGCGTGCGTGTGCATCTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 19616824 5' - accord 189 2 54.46 TTTCAGCGTCGGCGGAGGTTCGTCCTCGATCATCCACCAACAGAAGCAGCAACTTGTGATCGCCTCAAACCAAAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCA:1 + chr3R 15819190 5' + F-element 340 1 77.00 AAGATAAAACCCGGGCTGTCAGCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 - chr2R 21415174 5' + jockey 63 1 76.24 CCATTAACATAGAAATGCTTTTCATATCATTCAATAAGATATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 - chr2L 18188459 5' + Doc 41 1 61.00 GCGTTGCTTTTTGTGAAAACTTGATGTATGTGTGTGGCTATGTGTGGGTGTGTGCGTGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chrX 6146644 5' + hobo 17 1 62.38 AGTGTGCGGTATATTTAAGAACTATCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 + chr3R 24764571 5' + jockey 66 1 81.19 ATTTGTTCTGGTGATGTTATTTCCAAAATTCCAGAAAATTTATTAAATTTCACGTTCTCACTTCCACTACCTGACTAACGGGTATCTAATAGTCGGGGAAC:1 - chr2R 5949443 5' + INE-1 556 1 77.23 AAAGCGCTGCTCAACACACACTCTCACACATGGGCACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGAC:1 + chrX 22739427 5' + Tirant 243 2 63.37 CAAGCCGTGCATGCCCAAGGGCGGCATTCTTTCCGATATTGTTCCAAAGCTGTACCAAACTCACTAAACTCATATACAGGGTGCGGCAACATAACCTCCTT:1 + chr3R 27930869 5' + mariner2 4 1 70.30 TTCTGGTGGGCTTTAACTCAAGCAATTTGTTAATGAGCAAATTACATGGTCACTGCATATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:1 - chr2L 18506829 5' - flea 238 2 61.39 TTACATTTACTACATTTCGGCAAGTAAAATCTGTTACAGCCAAATTCATCGAACGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3L 153573 5' + 1360 23 1 57.43 GTCTTCGAAAATTGGAGGGAATTATTGCATATATTTCAAGCATATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAAATAATATA:1 - chr2R 1638086 5' - I-element 5314 1 58.42 CAGACGGATTATGATTGCTTTGGATTGGCCTCCAAAGTTCGCTGAAACTTTGCGGGCTTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTAAAAA:1 + chrX 13046446 5' - Max-element 8480 2 54.46 TATACTGGTACTGCCAGAGCAGGAAGTTATAGCCCTATACTATATATATATTCGCAACCCTTAGACCTATACATAGGTCCCCCACTATCAGATACCCGTTA:1 - chr2L 21689901 5' - INE-1 552 1 73.27 CAGTGAAAGCGCGCAAAGTTGCCACGGAGACGAGTCAGCGGAGTCAGATCCGGGCAATTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTA:1 - chr2L 9466380 5' - BS 4916 1 64.36 GCCCTCCTCACTTTACCACTCATTCAAGTCAGATGTAAGTGGAAGTGTCGTATATCTTAAAAGATGGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 + chr2R 12357471 5' - opus 493 2 73.27 CCAAACAGCAATCATAACTCTATGAAACGAAATAATATAGATGCACATATCTGCTCCGATATACGATTTTACGATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCCA:1 - chr3R 15641175 5' + I-element 5002 1 78.22 AGTTCATATAAAACCATTACGGATCCAATAGTATCGGTAATGAAAGACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:3 + chrX 4056262 5' + roo 29 2 55.45 CAATAATCGGTCGCAAATGAAGTTCAGAGATTGTGGCAAATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 - chrX 10211003 5' - I-element 5323 1 57.43 GTACGTATACGTAATATTTGCGTACAACATACGCGTGCATACGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGA:1 - chr3R 10281976 5' + hobo 2889 1 59.41 TGAGGAAGTGAGGCCCGCGGAAAATCAGGGGAAGCGGGACGATAGATTTGGTGCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATT:1 - chr2R 20148942 5' + invader2 4685 1 55.45 GTTTGAAAATGCATTTAATTGAGGTTGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTA:1 - chrX 12858240 5' - accord 456 2 74.26 AGTGGCATATTCGGTTTACTAAACAATCCCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGA:1 + chr2L 6392880 5' - roo 258 2 73.27 GAAAAGCTTCAAGTGAACATTCAGTGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGG:1 + chr2L 21075383 5' - Idefix 7020 2 75.25 GGAAATTTGTACTTCACCTGGGGACGAGAGAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCA:1 - chr3L 8262949 5' - hobo 2591 1 70.30 TGTGACACACATTTGCAAACACTACCAGCTCGGATACACACACCCATGTGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTG:1 + chr2L 18461721 5' + HeT-A 5984 1 53.47 GTGCAGCAGTTTTGAATATTTTGTGAATAGTATATTCCAACACGCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACT:1 + chrX 6416430 5' - copia 4811 1 77.23 ATGGGTAAGAGGTATCTGATAGTCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 10078336 5' - roo 356 2 75.25 TGGGATTTTTTAAATTATTTTGTTTTTTGTTTGGTTTTATAGCGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAG:1 - chr3L 15235976 5' - F-element 418 1 59.41 TCCAACAAGTTATCAACCATTTTTTAATTATTTTTTTAGAATTAATCGTATATAAAAAGTCATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 + chr3R 21998372 5' - 412 7532 2 64.36 TTAATATCGAAAAAATATACAGATTTTAAGAAGGTGACTTAAGCCAAATCCATTTTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTT:1 + chr3L 17751071 5' - 1360 3138 1 55.00 CAATGCTTTGATTTAGTTGCCAAGCGATGTAAGTGCGGCTCCAAAAAGGGGCTTTATTCCTGGCTACACTGAAGGAAAAGTGGGCGTGCCCCAACTCCGCC:1 + chr3R 9082769 5' + hopper 119 1 76.24 TAAAACGGAATTTTATTAGGTCGCACTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAA:1 + chr2L 14074933 5' + jockey 235 1 59.41 ACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTAC:1 + chr3L 19951225 5' + Ivk 57 1 81.19 AAAAGAGCACTAGAATGGCAAACTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr3R 14832514 5' + hobo 53 1 77.23 CCAATTTTCTGTTTGGTCATTTTCATTGCCAACACATTTTGGAGACCAACTCCAGTCCAAACACATCAATACTAATGCACACCGCATTTTTCTGTACGCTT:1 - chrX 4506153 5' - invader1 174 2 75.25 TGTGTGTTTAGCAATAGGATTAAGGTCAGCTTTAATCAGGTATATTCGCACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3R 26871099 5' - hobo 2909 1 54.46 CTTATAAACATTAGCACAGGTGAATGGTGCGCAATGCCATCGGATATTCCTATATCTTAGATCCTCAGTTTCTGAACTGTAAGTTGTGGACGCCGAAAAAT:1 - chr3R 23274124 5' - invader3 282 1 78.22 TAGCTTCCATTCAATTATCCCGCTGCGATTGCGGGCCAGTTCAGTTCCGCTCCGCTCAGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGAC:1 - chr3L 21913180 5' + Bari1 1698 1 68.37 GTAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTA:1 - chr3L 27415312 5' + transib2 19 1 59.41 TGTCATTGAGCTATCTTCCGTCTCTGTCGCACTTCCCTCGGTTTTTCGGGAAGGTATCGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCG:1 - chrX 8887727 5' - gypsy4 6482 1 62.63 GTGAGCTTATAAATAAAGAGCTTAGAGATTATATATTCAACATGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCA:1 - chrX 6156229 5' - 3S18 6070 2 56.44 CCACGGCTGGTGATTGATGGGCGCCGCAAAAAACCAAAAAGAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3L 10565352 5' - pogo 2072 1 58.42 GGAGACGACGTGGCTCTGCAATTGAAATGGGCCCAAAGACACACCGAAGGCATGGCCCAAACAACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCA:1 + chr3L 17214185 5' + F-element 307 1 66.34 GTATTTGTAGTATCCCCGAGGAAAGTCAGTTTCAGACTGTACAAAAGGCATAAATTTGCAGTCCCCTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr3R 9081912 5' + hopper 10 2 67.33 ATATATTAATAGACGATCAATAATATTTCTGTGGTAAAGTGATCGATACGCCCCCTCAGAGTCCTGATCTGAACCCCATTGAAAATTTGTGGACCTACTTA:1 - chr3L 22787121 5' + S-element 1249 1 72.28 GAGATAGAGCGCTTAGTAGCTGACTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 3635466 5' + roo 8714 2 77.23 CATCCCTAGCAGAATGTGCGAAACTATTAGTTCCTCACTGAATAAGCGATTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 + chrX 4267453 5' + hobo 84 1 57.43 AAGCGTAATTAAAAACATTTTTAAAGTGAATTCAAAGTTAAGCCGACTAACAAAGTCGGAACTCTCAACTTCACCAGGAATAAGCTTACAAATAAGGACTT:1 - chr3L 9146846 5' - Cr1a 4038 1 66.34 ATCCGGAGACCGCTGCTGCTCATCACCGCCGCCGCGGGGACAGAGGAGAACGGAGAAGGATATGTGAAGGGTCAAGATGCCCCGTCGAGATGCCTAACGGC:1 - chr2R 9234765 5' + gypsy8 4512 1 67.33 CCGGCTTGACGAAAAATTACAATTCGTTACGGATCGTTTGGGCTGCGATTGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGC:1 + chr3L 18323770 5' - Doc 4454 1 53.47 CATTGAGAATACTTTGGCACGCGATGCGTTTTTTTTTCGAATTTGGAATGCCAAGTTGATTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGA:1 + chr2L 10197554 5' - Stalker4 390 1 65.35 AATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGG:1 - chr2R 3760469 5' + accord 40 2 64.36 AACGCAACTTCATGGTTGGCTCAAAGCTCTATTCATAACCAATTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACA:1 - chr3L 10846285 5' - hobo 416 1 57.14 AACTGACCACGCCCCCAGTGGCGCCCACCACCTTCTGTTGTCACATCTGCAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chrX 8354434 5' + jockey 18 1 62.79 GAAAAATAGAATAGGTGTTCACACTGTGTTCACAAGAGTTTTGCGTTTCCTCAACCACATCAATCGGAGCGCAAAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTG:1 + chrX 21630937 5' - Cr1a 10 1 65.31 ACAGACACATCTACAGTTTACGTATGTGTAAATTATATAGATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGGGTTATGTTATTTCCAGTA:2 + chr2R 16160232 5' - gypsy 7425 2 49.50 AGATGGGCCACGCAATATGTTGTTTCAATCTTGTAATTTTACTTTCAAGTTAACGTTTCTTATGCTTGAATTAGGTCTTAATTTGATTTGTGTGTTTTTTG:1 + chrX 12941603 5' - Porto1 4446 1 68.32 ACTGCAGCGTCGAGATGCCCCCGACTTTGGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGG:1 - chrX 4564218 5' - Idefix 7155 2 77.00 TAGAGTCATTAGCGGGCGAGCAATTAGCAGAAGTTGGCAGCGAAATGCAATTGCAGGTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 - chr3R 29711053 5' - mdg1 7437 2 54.46 GTTAGAGGGTGAAATTGAAATGAGTGTTCAATTTAAGTTTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTA:1 + chr3R 4682187 5' - copia 199 2 74.26 TTCCGGTAATTCAGAAACTCAAGAATCCAGGACATTAGCATAAAGAAACCACCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTT:1 - chrX 7598512 5' - F-element 264 1 54.46 CGACTGCCGCCTGTCGCTGTGTGGCGTACATGTGAGGTCCTGTGTGTGCGCGCGTGTGCGTATGTGTTTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chr3R 27386378 5' - hobo 2934 1 72.28 CCGGATGAGGAGGATGACCGGGATGTGGAAGAGCCCAGCGAGAGCAGTGAACCTAGGGGATTCAGCAGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAAATACTGC:1 - chrX 7867347 5' - Cr1a 161 1 72.28 CCTTTTGGTTACCATTTTGTACATTTACGATACGATGATTTCACGTCGGCGATAACAGAACAAAACGCCTTGATCTCGGAACTATAAAAGCTAGAATGTTG:1 + chr2L 7138840 5' + INE-1 159 1 65.35 CTGCTTCTCCTGGCACTCCGGCTCCTTCTGGCCACCGTGTCTCTCCGACTCGTTCACTGTTTATTCTTTTCCGACTTATTCGCGCGTTCTCACTCCCGAAC:1 - chr3L 17202110 5' - gypsy8 440 1 57.43 AGATAACAGTACATTCTGCTACTGGTCTATTTAAAAAAAGATTTAAATATTTCAATTTAACAGCATCTTGAAAAGTAGGCCACAACGGCAAAGGCGCGCTC:1 + chr2R 16850251 5' - mariner2 152 1 71.29 GCCAGCGTGTTGTTGTTGCTGCCGTAAGTTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTG:1 + chr3L 5274702 5' - Quasimodo 290 2 71.29 GTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTAC:1 - chrX 22386798 5' + hobo 49 1 67.33 GTAGCGAAGCGCAGCAAACACAAAACACACAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTAT:1 + chr2L 20628100 5' - Ivk 220 1 71.29 GGCGCCATTATTGGAATTTCTATAACAGGCAACTGGGGCACCATGGTTCCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGG:1 + chr3L 10507752 5' + Doc2-element 4501 1 69.31 CCTCCAAATACTTGGCCTTGGTGATTATCTCATCACTGGAATGTGCAATGGTTTGGCATGGGTTTAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAA:1 + chr3R 23081683 5' + 412 456 2 66.34 CCAAGAGGACAGAGGCACGGGTTTTATTGCCAACAGGGTGATTCTGAAACTATACTTAGTCTGGAATACAAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACC:1 - chr3R 21257925 5' + Doc2-element 4337 1 52.48 TGCACACAATTCAGTGCCAAATGGGATTTTGGTCGAACGGCAGCGAGTGTAAGCCATGGCCAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAA:1 + chr3R 22109929 5' + I-element 416 1 68.32 AATTACCAATATTATAATCGTTTTTCTCACATTTGCATTGGAAGTGAACTATATATTATAAATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATT:1 + chr2R 19244482 5' - Burdock 241 2 61.39 CTGTATTTGCTCGAGGGAAACTAATAAAACAAATCGCATGTTTAGCCAAAAGTAGTAGATATCTGGTCATTGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTC:1 - chr3L 21092743 5' - 1360 213 1 74.26 CGTTAGCATTGTAAATTTTCTTAAGTTCTCCATTTTTGTTTGGGCCAAGTAAGATAATCGAGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chrX 15259009 5' - roo 394 1 64.36 CTTTTTCCCCGCCCACCATCATTTTTCCAAGCGCATTGTTCTTCTTGAAAAAAAAGGTCTGGTCTGGATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAAT:1 - chrX 19360150 5' - P-element 201 1 66.34 GACATATGGCAGAATATTTCCCAAGCCCAAGCAAGCCGACTTGGCTTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 - chr3L 18142015 5' + blood 7042 2 56.44 GCATTTGGCCCAAAGAATCCGCCAAAGTTGTCCTCGTTGTTTGTTATTTTTCGAGAGCGAGAGAACGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCGACGTA:1 - 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chr2L 7745985 5' + I-element 13 1 62.38 GCCCAACAGGACGGTAGACACCTGCGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAACGAAAATGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTG:1 + chrX 19312937 5' - Max-element 376 1 76.24 AAGCATTTATTTTGCGACATTTAATTAGGCGAGATAGAGCGCTTAGTAGCTGACTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 3635496 5' + roo 20 2 61.39 GCGGACCAGGAGCGGTATCTGCCGGTGTGGGATCAGGAGAGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAATCCCTCAGCTGAGGGTTATGAATCG:1 + chr3L 9944637 5' + Rt1a 4993 1 67.00 AGTATCCATTATAGCATATCAACAACCAAATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACA:1 + chr2L 15019876 5' - BS 5074 1 53.47 CAAGGTGAAAAGTAGGTGAATGTTAAGCAGCGGCACCAACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATAT:1 + chr3L 4713768 5' + transib2 36 1 64.36 CAATTATCACACATAGCTGGCATTTTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:2 + chr3L 4051061 5' - pogo 2055 1 75.25 GGTTGTTTAATTAATTCGCTTTGTTTCGATTGCCTGGGAAAAGGCGATATTGTTTGTTAAATGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTG:1 + chr2R 23429723 5' - 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P-element 2854 1 42.57 AATTTATGCAAGTGATATTTTTATTGAACCAAATTGTCTCTAAAGTGATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3R 12729426 5' - roo 9044 1 62.38 TTAATAATTCTCTTTCTTTTTTATGTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 11100268 5' - gypsy11 3933 5 84.62 AGGTATTTTTTTATATATGTGTGATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGG:1 - chrX 22757530 5' - accord 138 2 82.22 CAAAACTCGAGGCACCAAAACAGCCCGAAAAAAACCACCTGAGCAACCTGCAGCAACTTGCAGATACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTG:1 - chr2R 10578513 5' + gtwin 6964 2 76.24 ATATTTTCGGGCTGCCCTAAATTATATAGTCGAGGCGATATTTCTGTGCATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2R 10345680 5' - roo 9045 1 56.44 AACAGAGAAGATGGGGGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 + chr2L 7970976 5' - blood 347 2 54.46 GCCGTCAGCCTGGTCAGATTTAGTCCAATACATAGGCTTAGTGAGTTTGAATGTCGTAATGTATTGTGTGTACGAAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCA:1 + chrX 10344017 5' - 1360 3187 1 78.22 GCCGCCCACTATTTTCCGGCCAAGTTCGTATACGCCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - 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Burdock 214 2 68.32 TAAGCTTTGATATCAAGGGTATTGGTTTCCCTACCCTTGAAGGGTATTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr3R 7883202 5' + roo 8691 2 54.46 AAGTCACGATAAAATGCTATTTTAGATCCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr3L 18034187 5' + Doc 53 1 69.31 AATGTATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGG:2 + chr3L 21912256 5' + Bari1 27 1 59.41 GCGTATCATTTTGCAAACCTTTCGCCTGCGTCCGATGAAAATTTAATGAGAATTGATTCCATTTAGTGTCAGGCATAGTGGGTAATGACCACTTCTGATGT:1 - chr2L 11354478 5' - invader3 299 1 54.46 ATGAAATCATCTATATATGCAGATGCTCCCATTAATTCGAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr3R 26871036 5' + hobo 35 1 57.58 TGAGCGATAATAGTAGGAGTATTCGCACATTATTATACTCATCTGAGCGCCGTCAAGTGACATGTTTATTGCAGCCCATAATTAGAACATATTTATAGTT:1 + chr3R 25572604 5' - rooA 7271 2 65.00 ATTGTTGCCAGCCATTTATAAACTACACAGTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chr3R 20396549 5' + I-element 48 1 68.32 AATGTGCAAATCGTGTGCCATAAATTTGCAGTTTAAATGCGAATTCGATTGACAAGCCAGCCAAGTGCACAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chr3R 21969033 5' - hobo 2932 1 72.28 CATTGCCAGACGTCTTCTTTGTTTTTTATATATTCCGACAAATGTATTTGTTCTATTTGAACTCCTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGGATC:1 + chr3L 24912012 5' + roo 8836 2 74.26 GCCACGCCCCCTTGGTTTATTTACGCGCCTAAGAACGACCTTGGATGCTCACTGGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGCATAAGAGTGCCGC:1 - chr3R 29326882 5' + frogger 2279 1 69.31 ATATTAATAAGTGTGAGGCGGCTAAAACTTGCCACGACTTTTATCCTTGAAATGCAGCATAGACGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCTAAAAATAGAATT:1 + chr3L 5385001 5' - 1360 3273 1 69.31 TATAATGTTAATTTCGTCAAAAATATCAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chr2R 12437178 5' + pogo 47 1 75.25 GTGAGGAGAGCGATCGAAACCAAGGGTTATAAGTTAATACTATAAGTGGGTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACA:1 + chr2L 16456765 5' - BS 5063 1 52.48 TCCTTTAGTTAAAGTGCTAGCTAATGAAAAAACAACTCCTACCTCTCATTTACCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAACCTTATACCCTCAAAG:1 + chr2L 8821086 5' + Porto1 317 1 73.27 AAAACATCGTTTACGCACCTATTAGTTGTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAG:1 + chrX 5275531 5' + jockey 4725 1 74.26 ACAAAATGTGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chrX 6146715 5' - hobo 2897 1 67.33 CGTGGGAAACTGAATGTGACTGGGCTGAAAGTTCAGTTACACAAAAAAAATAATTAACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAA:1 + chr3R 16399065 5' + I-element 4969 1 60.40 TGCTGCTCAAATATTCAAACACTAGTATGTATTAGTTTTGCGAACCATGATCTCATCCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 + chr3R 17064113 5' + Transpac 17 2 62.38 ACGTGAGTTTACCCATGATTGATAAGTATTTATTTACCGGTCGATTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr3L 3776538 5' - roo 9040 1 57.43 CGAGGAGGGTTTGTTAACGAGGTTCTTGAGTGTCGGTCGGTAGCCAAAGTCAGTAGTTCTCCCCCCTCGCATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAA:1 - chr3L 8776301 5' - 1360 3248 1 73.27 TTATAATCCGACGTAATCAGGCCTGTTGACTTCGTGGGAATCTCCGTAAGTAGGGTATAGCCGCAATCACCAAACAGACGAAATATAGTCGTAAGCCTCAA:1 - chr2R 1776000 5' + Burdock 6161 2 73.27 GCTAATTGCCTTTGACGTTGAATGAAAGAGATAGAGGAGCAAACAAAGAAAGAGAGGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTA:1 - chr3L 17767112 5' + BS 16 1 57.43 TTGATAAGTATTTATTTACCGGTCGATTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 3776520 5' - roo 9022 2 75.25 TGAGCTGTGTTCTCAACTCAATCACTATTAAGCGAACACGACTCATTCGTTATTCATTAACCAGATTTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 - chr2R 22619671 5' + jockey 4725 1 65.35 CCCGAGTCCTGAACAAAAAACATTAAAAAAAAAAAGGAAAACAAAAACAACTCCAACCTCCCATTCGCCCACATATCAAACAAACTACACAAACAATTAT:1 + chr2L 17800860 5' + Porto1 297 1 63.00 ACTAAAAATTTAAAAGTACATAGTACGGTTTCAAATAAGCCCAAAATGAGTTAGGAATAACAGATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 - chr3R 6425921 5' - copia 242 1 63.37 TAATACGAAGAACATTATAGTTAACGAACGCTGCAATTGTTTATCGTGGGACTACATAAAAGTTAACATGCGCAGGGCCACAATCGCTAACTCCACGATAA:1 - chrX 18501928 5' + gypsy4 20 2 71.29 AGCAGCAGGAGAGCCGAGCATCCGCATCCCTTTCGCAGCAAGTCCCACATGTCCTGCCATATCCTGCCACATCAAATCCAGCCTACCCTAATGTTTACATT:1 - chr2L 2607239 5' + Quasimodo 6893 2 72.28 TGTTATATTTTGCGTTAAACCATTCAAGAGAAATAATTAGGGATAAAAGTCAAGAGGCATAAGGTAAAGATGTTGTAGAATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 - chr4 1234615 5' + 412 6 2 73.00 CACAACCCCCACCCACAATTTTCCCCCCGCTGCCGCCTAATCGACACGAGTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTA:1 + chrX 5268350 5' - jockey 4698 1 50.50 TAATGACTGGAGCTGATTCGGTAGAAGAAGCTAATAAATTAATAACATTAATTTCCCATGAATTGCAGAAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACT:1 + chr3R 19445624 5' + Tabor 9 2 70.30 AGACATTTTTAATTCACGATATACTGTTCGGCACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr3L 25608332 5' + Doc 44 1 70.00 TAAACACTTCTTTGTGTGTAAGCAATGTGAGCTGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATG:1 + chr2L 654059 5' + diver 5940 2 73.27 AAGTCGAGGAGCAGCGCTGCCGGCATAGCCTGCAGCGCAGCAACGCTTATATGCGTATCTTATATATATGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTT:1 - chr2R 2308849 5' - Quasimodo 7362 2 75.25 GTAGGTGCTCGGGAAATGCCATCAAGCCTCAAAGGACCGGGTATGCTTGCATAATTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTG:1 + chr2L 5659427 5' + jockey 4551 1 55.21 GCCAAATGACATTTAAAGTTACGACAATATAATTAAGTATACTTCTGGGAGTTGACGCCAGGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGG:1 - chr2L 1238616 5' + F-element 4504 1 68.32 AAAGGATCCTGAAATGCTGAACATAACCAACGGATGCAAAAGCTTATGCTTCGAAATTCGTGTAATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2R 15826615 5' - roo 9059 1 66.00 GATTAAATGCAATGAAAAACCAAAACCAAAAAGCAATACAAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTACTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCCACCTCCAAC:1 + chr3L 17989975 5' + F-element 403 1 58.42 GTTAGTATGTGTGTTAGTATGTATTAGGGATAAATGGATATCTACTGCCTCTGATAATTTAAGATTAACAGAGGTAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTAC:1 + chr2L 21360593 5' - G4 3757 1 67.33 CAACGGCAACTGTAGCAATGTGGCCAATTGCAAAGCTTACACCCTCAAAGCGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATGGGAGAGACCCAACAGTTA:1 + chr2R 22850552 5' + Porto1 368 1 73.27 GAAGGTTGACTCTTGTGGTTGTTGCAGGTTGCAGGCAGCAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCGAGCATAGCCGGCAAAGCTCTGCACTTTGGC:1 + chr2R 18870380 5' + gypsy3 66 2 61.39 CCTCCTCACTTTACCACTCATTCAAGTCAGATGTAAGTGGAAGTGTCGTATATCTTAAAAGATGGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 + chr2R 12357473 5' - opus 7494 2 71.29 GCAGAATACAGGCATGGTCACAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAACATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chrX 21668286 5' + 412 53 2 75.25 GTTTCGAAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATT:1 + chr2R 17402695 5' + invader4 2771 2 67.33 CACGAGTTCATCTCTATGCGAGGCCTGCTTCTGATGTTTGTTCGTGTTCGGTGTCCTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chrX 21015777 5' + hobo 39 1 65.96 ATCTCAACTTTATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTG:1 - chr3L 15452929 5' - accord 7345 2 60.40 AAGATATCAAATTGCGCATACGCAGCGTTGTTCGCAAGAAGTTTCTGAAGTTTCTTTTGCTGCAATCGCAATAAAGTGAAACATCAACTACTCTTCCAATC:1 - chrX 9591487 5' + jockey2 49 1 75.25 GAGTTGATCATCATGCCCCAGCCGAGAAAATGCCGAGCACCGTAGTATTTGATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chrX 4784586 5' - hobo 2913 1 53.47 AAATCCAGTTCTTATTAAATTTCCGCACGCCAATTGTTTCAGTCTTAAGCTGATATTCAATCAATAAAAACGCAAAGCGGATTCATTCGGAGTTTTAATT:1 + chr2L 1027350 5' + Tom1 322 1 71.00 CTTCAGTGGTTCAAAAGCAGATAGTATATAATATAAGTATGAAGCCCATAGTGGCAGAGAGAAGCATATGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGAATATTAT:1 - chr3R 4606580 5' + invader3 74 2 64.36 TTGTATTTTTGCCAACGCTTTGCTTCTGTAGCATATCTACCCCACCTATCAAATAAAGAATGGGTATAACTTTGCATAAATACATTGTGACACTTTGTAT:1 - chr3R 28987493 5' + Stalker 63 4 75.00 AAGCTCCGCGTTCTATCTCTCTTTCTCTCTCAGGCAATGAAAGTGATTACGGGGAGATATGCGAAACACAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3R 12058594 5' + roo 7 2 72.28 CCCTTTGGCTCTTCCTCTTCCTGTCGCCCATCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCAGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTA:1 - chr3R 17951714 5' - 1360 72 1 69.31 GAATATTTTAGACGTGTTAAAAAATTGAGCAAACAATTTGAATATAAACAAATCTTATTAAAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chr3R 20369647 5' - pogo 2092 1 67.33 GAAATTATTATTGCATTAAATGCTAATCTCAGGCGCCATACATAGGGAACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACC:1 - chr3L 11241056 5' + G6 1783 1 67.33 TGCCGCCCTCTATTGCCTAAGTTAAATTCTGTCATATCACAACCAAGCAAGACATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATAG:1 + chrX 20632318 5' + I-element 5113 1 56.00 CTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTGG:1 + chr2L 18177045 5' - INE-1 540 1 68.32 GCCGAAGCTAGCTTCCTTTCTTGTTTTTTTATAACCTGTCGTTGGCAAAACTCTCCACAAACCGCACAAAACTGCCAAGCCCACACTTTTTATAAATGTGT:1 + chr2L 21368787 5' + INE-1 257 1 58.42 GTATATGTATAGCCCCCAAAAAGCCACCTCTAGAGCCATGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTAGTCTAGTGTCTT:1 - chr2L 16600359 5' - 1360 3 2 79.21 CTCTCTATCTATCTCCCCAGCTCGCTCGCGCCTTTGAGGAGCTTGTGCTCCAAGCCGTTGGCGTTTCGGTTTGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr2L 9437401 5' + P-element 4 2 76.24 GTGGCTGGATGAGGAGACGTGGGTGAGTTGCCCGCAGCTTGTGGGATGCCTTTGATCGTTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCT:1 - chr3L 22528443 5' - Cr1a 4074 1 62.38 CAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTA:1 + chr3L 17215740 5' + Ivk 52 1 72.28 TATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTT:1 - chr3R 14049402 5' - transib2 2778 1 71.29 ATTGTCTGAGAACGGTGGCGGCATCCATTGCAGCACAGATGGACTTTGCATGTAAGGCATTTGGTCATCGGTGTTGCAGTTTTGCACAGTCTGCAACGTC:1 - chr3L 22705584 5' - looper1 1546 1 74.00 CGAGAGCGAAACAAAAGTACAATGCAAACAAATAGCGAAACAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATT:1 + chrX 20494852 5' + I-element 4977 1 67.00 GTCCAAGGAGTCCGAGAATTCGGTCGTGGCTCATGACCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 - chr2L 16396629 5' - 412 454 2 65.35 GCTGGTCCATCTAGGGAATCTCGCAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGGTACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGTTCG:1 - chrX 13204582 5' - Doc2-element 4423 1 76.24 CTCGTTTTTCTGCTCGACGAACTGTTTAGTTGTCGATGCTCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr3R 19734583 5' + hobo 8 1 52.48 TCCCGAGCGTGTAAGATTTTCTCTCTGTCTGACTCGTCGTATCTTCGAATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTT:1 + chr3L 5012391 5' - accord 151 2 57.00 AGAGGAGAGTGGGTTTTCCTTGCGGATGGTTGCCGGGAATCGGGAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTTGCATTCTGCAGGTGCTAGCTC:1 - chr2L 14905416 5' - Doc3-element 353 1 58.42 TATCTGGCCATGTGTGCGAGTGAGTTCATGAGATGGGGTGTGTGTGTGCAGCCATACGACGACATAAAAAAAAATAAAAAAAAGA:1 + chrX 14367060 5' + Rt1a 5079 7 69.41 CTGCGAAACGACGTGACATAATTAGCAAGAGAAGGGGCTTGGTGGGGGGGTGGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGT:1 + chrX 3111578 5' - accord 7288 2 53.47 CTAATAGCCCGAATAAATTTGTTTACTTTTCGGCAGAACCAAAAACGAGTGCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr3R 29333769 5' - hobo 2915 1 55.45 TAAGAAACGTCCGATACGGTCTCGATTTGAAGGTATATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGG:1 + chr3L 12913608 5' + 1360 41 1 65.35 TGATGTATGGACGTGTTAATTAGGTCCACTCGTGCCGCATTTACACTCCACTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr2L 17283535 5' - hobo 2912 1 52.48 CTTGTTTTTATATGAACTTAATCATAAAATTATTCATTTGATTCATATTTAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCC:1 + chr3L 8014605 5' + transib2 43 1 59.41 GGTGAGCATAGTACGGAAAAAAGCGAAGCGGAATGGGGGAGAAGAGGTTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGGATAATTAT:1 + chr2R 15806714 5' - Doc 164 1 51.49 ATTCTGCTATTCTCCGCATCGTCCATGAAAGAATTTAAAAATCCAGCAAGCGCTCTGTCCTGTCTACAATTGCTCGCTTTTATAAAAAATGTTGCCAGGTT:1 - chr3L 24949413 5' + Cr1a 461 1 80.20 AACTTTTCTCAATTCAAAGCCGTTAAAGTGAAGCCGAAATCTTTTTTAATATCCCATCTATATAATATCAGAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTC:1 + chrX 18680741 5' + I-element 200 1 65.35 AGGCTGAGAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr2R 22856592 5' - 1360 3356 1 63.37 ACATGCAGAATACAGGCATGGTCACAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAACATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chrX 21668290 5' + 412 7102 2 71.29 ATAAATCGCAGTATCCATTATAGCATATCAACAACCAAATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGA:1 + chr2L 15019867 5' - 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gtwin 449 2 57.43 TGGAATCGTCGGTTTTCGAAGTGGTCAGAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 - chr3R 20547811 5' + 1360 50 1 77.23 AAATCGCAAATGGCAGATGGCAGAGAGCGGGCGAAAAAAAGGACTTTTTAGCGCACAAATGCGAAGCGATGATATAATTTTGTTTTTTCTTTTTTTTTGTA:1 - chr2R 19053040 5' - G2 3075 3 51.49 AACGGCAAGAAGAAGAGCCCCAGCACAAGGTGAAGAAGAAGAGCCAGCTCCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTAT:1 - chr3R 21348580 5' + Tirant 8280 2 59.41 CGGTCGAAAGTCACTTTCACTTTCGGTGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAAAAGGAATTTCTGGAATGCGA:1 + chr2L 14403498 5' - invader4 2777 2 71.29 TATACTTTGAACTAAATGCACGTTACAAGCAATAACATATGTGACCAATGGTGGTAATTGATCAAAAATAATATAGATTTGAAGTCTAAGAACTTCTAAG:1 + chr2L 22993573 5' - 1360 232 1 54.00 AATAGCCGGAATGTGTGTGTTCTATGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTAT:1 - chr2R 20358747 5' - Stalker 64 4 76.24 GTTTTTGGTAACCGATGCGAATGGGAGCGGAGTGGCGCTTTAGTGTTACGAGTCCTAATTTGTTTTTGATTTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGAC:1 - chr2R 1597460 5' - F-element 497 1 79.21 ATCATTTGACGTTGTCGAGCAGTCAAGTTGGGAAAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCATAAGCCAGGTAAAGAAGTCACTTTGATAAATTTGTCACTAAT:1 + chr2L 13118418 5' - Ivk 486 1 48.51 GCTGTTCTGTTTTGATGAATGTGGCAAGATATTCCTTTGTTTGGCGTGAATTTCTTTATCATGTACGGCCCGTCAAATCTCGGGGCCAATTTTGCCGCGAA:1 - chr2L 3245862 5' - Osvaldo 1354 1 56.44 CGCATTCACATTCACAGTCGCATTCATTTTGGCCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGT:1 + chr2L 11396457 5' - jockey 4597 1 67.00 AAATTTTGGATTTATTACTATTTTGTAGTACAAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 - chr2R 14796218 5' + hobo 55 1 67.01 TATATTTATTAAAAGGAAACCCAAGAAAATGGGCCTGGGCGTATCCCTCTGAAGAGGGGGATGAATGTGTCCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTC:1 + chr2R 19680347 5' - P-element 190 1 73.27 GGTAAAAATCATTTGATTTAACATTTATAGTAAGCACTTACTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2L 436879 5' - roo 9037 1 57.43 ATTGGGTTCGAATTTTTTTCACATTTTCTTTTTTTT:1 + chr3R 16057505 5' + FB 175 1 88.89 AGTTTTGTGTACCAGTCAATAAAGATTACTTTGTTTGCGAAAATATATTTTTTTTTTGGGGTTTTGAGGTCTCTATTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAG:1 - chr3R 11470730 5' - I-element 4923 1 80.00 TGTTCGAGTTCTTTCTGGGCTTTGGGAGATTGGAAGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAG:1 + chr3R 22340952 5' + X-element 4290 1 65.35 GGGTCACACACAAATGCGAAATTGCGAAAAAAGAGGGGAACTAGAAAAAAAAACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCA:1 - chrX 13959855 5' - pogo 113 1 56.44 ACACCTTTTGAAATGGAACAGTCTATATAACAATATAGTCCTAATTTTATATTAAGAGAGATATTAAGAGATTTGTTTAAAAAATAATTTAAAAATATTTT:1 - chr3L 15036464 5' + transib4 106 1 53.47 CTATCCCTTAACACCTCAGCTGCAGTGTTGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1 + chr3R 24229099 5' + 1360 47 1 73.27 ACTGCTCCCCTAGAACAATGTCAACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAAC:1 + chr2L 1238184 5' + F-element 492 1 75.53 ATGGGCACGACTATTCGCCGCTAAAAAAAAAGTAAATTAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 8860871 5' + F-element 4680 2 83.67 AGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGT:1 - chr2L 23295876 5' + micropia 4974 2 57.43 GATGATTTTATTTTTTTTTTTGGTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCA:1 + chrX 9354903 5' + I-element 147 1 77.23 AACAAAAGCATACAAATAAGAAGATGGGGAGCCAACTCTAATTTATGAACTGATGGCGAAGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGT:1 + chr3R 6964997 5' - 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chr3R 14283338 5' + Doc 477 1 67.33 GCAAGTGCAACTGCAACTGCAACCGAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chr3R 16486547 5' + roo 82 2 75.25 GATAAGTAAGGAGGTAGGTGGCACACAGAAAGTGGAAAAAAAATGGATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAAATAAAAGGGTGGATGAGTGAAGTAAAAGA:1 - chr3R 19763121 5' + invader2 346 1 66.34 TAAACTCCTAAAGATACCCGTTAGCAAAGTAAAGGTATAATGAACATATATCCAAATTTTTATTTATTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:1 - chr3L 4267243 5' - Juan 4195 1 56.44 TAAATAATGTGTGCATATAGACCGCGAGCCCCCTATAATAGAAAAAAAAATCATTTGAACTTCAACCCCGACGGACGTGTTTTTATCAGAGCTCCAGTTAA:1 + chr3L 21205183 5' + Porto1 29 1 64.36 ATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAG:1 + chr2L 3988548 5' + I-element 62 1 75.25 GACATCACTCCTTCCATATTTATCATTACCGTCTGCTGCCGTCCTCTCATCTATTCAATGTTTGTAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 + chr2L 4134305 5' - copia 244 1 65.35 CCACATAGATTACAAAAAGGTATTACAATTAGCATGTTGATAATGGTGGAGATTTAAGTGGATTAAAATATATATTATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTG:1 - 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Tirant 8468 2 65.35 TATTATTAATATTTGTGGACAGTTGAATTACCCATTCATGACTCAAAAAACCCCCTGAAGTCCAATGCTTTGTATAAATGTCAGAATTTTATTGGGGTTCA:1 - chrX 6420998 5' - baggins 5327 1 70.30 CATGCAATATTCGGAATTGAAATGTTAGTTAGTAAACTCCACTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr3R 13122843 5' + Transpac 37 2 58.42 GTGCGCAGATGGGCATGGGGTGAGTATCTGGTGGCATAACTTGCACTTGTTTTGTTGCTACAGCCCTGTTAATGCGGCTGAGTCTGATT:1 + chr2L 10927610 5' - gypsy2 491 1 55.06 CGAAGTAGGATGTAGTTTTACTGATGCGCTTTCCAATCGAATCGAATTTGGTTGGAAGTGAGTTTTGTGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTC:1 + chr3L 12645469 5' + jockey 4612 1 51.49 TCTTACTGGGGGTATAATGATTCAGTCAAAAGTTTCCAACGCGAAGAAGTGAACAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCTGATA:1 + chrX 20381398 5' - INE-1 559 1 77.23 AAAGGACAAGAGCAACTTAATTGATAAGCATTTAAGGCAACGACTACGTATAATTAATTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCC:1 + chr3L 19927502 5' + jockey 491 1 57.43 AGCCCAAAATGAGTTAGGAATAACAGATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 - chr3R 6425884 5' - 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chr3R 24357657 5' + accord2 7489 2 59.41 ATCACTTCAGCTCTTTACTAAGCAAGCGAAAACTCTTATCCATTTCCATTTTGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chr2R 5154811 5' + F-element 36 1 55.45 CGTATTGTCAACCTTGGGAGAGCGGAGTTAGAAATTGTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr3R 21969117 5' + hobo 39 1 64.36 TGTCCCTGTTAATTTGGAGGTTTCATTTATGTGTATTTCGTATTTTGTTGCCCTGCCCGCCGCTGACACACATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGT:1 - chr3R 9940202 5' - I-element 5344 1 71.00 TTTGTTTGTTTTTTAATAATATTCATAATAATAACAGTGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCG:1 + chr3R 20961330 5' - flea 4828 1 62.00 CTTCTCTTTTCAGAGTGGCAAAGTATTGCCAGCGTCTTTTTCTCAAGAGTCTGTATGCTGAATCGCAACCCTCTACGTTTTATAGTTCCTGAGATCTCCAA:1 - chr3L 12964621 5' - INE-1 145 1 65.35 CTGTGTCTTCCGCTTTTCCCAACCTCACACTCAATTGTCATTTCGACGCAGGACTGCATTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTT:1 + chrX 10119559 5' - FB 23 1 55.29 CATGTCAGGAGTACATAATGTCCAGTACATAGCGGACAGACTTGTCGGATAGTGACCATGTCCACACTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATT:1 - chr2R 11625706 5' - rooA 344 2 64.36 CAGGGGTCACAGGTCAGGGGTTGTCCAGAGATTAGAGGGTGGGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGG:1 - chr2L 17221639 5' + hobo 249 1 58.42 AAATATTTAAAACATTTATTCCTTGAATCACAGAGGAGAAGCGACAATATACAGAGGTGGTCAGAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAA:1 + chrX 21581100 5' - Bari1 1678 1 52.48 GTAAAAAATTGAAGAGCTTCGTGGTACAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTA:1 - chr3L 8012090 5' - transib2 2775 1 74.26 CTCAACCTTCTAGCTTCTATAGTTCCTGAAATAACAACGCTTATATGGACGTAAAGACAGACGGACATGATCAGATTGACTCGTCTATTGATCCTGATCAA:1 + chr2R 1751257 5' - INE-1 90 1 68.32 TATTTTCTTCATCCACCAAAATTGGGAATATGTATGGTGTCTTAGAAGGCGACATAAATTATTGCTTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 - chr2R 10777898 5' + pogo 8 1 71.29 GAGAATACTTTGGCACGCGATGCGTTTTTTTTTCGAATTTGGAATGCCAAGTTGATTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTG:1 + chr2L 10197558 5' - Stalker4 386 1 61.39 AACAACCGAAAAGGGGAAACAAATGGGTAACATTGGTTGTGCTTACAGCTTACTCATTGCCACTAAGTTCCCATACTGCCAACTTGGTACTGCGTTAAATC:1 - chr2L 13080249 5' - Burdock 6007 1 76.24 CCCTTCGATTTTCTGATTTTCTTTTGGCGCCAAAGATTGTTGCATATCAAATGGCGCCTAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3R 20869747 5' - hobo 2922 1 62.38 GAAGTTGGAAGTTTACCGCGGTAAAAGTTCTTTGGAAAAGACAGGATGTGTGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chrX 10436516 5' + hobo 23 1 54.46 GCCGCATAGAGTCATTAGCGGGCGAGCAATTAGCAGAAGTTGGCAGCGAAATGCAATTGCAGGTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 - chr3R 29711059 5' - mdg1 7443 2 60.40 GCCAGGTCGTTAAGTTATGTTTTTAAATTAGGAATTAGGTATGCACCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCC:1 - chr3R 30275704 5' - flea 4645 1 54.46 ATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr3R 15054272 5' + hobo 4 1 75.25 CAACAACAACGGAACAACCCGAACTGGACACCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAAC:1 + chrX 10034073 5' + I-element 5021 1 70.00 ACCTTAAAGGTGGGAACAGCGGGCGACAGTAGGCGTGGCGGATTAGTGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr2L 17056479 5' - 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chrX 21668090 5' + Tabor 17 2 62.38 GCTTAATAAAAGCGTGCTTCGCAAGAAAGAAAGCAAGAAAAAGGGTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3R 27500498 5' + Rt1a 5080 10 79.10 ATATTAATAAATTTATGCAAGTGATATTTTTATTGAACCAAATTGTCTCTAAAGTGATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 12729435 5' - roo 390 2 60.40 ATCATTTAGGATGTGAGCAGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATAATTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chrX 22690788 5' + roo 57 2 79.21 CGTGGGTAGTTAGTGTAAGCCACTGGAAAGCAACAACGATCAGCAAAATCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACC:1 + chr3L 486343 5' - hobo 179 1 59.41 GTATATCGAACTATGTAATTCACAAATAGTAAATAAACCGAGGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACA:1 + chrX 12334594 5' + G2 139 1 58.42 TAACAAGCAGACCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTTTAATCGAGTTT:1 + chr2L 22699412 5' - INE-1 574 1 75.25 TGGAGCCGTATTCTGGAGGGCTAGAGCCTGCGTAAGTAACTATATATCGATTGTAGTCTTAATAAAATAATACCCCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chr3R 16487425 5' - roo 408 1 77.23 GGTGATCACAGCTGAAAGGCTGCTCAAGCGACCAGACAAATGCGCAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAAT:1 - chr3R 28937330 5' + hobo 139 1 56.44 GCAAACAAATGGAAAACGTCGACGGCACACGCAGGTGCCGCACGCAAGTCCCAGTGGGTGGTGGGTGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2R 16478426 5' - hobo 2927 1 67.33 GCGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGCCTTTATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 + chrX 10824043 5' + jockey 4687 1 57.53 TAATTTACATTGTATTTCAACTTGAGTGTGCAGTTGAGGCTGTCTTTTATGTATGGCTTGACCACTTGAGCTGCTAAGTGCATGCTCAGCATTCT:1 + chr3L 5426258 5' - Stalker2 185 2 53.68 GTTGTTCTTTTAAATTTGCTGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:3 + chr3R 31188761 5' + I-element 56 1 82.18 CGTTGATGGAGCAGAGGGAATTGATGTGTTTCAGATTTTAATTTACAAGCTCAAATATAATCTACAATAAATATATGTAATTCGTAGGCCATAGCCACGAC:1 + chr2R 657934 5' + gypsy7 5438 2 58.42 CTGTTGCCATTTTGCTTTTGTTTTTCCCAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chr3L 4713820 5' - transib2 2779 1 69.31 ATTCTAAATACCGCAATTGCATTGAGTGCTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2R 15451578 5' - 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transib2 2762 1 80.20 AACTGCCACTCCATCCCGATGACTCCTTAGACCAGTCATATGAGCTCGAGCAAAACCAGGGGAAAATCCTTGGCCCACGTGGGAACCCCTTTTTAAAGCTG:1 + chr3L 4789547 5' + Rt1b 323 1 77.23 CCACAAGTGTTTCTAACCGAAAATTGTGTGTACATACAAACTCGTTGCAGTCACTACTTTAACATTAACATTAACATTAACTATGTCCAACTCCCAAACTC:1 + chrX 2672017 5' + TAHRE 10293 1 57.43 TGCAGTTCCTCAAACAGATTGTGATTGATGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTA:1 + chr2L 18121014 5' + flea 365 1 72.28 GGACTTTTGTCCAGGAGAATGTACGAAGGAGGAAGACAATTTAGTCACACTGGGACCCTAGTTAAAACTATTTAACAAAGTATACATTTATTAGTATAAAT:1 + chr3L 27358349 5' - Tc3 1501 1 67.33 ATGTAGATCCCAGGGGGACAAGTAACCCAATTCCTGGTCTTAAAGGGTGCGAAACAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2R 10345595 5' + roo 21 2 58.42 AATCAATAAACTGTGTAAAATGGACCCATCAATTTTCATAAGGCGTTCATATTAATCTACATCAATTCAGGGGAATATTTGATTTTATTTTATTTGATTTA:1 - chrX 12431283 5' + transib1 1898 1 72.28 ATGGGAAATGCTAAACGGAGGGATGGGGCTGGTGAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTT:1 - chr2L 3667286 5' - Ivk 163 1 66.34 TACGTGCCGCAGACTGAACGAAACCAAACGACGGCACCCCGCTGTCTCCTCTATAAAGTATTGACAGAAAATTGTAACATCGCCTGCGTACATAAGTACAC:1 + chr3R 22196602 5' - Q-element 566 2 61.39 TAGATACTTCTACACTTAGCAGTTAGCCACGCCTAAACTACACACATACATACATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chrX 8522940 5' + 297 15 2 65.35 CGGGAAATATGTCGGAAATCTACTCGAGACATTCGCCGAAAAAAGAAACCTCCCCACAAGCACCCCCAAAGCGTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAAT:1 - chrX 12827540 5' + jockey 4796 1 56.44 GCCTCTAGGGCTTAAAATTTTCCAAAATGGCTTCAACAATGTCACTGTGTAGTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 - chr3R 20396601 5' - I-element 5333 1 56.44 CAGTATGTCTTATCGCACGCGCACACTTTCGGCGGCCCAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 + chr2L 7991708 5' + P-element 32 1 43.62 TAAGAAATTCGGAAAAAATCAGAAGAAATTTGAAGCCCATTTCATGGATTTTTTCCATCGTTTTCACTAACTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 + chr3R 4945606 5' - 412 488 2 75.25 AACAGCATCGAATGCTTGAAACGTGAGTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTA:1 - chr2L 14606809 5' - Tirant 160 2 73.27 TAATTTCAGCAGGTACTATAGAACTTATACATATACATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAG:1 - chrX 16568818 5' + accord 494 2 72.28 TCCTTTGATAATACAATAGCTGCACGCGCCCAATTTACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr2R 14204739 5' + opus 37 4 63.37 ATAAAACCCCCCGCCCGACAGAACATTCCCATATGGTAATGGTGGGGGCCAAGGAGGCGGGATTGCATGGGGAATATACTAGACGAGATGCAACTCTTTAT:1 + chr3R 27421255 5' + Gypsy12A_LTR 127 1 70.30 ACTGAGGAATTTTAATCAAGCAAGCATATGAATATCACATAGCTTATACAGCCAAATTCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAAC:1 + chrX 22776390 5' + I-element 381 1 66.34 ACCCAATGGCGCACCTTAAGCGAATTTCGGTGTGGGGCTGTGTGTTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTGTTGTTGTTTTTGT:1 + chr3L 6452917 5' - I-element 137 1 57.43 AAATTATTTCTTTGTATTTTTCAGATTTTATGAGCCTTTTAACCTGTTTTTCGATTTAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAA:1 + chr3R 6425820 5' + copia 4887 2 59.41 GTGAAGCTTTCATCCGTTTTCCGTTTGCTATTCACTCGGCCCCCAAAAAAGAACAAAAAAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr3L 13164662 5' + pogo 15 1 61.39 GGCAAAAGTCAAAGAATTGTTAGTGCACACCCTGGGAAATCTATTTAAGACTTCATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGT:1 + chr3L 5267208 5' + Juan 3994 1 54.46 AGCGCCTACTTTGGGAACTCGCTTACCTGTCTCGCAATTAAGGAACTCGGTGCGCCGGTGATGGTACTTAGGGTTTTCGATTGGGCTCGTTGGATGATTTC:1 - 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Tabor 309 2 73.27 ATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 - chr3L 19274888 5' - transib2 2806 1 58.42 TTGCGGTTAACAGTTAAAAGTTAAAAGTCTTTATTAAAATAAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 - chrX 6150602 5' + I-element 32 1 56.44 ACAAAAGCCAAAAGAACCATGAGAATGCAAAAAAAAAACAAGAAACAAGAAAGAAAAGAAACCGGCCATCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATT:1 - chr3L 9690403 5' - I-element 261 1 48.51 TTTAATGTGTGTCACACATTCCACGGCTGGTGATTGATGGGCGCCGCAAAAAACCAAAAAGAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 - chr3L 10565372 5' - pogo 2092 1 68.32 ATGCAAAAACTTGAAGTATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 + chr2L 3988531 5' + I-element 45 1 58.42 CTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 - chrX 6146705 5' - hobo 2891 1 76.29 GGTTAAAAAGGGCAGATTTTGCAACCTTTATCAGCAGCTCCCGGAAAGTTTTGGGATAATTTCTTTATCGTAAATAGAGTGACTTTCAGCTGATCGTGATT:1 + chr3R 3345170 5' + Gypsy12A_LTR 197 1 81.19 TTATAAAACAGTGGATTAAAGACCGAAACGTTAATTTATATTAAGAGAACGAGTCGGAAAAACTTGTAATGTTGAAATGGATGATATAATAATCTTTTCAA:1 + chr3L 24088530 5' + TLD2_LTR 49 1 69.31 CAGAAAAGCGAGAGAAAAGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGC:1 + chr2L 1652261 5' - 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invader3 244 2 55.45 ACTTGAGGACGACTTTGTGGGCTGTCAGGCATTGCATAACCAGATTCGCAGGAATTTATATAATTGGCGCCCAACCAACAATCTGAACCCACCAATCTAAT:1 - chr2R 5993622 5' + gypsy 497 1 55.45 GGCAGGTCCTTTGAGGAACTTTGAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chr2L 7767144 5' + hobo 54 1 75.25 ATTAAATTCAACCCCATCCTTATACCAAATTCGAACTTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 + chr3L 9174659 5' + 412 9 2 70.30 CTATTGGATGATGTATGTAAAATTGTTCGTTGGGTTTGCCCCTCTCACTCTAACGCATCCACCCTTAACTGCGACGCTCACACTTTTGAAAAATGTCTAG:1 - chr2R 6721093 5' + INE-1 259 1 66.00 GGCGTATGTTTCGCGAAAGGAGAATTTTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGAAA:1 + chr3L 21924343 5' - Doc3-element 4470 1 73.27 GGATTTAAGACTCTTATTTCGTATATACATACATATACCTATATTACAAATTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGATAAA:1 - chrX 13850561 5' - Gypsy6A_LTR 180 1 54.46 GAGTGACTGCAGAGCGCCAGCACTTAGTTTTCGGTCTTTCGTCTCAAATCTGGGTTTGGCAGTCGAACTAGGGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3R 24229182 5' + 1360 1 2 78.22 AAACGTCCGGTACGGTCTCGATTTGAAGGTATATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGT:1 + chr3L 12913612 5' + 1360 45 1 69.31 GGAAGTCGTTATTGCTTTTGCTGTATCCATGGCTATTGTTTGCAGTTGATGATTTGGTTGGGTGATATTTTTTGCCTTTGTAGCGTGCGTTTGTTTATTTA:1 + chr3L 6689518 5' - G6 2016 1 39.60 GCGTTGCGGAAATTGATGCTGCCTCTGCCTCTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAATTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTT:1 + chr2R 14033464 5' + accord 7239 2 68.00 ACAAATTTATTTCTATTTTATTTCTTGCCGATTCTTCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAA:1 + chr3R 3298220 5' - Quasimodo 210 2 65.35 CAAGTGGGCGGATTTTGCAAATTGGTTTGGTATACACAAAAAATGCTGGCTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCT:1 + chr3L 9124475 5' + Tirant 8488 2 54.46 AATTTTTTCCCCCAGAAAACTGATGAAATTTTGCGATCGCCTTTCCACTAGCTAAGTAACGTGTATCTCATGGTAGGGGAAGTCGACTATAGCATTCTCTC:1 + chr3L 22848567 5' + INE-1 575 1 74.26 AGTACTTGCAGCAAGTATCTGACGCATAATTGCCGCTTTAATCTCAGGCAAGTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 + chrX 17526481 5' - jockey 4943 1 55.00 TATACACATCTCTGCGAAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:2 + chrX 19819979 5' + hobo 35 1 63.37 GGTAAACAAGAAGTAAAAGAAGTTCAACGGACGAATGCAAAATGTTCGACTTTTGGACAACAAACTTAAACTTTTGTTTAAAAAACAAAAAAAAACCTTTT:1 - chr3R 7514032 5' + HMS-Beagle2 492 1 77.23 TACTAATGCAAACATCTAAAGTCTAAATCACAAAGTAAGCATTAAATATTTACATAAAGCCTACCCATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 - 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pogo 47 1 71.00 ACACACGCACACCACACATATATTTCGTCTCTTGTTTTTACTCACTCAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGA:1 + chr2L 3599331 5' + 1360 3296 1 85.15 CCGGGCCAGCTTGTCCATTTTTGAATCACTCATGGTGGTGCTGTGTGTTGTGTGTGTTACAATGTTAAAATTCTTAGAAATAAAGTATCTGACACAGCAGA:1 + chr3L 9177201 5' - ZAM 227 2 59.41 TTCTTAAGTTCTCCATTTTTGTTTGGGCCAAGTAAGATAATCGAGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chrX 15259026 5' - roo 9040 1 63.37 TATTATGTATTATTAAAAATGTCCAGCAACGAAAGGCAGTTTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr3L 10554767 5' - roo 9040 1 55.45 GCCTGTTGACATATGGTGGGGAAGTTGTGAGGAAATCTTTAGCGCAAACATTCAGATAAGGCTAAACAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACGCAA:1 + chr3L 5084987 5' - 412 485 2 51.49 CGTATGTGTTCTAAGTAGGTAATTAATCACTCTAAAACATTGACTAACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCC:1 + chrX 280933 5' + Porto1 360 1 54.46 CGCTTATAACTGTGCCGATTATGAAGTTAATTTATCAGCAACGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTG:1 - chr2R 19929336 5' - Ivk 5267 1 58.42 CATCAGCTAGGACCAACCAGAACATACAGGACAAAGCCCAATGACAGTTGGTATACATGCTGCACTGGCCATCCAAGTGTGGGGAACAGCGTCTAAGACTT:1 + chr3R 20921001 5' + G5A 2449 1 73.27 CGCATTTCACTTGGCTGTTTGAAAGTTGGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 + chr3L 13674652 5' - hobo 2891 1 72.28 ATTTTGAACGGAAATTTATGGAACAAAAACTGCAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGA:1 + chr2R 22034440 5' + F-element 4541 1 67.33 AATAAAGTATATTCTTTTTTAAATCCAATTTGCATTCTAATCAAAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCC:1 + chr3R 19498502 5' - 1360 121 1 58.42 GTTTTGGCCAGAGTTTTTAGGCGCTTATGTCAGGGCATTTGCGGTCAATTGGGCTGTGTTGATGGTCAAGTCCTGGGTTGTTTGCATCCCTCAACTTCTCC:1 - chr3R 15298327 5' - I-element 343 1 69.31 AATTTAACGCACTTTTCCTTAATGGCTTACTGTGTATGGCCCTGCTTGTTGTTGCTCTCTCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTG:1 - chr2R 4151328 5' + invader4 3019 2 63.37 TATTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 + chr2R 17345946 5' - hobo 2904 1 60.40 ATCAGAAGCGCCCAACCAGAACGGCAGAAGTCCCATATGAAAGGAGCGCCAACGGCACGAGGATACGATAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTCTGT:1 + chr3L 22025165 5' - Porto1 4546 1 63.37 TATTTCACTCGCAGTTCTTTTTTTCGGATACCTTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATAGTTTTTATTTTGAGTCGAATTAAGATCAACGCCGAA:1 - chr2R 23761312 5' - Tom1 347 1 72.28 GTCAACGCGGATTAGCGTAAACGTAAAAAGTATCTGCGTGCGTGTGTGTTGGTTAGCGTTTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTC:1 + chrX 4753952 5' - I-element 4926 1 65.35 TGTACATGCAATATTCGGAATTGAAATGTTAGTTAGTAAACTCCACTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATAC:1 + chr3R 13122839 5' + Transpac 4951 2 54.00 CAGATTATCGACTATCAAGCCTTTGAGAGCATAACGCATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chrX 13058433 5' - 297 6941 2 64.00 ACAGCCAAGTTAATGAATCTCCAACAGCCGAAAAGAGACTAATGAATAAAGAGAGGGTACAGACTGTACCAAGCTGTGGATATAATCCATTAAAATATCCT:1 + chr3L 14323214 5' - Tc1-2 1281 1 56.44 ATTGGGCGGCATATCATATATCCGTATACAGACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chrX 5151935 5' + 297 34 2 77.00 CCCGATTCCCGATGCCCGATGCCCGACTGCTGAAGCTAAAGCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTC:1 + chrX 8618408 5' - Doc 4291 1 59.41 ACAGTTAGCACCACAACCACCACTATTCCCCAAACCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCG:1 + chrX 10034468 5' + I-element 4994 1 65.35 ATTTAATAACCAAAGCAGGTGTAATGGACCTGAGAGTCCCGACTTGATTCGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCATAGTAGATTCACTACAAACTATATACCCC:1 - 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chr2R 10916771 5' + R2-element 362 1 74.26 TAAAGGAATCAGCAAGTTCCGTGAGCCATTATCTATCGGAAAGTGTATTGTTTTACAGTTTCAGTCGTGAATACAATTTGGATCAATAACCGAATCGATCT:1 + chrX 21397823 5' + INE-1 97 1 69.31 AAAACATCCGTGCCTCGCACGCATATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chr2R 10191720 5' + 297 6627 2 79.21 CCTGTGGTCGGAGAGAGGGGGCATGTTAACTTGCAAAAGTATTGGCTGGCGACTAACTCAGCTCTTTAGAATTTGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTA:1 + chr2R 5061555 5' + accord2 7388 1 41.58 GGTCGAGGGACACCAAGTGCACTTAACGATAGATAAGAAATGAACGAGCATTTTTGACCCTCTGGTGGAAGTCGCGGATGCAGCTGCGGATGTTTATGTCT:1 + chr2L 16714224 5' - Quasimodo 7031 2 52.48 ACGGAAACAACACAAAATACCCACCGCAGTGATTCGACGGTATTGTTTTTATTTTGCGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATA:1 + chr2L 3797335 5' + Cr1a 61 1 64.00 GCAACCTTTTAGCCAGGTCTCTTCCGCTCCTCGAATTTTCTTGGCCTCCCCCAGTGCCTTAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCTTCCTT:1 - chr2L 17020863 5' + copia 108 2 67.33 GGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGT:1 + chr2R 19209467 5' + Doc 65 1 49.50 TTATGAGCCTTTTAACCTGTTTTTCGATTTAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:1 + chr3R 6425847 5' + copia 45 2 70.30 AAGAAGGACTTAGAGTGGAAGAGTGGGGCAGCCAGCAGATTGACAGTGCTACAATATGCAAATACATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGG:1 + chr2L 4109875 5' - I-element 5065 1 79.55 CAACTATGCGGATTATGCTCATCACCGAAGCGCCCAACCACCCAAACACCCACGACAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCC:1 - chrX 2293975 5' + I-element 5001 1 58.42 ATGTAAGTCCATTGACTGGCTTTCAGTTCACTGAACAAATCAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGT:1 - chr2R 13652414 5' + I-element 318 1 60.40 AAAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 - chrX 21668091 5' + Tabor 6855 2 61.39 GTATACCGATATAAATTGGCAAGACAGACAATAAAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGAAATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCG:1 - chr2R 79004 5' + 1360 44 1 63.16 TTCCTCGTCAGCAGGATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACG:1 + chr3R 4973088 5' - 1360 25 1 52.48 GTAAGTATTCATGCACTGAGAAAATAAGTGTGTTTAAAGCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 - chr3R 15631179 5' + opus 7149 4 63.37 GTGCCATTGTCGTCCACATCAATCACACGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3L 21852545 5' - 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chr3R 9940207 5' - I-element 5348 1 75.25 AATTTGTTGTTTCTTATCTTTATTTGATTTACACGTGTAAATCAAATAAAGATAAGAAACAACTAATTGTATATTTGTTGAAATTACGTTATAATTTAAAT:1 + chrX 21555925 5' + Copia1_DM 5 1 71.29 AGAAACTCCATCATCTCATAGTCCGCCTCGAAATCGGTGAAGTGGTTAAACAGCTGATTGAGAGAATGCAATTCCAAGGTATGTTGTTTTTAACGTATGTA:1 - chr2L 6326536 5' + transib2 291 1 63.37 ACTTTTCCTCGTCAGCAGGATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGT:1 + chr3R 4973084 5' - 1360 29 1 56.44 AAATCCACGAAAAATAACAAAAACTGCATGGGCACCATTTTTTGGGATATCGATAGATTTTGGGAAATGTAATGAGAAAAATTTTTTAAAAGTGTGGGCG:1 - chr3R 22956742 5' - INE-1 255 1 67.00 GGGGCTTGAAAAGCGAAAGATTTACGCGGCTACTGGAGCGAACGATGTAAACTTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3L 21782124 5' - roo 9049 2 54.46 ACAGGACACAGGTTACAGGATACAAGCACATATCACTCACACAAACAACGCCATAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAAC:1 - chrX 6137349 5' + Ivk 335 1 59.41 GAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAA:1 - 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chr2L 11805086 5' + P-element 26 1 53.47 ATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTT:1 + chr3L 21912272 5' + Bari1 43 1 75.25 AAGCGAAAGCCAGGGAGGGGGTTAACAGAGTACAGTGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTG:1 - chrX 17714030 5' - Doc 416 1 69.31 ATACATATTAAACAATTTAACAATTGAGCTCATTGAACGATTTCCATATTGATATTGCCGGTATTTCCCCATTGTTGATAGTCATAGGTCCAAATTGGTTT:1 - chr2R 5447932 5' - F-element 4256 1 78.22 CCAAGCCAAAACTGTTGCATACTCCCAGGAGCACAAACACAGCGAAAAGAGCACTAGAATGGCAAACTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr3R 14832470 5' + hobo 9 1 72.28 CGGACATATGGCAGAATATTTCCCAAGCCCAAGCAAGCCGACTTGGCTTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr3L 18142017 5' + blood 7040 2 54.46 TATACTTATATGGATGTGGATGTGTTTCATTTTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGAATTTGCATTTATCAGAATAAAGATCGGCAGCTCGTCAACTCCG:1 + chr3L 9146151 5' + Gypsy6A_LTR 194 1 75.00 AGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTA:2 - 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chr3L 10381316 5' + Idefix 15 2 54.46 CGATGGTGGTGCAACCGCTCTGCAGAGACACATTTCGGCAATTGAATTTCCTTGTCGTCTACAGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGG:1 + chr3R 27078441 5' - jockey 4965 1 64.36 CTCGATTTGCATGTCGAAGTGCGATGGGGAAAAAAAAGGGCTGGAGGCCAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 - chr3L 5387867 5' - mdg1 396 2 50.00 CCCGAACCGCCCCTGTGCGCATGTCGAGCGACCTACACACAAAAAGCACTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr2R 10158736 5' + P-element 26 1 53.47 GCATTAAATATTTACATAAAGCCTACCCATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 - chr3L 13608367 5' - mdg1 7412 2 70.30 AATGAGACATTTTTACTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr2R 5651925 5' + Tirant 8 2 73.27 AGGACCGGGTATGCTTGCATAATTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAG:1 + chr2L 5659459 5' + jockey 4588 1 77.23 GGGGGGTGGTTGGCCAAAAACTGGGCATCCAAACGGAAACCCAGAACGCCGAAAAACAGAACGCAGGAAACATAACCACCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 + chrX 2564892 5' + jockey 4763 1 75.25 CCGGAATGTAGGCAAAAACTGTGAAGAGCACTCATCGTTACAATAGCGTCGCTGAGTAACATTGTGGTCTGGCAGATCTTCCACCATATACCGATCGTTGT:1 + chr3L 12173879 5' - Bica 4766 1 65.35 TCGACATTTTGCTGCGGCTTCTTTGCGGTTGCCAGCAATTAATTCATATTAGGGCAAAAATGTTTCTTTGGATTTAGGTAGAATACGTTGGAGGGCTTGAC:1 + chr2R 11103941 5' - gypsy 7350 2 74.26 CTAAAGTTCTGCTGCCACGCCCCCGCGTCGCCTGAATGGCCCTCGAAATCACCACTCACTACTAAAATCCCCACAACCACTGCCGTCACATGTTCATCACC:1 - chrX 9725121 5' + accord2 7363 1 52.48 GATTTTTCTACTATTATATCAAGTATATTTTTCGTATTGTCAACCTTGGGAGAGCGGAGTTAGAAATTGTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:2 - chr3R 21969149 5' + hobo 7 1 71.29 CTGTTCTTCGCGAAGGCCGCCCAAGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGG:1 + chr2R 1658488 5' - accord 6985 2 75.25 TTCAGTAAAGTATAAAGTGAAATAGAAGTAGAAAACGAGAAACAACAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCAT:1 + chrX 12734387 5' + Doc 4569 1 55.45 TATCTGAGCTAGCCGATAATAAATCAGATGTGTTTGGATTGATTACAAGTTTCTCGGGGCCACCCGGTTGTTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTG:1 - chr2R 3340037 5' - Porto1 4417 1 74.26 CATCCGATCGCAAGAAAGCAACGGGATAATTCTCATACCACAAAAGCACACTCGTTCAAAGCCATACATACATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 - chr3R 5392384 5' - 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hobo 2916 1 56.44 AATAATTCAGCAAACATCAAGGAGAGCGCAGAGCGGGAGAAAGGACACTAAAAAAAGGGCGCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 + chr2L 11804998 5' + P-element 15 1 60.40 AAACATGGAAATGGAGGCACATTAAAAAATAAATAAAAAATACTCTACAATACTTACCCGGGGTCAAGAGGGGCTACTGCAAAATTTTGTCTCGACACGGT:1 - chr3L 25846047 5' + mariner2 100 1 49.50 AGTTTTTCTAATGCTAAATTCAAATTGAAGATTATATTGACTCTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGT:1 + chr2L 18773307 5' + Max-element 36 2 64.36 ATTAACTCTCCTATTCCTTGGAAATCCGATATCCAGTCGTTATCATCGCTTCGTAAAAAATGTTCATTATTAATATGTTTTACATTTGGTGCATCTAAAAG:1 - chr3R 26712537 5' - transib3 2488 1 74.26 CTTATATCGTACATCTGACATTGAGTTTGGTAGAAAGCGAAGCAGCTTCGTCAGCCATTTTTGGCACGCACGTAAGCAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTC:1 - chr3R 6256745 5' - Bica 10 1 76.24 TTATTTGCTGTATTTCTGGTGGGCTTTAACTCAAGCAATTTGTTAATGAGCAAATTACATGGTCACTGCATATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTT:1 - chr2L 18506842 5' - flea 251 2 74.26 TCTCTAAATAGGCTTCTATATATATTTAATTGAACGGATTTTTGTTTTGGCACCTACCAAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr3R 11073705 5' - pogo 2087 1 65.35 AATTAATTTTTATTTATGTCTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGAAGCC:1 - chrX 7381182 5' - 1360 79 1 81.19 TCTCATAGCCATTAACACGCAAAAGCCGAGCTACACTTCAGCAAAGAGAAGAGTTACCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAATGGGG:1 - chr2R 18337590 5' - hopper 139 1 79.07 AAAGGAACGAACAGCAGTGGCTAAAGAAAAAGGCAAAAGGGTAGTTAAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAAAAAAATTGATTTTGCGTTT:1 - chrX 5082555 5' + invader2 385 1 66.34 ATCAATGAGACATTTTTACTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 - chr2R 5651928 5' + Tirant 5 2 76.24 AGCTTATCAACTTTAAAAAAAAAATTAAATAAAA:1 - chr3L 15203270 5' + X-element 4714 1 61.76 ACACTGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTGCGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGA:1 + chr2R 19209469 5' + Doc 67 1 49.50 TGTGACTCTTCATTACGGACCGACAATTTTTCAATTCAATTTTTACATTAAGCTAGTGTTCGCTGACGTGTGAAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCGTATAA:1 - chr2L 5390341 5' + Doc2-element 30 2 78.22 ACAGGTGGCTGAGGAGATTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCAAAGTTATACCCAGTCATTTATTGTATT:1 - chrX 15707047 5' - Stalker 30 4 81.19 CTGCACGGGGCAAGAAAATGAAGGAGTGCAACACCTTATAAAAATTAAAATACCCCAGCACCAAAGACACTAAAATAACCAGATGCGTAACGGCCATTCAT:1 + chr3R 10976475 5' - 1360 3370 1 72.28 AGCCAAGTTTTGGGGCAGGATTTGGGTGAATCCCCGGATCTGGTGCCGGTAGAGATGCAGCACTACAACAACAACTACAAAAAAGAGCGCGCTCCTGCTCT:1 + chr2L 9291351 5' + F-element 362 1 77.23 GATTTGTCTTCTTTGCCCTCCAGTTCAATTCACTGATGAATAACTGATAAATTACCGCTCAAGAGCGATGACGAGCGCTTAGTATGTCGTTACGCATCTTG:1 + chr3L 24939754 5' - 1360 18 1 76.24 TTTGGCACGTGGCTTGCTCTTTGTCTCAACTTTTTCGAGAGTCGAGCGAGTCCGTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr2L 4057122 5' - hobo 2916 1 56.44 TGTAGCTCTATCCCTTAACACCTCAGCTGCAGTGTTGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTG:1 + chr3R 24229092 5' + 1360 40 1 66.34 ATTGGCGAGTCAAGAGTTCAAACTTCAAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGGGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 + chr2L 18979408 5' + Doc 28 1 56.96 CTTCCTTTCCCCGGGAAATCTCATTGTTTAATACCCGGCCAAATAGAATTCTAGTGATGTGAAGAAAAATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAA:1 - chrX 12576981 5' - Idefix 208 2 73.27 AAAACTTGAAGTATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 + chr2L 3988536 5' + I-element 50 1 63.37 TTTTAGATCCAGATAAGATTGGATACACCAAGGGAACTTTTGCTACACAGTGCGGGAAAATGTATGTATGTATTATCTTTATCTTCAATTATATGGGGTCG:1 + chr2R 6711517 5' + Circe 7090 1 61.39 GGGGTTCGATTTTCATTTAAAAAAAAGAGTGAAAAACCTAATATGGCATTATATAAATTTCTTCTATAAAGGGTATCTGATAGCCGGGAAACTTGACTATA:1 + chr2L 6799062 5' + INE-1 565 1 71.29 CACCTAAATTCACAAACACTCCTTTCCAACTCTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTGCCCACGTCCAGCTTTAGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCAAAA:1 + chr2R 1773398 5' + FB 128 1 62.38 AACGCCACATTCCTCGATTTGCATGTCGAAGTGCGATGGGGAAAAAAAAGGGCTGGAGGCCAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 - chr3L 5387879 5' - mdg1 7445 2 54.46 TTTTCTCAAATTCTTCGCATTTCGCATAGTGAAAAAAACCTAGTGAGCTATCTTCCGATTCCCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 3776450 5' + roo 8677 2 66.34 AGATTTGGTGGGAAATGAAATTGTACAATTGATCTTTGACAGTTATTTCAGTTTGAATCATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:2 + chrX 8522832 5' - 297 383 2 64.36 GAAGTGTGTGTATGTGTGTGTAAGTTAACACCATTTAACGCTAATGTAATGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chrX 12276838 5' - hobo 2937 1 70.89 GAAATTGTATTGCCTACTTTTTGGGGCCGGTCAAGATAAAACCCGGGCTGTCAGCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2R 21415206 5' + jockey 30 1 54.46 GACGGGTGCCGAGGAAATCGTGGCCATGGATCTGACCGCAATTAGTTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr2L 5653593 5' - hobo 2914 1 53.19 AGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAAC:1 + chr2L 15019909 5' - BS 5041 1 75.25 CGGCCGTGGCATTTGCCATCACATCGACTAACAATCACATAAGCGGCCCAGCAGCAACCATAACAACAACAGCGGCAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACG:1 - chr2R 8475620 5' + Transpac 5172 2 78.22 GTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCC:1 + chr2R 5582182 5' + Cr1a 456 1 52.48 TATAAAAAATAATTAATCTTTTGAATAATCTTTTAACTTACAGCCTTGTGGTCTGGCACAGTAAGTAATAAGAATATGTTTTACGACGCTTATTCGGAGTT:1 - chr3R 18245514 5' - Gypsy6A_LTR 209 1 62.38 ATTTTCAATTTACGGCATACATACACACACATTCACATAGCTGACTTTGATGGGTTCTCTAACTGGGGTCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTC:1 - chrX 10189953 5' - opus 7037 4 72.28 GCACTCCCACCAGCTGGATTCCTACCTGGGCGGAGTGGGCGGTATGATGAATCTGGGCGGCATGGGCCAAGTTGGCAAATACCGTTGCTAGTTTGAGGTCT:1 + chrX 17262772 5' - X-element 4364 1 73.27 CTGAAGCCCACCTAGCTAGCTACTAGCTACACATTTCATAAAAATCTCCTTTCTGATATAAAATTGTTGGGAAAACATACACACACACACACACAAACTCA:1 - chrX 13352459 5' + accord 7032 2 66.34 CACATATGCGTAAATGCGTTTACGTCTGTAGGCGTGGGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTATGGGGCAAGCCTGTGGGGAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAGAAA:1 + chr2R 19089418 5' + Doc2-element 220 1 79.21 AAATTAAACAAAAAACTAGTAACATAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr2R 9865528 5' + jockey 59 1 73.27 TAGGTGCCCAAAACGAGTATTTGAACAATAACACTGACTTTTTGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAAGTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAG:1 + chr3R 2532203 5' + Cr1a 103 1 61.39 GTATTGTTGCCAGCCATTTATAAACTACACAGTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 + chr3R 20396547 5' + I-element 46 1 66.34 CACTTCAAGTCAGAGGATTTTCATTTCCTGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCC:1 + chrX 11241692 5' - Doc 410 1 74.26 GAGACCACTGTACAGTATGTCTTATCGCACGCGCACACTTTCGGCGGCCCAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2L 7991696 5' + P-element 27 1 52.48 ATTAAAAACCCAAAGGGTTAAAATAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCG:1 + chrX 21224492 5' - Doc2-element 399 1 77.23 GAATTCGATTGACAAGCCAGCCAAGTGCACAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:2 + chr3R 21969073 5' - hobo 2892 1 76.24 GATTCTAGATGAGCAACTCAAATGTGGCATGATATGTATATTGTTTAATCTATTTCTTTTTCCATTAGATCTGTTACTATTTTTGTTATTTCGATTGAAAA:1 + chr3L 21397605 5' + Tc1 1530 1 65.35 GCGAAATTGCGACTTTAGAAACCGGTTAAGGTGTAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 + chr3L 10663580 5' - mdg1 7420 2 63.37 AGTCGCGTGCGTGATTCGTACGATAACCGTCGTTATATATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCC:1 + chrX 11149649 5' + McClintock 5983 2 66.00 TGAAATTTGTTTTTAAGCATGTATGTTCATTTCTTAAGTTCTTAAATAAATACTTTTATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCAC:1 - chr2R 22117356 5' + FB 88 1 61.39 ATATTTAACATTTCGCAACTTTCCGAATATGCCTCTCAAAGAGGGTGAGACAAACACCACCAAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACA:1 - chr2L 746694 5' + G6 1845 1 68.32 TCGGTAAATGGGCAGAAACACACACTGAGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTGAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGATATTATGTATGTGT:1 + chr2L 22078497 5' - invader2 18 2 72.28 GGCGGGGAACTGTCCCCAAGATTGCAGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCC:1 - chr3R 15328011 5' + P-element 228 1 32.67 TCTGCGAAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chrX 19819989 5' + hobo 45 1 73.27 CTTCGAAAATGGGAACCCCCACGCTCCCCAAAACAATGCTTCCGAAACCCCGAGCAGCAAACAAAAACCACCTGAAAAGCAATCGATTATCACTTTT:1 + chr2R 11775879 5' + Cr1a 4258 1 79.38 TCGCCTCGCATTTGCTGATGCCACATTAAAGTTTTTGGCCCCGTCAACGTCGTCGCCATCGCCATCGCCTCTCTGTGAGTGTGTGTGTGTATGTGTTCGTG:1 - chrX 14979314 5' - accord 180 2 36.63 ATCTAAGCGATAAATATTTCCCGTAATTATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2R 16338096 5' - roo 9025 2 71.29 TCATTTACTGTATCAGTTCATTAGCATAGAAGAAGCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGT:1 - chr3L 22094320 5' - Stalker2 360 2 66.34 GGGCGACGCCGACTGCGCTGCCTTGATCAGTCACTCACACAGATACAGATACTAAGCGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chr3R 18448923 5' + hobo 18 1 61.39 GATGAACAGTTGAATATTGCCAACTTTTTTCAATAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2R 22521871 5' + roo 8706 2 72.28 TGGACAGGATGGCCAAGACAAGGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAA:1 + chr3R 31371979 5' + opus 7376 2 78.22 CCCTGCTGTTCCCTTATTCAGCCGCATGCATGATTTCGTAATTTAAACGGCAATCACCTCTTTGGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 - chr3L 5085093 5' + 412 10 2 69.31 CAGCAGCACTATTTTAACACACCCTTCCAACTGTCATTGCCGCCGCCGGTATATTCATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACACAT:1 - chr3L 1535958 5' - Bica 4858 1 54.46 ACACACATTATTTCTCATTACACCAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAA:1 + chr2L 17287624 5' - hobo 2495 1 76.24 CATAATGTAATTGCGTTTCGTTTCTGTTTTCTTTGCTTCGATCTGGTTAATTTTATATTACGATGATGTTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1 + chr2R 22619587 5' - jockey 4970 1 50.50 GGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTAGTACAGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGAGTA:1 + chr2L 15833012 5' - hobo 2816 1 52.48 TATGCAATATTGCACCTGCTATCTTTAGGAATGCTTCCGCATCCTGGGCGTTCACGAATCAGCTGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAAA:1 + chr2L 7013625 5' + Idefix 7223 2 72.28 TTTCATAAAAATATGATAACTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGA:1 + chr2L 6007626 5' + Max-element 8277 2 79.07 TCACTACTTTGACTGCCACACTCTGCTACATGGTTTGGGTTATTGCAGGCGTTGTAATTTTTACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCG:1 - chr3L 15394588 5' - accord 6905 2 70.53 GCCACAGGGCTATTGGTTATTATTCGCCAAAAATCCGTCCTTCTTCGTCCGTATGAACTTTGAGAACTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAA:1 - chr3R 22940197 5' + INE-1 166 1 53.47 GGAGCCTAAACACATGAAAATACAAAAACACGATTGGCACTTTGTCAAACCACTTGGAAATCGAGAAAAATAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chr2R 17535057 5' - pogo 2097 1 69.31 TCTGAATAGTCCGGGTCACTCGTTTCTCGGAATCTCGCCTTTCTGTGGGAGGTCTCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr2L 7767200 5' - hobo 2919 1 59.41 CGTGAAAAACATTTTCCCACGATTTGAGTGCGGCGACGATGACGTTCGTCACCTAGAGAGGAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATCGCAAACGG:1 - 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chr2L 8251165 5' - invader4 96 2 69.31 AGCAGTTAGATGCTGTGAATGCGATCACGTGAAATGCTGAATTTTCCCAAGCAACTCAGCTAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAA:1 + chr2L 18554776 5' - invader2 4922 2 69.31 AAGTAATTTAGCTGTAGGCCGCAAACTTGAAGGCCGGAAAAGCGGAACTAATAGTGCGTCTGCAGGCCATTTCCCCAGAAACGCGTGGCGATTCACCGCCA:1 + chrX 13516511 5' + invader3 449 1 63.37 GCAGTAAAAATTAGAAGAAAAAAAAAAA:1 + chrX 13173484 5' + Doc 4698 4 82.14 CCTGAGAACCTTTTAACCCCAAGCGACTTAACGCATTCGTGTCATGTGGCGGCATTTAAGACTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 23243954 5' + jockey 18 1 62.38 TGTGCGCATGTCGAGCGACCTACACACAAAAAGCACTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chr2R 10158723 5' + P-element 39 1 40.59 ACCCCTTTGTGCCCCCTGTTCTGGATATGTGTCTGTGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGA:1 - chrX 7523714 5' + 1360 474 1 65.35 TAATGTTAAGAGTAGTCGAGCTGAACGGCCATACCAAAAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3L 19933710 5' - roo 9036 1 63.37 GTAAAGGCCGTAAAGCTGTCGTTGCGGCCCATTGAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr3R 23080838 5' + 412 40 2 62.38 AACAGCAGCAGCTACTTGTTAATAAGCGTATTAAGGTTCCCTTTGATCTGCTTAATCGAATGCCGAAATGAAACGCAACAAGCTTAACGTAGGTAGATAAC:1 - chr3L 16023188 5' - diver2 160 2 78.22 AATGGGTCAACAAACTTGCGCTTGGTCTTTGACTCCGGAATCTGTATGCTGAATCTCAACATTCTAGCATTTTAGTTCCTGAGATCTCGACTTTCATACGG:1 - chr2R 5296379 5' - INE-1 135 1 80.20 TAACTGCTACGTCAGAACTAAATGGCTTATAAGGAGACCTCAAACTGAACTCTGATTATTACTCGGATTTGATCGATGTTCAAGCCTCGGCTTCGAGCTTT:1 - chr2L 9573339 5' - Idefix 7242 2 61.39 GTTATTTCGGTTTGAAGTACATTTTTGTAGTTTTCCTTTTCGTTTTCGGTTTCTTCTTTGCCTACCGGCAAATTCGTGTTTGGCTGTGCAAAAAGAATTGA:1 + chr2L 18726815 5' + G3 16 1 64.36 GGCGTCCTGTCGTTCGTGTCCTGGCTTTCTGCTAAATCATGCGACTGCCATTAAACCTCGCTGCTGCAGCCGATATGCAAACAGACTGAGCGCCCACCCGA:1 - chr2R 13096423 5' + G5A 2617 1 68.32 CCCATGTCGTTGCCCATGTTGTTCGTGAATATCGACGTTCATACGAATAGACGGAGAGACGGACATGGCTAGATCCACTCGGCTATTGATCCTGATCAAAA:1 + chrX 4359735 5' - INE-1 88 1 69.31 GGTGTTTACCAAAACGAGTCACCTTTCTGCAAAACGGAGGCATTCCCCAAATCCGCTGGGTCAGCAGATTCGCGACAACACAGAGCCATACATAATACTTG:1 - chrX 6545502 5' + gypsy5 7175 2 72.28 ATCACTCACGGTGCAACTGACCACGCCCCCAGTGGCGCCCACCACCTTCTGTTGTCACATCTGCAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chrX 8354448 5' + jockey 18 1 68.00 GCCGACTCTGTCTACCATGGGAAAGGTTAAACAATCAATTCTGCCTTCAATTGAACTCAATTGTGCGTTGCCCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTT:1 - chr2R 17269815 5' + transib2 2 1 75.25 AGTTGACATCATGGCACCCCCGTGCATTCAGCCACATACTATAATATATATTGTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chr2R 12130678 5' + hobo 22 1 57.43 CCATTTATTGAAACTAACACACACATACGCAGACAAGAAATTTGAATTACCCATTCACTTGTGTAGGCGTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGAATTGTA:1 - chr3R 3611118 5' - ZAM 7980 2 59.41 TAGATTTTTCTCTGTGCAGTACTTTACACATGTCAACGGGGACAACAGCAAAAAAAAAGTAAATATATAGAAAAGTAAAAAAAAAGTGTAACAAATAGCGG:1 + chr3R 28467529 5' + invader2 4762 1 78.22 AATACCAGTTCAGTAATCATATATTGAATAAAAAAACCTATGCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3L 17786292 5' - roo 9039 1 59.41 TTTGATTCGTTTTATTTGTTATGCAAAAACTTGAAGTATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 + chr2L 3988511 5' + I-element 25 1 64.36 TTTTTAATTCATTTTGGATTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACCACACAGGGCTGTATGGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr3L 25272563 5' + 1360 15 1 59.41 AGTATGATGAAGTGAATAATTCTTTTTATGTTCGTTTATTATATATCAAAAAACAATAACAACTTTAAATATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTAA:1 + chr3L 26013609 5' - 1360 163 1 68.32 TATTCAATCAAATAATATTCATTTCATTTGCAATCAACAAGAGCAGCGGCAATAAGGAGTAAAGAAGTTTTCCAGATGGTCGGCGAACGCGTTGGCTTTCT:1 - chrX 12270662 5' - G7 27 1 61.39 ACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTG:1 + chr3L 19951209 5' + Ivk 41 1 65.35 GTCGCCTAAAATGCCATCAGCAAAATTGGAAAAATTCCCCCACATATGTATGTAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGATCTAA:1 - chr3L 14260432 5' - 297 6961 2 66.34 TTTGCTGCTTCCACTTCTTTCCACAATCCACAACTTTCTTTTCGGTCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTATTCCGTGCCGTT:1 + chr3L 18162087 5' - Bica 397 1 55.45 GAGTTCTCGCTGCTGAAAACTGATATTGTGGAGTGGCATAGGTTCAGGTCGGTTTTAGGACGGAGTTGTAGAGTAAGACCTTATATTCTAGTCTTAGGGGA:1 + chr3L 5697186 5' - Fw2 3493 1 66.34 TGCCGGGGCCGTAAATTATATAGATTCTGGCCAGCGTTTCTACACTTCTGGCATACAGGCGGCAGTAGACCTTAGATGTTCCCTCCAAAAAATTTAATTAT:1 - chr2L 17185209 5' + G2 3015 1 80.20 ACGGGTGAGGCCTGGAAAGAAAGACGCGCCGAAGTTACACCCGGACTTTCGGCAAATCGGGTAAGCTTAGGTTGCCTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGA:1 + chr2L 5211002 5' - gypsy12 10194 2 73.27 GCAGGGATATGATGTGGCAGGATATGGCAGGACATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATTGACGCTT:1 + chr2L 2607179 5' - HMS-Beagle 6775 1 75.25 ATTAATGCACCGTACGTTGGCTGAATATAAATGCAATATGCATCGAAATGCAAGAATAAATATATAAAAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAA:1 - chr2L 18428670 5' - Juan 444 1 71.29 TAGTTGACAGTCTGGCCGGGGGATGACAAATGCCCTTGGGCCATTGGGCTATTGGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr3R 20170441 5' + hobo 22 1 55.45 TTGACGGGTGAGGCCTGGAAAGAAAGACGCGCCGAAGTTACACCCGGACTTTCGGCAAATCGGGTAAGCTTAGGTTGCCTGTAACGTGTAACGAATTAAAC:1 + chr2L 5210999 5' - gypsy12 10197 2 76.24 GAATTCCTATGGCACATCAATTTATTCAATTTAAAATGTATACACTTGTAAAATCCCAAAGCAATCACTCCTATTCATTTTATTCAACAAATACGTGGTCA:1 - chr2R 12379380 5' - Tc1 225 1 55.45 TCCTGTGGATAATGTTTTTGGTGCATCCTTCGCTGGAGATTCCGATGTTCTGGACGATGCATTGCCTCATAGTTGACATCTATATGTCCATATTGGTTTTA:1 - chr2L 16870374 5' - Doc4-element 2588 1 59.41 AAATAATTTCATATTATATTATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATAAAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGACGTCAGGCCACCTTT:1 - chr3R 7212489 5' - blood 7334 1 79.21 GTCGAGGAGGAGGCCAAAAAGCGGTAAGCATGCATTTAATCTACTGTATTAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCA:1 - chr2R 9285604 5' - gypsy 432 2 49.50 AGTCTAAATATTCAACAAAGTAACTCTTACATTGACTGTGAACTTAGTTACAGTTTTTAATTGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chr2L 17887229 5' + hobo 13 1 56.44 CTCGGGAGGATCTCTGCAAGTCGACTGCGAGTATGCACTTGGTTACATGGCAGTATATAGGGTTTGCTTTGGCACTAGTAAATGTCACCGTTGTTGTGGTG:1 + chr3L 16413469 5' - BS 499 1 73.27 ACCGTTGGTGGGCTAAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 - chr2L 7971073 5' + blood 7017 2 68.32 CAATAAAAGTGTCATTTTAAAAATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:2 - chr3L 5490123 5' + 297 6630 2 81.19 AATTAACCACAGTCACTTACGGAACTGCATCTGCACCATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCACTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACA:1 + chr3R 19445492 5' + accord 243 2 62.38 ATCGCCTGCCAGCCAGCTGTTTATATTGCAAAATGTCAAGGACTCGCCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 - chr3L 9174778 5' - 412 488 2 73.27 TTTGTACTGCAAATACTTAAAAAAAACATCCGTCCCCTAATTAAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGG:1 + chr2L 12396071 5' + Idefix 246 2 80.00 ATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 - chr3L 20711706 5' + jockey 4681 1 64.36 TTTTGGCCATGCTCTTTGAAACTGAACTGGGCTTCCTTGCTGGCTGCTCCGGGGAGCAGAAGATTATTATTTTTGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACT:1 + chr3L 18562111 5' - Gypsy6A_LTR 272 1 72.28 GCGCGGCGAACTGAACGAGACCGCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACCTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr3R 7814373 5' - P-element 2835 1 28.71 CTTCCTTACATCCTAATAGGATTCATATACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 + chrX 3195639 5' - mdg1 7412 2 72.28 AAAAACATTAACGGCCGCATTACAGATGCACGTTGATGTGGCACAGTGGAGCGTCGCAATTACACGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3L 11367593 5' + roo 8676 2 48.51 CAGAAGGAAGATCTGAAGATGAAATTAATGATCAGAAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 + chr3L 7470877 5' + Doc 47 1 69.31 CCCAGCAGACAACAAGGAAAATGCAGACGGCAACAACAAGATGCAAAACGCAAATATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAGCAAA:1 - chr3L 16178812 5' + G6 33 1 58.42 GCCAAAAACGCTTACCACGCCCACACGTTTTATTGCCGCTAAAGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGA:1 + chrX 12606345 5' - 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G5 4641 1 61.39 ATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGC:1 + chr3L 17215737 5' + Ivk 49 1 69.31 GAGGCCAAGTGGGCTATTAAATGCCAAGTTAATGGGTTGAACAAATTGTTTTTACCAGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATG:1 - chrX 16572973 5' - I-element 5062 1 69.31 CGGGTACTGGAAAAACATATAAAATATTACGTTTTCATTCAGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr3R 31092923 5' - roo 9038 1 66.34 CGTTTCATCGCGCCGATAGGAAATAACTTGATTTGGTTTAAAACAATGGAAATACAAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 - chr3R 27926653 5' + I-element 24 1 60.40 GTTGCATCCAGTCGACCACAATTGCACCGCAACTAACTGCAAGCCACATGACGCCACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 - chr3R 545273 5' - Transpac 293 2 66.34 GGACCAGACCATAAATTTGAATGATACCAGCGATGTGCGTGGCGAGAAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGAGAGTCGAGTGGAAAAAAAGTGCCACC:1 + chr3L 22848878 5' - hobo 15 1 68.32 CAACGACGGAGACGGGCACGTGCCACTTGTTGTTTTCGCCCCGAATGGGATTGGAGCTTAATTTTTGTTAAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCGTTTT:1 - chrX 6642629 5' - gypsy7 5011 2 71.72 TGATTTTTAAACATTTGCTAAGTGAACAGAGAAGATGGGGGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:1 + chr2L 7970952 5' - blood 7383 2 71.29 AAGCGTCTGGTGCGGAACACAGCGGTGAAGGCCAGGAATGCGTGGTACCTGGTCGTTTAGCTAGACTATTAGGATGAGATTCTAGTCTGTCGTTGTATTTT:1 + chr3R 5235960 5' - jockey2 3080 1 54.46 ACTGAATGGGATAGAAATTAAGCATAATATAACTTAATGGCCTCAGTTCCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTT:1 - chr3R 28678247 5' + I-element 37 1 57.43 CCAAATGCCAGCTGGAGCTGGTTAGTTGCAGCCAGGAACACTCTCGCCATGTATCGCTCTCCACTTAGCCTGGAGTTCAAAGCTCTCCTATACAACTCCGT:1 + chr3L 896067 5' + Doc 4254 1 56.44 GACACCGAAGTGTATAAATTGCTTACGTTTGCCCATGTAGTCATAAAAATTGCTTTGGCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAA:1 + chr2L 15020717 5' + BS 4897 1 61.39 TAAGTTTTGAATAAACAATTCGAGGGCATGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGGGTCAGCTGTGACACAC:1 - chr2L 5211080 5' + gypsy12 52 2 72.28 AAGTAATTGGTGACATAGACATATACACATCTCTGCGAAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chrX 19819958 5' + hobo 14 1 65.35 GCATAAAAAACTGTCATTGCTGTCGCTGGCCTGTGATGGTTCTCAGGATTTTCGATTGGGCCCGTTGGATGATTTCTACGCTGCTGTTACTGGCGTTCCCC:1 + chr3R 22058355 5' - Fw2 3571 1 72.28 ATTGGCACAGCCCCAGGGCAGATCAGAGTAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATC:1 + chr2R 6783181 5' - Tabor 7276 2 72.28 TTTTGGATATTTTTTCATTTTTCATTTTCGGTACGGATTGTGAGTACGTCGTTCTTAATCTGTAAACACCGTGACTTCCTTCTTCCTTTTTTTTTTTCTT:1 + chr3L 16700083 5' - Doc2-element 229 1 73.00 TATGTTTTCATTCCGCCAAAACATGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAA:1 - chr3R 12729227 5' - roo 145 2 77.23 TTCATGATCATAATAGTTGACTGCATCCTGTGATCGGTGTTGGATGACCACGGGTTTTTTGCCCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 11199904 5' - roo 395 1 65.35 ATATGCGAAGCGAAAGGAGGCAAAGGACACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATT:1 - chr2L 11903320 5' + hopper2 1199 2 72.28 CTCTGGCTTAAATTTTGAAACGAACTTCATACTTCTTATTAGCAATATTATTTTTTTTAACAGATGTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1 - chr3R 7869774 5' - jockey 4975 1 48.51 AGCCGAATCCTGGTAAGATTTATGCAAATATTTTCCATTGCCATTCATGCTTTTGCCCTGGCTCACACAATTTTCCTCATTCTTTTTCCTTTTTTTTTCTT:1 - chr3L 10147358 5' - Doc2-element 231 1 52.48 AGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGC:1 - chr3R 1977615 5' - micropia 419 2 59.41 TTCTACGACTCCCAAACAAGTTTCATACTAAATTTCCGAATGTCTTGTTTAGTACGTAGGGGAGTTTCTATATATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAA:1 - chr2R 7381112 5' + 412 7463 2 77.23 GCGATGCACGCACTTTAGCCCGCAACTTGGACGGGGGCATTAGCGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 21782045 5' + roo 31 2 54.46 ACGATAGAGCAGATGTCGAACGTTGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr2R 18036636 5' + blood 7063 2 76.24 CCCTAGAAAACGAGGTCAACTATTTCTGCAAGTGGAAGGGGGCGGCGGGCACGCGGATTTGTGGGCGGCAGTGGGCGCCAATTAACAGACAACAATTTTAA:1 - chr3R 6429757 5' - gypsy4 261 2 71.29 GGAAACAACCTCAGTGATTCCTTGATGACGCACTCCAAGTGGATCAGTTCGTTAAACTGGAACATACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:3 - chr2L 5269889 5' + hobo 9 1 70.30 CTAGCATTATTTTGCAATTTCCCACATAATTATTAAGCGCCATAGCAAGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAG:1 + chr2L 3105826 5' - Doc 403 1 54.46 AATCTACAGTTCACACTTTAGCTAAAATTGCATGAAGAATAAATTCCGCAAAATTTTATTTCATTTCATTTATTTCACGCTTTTTTATTTATTTTATTTT:1 - chr2L 21626244 5' - F-element 93 1 76.00 ATAACCAATTATTCATAACACATTGGAATATGTTATATTTAAAATGCATTCCTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chrX 14500167 5' - roo 385 2 54.46 CTGGCCAGATGATTGATGTATGGACGTGTTAATTAGGTCCACTCGTGCCGCATTTACACTCCACTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 - chr2L 17283548 5' - hobo 2925 1 65.35 TGCTGAACTAAAAATAACAATATCCCTATTTTTTTACTTGGAATAATGAATTATGAATTAATTATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATT:1 + chr3R 4387001 5' - roo 19 2 69.31 CCAAACAGCGGGCCAGCAAACCCCACTAACAGTAGCTTAAGTACCCTTAATATACCGCCACCTCACATACGTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCC:1 + chr3R 11376237 5' + 297 6526 1 73.27 ACTGCGCGCTTCGCGTAACTAGCACTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 30655359 5' + roo 8717 2 78.22 GTAACTTCGTTAGGCCAATGAATCCAATGTGGCCGCCTGACGCTTCCACTGTTTGTTGTTTCCGACTTGACCGCGCGTTCTCAGTCCCGAACTCCTTCTGG:1 - chrX 14301403 5' - gypsy8 431 1 67.33 AAATACCAAAAGCAAAATATGAGAGTGGAAAACTGTTGCCGTTGGTCAAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 + chr3R 20868714 5' - Transpac 285 2 54.46 CTACGAGTAACGTCGTGTATCGTGTAAATAAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGATCCAGACAAAAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGAGATATCGATAGT:1 - chr2L 22928440 5' - INE-1 501 1 59.41 CTACGGTGGCCGTTAAGCAAAACGAAAATTGAAGCAATTCCGCTTACGCTTGGCATACACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chr3R 27386271 5' + hobo 18 1 61.39 GGAAACTGATGATTTGTATTTAATATTACTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr3R 31775056 5' - roo 9029 1 68.32 TCTGGCTACGCCAGCGTGTCATTTCGCTTGGTTCATATAAATTGTTTTGGGATTTAGTCGCACGCTTTTCCTGCCTTCCTTTTCTTTTTCTTTTTTTTGTT:1 + chr3R 11856529 5' - Doc2-element 233 3 76.24 GCAGTGTGTGCGTGTGAGTAAGAAGCTGTAATTAGTTAACAAATATTTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 - chr3R 24173057 5' - pogo 2075 1 53.47 TCTGTGGACCAAAATGTGCCATTAATTAAAAGTGTGAGCTATAATGTTTTGCTTTTTGAATATGTTCAAAAACAAAAAACCTACACACACACACACACA:1 - chr3R 6345181 5' + accord 253 2 51.52 GTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:2 - chr2R 5651889 5' + Tirant 8151 2 67.33 GATTTGTTTAACGAGGGAGAGAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCG:1 + chrX 11546538 5' - opus 7335 2 79.21 ACAAAGCAGCCTTGGAAAAAGGATAAGCCAAATGACGAGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTGCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGC:1 + chr2L 20623844 5' + F-element 353 1 62.38 CCACCCACAGATTTACTGACTACGACTAGTAGAGGAGCACAAAGTAAATGGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr2L 12276544 5' - 1360 3363 1 57.43 GAGTAAAATTTCTGTCTCCGTTGCGATATTGAAGTGCTGGCTAATGTGTAATTTCTGAACAAAGGATAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATAC:1 + chr2L 7642461 5' - INE-1 558 1 66.34 AGTCACTCACACAGATACAGATACTAAGCGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chr3R 18448951 5' + hobo 46 1 72.28 CTGCAGGCGGGCTTGAAAATTATAAACCGATATGTAGAGGAATATCTTGAATGGGACCACTAGCGCTCCGCTATGACATCAA:1 + chr3R 7746492 5' - mariner2 52 1 64.63 ATAAATACTCGCGTAAAGTTGTCTGACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 - chr2L 9330273 5' - hopper 1366 1 73.27 TGTTGCAATAGTAAAGTACGGAAATATACGCGCAAATAGTAAATGTTAAAACATAATGGCCCATTTGAATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr2R 4582645 5' + 1360 7 2 71.29 GCTTGCTTTTGGCCCGGCATTATAATAATGCTCTGGTAATAGTTCGATGGCCATAGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 14285084 5' + roo 20 2 60.40 GCTGTGATTATGTCAGCCCCTGTATGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAG:1 - chr2L 19083412 5' - Tirant 351 2 77.23 GTAGCTGCTACTTCTGCAGACTTTTGGCCATATCCTTTGGCCCTCCAGACTGCCGAAGCTCCACCACCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAGCAC:1 + chr3R 28940696 5' + hobo 12 1 66.34 CACACAAATTAGGTACAAAAACATATTTAATTAGCGCTTCCTGTCAGTGGAGGAAAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAA:1 - chr3R 7212300 5' + I-element 371 1 54.46 GACGTTTATTAGTAGTAAATCTTATGGTCTAAGCACCATGCCTAAATACTGCTTTTCACTGGCAGACTATCATTACATGGTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr3R 16487289 5' + roo 8664 1 75.25 ATCGAGTAACCATGGCCGACGAGCCACTTAAACCCGGCCAATTTGTGGGCGAGAGAGCGCAGAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGC:1 + chr2R 12355952 5' + G2 293 1 67.33 ATCTCAACTGATAAGTGGCGCGAAATGGGCAAAATAATAACAGGTGTATACCAGGGTAGTGAGCAGGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCA:1 + chr3R 11811278 5' + F-element 4393 1 73.27 AACGACTGTTTGATTGCTGCCAAAGGGAAATCAAAGAGAAATCGGTGGCACTATACCGCCTATATACATACTTTTAAACATACTCATACTTTCTGCTGTG:1 + chr3L 19178219 5' + ZAM 8176 2 69.00 GAACCGGAAATAGCATCAGATCCAGCGGACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGGTGAACATAAATTTATAATTATTAAAAGGAA:1 - chr2R 11625221 5' + I-element 254 1 72.28 GCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCT:1 + chr3L 19951211 5' + Ivk 43 1 67.33 GTTCAATGCGCTTAACTTGTGGGAGATCTGACAAATATATATAATTAAATTCTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTTCACTGAAT:1 - chr3L 8918626 5' - Idefix 7355 2 66.67 AACGGTACTGTGAAAACTTTGGCTCCAAATCGTTTCCGCTCATATAAAGTATATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGAACGTCGAGATCTCAGGAGCT:1 - chr2R 5204826 5' + INE-1 141 1 73.00 CAAGTTCAGGCGGACGGGCAATTAAATTGTGAGCGAATCCAAGACTGAAAAATCAATCGCAAAAGAAAGGCAACAGAACAGCAAACGAATCCCAACCAA:1 - chr3R 26247824 5' + G2 99 1 57.58 ACTTAAGAATCGCGATAGATGGTTAGAAAAGCATCGACTGTCGCAGTCATCATCGTCTTTTTCCTTCGCGAGCTTCTTGTTCCTTGTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr3R 7057778 5' - transib2 2641 1 77.23 CGTTCTACACAGGCGTGCCCAATCCAGCGCTTTCGGGATTATATGCAACATTCACATAGCCAACAAAACATTTTTATAAAAGCAGACAACATTTATTGTTT:1 - chr2L 22688359 5' - Cr1a 439 1 60.40 GTCTATAAGCCTTTAGTTTATGTCGGCTTTCCATTATGTATATTTTGTAGGCTTTCATTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCC:1 + chrX 11463604 5' + flea 4772 2 54.46 CGAGAGTAGACCCACGGTTCAGCTACAACTATGCATTTCAAAACAAAAATGTAAAAGAAAAAGAGGAAAAAGCGTGCGTCCGGCTCTCTTTACAACGCAAC:1 - chr3R 2926925 5' + Doc 263 1 82.18 GGTGTTGCTTAAATCCAAATCGGTATCCAAGCCGTCAGATGATACCGTGAATATGTCGGAATTGTCGTCGCCTAATTTTTCTATTTGAATTGACACACTCA:1 + chr2L 16344597 5' - Copia1_DM 330 1 65.35 TACCTTAAATGTAATTTTCAAATAAAATAAGAAGTCATGTGCAGGAAAACACAAAATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCAAGAGAGCAGT:1 + chr2R 974015 5' - Cr1a 350 1 63.37 CCCGCCTGAGATATCCATTCTCCAGTCTCTTATATAATCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTT:1 - chr3L 3893040 5' + Juan 3845 1 66.34 AATTTGATTCGTTTTATTTGTTATGCAAAAACTTGAAGTATATTATTATTACCCATATATACGAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:2 + chr2L 3988509 5' + I-element 23 1 66.34 GACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAATACACAGCAACACTTAGTT:1 - chr2L 7971040 5' + blood 39 2 59.41 CATCGATGAGCTGATAAGTGGCAATTGAGACTATACGCGTACGTGTGCGGGTGTATATCTTTATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 + chr3R 18887011 5' + 297 10 2 68.32 GATCAACAATAATCTTAGAGAGGCATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAGCAAAAATTGCAGATGTGGATGTTACAGCAAG:1 + chr3L 27661523 5' + I-element 443 1 76.24 GTAACAAGCAGACCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTTTAATCGAGTT:1 + chr2L 22699411 5' - INE-1 575 1 75.25 CGTCGGGAGTTTCGAAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTA:1 + chr2R 17402687 5' + invader4 2763 2 75.25 AGATATGCTAGAATATTAGAAAATCCACTACTGCGCTGTGTTTATGTCTTTAGAATCTGTATGCTTGATCTCAACCTGCTAGCTTTCATAATTCCTGAGAT:1 - chr3L 26324962 5' - INE-1 151 1 69.31 CAGGAGCAATTCCGGAAATGCTGTCACAAATTGTTTCAGAACCACCATTTAATTTATTTTATTTACAGAAAATTCAAAGAGCCTTGTAATAATTGTAATGC:1 - chr2R 17292571 5' - Tabor 490 1 80.20 GTTTTCTAATTGTTGTTCTTTTAAATTTGCTGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 + chr3R 31188750 5' + I-element 44 1 71.00 CCATTATAGCATATCAACAACCAAATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCA:1 + chr2L 15019881 5' - BS 5069 1 53.47 CATAAAAAATCCCTTGAAATTGGCCAAAATTGCTCTCTCTCTCCGCTCGCGTAAAATGGAGTACTTTAAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTTCTTGTGTGA:1 - chr4 135377 5' - 1360 3258 1 79.21 TACGAATGCACATGCAAAGGTGGAGCCCGTTATCAAGGAGTCGAAGGCCAGTCCGCTGATGTCCTTTTTGGAAAGTTTTTTTTAATTAATTTTATTTATTT:1 + chr2L 18127505 5' - HeT-A 2 1 70.30 TCACTTTACTCTTAACAATGTAGGCAGTAAATCAAAACCCCTTTCACTGCTCCCCTAGAACAATGTCAACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGC:1 + chr2L 1238139 5' + F-element 454 1 69.31 CCATGGCGAGACAGTTGGTTGATTCCTGGCAGAGACGGCGTCTCGAGTTGCAGAATTGAGGACCGCGTCTGGAGTAATAATGCGGGCAGTGAAAAAGCTG:1 + chr3R 15185542 5' + diver2 4456 1 86.00 TATACACAGAGATACAGATACTTAGTTGCAAACATCGTTGCATACTTTTCGGTGCACTTGGACAAGGACACGGTACGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 + chr3L 21852463 5' - 1360 3388 2 78.22 ATCGTGTGCCATAAATTTGCAGTTTAAATGCGAATTCGATTGACAAGCCAGCCAAGTGCACAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chr3R 21969042 5' - hobo 2923 1 63.37 CTTTTTCAAAAATGATTCGAACAAACTTTTTATTTTATTTTAAATGATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr2L 18093874 5' - roo 9041 1 59.41 TGATGCCATTTGGTTTTATACATATGTACATACTATATTAATCTGTTATTATTATTATTATTATTAATTGTGCCTTCGTTTATTTTTCTTGTTGCCTATCC:1 - chr3L 14156666 5' - invader3 5008 1 83.17 GTTACGATGTTATCCTACAACACCTTGTTTTTCGAGAGCCCGCTTGGGATATTGATTGTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGT:1 - chr2L 22689565 5' - Bica 122 1 71.29 TGGATGAGGAAAAAGGCACATTTGCAACGCTTCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACG:1 - chr2R 2092779 5' + Doc3-element 96 2 69.31 CCATTTTTGCGTAAATTCATTTTAAGCAATCCTTTTTACTTTCGCCGACCACCAATCGATAGACAGCTCGTTCAGCGCTCGTTGTTGTTGTTTTCATTTA:1 - chr2L 9106877 5' - gypsy9 452 1 66.00 CGTTGATCGGCGAAACTTTGCGACTTTAGTTAGTCGCTTTTTGAGATTCCCCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chr2L 852819 5' - P-element 2863 1 55.45 ACCTGAACAGTACTGGGCAATGTTCGCATGGTAAGACACGTATGCAGTCATGCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr2R 5200924 5' + 1360 23 1 54.46 TAATTGTTGTTCTTTTAAATTTGCTGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 + chr3R 31188756 5' + I-element 51 1 77.23 AAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:2 - chr2L 7971059 5' + blood 7031 2 55.45 AAAACCAGACTTGTCGGATAGTGACCATGTTCACACTATAAACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGCTTAAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGC:1 - chr3R 3619401 5' - rooA 301 2 73.27 TTTAATAATATATAACCTCCATAATCTGTATTTGAATACAAATAGAAGCAACCCATAGATTAAATCAACCTGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTT:1 + chr2R 13750665 5' - Doc 4462 1 79.21 GCCGGCTGCGAATCTCACCTGGTGGATCAATGACATACAGGTGCCACCCAATTAAAGTCCATTTTTATGCGAAACAATAATGATGAGTTTTTGCAAAACTT:1 - chr2L 15906690 5' + pogo 1794 1 53.47 TCCATCACAACACGAAATTGGCAAAAACTTATTATTCACTTTAGCACACATTTGCACAGGAGACTCTAAGGGAAACGAGCAACTGGAACACCGCATCCGGC:1 - chr2L 9407794 5' + Tirant 72 2 80.20 GATGTGAAGATAACTCTTCGGATTTGTTACATTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTG:1 + chr3L 5975746 5' - invader2 4698 1 79.21 ACTTCCTGAAGCCTGAGAACCTTTTAACCCCAAGCGACTTAACGCATTCGTGTCATGTGGCGGCATTTAAGACTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 - chr3R 23243965 5' + jockey 7 1 73.27 ATGTGCCGGAATCAGTCAGACGTAGCTTAAGAGCTTCATTCCCCCCAATACACACACACACACACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTCATG:1 - chr2L 12765724 5' - accord 180 2 56.44 TTTATGTATCTTTTTGTTGTGTTTGTTGCTCCGCTGGTCGCCAACTAATTTGCATATTAATACCCGCACACACCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAAC:1 + chr3L 11350316 5' + F-element 304 1 77.23 TGCAACAAGGACAAGGAGCTGAAAAAAGGAGTAAAGGACAGCTCGATACGAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTTTATTAGAGATGGAACATAGAAAA:1 + chr3R 27837856 5' - 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Cr1a 4030 1 51.49 CAAGGTAGCTGACATATTGACTCCTTTCCAAAATACTGTCCCATCTTTGGCTTAATTAGCAATGACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 16449820 5' - roo 398 1 68.32 GCTAACAGTTTATCGTTTCGTTTGTGGTCGCTGGAAATAAAGTTATTAAAAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chrX 13065022 5' + 412 60 2 55.45 ACTCGCACGCCTGCCAGCATAATAAAAAGATCCCCTTGCACTTCCCATTTCATCGCGACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAAT:1 - chr2L 20546254 5' + I-element 4892 1 60.40 GTGACAAGGGTTCCTGGAGTGCCCGATTCGGCAAGGAGACAGTAGTTAACAATGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 23485650 5' - roo 9048 2 55.45 CTGATTATGCCTCTAAGTCACGATAAAATGCTATTTTAGATCCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3L 18034173 5' + Doc 39 1 55.45 CAATAAAACTAAAGAAAAGTATAATAATAAAACCTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGG:2 + chr3L 3685388 5' + Juan 46 1 73.27 AAGCTATGCTATAGTTTTTTCCACTTCGGCTTGTGGACTGTTGGACGTTATGTTGGAATGCCTATGAAGCCTCTTTATGTACCGATCGCTGCACTTCTTT:1 + chr3R 28496977 5' - G7 947 1 53.00 ATGTGTTGGTCGATCGGAGGGGGGCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chrX 10629249 5' - P-element 2837 1 29.70 CGTTGTGAAATATTGTGTAAGAGGTGAAGGTGACGTTTTATTGACTGTCTTCCCGGCTCGTGGGCGGTACCGGGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGT:1 - chr3R 6857956 5' - F-element 262 1 78.22 CATGACTTTATTGACGGCTTGCTCGACTTATCGTTGTCGCAAGTTAATTATATCCCAAAAAAATTATGAAATTTCGCCATCGCATTCCCACTAGCTGAGTA:1 - chr4 1150742 5' + INE-1 532 1 56.44 AGAGCGTTGCCCAAGAAAATGGTATTAGGTTAATTGGGGGAAAATTGTGTTTTTAATTTAACGCACTGCTAGTGGCGTTCCCCAATAGCTGGGAACCATAG:1 + chr2L 10553137 5' - Fw2 3553 1 67.33 AGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGCACGCATAACATAGCACGTTTTCACATGTTTTTATGAACTCTATTAGATGCCTAAAACTAAATCTTAGGCTTCTAGC:1 - chr3R 29588499 5' + Transib5 2930 1 48.51 CGCGGCAAACAAATCAATTTGCCATAATCATCAAGTAACCGTAATGCTAGCTCGCTTAAACACAGCCACTATCACCGAAATCACCACTCACTTGTCCAACC:1 - chrX 8316602 5' - diver2 479 1 60.40 TGTTATATTATGTTAAATAATATCCAATCGATCGCCATGGGTAGTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAA:1 - chr2R 24687766 5' - accord2 7570 2 59.41 ACTCTCTCGGTCTTTTGGCTTAATTGATATGGGTTGCAAAGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAC:1 + chr2L 2912024 5' - 297 6945 2 64.36 CAAAACACTCTTAGCCGATTCCCATTTTTGTGGCGGTCTGCATCCTCCGGGTCTCGGGAAGAGCATCGATGGCTGTTTTGAGGGAACACTTTCCAGAGCGA:1 + chrX 754186 5' + mariner2 511 1 67.33 CCAAGACTCAAGAAGGGGTGTGCTGCTGGCCAAGATTGCCCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTT:1 - chr2L 5495363 5' - Quasimodo 358 2 66.34 TAAAATTTTTAAAAAGTTTTATTCACCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTAGCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAC:1 - chr3R 7641687 5' + INE-1 556 1 81.19 GGATCCGGTTGGGATGTCTCGATGCATCGCTTTATGGAGGCGCATTGCTATACTGTCTGATAGTTAAGCAGTTAGTTAATTGAAAAAAGTGAAATTTTTGA:1 + chrX 8759110 5' - FB 161 1 58.42 CGCAAAACTATTGCACTAAACCAAAAATGATTTCGTGGTCCGGACTTTAATTACATCTCATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCAC:1 + chr3L 15668205 5' + rover 181 2 64.58 TTTGGAACAAGGGTCCCCCCATTGCAATCCTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGT:1 + chr3R 12215278 5' + hobo 44 1 67.33 AATCAGCTTTGGCTGGGATTGGTCAACGAAAAGTTCGATCAGTTCTGGGCCGTCAATCGGAGGCTAATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACGATAAGAGTCCAG:1 - chrX 7322664 5' + gypsy7 5284 2 68.32 ATATTTTCCCTTATCCTGGAAGTTTGCTGTGCTAGTAGCTAAAGAACTTGACACCGTCTTGAATGGGGAGAGCTTGAGCGAGACGCTCTCAGTGCTTTCGG:1 - chr3R 3005174 5' - Doc3-element 423 1 77.23 TTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTG:1 - chr3R 14049441 5' - transib2 2817 1 70.30 AGATTTTAAGTTGCGCTGGAATTCAAATTGCACATGTTTAATTTAAATCCCGAACTCATTAAAGCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2R 21860471 5' + roo 8675 2 69.00 CACTATAATCTCATTTTAGAAAAAGAGAAGTGAACATAAAGCTAATTAGAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCACAGCTGTGACAAATAAACGAAAAA:1 - chr3R 10413026 5' + gypsy4 333 2 63.37 TGCTGCTGTATGTAATTAGAGAACTCCTGGTGCTTTGGAACAAGGGTCCCCCCATTGCAATCCTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chr3R 12215245 5' + hobo 11 1 68.32 TTGCGACTGCATTGTGACGGGTAAGAAATTCGCGATCAAAATTAAACAAGAGAGAGTTCTATATATTAGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAG:1 + chr2L 22051897 5' - INE-1 547 1 61.39 CATTATTCCTTTGCTAAGACCTTTCCACCTTATGGCAATCCCCAGTTCAAATCACAAAATCGTTTCCCACAAACTCGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCG:1 + chr2L 12363253 5' - 1360 3314 1 77.23 TGCTACGTGTTTCTTAGCTGGCCGAAGTGTGTGTATGTGTGTGTAAGTTAACACCATTTAACGCTAATGTAATGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 - chrX 12276861 5' - hobo 2938 1 78.22 TTGCTATTTTGGTTGTAGCTCTATCCCTTAACACCTCAGCTGCAGTGTTGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 + chr3R 24229079 5' + 1360 27 1 53.47 ATGGTTGATTTAGCCCGATTGAACTCCAAAATTTTGGAACTGTGCTTGGCAACGACGGAGAGAAAGAGTGCGCTTTCTGGTCTTGGGAGGGCTTGAGCGTT:1 - chr3L 8900468 5' - Doc4-element 96 1 78.22 CTATGACGCCTTACACCTCATTTTGATTTACGAGAAAAATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCG:1 + chr2L 8374191 5' - invader1 366 2 70.30 CTATTGCTGCTGTTGGTGTGTTGCTGGCATCCACGCTCGTTGTGGAGTTGCTGGCTGCTATTGTGGTCACTTTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCA:1 - chr2R 8078073 5' - Quasimodo 6984 2 77.23 TTTCTTTTCTTCTTTTAAGAAAAACAAGGGAACTCCGAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGT:1 + chr3R 9229973 5' + X-element 52 1 63.37 ATTACAACACCGCAGTTTACCACCCAATCTTCGGCTGGCAAACTGCGGTGTTGTAATCGGATATAATTATGTAATAAAAAAGTTGAAATCGATTGTTTTAA:1 + chr2R 6588273 5' - Cr1a 4256 1 47.52 CAAATTAATTGAACGAAATGCTGGTTCTTATCCTCCTCTTCCCGATTTCCTTTTTCGCTGCTGCCGTTTTCCACTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 7753800 5' - Doc2-element 233 3 82.18 TATCTAAGCCGTAAATTCCTACATTGTTTATTTATTTTCTTCTGTATTGTTGCCAGCCATTTATAAACTACACAGTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGA:1 + chr3R 20396504 5' + I-element 3 1 76.24 CACTCACACTCCAGTTCCACCGCGTTAATTGGCGACATTGCACAAATCACACAAATGCTTTCAATTACATGGACAACGCCCAAAAAAGTATGCTACAA:1 + chr3L 13497612 5' - Rt1c 478 1 73.47 GTGTTAAATAGTTGTCAATAGTTGTTGTTGTGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2L 1195095 5' - hobo 2893 1 67.33 TAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 - chrX 21668077 5' + Tabor 6868 2 53.00 ACAGCACACACACACTCACACACTCTGCTGCATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAGGG:1 - chr3R 20397715 5' - 1360 308 1 65.35 TATTGCGTTATTACGCATATCAACGGACCGCAAATTCAACGACAACCGCCGAAATGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTC:1 - chr3L 6676410 5' + F-element 327 1 54.46 ATTTTGCGACATTTAATTAGGCGAGATAGAGCGCTTAGTAGCTGACTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3L 3635488 5' + roo 28 2 55.45 CACAACAAAGATGGATACCGCACAGCGACACTGAGAACTAAATTTTTTGGCCCAAATTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTT:1 - chr2L 16214602 5' - Doc 4553 1 55.45 AAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCT:1 + chr3L 11257359 5' + 1360 3385 2 48.51 GGATAAAAGTAAAGAGGCATAAGGTAAAGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr4 1234575 5' + 412 38 2 69.57 ACTCACCGACCAGTTGCCATAGACTGATTTCCCGTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTC:1 + chr2R 16396781 5' + X-element 47 1 60.40 TCTGTTTTGCCCCCAAATGGCAGTTGTTGTGCTGCTTCCTTTTTTGTAGCTGGGATAATACAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3L 21992821 5' + 412 7069 2 64.36 GTCGCCGCCGTATGACCATAGTGATAAGGTCCGCGCTCCGAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTAAATTATTTTTGATCAATTG:1 + chr3L 6834533 5' + 1360 256 1 60.40 AATGGCATTGAATTGCGTTCTTATTTATGAATACGCAATTCATTCCTTGAGCGTTAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCCCCA:1 - chr2R 8539316 5' + flea 4645 1 57.14 GAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAG:2 - chr3L 23678154 5' + Osvaldo 18 1 71.00 GATAAGTTTTCGCTTCTGTATCTATTTATCCTACAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chr3R 19657790 5' - P-element 2843 1 35.64 CGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 - chr2R 5651898 5' + Tirant 35 2 58.42 TATTTAATTTATTTTTTTTTCCTTTGACTGCCGGTACATCCTTATCTCGGCTGCCTCGTTGCTGTTCTTTTTATTATTTATTATTTTATTATTTTTTTTTT:1 + chrX 4741562 5' - gypsy11 3934 2 64.36 AAACTTTGCGGGATTTATAATTGTCTGGATATTAGGATCTGCTATAGCTACATAGGTTCTTATCATCTAATTTTATAATGCAGCGCTTGTAAGACGCCGCA:1 + chr2R 5021446 5' - rooA 234 2 52.48 ATTTCTTGTTGAATTCAAAACTCATTTTTATTTTATTGGGTGAGGTTCGGGCACAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr2L 1195034 5' + hobo 23 1 48.51 GGAAAACGAGAACAATTAAACGAACAATTGCACGCACTAGCGCGCATTTCACTTGGCTGTTTGAAAGTTGGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr3L 13674610 5' - hobo 2933 1 73.27 TGCGTTTACGTTTTGCTGTCATTGTCACGGGATTGTGGATTGATGGCTTAGATTAAAAATACCCGCATAGCCGCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr3R 10494710 5' - P-element 2886 2 46.53 TGGAGGTCTGAAATCGAATAGGTCTGCTCACTGCAAAAATATTGACTCAACTGCAGCATTTTTGTTGTGGGGGGTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGC:1 - chr2L 13064053 5' - F-element 267 1 75.25 AGAGAGAAAAAAAATATTTTCAACTCATTTCCTAGTCTTTGCACATCGCCGCCTTGAATAGTTACTTTTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chr3R 2933636 5' + F-element 26 1 67.33 ATATAATTCTAGTTGCGGAGCTATAACTATGAATTGAGAGACAAATTAGAATTAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGATAATTCGAGCGACGATTT:1 + chr3L 12913775 5' + 1360 2985 1 64.36 AAGCAAATCATAATAAAATAACATGTCCTTCATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTA:1 - chr3L 14327708 5' + Bica 225 1 69.00 GGTCGATTTCCCCTTATCATATGTCACTGCCCAAATCGAGCGAGATAAAGCGAAAACCGACAAAGAAAGCACAGGGAGAGGAGCTGGAAGAGAAGCCAAG:1 + chr2R 17640022 5' + G6 479 1 62.00 TGCAGAATACAGGCATGGTCACAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAACATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 - chrX 21668287 5' + 412 52 2 74.26 CAAATTTTCCACCCCACAACACTCCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAG:1 - chrX 16518730 5' + accord 104 2 72.73 CATTTAAGTGTGATGGTGACAATTTTGAGCTGTTAGTGGGCGTGGGAGAAGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTT:1 + chr3R 3625222 5' - INE-1 167 1 66.34 CAACCACATCGTGTTCTCTTCGAGTTTCCTGACCATTAGATACCCAACCAATCTGGAATCTGCCTGCCTAGTCACAACGTTCTAGCTTTTATAGTGCC:1 - chr2L 21717967 5' - INE-1 157 1 52.04 TAATAAAAACATTATTGGAACAAACACCCGATGCGGGACGTACAAAAAAGTGTGGCAGCACTTTAACGTTATGATATTATATTTCGTGCACTGAGCCAACT:1 + chrX 12183620 5' - Gypsy6A_LTR 28 1 56.44 GAGGGCTAGAGCCTGCGTAAGTAACTATATATCGATTGTAGTCTTAATAAAATAATACCCCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3R 16487410 5' - roo 393 1 62.38 TATGTCTATTAATTAATTAAATTTACTTACAGTTCGCATTTCTGTATAATGTTATCAAAATATCTTTTACTTTAGCATTATTATTGCTTCTTCCGTCGAAA:1 + chr3L 23278142 5' - invader2 470 1 75.25 GGACTCTGGCTTCCAAGCAGGAGCTGCATAACTCCCACCTCCACAATCCCGGAAAATGCCACTCCAAACTACCTCAGTATCACCCTCGATAGATGACTTAC:1 - chr2R 4933471 5' + G7 700 1 61.39 ACGTATTACGAAAATTCAACAACAAATGATCATACATGGAATCATACATATATATAGATAATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:1 + chr2R 10531108 5' - I-element 5320 1 65.35 AAACATTGCAATGACTGAAACTCTTGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:2 + chr3L 3986403 5' + jockey 62 1 75.25 AAACCTCTGACATTTTCGCCACCAAAGAGTGGCGAAATAGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 + chr2L 7463516 5' - blood 340 2 60.40 TCACGTTCGAGTAATTCGCAAATCCCACAAAAGTGTCACAAGGCATTGCTGTTTTCATAGTCCGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCA:1 - chr3L 20945458 5' - roo 123 2 74.26 AACTGGCCTTTGCCGAAAGGTAAACGATATTTTAAATATTAAAATGGTTTAATGCTAGAGTCGAGTTTCCCGACTATCAAATACCCGTTACTGAGCTAGTG:1 - chr3R 26145258 5' - INE-1 541 1 55.45 ATATGTATAGAAGCATAAATATTTAGGCGAATTGATGGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr3L 4637350 5' + hobo 39 1 60.40 CAATCGAGAATATACACAACTTTCATTCAGAACAGAAAGGCCTTTAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGC:1 - chr2L 16758818 5' + Doc 4463 1 55.45 GGGAATATGTATGGTGTCTTAGAAGGCGACATAAATTATTGCTTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr2R 10777875 5' + pogo 31 1 61.39 AACGGTGTCCTCCGTCTGCCAAAACCCAGTTCTTTTTTTGCCAGCAAGGATTTGCCTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - 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frogger 1991 1 69.31 AAGCGGTAAGCATGCATTTAATCTACTGTATTAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGGGTTATGTTATTTCCAG:1 - chr2R 9285586 5' - gypsy 440 2 45.54 ATGCCATCAAGCCTCAAAGGACCGGGTATGCTTGCATAATTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACA:1 + chr2L 5659442 5' + jockey 4571 1 60.40 ACACGAAAATAAATACCCAAACGGCACCTTGGGTTCTGTAACTCATCGCATCTTCATAGCCAAAAAGCAACATCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 + chr2L 20631420 5' + blood 5 2 53.47 GGGTAGGTGAGGTATTTTGAAATTGCTTTTGCTGTTGTTAAAAGGGTGGAGCCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACAT:1 + chrX 9397723 5' + Circe 7210 1 67.33 AAGCAAATCGGCTGTTGGCATCAAAGCAGTGCATAAAATAGGGAAGGGGCGCCGCAATAATGGCGGTCGATCGATAGGGCAGTATGTAGGGTAAAGCCATT:1 + chr2L 23071190 5' - G5A 160 1 79.21 TGCAACAACATTGCGTATAATTAAACGCACGCATGCCTTCTTTTCATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chr3L 10035716 5' + jockey 63 1 55.45 ATTAGAGCTCGGCCTACTGATTTCTGCAGTTGTTGTAGATGTACTATTACAAGTACCACTTGTATATGTTATTGTCGTAGAGATACCTTTTCTCTACAGAC:1 + chr2R 4978721 5' - Gypsy12A_LTR 2146 1 79.21 ATGCGTCATAAAAATGTGACGCAAACTTGTTACTTTTGTATGTAAGATATGATTTAAAGATGGACGCGGCAAGGTAGTTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAG:1 + chr3R 5026645 5' - Chouto 432 1 77.23 ACATTCGTAGAACTAGTTTGGTTCTCTCCTCCTCTCGCAGCTACAATGTGAGCTGTATGAATCGTGACGCGAGTCCCAGTGTGACTAAATTGTCTTCCTC:1 + chrX 16836169 5' - Tc3 1290 1 76.00 ATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCACATTTAATTAAGTCATTTGACTTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATA:1 - chr3R 22232287 5' + 1360 476 1 53.47 AAAGTGGGCGCCGGCTGAGGTTGGTATGAGGGGAGGGGGGGCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCCCGAATTTTTG:1 - chrX 2798538 5' + 1360 82 1 58.02 GGAACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTC:3 + chr3L 17215712 5' + Ivk 24 1 55.45 GCCTAAAACCCCTCGTAAAATGATAAAATATCCAAACTAAATGAAATTTACGAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCT:1 - chrX 8411962 5' + Ivk 338 1 55.45 ATGGTTGAATGGCCATGGCCTGGATGTGTGCCCCTTGCTAGTGCTTGTAAGTGTGTTAGTGCTTGTGTGCCAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3L 10421770 5' - accord 7030 2 67.74 AATACGAATTTGTTTTGTGGTGTATACAAAACATCCGTGCCTCGCACGCATATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr2R 10191693 5' + 297 19 2 62.38 GCAATCCCAACCAAGTCGAATATAACTAATTAAGTTCCGTTCTTTGGTCCCTCGGCACTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGATGCGATGAATCAAA:1 - chr3L 2856573 5' - BS 5077 1 53.47 ATTCCTGTTGCCGATGCAATTGTAGCCTGTTGACCTTAAATGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTT:1 - chr2R 4550622 5' - Doc2-element 4401 1 60.40 GAGGGGCGTAGAGCCCAGAAATTGACAGACCTCGTGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 16396577 5' + 412 7095 2 65.35 CAATCCGATGGGTGAGGTGACCGTTGGTATGGGCTCAGCGTGCTCGAGGGGTTCCTCCAGGAGTATAAATGACTGCATCAGCAGGAGAGCAGCGGCAATA:1 - chrX 6580579 5' - G7 74 1 82.00 GATCTGTTATCCTACAGCGGCAAAACTGGAACCGGATCCCTGCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATCGCCCAG:1 + chr2R 14770751 5' + F-element 315 1 56.44 TTCGCTTTTATGGGCAATGGGAGCTGGGCTTTCACTTTCCTTTCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 + chrX 1524487 5' + jockey 4763 1 57.43 TTAGCCAAGCAAAACTATTGGGATTTTTGCCACTGATGCGGTGTGAAAATCACGTGTTGAAAATGGCGTGAATTCGTCGCCCGAACAGGGACCAACAAATA:1 + chr3R 22673804 5' + HMS-Beagle 271 2 55.45 CTCCGTAACAGTGGCGCCCTCTTGCTCGCCACACTTTAGAACAATTTTTTTTATTTATTTTATTACCCAATATCTACCGATATCCCAGAAAAATTATGAAA:1 - chr2L 20922972 5' + INE-1 508 1 72.28 AGCGGAGACAACAATAAGCGGTTGTCTAAACATGTATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr2R 20396319 5' + blood 37 2 63.37 GAAACTGTCTGGTTTTTGATTACTCCAATAAAGTTAAGGACAATGTAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAGATC:1 - chr3L 17582518 5' + I-element 5158 1 50.50 ACTTATTTCGACATTTAACAAACATTTAACAAACGTTGTAAATTATAGATTTAAATGTAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 + chrX 12401791 5' + I-element 19 1 49.50 GTAGAATAACTCTATAATCCCCTGTCTCATTCTCATTGCTCAGCTCGAACAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAA:1 - chr3L 12934809 5' - 1360 413 1 60.40 TTTGAAAGAAGTTATATTTTTTGCTGTTTTTATGCTTTCGATTTATTTATTTATTTTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGATTTTATACGGAGCTCGATGA:1 + chr3L 11027943 5' - Doc2-element 34 2 70.30 ATGTGTTTTTGTTATTCTCTGACGCACAAGCAGGGGGGAGAAAGACTGGTGCAGACAGAGAGAGACGCGAATGTGAATTAACAAACAAACAAAAATAT:1 + chr3L 8128488 5' + gypsy10 493 1 65.31 AACCAACCCAAAACAGCCCAAAGTCGGCAGTCACCACCACGTAGCACATAAGAATTCTTTTTCATATGTATGCACATAAGCATACGCAAGAGGCGCTCTCG:1 - 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chr3L 11625631 5' + roo 23 2 56.44 AGAATGGCTATGTCATGCAAGGCAGCCCTGGCGGCAGCACCAGCAGCGAGGGCAGCA:1 - chr3L 8435526 5' + G6 400 1 92.98 CTGCTCGAATATTGCACTGTTTGGAAAATTCCAGGTTGGAAAACAATTTGAAAGCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 22521801 5' - roo 9053 2 59.18 TGGCTGTGGATCAGCAGAGTGGCGGTGCTGCCGGGTGTGATGCCACTGCTTAAAATGGGGCTCGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATAT:1 - chrX 11552683 5' - gypsy4 6372 1 59.57 CCAACAAATTAGGTCGATTTCCCCTTATCATATGTCACTGCCCAAATCGAGCGAGATAAAGCGAAAACCGACAAAGAAAGCACAGGGAGAGGAGCTGGAAG:1 + chr2R 17640011 5' + G6 469 1 51.49 CTAACAATTAAGTGGCAAGTATCGAGAGAGCGTTTACATACTTGTGCCACAAAAGAAAGGGATTCGCCAAAACACCTGGACAACCCTAAAAACCCCCTCGA:1 + chrX 6144000 5' + BS 4956 1 63.37 ACTCCGGGCGATGGCTTTGGGCTCAGTTTGGATTCGGAGCCAACGAGCGCAAGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACA:1 + chrX 12015466 5' + accord 7036 2 58.16 GGAAAGACAATTTTGACCGTTCAAAAATCAATTAAATATAAACATACATTTCTTTCGGACATATGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGT:1 - chr2L 22208797 5' - gypsy 449 2 66.34 AACCTTCTTTCAAATGAAGTGCATAAATGATGTGTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 - chr2L 13711446 5' - hobo 2898 1 71.29 AGTAAGCGATTAATATTGCATTGATATAGCCCAGTTTTACAAAAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAATTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chrX 20989380 5' + pogo 27 1 54.46 AAATTCCACAGATTTTAAGTTGCGCTGGAATTCAAATTGCACATGTTTAATTTAAATCCCGAACTCATTAAAGCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr2R 21860462 5' + roo 3 2 77.23 ATTGCATTGGTTTTCTTTGCATACTTTTTGGGGCAAAGTGTTGATTGAGTGTGCGGTATATTTAAGAACTATCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3R 24764524 5' + jockey 18 1 68.32 TCTTTGGCCTTGAGCTCGTTGGGCGGAATGGGTCCAACTCCGGAGATGTGCTGGTAGCTACCGGTGCTTCCTACTCCGCTGTTGCTGCTGATGGAGGCTGC:1 - chrX 17776531 5' - TART-B 144 2 74.26 ATGGATGAACAATAACGTAACAAGACTTGAGCAAGTTGCGTTAAGCAAATTAGAAAGGAAATTCGCTCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCT:1 + chrX 9532182 5' + 1360 3227 1 70.30 CCGGATGTCCAAGAGCGGTGCTACGAAGAGCTACAAGACCTTCCCGAGGATATTGATGAAGTCAGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2L 5269780 5' - hobo 2927 1 66.34 TTTTTCGTATCTTTCGGGTAAATGGTAAATCTTGGATCAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTT:1 - chrX 3358765 5' - roo 9036 1 61.39 AGCAATGTGCGCTCAACAAAATACGTCATTATTTCTGACTAAAAAACTAAATTTATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chrX 7697643 5' - pogo 2082 1 58.42 CATGTCCTCATCACCTTTTACTATTTGACCACTCTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTACTGAAGGGCCACATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCATAGG:1 - chr2L 15939309 5' + Gypsy12A_LTR 1940 1 67.33 GCAGGTGAGCAGTGATAGAGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGT:1 - chr3R 10495638 5' - F-element 280 1 81.00 TTTTTTAATTTGCCTGCCCATCTATCTTGGCTTTTTCAGCTCTGTAATTGTGCAACAAAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAA:1 - chrX 7247143 5' - I-element 5016 1 64.29 GAATGATTTTTAAACATTTGCTAAGTGAACAGAGAAGATGGGGGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 + chr2L 7970949 5' - blood 374 2 74.26 TATTCAGTAGCAGCTCTGTGCGGAAATTGTGGCGAGCGGGGGAGCGGGGAAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGTAGAG:1 - chrX 2676097 5' - Doc 397 1 61.00 CTCTGGTAATAGTTCGATGGTCATAGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 14285054 5' + roo 50 2 78.22 GTGAGGCACCATAAAGCAAATGTGAGCCTTGGCCGAAGCATAAAAAATATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 - chr3L 13264544 5' + Burdock 19 2 57.43 CATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCA:1 - chrX 22824222 5' - Gypsy12A_LTR 2247 1 46.53 GGGGGCGTGGTGGGGCGGATGATTGGCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCG:1 - chr3L 19360027 5' - jockey 450 1 79.21 ATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGT:1 - chr3R 11151869 5' + mdg3 5306 2 78.22 CGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAAC:1 - chr3L 23678149 5' + Osvaldo 24 1 76.24 TGTTGTTGCTACTACGGCTGCTGCTGCTCTTCCTGTTGTCCATTGTTGCTTTTGCTTTTGGTTCGGGAGCCATCGCCGTTGTTGTTGTTGTGGCTGC:1 + chr3R 6087664 5' - TART-A 124 2 75.26 TTGAAAACAGCAACCGCACAAAAACAAAACAGGCATTTGAACATAACAAGCCAGCAATTAGT:1 + chr3R 6123567 5' + I-element 5215 1 67.74 TTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTG:1 + chr2L 23299998 5' + invader4 365 1 77.23 GCTGGCTGCCTGGCTGGCAGCCTTTTCAGTTTCCCCCTTATCCGCCTGACAACTTGTGACAATCTGTCTCTCACTCATAATTATTATTATTATTATCATTA:1 - 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invader2 4786 1 58.42 ACTGCCCCTGACCATCAGGCTCTTATCCCTGGCCGGCTAGACAGCAGGATCGGCCTCTTCATTCCGTGCACGCTCCAGAAACGGTCCATCCGAACACCGTG:1 - chr3L 10913681 5' - Max-element 8131 1 77.23 AACTTTTAAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTTTATTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAA:1 - chr2R 5438502 5' - HeT-A 6044 1 76.24 TGTGGTTTTGTATTCCGCTCTTTTTTGCGTGGTCTATGTTCCATGTTTTTAGGCTCCTTCTTTTCCGTTTTTCTGTTCCCTTTTCTATATCGCGTCTATCT:1 - chrX 12719136 5' + Cr1a 4360 1 76.24 GCTGCATGGAAACGCGCGAAAATAAAATAGCTGGCGGTGGGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 + chr2L 12908362 5' - hobo 2903 1 58.42 CAACTTTTGTTACTAGCGTATGACTTTAAGCGTGTATTACTGTAAGCCTATTAAGCTGAGTCTTAGAGGCTGTTCCCCACACATGGATGGCGTAGGTCAGT:1 + chr3R 5856406 5' - G5A 2427 1 66.34 TTTTCGCACAGTTCTTTATTGCTATTTTGGTTGTAGCTCTATCCCTTAACACCTCAGCTGCAGTGTTGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3R 24229061 5' + 1360 9 2 71.29 GTGGTCCATGAATGCAAACCAATTTTATGAATGACAGCGGAATGAAATTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATG:1 + chr3R 8379922 5' + copia 4696 1 61.39 GATCGTCAGATACTCACTTTGGCAAATTTCGCATTTGATTTTTTCCTACACTTAAACGCAATCAATTTTATTGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATAT:1 + chrX 9214032 5' - Quasimodo 410 2 75.25 GATCGACTTTCAATGGCTTCTAAAGTGCGTCGCAGCTGGAGCTGAACCCATTAGGTGTTTTTGTATTCATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:2 - chr2L 7504964 5' - roo 401 1 63.37 AGGCAGAAATTATTCTTGTTCGCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACA:1 - chrX 7334439 5' + Tirant 8210 2 78.22 GTTCGATGTAGGTGCTGATTGTTCGGCTCGAAAAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGC:1 + chr3L 2996884 5' + hobo 360 1 67.33 AACGACCAGATGGTGCAAGGGGGCGAATTTATTTATTTCGCCGTTTCCAATTGAGAGCTTAAAAGTTTATTGCTCAGAAAGACAGCATATGGTACTTATTA:1 - chr3R 26465162 5' - Tc1 102 1 52.48 GCCGGAGACAAGCCTTTTACACGTGATACTGATATATATATAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr2L 12022246 5' + 297 27 2 66.67 CCCCCTTGATGCTGCCTAATCAACTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGAC:1 - chrX 16991817 5' + Doc 454 1 77.00 CCGGAAAAGCGGAAAATGGGAAAAGGCCAGCACAGGTGTCTCTGACAAAGCCTAGCGGTCTACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGG:1 - chrX 3005256 5' + invader2 4988 2 72.73 CAGAAACTCAATTTGTAAAACGGAATTTTATTAGGTCGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGC:1 + chr2L 14074918 5' + jockey 220 1 76.24 GTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGA:1 - chr3R 16611515 5' - Stalker2 7604 2 71.29 GAACAGTCCTTTATAAGTAGAATGTTTTTTAATATGCAGCGAAAGTTTGTTGACCCATCTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTGC:1 + chr2R 5746509 5' + INE-1 348 1 67.33 TAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGG:1 + chr3R 4973106 5' - 1360 7 2 46.53 CTGAAGTGCCGACATTATAATTGAAACAAAATTTCCAAGAAATTATTAAGGAACTCAATAAGTTTTATAAGCTATCCCCTTAAATAATTTTTTTTTGACTT:1 - chr3L 14599191 5' - transib1 35 1 43.56 TGTTAAATATGTAAACTTGATATTTATGAGTAAGCAATTTTATAATCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr3L 4491597 5' + pogo 28 1 61.39 AGAACGAATAGACATTTTAAAAATTTGTAATAAGAGTCATTATAATTGACAAACCGACAAACATTAGATTTATCAGTCGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTT:1 - chr2L 7533877 5' + blood 7177 2 55.00 ACATTGAGTGCTAAACGCATGATCCAAAAATAAATTCGCGTGTACTTATTGTAGGGGTATTATATATCCTCCTAGTTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAG:1 - chr3L 15074594 5' - invader2 5073 2 53.47 GCAGTGCCGTTGGTGGGCTAAGAACGTCTCCTTCCGCCGACTTCCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 - 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F-element 213 1 69.31 TTGTCTCGCTCGTTGATGCCGTGCCATATTTCGTAGGAGCTCTTCGTCACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACG:1 + chr3L 15562200 5' + F-element 238 1 53.47 TCTCTGACAGGGTTTGGGATCTTCAATCGGTTGGTGTTACGTGGGTATTTATTGCTTCGATGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTCGTGCAGGGTTGTGTTC:1 + chr3L 18136186 5' - BS3 1417 1 55.45 CTGACCACGACATTTGATTCGCTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTAAAAGCGGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCA:1 - chr2R 7169580 5' + FB 56 1 76.24 TAAGTGCAAACTACAAACAAGCTATAACAAGGCAAATACATCAAGGTGTTTGCATCAGAGAACTGCAATGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chrX 12276757 5' + hobo 24 1 54.46 ATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGTTATTCTAGGG:1 - chr3L 11257375 5' + 1360 3382 2 47.52 TTATGAATGCGAAATACTTTGGCTGACATTTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACCTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chr2R 16980064 5' - opus 458 2 68.32 GTCTGTCAAATGTATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTG:1 + chr3L 21912248 5' + Bari1 19 1 61.39 ATCCCAAATTCAAAGTTTAAAACCCCGAAGCAACGCATTTATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAAT:1 - chr3L 21912352 5' - Bari1 1693 1 65.35 AGCAAAGCGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCA:1 - chr3R 3346231 5' + P-element 156 1 22.77 TGGAACGTAGGCGAAAAGTGGGACACCAACAGCTGGCCACAGAGCAAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chr3L 18095735 5' - I-element 5328 1 54.46 AAGAAAACTTATTCAAAGTGCCACAGGAATCTAGTCCTGGCGCAGCTTATTCGCTTTCTCCTTGCTTGTACAGATACCTTTTCGCTACAGACATTAATAAA:1 + chr2L 4111146 5' - Gypsy12A_LTR 2137 1 64.36 GCGATTTTATGATGTCAGAACGTCAAAACAAGTTAAAAATCATTGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2R 15451629 5' + roo 31 2 57.43 CTAATCGAAAATTTGTATTTTGAACCGTCCAAGAGCCCTACAAGATTTGAAAACCAACATCCAAGAAGAAATTGCCATCATAACACCTGCAATGCTAACAA:1 - chr4 1083279 5' + mariner2 692 1 78.22 AAGACTCGACCTTACCAAAAATATACTAGAGACTAGTATGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 - chrX 21945921 5' + F-element 50 1 66.34 GAATATTTATTTCATCAACTTGTTTTAACTCTTTTTTACTTAAAAGCAATGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTT:1 - 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HMS-Beagle 233 2 66.34 TTTGTTTTTCGTATCTTCATTTTGTTTTTGTTTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCT:1 + chr3R 15647594 5' - I-element 5121 1 78.22 ATTAGTAAGCGCTGCTGCTGCCAAACGGCTACCCCACACATTGGTTCCCGAAAGAAAGGGCAGACTAATCCGTGGTAGTAGAACACGTTTTATTCTGGAAG:1 - chr2R 7421829 5' - aurora-element 6 1 79.21 GCGTGTGTGTAGGTGCAGACGACAATGATGACTAAAGGAAAAGCAGCAAAAACAACAACTAATGGACGGCCAGAACGTGAACCAAAGCGGAGGATGGGCAT:1 - chr3L 22176742 5' + TART-A 12956 2 60.40 GGGGCACAGAAATCAAGCAGCAAATTCGCGGCAAGGTGAGTGCTATGAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3R 14882910 5' + pogo 26 1 54.46 GAATAGCACCAAGTTACGGAACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGC:1 + chr3L 17215695 5' + Ivk 7 1 72.28 TTGTTAACGGGGTTTTTAAAAGAGTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTAAAA:1 - chr2L 18773349 5' - Max-element 246 2 77.23 ACGCACGCATGCCTTCTTTTCATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chr3L 10035740 5' + jockey 86 1 79.00 CCGATGGACCAACAAAACCTATCACACACACACACACACACACACACACTTTCA:1 - 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chr3R 5392350 5' - 412 456 2 62.38 TGCTAATTAATTAGTCCACTCCTCGTTACTCCGGACCACTCGACTCGAGTGGCGTTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chrX 13587914 5' + hobo 18 1 60.20 TAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTT:1 + chr3L 17215727 5' + Ivk 39 1 59.41 AAAAAAAAATGGTTTACAAGAATTTGGTATAAATAGCCCCAAAATTGTCAGATGAGAGACAAATTAGAATTAAACATAAATATGAATGTGTAAACGGTAGC:1 + chr2R 2832599 5' + 1360 2967 1 60.40 ATCTTCCTTCGCCAGGATTTCGGCATCGAAGCGGGTACAACAATCAATAAAATTGAAGATTTGCCTTTTTCGCCCAAGTGACACAGCTGGTGGCCTCCATT:1 - chr3R 19516745 5' + G6 1569 1 75.25 GTCGAGATATTAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGAAGTACTTTTATTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTT:1 + chr3R 14656085 5' - GATE 436 1 56.44 GAATGCAGCTCGAAAACCCTCGAAACACACACAGGCACACACACCTCGCACATACACACACACACAC:1 - chr3R 18960749 5' - Stalker 446 1 59.70 TTTTTAAACACAATTTTCTTTAATCTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTAT:1 - chrX 4413724 5' + Cr1a 498 1 73.40 GAATATCAAAAATAAATTGATTTTCAATGTTACAATTAACTTAATTTTATTCTAATTTAGTTTATAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGA:1 + chr3L 21926663 5' + accord 7351 2 73.27 TTTAGGTAAGCTGTTGCATGACCTTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGNNNAAATGCGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGA:1 + chr2L 21364973 5' - baggins 5092 1 71.58 TGGGATCAGCTGAATTGCCAGATTATACTGGTTAGTGTGGAAGAATCTCTGATTTATTATGATGATATTCGATGGGGGTTTTGCCTACTTATCATGTCTAA:1 - chrX 8355968 5' - rooA 7251 2 80.20 TGCATATATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCG:1 + chr3L 15452880 5' + accord 46 2 69.31 AGTAATAAACTTGTATGTACATATGCCGCACCAATCCAATCAAACTCATATAAATATGTACATACACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chr2L 2912123 5' + 297 4 2 76.00 TTGTGTGGCAATCTGCTATTGGTTATGACCATCAAAAGTAACAGCGTGTCGATGCCTTATTGATTATTATTTCATAAACTTACAAGCTCAAATTTAATCTA:1 - chr3R 3963817 5' + gypsy7 175 2 67.33 CCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTTTTTCGAGAGCGAGAG:1 - chr2R 5531165 5' + 1360 96 1 68.32 CAGCAAACAATTTCCGAGCCGCAAAGGCGCAAAAAGCAACGCACCACGCCACATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr3R 17508174 5' + jockey 32 1 53.47 AAATTGGAATTTCACGTCCGGAACAAGCTTCTTTTTTGCAGCCAAATGTTTCTGCACCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 + chr3L 21967007 5' + Doc 23 1 57.43 GCTACAACAAATTGGGCTGGCAAACAAGTGTGCCTGTGTGCGTTTGTGTTCCGCTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr3R 18449010 5' - hobo 2914 1 52.48 TAAAAAAAATAAAAAATATAATATTTCTTAAGAGGGATATTGTTAAATTTTTGGGGATTGTTCAAGTTACGTGGTTTGGACTGTCTCCCGCTCTCCGCTCC:1 + chr2L 4177207 5' + GATE 31 2 43.56 GGAGCTGAAAAGAATCTGAAAGAAGTGATCAAAGGAGTGTGTGTTGTGGACTAGAAGTGATTGAATTTTAATTTCTTGCTAAAGAGCCGATGTTGCGAAAC:1 + chr3L 14707761 5' - invader2 4958 2 68.32 CCGCCCTCTCACGACAACATCTGCAAACAGTCCTCCAAGTACCATATTGTAAACGACTACCTGTACAAGCCCATCAATCTTTTGGATGCACCAAATGTAAA:1 - chr2R 15545249 5' + transib3 2489 1 72.28 GGACGTGTTAATTAGGTCCACTCGTGCCGCATTTACACTCCACTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - chr2L 17283527 5' - hobo 2904 1 56.44 TGAGCCGAGTTTGCCGCAGTCCTTAGCTTAGCGTTATGTTATGGAGATTAGGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTTAGTTATTATCACTAGCCTTGTGGC:1 + chr3L 17711924 5' - gypsy 328 2 62.38 GTTTACTTCATTATATCCAGTTTCAGCCCTACATGGGGTTTATCAATCAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATC:1 + chr2L 15842835 5' - Idefix 7249 2 54.46 GGCCAATAAAACCAACGAGCCGCTCCAAAATAGGCTGCATGGAAACGCGCGAAAATAAAATAGCTGGCGGTGGGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr2L 12908329 5' - hobo 2936 1 82.18 AAGCGATTGAGTACGAACAACAATAATATTTGCCCCACAAACATGGGAGGGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr2R 7882032 5' + 412 7079 2 53.47 TCTGTCTGTATAGTTGAATGAGCCCTGGAGTGGCGACATACTGTCTGGCAGGATCCCGATCTCATGACCAACTGGTTCGAGTGTAATAAACCAATATATGC:1 + chr3L 14152060 5' - blood 379 1 77.23 TGCACATTGTGCGATGCACGCACTTTAGCCCGCAACTTGGACAGGGGCATTAGCGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3L 21782035 5' + roo 8685 2 58.42 TATGCGAATGTGTGGTTTGCGCCTTGAACATTTTCCACACACCTGTCAAGACTGAACAGAACCCTGGGTCCTACCGGCCAATCAGTCTCCTCCCTTCGATC:1 + chrX 22732825 5' + BS3 442 1 63.37 TCTATGGAAATTGTACATGCAATATTCGGAATTGAAATGTTAGTTAGTAAACTCCACTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTAT:1 + chr3R 13122828 5' + Transpac 4941 2 57.43 TATAACAAAAAGAAAAATCACCGAAATAAAGGCATCAAAAATAAAACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAA:1 - chr3R 26551938 5' + I-element 442 1 62.38 AATAGCACCAAGTTACGGAACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCG:2 + chr3L 17215696 5' + Ivk 8 1 71.29 GAATGCCCGCGTGGAGACACCCAAGAAGGTTGAGGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATGG:1 + chr3R 6619320 5' - Doc 330 1 64.00 GCGTTAAAGAGTGATGGTGCGGGGGACGGAAAAAGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTT:1 + chr2R 11601655 5' + hobo 2637 1 66.34 TTAGGCATGAGGCCATACAAGCAATGGTACTGCTAGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTG:1 - chr3R 14369761 5' + opus 7445 2 65.35 CCCGCCTTTTATTTAAACTTCACCATCTTTCGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr3L 26132188 5' + Doc 51 1 70.30 AAAAGGGATGCGCTCACATTCGCATGGCTATTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chr2R 17345918 5' - hobo 2932 1 72.28 TGGATGTACACTGCTCTCGATTGGAGCCAATAAGCCAGCACTCCTGCAGCTTCAATTGGCGTTGCTCCATTTGCACTTTGCCAACGTCATCGCCAAACAAA:2 + chr2L 22189186 5' + BS3 221 1 78.22 ATGCCTCAGCAAATATTTACTAATTCGTAGACAAATTTTCGAAGTCGAAAGGAAAAACTTTTGTCCTTTTGTGAACACCTACCAGTACTTAGGCAGTCTAA:1 - chr3R 31911604 5' + baggins 5033 1 60.40 GAAATTGTACAATTGATCTTTGACAGTTATTTCAGTTTGAATCATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:1 + chrX 8522848 5' - 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Quasimodo 196 2 58.42 CGAAATTTAAGTAAAAAAGGCATTATAATTAATTAAAAAATAACCTACAATCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCA:1 - chr2L 12802261 5' + invader3 5213 2 51.00 AGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAA:1 - chr3L 27415309 5' + transib2 14 1 62.37 GGCAACTACCTCAATAGATTTGATGGTGATGCCGGCGATTCGGCCAACATACGTGGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTT:1 - chr3R 20789026 5' + 1360 21 1 65.35 AAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATC:2 + chr3L 17215735 5' + Ivk 47 1 67.33 TTTTTGCTTGAGGCCAAGCTTAAACTGTAAATTGGCCGTAATATCTTTAATTGAAAAGGTAAACGGCAAAATATACCTCTCGCGTGTAAATATAATTGCAC:1 + chr2R 5496704 5' - Tc1-2 107 1 51.49 GCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTTCGCATCTTGTTATTCTAGGGTC:1 + chr3R 4973108 5' + 1360 3384 2 46.53 AGGAGATGTGTGTGTGCTTATGATGGTTGTATTTTGGCTTTTTGTTTGGGCCACTACCAGTGGCAGCGAGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATG:1 + chrX 12454111 5' - Idefix 238 2 68.32 GCGTGTAGCACTTATACTCATGCATATGTATTAGGTACATATAGGAATAAACTTAAACATTTTTTGATTTGCTTGGCGGCGGTTATGTTCGCCATGATTTT:1 - chr3R 23726715 5' - TART-B 10313 1 60.40 CGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTG:1 + chr3L 23456268 5' - gtwin 7363 2 49.50 TAGTTTTTTTTGTTGATAAGTCAACGACGGCATTCTCAGGATTCTTTGGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTA:1 - chr2R 3522208 5' + Cr1a 4037 1 52.48 CTTTGCATATTAAATTGAGTAATGACACGATCCGAAACACTTAGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 - chr2R 9129718 5' + P-element 33 1 46.53 CATTAGGAAGAGAATATTATTGGATTAAACGATCATTACTTCTGGCATTAAGAAATAAAATACAAAACAAGAGCAGTCAAGTTCCCCGACTATCAGATACC:1 - chr3R 14707716 5' - INE-1 557 1 50.50 ACCCACACACATGCTTTTGTCTCTGCACATCACCCACGTGACTTGGCGTTATTAGATCCATTATTGTTTGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTC:1 - chr2R 19206373 5' - Doc 366 1 68.32 AAAGAATATGCTAAAAACGTTTATTTGCGATTTAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTA:1 + chrX 12151622 5' - diver 6061 2 68.32 TTCTCTGTCTGTTTTTTTTTTGCAATAAAACTCCAATTAAAAGTACGCTGTGATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr3L 5492379 5' + pogo 22 1 57.43 ATGGGCACCGCCGAATGTGAAAACCAATATCTGGACAAAGGGTTCGTGCATCATTTAGGATGTGAGCAGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATAATTAA:2 - chrX 22690837 5' + roo 8672 2 71.29 AAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr2R 17345995 5' + hobo 46 1 69.31 TAGCACCAAGTTACGGAACATTTGAAAAATAAATTAAAAATGCAACTCTATATGAAATATAAAAATCTTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGA:1 + chr3L 17215698 5' + Ivk 10 1 69.31 CAATAAAACGGAAGCTAAATCAATTAGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTA:1 + chr3R 25514127 5' - hopper 1368 1 73.27 TAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGT:1 + chr2L 14074968 5' + jockey 269 1 73.00 GTTGAGAGCGTGTGTGTGCGTGTGTATAAGAGTGCGAGCTGTAGATGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAGGTATAACTTGATT:1 - chrX 10256016 5' - Ivk 4909 1 55.45 CCACCACAGGCATCGCACCACCGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATT:1 + chr3R 28196718 5' - hopper2 1551 1 80.20 GCCCGAAGACTAAGTGACATGCCGACATGACGAAACGGGTGTTCAAAGTGTCAGGCAGAAATTCTGATGTTCAATGAAA:1 + chr3R 31037414 5' - HB 1435 1 74.68 GAGCCCGCCTTTTGATTTGTGCGTCAATGACAGGCGGGGGGTAATGGGTGCTGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTG:1 - chr3R 22964011 5' - F-element 424 1 53.47 CTTGATGCGTGGCTGTTAATTAACACTAGACAGCACTTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATAAACGCACTGTTACCCATGCGG:1 - chrX 13641411 5' - jockey 4965 1 61.62 AAAATTAAAAAAAGTGAAATGTTTGATTTTCGGAAATTTTCGTACTGGAGGTGGGCAAAATGAAAAATTAATTGGTGGGCAAAAATGGGCAAACGATTCC:1 + chr3L 10356836 5' - FB 52 1 49.00 ACGATGTAGATCCCAGGGGGACAAGTAACCCAATTCCTGGTCTTAAAGGGTGCGAAACAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2R 10345592 5' + roo 17 2 62.00 TTGAATGAGCAAAATCTTCAATATCGGGCTCATACTGCAAGATACAGAAATGAATTAGATAACCATATAACGATGCTGGAACAGTCTTTATTTGTAATCCT:1 - chr3L 24008571 5' + Cr1a 4036 1 70.30 AGAGTGGTGTTCTTCCAGTTGACATGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATTATTATTATTCTAGTGTCTTTGGT:1 - chr3L 12787533 5' + Tc3 312 1 41.58 CAAACAAACGAATGGAATAAAATAATGCACATATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATA:1 - chr3R 13498164 5' - accord 180 2 76.71 ATTTTTACACATTTTTATTAGTCTTGTAAATAGTCATCGATTTGCAAAAAAAAAATTCTTGCCACGTCCACTGTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTACC:1 + chr2L 22063436 5' + INE-1 349 1 71.29 ATTTCATTGTTCGGGCTTACACAAAAGGCAAGAGAAGGGCGATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr2R 14744227 5' + roo 8700 2 63.37 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAG:1 + chr3R 17660025 5' - micropia 5410 2 55.45 CTTTGACTTGAACACATATACACGCACCAGTATCTCGCTTACACAGATTCACTACCTAAATCCCAATTCAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAA:1 - chr3R 17885334 5' - I-element 5009 1 53.19 AGATCTGGCATTTACTCTCAGTGTCTATGTGCGGAATTGTTTATATTGGATTGCACGTGCCTTTGACATGCCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCACC:1 + chr3R 19205553 5' + Quasimodo 7009 2 74.26 CGCGAGACAGAAGTGAAGCGCGATTTTATGATGTCAGAACGTCAAAACAAGTTAAAAATCATTGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2R 15451648 5' + roo 8674 2 66.67 ATAAAGGACGAAAAAGCATTCCACTCTTCACATCCGCACACATATACACATTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGAT:1 + chr3R 31428240 5' + 1360 3267 1 64.36 TTACAACACCGACACGGAAACAAAAGAACATGAAACAACCAAAAAAAACACATACAACTTGTACATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGA:1 - chr3L 13533272 5' + Idefix 74 2 51.04 GGTGTCTTAGAAGGCGACATAAATTATTGCTTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr2R 10777863 5' + pogo 43 1 73.27 TAGTGATCAAACAAAAGTACACTTTGTAAACTAATGCCTTTTCTAAGTACAACTTTAACCTTGGTGCTTCTTGGTGCCATACAAAAGTAATATTCCACAGA:1 + chr3R 22663233 5' - transib4 405 1 54.46 GAACTGGAACTGGGGAACAACACAAAAAAAAATTGATTAAAAGTCGTACAAAACTAATAATTATATGTGCTTTACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAG:1 + chrX 19080252 5' + Ivk 4 1 69.31 AAATTAATTGGCGAATCGCAGGGAAATCACATTAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATATCGGCCCGAAAATCGTC:1 - chr3L 21717630 5' + 1360 3187 1 68.32 GAACAGTAAAATCAGTCAACTGTTTTTGATATGTTTGTGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 - chr2L 10687747 5' - hobo 2900 1 64.36 GCCGATGCCCAGATGCTGTTGCATACTTTTGTGGATGCGCCGCTTGATTGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCC:1 - chr2R 17960501 5' - jockey 318 1 53.47 ATTCAAGGATTTCTTGTGAAGAAGTGTCGGATCCCCGAACGGAAATCCGACATTGAAGTGCAGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTC:1 + chr2R 8313195 5' - P-element 2810 1 69.31 CCCCAGCATCGCATCCCGCAACCCCCTCGCTCTCGGTGATATTTAAATCCTTGTTCCTACGCAGGGATAGCTGTAGCAGTTACTGAGATCTCGACGTTCAT:1 - chr3L 5014290 5' - INE-1 139 1 72.28 CCAGCTCTTTGCAAGCGCACATCCTCCACGACGATATGCGACGCCGCGGTTTAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 - chr2L 12018927 5' - 297 368 2 50.51 ATTTGGCATTGTCAAACGAATGATATGTATAAGAAAACTAACCAAGTCGCAAACCCCAGATTCAGTTCCCTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTA:1 - chrX 18195675 5' - BS 4916 1 74.26 TGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTA:1 - chr2L 23373495 5' - Tc1-2 1575 1 72.28 CAGCAGCAGAAGCAGCAACAACAACGACATCAGCAAGTCAAAACAAGAATTTTCTGTTTATCCAAAGACACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr3L 13872470 5' + 297 6584 2 97.03 TCTCTGATTGCTTTTCCTTATTGGGCGCTCTGCTCTTGGAATTATCTTTGTGCGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTCTCTAATTTAAAGAATGTAGAT:1 + chr3L 3759011 5' - TLD2_LTR 155 1 53.47 CATTTTTCATCCTTTAACGCTGATTAAAGTTCTTTGACCTCAAGGGTTGTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chrX 22443118 5' + jockey 33 1 53.47 GGTAAATTTAACAGAATTGCCAATTCATTTGCATAAGTTACGGACTGACATTACATTTCAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr3R 14906909 5' - hobo 2923 1 62.38 TCAGAGTTTCTTCGATCGCAGCTGATTCGGAATCCGAGTTTAACGGATTTTGCTCTGTTCTACATAGCCTCGGTTCGACGATGCGTTAGAGTGAGACAAAT:1 - chr3L 18988434 5' + invader6 4676 2 66.34 ACTTTTAATTTTTATCCTTAATTTGCTGGCCAATTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGT:1 + chr2L 18165990 5' - Tirant 8187 2 69.31 CCGCCTCAATCTGCCGGCGGTCACATAGGTAAGGTTAACTAAGCAGCGGGCACAGGGGTTAACTATTCCCCCCTCAAGTTGGAGGCCGCCCTCGGCCGACC:1 - chr3L 22422590 5' - gypsy3 6539 1 62.38 TTCAGCACCCCTGAAGGTTTATTTGTGACTGAACATCTTCTTGTCTTCTTACACTTTGATATTGTAAGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATGCCC:1 - chr2R 3152458 5' + diver2 4608 2 55.45 TAACGGGCGACGCCGACTGCGCTGCCTTGATCAGTCACTCACACAGATACAGATACTAAGCGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3R 18448919 5' + hobo 14 1 65.35 ATAATGCACACGAAAAGGAGACGAGGGGCAAGGAGCTATTTGATCATCATGATAATTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:2 + chrX 3358689 5' + roo 8685 2 57.43 GACGATGCTTAACTTCTGTAGGGATCTTATATTTGTAATTAAAAATCTGTTAGTGAAGAGTACTCTTTAAAACGTTTATATAAATTGAGAAATAAAATTAA:1 + chr3R 12844339 5' - INE-1 473 1 50.50 TATATGTAATGAACATTTGGATTTTTCCAATTGTGGTAGCTAAAAGCTTTTAAGAAGCGTGGGAATACTGAGGAGCGGAGCGTGCCTTTGCCGTTGAT:1 + chrX 13092632 5' + mariner2 151 1 61.22 AGCATACATTTTAGGGCGACGTGTCAATGTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr2L 16968468 5' - 1360 3344 1 75.25 CTAAGAAACGTCCGATACGGTCTCGATTTGAAGGTATATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr3L 12913607 5' - 1360 3350 1 67.33 GGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGT:2 - chr3R 1844854 5' + Cr1a 122 1 63.37 TTCCCACTAACTGAGCAGTTGACATCATGGCACCCCCGTGCATTCAGCCACATACTATAATATATATTGTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2R 12130694 5' + hobo 6 1 73.27 TATAAGTAGGTTCTCTGTGAATTTTCACAACTCATTTCATCAATTTGCACCAGGCCCAGAGCAGCTAAAGACGCTGTCAGGTACCCCGTTCAGCCCTAGTG:1 + chr3R 22826168 5' + Rt1b 4689 1 67.33 TTCTCCTCCTCTTTCTTGGCCTCTGTGGTTTATCGGGGTAAAGGTGTTAGTTTTGAACTAGCTTGAACGCAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr2R 22856499 5' + 1360 5 2 57.43 ATGCTTTTTGAGTAATGATCGCGGCTTGACCTTTGGCAATAGTCACACCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 9606274 5' + roo 30 2 58.42 AGTTGGTAATAAATCGCATAAATGACATTTAGCTAAGCCATATAATGGCGCCCAACTATAGTTTCAATATTGTCTTCTACTCAGTTCAAATCTTGTGACGA:1 - chr2R 15081964 5' + gypsy 7222 2 70.30 TTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCG:1 + chr2L 14074966 5' + jockey 268 1 71.29 AGCTGCCCGAGGGAGGACAACCCGCACCCTGACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTG:1 + chr2L 10831429 5' + accord 6915 2 69.31 AAAAACGTACTAAAGCTACCAGCTATGTACTTTAGGAATGAAATAAAAACAAGGCCTGATGGAAGAATTTTTAAAGAGGACTTGTTGTGTCCTGCCATTCA:1 + chr4 864961 5' - Q-element 419 2 57.43 CTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATC:1 + chr2L 14074965 5' + jockey 267 1 70.30 CATCGTAAAAACATGGGTTAGCCGGATCCAATCCGGTGATTCTCTTCAGGATTTGTCCCCCAGACAATCGTCGATAGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTT:1 - chrX 17213453 5' - hobo 449 1 82.18 GGATCTTCTTGGCCAGCTTGATGGCATTGTCCACTTGTTTCTTTAGGGACCACACCTTGCGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 17283928 5' + roo 16 2 61.39 GAAAAATAAGCGTAAAAAATTGAAGAGCTTCGTGGTACAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTT:1 - chr3L 8012101 5' - transib2 2786 1 63.37 CTCGCAGCCCCCAAAAAAGATTGCTCTAATGATCAGCTCACACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCGTACCATCGGCTACAGGAGAG:1 + chr3L 15224588 5' + Bica 4689 1 59.41 TGGAGGGCGATGCAATCGTCTCGTCTCGTAGGGAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCT:1 - chrX 19821282 5' + hobo 351 1 76.24 ATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATT:1 + chr2R 17402733 5' + invader4 2809 2 73.27 GCGGGAGGTTCAAGATCCCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr2L 128716 5' - P-element 2829 1 22.77 TAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTG:1 + chr2R 19209493 5' + Doc 91 1 75.25 CCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 + chr2R 19209463 5' + Doc 61 1 53.47 ACAGTGCAGTTACATACGGATACATATAGTACACATAGTCAGTACCTAAACAAGTTTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACC:1 + chr2R 6922115 5' - accord 220 2 61.39 ATCTTGTTTTTTAAATTTTTATTTGCTCCGTGTGTTTCCGCTAAATGCACAAGTGGAATCAGCCGCCTCGTAAACATTAAAGTAACCAAAAAAAAAGCAAA:1 + chr3R 23894169 5' - frogger 2181 1 54.46 CATTGTGAATACGCAGTAAAACGAATGAATACTCTAATTGAAAACAAAGAGAAGGTGTTATGCAGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 + chr3L 27264711 5' + P-element 12 1 65.35 ACAAAGTTTTACATAATTATTCAGTGCGTTGAACTGATCCAAGTGCAACAAAGACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chr2L 16818865 5' - pogo 2081 1 60.40 GTTGAATTCAAAACTCATTTTTATTTTATTGGGTGAGGTTCGGGCACAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr2L 1195041 5' + hobo 30 1 54.46 CAACCACCTCGAAAGTATAGGGTATGGTATTATTGCCGTCACAATGAAATTGTCTCATAGCTAAAGAGCAATATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 12913694 5' + 1360 4 2 75.25 AGCTTCAATGGTATGACAAATACAAATGCCTAGACATTACGATAGTAATCACTCTCCCTATTCCAAGTTCGGTGTCGTCTTTAGCTACCAGTACAGCAATT:1 + chrX 8847591 5' + Doc3-element 481 1 54.46 AAGTGGGCGTGACAGGCGGCAGGTGGGCTTGGGAGCGGGGACAAAGCATTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAG:1 - chr3L 10702304 5' + Rt1b 4794 1 76.77 CTTAATTGCACAGAAGAAAAATTAAGAGACAAATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - chr2R 3032557 5' + opus 38 4 70.30 GCCGGTCTGCCAATAAAACTCATTGTAATGATGCATTTATAAAAATGTTAAAATGTTTGCCTTCTTTGAGTTATCCTACCGACTGCGCCAGTTAAATAGTT:1 + chr3L 6311744 5' - McClintock 488 1 67.33 TGGTTGTTTGGATGTTAGCTGGTGGCACACTTTTGGCTGAATGGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 - chr3R 23080896 5' - 412 7512 2 59.41 TAGCAATATGATAAAATAAAATAATTATTAAAAATTCACGCCCATTTTCCCTGAGCATACCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGGTGGACAACGC:1 + chr2L 5307481 5' + Circe 199 2 64.36 TGTGGTGCCTGCTCCAGCCATGGACATTTGACAGGTGGGCAGGTTGGACAGTGCCTGTCGTGGTACCGGCTGGAGTGTATGTATATTGCCTCGAAGACAG:1 - chr2R 19020007 5' - BS3 1452 1 60.00 AGCTGATTTTAATCGCAACCAAAAGCCGCCCACTATTTTCCGGCCAAGTTCGTATACGCCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 - chr3L 7742794 5' + Doc 23 1 57.43 AAGGGGATCAGTTTGAAAAATTTGAAGTTCTTTGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr3L 16755829 5' - pogo 2061 1 69.31 TTAGCCCTAACAGTTACCAACTGTTTTTACACCCGTTGCTAATACGTAAGTAAAACGGTATACTAGATTCGTTAAAAAGTATGCAACAGGCAGAAGGAAGC:1 + chr2L 22719101 5' + INE-1 29 1 78.22 GGTGTTTTTGGCTCGGTTTTAGTATTCGGGCTCGAGGGTTTTCCGTGTTTTCCATACATGCCCAGCGCCAGAAAGCGCCATGCAATCACATATAATATGTG:1 + chr3R 21822089 5' - baggins 5237 1 63.37 CAACCGCGTCCAATTATAAGCAGTCAAAGGAATCCACATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCG:1 + chr2R 20624539 5' - blood 139 2 60.20 TTACTTTAGCATTACGGCGAATGGACCATTTGGAGGAAGTTGTCAGGTTCATGGCCCAGTGCCGCCACTCACATGTCGTTAAAGTCGAAATTTTAATGTCA:1 + chr3L 23278207 5' + transib2 32 1 71.29 TACAAGGGTTCCATTTGGTTGAGTTTTCCTTAAGCTTTAAGGACTTTTCCTTTTCCTGTCCGTTCTCTTCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGAG:1 + chr2R 21254383 5' - Ivk 5058 1 53.47 CCGAACTGCTGCAACTGGTGTGCCACTGCTAAGCCGGAGATCCCTGCCCCAATCACTATGACTTTGCCCAGCTTTTTGACGGTGAGCGCGCAATTCGCGTT:1 - chr3L 20227654 5' - Doc3-element 228 1 77.23 GAATTTGAACCATTAAACGCTGCCAAGCCCAATATATATATAAATCTTATATATATATGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCAC:1 - chr2L 5974550 5' - invader4 307 2 50.50 GTATGCATGCCATGCATGTACATAGTACGTATGTATGTGTATGTATACATGTCCATGTGCAGGTCTATAATACCAACACATAAACAAACAAATGCAAATTA:1 + chr2L 20244923 5' - S2 99 1 82.18 GTCCTTGGTGAAAGTGCTTATCGCTTTATGATGGGTTCTGTTCAGTTCACTTCGGTTTAGCACTGTTATCCTTTGGAGCTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr2L 10023613 5' + roo 1 2 78.22 GCTGCAGAAAAGGCCACGGCAAGAGCTATACGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCAATGGTAGACTAAACATCCGTCCCCT:1 + chr3L 17810459 5' + Idefix 184 1 74.26 CTGGGCTCCCGGCATCGGTGCGCTCCTTAATGTCAGCGGACATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 + chr2R 14204676 5' - opus 7467 2 60.40 TTGGGGCACCCTTGTCATTTACTTTTATTTTTTCTTTACGTGTATGGCTAAAAGCTAGCTGTCACACACACACACACACACACACACACACACACACTGGG:1 + chrX 5107935 5' + accord 7104 2 72.28 CGCGGCCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCTTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTA:1 - chrX 11025557 5' - hopper 1368 1 71.29 CTATTGAAGATTCCAGTGGCAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTTCACTGCTGCCTTGCGA:1 - chr3L 23481463 5' - flea 4869 1 78.22 CGTTGGGGGAAGGCGCGTTTAATTATCCAGCTTAAAGCAATTTCATTCATTCCGAAAATCAACTCAGGTGGCCAACTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTAT:1 - chr2R 10958250 5' + micropia 5108 4 76.24 AATATTGCACTGTTTGGAAAATTCCAGGTTGGAAAACAATTTGAAAGCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2R 22521808 5' - roo 9044 1 55.00 CAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACG:1 + chrX 15408750 5' + INE-1 535 1 82.18 GGCCGGAGTACCGCCCTTCCGGCTGCCGCCCTTTAGCACACCAGAGCTGCTAGTTCGTCGCACTCTTATGTTGCAACATTGTCGGCGGAAACAGCTCAGCA:1 + chr2R 17751920 5' + gypsy5 166 2 64.36 GTCATAGCTATCAAACCAATCGCCTATAAATATATTTATAATAATTAAAGCTTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGT:1 + chr3L 22094257 5' + Stalker2 7275 2 54.46 TTTGTTGAACTTGACACGATTGTTGCCCATTCAGTTTTTGGTGTAGTTTTTGTTGTTGCCATTGCCTTTTCTTGCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTC:1 + chr3L 7744020 5' - Doc 350 1 76.24 TAAACTTGGTAAGATAGTCCTTGCAATTCATACCATGCAGGGGGCGATAATCTGATGACGCGCAGCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATTCCTCTCCAT:1 - chr3L 25808375 5' + Q-element 57 2 68.32 TGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATG:1 + chr3L 27356085 5' - Tc3 1677 1 61.39 GCTAAAATAATTTTAGCTTAGCTCAACCGTTTTCCCGACCTTTTCCGCCTTCTCCACCCAACCAAGAACTTCCCTAATAATAAAAAAGGAAAAAAAAAACA:1 + chr2L 19674267 5' + gypsy7 5008 1 61.39 CTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATG:1 - chr3L 15452891 5' + accord 6997 2 78.22 AGAGTTTCGAACCAACGACTACGCTTACACAATGGTATATAGTCCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chrX 22690744 5' - roo 9041 1 56.00 ACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTAT:1 + chr2L 23372506 5' + gtwin 6921 2 74.26 CGTCGAGCTTACCAAAAATCAAGTTAACTTGGCACAAAATTTGGCACAAAGTTCCTTACGGCAGGTGACTGGAACGCAAAA:1 - chr3L 8902371 5' + G5A 414 1 61.73 TCAGTAAATTTGTTGGATACAAGAACATTTTCAAAATGAAATGAAGGAATATGATAAAAGATAAAGAGATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCAC:1 - 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Tirant 337 2 64.36 TCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAAT:1 + chr2L 14074959 5' + jockey 261 1 64.36 GGCTTGAAAAGCGAAAGATTTACGCGGCTACTGGAGCGAACGATGTAAACTTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 21782122 5' - roo 389 2 55.21 AGTAAAAAACCGAAGGCATCGACTCATGTCTAATAAGCAGATTACGCAGCTGATTCTGCTAAGACCCCACCTATCATTCTGTCTGACGTCAATGATATAAG:1 - chr2R 7751655 5' + G4 180 1 54.46 ATTTCTGGCTTCTTCTCCCATTTTGCGTAGAGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr2L 17283475 5' + hobo 43 1 65.35 ACGTGGTATTGACCCATTTCTGGGCCTGTCATTGACCGGTTTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTAT:1 + chr2R 12655226 5' - P-element 405 1 47.52 ACCTCGATGGTCCAGATAGCTATAACTACTATTTCTATGATCAGTCATAAGTAGCTAAGTTTCTGATCTCTTAAATTTGTTTTTATATCATTTTTATTTTT:1 - chr2R 2557278 5' - Tc3 1570 1 62.38 TCAAGATGAAAAACTTCTTTCAGCCAAACTTTTATCCGTCTCTGTTTGCACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAG:1 + chr2R 11111400 5' + F-element 310 1 54.46 GAACGGAGGGGACAAATGGGAATGGCAAACGATAAACTGAAATACACTATTGGGCATAAGTATTTAGAAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTGA:1 + chr3R 8927567 5' - 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invader4 2695 1 62.38 TGCAAAGCGGCTTTCCTCCTCCAATATTCGCCCTTTTTAAAGCCGCCTTGTGGTGTGTACATAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGT:1 + chr2R 5067216 5' - 1360 390 1 63.00 TCATACAGAACGACGACAATGTATGTTGAACTTTGTTTTGTGGCCATTAAGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 + chr3R 28678186 5' - I-element 5333 1 57.58 CGCTGTTGGTATTGAAACTTGGCATGTGCAATGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chrX 19820027 5' - hobo 2892 1 74.26 AAATTGTATTGCCTACTTTTTGGGGCCGGTCAAGATAAAACCCGGGCTGTCAGCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2R 21415205 5' + jockey 30 1 54.00 TTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr2R 19209442 5' + Doc 40 1 74.26 ACACCAATATACAATACAATGATTCAATAAAGGGAATGTGTTTATTTTGGGTAAGGTTAACAAATTCATATTAAAAAGTTTTTACATATTTCTATTTATGT:1 - chr2R 11619378 5' - 1360 2961 1 65.35 TTAAACATCTATTGTTTTTCAATGGAAAAACCAGTGTATTTTCCAGAGAACCTTACCTAAGTTTTTATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr3L 17652799 5' + pogo 7 1 72.28 CGCTGATGCTTTTTACAGCTTGATGTCTTCATCATTGTTGCAGTTGCAGTTCCTTGGCGACCGCGTGGCTTTTACTAACCAAGTGTCAGGCGGAGACGTGA:1 + chr2R 8652562 5' - gypsy2 283 2 68.32 TGACCAGGACGCATACACTGAGAATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATA:3 + chr2L 17168455 5' - flea 205 2 80.20 ATGGTAAAAATCATTTGATTTAACATTTATAGTAAGCACTTACTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr2L 436877 5' - roo 9039 1 57.43 GAGTGTGGTACCTTTAGCTACCTACAACTTTATCGAGAGCGAGAGTGTGGAAAAGTGAAGGTGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAA:1 + chr3R 30375255 5' - Ivk 336 1 63.37 CCGCAAAAAACCAAAAAGAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 - chr3L 10565329 5' - pogo 2050 1 81.00 GAAAGAAAAGTTTAGCTCTGGAAAACTGCGGAAAGTGGGCAAAGCAGGTAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCG:1 - chr3L 7997552 5' - Doc 349 1 57.43 TATATGTTATATGTTATATGTTATGATATAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGC:1 - chr4 96889 5' - accord 370 2 79.21 GAAGATGTATCTCTTTTCTGGTTCAAATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chrX 21668253 5' - 412 7499 2 71.29 GGAGGCAAGTGACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATAT:1 - chrX 21247585 5' + blood 170 2 72.15 TAAAACTAGTGCAAATCAACAAAGGGAGCGGCAAAACCGGAGAGCTCGAGAATCGCGAGCTGGCACAGGGAGAGGAGCTGGAGGAGGAGCCAAGCACTAGC:1 - chr2L 17827700 5' + G6 486 1 68.32 ATGCAACCCGCAGCGAAATTAAAAAACAATCATGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACAT:1 - chr2L 10197624 5' + Stalker 6897 4 73.27 AATATACAACAGCCGCGACGCATCCATGGACATGATCTACTCTTGCAACAGCAGCAGCAGCAGCTCCCACAGCAGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTG:1 + chr2R 21650295 5' - jockey 4681 1 77.23 CTGAGAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 - chr2R 22856589 5' - 1360 3353 1 66.34 AAACTCCAAAATAACATTTTTATCATATACATGCCCCGTTCGGCAGAAACTCTAACTCTAAACTCAAAAGGATAGAAAAGGCGCCTGCATGACGCGTGCCA:1 + chr2R 5617181 5' - invader1 3653 2 52.48 GTGCAAGAGAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTA:1 - chr2R 6482737 5' + gtwin 6949 2 59.41 TGGGGCTTCCAGCCCCACACCGTCCAAACCCCTTCGACTGCGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCC:1 - chr2R 6527151 5' - I-element 354 1 59.41 AGCAACATCAGCAGGTCTCAAAGGCGGCAGGAAGCCAAGCGATAAAACCAAACCAAACCAAGTCAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACAT:1 - chr3R 21827310 5' + flea 4639 1 68.32 GCTCTTATCTGTTTGGCATTGGCTTTTGTCGTGTGGGAGATGTGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr3R 13583195 5' + jockey 62 1 65.35 GGTTAAGCAAACCCGAAATTCAAGCCACCAGTCTTCAGTTTAAAAACTCATCTGAACGCGCATAGTCGCAGAATAAACCACAATAATTAAAATTGTTGTCT:1 - chrX 264003 5' + gypsy4 254 2 67.33 CTTTAACTCAAGCAATTTGTTAATGAGCAAATTACATGGTCACTGCATATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTCTAAATG:1 - chr2L 18506819 5' - flea 216 2 53.47 GATTGCTAACTTTTTCAATCCTGAATTAAAGTTTGATGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTT:1 + chr2R 3919668 5' + 1360 36 1 59.41 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTTGCGTCGAACCTAATTTTCCATTTCTTCT:1 + chr2L 16217660 5' - Bica 4607 1 42.57 TTTGGACTATGTCTGCAAATCATTCCATAATAACACAGTGAAACAAAGTCGAAACCTTGCTTGTTCATGAAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAG:1 - chr2L 20387936 5' - 297 389 2 60.40 TTGATGCACTGTAGCTGTGGATTGATGGCTTAGATTAAAAATACCCGCATAGCCGCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 + chr2L 9699191 5' + P-element 18 1 62.00 ACGCCGAGCTCGAAGGATACCCTCTCTAACAATCTGTGAGCCATGTAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTG:1 - chr3R 29657517 5' - 17.6 7023 2 54.46 CTTTCAATTGCAGCTGGATGAAGCTGCCCTGGATCGAGGTACTTTGCTTTCACATCACAACAATTTTATAAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACC:1 + chr3R 4492772 5' - S-element 71 1 61.39 GATAAGTCTTATAGACACTGGAGGCTGAATACGTTGGATTGCAGCGGTGATAAGGATCTTCATTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAA:1 - chrX 12973260 5' - TAHRE 10413 1 53.47 GGACTTATAATATTTACAATAAACCCTATTAAAAACAATCAAGGATTCGTTTTATTTGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAA:1 + chr3R 4014549 5' + 17.6 439 2 57.43 CTGAAAGAGACGACACACACAAGGTGACTCGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr3L 14152146 5' + blood 7060 2 74.26 ATACACATACGAATTATATACACGCTGCGTATGTATGTATGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGCGAGAACGTCGCCACCACGCAGTATGTGTG:1 - chrX 6412561 5' - accord 206 2 77.23 ATGTGGAATGTGAAGTCCTGAATTTAAATCTAAACTGGTGCGTAGGATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACA:1 + chr2L 12802186 5' - invader3 5433 2 52.48 ATGAGAAGGAATTAAATTTAGGTAAATGCATTGAAGGAATTCAATTTTAAACAAAATGCTGCTAGCGTCACACAATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 - chr3R 27435121 5' - jockey 4987 1 74.26 AATTTTCGGCTTTAAACGGTGGCAACCTAGCCAGCAAAGGGGCAGAGATCCCTCTAATCGGGCCCGATTGGTCAACACAGAGTACTGGGCTTACTAAAGTC:1 + chrX 15166256 5' + baggins 4973 1 78.22 ATAAAACAGAAGCCAATGGGCCAATTTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATCCATTTTTTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATAATGTAG:1 + chr2R 22768375 5' - invader2 262 1 77.23 CGGGGAGATATGCGAAACACAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:2 + chr3R 12058643 5' + roo 8720 2 81.19 TGGGGAATAAAATGAGAAAAAACTTAACGCCCACAAACCGTACCAAGATTTCACGCCCACACATCTTAACAACCTAATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGA:1 + chr4 809182 5' - INE-1 561 1 80.20 TTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATA:2 - chr3R 14049436 5' - transib2 2812 1 65.35 GGCGACGATCTTCGTTTTGTCGGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 - chrX 10585446 5' - P-element 2833 1 26.73 GTCTGTTAAAAATATCTTGCATTTAACAAGTTTAGCAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 + chr2L 23374523 5' - flea 4978 2 63.37 CAGAGTTGGAGAAAAAGATGGTAGGATTCACTCCAAAAGCTTCCAATAAAACGTTTTCAAAACTTACTCCGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTT:1 - chr2L 20837168 5' - Quasimodo 7078 2 37.62 TACGGCTTTTTGCCACCTCAGAAAAAGGAAGAATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAAT:1 + chr3R 27088453 5' + X-element 4283 1 71.13 AACTGGTCAGCCGGCCATTGACCTGCGCATCCAGGCACGGGAGCAGCTGATCTCGCAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 28879995 5' + roo 8684 2 57.43 TTTTACAAAACAATATTGTAGCATACATTTTAGGGCGACGTGTAAATGTCAAACCAAAGACCCTAGAA:1 - chr2L 16968487 5' - Tc3 318 1 76.47 TTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTA:1 - chrX 20999562 5' + BS 41 1 72.28 ACATAAGTGCAAACTACAAACAAGCTATAACAAGGCAAATACATCAAGGTGTTTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chrX 12276754 5' + hobo 21 1 58.00 AATAACTAAGTACCTACTATACCTTACTATATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 - chrX 3244623 5' - I-element 5310 1 70.30 TACAAAAGGCATAAATTTGCAGTCCCCTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATT:1 + chr3R 9081951 5' - hopper2 1559 1 72.28 ACAATCACGTGCCCCTCAATTTTTGCTGGCTCTTTTTTTTGTGTATATTTTTATATGTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATT:1 - chrX 5571793 5' - Stalker 6912 4 64.44 TCAGACCAACAAAACATAATCCACAACTTTAATCGAGGCAGCACAAAAGAATGAGCACCTTTGTAGATCAATAATATCACCGTGTCAGCACGGTTTTATGA:1 - chr2R 25109933 5' + Q-element 202 2 63.37 AGGGTAAGGAGCTTTTCAGCTACGTTCTGGTTGTGTAATTTTCTTTCGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2L 13314073 5' + jockey 36 1 53.00 GGTATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCCTTATGGAAGGATGTTACAATAGATTATACCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCAAAACGTGTC:1 + chr3R 2555506 5' + Tc1-2 1315 1 69.31 AAAAGGATCCCTTAAAACTTTACTCCACACTCCGCCCCTGTACAAATCGAAAACAGGTTTTTTCGTTCAGTATTTCTGTTTTTTTTGTTTTGCTTTTTTTT:1 - chr2R 19142770 5' - Doc2-element 254 2 58.42 GGTAAAAAGAAAAGAATTTATTTAAGAAGTGAAAGAAAATGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTACCACTTCTTCGTCT:1 + chr2R 1320398 5' + diver2 209 2 56.18 AGTAATATGTGCATCGTATGTGCGTATGTACAAGTGCGTATGTCAGTGCATGAAACACTGGCCGGAAACCCGTGTGCAGCCGGCAAAAACACCATATTTGC:1 - chr3L 24510193 5' + Gypsy6A_LTR 97 1 58.42 GTTAACCAAACGAAACAAACCGGAGCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCA:1 + chr3R 20177527 5' - hopper 348 1 75.25 CGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 + chr2L 7970998 5' - blood 7337 1 76.24 GATTTTCAGTATTTTGTATCATGCTAATCGCCTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGA:1 + chr3R 6403796 5' - hobo 2819 1 68.32 CTGCTCACTACTCGAACAGGAAGTGATGAAAACTTGACTTGATTGTGACATTTAATTTATCGAACTAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 + chr3L 18141925 5' - blood 7378 2 67.33 ACAAGCGAACTGGTTGCATCCAGTCGACCACAATTGCACCGCAACTAACTGCAAGCCACATGACGCCACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCT:1 - chr3R 545285 5' - Transpac 5224 2 78.22 CCCGAAGCAACGCATTTATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTT:1 - chr3L 21912329 5' - Bari1 1670 1 62.38 GTATGGCATCCGATTTCATCATCGACTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:2 - chr2R 18036667 5' - blood 7339 1 74.26 CTGTCTGCTCTCCCATTTTTTTTGTATTGTCTAACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr2L 10820649 5' - roo 9029 1 70.30 GAATTTAAGAAATTCGCTTTGGGAATCCTAAGGGACCCTCTAAGCAAAGACACTAGAATAGCAAGATGCGTA:1 - chrX 14742592 5' + 1360 7 2 69.44 TGGTTTCCCCAATGGACCTCTAGCTGTCGAATAATTGAGTACAGTCAAGCGTTCCTAAGTGACCAAGCTGAATACTCTAATGACAAAAATTACTTTATATT:1 + chrX 18150775 5' + 1360 378 1 65.35 CGGCCACTTGGTAACCCCTTTGACGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAC:1 - chr3R 20485165 5' - accord 7198 2 76.24 GGACTCTCCCAACACGCACGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAATTAACATTAACATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 - chr2L 19591174 5' + F-element 27 1 72.28 TTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:3 + chr3R 19450174 5' + roo 8707 2 61.39 GTTTGTTTCATGGACTACAAATATAAAGTACTATTGAGAAAAAAACCAAAGAAAGCGTTATTAAAACTTTGCCCGGGAAAGAAAACGAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 6683019 5' + Doc2-element 221 1 74.26 CTTTTCTGGCGGAAAACGGAGCTAAAGTTGCACGTAGCTAGAGACACGCGTGGCTTAACCACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTA:1 + chr2R 15188093 5' + Bica 4663 1 64.36 CTCTGACGATCTGTGCCTTTAATTTCTGGCTTCTTCTCCCATTTTGCGTAGAGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:2 + chr2L 17283454 5' + hobo 22 1 57.43 CATTTTGTGTGCACATATCATTTTTGCGGAGGGTACACAGTTGTTTGAAAGAAAGAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAG:1 - chr2L 14083191 5' + 1360 3162 1 68.32 CTATTTTCCGGCCAAGTTCGTATACGCCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chr3L 7742762 5' + Doc 55 1 73.27 TTTTTTCACAGTGAACTTCCCCAACTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGC:1 - chr2L 2163580 5' + Doc 444 1 76.24 CTTGAGCGCCAGGAACTATCCGGCTTGTGATATCCAGGTTCAATTTCCAAATAATCGGTATACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATT:1 - chrX 21581193 5' + Bari1 15 1 56.44 TAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTT:1 - chr3R 14049394 5' - transib2 2770 1 79.21 CTTCAGGCGAAATTAGAGCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGAATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGAAGCACTTTTGCAAC:1 - chr2L 6596792 5' + Tabor 6897 2 75.25 ATGATTATGCTTTAAATAAACTTTACCTGTCCGCGTTCTTAATCAAGTTTATTTTAAGCATAATCATACTTATGTCATTCCTGGGCTATGGGTTATTGACC:1 + chr3L 25754987 5' - F-element 316 1 65.35 GTCACACGCGATGTTCGGGGTCGCGAACTGCTGCGAACGACAAACGGAGGCGTCTTCGCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3L 813894 5' - roo 391 2 61.39 ATTTAAGTAAAATTCCAATTACACAACATTATGTGTTCCAAAAAGATCAAATTATTTCGTAATTTTAATCATGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATAC:1 + chrX 6156138 5' + 3S18 6 2 71.29 GTGGCAATGGGGGCCTGGCCATAAAATTAGTATGACATGTTGACCTCTGTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTTAAAATAGAATTTGCTTGT:1 - chr2L 2927871 5' - 1360 3266 1 61.39 TGATTCGTAGCCCGAATGGCTATTACTATATATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTCTTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCA:1 - chr2L 12371743 5' - invader3 5396 2 67.33 ACACAGTTCCGCACTCGTTTTAATAGCAATTTTTATTTTTATTATTATTATTATGATTGTTATTATTATTTTTATTTTTATTATTATTATTATTATTATTA:1 - chr3R 28734343 5' - mdg1 39 8 72.28 CCATGTTTATTTTTGTACGTATTTTTTGTTTTCTTGCCATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr3L 4637298 5' - hobo 2900 1 60.40 GCTTTCGCAGATGGTTGTTGCAAATTCTTTTGCCGGCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3R 846506 5' + 297 6613 2 67.00 CGGGAAAATGGAAAAGTTTTTATTTTTTTTTTTCT:1 + chr3L 9545498 5' - HMS-Beagle2 490 1 82.86 CCCGATCGCCAAGAAAAATAAAAGGGCAATCAAAAAGCCAACGGGTGGATGATTTGGCACTCGCGACGTCTGACACGACTGTGAAGTATACATTGTTCCGC:1 - chr3L 18282233 5' - Doc3-element 286 1 59.41 TAATATATAATTGGCCTCACTTAATTATACTATTGAAACTGAAGAAGAATATTGCTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATACTTAGATCTACAATGATTTAAG:1 + chr3R 23667645 5' - Cr1a 4147 1 64.36 CGTCTAATCTCCACGGCAATATCATCACGAACGCTGGATACCCGGCTTACCAGCTTACCAGTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCA:1 + chr3R 5090650 5' - invader4 2704 1 70.30 TAAGCACTAAGCAACACGACCAGTTCAAGACAATGACAGCCAAGAACACTCCCAGATAAGTCTCTGGTCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCAC:1 - chr2R 6783258 5' + Tabor 8 2 72.28 TGTGTGTGTGTGGCACCGCAGATTTCTCTCACCATCATACATAGCATCACACCCGCACTTGCACACACACACACACACACA:1 - chr3L 6015081 5' + accord 182 2 77.78 AAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 + chr2L 13598193 5' + pogo 37 1 63.37 AGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chrX 16217539 5' - P-element 2874 1 66.34 CATATGGCAGAATATTTCCCAAGCCCAAGCAAGCCGACTTGGCTTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 - chr3L 18142013 5' + blood 33 2 58.42 AATATTTTTACATTCCGAAATTGGTATTGTTTTATTTCGTCGTTCCTTCTTTCTTTTTTTTTTGTTAGT:1 + chr2L 17260296 5' - gypsy2 397 1 62.32 TGACGAACATGCTGCTCAGCATACCGTAGCAAACTCCAATATGCCACAATCTTCTTTGACGTCTTGTTTTTTGAGTTGGCAGAGATTCCGGCAAATCTAAC:1 - chrX 4801103 5' - diver 462 1 57.43 ACAATTGTGTTAAACAATAAATATCCTACATTTGGGGGCTCAACCGATAAAACAATAAAAAGATTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATA:1 - chrX 22426256 5' + 1731 16 2 61.39 CTTTGTCTCAACTTTTTCGAGAGTCCAGCGAGTCCGTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr2L 4057140 5' - hobo 2915 1 57.14 TATCACCCTGACATAAAAACCGCTCTTGACCGAGTCAACTTTTCCTATCACTACCATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCGACGGCGAAAAAATC:1 + chr2R 15668172 5' - 1360 53 1 61.39 TCTACAAATATGTGTGCAACACCAGAAAAAGCACCATGACACTGAGAGCCAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATA:1 + chr3R 18885998 5' + BS 4662 1 78.22 AGTCGAGATTCAAGCGTTATGAAGACGAACATGAACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTT:1 + chr2R 19585591 5' - 17.6 376 2 66.34 TTGCAAACGAACTTCGAGGGATTGAGTGGTGTGTTGTGGGATCAATGGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTG:1 + chr3R 8925522 5' - Ivk 5007 1 53.47 GTTTTTTGCAGCTGACAACCCAACCTAACGACCCATTACCTTTTTTAGATGATTTGGTAAAAATAATTTTTTTTTTCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCG:1 + chrX 6897328 5' + Ivk 2 1 72.28 CGAGTTTTCAGATCGTATCTGTGGACCCGAGGGAGGGGTTTCGAACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATC:1 - chr2L 21068660 5' - X-element 4286 1 63.37 CGCCGACTCTGTCTACCATGGGAAAGGTTAAACAATCAATTCTGCCTTCAATTGAACTCAATTGTGCGTTGCCCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTT:1 - chr2R 17269816 5' + transib2 1 1 76.24 CAGAAGTTGCTTAAATACGCAATGCTGAAATATATACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGC:1 + chr2R 11092603 5' - accord 7062 2 66.00 GCAAAATATGATCATAAAAAGAGCTGAGCAGCAGCAGAAGCAGCAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACC:1 + chr3R 14941083 5' + I-element 132 1 60.00 TCCCATTATCGCTAATTCGTTTATGTTTTTGGCAAGAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr3R 12058883 5' - roo 320 2 70.30 ATCAATATCCCAAGCGGGAGATCTCGTTCCCGAAATAATGTAAACAAAAGGGCAGTACAAATACGATTTGTTTGTCTTAAGCTAAGATCAAAAGAATAAAG:1 + chr4 970229 5' + 297 289 2 48.51 CATTTTGGCATTTTGAATACGTTTTGTGGCACCTTGAATGTCTTGGATTCGGCGGGTTTTTCACCATTTTCTTCTTTTTCCTTTTTTT:1 - chr3R 6483949 5' - Doc2-element 236 1 63.64 TTACTTTCATTGCACCACTGTCATGTAAGAGAACACACACTGAATCCCGCGAATCGAATTACTCGTGTCAATTCAAATGAATGCAAGGCCGAAGTAGAAGC:1 - chr3R 8680148 5' + Chouto 5955 1 77.23 CTATACGCACAAAATGTGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chrX 6146723 5' - hobo 2905 1 59.41 AAATCGGACATTGCCCTTCTTGTCTTTTAACTTTGTAAATATATACAATCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGATTAGTCTTTATTTGTAAGCTCAT:1 - chr4 618110 5' + Cr1a 4038 1 53.47 CGGTTTGGAGTTTGTTGCTCTGTGGCCGAGTGATATTGTATCTGTGTGTGAGGGTATGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTCG:1 - chr3R 25375383 5' - accord 7026 2 60.64 GGCCATCCAACAAAGAGTCATAATAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTGT:1 - chr3R 23249940 5' - 1360 3321 1 80.20 GGCCGCACTTCCGAGTCGCACGCAAAAGCGGAGTGCCATCAAGGATCGTCGAGAGTCGGGCAAATCGGGAGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTA:1 + chr3R 27805362 5' - Quasimodo 7085 2 78.22 GTTTGAGTTCGATCCGGACAACATGCCCAGCACCGGATTTAACTTTTAGCACCCTACCTCACACACATGCGATTACCTCAAATAATCTCACCCAAATTGGA:1 + chr3L 19809772 5' + I-element 4896 1 57.43 GTTTGTTATTTTAGATATGCCGAACTGTACACCTTTCGTTGCAGAAGAAACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 - chrX 9048722 5' + Tirant 20 2 56.84 CCTGAACAATTTGGATGGATGCCTGCTAAACAGAGGCACTTTTGCACTAATGATCAATTAAACGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 19449120 5' - roo 395 1 58.42 ACTTTTAGGCGTTGCACAGTAAATTCTACGGATATTGGTATATGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr2L 16125093 5' + hobo 33 1 59.41 GTGGCATATAAGAAGTGGAAAAGATATTCCAATTTATATATTATTTGGTATATTAGTGTATAAACAACCCACTAACTCAGTACATCTAAGATTTTCTCATG:1 - chr2R 17265345 5' + Tom1 251 1 65.35 CATAAGGTTCTTAAGGATTCTCACTCGTATATTAATGTAACCGAGTACGAGTATTAAATGCATTAATTTGTGGGAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAA:1 + chr3L 7412399 5' + invader3 5198 2 61.39 CCTGAGACAAAAGGCAACCGGCAACAGCCGGTCGTATCTGCAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:3 - chr2R 17346004 5' + hobo 37 1 60.40 ACATTAATTTCCCATGAATTGCAGAAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:1 + chr3R 19445668 5' + Tabor 53 2 75.25 TGGTTTTTTCGATTGAGCACTGACGTCTACATCTCCATATCCGTGCGTATCTCCACATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTAT:1 + chr2L 433033 5' - I-element 314 1 50.50 ACTAAATGTATGCTACAGCTGAGAAACTAGGAAAATTGAAGTCTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:2 - chr3L 5267277 5' - Juan 4186 1 54.46 TGGCATGTTGCGCCGAAATTTATGACTTTCATTTGTGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCT:1 - chr2L 7117472 5' - mdg1 299 2 75.25 TGCTGCTGCTGCTGTTCAAACGTGGCTAACAAGGTGAAAAGTAGGTGAATGTTAAGCAGCGGCACCAACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTG:1 + chr3L 4713739 5' + transib2 7 1 70.30 AAGTGATTTGTAACCAAAGAACTTGCCGGACACGTGTTAAATAGTTGTCAATAGTTGTTGTTGTGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 - chr2L 1195128 5' - hobo 2926 1 63.37 TAGAAGACGGCCCGGAACCAAGGCCACAGCTTCATGAATTTCATTTGTTTCTTATGACACAAAGTTATTAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACT:1 + chr3R 11889422 5' + pogo 347 1 57.43 GTGTGTATGTGTATGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGAAATTAACATGAACCTACACACACAGA:1 - chrX 12036010 5' + accord 247 2 60.40 CTCGCCTTTCTGTGGGAGGTCTCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 - chr2L 7767167 5' - hobo 2886 1 78.22 TTAAACGCTTGCTTTAAATGTGCTTCAATTTAAATCTAAAGCGGCTAACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCA:1 - chrX 2323567 5' + jockey 4658 1 53.47 ACTCACCATTTTATTCACCCCACTTTTTTTTTTAAACTGCTGGCTTATACTATTTCAAACACAGACTATGTATTCGAGCGATGGTGCATCGCACAGAGCG:1 - chr2L 10898307 5' - Doc2-element 122 1 75.00 TCTTCGGCACATTTTTCGCTAGCATCCCAGGTTTGTGTGTATTTTTACAGAAAATTTTGACGGTCTTTGGCGGTAAAGTAATAGCTTTTGCCCATTTTTGC:1 - chrX 15554353 5' + transib2 493 1 46.53 ATTTGGGCAATAAAATGTGGGGAGCATAGGGTGGGTAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAA:1 - chr3L 14428573 5' + Ivk 304 1 64.36 TGGGAGCAAAAAATAACAAACGAGCACAACATGAGCTGAAAATAAGATTTTTGAGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr3R 10428070 5' - hobo 2916 1 56.44 ACTAGATTCATTGAAAAGTATGTAACAGTCAGCATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCGACTTTGTCTCTAGTATCTGTAAGTTGAATCTGAACCTTCTAGCT:1 - chr2L 22211545 5' - INE-1 168 1 58.42 TAATATTGGCATATATTTTTTAATCCCATATTCTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATC:1 + chr2L 9299668 5' - 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copia 486 1 60.40 CGATGATGCGGGAACCAACAAATACGTACTTGTCGAGTTCTTCGCCACCTGGTGTGGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAA:1 + chr3L 14728902 5' - opus 106 2 61.00 AGACGATGGAGTGCTGTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAAGGAATTTACATTGTACATATTAGG:1 + chr2R 20193269 5' - 1360 3147 1 81.82 CGCTTATGTATCATCCTATATTTGTTGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chrX 7698605 5' + pogo 47 1 72.28 AGTCCCAAAACCCCAATGCAATTTGGCTAGAAAATGCATTTGGAGATTGCAGAGGGACGGTGGGTTGGAAAATAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACG:1 - chrX 12800331 5' - invader3 5459 2 72.28 ATACGGAGACCAAGGGCTGGCTGAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATG:1 - chrX 6723563 5' + opus 449 2 77.23 TTCCCTATTTAAACAAACTATATACATATATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATT:1 + chrX 8521090 5' + 1360 3166 1 80.20 GGGAGAGTCACCTTTCAACATCAATCAACAAAATTGGGGAATAGCAAATAAATAGTAATAGCCGAATCATAATATCACAAAATAAATTTCAAAAATTACCT:1 + chrX 17478057 5' + 1360 372 1 64.36 TCACTCCTCAAACCTTGTCATATTTCCACTCAACTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGA:1 + chr3L 3635426 5' - roo 9029 1 65.35 GACTGCTGCAAAAAGGATATTGCACGATGGCGGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAGACTATTGGAGATA:1 - chrX 12883629 5' + hopper 42 1 70.30 CAAATAGTTTATAATAAAAAAAACTAAATAACACGGAGACATGCCACTTACGAAAAGAAAATTCTCGCTTTGTGGAGATTATGTTGGAGGGCTTGACTTCG:1 - chr2L 22208397 5' - gypsy 359 2 69.31 CCCAGAAACTGCGGCTGGGAAAGGGGAACATCGAGATAAACTTAATGTGTTTTAAGCTGATATCCGAATAAGGAAGTTCAACTGACGGGACATTAGTTCGA:1 + chr2R 17845646 5' + 297 367 2 54.46 ACTATTTTGGAGAAGAGGCAGCAGAATCTAGGAATAAAATTTACAAGTCGGACAGACTTCACCATTCAGCAGAGTCTGAAGAATCGTTATCAGGTTCAAAA:1 + chr3L 17863091 5' + hopper2 93 1 67.33 CGCAGTATCCATTATAGCATATCAACAACCAAATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAAT:1 + chr2L 15019873 5' - BS 5077 1 59.41 GGGGGGCGAAGGAAGATGGCATCATGTTCGTCATGTGCGAGTGTAATAAATTTTATTAAAAACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chrX 18991621 5' - pogo 2089 1 69.31 GCGCTGCCTTGATCAGTCACTCACACAGATACAGATACTAAGCGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr3R 18448937 5' + hobo 32 1 58.42 AATAAGACATATCCCGAAAAGTATGCAGCACTATTTTGGTTCGGAAGATACAATGTTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - 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chr3L 11199889 5' - roo 9043 1 55.45 ATGCCATAGTCGCCAGATTATTCAAAAAGGGCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chr2L 5741324 5' - 412 7500 2 69.31 TTCCCCCAGAAAACTGATGAAATTTTGCGATCGCCTTTCCACTAGCTAAGTAACGTGTATCTCATGGTAGGGGAAGTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTT:1 + chr3L 22848573 5' + INE-1 581 1 74.26 ACGTACATCTGGTACGGATGGCTTATTTTATCCTAAGATTAATAAGATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTT:1 - chr2R 12357576 5' + opus 7114 3 69.33 TTTACAAAAATGTTTTATATTTCCATCGTAAAAATATGTGTTCGCTGGCAGTACCCCAAAGCTGTATACCATAAGTCCACACGGGCTTTAGTATAGCTTTG:1 - chr3R 6683748 5' - G4 3407 1 56.44 CGGGCCATAAAAGAAGAGCAGGCCGAGCACAGTCGAGTTAATAATAGGCAGCCAGCCAGCCAGCCAAGTAAGCCCACCAAGAAGGCTCCACAGAAGACAGC:1 - chr2R 10598088 5' + BS3 1553 1 74.26 GATTGATAAAAAAAAAAGGAAAAAAAA:1 - chr2L 18438620 5' + Rt1a 5079 11 85.19 ACATGGGAGATTGAGTATGCGCTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chr2L 6324525 5' + hobo 51 1 76.24 ATGTAAGCTGGTGGCAGATTAAGGAACTAAATATATGTGTAGTTTAGTATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAA:1 - 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rover 7094 2 62.00 CAAGTGCGGTGTTTAAGATCTGAAATATGGAGCCATGAAAGACATTTTTAAGCAAGCGGACAGTATATCCCCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 - chr2R 6041664 5' - opus 499 1 80.20 TTGCCGAAAATTAAAATGCGTAATTTAAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGGTGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 - chrX 7335130 5' - Tirant 354 2 70.30 TCTTCGTCGTCTGCATCGTTGTCTGGAGTTCTTTTATTTTATTTGCTACGTTTTTTGGTTTTACTTCTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCT:1 + chrX 4467162 5' + copia 4745 1 76.24 TTTGGAAACCGTGAGGGTCTTCAATGGGGTAACACGAGATTTAGCGCAGAAAAGATGAGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTC:1 - chr2L 22228015 5' - Bica 4915 1 68.32 GCAGATGTTTCAAAATTGATTGATATTGCAGCTTATCTTAGTATTGTACATTCTGCAAACATTGTTATTGATTTATTCTTTTCAGGTACCCCCGTCAGAAG:1 - chr3L 3310965 5' - TAHRE 10108 2 63.37 TGTGTGTGTGAAAACGTGTTCAATTGATATTTCTGAACGCGCAAGGGAAAAGTTATAAATAGAAAAACTTGATGATGAAAACTACAGTGCGTGGGCTGTAC:1 - chr2R 9649126 5' + Dm88 359 1 61.39 CATAAAGGACTGGACGAAAATTACAAACAAATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 27864711 5' + roo 43 2 72.00 CAATTGACTGCAACAGCAGCGGCTGCAACAACAACGTTGGCATCAAACAGCGAGCACAAACAAAGATTCTGAGAACCATAACTGGGGCACCGTGGTGCGT:1 + chrX 14124233 5' + F-element 4353 1 62.00 TGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTGCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr2R 17345950 5' - hobo 2900 1 64.36 AATCGAATTTCAAAAATTTTTAAATTTACTTGTATTATTTTCATTGGACATGTCGGTATGTTTTTTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chr3L 17650783 5' + F-element 22 1 36.63 ATTATTAAAAATGTCCAGCAACGAAAGGCAGTTTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3L 10554775 5' - roo 9032 1 63.37 GTGAGTTCTATAAAAAGAAGCAGCACCTTTTATATTATTTATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chrX 20989457 5' - pogo 2069 1 66.34 GTGCTCGCCACCAGGATGAAGCGGATGAGGAGCGATCTTCCCGAGAGGCTGACGGGGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGTCACCATGCGAAA:1 - chr3L 6736188 5' + 1360 269 1 62.38 TTTATTTAATTTAAAATTAATATGTTCTTTATAAATTCCCTGATTTTGTGCAATAGTAATTGTTGGGTAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAA:1 + chr2R 16347630 5' - diver2 161 2 75.25 TTTACTGTGACATCACTTCAGCTCTTTACTAAGCAAGCGAAAACTCTTATCCATTTCCATTTTGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:2 - chr2R 5154822 5' + F-element 25 1 58.42 AACTGACCACGCCCCCAGTGGCGCCCACCACCTTCTGTTGTCACATCTGCAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:2 - chrX 8354434 5' + jockey 33 1 53.47 AGGTCTTCAAACGCAATCGAAATTTAAGTAAAAAAAGGCATTATAATTAATTAAAAAATAACCTACAATCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACG:1 - 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chrX 17283995 5' - roo 358 2 74.26 CCAGAGTGTTGCACTTTTCATTAATGCTAAATTAAACGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr2R 21860552 5' - roo 9032 1 66.34 AGTCTCGTTTTTGTGGCAAAAACTAAAGCGACAATCTCAAGCAAAAATGTAAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTG:1 - chr3L 7473631 5' - rover 56 2 60.47 CAGATTTTAAGTTGCGCTGGAATTCAAATTGCACATGTTTAATTTAAATCCCGAACTCATTAAAGCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr2R 21860470 5' + roo 10 2 70.00 AAGCCGCCCACTATTTTCCGGCCAAGTTCGTATACGCCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 - chr3L 7742772 5' + Doc 15 1 50.70 ATTGCATACTTACAGGCAGCGGAGTAAGGATTTTGGTCCCGGCAAAAGCCAGTGTCGATACAGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACT:1 - chr2R 19655079 5' + jockey 4731 1 63.37 GATTTGTGTCCGGGTTTTTCGTTGCAATGAGAGCCTGCGATCGTTGATCGTCTCATGTTTTTTTTTTTGATGTAAAACTACTTGCTTATACTATTTCAAAC:1 + chr3L 1472949 5' - Doc2-element 182 1 42.57 AATTATTCAACGAATCATGACAATATCATTGGCTGTTTGCATTATGCAAGCATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 - chr2L 5659500 5' - jockey 4966 1 52.48 GCTGAAGCTGACGCCGATGCTGATGCACTGCCGCCGCCAAATCACCTTTGTAGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGTAA:1 + chr2R 11241826 5' + Stalker3T 32 1 64.36 GGGAAATTGATCCACAAGTAATCGGGCAAACAAAGCGGCAAAGTGCGACGCCATTAACTAGTGTTTAATATGAAGAAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGA:1 + chrX 13374407 5' - I-element 5044 1 65.35 TTTGGCTGCTGGCCGTGCACTCGCACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAG:1 + chr2L 22208725 5' + gypsy 49 2 76.24 CATTAAACTGGTGATAGAGGAAGAGTTCTTCCATGGGGTCTTACTACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chr3R 15631104 5' - opus 7476 2 54.46 GTCACTGAGTCAGAACGTGTAAAGAAGGAGATAGGTCTCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTCAGATGCATTTACCAACGTAGACTGCGGCGTCTTACAA:1 + chr3L 24566372 5' + rooA 7462 2 73.27 TATCCAAGCTGTCTCTTGCTTGTCAATAGCCACAGACGAAACTAGTATGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 - chr3L 20286680 5' - mdg1 392 2 53.47 CAATCCCCGCATATCCCCAATACTCATACACTCATACAATCGTACGCCCGCGAGTGCCAAATTATCATCCCGGTCAATGACCTAGCACCTACAGAATGCAA:1 - chr3L 7176297 5' + Doc3-element 354 1 57.43 TGAAGTGGAGTGGGCGGAATTGTTTGTTGTTGCGGCTAATTCCTCCAGACCGCGGAGTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAG:1 - chr3L 25186378 5' - Max-element 8339 2 53.47 GCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAACCAACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr3R 19449493 5' - roo 317 2 77.23 TATGAGTTCTTGGTGGCGCGAGTTCCGTTTTGTATTCTTTATTACATACATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGCTATGTATAGCTTGAC:1 - chr3L 25722254 5' - Stalker2 7466 2 68.32 CGAAACTTTGTCTATCGATGCGATGTCAAATTACTTTGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAA:1 + chr3L 9120883 5' + Tirant 8220 2 63.37 TAACATTTCCAGCAGTTAGCGTTGCTAACTATTTATAAACGCCAGCTCTTTCTCCTTCCCTGGTGAAGGTGGCATTTGATTGTAAGCATTTGTAACCAGTT:1 + chr3R 4815824 5' - Chouto 6153 1 66.34 CTGGATATTCCTTCAATTCATTAATTACGATTCAATACAATTCACAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chrX 8959288 5' + 297 6642 2 56.44 ATGTAAATAGTGTAGAAAAGATCCAGATCTAAAATAGTATTGCATGACACCCAGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chr2R 11195690 5' + 1360 20 1 61.39 GACTCCCAACCAAAAGCATATGCATACATCATTTCCTCGCAGCCCGTTTCCTGCTATTAGCCAAAAGTTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAAT:1 - chr3R 24671687 5' + 297 6957 2 71.29 AAACGAGGGAAAAACAAAACACAGCCCATGAATGAAATAAGCCTGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCAATACCCC:1 + chr3L 6402826 5' - BS 4691 1 57.00 TGTTTTTGTTGTGCCGCCGTCAAATGAAAATAAGTCAAAAAAATAGAAAATGAATTGAATTATTGCAAATATGAATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTT:1 - chr2R 8385444 5' + accord2 113 1 52.48 CAAGAAAGCAACGGTATAATTCTCATACCACAAAAGCACACTCGTTCAAAGCCATACATACATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 - chr3R 5392374 5' - 412 479 2 64.36 TACGCGGCATAGTTTCAACTTTTCAGGCCTCTACACTGTCAGAAATTTATATTTGTTTGTGTCCTAGATATTAAAATGCATAATAAATAAATAAATCTCAT:2 - chr2L 1615496 5' + G3 346 1 49.50 CACTTCTATAAAAGTGTAACCCATTTTGGTTTTGAAATTGATATTAGCAAACACCATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCC:1 + chr3R 21168707 5' + Quasimodo 77 2 68.32 ACTTTTTCACCAAAAGGTGCGGACCATTCGAAGAATTCGTAATGAAGCCACGATTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 - chr2R 11086483 5' + Doc 30 1 53.47 AAATGTCAAGGACTCGCCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr3L 9174748 5' - 412 7511 2 62.38 AAAGTGGGAGTATTGTTATCTCAAAACTATACTCGTAGTAGGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAACCACTCGGTAC:1 + chrX 1252785 5' - hobo 2904 1 56.44 TCCTCAACGATCCTATCACCATGACCGCCCCCACCACCACTATATATGTATGTGTACATATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCC:1 + chrX 16217898 5' - P-element 2766 1 56.44 CTTACGAACAACACTTTTGGCCCTCCATTAAATTAATTACTGAATTCTTTTATGTTTTATATGTATTTTTACCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:1 - chr2R 23265823 5' + Juan 9 1 70.30 TATACCAAATTCGAACTTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3L 9174679 5' + 412 7082 2 52.48 CTTGCTTGTGAATAGTTAGTGATGTGCGCTGACACCAATGAGATCATCATCATCTCCTGGTTCTCGTCAAGGGGGACGTTTGATGAGGTCCTTCGGATGT:1 + chr2R 4181252 5' - BS3 1570 1 60.00 AAAGTCGGCACAGACACAGGTCAATTCTTTGGTTAATTAATTTGGCAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTC:1 + chrX 7114259 5' - mdg1 7377 2 54.46 TTTTAATTTTATTGGATTACAATTGGAATTAAAATATTTTTACCAAATATGGACTGGTACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAAATATTTTA:1 - chr3R 19450075 5' - Juan 436 1 43.56 CTCATGTTTCATTGGCAGCTCAGCTTAAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACA:1 - chrX 3273029 5' - hobo 2491 1 73.27 AATTTTCTCAAATTCTTCGCATTTCGCATAGTGAAAAAAACCTAGTGAGCTATCTTCCGATTCCCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 3776448 5' + roo 10 2 69.00 CTCGCAATTCCGGGTGTGAGTTTCTGGCACTCAAGCGTAAAAATTTATTATGCTTATGGATGAAATGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGG:1 - chr3L 18343385 5' - Idefix 7177 2 71.29 GATACTTCAGATACTTGTTCAGATATGTGGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 + chr2R 11195623 5' + 1360 44 1 72.28 ACATCAATTCCATCCGAATTTATCATATTCAGACTTTGGCATTTTCATCCCTTCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATAGGTTTCAATATAGAATTG:1 + chr2R 5709707 5' - F-element 4243 1 58.42 ATGTGTAGGTGCTCGGGAAATGCCATCAAGCCTCAAAGGACCGGGTATGCTTGCATAATTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGG:1 + chr2L 5659423 5' + jockey 4552 1 55.45 AGCTTAGATAAGGTTTGTGTTGTCACTATTGGCTTGTGTCTTTAGTTAGGTTCGAAATTTGGATAGGGGTTGCGTTTTCGCGCCAATTGAAAACCTT:1 + chr3R 3374272 5' - invader2 4651 1 75.26 ACACAATTATTTCAATACATTGTTCTTCCTTTAGTCTGGAGTCATTCGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGC:1 + chr2R 15050250 5' + gtwin 6962 2 53.47 CCGCAACACCTTGAAAACAAAAGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTTCCGTGCAGCTTGAACCAAA:1 - chr3L 4700702 5' + hopper 477 1 78.22 CTTCATTTGAGTGCTGTAATTGCTAGTGGTTATCCAACAGTTGCCAGCCATCCATTCCGATTATCCATTGTTTGTCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACG:1 + chr2L 6743283 5' + Quasimodo 7157 2 77.23 CCATGCTCTTTGCCTCCGCCGTCCTCTGCTTTTTTTTTTTGTTTTATTTTCAAAAATTTAATTTCACAATGTATTTCTCCTTACTTTAGTTTATATTTTAT:1 + chrX 7319901 5' + Gypsy12A_LTR 1794 1 71.29 GGACCACCCAAATACGTCACTATATATATCGTCTTTGTGTTTTGTTTGCTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGC:1 - chr3R 846553 5' + Cr1a 251 1 80.20 ACTAAAGCACCTGCCAAGACTCCAAATTATAAACACATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chrX 6739661 5' - roo 9031 1 65.35 GTTTAGTTAAAAGCCTTTGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGG:1 + chr3L 16470548 5' - BS 4970 1 80.00 CTTTGACTTTCACTTTCGCCTCATCCAAATGAAGCGAGTCCCAAGAAGTCACTCCACTCTCCGCTCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACC:1 - chr2R 14797144 5' + 17.6 110 2 67.33 GTCTGCGTTCGGCGGCTGCTCCTTGGCCATAAATCCTGCAACGTGTCTTGCATTCAATTTCCCGCCATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAG:1 + chrX 20577910 5' - I-element 421 1 65.66 GTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACT:1 - chr3L 23678148 5' + Osvaldo 25 1 77.23 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCG:1 + chr2R 1982172 5' - 1360 3295 1 88.12 GAGGTGGTTGCGCCTCCTTGTAAGGATCGTGTACAATGTCTGAGTGCAATCGACTGCAGTCGTCGATAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGT:1 + chr2L 21612759 5' - Ivk 5116 1 61.39 CCAACCCTCGTAGCTAGCTGAAATAAAAAAAAATAAGATAAAGCGGTTTTGAAACATAATGACGTGCAAGTGCAAATAAAACAAAAGAAACAAACAAAATC:1 - chrX 12566523 5' - accord2 7253 1 82.18 GGTATACAAAGAACGAAAGCAGGAGGAACTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGT:1 + chr2L 18231797 5' + 1731 4362 2 77.00 CCACAGGGCGCCCTCTCTCCCTCTTCCCGCTCGTCTAGAAAGAAAACAAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTA:1 - chr3R 12059224 5' + roo 9046 1 54.46 CTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACA:1 - chrX 23108336 5' + BS3 1412 1 63.37 TCGATGCATTTTCCTTAAAGTCGCCATGGAGTTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2L 16136657 5' + hobo 42 1 66.34 CAACAGTAGTAAGCACTAAGATCACATGCTTTTACATTCTTCTAGCAGAACTTTAACAATACCGCTATAACATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chr2L 7504845 5' + roo 6 2 68.32 ATAAAATGAGAAGAAACTCTCACAACGTCGGCGTCACTAGAAGCTGCACTCCTAATCTATTGCTTTTATAGGGGATATCGACGTTCATGCGGACACACGGA:1 + chr2L 20840153 5' - INE-1 126 1 69.31 CGTAACAATAACCAACTTGTTAATAACGCTAGTTTCCGACAGCTTTGTATGTTTTATATACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCT:1 + chr2L 5974451 5' + invader4 2777 2 62.38 GGTGAACCAAAAGTATTTCCATTCCCAATTGCAGCATGTCCTTGTGATTTTACTTCTGCTTTTGCGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAATATCCGATTCTGAA:1 - chrX 6486965 5' - Bica 4548 1 71.29 GAAGAATATGTAACGGCCATTTACAAAATATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chrX 19326845 5' - pogo 2058 1 71.29 CACGAATTCTCTGTTTTATCACGGGCACCATGGTATCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAAT:1 - chr2R 22606182 5' + Doc2-element 4488 1 77.33 GTGTTCTCTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGA:1 - chrY 3648883 5' - HMS-Beagle2 7168 2 72.28 AAAAAAAAATTGATTAAAAGTCGTACAAAACTAATAATTATATGTGCTTTACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAA:1 + chrX 19080275 5' + Ivk 27 1 56.44 CCAGCACATGATGCAGCCCCTTGGTAATCACTACCACTACTATATAGTCTGTATATAGTCTGGTCGGCATGTGGTCGCTGTCGCTGAATTAGCTGTAAGTG:1 + chr3R 14077303 5' - Porto1 4311 1 74.26 TCTATTGTTTTTCAATGGAAAAACCAGTGTATTTTCCAGAGAACCTTACCTAAGTTTTTATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:2 - chr3L 17652792 5' + pogo 14 1 65.35 TTCATGTGTGTTTGCTTGTGGGTGTATAGTCGATAGTCATGGATGGGTGTATGAGTGTGTAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTAT:1 - chr3L 9184865 5' - mdg3 5296 2 63.37 GCCAGGACGCAAGTTTAAAGCGAGTCCTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCTTCAAGATATGAA:2 + chr3R 12781651 5' + 1360 480 1 73.27 CTAATACCGTATCTAGCGGATATATAAGATGCTTTATACGTGATGTTAGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTGCATATATACATATACATATGTATGC:1 - chr2R 4620251 5' - Stalker2 7498 2 55.45 AGTGTTCCGTGAGTTTTGTTTTATAATCTGCCATTTTGAATTATCATTCCATTATATTTCTTTACATATTGTCAATACTTTTTTTTTTATATTAATATATA:1 + chr3L 11511077 5' - Rt1a 5070 1 80.20 CCAGGGCCAGCATAAAATGAGGAAAAACACCACGAAGCAGCCGCAAACAAATTGGTTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACC:1 + chr2L 15833364 5' + hobo 2660 1 50.50 CGCTGCCTTGATCAGTCACTCACACAGATACAGATACTAAGCGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr3R 18448938 5' + hobo 33 1 59.41 CTTTACCGATTTTTGCCTAACCCCGAGCGGGTTTAATAACTTAAATCTTAATAAATTGTGAGGGAGTTGACAGCGGACGATTGACAAAAAAAAAGAAAAAA:1 - chrX 5173051 5' + gypsy7 5001 1 53.47 TAAAATATTAAGTGGACATCAGTAAACAAGTTGGATTTTTCGGGCTTACTGCTTGAATGAATGTCTCTATTAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATT:1 + chrX 9110254 5' - accord 7026 2 53.47 CGCTTGGCTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTA:1 + chrX 1622516 5' - P-element 2821 1 20.79 TTTGGCTTGAAAAACATATTCTTCTGATGTCTTGTATTTGATTTTCAACCTTGTTTATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGA:1 + chr3R 5393541 5' + 412 7320 2 54.46 TAACTCGCAATTCTGGCTGAAGTAAGAAATGACAAAGCCGATCATATAAAGTATAAATATTCTTGATCAGGATCAATAGTCGAGTCGATCTAGCCATATCC:1 - chrX 21487312 5' + INE-1 107 1 67.33 AAGTGGGACACCAACAGCTGGCCACAGAGCAAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:1 - chr3L 18095720 5' - I-element 5313 1 69.31 ATGTTTCATAGTTGTTATTGTCGTTGCTGCCCGGGTAATTGTGCACCTGTTGACCGCTTGCCATTTCGCATCACCCTGCAGCATGAATGGGACTAGGTTAT:1 + chr2L 15103615 5' - Rt1c 5189 1 54.46 GACACAATCCATCATTACCATTTCATTGTTCGGGCTTACACAAAAGGCAAGAGAAGGGCGATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2R 14744208 5' + roo 8681 2 63.37 ATTCAGTTTGGTTACATTTTTTCTCAGTGTAAATATAGAACGCCTCGTTGAGTTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCA:1 + chr2R 14126380 5' - micropia 5295 1 58.42 ATTCTTTTTTCTATTATACCGATCAAGGGACGCAGACAAGGCCACTATAAGACGATTCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCA:1 - chr2L 21630625 5' + Bica 4566 1 56.44 TTCGACCTGTAATCGAATTAATCGGCGTCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAAT:1 - chr3R 25096391 5' - 1360 274 1 73.27 ATCCCATAAAGAGACACACCATGTAGCAGATGAAGCATTTTCCATGCAAGTTTTGTAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGT:1 + chr3L 344980 5' + S-element 1535 1 66.34 CAACAACTTGAAACAATTAATGTGGCATTTGTGTTCCGCCGCATGACTTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCT:1 + chr3R 29548682 5' + Doc 438 1 54.46 ATGGCCGCTGTTTGTTTGTTTACAATGAAAAGTGGCTTCGGTGATTTCAGTGAACACCAGATTTCTGTCTATTATGTTGTTTTAATTTATACTTTCGAAAC:1 - chrX 19185198 5' + HB 1470 1 57.43 TCTTGTTTTTTTTTTCTTTTTCGGTTTTATGAACAGTAGGTTATCGTAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAAC:1 + chrX 6120070 5' + Doc 4456 1 51.04 CACAATAAAGTCTCTAGACAAACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAACACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGA:1 - chr3R 6996110 5' + I-element 169 1 77.23 TCACACGGCGTCTCACCGGTATCCGCTGGGTGTGAAGTGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGG:1 - chrX 7768226 5' + hobo 159 1 61.86 TTTGACAGTTATTTCAGTTTGAATCATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 + chrX 8522866 5' - 297 6930 2 76.24 ATATGCACCCCACTCCTTTCGTCGTCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAA:1 - chr2L 14073641 5' + jockey 278 1 75.25 GTGAGGCAATAGTGTTACAAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACA:1 + chrX 17346515 5' - P-element 81 1 27.72 AACTCAATTTGTAAAACGGAATTTTATTAGGTCGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGG:1 + chr2L 14074922 5' + jockey 223 1 73.00 TTTGCATCTTAATTGAAACTACTCGCATTAAAAGCGCATACAATTTTATATTCCTTAGCGCGCCATAACAAAAAGGAGACGAAGAAACATAAAGAACAAAA:1 + chr2L 7078333 5' + HeT-A 266 1 64.36 TGCAGGATGCAAGTGACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATAT:1 - chrX 21247589 5' + blood 168 4 75.90 TCCCCTCGCCTTGAATTATGTGCAGGGTTTTAATGAGCTATCGAGACTGGTGGGTGGTGCGTTTGCTGGTGTATTTGGCCTGGCAGCCCGAACATCGCTTG:1 - chr3L 22611237 5' - Stalker 496 1 69.31 GACGGATGCCAGCGACTATGGGCTGGCCGCGTTCCTCACACTGCAGTCCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGG:1 - chr3L 23678136 5' + Osvaldo 16 2 72.28 TGGTTCGCGGACAGAAGGTTCTCGATACTGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGT:1 + chr4 1033129 5' - F-element 257 1 77.00 CCCTTATTTTTATTTTGAAGTTTATTCCTTTTTTGTTAAAAATTTAATTGTTTAACTATGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCC:1 - chr3R 3629174 5' + GATE 31 2 57.43 AGAATCTAGACATTTTAGGCCATGCGAAAGAATAGTTATTAAACGGTCAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTGAAATCTATGTTTGAGGCCTATGACAGCGCT:1 - chr2R 19133526 5' - rooA 169 2 52.48 GGCGGCGCACGCCCAGCACTTAGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 + chr3R 20869689 5' + hobo 55 1 76.24 GTGTGAAGTCGTTTCACTGCGTGAATTTAATATGGGTTTAAACGATGCGGGGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGC:1 + chrX 4783819 5' - hobo 413 1 60.82 TGCCAAAAAAGCTCTTTTTGGCCACGTCACTGGGGTCCCACAACCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTAGATTCG:1 - chr3R 20787278 5' - Cr1a 4389 1 66.34 TGATTAACGTCAACTGTTTATGGTTATTTAATAAAATCTCTAACTTTCATAACGACTTTTACATTAACGAAGGGTATTTAAGGTTATTAATGGCAAATAGA:1 + chr3R 23109739 5' + gypsy7 471 1 78.22 TTTTAATCTGCATCAGTTTTCTCCTTGTGTAGTGTTGTATGTCCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 + chr2L 1590413 5' - mdg1 7426 2 63.37 AAATTTCCCCCATAACTGTCAGAAATGTCTCTGTATGTACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTAATCA:1 - chrX 817920 5' - Quasimodo 7335 2 63.37 TTTCAGCTATTCTTTAATTAGAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGA:1 - chr3R 18859987 5' - Ivk 14 1 79.21 TGACACTCTCCCTGAGCGAAAATGCACTCTTCAATGGACTGTGTGTGTGCGAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 16087660 5' - accord 186 2 74.26 GACGGTAGGAAACCATTCAACAGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3R 23485705 5' + roo 8718 2 81.19 CCCTTTCCCTACTCAAAAGCATCAGCTTTCGAGGCTGTTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAAT:1 - chrX 5210415 5' - hobo 406 1 62.38 AAATGCCGGCATAGGAAATCCTTGCGCCTTACAGAACAAGTTCAAAGATCTATTCGAGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATA:1 + chr2R 7356747 5' + accord 7028 2 58.42 ATTATGGCTTACTTCATAAGATGAAATCACTACTACTACACTACTGGCCCATGAGGGGAACTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGT:1 + chr3R 1136122 5' + diver 286 1 56.44 CGGCCATACGTAATGGTATCCAGCTTAAATAAGTCTCGTGGTGAGGTTAAATTCTCTACAGTGTGCACTCTGTGAGAAGACTTAAAACTCCCCAAAAATCT:1 + chr3L 23690884 5' + gypsy8 8 2 62.38 CGGTGTGCAAAGAGACTCCTATACAATCAAATATCTGCTATAGTGCAGTAGTACATTTATATTTTTCTTGATAACGTGTTTACTACCTACTTTTATTTCAT:1 + chr4 347794 5' + Tc1-2 317 1 70.30 GGACGTGGCGATACAAATTTACAAGACAAAACTAGAGAAAATGCTACAGTCGAGTTATCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAACTAGTGTGAATGCGAAC:1 - 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chr3R 14906897 5' - hobo 2911 1 52.48 ATTACAAACAGCGATATAAAACAATCAAGCTCAGATCAAAATATTTCCCTAAGTCCTTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGCCTGCTGCGACGCTGGCGACGC:1 - chr3R 2649233 5' + HMS-Beagle2 185 2 47.52 AGTACTTCGATAGACGATAACCAAAATCGATAAGGTTGTCCATGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCAT:1 - chrX 18142580 5' - Doc 4296 1 58.42 TTTCCCTCGCTCTATTTGCGTCCCTTATTTTTCCTTCTTCATTCTTCATACCCGTTACTTGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:1 - chrX 5256761 5' + INE-1 13 1 77.23 CAGACCCATCACATGCAGATAACACACAAAACAATCCGAATTAGTAGAAAGCAAAACAAGGCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAA:1 - chr3R 27993420 5' - transib2 2810 1 65.35 GTAATGCAAGCTGGCTAACTGTGCCGTTTACCTAACTTGGCTTGCAAGCTGCATGAAAAATTTTGAAATAAGGAGTTGTATTAAAGGTTTTAACTGAATTT:1 - chr3R 14705771 5' + Tc1 306 1 59.41 TTCAAATATAGTTTTCATGGGTTTAAAAAATAGCATAGCATATGCTTGTGAGGGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGTGTGTTGTGCTAGA:1 - chr3L 19238842 5' - 1360 3210 1 52.48 CATGGGAAAGGTTAAACAATCAATTCTGCCTTCAATTGAACTCAATTGTGCGTTGCCCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTC:1 - 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chr2L 8837237 5' + aurora-element 3833 1 51.49 GGAGTCAAACAAATGCAAATGTCGAAAGGAGCGCGTGTCTGTTTCCAGTTTCGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGG:1 - chr2R 2751148 5' + R1A1-element 5165 1 56.44 CGGTTAGAAGTTGGAAGTTTACCGCGGTAAAAGTTCTTTGGAAAAGACAGGATGTGTGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGTCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chrX 10436510 5' + hobo 17 1 60.40 ACTAAAGCCTCTTTTTCTTGGCAGTTAAAGCCGAAAGCTTCATTTGGCTTGCATAGATCATATTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTAGA:1 - chr2R 25048572 5' + 1360 42 1 68.00 AACGAATGCGTTTGCATAAGTGATTGCGAATGGATTTTCCAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCAC:1 + chrX 17051364 5' + Idefix 160 2 62.38 GTTTCTCTCTCTTTTTCGCTGCCGTCCGCGCAGCTCTTTTCGGGTTCTGTCCGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTG:1 + chr3R 5392800 5' - 412 7398 2 56.44 CCAACATCTTTGAGAGTAAGAATACTGGAATCACTTTACAAAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAG:1 + chr2R 2946021 5' + Tc1 1585 1 63.37 ATCGGGCTCAAGTACACTTATCGTTAACATGCTTCAAAGCTGGCATATAATTATTTTCAATGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chr3L 17652679 5' - pogo 2092 1 76.24 TACCCGACCGCGGAATGTGCTAAATAGTAATACCCCCACCAACAACACGGATACATCAAGCCGCCCAACACTCACTATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTC:1 - chr2R 20161056 5' + Ivk 337 1 78.22 CAAGCCGTCAAAGCAATGACGAAGAATTGCTCGATTGATAAGGTAAAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTG:1 + chr2R 3293718 5' - 1731 4620 2 71.29 CTCACTCCTCAAACCTTGTCATATTTCCACTCAACTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGG:1 + chr3L 3635425 5' - roo 9030 1 64.36 TTTTTTCTGTTGTTTATCTAGCGTCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 8869189 5' + roo 8717 2 79.21 AAAAACAAAAAACAAAAAAAGAAGATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr2R 12400752 5' + opus 19 2 66.20 TGCATCGAGTGAAAATTGCTGGCCATGTCCGAGGACCTTATATGGCTGGCCGGCATAACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 14284982 5' - roo 394 1 59.18 GGACCATAAAATTCCCATAGTTATATTAACACAACAAAAAAAGAAAGAATGCTATAGTCCAGTAACCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTTTTGTGA:1 + chr3R 20783259 5' - INE-1 538 1 77.23 GTCAGGAACTTGATATTTTGATGTATTGCACATCACTTTCATCCAAGTAATAAAATTGTTTTTGAAAATAAATCATTATTACTGTTCACACATGAACACGA:1 - 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chrY 3648862 5' - HMS-Beagle2 264 2 82.18 GTCAAAGGAAAATATCATTTTACAATTGTTTGACCAACACTAAGCGCGAGCAGCAACAAAATCGGTTGTTTTGAGTAAAGTGAACGCCAAATAAAATAAAC:1 + chr3L 18355097 5' + F-element 80 1 59.41 ACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGCTGTTGGTATTGAAACTTGGCATGTGCAATGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chrX 19820053 5' - hobo 2918 1 60.40 ATAAAACGGAAGCTAAATCAATTAGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 + chr3R 25514129 5' - hopper 1366 1 75.25 GATGCAAAGTTTTTTATTTTGGAAGAGTTAAAAGTTTGACAGCCGTCAGTCATCACACACACATACAGAGACAAACGCCACACACACACACACACACTGCC:1 + chr2L 14721019 5' + accord 7104 2 51.49 GCATTTATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTC:1 - chr3L 21912318 5' - Bari1 1659 1 73.27 GTCTGTATAGTTGAATGAGCCCTGGAGTGGCGACATACTGTCTGGCAGGATCCCGATCTCATGACCAACTGGTTCGAGTGTAATAAACCAATATATGCCAC:1 + chr3L 14152063 5' - blood 376 2 74.26 AAATTATTCGCCTATATACCATATAGCATATAGCATATGTACCACACACAAACAACACACACCACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAG:1 + chr3L 20342107 5' + Idefix 104 2 61.39 CCGTTGAACTAAAACTAGACGAGTAAAGCGTATCTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTCG:1 + chr3R 5594958 5' + 1360 40 1 64.36 GCAGCTGATTTTAATCGCAACCAAAAGCCGCCCACTATTTTCCGGCCAAGTTCGTATACGCCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 - chr3L 7742796 5' + Doc 21 1 59.41 CAGGGGGCCACGTGATTAAAAACGTATTCCATGATGAAACATATGCATAAAGATTTCATATTTAAGCCCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chr2L 14886465 5' + jockey 16 1 69.31 GTAGGCAGTAAATCAAAACCCCTTTCACTGCTCCCCCTAGAACAATGTCAACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGC:1 + chr2L 1238158 5' + F-element 460 1 56.18 TTCTTACCATCAGGCGGACAAATCGCCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATC:1 - chr2R 13340470 5' + Quasimodo 7022 2 78.00 CAAAGATGTATCTAGATGTATGTATCTAGTGTCTTTGGATGTATGGTATATTTGATTTCAAAAAATGTTTCTTACGTACCATTCGTAGCCGGTAATCGTCC:1 - chr3L 23774134 5' - BS3 1386 1 64.36 CTAAGGGTAGTATAAATAAAGAAGTAGCTGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCGCTCCCTTTTACTCTCTCCCGCTCTTCA:1 - chr3L 7692502 5' + GATE 8289 3 71.29 CTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCG:1 + chr3L 26647262 5' - gypsy4 6641 2 68.32 CGATCGATCTTCAAATAGCAAAAATGCAAACACGCGGCACTACCGAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGAC:1 - chrX 2667540 5' - jockey 159 1 54.00 AGAAGGGCGTGTGGCAACCTGCGTTCGCCCCTTTAAACATTTTTTAGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTAT:1 - chr2R 15724980 5' - mdg3 5063 1 68.32 AGTAATCATGTATGTTAAATCTTGTGGTTAATAAAGCGCTTATTGCAACGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACC:1 + chr2L 18936665 5' + blood 385 1 55.45 TGTTGATTTTCACTTATTCACGCTGTGATCCCCACCCATTTCTCACTCCACAATAGCCGAACACTTAATATTCGGACAAGTGGTGTATTTTTAACAGAATC:1 + chr3R 31390245 5' - transib3 226 1 42.57 AAATTCAATTAAAAGTCTTTATTAAAATAAAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 + chr3R 6135234 5' + I-element 44 1 68.32 AACTGACGGACTGAAAAAAAAAAACCAAGGGAAAA:1 - chr2R 11439786 5' + Porto1 170 1 80.00 GGGCCTGCGAAAACAAATGCCAAATCAATGTCCATGTTAGAGAAGAGAACGCCTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAAAATACGATTTTCGGGACGAAATCAA:1 + chrX 5336702 5' - 1360 3186 1 62.38 GCATTTCATGAGGCTAATTAATAAAGTTCAGTCCATCAGCATGCAGCTTCATATCGCCCTCCCGCTCTCCATCGGACTCTTTTTTTTTTCTTTTTGGCCTC:1 - chr2R 14001958 5' - Transib5 17 1 63.37 GGGCGTGGTGGAGGGCGATTGTAGCCGAATGGGATTTTGATTGTGTGTCGTCGTGCGCGGGTGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCA:1 - 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Osvaldo 340 1 65.35 TGGAAAAGAGAGGGTTTTCCGCGAAAAGAAAAACTATACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chrX 7823186 5' + Transpac 4955 2 66.34 GAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chrX 16217538 5' - P-element 2875 1 65.35 CAGTCACAACATATTCGGCTCTTCGATGCATTTTCCTTAAAGTCGCCATGGAGTTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr2L 16136679 5' + hobo 20 1 60.40 GGCTTGTGATATCCAGGTTCAATTTCCAAATAATCGGTATACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACA:1 - chrX 21581172 5' + Bari1 36 1 61.39 GGGTGAGCTGGCTGCTCACTGGCTGCTGGCTTATTAAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3L 9174278 5' + 412 7076 2 46.53 AAACTCAAACAGATTACCAGGAGCGTAAAACGACATGGAACGGAACTAAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGG:1 - chr2L 17906713 5' + F-element 4470 1 59.41 ATCTGATTTCATTCAATGCATTTCAAAGTAATGAATTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 - chrX 12954242 5' - pogo 2064 1 71.29 CTACACACCCGTAACACCCTCATACTCGCCGACAAGTCCGAACTATTCAGCGTCGCCGCAATATTCTCCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTC:1 - chrX 11563998 5' - mdg3 374 1 76.24 TTGCTGTCTTAGCAAATGCTGAATTCCCGGATAGTCCACAAAGATGGGTGCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chrX 7768989 5' - hobo 2914 1 55.45 TTAAAAAAAAACAACCAAACCAATGTTGACAGAAGCAATGATTTCCAGTTAAAAGTTCAACAAAAACATACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATA:1 + chr3L 17200458 5' + I-element 240 1 63.37 CTTGGGAGAGCGGAGTTAGAAATTGTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chr3R 21969105 5' + hobo 51 1 76.24 CGTTACGTTTAATGTGTGTCACACATTCCACGGCTGGTGATTGATGGGCGCCGCAAAAAACCAAAAAGAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 - chr3L 10565379 5' - pogo 2099 1 75.25 AAAATACTCGACCTGGAACATTACAAGCCAAAACAAGAGAGAACGCTATAGTTGAGTTCATCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCCA:1 + chr2L 23023252 5' - INE-1 532 1 76.24 AATGCGCGTCTTCTAGTCGGGGCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 - chr3R 17064179 5' - Transpac 260 2 77.00 TTTATGAATGCGAAATACTTTGGCTGACATTTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACCTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr2R 16980063 5' - opus 7462 2 67.33 TCTTTATCATTTAGAGCGGTATTTCGAAGGGCTGTTCAGCCAAGAATTAAACTTTTAATCGTATATATCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 + chr2L 16032227 5' + 297 6581 1 61.39 AACAATTAGCTAAGTACTAAAATCAAAACGAAAGACTTAGGCAACGAACTCGCCCGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCT:1 - chr3L 20607608 5' + Doc 4239 1 63.37 GAATGCGCGTTATAAACTGCAATTAAAGTCGCAACAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAAC:1 - chrX 10318084 5' + Doc 190 1 65.35 GGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:2 - chr2R 22856582 5' - 1360 3346 1 73.27 CTCATAGCGGCCTAAGTGTGTGGTATGAAAAAATATGTTGTTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chr2R 20196859 5' + pogo 34 1 61.39 TTACCGCATCTTCATCAAATAAACATCATCAACCGCCTCCCAAAAGCTGCTAAAACTTCATCAACCAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAGAT:1 - chr2R 10492869 5' + I-element 204 1 73.00 TTGCGGACACACACAATCCACACGTCGGTGTCGCTCCAGGCAGTCGTCCTAGTCAGGACCATCCATCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTC:1 - chr3L 27365928 5' + Doc 248 1 75.25 TTAAGGTCAACGAACAGTTAAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACA:1 - chr2L 1795801 5' + copia 53 2 83.51 GGTTTTCATTGTTTGTTGAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGAC:1 + chr2R 8190215 5' + I-element 499 1 82.18 CGAGAGGCTTCTACATCTCTGGTGTGTTTTCTTTCTTGTCCCCCCCAGTTTATGTAGGTTTTCTTCCTACATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 19026813 5' + hopper 146 105 56.99 TGGCCAAATCCCCGACGGGCTTCCTCCAATCCACACACTATTCTACCGCTTCTAAACAGGAGCCGCACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr2R 22946937 5' + roo 8693 2 70.30 AAACAGGGTTCAGCTAATTTCAAATAAAACATGTAATTTAAGTGCATACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTA:1 - chr4 1104214 5' + roo 8852 2 73.27 CATTGAAACGTCAAACTGTAAATTATAGTTATTAACATTTACTTGTAGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAA:1 - chr3R 13122912 5' - Transpac 280 2 52.48 GCTAAATGATGGCCCAACTTACTAATGAAGCAAAAACTGCAAACATATAGCTTTAATTACTTTCACCTTCATCAGAACCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTA:1 - chr3L 17146880 5' + Idefix 7218 2 73.27 ATATTTATATTTTCTTTTTGAGGTGCGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chr3L 10565294 5' + pogo 49 1 77.23 GTTTCAGAACCACCATTTAATTTATTTTATTTACAGAAAATTCAAAGAGCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:1 - chr2R 17292539 5' - Tabor 7297 2 50.50 AGTGAACAGAGAAGATGGGGGCCAGGCGGGAAGCGATCTCGAGACGGGTCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 + chr2L 7970972 5' - blood 351 2 51.49 TATAAGAAAATCAGCACCATGAAGGAAGGAAGAGCTGGGGGCAATCACTCGCTACAACTAAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCA:1 - chr2R 1730378 5' + Idefix 92 2 66.34 TCGAATATCGCGGTGATGAATATCACATATATCAGTATCAGTATCAATATCCACATATCAGCCTTCTTATACATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATTCTC:1 + chr3L 27392346 5' - 1360 416 1 79.21 TATTTGAGCGAGAATTGCAGTTAAGGAAGTGAATGTATATGTATATATAGTAAGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chrX 3244569 5' + I-element 24 1 54.46 TCATAAAGACCACAGTTATGATGGACATATATTAGTAATTGATTCCTAAGTAACATATTTGTTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCT:2 + chr3L 10045214 5' + Stalker2 7261 2 57.43 CGTTGCTTTTTGTGAAAACTTGATGTATGTGTGTGGCTATGTGTGGGTGTGTGCGTGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chrX 6146645 5' + hobo 18 1 61.39 CCCCCACTCGCGATTCCAAAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAAC:1 + chr2R 23908374 5' - Transpac 259 2 79.59 TGCAATTGATTTGGAAGCTAATATGCGTGACCAGGGCACCGATGAGCCACCACCACCCGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTG:1 - chr2L 16992805 5' - hobo 467 1 50.50 AGTTTCAGTGGGGGACAAAACGTTGACTGCTTGGTTTTTTGGGGCTCCTTGTTGCATAAATTAGTGCCGACATGTGAACCAAAAATTCAATTAAAACTTTT:1 - chr2L 13460660 5' - Tc1 309 1 62.38 CCAGAACTAGATCACTTAAAACTGTTTACGTTTTCGTTTTGTTTTGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGAGTTAGT:1 + chr3R 23817687 5' - F-element 492 1 76.24 TTCGTGTTGGCCCTCTTTGGGGGTTGACTTGACGGTTTTTCGTTTTTTTTTTCTTTTTGGTTGGCTTATTTTTAAGGTTTATTTTTAATTTCAATATTGTA:1 - chr2R 12704013 5' + hopper 191 1 71.29 CAACCCTTTGCTGTTGTTGTCCTTGGGCTTTTATTGCATGTTTTATTATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTGTACTATGAAAAGCATAGCCCAGCAGT:1 - chr2L 2072629 5' - Tc1-2 40 1 69.31 TACGGTTTCTGCATGCTGCGATTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCACCCAGTTTAAAGCACGGCTTAGCGTAAGCCCAAAACCCTT:1 - chr3L 10117890 5' + I-element 57 1 76.24 GAGCTTATAAATAAAGAGCTTAGAGATTATATATTCAACATGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGA:1 - chrX 6156227 5' - 3S18 6068 2 58.42 AACAGCAGCAGGCAGCACATGCAGAAAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 + chrX 4398755 5' + G2 3077 5 88.37 TTTACATTCACATGTTGCCCTTTGGGCGACACACTGCTGATGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA:1 - chrX 3446042 5' - accord 7028 2 60.87 GTGGGAAGCAGAGTCCAACAAATTAGGTCGATTTCCCCTTATCATATGTCACTGCCCAAATCGAGCGAGATAAAGCGAAAACCGACAAAGAAAGCACAGGG:2 + chr2R 17639997 5' + G6 455 1 60.40 GAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTT:1 + chr3L 27356069 5' - Tc3 1693 1 77.23 GTATCCACTGTGTGTATCTAAAACATTGATTGATTGTCGGCTTAAGATTGAAACAAGTGGCATGAGAAAATCTTAGATGTACTGAGTTAGTGGGTTGTTTA:1 + chr3R 9350434 5' - Tom1 232 1 62.38 CATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAAGGGAAAAGAATA:1 + chrX 7480765 5' + Bica 342 2 59.60 ACACACACACACACAGACACAGGTATTAAATTCCCTCCGAAGGCTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr2L 9796489 5' - roo 9039 1 55.45 TACAGGGAATGCTTCTTTATTCATTCCCTGAAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATATAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTG:1 + chr3L 24031818 5' + Stalker 7129 4 75.25 ATGTCAAGTGTTTATGTCTCGAGCTCCAGGAGCTTTAGTCGCCAAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTAT:1 - chrX 16466975 5' + Doc 4276 1 56.44 CCACATTGATGATGACTCCGAGTTTCCAAGCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr2R 10865688 5' - pogo 2058 1 74.26 TGTTTTGTGTTATTTTTTTTATTTTTTTTTCGCGCGGGTCCCACGGCCACATCTCCCTCCCAACCGACTGAGGGGCGCTGCCGTGTATCG:1 + chrX 11622209 5' - Cr1a 4403 1 78.89 GGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCC:1 - chr2R 2868557 5' - Rt1b 4730 1 44.00 TGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACGTCAAGTGCTGCCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr2R 19209448 5' + Doc 46 1 68.32 AAATTGTATGTAAATAGTTAATGATATTTCAATTTGTTACCTAATTATTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGT:1 - chr2L 11156332 5' - copia 227 1 62.38 TTGTTATTGCATAAAGCGAGAGAGCACGGTGAATATTTAACAACCGTGCGCCTATTTAGCTCTAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 - chr2R 20996515 5' + P-element 14 1 66.34 TGGGCAATATTACATTTCTTAAGACTATATTAGATATGATGATACACAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATT:1 - chr3R 10715854 5' - Juan 4113 1 53.47 TACGCACGTGCGTTGCTTTTTGTGAAAACTTGATGTATGTGTGTGGCTATGTGTGGGTGTGTGCGTGTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chrX 6146635 5' + hobo 8 1 71.29 GGAATGGGGAAAAAGTTGTATAAATTTATTTATACAGTATAGTTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chrX 7698648 5' - pogo 2055 1 73.27 TTCGTTAAGTGATCAATTTGAATAGGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 - chr2R 9001687 5' - mdg1 370 2 76.00 CTTCACTTTACTCTTAACAATGTAGGCAGTAAATCAAAACCCCTTTCACTGCTCCCCTAGAACAATGTCAACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCT:1 + chr2L 1238137 5' + F-element 452 1 71.29 GTTGCATGGTCACGCTTTGGGACTGTGGCTGCTGTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTT:1 + chr3R 18655780 5' - Porto1 201 1 67.33 AACCCTTTCAATTATCCATGGAGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 + chr2R 4344557 5' - pogo 2050 1 76.24 TGTAGTTCACGCGTTAATTGAATATATACCACGAGGTAATATGCATGCCGGAGCGCATGCTGTATTCTCGTTTGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTA:1 - chr3L 25997104 5' + micropia 188 2 78.22 TAAATTAGTTTGACATTTAAGCCCAGGCAGTTTGGCATCAAACGGCCGGTGGGTCGGTGTTTGATTCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAAT:1 + chr3L 3256713 5' + invader4 2770 2 74.26 TTTTGCTTTGGGCGTGAAGTGGATTTTTGGGTCAGTCCGACTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAG:1 - chr3L 8869230 5' - roo 8601 1 60.40 ATAATTATGTAGATACTTCTACACTTAGCAGTTAGCCACGCCTAAACTACACACATACATACATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chrX 8522949 5' + 297 6 2 74.26 GGTGGGAAAGCGAAAGAGGGGAAGTTGGCGTCTCAGCCTGCCGTTAGGCATCTCGACAGACATCTTGACCCTTCACATATCCTTCTCCGTGCTCCTCTGTC:1 + chrX 7386111 5' - gypsy8 4471 1 76.24 GCTCGTGCGAATGTTTAACCCAATTTGTTGCTGCTGATACCTAATTGGCCCTTGTGTATTTCGCCGTAATGTTCGCCGGCTGAGCCAATCACGGTGCGCGA:1 - chr2L 16033196 5' - G-element 116 1 69.31 TTTGCACCTGGACCTAAACCGGATCGAATGGATATAGAGCCGCCCATTGTGAATCTAGCAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGTGACTGTCAAGA:1 + chr2L 246628 5' - S-element 1516 1 63.37 TTCCCCGAACGGCGGACACTGCAGCGCACACACACACACAAATACAAACACAAACACTAGAACACGTGGGCATAAACACACACACACACACACATACGCAC:1 - chr3R 14002668 5' + accord 187 2 65.35 TTTTCTGCCTTTTGGATTTTTTTTTTTATTTGTCAGCTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGCAGGTTTTTATATC:1 - chr3R 13527016 5' - Burdock 288 1 61.39 GTTTCTTGTCTATACGCACAAAATGTGCTTCTCATTATTTTTACGTACTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chrX 6146732 5' - hobo 2914 1 54.46 TGGGATAGAAATTAAGCATAATATAACTTAATGGCCTCAGTTCCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 - chr3R 28678241 5' + I-element 43 1 63.37 TGGAAAATGCGCAAAATCGCCGTCCAATGGTGTCCAGTGGCCAACTGTCCAATGGGCAATGTGAAATCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTG:1 + chr2R 12256550 5' - roo 388 2 60.40 TGATGATCATCTGGTAATGAGCATGATGATGTTGCTGTTGCGCCCACTTTGTGTGGGCGAGTTGTTGCTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGC:1 - chrX 7633338 5' + P-element 199 1 68.32 GGAAATGGAAAAGCAAGTTCCAAGCACCAGGCGAGGAAAAAAGGTGGTCCTTCAAATCGACGCACCTGGCATTCAAAACATTGACGCGGTGCCCAAAGCAC:1 - chr3L 3476170 5' + HMS-Beagle2 6775 1 66.34 ATACATATATACATTTGTCAGCGTGTGCGCGTGTGCCTTATTTTCGTTATTTTTTAATCTACCGTATCTCTGTCTACAATACTGTAGACAGAGATACGGTA:1 + chr3L 17189325 5' - Circe 95 1 52.48 CGAAAATTAAAATGCGTAATTTAAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGGTGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAG:3 - chrX 7335126 5' - Tirant 8457 2 74.26 ACTGGAGCCCCGGTTCTGAAGTTCCCCTTTCGAAAAGCAATGTAGATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3L 22418480 5' + hobo 31 1 59.41 AGCTGACCTCATAGTTGTTCCCAACTCCAGAATGGCTAAAAAATCTTCGGTATTTGTGTGCGCTCCTTCAATACCATACGTCCGGAGAAACATTAGGCGAG:1 + chr2R 915546 5' - Gypsy12A_LTR 1886 1 68.32 TAAGCGCATTGCCCATTTACACGCAGTTGAGCATTTTTTGCGCTTAGTTGTTGTTGTCATTACCGTAGTACGTCTGTGTTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTT:1 + chr3R 21972526 5' - Doc2-element 218 1 82.00 TAGGCATTATTATTGATTGAGTATGTGCACACAAGCGATTTCTAATGAATGACTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGAAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGC:1 - chr3L 15633437 5' - Max-element 89 2 53.47 TACGCAGACATACGGACAGACATATATACGGACATACGGACATACGATTAGTCTAGCATAAGACGTAAACAAGTTACAGTTAGAAGGGAGTTAGAAGTTTG:1 - chrX 14985403 5' - 3S18 5919 2 60.40 TGACCAGAATTCCCTGAGGGTGGCTTAAGATTTGACCAGGATTTTTGGCTCCCCTGGTACGTGACGAACAAGGTAATCGAAAGAGACCTGAAAGTTACCCG:1 - chr2L 23033520 5' + G5 4511 1 62.38 AAGAAACGTCCGATACGGTCTCGATTTGAAGGTATATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGC:1 + chr3L 12913609 5' + 1360 42 1 66.34 AAACAATCGGAGAGCGGGCGAAAATTCTCATGGGAGATTGAGTATGCGCTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chr2L 6324552 5' + hobo 24 1 55.45 CTTTCAACCTGTATCTTCCAACGTTTTCGCACATAAATCTTCTGCTTTTTATAAGCCATCGCATCGTGGGTGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCT:1 + chr2R 21877047 5' + 1731 4598 1 83.17 AAGGACCCGTCGGGCCGACGTACAACGATGACGAAGGATTAGCCGAACCAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATT:1 + chr3L 21194809 5' - 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G5A 2696 1 55.00 CCCGAAAAAAGGACAACCTGACCAGGACGCATACACTGAGAATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATT:1 + chr2L 17168437 5' - flea 4982 2 62.38 CTGGCAAGCAGTAAAAGAAGACTGTATGTATGAAATTTAAAACTTTGATGCCATGTCGCGTTTGCACGTTCAGCAATTCCGTTTTGCTGAGGGGTATACGA:1 - chr2L 22323404 5' + frogger 2091 1 63.37 TTGCTTTTGGCCCGGCATTATAATAATGCTCTGGTAATAGTTCGATGGCCATAGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 14285082 5' + roo 8686 2 58.42 CAACAGCGTCGGTAACAAAGCAAAACAGTTTATATGCAAGAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGA:1 + chr3L 21924964 5' + mdg3 5158 1 60.40 GGCAATAAATCAAAGCGCCAGCTCTCAGCGACTACGACTCACCTCAGACTAAAAGCAAGGGATCTACACTAAACGTTCGCTCTCCCCTAAGCTTGGAGTAC:1 - chr3L 3674115 5' + Doc3-element 4263 1 65.35 TAATCGCAACCAAAAGCCGCCCACTATTTTCCGGCCAAGTTCGTATACGCCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 - chr3L 7742785 5' + Doc 31 1 50.00 TTATAGAATGAAGTTGAATTGCTATTATTTTAACCGCTGCTGTGCTGAAATGTGCATGCATGTATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 - chrX 13749544 5' + S-element 8 2 73.27 TATTTACTTTATTGGTATAAAGGCCAAATATTTGTTGATCGACCAAATGAATAATGAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCC:1 - 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G4 209 1 67.33 CCCAGATTTTATTGGCGTGATTCATTTGAAATGCTGCCACATGTTGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTC:1 - chr3L 3637334 5' - roo 75 2 61.39 CGAATCTATCATAATTCAGAGGCAGCAGAGAGAAACCATTAATAACAACCAATAACCTTTTGGAGCTAACTTCCTTCGTAATACAGGGCTTCAGAAATAAT:1 + chr2R 21410242 5' + Q-element 270 2 57.43 CACTCCCACCATTTCCCTTTTCCCGCTCACATATTTGCACATAGTACACATTTCATGCGGAACTGACGCTTGTGTGACGCTTCGCCCAAAAATATATGGAA:1 + chr3R 27434999 5' + jockey 4639 1 80.20 TCCCATTAAAGCAGCACACACACACACACACACACATATA:1 + chrX 12993267 5' + accord 7030 2 75.00 GAAAGGAAAGCGGTGAAAAACGGGCTGCGAGGAGAGAAAGGAAAACAGGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCCGCTTGGTTAGAAAGG:1 + chr3L 17213427 5' + micropia 234 2 55.45 CTTTTTCCCGATTTTCCGACTTTCTTTGCGTCCATCTGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCCTTTTCACTT:1 - chr3L 15724871 5' + 17.6 315 2 61.39 AATAATGAAGTCGTTAACCCACTGCGATTACCGGTTCTCACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACC:1 + chr2L 3680876 5' + Idefix 91 2 61.39 AAACAATCAGGGGGAAGTTGAATTTATTTAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 23064711 5' + TART-B 10505 2 57.50 TTGTAAAACGGAATTTTATTAGGTCGCAGTCGAGCCTTTAGTTCCCTGCCCGCTCCCCTCTTTATCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTA:2 + chr2L 14074930 5' + jockey 232 1 64.36 AACTCATCGCATCTTCATAGCCAAAAAGCAACATCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 - 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chr2L 7971041 5' + blood 38 2 60.40 GGAGGGGGATGATTTCCTTATAATTGTCAGCGGAGGTGCAAAAGGAAGAAGGAAAATATATGCTTTCCTTCTTCCTTTTGCTCCTCCCCTCTTAATTGACG:1 + chr3R 26527614 5' - HMS-Beagle 6778 1 66.34 TTATATTGCAAAATGTCAAGGACTCGCCGATGCAATTCAATTTTTTATGCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:2 - chr3L 9174758 5' - 412 468 2 53.47 GTTGGACCAAAACTGCCTTCTAGACCTTCCATCAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAACCGTTTCCGACCAAATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCA:1 + chr3R 3864525 5' + INE-1 81 1 67.33 TGACCACTCTAATGGACCATCCTCGGTGTGTGCACTCAGCGAAACAAATGCACATGGTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chr2R 22793419 5' + hobo 16 1 63.37 CTGTTATATTTTGCGTTAAACCATTCAAGAGAAATAATTAGGGATAAAAGTCAAGAGGCATAAGGTAAAGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 - chr4 1234616 5' + 412 6 2 73.27 CTTGATTTGTGGCGACTTTTGAGAGCCACCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr3R 20463398 5' + hobo 47 1 73.27 CAAGTATATTTTTCGTATTGTCAACCTTGGGAGAGCGGAGTTAGAAATTGTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3R 21969130 5' + hobo 25 1 53.00 TCTGAAGTGCAGACGATTTGCATAATTCCAAGGACCAGCAAAGGACGCACCCTTCGCTATCCAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGC:1 + chr2R 14803223 5' + hobo 2704 1 62.38 CCTCGAAACTGAAATCGAACTGCACTCAACACAAACCGTATATATCAAAGACACTAGAATAACAAGATTCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 - chr2R 11400374 5' + 1360 35 1 59.41 ACGGATGCAAAAGCTTATGCTTCGAAATTCGTGTAATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr2R 15826586 5' - roo 9029 1 65.35 GTTTTATTTTTAATAATTTAACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATT:1 + chrX 20524856 5' - P-element 157 1 21.78 TGATGGCTTTTCGACAACTCAGAGACTCCGTAGCGAGTGTATTAGAGAGCGCTGCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chrX 10437630 5' - hobo 2919 1 61.00 AACATCTATTGTTTTTCAATGGAAAAACCAGTGTATTTTCCAGAGAACCTTACCTAAGTTTTTATATGTACAGTATCATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chr3L 17652796 5' + pogo 10 1 69.31 CCCTTAACCCATGCCATCCAACAACCTGATTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 - chr2L 7971035 5' + blood 7055 2 66.34 TTCTGAGTGACTCCAACCAAGGACTTTTTGCTTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 12058675 5' - roo 9027 1 67.33 TTCTCACGTTCCTCTGACTAATGCCCCCCGATGTCTTATCACTGAGTCAGCTGTTGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCG:1 + chr3L 5823165 5' - X-element 4391 1 54.46 AGAGCCTTAGATGCGACTCCAGTTTGCGGCTGCATCCAGAATGCAGAACGCGATCTCCTCGAGTGCCGGCGAATTGAACTAAAATAAAAATAAAAAAAAAA:1 + chr3L 6390069 5' + F-element 4685 1 70.30 TTTTACTTTCAAACGGTTCGATGATAAATTAACCGAAATGAGGCTCGTAAAATGCATAAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACACTGGGACAAACAAGAAA:1 + chr3L 10521234 5' + Tc1 1609 1 60.40 CTACGCTTTCCCCCACTCGCGATTCCAAAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 + chr2R 23908365 5' - Transpac 5184 2 71.29 GCGTAACAAATGAAATGTGACACATTATGCGCTGCAGGAGTAGGTCGGGCTGCCCTGATATGTTGACGTAGTTGCTCGGTTAGTCGGTGATCCTTGCTGAA:1 + chr2L 12789644 5' - Chimpo 3833 1 74.26 TGCCTGAAATGAAAGGAAACTTAATTTCAGTGAGTCAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 + chr2R 4167438 5' - 1360 3349 1 67.33 GAAATTGCCTGGAGCAACTCTTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTATTCTATCACT:1 + chr3R 25989350 5' - BS 4855 1 77.23 TGGAAAGTTTCACTGTTTTCCGCGTTCTCTTTTCCCAAACCGGTCGTTAACCCAACTCCGAACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 + chr3R 8015082 5' + hobo 84 1 68.37 GTAGTCCAATAGGAGCTCATTACAGGCGAAAGAGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCGTAT:1 + chr3L 14380596 5' - 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F-element 4681 5 71.29 TGAAATTATTGTTTTTAATCTGCATCAGTTTTCTCCTTGTGTAGTGTTGTATGTCCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr2L 1590401 5' - mdg1 7438 2 53.47 CAATGCAATTGAAGTCACTATCGCACTTGTGGGTCTAAGCTCATAGATAAGATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACAG:1 + chr3R 2916134 5' - Cr1a 4107 1 63.37 TATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCT:1 - chrX 20999573 5' + BS 30 1 61.39 CCATCCCATTTCATGTTTGGCTTGATGCGTGGCTGTTAATTAACACTAGACAGCACTTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAAC:1 - chrX 13641431 5' - jockey 4983 1 55.45 CAGTTAGACATTTTTCGTTAGCATTGTAAATTTTCTTAAGTTCTCCATTTTTGTTTGGGCCAAGTAAGATAATCGAGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chrX 15258994 5' - roo 409 1 79.21 TACTTTTCGGCAGAACCAAAAACGAGTGCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chr3R 29333746 5' - hobo 2892 1 72.28 CCAGGATGTTTTCCCCTCACGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTA:1 + chr2L 3909444 5' + copia 4797 1 80.20 CATCTAACCGAATCAAATGGCTGATAGAGCCATCAAATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - 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chr2L 13711457 5' - hobo 2909 1 60.40 TTTTGCTGCTCGAATATTGCACTGTTTGGAAAATTCCAGGTTGGAAAACAATTTGAAAGCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 22521796 5' - roo 9055 2 62.38 TGTTTGTTTGTTGATCTTTGACACTAGGCTGTAATTGAAAGTTTTGTGCGGACATTTGAGGAGACAAAGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCG:1 - chr2R 13352258 5' - Transpac 5220 2 71.29 AACTAATGGAAGCTTTTCTGTGAAATGATCGCACTTACTAGCTTCTTTTGCCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGT:1 + chr2R 24538956 5' - Doc 4410 1 52.48 CAATTACTTTCTGCTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATAT:1 - chr2L 12237283 5' + P-element 140 1 24.75 TTTGCATTGAAACGAAAATCCATGTTTAAATTTGCATCCCCAAGAAGTAAGTCAATGATTTTGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chrX 12954154 5' + pogo 11 1 66.34 GGAACTTGTAGTTGTGCGTGTGGAGGGACCACATGGTCATGTTGCGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTG:1 + chrX 18307044 5' - Quasimodo 7088 2 55.45 CAGTTTCCTATTATATACATACATTCTCTAAGGCCCTGTAAAGAACTTAAAAAAATTATGAAGCTAGATCGAAATCAAACATATAAAAAAAAGAACCAAAC:1 - chr3R 7942172 5' - BS 5020 1 49.50 TTGCATCCACTAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 + chr3R 22494709 5' - 1360 3349 1 70.30 TTTGCACGCTTATCTTAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chrX 14521671 5' - roo 353 2 83.17 AATTTTGTTTAAAGTTGTTGACCCAAAGAATATAAGATCCCACATCAATATGATCTTGAAAAGTTATTTTTTCAATGGAAAAACTTCTACAATATTTTATT:1 + chr3R 18917414 5' + S2 1389 1 88.12 TGACTACTTGGGCCAAGACACATCTTTGGAGAATTAAAAACGTGAATAGAAGTGTGTTTAAGCCGATTCCGTCCGTGGTCGCCAGTTTCGTTTTTTCCAAC:1 + chr2R 10489785 5' + Max-element 415 1 64.36 GTAGAGCATTTTCTTTTGGTTGGCTATAAAATTCAACTAAATTAGCTTATTAAATTCACTACCGCTCCTACCCCCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTC:1 - chrX 9746813 5' - invader1 3712 2 64.36 CAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAAGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGC:1 - chr2R 4677357 5' + invader3 5200 2 66.34 CCTAGAAAATGTTCGCTTTTATGTCAACTAAAGCTTGAGTTGTTCGTAGTGTTTCCACCCTTTTACAACCGCTGCCTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAA:1 + chr2R 9511648 5' - Circe 7133 1 53.47 AAAATCAATTAAAAATAAATATACAAGTGAGTAGGCACAGCCAATTAAACGGACCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCAAAGAACTTCTAAGGCGAAGGGC:1 + chr3L 24505236 5' - 1360 223 1 53.47 GATTGATAAGGTAAAAGTTACCATGCAAGCAGGCACGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCT:1 + chr2R 3293750 5' - 1731 4588 1 61.39 GGCCAAAGGAACACATGAGCACCACGATTGGTGGACTTGATTCCTCGTCATCGGCTGCACCCGC:1 - chr3R 19841631 5' + F-element 460 1 79.69 GTCAAAGTTGCCATCGTCCTTCTGCAATATAAATACAAATTCAAATATATAATATATTTGGGTATTAATTTAAAGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chr2R 12370665 5' - roo 408 1 82.18 GTCGCAATCGAAGTTGTCGTATTCTCAGCCTGTTTATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 + chr3L 14260347 5' + 297 56 2 47.52 ACGAGTGTATTCTCATTTATTGTCTTCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 - chr3L 25411880 5' + 1360 31 1 74.26 TCGCATGGGAAGTCTTCTGGTGCGCTTCGTCACTACGAGGACTGCCGTTCATAGTGATACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr4 1234506 5' - 412 476 2 61.39 ATATGATCGCGAGATATTAGATTGATACAGCACACCTTTCGAAAAACATATAGATATGCTTTAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCG:1 - chr3L 20224250 5' + Chimpo 2 1 74.26 AAATTTCGTGGCTATTTATGGATATTTGCAGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr2L 10820606 5' + roo 8711 2 78.22 CACTTGTGCAAAGGACTTAGGTCCCGGTTTTTCGAGGGCAGGTAGCCAGGATCCGACCCCGTACCAACCCCTGTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chrX 409560 5' + P-element 4 2 76.24 AGAAATGTCCGAACACAAATACTTTGCAAATTATTTTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCCAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGA:1 - chr2L 19610310 5' - Idefix 393 2 71.29 ATTTTGCATACTCCAGCTCCGCAATGGAGCGAGGATGCAGAACGCCGCAGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAGAACTACAC:1 - chr3L 20936135 5' + Porto1 4536 1 54.46 CACGGACGACACACTGGCCCCCACTCCGACGCCCGCGGCGGCACCGATCTTACGATCCATACAACCAAATACCATAACTACATATATACATATACTACAAT:1 - chr2L 9986864 5' + gypsy11 30 2 60.40 TTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGATG:1 + chr2L 23286585 5' + Tirant 416 1 60.00 ACTGGAAATCAAAGAACCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGACCCA:2 - chr3L 25350823 5' - baggins 5416 1 41.58 TTGTGGAATTTCTTGGGGGAGCTAATTGAATGTTTTTGGCTGATCATTGTGGCTGCTTTGATGCACTGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTT:1 - chr2L 9278602 5' - I-element 280 1 71.00 AATCAACTAATGAAAAGTGCAAAATAACGCAAAAAACATATGAATATTATATTGTTTGGTAACAAAATGTTTGTTTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 + chr2L 16968383 5' + 1360 1 2 76.24 GGACGAAAAGTATGCTATACAAATCTCAGCATGGTGAATTCTTAGCGTTTACCATGAACATACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCT:1 - chr2L 11475204 5' + jockey 4690 1 58.42 GGTTACACTACATTATTAACCCATTCGAGGGAGATTTGTAGGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 - chr2R 16902926 5' - flea 4983 2 58.42 TTTTTTATGATCAGCGAACTATTTTCTGGCCATAAATCGATTTTGAAATATGTTACCAATATTTAATCGCTCTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 - chr2L 7745993 5' + I-element 5 1 70.30 TTGCCAAACTTTAAAGTGCCCCAGCAATTTGGATCATTTTGTTGCCTTCGCTGAATAAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCC:1 - chr3L 3739584 5' - Porto1 4278 1 63.37 CCGGACCACTATAAATAAATGGTGCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 - chr2L 16718003 5' - 1360 3337 1 77.23 GCCGTCGTGTTACACCCTTCGATGCTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACCACGGCGATGG:1 - chrX 17234659 5' - gypsy4 6429 1 81.19 AATAAGTCCAACGCCAGACTATTGGAACTTTTGGAAAATAAAATGCTTGAAGAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGAC:1 - chr3L 24335900 5' - 17.6 351 2 58.42 AGAATCAATAAAGTCCTCAAATCCCTAAAGAGCCTACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3R 21998452 5' + 412 7092 2 63.37 TGACTATGCCTCTAAGTCACGATAAAATGCTATTTTAGATCCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr3L 18034174 5' + Doc 40 1 56.44 GAACAGCCAGGAACAACAAAGGCAGCCTGGGTGTTTGGAATCGTCGGTTTTCGAAGTGGTCAGAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 - chr3R 20547856 5' + 1360 15 1 45.54 TTTCTGCCATGACCACAACAAATAAACTTGAGCATCTTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAA:1 - chr3R 28281873 5' + opus 7471 2 64.36 ACCCGATCCGTGAGATTTTTATCAATCATCTACCTCCACGATTTGTAATCAGGCGTGTAAAAATTAATTAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCAC:1 - chr3R 17551503 5' + 1360 460 1 62.38 TGTTTGAATTAAACGGCAACAAGTTAATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGC:1 - chrX 1523524 5' + jockey 4719 1 74.26 TTCACTCATGGCCAAGTATCGAGAACCTATAGAACTTTATGAGCACAGCAAAAACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAA:1 - chr3R 30506892 5' + 297 6556 2 59.41 AAATGAAGTTCAGAGATTGTGGCAAATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATT:1 - chrX 10210989 5' - I-element 5309 1 71.29 AAAGTATTTGCGATTAAAACAATATTTAATTTAATATAAAATATAATTTGCCTACCTGAGAGCAATCCAAACGTCACCTCATTATTTCCTTCTCGGAATTT:1 - chr3L 135420 5' + copia 401 1 55.45 TATTTTCAAGCAAAAGCGTACAAGTGCTTTTGGCGCATGTGCCAGATCAATCAATCCACTTCAATATTACGCATTCTGAAATGGAATTGTCTGATAGTGCC:1 - chr3R 26773676 5' - Bica 4527 1 75.25 GATGACGATGATGATGATGATGATGGTGGCATTGCAGGCGTGACGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 - chrX 14148478 5' + Doc 59 1 57.00 TTTAATCGCAACCAAAAGCCGCCCACTATTTTCCGGCCAAGTTCGTATACGCCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 - chr3L 7742787 5' + Doc 30 1 50.50 CCCAAGGTAGCTGACATATTGACTCCTTTCCAAAATACTGTCCCATCTTTGGCTTAATTAGCAATGACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 16449822 5' - roo 400 1 70.30 TCTTGGAGCGCTGCTCTACCATTTTTATCAACGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCATTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGC:1 + chr3R 20965348 5' - Quasimodo 254 2 69.31 TCATCTCAGTCTGCGTTCCATTAGGATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACA:1 + chrX 20365694 5' + McClintock 96 2 75.25 ATATATGTATAAAAGTAAAAATGTTCGCTAAGAAACGTCCGATACGGTCTCGATTTGAAGGTATATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chrX 12024042 5' + 1360 13 1 66.34 GCGCTGTAAGTCAATGCCAATTGCTGAAAGCGCTCGGCGAACAAATAGCGATCGTGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 16338161 5' + roo 8685 2 58.42 GGTCCTTCATCAAGTCCATTTTCTCCCCTTTTCCACCGCCTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chr3R 25443041 5' + 297 6608 2 59.41 TCGTGTGTTGGCCAATAGCTCTGCAGCCAGTGCTCGATATTCACTTGGAAGAACCGCGCAAAAACGCAACAACGCAGCAGGAATGAGCGCCGTACAGATAA:1 - chr3R 22721024 5' - diver2 127 2 82.18 TTAATTGTGTGCCTCAGAGATTTTTGATTGAATTTAGTTGATTTTGTTCGATATAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACG:1 + chrX 12783808 5' + McClintock 6394 2 62.38 GGTTCGTTGACAATGTTTTCGTTGCTTTTCGCCAGGACTCATTGTCAGTCGACTCGGCCTATAGTCCATTTAGCTGGTGGTAGATTATCATCCTTTATAA:1 + chr2L 15189579 5' - diver 5657 1 52.00 TGCGTAACGTGCGTTTTAATGAAATATTGAATTTTATTGCCTGCGTGCCACAGTGCGCTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGT:1 + chr2L 3987917 5' - Circe 7119 1 49.50 GGGTGATCGCAGTGCTCGCTTTGATTTCATTTGATTGGAAACTTGCATTTCTCCGGGAATGTTTTCAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCA:1 + chr2R 17033423 5' + Transpac 5127 2 70.00 GTATCTGTGTTTTTTTCTCTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 18270312 5' - Porto1 171 3 84.85 ACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATT:1 + chr3R 14049368 5' + transib2 53 1 78.22 ACATGCAGATGGATGGAAAGTTATCATTTGCCAAATACTCGGCCACCTCTTGCATCAGAGTTCACTTTACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGAT:1 + chr3L 1889492 5' - F-element 44 1 66.34 AACAAGCAGACCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTTTAATCGAGTTTC:2 + chr2L 22699413 5' - INE-1 573 1 75.25 AGAGCGCGCAACTAAATGTATGCTACAGCTGAGAAACTAGGAAAATTGAAGTCTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:1 - chr3L 5267287 5' - Juan 4196 1 58.42 TCTTAATACAAACCTTGAAGAGTGTATACTTATCGTAGATTTTCATCTTAATATATATATTCTTGAGCATGATCAATAACCGAGTCGATCTGGCCTTATCC:1 - chr2R 4407931 5' + INE-1 107 1 72.28 CTGGTAACCCACCTGCAACACCAATCTTTTAGATGTACCAAATGTAAAACATATTAATAATGAACATTTGTTGGGAAGCGATGATAGCGGCTC:1 - chr2L 6695995 5' + transib3 2534 1 80.65 TCTCCCGCCGGCACGCTGCCACCAATTTTTTCCCTTCGGCAGTGCATTTTCATTGTTCTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr2L 19629702 5' + hobo 18 1 62.38 AAAAGAAAATCACGTTTTGTAATTATACAACAGAGAATACACGGTCAAGGAACGAGCATTGCCATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr2L 15832651 5' - hobo 2925 1 64.36 CCCTGCTCGCTTTTGGCCAATCGCATCCTGTAGGTATGGGCATTGATGGTTTCATGAAGACTGCATGCCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTT:1 - chr2L 443830 5' + 1731 11 2 79.21 AAGCACCATGCCTAAATACTGCTTTTCACTGGCAGACTATCATTACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 16487322 5' + roo 17 2 57.95 TTTGGGGGAATAAATTGAGTTGGTCTATATGCGCGTTATGATTATCGTTTTATTTGAATGAAATCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATG:1 + chr2L 20335913 5' - Stalker2 7546 2 56.44 GACGTGGTCATTCATGAAATGTTAGTCAAGAATACAGATCTTTCGTAAGCTGCACTCGAGCTTACTAAGATTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAAACAT:1 - chr3L 22670955 5' + baggins 5058 1 62.38 GCCACCAATTTTTTCCCTTCGGCAGTGCATTTTCATTGTTCTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr2L 19629685 5' + hobo 35 1 61.39 TTTCATTTTGGTAGATTGATTGTTTACACTGTCGAAAGCGTTCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - chr2L 14743280 5' - 1360 3358 1 61.62 TGAGGCCCATCGTAAAAAAGAAAACTATTTCCATGCTCAATTGATAAAGTTCGTGCCCCCGAAGAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAA:1 + chr2L 18339603 5' + mdg3 5174 1 72.28 GATACGTTATGTGTGGAATACCTTGCTTTTGGAGCAGCTGGTGTAGGGGGATCTCCAGTGCTGCTTGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGAC:1 + chr2R 12358402 5' + opus 175 4 67.33 ATCTACTACAAAGCGAATTAGTGAGAATCAATAAAGTCCTCAAATCCCTAAAGAGCCTACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 21998475 5' + 412 7069 2 63.37 GCCTCGTTGCTCCGCCATTCAGGGTCCTTCATCAAGTCCATTTTCTCCCCTTTTCCACCGCCTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chr3R 25443019 5' + 297 5 2 71.29 GTACCAGTTCCAGTTTCCAGTAGTGTGTCACAATTATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGC:1 - chr3L 8650738 5' - accord 7347 2 66.34 ATTCAGGGTCCTTCATCAAGTCCATTTTCTCCCCTTTTCCACCGCCTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3R 25443035 5' + 297 6602 2 55.45 TGGAGCTGATTCGGTAGAAGAAGCTAATAAATTAATAACATTAATTTCCCATGAATTGCAGAAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 + chr3R 19445631 5' + Tabor 6855 2 63.37 GAAACCGGGTCATTGTTATTATTATTAGAGACGGCCCTATGATTTCTTGGAGAATCTTTGCGCTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGACTCGCGTAAGCGACTT:1 + chrX 7548722 5' - Doc2-element 4585 1 77.23 TCTTGGCGCTATCTGAACTGTCCGCGGACATGAACAATTTACTCCGTCCACTTTTAAATAAGTTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAATTAAAACA:1 + chr3L 17999095 5' - invader2 229 2 72.28 AACTTTATAAATGATCGAAGTCTAGTAATACCCTTTACTTTGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCT:1 - chr3L 7926953 5' - Stalker4 178 4 61.39 TAATGTGAATACAGGTAGTGGAAGGACCAAATGTGATTCGATTTGCGAGAAGATAGACGCGATATAAAACAGAGAACAGAAACAAGGAAATGAATATAATG:1 + chr3L 13699996 5' - Cr1a 4331 1 63.37 AGACTATACGCGTACGTGTGCGGGTGTATATCTTTATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr3R 18887038 5' + 297 37 2 66.34 GGATTAGCCACCTGATCAAATATGTCCACCTCGCCAAAGGGTATGTAAAGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGATAGGGTGGG:1 - chr2R 7716320 5' + Circe 7188 1 67.00 GGGAATTTTTAAATGAGATTGCTGTGGGACCTCAAGACGTGCTGATCAGCGGAAGAGATGAGAGCGGGAGAGTTGAGGGTGTTTTTATTGGTATATCGGAA:1 + chr3L 14225159 5' - Porto1 450 1 57.43 CCATCCTTATACCAAATTCGAACTTATGCGCCAGCTGAGCGGACGAGGTGAGGTAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr3L 9174672 5' + 412 7075 2 57.43 ACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTACTGATCAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 + chrX 21555683 5' + F-element 45 1 60.40 CTTAATTGTATTGTATTTTAGCACAATTATTAACTGTAGTCCCAAGCACATCAATATTATTATTTATTTTTGTATATTTTTATTAAGGCAAACGGGGTAGC:1 + chrX 22729103 5' - BS3 1752 1 88.12 CCTCGTATATCCTTACAGTATTCGGCGCACAAGAGTGATTTATGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTTCAGATAATAGGATAACGTCTGTTATAGTCAGAACAT:1 - chr2R 12142306 5' - Cr1a 4198 1 60.40 AAAATGTACAAAGCACACACAGTCGAGGTCAACAAAATAGTGGTATGTACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - chrX 20982300 5' + 297 18 2 62.38 CGGCTACTTCTGTTGATCTAAAACCAGCAGACCAGCCTTTTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTA:1 + chrX 8344562 5' + hobo 2679 1 61.39 GGGGGTGGCTGGCTAAGCCAAAAAACACGGCTAATGGAAAAACCTCCACGGCTGAGCTGTTAGTTCGTCGCAGCATAGTGCAACATTGTGGGCGGAAACAG:1 + chr3L 14433841 5' + gypsy5 7098 2 62.38 AAATTAATCAAAAGCAAGCAAACAAAAACGAAACGCAAAAACTATTAGTAGCTTTGCAGATATCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATAT:1 + chr3L 3989155 5' - hopper2 191 2 62.38 CTGAGTGTGTGTAACGAGGCCATGCTGTAAATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTA:1 - chr3R 20100400 5' - Stalker2 7292 2 70.30 GGTTTCTTGCCATAGTAAAGTATTTCATTTAATTATCTAAAGGTAAATTTTTTTTTCTTTTCTTCGTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAA:1 - chrX 7548706 5' - mdg3 5067 1 50.50 CGAGCAGATCTCCGGCCAAATGGTCATGGGCAGCCCAAAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATG:1 + chr3L 203155 5' - Quasimodo 6917 2 62.38 AAGATTCACTACCGATCGCAGTGCAATTTGCAACTGCAACTGCGACTGTGTGTTGTGGCACGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGT:1 - chr3L 3396717 5' - Chouto 452 1 54.46 AAACAAGACCAGCAACTGAGCGCTGTCTATGTGTTGGTCGATCGGAGGGGGGCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chrX 10629277 5' - P-element 2865 1 57.43 GGGTGATTTCAAAAAGGGGTGGAAGTGGTGGGGTAGGTTTCGTCTTAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGAA:1 + chr2L 12236576 5' + I-element 4902 1 53.47 AAGCAACGAGTCTTGTTACCAAAACGAAGAAAAAAAAATGGGAAAAGAGGAATAGTAAACGATTGGATAAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAAAAGCA:1 - chrX 3556594 5' + Bica 256 2 69.31 AAATTGAAGCAATTCCGCTTACGCTTGGCATACACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACTTTTGTGTGC:1 + chr3R 27386296 5' + hobo 40 1 66.33 AGGGAGACGGAATCGTTTGCCGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 + chr2R 12130136 5' - hobo 2884 1 79.00 CAGTTTCTAAGAAAAGAGAATCGCTTAAAATGAGAGACTACTGGCCGTAAACTTTTCCCCCCGGAGAATGTCTAAATATGTGTTAAGACATGATAAGTAGG:1 - chr3R 1251662 5' + rooA 12 2 74.26 ACCATAAAGCAAATGTGAGCCTTGGCCGAAGCATAAAAAATATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 - chr3L 13264537 5' + Burdock 6162 2 58.42 TTTGGCTTGCTTTTGGCCCGGCATTATAATAATGCTCTGGTAATAGTTCGATGGCCATAGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3L 14285088 5' + roo 8680 2 64.36 CATTTTCGCTCTAACCACGCCTCCTGGAATTGTTGTTCCTGCGCCTGTTGTTGTTGCTGTTGTTGTTGGATGCCTTCTTTTTGTTGTTAGATTTTGTGGTA:1 + chrX 3248705 5' - I-element 5181 1 75.25 ACCCATTACCTTTTTTAGATGATTTGGTAAAAATAATTTTTTTTTTCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTG:1 + chrX 6897358 5' + Ivk 32 1 54.46 GCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTCATCGGTGGCTTGGACTACCGTACCACCGACGAGAACC:1 + chr3R 28600772 3' - Quasimodo 269 2 62.38 AGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCCACAACCGGCCGAAAAGCCCGAAGAAAAGAGTCCAGAACATTTGGCATACTTAGATGCGATCAAGCACCTG:1 - chr2L 3913332 3' - F-element 81 1 73.27 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATTTACACAAAAGGGATCCGCACACGCACACACCCACGCACACACACACACACACACCCGCAGGCAG:1 - chrX 20356001 3' - hobo 12 1 64.36 GTACTTGGGCTAGGATTGATGGATATAGTATGGGAAAGTGTGCATTTGTATTTGATTTGACTATTTCTTGGTTTGGCGTGACCTGATAATTTGAAAAATGT:1 + chr2R 7097833 3' - 297 6537 2 74.26 CAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTATCATATATCAGGCGTTTTGATTATGAATTTAATCAACTTTCCC:1 - chr2L 6712687 3' + mdg1 7216 2 60.40 GGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATGTAATACTGTTACCATTCATATTCATTTT:1 - chr3L 15502733 3' + I-element 370 1 68.32 AATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTT:2 + chr3L 9764440 3' + P-element 196 1 25.74 CACGAACACATACACACACACACTCACAGAGAGGCGATGGCGATGGCGACGACGTTGACGGGGCCAAAAACTTTAATGTGGCATCAGCAAATGCGAGGCGA:1 + chrX 14979314 3' + accord 7026 2 36.63 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAAGATCTTTAGGAGCTTCAAGAAAGTAATTGCTCTC:1 - chr3L 17902250 3' - pogo 38 1 71.29 AAAAAAGAAATAATAATTAAGTTTTAATATCAAATGTTTCGAAAGAAATCAAAAGGTTTCTTTTGGTTTCAGCCATTTACCGATTCCAGGTTCGCCAGCGA:1 - chrX 14758305 3' + Tc1-2 389 1 63.37 ATTTGCATTTTTGAATGCAAAAAAAATTGTGTTTACTTAGCATTTTTATTTATGCTTCAGCTTCAGCTGCTCAATTCAGCTTCATTTGAGCTGTGCCGTAA:1 + chr3L 18936078 3' - TAHRE 10326 1 51.49 TCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTAAC:1 + chrX 10119636 3' - FB 25 1 52.48 TTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTTTGTCGATTTTGGTTCATTTTACATTTTATCCCTTCATTATCCGTTTATCGCTGACAACTCGTCACATTTTTTTTT:1 - chrX 10970860 3' + blood 166 2 65.35 GCTTCGCGACTTAGAATTTTGTCTGTCGTACGCGTTATCCTGTTCGTTCTGTGTCACATTAAATGCGCTTAAGGCGCTAAACAAACCCGTCCGGATCGTCC:1 - chr2L 5507829 3' - HMS-Beagle2 372 1 75.25 AGAAACGAAGACATACATAATAATTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAACAAAAAGCAGCAAAAAACAACTTAACTTGGCTTGCCAAGCCAA:1 + chr2R 11080569 3' + Porto1 4380 1 76.24 AAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAACTTACAGTTCAGAAACTGAGGATCTAAGATATAGGAATAT:1 + chr3R 23274081 3' + invader3 5425 2 62.38 ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTGCTCTGTGGCCAGCTGTTGGTGTCCCA:1 + chr3L 18095717 3' + I-element 5310 1 72.28 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGTCGTTGGTTCGAAACTCTTGTTTAAATAAATAGGCGATTCCGTTATAG:1 - chrX 22690714 3' + roo 407 1 75.25 GTTATTATGTTCGTATATACTACACAGGAATATCTTTGCAAGAATGCAGTGCCGCGCTATCAACGAACTCGACATTTTATCGCGTCTCAAGCAAATGAAAA:1 - chr3R 29710945 3' - mdg1 3 2 70.30 GCAGGCGAAACTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCTGGAGAAGGCTTTGGCTGGATGCCGGGTGCTTCTCTTCGTTGCCT:1 + chr3L 20855785 3' + R1A1-element 492 1 63.37 TTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGGCCCGATGCTGGGGTCAGCACTTTAACGTAATGGTATTAAATTCTTGGTATGGCGCCATATCGATTGCCGGGTCCAG:1 - chr3R 31579585 3' - Gypsy6A_LTR 82 1 66.34 GAATAATGAAGTAAAAGTAAAAAAAGTAATTTTAGACCTTAAGGAAAAAAGCCTTTGCACGTGCTTCCAAAATTAGCTTTTTCTATTATCTCATCAAATGA:1 - chr3L 5514729 3' + Doc3-element 164 1 56.44 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGGGTCATGAGCCACGACCGAATTCTCGGACTCCTTGGA:1 + chr2L 16396628 3' + 412 7507 2 66.00 TGGGTTTCGGCTACGAGTAGGATATCGAGGATGATTTGCATATGCCACTCGCCGCAATGCGTGTGCGGCTTGTCTTTGGGTTTTCGGCCGATTTGTCGC:1 - chr3R 14186072 3' - G6 1702 1 76.77 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATGAAAAGAAGGCATGCGTGCGTTTAATTATACGCAATGTTGTTGCAT:1 - chr3L 10035715 3' - jockey 62 1 54.46 ATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGCGGAGTGGGTTGCACAGGGTTGCCAGGTGGCGGATGGCAATGCTGAGGTTTCTAAAGCTATTTTAAG:1 - chr3R 7814266 3' + X-element 4655 1 71.29 CCCATTCTAGAACTGTCCGCTTCCGAAAGTATTAATTGGCTTCCTCCGATTTTTGTACGTTGGCTCAATCATTTTGTGGGCGGGATTCCGG:1 - chrX 610204 3' + gypsy12 9984 2 71.43 AGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCACTGTTATATATTTCATTTAAATGACATTTTAATTAATGT:1 - chr2L 17892099 3' - Doc 327 1 64.36 GGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGTCAGCAGTCAGCAGTCAGGAGTAGAGAGCTGGGATCCCGGCCTGCGACTTGGACTCGCAGTTGAGCCT:1 + chrX 16137212 3' - I-element 393 1 72.28 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATTTGAACCAGAAAAGAGATACATCTTCATCTTTAATGCGAAGGAAATTAAAGTAAAAACACCAGAAG:1 - chrX 21668213 3' + 412 7539 2 71.29 GTAACGCCGTACGATTTTTTGGCACACGATTTTTCGCCGACTGCTAAGCCGACGCTCTCAGTCGCCGAGCGCATGCATCGTAAGAAACTTTATATTTGTGA:1 - chr4 853455 3' + 1360 26 1 66.34 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGTGCACTTGGCTGGCTTGTCAATGTGGGGGTTTTTCCTCATGCCTGGGATTTTGCAATTGCAAAT:1 + chr3L 768638 3' + hobo 2928 1 49.00 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACCATCTTTTAAGATATACGACACTTCCACTTACATCT:1 - chr2R 12357501 3' + opus 7466 2 69.31 GCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTGTGTGTGTGAGTGAGTGTAAATGTGTGCATGTATGTTCGACCTAAATCAGAGTCACTTATAACACTAAGAAGCA:1 - chr3L 5651327 3' + copia 5018 2 75.25 ATTTATTATGACAAAGTGTTGCAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATTTATTGTTTTTGCTGCTCGTTTGCTTAGTTGTCCAACTGAAATCACTC:1 - chr2R 19075567 3' - Stalker 71 4 62.38 CAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACACTTGCAGAACTGGAGGTAAATCGACACGGCGA:1 + chr2R 4503558 3' + G2 2852 1 60.98 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGTTCTTTCCACCGAGTTGAGC:1 - chrX 3176303 3' + P-element 2832 1 24.75 GATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGGTTTGGCCAAACTCTGATGTTTTTGCCT:1 - chrX 5381860 3' - Bica 482 1 74.26 ATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACACAAGCGACTGAGATTCAAATGAATCCCGAAATCGAACCGAATCGAGTTGAAA:1 + chrX 2539507 3' - hopper 352 1 55.45 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTCCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGATAAGCGAATTATACTGTATATACAAAATCATTGACTTACTTCTTG:1 - chrX 12954194 3' - pogo 46 1 77.08 ATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCGTTGATTTTTATGATTATTACGACTTTGATG:1 + chrX 5173581 3' - pogo 131 1 69.31 CTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATATTTCATTCTAAAATATCATTTTATTT:1 + chrX 23457226 3' + invader4 3041 2 71.29 GAGCCACCTCTAGAGCCACACCGAAAATTCGCGCGAAATGCCAAAAAGCCAAGACGGCAACATTTCAATTGGCAAAGCAGCCACGCAAACTTCACAAAAAA:2 + chrX 15123211 3' - 1360 62 1 76.24 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATGCTTGCATAATGCAAACAGCCAATGATAT:1 + chr2L 5659478 3' + jockey 4944 1 74.26 TTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTGCTACTTAGCTAATCCATATACAAGGCTAGCATTGTATCAGCTTTCAAATTCACTCAAGTAGGAGGTTTCGGTC:1 - chrX 17770495 3' + pogo 291 1 71.29 TGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTCGTAAGCGAGCGGAAAAAGGGTAATTTTGCCCGTCACCAGGATCTCAATTAAGATTACTATCTA:1 - chr4 718874 3' + jockey 4980 1 42.57 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACAGCCAATTGGGTGCACTTACAGGTTGCGCGTACTTCGCGTTGCTTAACTTGACTTTAGTACCGCGCA:1 + chr3L 27728977 3' - P-element 9 2 70.30 TTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAGCAAATTTTCTGCCTTGTTGTGGTCAGTCACCCCTAAGTGAGTACCCGTTA:1 + chr3L 20919530 3' - I-element 248 1 55.45 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCCTGTTTTGGGTTCGGTAGAGGGTTAAGAAGTTTAAGAGCGGGAGGGAAAGTGCCGGATTACCATATT:1 + chr3R 30088875 3' - jockey 4751 1 69.31 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAAACTGCCTTTCGTTGCTGGACATTTTTAATAATACATAATATACTTGACTTCGTAATATCCTTGAAATTCAGT:1 - chr3L 10554735 3' + roo 409 1 72.28 TGCTTGTGAGCAATTTCTATGTTTTCAGAGCTAACTGTAAGCGTGCCTTTTGTTTTTATCTGTTTTAATATTTTTTAACCCCGATGATTTGTCAATTTTTT:1 + chr3L 24300825 3' + looper1 23 1 61.39 TTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTGCGATGCCTGTGGTGGTGCATTAACACATGCGCCAATAAGTATGCAATGCGCTGTGA:1 - chr3R 28196677 3' - hopper 15 1 62.00 TCAAATGCTGAGCGATACATAAGTAAACTACACAACCATGATAATGTCCTAGCACTAGGCCTACTAGATAACAAAAGTCATTGAGGCGCAAAAGTCAAGCA:1 + chr3R 14478454 3' + G3 4364 1 66.34 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTG:1 - chrX 4056287 3' - roo 8717 2 80.00 CGTAAGATAGTATAATCTCTACATACGTATACACTATAATTGAGGAACAGAATCCATAATATCTTTCAATCTAAAAATACTCGCAACAAAATCAGTCTAAT:1 + chr3R 19208157 3' + G5A 2716 1 68.32 CCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGATTGTTGCTACAAGTTAACTTGTACCTTCATATACCCCCACCCATATGGTAACTCTATTCCCCGAAAAGCCAAA:1 + chr2R 13342253 3' - invader2 135 2 68.32 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCATTGCACATGCCAAGTTTCAATACCAACAGCAAATATCACACTCTTTTAGTTTTAGGTTTATCTTTT:1 + chrX 19820062 3' + hobo 2931 1 72.16 TCCAAATAAAATCAGTTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAAT:1 - chr3L 11367507 3' + roo 365 1 66.34 GACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTTCAACTTTTTCAAGGCGCCTTGGAC:1 + chrX 13644627 3' + Doc 434 1 75.25 TTGGTCATATCTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTATTAATTTAAGTCAAATGACTTAAAAAATATAATAAATAAATAAA:1 - chr2R 19150912 3' - 1360 483 1 59.41 AGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCATCAAGTTTTCCTGTGTTTCGTGGGTCTGGAGTAATAGCTAACACAAGGTTACGCATAAAACCAACTAGCA:1 - chr4 169567 3' - INE-1 557 1 69.31 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTCAGATACCAAGACATCAATTCTAAAAAGCTGCATTCAAATTACTTGTGACTTTTTGGAAGGTAT:1 - chr3R 7212420 3' - blood 9 2 70.30 ATGACAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTTGGTGCCGCTGCTTAACATTCACCTACTTTTCACCTTGTTAGCCACGTTTGAACAGCAGCAGC:1 - chr3L 4713743 3' - transib2 11 1 66.34 ATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTAGTTGAGTGGAAATATGACAAGGTTTGAGGAG:1 - chr3L 3635429 3' + roo 9026 1 68.32 GCCTGCTATGCTAACAAGAGTCGCGACAAACGCCAGAAATCGGTTTACACAATGTGCCAAGTATTATTGTTGCCACGACGAAACCTCTGAATTATTCA:1 - chr3L 14310685 3' + mariner2 697 1 56.12 CCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAAAACCATTTCTCTTGCTACTTTGTGCACTAAGCCAG:1 - chr2R 17649960 3' - 1360 41 1 68.32 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATAGCACTTTAGGAAAAAACCCATGATTCTATCAAAAAGTTGTTTCTATT:2 - chr2R 10865642 3' - pogo 21 1 52.48 GTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAAGGGGGCAGCCCGAACAAAGGGGGCGCCTCCGATGGGCAA:1 + chr3R 18264009 3' - FB 980 2 60.40 ATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAAATTAGCGATCCGCATTTGATGGAGTG:1 - chrX 20767355 3' + jockey 4618 1 73.27 ACGGCAGATGCTTCAGCATCGCCAATTGCATCACTTGAACGTTTGATTATAGTTTTTTGTTCATATCGGGAAGAGCCTGTTTCTAAGTACC:1 + chr2L 8478038 3' - 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F-element 29 1 58.42 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTAAATTAATCTTTGGCTGCCGCACAAAA:1 - chrX 18155853 3' + hobo 2892 1 72.45 TCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACACACATGGACTTTCCAAATTCAGACA:1 - chr2L 20478467 3' - hopper 379 1 75.25 TCTTGTTATTGTTATTGTTATTATTGTTGTTGTTGTGGTTCCTGCTGCCAGTTTTTTTAATATTTGAGTTTTAAGTGTGTTTGCCATCCCCCTCACTCACA:1 - chr2R 17290128 3' - mdg1 19 2 51.49 TTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGCTCTTTGGAGCTCGAGATTAATGCTAATGTGACAACTTAATCGAAAGCCATTTACAAGTCAT:1 + chr3R 8443114 3' + Quasimodo 7095 2 66.34 TTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCAAATCTGGTTAATGAATAACGAATGAGTCGTG:1 + chr2R 22619635 3' - jockey 4761 1 70.30 TGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGGAACAGCAGCGGAGGCAGATCAGCAAAAGGCCGAGAGTCATTCACATTACAAAGAAGT:1 + chr2L 18231858 3' + 1731 295 1 57.43 ATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGAGGAAATGGCAAGACTTCTGCTTTAATAAAGGCAAGGAAATTTGACAGACTTTTTATG:1 + chr3R 11260900 3' + accord 6973 2 57.43 TTAGTCATTACCCACGAACAAAAAAAAAGTGCAAAAATTAAAATAAAGACAAAATCAGCCACCTTGAACCCATTCGAAAACCCACTTTTCGAATTCGACC:1 + chr2L 3863278 3' + gypsy2 384 1 63.00 AACTCCGAATAAATCCGCTTTGCGTTTTTATTTAATTTTAAATAGATTTCTTATCTATTTGCCATAAACTATGTATTAAAATGATGACAGCACTATAAGAC:1 + chr2R 16692260 3' - Tom1 316 1 74.26 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCACAGCGTACTTTTAATTGGAGTTTTATTGCAAAAAAAAAACAGACAGAGAATTG:2 + chr3L 5492382 3' - pogo 19 1 60.40 GCACGCTCAATTTCTTAATCTTATTAATTGTTGTCTGTAATGAAAAGAGATCTGTACAAGCAAGACCACCTACCGAGTGCCATGCAAGTCGTCGCGCAGCA:1 - chr3R 17476069 3' + gypsy12 10072 2 69.31 ACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTATTAATTAAGTCAAATGACTTGAAGTACAATAGAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATAAATTTCATAAAAT:1 - chr3R 7255529 3' - 1360 454 1 52.48 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTTTTATGGTTTCCATACCACAAATTATCGCACATAAATTGCCATTAG:1 + chr2R 18731607 3' - 1360 43 1 57.89 CTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGTCCAAAAAAGGGTTAAACTCATAATTACAACTTTACATAGAAATCCGAAAATCCG:1 + chr3R 9872237 3' - 1360 88 1 54.46 CATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTATATTATTTAGAACGAAATTTGTAGCGC:1 - chrX 3177448 3' + P-element 2758 1 25.74 TTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATATTTGAATAATGAAATTACCTGCGATGCTTTCAGTAGTT:1 - chr3R 20888060 3' - 1360 3013 1 65.35 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTTGATAAACACAAAAAACAAGCACAGGGCGATGGAAAAAATAAACACAAAGGAAATGAGG:1 - 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G3 344 1 51.49 CTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACAAAATGGAAATGGATAAGAGTTTTCGCTTGCTTAGTAAAGAGCTGAAGTGATGTCACAGTAAAGTAGCATAATT:1 + chr2R 5154833 3' - F-element 14 1 69.31 AATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTATTTGTGGAATCGAAATCGAAATCGTTGCG:1 - chr2L 9884951 3' - Doc 4562 1 70.30 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATATATAGAAATTCAGAAACGATACAAAATATGGAG:1 + chr2L 17066867 3' + copia 5087 2 68.37 AAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAAAAACACTCAAATGTACCTATTTGTTATCAACAAAAAAAGGCACTTCTATAATATATA:1 - chr2L 13725113 3' + Juan 76 1 44.55 CACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCCGGGACGTCAATTTTTGTCTTGGGCTTCTCCTCTCTGCTTC:1 + chrX 16217546 3' + P-element 2886 2 70.83 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTCGTTTGGTTTTCAGTTCGCTTTCCAGCTCAGTCGCTGTCAGTCGCTCTGCGCGC:1 + chr2L 9437509 3' + P-element 2869 1 62.38 CCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGGGATTGTTTAGTAAACCGAATATGCCACTA:1 - chr2L 6392879 3' + roo 8923 2 73.27 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGTTTGTGTTAATTGAGTTTATGTTATCAAAGATGTGCTTTGTTGTG:1 - 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mdg1 7150 2 55.45 AATATACATATAATTCTACTATTACAATATATTAATCAAAATTTTCTACGTCCAAATGGATAGAAAATGGATGGCGGAAGGCGAAACAGACTTCACTAAAT:1 - chr3L 966242 3' - transib3 2618 1 71.29 GTCCTGTGGTGAGTTCGGACCAGCATGTATCAAGCTCGACGACCGATTTAGAAACATAGCCAGGATCTGAAACGGAGCACGTGCGGTTTACGAATGTCGCA:1 - chr2R 25016033 3' + invader6 4702 2 64.36 TAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAGGAAATT:1 + chr3R 8914541 3' + roo 371 1 56.44 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGCCACGACACTGATTAGATTTATCAGCCAGTCGAGTTGCACATAATGAACGGCAGTGGC:1 + chr2L 17056566 3' - 412 18 2 61.39 GATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGTCACAGTGCTCATCATCCTTGGCCAAAACGAAAGGCAAAACAAAACGCCGGCTTCAACAAACTCG:1 - chr3R 9893708 3' + I-element 309 1 62.38 TGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATGAAAAGAAGGCATGCGTGCGTTTAATT:1 - chr3L 10035734 3' - jockey 81 1 73.27 ACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTA:1 - chr3L 27356079 3' + Tc3 1683 1 67.33 AACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTCCTCCAAGCCAGCAAACGATTAGATTATGTTTATAATAATGCGGGGAGCAGACTCCGCGCAG:1 - chr2L 832702 3' + I-element 136 1 62.38 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGAATGCAAAAACTGCAGGGGCCATTGAAACAGAATTTTTATATACCCTGGAGGAAAGTCCATAAAG:1 + chr2L 12908447 3' - hobo 9 1 69.31 GAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTTGCGCCAAATAGAATAAATAATAATTGCCCACAAAACGAGAACGTGGGAACGAACAACAATTG:1 - chr3L 26508583 3' + TLD2_LTR 174 1 63.37 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTAAATCGAAAAACAGGTTAAAAGGCTCATAAAATCTGA:2 - chr3R 6425840 3' - copia 38 2 63.37 AGTTGGAAATTTCGACAAGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGCAACTACAACAATCAGTGGGAGTATGTGAGGTGTTTACCAAC:1 - chr3L 681929 3' + invader2 4807 1 58.42 ATGTAACAGGCATGAGGAAGCGTTTGCGACAGAAGAGTTCACAGCAGAAGGTCAGACCATAATATTAATGTGTTTAATATCAAATCATAAAGAAACGAAAG:1 + chr2R 6965547 3' + INE-1 30 1 69.31 AAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGACAAGTTCGCCTTGAGGTCTTACCAAAATGGCGTTAAAACGGTAAAAGGC:1 + chr3R 21969329 3' + hobo 261 1 56.44 AAACAAAAAAATTTATGAAAAATAAAATCTTGTTGGCTTTGCAGAGAGTATTACAATTAATGCTATACAATACATATACATCGATATTTCGAGGGGGGAAA:1 - chr3L 15954793 3' - INE-1 403 1 67.33 GGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCCCCCTGGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - 412 7142 2 51.49 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACAGTGTAGCACAGACAGTCAAAAAC:1 + chr3L 10554816 3' - roo 8715 2 76.24 TATTGCATAGGCACATACTACAGTTGCCACGACACTGATTAGATTTATCAGCCAGTCGAGTTGCACATAATGAACGGCAGTGGCAAAGGGGGTTGGCAGGC:1 + chr2L 17056583 3' - 412 1 2 78.22 AGCGCGGCAACAGAGGACCCCGAATCAGTTAACTTCCCGACATATACGACTTTGGATTTAACTAACGGTATTATGGTGACAGTGAGCGAGAATGACGACGG:1 - chrX 5378813 3' + invader6 4844 2 68.32 CGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCATGGCCCGCAAAAAGAAGAGTTAAATAAAAAGCTGGGTTG:1 - chr3R 22324419 3' + Bica 404 1 65.35 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATTTGATGGCTCTATCAGCCATTTGATTCGGTTAGATG:1 + chr3R 24023373 3' + roo 9032 1 65.35 CCCATTATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTGTTTGCTTGTTGCGGATTCGGTTTCGCATTGTAAATGAAATGGAATTAAATGAAATGTGAA:1 + chr3R 9829918 3' + 1731 284 1 71.29 TTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAAATAAAAATGGAGAGAAAAAATTCACTAGAAGAAGACCAAG:1 + chr3R 14685967 3' + F-element 40 1 69.31 ATTTATTTTATTTAAAAAAATTGTGGGACCAAAAAAGATGAAATAGCTTTGAGATAATTTGAAATGTGCGGTCAAATTATAATGAATCGTACTCAGAAA:1 - chr4 97586 3' - Ivk 5378 1 71.72 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGGCGTATACGAACTTGGCCGGAAAATAGTGGGCGGCTTTTGGTTGCGATTAAAATCAGCTGC:1 + chr3L 7742796 3' - Doc 21 1 59.41 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTGCAATTAAAAGGCTCAACTGCCAGGCG:2 - chr3L 5492312 3' + pogo 2054 1 75.25 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAGTTTGCCATTCTAGTGCTCTTTTCGCTGTGTTTGTGCTCCTGGGAGTATGCAACAGTTTTGGCTTGGC:1 - chr3R 14832469 3' - hobo 8 1 73.27 ACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTTGCTGCTGGCTTTCCTGCGCGCTGCCACCTTGACGA:1 - chr2L 20707570 3' + I-element 203 1 64.36 GTGCTCCATGTTGTAATTGTTGTTGTGAATGAGGGGAGCTTAGAAAACGGAGATAATGCTACACATCTTAGGTTCCAAAGAGTTTAAGGCTGATGGCAGAG:1 - chr3R 1838332 3' + transib3 330 1 76.24 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGCTGAGATTTAGACGCTTGATCAGGCAATTTCAACTTCTTTATTAGTTATTATAATTTTCTGCTTGAC:1 - chr3L 19439082 3' - jockey 4747 1 66.34 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTTAGACAATACAAAAAAAATGGGAGAGCAGACAGAAAAGTTATTTAAATTTCGAACC:1 + chr2L 10820672 3' + roo 9052 2 59.41 TCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTTGTCCCCGTATTTATTGGCACACACCGCAGCGAGCAGAAGGAAACGCGATGTGAAAATG:1 - chr3L 1069168 3' + gypsy2 6658 2 59.41 TACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCATGTGTGAACAACCACCAAAAAGTAACAAAGCTC:1 - chr3L 16449755 3' + roo 8602 1 67.33 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGGGGAATCGGAAGATAGCTCACTAGGTTT:1 - chr3L 3776485 3' - roo 48 2 72.28 ACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGAGATTAAATGAAATCTTGAAATAACATTTTAGTTCTTATATATAATCAAGCCAGTAGTTTTGAGTGTTGACCA:1 + chr2L 15174197 3' - Juan 4031 1 71.29 GACCAGCTGTCCCAAGCGCTCCAAATGGACTTGCTTATGCAACCGATCACCCCCAGCGATATTGCTGACGGCATCGAATCGAAATGCAAATGAAAAACACC:1 - chr2R 13601662 3' + BS3 158 1 73.27 CGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCTGGTCTCTGTGCATTCGTCTTTGTGCGTGTGGCATCTTTGGGGGAATGTTCAATCCTTTTT:1 - chr2L 14117255 3' - X-element 4388 1 63.37 GACCGCGAGGACAGAGGAGCACGGAGAAGGATATGTCCCTGGGGTTGGTGAAATGTGGAGCTGGGTGTTATGCGGCGGTGGGTGTCATAATACTC:1 - chr3L 4608729 3' + gypsy8 4462 1 65.26 TTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCCCGCATTTTGATCATTCCTTTCCCACCGCTACTGCTTTCCCCCCGATTGCAAGCAGGCTGTTTTACGGGGGTTC:1 - 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roo 12 2 65.35 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGACAAAGAGAGCGGCAGTCCCGTTACGCGCTGCTAACGCAACAGCGGGATG:1 - chrX 10629193 3' - P-element 24 1 54.46 GACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCC:1 + chr3L 25350820 3' + baggins 5413 1 42.57 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTTTGAATTGATTTTCTTTTCAAATCCGT:1 + chr3R 31243359 3' - copia 50 2 76.24 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTCAATTAAAAACTGTAACTAAGTTCACAGTCAATGTAAGAGTTACTTTGTTGAATATTTAG:1 + chr2L 17887226 3' - hobo 15 1 55.00 TTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATTTCCATCTCTTATAAAACCCATATATTACCTACACAATTGAGGATCAACATGCGAGGAATTTC:1 - chr2L 7271433 3' - I-element 5104 1 65.35 AACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACAGTCCAATGACAGCGCCTATGTCCAGCGACTGATGCGTCTGTCCAAGTCCGCCGAAATGCGGAGCTA:1 - chr3R 28879894 3' + roo 397 1 65.35 ACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTACGGGTGTTGGCATGTCAGCAGTGAACAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + Stalker2 397 2 29.59 TGATTAACTTGGAGTTAGGTTTTTTTTAGTTTGTTTTTGACTTTTTTTTTTG:1 - 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chr3R 27325198 3' - I-element 4959 1 69.31 GTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAACTTTTAC:1 - chr2R 3293760 3' + 1731 267 2 71.00 CAAGCTTAACGTAGGTAGTTAACAAAAAGAACAAGGAATGAGGGTAAACATTGAAAAATGTCCCATCTTAGGCGATGAAGTTGCTTGGAAAATTAAGTTTC:1 + chrX 4863300 3' - diver2 4693 2 62.38 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATGGGTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTAACTTATTTTAAACATTT:1 - chr3R 19450014 3' + roo 391 2 64.36 CAGTGGATGTGGGGATTTTATTTCACCACTCACTACTAAAATCCCCACATCCACTGCCGTCATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGTACTTGATTTTGT:1 - chr3L 947592 3' - accord2 7344 1 45.54 GCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGCAAAATATAAAGAACACAAATTTAACACTATTGGAAATGAAAAATATTGA:1 + chr3R 26021469 3' + BS 5070 1 56.44 AAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCCCTCTTTTTTGTGCACCACCCATTTGGCCAAGATCGTGGTGGCATTGACTCG:1 + chr3L 4391966 3' + FB 705 2 57.43 AACCGAGCTTCCCGTTAATAAACAATCCATCCACTCTTCCCTCATCAATGCAAAAATCAAACATTATTTATGCAAATTACAAGCCATTATTATTTAAGCCA:1 + chr2L 5659097 3' + Circe 303 1 69.31 AAAGCTGGAATCGTTTGCCTATTTTTTGCCTATGTTTGCCCACCAATTATTTCTCCATGTGCACGCTGGCAGTCATACCTGATTCCGCGGGATTTAAACCA:1 - chr2R 11262516 3' + FB 46 1 56.44 CTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATGTCTAAGTA:1 + chr3L 26007758 3' + G5 4761 1 53.47 ACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATCGTCGAGTCCCGTCACTCCAGGCACTCCAGCAGGTCCACATTTCTCCTCGGATGAGGAGTACAGGACGGC:1 - chr2L 14604248 3' + 1360 6 2 74.26 CCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGGTAAAAATACATATAAAACATAAAAGAATTCAGTAATTAATTTAATGGAGGGCCAAAAGTGTTGTTCGTAA:1 + chr2R 23265822 3' - Juan 10 1 69.31 TCAAAGCGAACGGTCGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAATTCAATCTAGATTCCTACTGAATTTATTCACATAGATACACA:1 - chr3L 7207463 3' + Cr1a 8 1 57.43 TTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACTAAGTACCCGCTAGTGGGCAAACCGAGTGCGCTAAACGCGCTTCTCAGCAGGGCGCTGAATA:1 - chrX 763471 3' - 1731 4625 2 72.28 TCTTCATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCCATGTCCAACTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAACGGGTATCTGATTGTC:1 + chrX 1130845 3' + INE-1 88 1 73.27 CAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCAGCAAACGTTTTCAGGGAACCAATCAGTCGGGTAAGCCGATAAGTCCCCGGCTTTCC:1 - chrX 2976223 3' - FB 52 1 56.44 CATGAACACACACACACACACATATTCACACATACGCGCTCGCTCGCACTAACTTGTGCGGCTTTGAAGTTGCTCCTTTTGTGTGTATTTCTCAATTTTGC:1 + chrX 17982461 3' + accord 180 2 78.22 CTCTTTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTATTATTGTTTATATTCATTTGTTTATATTCATTTTTTTTTCTTTTTTGGCTC:1 - chr2L 20622982 3' - invader2 369 1 48.51 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCAATTTTGAAACAGCAGCAGCAGGAGAACAGGAGGCAGTGAGACAATCAGGCT:1 - chr2L 17170355 3' - flea 35 2 54.46 ATAATAATAACAACGTTATAAGCCAGCCGATTAAAATACCGCATCCAGATCCGCTTCGTCATCGATTTGGGGCTCGGCTCCTTGCTCCACATCCTCGG:1 - chrX 2660920 3' + G4 3664 1 57.14 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAAGCAATGCACCGGGAGAAATTAAAAATGCTTGTCCATTAAGTTTGGGTTATCAAAGAGGAAAAATTG:1 - chr3R 31243286 3' + copia 246 1 68.32 AGTTATATGTGTTAAAAACCTTATATATCTCTGTGAAGAAGATAAACAAAAAAACAAGTAAAAACAATAAACCACAAAAGAGGAGCTGCAGAAAAAGGGGC:1 + chr3R 15680543 3' + Porto1 122 1 73.27 ATGTTGTCGTATTTCATACGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTGGTTTAGATACGGAAATCACATCACGAAAACATAATTCATATGCTAAAATACATTAAC:1 + chrX 16149522 3' - gypsy2 30 2 52.48 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTTGGAAAATGTATGAAATTACAGTAGTTATAATAATTTCTATTGTACTTCCTTTAATTAATTAGTATATTTAT:1 - 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INE-1 514 1 75.25 AAAATTGGTCCTTCGAGCCGGATAACCGGAAGTGCGTTTCGTTCGGGCTATACTCGTTAGATCTGATTACGCACTTTTATTTAACGGGCGTCTTGATAAGA:1 + chr3R 26105373 3' + 3S18 364 1 56.44 GAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTCAAGGATGTTGGGCTTAATAGAAATCGCAATGGAATTGA:1 + chr3L 13305237 3' - 297 6818 2 61.39 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGAGGATCACTGTGCTGCCCGAGGCGTGTCTTTGTTTTGGCG:1 - chr2L 10636500 3' + hopper 1412 2 65.71 TGGCGACTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGAATCTCGCAAGATGGTTAGCGTAGGTTGTC:1 + chr3L 23878420 3' + invader2 4778 1 67.33 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCTCGCGTTTCTTCTGCAACGAAAGGTGTACAGTTCGGCATATCTAAAATAACAAACAGATAATAGTTATTAGTGATAA:1 + chrX 9048744 3' - Tirant 4 2 75.25 TTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCTACGAAGACACACACACTAGCACACACCACGCAGTGGCAAGTGGCAAGTTAAGCACCCAGCATTGACTACC:1 - chr2L 2328847 3' + I-element 497 1 65.00 AACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCACCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGTTAGTGCGAGTGCGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTT:1 + chr2R 1461346 3' - INE-1 580 1 85.15 GACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTA:1 + chr3R 1977616 3' + micropia 5406 2 58.00 ATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTCAGCAGTAATTCATATTATATTGTATATTAGTATAAATCTGAATATTCTTTAAACGCCACCTGGCGGTT:1 + chr2R 13805763 3' - Ivk 5320 1 69.31 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAAGCCAAGTCGGCTTGCTTGGGCTTGGGAAATATTCTGCCATATG:1 + chr3L 18142013 3' - blood 7044 2 58.42 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCAAGAACATTGTTGGAAAAACAATAA:1 + chr3L 22340008 3' - hobo 51 1 78.79 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTTAGACAATACAAAAAAAATGGGAGAGCAGACAGAAAAGTTATTTAAATTTCGAACCCATTTCAAATCTAT:1 + chr2L 10820686 3' + roo 404 1 74.00 GATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTGTTGCTTGTTTTGTATTGTTTCAAGCCGAAAGGTG:1 - chr2L 2074163 3' - I-element 195 1 73.27 ACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGCCAGTGAAGGGTTAAAGATGCCGACATTATAATTCAACATTGGCATTATGCAAAAGCG:1 - chr2R 17269700 3' + transib2 2808 1 61.39 CCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATATTCACACAATCTCGCTGGCACTGCTAAAAAATCGACAAAAACAA:1 + chr3L 5881401 3' + I-element 423 1 55.45 CTTACACACACACACACACACCGCAATGCATTTTCAATTGCAATTTATAGCCGCACGTGGTTGTTGCATGTATCACGTGACACTTGATTTCCGGCGCAGTT:1 + chr2L 15149383 3' + Quasimodo 36 2 62.38 ATAATTAAATTAATTAAAATTAGACTGCACTAATTGGTTTCCAGTGTATCGCCTGAACTTAAAGTTATCTTCAGGGTAGCCTGGCTTAATTTCTCATCTGG:1 + chr2L 17762556 3' - HeT-A 381 1 71.29 TTTTGTATTCTACCGACTGCTCCAGAGAAATATGGTAAAAAAAAAGTAAAAAATAGCTGAGGCTCTTCCCTTCTTGCCACTGTGAGTCGGTTATAAAGTTT:1 + chr2L 19446025 3' - 297 416 1 57.43 TTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGGAGGCGAGAACTTTTAGACATAAATTACTTAGTAGATCTTGAAATGGCAAT:1 + chr2R 14742784 3' + roo 174 2 50.50 TGTATGCTTAATCTTAACCTTCTAGCTTTTACAGTTCTGAGATCTCGACATTCATACGGATGGACCTCGTAGTTCCCACAGCCAGCCAAGCAATTTATTGC:1 - chrX 16541394 3' - INE-1 173 1 72.28 CGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCATTGTACTTTTCAATTGATACGGATTTGCTGGGTGCTCATTGAATCGACGAGGCAGAAGACG:1 - chr3R 10370364 3' - Doc 297 1 65.35 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATAACATGCCCACCAGGAACATAAACACGAACATACTGCCGAAAAATAATCTAGCACA:1 - chr3L 9166761 3' + 412 7519 2 57.43 ACAATCTTATTCTTATCTGGTGTCTGTTGGGTTAGTTTCGGTTATGTTTCTTATAAGGGTGGGTGTTTTGGTTGTCTGTCTAGTAGTCCGAGTTAAATTAG:1 - chr2R 964661 3' - Idefix 109 2 78.22 ACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTTTCTCGTGGCCTATGCTGCGTACGCTG:1 + chr3L 17990072 3' + accord 266 2 73.27 ATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGTATGTACATATTTATATGAGTTTGATTGGATTGGTGCGGCATATGTACA:1 + chr2L 2912108 3' - 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chr3L 18141957 3' + blood 334 2 65.35 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTTATTTTAATAAAGACTTTTAATTGAATTTTCAATTGTTGCGCCGGCTTTG:1 - chr3R 6135213 3' - I-element 23 1 56.44 GTTCGCGGGTAGGAGCGGGGGAAGTAGATGTCTGCACGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCAGGAGGGTGCAATGACTGCAACTTGTTCGCAGAGAAA:1 + chr3L 5182846 3' + invader1 3734 2 65.35 TGCCGACCGCGAATTTTTTATTAACTCACGGGAGTTTCTTCGGCACTAATTTAACCAATGTTTTGAGGAAACCCGCAGAAGCCACAGAAATAAGAGTAGTT:1 - chrX 10453889 3' - HMS-Beagle2 458 1 57.43 CATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTATTCTATTATTTTATTTTTTACGTGACAGGTTATCAAATGTCGGTACGACTTTATTTCATTCTT:1 + chr2L 21709397 3' + FB 65 1 67.33 TAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTTGGGTGGAAAAAGTGAGCAGCTCACCGCT:1 + chr3R 22496354 3' + Tc1 1571 1 71.29 AACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCATTTGCGTGCAGCATGTGGATATAGTAATTTAAATATTTATTCCTTTTTTTTTTATGCAGGCAACACTTGAG:1 + chr3L 7744578 3' + Doc 369 1 74.49 CACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTTAAGTAAGT:1 + chrX 21945943 3' - F-element 28 1 59.41 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACGAGTGCTCCCCACCTTTTCGAGGAGAGAGTCCGATCGCGATCTTGGGGGCTGTGGGGCTCT:1 - chr3L 16800218 3' - P-element 15 1 65.35 ACCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGACGCCCTCGCAGCAGCGAGTCCGTTAGATTCAAACACCCGAATGAAACTTATGCAAGGCGACTGCCTAAGCTGGG:1 - chr2L 179295 3' + rooA 278 2 68.32 AGTGTGCAAAGTACTCGTGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTGATCATTTTAGATGGGAACTATTTAATTTAATTTGCCTAATGTCCGCTTATCTA:1 - chr3L 4491516 3' + pogo 2082 1 47.52 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAAATGGGTGGGCCAAATGTGGCCTATAAATA:1 + chrX 12818921 3' + roo 404 1 74.26 ATACTTTTCAACGAATCTAGTAAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACAAACAGGAAAAAAAACCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCGAA:1 + chrX 11906340 3' - INE-1 10 1 52.48 GGTTGGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTTATAGTGGCTGTGTTTAAGCGAGCTAGCATTGCAGTTGGCGTACAGTGTATAAACAAGCAACCACTGCGGTTT:1 - chr3L 3907891 3' + diver2 479 1 59.41 AGTAATCACGGTGGCTGGGCGCATGTACTTATATATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAAACGCATTGTGGGATCAGGTAGATCAT:1 + chr3R 8930518 3' - Max-element 495 1 78.22 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGA:1 + chr3R 8914525 3' + roo 9019 2 71.29 GACTACTCCAGGCACCATGATATGGATTTCGTGCCAATTGAAAACCTTTAACATCTTTAATTAAAAGCCTATAATTTAACCAAAATTAATTAACACACGCA:1 + chr3R 19147416 3' - invader2 4677 1 78.22 GTGCGAGGGACTTTAAACGGTGCTAACTGTGCCATTTCCTAGGATAGTTGAGTGGGCAAATCATTTTTCATTCCATGTACCGCCTGATTGACCAGATTTCC:1 + chr2R 1568947 3' + Stalker 462 1 74.26 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATATCTGAAAATGTGGGCAAAGGCGAACGTTCGAGCGTTCAATGTGC:1 + chrX 8611098 3' + Burdock 227 2 55.45 TTTATATTTATTGTGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATAATTTATTGGGTTCAACAAGTAGTACGGTATTTTGGTAGTTGATGA:1 + chr3L 24104318 3' - Stalker4 76 4 68.32 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGGGCTTAATATAATACTTGTCATACGTTGCTGTTCATTTAAAGTTCGGGAACTTATC:2 - chr3L 14886188 3' - 412 21 2 58.42 CAGTGGGGTGTAACCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATCGGATTGCTAAATTTATTGAGCTATTACCCCATCTCCGTTTCGTTAAATACTGAATAACTCCAT:1 + chr3L 22008326 3' - G5 4639 1 63.37 GTGCAAAACAAACTTAAAAGTAGTGGCACAAAAATCGAATTGATTAAAAGACTTGAAAATATTAAATTTGCATGGCAACTTACACGCAACACCAACAGCAG:1 - chrX 9738278 3' + gypsy2 420 1 69.31 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATATGTGAAATTGGATTGGCACCGAAAATATATATTATTGTAT:1 + chr2R 15606086 3' - roo 35 2 61.39 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAACGACCCTCTTCCACACGCCATTGCCTGGTTCGA:1 + chr3L 153637 3' + 1360 3383 2 58.73 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATAATTACGGGAAATATTTATCGCTTAGATACGGCCAGCGAGCACGAAACACAATCGTCGGGGG:1 - chr2R 16338062 3' + roo 397 1 66.00 TGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTTCTGCAATTCATGGGAAATTAATGTTATTAATTTATTAGCTTCTTCTACCGAATCAGCTCCAGTCATTAGG:1 - chr3R 19445622 3' - Tabor 7 2 72.28 AGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAACAAGACCAAATTATAACAAAAAATCTGAAAACAAAACAGACAAAAAGGGAACAATGACGCCCCTTCTG:1 - chr3L 22978953 3' + I-element 5135 1 71.29 AAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGGGGAAATAAAGGCGCACAATTTCACCGACATGTCCTTTGATGTGGTAGCTGC:1 + chr2R 21994647 3' - Circe 7224 2 59.41 AGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAATAAGAATAGATGATTTAAAATAAAAA:1 - chr2L 22089935 3' + mdg3 5449 2 72.28 TCATGTCACCTATTTAAACCGAGAGTTTTCCACAAAGCTTTAAAGCAGATTCATCAAATAAAAGTAATAAGAGCATTTTCCCCTTAAGCAAGTGCAGTTTT:1 - chr3L 10556220 3' + roo 9000 2 75.25 AGCGATCAGGCCAATCTGGACGTATGGCATCCAACTATAGCACAGCCACCGGCATTAAGCTTATTGCATTTTTATGTAAATTCACACTTTGCGCCCCATGT:1 - chr3R 17494426 3' + G7 839 1 52.48 AAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGGCAGAAAAAATTTAATACCGAGCAAACGAAGTCCGATTTCCA:1 - chr2L 20837351 3' + Quasimodo 6955 2 56.44 GAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGGGGGTCAGAGTATTTAGTTTTGCAC:1 - chr3R 19625799 3' - Doc 4486 1 75.25 TTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCAATTTTAACGATTCAGTGAAAATGTCGCATAGATTACGTGACTTTGATGCGATTGACAT:1 + chr3L 4715481 3' - transib2 2469 1 65.35 TGCTTTACTTAAAAATACTCTTTCGGCAGCAAGCTTATGGGACGATAAATAGCGAGATTGGTCTCAGGTTTTCCAGGAAGCCACGGAATAACTCGCGACGC:1 - chrX 18300532 3' - G7 308 1 72.28 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGTGTTTATAATTTGGAGTCTTGGCAGGTGCTTTAGTGGTTCGATTTTCTTTT:1 + chrX 6739677 3' + roo 9047 1 54.46 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTTTAAAATAGGTTTTAGTTATCATTTGGCTGTGAAATGGTAAAATGACTGCGATGACAAGGTAA:1 - chrX 10449776 3' - mdg1 7050 2 63.37 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTCGTTTGGTTTTCAGTTCGCTTTCCAGCTCAGTCGCTGTCAGTC:1 + chr2L 9437498 3' + P-element 2858 1 51.49 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACATATAATTTCCATAAGAATAAATTCGAGTAAGAAAAAACATA:1 - chr3L 13608315 3' - mdg1 7072 2 61.39 CACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGGTATATACACGGATATATATA:1 + chr2R 15199188 3' + accord 198 2 79.21 GCTTTGAATCGTGCAAATTGGCAAGAGAGGATTGATATTCACAGGAGCAGAAGATGGAGTGTTTAGTTTGTGTAATTCCTTTTTACGAACAGGTGACCTGG:1 - chr3L 20702600 3' + transib4 181 1 62.38 GCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGAAGCTGAGCTTCGCGACACTGGAGCTGCACCTGTCACCGCCAGGTGAAATGTACGTGAGAGCAGAGTCG:1 + chr3L 5801273 3' - Max-element 8313 2 73.00 CGCTCGAATTAGCTACCGTTTACAAATTTATATTTATGTTTACGATCTCCTTATGGACTAAGTCTTTAATTAACCACTTAAATCTGTTAACAGCTAAGAAA:1 - chr2L 16726619 3' - 1360 2978 1 55.45 TTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTCAGTCGATTTGGAAAGATCAAGGTAAAAAGAACAAAAAAGGCAAAGATTCGTGGATAATTTAGAGTAAG:1 + chr3L 13257079 3' + Burdock 6240 2 64.36 AAGCCGACTAATCCAGTCGGGACTCTCAACATCACCACGAATAAGCTTAAATAAAGACTGTTCCAAGCAGAGTGCTTCGTTAGTTGGCTCGGTAGATCTCT:1 + chr3L 6333793 3' - 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Doc 54 1 45.54 CAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGCGCCTGGGCCATTGTTGCGTGGCCTTTTTAATTGGCCAGCC:1 + chr3R 22100151 3' - 297 6835 2 62.38 ATTATGTTCGTATATACTACAATATTGTTCTTCCCTTTCAACTCCTATCCGTACTATACCATTCGATAAACACACAGTTTCATCTGTGTTGTGTACCAGCA:1 - chr3R 27179136 3' - mdg1 7038 1 67.33 AAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCGCAAATTAAACGCAAAAGCAGCGCAACAAAAA:1 - chrX 4796035 3' + Doc 4463 1 68.32 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATTTGAAACCGT:1 + chr3R 6425897 3' + copia 218 2 70.30 CCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCGAACTCAATACACCTGATGTTGATAAAATGCCTAAT:1 + chr2L 12905680 3' + hobo 2586 1 64.36 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCCATCGTGCAATATCCTTTTTGCAGCAGTCACAATCAAATGGCCGGATAGAGAGATTGCATC:1 + chrX 12883661 3' + hopper 1405 2 70.30 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTCG:1 - chr3R 10978704 3' + roo 9033 1 64.36 AGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTT:1 - chrX 14317415 3' - 1360 51 1 69.31 TAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAATGCCAAAGACGATATAAAAAAAATAGAAACGCTTCTGAGCTAAAGACCTTCTTAG:1 + chr2R 9514240 3' + G6 2004 1 66.34 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGTAAGTGCTTACTATAAATGTTAAATCAAATGATTTTTACCATTAGCAAGGAAATTATCCTTGTC:1 - chr2L 436855 3' + roo 398 1 66.34 ACTGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAGTTTATCGGATGAGTAGATCGTCTTTTAA:1 + chr3L 23090536 3' - 1360 45 1 94.06 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATTAAATGTCGCAAAATAAATGCTT:1 + chr3L 3635496 3' - roo 20 2 61.39 TGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCTGACCAATGTCCACCCGAAAAACCCCATCGCTTTTCCGCAAAACTTTTCGTCAATAAAATATGTGTATGCAGCAT:1 + chr3R 15054397 3' + hobo 2938 1 78.22 GTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCTCGAACATTATGTTCTCCGGTTTCAGGTCACCGTGTATAA:1 + chr3L 11082082 3' + jockey 109 1 63.37 CTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGTCAAATGGTTATTCGCTCTTTGTTCTAG:1 - chr3L 10007024 3' - I-element 5185 1 72.28 ATAGTAGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTTTTCTTTAATCCCAGCTTGTTTTCCTGTGATCGGTTCCTACACAA:1 - chrX 20806094 3' + INE-1 565 1 84.21 TGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTTCGTGGGGCCAGAGCCAGAGCTGCAGAAAATATTAACACGATATTTTTCAAGCGAGATTGCTGAACT:1 - chr2R 13469333 3' + jockey 4578 1 72.28 GAAATAAAATAAAATAAAATTATGGATATAGCGCAAAAATGTATCGCAGAAGCCAGAGTTATTTTTGGAGTCTTACAGAACTTGGCCGAAAATCGGCTAGC:1 + chrX 5895529 3' - transib1 1898 1 80.20 AAAACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTATCAGTGTTTGTTCTGGCTAATGCATTTCTTGGCTAAATTTATGTATATATCCATTTCTCCAACTGGCTTTTCGA:1 - chrX 14517029 3' - INE-1 258 1 70.30 CCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACTGCGACCTAATAAAATTCCGTTTTACAAATTGAGTTT:2 - chr2L 14074921 3' - jockey 223 1 73.27 TCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCCGCATGGCGGTTGGGTGAAGTAGTCCGTATGGGATTT:1 + chr3L 13247759 3' + opus 7239 2 63.37 GTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGTACAACAAAAAGGCAAATGACGACACCCAGCACATGGCGTCAAATATTTCATA:1 + chr2L 11769549 3' + Doc 490 1 51.49 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTCCTGTCTGCCATGGATTAAAACGAACC:1 - chr3L 27728816 3' + P-element 2840 1 21.78 TACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAAACAAACATTTTGTTACCAAACAATATAATATTCATATGTTTTTTGCGTTATTTTGCACTTTTCATTAG:1 - chr2L 16968389 3' + 1360 3382 2 70.30 GGACTTGATTGGTGGACTAGACACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGATTTCCCCAAGACAAGCAGTAGTAGTATGTCTTCGAAGTCG:1 + chr2R 10731766 3' + invader4 2705 1 60.40 GACTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTATTTTTCGGATACCTGTTCCTACTCCTTGATCTGTGGGAGTTATCGCTCGATTTCTGTCAAGC:1 + chr3L 5605836 3' - Tirant 407 1 64.36 AGACAACGAGCGGCCAATAACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCAATTCTAGCTCCGACACAAGCCATGTTGAATACTGTCATCAAGCAAAGCTCAAAAAAAT:1 - chr2R 9994536 3' + F-element 305 1 57.43 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGCCGGAAAAAGTGTACATATATATACTGACAGACATCT:1 - chr2L 20387823 3' - 297 32 2 70.30 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGCCCTTTTTGAATAATCTGGCGACTATGGCATCGGATAATTATAAATATGTGTATAGAGAATTTATTCTCTCCA:1 - chr2L 5741282 3' + 412 7542 2 73.27 TCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATAAAGGCCATAGTAACAAAGAAGCCGCAACGCAAG:1 - chrX 10824040 3' - jockey 4712 1 66.34 ACTAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCAAAACTAACACGCCCACGATTTTAAAAAATGTTTAGATTTTTTTTGCGCTTAACTTTGTGGCTCCATCT:1 + chrX 20996621 3' + INE-1 102 1 70.30 AGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCAACTCGTGTTGCGTTTAACCTTCG:1 - chr3L 18580079 3' - 412 230 2 76.24 GCGAAACACAGCTGGAATCGTGTTTACAGATTGCCCTACAAAGGTAGACGAACTCCTGAAAACACTTGAGAAGCACGTTGAAGAAGAAAACGGACAAATGG:1 + chr2R 5266139 3' - gypsy12 9937 2 71.29 TACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTT:1 + chr3L 14152149 3' - blood 5 2 56.67 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATGCATGTATTTCTTGCAGTGTTTGCTGGGGCATGGCAGTGTCATAAATATTCTTTGCCGCTGCTTTATTCCTTGCT:1 - chr2R 20543949 3' - 297 1 2 76.24 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCC:1 + chr2R 22856591 3' + 1360 3355 1 64.36 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATGGGTAGGCTTTATGTAAATATTTAATGCTTACTTTGTGATTTAGACTTT:1 + chr3L 13608388 3' + mdg1 414 2 62.20 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCCAGCAGGCTAGCCAGCCGAATTCGATTTCATGAGGATCGGAAAATG:1 + chr2L 7991769 3' + P-element 2857 1 43.56 TTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAATGTCCAATGTAATTGCCTCAAG:1 - 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Stalker4 2 4 77.23 GCTCTCCAGCATTGGAGGGACCCAACAATTAACATGCTCAGATAAACAGACTTTTACACTCAACGATACTCCACCAAAAATATGGCTATGAAAGCCAAAAA:1 - chr3L 9517790 3' + Porto1 359 1 70.30 AGGACAAGGGATTAACAATGCCCACTACGCTTATCCTCCAAATCCAAATGTTGCCAGCAATTGCCGTGCAAGAGTTGGCATAACACACAACTGGCCAAACA:1 - chr3L 11702000 3' - accord2 7400 1 63.37 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCAAACACCTTGATGTATTTGCCTTGTTATAGCTTGTTTGTAGTTTGCAC:2 - chrX 12276760 3' - hobo 28 1 53.47 AGCCTTTTTGCGTGGTGTTGTTCCAAGCTTGTGGGTGCGCGGGGGGGTCTGCCAGTCTACTTCTCCAAAGTTGATAAGGAATGAGTACAGCTGAACGATTG:1 + chr2R 17327468 3' - G6 360 1 79.21 ACAAGTTGAAGCCTTTTTTTCATGGATTGGACAAGTTTTTGCAGGTCATATTCAAACGGGATCTTTTCTCATTATCATTAACACTTCTGACATTGTGCCTA:1 + chr3L 8038472 3' - S-element 1386 1 67.33 TTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTAAATCGAAAAACAGGTTAAAAGGCTCATAAAATCTGAAAAATACAAAGAAATAATTTCTGTACTATATT:1 - chr3R 6425808 3' - copia 4875 2 71.29 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGGAATGCATTTTAAATATAACATATTCCAATGTGTTA:1 + chrX 14500152 3' + roo 9033 1 63.37 TACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACATTTTATTATTATACTTTTCTTTAGTTTTATTG:1 - chr3L 3685388 3' + Bica 96 1 72.28 ACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGGAAAGAAGAAACTAAACCGAAATGAATGGGGACTAAGACTGGGAATGGAGGGCTAT:1 + chr3R 28680007 3' + I-element 284 1 57.43 GGTCAAAACCAGGTTTGGGAGGTTTTTTGGGTAAGAGGTGGGGTTTG:1 + chr3R 19717365 3' - jockey 4774 1 61.70 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATAGATTTATATAAAAGTGACACACTCATGGTAAAATCTTGTTAGAGACATTTAATCG:1 - chr3R 31371715 3' + opus 485 2 66.34 CAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAATTCTGTT:1 + chr2R 21020040 3' - Porto1 4624 1 83.17 TGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCTTAAAGCAAATTGAACCCTGCCAAAAATGTTCGA:1 - chr2R 19301268 3' + F-element 233 1 66.00 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCACTCAATGCAATTGCGGTATTTATAATGCAGCAGAACGCGTTC:2 - chr2R 15451562 3' + roo 9037 1 54.46 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGTGCACTTGGCTGGCTTGTCAATCGAATTCGCATTTAAACTGCAAATTT:1 - chr3R 21969054 3' + hobo 2923 1 58.43 ACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTTGACGCTGCCTGTGTGCAGCAAGTAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - mdg1 178 2 35.64 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATGAAAAGAAGGCATGCGTGCGTTTAATTATACGCAATGTTGTTGCATACTTTCGAGGGCCGCCTTCAACAATTCC:1 - chr3L 10035687 3' - jockey 33 1 72.28 GAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTAGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTGGTGTCTTTGCCAGCACCACCATCGCCATCAATCTCAATCA:1 - chrX 3059279 3' - 1360 50 1 77.23 CCTGAGATCGCGACGTTTATACGGACGGACAGGGTCAGAACGACCCTGAACGATTTTTAAACAAAATTTTACGATATGCTGATCTAAATCATGAATATCAT:1 + chr2R 5211591 3' - INE-1 137 1 43.56 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATCGCCCTTCTCTTGCCTTTTGTGTAAGCCCGAACAATGAAATGGTAATGATGGATTGTG:1 - chr2R 14744210 3' - roo 19 2 61.39 AATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTATACGAAAGGGTTGAACTTTGTAGTAGGAGGAGGTAAATTGGTCCTAGAAAATGCATTTCAA:1 - chr2R 18454888 3' - jockey 4599 1 53.47 CCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGGGAATTGGATTCTCTCAATCAGCAGATTAACAGGCCTGAGGTCCTAAGACAAATTGTCCACCAGGGACA:1 + chr3L 14581541 3' - transib2 205 1 56.38 GTGATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACCCCTACAAACAGTACACCTACAAGTCCATGAAAATAAAAATAAAAAAATATCGCTGGTCA:1 - chr2R 21496778 3' + baggins 5386 1 63.37 AAACGAATTCTGGACCATAGTGGAATGGATGGGAGGGATGTTGGTTCTCCATGTTTATGGATGGTTTTTTTTTCGTTCTTTTAAGCATGTAAAACGGTGG:1 + chrX 1018471 3' - transib2 1 1 75.00 AGTGTGTCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACATGCCCTCGAATTGTTTATTCAAAACTT:1 + chr2L 5211079 3' - gypsy12 53 2 73.27 AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGATTATTAAAGAAAAGTAGACTTAGTTTATATTTCATTATATGTCTTATATGTAT:1 - chr2L 11595981 3' - 3S18 5789 2 52.48 AATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTGGCGCATTCATGCTGGGCTCTCAAAGTGGTTGTGAAATGCATTTCCGCTTTGCGCGGCATATCACA:1 - chr2L 19569918 3' + Burdock 6377 2 68.32 TAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATTTGAAACCGTACTATGTACTTTTAAATTTTTAGTCAGGATGAAACTCTTG:1 + chr3R 6425937 3' + copia 258 1 77.23 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTTTTTTGTTCTTTTTTGGGGGCCGAGTGAATAGCAAACGGAAAACG:1 - chr3L 13164676 3' - pogo 28 1 54.00 TATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACAGCAAATTTAAAAGAACAACAATTAGAAAACGCAATTAAAAGCTAAATATACCCGAG:1 - chr3R 31188724 3' - I-element 7 1 66.29 TTTAATGCACTGTATAAATGCCAAAATTTTATTGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTGGTAGCTTCTAATTGGTAGTTACAACATTTCAATATCAACTTTTAA:1 + chr3L 566234 3' - baggins 5346 1 54.46 GAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTGTATCTGTGTATCAGTGAGCGCCTGTGTGTTTGGTTTTTATCTATGAAA:1 + chr2L 527556 3' - 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jockey 26 1 60.00 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCAGAGCCCAACATTTTCCCTTGATTTGCCACCCAATTTCCACACCATATGTCAACAGGCAACAAA:1 - chr3L 5084981 3' + 412 487 2 67.71 TTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAAGGACTTTGTGTGCTATTCGCATTTGGGCG:1 - chr3L 10865650 3' - jockey 4723 1 69.31 TACGACGTATGGAGCATTTTAATGCGTAGTGTGTATAAAAAATGCACATTTTACGCAGTCACCTGTAGGTAACTCGATGCATTGGAAGCAAAAACTATGTA:1 + chrX 17708755 3' + Copia1_DM 371 1 78.22 TTCAGCTATAGTCACCGATCGTGGCCACTACCTGGTCCTGATCCACACTCTGTAAATTGATACCAAATTTGTGTAGTAGTTTTGAAACTTACCTACTTTTA:1 - chr2R 13900772 3' + Chouto 238 1 53.47 AAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAA:1 - chr2L 14074971 3' - jockey 273 1 76.24 GGGGAAGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAACCGTAACGTTCGGATGCTCCAGCAAGTATATGATCCTGGGTACAACTTCAAAATCAAGTAACATTTGAAT:1 + chr3L 6010194 3' + invader1 145 2 72.28 AAAAACGTTTTAAAATTATTTAAATTTCTTAGATACTATTTTGAGTTTCCAAACAAGACTGTTGTTATAAATGCTTTTGATATGCAAAACCGTAAAATGTT:2 + chr3L 9336596 3' - transib4 107 1 35.64 ATAACCATAAAAGATTCAAGACCTTAATGGCACACAGGAAAAAGACCGTGCGCATTTTCACTGGCCTTCTTACGGGGCAATAATCGTATAAAAAGTTTGTT:1 - chr3R 6191787 3' + baggins 5072 1 76.24 ATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATCCTACGCACCAGTTTAGATCCAAGTGCCTCATTCCACACATTCCCCATTCCTTGCGCTCCAGGACTTGGACCTCCGC:1 + chr2L 12801351 3' + invader3 278 1 61.39 CTTGGCTCTGCGCTCCTTGAAGTCATACTGGTGCTGAACGCTATTCACCTTCTGGCAGTGCGATTCG:1 - chrX 5068732 3' - Stalker3T 303 1 88.06 CTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGTACATATATACTACTATCTTTCACTGCAAACTTCTGAC:1 + chr3L 22953338 3' - Quasimodo 47 2 72.28 ATGTACTATATATGTATATATATCTTATATGTATATGTAAGTATTTTTGCACCTCATTGTTAACAACTCGAAGCGGTATCAACCGGTTTGCATTTGTTCAA:1 - chr2L 12459678 3' + Dm88 4375 2 60.40 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGTATTATCCCAGCTACAAAAAAGGAAGCAGCACAACAACTGCCATTT:1 + chr3L 21992807 3' - 412 7083 2 54.46 AGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTATTTATATTTTGCTACAACTATTT:1 - chr3R 26021429 3' - BS 5067 1 77.23 GCATATACATATACATATGTATTGATTGAAACAAAAAAGAAAATAACGCTATATCAAACCATAATTTATAGATATTTCTCCACATAAAATATTGTCTAATT:1 + chrX 7466805 3' - Stalker2 7500 2 35.64 AATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGCTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAAAATTATTTTTACCAAATCATCTAAAAAAGGTAATGGGTCGTT:1 - chrX 6897354 3' + Ivk 210 1 57.43 TTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTGAAATGGTTTCTTCAGTTGAGAATTTAATTGATTTCTGAGAATTTTA:1 - chr3R 27071851 3' - jockey 4674 1 68.32 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAGGGCTTAAATATGAAATCTTTATGCATATGTTTCATCATGGAATACGTTT:1 + chr2L 14886446 3' - jockey 35 1 52.48 CAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTCAGCAGTAATTCATATTATATTGTAT:1 + chr2R 13805720 3' - Ivk 5363 1 73.27 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTAAATCGAAAAACAGGTTAAAAGGCTCATAAAATCTGAAAAATACAAAGAAATAATTTCTGTA:1 - chr3R 6425815 3' - copia 4882 2 64.36 CTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAAGGCGGTCTTGCTGCGGGCGGCCTCGCTCAGGTGGGCGTGGCCGAGGGCCTGCAGGAAGG:1 + chr2L 2309193 3' + Doc 4380 1 65.35 CGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAACTAAAATGCTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTCCGGAGTCAAAGACCAAGCGCAAGTTTGTTGACCCATTT:1 + chr2R 5296380 3' + INE-1 136 1 79.21 GGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGACAAACAATGGATAATCGGAATGGATGGCTGGCAACTGTTGGATAACCACTAGCAAT:1 - chr2L 6743301 3' - Quasimodo 7175 2 59.41 TAACAAACAAATTTAAAAAACTTTAAAAGGGCATGTACTGAATGATTGTAACAATAAAGGAAAAGGCAGCAAGTGTTACAAATGTAATCAGTAAAAAGTGC:1 - chr2R 1340349 3' + 1360 3007 1 72.28 GTTCGCTGAGGGACAAACTTGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGATGTAGGGGGGCAGGCTTACAGGACACAGATGCTCCTGGC:1 + chr3L 10121071 3' - GATE 305 1 69.31 CGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGAAAAAAAAAATTATTTTTACCAAATCATCTAAAAAAGGTAATGGGTCGTTAGGTTGGGTTGTCAGC:1 - chrX 6897338 3' - Ivk 12 1 62.38 CCGACTATCAAATACCAGTTACTCATGGGAGTAATTTTCAGTAACGGAGAAGCAGCGATGTACAAGTGTTAAACACTTGCTAGTTCCAGGTGTGCGATGTA:1 - chrX 140138 3' - INE-1 551 1 76.24 TACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTGCGATGCCTGTGGTGGTGCATTAACACATGCGCCAATAAG:1 - chr3R 28196694 3' + hopper 1383 1 61.00 AACGACAGACTAGAATCGCATCCTAATAGTCTAGCTAGACGAAGAGATTGGCTGATTCAGGAAATCATCTTATATTTTAGGGTTAATATGTAAAAATGCCA:1 + chrX 4609534 3' + jockey2 3087 1 64.36 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCACACGCACACACCCACACATAGCCACACACATACATCAAGTTTTCACAAAAAGCAACGCACGTGCGTATAAA:1 - chrX 6146631 3' - hobo 4 1 75.25 AGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAATTAGCCAGTGGAAATTCAGTGTGAATG:1 - chrX 12002455 3' + I-element 243 1 73.27 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACAAAATCATTGACTTACTTCTTGGGGATGCAAATTTAAACATGGAT:1 - chrX 12954171 3' - pogo 28 1 59.41 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACAT:1 - chr3R 10978717 3' + roo 9020 2 77.23 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGTGGTTGCTTTACAAGCTCTATTTA:1 - chr2L 15907165 3' - pogo 49 1 78.22 AGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAGTTGTGTTTTTGTTCGATGCTCACGGCGGGGCGTGTGAAAACACTGTTGCTTTTACTCTTTTCTTT:1 - chr2L 20710883 3' - mdg1 366 2 78.35 TTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATTAGCTTTGAAGAGCTACCCAACTTTTCTGCCAGTGCACTCCTAAGGGACTGGGCTGCC:1 - chr3R 29964790 3' + Quasimodo 7355 2 68.32 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGTCGTTGGTTCGAAACT:1 - chrX 22690746 3' + roo 9038 1 57.43 GAATGGAAGCCCGAAAACCGTGCTTCCATAGATATAACCACAGATATATAGCATCGACGCATTGTTCATTTTCACATCAAAGAGCTCTGTGCGATTGTTGT:1 - chr3R 4161386 3' + HB 486 1 63.37 GAGATCCCCTACAAGAGGAGTCCGAACTCCAATTCACGGAGCGAGTGTTGAGCAAGCAGCCGAAAACTAGCTTGCATTGCCCACTGAACCAATT:1 + chr2R 13346223 3' + Rt1b 451 1 71.28 GGCGGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCGACGTTCCATACATAACGGGTTATTTTTTATTTGCTTAGCCGATGACGATGATGTTGGACTTG:1 + chr3R 10597933 3' + 1360 3376 1 65.35 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGTGTCATCCACTCGAACACATCCTGTTCTGTTCACCTCACAATATGCATACGCCATCGCCTGACCATTAATCTT:1 - chr3R 8914448 3' - roo 2 2 77.23 GAGGAAATGCTATAGTCGAGTTCACGACTATCTATCAGTTACACAGCTAGAGACACAAAAATCTATAGATATTAGGTATTTGCCCGATTCAGCACGTAACG:1 - chr2R 5354744 3' - INE-1 575 1 79.21 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAACACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGT:1 + chr3L 20711708 3' - jockey 4679 1 66.34 GCCGTTAAACACAATTGTTCTTATTTACAATCAAAACATAACGCTAAGCTAAGCTGCGGCTAAATTGCATTCAAATGATGTAAAATCGCCTCTAATGGGCC:1 + chr3L 4266453 3' + gypsy 7272 2 66.34 TCTTCGAGCTGGTGCAGAGGAACATGGAGAAGGTGACGCAGGAGCAGGCGCGCCACTATAATCTCCGATTTGTTGGTTCTACCTTTCCCGTCCGGTATGAG:1 - chr2L 4345201 3' + Osvaldo 1211 1 63.37 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGACAAAGAGAGCGGCAGTCCCGTTACGCGCTGTTAACGCAACAGCGGGATGATGTT:1 - chrX 10629188 3' - P-element 19 1 61.39 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGTTCATGGTAAACGCTAAGAATTCACCATGCTGAGATT:1 + chr2L 11475183 3' - jockey 4711 1 61.39 TCCTTTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCCATGATACAACATTATTTTCCACTCGCGCAATAAGAAATACCCGTAAGATACCCAAATTGCTGATTAGCA:1 + chr3L 18331605 3' + 17.6 7391 2 79.21 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGCAGTTGCCTTGCTTGTTCGCTTTTTGTGGCTTTGATTTTGGCCAGTCCTTGATCTTGATAG:1 - chr3L 3734688 3' + roo 9002 2 67.33 AATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGCTGATGGACGGACGGCGACAAAGTGCGTTCAC:1 + chr2L 20633439 3' - Ivk 166 1 71.29 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCCTTATTTCGGTTAATTACTTTAAATGGCAAACAATATAAGTTTACTTAGTTTAAAAACG:1 - chr2R 17292452 3' - Tabor 19 2 61.39 GCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATGCATAGAAGAACCAAAAGGTGAAAGGTTTTGTATTACCTACGATCTAAAGTTTGTTTTTTAAACAC:1 - chrX 8447104 3' + opus 497 2 73.68 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCGAGCTCTCTCAATGTGTCTCTCTGCGTATGGAA:1 + chr3L 9373691 3' - P-element 45 1 30.69 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCCACACACACACACTTGACTGTGTTTACAGCTCTCGAAGCGATTTC:1 - chr3R 22276845 3' + hobo 2907 1 65.35 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGTTCTTTCCACCGAGTTGAGCGCAAAGCAGCAAAGAGAGAG:1 - chrX 3176283 3' + P-element 2861 1 46.74 TATTATTATTGTTATTAATTATTCTAGTGTCTTTAGTATATCAAGTATAACAACTCACACAACTCTTTGAGCAACCTCCTTAATAGCCGATTGCCCGCCAA:1 - chr3L 18284561 3' + gypsy12 9767 3 71.29 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGATAATCCTGACTTATGCTGCGAATAATGTTGCTAAACTGTTGACTGCACTTTCACTTTAACTTTCCTCTTCACTC:1 - chr2L 16200525 3' - pogo 47 1 76.24 CGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGCGGTACCCGTGCGGAAAAAGAAAAATAATAATAATAGTATTCGAATTATAAATTGTATTTTATATCATATTTT:1 + chr3R 12811796 3' + Cr1a 4424 1 54.55 CTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATATTATTTGATGTCGAAGGCTGGAAGTTAAGGGTTTTATTAAAAGAAGAACGAAGAGGAGGAGAAGAA:1 + chr2R 16190734 3' + hobo 345 1 48.51 GTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAACT:1 - chr2R 3293765 3' + 1731 261 2 76.24 GCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATGTGTGCTATCACTTCACTGCTGTTCGCATCTG:1 + chr2L 7274281 3' + 1360 111 1 74.26 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATTGTGTGACGCTAGCAGCATTTTGTTTAAAATTGAATTCCTTC:1 + chr3R 27435089 3' + jockey 4955 1 62.38 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTACCAGCCGGTGGCACCCACCCGACACACCCCTTGTGGTTTCGTCTGTCTGTGTGCGTGAACAGA:1 + chr2R 22945479 3' - hobo 14 1 65.35 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACATAAACTTGATGATATGGTATAAGTGCTTTTGCCTCTTCAATGGTCCTTCAAT:1 + chrX 3195700 3' - mdg1 7063 2 54.46 TTTGCATTTTTGAATGTAACATTACATGTGGTGAGTTTGGGGGTTGGACATAGTTAGTCTATGATGCCATTCGAAGCAATTTGCTCGTCGCTCCTCGTAGG:1 - chr3R 20954345 3' - TAHRE 10325 1 57.43 AAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAATGCGTATATGTGGCGGCGTATTTCGTTGCGCCGTTATTCTTCTTCTGG:1 + chr3R 2459545 3' - 1360 3269 1 64.36 TATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAAGCCCTCTTAGAGGGTTGATCTAGTTGAATG:1 + chr3L 16470306 3' + BS 5055 1 63.83 TATTAATTTTTCACTCGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGAACCATTTCAGAATTTCCTTTGTCTGCAAATAAACGAAGTGA:1 - chr2L 17642132 3' - 1360 428 1 61.39 ACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAGGAAATTGCCTGCAGTTCCTGGC:1 + chr3R 8914557 3' + roo 9050 2 60.40 AAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTGAAGGTGACGCAAATTTTCCACAGTTTTTTAATGTTTAAATTTTTAACCTCGAACA:1 - chr2R 5037251 3' + Doc 162 1 55.45 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTGTATGCCAAGCGTAAGCGGAATTGCTTCAATTTTCGTTTTGCTTAACGGCCACCGTAGACAC:1 - chr3R 27386267 3' - hobo 14 1 65.35 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTTATGTGGAGTCGTGGTT:1 - chr2R 6074395 3' - 412 57 2 80.20 TTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCTATTTCGCCACTCTTTGGTGGCGAAAATGTCAGAGGTTTCTACGGAGCTCGTAGATTTTTGGATT:1 - chr2L 7463490 3' + blood 366 2 67.33 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCA:1 - chr3L 9174698 3' - 412 48 2 71.29 GTAAAGCATTTGACTCTGTTAAGCATTCTCTTCTAGTGACGACGGAGCAGAAGAAGGGTGGAGAAAAAGATTTGACACTTGATTCTGGCTGCGATCAATCA:1 - chrX 14996967 3' + Q-element 323 2 67.33 TTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGAAAAAATAATTGAAACCAGTTTGATTGATTGGCTGAAATATAGCAGTTAACTAAGGTTCTGCGC:1 - 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chr2L 14249265 3' - Doc2-element 4637 1 77.23 TCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTTTTGTCTGTTTTTTAATTTTTTATTTTTTGGGTGGGGTCATTATTTCGTACAGGAATCGAACATGTGTCAATCACT:1 - chr3R 8874949 3' + S-element 1527 1 79.21 TGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCTTCGATTTCAGTGGTTAAATTTAGCCGGCTTGTGTTACCTTTTCGAACCAAATAGCAGCTGCCGGCGAGTATCTT:1 - chr2L 18893254 3' + 297 6826 2 76.24 CACAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCAATATGATTGCCGATGGGCCATTGTAA:1 - chrX 13832742 3' + Ivk 4961 1 73.27 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGCCTTGTTTTGCTTTCTACTAATTCGG:1 + chr3R 27993385 3' - transib2 48 1 80.00 TTAATTTATATACATACATACAACTACTGGAGTGCCATACGGACGGCGGTGCTCACATTTGATTTCGAGAGTGTGGATGTGAGTGTGAGTGAGTGGGCCGC:1 + chr3R 10268365 3' - 1731 100 1 66.34 CTTGGCATCACATCCTGGTCACCGATGAAATACTTTAACTGACAGTCCGGGTGAGCTTGACAAGGACAGGTGAATTAATGTTTTCTAAGCATTTCAAAATA:1 - chr3R 13613493 3' + Rt1a 4884 1 69.31 ACGTTCATACGGACAGACGGATATGGCAAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATGTATGTATAGGATGTACGTCATTCACTCTCAAAG:1 + chr4 51402 3' - INE-1 125 1 75.25 GCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTTCTCCCTTTAGCCATCGAGAACCTGCCCGACATTCGCATAAATTAGTTTTGATGCTGGCAAATGAAGAGAAGGT:1 + chrX 7153953 3' + Max-element 8319 2 73.27 TGTGTTTGTCAATCCAGCCGTGGTTTTTCATAATCTTCTTTAATTAACATTTTATTTATTTTTCTGAGTGCACCTCTCTCTCTCTGGCCCTGGGTTCTAGG:1 + chr3L 13903645 3' + Cr1a 51 1 57.43 CCTAAGTCTTTATGGATATTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGGATTAACAATTAAAACTGCCTAATACGTGCACGCAGAGAACTTTTCGATTTAATTATG:1 + chrX 12860556 3' - G4 3547 1 56.44 TACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCGCCTGGTGGGGTACAACATCATTTTCTGGCGATGATTTATT:1 + chr2L 3813023 3' + Doc 4265 1 59.41 TTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGCCCATTTTTTTGCGACTCTCCTGCCACA:1 + chr2L 9058293 3' - Juan 407 1 72.28 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCACACATCCTGTCTTTTCCAAAGAACTT:2 - chrX 10436540 3' - hobo 47 1 74.26 ACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAATGACATAAGTATGATTATGCTTAAAATAAACTTGATTAAGAACGCGGA:1 + chr3L 25755003 3' + F-element 287 1 54.46 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTATGAATATAGCAAAGAAACAGATTAAAATGAATGTGCACCACAGACGGAATAAATTGTTGCATACTTC:1 - chr3R 17495155 3' - jockey 15 1 53.47 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGACTCACCTATGAATAGTCGTTGT:1 - chrX 2125588 3' - P-element 52 1 27.72 ACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGAGATCATCAAGTGACGGAGGCCAACTCCGGCGCTGCCGTTGCTC:1 + chr2L 1180776 3' + hobo 69 1 57.43 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCAACAAATATAGGATGATACATAAGCGGTCGTCGTT:1 - chrX 7698596 3' - pogo 38 1 63.37 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTAGTTGCTTTGTTTAAAATGTATGTCTCATGTTTCATGTGCAATTTAATGAGAAAGCAATTCACCTTTGA:1 - chr3R 12729327 3' - roo 7 2 72.28 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGATCTTGAACCTCCCGCGCCTGCTCTCACCTCACCCTAGA:1 - chr2L 128693 3' + P-element 2852 1 45.54 ACAAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTGCCTGTACTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCG:1 - chr2L 15833004 3' + hobo 2824 1 50.50 CTTTGTAGTAAAGCAATTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTTTCGCTTTCAATTTATTTATTTATTTTATGATATTAACTATTTAACTGCGAACTGTGAGCT:1 + chrX 10822682 3' - Doc3-element 129 1 79.21 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGAGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTATGTTCCAGTTTAACGAACTGATCC:1 + chr2L 5269849 3' - hobo 48 1 70.00 GACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTATATTACGTTTCGCGCCGCACGTTTTTGTTGATGGTGTCTTGTTCCTTAATCAGAAATTTACACAA:1 + chr3R 8444000 3' - Stalker 6809 2 71.29 CTAACGCAGTCGCGTCGTGCTAAGTGGAAAGTGCTAACCAACGGTATAACTAACCTTATAACAAACGCGGATCGTGTCAGCAGTTGGCTAAGTTGGCTAAG:1 + chr3L 12027865 3' + rover 445 1 79.21 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAGTAATATTAAATACAAATCATCAGTTTCCCATCACTAAAATAGTT:1 - chr3R 31775040 3' + roo 9045 1 54.46 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTGTTATTCGGTTTGATCTATCATTTCTCAACAGATTGCCGGAGTTGCATACTAAAGCA:1 + chr2R 12999802 3' + hopper 1358 1 63.37 GCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATCCTACGCACCAGTTTAGATTTAAATTCATGACTATTAATTAAATGGCCAAGTAAATATTTCCCCGACAT:1 - chr3R 27425463 3' + invader3 270 2 45.54 ACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCAGAAGATATCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' + Chimpo 34 1 48.51 TAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGCCGCTGAGTGGGTGGAATGCGACTTGCTAATTTTCAGATCTT:1 - chr2L 1576695 3' - F-element 259 1 64.36 TAATTAATATTATTATTATTAAAATTCCTATTGATATTTCAGTATAGATATCAAAATTAGGGGAAAACATACATATATATTAATTAAGATAGTATATTACT:1 + chr3R 14750639 3' - mdg1 7076 2 67.33 ATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAAT:1 - chr2R 5284580 3' + Doc4-element 2596 1 70.30 GCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAATAATTTAGGCTGCGCGCGAACTAAATGG:1 - chr3R 29193727 3' + BS 5050 1 70.00 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTAAAGCACATATAATTATTAGTTTTGTACGACTTTTAATCAATTTTTTTTTGTGTTGTTCCCC:1 - chrX 19080263 3' - Ivk 15 1 58.42 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATC:1 - chr2R 19209474 3' - Doc 72 1 56.44 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGACTATCAGATACCTCTTACCCATGCTCTAGGAATATGAAGATGTTTCAGTAGCAA:1 - chr3R 10078304 3' + roo 389 2 59.41 TAATTAAAAATTTAACAATAATTCAAGACCTTATGAAATAAATAATACGTATTTAGATGGCACAATTGGATATGAGAATTCATTCGAATAATTTAAGGAAC:1 + chrX 16850867 3' - copia 4825 1 78.22 CAAACCCGTCAAACCCCACCTGAAGATCCGCCAGCAGCAGCAACAACAACGCCGCCGATTGCGCAACAAGAATCGTCAATTCTACGGCGACGAGCCCATCA:1 + chrX 4559748 3' + G2 118 1 73.27 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCACAACAACAACTATTGACAACTATTTAACACGTGTC:1 + chr2L 1195100 3' + hobo 2898 1 62.38 TTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTATTTGACACTCA:2 - chr3L 21912262 3' - Bari1 33 1 65.35 TAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGTCTCTCCGGCATCTGACTCTATCTGCGCCCCTTC:1 - chr3L 3644350 3' + Doc 344 1 66.34 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTCTTATTCTAGTGCCTTTGGTTACACGATAGGGCTTTTTATCC:1 - chr2R 3877806 3' + 1360 3333 1 78.22 CTTCAACTAACTCGAAACTTTTCCCGCTCTCCCACTCACTCACTCACTCAGCCCCCGTCCATTATCCTACCCTTCCCCCTTTGCCCA:1 - chr2R 11605195 3' + Doc 337 1 77.01 TTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGCGCGGTAGTTGGTTCGGCTGTTCGTAGTACATATTTTAAAAAAGTTCAACAAGTGTAAG:1 - chrX 4246138 3' + accord2 185 1 46.53 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCGCTAATGCCCCTGTCCAAGTTGCGGGCTAAAGTGCGTGCATCGCACAATGTGCAAC:1 - chr3L 21782033 3' - roo 18 2 61.00 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGGTCTCTGGCGTTGAGTTAACTCAAGTTCAGCT:1 + chrX 13587968 3' + hobo 2906 1 64.56 GGCATAAAGTCAAATTATAAAGCTAGAGAGCTGCATTTTTGTAGATTTGATGTATTTGACAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - transib3 2835 1 59.41 ACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTATCTCTTTCTCTCCTCTGAAGCTTTGCGCTTTCTTC:1 + chrX 12602323 3' - invader2 216 2 65.35 TCGATCAGAATTGATTTCGGTCCGAAAATCGTAACTACTGCAACTTTATTTATGCGATACATACATAAATAAAGTTGCAGTAGTTACGATTTTTGCAATTT:1 + chr3R 24681110 3' + 1360 3176 1 50.50 AGCTTTACCTATAAGAAACTGTATCTTGTTATTAGTAGATTAAGCTTTAGAGTTCTTATTAATTTTGGAAATATGATACATATCAATCCTCTATAAAGTGA:1 - chr2R 23583700 3' + Burdock 70 2 51.49 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTCCTCGGACATGGCCAGCAATTTTCACTCGATGCATT:1 - chr3L 14284980 3' + roo 393 1 59.41 CGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATTTCCTTTACCAAGACAAGCACATTGCAACAGGTTGCACGCAGACTGATAGGGAT:1 - chr2R 6735246 3' - Burdock 6151 2 64.36 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTCAGACAACTTTACGCGAGTATTTATAACTCAACGCTTGC:1 + chr2L 9330287 3' + hopper 1380 1 59.41 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATGTTATAAGCATTTAATACTTTTTATCTCAAGATTTATATATTTCTACTTT:1 + chr3R 28804473 3' + roo 9047 1 62.38 GAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAAAAGTATGCAACTGCAGTTGTGCGGTGTGGCCCGTCGAGCGAATGAATGAGTGAGGAAACGAACG:1 + chr2R 17345784 3' - hobo 347 1 68.37 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTACATACATATGTGGGGGAATTTTTCCAATTTTGC:1 + chr3L 14260413 3' + 297 361 2 71.29 AGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACTGCGACCTAATAAAATTC:1 - chr2L 14074940 3' - jockey 242 1 54.46 CGCATTCACACTAACTTAGTAAAGGGTATCCGATAGTCAGGGAACACATACAGAACTCGCTGGAAAAGGTAACTATTGTGATAAATCTTTGTATTTCAACA:1 + chr2L 10233573 3' + INE-1 533 1 62.38 TTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTAACTTTAGATACTTAGATATTTTTTATCCTCTTCAATCCTCAATCGTTTTAAAGA:1 - chr3L 25607310 3' - F-element 147 1 54.46 CCGTGGGACCCGTGCGATAAAAAAAAAATCAAACAAGTTGGATTCATTCTGTTCTGGAATACGACTTCTTGAACAAGGTGGTTGTATAACCAGAGCTTGTG:1 + chr2L 14917068 3' + Cr1a 4447 1 81.19 TCGATCACGGACTTAACTCACGCCGAGATATAGGTGCTCATGCAAATGCAGATACACACATCGGTTATATGCGAGTTGGCAACTTGAAATATTTCATTAAC:2 - chr3L 9120405 3' + Tirant 402 1 28.71 CCAAACATACCGGCCCCCCTGAACGGTTGTTCAGCAGAGAGGCAGTACAGCGACACTGCCATTCGCGTTTTTCCACGAACTCGTCCCAAATTTTCCCCAC:1 + chrX 6157101 3' - 3S18 5751 1 53.00 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTATTGAAAAAAGTTGGCAATATTCAACTGTT:1 + chr2R 22521867 3' - roo 8710 2 76.24 ATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTAAAGCACATATAATTATTAGTTTTGTACGACTTTTAATCAATTTTTTTT:1 - chrX 19080276 3' - Ivk 28 1 57.43 GTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGGGCGCCGCGCTTCAGTGGCC:1 + chr2R 11400171 3' + 1360 3170 1 80.20 AAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCATTGGTGCCACGCCTACAC:1 - chrX 21667975 3' + Tabor 484 2 71.29 ATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCATTCGCTTTCTTTATTTTGTACATATTGCATCGATGCCAAATCT:1 - chr3L 25331162 3' - F-element 161 1 70.30 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGACTCACCTATGAATAGTCGTTGTTGTCGACGTCGTCGTGGCTATAGGCAAATCAAAATGGAGAACGTTAAA:1 - chrX 2125540 3' - P-element 4 2 75.25 TAACAGGCAGAAGGAACCGTTTCCGACCTTATAATTCTTGTAATTCTTTAATTCTTTTAATTCTTTCGGAATAGTTAGAGCACCATCTTTATTCTGATTCG:1 + chr3R 3854456 3' + INE-1 33 1 45.54 CTCACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACAAAGTCCAATAATAAAATATTTCCATA:1 + chr2L 19408573 3' + accord 188 2 72.28 TTTTGGTGACGGTCAAAATTGATCTCTTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATGTGAAGATGTTGTTGGACACTAAAAGAAGTCGTT:1 - chr2L 4851599 3' - 1360 3324 1 66.00 GCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGACCAGAGACTTATCTGGGAGTGTTCTTGGCTGTCATTGTCTTGAACTGGTCGTGTTGCTTAGTGCTTAGT:1 + chr2R 6783260 3' - Tabor 6 2 74.26 AAAAAAAGAAAAAAAAAATGAAACGGTGTGCGAAATGTTCACACATTTCAAGGAACTATCTGTGGTTCGGCAAATTGCTGCGAGTATACAAAGAAAATCAA:1 - chr2L 13302258 3' + gypsy7 5009 5 73.27 CAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCCCCGCTGCCTCCAACAACAACAGCTGGACATACGATGGATTTCAGG:1 - chrX 8306644 3' + F-element 355 1 78.22 TAAATAAATCAACTGCTCGGTTTTAGTGTTGTAGACATACATACGTTGTGCCTTCGTGTATGTGCGTGTGATTTCTGATTTCTGTTTCATACCCAAGTTGA:1 - chr3R 20049962 3' - accord 7244 2 79.21 AAAATAATTTTTAAAAATTCGCGGCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTATCATTTTAAAACAATTTGAGAGCATTTCTATGCACATT:1 + chr3L 18064044 3' - 1360 3087 1 65.35 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATAAAAACTTAGGTAAGGTTCTCTGGAAAATACACTGGTTTTTCCA:1 + chr3L 17652777 3' - pogo 29 1 58.42 ATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTGCTAAACTTGTTAAATGCAAGATATTTTTAACAGACCTGATAGGCATCGA:1 - chr2L 23374509 3' + flea 4992 2 58.42 GCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAAAACCAAAAGGCTAAGGAAACGGCAAGAAAAGGAAATTCAAGCGTAAAGCGAAAGTAACT:1 + chr3R 15039501 3' + Bica 411 1 67.00 CGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACGGGAAATCAGTCTATGGCAACTGGTCGGTGAGTTTCCCCAACTTACCACCGCCACCCCACGCGGCCCT:1 - chr2R 16396746 3' - X-element 12 1 64.36 GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAGAGTCAATATAATCTTCAATTTGAAT:2 - chr2L 18773324 3' - Max-element 53 2 79.21 TGTTGCCCATGCTTTTTTAATTGCTTCAACTAGGGTCCCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTCCTTCCTTTACCGTTTTTCGCGGCTCATTTTAGAAAATTT:1 - chr3R 4576771 3' - Tc3 1330 1 74.26 TCTGGTGGAAGTCGCGAATGCGTCTGCGGATGTTTATGTCTGTGTTGGCCAATTCCATTTGACAGTTGAATTGTTTTGATCCCGAGCATTTAGAGAAATAA:1 + chr3L 3871041 3' - Quasimodo 7050 2 62.38 TTTTTATCTTTATTAATAAAACTCAAATGATCAATGGATTTGACTTGCTAATATACTAATACTTTTTGGACAAAAGGAAGCACCTGAGATGGCAAACTCTT:1 - chrX 3260363 3' - 3S18 346 1 73.27 TCTCCAGAGCTCGCCCACAAAGAAGGCTTTACAGGAGACAGCCGAAGAACTTTTATTACATTCGTATATCACACAGTACAGAATGGAATTTACAAAAACCG:1 + chr3L 4636710 3' + BS3 1533 1 60.40 GACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCCGACACGTGCCCAAGCGATGCCAAAAGCTCGGAACT:1 + chrX 7594019 3' - 17.6 7130 2 64.36 TATAGTATATACATATACATGGATGTGCGAGACTCCCAAGCGGATTGGGGAAATTGCTTGAAATAATAATGTTAGACATCGGCGGGG:1 - chr3L 19383239 3' - Stalker2 256 2 63.22 GCGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAACTAATTGCGGTCAGATCCATGGCCACGGTTTCCTCGGCACCCGTCCTTTCGTTTTATCGATGGGTCGCAAAAGGG:1 + chr2L 5653623 3' + hobo 2937 1 76.24 CGGCCCGAAAATAGTCTTCTAGCACAACACATTCACACTCATATAGACACTCACACAGCAACAAACACACACACTTTGTCTCCTTCTCTGTCTCTCTAGAA:1 - chr3L 9152596 3' + 1360 3193 1 73.27 GCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACACACATACACACACACACGCAGAGCAAC:1 - chrX 14674236 3' + G6 1837 1 73.27 TTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCGGATTTGTACGTTGCCTTTGGCTCGCTTAACCA:1 + chrX 22691462 3' - Doc 4606 1 65.62 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTGCCGAACAGTATATCGTGAATTAAAAATGTCTGGT:1 - chr3L 25608329 3' - Doc 42 1 67.33 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGATTTGCCCTTTCCGAAGGGCAAAGTAATTGTTGTCATTTTGTTTTTTCTGGCATTTGATTCTTTTGCAAAAGGGA:1 - chr3R 20775231 3' - F-element 21 1 35.64 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTAGTTGAGTGGAAATATGACAAGGTTTGAGGAGTGAGAAACTGATTTAATGGAAATATTT:1 - chr3L 3635402 3' + roo 390 2 60.40 ACGGGTATCTGATAGTGGGGGACCTATGTATAGGTCTAAGGGTTGCGAATATATATATAGTATAGGGCTATAACTTCCTGCTCTGGCAGTACCAGTATAGT:1 + chr2L 21689903 3' + INE-1 554 1 75.25 TAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTCCGTTTGCCCGGAAAGCGGAGGTAGGGGAGCTACGACCGCTATTA:1 + chr2L 919708 3' - Doc 254 1 55.00 GAATAAATCCGCTTTGCGTTTTTATTGATTGAATGTCAGCTTAAGACAGAAACAGTAAAGGAAACAGGAACAGGATATAGGGAGCAGGGATAATGCGAGGA:1 - chr3R 17572239 3' - Tom1 310 1 56.44 TGAAATAAATCCTGAGGAAATATCAGGAGCTCTAATAGAACAAGGTTTTAAGCCGAAACAGAAGTAACTGACAGAACGAGACGAGGATATGTACGGCGAAA:1 + chr2R 17331076 3' + Fw2 460 1 57.43 CAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCAACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACACATAGCCCAGGAAACCAACAAATAGGCTTGCATT:1 - chr3L 2005564 3' + F-element 260 1 84.16 AGTTAGATTTTGGAGTCTACTCAAGATTGCCGGAATGAGTAACCTGTATCAGATCGATAAGCTGGAGGATGGATGTGGATGGGAACGCGAATT:1 - chrX 9709970 3' + 1731 397 1 83.87 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATAATTGAGAACTTTGAACTTTTATTTCCTTCTTCTGCGGAAA:2 - chr3R 7883130 3' + roo 9038 1 64.36 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCCCCCAAATACGTCACTATATACATAAAGATATACACCCGCACACGTACGCGTATAGTC:1 - chr3R 18887039 3' - 297 15 2 55.13 AATACTTTGTATATTTGTTTAAAATACTGCACACATCACGTGGAGAACTTCAACAATCTACTGCCCGACTTTCCGGAAAGGCTCAATAAGGACTACAAGTA:1 - chr2R 3524637 3' - Cr1a 169 1 72.28 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCACGAGGTCTGTCAATTTCTGGGCTCTACGCCCCTCGTCCGTTGTCGTTTTATTTTTAAT:1 - 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chrX 17535525 3' + BS3 1513 1 66.34 GCTCAAGATTGCCGGAATGAGTAACCTGTATCAGATCGATAAGCTGGAGGATGGATCCTATGAAACGTGAACACTTCCTTCTTTCCGCGTTGGAGCACACA:1 - chr3R 26884470 3' + 1731 415 1 67.33 AGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAGGGGG:1 + chr2R 21468419 3' - pogo 298 1 65.15 TTGTTGATAATAGTGGGTCCGAGGAATCAATAGCTCTGTGGAACGTGGCTAGCACGAAATGAATATTTTGAATACAAATAACTTAAAGGCGGACATTCGGA:1 + chrX 9808075 3' - transib2 2397 1 68.32 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAAATGGGTG:1 + chrX 12818899 3' + roo 9045 1 53.47 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAAT:1 - chr3L 17215717 3' - Ivk 29 1 51.49 CAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCGAAATCAGATTCAAGCAAACAGACAGTACCG:1 - chr2L 7277067 3' + invader4 174 2 69.31 AAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGTTTGTGGTTCAACAACCGGGCCACCGGCGGCAAGGAGTCAGCTTCACGGCAGAGTCGGATG:1 - chr3R 20946872 3' - HMS-Beagle2 6822 1 63.37 AAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACTTTAAATTAATACCCAAATATATTATATATTTGAATTT:1 + chr2R 12370629 3' + roo 372 1 67.33 AGAAGGACACAAAGGGGCTCCAAGATTTCCCCGTATGCCTTAAAAAATAAATTGATTCATATTTTGTATTTAATGTATCAGTACAATGTTGAGCTAGTAAC:1 - chr3R 19837291 3' + X-element 4675 1 52.48 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCTGATTTTCGATTGACGTG:1 - chr3R 9606229 3' + roo 9014 2 82.18 GTCTCGTAATCGGGTTTTCTTTGAAAACACTTCGGACTCGCGCGCTGCACAATAATAGGAATCCATTTCCACAAACGCAACAAACTATAACTAACAACCCC:1 - chrY 520263 3' + gypsy10 430 1 64.36 GTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACTAACAAAAATTGCAGGTGAACAATGTGAAAGATACAACAGTTTCGGA:1 + chrX 4280289 3' + I-element 349 1 71.29 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATCGATGAATCCACCCTAACACAACATCAATGTGTTCCAAAATCCACCCCCTTTAGGGGTTTCAGCACAGGTGG:2 - chr3R 17846843 3' + roo 406 1 74.26 GCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTTCCTCCTGCTTTCGTTCTTTGTATACCCTTTCAATGGTTACACACCTTCCAAGGACA:1 - chr2L 18231767 3' - 1731 4333 2 56.44 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGAACCGCCAAACCACCGCTGCAGCGCGCTGGCAGGCTAAATGTTACGCGCTGCATGCATTTGCGGCT:1 + chr3R 28196785 3' + hopper 1406 2 61.39 TGGGTGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGGAGTGGTACTGTCATAATATTTATAATGATCTTAATGATGACACAAACTAAAGCA:1 - chr2R 2009408 3' - I-element 21 1 79.07 GACTATCAGATACCCGTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAA:1 + chr3L 24731968 3' - INE-1 549 1 81.19 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTCAAATTTTCCTTCAAACATTCCCCTAAGTTTGG:1 - chr3L 16755771 3' - pogo 38 1 66.34 GTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTGCATATCAAAGGATTTGAAATGTAATAACCTAGACAATTGTAAATTTCGATGG:1 + chrX 13504105 3' - R1A1-element 5149 1 54.46 ATTTTCAAAAAGTTTCGGGATAGTCTACAATTTGGAGACTCCTTTAAAATTGCTCCACCCAGCCTTTCTTCCACTTCCGTGCTTCTCAATTTCCGATTCTC:1 + chr3L 2543797 3' - Q-element 135 2 52.48 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAGGTAAAAAAAACAGTAGTCAAGATATGCTAATGGTT:1 + chr3L 6128305 3' + jockey 4953 1 80.00 GATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCAAAAAGCATTTGTTTCTAGAGAAACGGAGCATGTCGGATCGTTCGGAGAACT:1 - chrX 12902762 3' - micropia 5141 2 53.47 TATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACAGTCAATACGCACAACTTCTTTCT:1 + chr2R 4023405 3' - Doc2-element 67 1 65.35 CTTGAAACAGCCTTTATTTGTAAGCTCATTCGAGGTGGTGTGGTGTGTGGATATCGTTGTGAGTATCTGTGTGAGAGAGGTGACCGCAAACATACAAACAC:1 + chr2L 16096376 3' + Cr1a 4031 1 66.34 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAGTCTTAACAAAGCAGCTGCCAGAGACCTTCGTCTCCTCGTCGTCCGTTTGGGGGCAA:1 + chrX 17284028 3' + roo 9055 2 62.38 TTACAGCAAGTGAACATAAAAGATTAAATTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTCACCTCTAACATGTTTTAAATTAATTTAATGAAGCTGAAGCTCCGTGCAC:1 - chr3R 15724820 3' + I-element 455 1 54.46 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTT:1 - chrX 10210957 3' - I-element 38 1 61.05 TTTTTTTTCTTTTCTTTTTCTCCAATTTTTTTTT:1 - chr2R 12580809 3' - Doc2-element 220 1 76.47 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGGGTATTATTTTATTAAGACTACAATCGATATATAGTTACTTACGCAGGCTCTAG:1 + chr3R 16487405 3' + roo 9051 2 57.43 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGCACCTCAAAAAGAAAATATAAATA:2 - chr3L 10565295 3' - pogo 50 1 78.22 ACCCACACACACACATACACTCACGCACTGCGTGCTTAATAAGCAGCACACACACACGCACACATGCGAAAGGCCAAGGAGTAAGCCCAAAAAGTTAAAAC:1 + chrX 5284714 3' + accord 7100 2 52.48 GATTGTGAAGAGGAAGACGACTATGAAATTTTAGACATAAGTGTGTAGGTCTTAAGAGTACATAGGTTTTTAATGTAAACAGAGACATATTTTGTGCCGCT:1 + chr3L 25824647 3' - hopper2 59 1 69.31 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATTAAATGTCGCAAAATAAATG:1 + chr3L 3635493 3' - roo 8687 2 58.42 TGTTTCTTATGGCACAAAGTTATTAAAATGGGAAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATGTTGCCTGTAATCAATAATAA:1 + chr3R 10109066 3' + pogo 313 1 77.23 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAGTTTGCCATTCTAGTGCTCTTTTCGCTGTGTTTGTGCTCCTGGGAGTATGCAACAGTTTTGGCTTG:1 - chr3R 14832471 3' - hobo 10 1 71.29 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATATCTGAAAATGTGGGCAAAGGCAAGGAGCATACAAG:1 - chr3L 13264462 3' + Burdock 218 2 64.36 AGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGCCAGTCAACCGGCGCCAGAGCCAGCGTACGTTGTCCCGCTCGGGCTCGTCGTCACGCTCTCGATCGCCGTCCCGC:1 + chrX 22874953 3' - INE-1 150 1 79.00 GTGTGAGTAAAAACAGGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTCGAAAAACTACGCTTGGGATTACTTCTTTTTA:1 - chrX 20924765 3' - 1360 3242 1 73.27 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATATCATTCTTTCAGCTGGATATTCTT:1 - chr3L 11844354 3' - Burdock 6180 2 75.25 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGGCCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCCACTTTTAATGTGGTGAGGTAGGAATGTTTCATTGATG:1 + chr2L 11805075 3' - P-element 31 1 46.32 TGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAAT:1 + chr3L 21912345 3' + Bari1 1686 1 58.42 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGTACCACGAAGCTCTTCAATTTTTTACGCTTATTTTTCCCCATCTGTTGTCATAATCAGACAAAAACTTT:1 + chr3L 8012133 3' + transib2 2818 1 71.29 CGGCTTTGACTGCATACTCAGATTAGTTTTCTTCCTCTCTTTTTCGCTTAATTGGTTTGCACGACGGCCATTTTGGTTTTTACTCGCCGATGATTGCCAAT:1 + chr3R 14494521 3' - Doc 4521 1 52.48 TGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCAAAGTTTTTGTTTAATGCCACCGCGGGCCTTTTGTCGACCTGGCCAAAAACTTTGTAAGCCCAAAATTGTAAGCTAATAT:1 - chr2L 8628964 3' - accord 7028 2 74.26 GTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATTTACATATTAGTATCTTTCGCGCTCTTTGTAATGGCAATCGAGATATGGCTTTATGTGCTAGCTGCATACA:1 + chr4 1131764 3' - Burdock 281 1 34.65 CGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAACAACATAATAATTGGGATAGGCTAAAGAATATTGGTTGTTACTAATAAAATCGGTAACGTTTAAGT:1 + chr2R 14944734 3' + hobo 72 1 75.76 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTCACTTTGTATGCGAGCCAAAATTAGTGGAGACAACCGCCGACCAAAAGGAA:1 + chrX 13881357 3' - jockey 32 1 51.49 CGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACCCGCAATCCCAATGACAACATGCTGCTCCTCCTTGGAGATTCCGTGTGCCACCTCTTCTTCCACTGAACTTG:1 + chr3R 24775564 3' + Idefix 241 2 60.40 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATCGCCCTTCTCTTGCCTTTTGTGTA:1 - chr2R 14744244 3' - roo 8717 2 80.20 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAATCAGGTTGTTGGATGGCATGGGTTAAGGGAAGTCGGC:1 + chr2L 7971043 3' - blood 7047 2 58.42 CGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGCATGACTGCATACGTGTCTTACCATGCGAAC:1 - chr2R 5200945 3' - 1360 44 1 69.31 GCCCTAGAACCGCCCAAAACTGCCACGCCTACACTTTTGCAAAATGTTTTGAAATTTTTTGAAAGTTTTTGTCAAATTGAGCCTCTCGACGGAGCAGCCTT:1 + chrX 16491058 3' + INE-1 347 1 68.32 AGACCTCTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTCGTATTGTGTTTCTAACCGTTGAACTGTGAACCGTGTCAATGTCAAGCGTAAGAAACCCTATTAAGTT:1 + chr3L 2925785 3' - HMS-Beagle2 70 2 73.27 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGGATAAG:1 - chr3L 11367487 3' + roo 385 2 53.47 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTTATTTTAATAAAGACTTTTAATTGAATTTTCAATTGTTGCGCCGGCTTTGATGGGGCCATGCCATCGCA:1 - chr3R 6135194 3' - I-element 4 1 75.25 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGATCTTGAACCTCCCGCGCCTGCTCTCACCTCACCCTAGAG:1 - chr2L 128692 3' + P-element 2853 1 46.53 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAAGTTTACATCGTTCGCTCCAGTAGCCGCGTAAATCTTTCGC:1 + chr3L 21782112 3' + roo 9037 1 59.41 GGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATTTTTCTCGTTTGACATGAATAAAGTAGAGCGAGCG:1 + chrX 8815868 3' - Quasimodo 7047 2 65.35 ATGAAAAGGGTTGGCCGGCGGTTAACGCGCGCGGCTTTTACTAATCAGGTGTCAAGCCGGTGGCCTCACACTAAATACATGACGGAGTAACTTTTAAGAAC:1 - chr2R 4133472 3' - gypsy2 328 2 56.44 ATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTGGCGCCAAATCGGAAACGATAATGAAAATAGGAAATTTAAGCAAGATGAATTAACTAAGTTAAATAAGTATATAT:1 + chrX 11959774 3' + Burdock 6386 2 63.37 TACAAATTATTTTCGTCCACTACAAACTTTAGACGATGGGTCTGGGAGTGGGTATGGATCTCGACTGGGGGCGCGGTCGCTGGCCAAGATGGTCCAGGGAC:1 - chr2L 8475749 3' + Juan 241 1 66.34 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACTCCATGGATAATTGAAAGGGTTGGAA:1 - 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Rt1b 4918 1 62.00 TTTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTCTCGTTCTTCCAGTCGGAACCTTTTTTCGTTAACTTTTTCTTAAGTTAAACAAAAGGCAAACATT:1 - chr3L 13880079 3' + Cr1a 230 1 69.31 AAAAATGCTATTTCACAATTTATTTTCACAATCTTTAATTGTGCTCCGACATATATATATTTTTTTTTTGTCATTTTGTCAGGGTTCCGTAATTTTCTTA:1 + chrX 4564848 3' - copia 337 1 50.00 CTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTCCATTTTTACTAGCACTCTGTTGGCTGCAGTAAGTAATCTACATTTTTAGGAATGCAAGTATGATATTCAGCCTAT:1 - chr2L 5443871 3' - I-element 471 1 78.22 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTGCGATGCCTGTGGTGGTGCATTAACACATGCGCCAATAAG:1 - chr3R 28196694 3' + hopper 1382 1 61.39 TCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAA:1 + chr2R 4023367 3' - F-element 57 2 62.22 TAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATAGCGAGGCTTGAACGTCAATCAGATGAATAGGGAGCAAACTCCGACTTAATGGCCGTCTTGATTATGC:1 - chr3L 22292201 3' + Idefix 7219 2 57.43 TAAGATTTAAATAATTATTGCTCTCTCTCTCTTTCTCTCATTTGACTTTTTCGTTTTTCCCAGTTGTATTATTGTTTTTGCAGTAGTTGTTGTTTTTTTTT:1 - chr3R 21924573 3' + Doc2-element 4714 1 78.22 TTAAATTTCTATCGATTTGCAAAATGACTTTTTGCCACACCCACTCTAACGCCCTAAAGGGTAAAATAGGGTAAAGACCAGTATAAATTGGTATCCAGAAG:1 + chr2L 21625473 3' + INE-1 306 1 58.42 GGGAAGATTCAATAAATAATAAAAATTAAAAAAAAAAATTTCAAAACCTACCACTCCTCCGTAATCCACCACACTGGTCCCAGGTATTGCTAAATGATATT:1 - 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chr2L 18461738 3' - HeT-A 6001 1 69.31 TTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTTGACCAACGGCAACAGTTTTCCACTCTCATATTTTGCTTTTG:1 - chr3R 20868720 3' + Transpac 279 2 60.40 TAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTAGAATAAGGAGGTACTCTTGGGAATGCTCAAGTTTCTGCGGATGATGCTTCGGCTGCTGATGGAGATGTTCGGAATG:1 + chrX 23087233 3' - Cr1a 3982 1 69.31 CAAAAAAAGATAAAAAAAAACATTAAGGAAGGGGTTGGTGGGGGCGATGGGCGTGGCAACAGGCAACGTTGACAGCAAAAAATGAAAACAAGTGCATGCCG:1 - chrX 2865981 3' + gypsy7 5008 1 62.38 CATTTTTGATTTCACTTTTTGTTTGACCGCGTGTAATTGTACTCATTCCTGAGCTCAGTTTAAGCAGGATATTCAGTATCCATTGCCACCCGAGAGCCACC:1 + chr2L 7247705 3' + Tc3 338 1 69.31 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATAAATATGTAATTAATAATTTAAAGAATAAATTACCATGTAGTTCGGTGCATATGCA:1 + chr3L 17786373 3' - roo 19 2 60.40 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTTATATGAACTGGGTGCACTAATCACCTCAATCCATTAG:2 - chrX 4056234 3' - roo 8665 2 78.22 CCCCAAAGATCATCGTTATTATTGGGTTTGGCTTCAGAGACCTTTTTTTCACGTCCGCCCAAAGGTTTTCGCTTTGGATACAGTTCGCTGGAGGTGGAACT:1 - 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Doc2-element 68 1 64.36 AACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGCCAAAACCGAGTGACACCAATAATCCGAAGCTGGGATCTGGGACGCCCAGAAAGATATTCAAAT:1 + chr2L 6820468 3' + Quasimodo 187 2 62.38 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAAACAAACATTTTGTTACCAAACAATATAATATTCATATGTTTTTTG:1 - chr2L 16968412 3' - 1360 30 1 57.43 ATTATTATTATTATTATTATTATTGACCAGCATATCTCGGACATGTGTTCTATGCCAGTCGATTGGATCTCGAAAATCAAATCAAAACTCGTCGTCGTTTT:1 - chr3L 10772299 3' - mdg1 30 8 60.40 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGGCAAAAAACCCGTGGTCATCCAACACCGATCACAGGA:1 + chr3L 11199879 3' + roo 9033 1 62.38 AAATAATAAAAACATCATAGCATTTCTTGTAATCAATGCTGTAAACACTTATTTTTGTGGTTGTCACCGAGCTCCAACTGCAATTTGCGACCGAAAACAGA:1 - chr3R 15714101 3' + jockey 4990 1 80.20 ATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATTGTATCTAATACAAAGCGATCTAACTTATTTTTAAATTTCAGC:1 + chr3L 7412487 3' + invader3 5431 2 55.00 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATGACTTTTTATATACGATTAATTCTAAAAAAATAATTAAAAAATGGTTGATAACTTGTTGGAAAAATCTCCTA:1 - chr3R 21998361 3' + 412 490 2 75.25 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTACATTGAAAATAATTATATGCCAGCTTTGAAGC:1 - 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F-element 4493 1 72.28 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGGCGGGGGTC:1 - chrX 11025501 3' - hopper 30 1 50.50 GATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAATAGTGACGTATTTGGGTG:1 + chr2R 1355076 3' - rover 111 2 80.20 CACTTGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGAATGTTCGATTGTGGCTGTAGTTACGGAGTTGCCGTTGGAGGAGGCCGCCGCTGCTGGAGCGGCAG:1 + chr2L 5670608 3' - Doc 489 1 54.64 TTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGCTGACACACATAATTTTTGCTCTTTTTCGCCTCAGCCCG:1 - chr3R 9940123 3' - I-element 5054 1 61.39 TTTTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTGTGAGTGTGTACTTGTGCGTATCGATTATCCTGGCAGA:1 - chrX 12372813 3' - I-element 4948 1 64.00 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCAACAATACAGAAGAAAATAAATAAACAATGTAGGAATTTACGGCT:1 - chr3R 20396510 3' - I-element 9 1 70.30 CCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATAAGTGTACATAAATACCTGTTGTGAGGTACATCGCTGACTGTAAGATTAGCTAA:1 + chr3R 25214120 3' + diver 6089 2 55.45 TCATAATAATAATAATAATAATTAATCGCTCTTTTTAAGGGTTTAAGCACTGATTGTTCGGGTAAATAAGCTAACAATCCATTCTAGAATGATTTTAACGG:1 - 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INE-1 575 1 64.36 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTCCTCGGACATGGCCAGCAATTTTCACTCGATGC:1 - chr3L 14284983 3' + roo 9053 2 56.44 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTAAATTAAGAGTGTCCAAAAAAGCTATTTTTAT:1 - chr3L 10792175 3' + pogo 2064 1 64.36 ATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTGATTAAAACTAGTCTACTGGAATAAGTTGAAAAGTTACCTCCGAAAATAGTTGCCCCTCTTGCGATTGA:1 + chr2L 15981717 3' - Cr1a 4008 1 60.40 TTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTATCGATTTGCAAAAACATCTTGCATCTATCCCGCCCACACATTAGAGCAATAAAA:1 - chr2R 2119455 3' + FB 943 3 61.39 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACAGACACAAACGCGCACATATACACACGGCACAGTTGCGGATTAGGGCAGCAAGGTGC:1 + chr2R 16406520 3' - hobo 19 1 61.39 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAAATGGGTGGG:1 + chrX 12818901 3' + roo 9047 1 54.46 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGCAGAAAGGAGTG:1 - chr3R 25514110 3' + hopper 1385 1 56.44 AAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGTTGTATCGTTGTCTTGTTTGTGC:1 - chr2L 4234318 3' + hopper 1364 1 73.27 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCACACATCCTGTCTTTTCCAAAGAACTTTTACCG:1 - chrX 10436534 3' - hobo 41 1 68.32 GAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGAAATGCATCTAACCAAAATGTCTGTGGGCGAA:1 + chr2R 9517842 3' + G6 1806 1 68.32 AATTTCAATATTTACTATAAAAACTTTTCAAACTTTATTTCCAATAAATTGAGAGATTAAACAGATTTCTTCTTTTTCCTAAGTTTGGGAACGTCCTGCTC:1 + chr2R 20622116 3' + TAHRE 10159 1 75.25 GGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGATCCGGACAGTTTACTCTTAATTACAGCAAGCCATTGGAATTGGCACACAAAAATAC:1 + chrX 12294988 3' + X-element 4382 1 71.76 ATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGACTGCCAGCAACTTGCTCTAATGCATGCAGGCAGACTTCCCCAGCTCACCGACATCCCCGCCCCACTTC:1 + chr3R 21711047 3' - hopper 442 1 73.27 CATCGTGTAGAATCGTTCCCTTCTTTCGACCACCATGCGGAGTGTTGTGTGGATGGGTATGTGGGTGTTGTTGCGTTCGTATGATGGTGAAGTGATTGATG:1 - chr3R 20297521 3' + 3S18 463 1 64.36 TAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAATTCGTGTCAAATTAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - 17.6 425 2 46.53 CGAATTGAACTCATTAAATGTACGCACAAGTTTATAGTGTGAACAATTGTTCTATGTATAAAGCAAAACTGCATACCCTATTTCGTTTAAAAATTATTAAT:1 + chr2R 5329414 3' + rooA 7577 2 56.44 TTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTAACTCTCTCTATCTCTCTCTCCGCCGTTCTATATATCCGCTAGAAAAACAGATTGAA:1 + chrX 1642540 3' + Cr1a 252 1 58.42 GACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATTTACTCAAAGCCCACATTTTTGGCACGCATATTTG:1 - chr2L 20521385 3' - flea 50 2 68.32 AAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCTAACTGATTAATGCCTGTCCGTGCTGCGCAGTGCAATTTTTTATGGGGTGCAACAATCATTTTCC:1 - chr3R 19810359 3' + Juan 76 1 67.33 CCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCTGCCGAATCCAGAGAGAGTTCGGGGAAATGAACTTCCCGAGAGAGAGGATGAACTCATTCGGGCTCGTTCTAAT:1 - chr3R 15666013 3' + P-element 2885 2 78.22 AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAAT:1 - chr3R 14049374 3' + transib2 2765 1 82.18 GACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATCTATATAATTTACACATACGTAAACTGTAGATGTGTCTGTGTACGTGTAGCGCTAAAAGGTA:1 - chr2R 16160210 3' + gypsy 434 2 54.46 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGGGTGGAGTACGTAAAAATAATGAGAAGCACATTTTGTGCGTATAGACAAGAAACGTAGCATACTTTTTT:1 + chrX 6146747 3' + hobo 2932 1 69.39 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTCCTTGATGTTTGCTGAATTATTTG:1 - chr2L 11804996 3' + P-element 2874 1 62.38 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTT:1 + chr3R 8914522 3' + roo 9016 2 74.26 CCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGACCTTCTTGATGGCGGGTGGGTCTGTACG:1 + chr3R 3706379 3' - G4 57 1 73.00 ACGCAAATCTGCAGCGTCTGCAGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGTAGTATGTCGATGTTGTTATCTTATAGATCTTATCTTCCCGGT:1 + chrX 21667902 3' - gypsy2 6586 2 88.12 TAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTCGGCTTGGTATTTATTTTTTCTTTTCTTGTGCTGTTCTTTGCTTCCGTCGTTGTCTAAGCTTGGGA:1 - chr2L 7932046 3' + hopper 48 1 68.32 ATAGTCGAGTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCAGCTAATGTAAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGATATTGGGGT:1 - chrX 23078695 3' - INE-1 564 1 82.00 ACGACGGTTAAGTATGCATTGTTCCGGTGCGAAGGGAGTCGGCGCTCGTCTTGGCACTTTAACGTACTAAAAACAATGGAAATAACATAAAATTAATGCTG:1 - chr2L 19441563 3' - Doc3-element 291 1 53.47 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAAGATCTTTAGGAGCTTCAAGAAAGTAATTGCTCTCAGATAAGATGAATTGAAAAATACAAGT:1 - chr3L 17902223 3' - pogo 11 1 69.31 CGACTCACACTCAACAATTTTGAGTGCGGGTGGCACTCACCATTCACATTGCGCATACTTACAAACAGCTCAGACGCTGCAGGCATTCGCATGAGATCACT:1 + chrX 22834013 3' + hobo 35 1 64.36 GCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAATGTTCCGTAACTTGGTGCTATTC:3 - chr3L 17215695 3' - Ivk 7 1 72.28 AGCCCACTCTAACGCCCACAAACCGCACAAAACTGACACGCCCACACATTTGGAAAATGTGTGGAAATTTTTTCTCATTTTTTTTTTTGGTCTT:1 - chrX 12518024 3' + INE-1 217 1 72.34 GTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCTTATCGATTTTTGTACTCCTCAAGTAGAGCCAGCGGTTCGGTCTTCCCTCTC:1 + chr3R 18358771 3' - 412 188 2 51.16 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTGTTATTGGATTTGAGCAGCTG:1 - chr2R 15436713 3' + pogo 2048 1 80.20 TTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATTTCCCTTAATAGTTACTTAATCAACACTAACTGCTAACATTTATGTTTACTTTGCCAT:1 + chrX 5010280 3' - Bica 473 1 57.43 GAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCGAACCACTGAAACCTCCGGTAACCATAAAGATTAATACCGTAGA:1 - chrX 10654589 3' + Ivk 263 1 56.18 CTCTCTCTCTCGCTCTTTCCCTTTTGGCGGCTTCGGCTTTTCCCCTCCTTTTGGGGAGCTGTCAGTTTTGACCACGTGGCCAAGGATGCAGTTGGGTGTAT:1 - chr3R 10624161 3' + Cr1a 294 1 51.49 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTTGGTAAATTAATTTTTGGCTTCCGCACAAAAGTATGCTACACAAATATAAA:1 - chrX 18155833 3' + hobo 2927 1 54.22 AGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAAATGATTTCTTTGCCATGGTTTATAATTAATTCCAAAACGTTCGATTTGCAA:1 - chr2L 4136529 3' - copia 5072 2 58.42 ACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTAGCCGTCAGAATTCGCTTACTCCGGCTGGTCCTGCGAAATATTTAAATAACCCT:2 + chrX 18119578 3' + hopper 1395 1 59.41 AGATATGAACGGAGCCCAAAACTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCGTGTAATTGCGACGCTCCGTCTTTCCCGCAGTGCTTCC:1 - chr3L 11199824 3' - roo 39 2 62.38 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGAGAATTAATTTGAAATTGGCAAATGGGGATTTAAGGAAGCAGATTT:1 - chr2R 9866835 3' - roo 8692 2 59.00 TGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTTTATGTGTGCGTGTTCTTCCAGAAGACGATTTTCGTTGGCCTTTTTGTCTTTGTGTGTGCGCCTTTGGGGG:1 - chr3R 9647689 3' - 1360 3241 1 64.36 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAACGACCCTCTTCCACACGCCATTGCCTGGT:1 + chr3L 153633 3' + 1360 3341 1 73.27 ATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTATACGAAAGGGTTGAACTTTGTAGTAGGAG:1 - chr2R 18454920 3' - jockey 4631 1 70.30 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGCACCTCAAAAAGAAAATATAAATATGAAAGAAAAATGCGTTCAAATATTTGTGGGGGG:1 - chr3L 10565261 3' - pogo 16 1 63.37 GCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGAC:1 - chr2R 6438362 3' + Stalker4 363 4 72.28 AATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATATATAATAGTGTGAGGTTTTTCGAAATAGAAGGTGGGGGCGGGGGGCGGGGTTTACTAGCACAGCTTGAACAAATTG:1 + chrX 8769029 3' - blood 169 2 76.24 ATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGTCAACTTGTGAAATGACTCGTGATCTGCATACAAAGGTTTCTTAGCCCAAG:1 + chr2R 4937681 3' - Tabor 409 2 56.44 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGTGTTTATAATTTGGAGTCTTGGCAGGTGCTTTAGTGGTTCGATTTTCTTTTC:1 + chrX 6739678 3' + roo 386 2 56.00 ACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATTAGACAACTTTGTTGTTGCTGTC:1 + chr3L 18757395 3' - blood 216 2 77.23 TTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGAACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTCCCATATGCCTCTGAATCCTTCAAATATCT:1 + chr3L 22803218 3' - X-element 4351 1 70.30 AGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTAGTCAATAAAATAAAATAAACAACAAGGAATAAAAACAAAAAATATTTTTTTCGGCGGTATCGAGAGGGAAAG:1 + chr3L 15397514 3' + jockey2 3350 1 66.34 AAAACTTTCGCTTTGTTCAAATCGTTTTTATATATACTTCAATTATATTTTAGAGTCTCCATTAATTGGAATCGTTTTTGAGAAGTTGACCACAATTTACA:1 + chr3R 19489615 3' + FB 163 1 74.26 ACAAAGTTTCGAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGCCAGTGAAGGGTTAAAGATGCCGACA:1 - chr2R 17269732 3' + transib2 2776 1 69.31 AAAATTAAAAAAAAAATCAAAAGCACAATCTAAAGCGACACGTGCGACAAAAACAGGGCGAGCCCTGGGTGGTGCTAATGGAGCCGGTGGCTTTAATGCTG:1 + chr2R 20605494 3' + Doc 4698 1 60.40 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATATCTTATTGAATGATATGAAAAGCATTTCTATGTT:1 + chr2L 18188454 3' - Doc 47 1 66.34 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCCTATTCAAATTGATCACTTAACGAATC:1 + chr2R 9001689 3' + mdg1 371 2 74.26 TTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATGTGTACTATAATATTATGGCCAAGTGAGTGGAGTGGAGTGGCTTTTTGACCAACCGTCGGCCT:1 + chr2R 10778428 3' + pogo 1913 1 69.31 GTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACCTTACACCTAGGCGGCATGGAGTAAACCAAGTCCTGGCCTTCTCTGCCACCCAAATCCC:1 - chr3R 16537684 3' + 1731 296 1 79.21 GCAGTGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAAGTATTGTAAATTTTGCTAAGTGCCTGAGCAGGCTAATTATAGTTAAATAGTTAACTATGGGTAG:1 - chr2R 6194039 3' + R1A1-element 398 1 67.33 ATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATCGTTTTTTGAAGAGGGGAGGGCGCGGGAACAGCT:1 - chr2L 11228009 3' - F-element 4290 1 66.34 AGAGAAAAAAAAAACAAATAAATTAAAGCTTGTACTCTTTAAAGTATCTAAACATGTCATATATCCTCTTAAAACATATATGTATCTGCATTTCTAGCGC:1 - chr3R 14037977 3' - Circe 426 1 57.00 TTTCCGACTTGTTCTCTCAATATGTCATCCATTGCTTGTTCCAGTAGCGTCGCTGTTTGGTACAGGTTCCCACATCCCACCTTTATTTATGAGACGGAGCT:1 + chr3L 25725389 3' - TLD2_LTR 6 1 68.32 CGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCCGTTGTCCAAGTCAGATCCATATATTTTTATTACAAAGCTTTCCTTATACCCTTG:1 - chr3R 9858118 3' - Doc 304 1 60.40 GAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGTATGGATTATCGGTCTCTTAGTCATAGCAAATTAAATTGCTTTATGTTTTGGCATTCATTAGTTAAACATATC:1 - chr3R 25516666 3' + hopper 938 1 73.27 CGAGCAAATTCTATTTTTAGATTTGTTACGCTCAATTCTACACGAGCGCACGAGAGCAACAGTCCAATAACAACAAAAAAAGGCATAAAAAATATAACTTG:1 - chr3L 5187464 3' + 1360 3267 1 53.47 CCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACTTTAAATTAATACCCAAATATATTATATATTT:1 + chr2R 12370623 3' + roo 366 1 73.27 AAAAAAAAAAACTGCAGCTCATCCAAATAAATCACATTCATATGTTTGTTAGCTCCCAACAATCATAATACATTGAGGGGACATTGAACTTGAAAAA:1 + chr3L 16152499 3' + TART-B 10519 1 52.58 CTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGTCGAGTGTCAGGATTGTTTTGGTTACGCGACTGCCCCGCTAG:1 - chr2L 9566648 3' + F-element 377 1 58.42 CAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCCTTATTTCGGTTAATTACTTTAAATGGCAAACAATATAAGTTTACT:1 - chr2R 17292465 3' - Tabor 28 2 52.58 CACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATA:2 + chr2R 5531203 3' - 1360 58 1 69.31 ACCGTTATTGAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTACTAAAAGAGTTGGCTAGCTCTTTGACCTAACGTACCGTCTCTTTCCTTTGCTTTCCACCCATCTCTT:1 + chr3L 14321105 3' - Tc1 1256 1 74.26 AATCATCTATTGTATTCTTAGGGAAGATTAGTCCAATATGCTACAATAGTAATCCATTCCATCATATCACCGTACCGGCCGCACCGCACCTCTGCACC:1 - chr3R 5773151 3' - Stalker 6873 4 55.10 GGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGCTACTTTTCTATGGTTTTGCCCTTTCATGCT:1 + chr2R 5884489 3' + roo 8760 2 69.31 GTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGGACACTAAATGGTAAACAAATGATTTCGTCTTTTTTTCATATGTAATACGTTCAAGTTATCACACTGGCACCTCCG:1 - chr3L 13359393 3' - gypsy7 5009 2 71.29 CACACACACACACACATACGTACACACGAAGAAGAACCCCACACAAAAATTAATAATAAAAATGAACAGAACGCTTATTACTTTCGCAAATGTAATACGAC:1 - chr2L 19596414 3' + Quasimodo 38 2 78.22 GTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGCGTCACACAAGCGTCAGTTCCGCATGAAATGTGTACTATGTGCAAATATGTGAGCGGGAAAAGGGA:1 - chr3R 27435012 3' - jockey 4652 1 67.33 TACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTAGCCGTCAGAATTCGCTTACTCCGGCTGGTCCTGCGAAATAT:1 + chrX 18119566 3' + hopper 1383 1 57.43 CAAGCGATGTTCGGGCTGCCAGGCCAAATACACCAGCAAACGCACCACCCACCAGTCTCGATAGCTCATTAAAACCCTGCACATAATTCAAGGCGAGGGG:1 + chr3L 22611236 3' + Stalker 496 1 69.00 TCACACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGCCGAAGTAGAAGCGTTGCTGTTCATCAATTTGAAAGGTAAGGTAAGCCGGCAGTTCTTCCAGTTCCACA:1 - chr3R 5027901 3' + Chouto 5932 1 55.45 CATGAAACCAGTTTACATTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGGTCATCAATATGCTATCAATGTTTACGCATACATTTAAACTACATATCAAGT:1 + chr3R 15652670 3' + rover 7029 2 53.47 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAAATTTATACAACTTTTTCCCCATTCC:1 + chrX 7698648 3' + pogo 2055 1 75.25 TAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATAGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAATGCCAAATGAGTCGAGTCGACGAGGATGACGA:1 + chr3R 11657754 3' - Idefix 303 2 68.32 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCACCCTGCGTATCCATAATCTGTATGTATCTGTGTAGCTTCGCTGAGTAAAA:1 - chr3L 153677 3' - 1360 52 1 58.42 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTGAGACCTCCCACAGAAAGGCGAGATTCCGAGAAACGAGTGACCCGGACTATTCAGAATACGTTTCCGTAAACAG:1 + chr2L 7767218 3' + hobo 2937 1 77.23 ACAACCAGAGTTCCCAGTGCTTGGTGAAAAATGAAACTTTCCATGCACGAAATTTATTGTTATTATTAGGAGAGCAATCGCCCCGATTGATAGGGGAATTT:1 + chrX 2980667 3' + Dm88 4071 1 59.41 GCGATGAAAGATATTATTAGAGTGAGTTTTCCTCGTCACAAAACGGCTAAATAAAATTCTATTCGAAAATGGGGTTTCAAAGTTTAACTCGTTTCGCAAAT:1 - chr2R 11505500 3' + Gypsy12A_LTR 350 1 59.41 CGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTTGAAAGAGATGATAACAACCAAATGAGAGAAGCTAGCCCTTGCAGGACTTAGTTTGAAGTCCGTGT:1 - chr2L 20067305 3' - F-element 4467 1 65.35 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATACATGTTTAGACAACCGCTTATTGTTGTCTCCGCTTGTTTCACACTCGCAATAATCATAC:1 + chr2R 20396344 3' - blood 7023 2 70.30 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGCTGTCTATAAATCGGGAACGCGCATATTCAGAGCAGAAATTGCGACTATTT:1 - chr2R 18355515 3' + P-element 2819 1 56.44 TTATTATTATTATTGTTATTACTCTCGTTGATGTTGCTCTTGTCGTTGCCTTTTACTTTTCGGACACTAATTGTAATTGGAAAATGTATTTTAAGCGCCTG:1 - chrX 15256822 3' - mdg1 29 2 61.39 AGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTGGAAAGCTTAACTTTTTAAAAGTCTCATAGTAAAGGCACA:1 - chr3L 24196321 3' + 17.6 7277 2 66.34 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTACACGATAAGAGCGAATTGGAAATGAAAAGCTTTCTAATCATTAAAAGCACTTTATGGTTTATAGAGAAGCA:1 - chr2R 16289186 3' - P-element 4 2 75.25 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAAACATATTATTTAACTGAGTTGCTACAAAGT:1 + chr2L 18513517 3' + 297 354 2 79.21 GTGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGCATGCTCGATGGTGGGCATGGTGCGGCATCCACTGCTGGTCGTCTAAAAAAAGCCCA:1 - chr2L 19456395 3' - Circe 7412 2 54.46 ATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACACTTTGTGCGTTGAAAAGTTCCGGGGCTGTTCGCTGGTGTTCGTTGGACTTCCGCAC:1 - chrX 15383869 3' - 1360 182 1 70.30 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAACGACCCTCTTCCACACGCCATTGCCTGGTTCGACGCGAGTGCAAAAACGAATTTTACTCAGC:1 + chr3L 153666 3' + 1360 3374 1 64.36 GAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATGCCAACGAACCGCATCGGTGGGTGGATCGGCGAAAAGCGGCTGCCTGAGTTTGCTTTATG:1 + chr2R 9904188 3' + G2 71 1 63.37 AAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTTAACGCTTTCTACATTAAGCAATCCA:1 - chrX 18680628 3' - diver2 107 2 74.26 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGTGTTTCGCATATCTCCCCGTAATCACTTTCATT:1 - chr3R 12058629 3' - roo 42 2 67.33 AAATACATTCTAGCTCTTTTAACTTCTCTTGAAATTTTTCGGACGGCTTAATAAGCGTTGGAAACGCTGAGAGCGTCGGTAGCGAGCATTGCTAAAATGGG:1 - chr3L 26822191 3' - P-element 2467 1 53.47 CGTGTTTCGTTCTTTTCGACAAACAGCAGTGTTATTAACCCAAATTTTTCTTTAGGTGCAAACTTCACCATTAGAGTCAGCGGATGATGAGTGGTGGTAAT:1 + chr2R 5080082 3' - Tc1 492 1 81.19 GTGCAAGATCGTATGTACAATGCTTATGTAAGCGTAATATGTGAAGCATCTCATTCATTTTACGATGTCGTTATAGGGGTGAGAGCAATAGCCACTCCTCC:1 + chrX 22260223 3' - rover 45 2 51.49 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATGAAAAGAAGGCATGCGTGCGTTTAATTATACGCAATGTTGTTGCATACTTTCGAGGGCCGCCTTCAACAATTCCG:3 - chr3L 10035686 3' - jockey 32 1 73.27 TACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGATACTCGAAATATAGATTAGTGTAATTACTATACCATGGAAAATGACGTCGACATGAACATG:1 + chr2L 9023121 3' + hobo 68 1 69.31 AGACTGGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTATGACTCCACTTAGGCCTTAACTCGGGTCTTAAGCTGCCAGCATGTAATTGCATTAATTTATTTTACC:1 + chr3R 28351581 3' - opus 7309 2 73.27 TCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACTCCCGATTTGCCCGACTCTCGACGATCCTTGATGGCACTCCGCTTTTGCGTGCGACTCGG:1 - chr3R 27805372 3' + Quasimodo 7075 2 68.32 GAATTGTTTTAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGTTGACTTATCTAGAATTTGGGTTTTTTTTTAGAATATACAAAAGTTTCCCAAATCAGGA:1 + chr3L 7982654 3' - Idefix 198 1 72.28 ATGATTTATTTATTTGTGCTTTTTTTAAGCTTAAAAGAGGTTCTCTTCTCTTTAGTTCTTCATAAGTAATGTTTTAAGATTTGAAATCGTGCTCGCTAAAT:1 + chr3L 2462391 3' - Juan 4210 1 45.54 TTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATGGATAGTATTTGACACTCATACATTTGACAGACATACACTG:1 - chr3L 21912240 3' + Bari1 1684 1 50.50 TTTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATCCACCACAGCGCAGCAGAAAATCCCCCAACGTGCCCGCGAAAATGTTTGCATTTTGTATTT:1 - chr3L 10572626 3' + F-element 283 1 62.38 ATCCAGATGCGTTCAGTGTTGGTGCACTATTTCGGGATAATGCTATACAATTTTGCTGAAAGATTGCGTCATTTTTTTTTTCGCCTTTTGATTGTGCGG:1 + chr3L 16699214 3' + 1731 488 1 78.79 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTTCAACCAAGAATGACAACAACA:2 - chrX 10210936 3' - I-element 23 1 58.42 TTATGCGTTGTGTGGGTGACCGATTTTAAGGCATTTGGTTGTAAAATATGCCAAAGTGAGCATTGCTCCTGTAGCTTCAACTTCCGTTGCCTGCGCCTTCG:1 - chrX 5204311 3' + S2 311 1 58.42 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCACACATCCTGTCTTTTCCAAAGAAC:1 - chrX 10436542 3' - hobo 49 1 76.24 TGATAACTTACATAGGGATTTATTCATACTTCCGGTCAGCATATGCAATGCCAAACGGGTCGCTTCATTATGGTACACTCCCATGAATAGTTGAATCTATA:1 - chr3R 27480407 3' + Fw2 3664 1 65.35 GGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGCGTCACACAAGCGTCAGTTCCGCATGAAATGTGTACTATGTGCAAATATGTGAGCGGTAAAA:1 - chr3R 27435016 3' - jockey 4656 1 58.42 AGTCACGACATACGCCAGAAATCGTTTTACGCAATGTATGGAGAATGGGAGACGTCACCTATCAGATTTCATCTCAAGAAAATACCGCATGCCAGAAAACC:1 + chr2R 3031970 3' + mariner2 715 1 73.27 GTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCTGTGTGTCCTGACAGCCTGGTTGTCTCTAAAAAG:1 + chr3L 12684063 3' - I-element 400 1 66.34 ATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAACGGAACTGAAGTCTCGGGTCTCCTCCGATGAGCTCAGATGAGAGACCCGGCCGAA:1 - chr3R 22183989 3' + Porto1 4236 1 52.48 AACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCAGTATACAGATTGTAGAGACAAATGTGGGAGAAAAAAGGAGGGCAAAACATCGTTG:1 - chrX 22862278 3' + INE-1 142 1 67.33 TTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGTCATGAGATCGGGATCCTGCCAGACAGTATGTCGCC:1 - chr3L 14152091 3' + blood 7360 2 51.49 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGCGGCAACCGATGTCGATGTTGCTGTCGTGTTGTTGCCGCTGCAGATGTTGCAGATGTAGCTGCC:1 + chr3R 15666132 3' + P-element 2876 1 66.34 ATTTTAAATAAAAAATAAAAGGATATTTTAAAGGCCACAAGAGCCCTGTAATAATAATAATAATATATCTTATGTGTGTACTAACCATCATGATAGTACAA:1 - chr2R 13283143 3' + G2 3052 1 74.26 CTTTTATACTTCCTGAGATCTCGACGCTCATACGGACAGACAGACATGGCTATTGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAA:1 - chr2L 21274689 3' - INE-1 148 1 46.53 TGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACCAGAAATCAGGGCGTTGAGGTGG:1 + chr3R 7832915 3' - 3S18 53 2 75.76 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGCGAACTGGGATTCTATTATCATTTTGCGGTAGCCAGTCCCCCTTTCACGTGGTCCGTGGGAAA:1 - chr2R 6890632 3' + hopper 1406 2 68.32 AGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGTCATGAGATCGGGATCCTGCCAGACAGTATGTCGCCA:2 - chr3L 14152090 3' + blood 349 2 50.50 GCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTTTTATATAAGCAAATGTAACGAACCAAAAACTACTACTAACACTATTTCTTCT:1 + chr3L 23002017 3' - micropia 5414 2 55.45 AAAAGTTTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTTACAACTTTTACCGATTGAAGAATGGATATTCCCACCATCACACCTCAGGATTTCGATTTAATAGCCGATGG:1 - chr2L 14285749 3' - HMS-Beagle2 492 1 58.00 GTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTTGACATCCCCTTTACCAACGCAACTCAAAGGCAATCGAG:1 - chrX 8613908 3' + Chouto 477 1 73.27 CTCTTAGTTAGTTGCTGCCCGGGCTGATGTGATGGGAGAGTTATAAGTTCTTACTTTGAATGACTTACAATTTCAAAAATTTGTAATCAATCAAAGGTTTT:1 + chr3L 3873278 3' - accord 7340 2 56.44 GTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCA:1 - chr3L 17215738 3' - Ivk 11 1 54.84 TATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGTCGATCTGGCCATGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAG:1 - chr3R 16611516 3' + INE-1 83 1 78.22 GGTTCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCATTACTCCCTCTCTCTGTATGACAGAGAGAATTGAGGGAGAATTTGTTTTAAAACATAA:1 + chrX 16332695 3' - baggins 5311 1 65.35 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTATATTGCTACTAACCGTCATTTCGAAATAGAATTCCACAGGCGAATCGTCGCTGCCATAGCCGA:1 - chr2R 12370543 3' - roo 8674 2 65.35 TCCAAAAATTTTCAAATAAAACAGTCATGGGGAGTGGTGCAGGTGTAGCGGCCCCATGACTGTTTTATTTGAAAATTTTTGGAGAAAGGCCACATGG:1 - chr3L 16872391 3' + transib3 251 1 71.13 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGCATTGAACACCTGTAGCTTAGTTGACATTGA:1 + chr3R 10078373 3' - roo 44 2 70.30 AACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCGTGATTTACGAGCTGTCTCATATAG:1 - chr2L 4133043 3' - copia 4812 1 75.25 TTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATACTCGACTCGATAAAAGGAGAACAACAAAAGGGCAGGGAAAAAGGCTCAG:1 + chr3R 21824628 3' + I-element 4889 1 59.41 CATTCCCACTAGCTGAGTAAAGATCTGGGATTTAGTAGCCTAGTGTGAAACCAAGAAATCTACAACCACAATAGCCGACAGCCAAGGGAAATTGAAATCGA:1 - chr3L 17147830 3' + INE-1 535 1 65.35 GTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCCTAAAAAAGGTTCGCTGCGAATTGGTAATGGCCAACGGCACACA:1 - chr3R 28941861 3' + hobo 141 1 63.37 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGAATGCAAAAACTGCAGGGGCCATTGAAACAGAATTTTTATATACCCTGGAGGA:1 + chr2L 12908435 3' - hobo 21 1 59.41 ATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGCATATATTTTCTGTTTATTTTTGA:2 + chrX 12151658 3' - diver 51 2 77.23 CCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCTCGTTTGCGCAACTAAACTGAAATTAGTTGAAAGGGCAAATAATTATAAAAAAATATGGGTTCTATTTTAGGTTG:1 - chr2L 12638978 3' + P-element 46 1 46.53 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACAGTGTAGCACAGACAGTCAAAAACGCAGCATTGGGTTGTCTGTTTCAACAGCAGCAGAAAGGCAGAAAAAA:1 + chr3L 10554863 3' - roo 8668 2 64.36 AATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTAGCCGTCAGAATTCGCTTACTCCGG:1 + chrX 18119549 3' + hopper2 1559 1 74.26 TGTAACATTGACATTATTCAGCGAGGACAGTCAACAATATTTTGGCTCGTCGACTGGAGCATGTGGCAATTGTCCCCCAATTGATAAACAAAGGGTAGCCA:1 - chr3R 13399960 3' + Doc 4328 1 68.32 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCAAGAACATTGTTGGAAAAACAATAAATGGCAAATGTGTGGCAGCATTTTAGGCGCATAGCGCT:1 + chr3L 22340046 3' - hobo 15 1 65.35 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTTATTTTAATAAAGACTTTTAATTG:1 - chr3R 6135239 3' - I-element 49 1 73.27 CTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTAAATTATGCCACAAAAGGAAACGAACGCCACTGACATACGCAAACTGATTCGCACCA:1 - chr2R 23334370 3' + I-element 5115 1 59.41 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGCCTGTACTACGCCTCCGTGGACAACCGACGCCAAGTAAGTAGAGATCCGCCTTGAAAG:1 - chr2R 23811771 3' - F-element 48 1 66.34 GCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGCCACTCGAAATGAGCACACGGCGCCATTTGCTGC:1 - chr3R 27378232 3' + BS 4784 1 66.34 CAAAGTCCTCTTATATAACTCCGTTTTGAAACCCACATGGCTTTCGAAAAGCAAAAAACGTCCTACTATGAAAAACTTTCTTTCCACGATTTGTTTGTGGC:1 - chr3R 844459 3' + Doc3-element 4284 1 70.30 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGGCAAATCCTTGCTGGCAAAAAAAGAACTGGGTTTTGGCAGACGGAGGACACCGTTTAGATGCTGTTCCT:1 + chr3R 25509348 3' - Doc 22 1 66.34 AGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCGAATAAATTCAAAACGCTTATGCTAGAGTTTATTTTTTATACTGTTTCAATCATTTCTGCATAAATTC:1 - chr3R 8886541 3' + 1360 3213 1 67.33 GAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGACCACAACCACAACCCTTTGGCGACGCAATGCCAGCGGTGAACCCGTGTGCAACGCCTGCGGATT:1 - chr3R 8153277 3' + gypsy4 449 1 68.32 TTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGACTTTAGTTTTGATCGGAGCTTCCATGGGCATTGAGCGCTTCAAATTGCTTCTGACGATCAACGAGAGTAAG:1 + chr2L 2696337 3' + Transpac 30 2 69.31 CTTAATTTTTATTTACATTCTTTACATAAATCAAATAAAAATTAAAGTAAGTACTTATTAATACTTAGAGCTTAATTCGAAGTGGAATATCTATCAAACGT:1 + chr2L 20241287 3' + 3S18 5807 2 52.48 CTAATAAAAACCAAAAATGAATTACACTGAGAAAATTCCATATATTATATCAATAAGAAAGGATAAACGTGAACAAACAAACCCTAAATTTACTTCTGTCA:1 + chr2L 18145455 3' + I-element 385 1 78.22 TCCAAATATCTCCAATAGATTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCATTCGTGCTAACGTGACCAATATG:1 - 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chr3L 3635395 3' + roo 9060 1 67.33 TTTCGATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTA:2 + chr2R 2092791 3' - Doc3-element 84 1 57.43 CAAAAGTGTTGGCGTGACAGTTCTGTGCGGTTTGTGGACGATCTTGCTTGTGCGTCACCCACCCAAAACCACCTTGCCCAAGCATACAAGCAGGTTTTTGT:1 + chr2R 4550533 3' - INE-1 247 1 65.35 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGACAATTAATTTGCGAAACAAGAGTTTTTCAT:1 - chr2L 19698262 3' - hobo 44 1 69.31 TATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGCATTTTCTGTAAATCCATTTCACTTGAGCTGCGCTGCGTACAATTTCCTTTTCTC:1 - chr2R 19604828 3' - F-element 138 1 57.43 GAAGTAGAAGCGTTGCTGTCAGCCCATGGAATGGGGTACTATTAACCGTTTGCAGCTCTCCTCCTTTTTCTCTTTCATCGCCATCGCCACATCCTTCGTGC:1 - chr2R 12096463 3' + Chouto 5966 1 55.45 TGTTAGTAACGCCTTTTGCCTAAATTTGCCTATACTCTTAATATTTTGCCGTTTGTAATTTTAACTGCGTTGCAATTTGTTAAGTGCAATGGCCAGTGTGT:1 + chr3R 26821538 3' + transib3 487 1 57.43 GAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTCCAACTGGGCAATCCAGTCCAATATCTATGAT:1 + chr2R 2119198 3' + gypsy 7402 2 68.32 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCTGATTTTCGATTGACGTGCAGCTGGGGTAAATAATTTAATTTCATTTATTTACA:1 - chr3R 9606193 3' + roo 9050 2 59.41 CCCCCCGTTGGAGGCTTGGCTTCCAACAGAGTCCTCAAGGGGAAGCAGACACAGCTTGTTCACTGCCCGTCGCCAGCTGGATGCAATTCCCCAACTACACT:1 + chr2L 18982700 3' - diver2 4507 1 68.32 CCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAGGGCTTAAATATGAAATCTTTATGCATATGTTTCATCATGGAATACGTTTTTAATCACGTGGCCCCCTGA:1 + chr2L 14886466 3' - jockey 15 1 70.30 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATAGCATTTCTTGTAATCAATGCTGTAAACACTTATTTTTGTGGTTGTCACCGAGCTCCAAC:2 - chr3R 15714124 3' + jockey 4967 1 57.43 CTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTA:1 - chr3L 27356099 3' + Tc3 1663 1 74.26 TTGGAACAGTCTTTATTTGTCAGTATATTCGTGGCGATATTTTATTGAATCTTCTCTTGGTATATACAGACTAACATTAAGATCACAAAACCTAATCTCCT:1 + chr2R 5284534 3' + Cr1a 4032 1 68.32 GTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTGCCTGTACTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATA:4 - chr2L 15832987 3' + hobo 2841 1 67.33 TTGCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTATTAATTTAAGTCAAATGACTTAAAAAATATAATA:1 + chr2L 11362282 3' - 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chr2R 20196870 3' + pogo 2056 1 73.27 TTACTTATTACTTACTTACTTATTTTTCGTTGCGTTATTAATCTACAATATATTTATTTCAAATAAATTTCAGTTAAAAGTTAAAAGACCTAGAAAATTC:1 - chr3R 6786748 3' - Stalker3T 39 1 81.00 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATATATCTGCTAAACCATTTGAGTGAAT:1 - chr3L 19933662 3' - roo 8713 2 74.26 CTCGACTTTCATACAGACAGACGGACATGGCTAGATATGGATGCGCATGTGCATTTAAATAAATACATCTCGTATGTGGCGATTGAGCAACCTATTACGCC:1 + chrX 18801899 3' - INE-1 129 1 73.27 GCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCAATCTCCCAAGATTAAGCTAACATAACATGCTTTTATCAGTTGCTGATCTACCGTTTCAAGCT:2 + chr3L 24513040 3' + McClintock 6393 2 61.39 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGGCTTGTTAGCACACATTAAGGTTAATTCCCCGAGATGGGCATTCGACA:1 + chrX 11654697 3' - roo 28 2 57.43 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGAAATGCAAACAGCGAAGTTAGTTAGTCGGCCAGAAAAAGCGCTACAAATTATCCACACTT:1 + chr2L 2694674 3' - Transpac 4931 2 66.67 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTCCTTGATGTTTGCTGAAT:2 - chr2L 11805002 3' + P-element 2868 1 56.44 AAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTATTTTGTCTATAGAATATCTTGGTGCTATATCTTTAGGTAATG:1 - chr3R 19448225 3' + accord 7207 2 58.42 GTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTGATTCATTCAATCGGTTTTCCAACTGACAACAGCTGAAAGATTACGCCAATGATTTGCCAAAAAAAATCAAA:1 + chr2L 16458263 3' - roo 117 2 72.28 AGAGAATGCTATAGTCGAATGTGAACGCGAAATTTCATCATTTTTCTGGGGTATTTAGAAAATATCAGTAACAAATCACACATAATGGTTTATGGAACCTC:1 - chr3R 4128298 3' - INE-1 574 1 53.47 GGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATTCATAAAGCCGAAAGACAAAAGTTAGACAAAACACTTTGGCAAAGAGACGTGGTGGAAAAGCGTTTTATA:1 + chrX 20891509 3' + invader2 4851 1 74.26 CGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAAAATTGATTGCTGTTGTTCATAGCTGCGGGATATGGCCAAAGTTTTTAAGTTCCCAATGCCTGTCCCCCG:1 - chr3L 15489668 3' - 412 213 2 77.23 ATAATAATACATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTAGTATGATTTTGGGGTAATTTTGTAAACGTTTAGTTAGTTTCCATGATTCAAGAGTCGCTAGACGCG:1 - chr3L 28007211 3' - I-element 245 1 65.35 AATCCTTAATTTCAATTTTTTTTTTATGTGCTCACATTTTCAACATTTTACAATATTTCGTACCCCACCCAATCCTAATTGCCTGAACAGCATTGTTTTCG:1 - chr2L 11044778 3' + HeT-A 5787 1 73.27 AACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTCTTAAGAATTATTAAGCACTATATCTAGAAGTTATTTAGTTATTATTAAATGTTTAGTTTTTGCCTATGCAT:1 + chrX 6917179 3' + 3S18 336 2 58.42 TATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCATCCCCTTCGCAACTACCGATGATGCAGCTCGAAAATGCTGGCTGG:1 + chr3R 5773249 3' + Stalker4 401 1 71.29 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTCCT:1 - chr2L 11805017 3' + P-element 2853 1 43.56 TTCAACAAGACGGTGCAACAGCTTGTTTAAAATAATCAAGCTGTTGCCCCAAAACACACATAAGCTACTGAAGTCATACCTAACTATAATCTAATATTAAA:1 - chrX 8617206 3' + mariner2 459 1 63.37 GGGTGAGTGGACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGTGCGAATCAATAATTAAATGGTTAAGTGCAGCTCAAGCTTATT:1 + chr3R 14849262 3' - hobo 2757 1 57.00 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAAT:2 + chr3L 21912316 3' + Bari1 1657 1 75.25 GTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATTATGGAAAACGTGCGCCGAATTAAAAGTAGATTTAGCACAGTTACAACAAAGGACGAACTATGGCGAGTGCCACGG:1 - 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hobo 14 1 65.35 TTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTTAAGAGTATCTTTCCGTTTTCGCGGCATAGCTCCATTTTGCGTTGTGATTGTTGTTCCT:1 + chrX 560086 3' + F-element 40 1 69.31 AACGGGAATGTCTAGTTAGTATATGTGTACAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCAGACGCCAGGAGCTCGCAAAATATTTGAACTGAAATGGTTT:1 + chr2R 13676909 3' - rover 7119 2 60.40 AATGCATTTTTGTGTTCCTTCTCAGATCTAATTTATCTAATCTATCTTTAGAAAGTTAAAAAAGTTTCTAGGATTT:1 - chr3L 18862849 3' - Tabor 473 2 89.47 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCATTACATTAGCGTTAAATGGTGTTAACTTACACACACATACACACACTTCGGCCAGCT:1 + chrX 12276846 3' + hobo 2923 1 63.37 AGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGACCCCGCGAGCTCCGCCTTTTTATA:1 + chr2L 11561828 3' - transib2 50 1 73.27 TCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCAGTAATCAACCGTAAGAGGACAGGGTTGGGTG:1 + chr3R 26490623 3' + R1A1-element 349 1 68.32 CGACCTTATATAGTAACAAAGGTCCTCAACAACGATCGGTATATGGTGGAAGATCTGCCCCTCATCCTGTTTTCACTCTAGCGTCCGCCTGTCAACGTCAA:1 + chr3R 17984548 3' + Bica 4738 1 58.42 ACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATGCCTTCTTTATCGCTTGGCTTGTTT:1 + chr3R 21937384 3' - P-element 472 1 28.71 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAATAAATAAAAATTTGGATATATGTTCATTATACCTTTACTTTGCTAACGGGTATCTTTAGGAG:1 + chr3L 4267239 3' + Juan 4191 1 52.48 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAAATCGTCTTGCATTGTTATAAGCCGCAAAACAAGGCACAAAAACCGAAAATCCTT:1 + chrX 14381548 3' - pogo 54 1 59.41 TTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTTCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCAAACCCACCCACCCACATGACGAGCGGTTCGCCAAGTGGAA:1 + chr2L 3158114 3' - 1360 3324 1 58.42 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCAGACTTTTAACAGTGAAAGCAAAACGCTGTTAAAGATCGAAATCTATTCGCACACAGTGGGAAGTGCGCTA:1 - chr2R 12655851 3' + P-element 2882 2 73.27 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTTCAACCAAGAATGACAACAACAAA:1 - chrX 10210934 3' - I-element 21 1 60.40 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTC:1 - chr3R 10978705 3' + roo 9032 1 65.35 TAACATAGTAATATTATCGAGATTACCAACTAGTATACTGCAAACTATACACATATGATGCCAGGGGAGCTCATGACAATTTTGCTTTTCACTCGCTTA:1 + chr3L 9196013 3' + mdg3 106 2 66.67 AATAAAAATAATATTTTTAATAGTACATACTACATACTACATGTCTAAAATTGTTTTTAATTTTTAAAAAGAATTTTTGAATTAAATCATGGCATATGTAT:2 - chr2L 7547230 3' - Burdock 499 1 79.21 CGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGCCAAAAAAACATCAACGGTGGCGACAGCAATAT:1 - chr3L 19571941 3' + Quasimodo 237 2 72.28 AGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAATGTTCCGTA:1 - chr3L 17215709 3' - Ivk 21 1 58.42 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTCCTTGATGTTTGCTGAATTATTTGCTCGAGA:1 - chr2L 11804989 3' + P-element 2881 2 69.31 ATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTCGAAATTAATTTGACTTCTTCCCCGCCTAATATGTACATATCTGCAAGAAACTAAAATAATAATATAGACA:1 + chr3R 21891568 3' - 1360 392 1 73.27 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGCCCTTTAATACACATCAATAACTATCGACG:1 - chr3L 27262078 3' + P-element 2842 1 34.65 GCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGATTGTAGGTTATTTTTTAATTAATTATAATGCCTTTTTTACTTAAATTTCGATTGCGTTTGAAGACCTTCTTGT:1 + chr2L 12802284 3' - invader3 5191 2 72.28 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAAGCCAAGTCGGCTTGCTTGGGCTTGGGAAATATTCTGCCATATG:1 + chr3L 18142013 3' - blood 7022 2 58.23 AATCGATTGCTTCAAGAGCGGCAGAGGGGCAAGATTACAGCCGCACACAAAAGGACATCGATAGCTAACACAGCTGCAAATGTAATGGAAA:1 - chr3L 18342395 3' - Cr1a 4249 1 63.74 GGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACACGCACGCCCACAGCCATCCCCTGTTACTGCGCCCAGTTGCCATGAATTCGCGAAGGTCTAATCGGAAATCCAATT:1 + chr3L 22278001 3' + Doc 424 1 80.20 ACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTACGTCGCAAAGTTCTCGATTCTCGCTCGCTCTCTCTCTCTC:1 - chr2L 6079183 3' - Doc 4513 1 60.40 GGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTGGTTATCTGCTTTGGGGAAATTACATTTCCCAAAGATTTCGACATCTTGTATCCTTTC:1 - chr3L 16102427 3' - pogo 1710 1 63.37 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTATGTTCCAGTTTAACGAACTGATCCACTTGGAGTGCGTCATCAAGGAATC:1 + chr2L 5269874 3' - hobo 24 1 55.45 ATTCATTTTATTTTTATCTTTGTAGTTTTCTTTCCAATTCAATGGAAAGAATTAGTGGGCAAAGAAATTTACAAAAATGTACAGAAACCCCATTCGTTACA:1 - chr2R 12035252 3' - invader2 293 1 58.42 TGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACCCCGCATCGTTTAAACCCATA:1 - chrX 4783849 3' + hobo 379 1 79.21 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCATATACCAATATACGTAGAATTTACTGTGCAACG:1 + chr2L 16125084 3' - hobo 42 1 68.32 AAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATGTTATAAGCATTTAATACTTTTTATCTCAAGATTTATAT:1 + chr3R 28804462 3' + roo 9036 1 67.33 CGACAGAGCAGTATACGCAAACATTCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCTAAATCCATTTCAGCCTTCTTCTCTACTTTCGTTTTGCTAAAGTTGGTTG:1 + chrX 12152175 3' + diver 387 1 53.47 CGTGTACTTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGCCCTGAAACGCAAACCAACTACGCACTCGGACGAGTAACTCGCTGGCAGAAGTACTTGC:1 - chr3L 6189126 3' + Q-element 565 2 61.39 TATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTGGGTGAACTGGTTTTTTTCTCGCTTTGGGTTTTCGGGACTTCATCTTCGCTTTCACTGTCCATTCGTTGTTTA:1 - chr3L 4314828 3' - Doc 4432 1 74.26 AAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCTGTCCGCTCTAGCGATCGTTACAAGGCTCAAGTTATTGAAGCTTTGCGGCGTGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGAC:1 - chr3L 23094692 3' + 1360 385 1 77.23 ATTTCTGATGTCGATCCAAGGTCGGTAGACTCCTCGTTACAAGAGTCTTCCTCTGTTTCCTCAACGAACCGCTTTCAAGGCAGTTTACTTTCAGATCCAGA:1 - chr3R 25549367 3' - invader5 339 1 73.27 TGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACAATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGAATTTGACACTCATACATTTGAC:1 - chr3L 21912252 3' - Bari1 23 1 55.45 AATCAGGAATAGATCTGGAATGTTCACTCGCTTAATAAAAAACCAAATAAAGCAAACTGAACAACAAAATTTCAATGGCGATTTATTACCGTTACCAACGT:1 + chrX 10447076 3' + mdg1 7360 2 55.45 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATACTAAACTACACATATATTTAGTTCCTTAATCTGCCACCAGCTTA:1 + chr3R 13078425 3' - jockey 4699 1 52.53 TACTATGCGACAATCTGAGCGCCTCGAGACTTGCAAACTACACACCAAGCACAGTACCAAATAAGATCGAACTCTTGGATTCGATATCTTTGGACTGTGCT:1 - chr2L 9903449 3' - frogger 439 1 74.26 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAGGAATATCTTTGCAAGAATGCAGTGCCGCTCTATCAACGAACTCGACATTTTATCTCGTCTCAA:1 - chr3R 29710956 3' - mdg1 14 2 63.37 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATATTACTTTCTTCAATAGTAAGTAACCTTAAAGTATTTGGAGC:1 + chrX 7741768 3' + roo 9039 1 60.40 TTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGTTCTTATTCTATTGTTGCGCAGAAATGTTCGAATACCGAATCGTGTATTACATT:1 + chr2R 1076548 3' + FB 284 1 69.31 TTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTTCGTACACACAATACATTACGACATTCAAACTCACTAAGCCTATGTATTGGACTAAATCTGAC:1 - chrX 10344029 3' + 1360 3175 1 66.34 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGGCTCAAAAATCTTATTTTCAGCTCATGTTGTGCTCGCTTGTTAT:1 - chr3R 10428082 3' + hobo 2904 1 54.46 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTTGTTTAAGTAAGTCA:1 + chrX 21945945 3' - F-element 26 1 61.39 GAGCCTCAAGATATGACCAAAGCTGATAATTAACAAGCAATTCAATAAATTCGTTGGAAAATTAGTTGTAAAATATTCCGAAGCGAATGTGGTACTTCATC:1 + chrX 20579557 3' + 1360 485 1 76.24 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATAATTGAGAACTTTGAACTTTTATTTCCTTCTTCTGCGGAAAACCCTTCTTATTGCATCTAACGAGGGCAATTT:1 - chr3R 7883098 3' + roo 407 1 77.23 TTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTGCATTCCTTATATATACGAATTTCATGTTACATAAGCGCTTTTGCAACGGC:1 + chr2L 5893938 3' - I-element 415 1 55.45 CCTGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGGCTCAAAAGGATGCCAAGTACTTTGA:1 - chr2R 16234572 3' - Doc 4270 1 72.28 TGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGTCGCTTCTCCTCTGTGATTCAAGGAATAAATGTTTTAAATAT:1 - chrX 21581102 3' + Bari1 1676 1 55.45 AATTGGACACCCCTTATCCGGGGTACCACCGGCTTGAGCGGATTGGGCGTGGGACCAA:1 + chr3R 15385271 3' + gtwin 7037 2 62.07 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGATACTGACTTCATCAATATCCTCGGGAAGGGCTTGT:1 - chr2L 5269812 3' + hobo 2900 1 66.67 CATGACCCTTACAGAGTATTAAAGTTTTTTGGAAATTCGATAGAATATTACAACACTAATAAAGTTAAAAAAAAAATATCCAACTATTTTTCAAAAATGTT:1 + chr2R 4828137 3' + Cr1a 4178 1 49.50 AAATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAGCTTTAATTATTATAAATATATTTATAGGCGATTGGTTTGATAGCTATGACTGCC:1 - chr3L 22094253 3' - Stalker2 23 2 56.44 TACGGCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGCGGTATAGCAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATATAAGGTAAAATAACTATTATTAATATTATT:1 - chr2L 19875668 3' - Cr1a 4381 1 85.26 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTATATCAAATTATACTTTTCGGGTAGTCATTTGCATTCGGATGTGTGTGAGAGGAACCACAGCTA:1 + chr3R 20369764 3' - pogo 11 1 62.38 ATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACATATATATATAAGATTTATATATATATTGGGCTTGGCAGCGTTTAATGGTTCAAATTCCAATGAAT:1 + chr2L 5974558 3' + invader4 315 2 61.39 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATACACTTCTACTTGTACCATGTATTGTATGTATGTACATACGTACA:1 - chr2R 22793336 3' + hobo 2909 1 59.00 ATAATTAAAGAAGATTATTAAAAAACACGGCAGGTTTGACAAACACAAAAAAAAAATTATATTAGTTTTCCTTTGTTTTCACGTTGACTTGTGCCTTTGAT:1 + chr3R 22075211 3' - Cr1a 76 1 52.48 AATTTAAGCATGTAACATTCACACTCAACCGGCAAGACTGCCCCTGTCATTGAATCTACGATGGGGCTTATTGCTAAAATCTTTGTGCCTTTGAAAAAGGT:1 - chr2R 25247287 3' + Fw3 3074 1 68.32 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTTCTATTTCCTTATTGGGGCATAACTTGAACCTTAGGTTCATAAA:1 - chrX 14965173 3' - FB 33 1 62.38 TCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATTAGCGTAATATGCCGGAAAAAGGGAGCCTCGATTTTTAATAGACGTGTGCGGG:1 + chr2L 19699053 3' - hobo 2591 1 57.43 CATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTGACACATCATCCAGTACCCAGCACCTACTATCCAGCATCCATCCCCTTCTCTGTGAACCGTGAAG:1 - chr2R 15881003 3' + roo 160 2 71.29 AACAAAAAAAAAGCAAGAAAAATAACTAACTAACGCTAAGGAGCAGAAGAATCGGAGTAATTCGGAAAACTATATCGCAAACTCAAAAAGCGGAAACACTG:2 + chr3R 17944443 3' + gypsy7 5004 1 67.33 CAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCACAGGAGCAACAAGCAGCATCAGGACAACAGGAGCGCAACAGCGGCAAAATAGCAATATTGGAGCAATAAGA:1 - chr3L 9438718 3' + Max-element 8255 2 76.24 TCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCACATATGGTCACCTTAATTTTCCACG:1 + chr3L 19158274 3' + blood 7090 2 79.21 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAGTGGAGTTTACTAACTAACATTTCAATTCCGAATATTGCATGTAC:1 - chr3R 13122840 3' - Transpac 34 2 55.45 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGAACAATGAAAATGCACTGCCGAAGGGA:1 + chr2L 19629672 3' - hobo 48 1 74.26 ATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTTCTGCAATTCATGGGAAATTAATGTTATTAATTTATTAGCTTCTTCTACCGAATCAGCTC:2 - chr3R 19445633 3' - Tabor 6857 2 61.39 AAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAGGAGCTGAAGAACGGCGCCGATAAGTGTATGCAAAA:1 + chr2L 7971317 3' + blood 7328 1 53.47 GCCAGCTAGAGAGTTGCCGGAGCTGGAGTGACGGTTTAGACGGCCAGCGAGGAGGGATTTGCAAGGTCGGATCCACGGATCCATTGTCGCCGCGCAAGTCT:1 + chr3R 14317837 3' + aurora-element 177 1 58.42 ACGCTCTCCCGATCTGTTTCCTTGTGATTTTCTTCTATGGGGTTTAACGTAATTAGGCTTTAACTTTGGGCCGCTGAGCGCATTAGCGTTAAGTAAATTTC:1 - chrX 18351647 3' + mariner2 568 1 56.44 AATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAAT:1 + chr2R 21020034 3' - Porto1 4630 1 83.17 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCACACGCACACACCCACACATAGACACACACATACATCAAGTTTTCACAAAAAGCAACGCACGTGCGTATAAATT:1 - chrX 6146629 3' - hobo 1 1 76.00 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGCGTGCGAGGCACGGATGTTTTGTATACACCACAAAACAAA:1 - chr2R 10191701 3' - 297 6603 2 58.33 CCATGATAATGTCTTAGCACTAGGCCTACTAGCACCACCACGACCACTGCTCAGCCGGAAACGGAAATGCCGAAAATTGTGGAGATCACTGCCAGCGGG:1 + chr3R 7175330 3' + G3 4399 1 74.75 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATACACTTCTACTTGTACCATGTATTGTATGTATGTACATACGTACATAGTACACATCATGGAAATCCGAT:1 - chr2R 22793312 3' + hobo 2932 1 74.26 TTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGGGATAATTGTTTATATATATTATGTGAGCATTTTTTAAGTCATCGCC:1 - chr2L 17167584 3' - flea 4817 1 53.47 ATTGAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGGGAGGGATCCGAAA:1 + chr3L 15279172 3' + R1A1-element 79 1 75.38 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACAGTGTAGCACAGACAGTCAAAAACGCAGCATTGGGTTGTCTGTTTCAACAGCAG:1 + chr3L 10554846 3' - roo 8685 2 54.46 GATCAGGATCAATAGCCGAGTCTATCTAGCCTTCTCCGTCTGTCCGTATGAAAGTCGAGACAAACAATGAAACGAATAAAAATCTAAACATTTTTGAAAAG:1 + chr2R 4886207 3' + INE-1 92 1 59.41 GTGGTCAAGCCATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGTACAATATGTAATCCACAACATTCCAATGAAACTAG:1 + chr3R 19595569 3' + Stalker2 215 2 76.24 ATGAATTAGAAGCCAGAAAACTCTTAAAACTCTTAAATTTCCTTTAATGGGTACCTCCCATCTGCCGGTGCCTGGTTAATGGTAAGCTACATTACA:1 + chr3R 28706948 3' + I-element 401 1 67.71 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTTTGATATGTCACAATGTTCGTAGGTATTTTCCAATTCCAATTTAAAAGACCCTTTTTTTT:1 - chrX 16131286 3' - pogo 19 1 64.36 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCAATGATTTTTAACTTGTTTTGACGTTCTGACATCATAAAATCGCGCTTCACTTCTGTCTCGCGAAAAT:1 + chr2R 15451653 3' - roo 8671 2 64.36 AAATCTATGTACATATCATCACAAAATAAATTTCCAAGATTCAGATCGCGGCGCGCGAACCGCAGATCTCCCAGATACCGATCTAAACTCACTCGGCG:1 - chr3R 7294210 3' + 1360 349 1 71.43 GTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCAGTTCGTCTGAAGCTTTTGCACTTCACTTTCTTTTGAATTCTTCTCCCCTTTCTTCAC:1 + chrX 5770259 3' - R1A1-element 5292 1 60.40 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTGCGAGATCAGCTGCTCCCGTGCCTGGATGCGCAGGTCAATGGCCGGCTGACCAGTTAGCAGG:1 + chr3R 28880001 3' - roo 8678 2 63.37 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAGGCTC:1 - chr2R 19209460 3' - Doc 47 1 63.33 TAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGAAATTTGGACAAAAAAACGAAATAGAAACCAA:1 - chr3R 20054601 3' - pogo 1802 1 68.32 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTG:1 - chr2L 11805026 3' + P-element 2844 1 34.65 TTTTACTTATAAATCAAAAAACAAGTTAAATATAAAATAAGAGGGGGAAAAGCAAGAAAAACACACAAATGAAATAAGATATTTTAAATTAATTGCCGTCG:1 - chrX 18286386 3' + S-element 127 2 80.20 GCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGA:1 - chr3L 19951217 3' - Ivk 49 1 73.27 TCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACCAAGCTGGAGAGCTTCACCGAGCACCTCATCGACATGAAGACCGCCCAGTCCAGG:1 - chr3R 5514124 3' - opus 348 2 61.39 AGTTGCAGTACTGGGTATACCGAGAGAGGGGCAGCAATTTTCGGCTGTCGCTGTAATTCGACGCTCATCTCCTGCTCTACTTTGCTCTCTTTCTACGCTCT:1 + chr3L 5664775 3' + accord2 7610 1 75.25 ATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAACTGGCGACCACGGACGGAATAGAAAGAGGCGCAAGAGGATGCGGAAGTGGGGCCAACTCTACACAAAGCCAAGATG:1 + chr3L 7855038 3' - Max-element 424 1 58.42 GCTGGCATTGCCCCATAACTGTGGTTCGGGTGTCTAATAGCTTCATAATGGTGTGGGGG:1 - chrX 12562795 3' - F-element 4279 1 76.27 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGGGTCATGAGCCACGACCGAATTCTCGGACTCCTTGGACCCAAAAAAA:1 + chr2L 16396638 3' + 412 463 2 56.44 TTTTTTTTTTAAATTTGTTTTTAGTTGCCCTAAGCGCTTTTCTGAGTGTAAATTGACATGGTTCTTAAACTCTTTTTTAGTAAGATAAATTTGTGAAATG:1 - chr3R 25810941 3' - gypsy2 423 2 43.00 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTGATCTGTATTGCTGGGTACCTATTTAATTTCATATTTCAACTGTATGCATC:1 - chr3R 29920619 3' - opus 7143 4 49.50 AAGAATGTACACCTAGCTCACTCTCTCTTTTGAAAGAGCATAAGAAAAGAGGATAATACCCAAATAAATTTCAGTTCACTGCGGAAGTGGCCAACATAAGC:1 + chr2L 12804932 3' + invader3 135 2 52.48 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTTC:1 - chr3L 9174691 3' - 412 7094 2 64.36 GCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTTGACATTGTTCTAGGGGAGCAGTGAA:1 - chr2L 1238181 3' - F-element 495 1 74.00 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGGAATGCATTTTAAATATAACATATTCCAATGTGTTATGAA:1 + chrX 14500156 3' + roo 9037 1 57.43 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAATAAAAGAAAGGGTGAACCGCATGAGTCGTCTCTT:1 + chr2R 6074431 3' + 412 7506 2 70.30 CGAAAACACGAGAACCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAGTTCGAGTAAGTCTGGCAAATCAGGAATCTTTTCTTATAC:1 + chr3L 20556669 3' - opus 156 4 58.42 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGTACACTTGTAATGAAAAGTAATTTGGGCCATATTCGCTTGATTGTGCGTATTTTGTTTGTGGACTCAA:1 + chr3R 18861251 3' - jockey 4764 1 73.27 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACAGTGGTTAATATTAATTACAGAAATAATCTGTAAAAAATCATTG:1 + chr2L 4888795 3' - BS 5026 1 57.43 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAATCAGGTTGTTGGATGGCATGGGTTAAGGGAAGTCGG:1 + chr2L 7971042 3' - blood 7047 2 59.00 AATATGTAGGTACAATAATTTGAATTTTTGAGAGTACATTGCGTGGGGTGAGTGCGTGTGGGCCTAGACATATGGCGACAAAGAGGCTGACGTCATAAGCT:1 + chr2R 21375152 3' - TAHRE 10343 1 54.46 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATGAATACAAAAACACCTAATGGGTTCAGCTCCAGCTGCGACGCACTT:1 + chr2L 7504942 3' + roo 9042 1 60.40 TTAGTCGCGTTTTACGACAAGCCGGGAATGCTGAGGTAGAATTCATCGCCCGCCGCCACCCTTATAGAATCTTTCGGCTCGTATTGCTTCAGAGCACCATA:1 + chr4 517568 3' - Rt1b 4883 1 60.40 CTTCTCCTCAACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCTAAGCATCCAAATGTTCTCCCAAAATACACTAACACATTGGGGGCCTCTGCCCCACTAGACC:1 + chr3R 30532483 3' + 17.6 7170 2 73.27 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATACTAAACTACACATATATTTAGTTCCTTAATCTGC:1 + chr3R 13078415 3' - jockey 4711 1 63.37 ATACATATACATATATACATATTATATTTTTTTGTTTTATTTTGTATTTATGTATAATTTTACTTGTTTTTATTCTGTGGAAATATTTAAGTGTAAACATT:1 - chr3L 19784593 3' - G3 4507 1 53.47 TTCTAGCATTTTGTACATTTAACTCATTTTCTTTTATCATTATATATGACCTATTAGTATCTAAAATTATTATATGAATTGAATATTTCCCCAATTAGCTT:1 - chr2L 12584488 3' - hopper 1076 1 50.50 TAAGATAAGGGGTATATAGTTACTAGTGAATCTAGCGGGACTCTCAACATCAGCAGCAACAGCCAAACGAATCGGATGTCGTGCCCATTA:1 - chrX 21333226 3' - Cr1a 4129 1 61.11 GGGATCAAGCCCTAAACCAACAATTATGACAGGCCCACCAAAAAATACTGCCTCTCGAAAGTTTGTACTAGTGGGCCGTGAATTAGTCGGGATCGAGCCCA:1 + chr3L 23617268 3' + I-element 162 1 63.37 TAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGAGAAGATTCAATAACCAACAATTTATTATCAATTCCAAATTGTTAATGAGAT:1 + chr2R 977115 3' + Doc 4629 1 62.38 TTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTATACCGATTATTTGGAAATTGAACCTGGATATCACAAGCCGGATAGTTCCTGGCGCTCAAGCCCAAAAC:1 + chrX 21581201 3' - Bari1 7 1 67.33 TTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATTTCCTTTACCAAGACAAGCACATTGCAACAGGTTGCACGCAGACTGATAGG:1 - chr2R 6735249 3' - Burdock 6154 2 61.39 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGACTCACCTATGAATAGTCGTTGTTGTCGAC:1 - chrX 2125581 3' - P-element 45 1 34.65 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCATCGGCGAGTCCTTGACATTTTGCAATATAAACAGCTGGCTGGCAGG:2 + chr3L 9174774 3' + 412 7537 2 69.31 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGGGGAATCTCAAAAAGCGACTAACTACAGTCGCAAAGTTTCGCCGATCAACGGAATTC:1 - chr2L 852813 3' + P-element 2870 1 60.00 ACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTTATTTTAATAAAGACTTTTAATTGAATTTTCAATTGTTGCGCCGGCTTTGATGGGGCCAT:1 - chr3R 6135203 3' - I-element 13 1 66.34 TTTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAGATTTGATTAAATTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTGGATGCATTTAGCACCCT:1 - chrX 19125980 3' + 1360 179 1 70.30 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTCGACTCGAGACGCAGAAGTTTGCGTGACTAGCGCATAG:1 - chr3R 10978668 3' + roo 406 1 79.21 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCTGCATAACACCATTCAAACCGGCAAATCAAACAGTCGTGCTGAAATGAA:1 + chr3L 27262136 3' - P-element 27 1 52.48 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATCAGGAGCAGAACGAACTTCCTG:1 + chr3R 29661721 3' - 412 51 2 78.22 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCACGAGGTCTGTCAATTTCTGGGCTCTACG:1 - chr2L 16396583 3' - 412 48 2 71.29 GATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTTCTCTTGTTTTACGTTCTGTCTCTCAGTTCTTTTCACATATAGTACGTTTACATCTGTTTACATACGCTTATA:1 + chr2L 22315497 3' + INE-1 564 1 59.41 AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGGAATGGATGGGAGGGATGTTGGTTCTCCATGTTTATGGATGGTTTTTTTTT:1 + chrX 1018443 3' - transib2 23 1 51.58 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATCGATGAATCCACCCTAACACAAC:1 - chr3R 17846892 3' + roo 356 2 75.25 ATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGATGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGAGGAAAGCTGATTTGCTTGAATAGAT:1 + chr2L 18871895 3' - 1360 301 1 74.26 TCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGATGCGGTATGTGTCGATACAGCTTTCAACGACGGCGTGCTCAGGATTTGTGGATCCCGAA:1 - chr3L 25802188 3' - Cr1a 4442 1 59.41 GTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCACGCTCCGTATTTCGTATTCCAAAGACCCGGGTAACTCCATACACCTACGCAAATGTTAATTTATGCGGGCATG:1 - chr3L 14892952 3' + Ivk 53 1 76.24 AAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAAACTGAAAATGAAAATGGAAAAAATCTAAGCCGAAAGAGATGATTGCGTCCTTTTTTGTTTTTGGGGCGCAAAGTTTG:1 + chr2L 9471589 3' - hopper 146 111 63.37 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGGGCTTAATATAATACTTGTCATACGTTGCTGTTCAT:1 - chr3L 14886208 3' - 412 7094 2 67.33 AAAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGCTCGTGTCCTTAAAGTTTTCCCACTCAATCATTCGATCA:1 + chr3R 30539878 3' - flea 495 1 61.39 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTACACGATAAGAGCGAATTGGAAATGAAA:1 - chr2R 16289230 3' + P-element 2870 1 32.00 CATCAAAAACTTGGCACAGGATATGGCCAGGAGTTTAAGGCGGGGGGGTGCGGCCGCAAAAGTTTCTTGAACTCGCAAAGGCGAAGGCAGCTTATCAAAAA:2 + chr3R 30354410 3' + Penelope 384 1 87.13 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATGTTGCATAGGCACATACTACAATATCTGTGACCATGCCTGTATTCTGCATGTCACAAT:1 + chrX 21668296 3' - 412 43 2 65.35 GTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTTTATCATGAGTAAGCATGATTATGCTT:1 + chr3R 8970898 3' + hobo 299 1 73.27 TCGCTCTAACTCTCTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCAGACATCTGTGCTCGACGCCTTGGGTGCATTAGTGCCGGCGACGGAGACG:1 + chrX 16182953 3' + Cr1a 289 1 57.43 TCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGTCCTATCTTCCACTTTCAGGCGTTCGGCCGTTCAGCGCGTATTATTAATTGCAATCGT:1 - chr3R 20464932 3' - I-element 308 1 65.35 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGCATTCACAAACAACAGACTTTAATCAATACTCGTGGC:2 + chr3R 4524243 3' + mdg1 383 2 63.37 TCACCAAAAATGTGGCTGCATAGTGCCCAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTCAGTGAGAGACGTGCGGGAGCG:1 - chr2R 3073484 3' + 1360 3337 1 74.26 GCTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATAAACCTCACGTTGGACCGAGATTTTCACCAGATCCTCACAAC:1 - chr2L 15648394 3' - Rt1b 5125 1 57.43 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAATCGACCGGTAAATAAATACTTATCAATCATGGGTAAACTCACGT:1 + chr3L 3776538 3' + roo 9040 1 57.43 CATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAAAAAGCAAAAAGATACAAAAGAATCT:1 + chr2R 12242942 3' + roo 428 1 57.00 TTAATAAAACAAATAAGTTTATATGAAAGTTTAGATATTTATATCGCATTTAACAGAAGAATTCTTTTAATACTTCAACCTTTCCTTTACATTTAACTAAC:1 - chr3R 16163152 3' + TAHRE 61 1 66.34 GGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCAGGAAGGAAAAAGGATATGGGTGGTGGGACGTGCAAAATACCAGGCCAGCTAGAGTCGCACTTGG:1 + chr3R 14207297 3' + roo 433 1 70.30 GTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCATTGAAGGTCCGGCTGCGGCCATAACAAGGCGTGACTTACAGCGTACTTGAAGGGCCAGAATGAAGCAA:1 - chr2L 17889072 3' - hobo 215 1 70.30 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCTATTAAACTCCCCAAACGGCCACGCCCCCTGTCTGTGTGAAAAGCCCTAAAAGGCCGTATGCAG:1 - chr2L 9330198 3' + hopper 1405 2 69.31 TTACTAAAATAAATAATTATCCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAACCTCTTCTCCCCCATTCCGCTTCGCTTTTTTCCGT:1 - chr2R 15806726 3' + Doc 152 1 63.37 TCTCAGGAAGTATACAAGCTAGACGGTTGAGATTCAGCATGCAGGTTCTAGAGACATGGACACGCGCGGTTGTCACCTCGTTGTTGTTGGAGAGATACATT:1 + chrX 20607254 3' + INE-1 152 1 56.44 GTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTATTGTATTGCCTCAACTATCTGATACCGGAAGTGCTAAGGAGTCA:1 + chr2R 17650020 3' + 1360 3359 1 57.43 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATCAAATACTACGGTGCTCGGCATTTTCTCGGCTGGGG:1 + chrX 4784571 3' + hobo 2934 1 60.00 GTGGACGGAGCGAAACAGCAGAGCACGTTCTCTTCTCGTGGGTTAAATATGCAAGTTATAAAACTACTTTTATAAGTCTTAAAGTACTTAATTTATGCGAA:1 - chr2R 1778459 3' + Rt1c 5087 1 54.46 TTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAATTATGCAAGCATACCCGGTCCTTTGAGGCTTGAT:1 - chr2L 5659447 3' - jockey 4576 1 65.35 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGACTACATTTGAGCAGCCGCAAAGAGCTTGC:1 - chr2L 10898481 3' - jockey 4716 1 70.30 TTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATTCAGACCAGAAGCGCTTCCTCGAGAGCAAGAACAAGCGGGCGG:1 + chr2R 14011014 3' + Tabor 6935 2 69.31 CTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTA:1 - chr3L 16973393 3' - S-element 1584 2 72.28 TAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCCAATGCAGGGGCAGACATATAGAGCTGTTATATCGAATAAAATCGGACGTTGTTTCAGCCGCCAAAAA:1 + chr2R 10191805 3' + 297 393 2 76.77 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGACAGCGCTCAGTTGCTGGTCTTG:1 + chrX 10629274 3' + P-element 2862 1 54.46 GAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCGCACATATACGCGTTCTCGTCTTTTGTTTTTACTCACACAAACAATAAAGAACTATCCTGCGTATCCCGCTGGAC:1 - chr3L 15492699 3' + 1360 3199 1 70.30 AGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAATAAAAACAAATGGGCAATAGATGACATATTCACATTCACATTCATATTCACATATTCACGGAAG:1 - chr3L 23603290 3' + Bica 195 1 64.36 CACGGGTCGAATGACACCTTAGTCCGGCCAGGAGATGTGGAAATTTTTTAGAGTTTCCAGCTGACCTAACTAAGAGCCACTTGAACAGCTTGTCTACGATG:1 - 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chr2L 4134346 3' + copia 237 1 74.26 TTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTCCCAGCTTGGGCCACGTGAACACCCTTATGCAAAAACAAATCAAAACAGCATAAAAAGTCGTAA:1 + chr2L 15438831 3' + I-element 10 1 69.31 TGTTTTCTTTTTTTTTTATTCCTAACCCGTT:1 - chr3L 10168535 3' - Osvaldo 1521 1 90.32 TTCCAAGTCAAGTTAAATTTTGTTAATTATGTTTTCATAGCACAACTTAGGAGGGTAGAGTGTAAATAATGTGTTGCTTCAATTTGTTAGAGTGTTGAGTG:1 - chr2L 7266011 3' + HB 1388 1 52.48 AAAAAAAAAAAGGAAAAAGCGGGAATAAGGCAAAGGGATATTAACGCAGCCAAAGCTGGAAAA:1 - chr3R 15676086 3' + Bica 341 1 73.02 TAACGTAAACAATAAGTGACCACCATAATGTTCAGCTCGGTGGGGCTCCCCAGCAAATGGCTTATTTTGGTGAAGCTCTTATGACCCCCTCAATATTGCAG:1 + chr2L 19829279 3' + 17.6 58 1 79.21 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAATCGAACAGAATGGGGGTACTGAGCAGTTAAACCGCAAACTTTAGCATCACCACCCACTTCCTGAATCATCT:1 - chr2R 16902824 3' - flea 4758 1 65.35 TTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATT:1 - chr3L 5267222 3' - Juan 4008 1 58.42 TAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACGCATCGCATTATTGGAGGGCCGTTCTCTGCGCTTCTTAAACGGCCTTTGGAGTCACAT:1 - chrX 21976899 3' + baggins 5073 1 62.38 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTATCTGGTCTGCACCGTGTGCATTTGGCTCGGTGAATAA:1 + chr3L 1047062 3' + hobo 2892 1 71.29 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCACAGCGTACTTTTAATTGGAGTTTTATTGCAAAAAAAAAACAGACAGAGAATTGATTAAATGCA:1 + chr3L 5492392 3' - pogo 9 1 70.30 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCAGAGCCCAACATTTTCCCTTGATTTGCCACCCAATTTCCCCACCATATGTCAACAGG:1 - chr3L 5084988 3' + 412 7528 2 59.41 GTTGAAGGTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAATCTAGCCAAGATGGCAAGTCTTGCAGGTTCGCGTCGTCG:1 + chrX 20113885 3' + invader2 4647 1 61.39 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCCTTCTGCTCTGTTTGTGTTTGTATTGGTGCTGCTGTTGGTGTTAGGGATTTGGGGGTGCTG:1 + chr2L 4234386 3' - hopper 14 1 61.39 AGCTGTTGACCGCTTGCCATTCCGCCTCCGCATTCAGTCTGCTGCCAGCACTTAACCCCAGCAGACTCCTACTCCTTGCCTTGCACGATCACCAGCACACC:1 - chrX 1407213 3' - Rt1c 5224 1 58.42 AAGGAAAATTGAAAAGGTAAAAAGCAAAACATACCTCTCGCTTTGGTAGTCGCTCCATTCTGAACTATAGCACGTCCCTCGATTTGGTCAACTATTGAAAG:1 + chr3L 16143563 3' - Tc1-2 144 1 67.33 TCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGCTCCCACGTTCAAAGCTTGGAGCCGCAATCCCGAAACCCCCGATGCGACCCGC:1 + chrX 8323592 3' + Idefix 7017 2 83.17 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCACACATCCTGTCTTTTCCAAAGAACTTTTACCGCGGTAAACTTCCAACTTCTA:1 - chrX 10436514 3' - hobo 21 1 56.44 GGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACACATACTCTACGGGTTTTTCTTCCTCGATCTCTTCGATCTCCTCGATAATTTCTTGAA:1 + chr3L 2048345 3' - GATE 8267 2 62.38 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTATATCAAATTATACTTTTCGGGTAGTC:1 + chr3R 20369727 3' - pogo 48 1 77.23 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCG:1 + chr2R 22856577 3' + 1360 3341 1 78.22 TTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGAACCTCATTTGGCATTCCGGTCTTTCGAGTATCTTTGATTATTTTTCGCAGTCGCCGCAGTTTCGA:1 - chr2L 12259795 3' + 1360 444 1 46.53 TCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCCAATGCAGGGGCAGACATATAGAGCTGTTATATCG:1 + chr2R 10191772 3' + 297 6946 2 61.70 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGCTCTCGTGCTGCCGAGGAGTGCAGCTTGATATAGAGAGAGGTACTAGACAGTGGAAGTACTTACTGCT:1 + chr2L 128782 3' + P-element 2881 2 74.26 GTGCATTACTGATTTCTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATAAACAGGCTGAGAATACGACAACTTCGATTGCGACTGCGATTCTTGGC:1 - 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jockey 20 1 66.34 TCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCAACCACTCTCCCTTCCCGTTTTTAA:1 - chrX 4042369 3' + Doc 390 1 75.25 CAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCATCGACCGATTGATCGCCCTGCGATCGACACTCTTCGTCCAGCGCCAAAG:1 + chrX 16790129 3' + F-element 403 1 55.45 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATATATTTCACTTTCACTTTGTTGACTGCTTCATAAGTTGAGTTGTTCGCTTTGTGAACTCTG:2 + chrX 11463716 3' + flea 5008 2 70.30 TTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGTACTGTCTTTCTTACTTTTTCGCCATTTTGGCCGTGTCAT:1 + chr3R 10268905 3' + hobo 275 1 59.60 CTAATAAATATTGAAATATGTAAAAGATACATCCTTGTAAATTTGTAAATATATTTAATGTTATATTTAATACAATAGTATTACTAATTCATCTTCATCAA:1 + chr2R 14434644 3' + Penelope 155 1 79.21 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCGAGCTCTCTCAATGTGTCTCTCTG:1 + chr3L 9373682 3' - P-element 54 1 15.84 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACAGTCCAATGACAGCGCCTATGTCCAGCGACTGATGCGTCTGTCCAAGTCCGCCGAA:1 - chr3R 28879905 3' + roo 9049 2 56.44 GGCGTCCGCCCGGTCTAGTTATCCTTACCCCTGGTCCTTAGTTGCTATTCCTTTCCGCTGGTTCTCTATTCATTTTGTCCACATTAGTGTGCCCGATTCAC:1 - chr3L 27980098 3' + baggins 310 1 81.19 TTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATGTGAGGTGACAGTTTTATAGCTTTGTTAACAGGGAG:1 - chr3L 13660896 3' - I-element 298 1 62.89 AACAAAAAACAAGAAAAAAAAAACAGAAAACCAAAAAGTGCGGGTAAAATGTGACCAAAATTGATATTCAAACGAAATGAAGAGCAACTGAGCTTCTAGT:1 - chr2R 8247843 3' + gypsy7 5004 1 54.00 GGCAGATGAATTTGGCGCGCGTTTCCTCCACTTTCGAAAGGTATGGGGGAAACGCGCGCCAAAATTTGAGATATGCTCTTCTGCGCAAACTCTCTCTATCT:1 + chr3R 7037258 3' - Porto1 411 1 76.24 CAGAATTGTTCTCATTCATTGTCTCAATAATAATTCGTAATATTTACAAAATAACTTGCAGACAATTCGACATTGCTGTCATGTTAAATTCATGACACTTT:1 - chr3R 28098198 3' - BS 338 1 52.48 AAATATAAATTATAAATTACAACAGCTACAAACATTGAATAGATGAGAGGACGGCAGCAGACGGTAATGATAAATATGGAAGGAGTGATGTCGACCAGACG:1 - chr2L 4134296 3' + copia 253 1 74.26 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGACATACAACACTACACAAGGAGAAAA:1 - chr2L 1590429 3' + mdg1 7410 2 79.21 GACTTCGGTAAGCAGGATGTGAGGCCAGACTGCCAACGACACCAGCTAAAACATGGCACTGAAAAAAAAA:1 - chr2L 5444904 3' - Rt1b 4962 1 68.57 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTCGTTTGGTTTTCAGTTCGCTTTCCAGCTCAGTCGCTGTCAGTCGCTCTGCGCG:1 + chr2L 9437508 3' + P-element 2868 1 61.39 GTCATATGCAAGAATATTTACAGGATGCTCTGACTTTCGTGCGCGAATATGGACGACCATGTTTTACAGTGTTTTGATATGACAATCCAAAATGTATACAA:1 + chrX 23183118 3' + Helitron 110 1 63.37 GTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGGCACTTAATTTATGCAGTCTGTATGGGCTTTGTTTAACTT:1 + chr3L 7104880 3' + Doc 4448 1 60.40 GGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGAGCGCCACGAGAAGGTTAAGCGCATTTACCAGGAGGCATCCGTGCAAC:1 - chr3R 17537239 3' + X-element 4486 1 55.45 AACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATGCAGGCCACTAGTGAGGCGTTGAAAATTAAAATAAAAAATT:1 - chr3L 5309184 3' + Tc1 1610 1 68.32 TATTTGAAATCTATCTAGATGGTATTGTAAGTCCAAATGGCACCAAATTCCTAAAATCTATCTCATTCATCGTCGAAAAAGGATAAATAGTATAATCTGGA:1 - chr2R 5092390 3' - Q-element 642 1 57.43 AGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGTCTGATCGGAGATTTGGTATTATCCGAGATTAGGGGTTGGGTATTTGCTC:1 - chr2L 17292630 3' - I-element 365 1 56.44 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCATTGTTAACTACTGTCTCCTTGCCGAATCGGGCACTCCAGGAACCCTTGTCA:1 - chr3R 23485651 3' + roo 9047 1 54.46 GTTTTTTAAAGGGGGGGCAAACGATAAAGACAGACACGTTTTGGTCATTTTCACGACTGCACGCGCCCTAGGCTTTGTTGTTTTTTTATTTTTTGCAAGA:1 + chrX 12504612 3' - FB 385 1 80.00 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGCGGCTATGCGGGTATTTTTAATCTAAGCCATCAATCCACAGCTACAGTGCATCAAATCG:1 - chr2L 9699187 3' - P-element 15 1 65.35 CATTTGTTGAATTATTTTTTTTATTTCTTTGGTGTAACGATTAGCAGAAAAAAAAAATATATTATAATCCAAATTGGTTCACAACTTGTCATTTTCAGGTA:1 - chrX 23042981 3' + Tc1 1387 1 73.27 ACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACTGCGACCTAATAAAATTCCGTTTTACAAATTGA:2 - chr2L 14074925 3' - jockey 227 1 69.31 AAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAAGTCTTTGCAAAACAAAAAAATTTGGTGGCCATCAGCTGCAAAAAATCATTTCACACTTCCCATACCGGG:1 + chr3L 22847716 3' + hobo 2481 1 73.27 GGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATTTTCGTTGCTTTGGCTTTGTTATTTATTTACG:1 - chr2L 1570053 3' - Doc 4368 1 72.28 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACTTTCGTAGAATCTAACATCTGAACAAGCTGCATACATATACACTCTCGTATGTGTGACGTAAT:1 + chr3R 19650893 3' + P-element 2819 1 66.34 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAGTTTGAAGTTTGAACTCTTGACTCGC:1 - chr2L 18979412 3' - Doc 54 1 74.26 AGTGGTTCCGTCAGAGGCCAAAAATAAAAAAAACATCTAAATAAATAGATATTAAAGTCTTGTGCTTATTTGTGGTACCTGTGGCACCAACAATTTCTTTC:1 - chr2R 9922707 3' + Transib5 4 1 60.40 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGTAGCTCCTCTGCCGAAGTCGCTGCCTCTGTCGCGGCGCGTTTTCCTCTGCCACTACCGGGTATTTA:1 + chrX 409677 3' + P-element 2878 2 66.34 GATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAACGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTTTGTCCAGAACATCCTGAATTTGCTGCTGGGAGTACTGGGATTC:1 - chr3R 7888078 3' + invader4 2895 2 56.44 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGGCAAAAAACCCGTGGTCATCCAACACCGATCACA:1 + chr3L 11199876 3' + roo 9030 1 65.35 TGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGAACTGAGGCCATTAAGTTATATTATGCTTAATTTCTATCCCATT:1 + chr3R 28678243 3' - I-element 41 1 60.40 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATATCAGAGTGGTTTAATAAAAGAGGAATGGTTTTTTCTGAAAGCTC:1 + chr2R 6735337 3' + Burdock 6363 2 57.43 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGATAGTTCTTAAATATACCGCACACTCAAT:1 - chr3R 24764567 3' - jockey 62 1 77.23 GAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCGCTGTGTCTAAGTTAGCGCACCTGAAACTGCA:5 - chr3L 15452842 3' - accord 8 2 69.31 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCGCT:1 + chr2R 17346027 3' - hobo 14 1 63.37 CAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCA:1 + chrX 21945924 3' - F-element 47 1 63.37 ACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTCGAGTGCGAAAGTATGGGGAAATAATACGCAAACGTATTAAAATTCATGCCATTGAGCCAAAGTC:1 - chr3R 21968892 3' - hobo 2574 1 71.29 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTAACGATAA:1 + chrX 10119641 3' - FB 20 1 57.43 TCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGAGGAATAATGAAATCACTTAAGTTCTCA:1 + chrX 20313960 3' + roo 8712 2 72.28 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTTCAACCAAGAAT:1 - chrX 10210946 3' - I-element 33 1 52.48 TCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTAAGTGAAAGAGGGGCAAAAGATGGCCCAAAAGAACAGGGGG:1 - chrX 11268169 3' + Doc 4560 1 63.33 AATTCTCTTTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAATTCTCGAGATTTCCCCCTGCGCGCTCTCTTGTGCTTATTTCAAGTAGTTGAAATTAT:1 - chr3R 28301099 3' - invader2 373 1 61.39 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATTACACGAATTTCGAAGCATAAGCTTTTGCATCCGTTGGTTATGTTCA:1 + chr2R 15826598 3' + roo 9041 1 53.47 TTGTTTCCCATGGGACTACATACATGCCCACGAGTCTGTTCCTCCTGATGAAAAGCGCCATGCAGTCACATATAATTTTCTTGTGTCTTTCCTACAATGAA:1 + chr3L 1168686 3' - baggins 5296 1 75.25 TCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTTTTTAATAAAATTTATTACACTCGCACATGACGAACATGATGCCATCTTCCTTCGCCCCCCACCTTCT:1 + chrX 18991628 3' + pogo 2096 1 76.24 TTTAAAGATTAACAAGTTACAGCGGCACAATTCCGTCGGTATGCCATGGATAGTAGGGAACTCCGTAATCCCATGCCCGAGCTCCGGCGAGGAGG:1 - chrX 12970760 3' - Burdock 6224 2 55.79 ATTGATTATCCATTTTAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGATATATA:1 - chr3R 9175187 3' + hopper2 1357 2 77.23 TGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAACAAGCCAGCAAGGCGCGCGCTACGCCCACAAAAAGTTCAAGAAACA:1 - chr3R 18103040 3' + gypsy4 435 2 65.35 TCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGGAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGT:1 - chr4 281583 3' + Cr1a 4244 1 77.23 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACATAAACTTGATGATATGGTATAAGTGCTTTTGCCTCTTCAATGGTCCTTCAATGGTATC:1 + chrX 3195706 3' - mdg1 7057 2 60.40 TACTCGTAACAAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTGCCTGTACTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCC:1 - chr2L 15833012 3' + hobo 2816 1 52.48 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGCCAAGCGGCCACGAGAGGACAACGAGGCTACTTCGGA:1 - chrX 20330496 3' + P-element 2851 1 39.60 CAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGATTATTCAGATCCGATGTGGCAACATATGCGCC:1 - chr3L 19659125 3' - copia 4840 1 67.33 TTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAAGTCTGAATGGGAATATATACAGGCGGAACTGAACGAGTCCCCAACAATGGTTGTGATTTATTCGGTTACTTGTGTG:1 + chr2R 20388463 3' + micropia 5119 2 46.53 GGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGTCGACCAGCATCCCAGCACCCAGCAACTTGCAAGCCGTCTGGCTGGGAATCT:1 - chrX 6055534 3' + Doc 483 1 60.40 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCGATTAATAAAATAACTCAAATTTATGATGAGCTGCTGCTGGCTGCGTAAC:1 + chr3L 25413276 3' - Doc 31 1 55.45 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGGCGCATTCGTGCGTTTTATTCCCGGCCAAAACCCGTGAATTCAAAGC:1 + chr2L 2624289 3' - hopper 24 1 57.00 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACCATTCAGCCAAAAGTGTGCCACCAGCTAACATCCAAACA:1 + chr3R 23080892 3' + 412 7508 2 63.37 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTCGACTCGAGACGCAGAAGTTTGC:1 - chr3R 10978683 3' + roo 397 1 68.42 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCTAAAGAAAATATAATTTTTGACTTATTAATAATAATTGCAGTCTATCCTTGCGGAACGCCTAATTCG:2 + chr3L 14886291 3' + 412 7537 2 69.31 CTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTATGCTGCTGTACAGAGCACGCACCTATGCAATAAACACAAACTAATTGCTCAGGAGGAGGAAATAGCGCAAG:1 - chr3R 5176418 3' + Tc1 146 1 74.26 AATTTGATTAAAAACATTATCTCTGAAGGAAATTGGTCGAATTGTCGGTTGTTCAAAGTCAGATGAAGGAC:1 - chrX 15868139 3' + Tc1 395 1 77.46 ATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATGTACAAAACCAAATAAACGCCAACATTAAGGCAA:1 - chr3L 7807552 3' + Stalker4 40 4 72.28 TGTCTTTCTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTCGTGCGTTGTTCTCTTTGTTGTTTGGTGTTGTTTTTTTTTATAAAAAGTATTTGTTCATTTTTTTGCAGTAT:1 - chr2R 21848341 3' + Cr1a 201 1 64.36 AGTAACAGCAGCGTAAAAATCATCCAACAAGCCCAATCGAAAATCCTGAGAACCCTGGAAACTCCGTTGGCGGACAGGGAGGGAGTTGCCCACTCCCACTC:1 - chr3R 30271461 3' + Fw2 3581 1 55.45 TCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGTGAAAGGACTGAAGATCACGCGGATTACTGTTAAGGAGAATGGCAGTGAGA:1 + chr2R 4028603 3' + Rt1b 4962 1 73.27 AGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAAAAAGGAAGTAAACCTGAGGAGGGTTCGTATGATCA:1 + chrX 20930154 3' + 297 462 1 65.35 AAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAGGTTTGCAGATATAGGGGACATGGGC:1 + chr2L 17168894 3' + flea 4704 1 74.00 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAGGAATATCTTTGCAAGAATGCAGTGCCGCTCTATCAACGAACTCGACATTTTATCTCGTCTC:1 - chr3R 29710958 3' - mdg1 7054 2 61.39 GGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTGAATTTTCTTTAATATGTATAATTCTGCATTGGTATGTTACCTTCGGCATG:1 + chr4 717033 3' - jockey 4896 1 49.50 AAAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAGGAAATTTATAAAGAAATCTCCATGGACAGTATGGATGCCATTTACCTTGGTCACGTGGCCGGCAAACGCACCTGG:1 + chrX 15270610 3' - transib1 1900 10 77.23 CGTGGCCGCTACGAATATGAAACCGCAACAATGTGTTTCGTTTTCATTTTTTTCGTACTTTCCGCGAATTTTCTATCCTTTTTGTTTTTCCACTGGCGCAC:1 + chr3R 28747536 3' + gypsy2 117 2 65.35 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTT:1 + chr2R 17345995 3' - hobo 46 1 69.31 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTATTTTTAGGCTAAGCCCGACACAAAACACTATATTTTGCCGGACTATAAGTAA:2 - chr2L 12942187 3' - jockey 4696 1 51.49 TATTTATTTTTTTTCTTTTTCTTGACAAATTTGCTGGCCACAAGCGTGAACGACAGATGACGGACCAAACCGGACTGTTGGATTGTGGGGGACATTGACGT:2 + chr2R 18937426 3' - Doc2-element 221 1 72.28 GTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCATGCTTCGTTCGACATATCGATAACAGGCACTTAAGTGCAGGACTTAACGTCATGCATAATAAACTTTTGCCATGGG:1 - 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412 2 2 75.25 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATATCTGAAAATGTGGGCAAAGGCAAGGAGCATACAAGGGAA:1 - chr3L 13264458 3' + Burdock 6368 2 56.04 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTCATTGCTAATTAAGCCAAAGATGGGACAGTATTTTGGAAAGGAGT:1 + chr3L 16449801 3' + roo 9042 1 57.43 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTCATTGCTAATTAAGCCAAAGATGGGACAGT:1 + chr3L 16449786 3' + roo 9027 1 71.29 GAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGCAATTCGTTTTGTTAAAATAGTCTGTATCTCGCTGGCTTTTACCGCTTCCTTTTAGTCCTCTGC:1 + chr3R 7453994 3' + 1360 416 1 65.35 TGGGCATTGCCTATATTCAACAGTTCCTCCTGCTTTCGTTCTTTGTATACCCTTTCAATGGTTACACACCTTCCAAGGACATGTGGTTTGTGGAAAACCTA:1 - chr2L 18231747 3' - 1731 4313 2 76.24 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGTGCTAGTTACGCGAAGCGCGCAGTT:1 - chr3R 30655358 3' - roo 8716 2 77.23 AGGATCAATAGCCGAGTCGCTCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCGTTCTGTTGGTCGGCTGTCTTTCTATCCGCTTGTTGCCTTCAGCTGGCGTATT:1 + chr2R 9780016 3' + INE-1 96 1 67.33 GTGGTTGTTGATCTGCTTTTCATAAAACCGTGTGGTTGGTTGTTATTTATTCCAATAATAAATACTCATTCGAGCCGGAATGAAATTTGCAATCGAGAGTA:1 - chr3L 9460696 3' - Q-element 221 2 72.28 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGTAAGTGCTTACTATAAATGTTAAATCAAATGATTTT:1 - chr2L 436883 3' + roo 9033 1 62.38 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACAATGTATTTGGAAAACAATCA:1 + chr3L 24766009 3' + 1360 3386 2 76.24 CTTTTCCCTTTTTTTTTTGTCTGGCACATTAGCGACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGGGTTGTTGTAAT:1 - chrX 7480766 3' - Bica 338 1 62.37 AGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCATGCGGAATGCACTATGTGTGTCTCTTCATATTTATATGAAATTATACATTATTATTAATGTAT:1 + chr2L 19626033 3' + P-element 67 1 69.31 CCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGATGCGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATT:1 - chr3L 12364634 3' - I-element 5186 1 57.43 GCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCAACCCCCAACCCGCCCCCATAAACACATGCTCAAACGTCAATAAAAATCAGCCACACACACACAC:1 - chr2R 25116093 3' + hopper 96 1 67.33 CTCTACCCACTAAAATACATTTTTTTTTTAATTATTGCCCCACCTTAGCGCCCTGAATTTCCGCTCATTTCCTCTGCCCACAAAAGCGATTGGCAAATTTG:1 + chr3L 10380307 3' - HB 339 1 63.37 ATACACCATATGTACAATATGTACAATATGTACAATATGTACAATATGTACACAACGCACAATATGCACGATACATTAGTCTGTAATTAATGTCGCATAGT:1 + chrX 20455898 3' + Stalker2 268 2 73.27 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCA:1 + chr3L 27415292 3' - transib2 39 1 63.37 CGCCTCCTTTTAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCATTGATGCACAGAGAATAATTTTACTTTTTATATTGTTCCGGTTAGTGCA:1 - chr3R 26398896 3' - P-element 331 1 58.33 CGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACAACAGCAGCGACGAATGGCCCCATATCCCCACCCCCAGATGCACATGGCCCAGA:1 + chr3L 10871570 3' + Max-element 8474 2 59.41 AAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTAAAGCCAAGAGAAATAGCATTCGTGCCACTTT:1 + chr3R 21603826 3' + Idefix 7104 2 80.20 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTCATTGCTAATTAAGCCAAAGATGGGACAGTATTTTGGAAAGGAGTCAATATGTCAG:3 + chr3L 16449812 3' + roo 9053 2 60.40 GATGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGTCATGAGATCGGGATCCTGCCAGAC:1 - chr3L 14152102 3' + blood 337 2 61.39 AGAGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCCTGAAAGCAGCACTTACCGTGTGACCACTCCCTCGTCCATTTTC:1 + chr3L 11625622 3' - roo 8696 2 57.43 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGACAGCGCTCAGTTGCTGGTCTTGTTTGG:1 + chrX 10629279 3' + P-element 2867 1 59.41 CGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAATTAATGAGAGCCAAAGCGAATTTCGTG:1 + chr3R 20079331 3' - Ivk 308 1 72.28 AGTGAATTCATTCGAATAAGCCTCTTCAAGCAGAGCAGAGCCACCAACCCTGCAGTCCCGAAAGCAAACACATCAGCTGCTCGTTCCCTCTGCC:1 + chr3L 16329126 3' + Stalker3T 280 1 62.77 ATGTTTGCTTTTCCTTTTTCCAAAGCCTTTGCGTGTGCATGTGAGTTTGTGGATGGCAAACTCACACACGTACCACTCCCATTCCCATGCAAACGGTC:1 - chr3L 13730797 3' - Penelope 548 1 67.35 ATCTTAACCTTCTAGCTTTTACAGTTCTGAGATCTCGACATCAACCAGAATAAAATCTTAGTTTTTCTTAAACGTGAATATTTGTGCACTTTGTTGTTATT:1 + chr2L 9968495 3' - INE-1 163 1 61.39 AAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACGGTATAGTTGTGATTTACACCCATTAGTTCTGTACGTTAATGAACTTCCCAAAACA:1 - chrX 10208789 3' + I-element 86 1 64.36 AAGCTTCCAGCGGGGGGAGGATTTTGGGTCATGCAGCCGCCAGAGCTGCAGCTTGCTGAAAACGGCCGATCGGTCCAGATGCAGCCAATGAAGGGGTATC:1 - chr2L 1974331 3' + diver2 4512 1 71.00 TAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCATTTCCTCCTAACCCCTGAGGGCTGATTTTATTACAAAGGCCGTAAAA:1 + chr3R 10973270 3' + I-element 5050 1 56.44 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGCCACGACACTGATTAGATTTATCAGCCAGTCGAGTTGCA:1 + chr2L 17056547 3' - 412 37 2 62.38 AGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTAC:1 + chr3R 1977614 3' + micropia 5403 2 60.40 CGCTTCGGACTCGCATGCTGCACAACAACAGTGAACATCAACACACAAACAAACTGTAGCCAAAGTCAAACCACCAAACCACAATACCGCAATCAGGTAAT:1 + chr3L 10430362 3' + gypsy10 457 1 52.48 GATAACATAACTTTATTTCGGTTGGATATATTTCTTGAAATTATTTTTTGATCTCTTAGGAATTTTTGTTTCTTCCTATTTAATGAAGGATCGTATTTTCC:1 - chr3L 2818426 3' - Chouto 148 1 50.50 GACATGAGCGCATCTTTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGAAATCAGCAAAGCAAATGAAGCGGAACATCCAGTATGGGGCTATGGCACTGATTGGTGGT:1 + chrX 5578664 3' - G2 65 1 65.35 GAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGAAAAAAAAATATATATATGCAACATTTCAAATTGAGCGGCATTATTGGCCCGCCGGCAGTGGCATCAAACTATATA:1 + chrX 8334156 3' + F-element 4660 1 56.44 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTATTTTTAGGCTAAGCCCGACACAAAACACTATATTTTGCCGGACTATAAGTAATGATGTGACGATTTGGCAG:1 - chr2L 12942168 3' - jockey 4677 1 70.30 ATCCAGAGTTATGTTANTTCCAGTAGGTCCAGGGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCTGCAAAGAGTTGAAATTTGAGTTCTTG:1 + chr3L 15350404 3' - gypsy 441 2 53.47 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACCATTCAGCCAAAAGTGTGCCACCAGCTAACATCCAAACAA:1 + chr3R 23080893 3' + 412 7509 2 62.38 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCTAAGTGCTGGGCGTGCGCCGCCAAACAAATCAAATCAGAATTCGGCTTTTTACGGCCCCAACTCCATTTATT:1 - chr3R 20869639 3' - hobo 5 1 74.26 TTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGTGCGAAACACTCGTCGCTGCATCCCTCCTCCAATTCACTGCCTTTTTTCCCGGGAA:1 + chr2R 7855173 3' + X-element 4297 1 54.46 GGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACGAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAGTCTTTGATTTTACTCGTTTCGAATTTTTC:1 + chr3R 27423220 3' + I-element 340 1 70.30 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAATATGCCCAGTAATATCCCACATACCGTGTTTGAAAAATAAATAAATAAATGATTTCTTT:1 + chr2R 18273692 3' - hopper 34 1 60.40 GTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTATAGATCTAACGATGAGTATGCGGAGGATAATCATGGCGGCGGCGGCGATGATGATGT:1 - chr2L 14261086 3' + Cr1a 4116 1 58.00 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGTTATAGCGGTATTGTTAAAGTTCTGCTAGAAGAATGTAAAAGCATGTGATCTTAGTGCTTACTACTGTTGTA:1 - chr2L 7504843 3' - roo 4 2 70.30 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGGCAAAAAACCCGTGGTCATCCAACACCGATCACAGGATGCAGTCAACTATTATGATCATGAAAATG:2 + chr3L 11199908 3' + roo 399 1 69.31 AAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAAACATTTCAAAAATGTCTAAAACTCCATCAAACCGACAACTAA:1 + chrX 9092688 3' + mdg1 309 2 58.42 GATTTGCACGTACGCGTTGATAAGGTCAAGAAGATAAGATGATAAGATTTTTAAACATTAGCAATTTTAGATATTTACTTTACCAAGCAATGCATATGTTA:1 - chr2L 3972966 3' - Ivk 137 1 53.47 ATCACGCGGTCAAACAAAAAGTGAAATCAAAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAACCTATTCAGTTGAGCACTGTATTTGAATATTCTAATGTCTTTGGTT:1 + chr3R 4577555 3' - Tc3 351 1 54.46 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGATTTGTTGTAAGAAAATACGATTT:1 - chr2L 18093826 3' - roo 54 2 79.21 TTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGTACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAGGAAATTGCCTGCAGTTCCTG:1 + chr3R 8914555 3' + roo 9048 2 56.44 CAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTGGCCGCTCTAATGTCTGATAAACAGCTTAAAAAGCTGTTCGAAAGATTTTA:1 + chr2L 22548645 3' + Idefix 455 2 59.41 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATGCATAGAAGAACCAAAAGGTG:1 - chrX 8447154 3' + opus 446 2 81.19 TGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGGAGTTCCAATGCTCCAATGATGGGGCATAATATGGACACACTTGTTTTATACGGCTCCAATATCCAA:1 - chr2R 20533313 3' - Quasimodo 6990 2 77.23 AATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTATTTTCCAACCCACCGTCCCTCTGCAATATCCAAAT:1 + chrX 12800294 3' + invader3 5422 2 66.34 TGTGTTCAGATTAATAGCACTGCCATCGTATACTAATTTTAGTGCACTTTGGGCTAAATTAGTTGCACAGGATGTAGGAGTAGTAGTAGGAGCATGCATCT:2 - chr3R 25239200 3' - HB 1623 1 72.28 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGACTACATTTGAGCAGCCGCAAAGAGCTTGCCCCGAAAAGTAGGCAAGAAAACTCGCATCG:1 - chr2L 10898451 3' - jockey 4686 1 60.40 AGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAAGTCGAACTGGAGCCATCGAGTCAGAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + roo 482 1 34.02 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATTTGAACCAGAAAAGAGATACATCTTCATCTTTAATGCGAAGGAAATTAAAGTAAAAACACCAGAAGGCAAT:1 - chrX 21668208 3' + 412 491 2 76.24 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATTAATATACATAGTTTTAATACCACC:1 - 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hobo 29 1 52.48 GATCCTGATCAAGAATATATATAATTTAGATGGTCGATGGTGGTTCGATCGGTAGCTGTCCCCTGCCATTGCTTCTATAACCGTTAGTGTTATACCCGTTT:1 - chr2R 2045799 3' - INE-1 80 1 63.37 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAATCGACCGGTAAATAAATACTTATCAATCATGGGTAAACTCAC:1 + chr3L 3776536 3' + roo 9038 1 59.41 CTTTTCGCTGACAACCCTAAAAGATTGGCTACGTATTCTGGGCCAAACAACTCTGAACACAAAAAACTGGGGAACACGCAAGGCGAAGACTTCAAGTAAAT:1 - chr2R 21784046 3' + mdg3 322 1 57.43 AAGGACCAAAATGTTGGGATGTAGGGGTATGCAGAGTGGAAAATCGGGTGGAAGGCGGTGACAGTTGGGGGGAAATCGGCAGCCAGCGAGTGGAGCATAAA:1 - chr3R 31629043 3' - GATE 262 1 65.35 GCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGCTGGATGCGGATACGGAGACTGTGGATGCGGTTACGGCGGTGGTCAGGCCGGAGATCATCGATGGCTT:1 + chr2R 7778948 3' - F-element 4486 1 67.37 TCAGAATTGATTTCGGCCAGAAAACCGTCTTCTTACACAATATGAAATTCGTATGACAATCGCCTTGCAATGGGGGCCGCCTTCAGTGGTTTCACTTACCA:1 - chr2L 5609720 3' + 1360 3180 1 64.36 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAGGCTCTTTGAATTTTCTGTAAATAAAATAAATTAAATGGTGGTTCTGAAACAATTTGTGACA:1 + chr2R 17292550 3' + Tabor 469 2 61.39 ATATACATACATACATATATTTAATACATGTGTGCGGGGGAAAAAAAAAACAAAACAGAATAAAAGGCACTACTTTTGCAGTTCTTTGCGATTTTTCCTTT:1 - chr2L 13559583 3' - 1731 4409 1 63.37 CGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGAAAAAAAAAATTATTTTTACCAAATCATCTAAAAAAGGTAATGGGTCGTTAGGTTGGGTTGTCAGCTGCAAAAAAC:1 - chrX 6897328 3' - Ivk 2 1 72.28 CACAACCACACACACACACACACACACACACACACACCCGCACACACCCGCACACCCACACACCCAAAATGCACTTGCTGCAGTTAGCCCCATCTCTTTCT:1 + chrX 3558699 3' + gypsy3 419 1 77.23 TATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTGTCTTCCAAATGAACGCGGTTTTCTTTTTCTTGTGC:1 + chr2R 3170140 3' - 297 6514 1 67.33 TGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTATCCAAACTCCTTGACTAGCCATGTCCCATTTAACATTTTATAGCATACTTTTATGGGGCAACAAAC:1 - chr2L 19681064 3' - invader2 251 1 41.58 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCCAAAGAGGTGATTGCCGTTTAAATTACGAAATCA:2 + chr3L 5085063 3' - 412 7093 2 65.35 ATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACAAGGCAACAACTCGCAACGACCCTTTTAGCCATGGA:1 + chr2R 20167310 3' + Quasimodo 7003 2 64.36 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTCAAATTTTCCTTCAAACATTC:1 - chr3L 16755783 3' - pogo 50 1 78.22 GACTATCGCAGCCATGAGTTGTTGTCGTGTTTTGGGGCCCCTTTTAATGGGGCACAATCATGGCACGAACTTACCTCAATCGCATGTGGGAATTCAATTAA:1 + chrX 21092816 3' - S-element 1309 1 62.38 ATAAATTTGTTAAAAAAAAAAACAATGTCGCCCAATTTTATTTGGAACATAATTCTTGATTTTTGGTTTTGCCTTTTTTTTA:1 + chrX 17400220 3' + jockey2 3406 1 67.07 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTGTATT:1 + chr3L 11257425 3' + 1360 3383 2 73.27 CAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGACCGTATATGTGTACATCAAACGCTGATAAGGCAACCGATTCACGCACACCTTCAAGCGCAAACGGTTAAAACCAGC:1 + chr3R 12080110 3' - accord2 7232 1 57.43 GTCGTAGGTAGGGTAGGGCAATGGGAGAACACAAGAAAGCAACGTGAGCAAGTAAAGGAGCAGGATCGCTTCGTCGAGACTATCGGTGTCAATCAGGACAT:1 - chr3R 2744555 3' + Gypsy12A_LTR 1954 1 74.26 TCATTTTGGACCCCATATAATTGATGATAAAGATAATACACCTTAATACACATCAAGTATGCAAAATTCGTGGAACGATACCCAAGTTAATTAATTGGTGT:1 + chr2L 21731623 3' - Circe 7097 1 66.34 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGT:1 + chr3L 14152151 3' - blood 7055 2 69.31 GTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAAC:1 + chr3L 11257394 3' + 1360 26 1 47.52 TATTAAAAACCACGGCTGGCTTGACAAACGGGGGAAAAACAGGGCTACAAGGTGTACTACACGACCAATTCGAATCA:1 + chr2L 19715774 3' - Cr1a 61 1 55.84 TAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTCGGAGTTCCCTTGTTTTTCTTAAAAGAAGAAAAGAAAAATATATGTGA:1 - chr3R 9229962 3' - X-element 41 1 52.48 ATGCCAAAAAAAAGAGAATCTGGCCAAGTGTGCAGTGTATAGATACTAATATGGCCTGCTTTCAAATAAATGTCGCTTAAGTTCCTCGACGCGGATTCTCT:1 + chr3R 2117801 3' - transib3 11 2 77.23 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTTCGAATT:1 - chr3L 9174686 3' - 412 7088 2 59.00 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTAAATTAAGAGTGTCCAAAAAAGCTATTTT:1 - chr3L 10792178 3' + pogo 2061 1 67.33 CCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGATAAGGTGGTGTGTGGAAAGTGGAATTGGGATAGGGATAGGTTGATGG:1 - chrX 2450323 3' - opus 288 2 52.00 CAAATAAAATAAAATAAAAAAAGGGTGTGTCCGCTCGTGGCGCTTGACGCAATTAAAAGTAAATAAGTATTTGTGTTCTGCAATTGCACACGTAATTAATA:1 + chr3L 22768028 3' + F-element 88 1 74.26 ACTCCCTTTGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCAGTTGCTGTTACTTCCACACCATCCATCTAAGGCCCTAGCCATTTATTCATTAATTCCAAGTCCTGCGA:1 - chr3R 16670469 3' - I-element 476 1 52.48 CGCTCAGACAGGGCAACGCATACAATTCCATATACATACTTATAAACATACTCATACTTTTAAATGTGCTTTAATTTTTAAAATTATAGGTTTAGTTAGAT:1 + chr3R 20105840 3' + ZAM 168 2 59.41 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATAGATTATATTATTTGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATACATAAAAAATTTTACAAT:1 + chr3L 27864787 3' + roo 396 1 67.33 TTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAATGTATGTGATGGCTTATCAGACACCGGCAGCAAATCGTACCTCAATTAACCCATTAACGACCCTTCCCTGTGCGG:1 - chr3R 24023280 3' - roo 8663 1 76.00 TCTCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAATGGGGTCCACCGTCTGAGACCTGGGCAGCAGTTGTTGCAATTACAACTGGACACCACATGCTACAG:1 + chr2L 14370415 3' + Q-element 119 2 77.23 GTTAACTACTCCCCCCTCAAGTTTATGACCGTCCTCGGTCATGTTGAAAGTGTCGATGGTGCGCTGTATCTCCTTCAGTGCCGTTTTTATGCACAGA:1 - chr2R 19620620 3' - gypsy 6973 1 75.26 GAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCAGTATTACGATGAATCAAGATTGCTTTCCCGATTACCGCCCACTAAGCGGTAGTTTCAA:1 - chr2R 6506220 3' - pogo 1903 1 62.38 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTC:3 - chr2R 19209468 3' - Doc 66 1 50.50 ACCAAATTATCCCTGAACTTTCCGTGTGCAGCTGATAAGGGTTGCATCTCGTATACTATATTCCAGATGCATAATACTGCATTTAATATGACTTTAAATTA:1 - chr3R 21152830 3' - Gypsy12A_LTR 161 1 82.18 ATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACGGTCTGGTCGATCCCAAATCGCTGAA:1 + chrX 17259818 3' - X-element 4635 1 74.26 GTTCATTTCGTGAAGTCATAAGCACTCTAACGCAAAGAACGCCGTGCTCCATGGCTTCGCAGCTCCGTCTCCATCACCCCGTCCATGATTGTTGTGGCTTA:1 + chr2L 409369 3' - Doc3-element 401 1 59.41 AAAAAAAGGAAAAAGTAAAAAAAGGTGAGAATTTTTATTAAGCATTAAAGATAATTTTAGAACAAACTTATGCATACAGAAAATCCAGGTAGTTTGATCAA:1 - chr2L 19648357 3' + Doc2-element 236 1 88.12 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACACTTTCTGTATTCACAAATTATCTTCCGGCCGTTCAAATTCTACACATCGAGCGC:1 + chr3R 7943930 3' + roo 9046 1 54.46 TAATTTGCAATAAATTATTGGAAATTTTGCACCGACGCCCGGGCGGCTACGTCAAACGCTGCCATCGATGCTGACCCCCATCCATCGACCTCTCGTACTTG:1 + chrX 4053182 3' + R1A1-element 141 1 76.24 TTGGATGCCTACCGGTATACCGTACAGTGTCCACTGTGGCAATGCAGGTTTGGATTGCGTCTAAGGTGAGCTCAGCCGAAAACAAATTTTGTAAAAAGCAA:1 - chr3L 13252628 3' + R1-2 3156 1 58.42 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCT:1 - chr2L 11805027 3' + P-element 2843 1 33.66 CTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGGTTCCGAATCTGCTGCCCGTGAAGGAGTACCT:1 - chr3L 16544782 3' - Doc 4462 1 75.25 TCCCGGTGAGCGTTCAAGGACTGAAGAGCACACGGAGGTTTTTGTTTTACTATAGTAGGCAGCCAAAATCGGAAAATTCTCGCCCTTAACAACCTGCCATA:1 + chr2L 17645211 3' + Rt1b 5000 1 52.48 GTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTTTTTTTTAATTTGAAGAGTATTTCTCAAAACCTTCTCGCATGAACGTTTATGCAAAT:1 - chr2R 22127676 3' - pogo 6 1 66.32 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATATATTTCACTTTCACTTTGTTGACTGCTTCATAA:1 + chrX 11463689 3' + flea 222 2 66.34 GGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAACTCCTAGAAGTGGAAATGCCGACGGTTACACAGGAT:1 + chrX 4511668 3' + I-element 343 1 75.25 AGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATAATGACAACATCTCGAAATATATATTAATTTGAAAG:1 + chr2L 19990151 3' - Burdock 6173 2 69.70 ATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATCTTGAAATAAACAGTTATCATATTTTTAATTTCAATCTATGGAAACATAAGTAAAT:1 + chr2L 16391931 3' + 1360 497 1 70.30 AGTTTTATTTTGGCAAAACTAAAACTAAAAAAAAACAAGTACCCCTTTTTGTTTTGATGCTTTGGCATATAGATAAATTTTCCTCTGCAGGAAAAGCGTTT:1 - chr2L 4035146 3' + 17.6 7333 2 66.34 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACAAAATCATTGACTTACTTCTTGGGGATGCAAATTTAAACATGGATTTTCGTTT:1 - chrX 12954163 3' - pogo 20 1 57.43 AAGCTATACTTCGGATGCTGGTCGGCATGTAATCTTTGATATTTAGGAGATGTTAGTATTTTGCTAAAGTACACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGC:1 - chrY 3648939 3' + Chouto 52 1 77.23 TGCATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTACCTTCTAGCTAATGTGTCGACGTTCATACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAA:1 + chr2L 21738001 3' - INE-1 173 1 76.24 ATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATATCTGAAAATGTGGGCAAAGGCAAGGAGCATACAAGGGAAAATGCAAAATGCCGGGGCTCGCCTATTG:1 - chr3L 13264430 3' + Burdock 250 2 74.26 TTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACCCACTTATAGTATTAACTTATAACCCTTGGTTTCGATCGCTCTCC:1 - chr2L 16456769 3' + BS 5059 1 55.45 CCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGAAAAGAAAAGATAAATAAAATAAAACCGAAAACCAACCAACTGGGTTTCAATATGTTCTAAATTCACAGCGGAAAAA:1 + chr3R 22580414 3' - Doc 6 1 74.26 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTTTCAAATTGTTTTCCAACCTGGAATTTTCCAAACAGTGCAATATTCGAGCAG:1 - chr2R 22521801 3' + roo 388 2 58.00 ATGTTGAGGTCTGGACTTTAAAGTGGCTAAAGTTTAACAACTTTTACCTTTCAGGTAAGAAAGCATGTCATGGATTTTAGCATTTAAGACCCGAAACATAC:1 - chr2L 23174015 3' - Tc1-2 1164 1 72.28 ATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCATTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATA:1 + chr3L 7319825 3' - 1360 477 1 70.30 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTAACATAATATAATTGCGAATTAGTGCGACCCACCTGCTCCCGCACAAGATCGTCC:1 - chrX 13031799 3' + flea 239 2 64.36 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATAAAAAAAAATAATTAATTTGGTAGGCACCTCGTCTGAAAGTAC:1 + chr3L 19927564 3' + jockey 4965 1 65.35 CAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATAGATTTATATAAAAGTGACACACTCATGGTAAAATCTTGTTAGAGACATTTAATCGTATATATTTATGT:1 - chr3R 31371702 3' + opus 498 1 77.23 TATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGCATATATTTTCTGTTTATTTTTGAAGCTAT:1 + chrX 12151664 3' - diver 44 2 71.00 AGTCTTTAATGTTTGTAATTTGTAATGAATCAGTAAGGCACGGTCATCGCTTTAGCCATTATAAGCTTCAGCTCGGCAACTGCTACTCTCTACCACCCACC:1 + chr3R 13652026 3' + gypsy7 5095 1 59.41 TTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAATCCGACGAGGAAGGAGGTGCAAGGAAAATGGGTGGCGGTGGAAAGGGGTGAAATTCGTAGCATTCGAC:1 - chr2R 22511437 3' + Doc3-element 4538 1 72.28 CGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAAACGAAACGTCACAAACAAATAAATCTAAGAAAATAG:1 - chr3L 15635080 3' - Max-element 8276 2 65.35 ATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAACTTTTACCTTATCA:1 - chr2R 3293753 3' + 1731 4585 1 64.36 ATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGTTAATAGGTTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCAAAAAA:1 + chrX 1280901 3' + 1360 254 1 55.45 GATATATGCACATACTACACTAGAAATCAGGTTGTTGGATGACATGGGTTAAGGGAAGTCGGCGGAAGGAGACGTTCTTAGCCCACCAACGGCACTGCAAT:1 + chr2L 7971081 3' - blood 7009 1 75.25 AGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCAGCGGTATATGGAATATGCACATACAAAGCATCTTCGACGACATCCCCCCCGC:1 + chr2R 15617577 3' + blood 47 2 61.86 TCTTAATTTTGGCCACAAAAAGGTACCATTTAGCCTATAGTGCACTGCACTGGAAGCTGGCGAGAAAGATGGACGCGGTGCGGTGCATCCAGGAGCGGGCG:1 + chr2L 16235809 3' - Transib-N1_DM 21 1 60.40 CGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCTGTGTGGCCTGTATCTGGATGTTCTCGGGCTTCCGTCACGAATATGGCAAATTCAACA:1 - chr3L 19486355 3' + G2 2721 1 62.38 AGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCTGGGCACGTTGTTTTTGGCCATTGTAAATTACCGGGAAAATGTGAGGCATATGCCTTTCTGAGAAAACACTGACATT:1 - chrX 12853550 3' + aurora-element 4111 1 64.36 GCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATAGTGTGTTAAAAAATCTTATGGTGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTCTCCAAAGGTTATTTTGATACCTGTTG:1 - chr2R 2305680 3' - 1360 60 1 73.27 CCCTAATTAAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGCCCAAGCTCGGTGCAATATAAACCAACTAAAAAGTTTCACGCAGCGCAAACTTTCAGCTT:1 - chrX 14439640 3' + Idefix 7019 2 65.35 ATGCCCTTTACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATCTTTGTATCTTTCATTGGCCATCGCTGGCATCCGCGATCTTCGCCGCTTGTGGCCAT:1 + chrX 12205764 3' + 1360 221 1 59.41 TTCATTTTTCGGCGTCCACAAATCCTACGCACCAGTTTAGATTTAAATTCAGGACTTCACATTCCACATATAGATTCGCCAATATATTAATTTGAATTTAA:1 + chr2L 5374338 3' + invader3 279 1 78.22 ATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCGTCTGT:1 - chrX 19820620 3' - Rt1b 4964 1 67.33 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGCATATATTTTCTGTTTATTTTTGAAGCTATTAACTGGCAGCT:1 + chrX 12151676 3' - diver 33 2 59.41 AGATCATAATTTTTAAAACAATTTTTAATCCAATATTAAAGTCACTGGTCACCGGCTTGTGATCACTGATGGTGTACAGGGGATGGGAC:1 + chrX 16597256 3' + Juan 3775 1 59.55 GAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATCAATGTGACTCTCAGATAAAGGCAAATTAATATCAGCCGTCGCTAAATA:1 + chr2R 2057950 3' - invader3 267 2 51.49 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGCAGAAAGGAG:1 - chr3R 25514112 3' + hopper 1385 1 57.58 GTGCTCTTTGTAAAATATTAAAATCAAAGAAGAGCGGAAATTTAAATTCCTTGATTACTAATTTACAATTAATGTAAAATGTACAAATAGTGGAAAGGCA:1 - chr3R 7564383 3' - TLD2_LTR 111 1 91.00 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCAACGCCACTCGAGTCGAGTGGTCCGGAGTAACGAGGAGTGGACTAATTAATTAGCAGCTAATTTAACGCCTC:1 - chrX 13587898 3' - hobo 5 1 74.26 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTAATCATGGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCT:1 + chrX 16217525 3' - P-element 19 1 56.99 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTTGTATTTCCATTGTTTTAAACCAAATCAAGT:1 + chr3R 27926628 3' - I-element 49 1 74.26 TACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATGTGTCGAGGTCTTTGAATCGCGCGGCATGCAGGTC:1 + chr2L 9460705 3' + Gypsy6A_LTR 247 1 65.35 TGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGAC:1 - chr3R 14049325 3' - transib2 10 1 69.31 AAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATATTTTTTATGCTTCGGCCAAGGCTCACATTTGCT:1 + chr3L 13264530 3' - Burdock 33 2 65.35 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAATTAAAAAATTAATAGCCTTATCCTGGCTGAATAATTGGTTTTAGGTAATA:1 - chr3L 12240926 3' + Juan 4184 1 57.43 CGACGTTCATACAGACAGACGGACAGGGCCAAATATGCTAATTTTGTTGGTAGTGATACCGATAGACGAAACCACTTCCCCGAGAACCCCGATAATTTACG:1 + chr3L 12083619 3' - INE-1 127 1 77.23 CATTACTGGAGCTCCATGGTATCTTCGGAACTAAAATATACATATAGGCAAAATAAAGTACCAGGGGTACAGTAATAGGCGGAAAACTGTACTTTAACTCT:1 - chrX 13639072 3' + Doc3-element 4407 1 68.32 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATGAAAAGAAGGCATGCGTGCGTTTAATTATACGCAATGTTGTTG:1 - chr3L 10035718 3' - jockey 65 1 57.43 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGTTATAGCGGTATTGTTAAAGTTCTGCTAGAAGAATGTAAAAGCA:2 - chr2L 7504871 3' - roo 32 2 62.38 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTGCTAAACTTGTTAAATGCAAGATATTTTTAACAGACCTGATAGGCATCGACAACCAAGCAGAAAAA:2 - 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jockey 4759 1 78.00 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAAGCCAAGTCGGCTTGCTTGGGCTTGGGAAATATTCT:1 + chr3L 18142005 3' - blood 7052 2 66.34 TTTTTTTTTGTTTTGAACATCCTTCACACATCAAAATTTTACGCCGAGTGGGCGGCTTTAATGGGTTAATTATTGTTCTACTTTTTAAGAAATATTATGTC:1 - chr2R 19338692 3' + Tc3 94 1 64.36 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTAATGAGCGTAAAGTCAAGTTGAATAGCCATATAAAATGCGCTGAA:1 + chr2L 19571313 3' + P-element 2854 1 47.52 ACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTTTTATTATGTGTGCTTAGTTTGATACCACGGTTCTGTGGATCTGGGGCTTATCT:1 + chr3R 13846221 3' - rooA 302 2 51.49 AAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATATTCTCGATATAGATATTTTTGACCATATCCTGTTTGGAACGGAAGCTATATTGGGCTAAGTCCAAGTCGT:1 + chr2R 16631743 3' - 1360 373 1 64.36 AAAATAGCAATATACAAGACGATAATAAAACCAATATGAACGTATGGAATAGAACTCTGGGTCCAGCTTTCGGCAGCAACCTTTTGCAAAATGGATTGGGT:1 + chr3R 30280035 3' + Porto1 4233 1 58.42 TGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAAATCAATCTGATGAGTAATGCAGTTGACACCTTTTTCGCTGCATACTTTTGGGC:1 + chrX 19640832 3' + BS 5069 1 48.51 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGATTTCCTTGCAAAATTGAATGCGAAAGGCGAGATCAAATCCTTATGCCCTTTGTGGAA:1 + chr3L 18731717 3' - jockey 4778 1 59.41 TAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAGACAAATGGCTAGGAGTTCAAGTGCACTTATT:1 - chr3L 9767653 3' + hobo 2466 1 74.26 AGAGGGTCGAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAAGGAAAGACCACTGCCCGAGAAGCGGGAAAACTCCGTGCAAACGGAGAGCACGATACCCACGG:1 - chrX 21114087 3' + Quasimodo 7069 2 62.38 TGTGGGACACCGGTTGTGACTCGGAGAATACAAGATAAAGAATTTATAAAGAGGACTTGTTGCTTCTAACTCTTTTGCTTTTACTCAGGATATTT:1 - chr3L 3845481 3' - Q-element 473 2 66.32 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATAATATAATATGAAATTATTTATCTCCGCTTCACGCACTTCACTTGACCTAACCATCTCTGA:1 + chr3R 7212530 3' + blood 7375 2 64.36 CCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTAAGCAGCTTAGGGTCCTAAATCACTTGGCCAAACGAGCCGCGATGGGCTCGAACGTTTCTA:1 - chrX 18452309 3' - Doc 4566 1 66.34 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATGAATACAAAAACACCTAATGGGTTCAGCTCCAGCTGCG:1 + chr2L 7504934 3' + roo 9034 1 66.34 TTTTGGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAATAGAGTAATTGAGAAATTCCAAGGAGGGACAATATTCACAACATTGTACTTAACCAACCAACCAATATTCA:1 + chr2R 4613310 3' - 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Tabor 52 2 74.26 TCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGACCGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGTCGTGCATGCGAATGTTGTTCTTGA:1 - chr3L 6200772 3' + R2-element 424 1 71.74 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGATGTGGCGTGGTGCGTTGCTTTTTGCGCCTTTGCGGCTCGGAAATTGTTTGCTGCG:1 + chr3R 17508176 3' - jockey 30 1 55.45 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGAAACTCATATTAATGTTTAAATTATCTTTTAAATTTCAGTT:1 - chr2L 17887147 3' + hobo 2904 1 59.41 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCTGGCCAGGTGTTTCTGGGAAATTAAGAGAAAATGTCACGCGAATGATACCACTTCG:1 - chr2L 19629610 3' + hobo 2919 1 59.41 TATCCATGAGCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAAAACAACATTCACTTGTCATATGCAGTTGGCTTAAGTAGAATCCACCATCCAGGTCCACTCGTCCGAC:1 - chrX 1336830 3' + Quasimodo 7139 4 71.29 GGGGCCGGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATTGTTTTTGTCGACTTCCTAGAG:1 - chr2R 6041578 3' - opus 49 4 77.23 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATCGATGAATCCACCCTAACACAACATCAATGTGT:1 - chr3R 17846882 3' + roo 9030 1 65.35 TGATAACATACATACATACATACGTACATAAAATACAAAAACTCGATTCGAAACGAGACTCAACGAAATCCGTTGGCATTGTTCCGTCTATTTGTCCAGCA:1 - 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roo 8813 2 58.42 GATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAAACCTAGTAAAATGTACGTTTTTTATATTTATGAGAAGATTAACTTATA:1 - chr2R 5295925 3' + Doc4-element 2609 1 52.48 TGTTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCTGTTAAGCTAAACCCTGCCCCCAACTTTTTTCGCAACTAAAATTTTTGTTTTCGCAATTGTGG:1 + chr2R 23117785 3' - gypsy4 6662 2 66.34 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACAACGTTCGACATCTGCTCTATCGTCTAGGTTCGCAAATTTCG:1 - chr2R 18036618 3' - blood 34 2 58.42 GCACCGAGAGCATCGGCCTCCAGTAATCCGCCAACTATCAGTGGAGATGAACGCCTTGCACGGATACACTGAGAAAAATGTAGTAATGTTCTTCATTTTCG:1 + chr3L 20586178 3' + invader4 452 1 73.27 GACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCCGTCTTCGCTGTCGTGCCATTCGCTTTTGGTGTGGAGGCCATTTT:1 + chr3L 14513230 3' - F-element 177 1 55.45 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTCATTTATTGTCTTCTCCAAAAAGTAGATCGTGA:1 - chr3L 25411856 3' - 1360 57 1 71.29 ATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGTACAATAATATGAAACCATGAACAATAGGTATGATTTATGTCGATTA:1 + chr3R 21299195 3' + Stalker2 7474 2 60.40 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTTTGAATTGATTTTCTTTTCAAATCCGTTTGTGTGCCATTATGCAAAGTTTGCATTTGTTTG:1 + chr3R 31243393 3' - 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chr4 158192 3' - 1360 3227 1 72.28 GTTTTGGTGTTCCTTATGTATGCTCTTTCACAATATATATTTATCTTGATCCTGGCTGTATTACTTCTTTTTCCGTAGTCGAAGGGCAGCACTGTTGCCAT:1 + chrX 3779741 3' - transib3 89 1 60.40 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTTCAACCAAGAATGACAACAACAAAGCAAACA:1 - chrX 10210927 3' - I-element 14 1 67.33 ACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGTTAACCACCTTCGTCATCTTCGCACGATGACAATTCACTAA:1 + chr3L 14152191 3' - blood 7015 2 75.25 GATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAACTTTTACCTTATCAATCGA:1 - chr2R 3293748 3' + 1731 4590 1 59.41 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTAGCCCTACGTTACGTAGCGCCCGCTACGTTAGTGCGAGGAAATGAGAGC:1 + chr3R 28330921 3' + P-element 2859 1 51.49 GCACGCACACACACACACACACGAACACCATGCCCCATCTTTGGAAACCGCGTCGCTGTTGCACGTAATCTGCCTTAAGGCGATCGTGCATGGGG:1 - chr3R 8459770 3' + accord 7025 2 75.79 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGGTGCCATAATTTATGCCCAGACTAAGTGCATTATGTTTGGCACACGGGCTTTTAGTTACGCTGC:1 + chr3R 22276937 3' - hobo 10 1 69.31 GAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTTATTGCCAGCTTTTATTTTATGCTTTTGATTTATCGTGCGGCTTTT:1 + chr2R 13536905 3' - Doc 277 1 54.46 CACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACCAGTTACTCTGAAATATCACTTGAGTAA:1 - chr3R 30213930 3' - opus 7485 2 68.54 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTAGGCTGCTTGCAACTTTCTGTGGCACACACACACACGCGCGCTCATTGCCTGTTTGCTGCGTAT:1 - chr2R 20996410 3' + P-element 2876 1 68.32 GTGGTGTCGTCTAAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGCAGAGAAAGTGAATGTTTAACGAATGCGCCGGCGAGCAAGAACACGGGAATGCA:1 + chrX 15287000 3' - BS 4857 1 59.00 CGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTCTCTCCCTTTTTCTGGCTTTATCCTTCTGCCTCACGAAGTCAT:1 + chr2R 9519240 3' + blood 7150 2 68.32 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGTACGACTTCAACCGAGGTGCGTCGTTCCGACAAATTGCCGTGGAATACAAAAG:1 + chr2L 22100649 3' - jockey 4732 1 60.00 ACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCCATTTTCAAGATCCACCACCAGAAGAC:1 - chrX 11324935 3' + 1360 3262 1 73.27 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAAACTGCCTTTCGTTGCTGGACATTTTTAATAATACATAATATA:1 - chr3L 10554765 3' + roo 9042 1 55.45 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGTAGCTCCTCTGCCGAAGTCGCTGCCTCTGTCGCGGCGCGTTTTCCTCTG:1 + chrX 409660 3' - P-element 26 1 51.49 TGAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACAGTGGTTAATATTAATTACAGAAATAATCTGTAAAAAATCATTGCA:1 + chr2L 4888797 3' - BS 5024 1 53.47 TCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCAGCAGGAAATCTGCAAGGATCAGGCCACCGAAGTTGTAAATACTCTCATGGCACTAAGGCTTTCTGAATGAGAAGTG:1 - chr3L 10740965 3' + F-element 347 1 84.16 CTGACTGACTGATCTCTTCTTCACAAAATCAAGTATTATGCTATACACGTAGTTTTATTTCGTTTATTTGCGGGGAAGATTCAATGTCGACTTTATCAAAT:1 + chr2R 6621830 3' - invader1 3899 2 76.24 CAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCTTATCAAGGAGGTGTATTCTTCTTAACTATACATTTTCCAACAGACTATCCCTTTAAACCACC:1 - chr3R 14733810 3' + I-element 4977 1 66.34 CACAGGAGCGCAGAATACGCGCCTAATTCATCTACACGTACACCAACAACAACTTCCGCCTATCGGATTCGGAAATGCCCGTTCGGGGGGTATAAAAGCGG:1 + chr3L 749362 3' + Porto1 397 1 58.42 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTAAGATTTGATTTACAGCAGCGGTCAAAATTATTATTTCGTTGAAGAACGTTGAAATCACCAT:1 + chr2R 8537934 3' + flea 245 2 69.31 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGATATGATACTCGTGCCATTTGCCAGGGTGCTGGTAGGTTTCATTCATCTGGAATGATAATAGAGTGATTT:1 + chr3L 21622286 3' - jockey 4762 1 74.26 ATACCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATTCGCTAGACCATCCTTAACAATTTATAGAGACCAAATGCAG:1 - chr2R 7169543 3' - FB 35 1 61.00 GAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAACACGAAAA:1 - chrX 10119545 3' + FB 22 1 65.00 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACAGCCAATTGGGTGCACTTACAGGTTGCGCGTACTTCGCGTTGCTTAACTTGACTTTAGT:1 + chr3L 27728969 3' + P-element 2870 1 62.38 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATAGCATTTCTTGTAATCAATGCTGTAAACACTTATTT:1 - chr3R 15714148 3' + jockey 4943 1 70.30 AAGAGAGATTCGAAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAATAAAAACTACAGGCAAATGAGTTAGTATGCTAAGAAATTTAATGGTAATATCCAAT:1 + chrX 13244626 3' + Bica 297 1 55.10 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGACTTAAAATTTATCTTGCAAATATATTAACACCCGCCATGGCGATGTGTCAAAA:1 - chr2R 13095680 3' - Doc 32 1 75.25 CACGACAGAGCTAATTCCCGTTGCCCTTCGATTAATCACTTCGAACGCATAAATAATTCACGCTGAGCCATTGCCATGCAAATTGCATTTGGATACAGGAT:1 - chr2R 10345328 3' + diver 427 1 69.31 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCATGCATTTTCCATGTGAAACAGCTTACTTCAAAGAA:1 + chr3R 20868786 3' - Transpac 37 2 62.38 TAAATTTCTATCGATTTGCAAAAAACTTTTTCCCTAAAAAAGCTTTTTGGTTATAGAGGGGAATGTGGCGGAGGACTGCAATTCTTGATGTAGTTACAACG:1 + chr2L 22000752 3' + INE-1 307 1 71.29 ATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAATTGGCGATGCTGAAGCAAAGACCAATTTATTAACAACAAACTAATAAGGAAAAC:1 + chrX 5403901 3' + Juan 100 1 63.37 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATATATTTTAATTGAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAGGCTC:1 - chr2R 19209460 3' - Doc 47 1 58.89 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCC:2 - chr2R 19209467 3' - Doc 65 1 49.50 GGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGCTATGGAAGCTAAGGCACTATATTCTATTCCATAAGTTGGGTATATA:1 - chr3L 6726977 3' - I-element 211 1 53.47 CTATTTTTAGGCTTTGCATACTATTGCTATTGGTGGTGGTGTGCTGCTTGATCCGGTAGAAGATGTTAAGACGTGGTCTCTTCTGCCCACCGCACGTTGTA:1 + chr2R 11623701 3' - G2 261 1 79.21 TAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGCTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGAGAGGCAACAACTGTGCACAAATTTGCGCTAAA:1 - chrX 12123647 3' - accord 7125 2 66.34 TATTCCTCTTTTCTTATGCTCTCTGAAGTGTGTGTGGGTGTGTGTGTGGGTGTGTAAGTGTGGGAGTGTGAGTTTATGCGAGAATTTTATTCGTCGCTATC:1 - 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chr3L 4255282 3' - Cr1a 4118 1 56.44 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTCTTTGTTGCACTTGGATCAGTTCAACGCACTGAATAATTA:1 + chr2L 16818852 3' + pogo 2068 1 61.39 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTTATATGAACTGGGT:1 - chrX 4056258 3' - roo 8689 2 54.46 TGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTAGGTGTAAGTGAGTGCGTGACGCCTCGAAGGTGCCGCTAACGATGCCCCAAGCGGAATGCCGA:1 + chrX 992252 3' - I-element 4974 1 68.32 AGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACAACATAAAATTCATTTTCCACAAGCAGAAAATTAATAATCTTTAAATGAATTT:1 - chr3L 6507322 3' + I-element 4920 1 55.45 ACACACACACACACTCACACATATTTGAAATTGTAATTAAACCCACCTTAATCAAGTGCTCCATGGCCGTGGAGGGGCG:1 + chrX 9933266 3' + accord 191 2 75.95 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGTCGATGATGAAATCGGATGCCATACGCTCCGGGCGGCTGGTAAGCT:1 + chr2R 18036688 3' + blood 7360 2 53.47 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTTGGTAGGTGCCAAAACAAAAATCCGTTCAATTAAATATATATAGAAGCCTATT:1 - chr3R 11073711 3' + pogo 2081 1 59.41 CCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTA:1 - 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gtwin 6932 2 63.37 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTCGACTCGAGACGCA:1 - chr3R 10978692 3' + roo 9045 1 55.45 CTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACTTTACATTATTAACTTTCACTTTAATATAAGTGTGTATAATGTTCTAGCATTGAG:1 + chr2R 6521349 3' + F-element 4214 1 65.35 ATCACATTAAAAATGGGCGTCCTCGTCCATGTCTATGTTATCAAGGATTTGCGTTGTCGACATCGAGGCTCCACTTTGCCACATTTTAAATGTATTCGAAT:1 - chr2R 8669244 3' - Chouto 6305 1 78.22 TCAAACTCGGCTGATCTGTATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTATAATAAAAATAGCATTAATTGATTACAAATTGCTTGGTGAGACGGA:1 + chr3L 16644782 3' + Quasimodo 7121 2 55.45 CATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAATAGTAAAACTCGTTGTCGCCAAAGCTGGAAGACAGTGGATAGGATCCATATAGTTTTTG:1 + chr3R 6987000 3' + F-element 466 1 64.36 GATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAGGAGTAGGGATTTAACAGAAAATTTTGGTTTTATTATGGCAAGATTTAAAATGAATG:1 + chr3L 3477454 3' + jockey 4889 1 59.00 AAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGGTGCCGACGACCGCGTGAATCGATTT:1 - 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chr3L 20856343 3' - Cr1a 4244 1 78.22 CAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGCGAAACAAAAAAAAAAAGGGG:1 - chr3R 26759755 3' + Cr1a 4413 1 88.41 AACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAGTGCCGCCAAAGTGCCGTCCTGGGACGGGCAAATCGTATATAAAATTAATTTAAAACACGCCACAAT:1 - chr2L 17174304 3' + 1360 16 1 63.37 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCGCTTAGTATCTGTATCTGTGTGAGTGACTGATCAAGGCAGCGCAGTCGGCGTCGCCCGTTAAAAAAGC:1 - chr3R 18448912 3' - hobo 7 1 72.28 TCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACGCACACACACACACAAGTGTCACTTAAATGTTAGCTATGGAAATGGCTTAATGGAGATTTTCTAAATA:1 + chrX 5372168 3' + accord 7000 2 56.44 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGTTGGTGGTGATTTCCTTGCAAAATTGAATG:1 + chr3L 18731680 3' - jockey 4815 1 79.21 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGGCAAAAAACCCGTGGTCATCCAACACCGATCACAGGATGCAGTCAACTATTATG:1 + chr3L 11199896 3' + roo 387 2 57.43 TGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAACGAGGCATCTGTATCTGCATTAGTATCTAAAGGCCTTTGGAGCCTGGCCGCCAGTCGGCGTTGGA:1 - chr2R 19898189 3' + S-element 351 1 72.28 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATACTTGTGTTTGTTTCTATGACAGTTTCTTCACAGCTTTCGATTTTCTTATG:1 + chr3L 11844426 3' + Burdock 6369 2 57.43 GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGCCAGTGAAGGGTTAAAGATGCCGACATTATAATTCAACATTGGCA:1 - chr2R 17269713 3' + transib2 2795 1 52.48 CAGAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATATACATGCATTGCTTGTGTGCTCCGATTAGATATTATCTCACTCAACCA:1 + chr3R 2476379 3' - S2 28 1 78.22 CTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAGGAAATAGATGGTCAGAAAA:1 - chr3R 28136018 3' - Max-element 275 2 60.78 CCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATAAGTTTCACACCTAATTGCTATTCGGAGGCCGTACTGTAGTTG:1 + chrX 7707058 3' + invader2 5069 2 64.36 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTATTTTTAGGCTAAGCCCGACACAAAACACTATATTTTGCCAGACTATAAGTAATGATGTGACGATTTGGCAGCAAC:1 - chr2L 12942164 3' - jockey 4673 1 72.28 AGCAGTGAGGCATCACAACTATCCAACTATGTCAGTATTATATTATTTTGAAAGAAATTGAATTATAAGGTATGCACACTTCATTACCATAATGAAAATTA:1 - chr3L 8712509 3' + diver 221 1 57.43 ATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTGGCGGAGTGGGAGGATCAGGGGGCGTGGCAGCTGAAAGTGCGCTTTT:1 + chr3R 13474064 3' - Juan 4167 1 52.22 TTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTATTTTCCAACCCACCGTCCCTCTGCAATCTCCAAATGCATTTTCTAGCCAAATT:1 + chrX 12800312 3' + invader3 5440 2 53.47 CTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGGGGGTTGAACCGGAAAAGGGCAAAGGCGACAAGGACACCTGGTGGCTTTCCGTTCGT:1 + chr3R 14086161 3' - roo 8853 2 57.83 GGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGACATGGGCGAATTCACGAACTGCGGCTGTCGTTTGGGCTCAAAGGTGCTCAGTTGCGGGAAGAG:1 - chrX 6581492 3' - I-element 5108 1 70.41 ATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCCAACAAATGCAGATGCTGCCCCAGCAGTTCACCATCTCCCAGCAGCCGCAGCAGCAGC:1 + chr3R 29098369 3' + Doc 4451 1 60.40 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTCATTGCTAATTAAGCCAAAGATGGGACA:1 + chr3L 16449784 3' + roo 9029 1 72.16 ACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTACCGTGGTGCCTGTGGTTGGTACCAATATTGCGGGTAGAGCAGAGGACAGCAGCAGATGGAAGCTGGA:1 - chr3L 26132132 3' + R1A1-element 4967 1 73.27 GGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGGTATACCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTACTCACAACACTGACAACACACCACAATCCACTATTCC:1 + chr3L 14065378 3' - Bica 423 1 61.39 CCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACT:1 - chrX 21852438 3' + gtwin 7376 2 68.32 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATATATGTAGATATGTATGTGTAGTGTGTATCTCGCAGATGCGTGGTAATCAAAATGATGATGTGAAAA:1 - chr2R 11400305 3' + 1360 3380 2 48.51 CGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTAAGATTAAAGGGCCAAGATCAGCTGGATCAGACCTTCGCATGGGATGTAAATAATCTGGTGGGTGTGGAACAAAGT:1 + chr2L 17176147 3' + flea 4803 2 74.26 CACCAGCAAAGTTAAAAAAAAACATAACCAGCAAAGTTAATAAAAGTTAAACAAAAGAAAAGGCCGTGGAAATGGCAGCAAATGAAAAAGGTGGGAAAATT:1 + chr3R 9085742 3' + TAHRE 10434 1 50.50 TTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGG:2 + chr3R 1977610 3' + micropia 414 2 64.36 AAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGACCGGTTGGGCGGTTTGAGTGGGCGTGGCAAAATTTACAAGACTAATACATATGTGAACAAATATCAACACATTT:1 - chr2R 5466809 3' - INE-1 255 1 55.56 CGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAACAAAAGTCATGACTGTAGAGTCCAAAGAAAGAGCAAAGGAAACAAACACAAAGCTACGATTGTCGAGGGTT:1 + chr3L 1661056 3' + 1360 477 1 76.24 GAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTTTCATTTCTCGCT:1 - chr3L 5267190 3' - Juan 3976 1 72.28 TCGATGCATTGCTTATATCCATTTTTTTTGTGGCCCCGGCTTTTCACAGTTTTATTTGGGTTTTCCGTTTTTGCTCGGTTCTCATTCCTATGTTTTTTTTG:1 - chrX 17986866 3' - invader2 309 1 78.22 AACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACATTGCAATGTCTTCTGTGGTGTGTGTCGTTTAATGCGTGGCCGCCTCGCACGGCGCTTTATTAAT:1 - chr3R 18026891 3' + mdg1 7444 2 63.37 TGCTCATCTCCCAAGCGAATGACAAGAAATGGGCGGTGGTTGTTGAGGCAGTGCCTCTAACATCAAAAGCAGGAGTGGCAGCGTTTGATGTTGATTAGAGC:1 + chr3R 15714240 3' - jockey 6 1 76.24 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGAGTCCCGGGGCCTTCCATCATCCAGCTTCCACTACGGTCCACTGGCTCCAGCAAGAAGTTCCCCG:1 + chrX 18293713 3' - jockey 4776 1 72.00 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATTTGAAACAGAAAAGAGATACATCTTCATCTTTAATGCGAAGGAAATTAAAGTAAAAA:1 - chrX 21668222 3' + 412 478 2 61.00 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTCAAAGTTCCTCAAAGGACATGCCAAGCATG:1 - chr2L 7767137 3' - hobo 47 1 68.32 GGCGAGTATCCTGTGGTCTCCGCCACACTTGCCCAGCATGACGCATTCATTCATCTGCAGAGCTGCTCCTTCGATGAGGAATACTATCCTCTGTCCACTTG:1 + chr2L 4132553 3' - Osvaldo 1070 1 75.25 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGCCAAGCGGCCACGAGAGGACAACGAGGCTACTTCGGATACGGACTCGGCTAG:1 - chrX 20330481 3' + P-element 2876 1 60.44 TAAGTGGGATTCTCAACTTAACCCTTACCCCAACTCTAATCATATTTTAATCTTTCAAAGTGGTATCGCACACATATGGAAATGAGTCCACATGTGTGGTA:1 + chrX 20331876 3' + springer 447 1 79.21 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCCACTTTTAATGTGGTGAGGTAGGA:1 + chr2L 11805061 3' - P-element 51 1 29.70 CCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACCCCCTCTCCGTTCTGTAAACACATGTTGGTTGGACTTTATTATCCACCGGGCTA:1 + chr2L 2486476 3' - invader2 165 2 56.10 ATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTATAATGATAAAGGGTTCCGAAAAGAGAGTTCACTTTACAAGCTGTAAAAGAGACGAGCAAAAGAGAAT:1 - chr3L 25731356 3' + INE-1 139 1 63.37 AAAAATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCGTTTTCACATGTTTTTATGCACTCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACAT:1 - chr3R 9952239 3' + Transib5 2857 1 56.44 TTACAAAAAACAAATGAAATTCATGAAGCTGTGGCCGCGTCAGGTTTAAAAAGAAAGCGTCAAAGAAAGGTAAGATGGGATTATTATTGATATGTATCTCA:1 + chr2L 19798259 3' + pogo 475 1 67.33 CATTAACTGGCGCCCAACGTGGGGGGTTGGCACTCAAAAACTGGCGGAGATCGAGACAGGTCGCCAAGCCAAGTCCGCCAGCCTCCCGATCCCGGGCTT:1 + chr2L 7373594 3' + gtwin 488 1 68.69 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTAGAAATATTTCAAATATTACTCATATCACATGTTGGACAGAGATCCGCCCGTTTTC:1 + chr3L 10864987 3' - jockey 4787 1 59.41 ATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGACAAAGGTGAGTCCTGCGCCTCAGCTCGTATATCTTTCAGATTTTGATTCCTTATTTGCCTATTC:1 - chr3L 12416216 3' + Doc 4473 1 69.31 CACACACACACACACACATGTTTTGTTTCGGGTCAGCGGCAAATATTTCAACAATCATTTGCACTCGTTTAAAGAACCCATTCAGCGAAGTGGGCGCGATT:1 + chrX 13507337 3' + accord 184 2 82.18 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTGATGTTATTTCATCATGCCTCGGGGAATCTCAAAAAGC:1 - chr2L 852854 3' + P-element 2828 1 22.77 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCCACGTACATGCGTACATATGTAAGTAAAAATGTC:1 + chr2R 5651920 3' - Tirant 13 2 66.34 CCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACAACTACAACGACAGCAACAGCAACAGCAACAGCAACAACAACAACAACTCGAACAACTGTCAATGCGCATG:1 - chr2R 18246566 3' + I-element 4918 1 62.38 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCTTTTGGTATGGCCGTTCAGCTCGACTACTCTTAACATTACCTTTGA:1 + chr3L 19933717 3' + roo 9043 1 56.44 GGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTACATAAAACCCAAAGAAAAAAAACCTCAACAACAGCACGCTATATTAACGGGGCCAACGAGC:1 - chrX 11393019 3' + F-element 64 1 57.43 AAAAAAACGTATGGCGTTACGCATCTTGATATTCTATTGTCTTTAGATGGAGGCGGAGTGAGTAGTAAACTTGTAACAACATCCTTATGCGATAACAAGCA:1 - chr2R 15433380 3' - 1360 24 1 54.46 ACCACGGGTTGAACAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGCAAACTGATTTGTAACTCGGTCACTGGTGGAAACACTGGTGGGCAGCAGCTTGTGTTGCCCAT:1 + chr3L 8548560 3' + R1A1-element 4942 1 70.30 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAATTGATTTGGCTTACTCCTGCCGACGACGCGAACCTGCAAGACTTGCCATCTTGG:1 - chrX 20113873 3' + P-element 2805 1 61.00 GACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGCCTTGTTTTGCTTTCTACTAATTCGGATTGTTT:1 + chr3R 27993392 3' - transib2 42 1 73.27 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTGCTCTGTGGCCAGCTGTTGGTGTCCCACTTTTCGCCTACGT:1 + chr3L 18095731 3' + I-element 5324 1 58.42 CAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAA:1 - chr3L 17215718 3' - Ivk 30 1 52.48 AAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCTGGCCAGCCTGCGTGGCATATACTCTGGTCGTTCGAGGGCAAGATTATCAATATGA:1 + chrX 3130980 3' - McClintock 51 2 67.33 TATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAGAAAATAATCTGTATACCTCTTCCAATCTAATCTCCCTTGATCTCTACACTCCATGGTATGGAATTTTTGTATGT:1 - chrX 5187512 3' + Ivk 5373 1 72.28 TAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTTGAATAAACCGCTTCAAGCAGATCAACGATATTTGCATACTCCAACAAACTAAAACTAGGGATGCCG:1 - chr3R 13453427 3' + Stalker 307 4 55.45 TCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTAGTTGGACGTAGAATGAAAATGATTGCTTCGGT:1 + chr2R 14603702 3' - I-element 276 1 68.32 AAAAGAAAAAAAAGGGAAAAAGGGAAAAAGGAAGACCCCCAACCACAATGATTAGCAAGCC:1 + chrX 16190777 3' + Doc2-element 229 1 83.61 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATACATGTTTAGACAACCGCTTATTGTTGTCTCCGCTTGTTTCACACTCGCAATAATCATACGCC:1 + chr2R 20396347 3' - blood 9 2 73.27 CCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAAAACCCAACTACCAGTCAGTCAGTCAGTCACAGCAGTTACAGCAACCAACC:1 + chr2R 9522895 3' + G6 1821 1 52.48 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGGAATCGTAGGAATCAACTCATCATTGAACGAAGGTGGATTGAAGGGCTGAAGGATCATAAG:1 + chrX 1252865 3' - hobo 15 1 62.38 TTGGGCTCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACACCAACATACACATACACAGATTGAATAATCGATTTTTTACATTCATTTCCTTTTTCTGAGTT:1 + chr2L 9699053 3' + 1360 3191 1 71.29 CATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATT:1 - chr2R 4260433 3' - micropia 179 2 82.18 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCCACTTTTAATGTGGTGAGG:1 + chr2L 11805056 3' - P-element 56 1 24.75 AGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACCGTAAGCAATTAGAGGAGTCTCCAAGGTCACTGCTAATTCTGTGGCTGAATATGCTTGTGAAT:1 + chr3R 4524133 3' - mdg1 328 2 73.20 TTGGTATAAGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAACCGGATTGTTGTAAGGTGACGACGAGGGCCTGACCAAGCCAACTTCCTGGCT:1 + chr3L 25255067 3' + jockey 4570 1 46.53 TGCACGCAGTTTGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACGCAGTTAGGCCAGCGCACAGGAAATTGTTGCATCGAGTTGGCCATATTATGTAAATCAC:1 - chr3L 5086248 3' + 412 7148 2 50.50 CACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCGGCTCACTAAAACAAACTAAATGGCAGGTTTTCTCCTCTGGGAGGAGCCAACACCTCAACTCGTCC:1 - chr3R 13778316 3' - 1360 3329 1 63.37 TGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTCCTTGGTTTATGCAGAATCAAAAGCCC:1 - chr3R 9818211 3' + hobo 17 1 73.27 CATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAAAATTATTTTATTTTATTCGATGGTTGGCAAGCAATATGTTGCGGGCTTAATGTGCTCCGGAAAA:1 - chr2L 22761620 3' + Doc 174 1 65.35 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACAGCAAATTTAAAAGAACAACAATTAGAAAACGCAATTAAAAGATAAATATACCCGAGTAA:1 - chr3R 31188721 3' - I-element 16 1 63.37 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACAAAATCATTGACTTACTTCTTGGGGATGCAAATTTAAACATGGATTTTCGTTTCAAT:1 - chrX 12954159 3' - pogo 16 1 61.39 AACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATATGTAAAAAATTCAAAAAATGAATATCACTGAAATGCAATGTATTAACTCACTTAGGGAATTA:1 - chr2L 4749943 3' + Quasimodo 7362 2 75.25 CTAAGTAATACAAAGAAAGAAAGCTTAAGATTACCCTATCTCGCACAGATCACGGCCGCCTCCCTTCCCATCAAGTCTCTCTTATCCATTCTTTGTAGCCA:1 + chrX 7356843 3' - Chouto 113 1 59.41 CAGAAGCAGAGTACGTTGCTTTATCCACGGCTGCAAAAGCAAACACACAAGCACACATTCAGAGGGGAGAAGAGAAGGAGAAAAAAACACAAACACTAAAC:1 + chr3R 11947771 3' + Copia1_DM 3963 1 68.32 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGCTCTTTGCTCTGCATGCTTGTTATACGCAACGGCAGGTGGGTGGGTCGCATAGATTTGGGCCTGGCT:1 - chr2R 17688355 3' - jockey 4777 1 71.43 TATAAATACCCTGGCTTTTAATTTGTGGTGTCTCCTCTAGTTTTTTCTTCTGATTATCGGCTGAGTTATTGCTGCAGCCAGAAAGGTCCTTTTATAGCCTG:1 - chr3L 13314961 3' - TAHRE 395 1 60.40 GGCATACGTTTTGGTACAGACTGTACCAAGCTGTGGATATAATCTATTGAAATATCCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAATGTGATATATACTATAGGA:1 + chr3L 17202502 3' - Tc1-2 1317 1 81.19 ATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACAT:2 - chr2R 4260437 3' - micropia 183 2 79.21 CACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGGAATTTTGGGTTGGAGGCGTCATACCTGATTTTAAAACGTTTGCAAATGTT:1 - chr4 188833 3' + F-element 4329 1 56.44 GGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGGTGCCCAGCTGTGGCACGCTTCGGTTCAGAAAAAAGTCTGGCTCCTCAG:1 + chr3L 16497687 3' - accord 7376 2 57.58 GAGCGAGCGCGATAGAAAACGTAGGCACGGTGATTTATCTGGATGAAGCCGACCACGTCGAAACAACATAAAAAATGCGCTCGAATACTTCGCAAAAATGA:1 - chr3L 12354033 3' - diver 359 1 56.44 TAAGATATGATCGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATTA:1 + chr3L 3635475 3' - roo 8705 2 66.34 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACA:1 + chrX 10629248 3' + P-element 2837 1 29.00 GTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGAAGGTGATGTTGTGGTGTGGACTGGCGCAGGACGAGATCCTCGCCCGCGG:1 - chr3R 19169431 3' - accord 6971 2 77.23 ATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAATGAATATAAGCAATTAATTTGTGCGCTTTTCACTCCGAAAAGAGAGAAATTTACTTGGGTTTTTTGTTTTGGCTGT:1 - chrX 14740191 3' + invader2 284 1 65.35 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTCAAAGTTCCTCAAAGGACCTGCCAAGCATGACGCTGC:1 - chr2L 7767130 3' - hobo 40 1 61.39 GGCTTATAGGCCGATACGACTCAGGATCAACTTCTGGTTTTCCCGCTTTTCTATCCTATTTTTTTCCCAGTGATGACCGCCTGAGTCTTGCCGAATTTTCG:1 + chr3R 19688188 3' - Helena 178 1 64.36 CCTCATAATTCACTTATACAAAAGACCGACCGCGTTGGTCCGCCGTATTGATTCCTCGTTAAGCAAAGTGTGCATATTAAGTGCACCCACTTTCCAAGCCA:1 + chr3R 18109810 3' + Tom1 20 1 61.39 AGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAACTTACAGTTCAGAAACTGAGGATCTAAGATATAGGAATATCCGATGGCATTGCGCACCATTCACCTGTGC:1 + chr3R 23274111 3' + invader3 269 2 65.35 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGGCGCATTCGTGCGTTTTATTCCCGGCCAAAACCCGT:1 + chr2L 2624278 3' - hopper 36 1 62.38 GACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTGGCGCTAAATCTACATCCGGAGGCAGCACGACGCCCGACATCAAATACAATA:1 - chr4 390451 3' + McClintock 4 2 51.49 ATGGGTGGTCGGCTTTTCGTTATGCTTCGTTTTTTCCAAATATATATCATTTCCATTTGGTTGCTTTTCATGGAGATATTTGACTTCTCTATCCACCCCAA:1 + chr3L 22121849 3' - Doc 4474 1 73.27 GCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACGTTTGGAAATAGAGTTAATACAAGTACCTGTTTATATATACGTATAGCGCCCATCACTTCCAGTCC:1 - chrX 14985567 3' + Ivk 5052 1 72.45 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAAGGACTTTGTGTGCTATTCGCATTTGGGCGGCGCCTGTTGGTATGCAACA:1 - chr3L 10865630 3' - jockey 4703 1 50.50 TTATTATGTTCGTATATACTACAATACATATAATTTCCATAAGAATAAATTCGAGTAAGAAAAAACATATACGAGCTTAGTCAAATTTACGGCCGTGTCCC:1 - chr3L 13608283 3' - mdg1 7040 2 77.23 TAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGTGCGGAAACATTTTCGAGTTG:1 + chr3L 13779337 3' - transib2 54 1 75.25 GCTGAAATTGGTTGCATTGTCGGTTGTTCAAGCAAAACATACTAGAAATAGATATTTACAAGCAACAATAAGTATAATTCGAATATCGAACAGAACGAAGA:1 + chr2L 14091775 3' + Tc1 434 1 71.29 TAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGCTTCAAGACTTCCCCGTATGCCCTGGTAAATAAATAGGACAAGCGTCA:1 - chrX 5106040 3' + X-element 4639 1 81.19 GGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATAAGAAATAACACTGTAACTTTCAAAATAATCCAAAT:1 - chrX 21006606 3' - 297 182 2 64.36 ATCCAATTTGGGTAGGATTGTTCTATATCGATCTGGAGTTATTTTTCTATTAGGTTGGGTAGGCTCCATGATGGCTAGATAAATATTAAGCAACTATGTGG:1 - chr3L 15662913 3' - I-element 4897 1 75.25 CACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAGGGCTTAAATATGAAATCTTTATGCATATGTTTCATCATGGAATACGTTTTTAATCACGTGGCCCCCTGAA:1 + chr2L 14886467 3' - 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G7 33 1 69.31 AATAAAAAGTAAAAAAAAATAATTTGATTAATCGCACTCAATTGCCTTTAATTGAATAAGCTGATTTTCAATTCTATTTATCTTGTCCTAAATTCACGTTG:1 - chr2L 3690620 3' + Doc 4694 1 80.20 GTCGTTTCGGTTGTGCAAAAAGAATTGACTTTGTGCGGAAACACACTCACACACACACAAGCCCATAATGTGTATAATATGTATTCGCGTATCCTGTACGC:1 - chr3L 17155156 3' + G3 10 1 58.42 GACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGCATATATTTTCTGTTTATTTTTGAAGCTATTAACTGGCAGCTTTTCAAATTTG:1 + chrX 12151687 3' - diver 20 2 58.59 ACACTTTTGAAAAACGTGTTGATATTGGGGAATAAAATAAGAAAAAAATTAAAAAATTGTGGGCGGGACCGATTAGGCGGATTTAGGATGTTAGAGTGAGA:2 - chr3L 24165324 3' + INE-1 260 1 77.23 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGCCTTTGCTAAGACCGTACTGTACTGCCCCACAGTGCCGCGCTCCTTGCCATTTGGCCGCTGGACGTGCTTC:1 + chr2L 18137560 3' + 1360 3374 1 54.46 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATTTTTAAAATGACACTTTTATTGTCAAGCTACGCTGAGTTTAGGGA:1 + chr3L 5490146 3' - 297 6607 2 58.42 AATCGGTGGTTTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGAGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGTTAATATAACAGAGCACAGAGCGAGCACTAAAGCCA:1 - chrX 1006647 3' + I-element 320 1 73.27 GTGTTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTACAAAGAGTAAAAAAGTGTATTTAAAATGACTCCTAAATAACTATTGGTAACGACTTAGGCGTAAAGTACTCACA:1 + chr2L 15168945 3' - I-element 131 1 49.50 ATGCAACAGCAACATTGAAATAATACAACGAGCACGTTCCCAAAATACGTACTACATTCTGAACGCATCAAAAACGCATTAAAATCATTCACATTTCC:1 - chr3L 22034752 3' + Doc4-element 2631 1 67.35 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAATCGTGGCTTCATTACGAATTCTTCGAATGGTCCGCACCTTTT:1 + chr2R 11086472 3' - Doc 41 1 57.43 AATATATTAATACTAATATACCCAATAAAAAATGAATATATTTGAATATATTTTCTTTTGAAACGCAGCAACAATCGATTAAATATAATATATATACTCAA:1 - chr2R 17194331 3' + hopper2 1543 1 54.46 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCACTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATAATATAGTTTGAATTTCTCTTCCTA:1 + chr3L 14692896 3' - flea 4806 2 74.26 GAGGGTCAGCATTGACCAAATCTGGTTAATGAATAACGAATGAGTCGTGTTCGCTTAATAGTGATTGAGTTGAGAACACAGCTCATTATAATTAATGTAA:1 + chr2R 22619686 3' - jockey 4709 1 81.00 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTGAGACCTCCCACAGAAAGGCGAGATTCC:1 + chr2L 7767172 3' + hobo 2895 1 72.16 CTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAAGTTAAGATCTTAAGGTATTTTAATTGAAAGTATTGCTTTCA:1 - chr3R 23274012 3' - 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chr3R 17244693 3' - BS4 225 1 67.33 TTTACAGGAGACAGCCGAAGGACCTTATCATAAGGTCCCCCTTGACGCCGCCGCGAGTTCATTAGGAATGCAGGCTGCATGGCCGCCGGAGTTGATTGCCA:1 - chrX 18579744 3' + BS3 1560 1 63.37 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCATTACGTAGCACACTGATATGCGACGACAG:1 + chrX 12890965 3' + pogo 2062 1 66.34 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCTCGCGTTTCTTCTGCAACGAAAGGTGTACAGTTCGGCATATCTAAAATAACAAACAGATAATAGTTATTAG:2 + chrX 9048738 3' - Tirant 8117 2 69.31 ACAACACGCACACTTATACGAGTTCTCGTCTCTTGTTTTCAGGCACATTTTTTCTAACACTGTATTCTTGGGGTCACTGGGAGCTCTTCTTCGACTTCCGT:1 + chrX 7039017 3' + 1360 3216 1 72.28 ATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTCTGATATTATATAGATGGGATATTAAAAAAGATTTCGGCTTCACTTTAACGGCTTTG:1 - chrX 18680755 3' - I-element 214 1 51.49 CGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCACTACAAGTAAATGTTAATAACTATAA:1 + chr3R 13122890 3' + Transpac 5177 2 72.28 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCGCATTTACTCAAGACGATTCTCCCTCTGAAAAGTGTAGCCACA:1 - chr2L 13602347 3' - FB 34 1 55.45 GAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGGGCGGTTGGTCTGCTGGGAAGTTGGGCAGTTAAGGTGGTTGGT:1 + chr3R 11270512 3' + Quasimodo 6928 2 57.43 AAAAAAAAAAATCAATAACAATTACTTGACATTACCCGTGTGGGCAAGCGATTGAATTATTTACAAATAATTCTCAACGTTTTTATAATGCCAACAAATT:1 - chr3L 9775126 3' + TAHRE 10127 1 65.00 GCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGTTGGTGTTATTGTGGTTGTAGTTATGGTGGAGGGGCTTCTCGCGGATGTTCGAGTTGTCCTTCAAGGGAAGAG:1 + chrX 2131619 3' - F-element 4505 1 76.24 TTTGCCTATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGGTTGAGAGAGCATCGTATTTATTTCGGGATTTATTAGAAGCAATTAAATAAATATGCAATTTGTTG:1 + chr2L 11746710 3' + FB 70 1 73.27 TCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGATTGTAGGTTATTTTTTAATTAATTATAATGCCTTTTTTACTTAAATTTCGATTGCGTT:1 + chr2L 12802269 3' - invader3 20 2 57.43 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATATTACTTTCTTCAATAGTAAGTAACCTTAAAGTATTTGGAG:1 + chrX 7741767 3' + roo 9038 1 61.39 GACGTAGATAACGCAGAAAATAGCTTGAAACGGTAGATCAGCAACTGATAAAAGACATTTTGTGTGTATTTTGTGGGGCCGCCTTTAACCCCCTTAACCCC:1 - chrX 3350011 3' - McClintock 142 2 58.42 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATGGCAAGAAAACAAAAAATACGTACAAAAATAAA:1 - chr3L 4637303 3' + hobo 2895 1 65.35 AAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAAAAAATCAGACACCGCGTAATTTCAATGGAAAAAATGTTCAAG:1 - chr2R 18327094 3' + invader3 179 2 58.42 ATATATGTAGTATATATATATTATATACGTACTCGGTTAGAACTAAAAGAAGGCTTAGACTTATCGGTATGTATTTTGAACTCTGTCTATGTTCATTTCCA:1 + chrX 19336008 3' - accord 7274 2 69.31 CATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATGCTGAACACGATGTGGAAAAGTCTTAACATGCATCAGTATGAATCATTGCGAGTGTTGTTCTTAATTAAC:1 - chr3R 18113199 3' + flea 4975 2 77.23 GTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGGCGGATGAAAGTTGCTCGTGTGTGTGAACTATTAGTGAATGTCCACAAAAGGAGTGATGGCTGAGGA:1 + chr2L 11047605 3' - Ivk 5060 1 63.37 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATTAAATGTCGCAAAATAAATGCTTAATTGGACAGA:1 + chr3L 3635507 3' - roo 8673 2 72.28 ACTAACTTAAATAGTATAGCATTAGCTACAGGGCTTAGAGCTATATTTATTTACATTGTTATTACTGTTGGTACTGTTTGCCGACCAAATATTCTCATTTT:1 - 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invader4 2770 2 69.31 TAGGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCATTGTTAACTACTGTCTCCTTGCCGAATCGGGCACTCCAGGAACC:1 - chr3R 23485658 3' + roo 9040 1 54.46 TGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGCCAGTGAAGGGTTAAAGATGCCGACATTATAATTCAACATTGGCATTATGCAAAAGCGTCTAAA:1 - chr2R 17269694 3' + transib2 2814 1 67.33 CAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAGGAAATTGCCTGCAGTTCCTGGCA:1 + chr3R 8914558 3' + roo 388 2 61.39 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATATATCTGCTAAACCATTTGAGTGAATTA:1 - chr3L 19933660 3' - roo 8702 2 69.57 GGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCACAAATTTTCATGAAAATCCCCTCGGATTTCCATCTGCTCCGCTTAAAACAAAGCATATATCTTA:1 + chr2R 22143234 3' - S-element 1274 1 58.42 TATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTGTTGTGGTGTCCAGTTCGGGTTGTTCCGTTGTTGTTGTGCTTGTTGTTGTCGG:1 - chrX 10034057 3' - Idefix 102 2 53.47 GATTGGCATTGAAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTCCACATGAAAGTGGTGATATTCTTTGATATGGATCTGCTGAGG:1 - chrX 19302245 3' + baggins 5178 1 63.37 GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACCATCTTTTAAGATATACGA:2 - chr2R 12357518 3' + opus 447 2 86.00 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATTTGAAACCGTACTATGTACTTTTAAATTTTTA:1 + chr3R 6425919 3' + copia 240 1 61.39 GTTCGACTCGGCCATTGATCCTAATCAAAAATAAATATTCTTTATTTTGGTCGGAAACAGTGCTAGCACTGTTTCCGATTATGGACGAGGAACCGTTTGAA:1 - chrX 4222171 3' - INE-1 96 1 57.43 AAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCTCAAGTAGCCATTAAACAATTTTGA:1 - chr3L 5611332 3' - Cr1a 197 1 75.25 TTGGTTTTATTATCGCTTTGTATATTGCTATTTTATTATATAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCAAAGGTTTGTTGCCGCAGCGCTTTCGATTTTACAAGT:1 - chr3R 11338342 3' - Porto1 4245 1 63.37 TAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTAAGTCGGATCATCTACTGCGTTCAGA:1 - chr3R 28880197 3' + roo 109 2 74.26 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGCGAAGACGCCTCCGTTTGTCGTTCGCAGCAGTTCGCGACCCCGAACATCGCGTGT:1 + chr3L 813891 3' + roo 388 2 58.42 TGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGAAATCCTACAACTCTTCTTGTTTTTGAAATGAAACTCAAAACTCTA:1 + chr2R 17402812 3' + invader4 321 2 75.25 GCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAGATTCCATTGGTCATACCGTCGA:1 - chrX 12792468 3' + Doc 4387 1 77.23 AGTATATTCTCGATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTAGCCATGTCCGCGCTGGATGGCCACTCCACGCATTGCGGCGGCAACGGCGG:1 - chr3L 10584816 3' + INE-1 81 1 52.81 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTTATTTTAATAAAGACTTTTAATTGAATTTTCAAT:1 - chr3R 6135229 3' - I-element 38 1 63.00 TCTTTATTGAATATAAAATCAAACTGAACTTAAGGCTAACAAAATATGAAACTCATAGCGGCCACTCCAATGGGTAGTTGAAGCTCCATTCCGTAGGTTCG:1 + chr3R 22903382 3' - gypsy6 165 2 77.23 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGTATGAACAATATTCCTGATATTATGTGTTTGCTGCATACTTTTAGACACTTCTGTAA:1 + chr2R 20196948 3' + pogo 2084 1 55.45 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGGCGTATACGAACTTGGCCGGAAAATAGTGGGCGGCTTTTGGTTGCGATTAAAAT:1 + chr3L 7742789 3' - Doc 27 1 53.00 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGCGAAGACGCCTCCGTTTGTCGTTCGCAGCAGTTCGCGACCCCGA:1 + chr3L 813880 3' + roo 9040 1 56.44 CGGCAGAGAGGCCGTCGGCAGAGACGTTGCTTTGCTCTTATGAACATGGTTTGGATGGATTTTGGATGGTCAATCTTATGTTAATCTTATATTATATTAAG:1 + chr2R 17293872 3' - Tabor 7119 2 68.32 CAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGAATAGCTGACATCCCTCGGAGGCCTGACTTAGAATTCGC:1 + chr3R 8639697 3' + Quasimodo 340 2 61.39 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTCCTCGGACATGGCCAGCAATTTTCACTCGATGCATTGAC:1 - chr3L 14284977 3' + roo 396 1 62.38 ATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGCGTCTAATGGACGAAGAGGGCGATACAGAAATGCAGATCGAGTCGGACGACGAGGGCGACTCCCAGGCTAACAAC:1 - chr3R 17001042 3' + I-element 321 1 80.20 ATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACCCACCCTCTAATCTCTGGACAACCCCTG:1 + chr2L 17221625 3' - hobo 263 1 72.28 TTAGATTTAAAAAATTTAAAATATTTATGCATGCCATCGCATTTGGTAAGTCACCGTAATTATCTCTTCTGCGAATCTTAATCTTAGGATGATTGTTATAT:1 + chr2L 8862599 3' + Transib5 253 1 88.12 AGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGAAATAAAGCATGTATAACAATATTGAAGTAGATTAAACTGAAATTTAAGAGCTGAGCCAGCCGAACT:1 + chr3R 30215532 3' - opus 3 2 55.45 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAAACTGCCTTTCGTTGCTGGACATTTTTAATAATACATAATATACTTGACTTCGTAATATCC:2 - chr3L 10554747 3' + roo 397 1 60.40 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTCAAAGTTCCTCAAAGGACCTGCCAAGCATGACGCTGCGGAAATCCC:2 - chr2L 7767121 3' - hobo 31 1 52.48 TGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACACTGGTTGGCTGCAGCAGGAGAGGAGACATATAGCCGCAGTTATAAATTTATCAATATA:1 - chr3R 6354176 3' + 1360 3187 1 69.31 GCAGTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTAACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATGAAAAGTGCAAACAGAAATTTAGATGATGATG:1 + chrX 8208457 3' + Cr1a 193 1 56.44 GATTTATACAAAATTCCACGGGCAACTGTGTTTACCAACAATAAAAGATAAATCGTCTGGTTTATATGTAGAGCAGACAGCACAGGGCACAATGAGCGCGA:1 - chr2L 11452842 3' + Tc1-2 443 1 75.25 AACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATG:1 + chr3R 16611518 3' + Stalker2 359 2 68.32 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGCTGACAGCCCGGGTTTTATCTTGACCGGCCCCAAAAAGTAGGCAATACAATTTCAGATCAATGCCAGAA:1 + chr2R 21415221 3' - jockey 15 1 69.31 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCACGTACCGTGTCCTTGTCCAAGTGCACC:1 - chr3L 21852513 3' - 1360 51 1 78.22 GTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCATGTTCTCTGAATAAAATACATTACTGAATACTCCAAAAA:1 - chr3R 27020232 3' + 1360 3357 1 61.39 GAGGGGGGAATAGTTAACTAAGGTAAACGTCCGCGGACGGCCAAATAAAATAAACAACAGAAACAGAATCGGAATCGGACTCGCGCGCAGAGCTTTAATGT:1 - chr3R 6474710 3' + springer 7127 2 59.41 AAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGAAAATCCTCTCGCGAAGTCGCTTACGCGAGTCTGCAGTCAGCCGTGAAATACTACAATAAAGCGCC:1 + chr2L 23070694 3' + Doc2-element 4536 1 75.25 TTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAGCAGCATGGCAGAAATATTAGGTAACGCTGGCTCCGGGTTTTAAATTCGTTTTTAACCCTTCGACGGCGA:1 + chr2R 6147454 3' + 1731 303 1 68.32 GGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCCGCTGCAAGCTTTACTTTGCTTTATCGTTCAATATGCGATGCATG:1 + chr3L 16683388 3' - Doc 314 1 55.45 CGGCTGTCACTGTATGCGTAGAAAAGATCTGTTCGATGTAGAGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTTGAACATGTCGGCAAGTTGGCTTTATTACTTCCACACTG:1 - chr2L 15884545 3' - 1360 148 1 65.35 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATCGATGAATCCACCCTAACACAACATCAATGTGTTCCAAAATCCACCCCCTTTAGGGGTTTCAG:1 - chr3R 17846852 3' + roo 397 1 65.35 AAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAACTAAGCTTTATTTATTGATAAATCGGATATATCAGCCTCTTTGCATAAGCAAAA:1 + chr2L 10920805 3' + mdg1 7359 2 64.36 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTAAATCGAAAAACAGGTTAAAAGGCTCATAAAATCTGAAAAATACA:2 - chr3R 6425832 3' - copia 30 2 55.45 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGATAAAAGTTTCGAAAAAATGTAAATATGAATT:1 + chr3R 26912988 3' + 412 7500 2 74.26 TGTGGCCGTGGGACTCGTGCGACAAAAAAAATCGTTATTCAAACATTAATTGACAATTCATCTCAGGATTGATTTTTCTTTTACAGACTTAATTACAAAGA:1 - chr2L 23232620 3' + Cr1a 4442 1 65.35 GATATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCCTGAAGATGCACATCCGCACCCACACTCTGCCCTGCAAGTGCCCCATTTGCAG:1 - chr2L 15477173 3' - Tirant 418 1 57.43 CGAATTGAGAGCAAAGGCTGAAAGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGCGTGTCCGAACACGAAGATGCGTCCAAAAGTTAGGTAAAAAAGTAA:1 + chrX 4667119 3' - 1731 235 1 72.00 CTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAGGTTGGGTTTTTTTCTGAGCCCAGTTATCAATCA:1 - chr2L 21234982 3' - F-element 4210 1 78.22 CCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACGACTCGTATTTTTGGGCCACAAATTTGATGGTTCGGAAGATGATTCCCGTTTAAGTGCAAA:1 + chr3R 31183689 3' - hobo 282 1 72.34 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTATATCAAATTATACTTTTCGGGTAGTCATTTGCATTCGGATGTG:1 + chr3R 20369744 3' - pogo 31 1 60.40 AACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCTCCCCTCATGCATTTTTTTAAGACAAGCAATCAATTTCTAGAACAAAAGGGAATTTAA:1 + chr4 1036342 3' + roo 8617 1 64.36 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCAATGCACATTGTGCATTGTGTTTTTCGCAGAGA:1 - chrX 19819987 3' - hobo 43 1 71.29 TTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAAAACCTGAATTTAAGCAGGCCTTAATCGGTTGAATACTTCGTTAAGGCC:1 - chr2R 19977884 3' - roo 176 2 52.48 GAAAGGGTGACTTGGTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACAATGTATTTACTATATTCAATCTTGCAAAGTGTTGCATATTTAATGTTATTGGT:1 - chr3L 26377757 3' - 3S18 25 2 54.46 AATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACCATTGCACCACCCAGCACACTACTCACACGCACCACTTTGTGTCCCCTTTGCACGTAG:1 + chrX 18423887 3' + S-element 164 2 64.95 GATATCCCCGACAGGTTTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGTATATAGAAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGGCGCATCTCGTAACCATCG:1 - chr2R 12316227 3' + G4 3708 1 81.19 GGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACAACTAATAGGTGCGTAAACGATGTTTTCCACA:1 - chrX 5275526 3' - jockey 4720 1 69.31 AGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAATCACCCACTACTGAGCAAGTTTCAGGTCTGCTTAAAGGGTCACTTAATACGTACTAAACGTGAAATAGA:1 + chr2R 1367736 3' + Bica 384 2 72.28 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATACATAAAGATATACACCCGCACACGTACGCGTATAGTCTCAATTGCCACTTATCA:1 - 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TAHRE 10077 1 65.35 ACAGAAGAAGAAACTGCTAAACTAATTGCTGCAATGAGTAACAACAAGGCATCCTATTAAAATTCCTATTGGGGAAGCCCCTATTCCAACTGAAGAAGGAG:1 - chr2R 2894983 3' + G7 156 1 60.40 GTGGACAAACATGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAAAAAATGATGGGTTGTAGGGGGGTGATATTTATGCACTAGACCTTTTACATTACGATC:1 + chr3R 24939836 3' - GATE 297 1 60.40 TGTGTACCTCTAGCTTACTACATTTGTTTTCTAAATTCGGCACCTTGGTCACAAATGAGTTTTTTTGGTATGCCAAAACTTTGAATAAATTGCAAAATAGC:1 + chr2L 23374199 3' - invader2 1 2 68.32 GGCTTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATGAATGAATAAAAAAGGCTAAAGTTATTCGTTCTTTAC:1 - chrX 20287299 3' - Rt1b 4808 1 66.00 AAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACCAGCGAGAGCCCAGCGAAAGGACTTAATTCTAGCGAGGATCTGGACGCCAAGCGG:1 + chrX 11720961 3' + Quasimodo 23 2 59.41 TTTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTTTGGTTTCTCTTCGGTTTTATGCGTTTCTTTTTCGGTTTTTTTTTTATATTTATTTATT:1 - chr3R 6894608 3' - I-element 4901 1 74.42 AGTACCCATGAGCAATCCACTCAAGAGGGCATCCAATCCAACAGACATAAAAATTCCAACCGGACAAAAAAGAACTAAGAAAAGAAACTTTATTACCGGGA:1 - chr3R 7941842 3' + Quasimodo 6989 2 53.47 GTTACATACTTTTCAACGAATCTATTGTAGTATACCATCTTACTCTACGAGTAACGAGTATACAAATATGAGGCTTGCTCAGATTTTTAAACTTTCAGCGC:1 + chr2L 20026415 3' - INE-1 15 1 80.20 ATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACATGTTGAATATATAATCTCTAAGCTCTTTAT:1 + chrX 6156217 3' + 3S18 293 2 68.32 TTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATCCTACGCACCAGTTTAGATTTAAATTCAGGACTTCACATTCCACATATAGATTCGCC:1 - chr2L 12802175 3' + invader3 5444 2 57.43 CGCCAGTAACAGCAGCGTAGAAATTATCCACTGATACCAACCAATTTCAATAGGTAAAGGGTATTTGTTTATTCGCTCACCTGAAACTCGTACCCATTATT:1 - chrX 9783379 3' + Fw2 3577 1 70.30 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAAAGGCGGTGGAAAAGGGGAGAAAATGGACTTGATGAAGGACCCTGAATGG:1 - chr3R 25443033 3' - 297 6582 2 69.88 AGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAAAAGTTCTACTCCAGTTTAAAAGAAAATATCGACAAAGCTCTTGAAAGCTGACCTTGAAA:1 - chr3L 22898686 3' - R2-element 3224 1 67.33 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATTGTGTGACGCTAGCAGCATTTTGTTTAAAATT:1 + chr3R 27435079 3' + jockey 4946 1 72.00 CCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGACATGCTTTGTGGGGCACAAGTTTCG:1 - chr2L 21248168 3' - Porto1 352 1 75.25 ATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGCATAATCAATTTTTGCCACGCCCACTCAAACACCACCAAAGCGCCACGCCCTTGTTTTAATCTTAAGATGTTT:1 + chr2L 23026403 3' + INE-1 297 1 60.40 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGTCGGCAAATCTGAAGCTAAAACCAAACAATGACTAATAGATGGCTTAGGACTATAGCTAAGAA:1 - 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chr2L 18979368 3' - Doc 9 1 66.00 AATAATTATCAGAGTTCAGTTTGGGATCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGATAATAATACAATTTGGGATCAACATTAAATATCGT:1 + chr2R 25034430 3' + Idefix 463 2 66.34 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCTCTCTTGTGGAGTTATTAGAACCGACGACAACT:1 - chr3R 4567278 3' + 1360 3349 1 70.30 AACATGCTGTGTTTGCCGGCTGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTACCTTGCACATGTATTATTCTTGAATTTTTTTTTTGGCTT:1 - chr3R 3269639 3' - Gypsy6A_LTR 94 1 75.82 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCCATCAATTCGCCTAAATATTTATGCTTTTATACATATTTTCCGGAGCCATTTTGGCATTCGTCTCGCTGTGAC:1 + chr3L 4637386 3' - hobo 3 1 76.24 GTTGGGGCGCATCAGCATTGTTCGTGTGAAGTCGTGCTGCATGAACCCGATCTAAGATCCCCGATGTGGCGGAGGTTCTTCATGGTTACCTCATGTAGGAA:1 - chr2R 4878848 3' - gtwin 6976 2 65.35 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATATCTGAAAATGTGGGCAAAGGCAAGGAGCATACAAGGGAAAATG:1 - chr3L 13264454 3' + Burdock 226 2 56.44 TATTGAGCCGAGTCTTAGAGGCTGTTCCCCACACTTGGATGGCGTAGGTCAGTGTTGAATGGGCAATGGGGAAAATGGGAAATATGGCAAGGGTTAAAATG:1 - chr3R 30286029 3' - G5A 2458 1 56.44 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATGGCAAGAAAACAAAAAAAACGTACAAAAATAAACATGGCACAAAGACAGCAAGCG:1 - chr3L 4637281 3' + hobo 2933 1 63.53 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTAAATTAAGAGTGTCCAAAAAAGCTATTTTTATTCCATCAGGATCTCTTGATT:1 - chr3L 10792155 3' + pogo 2084 1 67.33 TACCTGAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCAAAACCCAACTACCAGTCAGTCAGTCAGTCACAGCAGTTACAGCAACCAACCATT:1 + chr2R 9522898 3' + G6 1801 1 61.39 AAATGTCAAGGTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGGAGTTGTACTGTTTGTATGTTTTATCTCTTTTTTTTTTTGTAAAAAGTGTTTCC:1 - chr3L 19275156 3' + transib2 280 1 63.00 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGAATATTCTCCAGTCTGTGATGTTAAGATTCTTCACTTAATACATTTAAAATTTAAA:1 - chrX 6917073 3' - 3S18 5787 2 58.42 TTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATAGAAATCTCTTAAAAAGGCAATCATTTATTTACTGAAATGGCGATCCTATGTAAATATTACTTTTATACCT:1 + chrX 14965263 3' - FB 6 1 73.27 GAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCATTTTCTGAGGTGGCAAAAAGCCGTAGGTATGGAA:1 - chr3R 27088444 3' - X-element 4278 1 66.34 ATGCTTTTATATGTTTTTTATAAGAAACCCTCCAAAAAGAAGAAGGACTCTGGCAATTAGGGATGGGGCTGTTCTCATTGACCGGCAAGTGGCCAAAAGTT:1 - chr3R 12210591 3' + Circe 421 1 53.47 AAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAACAATCAAAGGCAATTTCTGGAATTCAGTTCGCAGGATTACTTCTAATAATTTAATAAACCCATGAAA:1 + chr3L 14332276 3' - Cr1a 57 1 68.32 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTGCAATTAAAAGGCTCAACTGCCAGGCGATCAAAAACGGCAGCCTTG:1 - chr3L 5492293 3' + pogo 2073 1 56.44 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGTCGTTG:1 - chrX 22690756 3' + roo 9028 1 67.33 ACGAGGATCAACACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAATTCAATCTGTTCGGACCGCAACAAAAGCCAAAACGGAGTTGACTCTCGGAGG:1 + chr3R 10620741 3' + Transpac 335 1 57.43 TTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTGTTTAAATGTTGATAAGATATAGAAAAACAAAAATTATCTGATGGAGGTAAATAAAAGCAGGGG:1 + chr3R 20787546 3' - I-element 452 1 68.32 CGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACAAAATGGAAATGGATAAGAGTTTTCGCTTGCTTAGTAAAGAGCTG:1 + chr2R 5154804 3' - F-element 43 1 62.38 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTTAGACAATACAAAAAAAATGGGAGAGCAGACAGAAAAGTTATTTAAATTTCGAACCCATTTCAAATCT:1 + chr2L 10820684 3' + roo 401 1 71.29 GTACGATTGTTAATACGCATCCATAAATTATAGTAAAATATGGAAAATAAAAGCCAAGCTATAGTCGACAATTCAGGGGCGTCGACTTTATATAGTTCAGG:1 - chr3R 14062246 3' + transib2 232 1 57.43 ACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTATGCCGTCTGCGCTTTGAGGTTACGAGTGGTTCCTATA:1 - chr2L 17886246 3' - hobo 2884 1 63.37 ATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAACTTAACTCGTCAATGAATTGATTTTGAGCTATGAGTGTCTGCATT:1 + chr4 808985 3' + 1360 387 1 63.37 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCAC:2 + chrX 21945929 3' - F-element 42 1 58.42 TGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTGTTCCTTTTACACAAACCTTAAATAAGCGATTGTTATGTTTGCGTGATTTTAATTTGGGCTTGCTGTTTGCC:1 - chrX 16130413 3' - F-element 4390 1 75.25 TCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACTACCAAAATATAACCGCACCACCTATGGATACACGTA:1 + chrX 3826449 3' + Stalker3T 291 1 73.27 TGCGGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGAGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGCACGTACATAATTTAACCGCCATTGTGTTCTATATTCTTGGCG:1 + chr3R 13153091 3' + hobo 59 1 62.38 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGTGGTTCGCTGGTTGGGTGGTTGGTTCGGCGGCGGCTTAGCAGCTCAGCGGCTCAGCGG:1 - chrX 15125624 3' - P-element 16 1 58.42 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAATCAGGTTGTTGGATGGCATGGGTTAAGGGAAGTCGGCGGAAG:2 + chr2L 7971048 3' - blood 31 2 53.47 AATAAAAACATAGTGGGCCTGATAAAATTGTTAACAAACTGCCATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAGACAA:1 + chr3L 13677119 3' - hobo 2479 1 83.17 TAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTTACAAAGACATCTCCATTAAGTTGTTATAAGATTTCGTCACTTGCCTGCAGAAAATTAGCTTAAAT:1 - chr2L 5976044 3' - invader4 2620 1 50.50 ACACGTCGGCGATCGAATTGAACAAAATGGAAATGGATAAGAGTTTTCGCTTGCTTAGTAAAGAGCTGAAGTGATGTCACAGTAAAGTAGCATAATTTATG:1 + chr2R 5154837 3' - F-element 10 1 73.27 TTAAGTACTTCAAAAAAAAAATCCCCAGGATAATATTAAGTCTAAGTTTATTGAATATGCAAATATGCCTGTTTTAATGAAAAAATAAAATCATATTAAAA:1 - chr2L 4086790 3' + P-element 2624 1 82.18 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCATCGGCGAGTCCTTGACA:1 + chr3L 9174745 3' + 412 455 2 65.35 TATTTAATTGATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTATTAACTTTGTTTAACTTTGCTTTAACTTTATTTTTAACTTTTTATCTTTGCTGGTGGAGGT:1 + chr4 1294992 3' - HeT-A 15 1 67.33 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCTATTGTTGTATTGTAGTGAATTTGGTTTCGCCGAGCCCATTGTCTGTGTTACGAAGGAAGAGCT:1 + chr3L 25310227 3' + blood 7346 2 68.32 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGCAG:1 - chr3R 25514119 3' + hopper 1376 1 65.35 TTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAAGAAGAGCAACTGAAGCGGAAGTGAAAACGCATCTTCGAGTGGGGTTGCGGCCATCCGA:1 - chr3R 22557497 3' - F-element 135 1 52.48 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAAAATGCCAGCTATGTGTGATAATTGTTTTGTGTTTTACTTTCGAACCGATGCACTTGA:1 - chr3L 4051028 3' + pogo 2088 1 67.33 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTCCTTGATGTTTGCTGAA:1 - chr2L 11805003 3' + P-element 2867 1 55.45 GCCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGTCTCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTTTATCAACATATCGTCAACGTTGTTGGGCTGTTGTTGTCTGACAACAGTG:1 + chr3L 4908411 3' + Idefix 7059 2 57.43 TAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATT:1 - chr2R 5582169 3' - Cr1a 442 1 66.00 AACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGA:1 + chr2R 17402767 3' + invader4 3035 2 77.23 ATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCAACCAGAGTGCAAATACAAATAGCAAGAGCGTTGCGTCGCCAGTCGGTGGGCCCGTCTCT:1 - chr3R 7967157 3' + Quasimodo 296 2 60.40 CAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTCATTGGAATGCAAACATAACGCATACGCAGCGTTGGCAATTTTGGAGAAGAGACCGAAGCTGTAGGCCA:1 - chrX 1018346 3' + transib2 2817 1 72.28 TTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTACTTAAAAGTG:1 + chr2R 2092801 3' - Doc3-element 74 1 51.49 TTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATTTGAACCAGAAAAGAGATACATCTTCATCTTTAATGCGAAGGAAATTAAAGTAAAAACACCAGAA:1 - chrX 21668214 3' + 412 7538 2 70.30 TAATTTAAAACCTGATCCATCAATAATGGCGTTTTGGGTTTTAAATCCTCTGGCTTATGAATAATGTCCTTTAGGATTATAATTTAAATTTAAATCCCTCA:1 + chr3L 14949456 3' + transib2 2498 1 69.31 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTATAGTTTTTCTTTTCGCGGAAAACCCTCTCTTTTCCA:1 - chrX 7823186 3' - Transpac 36 2 66.34 GAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTGCACCATTTATTTATAGTGGTCCGGCA:1 + chr2L 16718005 3' - 1360 50 1 75.25 GACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCAGGCCATCTTTTGAGTTACAATGATGTATAAAGTTGAGATAATACCTTTTGTATTTTGGAGTGACTGCA:1 + chr3L 15452958 3' + accord 7374 2 67.33 TTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGAATATAGAGCTTTCAAGTTGATTATATTTGTAAGGCTAATCTGGT:1 - chrX 15302239 3' - 412 7511 2 56.44 TAAGTTAATTAAGTTAAATTAAGTTAATCGTTAAGAAAACGATTTTGAATCGTCTGCACGTTTTTGCCATTATATTTAAATAAATGATTTATTTTCGCGCA:1 + chr2L 11910569 3' + Doc 4620 1 76.24 ATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGAAATTACATTACATTTCTTTGCATCCT:1 - chrX 4363493 3' + hopper 289 1 74.26 TTCACACTAGCTCAGTAACGGGTATTTGATAGTCGGGAAACTCGACTCTAGCATTAAACCATTTTAATATTTAAAATATCGTTTACCTTTCGGCAAAGGCC:1 + chr3R 26145254 3' + INE-1 537 1 53.47 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAA:1 - chr3L 11367511 3' + roo 9025 2 70.30 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATGCGTATGTAATCCAGACAAATCTGTCACGTGTTTTGGATATCTTTTTCTGAGGCCGCCAGTCCGGGAATTTA:1 - chr3R 6592902 3' - mdg3 5314 2 73.27 CCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGTTAACCACCTTCGTCATCTTCGCACGATGACAATTCACTAAA:1 + chr3L 14152192 3' - blood 3 2 76.24 CGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATATTTTTTATGCTTCGGCCAAGGCTCACATTTGCTTTATGGTGCCTCACCTCTGTGGCTCCTTT:1 + chr3L 13264559 3' - Burdock 6140 2 72.28 ACCTTAATATTCTAGTGTCTTTAAAAAAAAGTGTATACTACAATATATTCGATGAAAAGTGTGTAACATGCAGAAGGAAACGTTTATCGCAGTAGTCACAG:1 + chr2R 7514810 3' + Tc3 309 1 80.20 TCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTATTTTTAGGCTAAGCCCGACACAAAACACTATATTTTGCCGGACT:1 - chr2L 12942195 3' - jockey 4704 1 53.47 AACATACCCCCTCTCTCGGTATACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCGGAAGAAGAAGAAGCGCTGGAAGCTGTCCGT:1 + chr3L 18800207 3' - accord2 7626 1 69.00 GCGGCACTCAGCCGTTCTTGTAAACATCCTAAAACCTGACATAAGCCGATTATTTTGTAAAAATAATACAAACATACATAGTTAAAAGTTAATATTTATAA:1 - 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chr3R 4835602 3' + hobo 2649 1 57.43 TTAAAACTCCCCACAAATCTCGTGCAGGGGGGTGGCCTAACAACCAGCAACAAGGCGACATCGGTTTAGGCCTTTGAAAGCACTACACCATGGACATGGCC:1 - chr3R 21897859 3' + gypsy8 10 2 62.38 TCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTGTCGGCCACCCAATCGATCGCCGTGCTGGGAATTGCCCTGATCGCCATGGGCGAGGACATTGGTGCCGAAATG:1 + chr3L 19917281 3' - G2 2607 1 78.22 GCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGGAGGAGTGGAGTGGGGTCTACCTGGGGATGTCTTACGGGTGAGAGGCACGG:1 - chr2R 15465477 3' - Doc 368 1 56.44 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGTGTGATTGATGTGGACGACAATGGCACTC:1 + chr3L 21852547 3' + 1360 3343 1 76.24 GCAGCTGGGCAGCGAAGCCCCAATTCGAGTAAATTAACAAAAAAAAAACACTGTAGTAAAA:1 + chr3L 10384725 3' - X-element 203 1 62.30 ATGTGCTTAAGTCTAAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAGATAACCGGACTCATAATGTTTATACTGATTGTAGGTGAATCGCATTTTGATTGATTTT:1 - chrX 13645545 3' - Idefix 15 2 55.45 CAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTAAATAATACACATTAAGAAGTATATATATAAAGATATACTGAGAGTATATCATATTTTGTATTG:1 - chr3R 11568294 3' + BS 4845 1 62.38 ATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAGTTTTTTTTTAAGTAAATTGTAGTATACAGTTGGTTCAGCA:1 + chr4 460172 3' + 1360 395 1 59.41 AATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAATCGAAATGGTTGGGGCACCCTCTAAGCTAAATGTCTGAGGGAAAATCTGTATCCCCGG:1 + chr3L 9123358 3' + F-element 320 1 65.35 AAAATAAAATAAAATTATTTATACGTTTCGCTGGCGTGTGGAAAATTGATGCTGTTGCTGAAGTTTTTGGCTTTTTGAACTGACAGCTGCGATTTTTATGC:1 - chr3L 17704947 3' + NOF 3960 1 72.28 GACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTGTAGGTATCTTTTCATTGGAATTTTCCCCCGT:1 - chr2L 13316675 3' - jockey 4886 1 68.32 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCTGATTTTCGATTGACGTGCAGCTGGGGTAA:1 - chr3R 9606217 3' + roo 9026 1 70.30 CTGAAATTGTCCAGCAAAAGGCTAAATACCTAAAGCGACTTGCAACGCGCCTCCAACTGCACGTGAAACGATAGATTTTGTGTGCTCGGCATAAATAAACC:1 - chrX 326425 3' + Doc4-element 2756 1 56.44 CCAGTGCGTGAATAAAGAACGAAAGGTTGACTGGCCAGAAACTCGCGGTTTTAATGTGTTTTTAATGTTATTTCCATGACATGCCGCCAACATTTAAGCTT:1 + chrX 18956739 3' + Max-element 200 2 75.25 CTTCGGAATGTGCCGATTGGATTTTGCTGTGAGATCATTTCCTGCAACTGCTGCCGCTGTTGTTGTTATTGCCGCTTTATACACCAAATTAGAAATATGCT:1 + chrX 3023529 3' - TART-A 177 2 59.41 CTGAGATCTCGACGTTCATACTGACGGACAGATAGAGGGGCACTGAGCCATAGGCCTCCGTCTCCGTCTCCGTCTTCATCTCCATTTCCATCCGAATCCCC:1 - chrX 20340386 3' - INE-1 136 1 49.50 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCACAATTTCTAACTCCGCTCTCCCAAGGTTGACAATACGAAAAATATAC:1 + chr3R 21969127 3' - hobo 29 1 54.46 AGTGTGGTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAATCGTCTTGTCACCTTAATACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAAT:1 - chr2L 16687334 3' - Transib-N1_DM 226 1 74.26 ACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAA:1 - chr2R 19209492 3' - Doc 90 1 74.26 TGGAGCGTTCTTGGTGGGCGAGCTCTGGACAGTGCCTTGGATAGGCACATTTCTGTGGCGTTGGCTTAACGATGTGAGGATCATAAATGCG:1 - chr3L 22146089 3' - BS3 1542 1 65.93 AGGTAAGTCATCTATCGAGGGTGATACTGAGGTAGTTTGGAGTGGCATTTTCCGGGATTGTGGATTCGCCCGACCGAAGAGAAGACAGGGTTGCAGATTAG:1 + chr2R 4933938 3' - G7 702 1 70.30 TGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAAAAAACAAGTATATCTATTACTGAAATC:1 + chr2R 17402771 3' + invader4 3039 2 73.27 TTTAAAAATGAAATGAAATTAAATTAAATTTAGGATATAATGGAATCAAACCCGAAACTAAAAAATTTCTTCATCTGATAAATCCTATCATCTTTAATGG:1 - chr2L 11870981 3' + NOF 3956 1 88.00 ATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAAAGGAAAGACACACGTGAGAAACTTTGCAAATGGAAAAGTGAAACTGAAAACTGCGTCGCC:1 - chr2L 14044278 3' + Quasimodo 31 2 64.36 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGACATACAACACTACACAAGGAGAAAACTGAT:1 - chr2L 1590424 3' + mdg1 377 2 74.26 TATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCCAAAGAGGTGATTGCCGTTTAAATTACGAAATCATGCATGCGGCTGAATAAGGGAACAGCAGGGCGATGGAGG:1 + chr3L 5085102 3' - 412 1 2 76.24 GTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATATTGGATTTTATCTGTGGCGAGGCAGGAGCAGTGGCTTTGCGGAAG:1 - chr2R 15599390 3' + hobo 271 1 55.45 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATCACTTTAGAGACAATTTGGTTCAATAAAAATATCACTTGCAT:1 + chr3R 12729421 3' + roo 9039 1 66.34 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATGAATACAAAAACACCTAATGGGTTCAGCTCCAGCTGCGACGCACTTTAGAAGCCATTGAAAGTCGAT:2 + chr2L 7504963 3' + roo 400 1 62.38 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTTATATGAACTGGGTGCACTAATCACCTCAAT:1 - chrX 4056241 3' - roo 8672 2 69.31 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCTAAGTGTTTCGGATCGTGTCAT:1 + chr2R 9129697 3' - P-element 54 1 25.74 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGACTATCAGATACCTCTTACCCATGCTCTAGGAATATGAAGATGTTTCAGT:1 - chr3R 10078309 3' + roo 9047 1 54.46 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGCCCTTTAATACACATCAATAACTATCGACGTCTCAC:1 - chr3L 27262072 3' + P-element 2848 1 40.59 TGTTTTGTACGCTTGTGATTAATTGGATTCTTGGCAATACTCGAGGCGCTCAGATTGTCGCATAGTAGTTTCAATGTTGTGTCTGTTGATAAGCAACGTCT:1 + chr3R 16292000 3' + frogger 394 1 75.25 CTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCAGCAGACCAGACGCGGCGAAAAGTTTCTGGAACAGATGCAATAAATAAGCGTTTCGCCTTTTTGGGGCCA:1 + chr2L 7933756 3' - hopper 449 1 78.22 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTAT:1 - chrX 10210959 3' - I-element 46 1 65.35 CATAACTTCCTATTTTAAAGTGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGCTAGTGGTCCCATTCAAGATAATCCTCTACATATCGGTTTATAA:1 - chr3R 7746511 3' + mariner2 14 1 75.25 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGGTTAATAGCGAAAGATGGCAGGGGTAAGGGAGAGGGGGAGAGGGTTGGGCCAGAGGCTGG:1 + chr3R 11491374 3' + opus 7441 2 71.88 GCTTAAACACACACACACACACACATGTAAGCACATATATGTATTGGCAGGCAGTATATGCATGCACACGTATGTACACCCACACGAAAACACTGCTGTTG:1 + chrX 7154159 3' + accord 7025 2 61.39 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAGTCTTAACAAAGCAGCTGCCAGAG:1 + chrX 17283995 3' + roo 358 2 74.26 AGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAAATGATGATAGAAAGCACAACGAAAGGATTGATGTAATGCGGCTTGATCTGAATTAAAATAATGGTTG:1 + chrX 15220621 3' + invader2 275 1 69.31 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCTGGCCAGGTGTTTCTGGGAAATTAAGAGAAAATGTCACGCGAATGATA:1 - chr2L 19629618 3' + hobo 2911 1 51.49 TAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATACATAAAGATATACACCCGCACACGTACGCGTATAGTCTC:1 - chr3R 18887037 3' - 297 6600 2 53.57 CCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGACTACATTTGAGCAGCCGCAAAGAGCTTGCCCCGAAAAGTAGGCAAGAAAAC:1 - chr2L 10898459 3' - jockey 4694 1 52.48 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATGAAAAGAAGGCATGCGTGCGTT:1 - chr3L 10035739 3' - jockey 86 1 78.22 AAGTAACGGGTATCTGATACTCGGAGAACTCGACTATTGAATTCTCTCTTCTTTTATATTATTTTTGTATTAATTATTCCCAATACAGATTTTTGTCTTTC:1 + chr3L 27859868 3' + INE-1 549 1 62.38 CGTATGAACGTTGATATCTCAGGAACTATAAAGGAAGATCTCAACCTCAACCTAAGCATAATCTAAAAACCGAATATAACCCGTCCACAACATGGCATATA:1 + chr3R 31045889 3' + INE-1 136 1 81.19 ACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAAACAAACATTTTGTTACCAAACAATATAATATTCATATGTTTTTTGCGTTATTTTGCACTTTTCATTAGT:1 - chr2L 16968388 3' + 1360 3383 2 71.29 AAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTAC:1 - chr2L 23295814 3' + micropia 403 2 73.27 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATTATAATGCCGGGCCAAAAGCAAGCCAAACCGAATCGA:1 + chr3L 14285097 3' - roo 8670 2 74.00 GAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCCCTCCTTGCAACTTCTGCTGCAGCTTCCTCAACT:1 + chr2L 7104983 3' + Doc 325 1 66.34 TGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAAATCGTAATTACCCAGCCCGAGTCGTCGTGGCCGCAGGGCCTCAAACATTTAAAAAAAGCAA:1 - chr2R 21563924 3' - 1360 3204 1 66.34 TTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTACATACAGAGACATTTCTGACAGTTATGGGGGAAATTTGTTGTCTGAGGTACTAAA:1 + chrX 817938 3' + Quasimodo 7355 2 65.66 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACAC:1 - chr3R 10978707 3' + roo 9030 1 67.33 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATTTTCAATTTTTGATGTCATCGAGCGCACCGCACGGCTATAT:1 - chr3L 21992738 3' + 412 7512 2 56.44 GTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCAAAATAAACAGAGCAAACAAACAATCGGGGCCATCAATAATGAAATCGATT:1 + chr3R 10192507 3' + diver2 250 2 65.35 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAAGCAATAATTTATGTCGCCTTCTAAGACACCATACAT:1 + chr2R 10777869 3' - pogo 37 1 67.33 TTGCTGGGCTGGGAGGTCTTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTGCATAGATTTGTTTGATTT:1 + chrX 18007962 3' - Doc 4552 1 78.35 AGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTAAATGAAATAAATGCCAGAGCCCTATGGAAAATCCAAAAACGTGCCAACGATCCCTATTCCAGATAGTCCGT:1 + chr2L 10021906 3' + roo 490 1 70.30 TCTGACTATAATTGATTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCGCCGCTCGTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAAAAAAAAGAAAAAA:1 - chr2R 16256877 3' + Cr1a 4202 1 80.20 GGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGAATATGGGATTAAAAAATATATGCCAATATTATGAAAATGTATTGTAACAATTTTGTTGCTTTGTAATCTCCGATT:1 - chr2L 9299604 3' + 1731 313 2 42.57 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAATCAGGTTGTTGGATGGCATGGGTTAAGGGAAGT:1 + chr2L 7971039 3' - blood 40 2 62.38 GGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGT:1 + chr2R 2529357 3' + 1360 3376 1 36.63 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTCGTTTGGTTTTCAGTTCGCTTTCCAGCTCAGTCGCTGTCAGTCGCTCTGCGCGCTCTTT:1 + chr2L 9437514 3' + P-element 2874 1 67.33 AACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTTACCGCCCCGTGACGTCAGAGGTCGCTGCC:1 + chrX 8908232 3' - 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INE-1 148 1 51.49 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAAAT:1 + chrX 12818894 3' + roo 9040 1 56.44 GTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGACTAAAAGATCCAAGCAATTGACCGAACCATAAAATTCGAAACTACATTAGAGGTAGTTAAATCTTTACCG:1 + chr3L 25723102 3' - hobo 2659 1 74.26 TTGCTTGCCTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGCGGGTAAGTCAGTGAAGAGCGAACTGTGAAAGTGTCGGGAACTTAGAAAGGCGCAGGACACAGA:1 - chr3L 27130726 3' - 1360 3248 1 70.00 TATGTCGATGTTGCTTCTCGATGCGTTGCCCCATAGCTCTTATAGGCCTGTAAGATTAAATTATTTAGACTTCGTAATCTTGATAGCTTAATAGATTTAAC:1 - chr2L 18592123 3' - Doc3-element 4353 1 66.34 AGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAACTTACAGTTCAGAAACTGAGGATCT:1 + chr3R 23274066 3' + invader3 224 2 77.23 GGGTGGGCGCTAAGTCTGTCGACGTATCGGCTGCTGTGGGGGTTGGGGGGTGGTTCAGCATCAACGGCCAAAGATGAAAGCAGACAATTTTGCCAGCTTT:1 + chr2R 20933861 3' - G5A 2615 1 64.00 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAAGTTTTTGCATAACAAATAAAACGAATCAAATTAAGAGGTT:1 - chr2L 3988501 3' - 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chr3L 13674615 3' + hobo 2928 1 68.32 CTTACAAAAACTCAACTAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAAATGGGTGGG:1 + chrX 12818901 3' + roo 9047 1 54.46 TAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAGCGAACTTAGCAGCAATAAAACACGGCCTCAAAAGACACTTACAG:1 + chr2L 21038722 3' - S-element 371 1 55.45 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATATACAAAATAGCTTAAAACCTACGCAGCTGAAAAATGCCACCGAAATATGAA:1 + chr2L 10073656 3' - pogo 19 1 58.42 ACTCGAGTATTTTGTGTTGCCTGTACTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTCACA:1 - chr2L 15832980 3' + hobo 2848 1 74.26 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCATTTATCTGGTACTTGGCTTTATGAATAATT:1 + chr2L 5741365 3' - 412 7099 2 70.30 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGTATGTACATATTTATATGAGTTTGATTGGATTGGTGCGGCATATGTACATA:1 + chr2L 2912110 3' - 297 18 2 62.38 TATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTATCTGTGATTGCCGGCAACTAAAATGGATTAAGATATGAGAT:1 + chr2R 17055179 3' + copia 4672 1 58.42 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTCATTGCTAATTAAGCCAAAGATGGGACAGTATTTTGGAAA:3 + chr3L 16449796 3' + roo 9037 1 61.39 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTTGTCGTGCTATCTCTTGATTCGCTTCTTAAATGTTCCCTTTGACTTTTGTTTCTCTTAATGTAAAT:1 + chr2R 24863095 3' - roo 8690 2 69.31 AACATACAAAAACTCATACTTTTTCTCAAAAAAACCAAATTATACGAAAAAATCTGAAAACAAAACAGGTAATTGTACATTTGGCGCTGCAACGGCGACGG:1 - chrX 13878395 3' + I-element 5139 1 79.21 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAG:1 + chr2R 17346016 3' - hobo 25 1 52.48 TATCGAATGCACTAGTTTAGTGTCTTCCGACAGACGAGAATTGATGTACAATGATACGAAAGCGAATCAGCAGGGCGATTAGCAGAACCAATTGTAGGTG:1 - chr2R 4374883 3' - diver2 4772 2 67.00 TTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTCTGATATTATATAGATGGGATATTAAAAAAGATTTCGGCTTCACTTTAACGGCTTTGAATTGAGA:1 - chrX 18680747 3' - I-element 204 1 60.61 GACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAAACAACTCAACGCGCTATGAATATGAAATTTGTTG:1 - chr2L 17755338 3' + invader2 474 1 65.35 GGATGGGCATGAGTTTAATATATGGCTTATTTCGAGGAGGACGCCGGTGCAGCCGACTGCAATATACCTGCCACACTTGTTGTTGGTGCTGTCTGTTGGAT:1 - chr3L 15190245 3' - I-element 5045 1 74.26 AGAGCTCAGCGCCTACGCAGGCGAAACTGGTTGCCTTGACAGTCCACTGCAAAAGGCGGGCGCGCGGCGTTTTAATCGTCTCGAATCGACACGGCGATTTA:1 - chrX 18515484 3' + R1A1-element 476 1 63.37 TTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATTCCACTTTTGTAGCAAACGCACATAGCTTATGAATTCCGCAATCCCCGATGCGGTGCAGCAGCAAAATGGT:1 - 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Cr1a 87 1 59.41 GGGTAATGACTAACGCACTGTCAAATGCCCCACGTTGGGCGCAAGAAGAAAGAGGAGGCAGAGCTCAATAAAAAATGTAAAGAAGCAGCTGCTAAAAAGAA:1 - chr2R 13662486 3' - gypsy2 375 1 61.39 ATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTTAGTGAGAAGGACCAACAAGAAGTTTTAACACCAGGTCATTTTTTAATTGGAAGACCACCTTTAG:1 + chr3R 19447759 3' + roo 55 2 66.34 CTTTGTCGGTTTTCGCTTTATCTCGCTCGATTTGGGCAGTGACATATGATAAGGGGAAATCGACCTAATTTGTTGGACTCTGCTTCCCACGAACTTTGAAG:1 - chr2R 17639986 3' - G6 444 1 71.29 AAGTGTGGGCGTGACCGTTTTGGGCGTTTTGAAGGTGTAGGAAACCCTAAGCTATATGCTATCAAAGTTCATGCAAAATTCAAAGGCCCAAGCCAGCATAA:1 + chr2R 9662551 3' - INE-1 244 1 62.38 ACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGACGTGGCTCTAGAGGTGGGCGCTTCGTCCACTTGACATGCTACACCGATTTGCCAATGGGACAACTG:1 + chr3R 14859846 3' + 1360 29 1 53.47 ACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTACAAAAGTATTATCAAAGA:1 - chr2R 15082000 3' - 1360 452 1 72.28 GAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTTATAGGCCTCTCCGCCACGCGGCGCTCTAATGCAATAGTCAAACATAAATTTACATAAATATTGCA:1 - chr3L 14932238 3' + Tirant 8346 2 75.25 GCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACACGCCCCGTCAATATAAATAATTGCTAATTGCTAGCCATGATTAATGTCTGGC:1 + chr3L 8070169 3' - 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Doc 4317 1 64.36 TTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCGAAATTTATTCTGTTTCCCATGATGATCCA:1 + chr2R 15040613 3' + roo 8960 2 73.27 CTCCTCAACGTAAACGTCCAAGAACATCTCCCTACTTTACTCCTATCTCGAAATATGCTCAAAACAAGATGCTCAGCCCGAGTGACAAGTAAAAACTGC:1 + chr2L 14080418 3' + McClintock 92 2 75.76 CTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATT:1 + chr3R 25443122 3' + 297 6950 2 63.00 ACTTTTTGAAAATGTTATCACTATTCATTTGCAGCACCTTTGTAGGCACCAAGTACATATAGAAGATACTTTTCCGATTCACTGCCAATACTAAAGTGATC:1 + chrX 9963903 3' + Q-element 144 2 64.36 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCAACGCCACTCGAGTCGAGTGGTCCGGAGTAACGAGG:1 - chrX 13587934 3' - hobo 41 1 63.37 CATATCTTGAGGCGCGAAGTGCGGACACTAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAA:1 + chr2L 17599965 3' - 1360 478 1 61.39 GGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGGAATGTTCAACTCACTTATGCTTAAAAGAAGAACCATTTTGAGTTGGTTATTATGGGGT:1 - chr3L 3988485 3' - 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Doc 226 1 81.19 AATTATATTTCATATAAAAATGTCCTCGTTTTGACAAAAAACAAATCTCCACTGCTTGCACATTAAAAGTTAAAGTCATCTAAAAGTTTCATTTGAAGATT:1 - chr3L 16222196 3' - S-element 93 2 30.69 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCAATGCACATTGTGCATTGTGTTTTTCGCAGAGATGTGTATATGTCTA:1 - chrX 19819973 3' - hobo 29 1 57.43 GGGTATTTGATAGTCGGGAAACTCGACTCTAGCATTTTCTCGATGCCATCTCCGAAAAAGAGCA:1 + chrX 22743920 3' + INE-1 556 1 60.94 TGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCTTCATTAGGGCACTTTGTGGCTGGATATACCTTGGTTTGGCCTCTTTTCGCATAATT:1 + chr2R 11488754 3' - Porto1 239 1 58.42 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGTGCACTTGGCTGGCTTGTCAATCGAATTTGCATTTAAACTGCAAATTT:1 - chr3R 21969054 3' + hobo 2921 1 54.95 GCCAGGTGGTTGTGGTGGTTGACAGTCAGTTTTTGTTTGCAGCGGGGTTCATGACCCAACATTAAGCAGTGCCGCTGTTTATTTGGCTTAATAAATCAAAT:1 + chr3L 6839722 3' - G2 2860 1 64.36 TATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCATTCAACAAAGCCGCATTCCCTCTGTGGAAAGCTTTTCACAATTAGAAGCAGATCCTGGCCAGCAGTCGAAG:1 + chr3L 20077054 3' + Cr1a 4225 1 76.24 GGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTGGCATTTTCGATTTGGGTCAATGATTTAAGCA:1 + chr2L 20540098 3' + hobo 2579 1 68.32 CGAAAGCAGTCTGCACGCTAAGAAATTCTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAACGGGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGTGTTGTGTGTGTGCGTGCTGCC:1 + chrX 18371247 3' - Cr1a 338 1 68.32 AAAATCTGCAACCACTCTGGAAAATAAAGTTCGTTTATAGAAAGCTATACTAAAGCACGTTTTGACTTATAAAATTAGATCTGTAATCAAAAATCTAATTT:1 + chr2R 5539218 3' + G4 3368 1 65.35 GAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTCGGGGGAAATTGGTTTGGAAAATGTCATTCAAGTTGCCAGGCAAGTTGACAAAT:1 + chr2L 11960973 3' - F-element 4501 1 57.43 GATATTTGCAAAAAACTACGATTAACATGTAAACAATTTTCCGAAAGTGGGGTTGTTTGGAGCGGAAAATCGAATGAGTTGACTCTCGACTTGAATTCGGC:1 - chrX 6925347 3' + Juan 105 1 78.22 GAAGAGTCGCGCTCCGACATGTATATAAAACATACAAAGCTGTCGGAAACTAGCGTTATTAACAAGTTGGTTATTGTTACGGTCATAATTGGCATGTAAAT:1 - chr2L 5974431 3' - invader4 2757 1 82.18 ATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGTTGAATTGCGTGCACAGGATGGTGCTG:1 + chr3L 17432079 3' + hobo 108 1 72.45 TCCGTCTGTCCTTATGAACGTTGAGATATCAGGAACTATAAAAGATAGGTTGAGAAGCCCACAAACCACACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAATAT:1 - chr2R 12521468 3' + INE-1 126 1 45.54 CTCTCTCTCTCTCTCTCTACTATCTCTGTTTACATTTGTGTTTGTAATTGGATTTTTGCCGACTCACTTTGGGGCTCTGTCTATCCGGCTCTTGCTCTGTT:1 - chr2L 1344482 3' + blood 169 2 56.44 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGCATAGGTTTTTTTATTCAATATATGATTACTGAACTGGTATTTATCCTTTGGCTTTCT:1 - chr3L 17786276 3' + roo 9055 2 60.40 AACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTGTATTTTACAAGCCGCCATGAGGAAGATTTTTGCTG:1 + chr3L 14500994 3' - Doc 4639 1 64.00 AGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAGAGTCAATATAATCTTCAATTTGAATTTAGCATTAGAAAA:1 - chr2L 18773310 3' - Max-element 8274 2 67.33 AAGCAGACACAGCTTTTTCACTGCCCGCATTATTAGTTGCCAGCCGCGGTATAAATTTCGGTCAACAGCCATAAGCAGAGATTTAACAGTTAACATTGAAA:1 - chr2R 20403347 3' - diver2 4465 1 73.27 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATGAATACAAAAACACCTAATGGGTTCAGCTCCAGCTGCGACGCACTTTAGAAG:1 + chr2L 7504948 3' + roo 392 2 51.06 AATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTGATCACTTTACTAGGTACGGCACACGCGATTTCCAGTCTTCCAGCTGTATATGTGTACATTAT:1 + chr3R 28331025 3' - P-element 2672 1 43.56 GAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGTAGTAAGACCCCATGGAAGAACTCTTCCTCTATCACCAGTTTAATGTTAGCTAGGTTGGG:1 - chr3R 15631090 3' + opus 487 2 64.36 GCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCGTGTTGGGGGCGCACTTGATGCCGCATAAAGCGAAAGTGGCACACCCA:1 - 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hobo 14 1 60.64 AAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGGCATTGTCGATCTGCTTCCTCAGCAGAGCTACGTCCACGGCCAGATCACTTTCCAGCTTGGACAG:1 + chr3L 17427929 3' + Doc 4498 1 72.28 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGAAACTCATATTAATGTTTAAATTATCTTTTAAATT:1 - chr2L 17887153 3' + hobo 2898 1 65.35 AATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCGCTCGAGCATTAGGAATCATTATTTCTGGCCAGCTCCTTTTGCCTTTGGCTGCTGCA:1 - chr3L 18477233 3' - hobo 315 1 58.42 TTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATTTGAAACCGTACTATGTACTTTTAAAT:1 + chr3R 6425914 3' + copia 235 1 56.44 TTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTTAACAATCTTATTCCTTCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTGCGTACCCTATGTATAGTTCAGTTT:1 + chr2R 13748308 3' - Idefix 6967 2 75.25 TGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTTTGTGTTGCTTTTGTTGTCCCTGGACCTGGTGTTACGTGACGGTCGGAAAGGCAGCAGACA:1 + chrX 7335463 3' - Tirant 8270 2 62.38 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGATCTTGAACCTCCCGCGCCTGCTCTCACCTCACCCTAGAGCTTTTGT:1 - chr2L 128685 3' + P-element 2860 1 53.47 GGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTATGCTTTCTAAGTTAAGCTCTGGATTTTTGATTGTTTGTCGTACTTTATTTTTAAAAGGGTCTATTGTAAAGG:1 - 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HB 1614 1 68.32 GGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAGTTGCGGTGCAATTGTGGTCGACTGGATGCAACCAGTTCGCTTGT:1 + chr3R 545285 3' + Transpac 306 2 79.00 ATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCTTGTTTTGCCCTCTCAACGAGTGCCAGATTACGCATACGCAATGTGTGCTGCCATTGTGTTACATTGTGTTATGT:1 - chr3L 5387761 3' - mdg1 7038 1 79.21 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAACAAATCTAGGCAGGCCAAAATCCAAGAAAGAGGCAGTAAGAGCT:1 + chr3R 18026977 3' - mdg1 7070 2 57.43 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACACACACACACACACACACACAAAGAGCATCGACAACTAAACAGTTCGTCGAGCAGAAAAACGAG:1 + chr3R 19734583 3' - hobo 4 1 54.64 GCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' + 1360 478 1 58.42 ATGTACATATGTATAAATACAGGTCTTGAGATGCCCATTTGGTCAAGCGCACACTGAGCGAAAAAGGTTAAAAAATTACATATGTATATTTTTTTGAAATT:1 + chr2L 12548422 3' + invader3 5090 1 72.28 GTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGCAAGGTATAAACAAAATACAGCTCAGCAAATAATGGGTAACTTGCCAAAATATAGAGTGACGATGACATTCCCGT:1 + chr3R 19447189 3' + roo 8728 2 76.24 CATGGGGGACAGCTGCGCCTATTAAATGTGCTGTACGATATATCAGTACATTGTTCAATGCCATAGCGCAAAACAATTATTTTTCCAACCAAAGGAAAAAA:1 - chr2R 4678648 3' - Doc4-element 2366 1 74.26 TAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAATATAGAAGGACTAAAGTACAAGGAACGAGATGGCTTTGAG:1 - chr2R 18453890 3' + jockey 4666 1 59.41 GTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTG:1 + chr2R 2879475 3' + Stalker 132 4 60.40 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAATAATTAGGAAACAAATTGAAATATCATTAACTATTTA:1 + chr2L 11156322 3' + copia 218 2 72.00 CCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGAATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATATATACGGTTTGTGTTGAGTGCAGTTCGATTTCAGTT:1 + chr2R 11400368 3' - 1360 41 1 64.36 CCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTATTTGACACTCATACATTT:2 - chr3L 21912255 3' - Bari1 26 1 58.42 TACTAACAGTAATATTTAATAGTTATTTTACAGTTATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCGTCCTTGCGATTGGGTGCCATTTTGATATACGCTTTTT:1 + chrX 13004740 3' + Cr1a 4299 1 62.38 ATCCAATTATCTCCAATAGTCTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCCATCGTGCAATATCCTTTTTGC:1 + chrX 12883622 3' - hopper 49 1 75.25 CATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATGTATATAAAACATACAAAGCTGTCGGAAACTAGCGTTATTAA:1 - chr2L 5974470 3' - invader4 2796 2 64.36 GTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAGTGTCGCGAAATTTCTTCGCGCCCCGTGTAACGCATTTTAATTGCCTTCGCCATC:1 - chr2R 19039009 3' + G-element 55 1 67.33 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCAGAGCCCAACATTTTCCCTTGATTTGCCACCCAATTTCCCCAC:1 - chr3L 5085002 3' + 412 461 2 56.44 TAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAATAGTACAATGTTGTGTTTTTCTTTCTGCGCACGTACATATATATGTATGTATATCGATCTTTC:1 - chrX 10780931 3' - transib2 353 1 67.33 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGCCGGCAAAAGTGTACATATATATACTGACAGACATCTTGCCGACATCAGTGTAGGAAAAGAT:1 - chr2L 20387798 3' - 297 6588 2 70.30 CGAGTGGAAAATGAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCCCCCCTGGAGCACTTATCACTTGGAAAGCCAAGAGCAAGTGCAGCAATTTAAGAA:1 - chr3L 1074756 3' + 297 460 1 56.44 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGACTGCAAATTTATGCCTTTTGTAC:1 - chr3R 9081950 3' + hopper2 1560 1 71.29 CTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCCACTTCCCCGCCCTTCCCACAAGTGGGCGTGTCCTTGTCCACTCCCACAGGACGACCGCTGGTCG:1 + chr2L 4233237 3' + hopper 1147 1 64.36 TAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTCAAATGATGTGAATGGTTCTATTTAGGA:1 + chrX 16456841 3' - I-element 5090 1 72.28 AGCATAAGTGGCAACTACAGACAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGAGATATGACCACAGTCGTTTTCACAGAAGACCTTATTCTTAT:1 - chr2L 9347926 3' + rooA 85 2 68.32 AATGTAAATAAAAAAAGGATAACAAGAAAAACTAACCGGATTTTCTTTTTTTCCCTATCTACACATTGTATAATACACTACGCTCATTCAAGGTATATAAA:1 - chr3R 24686160 3' - HB 161 1 67.33 ACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTTTCATTTCTCGCTTTA:1 - chr3L 5267187 3' - Juan 3973 1 75.25 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATT:1 + chr3L 14285061 3' - roo 8707 2 71.29 GAGGGCGCGTTCGATGTCTCTTGTTATACGAAAGGGTTGAACTTTGTAGTAGGAGGAGGTA:1 - chr2R 18454914 3' - jockey 4585 1 52.46 GTGGCGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGCAACAGCGTCTCAGATCTGGGCATGCTCCATTGCCGCGACCCTTGGCTCCCATTTCGCCACCGGATGGTATTG:1 + chr2L 1936216 3' - ZAM 138 2 78.22 AAAGAAAAATAAAAAAAAGGAAGAATCGTGTCAATAATTGGGGTATAATTTCTTTGGTCAACAGCTATGCAAAATTATGAATCATCGCGAACCTAATGAGA:1 - chrX 9992122 3' + Doc2-element 225 1 59.41 TACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATATCAGAGTGGTTTAATAAAAGAGGAATGGTTTTTTCTGAAAGCTCTCTCCTTG:1 + chr2R 6735345 3' + Burdock 235 2 59.41 ATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGTATTCAATAGTTTTGTGGCTTCAATGAAGCACGAAAA:1 + chrX 8707753 3' + Stalker 7097 4 60.22 GTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGATGGTCGGGATATATGTATGTATGTATATACATGTTT:1 + chr3L 10329197 3' - accord 6911 2 63.37 GAGATCTCAGGAAATATAAAAGATAGAAGATCCAGCATACGGATTGATTATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACATAAATAACTAATTTGCAATTTGGTA:1 + chr2R 18487376 3' + INE-1 148 1 42.57 TAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATACATTTAGTTGCGCGCTCTAATGCA:1 + chr3L 5267293 3' + Juan 4202 1 64.36 AAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTACAACAGCCATAATAAATTACATGTTTCGGCAGTGATTTGGCACATTCC:1 + chr2R 17263521 3' - I-element 280 1 62.24 AAGGCAGTCGTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTGTGGCTAGTTAATTCTGAACTTAAT:1 - chr2R 17291146 3' + Tabor 7190 2 75.00 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAGGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAAATGTCAGCCAAAGTATTTCGCATTCATAAATAATAATAT:1 - chr2R 16980054 3' + opus 468 2 58.42 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCCAAAGAGGTGATTGCCGTTTAAATTA:1 + chr3L 5085055 3' - 412 7101 2 72.28 CACACACACACACACACACATTAATAGAGACATTCATTCAAGCAGTAAGCCCGAAAAATCCAACTTGTTTACTGATGTCCACTTAATATTTTATTAAGTGA:1 - chrX 9110246 3' + accord 184 2 61.39 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGGGTCATGAGCCACGACCGAATTCTCGGAC:1 + chr2L 16396620 3' + 412 7498 2 74.26 AATATACACACACACATACACACACTTATTTGGTGAGTAAATGCCACACACATTCATAGGCCATCACACAGATACTGAATCACACACACACACTCGCAGAG:1 + chrX 6428832 3' + accord 7099 2 65.35 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAATAAATAAAAATTAAGCCTTCGGATCAAATTAGTTTCAATTGTATATTTATACTAATAATGCACACTGATT:1 + chr2R 12753119 3' + Juan 4199 1 53.47 TCCTCCCGGTCCAACTTCAGGGTCAATGGAGGAGACCACGTCAAAGACATGCCAAACATATCACGTAAAACATTAAAATCCTGGAGAGCTTGGCAAAATG:1 - chrX 10677316 3' + G5A 136 1 76.00 AAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAAATGCCAAGGCCTAATGAAACAAGAAGCAATGAAATTA:1 + chrX 3103007 3' + hobo 314 1 66.34 CGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGGTGTATACAGCCGGAGGGGCAGGTGTGTTGACTGACAACCAG:1 + chr3L 21042496 3' + Bica 4914 1 58.42 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGACTGCAAATTTATGCCTTTTGTACAGTCTGAAACTGACTTTCCTCGGGGATACTACA:1 - chr3R 9081917 3' - hopper 15 1 62.38 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTATATCAAATTATACTTTTCGGGTAGTCAT:1 + chr3R 20369729 3' - pogo 46 1 75.25 AAAAAGAAAAAGAAAAGGGAAACGGTTAGCGGAAAGTTCAAGCCGTGGTTAATTTGTACAGACAAGCGCTCACTTCTGCTCGTGTTGCTGTTGCTGTTGCC:1 + chr3R 31440352 3' + Doc2-element 245 1 78.22 TGGTGGATTTAGCTTTTGTTCTTTATGATTCTTCGTCTCCATTTTGTTAGCGCATTGAGCGGGGGAAAATTACATTCTCAGTAAAACAAATGAAAACACAG:1 - chr2L 3420354 3' - HeT-A 279 1 64.36 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGCATTGAACACCTGTAGCTTAGTTGACATTGAACAGTAAAATAATGATTTGTTTTGATA:1 + chr3R 10078400 3' - roo 17 2 62.38 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTATATGAATCCTATTAGGATGTAAGGAAGACCCTCCTTGTTTAACTTTAACTAACTTTAAACTAAATGTA:1 - chrX 3195598 3' + mdg1 415 2 72.28 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTATGTTCCAGTTTAACGAACTGATCCACTTGGAGTGCGTCATCAAGGAATCACTGAGGTT:1 + chr2L 5269883 3' - hobo 15 1 64.36 GCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAAAAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTTATTTTGTTTCCTGACTCGCAGGATCTTGTGCGTTTGTTTGTTTGT:1 + chr3L 3580712 3' - diver2 4882 2 57.43 ATTTTCAAATAATAATAACGTTAGGGCAATGCAAAACAATAATTTTTCGCCAGTTTGCAAGAATTGCCAAGCCTCGTTGAGAACTCCGCGCAATACGAACG:1 - chrX 6726936 3' - 1360 312 1 60.40 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCTGCCACTGCCACTCGCCGTCCATATGT:1 - chr3R 27993138 3' + transib2 2778 1 72.28 AAATTTGTTAAACATGGAGAAAACAAAGGAACTGAGCGAATTTATAAAAAATGAAATGAGGTCTTTGAACCTGTAGGACAACGCCAGCACCCGCGTTAGCA:1 + chr3L 26701170 3' + Tc1-2 343 1 56.44 CCGCAGTTTTTTTTTTTATTAATTATATTATTTTACATTGCTATTTCCGGGCTATATGTTTCGTATGAAATACTTTGGTTGTTGAATTAAATTTTTCGTTT:1 + chr2R 11404894 3' - TART-B 10514 1 53.47 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTAAGATAAGCGTGCAAAACGTGATCCAGATTTAGGA:1 - chrX 14521652 3' + roo 9036 1 61.39 TCATTGAATACACCCTCAACTTAGTTCAGTTCTAGTTTTGTTTAGTTTTTCGTTTGCCCCTTTTGTGCCTTTGCCTTTTGTTTACCCGCCTGAATATGCTT:1 - chrX 21418103 3' + Transpac 129 2 53.47 GACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAGTTGCGGTGCAATTGGGGTCGAC:1 + chr3R 545263 3' + Transpac 283 2 57.43 GTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTAAGTGGGTAAAAGGACGATGATGTATATTTTATGTACCGGATTTGTGTACTTTTTTCAAATTTTAGGAAATA:1 + chr2L 9175139 3' + S-element 1714 2 54.46 ATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTTTTTCATTACGTAATATCCAGGTATTTTGGAATACGAACACATGGTGTTCCAGAGCAGCAG:1 + chr3R 3702663 3' - Porto1 4256 1 55.45 TGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACTGCGACCTAATAAA:1 - chr2L 14074944 3' - jockey 246 1 50.50 ATATATAATCAATAAAATATTTAAGAAAAAAAAAACCAAAAAACCCATATCCTTACACACCCTCACACACACACTGGCACAGATAGTGTGATACGAACAC:1 - chr2L 8842046 3' + transib1 1924 1 67.00 TATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCCACCCCCCCACCAAGCCCCTTCTCTTGCTAATTATGTCACGTCG:1 - chrX 3111586 3' + accord 434 2 56.44 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATACAGTATTATTGGTATGTTATACCTTATACTTATTTTTTAGCGAGGTTTATTTAGTTTAAAATTTTAGTA:2 + chr3L 10792271 3' - pogo 3 1 76.24 TGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCAATCCCCAGATTCATGCATATTTCACCTACCAA:1 + chr2L 16032341 3' + 297 356 2 70.30 TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTTTGTTAACAACTTTGTAAGATTCCTTTAATTTAATGTTAAGGATGAATACCTGCCA:1 - chr2L 11156249 3' - copia 21 2 58.42 CAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCGCCCACGAAAACAGTATACCTCAGGCTGGGGGCCAGCGTGATGCTGGAGTATCCGCTAGACGAGGCGGAGGCTCTG:1 - chr3R 11409278 3' + roo 8831 2 76.24 TTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGTGCATGAGTTCCACTTGGCCCGCTGTGCCTTTTCACATGA:1 + chr3R 26281391 3' - Quasimodo 460 2 66.34 GAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACAAACAAACACCTGAGATACATCATTAGATTAAACGCAAAAGATACCACGAAAT:1 + chr2L 17348696 3' - Cr1a 281 1 55.45 CAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGTCTATGGTCTATGGTATTTCCCTGATGTGCATTTAAGGGAATTAATTTACAGGTAGTTTACATA:1 - chr3R 26509401 3' - G2 2919 1 57.43 CTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCGGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTTGACATTGTTCTAGGGGAGCAGTG:1 - chr2L 1238183 3' - F-element 498 1 74.26 CTTCTCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAAGTTTTTGCATAACAAATAAAACGAATCAAATTAAGAGGTTATTCAG:1 - chr2L 3988495 3' - I-element 9 1 78.22 TTAAAAACGTTTTAAAATTATTTAAATTTCTTAGATACTATTTTGAGTTTCCAAACAAGACTGTTGTTATAAATGCTTTTGATATGCAAAACCGTAAAATG:1 + chr3L 9336594 3' - transib4 109 1 33.66 AAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGATCCAAGATTTACCATTTACCCGAAAGATACGAAAAA:1 + chrX 3358765 3' + roo 9036 1 61.39 TGGATGTTTTCGTTCCGAACGTAGCTTAGTTTATAAAAGACGAGGAACTTAGGAAGTCGATTCGCTGCTATTAAAATGTGAGGCGAGTTTTTATTCGCTTG:1 - chr3R 7049798 3' - F-element 4371 1 75.25 GCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCACGTATCCGCTGGCAATCCCCACGCTGCCACTCCCCTCTGTCAATTATGGTCTATGGACATTAAATGTC:1 - chr2L 12330689 3' + HMS-Beagle2 117 2 64.36 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTCTGAGTGAGTGCGGCATTGAATTT:1 - chr2R 23106501 3' - jockey 63 1 79.21 CTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCT:1 - chr2R 5582184 3' - Cr1a 458 1 50.50 AGTGTGCATATGTGTGTGTGTGTGAGTGCTGGTGTTGTTGATTACATCTGCCGCTCCTGTGGTCGGCCGCCTTTTGGCCTCGTCCTGCCACAGGCACATCC:1 + chr2L 13464881 3' - accord 7036 2 72.28 GTCTGCGCCGGCAGAGAGGCCGTCGGCAGAGACGTTGCTTTGCTCTTATGTACTTAACTCTGGAGGGTGTCCTGTCCTGCCGGAGGACCCCGAATCCTGCC:1 + chr2R 22002900 3' - Tabor 7127 2 58.42 TTGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAAGAATTGGTCAAGATTTACGATCAATTTGTATGTGTGTATATTTATA:1 - chrX 3200441 3' - rover 7137 2 55.45 GGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCAGGCCATCTTTTGAGTTACAATGATGTATAAAGTTGA:1 + chr3L 15452926 3' + accord 496 2 63.37 GTTGCTAGGCCACTCCCCTACACGAGATTTGTGGGGAGTTTTAAGACACATCACAAGACACATCTAAGTCAAATGACTTATTAGGATGGTATGGGACAGGG:1 - chr2L 22407378 3' - gypsy8 32 2 63.37 AGTATCGCAAGACGGTGCGATCTATCTTTAGTTAATTTACACATAGAATATTAACTAACAGAGTTGAGTGTACTTTGAGAAATTTCTCCCAACAGTAATCA:1 + chr3R 3149625 3' + Gypsy6A_LTR 384 1 63.37 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGACTTTCGCGTTTATTTTTTACTACTTACTTACTATTTGCGCTTATATTTCCCTACTTTACTATTGCAACAAAA:1 - chr2R 4582642 3' - 297 6583 2 78.22 ACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAA:1 - chr2L 23286585 3' - Tirant 417 1 60.40 CTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTGTTAAAAAGACGAGGAAAACAAGTTAGAGATGATGATAATACAACGCGACGA:1 + chrX 20487555 3' - 1360 3240 1 56.44 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTGAAATGGTTT:1 - chr3R 27071888 3' - jockey 4711 1 64.36 TTGAGTGTCCGATTATTTGTTTAGAGGCGTTGCGGAAATCTGAAATGGCATCAAAACTGTGGAACTGCGGACCTTGAAAAGCGCGACAAGAAATACTAGAA:1 + chrX 7334658 3' - Tirant 8145 2 75.25 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAAACAAACATTTTGTTACCAAACAATATAATATTCATATGTTTTTTGCGTTATTTTGCACTTTTCATT:1 - chr2L 16968391 3' + 1360 3380 2 68.32 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGCATTCACAAACAACAGACTTTAATCAATACTCGTGGCCGAATCCCATATTGCCCTCGTC:1 + chr3R 4524265 3' + mdg1 7443 2 62.38 GGAATCCTGACGACGACAGTATCGTAAGACGGTGCGATCAATCATTAGATTAATTGGCGCCCCACTAAGGAAACCCCTACCAATGCTCAGGTAGAATCCAG:1 - chr2R 22917138 3' + Gypsy6A_LTR 367 1 75.25 TTTTTTTTAAATTTTACTATTTTTTGAACAATTTTCATTTATATGCCAGATGGCAGATAGTTATCTTAAGTACGTGTAACTGTCGCTCGATCCAAAGTCGA:1 + chr3L 16322013 3' - Doc 4690 1 58.42 TATTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCAAAATGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + hobo 90 1 48.42 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCTGCCGAAAGAGAGTACTTCTTGGGTGATATGAGAAATAACATTGAATTTTCATGCCGGCTGGTGTTG:1 + chr3R 15665005 3' + P-element 2878 2 63.37 GACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCAGGCCCATTTGCATTATCACGGA:1 - chr2R 15712035 3' + roo 8695 2 77.23 ATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGATAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGTTCTGCAAGCTGCGCCTGCTCTGCCGCACCT:1 + chrX 13712284 3' + Bica 4885 1 69.31 ATTATATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACAGTCAATACGCACAACTTCT:1 + chr2R 4023401 3' - Doc2-element 71 1 61.39 TAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCAGCGAGTGGGTCAGTTGGCCCTGCAAGCGGAACGGCA:1 - chr2L 11838610 3' + hobo 2874 1 68.00 CTATGAGGGCTCCTCCTTCCACCCTCCCCCCACTTCAATTTTATTATTTGCGCGACACACATACAGCAATGAAATTGTAGTGGGGGGAGGGTGGTCGGCAA:1 + chrX 22578317 3' - Rt1b 4908 1 44.55 GGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGCTGACACACATAATTTTTGCTCTTTTTCGCCTCAGCCCGTTTCGGC:1 - chr3R 9940116 3' - I-element 5046 1 54.00 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATCAAACTTGTTTAAATCTACTTGCATACTTTAGGGATCTATTAAGCTTGTGGTGCAT:1 + chr3R 27071950 3' + jockey 4982 1 57.43 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTGTATGCCAAGCGTAAGCGGAATTGCTTCAATTTTCGTTTTGCTTAACG:1 - chr3R 27386281 3' - hobo 28 1 54.46 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTCTCAGTGTATGCGTCCTGGTCAGGTTGTCCTTTTTTCGGGATTGCATTTCCG:1 - chr2L 17168425 3' + flea 235 2 59.41 CATAAGGCTGGCAGTTAAAATAGGAAAGTTCCTCTCAACATAAATAACAATCTTCTGCACCTCCGTTCCCCTTCGTTGGCCAACTTTGTTTTAAGTGAAAA:1 + chr2R 17256824 3' + Gypsy6A_LTR 260 1 55.45 AACAATACCGCCAACCCGGGCTCAAGCTCTTAACCAACAATGGCTAAGTTACACCGATTCGGAGACCCATTCATTTTCCCTGTGAATTTCCTCTCTAAACT:1 + chr2L 19899517 3' + I-element 145 1 68.32 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGTGGTTGCCGACTTTGGCTAATCTGTAATTATCCCCTCAAATGATGCTGAACTGTAAAGTTAGTTCCG:1 + chr3L 3481551 3' - I-element 63 1 71.29 ATTGATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGAGCACAGAGAGCTAAACTCAGACGACGCCAAGT:1 - chr3L 19234581 3' + I-element 306 1 68.32 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATAGTGCCCCATCATGTGGCATTCCTAAACCCAAAGTGTCTTTACCCGCTTTCGGGACGTGACCG:1 - chr2R 15606002 3' + roo 395 1 71.29 CGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACATATATATATGGGCGACAAATGTTTATCCCATTGATTTGAA:1 - chrX 10736180 3' - FB 37 1 67.33 AAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAAGAGAACACACTTGGAACAGTTGAATAAAG:1 + chrY 3648904 3' + HMS-Beagle2 7189 2 73.27 TCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGGAACGGTGATAGTAGCAGAACAGACCATTTGAACAAAAAAGAGCTCGGAGAACTTCGCTGAATTTGTATGAAGT:1 - chr2R 5036683 3' + Doc 182 1 73.27 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACAGTCCAATGACAGCGCCTATGTCCAGCGAC:1 - chr3R 28879931 3' + roo 359 2 71.29 ACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAACTTTTTTTTTGTTGCTTACGAACCTT:1 - chr3R 21975353 3' + flea 437 1 73.27 TCTAAATAAAAAATAAAAAATAGTAAAAATATTGTTTAAGATAAAGTACTGCATTTTCAGAATATACTGAAAAGAAAAGACTTTACTGAACCTAATTGAAG:1 + chr2L 9657367 3' + BS 5091 2 71.29 CTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTGATACGGACAGACGGACATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTT:1 + chrX 21587701 3' - INE-1 148 1 75.25 GTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATCAGAGCCGAATGATTGAGTGCTTGTGGCTGAAACTAAGTTCTTAATCGTAGACTGGGACTT:1 + chr2R 17975798 3' + 1360 409 1 63.37 TTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCAT:1 + chr3R 8914533 3' + roo 363 1 64.36 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGATATATTTCCTGTTTCTATAGTAATTTAAAGGCATTC:1 + chr3L 11335515 3' - pogo 36 1 64.36 CGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTCTGTGTGCCTGTTAGGCGAGTGGGCGTCGCAATCAAGTGCCAA:1 + chrX 773263 3' + opus 168 4 63.37 ACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCACTGACGGCTCTTGAATAACAATTTGTTGACAAGGCAGTGTCTTTTTTCGGCAAGTTTTCCAGC:1 - chr2R 2645437 3' - HMS-Beagle2 6886 2 76.24 AATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAGTTGTTTGTGGAAAACTCGTATGCAATGGAATTC:1 + chr3R 25696103 3' + 1360 377 1 66.00 CGTTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTTCTATATCTACGAACTTTTTCAATGCATAATTTTTCTTCGAGTGTATATTGAAGTGGTCGGGGGTGTGGACTGAGGC:1 - chr3L 21871120 3' + Cr1a 4340 1 76.24 CAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGCTAAAGCTAAGCTAATGTTTGCTCATTTGGGGGCTAGTCTATAGGAGCTGGGATCTCGGAACTTGGTCCTATCTGTG:1 - chr2R 21851497 3' - blood 167 2 57.43 GAAAAAAAAGGTTTCCGAAGCCAAACCCAATAATAACAAACCAATCATCAATTCGGGTTGGATTCATCTAAGCTTCGAAAGAAGCATTAGATATATGTATA:1 + chr3R 5683954 3' + Tc1 1186 1 69.31 GAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTTATTAACCACTGACACTAATCCTATTAAATATTTGTTTTTAATTCAT:1 - chr3L 12755092 3' - P-element 2807 1 49.50 TCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATAGGCATGAATTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCAACTTGACAAACTGTCAGTTGTTCGGTTGTATTGCAGCGATA:1 - chr2R 8417710 3' - I-element 5065 1 69.31 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTAAACAGGCCAGAATCCGAATCC:1 - chr2R 10158686 3' + P-element 2834 1 27.00 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGCCAGGTGACAACTTCCGCCCGCTGTCCTTTCTGCAAAGTAAATTATAAAT:1 + chr2R 16891477 3' - jockey 4764 1 52.00 TAGTCTACCATTGGGTGACTTATCTAGAATTGGTTTCATTTTTTTGCATTGGGGTTTGTTTTGAGGCCTTGCCAGTCGATGCTAAATAATAGCA:1 + chr3R 3850470 3' - Idefix 170 2 71.28 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATGCTTGCATAATGCAAACAGCCAA:1 + chr2L 5659472 3' + jockey 4938 1 80.20 AATAATAAACAATCTTACATACATATTCAGGTTTATAGTGTTTACATGTAAGGTGTTTGTAGGTTCTTTATTGAGGCAAATATATAAAAAAATAAATAAAT:1 - chr2R 19069325 3' + flea 257 1 80.20 ACTATCAGATACCCCTTACTCAGCTAGTGTAAACGCTTTCGCTCACCCCCAGATAGCTTTTGAGCCATGGTGTTTAGGGTGTCTTTTAGGCGCAACATTCC:1 + chr2L 119040 3' - INE-1 548 1 71.29 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCTCGATTATCTTACTTGGCCCAAACAA:1 - chrX 15259044 3' + roo 358 2 81.19 GCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGCGTCACACAAGCGTCAGTTCCGCATGAAATGTGTACTATGTGCAAATATG:1 - chr3R 27435028 3' - jockey 4668 1 51.49 CACATATTACACATAAATAATTATCAACATAAATATAAATATGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAAGAAGAGTAAAAAGAGCGGTGTAAATG:1 - chr2L 9876783 3' + 1360 2935 1 74.26 TTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACATAGTATGTGCGTATGTGCACATACGCAGACAAACATT:1 - chr3L 27262268 3' - P-element 258 1 41.58 TTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTAGAGAGACGGATGCGCTTGTTTTTTTTTGTTTATTGTTTTATGTGCGCGCATTTTCTCTCAT:1 + chr2L 21030960 3' - Porto1 248 1 76.24 CCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATAAATAAGAGCTGGGATGCGGACTCTCCCACACAA:1 - chr2L 18168343 3' + 412 215 2 72.00 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAGGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAAATGTCAGCCAAAGTATTTCGCATTCATAAATA:1 - chr2R 16980061 3' + opus 461 2 65.35 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAACATATTTTTTCATACCACACACTTAGGCCG:1 - chr2R 20196866 3' - pogo 41 1 68.32 TGAGGACAAGCGTCGATTAAGAGGGGAGTAGTTATTGCCCTGCTCGTCGGCACCTGGCGAGTTAAAGGATTTATCCTGCATCCTTGTTTTGAACTACCACT:1 - chr3L 9117526 3' + HMS-Beagle2 6855 1 65.35 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATGTACATACCACTATTTTGTTGACCTCGACTGTGTGTGCTTTGTACATTTTCAATGCA:2 + chrX 20982307 3' - 297 11 2 69.31 GTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGAAGGCTTAATTGCTTAATATAAAAAAGAGTATATCTTCAAATAAATGTGATTTACAAACTTGACAATGGTGCCAA:1 - chr2R 12753013 3' - Juan 6 1 64.00 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATAATTACGGGAAATATTTATCGCTTAGATACGGCCAGCGA:1 - chr2R 16338085 3' + roo 9036 1 60.40 TTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACAGTCAATACGCACAACTTCTTTCTTC:1 + chr2R 4023407 3' - Doc2-element 65 1 67.33 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCCAAAGAGGTGATTGCCGTTTAAATTACGAAATCATGCATGCGGCTGAATAAG:1 + chr3L 5085081 3' - 412 22 2 57.43 TTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTG:1 + chrX 21945906 3' - F-element 63 1 80.81 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCATTGCACATGCCAAGTTTCAATACCAACAGCAAATA:1 + chrX 19820031 3' + hobo 2899 1 69.39 GTGGCCATACCAAATACCAAATAATGCTAAAACATTGCCTTTTATTATTTAAACTATCCAGTGACTTGAAATGTTTTTATGTCACGTTCAAGTTTTCATAA:1 - chrX 12658000 3' + Tc3 1425 1 71.29 CATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAACAAACGATAGCCAATCAGTTATCGACCGCGACCCCACAAACATGAAATTGATGTATTGAAAAAGAGTGATTA:1 - chrX 6123127 3' + Porto1 4409 1 73.27 TTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGGGTATTATTTTATTAAGACTACAATCGATATATAGTTACTTA:1 + chr3R 16487393 3' + roo 376 1 58.42 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATTCAAGCGCGAAAGCATCAACAAATCGTACAAGTTGGAAAA:1 - chrX 6739605 3' - roo 36 2 61.39 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGGCAGCGCATACTCAATCTCCCATGAGAATTTTCGCCCGCTCTCCGAT:1 + chr2L 6324547 3' - hobo 29 1 54.46 GGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGGAGTTCCGTGTGCGTGACGATCTCATGGGTTTGGCGATTGGCTCGCATGGCTCGAATATT:1 - chr3R 10105297 3' - G2 2953 1 75.00 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGCCAAGCGGCCACGAGAGGACAACGAGGCTA:1 - chrX 20330503 3' + P-element 2844 1 32.67 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGTGGTTCGCTGGTTGGGTG:1 + chr3L 3683780 3' - P-element 56 1 25.74 AACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAACTCCTAGAAGTAACAAAAATTGCAGATAAAAATAACAAGTACAAGGTACTTTCTG:1 + chr3R 19208091 3' + I-element 362 1 72.28 GATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCCTGGTGAGTGCAGTGAGTAGACCCCTTTCATCTTCGGAAGATTTAAGTGCTAATCTT:1 + chr3R 16039231 3' - jockey 262 1 59.41 AATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGAAGAGCAGGTTAAAGGCTTTGAATTCTGGTTCGACTGGCTCTTTGATTTCCAGTAGACGAGGCAAGTCGTA:1 - chr2L 22257018 3' + 1360 402 1 70.30 AAGTTTTTTTTTTTCTGTTTTTTGGCATTCGGCTAAACAAAGTGTGTGTGTGGCATATGTTAAATGCAATTTGCGTAGTCTGTGCTGTATTAATCAAGCG:1 + chr2L 1692938 3' - HMS-Beagle2 490 1 89.00 CCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGCTCACAGCTCATCCCCACTACCTCCCCCCCTCCCATCACTACTGTGGAGCCGGCGACTTGTTAACTCGCTG:1 - chr3L 13241407 3' + Doc 4504 1 73.27 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGACAGCGC:1 + chrX 10629258 3' + P-element 2846 1 38.61 AAAGATATTAAAATATTTGTATCAAGGTAAAAACTTATCAAGCTTTTTTTGTGCGTGCAACAATTGTTTACAAGTCGCCGGTAATGAGGTTGCCGTGGCAG:1 - chr3R 20108318 3' + Transib-N1_DM 292 1 64.36 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACACCTGCAATTGCATTTCGCTGCCAACTTCTGCTAATTGCTCGCCCGCTAATGACTCTATGCGGC:1 + chr3R 29711059 3' + mdg1 405 2 60.40 ATATTTTAAATGTTACAAAATTAAAAAGTATCACAATTAAATTATCATTAAATTGTAGTATAGAATAAGAAATAGAATGGGCTCTACAGAATTGGTTGCAA:2 + chr3L 5626695 3' - gypsy3 491 1 88.12 TGGGTATAACATAGCGTAAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAGTAACAAAACCGAGGAAAAGGAAAAATCAGCGA:1 + chr2L 2283136 3' + Stalker4 7001 4 67.33 CTCGAGTAGCCACTCCCTGACAATAAACTTCATACAGTTATGAAATGACCCGAAGGGCTTGTCCACCTAAAAAGCGTTTGACAAGTAATTTTAGCACTCTT:1 - chr3L 189464 3' + Tirant 244 2 68.32 CTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATGTAAGTGAGTGAGTGAGTGCACACTGTATGTTGCGAAGGCAAATTGC:1 + chr3L 3476422 3' - jockey 4667 1 50.50 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGCATTCACAAACAACAGACTTTAATCAATACTCGTGGCCGAATCCCATATTGCCCTC:1 + chr3R 4524262 3' + mdg1 7441 2 60.00 GATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTAATTTCAATTTCGGTTTTAGGTCCGAAAACAGCAATTGGATGCTGACCTATTGGAGTGG:1 - chr2L 15071319 3' + pogo 1709 1 64.36 ACTTAGAACGAACTTAGTTTTTCTTTTTAATGTTAATTAGGGCATACGGCGGATACGACTGCTCCAGGGAGGTGGTGCTGCTGCTAAAGCTCTGGTAACC:1 - chr2L 16047048 3' - HB 1374 1 64.00 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACCCTAGTTCGACTGCCAAACCCAGATTTGAGACGAAAGACCGAAAACTAAGTGC:1 + chr3R 24229163 3' + 1360 3369 1 59.41 TAAATTTAAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGGCAGGCGGCTGGAAAAATTGGAACTGAGCAGACAACTTAAAGCGAA:1 + chr2R 19044618 3' + 1360 375 1 60.40 GTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTGTTTAAGCGAGCTAGCATCCTCACATATATATGTCCTGTGTATTTTTGGACATTTTTCCTCAAGACACAAAATTT:1 - chr2L 23052733 3' + diver2 493 1 63.37 AAACCTAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCTTAGTAGGAAGTGAGAAAACTCGTTCTCTCGCTTTAGCCAGCTGACTATGTCTGGGTTAGTTTTGGGTTGGTT:1 + chr3L 7815284 3' + mdg3 5112 1 76.24 CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCATTGTTAACTACTGTCTCCTTGCCGAATCGGGCACTCCAGGAACCCTTGTCACCGTCACGAAGTAA:1 - chr3R 23485637 3' + roo 9062 1 69.00 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAGTAGTGTCCACGTTGCGTATGAGTAATGCGAGTTTATATCCCACTCTCTCATATCTTTCCGTCTCCATCTGGCTGTTTTC:1 - chrX 11632906 3' + blood 168 2 73.27 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCCGACAAAACGAAGATCGTCGCCGGCAGCAACA:2 + chrX 10585456 3' + P-element 2843 1 36.63 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAATCGACCGGTAAATAAATACTTATCAATCATGGGTAAACTCACGTTTTATGCAAACAACTCTT:1 + chr3L 3776556 3' + roo 395 1 65.35 CTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTACGCCGTGTGGCACGAGTCCAAGCCAAACGAAACGGAAAAAGGCAACCGCAGACTGCGTGATGTTGTTGCTTTT:2 - chr2L 3987842 3' + I-element 37 1 74.26 AGTTCAATTATTTTGTTTACAAAAACATTCGAGCTTTTCTCTCGAATGTATATAGGTGTGGGCTTTGGCTTCTTTTTGTCCCCTTCATCAGTGCTGGGGAG:1 - chr3L 25552471 3' - Fw3 21 1 81.19 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAATGTATGTGATGGCTTATCAGACACCGGCAGC:1 - chr3R 24023324 3' - roo 44 2 71.29 CAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAACAATTTTATGTGTATTTTATATATATAAAAAATTTTATTTTACATTTTATTATGT:1 + chr2L 23313758 3' + S-element 1696 1 59.41 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGTGGGGTACGTAAAAATAATGAGAAGCACATTTTGTGCGTAT:1 + chrX 6146721 3' + hobo 2925 1 50.63 GGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGA:1 - chr2R 6438345 3' + Stalker 380 4 54.46 CGGGCTTTATTATAGCTTTGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTGGTGTCCGATGGCTTGATAGTTG:1 - chr3R 7239147 3' - G4 3405 1 68.12 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCGCTAATGCCCCTGTCCAAGTTGCGGGCTAAAGTGCGTGCATCGCACAATGTGCAACATGGATTTTG:1 - chr3L 21782023 3' - roo 8673 2 70.30 ATTAGGAAAGGAAATATAACTTTCTATTGACATTCTTCTTTTACTAAGTGGCCTAAATTACTTTTATGAATGTCAAAATGTGTGACGCACTACTAAATTAT:1 + chr3L 14244923 3' + copia 242 1 57.43 TATTATTTATTATCAATTGGCACCAGTAATTGTGATGAATTTGATTGTCCGAATTGTCTCACGTAGTCATTGCGCCTGTACAGACCCCAGACTTAAGTGTA:1 + chr2R 2564500 3' + 1360 259 1 80.20 TTTTAAGTATGGTTGCAAGATCCCGCAGTCCGCGCTTCCGAGCTTGAACCAAAAGACGTTCTTCGGAGCATTCTGTTCCCATCAATAGTACTACCCCGGTT:1 + chrX 12247607 3' + hopper 443 1 60.40 GGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACGATAGCATTCTCTCTTGTTTATGAGAACTAATAAGTAGTTGTGTCCCCCGGCTGGCGCGTCTATACTTTTCGTT:1 + chr2L 18754614 3' + INE-1 556 1 56.44 GGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCGCTGTGTCTAAGTTAGCGCACCTGAAACTGCAT:1 - chr3L 15452841 3' - accord 7 2 70.30 GCACTCAACAATCATTGCCTTATTTTTTTATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAAACCCAACTAATTAAGCTCTCCATGTCCAGCGGGTCCAATTGAGGACTC:1 - chr2L 9054862 3' - 1360 448 1 54.46 CGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCGAGTGCGGGTGGACTGCGTGGTGGTGGAGGGGCGATCAGCCAGCCATTGTGGACTTCTTGATC:1 + chr3R 23464142 3' + invader1 3696 2 65.00 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCGAACTCATTTTGGGCTTATT:1 + chr3R 6425888 3' + copia 209 2 79.21 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACATTGCAATGTCTTCTGTGGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGCTCCAAATA:1 - chr2L 1590226 3' + mdg1 7427 2 52.48 TGAACCCACACACACACATACACTCACGCACTGCGTGCTTAATAAGCAGCACACACACACGCACACATGCGAAAGGCCAAGGAGTAAGCCCAAAAAGTTAA:1 + chrX 5284711 3' + accord 251 2 56.44 AAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTACAGCAAAAGGGTTGGTTCTGGCTCCCCTCCTCTCTCCCACTG:1 - chr3L 22202974 3' + G6 1818 1 57.43 GTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCAGGTCATCTTCAAACTTTTTAAATTTAGTTGCTGGCGCTTTGGTACGAACGACACACACAAAAGTTGTACTAT:1 - 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jockey 4794 1 78.22 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAATCGACCGGTAAATAAATACTTATCAATCATGGGTAAACTCACGTTTTATGCAAACAAC:1 + chr3L 3776552 3' + roo 391 2 61.39 TTTTGTGATGATATGTACATAGATTTCGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAAAGGCAATGCAGAGTTTGGGAGATGGTAGTAGCCTTTGATACG:1 + chr2R 1771454 3' - 1360 353 1 68.32 AAAAGCAGTTTTCTTACAAAAACTGCTTCAATATTGATTAAAGTTACTGTTTCTCCCTCTCGATTTTCCACACTTTTCCTCTCTTTTCGTATCATTCATTT:1 - chr3L 5067039 3' + roo 372 1 80.20 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCTTTTGGTATGGCCGTTCAGCTCGACTACTCTTAACATTACCTTTGAAATACCAAT:1 + chr3L 19933726 3' + roo 9052 2 59.41 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTC:1 + chrX 21945927 3' - F-element 42 1 59.60 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGGCAAAAAACCCGTGGTCATCCAACACCGATCACAGGATGCAGTCAACTATT:1 + chr3L 11199893 3' + roo 9047 1 54.46 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAAGTTTTTGCATAACA:1 - chr2L 3988527 3' - I-element 41 1 54.46 AATTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGGGTCCCTTGTTAACCTTATTTTCTTTCCCATTCTGATTCAGGCTCCCTTGATACACATTATTCACACATTTAAAACA:1 - 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chr3R 23734541 3' - pogo 10 1 68.32 ACCCCTCTTGGGGATCAGATTAATTTTCACAGCAGCCGTTATGCCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAACCGACAAGGTTGTAAATCTGATGACACCGCTA:1 + chrX 10660434 3' + G5 4528 1 73.00 GTCGTAAAAGGCGACTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTAAACCTTGAATATTTGGATAGATTGTCCCGCCTAAAGGCCATTGTGGTACCGGAT:1 - chr3R 8297280 3' + Rt1b 4887 1 58.42 TTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTAATTACGTGCGCTGCAATTGGCAGCTTC:1 - chr3L 4377985 3' + Cr1a 3973 1 74.26 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACTCACCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGTGAACCCTTGAAAGTATGC:1 + chr3R 29288796 3' - BS 5071 1 51.49 CGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACAAAAGATAAAGGGCAAAATGCATCATAATAAATGCAATTTATGGTTT:1 - chr3R 15681642 3' - hopper 461 1 53.47 GAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTATTTTCCAACCCACCGTCCCTCTGCAA:1 + chrX 12800285 3' + invader3 5415 2 74.75 TCTGGATGCTCCACGTTTCATAGGATCCATCCTCCAGCTTACCGTCTAATGCAAACTCCAAGTCCGTAAATGTTCATATTTTAAAGGGTAAATACATTTAA:1 + chr2R 3190797 3' - 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chrX 7698866 3' - F-element 4409 1 57.43 GTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCCTTGATACAAAATAACTACTTGACACTCGCCCCCTTTC:1 - chr3L 14260726 3' + 297 6596 2 62.38 AATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCTTTATTTATACTATTTCTGTTGGTTTTTTTTT:1 - chr3R 13654512 3' + Cr1a 173 1 68.32 TAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTA:1 - chr2R 5582168 3' - Cr1a 442 1 66.34 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGCCACGACACTGAGTAGATTTATCAGCCAGTCGAGTTGC:1 + chr2L 17056546 3' - 412 38 2 63.37 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATACAGTATTATTGGTATGTTATAACTTATACTTATTTTTTAGCGAGGTTT:1 + chr3L 10792250 3' - pogo 24 1 60.40 AACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTTGTCGGTAGTAATGGACAAACAAAATAAAATGAAGCCTTTTGCAAGCCTTTTTCAAAAG:1 - chr3L 25106711 3' + F-element 353 1 57.43 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAATCGTGGCTTCATTACGAATTCTTCGAATGGTCCGCACCTTTTGG:1 + chr2R 11086474 3' - Doc 32 1 52.13 GTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGGAAGTAACAAAAAGAAATGCAGGGCAACGAAATGAAGCCATCAAAAACGGTTGACATCGTTACGCAAAAGCGGAAAT:1 - chr3R 31959648 3' + invader2 5021 2 69.31 TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGA:3 - chrX 21668026 3' + Tabor 433 2 74.26 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCACTCAATGCAATTGCGGTATTTATAATTCACTCGCCCCACCCT:1 + chr3R 27387342 3' + roo 9037 1 54.46 AGTAACGGGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGACTGTAGTATTCTTTCTTATTCTTATTCAATTGTTTAATACGAAAATAACTTTTCCCTGCACATAAGGGC:1 - chrX 19330565 3' + INE-1 550 1 69.31 TTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATAATGACAACATCTCGAAATATATATTAATTTGAAAGCCAAATTTGCAGATTCTAATT:1 + chr2L 19990172 3' - Burdock 18 2 61.39 GAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAGTATCTGTCTATATGGAAAACGATC:1 - chrX 6718407 3' + jockey 4658 1 75.25 GTAAATGACAAATTTATCAAAGTGACCTCTTTACCCGGGTTATGCGATATCGAGTGCAGTCGATAGAGAACAAATGAGGGTACAAGCAAGAAAACATGCAA:1 + chr3L 26847644 3' + Ivk 486 1 55.45 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGGCAATCGTTTGACGTCGGTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCG:1 + chrX 20330583 3' + P-element 2880 2 73.27 GCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGATAAGCAGTTGATAAATAATACAAACAGATCAAAGCATAATCAATATAAAGAAATATACAGAA:1 + chr3R 24686684 3' - Cr1a 4076 1 66.00 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGTGCTATTAGCAATTCCCTTTTCTCAATTCAAATGGATTTCCTTATCTCCATAAAT:1 + chr2R 9866919 3' + roo 9052 2 57.43 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTTTTTAATAAAATTTATTACACTCGCACATGACGAACATG:1 + chrX 18991599 3' + pogo 2067 1 69.31 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAACTCCATGGCGACTTTAAGGAAAATGCATCGAAGAGCCGAATATGTT:1 + chr2L 16136672 3' - hobo 27 1 53.47 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACAGTGTAGCACAGACAGTCAAAAA:1 + chr3L 10554815 3' - roo 50 2 76.77 TCTAAAATTAAAAGAGAACTTTACTATTATAAGAATCAACTTATGTAATGACTATGGTTGATCTTAGGAAAACAAATTGTTAACAAAAAGTAATCGTACGC:1 - chr2L 8221386 3' + G4 224 1 63.37 ATGATTCCGGCGGTCCTCCGCTCCGGTGTCTCCTCGCATAGGCAGCTTCCTTGTTCCTTCCACCCATCCACTGCTTTCTCGTGGCCTATGCTGCGTACGCT:1 + chr3L 17990071 3' - gypsy8 4595 1 70.30 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGATTCAAACTGAAATAACTGTCAAAGATCA:1 - chrX 8522861 3' + 297 354 2 71.29 AAAATTTAAATAAATATTTTAATTTGCAATTTTTAAGACATTCGTTGGTTTTCTATTAGAGTATTTACATTCCTTAGTTATTAGATATGTTTTGTATTAAA:1 - chr2L 7445403 3' + 1360 3047 1 70.30 GAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGAGTGTGTGCTGTGGCGCTTGGAGCAT:1 - chr3R 21613297 3' - G2 2977 1 71.11 CATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGATCCAAACAATCTGGGTCATCACGGCCAGAAACTGCTCGTGGAAGACGCGGTCGCGACTG:1 + chr3R 10710540 3' + Doc3-element 4525 1 65.35 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGCCCTTTTTGAATAATCTGGCGACTATGGCATCGGATAA:1 - chr2L 5741317 3' + 412 7507 2 63.37 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTTGTACTACAAAATAGTAATAAATCCAAAATTTAAATCACAAAAGTTTACGTTTTTCTTGGTGGTGAGATAAATGAAT:1 + chr2R 14796263 3' - hobo 14 1 69.31 TTACTACTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGTTGCTCGGCCTGCCAGTTTCGTTTCACTAACAGTGTGGGAGTCTTTCCGATAACTTTTGTCGCCGC:1 - chr2R 2557975 3' - mdg1 38 2 57.43 GATTTGTGGGGAGTTTTAAGACTCCTCACATCTCCCCCTTCCTTCGGAAGTTTTTGAAAAGGATAATGAGCTCTGTTTGAACTTCCCGCCTTTTATTTAAA:1 + chr3L 26132183 3' - gypsy8 4658 2 67.33 TGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGGCAGCGCATACTCAATCTCCCATGAGAATTTTCGCCCGCTCTCCGATTGTTTTTGTTT:1 + chr2L 6324558 3' - hobo 18 1 61.39 ATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAACATCTAACATGGAAAATAGTTGTTAAGTGAGTAGTAAACTAAGATA:1 + chr2L 3430798 3' + accord 470 2 53.47 AAATTGCCGCTCGAATGAGCTACCGTTTACACATTTATACCAATTGCGACACACATTTTCGCCTGCCTTCTCCTGGATTTTGCTTCTCGCCTTTTTTCTTT:1 - chr2R 19580992 3' - 1360 2985 1 75.25 TTGCATTGCAAGCAAAACAATTAACAGCTACAATAACACAATTAAACGAGCTTTGCCGGGGTAAAAATGAATGTTAAGCAAACATGACAAGGCTTTTAAGT:1 - chr2R 16507936 3' + Doc4-element 380 1 67.33 GATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGCAAATTTGCATGACACCAACAGAAGCGGCCAGGGTGGGTGGGGGGTGGCAGCTGTTGTGGGAGG:1 + chr3R 27357838 3' - jockey 9 1 69.32 CGACTCTTATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCTGCTGTTGCTTTTTTATTTTTACTGCAACTGTCGGTGTCTTGTTTTAAAGCGAT:1 - chr2L 21065427 3' - gypsy7 5282 2 57.43 CTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCAT:1 - chr2R 4860116 3' + micropia 4992 2 64.29 AAGGGGACTTAAAAGGTGTCCCATTGGGGTACCAAATAAACTTCCATAGCAGCCGTTCTGTGTGTAGCTGTAAACAGGACGAAAGGGCAGGGATTAGCCAA:1 - chrX 19664901 3' + G5A 2555 1 54.46 ATTGATTTCGGTCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATACGTCGACGCGGTTTCGTCCTTGTATGATATGTGAAATGGCAAACAAATATTTTT:1 - chr2L 4161151 3' + 1360 3185 1 62.38 GTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCACAACCCACTCCGACCCTCGATGGGATGTCCTGTTCCCGTCTGACGCTGATTGCACGGCGGTTTTTGC:1 - chr3L 3963350 3' + Quasimodo 262 2 71.29 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGACATTGACACGTCGCCCTAAAATGTATGCTACAATATTGTT:1 + chr2L 16968479 3' + 1360 3355 1 64.36 ATGTTCTCATACAAAATTACATATGCACATTTGGGCATTGCTTATATTCAAGAGCCTTCCTCAATTCCAACATGTTTACACTGGGCCTTTAAATAATTGCT:1 - chr3L 5348479 3' - 1731 60 2 75.25 TATTATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTTGTAACCTCGAAAAAGTTTCCCAGTTCATTTGGAA:1 - chr2L 22348524 3' - rover 367 1 65.35 TAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAAAAAAAAAAATGTGAGAGCAAACGCTTTTGTGTAC:1 + chr2R 10653470 3' + invader2 5092 2 75.00 ACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAA:1 - chr2L 14074967 3' - jockey 269 1 72.28 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTCAAATTTTCCTTCAAACATTCCC:1 - chr3L 16755781 3' - pogo 48 1 76.24 CCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCT:1 + chr3L 23678152 3' - Osvaldo 21 1 73.27 TGTTAACTATTCCCCCTTCAAGATTACGGCCGATCTCACGCTGGCCCAAAGTTCTGACCGCATACCATGTGTGCCCCCGCCGCTCGGCGACAATTCAAAAA:1 - chr3L 28092831 3' - gypsy 6974 1 71.29 TATTGCATAGGCACATACTACATATCATTTTTAAAAGAACCGCCAAAGTTTTGAAATCAGATAGAATTGGTGGCAATACTGGCCAGTGACTATGCAGCCCT:1 - chr3R 26912902 3' - 412 1 2 72.28 CTAGCACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTATTAATTTACAGATATTTATAGTACAATTATGTGCTCA:1 - chr2R 12983006 3' + Cr1a 4301 1 66.34 ATGTGTGTATGTGTTAGAATGTGTGTTCTCCTGTGTGTGTGTGTGCCGCTGCAATAAAATGTCTTACATTCATAGCAGATTTAAAATTTAATTTAATTAAA:1 - chr3R 20340700 3' - ZAM 8225 2 51.49 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGATCTTGAACCTCCCGCGCCTGCTCTCACCTCACCCTAGAGCTTT:1 - chr2L 128688 3' + P-element 2857 1 50.50 CCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTGCCGAACAGTATATCGTGAATTAAAAATGTCTGGTCTAAATCTTAAGACATCGTTTTTTCCTGATCAATAA:1 - chr3L 25608293 3' - Doc 6 1 65.35 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATTTTCAATTTTTGATGTCATCGAGCGCACCGCACGGC:1 - chr3L 21992743 3' + 412 7508 2 61.00 ATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCGCCCTGATTTTTTGGCCACTTCCTGCTGCAACTGCAGCTGCTGGCCGTTAACATCCG:1 - chrX 9857731 3' - Stalker4 7184 4 63.37 AGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAAGAAGCAACTTTAGTAGCATATTTCAC:1 - chr2L 5659383 3' + jockey 4588 1 73.27 CTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGCAAAGGGGCGGGGCGGCGAGGTTGAAGGATGGGCGGCAGAAGGAAGGAGATACGAAGGGAGAG:1 + chr2R 9518058 3' + G6 1846 1 68.32 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGGAATCGTAGGAATCAACTCATCATTGAACGAAGGTGGATTGAAGGGCTGAAGG:1 + chrX 1252857 3' - hobo 21 1 55.56 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCACAATTTCTAACTCCGCTCTCCCAAGGTTGACAATACGA:1 + chr3R 21969118 3' - hobo 38 1 63.37 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAGGTAAAAAAAACAGTAGTCAAGATATGCTAATGGTTTAATTAGCGTCATTTGCTAGCTCAACCAGCTC:1 + chr3L 6128337 3' + jockey 4984 1 57.43 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAAGGGCCTTCTCCACCTTTTGGATGACGAAATCTAAGACCGGCTTTCATAAGC:1 + chr3L 9505895 3' + P-element 2863 1 54.46 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATTATAATGCCGGGCCAAAAGCAAGCCAAACCGAATC:1 + chr3L 14285095 3' - roo 8673 2 71.29 GTGAGGACACAAGATGCAAAAACCATTATTATGAATATACTATTGTACAGTAAAGTTTTATTGAGCAACACAACTAAATTTGATATGCTTAAAGAATTGCA:1 - chr2R 5458398 3' - transib4 2324 1 70.30 CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACATTGCAATGTCTTCTGTGGTGTGTGTCGTTTAATGCGTG:1 - chr3R 18026917 3' + mdg1 7420 2 60.61 GCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACTGCGCCACGTCAAAGTCGACGTCGTTGTTTTTACTCACCTTCACCCTACACGCACGCAC:1 - chrX 18366290 3' - P-element 236 1 64.00 GGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTATTTTTCGATATTATCTGTATATTTTTTCGGGCACTTAACTTGGCGTTCTTCTTTTCACTGG:1 + chr2R 12118565 3' - Doc 4482 1 67.33 GATTTATTTGTTTGTATTATATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACAGTCA:1 + chr2R 4023386 3' - Doc2-element 86 1 57.43 GACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGACTCAGGTTGAGTTTGTGTTCGAGCACCCGAGAC:1 - chr3L 9153809 3' + Doc 372 1 66.34 GTACCGAAACGTCTTCAAAAGGTGATACACGCTAAGGGATTAATATCCAGGTATATATGAAAACAAAAATTATTTAAAAACTGTTTGTATAATGTAATGTT:1 + chr2R 5528843 3' + Tc1-2 1322 1 70.30 TGATAATACAACAAAGAGTGCAAATACGCGAGAGGTATGTTTTGCCGTCAAGGGGGACGTCGAACATTTTGCACCATCACCATTCTCTGCGCTATTTT:1 + chr2R 6167239 3' + Tc1-2 90 1 55.10 CGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGCTTTTGCTTCAAAGCGGTGCTTGTTACTGGCGGTCGGTAGACCATGGCCGCCTTTCCCTGCTG:1 - chr2R 6615171 3' - gtwin 455 2 70.30 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCAACAAATATAGGATGATACATAA:1 - chrX 7698608 3' - pogo 31 1 69.51 GAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTAAAGTGAACTCTGATGCAAGAGGTGGCCGAGTATTTGGCAAATGATAACTTTCCA:1 - chr3L 1889505 3' + F-element 32 1 54.00 TATTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTCAAATTTTCCTTCAAACATTCCCCTAAGTTTGGCTATAAAACTAA:1 - chr3L 16755759 3' - pogo 26 1 52.48 TTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTATACACATATACTGATTAGACATTCTCATTTCTCTTGCTGTTTGTTTATTTGTTTGTTGGTT:1 - chr2L 8874833 3' + rover 121 2 66.34 GTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAATATATGCCCTTCTTAGACTTATAAACTCAATATTGGCATCGATGCGTCCGATATACATGTATGCATCAAATAT:1 - chr3L 27980684 3' + 1360 190 1 50.50 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCGCTGACACAGATGGCGCCCGAACAGGGACAGGTGGCTGCCAAAAAATGCGGCTTTT:1 + chr3L 4051131 3' - pogo 20 1 59.41 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCCAGCGAATCGCCAGGATTGTCATTCTTTTGTA:1 - chrX 11463888 3' - jockey 4784 1 68.32 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACAAAATCATTGACTTACTTCTTGGGGATGCAAATTTAAACATG:1 - 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chr2L 9485802 3' + hopper 387 1 67.33 CATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTATTTGACACTCATACATTTG:1 - chr3L 21912254 3' - Bari1 25 1 57.43 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATCGCCCTTCTCTTGCCTTTTGTGTAAGCCCGAACAATGAAATGGTAATGATGGATTGTGTCCTTTGTTTTAT:1 - chr2R 14744197 3' - roo 6 2 73.27 TAATCATTGAATCACAAGATGCAAATCCAACTGCATCACCAAGATTGCGAGGACATCATCGGGGATCAACCGTGTCGATTTAAATATGTGGAAACCACACC:1 - chr3L 12134977 3' + rover 6847 1 62.38 CCCTCGATATATGCACATACTACACTAAGCCAAGTCGGCTTGCTTGGGCTTGGGAAATATTCTGCCATATGTCCGATCACAACCGGTTCCGCTTCCAGACG:1 + chr3L 18142043 3' - blood 7014 2 73.27 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCTTTACCTTATGCCTCTTGACTTTTATCCCTAATTATTTCTCTTGAAT:1 + chr4 1234594 3' - 412 28 2 53.47 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTTTTACACACCATCTGCCCAGAAAGGACAGAATCTTGTGTCTAGCTGCAGGCGAGG:1 + chr2L 10165072 3' - mdg1 7059 2 58.42 GTTATAGATATTGTTATTAATTCAATCAATCCGCAATCCGCGTACACGATAACACTTACGGAGCGGAAGGGAAGTGTGAACGATGGAGCACAAATAAAGAA:1 - 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Doc3-element 80 1 53.47 TAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTA:1 + chr2R 12185408 3' - accord 26 2 52.48 CGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACACCTATGGCAAACAACTTCATAAATTCAACTCGAAATGTAATAAAACAGACCC:1 - chr3R 756878 3' - gypsy6 7441 2 57.43 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTCCTCGGACATGGCCAGCAATTTTCACTCGATGCAT:1 - chr3L 14284981 3' + roo 9055 2 58.42 GGAACTATAAAAGCTAGAAGGTAGAGATTAAGCAGATTGTAGAGACAACCCCTTCCCAGTATGTAAATCTCCGAAAATGAAGTTGAACAAAACGCAAACAG:1 - chrX 694765 3' + INE-1 157 1 60.40 AAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTAACAATGGGAATGAGATCAGTGCGAGGTCAATGG:1 + chr2L 7970485 3' + Doc 67 1 67.33 AGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCATCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTATGCGCCTGTTGCAGTTCGCAGTTGCAACTTCTTCGGTC:1 - chr2L 2666642 3' - Doc 323 1 64.36 GTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGGTTATGGGCCCAGCGCCCTAGGAGCTGCCATCGACTGCGAAAGAAATGATAAGCTGACTAGAT:1 + chrX 13676457 3' + 1731 300 1 66.34 ATTGATCCTGATCAAGAATATATTAAATTTATATGGTCCAAAAACCTTCTAGCTTGCCCTTCCAGCACGTTTTCCCGCCTAACATTTCGCTGTTTTTTCGC:1 + chr3R 20286314 3' - INE-1 83 1 55.45 GCGGGAGAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGCATGGAGCAGCCAGCCTTGAACTTGCCGCACAGACTCAGTG:1 + chr3L 12011895 3' - Porto1 466 1 59.41 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCTGCCGAATCCAGAGAGAGTTCGGGGAAATGAACTTCCCGAGAGAGAGGATGAACTCATTCGGGCTCGTTCTA:1 - chr3R 15666015 3' + P-element 2884 2 77.00 CGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGGCGAGGGGCGAGGGGCGGTGGAGCAGAGCGGG:1 - chr2R 9504630 3' - F-element 4503 1 65.96 AGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGCATATATTTTCTGTTTATTTTTGAAGCTATTAACTGGCAGCTTTTCAA:1 + chrX 12151682 3' - diver 21 2 55.79 GACAAAAGGTCATAACTTTACACTTCGAGCCATTTAATAAAAAGAGAATCTTGCCGCACATTTAACTTAAATTTAGGCGCCCCTTTTTTGGCCCCAAAAAG:1 + chr2L 11399815 3' - Q-element 674 2 73.27 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCNNCTCCCATGCGAATGTTTATGTTACTAGTTTTTTGTTTA:1 - chr2R 9865532 3' - jockey 58 1 73.96 AGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTTTCTCTTGTTTTTTAAAGGGCTTCTGGCCCGGCCAGCATTTCCTGTCCATAATGTGGAGGCTCCTCACGATGGGTT:1 - chrX 5017084 3' + INE-1 567 1 61.39 AATGGGACAACTTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCCGTTGGTCACATTCCCCACACTTGGATGGCGTAGGTCAGTGTTGAATCTATAATAATAAATATAATA:1 + chr3L 5369128 3' - 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chr3L 18647894 3' + I-element 239 1 70.30 AAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGGAGGAGCCGACGACGAATGACACA:1 + chr3R 19734778 3' + hobo 97 1 76.24 TTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCCATGATCGAGGATACTGCCAAGTGGAG:1 - chr2R 18759398 3' - accord 131 2 72.73 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCACATCTGTTAAAAAAAATAATATTGCTAATAAGAAGTATGAAGTTCGTTTCAAAATTTAA:1 + chr3R 7869767 3' + jockey 4968 1 52.48 TTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGGAT:1 - chr3L 11367490 3' + roo 382 1 51.49 TAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCAT:1 - chr3R 11151842 3' + mdg3 194 2 75.25 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTGGGAAAAACAAAAGCAAAATGGCAACAGCACCAACAATGACAATAAGTAAACAACATT:1 + chr3L 4713850 3' + transib2 2809 1 64.36 TCACTTCAGCTATAGTCACCGATCGTGGCCACAGGATTTACTCCACACTCCTTTGACCTTTGGGCTCTTCATTCCGGATGGACATGTCATTGTAATGAAAT:1 - 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Quasimodo 33 2 65.35 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATATTGCTCTTTAGCTATGAGACAATTTCATTGTGACGGCAATAATACCATACCC:1 + chr3L 12913675 3' + 1360 3366 1 57.43 TGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGAAGTAAAATATACGTAGAAAGGGTAGAAATATGTAAAATAAGTGTAGCAACACTCGCATGTGCTTGATATGAAAA:1 + chr2L 5270469 3' + hobo 248 1 75.25 TCCGAGGGTCAGCATTGACCAAATCTGGTTAATGAATAACGAATGAGTCGTGTTCGCTTAATAGTGATTGAGTTGAGAACACAGCTCATTATAATTAATG:1 + chr2R 22619683 3' - jockey 4712 1 78.00 TTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTTGTTCGATGCTCCCTTTGCCCAAAAAAC:1 + chr3R 15647197 3' - I-element 4917 1 72.28 AAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCGAATATCGAAGAATTTTTAAAATCGAAAACAAAAGAAAAATGAACACTAAAACAAAGAAAATAAATACAA:1 - chr3L 19068030 3' + I-element 4964 1 76.24 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACACACACACACACACACACACAAAGAGCATCGACAACTAAACAGTTCGTCGAGCAGAAAAACGAGGAAA:1 + chr3R 19734587 3' - hobo 2 1 57.58 GACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGACATACAACACTACACAAGGAGAAAACTGATGCAGATTAAAAACAATAATT:1 - chr2L 1590404 3' + mdg1 7435 2 54.46 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAAACGCATAAACGAGATCCAAGATCCAAGTCAAGGTGGAAGCCAA:1 - 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transib2 22 1 55.45 GAAACTCTCGCTTCTGATTTTAAGCGTCGGATGCTACGGAGTTGAAGGTCACATCGAACCTGATGCGGGAAATGAGGTCCGTAAACTTGACCACTGGCACA:1 - chr3R 24925945 3' - Porto1 229 1 73.27 CATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAAACAAACATTTTGTTACCAAACAATATAATATTCATATGTTTTTTGCGTTATTTTGCACTTTTCATTAGTTG:1 - chr2L 16968386 3' + 1360 3386 2 74.00 TTATAAAAAATCAGTTGAACTACTTCAAACTCAATATTTTCAAGCCAATATCCAAAATAAAGCGCCAAGCAATCGCACACGATAGTAGAAAGCAAATAGTC:1 + chr3L 23227914 3' - S2 431 1 64.36 GCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAAT:1 - chr3R 1875807 3' + Rt1b 4738 1 41.58 TAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGGATTTCGTTTTAACATTTTCAGCAACGTTAATCCCCAATACCCAAATGCAATCGCCTGTCTGCTGGTGGT:1 - chr2L 15145698 3' + Porto1 4304 1 74.26 ACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATAGAAGTCTCTCCTCTCGATCCCTGGCCTTTTCTCTCGCCAGAGCCTGTCGCTGTTTCTCCTTCTGCTCCTGCATCT:1 + chr2L 18939559 3' - Rt1b 4929 1 76.24 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACCAAATAGTAACAAAGCTCGAAGGTTAAATGTAGAAAGGGGAAAGGCGGCGAACGCCTG:1 - chr3L 16449715 3' - roo 8681 2 60.40 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAATTATCATGATGATCAAATAGCTCCTTGCCCCTCGTCTCCT:1 - chrX 3358704 3' - roo 8700 2 65.35 CCAGATCGACTCGGCTATTGATTTTGATAGAAGGCTTGCGAAAGTGGAGGTCACGAATAGGTGGTCCCTAGACTTTTCAATTCTCCACCGATTTAGTCCTT:2 + chrX 22638576 3' - INE-1 99 1 59.41 TCGAATAAAGGGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATCCTACGCACCAGTTTAGATTTAAATTCAGGAC:1 - chr2L 12802200 3' + invader3 5419 2 64.36 ACCCATGACATGGAGAATCAGCAGCATTTACGAACTTCTCGGATCATCCAGACACGCAGAGCTGCCTTCGCCCAGCCCCTTGACATTGTCACCTCAGACTG:1 + chr3L 13262111 3' + Burdock 5930 1 68.32 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTCCTAGCACAAAGAGTGGAAGCATAAGAA:1 - chr2R 9950706 3' + S-element 1673 1 70.30 TATGTGTGCACATGTATGCTCGTGCATTGTAAATGTTGTTTCTATATTTCATAATACCGTAAAGAAAGTTCTAGGCCAAGAAAAGTTAATAATCCGAATCA:1 - chr3L 25108823 3' + 1360 177 1 70.30 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTAGTTCGATAAATTAAATGTCACAATCAAGTCAAGTTTTCATCAC:1 - chr3L 18141947 3' + blood 7356 2 55.45 TTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTATTTTTAGGCTAAGCCCGACACAAAACACTATATTTTGCCGGACTATAAGTAATGATGTGACGATTTGGCAGCAACCGA:1 - chr2L 12942161 3' - jockey 4670 1 77.23 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGCTTGGATATTTACTAAGTAGGGTATGGTTATGATTATCATTACCATACCCTACTTAGTAAATATCCAAGCAA:1 - chrX 1264677 3' + roo 391 2 44.55 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATAGAAATCTCTTAAAAAGGCAATCATTTATTTAC:1 + chrX 14965225 3' - FB 44 1 68.32 GCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATAACATAAGTACGCAAACAGTCCTTAACCCCACATCATCCGGATTCCAGATGATGCAT:1 + chr3R 28086155 3' + accord 7250 2 52.48 ATTCTTGATCAGGATCATTAGCCGAGTCGTTCTGTCCATGTAAGTAACGAAGCAGCTCTGAATATTACTTACATTTAAGTTTTTTAACCGTTGGTTGTTGG:1 - chr2L 22687944 3' + INE-1 86 1 61.39 TTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCTCGCCACCACCCCGTTTTCCCCATTT:1 + chr3R 25573576 3' - invader2 4722 1 78.22 GAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGAGACAAAAACACAAAGATACGCCAGCT:1 - chr2L 169529 3' + micropia 417 2 69.41 GTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAATAGGGTCGACAAGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - G5A 2693 1 60.00 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAAACGCATAAACGAGATCCAAGATCCAAGTCAAGGTGGAAGCCAAAAACCAGGAGGGAAGG:1 - chrX 18991509 3' - pogo 11 1 66.00 TTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTAAATGTTCTTATATATAAATGTTTTGCACAGATAAATTAAGTGCAGTGCAATAAAACCAGTA:1 - chr2R 6003147 3' + pogo 1902 1 60.40 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTCGACTCGAGACGCAGAAGTT:1 - chr3R 10978686 3' + roo 9051 2 61.39 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGCGAAGACGCCTCCGTTTGTCGTTCGCAGCAGTTCGCGACCCCGAACATCG:1 + chr3L 813886 3' + roo 9046 1 53.47 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCAATGCACATTGTGCATTGTGTTTTTCGCAG:1 - chrX 19819990 3' - hobo 46 1 74.26 AGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACAGATACTGAGAGGGAGTTGCGGGTTTTCTAGCTTATGAA:1 + chr2L 5653507 3' - hobo 390 1 62.38 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGT:1 - chr3L 11367518 3' + roo 9020 2 76.77 GCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTTCAGGGTGGTGTTTCTTGGTCAGCCCACCCATTTTTCGCTTCGGTCACATGTTTCA:1 + chrX 22778907 3' - X-element 4383 1 57.43 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGATGCAGTTCTCTGGTAGGCAGCGCTCTCTAATACACTCGCT:1 + chrX 10437599 3' + hobo 2897 1 76.92 AACCGTCTAATACAGGCACTATAAGACGATTCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAAAATCGTGTAAACTTCATGCAC:1 + chr2L 4058324 3' + Bica 4513 1 77.23 TAGTTTGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGGCCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGTCGTCGCTGTCGCAGAATCTTCTG:1 - chr2L 11569486 3' - transib2 2731 1 74.26 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGGGAAAAATTGCAGCTGAGGTAGTTAGTGAAATCAGTTTTCACATTTTCCGATTAATGGCAACT:1 - chr2L 2694564 3' + Transpac 299 2 65.35 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTGTATGCCAAGCGTAAGCGGAATTGCTTCAATTTTCGTTTTGCTTAACGGCCAC:1 - chr3R 27386276 3' - hobo 18 1 59.38 TAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCT:1 - chr3R 19589918 3' - BS 5016 1 55.45 CCACGCCCACTCTAACGCCCACACACCGCACAAATCTGCCAAAATTCTTTTTCCCTGGCCCACCAAAAACCGCGCACCCCCTGAAGGAAATTTGGCCCAAA:1 - chr2R 16405920 3' + INE-1 214 1 58.42 CTTCCTCCAAATAGTCCGGGAATTTTTGCGGCTGCTGCTTCCTTCGCATCTCCTCCAATCACCTACATCCCTGCTGCTCTCTCGGATTCCCTGGTGAAGGG:1 - chrX 14151844 3' - Osvaldo 376 1 77.23 CAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGACAGGTGGTTGTGGTGGTTGACAGTCAGTTTTTGTTTGCAGTTTTCGGTCTGGTGTCCA:1 - chr2R 9390631 3' - G2 2900 1 58.00 AATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGT:1 + chrX 8027504 3' - Juan 21 1 59.41 TAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTACCTTTTACCTTGCATGCATATGTATGTATGTACATATATTCCCCCAATTAAAATGGTTTCTAATAATTTACTAAGCC:1 - chr3L 18189569 3' - S-element 62 1 64.36 CGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACTTGTCAACATTGAACGAAACAT:1 - chr2R 4501478 3' - G-element 57 1 76.24 TTTATATGTAGGTACTTAGTGTTGGATTAGTTTGGATTAGTTTGGATTTACATTCTGTTGTTATGCTTTTCAACATTTTTGTTTTACAGCTAAGGTCGGCC:1 + chrX 2914687 3' - Juan 3922 1 60.40 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTAGCCCTACGTTACGTAGC:1 + chr3R 28330890 3' + P-element 2832 1 21.65 AACTATAAAAGCTAGAAGGTTCAGCATACAGATTCTAGGGACATTGGCGCACCGTTTACTTAAAGTTGAGTTTCTCAAGTTGGAATGCTTGTGCAATTGCC:1 + chr3L 1376260 3' + INE-1 159 1 52.48 ACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTGCAGGATTCGCTTCTCGTTCAGC:1 + chr2L 9697273 3' + P-element 2630 1 25.74 GATGTTGATTGTTGATGTTGATTGTTGTCTTTACTTTTTGTGGATGTATTAGCACATGAGGTGGATGTATATTGTTTTAGTTCCTGCTAGTTCTGGATTTT:1 - chr3R 9186966 3' - gypsy7 324 1 76.24 ATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGTTTGGCTTCTACCGTACTTTGCGGCGAACGTGTCATATTCAGTTATGTATTTATTCCTT:1 + chrX 20340123 3' + INE-1 565 1 64.36 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAAGGGCCTTCTCCACCTTTTGGATGACGAAATCTAAGACCGGCTTTCATAAGCGTGGCAAACTCTATAT:1 + chr3L 9505911 3' + P-element 2879 2 70.30 TCGACTATAGCACTCTCTCTTGTTGTATTTTGGTTTGATTATGAGTAAGCATTTAGCTGGAATTAACACGTCGACAACAACCAACCAACACTTGAGTATTT:1 - chr3L 17666696 3' + INE-1 578 1 60.40 CGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCAACGTATTAGATTTTCTAGCTTCTTTAAGTGAACGATATGTTGGAGCTA:1 - chr3L 21483339 3' - Doc 4380 1 51.49 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAATTATCATGATGATCAAATAGCTCCTTGCCCCTCGTC:1 - chrX 3358708 3' - roo 39 2 69.00 AGCTTATTCGTGGGGATGTTCGTGTTGTGTCCTCGCTGTTCTATTATTTTTCTTTCATTTTTTTTTTTCTTTGTTTTGATTGGGATTTGGTTGGGTATCAT:1 + chr2R 10523179 3' + Cr1a 4053 1 80.20 ATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAACGAGGGTCAGATAAAATTGTCACAGCCAATATATAGAGTATAATGAAGCATTGTCTAAG:1 + chr2L 18683411 3' - 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chrX 7698584 3' - pogo 26 1 53.47 GAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGAGTGTCTGACCGGGATTTGTTGTGACACTTTCAGTAACCAGCATTCTCC:1 - chr3L 21859268 3' - blood 7175 2 56.44 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAGTTTGCCATTCTAGTGCTCTTTTCGC:1 - chr3R 14832511 3' - hobo 50 1 72.28 TGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCTCAACTTATATAAAAAATATTACAACCATGAAAATT:1 + chr2L 17106950 3' + micropia 5310 2 73.27 GTTGTTGTTTTATTTTTTCTTTTCATATTTTTACCAATTAAAACGAATAAGTAAGTAGATGAATATATATATGGCATTTAGCTCCAGAGTTCTTATGGCTT:1 + chr3L 922806 3' - gypsy7 5013 1 59.41 GCTTACGACGGGACCAACTTATGTTATTTCATCATGCCGCAGACTTTTAACAGTGAAAGCAACACGCTGTTAAAGATCGAAA:1 - chr2R 12655880 3' - P-element 15 1 54.88 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAGGTAAAAAAAACAGTAGTCAAGATATGCTAATGGTTTAATTAGCGTCATTTGCTAGCTCAACCAGCT:1 + chr3L 6128336 3' + jockey 4983 1 56.44 GAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGAGGCGGCGATTCAGCGATGGCTTGTCCTGCATTCGAAATAGAGGTTACACGATTGAAAGTCTTTGGG:1 + chrX 2368664 3' - Tirant 87 2 72.28 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGGGTCATGAGCCACGACCGAATTCTCGGACTCCTCGGACCCAAA:1 + chr2L 16396634 3' + 412 7512 2 60.40 TTTGTAAAAAAGTAATTTTTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCCATATGATTATTTTACTACATATATACATATACATATACATATAAATACATATATATG:1 + chrX 5271522 3' + Tc1-2 1461 1 60.40 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGGATAAGTGGCCCATCCCCAATCCG:1 - chr3L 11367469 3' + roo 403 1 71.29 CGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTGTTAAACTTTGAATTTGGGATAATTTA:1 + chr3L 21912358 3' + Bari1 1699 1 69.31 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATGGTATTTCATTGACTTAACCCCAGCTTCCCAAA:1 - chr3R 19447577 3' - roo 70 2 67.33 TCAAGATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTTCAATAAACAGTTATCATCCAAAAGAGGGAGGGTGCCTGCCG:1 - chrX 7564523 3' + 1360 490 1 76.24 GCTTCACACGCTCCGGGCAGTGACCATTTGGCTGGTGCTGGAATTGGCTCGAGCCACCTGCCTTCGCTTAGACAGCGACTAAGACTGACCC:1 + chr2L 11173601 3' - gypsy4 6687 2 53.85 GTACCACTTCAGGCTAGAGCGCCACAGAAATCGCAGGACAACGGAATAAGTTCCTTGGGAACAGGACAGCAGAATAGGACGCCCGGCATGCCAGGCCACTC:1 - chr2R 5611841 3' + BS3 1486 1 78.22 CGGTAAAGCGGAAAGACCGTGAACTAACGGAACCGCCCTAGTACTTATACTCGACTTGCCCTTCCGATTGCCTTTGATTGATGAGTGGCGCATTGGCCATC:1 - chr2R 12696396 3' + gypsy8 4717 2 53.47 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATTAATATACATAGTTTTAATACCACCAATA:1 - chr2R 8271454 3' + pogo 2056 1 74.26 TCGGTATTTATCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTGATTTGTTTAAATGCCTAAAGAGTCGCATTTGCCACCGTCTCTCCGGTCGACTGATAAA:1 - chr3L 11528567 3' - Porto1 4483 1 58.42 GCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACTGCGACCTAATAAAATTCCGTTTTACAAATTGAGTTTCTG:1 - chr2L 14074918 3' - jockey 220 1 76.24 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTAAACAATAGATACATTGATTAGGGTCTAATTTTTCCTTAAA:1 - chr2L 10164994 3' + mdg1 7429 2 54.64 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTCGTTTGGTTTTCAGTTCGCTTTCCAGCTCAGTCG:1 + chr2L 9437489 3' + P-element 2849 1 42.57 AGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTAT:1 - chr3L 17215726 3' - Ivk 38 1 58.42 AAAGAGAATCTGGCCAAGTGTGCAGTGTATAGATACTAATATGGCCTGCTTTCAAACAAATGGGCATCTCCATATGGATTTGAGCGGCATCAAACGAGTTA:1 - chrX 14755688 3' + transib3 2862 2 59.41 AAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAAGAAAACAGCCTTCGGTGGCTACAAAACGTTGAAACCACTTAGACCAGGAGGGAAATATC:1 + chrX 838086 3' + F-element 59 1 67.33 TGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCGGCAAAGTGCATGCTCAGCATACGCCGCGTTGTCATTGAGACGGCAGCTATTTTTAGCCCTCGCACATAACC:1 + chr3R 9903362 3' - Stalker4 7183 4 60.40 TAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGCTTT:1 + chr2R 5531209 3' - 1360 52 1 73.27 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTCGACTCGAGACGCAGAAGTTTGCGT:1 - chr3R 10978681 3' + roo 393 1 66.34 TAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTGAAATG:1 - chr3R 27071892 3' - jockey 4715 1 68.32 AAGCTGCGTGTGACGACGAACGACACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTTATATACGCGGGAACTCATGCCCCCCAGCAACGACAAAAATATT:1 - chr3L 25551334 3' + Chouto 23 1 46.53 CAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTTTTCGAGCCGAACAATCAGCACC:1 - chr3L 2996894 3' - hobo 370 1 77.23 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGACCCGTCTCGAGATCGCTTCCCGCCTGGCCCCCATCTTCTCTGTTCACTTAGCAAATGTTTAA:1 - chr2L 7970958 3' + blood 365 2 65.35 ATAACTTACTGATTTAGAATTATGTGTTCCATGTTGTAATTGTTGACCAAAGTGGCCTTGATCAGCTGGATAAGTATTTGTTGGATTCACACACTAACTAA:1 + chr2L 22678216 3' + transib3 307 1 62.38 GGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACTGCGACCTAATAAAATTCC:1 - chr2L 14074939 3' - jockey 241 1 55.45 TCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCGAAGCAAGTGCAATTTGGAAAATCT:1 - chr3R 11801090 3' + invader4 2783 2 75.25 TTTATTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTAAGCTGGCTAAAATTGTATCTTGTATAGTGCATTCAGATACAGGATACCTGAAGAGCGGCGATCTGTGGTCCGAC:1 - chr3L 11370305 3' + S2 108 2 68.32 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATGTCCGCTGACATTAAGGAGCGCACCGA:1 - chr2R 14204690 3' + opus 7453 2 74.26 CCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATAAAGGCCATAGTAACAAAGAAGCCGCAACGCAAGTCGTAAAATGCATTGCATACTTTCTGGAGTCGAAAAGTGC:1 - chrX 10824000 3' - jockey 4672 1 76.24 TTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGGCCCGATGCTGGGAACGCATAACGAGAATGCCAATTGAAACGGCGAGTGGCA:1 - chr2L 14071035 3' - Gypsy6A_LTR 83 1 57.14 TACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTCCGACAATACCAACTATGCACTACCAACTACCGAAACCGTTGCGCACCGGGCCAAGGCAGAGTTGGCAATAA:1 - chr2R 20916811 3' - blood 7259 2 72.28 AACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTAATGGGAGTGGGAGTGGGGCAGAGGCAAAGCGTCAACATCAACATGCCAACAG:1 + chr2L 15937258 3' - HMS-Beagle2 6818 1 47.52 ATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCTCCTGCTGTTGCGCTAAATATTTTAATTAAAG:1 + chr2L 14886660 3' + jockey 148 1 68.32 GCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAATGAAAGCCTACAAAATATACATAATGGAAAGCCGACATAAACTAAAGGCTTATAGACTAACTATCTTTG:1 - chrX 11463592 3' - flea 4760 1 66.34 TTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGATAACGGTAAAAAAAAAATAAAAAAAGGGTATACTTACAAAGCCACATCTTTTAGTACTGCTGCTATCTCC:1 - chr2R 698834 3' + Bica 498 1 75.25 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCACACATCCTGTCTTTTCCAAAGAACTTTTA:1 - 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chr3L 14356700 3' + F-element 64 1 78.22 ATAGACAAATTTAGGCAAAAGGCGCTACTATTACTGTTATTACAATAGTTTTTGGCACAAGTTGGCACAAATCATTTCTCACAATTTTTGCTATCATAAAA:1 - chrX 22913198 3' - transib3 498 1 47.52 GTACCAACAAATCATGAAAGAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACAATTCACCACCCCTCCCCTTTTCCCATCCACATCAACTTGGTGTAGATTTTTCG:1 - chr2L 4045692 3' + F-element 348 1 63.00 GACTAAGATGGCTTCCTTGTGGGACACCGGATACGGTTCTGGAGCGACTAAGGGATCTGCAGGAGATCGAGGAGTTTCAAGTCTTGGGTACCAATCCGCGA:1 - chr3R 18222329 3' - Q-element 490 2 75.25 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATTTTCAATTTTTGATGTCATCGAGCGCACCGCACGGCTATA:1 - chr3L 21992739 3' + 412 7511 2 57.43 TTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCATCAGTTTACATTTCTCGTTTTGTGCGTGAGCCTCTGACCCAAATAAAAACAAAC:1 - chrX 2746147 3' + Quasimodo 7109 2 55.45 TCCCATTGGGAGACCAAATAAACTTCCGCAGCAGCTGTCCAGTTTGCCGGCCAGGGGTCCTGGTCCTGGTCCTTGTCCCAGCTACTTGTTTCACTAACGAA:1 + chr3L 14695841 3' + G5A 2573 1 70.30 GTGCACCAAATCACCAGGGTTCTAGCCAAAACTTGAACCCTGGGATAGAAAGCTTTAACCATTGCAGTTTCCGAGAGATTGCTGCCTGTTTTGAGGTGAGC:1 + chr2L 9360701 3' - X-element 292 1 57.43 CATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGGAACAGAAAGGACAACAATGTGGAAGGGATAAGAAAGGACGACGAAGGAAG:1 + chr2R 10347307 3' - roo 142 2 55.45 GCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTATTAATTTAAGTCAAATGACTTAAAAAATATAATAAATAAAT:1 - chr3L 15436571 3' - 1360 486 1 66.34 TAGTCTTGTACATTTCTATCGATTTGCCAAAACACTTTTAGCCACGCCCACTCTAAAGCCCAAAAACCGCCCAACAACTGACCACAGGATTTTTCACGCGA:1 - chrX 14405521 3' + INE-1 299 1 80.20 AATGGGAAATGGCCGGATCGGAGCAAGGTATATATCGAGAGCGTCGAGAGTTCGGTGTGCGTTTTGCCCACCAAGACGAAACCCAAAAAGGTCGCCTTCT:1 + chrX 6830569 3' + accord2 265 1 76.00 TCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGTTAACCACCTTCGTCATCTTCGCACGATGACAATTCACTAAATGG:1 + chr3L 14152195 3' - blood 7011 1 79.21 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATTTTAAACTCTAGGTAAAAGCCATTTTAGCTACAATTTCAACAAATTGTGATGGT:1 + chr3R 11073812 3' - pogo 15 1 60.40 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTACACAAAGGATGTCACACGAAATATATTTAAAATTCTTCCAAATAACTATTATCAAAACGATTCCT:1 - chrX 22560007 3' - S-element 3 2 70.30 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTC:2 + chr3L 14152144 3' - blood 7062 2 76.24 TCCGGGTAGGGAGATCGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATAAACTACCGCCTATAGATACTCGCACTTCCTTGGCACATTTTCCCCCAG:1 + chr3L 15690962 3' - G5 4654 1 52.48 ATTCGGAAAAACGGCACAATATAGCAAACGTCTTTTCAGTTACATTTTTAAGTTATTTTCGGTTTTTGTTTAGATCTGTAGACGCTTAGTTTCCAATATGG:1 + chr2R 15464277 3' + Bica 304 1 74.26 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCACAGCGTACTTTTAATTGGAGTTTTATTGCAAAAAAAAAACAGACAGAGAATTGATTAAATGCATTTATGCC:1 + chr3L 5492400 3' - pogo 1 1 76.24 TGTGTGTGTGTGTGTGTTTATGTTTGGGTTTTGCCGTTTCATTATTTTTTTAACTTCGTTCCCTGCTGCGTGTTTATTTATTTGACTTGTGCATGTCGCTT:1 + chrX 18984538 3' - accord 180 2 48.51 AAACTTCCACGCCCACACTTTTGCGAAAGTCGGCGGAGAAAAAATGGTGCATACCGCCAGGCGCCCGAAACATTCCCAACATTTTTCGTAGTGGTAATAAA:1 - chr2L 2317635 3' + INE-1 246 1 73.27 ATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAAGAGCTGTCTAGTGTTAATTAACAGCCACGCATCAAG:1 + chrX 13641411 3' + jockey 4987 1 53.25 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATTAAATGT:1 + chr3L 3635480 3' - roo 8700 2 63.37 ACTTGCTGCGCTGCCGCACCAAATTACAAACTGAATAAACGAAATTGTTGCAGCTGTCTGCAGTTGCTGCTGCTGCTCTTGCTGCTGTGGTTGCTGCTGC:1 - chr2R 19910130 3' + invader4 277 2 45.00 TGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTATTTGACAC:1 - chr3L 21912265 3' - Bari1 36 1 68.32 ACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAAAACTCAATTTTCAGCGTTGTTTGGATTTTATAATCTTCTTCACCCAATTTTAGATTTACTA:1 - chr3L 24226362 3' + 17.6 382 2 58.42 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATAGCACTTTAGGAAAAAACCCATGATTCTATCAAAAAGTTG:1 - chr2R 10865650 3' - pogo 29 1 60.40 GATCCTGATCAAGAACATATATGCGGTACACTATTCAACGAATCTTGTATAGCCTTTTACTCTACGATTAAAAAACCATTTCAGTCGAAATTAAATTGATT:1 + chr2L 20423720 3' - INE-1 80 1 41.58 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTAGGCTGCTTGCAACTTTCTGTGGC:1 - chr2R 20996450 3' + P-element 2836 1 28.71 CATACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCCTCGTTTTCGTACAGACATCTACTTCCCCCCCGATCCCTGACATAGCATACACAAACT:1 - chrX 3693471 3' - 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I-element 126 1 78.22 ACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTGCGATGCCTGTGGTGGTGCATTAACACATGCGCCAATAAGTATGCAATGCGCTGT:1 - chr3R 28196679 3' + hopper 1397 1 59.41 GGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGGCAATCGTTTGACGTCGGTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCAGTGGTCCG:1 + chrX 20330570 3' - P-element 7 2 69.32 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATATTTTTATAGCTTAAGATACTTTTACGCAGAACAGATAGTGTAATGTTTTAATGCTACTATT:1 - chr3L 11335424 3' + pogo 2092 1 67.33 AGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAG:1 + chr3L 19339423 3' - Tc1 31 1 52.00 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAAACAACAAATCTATTAACGGAACTAAATATCCCAAACATGGTGAATGCAATACGAT:1 - chr3R 545170 3' - Transpac 4933 2 66.34 GTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGTGTGTGTGTAGGGAGTGGGGAAACAAATTTAAAAATTCAATATAATGAAATTTACTTAATTGTATAA:1 + chr3L 1071012 3' - 1360 3236 1 75.25 ATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATACAAATCATAATAAATTTAAAATTGTTTCTAACTTTT:1 - chr2R 18281551 3' - 1360 346 1 66.34 AGAACGCGTATGAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGGCTTCAATTGCTGATAAGCAATAAAAACAAATGGCAAGAGCATGGGCAGAGAACTCAGACTCCCCAA:1 - chr2R 20139701 3' - 1360 3220 1 69.31 TAATAAAAATAATAATAATAATTAAGAAATCGAATAAATATTAACAATTTATAACATCCATGCAATTTAAGCCACTTTAAAGTATTATTCAAATTAATCTA:1 + chrX 12423378 3' + mdg1 30 2 77.23 TTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAATTGTTGCTGTCCCTTTCCAGCATGCCACAACCGCTCTCT:1 - chrX 20966566 3' + hobo 254 1 61.39 CGGTGGTTATCGCTGCGGCGAAGCTGTTGACCGCTTGCCTTTCAATTACCAAAGAGGGAGATGGCGCACAAAGCGCTTATCAAGCTCTTCTGTTCGTCGTA:1 + chr2R 11202541 3' - Rt1c 5245 1 67.33 CTGTGTATGGAATAATAAAGTAAAACTAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTATAAAATGCGGGCGAAACTGGCAGTCGAGCATGAAAACAG:1 + chr3R 17988201 3' + Doc3-element 155 1 68.32 ACCACACACACACACACATATATATATATATATATATGTTCCTGTTGGGCTAACCCATTTAAATTGGCGTTGAATCCTAATGCCCATGCTCACGTACCTCT:1 + chr3L 2677655 3' + accord 184 2 45.54 AGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACGACACGTTAAAACTCTGCTAACAATTTAAATGAATTAATATGCAAAAATCCGATACGCTT:1 + chr2L 17000142 3' + Ivk 316 1 67.33 AAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGAATATGGGATTAAAAAATATATGCCAATATTAT:1 - chr2L 9299667 3' + 1731 4582 2 71.29 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATGAAAAGAAGGCATGCGTGCGTTTAATTATACGCAATGTTGTTGCATACTTTCGAGGGCCGCCTTCAACAATTCCGTTT:1 - chr3L 10035683 3' - jockey 29 1 76.24 GTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCT:2 - chr2L 15019909 3' + BS 5041 1 75.25 ACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAAGAAAAGTAGTCTACTGGGTCCGCCCAGGGAGTAATATGCCGTTCG:1 - chrX 11445040 3' - Cr1a 4030 1 72.28 ACACCGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTGATTCCGTATCCAAGACCAAGATGAACCAGAAGGATCTGGACAGTGAG:1 - chrX 18747486 3' - Doc3-element 452 1 52.48 GCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGCTTTAAACACACTTATTTTCTCAGTGCATGAATACTTACAGGGCCTGCAGTCGGAACTCTTCGTTTCTGT:1 + chr3R 15631210 3' - opus 2 2 75.25 TCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGCGGAGCAGAAACAGTTATTTATTAAATCCCTTTACGCGTTTTTATAACATTTCGAAAATGTTTA:1 - chr2L 21786705 3' - Tirant 31 2 68.32 CACACACACACACACATACTCACCCACTGAAATGTCCTCACACACTTACAGCTAGCTACACACACACATGCACAAACTCAAAACATTTGCACATATGCGAA:1 - chrX 5063308 3' + accord 186 2 67.33 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTCATAGCACTCACCTTGCCGCGAATTTGCTGCTTGATTTCTGTGCCCCGGGCTCTTTG:1 + chr3R 14882920 3' - pogo 16 1 64.36 GCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTCGCCAGGCAGAACATTGTTAGATTTTTTTTTTGGTCTTTTCGAGTTGTAATTGCTTTGTCTTCACTCGTTTTGG:1 - chrX 15148741 3' - X-element 4621 1 77.23 AAATTTGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCTTCAGTGTAGCCAGGAATAAAGCCCCTTTTTGGAGCAGCACTTACATCGCTTGGCAACTAAATCA:1 - chr3R 9082777 3' - hopper 127 1 70.30 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAACCACATATCTGAACAAGTATCTGAAGTATCTCTTGGTGCATGCATTCGGTATCCGTAT:1 - chr2R 11195595 3' + 1360 3373 1 57.43 GAGGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTCAGTATTCTC:1 + chrX 19820788 3' + Rt1b 4978 1 79.21 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCGCTGACACAGATGGCGCCCGAACAGGGACAGGTGGCTGCCAA:1 + chr3L 4051117 3' - pogo 34 1 58.42 CAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGATACACCAAAATGATAGTCTAAAAAAAAAGCGAACAGACATCAGTTTTCAACGG:1 - chr3R 14740253 3' + R2-element 3536 1 56.44 TAACCTAACGCGGGGAGGAGTTAACAGCGCGACGATTGCGATCGTTTTCCTTTTCCCTGAAACGAAATTTAAATTTAATTTATTAGAATTTTCAATGTATG:1 + chr3R 8865323 3' + gypsy4 6553 1 77.23 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGGCTTGTTAGCACAAGGATAGTGATTCCAGATTCCGCAGGTG:1 + chr3L 12724247 3' - roo 35 2 60.40 TAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGATGACGCGATCTTCGCGAAACCAAGGCCAAGGTGAAGCATTCATTGCCTATGACACAATTTTCAA:1 - chr3R 21523610 3' - flea 4950 1 67.33 CCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCG:1 - chr2R 12185346 3' + accord 493 2 72.00 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCTGCATAACACCATTCAAACCGGCAAATCAAACAGTCGTGCTGAAATGA:1 + chr3L 27262135 3' - P-element 27 1 52.00 TATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCTACAAGTGTCCCTCTGTGCCGCTGCCATCTGACCGACTCAAAAGCCACATATCTTCCACCATCTCAAACATTG:2 + chrX 16123782 3' - Quasimodo 38 2 41.58 CACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTA:1 - chr2L 14074968 3' - jockey 270 1 73.27 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGTGCACTTGGCTGGCTTGTCAATCGAATTCGCATTTAAACTGCAAATTTATGGCACACGATTTGCACATTACAGC:2 - chr3R 21969028 3' + hobo 2937 1 77.23 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGGGTCATGAGCCACGACCGAATTCTCGGACTCCTTGGA:1 + chr2L 16396628 3' + 412 7506 2 66.34 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGTCGTTGGTTCGAAA:2 - chrX 22690748 3' + roo 9036 1 59.41 TGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGGGCTCTTTCTTGAGTTGTATTATCTCCCTTGTCGGTTGCTAATTGCTTTATTGCTCGACTTGTCTGCTGCTT:1 + chr3L 15346576 3' - Doc2-element 463 1 59.41 CATTTTTTTTATTTATTTTTTTTTTTGGCTATGCATTCGAGTTGGCACACCGCACAGAAAAGGCCACAGGAACTTCCAGTGGATGCACTTTGAACCCGTTC:1 + chr3R 14230732 3' + hopper 142 2 91.09 ATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACAAGTAACGGGTATGAAGAATGAAGAAGGAAAAATAAGGGACGCAAATAGAGCGAGGGAAATGT:1 + chrX 5256764 3' - INE-1 10 1 77.23 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAGGCTCGTTAAGGAG:1 - chr2R 19209451 3' - Doc 49 1 65.35 GGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTAAGCTGCAGTGTCCATTGTTTGCAGTCCTTAGCTCCTCGGAAATGTAATTCCTTTT:1 + chr3R 30965533 3' + roo 8944 2 63.64 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAATAATTAGGTAACAAATTGAAATATCATTAACTATTTACATACAATTTTTGAAAATTGCTGATT:1 + chr2L 11156348 3' + copia 243 1 66.34 CGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGCCGTTGAATAATTAGACAGCTTCCGCTTTCGTTTCCGCTTC:1 - chr3R 23540958 3' + Doc 465 1 59.41 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTCCTTGATGTTTGCTGAATTA:1 - chr2L 11805000 3' + P-element 2870 1 58.42 CGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTCCGCAGAACAGCGAAGCCAGCAGATTCAGCCGTCACACCCAAGTT:1 - chrX 13887821 3' - jockey 208 1 55.45 TCAGGATCAATAGCAGAGTCGAATGAAGGATTCTAATTCGGTGTAAGTCCAGTTTTATGTATTATGTATTGATTGCTAAAATACTACATAAAATCTTAAAC:1 + chr2L 12286075 3' + INE-1 94 1 66.34 TAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCAAGCTAATACAATTTGTAGA:1 + chr2R 9323500 3' + jockey 138 1 80.20 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACAC:1 + chrX 12818882 3' + roo 9028 1 68.32 ATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTGTAGTCGCCGCTTGCCTTCCCATAGTTTTATCGAATAA:1 - chr3R 19686815 3' + micropia 140 4 72.28 ACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACCAGGTGAGCAATTCTAATTATTTATTAACATTGGCATTGT:1 - chr2L 9679297 3' + Stalker2 7306 2 60.40 TAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATAAAAAAAAATAATTAATTTGGTAGGCACCTCGTCTGAA:1 + chr3L 19927559 3' + jockey 4974 1 65.52 TGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAACAGAACAAGGAATCGCTTATCGAAATGTATTTGTTTTTAGACATTAAGGAATGAATCAACATCGTA:1 - chr2L 74347 3' - diver2 170 2 61.39 ATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATTTATTGAATTCATTTGTTAATTCGACTTCGTCCTGCAGCAA:1 - chr2R 9285536 3' - gypsy 7023 2 59.41 AGACTTTAGTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATGGGTAGGCTTTATGTAAATATTTAATGCTTACTTTGTGATTTAGACTTTA:1 + chr3L 13608389 3' + mdg1 396 2 51.49 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCATTTGCCTTTGCCTTTGCCTTGCTATAAATTTTTTTTTGTTCCCCCAACACGAAAGACAAACA:1 - chr3L 5257326 3' - Doc 18 1 64.36 CTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTACTGGGATCCAATATTTCTCTGGGATCAGCAGAGCTTCGAGGCCCGCTGGCACTTGCTGTTTTCCTGGTAGCCG:1 - chr3R 20928863 3' + accord2 7548 2 76.24 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGTAGCTCCTCTGCCGAAGTCGCTGCCTCTGTCGCGGCG:1 + chrX 409648 3' - P-element 38 1 41.58 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTTCAACCAAGAATGACAACAACAAAGCAAACAGCTG:2 - chrX 10210923 3' - I-element 10 1 71.29 TTGCTGAGCTGTTTCCGCCTACACTGTTGCAACATGAGGGGACAACGAACTAGCGGCTCAGCGTGGAGGTTTAGGGGAGGGTGACTGGGTGTCTGGATGAC:1 - chrX 7628787 3' - gypsy5 167 2 74.26 AAAATGCATTACAATTATTACACTACTCTGATCTACCCTGGGGCTGTGCCAATAAGTCGAGCAGCTTGTGATAAGAAATGCACAAGGTCAATATTGCCTTG:1 - chr2R 6783133 3' + Tabor 7324 2 74.26 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGAGATTAAATGAAATCTTGAAATAACATTTTAGTTCTTATATATAATCAAGCCAGTAGGTTTGAGTGTTGACCAA:1 + chr2L 15174198 3' - Juan 4030 1 70.30 AGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGATGAAATGCCATATTGTAAGCCAAAATAAGTATACGCACCGCTGTCTCGGTTGCATAA:1 + chr2R 14426678 3' + jockey 4887 1 60.00 TTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGACTAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAAAAGCTTAATTAAGTGAAGTTTTATTCGAGCTCTCAAGGG:1 + chr2R 4339527 3' + G5A 2803 1 78.00 CTCTTGAGTGGATCGCGCATGGATACTGGATAAGCTAAAGGATATTCGCTGCAATGGCAACGGCTGCTGGCAACTTATTGGC:1 - chr2R 21772066 3' - Quasimodo 414 2 56.10 TTTGAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTACTTCTATTGCAGCATTTCCATAAGTTATTATCACCGATCCGTTTATGCAGGTCTCATT:1 + chrX 21668189 3' + 17.6 7357 2 67.00 GGTCCGAGCATTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAAGCCTGTTGAGTTAGTGGGTCCGGATCGTAAATCAAGCCAACACATGG:1 - chrX 17500784 3' - Idefix 7066 2 53.47 ACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAA:1 - chr3L 17215719 3' - Ivk 31 1 53.47 CTTTAGGAAGCTTGCGCTTAACCGTGGGATTCTTATTTAGGCAAAAATTCAATTTAGCAATTATGTGACAAAAATTGAATACATTTTTTCATATTTACTTT:1 - chr2L 17784920 3' + Gypsy12A_LTR 49 1 40.59 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGCCAGTGAAGGGTTAAAGATGCCGACATTATAATTCAACATTG:1 - chr2R 17269716 3' + transib2 2792 1 55.45 GTCTTTGCTTTGGTCATATCTTGAAGCACGGCATTTAAGATCACAAATCGCTAATTAAAAATAATTCTTAATCAAGGCAGAAACCAATTACTATTTAATAT:1 - chr3L 14474361 3' - 1360 492 1 65.35 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTGGGAAAAACAAAAGCAAAATGGCAA:1 + chr3L 4713817 3' + transib2 2776 1 72.28 TTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACT:1 - chr2L 14074957 3' - jockey 259 1 62.38 GGTCATATCTTGAAGCACGAGGTTCGGACACAAGCACTCGGCACTCGATTTAAATTCCCTAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - 1360 481 1 34.65 AAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGT:1 + chr2L 22684579 3' - transib3 47 1 58.42 TTACGCATCTTGTTATTCTGGTGTCTTTGCCAGCACCCTGAGTGAAATGATATACCCTTCGGTTCTTTCACTTACCTTCATCATTTTAAGCCACCTTGTTC:1 + chr3R 19758665 3' - 1360 8 2 64.36 ATCGCAATGACATCGTTTGCCCACGTGGCCAGACCACTGAACCATCCGCCTCTTTCTTTTTTCTTCTTCTTCGATTTCGAATTTCCTTGCAGACGCCAGAC:1 + chrX 14897532 3' + FB 199 1 51.49 CTCTTCTTTCTTAAGCTCGCCTTTGATCCCAAGCCCAAAAGCTGGACTCTTATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATTAGCCTCCGATTGACGGCCCAGAAC:1 + chrX 7322623 3' - gypsy7 5324 2 80.20 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGACTATCAGATACCTCTTACCCATGCTCTAGGAATATGAAGATGTTTCAGTAGCAAATCGA:1 - chr3R 10078299 3' + roo 394 1 64.36 CGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTCCTGACTATATATCGTTAATATTTTAAAGATATGCATTTTATTTCCAGTGCAA:1 + chr2L 10635666 3' + hopper 398 1 62.38 ATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTTGCATTCACATTGCTTTGCTTCCTAGTATTA:1 + chr2R 17190076 3' - F-element 137 1 69.31 TACCTAAAATATCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAATTTTGCGCAACCACAGCCGTTACTGCTCTCTGATTTCTTGCGAAACTGGAAACAGACACG:1 + chr2R 2751115 3' - R1A1-element 5102 1 53.47 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGATGTGTGCGTTTGTGGAAACTTCTTATGGCCATTTCCATGATGACGACATGGGTTTGTTTGCCAAGAGCCAAGACAT:1 - chr3R 5017702 3' - 3S18 5786 2 80.20 AGAGCAAAAAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAAGCAACACATGCACACATCAAATGGTTGCGGGGACTATTGCACATTGTAATACGCTACCGG:1 + chr2R 488283 3' + Bica 291 1 63.37 TCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAAGAAATTAAATTACGCTTGAACG:1 - chr2L 16717976 3' + 1360 3337 1 81.19 TAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTCATTGGAATGCAAACATAACGCATACGCAGCGTTGGCAATTTTGGAGAAGAGACCGA:1 - chrX 1018358 3' + transib2 2805 1 60.40 CATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTTCCTTATGAGCATTTTTTATTAATAAGCTTGTTAGGTGGCATTTTTCTAAAATGATTGGATGTTTAACATTA:1 - chr3R 19446954 3' - Tirant 478 1 76.24 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCCAAGTGAAAAGTCGCTGGGAAAAATGGGATGCAAAAATAACTGAGAGTCAGGAGAGAACGCGACCACA:1 - chr3L 22741301 3' + P-element 2879 2 71.29 GATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACAAGAAATGGGCGGTGGTTGTTGAGGCAGTGCCTCTAACATCAAAAGCAGGAGTGGCAGCGTTTGATGTTGATTAG:1 + chr3R 15714237 3' - jockey 9 1 73.27 CGACTTGATTAGTAGGCTTAACTACTCGGTTCCAAGTAGATTTGAAGCCCAGTGACTGCAACTTCGGATCCGGACACCGAATCTCATTTCTAAATATCCGC:1 + chr3R 1854006 3' + Cr1a 4081 1 62.38 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAACTCCATGGCGACTTTAAGGAAAATGCATCGAAGAGCCGAATATGTTGTGAC:1 + chr2L 16136677 3' - hobo 21 1 59.00 TGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGTTAACCACC:1 + chr3L 14152159 3' - blood 7040 2 58.51 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTAATGAGCGTAAAGTCAAGTTGAATAGCCATATAAAATGCGCTGAACTTGCGAGCGTGTAGGTCAAGATCAGCGG:1 + chr2L 19571342 3' - P-element 4 2 76.24 ACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTCATTTCGCTTATCGGATGTTCAGAAGTTGCATAAATTAAATTTGACCGAATTTACTTTT:1 - chr3R 24300896 3' + Cr1a 173 1 68.32 TGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTAAATCGCAAATAAACGTTTTTAGCATATTCTTTAATAATTATTATTAACATTAATAATACGATAATTTCTCA:1 - chrX 12151583 3' + diver 212 1 66.34 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATGCATAGAAGAACCAAAAGGTGAAAGGTTTTGTATTACCTACGATCTAAAGTT:1 - chrX 8447118 3' + opus 478 2 56.00 CAAAAATAATAACACAACTATTAGCAATGAACGAATGAGTGAATGAAAAGCTGAATAAGCGAGTGAGTAAATGAATGAAGCCCACATGCAATCCGATT:1 + chrX 3404934 3' + S2 141 2 74.49 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCTTGTTTTGCCCTCTCAACGAGTGCCAGATTACGCATACGCAATGTGTGCTGCCATTGTGT:1 - chr3L 5387776 3' - mdg1 15 2 64.36 GGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGAGGAAATCTTTCGTCGCTGGTTCTTTTGTTTACAGATG:1 + chrX 8507926 3' - Doc 317 1 61.39 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCAAACACCTTGATGTATTTGCCTTGTTATAGCTTGTTTGTAGTTTGCACTTA:1 - chrX 12276757 3' - hobo 25 1 54.46 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGAACCGCCAAACCACCGCTGCAGCGCGCTGGCAGGCTAAATGTTACGCGCTGCATGCATTTGCGGCTGG:1 + chr3R 28196787 3' + hopper 1408 2 66.34 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATATCTTATTGAATGATATGAAAAGCATTTCTATGTTAATGGA:1 + chr2L 18188460 3' - Doc 41 1 60.40 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTAAGATAAGCGTGCAAAACGTGATCCAGATTTA:1 - chrX 14521655 3' + roo 9033 1 67.33 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGATATATTTCCTGTTTCTATAGTAATTTAAAGGCATTCTCATAAACTTAAGCTC:1 + chr3L 11335531 3' - pogo 20 1 55.45 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCTGTTGAATGGTTTCCTACCGTCTTACACCTTCGAGCTGCGA:1 + chr3R 23485724 3' - roo 35 2 62.38 CTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAGCATATCCAATAAGTACGAGAGGCGGA:1 + chr3R 21354988 3' + mdg3 5287 2 81.00 TTTTTTTTAGTTTTACGTTATTATTCCACTGTTCATTTTGCCTGACAGTTTTGTTGTTAGTTTTTCTAAGCAGCGAAGGGAAGGATGTAGAAAACAATTAC:1 - chr3L 22964739 3' - Doc3-element 168 1 39.60 AATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAATGCCTCTTGCTCCCGA:1 - chr3R 12116925 3' - transib2 2589 1 45.54 CTAGTAGGATCTAATTATGTATTAAAAAAAGTGAAAATTCACAGAGGGGGAAAACGGAGAGAACTGGTTGCGAATGGGCGAAGAAAATCGCGAGGGGCAGA:1 + chr3L 5245638 3' - Cr1a 4283 1 72.28 CACTTTTGAAAAATGTTTTGATATTTTTTCATATTTTTATTAGTTTTGTAAATTTCACTCAACCCATGCCAACGAAATTTTCATTATTATTTTTACGGGGC:1 - chr2L 12185976 3' + INE-1 261 1 55.45 CATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACATGCATGCAGGGATGCATGCAGGCAGGCATATCCTGCTACTTTGCAGGACATTGTTTGCGCTT:1 + chr3R 9184655 3' + Idefix 32 2 70.30 TCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCATGCCCCGTTGATGGAGCCGTTAAAGTTACGCTCCTTTGGCTCCTTTGTCCGGCTCACTGCCACTTGCCG:1 - chr3R 24488368 3' - 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Doc2-element 100 2 71.29 AAATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTTACCCACCGAATTGAGCAGCTGAACATCGGATGAATTGTGC:1 - chr2L 10539998 3' + HMS-Beagle 428 1 59.41 CTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAAAAAAAAAAAGTAGAAGAAAACCCCGCCTGTCAGTCGTCATAAGCCATAGGCTCCCCAATTG:1 + chr3L 7825053 3' + transib2 2406 1 70.21 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCACAATTTCTAACTCCGCTCTCCCAAGGTTGACAATACGAAAAATATACTTGATATA:1 + chr3R 21969135 3' - hobo 21 1 57.43 GCCGCTCTTAAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGGAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAG:1 + chrX 124083 3' + Cr1a 4249 1 72.28 CAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTGGAGACATAAAATGTGGGAATCCCACTTATGTAACTCTAGAGGGTATCAAATTGA:1 + chr2R 1986278 3' + INE-1 155 1 52.48 CAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTTGCCAGCTTACATCGGCTTTGACCCATCC:1 - chr2L 12370507 3' - Bica 13 1 71.29 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGGCCCCACATTCACATTG:1 - chr3L 5490089 3' - 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chrX 12818828 3' - roo 30 2 57.00 TTCGTATGGACCTAAATACCCGCTTGCCATCTTGCGCCTGGTAGTTGACGAATCCCCAAACCGACTGCACGGTATCCGCCTGCTTGATGGGAAACGCCAAG:1 - chr3R 24377096 3' - flea 4566 1 69.31 ACTCTGGAGACGTTGCAGGTAAGTAGTTGTTGTACTGGAGTTCCTATGAAATGTTACACATTTCGATTTAAATTTTTCCAAGTGCATTAACTTTGCTGCCC:1 - chrX 7469384 3' - HeT-A 5697 1 76.24 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTATGTTCCAGTTTAACGAACTGATCCAC:2 + chr2L 5269851 3' - hobo 47 1 70.30 AGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGAGTTCTTGGAATCTTAAGCAAGG:1 - chr3R 22190803 3' - hobo 364 1 78.22 TATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGCCTTGTTTTGCTTTCTACTAATTCGGATTGTTTTG:1 + chr3R 27993394 3' - transib2 37 1 70.41 GTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATTAACCTAATGGCCATTTGCTTGTGTAAATAAACGATTTGAGCTTTTTCGAATGGAATTGGGTCGGCTGAA:1 - chr2L 12270330 3' + accord 7067 2 72.28 AATTGGAGTTCATCATTACATGGGTCATGAGCCACGACCGAATTCTCGGACTCCTTGGACCCAAAAAAAAGTATATATATATTTATACCCACGACGAGGG:1 + chr2L 16396668 3' + 412 495 1 76.00 AATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTGCATTTGCAGGATGCGAACAGCGTATTGCTTTTTGTTTTCCGCCTTTGTTGTTTCGCTCC:1 + chr3R 6412178 3' - I-element 386 1 64.36 CCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCATCAACCAGGACGAGTTCGCCGGCTTCTCGTTCGTG:1 + chr3R 29046167 3' - flea 4842 2 68.32 GAACAATTTAAATTATTTAACAATATTGCGAATCGTACATAAAACCACCATCAAGTATACGCAGTGTTTACGAACGAACTCATATGAAACCATATTGAATC:1 + chr3L 18022457 3' - HeT-A 5809 1 86.14 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATCTACACCTTAACCGGTTTCTAAACCTAATTTAAAGTA:1 + chrX 10449859 3' + mdg1 383 2 62.38 TAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTG:1 - chr3L 5267210 3' - Juan 3996 1 52.48 ATAATTTTAAAATTTTATTTTTTTCTGAAATTTGTGTAACAGTTTTCATAATTCCGTAACGTTCGTTTGATTTACGTTGCTGATAAGACTTTTGAAACGCA:1 + chrX 8093231 3' - 1360 3053 1 77.23 TCCTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTGGTATTTTTGTTAACAAACTACCAATAACAAATT:1 - chr3L 9709643 3' - I-element 5220 1 76.24 GCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACAAAATGGAAATGGATAAGAGTTTTCGCTTGCTTAGTAAAGAGCTGAAGTGATGTCACAG:1 + chr2R 5154818 3' - F-element 29 1 54.46 AAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACACTGGGACAAACAAAGTTAGACCACACGCGACATTCGGGGCAAGCTCGCGTCAC:1 + chr3L 18722674 3' + Tc1 1566 1 60.40 TATTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATCAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACGGTCAGAAGGCGTACTATACATATA:1 + chrX 169097 3' + Cr1a 4057 1 75.25 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTG:1 + chrX 21668062 3' - Tabor 6884 2 68.32 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGGCAATCGTTTGACGTCGGTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCAGTGG:1 + chrX 20330566 3' + P-element 2868 1 59.38 TCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGACCTTTGCCTCGTTCGTCCCTTTCGCAGTAGTGGTTTCTTTTGCCGCGCC:1 + chr3L 18806053 3' + Bica 3 1 53.47 ACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTGTACTGCTTGAGCAATGGTGCCGCCTAAAATATGAAGGCAATTAGTA:1 - chr2R 14187964 3' + rover 7057 2 57.43 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCGCGTTCGTTGATATGCACAGAGTAG:1 + chrY 311463 3' + 1360 3387 2 67.33 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACAGGGGTTGGTACGGGGTCGGATCCTGGCTACCTGCCCTCGAAAAACCGGGACC:1 - 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chrX 7698580 3' - pogo 22 1 57.43 AATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTAACAGATGGATAGACTTAGATCAG:1 - chr3L 25396474 3' + F-element 95 1 75.76 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGTGCACTTGGCTGGCTTGTCAATCGAATTCGCATTTAAACTGCAAATTTATGGCACACGATTTGCACATTA:1 - chr3R 21969032 3' + hobo 2933 1 73.27 GATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTATTATCTGTTATCTTGACTCTCTAATCACTGCCTGGTGCGGTAAAAAATATTTGCCTTCATCACTCACTTCAAT:1 - chr3R 19445173 3' + Cr1a 4161 1 59.41 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGACAGCGCTCAGTTGCTGGTCTTGTTTGGCTTGGTTTAGTT:1 + chrX 10629291 3' - P-element 8 2 71.29 TTTTTTATTTTTTTTTTCTTGTGTGCGTATCATTTTTTCTCTTTCACAAGCCATTTGCCCAAGGCCAATGGACGATGGACGATGGACGATGGGCGCCCAAG:1 + chr3L 1879739 3' - G2 3076 2 41.58 CGTCACTCCCCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGTAGGTCCTTTGCATGCAATCAAGGCAACTTTCCAAATGTTTTCCTTGTTGTTT:1 + chr2L 22093824 3' - 297 6567 1 60.40 TGACTACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTATTTTTAGGCTAAGCCCGACACAAAACACTATATTTTGCCGGACTATAAGTA:1 - 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gypsy8 4473 1 63.37 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGTTAACCACCTTCGTCATCTTCGCACGATGACAAT:1 + chr3L 14152184 3' - blood 7022 2 68.32 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCGGACACTTTGAGCTCGATGAATGTTCGATTTTAAT:1 + chrX 7031702 3' - jockey 4716 1 66.34 CGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACCAAAATAATAATTGTGCTCCGACATCAGAAGTGGGATCTGGCTCGC:1 - chrY 472540 3' - F-element 43 1 56.44 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGTGCGGAAACATTTTCGAGTTGA:1 + chr3L 13779338 3' - transib2 53 1 74.26 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGTGTGATTGATGTGGACGACAAT:1 + chr3L 21852540 3' + 1360 3336 1 82.18 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACAGCCAATTGGGTGCACTTACAGGTTGCGCGTACTTCGCGTTGCTTAACTTGACTT:1 + chr3L 27728965 3' - P-element 21 1 58.42 ATTCTGAAATGGAAACGTCTGATAGTGCCTGTATTAGACGGTTGTTCGTCACGTCTCTTGGTGTTCGGTTGGTAGTGGAAATCTGCATTTGAATGGGAGTC:1 + chr3L 22161199 3' - Bica 4534 1 58.42 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGCTTTAATGAGTTCGGGATTTAAATTAAACATGTGCAATTTGAATTCCAGCGCAACT:1 - chr2R 21860479 3' - roo 20 2 60.40 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGATCCGACGTCTAAATAGTCTACACCAATTCAAATACAATTA:2 - chr2R 21560347 3' + pogo 2068 1 57.43 ATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTTATTAAGCGAGTGAACAATCGCATTAACAACAGCAC:1 + chr2R 18226055 3' - mdg1 401 2 75.25 TGGCTGCCCCAGTCGAACCTTGGGGTCTGGGCGGTGATGCTGATGCGCGATGGCTACGCCAAGCGAAGATTTTCCCGCCTTCCTCGCCCGCGCACATGTCA:1 - chr2R 16110910 3' - Gypsy12A_LTR 423 1 79.21 ATATGTACATAGATTTCGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAAAGGCAATGCAAAACAACGGCTCTCGCTCGTTTGGTTTATGGCCTCTCAGGTT:1 - chr2L 14226022 3' - 1360 343 1 75.25 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCCGACAAAACGAAGATCGTCGCCG:1 + chrX 10585447 3' + P-element 2834 1 27.72 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTG:2 + chr2R 17345997 3' - hobo 44 1 67.33 GAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCAAAAAAAATTGTATGGCATTACGCATATTGTCGTCGTGCCGTTCAGGGCACGTTAGTTAGATAGGGAAAACAACAG:1 + chr3L 27365625 3' - 1360 50 1 56.44 TCTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCATCCATTTATGCATGTTGTATGCCTAAATATTTGATGGATGTCATCGAAAAGGAAAGCAAAATGAAT:1 + chr2R 20701707 3' - Quasimodo 40 2 70.30 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCACATCTGTTAAAAAAAATAATATTGCGAATAAGAAGTATGAAGTTCG:1 + chr3R 7869754 3' + jockey 4963 1 59.14 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGACTGCAAATTTATGCCTTTTGTACAGTCTGAAACTGACTTTCCTCGGGGATACTACAAA:1 - chr3R 9081915 3' - hopper 13 1 64.36 CGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGATATCCACGATAATCTGAAGTGGA:1 + chr3L 11312810 3' - F-element 352 1 74.26 ATGTAGTCTCTATGTGCGTTTGCGGTTTTTTGAGAAATATTATGTTTTAGGAAGCAATATCTCGATTACCAGTGCTGCCAGATGGCCAAATTAGTTTGGTA:1 - chrX 11483510 3' - hopper2 1130 1 74.26 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACAACGTTCGACATCTGCTCTATCGTCTAGGTTCGCAAATTTCGGATAAATCTCGTTAATT:2 - chr2R 18036601 3' - blood 7028 2 59.41 CCAGGTGTTCGACGTCGACAGTGGAATACTGCAAAGGAGGATCACTCCCTATCCGCTTTCAAGAAGGCGAACAATCATCGGGCCCGTATTAATTGCACCGA:1 - chr3R 8391206 3' + R1-2 242 1 67.33 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGTTTGAATAGTATATTCCAACACTTTTGAATTGATTTTCTTTTCAAATCCGTTTGTGTG:1 + chr3R 31243366 3' - copia 4912 2 67.33 GTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGAGGACGCACCTGGAGTCGTAGCCGAGCATAAGGATATGTGCATAACGGCTTCA:1 + chr3R 9082014 3' - hopper 22 1 58.42 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATATGTGAAATTGGATTGGCACCGAAAATATATATTATTGTATGT:1 + chr2R 15606088 3' - roo 8697 2 59.41 AAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGAAAAAGGCAAATCCTCTGCAACGCTGATTGCTTTATAACCTGCTGGAGAAAGG:1 + chr2L 5568318 3' + Bica 426 1 58.42 CATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCTCTCTGACTTCAAAACTTGACTCAAAAGGTGTTTTCGTCG:1 + chr2R 18231314 3' - Bica 62 1 64.36 ATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAACACGAAAATGTTTT:1 - chrX 10119539 3' + FB 27 1 70.30 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACAGGGGTTGGTACGGGGCCTGGACTTTGGTATGTGGATCTAAAC:1 - chr2R 19341962 3' + P-element 2854 1 32.67 CAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAATGAAAGCCTACAAAATATACATAATGGAAAGCCGACATAAACTAAAGG:1 - chrX 11463613 3' - flea 20 2 52.58 CGCATAGTAGTTTCAATGGCCCCTTGTCGAACCATCCCATCTTTTGTAAAAGAGAGATCCCAAACTTTTCTCACAGCCCAAGTGAATTTGTTACTTTGTCC:1 + chr2L 9194469 3' + frogger 452 1 64.36 TAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGATGAGATCATGGTTCGCAAAACTAATACATACTAGTGTTTGAATATTTGAGCAGCAAATAAAGCG:1 - chr3R 17064104 3' - Transpac 4927 2 71.29 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATCGCCCTTCTCTTGCCTTTTGTGTAAGCCCGAACAATGAAATGGTA:1 - chr2R 14744223 3' - roo 32 2 59.41 CCGGCTGCACCAGTTACCTCCGGGGAGTCAACGGTAGGTATTAATGTAGCTTGTAGGTGGGTCTAGCTTGGAAAGGCATTCTATAAGGAGCCCGATTCATT:1 - chrX 20763003 3' - ZAM 463 1 62.38 ACACACACACATATACACACAGACAGGAAGGAACAAAGGCATAAAACAGTCAGTCCACAGATTTCAATGGTATGCCTTGATGCCTCGTCTTGGTGATATTT:1 - chrX 10002223 3' + accord 7037 2 61.39 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACACTTTCTGTATTCACAAATTATCTTCCGGCCGTTCAAATTCTACACAT:1 + chr3R 7943923 3' + roo 9039 1 52.48 CCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTGATTGTCTGGCTGTCTAACTCCGCATTACCCTCACTTCTTTCCGAAAAAGTCCTGGAGAAGTGTTAACTTG:1 + chr3L 3573520 3' + opus 7070 4 78.22 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATCCTAGTGTCTTTGGTTAGATCGACCCTCTGGATTGCCTATAAATTTCAACTGTTATCAAGCTAACCCGTCCACTTAT:1 - chr2L 9047141 3' - 1360 16 1 56.44 TTGATCAGGATCAATAGCCGAGACGATCCCGCAATGTCCATCTGTCCATATAAACGTCGACTTCTCGGTGGGAAATTGTTGTGCAACTCCG:1 - chr3R 30570561 3' + INE-1 90 1 70.33 CCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGAAGGGGTTCAGAGCTGTGAGTAATGCTAATGCGATAAGCCGGATGCGCTAACTCACCAAGTTGGCATGGGTGG:1 - chr3R 15333579 3' - Doc 462 1 75.25 AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGCATATATTTTCTGTTTATTTTTGAAGCTATTAACT:1 + chrX 12151669 3' - diver 5928 2 66.34 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCACTGACGGCTCTTGAATAACAATTTGTTGACAAGGCAGTGTCTTTTTTCGGCAAGTT:2 - chr2R 2645444 3' - HMS-Beagle2 10 2 69.31 AAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAAACGTTGGCCCCAACTATTGGTAACG:1 - chrX 8855581 3' + Bica 426 1 73.40 GAAGTGTAGCATATTAGACTAATCTACCCAATCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCTAATATGCTACACTTCTCTTTAATAATTCTTTATAACAA:1 - chr3L 26170892 3' + Stalker4 6953 2 76.24 ATTTAGAAATGCCTGGCAAACGATTGAGTTTTGAAGTAGTTAAGCTGATTTATTATTGTATAATCGCCATTATCATTTTCATTACAAACTTAGAACAAGCA:1 - chr3R 834177 3' + S2 395 1 68.32 TTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAAACTGCTGTTGTATGAGCTTCGC:1 - chr2L 22184970 3' + roo 292 2 78.22 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTTGACCAACGGCAACAGTTTTCCACTCTCATATTTTGCTTTTGGTATTTCGCTTTCAT:2 - chr3R 20868705 3' + Transpac 294 2 63.37 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGGGTATTATTTTATTAAGACTACAATCGATATATAGTTACTTACGCAGGCTCTAGCCCTCCAGAATACGGCT:1 + chr3R 16487422 3' + roo 405 1 74.26 TTAAATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGCGTATGGAATAGAACTCTGGGCGAATAGTAGGGAGTGAAAGGTTTTCATGGCT:1 + chr3R 17394242 3' + Porto1 4224 1 65.35 TGCGCAGAGCTGCGCTAGTGCTTGGCTTCTCTTCCAGCTCCTCTCCCCCCCACCGTACTCGTACTTTCTCGGGTGCTGCCACTTTTGGAGGGACCCGAAAA:1 + chr2R 6115768 3' - G6 499 1 63.37 TCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATTTACTTGAAAAGTTATCAAAGAGGATTATGTATGAGCATTTGCAAGTAATCATCA:1 - chr3R 23902905 3' - 1360 216 1 59.41 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGTCGATGATGAAATCGGATGCCATACGCTCCGGGCGGCTGGTAAGCTTAGTAATTACATGTCAGGTGCC:1 + chr2R 18036710 3' + blood 370 2 70.30 CTCGACTATAGCATGCTCTCTTGTGTTGTATAAAAGACTGCTTCGCATAAGGAAAAAAAATCAAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGAT:1 - chr3L 23747152 3' + INE-1 577 1 69.31 TCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGTGCTAGAAGAATTTCGCGGGTAATTCGATATTTTCTTAAGCAGGTTGCCCCCGGAATGATTATGATTCA:1 + chrX 5561976 3' - F-element 270 1 69.31 CTTTTGTATAAGGGAATTATGAGAAAGTCATAATTGCGTTACTGTAACCCCATTGCAACAAATTGTTACAATGGTTTG:1 + chr2R 3592846 3' - Tom1 22 1 83.33 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATTATAATGCCGGGCCAAAAGCAAGCCAAACCGAATCGAGC:1 + chr3L 14285099 3' - roo 8669 2 75.25 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATTTGAAACCGTACTATGTACTTTTAAATTTT:1 + chr3R 6425917 3' + copia 238 1 59.41 GGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAACCAACCAGGACATAGCGCGGCTCAATAAAAGGTCGGA:1 + chr2R 4546077 3' + hobo 62 1 62.38 GCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTCATTGCTCGGCTAAATGAAGCTGCCATTGGGTGCCGGGCCGGCTCCTTCTGA:1 - chr3R 20487064 3' - accord 61 2 55.45 TCTTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGTTGAGTTAAGCCAAAATAGTGTCGGTTATCAGT:1 + chrX 20984582 3' + gypsy4 297 1 67.33 TACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTGGGATTAAAAATCTGTTGAGATTAAGCAAACTTTAGAACGTGATTTCGAGTTAATTTTG:1 - chr3L 25754064 3' + jockey 4846 1 56.44 TCATGCAACTCATAGTTAAATCTACAATGATTTAAGATAAGGGTATATAGTTTCTAGTGACCTTACTAGAACTTGTCTCGTTAATACAAAGTTTAAAATAT:1 - chrX 7377837 3' - Cr1a 4161 1 59.41 ATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAATG:1 - chr3L 17215716 3' - Ivk 28 1 51.49 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGCGTCCGTCCGAAGATTCAGTTGTGCGCCAAGCTCAGCTTCGGCCTCTTCGT:1 + chr3R 15328743 3' + P-element 2862 1 54.46 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCC:2 - chrX 4056282 3' - roo 8713 2 75.25 AGGTTAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATACATTTTTTCAAAATTCTTAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAAGGT:1 - chr2L 13417061 3' - FB 269 1 75.25 TGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTCTTACCTACTTTCAGATACTACAAGATAAAGTCGGGCCTGGGCGCCCATCTA:1 - chr3R 24562906 3' - Doc 4489 1 51.49 AAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACACTTTCGCCATCAGAATTTT:1 - chr3R 22878485 3' + X-element 4696 1 67.65 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTACGAATGGTTGGAATGGACAGCGGCATGCACTTTACAGGCTGCCCGGTCCCGTTAATAACTGAAACGTGCC:1 + chr2R 20762262 3' + hopper 1412 2 76.24 CTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACAACACATGAATTACTTATGAATGTTAATTACTTTCGCAACTTGTATAAAATGTTTGATAAATGTCTAC:1 - chr3R 13389482 3' + jockey 4728 1 66.34 TAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAGTCAAGTCAGTCGACTTATCGATTCGCTTGCATACACACACACACACAGATATTT:1 + chrX 11006235 3' - F-element 4462 1 51.49 GCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGATGCGCCGATTTTCGGTTGCCTGGAATTTTGCAGCAACGCATTTATCCGGTTCTATGGTGTAACGGTT:1 - chrX 3427504 3' + 1360 128 1 68.32 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTAGATCTAACGACTTTATGTAACTGGGAGCGAAGTGAA:1 - chr2R 9129661 3' + P-element 2847 1 39.60 CTCGGGTCCTACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACTGAGGAGCCTCTTCCGATGGTGTTTTGGTGCGTGCTCCGCCTCGCGGCTTTTTGATGGGTGGTTG:1 + chr3R 16458868 3' - Cr1a 4439 1 65.35 AATAAAACAACAATTTTACTATATATACCAATCCCCAGATTCATGCATATTTCACCTACCAAACTCATTTTATTTGCAGATTTTATTGAAGCACTCAAGGA:2 + chr2L 16032380 3' + 297 395 1 74.26 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGAAAGAAAATTACACAACCAGAACGTAGCTGAAAAGCTCCTTACCCT:1 - chr2L 13314073 3' - jockey 37 1 53.47 AGTCTAAGGGACTTATGGATATGTCACATCACATTTACATAATTTGTAAAGCGCAAAAAGAAATGTATTCGTTATATGGAAGCCCTGAACGGCAATGGGCC:1 + chr4 107432 3' - Idefix 6 2 58.42 GACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCTTTTCTTCTTTCATTTGGCCCCGTTGCCGCTGGCTGCGTCTTGGAAT:1 + chr2L 19241672 3' - Tirant 284 2 54.46 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACCCTAGTTCGACTGCCAAACCCAGATTTGAGACGAAAGAC:1 + chr3R 24229149 3' + 1360 3355 1 63.37 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCAATGATTTTTAACTTGTTTTGACGTTCTGACATCATAAAATC:1 + chr2R 15451627 3' - roo 33 2 59.41 AACGGACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAAAAGAAAAGAGAAAAAACCGACATCGAGGGTAAAAAGAATGAGTGAGAAAAATTATTATTTCACATTT:1 - chr3R 22222785 3' - Cr1a 216 1 70.30 AAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACACTTTCGCCATCAGAATTTTCTTCAGTGTAG:1 - chr3R 22878474 3' + X-element 4674 1 67.33 TCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATACATCTGTCTACTTCTAGACTCCGAAACCCAAAA:1 - chrY 425003 3' + McClintock 6390 2 69.31 TTTTTTTTTGCGCTCCGAATTTTATTTGTGTTTTTGAAACCAGCCAAGGATTTTACTAATTTTCTTTTGATATGGGTCAATTCCATTATCAGGTCCTGCTC:1 + chr3R 1850343 3' + Cr1a 24 1 72.28 TATACTAACACACACACACACTCACACAAGGATACACTCACACACAACCACAAAAAATAAATAAAAAAAGGAAAGAGTTTTGAGCCCAAAGAAGTC:1 + chr3R 8153702 3' + Quasimodo 32 2 54.17 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCCACCGCCAGCTATTTTATTTTCGCGCGTTTCCATGCAGCCTATTTTGGAGCGGCT:1 - chr2L 12908346 3' + hobo 2923 1 61.86 TACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAAAGGAATACAGCTCGCAGCTGGTTGTGCAAGCAACTCGCTG:1 + chr2L 14076289 3' - jockey 392 1 60.40 CCCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATGAAATAAAACGTAAAAATCCTTTTCCATT:1 - chr3L 14396798 3' + I-element 52 1 79.21 GCATTAAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCACAAACGCATTCAGTTGGCCCGTTTATTTAGTGAAAAATCGAGGAAAATCGGGGAAAATGTGTTCG:1 + chrX 6190439 3' + invader3 5309 2 64.36 GTACATCCGGAGTAGTGTAGGGTTTGTTTGGGTGTACATGTTGTATGTGTAGTGGTGACGCATGGACAAAGGGTGCGGCGAACAGCAACAAATAAAGCGGC:1 - chr2L 6783370 3' - Idefix 79 2 59.41 CCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGGAACAGCAGCGGAGGCAGATCAGCAAAAGGCCGAGAGTCATTCACATT:2 + chr2L 18231848 3' + 1731 4597 1 53.47 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAAGTTTTTGCATAACAAATAAAACGAATCAAATTA:2 - chr2L 3988508 3' - I-element 22 1 67.33 ATTCGTTGAAAGGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGGGTTTCTGACCATAAAATGTATATGTTACTCATTAATTACGCAGGGCAAAACTAACCTATTTCGGTG:1 + chr2R 25214461 3' + INE-1 16 1 57.43 TACATTGTACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTGGAAGGGTTTTCGGAGTACAATGAGT:1 + chr3R 28113205 3' - accord2 7525 1 79.21 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTTGGTGCCGCTGCTTAACATTCACCTACTTTT:1 - chr3L 4713775 3' - transib2 43 1 71.29 CCTTCAACATCTTTAANTAAAAACCTATCATTTTTCAATACCTTCTCTATTTCATATGGACCCTTATGTTTCTGCAAACTAAACAAAATCCACTAATTAGT:1 - chr3L 5169184 3' - invader2 4633 1 69.31 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTTTTTGCTCATCAAATATGCATCGTTTTCACTTTTTTTTGTTCTTTCGTGGAGTAAAC:1 - chr3R 25599088 3' - FB 20 1 58.42 TCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATATAACTGAACATTCTATGTGTATTAAATAATTCTCTAAAGTTTAAAGTTTACAATTTGATT:1 + chr3R 24529812 3' - Idefix 6915 2 66.34 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTTTGTTCTTATTTGATGTTTAAAGAAGACAAA:1 + chr3R 3457025 3' + 1360 3330 1 72.28 TTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGCAGTTGGGGGGAAGGCGACAGGGGAGCAGCCGCAAAAGTTGCTCATACGCC:1 - chr2L 20629771 3' + hopper 1202 1 56.44 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGCCTACGCGTCGGCGGAGGGTGCATGTGTGTGGGAGCCAAAGCTGCTACTGT:1 - chr2L 6324472 3' + hobo 2913 1 54.46 ATATGCAGCTAAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCTATGACCGCGCTAATCACCTCCCGCTGACTATATACAATTTCTACCCACCTGCAGGCACA:1 - chrX 4416193 3' - rooA 7435 2 65.35 AATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTCGGAGTTCCCTTGTTTTTCTTAAAAGAAGAAAAGAAAAATATATGTGAATTATATGAAT:1 - chr3R 9229951 3' - X-element 30 1 51.49 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTAACTAATTCTATGTAAATGGCAGGGTGGACGTGGTCAGCAAGGATTCGG:1 + chr2L 14743455 3' - 1360 25 1 54.00 GCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCATCCCCTTCGCAACTACCGAT:1 + chr3R 5773224 3' + Stalker4 376 4 55.45 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGCATGCGGACGAGTATTGGCA:1 + chr2R 20544035 3' + 297 6928 2 78.22 TTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTATATGAATCCTATTAGGATGTAAGGAAGACCCTCCTTGTTTAACTTTAACTAACTTTA:1 - chrX 3195609 3' + mdg1 7442 2 61.39 TCTTCACTACTCTCGTTATTATCTGCGCAACGTTTTCTGGCGTTCTCTCTCCACCGCGTCTTCTTCTTCCACTTCACAGCTTTTGTGTGTGTATCTGTGTG:1 - chrX 7300776 3' - invader1 3980 2 67.33 GATGCGCAGCTGTCATTGCCCACAAAGGTCACGCAACCAAATAACGAAAAATCTGCCAAACGAGCGTCTCTTTGATTTCCGCCACTCTCGCCCAGAATTTC:1 + chr2R 1295774 3' + Tc1 1308 1 64.36 GCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAAACAAAA:1 - chrX 4947589 3' + Cr1a 4397 1 81.71 CACTTTTGAAAAATGAGTTGATATGTTGTCACATTTTTATTAGTCTTGTTGATTTCTATGCTTTCGCAAAAAAAAAATTGCCACGCCCACTCTAACGCCCT:1 + chr2L 2545705 3' + INE-1 261 1 73.27 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAATCGACCGGTAAATAAATACTTATCAATCATGGGTAAACTCACGTTTTATGCAA:1 + chr3L 3776547 3' + roo 386 2 56.44 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACCATTCAGCCAAAAGTGTGCCACCAGCTAACATCCAA:1 + chr3R 23080889 3' + 412 7505 2 66.34 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACAGGGGTTGGTACGGGGTCGGATCCTGGCTACCTGCCCTCGAAAAACCGGGACCTAAGTCCTTTGCAC:1 - chrX 409565 3' - P-element 9 2 71.29 GCGAAGGCTCTAACATTTTAGGCGGACAGAAAGACAAAAACCTCGGGTTGCACGAATATGAAAGGATATTTGAAGGAAGCCAACTGAGTGCCCGCTTCAG:1 - chr3L 12963952 3' + Gypsy12A_LTR 482 1 77.00 AAGCGCTGCGGGGCAGCACATTGGGGGCTCAAGAGAAACGCTATGTGGATTGGATTATGGATTATGGATTAGTTTGCTTATTTTTAGAAATTCCTTTAGTT:1 + chr2R 15241727 3' - X-element 389 1 67.33 TTCTGCTTATAAGAAAGCTAGATAGCCAACAATAGAGCGGCCAACTTTTTCACAGTTTTAATTCCGTTCGCAACTACTTTTTTTCTCCACTTTGACCATTT:1 - chr2R 4709405 3' + Tc1-2 164 1 73.27 CTTTTTTAATTTTTTTTTTCGTTTTCAGTTGTGCAGTATCTCTCCCCCCTTTGCCCCTCATTTCAACGACATTTTCGGGGGTTTTTGTCGCATTTGCTTAC:1 + chr3R 21946384 3' - Bari2 919 1 77.23 TTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTTGAAAA:1 + chr3L 13366417 3' + hopper 1371 1 69.31 CATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAACATAGGAACAGTCAACGAAACTGTTAAAAAAAAAGCAGCGCATACACATACACGCAGAAAGATACAG:1 + chr3L 22090602 3' + Porto1 4376 1 72.00 ACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAACGAGCGAGACGAACAGCAAGCGGAAAACATAAGAAATTAACTTCGCAAATTGCATAACAACGA:1 - chrX 11521831 3' + micropia 5360 2 73.27 CTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGAATATTCTCCAGTCTGTGATGTTAAGATTCTTCACTTAATACATTTAAAATTTAAAAAATGTA:1 - chrX 6917066 3' - 3S18 15 2 65.35 AAGACTGTTTGAAAATGTTATCACTCCTCTATTACTTGTAATATTAATGATTAAACGTATACAATTTTATAAAAATAAATCATGTGCAAAACCAAAAACTT:1 - chr3L 19867480 3' + Q-element 141 2 70.30 TCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTTAATGTTGGATTACGCATTCCGTTATCGTATCGTTTCGCAATCATATTTCAGTGGATAAATGTTTAGATCCACT:1 - chrX 4946325 3' - Doc2-element 4417 1 66.34 GCCAAAAAAATCGAATTCTGGCCCACAGTGCAATGTCAAGCTTCAATTTATATTTATTTATATTTTAAAACTCTTAA:1 + chrX 8107422 3' + transib2 2815 1 44.16 TAACTTTCAACTTAAGACTGATTTCAAATGTGAGTGAGATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAAAAAAAAAAGAAAGAAACAATAAGTACAGTTCATGC:1 + chr2L 23048705 3' - McClintock 273 2 64.36 GATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGTGATTTGTGTGGTTTTTGCGACTCTTTTGACAGTGCTAATCACGCGAAT:1 + chr3L 23267958 3' - Quasimodo 142 2 51.49 GACTAGAATATAAGGCCTTACTCTACAACTCCGTCCTAAAACCAACCTGGACCTATGGTTCCCAGCTATTGGGGAACGCCACTAGCAGTGCGTTAAATTAA:1 - chr2L 10553182 3' + Fw2 3501 1 70.30 TTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCATATGTGTGCCAATCTTTATCACTTTGGAGTGGCAGTAGGGAAAGGCTATAAAACAGATTTGGAATG:1 - chr3R 26883502 3' - F-element 279 1 74.26 GCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAGCACCGTTAAATATTGATTTAATATTCTGCAAATATATTTACACAATGGTAACGCGGCTCACCTGTTACA:1 + chr3L 11242412 3' + G6 1933 1 76.24 TAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCACCCACCCATCGGCATTAAGTTCAACTTTTTAAATTAATTCACCCGTCGCCCCAGAATCCTGTAGCAACCCGGA:1 - chrX 3040871 3' + blood 7067 2 44.55 ATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGGAACAGCAGCGGAGGCAGATCAGCAAAAGGCCGAGAGTCATTCACATTACAAA:1 + chr2L 18231853 3' + 1731 4602 1 52.48 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCCACACACACACACTTGACTGTGTTTACAGCTCTCGAA:1 - chr3R 22276853 3' + hobo 2899 1 73.27 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGATGCACAAATGCACAAATGCACAAATGCACACGCCGATGCCCAGATGCTGTTGCATACTTTT:1 - chr2R 17960493 3' - jockey 22 1 63.37 GTCTTTGACGGTAAAGTAATATCATTTGCCCATTTTTGCTCGTTTTCTTAAAATTGATTTTTATGCCGCCATCAACTGGTCGGCAGTCCGTTGGCGTTCTT:1 + chr2L 17204608 3' + transib2 476 1 60.40 TCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCAAAACTCATAACAATAACGGCTCTTTGGCGGTTGGGAAAAAATAACATCATCGAGTTCAGCGAGCGCA:1 - chrX 12000021 3' + roo 8967 2 76.24 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAGGCTCGTTAA:1 - chr2R 19209455 3' - Doc 50 1 63.27 AACTTCACCATTCATCATAGAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGGAGTTGAGGGATGCAAACGAACGAGAGAGAGCATAGCCGCTGCGAGGCGGG:1 - chr3R 10535961 3' + I-element 297 1 75.25 CACCTCAAACTACTTTGTCGTTTTGTTCTATTTGCCGCGCACACACATATCACGCAATTTGTTTTGGATTTTTTGATGCGAAGCGCGGTGATGTTTGTTTT:1 + chr4 830076 3' - accord2 46 2 74.26 CCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTAGTTACAAATGTTTATAAGCTTTACAGCAAAATCGAAATAATTGTTTGTGTTTC:1 + chr3R 15648363 3' - I-element 4936 1 60.40 CAGATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTACCCGAATCAATACGGTACTCTGCGTCGCGAGCGCCGATCACACTCGGCACTCATAACGG:1 + chr3R 1465946 3' - hobo 95 1 64.36 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCATTGCACATGCCAAGTTTCAATACCAACAGCAAATATCACACTCTTTTAGTTTTAGGTTTATCTTTT:1 + chrX 19820062 3' + hobo 2929 1 70.71 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAATATTCTTCGCTTTACACAAGAACGAACGACGAACATTTTGAAAACAAG:1 - chrX 3109945 3' + blood 330 2 55.45 GAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTACGGCCTTTCATCGAATAGTTGAAAGGATTTGGCCCGTTGTCATGGCGG:1 + chr2L 3394173 3' - Doc 388 1 59.57 CTTCATTTCTTTACGTTATTTCTAACTCTCTACAGCGCGGGTTGTGAGACATGTAAACAACATGCCCCATCGTTTCTCCCTCCGACGTCCCACAACGATGT:1 - chr2R 5374081 3' + blood 6975 1 67.33 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCACAATTTCTAACTCCGCTCTCCCAAGGTTGACAATACGAAAAA:1 + chr3R 21969122 3' - hobo 34 1 59.41 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACAACGTTCGACATCTGCTCTATCGTCTAGGTTCGCAAATTTCGGATAAATCTCGTTAATTCGTTAATG:1 - chr2R 18036593 3' - blood 7020 2 67.33 CAATAGAAAAAAATCACAAGGGGACAGATCGTGCCGGCCATTCCAAATTCGAAGCATAATAATTACTACTGCTGATCCCATTGCAATTTATAAGTTTGACT:1 + chr4 1082227 3' - mariner2 586 1 59.41 GTGAGTTTGTTTAAGTTAACTCGTATGTTTAAAAGGGCAAAAAAAAAAATATAAATAGCTTTCACCCCATTTTGACACTACGTGATGAATGCACCAACTTC:1 - chr2R 5508432 3' + HB 279 1 55.45 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTTTTACACACCATCTGCCCAGAAAGGACAGAATCTTGTGTCTAGC:2 + chr2L 10165061 3' - mdg1 7070 2 56.44 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCAACAATACAGAAGAAAATAAATAAACAATGTAGGAATTTACGGCTTAGATATC:1 - chr3R 20396502 3' - I-element 1 1 78.22 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATGTACACATTTATATGTATATATCGGTGCAAAGTGCCAAAGTTGAAAAAGTTATTTGC:1 + chr3R 18887126 3' + 297 6968 2 71.29 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGAAGTACTTTGGGCTTCTATTAATAGATCGTTTTTTGTGTACTGCTGCCTTGGTTTGTTTACACCAGA:1 + chr3L 13674726 3' - hobo 7 1 72.00 TTATTTATTTATTATTGCTTTAAGAACCATCGGTGTGCAGATCATTATGCAGGTCCGAGTAACCCGGAACTTATTCCTTTTTTGGCCTGCTCCTCGACTGA:1 - chrX 21252861 3' - Juan 4209 1 76.24 CAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATTCAGACCAGAAGTTCTTAGCAGCTAAAACTGGTTGCTTCTTCCTTGT:1 - chrX 14863459 3' + Tabor 6939 2 66.34 CTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCCGAGATATAGGTGCTCATGCAAATGCAGATACACACATCGGTTATATGCGAGTTGGCAACTTGAAATATT:2 - chr3L 9120413 3' + Tirant 394 2 32.67 CCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGTTG:1 - chr2L 23286581 3' - Tirant 413 1 56.44 TTTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATTCCTATAAAGGGGGCTTAGTACTCGTATATGGCCTTCTCATGGTTCACGATGTTTTCGT:1 + chr2L 11039951 3' + 1731 4379 2 65.35 CGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTC:1 + chr3L 25350819 3' + baggins 5412 1 46.53 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACCCTAGTTCGACTGCCAAACCCAGATTTGAGACGAAAGACCGA:1 + chr3R 24229152 3' + 1360 3358 1 60.40 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTTTTTAATAAAATTTATTACACTCGCACATGACGAACAT:1 + chrX 18991598 3' + pogo 2066 1 70.30 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACA:1 + chrX 12818870 3' + roo 9016 2 80.20 AGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTCGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGT:1 - chr3L 19274817 3' - transib2 44 1 67.33 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCCAATGCAGGGGCAGACATATAGAGCTGTTATATCGAATA:1 + chr2R 10191776 3' + 297 362 2 60.40 GTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTATACCGAGAGAGGGGTTATGAACACTGGGATGCGGGGTGCCGACTCTAACATTCAAACACATA:1 + chr3R 24226813 3' + accord2 7588 2 55.45 ACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCCTCATGTCCCCTTGCCCGACATCAGCCTACAGCCCACAACCAACGTCCCCAACATCGGGGCCAAACATCGATCGA:1 - chr3R 8435458 3' + Stalker 212 4 59.41 ACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTT:1 - chr3L 16973394 3' + S-element 131 2 73.27 ATTTTATTTTATTTTTTTTACTTTTTATTACTTCAGTCTAGAGCGCTTGAGCCGCTGATGTTGGCTTACTGGTGTTTCAGTTAGCGGTTAGCGGCCATTAC:1 + chr3R 18102293 3' + transib1 1900 1 70.30 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGACATACAACGCTACACAAGGAGAAAACTGATGCAGATTAAAAACA:1 - chr2L 1590410 3' + mdg1 392 2 60.00 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGGATACCAAATGCAGGAACGCAAAGCC:1 - chr3R 29333712 3' - hobo 49 1 72.28 TAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCAATCCCCAGATTCATGCATATTTCACCTACCAAACTCATTTTATTTGCAGATTTTATTGAAGCACTCAAG:1 + chr2L 16032378 3' + 297 6974 2 72.28 AAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGCCAGGCAAGCGAATCGTCTGGGGGAGGGAGGTTATAGCCATGTGTCTTGGTCT:1 - chr2L 16428391 3' - 3S18 68 2 62.38 ATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATAGAGGGATTTGAATGTTATGGGGCAGGG:1 + chr3L 23691163 3' - micropia 5089 4 72.16 AAGAGACGGCAACCTGTTAATATAAACCGAAAAGATTTTAAAGCTCTGCTGCAACCGCTTCCCAAACGAGATGGTTCGCTACTGAAGAGGCGCAAACGAAA:1 - chr3R 19487071 3' + I-element 369 1 72.28 TTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAAGCCCTCTTAGAGGGTTGATCTAGT:1 + chr3L 16470300 3' + BS 5042 1 72.28 TCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATGAGAGGTTTTTGGCAAGAAAGCCGCTGGAAGGACATTATAAATATTAGAAACTGATACAGCTAATATAAAACAA:1 + chr2L 4294815 3' + Max-element 313 1 72.28 TACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATAAAACGAAGGAGTGCTTCAATGGCACAGTGTCCTTGTAAATC:1 + chr3R 26246950 3' - Doc 4507 1 69.00 ATCTTACGGCGTGTGAAAAATTATTTGGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGGAGAGATCACCGGCGGTGTAGAAACCTTTCTGACATAGCGAGCATACCTGA:1 - chr2L 16301056 3' + 1360 424 1 58.00 AAGAGTGCCCGGCTGAACGGAGGGGAAGCCACCCCTATAACAACAGTGAGTCAGCAGCCAGCCCGGCCAAAGCTCGACGGCGCCACGTAAGTTCGCTTTGT:1 + chr3L 24059108 3' + aurora-element 488 1 62.38 ACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAGCTTTAATTATTATAAATATATTTATAGGCGATTGGTTTGATAGCT:1 - chr3L 22094262 3' - Stalker2 32 2 59.41 TCCAGCCTGTCATGGTATCTGCACAATGACAGTATTAATATGAAAAAACAAGCACAGCAAAGTTCAACAACTTCTACCAATATAAGATTTTCAATAGCTTT:1 - chr2R 17459138 3' - X-element 4411 1 81.19 ACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATCGTTGGAGGAAGATTGCAAAATTCCAATGCAGAATTTAATGTTAAAC:1 + chr3R 19446943 3' + roo 16 2 53.47 AACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTCAAGTTACCAAGCTCTCTTTGTCTCGATCCATTCT:1 - chr3R 27223264 3' + I-element 5006 1 70.30 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGCACCTTAAAAAGAAAATATAAATATGAAAGAAAAATGC:1 - chr3L 10565281 3' - pogo 35 1 64.00 AAATTATATTTTTAGATTTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAGTGTGTGTGTGGATTGCTGTAGCTGTTGTTATTGTTGCGCCTTGATTGCTGCCTGCCATGAA:1 - chr3R 30550357 3' + 1360 3272 1 69.31 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGACAGCGCTCAGTTGCTG:1 + chrX 10629268 3' + P-element 2856 1 48.51 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGAAAAAGTTATCCCATAGTTTACAT:1 + chr2R 21560401 3' - pogo 49 1 77.23 TCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCGTCATATCTTGGTTGACAAATAATTGCGGGCATAATGTACATTTAATATG:1 + chr3R 13176177 3' + Tabor 57 2 58.42 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGTCGTTGGTTCGAAACTCTTGTTTAA:1 - chrX 22690737 3' + roo 9047 1 52.48 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGCACAGAAATATCGCCTCGACTATATAATTTAGGGCAGCCCGA:1 + chr2R 10345674 3' + roo 9039 1 60.40 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATGTACATACCACTATTTTGTTGACCTCGACTGTGTGTGCTTTGTACATTT:1 + chrX 20982299 3' - 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chr3R 28683670 3' + I-element 176 1 71.29 TTCCTTGCATGGTGAAGTCTGTCTGACTTGTAAACTTTATTCCTCGATTCTGCTGCCTCAAACATAGCTTGCTTATATACTTATATGGATGTGGATGTGTT:1 + chr3L 9146155 3' + hopper2 259 1 58.42 TTTTTCCCTTTGTTAGCTTATAGTCAGTTCGTTTTGGATATCCAAAGAATAAAAACGAAATACACACAAATGCGTGGTGGTCAATCATGCGACACCTG:1 - chrX 8210056 3' + springer 7265 2 54.08 AGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGGCCGATCGTTGACTGTGCGTCCACTCACCCATACTGTAGCTTTGTATCTATTGTATTTACTTAAC:1 + chrX 6665791 3' + hobo 2713 1 69.31 GGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGCCATGAGATCGGGATCCTGCCAGACAGTATGTCGCCACTCCAGGGCTCATTCAACTATACAGA:1 - chr3L 14152064 3' + blood 375 2 71.29 CGATATATGCACATACTACACTAGAAATCAGGTTGTTGGATGGCATGGGTTAAGGGAAGTCGGCGGAAGGAGACGTTCTTAGCCCACCAACGGCACTGCAA:1 + chr2L 7971080 3' - blood 7010 1 76.24 CTACGCGCCATCCATACCTTCACTATGGCCATCGCTTTGAACTGGGGAGGGAGGAGTTACCACCACACCCCCTAAACCTATGCCTCAGCATCCGGAGAA:1 - chr2L 17012099 3' + Tirant 8056 1 79.80 AAATGGGCTGAATTAATAGAAAAGAACGACAAAAAAGTGCAGACGAAACCAATCTGCTATACGCCCACTCGTTCAACTGACAGCGGCCACGCCCACCACGG:1 + chr3R 30758029 3' + X-element 4653 1 70.30 ATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAACAGGCTGGATATTGGTGTCTGATGGCACATATACCAGTA:1 + chrX 15688402 3' + R1A1-element 5000 1 60.00 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCTGCTCACATCCTAAATGATGCACGAACCCTTTGTCCAGATATTGGTTTTCACATTCGGCGGTGCCCATACTTC:1 + chrX 22690842 3' - roo 3 2 76.24 AGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCATTTTGGGGAATAATTTACAATGGCGACGGCGATGATATGATGTGGTGGTTGAG:1 + chr3R 18687751 3' - Quasimodo 6903 2 58.42 TTCGTGGAGAACAGTCTATTTCCTGAGGTCAATGCGTGCTCATTTGAGATATGGAGGGGTTGCTCAGACGATGTGGATGACTACGAGGATCGCTATTGCCG:1 - chr2R 21821949 3' - Bari2 891 1 56.44 CTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCAATGCACTTAGATATTCCAACGTCTGGGTTGTTGCCTGTTTTTCATT:1 - chr3R 5314577 3' - opus 7299 2 53.47 ATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAAC:1 + chr3R 1844818 3' - Cr1a 157 1 72.28 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAACGACCCTCTTCCACACGCCATTGCCTGGTTCGACGCGAGTGCAAAAACGAATTTTACTCAGCGAAGCTACACA:1 + chr3L 153677 3' - 1360 4 2 75.25 GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTGAATATTCCATATAGAAAATTAGC:1 - chrX 8107355 3' + transib2 2774 1 76.24 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATGGGTAGGCTTTATGTAAATATTTAATGCTTACTTTGTGATTTAGACTTTAGATGTT:1 + chr3L 13608395 3' + mdg1 402 2 57.43 AAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACT:3 - chr2L 23295813 3' + micropia 5389 2 73.27 AATTTAGGCAAAAGGCGCTACTAACATCAATTTAATTACAGTTTTGAGACACGTTTCACAGATCTTGGAGACCACCTTGCTGGCCAGGTTCGCGATGGCAT:1 + chr2R 21150740 3' - transib3 491 1 58.42 TCCCAAAATGATCAATATTTTTTAAAAAGTGAATTGTGTGCGTATATGAGAACAAAAAGCCGGTGCATGAAACACACACACTGGCAAAGTTGAAAAAATCG:1 - chrX 4931785 3' + HB 251 1 75.25 AAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGCATGACTGCATACGTGTCTTACCATGCGAACATTGC:1 - chr2R 5200940 3' - 1360 39 1 64.36 AGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTATGGGAGAGCGAAAGAGGGAGAGATTGAGAGACAGAGCGGGAGAGAAGTAAGCTTGGCTTACGTTGACA:1 + chr3R 31058900 3' - Cr1a 331 1 60.61 ATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTATGTATGTTCCTAAGCCTGCTACGCATTAAGTAAAGTTGCTCGACTCGCTCGAACGTAA:1 - chr3R 28329264 3' - 412 248 2 71.29 ATATTGAGCGTACATAGGCATTAACATAAAACTAGCAATTCCCCCCTCATTAACTATCGTACGTCTTACGATAGTTAATGAGGGGGGAATTGCTAGTTTTA:1 - chr2L 4875763 3' - Quasimodo 463 2 61.39 AAGTGGCAGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAACCACATATCTGAACAAGTATCTGAAGTATCT:1 - 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chr2R 1774309 3' + HMS-Beagle 6612 1 74.26 ATCTAACGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACGTACTAAACAAAAACCTCCCCCCTCATAGTCCCCTAGATTA:1 - chr2R 8184452 3' - Rt1a 5018 1 78.22 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTTCGCCCACGATTTAAGTGAACGCTTATTGGCGAATTGAAGA:1 - chr2R 17097272 3' - P-element 36 1 41.58 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACAGTCCAATGACAGCGCCTATGTCCAGC:1 - chr3R 28879934 3' + roo 9047 1 64.86 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGATTTCCTTGCAAAATTGAATGCGAAAGGCGAGATCAAATCCTTATGCCCTTTGTGGAAC:1 + chr3L 18731718 3' - jockey 4777 1 60.40 TGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGATGGTGCTGTTGTGGTCTGGGGTTGTACATGGCAACAGAAAATTGGTCGGGTT:1 - chrX 7708109 3' - I-element 4899 1 57.43 CACACAAGGGGAAAACCCTTCGTCTACAGAACCTAGATATGGCGGCAACTCAAACCGTTTTGGTTTAAAAGATTGAGTTGTTACTCAAATTTATGGAATTC:1 - chr3L 4783194 3' + X-element 480 1 66.34 CCTGGATCCTTTTGATTTGGCTGTCGCATGCCAAGTCAGACAAATAAGCAGGACAAATAGTGAGCCCAAGGGGAGTACGAGTGCGAGCGAGAGGTCTTCGG:1 - chr3R 26291743 3' - X-element 4272 1 74.26 TTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAATCTACAATGATTTGGAAAATCGATATCAATATGTTTCAAGTGAAAGATAAATACAGGGCTATTTGGAACCTAAC:1 + chr3L 6750533 3' - Cr1a 4191 1 65.35 GAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTAAAGCACATATAATTATTAGTTTTGTACGACTTTTAATCAATTTTTTTTTGTG:1 - chrX 19080272 3' - Ivk 24 1 53.47 TCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGAGCGATTAAATATTGGTAACATATTTCAAAATCGATTTATGGCCAGAAAATAGTTCGCTGATCATAAAAAA:1 + chr2L 7745993 3' - I-element 5 1 70.30 ACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAATCCTAATAACAGATCCACGCGCTGATCTTCGTTAAAGTATAGGTTTTTCTGTATGTTTATTGTTCCCAG:1 - chr3R 2916448 3' + Circe 7368 1 68.32 TTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCCACGATTACGAGGTAAGGGCGACGCTCTCACGCGAATAACGGTGGTGGCCAAACCTCTCTCTTTTCCACAACAA:1 + chr2L 3426209 3' - P-element 2566 1 77.23 GCGGGCAAAAGTTTCGAGTTGGTTGAAGGTGAGAATAGATGACGAAACAAATAAGTAAATTAGTTTAAAAAACCCAGCGCTATGTTCACTGTACCTCAACG:1 - chr3R 9347390 3' - Doc 343 1 72.28 TTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAGTATGTTCTGCTGTCACATTAATGTTATTTATACCGCTAGTTTTAAGT:1 - chr3L 21714983 3' - 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I-element 5215 1 77.23 GTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAATGTCGCTTCGGTCAAGGTCATGGTTGCTATTATTTTCTAATGGTCTAGAATCGACCGTTTGATGGCTAGTAA:1 - chr3L 2184247 3' + flea 139 1 43.56 CCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATGTTTTGAACACCTGGTGATTGCCAAACTGGGGCGAAATCCCAATCAGTCACGGAAAACTATGTTGTG:1 + chr3L 21275847 3' + Quasimodo 7364 2 48.51 TGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACAACACAAGAGATATGTCAACATACTGACTGATACATTTGTCATTATATATTAGGAATTAGAAATTGAATCTG:1 + chr4 719823 3' + jockey 4723 1 81.19 GTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAAGGAAAAAGGCAAGGAAAAAGGCAAGGAAAAGAAGACCAAAGAGCCAAACTTTAGATCCTCTGAGGAC:1 - chr2L 328213 3' - hobo 2651 1 73.27 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATGCCTTTTGCCGAATAAAAAGTCACCTCATAACCCAGAGTGAATAAATTACACGGAAAAATAACGTAAAATACAC:1 + chr2L 159532 3' + roo 397 1 78.22 TTCCGCTGCGAAGAGAGTCGTCACTCCTTGGTCTTTTTTAGAACGATCGATTTGTTCGTTGTCTATTTTGTGTGCCACGTTAATTGCAGTGCATGGGTCAA:1 + chr3L 15275239 3' - Doc3-element 270 1 43.56 GAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCATTGGGAGACCAAATAAAGTTTAGCAACAACATCTGAGAGAAAGAAACAAAAAGCAGCCATCGAGCGATAAATACATG:1 + chr3R 5813284 3' + G5A 2554 1 65.35 GACCCCGCTCTCAATTAAGCCTAGAGAACAAATTACGGCTGTATAAAGCAGTCCTAAAGGCAGCCAGACCATGCCGATCTTCCAGTTGTCCGTGGTCATGT:1 - 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I-element 5014 1 64.95 CATTTCCAGTAGTGTGTCACAATTATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGAAAGGCAGAATCTGAGCCATCGACGTAAACACATGTGTTTA:1 + chr2R 5992191 3' - baggins 65 1 39.60 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGAT:1 + chr3R 4604461 3' - Ivk 47 1 67.33 CTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAAAAAAAAAACTTAATGATCGGCACCCAGTTCTTCAGTTTGTTTGTCAA:1 + chr2R 22098049 3' + 412 295 2 58.42 CTTAACCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGCTCAATGCTCGGACCCGAAATCCCGAAAAAAGGAAAACATAACACTACAAATTGAACAAGAACCACTCA:1 - chr2R 1569930 3' + Idefix 224 2 61.39 CCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCCGAGATATAGGTGCTCATGCAAATGCAGATACACACATCGGTTAATATCTTTTTTGATCAAACGTACGTTTT:1 - chr3R 6044933 3' + Tirant 8503 2 35.64 AGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTAATAATAGCAGCAGGTTTTGGAGCTGGCCAACACACAAATACACACACAAGCACAC:1 - chrX 3288101 3' + jockey 4621 1 60.40 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCACACGCACACACCCACACATAGCCACACACATACATCAAGTTTTCACAAAAAGCAACG:1 - chrX 6146645 3' - 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hopper 9 2 70.30 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGTACGTAAAAATAATGAGAAGCACATTTT:2 + chrX 6146713 3' + hobo 2899 1 68.04 TGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAACACCATGTCTTCGTTCGCCGGGCAGCTAACTGGGTTACTTTCTAGTTGAAACTTTAA:1 - chr2L 10561061 3' + McClintock 445 2 64.36 AGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGTGTGTGTGTGTAAGAGCCGGAGTGGCTGGGTGGCGAATTTTCGACGGCCCTGTTTGTGTTTACATTT:1 + chrX 15201636 3' - 1360 3251 1 71.58 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAAGTAATTTTCTTTGATTATATGCACAATGCCGAGTACCCTG:1 + chr2L 13314125 3' + jockey 4954 1 62.38 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCTACTCAATCTTGCCGAAGGGTGCCTCGCTGTTCACGGGAACA:1 + chr3R 27020297 3' - 1360 34 1 65.35 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCCTTAAGTTTGTATGACCGTTTTATTGCCG:1 - chrX 12539375 3' - jockey 4756 1 71.29 AGGTGTGGGGAACTGCCGCGAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCCAGTCGAGAGTGCGACAACATTTGTTTATAGAAATGGAATGGAATTTAAAG:1 + chr3L 539098 3' + G5 4400 1 57.43 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTCAATGGGCCGCAACGACAGCTTTACGGCCTTT:1 - 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Gypsy6A_LTR 197 1 77.23 GAGAGTTTCTTTTCTTTGAGGTATAGCTTGATTCGACTTTGGAGATCCTGGTAGCCATCGGACGGAGCAGCCCAGAGAGTTGTGAGCAGGTAATGGAGGCG:1 - chrX 9281198 3' - Ivk 4920 1 56.44 TAAAGAGATTGTGAAGTTATTTACCGTTGAATCGGAGCACACGCGTAATCAATTAATCATCTTCGCCACCCCCCCCC:1 - chrX 12801183 3' + invader3 5424 2 74.03 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAAATGGGTGGGCCAAATGTGGCCTATAAAT:1 + chrX 12818920 3' + roo 403 1 73.27 TTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAAAACCAAAACAAGGAACAAAAATATTTGA:1 - chr3L 17617362 3' - 1360 311 1 72.28 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCACTACAAGTAAATGTTAATAACTATAATTTACAGTTTGACGTT:1 + chr3R 13122906 3' + Transpac 5193 2 56.44 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTACAAACATTGAATAGATGAG:1 - chr2L 4134350 3' + copia 233 1 78.22 TGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGTCGCTTCTCCTCTGTGATTCAAGGAATAAATGTTTTAAATATTTTAAGAACGGCGGCTGTTGGGAGG:1 - chrX 21581077 3' + Bari1 1702 1 68.00 GTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTTCTGCAATTCATGGGAAATTAATGTTATTAATTTATTAGCGTCTTCTACCGAAT:1 - chr3R 19445639 3' - Tabor 6863 2 53.47 AAAAAAAAAACAAAAAATAATGGATAAGAAACGAAACGAAAAGATAAACACATAATACAATATATAAAAATATTATTATTTATGTGCCACTTGCAAAATAC:1 + chr3R 3848153 3' - hopper 142 2 36.63 TGCAGCCAAAGCTGACTGCACCGGAACGAACAACCAGCCCAGCCACTTTTTAGACAGCACAATAATCACTCTTCAAAATGCTAAAGCATCAGCGCGATTTT:1 + chr3R 32029051 3' + Doc3-element 4561 1 64.36 ATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGACAGAGCATAATGTATCAGTTATTGGCAATAGTTTATCGGCGAACGTATCTAA:1 + chr2R 16254174 3' - 17.6 101 2 60.42 TGGATAACGGAGTTTTAATGGTATGGGTGAGCGTCAGCGATTAGCCTCAGGCACTTGTTTTGGAATGAATCATGAAATGTTCTGGGGTGAC:1 + chr3L 13873711 3' - G-element 4016 1 71.43 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTTAGACAATACAAAAAAAATGGG:1 + chr2L 10820638 3' + roo 9018 2 81.19 CACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAAACGAAACGTCACAAACAAATAAATCTAAGAAAATAGTACAATCAAGCCGAGTCAATTGC:1 - chr3L 15635057 3' - Max-element 18 2 61.39 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAATATTCAAT:1 + chr2R 4727316 3' - Doc 44 1 35.64 TTTTAACTTAAGTGCATCATACCAGACAGGTGAGTGCAGTTCAGGAGAATATCCCAAAGAAACCCGTGTTGTTTATGCTGGTCATTTTTACATGTTACTTT:1 + chr2R 11691463 3' + pogo 133 1 79.21 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGCGAAGACGCCTCCGTTTGTCGTTCGCAGCAGTTCGCGACCCCGAACATCGCGTGTGACATTTGCTGC:1 + chr3L 813903 3' + roo 401 1 71.00 GTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAGAAAGATTTGTTCCAATAATGCCTTCAGCCATACTTTGCTCAGC:1 - chr3R 27495445 3' + F-element 497 1 60.40 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAAAGGCGGTGGAAAAGGGGAGAAAATGGACTTGATGAAGGACCCTGAATGGC:1 - chr3R 25443032 3' - 297 18 2 58.42 ATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGACGAACTCCCCGCACCCCGTCTCATTGTAATGGCAAAACTTCGTTGATGCTCTCAGAGATGCCAACAGA:1 + chr2L 18642754 3' + hobo 2683 1 70.30 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAGGAATATCTTTGCAAGAATGCAGTGCCGCTCTATCAGTTCGCCATTTAATCCATGTCATTGCAATTT:1 + chr3R 19996551 3' - mdg1 11 2 34.65 ACAGACGTCCGCACTTGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTATACATTTGATATTTTCTTACATTATTTGTTTTTGCTGCCTTTTTTTTTCCAGAACCCTCCT:1 - chrX 20738244 3' - Ivk 17 1 70.30 CCGCGTAGGTGTAAGGCTGTGACCTGTAAACTGTAACCTGGTGCCAATTGATCAAAAATATAAATGTTAAGAGCATAAATAGTGGCTTCCAGCACATAAG:1 - chr4 384162 3' + HB 1297 1 60.00 TTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGGATAA:1 - chr3L 11367488 3' + roo 384 1 52.48 TAAGCTTACAAATAAAGACTGTTTCAAGCATAGTTCTACGGATCATAGCTAGGTACTGAGCTGGCATAAGGAGCCGGTGTCTCCGGGTAGACGTAATCCAA:1 - chr2R 7932666 3' - Cr1a 4037 1 64.36 AGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGCTGGGCCATGACGATGCTCGACGATGTCGGGAGAGCGCACCTTTGAACTGCTGCTGTTGCTAGTGCTGTCAG:1 + chrX 1794487 3' + R1A1-element 375 1 77.23 ATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATAAAAAAAACAAAATGAACAGAGATACTACGAAATTGAATGTCAGCATAGGTATAATCGTA:1 + chr3R 11401469 3' + Idefix 108 2 57.43 TTTATTGTCTTTATTATTAATCAAGTAGTTACCGTATTGAGTGAAAATCAATAAAAAAAAAAAGGAAAACAAAAATAAGAAATAGAGAGACAGGAAAATGG:1 - chr3R 23808381 3' - Transpac 4752 1 63.37 TTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAACACCTTTTCCATGTTTGTGGCGCTCTCCCTTATTCGA:1 + chrX 3321467 3' - 17.6 7005 2 63.37 CGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGTGGCGGTAGTGCCGCTGTCCGCCATGCCTCTCCCCCCACCCCCTTTGGCCACC:1 - chr2R 14014488 3' - accord 46 2 54.08 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGACCCACCGAACCACCGAACCGCCGAACCGCCGAACCTGAGCGGTCTTCGTATGCTCGG:1 + chrX 15125717 3' + P-element 2871 1 63.00 ATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAGTGAAAAGTGAAAATATATAAGTACATGCGCCCAGCCACCGAAAATTTCACGCCCTCACAATCCAAAATACCTAAAC:1 + chr2R 19296098 3' + Max-element 444 1 64.36 TATGATAAAATAAAAAAATTTTTTAAAATCCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAGAGCGCCAGTATGCTGAATAGTATGAGTCAAAAGATTGAATATTCT:1 + chr3R 14100347 3' - 1360 3098 1 54.46 CTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAGGCTATTAATAAACACAAAACTGTATATTTTCACCCAAAATCCAAAGATC:1 - chrX 11462166 3' + jockey 4697 1 52.48 GTAGACTAATCTCATACTCTTTAATATTGGAGCAAACTGTGATAGCACTAGACCAACTTACACACCCGATTCCAACCACCACTATTATTACTTTCCCCATC:1 - chrX 5143410 3' + diver2 4564 2 75.25 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCAAAGAACTTCAAATTTTTCAAACTG:1 + chr3L 16755821 3' + pogo 2053 1 77.23 TAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTAGACCGCTAGGCTTTGTCAGAGACACCTGTGCTGGCCTTTTCCCATTTTCCG:1 + chrX 3005247 3' - invader2 152 2 55.45 TTAAAAAAAAAATAAAAAAAAAACACAACAAACGAAACCGAGAATTACAAAACAACAACAAAAATGTCAAGTTTTGAATGTTTTACGCGAGGGTGAAC:1 - chr2L 21853911 3' - hopper 151 4 61.22 TTTATTTCTCTAACCCATAGAGGCCCCTCCTCAATTCTCACTCACATTACAAAGGTGTTTGCTTTACCCCTTACCTGGAATTGAGGCTGAAGATAGCGAAT:1 - chr2R 2884759 3' + McClintock 6173 2 58.42 GAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGGTCTAGCTCATGGCGTTGGGTGTGGTTGAAGGTAATGTGCTCCGTACTCAACCCTGCTCCATA:1 - chr3L 9701341 3' - gypsy12 10162 2 65.35 GTATGGGAACTTAGTGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' + Burdock 6032 1 58.42 TTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGCATCAATCCTCGGAAAAGCCCACCTCCTCCTGCTTTCCAGGAACCTCGAAC:1 + chrX 20968464 3' - hopper 1390 1 54.46 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGGCAAAAAACCCGTGGTCATCCAACACCGAT:1 + chr3L 11199872 3' + roo 9027 1 69.00 AATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTGCTGCCCTCGCCATTGTTTTGGAAGCCAT:1 - chr2L 20457655 3' + jockey 4718 1 71.29 TTAATAGAATGTAAAATAACTATATTACATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAACTTAAAATTGATAGTTTTAGTTGATTAGTTGATTA:1 + chrX 16505004 3' - Cr1a 4320 1 77.23 CCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGGAGGAGCAGCCATTGGGGGCGTGGCCAGCCCATAAATTCCACGTGAGCGTGTGGTGCAGTGGGTTCTC:1 - chr2R 12283901 3' + BS 4790 1 62.38 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATTAATATACATAGTTTTAATACCACCAATAATATTCTGTAATTAGATTTCAGGCTATAAAAATAAATAAGAAT:1 - chr2R 8271411 3' + pogo 2099 1 77.23 ATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACCCGATTTTATCATTTTATCTAAGCTGCACAATTTTTCTTGTTGTCCAAAGCAGTCGTTTAATTC:1 - chr2R 19193813 3' - INE-1 545 1 52.48 ACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCA:2 - chr2R 19209473 3' - Doc 71 1 55.45 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGGCGCATTCGTGCGTTTTATTCCCGGCCAAAACCCGTGAATTCAAAGCCGTCGGCGCAAAATCGAACAA:1 + chr2L 2624310 3' + hopper 1411 2 77.23 GCTTCAACTTGTAGCTAAAGCCAATGGGGAACATACTACATACCAAAGCCAAGGACGAACAAAGGACAAGCGGGGGTTGATCGAGGGGTTCTCGA:1 - chrX 17328921 3' + S-element 1396 1 63.16 TCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTTTGAATTGATTTTCTTTTCAAATCCGTTTGTGT:1 + chr3R 31243365 3' - copia 44 2 70.30 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCAATGCACATTGTGCATTGTGTTTTTCGCAGAGATGTGTATATGTCTATGTCACCAATTACT:1 - chrX 19819959 3' - hobo 15 1 64.36 GAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATTTTTCTCGTAAATCAAAATGTGGTGTAAGGCGTCATAGAAACAACAATATTAATATAGCTACATTTCAT:1 - chr2L 8374160 3' + invader1 4006 2 73.27 ATTATGGCGACTGAACCGTGTCGAGACAAAATTTTGCAGTAGCCCCTCTTGACCCCGGGTAAGTATTGTAGAGTATTTTTTATTTATTTTTTAATGTGCCT:1 + chr3L 25846033 3' - mariner2 114 1 58.42 CATTTTTCGTCTTTGGGTTTTGTTTACTCTACCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTGCTTAGAAGGCGAAAAATCGGAAAAGACAAAC:1 - chrX 3723982 3' + Cr1a 194 1 64.36 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTATGTATGTGCGCCAGTTCTCCTTTGTTCTCG:1 + chrX 14648831 3' + 297 6935 2 75.25 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAAGCCTTCTGCAGCAGCGTTAAAGTTTCGAATTTATCTTGGCACTGAGTGCAG:1 - chr3L 14692832 3' + flea 235 2 58.42 TGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTAAGCTTATCTTTGCCAAAAACATAAACAGCGAGTTTCCGTAGACGTTGAAGTTCTTCTGAGCCTTCAATT:1 + chrX 22734617 3' + roo 162 2 74.26 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATACATGTTTAGACAACCGCTTATTGTTGTCTCCG:2 + chr2R 20396317 3' - blood 39 2 65.35 TCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTGCAGTGCACATGGTTTTGTCCCGCTCTC:1 + chr3L 14150350 3' + blood 127 2 69.31 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCATTTTTCCTAGTTTCTCAGCTG:1 + chr3L 5267262 3' + Juan 4171 1 69.31 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAAGTACACAGTTGTTTGGCTCCGTTTTAAATGAAAATATAATCAAACATT:1 - chr2L 9495660 3' + roo 9045 1 54.46 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGCAAGGTGTGGTCCCTAAAGAAACAAGTGGACAATGCCATCAAGCTGGCCAAGAAGATCCCGCAAACCGG:1 - chrX 17283918 3' - roo 8669 2 72.00 AGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATATCTAGAATAGATTATTTAAAAAAAAAAATGTCTAATTTGAATAATTTTAGTTT:1 + chr3L 14944606 3' + G5 4791 1 61.39 CATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGCAAACAAAACACAAAGACGATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 + chr3R 846554 3' - Cr1a 250 1 79.21 TCGATCAGGATCAATGGCCGAGTCGATCTAGGTATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGTGGCTACAGCAATGGCCAGGGGTTCGCTGCGGA:1 - chr2L 21261526 3' + INE-1 90 1 65.35 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATGCAGTGACCATGTAATTTGCTCATTAACAAATTGCTTGAGTTAAAGCCCACCAGAAATACAGCAAATA:1 + chr2L 18506841 3' + flea 5009 2 73.27 TAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATAGTAATACCTCTCTTCATTAGAAAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTT:2 + chrX 13134917 3' - BS 5035 1 50.50 AGTGACTTCGCCAGGTGGTGAAGGTAACGGTATAAATACTGGTTATAGTGTCGGTCTGCGGCCGTGTTTCGTTCAGTACCTTTTGCACGTCGGTACTGAAT:1 - chrX 4360684 3' - Chimpo 4231 1 66.34 AAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACACCCCAAGAAACACTAAATTCTTTATGTAAAATTCGATATGGAAATCCCTATTCATATTGTAAATGT:1 - chrX 10790716 3' + I-element 4930 1 67.33 TTTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAACCGCGCTGGAACTTATACTCG:1 + chr3R 2449587 3' - 1360 474 1 50.00 TGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTAAATTGTTGGTTAAATGTGTTTTAAACTTGATTTAATGGATCGTGAGTTCTTGAAACCATTTTTTGT:1 + chr3L 16138982 3' - I-element 456 1 73.27 TATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTACTTAAAAGTGAAATATGATTTTATACGATATAT:1 + chr2R 2092824 3' - Doc3-element 51 1 74.26 GAACACACACACACACACACACACACATACATTGGAACGCCAGTCATGAGACACACACTTTCCGCAACCAATTCAAAAACG:1 - chr2R 8680190 3' + accord 7029 2 62.96 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAGGCTCGTTAAGG:1 - chr2R 19209453 3' - Doc 48 1 65.31 GCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCCCTTTCTAACAACTCACCTAATTGTCAGTCTCTGTCTTACTGTGTGCTCGTCCAATCTGTGGCATTT:1 + chrX 14997496 3' - 1360 3334 1 67.33 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATTCAAGCGCGAAAGCATCAACAAATCG:1 - chrX 6739619 3' - roo 8714 2 75.25 ATATATGAATATACCGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGGTGTCAAGAGGAAGAGCATAGAGCGAGTATCATTCATGCAAATCTGATAATTGAGGG:1 - chr3L 18412429 3' + Bica 4897 1 65.35 GCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTTGCCAGCCAACAAGCCAGCCAACCATCATTTCACCCTTCATCTGCTGTCTGGTTTCTACGGCAAA:1 - chrX 10067867 3' - X-element 4691 1 69.31 AAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGACTATTTTAAATAAGTTGATATTTTATAAGGCATTACAACTCGCAGCCGA:1 + chr2R 8746858 3' - I-element 5191 1 51.49 CCTTAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGATCTATATGGTCGGAATGGATCCTCGACGATCATATGGACAGAGAA:1 + chrX 22905653 3' - INE-1 137 1 54.46 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTAGACATATTGATTTTATATCATCATCGATGGGAGGGATATATATTAGAATTCCATT:1 + chr2R 19658369 3' + 1360 3369 1 60.40 CTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGGCTTGTGTTTAGATGAAGATTTTGCGAAAAATTGAAATCTTGCGTGAAGTTAATACAAGTTT:1 + chr2L 21764629 3' + 1360 426 1 67.33 CATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTATCCCTTTGCGACTTGTGAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTCCGG:1 - chr2L 13489399 3' - 1360 3351 1 57.00 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCAATGATTTTTAACTTGTTTTGACGTTCTGACATCATAAAATCGCGCTTCACT:1 + chr2R 15451637 3' - roo 23 2 56.44 CTATTCTATCTATCATNATAATAATAATAATAATAATTTGCTCTGTGGCCAGCTGTTGGTGTCCCACTTTTCGCCTACGTTCCATCGTTTCCATCATCACA:1 + chr3L 18095752 3' + I-element 5345 1 66.34 TTCTACTGTTAGTGTTAAGGGAGTTGTAATTTACCAGTGCGTGAATAAAGAACGAAAGGTTGAAGCAGAACAACTGGGATTGAGTGGCCACCATCCTTTAT:1 - chr2L 13539332 3' + Max-element 8402 1 64.36 ACCCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATC:2 - chrX 15408753 3' - INE-1 538 1 82.18 AAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCGAAAATCGTGTAATCCATTAGCGTAACTTTTTAAAAATTTGTGACAATG:1 - chrX 16198892 3' - micropia 5208 1 56.44 TCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTAGTTGAGTGGAAATATGACAAGGTTTGAGGAGTGA:1 - chr3L 3635426 3' + roo 9029 1 65.35 ATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCACTAATTAAAAATGCATGATTCAGAAATAAGAACAACTGCAAACTGCAACA:1 - 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blood 7050 2 67.33 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGCCAAGCGGCCACGAAAGGACAACGAGGCTACTTCGGAT:1 - chrX 20330495 3' + P-element 2880 2 53.42 TATATGTATGTATATACCATATAGATTTGTGAAAGCTTGACAGCCTACACCCACACAAGCACTCGTCACACACACACACACACACACACACGCACGCAGAA:1 - chr2R 23182356 3' - INE-1 63 1 60.40 GTGCGCGGGGGGGCCTGCCAGTCCATCTTCTCCAAAGTTGATAAGGAGAAGATGGACAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - G6 326 1 48.98 AAAGCTTATTTAAATTATAACGTAATTTCAACAAATATACAATTAGTTGTTTCTTATCTTTATTTGATTTACACGTGTAAATCAAATAAAGATAAGAAACA:1 - chrX 21555932 3' - Copia1_DM 12 1 78.22 CGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTATGTATTCATTTATTTTTGTACTCCCAGATCCTTGTGGTTTCGAATAAGGCTGTCACATATGTGAGCATT:1 + chr2L 14434844 3' - 1360 3294 1 64.36 TTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTTACGATTAAGTCAAATTAGTAATTATGAATTCAAAAGGGATGTGAGTGCTGTTCATATTTGGTAAATCAAAAG:1 + chr2L 22078888 3' - Tc3 1673 1 75.25 GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATA:1 + chr2R 6947360 3' - 1360 67 1 74.26 GCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTAAAAGCGAAATATTTAAGGTCTCCACCTTAATATCTA:1 + chr3R 2899204 3' - 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I-element 448 1 62.22 AACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCTACAAACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTGTAGGGTGCAAAAATATCTCT:1 + chr2R 5952849 3' + I-element 5052 1 85.15 GAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACTCCGACTCTCAATTCAGCGCAACACAACTACGTCCACCACCACAGAGGCACCT:1 + chr3R 19669130 3' + F-element 194 1 69.00 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGGTGCCATAATTTATGCCCAGACTAAGTGCATTATGTTTGGCACACGGGCTTTTAGTTACGCTGCCCCC:1 + chr3R 22276941 3' - hobo 6 1 73.27 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATTCATTACTTTGAAATGCATTGAATGAAATCAGATGGGCTGTAATTTAATTTAATTCTCT:2 + chrX 12954267 3' + pogo 2089 1 63.37 CGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATAAACGATTCCTTCAGCCTTTATGACATTCCATTGTTTCGGCTCTGTAATCAGGCGGCAAATTTCGAGTGCATA:1 - chr3L 6004909 3' - INE-1 88 1 57.43 TCATATCTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGATGAAGGTTCAGTGCCTTCCCACTTCTCCCACCAAATCACCCATCGCCTCAAGTGCACAGAACACTTGA:1 + chrX 22693673 3' - 1360 479 1 74.26 TTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGTTTACAATTTTGTCATTCCCTGACTTGCATTTCCGCGGGAGTCCTCTCGCTAATTAGATTCATG:1 - chr2R 8537820 3' - 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Doc 38 1 55.45 ATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCCCCCGTCCCCATTTTCCAACCAA:1 - chr2L 3952745 3' - P-element 138 1 34.57 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTGCCGAACAGTATATCGTGAATTAAAAATGTCTGGTCTAAATCT:2 - chr3L 25608321 3' - Doc 34 1 59.41 AGAGCACTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCTCACACGTACACTCGTGTGTCCAGCGAAGTGAAGTT:1 - chrX 3522961 3' + 1360 415 1 59.41 GCGAAACGTGGAGTTTATGTGCATGGAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGATGTCTAGCCAAACACTAGAATATTAGACTAT:1 - chr3R 21359285 3' - Cr1a 271 1 69.31 CATTAAAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGAACTATGCAGCCACAGTTTTGGAATCCGTTTGGGCAAGAGCGGTAGCGGAATGGTGTGC:1 - chrX 18941048 3' + 1360 7 2 61.39 ACACACACATACACACACATACACACACATACACACACATACACACACACACACAGGAACACACAAGCCTGACACATTAAATGGCATGCATAATTGAATTA:1 - chr2R 18316463 3' + accord 7039 2 69.31 AATAATAATAGCAGTAATAATAGGAGACGGGCCAACGGCCGCGGCGGCACTAAATTCGAAAATAAAAGGGAAAAGCGTCCTGTGAAAGAAACAAATAACGA:1 + chr3R 19500057 3' + mdg1 25 3 68.32 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATAGTGCCCCATCATGTGGCATTCCTAAACCCAAAGTGTC:1 - 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chr2R 2645472 3' - HMS-Beagle2 37 2 68.00 ATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATTCGCAAATAATATTCACCCTTTGGGAATACACACATCTCTTGAATTGGCGGTAGATTTGAGTCGATAAATGGTAT:1 + chr2L 8477496 3' - I-element 4892 1 65.35 GAATTTACATTGCTGTTCTTGGGTACAGCCACCCGCACATGGCGTGCTTAAGACTATGTGTTTGAATATCTTACATCATCTTATGGCCGTTCGCATATATT:1 + chrX 420548 3' - Stalker3T 267 1 71.29 TCAGCTCCGCTGTAGATCTCCTCCCCACTGCCCTTTCAAAACGAGAAAAAAGCCATCGAAGAGAGGGTTTACTGTCGTTCTGAAACAATTGTTTGCGAGCC:1 - chr3R 29962838 3' - aurora-element 3901 1 80.20 AGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCAGGCCATCTTTTGAGTTACAATGATGTATAAA:1 + chr3L 15452921 3' + accord 491 2 68.32 CCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACAAGTGCAGTGACCTCCCTAGAAACTGTCACATGCACTTGACTTGGCCATAATCGAGTGCCAGCCAAAACGCAGGA:1 - chr3R 24794098 3' + Doc 480 1 55.45 AAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATA:1 - chr2L 23295810 3' + micropia 407 2 71.29 ACCACGTGTCCAAATATTTACAAATAAAATGGAACATCAAGGTCAAGGTGATTAATATTAAATCACTTAAGACCTCTGTTACTGTTCGAACCCACAGCCCA:1 + chr3R 12068607 3' + transib3 243 1 57.43 CAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTAACGATAAAAA:1 + chrX 10119644 3' - FB 17 1 60.40 TTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGAT:1 + chr2R 5651880 3' - Tirant 8160 2 76.24 CTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAACTCCAAGGAATCGAAACTTCCCAGCGAAACAAAGTCCAATGAACCCTTAATTGAAAACAATCGAT:1 + chr3L 5584910 3' + Idefix 181 1 64.36 GTAATAAATTGAAAATAAATTGGAAACCATGTCGAATCACTCTATAAAAACTACTATAAAATTTGTTTGCAACTGACAGATTGATGGGCATGTCGAACATC:1 - chr2R 19779995 3' + Fw2 75 1 65.35 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTTGCCCTTTAGGATTTGCGGAATATACATATCTCGCTTGCTCTTCTTAAATTCAGCGCATCGTGTCGCTGT:1 - chr3L 9505795 3' - P-element 6 2 72.28 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGAAAGAAAATTACACAACCAGAACGTAGCTGAAAAGCTCCTTACCCTCATATTCAGATACA:1 - chr2L 13314059 3' - jockey 23 1 55.45 TTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAA:1 - chr3L 11367504 3' + roo 383 1 59.30 AGGGCAATCCGCGAACACAACTACACCGGTGTTTCGCTAGCAACAAATTTCTCTCCGCTTTCTGCTCGGCGTTTTATTTCTACTATTTCTGTCAGTCTACA:1 + chr2R 8287698 3' + Gypsy12A_LTR 1968 1 52.48 AGCTGAGTAAAGGGTATCTGATTGTCGGGCTCAGTGCCACCAGATTCACAATTTGCAACGGCCGAAGGGAATTTAAGTCTCTGGAAATGGCCGTCGGCAAA:1 + chr2R 6611675 3' + INE-1 545 1 70.30 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCACAACAACAACTATTGACAAATATTT:1 + chr2L 1195090 3' + hobo 2915 1 62.16 GGGGAACTCGACTATAGCGTTCTGTCAAGATCATAAAGTAGATTTTAAACCATAAAATTATCAATTTCTATATCACAATTTAATAAACCAAACTAGTATCT:1 - chr3L 18851573 3' + INE-1 571 1 76.24 ATACATACATATGTACATACAAATTGCGTTGGCTGGAAGTGCGGTTCAAAAAGGGAAAATCCTTTCCAATCCCTCTCCATATGAAGGCAATAACCG:1 + chr3R 31496077 3' - invader3 5086 1 62.50 GTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAACTTTGAAGGTTATAAGCCAAGTAGGCGATGAGTTGTTGGGAGGCAATTCCGACCACTCGTAATTACCC:1 + chr2R 18739325 3' - Stalker 7075 4 75.25 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGAGATTCAGCCTCTAAAGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATCTATAAAACAGTAGTCGACTCTA:1 + chr3R 19449382 3' - roo 8687 2 68.32 GGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATATTTTATCAACTAACACAATTTAGGTTAAGTTTTA:1 + chr3R 26985356 3' - P-element 2865 1 43.30 ACGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGCAAAGTTAAAACCACCAGCAAAGTTTAAAAATTAAAAAATAATAAAAGTTAAACAAAAGAAAAGTTAAATAAA:1 + chrX 19147812 3' + HeT-A 6056 2 74.26 AGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCGCAAAGTAAAATGGAAAAGCAAACAGCAGTGACGG:1 + chr3R 14548730 3' + I-element 348 1 68.32 CCCAATCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACCCCTCACACCTTTTCCCACCACCCCTGTAAAATGCCTTGGGGCCGGGAAAGTGT:1 + chr3L 14338763 3' - Stalker4 27 4 56.44 CGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTACAGCGGCTCAAAGTCTGGCCAAAAGCGGGTGAAA:1 + chr3R 8971057 3' + hobo 288 1 65.35 GCAGGATGTGAGGCCAAGTCGCACTCCCTTCCGTGAGTGTAGCATATAAGGGTGGCTACAGGCGTACCTTAAACTAAAGGGGAAGTAGAGAGAGTGAATAT:1 - chr2R 4478523 3' - Rt1b 4951 1 60.40 CTATTTTTGGTGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGCTGTGTGTGTGTGTTCTGTATTTGCTCAAGCTGAAATTTTCAATTTGAGCACACAAAA:1 - chrX 3302491 3' - roo 8845 2 57.43 TTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAAGAAATTAAATTACGCTTGAACGGGCTCGGCCGAACATGGGGTAGTAGTAGGAAAGAGATAGCCTGCGGAAAGGTT:1 - chr2L 16717923 3' + Tc3 312 1 82.18 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGGATAAGTGGCCCA:1 - chr3L 11367480 3' + roo 392 2 60.40 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGCGTGCGAGGCACGGATGTTTTG:1 - chr2R 10191719 3' - 297 6626 2 78.22 ATCTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCATACATTATTTATTTCTTTTTTCCTACTGCGACTCCCTG:1 - chr3R 20139111 3' + jockey 4702 1 60.40 TCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATCAAATACTACGGTGCTCGGCATTTTCTCGGCTGGGG:1 + chrX 4784571 3' + hobo 2918 1 53.09 GCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGTCAACCAAAAACAATGATCAATACGGCGAGCGCCAAAACCCACAGACACATACTCTTATATATGTATGTATGTA:1 - chr2L 21019239 3' + Doc 4539 1 76.24 GGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCAAACGAATATAATTCATATGCTTAGAGTATTCACACCCGTTCATTTTGTGCCTTTCGTCTGTCGCGG:1 + chr2L 4872883 3' + G6 1644 1 74.26 CCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACTTTCACACTCAAAAAAGAAATTGCCATTGTTGAATGTTTGAGAT:1 + chr2R 14809005 3' + hobo 44 1 56.44 ATAAAATAAAATAATTAAATAAAACGATTAAAATAAATCAACATATAAATCAAAGATTTATTGGCAATTAAATTATGAAAAAGAACATCAAAAAACGATTA:1 + chr2L 16164052 3' + Doc3-element 77 1 88.12 TGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTATTTGACACTCATACATTTGACAGACATACAC:1 - chr3L 21912242 3' - Bari1 13 1 67.33 GAGGCACGAAGTGCGGACAGAAGAACTCAATAATCATTACTTAGTTAATTTTTCACACGTTTCGACGGCTTTTTATGGCGCAAAATCCACTAATACACGGG:1 - chr2R 20421097 3' - 1360 470 1 58.42 GTGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCATATCAGTTTGTGTACCCCACAGTCGTGTTTGCGAAATCTTATCTTTAACAC:1 - chrX 7323085 3' + Burdock 6045 1 53.00 GATCAGTACCCATGAGTTATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCTATGTCTGCTAAATACATTTCAATGATACTAGATT:1 - chr3L 26417963 3' + Quasimodo 6985 2 63.37 GGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGCTTGGGGCATGTTTAGTTAAGTCTTAGGCTTAAGTCTCAGTTCTGGGTAAGCTCGAATGTTCAT:1 + chr3L 18096023 3' - I-element 4992 1 66.34 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATGTAAGTGAGTGAGTGAGTGCACACTGT:2 + chr3L 3476402 3' - jockey 4687 1 70.30 TGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGTCATGAGATCGGGATCCTGCCAGACAGTATGTCGCCACTCCAGGGCTCATTCAACTATACAG:1 - chr3L 14152065 3' + blood 7386 2 72.28 GTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGATTATTTATTTTGTTTGACCCAACGACGTGACACACAAATAATGGTACAAGT:1 + chr3L 11826682 3' + INE-1 125 1 57.43 CATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCGTCTAATTGAATATTGAACGAGGTTTTTAGTGTTGTCTTTATTAGCGTTGCCA:1 - chr3L 9324618 3' - Quasimodo 38 2 71.43 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGACATTGACACGTCGCCCTAAAATGTATGCTACAATATT:1 + chr2L 16968476 3' + 1360 3352 1 67.33 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTAACATAATATAATTGCGAATTAGTGCGACCCACCTGCTCCCGCACAAG:1 - chrX 13031806 3' + flea 4991 2 57.43 CTTAACTTCTGTAAGTACAACGCATATTGGTTACTTAATAAGATCTCTAACTTTCATAACGACCTTGACACCGGTAAATCGCCTCCGTTGTCAAAGTTCAA:1 - chr2R 4898419 3' + gypsy7 385 1 65.35 TTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAAATGGCGGAGAGATGGGGCTTCCCCTTTT:1 + chr2R 23224850 3' - 17.6 200 2 75.25 GGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - mdg1 7175 2 58.00 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTCTGTATACGGATAT:1 - chr3L 20268093 3' - 297 6599 2 85.07 GCCTCTGCTTAGGCACCAGCACGGTGAGAGGATGGCGGGTTGGGGTCCTTCCGAAAGGGGGCATAAAATTCATTGTTATGGTTCCTGGGCATAAGTCAGTC:1 - chrX 20797474 3' - Rt1b 233 1 69.31 TTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAGATACAATAGTTACAGTCCTCTCACAGAGATGGAAATAGTGATAGATAC:1 + chr3L 16680750 3' - FB 26 1 53.00 GTTAGATTCAAACATCCGAATTGAACTCATTAAGTGTACGCACAAGTTTATAGTGTGAACACCCAATAAAACCCATCTCATATTTGTTTAGTTCTTATGGC:1 - chr2L 8007833 3' + rooA 7561 2 64.36 TGTGTTACAATGTTAAAGTTCTTAGAATTAAAGTATCTGACACAGCTGATATCAACTAGATCAAAAAGGGGAATAAATGAGTTAGGTCCTGTTTGTAAATG:1 - 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chr2R 20398927 3' - Stalker4 425 2 63.37 GTATATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTAATTCTAAGTACATAAGTTGCAAGCAAAACGCTA:1 + chrX 8432535 3' + accord 88 2 63.37 TTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGATGCGCCGCATGTATTTTCCAGCCTCGTTTAGCAGATTTGTAATGTCTTCCTTAACATTGATGGATAGCCACTGTG:1 + chr3R 5550442 3' + invader2 496 1 78.22 ATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAAGTCGGATCATCTACTGCGTTCAG:1 - chr3R 28880198 3' + roo 68 2 77.00 CAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACGGGTGGTGGTGGCTCCGGACTGTCCGTGTTGCGGACATTCCGGTTGCTG:1 - chrX 6123511 3' + hobo 458 1 53.47 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTTAGACAATACAAAAAAAATGGGAGAGCAGACAGAAAAGTTATTTAAATTTCGAACCCATTTCAAATC:1 + chr2L 10820683 3' + roo 401 1 71.00 TTAATAATAAAACATTCGCGTGTACCCGTCTTCCGCGGCCACTCGGAACGGCCAGTCTTCCACCGGCACTTCCTTCCACCGCTGATCGTCCAGCGACGCCT:1 - chr3R 3908168 3' + Q-element 547 2 49.50 GATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATAGGTTCTTGCATTTCATCTGCATCGCTCCTTT:1 - 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F-element 4472 1 71.29 ATATTAAAATTATTATTATTATTATTTCGTAGCCGGAGATAAAAATCTTTAAAAATATCAGATATCAGACTTCATTATAAGCTAGCTAAGTTAATGGTTGC:1 - chr3R 13953354 3' - mdg1 7076 4 59.41 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGACAATTAATTTGCGAAACAAGAGTTTTTCAGATGCAATATTATCGTTTAATTATTTATTGC:1 - chr2L 19698232 3' - hobo 14 1 63.37 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCCACCGATCTAAGCGTGAAGTCGCCGC:1 + chrX 2125616 3' + P-element 2837 1 31.68 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTTTTTTGTTCTTTTTTTGGGGGCCGAGTGAATAGCAAACGGAAAACGGATGAAAGCTTCACTCGATTGGCAT:1 - chr3L 13164651 3' - pogo 3 1 71.29 GTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTAAATTATTCCTTACGTAATATAGCTCCTTGAACCCAAAAACTCCTAAGCTATTCAAAATGAAGCTGG:1 - chr3L 15663578 3' - Stalker 6956 4 73.27 ACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGACTCGCAGATCTAATGTGTAAATAAAAAAAGG:1 - chr3L 23591175 3' - roo 9045 1 73.27 TTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCCACCTCGAAGTTTTTCAGGAACTGCGTGAATATCTGGTTTT:1 + chr3R 12811490 3' - jockey 4647 1 59.41 TATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAATATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTATATGC:1 + chr3L 16973465 3' + S-element 1701 1 63.37 ATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAAT:1 - chr3L 5267223 3' - Juan 4009 1 59.41 CTTAGCGTTGTACTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAAATGTCCTGTTGCACACACAAGCGTCGCCGTCGGCACAGATTTTGGCCAGAGA:1 + chr2L 3637126 3' + 297 6929 2 58.42 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCTAAACCGTCGACGGTTCGCCGCGGAATCGGTGTGCGATGTTTGATTTCATTTAGCACATGTCTAGACGA:1 - chr2R 19658267 3' + 1360 3380 2 72.28 TACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCATAAGTAAACATATAAATTTATGCGTGTTTGTATAGGTGGGCAGCAGGTACAGGCGCAACTACTTAG:1 + chr2L 11181445 3' - I-element 346 1 71.29 GGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTTGAAAGAGATGATAACAACCAAATGAGAGAAGCTAGCCCTTGCAGGACTTAGTTTGAAGTCCGTGTAGCGGCC:1 - chr2L 20067298 3' - F-element 4460 1 72.28 CCACAAAATCTTAAAACAAAACAGGCAATTGTACATCACAAGCCAGCAAATGTGATGTAGCATATTTCGTTATAAATTTACATTTGCGATAAACAACAAGA:1 + chr3L 7820208 3' + I-element 5183 1 53.47 TGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTGCCTGTGCGATATTATTTTTATTGTAATTTAATGAGTTCTGAGCCT:1 + chrX 10434487 3' - hobo 128 1 54.46 GCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTCCAACGAATCTAGTATACCCTTTTAGAGCGTAACGAACTGATTTTCCTGTTTCTGCTGGCTATGAACTGCAACGG:1 - chr3L 24248483 3' - INE-1 29 1 54.46 TATTAAAAACCACGGCTGGTTTGACAAACACAAAATAAAAATCTAAGCGCAAAAAAAACACGTCCATAAAAGTAGTCATAGTCATTAAAAAGTTCGTTCTT:1 - chrX 23175147 3' - Cr1a 61 1 63.37 CGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTACGACTTGGTGAACTGCCGGTTGCAGTACTTGCAGATGAACTGCTTCTTTGGACG:1 + chr2L 3605509 3' - flea 4869 1 59.00 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCCATCGTGCAATATCCTTTTTGCAGCAGTCACAATCAAATGGCCGGATAGAGAGATTGCATCTCTT:1 + chrX 12883665 3' + hopper 1409 2 74.26 CACGCCCACACTTTTGAACAATTGTCAAATTGGTTCTCATATTATTCCCCAATATTTATATACATATCTACCAACAAAAATTATTTCATAATAGTTAAAGC:1 - chrX 21156144 3' + INE-1 253 1 77.23 TACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGTAGTGGGAAACTTCTTGGCAC:1 + chr3R 25514165 3' - hopper 48 1 71.29 GCATGCACGATTCATAAGCGCTATCGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCATAATCCAATCCACCTAAGTTCCTGCTCCCATTGCCAG:1 - chr3L 6381832 3' - Rt1b 5070 1 60.82 TTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGAGATTAAATGAAATCTTGAAATAACATTTTA:1 + chr2L 15174149 3' - Juan 4073 1 68.32 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGGGCTTAATATAATACTTGTCATACGTTGC:1 - chr3L 14886215 3' - 412 48 2 70.30 GTTACAATGCATTCCGCGACCCATGACTAGAGAATTCTTGGTCTTCGTTTGGAACAAATTCAATTAAATCATTTATGCTCGCCCAATTAAAAGTTCAGTTC:1 + chr3R 14969356 3' - Tc1 361 1 67.33 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACTTTGCAACCCATATCAATTAAGCCAAAAGACCGAGAGAGTGGTCAATAAT:1 - chr2L 2912014 3' + 297 374 2 60.40 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCA:1 - chr3R 21575930 3' - Doc 50 1 42.86 GTTCAACAAAAATATGAAATATTCATTTTAATACATCGAAGCT:1 + chrX 5204688 3' + Rt1a 343 1 79.07 ACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGAGGACCAATATGAACCAAACGCAGCGGCTACAGTGGAGATTAGCTAAATGAAAAGCCCTCCAAATGCAGCTCATG:1 + chr3R 11470282 3' + R2-element 297 1 55.10 AAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTCCTCGAATTTTTCCTCTTTTCCTGCTCTTCTGCTGCTCTCCGCGTGCTGCGTTGTTGTTGC:1 + chr3L 10225082 3' + BS 4989 1 52.48 AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCAATC:1 + chr3R 25443136 3' + 297 6963 2 66.34 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATTCAAGCGCGAAAGCATCAACAAATCGTACAAGTTGGAAAAACAGCGGC:1 - chrX 6739597 3' - roo 8692 2 53.47 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACACACACACACACACACACACAAAGAGCATCGACAACTAAACAGTTCGTC:1 + chr3R 19734568 3' - hobo 23 1 50.50 CGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTTAACCTAATCCACATTATATATTGCATAATACAAAGCGTAGTTATAAGCCAAACAACCAACAACACACTGT:1 - chr2R 10523206 3' - F-element 295 1 74.26 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCCATCAATTCGCCTAAATATTTATGCTTTTATGACTTAGCCATTGAGATCAACGCCC:1 - chr3R 22157377 3' - hobo 20 1 41.58 TTTCATACTTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAACGTTTTTATGTCACATTATGTTTGTATGTCACATAACAAAA:1 + chr3R 4828019 3' - Tc1 1569 1 46.75 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCTAAGTGCTGGGCGTGCGCCGCCAAACAAATCAAATCAGAATTCGGCTTTTTACG:1 - chr3R 20869657 3' - hobo 23 1 56.44 CCGACTATCAGATAACCGTTACTCAGCTGGGCAAATGGAGGCTGCGAATCGATGTGGAAATGGGGAAAACTGGGCGGCGGAACAG:1 - chrX 21004003 3' - INE-1 551 1 74.12 AACAACAAAAAAGAAAAAAAAAACACATTCACATTTTAAATTGCATGCACTTTTAGGCGCACGCACACATATACATACACATGTACATATGAATTCGTAAG:1 + chrX 3080949 3' + gypsy7 5004 1 67.33 TATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACAGAAAAAAAGAGACGGATAGATAACGGATGAGGGGGAAAACGTGCACTCA:1 + chrX 1026354 3' + transib2 2407 1 56.44 CTACGTACTAAAACAAAACCTCCGCGTGTCTTCATTCCTTGCTCGCTCACCAGGACTGCCAACCTCATTTAAGTGCTTCTGCGACACGATCCTTTCTACTG:1 - chrX 6122513 3' - Rt1a 4963 1 61.39 TCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTTGACTCTAGATTAGGCCATAAAAATACGCATTAAGCTGTCTGGAAGAGATAACTTCATATG:1 - chr3R 31001642 3' - 297 424 1 72.28 GAGCGCTACAGCGAACCGCTCTTTTGTACGCATACAGCCAAAACAGTACAACAACAGCAAAGCAATGCACATCGCTTGCCAATTTAAGTGTTAAACGTACC:1 - chr3L 9169161 3' + 1360 124 1 67.33 TTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTCGAGAATGGGCACATCGTCGATATCCACTCGCGGCGCCTTGGCC:1 - chr2R 12471392 3' - F-element 4475 1 56.44 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTATTGAAAAAAGTTGGCAATATTCAACTGTTCATCATTTAAA:1 + chr2R 22521878 3' - roo 35 2 65.35 ATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACATTGCAATGTCTTCTGTGGTGTGTGTCGTTTAATGCGTGGCCGCCTCGCACGGCGCTTTATT:1 - chr3R 18026894 3' + mdg1 403 2 60.40 AGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGTCGATGATGAAATCGGATGCCATACGCTCCGGGCGGCTGGTAAGCTTAGTA:1 + chr2R 18036693 3' + blood 7365 2 53.47 AAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACG:1 + chr3R 1844826 3' - Cr1a 149 1 66.34 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTTTTTTTTTTGTTGCCAGAAAACTCACTCAACACTCACT:1 + chr2L 12339746 3' + jockey 4950 1 69.70 TTTATTATATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACAACTCCCCAACCACACACACTAAAGTAATTACTTTTAATTGTTACAACGAGTTGCATTTACGTT:1 + chr3L 26002517 3' + Tc3 285 1 58.42 AGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTT:1 + chr3L 21912341 3' + Bari1 1682 1 54.46 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCAAACTATAGGAAACTATATCCATGATACTAGTTGGGCAGTCTCA:1 + chrX 19850497 3' - pogo 29 1 57.43 GGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTTTTGTAGTTGTTGTTGTAGTGCTGCATCTCTACCGGCACCAGATCCGGGGATTCACCCAAATCCTGCCCCAAAACTTGG:1 - chr2L 9291353 3' - F-element 364 1 75.25 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACGTGTGAATGTGTGTGGACAGTCGCGGGAAAATGTTTAGGGCACGTGTATATG:1 + chr2L 20085211 3' + P-element 2863 1 57.43 CATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCGAGAGAGAGGGAGGCAAAAAGTAAAATGAAAATAAATTGTGATGGTCAAGGTCGTTGGCA:1 - chr3L 18033917 3' + Doc 227 1 66.34 TGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTTGTTTTCTTTCTAGACGAGCGGGAAGAGGGAGAGAG:1 + chr3R 12059212 3' - roo 9057 1 64.00 AGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGTTCTCTGCCACCACCCCCACACCCCCTGACTACCATCACTTCGTATCTGTCATCTGGCCATTGTGAGTTTTCCCTTGGAA:1 + chr3R 28940812 3' + hobo 2932 1 69.31 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACATATAATTTCCATAAGAATAAATTCGAGTAAGAAAA:1 - chr3L 13608321 3' - mdg1 40 2 67.33 GAACCCAACATCAGCACACATTGGGCGTTCAAATAAAAGACAAATCATGAAGTAAACAGAAATAAAAACATACATACACACACCTCGCCAAACCGCTATAC:1 - chr2R 547714 3' + Stalker 7161 4 70.30 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACTCCATGGATAATTGAAAGGGTTGGAAAAGTGAAAGGCTGATTAGATTGC:1 - chr2R 4344530 3' + pogo 2077 1 55.45 TATTTTCTATTCCAGTTTTCCCGCTGCGCCAGTTACCTACGAGAAGCTTCGCGAGGTATTGTAATACAGAGGAGAGAGAAGCCAAAGCAAATATTTCAAAC:1 - chrX 3768739 3' - ZAM 482 1 61.39 TGATCTTTAGTCTTAAGCTGATATCTGAATAAAGAAGTTCAACAAAAACCTTCCTTAAATAATTCTTCTCGGCGTTGTTGAGCTCGACAATTGTTTGGGGC:1 - chr3R 30102386 3' + 297 6855 2 77.23 CAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACACAACTACGAGACCTTTTGCCCGTATAATT:1 + chr3R 9202033 3' + Tirant 130 2 71.29 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACCGAAACGCCAACGGCTTGGAGCACAAGCTCCTCAAAGGCGCGAGCGAGCTGGGGAGATAGATA:1 - chr2L 9437406 3' - P-element 9 2 71.29 ATCAAGCTAAGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAATGCATGGGAAAACAAATTACAATTCGTTTGTCGATGG:1 - chr3L 6683450 3' + Bari1 1608 1 63.37 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGATTTGTTTGTAATTTTCGTCCAGTCCTTTATGAGCTCGACTCTTATAACAGCTTTATCTTAATT:1 - chr3L 27864679 3' - roo 12 2 67.33 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACTGACTTCATCAATATCCTCGGGAAGGTCTTGTAGCTCTTCGTAGCACC:1 - chr2L 5269796 3' + hobo 2911 1 54.46 ATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTGCTTAGTGGGTGGTTGGCTGAAGCGGGCATTGAAGACATTGAATTGAAATTAGGGGGAATAATATCCAGTGACA:1 - chrX 3697257 3' - accord 6996 2 77.23 ACCCTTTAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGGGGACGCTGAGGATGGACTCCTCACACACACACACACACTATCACAGATCCTAACCACTGGCGTTTGTCAA:1 + chr2R 15105469 3' - Rt1b 4888 1 57.00 CGATCTACCCCCTTGTGATTTTTTTCTATGAGTTTTTTTTCTCCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTT:1 + chr2L 16946125 3' + mariner2 577 1 68.32 CGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTGATGATCAAGGCCCAGAAGATAGTGGACGTGGACCAGGAGCTCCTGCCCACCGGGAAGCTGATGC:1 + chr3L 21640133 3' + Quasimodo 7050 2 68.32 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTT:1 - chr3R 19450156 3' - roo 8689 2 79.21 GAAAACACACATCTATTAACTGGCACCCAACATACTATTTATGCACCTACATTCCCCTTTATAAAGAATCCCCCCATTGAGAAAGCCCATTGCGCACATCG:1 - chr3R 21741146 3' + gypsy7 231 1 52.48 ATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGTCACACAATTATATATATAGATATATTTTGTAGCTATACAAGTCATAA:1 - chr3L 9147838 3' + I-element 5154 1 60.40 ACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGAGCATCGAGAGAAGGAACAATCTCGCCG:1 + chr2L 190354 3' + F-element 56 1 73.27 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAATTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCTGCTCACATCCTAAATGATGCACGAACCCTTTGTCCAGATATTGGTTTTC:1 + chrX 22690819 3' - roo 26 2 53.47 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACAACGTTCGACATCTGCTCTATCGTCTAGGTTCGCAAATTTCGGATAAATCTCG:1 - chr2R 18036607 3' - blood 23 2 53.47 CGCTAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTCTGTTCTCGTTGCTGTTTCACTGTCAGTTTGTTTGTGTGCACTTTTGTTATGTAATTACCGCTGCGCAC:1 + chr3R 20087860 3' - Porto1 4560 1 68.32 AGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGCTTTT:1 + chr2R 5531210 3' - 1360 51 1 74.26 CTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACACCAGAAGGGTTCGGGCCCAGCTTTCCGGCTTGGTCACCGGGCGATGCAACAGAGGCACGTTTTAC:1 - chr2L 109143 3' - baggins 4971 1 54.46 CATAATATGCTTCACATATTACGCTTACACAAGTATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAATCATGTAGCCTATATTCCTTTTTTCGCTTTTTTGTTTT:1 - chrX 3558831 3' + rover 6957 2 60.40 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGTTATAGCGGTATTGTTAAAGTTCTGCTAGAAGA:1 - chr2L 7504882 3' - roo 8707 2 73.27 TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTGCGATGCCTGTGGTGGTGCATTAACACATGCGCCAATAAGTATG:1 - chr3R 28196690 3' + hopper 1386 1 57.43 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTAGATCTAACGACTTTATGTAACTGGGAGCGAAGTGAAAAAGAGCTCCAGTCGAAGCTGAGGCCGAACA:1 - chr2R 9129630 3' + P-element 2878 2 70.30 GTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATGAGGCACAGGAAAAGGCGGAGGCGGAGGAAACCGCCGTCAGG:1 - chr2L 4236979 3' + hopper 1082 1 58.42 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGGGCTATATCTGCAGTGCTCGTAAGTCGTGGGCAGC:1 + chr3L 22741383 3' + P-element 2847 1 39.60 TTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTATTTTTTAA:1 + chr3R 21985348 3' - TAHRE 69 1 58.42 GGGGTGCCTAGAGTAACGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGATAGCAACTTCTCTGATAGTTCCTATACG:1 + chr3L 22418532 3' + hobo 2892 1 68.32 AACTCGACTATCGCATTCTCTCTTGTTTTCCATAGATGTCCCTATCTGCACTTGAAATATTTAAAATACTCTTTTAGTTTAGTCGTTTCCATTTAGATTAA:1 - chrX 17606491 3' + INE-1 575 1 55.45 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTAC:1 + chr2L 22150636 3' - S-element 31 2 78.22 AGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGAACAAATATGTTACTTAGGAATCAATTACTAATATATGTCCATCATAACTGTGGTCTTTATGATTTAA:1 - chr3L 10045209 3' - Stalker2 7256 2 62.38 TACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGTTGTGACTAATAGAGATTTTGATTAGATGTCATAACCCCAGGTGCCAGTTAAGTTGCATCTTGGCAGTCTAAAGT:1 - chr3R 20384311 3' - Quasimodo 7097 2 74.26 CGCCGGCTAACAAAAGTTAGCTGATACAAACAATAAAACAAATATTACAATTAACAATATATCCATTTGAAATCATCGACAAGCGCTGTCATCTAGGGGGT:1 + chr2L 3939252 3' - BS3 1680 1 76.24 ACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGTCTAGCGTCCGAACTAGCCGTTCTGTCCATCAATTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAACGTGGGAAGTATGT:1 - chr2R 5621009 3' - 1731 206 2 65.35 GACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCGTTTTGACCACGGAGCAGCAAACAATCGATGCTATGATGGCCACGCACACAACGTCGCTCACGCAGACAGA:1 - chr3R 27980670 3' - rover 7252 2 73.27 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATCTATAAAACAGTAGTCGACTCTAAAAGTTACTGGG:1 + chr3R 19449394 3' - roo 8671 2 59.60 ACTTGATCTTTTAGGTTTCCCTGTTGATCTTCTAAATTGGATTTCTAGCTATCTGAATGGCAAGACACAACAACATCTTTCCACTTATTGTGCGGTAGGTA:1 + chrX 5302257 3' + Q-element 366 2 72.28 TGTTAAATAATTTAAATTGTTCTTTTCATAAAAATCATCCTTTCGAAATGCGTGTGAATATTTTTCTGAGAAATCACATTTGCTTGTCAGCTGCAGCAGAT:1 - chr3L 18022325 3' + HeT-A 5809 1 66.34 TTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCGCTTAAGTCGCAAGACGCTGCGCTCCACTTTGCTGCTAACTGCACATTAAACGGCTCGATGGCAAAAGCTCCACTC:1 + chr3L 12930608 3' + 1360 3172 1 80.20 TCTTATTTAATTTATTTTATTTGCGGCATTTACTCTCGACTCGCCTCCTGCGCTGCCGTTCTTGCATCCATTCGTTTATTTGGATGGGAGTTTTCAGTATA:1 + chr2L 21019392 3' - F-element 89 1 56.44 TAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATATTTTTTCATTAAAAAATATAAAATTTAACAAAGATTCACATACCCAAGACCAATATCGACA:1 - chrX 12149929 3' + jockey 4842 1 49.50 CTGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCGCAACACAAAATCCACGCCCATTTTCCCTGAGCAAAGTAGTTGCATTAAAAAATAAATCTCTA:1 - chr3L 18666946 3' + Circe 105 1 71.29 TTTATTAAGAAAGGAACTATAAATTCTAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAAACCTTAGAACCCCTTAGATTAAGTCT:1 - chr2L 1795776 3' + copia 239 1 70.30 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGGCAATCGTTTGACGTCG:1 + chrX 20330533 3' - P-element 57 1 23.76 GAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTACAAACATTGAATAGATGAGAGGACGGCAGCAGACGGTAATGATAAATATGGAAGGAGTGATGTCGACCAGAC:1 - chr2L 4134297 3' + copia 252 1 73.27 CACCGTGAACTAACGGTATCGCTCTGGACCTTGGACTTCAGCAACCGCATGGACAGCTACTGCGAGCAGTTGGAGAAGTCTTTGGGCATGTCCCAGCAGCA:1 - chr3L 1025472 3' + gypsy8 172 2 68.32 AGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGATTATTAAAGAAAAGTAGACTTAGTTTATATTTCATTATATGTCTTATAT:1 - chr2L 11595985 3' - 3S18 28 2 56.44 TAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTAATTATATGTATTTATTTAGTAATATTACGGCTGATCATAGTTGCATTTTC:1 + chrX 3243058 3' - I-element 136 1 56.44 TCGGAGCCATAGGTCCAGATAGGTTTAAAGACGGAGTTGTATAGGAGAGCTTTGAACTCCAGGCTAAGTGGAGAGCGATACATGGCGAGAGGGTTCCTGG:1 - 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chr3R 23540923 3' + Cr1a 4225 1 76.24 TGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAAGGGTGTTGCAAGCAAACAATGACCAAACAAAG:1 + chrX 19972882 3' + Stalker4 7256 4 67.33 TATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATTGGTGTTGCACAGCACATTTCCGTATGAAATATATTATTAATACTACCATTATTATTAAAGCAATAATTAAT:1 - chr3R 19449798 3' + BS 5029 1 71.29 TTCGCTTTTCATTATATAATTTTCCCTTTCTAACCAAGCGGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCCTGTTTTCCTTTCTCTCCTCGCAG:1 - chr3L 17213451 3' - micropia 258 2 70.30 GACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCATATTTAATTTGAATAAGAAATTAGCAACTTCTTTTCAGGATGA:1 - chr3R 15038948 3' + F-element 401 1 56.44 CGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGAGTGTAAGCAAAAATGTGAAACATATTATGCTACTATATATATATGACATGGACATGGACCTCCTCTATTTCCCGAATA:1 - chr2R 4122447 3' - rover 185 2 68.32 CTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGGGTAATATCTATGGATAGTATTTGACACTCATACATTTGACAGACATACACT:1 - chr3L 21912241 3' - Bari1 9 1 68.37 AATTGATCCTGATCAAGAATATAAATGTAGATTATATGGTCGGCTGCTTGCTTTTTCTGCCCTCTTACTCCTTTTAAACCAAATATAATATTTGGACGACC:1 + chr2R 1090955 3' - INE-1 84 1 63.37 CTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGCAAATTATAGTTTACAAATTAATCGCTTGTCAAAATCGAATTCATCATTATTATTATGTAATATTTGTCAATAC:1 + chrX 20112309 3' - INE-1 17 1 68.32 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGCTGACAGCCCGGGTTTTATCTTGACCGGCCCCAAAAAGTAGGCAATACAATT:1 + chr2R 21415204 3' - jockey 32 1 52.48 GAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTCTTAAGAATTATTAAGCACTATATCTAGAAGTTATTTAGTTA:1 + chrX 6917149 3' + 3S18 6071 2 57.43 CATGAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACAACCAACCAACAGCCACAAATAATTAATCAATCATTAAACGGAGTAAATTCACAAATCTGTAATA:1 + chr2L 8089521 3' + Bica 123 1 65.35 GTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAGAAGCGATCTGAAAACTGAAA:1 + chr2R 18345567 3' + micropia 339 2 72.73 CTATTATGAACTGAACTTATGTATATGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACTAAAGACAGATTAGCCGCTCTCCATGCCGCCCAATCTGAT:1 - chr3R 24104399 3' - invader2 4882 2 60.40 TAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAACGAGACGGTTCGGGGACTTGGCCAAAACAAAGGCTGCCACA:1 - chr2L 5654570 3' + jockey 4686 1 59.41 GCACAGTCTCGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACCTTTGCCTTATCTTATCGCTGTGCACATA:1 + chr3L 9760116 3' - P-element 474 1 31.68 CTTTTCAGGTATCTCTCGCTGAGCCTGGAGATTTCATCAGCGACTTGTGGGATTCCAAGTTCCCTATGTATGGCGACTGAGATTAGCATTTAATGCAATAA:2 + chr3L 11241049 3' - G6 1790 1 76.24 AATAAACAACAAATTTCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCTTTTATCGAAACTAACACGCACATAGTATGTGCGTATGTGCACATACGCAGACAAACAT:1 - chr3L 27262269 3' - S-element 1540 1 61.39 ACAAATTTCAAGTTTACACACTTTTGAGAGTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCTTTTTCGTTGATAGACTATATTATTCTTAATACCTGTGT:1 + chr2L 5890523 3' - S-element 1532 1 62.38 GGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCATGCAAAATGAAAAGGCAGGGCTTTACGAACTCGAGCCAACTTTTTTATGGCCAGAACATATTTATTATTGTG:1 + chr3R 12116179 3' + 1360 61 1 63.37 TAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCAGGTCATCTTCACACTCATTCTCTAGTCCCGACTCCTTGGTCCTTAGCCAT:1 - chr2R 19112258 3' - G4 3383 1 65.35 TAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATAGCTTTCAGTACGTTACTGTATACCTTTCTATATCAT:1 - chrX 812271 3' - Quasimodo 18 2 59.09 TGTGCAGTAGTTTAAACAAAGATACAAAGTCTTTTGAATTTTTCGTCCTTGTGTTTAGTTTACACATCGGTTTGTGCGTGTGTGTGAGTTTTGTGGTTTTG:1 - chr3L 6692689 3' + Cr1a 158 1 66.34 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGAAAAGAAAAGATAAATAAAATAAAACCGAAAACCAACCAACTGGGTTTCAATATGTTCTAAATTCACAGCG:1 + chr3R 22580408 3' - 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roo 22 2 59.41 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCACGAGGTCTGTCAATTTCTGGGCTCTA:1 - chr2L 16396585 3' - 412 50 2 73.27 TGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGGGCAACGCACAATTGAGTTCAATT:1 + chr2R 17269767 3' - transib2 50 1 74.26 CGCTTCGCGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAATTTCTGCGCTTTCTTTATTCTGCTCGCTGATTTTGAACTTCGCCGTGCGCCTGATGTAAA:1 - chrX 20067292 3' + Cr1a 132 1 65.35 CCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGACATTATTATCATCTCGCTTGTGCTTGAGTGGGTTTCTTTGCCTACCACAAGGCTCTGGCCACTGTTTCTGCCCC:1 - chr3R 6911841 3' + I-element 5060 1 76.24 CACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTATTAATTTAAGTCAAATGACTTAAAAAATATATATATATGGAATGTGATCACCTGGCAATCAATGAAGATATAAA:1 + chrX 2507336 3' - 1360 453 1 33.66 ATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGCAAACCCAATGAGCAACGCCTGCGTGAAAAATGCAAATCAATTCAATTAAAAAAGAACAAGAGCAACG:1 - chr2R 21856192 3' + invader2 267 1 71.29 ATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGTATTGGTGCGCCGTTGTATCTGTATGAGAACA:1 - chr2L 1644482 3' - 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Cr1a 398 1 69.31 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAAACAAATGCCATTCAAAACTGAAATTT:1 - chr2R 2832928 3' + 1360 3340 1 77.23 GCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTATACAGCTGAGTGAGGTCCGATCGGGTGGTCTGCTGCTGCTCCAACTCGCGCTGCTTAAGCTCACGCGCATAGCGT:1 + chr3L 17970175 3' + invader4 2851 2 53.47 GTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGCCAGAACATAAAACTCTGTAAGCGTTCCGTTGTCCTCCTAGACATATTCGAACTCTGTCAGTTA:1 + chr3R 20742396 3' - Cr1a 4222 1 58.42 GTAGGGCAATCCGCGAACACAACTACACCGGTGTTTCGCTAGCAACAAATTTCTCATGCTTTTACTTTTTTTTACTATTAAAACAAATATTTTTTTTTAAA:1 - chrX 7082216 3' + Gypsy12A_LTR 1966 1 52.48 TAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACCACAACACAGACCAACAAAGACAAACGCACAGATGGGCGAAAAA:1 - chr3R 13357067 3' - transib2 366 1 56.44 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTC:1 + chrX 21945914 3' - F-element 57 1 73.27 TTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATCAAACTTGTTTAAATCTACTTGCATACTTTA:1 + chr3R 27071925 3' + jockey 4957 1 68.32 CGAGATATCAGGAACTATTAAAGTTCAAATATTGAGCACGCCCACTCTAAGGTCCCATAAACCCAGATTGCGTGCTAAATAATACATGGACGAGAAAACAG:1 - chr3L 3758656 3' + INE-1 147 1 54.46 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGTAGTGGGAAACTTCTTGGCACTTTCATGAACTTCTGGCCGGTAATTAAAATCCACCCACAAATACCA:1 + chr3R 25514211 3' + hopper 1413 2 77.23 CTTCGCAGGTTGAAGTGGTACTTATCAGGACCACTAGTCGAGTTGCTTTATTGTAAATTTAAAAATCGAACTACCCTAATCCCTGCACACGCACACTCACA:1 - chr3R 24474880 3' - I-element 2 1 59.41 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGT:1 - chr2R 10315299 3' - Doc 83 1 74.26 AAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAACCGACGGCAGCCAAAAAAGAGCTGATGCAA:1 + chr3L 392373 3' + Bica 369 2 69.31 GGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAAGTGATATGAAAACTTGCTCGTAAATTGCTTAATTGATTAA:1 + chr3R 14283318 3' - Doc 497 1 59.41 TGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTCTGATATTATATAGATGGGATATTAAAAAAGATTTCGGCTTCACTTTAACGGCTTTGAATTGAGAAAAGTTCTAT:1 - chrX 18680737 3' - I-element 196 1 69.31 GCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGAGTCTTTCGGAGAACCTAGTAATTCCAGGAAAACGGTCAGGTACGGAACTTAAGGAGGTGTATACACTGTTAAC:1 + chr3R 19449035 3' + roo 8964 2 75.25 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCGCTGGTCG:1 + chr2R 17346032 3' - 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F-element 4452 1 66.34 CCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCCTTATTTCGGTTAATTACTTTAAATGGCAAACAATATAAGTTTACTTAG:1 - chr2R 17292462 3' - Tabor 29 2 51.49 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTCAAAGTTCCTCAAAGGACCTGCCAAGCATGACGCTGCGGAAATCCCTGCAGG:1 - chr2L 7767115 3' - hobo 25 1 55.45 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAATCGACCGGTAAATAAATACTTATCAATCATGGGTAAAC:1 + chr3L 3776532 3' + roo 9034 1 63.37 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACACCTGCAATTGCATTTCGCTGCCAACTTCTGCTAATT:1 + chr3R 29711032 3' + mdg1 7416 2 64.36 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTCGACTCGAGACGCAGAAGTTTGCGTGACTAGCG:1 - chr3R 10978673 3' + roo 401 1 74.26 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATT:1 + chr3L 3635474 3' - roo 8706 2 69.31 GCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGG:1 + chr2R 5532338 3' - 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flea 4974 2 53.47 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCCATCGTGCAATATCCTTTTTGCAGCAGTCACAATCAAATGGCCGGATAGAGAGATTGCATCTCTTGTG:1 + chrX 12883668 3' - hopper 3 2 77.23 TGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCCCAGTCCGGTAGCCGCACCAATCACTATGAAGGTGCCAACAATTGCCACCGTTGAGGC:1 + chr3L 8464559 3' + Idefix 182 1 56.44 ACAGATATCAGATAACAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAACCCCAAAATAGTATGCCTAGAACTCACTGTTTCATTTTTTGAACACCTA:1 + chr2R 577248 3' + Idefix 104 2 57.43 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCACGAGGTCTGTCAATTTCTGGGCTCTACGCCCCTCGTCC:1 - chr2L 16396573 3' - 412 7091 2 61.39 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTGCAATTAAAAGGCTCAACTGCCAGGCGATCAAAAACGGCAGCC:1 - chr3L 5492296 3' + pogo 2070 1 59.41 AATCTTCTCATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTAAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTATATGGTAAGGGACAAAACGGATCATTAATATTCA:1 - chrX 287703 3' + roo 9069 1 79.21 ACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCAATCAGCGAGACATAAGTACCCGCGTATATTTTCCACTGGGGCAATC:1 - chr2L 2794596 3' + Doc 308 1 58.42 TCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGTAAGGGTTGCGGGGCAATGATTTGTGTGCGTGAGTCGCAAACAAAAAGCCATTACAAACT:1 + chrX 18603926 3' - Doc 414 1 67.33 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACCAAAAAGTAACAAAGCTCGAA:1 - chr3L 16449752 3' - roo 8718 2 79.21 GATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGATCCCAGTTTCGAGTTCGAGAAGCGCCGCAACGTGCCCATCAAATACAGCCGCGAGACCTGGCAGAAGGGTCTG:1 - chr3R 11431150 3' - G2 421 1 76.24 TTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTCTCTTCTTGTTCACTGAATTTATTTGCGTGCGTATTATAAATAATTATGTTCTCCAAAGG:1 + chr2L 19686478 3' - I-element 156 1 65.35 TATTGTTATTATTATTATTATTATGTTCGTATATACTACAGCAACAAATCTAGGCAGGCCAAAATCCAAGAAAGAGGCAGTAAGAGCTCCAGCTCTAGTCC:1 + chr3R 18026990 3' - mdg1 19 2 60.40 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAGGAATATCTTTGCAAGAATGCAGTGCCGCTCTATCAACGAACTCGAC:1 - chr3R 29710973 3' - mdg1 7069 2 53.47 CTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCAAATATTTTGTATTATATACATTTATTTATTTAAATTGCAGTATAAGTTTGTAGTAA:1 + chr2L 18977550 3' + Doc 406 1 56.44 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTTTTGTAAAACTGGGCTATATCAATGCAATATTAATTGCTTACT:2 - chrX 20989380 3' - pogo 27 1 56.44 CAACACGCACACATATACGCGTTCTTTTCTCTTCTTTTTTTCGATGGTTTTTCGCCAGGCTGGGCGCTGCCAAAACGCTGATACGGCGGCCAC:1 + chr3R 17718176 3' + 1360 3217 1 80.65 ACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGACCGTATATGTGCACATCAACAACTGGAGATGCACATTCCATTTCCGTATCCGATTG:1 + chr4 1017798 3' - accord2 7252 1 63.37 TATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGCGAGGAGTGATAAAAGGGACAGATAGTGTCGAAGGGGGTCGGT:1 - chr2L 17918433 3' - accord 6921 2 57.43 GTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACATAAATAATCCCAATTAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + rover 160 2 40.21 ACGAGCCGGGGACGCTGAGGATGAATTCTTCGCCTTTCTTACCGGCATGCCCACCATCGAGTTAGGCGTAAACGATATGTGGCGGCAGGGAAAGGAGG:1 - chrX 22985420 3' - Rt1b 4867 1 70.41 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCG:1 - chr2R 19209466 3' - Doc 58 1 53.68 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGACAAAGAGAGCGGCAGTCCCGTTACGCGCTGTTAACGCAACAGCGGGATGATGTTAAGG:1 - chrX 10629184 3' - P-element 15 1 65.35 ACAGACACACACACATACACAAATACACAGATATACTAGCGAATTTCACATTGCGAATTCTCTGTTCAATTGCGGCAAAAGTTAAAGCGGATATCCTTTGG:1 - chr3R 28939853 3' + Quasimodo 39 2 42.57 ACGTAGTCTTAAGCGCGTCATGTGCGAGTGAGCACACTAAAAGACAGCAGAAGCAATCACACAAGAACACTTGAAGAAATAAAGTACACAATATACGTAGA:1 + chr2L 11825702 3' + Stalker3T 230 1 76.24 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCTACGTATTCGCAGAGAGTGATAAGAAACCG:1 - chr3R 28330865 3' - P-element 46 1 33.66 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTTAACTTGATTATTTTCAGTTTT:1 - chr3L 20197799 3' - 297 6623 2 72.04 ACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTCAGCAGTAATTCATATTATATTGTATATTAGTATAAATCTGAA:1 + chr2R 13805737 3' - Ivk 5345 1 56.00 ACGAATAAGATTACAAATAAACACTGTTCAAAGCATCGTTAGCTGTGAATTGTTTTTAAATTTTCTTTTAGAGTGTTGACTCCCCACCAGCATACTAACGC:1 - chr2L 22326654 3' - Cr1a 4042 1 60.40 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCACACATCCTGTCTTTTCCAAAGAACTTTTACCGCGGTAAACTTCCAACTTCTAACCG:1 - chrX 10436510 3' - hobo 17 1 60.40 CCAACGCCAACGAGCTAGAGCCGTCTAGCTAAAGCTTGCACCCACCAGTACAGGTTCCCTTGCCTTCCATCACGTTACACTGCCAGGCCACCTTTCTTCAG:1 + chrX 21175367 3' + Gypsy12A_LTR 2188 1 60.40 GCTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGAGTGTAAGCAAAAATGTGAAACATATTATGCTACTATATATATATGACATGGACATGGACCTCCTCTATTTCCCGA:1 - chr2R 4122450 3' - rover 188 2 71.29 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTCAATGGGCCGCAACGACAGCTTTACGGCCTTTACCCTTTGACGC:1 - chr3R 23080828 3' - 412 26 2 52.58 CGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCCTCCTCCTCAGCGGGTACCTCCTCAATCATCTCCATTTT:1 - chr2L 8439477 3' - pogo 1707 1 61.39 AATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGTGCGAGTGCACGGCCAGCAGC:1 - chr2L 22208729 3' - gypsy 7040 2 80.20 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCTTACTTCATCAAAGGGAGAGGGTAAGAACATGTTTTAACTGTGGGGACGAGTCACACATAAAAAGAGATTGTCC:2 + chr2R 4546010 3' - hobo 2 1 79.21 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACAACTAATAGGTGCGTAAACGATGTTTTCCACAGCATACTTTGCGGCGACTTTTGGGA:1 - chrX 5275501 3' - jockey 4695 1 57.43 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGATATATACGATTAAAAGTTTAATTCT:1 - chr2L 16032277 3' - 297 6623 2 78.22 TTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTGGAGATAAGAACTCTTGCTAACTCATAGTTTTACTACCTTTTCAGAGCCTACTACTTTTTGTTACGT:1 + chr2R 22243693 3' + Burdock 6209 2 51.49 TGTTGGCCAAACGTTTTTTGTTCCCATGTTCCTGTTTAGACCATTCCTTTTCTCGTCATCCTTTTTTGCCGGCATTTCGGGCATTTGATATC:1 + chr3R 21898708 3' - FB 344 1 77.17 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGAGGATCACTGTGCTGCCCGAGGCGTGTCTTTGTTTTGGCGGCGGTGTCATCCCGGTTTAACCT:1 - chr2L 10636477 3' + hopper 1404 2 68.32 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGATCATCAGGCCAAAGGGTATTTGGGTTATCACATAGCC:1 - chrX 4784519 3' - hobo 37 1 66.34 GGAAATATAAATTATAAATTACAATAGAAGAAAATACGATTCATTTAAGCCTTGAAGGAGTTTAGTTTTTTGTTGCTGCCTTAAATGGCCTGGCCAAAAGT:1 + chr3R 27892636 3' + copia 251 1 74.26 ACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTTCCTCCTGCTTTCGTTCTTTGTATACCCTTTCAATG:1 - chr2L 18231788 3' - 1731 4354 2 68.32 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGACCCGTCTCGAGATCGCTTCCCGCCTGGCCCCCA:1 - chr2L 7970987 3' + blood 7348 2 65.35 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATGACTTTTTATATACGATTAATTCTAAAAAAATAATTAAAAAATGGTT:1 - chr3R 21998386 3' + 412 7518 2 52.48 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATGAATACAAAAACACCTAATGGGTTCAGCTCCAGCTGCGACGCACTTTAGAAGCCATTGAAAGTCGATCTTT:1 + chr2L 7504967 3' + roo 404 1 66.34 AGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCACTCAATGCAATTGCGGTATTTATAATGCAGCAGAACGCGTTCGATGCAGTTCGTTTTGCTTCCAGCGAT:1 - chr2R 15451535 3' + roo 9064 1 71.29 TTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTCCCCAGGCTTCGTGTTTATTAATTAACAACACAAA:1 + chr2R 13576443 3' - hopper 38 1 63.37 GCACGAATCATTTCATAAAATTATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTAGAAAACCTATTGTTAGTTGAGGGAAAGCATCGACTAGATCGAGCAGAATGAA:1 - chr2R 1954158 3' + Doc3-element 4626 1 65.35 CAGTTGTATAGATTTTGTTTGAACACAATATTGGTAAAAGATCACGGAATAACTAAAAGTCCATTGCTCTGCGGACATATCGCGGACCTGCGCTCACTTGT:1 + chr2L 3580792 3' + flea 415 1 78.22 CCGAGCGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCTTCATAATATAGGCAGAAAGCAGTAAATAGATATGTA:1 - chr2L 18247171 3' - 1731 4496 1 68.32 GTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGGATGGAATGGAGAGAGTTGAAATTTGCAAATGCCAATCCAAATAACCCAATAACCGATTCAAGTGCGAGAACAGAA:1 + chrX 11693073 3' - accord 7035 2 60.61 TTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCTAAAAGAAGACAGAGATCGGATCATTTTAATTAAGACAAAATATTTGAAATTCTGCACAA:1 - chr3R 15923828 3' - Quasimodo 6934 2 69.15 ATGACAAAGAATCTTTCAAAGGGAAAGCATAATGGTATTTGAAAAATATGAAAAATTATATGATGTATATGTGTTTTCTATTCCATTTCTACGAAATCTTT:1 - chr2L 3349702 3' + 1731 4219 1 66.34 CACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAAAAACCACAAAAAGACCAGAGTCAAGAATAAAGATCAAGAAGCTCCACATGGCGAGGCA:1 - chr2L 647129 3' + Stalker4 7031 4 64.36 CAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACAACTTTACTAGCTCATAGTTTTTATTATGACCA:1 + chr3L 3271963 3' - P-element 77 1 37.62 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTCAAAGTTCCTCAAAGGACCTGCCAAGC:1 - chr2L 7767140 3' - hobo 50 1 71.29 ATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACAAGTAACGGGTATGAAGAATGGAGAAGGAAAAATAAGGGACGCAAATAGAGCGAGGGAAATGT:1 + chrX 5256764 3' - INE-1 10 1 77.23 ACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTGTCATCATTCATAAGGAGTTTATGTTTTTGGAGTAGTTGATTTGTAATTGTAAAAAAACCCTGTGTTTCCTTTAGCAA:1 + chr2L 8463299 3' - Juan 1 1 65.35 CAAGGTATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACC:1 - chrX 19820626 3' - Rt1b 4970 1 61.39 AAATAAAATAAAAAAAACAAAAAATCCAACGAAGATATGCATGCGAGGCAGTCGCATGTGTATGGTTAAATTTGAAGATGATATTTTATATTTT:1 - chr2L 4052465 3' + F-element 4687 4 63.83 TCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGGAAAATTGAAAAGGTAAAAAGCAAAACATACCTCTCGCGTGTAACTGTAATTGTTTTAGTAATGTATTTGAAAT:1 + chr4 965540 3' - Tc1-2 168 1 79.21 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATTTTTAAAATGACACTTTTATTGTCAAGCTACGCTGAGTTTAGGGAATTTTT:1 + chr3L 5490152 3' - 297 18 2 60.61 AGATCGTATTACTGGAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTTTTGCTTCGTATTACTGTTAACTTTGTGAATTTCGACGGTTTAGATAC:1 - chr3R 11395033 3' - Stalker 142 4 51.49 ATCAAAAATGCTAAGAAAAATCACAAAAGATCTATAGCAATAACTAAGAACACCATGAGCGATTAAAGAGAAAGAGTTTTTGGGCCCAGGCCGAAATAAGA:1 - chr3L 3714989 3' + Porto1 4337 1 75.25 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAAAAAAAAATGAAATCGCGGTGGCAATGTCAAGCGGCAGCAGCAAGAAAGTGTTGC:1 + chr2R 17348624 3' - jockey 28 1 54.46 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATCGATGAATCCACCCTAACACAACATCAATGTGTTCCAAAATCCACCCCC:1 - chr3R 17846866 3' + roo 9046 1 51.49 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGAAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGGTAACACGCGAATTTAAAAATATT:1 + chr2R 4995017 3' - F-element 71 1 96.04 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAATATAGGCTTCGTCTCCTTCTTTACATTCGTTATCCAAAAGCAGATTCGGTAGTCGTCGCA:1 + chr2L 21266658 3' - FB 16 1 64.36 TACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTG:2 - chr3L 17215740 3' - Ivk 52 1 72.28 GCGCTGGTGTGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGATGGTCCTAAGTAAATGTGTGTCGATAAGGAAAGAGGGTTCTAAGATGTTCAGGGATATAACTTTTTG:2 - chr3L 22060346 3' - opus 138 4 68.32 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCCACCCCCAGCTATTTTATTTTCGCGCGTTTCCATGCAGCCTATTTTGGAGCGGCTC:1 - chr2L 12908345 3' + hobo 2930 1 64.84 TAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATACA:2 + chr3L 5267271 3' + Juan 4180 1 60.40 AACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGTTCACTTCTTCGCGTTGGAAACTTTTGACTGAATCATTATACCCCCAGTAAGAGCAGGCAAAAGCTTAG:1 - chrX 20381382 3' + INE-1 575 1 77.23 CCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCATTTTCAGCTACCTGACGCTGATGCTTCATCACAAGGTGGCAGCATTT:1 - chr2R 18010888 3' - HMS-Beagle 6995 2 52.48 TGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGATGATGATCGTCGCTTAAACTGTGATATAATTTTTATTTCTAGGGCTAGGCAGTAGAAACAATATTTATGTTGC:1 + chr3L 19139961 3' + micropia 158 2 74.26 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTCTTTTTGGTTTTTTGCGGCG:1 + chr3L 10565331 3' + pogo 2051 1 79.21 CAAAACAAAAAAAACAAACAAGTGAAACTAGAAAGCTTAAAAATAATAATAACATTGAATAACTAAACCAACCACGAGCTAAAAAAAAAAATTCAGAAAAA:1 + chr3L 14702480 3' + mdg3 5082 1 59.41 GGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCTCACAAGCAGTATGTGTTTTTTTTTTGTCGTTTTCGGACATTTTCATAATGAATAATATTTTGTT:1 - chrX 12881412 3' - Doc2-element 448 1 71.29 GTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATTGCTGGTAATGGCCATCTGTTCTTGGCCTATGGCTCATTGATTTCTTTGTTAGTTTGCCTCATTGTGG:1 - chr2L 11064992 3' - Quasimodo 7046 2 73.27 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGCTGACAGCCCGGGTTTTATCTTGACCGGCCCCAAAAAGTAGGCAATACA:1 + chr2R 21415201 3' - jockey 35 1 49.50 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTCAGTCTTAAATGCCGCCACATGACACGAATGCGTTAAGTCGCTTGGTGTTAAAAGGTTCTCAGGC:1 + chr3R 23243955 3' - jockey 17 1 61.39 TTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTATTATCAGGTTGCCGTCTCTTGGCTGTTTGCTTTGTGTCCTCTCTGCTTTTCAATTTTAATTTGTAAATGTG:1 + chr3L 16462835 3' - I-element 398 1 55.45 TCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTTCCGCGTCCTGGCCCTCGACTCCTTGGCCCTTGATGGTCGGGCCA:1 + chr2L 10900352 3' - jockey 4772 1 55.45 TTGGCCCTGCGCGTGTTAACTTATACAAGACAAAACAAAAGCCGATAATATAAAAATGAAAAAATTAACAATAAAAATAGAATCAAATTTGTGGGAAAGAT:1 + chrX 4694493 3' - gypsy4 6570 1 66.34 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTGATATTTTTGACGAAATTAACATTATAGATCCAATC:1 + chr2R 12437187 3' - pogo 38 1 66.34 TATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCTGTGTATCCGCCAACTCAACTCTCCATTTAGCTGGAAATTT:1 + chr2R 11553710 3' + 1360 3276 1 60.40 TCATTTACACTAGCTGAGTAACGGGTAAAACACGACTATAGCATTCATTTTTTTTTTTAATGTGTTCTATATGTACTATGCTTTCAGGAAGTCTGGAATC:1 + chr3L 23580253 3' + INE-1 534 1 57.00 TTGTATTAGTTAAAGACCGCCCTAGGATTTTTTTCTGGCCTTAATGTTGAATCTTTCCTCGAACAAATGGCCACACTGCGTATGCGTAATGCTTTAGACCA:1 - chr2R 13057608 3' - Doc2-element 4658 1 70.30 TTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGTTTTCCAAACACGAATATCACGTGGACTACGAATTAAAAGCTTTGCCGCTCCACTAAGTAATTGTT:1 + chr3R 2998952 3' - 1360 3040 1 37.62 GTGAAAATAGTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTGGGATAATTTATTGG:1 + chr3L 21912362 3' + Bari1 1703 1 75.25 ATATTCATCGAACAACAGATCAATGCGAACTAATTAAATGTGATGCCTAAATACTTTGGCCTCCACCTCTACTTTACAGGCTAATCATTTCAATCTGTCCA:1 + chr2R 18154922 3' - Tc1-2 245 1 54.46 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAGGCTCTTTGAATTTTCTGTAAATAAAATAAATTAAATGGTGGTTCTGA:1 + chr2R 17292536 3' + Tabor 455 2 52.48 CCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAATTGTTAATTATTTTCATTGTACTT:1 - chr3R 15710403 3' - jockey 222 1 76.24 TGATAGTCGTGAAACACGACTATAGCATTCTCTCTTGTGTAGTGGCGACTGAGTCAAGTCCTTCGTTTCCACCTTTTTGCAATAGCGTTCGGTTTTGGCTT:1 + chr3R 11269836 3' + INE-1 563 1 59.41 TATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAACCCAGATACCGCAGGACTTCTACG:1 + chr3R 13056073 3' + jockey 4856 1 76.24 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGT:1 + chr3L 23871314 3' - Doc 41 1 58.42 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGACAACCTTGCAGTTCTCTGGCCAGAACAATGAAAATGCACTGCCGAAGGGAAAAAATTGGTGGCA:1 + chr2L 19629686 3' - hobo 23 1 54.44 TACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATTGTCCAGCAATGTCTGTACTCCATTAGGTGGATTAACCGTATTTTGAACAC:1 + chr3L 10036547 3' + 412 235 2 50.50 ACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGTTCAAATTCGCTTACATTTCATTGGCATTATGATTGGAAGCTGTCGTCGTTTG:1 - chrX 21256875 3' + hopper 222 1 65.35 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAAACTGCCTTTCGTTGCTGGACATTTTTAATAATACATAAT:1 - chr3L 10554768 3' + roo 9039 1 56.44 CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGCTCTAATTTCGCCTGAAGCTGACCACGTGATGG:1 + chr2L 6596807 3' - Tabor 6882 2 64.36 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGCGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTGTTTAGCCTTATCTGAATGTT:1 - chr2R 7881979 3' + 412 439 2 76.24 CATCGAGGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCCACTGAATAGAAT:1 + chr3R 14909695 3' + Rt1b 4974 1 62.38 ATCACAGGCACTATAAAAGCTAGAACGTTGTGACTAGGCAGGCAGATTCCAGATTGGTTGGGTATCTAATGGTCAGGAAACTCGAAGAGAACACGATGTGG:1 + chr2L 21717964 3' + INE-1 151 1 56.44 GACGTAATATATCTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTTTGTTCCTATTTTTTGCAATTTTTTTTTATGTGTTTTGTTTCGTATTTTAATTCAACAGA:1 - chr3R 21975211 3' - Stalker4 6916 2 47.52 CAAAGAACGATATATTGACATAAATACTTAGACTGCCCAAAAAAAAAACGAAGATACAAACGTTAATTGTGCCTTAATTATATGAAGTTGGCAAACAATAA:1 - chrX 5716798 3' - transib2 47 1 62.38 GAGGGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCATTACATTAGCGTTAAATGGTGTTAACTTACACACACATACACACACTTCGGCCAGCTAAGAAACACGTAGC:1 + chrX 12276860 3' + hobo 2937 1 77.23 GTTGATCAAATAATAAAAACATCAAATTAAAAAAGGATACAACGTGCACTTTACACTTTTAAGCGCAGTAAAATACTGACAATTACCATGCATGCTTGTTT:1 - chr3L 22124148 3' + jockey 4983 1 80.20 ATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTG:1 - chr2L 15019895 3' + BS 5056 1 61.00 AGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGTACCGATTCCACTTTGTACGTAACTTTGTCGTATCGGTTTCACCCGAAAACACCTCAAGAGTTCCC:1 - chr3L 2853532 3' - copia 191 2 71.29 ATATGTATATATGTACATATATACATATCGAGGTAGGCACTATGTTAGTGCATAATGATTTCTCAATATCAATGTTAATGTCTTTTATATAGATGTAAGTG:1 + chr3L 18228110 3' + G3 4507 1 60.40 AAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAAT:1 + chr2L 21570228 3' - Dm88 4414 2 79.21 CTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAGTTTTCGTACCAATAGCACTTAGGACAAGTGACCAACTCAGATCTATAAAC:1 - chr2R 4917521 3' + S-element 349 1 50.50 AAAGTAAAAATTAAAAAAAAAAAGGGGGGGTGGTGGTGGCAAGGGAAGGAGCACCAGCAGAAGCTGCTCGAAAAGAAGGACCAGCTGAAGATTCCCCC:1 - chr3L 17144438 3' + Doc 4692 2 75.51 TCTGATCGGACTCGCTTAATCATATTAATGATAAGGCCCAGCTTTATACTCTTGAGTATAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - Rt1b 4777 1 43.00 TCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGCTGGGGAAGGCGAGGCGAATGGAAAATAGGAGAAATAGGAAAAGGGC:1 - chr3R 31472130 3' - Doc2-element 431 1 55.45 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCCAATGCAGGGGCAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + 297 6958 2 45.54 TCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTTAATTAATAACAAGCCAGTCGAAGAAGCCCCACAAAATTCCAGTCACAATTCATTGGTGCGTTTT:1 + chr3R 13654408 3' - P-element 170 1 73.27 GGCTGTCAAACGACAAGTGCCTAATCAGGCATCGATCTGGCACATCATCCCATGCCCATGTACTCAACGAGCCCGATGTTTGGCACGAACAGCACCATCAC:1 + chr2R 20475959 3' - Circe 285 1 70.30 GTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACATAGTAATCTGCGACGCTCCTCTCGAG:1 + chr2L 17124516 3' + Cr1a 4116 1 77.23 GCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAGCCATTACTGCGCTATATATCGACTATGTGTACGATTTCACAACGATCTGCTGCGAGTTT:1 - chr3L 3326577 3' - P-element 15 1 62.38 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCCAAGTGAAAAGTCGCTGGGAAAAATGGGATGCAAAAATAACTGAGAGTCAGGAGAGAACGCGACCACAAGAG:1 - chr3L 22741297 3' + P-element 2883 2 75.25 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGATGCACAAATGCACAAATGCACAAATGC:1 + chrX 13565497 3' - jockey 57 1 75.25 CGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAAT:1 - chr2L 3988550 3' - I-element 64 1 76.24 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAGTTTGCCATTCTAGTGCTCTTTTCGCTGTGTTT:1 - chr3R 14832504 3' - hobo 43 1 67.33 ATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACACACACACACCCGTCGAGGTAATTACGCGGAAATGG:1 - chr3L 5281383 3' + accord 7057 2 64.36 TGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCATCGCGCATCGAGTCAGGGAAATCAATAAAATAACATTTGATCGATTATCATTTTTTTTTACATCTGGATCG:1 + chrX 22755502 3' - Ivk 326 1 67.33 ATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCATTCAAACACATATACTCGTATAGTTTATAGTCTGGCGCTATCAAC:1 + chrX 14525361 3' + Quasimodo 9 2 61.00 ACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCGAACAGCTTTTTGGCCAAGCAAACACACAGC:1 + chrX 20867677 3' + Tirant 24 2 69.31 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTAAGATAAGCGTGCAAAACGTGATCCAGATTTAGGAGATTGTTTTGTAGTTTTCTAG:2 - chrX 14521631 3' + roo 394 1 58.42 GAAAGAGGACGTTGCAGACTGTGCAAAACTGCAACACCGATGACCAAATGCCTTACATGCAAAGTCCATCTGTGCTGCAATGGATGCCGCCACCGTTCTCA:1 + chr3L 22705578 3' + looper1 1539 1 80.20 CTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATA:1 + chr2L 15019929 3' - BS 4847 1 72.28 CCGTTGAGTCCTACATTTCAAGCGGATGTTCGGTTATTAAAACACACCTCAGTTTCTAGAAATTGCTATTAATAATCACTAACACTGGTATCAGTTTACCG:1 + chr2L 22007212 3' + mariner2 165 1 58.42 GTGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTGTAGTCTTTGATTATGTTGGAAAACCGCAGTTCAAGTTGAACCGCCGACCTTTCCTCATTCGCAG:1 + chr3L 3729298 3' + 1360 3359 1 73.27 GTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTG:1 - chr2L 15019902 3' + BS 5064 1 62.35 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATATTTTTTATGCTTCGGCCAAGGCTCACATTTGCTT:1 + chr3L 13264531 3' - Burdock 6168 2 64.36 TGCCTATGTACTAAACAAAAACCTCCGCTCTCTCCTATCCTTGTCGAGCTCACCGGAACTGCCAGTAGAAGTTGCAGTAACAGTTAATCAATTACACGAAA:1 - chr3R 17886773 3' - Rt1a 4966 1 65.35 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTGTTTCGCACCCTTTAAGACCAGGAATTGGGTTACTTGTCCCCCTGGGATCTA:1 - chr2R 10345598 3' - roo 8688 2 55.45 AAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACATGATTAAAATTACGAAATAATTTGATCTTTTTGGAACACATAA:1 - chrX 6156166 3' - 3S18 34 2 55.45 GTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGCGGACAATAATTAAATGGTTTGGTTTGGAAAGGATGTGAATTACGAAGTGTGTACTAGTCATG:1 - chr2L 22748788 3' - G6 2019 1 53.47 AAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTGTCTTTATGTACATACCTGTCTGTGTGAACCATTTGTATGACTTATCGTTTTGGTAAGATCTTTTATTAAT:1 + chr3R 3821363 3' - I-element 154 1 74.26 GCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACATATAATCGGAGTAGACAAGTGACAGGAACATTGAAATAAATGGTAATGGCCAGCGACAGCAACCGGAACC:1 - chr2L 17733047 3' - Cr1a 4241 1 70.30 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATGTTATAAGCATTTAATACTTTTTATCTCAAGATTTATATATTTCTACTTTC:1 + chr3R 28804474 3' + roo 9048 2 61.39 AACTCATTAAGTGTACGCACAAGTTTATAGTGTGAACACCCAGTGATCATATCAAAAACAAAACAAACAACCATACATACATTTAATAGTAGAAATTGATC:1 - chr2R 4738865 3' + rooA 7584 2 79.21 CCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTATTTTATTTATTTTTTTCTTTTTATTATTATTTTTACTCAG:1 - chr2L 5450713 3' - X-element 51 1 62.38 GTATGCATTGTTCCGCTGCGAAGAGCAGGAGCAGAAGAAGATAAAGCCCAAACTTGAAATTAAGAGAAAACAGAGAAGGTATATAGAAGTATAGAGAAGTT:1 - chr2R 5316802 3' - Doc3-element 280 1 59.41 GTGTGTGTGTGTGTGTTTTTGTGAAGGTATAGATTTATCAGTGTTAGTGTGGGTGTTCATGCAACGCGAGTGGCAAGCCAGCGGCTTTTTCATCCTCTTCA:1 + chr3R 14611186 3' - gypsy3 420 2 78.22 TACTATATATACATACATATATATATATGTAGCACATACCATTGCAGACATATCCTAGCGTAGTTTAGCTCTTTTGCCCACCTCCCCCCACACTCCCCCAA:1 - chrX 17933786 3' - 1731 4411 1 72.28 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACAACTAATAGGTGCGTAAACGATGTTTTCCACAGCATACTTTGCGGCG:1 - chrX 5275511 3' - jockey 4705 1 56.44 AATATCGATATCCCAGAAAAATGATGAAATTTCTGCTTTGCATTCTATCTATTTGAGTAACGGAAATTAAATTAAAGTGCTAATAGGCTAATACATACATT:1 + chr3L 22982450 3' + INE-1 501 1 60.40 AAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTT:1 + chr3R 4604452 3' - gypsy 7137 2 57.43 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATATTGCTCTTTAGCTATGAGACAATTTCATTGTGA:1 + chr3L 12913656 3' + 1360 3347 1 71.29 CTCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCCTACTACGAGTATAGTTTTGAGATAACAATACTCCCACTTTT:1 - chrX 1252784 3' + hobo 2906 1 55.00 TTTTTTTTTGTTTTGAACATCCTTCACACATCAAAATTTTACGCCGAGTGGGCGGCTTTAATGGGTTAATTATTGTTCTACTTTTTAAGAAATATTATGT:1 - chr2R 19338693 3' + Tc3 94 1 64.00 TAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATAAGTGAAAAAAAATATAATTTTTAAGTTTTATATACAGCAGGATTAACAGTCACTTCTCTAAGCT:1 + chr3L 4579284 3' - rover 5 2 59.41 AAGCACTCAACAATAATTGCCTTATTAATTAAGTCAAATGACTTAAGGAAGTACAATAGAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATAAATTTCATAAAATT:1 - chr3R 7255528 3' - 1360 450 1 55.45 TGTGATTATTCTGAGTATTTTCGATTGCGTTCGCTGAACTAGCTGTAACTGGGACCTCGCCTCCTTTCAAACATTTTTTTTTTGCCCTAGCTTCCTAT:1 - chr3R 17355982 3' - Porto1 4340 1 55.10 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTC:1 + chr2L 15833065 3' - hobo 41 1 66.34 GAATTGCATCATGTTCAAGCCACAAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTCATGTCCGATATTAAAATTAAAGCTGGAAATGTATTTGAATTTG:1 + chr4 760343 3' + Ivk 4984 1 59.41 AGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATGGATTGGAGTTGGGGTAAACTAAACAACAAAATGCA:1 + chr3R 20398712 3' - I-element 4903 1 69.31 CCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGTGCGATATACTCGTCCGCCCGCGGGACACGGA:1 - chr3R 20486356 3' + accord 492 2 68.32 TAAAGATAAAGGGTGACTTGGTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACAATGTATTTACTATATTCAATCTTGCAAAGTGTTGCATATTTAATGTT:1 - chr3L 26377763 3' - 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F-element 357 1 81.19 AGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAAACGAAACGTCACAAACAAATAAATCTAAGAAAATAGTACAATCA:1 - chr3L 15635072 3' - Max-element 8268 2 58.42 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTC:1 - chr2L 11805019 3' + P-element 2851 1 41.58 GTAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGAAAAAAAAAATTATTTTTACCAAATCATCTAAAAAAGGTAATGGGTCGTTAGGTTGGGTTGTCAGCTGCAAAAAACA:1 - chrX 6897327 3' - Ivk 1 1 73.27 ACCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAAGTAATTTTCTTTGATTATATGCACAATGCCGAGTACCCTGTCCTTATGCC:1 + chr2L 13314135 3' + jockey 4964 1 51.49 GACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGGATGCGCCAAATTAAGA:1 + chrX 10626562 3' - P-element 482 1 21.00 CTTGATTTGATTTTATTTTATTTTTATTTTTATTTCGCTGTTGCCACTTGCAAACATTTCACAGTCTGCTGCCTGTTTAATGCCGTAATCCACTTTAAAGC:1 + chrX 6441171 3' + transib1 1891 1 77.23 TTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTG:1 + chr3R 14049426 3' + transib2 2802 1 55.45 GCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTATTGCCCCCATATCGGTTACTACCATTCCCATTATTTCCA:1 - 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roo 13 2 67.33 GAACAAGGCACCCTTTATCTTTGCTTACAAGTTACAAGTGCCGCTGACAAGTGTCAGCGAAGTCAATGTACTTTTTCATAACTTCTAACTCCTTACCCGAT:1 + chrX 19820357 3' + 3S18 30 2 57.43 AAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTCCTGGACGCCTCCGCTCTGTGTGCGATGAACATCAAGAATTTCGATCACATCCGTCAGA:1 + chr2L 4890510 3' + F-element 495 1 63.37 ATTGTTATTATTATTATTATTGTTGTTATTGTTGTTGTCACACTAGTGTCACTTGTTGAGCGAGCACATGCCAAACATGGATATGCCGAGTCCTAACCCC:1 + chr2R 12999235 3' - mdg1 7056 7 67.00 CATATACATACATATGTACATATAGTATGTACATGCATGTACATAGATTCTCCCAGATACGGCAGTCGCGCACACACCCATGCGCGCACGCACACAGACGG:1 + chrX 19713097 3' - G3 4508 1 42.57 AGATTCGGAAATCTATAAGGTATAACCAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACCAAATATTATCAACAAAAAAAAAAGGGAAA:1 + chr3R 30808942 3' + transib2 2561 1 65.91 GCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCCATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTG:1 - chr3R 178128 3' - BS 48 1 73.27 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACAAGAAATGGGCGGTGGTTGTTGAGGCAGTGCCTCTAACATCAAAAGCAG:1 + chr3R 15714211 3' - jockey 35 1 53.47 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATTATAATCTCATTGAAAGCAAAAGTAACTCCAAGTACTCAATTGATTTTT:1 + chr2L 17168513 3' - flea 25 2 54.46 TTATTGTTATGGTTATTATTATTTAAATTCAGTCGGGAAGCCGGTAATAATGCTCGACAGGCTCACAAAGGAATTTAAATAATAATAACCATAACAATAAG:1 + chr3L 3012297 3' - mdg1 26 2 71.29 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTTTGCTCATGCATTGTAAATTTGACACAATATGCT:1 + chr3R 4571527 3' + Burdock 218 2 61.39 GGACTTTTGTCCAGGAGAATGTACGAAGGAGGAAGACAATTTAGTCACACTGGGACCCTAGTTAAAACTATTTAACAAAGTATACATTTATTAGTATAAAT:1 - chr3L 27358588 3' + Tc3 1262 1 67.33 TGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGCGTCACACAAGCGTCAGTTCCGCATGAAATGTGTACTATGTGCAAATATGTGAGCGG:1 - chr3R 27435021 3' - jockey 4661 1 58.42 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATATACAAAATAGCTTAAAACCTACGCAGCTGAAAAATGCCACCGAAATATGAATGGAAAATCCC:1 + chr2L 10073667 3' - pogo 8 1 69.31 ACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATACCCAGTTTATTTTTTTCTGTCTTGCTTCAAGAACTTTTTCGGACGCGTGTCTTTATTTT:1 - chrX 8859363 3' + invader1 3944 2 64.36 CACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGAAACCCGCCGGCAACTGAATCCAC:1 + chrX 20540789 3' + Idefix 179 2 76.24 GTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGGAACAGCAGCGGAGGCAGATCAGCAAAAGGCCGAGAGTCATTCACATTACAAAGAA:1 + chr2L 18231856 3' + 1731 4605 2 55.45 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAGAGAAAAACAGGCACGAGTCCCTCATTCTCCGCGTTGCCTTCTTCTATAGTATATGTATATAATACTTCTTTTTTTC:1 + chr3R 28373853 3' - jockey 4759 1 75.25 TCTGTAACCCATAGAGGCCCCTCCTCAATCTAACTTTCATTCATTTCACCAGTAACTTTGCTCATTTCACACTTTCTGAGCCCCATGTATTTCCTACAACT:1 - chr2R 15781923 3' + McClintock 227 2 65.35 CTGCAGCCTCTTCGCCAAAATAACCGACTGGAAGAACTGTGTTTTCGGAAGCCAGGGAAGCTGGTCAAAAATAAGTTCCCCGGTCTTATGGCACAGTTGTT:2 + chr3R 4593998 3' + hopper2 308 1 55.45 AGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 8268 2 52.00 AACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACAGAAAAAAATGTTTGTATAG:1 + chr3L 23686666 3' - F-element 4625 1 82.18 AGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGTGCGATATACTCGTCCGCCCGCGGGACACGGACCAAACACGCATTTGCCATGCC:1 - chr3R 20486334 3' + accord 7360 2 55.45 CCGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCAAACACCTTGATGTATTTGCCTTGTTATAGCTTGTTTGTAGTTTGC:1 - chrX 12276762 3' - hobo 30 1 53.47 AAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCGTGGT:1 + chr3R 2533954 3' + gypsy8 4902 4 54.46 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTCTTTTTGGTTTTTTGCGGCGCCCATCAATCACC:1 + chr3L 10565344 3' + pogo 2064 1 66.34 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCATCGGCGAGTCCTTGACATTTTGCAATATAAACAGC:1 + chr3L 9174763 3' + 412 7526 2 58.42 ATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCAATAGAGTGGTTTAATTTAGAAAGTATTGGTCGTTCGGTTAGACAGAGTTGCACAGCAGTGTGTTTGT:1 + chr2L 21925935 3' - roo 8654 1 35.64 GGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCCGGGGGAAGGTTGTTTCGGTTTTTGTTCTTTTTGGAGAAG:1 - chr2L 20836577 3' + Quasimodo 6950 2 60.40 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACAAAATGGAAATGGATAAGAGTTTTCG:1 + chr2R 5154785 3' - F-element 62 1 81.19 GCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTAAATTGGGCGCGTGCAGCTATTGTATTATCAAGGAGGCCGCTTTAGCTTCAACAA:1 + chr2R 14204759 3' - opus 2 2 71.76 TGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCG:1 + chr3L 25232908 3' - GATE 35 2 50.50 CAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCAGCTAGATACTCTCTATACTTTTTCAATTGTTTGTTCCTT:1 - chrX 21247951 3' + Quasimodo 340 2 60.40 AATCATAAGTTGTAATTTTAGCAATTGCCCATCCACATTGACACTGATTTACATACCTTTTTTCTCCCTGTGCACCCACCAGCTGCAACAATGGAATCCGC:1 - chr2L 3185060 3' - Juan 386 1 74.26 TTGAACACACTACAACATGGATATAAACACATACTGAACAAATTTGAACAAATATTTGCGTGTTGCGTAAGTTGAACACCCGAACCCACCGTCTAAGCTCC:1 + chr2L 2047653 3' + hopper 963 2 52.48 CACAGCATGTTTGCGTGGACGCTGCGAGTCTTTGTTAGGTATAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGATTTCACTGCCGTCGAAAGGAAAGTGAT:2 - chr2R 8803304 3' + Gypsy6A_LTR 105 1 75.25 TTGGTGGGTTCAGATTGTTGGTTGGGCGCCAGTTATGTATTTCTCTCCTGTGTTCAAAGTTATGCAAGTTATGTATTTCTCTCCTGTGTCCAGAGTTATGT:1 - chr3L 25773235 3' - gypsy 491 1 68.32 CACAGGCACTATAAAAGCTAGAACGTTGTGACTAGGCAGGCAGATTCCAGATTGGTTGGGCATGGATTTAAAAGGGGGTACATTTTGTAATGTTAATAAAT:1 + chr2L 13049230 3' + INE-1 153 1 54.46 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCAACAATACAG:1 - chr3R 20396545 3' - I-element 44 1 64.36 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAAAAGCAAGTACTTCTAGCATA:1 - chrX 21018727 3' + pogo 2033 1 61.39 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGACAGCGCTCAGTTGCTGGTCTTGTTTGGC:2 + chrX 10629280 3' + P-element 2868 1 60.40 GCACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACAAGCATTGATGCCTATGGAGCCTGCGTTTATGGGGTTTCTAAAGGAAATCAAGGGTTTAGCCATTTGCTT:1 + chr3R 2653550 3' + Stalker2 395 2 70.30 TCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACTGCGACCTAATAAAATTCCGTTTTACAAATTGAGTT:2 - chr2L 14074922 3' - jockey 224 1 72.28 TGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGGCCCCACATTCACATTGCCAAACACATCCGACATG:1 - chr3L 5490071 3' - 297 33 2 64.36 CATTAGTTCGACTCACAAATATAACAACTATTTTTCTATATAACCTCGGCATGGCAAATCTATCTTTCTTTCTTGTTGGTAAGTCTTATTTGCATCACAAA:1 + chrX 22577184 3' + 297 6959 2 38.61 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACTGCTTATTGTACCATGCTAACAGACAATTAGGTTCTCCGTTAGTTTATGTGTACATAAGAG:1 + chr2R 5311510 3' + 1360 3374 1 43.56 GAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAA:1 - chr2R 3293767 3' + 1731 4571 2 78.22 ACTTTGATTTAGTGTTTTGTGTAATGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTCACGTAACTTTTACTTTTGCCTTAG:1 + chr2R 16196419 3' + S-element 1486 1 75.25 ATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCAATCTCAACCATTTGTGAGTGCCTTAATTTATGCAGCCGACAAGAGTGAATATTAAAAGTTTTCAATGCGC:1 - chr2R 21733642 3' - hopper 431 1 76.24 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTGTTTCGCACCCTTTAAGACCAGGAATTGG:1 - chr2R 10345621 3' - roo 47 2 72.28 CAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACACAAGCCGCCTAAAATAAAAAACCGTTTGAC:1 + chr2R 4996108 3' + F-element 334 1 74.26 AAGAGACATCCACTTAACGTATGAAACGTGCACTGAATTTAAGTGCTACCTTATACTCGACGGAGAATAATCAAAATTAAATATATTTTGTAATATGCTTT:1 - chr3L 22234781 3' - P-element 2853 1 63.37 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGCACAGAAATATCGCCTCGACTATATAATTTAGGGCAGCCCGAAAATATTATTCAGTAACCAAATTTCGTGGTTG:1 + chr2R 10345706 3' + roo 408 1 79.21 TAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCATTTAATTGTCAATTTTGTCGGTTTTGTTCGATTTAT:1 - chrX 20939531 3' + 297 426 1 64.36 AGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATAGGAAGAACATTCAGGTATTATATTTCGTGCGGCCGTAAGTTATTCTGCGGGGTGTTATTGTG:1 + chr2R 6735112 3' - Burdock 6210 2 65.35 AAAAAAAACAGGAAAATAAAACACCGAAACGACCGACAAGCAGCAGCCACGAAACACCTATCCCGATCAGCCACGCGTGAGGTGGAAACCGAAAATATTGC:1 - chr3R 9339829 3' + Doc2-element 252 1 75.25 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGACTAGAATG:1 - chr2L 13598180 3' - pogo 24 1 55.45 GAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCA:1 - chrX 15746287 3' - jockey2 3222 1 56.44 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCATTCTAAATTTGGCTTAGTGTGTGGCATTA:1 + chrX 3465619 3' - hopper 46 1 92.08 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATTGAAATGTAATGTCAGTCCGTAACTTATGCAAATGAATTGGCAATTCTGTTAAATTTACCAGTCCGATTGATTT:2 + chr3R 14906923 3' + hobo 2937 1 76.24 CTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACTATAAAAACGTCTTCACACGACGACGACGACGACGGCCATGTTTCCACCCACACATGCACGAAAGCTTCCCA:1 - chr2L 4305971 3' - F-element 54 1 54.46 ACTGCAGGCGTCGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTAGCATGTTGTTTTTCCACTCCCCGTTTAAACATTTCACTTGATCCCTCTTT:1 + chr2R 10348004 3' - Ivk 5143 1 56.44 CTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTA:1 - chr3L 15452877 3' - accord 43 2 66.34 CTCCAATTATTTTTATTCAGCAAATACGTGGTCAGTGCCTCGGGGTCTTGGAAACGGAATGGCAATAGGACAGACATCCTGTGGGGAAGATACCCGTTTCC:1 + chr2R 20063561 3' - Tc1 237 1 64.36 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACCGAAACGCCAACG:1 - chr2L 9437456 3' - P-element 59 1 21.78 TGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAACGCTGCATGCGTCGTCCCTGGAAAATGAGTCCTCGCGAGGGTCCTCGCAGCCAT:1 - chr3L 18349108 3' + micropia 5275 2 56.44 TCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAATAATACAAAAGAATCCTTTTCAATCCATAACACT:1 - chr3L 5075878 3' - 1360 437 1 69.31 TGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAAAGTGACCACAATAGCAGCCAGCAACTCCACAACGAGCGTGGATGCCAGCAACACACCAACAGCAGCAATAG:1 + chr2R 8078073 3' + Quasimodo 256 2 77.23 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCA:1 + chr3L 9174728 3' + 412 7504 2 79.55 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGACCAAAAAATCATGTGCCAAAAAACCGGGTAACATCATTTAGCGAAAGGCCAGCAGTTGCTGCCGTGCAG:1 - chr2R 15379115 3' - 1360 73 1 52.48 TGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTTTGATTAGGATTTATGGCGATTTATGGCAGGCCTGTGGATGAAAGGGGTGACTGCGGGTGGACTCC:1 - chrX 13942730 3' - Doc 354 1 71.29 ATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGACCCCTAGTTGTTTATCGATTTAAAGTATTGAATACACTAAAGAACTTTGCTCAG:1 + chr3L 16480631 3' - F-element 4432 1 59.41 CGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGAC:1 - chr3L 25232765 3' + accord2 175 2 51.49 CTTACTTAGAGTGTAAGTCATGTTTGAGATTAGCCGATCGGTTGTGCTGGAGGAATGGATCAAAGGAGATCGAAATGACAAGTATTGTCTACCGTTCTAAT:1 - chr3L 1851197 3' - Q-element 712 1 65.35 TTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACTCACCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGTGAACCCT:2 + chr3R 29288785 3' - BS 5082 1 62.38 TCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCACTGTACTCTGTTAACCCCCTCCCTGG:1 + chrX 17714021 3' + Doc 408 1 78.00 TTTATTCGGCTATTTATTATTCGAAACTGTATATTGAACCACAATTACAACCATTATCGTTATGATAAACAAGCATTTGTATATTGTACTGCCTGCCTAT:1 - chr3R 9550016 3' + diver2 330 2 76.00 GATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTGGTTTTGGTGCATTTTCATAACTCCCACCCATCATCGGCCTATATAGACATCGGGATCCAGGCATCGCCTT:1 + chrX 5628864 3' - Porto1 214 1 75.25 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTCAGTCTTAAATGCCGCCACATGACACGAATGCGTTAAGTCGCTTGGGGTTAAAAGGTTCTC:1 + chr3R 23243951 3' - 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Stalker 10 4 69.31 AAGAGCGGCAGAGAGTCAAAAATTCAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAATAATTAGAATGATTCTTTAAAGGGCAATTACCTAATTT:1 - chr2L 12827106 3' - Cr1a 4236 1 62.38 CGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACAGCCGTGGGCTTTGGCATCGCTTCTA:1 - chr3R 17760076 3' - Ivk 5025 1 74.26 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGCCACGACACTGATTAGATTTATCAGCCAG:2 + chr2L 17056537 3' - 412 7100 2 72.28 GGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCGTCGTCTATCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATTTTTAAGAATATGTTTGTAGTGAACAA:1 + chr2R 1089868 3' + diver2 182 2 72.28 TAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTGTTATGTTCACTTGCTCTTACATCCACATTTTCATTCTTTTCGTTCTGTATTAGAGTATTGTATGTGACCAT:1 - chrX 16886967 3' - I-element 482 1 57.43 AACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTATTTTTTGTTTGGCCGATTTCTATTGGTATGCCAAGAATAATGCCCACAAGCCGCATATA:1 - chr2R 2122181 3' + S-element 1540 1 59.41 CTTTGGCCACATCGTTTGGTTATTGTTTTTATGTGTGGCCCAAAAGTAAGGCGCTTATCTAAGGTTATGATATTTCGCTTGAATGTGTAAGTATCTGCCAG:1 - chr3R 4591834 3' - BS4 461 1 77.23 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTTCAAC:1 - chrX 10210953 3' - I-element 40 1 59.41 TGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTAGTTAAATAATTTTTAGAAACCAAACTGCTGGTATCGTTATTTAAAAATTTTTTGTCAATTTTTGCG:1 + chr2R 1340328 3' - 1360 3281 1 73.27 CGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAACAGGAAGTGATGAAAACTTGACTTGAT:1 + chr3L 18141946 3' + blood 232 2 73.27 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCCTTCTGCTCTGTTTGTGTTTGTATTGGTGCTGCTGTTGGTGTTAGGGATTTGGGGGTGC:1 + chr2L 4234384 3' - hopper 16 1 61.39 TTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGTAAGTGGGTGGAATGTGGGCTGAAAGTCAGCCAGGTGAACAGGCAGCCAGACATGGACTTACGCCTTGGCCC:1 - chr2R 13381119 3' - Doc 4499 1 79.00 AAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTAGATCGGAAGAGCAAAAGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' - roo 426 1 57.14 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAAGCCAAGTCGGCTTGCTTGGGCTTGGGAAATATTCTGCCATATGTCCGATCACAACCGG:1 + chr3L 18142028 3' - blood 16 2 61.62 GATCAAGTTTTCTTACTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCTAATGCATTACTAAAGTCAGACTGAATGCAACAAAGAAAATGCAGTTCGACAGCGGTTGTA:1 - chr2R 4690671 3' - Q-element 352 2 55.45 GTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATTGTTTTTGTCGACTTCCTAGAGTGTCCTGCAAATGTTTATTATGCACTTGAG:1 - chr2R 6041548 3' - opus 7022 2 60.40 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGTTGTATCGTTGTCTTGTTTGTGCCCCGTTTTCCCCCAAAAAGCTCCATTCAAT:1 - chr2L 4234288 3' + hopper 1394 1 59.41 CTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCCCCCCCCTGCATCATACCCGCTCATATATAGTTTATGCAATTTCTTTGGCAAACA:1 + chr3R 27076377 3' - opus 333 2 55.45 ATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCATTTCGTGTCATAAAAAAAGCATTTTCAACACATTTTTTAACGACAAGTGTCGGGCA:1 - chr3L 10340046 3' + roo 89 2 58.42 ATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTATTGCTAAAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAACTTCAAACATTTAAATATGTTTG:1 - chr3R 6854698 3' - transib2 79 1 77.23 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGACTATCAGATACCTCTTACCCATGCTCTAGGAATATGAAGATGTTTCAGTAGCAAATCGAGAGTT:1 - chr3R 10078294 3' + roo 399 1 69.31 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAAATCAACTACAGAAGAATCCAAATATGTATTATAAGAGATGAACAATACTTTCCAAGCAAACAGTAG:1 + chr3R 4300039 3' + 297 6943 2 65.35 ATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAAGTTACTGCGATCCAGTAGTCAGGATGTCACG:1 + chr2L 3484451 3' + 412 7073 2 68.32 GGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACTACTCACTGCATCCTTTTGCAGTTTTTTATTTTTTCATTCGC:1 - chr3L 6780548 3' - I-element 375 1 58.42 ACATGTAACGAAATAGATTGATGGAAGGCGAGGGAACCAGTTCTTGTGTGTGGGTGTGGTGGTGCGGCTTCTGTGGCCAGGACTCTTGATTGACAGGCACA:1 - chr2L 12799297 3' - Gypsy12A_LTR 2255 1 56.44 AAAAAGGACAAGTTGGTATTGAATTGTGATGAGTGTGTGTGAGTGTGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGCG:1 - chrX 7978947 3' - I-element 4998 1 48.51 AAATAACGTAAAGAAATGAAGTTATTTTCTATCAACTATATTACCATTAATGGGAATGAGATCAGTGCGAGGTCAATGGCTGCTGGTTGGGCAAATGCGTA:1 + chr2L 7970507 3' - blood 6974 1 52.48 TTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCATGAGTCACGAAAGAAGGTCTTGTCGAAATGAAAATGTCAAAGTTCTGCTGTTTGGATTTTAAATGGGCAGCGA:1 + chr2L 3415415 3' - 1360 499 1 74.26 AAGTCCAATGCACTGTATAAATACCAGCATTTTTTTTGGGTTTCCGGGCTGCAATTATTTCCCTGAATTCCGTTTTGCATTAGTGCTGGGCAACTCATTTT:1 - chr2L 17705493 3' - baggins 5349 1 60.40 ATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAAAATGCCAGCTATGTGTGATAATTGTTTTGTGTTTTACTTTCGAACCGATGCACTTGAAAGAAAT:1 - chr3L 4051021 3' + pogo 2095 2 74.26 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCGCTGACACAGATGGCGCCCGAACAGGGACAGGTGGCTGCCAAAAAATGCGGCTTT:1 + chr3L 4051130 3' - pogo 14 1 62.77 ATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACACTGTACCTGGATTCGGGTAGTACTCGAACGGCAGTGGGGCACTCGTCGCTCCATCCGAGGGTCTCACTAGT:1 + chr2L 17417614 3' - 1360 3169 1 71.29 TTATTCTAGTGTCTTTGGTATATATGTAGATATGTATGTGTAGTGTGTATCTCGCAGATGCGTGGTAATCAAAATGATGATGTGAAAATATTTGCTCATCA:1 - chr2R 11400292 3' - Tc3 238 1 61.39 GTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTACGATCTGGTTTCACTTTTACTGCTGCC:1 - chr2L 3822245 3' - P-element 458 1 30.69 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCAAACACCTTGATGTATTTGCCTTGTTATAGCTTGT:1 - chrX 12276773 3' - hobo 41 1 66.34 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACAGCAAATTTAAAAGAACAACAATTAGAAAACGCAATTAAAAGATAAATATACCCGAGTAAAGTTCTTTATGAACT:1 - chr3R 31188706 3' - I-element 1 1 78.22 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGT:1 - chr3R 19450160 3' - roo 28 2 76.00 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACTCACCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGTGAACCCTT:1 + chr3R 29288786 3' - 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jockey2 3083 1 68.32 ATAAATATAAATATAAAAAAAATAATTTAGGCTGCGCGCGAACTAAATGGCGCTTTTAAAGTACGAACCGTCAGGCGACCCCAATATGGGCGACAAACGGG:2 - chr3R 29193676 3' + transib4 2574 1 80.20 CTGGTAGCTAAAGAACTTGACACCGTTTGGAATGGGGAGGGGTGAGTAATCTTATCTTTTATGATACCAAAGAGTACACTTTACCACATTTCAAATTTAAT:1 + chrX 9020070 3' - Doc3-element 471 1 69.31 AGAACGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGATCGATGTCAAAACATCGGCGACCTCAGCGAGAATCGTGTGACAGCGGGAGATTTTTGGGA:1 + chr3L 11243407 3' - 1360 3279 1 66.34 AGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTTTCAAAATTTCACAGCAGCGCACTCCGCTAAAAAAAACAGTTTGTTCATATGGAAACAACC:1 + chr2L 6684326 3' - Quasimodo 7136 2 62.38 AACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGTAACAATTTTTATAAAAGCAGACACACTACACGCTCTGTATAATGTCATATGCATACATACTC:1 + chr2L 8097495 3' - Cr1a 492 1 59.41 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTAAAGCACATATAATTATTAGTTTTGTACGACTTTTAATCAATTTTTTTTTGTGTTGTTCCC:1 - chrX 19080264 3' - Ivk 15 1 58.00 AGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATAAAATACTATTTGATTTTCTGCACTAGTAACGAAAAATATTTGTATTTTA:1 + chr2R 20543761 3' - McClintock 478 1 67.07 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCAATGCACATTGTGCATTGTGTTTTTCG:2 - 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chrX 20494827 3' - I-element 4953 1 60.40 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAG:2 + chr2R 17346003 3' - hobo 38 1 61.39 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTCGCATTAATGGGAGAATCTGC:1 - chr3R 26871054 3' - hobo 55 1 80.20 TTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCG:1 - chr3R 11151804 3' + mdg3 5487 2 67.35 CTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTATTCTGGATTTTTGGGCCTGCACTAATTGGAAATTGACACTGTTTAGATTTGATGGACATATTC:1 + chrX 18217763 3' - Doc 4512 1 68.00 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGGGTCATGAGCCACGACCGAATTCTCGGACTCCTTGGACCCAAAAAAAAGTATATATATATTTATACCCACG:1 + chr2L 16396661 3' + 412 487 2 68.32 CGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGTGTAAGCGCAATTTCTTATTTGTTAAAATGGCAATGTATTCAAAAATATTTCAGTAAA:1 - chr2L 17272154 3' + Doc 4444 1 64.36 TATGGGTCTAAGAGCACCACCTGTCGAAGGCAGCTGCGATCACAGCAAAGGCAATGACAAAGAATTTCTGCAAGGCAATAAGCGAAGGAGAGGGTT:1 - chr3L 4896961 3' + Osvaldo 1313 1 71.88 TCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGTAGATTACGTGCTTGTTTATAAGGACACTACGTTTGATCCACCTCGAAG:1 + chr3L 710942 3' - P-element 421 1 56.44 ATAACCACAATAATAATAATATTTGTAAAATTAAAAATCGAAGCGTGTGTTGCACTCTATGTCTTGCTTATTGGCAATTTCATCTGTTGCAAGTTTTTATT:1 - chr3L 15329204 3' + mdg1 32 2 72.28 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCTTGTTTTGCCCTCTCAACGAGTGCCAGATTACGCATACGCAATGTGTGCTGCCATTGTGTTACATTGTGTT:1 - chr3L 5387765 3' - mdg1 4 2 75.25 GTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATATTTTTTTTGGGGCAACTGGCTTCGTTGTACGGCTACAAGTGTAAGGGTTTTAGCTAC:1 + chr2R 16980157 3' - opus 15 2 45.54 CCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGAACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCAGTTTTCATCGCCATCGGGGCCTT:1 + chr2L 21103871 3' - X-element 4362 1 76.24 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATATATAGAAATTCAGAAACGATACAAAATATGGAGTATAAAAATTTAAATGACTCCCTAAATAAAAAT:1 + chr2L 17066900 3' + copia 248 1 72.28 CAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGCACAGCTTTTAAGATCCGTCTCAAATGAAAATAAAATCATTATAAGTTCCAAACTGATG:1 + chrX 14531480 3' - 1360 3167 1 52.48 TCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATTAACTTGTTGCCGTTTAATTCAAACAAGAAAAATGTTATTT:1 + chrX 1523539 3' - jockey 4704 1 59.41 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGCCCTTTAATACACATCAATAACTATCGACGTCTCACGACTCTACATACGATCTATTACAAGCAGGCAA:1 - chr3L 27262040 3' + P-element 2882 2 73.74 TTTATTCATAATTTTATTAGTTGTGTAAATTTCTATCGATCTGCAAAAAAACGTGTGTTTTGAAAGTGAGCACAGCACAGAATACAACAAACTGCTCTCTC:1 + chr3L 23633438 3' + INE-1 402 1 57.43 CGAGGACAGAGGAGCACGGAGAAGGATGTTATGGTGCAGGGTGTATCGTCCACGGGCGAGGCAACGCTCGGCCTCGGACCACCTTGGTTGGCCACTGACTC:1 + chr3R 3380081 3' + gypsy8 4467 1 79.21 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGTGCACTTGGCTGGCTTGTCAATCGAATT:1 - chr3R 21969074 3' + hobo 2899 1 75.27 CAAGTGGACTCGTTGAATGCGCACAGCTGTACAAATTGCGTAGTGTAAGTCATTATGAGTGACGCCGATATGGGCGGATAAAATAAAATTAAAATCCTTTG:1 - chr2R 502715 3' + micropia 5345 2 72.28 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGGGCTTAATATAATACTTGTCATACGTTGCTG:1 - chr3L 14886213 3' - 412 46 2 72.28 CACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAGGTTTTATTATTATACTTTTCTTTAGTTTTAT:2 - chr3L 3685390 3' - Juan 48 1 75.25 CGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCCAAAACTAAGTAAAAAAATGCAATATAAAATGCATGTGGTAAAAAATATAATTGCAGTTTACTAAT:1 + chr3L 2418237 3' - Tc1 1440 1 59.41 CAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCATTGGATCCCAAGCAGGGCCGAGCTGTCCATTTG:1 + chrX 13026083 3' - flea 20 2 66.34 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAGGCTC:2 - chr2R 19209460 3' - Doc 48 1 62.64 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATTTTAAACTCTAGGTAAAAGCCATTTTAGCTACAATTTCAACAAATTG:1 + chr3R 11073805 3' - pogo 22 1 59.41 TGAAATTGTTGCCCAGGCTTTTTTAATTGCTTCAACTAGGGTCCCAGTGTCTATTGAAGATTAATTTCATTTACACAACTTCATCGCCTTG:1 + chr2L 15315249 3' - Tc3 1336 1 56.04 AACACTAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTTCCACTTCGTTAGCTCCTCTGTTTCTCGGCTCCGTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr3R 29013347 3' + 17.6 285 2 59.30 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCTTTACCTTATGCCTCTTGACTTTTATCCCT:1 + chr4 1234577 3' - 412 45 2 70.30 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGT:1 - chr2R 981625 3' - 1360 64 1 71.29 AAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAACAAACCAGCAAACAAACAAACATTGACGCAATTTTTGCTGCAATATGAAAAAGTTTTTCCCTCTCCTGCCACGC:1 + chrX 21234095 3' + gypsy4 465 1 63.37 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAATATTCAATTCAATTC:1 - chr2L 2157855 3' - Doc 37 1 28.71 TTTATTTTCTTTTTCCTTTTTTTCTGATGCGCCGTTGCCGCTTTTCTGGGGCCGCTTATAGCTTATGGTATATAGGGTATATAACCTGCTTGAAAAGTGC:1 + chrX 12206472 3' - Doc2-element 237 1 50.00 TAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCACAATGTAAGGCAAATGAGAAAATTACATCC:1 - chrX 8695186 3' + accord 6908 2 69.31 TTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGTGACGAGATACATACATAAAAAATTTACATAATACCCCAAAAAAAAGA:1 + chrX 6146340 3' + hobo 2552 1 52.48 TAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTAGTTTCTATTCCTGCCCAGCTCAGTTTGCTCCGCCATTCGAACCCAAACACAGATCTCC:1 - chrX 8433668 3' - Stalker4 143 4 55.45 GATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTATAAGCATGCTCTGGAAACTCTGAAGAGTAGCCGACGG:1 - chr3R 29618762 3' - rover 7144 2 59.34 CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGAAATATGTAATTCATCTGTAAGGA:1 - chr3L 8012053 3' + transib2 2777 1 69.31 GCGTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTTCCGTTTATGTACGTTCGTTGGGACTTTCTTTGTTTGTTTGCCACGGCATTAATGAATAAATGCATGGTGGATGT:1 - chr2R 18035041 3' - Ivk 5032 1 58.42 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCGCATTTACTCAAGACGATTCTCCCTCTGAAAAGTGTAGCCACAAATGCCAGCATT:1 - chr2L 13602335 3' - FB 22 1 53.47 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAAAGAACGTTAAGATAATTTGTGTCTATGGGGGTA:1 + chr2R 8474974 3' + Transpac 270 2 71.29 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCCCCCCAATACGTCACTATATGCATGTATTTCTTGCAG:1 - chr2R 20544007 3' - 297 6632 2 82.80 AAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAATACCTATAACTCGCCGCTGTCGATTGGCAAATAGTTGGCCAAACAGAGGAAGGCCCTTTGTGCAGCCAGCGATACGCTC:1 + chr2R 23262252 3' + Doc2-element 219 1 54.46 CATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCGCTGTGTCTAAG:2 - chr3L 15452862 3' - accord 28 2 51.49 CCGTTATGCCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAACCAACTAGCAAATATCCTAGCTAATCCCATCACCCATTGTATTCGGAGCTAAACAGTTATCAAAAAGC:1 + chr2R 5360945 3' + G5 4563 1 63.37 GTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAGGCTGAGACGCAGACAAACAAATGCTTGGGCGCACATTAAAAG:1 + chrX 2841720 3' - accord 7035 2 80.43 CAATGGTTAACGGAGTATGTGTGTAATTTGGAGCTGCAGCAACTCGAAAGGGGAGAAAACACAAAAAC:1 + chr3L 2541865 3' - Doc4-element 217 1 63.24 ACAAAAGGTAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGATTTTTCTCACACGTTTGCACTTGTTATTGTTAATTTATAGTAATCTGCT:1 - chr3R 7164427 3' - Cr1a 211 1 54.46 ATAATATTTTTAATTCGTTCAATAAGCGTTATACTTACAATATAATAATAGTGATTAAACTTTTCTTCAGTGCATCGGTTACAGTGGATAGCCAGCCAGCT:1 - chr2L 18328827 3' - Burdock 492 1 57.43 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATTTCATACGGAAATGTGCTGTGCAACAAAGAATGCAAGCCAATAACCTTTGCAGGTCCGTTGCC:1 + chr3R 19449881 3' - pogo 9 1 70.30 AAGATTACTGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAATTAATAGTTAAACAAGTGGCGGCAGTAAAGAGGAA:1 - chr2L 5117471 3' - Cr1a 4219 1 71.29 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTTCGAATTTGGTATAAGGATGGGGTTGAATTTAATCA:1 - chr3L 9174657 3' - 412 7 2 72.28 GAACCTATGTAAAAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGTAGCTAGTCAGTAAAAGGTTGGTCAAAACTTTGAGACCTGCTTAATTCCCTGGAAAGTGCA:1 + chr3R 17837329 3' + rooA 7511 2 57.43 ATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTATTTGACACTCATACATTTGACAGACATACA:1 - chr3L 21912243 3' - Bari1 14 1 66.34 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCACTCTACGCAAAATGGGAGAAGAAGCCAGAAATTAAAGGCACAGATCG:1 - chr2L 17283460 3' - hobo 28 1 51.49 AAAGAAATTTGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGCCCACAATTGCACTGCGTCGAGCATTAACAGTTTTTCCAGCAGTTCTGTGCTTTGCCTGGGCTGTTG:1 + chr2R 20362192 3' + Tc1 390 1 72.28 CACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTGCGACCGCGCCAGCGACCCATCAAAAAACAATCAACAATTTGAGGCACTCAATAAAATATTTAAATGCTAA:1 + chr2R 11086868 3' + Doc 334 1 68.32 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTCGTTTGGTTTTCAGTTCGCTTTCCAGCTCAGTCGCTGTCAG:1 + chr2L 9437496 3' + P-element 2868 1 56.18 CCACCTTATGTTATTTCATCATGTCGAGCTCTCTCAATGTGTCTCTCTGCGTATGGAAACTGACCTTCCCCAAGGCGCAACAGCGAGAGAGAACTTCGCTA:1 + chr3L 9373734 3' + P-element 2885 2 73.27 CTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTCCCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTAAAGCATATCTAT:1 + chr3L 20224201 3' - Chimpo 52 1 75.25 CACACACACTTACACACACACATGTACATGTACATACATATAAACTTTTCTATCCCAACCAGCCAGTCTCGAATGTTGGTGGATTGAGAGGGTTCATTGC:1 - chr3L 10763993 3' + Quasimodo 28 2 71.00 ATTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACATATGTCCGAAAGAAATGTATGTTTATATTTAATTGATTTTTGAACGGTCAAAA:1 + chr2L 22208787 3' + gypsy 439 2 56.44 CAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATGTAGTAACGGCTTTCCTGATTTAGTTGGCGAATAGAGAAAAAATT:1 + chr3L 9167433 3' + 412 7269 2 55.45 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCTCGCGTTTCTTCTGCAACGAAAGGTGTACAGTTCGGCATATCTAAAATAACAAACAGATAA:1 + chrX 9048728 3' - Tirant 19 2 60.00 TAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGTGCGATATACTCGTCCGCCCGCGGGACACGGACCAAACACGCATTTGCCA:1 - chr3R 20486338 3' + accord 7356 2 51.49 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCTATTAAACTCCCCAAACGGCCACGCCCCCTGTCTGTGTGAAAAGCCCTAAAAGGCCGTATGCAGACAC:1 - chr2L 9330194 3' + hopper 1409 2 73.27 CATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGACATTCGAGTGCGATGCACTCTGGCCGAAAGGTGTTTCGCTTGATGTTTTGCAA:1 + chr3R 7775392 3' - Doc 4277 1 58.42 ACGACACCCCGACTCCAGCATTGAGATGACGATACCTTCCGAAAAAAGCACGAAAACCTTGCCTAGTGTAAGGCGCCATCA:1 - chrX 7621281 3' + gypsy4 6493 1 55.56 GCGGTTTATTTGAATGAATCCATATTGCTGGCCTGGCTTTTTGGGCTCTTTTTTTGGGTCCAGAGAGTGGAGTTTCGGTCACGCTGCTAATTTCTTTCATG:1 + chrX 4037513 3' - Stalker3T 282 1 75.25 TTTTTATATATTTTTCATATTTTTTCATAACTTATATATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCTGTTGAAAGCACACAAAAAATTGC:1 + chr2R 10552461 3' + copia 4666 1 81.19 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACAGTGTAGCACAGACAGTCAAAAACGCA:1 + chr3L 10554819 3' - roo 48 2 73.27 TCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1 - chr3L 25232768 3' + accord2 179 1 51.06 GTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCAAAGCACTTGAATACATCGTGATGTACCCATTCAATGGTAGTATTTATGTACATTTGGCATTAAATTTGAAGTTCTAAT:1 + chrX 20494300 3' - I-element 4951 1 78.22 TTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATATCTGAAAATGTGGGCAAAGGCAAGGAGCATACAAGGGAAAAT:1 - chr3L 13264455 3' + Burdock 6361 2 57.43 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGGGCAACGCACAATTGAGTTCAATTGAAGGCAGAATTGATTGTTTAACCTTTCC:1 + chr2R 17269796 3' + transib2 2803 2 56.44 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATGTTGCATAGGCACATACTACAATATCTGTGACCATGCCTGTATTCTGCA:1 + chrX 21668287 3' - 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412 7105 2 78.22 GCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACACGGCTCTTCACACTTACCTTGACTACCAGTGACCCA:1 - chrX 21907837 3' - micropia 44 4 68.32 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTTTTTTTACATTCATAATACACATAGATATAAATGTCTT:1 - chr2L 17066812 3' - copia 37 2 63.37 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCCACTTTTAATGTGGTGAGGTAGGAATGTTTCATTGATGTGTGTGTGTGTGCAAATCTCCAAA:1 + chr2L 11805097 3' - P-element 13 1 64.36 TCTTATAATTTGTGTATTGAAATCGATATTTTTGTTTTTCGGGATTGCGAGTCCGAGCTTTGAACGTGTAGTGAGCCTGGCAGATGCCGCAGAAGAGCACA:1 + chr2L 6681635 3' - Idefix 298 2 67.33 TTTTTTTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAACATCTAAGGTCTACTGCCGCCTGTATGCCA:1 + chr2L 17185161 3' - G2 3063 1 73.27 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACCATTCAGCCAAAAGTGTGCCACCAGCTAACATC:2 + chr3R 23080886 3' + 412 7502 2 69.31 TTATAACGTTGTTATTATTATTATTACTGTTACTTACGTAACTTAATTCCCAGGTGTTCATTAGAGAAACAACCAATTTGTAGATATTTATTACAATGAAT:1 + chrX 2657027 3' - G4 3663 1 71.29 ATTTGTGGGGAGTTTTAAGACTCCTCACATCTCCCCCTTCCTTCGGAAGTTTTTGAAAAGGATAATGAGCTCTGTTTGAACTTCCCGCCTTTTATTTAAAC:1 + chr3L 26132184 3' - gypsy8 4657 2 66.34 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAAAATAAAATGCAACACGGAGTCCTTGTCCG:2 + chr3R 6135266 3' + I-element 5303 1 76.24 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAAAACCATTTCTCTTGCTACTTTGTGCACTAAGCC:1 - chr2R 17649962 3' - 1360 43 1 70.30 GCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCCTAGAAGTTCTTAGAAGATGCGGCACTAATAAAGTGTGCTGCCCCAAGTGGGAAACGTATCTGCCACA:1 + chr3R 13380395 3' + 1360 200 1 59.41 AAAGAACGGTATGGATGCTCAACGCATTTACACCCGCCACAGGGCCATGTGTCACTCAGTGCTTCCAGCCCGCAATATCCATTTTTTTTTGTTCACTTCCG:1 + chr3L 10733355 3' - rover 7075 2 82.18 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTTTTTTGTTCTTTTTTGGGGGCCGAGTGAATAGCAAACGGAAAACGGATGAAAGCTTCACTCGATTGGCATG:1 - chr3L 13164650 3' - pogo 3 1 73.27 CAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCAATCCCCAGATTCATGCATATTTCACCTACCAAACTCATTTTA:2 + chr2L 16032351 3' + 297 366 2 60.40 TTTTTTTTTATTTATTTTTGATTAGTTTCTCTGCTAAGTTTTCCATAAACTAACTGACTTATATGCCTGGCTTTTTTTTTTTGGGTAGCCCTATAAAA:1 - chr2L 2286899 3' - R2-element 3583 1 65.31 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATATTTTGTAAATGGCCGTTACATATTCTTCATTT:1 + chrX 19326849 3' + pogo 2062 1 67.33 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTTTTTTCCGATTTATTTTCCTGCCCGGCTGCATTGGCCACAAAAATA:1 + chr3R 28630138 3' - FB 23 1 53.19 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATATATTTCACTTTCACTTTGTTGACTGCTTCATAAGTTGAGTTGTTCGCTTTGTGAA:1 + chrX 11463711 3' + flea 5003 2 65.35 ATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACATGATTAAAATTACGAAATAATTTGATCTTTTTG:1 - chrX 6156176 3' - 3S18 44 2 65.35 TTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTTAATTGCTAATCATCTTTGTAATTCCTAATAACTCAATTGATTAAACTT:1 - chr3R 18889116 3' + 297 6569 1 53.47 TGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAACTTCCTC:1 + chrX 21668059 3' - Tabor 6887 2 71.29 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAAGCCAAGTCGGCTTGCTTGGGCTTGGGAAATATTCTGCCATATGTCCGATCACAACCGGTT:1 + chr3L 18142030 3' - blood 7027 2 62.38 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCGTTGAGTTAACTCAAGTTCAGCTATCTGCGCGCTGATTTACGCCTCCCTTTTTTTT:1 + chrX 13588001 3' + hobo 2917 1 59.41 TTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTTGTTTATTGTTTTTACTTGTTTTTTTGTTTTTGTTTTTATATATGTATATAATAGATATAGGACACCCGT:1 + chr3L 8439563 3' - Porto1 211 1 65.35 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATTAATATACATAGTTTTAATACCACCAATAATATTCTGTAATTAGATTTCAGGCTATAAAAATAAA:1 - chr2R 8271418 3' + pogo 2092 1 70.30 TTACAATGCATAAGCATACGTGTGCACACATACAATTGCTAGCAACACGGATTGTAACGTAGCGATAAGTCCGGGACATAAGTCCGCAACATATGTTTCAG:1 - chr3L 23005409 3' - 1360 187 1 66.34 TTTTGCATCTTGTGTCCTCACTTCGCTCCCACTGCAGTCCTTGTCAATGTCGGAAATCATCCTCTTAATCTCCTCCTTTTTTGGCTCGAATCCCAGAGCCC:1 - chr2L 22550761 3' + transib4 2325 1 73.27 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGCATAGGTTTTTTTATTCAATATATGATTACTGAACTGGTATTTATCCTTTGGCTTTC:1 - chr3L 17786277 3' + roo 391 2 59.41 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAGGATTGCAATGGGGGGACCCTTGTTCCAAAGCACCAGGAGTTCTCTAATTACATACAGCAGCAG:1 - chr3R 12215244 3' - hobo 10 1 69.31 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCATCGGCGA:1 + chr3L 9174735 3' + 412 445 2 75.25 GCAGTCGTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAAAACGGAATTGCGGAAACTTATAACATCCAATTTTGAACAGTAAGGCTTAGTAAGGCTA:1 + chr2R 13663542 3' + Tabor 7193 2 60.40 TTTGTCTTTAGAGTATTCAGCTAGCGACGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCACTCGACTTTGGTGCGTTGTTAATCTTTATGCGGCTG:1 + chr2R 12839245 3' + 1360 406 1 61.39 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACAT:1 + chrX 10629249 3' + P-element 2842 1 31.25 GAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGAGTGTGTGTGTTTTGGGGGCGCTCTGAGTTTTTCAATTAGCTCATTTCTAATAATTCAGGA:1 + chrX 19037725 3' - accord 7059 2 72.00 TCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCCCGGTACCGCCCACGAGCCGGGAAGACAGTCA:1 + chr3R 6857915 3' + F-element 221 1 68.32 TACCACGGTTTTTGGGCTTCCATTCATATTTAAAAGATGTGCTTTCAGATAATGTAAATTGAAGGGAGGGTCGTGAAAAGTGAATCTTGCGGCTCACCGAT:1 - chr2R 13846975 3' - HB 489 1 84.16 CATATTACTTACTTACATATTAACTCTACTCTACATATTGAGGGTAGATACACTACAAAGGTGATTTGCAAAACTATTGGGTTAGGGGATAGTGGGTGGTG:1 + chr3L 7810082 3' - Stalker3T 36 1 67.33 TACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAG:1 - chr3L 16973357 3' + S-element 168 2 64.36 TGTATATTTGTACATTTATGTTGGGATTTGTTCAAGCAAATCAGTGTCTGAATGAGAAAATATTTAGCAGGAAACGTGAAGCGTGCTTTCACTTTTCGGTT:1 + chr3L 19784901 3' - Stalker 90 4 62.38 ATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGTGCGAGTGCACGGCCAGCAGCC:1 - chr2L 22208728 3' - gypsy 52 2 79.21 AATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTAGGCTCTTTAGGGATTTGAGGACTTTATTGATTCTCACTAATTCGCTTTGTAGTAGATGCCATTAGAAGGC:1 + chr3R 21998488 3' - 412 3 2 76.24 TCTCTTTCGCTTTAGATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATC:1 + chr2R 2092781 3' - Doc3-element 94 2 65.35 GCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTTGTCCAGGACAAATAGAGTTCAAAAAGAGTGCAAAGGCACAAAGTAGTCTGCGTGCTAAAGGAGGTGCAGATATTGAA:1 - chr2L 16717782 3' + blood 7179 2 74.26 TGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATT:1 - chr3R 11151811 3' + mdg3 225 2 58.42 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAATTATTGGTATCAATACGATGTCAGTGAAAGTGGATCGCAAATGTAGGAAT:1 + chr2R 9007293 3' + roo 9045 1 55.45 CGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACAGTACCGCACAGAATATTGAAGAGGCGAAAGAGAGGGCACGAGAGGAACAGAACGAGATAGCAA:1 - chrX 12269693 3' + accord 237 2 75.25 ACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTT:1 + chrX 11025550 3' + hopper 1361 1 80.20 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTTGTACGCAACTTTTGCGACAAATAAATCT:1 - chr2R 14796188 3' + hobo 2891 1 72.28 TTTCTAAGCTTATGAATTTACATTCTTTTGCTTGGGCCTGTTGTCCTTCTCTAAACGATTTTAGCAT:1 + chr2L 8783894 3' - HB 388 1 61.19 CATAAGAAAAAAAACAACAAAACATGAACTTTTTTCGGTATTGCTATTGTTATTGGTCTGAAAAAATATATACATAATTATTGACACTTTAAAATCATATA:1 - chr2L 15546299 3' + gypsy11 3930 1 62.38 AAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTTCTTTGTTGGTGGCTGACTGCTCAAATGAGCTTTTTT:1 + chr3R 18616504 3' + hobo 281 1 68.32 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCACGAGGTCTGTCAATTTCTGGGCTCTACGCCCCTCGTCCGTTGTCGTTTTAT:1 - chr2L 16396560 3' - 412 7078 2 55.45 CTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAAGTTAAGATCTTAAGGTATTTTAATTGAAAGTATTGCTTTCAAGT:1 - chr3R 23274009 3' - invader3 34 2 57.43 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGTACGTAAAAATAATGAGAAGCACATTTTGTGCG:1 + chrX 6146718 3' + hobo 2900 1 64.36 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTACCAGAACCAGCCTGATTGTCCTGTAATTATTGCGTCAAGGATATGATCTACTTGGGGCTGCAGGA:1 - chr2R 9311794 3' - hobo 12 1 67.33 CTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGAGGTAAGGGTGTAATATACAAATGAACCCAAATGAACATCTTAAGAATATTTTATTTGTTTTATAA:1 - chr2L 22540869 3' - Cr1a 3992 1 65.35 CACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGTGCAGAAACATTTGGCTGCAAAAAAGAAGCTTGTTCCGGACGTGAAATTCCAATTTTTTTAAATTAACTTT:1 - chr3L 21966992 3' - Doc 8 1 72.28 TGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCCAATGCAGGGGCAGACATATAGAGCTGTTATATCGAATAAAATCGG:1 + chr2R 10191783 3' + 297 6951 2 56.00 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGATCTTGAACCTCCCGCGCCTGCTCTCACCTCACCCTAGAGCTTTTGTTTCCGGTCCTGGCTAG:1 - chr2L 128669 3' + P-element 2876 1 69.31 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTAGGCTGCTTGCAACTTTCTGTGGCACACACAC:1 - chr2R 20996442 3' + P-element 2844 1 36.63 GTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGTGCGCGAGTATCGTTCTGACTCATAGTTTTATTTAATAAATAAATTCGATACTCTCGTTTTCCTTCATTCCAGGAA:1 - chr3R 6488160 3' - F-element 219 1 55.45 GCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGCGGGGGCGAGAATATTTTGCAAATAGTTGAAAGTCTGTCTGTGCGGAGTTGAAGGAGTTTCCCGGCCGTCGAAT:1 + chr2R 22033952 3' - Cr1a 293 1 74.26 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGCACCTCAAAAAGAAAATATAAATATGAAAGAAAAATGCGTTC:2 - chr3L 10565277 3' - pogo 32 1 60.40 CTTTCCGCTGTTATCGACCAGCTAAAGTGCAATCATCTGCACTTCTCCGCCTCTAACGGCACTGCTTGCAAATGGCCAGCGACTTGTCCTTCAGGAACTCG:1 + chr3L 5795851 3' + HMS-Beagle2 97 2 50.50 GTCGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTGGCGCGCCAGGCGCACCTGGTAAACGTCGATGTCGTTGCG:1 + chr3R 13676055 3' - Doc2-element 361 1 60.00 TCTCCACTTAGCGTGGAGTTCAAAGCTCTCCTATACAACTCCGTCTTAAAACCAATCTGGCCTTTTTCATTTCCAACCCATCGTTCAACCCCCTTCCAATA:1 - chr2R 19530893 3' + Doc 4232 1 59.41 TAAAGCCCCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTTATTTAAAACATCTCACGGCACTGGCAATAAAACACCGAAAAAGTGTTAGGTTC:1 - chr2R 20164758 3' + I-element 46 1 61.39 AAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAATGAATTTGCGCACGAAAGTTTGGTCGGGATTCTCAGTGGGTTGGGATGGGGTGATTG:1 - chr2R 10831806 3' + P-element 2668 1 64.36 GGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCGGCACATGGTCCACTGTATTGAAGTCTATGGTCAGCTACCCTGAAGGGTAAGTGGGATTCGAATT:1 - chr2L 10845091 3' - accord 24 2 71.29 TGAAGAAATTCAAAAAAAAAAATCGTGTAAAATACATTTATGATCAATACAATTCGATTGATTTTGAGCCCGGCGGGAAAATGCGTAGAAAAAGTGAAA:1 - chrX 3103648 3' + TART-A 13401 1 77.78 GGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCTTATCTGCTTGTATTCATCTTGAAAATTGTTTCTAGTTGAAGTTTGCCTTTTAATTGTTAGGCGCAAA:1 - chr3L 15202863 3' + Max-element 15 2 72.28 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCATTACATTAGCGTTAAATGGTGTTAACTTACACA:1 + chrX 12276822 3' + hobo 2899 1 66.34 AACACCATACAGCACTGCGAAAAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACACACAACTCCATTTGCTGCGTTGCAATGGTAAAATAAATAAATATTCAT:1 + chr3L 13245553 3' - Cr1a 238 1 53.47 AAGATCCCCCTGACGTCCAAAGCACTGTATATATGGCATCTGCTGGTGGAAACGGTTCATATAGCGCGCATCAAGACGAGTCTGCACTTTTCGGACTACG:1 + chr2L 1229159 3' - baggins 5361 1 74.00 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACAACTAATAGGTGCGTAAACGATGTTTTCCACAGCATACTTTGCGGCGACTTTT:1 - chrX 5275505 3' - jockey 4699 1 53.47 AGATCGGCAGCAGGTCATTTTTTGTACTCATAAAATTTGTATGGGTGGCGGTTGTGACGGTCTAACTAACTTGTAAATTTCCACAATTTCCAAAATGTCTT:1 + chrX 7143879 3' - hobo 2735 1 64.36 TATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCCCAGTCCCACCACCGAGGAGACCAAGGAGATCAAGGAGACGGATCAATCCCA:1 + chr3L 19971078 3' - roo 205 2 59.41 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCCTACTACGAGTATAGTTTTGAGATAACAATACTCCCACTTTTATCGCCCCTATTTAGGGGTT:1 - chrX 1252764 3' + hobo 2925 1 66.34 TCAACCATCGGCAAACAAGGGGAAAACCCGAGAGAACGAGAACCAAAAACAAACAAACAAAAAGGATGAGCGTACAGGGGG:1 - chrX 6699833 3' + X-element 469 1 75.31 TGCGCTGCGCCGCGGCCGACGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACGACTTCACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAACATTTTCATTGGCGCGTTTAATTGAAGT:1 + chr3R 30783281 3' + HMS-Beagle 100 2 78.22 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTAGAGCTAAATAGGCGCACGGTTGTTAA:1 + chr2R 20996479 3' - P-element 50 1 30.69 CGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCAAACTGCTTAGCTCTTAAGGAAGTAGCTGCCACAGTGGCTTCGAAGTGGCCAAACCCAAGGCGATTTGGCT:1 - chr3L 5992901 3' - F-element 449 1 79.21 ATTTTTTTTAGCAAATCAACTTTCAACCTGCAGTAGTGCTATTACTTTAACCGCAGCTGTATGGGCACCACGGACCACGAAGACCTCATCAGCCAGTTTCA:1 + chrX 17303306 3' - Tc1 40 1 62.38 TTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTCGGAGTTCCCTTGTTTTTCTTAAAAGAAGAAAAGAAAAATATATGTGAATT:1 - chr3R 9229959 3' - X-element 38 1 49.50 GGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCAATCAAGCGGATCGGGTACCAGAAAGATCTGGTCAATGAGTGGATTAAGCTGGTACCGAATTCTTCATAGA:1 - chrX 22447925 3' - accord 4 2 68.32 GCCAAGCTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCGCTATTTTCGACTATAGATATTTCATTTAT:1 - chr2L 15994154 3' + Porto1 417 1 70.30 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACAGTCCAATGACAGCGCCTATGTCCAGCGACTGATGCGTCTGTCCAAGTCCGCCGAAATGCG:2 - chr3R 28879900 3' + roo 9054 2 61.39 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGTGCACTTGGCTGGCTTGTCAATCGAATTCGCATTTAAACTGCAAATTT:1 - chr3R 21969054 3' + hobo 2921 1 57.14 GAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGGTTATGCTCTTGAAAAGGGTTTTAATAAATTCG:1 - chr2R 17953202 3' + 1360 401 1 69.31 CTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTCAAACGGGCCTGGTTTTAAAGTCTAGAAATTCCATCTCTTTAGTAATAGCGCTACCGTTGGACAACCGCAGGATGC:1 - 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chr3L 23780889 3' - TLD2_LTR 39 1 57.43 CGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAGAGTCAATATAATCTTCAATTTGAA:1 - chr2L 18773325 3' - Max-element 8289 2 80.20 TATACATAAATATTTCATTCAGGGCGGTGTCGGGACGGATTGAACCAAGTTTGAATGGACGCGATGAGGAGCAGTGCAGCATGTTGGTCACCGATGTGGCG:1 - chr3L 6599524 3' - copia 4654 1 58.42 CGATAAGCTGGAGGATGGATCCTATGAAACGTGGAGCATCCAGATGCGTTCAGTGTTGGTGCACGCATGTTTGTACAAGGTATCCGTGTGCTTCCAAGGGC:1 - chrX 7612228 3' + 1731 451 1 73.27 TTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAA:1 - chr3L 27356103 3' + Tc3 1659 1 78.22 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAATGTATGTGATGGCTTATCAGACACCGGCAGCAA:1 - chr3R 24023322 3' - roo 8706 2 69.31 AGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCCACACACACACACTTGACTGTGTTTACAGCTCTCGAAGGGATTTCCCTCATTTTCCTCATTCGGTAGGCAAAACAT:1 - chr3R 22276814 3' + hobo 2938 1 73.27 CTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACTCGTCGATTCGTCGCCTTCTGACTCTGAGTGAAGGACTGTGGTCC:1 - chr2L 15193210 3' - G-element 34 1 53.47 GTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAATTTGTCTTGTGGTTTCTTTTGCTTTTGGGCAACCAGACATGTTGGCATTCCGGCGGTTGCCTTTGCC:1 + chr3R 14205480 3' - G5 4734 1 66.34 ACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATAT:1 + chr2R 3760468 3' - accord 41 2 65.35 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTTATATGAACTGGGTGCACTAATCA:1 - chrX 4056248 3' - roo 15 2 64.36 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGCCCTTTAATACACATCAATAACTATCGACGTCTCACGACTCTACATACGATCT:1 - chr3L 27262055 3' + P-element 2865 1 57.43 CTCTTGAGCCCCCAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTTTCAAAAAATAAAACGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGAGTAAAGCAACAAAACCAGCAATCTTAACAGA:1 + chr3R 9447896 3' + X-element 376 1 64.36 TTCATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAAGGGGGGAGGTGTAGTATGTGCATAAAGCTTTTGGCTGTTGATTAACAGCCGTAGAAGA:1 + chr3R 31944242 3' + blood 6961 1 66.34 AGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACCAACCTAATTCCACTAAACAGCGAGCCTGCAGCAGGGCCACATCCTGGCGAGTCATTCCCA:1 - chr3R 30604964 3' - opus 7243 2 59.41 TTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTATTACAGTAAAAAAAAAATTCAGATCTGGTCAGTGAGCTGGCTTT:1 - chrX 3529748 3' + F-element 4630 1 66.34 TAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATGTGTTTTTGGCATGAAGGGTTACGAGGCGAAAAGCATATTTCAATACACAACCTTTG:1 + chr2R 2261412 3' - copia 32 2 60.40 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATCGATGAATCCACCCTAACACAACATCAATGTGTTCCAAAATCCA:1 - chr3R 17846871 3' + roo 9041 1 55.45 TAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATATATAAGCCCGTTTAACGTTGGTTGACTTTGTTGTTCCTACTAGTTTAAGTTC:1 + chr2R 8404586 3' + Quasimodo 3 2 52.48 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCAGGTTAATGAATATTTTCTCCAAGTGTT:1 + chrX 15259078 3' - roo 49 2 79.21 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTAGCCGTCAGAATTCGCTTACTCCGGCTGGTCCTGCGAAATATTTAAATAACCCTGCCCAAGTTCGCCTT:1 + chrX 18119593 3' - hopper 5 2 74.26 AGATCTCAGGAACTATAAAAGACGGAAAGAAAAGCTAAAAGACAAATGGACATACATAGATTTGGATTGGGACATGGACTTGCAAATATGCAAAGCGATTT:1 + chr3R 20765325 3' + INE-1 149 1 60.40 TAACTGGAGCTCTGATAAAAACACTTCCTGTCGGTAAATAAGAGAAAACTATAAATTCCTAAAATGTTCTCCGCTACTCGAGAGCAATTTGCATGCATGCG:1 + chr3R 30753562 3' - Porto1 28 1 77.23 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATCTACATTGCTTTTCGAAAGGGGAACTTCAGAACCGGGGCTCCAGTTGCACTTC:1 - chr3L 22418472 3' - hobo 23 1 58.42 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATATGCCCGGGTACTTACACTGATTTACAATGGTCAATGGACATGGTCTA:1 - chr3R 26497910 3' + P-element 2795 1 57.58 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGTACGTAAAAATAATGAGAAGCACATTTTGTGCGTATAGACAAGAAACGTAGCATACTTTTTTGGGG:1 + chrX 6146751 3' + hobo 2933 1 73.27 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATGCAGTGACCATGTAATTTGCTCATTAACAAATTGCTTGAGTTAAAGCCCACCAGAAATACA:1 + chr2L 18506834 3' + flea 5002 2 66.34 GAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTAAAATCCATTCGGACTCCACCCACAACCCTTTTGCCGCATTTGGCCAGTTTTTGAA:1 + chrX 6154041 3' - Circe 9 2 71.29 ATTAGTTTTTTTTTTAGTTTTAGTTAGTTTTCCCATGGTCAGTTGTACGTGGTCCAAGTCAATGATATGGACAATTCTCGTTGTTCCTATCTGTATCTGTC:1 - chr3L 26386143 3' - rover 6829 1 78.22 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAGCGGAACACAAACGCACACAGGCACACTTGTTTGCCAGCCCAATTTGTTGTAGCTGTTGGTGAATTTAATA:1 + chr3R 18449027 3' + hobo 2931 1 69.31 GACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGCATATATTTTCTGTTTATTTTTGAAGCTATTAACTGGCAGCTTTTCAAATTTGAT:1 + chrX 12151689 3' - diver 20 2 59.41 ATACCTTTGTATTAATTAGTATTCCTCGCAGGAGGCATATTCTCATTTATTAATGCGTCGTCACTGCTGTTCCCAGTTCCCATTCCTATTCCTCCTGTGCT:1 + chr2R 6984869 3' - HB 38 1 77.23 GGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAAACGAAACGTCACAAACAAATAAATCTAAG:1 - chr3L 15635087 3' - Max-element 8283 2 71.29 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGGAGTGCGAGGGAAAAAAAATTGCAATTGTAATTCAACTTTAGTGTTTCCAAACTGTCGGAATGGAGCTG:1 + chr2L 16121391 3' - hobo 21 1 68.32 ACATAGATATCAAATATCATTTTACCAGAGAACAAATTGAAAACAAACTAATTTGTGTTAAGTTGTGTCATATATCATTTGGCTTTCAAAGCGAACGGTCG:2 + chr2R 3341943 3' + Copia1_DM 4131 1 62.38 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAAATGGGTGGGCCAAATGT:3 + chrX 12818909 3' + roo 9055 2 62.38 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAATCATTAAGAAAGACAAATTTGGATATATATGTCCAATGATAGCTGTCTGGTCAGTGAGCATTG:1 - chr3R 29313412 3' - roo 8683 2 66.34 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGCATTGAACACCTGTAGCTTAGTTGACATTGAACAGTAAAATAATGATTTGTTTTG:1 + chr3R 10078397 3' - roo 8684 2 59.41 GATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTTTGAACAACGTTCTTTGCCCTTATTATTTATTTTATTTTCCTGTAATTT:1 - chr2R 4924416 3' - Ivk 5206 1 56.44 CAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTGCCACCACTTAGTTTTCGATTTTCGTTTGAAATGTACTCTTTTTGACTAGAATGATTATTTGTGGCAC:1 - chrX 11977213 3' - Doc 4436 1 70.00 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGACCTTTGTGTTCTTGGCCAGCTCGAGTCCAA:1 - chr2R 1597757 3' - 1360 12 1 65.35 CACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTAAACGCGCAAAAAAAAAAGTTATAAGAAAAAATCCCTGTGTGTGCGAGTGGAAAAACCGGT:1 + chr2R 18879344 3' - 1731 4560 1 57.43 CAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTTATATTTTTAATATTTCATATTGTACAAATCCCATAAGTCACGAGAGTGATTCAGATGATCTTTTAGCAGGCA:1 - chr3R 30215385 3' + opus 498 1 77.23 CTTCCGAAAGTATTAATTGGCATGCGATTTTACTTGTTTTACTAGCCG:1 + chr3R 8107220 3' + gypsy12 10003 2 68.75 CAATGTTCTCAGGTGATCTAACGGGTCGAGGAACTCCAGCTCTTCGCTTTGTCGCACTTGCAGTTCGCCTGAATGTAGTCTGAAGGCGGCAGAGTAGGCTA:1 + chr2R 2109940 3' - mariner2 344 1 76.24 TTGCGGTTTTGCTTTCTCTGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACAGAAGGTCGACCAGCCATCAGACGAGTTTTCGAAAGCAAA:1 - chr2R 8672715 3' - F-element 497 1 45.54 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCAATTGATTTCGAATTGCAGCAGTGTCAGAGGAAACGGGAGT:1 + chr2R 11372253 3' - roo 34 2 61.39 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGTCGTTGG:1 - chrX 22690755 3' + roo 9029 1 66.34 ATGCGATAGTAACCCTATTCAATTCTTCAATTATTATCCACAAAAGAAACGGAATAAAGAACCCAAAACCCACCGGAAAATAAAACCTCAAAAAATGGCAG:1 + chrX 5598218 3' + rover 397 1 66.34 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTCTGAGTGAGTGCGGCATTGAATTTTCACACAATCAGAAACCAGTTTGAACGCATCC:1 - chr2R 23106469 3' - jockey 30 1 57.43 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTGTTTGATGCAAAAATATTGGTATTTCAAAGGTAATGTTAAGAGTAGTCGAGCTGAACGGCCATACCAAAAGACA:1 - chr3L 19933689 3' - roo 41 2 74.26 ACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAAT:1 - chr3L 19951173 3' - Ivk 5 1 74.26 GGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAATCGAAAATATATAGCGTACCGCGGCGCAGCAGTCGGTA:1 - chr3R 28744679 3' + 297 6829 2 61.39 CGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCCCTTCCGCTCTCTCCACTCTTCCTTCCGCTCTCTTTTCACAACAATAAACAACAACAAACACGC:1 + chr3L 1882811 3' - gypsy7 37 2 72.28 TTACTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAATTCGCTGAGTTTTAATCGAAGAGTATAGAGCTCTATTTGGAACAATTTGCCACCTGGGGAATGCTGACCGTCATGC:1 - chr3L 7856964 3' + 1731 228 1 75.25 GGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGAAATCCTACAACTCTTCTTGTTTTTGAAATGAAACTCAAAACTCTAC:2 + chr2R 17402813 3' + invader4 322 2 75.25 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCTCAAAAATCTTATTTTCAGCTCATGTTGTGCTCGTTTGTTATTT:1 - chr3R 10428080 3' + hobo 2906 1 54.46 GCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGTGTTGTTGTGTTTCCCCTTCTTTTTTGCCGCGTCGAATTTTGTTTGTTTGGCAATTTGTGCAAC:1 - chrX 4816048 3' - F-element 283 1 67.33 ATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGATGGGGGTACCAATAAAAACAAAAACAAAATTGTCACCAACTTTTAGCTC:1 + chr2L 12534763 3' + accord 446 2 58.42 GGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCTAAGATGGAATACACAACGAAATTTAGTAAAATTTAGCCGACTTAACATCAGTCTCCCATAAATTACCGA:1 - chr2R 4816388 3' + copia 440 1 78.22 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTACTCTGATCTGCCCTGGGGCTGTGCCAATAAGTCGAGCAG:1 - chr2R 6783170 3' + Tabor 7287 2 61.39 CTGGACTATAGCATTCTTTCTTTTTTTGTTGTGTTAATATATTCCATTCTCGAACTGGGAACACATTTCTCAGATACGGGGAATGTTGTCTCCGATGACG:1 - 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chrX 13865344 3' + TART-A 13140 1 60.40 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATGTGTGTCAGCGGCGGGCAGGGCAA:1 + chr3R 9940155 3' + I-element 5296 1 76.24 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACAACTAATAGGTGCGTAAACGATGTTTTCCACAGCATACTTTGCGGCGACTTTTGGGAAT:4 - chrX 5275499 3' - jockey 4693 1 59.41 CGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTATTTTTACTCCGTGTTCACGAGCATAATCGACAGCCATCCAGACCTCTTCAAAGTCCATTGTCCTTGTTACTA:1 - chr2R 6729857 3' + diver2 195 2 62.38 GTGGTCGCTTTGTACATAGCTACAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTTTGTTTCGTTCTATTTCTAAATCCCCTTTGAGTGTAATTTAGTTATATCTGA:1 - chr3R 11025664 3' + R1A1-element 5187 1 57.14 AGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCCCAGCAGACACTCGTAGTTGTTAATTGAAGGGAAGCCAACTGAGACACCACTAGAGCAG:1 + chr3L 14680229 3' + flea 122 1 52.48 TATTAAGAAACTATGCACAGTGCTAATTGGTTAAGTTTGTTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTGGGCTTTAGGATTGGACGTTTATGATGAGCGGTAACATAAA:1 + chrX 17949563 3' - gypsy7 5048 1 57.43 TTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCCAACCAAGCATGGCTCCACAACCAGCCCCGCTCATCTTTCCTCGCCAAAACAACATTAATTTTGGACAGTACTACCC:1 - chr2R 1574969 3' - micropia 5237 2 79.21 GACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACCCTTCACCGATCCTTTTCAATTATGCTCGAATGAAGCGGAGGGACAGCAAAAGAAAAGGGACACAAGGACG:1 + chr2L 3136449 3' - 1360 3317 1 76.24 GGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATATCAACATCTACAAAGTTTAAAACTTAAAACTTTGTAGATGTTGATATATCCTTTGATCTT:1 + chr2R 14909553 3' + 412 314 2 45.54 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATTTTTAAAATGACACTTTTATTGTCAAGCTACGCTGAGTTTAGGGAATTTTTA:1 + chr3L 5490153 3' - 297 6600 2 60.40 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCTTCATCGTGTCCGGGGTCAGGGCGTTGCGTTATAAAACGCCAAGACGTTGTTGACAAGCACGTGACAGTA:1 - chr3L 12628231 3' + roo 9041 1 76.24 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCT:1 + chr2R 17346000 3' - hobo 38 1 63.27 ACATGGATTTGGCTTTTTCTAATATATTTACAAAAATAATACAAAACAGGTTATGATCACTCAAAACACCAATACATATGGGGTATTTACAATACATTAGA:1 - chr2R 21389180 3' - 1360 337 1 53.47 TTAGTTTCTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTAGGTCATCTTTTAAAAATAAATATTTTCCATTAAAAAAGTTTGCCCACACTTAAAAAATGGTTTTTATCGTT:1 + chr2R 5180265 3' + FB 92 1 77.23 CTTTAAATATATTCGTGGTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTTATATGAACTGGGTGCACTAATCAC:1 - chrX 4056247 3' - roo 10 2 68.04 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTAACATAATATAATTGCGAATTAGTGCGACCCACCTGCTCCCGCACAAGATCGTCCCA:1 - chrX 13031797 3' + flea 5000 2 66.34 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAGTTCCTCTGTTTATAGTTTATATTTATGTTTATAGTTTATGTTCTTCTGCATCTATATTGATAC:1 - chrX 19326762 3' - pogo 10 1 67.33 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGTCGTTGGTTCGAAACTCTTGTTTAAATAAATAGGCGATTCCGTTATAC:1 - chrX 22690714 3' + roo 407 1 74.26 TTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACATTAATATTTTAAACAATTACAATTAGAAAATATCAATATCATTTTTATT:1 - chr3L 10964481 3' + 1360 265 1 67.33 GAATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGGTAACCGATCCCAGAGATGTCCCAGCATTTCACCCACTCACCATTAACGTTGCACACTGCAATTTGTGTTTCAAGC:1 + chr3R 26584171 3' - accord 185 2 54.46 TAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTGAGATTTCTTGTCTGGTTGCTTCCAGC:1 - chrX 11697183 3' - P-element 2871 1 32.67 AAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTCATTCGTTGGTGGCTTGAATATGATGCAATTCGGATTTATAGCCATGACCGCCATAGGAGGTCTAAATAAATTGAGA:1 - chr3R 9364577 3' - Ivk 5019 1 65.35 GTGTGTGTGTGTGTGTGTTGATGGAAGAAAGTTGTAGTTGCATGGGTAACTGCGAGAAATCGGGAGGAATTGTGAAGAGGGCGGCATGCAGGCTACCAATG:1 + chr3L 7162621 3' - accord 7027 3 69.31 AATATTGCATAGGCACATACTACACCTTAATTCCGCACTTTCAAAGCTTATTATTAACTTGCACACTTCAAAATAAATAAAGTAGATTAGGGAAATCATTT:1 - chr2R 19873032 3' - 412 3 2 76.24 AATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACATGATTAAAATTACGAAATAATTTGATCTTTTT:1 - chrX 6156177 3' - 3S18 45 2 66.34 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATTCTTCTTTTAAGCAAATACTTTCTTGATTTCTATAGATAGTTATAGCACTAGTTTCTTCGAGTGTCTTG:1 + chr3R 27179263 3' + mdg1 415 2 67.33 CGACTATCAGATATCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCTATTGCGAAAATTTCATAATTTTTCTGGAATAAACATAGATATAGCGGCATAAATCCAGCAA:1 + chrX 21302506 3' - INE-1 550 1 72.00 TAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTGGCCCAAACAAAAAACTGAAAACGAAAATGGTGAGCACGGACCCAATTCGGATATTGCGTA:1 - chr3R 19416457 3' + invader2 4778 1 68.32 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCACAGATTTCCTTTATATCTAAGCAATAAT:1 - chr3L 21110282 3' - 297 6625 2 76.24 TGTGTCATTAAGGTCTTGAACCTTTTATGGTTATATTTATGCAAACGTACTACATGCATAAATATATACCAATATTGGATACAAAAGAAATATCCAATATT:1 - chr2R 5449567 3' - baggins 5084 1 40.59 TTAGCTAGGGAAGGTAAATTTATTAAAAGTACTACGCCTACATCTACAACAAGGACGACTCCGAAGGTAACAACAGTGATCGTTTCTACTCAAAATCCAAA:1 - chrX 1554895 3' - Cr1a 3996 1 75.25 GGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGATGATTGCCACAACGGTGTGTTTCTACTTGGTGGTCTTGGCCATTCTCATGGCCTTCCTG:1 - chr2R 6050063 3' - 1360 3227 1 58.42 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATATATGTGCAGTTGGGCGGCTGATTGG:1 - chr2L 14001155 3' + 1360 3353 1 73.27 GCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTCATTGGAATGCAAACATAACGCATACGCAGCGTTGGCAATTTTGGAGAAGAGACCGAAGCTGTAGGC:1 - chrX 1018348 3' + transib2 2815 1 70.30 CGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGGAACGAGACAAGACCTCCTTCAGT:1 + chrX 12401423 3' - I-element 226 1 76.24 CTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATGTGTGTTTGTGTGGAAAGTTGTGGGGGAAACGGGT:1 + chr3R 9137329 3' - Doc 4544 1 65.35 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAACCCTTTT:1 + chr2L 15833088 3' - hobo 17 1 59.41 TTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTAGCATCTGCGGCGTTGAGTGCTTGGGGCTCAGTATTCGTGTTAGCCATGTGCATTAATAATGCAA:1 + chrX 2302218 3' - F-element 4312 1 69.31 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTAAATTAATCTTTGGCTGCCGCACAAAAGTATGCTACACAAATA:1 - chrX 18155837 3' + hobo 2906 1 57.00 CACACAGACTTACACACACACACATAGAGAAGCACTGAGATGATTTGGCAGGATACGGGTCGTATCGGAACAGATAGAGGACGACGACTCTTAACAGCAGG:1 + chr2R 12275558 3' + Quasimodo 28 2 77.23 CTCAAAACTATTTTTTTCAACCATTTTTTTT:1 - chrX 3249369 3' + 17.6 7404 2 70.97 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTATTGTATTGCCTCAACTATCTGATACCGGAAGTGCTAAGGAGTCAACAGTAGCTCCACCTAGCG:1 + chr2R 17650039 3' + 1360 3378 1 70.30 CAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCCGAACAAAAAAAAAAACGTTGAAAACACTAGAGAATGCACTCAAACCGACTGCTGGTGGCCAATTGTGCAATTT:1 - chr3R 17994877 3' + I-element 360 1 75.00 GGTGAGTTTGGGAGTTGGACATAGTTAATGTTAATGTTAATGTTAAAGTAGTGACTGCAACGAGTTTGTATGTACACACAATTTTCGGTTAGAAACACTTG:1 - chrX 2672020 3' - TAHRE 10296 1 54.46 AAAGCAGTGAGGCATCACAACTAAATCGCAAATAAACGTTTTTAGCATATTCTTTAATAATTATTATTAACATTAATAATACGATAATTTCTCAGTGTTAA:1 - chrX 12151576 3' + diver 219 1 73.27 GAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAATAAAAAACGGTATAATGCCACGCAAAGTAAATAAACG:1 - chrX 13315292 3' + F-element 47 1 66.00 TGTTTATTTTACGATACTGCTTATTTCGCGAGTTGTTTACAGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACTTATCCAGTTGAATGTAATAATTT:1 - chr2L 17888008 3' - diver2 305 2 76.24 TCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCCGCTGACCAGGAGTTGGCGCTGCACTGAGAAAAACGAGTGGAGCTATTTTAAAAGAAGTGT:1 + chrX 12099872 3' + opus 137 4 63.37 TGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGAAAAAACAATTGAAATACCCGTCCACAAAGCAAACCTTAAACAAAATCCAAAAACCAAGCTGTGTGCAAATTCAAA:1 - chr2R 18119621 3' + HeT-A 6051 2 82.18 ATTTAATGTATTTATATTTATTTATAAACGGGATCTTGGACTCATTCTATCACAATCGCATATCTGTAAAGAACGTTTTTGGTTAAAGTATGCACCTGGGC:1 + chr2L 10218906 3' - diver2 450 1 71.29 GAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTTCCACACCAACTCCTCAGAGGGGGCTCCTCTTTTCACCCTCTCTTC:1 - chr3R 6410986 3' + Doc 350 1 54.46 TTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCCACCATACCGCTTGCTGTTGCTTTTCCACAATGGCATGCCAGAACGCTAGAC:1 + chr2R 17348030 3' + hobo 275 1 59.18 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGTCGTTGGT:1 - chrX 22690754 3' + roo 9030 1 65.35 CGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCACTCACACATTTACGGGCAAATACTAATGCATACTGGCAA:1 + chr2L 11220032 3' + F-element 4365 1 66.34 TGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATCTAGTTTAGTTAGCAAGGCGCTGACTGGGCTGACGATGACAGTTGTGGGTAATTGAAGCCAAAAACCAACGTG:1 - chr3R 9341923 3' - I-element 394 1 76.24 TCTAAGTCAAGTTGAATTTTGTTACTATTTTTTTTACTTGAATCTTTCAGTGATTTTATTGTGGCAATTTACCCTGTTGTTGTTTATAGGGCCCTGCGGCT:1 + chr2L 179086 3' + HB 1389 1 74.26 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATT:1 - chr3L 25272568 3' - 1360 58 1 80.20 TTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGGTTTTAATAAACTTAAAAAGAAATTATATAGTGTACAAACATTTTAGAACACTTTATGGAC:1 - chr2R 12245016 3' - Stalker4 7049 4 62.38 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTTCATGAACAAGCAAGGTTTCGACTTTGTTTCACTG:1 + chr2L 20387901 3' + 297 354 2 65.35 CACACCATTTGTTTCAGTCTTAAGCTGACATTCAATCAATAAAAACGCAAAGCGGATTTATTCGGAGTTTTAATTAATTTCGCCCACCAATAAATTGCGCA:1 + chr2L 1857805 3' + Tom1 269 1 73.27 TTGTAACTGGCGCAGCCGGTCAACGGACAAGGGATTAACAATGCCCACTACGCTTAAAGAGGTATTGAACATGTGGACAGGTGTGAGTGCGTGGGCCGATA:1 - chr2L 1597943 3' - accord2 7423 1 74.26 CATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCAAACACGATTCCGACTATACGTATGCATATTGCATATGGGTGTGTTTGGCCTGGCT:1 + chr3R 22642672 3' + Gypsy12A_LTR 1935 1 56.44 GTGTGCATGAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATATTATTTTATTGTTTATTTACTATTGATATTTATAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAG:1 - chr3R 19449885 3' + invader1 3802 2 59.41 TTGCATTTTTGAATATTACATTTTTTCTACCTAATATCTAATTTTTAAAGATAAAGTTGCTATATGAATGCAATAAATAATACATAGTAAGAGCCATCATT:1 + chr2R 20379286 3' - TAHRE 10324 1 58.42 TCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTAACGGTTGTGCTAGACCCAATTATCCAGGAGTGTATA:1 - chr3L 14674755 3' - Idefix 276 2 63.37 CGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGAAATAAAGCATGTATAACAATATTGAAGTAGATTAAACTGAAATTTAAGAGCTGAGCCAGCC:1 + chr3R 30215527 3' - opus 8 2 50.50 CAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGGGGGCAAACGTTAAATGAGTTTCTAGGTAAATCCTATCCTCAAAACTATGAAACTAATTTTTTATGTCTTCAAT:1 - chr2L 18565454 3' - FB 729 2 70.30 ATATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTTGTAATGGTAAATGAATGCAATTAGGCTGGGAATATCCCCTGCGGCAGCTGC:1 - chr3R 26204042 3' - Max-element 320 1 65.35 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGGATAAGTGGCCCA:1 - chr3L 11367480 3' + roo 393 1 61.00 ATTATTGATTTTATTTATTTAAAAGAAGTACCAATTTTTTTACTAATATAAAAATTATACTTTCAAAAACTTTTTACGATAACTTGTATATTCAAATGGTT:2 - chr2L 15819509 3' - HeT-A 38 1 56.44 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATGAGCATTGCTTCTATTTTTTTCGGTGCAC:1 + chrX 910835 3' + I-element 5309 1 74.26 TTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCAATTTGTACCACATTCACTTCGACTAGTAGAGCAGAAAAAAATGTTTGCTTGCGAT:1 - chr3R 8544879 3' + transib2 2782 1 62.38 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATTATAATGCCGGGCCAAAAGCAAGCCAAACCGAATCGAGCC:1 + chr3L 14285100 3' - roo 8667 2 77.00 TGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTGGGATAA:1 + chr3L 21912354 3' + Bari1 1695 1 67.33 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCCAACTTTCAAACAGCCAAGTGAAATGCGCGCTAGTGCGTGCAATTGTTCGTTTAATTGTTCTC:1 - chr3L 13674617 3' + hobo 2926 1 66.34 GGCTGTTGGGGTGTACATCAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTGAAATGGTTTCTTCAGTTGAGAATTTAATTGATTTCTGAGAATTTTAGATTTTTTAG:1 - chr3R 27071841 3' - jockey 4664 1 76.24 TTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTAGCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCAAGTT:1 - chr3R 6769706 3' - mdg1 37 4 63.00 AATGTTCAAAAAGAAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGACACTTCTGGTTCAGTGAAGCATAAGAAATTCTCGAATGAATCGCT:1 - chrX 20033231 3' + invader2 492 1 55.45 AATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGAGGAAGACACAGAAATAACACGAAAATGTTT:1 - chrX 10119540 3' + FB 26 1 67.33 AGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATA:1 + chr2R 545173 3' - F-element 441 1 58.42 TTGCATGCATTAATTAATGCACTTATCCCGTTTATAAATAAATATAAATACAATAAATTAACTAGTTTTTGATGTTGTGTCATGCAAAATAATTTTCGAAT:1 + chr3L 5627554 3' + diver2 414 1 55.45 GTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCGTCTGTTTTGTCTTGTTATTGCTTTTTGGTTTCTCTAC:1 - chr2L 12521106 3' - I-element 489 1 70.30 GATATGGTTTTCTGAGAGTTTTTTGATGAGACTACTAAAAATGTTGGATGCTTTCATATGGTCATCAGTGGGGGTCAATTTGTACAACTGACTTTGGGTGC:1 + chr3R 14698613 3' - Ivk 352 1 52.48 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAAACTGCCTTTCGTTGCTGGACATTTTTAATAATACATAATATACTTG:1 - chr3L 10554761 3' + roo 9046 1 52.48 AAAACTGAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCTGATTTTCGATTGACGTGCAGCTGGGGTAAATAATTTAATTTCATTTATTTACATGG:1 - chr3R 9606190 3' + roo 9053 2 62.38 ATCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGACAGACTGCAGTGTATATGAACACAGTGATGGGTAAAATAATTGAGCTGACTAGTAAAAATATTTGTTTAATT:1 + chr2R 22732818 3' + Doc3-element 338 1 51.49 TATTGATTGAATATCAGCTTAAGACTGAAACAATTGCGTGCTGGACTTTTCTCCTTATTGTATTTACACCTTAGCTCCGAGAGTCTCTATATAACTGCTCC:1 - 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chrX 14729034 3' + Q-element 221 2 75.25 GTTACATACTTTTCAACGAATCTAGCAAATTATAGTTTACAAATTAATCGCTTGTCAAAATCGAATTCATCATTATTATTATGTAATATTTGTCAATACAT:1 + chrX 20112311 3' - INE-1 15 1 66.34 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTTAGACAATACAAAAAAAATGGGAGAGCAGACAGAAA:1 + chr2L 10820652 3' + roo 9034 1 66.67 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAGGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAAATGTCAGCCAAAGTATTTCGCATTCATAAATAATAATATGGAAAA:1 - chr2R 16980048 3' + opus 474 2 55.45 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGCTTTAATGAGTTCGGGATTTAAATTAAACA:1 - chr2R 21860505 3' - roo 8710 2 73.27 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCTCGATTATCTTACTTGGCCCAAACAAAAATGGAGAACTTAAGAAAATTTACAATGCTAACGAAA:1 - chrX 15259006 3' + roo 397 1 67.33 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTCATTGCTAATTAAGCCAAAGATGGGACAGTATTTTGGAA:1 + chr3L 16449795 3' + roo 9036 1 62.38 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAGGAACTGTAAATCATTACGTTCGGAAACGTGCTGCTGCTCGGACGGAAACGCAGAAACTGCGGATAAAAGG:1 + chr3L 9763588 3' + P-element 2881 2 74.26 ATTTAAGTTTGTTGTTTTTTTTTTCGAGTTTAACTAACTAAACATGACCACTACGGTTTTCGGTTTACGACTACTCCGTATGGCATTTGTTCTTGCCTCTG:1 + chr3R 20786270 3' - gypsy7 5020 1 53.47 TCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGCCCCACATTCACATTGCCAAACACATCCGACATGCAAAAGTT:1 - chr3L 5490063 3' - 297 6561 1 58.00 ATTTTCTGACGATGAGGTTCACTCAATCTCCTCCGTGCATATGTATTTTTTATAAGGGCGTGCTCAATTAACGATTATGATTATGATATCAATAGAGCCCG:1 + chr2L 503468 3' + TAHRE 473 1 75.25 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCTTTACCTTATGCCTCTTGACTTTTATCCCTAATTATTTCTCTTGAATGGTTT:2 + chr4 1234599 3' - 412 7076 2 56.44 AGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTATGAAATGAATCGTGCTGTGTGTCCTCGTATCCTGGCAACCTCCAATCCGCGCTCGCGAAG:1 + chr3R 30227912 3' - Doc3-element 4660 1 61.39 GCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATACATATGTATAAGCCGCTAGCGTTTGGCTTGCCGTTGTTTTTGCCAAATGTTATCAGTTC:1 + chr3L 10381314 3' - Idefix 17 2 56.44 ATATTTAAAAAGAAAAAAAACACAATTTCGCTAAATGGAATTTCCCCTAATGAACATTTTTCTGCTGCTCTTTTCGCTGCCTGATTTTTTATGCGTGGTCG:1 + chr3L 14359025 3' + TART-B 10510 2 79.21 AGTCACGACAAACGTCAGACATCGGTTTACGCAATGTATGGAGAATGACCACCATTCTCAGTCACCTATCAGACATCATAAAAAGACAATTAAGTGTCTAG:1 - chr2R 1779903 3' + mariner2 715 1 72.28 TCACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGAAACCGTCGAAATCAAACCAAAGCAGTTGGCTGTTAACCTGTTAACTTGGTTCGCA:1 + chr2R 13996567 3' + flea 4589 1 58.42 ACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAGAAGGTTGAATTTCACAAGTTTATTTG:1 + chr2L 18977749 3' + Stalker4 6989 4 73.00 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAAGTTGAATACAGCATACTCATTTCAACCGTTGCCAACAATATGAAGTGGATGTCCTTGGTC:1 + chr2R 18389988 3' - F-element 33 1 45.54 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGGGATGCCCGGTAGTTAACCAGCCATTAATTCCCATCGAATCGATGGAAAAGAGTGGCCTCCCTTTGG:1 + chr3R 20170540 3' + hobo 2931 1 65.00 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTATATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGCTCTCGTGCTGCCGAGG:1 + chr2L 128731 3' - P-element 57 1 23.76 TGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTA:2 + chr3R 2689431 3' + diver2 4476 1 66.34 CGGCTCCGCCTGACACCTGATTAGTAAAAGCCGCGCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTCATAATTGGCGTCAATCACGAAATCAAATGAAAAACATAG:1 - chr3L 14429349 3' + gypsy2 6774 2 71.29 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAAGCAATAATTTATGTCGCCTTCTAAGACACCATACATATTCCCAATTTTGGTGGATGAAGAAAATATATA:1 + chr2R 10777902 3' - pogo 4 1 75.25 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACACTTTCTGTATTCACAAATTATCTTCCGGCCGTTCAAATTC:1 + chr3R 7943916 3' + roo 9032 1 59.41 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATATTTTTATAGCTTAAGATACTTTTACGCAGAACAGATAGTGTAATGTTTTAATGCT:1 - chr3L 11335430 3' + pogo 2086 1 61.39 GTTGTTGTGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGCATAAAAGTAACAAAATAAATGCACATTGTAAATTAT:1 + chr3R 11049574 3' - I-element 117 1 63.37 CTAGCACAATACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCACACACACACACACACACACGATATAATTAAAATTGTTAATCGC:1 + chr2R 21309305 3' + 1360 3211 1 55.45 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTCAGACAACTTTACGCGAGTATTTATAACTCAACGCTTGCTTTTAGTTTGTGCGGAAAGCTTTCAAGTGG:1 + chr2L 9330317 3' - hopper 4 2 74.26 CCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGTATCCTTTTTATCATAGTCTCGAAAAAGATACATTTCTCGCAGTGCATTGTCAGTCATTGTGTTG:1 - chr2L 1263432 3' - F-element 4357 1 64.36 TAAATAAAATAATTTGTTTTAAAACTCTTTAAATATTTCGAAAATCATCTCCAGGTAAATTTTCATTTCATTTTCATTTGAGTCAGTTAGTTTCCCACAGT:1 + chr2L 12553436 3' + jockey2 3385 1 75.25 GTTTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTCTTCGTCTATCAGGTTTCAATTAAAATTTAGCATAAGACGCGGACAGGCAGCCTTAAGCGC:1 - chr2L 12381198 3' + diver2 227 2 62.38 TTACAGTCTTTTTTTTTTTAATAAA:1 + chr2R 11711493 3' + accord2 348 1 96.00 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAATGTTCCGTAACTTGG:2 - chr3L 17215703 3' - Ivk 15 1 64.36 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAACGACCCTCTTCCACACGCCATTGCCTGGTTCGACGCGAG:1 + chr3L 153643 3' + 1360 3351 1 64.36 TTTTAAATTGTCGTCCTTCCAGATATGACTTTAAAATGAGTCGAGCGACGGTTGAAGGAGCGAAGGGTCGTAGTCACTGGAGTACAAGGAAACCGGGGACA:1 - chrX 5853338 3' - Helena 496 1 57.43 GTTGTTGCAGCTGGTCAGCTAAGGGCCAGTGCCACTAACCTACTTCAAGACAACCGACAACTGAACCGACTCACAAGCTCAACAAGCCAGCAGCTCCCCG:1 - chr3L 8005944 3' - TART-B 113 2 72.00 GTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGAACTGAGGCCATTAAGTTATATTATGCTTAATTTCTATCCCATTCAGTGTGGAGACAGTCGTT:1 + chr3R 28678262 3' - I-element 22 1 56.44 AAGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCTTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAG:1 + chr2R 4677360 3' - invader3 5197 2 69.31 AACATTGCTTAATTTGTTTCTTTTCAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTC:1 - chr3R 19449418 3' - HeT-A 5765 1 57.43 CTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGAGGCTAATGCGTGTATGAATGAATATTTGTTATTTTGAATGCATCCACGACTCGAATGCAAACATATTTG:1 - chr2L 14703332 3' - Quasimodo 7027 2 73.27 TATGTCCTCTGCATACACATGTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGCGTGTGTATCCGTGCAGCCCCATGTGTGTGTGAGTGTGGACTACTTTCTGGTGCGG:1 + chr3R 19749798 3' + Stalker2 7488 2 70.30 CTGAAAATGTGTAAAAAAAAAACTGGCTAATCCCGCTGGGTAAGTGGTAAGTAGACTGCTGCTATTGCTTAAAATTCATTCAGGAGACT:1 + chr2L 3873014 3' + TART-B 10504 2 91.01 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATATTACTTTCTTCAATAGTAAGTAACCTTAAAGTATTT:1 + chrX 7741763 3' + roo 9034 1 65.35 TCCTCCCATTCTAGAACTGTCCGCTTCCGAAATTCCGGTGTGGGCGGCGACGTTTGTCTAATCTTAACGGTTTTACATTTCATTGCGCCGGGTAATTGTCT:1 - 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F-element 63 1 76.24 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATAAACAGGCTGAGAATACGACAACTTCGAT:1 - chr3L 14260353 3' - 297 62 2 50.50 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTTCGAATTTGGTATAAGGATGGGGTT:1 - chr3L 9174668 3' - 412 18 2 61.39 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATGCAGTGACCATGTAATTTGCTCATTAACAAATTGCTTGAGTTAAAGCCCACCAGAAATACAGCAA:1 + chr2L 18506838 3' + flea 247 2 70.30 AAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGCCAGTGAAGGGTTAAAGATGCCGACATTATAATTCAACATTGGCATTATGCAAAAGCGTCTAAAAACTTT:1 - chr2R 17269688 3' + transib2 2821 1 74.00 ATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGTGGCGGTCGTAATCCTTATTCTTATCCCGCTCGCGAT:1 - chrX 13299353 3' - Max-element 318 1 63.37 CTAAATATCTCGGATTTTTGCACGGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTAGCTGAAATGTTTGCAATTTTCCAACATCCAAGACGCTCTG:1 - chr3R 9228236 3' - Ivk 318 1 61.39 CTCGAGTATTTTGTGTTGCCTGTACTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTCACAC:1 - chr2L 15832979 3' + hobo 2849 1 75.25 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATA:1 + chrX 10629250 3' + P-element 2838 1 30.69 AGTCGCGAATGCGTCTGTGGATGTTTATGTTTACATTAGGGCAAGGACAAGACTATTAAAGAGTAACTGAAGCCCCAGGTTTTGTATATTAAACAAAGACA:1 + chr3L 20325503 3' - Quasimodo 313 2 64.36 CTATCTATCATAATAATAATAATAAAATAAAATGCAACACGGAGTCCTTGTCCGTGAAATCTGGCCACGCCCCCAGTACACAACCCCCCAGATTTTGCGGT:1 + chr3R 6135313 3' + I-element 5350 1 76.24 GGGGTACTGCCAGCAACTCAAATATTGAGATTCTACAACTTCGTCGACTGTCTCCTTCTGACATTCGGTTTGCGGGTTTTGCAGAGGGGTACTGTTAAGAA:1 + chr2L 12318763 3' + G4 3451 1 65.35 AGCGGAGCGCTAGTGGTCCTGCTCAAGAGGGGGCTCCCAGGCGTACATTTTCAGCACCTGAATGGCGGAGATTACTTCATTGACCATCCGAATCCGGTTGT:1 - chr2R 9391858 3' + mariner2 62 1 72.28 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACTGCAAATATCCATAAATAGCCACGAAATTTTCCATTT:1 - chr2L 10820599 3' - roo 8703 2 71.00 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATGTAAGTGAGTGAGTGAGTGCA:1 + chr3L 3476396 3' - jockey 4693 1 76.24 CAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACGTATCTGTTATAGCTCAACCTAGACCATTGAATCGTCCCCCATATGTCAGCAACCAAAGAGGGTAAAAAAAAA:1 + chr2R 17357152 3' - jockey 4907 1 41.58 AAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTCCGCGAACCTCCATCAAAAAATTTGCATAAGTCGACGACATCACTGAACTGATAA:1 + chr4 405328 3' + jockey 122 1 57.43 GCTGAGCATGCACTTAGCAACTCAAGTGGTTAAGGTAACATCGCGAGTACCCGCTGCGGACTTTGAAAGATTGCCAAATAATTTTGGTATCTTATATTGAA:1 + chr2R 16659656 3' + Stalker2 7438 2 67.33 AATACTGCATTTAATATGACATTTTGGTACATTGTTGGCTGAAAGGACATTTATTTAATTGCCCCATGCTTGGAGCAATTAAATAAATGTCCTTTCAGCCA:1 - chr3R 14991052 3' - Gypsy12A_LTR 88 1 55.45 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTTCTGCTGTCACATTTCTTTTTCTGCTTTTCAGCTTCTCGCGTGTTTTTTTCCACGGATCTTTTTAAATTTTTTTTTAGT:1 + chrX 323657 3' - accord 181 3 67.33 GCGTGGCGTGCAGCTCTCGACTGGACCACCCACAAGTCGTGGCCCGCTTAAAGGGGAGAATGATATTTCAGTTTCTATTTATATTTCAATGGCGTCCAACA:1 + chr3L 22821521 3' - G5 4451 1 75.25 ATAAATTATAAATTACAACAGCTACAAACATTGAATAGATGAGAGGACGGCAGCAGACGGTAATGATAAATATGGAAGGAGTGATGTCGACCAGACGACCA:1 - chr2L 4134292 3' + copia 257 1 78.22 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAAACAAACATTTTGTTACCAAACAATATAATATTCATATG:1 - chr2L 16968419 3' - 1360 37 1 64.36 TGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCGCTGTGTCTAAGTTAGCGCACCTGAAACTGC:4 - chr3L 15452843 3' - accord 9 2 68.32 ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACCAGAAATCAGGGCGTTGAGGTGGTATCAAA:1 + chr3R 7832922 3' - 3S18 48 2 69.31 ATTATAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGAATGCAAAAACTGCAGGGGAGCGATGGATGGAAGTGCATAGCA:1 + chr3R 18113622 3' - hobo 31 1 58.42 ACACTATAAACTTTTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCCTTCAGTCGGCCCAGGACGTCACTTTTTGCCCGCTGCCAGCTATTCTGCTATTCTCCTGCT:1 + chr2R 19201565 3' - rooA 7595 2 65.00 CTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGAAATCCTACAAC:1 + chr2R 17402778 3' + invader4 287 2 66.34 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGG:1 - chrX 4056275 3' - roo 8706 2 68.32 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAAGGGCCTTCTCCACCTTTTGGATGACGAAATCTAAGACCGGCTTTCATAAGCGTGGCAAA:1 + chr3L 9505903 3' + P-element 2871 1 62.38 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTG:1 + chr2R 17345990 3' - hobo 51 1 74.26 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTCTTTTTGGTTTTTTGCGGCGCCCATCAATCACCAGCCGTGGAATGT:1 + chr3L 10565357 3' + pogo 2077 1 53.47 GTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCATTTAGGACGACGGCTGAAACCAGAATGGCAACAACAATTAC:1 + chr3L 9982694 3' - F-element 406 1 58.42 ATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGTAGGGGGAAACTTCTTGGC:1 + chr3R 25514163 3' - hopper 49 1 72.00 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTTTCAAATTGTTTTCCAACCTGGAATTTTCCAA:1 - chr2R 22521821 3' + roo 9030 1 66.34 AAAAAAAATTACATTAAAACCATTTAGTCTTCAACAACTCTATTTTTACATTCGACAGTGCTTTGACTAAATTGGCTTAACTAAACTAAGCTTAAGCTGTC:3 - chr3L 17206718 3' - transib4 27 1 63.37 ATTATGTTCGTATATACTACAATGTAAATAGAAATGAAGAAATGTAAGAATGCTAAAATAAAAACGTATTTGATTCTTATATCTTTGATTTCTTTCTCTGT:1 + chr3L 6024607 3' - mdg1 7038 1 68.32 ATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAAATAATTTAATGACTTGGAGGAGCGGTTGCCCATTGAATGGCAGGGAG:1 - chr2R 7694057 3' + I-element 5315 1 56.00 GCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTAAAGCACATATAATTATTAGTTTTGTAC:1 - chrX 19080297 3' - Ivk 49 1 74.26 TTTTAATTTAGTTTATTTTATAATGCTCTCCGGTTTTTTTTTCAGTGCGACGACTCTCTGTCGTTGTCCTTCTATATTGACAATTTTTACAGCTTTTATCT:1 + chr3L 10666147 3' - F-element 90 1 60.40 GTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAACTTTTACCTTATCAATCGAGCAATTCTTCGTCAT:1 - chr2R 3293733 3' + 1731 293 2 56.44 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGACTATCAGATACCTCTTACCCATGCTCTAGGAATATGAAGA:1 - chr3R 10078318 3' + roo 9038 1 57.43 ATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTAAATCGCAAATAAACGTTTTTAGCATATTCTTTAATAATTATTATTAACATT:1 - chrX 12151603 3' + diver 192 2 49.50 GGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTATAGCGATTCTGAGCCGCGCTTCTCGGCAAACCCCTCTTAGTCGCCATTCTTTGGCCGC:1 + chr3R 25704008 3' - accord 419 2 44.55 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGGAAAATCATTTTGTATTACTCATGCGCCTTTAATATGATAGTTTTATTTTATTCGTACAATTG:1 + chr2R 23908447 3' - Transpac 4926 2 73.27 AGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATTTGTCAGATCTCCCACGAATTAAGCTAAATTAGAATCGCCGAGGGTTAATGCTGAGGCGGTAACTCGC:1 + chr2R 3351519 3' + micropia 5436 2 69.31 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCATTTATCTGGTACTTGGCTTTATGAATAATTCAATATTTGCCTA:1 + chr2L 5741378 3' - 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Idefix 7033 2 77.23 GATGGGTGGCGAAGGAGGTGTGGGTGTTATTCTAATGTCTTTGGTTATGCCGTGACACAGATTCGACGGTGTCTAAGCACGGTGTCACTCTAAGCCCTTTC:2 + chr2L 22541710 3' - transib4 2418 1 76.24 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGAC:3 - chr2L 13598187 3' - pogo 31 1 57.43 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACAGTGTAGCACAGACAGTCAAAAACGCAGCATTGGGTTGTCTGTTTCAACAGCAGCAGAAAGGCAGAA:1 + chr3L 10554859 3' - roo 8 2 65.35 GAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGATTGACTGAGCAATTTGCTAATCGGTCAAACGGGATTAGCTTGTCGGCAGGATTAGCGAGCA:1 + chr3R 9479188 3' - flea 158 1 70.30 TGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACTGGCTGCCGCGGCATTAACTCACTTTGCATTTGCAGCTGAAGCTGAAGTTGCAGCAATAGCTAT:1 - chr3R 16129760 3' + jockey 34 1 69.31 ATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTCTGATATTATATAGATGGGATATTAAAAAAGATTTC:1 - chrX 18680776 3' - I-element 235 1 64.36 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTTTTTTTACATTCATAATACACATAGATA:1 - chr2L 17066822 3' - copia 4916 2 73.27 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTTGTAGGCAGCGCTCTCTAATACACTCGCTACGGAGGCTCTGAGTTGTCGAAAAGCCATCAAAAGTCGTGGCTTTT:1 + chrX 10437645 3' + hobo 2933 1 69.31 AAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCATAAAAAGCGAACAAAGACTGCAACTCGGAGATGTCCCGACTG:1 + chr3R 7009387 3' + F-element 58 1 63.37 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCGTAATGAACGCTTGTTAGTTATTTTACTTTGTAGACTTTTGGAAATTCGTTGAAAATTGTTCACAA:1 + chr3R 17909123 3' - jockey 4837 1 74.26 CTTTAGTCGCCTTTTACGACAAGCCCAGAGCGCTGATGTAGTATTTTTGGTCCGCCACCACAGGACACATGTTTATCCTCTAAATCATTCGTCCTATTTTA:1 - chr3R 23267718 3' - Rt1b 4885 1 74.26 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCGCTGACACAGATGGCGCCCGAACAGGGACAGGTGGCTGCCA:1 + chr3L 4051116 3' - pogo 35 1 59.41 CCACAAGGCTGGTAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACCTAATATATTGGACAGCAGTTGCATGTAAGCCTCGTTACTAGGGGAAACACGCCCCAACAC:1 - chr2L 9810339 3' + Gypsy6A_LTR 259 1 58.42 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCAAACTATAGGAAACTATATCCA:1 + chrX 19850475 3' - pogo 51 1 79.21 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGCAGAA:2 - chr3R 25514117 3' + hopper 1378 1 63.37 GCTTCAGAAGACGGGCTACTTCATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCAGAACGCCAATAGAAATCAGAAGGGGTAAAGGCCGAA:1 - chrX 10399639 3' + gypsy4 166 2 70.30 AAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAACAAGCGAACCAATTCGAATTTTTTGAATTCAAGTTATA:1 - chr2R 10823445 3' + G2 3025 1 62.38 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCCTATTCAAATTGATCACTTAACGAAT:2 + chr2R 9001688 3' + mdg1 7408 2 75.25 ATATTACTGCTCGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAAGAGGATAACACAATAAGAGAAATCCGTTTGTCTGTTTGCTGATGGCCAAGTCGACACTTGTCGG:1 - chrX 12872145 3' - Dm88 137 2 58.42 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGCGAAGACGCCTCCGTTTGTCGTTCGCAGC:3 + chr3L 813865 3' + roo 361 2 71.29 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCAACAAATATAGGATGATACATAAGCGGTCGTCGTTGTTCAATTTTCCGCTGCTATTGCTAAA:1 - chrX 7698569 3' - pogo 11 1 68.32 GACCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGACCTGTTCGCTTTAGCGATATGATACCACTTTAAGTCGTTTGACTTT:1 + chr4 184019 3' - 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I-element 354 1 65.35 TGGTCCTCATGTACCAAGGAGCGCCTGTCTCTGCCCGCCTCGTCAATCCTGTTGGTGTCCCTCCTGCGTTTTGTCAGTCAGTCAGGATGAGTTTGCCGTGG:1 + chr2L 8554716 3' - jockey2 2997 1 59.41 GTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTGGCGCAGCCGGACTAGAACTAAAAGGATTGCAGCCATGGCCCAAACATTGGCCATGG:1 - chr2L 1750091 3' + accord 7361 2 72.28 ATTCACACGCTCCGCGATCGGCTTATGAATTGTATAAGTTAAATACCAGTTCTCGAAATCTATTTCTAAAGGCGTGTTAACTTTTAAATTAATAGTCTTCC:1 + chr4 617503 3' - Stalker2 7416 6 67.33 CGATAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTAACTCAGTAACTTTTCTCACGTCCCAATGGTTCGAGTTAACAAGATAAGGGAAGCAAGAGACTCGGATTC:1 - chr3L 22235754 3' + Rt1b 5102 1 75.25 TATCGAATGCACAAGTTTAGTCTTTTCCGAAAGACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCAGGACTAGTCTGGCCGGGAACAGC:1 - chr2L 10024513 3' - diver2 240 2 76.00 ACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATGCGTACCAACGGCAGTAGAGGGTTAAGCGAAACCATCGCATTTGTGCAAAAGTTTCACG:1 - chrX 5210699 3' - G2 2863 1 68.32 CCTAGTAGATCTTTAGATACACTATAATACCCAGGGCCTGCTTGTCCGCGCCTCCAAGCGGGGTCGGTTCGATGTACGCTACTACTACGATCATCTGAAGC:1 + chrX 12329561 3' + mdg1 134 2 75.25 TCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAATGCGAAGATTTTAATGTTTGCAAGACACCCAATTGTGCTTATAAAACCATATACAAGAATAGCGGTGCAA:1 - 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chr3L 13668978 3' + Idefix 263 2 54.46 TGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGC:1 - chr3L 25232769 3' + accord2 171 2 54.46 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTTCGAATTTGGTA:1 - chr3L 9174681 3' - 412 7084 2 54.46 ACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGCATTCAATTTGTAAAGCAATTCACTCGCTTCTTATGCTAAATGGCAATGGCATTATATAAA:1 + chr3R 27886609 3' + copia 4889 2 65.35 CGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATAGCGAAATAATGATAACGAAAAAGAAAGAGTAAAACCTAAAACCGAGACGAAACGA:1 - chrX 20771144 3' + Idefix 7207 2 58.42 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTAGTTGATTGCCAGCACTCAATTTCTTCAAAGATGGAAAG:1 - chr2L 5653539 3' - hobo 37 1 64.00 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGGC:1 - chrX 11025508 3' - hopper 37 1 57.43 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTAAACAGGCCAGAATCCGAATCCGAAC:1 - 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412 1 2 76.24 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATATTTTTATAGCTTAAGATACTTTTACGCAGAACAGATAGTGTAATGTTTTAATGCTACTATTTAAGCC:1 - chr3L 11335418 3' + pogo 2098 1 73.27 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTTATATGAACTGGGTGCAC:1 - chrX 4056254 3' - roo 8684 2 59.00 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTTTTGCATTGCCATTCGATTGGTAACATTTTAAAGCTTATTTGATTCGGAACGCACGTACCAAACTCCTCGG:1 - chr2L 10165563 3' - mdg1 5 2 76.24 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGTAAAATCACGTATTAATTATT:1 - chr2R 7242960 3' + 412 441 2 80.00 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGGGCTATATCTGCAGTGCTCGTAAGTCGTGGGCAGCTGTGCAGAGGCTT:1 + chr3L 22741396 3' + P-element 2860 1 52.48 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGCGAATATACCTGATTAAAGCTGACCTTAATCCTATTGCTAAA:1 + chr3R 26871093 3' + hobo 2913 1 56.04 TAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGATCAGTCTGCTTTTCTTCAACTCGGA:1 + chr3L 1572392 3' - 412 455 2 74.26 CCTTTCCTCTCAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACAC:1 + chrX 10629247 3' - P-element 74 1 27.72 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCA:1 + chr3R 8914532 3' + roo 362 1 65.35 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTTAATACTACCATTATTATTAAAGCAATAATTAATCCAGCATGTCCGGAAATATGATG:1 - chr3R 19449775 3' - pogo 24 1 60.40 CCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTGATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTA:1 - chr3L 5267228 3' - Juan 4014 1 62.38 AAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGA:1 + chr3L 15099639 3' - G4 3811 1 37.00 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATCTACACCTTAACCGGTTTCTAAACCTAATTTAAAGTAAACCAAATAAATTTTTTTACTCATTC:1 + chrX 10449885 3' + mdg1 7447 2 65.35 ACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAAT:1 - chr3L 19951219 3' - Ivk 51 1 75.25 AAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGGATATTAAGGTTAAGTAACATCGTATATGCATTTTTAC:1 + chr2R 17499381 3' - 297 326 2 62.38 ACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACA:1 - 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chr3L 13608294 3' - mdg1 7051 2 66.34 TACGACGAGCCGGAAACGCTGAGGTAGAATTCTTTGCGGATGCTTTACTTCTGTGCCACAGGACAACGGTCCTTAGCTGACAAACTGAC:1 - chr3R 30737215 3' - Rt1b 4871 1 60.67 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGT:2 + chr2R 17345998 3' - hobo 43 1 66.34 ACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAGGTTTTATTATTATACTTTTCTTTAGTTTTATT:1 - chr3L 3685389 3' - Juan 47 1 74.26 CAACTAGGGTCCCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTCCTTCCTTTACCGTTTTTCGCGGCTCATTTTAGAAAATTTAGAATACAAAAGAATTAACTCTTTAC:1 - chr3R 4576745 3' - Tc3 1304 1 50.50 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTCCTTGATGTTTGCTGAATTATTGGCTCGAGAAAAA:1 - chr2L 11804985 3' - P-element 2 2 71.29 ATTGTTGACTGTCCTCGCTGAATAATGTCTAATGGATGTGTAAGTCCAACTGCCAGACAAATTAGATGTGAAAAGGGAGTTTC:1 + chr3R 30409529 3' - Doc 4344 1 74.70 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTTGGAAAATGTATGAAATTACAGTAGTTATAATAATTTCTATTGTACTTCCTTTAATTAATTAGTATATTTAT:1 - chr2L 17599966 3' + 1360 3363 1 71.29 AATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTTTCCGTAAAGCAGCAACACCCGTCTATCTATTCTTTGCCAACACTTTGTGCCTGAAATCTTGT:1 - 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F-element 231 1 59.41 TCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAGGTAAAAAAAACAGTAGTCAAGATATGCTAATGGTT:1 + chr3L 6128305 3' + jockey 4952 1 80.20 CGCATGCACACACACACACACACAACAGCAACAGAACGGCACACACACCATGCGGCAAAGTCGTCGCTCAGAGACAGAC:1 + chrX 19637627 3' + accord 178 2 58.23 GACCAAAACGCCACTGAACATGTTCTATGTAGATATTGAACCCGTTACAAAAACAAAACATAAACAAAGTGAGAGAGGAATTACTATAGTGCACATGTGCG:1 + chr3R 14020775 3' + G4 493 1 62.38 TAATAAGTTAAGTTAGTTGCAATTGTGAAACATTGAATTCTTCCAGAATAAAACGTGTTCTACTACCGTTTCGTGGGCGGCAAGCAGAGCACCACCACCGT:1 - chrX 10844807 3' + aurora-element 4224 1 66.34 TCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + X-element 4526 1 59.41 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTTGTACTACAAAATAGTAATAAATCCAAAATTTAAATCACAAAAGTTTACGTTTTTCTTGGTGGTGAGATAAATGA:1 + chr2R 14796261 3' - hobo 16 1 67.33 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATGAATACAAAAACACCTAATGGGTTCAGC:1 + chr2L 7504924 3' + roo 9024 2 76.24 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGACCATACATAAATAAGCAAAACAAA:1 + chr3L 13738046 3' - copia 52 2 78.22 GTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGTGTTTGTGTCCGTATATGTGACTGTGCACAATGGCGACGAGGTAACGTGAAGAAGAACTGAA:1 + chr3L 13890026 3' - 297 6510 1 72.28 CGTTTGGGCGCCAATTATTGTTGAATACATTTCAGATATTTCTCTAAGTTTTACTTTTTGTGCCTAATTATCTTCCATGAGAAATTTCCACTTTTCCACGA:1 - chr3R 19313680 3' - Burdock 266 1 71.29 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCGTTCGATGAATTTGGCTGTAACAGATTTTACTTGCCGAAATGTAGTAAAT:1 - chr3L 153577 3' - 1360 27 1 53.47 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTAGTTGCTTTGTTTAAAATGTATGTCTCATGTTTCATGTGCAATT:1 - chr3R 12729352 3' - roo 32 2 61.39 AATCAATTAAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCAACTAACTGCCTTTTTACTCGGCGCGTCTGTGGGCG:1 - chrX 15364930 3' + invader2 432 1 43.56 TCATGAAGAGGAATCACAAAGGACTCCTTCCATATAAACCACACCCCACCACCCCGGGAAGGGGTTTTGTGTCAGCAAAAGGTTATGCCACAATAAAATTA:1 - chr2L 20554493 3' - Q-element 59 2 71.29 TGTTGTCGCTTGTTTTTTTTTTATCCTGCCGCTCCTTTATATGATGTCCTGTGCTGATGGTGGAGAAATAAGCGAATGCATCTCCACCCATTAGTTAAGCC:1 + chr3R 15938352 3' - Porto1 172 1 68.32 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTCGACTCGAGACGCAGAAGTTTGCGTGACTAG:1 - chr3R 10978675 3' + roo 399 1 72.28 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCACAACAACAACTATTGACAACTATTTAACACGTGTCCGGCAAGTTCTTTGGTTAC:1 + chr2L 1195119 3' + hobo 2917 1 54.46 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTCTTTTTGGTTTTTTGCGGCGCCCATCAATCA:1 + chr3L 10565342 3' + pogo 2062 1 68.32 ACGTTATTTACGTTAAGGACATCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCCACGACAAAATAAAGGAAATTTATTATTGTTAGAGAATATTCGAATCCCAAGGT:1 + chr3R 19446070 3' - Circe 7017 1 63.37 AAATAAGAAAACTTGATCTTTTAGGTTTCCCTGTTGATATTTTAAATTGGATTTCAAGCTAAAAATGAATGTCCTTGGCAAATAAGCCATCCTTCACCGTC:1 - chr3R 8062531 3' + Q-element 356 2 60.40 AGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGCAGGCCAATTAGTTACAGAGTTTATGTAAGTTTATAATCCCTTTTTAAT:1 + chrX 15965193 3' + 1360 3321 1 56.44 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGAACCGCCAAACCACCGCTGCAGCGCGCTG:1 + chr3R 28196748 3' - hopper 46 1 68.32 CCTGTGACTGCTCCAGTCGAACCTAGGGGTCACTGCGGTGGCCTATATTTTTCCAGATTAACAATTGTTCTTAAGGACCACTTACAGCCAGATCGCCTAGG:1 - chr3R 30253944 3' - Gypsy12A_LTR 427 1 60.40 GTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGCTGTACCCTTAAAACGACATCGATTGGCAGACTATTGGTCATGCGGACGGCTCCTGTGACTTCATATGTTGCCA:1 - chr2L 9649539 3' - opus 15 2 76.24 CACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCTGCAACAATGGATAGCAACTCGAGATGGCGTTCGAACGAGTCGGATATGAACAATAAAT:1 - chr2L 23297419 3' + accord 458 2 63.37 GCCGGGGACGCTGAGGATGAATTCTTCGCCCGCCGTCACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGCATCCTTGTTGTTATAGCTGCTTAGCTATTCGTGACATG:1 + chr2L 9009625 3' - Rt1b 4863 1 65.35 CGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACACGCCGGACTAAGCCTAATCCACCAACTCAGGCTGACCACTGTGGTTTTTTCTTTTT:1 + chr3R 23195868 3' + I-element 161 1 61.39 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGAGCGATTAAATATTGGTAACATATTTCAAAATCGATTTATGGCCAGAAAATAGTTCGCTGATCA:1 + chr2L 7745986 3' - I-element 12 1 63.37 CTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCTTGTGCAGCCCTGGCGCCTAACAGTAGCTGTTAAAA:1 + chr3L 7604933 3' + accord 6999 2 64.36 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAAGTTTACATCGTTCGCTCCAGTAGCCGCGTAAATCTTTCGCTTTTCAAG:1 + chr3L 21782120 3' + roo 9045 1 51.49 AATTTGCTTGCTTGGGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACTTAAGCTTAATATGAAGTAGCCCGTCTTCTTGAGAAGACAAGCTGCGCCAGGGCAAGACT:1 + chr2R 1265755 3' - 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chrX 20982194 3' + 297 6960 2 63.37 CGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACTTTATGGAGTTTGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTGTATAATTTTCAACGAATCTAGTATCCCATTTTACTA:1 + chr2L 21794184 3' - invader1 4 2 76.24 GATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGTCTAAGGTGAGCATTTGTGTGCCTGCTTGTGAAAGGATGCTCCTCGCGAAAGTCAGCAAGAATA:1 - chr2R 8184569 3' - I-element 215 1 70.30 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATTTGATGGCTCTATCAGCCATTTGATTCGGTTAGATGTAGCCGATATTATTGGATATTAA:1 + chr3R 24023396 3' + roo 9055 2 63.37 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACCGAAACGCCAACGGC:1 - chr2L 9437454 3' - P-element 57 1 23.76 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCCACCGCCAGCTATTTTATTTT:1 - chr2L 12908380 3' + hobo 2900 1 72.09 AAGCAAGACATATTTAACAACACCAACCCTCCCCTACTAATAACCCTTGCACCTACAAAATCGGTCATTTCCTTGTCCTTTTTCTTGCGGCTATTTTCATA:1 + chrX 13038808 3' + I-element 5079 1 64.36 TTTTACTTTTATACTTAATAATTTGTAACCCTTAAATTTATATGGTAACTTTGGAACTATTTGCCTGTAATACTTGCAAATAAATACTTCTTGGAACGATG:1 + chr3L 19014111 3' + G5 4723 1 51.49 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCTATTAAACTCCCCAAACGGCCACGCCCCCTGTCTGTGTGAAAA:1 - chr2L 9330219 3' - hopper 31 1 56.44 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGGAGTTCTCTGGGGTGGAGTACGTAAAAATAATGAGAAGCACATTTTTTGCGTATAGACAAGAAACGTAGCATACTTTTT:1 + chrX 6146746 3' + hobo 2928 1 64.36 GAGCACCTTTTCAACAAACAACAGAATATGGGATTAAAAAATATATGCCAATATTATGAAAATGTATTGTAACAATTTTGTTGCTTTGTAATCTCCGATTT:1 - chr2L 9299603 3' + 1731 4626 2 43.56 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTATGTATGTGCGCCAGTTCTCCTTTGTTCTCGACACCTATAAATCTAAGGCGAATTTATGCTCCAAG:1 + chrX 14648866 3' + 297 6970 2 71.29 TCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACGACAGCTGCTCAACAGGCGGACAGACGGAACCGATGCAGGTTGAACTACC:1 + chr2R 6573598 3' + F-element 283 1 58.06 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTCCTCG:2 - chr3L 14285018 3' + roo 361 2 70.30 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCGCTAATGCCCCTGTCCAAGTTGCGGGCTAAAGTGCGTGCATCGCACAATGTGCAA:1 - chr3L 21782034 3' - roo 8684 2 59.41 TAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACAATTGTGTTTTCACAGCTCGGTTTGAATAGAATAACTTTTAGTAATAG:1 - chr3L 14277388 3' + roo 8729 2 53.47 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAGCCAAGAGGCAGAGAAACGAAGGAAAGAAGCGAAACAAAAGCCAAAGGCAATGTGGGAAGTCGAATGGGCGAA:1 - chr2L 2924697 3' - copia 4873 2 73.27 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACATACGTGTTTATTTTGTGTTTTTGCCGGCTTCGACTTGTT:1 - chrX 13749449 3' + S-element 1683 2 62.38 AACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATTAGCTTTGAAGAGCTACCCAACTTTTCTGCCAGTGCACTCCTAAGGGACTGGGCTGCCTAC:1 - chr3R 29964787 3' + Quasimodo 7362 2 74.23 GCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAA:2 - chr3L 19951175 3' - Ivk 7 1 72.28 CCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATCTGATGGCAAGTAGGGAATCAGTG:1 - chr3R 7953969 3' - I-element 320 1 76.24 CTCATCAACCATTCGACACTCTATCCAAAAATCATCGAACCCCCGCTTTTGCCAGCGCAAATCGTGAAAAGTCGGTGAAAATTAGCGAGGATAAATAGCCG:1 + chr3L 13486931 3' + G5A 242 1 72.28 GAATATATTTAAAGACTTAGAGGTGGTAACCAAATCTCCGTGGTTTAGCATAGATTTAAAAATGAGAATATCTCGTCGAAGTTCATGCAAAGAAGGGAAAC:1 - chr3R 28880618 3' + roo 18 2 79.21 GGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGATATATACGATTAAAAGTTTAATTCTTGGCTGAACAGCCCTTCGAAATACCGCTCTAAATGATAAAGA:1 - chr2L 16032227 3' - 297 6581 1 61.39 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGTAGTGGGAAACTTCTTGGCACTTTCATGAACT:1 + chr3R 25514176 3' - hopper 37 1 62.38 AGTTTTTTGTTGTTTTTTTTTTATTTCTTCGTTTTGGCTAGTCTATAAATAACACCCGCACCGCACACAGACACACGTCCAACTGAGGCAATAACGGTGC:1 - chrX 11373011 3' - HMS-Beagle2 489 2 54.00 AGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTTCTTTGCCACCGGCGGTCGCTCTTCAGAGCTGGCCCTGCTGTTGCTTAAGGATTTAAAGTCCCCGTC:1 + chr3L 6736138 3' + copia 4970 2 74.26 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTATGTATGGCTTTGAACGAGTGTGCTTTTGTGGTATGAGAATTATACCGTTGCTTTCTTGCGATCGGATGA:1 + chr3R 5392385 3' + 412 7543 2 75.25 ATTAAAAACAAATAAAAAAAAAAGTAAAAAAGTACATAACAAAACGTAAATGTAAAATTGCAATTTTCAGAGCGTCCAATTTGGATTTGGACCGGGAGAGT:1 + chr2R 18149334 3' - hopper 152 3 75.25 CTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGCTGACACACATAATTTTTGCTCTTTTTCGCCTC:1 - chr3R 9940129 3' - I-element 5060 1 67.33 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATTCTTCTTTTAAGCAAATACTTTCTTGATTTCTATAGATAGTTAT:1 + chr3R 27179238 3' + mdg1 390 2 57.43 GGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCGCTGTGTCTAAGTTAGCGCACCTGAAACTGC:1 - chr3L 15452843 3' - accord 9 2 68.32 AAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATCCCCGTCAACTGCTGCTTCTGCACAGAGCGAAAAAAGTCGAAGTATTCGTAAAATTGGAAA:1 + chrX 18153863 3' + hobo 2624 1 53.47 GTTTTGGGCTTACGGGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTGTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCA:1 - chr3R 20396554 3' - I-element 53 1 69.31 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGTGCGGAAACATTTTCGAGTTGAGGAGCTACCAGTTT:1 + chr3L 13779352 3' - transib2 39 1 60.40 AATAGCACTACTGCAGGTGAAAAGTATATTTCCGTAATTCGTAATGATTTTCACTTGGCACTTTTGAGTCCTGTTCGACGAGGTCGTTTTCGTGGGTGATC:1 - chr2R 17458896 3' + Tc1 19 1 76.24 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTAAATTAAGAGTGTCCAAAAAAGCTATTTTTATTCCATCAGGATCTCT:1 - chr3L 10792160 3' + pogo 2079 1 62.38 CTACTGGAAATAACATAACCCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATCTATATAATTTACACATACGTAAACTGTAGATGTGTCTG:1 - chr2R 16160233 3' + gypsy 437 2 49.50 TTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAGTGACCAATTGTGACAAGCAGGTGGTTGAAGACGAAGTGGATCACGGTT:1 + chr2R 4916266 3' - S-element 155 2 54.46 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTCAAATTCAAATGCTACAATATTATTAAATAAGACGCACACGCACATAATAGACATAAA:1 + chr3L 23600400 3' - roo 8683 2 53.47 GACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGCTTGAGATCCGCGACCTTTCCTTGACAATCGAATCTCTAACGA:1 + chr3L 14149324 3' - Transpac 183 2 67.65 CACAACTCCGTCCTAAAACCGACCTGAACCTATGCCTCCCAGCTATGGGGGAACGCCAGTAACAGCAGCGTTAAGGTTCCTGTGAATTCAAAAGTCCGTC:1 + chr3R 19449454 3' + Fw2 3524 1 70.00 TTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTAAAGGCCTTTCTGTTCTGAATGAAAGTTG:1 + chr2L 16758802 3' - Doc 4479 1 71.29 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGACTACATTTGAGCAGCCGCAAAGAGCTTGCCCCGAAAAGTAGGCAAGAAAACTCGCATCGC:1 - chr2L 10898450 3' - jockey 4685 1 61.39 TGTAGCTTAAAAGATATTATGGACTCTGTTCCTTAATTATAGTGTATGATTAAAGGACGGAGTACGAGGGAGGGGAGTCGAGTTATAGAGGTTGAGGAGAG:1 + chr2R 9301640 3' - G5A 2769 1 58.42 AAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAACACGCAGCTGGTGTTATTTTATCAAATGTCGAGATAGATACTTT:1 + chr3R 5677870 3' - hobo 2551 1 56.44 GGGACGACAAAGAGCTATATCGAACGCACAAGTTGAAAATATTCCATGCGGCAGTGATTATCGGCACCTTTCCCCAAGCCCAAATGACATTAG:1 + chr2L 254477 3' - diver2 257 2 66.67 TAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGGTTTTAGCATCCTTTTTGTACCTGCACGTTTCTGTTTTGCTAATCCATCTTTCGGCTTAT:1 - chr3L 6945931 3' - mdg1 7420 2 57.43 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGACAG:1 + chrX 10629255 3' + P-element 2843 1 35.64 CGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCACAGCGTGTAAATCACCGTCGGATGTAAGCATTTGT:1 + chr3R 11999866 3' - I-element 4930 1 64.36 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCACCACCCCCACACCCCCTGACTACCATCACTTCGTATCTGTCATCTGGCCATTGTGAGTTTTCCCT:1 + chr3R 28940807 3' + hobo 2933 1 68.42 ATGGATACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGCCTACTGGTTCCTTTCATTTGGCCACGATTTGGTGGCAACAGTTTCA:1 - chr3R 29297676 3' - Quasimodo 248 2 57.43 AAAAAAAAAAGGAAAATTAAATTGTGAAACGTAATGTTAACGCAGCCAAATGCCCAAAAGTCCAAGAGAGGCGGCGATTCAGCCGACCCAATTCCATTCG:1 + chr2L 12270331 3' + Doc2-element 252 1 81.00 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCAACGCCACTCGAGTCGAGTGGTCCGGAGTAACGAGGAGTGGACTAATTAATTAGCAGCTA:1 - 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S-element 1539 1 70.30 CCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTGCGCTGCCTGCATGTACAGTCGAAAGTTTGGGAACGTGTTGAAAAAGACTTAATCTAAAGTTCTTTTTTTCCACTG:1 - chr4 257993 3' - F-element 316 1 79.21 TTTCGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTAAGTCTTTCGGGTGATAGTGTCACCTCCACAAGGGGGGTCAATTGGATTGA:1 + chr3L 21554834 3' - I-element 234 1 75.32 CAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTTTGACTGGAGGATTTTTTGGGCGGCTCCGCGGTTTGGGGTCTCTGGCGT:1 - chr2R 18687610 3' - Max-element 8306 2 54.46 ATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGGCCCCACATTCACATTGCCAAACACATCCGACATGCAAAAGTTGCTCT:1 - chr3L 5490058 3' - 297 20 2 56.44 TATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTTCAGCACAAGGACACTTCGTGCCATTTGGCTTTACAATCCAAAAGCCCAGAATCAATACTTCAATCAGTCT:1 - chr2L 9877585 3' + Q-element 573 2 69.31 AACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATATCTTATTAAACTTAGGATAAAATAAGCCATCC:1 + chr2R 12357561 3' - opus 152 4 70.30 CAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATT:1 + chr3L 21912346 3' + Bari1 1688 1 60.00 TTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATCTTCATATCTGATTTGGAGACTCGCCAAAAAGCTTGCGACAAAGCTCGCAGGCCGA:1 + chr3R 15328686 3' + gypsy2 152 2 59.41 CTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGG:1 - chrX 21668013 3' + Tabor 446 2 61.39 TTTTTAATTCAAATATTATATTATCGGTTATCTTTTGTGCCCTCAACCACACACAAAACTATCCTTTCAAGAATCTCTACCTGCCCTACTAACTTCGTAAC:1 + chr2L 12462842 3' - G7 1159 1 67.33 TCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGGACTCAGAGAAAGGCCAGCTTTCCTTTCAGCTGGTTCTGCTGTGCTCTTGTTGTTGTTTCGGGCATAAAGAA:1 - chr2R 8844670 3' + roo 456 1 52.48 CCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCTCAGTCCGCAGTCCACAGCTTTGGCCCTATCTC:1 + chr3R 6034313 3' - Ivk 5104 1 67.33 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTACAAACATTGAATAGATGAGAGGACGGCAGCAGACGGTAATGA:1 - chr2L 4134327 3' + copia 257 1 55.00 TATTTTTTTATTTTTTGTTATTAGCTTTTCACACTCCAAAAAATGTGGTCTACTTTTCAAGGAAAAGATAAAACCATTAACGGCAAAGTGGAGAAATGTGG:1 - chrX 12367153 3' - Doc3-element 76 1 52.48 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGACCCGTCTCGAGATCGCTTCCCGCCT:1 - chr2L 7970995 3' + blood 7340 1 73.27 ATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTAATGTTCGGTTTACAATGGGTGCAGCAGTATCCAGTCTCATCTGGG:1 + chr2L 16342200 3' - Doc 4508 1 55.45 GGCCTTCTTACGGGGCATTGTCGACTTCACAGCCATTTACCCAAAAACCGCAACACTTCCGGATTTCGAGCATCTACTCCTTGGATAGGAAATTCCGCCCA:1 - chrX 7406055 3' + baggins 5134 1 66.34 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATATCGAGTTGAAATTGATTTTTTGCCGTGTGACAAATTTTCAAATGTCCTGGCAGCGCTGCCTTT:1 + chr3L 10041541 3' - 412 12 2 67.33 AATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGGCGCATTCGTGCGTTTTA:1 + chr2L 2624260 3' - hopper 54 1 78.22 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCCGACAAAACGAAGATCGTCGCCGGCAGCAACAACTCGCTGCG:1 + chrX 10585466 3' + P-element 2853 1 46.53 TCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCTGACACCCCAAAAAAACAACAAAATACAAGAATATCTAC:1 + chr2L 1556784 3' + Doc 4501 1 61.00 CTTCCTAAAACATAATATTTCTCAAAAAACCGCAAACGCACATAGAGAAAAACCTGGTGGGAATGAAATCTGATTAGGCCATATGTCATAGAGCCATTTAA:1 - chr3L 952395 3' + hopper2 1098 1 60.40 CACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTCGCACACACGCTCCCCGCCCACCATGCCTGGCTGGCTGG:1 + chr3L 6438153 3' + Max-element 8240 2 56.18 GATGCTGGTCGGCGGCCGTGATCTGTGCGAGAGTGTGTGTGCGGCACAACAACCACCAAAGCAAAGCTCTGTCGCGGCGGCTTCCTTGTGTCTAGCTGACA:1 - chr2L 5997812 3' + Chouto 65 1 74.26 GAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAGGAAATTGCCTGCAGTTCCTGGCATCGAAAAGTGTG:1 + chr3R 8914570 3' + roo 400 1 73.27 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTTTTACACACCATCTGCCCAGAAAGGACAGAATCTTGTGTCTAGCTGCA:1 + chr2L 10165065 3' - mdg1 28 2 52.48 TGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGACCCCGCGAGCTCCGCCTTTTTATAGCCAACCACCCACTCGAGCAGCATCTCACCCAAAAGACTA:1 + chr2L 11561868 3' - transib2 10 1 69.31 CTTCACACTACAACTATCTGCTGAGTGTGTGCTATTGTAGTTGCCATGCTTGTTAAGATATTTTTGGCTCTTAACTACATTGAGAGATGGCGACAAAGCCA:1 + chr3L 9120443 3' + Tirant 324 2 39.60 AACAGTCAACGAAACTATTAAAACAAAAAGCAGCAAAAAACACACCAATCCCCCCAATCCCCCACTTTCTTTATTCTCC:1 + chr2L 1365675 3' + Porto1 4415 1 60.76 ATCTGATAGTCGGGAAACTCTACTCTCTTTTGTCTTTTTTTTTGTTGGGGGGGGGCCAGAGCAAGTGACCCA:1 + chrX 8313184 3' + INE-1 560 1 80.56 CATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCTCTGTTAAAATGTATTTTCCATCGGAAATCATTTCAAAATGTGCG:1 - chr2R 7412877 3' - FB 107 1 56.44 AAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAGTTAATACGGACGGACAGACGGACAAGGCCAAAATGTATAAACTTTTAAACGAATCTAAG:1 + chr3L 20284082 3' + mdg1 321 2 62.00 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGCGGTTCTCGGCCTGCGAGCTTTGTCGCAAGCT:1 - chr3R 15328682 3' - P-element 44 1 36.63 TTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTGTCAATGAACAAGATCGATAATAAAGTGCAAAAATTGAAGTCGATCCCGGGCGTTTA:1 + chr3L 25186329 3' - Max-element 21 2 58.42 AAGCAGATTTGACTGCTCTCTTTGAACCTTTTCCTAATCTTAAGAATCTTTCTTCAACGCAGATCCATCCATACAAACGGAGCTAATGTTTCGGATACAAA:1 + chrX 8666432 3' + 297 156 2 58.42 CATCGGTACGATACAGTGCGTATGCATACACAGTTTTCACATTCAACGTGAACCGTTGAATAACTTCGTCTGGGTTCTTTTTGGGGTATGCTTGTGGTTTT:1 - chrX 22726024 3' - Helena 1047 1 67.33 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAAGCCAAGTCGGCTTGCTTGGGCTTGGGAAATATTCTG:1 + chr3L 18142006 3' - blood 7051 2 65.35 TGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTTTGTGCGCTTATGCTTGTGTGAGTGAGCCGGAAG:1 + chr3R 20100063 3' - accord 7085 2 69.00 CCCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGATGACAATAATAAGCCACATATCATCATTTCACTCTCCACACATATGCACAGACGTATGTGCGTTCCACTCGAT:1 - chr2L 16359110 3' + Gypsy6A_LTR 352 1 72.28 CGATTCCGAAAAGGGACATGAAAAAATACCTTTGTATTACAAAGTTTCCCCGCTCACACACAATTTTTATCCATTTTTGCAGGAGCAATGCGGCGAAGCGG:1 + chr3R 22173929 3' - HB 63 1 56.44 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGTGGTGGAGCTTCGGCAGTCTGGAGGGCCAAAGGA:1 - chr3R 28940728 3' - hobo 44 1 65.35 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTTGGTAGGTGCCAAAACAAAAATCCGTT:1 - chr3R 11073737 3' + pogo 2055 1 73.27 CAAAGGCTGAAAGAGCAAACGCGAAATAAAAAGTCCCGATGCGCGAGTGCCATTAGTGGAAGGGTGGTGAGTTTGCCAAATCGGGGCTTAGTTGCAGCAGG:1 + chr3R 7015014 3' - 1731 224 1 65.35 TAGGTTCTGGTTGATGTTCGCGTTCCGGATGTATCAAGGCGCATCCGTTATTGTTCGCAGGACTTTTCGTTTATGCCGAGATGCTGCAGGAACGGAACGGA:1 + chr2R 17651097 3' - Doc4-element 2715 1 69.31 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACATGCGTACATATGTAAGTAAAAAT:1 + chr2R 5651917 3' - Tirant 8123 2 65.35 GGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGGGGGAATAAGCAGCATAATCTCTTGATATGTTAG:1 + chr2R 5076113 3' - Tc1 1642 1 65.35 ATTTTTCACACGTCGCAAGCTGAATATTCTCTAACAATAATAAATTTTCTTTATATTTTTCCCAATAATTTTTATCTTCTATGGATAATTCCTGATCCCAT:1 - chr3R 19446000 3' - 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chr3L 6605676 3' - R2-element 286 1 77.23 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATGCGGGTCAAGATTTCAGATT:1 + chr2L 13602386 3' - FB 55 1 78.22 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGAACTGAGGCCATTAAGTTATATTATGCTTAATTTCTATCCCATTCAGT:1 + chr3R 28678247 3' - I-element 37 1 57.43 TATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGCTCTGGCTTTAGCTTTGGCTGGGAACGTAGCCAAAGTATCTGTATCTGTGCCTGTGTATC:1 + chr2L 16474808 3' - 412 421 2 62.38 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATCAAGAGTTTCAGTCATTGCAATGTTTTTGTGCCGGAAAATATACTTAATGTA:1 - chr3L 3986377 3' - jockey 35 1 49.50 CATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGGTTCCATTGCTATGAACGGAGTAGGTGCCATCCACGTTGCAGGAAGTATCGGGTATTCTGCGGCAA:1 + chrX 2489005 3' + flea 4677 1 69.31 ATAATGTCCTAGCACTAGGCCTACTAGATAACAAAAGCAACCTAAGGCGACTAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCAAGGATAACAGCGTTCCACTTCCC:1 + chr3L 27355972 3' + G3 4404 1 65.35 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGGGTCATGAGCCACGACCGAATTCTCG:1 + chr2L 16396617 3' + 412 442 2 77.23 AAACCAAAAAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAGTACCCCTACAAATAGAAGCCGAATCGAAAAGAGTTATATCTGTTC:1 + chr2R 637059 3' + invader2 199 2 63.37 TATTGTCACGTCTCCGCCTGACACTTGGTTAGTAAAAGCCGTCAGCGGCTATTACACATTTCATTTTATTGTCACGTACGCAGCACGTCTCTTTATGGCAC:1 - chr2R 22363443 3' + gypsy2 278 2 61.39 GGTGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGAATATATTTACAAACACATGTCAATTCATTAATT:1 + chrX 11969858 3' - Idefix 7037 2 65.35 AAACAAGGAAAATATAAAAAGATACAAAGAAACAAAAATGTGTGTGTGATAGGGTATATGAATATTTTGTACAGTTTCTCGGGTGTGTTCGTGTTGATAAT:1 + chr3R 6389393 3' + Doc2-element 256 1 62.38 GTGAGTGGACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCCAGCGTGTGTGCAAGTGTATTGTATTATATCATATTGCAGTTTTGGTTGTCT:1 + chrX 8810814 3' - hobo 2755 1 57.43 GCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCACTGACGGCTCTTGAATAA:2 - chr2R 2645482 3' - HMS-Beagle2 48 2 78.22 TAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATGGATATGGCTTTTCGATTGTGTATATATTTTGGAAATAGATTTGTGTGCTTTTTTGTTCGGCGGCCTT:1 + chr2L 7464712 3' + blood 7134 2 72.28 GCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGCTTGGGAAATTACTCAAGTGAAGGCCCCACATTTCGTGATCCCCAACTGGCGACAATTCGTGTCCGTCT:1 - chr3L 9874846 3' + I-element 334 1 76.24 TTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGAACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGGCCGCCGATCCGAGATGCTCGGCCCG:1 + chr3L 18619741 3' - 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Cr1a 4171 1 72.73 CACCACTACTTACCTGCAACGTCTCCAGAGGCTTCCAACGAATCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGTACCTGAAAAGAAAAGCAGGCAAAAGGCGAAG:1 - chr2L 846532 3' + HeT-A 5688 1 74.26 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTCATTGGAATGCAAACATAACGCATACGCAGCGTTGGCAATTTTGGAGAAGAGACC:1 - chrX 1018360 3' + transib2 2803 2 58.42 AGAGCTGCGCTAGTGCTTGGCTTCTCTTCCAGCTCCTCTCCCTGTGCTTTCTTTGTCGGTTTTCGCTTTATCTCGCTCGATTTGGGCAGTGACATATGATA:1 - chr2R 17640036 3' - G6 494 1 76.24 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCACATCTGTTAAAAAAAATAATATTGCTAATAAGAAGTATGAAGTT:1 + chr3R 7869752 3' + jockey 4953 1 67.33 ATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCAACACAAAAAAAAAAGCCAGAACGACCACATGATAGAAA:1 - chrX 8234530 3' - Quasimodo 29 2 60.40 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATAATTACGGGAAATATTTATCGCTTAGATACGGCCAGCGAGCACGAAACACAATCGTCGG:1 - chr2R 16338065 3' + roo 393 1 63.37 CCACACACAGAATATTTTGTAGTATAGCAATTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATATAGTTAATAACATAAAATAAATAAATAAAT:1 - chr3L 7777135 3' - Doc3-element 143 1 72.28 AAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCAGGCCATCTTTTGAGTTACAATGATGTATAAAGTTGAGATAATACCTTTTGTATTTTGGAGTG:1 + chr3L 15452952 3' + accord 7368 2 63.37 CGAGGGGGTCTTTAGGGTTATCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCAGCACACGTGACTAACGCTTTATTACCATTTTTCT:1 - chrX 20999194 3' - BS 4955 1 63.37 ATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACATGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCATTATAACAATGTTTCAATTATAATTGAAAAAA:1 - chr2R 705585 3' - Bica 71 1 67.33 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCGC:1 + chr2R 17346026 3' - hobo 15 1 62.38 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTCTTTTTGGTTTTTTGCGGCGCCCATCAATCACCAGCCGTGGAATGTGTGACACACATTAAACGTAACG:1 + chr3L 10565379 3' + pogo 2100 1 76.00 ACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCA:1 - chr3L 5267240 3' - Juan 4015 1 73.33 CGGCGGACTTATTAAGCCGTCCGAAAAATTCCCTGCGTCATAAAAAGAGTAATGTATATTGTATATTTTTTTGTTGGTTTTATTTTTAGAAGTCACGTACG:1 + chr3L 14543420 3' + P-element 2427 1 78.22 TACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGCCACGCTCCTCACAAACACGCATGTGCACAGCCCACCATTCACTCACACCATACACCATACAC:1 + chr3L 16115955 3' + F-element 270 1 66.00 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAAGCAAAAAGTCCTTGGTTGGAGTCAC:1 + chr3R 12058669 3' + roo 9021 2 73.27 GACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATATATGTTTGTATGTATGTATAATTTATATATATGCTAATTTGTAACTATAATTAAAATATATGTATAAATAT:1 + chr3R 6104398 3' + hobo 2611 1 79.21 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTGTGATACTTAATTAATAGCGGCACAGAGATGCTCAAAGAGAACTAGTTCATTATTTTTATTTATTAATT:1 - chr2L 10687664 3' - hobo 8 1 73.27 TCTTTGCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAGGTGCGGACACATGTCGGGGATGGCTGATTACTGACGCTAGATAAATATTAAGCAACTATGTGGAGTGTTT:1 - chr3L 15662906 3' - 1360 491 1 65.35 TTAATTATCATATATTTTAAATGTAATTATTAATTATATTCGCTTCGCGAGTGATTCTTTGCGATTTGTGATACCTGAGCATCGATTTTTCAATTTCAAAT:1 - chr2R 2557783 3' + Cr1a 90 1 69.31 GTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCCTAAAAAGAGGAGGTCCTCTGATCCGATGAGTGGCCCATTTGGAGACCATTTTCAGAGCGCCTTAAAGCGACGGAG:1 - chrX 19547392 3' + hobo 173 1 73.27 TCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCGCTGACAAAGATGGCGCCCGAACAGGGACAG:1 + chr3L 4051106 3' - pogo 5 1 54.10 ATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACAACACCAAGCAGCGGAAAAAACGTGGAAGCCCCAAAATGGCAGCCGCGTCTAATGATTTTCCAGCGCG:1 + chr3L 9196479 3' + 1360 3109 1 75.25 TTAGGCGCTGAAAATTTAACAAAGAAAAAGAAACCAAACACGTGATAATGAAGGAAACAACACAACTCGTTTATGTTTTTTCCACCGGATTGTTAGGGATC:1 - chrX 8724816 3' + TART-C 11086 1 47.52 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGCGTCATCCACTCGAACACAT:1 - chr3R 8914501 3' - roo 8719 2 80.20 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGCGTCACACAAGCGTCAGTTCCGCATGAAATG:1 - 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Doc2-element 99 2 70.30 GTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAACAAATCTAGGCAGGCCAAAATCCAAGAAAGAGGCAGTAAGAGCTCCAGCTCTAGTCCGCCAATCCATGCCACA:1 + chr3R 18027006 3' - mdg1 3 2 76.24 ACTTTGTATGCATACCGTTAGCATTAATAACACTTTGTATTCGTTTTTTTTTAATATCTTTTAGTTTTTGGAGCACGCGCGTTGATCTTTGTTTATCTTAT:1 - chr2L 8531618 3' - S2 1414 1 54.46 TGCTGAGCCTGGAGATTTCATCAGCGACTTGTGGGATTCCAAGTTCCCTATGTATGGCGACTGAGATTAGCATTTAATGCAATAATAATTTCTATTGCACC:1 + chr3L 11241065 3' - G6 1774 1 59.41 AATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACTTTCGCCTCACAAGCGACTCTGGGCACACTTAGTCACTTGGTTTCATGAGTAAA:1 - chr2R 20357642 3' + copia 29 2 60.40 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTCGTAAGCGAGCGGAAAAAGGGTAATTTTGCCCGTCACCAGGATCTCAATTAAGATTACTATCTAT:1 - chr4 718873 3' + jockey 4981 1 42.57 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACAACTAATAGGTGCGTAAACGATGTTTTCCACAGCATACTTTGCGGCGA:1 - chrX 5275510 3' - jockey 4703 1 55.00 AGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATGAGTTTCTGGTTACTGATGAAACTCAATGGTGATTTCTTACAAATTCCGTGGTAG:1 + chr2R 1985036 3' + Idefix 30 2 54.46 AGGCGACTAAAGGTTGGAAGGAGGAGCCCTCATGGACTACACTGATGAAAATAATCTGGGGATTCAGAAGACTACGCGATGTATGATAAAACAAGAGAGAA:1 - 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P-element 32 1 48.00 GTGATGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGAGGGTGGCCAGAGTTGACCTAGGCTGACCCCCAAGGAGGGATAAAGCCTTTTGGGCACTTTGCTGTCAAAT:1 - chr3R 27437945 3' - accord2 7362 1 74.26 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTC:1 - chr2R 981624 3' + 1360 3341 1 74.26 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCATTACATTAGCGTTAAATGGTGTTAACTTACACACACATACACACACTT:1 + chrX 12276837 3' + hobo 2926 1 61.80 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCTGTATCGACACTGGCTTTTGCCGGGACCAAAAT:1 + chr2R 19655050 3' - jockey 4760 1 67.33 GATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCGTGTCCGTTTTTCCGTATGAACTTCGAAATCTCAGAAACTATAAAAGGAAAGAGAGAAAAAAGAACAGCTAAGGCC:1 + chr3L 24750415 3' + INE-1 98 1 71.29 TGATCAAATAATAAAAACATCATCACATCTGTTAAAAAAAATAATATTGCTAATAAGAAGTATGAAGTTCGTTTCAAAATTTAAGCCAGAGGTTCACTGAA:1 + chr3R 7869784 3' + jockey 4985 1 58.42 AAATAAAATAAATAAAATAATTTGTTTTAAAACTCTTTAAATATTTCGAAAATCATCTCCAGGTAAATTTTCATTTCATTTTCATTTGAGTCAGTTAGTTT:1 + chr2L 12553428 3' + HeT-A 6 1 67.33 GAGGTATGCGGCAGCGAGGGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACCATCTTTTAAGATATACGACACTTCCACTTACATCT:1 - chr2R 12357501 3' + opus 463 2 67.33 AAAATAAAATTTTAAAAAAAATTAAAGTTGTATTTGATTTGCTATAAGTTGTTTTTATTCACACAACAAAACTCCACTTGTAACTCAACGTTAG:1 + chr3L 13860064 3' + P-element 2695 1 92.55 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTCTTTTTGGTTTTTTGCGGCGCCCATCAATCACCAGCCGTGGAATGTGTGACACACATTAAACGTAACG:1 + chr3L 10565379 3' + pogo 2099 1 75.25 GTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGAATATTCTCCAGTCTGTGATGTTAAGATTCTTCACTTAATACATTTAAAATTTAAAAAA:2 - chrX 6917070 3' - 3S18 5784 2 61.39 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAAT:1 - chr3L 11367510 3' + roo 362 1 69.31 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATTTGAACCAGAAAAGAGATACATC:2 - chrX 21668256 3' + 412 443 2 74.26 TTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCCTTATTTCGGTTAATTACTTTAAATGGCAAACAATATAAGTTT:1 - chr2R 17292468 3' - Tabor 35 2 57.43 CTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCACTCCCACTACCATCATCATTTAGTTTAAAGCTCGGCGATGTCGCTGATTGCGCGACTTGG:1 - chr3L 7174220 3' - X-element 4525 1 75.25 TTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTTTTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTTTGCTTGCCATTTCCGAGCTCGCTGACGTCATTACAATGACGTTTTTTCG:1 - chr3R 14406906 3' - 1360 76 1 54.00 GTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTACTTAAAAGTGAAATATGATTTTAT:1 + chr2R 2092815 3' - Doc3-element 60 1 65.35 GAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTCTGAAAAATTAATGAGGCAATGATGATTGATTATTTGCTGAACTATTTAATTTTATAGATTTACCT:1 + chr2R 16615958 3' + 1360 401 1 58.42 CTTTTATTGTTCCTGACATCTCGACTCGGCTATTGATCGTGATCAAGAATATATATACT:1 - chr2R 5720575 3' - INE-1 148 1 93.22 CAATAGTTTAGGAGGTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGGAGGGGGAAACTTCTTGGCACTTTCA:1 + chr3R 25514170 3' - hopper 36 1 65.96 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGATCCAAGATTTACCATTTACCCGAAAGATACGAAAAACGATTTTGAAATCCGAAAAGAGAGCCA:1 + chrX 3358792 3' + roo 400 1 67.33 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTGCGATGCCTGTGGTGGTGCATTAACACATGCGCCAATAAGTATGC:2 - chr3R 28196689 3' + hopper 1387 1 56.44 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGCATTCACAAACAACAGACTTTAATCAATACTCGTG:1 + chr3R 4524241 3' + mdg1 7422 2 64.29 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCAACAATACAGAAGAAAATAAA:1 - chr3R 20396534 3' - I-element 33 1 53.47 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCTAAAGAAAATATAATTTTTGACTTATTAATAATAATTGCAGT:1 + chr3L 14886266 3' + 412 7513 2 61.00 CATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGATCCTGACCATACAGCGGGCCATTGGACGCAAGGTTGTGAAATTCTTTTTCGAGGATACGATGCTCAAACTG:1 + chr3L 4879152 3' - accord 162 2 78.22 TACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGCCGGTGTCTGTTTGCATTCAC:1 + chr3R 8488203 3' + blood 435 1 77.89 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAAGAATCATACTAGATTTGCTTTACCGA:1 - chr2R 4545932 3' + hobo 2891 1 80.81 ATCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTGGAGACATAAAATGTGGGAATCCCACTTATGTAACTCTAGAGGGT:1 + chr2R 1986268 3' + INE-1 145 1 62.38 CGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCGATTTGGGTGAGATTGTTAGAGGATAGGCTTTGTCACCATTGTCCTCTCTCCACCCGGATAAACTACACC:1 + chrX 17500763 3' - I-element 4924 1 54.46 GAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGACTCGAACATTCGAAGATTGCAGGATACGAAGAAGGATGAAAAGGATAAGGACAAGGCAACTTATAATGGGAACTC:1 - chr3L 7972577 3' - I-element 200 1 76.24 GAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAATCTAAAAATTCCCTAAACTCAGCGTAGCTTGACAATAAAAGTGTCATTTT:1 - chr3L 5490127 3' + 297 6504 1 56.44 ATTTATTATATTTTTTAACTTTCATTTTATCCTAGTCGCACTCCTGGTTCACGTCAACCATCACCTGTGCTGCCATTGGCATTCCGCCGCCAACGCCGTTC:1 + chr3R 9213992 3' - TAHRE 20 1 64.36 TTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGT:1 + chr2L 21570247 3' - Dm88 4395 2 60.40 ACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATATTATCAAGCAAAGTTTATTACACTGCGACTAATTAGACCAGCTAACGCTACTCGAAAACAT:1 - chr3R 17908791 3' + Doc3-element 4446 1 62.38 CCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGTGGCGCAGTCGGTTTTTGTGGTTCCTTC:1 - chr3L 14819885 3' + 1360 231 1 72.28 TCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAATGTAAGCGATAAATATTGCGGATTTCGTGG:1 + chrX 2389691 3' + invader2 4697 1 75.25 ACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAGGGGGCTTGTCGTGGGCGGGGGCGTGGCA:1 + chr3L 10807969 3' + I-element 329 1 71.29 TTGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCAAATCTGGTTAATGAATAACGAATGAGTCGTGT:1 + chr2R 22619636 3' - jockey 4760 1 67.33 ATGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGCTCTGCTGTGGCGGTGTGCGAGTGTGTGTGTGTACTGCAATCACCAAAGTAATCAATTGTTATCGGTGTGCTAT:1 - chr2L 9812843 3' - accord 7027 2 86.14 TAGTCTCTTCCGACAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAAATGCAGCGCCCAACTGCTGCATTCATTTAATGCCAGCCGAAATTGTCT:1 - chr3R 17704914 3' - diver2 223 2 65.35 ATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGAATATGGGATTAAAAAATATATGCCAATATTATGAAAATGTATTGTAACAATT:1 - chr2L 9299627 3' + 1731 4602 1 51.49 GGCCTTAATAAATTCGATTTGTAGTTAGTACTAAAGAACGGAACCAAAAGTAAAGCATCAAAGGTTATAGGTTATATAGATGGGTAACCTCAAACAAAACA:1 - chr3L 18320234 3' + gypsy10 259 2 80.20 GTAATGGGTATCTGATATTCGGAATTCGACAATGGCGGTCCATTTTCCGGCAAGCTTTGTGACAGCTCAAACTGCCTAAAATAACAATGAAATCCGAAAGC:1 - chr2R 20229088 3' + INE-1 551 1 61.39 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCAAACACCTTGATGTATTTGCCTTGTTATAGCTTGTTTGTAGTT:1 - chrX 12276765 3' - hobo 33 1 58.42 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAACCACATATCTGAACAAGTATCTGAAGTATCTCTTGGT:1 - chr2R 11195616 3' + 1360 3352 1 64.36 GTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATGTAAGTGAGTGAGTGAGTGCACACTGTATGTTGCGAAGGCAAATTGCACCCGGG:1 + chr3L 3476429 3' - jockey 4660 1 55.45 GGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGT:1 + chrX 22386796 3' - hobo 51 1 65.35 TGATGAAATCGGCATGAACACACACACATACACAGACAGGGAGTGAAAGAGAAGGCAGCTCACAAAAATCCCTCAATCACTGCCAATTAATGTCAGACACA:1 + chr3R 13581130 3' + accord 168 2 82.18 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGGAAAATCATTTTGTATTACTCATGCGCCTTTAATATGATAGTTTT:1 + chr2R 23908429 3' - Transpac 4944 2 55.45 AGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCACATTCGAGGCGCCGTGTAGGGTTTTCGCTCGAAGACGTCTCCCTGTCATTGTCG:1 + chrX 5370457 3' + roo 8661 1 56.44 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGCCCTTTAATACACATCAA:1 - chr3L 27262090 3' + P-element 2830 1 22.77 GTTCATACGGACAGACGGATGGACATGGCTACTTTATATTCATATATTAATTTGTGATTCTTAAAGGATACCTAGTGCATGCTCATTAACTTACATGGGCT:1 - chrX 20956382 3' - INE-1 123 1 45.54 TTATAAATTAAAAATTACGTAAGCCAGAACGCATGACTGCCTTAAATTCATTTGGCAATGGGGGGAAAATATTTCTATGTAGGTGATTTCAGGCAAATTAT:1 - chrX 16773970 3' - blood 6928 1 32.67 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCCTCGGCGAGTCCTTGACATTTTGCAATATAAACAGCTGGCTGGC:1 + chr3L 9174771 3' + 412 7534 2 64.36 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTT:1 + chrX 21945921 3' - F-element 50 1 66.34 TCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTATCTTTGTGAAAATTAAATTTTTTTCAATATCCATCGTTAACATTCATCTTCATATCATATAAATTCA:1 + chr3L 21079868 3' + INE-1 561 1 77.23 ATTAACACATTTTTCAAAAGTGTGAGCATGATAGTTTTGTGCGGTTAGTGGGCGTTAGTGTCCGTGGCAAAAATGGCATAGAGAACCAAATTGGCAAGGCA:1 + chr3R 4591184 3' - INE-1 261 1 57.43 TACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATTTATTGAATTCATTTGTTAATTCGACTTCGTCCTGCAGCAAATCCAAGT:1 - chr2R 9285528 3' - gypsy 7015 2 51.49 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCCAATGCAGGGGCAGACATATAGAGC:1 + chr2R 10191762 3' + 297 6929 2 74.26 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCT:1 + chr3R 8165793 3' - 297 13 2 97.03 ATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATAATCCTAGAACCTGTTTAATCCTTGCAGGAAAACCTTAAGATGACGAATTTAAGGACCTAGAAA:1 - chr2L 21673237 3' - HB 1419 1 65.35 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCACCACAGTTAAACCTTTTCATATTCTGGGAACCCTAGTGGAGGATTTAATAA:1 + chr3L 17323384 3' + roo 9046 1 56.44 TAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGTGTTTCATAGGAAGGTAGTTAGGCCTAAAAATTTTTGTTCCCAAGGGATTTTAGGGTTC:1 - chr3L 15041324 3' - mdg3 5364 2 67.33 TTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGCTTTGGGATTACGCAGAAAAGAAACATAAATATTCGTATAACAATATATAGTTCAGATGCATTATAGAAATA:1 - chr2R 9521677 3' - I-element 81 1 62.38 GCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAATGATCGGAAACGACCAATTAAATGTGTTGAA:1 + chr3L 9197827 3' + Doc 4539 1 68.04 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGAACTGAGGCCATTAAGTTATATTATGCTTAATTTCTATCCCATTCAGTGTGGAGACAGTCGTT:1 + chr3R 28678262 3' - I-element 22 1 56.44 ACAGACATTAATGAATAAGATCGAGAATTGAGCGTGCTTGCGACAACCAATGCGCAGCAGCGAAGACAACAAACTGAGAAATGAGAGGCAAACCAGCTGGG:1 + chr3R 19641232 3' - Gypsy12A_LTR 2130 1 58.42 CGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTGTTGGGGTGTATTGGTTCAGCGGCTGCCGCGCT:1 + chr3L 9176323 3' - Idefix 6938 2 77.23 TCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATTTGATGGCTCTATCAGCCATTTGATTCGGTTAGATGTAGCCGATATTATTGGATATTAAGTGAATGGGCGTGTTA:1 + chr3R 24023412 3' + roo 408 1 79.21 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGAACGCTTTCGACAGTGTAAACAATCAATCTACCAAAATGAAATTCTTCGTAAGCTCTGCAAATTCCTT:1 + chr2L 14743306 3' + 1360 3382 2 72.28 ATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACTGAGAGGGAGTCAGTCGAATGGTAAAGCTGAACACGGATTCAACTCTGATGCTGCGGTGGC:1 - chr3R 17222236 3' + invader2 110 2 77.23 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCTGCATAACACCATTCAAACCGGCAAATCAAACAGTCGTGCT:1 + chr3L 27262128 3' - P-element 35 1 44.55 GAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTGGCCGTGTTTTGTTATTGAGTTATTAACCTCTCTCTTTGGCACACCGAATCGCTGGAAACAAACGAGTTTC:1 + chrX 17774661 3' - Burdock 6170 2 75.25 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAGGTAAAAAAAACAGTAGTCAAGATATGCTAATGGTTTAATTAGCGTCATTTGCTAGCTCAA:1 + chr3L 6128330 3' + jockey 4977 1 55.45 CCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAGGTTTTATTATTATACTTTTCTTTAGTTTTATTG:1 - chr3L 3685388 3' - Juan 46 1 73.27 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAAATGGGTGGGCCAAA:1 + chrX 12818906 3' + roo 9052 2 59.41 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGGCAAAAAACCCGTGGTCATCCAACACCGATCACAGGATGCAGTCAACTATTATGATCATGAAA:1 + chr3L 11199905 3' + roo 396 1 66.34 TCAACACACAAAAAAAAAAATCAAAATGAAAGGGGATTTT:1 + chrX 5535030 3' + gypsy10 494 1 82.50 CTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCTGGGCATCTGAGCTGAGGTGCTGATTCTGTGCATCATCATTCTCATTTATGAGAAGCGACGCAACAA:1 + chr2L 8107820 3' - 1360 3327 1 70.30 TATTTTTGTAGGTTGAATAGTATTCCAACATCTTCATACAGCACATATATGGTAAAATAGCAAATAGTATGCTATGAAATTTTCACAGCAGATGCATTTAG:1 - chr3R 27892513 3' - copia 4880 2 67.33 CGGTCCATCCGAACACCGTGTTCTGCGCGAGGGCGTACGGCAAAGGAAACTCACGAAGTTATTAACGGAGATTCCTCGCCCCCAACCAATACAATTTACG:1 + chr3L 14900381 3' - Max-element 8129 1 70.00 TCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCACCTCTAGAGCAACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGCCATTACACATCTTTCGACTTAAGAC:1 + chrX 7583273 3' - 1360 93 1 83.17 ATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCATATATCCGCCTGCATTTGTTTGTTTGTGCCCCATTTGTATTATGCCATCAGTTTAAT:1 + chr3R 21988461 3' - P-element 106 1 72.28 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCGAAAGATGGTGAAGTTTAAATAAAA:1 - chr3L 26132194 3' - Doc 57 1 76.24 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTT:1 - chr3L 9174692 3' - 412 42 2 65.35 AATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGTGAGCGTCATGACCTTTAGTGGGCAAAAGAGAAGAG:1 + chr2R 11252896 3' - 17.6 325 2 67.00 GCTTTCCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTGCCACGGGAAACAATTGCAGCCCTGAACCCCGATATGTTACAACATATACACGTAGTTG:1 + chr3R 1939208 3' + baggins 5262 1 76.24 AATAAATAAAAAAAATTAAATAATAACTTTTATTATGTGACTAACCCACTGTGATAGTGTGTTTCAGAAATTTTTGCGCTCTGTCTGCAAATGAAGTCTGC:3 - chrX 2822535 3' + Doc 4687 4 80.20 CCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAAAGACGGGACCAGCTTCAGTTTTGAGTTCGGCGTGTGCTTCGCCAGGTGCTCTCAGCTCAGTCGCA:1 - chr3L 13925325 3' + Doc 436 1 70.30 GACAGACGACGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCATGGCTCCACAACCAGCCCCGCTCATCTTTCCTCGCCAAAACAAC:1 - chr2R 1574992 3' - diver2 4744 2 55.45 GCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCAGCAGCAACACCAAGCACACGCGGTGCAGTGGAAACACGTTTTCCGCTTTTTGTTGTGGTT:1 - chr3R 28332904 3' + jockey 491 1 55.45 GTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGAATATGGGATTAAAAAATATATGCCAATATTATGAAAATGTATTGTAACAATTTTGTT:1 - chr2L 9299622 3' + 1731 296 1 46.00 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGAGCGATTAAATATTGGTAACATATTTCAAAATCGATTTATGGCCAGAAAAT:1 + chr2L 7745973 3' - I-element 25 1 50.50 CTATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCAACGCCTGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCACTTATAAGTCTCCAAAGTGTGTTTGTATTG:1 + chr3R 4565288 3' + Ivk 5117 1 75.25 TAAAAAAAAAAATAAAAAAAACGGCAGAAACAAAA:1 + chrX 8801241 3' + TART-C 11102 15 80.00 TAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCC:1 - chrX 8027437 3' + Juan 4180 1 59.41 AGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACACTTTCGCCATCAGAATTTTCT:1 - chr3R 22878483 3' + X-element 4675 1 73.63 AGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGAAATAAAGCATGTATAACAATATTGAAGTAGATTA:1 + chr3R 30215500 3' - opus 148 4 65.35 ATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACATACTTTACTTTAAAGTTAATACTATGCACATTCAACTCAGCATTTCCCCTCTGTTCAG:1 + chr2L 4750057 3' - Quasimodo 11 2 66.34 GAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTGGATGGGGGGATTGTACAGTGACAGAATGTAATTT:1 + chr2L 1619154 3' - F-element 4301 1 65.35 GGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTAAAGCACATATAATTATTAGTTTTGTACGACTTTTAATCAATTTTTTTTTGT:1 - chrX 19080273 3' - Ivk 25 1 54.46 TTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCTTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAA:1 + chr2R 4677359 3' - invader3 5198 2 68.32 AGAGCAGCGGCAATAAGGGGTAAAGACGTTTTTCAGATGGTCGGCGAACGCTTCGTGACCTGCTGCAATTCGTCTCCGCTTGACGCGTCCCTGCTTGACCA:1 + chr2R 4932827 3' - G7 67 1 51.49 CGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCATTTAAGGAGCTGTCGTGTAAGTTATAAACTATTCACCGGTATATAC:1 - chr3L 19322110 3' - R1A1-element 5152 1 55.45 TATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATGGCAAATAACAATTAAGCTCAAGTTGACTTAATGAGCTGGGAAA:1 + chrX 12876965 3' - hopper 390 1 57.43 TACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCCTTTACTTTACCTAACGGGTATAACTATATTTTAAGAGATATTAGTGGTCTTAGCAAGACTTCTAACACAC:1 - chr4 180166 3' - INE-1 13 1 82.18 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGTAAGTGCTTACTATAAATGTTAAATCAAATGATTTTTACCATTAGCAAGGAAATTATCCTTGTCAATAA:1 - chr2L 436850 3' + roo 405 1 72.73 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCGCTTAGTATCTGTATCTGTGTGAGTGACTGATCAAGGCAGCGCAGTCGGCGTCGCCCGTTAAAAAAGCAGCA:1 - chr3R 18448908 3' - hobo 3 1 76.24 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATTTGAAACCGTACTATGTACTTTTAA:2 + chr3R 6425912 3' + copia 233 1 55.45 GTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCATCGATCCTGCTGGCGGCGAATTCGACATCATGTCTCGAAGGG:1 - chr3L 21266924 3' + transib2 2668 1 58.16 ACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCACTCGGACCTTATCATCATTCCCCTTATGC:1 - chr3R 19448013 3' + 17.6 129 2 71.29 TAATGACTAACGCACTGTCAAATGCCCCACGTTGGGCGCCAATTATGAAAATAAATTAAGCAATCAAACTAAAGCCATTCGGTTTTTGGTAAAAACAAACG:1 - chr3R 18680699 3' - gypsy2 372 1 53.47 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCACGAGGTCTGTCAATTTCTGGGCTCTACGCCCCTCGTCCGT:1 - chr2L 16396571 3' - 412 36 2 59.41 AAAAATGGGCAAACGATTCCCGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAGCGAATCAAATGTCGTGGTCAGCAGAAA:1 + chr2R 7169586 3' - FB 50 1 70.30 CCCGCTCACAGCAGTTACGGTCTCAGCTCTCCCACTCTGAACTCTTCCGCAACTGCAGCAACTATAGCAACAACAAAGTCTGAAAATCTACATGCTGCATA:1 - chr2L 19362185 3' + Porto1 483 1 75.25 AGTCGTTCGATTAAGATAATATTAAATGCATGCATTTAATGGGAGACTGCTTTCCCGTATTACCAGATTAAAAGTTGGCAAATTTTAATTTGAAACG:1 + chrX 2081750 3' - Transib-N1_DM 444 1 62.89 AAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAATATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACTATAATTCAAAAAAAATTAAACGGCTTAAAATTAAAAAAGAAA:1 + chr2R 11141384 3' + Porto1 4206 1 63.37 TCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGCGGTTCTCGGCCTGCGAGCTTTGTCGCAAGCTTTTTGGC:1 - chr3R 15328675 3' - P-element 28 1 47.83 GCTATTTTCTGCGTTATCTACGTGTCGATCGTTTATTACAAGTTTATGTTTTTGTTATATTAATGTTTTCGAAGGCGTCGACAGCATAATCTGTGGTGGCA:1 + chrX 20802603 3' + McClintock 140 2 71.29 TGGTAGTCACCGCTAAGGATTGTGTCTTGGGACAGGATACCCGGAAAGCAACAAAAAAAGGAAAGGAAAACTCCTTGAAAAAGCATGTTGAAAGTAAATTG:1 + chr2R 19928853 3' + R1A1-element 238 1 68.32 ATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTTTGGAATCGCGAGTGGGGGAAAGCGTAGTATTAATGAA:1 - chr2R 23908355 3' + Transpac 5194 2 61.39 TCAAATATTAAGATTCTACGACGCTACCAATCAAAAATATTAAGACACATTGTTATGCCTTGAACCATTTTGATACTTTTTATTAGTCCTAAGTAGGTATT:1 - chr2L 8687586 3' + G4 3468 1 54.46 TGCACACACACACACACACACACACATTAATAGAGACATTCATTCAAGCAGTAAGCCCGAAAAATCCAACTTGTTTACTGATGTCCACTTAATATTTTATT:2 - chrX 9110252 3' + accord 7028 2 55.45 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTGTTTCGCACCCTTTAAGACCA:1 - chr2R 10345629 3' - roo 8719 2 80.20 AATCAAAAACTTAAGCGAACGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATGAAAACTAAATTGTATCGATTGGAACTTA:1 + chrX 13859480 3' - Quasimodo 7318 2 71.29 GTACTTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATACCTCCGGACAATTTTCAAAGGCATCAAGGATATGATGTGTACCACGATGGGCTTGTTCTGGTGTTTCCG:1 + chr3L 23854845 3' + Q-element 568 2 60.40 GACTATCAGATACCCGTTAGTTAGCTGGTGGAAATGTTCTGTTCTTTATACGACAGTAGAATATAAAGTTCATTCCATTTGCAAGCAAATACGAATTTTAA:1 - chr2L 11552290 3' - INE-1 549 1 65.35 TCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACAAGGGGGCTGTAATCAACACCAACGGCGATTGAAATGGAG:1 + chr2L 13714323 3' + 17.6 322 2 62.00 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCACGAGGTCTGTCAATTTCTGGGCTCTAC:1 - chr2L 16396584 3' - 412 7102 2 72.28 TTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTT:1 - chr3R 19589926 3' - BS 5024 1 51.49 TTAAAGAAAAGTACTTATCCATTCTCACGGACGCCCGAGAATGGCGGAATAATAACAAAAACAAATATCCGCACAAAAGCCAATGAACGTCAGTCAACGGC:1 + chr3R 14555285 3' + GATE 461 1 75.25 GAAGGACGGAAGCACCGATTCGTTGGAAGCCTCTGGAGACGTTGCAGGTAAGTAGTTGTGTACTTGGGTAATTACAAGCAAGTAGCTAACTTGGC:1 + chr3L 6377950 3' - HeT-A 5726 1 66.32 GTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGCAATGTTTTTTGGGTCCAAGTCCACTGGCGCTTATTTGATCAAGACTATTATACAATCTTACACG:1 + chrX 7336186 3' - Tirant 8167 2 69.31 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCAAAGAACTTCAAATTTTTCAAACTGATCCCC:1 + chr3L 16755827 3' + pogo 2059 1 71.29 ATGGTCTACATTGATTGCTTAGTTGTATGATGAATTCTTTTACATTATTTATTTGGTATATTTTGCAACAGATTAGAAGTCGTGTGTAAGTTTTATATGCC:1 - chr3R 10222114 3' - invader3 5132 1 55.45 TAACTTCATTGTTGATTTAACAAAAATTACTTTCTTACAAATTAGCAGTGTAGTCTCACGAAAGAGATGAGTTACATAGAGATTCCATCGAACTGTCTGCA:1 + chrX 20032900 3' - Tc1-2 1480 1 59.41 GTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGATTTCCTTGCAAAATTGAATGCGAAAGGCGAGATCAAATCCTTATGCCCTTTGTGGAACTTTTTCGCAAAGCGCA:1 + chr3L 18731734 3' - jockey 4761 1 76.24 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAATCGACCGGTAAATAAATACTTATCAATCATGGGTAAACTCACG:1 + chr3L 3776537 3' + roo 9039 1 58.42 CACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATTAGACAAACGCACGCCCAAGGCGTCT:1 - chr3R 13543174 3' + Quasimodo 7065 2 74.26 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCTGTAGCTGCAATTTCCGCGCGCGCGGTAA:1 + chr2L 315170 3' - hopper 44 1 66.34 GAGAATGCTATATTCGAGTTTCTCGACTATCAGATGCCCGTTACTCAGCTCGAGTAAATGCGAATGCGAAATTTCATCATTTTTCTGGAATATCAATAGAT:1 + chr2L 9778708 3' - INE-1 573 1 77.23 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGCGTGCGAGGCACGGATGTTTTGTATACACCACAAAACAAATTCGTATTTATAAGATTTTATT:1 - chr2R 10191679 3' - 297 5 2 76.24 TAATCACGAAATTTTTATTTCTTAGGTTAGAGTTAATTAGCCAAAGCCGCTGGTTGACAGAATACCACACTCAGTCCGAGTTTTGCAACCGGGACCGCTTT:1 - chrX 14426350 3' - Burdock 385 1 54.46 GGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCCGTGGATGGCTACGTTGACGTAGCCGACTTAGTTGTTAGTTAGGTAGATTAAGCTGAATTTAGTTTCGCGAGCTA:1 - chr3L 27366570 3' - F-element 4399 1 74.26 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGAAACTCATATTAATGTTTAAATTATCTTTTAAATTTCAGTTTTCCAATGACCCTTTGTCTCCAAAA:1 - chr2L 17887122 3' + hobo 2929 1 69.31 TTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGGATCTAAAATAGCATTTTATCGTGACTTAGAGGCATAATCA:3 - chr3L 18034174 3' - Doc 40 1 56.44 GCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTCCCCACATCATTGCATTCTTTAATTCCCTACATTTTAAATAGGAGCAGTTTCAGATGTTTCGAAATATT:1 - chr3L 19233763 3' - I-element 134 1 77.23 CACCATGGTTCCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATGGATAAATGAAAAAGAAAAATATCATTAGGCGTAACTGCAAAAATGCATTT:1 - chrX 13864770 3' + Doc2-element 4460 1 56.44 CATTCATACACCACTACACAGATAGACTGTCAGTTTTCCCTCCATCAGCCCACATACCCACTATTGTAAGTAAGCACTGCACTTTACGGCATACATCTACT:1 + chr2R 17022741 3' - invader5 187 2 78.22 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAATAAAAGAAAGGGTGAACCG:1 + chr2R 6074416 3' + 412 438 2 85.15 TATAATAAATGTATCTCCCAAAACTCTCCATTCAGCTGATGGATAATGTTAAAAGTTCTTTGCGCCACAAGATATGTATATGAATCTAAACTATTTATCAA:1 + chrX 10585635 3' + accord2 107 1 79.21 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATTATAA:1 + chr3L 14285065 3' - roo 8690 2 62.50 CAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGGGACATTAATCAACATGTGTCGAAGAAGGGTCCAGGCTCTGTACACATACAACACAAAACAGGCGAT:1 + chr2R 16859920 3' + HB 51 1 61.39 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCCAAAGAGGTGATTGCCGTTTAAATTACGAAATCATGCATGC:1 + chr3L 5085070 3' - 412 7086 2 58.42 TATTCATTTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATGTACTGCAACCAAACACCAAAATTCACACTGAATAAGCAACGTTATATTTAT:1 + chr2R 11813231 3' - invader2 294 1 56.44 TCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGGCAAAAGAAGCTAGTAAGTGCGATCATTTCACAGAAAAGC:1 - chr2R 24538967 3' + Doc 4399 1 60.40 GGCTGAGTAACGGGTATCTGATACTCGGGGAACGCGACTATAGCATTCTCCGAGTATCAGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + INE-1 545 1 46.53 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGG:1 + chr3L 23871313 3' - Doc 42 1 59.41 ACCAGCGCCGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATAAGGGGAAATCTGTTATGGATTGAAAAACTGTCCATTATCTAGACTTTGCGAAAGCCTTTGAGAAAATA:1 - chr3R 852086 3' + Doc3-element 264 1 72.28 AATATGTTTTAATTTGTTTCTTGAATAACTGGAAATTTAAAAGCTCACATATTTCATTGAATTTTCCCCTCGTACTTTTACATTTATTTATCGCTCCCCTT:2 + chr2L 12275322 3' - HeT-A 5765 1 59.41 ATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAATAAGGCTATTAAATTACGCAATCAGTGGACAACGAGGCATTGGAGCGAAAAATGCAATTATATCAAAAATACA:1 + chr3L 12241007 3' - Juan 4060 1 73.27 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAGGTAAAAAAAACAGTAGTCAAGATATGCTAATGGTTTAATTAGCGTCATTTGCTAGCTCAACCAG:1 + chr3L 6128334 3' + jockey 4981 1 54.46 TCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTA:1 - chrX 21668001 3' + Tabor 7298 2 50.00 ACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGGCATCTATACTTACACCAACTAATGAACAAGAAATAAAACATAAGACACGAAATGAATTTCAGAGGAGATTC:1 + chrX 5382544 3' - Bica 54 1 70.30 GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTGGGAAAAACAAAAGCAAAATGGC:1 + chr3L 4713815 3' + transib2 2774 1 74.26 TTTTTTGGGATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATGAGACAGGAGGGCGTTAGAGTGGGGTTCGCCCAAGGTTCGTTGCTCTTTTGCTTTTGCA:1 + chr3L 14198507 3' - INE-1 499 1 63.16 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAAT:1 - chrX 10210965 3' - 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Tabor 6849 2 67.33 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGTTATAGCGGTATTGTTAAAGTTCTGCTAGAAGAATGTAAAAGCATGTGATCTTAGTGCTTA:1 - chr2L 7504854 3' - roo 8677 2 60.61 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAATTCAGTTTGCAAGTAGAAGATGTTAAGGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - hobo 33 1 35.64 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTGCCGAACAGTATATCGTGAATTAAAAATGTCTGGTCTAAATCTTAAGACAT:1 - chr3L 25608313 3' - Doc 26 1 51.49 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTACAAACATTGAATAGATGAGAGGACGGCAGCAGAC:1 - chr2L 4134335 3' + copia 248 1 63.37 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACAACTAATAGGTGCGTAAACGATGTTTTCCACAGCATACTTTGCGGCGACTTTTGGGAATACGTCCTGGAAAATTCT:1 - chrX 5275482 3' - jockey 4676 1 76.24 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGGAATGGGTGCGGAAGATTTATGGATTAG:1 - chr3R 6210247 3' - hobo 45 1 70.41 TTATAAAAGCAGACAACATTTAGGGTTTCCATATTTATCTGAAACCAGACCACTGTGCACGAAAATATATATGCATTACTAAAAAATATATTACATTATAT:1 + chr2L 12410316 3' - Cr1a 445 1 58.42 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTCGACTCGAGACGCAGAAGTTTGCGTGACTA:1 - chr3R 10978676 3' + roo 398 1 71.29 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGCCCTTTAATACACATCAATAACTATCGACGTCTCACGACTCTACATACGATCTAT:2 - chr3L 27262053 3' + P-element 2867 1 59.41 GCTGTTGTTGTTTTGTTTAGCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGCACACATACACAAACTAATGTTGATGACAATGTTATGGGCGTCCTGACA:1 - chrX 7466469 3' - Porto1 252 1 49.00 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTTGGAAAATGTAAACAAAACAAATCGTTTTCT:1 + chr2L 7673182 3' + 1360 3322 1 69.31 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGAAATATGTAATTCATCTGTAAGGATATTTTGTAAAG:1 - chr3L 8012041 3' - transib2 35 1 60.40 CATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATCCAACTATGTCAGTATTATATTATTTTGAAAGAAATTGAATTATAAGGTATGCACACTTCAT:1 - chr3L 8712526 3' + diver 204 1 44.55 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTAATCGCTCTTTTTAAGGGTTTAAGCACTGATTGTTC:1 - chr2L 7745915 3' + I-element 5335 1 61.73 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGTACCACGAAGCTCTTCAATTTTTTACGCTTATTTTTCCCC:1 + chr3L 8012104 3' + transib2 2789 1 60.40 GAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATTTATAATGGTGTGCGGTCGCTTTGACGTAACACATTACGACAAACGGGCAGCGACGTCGACGTCGACT:1 + chr2R 16160309 3' - gypsy 6993 2 73.00 GATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGGTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTA:1 - chr2R 4673579 3' + Quasimodo 7336 2 65.35 TAAAAGAGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGTAGCCAGGCAACGCCGCAAAAGAGGAGAAAGTGGACCTGGAGCCCATTGAATGGCGATAGGGAAGCGA:1 + chr3R 27886976 3' - copia 491 1 73.00 ACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCAGAAGGTAGAAAGTGAAGATGAACGCGTGTCACGAGCGATTATGGGCTAATAGATTAGAAATGGCATAA:1 - chr2L 12830631 3' - Quasimodo 203 2 78.00 GAAACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACATTAATTAAATCAAAATATTTATTCACCCCGTGTTTGTTTTCGCTTATGCAGC:1 + chr2R 23267574 3' + Juan 299 1 63.00 CTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGATAACCGGGCCTCTCGTCATTTTTCGGTGGCCTCAGGTGATGGCATTTTCC:1 + chr3L 3566859 3' + invader2 4975 2 53.47 ACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACTGCGACCTAATAAAATTCCGTTTTACAAAT:1 - chr2L 14074928 3' - jockey 230 1 66.34 AAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGT:1 - chr3L 5267204 3' - Juan 3990 1 58.42 TTCTGCAGCCTCTTCGCCAAAATAACCGACTGGAAGAACTGTGTTTTCGGAAGCCAGGGAAGCTGGTCAAAAATAAGTTCCCCGGTCTTATGGCACAGTTG:1 + chr3R 4593996 3' + hopper2 306 1 53.47 CTTAAAAACCTTCATACATTTACACACCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTTAAATTACGCATTTTAATTTTCG:1 + chrX 7335126 3' + Tirant 350 2 74.26 TCTGCAGACGTCGGAGAGAAATAGGGTCAGTTTTGTCAGGATGCCAGCCACCAAAATGTATCTGTTGTCTATTGTGTGAAAATGCGCATATGGCTATATG:1 - chr2L 2682818 3' - G5A 2668 1 75.00 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATGAAAAAGTGCACTTGGGTTT:1 - chr3L 25272549 3' - 1360 39 1 63.37 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACAAGAAATGGGCGGTGGTTGTTGAGGCAGTGCCTCTAACATCAAAAGCAGGAGTGGCAGCGTTTGATGT:1 + chr3R 15714230 3' - jockey 16 1 66.34 CTATAAACTTGTACGTACACTTCCCGAGCAAAATCAATTTTAGATGAGGCCCAAACGTGGTTCAGTTGCGGGCAGAAACATTTCATGCAAAATTCAAAGCC:1 + chr3R 20384541 3' - rooA 7592 2 81.19 CTGCCTAAGTCCTGGTAGGTGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTCTCTTCCTCTATTGATTGAAGAAGGCGAAAAAATTCAAGCAGGCATTATAAGCCTGTTG:1 + chr3R 19448880 3' - baggins 5028 1 56.44 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATGGCAAGAAAACAAAAAATACGTACAAAAATAAACATGG:1 - chr3L 4637298 3' + hobo 2900 1 60.40 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCGCTAATGCCCCTGTCCAAGTTGCGGGCTAAAGTGCGTGCATCGCACAATGTGCAACATGGATTT:1 - chr3L 21782025 3' - roo 11 2 68.32 AGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGATATATCTTAAGCCCACATTCATCTAGATATTTTACAGTTCTTGCCTGTTG:1 - chr3L 4379584 3' - Doc 371 1 55.45 CGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGACATAATAATAAACATAACTACATTAAATGTGATAGTTAAGCTCTGCTTTTAATCCCGAAAGAAAGGCTCCGTGTGAC:1 - chr3L 7413327 3' - Juan 3 1 45.54 TTTAAATTTATTTTTCAAATTTTAGTTTTTCTACCAATAATTTGCCTAGTGAGGGTACCAAAATATGTTTTGGCCATCCCGTCGCTGGCAATTTGTTCAAA:1 + chr3L 3983125 3' + copia 4666 1 45.54 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGTCTGTATACGGATATATGATATGCCGCCC:1 - chrX 5151938 3' - 297 6611 2 76.34 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCAGAGCCCAACATTTTCCCTTGATTTGCCACCCAATTTC:1 - chr3L 5085007 3' + 412 7509 2 61.39 ATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATTTTGATAGAAGGCTTGCGAAAGTGGAGGTCACGAATAGGTGGTCCCTAGACTTTTCAATTCTCCACCGATTTAGT:1 + chrX 22638572 3' - INE-1 103 1 63.37 AATAAAGGGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATCCTACGCACCAGTTTAGATTTAAATTCAGGACTTC:1 - chr2L 12802197 3' + invader3 5422 2 61.39 CCAAATAAAATCAGTTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATT:2 - chr3L 11367506 3' + roo 366 1 65.35 AAGGACCAAAATGTTCACACTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCAATTAGTGCAATCCGGGGACACAAACAGTTTCCATTTCCTCCAGCC:1 + chr2L 1189483 3' - rooA 376 1 54.46 GTTGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTTAATTAGGGGACGGATGTTTTTTCTACCAGTGGTGGTTTAGAAGAAAAATAAGTAAAAGGGCGGCAAAT:1 + chr2L 19848791 3' - Idefix 7037 2 62.00 GTGGGTTTCAGCTGATCGTGATTTCCGCCGATGGCCTACACCTCGGCTTGAGTTTCCGATTTACCTCATCATGTAAATAAATTATATTGAGGTTTTCCTT:1 + chr2R 5527596 3' + Gypsy12A_LTR 196 1 64.00 GGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATTTTTCTCGTAAATCAAAATGTGGTGTAAGGCGTCATAGAAACAACAATATTAATATAGCTACATT:1 - chr2L 8374164 3' + invader1 393 2 69.31 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGAACCGCCAAACCACCGCTGCAGCGCGCTGGCAGGCTAAATGTTACGCGCTGCAT:1 + chr3R 28196773 3' - hopper 21 1 54.46 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTAAATTAATCTTTGGCT:1 - chrX 18155864 3' + hobo 2902 1 79.22 TAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTT:1 - chr2R 4830336 3' - 1360 52 1 94.00 TAGAAAAACACTCAAAACTAGAATTACACAATAAAATAGCAATATACAAGTGCAATGAATAAATTTGCTGAATAAAATATAATCACTAAAGTATATACTAC:1 - chr3R 24086337 3' + Porto1 4201 1 63.37 TTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAGATACAATAGTTACAGTCCTCTCACAGAGATGGAAATAGTGATAGATACAGATGGAGGGGTATAGGGAGA:1 + chr3L 16680771 3' - FB 6 1 73.27 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACAGTGGTTAATATTAATTACAGAAATAATCTGTAAAAAATCATTGCATACT:1 + chr2L 4888801 3' - BS 5020 1 51.49 AAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGAATTCCGAGCAAAAAAATATATGCGAAATCTAACCTTCAAAATGAGA:1 + chr3R 10133949 3' - Ivk 5064 1 57.43 GTTGGAGCTCTGCGTTTTTATCTGCTCGGTTAGTTAGTTTTTCGGATTCTTCTGCGTTTTTCATCAACCCTTTTCGTGTTTAGAACTGATTTAAAAACACA:1 + chr3L 18185459 3' - Porto1 4526 1 78.22 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATCCGGTCGCCGTTCAGGTGCCCAACGTAATTCGGCTGCAGATTCCGGAACCCTACGCCGTCCACGTGCCCGT:1 + chr2L 9656994 3' + hopper 1402 1 70.30 GTAAAACAAAAAAAGAAAAAAAAAAACGAAAGATATATAAAATACGTAATCACTCATACGTCATGTGGAACCATGGCTGCTTCTGATGTGGGCGGTGGGTG:1 - chr3R 9074996 3' + F-element 4684 1 68.32 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACACACACACACACACACACACAAAGAGCATCGACAACTAAACAGTTCGTCG:1 + chr3R 19734569 3' - hobo 21 1 49.00 ACAAAATCTTAGGCTTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATT:1 + chr3L 25322743 3' + Transib5 2931 1 65.35 TAGGGCCACACAAACTCATATCAGTTGCAATAGTGACTGTTAGTTAAGTACTTTTAAGATTTGTAAACTTGCTGCATTTGGAATTGAATCTTAGTGGATTC:1 + chr3R 19997792 3' + Fw2 3840 1 70.30 TTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCCCAAAATAATTATGTTCATTTTTTCTTTTTGCCGTTCTTATTATGGAGT:1 + chr3R 8686889 3' + 1360 41 1 54.46 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATTGTGTGACGCTAGCAGCATTTTGTTTAAAATTGAATTCCTTCAATGCATTTACCTAAAT:1 + chr3R 27435106 3' + jockey 4972 1 59.41 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTTTGTATAAATACAAGATTTATTTATAATAAATCATTTAAGCAAAGTTGTTTCAAGTATA:1 + chr2R 9957319 3' - Transpac 4934 2 62.38 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAGCAAACAATATCCCTATGCTACGTCAGTATTTGTATCTCCTCGAATATTTGTTCG:1 - chr4 294587 3' - 1360 24 1 71.29 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCCAACTTTCAAACAGCCAAGGGAAATGCGCGCTAGTGCGTGCAATTGTTCGTTTAAT:1 - chr3L 13674624 3' + hobo 2920 1 58.00 AAAGAACTTCACCATACATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGATTATCGCCGGAATTTAGAGCACCTAAGTAGGGCGAACCAT:1 - chr2L 9391477 3' + I-element 293 1 58.42 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCTGTGTGTCCTGTATGCTTGGTGTGCCTGTGTATGTGTTTGGCCTGCCAATGGCCAGTTTTGAGGTCTCTC:1 - chr3L 4189878 3' + hobo 2933 1 75.00 CGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCAAGTCGAGTC:1 + chrX 8027516 3' - Juan 9 1 70.30 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCCTGCCGCAGCACGTTTTTA:1 - chr3L 9763521 3' - P-element 57 1 22.77 TTTTATTTTTTTTTAATGTATTCCAATACAGAAGAATTAGTTCATTACCACCCCAAATTCCAATAAAATGTGTGAGAATTTTACCGTTGGGTGAGGTAAAA:1 - chr2L 16354527 3' - BS4 733 1 76.24 CGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCGAGAGAGAGGGAGGCAAAAAGTAAAATGAAAATAAATTGTGATGGTCAAGGTCGTTGGCATGTG:1 - chr3L 18033913 3' + Doc 231 1 70.30 AACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAAATATTTGACTTTAAATAAGGTTCAATGGTAATTTT:1 - 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chr2R 4500905 3' - Chouto 234 1 73.27 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGCGGTTCTCGGCCTGCGAGCTTTGTCGCAAGCTTTTTGGCGAGTCTCCAAATC:1 - chr3R 15328662 3' + P-element 2863 1 53.47 AATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCATCAGATTTTAAGGTTATCAAGCTGGCTTTCAAGGCTAACCTACTA:1 - chr3R 13886235 3' - BS 4904 1 54.46 GTATACATATATATATTTATGTTTGGTCAATTAAATAAGAGTGGTAGGGAATTAAATGTAATTCCGAATTTTTGTGTCTTTCCCAGGTTTGTAAAACTGAA:1 + chrX 14116412 3' - 1360 2961 1 64.36 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTAAATTAAGAGTGTCCAAAAAAGCTATTTTTATTCCATCAGGATCTCTTGAT:1 - chr3L 10792156 3' + pogo 2083 1 66.34 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCATGTATGTATGTGTGTAGTTTAGGCGTGGCTAACTGCTAAGTGTAGAAGTATCTACA:1 + chrX 8522942 3' - 297 6594 2 67.33 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTAGATCTAACGACTTTATGTAACTGGGAGCG:1 - chr2R 9129668 3' + P-element 2840 1 32.67 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGA:1 - chrX 21667997 3' + Tabor 462 2 51.49 CTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCATTTTCCGCTCGTCCATCAGGCAGCTAGAGAGCTGTATTGTTGTTGTGTCACCGATTTGGGAGTT:2 + chr3L 3536165 3' - hobo 2890 1 69.31 TTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATTTATTAACTCGTACTTTAACCATAAGTATATAACTTTCATATTGCATTGTGTATTAATCATTCTCTTTT:1 + chr2L 5362900 3' - BS 23 1 70.30 TTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTGGGTATGAGTGTGTTTTTGCTCGGCTCTTTTGTTATCTTTTGCCATTTCGCTGGGCG:1 - chr3L 17220410 3' - I-element 412 1 67.33 ACGTCAATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATGCAAAATCTCGAGTCGGAAATCAATG:1 + chr2R 7836137 3' + Idefix 7264 2 75.25 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACTATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGATGTCTTCAGTTCGTTTCGTGTCTT:1 + chr3R 8715277 3' - F-element 71 1 80.20 CGAAACTCACTAACCTGCAATTTGACCCAGTCGAAGCTAGGATTCGGGACTCAGGAGGGGACCGGAGGCAGGCGCTCCGTAATTAAAATGAAATCAGCATA:1 + chr3L 21794754 3' - gypsy12 494 2 62.38 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGTGGTGGAGCTTCGGCAGTCTGGAGGGCCAAAGGATATGGC:1 - chr3R 28940722 3' - hobo 38 1 59.41 CCATGCGCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCACCAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACGAAAACGAAACGTGAAGCTGAATGGAT:1 + chrX 15132707 3' + Quasimodo 7142 2 73.27 TGACTCTGCATAGGTTTGAATTTGCAAAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCGCTTGCCAGAATTTTGAATTAAGTAGAAATGAAATGAAAT:1 + chr3L 21904837 3' - Bari1 114 1 64.00 CGTGCTGACACGGTGATATGATTGATCTACAAAGGTGGTGCAAACGGAGGAGCAGACGAAGAAATTGTGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGGAAACAAGTAGAA:1 - chr2L 1323615 3' - Q-element 193 2 52.48 CGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATTTTATGACTTTTGTTGCTTTCATATTTTAGTTCTCGCTGCTCC:1 + chr3R 7717783 3' - gypsy6 30 2 57.43 TGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGCCCCGACTAGAAGACGCGCATTTATAACTCGAAG:1 + chr3R 17064191 3' + Transpac 281 2 61.54 CAGAGGATCCCGAAACAGTTAACTTCCCGACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACAT:1 + chr3L 13306248 3' + invader6 362 2 69.31 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTATATTGCTACTAACCGTCATTTCGAAATAGAATTCCACAGGCGAATCGTCGCTGC:1 - chr2R 12370552 3' - roo 8683 2 58.42 TTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAATTTTGAGCGGTTTGTGGGCGTAATAGGGGGAGTGGCAAGCCTCTTCAGGTGAAACAGCAGGTTATCACGGGGAAGCTC:1 + chrX 5386953 3' - INE-1 250 1 60.40 TTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTCACACACACTGCCTGTCGTTCGCGTGGTGAATTGACCAGGGAGTTGTTAACC:1 + chr3R 17916782 3' + 17.6 204 2 68.97 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAATCGTGGCTTCATTACGAATTCTT:1 + chr2R 11086453 3' - Doc 52 1 74.19 TATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAATAAATAAAAATTTGGATATATGTTCATTATACCTTTACTTTGCTAACGGGTATCTTTAGGAGTTTAACT:1 + chr3L 4267246 3' + Juan 4198 1 59.41 ATCCACACATCAACACTTACTGAAGAGAACGGCGCTACCAACATGCTAACTATGCGGGGATGAAGCCGAGTCAACAAGTTCAATTAACCCACTACGGAA:1 + chr2L 18198857 3' + Ivk 5068 1 57.58 CATCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTGTCACCTAATATA:1 - chr3R 4353325 3' - Tirant 416 1 59.41 TTCTAATAAGAAAACTTGATATTTTAGGTTTCCTTGTTGATCTTCTTCTAAATTTCCAACTTAAAGGCCTCCAATGGCAATCTTGTTAGTCATACTAGCCA:1 + chr2R 7603893 3' + Q-element 353 2 57.43 TCACCTTGGCAAAACGCACAAGTTGGTATTGAATTGGTATTTCTTTTTTGTTTGTTTGCGGTTATTTTGTTGTGTACATTTTTGGTCAAGCCGAGCCAACG:1 + chr3R 31964579 3' - I-element 5008 1 64.36 TTCTCATACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCTGCGCACTCCTGGCTCATAGTTTTCC:1 + chr3L 645362 3' + F-element 273 1 70.45 GACTAATCAAGTCGGAACTCTCACATCCCCACGAATAAGCGAGTAGGACCGTGAACCCGAAGTCTTGCCAAAAACGCAGGCTAACGAAGGAAACGAAACTT:1 + chr3R 21245303 3' - Cr1a 4073 1 43.56 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCCAATAGCCCAATGGCCCAAGGGCATTTGTCATCCCCCGGCCAGACTGTCAACTAAGTGA:1 - chr3R 20170436 3' - hobo 17 1 60.40 AAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTATAGATGATTCCAATTCCGCCC:1 - chr2R 6082627 3' + 412 7240 2 79.21 GCCGCTGTTGTTGTTGTTGCTGATGCTAGTAAGTGTGTCGCCGCCTGGTCCCGCTGGGCTGATTCGAATCCTCGGGCGGCTCAAGTGCACTGCAGC:1 - chr2L 16171971 3' - TART-A 125 8 58.33 AACACGTCCGTCGGGGTTGAAGTTCAAATGATTTTATTTGGTTTTATGTATATTTTCGTATTATGATTGTTAACTTATTTCGGTCTTGAATTGCAGCTGGC:1 + chr3R 10519024 3' - Porto1 9 1 72.28 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGTTTCCGAGGCGGAGATTGCGCTGTTCTGCTTAAAATGATCAGAAAGTGAGTTCTCTCGAGTGC:1 - chr3L 7806532 3' + 1360 3378 1 68.32 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGATTCTTATGAGTTATAACTTATTTCCAATCCCCAACTGTATGTTATTCAAT:1 + chr3L 13778676 3' + transib2 2778 1 54.46 GTGCATTACTGATTTCTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATAAACAGGCTGAGAATACGACAACTTCGATTGCGACTGCGATTCTTGGCT:1 - chr3L 14260333 3' - 297 6623 2 61.39 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGGAATCGTAGGAATCAACTCATCATTGAACGAAGGTGGATTGAAG:1 + chrX 1252848 3' - hobo 32 1 54.46 TCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAATAACAAATAATTTAAATTAAGAGCTAGTGAATTAATAAAAGCTGCGGCAGCAGAGGCC:1 - chr4 195703 3' + INE-1 126 1 61.39 TATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAAATGACATTACACCTCAACAAAAGGATATGTTTTA:1 - chrX 6516722 3' + 1360 323 1 69.00 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCT:1 + chr3L 13366411 3' + hopper 1365 1 75.25 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATCAAATACTACGGTGCTCGGCATTTTCTCGGCTGGGG:1 + chrX 4784571 3' + hobo 2899 1 62.00 TGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATGTAAGTGAGTGAGTGAGTGCACACTGTATGTTGCGAAGGCAAATTGCACCCGGGGT:1 + chr3L 3476431 3' - jockey 4658 1 57.43 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCCAACGAATCCTGTTCAATATCGATGAGGAATCCAT:2 - chrX 7768916 3' - hobo 32 1 59.41 TAATAAGTGTGTGTGTGTGTGTAGGTTCGCGTTTAAGAAAAGCAAATGAAAAACGGCTAAGAAAAGCGGCGTGTAAAAGTTTTTCCAGTTCCCTGTA:1 - chr3R 28152191 3' - accord 7031 2 62.89 GCTTTGCGATACAAAGTTGCAACATAAACATCAACGATGAGTACGCCGCCGACATCCGCCCATCCACATCCAGTAAATATTTAGTTGCTCATAAATTACGG:1 - chr2R 13384646 3' + ZAM 83 2 55.45 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTAATGAGCGTAAAGTCAAGTTGAATAGCCATA:1 + chr2L 19571299 3' + P-element 2841 1 34.00 ACAAAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCG:1 + chr3R 2533950 3' + gypsy8 4811 2 51.00 AATAAAAGCAAAAGAAAATAAATTTCATTAAATTTATAAGAATATTTCTGCCACCTGCAAAACAACATATCCCTTTGTTGCACCTGAGACAGGCATTGGAT:1 + chr3L 9583073 3' + F-element 4672 1 70.30 ACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGAGAGCACCCAGCACCTATGTACATACATA:1 - chr2R 22803278 3' + hopper2 1562 1 65.35 GAGAGGGGGTATGTTAACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGCCCACCACTGTGTTGTAATTTATGTGCGGATTTTTATGGTTTGTTAGTTTTTGCAGCCATA:1 + chrX 10106030 3' + accord2 206 1 64.00 AATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGACAAGTGGAAATGCTTGCCCGTGCAT:1 + chr3L 565947 3' - F-element 4233 1 74.26 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCTGCCGAATCCAGAGAGAGATCGGGGAAATGAACTTCCCGAGAGAGAGGATGAACTCATTC:1 - chr3R 15666027 3' + P-element 2878 2 69.15 TGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGTTATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTGCTTGCTCTACTCTGTACATA:1 - chr3R 10738086 3' - accord 479 2 77.23 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTT:1 + chr2R 17345996 3' - hobo 42 1 67.35 CGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCATGCGGCAACTTAAGCTGCTCTGGCTTGGAAAATTTCAATATAATTGATTTTTCGCTCAGACA:1 - chr3L 3477277 3' - jockey 4988 1 54.46 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCGCTGGT:1 + chr2R 17346030 3' - hobo 11 1 66.34 TATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGTGCGGAAACATTTTCGAGTTGAGGAGCTACCAGTTTTC:1 + chr3L 13779354 3' - transib2 37 1 58.42 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTAGGCTCTTTAGGGATTTGAGGACTTTATTGATTCTCACTAATTCGCTTTTCATCTGCCA:1 - chr3L 5707164 3' - 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Rt1b 5111 1 80.20 AAAAAAAAAACAAAAAAAATACACAACAGAAGGAGCAGAACAATGTGTCGAAAGGACGAGGGGGAGCAGAAAACTTGCAGGCAAACGACAGCCGTGAAAAA:1 + chrX 14715714 3' + Rt1a 5087 8 78.22 AAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGCTCGGTATGGCGGCGCCTGGATGATCATCGGC:1 + chrX 15881366 3' + invader2 4765 1 68.32 CAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGTGGAATATAACACCACCGGCAGCA:1 + chr2R 10581506 3' + Ivk 140 1 76.24 ATAGATTTTAAATAAATACATACATCGAAAACAACTAAAAAATTTGCGAAAGTACATAAATATGTAAATTAATTTTCAGTATTACTGGGTATTCTCATATT:1 - chr3L 3037088 3' + G-element 4299 1 43.56 CTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACAGGATGTCTTGGGAGCAAGAGGGAGCGATCCCCGCTCGCTCGTCTAAT:1 - chr3R 5441135 3' + accord 440 2 52.08 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGAAACTTAAAACTTTACCACTCCCCCCATTCGATGGGTCAAAGGAGAATTAATAAAA:1 - chrX 19850409 3' + pogo 2084 1 61.62 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCATGCATTTTCCATGTGAAACAGCTTACTTCAAAGAATGTAAATGCC:1 + chr3R 20868796 3' - Transpac 4946 2 52.48 ATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGTGTTGGTGGAAAATTCTCAATGTGCGTGTGTGTGCGTGTGGGTTCTATTGCCTTTTGTCTTTTGGCCCAAGATCGTTTTG:1 + chrX 9700545 3' - Quasimodo 33 2 57.43 GGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTCTTCTCCAAGCAATTTGATATCGAAACGAATAGCAGTGAATGGTTTTTATTGCAGTCTTCTTGCCACTTCG:1 + chrX 2756184 3' - Doc 4472 1 74.26 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCATCGGCGAGTCCTTGACATTTTGCAATATAAACAG:1 + chr3L 9174762 3' + 412 7525 2 57.43 TGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCTGAGGACTTTTCATGAGGATACTACTTTTTCTTGCCTAACTTTAG:1 - chr3L 20582568 3' - Ivk 396 1 55.45 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCACAATTTCTAACTCCGCTCTCCCAAGGTTGACAATACGAAAAATATACTTGAT:1 + chr3R 21969132 3' - hobo 24 1 54.46 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCATTACATTAGCGTTAAATGGTGTTAACTTACACACACATACACACACT:1 + chrX 12276836 3' + hobo 2913 1 53.47 TCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGCTTTACGGCATCTAGTGAACTCTTCTACAGCTACTTT:1 - chr2R 25132154 3' + Doc 4228 1 68.32 GCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAACAAAAAACAGCGCAGAAACATTTTTAACTAAAATGTGGAAAGCAAGCAAGGAAACA:1 - chrX 5082061 3' + hobo 85 1 59.41 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATAAACAGGCTGAGAATACGACAACTTCGATTGCG:1 - chr3L 14260349 3' - 297 58 2 45.54 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAAACGCATAAACGAGATCCAAGATCCAAGTCAAGGTGGAAGCCAAAAACCAGGAGGGAA:1 - chrX 18991511 3' - pogo 14 1 63.37 GTCACCTCTCAGCCCGAGAGGCTTGGTTGCTGCTGCTGCTGTTGTTGTTGTTGAACTGGCTGTGGCATGAGACTGAAGCCGCCC:1 - chr3R 29103152 3' + Rt1a 4650 1 67.86 TGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACATGCGTACATATGT:1 + chr2R 5651907 3' - Tirant 26 2 55.45 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTGCAGATGTGACAACAGAAGGTGGTG:1 + chrX 8354409 3' - jockey 59 1 73.27 TGTCCCGTCAGTTGACTGAGGACAACGCCAAGAAATAAGTGAAGGGAAAAGCGCAAAATGTAAACAAATTGTATCTGATCGGGATAAAATTTAGAAATTAA:1 - chr3R 25444006 3' - 297 6939 2 58.42 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATATCATTCTTTCAGCTGGATATTCTTGTTCTAAGTTGATATGTATATTTATTTATC:1 - chr3L 11844324 3' - Burdock 14 2 50.50 AAAAATGCATTACAATTATTACAAGGCTCTTTGAATTTTCTGTAAATAAAATAAATTAAATGGTGGTTCTGAAACAATTTGTGACAGCATTTCCGGAATTG:1 + chr2R 17292565 3' + Tabor 484 2 74.26 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAACAAAAAGGAGTTGACAAAAAAAAAAGAAGGAAGCCCAACGAACAATGTTGGCTATA:1 + chr3L 13164763 3' + pogo 2082 1 56.44 TCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATTTTTGCTTGGCCCATTTATGCATGACATTCTGTTTTATTTGTGCGAGTGTGTGTTTGCGGGAGAGTCAGC:1 - chr2R 15664617 3' - hobo 2739 1 79.21 CATCCAAATCATCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCGAAAGCCGACTAATCACTGAGCACCGCGCTGGGTTTTTGGGCTACGGCTGTAGTTACTG:1 + chrX 19991171 3' + Doc3-element 4525 1 52.48 GTCCTCGTTGTATTATTTCAATGTTGCTGTTGCATGCATTGCCTCATAGTTGACATCTAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' - Doc4-element 2644 1 54.46 GCAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGATGACAGCTCATGGCCAACAACAGGAACTCTTATAA:1 + chr2L 6641419 3' - Tabor 7253 2 62.63 ATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACCAAACTGGCTTGCACATTGATTTATGCCCGGCCAAATTGTTGTCACTGTCACAAACAGAA:1 + chr3R 19735179 3' + hobo 423 1 71.88 AGTAAAACTAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATAGTTATTTAATTCTGGAAGGACAATTAATTGTGGATAG:1 + chr3R 852497 3' + Doc3-element 173 1 58.44 CTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAATGTCCAGCATGGGCGGAACCACCACATCGCAGGTTTCCTGA:1 - chr3L 11729301 3' + Idefix 442 2 60.40 AACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATTATGACTTCTTTATTAAAAACTTTTCTTTGTTTCTCCGAACGGCTGTTTT:1 - chrX 22728085 3' - Ivk 5119 1 58.42 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGTTTGTGTTAATAGTTAAAAGGATTATGTGTACCATTTTGTAGAGTTCATTATAAAGTGCAAGGAAAACCAAGC:1 + chr3L 3886656 3' - hopper 2 2 69.31 TGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGCCGTGTATCCGTCAGATACGCAAAGCAAAGCATAAGCAAATCGCTGACGTATTTTCCCCC:1 + chr3R 9929338 3' - 1360 3239 1 68.32 TATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCGAGCGTTCGGGCAAAAAAGATTATCTATTAATAGATTGCGGAGTGTGTTTGTCCGACCACATCCAGA:1 - chr3L 17291185 3' + accord 93 2 73.27 ATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTAATATTTCAAGGGGGCTGGACGACAGACGCTCT:1 + chrX 13027646 3' + 297 6533 2 70.18 AATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCCCAACCCAGGTGCTGTTGTCTCAATTGTCAATTCATAAACGAACGAAGGGGTTTCTTCGAT:1 - chr3R 13888126 3' + F-element 4446 1 66.34 TTACATAATAAAATAGCAATATACAAAGCGATAAATAAATTCCGAATCTGGTGTTTTTCGCAATATTCCCTGAACAAATTTGATGTGAAAGCTGCACCACG:1 + chr3L 25484773 3' + Porto1 4224 1 74.26 TCCCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTAGAAGATAGACGCGATAAAAAAAAAATATATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCT:1 - chr4 836649 3' - Cr1a 4433 1 69.31 TTAATGACACACGGGAAAAACACCGAGTGCATTTTGACTTTTCTGTGTGGCGTTGCACTATTTATGAGCATCAATTGCAATTAGCATTCTGCACAGGCTTA:1 + chr3L 15636161 3' + baggins 5095 1 67.33 TAACATAAGGGATTCCTAAGTCTTTATGGATACTTGCATTTGAAATAATGACCATGATACGGTCCCATGACGATCCATCCTTGCTCCAATGCTTACACTA:1 - chr3R 7078429 3' - G4 3561 1 56.00 GCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTTTCTAAGCCAAGCCAAACATTATGTAAC:1 - chrX 10091665 3' + 17.6 160 2 72.28 ACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCACTTGAATTCGAAATCGCAAACAAATATAATTTTT:1 - chr3L 15259332 3' + 17.6 7111 2 68.32 CATATAATTTGTAAAATGGCAAAAACAAAGGAGCTATCAGTTTGATCTGTGTCGAAGCCGCGTCCATCCCTCTGAGCCGCGTCTGCATTAAATCCAATTAT:1 + chr4 902580 3' + Bari2 240 1 65.35 TGTAACACGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATGAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATTGGTTTGATTTGAACACAATTCCGGAGCACAAATTAA:1 + chrX 18159876 3' + INE-1 31 1 63.37 TTTCATAATTGGCGCCCAACCAGTGGTATTTGACAGTGCGTTAGCCATTACCCACGAACACAAAAAATTCACAAAAAAAAAAAGAAGAAAAACGATGAACA:1 + chr2R 13719397 3' + gypsy 473 2 70.30 TGTTTGTGATGGTTCACATTTACGTTTTTGTTTTATCCGCTCCAGTTAGAGTACTCAA:1 - chr2L 16382747 3' - jockey 73 1 62.07 ATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCGTCAGTATCAGCCACTGACCGGGAGCAACTTCGAGCTGTACTCGTACGGCGAAAAGGGAACGCCGCCG:1 - chrX 931331 3' - Idefix 7090 2 69.31 ATTGCTCATCTCACATGCGAATGATGTGGCGTGGTGCGTTGCTTTTTGCGCCTTTGCG:1 + chr3R 17508155 3' - jockey 8 1 60.34 CGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTACGATAACCTACTGTTCATAAAACCGAAAAAGAAAAAAAAAACAAGAAGAT:1 + chr3R 12320635 3' - Doc 4457 1 49.50 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATA:2 + chrX 12818874 3' + roo 356 2 76.24 CACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGAGTCATGAGAAAAATGAGAACTTTGCCCGCAGAATGTTATTTTTAAAGTTTTGCTATCGTTGTCGCATT:1 - chr3R 23868856 3' + hobo 2678 1 50.50 GCACCCGGAAAGTTTTGGGATAATTCGGTTATCGCAAAAATAGTGAGTTTAACCTGATCGAACTCATTGCCTCGGAGATACCACTCGGACATA:1 + chr2R 9574445 3' + Gypsy12A_LTR 154 1 58.06 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGGTGCCATAATTTATGCCCAGACTAAGTGCATTATGTTTGG:1 + chr3R 22276913 3' - hobo 34 1 61.39 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAATATACCTTCAAATCGAGACCGTATCGGACGTTTCTTAGCGAACATTTTT:1 - chr3L 12913596 3' - 1360 29 1 54.46 TCTTTCGCTTTCGATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTT:1 + chr2R 2092783 3' - Doc3-element 92 1 65.35 GCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + hobo 2483 1 59.41 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGGATCTAAAATAGCATTTTATCGTGACT:1 - chr3L 18034188 3' - Doc 52 1 69.70 AAAGATTATATGATTAAGAGTATTAAAGAAATGGAATGTTTAGTAATATTTAGAAGATTTGATTGGGGTATTTGCCAACTGACCAACTACTGTCCATCTGA:1 + chr2L 6372041 3' - jockey2 3278 1 61.39 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGTGTCATCCACTCGAACACATCCTGTTCTGTTCACCTCAC:1 - chr3R 8914482 3' - roo 36 2 64.36 GTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCGCTTTTGCGAGGATCTCGTCTTTGTGTTTT:1 + chr3R 14986011 3' + opus 169 4 70.00 AGTGTTATTATATTCTTATATATTGTCATACAATATTAAAATATTTTTTATTGCTAGTAAAGATACGTTATTTATTGAGTGAACTGGTTCCTCTTGTCCAG:1 + chrX 7746959 3' - mdg1 6 2 34.65 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTTCGGGTTGTGCTGGAATCAT:1 - chr2R 10777819 3' + pogo 2052 1 79.21 CATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCCACCTTGATCACGCAATCACAACATAATCTGCCAGGC:1 + chr3L 3734075 3' + roo 314 2 63.37 TTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAGCTTTAATTATTATAAATATATTTATAGGCGATTGGTTTGATAGCTATG:1 - chr3L 22094259 3' - Stalker2 7277 2 56.44 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAATACAAGTACTGTGATGATGTTGGGAATTTAAAGCAAT:1 - chr2L 10073573 3' + pogo 2067 1 64.36 ATCCAAGAGAAACGTAAAGCTTTACGTTTCTCTTGGATTCAGGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATGGTTTGTTTTTTCTCAACA:1 + chrX 10794150 3' + Idefix 358 2 75.25 ACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATACATATATATTTCACTTTCACTTTGTTGACTGCTTCATAAGTTGAGTTGTTCGCTTTGTGAACTCTGACC:1 + chrX 11463719 3' + flea 252 2 73.27 CCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACAGCTAGCTTTTAGCCATACACGTAAAGAAAAAAGGAAGTTGAAAATAGACAGAACTTTC:1 + chrX 5113161 3' - accord 258 2 48.00 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATAATTACGGGAAATATTTATCGCTTAGATACGGCCAGCG:1 - chr2R 16338086 3' + roo 9035 1 61.39 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAACTCCATGGCGACTTTAAGGAAAATGCATCGAAGAGCCGAATATGTTGTGAC:1 + chr2L 16136677 3' - hobo 7 1 68.60 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGA:1 - chr3R 25514126 3' + hopper 1369 1 72.28 ATTCAACTTGACCTAGAACTAACTTAGTTTTCCTTTTGAATACGTTAGGGCATTTGAATTAGGGCTTAAATACATTTTCCACCGCCGTCTGTGAATTTTTT:1 - chr2L 22114903 3' - HB 1384 1 51.49 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGG:1 - chrX 21668006 3' + Tabor 455 2 53.54 TGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGATACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGCCTGCGTGTGCTTTATCAGTTACTACTGT:1 + chrX 12738387 3' - Doc2-element 4483 1 71.29 CTTTGATCTTGTGTTTTTGTGCACAATAGTCTGATTTTAGTCTAAATGTTTGTGCATTTCGACATTATTTTTTAGCAATAATAAATAATGATTTAAACAGT:1 + chrX 15168785 3' + Cr1a 389 1 61.39 TCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACATACACATACACTCAGGCTGCACACATTACGCTATATAGAGATATAGA:1 - chrX 11508776 3' + 1731 4592 1 62.38 ATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCG:1 - chr2L 23372507 3' - gtwin 5 2 74.00 TATATATATATATGTACATACAAGTACAAGTAGTGTCTAGAATTCTGGAACTGAAACCGAAACTTTGGAGGCAGCGGAGGCAACAGCTCATTGCCGCTAAT:1 - chr3R 30301744 3' - invader3 5087 1 77.23 GGGATTGTTTGAGCTAATCGCATGTGCTCTGGTTCCGCGATAATGCCGGCATACCGCTCTATAGGTGAGTCCTAGAGGACGACATCTCAATTGGACTATTG:1 - chr2L 14941481 3' - I-element 4884 1 77.23 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGCTCTCGTGCTGCCGAGGAGTGCAGCTTGATATAGAGAGAGGTACTAGACAGTGGAAGTACTT:1 + chr2L 128776 3' - P-element 12 1 68.32 TGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCGGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCCTGACATTTTTCGGATTGATTGGTAACAAAA:1 - chr2R 11400758 3' - 1360 3318 1 71.29 GACCGTTCAAAAGTATCTCTACTAAGAAGAATAAAATAACCAATAGGAATAGAGAGACACATTACTACAAGACCCATGTTTCCCTCGATTTACACTGGACA:1 - chrX 310155 3' + mdg3 5132 1 45.54 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAAGGGCCTTCTCCACCTTTTGGAT:1 + chr3L 9505866 3' + P-element 2834 1 25.74 AACGATGATCTTTGGGGTCTGGTCAAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTCAATAACGGTGCCAGGACTTGGTGGACTTGAAGTGCATTTATGGCTCTAATTA:1 + chrX 10460113 3' + Tc1 1220 1 75.25 AAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATTTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATATCCTTTTATGCTTGGCTGGCGTCATAACTGGGTTTGTTTACCAGCC:1 - chr3R 9215371 3' - invader4 235 2 64.36 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATGTTATAAGCATTTAATACTTTTTATCTCAAGATTTATATATTTCTACTT:1 + chr3R 28804472 3' + roo 391 2 60.22 ACTCAGCTAGTGTGAATGCGAAATTTCGTAATTTTTCTTTAAAATCGTTTGTTCCACATTGTGTTTCGTGAAAATATATGTAAAACTTATATTTGCCAAAT:1 + chr2L 21704915 3' - INE-1 531 1 67.33 GACCACCTTGTGTTATTTCATCATGGTCATGCAGCATAAATTTCATACGAATTCCGCACACTCGCAACGCGTCGCAGATACTTTTCGGCAAAGTTTTCCG:1 + chr3L 6942970 3' + P-element 2883 2 75.00 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATTTGAACCAGAAAAGAGATACATCTTCATCTTTAATGCGAAGGAAATTAAAGTAA:2 - chrX 21668225 3' + 412 474 2 59.41 TAACTGCTGTGAGCGAGAGAGTTGAGGGTGTGTTTATTGTGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAATTTGGCGCCCAGAAGTTTGAATTCAACGAC:1 - chr3L 10817839 3' - Porto1 478 1 78.22 CGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGCGAGCGAATTGTGGGTTGGTGGGTTGGTTAA:1 + chr3L 21992359 3' - Doc 4283 1 74.26 GCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAGGTGCGGCCTAGTAACAGCGAAGACGGCTGGAATGCAAGAAGAGTCAAGGCCGAATCGTAATTAATGGACCTTCGA:1 + chr3R 2446893 3' - 1360 486 1 72.28 GAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGCGAGGTGTTCCAGGTGCGAAAGTCGTCGCATAGCAAGAAAGTGA:1 + chr3R 7067820 3' - Doc 343 1 56.00 GGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACATACAGTTGACTGTTGTCACTGTATGCGTAGAAAAGA:2 - chrX 3464215 3' - 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P-element 30 1 49.50 ACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCACCCCAAAAACCAAGAACACAAATTAGAGACGGTTTTTCGTAATACCCTAATGTCGCAAGACCTCTTTA:1 + chrX 3521746 3' + accord 459 2 71.29 TTAATATTTTTCATTGGTAGCGTTGTAAAATCTCAATATTTGAGTTGCTGGCAGACCCGAAAATAATTATAACAGCGACTATATGGCAAGACAAACAACTA:1 - chr3R 14769155 3' - G4 3489 1 53.47 AAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTCGTATGCACGCGTATGTTGTACGCAAATATTACGTAT:1 + chr3R 10281970 3' - hobo 2895 1 65.35 TCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCCAATGCAGGGGCAGACATATAGAGCTGTTATATCG:1 + chr2R 10191772 3' + 297 6939 2 64.36 CGTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTGACTGAATTGAATTTGATTATTTCCAGTATTTGCACGTTTCATTTCAACGCCCCTGCCAAATCAAACTCAAAATAA:1 - chr3R 14070626 3' - Doc2-element 219 2 67.33 AATAAATATATATAAAAAATCAATCTGATGAGTAATGCAGTTGACACCTTTTTCGCTGCATACTTTTGGGCAGCCTAATTTATAAGTGGTAATTAGTGCAT:1 + chr2R 10857791 3' + Tc1-2 481 1 74.26 CTAAAAGAGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGGCATTTCAGTTGGCTGAAATGGAGAAAGTGGTGGCCAACAATTGCGGCAGCCGATAT:1 - chr3R 6155262 3' - copia 492 1 57.43 CACACTTTTTAAAAGTGTGGGCGAGGCAGTAAACATTTACACTTTTACAGATACTGTATAGAGCATCCGACCTGGTTAGCCATAGACAAAGATGTTGTAAA:1 - chr3L 25751364 3' - INE-1 256 1 74.26 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCGCTTAGTATCTGTATCTGTGTGAGTGACTGATCAAGGCAGCGCAGTCGGCGTCGCCCGTT:1 - chr3R 18448920 3' - hobo 15 1 64.36 TTTCCGACTTGTTCTCTCAATATGTCATCCATTGCTCTGTCAGGTATTGTGCTTTCGTTTAATTTTTTGTTTGAAATATAAAGCTTTGTCTGTCGATAGCT:1 - chr2R 10525948 3' - TLD2_LTR 6 1 67.33 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCGAGGCAGGAGCTCGCCCGATCCGCGTCCAGCATTACGGAGCACCACTTGCGA:1 + chr2L 852901 3' - P-element 24 1 53.47 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCAACCAAATACGTCACTATATAAATATATGCGTGCGAGGCACGG:1 - chr2R 10191727 3' - 297 38 2 81.40 CGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATCGCACATTCAGTCAAGGTAATAACTCATTCTAGTGGAAACCATAATCATTTCGAACCAAAAACGAAAAACAT:1 + chr2L 14084345 3' - Doc 297 1 83.17 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATGGGTAGGCTTTATGTAAATATTTAATGCTTACTTTGTGATTTAGACTTTAGATGTTTGCATTAGTAAC:1 + chr3L 13608407 3' + mdg1 414 2 69.31 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTGCGTTCAAGCTAGTTCAAAACTAACACCTTTACCCCGATAAACCACAGAGGCCAAGAAAGAGGAGGAGAAGC:1 - 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chr2L 14994461 3' + mdg1 7311 2 54.46 TGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTATAATCAAATATTGTTGAAGCAATAAGTGATTTTCCCATGCCGGACAAAGTCAAAAGTCGTGACCTCTT:1 - chr3R 25783949 3' - Juan 401 1 77.23 GCTGCGCGATTTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGCCAATAAATGCTGCCTGCCTGCCGACTGGGTTCCTATATAAAAAGGACACTGCAGCTGTGTGTGAA:1 + chr3R 28048399 3' + Rt1a 41 1 67.33 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCGCTGGTCGTCGCT:1 + chr2R 17346037 3' - hobo 3 1 74.00 TGAAACGCAGCTCAACAATCACTAACCTTTTGGTGATAACTTCCTTGTTAAAACAGGGCTTCAAAACTAATGTATTTCGCCACGCCACAGAAAACTAAATC:1 - chrX 14387040 3' + Q-element 221 2 65.35 AAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATTTCAACGATATTTACATCGCTTTAAGGTGGCATGCAGTATTTTCCACGTT:1 + chr3R 10944986 3' - roo 9053 2 55.45 GTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGCTCCACCAAAGATGACCTAAACGAGATCAA:1 + chr2R 912928 3' + copia 448 1 76.24 AGCGGTTTGCACTGTGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTAATTCGGCTTACAATATTAAAAAGTATAAATGTATATGACCCAACATCCTCCCCCCGTTG:1 - 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Q-element 192 2 60.40 ATATATACATATATATTACATCAACTAATATGCTATGTAACATTATTTGCATATATATTATTGCTGTCATTTCAAAGAGATTTTATTGTGTGGAACATATC:1 + chrX 7850369 3' - Dm88 14 2 48.51 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAGGAATATCTTTGCAAGAATGCAGTGCCGCTCTATCAACGAACTCGACATTTTATCTCGTCTCAAGCAAA:1 - chr3R 29710951 3' - mdg1 7047 2 68.32 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCGTTCGATGAATTTGGCTGTAAC:1 - chr3L 153605 3' - 1360 55 1 79.21 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTAAGATAAGCGTGCAAAACGTGATCCAGATTTAGGAGATTGTTTTGTAGTTTTC:1 - chrX 14521634 3' + roo 392 2 56.00 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCAACAAATATAGGATGATACATAAGCGGTCGTCGTTGTTCAATTTTCCGCTGCTATTGCTAAAATTA:1 - chrX 7698565 3' - pogo 7 1 72.28 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGACTCACCTATGAATAGTCGTTGTTGTCGACGTCGTCGTGGCTATAGGCAAATCAAAATGGAG:1 - chrX 2125549 3' + P-element 2874 1 66.34 GACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACGGTGCAAAGGGAGAAGTGGAAGCGCTTGAATATTTTTTGCATTTCAAAGCCAAATGCGCGACATTTT:1 - chr3L 13779275 3' + transib2 2807 1 60.40 TTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATAGCGAGGGAAATGAAATTGAAAC:1 - 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Doc 92 1 76.24 CAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGTTCTCACTGCAAAACGTAGTAAAGTTATTAGGTGTTGGTTTCATTCGCTTTAGTTTATTCATTGTTAACAA:1 - chr3R 10300808 3' + 1360 3325 1 77.23 TCTCTTGTGGCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGTTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAAAGTGCATAT:1 - chr2L 23299989 3' - invader4 356 1 68.32 TTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACACGGAGTACGGAGTACGTAAATTGACGAACATCTAGAGATGGCGGCGTCGTAATCCGAGGAGTGTG:1 - chr3L 9787075 3' - Ivk 5248 1 66.34 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCCACCGCCAGCTATTTTATTTTCGCGCGTTTCCATGCA:1 - chr2L 12908364 3' + hobo 2901 1 60.40 TTAAAGACGAAATAAAGTCAAATGCTGAGCGATACATAAGTAAACTAACCGAATTATTGTTTTTCTTTATGCTGGTTAAAAGATTAAACGCACCTGAATTA:1 - chr3R 11651567 3' + G3 4347 1 59.41 GTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTGAATAAATAACATTGGCAAATGCAA:1 + chrX 10680711 3' + hobo 350 1 75.25 CCAATAATCAAAATCAAATGCCCGAAAACCCCCGGACATCAAAGGACATCAGTTTGTAACCCTGTGTGCGTTCGCCTGTCTCTGCCAAAATATTTTCATTG:1 - chr3L 18356578 3' - 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INE-1 572 1 78.22 GTGTGTGTGTGTGTGTACATTCGTTACGTACGTCCTTTTCGCCGAGAACAGACGTCGCATATTAAACTGTTGATGGTTTGTTGCTTCGTTTATTTGTTGCT:1 - chr2R 12099267 3' - accord 7025 2 64.36 TACATATATATATTTATGTTTATAATTAATAATACATAGTAGTCACTGTCATTAGTGTGCCGTGCAAAAACTTCGTGTGAGATCACAGAGGCACGTGTTTC:1 - chr2L 8988742 3' - 1360 2958 1 67.33 TGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTGCCAATGTCCTGGCTCTT:1 - chrX 11791149 3' + P-element 139 1 24.75 GAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTAAGATAAGCGTGCAAAACGTGATCCAGATTTAGGAGATTGTTTTGTAGTTTTCTAGATTTCA:1 - chrX 14521625 3' + roo 400 1 64.36 AAGTTATGACCTTTTGTCATGCCAACTAATTCGCCCCCTGACCGTAATCCAACACTCATCCAGCGAATTAGTTGGCAAAAACACGGCATATGCGAGGGGT:1 + chr2R 14788364 3' + Q-element 678 2 69.00 GTAACGGGTATCAGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGTTCACTTCTTCGCGTTGGAAACTTTTGACTGAATCATTATACCCC:1 - chrX 20381406 3' + INE-1 551 1 77.23 GACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAATGAAGAATTATTATGTGCGACGAGAC:1 + chr3L 10013867 3' - 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roo 8680 2 61.39 AAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGAAAAAAAAAATTATTTTTACCAAATCATCTAAAAAAGGTAATGGGTCGTTAGGTTG:1 - chrX 6897348 3' - Ivk 22 1 53.47 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCCTGAAAGCAGCACTTACCGTGTGACCACTCCCTCGTCCA:1 + chr3L 11625617 3' - roo 33 2 63.92 TTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACTCTTAGCCTTGAATTCCTTTTGCTTTTTCGCGCTGCGGGCTCAGCTATCGAATTACCAGCC:1 + chr3L 20569310 3' + transib2 2483 1 66.34 CAGCGGCGAAAAGACCAAGACGAGCGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATACATATTTCACCTTACGTTTTCCTCCGCCTCCACGGAACGCTTCTGG:1 - chr3L 11980669 3' + Doc3-element 245 1 64.29 GATGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCCTTTAATAATAATAAATTTAGGTTCCCTAATTGCAATGTAAAGTGTTTAGACACAATTTAGTTGCTTCGA:1 + chr2L 11706996 3' - I-element 281 1 60.40 ACCGGATGATGATGTCCTTCGGCAGCTGCGAAACGGAACAACCTATTTATTGTACTTTTTTTTTACTCCCAGGGACTTATGTAGAATTGAACTTACTTCTT:1 + chrX 16729371 3' - BS3 1574 1 70.30 ACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACGGGAAATCAGTCTATGGCAACTGGTCGG:1 - chr2R 16396786 3' - X-element 52 1 65.35 TATTGTTTAATTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGATTTTTATTTTCCCTGAAAGGCA:1 - chr3L 15834037 3' - Porto1 4540 1 77.23 ATTTCCACATCTCCAGGCCGGACTTAGGTGTCATTCGATCCGTGCCGAGAGTCTGCGCAGCTGCATCTGGCTGTAGGGATCAAAATGTCAAGAGAATAGCA:1 - chr2L 22391468 3' + baggins 197 1 55.45 GTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGCTTCTAATTGTTTTCTGAGGTCTTTGCATATTT:1 - chr3R 19567827 3' - opus 7377 2 67.33 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTTCGAATTTGGTATAAGGA:3 - chr3L 9174675 3' - 412 25 2 54.46 TAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACTCCGCACATCCTAGTCTATGTACATATATTCGGGAAAATTT:1 - chr2R 5776196 3' - jockey 244 1 59.41 GGGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTAAAAGGGGCAAAAGGAGCTGCTCTCTGGCGACAGGACTCAGTGGAAGACCTA:1 + chr2R 23501807 3' - hobo 25 1 55.45 AAAATTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACTTTAGACACATCGACGAAGACACAATTCTACAAAACCAAAACAAATATGTGTTACACTCTAAACGA:1 - chrX 3248320 3' + I-element 479 1 72.28 TATATCTATTGCATTTAAAGTGAGAAAGTGAAGCGGGAAAGGTACATCGCATCGGAGGAGGAGAAGCGAGTACGTATCATCGAGGAGGATGTGTCGATTAA:1 - chr3R 27303276 3' + flea 385 1 80.20 CACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATGTGTTTGCACTTCTGCACCGGCATAGTTTACATTCGGTTGT:1 - chr2R 17231788 3' - Cr1a 212 1 63.37 ATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGGCATGAGGAAAAACTAACTTATGAAAATTTATATTTTCCCACTAATAAAGGTTAT:1 - chr3R 25972343 3' + Stalker4 264 4 58.42 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAATAATGATGCTGGGGCTGAAATGTAAAAT:1 - chr3R 20901159 3' + Juan 4174 1 69.31 GGTTAGCTAGGGACCGTATATTACCTCCTTATTCTAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACGGTCCCTAGCTAACCGTAGAAGTATGCTCAGGGATGATGAG:1 - chrX 4408828 3' - Cr1a 3998 1 75.25 TTTTGGGCGGTTTTTGGGCTTTAGAGTGGGCGTGGCTAAAAGATGTGGCTTTCAGCAATGCCTCGTCAGAAATGTTTACTTTTAAATTTTTTTTATTTTCT:1 + chr2R 672631 3' - INE-1 344 1 65.35 GCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAAACGAAACGTCACAAACAAATAAATCTAAGAAAATAGTACAATCAAGCCGAGTCAATTGCTGCA:1 - chr3L 15635053 3' - Max-element 8249 2 65.35 TTTAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTATATCAAATTATACTTTTCGGGTAGTCATTTGCATTCGG:1 + chr3R 20369739 3' + pogo 2060 1 49.50 TTTGGTTTTTTTGAGAAAAAGTATGAGTTTTAATAGCTTTACTTAAGGTTTGCCCCAGGGGGTTTCACTAACTTTTTTTTCCCTTTTCCACCACGTGCCAC:1 + chrX 5140715 3' - I-element 5156 1 71.29 AAAGAAAAAGAAAAAATAAAATTTAAATTAGATATTTGAAGAAGTCAGGGATTTCTTTCATGGCGATGTAAGATGAACTAAAAGAAGGATTTTCCTCTGGC:1 - chr3R 17630456 3' + Doc2-element 219 1 90.10 AGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATTCGGAAATTAAAAAATACTGAATGGA:1 + chr3R 19446427 3' - roo 392 2 76.24 CCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACACCAAAACATCAAAACATTAATCCTTGTAAAGTT:1 + chr2R 14263812 3' + X-element 4453 1 66.34 CAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAACCAGCTAACCAACTAACCACCTAGCCATCAGGCCATCCAAAGGAGCTGCCTCATTAGAACTGAAGGAGT:1 - chrX 15531011 3' + gypsy 7 2 73.27 CCAAAGACACAAGAACTCAACAATCACAGTTATTTAATTATTGCATGTCAAAAGTGCATGTTTTAGTATGAGCTAATTCATTTACCTGTGCATTCATTTGA:1 + chrX 6339218 3' - hobo 336 1 74.26 ATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAAATTAAGCAAGATAGAAACAATCCTCTACACATACAACCATAAAATTAAA:1 - chr3R 597413 3' + Quasimodo 7172 2 61.39 AAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGCAAAATAGGAAAGTGTCAAAGAAACTGTAAGGAAACTGTAGGGAGAATCTCAAAATTAACTCG:1 - chrX 20682485 3' + flea 410 1 66.34 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATGTTGCATAGGCACATACTACAATATCTGTGACCATGCCTGTATTCTGCATGTCACAATTACTGTG:1 + chrX 21668303 3' - 412 7089 2 58.42 TGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCGCGGTTATTAATCCCATGGCAAATATTTTTATGATTCATTCACGGCCTGAGTGCACCCA:1 + chr2R 10190001 3' - I-element 184 1 57.43 ACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATTTCCTTTACCAAGACAAGCACATTGCAACAGGTTGCACGCAGACTGATAGGGATGT:1 - chr2R 6735244 3' - Burdock 13 2 66.34 ATATGATAATATGAAATAAAGTTAATTTTTTTTTTGTTCTACAGTGCTGGCT:1 - chr2L 19298922 3' + Dm88 32 2 80.77 CCAGGGAAGACACATCCGGATCCATCCTTTTTACCCTCCGCCAAATCAATTCCACAAATCAACATAATCAACTTCTCGCCGTAAGTCCAAAATATAATGCA:1 + chr3L 18440951 3' + transib4 2366 1 75.25 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCT:1 + chr3L 3635470 3' - roo 46 2 73.27 TGCATTACAATTATTACAAGGCTCTTTGAATTTTCTGTAAATAAAATAAATTAAATGGTGGTTCTGAAACAATTTGTGACAGCATTTCCGGAATTGCTCCT:2 + chr2R 17292570 3' + Tabor 489 1 79.21 ACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGAATTGCGTGGCGATGACGACCAGGCACAGGTTGATCATGAAG:1 + chrX 6128587 3' - Doc 399 1 58.42 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTAC:1 + chrX 11025564 3' + hopper 1375 1 68.32 AATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAATGGGCAAGTTGGTATTGAACTGGGATTTATGTGGATTCTAAAAAGCACAAGGAGGTTCCCAAGAAA:1 + chr3L 18097335 3' - I-element 5029 1 59.41 TCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTAAATATCAATTGGTTACTTCTTGTCTTGTCTGTCTTTGTTTAT:1 + chrX 13862802 3' - 17.6 163 2 65.35 CGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTTGCAAATATAAAAAAAGGACCTGGCGCTG:1 + chr2L 20508677 3' + F-element 4485 1 71.29 TGCGTGTGTGTGTGTGTGCATGCCAACTCTTATACTCGCATCTCAAGATAAAATTTAAATAACTTTGGTTTGTGCTTCCGCTTCTCGCTGACCTGAGTGCT:1 - chrX 14575331 3' - accord 7026 2 60.40 TTATTCCAGAAGACTACTTTTAATTAATTTCCCATTAACCTACTTCCAAAAAATGAGCAGCATCTGTCTCGCTCCCGCCATGTGTGGCGTTCCTTTCTCCT:1 - chr2R 13349692 3' + Cr1a 3973 1 75.25 AGGACGGAGTTGTAGAGTAAGACCTTATATTCTAGTCTCAGAGGTGTTACCAAGATGGCACCGCTTGATGCACTTGTCGTCGAGTGTCGTAGGTGTTAAT:1 - chr2L 7268958 3' - Fw2 3516 1 61.00 GTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTTGACATTGTTCTAGGGGAGCAGTGAAAGGGGTTTTGATTTACTGCCTACATTGTTAAG:1 - chr2L 1238149 3' - F-element 464 1 59.41 AAAATGTATCGAAATACTATCTTTATCTTCAATTAAGATGGGTCCCAAATGTGGGTTGTATGCAGGCCAGTGTAAACTGCCGCAAATCTTAATTCTCCCCG:1 - chr2R 10210683 3' + Circe 7067 1 68.32 TATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGCGTGCGTGTTTGTATGTGTTTGTATGGGTTGTATGTGTTTCTGTTTGCTGTCATGTAGTTGTCCCTGACAT:1 + chr2R 20756454 3' - hopper 1117 1 72.28 TTTAAATATACGAATTAACTTAACCAAACACACTTTTTAGCTAAGTAATAATTTGAAAATATTAATAAAAGTTCTAGCATATAGGTTAGGATGTATAAGGC:1 + chrX 22460256 3' - HB 290 1 58.42 GCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGACTGCAAATTTATGCCTTTTGTACAGTCTGAAACTGA:1 - chr3R 9081937 3' + hopper 1380 1 58.42 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGAACCGCCAAACCACCGCTGCA:1 + chr3R 28196740 3' - hopper 54 1 76.24 ATATTCATCGAACAACAGATCAATGCGAACTAATTAAATGTGATGTCTAACTATTTCGTCGTATATTGCACACAAAGTAAATGAGACATTTGCAATCCACA:1 + chr4 803444 3' - Tc1-2 245 1 56.44 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTTCTATTTCCTTATTGGGGCATAACTTGAACCTTAGGTTCATAAATTGGTTAAGTGAACTGGTAT:1 - chrX 14965153 3' - FB 13 1 64.36 TTCTCGACTATCAGATACCCGTTAGTAATAGTAAAAATAAACTAATCAATAATCAATAATCAATCAATAATAAAACTAATCAAAATGTTTATAAAGAATGT:1 - chr3L 15172627 3' - INE-1 554 1 34.65 GAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTTTCATCTGTCAGTGGTCCGCGTCACGTGTGTGCATATTTATTAGGT:1 - chr3L 14454879 3' - I-element 402 1 54.46 TTTAGTTCTGAACTGACAGCCGAAATAAAGTTACGTTATCGCGGTTTTGGATTACAATGGAGTGTGCGATCTTGAATGGTTTTCGGTACTGAGTGTTATA:1 + chr2R 4478729 3' + Chouto 130 1 64.00 TGATGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGACTCCGCTTAAATGAGAGCTATAGAGCTGTTGCTGGCCGGGCAAGAAATCGAAATCATGACCAGAGCT:1 + chr3L 13287760 3' + micropia 185 2 68.32 AATAAAAATTTTGCTAAAAAATTCGTTGGTTAAACTACTACGATGGCGCACCTGGCAAATTATCTGGATTCGTCAACCAAGTGGAACAACTGCTCAGTTAA:1 + chr3R 3802392 3' + HMS-Beagle 331 1 71.29 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACAACTAATAGGTGCGTAAACGATGTTTTCCACAGCATACTTTGCGGCGACTTTTGGGAATACGT:1 - chrX 5275495 3' - jockey 4689 1 63.37 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATAGTGCCCCATCATGTGGCATTCCTAAACCCAAAGTGTCTTTACCCGCTTTCG:1 - chr2R 15606013 3' + roo 9047 1 60.40 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATATTGTGCAAGAAATGTGACCAAGCCCTCAAAAAATACTTCAACTCTTTATTGGCCAGTCACTCA:1 + chr2L 436966 3' - roo 11 2 69.31 TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGCCAGTGAAGGGTTAAAGATGCCGACATTATAAT:1 - chr2R 17269725 3' + transib2 2783 1 64.36 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGCCCTTTAATACACATCAATAACTATCGACGTCTCACGACTC:1 - chr3L 27262067 3' + P-element 2853 1 45.54 CTAATATAAAGTCATTTTTGAATTTCTTTTTTGATTCTAGAACTCTTAATCGATGGTTTTGAGCCAGAATATAATATTGTTCAACAACACCGGCGACAATT:1 + chr2L 21882789 3' - 1360 380 1 78.22 TACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACCTGGCCCATAGCCACCACACCCAGGATAGTCTGATGTCCGTGAG:1 + chr3R 10398452 3' - Cr1a 4097 1 56.44 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAAAGGCGGTGGAAAAGGGGAGAAAATGGACTTGATGAAGGACCCTGAATGGCGGAGCAACGAG:1 - chr3R 25443021 3' - 297 7 2 69.31 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGTGTGATTGATGTGGACGACAATGGCACTCGGGGATGGAGGGATGAGGAGGTAGGCGGTCG:2 + chr3L 21852578 3' + 1360 3374 1 65.35 AATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTAGTTGAGTGGAAATATGACAAGGTTTGAGGAGTGAGAAA:1 - chr3L 3635422 3' + roo 9033 1 61.39 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTAGCCCTACGTTACGTAGCGCCCGCTACGTTAGTGCGAGGAAATGAGAGCGCGATAATCAGGGCG:1 + chr3R 28330936 3' + P-element 2874 1 66.34 TACGACCCTGCTACCGGCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCGTAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' + Chouto 203 1 43.00 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTATTATTATTATTTTTATTATTATTCCCCTTCCCCCTCCCAGCAACAAAAGTTGCCGGCCAAAA:1 - chr3R 10526301 3' + mdg1 7065 8 65.35 TATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTTCTTTTTTTTCTTTTCACGTTGACTTCACTTCGGTCGAGAAGA:1 + chr2L 12488911 3' - F-element 4433 1 67.00 TTATGTAAAAAAAAATAAAAACTTAACATGTTTATATGTAAAACCATTTTAAACTGTATGAACATGATTAGTTGATATTTGCATTTATATTAATCCAAAGT:1 - chr2R 17884660 3' + transib2 2635 1 60.40 AACGCTTCCTTCTGCCTGTTAAAACCTTTTCAACGAATCTATTATAGTATATATATACACTTTTACTCTACGAGCAACGGGTAAAAAATTTATACCACA:1 - 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hobo 14 1 64.00 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTTTTACACACCATCTGCCCAGAAAGGACAGAATCTTGTGTCTAGCTGCAGGCGAGGC:1 + chr2L 10165073 3' - mdg1 7058 2 59.41 AGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGATGCTCCAGCAGAGCCTCCTTTAAAGCTTGTCCA:1 + chr2R 6972297 3' + mdg1 7145 2 67.33 GGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTACCAGCTAATTCAGCAGCTGGGAATTTACAAGTTGAAAGGTATATTCGGTAGTCCTCATCCTGATCCCTCAGATC:1 + chr2L 11305669 3' + jockey 153 1 78.22 TAGTATGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCTAAACCGTCGACGGTTCGCCGCGGAATCGGTGTGCGATGTTTGAT:1 - chr2R 19658291 3' - 1360 33 1 54.46 CACTAGCTGCGTAACGGGTATCTAATAGTCGGCCAACTTGACTATAGCAATCTTTCATTTTAGGCTATTTAGGAAACAATAAATGTAGAAAGAAAGCAGAT:1 + chr4 1090537 3' + INE-1 541 1 55.45 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTCTCAGTGTATGCGTCCTGGTCAGGTTGTCCTTTTTTCGGGATTGCATTTCCGTCTCCCGTTTGCTTA:1 - chr2L 17168410 3' + flea 5009 2 73.27 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATTATAATGCCGGGCCAAAA:1 + chr3L 14285078 3' - 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P-element 16 1 63.37 ATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATAAGTTGCAAAATAACGAATTCACTGGCCCTAAAAACAACTTGAA:1 - chrX 19019206 3' - hopper 984 2 56.44 TTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAA:2 + chr2R 5651888 3' - Tirant 8152 2 68.32 AGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCTCGTGTTAACTTGCACAAATATTCTCGGAATGCGCACACCGATGCACCGCAAGTACCGAAGTACACATACATACGAA:1 - chr2R 6120784 3' - Gypsy6A_LTR 14 1 60.40 ACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTTTTTAGGGTTGTCCAGGTGTTTTGGCGAATCCCTTTCTTTTGTGGCACAAGTATGTAAACGCTCTCTCGATAC:1 - chrX 6144018 3' - BS 4974 1 60.40 TTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTCGGTATAAATATTATTTTAAATGACGATTAGTTTACTTTCCATAGGTGTCTGG:1 - chrX 3694603 3' - roo 385 2 60.40 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAAACGCATAAACGAGATCCGAGATCCAAGTCAAGGTGGAAGCCAAAAACCAG:1 - chrX 18991518 3' - pogo 21 1 54.46 GAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTTGAATTAAACCTAAAACAAACAAGCGAAAGCCAATTGATGCAAACCGTTAAAACTTGTTG:1 - chr3L 6126925 3' + jockey 4581 1 67.00 TCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAATAAGAATAGATGATTTAAACTAAAAAAA:1 - chr2L 22089933 3' + mdg3 5457 2 68.42 CAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTATCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTGCACAAATGGCGGGTATGAAGGTGG:1 + chr3R 10253975 3' + 1360 3138 1 80.00 AGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAATGGACAAGGAAGAAGCAGCGCCCGCAGCATTCATAAGCGGTAAGCGGGATAAG:1 - chr3L 6502106 3' + 17.6 6963 2 62.38 GCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATGAAAAAAATGAAACGAGAACTGCTAATTGTTGATACTGGTAACCGGGTGATGACGT:1 - chr2R 552661 3' + 1360 3087 1 55.45 CACTGGCGGTTTTATTTATAAACACATGTTGAATATATAATCTCTAAGCTCTTTATTTATAAGCTCACATACATACATGTATGTACATATGCATAACTCAA:1 + chrX 6156258 3' + 3S18 6103 2 69.31 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCCAATAGCCCAATGGCCCAAGGGCATTTGTCATCCCCCGGCCAGACTGTCAACT:1 - chr3R 20170442 3' - hobo 23 1 54.46 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGAGGATCACTGTGCTGCCCGAGGCGTGTCTTTGTTTTGGCGGCGG:1 - chr2L 10636496 3' + hopper 1385 1 58.42 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATTAAATGTCGCAAAATAAATGCT:1 + chr3L 3635495 3' - roo 8685 2 60.40 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCACCACCCCCACACCCCCTGACTACCATCACTTCGT:1 + chr3R 28940776 3' + hobo 2903 1 61.70 CGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAATGTTCCGTAACTTGGTGC:1 - chr3L 17215700 3' - Ivk 12 1 67.33 AATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGTACTTTGCTCCCTAGAGAGAGGGAGAGCGAGAATTCTCCGTCTCGGT:1 - chr3R 24273178 3' + I-element 274 1 59.41 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGACAGCGCTCAGTTGCTGGTCTTGTTTGGCTTGGTTTAG:1 + chrX 10629289 3' + P-element 2877 2 69.31 GTACGCAGACGATGTTAAATTTTGCCTCCAGCACAAGGACATCTCGCGCCATTTGGACTTACAATCCGATCTGGGGGATGTGAGGCGCCGTTCCGGA:1 - chrX 16193688 3' + Q-element 576 2 74.23 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGTGCAGAAACATTTGGCTGCAAA:1 - chr3L 21967041 3' - Doc 57 1 82.18 GCAGCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCTATGACCGCGCTAATAGGCCGCTGCAATCGTACTTATCTGTAGTCTCGTCCTCCTGTCCAGAAG:1 + chr3R 7184871 3' - rooA 7431 2 80.20 AATATTGCATAGGCACATACTACAATACATATGTATGTATATGCATGTGAAAGTTACGGATCTCTTTCTATTCCGCTGCCAGCCTCCCGCTTTTCATTTTT:1 - chr3R 5392258 3' - 412 3 2 79.21 TCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTTATTTTAATAAAGACTTTTAATTGAATTTTCAATTGTTGCGCCGGCTTTGATGGGGCCATGCCATCGC:1 - chr3R 6135195 3' - I-element 5 1 74.26 TGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTCTGATATTATATAGATGGGATATTAAAAAAGATTTCGGCTTCACTTTAACGGC:1 - chrX 18680759 3' - I-element 218 1 47.52 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAAGCAAAAAGTCCTTGGTTGGAGTCACTCAGAATGTCTT:1 + chr3R 12058681 3' + roo 9033 1 61.39 ACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACAAGCGACGTCTCACAAAGGATCGCTTCAAGACCTACACCATAGCCACCAGCTGCGAGATGGAAGCACCA:1 - chr3R 28834444 3' + Doc 226 1 73.27 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCT:1 + chr3L 3635461 3' - roo 55 2 82.18 TTTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTTATATATCTTGTACTTCTATCGTGTAAAAATGTTTGTCAATA:1 - chr2L 21228374 3' - Juan 432 1 58.42 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAAACGCATAAACGAGATCCAAGATCCAAGTCAAGGTGGAAGCCAAAAACCAGGAGGGAAGGCGAGTG:1 - chrX 18991503 3' - pogo 6 1 71.29 CTGAAGGTAAAACCTACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGCCTGTAGTTGGATATTGTGGTTCGAGTGTGCGTCTGGACGGATACATTTGTATCTTTT:1 - chr2R 7376794 3' + Tc1 417 1 67.33 AAATCTATTACATATACTACATCTATACCTGTTACATTTTAAAACTATTACCGCAGACACAAGGACACCGAAGACAGGAGCGAAAGGACAAGGACTCGACG:1 - chr2L 17319200 3' + Stalker 387 1 54.46 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGTCATGTTTGGATGATGGCCCACGCCCACATCGGTTTTCTGGGCGGT:1 - chr2L 9135202 3' + blood 7336 1 54.46 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGGGATGCCCGGTAGTTAACCAGCCATTAATTCCCATCGAATCGATGGAAAAGAGTGGCCTCCCTTT:1 + chr3R 20170538 3' + hobo 2928 1 66.34 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTAGTGCTTTTTGTGTCTAGGTCGCTCGACATGCGCACAG:1 + chr2R 10158724 3' - P-element 30 1 43.01 CGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTATATATAGGGACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTGGCC:1 - chr3R 3673417 3' + rover 329 2 61.39 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCTTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTAAACAATAGTTACATTG:1 - chr2L 10165018 3' + mdg1 364 2 78.00 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATTTGAAACCGTACTATGTACTTTTAAATTTTTAGTCAGGATG:1 + chr3R 6425928 3' + copia 249 1 69.31 ATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCAATACAGCTGCCTTTTTTTTTGATTGTTTTAACGAACTCAGGTTG:1 + chr3R 14004964 3' - pogo 1901 1 65.35 CTAAGAGCACTTGTATGCAAGAGCAAATACACTTGAATCCTGTGAGCTGAACAAGAACTTTGCTTTATTTGTATTCTAATGCCAGCGCAAAACTAGGATTT:1 - chrX 6940019 3' + Idefix 322 2 63.37 CAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAACTGACAATCAGCTCTGTTGCCTCTTTGAATCCGATATTCTTGACCCGAAGAATTCTTGTTCTGCCC:1 - chr2L 22207877 3' + gypsy 7398 2 70.30 CATCAATACTAATGCACACCGCATTTTTCTGTACGATTCCGTTATTCCTGCAGGCATTTAACCTATGAAATAGTTTTGGTTTTCGGTACCGCAAGATTTAT:1 - chr3L 1360070 3' - invader1 190 2 54.46 AAGGTATCTGTACAAGCATGACCACCATTCCCAACGCCAACGAGCTATTGCCGGATTTTGCGGGCCCCAGCTCAGCAGGTAGAAGATTTTTAGTTTGCACT:1 - chr2R 18130439 3' + Gypsy12A_LTR 2158 1 56.44 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTTTTTTTTAATTTGAAGAGTATTTCTCAAAACCTTCTCGCATGAACGTTT:1 - chr2R 22127684 3' - pogo 19 1 57.00 TTTTGGTTTTGTTTTGTTCTTGTATATAGTGGGGGGGATTGAAGTGGGAACTGTTGTTCGCTAACAGGCAGACACTACGAATGCTGTACTGGGAAGCAGGT:1 + chr2L 2783510 3' - mdg3 5100 1 68.32 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAATATAGGCTTCGTCTCCTTCTT:1 + chr2L 21266619 3' - FB 55 1 79.21 CACAACCACACACACACACACACACACTCATACAGACAAGGGATGACTAGCAAAAGGGGGCTGGCTGATGACGAGGGGTTATTGGGCAGAGACGACATCTA:1 + chr3R 21968819 3' + gypsy3 419 1 68.32 CAACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGTAGGATAAATAGATACAGAAGCGAAAACTTATCTAGCCAAATGCGTTTTGGCTTGCCAAGAAAATAG:1 - chr3R 19657756 3' - P-element 10 2 69.31 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGCGGCTATGCGGGTATTTTTAATCTAAGCCATCAAT:1 - chr2L 9699211 3' - P-element 35 1 43.30 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATGACTTTTTATATACGATTAATTCTAAAAAAATAATTAAAAAATGGTTGATAACTTGTTGGAAAAA:1 - chr3R 21998368 3' + 412 483 2 68.32 TTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCATTCCAGACGACTAGGTGGAGTCATCGGATGTGTATCAGATTGTGGACGCCCTGCGGCGGAACACCAACCTAAGCTTC:1 - chrX 8098145 3' - G6 1639 1 58.42 GTGGCGCGTTAATCCCCGTGTGGTACCTACTGGCGTGGTGTCCATAAAATGGTGCAAAAATATGAAAAAGCATAACTAAGCAAATATGTTGTTGTAAAATT:1 + chr3R 26042963 3' - baggins 22 1 55.45 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCACGTACCGTGTCCTTGTCCAAGTGCACCGAAAAGTATGCAACGATGTTTGC:1 - chr3L 21852490 3' - 1360 28 1 55.45 GGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATA:2 + chr3L 25232912 3' - GATE 31 2 54.46 TTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACAACTAATAGGTGCGTAAACGATGTTTTC:1 - chrX 5275530 3' - jockey 4724 1 73.27 CACACACACACACACACATTAATAGAGACATTCATTCAAGCAGTAAGCCCGAAAAATCCAACTTGTTTACTGATGTCCACTTAATATTTTATTAAGTGAAC:1 - chrX 9110244 3' + accord 7032 2 63.37 CTCTTGTGGCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGTTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAAAGTGCATATT:1 - chr2L 23299988 3' - invader4 355 1 67.33 TTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAAGCCCTCTTAGAGGGTTG:1 + chr3L 16470293 3' + BS 5035 1 79.21 TGAAGATTGAGGTCTTTATGGAGTGTGGAGTTACGTACATACCAGACACAGTTGGTTGTCTGCGCAATATCCGCGAATTGGCCTTGCGTGCCGAGGAATAT:1 + chr2L 7390783 3' - Helena 1193 1 54.46 TAGATGAATTATCTATGAACGGGACTCCGCTTAAATGAGAGCTATAGAGCTGTTGCTGGACGTGGCCACTTACGCTATATATCAATATTTGGGCATCTGCG:1 - chr2L 20329129 3' + micropia 195 2 75.25 GTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCATAACCCTTAACCCCTCATTCCTCACAGGAGCTGCTGTTATGCGATATGCCCTTAAAAA:1 + chr3L 10181576 3' - copia 169 2 62.38 TGACTAGAAGTGAAAAATAAAAGAAGCGGCCCTTTCGGATGCAAGGTTTAACTAATGTCGGATTTGTGGGGAGTTATAGGATTTTTCACATTTCCCCCCTG:1 - chr2R 979683 3' - Porto1 4609 1 71.29 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATTGAAATGTAATGTCAGTCCGTAACTTATGCAAATGAATTGGCAATTCTGTTAAA:1 + chr3R 14906903 3' + hobo 2917 1 56.44 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATTCATTACTTTGAAATGCATTGAATGAAATCAGAT:1 + chrX 12954242 3' + pogo 2064 1 71.29 TGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTGTCAATGGAGCGTGGAACGTGCGAGGGTCGATGTCGATGTCGGTGGT:1 + chrX 15637886 3' - Doc 4543 1 60.40 CTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGATGCACAACAACAACTTGCACTTGTGCCCCAACGACAACTACTCCTAGATCCACAACAAAAACTTC:1 + chr2L 4940720 3' + I-element 430 1 61.39 CTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTAGCCGTAGGAAAAACGGGCGTTGGGCAAGGGGATGGGAAAGTCTTTGGCGGGCGGGCGGCGAAAGG:1 - chr3R 16672050 3' + Doc 389 1 72.28 AAATATTTTATTGATTTTATGTTTTTCGGTAGTTTTTGTAGCAACAATACTTAGCATGATATAAATGGATATGTTAAGGCAGGGTATGCCCAAAGTCGACC:1 + chr3L 5704691 3' - transib1 1924 1 76.24 TGTGTGTGTGTGTGTGTTCCTGTTTGTGTGTGTGGATGTATCTGTGTCGGTGGGCAATTGGCAATTAGCCAAAACGTAACTTATCGCCAATGGAGCGGAG:1 - chrX 1225904 3' - accord 180 2 58.00 TATTATTATTATTGTTATTATAATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCTTGTTTTGCCCTCTCAACGAG:1 - chr3L 5387815 3' - mdg1 7054 4 73.33 CTGCGATACTTAGTCGTCTAGCTAGACTATTAGGATGCGATTCTAGTCTGCCATTTGTTGTCAAGCACTTATCGCTAATACCCAGTAAAGGTTTTTTGCAA:1 - chr2R 25017186 3' - jockey2 3120 1 54.46 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTC:2 - chr3L 14285022 3' + roo 9021 2 75.25 GTTATTGTTGCTTTTGTTGTTAGCTGGTTGGCATACAATAAAATACGAACGAACGACAACAAAGAAGTACAAACTTGAACATCTTGAATTGATTGATTTTG:1 - chr3L 3790825 3' - I-element 132 1 70.30 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTACCAGAACCAGCCTGATTGTCCTGTAATTATTGCGTCAAGGATATGATCTACTTGG:1 - chr2R 9311804 3' - hobo 22 1 57.43 TTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCTGTATCGACACTGGCTTTTGCCGGGACCAAAATCCTTACTCCGCTGCCTGTAAGTATGC:1 + chr2R 19655076 3' - jockey 4734 1 60.40 TTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGAGATAGCACTTCATTTTCACCTCCTCCTTCGCAATCACATAAATAAATTATCAAGTGCAAGA:1 - chr3R 15146720 3' + copia 136 2 64.36 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATGTAAGTGAGTGAGTGAGTGCACACTGTAT:1 + chr3L 3476404 3' - jockey 4685 1 68.32 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACATAAACTTGATGATATGGTATAAGTGCTTTTGCCTCTTCAATGGTCCTTCAATGGTATCA:1 + chrX 3195707 3' - mdg1 7056 2 61.39 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAG:2 - chr2R 981626 3' - 1360 65 1 72.28 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTGCACCATTTATTTATAGTGGTCCGG:1 + chr2L 16718003 3' - 1360 52 1 77.23 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACAGGGGTTGGGACGGGGTCGGATCCTGGCTACCTGCCC:1 - chrX 409595 3' + P-element 2848 1 39.60 ATAGTGAAACGAAAACATTTTGTGTAAAATGTTTTTGTGAAATGACATTTGTAGCTGACACGCCTAAAACAAATCCGAAATAAATGCCTACC:1 - chr2L 14498150 3' + X-element 150 1 50.00 CTATTGAAACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAACCCACACAAACAATAATTGTACCCTTCGCAACTGTTTACTTTTTCAGAACAAAGAACTGGATGC:1 - chr2R 9719214 3' + Juan 294 1 63.37 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTCCGTGACTCTTTGTTTATATCAAAGTTTAATTAAAGTTTAAGCGTTTGTTGCATTAGCATTGCCCTGCCAGC:1 - chr3R 11100083 3' - 1360 36 1 77.23 ACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAGGAAATTGCCTGCAGTTCCTGGCATCGAA:1 + chr3R 8914563 3' + roo 393 1 66.34 TATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTTCGGTTTCTGCTCGTATTCTTTTTATTTTTTTGGCTGCCTTGAGT:1 + chr3L 22004920 3' - P-element 434 1 51.49 TTTGAATTTCAATGCAAAAATATAAAGGCCTTTGTAGTAAGTGTTTTGCAATGGTTCATGAATTCCTTAATTTCCTCACAATATAAGTCTTTCAGCTTGTA:1 - chr2R 2962275 3' - S2 1670 1 67.33 TGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGCAGCACATTTATAATGATATCAGCACATAAAAATCGTGT:1 + chrX 14371440 3' + rover 7050 2 61.39 ACAATTTTAAGGTAGATGGTCTTAGTAATTAATATTCTATCATTACTTTTATGTAACGCACTTTTCCTAGCCGTAACAACAAACGAATGAAGTAAATACAT:1 + chr3R 8314766 3' - Burdock 431 1 71.29 AGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACATCGTTGATATTCGGATGTGAGA:1 - chrX 7330965 3' - invader4 2755 1 78.22 GTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCATGATCTCTCTTTCGCATTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' - Burdock 309 1 55.45 ATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTCATTTATTTTGTTGTTGCTGAAAGCCGCTCTGAAACACAAAATAAATGTATGGCAGTTAGCATAGGATAT:1 + chr2L 1499441 3' - hobo 471 1 62.38 TTAGGTAGTGTTGGTGGGCTATGTTTGTGTGTCCTAGTCAAAGTCGTATTATTTTTATTGACACAAGTTGCTGGCTG:1 - chr3R 23426871 3' - I-element 4968 1 76.62 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCCTACAAATCTCCCTCGAATGGGTTAATAATGTAGTGTAACCTTTCTTG:1 + chr2R 16902933 3' + flea 4990 2 51.49 CATTAACGCCAACGAACGGTTAAAGTGCGACATCAGCACTTCTCCGCTGCGACGCTGCTGACGCCTCCACGTTGAAATGCGGCTTAACATAACGCTCATA:1 - chrX 8440026 3' + HMS-Beagle 59 2 70.00 CTTGGTCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATGTC:2 + chr3L 26007752 3' + G5 4755 1 51.49 TGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCGAAGCCGAAAGCCAATCCCGAAGGACTTT:1 + chr3R 7063865 3' + Quasimodo 6997 2 71.29 AATGCGCTCTTTATTGAATATAAAATCAAGCTGAACTTCCTGGAGAGTCATAGTTCCGAGTTTAAGTGAGTTCTACAAAATATTTTGGAATTTAGCTTAAC:1 - chr3L 19610216 3' - gypsy6 7591 2 74.26 GTAAGCGGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGTCTTCAATGAAATGTTTATTGCTCTGTTCTTTTTTTCGAAGCCCCCGACTCCTATTGATTGA:1 + chr2R 13632179 3' - Quasimodo 6944 2 63.37 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATCGATGAATCCACCCTAACACAACATCAATGTGTTCCAAAATCCACCCCCTTTAGGG:1 - chr3R 17846859 3' + roo 9053 2 58.42 CAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATTTGCCATCATCGTTCATGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGGAACATACCGCTTTTCAAAGACAATGTCTT:1 - chr2L 22225152 3' - Bica 96 1 71.29 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAGTCTTAACAAAGCAGCTGCCAGAGACCTTCGTCTCCTCGTCGTCCGTTTGGGGGCAAGTGTTGGA:1 + chrX 17284036 3' + roo 400 1 70.30 GCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAAGGGTCAAATATAGACATCAAGATTTGCAGAACCTCT:1 + chr2R 4624326 3' + Bica 430 1 64.36 GTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGCACACACATACAACGACACGCGCGCAGCCGAGTCAAACAAACAAATAAAATGTGA:1 + chr2L 16533577 3' + Stalker2 7 2 56.44 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCTCGCGTTTCTTCTGCAACGAAAGGTGTACAGTTCGGCATATCTAAAATAACAAACAGATAATAGTTATTAGTGATAACGG:1 + chrX 9048747 3' - Tirant 8107 1 79.00 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACT:1 + chrX 16217517 3' - P-element 35 1 44.55 TGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACATGCGAAAAAAGTTCTTCTTGCCTGTTTGCCATATGGGTGTGTTTGTATTTGTGATGCCTCCGCCTGTGA:1 - chr3L 3881407 3' - F-element 37 1 75.25 AACTTAGTTTTCAATATTGTCTTCTACTCAGTTCACACCCATTGATATATGTACACAATGCTCACGGTTCGAACTGTGTGGATGGATCCATACACATATGT:1 - chr2R 16161631 3' + gypsy 7196 2 67.33 CCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGTGCGAGTGCACGGCCAGCA:2 - chr2L 22208731 3' - gypsy 55 2 82.18 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGAACAATGAAAATGCACTGCCGAAGGGAAAAAATTGGTGGCAGCGTGCCGGCGGGAGAGACCGCA:1 + chr2L 19629709 3' - hobo 11 1 69.31 CGCAGCGTCCACGCAAACATGCTGTGTTTGCCGGCTGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTACCTTGCACATGTATTATTCTTGAATTTTTTTTTT:1 - chr3R 3269644 3' - Gypsy6A_LTR 109 1 63.37 ATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTTCGGTTGTTCATCAATGAACCTCTTATATCCGCCTCACAGGATTATGGAGGCAGCATGGCACATTGCTGGCAT:1 - chr3R 6186466 3' - Quasimodo 69 2 77.23 CATTTCCTCGTTTCTGTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAA:1 - chr3R 1135322 3' + Cr1a 4340 1 72.28 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACGAGTGAAATTGTCGTTGGG:2 + chrX 3176321 3' - P-element 57 1 22.77 ACATAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGTATTTTTTTGTAATTCTATTACTACAACATTTTGCTTGCAACCCCTTTGCGTAACTTTTGCAA:1 + chr2R 22781186 3' + invader2 48 2 68.32 TCGAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAATTGCGGTTGTCTTTGAGTCTTTAATGCTGGCCAATTTGTAAGCCAAGCCCATTTGAT:1 - chr2R 16903161 3' + flea 4640 1 60.40 CTATTTTTTTTTTAAATATTTTTTAAGTCAGCAAATGCATTTGGACTTTCGAACGTGGCATTTTTTATGTTTTTCGTATTTTTGTCGTTTGTTGTTTGCGT:1 - chr2R 20541865 3' - TART-B 10507 2 70.30 CAGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGGGAAAAATTGCAGCTGAGGTAGTTAGTGAAATCAGTTTTCACAT:1 - chr2L 2694583 3' + Transpac 280 2 53.47 CACTGGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTTGGGGAACTCGACTTTAGCGTTCTCTCTTCGGGCTTTTTGGTTTTTAGCTTACAAGAGCGAGGAAGCAAAGC:1 + chr3L 6315540 3' + INE-1 541 1 86.14 ATCAGATACCCATTACCCAGCTAGTGGGAGTGCAAGTACATAAATTCAATTTACGTGGAGCGGACCCCGCTGTCACACAATTTGCAATCAGTCCAGCCAGC:1 - chr2R 7163328 3' - INE-1 545 1 72.28 GTAGACAGAGATACGGTAGATTAAAAAAAATAATAATAAGAAATAA:1 - chr2L 9691385 3' - Circe 91 1 65.22 CGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCGAGTGTGAATGTGTGGGCGTGACCGTTTTTGGATTTCTTTTTGAATTATGTTTAGTAGTATTATTCATTGATTTA:1 - chrX 16862840 3' - INE-1 550 1 53.47 TTAGCTTCATCGATTCGTAGTCGATAGATTTTTGCTGTGGACCGTTCGAGTGTAACTCATAAGTTGCAGTATCAATCGCTGCGCTTTTATATGTGGATTTT:1 + chr2L 19913536 3' - G5 441 1 62.38 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTT:1 + chr2R 17345996 3' - hobo 44 1 68.00 TTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGAGCAAGTGAGGCACTGAATGAAATGTAAAAGCTATTAACTCCCTAATTTAGTTCATATGAAA:1 - chrX 9048628 3' + Tirant 8490 2 63.37 AAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCTAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCACCACCATTCATCCAGAATCGAGCTCAATCA:1 + chr2L 3131587 3' + I-element 316 1 69.31 CGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCTCATTCTGTGATTTTTATCAGGGGCCCTAATCTTTATGGATGTTGTCACAAAAAAAAG:1 + chrX 7967052 3' + Ivk 28 1 62.38 TGGTCATATCTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTATTAATTTAAGTCAAATGACTTAAAAAATATAATAAATAAATAAA:1 - chr2R 19150912 3' - 1360 482 1 59.00 TGGCGCAGTCGGTGGGATACAAAGAAGTATCAAAAAAAAAGGGATGCGCCAATAGCCGTCTAAAACTATTTCAATATAAAATTCATTTCGTTT:1 - chrX 11000892 3' + 297 414 1 66.67 CAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCTAATTCCAACGAGAAGGTTTATAATGTTAAATAGCCAAACGCTGGTAACAAACATCAGAACGAACT:1 - chr3R 25219818 3' + F-element 255 1 69.31 TGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAGGCTGAGACGCAGACAAACAAATGCTTGGGCGCACATTAAAAGCG:1 + chrX 2841722 3' - accord 7036 2 77.89 TAATTACCGCATTTAGAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATGCAGTGACCATGTAATTTGCTCATTAACAAATTGCTT:2 + chr2L 18506810 3' + flea 4966 2 61.39 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTT:2 + chr2L 22150624 3' + S-element 1673 1 78.22 ATAAGTTATTGTCCCACATCTTATATTTTCCAAATCATAATCCTTAAGTAATCCTGGTAGAATATCACAAGAAAATCATTCGCTCTAATTTCGTCAACAAC:2 - chr3L 23437147 3' + HMS-Beagle2 13 2 78.22 GTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTCCGTCCTCATGAACGTCGAGATCAATAGAGAATACTGAGG:1 + chr2L 10230193 3' - Ivk 5054 1 59.60 CAGATCGCAAATCATATACTGGATGGGCGTTTTTTTGCTGCTGGTGCTGCCTTTAGTTGGGAGGGATTACTATTTGGTTGACTGGCATAGTGGGGCATGGC:1 + chrX 12714464 3' + Copia1_DM 3867 1 59.41 AACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTATGTGTATCTATGCCTGTATCTAACTATCTGCCATTTT:1 + chr3L 7489992 3' - BS 4918 1 62.38 AGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACACAAAGCTTTTTCTCTTCATGATCAAAACCCTAAAGTCTAAAGTCCTTCAAAAGAAAAGCGAACGCCATCA:1 - chr3L 3925935 3' + Idefix 7158 2 81.19 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGCCTACGCGTCGGCGGAGTGTGCATGTGTGTGGGAGCCAAAGCTGCTACTGTAC:1 - chr2L 6324470 3' + hobo 2920 1 59.38 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACCGAAAAGTTAATCATAAAAACGCCGAGTGAAAATGCCAAGGTTCAACGT:1 - chrX 3286125 3' - blood 7046 2 57.43 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGTGTCATCCACTCGAACACATCCTGTTCTGT:1 - chr3R 8914491 3' - roo 8709 2 73.27 ATATGGAAAATCTTCTAAAATGATAATTTGTACATATCAGAGTGGTTTAATAAAAGAGGAATGGTTTTTTCTGAAAGCTCTCTCCTTGCATTTACCTTTTC:1 + chr2R 6735358 3' + Burdock 6384 2 72.28 GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAAT:1 - chr3R 14049344 3' + transib2 2795 1 52.48 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGCAAGGTGTGGTCCCTAAAGAAACAAGTGGACAATGCCATCAAGCTGGCCAAGAAGATCCCGCAAACCG:1 - chrX 17283919 3' - roo 6 2 71.00 GTGCTTTGGACTTGAGAGTTTAAGATAAAAAGTTCCTATGATTTACAGTTTTACATAGTAAATTTATACTTTTTTACAACATGTTTCCATTATTTTAGTAA:1 - chr2L 5472753 3' - HB 1604 1 64.36 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTATGTTCCAGTTTAACGAACTGAT:1 + chr2L 5269847 3' - hobo 51 1 74.26 AATGCTTGGTCAGCAATTTGACCAGACGCTTTAATTTAATATGCCGTTGACCAGAAAAAAGGATGGGAAAACACAAGGGCACAATACCAGGCAGAAGCAAA:1 - chr2L 10577350 3' - springer 7182 2 64.36 TATAAAAAAATAAAAAAAAATAAGTTGCTGTATTTATGTCAATAAAACGATAAAAGTGCAAAATCATCCTTGAATCAACAAGGATTTGCCATTGTTTATAA:1 + chr3R 13659972 3' + HMS-Beagle2 482 4 66.34 ACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAAGCAATTCCGTTTCAAAAACGTATCAATGGGTAACGCGTTCCATTCGACTTCGTACTCAAG:1 - chrX 17514050 3' + Doc 4476 1 68.32 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCACCCACCACCCACTGGGACTTGCGTGCGGCACCTGCGTGTGCCGTCGACGTTTTCCATTTGTT:1 - chr2R 16478429 3' + hobo 2924 1 64.36 ACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTTGCACACAATTTTTTCGCCGGGCATCCAAGAGAAGCATAAATGTATATACCTCAATTCTATTTGTCCAGGAG:1 - chr2L 13889057 3' + 1360 17 1 51.49 CATCCTACCGACTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAAGGGTGTCTTGAGGCATATTGTATTGGACCGACAGTTTGTCACACGCAGCGACCTAAA:1 + chrX 7336640 3' - Tirant 416 2 65.35 CAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGCGCCATTGCGTGACAGCCGTTTGTCTCATCCCCTCCTGCCACGCCCCCATCCATACAG:1 + chrX 14395916 3' + BS 4700 1 57.43 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGGGTATTATTTTATTAAGACTACAATCGATATATAGTTACTTACGCAGGCTCTAGCCCTCCAGAATACGG:1 + chr3R 16487420 3' + roo 403 1 72.28 CTAAGCACATAGATATTAAGTATCATTTTGTTCGATGAAGTCATTGCGCTTAATGCCGTTCTTGAGGCGGTAGTCAACGGTGTTCTTAACC:1 + chr2R 8565160 3' + Copia1_DM 4125 1 75.82 CTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTCGGAGTTCCCTTGTTTTTCTTAAAAGAAGAAAAGAAAAATATATGTGAATTATATGAATTTGCAT:1 - chr3R 9229945 3' - X-element 24 1 57.43 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGTAAAATCACGTATTAATTATTCATTAAGAAATGAGAGCATATATATAAGAAAGTAAGT:1 - chr2R 7242923 3' + 412 478 2 61.00 GACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTTGACATTGTTCTAGGGGAGCAGTGAAAGGGGTTTTGATTTACTG:1 - 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invader2 5058 2 74.23 GCTCCTCGGAGTCAGAGCCTAGGGAAGTCAAGCGCAAAGCAGCGAGCAGAGACGCAAAGGAAGCCGCCGACAAGTGCCTGAGCAGCACCACCAAGGACAAC:1 - chr2L 18810429 3' + G-element 431 1 75.25 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGTGCGGAAACATTTTCGAGTTGAGGAGCTACCAGTTTTCTAATA:1 + chr3L 13779359 3' - transib2 32 1 53.47 TCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCGCTTTTGTGTCCGTTATCTGGACAG:1 + chrX 4060849 3' + I-element 308 1 54.46 TGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATGTAAGTGAGTGAGTGAGTGCACACTGTATGTTGCGAAGGCAAATTGCACCCGG:1 + chr3L 3476428 3' - jockey 4661 1 54.46 CCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGCATGGCGTTTTTCCGGTGTGTCATTAAGGTCTTAAACCTTTTATGGTTTATTTTTGAACATTAAGCCAACAATACG:1 + chrX 5393802 3' - baggins 5125 1 73.27 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTT:1 + chr3L 14152143 3' - blood 52 2 77.23 AGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGAGGAGGTGAGGGGTTGCTGCAATGATTGATTGAGTGCAGGAAGGTTGGGGCAATCATCATCA:1 - 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P-element 1 2 76.77 GCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCTGCTGTGGGAGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCAAGAGTAGATCATGTCCATGGATGCG:1 - chr2R 21650313 3' + jockey 4663 1 59.41 TAGGTGGGGGCTTAGCAGAATCACTTGCGCTGTCTTCAATTACCATTTCGAGATCTTCGTTTTATATTTATATTTGTGTAAATATGTAAAAGCAACACAA:1 - chr3R 3696442 3' - G4 152 1 68.00 CTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGTTAACCACCTTCGTCATCTTCGCACGATGACAATTCACTAAATG:1 + chr3L 14152194 3' - blood 7012 2 78.22 ACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACCCACTTATAGTATTAACTTATAACCCTTGGTTTCGATCGCTCTCCTC:1 - chr2L 16456767 3' + BS 5061 1 56.44 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGCTTTGCTTTTTAAAGACCTTCAGGGTGGGAGGAAAATGGCAAAG:1 - chr3L 8883509 3' + mdg1 389 2 59.41 AGCAAGAAAACTAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGAACTCCCTGCCAACCATAAATACTCGAAAAACCCATAAAATCACTGAAATT:1 + chr3L 8665602 3' + Doc 4507 1 56.44 TTTGTTTGTATTATATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACAGTCAATACGC:1 + chr2R 4023392 3' - 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chrX 8463670 3' - looper1 158 1 66.34 GAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATATTCATTTTGCAGATAAAGAAGAGCAATGATACCTTGCATTTTTTTTACCAGAGAATAAATTATTT:1 + chr3R 28257987 3' + 1360 3199 1 70.00 CTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCTCGCGGTCCATCTGGCGACGCACGTCCTCTTGCAGCGATTCCAGGCGTCGCGGC:1 + chr3L 358653 3' + Idefix 204 2 56.44 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGATCCAAGATTTACCATTTACCCGAAAGATACGAAAAACGATTTTGAAAT:1 + chrX 3358777 3' + roo 385 2 52.48 AAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCATCTGTGCGCCGGCGGGCCTATAGCCCTGATAGCCCTGCGTCGGCGGATACTGGGCATAGCCACCGGC:1 - chrX 8402421 3' - Max-element 283 2 78.22 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCAAAGGGTTCTTGAGGATCTAGATTGGCTGCTATTAAAGGAGGCAGAATAAAT:1 + chr3R 3211970 3' - F-element 32 1 56.57 GATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGCATCCTTGGAGGTCACGGCCTTGGGCAACGGGCGAACAAGACGATCCTTGGCTTTTTGGGAA:1 + chr3L 4753192 3' + hobo 400 1 63.37 CGAAAAAGTGCAAAGTGACGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCAAACAATCCATAAACATCGAACAATGCTGGACAACCTAAACAACTCA:1 - 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Q-element 257 2 55.45 GACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATTCGAGTCCATCCATACCCACTCGGCTACCG:1 - chr2R 11098041 3' + roo 8933 2 70.30 GTTTTCATGGACTTCAGCTAAGCAGAGCGTCGTCGCCATGAGCAGCACAGAAGCAGAGTACGTTGCATGTAGTCAGATTCGCAGCGCCACTCCCCAGCTTG:1 - chr3L 1106875 3' + Copia1_DM 3916 1 65.35 AACCCAATTTAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACCAAATTATACCAAAAAATCTGAAAACGACAAGTGAAAGTTTCCATCCATCTT:1 + chr3R 8878949 3' + I-element 5125 1 76.24 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTTGTACTACAAAATAGTAATAAATCCAAAATTTAAATCACAAAAGTTTACGTTTTTCTTGGTG:1 + chr2R 14796248 3' - hobo 29 1 56.44 CAGTGCTGTTTGGTGATGTTTTTTGCATGCACATAAAGGACAAAACTCGAAGCATAAAATAGTTTGTAATTTAATAAAAATTCCATAACTCGAACTTTCCC:1 + chr3R 4620320 3' + Cr1a 243 1 59.41 ACACTTAATATTAATTAGTTCGACACCGATGCGTGCGTTTTCTCGCAGATCAAAAATGTGACTAACTTAAGCTTTGGCACTTAAATCTAAACGACCGCTGG:1 + chr3L 22210843 3' - 3S18 6047 2 77.23 GCCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAGTCAAAATGCACTCGGGGTTTTTCCCGTGTATGGTGAGGGGCACGACTCCGCTGCACAGATCGC:1 + chr3L 25344873 3' - 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I-element 2 1 66.00 TTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAAGCCCTCTTAGAGGGTT:1 + chr3L 16470292 3' + BS 5034 1 80.20 GTTGTTATCGCTGCGGCGAAGCTGTTAACCGTAGAAGAGCCACACAAGCGCAGGCAACCTGTGCAGTGCACCAACAAGCTAGAACAGAATGACAACAAACA:1 + chr2R 12778565 3' - Rt1c 5243 1 49.50 CGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTCTGATATTATATAGATGGGATATTAAAAAAGATTTCGGCTTCACTTTAACGGC:1 - chrX 18680759 3' - I-element 218 1 47.52 GCCTGCGGTATTTTAATATTTAGTTGGCTAGTTGTTTCCGTTGCCCGGCAGCAGATGCTGCCACAAGAACATCAGCCACGTAATGCCGGAAAGTTCCGCGG:1 + chr3R 21342114 3' - baggins 414 1 70.30 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTCCTTGATGTTTGCTG:1 - chr2L 11805005 3' + P-element 2865 1 53.47 ACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTTATTTTAATAAAGACTTTTAATTGAATTTT:1 - chr3R 6135233 3' - I-element 42 1 67.00 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCCTAAAAGTGTTCTTAGAGGTATATATTGCATTGTTCATATTTTTTT:1 + chr3R 5993190 3' + pogo 2074 1 55.45 GACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGATTAGTAGCGGGAGCGAGCGGAGGAGGCCACTGGAGAAGGACGCATAAATTCTAATTAAA:1 + chr2R 22774289 3' - Doc 458 1 72.28 AGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTCAATTCAATCACTTTGGAAGCATTGACAAGAGAATTCCGCCC:1 - chrX 8206552 3' - accord 7304 2 58.42 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGAACAATGAAAATGCACTGCCGAAGGGAAAAAATTGGTGGCAGCGTGCCGGCGG:1 + chr2L 19629698 3' - hobo 22 1 60.40 CGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTTCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACACTAAATTAATTAAAGTTTTTATTCCATCCGATAGTAATCACAG:1 - chr2L 10556070 3' - Cr1a 4041 1 67.33 AGGTAAGTGGTTGTTGATCTACGTTTCATAAAACCTTGCTGACATGGTGATGCTTTAAAATTCAAATATTGTATATATGAAACATATCGTAATGCATGAAA:1 + chrX 4025614 3' - Q-element 227 2 48.51 CATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACCCACTTATAGTATTAACTTATAACCCTTGGTTTCGATCGCTCTCCTCACATCACATTTTTTCACATCCCA:1 - chr2L 16456744 3' + BS 5084 1 69.31 CTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGCGTCACACAAGCGTCAGTTCCGCATGAAATGTGTACTATGTGCAAATATG:1 - chr3R 27435028 3' - jockey 4667 1 52.00 ACGCAACTGGCTCTACGCTATGCACGAGGGATAATTATTTGTGTATCAACTGCGTGGCGATTAATATACAGAAATCAACCGACTAATACAATCATTATCTC:1 + chr4 1156943 3' + jockey2 407 1 53.47 GGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGACACCCGCCCCTGTCGTCCGCTGCTCCGATTTCGGGTATATTTGTGTG:1 + chr2L 18932102 3' + hobo 369 1 52.48 ATCGGCTTATGCATAAGCGTTAGATCGTATAACTTGGGCGCTGGAATGCTAAAGTAGTTGTTTGCGCTCTTTTGTGGTTTGTAGTTAGCTTGTTGGGTGCG:1 - chr2R 15387221 3' - Stalker 163 6 75.25 TGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACGTACGTGCAATACATAAGCGACTTATTTATGCCCCTCACACAGACACCGCCAATA:1 + chr2L 2315505 3' + accord 215 2 54.00 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATT:1 + chr3R 8914521 3' + roo 9015 2 75.25 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAACAATTACAAATTACAATCAATACAGAATCGATAAATGATAGGTTTGCTAAAA:1 + chrX 19831811 3' + Tabor 7279 2 60.40 AATCTCAACCTTCTAGCTTGTATAGTTCCTGAGATCAAGACGTTCATACGGACAGACGGACGACGGCAACTTCTGGTAAAATCTACTACTACTTTTCTTTT:1 + chr3L 9292977 3' - INE-1 164 1 60.40 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAATACAAGTACTGTGATGATGTTGGGAATTTAAAG:1 - chr2L 10073577 3' + pogo 2063 1 68.32 TATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAGGCTCTTTGAATTTTCTGTAAATAAAATAAAT:1 + chr2R 17292520 3' + Tabor 7278 2 68.32 ATAGGCGGAGGGGGTTGTTGAGGGGGGGTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCAAGTTCAATTTAAATGACTGCGGCAGCTCAATTGAGTTCCAGTTGG:1 + chr2L 5210450 3' - accord 27 2 53.54 TATAATTGATGTAAATTGTCCGCACATTCAATTCAATCGACTGGCAGAACCTTAAAGAATCTGGGGCATGGCTTACACAATGTATCTGAGAGATACAAAA:1 + chr3R 11865430 3' + accord2 7158 1 47.00 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTATATTTATCTACCACTCTCCC:1 + chr3R 776938 3' - Doc 48 1 39.60 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGCGAGTTGGCAGATCGGAGATGGCGGCTGCACACACAAGTGGAAAATCACGCACATCGTCTCAGAAAACCGAA:1 + chrX 9473974 3' - I-element 24 1 75.00 CAGTGATATGATTGTTGATTAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATGCGCCACCTGAAAGCAAAGA:1 - chr3R 15799363 3' - P-element 2769 1 23.76 AAAAAACAGTTTTTATCTTTATTGCAGCACAGATAGATTTAGCATTTAAGGCATTTGGAATCACATTTGTTTGAGCACATTAAAATACCAAGTTCAAAAGG:1 - chr2L 6715551 3' - looper1 1618 1 57.43 GCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGATGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTATTGTTTTAGCATTATCGTCGATCATTTTGTTTGC:1 - chr3R 14466590 3' + I-element 412 1 56.44 CTCAGAAACGCGGCGCAAACCCCAGAGTGGATTTGCAGGTTTATGTTGCAGTTTACGGCTGACCGGAGCTCCGAGCCCTGGAGGATCGTGCCAGGGGTATA:1 - chr3R 30705481 3' - 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mdg1 24 2 55.45 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTGCCGAACAGTATATCGTGAATTAAAAATGTCTGGTCTAAATCTTAAGAC:1 - chr3L 25608315 3' - Doc 28 1 53.47 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGGATCTAAAATAGCATTTTATCGT:3 - chr3L 18034192 3' - Doc 58 1 74.26 AACTCATGCCCATCCCTTCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCATTTGCCTTACCCTCAATCTTGTTACGAATAGCT:1 + chr2L 23389674 3' + I-element 5052 1 66.34 CAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGATCGCAATCAAAAATGCTCAGAAAAATTGAAAAGAATTACATTTTCCATTTTCAATTGATAAACTAATAAA:1 + chr2L 4646512 3' + Porto1 4301 1 56.44 ATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATTTTCAAATTAAGTAAATAAGTTTGCGTAAAAAGTTCTATGGATACAGAAACAGACCG:1 - chr3L 9239048 3' - hobo 2537 1 62.38 TTTTGTTGTTTTTGTTTTGTTTTTAAATTAATTAATATACAGTTTCAACCTTAAGTTTACTCTGCGTTCAAAAGTGAAGGCATACATTTAGGTATGGAAGG:1 + chr3R 20746678 3' - gypsy9 454 1 61.39 CGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTCGTCAGACATTATTAAAACTCTTATTTCCCCTCTTATCT:1 - chr3R 11247435 3' - HMS-Beagle 6829 2 61.39 ATCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGT:2 - chr2L 23286583 3' - Tirant 415 1 58.42 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCTATTTCGCCACTCTTTGGTGGCGAAAATGTCAGAGGTTTCTACGGAGCTCG:2 - chr2L 7463504 3' + blood 352 2 53.47 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAGTAATATTAAATACAAATCATCAGTTTCCCATCACTAAAATAGTTTTTACACAATACGTATTGCTA:1 - chr3R 31775019 3' + roo 403 1 67.33 GTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGGCTGGTTGTGTTTTG:1 - chr3R 22182906 3' + P-element 100 1 27.72 GCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTGGTGTACTTGGATCTGTGCCAGTGCTACGCGAATCGGCGGCGGCGGCTGGC:1 + chr2L 10242919 3' - 297 6529 1 56.44 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTAGCCCTACGTTACGTAGCGCCCGCTACGTTAGTGCGAGGAAATGAGA:1 + chr3R 28330919 3' + P-element 2858 1 50.00 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAATCGAAGTGCCATAAATATTGGACTAAGTCGTAACCGATCACAGAACGGTACCATAGCAAAACTGTCAGACGAAAAC:1 - chr2R 11372154 3' + roo 409 1 77.23 AAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACTTATTTACTGAATAAAATTAATAGGAGTGATTGCACTGCTGTTTGTCGCAAAGACAGGCCACGAAGGC:1 + chr3R 31915111 3' + Tc1 199 1 65.35 TAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATATTAATTTATGTGAATTTCCCTAGCACGAACCAATTCGCCC:1 - 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chr3R 28196674 3' - hopper 13 1 64.36 GAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGGTCATGTCAAGGTTTTATCCAGCTTTAAACTAAAAGACTTCC:1 - chr4 680517 3' + 1360 136 1 64.36 GTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAACTAAAATGCTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTCCGGAGTCAAAGACCAAGCGCAAGTTTGTTGACCCATTTT:2 + chr2R 5296381 3' + INE-1 137 1 79.21 GGAATACAGGCACACATTGGCCAAAAAGATACCACAAATGTTCGAGGAAAAAAGAAATGGGGAGCACAACTAGGGTTCACCTGGCATGCCAGGATGACGCA:1 + chr2L 10098291 3' - Bica 4853 1 75.25 AGAGGCAGATTGCGAACGGAGAGGGAGTCGGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGGAAGTATCAAATAAACCAAAAAGTCCAACCTCAATTACGAGCTCATC:1 - chr2L 10106913 3' + invader2 4991 2 74.26 AAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTTATCAGCATGAGTGTGTAAAGGGATTTTTCGTTTCGCAAAT:1 + chr3R 10427296 3' + hobo 487 1 59.41 AGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAACACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAACACACAGCCCCACACCGAAATT:1 - chr3L 6452939 3' + I-element 115 1 75.25 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTAAATTAAGAGTGTCCAAAAAAGCTA:1 - chr3L 10792182 3' + pogo 2057 1 71.29 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTCTTTGTTGCACTTGGATCAGTTCAACGCAC:1 + chr2L 16818842 3' + pogo 2058 1 71.29 GTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGACCCGTCTCGAGATCGCTTCCCGCCTGGCCCCCATCTTCTCTGTTCACTTAGCAAATGTTTAAAAATCATTCTC:1 - chr2L 7970947 3' + blood 7388 2 76.24 TTTAAATTTTAAAATTTTTAGATATAAGTATAAGATGTTAGTTCAAATGAATCCAAATCTTGCGTTATGTTAATTAACATTTCAAATGAGTAAAAAATTTT:1 - chr2L 17092392 3' - 1360 3035 1 70.30 TTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTTAAGATACCCTGGGAGTGACTACTGTGCGTCGATTTATTGACACCGAAACC:1 - chr3L 6128276 3' - jockey 4608 1 49.50 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATTTGAACCAGAAAAGAGATACATCTTCATCTTTAATGCGAAGG:1 - chrX 21668237 3' + 412 462 2 55.45 CTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCATAGTTTCTGGCTCTATTAGGTATTGTTTCACCTGTACAATAT:1 + chr2L 16333929 3' - P-element 435 1 47.52 CGACCCTACTTCCCTCCGACATCTGAAGAGCTGGAATCTCGCCACCAGCGAGATTTCCTATGGGGAAAACAAAAGGCGGTGTGCAGGAGGTGCCAAGAGGA:1 + chr2R 4997831 3' + G5A 2661 1 76.24 AACTCGGTTCCTCACATACCAGGGTACCCCAAATGCATGTCGTGCCGCTCGTGATTGTTGTTACTCTCTCCACCTTTTTCTTCACATAGTTTGCGCTTTTT:1 - chr2R 2950848 3' - G5A 2529 1 60.40 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGTCGTTGGTTCGAAACTCTTGTTTAAATAAATAGGCGAT:2 - chrX 22690724 3' + roo 397 1 65.35 AATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTGCTTTCGGTTGTTATTATACTTGCGTTTACTCCCGGCAA:1 - chr3R 13521306 3' + 1731 4436 1 61.39 GACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATATGTTCATGGATTCTTACCCTTGAAGATGTGC:1 + chr2R 17977422 3' + invader4 3048 2 66.34 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGG:1 - chr3R 10978711 3' + roo 9026 1 71.29 GTGCGTGTTGTGCTAGAAGGCGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTATTGCCAACTGTGAGTTTTCATCA:1 + chr2L 21709478 3' - 1360 3205 1 81.19 TTTTTTTTCGCTAAATTTTGAAAATTGCCGCTCTTCTCTTAAAGATTAATCTTGATGATTTGAACAGCTGTTTTACATTATCAGAATGAAAATATTGCGAT:1 + chr2L 12134311 3' + Tc1 272 1 63.37 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATATCGAGTTGAAATTGATTTTTTGCCGTGTGA:1 + chr3L 10041508 3' - 412 45 2 70.30 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAGAGAAAAACAGGCACGAGTCCCTCATTCTCCGCGTTGCCTTCTTCTATAGTATATGTATATAATACTTCTTTTTTTCG:1 + chr3R 28373854 3' - jockey 4758 1 76.24 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACAGTGTAGCACAGACAGTCAAAAACGCAGCATTGGGTTGTCTGTTTCAACAGCAGCAGAAAGGCAGAAAA:2 + chr3L 10554861 3' - roo 6 2 64.36 AATGTTGCATAGGCACATACTACAATATCTGTGACCATGCCTGTATTCTGCATGTCACAATTACTGTGATTATTCTTTAGTAGATTTTGGATACATAATTC:1 + chrX 21668336 3' - 412 3 2 74.26 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTGCTAAACTTGTTAAATGCAAGATATTTTTAACAGACCTGATAGGCATCGACAACCAAGCAGAA:1 - chr2L 23374496 3' + flea 246 2 71.29 TTTACTTCCCCCAAGATGATTTACAAAATTTCAAGTGATTTGGTCAACTTTCATATATCTGCCCACTACCAATTTTTAGTTTACGACTCTTCACATTTTAA:1 + chr3R 15575947 3' - transib1 2065 1 60.40 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCGGACACTTTGAGCTCGATGAATGTTCGATTTTAATTGCATTCGGGCTGACTGC:1 + chrX 7031720 3' - jockey 4684 1 62.07 TCCTGCCTTTGTGTGTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTATTCGTTTCCTTTGCTCTGGTGTTAAAAGTTTCA:1 + chr3R 28106155 3' + invader2 5074 2 57.43 GGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAATCAGTTTAATATACAAGTTTCAGACGTAGCAGATTTATTTTAACAGACACTCTGAGTGCATA:1 - chr3R 13613616 3' + Bica 241 2 65.35 GCAAACGATTCCACCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACTTATAACGTGTAATTAAATTTATATATAAATTTC:1 + chr3L 20490718 3' - FB 42 1 73.27 TTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTACAACAGCTTCGTTTCGATGTTTCAGTCGAGTTGTTTAATT:1 - chr2L 16421899 3' + Cr1a 3973 1 59.41 GGAGCGCCAGAACGAACGGGGCTCCAAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACATTTT:1 - chr3R 12046727 3' + Juan 208 1 65.35 TACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCG:1 - chr2L 14074960 3' - jockey 258 1 63.92 GTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGCTTTGCTTTTTAAAGACCTTCAGGGTGGGAGGAAAATGGCAAAGGGATTCACGCTCGTCACACATGGAAAATCG:1 - chr3L 8883479 3' + mdg1 7457 2 72.28 TTTAATATAGTTATTTTTCATACATTATTGTTCAATGAGTAAACTATAAACAATAATGTATGTAAAATAACAACACACGGCAGCCACCTTGGAGCTGATTT:1 - chr2L 1934222 3' + Cr1a 4313 1 53.47 CGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCTGTATCGACACTGGCTTTTGCCGGGACCAAAATCCTTACTCCGCTGCCTGTAAGTA:1 + chr2R 19655073 3' - jockey 4737 1 57.43 AATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATATCAGAGTGGTTTAATAAAAGAGGAATGGTTTTTTCTGAAAGCTCTCTCCTTGCATTTACCTT:1 + chr2R 6735355 3' + Burdock 6381 2 69.31 ATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAACCATAGGGAAACAGGCGTCTGGTCGCAGTACCAGTGGAGAGGAAGCAACCAACCTCCGTTTC:1 - chr3L 27413420 3' + hopper 1004 2 70.30 TGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGGTGGGGTATATCAGCGCAGCGGTATGATAGCATAATAACTATAGGGGTCCTAATAGATCAA:1 - chr3R 25174439 3' - hopper 948 1 66.34 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAGGCTCGTTAA:1 - chr2R 19209455 3' - Doc 53 1 61.39 AAGTTTAAGTGCAAAATTCAAGCCCAAGTGCAACCATCATATAAAAGCGAAAAGACGCTAAGATAAACAAAAAACAAGCGGAAACAATAAACAAACAAAAA:1 - chr2R 20570186 3' + Porto1 56 1 58.42 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAAATGAAATCTTCTCATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTAAATCGAATTGCCAACCCTTTTGTA:1 + chr2R 16406829 3' + roo 9014 2 76.24 CAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCTTTTATTTATGGCTACTAAATTACGTATCAGTGCTGTGGTCCCGATGCCGGCCAGGCTTTGATTAATGATCT:1 - chr3R 14504254 3' + jockey 444 1 74.26 ATCATATAATCTTTGTAAAAAACAACTTAGATAAGAAGAATAGTGAGAAGTATCCCTTATTTCCTTGACGCACACCAAAATGTCTCGTATTTTAATTGTCA:1 + chr3R 20134824 3' + jockey2 3286 1 66.34 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCCATCGTGCAATATCCTTTTT:1 + chrX 12883620 3' + hopper 1364 1 81.19 CGAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTGATATGGACTTTAGTCTTAAGGATGTCCAAGGCAGTC:1 - 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chr2L 2795198 3' - TLD2_LTR 7 1 77.23 TTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAGTTGCGGTGCAATTGTGGTC:1 + chr3R 545260 3' + Transpac 280 2 60.40 TAACTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATGGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAGCGGACTAGCATATAGATGGATTAACAGGCA:1 + chr2L 8547063 3' + G5 4741 1 72.28 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCAATGATTTTTAACTTGTTTTGA:2 + chr2R 15451607 3' - roo 53 2 79.21 CCAACATGTTTACAAAAATTAAAACAAATTTAACATTTTCATCAACTGTCGCTGCTTTTTGTCTGTCGCTTTTTCTCCCCCACTTAACATTTTATTAAGCG:1 + chr2R 18375184 3' - 1731 4278 1 63.37 ACTGGCAAAGCGATTATCCCACAAATTGAGTGCCCGGGGGACATGGTTAATAAATTTATTCTTCATTTTTGTTTTTCTTTCCATCTGCGACGATCGTTTTA:1 + chr4 407131 3' - Ivk 215 1 59.41 GAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGTAACCTCATGGTGCACCATCGTAGTAATTTAATTCTTTGATTTCGTTTAGTA:1 + chr3L 26533430 3' + invader4 372 1 59.41 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATTTAGTTGTGCATCGTTTCTGTCGCTGCCAGATGTCGCCCATTTCGATTTTGGTAAATTGGTAAA:1 - chr3R 23734536 3' - pogo 3 1 74.75 GAAAAAGTAGAAAAAAAAAAAGGCAAAGAGCGGAATCCAGAAGAA:1 - chr3L 2880731 3' + Doc2-element 222 1 77.78 ACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACA:1 - chr3R 19589940 3' - BS 5038 1 65.35 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGTCGATGATGAAATCGGATGCC:1 + chr2R 18036663 3' + blood 7335 1 78.22 CACTACATTCAGACAAACTGCAAGTGCGACAAAACGAAGAACTGGAGTCTAACAACTTTCGAGCCCAATTTACAAATAGGTTTTATGCTGTTAAGCTCTAG:1 - chr3R 2651432 3' + mariner2 286 1 60.40 TCACTGCATTTAATATGACCCTAAATTAGAATCCCAAAGCTAAGCACAAAAATCCTGGTTTATTTTAAGTTCTATTAAAATTAACTATTTCCCCCCATTTC:1 - chr3L 17193683 3' - Gypsy12A_LTR 87 1 57.43 TCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCTCAGTCCGATCGTTTGATTGGGCCTCACTAGCCGACGC:1 + chr3L 18620497 3' + F-element 4412 1 62.38 ATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTATATGGGTCTAAATATGTTAGTAAAGAATTGTAGGACTTAAACAAAAATAGTCTAGGGAAATGTGCGT:1 + chr3R 6996559 3' - I-element 214 1 69.31 GGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAA:1 + chr3L 25232904 3' - GATE 8266 2 50.54 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGACTAGAAT:1 - chr2L 13598181 3' - pogo 25 1 54.46 ACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACATCAACTTCGTCACGCTGGCCAACAACAAATTACGCACAGAAATAGCT:1 + chrX 17530568 3' + Doc 495 1 65.35 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAGTAATATTAAATACAAATCATCAGT:1 - chr3R 31775060 3' + roo 361 2 72.28 CACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAGTTGCGGTGCAATTGTGGTCGACTG:1 + chr3R 545265 3' + Transpac 285 2 58.42 ACCATAAATTCCAGGATGGAATATGAAATACCTAACTGAAACTAAAAGTGGATGGTTTGTTAAGACACTCTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAAGGA:1 - chr3R 3947577 3' - Circe 362 1 59.41 GAAAAGAAAAGAAAATGTAACACATACACCTAGAATTGGCCATTTTTGATATTTTGCCAATCCTTGCCCCTCTCTCGACTTTTTTTAATTACTCATAAACG:1 - chr2L 11362561 3' + invader2 4754 1 70.30 TTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTAGATAGTCACTGTGTGGCTGAAGGGGTTGATTGA:1 + chr2L 15507014 3' - F-element 4437 1 66.34 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTTTAAAATAGGTTTTAGTTATCATTCGGCTGTGAAATGGTAAAATGACTGCGATGACAAGGTAACGCAAA:1 - chrX 10449770 3' - mdg1 6 2 67.33 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGGGCAACGCACAATTGAGTTCAATTGAA:1 + chr2R 17269770 3' - transib2 47 1 71.29 CGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAATGTTCCGTAACTTGGTGCTATTCTCTTG:1 - chr3L 17215690 3' - Ivk 2 1 77.23 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACG:1 + chrX 16217512 3' - P-element 39 1 40.00 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACACCTGCAATTGCATTTCGCTGCCAACTTCTGCTAATTGCTCGCCCGCTAATGACTCTATGC:1 + chr3R 29711056 3' + mdg1 402 2 57.43 ATATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTCGGAGGTTTAAGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCATCGGACTTGGACACAGGTCGGGGGCGGCGGGGGGCG:1 + chrX 11689492 3' - INE-1 255 1 64.36 TATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAACTATCGTTGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACAAAATCATTGACTTACTTCTTGGGGATGCAA:1 - chrX 12954185 3' - pogo 2097 1 38.61 GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATACATTTAGTTGC:1 + chr3L 5267280 3' + Juan 4189 1 51.49 CTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCGAAGTGAACTGTGACAAACAAATGCAGAAGGAGAACAATGTCACGGCGGAGAATTGCCAATTTGTGGGGCCCTATC:1 - chr3L 15911187 3' + gypsy4 434 2 56.44 CAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTACATAAACTTGTTTAAATAAATCGAATAAACCGTGTAAGAAATGCGTTTAAGCATACAA:1 - chr3L 1560035 3' - Stalker2 55 2 68.32 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACCGAAACGCCAACGGCTTGGAG:1 - chr2L 9437448 3' - P-element 23 1 41.10 CGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGCTTTAAACACACTTATTTTCTC:1 + chr3R 15631162 3' - opus 7166 4 80.20 CATTTCTTTGATCAGAATTGATATCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAAACGTATCCCGGCGCGTTCAACTTTTGCAATTGACAGATTTATGCAATGCC:1 - chr3R 26596437 3' + 1360 3169 1 59.41 TGGTACCGAAAAGAGGCTCGGGGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCAACGGACATTGGGAACCTTC:1 - chr2L 4097941 3' - R1A1-element 4924 1 64.52 AAAGTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAGGTAAAAAAAACAGTAGTCAAGATATGCTAATGGTTTA:1 + chr3L 6128307 3' + jockey 4954 1 76.24 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTATCATAATGATAATAAACACTTTCGCACGAATTGGTCGCGTGAAGAAAGCGTAGCATACATTTT:1 + chrX 12135728 3' - jockey 21 1 62.38 GACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTAGTTATGAGGTTCTGTTTCTGTGCCCACATTCGTGAGCTCCTCAGATGGCTG:1 + chr2R 16152691 3' - 17.6 422 2 56.44 CTGTTTTATTTTCTTTTTCCTTTTTTTCTGATGCGCCGTTGCCGCTTTTCTGGGGCCGCTTATAGCTTATGGTATATAGGGTATATAACCTGCTTGAAAAG:1 + chrX 12206469 3' - Doc2-element 241 1 50.50 TTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAAGTGCTGTCTAGTGTTAATTAA:1 + chrX 13641396 3' + jockey 4957 1 77.17 CGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAG:1 - chr3L 19951216 3' - Ivk 48 1 72.28 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATTTGAACCAGAAAAGAGATACATCTTCATCTTTAATGCGAAGGAAATTAAAGTAAAAACACCAGAAGGCA:1 - chrX 21668210 3' + 412 7542 2 74.26 TCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACTTTAAATTAATACCCAAATATATTATATATT:1 + chr2R 12370622 3' + roo 365 1 74.26 GCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAAACAAACAATTTCAATCATTTACCTTTTAACGAATGCAGCATTCCGC:1 - chr2L 114968 3' + roo 8643 1 60.40 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACATGCGTACATATGTAAGTAAAAATGTCTCA:3 + chr2R 5651923 3' - Tirant 8117 2 71.29 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCCGACAAAACGAAGATCG:1 + chrX 10585441 3' + P-element 2828 1 21.78 GATATATGCACATACTACACTAAGCCAAGTCGGCTTGCTTGGGCTTGGGAAATATTCTGCCATATGTCCGATCACAACCGGTTCCGCTTCCAGACGTAATC:1 + chr3L 18142048 3' - blood 7009 1 78.22 GCAGACAACTGTATGTGTGCAAACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCATTTTATTTGTTTTTAAGTGCATACAAAAAGA:1 - chr2R 6271576 3' + 1360 166 1 67.33 CTAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGCAGGAAACTAAGCCAACAAGAAG:1 - chr2R 21900380 3' + Stalker4 149 4 77.23 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTTTTAATAACTTTATTTCCAGCGACCACAAACGAAA:1 + chrX 13065007 3' - 412 7128 2 69.31 CTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCAATACTTTCGTTCTTCGGGATTGCGAGTCCGAGTAACCCGGAACTTATTCCTTTTTTGGCCTGCTCCTCG:1 - chrX 21252866 3' - Idefix 305 2 63.37 AATAATAAACAATCTTACATATATATCCTACAAATCTCCCTCGAATGGGTTAATAATGTAGTGTAACCTTTCTTGTGAATATTTAAATTGGAATTTGCGAC:1 + chr2R 16902959 3' + flea 257 1 75.25 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTCAATGGGCCGCAACGACAGCTTTACGGC:1 - chr3R 23080844 3' - 412 46 2 68.32 TGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCACCGCAGATTTCTCTCACCATCATACATAGCATCACACCCGCACTTGCACACACACACACACACACACACACG:1 - chr3R 9418241 3' - accord 186 2 68.69 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGTTTAAGTTCGCTTCTTTTAGTATTTAGATTAAAT:1 + chrX 4056326 3' + roo 9031 1 67.33 AGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAA:1 - chrX 10119556 3' + FB 11 1 54.00 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTCACTTTGTATGCGAGCCAAAATTAGTGGAGACAACCGCCGACCAAAAGGAAGCGACG:1 + chrX 13881363 3' - jockey 26 1 57.43 CTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGAATATTCTCCAGTCTGTGATGTTA:1 - chrX 6917105 3' - 3S18 54 2 75.25 GTTAGTTGATGAAATAGCGGAGCACTTGTGGTTTCTTTCGTTCGCAATTAGCTCCCTCCGGTTCTGGATGGTCAACCGCACTAAGCACCTAAGCAGCACCC:1 - chr3R 8436027 3' + mariner2 47 1 50.50 AGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGACAGCAAACGAGCAAATTTCTGTGACGACCACGACCACGCCCACGGAA:1 + chr2L 9058549 3' + 1360 110 1 59.41 GTTTTTTTTGGCAAATCGATAGAAGTTTACAAGACATAAAATTAAGAATAAAATATCGACAAATGCAACGGCGACTGGGAAAAAAAGCGACAACAATGACG:1 + chr3L 15754113 3' - INE-1 314 1 62.38 CAACCATTATTATTAGTTTTTATCGTTTGTGTAATTGTTGCAACAATTGTGCTTTCCGAATGGGATATGTACATGTATATGTATATGCCAAAAGGGGGAG:1 + chrX 14965730 3' + FB 361 1 74.00 TACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAATCAATATAGAATAGAACTCTGGGGAACTTCCAGTAAATCCCATAAATCGATGTCCAGCCACG:1 - chr3L 7271093 3' + Porto1 4225 1 80.00 TAAAAACCTTATATATCTCTGTGAAGAAGATAAACAAAAAAACAAGTAAAAACAGAAAAACAAACTGAGGGCAACGGAACAAAAAACAACATGCACTGTGA:1 + chr2L 16031552 3' + Porto1 134 1 61.39 GAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 8269 2 51.49 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGGAGTGGTACTGTCATAATATTTATAATGATCTTAATGATGACACAAACAAAACCAGGGACAGCCACACCAATGGACAGC:1 + chr2L 17185809 3' - I-element 12 1 51.49 GCTTTAAGAGCGCTAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGGTAGTTCTCTAGCTAAATTGCCCTATTTGCCAATCGCATAGCCGAATGCCTCCATTCTCTT:1 + chr3L 25729760 3' - Cr1a 4241 1 63.37 GTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCGGGAAAATCAAAGTATTAACAACTCGTTGCCTCTCCTTCTGGCTGAGACTCAGGATTCAG:1 + chr3L 17310483 3' + Doc 80 1 62.38 CATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTGCACTTTTTAATTGGCAAGGGTCCACTTAAAGCAG:1 - 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chr2L 5761692 3' - I-element 4976 1 70.30 TATTTATTAGAGTTATTTTACATAAACAAAAGTACACTTTTTTGGATGCAGTTTTAAGTTATGTTGTTTTAGTTAAAATTAAAAAATCGGCTAATTACCGT:1 - chr2R 1442704 3' + Cr1a 4311 1 69.31 TTGGGCGGGAGGTGTGGCCGCGGTACCCGTGCGGAAAAAGAAAAATAATAATAATAGTATTCGAATTATAAATTGTATTTTATATGTTAATAATTCTAAAT:1 - chr2R 15690191 3' + Cr1a 4430 1 50.50 AACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTATTGGCTACATCCTGCT:1 - chr3R 4973097 3' + 1360 16 1 43.56 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATATTACTTTCTTCAATAGTAAGTAACCTTAAAGTATTTGGAGCATATGT:1 + chrX 7741774 3' + roo 9045 1 56.44 CAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACA:1 + chrX 20999559 3' - BS 44 1 75.25 TACGATTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATTATTTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGCCTAACAATTTTCCCGGCTCGTTTTTACTTGTCTTT:1 + chr3R 26282564 3' - Doc3-element 4662 1 72.28 CTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTAACAGATATAAGAATAACGGTCGCGAACAGCGAACAGTGACAGCCAGA:1 - chr2R 6611108 3' + Copia1_DM 147 1 60.40 CGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTACTTAAGGGGCCATAAAACCGGAGTAGAAAGAGTATGATAAATGGGAGTATATTCTATGAGCGGATTAAATGAG:1 + chr3L 18186430 3' + Gypsy12A_LTR 1888 3 68.32 CGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTGGGATAATTTA:1 + chr3L 21912358 3' + Bari1 1699 1 71.29 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAAGCAAAAAGTCCTTGGTTGGA:1 + chr3R 12058664 3' + roo 9016 2 78.22 AAATACCTAATGATATTATAAAAAATAGCGCATCAAAACTTTAAATCATAGGAATTTTTTATCTTAAACTCGCACGAACTGAGCAAAGAACGAATCAACAA:1 + chr2R 12588250 3' + HB 1537 1 73.27 GGCGATGGCAAAAGTATTTAGACATCACATTTAATTAGTTCGCATGGAAGGGGAAACTGCCGGGAAAAGCTCACAGCTGCTGCAAATGATATTCAATTTGT:1 + chr2R 19193481 3' + Tc1-2 200 1 57.43 TATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAA:1 - chr2L 15019884 3' + BS 5066 1 50.50 ATTTATACAGTGCATTAAACTTCAGGGGGATCCTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGTATACGTAACCATACAAGCATACGGGG:1 + chr3R 21955217 3' + baggins 5349 1 74.26 ATCCATTTTCAAAAAGAAATTTGATGATAAAACCTTCCAATTTCTCGCTGTGCTGCAGCCCATTCAGAAACCATTCAGCGGCAATTAATGTTAAATTTAAA:1 + chr3L 14319397 3' - G5 395 1 88.12 AAGCGGGAGAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGAAAGTTGTTGTTGCTCTCATCCGGCAGTCTCTGGGCAATGGCATGATAATGGTGGCCGGAGATC:1 + chr3R 8953542 3' - Porto1 468 1 61.39 TAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGCGTCACACAAGCGTCAGTTCCGCATGAAATGTGTACTATGTGCAAATATGTGAGCGGGAAAAGGGAAATGG:1 - chr3R 27435007 3' - jockey 4646 1 73.00 AAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGTGCAGAAACATTTGGCTGCAAAAAAGAAGCTTGTTCCGGACGTGAAATTCCAATTTTTTTAAATTAACTTTTCATAT:1 - chr3L 21966986 3' - Doc 2 1 78.22 CCCGTGTGTCATTAAGGTCTTAAATCTGGGCAAGATTATCTCTGTTTTTCTCTAAACACTAGCTGTTTCAGTTGGAATTTGTTCGCCGTGTGTAAGTCACA:1 + chr3L 4384876 3' - baggins 5088 1 73.27 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATTTGATGGCTCTATCAGCCATTTGATTCGGTTAGATGTAGCCGA:2 + chr3R 24023380 3' + roo 9039 1 58.42 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGACAAAGAGAGCGGCAGTCCCGTTACGCGCTGTTAA:1 - chrX 10629208 3' - P-element 27 1 47.19 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTAATAAACGTCTACTCGGTAGTTCAAGCATTTCATCAAGTTTGAGATTATTGAAACTTTCAGCTGCCATAC:1 - chr3L 20286582 3' - mdg1 6 2 73.27 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGCACAGAAATATCGCCTCGACTATATAATTTAGGGCAGCCCGAAAATATT:1 + chr2R 10345681 3' + roo 9046 1 55.45 AGTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGC:1 + chr3L 3635468 3' - roo 8712 2 73.27 ATGATTAGACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGGCTGAGGGTGCGAGGGAGAGGGGCTGAGGGACTGAGGCGG:1 + chr2R 21706109 3' - F-element 4554 1 65.35 ACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAATTTTTTAAAAAGAACTACAGACAGTTACTTCGTAACCATTACAATTAT:1 - chr2L 16382833 3' + hopper2 1193 2 65.35 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGA:1 - chr2R 19209465 3' - Doc 63 1 51.49 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACAGTCCAATGACAGCGCCTATGTCCAGCGACTGATG:1 - chr3R 28879926 3' + roo 9028 1 66.34 TTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGAAAGCTTCGTGCCCTCTCTGACGCAG:1 + chr2L 8437744 3' + opus 7175 4 72.04 CAGTCAAGGCCTGCGGTATTTTAGCATTTTTGGATATATTTTACCCGGGTCCCCGGCGAGGGCTTTGATCTCACCATTTCGGCAATGCGGAAATTGGTTTG:1 - chrX 13501184 3' - baggins 422 1 63.37 ATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCAGAAAACTGGACTGTCCGGTAGGAAGATGCGTTGCAGTCGTGCCTGACCTTTGGCAATTCGAA:1 - chr3R 6106268 3' + X-element 4420 1 73.27 AACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCAAACCGAACTCACTTGGTAATGTTCC:1 + chr3R 24603407 3' - Cr1a 131 1 47.52 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAAGCCAAGTCGGCTTGCTTGGGCTTGGGAAATATTCTGCCATATGTCCGATCACAAACGGTT:1 + chr3L 18142030 3' - blood 7027 2 60.40 AAGCAAATTAATATTTTCGGAATGAGACAGTTCTAGAAGAGTGGAAAAAGCTGGAGAATTTGTTGCCTTCGAAACACCCCTTCCACGACCCTGGATGCCCT:1 + chr3L 14138307 3' - Gypsy12A_LTR 2051 1 77.23 AATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGTGTGTTGTGCAAACAGCTGTCGCGTGTCACCGGCTGCCGTTC:1 - chrX 13434088 3' - 1360 3260 1 68.00 ACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGCCGGCGGCTAGAATACATTTTCGCCCGTTACCATATTTTTCCCTCT:1 + chr3R 20165981 3' - hobo 2547 1 54.46 ACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCATGCTCCTACCGAACGGTTTGCACG:1 - chrX 7352221 3' - Doc 488 1 75.25 TGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAAGTTAAGATCTTAAGGTATTTTAATTGAAAGTATTGCTTTCAAGTTAACTTT:1 - chr3R 23274002 3' - invader3 27 2 52.48 CAGCTGAGTAAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATATGCTTTTAAGTTTGCGCTGGCAATGTTGCACTATTTCGTTCATGCCTGGCCACACTGAACCCAGAC:1 + chrX 6884946 3' + invader4 2879 2 70.30 TATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCTGGGGTGCTGGCTGGGGTGTTTGGGTGACCCTCATGGG:1 + chr3R 9085123 3' + hopper 357 1 69.31 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCAATGATTTTTAACTTGTTTTGAC:1 + chr2R 15451608 3' - roo 8716 2 78.22 AATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTGG:1 + chr3L 21912349 3' + Bari1 1690 1 62.38 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTGGCCTCCAGCCCTTTTTTTTCC:1 + chr3L 5387841 3' + mdg1 7406 2 77.23 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTT:1 + chrX 16217526 3' - P-element 26 1 53.47 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGTCATGAGATCGGGATCCTG:1 - chr3L 14152108 3' + blood 331 2 69.31 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTCAGCTTTTACGTACATACATATGTAAGTGATTACATAAGAT:1 + chr2L 15907223 3' - pogo 29 1 58.42 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCCTGAAAGCAGCACTTACCGTGTGACCACTCCCTCGTCCATTTTCTCCCGGAGAGCAGCT:1 + chr3L 11625637 3' - roo 8681 2 62.38 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATGCATAGAAGAACCAAAAGGTGAAAGGTTTTGT:1 - chrX 8447143 3' + opus 457 2 70.30 GTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAAAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTTTTAAATTCAGTTGAGAACACAAAATGAAATTAACGACGACAACAAATAA:1 + chrX 17232255 3' + INE-1 558 1 92.08 TTTGTATGCGGGCTGCAGTTGACTGCAAAATGACTCATTTTTCGTCGCGTCCAGCTCCCGTTGGATTAGAATTACTCTTCATTCTTGTGGGTTGCCTTCCT:1 - chr2L 22760284 3' - hobo 2715 1 64.36 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGCATGACTGCATACGTGTCTTACCATGCGAACATTGCCCAGTACTGTTCAGGTTCCAAAGCTTCGTCACAGCTG:1 - chr2R 5200903 3' + 1360 3387 2 74.26 CCACTAACCCAGTACATCTAAGATTTTCTCACCAGCTGGATTTACTAGTAGATCGGACTGAAATGCCTATGTTAAATCGCATGTTAATACGCTTTTTACGA:1 + chrX 9971969 3' + Tom1 240 1 71.29 TTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTGTGTTTCCGTGCCTTAGTTTAGTGT:1 - chr2L 17280488 3' - Doc 4654 1 75.25 TTAGCCACCAAAACTAAAACTTGAAACAATCACACGCGCAGAAAGGGAAGTAGAAGAACTACAACGAAATAAGACCATAAATGCATTTTAACAAAAGGCAA:1 + chr3L 18221428 3' + Porto1 4469 1 75.25 TAATAAATAATAATAATAAAAAGGAAACATGTCTTGAACCCACCCAGACCATTGTTTTGAAGTAGCTTTGGTTCATAGATGGTGATCGCAATCCTTTAGAC:1 - chr2L 21747679 3' + flea 246 2 77.23 TTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATACATGCATGCACATTTCAGCACAGCAGCGGTTAAAATAATAGCAATTCAACTTCATTCTA:1 + chrX 13749541 3' + S-element 1705 1 70.30 GACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACACACACAAAAGCACATCACGAATACAGGTGCACCGGTTTTCCTCGCTCACACACACAATTAACCAATTAGCA:1 - chrX 8361930 3' - opus 235 2 76.24 CATAATTACACACACACACACACACATACGCTCAAGGGCGTGGGCCAGCCCACTTGCAATCTAAAGGACAATTGCAATTTGGGCG:1 + chrX 15126126 3' + Quasimodo 32 2 62.35 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATTTCATACGGAAATGTGCTGTGCAACAAAGAATGCA:1 + chr3R 19449854 3' - pogo 37 1 69.31 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTCCTCGGACATGGCCAGCAATTTTCACTCGATGCATTGACAG:1 - chr3L 14284975 3' + roo 398 1 64.36 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCTCGATTATCTTACTTGGCCCA:1 - chrX 15259049 3' + roo 353 2 86.14 TGGAGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAAC:1 - chrX 10119552 3' + FB 14 1 57.43 GGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATTCTAGCCATAGAAAGTTTTAATACCCGAAATGAA:1 - chr3R 11595297 3' + Max-element 257 2 65.35 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGGGCGTATAAATATAAAGCAAAATACCAGTTAATATATGTTAGAA:1 - chrX 15258538 3' - roo 8671 2 56.44 ATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTTTGGGCCTGTCTGCTGTCCCCCATGCTGGTGTGGGTGA:1 - chr3R 11770894 3' - I-element 242 1 62.38 TTGAGATTAGTCTACTACACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACACTAATGTTTTGGGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' - diver2 25 2 55.45 GAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCAGAAATGACCCCGTTATTTCTAATGACAACTAATTATTTATTATATTGATAGATTAAATTCCAAATAGAAAACAT:1 - chr2R 13643840 3' + Doc 4468 1 74.26 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATGAATACAAAAACACCTAATGGGTTCAGCTCCAGCTGCGACGCACTTTAGAAGCCAT:1 + chr2L 7504952 3' + roo 9052 2 51.49 AGGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGTGCAAAGATGGACGAGATTGCTACGGAAAATAAGTTAAGACAGCAATGAAATG:1 - chr2R 24590609 3' + Stalker3T 203 1 50.50 CTCCACCCGAAGACTGTCGAATGCCGAATGTTGGATCTGAATTACTTTTATACTCGGCATCACTCTCTACCGCGTCGGCGTAACGTTTTCTGAC:1 + chr2L 22490476 3' - Doc 11 1 71.28 ATTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTAGGAATTAGAGAGGTGGGGG:1 - chrX 10489800 3' - Bari2 911 3 92.86 CTGATATGGACGGACGGACGGGCGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACACGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGTGGTACT:1 + chr3R 1977615 3' + micropia 5410 2 52.63 GCCTCGGGTGGTTTTTTTACTCGTAACAAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTGCCTGTACTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCC:1 - chr2L 15833029 3' + hobo 2799 1 69.31 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTTCTCCTCTCTGCT:1 + chrX 16217544 3' + P-element 2879 2 71.29 CTACCCTGGTAAGTGAGCAGCCGAGTTATCGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCAGAAACGCAAAAGATTCAGTTGCACTAGGAAGTACAGGTCACGTTCGG:1 - chrX 16646776 3' + G5A 2524 1 53.47 TTCGAAAGACTATGTGTACCAAATAATTGAGAATTTACCTTTCATGCAGCTGACGTCGTTGTTTTTCCTTTTGTAGTTCTGTGTGTTGCGCATGCGCCCGG:1 + chr3L 18800149 3' - Ivk 5193 1 76.24 CTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCAGGCCATCTTTTGAGTTACAATGATGTATAAAGTT:1 + chr3L 15452924 3' + accord 7340 2 65.35 ACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCCTGCCTTTCGATTGCCAACTATAAAAGTGCGCGCAGGCGCTGCAGT:1 - chr2L 13923554 3' - Tirant 8302 2 54.46 TTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTGCTTGGTTTGTAGTAGGCATGTGAGTGAGTGAGTGTTTTAACAAATTGAAATGCATTG:1 + chr3R 12777128 3' - I-element 5104 1 60.40 TAACAATAATAATTATAATAATAAATAGTAATTTACGCTTTAAGCAATTGATCTTAAATTTTTTTGTTAGGAATCCCATTTTTTACTGATCGAGATTCTTC:1 + chr2L 7588332 3' + mdg1 33 4 74.26 AACTCTTTCGAAAGAACATCACCATATATCAATAAATAATAAGGAAGAATTGCCTTAACAATAAGTAACACAATATATAACAAGAATGCAACCTATCCAAG:1 + chr3L 24209029 3' + I-element 283 1 73.27 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATTAAATGTC:1 + chr3L 3635481 3' - roo 8699 2 62.38 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACATATAATTTCCATAAGAATAAATTCGAGTAAGAAAAAACATATACGAGCTTAGT:1 - chr3L 13608303 3' - mdg1 22 2 57.43 CATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCGCATAATCGTTTCGGTCTTAAAGGCTA:1 - chr3R 15031230 3' - BS 5037 1 76.24 CTTGCTGGTTAACTCCAGGGAAGTAAGTGACAAATTTATCAAAGTGACCTCTTTACCTGGCTTATGCGATATCTCATGCGCCACAATCCTTCCCTCCCCTT:1 - chr2L 14930901 3' + Ivk 464 1 72.28 TTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACACCGACCTTTACAATGTTGAGAGCGTTTGCCTT:1 + chrX 12967907 3' - F-element 4426 1 70.30 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGGGTATTATTTTATTAAGACTACAATCGATATATAGTTACTTACGCAGGCT:1 + chr3R 16487401 3' + roo 9047 1 55.45 GGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATTGTTTTTGTCGACTTCCTAGAG:1 - chr2R 6041578 3' - opus 160 4 78.79 GCGCAGAATACGCGCCTAATTCATCTACACGTACACTCGAAACACTTTGGGTGATGAACAACACACTCCTCAACTTTCGCCGCAAATTCTTTTTCGCTGTC:1 + chr2R 13922054 3' + Porto1 404 1 69.31 GAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGATGATGAGCGTCTCGTCCAGATCCCAGACGAACACC:1 + chr2L 6528946 3' - Doc 434 1 65.35 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACAACGTTCGACATCTGCTCTATCGTCTAGGTTCGCAAATTTCGGATAAATCTCGTTA:2 - chr2R 18036604 3' - blood 20 2 56.44 TTATGCCGTATAATACAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTGAACTGTCTTGGAAATACCTGTAAAACAAATATATTTTGTATGCCGAT:1 + chr2L 18514440 3' - jockey 303 1 59.41 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACTCACCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGTGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTTTGCAATCCGCTTTTAAAAC:1 + chr3R 29288824 3' - BS 5043 1 71.29 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGGAGAAGTGGAAGCGCTTGAATATTTTTTGCATTTCAAA:1 - chr3L 13779294 3' + transib2 2788 1 59.41 TATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGCGCGGCCAATGGCAAGCGGGCAGTGCGATTCAATTCGATGCGAATTCGAC:1 - chr3R 20449606 3' - 1360 3258 1 61.36 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACAAAATCATTGACTTACTTCTTGGGGATGCAAATTTAAACATGGATTTTC:2 - chrX 12954167 3' - pogo 24 1 55.45 GCAAAAAAAAAACAACAAAATTAGCCGGGAAAAACAGGAACAGGA:1 - chr3L 7410757 3' + gypsy7 5016 1 66.67 ACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAA:1 - chr2L 14074971 3' - jockey 269 1 75.26 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAAGTAATTTTCTTTGATTATATGCACAATGCCGAGTAC:1 + chr2L 13314121 3' + jockey 4950 1 66.34 GATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTAATCTATACCCACCCTACCTCTGAAATCCTGGCCAGTTCCTCTCACAAATTTGGTTCTACAATACAATGTTTCCT:2 - chrX 7036242 3' - Circe 7222 2 56.44 ATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTACTTAAAAGTGAAATATG:1 + chr2R 2092808 3' - Doc3-element 67 1 58.42 TACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAATGAATATAAGCAATGGTCTCAAAACTCACGCAATGAACGGTATGACTATAATGAG:1 + chr3L 3120463 3' + invader2 263 1 60.40 CGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCGCTGT:1 - chr3L 15452869 3' - accord 35 2 58.42 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAGTTTGAAGTTTGAACTCTTGACTCGCCAATTTTGGTC:1 - chr2L 18979401 3' - Doc 43 1 63.37 GACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTCCAGCCACTTTTCAAAGACTCCAATGGCCG:1 + chr3R 24799250 3' + Doc 376 1 70.30 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGTGTGATTGATGTGGACGACAATGGCAC:1 + chr3L 21852545 3' + 1360 3341 1 78.22 CGTAACGGCCATGCATTGGTTTGGCACTATGCAGCTCACTTGTTTTCTTACCTTGCAAATTATAAGCAGAGCTCACCGAATCCCTGCATTTTGCATTAATC:1 + chrX 14502160 3' - 1360 3364 1 68.32 TCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATTGTATATTAGGGTAGTTTTTGCTTTTCCTTTTATTTTGTTATTGCGTTTAACTTGTG:1 - chr3L 5692021 3' - 1360 3179 1 67.35 CACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGAGGACTTGCGCTGGACACTCCATCTTGCTGCAGA:1 + chr3L 1123769 3' + micropia 5366 2 61.39 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGTGCACTTGGCTGGCTTGTCAATCGAATTCGCATTTAAACTGCAAATTTATGGCACACGATTTG:1 - chr3R 21969039 3' + hobo 2928 1 67.68 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGTACCACGAAGCTCTTCAATTTTTTACGCTTA:2 + chr3L 8012095 3' + transib2 2780 1 69.31 GGCCGTCTTCTGTGGAGCCTTCTTGGTGGGCGAGCTCTGGACAGTGCCTTGCCGCCCTCCATGTGACCCAAGCTCATGTTCTCCGGCTCCTGCAGATCCTC:1 + chr2R 8056926 3' - BS3 1554 1 54.46 AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGC:1 + chr3L 5267266 3' + Juan 4175 1 65.35 TTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAATAAGGCTATTAAATTACGCAATCAGTGGACAACGAGGCATTGGAGCGAAAAATGCAATTATATCA:1 + chr3L 12240999 3' - Juan 4068 1 65.35 TCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATCTTGCTGAATGGATGGGCGGAAGACAGCAAGAAGTGGTATAGAATGGGCACGAATAGATGCGGAAGGATG:1 - chr2R 16782972 3' - I-element 96 1 63.00 TGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCCCACACATATGCAGCAATTAGCTTGTAACTATCAGCCACGACATTCCACAACCACGTCGTCGCCCTCATCCACAC:1 + chr3R 9441170 3' - invader2 174 2 77.23 ACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACTCACTATATATCTCTCTATCTCTCGATCAATCAATCACGT:1 - chrX 20795266 3' + accord 7045 2 60.40 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTATATGAATCCTATTAGGATGTAAGGAAGAC:1 - chrX 3195637 3' + mdg1 7414 2 70.30 TGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGCGGTCATAGAAAATTCCATTTTGGGAAAATATTGGGCGGCCTACGTAAATGTATAAAAAATCGCGAGGGCGTAC:1 - chr3L 8064588 3' + P-element 425 1 78.22 GGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGCCCCGACTAGAAGACGCGCATTTATAACTCGAAGTTTTCGTTAATTCGAAAGGGTTTGTAATCATACAC:1 + chr3R 17064226 3' + Transpac 5225 2 77.23 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCCTACAAATCTCCCTCGAATGGGTTAATAATGTAGTGTAACCTTTCTTGTGAATATTTAAATTGGA:1 + chr2R 16902950 3' + flea 5007 2 66.34 GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTAATATACT:1 + chrX 21668099 3' - Tabor 6847 2 71.29 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGGCAATCGTTTGACGTCGGTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCT:1 + chrX 20330556 3' + P-element 2881 2 64.38 GGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGCATGTGTGTAGGGGGGGGCCCAGAAAAGAAAATGGCGGTGAACCAAAGATATGGTAGAAGATAAAG:1 + chr3L 10262639 3' - gypsy7 5007 4 81.82 GAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGCTGTCTTTGGTTCCTATGACAGTTTCAACATGTTTCCACTGTA:1 - chr2R 9399024 3' - Stalker2 363 2 67.33 CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGA:1 + chr3R 14049399 3' + transib2 2777 1 73.74 TTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATCCTACGCACCAGTTTAGATTTAAATTCAGGACTTCACATTCCACATATAGATTCGC:1 - chr2L 12802176 3' + invader3 5443 2 56.44 AGGATCTAATTATGTAATAATAAAGTTAAAATTGACTGCTTTAAAAGCGCCAGAGAGTAGACAAAAATGGTAGGTTCGCCGCCATGGAGCGACTGCGTCAG:1 - chr3R 21671501 3' - Cr1a 4278 1 56.44 AAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGATGGCTGCTAGAGAAGAGCGAGAGGGAGGGAGTGAGGGCGAACAAAG:1 + chr3R 14025025 3' - 1360 3272 1 54.46 TCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAAGGTCCGTTGTCGCTTCGATCTTTCGCTCAGTTGTTGCATA:1 - chr3R 12005449 3' + I-element 5321 1 61.39 GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGG:1 + chr3R 14049419 3' + transib2 2795 1 54.46 GAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCCTTCTTATCATTAGTAACGTCACACGCCTGACATTTACTTAACTTAAGCGAACTGAAAACT:1 + chrX 8446010 3' + opus 7271 2 67.33 TTTTAGAAAATATTAATCATTTCGGGACTTTACGTTGGTCAGAACAGATTATTTTCTTCAGAATTATCAGATCATTTCTATGATATTAATAGCATGACATG:1 + chrX 22835373 3' - HB 256 1 64.36 TAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTGAAAATGCAGTCACTGAACACGAATGCCTTGACCATGAGGAGGGGGAAATGCGAGAATGCGAGTAGC:1 + chr2L 7585901 3' - McClintock 6416 2 70.30 AGTATTTTTGAGAAGTCCGAATGTGGAAGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCTGGCCACATTGTTTTGTAATTTATTTTGTATCAGACAGT:1 + chr2L 16024708 3' + aurora-element 4084 1 71.11 CAGGACGCCAGTTTGGGCTTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATGGGCGATGGTTGTTATTTCAGAC:1 + chr3L 25511129 3' - Rt1b 4823 1 77.23 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGGGCAAGTGTGGTTCATGTTTGTGTGCCCATCGATGAATTCAAACACCATTCTGGCCAAATGGTTGTGGT:1 + chr2R 7037213 3' + 1360 3385 2 76.24 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGCCACGACACTGATTAGATTTATCAGCCAGTCGAGTTGCACATAATGAACG:1 + chr2L 17056558 3' - 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Ivk 27 1 52.48 TATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGTTTTATGATCCCCGCTCCTTATCCTTGCACAAGGATATCGCCATGGCCACGC:1 - chrX 15646959 3' + 17.6 141 2 65.35 TGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTCTCTCTCCCGTCCACTCGTTGTTACTTCATGTACTAATTTTTTTTTCTGTGCTTGCGGCTTCG:1 - chrX 7097223 3' - 1360 3335 1 68.32 TGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCCCATCCAATTACGATTCCTCATAAACATCCGCA:1 + chr3R 6210286 3' + hobo 2896 1 69.31 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCTTTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGG:1 - chrX 21668012 3' + Tabor 7293 2 55.32 AAAATCTTAATTATTTTAATTGCAATGCAATCATCAATGCCTGGGCCCCGAATATAATGCCTGCCATTAAGTGTGAATGGGAATGCTGGGCAAACAATCGC:1 - chr2R 17983575 3' - TLD2_LTR 100 1 79.21 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCTCGATTATCTTACTTGGCCCAAACAAAA:2 - chrX 15259042 3' + roo 9024 2 79.21 AAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAGGAA:1 + chr3R 8914538 3' + roo 368 1 59.41 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCAAACACCTTGATGTATTTGCCTTGTTATAGCTTGTTTGTAGTTTGCACTTATGTATACACTGAACGAATAT:1 - chrX 12276737 3' - hobo 5 1 74.26 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCCCATCCAATTACGATTCCTCATAAACATCCGCAATTTATTGTGTGCTTTCGGGTGCTTGACTTTC:1 + chr3R 6210318 3' + hobo 2928 1 68.32 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAAGCAAAAAGTCCTTGGTTGGAGTCACTCAGAATGTCTTCTTAAAGTTAAC:1 + chr3R 12058693 3' + roo 9045 1 55.45 TACACTCTAAGTGGGTGCTCCTTGGACAGAATAACACGAGTTGGGTGAGTTGGGTAGGTCGGAGTAGATTGGAGAGCGGAGAAGTGCCGGATGGGAGG:1 - chr2L 530078 3' + Q-element 719 2 60.20 GTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATGTGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCAT:1 + chr3R 22232287 3' - 1360 460 1 68.32 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTATATCAAATTATACTTTTCGGGTAGTCATTTGCATTCGGATGT:2 + chr3R 20369743 3' - pogo 32 1 61.39 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAAGTTTACATCGTTCGCTCCAGTAGCCGCGT:1 + chr3L 21782101 3' + roo 9026 1 70.30 CGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATTGAGGGGGGGATTTCATTAGGAGT:1 - chrX 21238792 3' + Burdock 237 2 76.24 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCCAACGAATCCTGTTCAATATCGATGAGGAATCCATTGTCAACTTG:1 - 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chr3R 27071882 3' - jockey 4705 1 58.42 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGGGCAACGCACAATTGAGTTCAATTGAAGGCA:1 + chr2R 17269774 3' - transib2 43 1 67.33 TATAATAATCTTTTCTAATACAATTGAACAACATTACACTGTTAACTTAAAGTATCTTTAATGTAAAATTTGAAATGCCTTTATTTTCAGAGCATTCTGCA:1 + chr3L 14143058 3' + TLD2_LTR 54 1 53.47 GAAAATGTTTTCGTTTCACTATTATTTCACTGTTAGTGACTTGGGGGGACACATATGTATGTACGAAAATAAGCAAAGTACATATAACTTGAAAACCCAAA:1 - chr3L 9098714 3' - X-element 150 1 63.37 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGTGGTGGAGCTTCGGCAGTCTCGAGGGCCAAAGGATATGGC:1 - chr3R 28940722 3' - hobo 38 1 59.41 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGCATGCGGACGAGTATTGGC:1 + chr2R 20544034 3' + 297 6927 2 79.21 CGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCAACCACACCCTGCATTCAGTGCATCACATTTCTGTTCTCATCGTATCTTTCATAACTAAA:1 - chr2L 19340958 3' - Doc 4487 1 58.42 TTTTGTTGTTATTTTTTTTTCTTGCTAAGAAAAATGGCAACAAATACAAACAAGGCGATAATGTGCAATGCACAAATTAATAAACTACTTTATATAAATAC:1 + chr2R 13627929 3' - Penelope 627 1 74.26 GAGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTTCGGAGTGCCAGTGAAAGAGTGCACACACACCTACGCGGCAATTAATTTCGATGCACAAAC:1 - chrX 12842244 3' - Stalker 129 4 73.27 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGGCAATCGTTTGACGTCGGTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGGAG:1 + chrX 20330560 3' - P-element 30 1 50.50 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAGTGAGATTTATGGTGCTGCCTTTATCCACGTGAAGGTCAGGACCTCCCAGGATGGTGGCCGTTGGCAC:1 - chr3L 10037343 3' - jockey 4746 1 70.30 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGTAGCTCCTCTGCCGAAGTCGCTGC:1 + chrX 409635 3' - P-element 51 1 28.71 ACAGCAGTTACGCTCTTAGCTCTCCTACTCTCAACTCTTCCGCTCTCAGCAACTTCAGAAACCAATACCACAACGGCAGCTCCTTTCGTGTCTGGGAAAAC:1 + chr2R 25134613 3' + Porto1 490 1 77.23 CTTGGCGACCGTGTCTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGCATCGAAAAAATATCACAAAAATCTTCCTTTTGCCCAAAA:1 - chr3R 23229812 3' + Stalker 406 1 59.41 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACACGTACGTATTTCCAAAGAACTTCTTTATTAATCAAAAGCCTTCAAAGAAAGT:1 + chr3L 18580434 3' - 412 7079 2 53.47 GGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGACTATTTTAAATAAGTTGATATTTTATAAGGCATTACAACTCGCAGCCGAGAGATGCTCGCAACCCGCCGCCCGAGTA:1 + chr2R 8746886 3' - I-element 5163 1 77.23 TAACATGAACCTACACACACACACACACACACACACACACACGCACGCACGCAGACAGGGAGAAAGGTGGCCAAATCCACTGATAACAGTTTCGCCTGGAT:1 - chr2R 17874005 3' + accord 7092 2 73.27 AAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTATCCATCAAAATGGGACTT:1 - chr3R 15924589 3' + Quasimodo 7343 2 56.44 ACGTTCGCTCTCCCCTAAGACTGGAGTACAAAGTCCTCTTATATAACTCCGTTTTAAAACAAATAGAAATTAATTGAAAGTCTGCGGCAGGAATACACATA:1 + chr3L 15447958 3' + Doc3-element 4256 1 59.41 TATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAATCCTAAAGTCTAATTGATCGGGTTTTCTGGTTTTCTG:1 + chrX 8453432 3' + Idefix 7152 2 76.24 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCAACACTGCAGCTGAGGTGTTAAGGGATAGAGCTACAACCAAAATAGCAATAAAGAACTGTGCGAA:1 - chr3R 24229063 3' - 1360 11 1 69.31 TGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGAATATGGGATTAAAAAATATATGCCAA:1 - chr2L 9299673 3' + 1731 4576 2 77.23 AAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATCATTGCATAATGCCCGCTTTTGTACGAGTGTGCGTGCGGAGAAGGCTTATCTTCCCTCTGTTT:1 + chr3L 531832 3' - FB 14 1 65.35 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCTCGCGTTTCTTCTGCAACGAAAGGTGTACAGTTCGGCATATCTAAAATAACAAACAGATAATAGTTA:1 + chrX 9048734 3' - Tirant 8121 2 65.35 CAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATGAAAAGAAGGCATGCGTGCGTTTAATTATAC:1 - chr3L 10035730 3' - jockey 77 1 69.31 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACAGCAAATTTAAAAGAACAACAAT:1 - chr3R 31188758 3' - I-element 53 1 79.21 CAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGAAATATGTAATTCATCTGTAAGGATATTTTGTAAAGTGCATTACTTTTACACGAAGAAAATATT:1 - chr3L 8012013 3' - transib2 7 1 70.30 TTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGGAGGGCAGTAAAAAATGTTTATATTAATTTTTGTATGTTGTTAAATTGGTTTTG:1 + chr3R 18474608 3' + I-element 300 1 60.40 TTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGCCCACTAATGTATACACTATAATATATAATTACAAGAACTTAAAAAAATTATCTTATTTGAGTATGTTATT:1 - 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chr3L 24500376 3' + 297 6844 2 77.23 GAGAGAATGCTATAGTCGAGCTCACCGGCTATCAGATACCCGTTAATCAGCTAGTAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - INE-1 575 1 51.04 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGGGCTATATCTGCAGTGCTCGTAAGTCGTGGGCAGCTGTGCAGAGGCTTGC:1 + chr3L 22741398 3' + P-element 2872 1 60.44 GGGCGAGGTCTGTTTAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAACCTATCATGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' - X-element 4456 1 58.42 ATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCATCGAGTTTGGCGGGAAACGCTGTAATTCGTCAGATATTCTGC:1 + chrX 7768331 3' - hobo 243 1 57.43 CGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTAAAGCACATATAATTATTAGTTTTGTACGACTTTTAATCAATTTTTTTTTGTGTTGTTCCCCAGT:1 - chrX 19080260 3' - Ivk 12 1 61.39 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCTTTATCGCCTCCTCG:1 + chr2R 22856606 3' + 1360 3370 1 60.40 GATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGTGTGCTTTTGTTTAAGGAGCGGGACACACCGAGAGCCGAGG:1 - chr2R 19220824 3' - Tirant 361 2 57.43 ATATTTTCTAAAAAGTGAGTTTGATTAAGTTAATTTGTATATTTAAAAGGGCAATATTTTTGGACAGCAATGAAAACTTCTTGTATTGAATTTATAAAACA:1 + chr3R 7022966 3' + HB 265 1 58.42 TAATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACTACAAAACAAAATATAAATGGAAGCGAAGAAAATAT:1 + chr3L 2529295 3' - Circe 7080 1 64.36 CATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTTCTGTAACCTGTGCCCACCATCCCTAGAGCCTTTAAAAAGCCTCATAT:1 - chrX 7349972 3' + pogo 205 1 54.46 CGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACATATATATATAAGATTTATATATATATTGGGCTTGGCAGCGTTTAATGGTTC:1 + chr2L 5974544 3' + invader4 3060 2 56.44 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACAGCCAATTGGGTGCACTTACAGGTTGCGCGTACTTCGCGTTGCTTAACTTGACTTTAGTA:1 + chr3L 27728970 3' - P-element 16 1 63.37 GATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAACAAAGACACTAGACGGAGAAGAACGAGAAGGCCGAGCTCGATAGGGAG:1 - chr3R 9063421 3' + 1360 457 1 64.29 CATTGTTTTTGTTTTTTTTTTTATATATATATATTTCTGATTGCTTATCGCTTTGGGATTTAGCAACTGATTCGACTGCACCAGTTTGTTTAATTAGATTT:1 - chrX 16245444 3' + hopper 142 2 66.34 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGTGTTTCGCATATCTCCCCGTAATCAC:1 - chr3R 12058636 3' - roo 48 2 74.00 CTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCCAAAACAAATTTACGACAGGAGAAATTCGTCTGAACAGTAGCGTAACTGGATGCCTTC:1 - chr3R 15846557 3' + I-element 382 1 60.40 ATAAGCAAAGCTCACACAATTCAAAAGAAAAATAAAACACTCAAATAAACTCACAAAGAATTCCTTATCGCCAAGGGGGCCAATGTTCCAAGGTTCTTTCG:1 + chr2R 16831307 3' - Ivk 46 1 83.17 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATATGTGAAATTGGATTGGCACCGAAAATAT:1 + chr2R 15606074 3' - roo 47 2 73.27 TACCATTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGTTGTGTGTGTTGTTGTGTGCCAGCGACATATGAATAAAAATTGCAAAAATAAAATGGAAG:1 + chr2R 15410248 3' - 1360 2965 1 69.31 GAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTGTCTAAGCAGCTTTTGCGCGAGGGCGTGGCATGAAATGGAAATCAGGCACCAGGGCTTTAGC:1 + chr2L 19310685 3' - 297 6798 2 68.32 GAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTGCTTCATTAAATTCGCCCCTCTTCGCACAGAC:1 - chr3R 25369207 3' - Doc 4645 1 75.25 ACGATTGCTGGACTCGTCAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAACGCCGATGGAGAGCGACAGCAGTGTGCCAGCGCATACACTGTAAAAAATGTACATAT:1 - 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chr3R 19284814 3' - Doc2-element 224 1 68.75 GTATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCGTCT:1 - chrX 19820622 3' - Rt1b 4966 1 65.35 CTTTAGACATGTACCTTCATTATAAAAATAAAGAAATATTTTCCAATGCCTAGCTTTCATTGAGTTTTGAAAAGAGAATAAACGAGGTCATCGCAAGAGTA:1 + chr2R 2795860 3' + mariner2 810 1 77.23 CTTCTTGTACCAACAAATCATGAAAGAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACAATTCACCACCCCTCCCCGCTTTGGACCATCGACTAACCCTATATTGGG:1 + chrX 3562203 3' + F-element 342 1 68.32 ATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAG:1 + chr3R 14049437 3' + transib2 2813 1 66.34 GAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGAAGGTAAAAGGAAGGTGAAAGCATAGACAAAGACTATAGAATGGAAATAAAATGAAAGGGAATGGAATGGAATGGA:1 - chr3R 9347274 3' + INE-1 158 1 58.42 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAGGAATATCTTTGCAAGAATGCAGTGCCGCTCTATCAACGAACTCGACATTTTATCT:1 - chr3R 29710964 3' - mdg1 7060 2 55.45 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTATCTTTCCTACTCATCATCACTGGTAACGAAGCTTTATTGCTTGC:1 - chr3L 16680681 3' - FB 33 1 58.42 AAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCA:1 - chr3L 25272577 3' - 1360 80 1 76.40 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAATTAAAAAATTAATAGCCTTATCCTGGCTGAATAATTGGTTTTAGGTAATATTGACATGTGGAC:1 - chr3L 12240913 3' + Juan 4197 1 54.46 CCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGGGGGTACACCCCACCCATTTTGTTTATTGAAATCTTTCACTCCGTCGTTTCATCGATTCTTAGCCTAAATCTAAGCAG:1 - chr2L 1696906 3' + G5 4622 1 58.42 TTTTTTTTTTGTATTTTATTCCCCAACATCTATCGATATCCTAGAAAAATGCTGAAATTCCAGTGCGATAATAACATAGCCCTCGAGCTAAATT:1 + chrX 9778585 3' - Osvaldo 1521 1 58.51 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTTGTATTTCCATTGTTTTAAACCAAATCAAGTTATTTCCTATC:1 + chr3R 27926639 3' - I-element 38 1 63.37 GGTAGGGCAATCCGCGAACACAACTACACCGGTGTTTCGCTAGCAACAAATTTCTCATGCTTTTACTTTTTTTTACTATTAAAACAAATATTTTTTTTTAA:1 - chrX 7082217 3' + Gypsy12A_LTR 1965 1 53.47 AGAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATGCAGTGACCATGTAATTTGCTCATTAACAAATTGCTTGAGTTAAAGCCCAC:1 + chr2L 18506824 3' + flea 233 2 57.43 CGGACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACACTCAGGCCAGAGAATTGGGTCAATACATTTAAAGCACGCAAAAGGAAATGCAAACGTACAAAA:1 + chr2R 19615764 3' + I-element 246 1 67.33 ATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCTCATCTTTTCTGCGCTAAATCTCGTGTTACCCCATTGAAGAC:1 + chr2L 22227999 3' + Bica 4899 1 58.42 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGCCTTTGCTAAGAACTAAACCACAACTGCCGATTATTATTATTTATTGTTTGG:1 - chr3L 5253746 3' + 1360 3355 1 60.40 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTCACTTGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' - jockey 35 1 53.47 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCACAATTTCTAACTCCGCTCTCCCAAGGTTGACAATACGAAAAATAT:1 + chr3R 21969125 3' - hobo 31 1 56.44 GTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGTATGAGTGTAAATTCGTAGGCGCTTCCGGCTGATTTTCACCTAATGGAATGTAATTGTCGATTGTAAAGTGA:1 + chr2L 20559325 3' + Tc1 1577 1 78.22 TGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACAAGTAACGGGTATGAAGAATGAAGAAGGAAAAATAAGGGACGCAAATAGAGCGAGG:1 + chrX 5256757 3' - INE-1 16 1 77.00 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTTAAGCGCCTTTATGGCTAATTAAATGAAACTGAACAGATCCGCCTTAATTGCC:1 - chr2R 23501725 3' + hobo 2924 1 61.29 AACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGTTGTTATAACCTGGCAACAACAAAGGCAGCAACTTGAAGCCATGCTTAATGAAAGTCAGACAGTGGGCGGGGTAGAA:1 + chrX 6624717 3' - Cr1a 492 1 63.37 CTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAATGTTCCGTAACTTGGTGCTATTCTCT:1 - chr3L 17215692 3' - Ivk 4 1 75.25 CCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATAGATTTTTTGTTAATTTATCAAAATGAAATAATTGAAATGAGTGTCAAAGACACAG:1 - chrX 12729774 3' + 297 6768 2 60.40 GGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTTCAACCAAGAATGA:1 - chrX 10210944 3' - I-element 31 1 50.50 TGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACATACTTTACTTTAAAGTTAATACTATGCACAT:1 + chr2L 4750030 3' - Quasimodo 42 2 74.26 GTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGGATGACAAAATGTTTCATCATTTTTTTTTAGCAGTGTAGC:1 + chrX 12366691 3' - F-element 4429 1 60.40 TTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGAAACAGACGAGCGAACAAATTGCAACATGCAACAGAAAAAAACCATGGGGATTTTCAGGAG:1 - chr3L 1842759 3' + Stalker2 337 2 73.56 AGAGTGACTTTTAGCTGATCGTGATTTCAGCCGATGGCCATTTGACATTTGTTAAGTTTTCTTATCGCGCGCTTTCATTAGCGACCGTCGTCTGGTTCGGC:1 - chr3R 28024679 3' + Gypsy12A_LTR 193 1 65.35 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATCAAATACTACGGTGCTCGGCATTTTCTCGGCTGGGG:1 + chrX 4784571 3' + hobo 2937 1 62.90 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCGGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGT:1 - chr3L 19274787 3' - transib2 14 1 63.37 TGTGTCCCCGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAACATAGCCGCGACCTTCCGCTTGCGGTCCCTGTTCGTTCTGTTCGTCCTGTTCAGGACTCGCTTCAT:1 - chr3L 22132312 3' - Rt1b 4740 1 55.00 TACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGCGTATGGCTGTTCTTATGTGTATGTGTGTGTGTGTTTTCTCCAGTTTTCCCCTCGGA:1 - chr2R 16710235 3' - Quasimodo 104 2 73.27 ACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCCACATCATTCACTAAATTTGGCCTGGCCTCTCTTTCCGTTTTATT:1 + chr2L 8715593 3' + 297 6497 1 55.45 CTACACTACTCCGGATGTACCCAAGAGATACCAGATAAGAATAAGATTTTCATATGATCCTGAAGAGCTAAAACCGAAAATTGAGATTACAACTGAAAGCA:1 - chr3R 8928978 3' + Idefix 81 2 68.32 TGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATTTTCCATTTTAAAACCAAATCAGGCTAGTAGTATTCTATTTA:1 + chr3R 29964886 3' - Quasimodo 26 2 59.41 TTTTTCTTTTTCTTTTTCGTTTTCGATTTTATTTCTCATTTTGCGTTTTCCGATTTTCCGCTGCTCACGCACACAGTTTTTCCAAGCACAGCACGCTCCAA:1 - chr3L 2896759 3' - Doc2-element 218 2 58.42 AACGTCAATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGGGGGAGTAAGCAAAAAACCATATCATCTACGAAAAAACAAAGTCGAAAATAACAACTGACCGGAG:1 - chrX 6456826 3' + Idefix 7263 2 59.41 ATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAATGAA:1 - chrX 8027409 3' + Juan 4208 1 63.37 CTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACTGGGAAATGGATTTAGCAAGAAGATGAGGCGATAAGCACTATGATTTTA:1 + chr3R 6191329 3' + copia 4891 2 56.44 TAAATCGGACCACGACCACCCATACCGCCCATATTAGGATATAAAGTTAAGGAGTGATTTGGTAAACAATAAGATTAACACGATTTACAGAAACTTAGTAA:1 + chr2L 22674667 3' - transib3 2747 1 64.36 CGGAAAAATCGAAATTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCAACTGTGAGTTTTCATCACTTAGGATTAATAAATTGAGCTAGGCTTTTTATATCA:1 + chr2L 21709515 3' + FB 20 1 60.00 ATTCCAGTAGACTACTTTTATTTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACAACGCTTGGAACAATTAGGATCTAACGGCACTTTCGTACAACTCGCTAG:1 - chrX 8386259 3' + Cr1a 3975 1 64.36 GTATTTGAAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGGCAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCTTAATAATCGCCTTGAATATTTTATTGTGCAAGTAGAGGG:1 + chr2L 2163175 3' - TLD2_LTR 53 1 69.31 TAACCAGCAAGAGAAGGTTACCATCGCGAAAATTTGAGATGGATGTGATGTCTTTGCTGATATACTTAATGACTGGAGACTACAAGCCTTAAAAATGAACT:1 + chr3R 20796094 3' - Ivk 453 1 70.30 AGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTATTTCAAGAATTAGCGCTTTAA:1 - chr3L 24242357 3' - X-element 4451 1 78.22 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGATTATAAAATTGCTTACTCATAAATATCAAGTTTACATATTTAACAACACTGATCTCTGTTAATAGCTCT:1 + chr3L 4491621 3' - pogo 4 1 73.27 ACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTGTAACAGGTAGTCGCGTTTCGTTTCCATTTCCAGGGATCTCTGTTCTCTCCACGAAAAAGGGCATG:1 + chrX 6997512 3' + micropia 5168 1 79.21 GTTGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCGTTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCACATATTATCTGGCTAGCACCATTTCAGTCTATCATTGC:1 - chr2L 4866191 3' + baggins 5153 1 70.30 TAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTACTTAAAAGTGAAATATGATTTTATACGAT:1 + chr2R 2092820 3' - Doc3-element 55 1 70.30 ATTATTATTATATAATTATTATTATCGAACTTGTTGAGCTCCCAAGAATGATATTTGAATACATAACTAAATAAACAAGATTTTTTTCCTATGTCCTTGTG:1 - chr2L 21076079 3' - invader3 5049 5 78.22 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGGATCTAAAATAGCATTTTATCGTGACTTAGAGGCA:1 - chr3L 18034180 3' - Doc 45 1 62.00 GATTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTATCACCATAGCAACTAGTCCCTGTCAGCTGTGAATAAAATTCAATTCGCTTGCA:1 - chr2R 16977858 3' + R1A1-element 255 1 70.30 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATTCATTACTTTGAAATGCATTGAATGAA:1 + chrX 12954235 3' + pogo 2057 1 78.22 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATTCAAGCGCGAAAGCATCAACAAATCGTACAAGTTGGAA:1 - chrX 6739607 3' - roo 38 2 63.37 AAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTAGCACTGGAATTGATCGTTGGTAATACTTTAAAGATGCTCTAAAAAAGAAGTGGGAC:1 - chr3R 26274322 3' - S-element 1545 2 61.39 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTCAATGGGCCGCAACGACAGCTTTACGGCCTTTACCCTTTGACGCGTGCCGTCG:1 - chr3R 23080819 3' - 412 21 2 59.41 ACGTTCAAAGCTCGGACCCGCAATCCCGAAAAACTTTCGTCCTGATGGCCATGGCAAGCAGGACACCAGGAGCGGTTCAAAGGGATGTGATGATGCGGGGC:1 + chr3L 19582454 3' + Idefix 253 2 73.27 TTTTATGTTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGAATCTTAGTAAGCTCGAGTGCAGCTTACGAAAGATCTGTATTCTTGACTAACATTTCATGAATGACCA:1 + chr3L 22670951 3' - baggins 5062 1 58.42 GATCAAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTCCTTTTTTTCGCAGCAGACACCGACGCAGATAGGGAAAAAATATTGGGATAACAAAG:1 + chr2L 14789178 3' - 1360 3160 1 61.39 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTTGGCCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATTCGTGCGAGGGACGGATGTTTTGTATACAACACAAAACAAATT:1 - chr2R 10191699 3' - 297 22 2 52.04 ATTTAATTTTGTTAGATTAAATCGCTCCTAAAAACTGTCCAAATCTATCGCTCCCACACCTTAGAGCATGTGACCTTCGCCTCCGACGATCAGTTGACTAA:1 + chrX 7267450 3' + Ivk 5374 1 68.32 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTCATTGCTAATTAAGCCAAAGATGGGACAGTATTTTGGAAAG:1 + chr3L 16449797 3' + roo 9038 1 60.40 GGTGGGTTATGTCTGTGTGTCCTAGTCCAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGCGCCTGCTCTCATTAGGTCCTTGATTAATGATAGTTCTGCTCTCGTTT:1 + chr3L 15671223 3' - I-element 4956 1 52.48 AACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACACCTGCAATTGCATTTCGCTGCCAACTTCTGCTAATTGCTCGCCCGCTAATGACTCTATGCGGCA:1 + chr3R 29711060 3' + mdg1 7444 2 61.39 GCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTTTCAGTTCATTTTTTTGATTTAGCCCCTCCGACCGGCGAG:1 - chrX 20607311 3' - invader2 381 1 61.39 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGATTATAAAATTGCTTACTCATAAATATCAAGTTTACATAT:1 + chr3L 4491591 3' - pogo 34 1 67.33 TTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAAACATCATCGTAATATAAAATTAACCAGATCGAAGCAAAGAAAACAGAAACGAAACGCAATT:1 - chr2R 22619595 3' + jockey 4962 1 55.45 AACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATTCAGACCCTTGATCCTGGGCATTTCTACATATTAGGTTGTAATTATACATACATATACACCTTCTCCAATATAG:1 + chr4 114241 3' - 1360 3361 1 70.30 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGTGTGATTGATGTGGACGACAATGGCACTCGGGGATGG:1 + chr3L 21852555 3' + 1360 3351 1 68.32 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGACATTGACACGTCGCCCTAAAATGTATGCTACAATATTGTTT:1 + chr2L 16968480 3' + 1360 3356 1 63.37 CAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAATGAAAGCCTACAAAATATACATAATGGAAAGCCGACATAAACTAAAGGCTTATAGACTAACTATCTT:1 - chrX 11463594 3' - flea 4762 1 64.36 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGTGTTTATAATTTGGAGTCTTGGCAGGTGCTTTAGTGGTT:1 + chrX 6739665 3' + roo 9035 1 61.39 GCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGAAAACATTCCCGGAGAAATGCAAGT:1 - chr2R 17033463 3' - Transpac 249 2 75.25 GAGAGAGAGTGAGAGCGAGAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAATAGCACTGAACTAACATTTACCTTGGCTGGCCAAAAATAAATCCT:1 - chrX 18730519 3' - Cr1a 285 1 63.37 GGGTGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCATGCAAAAAACAACACCAAATAGCACTGCGAACATGACAGCGGCAACAAAAAAT:1 - chr3R 12851533 3' - Cr1a 299 1 65.26 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCTGCATAACACCATTCAAACCGGCAAATCAAACAGTCG:1 + chr3L 27262124 3' - P-element 39 1 40.59 GCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATAGATATGAGGTTGGAGCTGACTAAA:1 + chr3L 60078 3' - Ivk 221 1 74.23 CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGCTTTAAACACACTTATTTTCTCAGTGCATGAATACTTACAGGGC:1 + chr3R 15631184 3' - opus 141 4 58.42 CTGCGGCGTCTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTT:1 + chr2L 23390132 3' + rooA 233 2 53.47 CATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGAGAAATATTCGATTTTTTAATAGGCAGT:1 + chr2R 5424277 3' - 1360 3355 1 73.27 GCAAAAACCATTATTATGAAATAAAAGTCAATACATTTTTCTATATTTTATTAAGCTTATTGCTATTCTCAGTGTAGTTGATCCGCTTAAATTTGACAATT:1 - chr2R 5468229 3' - transib4 2309 1 66.34 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGCGGCAACCGATGTCGATGTTGCTGTCGTGTTGTTGCCGCTGCAGATGTTGCAGATGTAGCTGCCG:1 + chr3R 15666133 3' - P-element 10 2 67.33 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTTAATACTACCATTATTATTAAAGCAATAATTA:1 - chr3R 19449800 3' + pogo 2054 1 71.72 CAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATCCGCGTTTGGGTTCCAGCTGCATCCGGGG:1 + chr2L 948057 3' + Quasimodo 299 2 57.89 GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCACTGGACGTTCTAATATACT:1 + chrX 21668099 3' - Tabor 8 2 69.31 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGC:1 + chr2R 17346021 3' - hobo 17 1 59.18 TTTTTTATTTTTGGCCTCTTACGGAACCACTGTGCAATGTAAAGTATCCATGTCCTGCTATCGCCTTTAATTATGCAGTTCTTGGATACATTTCACGGTCT:1 - chrX 20082941 3' - Transib5 13 1 52.48 CGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCA:1 + chrX 21945928 3' - F-element 43 1 59.41 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACACCTGCAATTGCATTTCGCTGCCAACTTCTGCTAA:1 + chr3R 29711030 3' + mdg1 7414 2 66.34 CCACCCCAGCCCCTAAACCTCCACGCCTCTAACGTTGTCGGACACCGAACCGGGAAGGCGAACAACTAGAGCACCGCATCCAGCTCTGATTCCGTCCCACT:1 - chr2L 9671166 3' + Tirant 8 2 78.22 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAGGATTGCAATGGGGGGACCCTTGTTCCAAAGCACCAGGAGTTCTCTAAT:1 - chr3R 12215259 3' - hobo 25 1 54.46 GTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGGTTGGGGCAACTTGATTTCTTATTTGAATATTTATTTCTGGCGGCAGGGACGTTGTCTTCGGCGTCGC:1 - chr2R 11738904 3' - F-element 251 1 77.23 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAATTATTGGTATCAATACGATGTCAGTGAAAGTGGATCGCAAATGTAGGAATT:1 + chr2R 9007294 3' + roo 9046 1 56.44 GAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTGCCGAACAGTATATCGTGAATTAAAAATGTCTGGTCTAAATCTTAAGACATCGTTTTTTCCTGATCAATAAGTA:1 - chr3L 25608290 3' - Doc 3 1 68.32 AATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACGTTTAACAGCATGAACGATGCGATATCTAAATTTATAGATAGTTGCACAGAAG:1 + chr2R 3293817 3' - 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chr2R 19209453 3' - Doc 51 1 63.37 GGCGTTCCTTTGCCTATAGTGGTGCGCGAAATAATTCCTGCTTGTGTTTTCCGGCGATATACAGCCGAAGCCTGCATCTTTTAAATATTTATTTTTTGTGT:1 - chr2R 21839065 3' + gypsy12 358 2 63.37 ATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATTTTTCTCGTAAATCAAAATGTGGTGTATGGCGTCATAGAAACAACA:1 - chr2L 8374183 3' + invader1 3983 2 63.37 CCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGCATAATTACACACACGCCAAGGCGAGCATGGCGTGCATGTAATTATGCTGGAAACAGTGGCGTGG:1 + chr3R 11555089 3' + I-element 5101 1 55.45 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGGGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTGCAATTAAAAGGCTCAACTGCCAGGCGA:1 - chr3L 5492311 3' + pogo 2055 1 72.28 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGTCATGAGATCGGGATCCTGCCAGACAGTATGTCGCCAC:1 - chr3L 14152089 3' + blood 350 2 50.50 TTTCGATTTATTTGTTTGTATTATATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACA:1 + chr2R 4023382 3' - Doc2-element 90 1 61.39 TCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACA:1 + chrX 22671399 3' - 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chr4 621934 3' - mdg1 39 8 73.27 ATATACAAGAAAATAAACAAGAAATTCCAAGTTTACACACGTTTGGTTATGTGTTCGTCCACCCGGAAAGTCCTTAATTTTTATAAAAGGGTACCATTATA:1 - chr2R 9869838 3' - S-element 1551 2 67.33 AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAGTGACACTTGCACATTCATTTGTAGCACT:1 - chr2L 14886895 3' + jockey 4940 1 72.28 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGGGCTTAATATAATACTTGTCATACGTTGCTGTTCATTTAAAGTTCGG:1 - chr3L 14886197 3' - 412 7083 2 56.44 ATACATACATATGTACATACAAATTGCGTTGGCTGGAAGTGCGGTTCAAAAAGGGAAAATCCTTTCCAATCCCTCTCCATATGAAGGCAATAACCGAATTG:1 + chr3R 31496082 3' - invader3 5086 1 59.41 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTGGGCCGCCGAAAGTGTGCGCGTGCGATAAGACATAC:1 - chr2L 7991710 3' - P-element 41 1 38.61 GGCCGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAAATTAAAAGCCAGATAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAAT:1 + chr3R 19450119 3' + roo 8658 1 55.45 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAGGAATATCTTTGCAAGAATGCAGTGCCGCTCTATCAACGAACTCGACATTTTATCTCGTCTCAAGCAAATG:1 - 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chrX 1813936 3' - I-element 172 1 57.43 AAATTCTAGAATACAAACAAAAAGCATTGTTAAGAACAAATTTACTTCCATTTTGCATATACAAACACACACACACGCAGAATATTTGTGTCTCATTTCCG:1 - chr3L 17448786 3' - Tc3 388 1 68.32 GAAGGTCGAGATCTCAGGAAATATAAAAGATAGAAGATCCAGCATACGGATTGATTATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACATAAATAACTAATTTGCAA:1 + chr2R 18487369 3' + INE-1 141 1 42.57 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCATTGTAAATTTGGCTTAGTGTG:1 + chrX 3465611 3' - hopper 54 1 94.06 GTGAACAAGATAAACAAAAAAAGTGAAAACAATAAACAAAAGAAAAATATGAGAGCATTCTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCG:1 - chr3R 19449396 3' + Porto1 154 1 55.45 CTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGATCTCGACTATAACATTCTCTATTGTTTCGTACTTACGCGATAACAAATATTTCTGTAATTGCTTGTCA:1 + chrX 20672602 3' + INE-1 543 1 73.27 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGGATAAGTGGCCCATCCCCAATCCGACC:1 - chr3L 11367466 3' + roo 406 1 74.26 CCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTAT:1 + chrX 21668078 3' - 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I-element 5209 1 71.29 TTGTATATTGCAATTTTATTATGTAATTATAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCATTTAAGTTGTTGATTTGTTGATTTACACTTGGCCTCGCCGCATTC:1 - chr3R 25406943 3' - Porto1 4228 1 71.29 TTAAAACAATTTTAAATCCAATTACAGAACAAGAAAAAGCATTTTTCGTTAGCTTTCATCCTGCTCAACCTTCATTTTGTGTAGTGCGAAAAACATCTGAC:1 + chr3L 3822287 3' + Juan 3787 1 69.31 TCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGATGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGCACTCTGATCAGCAGAATTCTGGGATTTGGCTTGCTGT:1 - chr3R 18920834 3' - F-element 4512 1 60.40 CTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCATCTCCGCCGCTCTCGCTCTCTCTCTCTC:1 + chr2L 21618826 3' + Doc 293 1 72.28 GGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAGAATAGAAAAGGCGCGTGGATGGCGCGTGCCAAGTCACGCAGTTCGCCACGTGAGCGGCGGCTTTTCACTGCCTACGGC:1 - chrX 2685024 3' - invader1 3686 2 53.47 ATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACGGAAGAGAATAAACAAAAACGATATTCGA:1 + chr3R 15128359 3' + hobo 2490 1 71.29 GTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCCGAGGGAAGTGGGTCAACTGCCTGTCG:1 + chr2R 17079628 3' - 412 216 2 73.27 CCATGCTTTTTTAATTGCTTCAACTAGGGTCCCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTCCTTCCTTTACCGTTTTTCGCGGCTCATTTTAGAAAATTTAGAATA:1 - chr3R 4576765 3' - Tc3 1324 1 68.32 TGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGACCAGAGACTTATCTGGGAGTGTTCTTG:1 + chr2R 6783218 3' - Tabor 48 2 69.31 GAGTGTTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATGTGACTTGAGGTGCTCGTAGAAGCC:1 + chr3L 7653299 3' + 1360 464 1 80.20 TTAATTTGCTTCCTCCGATTTTGTATACTAGCGCCTTCATTTTCTTGTTGTTGCAATGTGGCAAGATGAACAGGTCCTGGTCTTCGACTCCGGCACACG:1 + chr2L 16084177 3' + Gypsy12A_LTR 2062 1 54.55 TCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTCCTCTGGTCACCGCTCTACCTACTCCCATCACCCAACAGCCGGTAAAACTCGTGACGTGATCGGT:1 - chr2R 19952608 3' + Max-element 70 2 67.33 ATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCTGGTTTCCGTATCCTGTTCCGCCTTCGTTATT:1 - chr3L 20766874 3' - accord 107 2 68.32 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCTCGATTATCTTACTTGGCCCAAACAAAAATGGAGAACTTAAGAAAATTTACAATGCTAACGAAAAATGTCTAAC:1 - chrX 15258996 3' + roo 407 1 77.23 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAACTAACCACATACCACAAAACCCATGGCCGGGGACATGTTTTATTGGCCTGGTTAACGCATAAA:1 + chr3R 14832577 3' + hobo 2937 1 74.16 GTAACTTGTTTACATCTTATGCTAGTTTAATCGTATGGCGTGACTGGAAAGGCGTAAGGCGCAGCCATCTTTAAAAGGATCAGCTGTTTTAGTTAGTTTGA:1 + chrX 759351 3' + 3S18 178 2 61.39 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCTTTTGGTATGGCCGTTCAGCTC:1 + chr3L 19933693 3' + roo 9019 2 80.20 TGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATGTGTGTCAGCGGCGGGGAGGGCAACAAAATACGAAATA:1 + chr3R 9940169 3' + I-element 5311 1 62.00 TGTTGCAATTTGTATTATTTTAATCTAGTTAAATGTTTGGAATAAATAATTGACAATCGTTATAAAACTCATTTAAATCTTGTAATCATTAATTTGATCAA:1 - 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transib1 1896 1 82.18 CTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCCTCCCCCCGCACTCCGCAAATAGGTATTGGGCAAACAGGACCACTTCGATGGCATTC:1 + chr3R 31174862 3' + Max-element 8301 2 63.64 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGATGTTGCTTTTTGGCTATGAAGATGCGATGAGTTACAGAACCCAAGGTGCCGACGCCAC:1 + chr2L 7463593 3' - blood 19 2 60.40 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACACTAATCCGCCACGCCTACTGTCGCCCG:1 - chr2L 17056498 3' + 412 447 2 69.00 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTTCTCCTCTCTGC:1 + chrX 16217543 3' - P-element 9 2 70.30 GGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCATCTTGCTGATCAAGGATCCGGTGCGGGGTCACAGCGAGGGATCGCACAATTTGGA:1 + chr2R 16132437 3' - hobo 237 1 60.40 CACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCCGAGATATAGGTGCTCATGCAAATGCAGATACACACATCGGTTATATGCGAGTTGGCAACTTGAAATATTTCA:1 - chr3L 9120410 3' + Tirant 8504 2 29.70 AGGCACTATAAAAGCTAGAACGTTGTGACTAGGCAGGCAGATTCCAGATTGGTTGGGTATCTAATGGTCAGGAAACTCGAAGAGAACACGATGTGGTTGG:1 + chr2L 21717968 3' + INE-1 156 1 52.00 ACATTAATAAATTAATAGTTTAATTCTGTTTCCGTTAACTGCTTTGGCACACTTGTTTCTGATTATTATTATGTTTTGTCTCTTGTTCTGCTGCTTTCACC:1 - chr3R 15059015 3' - Porto1 4553 1 74.26 AACACACAAATCAATTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGGAATATGGCGAGGCAGCGGCGACAAACA:1 - chr3L 19154997 3' + Porto1 4451 1 72.28 CCTAGATAGCGAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGCACGTTTACGCACTACTTCGTTGCCATTGGTTGCCTGTTGTCGTTTCCTC:1 + chrX 6036050 3' - accord 7140 2 60.40 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTTGGTAGGTGCCAAAACAAAAATCCGTTCAATTAAATATATATAG:2 - chr3R 11073720 3' + pogo 2072 1 56.44 AGAGAATGCTACAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCTATA:1 - chr2R 10552699 3' - INE-1 574 1 86.14 TGATTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTGTGAAAATTGATCTGATCCCAATTCAAGCTTCTTTCGAATAGCACCGAAAAAATTTCCTA:1 - chr2L 17152548 3' - G5 4577 1 60.40 TTCGTTCAATTTGCTGTCAGATTTATTGTCAGATCTAACGGATTTGTGGCTGGCCCTCCATCTTTGTGGCCTTCCCACAGCAGCGGCAATCAATGTAATTT:1 + chr2L 9922196 3' + GATE 400 1 61.39 GCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGGGAACTGGGGGGGGGGCAGTTAATATGCCA:1 - chr2R 19020951 3' - F-element 4505 1 70.30 TTGGGCTTATGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGAACTGAGGCCATTAAGTTATATTATGCTTAATTTC:1 + chr3R 28678234 3' - I-element 50 1 68.32 CCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTTCTGGGATATCGATGATATATGCTTGATTTGGGATCCTATTCCATTAATACTACT:1 + chrX 15885822 3' - INE-1 536 1 65.35 ACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGATTTCCTTGCAAAATTGAATGCGAAAGGCGAGATCAAATCCTTATGCCCTTTGTGGAACTTTTTCGCAA:1 + chr3L 18731728 3' - jockey 4767 1 70.30 ATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAATAGTTTTTATGTGGGAAATAAAATGTGAA:1 - chr3R 23139648 3' - 297 6968 2 80.20 ACGCACACACACACACATATTTTGCTGGCAGTTAATAAGCGGAACGTGTTGATAATTTTTGCCCCAAAATAGCATAAATCAAAAGTGGGTCTAATTACGAC:1 - chr2R 13678029 3' + accord 185 2 61.39 TAATAATAAACAATCTTACATATATATTCTCAGTGTATGCGTCCTGGCCAGGTTGTCCTTTTTTCGGGATTGCATTTCCGTCTCCCGTTTGCTTATTTGTA:1 - chr2L 17168404 3' + flea 256 1 77.23 TTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAACTCAATTAAGTTAAAGATTTGAAGAGACCTATAAAGAATAT:1 - chr3L 18410917 3' - X-element 4703 1 59.41 CAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTAGGGATATGTGGGGGACAAAAAGAGGACATGGAGGCGATGGAGGCTAGTGGCTTTATTCCTGTCTTGCGGTCTCAAC:1 + chrX 12276378 3' + hobo 1 1 75.25 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAA:1 + chrX 12818891 3' + roo 9037 1 57.43 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCCTATTCAAATTGATCACTTAACGAATCCATATTTTTCTACACCAAA:1 + chr2R 9001708 3' + mdg1 7428 2 55.45 GAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGTATGTGTGTGAGGTAGATCACTTGTCGCAACTTGGC:1 + chr2R 9572010 3' - I-element 4929 1 79.21 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTTCATGAACAAGCAAGGTTTCGACTTTGTTTCACTGTGTTATTATG:1 + chr2L 20387911 3' + 297 6945 2 55.45 GGTAGCTAATTCGAGCGGCAATTTGTTTGTTAAAATTTGTTATGTTTAATTAATTGTTTGTGTTAATCATATGAGCAAATTTTGTGCATTATTATATATAT:1 - chr4 996773 3' + 1360 2983 1 49.50 ATAAAAATGAAATAAAAAAAAAAGTGCCAAGAGCCAACAGCCAAGAGCTGAGAGCCAAGTGCCCAGAGGGCCAAGAGCTGGGACCTGGAAGCCGGGAGTGG:1 + chr3L 6458533 3' + Tc3 1574 2 73.27 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGATATATTTCCTGTTTCTATAGTAATTTAAAGGCAT:1 + chr3L 11335513 3' - pogo 38 1 66.34 TTATAGAAGTTACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACACATAAACGAAAAAGGCAACAACGAGCACAAAGGTGGCGGAAATGTGCACAGAGAGAAA:1 + chrX 9352798 3' + gypsy4 299 1 59.41 TGGGGATGTTGAGAGTCCCTACTTGTTTAGTCGGAAAACGCACGTCGCGACGTGGGATTTCTGTGGAAGATCTTGGAGATTTTCACTCTCGGATTTGT:1 - chr3L 20829265 3' + Cr1a 4063 1 69.39 CTGCGATCCTGCCTTGGCCCGACGAGAGTGTCGCAAGGGCATCGTGGAGGAGATCTACAGCGGAGCAATGTGAAGAGGCATCGGCCTGCTCAACGCGCTTC:1 + chr2L 8514079 3' + aurora-element 3854 1 65.35 AGTATGCATTGTTCCGCTGCGAAGAGAGTCGGCGCTCGTCTTGGTCTTTTTGCCGCTGATTAGCAACTAATTCCGCAGCGACCACGTTGCGTATGAGCAAT:1 + chr2R 20457948 3' - Doc3-element 281 1 58.42 CCTAGTTTACATACGGATCATTTGTTCGGCTCACAAAAAAATAAACCCTAAAAACAATAAAACATGACTATATCGCCGAAAGGTTGCACGACTCACAGGGT:1 + chr2L 2124662 3' + McClintock 382 2 70.30 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGGGTCATGAGCCACGATCGAATTCTCGGACTCCTTGGACCCAAAAAAAAGTATATATATATTTATACCCAC:1 + chr2L 16396660 3' + 412 7539 2 66.34 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTGGGCCGCCGAAAGTGTGCGCGTGCGCTAAGA:1 - chr2L 7991715 3' - P-element 46 1 31.68 TAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATTTACGTGGCTCAATATTAGTGGGAAATTACTCCTAGAGAGAGGAGCTCGGCAGGGGGGAAGTTTCAGTAAATTATT:1 - chr3L 14465989 3' - INE-1 563 1 78.22 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGCTTGCTAAGGAAGGACAGTAGCTTTTCCGACGGACGATCCACCGAGCACTTGCGTGCGGTCCACTG:1 + chr3L 9418528 3' - mdg3 46 2 67.33 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTGAGACCTCCCACAGAAAGGCGAGATTCCGAGAAACGAGGGACCCGGACTATTCAGAATACGTTTCCGTAAACA:1 + chr2L 7767217 3' + hobo 2936 1 74.26 CAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1 + chr2L 16999511 3' + 1360 3325 1 90.10 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCACAAACATATCAAAAACAGTTGACTGATTTTACTGTTCGCCATAATAAATGCAAATTTTCT:1 + chr2L 10687770 3' + hobo 2924 1 62.00 AAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGCAACTTGGCCAGGAGGTCCTTTGCCAAGGACTCTGGC:1 - chr2L 2084837 3' - 1360 38 1 64.36 TTCCTTTATTTTATCGTTGATAAGCAAAATTAATTCGTTCGAATGAATTCGAAACCATGGAGTTTTAATTAATGGTTTTGACAACTACAGTGCTAATTCAG:1 - chr3L 4227819 3' + Circe 6974 1 76.24 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATCAAACTTGTTTAAATCTACTTGCATACTTTAGGGATCTATTAAGCTTGTGGTG:1 + chr3R 27071947 3' + jockey 4979 1 54.46 AAGAGAGTCAAGATTACAGATGAAAGGATAAAGTTATAGTCAGAATCGACAATATGTTTTCTTCCATGATAGTGTACTAATATAAGAACAAGTTAAACACA:1 + chr2R 10974986 3' - Cr1a 4228 1 60.40 GGGGAGGGAAGTAGCATAATATGCTTCACATATTACGCTTACACAAGCATTGTACAAATTAGAAAAAGAGTTGGTTGGTGTGGCGTAGAAGCTCCTCCTTT:1 - chr3R 30756058 3' + rover 6943 1 73.27 ATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATATAGGGGGAAATACCATATTGAAAAGCAATTTTTTTCAAGAACGGATTA:1 - chr3R 7883814 3' + roo 89 2 51.49 AAATATAAACATTTAATAATTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAAT:1 + chr3L 19339398 3' - Tc1 59 1 75.25 GTTCTGCATTGACAACTTGATTGCTTGTACAAAAACTTATGTAAATATCACATAACGTTCAAGGTTACAAAAAGAGTTGCTATCCTTATATACCCTGCACA:1 + chr2L 8293801 3' - HMS-Beagle 6608 1 74.26 TTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCCGAGTGGTGTGAATTGTTGGGAAAAAAGGCATTTCGACTGCTAATTTGCTGTTAA:1 + chr2R 14683464 3' - I-element 399 1 61.39 CGTTTTTCCACGGTGATATTTCAATAAGCCCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTAATGTGTATATAGCTGTGTG:1 + chr2L 8898870 3' + I-element 5014 1 80.20 AAAATAACTGTATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTATACCGACAAAGGTTAAGCGATTTATGTCTATGTACGAGTGCGCATGTCGCCTGTATTCGGCGT:1 + chr3R 15991968 3' - Cr1a 4308 1 63.37 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACATAAACTTGATGATATGGTATAAGTGCTTTTTCCTCTTCAATGGTCCTTCAA:1 + chrX 3195699 3' - mdg1 7063 2 53.00 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAGACAGGCCAAAAGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGC:1 + chr3L 13366410 3' + hopper 1364 1 72.28 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTGTTTCGCACCCTTTAAGACCAGGAATTGGGTTACTT:1 - chr2R 10345614 3' - roo 8704 2 65.35 CTTGCACACACACACACACACACATAGCCACTGTCTGTATGACAGTGGCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTATGTGTGTGTGTGTGTTGATATT:1 - chr3L 16714055 3' + Quasimodo 36 4 69.31 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACATATAATTTCCATAAGAATAAATTCGAGTAAGAAAAAACATATACGAGCTTAGTCAAATTTACGGCCGTG:1 - chr3L 13608287 3' - 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roo 8704 2 67.33 GCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACACCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTGAACTCGCGCGTTTAAATTACGGATTTTA:1 + chrX 7335119 3' + Tirant 343 2 79.21 TGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGCTGTTGACTTTAGTCGGGGTTTATTCAACTCGTATCGGAGTCGCGATTCTGTGGCTTTGCCCCTGT:1 + chr3L 8014127 3' - I-element 5114 1 71.29 TCGCTTTCGATTTATTTGTTTGTATTATATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCA:1 + chr2R 4023378 3' - Doc2-element 94 1 65.35 TATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTG:1 + chr2R 6482734 3' - gtwin 36 2 62.38 AAATTAAAATCGTCTTCCGGCCGCAAAGTTTGAACCGCGACGATACAAACATTTAATAGACAAACAAAAAGCCACAAAAATGTAATTAAAAGCAGCCCCAC:1 - chr2L 13630489 3' + TAHRE 166 1 63.37 TTTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACTGATGGAAAGGCAATTGTATGGTGATTACATTTTGAGGCAAACCAGATAAATTATTCATTCAAGGC:1 - chr3R 8725399 3' + 1360 181 1 65.35 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGCCAGTGAAGGGTTAAAGATGCCGACATTATAATT:1 - chr2R 17269724 3' + transib2 2790 1 65.26 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGACTAGAATGGATAA:1 - 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roo 32 2 64.95 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCTTTTGGTATGGCCGTTCAGCTCGACTACTCTTAACATTACCTT:1 + chr3L 19933714 3' + roo 9040 1 59.41 TACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAAGAAAATTACTAATCTTCTTTCTAATATCGACAGTAATGACGATAA:1 - chr3R 2875034 3' + Doc 446 1 55.45 ACGGCCAAAATTACTCTCTTTCGGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATATGTATATACGTAATGTAAGGTAACTAATGGTAACGTACA:1 + chr3L 1491074 3' - 1360 3316 1 61.39 ATTAAAAAGCGAGGAAGAAGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAGATTGGTGGAACTTCTCCATGTAAATTTAGCAAACCAAAAGGACAAGTTCCGTGCA:1 - chr3L 12778309 3' + invader2 449 1 69.31 GTATACATTAGGGTAGGCTGGGCTTGTTATTGTCACCAGAATTCGGGTTCTTATTGGATACATTAAGAAATCATAAGGCGAACGCTCGGTGCATGGGTGGG:1 - chr3R 24690793 3' - Quasimodo 162 2 62.38 GATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTACGTATTTGCGACGAAATCGATGGCTGCAACTGGCAACAATCTGTTGGAGTGTGGCAGCTGCAAAAATGGTTG:1 + chr2R 13956288 3' - Tc3 1649 1 78.79 AAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACAAGTTCATTAAAAAAGTTAGCACAAAAGCAGCAGAAAAAAGG:1 + chr2L 18029946 3' + I-element 418 1 59.41 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTTCAACCAAGAATGACAACAACAAAGCAAACAGC:1 - 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chr3L 7065590 3' + 17.6 7215 2 58.42 TAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACACAAAAGCCTCGTCTACTACGATTATAATAACCAAATGCATCTAACCACAACTAACC:1 - chr2L 2791103 3' - I-element 387 1 63.37 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCGCTGG:1 + chr2R 17346029 3' - hobo 10 1 66.67 CGATCACGGACTTAACTCACGCCGAGATATAGGTGCTCATGCAAATGCAGATACACACATCGGTTATATGCGAGTTGGCAACTTGAAATATTTCATTAACT:1 - chr3L 9120404 3' + Tirant 403 1 29.70 TTTTTTTCTTTTTTATTTAAATCAAGGCCCCCGAAAAAGGCGAGAAAAATGTTAAACAAAACATATTGCCGCAATTGGAGGCCATGTGCGGTGCGGCAAG:1 - chrX 14627784 3' - TART-C 11099 2 78.00 ATATTCGGAAGAAGATAGTTCTAGAAGAGCAGAAAAGGCATGTGATGGCACTGGTACAGCAAGTGCTCAAAATGTTGCGAAACAGATTTAAATAAATTATA:1 - chrX 15401902 3' - Gypsy12A_LTR 2039 1 67.33 CATTTAATATGACCCCAAATAAGAATTCAAAAGCTAAGAGCAAGCTTCCAGAAGTTTGGATTATTTCTATCCAGATAGGTATTAAGCACCATGTACGCCCT:1 - chr2L 9089312 3' - Gypsy12A_LTR 81 1 53.47 TCCTCTTTAAAAATTCTTTATCTTGTAATTGCATGCATCCAAATTCTTCAGCTCGGGATCCAGCTGCACTTACAACTCGGCTTCAACCTGGCTTCAATACG:1 - chr2R 9675028 3' + Q-element 440 2 55.45 ATCGACACTTCTGCGCTGCGCCGCGGCCGACGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACGACTTCACTTGATTGCTAGGGACTCGGGTGACAAATACACGGTAAAAA:1 - chr3L 3534477 3' + HMS-Beagle 89 2 76.00 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACACAACCACACACACACACACAAAG:1 - chr3L 10299270 3' - hobo 17 1 64.29 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGTCGATGATGAAATCGGATGCCATACGCTCCGGGCG:1 + chr2R 18036677 3' + blood 7349 2 64.36 CAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATGTGCAAAATATATACGAGTATGTGCCAAATTGTCGGTGGGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 17971844 3' - X-element 4409 1 58.42 AACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATTCCACACACACTCTCACGACCCAGTCGAGTGTAAAGACACCCCGCACCAAATCCGATTTGCACACG:1 + chr2L 9299743 3' - 1731 4323 2 66.34 TATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAATAAGGCTATTAAATTACGCAATCAGTGGACAACGAGGCATT:1 + chr3L 12240975 3' - Juan 4092 1 59.41 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTTAGTGAAAACGATGGAAAAAATCCATGAAATGGGCTTCAAATTTCTTCTGATTTT:1 - chr3R 4945620 3' + 412 474 2 61.39 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGTGCCGATGCTGGCCAAGAAGGGAAC:1 - chrX 14397147 3' + BS 5045 1 75.25 TTTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCA:1 + chr3L 24916688 3' - Porto1 151 1 55.45 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCGCTAATGCCCCTGTCCAAGTTGCGGGCTAAAGTGCGTGCATCGCACAATGTGCAACATG:1 - chr3L 21782030 3' - roo 16 2 63.37 ATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCATTGGCTAAAAATATATACAAGCTCAAGCTCTCGGAAGGCAAAGCGGTAGA:1 - chr3L 25255842 3' + Burdock 312 1 58.42 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTGAGACCTCCCACAGAAAGGCGAGATTCCGAGAAACGAGTGACCC:1 + chr2L 7767188 3' + hobo 2931 1 62.34 CAGATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGT:1 + chrX 22386752 3' - hobo 95 1 72.28 AAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAACTATTGACTAAACTGCATCACTTTTGATTTTCTCGACCATTGAATTATATTTGGTTTGCTCTAAGTGGA:1 + chr2R 9312234 3' - hobo 2475 1 72.28 GTTGATCTTAAGCAAAAGTGTTGGAAATATAAGAACTAATCGCTTTGCCTTAACTTATCGGCCAGAGGCACTTCAAAATGTCTTGATAATCAAAATGGAGA:1 + chr3R 25899881 3' - frogger 202 1 68.32 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATATCTTATTGAATGATATGAAAAGCATTTCTATGTTAATGGATTTGTCA:1 + chr2L 18188467 3' - Doc 34 1 53.47 CCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGGAATGGATGGGAGGGATGTTGGTTCTCCATGTTTATGGATGGTTTTTTTTTCGTTCTTTTAAGCATGTAAAA:1 + chrX 1018465 3' - transib2 8 1 68.32 TCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAG:1 + chr3R 8914535 3' + roo 365 1 62.38 TGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTATTTGACACTCATACATTTGATAGACATACAC:1 - chr3L 21912242 3' - Bari1 13 1 65.35 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTTTTTTGTTCTTTTTTGGGGGCCGAGTGAATAGCAAACGGAAAACGGATGAAAGCTTGACTCG:1 - chr3L 13164659 3' - pogo 12 1 62.38 TTAGTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTTTTGAGCGATTTTCCAACGTTAAATTGTACTCATCCGCAGTTAATATTCAACCAATATGCATTCACTTGGA:1 - chr2R 17483403 3' + Tc1 141 1 76.77 CGGAGCTAAGAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGCTGTGACAATATTTGCATGCCAGCTCGACTCGCACACTCTTGCTGGGAGCG:1 + chr3L 6268959 3' - F-element 380 1 54.46 TTATTGGCTTATTAATTTTTCACACGTCGCAAGCTGTGCGAGTGTTTTTGTCTGAGTTTGTTACTGATAACGCTCGGTTGAAAAGTGTTTTTTATTTATAC:1 - chr3R 11126417 3' - 1360 437 1 67.33 AATAATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTAAATCGCAAATAAACGTTTTTAGCATATTCTTTAATAATTATTATTAACATTAATAATACGATAATTTCT:1 - chrX 12151585 3' + diver 210 1 64.36 TTGGGCCTACTTAAAGAAAAAGGTGGAAAAAAGGCCATTTGTGATTAACGGGGGGCATTGCAAATCCCCCTCCGTTTTCTAAACAACCCTTTTGGAATTCC:1 - chrX 7640147 3' + S-element 1258 1 61.39 CAGGGAAAATGGGCGTGGATTTTGTGTTGCGATGAACGAAGTCTAAGTAAACCTGTTTTTAAATTAACACAAAGAAGACTCTTATGCTCATTTAATCTGAT:1 + chr3R 28947105 3' - Circe 151 2 65.35 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAAGTTTTTGCATAACAAATAAAACGAATCAAATTAAGAGGTTATTCAG:1 - chr2L 3988495 3' - I-element 9 1 78.22 GCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGACGTATGTGAGGTGGCGGTATATTAAGGGTACTTAAGCTACTGTTAGTGGGGTTTGCTGGCCCGCTGTT:1 - chr3R 11376240 3' - 297 6529 1 70.30 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGGATCTAAAATAGCATTTTATCGTGACTTAGAGGCATAAT:1 - chr3L 18034176 3' - Doc 42 1 58.42 GAAGTTATTTTCAAGTATATAATAATTTTTTTTTTAATAACGAATACTCACTTAGGGTATTACAAGCTTCGGTTCCCAAAATTAACCAATATTTCTCTTTG:1 + chr3L 5390397 3' - mdg1 6984 1 73.27 GGGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTGTGGCGTAACCACGTACACCTTCTCGTTGGTCTGCGGCAGGATGGCCACCTGGGCCTGTTTCCACAGCT:1 - chrX 19234679 3' - jockey 4748 1 73.27 TCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGGGTGTCCAATTCAATAGTTGTCTATGGCCTAAACAATTAAGCCAAATACTCGTGTGTGCACT:1 - chr3R 7870123 3' - jockey 4752 1 62.38 TCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCGAATAGCAGTTGATGGGTTGGGTAAAATGGCTTAAAAAATAAAAACAAA:1 + chr2R 17897723 3' + transib2 2412 1 51.49 ACCTTCATACATTTACACACCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTTAAATTACGCATTTTAATTTTCGGCAATTG:1 + chrX 7335133 3' + Tirant 357 2 67.33 AGCGGGAGAGCAGGGGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGCATTGGCCTGGCGGAGATTGGCAAAGAACTGCTGGCGACGTGGGCCACCTCC:1 - chr3R 25966637 3' - F-element 368 1 63.74 CACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTCACTAATAAAAACTTCAAGTTTCGCAGAGTGTGCGATGGTAACTTCCCA:1 + chr2L 1823524 3' + accord2 7288 1 62.38 ACAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAACAGCCCAAGGCAAATTTTACACTGCCATGTGCTTGCCTTTTTCACGA:1 - chr3L 16105983 3' + baggins 5402 1 67.33 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCCAAAGAGGTGATTGCCGTTTAAATTACGAAATCATGCATGCGGC:1 + chr3L 5085073 3' - 412 7082 2 55.00 GTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTGTTTTCATGTGTGTGACTGCATGAGAGTGTTTGTGTGT:1 - chr2L 4115645 3' - I-element 264 1 62.38 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACAGCAAATTTAAAAGAACAACAATTAGAAAACGCAATTAAAAGATAAATATACCCGAGTAAAGTTCTT:1 - chr3R 31188714 3' - I-element 9 1 70.30 AATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAGGAAATTGCC:1 + chr3R 8914544 3' + roo 374 1 52.48 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTTTGTATAAATACAAGATTTATATATAATAAATCATTTAAGCAAAGTTGTTTCAAGTATATTGTTACTA:1 + chr2R 9957328 3' - Transpac 6 2 73.27 GGCTCTGGTGTCCGAGTCGAGGCAGTACAAACCTCCTGCCTGAATTTTTGCCTTGTGTTTGGCTTTTAAAGCCCCAGCCACTCCACTCCATTCATTTTGTT:1 + chr3R 22965466 3' + Rt1b 252 1 65.35 ATTTATGGCATTTTACAATTTCGGATCAGCGGCAGTTGTGCGCGCTTTAGTTAGAGAAGTAGGTTTAAGATTTACAATTTGCTTAGCCTTAGCATTGCCTT:1 - chr2R 7776884 3' - TART-B 10422 2 71.29 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTTGACCAACGGCAACAGTTTTCCACTCTCATATTTTGCTTTTGGTATTTCGCTTT:1 - chr3R 20868708 3' + Transpac 291 2 60.40 TTGTAGGGTGTGAGACGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCTTACTTCATCAAAGGGAGAGGGTAAGAACATGTTTTAACTGTGGGG:1 + chr2R 4545982 3' - hobo 30 1 51.49 CCCTTACAGAGATTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTCTTACCTCTAATCCTGACTGTCTTCCGGTCTCTCTTTCCCAACTTGTATACCCTTTTC:1 - chr3L 25481538 3' + Cr1a 4183 1 57.43 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGTTAACCACCTTCGTCATCTTCGCACGATGA:1 + chr3L 14152180 3' - blood 7025 2 65.00 AAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAGTGTCGCGAAATTTCTTCGCGCACCGTGATTGGCTCAGCCGGCGAACATTACGGCGAAATACACAAGGGC:1 + chr2L 16033149 3' + G-element 71 1 78.00 CACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGAAAATGAGGAATTTCGAATTTGGATTTGGAAGCCAATATCG:1 + chr3L 4246639 3' + Doc 494 1 56.16 CGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGGGTACATCCGAAGTGGTGTATGTGTGTGTGTGCGACTGAGCATGCAATTTGAATTGAACTTT:1 - chrX 21006791 3' - Idefix 6938 2 63.37 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTCGACTCGAGACGCAGAAG:1 - chr3R 10978688 3' + roo 9049 2 59.41 AGTTGATATAACATAGTAATTATTATTAAAGGGTCTAAAGAGGATATATTGTTAGCTATTGGTCAAAATCCAACTGTTATTATAGAAACTCACGTTTTGTT:1 - chr2R 9713096 3' - jockey 4842 1 76.24 AAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGATGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCATTGGTGCCACGCCTACAC:1 - chrX 21667975 3' + Tabor 7323 2 69.31 AGAGGCCGCAGGGATCCCGATATTTCCCTTTTTGCGCACGGCACAACTGACTCCTGGTCCGTGTCCCAGGACTTCTGCTGACTTATGCGATGCGTCGTGC:1 + chr2L 15976089 3' - gypsy8 325 1 58.00 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGACAAAGAGAGCGGCAGTCCCGTTACGCGCTGTTAACGCA:1 - chrX 10629204 3' - P-element 35 1 45.54 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGAAACTTAAAACTTTACCACTCCCCCCATTCGATGGGTCAAAGG:1 - chrX 19850422 3' + pogo 2069 1 66.34 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATT:1 - chr3R 19589922 3' - BS 5020 1 51.49 AAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTCTTACTCTATAAATAAAATACAAATTTGTCCTAGTATTTAGTCAGTTCCGTAAAGGGTTAATGTGTAA:1 - chr2L 3802286 3' + Doc 88 1 76.53 TCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTTATTTTAATAAAGACTTTTAATTGAATTTTCAATTGTTGCGCCGGCTTTGATGGGGCCATGCCATCGCAG:1 - chr3R 6135193 3' - I-element 3 1 76.24 AATATATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGGAAGAGCCTTGGCTTTTTAGCGTGCAACGGGGCGTATGCGT:1 + chr2R 9507736 3' - G4 39 1 70.30 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGTCTGTATACGGATATATGATATGCCGCCCAATGTGAAACTTCTGT:1 - chrX 5151922 3' - 297 6603 2 64.36 ATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCATCATAATCCCTTCGATGACCGCGTGTATATAACATAAAGTTGATCAAA:1 - chr3R 26135396 3' + Max-element 263 2 58.42 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATGCGAGTATTTGTGCAGTCTTTTGTTTGACTGCCAGCGAAATATG:1 - chr3L 8460342 3' + copia 240 1 56.44 CGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACACCTATGGCAAACAACTTCATAAATTCAACTCGAAATGTAATAAAACAGACCCCATAACAATATGTGTTTC:1 - chr3R 756860 3' - gypsy6 7423 2 75.25 TCTAGCTTTTATAGGTACTGAGATATCTACGATTATAAGGACGGGCAGACAAACGCAGATGGCCAGATCACGTACGTACCCTAATATTCATCGTATTCAAA:1 - chr4 972008 3' - INE-1 153 1 69.31 AATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAAG:1 - chr2R 6438337 3' + Stalker4 388 1 60.40 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAACTCCAACTGTTTTGGCCCTCTCTTTCGCTCCTTGCAGCGTCGCCAGTTGGGCAAATGCTAA:1 + chr3L 6832954 3' - blood 166 2 68.32 TTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACAAAACAAAGAACAAGGAGAAGGTGGATAAAGTTCAAGTGCTAGTGTCAGTCATGCCTAAGC:1 - chr3R 17874961 3' + I-element 91 1 69.31 GTTTACTATGACAAAGTGTCACAATGTATTTATGCAAAGTAGGACCTCATGTTAATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAG:1 + chr3R 19446222 3' - Stalker4 7027 4 69.31 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCACCCACCACCCACTGGGACTTGCGTGCGGCACCTGCGTGTGCCGTCGACGTTTTCCATTTGTTT:1 - chr2R 16478428 3' + hobo 2925 1 65.35 AAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCACTGACAAAATCGTACAAAAAGAGTCACAAATAAAGGCGAGAAA:1 - chrX 17309363 3' + mdg1 7139 2 56.00 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAAACGCATAAACGAGATCCAAGATCCAAGTCAAGGTGGAAGCCAAAAACCA:1 - chrX 18991519 3' - pogo 22 1 55.45 AATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAGGCTCTTTGAATTTTCTGTAAATAAAATAAATTAAATGGTGGTTCTGAAACAAT:1 + chr2R 17292542 3' + Tabor 461 2 53.47 TCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGCT:1 + chr2R 5531207 3' - 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chr3R 20477033 3' + Doc2-element 4565 1 54.46 AGCTAGGGATAGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTAGTTTTTTTTTTTAATTAATTT:1 - chr3L 21690537 3' - Cr1a 3994 1 63.64 AAAGACTCGCAGCGTCCACGCAAACATGCTGTGTTTGCCGGCTGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTACCTTGCACATGTATTATTCTTGAATTT:1 - chr3R 3269651 3' - Gypsy6A_LTR 116 1 56.44 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGTGTCATCCACTCGAACACATCCTGTTCTGTTCACCTCACAATATGCATACGCCATCGCC:1 - chr3R 8914462 3' - roo 8680 2 63.37 AAATCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGTACCTGAAAATAAATCAATCAAACAATGTTAGTCTTAAATCTTAATGTTTTTAAACTAGACCAATAAAAT:1 - chr4 424460 3' + HeT-A 5727 1 76.00 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCCACTTTTAATGTGGTGAGGTAGGAATGTTTCATTGATGTGTGTGTGTGTGCAAATCTCCAA:1 + chr2L 11805096 3' - P-element 14 1 63.37 CCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGGAGTGCCGGGTATTACGTGTATGAGTTATTATTTTGAATACTTCTGTGGAATTTGTGAATATATTTTTTGGTT:1 - chr3R 7758181 3' - I-element 5005 1 76.24 TGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATTTGGATCTTTTGATTTATGCACTAGTTTAAACAAATTGCAAATACCAATCTCAGCG:1 + chr2R 4017918 3' + Doc2-element 4721 1 80.20 GGGAGAGTCAGATAAATTGGATGCAGCTAGCGAAAATGTTCAGAACGCCTGGAAGACGATGATGATGTAAAGAAGGAATGCCGACGGACAATTAGCGTTGG:1 + chr3R 17206720 3' + Bica 4704 1 81.19 AAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGGGAAAAGTGAACGGCAGTACATCGCAACAGCCCATTAGCCTTTAATGGGGCCAAGTTGCAAGA:1 - chr3R 14952859 3' - Doc 253 1 69.31 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGCTGACAGCCCGGGTTTTATCTTGACCGGCCCCAAAAAGTAGGCAATACAATTTCAGATCAATGCC:1 + chr2R 21415217 3' - jockey 19 1 65.35 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTATCTTTCCTACTCATCATCACTGGTAACGAAGCTTTATTGCTTGCAACCGCTAGTTCTCTTAA:1 - chr3L 16680663 3' - FB 15 1 65.35 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAACTCCATGGCGACTTTAAG:1 + chr2L 16136644 3' - hobo 55 1 79.21 ATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTAATTTTTTCTGTGTTTTAATTTATTCAGGCAACTACAATATTTAATTCTCTTTTCGT:1 + chr3R 26118191 3' - hobo 2556 1 58.42 AACCGCCCTAAAACCGCCCAAAACTGACACGCCTACATTTTTGAACCATTTTTCTATATTTTTTCACAATCTTATTAGTTTTGTAAATTTCTATCGATGTG:1 - chrY 1803419 3' + INE-1 343 1 73.27 ATATTCGTGTTCAGGTGTGAACACATGTTATAGCGGTATTGTTAAAGTTCTGCTAGAAGAATGTAAAAGCATGTGATCTTAGTGCTTACTACTGTTGTA:1 - chr2L 7504843 3' - roo 2 2 71.72 TATTGTCACCAGAATTGGGGTTCTTATGGGATACTTGAATTTATGACATACATTTCGTCACAATGCACTTAACAAGGCCGTTATTCTAAATATACCCTATT:1 - chr3L 15216348 3' - Quasimodo 135 2 58.42 TTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTTTTCTTATCTGGAATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTCGTGTGGTTGGTGGTGCAGTTGGGTGGTGCA:1 - chrX 5257307 3' - Idefix 6947 2 73.27 TATATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAAG:1 - chr4 829449 3' + INE-1 77 1 80.20 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTAGTTGAGTGGAAATATGACAAGGTTTGAGGAGTGAGAAACTGATTTAATGGAAATATTTCAATACTGAA:1 - chr3L 3635392 3' + roo 9063 1 70.30 GTAGGTGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCTAGTGACTTTAGTAAGCCCCCCAACCGATAATTCGCTGTAGACACTTCAGGGTCGTCAAAGAGC:1 + chr3L 9334676 3' - baggins 5014 1 57.43 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAGTTTATCGGATGAGTAGATCGTCTTTTAAATCATGACCATACAGAAACCATAT:1 + chr3L 23090560 3' - 1360 21 1 96.04 TCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTTTCGTTTAATAGGATATTTCCTGTTTACAACCTGACCATAATTCTTACAATTTTA:1 - chr2R 16980243 3' - opus 7328 2 64.36 TGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCACTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTTGCATGCTAGGTCAGTTTTTCGTTGGGCTAAGCAA:1 + chr3L 23937076 3' - 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hobo 23 1 55.45 AGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCAAAGGTCGTGACCGTTTCGGAAGTTTTATATATGT:1 - chr3L 22983130 3' - transib2 2612 1 65.35 GCTCCGACGCACTATCTTCTTCCACGTGCGATCTTGCTGTCTCACTAAGTGCAGCATTTCCATTTCGATGGTAACAAAATCAAAGTGAAAACTGTTCTCAT:1 + chrX 12309401 3' - gypsy8 405 1 58.42 GCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTAATAGCTTATCTCCATCGTG:1 - chr2R 17402736 3' - invader4 52 2 76.00 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGGAATGCAAAAACTGCAGGGGCCATTGAAACAGAATTTTTATATACCCTGGAGGAAAGTCCATAAAGGCTTT:1 + chr2L 12908452 3' - hobo 4 1 74.26 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACAGGGGTTGGTACGGGGTCGGATCCTGGCT:1 - chrX 409603 3' + P-element 2840 1 33.66 ATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGGAGAAGTGGAAGCGCTTGAATATTTTTTGCATTTCAAAGCCAAATGCGCGACATTTTTATTGT:1 - chr3L 13779269 3' + transib2 2813 1 66.34 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACT:1 + chr3R 25443117 3' + 297 6944 2 68.32 TTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATAC:1 + chr3L 5267270 3' + Juan 4179 1 61.39 AAGTGGTTTCTTAATTATGAAGTACAGAAGGAAAGCCCTTATAAATTATTATTTTAATTTTTGCAATCTTATCTTTAATATCAAGATATTCTATACAACAT:1 - 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Doc 35 1 51.49 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCACACGCACACACCCACACATAGCCACACACATACATCAAGTTTTCACAAAAAGCAACGCACGTGCG:1 - chrX 6146637 3' - hobo 10 1 69.31 TAAAAAAAATAAATAAATCCAATGCAAAGTTATTAAAGTCGTAAAAGTTTGAACCAAACCTGTTGTAAACATGAAAATGAAAAGAACTCAAAAGTCTAAAA:1 - chrX 11278257 3' + Doc3-element 83 1 63.37 CCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGAGTCATGAGAAAAATGAGAACTTAGATCGACTGTAATTATTCGCACATGACTTTAAACACTATGGACACTGT:1 + chr2R 2706033 3' + hobo 2681 1 54.46 CCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACAGTCAATACGCACAACTTCTTTCTTCAACGAGC:1 + chr2R 4023414 3' - Doc2-element 58 1 74.26 AGATACCTTTTCGCTACAGACATTAATGAATAAGATCAGGAATTGACCGTGCTTGCAACAAAAGAAGAGAATAAAGCCTGGCCAAAATCTGCGAGCCGTTT:1 + chrX 11493282 3' - Gypsy12A_LTR 2145 1 69.31 AGTCGGCTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGCGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTTTAATCTACCGCTTGGGGGGCAT:1 + chrX 5752277 3' - Doc3-element 4556 1 77.23 TAATTTATTTAATTGTTTAATTGTTTTGATTGTTAATTGAACTGTTTTTTTTTTATATAAAAAAACATAGCTGCAAGCTATCATATAACTTACATGTTCCT:1 - 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F-element 45 1 64.36 AAAAAAAAAAGAAAAAACAAGTGCAAGTGCAACAGCAGCATGTGTCGCCGCCGCAAGGCGGCAAGAGCAAACAGTAGCAATAGCTGCCATTAGGCCATGA:1 + chrX 11783460 3' + Porto1 165 1 76.00 GATTGATGGATATAGTGTGGGAAAATGGATTTTCCCTGAAAATTGTTTGATATAGTAAGTCCCTGTTAATAGCCTTACATTTTTATTAGGTTTTTACTGCT:1 - chr3L 14319247 3' - 297 6524 1 72.28 GTGTAATGTTGTTCAATTGTATTAGAAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTACATCACTTAATTATTTTCACTTACATCGACACACA:1 - chrX 4155424 3' - TLD2_LTR 71 1 64.36 TGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTAAAATTGGAGCTGGTGACAGAGAACATACG:1 + chr2R 979477 3' - Ivk 348 1 70.30 TATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATTATCCATAAGTATATGACCCATAAACTATTATAGCACTGTAAAACTACTATATTT:1 + chr3L 3387570 3' - hopper 1348 1 61.39 GTATTATATTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAAAATATATAGGAAAATCTAATCAAATTGTGTCAAAACACAATTCTT:1 + chr2R 8510514 3' - I-element 4923 1 55.45 AAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTAAAAGCTCCGTTTGTGCGATGCTGTGCACACGACCATATCCACCCATTCCCAT:1 - chr2L 903696 3' + jockey 90 1 58.42 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGCTTTAATGAGTTCGGGATTTAAATTAAACATGTGCAATTTGAATTCCAGCGCAACTTAAAAT:1 - chr2R 21860473 3' - roo 14 2 66.34 TCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCAATAAAATTGATTGCGTTTAAGTGTAGGAAAAAATCAAATGCGAAATTTGCCAAAGTGAGTATC:1 - chrX 9214040 3' + Quasimodo 7130 2 67.33 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCAATTGATTTCGAATTGCAGCAGTGTCAGAGGAAACGGGAGTCCTGTCCAATCG:1 + chr2R 11372265 3' - roo 22 2 57.43 TTTTAATCGCAATAACATCGTTTGCCCATCCTTTAGAATTTTGTATCCGAAACGCCTTTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTTGCTGACTGAGTTTGTTCCATTT:1 - chr3R 20302808 3' + FB 194 1 66.34 CATCAATGGCTGTTTTGAGGGAACACTTTCCAGAGCGCCGAGGAGAAGCCTCCGCGTACCATCGAGGAAAGGATCGAGGAGGCGCAAATTTATCGCAAATT:1 + chr3L 205202 3' + mariner2 495 1 66.34 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTTCGAATTTGGTATAAG:1 - chr3L 9174677 3' - 412 7080 2 52.48 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATTTGAACCAGAAAAGAGATACATCTTCATCT:1 - chrX 21668249 3' + 412 7503 2 67.33 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTAGCCCTACGTTACGTAGCGCCCGCTACGTTAGTGCGA:1 + chr3R 28330909 3' + P-element 2847 1 39.60 GAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTT:1 - chrX 14317416 3' - 1360 50 1 85.15 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTTCGAATTTGGTATAAGGATGGGG:2 - chr3L 9174670 3' - 412 20 2 59.41 TGCTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCATGTGTCCGCCTATCCGTATGAACGTTGATATCTCGGCGGTCAGGGCTTGTGTCCTGAACCCT:1 + chr2R 11781994 3' + INE-1 91 1 70.30 ATAACGAGAATAGTGAAGAGGAAGAAGGGCGTCCTGATGACTCTTCGACATTTATCAGGACCTTGTTTAATTTGGCCAACAACAATTCGAAATATGTTTCT:1 - chr2R 3144067 3' + invader1 3983 2 50.50 GATGCGCTCTTTATTAAGTACAAAATCAAACTGAACTTAAGGCTAACAAAATATTAATTCACAAGGCGGGTGGCTAAAGTCTTAAAATGTTCTCATTCCAA:1 + chr3R 7627362 3' - springer 7300 2 55.45 TCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGTCATGTATCGCTTGTTGTACGACACAATTACTTTACCGTTATGCCAGGTTCTGGGTCAGCTGTGCGCATGGGCA:1 + chrX 22480785 3' - Cr1a 4418 1 74.26 CGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTAATGAGTTAGATTAAAACTGGCGGATGCGCGGCTTTTCCGGAGCCAGTTGCTC:1 - chr2R 10744455 3' - 1360 3290 1 55.00 AATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTATATCATACGATCAGTGACCAATTGTAAAGTATATCATAAGTTTTTGAAAAGTACTCGGATTGTA:1 + chr3L 4136495 3' + jockey 401 1 67.33 CGGGGACAAAAAGAGAATTGAATTTGCGTTTGAATATTAACATTCAAATACGCGCAATTTCGGTGTATATTTCCGAGTAACTAAAATTTATTTATATAAGA:1 + chr3L 6550840 3' + invader2 376 1 72.28 CTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAGGAAATTGCCTGCAGTTCCTGGCATCGAAA:2 + chr3R 8914564 3' + roo 394 1 67.33 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATCATTTAAAATAAAATAAAAAGTTTGTTCGAATCATTTTT:1 + chr2L 18093867 3' + roo 9034 1 66.34 AAAAAACAAAAAACTGTCAAATGAGCAAAGAGGCGGAAAAGATCACGATCACGAAAACATCATCATCAAAGGGGCTGCTCTCGAGATCTCTGAACAAATTT:1 - chrX 3188661 3' - accord2 345 1 62.38 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTATATTACAAGTATGAAGAAATTTTGAATAGGTTGAATATCAA:1 - chr2L 21266581 3' - FB 36 1 58.42 TGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTTTTGATAACGCGACAGCGAGCGAAACAGAGATAGAGTGATATCGAGTGAGAGTGAGTACAATAT:1 + chrX 20794203 3' - G6 1834 1 79.21 CTAACAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTTTGCAAATGGCGTCTGGTTCAAAGTGAGATTGGCACACATATAGCTCTGCAG:1 + chr2L 19747224 3' - Doc3-element 4669 1 55.45 GACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTAAAGCACATATAATTATTAGTTTTGTACGACTTTTAATCAATTTTTTTTTGTGTTGT:1 - chrX 19080268 3' - Ivk 20 1 53.47 TTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTACCTTTTGTGCCTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTGTGGTCTGGTCTGAATTCATTAAAGGTTTTTGGG:1 + chr3L 13868338 3' + Cr1a 199 1 66.34 AAGTGTCCGTGGCCAAAAGAAATAAAATGAATAAATTCAAACATTACAAAAGCTCTTAAGTCTTTAAAACCAAAGTTTTAAGTGCAAAATAATAGGGTTCG:1 - chr3R 28144029 3' + Stalker4 486 1 53.47 GAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACTAAATTTGTGGCAAGCGAGCGCAAAAAGGTCCACAAACTGCGAACTTAATGATGGGTAAAGAGGATTCA:1 - chrX 21256332 3' - BS 4752 1 76.24 TTCCGTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGGTTTCCTTTTGGCTTA:1 + chrX 10279947 3' - Doc2-element 244 1 80.49 TCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATAAAGGCCATAGTAACAAAGAAGC:1 - chrX 10824051 3' - jockey 4712 1 74.44 GGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTTTTTTTACATTCATAATACACATAGATATAAATGTCTTTACGCAAGGACTGGCGCAAAACAACGATGGATATTG:1 - chr2L 17066776 3' - copia 4870 2 78.22 GCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACT:1 + chr3R 1977615 3' + micropia 419 2 59.41 TGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTATAAGTTTGATTATATTTATTTGATCTTATCCATAACAGTGAT:2 - chr3L 21275757 3' - Quasimodo 28 2 63.37 ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTAACATAATATAATTGCGAATTAGTGCGACCCACCTGCTCCCGCAC:1 - chrX 13031809 3' + flea 4988 2 56.44 GACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGTTCAAATATAAATATTTAACATTTCAGTGCAAATCGTCGAAATTCCGTTTTAAG:1 + chr3R 8539720 3' - Ivk 323 1 55.45 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTAAATCGAAAAACAGGTTAAAAGGCTCATAAAATCTGAAAAATACAAAGAA:2 - chr3R 6425827 3' - copia 4894 2 52.48 ATTTGTTTGTATTATATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACAGTCAATACG:1 + chr2R 4023391 3' - Doc2-element 81 1 52.48 GCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAAAGAACTGGACCATAGCATTCATCCTTGTTTTCGGGCTTTGCAAATCTTTGCAGCTGGCGTTGAAAGTTTGTCAT:1 + chr3L 9757723 3' + INE-1 546 1 57.43 TCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTGCCAACTAAAGTTTACCTCTACACATTTGAAAAATGTTAACTTTTTACACTTTTCACTTAG:1 - chr3L 15450952 3' + P-element 2793 1 66.34 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGAACCGAGTTTTCCCGACC:1 + chr2L 9699245 3' + P-element 2830 1 22.77 GCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTCTGTGTGTTTGTGGGATAGTGTGTGTGTGTGTGTTTG:1 + chr2L 11705654 3' - accord 7158 2 69.31 GCGTAATACGCACGTCTTTTTGCATATCTATGACATGCAAAGGAGGAGAGCGTGGGACACGAGTGATTGCATTGCGGCCAACTGCAGCGTTCCAGCAGACG:1 - chr3L 16031126 3' + Rt1a 15 1 53.47 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTGCTAAACTTGTTAAATGCAAGATATTTTTAACAGACCTGATAGGCATCGACAACCAAGCAGAAA:1 - chr2L 23374495 3' + flea 247 2 72.28 GATTTTGTTTTATTTCATTTTCGACTCGCTTCGTTTCGATGCAAATCAGCTGATGGCCTGACAGTTGACCAAGTTGGCACAGTGTCCATAGGGTATTCGTC:1 + chr2R 8307825 3' + transib1 1899 1 75.25 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGACAAAGAGAGCGGCAGTC:1 - chrX 10629225 3' - P-element 56 1 24.75 ATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGCTGGGGGATTTTTATTAAAATTCTTAGACTTATTGCTAAAGTATTTACAAGAATTCCATGATTT:1 - chr3L 10669138 3' - F-element 4391 1 74.26 TTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACATGTTGAATATATAATCTCTAAGCTCTTTATTTATAAGCTAACATACA:1 + chrX 6156234 3' + 3S18 310 2 51.49 AAAGAAAAAAAGAAAAAGAAAAGAGTACCAATGGGCAGTAGGGGCGCATAGAATGGGAAAGTTCAAGGTACTTTCGTGGGGTTTCAGCTCGCTTCTGGATG:1 + chr2R 10548649 3' + Doc2-element 233 3 70.30 GTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAATTATTGGTATCAATACGATGTCAGTGAAAGTGGATCGCAAATGTAGG:1 + chr2R 9007290 3' + roo 379 1 57.43 GTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAATAAGGCTATTAAATTACGCAATCAGTGGACAACGAGGCATTGGAGCGAAAAATGCAATTATATC:1 + chr3L 12240998 3' - Juan 4069 1 64.36 AGATACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTAATTTCGTGCAGTCATAAGTTGCCGCCAAATTGTTGCATTGTACCTGCTGCGAGACGCAGGGAAATCAGATTTAA:1 - chr2L 21778992 3' - Doc3-element 424 1 63.37 TTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAATGAAGATCCTTATCACCGCTGCAATCCACACACATTGCCTTTTACCCACGACTGGGCAGCCAC:1 + chr3L 13638917 3' + TAHRE 10414 1 52.48 TTGATGCTAAGATTATCTTTGATTTGGCACTTTATTGAAAAACATGTTGTTTTCAGGTAAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - diver 5624 1 46.53 TCTGTCCGTATGAACGTCGAGAACGTATCCAAGCGAAACAGTTAAACTCAGAAGAAAAACAGGCACTGCTTTCAGTCTGCTGAAAAGAAAACTCGTACCTT:1 - chr3L 23652973 3' + INE-1 130 1 77.23 AATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTATGCTAATTTCATTAAAAAGAATCAACAGATCCGGCTTGTTGATTCGCTTCCTGGCGGAATCATTCACTTTTCCG:1 - chr3R 30257183 3' + gypsy 15 2 79.21 TGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTTGCATTCTGCAGGTGCACAGATGCACCCACGAAAAACAACAGGGCAGCGACAAGGTAGGCTGGGGAGATTATTCCATT:1 - chr3R 29083833 3' - Doc3-element 376 1 66.34 GTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGAATGAGAAAGCGACATAATGAAAAGGGAATGACGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGGAAA:1 + chrY 2720362 3' + micropia 5211 1 48.51 ATAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACTCACAAAACTAATATAGTCAATAAATGGTTGGAAAATCAGCACAATA:1 - chr3L 20449402 3' + I-element 251 1 53.47 CCCCTACACGAGATTTGTGGGAAATCTTAAGGGAAACATCTTAGGTACCAGCGCGCAATGGCAGATAGGATTGCTGAAATATGATGGTATTTAATACTTTC:1 - chr3L 2873786 3' - gypsy8 18 2 81.19 ACTCAAGGAACATAACTGTGAGTTCTACACGTACGATACGAAGTAGGCGTAGGCCAGTGTGGATCCGCAGTACTCCCCAGGTGCCTTCTCGGCGTCATCGT:1 + chrX 11950074 3' + Juan 484 1 68.32 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCACATCTGTTAAAAAAATAATATTGCTAATAAGAAGTATGAAGTTCGTTTCAAAAT:1 + chr3R 7869763 3' + jockey 4963 1 56.44 CAAAAACTGGACGTGCGTAAAAAAAAACTAATTGCTGGGCAAAAAATGGGCAAACACAAGCGCCAATGAGGAGAGAGTTTTCTCACCACCTGAGAGATTCG:1 + chr2L 16734463 3' - FB 100 1 53.47 CCGCTCCCAAGCCCCCCTGTTCGCCCATTCATTCATTCATTTTCGCATTTCACTGGCTCACATTTCTTTCTCCAAATTGTTAAAATGGAGCATGCAAAATA:1 + chrX 12191306 3' - Rt1b 4733 1 80.20 TTATTAAAACACAGCGTGTATTTCGGAATCGCTTTAATAAAGCCCCGTTGGCCTTCGTCCCAGACCAGCACGTAGCAATAACATGATGGGTGTCCTTAAGG:1 - chr2R 2095122 3' + mariner2 198 1 65.35 GACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGATTTACAGGGTCCTTCGGTTGAGACCCAAAAGTGTGGCAAAA:1 - 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Copia1_DM 177 1 73.96 AATCTCAGCCTTCTAGCTTTTATAGTTCCAGAGATCTCGAAGTTCATACCGAATTTCGTACATTTCCTATTCAACCAGGATATGCGGTCTTTCGACATAAA:1 - chrX 665205 3' - INE-1 164 1 44.55 GTAAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACAATATAAATGCTACAATAAATGTTGCCAAATTAATAG:1 + chr3R 10238296 3' - Cr1a 4104 1 66.34 CCGGTCGTCTTTTCGTCGAACAACGCGTTGGCCCGCCCCTGGGTTTATCCATCCATCCCGCAATCACTCTTCTCTCACCTTGGTCCTTCGGCAAATTTGC:1 + chr2L 16202747 3' - Osvaldo 1136 1 75.00 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGGCAGCGCTCTCTAATACACTC:1 + chrX 10437596 3' + hobo 2911 1 78.38 GGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGAGTGCAGATAGGTGTGGTGGGGAAAAACATTCGAACTGCCGAGTTTTCCTC:1 - chr2L 9174256 3' + invader4 3033 2 60.40 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGACGATAGAGGGCGCCAAGTT:1 + chr4 718830 3' - jockey 4795 1 79.21 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCAGCCGCGGCGCAAAACAAAAATGACAATGGCAG:1 - chr2L 2624222 3' + hopper2 1567 2 62.38 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGAGGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAA:1 - 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gypsy7 5009 3 83.67 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTTGGTGCCGCTGCTTAACATTCACCT:2 - chr3L 4713781 3' - transib2 49 1 77.23 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACTCCATGGATAATTGAAAGGGTT:1 - chr2R 4344557 3' + pogo 2050 1 76.24 GACAATATAGCGATCTCCACGGCGTTCTGCGCGAAAACACAGATCTGCCCGAGATTATTGTTCCGTTCGAGTGCATCTGCTTGATTTAGCGTATCGCTCAT:1 - chr3L 9027985 3' + mariner2 379 1 54.46 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGTACGTAAAAATAATGAGAAGCACATTTTGTGCGTATAGACAAGAAACGTAGCATACTTTTTTGGGG:1 + chrX 6146751 3' + hobo 2937 1 76.29 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAGTTTTATGGACAAGAAAATCCTTTTTTTTAACATTTTTACGACCTTAAAGATTCTTATCT:1 + chr3L 8712620 3' - diver 17 2 41.58 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCAATGCACATTGTGCATTGTGTTTTTCGCAGAGATGTGTATATGTCTATGTCACCAATTACTT:1 - chrX 19819958 3' - hobo 14 1 65.35 TTTTAAAATTCTTTTTTTTTTATTATTTCCACAGGATAATTTCAATGTCATTCTTTTTCAGTGCACTTCTTAAGCTCATCCCATGCACTTTTTTGCATTTT:1 + chr3L 13185006 3' + FB 176 1 89.11 ATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTCCAACTTTCCTCGCATTTCCTTCGCATTGTTGGCCTTTGAGTTTCGGCCTCTT:1 - chrX 5216048 3' - roo 8823 2 56.44 AATAAATAAAATAAAATGTTAGCAACGTTACAGCCAAAAGCGATCGCTCGCCTTGAACGACTATATCTACTGATAGAGCCTAGTATTTTTGTTGAATTAT:1 - chr2R 10082218 3' + G7 1150 1 72.00 AAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTTGGTGCCGCTGCTTAACATTCACCTACTTTTCACCTTGTTAGCCACGTTTGAACAGCAGCAGCAGC:1 - chr3L 4713740 3' - transib2 3 1 72.92 CAATAAAGTTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATAATAAATACTTACCCTAATAAATATATAGCAGTTACGATTCCAGATACAACAAAGCTAA:1 + chr2R 2119001 3' + transib2 2656 1 65.35 CTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGTGCGATATACTCGTCCGCCCGCGGGACACGGACC:1 - chr3R 20486354 3' + accord 494 2 67.33 TGGAAGTATTTATGGCCGCTGCTCCATACAAGCGGAGCCACTGTGGGACTGGCTGCCCCGAGCTGCACTTGCGTCGTCCC:1 + chr2R 5258172 3' + Transib5 2957 1 61.25 TTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGG:1 - chrX 21668006 3' + Tabor 457 2 52.58 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGATCATCAGGCCAAAGGGTATTTGGGTTATCACAT:1 - chrX 4784523 3' - hobo 41 1 70.30 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGA:2 - 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chr3L 3635430 3' + roo 361 2 69.31 GTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTTAAATTAATCTTTAAACTCAATCCTGACCACCTTTACACGACCCC:1 + chr2L 2670738 3' + P-element 2628 1 52.48 TATTGTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCAAGTCCATCTGTCCGTCTGTCCGGACAATTGCCAGGATCAGTACAATCC:1 + chrX 12971090 3' + INE-1 85 1 68.97 ATCGCAAGACGGTGCGACCAATCTTTAGTTAATTTACACATATTCATGTAGGGTGTTTCCTTTCCTTTGCATACAATTTGTGATAAACTTGCACCACACAA:1 + chr2R 13988212 3' + Gypsy6A_LTR 387 1 78.22 CACGTTCAAAGCTCGGACTCGCAATCCCGACAAACGAAAGATCCATATATGTAATTCACGCAGCCTCCATACATAGTCGACGGAGATGTGACATTGACATC:1 - chr2R 2095261 3' + Idefix 252 2 72.28 ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATTAGCTTTGAAGAGCTACCCAACTTTTCTGCCAGTGCACTCCTAAGGGACTGGGCTGCCTACA:1 - chr3R 29964786 3' + Quasimodo 7359 2 72.28 GCATCACATCCTGCTCACCGATGAAATACTTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCTTGACAAGGACAGGAAAGTGAAGAGCGGCTTAACCCGTTTCATTTGCG:1 + chr2L 17985757 3' + Rt1a 4888 1 74.00 CCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGAAAGAAAATTACACAACCAGAACGTAGCTGAAAAGCTCCTTACCCTCATATTCAGATACATATATGTA:1 - 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Doc4-element 2718 1 78.22 AAGCGACTTCTGTGAACACGTCCACGCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACAAGAAAAGGGCGGTGGTTGTTGAGGCAGTGCCTCTAACATCAAAAGCA:1 + chr3R 15714210 3' - jockey 36 1 49.50 GCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTAATTCATCATGGCTCAGGCAATCGTTTGACGTCGGTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGG:1 + chrX 20330558 3' - P-element 21 1 54.44 TCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGA:1 + chr2L 15019934 3' - BS 4842 1 67.33 GATATGGTTTTCTGAGAGTTTTTTGATGAGACTACTAAAAATGTTGGATGCTTTCATATGGTCATCAGTGGGGGTCAATTTGTACAACT:1 + chr3R 14698601 3' - Ivk 352 1 52.81 GCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGAAGAAGATGGACTACACGAAAAACAAAACGGAAAGCAACTGCCTTACACATTTTTGCAGCTGGGAAAAAATAAAC:1 + chrX 3800929 3' + Ivk 5101 1 77.23 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGCACAGAAATATCGCCTCGACTATATAATTTAGGGCAG:1 + chr2R 10345669 3' + roo 9034 1 65.35 TTCGCAAGCTAACATTTGAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTCTGTTTCGACTTTTGTTTCACTGCTGATTGCCTTTGATTTTCGGGCTATTTAT:2 + chrX 7623016 3' + hopper 276 2 57.43 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGGATCTAAAATAGCATTTTATCG:4 - chr3L 18034193 3' - Doc 59 1 75.25 TGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACACCGCTGCAGCTGCCGTAAGTCAAGTGGTTA:1 + chr3R 23244148 3' + jockey 205 1 69.31 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATTTGAAACCGTACTATGTACTTTTAAATTTTTAG:2 + chr3R 6425920 3' + copia 241 1 62.38 CTCCGCGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTCGTCGCCGTTGGTTCAACTTATAGTTATTCCCATCGAAAGTGGAGTATTTTTTTGGCCAGCGG:1 + chr2L 19936619 3' - transib2 390 1 71.29 TACATTGGTTTTTCACTATGCAGACACTTTTTTGGTGACTTGTGAGTATATATATATATGTAAATGCCAATTTTGTAAACATAACGTAATCCTTTTTTTAA:1 + chr4 142166 3' - 1360 3353 1 67.33 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCGTTGAGTTAACTCAAGTTCAGCTATCTGCGCGCTGATTTACGCCTCCC:1 + chrX 13587993 3' + hobo 2909 1 51.49 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTCATTGCTAATTAAGCCAAAGATGGGACAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGC:1 - chr3R 19450182 3' + roo 395 1 41.58 AAGCTTCACTAAAGCTTTTTATGAACTTCTACTACTGCCCACCTTTTGGCCCCGAGCCAAGCATTTGATTGTTACCCTCACAATCCTGGCGTCGTGGTTA:1 + chr3L 4371262 3' + transib2 130 1 75.00 TGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATATCTGAAAATGTGGGCAAAGGCAAGGAGCATACAAGGGAAAATGCAAAATGCCGGGGCTCGCCTATTGC:1 - 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Chouto 6254 1 78.22 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTAAGATAAGCGTGCAAAACGTGATCCAGATTTAGGAGATTGTTTTGTAGTTTTCTAGATTTCAAAAA:1 - chrX 14521621 3' + roo 404 1 68.32 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAGTTTCCTAGTTTCTTTACCTTAACACAACATAGCCTTTTGAACCAGAACACTAGACACGC:1 - chr2L 18506726 3' - flea 4770 2 66.34 AAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTTGGTTGAGGGGGGCTGTTGTCAAAGGGCGGAC:1 - chrX 8202343 3' + jockey 4648 1 68.32 GGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATCCTACGCACCAGTTTAGATTTAAATTCAGGACTTCACATTCCACATATAGATTCGCCAATAT:2 - chr2L 12802170 3' + invader3 263 2 62.38 TACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCAACAGAAAAAAAATTCCAATAGCGAGAGCGAGTCTCCATGCGTTTTATTTGCTTTGCTTTTTGGCTTTGAGC:1 - chrX 5087451 3' - blood 231 2 75.25 CTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATAGATGTGAAGATCTCAGGAACTTTAAAAGCTAGAAGCTTGATATTCAGCATAAATGTCCTATAACAACTTTTGGCTT:1 + chr3R 3626749 3' + INE-1 117 1 75.25 CTATAGTCGAGTTTCCCGACAATCAGATACCCGTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGGCGGGAGCAGTAGTCAATGGAAGGATCCCAATTT:1 + chr2L 14779250 3' - INE-1 566 1 35.64 AAAACTAAGTTCGTTCTAAGTCAAGTTGAATTTGTTACTATTTTTCATAGAATTTCTGCATTAGAGTTTAGTTAAAGTGCAGCTGGTGCGAATCCCAAAGG:1 + chr3L 19215489 3' + HB 1375 1 60.40 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACATGCGTACATATGTAAGTAAAAATGTCT:1 + chr2R 5651921 3' - Tirant 12 2 69.31 AGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAA:1 + chr3L 21912314 3' + Bari1 1655 1 77.23 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGC:1 - chr3R 25514121 3' + hopper 1374 2 67.33 CTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATGTAAGTGAGTGAGTGAGTGCACACTGTATGTTGCGAAGGCAAATTGCACCCG:1 + chr3L 3476427 3' - jockey 4662 1 53.47 GTGGGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAATTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAAAAACTATATACCGTGTAGCTGTAGAGTGCAGTGCACTTGAAGAT:1 - chr3L 9140756 3' + Cr1a 4071 1 68.32 TTTCGCCTTGTTTGCTGTGGTCTTAATTTATACAGGACTACTTTGTTAACTGTAGTTTCACAGCCTTTATGGATTTCCATATGCGATTGCTGCAGCCAATT:1 + chr2L 1904691 3' - gypsy4 484 1 56.44 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAAGAAATTAAATTACGCTTGAACGGGCTCGGCCGAACATGGG:1 - chr2L 16717958 3' + 1360 3356 1 63.00 ATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTCATTACAAATTGGATTTTGCAGTCACATTTCGCTTATTACGTTC:1 + chr2L 15833758 3' + hobo 2576 1 56.44 GTTAAAGTTATATGTTCTTAACAATTTAATTTTTTGCCTAGCGTACTTGTTTTTTGTTTTTGAGCACGCAAAGCAATTATTATGTTAGCAGTTAAAGTTAT:1 + chrX 8832462 3' + transib4 447 1 61.39 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATAGTGCCCCATCATGTGGCATTCCTAAACCCAAAGTGTCTTTACCCGCTTT:1 - chr2R 15606015 3' + roo 9045 1 58.42 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGCTTGGAAACTCGGAGTCATCATCAATG:1 + chr2R 10865685 3' + pogo 2055 1 77.23 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAAACGCATAAACGAGATCCAAGATCCAAGTC:1 - chrX 18991539 3' - pogo 42 1 71.29 AATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTAATACAGTAGATTAAATGCATGCTTACCGCTTTTTGGCCTCCTCCTCGACTTTCCGGGCCAAC:1 + chr2R 9285617 3' + gypsy 445 2 62.38 TAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTCGTTTGAAATTTATTTCAGTTCAACCATTTAATACATTTTTTTGTAACCAGTAAAA:1 - 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invader3 5218 2 55.45 GTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACAGGTTGGTAAGAGGCTTCCTTACTT:1 + chr2L 4134209 3' - copia 196 2 75.25 CCCGTTGGAAGCTTGGCTTCCAACAGAGTCCGAAACAGGGAAGCTGAGTAGGGGTTAAAGGCAGAGATAGAGACATCCATTTGCCACAGGTAGTTTGCGAT:1 - chr3L 14875046 3' - diver2 4504 1 69.31 TTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACAACAACCAGACCACAAGCTTCATAATCGGAGGTACCACCAATATTAACAACAACAACAATCAGCTTAG:1 - chr3L 12055298 3' + accord 3 2 72.28 GGTTACTATCGCATCAACAATGTATTATCCTACCGTTACTTCTTACAATAAACTTTTACGCTGTTTTACACGGCGCAAAACCAGGGGGCAGTGAACTATAA:1 + chr3L 11310776 3' - rover 389 1 70.30 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACAAGAAATGGGCGGTGGTTGTTGAGGCAGTGCCTCTAACATCAAAAGCAG:1 + chr3R 15714211 3' - jockey 26 1 52.17 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGACTACATTTGAGCAGCCGCAAAGAGCTTGCCCCGAAAAGTAGGCA:1 - chr2L 10898466 3' - jockey 4701 1 56.44 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATATCTTATTGAATGATATGAAAAGCATTTCTATGTTAATGGATTTGTCAATCAATAAACAGCT:1 + chr2L 18188481 3' - Doc 20 1 53.47 TTGTATATACATATACATGTATATATATGTACACACCCATCGAACAATTGGGGCCGAGGAAAAGCCGAGTGGGTTGAGCAAAAAGATGACGACAGCTTGGG:1 - chr3R 25573683 3' - Stalker2 7502 2 62.38 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTTTTAATACTTCATTCTTCATTAAGCTCTTTTACAAATTTATGACTAGTA:1 - chr2R 11691066 3' + pogo 2077 1 59.41 AAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTTTCATTTCTCGCTT:1 - chr3L 5267189 3' - Juan 3975 1 73.27 AGGAACTATAAAAGCTAGAAAGGTTGAGCATCGACACGGCTTAATAAGAATATATTTTATCGGATGAATTGTAACAGGTATAATAAACGATTTCTTATATA:1 - chr2L 21236182 3' + INE-1 156 1 50.50 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCGCTGGTCGTCGCTGTC:1 + chr2R 17346040 3' - hobo 1 1 76.24 CCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAATTATGCAAGCATACCCGGTCCTTTTCGTTGTTTTATTTCACTGCGCAATCTTTACGCACGTCTCTTT:1 - chr2L 12485090 3' - jockey 4543 1 42.57 GCGAGCACGGATGCGGGGCAGTTAGTGAGACAGCAAGATCGCGCACGGAAGAAGACAGAGCGAAGGAGTTCGATAGCTTAATTTGTGGAGCGGGCCTTCGG:1 - chr3R 10563897 3' + gypsy8 358 1 71.29 AGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCC:1 + chr3L 15099642 3' - G4 3809 1 39.60 CTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACATATGTATGTATATGCATGTGAAAGTTACGGATCTCTTTCTATTCCGCTGCCAGCCTCTCGCTTTTCATT:1 - chr3R 5392261 3' - 412 6 2 78.22 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAAGCCTTCTGCAGCAGCGTTAAAGTTTCGAATTTATCTTGGCACTGAGTGC:1 - chr3L 14692834 3' + flea 245 2 64.04 AAATGATTAAATTTAATTTTGAATTATGCTTTATTATCACAGCTCATTTATTTTTCTAAACTAATTCCAACTGATTGTCGGGGAAGCATGGTTACTGAAGT:1 - chr2L 7570058 3' - Bari1 334 1 29.70 GATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGACGACTGCTTCCATCAATTTGTATGTGTTTTTCGTGTGTGTCTCCTTTTGCGGGCGATTGAATTGGCA:1 + chr3R 25429629 3' - accord 306 2 65.35 CATTGTCTTCATAGCAAACTTTGAGTTTATTTTTAATTATGGAAAAAACAAGTCACAGTATGTAAATTAATGGCGCGGGGATTGCCTAAAAAGCAACCGAT:1 + chr2L 22240014 3' + transib4 232 1 68.32 CCGACCTTTTACAATTAGGTCTCAAACTGAACTCAGATAATTCTCTTCAGAAAAAAATTTGTTCAAATAAGACTACTTTAGTAAGCAGCAGCTTGATTAGT:1 + chr3R 10841632 3' - Idefix 7303 2 69.31 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACAGCCAATTGGGTGCACTTACAGGTTGCGCGTACTTCGCGTTGCTTAACTTGACTTTAGTACCGCG:1 + chr3L 27728975 3' + P-element 2876 1 68.32 CTCTAAACCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACAGCCAAAGAAGAACCGTCGAAAAACCTGCGCAATTCCCACACAAAAATATACTGATGGTCTAAAC:1 + chr3L 3724752 3' + ZAM 7999 2 70.41 AAAGATATTAGGATAATTTTCTTAACTAAACTATTTTTTTGATTATATATCTAGTGATATACTAGTGATATCTACTGATAATTAAGAGTAACTTTCAAATA:1 + chr2L 12331898 3' + Transib-N1_DM 57 1 41.58 TCAACCTTCTATCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGGCGTTAAAACTCTTTATTTTGTTTGGCCTTTTTTGGTTGCTAGACAAAGTTTCTCTTACTCAGCAA:1 - chr3R 3519992 3' - INE-1 160 1 63.37 CGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCTGTCTCTCACGTTAACTCACAATCACTCTGTCTCTATCCAAAAATCCGAACCCTCTCTTTCTCTAT:1 - chrX 20795483 3' + Doc 421 1 71.29 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAACTAAACTAAACTAAACTATTAACCAAATGAAAGTAATATGGAAGCTTTGATGTTCTATTTTTTCACCTGCCATAATTC:1 - chr2L 7829863 3' + Juan 4201 1 57.43 TATTTGGTTGCGTGACCTTTGTTGGCAATGACAGCCGCGCATCGTCCTGGCATGGAGTAGCATGACGGGGATATTTTATGGGCTCCGTTGGCACTCTCTGA:1 + chr2L 4158092 3' - Tc1 1329 1 57.43 GGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTAACAATCTTATTCTTTCTGGTATCTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' - Idefix 158 2 59.00 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCAACGCCACTCGAGTCGAGTGGTCCGGAGTAACGAGGAGTGGACTAATTAATTAGCAGCTAAT:1 - chrX 13587908 3' - hobo 15 1 64.36 AGGCGAAGCCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTGGATTCAAACACCGGAATTGAACTCATTAAGTGAATCCTTACTGAAACTGGACCATATCTGTTTTATCTGG:1 - chr3L 2954509 3' + rooA 7534 2 62.38 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACACAAACACATACGCACACGCGCGCACACACAGGACCTCACATGTACGCCACACAGCGACAGGCGGC:1 + chr3R 27386373 3' + hobo 2931 1 68.69 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCAACAATACAGAAGA:1 - chr3R 20396541 3' - I-element 40 1 60.40 TCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTGCGGTTTTTTTGAGCTTTTTTTCACAGAAGTTTATCACCCG:1 + chr3R 1272019 3' - hopper 962 2 69.31 CTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTTCCTGGCATCTCGCAAGCGGAAGGAAGTTGAAACCATTAGAAATTGGCA:1 + chrX 7654524 3' - Bica 82 1 67.33 TGTGTGAGTAAAAACAAGAGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTGATCGTACTTTGACCACTGTTAATCCATGCTAA:1 - chr3R 19446361 3' - 1360 3243 1 48.51 ACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATTTGTCTCTTAATTTTTCTTCTGTGCAATTAAGTACTGTATGATTTAGTTTGCCCTATGTAT:1 + chr2R 3032586 3' - opus 9 2 70.30 TGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAGCTTTAATTATTATAAATATAT:1 - chr3L 22094286 3' + Stalker2 7254 2 56.44 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCCACTTTTAATGTGGTGAGGTAGGAATGTTTCATTGATGTG:1 + chr2L 11805077 3' - P-element 35 1 45.54 AATCATCAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGATAAATTATGTTAATAACGTTGAGTAGGCAACTTGGTTGAAAGTTGATAGAGCTGCGAAAGTTTTTC:1 + chr2L 13728764 3' - Juan 386 1 69.31 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGT:1 - chr3L 9174693 3' - 412 43 2 66.34 CTCTTGCCGACGGGAGCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGCCCTTTAATACACATCAATAACTATCGACGTCTCACGACTCTACATACGATCTATTAC:1 - chr3L 27262050 3' + P-element 2870 1 62.38 GGTCGGGAGGTGTGGCCGTGGAATACGTGCGAAATATGAAAGTGTTAAATGGCCAAGGGAGCGGGGTCATGAGGGATTGGCTTCTGACTAGCATTCTGCTC:1 + chr3L 5053450 3' + Cr1a 4432 1 69.31 TCACGTGTGCATGAAGTTAACGATTATAATAAAAGCATGAAGTGTCCGTGGCCAAAAGAGCGGCAAATTAAAAACTTTGCGTAAAATCCATTTTAACTTTT:1 - chr2R 21752594 3' + Stalker4 447 1 58.42 CCGTTTATACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCAGATGAGACACAAATTAGAATTAAACATAACAAATTTTAACACTTTCCCGATAGCACTGTT:1 - chrX 11971558 3' - 1360 2963 1 46.53 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAAAAAGCAAACTGCTGCTTCCGCGTTCAGTGAACATTACGCACTAGAAATCTCGA:1 - chr3R 13397256 3' - hopper 44 1 53.47 CCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATCTAATACCGAAACAGACATCACATAATTAGTCTCTCTAAATAAATCTGCCTGC:1 - chr2L 8854118 3' + mdg3 5116 1 56.44 TTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTATGAAATGAATCGTGCTGTGTGGCCTTACAAATTTAACTCTGGCCAAGACCAACCGGCACCAG:1 - chr3R 1585209 3' - Doc3-element 4658 1 80.20 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGACAACCGGGCTCACCCAACCAACAG:1 - chr3L 22964137 3' - roo 8674 2 75.25 TCTCTCGAATTTTTGTTGGAGAGCGAGAGAGCGGAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCAGCTGTTCGGTAGCGCCATCTGTCGGAATTTTAT:1 - chr2L 17590059 3' + 1360 89 1 67.33 AGGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTGAGAGAACGAGCGCGCGACAATCGCGAGA:1 + chr3R 14056146 3' - blood 166 2 76.47 TTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCTAAAAACTTCTAAGGTGAAGGGAATATGTTATCTTGTTAGAAATCAATGTGGTTATTCTTAATCTTAGCTTC:1 + chr3L 17704134 3' - 1360 253 1 53.47 CGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAAGCCCTCTTAGAGGGTTGATCTAGTTGAATGT:1 + chr3L 16470307 3' + BS 5049 1 65.35 GAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGCAGCATTGAAAAGCAAATAGTCCCAGAAAAGAGGCTGAAAAGGTTCTCTGCGGCGACA:1 - chr2L 1411152 3' + Doc 4406 1 65.35 GACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTTAACAACAACTAAAACAACAACCTACCTGGCGAGCAAGAGTCGTAATGAGCTTGTACACACAACACAC:1 + chr3L 20569479 3' + Porto1 223 1 66.34 ACCACCAACAAATTACACACATACTCCGTTAACCAATTTTAAATATAGAGTCTAACCGCTGGTTTAAGCAAAACAACAAAAATCAAAGCGCCGGAATTTAC:1 + chr2R 5531879 3' + Doc4-element 201 1 66.34 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACATTGCAATGTCTTCTGTGGTGTGTG:1 - chr3R 18026931 3' + mdg1 366 2 75.25 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTT:1 + chrX 16217532 3' - P-element 20 1 59.41 CAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAGGCAACCTAAGCTTACCCGATTTGCCGAAAGTCCGGGTGTAACTTCGGCGCGTCTTT:1 - chr2L 5211021 3' + gypsy12 10175 2 56.44 AATGGAACAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATACGAGAGCGAGTGAAATACGAGAAATACAAGAAAAAACCGAACGTGAATCG:1 - chr3L 16451745 3' + Porto1 4275 1 55.45 GGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACATAAATCAGCGCAGCGTATACACCTAATTGCCGTCATTTTGCACGCACTGCAAGAGTGTGGAAAGTCGGGCCCG:1 + chr3R 12167837 3' + 412 335 2 79.00 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTCGTTTGGTTTTCAGTTCGCTTTCCAGCTCAGTCAGAATAGCGTGCTGCGTGG:1 - chr2L 9432979 3' + P-element 2867 1 41.58 TGTCAATGACCTAGCACCTGCTTTTTCTGGTAGTGCAAACGATGTGCTCTTGGTTGGAATTATGTAGCAATGGAGTAACAATCGTGGCAGTGCTAGAGTAA:1 - chr3L 19577042 3' + Doc3-element 346 1 81.19 TAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATGGTGCTGGGGGGACGAGCTGTGTGTGCAGTG:1 + chr2R 11083595 3' - Doc 380 2 73.27 ACTGAACTTATGTCTGTGTACCTCTAGCTTACTAACATTTTTGCCGCGTGTGTGTTCTCTTTCCCCCTCTGCTTTATTTCATCTTCAATATTTTGTTATTT:1 - chr3R 22960691 3' - invader2 4873 2 70.30 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATCATTTAAAATAAAATAAAAAGTTTGTTCGAATCATTTTTGAAAAAGTTTTCTCGAAAATCTA:1 + chr2L 18093890 3' + roo 394 1 67.33 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATAT:1 + chr3R 14049403 3' + transib2 2779 1 70.30 CACCCTTTAGTCGCCTTTTACGACAAGCCCAGAGCGCTGATGTAGTATTTTTGGTCCGCCACCACGATCTCCTCCAGAGCGATTGCCCCGCGAAACGCTGG:1 + chr3L 3117164 3' - Rt1b 4889 1 64.36 CAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGGAATGGATGGGAGGGATGTTGGTTCTCCATGTTTATGGATGGTTTTTTTTTCGTTCTTTTAAGCATGTAAAAC:1 + chrX 1018466 3' - transib2 7 1 69.31 AAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCCCATCATGTCAACAATCAAGTCACAATCTCCACCACGGCCCCGAGATTTGAGTGCTGTAAAGTCA:1 - chrX 412871 3' - P-element 2575 1 69.31 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATTTTACAGCTCATATGTTTTTTCAAGTGTAGACCCAATTCAACTTA:1 - chr3L 6024490 3' + mdg1 7429 2 55.45 CTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCATCTTGTTATTCTAGGGTCT:1 - chrX 14317417 3' - 1360 113 1 79.21 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATAT:1 + chrX 12818875 3' + roo 357 2 75.25 GTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAACTTAAAGTAAACACAAGTCAGAAATGTGAATTTCACAATGCTGT:1 - chr2R 4269743 3' - roo 134 2 56.44 GGCTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGAGTGTAAGCAAAAATGTGAAACATATTATGCTACTATATATATATGACATGGACATGGACCTCCTCTATTTCCC:1 - chr2R 4122452 3' - rover 189 2 73.00 CTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAAATTGTATCTTTCAACTTTTAAGTCTATGTTAATTCCTTTACCTAGAAACT:1 + chr3L 15451288 3' + accord 232 2 50.50 CAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGATTCAAACTGAAATAACTGTCAAAGATCAATTGTACAATTT:1 - chrX 8522849 3' + 297 366 2 59.41 AAGTCGTATTATTTTTATTTGTTCATGCTCCAATTCCCACAAAAATGACCTGCTCTTTGAAGTAAAGGCGTAAAGAGGTTTCATCGAGAGTGGGTGAGAGC:1 + chr3L 20157067 3' - I-element 4928 1 69.31 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGTGTGATTGATGTGGACGACAATGGCACTCGGGGATGGAGGGATGAGGAGGTAGGCGGTCGGATGGGAGCT:1 + chr3L 21852588 3' + 1360 3384 2 75.25 GAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACAAACAAAATCTAGTCTAGAAATCGGCTTACTAGCGGAGTAGTTCTTTAAATGGCAAATGATCACGATGATAAT:1 + chr2R 12023670 3' + I-element 403 1 74.26 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAGCGGAACACAAACGCACACAGGCACACTTGTTTGCCAGCCCAATTTGTTGTAGCTGTTGGTGAATTTAATAC:1 + chr3R 18449028 3' + hobo 2932 1 70.30 GATGACAGAGTTAGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAGAAAAGAAAAAAACGTAAAAATTGTACTGAGCAGGCTTAACATAGTAGTCAAGAA:1 + chr3R 11412506 3' + Porto1 4503 1 58.42 ACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCCCGACATTCAATTAGAGTAA:1 + chrX 14576666 3' + Doc 329 1 80.20 TATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTTCTACAAAACATAACAAGACGAGACAAAAATCGGTTAAGTCGCGCTTGGT:1 - chr3R 24526559 3' - invader2 4894 2 76.24 CACAGCTTTGGCTGGTGAACAACAAGAACAACAACAACAACAACGTTCCTCCCTTTTGTCTAGACGAATTTCGAGTTAAATTAAAAAGAGAGTACACAGCA:1 - chrX 3148271 3' - gypsy4 417 2 66.34 TCAAATTTAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAACTTTTGCGACCAATTGGTGATCAACTTCGAACAGTGT:1 + chr3R 6190299 3' - copia 39 2 58.42 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGGGGAATCTCAAAAAGCGACTAACTAAAGTCGCAAAGTTTCGCCGATCAACGGAATTCGAT:1 - chr2L 852810 3' + P-element 2872 1 64.36 ATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCAGCACAGATGGAGTAATACGATTTTTAATTGGCATTGTGTGATGTAATACAGCGTTAAAGTTTTCTTGTAAA:1 + chr3L 6578301 3' + P-element 2 2 69.31 GGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTTGTTGTCAGGCGTGTGCGGTGCGCGTTGAATCCGCTATAACAGTG:1 + chrX 5044926 3' - Idefix 91 2 55.45 TCATCATGGTGACGATGATCGCGTGAGCCCCATCCCAAACGATTTTATCCCCCATCTAATGGCTAATATGTCACTGTGGCTGCATT:1 + chr2L 19344297 3' - Rt1a 4719 1 53.49 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGACCCCGCGAGCTCCGCCTTTTTATAG:2 + chr2L 11561829 3' - transib2 49 1 73.27 CCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGCAACGGCTGCCCCAATGAAGAAGGTGTCATAAAAA:1 - chrX 16256569 3' - Idefix 246 2 69.31 TTTTTTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGCCTAAACAGAAGAAAAAAAAATAGTTTGGGTGCTTAAAAATAAGTTACAAAGAGCATTTTTTAAA:1 + chrX 14871427 3' - Idefix 172 2 66.34 TGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGTTCTGCCTGCGTGGGTACGAAAGGCGGCAGGAAGCCCAAGGAATGGGGCTTCACCAGTCCACGGA:1 - chr3R 17254545 3' - ZAM 7973 2 55.45 TGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAACAATCGATTTCAACTTTTTTATTACATAATTATATCCGATTACAACACCGCAGTTTGCCAGCCGAAGATTG:1 + chr2R 6588284 3' + Cr1a 4232 1 66.34 TGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAACTTACAGTTCAGAAACTGAGGATCTAA:1 + chr3R 23274068 3' + invader3 226 2 75.25 CCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATAGATGGAAGCTGGCCTCAAAGAGAAACTAGGGCATGTTTGAAAGCTGACTTCTGAAAACG:1 - chr3L 5444278 3' + micropia 5121 2 64.36 TTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGACCTATTTCGCGGCTGATGCTGTGGATAACTGCACTTATTGGCGTGACACT:1 + chr3L 24361329 3' - Quasimodo 466 2 55.45 GGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTGGTGGAGGGTAGGCGACGCAAATGTTCCCGAGTGCTCCTTAAGCTGTCGCCGATTTTC:1 - chr3R 23244703 3' + jockey 153 1 58.42 AGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTCGGAGAGATCATCGTTAAGGGCACTTTTTGAGTATTTCTTGTGGAGATCAACCTTGAAGGGTGACATGCT:1 + chr3L 6736309 3' + F-element 404 1 74.26 AACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCGCCACATGGCAGGAGTGTTAGCCCCAACCTCCTGCCGAAGGATCCCTTTAATGCGCCCTTGATAAACGAGCCGCT:1 - chr2L 10603726 3' - Doc 363 1 76.24 GAAGAGTCGCGCACCGACACGGCCTTCCTGACCTTTTATTTTGGCTGCTATCATTTGTATTCTGTCAGTTTAAACTAAATATTCAGTCTTATGGTGATAAA:1 - chr3R 26582702 3' - invader4 2757 1 71.29 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAAAGAACGTTAAGATAATTTGTGTCTATGGGGGTAAGGTATAACCAGAATTCACTCAAATTAAT:1 + chr2R 8475003 3' + Transpac 5218 2 69.31 TCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGTACCACGAAGCTCTTCAATTTTTTACGCTTATTTTTCCCCATCTGTTG:1 + chr3L 8012112 3' + transib2 2797 1 52.48 TCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGTGTGCCTTGCTAATCCACTTCCTCACATTTTCTCACGTACTGGTGCTGCGGCC:1 + chr2R 2903639 3' + 1360 490 1 50.50 TACATAACAAGCCAGCAATTAGTTAACAAATTAGATATTAACTAAATTAAATATACCATTGACCAACCCACAAAAGGAGGCGCATTTGGAGAAAAATGCAA:1 - chr3L 14198524 3' + I-element 5214 1 55.45 CGACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCATCAATCTTTATATAATTGGCAAACCGAAAGCCGAGAGCCGAAAACAACCAACGGCTAAACAAGCAACCAGTCAT:1 + chr3L 5428397 3' + Gypsy6A_LTR 380 1 56.44 GGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACGCTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGTATGTATGTGCACTGGATGCCACATGCCGACAG:1 + chr3R 16892331 3' - mdg1 7320 2 65.35 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTT:2 - chr3L 17215735 3' - Ivk 47 1 67.33 CATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCACATGCCTACATACCAATACACATACACCACTTCGGATATATCAGGGAAAATAGGAAAGGAAATTAACCGCAG:1 + chr3L 27422017 3' + Idefix 5 2 65.35 ACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATACTTGCGTTTGTTTCTATGACAGTTTCTTCACAGCTTTCGATTTTCTTATGGCA:1 + chr3L 11844429 3' + Burdock 236 2 58.42 TAACAATATAAAATAAAAATTATATATCTTTACACTAATGGCACTCTTGAAAGCGTAATAAGCAGGTATCTAATAGTCGAGGTTTTCGTATACAGGGTATG:1 - chrX 8706133 3' - blood 6933 1 72.28 ACATGATCTCTGAAGGTAAAACCTACGCCGAGTCAGCGGATTGTAATTTAGCAGTTCCCACAGATCTCAATGCATTTCTGCCGGTGATTAATTGCCGTGCT:1 - chr3L 1164943 3' + Tc1 408 1 76.24 AAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATTTATAATGGTGTGCGGTCGCTTTGACGTAACACATTACGACAAAC:1 + chr2R 16160286 3' - gypsy 7012 2 52.08 AGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTTTGTTTATGCTCGCTCTTTGCTCTCTTTTGTTTTCAGCTGCTCGCGCTCAATTAA:1 + chr3R 19165866 3' - F-element 252 1 65.96 AATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAACAAAATAACAGCAAAATATCAGCGATAAGCTACTTAATTAATAACAAATTTGACATAAATAAA:1 - chrX 2539368 3' + jockey 4896 1 65.35 CAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGTGGTTTCCCAAAGGCCTATAAATAGCGATTGTTTTCAATGAGATTCCGCTGGCGCTCTCCGGCTCTCGGTCGG:1 + chr3L 2906639 3' + hopper 242 1 86.14 AGACGGAAATAACGGGATCCCTGCGGCCTAAAAAGGGTTAGATCAAAAATCAGTCCGTGCGTGAAAATCAGTTTCAAAACAAAAGTACAAGGAATAACAGC:1 - chrX 11807082 3' + gypsy8 316 1 65.35 GTCTGTCTGTATGAACGTGGAGATATCAGGAGAAAGCTTGCAGCAAAATGCTGTGTGTAGTGGGTGTCTCAAAGTCGGGAAACTTGCCATCTATAACGTTC:1 + chrX 13789923 3' + INE-1 129 1 68.32 CGGTATTTGTCTTAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGATGATTTGTGTGTTTTTTTTCGTTGGCTGGAAGCGTTGTAACCTGGTGAGTCACGTATAACT:1 + chr3L 23436460 3' - Porto1 4482 1 56.44 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTGGGAAAAACAAAAGCAAAAT:1 + chr3L 4713812 3' + transib2 2779 1 75.27 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTTAACTTGATTATTTTCAGTTTTGTTAGCAACAACAACAAAGAAACCGCTCGCTGAATAAGTCTAA:1 - chr3L 20197756 3' - 297 7 2 72.28 TCTACTGAGGAAATGCTGCTAATACTGCCGATTTGATCTAAAAAAATGAAACAAAGTGTTTAAATGTATGCTAGAGACTAAACTTAATATCAACAAATTTA:1 + chrX 20502968 3' + blood 433 1 66.34 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGCAAAATGCTTGGCCGAAGTGCTATTAAAAAG:1 - chrX 12533491 3' - jockey 56 1 67.33 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATGTACATACCACTATTTTGTTGACCTCGACTGTGTGTGCTTTGTACATTTTCAATG:1 + chrX 20982305 3' - 297 6594 2 67.33 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACACTAATCCGCCACGCCTACTGTCGCCCGCTGTTCCCACCTTT:1 - chr2L 17056484 3' + 412 460 2 55.45 CAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATT:1 - chr3L 17215729 3' - Ivk 41 1 61.39 TATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTTGCGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGACTATATTCCCCGCCAGTAAGCAATA:1 - chrX 15905504 3' + INE-1 503 1 75.25 CCGTCTGGAGTTACATGCCTTCGACGATCACCCAGCTAGTTAACATCCACAACGAACACTGTCTTATTATTAAGTTCGTATAATTCAAATAAGTATTTAAG:1 + chr2R 9503218 3' - gypsy10 180 2 59.41 GAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCTTACGAAATATAGTCTCTCTGCGCCAAAGCTAGTTGCTTCTAGTCA:1 + chr3L 21966735 3' - Doc 281 1 66.34 GGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTGCTTGTACTCATTTTGTTTGCAAGTAGCTGAAGTGCACTGCGAAAAAAT:1 + chr3L 11868266 3' - I-element 5113 1 54.46 AATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTGTTAGATGTGTAGAAACCGCGG:1 - chr2R 17649894 3' + 1360 2990 1 81.19 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATTTGAAACCGTACTATGTA:1 + chr3R 6425905 3' + copia 226 1 62.38 GCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAAGCCCTCTTAGAGGGTTGATCTAGTTGAATGTT:1 + chr3L 16470308 3' + BS 5050 1 64.36 GTGGTTTGTTCGAAACACCACCCTGCACAGAGACCTGAAACTCGCCCAGCTTAATGGCGGAACTAAAGAATACTAAACTCGCACTTTTAATTAAATTGTTT:1 - chrX 14527570 3' + X-element 4334 1 63.37 CTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCACAAGTCCTCGATTCCCCAGTGCAATCCCACAGATACGCCGCCTTTGTCCTTGGCTTGCA:1 + chr3L 20170550 3' + Tirant 8248 2 80.95 TAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACAGGAGTCCGTCGCTTGAAATGTCATTGGCTTCCTATGAAGAGGACTTCTTCAAGGGCTTGGAAGCC:1 - chr3L 11194788 3' - Cr1a 4208 1 72.92 CGACTATCAGATACCTGTTACTCGGATGGTGGATGCGAACGCTGGGTCATAACCACTTTTTATGCGCTCGAATTGTTGATGGATTTCGATGGTCGAGGTC:1 + chrX 3235754 3' - INE-1 550 1 70.00 TGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTAATACAGTAGATTAAATGCATGCTTACCGCTTTTTGGCCTCCTCCTCGACTTTCCGGGC:1 + chr2R 9285613 3' + gypsy 7428 2 58.42 TAAATTTCAAAAATGACTTTTTATAAGAATATTTGTCATTTGCTTATTTGCTAGCACATTCAACTATATGTGTTAACCACCTCTCTTTAAGATGATTCTCA:1 + chr3R 15065471 3' + 1360 375 1 63.37 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGGATACCAAATGCAGGAACGCAAAGCCAAAATAGAAACATAGCTCCGAAACAGTCAAAACACTCGACCTGGCCAA:1 - chr3R 29333677 3' - hobo 1 1 64.36 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGACAGCGCTCAGTTGCTGGTCTTGTTTGGCTTGGTTTAGT:2 + chrX 10629290 3' + P-element 2878 2 70.30 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTAGCCCTACGTTACGTAGCGCCCGCTACGTTAGTGCGAGGAAATG:1 + chr3R 28330916 3' + P-element 2854 1 46.53 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTTGATAAAATAAATAATTGTGCAAT:1 - chrX 20982231 3' + 297 6928 2 78.22 GTTGGAGTGGCCGCTATGAGTTTCATATTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGAATTTGCATAACTAAAGCCAATGAAGGCATACAAATGAACTCGTTTCCA:1 - chrX 10295589 3' + gypsy6 7535 2 60.40 GAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGCCAATTTAAAAGTACTCTTGTACTTACCTGGACTTCTTCAGCACGTTGCGGAATCCCTTGACGTCGTGCT:1 + chrX 15396735 3' - 17.6 7152 2 77.23 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAATAATTAGGTAACAAATTGAAATATCATTAACTATTTACATACAATTTTTGAAAATTGCTGATTGGATTTT:1 + chr2L 11156355 3' + copia 250 1 73.27 AAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAAGTTGAATGAAATGAATGCACCAGGGTCGATGTTGCTGCTACTGCTGTCGCATATTTGTGCTGCT:1 - chrX 6141526 3' + hobo 2521 1 67.33 GAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTTGCAATGCTTTTGAGCTTATCTCGCTTTCTTAAAATAACACACTGAGACATACATGTTATTAAGTTTATTATTGT:1 + chr2R 11440705 3' + 1360 438 1 82.18 ATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAGGAGTGCGGCAACAAATGTTGGTCGAGTCTTATAGCCGTTTTCCATGTGGGAGGCAGTGGGCGTGGTCGCCGCGGAC:1 + chr3L 11182215 3' - R1A1-element 5155 1 76.24 TCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAAGATTTTGGAGACCAAGAGGAGCCGCCTATATGT:1 - chr2L 9129288 3' + 1360 3207 1 71.29 AGAAAAATAAACGAAGACACAATTAAACAATAATAATAATACTATTAGTCATAATACGGAAAACCAATTATAATCATAGCAACAGTTGAGAAACCAAGCCG:1 - chrX 16528000 3' + invader3 5020 1 72.28 TCTTATTTGGGATTTTACACTGCTCGATTATCTTACTTGGCCCAAACAAAAATGGAGAACTTAAGAAAATTTACAATGCTAACGAAAAATGTCTAACTGAA:1 - chrX 15258992 3' + roo 411 1 79.21 TTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGCGTCACACAAGCGTCAGTTCCGCATGAAATGTGTAC:1 - chr3R 27435042 3' - jockey 4682 1 62.38 ATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAATTTTGATTTGGAATCAAGCAAAACAGAGAAATCGACAAAACAATGAGCATAGCAGCA:1 - chr2R 10223717 3' - hobo 296 1 69.31 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACTTTGCAACCCATATCAATTAAGCC:1 - chr2L 2912040 3' + 297 6929 2 80.20 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTATTGTATTGCCTCAACTATCTGATACCGGAAGTGCTAAGGAG:1 + chr2R 17650017 3' + 1360 3356 1 60.40 AAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTT:1 - chr3L 17215728 3' - Ivk 40 1 60.40 GTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCATGGTTAGAGGAACCTATCGCTGGTAACCAATTCTGCGCAGGAAACTGGGATAG:1 - chr2L 14783715 3' - R1A1-element 4922 1 69.31 GAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAATATGAATACTCTAAGTTAACAACTTATAATATAATAATTTATA:1 - chr3L 22724130 3' - 1360 463 1 77.23 CCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCACAACAACAACTATTGACAA:1 + chr2L 1195084 3' - hobo 2857 1 52.48 GCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAA:1 + chrX 21668052 3' - Tabor 55 2 78.22 TAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGATTCCAGATTTCCTCGGCTGTC:2 + chr2L 20144472 3' + P-element 2740 1 26.73 TTCCTATTACAGTTATTAAATAAAATGCCCAAAACAAACGCATTAAAGCTAAGGCCTGAAGAATGGACAACGCTAATTGCGAGCCACAATAAAAGCGGCTG:1 - chr3L 21911973 3' + Bari1 355 1 65.35 CAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCACTCTTCCGACTCGAGCCGGCTTAATTAAATTAAAACTTTAATT:1 + chr3R 11659410 3' - roo 155 2 57.43 TGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAGTTTGAAAAGAGCTTGTAGCCCTTTTGAATAAATTAATGT:1 - chr3R 27432366 3' - hopper 1113 1 60.40 TGTTAAAAAAGATATAGCAAAACATAGTAAAATGTAATGTCGTCCTTTTGGCTTTGGCCC:1 + chr2L 19820911 3' + G4 3578 1 55.00 GCAGTCCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATGTAAGTGAGTGAGTGAGTGCACACTG:1 + chr3L 3476401 3' - jockey 4686 1 68.69 AAAAAATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTACCAACTTGTCCGACACCCCTGCTTTTTTCCTTGGTCGTTGCTCGTTGTAGCTGTAGCTGA:1 - chrX 7464880 3' + I-element 4963 1 50.50 TGGCGCAGCCGGTCAACGGACAAGGGATTAACAATGCCAGCATAAACACGCTTAAAGAATGAATGAGACTGGAGAGTCGAGACAAGTTCGCCTTGAGGTCT:1 + chr3R 21969299 3' - accord2 7416 1 71.29 AAGCCCCGCTTCACGTAAGCCCAAAACCCTTATCAACAAAATCTTGATAAACAAATGATCACCAGAGGGCACTAACACCGATGTTGATCGACTAACGC:1 + chrX 1640522 3' + I-element 48 1 60.20 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTCAATGGGCCGCAACGACAGCTTTACGGCCTTTACCCTTTGACGCGTGCCGTC:1 - chr3R 23080820 3' - 412 22 2 58.42 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCTGACCAATGTCCACCCGAAAAACCCCATCGCTTTTCCGCAAAACTTTTCGTCAATAAAATATGTG:1 + chr3R 15054387 3' + hobo 2928 1 68.32 CCAATATGGACGTATGGAATGGAACTCTGGGGAATTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCAATAACAATAACGTCGTATGCTCAACGAGCCGAGGCTTCAGTC:1 + chr2L 7282706 3' + Porto1 4263 1 53.47 TACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCTGTCGCGACACAAAGCCGACACAAAGAAGTC:1 - chrX 22869237 3' - Idefix 7132 2 69.31 GAGCCAGGCTCTTAAGGAAAGAGTAAAGTTAGAGGATCCGAGTAAAAATACGGGCACAAAGCATGCTCCGCTCGCCGCAGTCAAAATATCCGGCGGTGCCA:1 - chrX 20947443 3' + Gypsy12A_LTR 1931 1 81.19 GTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAGAGTCAATATAATCTTCAATTTGAATTTAGCATTAGAAAAA:1 - chr2L 18773309 3' - Max-element 38 2 66.34 AAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGACCCCACGAGCTCCGCCTTTTTATAGCCAACCACCCACTCGAGCAGCA:1 + chr2L 11561851 3' - transib2 26 1 51.00 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATATATAGAAATTCAGAAACGATACAAAATATGGAGTATAAAAATTTAAATGACTCCCTAAA:1 + chr2L 17066893 3' + copia 241 1 65.35 AACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAA:1 - chr3L 25232775 3' + accord2 165 2 59.41 GAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGT:1 - chr3L 5267234 3' - Juan 4020 1 70.30 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGTGTTTCGCATATCTCCCCGTAATCACTTTCATTGCCTGAGAGAGAAAGAGAGATAGA:1 - 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chrX 10822929 3' + accord 179 2 73.27 GGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCCAACTTTCAAACAGCCAAGTGAAA:1 - chr3L 13674656 3' + hobo 2893 1 74.74 CGTACATACACGCACACACACAGGCGCGCTGAGCATCAAGAAGATGACCTACAGTACCAAACACGCGGCAAAAACCGTGGAGGATATGGCAGCCACCTCGA:1 - chr3R 13126917 3' - Stalker 445 1 74.26 CATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - invader4 194 2 59.57 AAGACAGCCGAAGGACCTCATCATACGGTCCCCCTTGAGGAGAACCAGGAGATGATGATATTCTCATAATTGTTATAATGCATAGGGAAAGTTGCTTCCTT:1 + chr3L 18346355 3' + BS3 1567 1 76.24 AAGTATAAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGTGATGTGTATGTTTTTACTATTTTTTTTTTTAAGATAAAATGGACGCTAGCCTGTCAATTAGC:1 - chr3R 24901105 3' - diver2 4561 2 73.27 GTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGGTTTTGTTTGTGAGATGATAGGTAATGTGGGGCTGTGCTGGATATATAGGTGAGCCTTATGTAAACAATTTTC:1 - chr3L 8002229 3' - jockey 137 1 46.53 ATTTTCCTTTTTTATTTTCATTCACATTATGTTTATAAAGTGGCAGCATACATATACGATTGCAGATATCCCCCCAATACACATACCAACACACTCTTGCA:1 + chr3L 6705799 3' - Doc2-element 247 1 71.29 TCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGGCGTATACGAACTTGGCCGGAAAATAGTGGGCGGCTTTTGGTTGCGATTAAAATCAGCTGCGCATTCA:1 + chr3L 7742803 3' - Doc 12 1 67.68 CTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATG:1 + chr3R 4571525 3' - Porto1 346 1 64.36 GAATCGTTCCCTTCTTTCGACCACCATGCGGAGTGTGCGTTTGTGGGTTGCGGGGCTTTTTCTGTGGTTTTTTGAATATGTCTCATTTTGTGATTGTGCCC:1 + chr3R 28435218 3' + 3S18 472 1 70.30 GGAACAGCCTCTAAGACACAGCTCAATAGGTTTAGAGAAATACAAACGGAGCTGCATCAGTACATAGTTGAGTACACGTGTCTCCTGCTTTGTCTTGATGG:1 - chr2L 19447036 3' + G5A 2452 1 59.41 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATGGGTAGGCTTTATGTAAATATTTAATGCTTACTTT:1 + chr3L 13608374 3' + mdg1 7419 2 63.37 CTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTACATTTCCATAGCGAGCATCCGCAACAACAACCACAATGTAAGCGCGATGCGTGCAGAGTCAA:1 + chr3L 17491839 3' + 1360 3247 1 48.51 ATAAACGGGAATGCGCGACCTTCATCCGTCTACGCACACCATATCCGATCGCATCCGCTCAGCTTTTAGGCCAGTGCATGTACGATGACAGCTGTAGTGGA:1 + chrX 875727 3' + Ivk 5019 1 70.30 AGGAATCCGCGAGACGCGGCATTGGGTGGCGTGTGACAGGAAAAGGATGCTAAAGAGCATCAGCAGGCAAATGCGGAAAATACATTTTTCCCTCTTCGAGA:1 - chr3R 4608955 3' + invader3 5370 2 71.29 GGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTATATTTCGGGCCTCTTGTCTGATGTTGATAATGAAAAAGTTTTGATTGCTATTTGATTTGAG:1 + chr3L 9172435 3' - 412 493 2 66.34 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGTGCAGAAACATTTGGCTGCAAAAAAGAAGCT:1 - chr3L 21967032 3' - Doc 48 1 73.27 CTTTTCGCTACAGATATAAATGAATATGATCAAGAATTGAGCGTGCTTGCAACAACAGAATAGTCGAGCGACGGAATGAAGTCGCTTTTAATTAATACCAG:1 + chr3L 10470583 3' - Gypsy12A_LTR 2139 1 63.37 TGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTAAACGTGTTGGCCTGCCTTTATTGGTTTTGCTCCCAGGCATTGGGATTGGGTTTTGTTTTCAGATTCGGCTT:1 + chrX 18974127 3' - Quasimodo 62 2 71.29 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTGCCGAACAGTATATCGTGAATTAAAAATGTCTGGTCTAAATCTTAAGACATCGTTT:1 - chr3L 25608308 3' - Doc 21 1 50.50 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATTATAATGCCGGGCCAAAAGCAAGCCAAACCGAATCGAG:1 + chr3L 14285098 3' - roo 8670 2 74.26 GCTGGTAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACCTAATATATTGGACATACATACTTATATGGGGAGTCCTTTTTTCGATCGTCTGCAACTGCGTCGCACT:1 - chr3L 18346903 3' + Gypsy6A_LTR 266 1 57.43 GGTCCTTTCGTCGGAGATGGGAAGGACTGCAGATGTGTTTGTTACCGAGTTGATTAAATTATGCCACTGCAGACGTGTGAAATTTGAACTGTCCATGGGTC:1 + chr3L 18152464 3' - F-element 4514 1 74.26 CAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTTATTAAGCGAGTGTACATATATCCGTATATACACCCTCGATCGGACGATCTTTATCTGAGGAG:1 - chr2L 3853138 3' - mdg1 374 2 53.47 AGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAAAAGAAACGTCAAAACGGCCACGACAGTGTAGAGAGAAA:1 + chr2R 13806177 3' - Max-element 39 2 63.37 TTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTCCCACTTCAACCACGCCTACTACCGGTTGCCCAGCTGGAAAAAAATTGGAACTTGA:1 + chr2R 12271960 3' - mdg3 195 2 46.53 TCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAACTTTTACCTTATCAATCGAGCAAT:2 - chr2R 3293743 3' + 1731 4595 1 54.46 TGGTAGCGGGGGACTAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTTCTTCGTTTTGCTGCACACTTTGTTTAC:1 + chr3R 16281463 3' - accord 6973 2 69.31 AAAAAGAAAAAAGAAGTGGAAAACGGCAGCAGCGAAAAAGGAAATCGTTAAATTGCTTGCCAAGTGTGATATATAATTATTATGAGCGTTTTCCCCCATTG:1 - 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chrX 12753040 3' + GATE 267 1 55.45 TGAGGGGATGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAGTTGGGGTTTTTCCACTCTCGAGAAACATATGAGCTGTAAGCTGCGCTGTGTTGGGC:1 + chr2L 22181537 3' - Idefix 186 1 75.25 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTAACGATAAAAAAAAA:1 + chrX 10119648 3' - FB 13 1 64.36 CTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCAAGATATGCCTGGGAACTGTGAGCTGAGAGTCGAACGAACTGACGCAACGGCGA:1 + chrX 10822718 3' - Tabor 6983 2 65.35 CCACAACAAAATCGCCAGGACGATTACCGGCTGCGAATGGTACGTAAGGAACACAACCTCAAGATAGCCAGTTCTCAAATTCTTACCGTTTCCAGCTTTAA:1 + chr3L 5101259 3' + BS3 1369 1 69.31 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATATATAGAAATTCAGAAACGATACAAAATAT:1 + chr2L 17066863 3' + copia 211 2 73.27 TTCAAAGAAAACAGTAATGCACTTAGGTTATTTCATTTTGCTTCAAAAAAGCATTCTACGTTGCTGCGTTCGAACCAAGGCTGACATAACGTCTGAAATC:1 + chr4 1242071 3' + 297 6623 2 73.00 ATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTGAAAAAAATAAAAAAAAATTTTAAAAGAGTTAAAAAAAAATTGTTTATATCCAAAGGAGGCA:1 - chr3R 16733619 3' - invader2 231 2 54.46 TGTACTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAAATCACAAAAAGTCTCCAAGTCTTTTTCAAGTCAGGCGTTAGGGAAACTTGGATGTTATGC:1 + chr3R 1439547 3' + 297 356 2 52.48 GCGAACAACGCACAAAAGGGAGAATAAACAAAACACAAAGACGAAAAATCGATGGCAAGCCAACAACAACAAATGTAATGAAAAGCAACTACAACAGATAG:1 + chr2L 12543227 3' - Cr1a 222 1 56.44 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGTAAGTGCTTACTATAAATGTTAAATCAAATGATTTTTACCATTAGCAAGGAAATTATCCTTGTCA:1 - chr2L 436854 3' + roo 399 1 67.33 GACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCCATCATCATCAACTTTTGTCGCCTGACTTTTTCTCGT:1 - chr3L 5266315 3' - Juan 3981 1 35.64 GTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCTCCTTACCTCCTAACTTACTTGCCTCTCCCATCAATCCGAACTCTTCTGTCTGTATCTCCAACTCGTGTTTGTTT:1 + chrX 2669466 3' + Ivk 3 1 61.39 GCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCT:2 + chrX 20999590 3' - BS 13 1 57.43 CTTTTAAAATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGCTGTTATAATAAAACAAATGGCAGCCCCATTTAATTGCTGGCCATAAATGTGCTTGGTCCTGCGTACA:1 + chr3R 8201867 3' - 1360 3005 1 73.27 TTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACCCGCTCACAGATAACACCCATAACTGACTTGACTCGACTCGACTTGACTCAATAAAAAAGATGACAAAGCGCCCAA:1 - chr2L 11474710 3' - jockey 4915 1 79.21 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGTTTAATTTAGCATTAATGAAAAGTGCAACAC:1 + chr2R 21860547 3' + roo 9027 1 71.29 TATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTACGAGTTGCATTTGGGTGAGTTACATAAATAAATGTTCTAACTAATAAATAACTAAATGTTCTAAA:1 - chr3L 25961309 3' + Cr1a 4135 1 64.36 TGTATTATATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACAGTCAATACGCACAACT:2 + chr2R 4023398 3' - Doc2-element 74 1 58.42 CAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTACTCGCCTATTTTTG:1 - chr3R 25090264 3' - TAHRE 10400 1 80.00 TAAGAGCGGCAGAGAGTCATGATTACAGATAACAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAGACAGAAAAGTAAAAGATTTTCTTAAAGTATTTAAGA:1 - chr3L 24796677 3' - Cr1a 4237 1 63.37 AGGAGGTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGTAGTGGGAAACTTCTTGGCACTTTCATGAA:1 + chr3R 25514174 3' - hopper 27 1 59.55 CACACGGGCTTTATTATAGCTTTGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTGGTTGCAGATTTTCGAACTCACGCTTGATTTGAATAATTAACAGGAAAATG:1 - chr2R 11174813 3' - G4 3409 1 62.38 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCG:1 - chrX 4056281 3' - roo 48 2 74.26 TCCTGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGTACCTGAAAAGAAATAAATTAGCTTGATAAATTAAAAAAGAAATAAATTAGCTTAATAAATTTAA:1 + chrX 3374285 3' + TAHRE 10085 1 58.42 CCCCCACAGGTTTTCAATCGGGCTTAAATCGGAAGATTGTGCTGTGGATCCTCGCAATCGTCGCCCTCGCAGGTGTAACAGCTGAGGCGGTCTTCGGGCAA:1 + chr2R 21823003 3' - HB 1155 1 58.42 CACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCAATACAATCCAAGCTATTCAAATAGCGACTAACATAATATCTTAAATATTCATAAA:1 - chr3L 14293227 3' + Doc 494 1 50.50 ATTATTTGAACATTCTCGCTGAGCCAAAAGGCCAGCGATCGACAAAGAGGGTTAGTCATTCCTCAAAACTGATATTCACATATATCTTTAGCTTACCTCAT:1 - chrX 10031493 3' + gtwin 318 2 57.43 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTTCAACCAAGAATGACAACAACAA:1 - chrX 10210935 3' - I-element 22 1 59.41 ACAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACACACACACAAACATCAGCAGTGTGTCGCCCAAAGGGCAAC:1 + chrX 3446029 3' + Quasimodo 16 2 53.09 GTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGTTATGCCTTATGTGTGTGGATGAGTATGGGTGTCTGGGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 9418240 3' + transib2 290 1 60.40 TACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGCGGACAAACGACGATCTGGACTGCTCCAACTTTAAAAAGGAAGATGAAATTAATAGATTGATTGAGGTTTTAT:1 - chr4 173182 3' + TAHRE 10428 2 49.50 GGACCATGTACCCGAGCGGGCCGTGCGTTAAAGGGAAAATAACGAGCTCCCCGCGGCCTTCGTTTTCAGCCTGGCAGTGTTAGCCTAACCCCGTCGACTTG:1 - chr3R 2451803 3' + gypsy8 286 1 58.42 GAGCGGAGCTGTAGCGTCGGAGACAAAATCAGAACTGAATATAAAATACAAGAATTCAAACTTAGGAGCTAGCATGCAAACGGTCACATCCTTGGAGAGTC:1 - chr3L 13730781 3' - gypsy2 215 2 79.21 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACTGACTTCATCAATATCCTCGGGAAGGTCTTGTAGCTCTTCGTAGC:1 - chr2L 5269799 3' + hobo 2908 1 57.43 TCGAGCTCCGTATAAAATCACTTGATTTTAGTGAAGTAAATCGACTCATGAAAGCGGAAGCGGACAAGCAAGTCGGCGCGGGGGTGGGCAGGGGTTCGCTG:1 - chrX 1899930 3' + Doc3-element 31 1 67.33 CAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCGAAGGAGGAACAGGAGCCCTTGGCCAGTCCAA:1 - chr2L 1238537 3' + F-element 4425 1 68.32 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGAACCGCCAAACCACCGCTGCAGCGCGCTGGCAGGCTAAATGTTAC:1 + chr3R 28196764 3' + hopper 1410 2 60.53 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACCCTAGTTCGACTGCCAAACCCAGATTTGAGACGAAAGACCGAAAACT:1 + chr3R 24229157 3' + 1360 3363 1 55.45 AGAAAAACATCTAAAGGATTTCATCTATAAAACTTGGATTGGAGGGCAAAACACGAAACTCGCCCAAACACATACAAGCGAAATCAGCAGAGTGTGAAATG:1 - 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Doc 40 1 61.19 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCATCGGCGAGGCCT:1 + chr3L 9174740 3' + 412 7504 2 70.00 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTATAAGTTTGATTATATTTATTTGATCTTATCCATAACAGTGATGTTG:1 - chr3L 21275753 3' - Quasimodo 23 2 59.00 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACAAATCATTTAAAATAAAATAAAAAGTTTGTT:1 + chr2L 18093855 3' + roo 9022 2 76.24 GCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCGGCTGAATGTTTAGCGTCTCGGGGGCCATTTATAGTTACGCTCGACTTCAC:1 + chr3L 7752207 3' + Doc 311 1 54.46 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCACACGCACACACCCACACATAGCCACACACATACATCAAGTTTTCACAAAAAGCAACGC:1 - chrX 6146644 3' - hobo 17 1 62.38 AGTAGATTCACTAAAAACTATATACCCCTTATATGAGTTGTTGATGGCGCGATTTCCGTTTTATGTTTAACTTATTATCGTTAATATTTAATGAGAACTTT:1 - chr3R 904131 3' + Cr1a 4115 1 68.32 GGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATGTAAGTGAGTGAGTGAGTGCACACTGTATGTTGCGAAGGCAAATTGCACCCGGGGTC:1 + chr3L 3476432 3' - jockey 4656 1 59.00 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTCTTTTTGGTTTTTTGCGGCGCCCATCAATCACCAGCCGTGGAATGTGTGACACACATTAAACGTAAC:2 + chr3L 10565378 3' + pogo 2098 1 74.26 TAAGAACTTTAACATTGTAACACACACATACATATTCACTGTCCCCTCTTAATTTTCCATTTTTCCCACTCCATTAGCAACACTTTACACTGCCATTTAGC:1 - chrX 3197704 3' + ZAM 252 2 68.32 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGATCAATGGGCCGCAACGACAGCTTTACGGCCTTTACCCTTTGACGCGTGC:1 - chr3R 23080824 3' - 412 7079 2 52.48 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAAATGGGTGGGCCAAATGTGGCCT:1 + chrX 12818914 3' + roo 397 1 67.33 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTGAAATGCCATATTTCATTGCATAGCTTGAAAAAGTTGTATGTTTGTATCATA:1 + chr3R 7694234 3' - jockey 4669 1 50.50 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCCGACAAAACGAAGATCGTCGCCGGCAGCA:1 + chrX 10585453 3' + P-element 2841 1 34.00 TCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGGCCTTGAAGTTGTGCTGGTGGTGGTGGTTGTGCTTCTGGTGGTGCTACCCGTTCGGTGGGGCAGCTTGAGCA:1 + chrX 17086783 3' - Doc 4504 1 76.24 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTTTTTTTTAATTTGAAGAGTAT:1 - chr2R 22127712 3' - pogo 48 1 76.24 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCACCACCCCCACACCCCCTGACTACCATCCCTTCGTATCTGTCATCTGGCCATTGTGAGTTTTCCCTTGGAAAG:1 + chr3R 28940814 3' + hobo 2936 1 70.71 AAAATAACTATATTAATTGTTAGTGTTTGTATGTTCAAAAAAAAAAAGTTTTCTCGTCGTGTTTTTCAATGCATTTTCACTTACTGCAAACTTGGCACTTT:1 + chr3R 8856404 3' - Cr1a 4308 1 71.29 AAAATTAAAATTTTCCTAAAAAAAGGAAATTGGGAATGGAGGGAGGTGAGCGACAGACAGGTGATATTTATGCATGCTTACATTGCAGCCTCTGTCTCCGC:1 + chr3R 4987771 3' + HMS-Beagle 329 1 75.25 GTGGCTGTCTCCATCACACAGTGTTGGCCCGAGTACTCACCGGCAAAAGGCAGAAATAAGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + Rt1c 92 1 49.50 TTATGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCATAAATGATTTGTGGGCTATATGAAAAGCTCTCAAGTTATGTGGGAAAAGAGAAATTTCCTCGTCGCACAAC:1 + chr3L 6395110 3' + Cr1a 471 1 55.45 TTGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTTTTTTGGGATAATTTACAGGCCCGCGGTACGGATACGTGTAGGTAGATGATGGTGATAAACATCGCAC:1 + chr2L 7532659 3' - G6 1877 1 72.28 TCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCCTTAGCATTCACTAATGAAACTCTTTTCATTTGCACTTTCTTCATTTAACCGGC:1 - chr3R 18887293 3' + 297 43 2 53.47 ACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAAGCATGTGCAAAGTGTCAGAAGAAATCAAAAATGAAATTATGCAAGCAGATG:1 + chr3L 8036759 3' + I-element 177 1 58.42 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATAAAAAAAAATAATTAATTTGGTAGGCACCTCGTCTGAAAGTACTTCTCATCGACGAA:1 + chr3L 19927578 3' + jockey 4979 1 51.49 ATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGCTTGTCGCGCACGAAATATCCGAGGATCCAGAATGTGTTCTTCTTCATTGTAATGA:1 - chr2L 6659202 3' - accord 7270 2 62.38 GACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACAGACAGCCCGCTCATATTTAATTTGAATAAGAAATTAGCAACTTCTTTTCAG:1 - chr3R 15038953 3' + F-element 401 1 57.29 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGCCTTCGGAGGGAATTTAATACCTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGAACAGGAAAAG:1 + chr2L 10023718 3' + roo 388 2 51.49 CGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAATCTTTTCGACATTTTAATTAGAATCGCACGGCTTATTAAGCCTTGGCGGAACTAATTGAT:1 + chr3R 20880816 3' + I-element 441 1 67.33 AAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCCGCTTGGTTAGAAAGGGAAAATAATTTTCAATAAAACTTGCGAGAAGCATAAGCAAA:1 + chr2L 3349960 3' + micropia 5181 1 62.38 TGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTGCAAACAGAGACGGATAAAAGTTTGGCTGAAAGAAGTTTTTCATC:1 - chr2R 11111404 3' - F-element 314 1 55.45 TCTTTTCCCTTTTTTTTTTTGTCTGTCACATTAGCGACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGGGTTGTTGTAATGAAAA:1 - chrX 7480761 3' - Bica 339 2 63.00 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATTTGAAACCGTACTATGTACTTTTAAATTT:1 + chr3R 6425916 3' + copia 237 1 58.42 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGTGGTGGAGCTTCGGCAGTCTGGAGGGCCAAAGGATA:1 - chr3R 28940726 3' - hobo 42 1 63.37 CATAAAAATTACAAAAAAAAAAAGAATTCGCTCGCCTTTTTGGGCTGATTGCTGTGTGCGATTTCGCCTCAGTTGTTCTGGCTCAGCTATCTTGTTTGGA:1 + chr2L 15205608 3' + Doc 4694 1 61.00 TTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGAAAAGAGAGCAATTTTGGCCAACACAAACATCCACACTAGCTAGACGGACAGCTAAATGAAATGC:1 + chr2L 12361558 3' + 1360 3280 1 53.47 TTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACGCGTTGTCGTCGTTGTTTTAGCT:1 - chr3R 5685189 3' - jockey 165 1 77.23 GTTATTTTACATTTTATTCATTTCCTCTATATCTTCTCGCAAATCGAACTAGTTGGCTTGTTTGGCATTATAGGGGGCGAAAGCTTTTTCTCTATCAATTT:1 + chr3L 15210057 3' + Cr1a 4322 1 63.37 GATTGCACTCAATTAGATCTCAACTATTTGGTACACATAGTCTTTCGAATTTTTATGTGAATATATCCCTAAACCCGATTGCTGGGCAGACGAGTGGAGTG:1 - chr3L 27665869 3' + Ivk 5166 1 55.45 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGGAATCGTAGGAATCAACTCATCATTGAACGAAGGTGGATTGAAGGGCTGAAGG:1 + chrX 1252857 3' - hobo 23 1 54.46 AAATAAAAACTGTTCCAAGCATCGTTCTACGGTTACCTAGGGAAGGTGAAGCAGTGGGATGGCGATAACTTCGAGAAGATTCTTACCTTACCTGGACACAT:1 + chr3R 18285770 3' - Cr1a 4028 1 58.42 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGCACAGAAATATCGCCTCGACTATATAATTTAGGGCAGCCCGAAAATATTATT:1 + chr2R 10345684 3' + roo 9049 2 57.43 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTAAATTAAGAGTGTCCAAAAAAGCTATTTTTATTCCATCAGGATCTCTTGATTT:1 - chr3L 10792154 3' + pogo 2085 1 68.32 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATAGAAATCTCTTAAAAAGGCAATCATTTATTTACTG:1 + chrX 14965227 3' - FB 42 1 66.34 GAGTTAGAAGTTTGGAAAAGTACTGGGCAAGCTCGCAGACAATTACAGCGGTGCGATTAAAATTCGATAATAAAGTGGGAATAAAGGAATCCCTGGAAGAG:1 - chr3L 12221425 3' - 3S18 146 2 56.44 GCGACGCTGCCGACGCCCACACTTGGCCGGTATCAAGTGTAGGAGAGACAAGGAAGAACCAGCTACCGCTACTAGAGGAATGAAACGGAAGACTTCAGAGA:1 + chr2R 4837465 3' + HMS-Beagle2 191 2 74.26 GGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATACACTTGAACTTCTCAACTTTTTGTCCTCCGTCTTTTCCTCCTTTTTTTTTT:1 + chrX 17792727 3' - INE-1 87 1 58.23 CTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAAACACACATACACCCTGCAATAAGGCAACAG:1 + chrX 22502119 3' - Stalker 269 4 75.25 CTAATATAAAGCCATTTTTGAAATTTATTTTTGTATGATATTCATTTTAGAAAGTTTAATGGTCAAAGTGGTAAGATATCGAAAATTTCATAACTTTTGCA:1 + chr2L 7748018 3' - 1360 380 1 72.28 CCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTCATTGGAATGCAAACATAACGCATACGCAGCGTTGGCAATTTTGGAGAAGAGACCGAAGCTGTAGGCC:1 - chrX 1018347 3' + transib2 2816 1 71.29 GACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGAGAGGTGTACAGCTTTCAGGCAGTTCAATCA:1 - chr2L 1588583 3' - mdg1 179 2 70.30 GCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGATTTTCTTCGACTCCGGGCAAAGTTGACACCTGAGCTATCTAAGC:1 - chrX 14514724 3' - micropia 365 2 57.43 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCAATGCACATTGTGCATTGTGTTTTTCGCAGAGATGTGTATATGTCTATGTCACCAATTACTTATTTCAGTAAGA:1 - chrX 19819946 3' - hobo 2 1 77.23 ATCGACAACAAGGTCCGAGTCGTTACAGTGAAGACTGCTCACGTATCATGTGCGGAGGGGTATTTGTGGCAGGCAAA:1 + chr3L 22774913 3' + 3S18 5650 1 55.84 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTTTATTTTAATAAAGACTTTTAATTGAATTTT:1 - chr3R 6135233 3' - I-element 43 1 67.33 ACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCCCGTATGTTTACTTAAAGTTCTGTGATTATTAATTGTCATTGCGGCAGTTTCGTTAACTA:1 + chr4 1174317 3' + 1360 390 1 61.39 CGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATCGGGGCGTGGCAGCTGAGCGGTCCATTTAAAGCTGATTACTCTGAATGCATCTTGGCTGGGTGACATCGATTA:1 + chr2L 20633734 3' - Idefix 245 2 74.26 CTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGAGCCTTTTATTGTTAGTGTCGCTGTCGCAATGTTCATCTTTTGTTTCAAT:1 + chr2R 14552300 3' - 1360 3249 1 58.42 TGAACTCCAGACTAAGAGGAGAGCGAGCATTTATATTACGGACTATCAGTTTACCTAGCGGTTCCAGCAATTCATCGTTAACAAGTATATAAGTTTATAAT:1 + chr3L 10220482 3' - Doc 4232 1 55.45 TGCGCAAATGTTTGTGATGGTTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATGAAAAGAAGGCATGCGTGCGTTTAAT:1 - chr3L 10035735 3' - jockey 81 1 72.00 TTCCCCCCGTAGAAGTATGCAGCATTTTTTAAATCAAATGACCATACATCATACAAGACTGATAAAATCATAGCTTATGGTATATTTTTAAAATGTAGTAA:1 + chr2L 20062500 3' - Transib5 2817 1 89.11 AAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCAAACTGCAATTCGATACATTTATTATTCGTTTGTTATTCTTTCTTACATCAATT:1 + chr2R 19478977 3' + Idefix 7122 2 62.38 GTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATGGGAAGCGCTTATTTTCGGGCAGATTTTGCCGGCTTTAGTTAAGGGCGCAATGCCACACAAAGTGG:1 + chr2R 18735329 3' - F-element 334 1 74.26 AAATTTGGGTGGGATTGTTTGAGGTAATCGCACGTGTGTTAGCCTCACACATTCTGTTTGGGTAAAAGTTGTTATTTGTATTTTGGATTTGGTTCGCAGGG:1 - chr2R 2145000 3' - I-element 4894 1 81.19 GTGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGTCGTAAATGAGAAATAAAAACGGGTTGTGGGCATCATGCAGGCTTGCGG:1 - chr2R 17343033 3' - hobo 2710 1 57.00 TTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTATTGGCAACATGAAGGAGCGGGTCAAGGAAATGAAGGTGTTCGGCTGC:1 - chr2L 8271994 3' + 1360 3018 1 60.40 TTTTTCTTCCTCTAGTGACTTTAGTAAGCCCCGACCCACGACCCCCGACCTCTGACCTCCGGCCCACATGGGTTAAGGCGTCCTGGAGCCTGGCGTTAGAA:1 - chrX 17384594 3' - baggins 4989 1 72.28 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCCACTTTTAATGTGGTG:1 + chr2L 11805053 3' - P-element 58 1 22.00 TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGACCAGAGACTTATCTGGGAGTGTTCTTGGCTGTCATTGTCTTGAACTGGTCGTGTTGCTTA:1 + chr2R 6783251 3' - Tabor 6854 2 65.35 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGTGTTTCGCATATCTCCCCGTAATCACTTTCATTGCCTGAGAGAGAAAGAGAGATAGAACGCGG:1 - chr3R 12058599 3' - roo 8676 2 67.33 ACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTTTGCCTTTAGTAATCGGTTATTAAATATTTAAGTAGGAAACATTTGATTAGAAAACAGATTCAAATATATTATT:1 - chr2R 7036577 3' - 1360 3150 1 75.25 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCACTACAAGTAAATGTTAATAACTATAAT:1 + chr3R 13122891 3' + Transpac 259 2 71.29 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTTGAAAATTAGTTGCTACT:1 + chr3L 13366429 3' - hopper 32 1 55.45 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCGTAAGTTGAACAGGCTCAAATAT:1 - chr2R 7037135 3' + 1360 3341 1 77.00 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCCACTTTTAATGTGGTGAGGTAGGAATGTTTCATTGATGTGTGTGTG:1 + chr2L 11805083 3' - P-element 26 1 53.06 ATTTACATAAGATATGAACGGAGGCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCAATTGATTTCGAATTGCAGCAGTGTCA:1 + chr2R 11372239 3' - roo 48 2 73.27 CAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTGGTCGAACTGAGCATTCTGGATTTGCAATTACAGAGTTTGCTATTTGGCCTTCGGTGTTTAGCAGTATC:1 - chr3R 7832846 3' + 3S18 332 2 70.30 AAAATAAAATAGTTTTAAACAATTCAAAGCAATTCTTCGTTATGGGGCGTTAAAAGTTGTTAAGAAATTGGGGAATTAATAGCTAATTACAAAATAGAGAG:1 + chrX 12078529 3' - 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I-element 5307 1 58.42 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACTTTAAATTAATACCCAAATATATTATA:1 + chr2R 12370618 3' + roo 9025 2 78.22 AGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCACTAATTCGCTGGGATGCTTCGCTTCGCTTAATTGCAGCCGCAGCGGA:1 - chr2R 19090462 3' - F-element 4594 1 66.34 CATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCCATTTCTCTAGAGACAAGCGAAAAGCTAGCAATCTGATAAATAAAAG:1 + chrX 1696644 3' + 1360 201 1 74.68 AACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACAGTGGTTAATATTAATTACAGAAATAATCTGTAAAAAATCATTGCATACTTCTAGGTATGTAAAGAGTC:1 + chr2L 4888820 3' - BS 5001 1 64.36 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAATGTATGTGATGGCTTATCAGACACCGGCAGCAAATCGTACCTCAATTAACCCATTAACGACCCTTCTC:1 - chr3R 24023287 3' - roo 8671 2 70.30 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGTGTTTCGCATATCTCCCCGTAATCACTTTCATTGCCTGAGAGAGAAAGAGAGAT:2 - chr3R 12058608 3' - roo 21 2 58.42 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCAGGAAAGATTTATAATTGTAGCAACAT:1 - chr4 311179 3' + 1360 3387 2 77.23 AGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAAATTTTTTATTTGTTAGGCATTACTGTGCCGCGTGGAGTGTTGCACATGCAGTTGCAGTTTCGGCC:1 + chr3R 19123333 3' - Stalker4 6894 2 59.41 AGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTTTACATTTACATTAAGTCAAATGACTTCGTGTGATTGCTGCAAAGGATGCGGACACCTTTGGTA:1 + chr2R 15370620 3' - 1360 3332 1 63.37 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAAGCAAAAAGTCCTTGGTTGGAGTCA:1 + chr3R 12058668 3' + roo 356 2 74.26 TTTTTTCCCTATATACACATTCCATTTAACAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTTTGAAGTGATATGACAGTGGTCGTTTAGCTTTTGGCTAT:1 - chr2R 5516709 3' - HB 115 1 62.38 TTGAATGTTTACGTTGAGGAGAGCCTCAGAGAGAGCAGACGAAACTGCTAGGTCCGGACTTCCGGTTAGACCCCTATAGCCCAGAACACTCGAATCGGCCA:1 - chr2R 17848048 3' - McClintock 91 2 53.47 CCAAAAAATGGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTGGCACTTCCTCTTTCTGTTTTCTATTCTTGGCTTTGGCAAATGTTTATCATAATTAGGC:1 + chr3L 10991942 3' - 1360 26 1 64.36 ATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCATCAATCACAATCTGTTTGAGGAACT:1 - chr2L 18121017 3' - flea 368 1 75.25 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGAAACTCATATTAATGTTTAAATTATCTTTTAAATTTCAGTTTTCCAATGACCCTTTGTCTCCAAAACTTCTAAA:1 - chr2L 17887114 3' + hobo 2937 1 75.25 GGACGTTAGAGTGGGCGTGGCAATAACTTTGTTTTGCTAAAGAGAGTGCGAGATATGAAAACAAGAATGCGACTGCTTCCCAGATTGAACACCGAGATCAC:1 + chr4 550135 3' - 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Burdock 6148 2 65.35 CCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCATTCTGAAAATCGAAAGCAAAACGAGCAGACGTTTAATTTCCCTCAACAAAAT:1 - chr3L 27391762 3' + 1360 3146 1 54.46 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGCTTTAAACACACTTATTTTCTCAGTGCATGAATACTTACAGGGCCTGCAGTCGGAACTCTTCGTTTCTGTGAC:1 + chr3R 15631213 3' - opus 7115 2 78.22 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATTTGAACCAGAAAAGAGATACATCTTCATCTTTAATGCGAA:1 - chrX 21668239 3' + 412 460 2 57.43 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAACTCCATGGCGACTTTAAGGAAAATGCATC:1 + chr2L 16136655 3' - hobo 44 1 68.32 TTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACAGCCGCCCAAGAGCAAGACAGTTGTGCGGCCCAGGTGGAAATGGAAATGGAAG:1 - chrX 4565378 3' - F-element 489 1 50.00 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTAAATTAAGAGTGTCCAAAAAAGCTATTTTTATTCCATCAGGATCTCTTGATTTTAAATGAAACTTA:1 - chr3L 10792141 3' + pogo 2098 1 81.19 TCGGTCGTTTGGCGCTGCGTGAAAGTGGGCGGGGCGGGGCGGGGCGGTGCTGGTCAGTGGAATTAATTCTAATCCCGAAC:1 - chr2L 12547962 3' - Doc 457 1 75.00 CGTACAGAAAAATGCGGTGTGCATTAGTATTGATGGCTAGGATGGAAAATATAGAAAAGACGGCAGCATTTAGATCTCATTCGTTATGTGTGTGTGACAGT:1 + chr2L 14004123 3' + invader1 177 2 73.27 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAAGTTTTTGCATAACAAAT:2 - 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chr3R 17495174 3' - jockey 34 1 49.50 ACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCAATGCCATGATCCGATGATATGGTAATGGGTCTTACAGAGC:1 + chr2R 11437155 3' - P-element 404 1 50.50 TAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAATCGTGGCTTCATTACGAATTCTTCGAATTGTCCGCACCTTTTG:1 + chr2R 11086473 3' - Doc 30 1 51.65 TTTTCTTTAAAAAAAAAAATAAATTTTCTTTATATTTTTTTCGAATGTTTTTACATCTGCCTGTGCTTCCTGTTTCATTTCCAACATGACAGACATCATTC:1 + chr3L 8041975 3' + pogo 2025 2 60.40 AACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGACTCTGATGGGCTGAACCCTTTCTTTCTACCAACCTTCGAGTGGTAAGCGGGAAAATGGAAAGGAACCCAG:1 + chr2R 11086948 3' + Doc 76 1 75.25 ACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAGTTTCTTCTTTCCCTCCGTTTTTCGGTTTATCTCTGTGTTTTTATGCTGCTGTGAAA:1 - chr3R 28679928 3' + I-element 98 1 57.43 TCGAAGGGAGGAGACTGATTGGTTTGTGAATCATGGAAATAATACCGAGCTTCCAACGGTAGGAATGCCTGGCTGGGTTTCCTTTGCCGGCTGCTCTGTAT:1 + chr3L 6566589 3' - BS3 440 1 68.32 ATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGTGACACAAAGGCGCCTGAGAAGCAGGGCATCAAGGATGAGACCAATGAGGAGGCTGCCGGTGATGAG:1 + chr3L 7363181 3' - 1360 3209 1 77.23 CCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAGTTACTCCTAGAGTCTTTGGTCCCACAATGTAATCAATGTGTA:1 + chr2R 3594169 3' - gypsy12 37 2 57.43 GCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTTTGGGCGAAAAGGAAATGAAAAACAAAAGAAAAACACAGTGAAACAGTAGCAACCCTTTGCCGA:1 + chr2L 16362632 3' - F-element 349 1 69.07 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATGAATACAAAAACACCTAATGGGTTCAG:1 + chr2L 7504923 3' + roo 360 2 77.00 TGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATACAATTGATATTTACTAAACCTTCTAATCTTATTCGTGACATTCTAT:1 - chr3L 21851013 3' - jockey 343 1 71.29 ATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATTTCACAATATGGCACTGTTATCAAAAAGATT:1 + chr3R 9340856 3' + Quasimodo 9 2 72.28 GCTCCACCGCGTGCTCTGCCAGAAGGATGGTCTGCATGGATGAGGTCATATCCGCTGAGTTTCAAGCGGCCTGGGGTCAGAATGTCCAGGATGTTCTACTT:1 - chr2L 18841634 3' - G2 442 1 57.43 GCTTGCACACACACACACACACACACACACACAGATACAGATACGAGTACAGACACAGATACAGAGACAAATATGCCAAGGAGCAGGGTCAGCCATTTTGG:1 - chrX 10822931 3' + accord 7025 2 71.29 AAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGATTTCCTTGCAAAATTGAATGCGAAAGGCGAGATCAAATCCTTATGCCCTTTGTGGAACTTTTTCGC:1 + chr3L 18731726 3' - jockey 4769 1 68.32 TGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTTAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCA:1 + chr3R 23947648 3' - Tirant 9 2 67.33 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTCCTCGGACATGGCCAGCAATTTTCACTCGATGCA:1 - chr3L 14284982 3' + roo 9054 2 57.43 GAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCCACTACTGGTGACATCCGGCCCTCCTATTTATCCTACGCTCCAGCGA:1 + chr2R 20941660 3' - Doc 4486 1 53.47 AAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTTCTACCTCCGACCAGTTATTTA:1 + chr3R 20231215 3' - I-element 187 1 71.29 GAGATAAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACTTACACAAATAAATATTGTCTAAAACCTTAACCAAAAT:1 - chrX 22576309 3' + Burdock 6285 2 43.56 GCATTAAGGAAGACAGTCATCTTCCCAACGTAATCATCGTAAATTTCGAAGTGGATTTATCACCCTCTTCCTGATTGCAAGAAAACTCAATTAAAATTTAA:1 - chr3R 24483136 3' + gypsy3 6816 2 66.34 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGCGTGCGAGGCACGGATGTTTT:1 - chr2R 10191720 3' - 297 34 2 74.16 TCTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAATTATATGAATAAATGGTAATCGTACTTAAATTATGTGCCACGTGGCATAAAAAATA:1 + chrX 11461869 3' - diver2 366 1 69.31 GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTGGTGCCGCTGCTTAACATTCACCTACTTTT:1 - chr3L 4713775 3' + transib2 2781 1 67.33 AACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTCTGTTTTTATGAGATACACTCAA:1 + chr3R 28802157 3' + roo 8677 2 75.25 GGCGGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGGTTCTGTCGGAGCCAACTGCCGTCAAGGGTCCAGCTCTAAGTAAGCGGCTGCATC:1 - chr2R 24124693 3' - F-element 431 1 56.57 GCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGCTTTGTCTGCCTGTGAATGAATGGAGTGAGTCGAGCGTGGATAAGTGTTTGGCGACCAACTTG:1 - chr3L 1889721 3' + Stalker4 167 6 72.28 CTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTAGTTCTATTAGTTGTAAGTGTTGAGCAAGAAAAGTTAACAAAATATTCTCGGGCTATG:1 + chr3L 10859540 3' - Idefix 6920 2 61.39 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTCATATTTCATGCAGATTTTCAACTTG:1 + chr2L 19698297 3' + hobo 2888 1 75.25 TTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGCAGCTGTTGATACCGGTTAAGAATATAAACACTTTTTATGGCGGCA:1 - chr3R 4544304 3' - Quasimodo 7161 2 55.45 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGTTATAGCGGTATTGTTAAAGTTCTGCTAGAAGAATGTAAAAGCATGTGA:1 - chr2L 7504866 3' - roo 8691 2 57.43 GAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTATCCTGGCTGGATTTTTGCCCCTCTCCAAAACCTCCTTCCACCAACTTTGCTTTGTTT:1 - chr3R 21882592 3' - F-element 361 1 60.40 ATCGTTATTACTTCACTTCACTTCTCACTCACATTTGTAATCAGTCTTAAGTTCTTTGGCGGATAACACAGATTACAGGAATTAAAAATTTTATATTTTCG:1 + chr2L 16329281 3' + McClintock 167 2 53.47 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTGCCGAACAGTATATCGTGAATTAAAAATGTCTGG:1 - chr3L 25608330 3' - Doc 41 1 67.68 TTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCT:1 + chr3L 14152141 3' - blood 7065 2 79.21 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTTCATGAACAAGCAAGGTTTCGACTTTGTTT:1 + chr2L 20387896 3' + 297 6931 2 70.00 GTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATTAATGCATTTAATACTCGTACTCGGTTACATTAATATACGAGTGAGA:1 - chr3L 7412417 3' - invader3 30 2 53.47 GCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGTTCCCCTCGAAATTCAGGTAATGTTGATCTTCCTCTTGGTCTTCCGGTGTTAACTGCTCGTT:1 + chrX 19206034 3' - Porto1 397 1 68.32 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTGCGAGATCAGCTGCTCCCGTGCCTGGATGCGCAGGTCAATG:1 + chr3R 28879980 3' - roo 8699 2 61.39 TCTCCCTCCCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCCCAGTTCAACTCGATTCAGTCCCGTTCTGTTCTCCGCTCCGGCTT:1 + chr3L 14055255 3' + Doc 390 1 55.45 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCACACATCATTTATGCACTTCCTTTGAAAGAA:1 + chr2L 13711442 3' + hobo 2894 1 74.26 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAA:1 + chr3R 8914527 3' + roo 357 2 69.31 GGTTTCCGCCGATGGCCTACGCCTCGACTAATGTTTCCGGTTTGCCTTCTTTTCGATCTTGTCTTGGGACGATTTTTCCTTACGAACTTGACTTGCCAGCT:1 + chr3L 14406519 3' + gypsy12 206 2 58.42 CATTCGGACTTCTCAAAAATACTAACTAGAGCCTATCGATAACAATATTCGATCCGCAGGTGGCACCACCTCAAAGTTCAGGTAACGTGGGTTATTTTGTT:1 + chr2R 11235955 3' - aurora-element 4085 1 56.44 TTGTTTTCTTTTGTTTTTTTTTGCAAGCTCCAAGAACTTCTTCTTTCTGCGGCTCATTCGTTTTTCTTGTATAATATGTTTATATAAAAAACGCTTTGTCT:1 + chrX 7075685 3' - Porto1 173 2 65.35 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAATTATCATGATGATCAAATAGCTCCTTGCCCCTCG:1 - chrX 3358710 3' - roo 42 2 71.29 TATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTCCTTCTGTACTATATTTTGTGGCGATAACATAGCGAAAAGGCCAACAGGATGAAATACGAGCGAG:1 + chr3R 6415487 3' + copia 4963 2 49.50 TACAAATATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCAAGTGATTACTTTAGGCATTTAAAACAAATTGAGCAT:1 - chr3R 24791828 3' + accord2 7528 2 63.37 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGCGGTTCTCGGCCTGCGAGCTTTGTCGCAAGCTTTTTGGCG:1 - chr3R 15328674 3' - P-element 36 1 44.55 AAATTATCAATATTTTCTAAAAAGTGTGTTTGGTTAAGTTAATTCGTATATTTAAAAGTTCAAACATAGAAATAAAAAATGTATTAATTACATATCGAAGT:1 + chrX 11973041 3' + HB 256 1 66.34 TTTTTGAGCAATGCACCCATGTCTCTCTCGATCACCAAAATCCACCACCAACCACTGTACCACTGATCCACCGATCCACTGACCCACTACCACAATCAC:1 - chrX 11960583 3' - roo 116 2 78.79 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTATATCAAATTATACTTTTCGGGTAGTCATTTGCATTCGGATGTGTGTGAGAGGAA:1 + chr3R 20369755 3' - pogo 20 1 53.47 CTGTTCCCCACACATGGATGGCGTAGGTCAGTGTTGTAATTCATCTGGAAGCCCATGTCCATGAAGACTTTGGTGCGGGTGTTGAGGTCAGCGGGAATGGA:1 - chr3R 24365686 3' - G5A 2437 1 66.34 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTCAATTAAAAACTGTAACTAAGTTCACAGTCAATGTAAGAGTTACTTTGTTGAATATTTAGACTGTTTTTGTT:1 + chr2L 17887238 3' - hobo 4 1 65.35 TAACTTAAAGCAAAATTGTTCATCCGTCTGTTCGTACATCGGCCTATCCTTATCTGCTTTTGGCCCGATATTTGTTTATGTTTAAATTAGATAAGAGAAAA:1 + chr2R 5503479 3' - Tc1-2 1560 1 76.24 GAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGCTGTCTTTGGGGCACGCATAGAAATTTTAATGTTAGCCTCGTG:1 - chr2L 14054227 3' - Stalker2 363 2 68.32 GGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAAGTATGGCAATTGAGAACCAGAATTTCTTTCCATTGGAGTGCATACTTTAGTGGCACA:1 + chrX 4799674 3' - F-element 4342 1 52.48 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAATTTTAATTGAAATTCTATGCTTCCTTCTATCTTAAATTTTTTTTATTTTGCTCACCCCAGCTTCCTATCCATTTC:1 + chr2L 10562863 3' - I-element 1 1 73.27 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAAACAAACATTTTGTTACCAAACAATAT:1 - chr2L 16968431 3' - 1360 49 1 76.24 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACAGTACACAGTACGTA:1 + chrX 16217493 3' - P-element 59 1 20.79 TCGAAATAAAAAAAATAGTAACAGATCTAATGCATAATAAAATTCAAAAGGAAAATCCAAAAAAAAATTGCACAGAAATGTGCAAGTGATTAGGCAAGATG:1 + chr3L 8855819 3' - Tc1 1523 1 72.28 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAATTATCATGATGATCAAATAGCTCCTTGCCCCTCGTCTCCTTTTCGTGTGCATTAT:1 - chrX 3358689 3' - roo 21 2 57.43 CCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTAGAAGATAGACGCGATATAAAAAAGAGAAAAGGAACGAGGAAGGGCGACTTAGGAGTAACGCTGCGAAG:1 - chr2L 22774406 3' - Cr1a 4416 1 71.00 AGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTGCGGATTGCGCGGGGAACTCTTCGTATCTAATTGCTT:1 - chrX 4208180 3' - 412 443 2 63.37 ATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTTATACTCCTGCTGTATGGTTGTGATCAGCAACTTGTCATCTTTCTTATGCGC:1 + chr2R 9865470 3' - jockey 4859 1 55.45 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAAGCAAAAAGTCCTTGGTTGGAGTCACTCAGAATGTCTTCTTAAAGTTAACCGGAAGTTAATGAAA:1 + chr3R 12058708 3' + roo 9060 1 70.30 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTTAGACAATACAAAAAAAATGGGAGAGCAGACAGAAAAGTTATTTAAATTTCGAACCCATTTCAAAT:1 + chr2L 10820682 3' + roo 399 1 69.31 GAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGCTGTTGTTGCTGCCGTTGAATGTTGATGCTGCTGCTGTGGCAACGAGTGTTTTGCCCATCGGGTCGTCAGCG:1 - chr3L 15752718 3' - F-element 4322 1 64.36 GTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCAGCCTTGGCTCGCTCTAGCAGCTCGATGTCCT:1 - chr3L 9622443 3' - 412 7418 2 68.32 ACATTCTTATCTCTTAATGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGAGATAGCAATGATATACGTAATAAATTCTCCGATTAGTTAGCACACATCAAATCAGCTCGGC:1 + chr3R 14087610 3' - invader3 5307 2 56.44 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGCAGACCGTGTCCTTTGCTCAGGGGATAAAAAGAAGAGATTGCGCAATCTCTC:1 + chr2R 5201006 3' + 1360 3363 1 53.47 CACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTAATGTGCTTGTTAAGTTTTTCCAATCAACAGTCCTGCCTCGATGATACCCACTTTTTGCTCCACTTC:1 - chr2L 20230895 3' + diver2 4652 2 81.19 GAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCATGAGATACACGTTACTTAGCTAGTGGAAAGGCGATCGCAAAATTTCATCAGTTTTCTGGGGGAAAAAATTTTAA:1 - chr3L 22848563 3' - INE-1 571 1 74.26 TTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTGGCAAAAAGCACAGCAGTCAACCAAGGGTTAAGACCATCAATTTGGCTGA:1 - chrX 13532784 3' - Cr1a 3996 1 57.43 ACACGCCACGTAAAACAAGTTCGCAGGGATCCGAAAAATTTTGCAAACTCCTGAAAATTACGCATTAAATCATGCAGAAGAGGGGTGAAAAACGGGGTGGG:1 + chr3L 10556940 3' + R1A1-element 5312 1 72.28 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGT:1 + chrX 16217523 3' - P-element 29 1 50.50 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATAATGATTTATTTTCAAAAACAATTTTATTACTTGGATGAAAGTGATGTGCAATACATCAA:1 + chrX 14521739 3' - roo 8679 2 52.48 CTAATAAGTTAATAGTTTAATTAGGTAATCCATATTAGGAATGTAAATCGGGCATAGTTATTTTATTAGTTTTTGAATTTACATATCATAGAAAATTACGA:1 + chr2L 20862681 3' - Porto1 4550 1 45.54 AACCATGATCAGGGGATCAGCTAGTCAGGATGGCCGAGTTGTGGTAGGAAGAACACATAATGTCACTAAAAAGGTATTTGATAAGCTACGATCAGCTAAT:1 + chr2R 20082333 3' + invader3 5148 1 54.00 AACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTG:1 - chr3R 178126 3' - BS 46 1 73.27 TTTTTTTTTTTATTGTTTATCTTCGCTTCGTCCCTATCTCCCTCTCACACGATCGTTCGCTCTCTGTCAATTTGCCACTTCCTTTTCTTTTTTTTT:1 + chr3R 30273304 3' - BS 5094 2 65.62 GGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTAAATAATAATGCCTTGTTAGTTTTCTTTATTTAATAATTAAATTATAAGCTATTTTTAGACACATTAAACATA:1 + chr2R 5676795 3' + baggins 5417 1 57.00 AAAAATCGTGCGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCCAGTGTCTTTGCTTTCACTCTGAGAGTTAAAGCAAAGACACTGGAATAACAAG:1 + chrY 917823 3' - 1360 38 1 79.21 AGATGGGAGGCACCCATTGAGCCCATCAAAGAGCAAAGACAAGAACACAAAATGTTTTTTGCTTTTAAATTCTTATACATTTTATTTGCAGAAAGTTCTGC:1 + chrX 21656965 3' + hobo 2574 1 58.42 ATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + hobo 155 1 62.38 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGTAAGTGCTTACTATAAATGTTAAATCAAATGATTTTTACCATTAGCAAGGAAATTATCCTTGTCAATAAGGCAT:1 - chr2L 436845 3' + roo 408 1 76.24 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCACAAACATATCAAAAACAGTTGACTG:1 + chr2L 10687735 3' + hobo 2888 1 76.24 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAGGCTCGTTAAGGAGTCATTTCAA:1 - chr2R 19209442 3' - Doc 40 1 74.26 GTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGGAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGCTTATTGTTATCAAATTAGGA:1 + chr2R 6036141 3' + opus 7233 2 77.23 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCCACTTTTAATGTGGTGAGGTAGGAATGT:1 + chr2L 11805065 3' - P-element 47 1 33.66 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATAAACTTTGCAACCCATATCAATTAAGCCAAAAGACCGAGAGAGTGGTCAATAATTTTTC:1 - chr2L 2912009 3' + 297 6960 2 63.37 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTTATATTCTTTATTTCGGCATTGCTGTAACCTATTTAAGTTGTGGTGCCAGGAAAAAGTAAT:1 - chr3L 46908 3' - FB 15 1 64.36 ATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAGTTGGCCACCTGAGTTGATTTTCGGAATGAATGAAATTGCTTTAAGCTGGATAATTAAACGCGCCTTCC:1 + chr2R 10958243 3' - micropia 5115 2 69.31 TTATATTTATTGTGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATAATTTATTGGGTTCAACAAGTAGTACGGTATTTTGGTAGTTGATGAA:1 + chr3L 24104319 3' - Stalker 75 4 67.33 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTGAAATGGTTTCTT:1 - chr3R 27071885 3' - jockey 4708 1 61.39 TTCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAAAAACAACTTCTTTCCAGTTTCAAAAATCTGGAAAAATTTGTAAAAATCGAAGGAATC:1 + chr3L 5183313 3' - baggins 5372 1 67.33 GAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTGACAATGTCGGGCAGTAGGTACCGTGTACTAACTACAATAGCTGATCAATCAAGCGAACGTAGCGAT:1 - chr3R 27893517 3' - Doc 364 1 74.26 AGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCGCTGTGTCTAAGTT:1 - chr3L 15452860 3' - accord 24 2 53.54 ATACACACACACACACACACATACACACCCAACGCAAAATGTTAGCCATGTTTGCCAGCCGAAGGTGTGAATTTCTAATGGCAGTAACGTAGGAAGTTCGA:1 + chr3L 19510464 3' + accord 7027 6 70.30 AACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATTA:1 + chr3L 14285062 3' + roo 8617 1 52.48 ATTAATTAATAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAGTATACGGTTTGCATCCCGAATTTAGTGCGGTTTGAGAAGAAATAAAAAAGAAAGTTTTTTGGAAA:1 + chr3R 21860404 3' - Cr1a 3979 1 58.42 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCCACCGCCAGCTATTTTATTTT:1 - chr2L 12908380 3' + hobo 2901 1 71.76 CAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATAGATAAGATATACATAAGAAGACTCTTGCAGATCAACCATCGGCCAC:1 + chr3R 10248351 3' + 412 7269 2 71.29 GCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACATCTTCAACATGGCGGCAAGTTTCGAAAAAGTTTCTCAGCCAATCCCATCGAAAACTGGCAACAT:1 - chrX 11458996 3' + F-element 396 1 63.00 AATATATCATCCATATAAACATTGCAACAACAACAGAACAACTTTAATGTCATTTTCCCATCCCACTTCGGGCACCCAAAATCCTCCACAGTTTGCTAACG:1 - chr3L 19668252 3' - TLD2_LTR 38 1 65.35 AAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAAATATGTTCAAAAATAAAATTTAAGAATTTTTAATTTATTTCTAGAGATTATAAGCAGCTGGTCT:1 - chr3R 22978194 3' - Cr1a 130 1 56.00 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAGTAATATTAAATACAAATCATCAGTTTCCCATCACTA:1 - chr3R 31775048 3' + roo 9037 1 58.42 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGGCGTATACGAACTTGGCCGGAAAATAGTGGGCGGCTTTTGGTTGCGATTAAAATCAGCTGCGCA:2 + chr3L 7742799 3' - Doc 18 1 62.38 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATTATAATGCCGGGCCAAAAGCAAGCCAA:1 + chr3L 14285087 3' - roo 17 2 63.37 TAACTTAACTTCTGTAAGTACAACGCATATTGGTTACCTAATAAAATCTCTAGCTTTCATAACGACCTTTACATTAACAACAACGGCAGCAGGGTCAAAG:1 - chrX 3522869 3' + gypsy7 382 1 78.00 CGAAAAAATCGTGCGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCCAGTGTCTTTGCTGTTACTAGGCCGCTTCCCCGCAACCAGGTTTGTGGAG:1 - chr3R 2446818 3' - 1360 41 1 63.37 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTTTCAAATTGTTTTCCAACCTGGAATTTTCCAAACAGTGCAATATTCGAGCAGCAAAAAA:1 - chr2R 22521794 3' + roo 394 1 64.36 CTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAAATTTTATTACACACCATTTAGTCAAAGTGCCAGGACTCGGCTAGTGAGTAAGTGTGTGG:1 + chr3L 19115594 3' + copia 4882 2 63.37 TTAATTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCTGCTCACATCCTAAATGATGCACGAACCCTTTGTCCAGATATTGGTTTTCACATTCGGCGGTGCCCA:1 + chrX 22690836 3' - roo 8 2 71.00 TCAGCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGACTATCAGATACCTCTTACCCATGCTCTAGGAATATGAAGATGTTTCAG:1 - chr3R 10078310 3' + roo 395 1 60.67 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTAGTTGCTTTGTTTAAAATGTATGTCTCATGTTTCATGTGCA:1 - chr3R 12729355 3' - roo 8699 2 64.36 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAATCGTGGCTTCATTACGAATTCTTCGAATGGTCCGCACCTTTTGGTGAAA:1 + chr2R 11086479 3' - Doc 34 1 50.50 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCCTTCTGCTCTGTTTGTGTTTGTATTGGTGCTGCTGTTGGTGTTAGGG:1 + chr2L 4234372 3' - hopper 27 1 52.00 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTACGGACTCGCTCGACTCTCGAAAAAGTTGAGACAAAGAGCAAGCCACGTGCCAAAATGTATTGCATACTTTG:1 - chr2L 4057105 3' + hobo 2933 1 73.27 TATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACATACTTTACTTTAAAGTTAATACTATGCACATTCAACTCAGCATTTCCCCTCTGTTCAGCGCATTGAG:1 + chr2L 4750066 3' - Quasimodo 2 2 75.25 GTTCATATCTTATGTAAATGAACCCGAAGAGGAGTACGACGAAAACGAGGATGGGGATGATGATCAAGAAGAATCTGTAGATCCTCAAGTCACAAGCACTA:1 + chrX 10040140 3' + roo 51 2 81.19 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAG:1 - chr3R 19450171 3' - roo 8704 2 64.36 GCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTAGGCTGGCCGGGTATCTGGGTATGTAGATGCGTAGAGAGGAGCTAAGAGTTTGGGACCTTTGGGAA:1 - chrX 10662708 3' + 1360 429 1 70.30 AACAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACCACGCTGCCACGCCAAATTAGCAAGTTCATTATTTGCTTAGCCATCGCCTTTTGCCAATTTAACGCCAATCC:1 - chr3L 17706084 3' - 1360 305 1 72.28 ATAATAATAACAATAACAACAACAGCATCAGTGCCACCAACGGTCAGTACACCAACTTGGGCATAATACTGGCATCAATGACGCGAAGTCCTCGGATACCG:1 + chrX 14919730 3' + mdg1 26 2 54.46 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGCACAGAAATATCGCCTCGACTATATAATTTAGGGCAGCCCGAAAATATTATTCAGTAACCAAATTTCGT:1 + chr2R 10345701 3' + roo 403 1 74.26 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACCAAAAAGTAACAAAGCTCGAAGGTTAAATGTAGAAAGGGGAAAGGCGGCGA:1 - chr3L 16449722 3' - roo 8676 2 62.92 CCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATGTGTGTCAGCGGCGGGCAGGGCAACAAA:1 + chr3R 9940159 3' + I-element 5300 1 72.28 GTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGCATGTGAAAAGAAAATGGGCTATGAAAAGCAGGCAGTTATTAGCCTGGTAAAACACGAGTCTTGCACATTTGAGAG:1 - chrX 17804196 3' - S-element 1501 2 44.55 CAACTTGTAGCCAAAGCCAATGGCTTTAAGGCGTACTACCATACATGAAAGTTTGAATACAATAGAGTTCTCAAACATGCTTTGAACTAGTTAATCGATGA:1 + chr2L 7176575 3' + S-element 1400 1 66.34 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGAGGTACGGAAAAACTGATTCGTTTAGCTTGTTAAGTTATTTGTGTACATCAAAACGAAA:1 + chr3L 3482780 3' + copia 238 1 53.47 CGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACAAAATGGAAATGGATAAGAGTTTTCGCTTGCT:1 + chr2R 5154791 3' - F-element 43 1 71.59 TAGTTTTCTTGCTAGGGGATTTGGATGGGTGGTGGGTTGTGTGGACGCAAGGTGATTTGGGTGGTCAGTCGACAATCCCAATATGCAGACGTGCTCGACAG:1 + chrX 12834033 3' - Doc 4498 1 70.30 TGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGCACTCTCTCTTGTTGTATTTTGTGGGGCCCAAATTTTAAATTATTTAAATAAATTAGACTACATTCTTTGGCAGTC:1 + chr2R 9800382 3' + INE-1 563 1 63.37 ATTTCCTTCTCAGAATTTGGGACGGTTTGTTGGCCAGTAAGTGACAATAAAAAGGTGCAGCAAGATAAT:1 + chr2L 17620868 3' + copia 405 1 68.12 CAACAATTTGTTACAAATGTTGATGGATGGAAAATGAAAATGAAGGAAATAGTGAATTTAAGAGCATGAATCTAATGGTTAAGGGTATTTTTGGAAAATTT:1 - chr3L 7956485 3' - INE-1 375 1 62.38 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATCATTTAAAATAAAATAAAAAGTTTGTTCGAATC:2 + chr2L 18093861 3' + roo 9028 1 72.28 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACACTAATCCGCCACGCCTACTGTCGCCCGCTGTTCCCACCTTTAAGGTTAACGTTAAGTAAAAGTTTCT:1 - chr2L 17056458 3' + 412 7539 2 71.29 CTTTCATAAAATGGTTTTTGGCCAAAAAAGGGCCAACAATATTTCCCATAGTGCGTTGCGTGGTGCAACCGTAACTGCAACATTGCGGTGGATCTACACTT:1 + chrX 22936830 3' + Transib-N1_DM 464 1 57.43 CGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATCAGGGTATTCAGAATGTGGTCGTCAAGTTGAGCACTGCGAGTTCGAATAGCTCATCCTATCTCCTAATCAAC:1 + chr2R 12356259 3' + opus 397 2 73.27 TTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATCACGAGTTGGGAATTATAAGCAGAAAATTGTAATTTGTAACCTTTAGAGGTGTT:1 + chr2R 14446523 3' - McClintock 291 2 59.41 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATACACTTCTACTTGTACCATGTATTGTATGTATGTACATACGTACATAGTACACATCATGGAAATCCGATT:1 - chr2R 22793311 3' + hobo 2933 1 75.25 TGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGGAGCGCGAGATTTCCCTAATGAGAGCCAGCATGTTTGGACAGATCGGAAGAGCACAC:1 + chrX 7622356 3' + Porto1 358 1 49.50 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAACACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATA:1 + chr3L 20711714 3' - jockey 4673 1 72.28 GGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTATTCATAATACACAAGCACATTGTA:1 - chrX 21852443 3' + gtwin 455 2 63.37 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGACCCACCGAACCACCGAACCGCCGAACCGCCGAACCTGAGCGGTCTTCGTATGCTCGGCGGCATT:1 + chrX 15125724 3' + P-element 2877 2 69.31 TCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCATCCATCCACAATTTGTGGACACAATTCCGGCATTCAACCAAAATTCCAGTTG:1 + chrX 15608236 3' + F-element 4497 1 58.00 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTCCTTGATGTTTGCTGAATTATTTGCT:1 - chr2L 11804994 3' + P-element 2876 1 64.36 ATGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTCAATAAACTATAAAATATGCAA:1 + chr2L 6306591 3' - jockey 4760 1 76.24 CGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCTATAAAACTGCAAATTATTGAATACTAAATATATTCATAT:1 - chr3L 18407991 3' - X-element 48 1 56.44 TTGTGAGAAACAATATAACCAATACCCATCGCAAAAACCCATCACAAACGCACGACAGGTAAATATATTGATATGCTAAACTTGTGTAACCCAATTAAAAA:1 + chr3R 18974734 3' - TLD2_LTR 187 1 50.50 TGACTCATGTAGTGTGTACTTGAATTACATGTTTTTGAGCATTGCAGCATTGTTTTTAATATATAACAAAATAATTGTGTCAAAATACATAAATATGTGAA:1 - chr2L 17369479 3' - roo 147 2 62.38 ATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATAGCAGGAGAGTGGGTCGTCGCCATACGGGCCAAATCGCAGTGAAAGGCATT:1 + chr3L 4769097 3' - gypsy4 492 1 61.46 AGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAAC:1 + chr3R 14049430 3' + transib2 2806 1 59.41 ATCTGTCCTAGCGGACAATAATTAAATGGTTTGGTTTGGAAAGGATGTGAATTACGAAGTGTGTACTAGTCATGTGCCTTAGTAGCAGGCGGTTTATGATA:1 - chr2L 22748761 3' - G6 1992 2 64.36 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGCATGCGGACGAGTATTGGCACCCAGCGGAGCGGACAG:1 + chr2R 20544052 3' + 297 364 2 61.39 CACGAACACATACACACACACACTCACAGAGAGGCGATGGCGATGGCGACGACGTTGACGGGGCCAAAAACTTTAATGTGGCATCAGCAAATGCGAGG:1 + chrX 14979311 3' + accord 7026 2 34.69 TAAAAATAATAATAACAATAACAGCGGGCCGCGGCAACTTCAATGTAAAACCAAGCTACTTAGTTTACAAAATTTTGTGAATAATAAAATAATATCAAATA:1 - chrX 12274547 3' + mdg1 7059 2 70.30 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATATCTTATTGAATGATATGAAAAGCATTTCTATGTTAATGGAT:1 + chr2L 18188461 3' - Doc 40 1 59.41 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGGATACCAAATGCAGGAACGCAAAGCCA:1 - chr3R 29333711 3' - hobo 48 1 71.29 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATTGTGTGACGCTAGCAGCATTTTGTTTAAAATTGAATTCCTTCAATGCATTTACCTAAATTTAATTCCTT:1 + chr3R 27435116 3' + jockey 4982 1 69.31 CATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCACTTTCCGTAGATTCCCGAAGCACTACCTTCACATCTC:1 + chr3L 13208602 3' + hobo 2597 1 62.38 ACAGGTGCTCCATGGTATATGACTAATCATGACATCCACATTTTTTGCATCAGTGGTCATTATGGCGTTATTTTTCCTAACTGAACCAAAGGACTTGACTA:1 - chrX 294293 3' + G3 4286 1 61.39 AACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTGCTAAACTTGTTAAATGCAAGATATTTTTAACAGACCTGATAGGCATCGACAACCAAGCAGAAAAAAC:1 - chr2L 23374491 3' + flea 5010 2 76.24 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTAGGTGTGTGTGTGCTCCCTTGTGTGTGTTTGTTTAACTTGGTCATCAAGTCAAAACAAGAGGCGGAAAAGAATG:1 - chrX 15241772 3' - accord 7030 2 46.53 ATATGAAATACCTAACTGAAACTAAAAGTGGATGGAATGCAGTGAGCCGCAGCTGGAGCCCACGGTGGTAGCCACAGAGGGTGCTGCACCTTCCACCAATG:1 + chr3R 7178429 3' - Circe 342 1 70.30 TTTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCATTTGCCATACATTGCGTAAACCGATTTCTGGCAGTGCACTTCGTTCAGTCCGGGATGGATTAA:1 - chrX 21227831 3' - mariner2 776 1 69.31 TTTCCTCCCATTCTAGAACTGTCCGCTTCCGAAAGTATTTTCCTCTGCATAATTTGTTTGCTTTTGTGTGTTTTGTTTTTGTTGTTTGTTAAGCATTTCAC:1 + chr2R 17451305 3' + gypsy12 9978 2 57.43 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATACATTTAGTTGCGCGCTC:1 + chr3L 5267286 3' + Juan 4195 1 57.43 TGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTTTCTTTTATTTCAGGCAAAGACCTTTACAACAATGAAC:1 + chr3R 16292726 3' - Doc 4473 1 62.00 GGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGCCTCGTTGACCGAGTGAAAGTCGTTGAAGATTA:1 - chrX 928601 3' - Doc 4538 1 67.33 TATCTGTAATCTTGACTCTTTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTCTAACTTTTTATACCCGTTACAGGGTAAAAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGATAAAA:1 + chr3R 14437796 3' + Cr1a 4228 1 49.50 ACCAACATAATTAGTTTAATTTGTATAATCGTTAGATCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTGATATTATTTATGTTTAT:1 - chr2L 1347463 3' + gypsy6 387 1 77.23 AAATAATTCATATTTTACAACAAGCCAATATGAAAATCTAAATTCTTTAAATAAGCAAGCCAAGTAAAATGTATACACATAAGCAACAAATTATCCATGAA:1 + chr3R 23869795 3' + TLD2_LTR 106 1 54.46 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACACACACACACACACACACACAAAGAGCATCGACAACTAAACAGTTCGTCGA:1 + chr3R 19734570 3' - hobo 21 1 48.51 TTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGAAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGGAGGAGCCGGTTGTGCGGCAGGA:1 - chrX 12586071 3' + flea 83 2 75.25 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGATGAGATCATGGTTCGCAAAACTAATACATACTAGTGTTTGAATATTTGAGCAGCAA:1 - chr3R 17064112 3' - Transpac 4935 2 63.37 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACACTTTCTGTATTCACAAATTATCTTCCGGCCGTTCAAATTCTACACATCGAG:1 + chr3R 7943927 3' + roo 9043 1 51.49 TATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCGAGTTAATTGAAAACTGAAAGTTATAATGTGCAGAATCGGCGAATATATACTG:1 + chr3R 31572032 3' - Porto1 4209 1 56.44 GATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCTCAAATACTTAAGTACTGAGATGCCAAGTAAGCGGTGAAAGAAGGAGAG:1 - chr2R 14962420 3' - Ivk 111 1 66.34 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCCAGCAGGCTAGCCAGCCGAATT:1 + chr2L 7991745 3' + P-element 2833 1 25.74 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCCGAAGAGCGCATATATGTGCAGGAAGATGTTAACATTCATGTGCTACATACAAACTCGCCTGTAA:1 + chr2L 17986077 3' + jockey 4979 1 66.34 ACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAATGTAGGAAGAAAACCTACATAAACTGGGGGGGACAAGAAAGAAAACACACCAGAGATGTAGAAGCCTCTCGGAT:1 - chr3L 19026810 3' + G2 3076 2 54.08 AAAAAAACAAGTAAAAACAATAAACAAACAAAAATATGACCGCATCCGACGTAATGCTACTATCAGAAACGCACCTCACAAATAAAAACAATTTTCATATA:1 - chr2R 20702963 3' + Porto1 175 1 54.46 ATGAACGGATCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTTTTCCTGGAATTACTAGGTTCTCCGAAAGACTCTGCTGAATTTTGGCACTTTCTTTTT:1 - chr3R 19448957 3' - roo 35 2 59.60 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGGCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCAAACACCTTGATGTATTTGCCTTGTTATAGCT:1 - chrX 12276776 3' - hobo 42 1 66.67 GAAGACTGTGGAATGCCGAAGAAAAGAAAAGATAAATAAAATAAAACCGAAAACCAACCAACTGGGTTTCAATATGTTCTAAATTCACAGCGGAAAAAACT:1 + chr3R 22580417 3' - Doc 3 1 77.23 TAACGCCATACGATTTTTTGGCACACATTGCTCTGTTATTATCCGTCGTAAATTCTCGGCAATTTAAATTTTGTATTTCATATGCCAAATGCCCTTCTCGT:1 + chr2R 20142646 3' + 1360 27 1 76.24 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGTTTAAGTTCGCTTCTTTTAGTATTTAGATTAAATACGTTGCTCTACTGAA:1 + chrX 4056342 3' + roo 9047 1 55.45 CTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGCCCCTACCCAATTTCCTCCCATTTTTCCTGTCTTTTCTTTCGCTTCGAG:1 + chrX 7624723 3' + Cr1a 4164 1 56.44 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCGTAGTTTGGAGTTCGCAGTTTGCAGCATGCACTTTTCC:1 + chr2L 4057191 3' - hobo 38 1 63.37 GTGTGTCCTAGTCAAAGTCGTATTATTTTTAGTTTTCACTTAGTTACACTGTTATTATTATTGTTCGTTTATTTCTGGTTAAGTTTATTTATTTTTCGCTT:1 + chrY 3649265 3' - I-element 4942 1 73.27 TTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGACCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAATTATGCAAGCATACCCGGTCCTTTGAGGCTTGAT:1 - chr2L 5659447 3' - jockey 4576 1 63.37 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGCCCTTTTTGAATAATCTGGCGACTATG:1 - chr2L 5741328 3' + 412 7497 2 74.00 AAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCATCAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAACACC:1 + chr2L 10861354 3' + F-element 356 1 76.77 TAAAAAAAATTACATTAAAACCATTTAGTCTTCAACAACTCTATTTTTACATTCGACAGTGCTTTGACTAAATTGGCTTAACTAAACTAAGCTTAAGCTGT:1 - chr3L 17206719 3' - transib4 28 1 62.38 AGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATTCTGTGTTAATTACAAAAGAACTGCCCCCCCACTCTGCGCTCACTCGATGATTATG:1 - chrX 13920066 3' + Max-element 8530 2 60.40 TATTTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATACGCTGATATTTTCGTTTTGTTTATTATTATACTAAATATTTGCTTGGCTAATC:1 + chr3R 26491904 3' - Porto1 244 1 72.28 GGAATTCGACTATAGCATTCTCTCTGTTTAGTTAAGAAAATGTCATTATGCACTCGAAATGCCTCACCTGCCCAAAATTTTGCTTACGCAACCGTTGGACA:1 - chr4 990469 3' + INE-1 573 1 75.25 AGTTTTGGTGGCTAAGTAGATGATTTGTGTTTGATTGTTTATTTGGGAGGCTTGAATCGCTAAATTTATAAATTGATTTTTAAGTCAGT:1 + chr3L 10690787 3' - Porto1 4462 1 66.29 TCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACATGCCCTCGAATTGTTTATTCAAAACTTATCTCG:1 + chr2L 5211085 3' - gypsy12 47 2 67.33 TAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCATGTCATCGATTATCGCTTGCAGTTGTCTTTGATTTGCTGTTTTT:1 + chr2L 14104582 3' + HMS-Beagle 6667 1 56.44 AAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATAGCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAGCCAGCAAAGTCGAAGGCGGAAAAGCCAGTGGCC:1 - chr2L 15255715 3' + Idefix 411 2 58.62 TTTTTGTTTTTTTTTTTATTGTCAACCAACGCAGCAAACAAATGCAAAGCAACAGCTTGGAAATGGTTACAGATAGAGCGGTAGCCACATAAAAAACCGCA:1 + chr3L 19029279 3' - Rt1a 5076 9 51.49 TTCATTGTTTCTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTGTGTAACTGTAATATTAAAATGTAATAGTAATAACAAGCGAATATCTAAAACT:1 + chrX 4091555 3' - transib2 2641 1 61.39 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGACTCACCTATGAATAGTCGTTGTTGTCGACGTCGTCGTGGCTATAGGCAAATCAAAATGGAGAACGTTAA:1 - chrX 2125541 3' + P-element 2882 2 74.26 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATATTTTGTAAATGGCCGTTACATATTCTTCATTTTGAAA:1 + chrX 19326854 3' + pogo 2067 1 62.38 TAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCACTTAAGAGCGTCGATGTCATGTCGACACGGCG:1 + chr2R 22033309 3' - Ivk 237 1 63.93 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTTGTATTTCCATTGTTTTAAACCAAATCAAGTTATTTCCTATC:1 + chr3R 27926639 3' - I-element 29 1 59.78 AAGTGAAAAAAATTGTTTTTCAAAAGTTTCCTGCTGAATTTCGCGATTGTTGCTGCTGTTGTTGATTGATAGTTATTGAATGTAGATAATTAATACTGAAA:1 - chrX 6731993 3' + Penelope 95 1 63.37 GGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCCAGCATCAACAACACCAAACGCAACACCGACCAAAATCAACAAAAACTGCTTTCCCAGCAACGA:1 - chr2R 5641027 3' - Cr1a 286 1 66.34 CGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGG:1 - chr2R 6438346 3' + Stalker 7228 4 55.45 AACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGATGATTTTATTTAAATGGAATTTTAATTG:1 + chr2L 17753449 3' - 1360 279 1 75.25 GCTGTTGCTGGCATTGCCCCTATAAACTGTGAAAAAAATTAATTTTACCGATTGCCAATCAGATCACAATGAATTCCATGCCAAGCACAATACATTGAGAA:1 - chrX 21231131 3' - F-element 4285 1 83.17 CATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCGCAATTAGGTGAACTAAGAAAACTCAAAAGGAAAGACAACAAATGAAGCGAATGAGTCAGTGGGGCCA:1 + chr2L 2681716 3' + I-element 204 1 74.26 CGCAATTGAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGTACAGAAATGCCCGAACTGGCCAGCTGGAATTGTTTGACTAACT:1 + chr3R 14838938 3' + invader2 334 1 56.44 CTGATTGTGAAGAGGAAGACGACTATGAATTTTTATACAATATTAAAATTGAAAATTCGAAGAGCGGAGAACCATTTAGATTTATTACGAAAGTGTAGCCT:1 + chrX 9176179 3' - hopper2 61 1 59.41 ACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACAACTTCTCCGTGTCCGCATTGGGAGCATTGT:1 - chr2L 1079824 3' + Stalker4 246 4 75.25 AAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTAGGACGGGCTTATGCACTTAATGAAATGTACACGGCAATTGTTACGGAGACCAAGCCGGAGACGG:1 + chr2L 17289817 3' + jockey 4694 1 63.37 AAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATAAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGAAAAATTTCTAAGATACAAGAGGAAATTCATAAAACAAAACAA:1 - chrX 3696027 3' + Porto1 4436 1 61.39 AGCGCCGTGGTACCTTCGGAATGAAAACAACACTAAAACTTGCCAGAGATAAAAAAAAATAACAAATTGAAGAAATTCAAAATATTGCAAAAACAAAAAAA:1 - chr2L 7862314 3' + Doc 4384 1 75.25 ACCGCAGTCAAGCCCTGCGGTATTTCAGTAGATTTTTTGGCTTTATGTACTTTCAGGCCAAAGACTGTCGCTGACTGATTAATTGATGCGGAAAAAAGATG:1 - chr2L 9283127 3' - baggins 426 1 74.26 AATTGGTTAACTAGATGTGAAAAAGAAAAGTAGCGCCCTTCCCAGTGCAAGGATACGCTAATATATAGAAAAGGTTATACGTTGAAAAGTGTGTAAATTAT:1 - chr3L 27366688 3' - Porto1 4616 1 62.38 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAAGTGCTGTCTAGGGTTAATTAAC:1 + chrX 13641397 3' + jockey 4950 1 78.00 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATGGGTAGGCTTTATGTAAATATTTAATGCTTACTTTGTGATTTAGACTTTAGATGTTTGCAT:1 + chr3L 13608400 3' + mdg1 7445 2 62.38 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAAACGCATAAACGAGATCCAAGATCCAAGTCAAGGTGGAAGCCA:1 - chrX 18991526 3' - pogo 29 1 58.42 ATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAGGAAAACGGAAACGCATACGCAGCGAGCCAGTGGCGCCTG:1 + chrX 4273769 3' - McClintock 246 2 67.35 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTGAATATTCCATATAGAAAATTAGCATTTGAAGTTGTTCAGCTGTTTGATCGG:1 - chrX 8107327 3' - transib2 22 1 57.43 AAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCCTAAGTTTAAACTTAAAATGCTGCACAGCTCGGAAATGCACATGTGGAGAGAGAGGGGCTAAACCTTG:1 - chr3R 28683678 3' + I-element 168 1 63.37 ACACGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCGCACAAGCAATTTTTTTTATTTGTCGATTTCGGAACGATATGTCTATTGAGTTTAGCGAACAAGAATTGAATCG:1 + chr2R 5531295 3' + 1360 3233 1 58.42 ATTTCTTCGCGCACCGTGATTGGCTCATCCGGCAAACTTGCAACCCAAAACTTCAGACTTAGTGTGCGTTCTAGGAAATAGTTACTTCTTAAGTGAAAAGC:1 + chr2R 15175471 3' + G-element 110 1 75.25 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTTTTTTGTTCTTTTTTGGGGGCCGAGTGAATAGCAAACGGAAAACGGATGAAAGCTTCACTCG:1 - chr3L 13164659 3' - pogo 12 1 64.36 TTTAATATTTTTTATTTTTAAATGTTTTATCATAATATAATAATTACAAAATAACGAATTATAATTTGGTGAGCTTTCTATTCATGGTTATAGGGTTAGGT:1 - chr2L 14798082 3' - 1360 3028 1 88.12 TAATAGTACGCTAGTCAATAAAATAAAATAGAAAGACTACCAGTATGAC:1 + chr2L 17358925 3' + jockey2 3366 1 61.22 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGTTATAGCGGTATTGTTAAAGTTCTGCTAGAAGAATGTAAAAGCATGTGATCTTAGTGCTTA:1 - chr2L 7504854 3' - roo 8679 2 59.41 AAGTATCAAATAAACCAAAGAGGCCAACACGTACACATACTCCTGCTTCAACGTGTATGAGTGCTTGTGAAGGATTCTATGTAATTCAAACACAGTGCATT:1 + chr2L 17323927 3' + invader2 5046 2 78.22 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACATAAACTTGATGATATGGTATAAGTGCTTTTGCCTCTTCAATGGTCCTTCAATGGTATCAGTAGC:1 + chrX 3195712 3' - mdg1 13 2 66.34 GAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAATTAATTATACGTAGTCGTTGCCTTAAATGCTTATCAATTAAGTTGCTCTTGTCCTTTCTTTTTAACCGCTT:1 - chr3L 19927488 3' - jockey 477 1 71.29 GTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTGGGATAATTTATTGG:1 + chr3L 21912362 3' + Bari1 1703 1 75.25 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACTCCATGGATAATTGAAAGGGTTGGAAAAGTGAAAGGCTG:1 - chr2R 4344540 3' + pogo 2067 1 59.41 TCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCCTTCTGCTCTGTTTGTGTTTGTATTGG:1 + chr2L 4234352 3' - hopper 48 1 72.28 GACGAAGGCTGTCCACAGACTTTTTACAATTGGCAAATCTATTTGAAAGCGGATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGTATATCGTATGCTAAGTGCTTGCAC:1 - chr3R 27586053 3' - Burdock 6102 1 75.25 CGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTACCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCTCTCCTCTCCACGACTTTCCTCGGTGTT:1 - chrX 13091401 3' + Doc 379 1 79.21 CAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATAACATTTGTCTGCTTGTTGCTACCGCTTTACATATCCGTAGGCTAACCTAT:1 + chrX 11802046 3' + 412 177 2 54.46 TAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGTTTCATTGTATTAAATCAAGCAACAGAGGCAATTTATAAATAAA:1 - chrX 470417 3' - Doc 254 1 65.35 TTATGAGTGTTCATTCTACCACAATCTGTTTTTGAGGTCCTCGCCAGGTAATCTGGCGGCAGGTGAGGCTATCCAGATAGTGGAGGTCCTTTTGTAGGTTT:1 - chr3R 20481753 3' - invader3 5188 2 70.30 TGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTCAGAAAGTGAGAATGGTTTGAGAGGCCGGTCAGGACTACCGAAGTAAGAATGGTGTG:1 - chr3R 3355627 3' - Quasimodo 7048 2 65.62 TGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGTTGTCAGCTCAATTTTCAAGTTGGTTTCCCCCTCAGCAAACCCAC:1 + chr3R 17965517 3' - accord 423 2 56.38 TTTTAGTCAGTAGACAAGAAGACCTCGATCTGTACCCATCATTGATTACAAAATTCTTGAGAAGGCCGTTCGAGACTATCATTCTCAGTTCAAAGACTATG:1 - chr3R 17065915 3' + Transpac 5010 2 66.34 GAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCTTGCTAATGGCATCGGTAAATAAT:1 + chr3L 18201562 3' - 1360 3278 1 77.23 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCAGAACCCCCAAAAAACCCTGGTGACCAAACAAAGT:1 + chr2R 22404241 3' + hobo 2897 1 64.36 CACACAACCACACACACACACACACACACACACACACACCCGCACACACCCGCACACCCACACACCCAAAATGCACTTGCTGCAGTTAGCCCCATCTCT:1 + chrX 3558695 3' + gypsy3 417 1 76.77 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTTGGATGACGCTTTTTGACTCAACTTGAATTACCCATTATTTTAGTAGATC:1 - chr3R 14563112 3' - jockey 4690 1 57.43 TGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGAAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGGTAACACGCGAATTTAAAAATATTTTT:1 + chr2R 4995020 3' - F-element 68 1 96.04 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAG:1 + chrX 11025567 3' + hopper 1378 1 65.35 CAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTTAACCAGCGCTAATGTCTCTGTATGTTTGTG:1 + chrX 6185420 3' - 1360 388 1 72.28 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCTGGCCAGGGGTTTCTGGGAAATTAAGAGAAAATGTCACGCGAATGATACCACTTCGAAATGCTAT:1 - chr2L 19629601 3' + hobo 2928 1 66.34 ATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGAAGGCGGCTCGGAGCCCGACTTATGTA:1 - chr3R 31188013 3' + I-element 255 1 74.26 GGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGATTCGGAAGGCCGCGATCACTTCCCGCTTACACACAATTGCACAT:1 - chrX 354207 3' - X-element 4483 1 55.45 GGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTATTTTTTTCTCCCTCGCTTTCGCATTACTT:1 + chrX 5354164 3' + hopper 9 2 69.31 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGTCATGAGATCGGGATCCTGCCA:1 - chr3L 14152105 3' + blood 334 2 66.34 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGC:1 - chrX 11025518 3' - hopper 47 1 67.33 CAATTGCAACATGGAACACAAATTGTAATTTTAAATCAGTAAGTTATATCTATATTAATCATACCTTGACCTTTAAAAAGGTTTTATGACGAGAATCCAGT:1 - chr3L 23770054 3' - transib3 327 1 74.26 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTTGGTAGGTGCCAAAACAAAAATCCGTTCAATTAA:1 - chr3R 11073730 3' + pogo 2062 1 66.34 TCTGCACTTCTCCGCCGCGTGGCCTCTGACGACCACTGAATCGCTGCCGACGCAGACATAATGGCAACGTTTGAGGGGCCAAGTGGAGAATTTGAATGGAT:1 - chrX 20335840 3' + HMS-Beagle2 7016 2 54.46 AATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAAATGCTGTACTACAAAATTTTAGTAAACGTACTAGTTTTAAAA:1 + chr2R 19907082 3' + Doc3-element 76 1 78.22 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTGGGCCGCCGAAAGTGTGCGCGTGCGATAAGACATACTGTACAGTGGTCTCTCC:1 - chr2L 7991693 3' - P-element 24 1 54.46 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCAAAAAGTAAGAACTTTTTTTTTGTATGTTTACAATTACAAAACAAAAC:1 - chr3L 25677648 3' + 1360 3358 1 72.28 ATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTGAATGTTTATTACCAGGCCTAGTCACCATTCGCTTGTAGTTGTGTGCCGGGCTTTGGCAGCCAATTG:1 + chr3R 24671946 3' - G6 2003 1 65.35 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTAAATCGAAAAACAGGTTAAAAGGCTCATAAAATCTGAA:1 - chr3R 6425839 3' - copia 37 2 62.38 TTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGCAAAGAAAAATATTCAATGTTTTGCCAAAGTGATATTCAAACAAATTAAATTTGCTTTACTGATGA:1 + chr2L 2312954 3' - McClintock 233 2 68.32 CTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAAGATCGCAGACCCTACGTGGAGGAG:1 - chr2R 14203167 3' + G2 2848 1 75.25 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTAACATAATATAATTGCGAATTAGTGCGACCCACCTGCTCCCGCACAAGATCGTCCCAGCCG:2 - chrX 13031793 3' + flea 245 2 70.30 TCCTCTCCCTGTGCTTTCTTTGTCGGTTTTCGCTTTATCTCGCTCGATTTGGGCAGTGACATATGATAAGGGGAAATCGACCTAATTTGTTGGACTCTG:1 - chr2R 17640005 3' - G6 461 1 53.54 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAAAGCAATAATTTATGTCGCCTTCTAAGACACCATACATATTCCCAA:1 + chr2R 10777877 3' - pogo 28 1 60.40 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCGTTGAGTTAACTCAAGTTCAGCTATCTGCGCGCTGATTTACGCC:1 + chrX 13587989 3' + hobo 2906 1 55.00 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTAAGTAAAAAAATTGCATGAAAAATCCGTATTTTTATGGTTCTTGTTTGAGTCAT:1 - chr3L 6491191 3' - blood 7061 2 58.00 GAAAAAAAAAAATGAAAAAAAACTACAAAAATCGGGGCAAAAAATACGAAAACTTTTTCCACAATTCCATGGAATGAAGGCCACTTCCCCCGTT:1 + chr3L 6682834 3' + Doc2-element 250 5 87.23 TAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCGTTTACTGTTTCTTGGTTTCTTGATTTGTGGATGCT:1 + chr2R 10503632 3' - Doc2-element 4429 1 64.00 CTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGCTT:1 + chr2R 5531208 3' - 1360 53 1 72.28 GTTTGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCGTATAAAAGCAGAGGTCTCAGCTCGAAGATTGGCGGCTGCGTAGATAAAGTCGAGGTGCATGGGATCGT:1 + chr2R 9689705 3' + R1A1-element 5330 1 57.43 ATTATATTCTATTTATTTAAAATATATTTAATATCTTTCTTATATTTTAAGATTTTGAGATTTTTTTTTAGCAGGAAAAATGAAGAGATATTGATTTGATT:1 - chr3L 11900314 3' - G7 1145 1 45.54 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTGTTTCGCACCCTTTAAGACCAGGAATTGGGTTACTTGTCCCCC:1 - chr2R 10345607 3' - roo 32 2 58.00 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCACACATCCTGTCTTTTCCAAA:1 - chrX 10436546 3' - hobo 53 1 80.20 TTTTTTATTTGCCATTTTTTTTTCTTCTAATGACCAGCCTCCCAGTTCGCTGGGAAAGTGTTCATCAAGTCAGCCTTGTCGTTTATCATATTTCGCTGCTA:1 + chr2L 1915214 3' - Doc2-element 253 1 81.19 GGTTGAATAGTATATTCCAACACGCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACCATTCATTCGTCGCTCCTATA:1 - chrX 10569145 3' - copia 1 2 79.21 GCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGAGGTCCAAGAGGGGGATTGAATATCC:1 + chr3L 15754241 3' - Doc 385 1 74.26 TTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGC:1 + chr2R 10160606 3' + P-element 2726 1 40.59 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCACAATTTCTAACTCCGCTCTCCCAAGGTTGACAATACGAAAAATATACTTGATATAATAGTAGAAAAA:2 + chr3R 21969147 3' - hobo 9 1 69.31 TATTATGTTCGTATATACTACACAGGAATATCTTTGCAAGAATGCAGTGCCGCTCTATCAACGAACTCGACATTTTATCTCGTCTCAAGCAAATGAAAATG:1 - chr3R 29710943 3' - mdg1 7039 2 74.26 CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGAACTTTTAGCTCGGCTTTCGCCTTTGTCACTAGTCCAGGACAAGAGCG:1 - chr2L 11561771 3' + transib2 2798 1 51.49 AGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGGTTGTTAGTTATCTGCTGAGGTTGGCCGCCCCCCGTTGGGTGTCCCGTTGTGCTCCACTTGCCACACAAGTGCCCACT:1 - chr3L 9175323 3' + 297 6577 1 65.35 ATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCCAGCCAACCACCGCCCACTCCATCACAGACATCATAGCTATCACATCACCGCCCTTCAATCATGTTTTCG:1 - chr2L 3379400 3' - flea 4813 2 73.27 TGGGTGCATTGCTCAAAAACATATACTTTGGAAAAACTGTCACATTGCGCACAAATTGAAGGGTACAACATGCCGTCATTCCACGACCTCGCGCATGTGCA:1 - chr3R 7884349 3' + roo 8783 2 79.21 CAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCCGATTCCACTTGAATAATTCAATTAGCATACTCTCGGGCTAACCAGATATACTCTACTCATTGG:1 + chr3L 16293219 3' + 297 6607 2 70.00 CTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAG:1 - chrX 21668024 3' + Tabor 435 2 72.28 CCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATACCAGCATGCCCACCCAAATGGCCCAGAAGCACACGAAGAAGATCCAGCGGAGTCGCACCCA:1 + chr3R 7976338 3' + accord 6928 2 61.39 TGGCTGGGATTGATGGATATAGTATGGGAAATGGAATTTATGCGCGGCCACACGCATTTTACGAGATTCATAAAGAGCAAGAAGTGAAATAAATAAATTAA:1 - chr3R 26792943 3' - 297 6531 2 66.34 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGAATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATATATACGGTTTGTGTTGAGTGCAGTTCGAT:1 + chr2R 11400361 3' - 1360 48 1 71.29 CCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCATCCCCTTCGCAACTACCGATGATGCAGCTCGAAAATGCTGGCTGGCCAA:1 + chr3R 5773253 3' + Stalker4 405 1 75.25 CGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACAGGACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGGAC:1 - chr3L 16047626 3' + Cr1a 4423 1 67.06 TTTCCCAAATGGTGATTATAAAAAATCAGTTAAACTACTTCAAAACTCAATCGATCGCTCAATCGTTTATACAAAACCCATAAGGGGCCTCAAAGAAAAGT:1 + chr3R 31052708 3' - S2 446 1 52.48 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTAGAGCTAAATAGGCGCACGGTTGTTAAATATTCACCGTGCTCTCTCGCTTTATGCAATAA:1 + chr2R 20996512 3' - P-element 17 1 63.37 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAGCGGAACACAAACGCACACAGGCACACTTGTTTGCCAGCCCAATTTGTTGTAGC:1 + chr3R 18449010 3' + hobo 2914 1 52.48 ACGGCACTCTTATAGAACTCACAATGTTCGTTAACCACCCAAAGCTGTGCCAGAAAAGCTCCATTTCCAACGCACACACACACCTTCTGCTGTGTGAAAA:1 + chr3R 9935511 3' + gypsy4 290 1 57.00 GTATATAGTTTCTAGTCAATCGTTTTACCACCCATTCGCAGCCACTCAAAGTGTTGTCAGTGGCAGGTATAACCTGC:1 - chr2R 20964120 3' - Cr1a 4118 1 80.52 AACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGG:1 + chr3L 23176368 3' - INE-1 580 1 61.39 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAACAAAAAGGAGTTGACAAAAAAAAAAGAAGGAAGCCCAACGAACAATGTTGGC:1 + chr3L 13164759 3' + pogo 2078 1 59.41 ATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACAATCTTGCCAGAATTGAGTTGGCCGATGC:1 - chr2R 1780076 3' + I-element 310 1 71.29 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGCCTTCGGAGGGAATTTAATACCTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGAACAGGAAAAGGTAAATGCGGTAA:1 + chr2L 10023731 3' + roo 401 1 64.36 GCGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATGTACATACCACTATTTTGTTGACCTCGACTGTGTGTGCTTTGTACATTTTCAATGCA:1 + chrX 20982307 3' - 297 6592 2 69.31 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCGGGGGTAAACAAAAA:1 - chr2R 12655265 3' + P-element 2828 1 20.79 GAGCATACCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTATAAAACCCAATACAACTTGCGTCAGTA:1 + chr3L 25768164 3' + Circe 7383 1 76.24 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAG:1 - chrX 11025516 3' - hopper 44 1 65.00 ATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTGGAAAACCGCAGACTAACCGGAAAAATTAGTGCGGCAAGCTAAGAACATTAAAGTAAAGTAAAA:1 + chrX 9820008 3' - Cr1a 4068 1 73.27 CCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTCACGGACTGCAAGTCTCATTTCAGCGGTAGGCAGA:1 - chr3L 11690971 3' + roo 8922 2 65.00 GGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGAAGAGCGCCACGAGCAACCACTGCAGAATCAGTTTGCAACCACATTGCGAAGACC:1 + chrX 10041881 3' + micropia 5306 2 61.39 TAAGACATTATCATGGTCGTGTAGTTTACTTATGTATCGCTCCTCATTACAGTTTGCTTCTTTATTTCTTATTGTCATCGGATATTGTATTGTGTTTCTAT:1 - chrX 8837808 3' - G3 4393 1 59.41 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTAGTTGATTGCCAGCACTCAATTTCTTCAAAGATGGAAAGTGCTTTCAGTTTCATAAGCTAGAAA:1 - chr2L 5653514 3' - hobo 13 1 57.43 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAGGCTCGTTAAGGAG:1 - chr2R 19209451 3' - Doc 44 1 68.75 TTATAAATTAAAAATTACGTAAGCCAGAACGCATGACTGCCTTAAATTCATTTGGCAATGGGGGGAAAATATTTCTATGTAGGTGATTTCAGGCAAATTA:1 - chrX 16773971 3' - blood 6928 1 32.00 AAAAATTTGAAAAAACAGAAATATATATACATACTATGGGACTTATATAAAAAAATTGTATTGTCTTAAAACTTGGTCCCACAGCCATTAACTGTAACAAT:1 - chr4 263541 3' - FB 167 1 78.22 CCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTTGTTAGAATAATGCGAATTGCCTAAACAATTTTATGCTCGTTTGAGG:1 - chr2L 3788650 3' - 297 408 1 55.00 TTAACTCTAAATAACGTCCAGTCACATTTAATAGGCGCAGCTGTCCCCCATTAACTCTAAGACGCCCATAGTAACCGTCAATATGAAAGTTAAACTAAAAA:1 - chr3L 15067371 3' + Doc4-element 2386 1 59.41 TTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATACAAGTAAAGTAAAAATAAAAAAAAAAGACAAAAAACAAAATAAAAAAAAAACAGAGAAATCTCT:1 + chrX 7372824 3' + F-element 4639 1 73.27 CAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGAAAAAAAAAATTATTTTTACCAAATCATCTAAAAAAGGTAATGGGTCGTTAGGTTGGGTTG:1 - chrX 6897343 3' - Ivk 16 1 58.00 GAGCGCGATAGAAAACGTAGGCACGGTGATTTATCTGGATGAAGACGACCCTCAGTTTCCTTCTTGGCTTTACTTATGAGTTTCTCCTCACGTTCCTTTAT:1 - chr2R 13668818 3' - diver 355 1 60.40 AACGCACTAAAACCGCCCAAAATCACTTCCACATCAGTTCAGTACCACCATATATAATCGGGCATGTTCCGGAGATCGAGAAAGTGATCGCCGAGCTGCAG:1 + chr2R 21171358 3' + INE-1 344 1 53.47 TGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTTAAATATTTATTTATAAATCTCTGGC:1 + chr2L 8097658 3' - I-element 201 1 74.26 TCAAGTCTGTAGCTCAATATTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGT:1 - chr3L 27415238 3' + transib2 2784 1 64.36 GAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCAAGTTCAATTTAAATGACTGCGGCAGCTCAATTGAGTTCCAGTTGGTTTTCATCCGCGTTGGCGAGG:1 + chr2L 5210471 3' - accord 8 2 70.30 CACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGCTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTGTATAATTTAGCGAAAGCGCCAGACGGCGATGTGAAA:1 - chr3R 15570373 3' + 1360 3220 1 63.37 TAATAAAATCCCCACAACCACTGCCGTCACATGTTCAATACCTCTTTAAGCAGTAATGGCGTTTAAATAATAGACTAACTAAGTCCAAGCACCTGCCGTGA:1 - chr2L 12596982 3' + accord2 7343 1 52.48 GCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATTTATTGAATTCATTTGTTAATTCGACTTCGTCC:1 - chr2R 9285544 3' - gypsy 44 2 67.33 CGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTTTACATTTATGATGACTGGGATATTTTCTGCAGTTGATAGGGTTGTAGATTTTTATTAACTTTAT:1 + chr3L 11217516 3' + invader2 4941 2 69.31 GCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGGGTGATGAAGCCATGGGAGGCCTGTAGAGGATTCTCCTCGGCGCCATTGAACAAAAAGAC:1 - chr2R 12356459 3' - opus 7459 2 65.35 TACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGAATATTCTCCAGTCTGTGATGTTAAGATTCTTCACTTAATACATTTAAAATTTAAAAATGTAAAAAAAAAACTGA:1 - chrX 6917053 3' - 3S18 5768 2 76.24 TGGAAGCAGTGCTGTCCTCTACCTGTTGTACGTCTGTCCATCATTTTTTTTTGTCTTTGTTTTGTTTTCTTGTTTCTTTTTGTTGTTATTTGGTCGGTCG:1 + chrX 12572254 3' - HB 355 1 57.00 TCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGCATATATTTTCTGTTTATTTTTGAAGCTATTAACTGGCAGCTTT:1 + chrX 12151678 3' - diver 31 2 57.43 TGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATAAAGATATACACCCGCACACGTACGCGTATAGTCTCAAT:1 - chr3R 18887034 3' - 297 33 2 62.38 CAACTTTGTCATCGGTATTTCTCTCAAGTTTGAGTTTAGGTGGCTAAAGAGGTGATTTGTGTGTTGATTTTCTGCAACTAATCAGAGTGTTTCTCTTTCTT:1 - chrX 12732414 3' - Porto1 4494 1 64.36 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATTCAAGCGCGAAAGCATCAACAAATCGTACAAGTTGGAAAAAC:1 - chrX 6739603 3' - roo 8698 2 59.41 GTAAGCTTTGTTAATTTTTTGTGTAGTTTGATATGGTGGTGAATGAGAGGTACGAGTTGTTTTTGTGGCTTCTGCAGTTGCCTGGTTATAAA:1 + chr2R 16129280 3' - Porto1 307 1 69.57 CGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCG:1 - chr3L 15452873 3' - accord 39 2 60.40 CATTTATACATATACATATATACAATCCGCTCATCCGACCCTTCCGAGAACAACGATCTAAATCTAAAATTTCGAAAAAAAAGAATTAAAAATAACCAAGC:1 - chr2L 3702962 3' - Stalker 245 4 68.32 GTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGAATGGTTGTTTGGTGGGTTGACCTATTTGCAACTTACCC:1 - chr2L 14083566 3' - G6 1900 1 61.39 CCAGTAGGTATCACAAGGGGATCAACGCGCCACCAACGGTGTTACGCGCCGTAATTATGAGCCCATTGATCAACAATTTATTGCTTGGCATTCGCTTAATC:1 - chr3L 14249019 3' + baggins 11 1 59.41 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATATATCTGCTAAACCATTTGAG:1 - chr3L 19933667 3' - roo 53 2 79.00 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGTTATAGCGGTATTGTTAAAGTTCTGCTAGAAGAATGTAAAAGCATGTGATCT:1 - chr2L 7504863 3' - roo 8688 2 54.46 ACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCTATCTCCAGCTGTTGTTGTTTTAGGCCTTTGTTAATCTAATGCTGTTGGTCAATTTGTTTTCATTATAGTTCAACTT:1 - chrX 22626996 3' - F-element 444 1 56.44 AGTCGAGATATCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGGTTGAGCATCGACTCGGCTTAATAAGAATATATTTTATCGGATGAATTGTAACAGGTATAATAAACG:1 - chr2L 21236194 3' + INE-1 144 1 63.37 ATGCGACAATCTGAGCGCCTCGAGTATTGCCAAGAAACCAATTAATCACAAGCCTACAAAACAGATATCATTTTGTTGAGTAGTCTAATAAATGATTTAAT:1 + chr3L 16434408 3' - frogger 435 1 73.27 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGTCATGAGATCGGGATCCTGCCAGACAGTATGTCGCCACTCCAGGGCTCATTCAACTATAC:1 - chr3L 14152067 3' + blood 7384 2 70.30 TTTTTTATTGATAATATTTCGTTTTACCTTTTCACTTGATATTGAATGATGGCCTTCACTACACAAGGTCGTGTTGGTGTCAGGATGGCCGTGTCGGAGTA:1 - chr2R 4159582 3' - FB 331 1 60.40 AGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCATATACACACACACACACACACACACACACATCTTGGCAGGAACAAAGTGCCTAAGCTGCTCCACCAACTT:1 - chr3R 18264198 3' + jockey 4586 1 72.28 ACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATAATTTATTGGGTTCAACAAGTAGTACGGTATTTGGTTAATTTTATCTTTTTGAGAGCAAGG:1 - chr3L 14382682 3' - Stalker4 61 4 46.53 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATATCGAGTTGAAATTGATTTTTTGCCGTGTGAC:1 + chr3L 10041509 3' - 412 44 2 69.31 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGCATGACTGCATACGTGTCTTACCATGCGAACATTGCCC:1 - chr2R 5200938 3' - 1360 37 1 62.38 CTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAGCGAGAAACAAATAAAAACAAGCTCTTTACAGTAAAGGCTGCTTT:1 - chr3R 6560299 3' + I-element 76 1 64.36 GTAGGGTTTGCTGAAAGGGGTGGCCGGTCTGGGTTTTGGTGTTTGTATTGATGAGGCGGTTGAAGTGGGCAAAGGCAAATCAATGCAATCAAGTGAAAGTC:1 + chr3L 21913015 3' - G2 12 1 70.30 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTGTATAATTAATGTGAAATATAATTAAAACGAAAAGAACGA:1 + chr3R 31775110 3' - roo 8701 2 69.31 CGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAACAGACCGACATGGCCAGATCCATTTGCCCGGTGATCCTTATCAAGAACATTTATACTTTATATAGTCGGAAACGCTT:1 + chr2R 1461346 3' + Cr1a 4448 1 55.45 GTGTTCACACATGAACACGAATAGATTTAAAGACTTACAATATGGCGCAATGCTTAAAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAG:1 - chr3R 19449485 3' + roo 8664 1 65.35 AAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGCATCGGTTTGTGTGCATTTCTTTTTCCCATGAATTTATTGCTTGCATATTTTTGGGCTTCTACAAC:1 + chrX 6904218 3' + hobo 314 1 75.25 AAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACCTAGATGAACAAACTAAAAACTGTTAGTAGATACAAAGTTGCATTTAAAACGAAATGA:1 - chr2L 17650252 3' + HeT-A 5961 1 61.39 AGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTTGACATCGGTCTGATTTGATTTCATGCTAATGAGTTTGCACTCGA:1 - chr2L 19328110 3' - Quasimodo 7041 2 66.34 GGACAACGCTAATAAATAAAAAAATATCGAATAAATAGTTTCCACGTCTTTACGATGCCTCAAATGGTGTGATAATTAGGTGAACAGACGTCTGCCAACG:1 + chr2L 14545314 3' - 297 339 2 57.00 ACAGTTTTGAAAAATGTGTTGAAATTTTTTTTAGTTTTGATTTCTATTGATTTGCAAAAATACTTTTGGCTGATGGTCAATACTACTCTTTCTTCATCCAG:1 + chr3L 23264492 3' + INE-1 260 1 65.35 TTACTATTTTTTAATTTTAAAGGATTATTATATGTCCAATTTAAGATTGAAATCCCTAAAGGCCAAACATATTAAAAGATCCACTTAATTTGGAAATCAAG:1 - chr2R 10668371 3' - 1360 3027 1 60.40 TATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGTTGTCGGATCACAGTATGGAAATGATGGACTATAACAAGACCAAGGAGTGGCTTAAAGTGGCTATAT:1 + chr3R 30509707 3' - 412 331 2 62.38 CGGAACACAGCGAACAGCGATCAAAAAGAAACGAAGACAAGAACAGCTCGATACGAAACATTTTCAAATTAGTGAATTTCCCAGGCAGATAACCAAACAAT:1 + chr3L 10820427 3' - invader6 4604 2 56.44 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTATGAATATAGCAAAGAAACAGATTAAAATGAATGTGCACCACAGACGGAATAAATTGT:1 - chr3R 17495165 3' - jockey 25 1 43.56 CAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGC:1 + chr2R 5532339 3' - G4 3762 1 45.54 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATATATATATGTCTGTATACGGATATATGATATGC:1 - chrX 5151943 3' - 297 6624 2 81.19 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAACAAATCTAGGCAGGCCAAAATCCAAGAAAGAGGCAGTAAGAGCTCCAGCTCTAGTCCGCCAATCC:1 + chr3R 18026998 3' - mdg1 7049 2 68.32 TAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATTCTTACACCTCGGCCCTCGGCTCG:1 + chr2L 18205887 3' + 412 273 2 76.24 TGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCAGGCGAACTTACCGAAAATGTGGCACAGGTACGCAGCACCCACCTGGGCCGCCAGTGCGTAGAAAA:1 - chr3L 21964794 3' + Doc 86 1 70.30 ATACATAATATCAGTTCATAATAGCACCATGTGCACAACGAAGGCCAATAGAACAGGCGTGGGACTGGTCATTTCCTTAGAAAG:1 + chr2L 22065184 3' + invader2 22 2 73.81 TATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTGGGTCTCTGTTTTGGGCTGGGAAATCCTTGAAAGCGCTGGCAATAAATGCAAAAATCCTTACAAATAATATGA:1 - chr2L 11432650 3' - Doc 4432 1 75.25 CATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATTTTGGTTTTTGTTTGGTTTTCTGTTCGATTAAGTTAATGGCG:1 - chr3R 16862015 3' - Doc2-element 4445 1 67.33 ACAGATACATACACACACACACACACATACATGCGCACGCACACGGAGACACAGTCGCACTTGAAGTTTGCCCTCTGCCGGACGAAATAAAGAAAGCGAA:1 + chr2R 18068713 3' + Quasimodo 29 2 67.00 TTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCAAAAACCGAATCGCCAACTTGGGCTGATTCGGA:1 + chrX 7221755 3' + opus 18 2 67.33 AACCTTCTAGCTTTTATAGTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCATCTGTCCGTCTGCCCTGTACGAACTATAAAAGCTAGAAGGT:1 - chrX 392288 3' - INE-1 158 1 80.20 AGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTTACGTCTGTTTGCTTAACTTATTATTTTGTTTACTCTGGGTTTAGTTAATTTTT:1 + chrX 13847064 3' - I-element 403 1 65.35 GTGCAGTTTATGTGCATACAAAAAAACCACACCAATTTGCAGCTGCAGCCAACATTTTACGCCGGGATATTCAACACCAAAAACATCGACTGAAAAATCGT:1 - chr2L 19242196 3' - Cr1a 264 1 80.20 TTGAACGGTCTTAAACATTTTTTAGGTTTTCTTTTCTTGGTTATCCTGCAAGCCAAAGAATTTATCTGTATGCATGTGGAATACTTAAATAAGAAAAACCT:1 + chr3R 4686362 3' - mdg3 5120 1 70.30 TCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGGTGCTGCCAACGCGGCCCAAAACCGACCAAAATATCAAAGAAAGGAAA:1 - chr2R 10823319 3' - P-element 28 1 51.49 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAAT:1 - chr2R 19209486 3' - Doc 84 1 68.32 ATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCC:1 + chr3R 1977623 3' + micropia 5413 2 51.00 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATTCTTCTTTTAAGCAAATACTTTCTTGATTTCTATAGATAGTTATAGCACTAGTTTCTTCGAGTGTCTT:1 + chr3R 27179262 3' + mdg1 414 2 66.34 GATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTGCGGCGGCTATGCGGTGCAATGGGAGCAAAATAAGGGACGTTGCGGTATCTGCGGCGATGCCTACCACGTCAAATC:1 + chrX 5301655 3' + McClintock 6076 2 77.00 ATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTAGTTTCACATTTCGTTAGATTTTAGTACACACATTCAAGAAGTTTTTGAAA:1 - chr2L 18392618 3' + accord2 7221 1 52.48 GTTGGACTCTTTGGTTTATTTGTTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTATTTGTGGCCCTGCCAGCTTTGACGCTTTAT:1 - chr3R 9958407 3' - invader2 194 2 69.31 TGGAAAGTTGATTTCGTAAAAAAAAATTATTAAATGTTTATTTTTTTTAAAGTCAGATTGCATGAATAATAAGCCATAGATATAGATATGTTGCTCTAACC:1 - chrX 13053084 3' + Tc1 36 1 76.24 CATAGGGAACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGCATAACAAAAGTTGAGCCCGGCTAAAGAAAGTGGCAAAAACTTTTGG:1 + chrX 20012588 3' + G6 1744 1 53.47 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTAATAAACGTCTACTCGGTAGTTCAAGCATTTCATCAAGTTTGAGATTATTGAAACTTTCAGCTGC:1 - chr3L 20286587 3' - mdg1 7049 2 68.32 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCACAATTTCTAACTCCGCTCTCCCAAGGTTGACAATACGAAAAATATACTTGATATAATAGTAGAA:1 + chr3R 21969144 3' - hobo 12 1 66.34 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATAGATTATATTATTTGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATACATAAAAAATTTTAC:1 + chr3L 27864784 3' + roo 393 1 64.36 TTTATACTTCCAGAGATCTCGACTTTTATTCGGACAGATAAACGGACAAACGGACTTTAGGTTATGAGACGCTTTTTAGGTGAGTCACGATCGTATTCGTA:1 + chrX 5621985 3' - INE-1 146 1 74.26 ACAAAACCCAAGACCATTTTCCTTGAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACAGTTAGTCATTTAAATCTTGTATACCTTATAAGCAGATAGTGCTAATCAATT:1 + chr3L 16750556 3' + Circe 148 2 59.41 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCATCGGCGAGTCCTTGA:1 + chr3L 9174743 3' + 412 453 2 67.33 AGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTATATCAGAGTTTTGCCGCAACT:1 + chrX 10736223 3' - FB 56 1 81.19 AGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAGTGAACTATATCATTTGTTTGGATTGTTGAAACTCATTGGATTGCAACTAATCAGGTGTAACCGAATTG:1 + chr2R 19587227 3' - 1360 222 1 80.20 CCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATATCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACAAAATAAACGAAACACCCAATTAGCC:1 + chr3L 9120560 3' + Tirant 399 1 81.19 AATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAAT:1 + chr3L 19339428 3' - Tc1 27 1 56.44 AATATATTCGTGTTCATGCGTGAACAACATTCAAGCGCGAAAGCATCAACAAATCGTACAAGTTGGAAAAACAGCGGCAAACTTTGTTTCCCATACCGAAT:1 - chrX 6739574 3' - roo 5 2 71.29 CCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTC:1 + chr3L 23678136 3' - Osvaldo 16 2 72.28 CAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGTCAAGCTACTCATGAACCTGCTCGTCTGC:1 - chr2R 4613085 3' + transib2 2416 1 71.29 GGTGGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGAGTAGTAGGCAGCGCGTCTCCCTTTAATTCTCTTAACCAAAG:1 - chr2L 15740352 3' - mdg3 5254 1 57.58 TGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACAGACGAGACAGGGTGGAAAGCT:1 - chr3L 17222250 3' - Ivk 396 1 78.22 CGACTTCACAGCCATTTGCACAAAATTGGCATTGCAGACGGTGAACTCTGCTTGCGGGAGCCACCGGGCGTCTTCTTTCTTCTTGTCACGAGGAGAGGCAG:1 - chr3R 21366030 3' + baggins 5155 1 57.43 GTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGTTTCGGTTTAATAATCATAAATTGTAACCC:1 - chrX 20549271 3' + opus 7096 2 70.30 AAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGAAATATTATGTATTTCCTTCAATTGCAGATATACAAGAATTCTATGAATTGAC:1 + chrX 11381859 3' + Circe 7030 1 62.38 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCC:1 + chr2R 17345985 3' - hobo 50 1 77.89 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGGTGCCATAATTTATGCCCAGACGAAGTGCATTATGTTTGGCACACGGGCTTTT:1 + chr3R 22276926 3' - hobo 21 1 56.44 GAAGGCAAGGGAACCTGTACTTGCGTTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCAACACAAAAAAAAA:1 + chr2L 16274224 3' - Gypsy12A_LTR 2232 1 60.40 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGCGAAGACGCCTCCGTTTGTCGTTCGCAGCAGTTCGCGACCCCGAACATCGCG:2 + chr3L 813888 3' + roo 385 2 55.45 CGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAGTGGAGTGTAAATGCGGCACGAGTGGACCTAATTAACACGTCCATACATCAATCATCTGGCCAGCGAAGGCAGA:1 + chr2L 17283558 3' + hobo 2938 1 77.55 TAGGTAGTGTTAGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTTAAAGGATCTGCCTACATTTGTTGCTAACATTGCAAATAGTC:1 - chr2L 2925362 3' - I-element 4967 1 58.42 GGGAATGCGCGACCTTTATCCCCTCCTCTTATCCCAATCCCCCATTCCGTGTGCATTGTGTCAATGTCAGCGATGTCTTTCCATCTTTCCATCTGCGTCTT:1 + chr2R 11763312 3' + Ivk 5025 1 78.22 TCTAAATTTCTCAGCGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTCGCGTTCACTTGCCGTTTTCACGCC:1 + chr2R 11205746 3' + Cr1a 329 1 75.25 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAAATGCCTCAACTTCGTTTGATTTATGCATCATTCACGC:2 - chr2L 17311080 3' + S-element 1681 2 67.33 AAAAATGAATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTGAAAGGATGGTTGAGTGAAAAAGAGGCTGCCAAGGGTGTAGAGCAAGGCAAACTTTCTGGCCTTC:1 + chr2L 158259 3' + invader2 305 1 58.42 AATAATAATAATAATAATAATGAATGAATTGTACTCCTTTTCTTTAAGTAGTTAATGAAAAGGGTTATTTTTCTACATTCACGGTACTTCCAGCAATTATT:1 - chr3R 26100884 3' + mdg1 7081 12 75.25 AATTACAATCTGTTTTTTTTAAACAATATGTAATTGGTTGACCAAAGTCATTATCAGGCTAAAAGAATAACCCGCTTAAGGTTACCGTCTTCATT:1 + chrX 1811787 3' - Porto1 4651 1 57.89 ACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGGGTAAACAAATTTCGTGACTGGGGTAAATC:1 + chr3L 21274387 3' + Quasimodo 215 2 68.32 AAAAGGCTCCACCCTAGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTTAAATTACGCATTTTAATTTTCGGCAATTGAGTTTTGGAGCTACTTATGTAGATGTCATG:1 + chrX 7335163 3' + Tirant 8495 2 68.00 ATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCCATTTTACACCCCAAGCAAAGCTTCATCATGTCGGTCCTGCAATACCCTAACATTTCCCGTTATTACCCCT:1 + chr2L 6412134 3' - jockey 414 1 75.25 TGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGT:2 + chr3L 23678161 3' - Osvaldo 12 2 66.34 TCCGTCCATATTAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTTTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGTGTGAGGGGGCGTGTCCTTCTGGTCTTCATGTGTGTGTGT:1 - chr3L 5426949 3' - micropia 417 2 53.47 GCTATGGGTTATTGACCGGTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - F-element 311 1 58.42 TATTATGTTCGTATATACTACAGCAACAAATCTAGGCAGGCCAAAATCCAAGAAAGAGGCAGTAAGAGCTCCAGCTCTAGTCCGCCAATCCATGCCAC:1 + chr3R 18027005 3' - mdg1 1 2 77.55 ATTAAACTTCTCTAAGAAAGTTATTTATTGTACCGCTTTATCTACCAGAGCTACCCTTAAAAAGCTTCTGGCTTTGCTTCATAAACATTGTGCTTAACTTA:1 + chr2L 19674174 3' + I-element 477 1 73.27 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATTAATATACATAGTTTTAATACCACCAATAATATTCTG:1 - chr2R 8271446 3' + pogo 2064 1 66.34 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATTA:1 + chr3L 3635475 3' - roo 41 2 68.32 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAAGTTGGAACTAAGTTCAACTTAAGGAAATGGATTTCCAACAATTTCAAAATATTAACCAC:2 + chr3R 19445726 3' + Tabor 7308 2 64.36 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGTACCACGAAGCTCTTCAATTTTTTACGCTTATTTTTC:3 + chr3L 8012101 3' + transib2 2786 1 63.37 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGACGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTTAATACTACCATTATTATTAAAGCAATAATTAA:1 - chr3R 19449799 3' + pogo 2053 1 69.31 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTAGGCTGCTTGCAACTTTCTGTGGCACACACACACACGCGCGCTCATTGCCTGTTTGCTGCGTATGAAAA:1 - chr2R 20996405 3' + P-element 2881 2 73.27 CAAATGCATAAAAATCGGTCACCCACGCAACGCATAAAGCGTGTACAAGGAAAATGGGAAATTGTCTATAAAAAAAAAAATAAAAAAACAGAAGGAGCAAG:1 - chr3L 12877659 3' - S2 326 1 63.37 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGCCCTTTAATACACATCAATAACTATCGACGTCTCACGACTCTACATACGATCTATTAC:1 - chr3L 27262050 3' + P-element 2870 1 62.38 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAAAAACATCATCGTAATAAAAAAGTGTCCGCAACTTGTGCTGCATACTTTTGTGCGTCGCCAGGAGC:1 - chrX 7031651 3' + jockey 4972 1 49.47 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGAGCGATTAAATATTGGTAACATATTTCAAAATCGATTTATGGCCAGAAAAT:1 + chr2L 7745973 3' - I-element 24 1 51.00 AAAAGGAAAAAAAAACATCTAAAAAAGAACCGCAAACAGATGAAACCAACAGGGAAAGCCAAAAATGAAAGCCAGAAATGAGAGGAGGACCAAAGCCAGCC:1 - chr3R 25436122 3' + Transib5 23 1 75.25 TAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTAACTGTTCGTTGACCTTAAAATATTTTCACAAACCTTTTGGCCATTTTGCATACATCTATATGCAGGGCTCAA:1 + chr2L 1795833 3' - copia 4872 2 51.49 TAATAGAAAAGAAGGACACAAAGGGGCTCCAAGATTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATACATAACAAAAAGAACATGATTGATTCGGCGCGTAAGCTC:1 + chr2R 4431388 3' + X-element 4666 1 66.34 TTTTTTTTTTTATTTTTCAATATAACTTATTCCCGGTAGTACCCACATTTGTATAAACGCACTTTGTATTTTAGTGCT:1 + chrX 12864235 3' - TART-B 10632 3 84.62 TGATAGGTGGGGTCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCATCATTTACCATTTCGAGATCTTCGGTTTCAGTTTGTGTAGTATATGTTGCCTACTTGAGGGCG:1 + chr2R 15079523 3' - G4 155 1 65.35 ATTTATATTATATCCAATTATACTAGTCTTTGATGTTTGCAATTTCACTGATAGTCGGGGAGCTCAATGATAGCCATTTCAGAAGGTATATTGATTTTAGT:1 - chr3R 4535953 3' + gypsy7 5071 1 66.34 ATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCGCCGGAAGCCGCAGCCTCTGCGATAAACGAGGCAGCCGGAGCAGACAACAAGAAGGGCCATCACCAGGGCC:1 + chr2R 16183282 3' + accord 7316 2 78.22 TATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTACACAAAGGATGTCACACGAAATATATTTAAAATTCTTCCAAATAACTATTATC:1 - chrX 22560019 3' + S-element 1701 1 58.42 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGCATGCGGACGAGTATTGG:1 + chr2R 20544033 3' + 297 345 2 80.20 TCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATTTGATTTTCGGTTTGGAAATGTTACACAATCTTATCGCAAATGTAAGATATAGCCGACATAAATGGGC:1 + chr3R 27136121 3' + 1360 3246 1 65.35 TTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCGTGCTTTGATGTCGCGATTTTACCGATCTACCGCCTGGGCGTTCAAATTGAATTTCAACC:1 + chr2R 8156456 3' + Cr1a 262 1 72.28 TGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAATGG:1 - chr2L 15019881 3' + BS 5069 1 53.47 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGAAATATGTAATTCATCTGTAAGGATATTTTGTAAAGTGC:1 - chr3L 8012038 3' - transib2 32 1 57.43 TACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTGAGGGCTTGAGTGGGGTGCTCGAAGTGTGACGATGTGGCGCTGCTCGGGGCTCTCCCGTCTGGGTGCTCCCG:1 - chr2L 3545473 3' - accord 260 2 74.26 GTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAAATAACAAAACTATTAACGGAACTAAATAACCCAAACATGGTGAATGCAATACGATACAACCAAAAGTC:1 - chr3R 545157 3' - Transpac 1 2 85.15 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTAGCCGTCAGAATTCGCTTACTCCGGC:1 + chrX 18119550 3' + hopper2 1560 1 73.27 TAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTACTTTCACATTTTTAGGATTTTGCATCTAATGTTGAAGGGGAAGTGTAAAAGAAAACC:1 + chr2R 7898213 3' - hobo 2469 1 75.25 ATATATATATTGATCAAGAGCTACCCTGCCAGCATAGCCTAGTCCCCCGCTACCTGACAGTCCCTCGGGGTCTCGAGTTTTATGTTTCTTTTATGAATTCG:1 + chrX 5174411 3' + accord 94 2 50.50 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGCCCTTTTTGAATAATCTGGCGACTATGGC:1 - chr2L 5741326 3' + 412 445 2 72.28 TTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAACCGCAAAACAAGAATTCATAAATAGTGCGAGAAAAAAAAATTCAACAAGGACGTGGCAAATTCTTTT:1 - chr3R 19688379 3' - 1360 322 1 70.30 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACA:1 + chr2R 5651894 3' - Tirant 8145 2 62.00 TGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCACCTCTATATCCATACAAATGTAGCTACTTAAAT:1 - chrX 16465732 3' + Quasimodo 10 2 72.28 TTCCGTCCTTCTGGCGGGTGTACCTGAAAGTAAATCAATTAAACAATGTTAGTTTTAAATCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACCTGAAAAAATAAAA:1 + chr2R 18483982 3' + HeT-A 5737 1 64.36 TTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTGCATTCACTT:1 + chrX 21945931 3' - F-element 40 1 56.44 CCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTATACGAAAGGGTTGAACTTTGTAGTAGGAGGAGGTAAATTGGTCCTAGAAAATGCATTTCAATTTTAGAAAT:1 - chr2R 18454878 3' - jockey 4589 1 63.37 AGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGGAACAGCAGCGGAGGCAGATCAG:1 + chr2L 18231823 3' + 1731 4572 2 78.22 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCTTGTTTTGCCCTCTCAACGAGTGCCAGATTACGCATACGCAATGTGTGCTGCCATT:1 - chr3L 5387780 3' - mdg1 7057 2 60.40 TGTCTTTGCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTATTAATTTAAGTCAAATGACTTAAAAAATATAATA:1 + chr2L 11362282 3' - 1360 493 1 73.27 CCGTGTGTCCGCATGAACGTCGATATCCCCTATAAAAGCAATAGATTAGGAGTGCAGCTTCTAGTGACGCCGACGTTGTGAGAGTTTCTTCTCATTTTATT:1 - chr2L 20840152 3' + INE-1 127 1 69.31 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACTTTAAATTAATACCCAAATATATTATATATTTGAATTTGTATTTATATTGCAGAAGGACGATGGCAAC:1 + chr2R 12370659 3' + roo 402 1 76.24 ACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAGGTATTATTATTATTATTTTTTTCGTTATACATTGGTCATTAAAATTAGGTCAGAGTCGAAGAGAACACAAAGCGAAAT:1 + chr3R 30275947 3' - Juan 1 1 70.30 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTAAAGCATACTTATTCCATTTTAACAAAGCTTTAATCAAATTAATCG:1 - chr3L 11104591 3' - mdg1 30 2 57.43 TTTTATTATTTTTTTTATTATTTTTTTATTTTATTTGTGGCTTTAAACTAATATTTTTGTCAGATACTTACGTCTTTTTTGGTGGCATCCAGAATCAGAGT:1 - chr3L 8677438 3' - BS 5099 4 78.22 TGGTTTGGCACTATGCAGGCACTTTTTTGGTGCCGCCAAAATTACTCTCTTTCGGCTCACTAACGCAGAAAATCAGAGTATCAACCCCGAACACCAAAGAA:1 + chr3R 435987 3' - 1360 3348 1 60.40 CAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATATGTAAAAAATTCAAAAAATGAATATCACTGAAATGCAATGTATTAACTCACTTAGGGAATTAAAA:1 - chr2L 4749940 3' + Quasimodo 7365 2 78.22 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACAAAATGGAAATGGATAAGAGTTTTCGCTTGCTTAGTAAAGAGCTGAAGTGATGTCACAGTA:2 + chr2R 5154820 3' - F-element 27 1 56.44 CAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGCCCACTAATGTATACACTATAATATATAATTACAAGAACTTAAAAAAATTATCTTATTTGAGTATGTT:1 - chr3L 26719146 3' - Tc1-2 22 1 59.41 ATATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAAAGTGCATATCCGAGTTGTTATAATGTAATGGCTAAGACAAGAATTC:1 - chr3R 6431085 3' - copia 168 2 53.47 TCCTTCTGGAAACACCTACCACCACTTAGGCAGTCTAAAAAAGGTCCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACTTTTAAATTAATTAAAGAGTAAGTT:1 + chr2L 12520817 3' + baggins 5017 1 75.25 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATATATAGAAATTCAGAAACGATACAAAATATGGAGTATAAAAATTTAAATGACTCCCTAAATAAA:1 + chr2L 17066897 3' + copia 245 1 69.31 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTATGTTACTAGTTTTTTGTTTAATTTTTCTATTGT:1 - chr2R 9865519 3' - jockey 12 1 60.94 ATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTGGGAT:1 + chr3L 21912352 3' + Bari1 1693 1 65.35 CTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCGACTTTGTATCGCAACGCTTCCCGGTTCGATGTCTTTACTTGGCCATTGTTGTTGTTGCTACTGCTGCTGCTGC:1 - chr3R 17087344 3' - ZAM 8068 2 66.34 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATTTTCAATTTTTGATGTCATCGAGCGCACC:1 - chr3L 21992750 3' + 412 7500 2 68.32 TTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTAGCTATAAATACACGTATGCGAGATTACTACTCGCAC:1 - chr3R 19552977 3' - Doc 4421 1 63.37 GCCAGGTGGTTGTGGTGGTTGACAGTCAGTTTTTGTTTGCAGTTTTCGGTCTGGTGTCCAAGCTCGAAGCATTTTCGGCATACAAGGGGCGGAGAAG:1 - chr2R 9390594 3' - G2 2860 1 82.47 GCTAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTTCATTTTATTTTTCCATAAATAAACTGCGTTGATTG:1 - chr3L 6836810 3' - Stalker2 7434 2 69.31 CCGACAGAAGCCCCACTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGATAGACCGACAGCCCGCCCTACCTCGTCATCGGCTGCACCGTCAGTGAAATAACAGCAAAT:1 + chr4 388164 3' + F-element 399 1 79.21 TCTCTCTCAAGCTCTCCCCATTTCAAACGGTGTAAAGTTCTTTATCTACATAACACAGCCCTCAAAATCGATAAACACTTTCTTTTACAGACGATTCC:1 - chr3L 15411862 3' + Doc3-element 441 1 62.24 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCACGATCGCTATTTGTTCGCCGAGCGCTTTCA:1 + chr2R 16338137 3' - roo 8709 2 71.29 AAATAGAAAAAAAAAGAAAAGATGGAGGAAAAGTCGGCAAATGGAAAGAAAAACTGTTGGTTGCC:1 + chr3L 1992957 3' - S2 233 1 78.46 CCAAGGTATGTTGTTTTTAACGTATGTAGTTAATATATGTGTAGTTGCATTGATTTCCTGGTTCACCTCGACTTCGATCGTGCATAATGAAGTGTGATGAC:1 + chr2L 22322592 3' + transib2 285 1 56.44 TGTTTACACACTGTGAAATAAGTAAAATTTTTGACTTTAAAGGTAAAAATTAAGGGTTCTTAAGACATGAATAAAAAATAAGATTATTGTAAAGTTAAGG:1 + chr3L 12599983 3' - S-element 1699 1 61.00 TCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATATTACTTCTTGTTCTTGTCTTCCTGGGATTCTATTCACTAATATA:1 + chrX 17935532 3' - Doc 4342 1 52.00 TTAAATTTTAAAATTTTTAGATATAAGTATAAGATGTTAGTTCAAATGAATCCAAATCTTGCGTTATGTTAATTAACATTTCAAATGAGTAAAAAATTTT:1 - chr2L 17092392 3' - 1360 3034 1 71.00 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTACACGATAAGAGCGAATTGGAAATGAAAAGCTTTCTA:1 - chr2R 16289221 3' + P-element 2878 2 40.59 AGTAGATTTACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCGGACAATTGGTGGGTGGAACGGAAATTTGG:1 - chr2L 18226959 3' + Cr1a 4115 1 70.30 GGAGGTGTGGCCGTGGGACTTGCACGCAAAAAAAGCTATCCAGCTTTATATTCCTAAGATATAAAACGTAAGCTGGAGGATGCCAAGGCACTTGCCTTTAT:1 - chr2R 22040729 3' + Cr1a 4437 1 65.35 TTTTAAATATCGTTTTGGTGTCCCTAATGTATGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAGTTTATATGCGATAGTGGCGCGTTTTAAGTGCTT:1 - chrX 17054111 3' - transib3 100 1 69.31 TTCTTCTGTTTCCTTAACGAAACGCTTTCTGGCACGTGGCATGACTATCCCATCATTGCGGACGACAAGAGGGAACTGGCGCTCAAGTTTAATATGCTGG:1 - chr2L 2877732 3' - invader5 3978 2 57.00 CATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTACTATATTGATTGATGCACAACACAGTGTTTTCGTTTTTATAAATTGTATTGTTTTATGTGAGTTTAATGG:1 - chrX 5048353 3' - Porto1 4249 1 76.24 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCAT:1 - chr3L 9174697 3' - 412 47 2 70.30 AGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAATAGGTTTAAACAAATGGTGACAGGAAAATAATGTTTACATGGGCCTACGGCGACAGCT:1 - chr3L 18222318 3' + 1360 400 1 63.37 TGTCAGAATGTAGTGACCCATGTAACAATTGATTTGTAATACTCCACGTAACTTGTGCAGCCAGTTTTAATTTCAAACTGACATGTTGGATTTTGATCAAA:1 - chr3L 23569179 3' - mariner2 279 1 71.29 AACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGCGGCTTGCAATTGTGAAAGGTCAACATTCATTCATTTTTGGGGG:1 + chr2R 19812942 3' + G2 115 1 56.44 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACTTTGCAACCCATATCAATTAAGCCAAAAGACCGAGAGAGTGGTCAATAATTTTTCTCACCCAA:1 - chr2L 2912001 3' + 297 6968 2 73.27 ATAATAATAATAATAATAATAATATAGGCAGCTCAGCTGCTGCCTGACGATAAGTTGGAATGGTCATCTATGGAGAAAATGTAAGCGGTTAGAATTCGAAC:1 + chrX 22755089 3' + mdg1 7076 8 70.30 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAAAAACATCATCGTAATAAAAAAGTGTGTTAAATGTTTGCTCGTTAACATAAACATT:1 + chrX 12635383 3' + jockey 4956 1 62.38 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGACAGCGCTCAGTTGCTGGTCT:1 + chrX 10629272 3' + P-element 2860 1 52.48 GTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATGTTGCAGGCGAATTCCGCCAGTTCACCCAAACGCTAAGCTCCGTTTTCCCCAGGG:1 - chr3R 27915845 3' + R1A1-element 5307 1 59.41 ATGGGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTAGGATTTCATTATTCAATCGTTCAAATTCCTCAGTATGATTTAATATTGA:1 - chr3R 19449682 3' - roo 8777 2 51.49 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGAACTAAACTATCGCCAAACTAAACACATTTATAATATGTAATTACCTTGCATTTAATTCACTCGCTTC:1 + chr2R 24447078 3' - 1360 8 2 73.27 TGCGGACACAAGCATTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATG:1 - chr2R 9940472 3' - 1360 459 1 53.47 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCATGTTCTCTGAATAAAATACATTACTGAATACTCCAAAAATTATAGTC:1 - chr3R 27020224 3' + 1360 3369 1 55.67 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAGGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAAATGTCAGCCAAAGTATTTCGCATTCATAAATAATAAT:1 - chr2R 16980056 3' + opus 466 2 60.40 GTGAGAGATGACAATGTGGCACACTCCAGTGTGTATAGACATTAGAGAATATGCAAAGGAAGTTGGCCCTGGAATTCAGCGAATGATAATGCATGTGAGAT:1 + chr3R 19449323 3' + invader4 2922 2 57.43 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTATGTTCCAGTTTAACGAACTGATCCACTTGGAG:1 + chr2L 5269857 3' - hobo 41 1 64.36 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATAAAAACTTAGGTAAGGTTCTCTGGAAAATACACTGGT:1 + chr3L 17652770 3' - pogo 36 1 65.35 CCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGAGTTGCGCCTGTTGGTTCTTCGGTAGCCCAAGTTGGATCCGAAGCTGGATCTGAAGCTTTAGCCGAGGCTGCAGT:1 - chrX 14715089 3' + Porto1 4501 1 76.24 TTGACACCGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTTAGTGCTTTCGGGTTCATTTCTGGCTCGACTGCGACGGGTCTATAAGTATGCTGGAGCA:1 + chr3L 13777046 3' - Doc3-element 455 1 62.38 TGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTACAGTATGTCGAGTCTTATGTCTTACGTGAGCT:1 - chr3L 24347320 3' - accord 449 2 67.33 ATATTTAAGAAAAAAAAAAACAAAAAACCCAA:1 + chr3R 545620 3' + TART-B 10510 2 78.12 TTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTATAATGTGGCTTATTGAAATATCACCTCTCAGCTCCGTACCACCGCCATTCCGGGTTTTTGTATCGAGTGTTTATA:1 - chr2R 5953729 3' - I-element 5054 1 53.47 ATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTACCATGCGGACGATCGGCAAATTGGAGCCTGAGCGAGGAGGATCGCAAGGTATACTGCCACTT:1 + chr2R 18100060 3' + flea 4722 1 66.34 ACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGGAGCACGCAATCGAGCGAAGATGTCGCTGCCCC:1 + chr3L 6265236 3' + Quasimodo 188 2 67.00 TGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAAAAAAAAAACTCACTACGTTTTGCATTTTTTATTTTTACTGATGCTTAAATTTAA:1 + chr3L 14534297 3' - hobo 2577 1 52.48 GCAAAGTAAAACAAAAAAAACAGGCAAAACGGATGAGCGCAGCAGTCAATTTACCTAGTACCTCCTACTTCTTCCAACTTCTCGGCCTTATTCTTGGCCCT:1 - chr3L 17670463 3' + F-element 4679 1 54.46 TAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGA:1 - chr3R 14049342 3' - transib2 27 1 52.48 TTGTGATATCCACGGCGTTCTGCGCGACAACACGGCGGTGATCAGAGTCTGGAAGTCCTTGATGGGCACCGGCGACTTGATGTCCCACTGCTTGTTCTTT:1 + chrX 9967865 3' + mariner2 386 1 73.00 ACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGAAGATGTGTCGGTCACCAGCTGGTTGGTGTAGGTCATTATTTGGTGGCTGTGGAGTAAG:1 - chr3L 21446851 3' + I-element 401 1 54.46 CTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTAAGTGTGCACTTAAATTACATGTTT:1 + chr2L 3672973 3' - roo 8853 2 75.25 GAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATGTAAAGCCAATGTTATGCTCCGTTGCATGGGTTGTAG:1 - chr3R 29944454 3' - roo 9038 1 63.37 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAAATGGGTGGGCCAA:1 + chrX 12818905 3' + roo 388 2 58.42 CGTTGGGTGTGGTGGTCTTACTTGTACAGATATCTTTTCAGAGATTCTGGTTGTTGTGCTCTTATCGTATTGTAGTTGTTTTTTACAAGGATTTGCCTTAA:1 + chr3R 13640586 3' - Gypsy12A_LTR 2172 1 67.33 TTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCCATTATGCATTAGCTTTGTTTGCATATCTCAACACAGTGTTCGGATCCTCCTTTTCACTGGGTCACG:1 + chr2R 15302584 3' + Doc 356 1 69.31 GAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCA:1 - chr2L 20360643 3' - micropia 4981 2 58.42 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTTA:1 - chrX 4056270 3' - roo 37 2 63.37 CATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTTGTCTCCGACGCTACAGCTCCGCTCGGCTCTCTCTATCTCTCTATCTCTC:1 - chrX 13874128 3' + gypsy2 6649 2 80.20 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGCATTCACAAACAACAGACTTTAATCAATACTCGTGGC:1 + chr3R 4524243 3' + mdg1 384 2 63.00 GAGAACACGCAAGAGCAGCTCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCAAAGCATAGACAGCGATATCAAGAAGAAGAAATGGCCAGAAAAACAACAAAAGCGGC:1 + chr3R 9220621 3' + G6 384 1 59.41 TAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAAAGTCAGTGGGTGAAGATGAACTGAAGAGGAGAAAGGGGGAAGCCCTGAGAGCCGCGAAATGGGAACACG:1 + chr2L 17754040 3' - Tirant 318 2 44.00 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGGGAAAAATTGCAGCTGAGGTAGTTAGTGAAATCAGTTTTCACATTT:1 - chr2L 2694581 3' + Transpac 282 2 53.47 TATTATGTTCGTATATACTACAAGGGCCTTAAAAACGTTTCACATTTCACATGACTCATCCGGCGGGCGAAGACTAACCAACTTGTGAACTCTTTTTGCAG:1 - chr2R 9001607 3' - mdg1 1 2 78.22 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTGCACCATTTATTTATAGTGGTCCG:1 + chr2L 16718002 3' - 1360 53 1 78.22 TTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAA:1 - chr2R 19209477 3' - Doc 74 1 59.00 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATGAAAAGAAGGCATGCGTGCGTTTAATTATACGCAATGTTG:1 - chr3L 10035721 3' - jockey 68 1 60.40 GAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAAACAAAAAAGAGGAAAAGCAGCGAAATGA:1 + chrX 5166046 3' + F-element 495 1 79.21 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTCTAAATCACATTAGACCCGAAGAATGAAAGAGAGAAATCCCTGTTCGAACCGCTTC:1 + chr3L 13263221 3' - Burdock 6180 2 56.44 ATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAATAAGGCTATTAAATTACGCAATCAGTGGACAACGAGGCATTG:1 + chr3L 12240976 3' - Juan 4091 1 58.42 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACAGGGGTTGGTACGGGGTC:1 - chrX 409614 3' + P-element 2829 1 22.77 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGGAATGCATTTTAAATATAACATATTCCAATGTG:1 + chrX 14500149 3' + roo 9030 1 66.34 GAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAGAGCAATGCGTCATATAACAAGGGTATACAGAAAAACTAAAAGACAACTTAAAATATTAATAGT:1 + chr3L 25724038 3' + 1360 121 1 66.34 GCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATTTATAATGGTGTGCGGTCGCTTTGACGTAACACATTACGACAAACGGGCAGCGACGTCGACGTCGACTGCAT:1 + chr2R 16160313 3' - gypsy 6990 2 76.24 CGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTACTGTACAGTAAAGATATACTTTAGTTATTACATACATCTTTGTAAAATATAGTTTTGTAATCTAGAAGTTAGGAAATGG:1 - chr3L 21423943 3' + Rt1b 5030 1 63.37 GAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCATATTAGGAATAAGTATAGGAGTGAAACATAGCGCTAGAGTAGACCTAAGTACACAGAAAGACAAAT:1 - chr3R 5600957 3' + invader3 40 2 55.00 ATTTATTCGACTCAAATAAAAAAATTTTAAAACTAATTTTACTATATTTGCATATATGTATGTACAATAAACACAACACAAACACTTTTCAAAAGCCTCGC:1 + chr2R 22997683 3' + Tom1 378 1 65.35 CTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCAAAGTCGTTTCACAGTTCTACATAACCGAGGCCGAGAATGAGTAC:1 - chr2R 7364308 3' - mdg1 7144 2 62.38 GAGAATGCGCAATACCCCTCTAAGGCTATCATTGCGACTTACGCCGATGATATTGCGGTTCTTTACAGATCCAAATGGGACTTGCTACCAACAGAACTAA:1 - chr3R 15954495 3' + BS4 148 1 77.00 CCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCGCACGTCCGCACACATCCTGGCAGCTAGGTCCACTTCTATCCGGTAGATTACGATTATATCATTGCTTTTTTGATCGA:1 + chr3L 12709745 3' - Bica 66 1 69.31 ATTAATATTATATAAAATTCAACATTTAGAGTTTGAAAACAGCTGTATAAATTTTTTAAATTCCAGATCCTTGTTTCTTTTTTCTGCGTAGTAACCATACC:1 - chr3L 5994194 3' - Tc3 252 1 68.32 GCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATA:1 - chrX 10119554 3' + FB 12 1 55.45 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAAATTTAGTTTTTTAGTCAGAAATAATGACGTATTTTGTTGAGCGCACATTGCTGTTGCCATTTTGT:1 - chrX 7697630 3' + pogo 2095 1 71.29 CTTAAAAACGTTTTAAAATTATTTAAATTTCTTAGATACTATTTTGAGTTTCCAAACAAGACTGTTGTTATAAATGCTTTTGATATGCAAAACCGTAAAAT:1 + chr3L 9336593 3' - transib4 110 1 32.67 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTGTAATTAGTGTTCGAAATGTAGGCACTAATAGATGATTTGT:2 - chr3R 5993111 3' - pogo 30 1 59.41 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGACCCACCGAACCACCGAACCGCCGAACCGCCGAACCTGAGCGGTCTTCGTATGCTCGGCGGCATTTG:1 + chrX 15125726 3' + P-element 2879 2 71.29 GTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCAAGTCGAGTCTCC:1 + chrX 8027519 3' - Juan 6 1 73.27 CCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATCTTGTTTTTTTATAAAAATGGAAGAAATCATTTTGTTATTGGATTC:1 + chr2L 1320996 3' + 1360 3176 1 63.37 TTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGACCCTTTCCCGTTTTCGTTTCCCCTTTTTATTGTTGTTTGATTTCAGCATAAAGGACGGATTTGGCAACAA:1 - chr3L 5388068 3' + INE-1 90 1 64.36 TCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTGTGAAGAGAACTTTTAGGGCCATATTTAAAT:1 - chrX 12820589 3' - roo 158 2 69.31 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATACCATGTGCATTTGTTTCGCTGAGTGCACACACCGAGGATGGTCCATTAGAGTGGTCAGTTGGCC:1 + chr2R 22793426 3' - hobo 9 1 70.30 GTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCGTCTTAGTAAGGAATGGAATTATACATGCTTAAATTACTCACCTTGGAGAAGGCACCTAAGT:1 + chr3R 22622122 3' - F-element 4450 1 65.35 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCCGAAGAGCGCATATATGTGCAGGAAGATGT:1 + chr2L 17986042 3' + jockey 4944 1 70.30 TATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATATCATTCTTTCAGCTGGATATTCTTGTTCTAAGTTGATATGTATATTTATTTATCAGA:1 - chr3L 11844321 3' - Burdock 11 2 53.47 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATGTTTTGAACACCTGGTGATTGCCAAACTGGGGCGAAATCCCAATCAGTCACGGAAAACTATGTT:2 + chr3L 21275844 3' + Quasimodo 7361 2 45.54 ATCGACTTTTTATTCCACTTATTTTTGTAAAATAGAATGTGTGGATAGGAAAAAAATGAAAATGACCGGAAAATGTGAAAATTGTCAAGTGCTTCTTGTTG:1 - chrX 11656412 3' + HB 81 1 60.40 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCATCGGCGAG:2 + chr3L 9174736 3' + 412 446 2 74.26 ACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAATAGCTGAGTTCCAGTTTACGATGGTTCCCTCTTTTCACATCGCATAATTACGAGTACTCCAGGATCAGCAATGA:1 - chr2L 6213904 3' + roo 172 2 71.29 TTGAGGAGAAGCCTCAGTGTTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGCTTCTTGTCTGTCGGGCATTGATATCGCCATCTGAGCAGTGA:1 - chrX 16141082 3' - 297 239 2 60.40 TTATTAAATAAAATAAAATGTTCATTTGGCTTTCAAAAGTTTCAAGCCTCAGAACTTTCTTAATATTCTCTAGTGATGTGTAATTTAAGCAGTGCTCGTTA:1 - chr2L 14970582 3' - TAHRE 68 1 61.39 ATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTCAAAAACCAACATTGAAATCATACAGCAACATCAGCCACTACCGCCAACTCTGCAACAGCAACCATCTCCGC:1 + chr3R 19041003 3' + Doc2-element 4368 1 55.45 AGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTGTAACTTCTATAAGAGTGCCGTGGGCGCCACTTAACAGACAACACTTTATTTGTGATGTAGCTGCACTTTCAGTTTT:1 - chrX 12445592 3' - gypsy4 414 2 72.28 GAAATTCAAAATGAAACTTATAAAGACTAGGGCAAAAAAAATTAGTTTCGAAGTAATCACATATATGCAAAGTCTGAAATCTTTGCAAATTTTAATAATGT:1 - chr3L 18104225 3' + Rt1b 90 1 78.22 TTCTCTTTGTGGTTGATATTTGAACGCAAAGGATAAAGAGTTAATGGCATTACTCACCTTATTTTGGGATTTTAGACTGATTCTAAGTGGGGAAACGCGTT:1 + chr2L 6948516 3' - I-element 99 1 77.23 GAGAGAATGCAATTCCCGCCAAATTATTTGTTTACTTTTGCACGTAGTACGATCGTTAATACGCATCCAAAAAAATATCAAATTGCATTTCAATGACAGGC:1 - chr2L 4768163 3' + transib2 186 1 72.28 AATAAACGGATCTATGCTCCAGAAAAACATCTAAAGGATTTCATCTATAAAACTTGGATTGGAGGGCAAAACACTAATACTCACTGGAAGTGCGCCGGGGG:1 + chrX 7282237 3' + gypsy11 4377 2 80.20 ACTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTT:1 + chr3L 14152143 3' - blood 7063 2 75.25 AGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAAACTATACACAGAAATGAAAATAGAGGGAATAAATTAACGGCAAGATTCACTCAACAAATAGTTCACGCTGAC:1 - chr3R 2520501 3' - rover 7129 2 77.23 GGTCAATTAAAATAATATTAAATATTAAAAGCATTCATATTTAAACCAATGTTTACTTCTGCATAACAAAAATAAATAGAAATCAATGAAACAATTCAGAA:1 + chrX 15553063 3' - Transib-N1_DM 440 1 78.22 AGCCTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTTTACGACGCTTAGTCGGATTCGTATTCGGCATGTCATTGAGCTGTGCGGCTCATATAAACAG:1 - chr3R 10687434 3' - Gypsy6A_LTR 247 1 56.44 TAGCTCTTGTCGAACGCGGTTTTAAAGTTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTT:1 + chrX 706056 3' + Juan 13 1 72.28 CGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGGATTACGGGGTTATAAAAGGGGTTACTGCGGTGTGGAAGGCAGGAGTTGATCTCGCGTCAGTTTC:1 + chr2L 10274495 3' + P-element 73 1 40.82 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCGCTGGTCGTCGCTG:1 + chr2R 17346038 3' - hobo 3 1 74.26 GAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACATAAATACAAAGCAGAAACAAAGACCCCGAAAGAGGTCACATATGGAAAGA:1 - chrX 7656408 3' + mdg3 5051 2 60.40 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGGAATGCATTTTAAATATAACATATTCCAATGTGTTAT:1 + chrX 14500153 3' + roo 9034 1 62.38 GCTTGTGGGTGCGCGGGGGGGCCTGCCAGTCCATCTTCTCCAAAGTTGATAAGGAGTGAGGAGGGGGGGGAAGCTGGTGTTGAAGAAACTGAATCAAATCG:1 - chr2R 12609201 3' - G6 334 1 76.24 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGACCGGCAAACGATTCCGTCTCCCTCGCTCGCCATTAGG:1 - chr2R 12130122 3' + hobo 2900 1 62.24 GTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAGTGGGTGCTTCTAGAGAATGAATGGG:1 + chr3L 11915593 3' - hobo 2644 1 80.20 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACACTAATCCGCCACGCCTACTGTCGCCCGCTG:1 - chr2L 17056495 3' + 412 7502 2 66.34 TGGCTGTAATCACGCCATACGATTAGTCTAGCATAAGACGTAAACAAGTTACAGTTAGAAGGTCGGATTGGAAAAAATAGGCAATTTGGTTTAAAACAAAA:1 - chr2L 16749855 3' - 3S18 5973 2 61.39 CCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCTTTTTCGCCCATCCTTGCATAATTCTTATATTTTTTTCTCCCGCCCTCGTCGGACGCTTAAT:1 - chr2L 12944668 3' + Quasimodo 298 2 68.32 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGAATATCCACCAAGTTAGGGTATA:1 - chr3R 23526221 3' + P-element 2804 1 28.71 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAAATGG:1 + chrX 12818896 3' + roo 9042 1 56.44 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCCAACGAATCCTGTTCAATATCGATGAGGAATCCATTGTCAACTTGTGGGATATCTTCGGAA:1 - chrX 7768890 3' - hobo 6 1 74.26 TTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATTAATGCATTTAATACTCGTACTCGGTTACATTAATATACGAGTGAGAATCCTT:1 - chr3L 7412411 3' - invader3 24 2 49.50 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACAAGCTGGCTTAGCTTTTACTGAAACGA:1 - chr3R 14882846 3' + pogo 2055 1 74.26 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATGTACACATTTATATGTATATATCGGTGCAAAGTGCCAAAGTTGA:1 + chr3R 18887113 3' + 297 6955 2 62.38 TCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAAATCTGGGCGTAGTAAGGAAGAACAGGGGTTATAAGAAACACTAG:1 + chr3L 4560392 3' - diver 6020 2 57.43 TGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCTACCGTCATGATGTATAATAGCAAATAATAACAAATTGTCTAGCACGATCGGCGAACGGTAGCGAATGCCAGCGTAT:1 + chr2L 17397194 3' + I-element 337 1 70.30 AAGCAATGCATCGACGGCGCAATTGAAAGGAAAGTTAACTATAGTTTTTT:1 - chr2L 20776666 3' + invader2 317 1 70.00 TGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTTTGCGGCCTCGCTCGCCTTTCTTTGTTATCTTACA:1 - chr3R 5992862 3' + 412 72 2 65.35 GTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACGGGAAATCAGTCTATGGCAACTGGTCGGTGAGTTTCCCCAACTTACCACCGCCACCCCAC:1 - chr2R 16396754 3' - X-element 20 1 58.42 TAGAAACGAAGACATACATAATAATTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAACAAAAAAGCAGCAAAAAACATTTACGGCTGCACACGTACACA:1 - chr3R 27782740 3' + Porto1 4379 1 76.24 GCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATGGTGAGAGACGCTAACAATAAGTATACAATAAAATAAACGCTGAAGACAGTATTGTTTTTGTTATAA:1 - chrX 12592531 3' + mdg3 5431 2 73.27 TTTTTTGGCAGAAAATTAAAAACGATTTCAAAATCAGCAAATATCTTGATCTTGTCTTGGTTATCAACCCAAAAATGATGGATGTGTGCTAGTATCGAATT:1 + chr3L 7116401 3' + transib1 23 1 60.40 ATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAACTCCTTAATATTCATTAAGAGCTCGCCAATTTTCTGAAGTTACTGCTCAAGAAAAAGTAACAAAAAGCCAATC:1 + chrX 8921182 3' - roo 8770 2 73.27 TGCAAGTATCCCTAAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAGAAATAGCAAAACATGTTAAAAAATATGCAGACGAAATGAGGAAGAATCGAGCTGGTG:1 - chr3L 5641842 3' + G4 3545 1 73.27 GCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGTGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACGCACACTCACACAATTGCACCGTAATTAACT:1 + chr2L 23390350 3' + G2 2795 1 69.31 GATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCTAAAGCAGAATTTCTGGACAGAATTGTGACCCATTGACCTCTTGTCTTTTCGGATCTAGAA:1 + chrX 12639948 3' - copia 5052 2 66.34 GTATATATATATATGTATATTCCCGACAATTATCGGAGCCACAGTCATTAGTGCAGGTGGAGTTTTTTTTGATTTTCTATTATTGTTCTTGCAACACTTTC:1 - chr3R 27402963 3' + INE-1 68 1 65.35 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGTGGTGGAGCTTCGGCAGTCTGGAGGGCCAAAGGATATGGCCAAAA:1 - chr3R 28940717 3' - hobo 33 1 54.46 TGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATTCGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACCTAATAATCGACCGGAATCTGGCAAATC:1 - chr3R 29659234 3' + 412 409 2 68.00 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCAACAAATATAGGATGATACATAAGCGGTCGTCGTTGTTCAATTTTCCGCTGCTATTGCTAAAATTAAAT:1 - chrX 7698562 3' - pogo 4 1 75.25 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATTATAATGCCGGGCCAAAAGCAAGCCAAACC:1 + chr3L 14285090 3' - roo 8678 2 66.34 CTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGTCAGTTGCCAAGGCAGGAGAGCAACCCGTTTGATTAGTGGGTCAATTTGGAAAATGAGTTATTGA:1 + chr2L 14614053 3' - hobo 2881 1 76.24 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTAGTTGAGTGGAAATATGACAAGGTTTGAGGAGTGAGAAACTGATTTAATGG:1 - chr3L 3635410 3' + roo 9045 1 53.47 TAACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCAAATTCTAAAGAGCTGAGTTAGTCGCCAGCCAATACTTTTGCATGTTCTCCTTGTTTCTGTCTGGTCTGTCTCT:1 + chrX 16133590 3' - accord2 7388 1 41.58 TTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTGCTAAACTGCGCTATATCAAGTCCTTGAAAA:1 - chr2R 12356901 3' - opus 7415 2 69.31 GAGAGGATTTTCGTGTGAGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTCTCGACCTCATCATAATACTCCAACAGGGTCATGTTGCTTCCCTGTCTT:1 - chr2L 13722255 3' - Doc2-element 4560 1 56.70 ATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTATTAAGAAATTAAACCGATTAGGTAATTGTTATAAAAGGATTATTCAGTGAG:1 + chr2L 22635708 3' + invader4 2627 1 51.49 CAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGTCGCTTCTCCTCTGTGATT:1 - chrX 21581125 3' + Bari1 1653 1 79.21 CGCTCTTAAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGGAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGC:1 + chr3L 19471446 3' + Cr1a 4251 1 70.30 TTGTGTTTTTTGAAATCCCGTGTTTATGTGAACCGTCCAAGAACCCTAGAAGATTTGAAAGCCAACATAGAATCTTTTTTTTCTGCTCTACGGGACTAAAA:1 + chr3R 25684857 3' + mariner2 605 1 67.33 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATTGTTCTTCCCTTTCAACTCCTATCCGTACTATACCATTCGATAAACACA:1 - chr3R 27179163 3' - mdg1 27 2 56.44 GGTGAGTAACGGGTATCTGAAAGTCTATAGCATTCCCTCTTGTTTTTGTTTTGAGATTGGGTATTGGGACTGCGCACTTAATGAGCGTTTAATTGGCTTC:1 + chrX 21180395 3' + INE-1 546 1 68.00 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATCAAATACTACGGGGCTCGGCATTTTCT:1 + chrX 4784562 3' + hobo 2915 1 61.33 GTATTATATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACAGTCAATACGCACAACTT:1 + chr2R 4023399 3' - Doc2-element 73 1 59.41 AACACACACACACACACACATAAAAAAATTGAAAATTGGGTGTAAAAATCTCGTTGCGGTTTGCAAGCCTCGCAAAGCAGAGTTGTGCAACAAACTGTATA:1 + chr3R 18944425 3' + accord 184 4 65.35 AACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATCCATTACCGATCCGCCAGCTATGAGCCGGTCTTTTGTG:1 - chr3L 7703792 3' + Stalker2 7541 2 62.38 TGGTGGGTTATGTTTATGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTAGACAGTCGCCATGAGAACGTGTTATTGTTTTTTCATAATCTACTTGCCGCC:1 + chr3L 10532840 3' - I-element 4957 1 55.45 TACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATGGATCTCTCTCGGCTCGCGTAAAATTGAGAGCGTAAAATCTAAAGCTCAAAAGGAAATTACAGAAATGCCTGAAATC:1 + chr2L 21018154 3' - 1360 3329 1 67.33 GCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAGTTTTATGGACAAGAAAATCCTTTTTTTTAACATTTTTACGACCTTAAAGATTCTTATCTA:1 + chr3L 8712621 3' - diver 5904 2 40.59 CGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGCCCCTTACACCAGTGCGGGAGACCTAGAGACGGGACACTGATGAAAAAAAAATCCACCAAACATGTGGTTACCT:1 + chr2L 12384869 3' + blood 487 1 78.00 GCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGACTATCCCCCTACCCAGTTTCCTTGTGCCGTCTATGATTATTC:1 - chr2R 16810279 3' - invader2 69 2 58.42 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAAATAACAAAACTATTAACGGAACTAAATAACCCAAACATGGTGAATGCAATACGATACAACCAAAAG:1 - chr3R 545159 3' - Transpac 3 2 83.17 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCTCGACAAGATGCAATTGCCATCAAGTGACCTTGATGGCCCCCGCATGT:1 + chr2R 11076569 3' - Doc 56 1 52.48 TAACCCAAGAGACGTGACGAACAACCGTCTAATACAGGCACTATCAGACAATTCCATTTCAGAATGCGTAATATTGAAGTGGATTGATTGATCTGGCACAT:1 + chr3R 26773640 3' + Bica 4491 1 70.30 CGTGTGTCCGCATGAACGTCGATATCCCCTATAAAAGCAATAGATTAGGAGTGCAGCTTCTAGTGACGCCGACGTTGTGAGAGTTTCTTCTCATTTTATTA:1 - chr2L 20840151 3' + INE-1 128 1 69.31 TTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTA:1 + chr3L 19339420 3' - Tc1 35 1 54.46 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGGGCTATATCTGCAGTGCTCGTAAGTCGTGGGCAGCTGTGCAGAGGCTTGCAACACTGGCT:1 + chr3L 22741408 3' + P-element 2872 1 64.36 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCATTCGTGCTAACGTGACCAATATGCTTGTCATTGCCATAATA:1 - chr2R 20762162 3' - hopper 24 1 52.63 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCCATCGTGCAATATCCTTTT:1 + chrX 12883619 3' + hopper 1365 1 81.82 AACGCTTCCTTCTGCCTGATACATACTTTTCGTTAAAATCTTCAACCACTTGTCCTCCTCATATACCCTTATACCGCAATTTTGACCACTTGCTTTTATAG:1 - chr4 150399 3' - INE-1 32 1 71.29 CTTTCCTTCTTTTACATTTTTTGTATTTTTCTGTGAGCGACAGCGTGACTCCACCTCTTATCCATCCCCACATTTTGCGTATTTCCCAGAGTTTCTTCTTT:1 - chr3R 22207497 3' + copia 127 2 78.22 GACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCAGCGATGATCATGGTTTACTCCATGCACCCGTAATGC:1 - chrX 16119689 3' + jockey 4732 1 63.37 CTGTAACTTGTTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCGATTTTCTCGTTTAAAATTTCGTTCTTGTTTTTGTTAGGATTATAGAA:1 + chr2R 12089915 3' + Burdock 6224 2 58.42 GTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGCAGACAGCATCGCAGACAAGTAAACTTTTTATGCCATCAC:1 + chrX 7625160 3' - F-element 334 1 60.40 AAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCTTAGTCAAAGGTTTGAAATGCTTTAAAAATGAAACAACGACTTTGTATGG:1 - chr3L 18214510 3' + Doc 4481 1 57.43 CAAGCACTCAACAATCATTTCCTGATTAATTTTTCACACGCCGCAAACACTCGGACCCATGGTGACCCAAAGTTGATTGAATGTGTCATGGCCGGCAAATT:1 - chrX 2334917 3' - 1360 451 1 63.37 GGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCCAAAAAATCAACAAATACTCACCTGCTCCCTTCTTATGCTGTCCTCTCC:1 + chrX 7337215 3' + TAHRE 9992 1 75.25 TGCACACACACACACACACACACACACACAGATACAGATACGAGCACAGACACAGATACAGAGACAAATATGCCAAGGAGCAGGGTCAGCCATTTTGGT:1 - chrX 10822930 3' + accord 182 2 71.72 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTTCAACCAAGAATGACAACA:1 - chrX 10210939 3' - I-element 26 1 55.45 TTGATGTACAAAGGTGCTGCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTTGGATAGCCGACAATTTGTATTTCTTTTGCAGTTGCTCAAAGGCAAG:1 - chrX 1092543 3' - Q-element 172 2 71.00 TAAAGATACCACATACCGTCCGTAGGTGGATTGCACGATTCATAAACTCTATTGGCATGCGCAGCGCATTGCGCGTGTTTAAAGTTTAGCCGCAAGATGTG:1 + chr2L 7538560 3' - Rt1b 5098 1 54.46 ACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGAT:1 - chr3R 11151836 3' + mdg3 5452 2 69.31 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAACCCTCCCATGTTTGTGGGGCAAATATTATTGTTGTTCGTACTCAAT:1 + chr2R 7882027 3' - 412 31 2 54.46 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGTGTGATTGATGTGGACGACAATGGCACTCGGGGATGGAGGGATG:1 + chr3L 21852562 3' + 1360 3358 1 61.39 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAAACTGCCTTTCGTTGCTGGACATTTTTAATAATACATAATATACTT:1 - chr3L 10554762 3' + roo 9045 1 53.47 CGAGAACCCTGATGCAGGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAAATGTCAGCCAAAGTATTTCGCATTCATAAATAATAATATGGAAAACTCCTGCTCG:2 - chr2R 16980038 3' + opus 7487 2 65.35 CTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACAAGAAATGGGCGGTGGTTGTTGAGGCAGTGCCTCTAACATCAAAAGCAGGAGTGGCAGCGTTTGAT:1 + chr3R 15714228 3' - jockey 12 1 68.42 GCACACATATTCGCGTTCTCGTCTCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCAAGAAGCGCTTGTTTCTGTGTGTT:1 - chrX 18451261 3' + 1360 3223 1 56.44 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGACTATCAGATACCTCTTACCCA:1 - chr3R 10078337 3' + roo 9019 2 76.24 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATAGCACTTTAGGAAAAAACCCATGATTCTATCAAAAAGTTGTTTCTATTCA:1 - chr2R 10865640 3' - pogo 19 1 50.50 GTTATTATTATTTGTTGTTATTATATTGTGTGCTTTCTTCTTTGGTATCTCTCTTCTTTTCCGCTTTTTCCCAGCAAAGTTTTGACTAAGTGCAGTTGGTG:1 + chrX 4350342 3' - hopper 1125 1 87.13 ACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGATATACAAAACGCGCTTATTTATATTTTTTGATTCATTACAATTTACGCTGAATTTAAATAAATCATTTTGAGGTTCCC:1 - chr3R 19445822 3' - Ivk 5 1 70.30 TAGCATTTATAGTTCTTGAGATATTGAGGCAGAAGGACCTACACCTATTTTGCCTGAATAATAATTCTGTTAACAATTTGTTTTAGATCGAAATTTGCTCT:1 - chrX 20359420 3' - INE-1 151 1 69.31 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGT:1 - chrX 22690761 3' + roo 359 2 72.28 CCACCAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACTATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCCGAGCGTGGATCATTTCAATTGCGTTCTGGATC:1 + chr2R 14298017 3' + Stalker3T 91 1 73.27 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTAATGAGCGTAAAGTCAAGTTGAATAGCCATATAAAATGC:1 + chr2L 19571307 3' + P-element 2851 1 42.86 AATAACTCCCTTAGAGAAATTTAATCTTTTATGTTCACTTGCTGTAACACCCACATCTGCAATTTTAGTAGTTCTATATTTTGGATGCCAGAAATTCTTTG:1 + chr3L 22789313 3' - I-element 480 1 65.35 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACATGCGAAGCTGACACGTAGTTAGTCATTTAGTTAGATCTGCCGGAATAGCTAAGGTAACAAGTGCTAATG:1 - chr3R 17612253 3' - 412 14 2 74.26 TACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGACTGCAAATTTATGCCTTTTGTACA:1 - chr3R 9081949 3' + hopper2 1561 1 70.30 TGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATATCTATAGGTGCAACCACTGGGAGTGTATTAGTCAGTGGTGAATTGG:1 - chr2L 17122735 3' - accord 7089 2 56.44 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATAATGAAAGGGAATTACTAGCCAATCTTATCGTACTTCAACCTTCCTTTATTTTCCCCTTATAACAA:1 + chr3L 14217575 3' - F-element 26 1 54.46 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATA:1 - chrX 8027418 3' + Juan 4199 1 54.46 GACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGGAAACCGAACATTTCAAAATAAACGTAGCATCCAGAGAAACAATTAGAAAAGCATTTACAGGTCTGTAATT:1 + chr2R 5788735 3' - INE-1 549 1 72.28 ATAGTCGAGTTCGCCGACTATCAAATACCCGTTAGTCAGTTAGTATGAATGCTTATGCATTTTGTGGCCAGGAAATGGAGACTTTCTCAACTTAATCATGG:1 - chr3R 9169397 3' - INE-1 564 1 55.45 TGCACTTATACTTTGTAGCCTTCGAGTGAACGATCATGTTACATCCGCCTTGAGCCTTATTGGTTGCATGGCAACAAAGTGGATGTGGATTCCATTCGAGG:1 - chr3L 3072379 3' - 412 140 2 80.20 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATAGTGCCCCATCATGTGGCATTCCTAAACCCAAAGTGTCTTTACCCGCTTTCGGGA:1 - chr2R 15606010 3' + roo 9050 2 63.37 CCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATTAAAAGTAACAAATAAATGCCGATGATTTCGGCATCGCATTTGACTGCGTTTCTCGCGTGCTG:1 - chr2L 20701168 3' - F-element 4268 1 66.34 TACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCTTAGCAATTAGAATTGCCAAACTTGCCTAGGAAATT:1 + chr2L 17828712 3' + 412 280 2 64.36 GGCGGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATTCATTACTTTGAAATGCATTGAATGAAATCAGATGGGCTGTAATTTAATTTAATTCTCTTCTCTTTCTTA:1 + chrX 12954278 3' + pogo 2100 1 74.26 AACACACACACACACACACACTGACACACACTCACACACACACACTGACACACACTCACACACACTCATCACAATTTTAATCGCTTTCGAACGGTCAAGGT:1 - chrX 12728041 3' + accord 7030 2 55.45 GCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTCAATGTAAATTGGGCGCGTGCAGCTATTGTATTATCAAAGGAGGCCGCTTTAGCTTCAACAAGCCACCGTCGCTGTGTC:1 + chr2R 14204776 3' - opus 113 3 77.23 AATAATAAAAACATCATCAATAAAGTAATTTTCTTTGATTATATGCACAATGCCGAGTACCCTGTCCTTATGCCACACAAAATAAACTAGCAAATATGTTA:1 + chr2L 13314162 3' + jockey 4991 1 74.26 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGGCAAATCCTTGCTGGCAAAAAAAGAACTGGGTTTTGGCAGACGGAGGACAC:1 + chr3R 25509330 3' - Doc 40 1 48.51 TTCATAGGCGGAGGGGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCGCTGTGTCTA:1 - chr3L 15452864 3' - accord 30 2 51.49 TTTTTTTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTG:1 + chr3L 24916684 3' - Porto1 155 1 62.38 AGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATTATAATCTCATTGAAAGCAAAAGTAACTCCAAGTACTCAATTGATT:1 + chr2L 17168510 3' - flea 4785 2 57.43 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAAGATCTTTAGGAGCTTCAAGAAAGTAATTGCTCTCAGATAAGATGAATTGAA:1 - chr3L 17902233 3' - pogo 21 1 59.41 CACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTATTAATTTATCCTAGGGGAGCAATAGTTCGATGCGTGTGCC:1 - chrX 10552578 3' - pogo 1682 1 59.41 ATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTT:2 - chr3L 17215734 3' - Ivk 46 1 66.34 TGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTC:1 - chr3L 5267221 3' - Juan 4007 1 57.43 TACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCTTGATTTTGCCTGTACTCTTTAAGTAAACGTTCCACTTCTCCTG:1 + chrX 15965515 3' + F-element 4448 1 56.44 AAAAGAAAAAGGAAAATAAAGAAAACAACGCTCCGGAAAAAGGGTAAAGCTACTTTTTCCGAAGGTCAGACCGGTTTCCTTGCCATTATGCATTAGCTTTG:1 + chr2R 15302535 3' + Doc2-element 252 1 47.52 CATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGCATTTTTCTTGTTTTTAACTAATGTCGCGGATCGATAATTGTAATCGA:1 + chr3L 24402221 3' + INE-1 535 1 59.41 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCTGATTTTCGATTGACGTG:1 - chr3R 9606229 3' + roo 9038 1 76.62 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACGTGTGAATGTGTGTGGACAGTCGCGGGAAAATGTAATCGTATAAATGAATGTACTAATGCAAC:1 - chr3L 10432308 3' + P-element 2874 1 38.61 CCCCTCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGCGAAACAAAAAAAAAAAGGGGGAGTTTAGTATGAACCGAAATATGCGGTATTCTACT:1 + chr2R 1949150 3' + Cr1a 4418 1 80.00 TTCAAAAGTGTGGGCGTGGAAGTAATGAGCTTTAGAAAGTGACAGCATAGGTATGACAACGCGGACGTAAACAAGGAGCGCGTCGGCCACGGACCCTGGAA:1 + chr2R 24939096 3' - INE-1 249 1 57.43 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATATTTTTATAGCTTAAGATACTTTTACGCAGAAC:1 - chr3L 11335453 3' + pogo 2063 1 67.33 GCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAATCAGAAATCCAGGAGTCGAACTCAGCTGCAGCTGCGTCCACTCCTGCATCCCT:1 + chr3L 6792144 3' + invader2 4936 2 62.38 CTGTTACTGGCGTTCCCCAATAGCTGGGAACCATAGGTCCAGGTTGGTTTTGGGCTTACTTTGTGTAGTGTGGTCTGTTCTTCTAGCTGCATCTATATTTG:1 - chr2R 9528962 3' - Fw2 3567 1 53.47 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAAGTTTTTGCATAACAA:1 - chr2L 3988526 3' - I-element 38 1 52.53 AATAAAAAAAAATAAAAAAAAAGAATTATTGTAGCTACATATCAGACATTGAAATATAAACTAGTTGCATTATATTTATGCGAACTTTACTAGGAGTTATA:1 - chr3R 13475120 3' + Rt1a 5078 4 75.25 GTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGCTCTAGCTCATGGCATTGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTGGATATAACTGGTGGTATTACAGGTG:1 + chrX 7689736 3' - gypsy12 10160 2 80.00 TTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTCGATCAATTGAAACATTAAAAAGATCAATCTTCTTTGTGATCAGATTTTTTAAAAATGTTGTTT:1 - chr3L 25607879 3' + flea 202 2 70.30 AGGCAGAGCGGGCTGCCGGTTGACATTGTTCTAGGGGAGCAGTGAAAGGGGTTTTGATTTACTGCCTACATTGTTAAGAGTAAAGTGAAGGATATAAAATG:1 - chr2L 1238126 3' - F-element 441 1 82.18 CGGGGAACTCGACTATAGCATTCTAGTTTGATATAAATAACAAGAGAGAATGCTATAGTCG:1 - chr3L 24797354 3' + INE-1 570 1 60.66 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCGCTGG:1 + chr2R 17346029 3' - hobo 5 1 70.21 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGCGTTTAAATGAAAAGATTAAATATTTGTTTGTAGATTTCCTCGATGAGGTCAAAT:1 + chr4 718542 3' - jockey 4786 1 58.42 CACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTTAAATTACGCATTTTAATTTTCGGCAATTGAGTTTTGGAGCTACTTATGTAGATGTCA:2 + chrX 7335161 3' + Tirant 385 2 65.35 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGAACTGAGGCCATTAAGTTATATTATGCTTAATTTCTATCCCATTCAGTGTGGAGACAGTCGT:1 + chr3R 28678261 3' - I-element 23 1 55.45 TAGCGTTTATAGTTCCTGAGATCTCTACGTTCATACGTGCAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTCGCGGAAAGCTAACTTAGGGGGAG:1 + chr2R 7082493 3' - INE-1 151 1 77.23 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTTGTATTTCCATTGTTTTAAACCAAATCAA:1 + chr3R 27926626 3' - I-element 51 1 76.24 AACATATTTATAGTTTGCCTACTTATCATGTCTAAACACATACAGCTTTGGGCCCTTTTGTGTTGTTTGGTTTGACTTTCGTTGTTTTTTAAATTGATCGT:1 + chrX 12311265 3' - rooA 29 2 58.42 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCAGACTTTTAACAGTGAAAGCAAAACGCTGTTAAAGATCGAAATC:1 - chr2R 12655878 3' - P-element 32 1 48.51 CTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCG:1 + chr3R 1844855 3' - Cr1a 121 1 64.36 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCAACA:1 - chr3R 20396551 3' - I-element 50 1 70.30 TTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGCCTTGTTTTGCTTTCTACTAATTCGGATTGTTTTGTGTGTTATCTGCATGTGATGGGTCTG:1 + chr3R 27993420 3' - transib2 13 1 66.00 GTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGTTCACGAAGGGAAGAGAGGCATTGCATTAGTGTGTGTGTGTGCAAAGGAGAGCAAGAGAGCGCAATGTGGA:1 + chr3R 14050944 3' - Porto1 307 1 74.26 AAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCCAGCAGCCAGCAGCCCAGGCAGCTACGTACTCGGGCTGCAAAAGAAAAAAAAAATACCAAGGGACAG:1 - chrX 18593959 3' + jockey 4659 1 65.31 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCGTAGTTTGGAGTTCGCAGTTTGCAGCATGCACTTTTCCCCTGTTGTTTATCA:1 + chr2L 4057205 3' - hobo 24 1 51.49 GCTCTTGAATATAAGCAATGCCCAAATGTTTTATTCGGCGACTTACTTAATACGTAGACTTTAAAAGCTGGTAATGAATTCCAGCTGCCAGGCAGCGACT:1 + chr2L 127075 3' + 1731 4311 1 77.00 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAGCCATGGCAGGAGCTGGCAGGGAGGAGCTGATGTTAAAGCCAAGGCAATA:1 + chr2L 4134399 3' - copia 27 2 50.50 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGTTATAGCGGTATTGTTAAAGTTCTGCTAGAAGAATGTAAAAGCATGT:1 - chr2L 7504868 3' - roo 29 2 59.41 GGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTTTCACTGTCTCTCTGGCTGTCTCTGTTTGGCACTGGAATGTATTGCTCGGTCCGCTTG:1 - chr3R 27736575 3' + blood 150 2 79.21 CTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGCCACACCACGTCCTGTTCTGTTCGCCTTGCCATTGAGCGGCCGCGACGATGACGCGTGCTCC:1 - chr3L 4619543 3' + Idefix 7021 2 62.38 TTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGGAAAATCATTTTGTATTACTCATGCGCCTTTAATATGATAG:1 + chr2R 23908425 3' - Transpac 29 2 58.42 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTACAATATATATTATAGTATGTGGCTGAATGCACGGGGGTGCCATGATGTCAACTGCTCAGTTA:1 + chr2R 12130687 3' - hobo 13 1 66.34 TCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTACTCTGATCTGCCCTGGGGCTGTGCCAATAAGTCGAGCAGCTTG:1 - chr2R 6783166 3' + Tabor 453 2 57.00 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGCAAGGTGTGGTCCCTAAAGAAACAAGTGGACAATGCCATCAAGCTG:1 - chrX 17283941 3' - roo 29 2 52.48 GACGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCAATTATTGCATAGGTAATTTATAT:1 - chrX 4339861 3' + Porto1 4271 1 76.24 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAGTTTGAAGTTTGAACTCTTGACTCGCCAATTTTGGTCGTCGAACTGGC:1 - chr2L 18979390 3' - Doc 32 1 52.48 ACCACGGTGCTCCGGTGATGGTTCTCAGGATTTTCGATTGGGCTTGTTGGATGATTTTTACGCTGCTGTGTATTCTACCGGATTTGTTTGTTAATTAGAAT:1 - chr3L 7968382 3' - Fw2 3632 1 68.32 TATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTGAGGTAATTGCATGTGTGTGCATCGGGCTCTGGACTCTTGGCTTTTCGGAGGC:1 + chr3L 4051274 3' - I-element 4922 1 67.33 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATACACTTCTACTTGTACCATGTATTGTATGTATGTACATACGTACATAGTACACATCATGGAAATCCG:1 - chr2R 22793314 3' + hobo 2930 1 72.28 AAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTTTTGCCACGTTT:1 - chr3L 5267202 3' - Juan 3988 1 60.40 TCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTAAGACGAAACCTACCCCACCACTTCCACCCCTTTTTGAAATCACCCA:1 - chr2L 12236575 3' - I-element 4901 1 53.47 TTTGGTCATATCTTGAGGCACGAGGTAGTACATCAACAAATAAAAAAGTGGCAAGAACAAATAAAAACGCTTCAAAAACTCACTTATTTCCG:1 - chr3L 6465664 3' - 1360 484 1 80.43 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTGCTGATGTGGTTGTTGTTGCTGCTTCT:1 - chr2L 2993388 3' - 297 10 2 95.05 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTTCGAATTTGGTATAAGGATGGG:1 - chr3L 9174671 3' - 412 7074 2 58.42 ATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTATTTTTTAATTTTTAAACTTTGCTGGTGGTTTTAACTTTGCTTTTTAA:1 + chr2R 25286867 3' - TAHRE 30 1 54.46 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAATCAGGTTGTTGGATGGCATGGGTTAAGGGAAGTCGGCG:1 + chr2L 7971044 3' - blood 35 2 57.43 TTTATAATTCCTGAGATGTCGACGTTATACGAGTCTAGGGCAAACAAAAAATAAGAACAAGGTCCAAGGCATTGGGTCAAAAGCCAAGTAAAAAAAACAAA:1 - chrX 305986 3' - INE-1 146 1 77.23 CACACATCAACACTTACTGAAGAGAACGGCGCTACCACCATGATCAACTGTCTGCAAACGTGCATCAATAACTGCATTCTGGATGTGGAAATATGTTAGAG:1 + chr2R 9574907 3' + Ivk 5071 1 44.55 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATTAAATGTCGCAAAATAAATGCTTAATTGGACAGATAGACT:1 + chr3L 3635513 3' - roo 3 2 78.22 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATATTACTTTCTTCAATAGTAAGTAACCTTAAAGTATTTGGAGCATATGTATA:1 + chrX 7741777 3' + roo 385 2 53.47 GGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTTTATATGTTGTGACCAATACCTTCTCTACCGCTATTTGACTCATCCAGCTTGGGTTTCTTTGTGGTCGGTTCTATC:1 + chr2L 6560611 3' - Idefix 71 2 66.34 AGCTGTTCGCTGTAGCGCTTCTCACACCGCTTAGCTTGCCTTTCAGCCACATTATATGTATAAAGCTCTTCGCAAAATTATTCCCACTTTAATCAGAA:1 + chr3L 3559245 3' - 1360 122 1 79.59 TAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAG:1 - chr3R 14049334 3' - transib2 19 1 60.40 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCCAATAGCCCAATGGCCCAAGGGCATTT:1 - chr3R 20170468 3' - hobo 49 1 74.26 TAACTAAGAGGATATATAGTACCCCTACAAATAGAAGCCGAATCGAAAAGAGTTATATCTGTTCCGACGCGACTAAAGGATGGGGATTTCCTAATAAACAG:1 + chr2R 1324146 3' + invader2 238 2 59.41 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGGGGTTTTCC:1 - chr2L 23189409 3' + 1360 3387 2 92.00 AGTTTCGAAAGTATAAATTAAAACAACATAATAGACAGAAATCTGGTGTTCACTGAAATCACCGAAGCCACTTTTCATTGTAAACAAACAAACAGCGGCCA:1 + chrX 19185197 3' - HB 1471 1 58.42 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTT:1 - chrX 4056272 3' - roo 39 2 65.35 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGTC:1 - chrX 22690760 3' + roo 360 2 71.29 CGGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAAAGCTATGTCTTAATTTTGGCAGAAATTCGATTTATGGCTGCGACGTGCTGA:1 + chr3R 17665348 3' + invader2 482 1 57.43 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGACATTGACACGTCGCCCTAAAATGTA:1 + chr2L 16968464 3' + 1360 3340 1 75.25 AGCTGAGTGAGGTCCGATCGGGTTCATAAATAGTGTGTTAGAAAGAGATGACAATGTAGTGCGCAAACGTCTCATCCGGGACAAAGAGCCCAAACCTGCTG:1 - chr3R 5819376 3' + invader4 2880 2 63.37 TGCTTCACAGGCGACCGTACATCAAACGCTGATAAGGCACCGGGATCGCTTGTGCGGGACAATTTACAACAATTATACCAACGAGATACATATTGATGACG:1 - chr3R 15079168 3' - accord2 7221 1 80.20 GGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:2 + chr3L 25232909 3' - GATE 8267 2 52.53 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGCATAGGTTTTTTTATTCAATATATGATTACTGAA:1 - chr3L 17786300 3' + roo 9031 1 67.33 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAGGCTCGTTAAGGAGTCATTTCA:1 - chr2R 19209443 3' - Doc 41 1 73.27 TATATATACATATATACATATATTTCCAAACTTCAGTGGAAAAAGTACTGTTGCATACTTTTAAACAGCTTTGTAAGTTAATTAAATTAAATCATTTCAAA:1 - chr2R 14443822 3' - G3 4506 1 67.33 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCCGACAAAACGAAGATCGTCGCCGGCAGCA:1 + chrX 10585453 3' + P-element 2840 1 33.66 TTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCGCTGTGTCTA:2 - chr3L 15452864 3' - accord 30 2 53.47 AGAACAAAAGAAAACCAAAAAGCAACAGTCGACAATAATTCCCACACAAAACAGAAAAAAATGTCCTGGAACAATACAACAAAGCGGCGATAAAAGAGAGC:1 - chr3R 8465210 3' + mdg3 5102 1 60.40 AAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGGATAGCGCCAAGAAAGGCAACCGTTAATTGATCTAACCCCTCGGCGGTGGTCAGTGCCAGAGCACAGA:1 - chr3L 20809101 3' + Doc 4480 1 73.27 TCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAATAAGGAAATACAGTACGAAAGAAGAAAAGCGAGGAAAACCAAAAAGGCACTAAAGACACCCAGC:1 - chr3L 14328835 3' + Transpac 320 1 65.35 AAATGTTAAAAATTAATTTTAAAGGATGGGCAAATCTGTTTTGAAAAGAAAAACAAATCGAGCAAATTGCAAAGGGGCAAAATGGCCAATTGACCCAAACG:1 - chr3L 18566370 3' - FB 974 2 73.27 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATATATGTAGATATGTATGTGTAGTGTGTATCTCGCAGATGCGTGGTAATCAAAATGATGATGTGAAAAT:1 - chr2R 11400304 3' + 1360 3381 2 49.50 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACAAAATCATTGACTTACTTCTTGGGGATGCAAATTTAAACATGGATTTTCGTTTCAATGCAAATC:1 - chrX 12954152 3' - pogo 9 1 68.32 GCGAAGCGAGCGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGTTG:1 + chr3R 1844858 3' - Cr1a 118 1 67.33 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATGTAAGTGAGTGAGTGAGTGCACACTGTATGTTGC:1 + chr3L 3476409 3' - 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jockey 468 1 72.28 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAAGCAAAAAGTCCTTGGTTGGAGTCACTCAGAATGTCTTCTTAAAGTTAACCGGAAGTTA:2 + chr3R 12058702 3' + roo 391 2 64.36 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCGCTTAGTATCTGTATCTGTGTGAGTGACTGATCAAGGCAGCGCAGTCGGCGTCGCCCGTTAA:1 - chr3R 18448918 3' - hobo 13 1 66.34 AGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATTTATATTCCAAACGTTTAGCCGAAGTATTATACAGATCAGTGCGGAAAATAACTGTATCCGCCTTGGTGAA:1 - chr2R 16529129 3' + Tabor 422 2 73.27 TCAGCGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTGTGGCAAATTGAAAAGACATGGGGCGGGTGAATGTGATAGG:1 + chr3L 22031710 3' + Cr1a 339 1 57.45 CGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAAATGTGTTCGCAAAAACCCAACGCAAAAACACCTACACACGCACGTGAATATTGAAATCTGTGTGCGGAAAAAGTGA:1 - chr3R 15663236 3' + P-element 211 1 79.80 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCTTGTTTTGCCCTCTCAACGAGTGCCAGATTACGCATACGCAATGTGTGCTGCCATTGTGTTACATTGTG:1 - chr3L 5387767 3' - mdg1 7044 2 73.27 GGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTAATGGGACAAATGCGCAAAGGCTTGTCACGTGCAGTCTAGTCTAGTCGCAACAAG:1 - chr2L 12226307 3' - gypsy4 476 1 60.40 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGTGCCCGAACCTCACCCAATAAAATAAAAATGAGTTTTGAATTCA:1 - chr2L 1195043 3' - hobo 32 1 56.44 GAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTGGGATAATTTATTGGGT:1 + chr3L 21912364 3' + Bari1 1705 1 77.23 CAAGAGAGAATGCTACAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATC:5 - chr2R 10552703 3' - INE-1 578 1 85.15 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGATGTGGCGTGGTGCGTTGCTTTTTGCGCCTTTGCGGCTC:1 + chr3R 17508159 3' - jockey 37 1 58.24 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGTGTTTATAATTTGGAGTCTTGGCAGGTGCTTTAGTGGTTCGA:1 + chrX 6739668 3' + roo 9038 1 58.42 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGACTATCAGATACCTCTTACCCATGCTCTAGGAATATGAAGATGTTTCAGTAGC:1 - chr3R 10078306 3' + roo 9050 2 57.43 GTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATATATGTAGATATGTATGTGTAGTGTGTATCTCGCAGATGCGTGGTA:1 - chr2R 11400326 3' + 1360 3359 1 61.39 AAAAAAAAGAATAAAAAAAAACGAAACGAAAGTAAAAAATAAAACGCCAACAATGAGCGACTTACAACCAGTCACGGTGCTTATTTTCCATTTCAACTCCA:2 + chrX 3094773 3' + HMS-Beagle2 488 6 88.12 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGTTAAC:1 + chr3L 14152155 3' - blood 40 2 65.35 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCCAAAGAGGTGATTGCCGTTTAAATTACGAAATCAT:1 + chr3L 5085064 3' - 412 7092 2 64.36 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGCGAATATACCTGATTAAAGCTGACCTTAATCCTATTGCTAAACACACACACAGGCTAAACTCAAGCCGAATTTTCG:1 + chr3R 26871127 3' + hobo 2937 1 77.23 CAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCTCCACAACCAGCCCCGCTCATCTTTCCTCGCCAAAACAACATTAATTTTGGA:1 - chr2R 1574980 3' + 1360 1 2 55.45 ATAGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCA:4 + chr2R 2092775 3' - Doc3-element 100 1 73.27 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATACGAACTCCGCACTTTTCGTTGCGCCTGCCTAATAAAAGCAATTTATGGAGCCCAAAGCG:1 + chr2L 3988607 3' + I-element 5335 1 61.39 TCAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAACGTAAGAAATAGAGAAAAAAGAAACGAAGATAAAAGCGCATTAATTGCAAAACTCTGCGCAAAGAAAAAAAGAGAA:1 - chr3R 14067682 3' + R2-element 3584 1 51.49 TTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAAACGAAACGTCACAAACAAATAAATCTAAGAAAAT:1 - chr3L 15635082 3' - Max-element 8278 2 66.34 ATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTTTTATCACAATATATATATATTTGCTTTTAA:1 - chrX 8660851 3' - rooA 7560 2 76.24 TTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTTTTTTTACATTCATAATACACATAGATATAAATGTCTTTACGCAAGGACTGGCGCAAAACAACGAT:1 - chr2L 17066784 3' - copia 9 2 70.30 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGACAGCGCTCAGTTGCTGGTCTTGTTTGGCTT:1 + chrX 10629282 3' + P-element 2870 1 62.38 ATTTCCGAATCTGAACTCGAATCGGAATCAGAATGTGAATCCAATATTTTGTTTTCAAATCTCAGATTGCATTTTATATTGTGCATGCAAACAGAATGTTT:1 + chr2R 19333679 3' - transib2 2551 1 58.42 CTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGGAACTCGTTGGAATGTACACTTTGTATGA:1 - chr2L 20629468 3' + Cr1a 4243 1 77.23 TCTCAACATCACCACAAATAAGCTTACAAATAAAGATTGTTTCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAGAAAACTTATAATGGTGCTTTTCAG:1 - chr2L 124058 3' - Cr1a 4055 1 75.25 GAGGGCATTAATCGTTGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAAAACAACCAGCGACACTTTTAATCGTGCCCCACAAACTTGGA:1 + chr3R 4693568 3' + micropia 326 2 56.44 GCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTT:1 + chr2L 21570244 3' - Dm88 38 2 63.37 AACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAAATACTGCCCAAACCGTCCAAAGGTATCTCGCCCTCACTTCGGTTTTCCCGA:1 - chr3L 22970410 3' - Cr1a 196 1 63.37 TTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACTCAATTTGGCCTTATTAACCTAAAAAATGACACAGAT:1 + chrX 20874404 3' + 1360 3171 1 63.37 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGTTAACCACCTTCGTCATCTTCGCACGA:1 + chr3L 14152177 3' - blood 18 2 61.39 TGATGAAAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCAGAATTATGGGGGGTGATGTTAGGCACCCAAACCGCACTGCGTTACA:1 + chr2R 11302253 3' + Dm88 352 1 69.31 TTCACCCTTCATTTCTTAGACCGTCACAACCGCCACCCATACAAATTTTATGTTATCATCATTTTCTTACAGAAAAGTTCCGCTGAAGTGACCACACTGAA:1 - chr2L 19032353 3' + hobo 2645 1 58.42 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGACCCGTCTCGAGATCGCTTCCCGCCTGGCCCCCATCTTCTCTGTTCACTTAGCAAATGTTTAAAAATCAT:1 - chr2L 7970951 3' + blood 372 2 72.28 GTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTGACAGTCAGTTTTTGTTTGCAGTTTTCGG:1 - chr2R 9390642 3' - G2 2912 1 71.29 GGAGGGAAGTAGCATAATATGCTTCTCATATTACGCTTACACAAACTTAAAACCTAACAAAAACACATAAAAAATATCGAAAAACTTAAGTGAAAAAAATA:1 - chr2R 13864760 3' + rover 6945 1 64.36 TGACATATTGCATTGAGAAGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATGTATTTTGCATGCACAAAGAGACCTCATCTATTTATCTCTCTCTC:1 - chrX 15401325 3' + Dm88 4338 1 67.33 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGT:1 - chrX 21668011 3' + Tabor 448 2 59.41 CACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGAGTAGCATGTCGTCCTCGGCGAATGATGAAGAAGACAGAAAAGATGGTGGTAATTGTAAGCTAA:1 + chr2L 6925552 3' - Doc 465 1 74.26 TAAAACCAAACCTCTCACTAATCATAGTAATACCTCTCTTCATTAGAAAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTAGAGTCTTGGATTT:1 + chrX 13134943 3' - BS 5009 1 68.32 AATAAGAAAAAAAAAAATGAAAATTTC:1 - chrX 15609377 3' + Doc2-element 245 2 96.30 GGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGAGCGGCCGTCCAAGGACATTAATAAGGCCCAAAGGATGTGGTGA:1 - chrX 10548885 3' + F-element 435 1 57.43 TTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTGCAAGGGAACGTCCTTTCGGTGGCGTTTGAACGTGTATAAGATGTGG:1 + chr2L 21033183 3' - I-element 406 1 53.47 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGGGCTTAATATAATACTTGTCATACGTTGCTGTTCATTTAAAGTTCGGGAACTTATCGCTTAAAATAATAT:1 - chr3L 14886174 3' - 412 7 2 72.28 GGTCAAAACTGCTTACACAGCTTTTAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAAAACTTCCTCGTTAATTTAGGGG:1 - chr3R 27358875 3' + Quasimodo 345 2 76.24 CTGCTCATCGAGGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTC:1 + chrX 19820779 3' + Rt1b 4969 1 70.30 GTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTAAAGCACATATAATTATTAGTTTTGTACGACTTTTAATCAATTTTTATTTGTGTTGTTCCCCAGTT:1 - chrX 19080259 3' - Ivk 11 1 60.40 AAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTACAGGTACACATACATAAGCTCTCGTTCATATTCCCGGACTCAC:1 - chr2R 20735655 3' + invader2 4813 1 80.20 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATTAAATGTCGCAAAATAAATGCTTAATTGGAC:1 + chr3L 3635504 3' - roo 12 2 69.31 TTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGGAACCATCCATCGACTGCTCTTTAGG:1 + chr3L 22669694 3' - 297 492 1 68.63 GTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTATTCTTTTGACTCAGGGGCTGCTCTTCTTTTAACAATTTGGCTGGCAAGCAAGCCATAGGTGTGAATAACCGCTAC:1 + chr2R 21413925 3' - jockey 4753 1 59.41 AAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCCAAATCAAAACATTCAGGACTTGACCTTGAGTGCCCGGGACAGATGAACACATCAAGGATGCAC:1 - chr3L 3476566 3' + jockey 4743 1 62.38 GTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGGGGGCGTTCAAAATTTAAATTTCAATATTGCACTGCACTGTCACTTGAATCTGTAATCTAAGTC:1 - chrX 21058365 3' - I-element 5120 1 67.33 TTTTTTTTTGCTTTTTTTTTATATTTGAAAGGGGTGTTTTGAGTGTTTGGGTGATTTTGATTGTGGACTGATGGGCTGATAGCTGGATGGCCGACCGGCAA:1 + chrX 14328275 3' - Rt1a 5079 10 70.30 TTTATTTTATTTTTATTATTTATTTATTTTGTAATTAACCTCTTTTCTAAATCCTTTCCAAAGAAGTGGACATTATAACATCGAAATAGGTCAGTCAATAG:1 - chr2R 19452073 3' - BS 5097 4 54.46 CGTAACGGGTATCTTATAGTCGATTAACTGGAATATAGCGCTCTTTCTCTCTTGATTTTTATTTCACTTATTTTGCGTAATCAATTTTTTAATAGGACTT:1 + chr3R 16111881 3' + INE-1 550 1 74.00 AGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATACAATAATAATAATACAATAATACAAATGCTCGCTTTAAGCAGATTCCAAATATTTGCCGCAAACAG:1 + chr4 719040 3' + jockey 4797 1 73.27 AAGCACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAGAACAGCAATATGAATTCATTCGAATATTTTCTAACAATAATAAATTTTCTTTATATTTTTCCCAATAAT:1 - chr3R 19446032 3' + Stalker2 7538 2 57.43 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGGCAAAAAACCCGTGGTCATCCAACACCGATCACAGGATGCAGTCAACTATTATGATCATGAAAA:1 + chr3L 11199906 3' + roo 398 1 68.00 TACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGTTAACCACCTTCGTCATCTTCGCACGATGACAATTCACTA:1 + chr3L 14152190 3' - blood 7016 2 74.26 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCTAAAGAAAATATAATTTTTGACTTATTAATAATAATTGCAGTCTATCCTT:1 + chr3L 14886274 3' + 412 467 2 53.47 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATCAAACTTGTTTAAATCTACTT:1 + chr3R 27071915 3' + jockey 4947 1 78.22 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGAACTGAGGCCATTAAGTTATATTATGCTTAATTTCTATCCCATTCAGTGTGGAGA:1 + chr3R 28678254 3' - I-element 30 1 50.50 GGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAGCTGTATGCGTAGAAAAGACCTGTTCGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + 1360 141 1 38.00 TTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGACTGCCAGAAACATTC:1 - chrX 10445552 3' + INE-1 543 1 77.23 GGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCCCCTTTTCGCTAAGCGCTTTACAGTTA:1 + chr2L 11804863 3' + P-element 2766 1 30.69 TAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATATGCC:1 + chrX 23078696 3' + F-element 4621 1 67.33 TTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATTTGAAACCGTACTATG:1 + chr3R 6425903 3' + copia 224 1 64.36 ATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTGGACGGTTTCAGGGGAGTGGTGAATGTGTAGTGGTAACTCGCGTGCGTCATGGAATATCTC:1 + chr3R 3921889 3' + Cr1a 179 1 61.39 GCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCTAAAAATAAACAAATTACAACAAATTAAATACAAATAAATAAAATATAATCAA:1 + chr3R 3734579 3' + I-element 5081 1 57.43 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAAACAAACATTTTGTTACCAAACAATATAATATTCATATGTTTTTT:2 - 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chr3L 14886183 3' - 412 7069 2 63.37 ATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACGAACTTGACTTCAGGTGGGTTACCCGTTTCGTAAAATTGTTTA:1 + chr3R 32054365 3' - hobo 490 1 57.43 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAACCACATATCTGAACAAGTATCTGAAGTATCTCTTGGTGCATGCATTC:1 - chr2R 11195606 3' + 1360 3362 1 59.41 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTTGGAAAATGTATGAAATTACAGTAGTTATAATAATTTCTATTGTACTTCCTTTAATTAATTAGTATATTTATT:1 - chr2L 17599965 3' + 1360 3364 1 72.28 CTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCAACTCTTCCGTTCTCAGCAACTTCAGAAACCAATAAACTCTTATAGACCGTGCCTTTTCATTGCAC:1 + chr3L 24210528 3' + Porto1 455 1 67.33 ACAAGTACTCTTAGATTCTTAAAATTTGTTTGTTGAAATCGATACTTTTATTTTTGTTCATTATTTTTGGTTGTTGTTTAACATATTATCGTTTTGTATTC:1 + chrX 15403721 3' - Idefix 314 2 54.46 TCTGCAGCCTCTTCGCCAAAATAACCGACTGGAAGAACTGTGTTTTCGGAAGCCAGGGAAGCTGGTCAAAAATAAGTTCCCCGGTCTTATGGCACAGTTGT:1 + chr3R 4593997 3' + hopper2 307 1 54.46 TGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTC:1 + chr3L 24916691 3' - Porto1 148 1 55.45 AAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAAATTGCGACCTACACGTTGTATTCTACTTTG:1 - chr3L 15324667 3' + I-element 81 1 69.31 CTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGAAAAAAAACATACCGACATGTCCAATGAAAATAATA:1 - chr2L 9067896 3' - F-element 54 1 68.32 TGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAGTTTTATGGACAAGAAAATCCTTTTTTTTAACATTTTTACGACCTTAAAGATTCTTATCTACA:1 + chr3L 8712623 3' - diver 5902 2 39.60 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCTTTTGGCCCCAAAAACATTCTCCCGCGGAGGAACCTGGTTGCCAGGCTGCG:1 - chr2L 12426128 3' + roo 390 2 50.00 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATTAACTTGTTGCCGTTTAATTCAAACAAGAAAAATGTTATTTGATACGTTTAT:1 + chrX 1523550 3' - jockey 4693 1 54.46 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTCGCATTAATGGGAGCATCTGCATATATAGATGATTTCATAAACGAT:1 - chr3R 26871029 3' - hobo 30 1 55.45 CCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGATGGATTAACGTTGCATCTAAAGCTAAATGTCAACATAAAATAAAAACTGAATTGCTAAACATTAG:1 + chr2R 9516201 3' + G6 1825 1 67.33 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGACTGCAAATTTATGCCTTTTGTACAGTCTGAAACTGACTTTCCTCGGG:1 - chr3R 9081926 3' + hopper 1391 1 54.46 GGTCGAGGGATTCCAGTTCATCGTTTTGTCGCACTCTCGTTTGTTCAGTTTCCCTTTCTTTTCACCCCCTGTCTGGACACTCGTCGTATGGATATATACAA:1 - chr2L 3564760 3' - mariner2 321 1 74.26 AAGTTATACCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGAGCACGCAGAGTTATGTGTGGCATTTTCATTTCACATTCCCCAGTTACACAGTTTTACCCAGCT:1 + chrX 6664568 3' + Ivk 4913 1 70.00 CGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTAAAAGAGCATTTCGACCCTAATAGTTTTCTACTTTCTCTCTCAGTAATACAATCTTAT:1 - chr2L 16723029 3' - Stalker4 7081 4 58.42 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATATTGCTCTTTAGCTATGAGACAA:1 + chr3L 12913645 3' + 1360 3336 1 82.18 CACCGTATTGATTCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATGCCATCTAAATAATAGCTAAAAATCAATTGATATA:1 + chr3L 6684310 3' - hobo 145 1 50.52 CCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCCTGTCAAACGATAAAGAGAAAGTCCTAGTGCCCAATACAAAATGGACACAGG:1 + chr2R 4352198 3' + I-element 5061 1 55.45 GTGGACAACGCTCCATGAGTTTGTTCGTTACAGTTATAATTGGCTGCCTGATTTGCGGCTAGGCATATATATTTTCTTCTGATGCCGCGCTTTTGCCCATC:1 - chr3R 14044046 3' + Circe 7421 2 61.39 TTATTCTCGTGTCTTTGGTTTTACATTGAAGTCATTTACATGACATTGAACAGGGACTTTTTATTCCAATTTGGCAACACCTTTGCGGATTATTGTACAAC:1 + chr2R 5952729 3' + Tc3 315 1 61.39 ACGAATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATATATACGGTTTGTGTTGAGTGCAGTTCGATTTCAGTTTCGAGGCAGCAGTGCGTGCAAAATGGATCAACGAT:1 + chr2R 11400403 3' + 1360 3383 2 71.29 ATCAACCATTCGCCACTGCATCGTAAAATCATATTCAGGCAGTAACTATTCAGCTCAGCCGCTTAATGTGCCGCATAAGTACCTATAAGTATGCAATGCAC:1 + chr3R 19537193 3' + G5A 245 1 54.46 AATTTGAAAGCTGGAATCGTATAAAAGGTGGCCAAAAGAGAGGCAGGAAAGGGGTAAAAAAAAGGGGAGAAGGAGAGGTGGGGTGGGCATAAAGGATAAT:1 + chrX 14981289 3' + FB 40 1 82.00 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCCAGCAGGCTAGCCAGCCGAAT:1 + chr2L 7991744 3' + P-element 2832 1 24.75 ATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGA:1 + chr2R 2529355 3' + 1360 3374 1 39.60 ATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTCGCACACTCGGCTGTTGGCTATAAATATTAATTAAAA:1 + chr3L 5880782 3' + 1360 3166 1 63.37 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATAAAGGCCATAGTAACAAAGAAGCCGCAACGCAAGT:1 - chrX 10824039 3' - jockey 4711 1 65.35 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTCAAACTGTAGCCGGGCTTTTATCACATTTCAGTCGCTCCAAAACTGTATGC:1 - chrX 15137384 3' - jockey 32 1 49.50 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGGCAAATCCTTGCTGGCAAAAAAAGAACTGGGTTTTGGCAGACGGAGGACACCGTTTAG:1 + chr3R 25509337 3' - Doc 32 1 56.00 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTTGTATTTCCATTGTTTTAAACCAAATCAAGTTATTTCCTATCGGCGCGATGAAACGA:1 + chr3R 27926654 3' - I-element 23 1 61.39 TTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAAAGGAAGATGTGAACCAAGCGGATATATTTTGATTTTTTTTTATAAATAGAAAAATCAATTT:1 + chr3L 6943384 3' - P-element 128 1 70.00 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATTTTCAATTTTTGATGTCATCGAGCGCACCGCACGGCTATATTTATTTATCAATGGCATT:1 - chr3L 21992720 3' + 412 7530 2 63.37 AATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAGCTTTAATTATTATAAATATATTTATAGGCGATTGGT:1 - chr3L 22094271 3' - Stalker2 41 2 68.32 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAGTGGAGTGTAAATGCGGCACGAGTGGACCTAATTAACACGTCC:1 + chr2L 17283527 3' + hobo 2912 1 52.69 CTCTATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCATTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGCAAATGGCTGGGGATACATCCCGGGATTCTGGGCGAAACACGCCCCGCAT:1 + chr3R 31553802 3' - baggins 5202 1 56.44 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACAACGTTCGACATCTGCTCTATCGTCTAGGTTCGCAAATTTCGGA:1 - chr2R 18036616 3' - blood 7035 2 52.69 TTAATTTATTAAATGTAATTATAAACGAGAAAAAAAACTCCACTTAATTTCCCGTGCTGTTAAGAAGTACAAGCTCTTTGAGCTATTTCCCGGATCATGTC:1 + chrX 19426478 3' - jockey2 3393 1 71.29 CTAAGAGTGCTGGCTAATCGTAGTTGGGCTGGAGCTGAAAACTCTTCTCCTTCTTTTTATCCAGTCCAACTGGAATTTCCAGAATGTACAATAATTAAATA:1 + chr2L 22391416 3' + baggins 147 1 57.43 ATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGAAAGGCAGACACTTGAATGCGGGGA:1 + chrX 10067265 3' - F-element 116 1 76.24 TCATTTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCTGGGCTGGTTTGCCGTTCCTTACAGCTCAGAATTGTTTAATCGCTCTGACTTTA:1 + chr2L 16688427 3' - Doc3-element 4627 1 65.35 TGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTTTTAATAGTTATCATATTTTTGGGGATTTCGTGTGGCTTTTGTGGATCGTTTGTCG:1 + chr2L 502406 3' - Doc2-element 292 2 63.37 ATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAATTAATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGCATTTGTTGTTGTCATAAATCCATG:1 + chr3R 10613601 3' - F-element 4600 1 75.25 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCTGGCCAGGTGTTTCTGGGAAATTAAGAGAAAA:1 - chr2L 19629634 3' + hobo 2904 1 64.13 AGATGACATCTGTTTAAAGATTATTTTTTAAACCCTGTAGTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGGGTTGGTGCACTCGGGGGCTGGACGAGAA:1 - chr3R 28740435 3' - Q-element 289 2 69.31 TCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAGGCAACCTAAGCTTACCCGATTTGCCGAAAGTCCGGGTGTAACTTCGGCGCGTCTTTCTTTCCA:1 - chr2L 5211014 3' + gypsy12 10182 2 63.37 CCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACACTTTTGAAAAATGATTAGATTTTCCTTCGTTTTATTGCCAATGTACGTCTTTCAAGGTCTGAGTCATGG:1 - chr4 1137227 3' - I-element 334 1 71.29 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAAAGTGGGATAGGATGTGCCGTTTGATAGGTTCAGTTTCGTAGGTGATA:1 + chr3L 22640096 3' - I-element 11 1 73.24 ATATATGCACATACTACACCGTATATTTAACGTATGTGGCGCTAGCATATCACAACAATGAAAAAACAAAAAAAAAAACGCAGCAGCAAGATAATAATGAG:1 + chrX 16306994 3' - blood 7008 1 80.20 CATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATAGTGACATATTCACAAACAAACAAATAAAGTAGGGAGCTGAATTGATTGTTGCAC:1 - chr2R 14701952 3' - Stalker4 278 4 64.36 TAGCTGTTTGAAAAAAATTGCAACTTTGAAGAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTAAATCCAATTAGACACATTTGTGTGGTGC:1 + chr2R 17229871 3' - hopper2 1241 1 76.24 TTGGTTTTGGTCATTCTTGGTGATGAAATAACGTGCCACAAAGCAGAAAAGGCCACCGAGTCGACGGAGTTCCAGATCCCGGTATCCCGGACTTCCCCACT:1 + chr2L 10524161 3' + invader5 3915 2 69.31 GGACACAAGCATTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGG:1 - chr3L 7319825 3' - 1360 456 1 48.51 ATTTAATAAAATAGCATTTTAAAAAATAATATAATAGATGAGAATAGGAAAGGGTTCATTTTAAGCACAAAACCGAATAAATATATGCTCTAGGTGGTACC:1 - chr2L 15170891 3' + 412 32 2 65.35 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTGCAATTAAAAGGCTCAACTGCCAGGCGATCAAA:1 - chr3L 5492306 3' + pogo 2060 1 69.31 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAACACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTA:1 + chr3L 20711677 3' - jockey 4710 1 61.39 TAACCCGCGCTCAAGCCCTTAACCAACATATTTCGATCTGGTTTGGCCAAACATTTACTTGGCTTGAGAATTAGTTTGCTTTCAACTCAATTTTGATTTTT:1 - chr2R 18139877 3' + I-element 156 1 76.24 TCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGTGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCTCTCAAATTGA:1 + chr3R 19449479 3' - Max-element 311 1 62.38 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGCATTGAACACCTGTAGCTTAGTTGACATTGAACAGTAAAATAATGATTTGTTTTG:1 + chr3R 10078397 3' - roo 17 2 61.22 CTGCGACCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATACTGCCGATTTGATTTAAGAATTCGAAACAAAACTAGTCTCTAGAATCCATCAAAATGGGATTTC:1 - chr3L 21933438 3' + blood 420 1 66.34 TTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTTGCAATATAAAGAAACCTCCGGGAACTGATTAGTTTTCGTAGAAACGGACAGGACAATATCAACTGGA:1 + chr3R 6171384 3' + copia 4986 2 67.33 AAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGGCAGTCAAAATGCGCACAGTGCTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTCGATTTGTTTGTTCTGCGTTGCTAACCTTT:1 - chr2L 4082138 3' - baggins 5139 1 70.30 ATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCCTAATGCACAGTTTCAAACAGATTTAACCTTAGTTCT:1 - chrX 15967770 3' + Idefix 7033 2 63.37 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGAAAGAGGTGAAAACCTACATTGATTAACTGAA:1 + chr3L 16447844 3' - Tirant 8148 2 66.34 TCTACTTGGAACAGAGAAGTTAAGCCGACTAACCAAGTCAGGACATCAGGAGCACCAGAACCTTAGATCCTGCTCTCGTTTATAGAAAAAACATTGCGAAA:1 + chr3L 15794211 3' - Cr1a 4099 1 64.36 TAACCATAGAACAATGTTCTCAATAGCTGGCAAATTACCTCACGAGATTGGTGTTTATTGATAAATTACGCCACAAACAATATTTTGATAACATCAATTAT:1 + chrX 21000341 3' + BS 388 1 55.45 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTAGCCCTACGTTACGTAGCGCCCGCTACGTTAGTGCGAGGAAATGAGAGCGCGATAATCAGGGCGTCGAAATAT:1 + chr3R 28330945 3' + P-element 2883 2 75.25 TTTACATACCCTTTGGTGCCCAACCACATAGTTCATTTTTATTTCTTGAGATTCCTTAACTATTTTTTTATCTTAGTCCGTGACTCACGCACTCATATCG:1 - chr2L 12598067 3' - Circe 7137 1 74.00 CGAGGGGCGCTGCTGTGTATCGACGTCTCAAAAGACTAAACACTATTAAAAGCGAACGACATGGTCAAGAAACAGACGATGGAAAAGCGGGCGCTGCCAAA:1 - chr2R 24396506 3' - Cr1a 4403 1 59.41 TATATGATTATTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTAAATCGCAAATAAACGTTTTTAGCATATTCTTTAATAAT:1 - chrX 12151616 3' + diver 180 2 60.00 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGTCATGAGATCGGGATCCTGCCAGA:1 - chr3L 14152103 3' + blood 7348 2 64.36 GAATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTTTAGTGTCTTTGCCGCTACTAATTTGTCCGTTAGTTGGCAGTCCACGATGTAATTACTTTTTCAACACGCACGTA:1 + chr2L 17846421 3' + 1360 3372 1 62.38 CTGCCATTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGCTTCTATGTTTAAATCATTATGCATATTATTTTTGAATTTTCGGTGAGAGGAGCTAGTACCTATGATAAATT:1 + chr2L 8899864 3' - Porto1 4424 1 55.45 TCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAATTATGCAAGCATACCCGGTCCTTTGAGGC:1 - chr2L 5659452 3' - jockey 4581 1 70.30 GAAAAAGAGCAAAACAAAGTGGGAAAACAGAAAGCAAGTGCCGCCAAAATGCAGTCAAGGATAAAACGGCAACGGCACGGGATGCCAGGATACCAATAACA:1 - chr3L 19190140 3' - S-element 246 1 82.18 TGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAA:1 - chrX 20893577 3' + Juan 20 1 79.21 CACACACACACACACATACTAAATATGAAAAGAAGAAGAACAGGAAACGAAAGCTGAAGGTGGGCTAATTGCAATGGTCGGCATATAGAGTAATTTGTACT:1 - chr2L 2525957 3' + accord 186 2 56.44 GGATGCGGCAGTATAACTTCCTTTTTTTAAATGCGCGTCAATATTGGGATCGCCACGGCGTTCTGTGAGAAGAATTGTTCATGATGATCTTCAATTTTATC:1 + chr2R 7394616 3' + mariner2 3 1 58.42 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGGAGTTCTCTGGGGTGGAGGACGTAAAAATAATGAGAAGCACATTTTGTGCGTATAGACAAGAAA:1 + chrX 6146731 3' + hobo 2916 1 51.02 CAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCATTGCCGATGAAGGGGAGGGAATTCCTTAACGTTTTGCTTGGTGATATCTAACTGTGGTA:1 - chr3L 1450622 3' - 297 394 1 64.36 GTACAGCTCGATTCGCGAGAATATAAACGCGATATAGAAAAGTTTGTAAACGAGAGATGTATGAATAATGTAGTACAACTGATATATTCCTTATTGATGAC:1 + chr3R 5859640 3' - Cr1a 4382 1 63.37 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACAGTGTAGCACAGACAGTCAAAAACGC:1 + chr3L 10554818 3' - roo 49 2 74.26 ATTTACGATGCATGAGCATACGTGTGCAGTCATACAGTTGTCGGCTGTCGCTGTATGACAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - 1360 189 1 57.00 GTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGGAACAGCAGCGGAGGCAGATCAGCAAAAGGCCGAGAGTCATTCACATTACAAAGAAGTTTTCA:1 + chr2L 18231863 3' + 1731 300 1 62.38 AATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGACCCGTCTCGAGATCGCTTCCCGCCTGGCCCCCATCTTCTCTGTTCACTTAGCAAATGTTTAAAAATCA:2 - chr2L 7970952 3' + blood 371 2 71.29 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGCCGCTCCATCGTCCACTTTTTTCTGGGGTCCGTGG:1 + chr3L 3326653 3' - P-element 39 1 40.59 ACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGACTTTAATTATTGTTGATTCTGCTTCGAACATCAGGTAATGTCCCTCATGGTATTTGTTGTTGCTT:1 - chr2R 25180928 3' + gypsy 435 2 69.31 CTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTGAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCCCGCATCTTCGTTACGAAGGCTTATACAAA:1 + chrX 5123876 3' - 1360 215 1 70.30 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTCTTTGTTGCACTTGGATCAGTTCAACGCACTGAATAATTATGTAAAACTTTGTG:1 + chr2L 16818866 3' + pogo 2082 1 61.39 TACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTGAGCCCGAACCTCTTGGATGAAACGGAGTTTGGCTAATAAATAAGCCCAATGCTGAATACTTTT:1 - chr3L 21601343 3' + pogo 1732 1 71.00 AATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTAAAATAGGGCTAGGTCATCCATATCGTGTTACCACTCATGCAACTTGGTTAAAAGCTAAAATAAATTATATGTC:1 + chr4 1193857 3' - hopper 1336 1 41.58 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAACTAATTGCGGTCAGATCCATGGCCACGATTTCCTCGGCACCC:1 + chr2L 5653590 3' + hobo 2911 1 56.38 GTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTCAAGCAATTCTTTCAAGATTGGATTTTATTTATAGCGATAAAAGACCAATCCATATACTCGAAT:1 + chrY 1739844 3' - invader2 161 2 66.34 AATAAATATTTTCAATAAAAATATGATGTATATATTAATGCAATTAAGCAGATCAAAAAATCAGCTTGGCCCACATTTAAACTACACAGAATTTCAAAGCA:1 - chr2L 16330378 3' + FB 477 1 58.42 CTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGGGGAGGTGCCAGGTGCCTCGAATCATTAGC:1 - chrX 15536462 3' + micropia 167 2 70.30 AAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAA:1 - chr3L 25272565 3' - 1360 80 1 67.33 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGCAAGGTGTGGTCCCTAAAGAA:1 - chrX 17283966 3' - roo 54 2 77.23 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAATCAGGTTGTTGGATGGCATGGGTTAAGGGAAGTC:1 + chr2L 7971040 3' - blood 7050 2 61.39 GTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAAGAAACTAAAATACAACTGAAAGTGGCAACGAGAACAGAGATC:1 + chr3R 17300758 3' + Doc 4390 1 57.43 TCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAATTATGAAAAATATCGATTACTTTTTAAAAAATGTGGGCATCTCGCCGGCACCTGAAAACTGGGAAATTGAGCG:1 - chrX 17504079 3' - INE-1 299 1 65.35 ATCTGCTGAAACTTAAAAAACCTTCATACATTTACACTCACGAACGCTTTTCCTACTTAAGCGTAAGAACTGGAAAATTATCTGCGGATTCGAGTGAATAT:1 - chr3R 14762611 3' + Tirant 339 2 71.29 GGCGTGTGAGCGAGGCATGTCTGTTCTGCTCAACGATCGATCACTAACTGACCCAATCGTTGAAGTTGCATTTCAGACGAAAGATGAAAACGATATGGCAA:1 - chrX 7616616 3' - invader1 333 2 57.43 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCG:1 + chr2R 17346025 3' - hobo 16 1 61.39 AGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCGC:1 + chr2R 17346026 3' - hobo 15 1 62.38 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATACCATGTGCATTTGTTTCGCTGAGTGCACACACCGAGGATGGTCCATTAGAGTGGTCAG:1 + chr2R 22793420 3' - hobo 15 1 64.36 GAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' - McClintock 231 2 58.42 ATGATAATAATAATAATAATAATAATACATGGTAAATGACAGGGTCTACTTGGCTGAGACTGCCAGGCTTAAAACGAACGGCGCAGGGTCGACGAGTGGAA:1 + chr3L 26526149 3' + mdg1 38 8 68.32 GTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACAAGTAACGGGTATGAAGAATGAAGAAGGAAAAATAAGGGACGCAAATAGAGCGAGGGA:1 + chrX 5256759 3' - INE-1 15 1 77.23 CAATGCAGTAATAGTAACATAACAGCGCAATTGGATCCCGACTCTCCGTCTACTTTAAGGAGCATCAGTTTACGGCCATTAAACGCACTATTCTTTTCGGG:1 - chr2L 14379007 3' - BS 5054 1 78.22 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGACATTGACACGTCGCCCTAAAATGTATGCTACAATATTGTTTTG:1 + chr2L 16968482 3' + 1360 3358 1 61.39 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACAGTCCAATGACAGCGCCTATGTCCAGCGACTGATGCGTCTGTCCAAGTCCGCCGA:1 - chr3R 28879906 3' + roo 9048 2 55.45 TGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGATTAGGGAATAGAGAGATGCGGAGACAGACAATGGGGGAAATATATCCAAATGGAGGTAATAA:1 - chr2L 16567950 3' - I-element 5121 1 65.35 TAGGTCTCAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGATGTTGTCGTCGATCTGGTCAAAAGCCCATCGGTGCAGTCAAACTGCACGTCGTCA:1 - chr2L 16382584 3' - Idefix 471 2 70.30 AGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAAAAAAATAAAGCAGCGAAAAAACGGAG:1 - chr3R 21987079 3' + I-element 342 1 76.24 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATGTACATACCACTATTTTGTTGACCTCGACTG:1 + chrX 20982281 3' - 297 6617 2 73.00 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCACACGCACACACCCACACATAGCCACACACATACATCAAGTTTTCACAAAAAGCAACGCACGTGC:1 - chrX 6146638 3' - hobo 11 1 68.32 TTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACGGGAAATCAGTCTATGGCAACT:1 - chr2R 16396792 3' - X-element 58 1 71.29 TATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTCCACCAAGGTTCGTACTCATAAGTAGACCACCTCGCCAAAACGCCAAACACAAAACACCACAAAG:1 + chr2L 3758125 3' - Ivk 313 1 71.29 CACAACCACACACACACACACACACATCAAACAGTTGTACAACAAACCAACTAACAAATATGCAATGCAAATCGGGCAATTAAGTATCCGCTTTAAGAATA:1 + chr3R 8615996 3' + gypsy3 419 1 68.32 GTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACAAATAAGCCGCAAAAATAAGCCGCAAAAATATCATACGAATATCGGA:1 + chr2L 11430978 3' - Doc 4470 1 53.00 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACACACACCCTGGTGCGGCAGGGGG:1 + chrX 9349818 3' + hobo 2919 1 73.53 TTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTAAAATTATTATAGCTAAATTGATATATAAATAAAAATGTATATTTTCCCAATTACAACC:1 - chr3L 6665904 3' + invader2 398 1 52.48 CCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGAGAGAATTAAGAAATGCAAACCTTTATATATAGAGATCTACATACATATATGTATGCATGT:1 + chr2L 15018300 3' + I-element 304 1 63.37 AGCATTGGAGAGGCCCAACATTTTTTATATGTTTCTGCTTCACAAAACTTTTGCGCAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTCACTTTTTTC:1 + chr3R 8709840 3' + Porto1 366 1 72.28 TATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGGTTCTATTCGCAACACTTTCTATTCCAACTTTACCCGTTTGCCGCATATT:1 + chrX 14726096 3' + 1360 3118 1 53.47 ATACATGCACACACACACACATATCCACACGTACACTTGGCTCACACATGTACACACGCAGTCATGGAGAGTGAAAATTATTTAAAATTATTTATTTCACA:1 - chr3L 6620563 3' + Quasimodo 33 2 57.43 CGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTGGATTCGCGCCATCTCCGACTGCAA:1 + chr2R 16268786 3' - accord 301 2 75.25 AGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGAACAGCATAATATTTGAGAATGGGA:1 - chr3L 20790917 3' + accord 7267 2 75.25 AGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTGGGAAAAACAAAAGCAAAATGGCAACAGCACCAACAAT:1 + chr3L 4713830 3' + transib2 2794 1 59.38 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCATTGCACATGCCAAGTTTCAATACCAACAGCAAATATCACANTCTTTTAGTTTTAG:1 + chrX 19820051 3' + hobo 2923 1 61.70 CGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATAGGTTCTTGCATTTCATCTGCATCGCTCCTTTTCGCCTAATTGGGATTTCCCGATTTGATGCTTAGTA:1 - chrX 12800212 3' - invader3 5196 2 70.30 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGTCATGAGATCGGGATCCTGCCAGACAGTATGTCGCCACTC:1 - chr3L 14152087 3' + blood 352 2 50.50 TTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGACCCCGCGAGCTCCGCCTTTTTATAGCCAACCACCCACTCGAGCAGCATCTCACCCAAAAG:1 + chr2L 11561864 3' - transib2 14 1 65.35 CGTGCGGTTCTTTTTTCAGCTCGCTTGGAAGTTTTGACCTTGTGGCTTTCAAGAAGATTTCAGAGTACCCAAAGATATTGAAGATCTCTTGGCTTCAATTT:1 + chrX 8846221 3' + Cr1a 358 1 65.35 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACCCTAGTTCGACTGCCAAACCCAGATTTGAGACGAAAGACCGAAAACTAAGTGCTGGCGCTCTG:1 + chr3R 24229173 3' + 1360 3379 2 69.31 AGCATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGGGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATATTAATTTTTTTTACCGATACTTGCTT:1 + chrX 21801648 3' - gtwin 47 2 68.00 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGGGCCTTAAAAACGTTTCACATTTCACATGACTCATCCGGCGGGCGAAG:1 - chr2R 9001636 3' - mdg1 26 2 51.55 TGATCAAAAATAATTTAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCGGTTTCGGTTTGGGGATAGTTGCGATTTTCGTCCTATTCTTCCATTCTCATTCGGTCTTT:2 - chr3L 16807712 3' - 1360 252 1 64.36 TGCTTGTGAAATTTTGTTGATCTAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTTAATGTAATATTTCCATGTTGTACAATTTGGTTGGCGTGGTGGGGGACGA:1 - chrX 21238112 3' + S-element 347 1 56.44 GTGTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACACACACAAGGAGCTGGAAAAAAAGGGGGGGAAAACGTAAAGTGGGAAAA:1 + chr2L 1674348 3' + 1360 3206 1 59.41 AAATACCTAACTGAAACTAAAAGTGGATGGATTGTTTATTAACGGGAAGCTCGGCTGTCAAACGACAAGGGCCTAATCAGGCAAATTGATTTTGCATCTTT:1 - chr2R 12987278 3' - Circe 337 1 80.20 CAATGTGCTAACGCCAAGTTAATCTTCTGTCTAAGTGAACTCCGAGGTAAATGACGGAATCACTTCGTGGAATTTGGACGTTATAGGGCAGGGTGTGTCGT:1 + chr3R 2975534 3' - Doc4-element 2458 1 80.20 ATCGAAAGCGTAAGAGAAGCTATGGGCAATGTGGAATAACAAAGTAAAACTGTAAAACCCAGCAGAGATCTCACAAAAATCTGAAGACTTCGAGCACAAAC:1 - chr3R 851561 3' + Doc3-element 99 1 55.45 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATAATTACGGGAAATATTTATCGC:1 - chr2R 16338102 3' + roo 355 2 77.23 CAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGGACACATTCATCCCCCTCTTCAGAGGGATACGCCCAGGCCCATTT:1 - chr2R 19680373 3' + P-element 164 1 47.52 TGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTATATAAGAGACTGGAGAATGGATA:1 + chr3L 3893029 3' - Juan 3856 1 77.23 CTTACGTTCTCAGCATGTGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACATGCATAGTGGCAGTTGGGCTCCAAATAATTGGAAGCGATTTTAGTCAAGC:1 - chrX 13337742 3' + 1360 3291 1 54.46 TCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACAAATTAGTCATCAGCCTGATGGGG:1 + chr2L 12534718 3' + transib2 2674 1 76.24 GTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAACATAAAAAAGGAAAAGGCGCCCCAGGCAT:1 - chr2R 14085314 3' + Doc 4533 1 75.25 GGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTGAAGTTTTACAAAATAACTGAGAAT:1 + chr3R 10976295 3' - roo 8829 2 75.25 ATGGCCAACAGAGTGGATTTCTAAGCCCAAACTGGCGTCCTGGGTGATGGCGGGCAAAGAATTATAATTAATTGTGTTTGACATATTTTATATGCTTGTGC:1 + chr3R 17249874 3' + Rt1b 4803 1 63.37 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTTGAAAATTAGTTGCTACTTATA:1 + chr3L 13366433 3' + hopper 1387 1 53.47 TGCAAACTGCACTTTACACATGTGTGTGTGTGTGTGAATTGCGATGGGTGGTTTTATTGATTATCAATATAAAGCTCGTAAAATACCTGAACGGAGCAGCA:1 + chr2L 17616227 3' - Doc 100 1 87.13 GGACTAGAAGCTGTAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAAGTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCATTCCCCCACCATCCGAGCCTGCTGTGTG:1 + chr2L 19316545 3' - R1A1-element 5200 1 73.27 GCTGCGTTTAGCGTTCTACTGGAGTAGGAGATTACTCGCTCGCCTCGATCGGAATGCTGTGTAAGGATTGCGCCCAGCCCACTTCCGCCTCTCTGCCCTCG:1 - chr2L 18911194 3' - Osvaldo 14 2 74.26 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTCCTGTCTGCCATGGATTAAAACGAACCGCCGCTGATAAACGCACCCAATTGGCTGCTCCAGC:1 - 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Circe 7182 1 60.40 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTAGATCTAACGACTTTATGTAACTGGGAGCGAAGTGAAAAAGAGCTCCAGTCGAAGCTGAGGCCGA:1 - chr2R 9129633 3' + P-element 2875 1 67.33 TACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGCGATATGATTCGGCCAATACACAATATAATAATAATACGTAAATTTACAA:1 - chrX 19734323 3' - 1360 399 1 64.36 GGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACTTGTCAACATTGAACGAAACATTA:1 - chr2R 4501476 3' - G-element 55 1 74.26 CTATGACAAAGTGTCACAATGTATTTATGCAAAGTTATACCCATTCTTTATTTGATAGGTGGGGTAGATATACTACAGCTTGGATACCAGCTCTTGTGCGA:1 - chr2R 4621715 3' - Stalker4 7022 4 77.23 GTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTAAATCGCAAATAAACGTTTTTAGCATATTCTTTAATA:1 - chrX 12151618 3' + diver 177 2 64.36 AGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACATACAGGGGCTGACATAATCACAGCTGGAATGGGAAACCCAACCCTTAGCGCTTCCAATTGGAAA:1 + chr2L 19083452 3' + Tirant 8498 2 71.29 ATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTAATTACCAGCCTTTGTTATCCGATTTTGCCAGGGTACCACAGAAATACAT:1 - chr3R 6533887 3' - 1360 243 1 55.45 ATAAATAAAAAAAATTAAATAATAACTTTTATTATGTGACTAACCCACTGTGATAGTGTGTTTCAGAAATTTTTGCGCTCTGTCTGCAAATGAAGTCTGCC:1 - chrX 2822534 3' + HeT-A 4 4 81.19 GCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAATGGA:1 - chr2L 15019880 3' + BS 5070 1 53.47 TTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCT:1 + chr3R 1844811 3' - Cr1a 164 1 79.21 GGAGCTAACTTCTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAAATAATCCTCAAACAGATATACATTTAGTTTGGTTCAGTATATTTATTATTTAACCATAACTGAAGA:1 + chr4 166564 3' + Q-element 252 2 51.49 TCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACATTTTATTATTTTATTTGTGTTTCCAAAACTACTAGTCACACCTTTTATAA:1 + chr2L 11681841 3' + flea 162 1 62.38 AGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATGTTATTTCATCATGGTGTAATCTCTAACAACGAATGAGCTTTCGGAGAGTAG:1 + chr2R 16289270 3' + P-element 67 1 37.11 ATACAGTTTAGTTCAATTAGCATCGACACATAGAATGTTAATCCGCTGTTATGACAGCTGTAGCACCGGTAGCAGGCACCTAGTCCTGCTTTACGCCGTTC:1 - chr3L 1651112 3' - diver 5960 2 66.34 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCGTATTTCAACCAAGAATGACAACAACAAAGCAA:1 - chrX 10210930 3' - I-element 17 1 64.36 TTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGCTCTTAAACATACCGGAACATATCAGCATGAGGAGGAAA:1 + chr3R 15298550 3' - Ivk 343 1 61.39 AAATAAAAAGTCTTGAGCCGAGCGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGATACTGAGAAAGCATACACAAAGCCGGCTGCATATGTAGAAATATT:1 - chr2L 4257523 3' - 1731 4513 1 64.36 CTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAAGAGATATTTTATG:1 - chr3L 25613041 3' + Stalker4 400 1 70.30 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTTAAATTACGCATTTTAATTTTCGGCAATTGAGTTTTGGAGCTACTTATGTAGATGTCAT:1 + chrX 7335162 3' + Tirant 8493 2 66.34 TCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGCGCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAAACTAAAGGGTTAGAAATTTGTAACAAGATTTTACTGAATATTATTAT:1 + chr2L 8010103 3' + Quasimodo 6971 2 58.42 AAAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGAGCAGTTGTGTTGGGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' - 1360 156 1 42.57 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGGTGGCTCATAAGAGCGTGGGAGGGTGGAAGAGGGAGTGGGTGTTTGTGTTATCACTGTGTTGT:1 - chrX 3677623 3' + hobo 2905 1 68.32 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATATACCATTGTGTAAGCGTAGTCGTTGGTTCGAAACTCTTGTTTAAATAAATAGG:1 - chrX 22690728 3' + roo 393 1 61.39 ATCATTTATTCGACTCGAAATAGTAACTACGTAAGTGGCGCAGTCGGTAGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAACTAGTATCAT:1 + chrX 23362241 3' + Tom1 375 1 57.43 ATTATTTACTTATTGTTCACTATCAACTAAGTTTGACTATATCACTGTCTAGATCAACATACAAAGCAACAACATAAAATGCTTCCTTAGCTCCAAAGCTC:1 - chr2R 1656719 3' - looper1 339 1 54.46 ATCCATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTAGCCGCAGAAGTATGCAACAATTTTCAGCAGCCAAGAAAAGCCGAGAGCGAATTTAACCCGGCCTTTCCGCCAG:1 + chr2R 19582760 3' + 1360 3323 1 73.27 AATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTCATCTTCTTGTTCATCTTAATGGTAAAAACATATGTTTAACTTATTAATGGAAATCATCGCGAT:1 - chr2L 9293111 3' - Ivk 273 1 72.28 TAATCGCAATAACATCGTTTGCCCACCCTTTACATTTTTGTTTGGTTTCAGTTTCGTTGGGGCTTTTGTCCTTTGGCATTAGTTCTTTTGTTGAAACTTTT:1 - chr3L 5250586 3' + FB 197 1 69.31 CGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTGGCGTGTTCCCCGCGTGGAACTGCATTTTTTTTTGTTTCCTTCCTCAGTTTTGTGTGTGG:1 - chr3R 23819022 3' + invader1 32 2 65.35 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTAGGCTCTTTAGGGATTTGAGGACTTTATTGATT:1 + chr3R 21998450 3' - 412 41 2 65.35 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCCTACAAATCTCCCTCGAATGGGTTAATAATGTAGTGTAACCTTTCTTGTGAATATTTAAA:1 + chr2R 16902945 3' + flea 243 2 60.40 TGAGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGATCATTCCTTGGCGAGCTTTGTCAGTTCGTGCTAATTACATT:1 + chr2R 24300074 3' - G2 232 2 70.30 CTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAATCCAACCAGTCCTAGCCAAGATGAGTTGAGCGGCCTCGCGGCGGTGCGACATCTCCTGGCTGGATGCCTTTTG:1 - chr2R 15801642 3' - I-element 4900 1 72.28 TTCGAAACACCACCCTGCACAAAGACCTGAAACTCGCAACGGCATTTGACGAAATAAACAAACACTGTAGCTGAGATCATGAAGGAGTTCGGGATGAGCAC:1 - chr2R 4938276 3' + X-element 4342 1 59.41 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTAAATTAATCTTTGGCTGCCGCACAAAAGTATGCTACACAAATATAAA:2 - chrX 18155833 3' + hobo 2909 1 53.47 AATAAAGAGGGATAGTCATGCCACGTGCCAGCAATGCGCTTTAACGATATGTCAGAGATTAGAGAGCGTTACAAATGAATGTTGGGCCAATTAATTGGGGG:1 - chr2L 16863573 3' + invader5 255 2 76.24 GAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAGTCGACTTAACGTTCTCTCTTGTTTCTTATTTGGCCTCTCATATCAGTCATCAGACGATTGGCAAATGGAAGT:1 + chrX 8049218 3' + INE-1 549 1 61.39 ATATTATAAATTAAAAAAAAAAACCCTTGGCTAAAAGCGGTACTATTGGTAACTGTGTGCAAATTCAATTAAGACCCGCTTAAAACCTGGCTTAAGG:1 + chr3L 4576898 3' - Tc1-2 1403 2 81.44 TGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATATGCGTGCGAGGCACGGATGTTTTGTATACACCACAA:1 - chr2R 10191707 3' - 297 6614 2 66.34 AATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTGTGGGATTTCTTAGTGGGTCCGACCACTAATTGCTGCCCATTCTT:1 - chr3R 22624582 3' - 297 6502 1 55.45 AGGCCAAGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGAGGGCTCCTCCTTTCACTCTTTAGCTGCTGACGAAAGCGCCACATATTCCGCCTCCGTAGTAC:1 - chr3L 23974032 3' - Rt1b 4941 1 61.39 TTAACTTTGTAGTTTTTTTTTTGGGATTTCATTACTATTAGGTTTTAACATTTTCTGAACGAGTTTGGGTTTTTGGAATGGGCAGAAGCTATATATATCTG:1 + chrX 11982391 3' - gypsy7 5018 1 45.54 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTTCTCCTCTC:1 + chrX 16217540 3' + P-element 2875 1 66.34 GGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTGGCATTTTCTCCGCTTGTTCTCTTTCGTTT:1 + chr2R 19277829 3' - Doc 4483 1 70.30 GAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGCTGATTGTTGGTTCTGTAATTTAGCTAATTAATGTAGGCACGACAAGAAATTCAGT:1 - chr3R 7944513 3' + roo 77 2 59.41 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCAGCCGCGGCGCAAAACAAAAATGACAATGGAAGGC:1 - chr2L 2624220 3' + hopper 1376 1 62.38 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTGTATGCCAAGCGTAAGCGGAATTGCTTCAATTTTCGTTTTGCTTAACGGCCAC:1 - chr3R 27386276 3' - hobo 23 1 56.44 CTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGCAAAATATAAAGAACACAAATTTAACACTATTGGAAATGAAAAATATTGATATTATATTCGCATTGCTAAGA:1 + chr3R 26021491 3' + Tc1-2 478 1 76.24 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGGAATGCATTTTAAATATAACATATTCCAATGTGTTATGAATAATTGGTTATAC:2 + chrX 14500169 3' + roo 9050 2 56.44 GCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGAAGGCAAGAACTTGGCGTGTTCGTAAGGGTG:1 - chr2R 4297355 3' - Doc 4550 1 70.30 AAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGTCATATTGTGTTTATATCTCAAATTAGTATATTGTTCAAAAATTCAAATATAGTTTTTTAAATACAATAGTTATTGA:1 + chrX 21255837 3' - hopper 1383 1 80.20 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAAACAAACATTTTGTTACCAAACAATATAATATTCATATGTTTTTTGCGTTATTTTGCACTTTTCATTAGTTGAT:1 - chr2L 16968384 3' + 1360 3387 2 75.25 TTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTACTTAAAAGTGAAATATGATTTTATA:1 + chr2R 2092816 3' - Doc3-element 59 1 66.34 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAACTAATTGCGGTCAGATCCATGGCCACGATTT:1 + chr2L 5653579 3' + hobo 2902 1 67.39 TTTTTTTGTTTTTCTATTATTAATTTGGCTTGGAATGTGTGTGTCTGCTGCTGTTTTTATTTTTATTTTCGTTTTTTTTTTTCTTTTTAAGTATTTATATT:1 + chrX 7448409 3' - Rt1a 5074 1 57.43 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAGTCTTAACAAAGCAGCTGCCAGAGACCTTCGTCT:1 + chrX 17284005 3' + roo 9032 1 64.36 CTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTAAATTGGCAGTTATAGCATTGGGATGGATATC:1 - chr3L 27988462 3' - 1360 96 1 73.27 GTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGGTCAGCATGGGTTAACGGCAGGGAAAGTGGGCTTTTTGGC:1 - chrX 2862238 3' + roo 64 2 60.40 ATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAATTTTGGACAGAAATCCAATAAAACTCCGCAGCAGGATGTCTTCACA:1 + chr3L 18434384 3' + 412 15 2 63.33 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAGGTCTGCAGTGCAACAATCAAT:1 + chr2R 14701944 3' - jockey 4815 1 78.22 TTCAAACTGAAGCTTAAAATTATTCTTATAGCTTACAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATATGATGTGCCATTGCGGGTTAGCTGGCAGACAAATTAT:1 - chrX 3456276 3' - Gypsy6A_LTR 152 1 65.66 ACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCCAAAATTGCTCATTTAAGCGTGGAAACAATGAATTCGAT:1 - chr2R 14379570 3' - 1360 3372 1 70.30 CGACTGCTCGATCTTTATGTCCACATGACTCTCTTGATGTCTAGGCCCATGTCTATATATCCTATATCCCATATCCCATATCCAATGTCCATCCAAGACAA:1 + chr2R 17504801 3' + Tabor 192 2 73.27 TGCGGGTGATTCTTTGTGATTTGTGGAGTAGTTTACACAAATAAACTCACTCTTATGCAATTTTTCCCTTTAGCTTTCCCTTTCCCTTACTCCATCCACAT:1 - chrX 21557405 3' + Cr1a 137 1 64.36 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATATTTTTTATGCTTCGGCCAAGGCTCAC:1 + chr3L 13264523 3' - Burdock 6176 2 72.28 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCTGCATAACACCATTCAAACCGGCAAATCAAAC:1 + chr3L 27262119 3' - P-element 44 1 35.64 GGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTGTTTCGCTATTTGTTTGCATTGTACTTTTGTTTCGCTCTCGTGTCA:1 - chrX 20494847 3' - I-element 4973 1 62.38 TTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTTACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCCATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTT:1 + chr2R 5260086 3' - 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chr3L 22746987 3' + FB 306 1 63.37 TTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACGTAGGCACATGAGAAGTAAATATAGGGGAGACCCGAAGTGGGCAGCAAAACAAGAGC:1 - chr2L 20085124 3' - P-element 19 1 60.40 TGGAAATAGGGTCGACAAGATCATTCGCCGACGTGTTCGGGTGGGCGCTCAGTCTGTTTGCATATCGGCTGCTGTGGAAGTTAGCCAAGTTGCTGGAGCTG:1 + chrX 2427674 3' - G5A 2653 1 72.28 AATATGTGTGTGTGTGTGTGTTTACGTAATGCCCTGGCGCCAAAATTATTACCATTTAAATGTCTGAGCACACAACGTAATGTGAGTGTGAACGTAATGTG:1 + chr3R 17068031 3' - accord 184 2 75.25 ATAATGTTATTAGTTATTAGTCACCACCATGAATGCAAACTAAAGTAAGATGAGGAAATATAAGGCAAAAGAGAAACATGCGTCCTTCGAAAAGGGTTAAC:1 - chrX 921388 3' + Gypsy12A_LTR 1818 1 38.61 GAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGGTTGATGAAGTTTTAGCAGCTTTTGGGAGGCGGTTGATGATGTTTATTTGATGAAGATGCGGTAAAG:1 + chr2R 10492871 3' - I-element 200 1 74.49 TATTTGTCATTAGAGCACTCAGCTTGCGGCGTGTCGTTTGTTCTCCGTTTAGACTGTGATTAGATACACAGGGGGCAGCAGATCGGACTCCTTCTTATCAG:1 - chr3R 23189675 3' + 1360 404 1 72.28 ATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGACATACATAATAATTTAAACATAGAAACAGTCAACATCTCTCAACATTCGTATATTCCCAGCTT:1 - chr3L 9778579 3' + Porto1 4353 1 71.29 ATAAACGATCTGGCCGATATGCCATAAAAATATTTACCTTACCAAAGAAAAAAAAATTTTGTATCTATCAAAATTGAAAATCAAATAAAATAAAATCATAT:1 + chr3L 18521334 3' - transib1 2000 1 65.35 AGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATG:2 + chr2L 15019932 3' - BS 4844 1 69.31 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGTTTAATTTAGCATTAATGAAAAGTGCAACACTCTGGTTGACTCCCCTCAAAACCCCTGACAAATATG:1 + chr2R 21860583 3' + roo 400 1 71.29 CCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGGATAATGTAATATATATAGAGAT:1 - chr3R 15639015 3' + I-element 4880 1 77.23 CAGCTAACCCGCACATATATTGCTTATATTGCTTATATCTATGTATTGTAGTTATCAAGAGAATGTTTTCCTTCTGAGTCATGCTTAAAATGTCTCTTTTT:1 - chr2L 11329182 3' - Stalker4 291 4 61.39 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATATTACTTTCTTCAATAGTAAGTAACCTTAAAGTATTTGGAGCATATGTAT:2 + chrX 7741776 3' + roo 9047 1 54.46 TGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTT:3 - 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hopper 433 1 76.24 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAAAATAAAATGCAACACGGAGTCCTTGTCCGTGAAATCTGGCCACGCCCCCAGTACACAA:1 + chr3R 6135295 3' + I-element 5332 1 58.42 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTTCTGCAATTCATGGGAAATTAATGTTATTAATTTATTAGCTTCTTCTACCGAATCAGCT:1 - chr3R 19445634 3' - Tabor 19 2 60.40 CTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGTGCAACTTGGCTAGTTGTATGCCGCACGTCCCTGGGATCAATTTCCAAAATGTGTCCACCA:2 - chr3L 5894985 3' - Doc 4235 1 69.31 ATAGTGGTCATAGGTAGGGTAGGCAATCCGCGAACACGATTCCACCGGTGTTTTGCAGGCGAGGGAGATGAGCCTTGTTGCAGGAAGCTGGA:1 - chr2R 21650475 3' + Gypsy12A_LTR 1948 1 65.22 GTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTATAAACTCAATCTAATTGTTTCAAAAAACTTTGTTGCAGACACCACC:1 + chr2L 3865484 3' + hobo 294 1 52.04 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCCAAAGGATAACAGTGCTAAACCGAAGTGAACTGAACAGAACCCATCATAAAGCGATAAGCACTTTCACCAAGGACA:1 - chr2L 10023612 3' - roo 8664 1 78.22 TTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTCCGAATTCCGTGTCCTGCCGCAAACTCCATGAGTGATGATGGCCTGTT:1 - chr2L 12998045 3' - 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I-element 117 1 59.79 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGACTGCAAATTTATGCCTTTTGTACAGTCTGAAACTGACTTTCCTCGGGGATACTACAAATAC:1 - chr3R 9081912 3' - hopper 10 2 67.33 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTTGTACTACAAAATAGTAATAAATCCAAAATTTAAATCACAAAAGTTTACGTTTTTCTTGGTGGT:1 + chr2R 14796250 3' - hobo 27 1 58.42 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTA:1 + chr2R 5531200 3' - 1360 61 1 66.34 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATATTACTTTCTTCAATAGTAAGTAACCTTAAAGTATTTGGAGC:1 + chrX 7741768 3' + roo 9042 1 61.22 TTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGCCAGGAGAACCCAGTGAACTGCCCGTGGGGTAATGGCGAAGCTAACGACA:1 - chr3L 17586649 3' - Tirant 53 2 53.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGCACAGAAATATCGCCTCGACTATATAATTTAGGGCAGCCCGAAAATATTATTCAGTAACCAAATTTC:1 + chr2R 10345699 3' + roo 401 1 72.28 CGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACTCTGTGAAACGATTGAATGTGGAACAAAAGATTATTTTACTC:1 - chr2L 13021540 3' + I-element 323 1 58.42 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAGTGGAGTTTACTAACTAACATTTCAATTCCGAATAT:1 - chr3R 13122849 3' - Transpac 4962 2 64.36 ACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGCCACAACCCGAAGTTCTCCGTTGCTCACAGTCTGAGTGTTGATACTGCGTTAC:1 + chr2L 128499 3' + P-element 2753 1 58.42 CCAATGCCGCGTCTCGCGGATTCCTCTTTTCTTATGCTCTCTGAAGTGTGTATGCGTTTGTGAGTGAGCGGTTTTGGGAAACTTCTTTCGAGTTTTACACT:1 + chr2L 4026565 3' - invader3 5373 2 68.32 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCGGACACTTTGAGCTCGATGAATGTTCGATTTTAATTGCATTCGGGC:1 + chrX 7031713 3' - jockey 4705 1 55.45 ACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACTGCGACCTAAT:1 - chr2L 14074947 3' - jockey 249 1 52.48 GATCAGGATCAATAGCCGACTGGATATAGCCATTCTAGTCATTTTGTTCATCAATATCTATCGACATCAATTATTTTATCGTGTGGAAAATAAAACTCGGA:1 - chr3L 11887685 3' + INE-1 92 1 80.20 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAATCAAACTTGTTTAAATCTACTTGCAT:1 + chr3R 27071919 3' + jockey 4951 1 74.26 TGGTCATTTTATTTTTATGTGGAAAACTTGAATAGAATATTATATGGATATTTCTTGTCCACATAATCTACAAAAAATCTGCGAGGAAGGCTTTCTTATAA:1 - chr3R 12583057 3' - mdg1 363 2 79.21 TTACGTTATAATTTAAATAAGCTTTATATGTTTTGATCTGGCAACGCTCAATTATAGCTTTCGAATACTAAATGTGAAAGTTACAGAGATTCTAATAACGC:1 - chr2L 21933687 3' + Copia1_DM 9 1 59.41 CCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCAAATCGCCGCTAGGCCTATAGACCCAACCCAAAACACCCAGCCTTCTG:1 + chrX 14894183 3' + BS 4844 1 59.41 GGGTGCGTGTGAAGCTTGCTTGAAAGAGATGATAACAACCAAATGAGAGAAGCTAGCCCTTGCAGGACTTAGTTTGAAGTCCGTGTAGCGGCCAAGTCTGA:1 - chr2L 20067290 3' - F-element 4452 1 80.20 ACACATAAAGCAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGCTTATGTTTATTAATGAGCAATCATTCGGTGCAGTGCAGGCTAAATAATCCCAGCACGAGATG:1 - chr3R 10430162 3' - hobo 2549 1 70.30 TGTGTGTGTGTGTGTATGTGCGAGGTGTGTGTGCCTGTGTGTGTTTCGAGGGTTTTCGAGCTGCATTCGCTCCTGGAAGCACACTCGAAATGCTCGAGTGC:1 + chr3R 18960782 3' + Stalker 445 1 73.27 AGATTAAAACGCAGAACTCCAACATAACTAAACTATTAAATTTTTATTGTATTAGCGTATCCTTGCACTGGGAAGGACATCTTCATCAGGCTAGATTAAAA:1 - chr3R 13789662 3' + Porto1 4525 1 77.23 ATGGCACAAAGTTATTAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAACCTTGCGTCATAATGCGACAGAATAAGCCACACCAATC:1 + chr3R 9219117 3' + pogo 321 1 62.38 AGAGTGTGGAAGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCTGGGCACATTGTTTTTGGCCATTTTGAATCGCCGGATGAGATCGAGAAGCGCACAAGGCGTCACAGT:1 - chrX 7104195 3' + aurora-element 4101 1 55.45 AAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGAAGATGTGGATGTACATTGACAACTTGCAACTCGTCGTCGGCAGTGGCAATAACAACAAATACGGCA:1 + chr3R 21682706 3' + I-element 410 1 48.00 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGAAACTCATATTAATGTTTAAATTATCTTTTAAATTTCAG:1 - chr2L 17887149 3' + hobo 2903 1 61.00 ATAAAGTCATTTTGGAAATTTATTTTGTGTTTTATGTAGACTATTTGATGTGAAAGAAACAACACCAAATAATGCCCAAAGGACGACAATCTGCGGAAGAT:1 + chr2R 15372257 3' - 1360 375 1 71.29 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAAAAAACCCATGACAAATAGTTCAAAGGCCCAACTCGTTGAGAGATATTTTTTCCGGCGTCA:1 - chr3R 28630054 3' - FB 16 1 63.37 GGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGCCAGTCTGCCGCTCAACGGCGCTTACCTAAGCAATGCAATTTATTAAACTA:1 + chr2L 9828615 3' + roo 8784 2 54.46 ATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTTGTTGAATTCTGAATTCAGAACCCAACTACAACAA:1 - chr2R 12280880 3' + BS 4851 1 65.35 ATATTTTCCTTTTTGCGCACGGCACAAATGACTCCTGGTCCACCGACCTC:1 + chr2R 4297798 3' - gypsy8 306 1 88.00 ATGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATCGCTGGGGGGCGGTAGGCTTTGCCAAATGGTGGGGAGTGGGTGTGTTTTAGGGGGCGGTGGGG:1 + chr3L 2823362 3' + copia 150 2 67.33 CTAAACGTTATTATTATTTAAATATAGCTTAGAAATAGTAATAGCCGAATCATATCGCAAAATAAATAAATGTCCTATAACAACTTTTGGCTTTAGTCCAC:1 + chr3R 3626757 3' + 1360 309 1 66.34 TGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTGCTTCATCGCCGGCAGCAGTTGCTGCTGCGGCTGTCTTTGGCGACAAC:1 - chr2L 14061922 3' - I-element 5125 1 53.47 CGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCAAACGTCGGCGATCGAAATCAAACCAATTGAGAAGATCAACATATTTGACTACCAATTACAGACACCTTCACGTCGGC:1 + chr3L 18445603 3' - F-element 33 1 64.36 CTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCGCTGCCTACTCTCCTTCCACTCCAGAGTGACACA:1 - chr2L 4255323 3' - flea 4612 1 69.31 ACTAGCTGAATAACGGGTATCAGGTAGTCGAGGAACTCCTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTCTTGTGTTTTATTGTTTCCATTATAAATGCCACTT:1 + chrX 22599111 3' + INE-1 542 1 65.35 AAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTTGGTGCCGCTGCTTAACATTCACCTACTTTTCACCTTGTTAGCCACGTTTGAACAGCAGCAGCAGCAGTAG:1 - chr3L 4713735 3' - transib2 2 1 75.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATATTACTTTCTTCAATAGTAAGTAACCTTAAAGTATTTGGAGCATATGTATAGTGTATTCGAAAGATC:1 + chrX 7741793 3' + roo 401 1 69.31 GGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAAATCCAATTGACAGTAAACTTGTTATATCCTTGCAAGGAATGTATACGTACAGCAGATTCT:1 + chr2L 7543971 3' - 1360 261 1 62.38 TTTTTCAAAAGTGTTGGCGTGGCAGTTCTGGACGGTTTGGGTGCCTTGGAGTAACTTTCTACAAATATTTCTAAGTATCTAATGGTTTTTAAGATTTTTTC:1 - 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HeT-A 40 1 81.82 TATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTCTCCACTTTTTTTCCCCCCCTTTAATATCGGCTATGTGCTTATTTGCCAC:1 - chr2L 5061567 3' - Stalker4 7108 4 55.45 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAACTAACCACATACCACAAAACCCATGGCCGGGGACATGTTTTATTGGCCTGGTTAACGCATAAAGTC:1 + chr3R 14832580 3' + hobo 2928 1 68.32 AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCAT:1 - chrX 21667992 3' + Tabor 7306 2 56.44 GTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGAATCAGCCAACAGAGTCTTTGTATTTCCATCCATAAATGTAATGGGCAGCATGATGGGCTTTTTGGATTTGGTGGCC:1 + chr2L 15048490 3' + P-element 82 1 78.22 GTTGCACTGGGAGGGGCCGCTTCCTTTCTTTTTCACATCTAGACAACACAATTAAGTTACCCAGGAATACCTACAAAATCGAGGACACAAGAAGGCGTGCA:1 - chr3L 16083063 3' + Porto1 4586 1 54.46 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCAATGATTTTTAACTTGTTTTGACGTTCTG:1 + chr2R 15451614 3' - roo 8708 2 71.72 ATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTCTCAGTTCAAGTTCACCCACATCCTGGCCGGAGCTTCGGCTTTCG:1 - chr2R 11689729 3' - pogo 1755 1 55.45 GTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGAGATCAAAAGCACTGCTGTTTGCCCGTTGTCGTCGTCCTCGCAGGTTGCCATACAGT:1 - chr2R 11995254 3' + accord 7125 2 66.34 CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACGTACAAC:1 + chrX 11025585 3' + hopper 1396 1 60.40 AGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCAAACAGGCAGACCATTCTTATAAAATATAAAAGAGTTCATTTAAGGAGGAGTAAT:1 - chr2R 2562402 3' - Quasimodo 7026 2 57.43 TACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGACCTTCATAAAGAGCTATGGACTCTTCTCGCTGGCGATTCCGCTG:1 + chrX 20486469 3' - I-element 5259 1 55.45 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACTTTGCAACCCATATCAATTAAGCCAAAAGACCGAGA:1 - chr2L 2912028 3' + 297 360 2 68.32 GATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAACAAAAAAAACACACACCGAAATCCAATGAGTTCGAGCTTTGAATATCCCCGGAATAGCTATCTCCA:1 - chr3R 25046432 3' + Rt1b 5123 1 56.44 ACGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTTGTATTTCCATTGTTTTAAACCAAATCAAGTTATTTCCTATCG:1 + chr3R 27926640 3' - I-element 37 1 60.40 ATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTAATTTTCGGCAGCGCACAAATGCTCGACTGGCTTTGGCGGCACCTTTGTTTATGCTC:1 - chr3R 22847187 3' - Doc 111 1 56.44 TCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTCAATCAATATCTCGTCTTGCTGCCTAGG:1 + chr3L 9146768 3' - I-element 353 1 71.29 AAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTCTAAAAGAAAAGAAATATATTTGATATGCATTTGA:1 + chr2R 4350445 3' + pogo 1707 1 66.34 ATAAATATTGCTATTAATTATTAAGCAACGATGAATATTGAAAATATGAATTTCTAAAAACTTAAATGCTGATTCGACTGGAGGGTGATATGGCCACCATT:1 + chr2L 12979436 3' + Gypsy12A_LTR 1814 3 71.29 AGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATA:1 - chr2L 23295810 3' + micropia 5403 2 67.78 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATGTTGCATAGGCACATACTACAATATCTGTGACCATGCCTGTATTCTGCATGTC:1 + chrX 21668291 3' - 412 7101 2 70.30 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTCCTCGGACATGGCCAGCAATTTTCACTCGATGCATTGACAGGTGGCC:1 - chr3L 14284969 3' + roo 404 1 70.30 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGNATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTGTTTAAATTAAGAGTGTCCAAAAAAGCTATTT:1 - 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jockey 4729 1 61.39 CGGATGGGCACGTAGTTTGTTGCTTGTTGTTTGTCCATTTGATAACGTTTGTTATCACTTCAAACGTGGGCAGCAACAATTACAAAAAGACTTTTGCCTAC:1 + chrX 10210593 3' - Fw2 3736 1 66.34 ACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTACACATACGTACACTAGCGATGGTTATCTGTGAGTTGTAAAATTTTGT:1 - chrX 21939049 3' + HMS-Beagle2 281 2 58.42 AGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTTGCAAATTCAAACGTAGTGGTGGTGCTGGGCCAACTTCTGGGTGAGCT:1 - chr3L 1327610 3' + Bari1 57 1 65.35 TTCGACGGAAGAAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAGAAAGAGGTGGTACAGGACGCACCTAACACGCCCATGGGCAGCATTTTCAAGAAGAACGATGGCA:1 - chrX 10079582 3' + invader2 471 1 68.32 AAAGAACACAAAAATGCATTACACTTATTACAAGGCTCTTTGAATTTTCTGTAAATAAAATAAATTAAATGGTGGTTCTGAAACAATTTGTGACAGCATTT:1 + chr2R 17292556 3' + Tabor 475 2 67.33 TAAACATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACAGACTAGCGATAGTGAGAGCACCTTAAGGCAAAACCACAACGAACAGTTGGACAAACTAATAGCTTATGA:1 - chr3L 6568158 3' + F-element 4401 1 70.30 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGAACCGCCAAACCACCGCTGCAGCGCGCTGGCAGGCTAAATGTTACGCGCTGCATGCATTTGCGGCTGGC:1 + chr3R 28196788 3' - 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Ivk 34 1 56.44 CAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAGAAACCAAACGAAAACTTCAATTACGGCACTTTGCTGCTCTTTGCTTTGGGCCAAAAC:1 - chrX 12727012 3' - rover 152 2 62.92 TGATTATGTTGGGAAGATGACTGTCTTCCTTTTGGCTTCTGGCCTAGGGACTCATCTTCCTCCATCGCGGCCCCATCTGGCCGTGGTCTGTGTCTTCGTTC:1 - chr2R 17173162 3' - gypsy3 255 2 53.47 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGTACGTAAAAATAATGAGAAGCACATTTTGTGCGTATAGACAAGAAACGTAGCATACTTTTT:1 + chrX 6146746 3' + hobo 2928 1 68.32 TGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATAAATATGCGGCCCGGTCCCGAAACAGGAAACAAGGA:1 - chr3L 17177374 3' - I-element 147 1 65.35 TTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTAACGGCTACAAGTCGTAACCACAATTCTTGCACCACACGC:1 + chr2L 19626256 3' + hobo 2632 1 60.40 TTTAATTTTATGTTTGATTTTGTGTGCACTTTTTACGCTTCCACCTCTTTTAATAGTGGATTGCTGTTGCCTTCGCTGGCTATATACCAAAAAGAATAAGA:1 - chr3R 29326523 3' - Rt1b 96 1 78.22 GTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGC:1 + chrY 2720336 3' + S-element 1686 1 61.39 GGAGAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGGCCAATTAAATTTGTTATGATTTTCAGATGGCCGGTCCAATTCATTTGTCTTTAAATCGGCACTTTTA:1 - 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INE-1 564 1 60.40 ACCTAGCATCTGCAGAATGCAAACGATCGCGGTCTTGCTCACCAATCCTTATGACTGCAAGGAAAGAACTCTTGGCAAAATTTGGAGAGCCAAGCCTCTCC:1 + chrX 20762384 3' + Doc3-element 354 1 58.42 TGAACTCCAGGCTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTTGGCAGTTGCTCTAAGAGGAATTCTCTACCGATTTTCTTGATTTTCCCCATTTCCACTT:1 + chr2L 13045326 3' - Doc 4232 1 64.36 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAAAACCATTTCTCTTGCTACTTTGTGCACTAAGCCAGTTAGTTTGCTCACTGGTTTCGA:1 - chr2R 17649938 3' - 1360 19 1 56.44 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCTGATTTTCGATTGACGTGCAGCTGGGGTAAATAATTTAATTTCATTTATTTACATGGGT:1 - chr3R 9606188 3' + roo 392 2 62.38 AACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACCTGCAACCGCCTGATCTTCGGCTGCGACAACTTCGCCAAGTGCGGCGATGAGCCGGG:1 + chr2R 23499895 3' + 1360 3218 1 59.41 TTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGTACCACGAAGCTCTTCAATTTTTTACGCTTATTTTTCCCCATCTGTTGTCAT:2 + chr3L 8012116 3' + transib2 2801 1 54.46 TGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTATACAATATTGAAATTAAAAATAAACCTTAAAAATAAGCCAACCAAAAAGAAAAAAAAAACGAAAAACCGTCAAGT:1 + chr2R 12703987 3' - 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chr2R 3293721 3' + 1731 305 1 68.32 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCTAATCAATCGTTTATCTAAGCCATA:1 - chr3L 11625572 3' + roo 9021 2 81.19 CTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTAACATTTATTTTAATAAC:1 - chrX 5034437 3' + micropia 5410 2 55.45 TAACTAGACCGGGCGGACGCCACTTGCCCGGACTGTCCGTAAGCGACTGGGCTAGTTGTTTCCCTGGCTGTGGTTTCATTTCCAGCTCCGGCGGCTTTCAT:1 + chr3R 6942912 3' - baggins 309 1 61.39 ATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATATCTGAAAATGTGGGCAAAGGCAAGGAGCATACAAGGGAAAATGCAAAATGCCGGGGCTCGCCTAT:1 - chr3L 13264432 3' + Burdock 6384 2 72.28 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCCTGCCGCAGCACGTTTTTAACCGAAGCGATC:1 - chr3L 9763509 3' - P-element 45 1 32.67 GGTTTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGAAGGGGTGGGCATGAGTTGATTTGATTCGATTTGATGCACTGTGCGCTAATCCGT:1 - chr2R 17913695 3' - I-element 5094 1 61.39 TAACCGTAGAACTATGCTTGGAACATTATTTTTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTTCTATATCGCGTCTATCTTCTCGCCCCATGACGATACACCCTGCCCCA:1 - chr3R 2772084 3' + Cr1a 4015 1 76.24 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTAGCCGTCAGAATTCGCTTACTCCGGCTGGTCCTG:1 + chrX 18119558 3' + hopper 1375 1 65.35 ATTCTTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACCCGAAATCCCGAAAAGCAAAGAATGTAACGGGAAGAATGTCAGTGGT:1 + chr2L 17872789 3' + Idefix 7033 2 69.31 GGAAAAAGAACGGTATAGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTTTGAAATATGAGTGCCTTGACAGGCTTAAAAAGAGGCATACATCACAACAAGTTAAC:1 + chrX 14715885 3' - rover 7079 2 60.40 AGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTCCATTCTCTAGGATCATATAAAATCAATGCTTTACTCACTACATGTTAGTTCGATTCAGGGATAAGGGAC:1 + chr2R 16082049 3' - Idefix 6977 2 56.44 AACTAATTGCTGCTGTCAAGTGCCTTGAATTTAGATACGGCACCTTGGAAACGTGCCGAGGTAGTAGTCGCTAAGAAGTCTACCGACCCTGAAGCAGCTGA:1 - chr2R 4932089 3' + G7 175 1 65.35 TGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTTAACAACATTTACCACAGACACCAGGAATCGCACGAAAATAATGTGAAATGCGCATTTATATTAATGTACAAAAA:1 + chrX 5845156 3' - roo 8615 1 71.29 GAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTTTTTCCTTTCTCAACAATTTTAATGGTCCTCCAGGGAGAGAGAGAGTTAAGGCGAAAAGTTCAGTTCGATGTCTTT:1 - chr3L 5334561 3' + baggins 4989 1 75.25 CTATCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGTCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGCGAGTGCTTTCAAGTTTGCTGCAGTTTTATTTTTTCCT:1 - chr3L 17600495 3' - I-element 172 1 66.34 CGGACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAATTGATGAGAGATTCAAGAAAAAAACACAACACGAAATGCTGACAGATATCCGAGGAAGCTGTCACA:1 + chr3L 13778367 3' + transib2 2398 1 72.28 TGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCTGTATCGACACTGGCTTTTGCCGGGACCAAAATC:1 + chr2R 19655051 3' - jockey 4759 1 65.35 TATGACCATATATAGTATATACAGCTAGCCAAGCGGAGAGGCTGATATGGTTGTCGATGCATTGACCCCTGAACTCTGAAAGAGATGTCTATGGTGAGCCA:1 + chr2R 19144863 3' + INE-1 54 1 70.30 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATAGCATTTCTTGTAATCAATGCTGTAAACACTTATTTTTGTGGTTGTCACCGAGCTCCAACTG:1 - chr3R 15714122 3' + jockey 4969 1 59.41 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCACGTACCGTGTCCTTGTCCAAGTGCACCGAAAAGTATGCAAC:1 - chr3L 21852499 3' - 1360 37 1 64.36 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATCAAATACTACGGTGCTCGGCCTTTT:1 + chrX 4784560 3' + hobo 2903 1 68.24 GCAGTTAGGCCAGGGCCGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCATCAGAATGGCTCTGCTC:1 - chr2L 4192796 3' + 412 7153 2 77.38 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACTGCAAATATCCATAAATAGCCACGAAATTTTCCATTTCTGGAAGTTAATGACGTCCACGAGTTCTGTTGGCAT:1 - chr2L 10820563 3' - roo 8668 2 75.25 TTTGGCATATTTTACAACCAAATGCCTTAAAATCGGTCACCCACACAACTGCAAAAAGAATCACATTTTTAATATCTTCGTATTGAAGATCACAAGTCAAA:1 - chr3L 17554866 3' - S2 344 1 54.46 AACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATGAAGTCTTAAATAGATTTCCCAGGGTGTGCACTAACAATTCTTTGACTT:1 - chr3L 5267213 3' - Juan 3999 1 49.50 CAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCA:1 - chr2L 19479165 3' - micropia 43 4 57.43 TTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCGCGGAGGGGGGAAATTCGGAGGAAAGCAGGAGGGAGTT:1 + chr2R 12747872 3' - P-element 128 1 42.57 GCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGGTACAAAGATTCGACGATGGCATTTCTATGGGGGCTCA:1 + chr3R 21544964 3' - Ivk 206 1 62.38 ACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGTGTCTATAGCTATGTACAGATTCCGTTTCTCTAAACGCCCTCTCCAACCCTCCGTTTCCCACAGCCGTTACTG:1 + chr2R 2751080 3' - R1A1-element 5249 1 60.40 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACACCTGCAATTGCATTTCGCTGCCAAC:1 + chr3R 29711021 3' + mdg1 367 2 75.25 CCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTCGGAGTTCCCTTGTTTTTCTTAAAAGAAGAAAAGAAAAATATATGTGAATTATATGAATTTG:1 - chr3R 9229948 3' - X-element 27 1 54.46 GCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAAAAGCCGCAACGTAGCGAGAGAGAATTTCCTTCGCGTTTCATTGATTTTT:1 + chrX 5086531 3' - blood 7332 1 56.44 TGCACACACACACACACACACACACACACAGATACAGATACGAGTACAGACACAGATACAGAGACAAATATGCCAAGGAGCAGGGTCAGCCATTTTGGTTT:1 - chrX 10822928 3' + accord 182 2 74.26 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATAAAGATATACACCCGCACACGTACGCGTATAGTCTCAATTGCCACTTATCAGC:1 - chr3R 18887020 3' - 297 6600 2 59.41 TAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTC:1 - chr2L 23372505 3' - gtwin 4 2 75.25 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCCACTTTTAATGTGGTGAGGTAGGAATGTTTCATTGATG:1 + chr2L 11805075 3' - P-element 35 1 44.44 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCACAAACATATCAAAAACAGTTGACTGATTTTACT:1 + chr2L 10687743 3' + hobo 2906 1 64.84 CGGGTGGTTTTTTTACTCGTAACAAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTGCCTGTACTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTC:1 - chr2L 15833025 3' + hobo 2803 1 65.35 CTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTCGACGCGTCGCAGAAGGGGAAACAAAACGGGTGC:1 + chrX 4249032 3' + blood 7219 2 66.34 GGGGGGTCCCTCGCTGCAGTCTCCGATGATTTGCCGGTTGGCTGATGGTGTCTCTCTTACAGGGGAAGAGGGTGATAAAATGAAATGAGTATTTTTTTCGG:1 + chrX 7606985 3' - gypsy3 353 2 76.24 CTAAGAAAAAGAACAAAACAAAGAAGGAAAACAAAATATGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTTGTGTGCCAATGTTGTTGTTCTTGCTGTTGTGC:1 - chr3L 18630878 3' - S-element 250 1 68.32 GGCATGGGGTGAGTTTGGGGGTTGGGCGTGGTGAGTTAGTTTATAATTAGTATTTTTTGTATTCTTGGCTTTTAGACAGCAGTTACGTCTTGAGGCTTAG:1 - chr3R 23172649 3' - HeT-A 5934 1 78.00 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAACTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCGTGTAATTGCGACGCTCCGTCTTTCCC:1 - chr3L 11199835 3' - roo 8712 2 72.73 CCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGCCTTTGTGTGACAAGAGTGACAACCGATGGAAACAAAATCGATCGCAAAAATTCACG:1 + chr3R 22220697 3' + Porto1 4473 1 65.00 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACAAAATCATTGACTTACTTCTTGGGGATGCAAATTTAAACATGGATT:1 - chrX 12954170 3' - pogo 27 1 58.42 AGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAATAAAACAAATGAAGAAAGCAAGAAGGCGGGGCAAAAAGAATTTGAAAGGCA:1 - chr2L 8563246 3' + Rt1a 5036 2 59.41 ACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATAACTAAATTATACACAGTGTGATTAAAGCTAGAGTCATACAAAAAGTAAACATAATGG:1 - chr3R 14301893 3' + mdg3 5273 2 60.40 ACTAATTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGGCAGAGTTGGAACCAAGAAGCTACAACCATATTTTCATTAACAAGGCCTTGGATCGG:1 + chrX 7905159 3' + Porto1 4464 1 61.00 TAGATTTTTTTATATTTTATTTATTCTCCGCAAGTAGTTTTCTGATTAAAAGCAGTAGTACTTATCTCGCTGCACTTCCAATTCTAATATTGTCGATCTGT:1 - chr2L 7029251 3' - transib4 2278 1 77.23 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTCCTTGATGTT:1 - chr2L 11805010 3' - P-element 27 1 48.51 CACGCACACGTAAACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACACCCGATTTAATGACCAGTATTTAAAAAGTACAAGGGTATAAGGTGTTCTCGGTCAA:1 + chr3L 11420776 3' + 1360 3220 1 63.37 GGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCCACTACACTTCTCACCCAAAGGCCACCCAGCGACGTCCTTGGAAACGCCTTGAAATGC:1 + chrX 3539597 3' + I-element 340 1 56.44 GTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTCAATTATTATAAATCATTTATTTGATCAGCTATTGATTGCTTCGTGTC:1 + chrX 3125884 3' - I-element 4961 1 58.42 TTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAACACACAACGCAGAGATATGTGTGGCGCACGTTCGGCCGCGATTAA:1 + chr2L 10199035 3' + Stalker4 7326 2 55.45 CCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTACTACTCGTTCTATACTACAACAGAATATCTATCGATAGCCATTT:1 - chr3R 21788704 3' + Doc 475 1 55.45 GCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTGTCGATAACAATTAAGAACGAAAATATCTCACTTCTTCTGTGGCAAATT:1 - chr3L 4025396 3' - X-element 4625 1 57.43 CAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACA:2 + chr3R 16611516 3' + Stalker2 357 2 70.30 CTCTCGCGTGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACGGAAACGGACGGAAAGACAGACGGACTGACATGGCTATATCGACTCGGCT:1 + chrX 188413 3' - Tc1-2 110 1 50.50 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGTGTTTATAATTTGGAGTCTTGGCAGGTGCTTTAGTGGTTCGATTTTCTTTTCATTTGCTTGGTTAATGCT:1 + chrX 6739696 3' + roo 403 1 73.27 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCAATCCCCAGATTCATGCATATTTCACCTACCAAACTCAT:1 + chr2L 16032347 3' + 297 362 2 64.36 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCACAGAAAGAAATTCAGCTAAAGTATACAAGTATAAATAGTACTTAGTCTATTTCCAATAAAGAAACAATTA:1 - chr2R 18038866 3' + blood 7335 1 74.00 CCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTATATTGCTCTCTAACTCTTCAAACAA:1 + chrX 22633927 3' - F-element 4357 1 76.24 AAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCAGAAACAGGCTCATTCGTCCTTCGCGTGATATGCGTGTGCGG:1 - chrX 985166 3' + 1360 2 2 59.41 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGAGCATTATTATAATGCCGGGCCA:1 + chr3L 14285075 3' - roo 8693 2 57.43 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGCAAAATGCTTGGCCGAAGTGCTATTAAAAAGTTTCCAAACATAATGAAGG:1 - chrX 12533472 3' - jockey 36 1 50.50 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAGTCTTAACAAAGCAGCTGCCAGAGACCTTCGTCTCCTCGTCGTCCGTTTGGGGGCAAGTGTTGGAC:1 + chrX 17284037 3' + roo 401 1 71.29 ATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATATGTTCAGATGGGATTCTCGAGTTGCAAACTCGGTTTCGGGG:1 - 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invader4 411 1 73.27 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTAGGCTCTTTAGGGATTTG:2 + chr3R 21998435 3' - 412 7109 2 80.20 AATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGGGGTCAGCCGCAAAAGGAGCCAATAAAACGGCTTGAGTAATGGTCGAGAGATTTTTCCA:1 - chr3R 7601748 3' - F-element 4226 1 63.54 CCTTGTATGTTTTTCCTTCCTTTCTTAGCAACAGAAACAAAAGAACCAAAACAAAAGCATTTTTCATTTATATAATTATTAACAAGCCAGACGATTAGCAT:1 - chr3L 8079292 3' - HB 408 1 79.21 ATAACAGTAACAATAATAATAACAACAAGCCAAGCCAAGTCAACTCAAGCCAACACACAACACAAACAAAAACACTAGCTGAGAAACTGTCAGTGGCCCAA:1 + chr3L 3760018 3' + mdg1 7064 2 65.35 GCCTCGGGTGGTTTTTTTACTCGTAACAAAAACACAACGTCGGTATTACATAAATGAGTTCATTTGATAACTCGAGTGTTTTTTGAATATTCGATTATCAT:1 + chrX 17727864 3' + hobo 2799 1 58.42 ATAGACGAGTTACCCGACTATCAGATACCCGTAACTCGGCGGAAGCTTATTGTTCAAAATATTAAAAAATCATTTAACTGCACAGCGTTCGTCGGAAAATC:1 + chrX 21212671 3' - INE-1 564 1 59.41 CTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTTTTACTGAAATTTATGTTTCAACTACAGAGAAAAGTCAGTTGGCTTATAAATTTCAGCGGCACACGCTTGGCA:1 - chr3R 15667821 3' + P-element 2788 1 78.22 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCGCTTAGTATCTGTATCTGTGTGAGTG:1 - 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chr2R 19209472 3' - Doc 70 1 54.46 TTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAATGTCTCCACTTCTCACCCTTCTTCTGTATCCACAAATTGCAAA:1 + chrX 5387836 3' + TAHRE 10394 1 63.37 GGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGGCCCCTCACCTTCATTCGATTGCCGTTTATATTTTACAACGCTTTCAAGAC:1 + chr3L 16555237 3' - opus 7303 2 56.12 CACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACTCAGATACTTAGATACACAGCCATGAATGGGTGCCACTTCA:1 + chr2R 9982443 3' + Idefix 52 2 64.36 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGGGGATATACTGTCCGCTTGCTTAAAAATGTCTTTCATG:1 + chr2R 6041631 3' + opus 472 2 61.05 CTTTTTGCGTGGTGTTGTTCACAGCTTTTGGGAGTTATATGTATGCTATGTTATGCATTAAGGAATATAGTAGTAGTTTTATAAGAAAACGCAGTTTATTT:1 - chr3R 16249235 3' - G6 357 1 80.20 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAAGCCTTCTGCAGCAGCGTTAAAGTTTCGAATTTATCTTGGCACTGAGTGCAGTTCT:1 - chr3L 14692828 3' + flea 239 2 62.38 ATATGTTAAAAGCAAAAACAAAGTGAAAGTGTTTAAAGAAATTGACGAAAGTCTGTGGGATGTGTTAATAGTAGTAAATAAATACAAAATTATACAATTAA:1 + chr3R 10102138 3' + Penelope 545 1 63.37 CAGCCAAAAATTACTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAAGTGCGCTGGTTTCTGGCAAGTCAAGTGGATTATTGGAATTTGCACCTAGCCGAT:1 + chr2L 2769674 3' + Cr1a 495 1 58.42 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTGTTATTCCTAACTCATTTTGGGCTTATT:1 + chr3R 6425888 3' + copia 5078 2 79.21 ATCGGGTTTTCTTTGAAAACACTTCGGACTCGCGCGCTGCACTACGACAGTGAACACCAACACAAAATAAAAAACGTATAGAACGAATGGTAAAAACCGTC:1 + chr2L 17074694 3' + gypsy10 438 1 63.37 TGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTGCGGACTATATGGGGATATTTGTTATGGGTATTACTTAAGTCTGGCAGACGTTCTTG:1 - 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Chimpo 48 1 71.29 GGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGAT:1 + chr3L 25232911 3' - GATE 32 2 53.47 TAACGCAATAAGTTTAAAAAAAAAAAGAGGAAGGCATAAAGTAAAGTAAAACGCAGGCAGGAAAATGAAATGAGTCCAAGGTAAGCCGGTAAACACACCTG:1 - chr3R 31914915 3' + Doc2-element 4765 1 80.20 GAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCAACAGGTGATCGCCGATGCCGACCATCCGCTCACCGAACCCGAGATCATGGACGCGGTCGCC:1 + chrX 4266267 3' + F-element 367 1 66.67 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCGCTCTGCGCTCTCC:1 - chr2L 11805018 3' + P-element 2852 1 42.57 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAAGCAAAAAGTCCTTGGTTGGAGTCACTCAGAATGTCTTCTTAAAGTTAACCGGAAGT:1 + chr3R 12058700 3' + roo 389 2 62.38 TATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAATTGAATGAATTGTCTTATTTAACCGAAATAAGCAATATC:1 - chr2L 19631464 3' - hobo 264 1 60.40 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGTATTATCCCAGCTACAAAAAAGGAAGAAGCACAACAACTGCCATTTGGGGGCAAAAC:1 + chr3L 21992818 3' - 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Transib-N1_DM 43 1 66.34 CAATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGACAATTAAATGCAACAAACATGCAACACTCACTTACTCACTGCGGAACGCGGCGG:1 - chr2L 5895694 3' + Doc4-element 2594 1 64.71 TGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTTCTTCGTAAACGTCACTTCATCGACCTCGACAATCACACGGGCGCCGTGGGATGTTTTGCCAATGG:1 + chr3L 2044834 3' - Copia1_DM 77 1 74.26 CTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATTTATAATGGTGTGCGGTCGCTTTGACGTAACACATTACGACAAACGGGCAGCGACGTCGACGTCG:1 + chr2R 16160306 3' - gypsy 6997 2 69.31 GTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTGGGATAAT:1 + chr3L 21912355 3' + Bari1 1696 1 68.32 ACACAGACGTCCGCAGTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTAAAGCACATATAATTATTAGTTTTGTACGACTTTTAATCAATTTTTTTTTGTGTTGTT:1 - chrX 19080267 3' - Ivk 19 1 54.46 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAGCCATTACTGAGCTATATATCGACTATGGGTACGATTTCACAACGATCTGCTGCGAGTTTCGGA:1 - chr3L 3326573 3' + P-element 2876 1 66.34 ACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGGTTCTGCAATATTCATGCAGCTCTCGAGTT:1 - chr3L 10604256 3' + Doc 335 1 70.30 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACGTACAACGCTGCGTATGCGCATTA:1 + chrX 11025602 3' - hopper 2 2 77.23 CAATATGTAGGTACAATTATTTGAATTTTTGAGGTGTACATTACGTGTGTTGTGTCTGAGGAGGCTTTCCAACAATAACGAAAGTGCATTTTAATTGCCGA:1 - chr3R 5648321 3' - HeT-A 5975 1 56.44 AATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATATATAAAAAGTATTGCAACATCC:1 - chrX 17517799 3' + Max-element 8497 2 77.23 ATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCGGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATGTTACCGCGACTCCCACTCAGTTTCGC:1 + chr3R 9115654 3' - invader4 2891 2 77.23 ACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAATGAATATAAGCAATGCATCGGGCTTATCCACTTTATCGTCGGTTTTCCCGACTTCC:1 - chr3R 26487402 3' + invader2 264 1 64.36 ACATATTCAACAATTATTTCATTTTTGTTAACTTTGTCCCTTATAAATATGATGTTATCGCTTTTTATGGTCCACTTTTATTGCAGGCAATCAGTCTTGCG:1 + chr2L 13693136 3' + frogger 328 1 61.39 GAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCTATAGTCTTCAATGTAGCAT:2 - chr2R 10552683 3' - INE-1 558 1 90.10 TGAAACATTTGTTCAATTGTTTGAAATTAATCACGTGGGTAACGCCGACGGACAGGAGCAGTGTGTGCATTTCAATTAATTCCATCAAAGCAACTGTCCCA:1 - 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chr3L 25608292 3' - Doc 4 1 67.00 ATATTTCTTTATTTTTATAATGAAGGTACATGTCTAAAGTTTCCTTATATATTAAATTTAGAAAGTAACACAGTGGATGATTTCCATTGAGAGAGTTGGTT:1 - chr2R 2793265 3' - mariner2 827 1 64.36 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATCTATAAA:1 + chr3R 19449366 3' - roo 8701 2 79.21 AAATGGATTATATCTTAAGAACTATTTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTGTGGGCAATGACAAGCGCTCATACAAAATGTGCCGAGCAG:1 - chrX 11792899 3' - Tc1 1370 1 73.27 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTCGTTTGGTTTTCAGTTCGCTTTCCAGCTCAGTCGCTGTCAGTCGCTCTGCGCGCTCTTTTCTCGACG:1 + chr2L 9437522 3' + P-element 2884 2 76.77 CTTTTAGGCAAAGCTCGATCTATAAATAGGAAAAACACTTGAGGATTACGACTATATATATGACTGGACTGCCTTGCAGCAGCAAAAGGATCAAATCTGCC:1 - chr2L 17554654 3' - Burdock 63 2 56.44 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCCAACGAATCCTGTTCAATATCGATGAGGAATCCATTGTCAACTTGTG:1 - chrX 7768904 3' - hobo 20 1 60.40 CATACATAATAATTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAACAAAAATCCAAATAAAAAACAACAAAAATCCAAGCTAAAACAACAGAAAAACG:1 - chr3R 24456996 3' + Porto1 4391 1 63.00 AAGTAGCATAATATGCTTCACATATTACGCTTACACAAGAATTGTCGAATAAGAAGTCCCCCATCATTGGCAATATTTTTTCAGTTCTCAAATGAAAAAGA:1 + chr3L 14408792 3' + rover 6951 1 68.32 TCTATCGATATCCCAGAAAAATTATTAAATTTTGCGTTCGCATTTACAGCTGATTCCTCCGAAGGTCGCCATCTGTTTCGGCGACGCCTTGCCTTCTTTGT:1 + chr3L 23768810 3' + INE-1 501 1 58.42 TACAACTTTAAATGCAATTGATTACAGAGCTTTCCGCCCGCACACTGACTGGCATATCCGGTGTTCACCATCCACCATCCGCCATTTCTATTACCATTGCC:1 + chr2R 15160469 3' - flea 388 1 72.28 ACCTACTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTGCGGATTGGGGTTCTCGATTGCTTATT:1 - chr3L 21782417 3' + roo 9007 2 72.28 TCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAAC:1 + chr2R 5651889 3' - Tirant 8151 2 67.33 AGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAACTGCTTCTGAAGCGAAGACGCGGCAATTATTTAAATCAAGTGAGACAACGCGTTCAACGA:1 + chr3L 15634697 3' - Max-element 440 1 59.41 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGATCCAAGATTTACCATTTACCCGAAAGATACGAAAAACGATTTTGAA:1 + chrX 3358775 3' + roo 9047 1 53.00 AAAAAAGTGCGACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGAAGTACTTTGGGCTTCTATTAATAGATCGTTTTTTGTGTACTGCTGCCTTGGTTTGTTTACACCAGAA:1 + chr3L 13674727 3' - hobo 7 1 72.28 GATCGCTACGTTTTTGCAAAACGTCAACGGAGTCCGCAACCCACAACAGCTTCCCGCCAAATCGTCCCTCTAATCGCCAAACTGCAGCTGCTCAAGTTCTA:1 + chr2L 13075776 3' + Doc4-element 481 1 63.37 TCCCTGTGCTTTCTTTGCCGGTTTTCGCTCTCTCTCTCTCTCTGTCCTGCATTGTTATTTTGGGTTTGCGGTAATATAAGACAGAGAATGAGAGGCAGTCA:1 - chrX 22383375 3' - G6 456 1 69.31 GATTCAGCCATTTACCTGGGAGTTGATCTAGACAGAAGATAAACTTGGCGTAAGCACATTTGCCGCTCACCTACAAAAACCCAACTTAAACTCAAAGCCAA:1 + chr3R 20953885 3' + Doc4-element 2419 1 59.41 TCCTGTCAATTCCTGGAGCTTTATGTTTCGGCAGTAATTTAATTAAATTCTTAGAATTCGCTATGTCTTTCTTCAGCTTTCACGTCACGTCACGCCAGGCC:1 - chr3L 2953271 3' - Helena 1 1 62.38 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACTATGAACATAAAATTCACAAAAGAGATCTTGA:1 - chr2L 15751353 3' + 1360 3348 1 70.30 TATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCCGGCATTCCCGAATCGAGTTGGC:1 + chrX 11948629 3' - Quasimodo 7204 2 78.22 TCTACAAAGGTGCTGTAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGAACAATTAAAATCGCTTGCCAAAAATCTGCAGCAACTTTATG:1 + chr2L 10130419 3' - Q-element 168 2 63.37 TGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTCATATGCCGTGACAAATATTTATTGTTGTTTCGA:1 + chr3R 9114007 3' - 1360 487 1 69.31 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTTGCATTTCATTAGCGTTAAATGGTGTTAACTTACACACACATACACACACTTCGGCCAGCTAA:1 + chrX 12276848 3' + hobo 2931 1 65.26 AGAAGCTGGCGTCGAAAAAATCGAATTTTTGAAACTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATGTTTGCCCACCGATAAGTTTTTTTTTGCCTTCGTTTAGTTT:1 - chr3L 11557569 3' + FB 8 1 76.24 TAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACATCAACTTCACTTCCCCTTCCGACGAGGATCTGCCCCT:1 - chr2L 14642353 3' + Doc 485 1 71.29 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTCTTTTTGGTTTTTTGCGGCGCCCATCAATCACCAGCCGTG:1 + chr3L 10565351 3' + pogo 2077 1 56.84 ATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAATATGTGCTTTAAGTTGGGACGAATCTGACTATAATAATACACACAGGTACACCAGCCATCTGGC:1 + chrX 19080357 3' + Ivk 5362 1 66.34 GTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAAC:1 - chr3L 24272104 3' - gypsy11 72 2 76.24 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTCGTTTGGTTTTCAGTTCGCTTTCCAGCTCAGTCGCTGTCAGTCGCT:1 + chr2L 9437501 3' + P-element 2861 1 54.46 CGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAATGCTGGCTGTTTGGTTGGCTGGGTGGTTAATTTGTTGTGAAATTGTCGTTTTGTTGCTTCAATGGCT:1 - 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chrX 6897366 3' - Ivk 39 1 62.00 ACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACTGCGACCTAA:1 - chr2L 14074948 3' - jockey 249 1 53.00 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATGCAGTGACCATGTAATTTGCTCA:1 + chr2L 18506796 3' + flea 4952 1 75.25 ATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAACTTTTACCTTATCAATCGAGCAATTCTTC:1 - chr2R 3293738 3' + 1731 4600 1 51.49 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGACTATGTACCATTGTGTAAGCGTAGTCGTTGGTTCGAAACTCTTGTTTAAAT:1 - chrX 22690735 3' + roo 9049 2 52.48 AACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTTTAGTACGTTTTGTGTTCGTTATCATGTATGCATCAAACGGGATGTTTTAATTCAACTGACCTAAATAATATAA:1 + chr2L 9091428 3' - HMS-Beagle2 6818 1 73.27 TACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAA:1 - chr3L 15452876 3' - accord 42 2 65.35 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGG:1 + chr2R 17345987 3' - hobo 52 1 76.77 TGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCGCTGTGCAGAAGAAGGCGCTGCTGGGCAGCGG:1 + chr2L 2949785 3' - 17.6 7161 2 63.74 TACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGG:1 + chrX 22386760 3' - hobo 87 1 64.36 GGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATTGTATCTGCGGCATTATTATTCTGAA:1 + chr3L 1350744 3' - accord 118 2 63.89 GATTTTGTTATCTAAGGCGACATGAGGAGGGGCGGGGGCGGATATCAATACTAAAATTACCACACATATACATGGTCGAATATCTTTTTACTCCAACTTAC:1 + chr2L 10818370 3' + roo 97 2 73.27 ACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGATAGCTAGGGAAGGTAAATTAAAAGTTTCCATTGCCGAAGTTTATTTAAAAACAAAGTTTGTATTAAAAACCCATTA:1 + chr2R 1983424 3' - Cr1a 4020 1 57.43 TGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTTGACATTGTTCTAGGGGAGCAGTGAAAGGGGTTTTGATTTACTGCCTACATTGTTAAGAGTAAAGTG:1 - chr2L 1238140 3' - F-element 455 1 68.32 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTTAGGCGCCATTTGATATGCAACAATCTTTGGCGCCAAAAG:1 + chr3R 20869727 3' + hobo 2902 1 63.37 CAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCAATGCACATTGTGCATTGTGTTTTTCGCAGAGATGTGTATA:1 - chrX 19819979 3' - hobo 35 1 63.37 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAACATATTTTTTCATACCACACACTTAGGCCGCT:1 - chr2R 20196864 3' - pogo 39 1 66.34 AAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGTCATACACATGTATTGCGGTTTGCGGTGTAATCTGCAACAGTATGCGTGT:1 - chr3L 7864072 3' + P-element 2686 1 60.40 TCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTATCCATTAGTTCCCTCAAGATTTTGTTGTGTTCATTAGCCAGTCGGGATTTTGCCCTTTTTCTTCTTGTTTT:1 - chr2L 1479824 3' + opus 7200 2 75.25 GAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATGATGATGTTGCAGGCGAAGGATTTGGCGCGCATCC:1 - chr3L 8221030 3' - Doc 4486 1 65.35 TTTTTGTTTTTTTTTTCTTAAAGTTTGTGCGTGGTTTTTGGCT:1 - chr3L 1898997 3' - TART-C 11100 1 88.37 TTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTGCGTTCAAGCTAGTTCAAAACTAACACCTTTACCCCGATAAACCACAGAGGCCAAGAAAGAGGAGGAGAAGCCACA:1 - chr2R 22856493 3' + Tc3 312 1 63.37 TTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCGATGGCTCTGGAAGGCTCTTCGTCTGCCACTTTCAACTCTCACACACAATGGCTATCGATTTC:1 + chr2R 17973148 3' - invader4 2975 2 68.32 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATGAAAAGAAGGCATGCGTGCGTTTAATTATACGCAATGTTGTTGCATACTT:1 - 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mdg1 7070 5 59.41 AACACACACACACACACACATTCACATACACACACACAGCTGCTGTGGTTGTTGTACTCGTTTTTCGTTGTCGTCGATGCATTTGCATGCAACACTTTTTT:1 + chr2L 12897052 3' + accord 184 2 74.26 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTAAAAGGGGCAAAAGGAGCTGCTCTCTGGC:1 + chr2R 23501784 3' - hobo 48 1 73.27 AACTAGTTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGACGAGCTCGACTATAGTGTTCTCTCATTAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + INE-1 541 1 56.00 ATTGGATTTTGCTGTGAGATCATTTCCTGCAACTGCTGCCGCTGTTGTTGTTGTTGCTGATGCTGGGAGCGTGTCAGGTTGTTCGAAAATAGTCTACCTAT:1 - chrX 13397686 3' - TART-A 162 2 57.43 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACAACGTTCGACATCTGCTCTATCGTCTAGGTTCGCAAATTTCGGATAAATCTCGTTAATTC:1 - chr2R 18036600 3' - blood 16 2 60.40 ATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGTTTGATTGGCAAAGTTCTGGGCGCCGCGCTGTGCGC:1 + chr2R 14069242 3' - jockey 4818 1 64.36 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCCAACGAATCCTGTTCAATAT:1 - chrX 7768931 3' - hobo 47 1 74.26 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAACCCTTTCATTAGAGGAAAAACTAAAGCGAACAT:1 + chr2R 7161554 3' - Doc 46 1 66.00 TTCTATCTATCATAATAATAATAATAAAATAAAATGCAACACGGAGTCCTTGTCCGTGAAATCTGGCCACGCCCCCAGTACACAACCCCCCAGATTTTGCG:1 + chr3R 6135311 3' + I-element 5348 1 74.26 TGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTTTCGCTCTCGTGTTGTGCTTTCGCTGCCTTTGCCTACAAGTATGTCATCTATTACAGTACATGTCCACTAATTCTA:1 - chr3L 20846053 3' - 1360 119 1 75.25 GCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGGGTTTTGGGTTACCTCTAAGAGTTTAAAGCCACGTTGAAAAGGCCTCTAAGTG:1 + chr3R 29663023 3' + 412 7149 2 56.44 GGAGGAGAGCGGGAGAAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAATGGAGGGCATATGAGGAGTAAACAATGATGAAGAACGAACGCCACAAAGAA:1 - chrX 19361234 3' - Max-element 8340 2 55.45 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGAGGATCACTGTGCTGCCCGAGGCGTGTCTTTGTTTTGGCGGC:1 - chr2L 10636498 3' - hopper 32 1 56.44 TGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTGTTGTTGTCCCTGTTGTTATTGCAATGTTTTTGACAAATAGTCAGGGAAATGCACACTGATGTCTGTT:1 - chr3L 13689394 3' - I-element 162 1 65.35 TCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGTCGATGATGAAATCGGATGCCATACGCTCCGGGCGGCTGGTAAGCTTAGTAATTACATGTCAGG:1 + chr2R 18036706 3' + blood 367 2 67.00 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCGCTGACACAGATGGCGCCCGAACAGG:1 + chr3L 4051101 3' - pogo 50 1 74.26 AGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGTTTGCTGACGCGCCAGCCGCGCTTCCATATTTGTACAGTTTTTGCGGCA:1 - chr2L 5975316 3' + invader4 206 2 57.43 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGATGTGGCGTGGTGCGTTGCTTTTTGCGCCTTTGCGGC:1 + chr3R 17508157 3' - jockey 36 1 59.09 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCCACCGCCAGCTATTTTATTTTCGCGCGTTTCCATGCAGCC:1 - chr2L 12908361 3' + hobo 2906 1 56.57 CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTNGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTAT:1 + chr3R 14049409 3' + transib2 2785 1 63.37 GACTGCTATAGCTCAGTAATCTGTCACTATATCGACTTGTATGTCTCCGTTTATAAAGCATAGGACTTGGGTTATTAGGATACAAATTATTGCTAAAAAGG:1 - chrX 20741716 3' - Helena 1261 1 62.38 AATATTGCATAGGCACATACTACAAGGGGCTTAATATAATACTTGTCATACGTTGCTGTTCATTTAAAGTTCGGGAACTTATCGCTTAAAATAATATAATA:1 - chr3L 14886170 3' - 412 3 2 76.24 TTGTTAGTCTTTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAGGCCAAGCATGTATAACTACCTCTTTTATACCGTTGTCGCAATAATTTCTATCGCTGTTGTA:1 + chr2R 4634401 3' + Doc3-element 4684 1 55.45 ATGTAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCCGCGAGCTTGCCCAGTACTTTTCCAAACTTTTGATTGCTTTGTCAACATAATGTAATTCCACGAGCTTGGGCA:1 - chr3L 4550526 3' + 3S18 103 2 57.43 ATCAAAGCTTACACCTTCAAAGTGATGGAAGAGCGTGATACAGTTTGCAAATGCACGCCGACGCATGCCAGCGACAGTTGACCCCCGACCCCTGTGACTCC:1 - chr3L 3791887 3' + Porto1 317 1 55.45 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGAACTGAGGCCATTAAGTTATATTATGCTTAATTTCTATCCCATTCAGTGTGGAGACAGTCGTTTGGCCTGTAAAG:1 + chr3R 28678274 3' - I-element 10 1 66.34 TTTAACACAAGCCAAAGAACTAGAACAGTTGGCTCAGTGCATGAAACATAATATCAAATTGCTGACCAAAACCAACAAAATCAGGCATAAGGGGTGTAGCG:1 + chr3R 16555956 3' + Gypsy6A_LTR 2 1 61.39 TAGCGGACAATAATTAAATGGTTTGGTTTGGAAAGGATGTGAATTACGAAGTGTGTACTAGTCATGTGCCTTAGTAGCAGGCGGTTTATGATAAAATCCTG:1 - chr2L 22748753 3' - G6 1984 1 72.28 GAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTATACCGAGAGAGGGGGTATGGATGTTTGTTCTTGCAAAGAACTCGTTTCGTAGAATGGCTATAGTC:1 + chr3R 5545307 3' + accord2 7591 2 54.46 AGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCGGCAAACGATTCCGTCTCCCTCGCTCGCC:1 - chr2R 12130128 3' + hobo 2891 1 70.30 AAGGCTGAAGGGGGTACACCCCACCCATTTTGTTTATTGAAATCTTATACTTCTGTTGTTCGGGAACTAAAATACTGCAAATTTTAAATTAGACCTGTGTT:1 - chr4 706828 3' + G5 4635 1 64.36 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACACTTTCTGTATTCACAAATTATCTTCCGGCCGTTC:1 + chr3R 7943910 3' + roo 9026 1 65.35 ATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACGGATTAACGGAAGACGGTGGTCAGAACGCAGCTGAGAACCTGAAAGCCAAAACACCTGAGAGGGGCAG:1 + chr3R 6136808 3' - I-element 5037 1 70.30 CGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATATCTGAAAATGTGGGCAAAGGCAAGGAGCATACAAGGGAAAATGCAAAATGCCGG:1 - chr3L 13264443 3' + Burdock 6373 2 61.39 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCGAACCAGTTGGTCATGAGATCGGGATCCTGCCAGACAGTATGTCGCCACTCCAGGGCTCATTCAACT:1 - chr3L 14152071 3' + blood 368 2 66.34 GCGCTGCCGTGTATCGTACGTCTCAATTCGCGAGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAAAGAAACGAAGAACTGTGATAGCTAAAAAGCTTTGAGGG:1 + chr2R 17364556 3' - Cr1a 4397 1 65.35 CACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTAGCAGTGGTGCAATTAGTGGGCATATTGATGGTAG:1 + chrX 10044320 3' + HMS-Beagle2 208 2 66.34 CAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTA:1 - chr3L 21912273 3' - Bari1 44 1 76.24 CTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACAAACAAATACTCGAAAACCAGATAAATCCCAGACAGGGAAAATACTCGTAGTTGCATTAAAACCACCCTCTT:1 - chr3R 23303671 3' + I-element 336 1 70.30 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTCATTGCTAATTAAGCCAAAGA:1 + chr3L 16449777 3' + roo 9018 2 80.20 CCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTCACTTTGTATGCGAGCCAAAATTAGTGGAGACAACCGCCGACCAAAAGGAAGCGACGCGAAATGCCTT:1 + chrX 13881374 3' - jockey 15 1 68.32 ATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATACATCCCATTGAGAATACTTTGGCACGC:1 + chr2L 10197554 3' + Stalker4 6928 2 72.28 CACAAGAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTATACCGATTATTTGGAAATTGAACCTGGATATCACAAGCCGGATAGTTCCTGGCG:1 + chrX 21581187 3' - Bari1 21 1 55.45 GTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTACGTGTGATGTGATGTGGGACGGGGTGTGAAGGAGGAATGGGAGAACA:1 - chr3L 5260546 3' - accord 244 2 58.42 GCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCGACCCCGCGAACCCAGCCCCTTTCACTTCTG:1 + chr3L 14149099 3' + jockey 4709 1 69.00 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAACATATTTTTTCATACCACACA:1 - chr2R 20196875 3' - pogo 34 1 72.94 ATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTTGTGTGCGAGCGCTTTGCAAATTCCTTGAAATTGAGCC:1 + chr3L 9178078 3' - Ivk 5171 1 62.38 CGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCTGCAAAAGTCGATTTTTGTTGGTTTAGGTCAGTTTAGTTAGCTGGCTTTGACAGCTCAAAGTCGAGGTCAACTTT:1 + chr3R 10433991 3' + hobo 2672 1 81.19 CTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACGTAGGCACATGAGAAGTAAATATAGGGGAGACCCGAAGTGGGCAGCAAAACAAGAGCCGAAG:1 - chr2L 20085119 3' - P-element 14 1 65.35 GCTTAAGTGTCGTAAAACCGTAAAATCCGTAGTAAAAAGATCTAGAAATCAAGGTCTCGGCACCCGCTCGCACTCACTTACCCGTGTCCTTAATCCAGTAG:1 + chrX 3514866 3' + gypsy10 377 1 58.42 ATATTGTCAAAATAATTAAAGAGGCTTTTAACTTGTGGTTACACGCCCAC:1 + chrX 21246051 3' + S-element 1452 1 92.00 AAAAAAGAAAAAACAAGTGCAAGTGCAACAGCAGCATGTGTCGCCGCCGCAAGGCGGCAAGAGCAAACAGTAGCAATAGCTGCCATTAGGCCATGAGAAGA:2 + chrX 11783465 3' + Porto1 169 2 80.20 TATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCAACATTTGCCACAGCAGCAACATCAGATAACCGCACAAATCCAAACCATGAAGGATCAACCGCAGCAGC:1 - chr3L 2796297 3' + G2 204 1 73.27 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATCTACACCTTAACCGGTTTCTAAAGTCGCAATTTCG:1 - chr3L 10663581 3' + mdg1 7419 2 64.36 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACAACTAATAGGTGCGTAAACGATGTTTTCCACAGCATACTTTGCGGCGACTTTTGGGAATACGTCCTGGAAAATT:1 - chrX 5275484 3' - jockey 4678 1 74.26 CACGGTGCGTCCTCTTTGTGCACGCACCGTTACCGTTCGACCTCTTCGAGTGAATTCACCTCACAGCTGTCCAGTTTAGAGATTCGCTTTGCACAGTAGCA:1 + chrX 402615 3' - gypsy8 245 2 47.52 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTAGATCTAACGACTTTATGTAACTGGGAGCGAAGTGAAAAAGAGCTCCAG:1 - chr2R 9129649 3' + P-element 2859 1 51.49 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTCCTCGGACATGGCCAGCAATTTTCACTCGATGCATTGACAGGTGGC:2 - chr3L 14284970 3' + roo 403 1 69.31 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTC:1 - chr3R 10978705 3' + roo 9032 1 63.37 CGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTTGAAAGAGATGATAACAACCAAATGAGAGA:1 - chr2L 20067341 3' - F-element 4503 1 70.30 CAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATC:1 + chrX 21668079 3' - Tabor 28 2 51.49 AATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATCTATATAATTTACACATACGTAAACTGTAGATGTGTCTGTGTACGTGTAGCGCTAAAAGGTAAAAACGTCGCG:1 - chr2R 16160199 3' + gypsy 7432 2 65.35 TTTGGGCACTTGCTGCAAAAGTGCACGAAATGAGGCTGACATGAAGCCGCAGGACTCGGTGATGCGATCATACGGAGTCTGGGGTCTGGGGATTGGGAAAG:1 - chr3R 26204981 3' + Tc1 172 1 63.37 ATTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGCAACAAAGGCGGGAACAAAGACACAATCTGGCATGAAGGATGATTAAAGTTTCATGTAAATTCCTAATGGCA:1 + chr3R 28776902 3' - blood 7180 2 45.54 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTG:2 + chr2R 5531195 3' - 1360 66 1 61.39 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACAAAATCATTGACTTACTTCTTGGGGATGCAA:1 - chrX 12954185 3' - pogo 42 1 73.27 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCC:1 + chr3R 8914518 3' + roo 9012 2 78.22 CAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCCATCAATGTCATAGAGAGGGCTGGACTCGCCATTGTTGGTCGTGTCACCGGCAATGTCCT:1 - chr2R 8020391 3' - Bica 13 1 62.38 GTAATTGTTGGGCCTCTCCAATGCTGGTATTGGTATTGGAATTGGTATATAGTAGAGTCCTTAGACATTAGTTCGACTTTTCATGGGCACCCCTAACATCG:1 + chr3R 18418596 3' - Porto1 369 1 77.23 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGGTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTT:1 - chrX 4056271 3' - roo 8702 2 62.38 TGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATATGTGGAGGCTACCGACCTAGAGGATTCGGCTTATCGATTTTTAA:1 - chrX 21098284 3' - 17.6 7161 2 54.46 CAGCGAGGAACCCCCTGCAGCCCACACCTTTTAATTAATTTCTACGTATCTCTTAAAGCTAGTTGTAACATTTGGGAACGCTTATATTCAAAAATATTCTT:1 + chrX 7337049 3' + gypsy3 6934 2 47.52 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATACTATATAGCATATATGTCGCCTGTTGTTTGGCGAATTACTTGCGCTTGTCAGCGATAATTCAGCA:1 + chrX 6262546 3' - pogo 1 1 78.22 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTT:1 + chr2R 22856569 3' + 1360 3333 1 83.17 TGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCAGCCGAACAATGTCAGACATCAGCAACAACAAATGTTATTAAATAATTGCAGGTCTCCACTGACAGCACACAAC:1 - chrX 15492332 3' + diver2 4691 2 73.27 CAGATACCCGTTACACAGCTGGTGGAAATGTGTTATCCCGTCTTTTGAAAGGAATTTGCCTTTTACAAGATTTTACTCTTTGCAATTTACACGCGTCGACC:1 - chr2L 12239459 3' - INE-1 543 1 57.43 GCCCGAGCAGGGACCAGCGTATTTTAAGCATACAAATATATTTGGGCTTTTCGAAATCCTATCACAACGTCTTATAAGCGGGCATATTTTATGATAGATG:1 + chr3R 27996486 3' + HMS-Beagle2 336 2 36.00 AGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTGACAGTCAGTTTTTGTTTGCAGTTTTCGGTCTGGTGTCCAAGCTCGAAGCATTTTCGGTAATTATTCAAGGA:1 + chr2R 9388697 3' - G2 2869 1 60.40 TCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGAGGTGAGTTGTTGCTGGCACAGGTGAGTCC:1 - chr2L 6252795 3' + accord2 7571 2 71.29 ACATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCTCGATTATCTTACTTGGCCCAAACAA:1 - chrX 15259044 3' + roo 9022 2 79.21 AAATCTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACCGGAATCAAAGCGGAAAGGACTTGCAGATCGAAATCAAAGCGGAACTATAT:1 - chr2R 22272329 3' - 17.6 379 2 53.47 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGGCGACTCTCCCAGAGTTCAGCCTGATCCGAGAAGCTTTCAAAGGCAGCTGAGT:1 + chr2L 17978001 3' - jockey 4760 1 55.45 GCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTTCACTAAATGATTACAATCTTTCATTTAGAACAACCAAACGACAATATTCATACCACAGAGAAAC:1 - chr2L 23382007 3' - Idefix 7378 2 57.43 TCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATATATAAAAAATAAGTTAAGCCGCATGC:1 - chr3R 14356395 3' + Max-element 8501 2 73.27 TGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATATATGTAGATATGTATGTGTAGTGTGTATCTCGCAGATGCGTGGT:1 - chr2R 11400327 3' + 1360 3358 1 61.39 GAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATTAACGGGAATGCGCGACCTTCATCCGTCTACGCCGGCAGCTGTCCAACAAGTTGTCTTCAATTA:1 + chr3L 21371670 3' + Ivk 4984 1 69.31 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGCGGCTCCTGTTTAGAAGCGGTAGAATAGTGTGTGGATTGGAGG:1 - chr2R 22946959 3' - roo 8715 2 58.42 GCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTGATTTTCCCTTGGTTCTCTTCTGTTAACCCAACCCCATCCCAGTCTTACCCCAGGTCGTGCCCTTTGACT:1 - chr2R 7346903 3' - I-element 134 1 75.25 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGGGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGG:1 + chrX 10119632 3' - FB 24 1 53.12 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTTTCCCCCTTTATTTTCGAGGCAAGGCCATTATCGGCATAGACAAAAGTCAAAACGAAATGGGG:1 + chr2R 11551743 3' - mdg1 15 2 64.36 TTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCACACCCAATCCACACATCAACACCGACTGAATAAGGTGCCGCGG:1 - chrX 17774544 3' + Ivk 4997 1 78.22 ATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTCGGTTTTCGACTTTTGGCTGCGTTAATTTGTACGTTCTACAA:1 - chr2L 2442362 3' - I-element 107 1 58.42 ACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTCAGCAAATGGGTTTCATATTTAATTAATTTTGAATTCTAATTTCAGTGGGCTA:1 + chr2L 17524623 3' - rover 130 2 59.41 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTGTGAATTAACTGGGTGTCCGGTTATCCAGTCCTTTCGGCCAGTTACTAGTC:1 + chr3R 17164997 3' - Ivk 23 1 57.58 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGAGGACGCACCTGGAGTCGTAGCCGAGCATAAGGATATGTGCATAACGGCTTCAATGACTTTGCCATGCCC:1 + chr3R 9082031 3' + hopper 1411 2 75.25 TTTATTTAACAAATTTAAGTATGCAATACTAAATATATTAAATTTAATGAGTACTAGATAGCTACAGGGTTTTGCATTGGTTGCAATATTTTCCTGGAATT:1 - chr2L 22975483 3' - Ivk 5372 1 73.27 TCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCAGAGCTATGCTGAAGTGGGCGTATTATTTGCCAGCATGCCGAACTTTTCTGGTGAGATTAAGCTAAT:1 + chr2L 21641599 3' + Cr1a 3977 1 71.29 CCTCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTTGGCCAGTACTTCCTTAAACTGGACAGTGACTTGATGGGGGCAAAGACGAAGATGGATGTACAAT:1 + chr2L 15200801 3' - gypsy3 6547 1 58.42 AAACTCAACGAGTAAGATCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAGGAAATTGCCTGCAGTTCCTGGCATCG:1 + chr3R 8914561 3' + roo 391 2 64.36 GATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACATATATATATAAGATTTATATATATATTGGGCTTGGCAGCGTTTAATGGTTCAAATTCCAATGAATTT:1 + chr2L 5974560 3' + invader4 3076 2 62.38 TCGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCAT:2 - chr2R 4860116 3' + micropia 33 2 65.35 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCACAGCGTACTTTTAATTGGAGTTTTATTGCAAAAAAAAA:1 + chr3L 5492367 3' - pogo 34 1 61.39 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAA:1 + chrX 20999562 3' - BS 40 1 72.00 CTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTATAACGGGTGAAGGAATGGAAAAAGGGTCGCCGAGATCCGCTGTGCAGTGCGGAA:1 - chr2L 3775756 3' - hobo 2703 1 60.40 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGGCAGCGCTCTCTAATACACTCGCTACGGAGGCTCTGAGTTGTCGAAAAGCCATCAAA:1 + chrX 10437632 3' + hobo 2920 1 60.40 CAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAATGTTCCGTAACTTG:2 - chr3L 17215704 3' - Ivk 16 1 63.37 CAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGG:1 - chr3R 11151830 3' + mdg3 206 2 63.37 AGTAATTATTTACTAAAATAAATTGGGAGGCGTCGATGGCAGATAATAAAGTAATGCTAATTCTTTCTGATGAATGCTTTTTGATGAGCTATTTGATGATT:1 - chr3R 14660974 3' + Doc 143 1 81.19 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCGAAAGATGGTGAAGTTTAAATAAAAGGCGG:1 - chr3L 26132189 3' - Doc 52 1 71.29 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTACAAACATTGAATAGATGAGAGGACGGCAGCAGACGGTAATGATAAATATGGAAGGAGTGATGTCGACCAG:1 - chr2L 4134299 3' + copia 250 1 71.29 CGACCAATCTACAACTTTGTAATCCCTTAAGTTAATGCCCCCCCTTTTAGCGGGGGCAGAAACAACAAGTTGAGCCGATCGATCGATCGTATGAAACCCGA:1 + chrX 13396265 3' + G-element 4225 1 62.38 CCCTTCCTTAAGTGTAGGCCATGTGGGCTCCTCCTTCCATCCCTTTGCCGCCGTCTTTGGTTCAATTTGAAAGTTTCCCTCCAGTTAAACCCAGGAGCAAC:1 + chr3R 26316210 3' - Rt1b 4926 1 66.34 GATTATTTGAAGCTTTTCCTTTAGTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATAACTTTGTGCCATAAGAAAATGTTGGCCAGGCCGTGAT:1 + chrX 8808440 3' - pogo 375 1 81.19 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATCGCCCTTCTCTTGCCTTTTGTGTAAGCCCGAACAATGAAATGGTAATGATGGATTGTGTCCTTTGTT:1 - chr2R 14744201 3' - roo 10 2 70.30 ACGTATTGAAGATTTCCGGACTTAAATTACATAAGAACAGCTTTCTGTTTCTGTCACTTCTTCCACCACTTCGAATGCACTTCTTGTAACGTTGGGTCCAA:1 - chr2R 9958047 3' - Transpac 423 1 60.40 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATACACTTCTACTTGTACCATGTATTGTATGTATGTACATACGTACATAGTACACATCATGGAAATCCGATT:1 - chr2R 22793311 3' + hobo 2937 1 78.35 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGT:1 - chr3L 19951215 3' - Ivk 47 1 71.29 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGTGTCATCCACTCGAACACATCCTGTTCTGTTCACCTCACAATATGCA:1 - chr3R 8914474 3' - roo 8692 2 56.44 TAAATAAGATAAAAAGAAGCGGACCAAGGTGGCAAAGGGGTGCCAAAAAATGCGGCGCCGAGCTAAATA:1 + chr3R 9220038 3' - Q-element 511 1 73.91 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCATAGTTTGGAGTTCGCAGTTTGCAGCATGCACTTTTCCCCTGTTGTTTATCATTTCGCT:1 + chr2L 4057212 3' - hobo 17 1 56.44 AGTTATAGTGAGGGAAGATACACTACAAAGCTTTAATTATTATAAATATATTTATAGGCGATTGGTTTGATAGCTATGACTGCCAATCAATAATCACAGCT:1 - chr3L 22094236 3' - Stalker2 6 2 73.27 TATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAAATACCCTCGACTATTTGCAATATTGTTTTAAATAGTCGAGGGTATTTTTGCTTAAAGAGACTTATCTT:1 - chrX 10093634 3' + 1360 3108 1 57.43 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAAACTGCCTTTCGTTGCTGGACATTTTTAATAATACATAATATACTTGACTTCGTA:2 - chr3L 10554753 3' + roo 391 2 54.46 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAACCATATGCCTGCAACAAGTAGAGTATTTGATGTGCAGCCG:1 - chr2L 13711390 3' - hobo 33 1 63.37 GTGTAAAGAAAGATCACCTTGGTGATGACGGGCACCATCACGCTGCTAAAGATAGTTATAAAACTGCGTGATGTCCAACTGAAAGCCACGAGTCAAGTTGG:3 + chr3L 14282682 3' - I-element 5021 1 49.50 GACTATCAGATACCCGTTACTCTATCTAGTGTGTCATGTGAGTGCAAAGTAAAATATTTAATCTGTCTCGCCACTAAGCAGCAAACTACAAATATATCTAA:1 + chr2L 1881916 3' - INE-1 549 1 78.22 TTTATTACTTAATGTGTAATATTTTATACTATCCTCCGGGAGGGAGATCTGAAAGAGCGCCTTGCAAATAACCTCCCACTTTTGATGATGATTGGCATTGC:1 - chr3R 2926012 3' - G5 4688 1 58.42 TCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCATATGTTTTATGCTGATTTGTTTATATTTGGTATGAATTTTCGAAACTA:1 + chr3R 16814380 3' - I-element 3 1 57.58 GGAAGCACCGATTTGCTGGAAGACTCTGGAGACGTTGCAGGTAAGTAGTTGTTGTACTTGGACAGAGGGCTGTTTATCAGGCGCAACGCCATTTCACTTAA:1 + chr2R 11713673 3' - HeT-A 5719 1 54.46 GGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTAATCTGATTTTGTGTCCCCACCAGCTCTATCG:1 + chr3L 19689258 3' - Idefix 199 1 68.32 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCAGGTTAATGAATATTTTCTCCAAGTGTTCCACTAACACAGCACCGATTGCCAAATGCCAATTGCCGCGAGTCAATTG:1 + chrX 15259127 3' - roo 8664 1 77.23 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTGCTAAACTTGTTAAATGCAAGATATTTTTAACAGACCTGATAGGCATCGACAAC:1 - chr2L 23374505 3' + flea 238 2 63.00 CCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTCTTCATTTCGCGATTGTTCGTAATGGCAAACTTGGTCCGCAAAAGAGTCGAAAGTCG:1 - chr3R 5287634 3' - invader4 335 1 58.42 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATATCTTATTGAATGATATGAAAAGCATTTCTATGTTAATG:1 + chr2L 18188458 3' - Doc 38 1 60.42 CCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTTTCGGCTTGTTAACCACCTTCGTCATCTTCGCACGATGACAATTCACTAAAT:1 + chr3L 14152193 3' - blood 2 2 77.23 GTGTGTGTGTGTGTTGTGGTGTGGCATGGTGTTGTATTCTGTTCATTTTTGTTAAATATTTCTCAGTAACCTTAATTAAAACGATTATACTCGGATCGAAA:1 - chrX 10462759 3' - gypsy3 418 1 62.38 AAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAATGTTCCGT:3 - chr3L 17215710 3' - Ivk 22 1 57.43 TAATTGGAGTTCATCATTACAATAAATAAAAGAAAGGGTGAACCGCATGAGTCGTCTCTTTAAATGAGGTTGCCTCCTACATTACTGTCCCCCAAAGCCA:1 + chr2R 6074471 3' + 412 494 1 77.00 TAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGGACTTCTTTTTACTTTCGGTTTACTAGTTTCGGT:1 - chr3R 19978884 3' - Doc 4594 1 66.34 GTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTACATAAAAAGGATTTAGCAAATAAGGCTGAGAAAGGGGACTC:1 - chr2L 19622972 3' - 297 6510 1 58.42 GTTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTAGCGCCGTTCTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGGTGCGCATCTTGAGATGGACGCCTCGT:1 - chr2L 904167 3' - Ivk 5116 1 76.24 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTTCGAA:1 - chr3L 9174688 3' - 412 38 2 61.39 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACACACACACACACACACACACAAAGAGCATCGACAACTAAACAGTTCGTCGAGCAGAA:1 + chr3R 19734576 3' - hobo 15 1 45.54 TAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTAT:1 - chr3L 19951213 3' - Ivk 45 1 69.31 ATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGGAAAAAATAATAATAAAAAAAGTTTATACGTAAGCGTTACTATGATATATGTAAGAATGTATG:1 - chr2L 19817820 3' + G4 3826 1 74.26 ATTAAAAGTAACTCCTAATCTTTCATTGTCACGGCTCCGCCTGACACTTGATTAGTAAAAGCCACGCGCGTTAACCGCCGGCCAACAAAAACACAACGGAA:1 + chrX 22963604 3' + gypsy2 255 2 83.17 TTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAACTTTTACCTTATCAATCGAGCAATTCTTCGTCATTGCTTTGACGGCTTGGG:1 - chr2R 3293716 3' + 1731 311 2 74.00 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAAACATATTATTTAACTGAGTTGCTACAAAGTATGCAATTAC:1 + chr2L 18513527 3' + 297 6945 2 69.31 TGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATCTATATAATTTACACATACGTAAACTGTAGATGTGTCTGTGTACGTGTAGCGCTAAAAGGTAAAAACGT:1 - chr2R 16160203 3' + gypsy 441 2 61.39 GCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGTTTACAATTTTGTCATTCCCTGACTTGCATTTCCG:1 - chr2R 8537849 3' - flea 4795 2 66.34 TTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAAT:1 + chrX 20999579 3' - BS 21 1 54.08 TTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGGATAAGTGGCCCATCCCCAATCCGACCCCA:1 - chr3L 11367463 3' + roo 410 1 78.00 GACTGCCGTGGAAACCCAAGGTGGGGGACACAGTATTGGCCAGAGAGAATTTCCTTCAAAAACATTTGGAGAGTGAGAAGGAGGCGAATTTCCCGATGAA:1 - chr3R 18850134 3' + Osvaldo 1280 1 60.00 TTTTTATTATTAAATATGGCAGTGGGTATTAAATATTTCCTGGCTGTCAAGGTTTCAGCTGCTCGGTTGGGGCCCCTTTTCCTTTTCCTTTGCCTTTGACT:1 - chr2R 13625326 3' - Rt1a 5064 1 61.39 ATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACTTTAAATTAATACCCAAATATATTATATATTTGAATTTGTA:1 + chr2R 12370632 3' + roo 375 1 64.36 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGCCTAATTAAATGTCGCAAAATAAATGCTTAATTGGACAGATAGAC:1 + chr3L 3635512 3' - roo 4 2 77.23 AATTTTTCTTGGATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATAAGAAAATCATAAAAATTGTTTCAAAGTGTGTTCCTACATTAAAGGTCATACTGAATGAATT:1 + chrX 15937136 3' - INE-1 502 1 68.32 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCACACATCCTGTCTTTTCCAAAGAACTTTTACCGCGGT:1 - chrX 10436530 3' - hobo 37 1 64.36 GATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATTTATATAGTTATTACTAACAGTACTCATTACTAAAATTACTTTTTTATTTAAAAGAAGTGAAATAGTA:1 + chr3R 4217435 3' - hopper 374 1 72.28 TTGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGTGGCGCGGTTCTGTAGGATTGATGGAATTTAGTTTACTGTGGGCTTACAATCCTTAAC:1 + chr3L 25119540 3' - Cr1a 4442 1 57.43 TGCGCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTTTTCTGGCCAAGTGGATGCATTTGTGTAGTTGCAATAAACTAAGAGTAGTCGAGTAATTTAAATA:1 - chr2L 18396586 3' + 1360 222 1 78.22 TGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCTCTCTCTCAGTCCAGCAGTTGGACATCCAGTGACCCTCCCACCTGGACCGTT:1 + chr3L 15182526 3' - 1360 147 1 58.42 AAAAGAGGCGTCTGCATGGCGCGTTCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACACGCCTTCCCACAAAAAGGAAACTGACAAAA:1 + chr3L 18348492 3' - invader1 3659 2 75.25 TGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCAATCAAGCGGCGCATCCACAAAAGTATGCAACAGCATCT:1 + chr2R 17960491 3' + jockey 308 1 61.39 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTTTCAAATTGTTTTCCAACCTGGAATTTT:1 - chr2R 22521825 3' + roo 9026 1 70.30 GTTGTAAGGGAGAGCAAGAACGTGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGATTGCACTCAACATGATTGGGGGGGCGCGATA:1 + chr3L 5642411 3' - Doc2-element 456 1 68.32 GCATATGAGTGTGTGTGTGTGTGTTTGCTGGCCACAACCTGTTGATGTTGCTGCTGTTGTTGCTGCCACCAAAAGCAGTATAAATCATCTTGGGATTTGTA:1 + chr2L 9734569 3' - accord 185 2 65.35 TTTTATTATTTATTGAATCTTCCCCTTGTGTCAGGGTTTTGTCCGCATATGTAAAGTCGAGACGCGCCAATACGGCATCAACATTTAATAACGTATTAACT:1 + chr3L 27613523 3' - Doc 4679 1 77.23 CAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAAAGCACTTGTTCCAGCTTGAGCAGCTCAACAAGATATTC:1 - chr3R 21859847 3' + F-element 4243 1 64.29 TTTTCCGATGCCTACAATAGTTCTGAAAAAAGTGGTAAAAGCCCGATCAAATCGTTGATTCAAAGGGTTATTAAGAAAGCTAAACATTTTAAACACGTTTA:1 + chr2L 22329118 3' + mariner2 848 1 76.24 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGACTGGGCACAATTTACCGCTCGTCCTGGCATCGC:1 + chr2R 6890718 3' - hopper 38 1 64.36 GAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGGGAGAGGCAGGAAAAGCTTTCGACTTGGCCACTTGCGAGGCAGC:1 + chr3R 20740076 3' + micropia 322 2 56.44 ATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAATGAAGCGAAATAAAAGCAGACCACGAAATGGCATACAAGGAATCGA:1 + chr3R 24581960 3' + Doc 4412 1 59.41 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATT:1 - chr2R 19209471 3' - Doc 69 1 53.47 GGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGTGGATGAAATATTAGTGATTGGACTTCACTGTTGATGCTGCTCGTGTAGGTAATGGGAATC:1 - chr3R 13311416 3' - HMS-Beagle2 6945 2 55.10 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAATCGACCGGTAAATAAATACTTATCAATCATGGGTAA:1 + chr3L 3776530 3' + roo 9033 1 65.00 AGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCCAGCAGCCAGCGAAGGGTGGCCCAAATCCCAAATATACACACAGGCACTGAGGAAAACATTGCGAGCGAGTAAG:1 + chr3R 14351521 3' + roo 490 1 78.22 TATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTGTGGCAAGGCCGAACCCTTTGGCCGCACCGTTGGGCGCCA:1 - chr2L 12810803 3' - 412 219 2 65.35 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCCATCAATTCGCCTAAATATTTATGCTTTTAT:1 + chr3L 4637344 3' - hobo 45 1 66.34 TAAACTTTATTTAAATGCAGTTGGGGTTTGGAGATAGGCGCTCACTTACATAATCTGTGTGTAATGCATGAGTGTTGTGGGGTGAGTCTAGTTGTTTGGAA:1 + chr2R 23760580 3' - gypsy3 476 1 69.31 AGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTGCGATTATTTCCCACGCGGGCACTTAAGGCATAAAGAGCAATAAATTAAGA:1 - chr3R 28203625 3' - hopper 952 1 52.48 ATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACAATCTTTCTTGCAGTGTATTGCGCTGGCTGTACTGCCTTGTTTGTTTGGATG:1 + chr2R 9624224 3' - I-element 5262 1 57.43 GGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTGTGTGCACTCACTTTTTATTCGC:1 - chr2R 10452391 3' + copia 68 2 77.23 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTTTCAGGTACGCACGCACACACACAGAACGCGCTC:1 + chr3L 20197848 3' + 297 6940 2 65.35 ATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCGTCGTTCCCAAGGCAAAGCTCGAAAGCATCGAAGAGCG:1 + chr2R 6107871 3' + Idefix 6985 2 79.21 TCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCGGCTTGTTTCGTATATCGCATTGCATATCGCGTAT:1 - chr3R 25565836 3' - Burdock 290 1 63.16 GAAGACTGTGGAATGCCGAAGAAAAGAAAAGATAAATAAAATAAAACCGAAAACCAACCAACTGGGTTTCAATATGTTCTAAATTCACAGCGGAAAAAAC:1 + chr3R 22580416 3' - Doc 3 1 77.00 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAGTTTATCGGATGAGTAGATCGTCTTTTAAATCATGACCATACAGAAAC:1 + chr3L 23090555 3' - 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pogo 39 1 69.15 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATTGAAATGTAATGTCAGTCCGTAACTTATGCAAATGAATTGGCAATTCTGTTAAATTT:1 + chr3R 14906906 3' + hobo 2934 1 68.97 CTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTACATTTAAATCTATAATTTACAACGTTTGTTAAATGTTTGTTAAATGTCGAAATAAGTGTGGCACAAATATGGTT:1 - chrX 12401774 3' - I-element 2 1 66.34 TTGTATATTTGTATATTTATATTTATTGTGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATAATTTATTGGGTTCAACAAGTAGTACGGTAT:1 + chr3L 24104303 3' - Stalker 91 4 74.26 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATAAAGGCCATAGTAACAAAGAAGCCGCAACGCAAGTCGTAAAATGCATTGCATACTTTCT:1 - chrX 10824015 3' - jockey 4687 1 61.39 TTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATGATGTTTGTTCTTGCTATCTTTAAGCGCATGTTTGTTCCCCGTTTAAACTAAGTTT:1 - chr2L 16723617 3' - 1360 3144 1 60.40 GCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCGTGTTTCGTGTATTTGTGAGTGGCTTCCCTTGCTCTTCGCGCTTCCTTTTCAA:1 - chr3L 18852074 3' - accord 185 3 57.65 ATTTCGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTTACTTGGAAGCTCCTAATCTATTGTAATTTACTAGCACATAACACATACCAAAAATTTGTTTTGGTTCC:1 - chr3R 3855261 3' - Idefix 7072 2 71.29 CTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGAAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGTCCACTAGTGTATGTATGTATGTATACTTTCGCCTGGCGACATAAGCT:1 - 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BS 5018 1 46.53 GTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCTTTGTGCTATAATTAGTAGTTAAATGTGTAAGCTAATCTAGTATAATATCAACA:1 + chr3L 22112717 3' - I-element 189 1 56.44 CACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAAATTATATGCAAATCCACAGTGATGAAAAAATCCCT:1 + chr3L 8085648 3' + Doc 4489 1 65.35 TTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTAACTTTGCTGGTTATGTTTTTTTTTAACTTT:1 + chrX 8642312 3' - TAHRE 47 1 50.50 TGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAATACCTTTTTTTTTCAAAGTTGAACCATTT:1 + chrX 4975316 3' - F-element 4240 1 71.00 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACTTGAGATGGCTTTTATGGTCTTCCAAAGCTTGCAGCGATAGAAAA:1 - chr3L 19202016 3' - 1360 27 1 56.00 GGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAAATTTCTTCACAGAATGCGCTCGTTCATCGAGGAGAACGAGAAAAATGATCCG:1 + chr2L 9291074 3' + Doc 4418 1 55.45 TAAATAAATAAATATATAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAATGGATACTGCGATTTATAGCGCAAGAA:2 - chr2L 15019857 3' + Tc1-2 479 2 75.25 GTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATCCAACTATGTCAGTATTATATTATTTTGAAAGAAATTGAATTATAAGGTATGCACACTTCATTACCATAATGAA:1 - 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chr3L 15436572 3' - 1360 487 1 62.38 GTTTACATTTAAGAACCTATGTACTCTTAAGAACAAAACACTTATGTACAAAACAGAGAGCTAGAGGAGACTTTATTAAAGAGGTAGACGCTGCTGCGATG:1 + chr3L 10554952 3' + Tirant 8302 2 72.28 AAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCATTGGTGCCACGCCTACACTC:1 - chrX 21667973 3' + Tabor 486 1 73.27 GATTGCTCATCTCACATGCGAATGCACAGTTTACAAAAATCAACCCAACTGCAGATGTAACATTTTGCTAACATACTTTCGGGGGTAAGACTTTCAC:1 - chr2L 901731 3' - jockey 9 1 76.29 AGATCAATCATATCACCGTGTCAGCGTGGTTTTATGAAACGCCGTCCTTCCGACACTATCGTTCCCTGAGCACAAATCCAGAGGCAAGGAAGCTGGCACG:1 + chr3R 22695801 3' + Q-element 187 2 65.00 TTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGGAATGGATGGGAGGGATGTTGGTTCTCCATGTTTATGGATGGTTTTT:1 + chrX 1018439 3' - transib2 33 1 57.43 TTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGT:1 + chr3R 14049425 3' + transib2 2801 1 54.46 CTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGCAGGCAGAAGAAGGATCTAGCCATGTCCGTCTCCCATTTTCTCTTAATTTTCGAACTTGAAAGCAAAACCTGCT:1 + chr3R 19758333 3' + INE-1 12 1 55.45 GTCGTCATTACCTTCGTACCATCGGCTACAGGAGAGTCAAGCGGATTCCATTTCTCTGGGGGAATCTTCGCAGCAAATATTTGCCGAGGTAAATGGCTGTA:1 + chrX 17614866 3' + Bica 4675 1 66.34 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAAGCAAAAAGTCCTTGGTTGGAGGCACTCAGAATGTCTTCTTAAAGTTAAC:1 + chr3R 12058693 3' + roo 9045 1 53.47 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATCAAATACTACGGTGCTCGGCATTT:2 + chrX 4784559 3' + hobo 2886 1 74.26 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGAGCAAGTGAGGCACTGAATGAAATGTAAAAGCTATTAACTCCCTAATTTAGTTCATA:1 - chrX 9048633 3' + Tirant 8485 2 58.42 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTCTCAGTGTATGCGTCCTGGTCAGGTTGTCCTTTTTTC:1 - chr2L 17168440 3' + flea 4979 2 65.35 ACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCATTCTCATCGTCGATCAGGGCGTAGAAGTGCAGCTCGAACTT:1 + chr2L 13445298 3' - Quasimodo 7054 2 63.37 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTTTCAAATTGTTTTCCAACCTGGAATTTTCCAAACAGTGCAATATTCGAGCAGCAAA:1 - chr2R 22521797 3' + roo 9054 2 61.39 AGTTTAAAAATCTTAAACATAAATGACTTATCCCTCTCTTATTTACTTGTTTATTTCGCTCAGTGCAGCCAGCGAGTACATATTCACGCTTTTGTTTTCCT:1 - chr2L 17656440 3' - F-element 4618 1 79.21 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATAGATTATATTATTTGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATACATAAAAAATTTTACAATTTGC:1 + chr3L 27864791 3' + roo 400 1 71.29 AGCTAAATGATCCGCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAACAAAATGACGTGGGAGCCCAAGAATCGCACAGATGACGATGATGACGCCTTGGTGTCGGA:1 + chr3L 12594434 3' + Tc1 464 1 61.39 CCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTCGTCCAATGTGCGTTCTCCGCGTTCCT:1 + chr3L 13701725 3' - Transpac 5201 2 73.27 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATAAAGTATTGATATTTATTTCCATTTTAAAACAATTGAAGAGGATTCTTATGTA:1 + chr2R 9559251 3' + opus 7485 2 63.37 AAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATTGTATCTAATACAAAGCGATCTAACTTATTTTTAAATTTCAGCACGGATATTCTTTAAT:1 + chr3L 7412503 3' + invader3 5446 2 55.45 TATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCTCCAGAATTACCACCGATA:1 - chr3R 4983004 3' + hobo 2855 1 81.19 CACGAAACCTTCGGCTGCCTTTGACAGGTGGTGCTCTTTGGCCCATGCTGTGTCCCCATCTGGATTTGTCTTTGGTATGGATTTCTTTTCATCCTCTTCCT:1 + chr2R 11827769 3' - Osvaldo 1338 2 54.46 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCCGAAGAGCGCATATATGTGCAGGAAGATGTTAACATTCATGTGCTACATACAAACTCGCCTGTA:1 + chr2L 17986076 3' + jockey 4979 1 66.00 ATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGCGTCTTATTGTGGCGCTTACCAAAGCTGGAGGTA:1 + chrX 15139085 3' + Juan 39 1 66.34 CAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGTTTACAATTTTGTCATTCCCTGACTTGCATTTCCGCGGGAGTCCTCTCGCTAATTAGATTCATGACAA:1 - chr2R 8537816 3' - flea 4762 1 72.28 TTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAATGAAAGCCTACAAAATATACATAATGGAAAGCCGACATAAACTAAAGGCTTATAGACTAACTATCTTTGGTA:1 - chrX 11463589 3' - flea 4757 1 69.31 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATCCCTCCCCCCTCCCCTTTAATCCCACTCCACTTGGTTGC:1 - chrX 12818830 3' - roo 8697 2 59.41 ATTTTTATCTTTATTAATAAAACTCAAATGATCAATGGATTTGACTTGCTAATATACTAATACTTTTTGGACAAAAGGAAGCACCTGAGATGGCAAACTCT:2 - chrX 3260364 3' - 3S18 347 1 72.28 CTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTTTGTCAGCAATTTTTTCAATAACTTTTAATGCCAACATATATCATGA:1 - chr2L 16378977 3' + I-element 5067 1 53.47 GGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCAAGTTCAATTTAAATGACTGCGGCAGCTCAATTGAGTTCCA:1 + chr2L 5210445 3' - accord 34 2 63.37 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATGCATGTCGTATGTAAAGCATTTCAGCGCATGCAAGGC:1 - chrX 18768146 3' - opus 145 4 63.37 TTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGATGTGACGAGATATAAAAAAATTAA:1 + chrX 7061999 3' - 1360 3252 1 78.22 GATCAATTGGCACCATGCTAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTCCATTTCAAATGAATACATTAGGATCAATG:1 - chrX 18135841 3' + 1360 269 1 70.30 TTATTTTAGTTTGTTTTGCACTTTTTTTGTGTTCGTGGGTAATGACTAACGCACTGTCAAATGCCGCGCGTGGCCAATTATCTAGCCAAGGCTCACTTGCT:1 - chr3L 6037173 3' - gypsy2 419 1 57.43 GCAATGCCCCGAAAGAAGGCCAGTCAAAATGAGCACGGTTGTAAATTCATTTGTTAAACGATGCGCTCATAAAATTTGCGCCCTTTTTTTTACGGCCCCAA:1 + chr3R 13938241 3' - baggins 5133 1 68.32 TATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTACTTAAAAGTGAA:1 + chr2R 2092803 3' - Doc3-element 72 1 53.47 TTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCCTT:1 + chr2R 2994311 3' - gypsy8 113 2 47.52 GTAAAATAAAAAATAAAAATAATATAATTGAAGGAGGTGTATATTTCATAAGATAATGTTAAGTAACGGACTTAAAGATACCTAATCTTCGAAGTTCGAAT:1 - chr2L 1303862 3' + F-element 4684 2 75.25 GGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 31 2 53.06 AAAGTCCCGAAATTGTCAATATTTTCTAAAAAGACCTGGGCAAGCAAGTTTTGTAGCTTATTGAAATTTATTGAGATTTATACATAATCTGTGCGGCGTCT:1 + chr3R 31949074 3' + HB 247 1 76.24 CCAACAAGTTCAATTATTTTGTTTACAAAAACATTCGAGCTTTTCTCTCGAATGTATATAGGTGTGGGCTTTGGCTTCTTTTTGTCCCCTTCATCAGTGCT:1 - chr3L 25552477 3' - Fw3 27 1 84.16 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGAGCGATTAAATATTGGTAACATATTTCAAAA:1 + chr2L 7745953 3' - I-element 45 1 67.33 TAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTCAGCAGTAATTCATATTATATTGTATATTAGT:1 + chr2R 13805726 3' - Ivk 5357 1 67.33 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCAATGATTTTTAACTTGTTTTGACGTTCTGACATCATAAAATCGCGCTTCACTTCTGTCTCGCGAAAATTC:1 + chr2R 15451655 3' - roo 8669 2 72.28 TTTTGGCGCCCGAACAGGGACCTTGGGAGTGGGATCAGCAGTGGGTATTTTTGTGGAATCGGTGGTGCCGCCGAGGTGGTTGTGCCTGGCATGGGGTCCTC:1 - chr3R 12336853 3' + HMS-Beagle2 329 1 57.43 TCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCCCAATTTGCGTAAACATTTATTACGCACTCCAAGGGAAACTTTTCTCGAATAATTTTCTCTCAGCTATTC:1 + chr3L 5198917 3' - invader2 4989 2 77.23 AAAATAATTTTCATTGAGTTCTGAAAAAAAAAAAGAAAATTATGCCTCACCCTGTAGTTGCGCTTGATGCAAAAAGAGGGGGGGGACACAAGTTATTTTTT:1 - chr3L 23571425 3' + mariner2 861 1 72.28 TGCAGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAGCCATTACTGCGCTATATATCGACTATGTGTACGATTTCACAACGATCTGCTGCGAGTTTCG:1 - chr3L 3326575 3' + P-element 2874 1 64.36 CTGTTGGGTACATCTGGAGTAATGTATGTTGTATTGGGGTACTGAAATGGGAATTCGGGATGGGATGGCGGAACAGGAGGATGTTGAAGAGCTGAAAAGGA:1 + chr3L 10828107 3' - Idefix 86 2 74.26 ATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTGATTGATTGACTGATGAACCGAGCGGGGAAAGTCGAAGTATAGTGACAATAGAGGAACTTATT:1 - chr2L 13713856 3' + accord 376 2 68.32 TTTGTCTCAAGTTTGCGTTTCGGTGCCTAAGTAGTTTATTTGTCTGTTTTTTATGCACCGTCGGCAAGCCCGCACCGCCACCCATCATCGTGTGATGTGTG:1 + chr3R 7868094 3' - Porto1 4477 1 59.41 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCACATCTGTTAAAAAAAATAATATTGCTAATAAGAAGTATGAAGTTCGTTTCA:1 + chr3R 7869759 3' + jockey 4960 1 60.40 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTCGAGTGGCATGTGGCACATGTGCATGAAAAATCGCTTTGCATATTTCTTGGCGCGCACTTCACATTTCACTTGGAG:1 - chrX 6144299 3' + hobo 2906 1 80.00 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGAGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCAACAATACAGAAGAAAATAA:1 - chr3R 20396535 3' - I-element 34 1 52.48 TGCATAACGATCGAAAACTGACTGACTGATCTCTTCTTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGATCATGAGGAACTTAATTATGCAAAAACACGACA:1 + chr4 828352 3' - invader1 3916 2 65.35 AAATAAAATCAGTTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAA:1 - chr3L 11367504 3' + roo 368 1 63.37 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCATTACGTAGCACACTGATATGCGACGACAGGGCGTAATCAAG:1 + chrX 12890977 3' + pogo 2074 1 54.46 ATGCAAGTTGTCAATAGTATTTTCACATGTTTATTGCGCTTCAAAAGTATTTTCACTCAACTTAATTTAGTAAATTCAGTTAAATAGGATAAATAAAAGTC:1 + chr3R 19127398 3' - Bari1 1509 1 75.25 TATTTGTTTGTATTATATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACAGTCAATAC:1 + chr2R 4023390 3' - Doc2-element 82 1 53.47 ATTATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCA:1 - chr3R 6769710 3' - mdg1 42 2 58.42 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTCAAAGTTCCTCAAAGGACCTGCCAAGCATGACGCTGCGGAAATCCCTGCAGGCCGGTAGTTTG:1 - chr2L 7767104 3' - hobo 14 1 66.34 TGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTGGAAATTGTTGTGCTATTCCGCTGATTCATTTCACTTTGTGAC:1 - chr3L 7742870 3' + Doc 136 1 57.43 AGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTTGTATTTCCATTGTTTTAAACCAA:1 + chr3R 27926621 3' - I-element 56 1 81.19 AGGCGGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTCTTTTTGGTTTTTTGCGGCGCCCATCAATCACCAGCCGTGGAATGTGTGACACACATTAAACGTAACG:1 + chr3L 10565379 3' + pogo 2099 1 75.25 AAGGGAGGGTAAACAAAACACAAAAACTTATGTGAAAATAATAAAATTAAAAGGAAATTTTCTGTGGGCTGGCCGCCGTCGAACACGGCGTATGTGTGCCT:1 + chr2L 1642125 3' - Cr1a 207 1 81.19 CTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATAAAGGCCATAGTAACAAAGAAGCCGCAACGCAAGTCGTAAAATGCATTGCATACTTTCTGGAGTCGAAAAGTGCC:1 - chrX 10823999 3' - jockey 4671 1 77.23 AACGAGCGAGAGCCGGATTCTAAGTTGAGTACCGAAACTACAGATACCTTAGGAATCAAAACACTTCTCCTACCGTTACACGCTACAAATGATGGTTAGAG:1 + chr2L 22356883 3' + Gypsy12A_LTR 2196 1 45.54 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCTAATCAATCGTTTATCTAAGC:1 - chr3L 11625576 3' + roo 355 2 84.85 AAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAATTTTCTCAATTCGGAGCATTCAAACAAATTCCTATTTACTTCAAAAATAATTAACGCGATAAA:1 - chr3R 9888876 3' + jockey 4894 1 69.31 GAAGTGAAGTATTTTTTCCGACTAAGAACACAACAAACCAACAAACAAAGCTGGCAAACAAAATAAATGTGTAAATGTGAAGAAGCAAAAAACTGGCAACA:1 + chr3L 17182257 3' + gypsy4 459 1 56.44 ACCAAACAAAAATAATACGACTTTGACTAGGACACACAAACAATGGGCCAAGAATTGGCAGCAGAGAATTCAGCAGGATGCAGAAGAACGCAGGAGGATGC:1 + chr3R 28269640 3' + I-element 4927 1 65.35 TTGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTTCTCCGCTTGATTCGCAATCGCGTCCTGCGCCGCTAGCCTCAGTCG:1 - chr2L 16682796 3' + invader2 4778 1 52.48 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACATACAGGGGCTGACATAATCACAGCTGGAATGGGAAACCCA:1 + chr2L 19083428 3' + Tirant 8474 2 62.38 TATTGTTATTATTATTATTATTATTTCAATGGCTTCCAGAATTCAGTGCCTTTGAAGCAGTTCTGTGTTTATATTTGGAGAATGTGCGGAATTGTGTCAGT:1 + chr3L 15074037 3' - mdg1 7057 2 68.32 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAG:1 + chrX 10629251 3' + P-element 2840 1 32.00 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACCGAAACGCCAACGGCTTGGAGCACAAGCTCC:1 - chr2L 9437438 3' - P-element 26 1 46.51 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAAGTTTTTGCAT:1 - chr2L 3988531 3' - I-element 45 1 58.42 CGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACACACCTAAAACACCATATGCCATAAGTTTTCGCACAGTTGATAGAATTTTGTGTTTGGTTTTATTTCGATGGTA:1 - chrX 13882226 3' - jockey 4988 1 75.25 AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTTAAATTACGCATTTTAATTTTCGGCAATTGAGTTTTGGAGCTACTTATGTAGATGTCATGTGG:1 + chrX 7335166 3' + Tirant 8497 2 70.30 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATATATAGAAATTCAGAAACGATACAAAATATGGAGTATAAAAATTTAAATGACT:1 + chr2L 17066886 3' + copia 234 1 58.42 TTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATAAAGGCCATAGTAACAAAGAAGCCGCAACGGTCATTTGGCCTAAATGCGGAAATTATGAAGGTTCGTTCCTT:1 - chr2L 11477356 3' - jockey 4674 1 52.48 TGGATGTTTACGTTGAGGAGAGCCTCAGAGAGAGCAGACGAAACTGCTAGGTCAGGCTTGGGTTTTTGGCTGATAGCGAACGAGAGATACGAGTATCCGAG:1 + chr3L 18769033 3' - McClintock 90 2 61.39 TATAGTTCCTGAGATCTCGACCTTCATACGGACGGTCAGGATCAGACTCTATTGATAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - INE-1 144 1 57.73 GTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAACTTTTACCTTATCAATCGAGCAATTCTTCGTCATTGCTTTG:1 - chr2R 3293726 3' + 1731 300 1 63.37 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGCCCTTTTTTTAGTGTCCTTTCTCCCG:1 - chr2L 11805031 3' + P-element 2839 1 29.70 TTATACCTCAAAGAAAAGAAATTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCTGTATAAATCTTTTTTTATCGCCCCA:1 - chr3L 9167872 3' + Ivk 4916 1 72.28 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCGCTGACACAGATGGCGCCCGAACAGGGACAGGTGGCTGCC:1 + chr3L 4051115 3' - pogo 36 1 60.40 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATTTTTAAAATGACACTTTTATTGTCAAGCTACGCTGAGTTTAGGGAATTTTTAGATTGGGCTCAC:1 + chr3L 5490165 3' - 297 6588 2 72.28 TGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATTAAATATCAGTTAAGGCGTGTGATTAAAGCAATCAGG:1 - chrX 8662103 3' - 1360 3208 1 64.36 GCAAAGGTAGCCCTGGCCGGCTAGACATCAGGATCGTCCTCTTCATTTCGCGCACGTTCCAGAAACGGTGGTCTATACGGCGCTGCTGCGACTGCCGGAAT:1 - chr2L 3337662 3' - Max-element 8194 1 66.34 CCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAAATGTCCAAGAAACAGCTGAAGT:1 + chr3R 22677391 3' + 1360 3196 1 78.22 GCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCATTAAACAGCAAAATCATAAAAATCAAGAACCATAAAGAAGTGGTCGCAAAGGAGCGCCA:1 + chr2L 7898475 3' + I-element 35 1 61.39 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATGTCCGCTGACATTAAGGAGC:1 - chr2R 14204697 3' + opus 7446 2 81.19 AAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCATTCCACGACCACCCAGTAATAAACTCCAGAATGTCCACTCAGCAGCATTCGACTGTGAATCCTCG:1 + chr3L 12685933 3' + Stalker 103 4 75.25 AGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTACTTTAAAAATCCGGAAAATGAGTT:1 + chr3R 13161829 3' - McClintock 230 2 76.24 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGGGATGCCCGGGAGTTAACCAGCCATTAA:1 + chr3R 20170501 3' + hobo 2891 1 73.27 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTGTGGTATGTGTAGTGTATGGTAGTGTGCTTTGTAGCTCTGGCTTATTTGGGT:1 + chr2R 356111 3' + 1360 3366 1 57.43 CAGACACACACACACACATTCAGTGCGCGAGGCAGGCAGACACACAAGCAAGCTATACAAACACAAACAGTCCATACAAACGTGTGCCAGAGGGAGAGGGC:1 + chr2L 1668781 3' + accord 186 2 57.43 AACTCGCAACGGCATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGCTACCATGCTCCGGCAGCTCCAGCATCGTCGTATTCAGCATCGGCTGGTCCTTCATAT:1 + chrX 2276728 3' + X-element 4372 1 57.43 CATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCGTCTAATTGAATATTGAACGAGGCTTTTAGTGTTGACTTTATTAGCGTTGCCA:1 - chr3L 9324618 3' - Quasimodo 38 2 74.19 TCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATAAGGCCGACAAAACCGAAAATTATATTATTGTAATCTAGTAGAGAGCAG:1 + chr2L 14061549 3' - F-element 317 1 56.38 GAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACTAAGTTTTTGCATATTATCAACGGCAGCAGCAGCCCAAATGCGTTCATAAA:1 + chr3L 15451835 3' + accord 149 2 49.50 TAGAAATAGCGAAATCTATGTACATATCATCACAAAAAAAATTCTCATATGCTTTCTCTTCTGGCTGGCAATGCATTGGAAAAACAAGAATCGTTCACGCT:1 + chr3R 2465909 3' + 1360 338 1 66.34 CAAGTGCTCAAAATGCTGACCAGAGGTCTGTATAGTCTCCGCTGCAAACCTAACGGCCTGGCGAACATCAGATACGTGACATATTTGTTGCGCAGCATTCA:1 + chr3L 27968655 3' + HMS-Beagle2 6946 2 60.40 AAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAATCGACCGGTAAATAAATACTTATCAATCATGGGTAAACTCACGTTTTATGCAAACAACTCTTA:1 + chr3L 3776557 3' + roo 396 1 66.34 GGTTCCCCAGAGGAAATTTATTCATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTAAATTGTGTTTGTGACGGACTTGAAATTCTCCTCCC:1 + chr3L 2036536 3' + R2-element 210 1 64.36 CACATTTTTGAAAAGTGTGGGCTTGGCTATCATACAAGATTTTTGAAATATATATATTACCCACATAGTTATAAAGCTTTAGTCTGCTAATATTCC:1 - chr3L 19682513 3' - INE-1 256 1 76.04 CACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTATAGATGTTCGCTGCTGCCCCGATCTCTCGGTGTGTAGGTTGCAATTAAGCTGAACATGTTAAAACTAAGGATTAA:1 - chr3L 5733484 3' + 1360 48 1 57.43 TACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGCGATACCTCACGTGTCATTATCTTAATATAA:1 + chr2L 14873599 3' - jockey 4651 1 69.31 CTATGCTGGCGAACAGGGGGGCTTGGGAGCGGGGACACAGCATTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACTATACTAGACTAGAATATACGACT:1 - chr3L 25846819 3' + Rt1b 4723 1 76.24 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATTGTTTTTGTCGACTTCCTAGAGTGTCCTGCAAATGTTTATTATGCACTTGAGCACTTTGCAGCA:1 - chr2R 6041536 3' - opus 7 2 72.28 AAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCCAATTGCTGTATTGTTGAGTGATTGAGCATTTGATTGTTCACAT:1 + chrX 15561704 3' - P-element 2853 1 46.53 TTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCGATGTTAAGCAACCCTTTTTTTTTTTAGCTCC:1 - chrX 7365360 3' + Stalker4 339 4 72.00 TTTGTGCACTAGTTTCAACAAATTAAATAATTCTTTGACATTTTCTGCCTTTGTTTTGAGCCCCTTCTCTTCCCTTTGCCGCTGAGGTTACTCCGGAGTTA:1 - chr3L 1682818 3' + Cr1a 156 1 53.47 AAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAGTGGCTTAGCAACAGCGACGATGCAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + Circe 7146 1 36.63 GCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACAGTGGTTAATATTAATTACAGAAATAATCTGTAAAAAATCAT:1 + chr2L 4888793 3' - BS 5028 1 59.41 TATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAGCTCCTCCCTCCCATCTTCCCAGCGTGCCACGCCCCCTCTTTATGTCGTAAAAGCGGCAACATCCT:1 + chr3R 12336437 3' + Doc 4285 1 69.39 GAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGATTATTTATTTTGTTTGACCCAACGACGTGACACACAAATAATGGTACAAGTACAACCACCTCTTTTGCTTGCA:1 + chr3L 11826704 3' + INE-1 148 1 73.00 GCAAACCCCAGAGTGGATTTGCAGGTTTATGTTGCAGTTTACGGCTGACCGGACTCGTATATGACGAAATTCGCGCTTCGATTAATTTCGCATACTAATTG:1 - chrX 2564129 3' - Rt1a 97 1 75.25 TGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCCTTCCGAATCTGGCCATGCCAAATAATCCCAGCTCAAAAGGAGGGGACCCGGCGGTCAGGGCCAAGGACATTGAA:1 + chrX 354296 3' + 1360 408 1 73.27 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTCATTGGAATGCAAACATAACGCATACGCAGC:1 - chrX 1018384 3' + transib2 2779 1 75.25 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGTGGTTGCTTTACAAGCTCTATTTACCTGCGCACAAATAATTTATTACAAAAAATGATGTT:1 - 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Doc3-element 62 1 63.37 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGATTTCCTTGCAAAATTGAATGCGAAAGG:1 + chr3L 18731687 3' - jockey 4808 1 74.26 CGTAGGCAGGTACTCCATGACCCACCTCCTCCGAGAACTTGACCACGGTGCGCGACGGTTCGCGCTCCTCGAACGGCTCAGAATCGGATTCCAGGTCACGG:1 - chr3R 26566362 3' - aurora-element 3767 1 76.24 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCTTTACCTTATGCCTCTTGACTTTTATCCCTAATTATTTCTCTTGAATGGTTTAACGCAAAAT:1 + chr4 1234609 3' - 412 13 2 66.34 AATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGTAGTAGCTGTTGGTAGTCAAGATGATAAATTTAGTTTGAATAAATAAATGGATGTAATTCACGA:1 + chr3L 18262420 3' - accord 360 2 66.34 CATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAATAAAAAAACATTGCTGCTGTTCTTGTGTATGCTCAACGGTAAGGTTTCTTTATTCGGAA:1 + chr2L 13730812 3' + Juan 4192 1 54.64 TTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATGAGTAAAAACCAACTGAAAGTCTTAACAAAACCGTTTAAATCAAATCAAGTAATGCACATTTA:1 + chr3L 12856796 3' + Doc 4656 1 67.33 TCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCCAGATCCCACTGCCCCCTTTTGTTTCTGGCTTTTCTGGCCGCATAACATTTTGGCAACGCTTTGCTCAT:1 + chrX 12253716 3' + G6 1702 1 67.00 GATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAACTTTTACCTTATC:1 - chr2R 3293754 3' + 1731 4584 1 65.35 CTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAAACGAAACGTCACAAACAAATAAATCTAAGAAAA:1 - chr3L 15635083 3' - Max-element 8279 2 67.33 CGGGACGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACAGACAAGCGGAAAGTTTTTGGGGCGGAGAGAGTTTGGCTATTTGTAGGGATACAAT:1 + chr3R 14027631 3' - 1360 3178 1 55.45 TCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCAACTGAAGGATATGCTATACGACTAGCTATCCAAGATTAGCGAATTAAAATAGTGATT:1 - chr2L 23381107 3' - Idefix 7229 2 63.37 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTTGTATCTCATGTCTGCGTTGCGAGCCAACAAAAGTCAGCTCTCATAATTT:1 + chr3R 20140169 3' + roo 9045 1 53.47 ACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAA:2 - chr2R 19209487 3' - Doc 85 1 69.31 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTCGAGTGGTGGACATGGACATACAGAACAAACAGAGTTGGGTTATACACAAAACTTCACCGACAAG:1 - chrX 6552497 3' - hobo 43 1 74.26 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTTGGTAGGTGCCAAAACAAAAATCCGTTCAATTAAATATATATAGAA:2 - chr3R 11073718 3' + pogo 2074 1 54.46 CCTTTGCCGTTGAGGCCTACTTTTGTTCGGCTGTTCGGTTATCAAAACACAGCGTGCATTTCCGATCACTTCTGTCTTGAACTACCAAATCGAATTAACTA:1 - chr3L 10157574 3' + mariner2 159 1 61.39 ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATTGTTTTTGTCGACTTCCTAG:1 - chr2R 6041580 3' - opus 7167 4 81.19 TAAACATGAAGATCAACCTGACAGATCTCTAAGAGGTGAGCTTCTTTACCTCCATCTGATTTCAGACGGCATTCTAACTGCGCTCCTGTTTCGTCTGATTT:1 - chr3R 23077001 3' + Bica 142 1 62.38 TAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAATTTTTTTAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGCGTTGCTTTCAATTAATTTAACAATAATTCTGTGTGC:1 + chr3L 21853190 3' - 1360 3052 1 63.37 CTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGG:1 - chr2L 14074973 3' - jockey 275 1 78.22 GTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCATTTGATATTGAAAGCATAAGTACGAGGAGCTGGGGCAGAATCGAG:1 + chrX 842341 3' + diver2 250 2 60.42 TTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATTTTTAAAATGACACTTTTATTGTCAAGCTACGCTGAGTTTAG:1 + chr3L 5490143 3' - 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mdg1 28 2 61.39 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATAATATAATATGAAATTATTTATCTCCGCTTCACGCACTTCAGTTGACCTAACCATCTCTGACCGTTCAAT:1 + chr3R 7212539 3' + blood 372 2 69.31 TTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGAAGCGATTTGTTCGTACAAACAGCCCTTTTGCCCATGATGAAATATTCGACATCGGAGTT:1 - chr3R 7473192 3' - X-element 4378 1 63.37 GAATGCGCGTCAAATTCATCTGCGCGTACACCAACAATTCTCTTGACAACATTAATATTTTAAACCCATTTATTGAAATTAACAATTGGAAAATATCAATT:1 - chr2R 4270104 3' + Porto1 409 1 70.30 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGTATACTGTGGCCATTGCC:1 - chrX 16217481 3' + P-element 2828 1 20.79 CCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAACCCCCCCAAAAAAAAGCAAACAGTCAGAAAAAGGAAAGTGCGCAAGCAGAGATGAGTTACAAAT:1 - chr3L 24153730 3' + BS3 208 1 44.00 TTTTTCTGGGATATCGATAAATATTGGGGAATAAAATTAGAAAAAAATGTAAAAATTGCTTAAAAGCATGGGATGACAAGGCCTTGGAGGTGAAACCAGCA:1 + chr2R 17404214 3' - INE-1 500 1 76.24 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATTTGTCTCTTAATTTTTCTTCTGTGCAATTAAGTACTGTATGATTTAGTTTGCCCTATGTATTCAGTGTGGG:1 + chr2R 3032596 3' - opus 112 2 80.20 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACATAAACTTGATGATATGGTATAAGTGCTTTTGCCTCTTCAATGGTCCTTC:1 + chrX 3195697 3' - mdg1 23 2 54.17 TCGCGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCATCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAACAACAAGAAAACACAAATACATATGTGTGCCATGGTCGAACTT:1 + chrX 3018767 3' - Doc 330 1 55.45 ATGCTTGGAACAGTCTTTTTTGCCCGCGTCTCCCAATCCGCGAAGAATTCTGTCGCAAAGTGCAATGCATTTTGCGACAGAATTCTTCGCGA:1 + chr3R 7309383 3' + Cr1a 4028 1 68.48 TCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACACACTCGCACACACAAGCGCAGCGAAAGGCAGACAGAGAGGCACACACATCCGGTGGCCATTTG:1 + chr2L 7166848 3' + accord 231 2 71.29 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAACAAACGCATAAACGAGATCCAAGATCCAAGTCAAGGTGGAAGCCAAAAACCAGGA:1 - chrX 18991516 3' - pogo 19 1 58.42 ATGCGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGCTCGGCTATCACTTTAATAACTTGTCAATATACGTAAAATGCTGGTCGCCGGGGCTCC:1 - chr3L 15452701 3' - rooA 7569 2 60.40 CTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGTTGTTGTCATGAAGGTTATCATCTTAACTTGATGTGGTGTTAAGCATTGTTCTTGCCGTTTGTTCGT:1 - chr2R 19051424 3' + invader4 2708 1 72.28 GTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGACTCTGATGGGCTGAACCCTTTCTTTCTACCAACCTTCGAGTGGTAAGCGGGAAAATGGAAAGGAAC:1 + chr2R 11086944 3' + Doc 80 1 77.42 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGC:1 - chr3R 14049360 3' - transib2 45 1 70.30 CCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCTGTGATCTGCCCTCCTCTTTGAGCAGTGCGTCCACGTTG:1 - chrX 5984919 3' - opus 7411 2 68.32 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGACTGCAAATTTATGCCTTTTGTACAGTCTGAAACTGACTTTCCTCGGGGATACTACAAATACGTTGAAT:1 - chr3R 9081905 3' + hopper 1412 2 74.26 GGATCAGCGGCAGTTGTGCGCGCTTTAGTTAGAGAAGTAGGTTTAAGATTTACTTAATTTGTTTCAATGTTTTCGTTTTGTATTGGACGGATGGTCGTATC:1 - chr2L 19386790 3' - TART-B 10400 1 55.45 ACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTTGTTTTATTCATTCAGTTATTTTGCCATAATTGCTTTCGCCTACGTGCATT:1 + chr3L 20161248 3' + jockey 4759 1 58.59 TGACAACCATACCTCCATATGGAGCTATAAATTGCTTGAAAATTGTCACCTTAACATATCTAGAATTTTCAGCAGCACTAAACACACTAAAAGGTAACACA:1 + chr2R 5617092 3' - BS3 1299 1 58.42 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTTGTATTTCCATTGTTTTAAACCAAATCAAGTTATTTC:1 + chr3R 27926634 3' - I-element 43 1 68.32 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTTATATGAACTGGGTGCACTAATCACCTCAATCCATT:1 - chrX 4056236 3' - roo 8667 2 76.24 TCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTGTTGATGGGAAACATGTTGTTGTGGTGTCGACAGTGTTGCTACTGCGT:1 + chr2R 19538376 3' - G6 1851 1 66.34 AAACGCAATTTGTTTATAAAATATAATAAAACAATATTTAATATAAATATTTGAATACATTTTACATGTGCGCTTCTTGTGTGTCGTAAGCGAAAGTTTTG:1 - chr3R 8831237 3' - S-element 1629 2 64.36 ATATTTATTTACAATGGTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGCTAGCTGGCTTTTTATGTTCATTTTACTGCTTTGGGTGGTTGTGATCGAAT:1 - chr3R 24701049 3' - I-element 5268 1 68.32 CTATAAAAGCGAGAAGGTTCAGATTCAGCATACAGCCTCTAGAGACATAGACCATGTTGCCACGCGCTCCCCCTTAAAAAAAACGCTTTAAACACATTCTT:1 - chr3R 7080288 3' + INE-1 161 1 64.36 GTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTGCACGCAATTACCA:1 + chr2R 6482747 3' - gtwin 23 2 56.44 CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAA:1 + chr3R 14049400 3' + transib2 2777 1 73.00 GCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTGTCTTTTACACCCTTTTTGCATCTGAAACAATCTGTTAACTACCAACCACCGAACCACCAAACCATCAGGCATC:1 + chrX 13033226 3' + blood 168 2 67.33 AATTTGAAAAAAACGAAATTTTTGATTTTCTGCATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTCACTCACTAAACTTAAATACTACAATAATTTTCAATCGAAATA:1 + chrX 20566705 3' - FB 164 1 74.26 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACAGTGTAGCACAGACAGTCAAAAACGCAGCATTGGGTTGTCTGTTTCAACAGCAGCAGAAAGGCAGAAA:1 + chr3L 10554860 3' - roo 2 2 69.79 GGTCGCGCTCTTCCATCACTTTAAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTTATTTGGGGTTTATGCTCGAGTACCCTAGAGGTCAATTAAAAAG:1 - chrX 18333699 3' - Porto1 335 1 56.44 CCAATTAGAGGCGATTTGGAATGGCCGGTACGCCCTCCCGATCTGTCCTCTTGTGATTTCAGTTTTCATTTGATATGGAATCACGATTAGTTCTCTGCATG:1 + chr3L 25485159 3' + mariner2 539 1 62.38 CTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAGCCTTCAACATCTTTAATTAAAAACATATAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' - invader2 4662 1 53.54 ATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCGAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACCTAGCATAGTTCCATCGTCTGGTTCC:1 + chrX 12598504 3' + Quasimodo 313 2 77.23 GCCATAACGAAGGAATGGACGAAACGTAGTTGACCGAGGGAGTATGGTTGGGTAGGTAAGTAATGTTTTTTTTTTCTACTTTTTCGCTCTTATTTGGCTTT:1 + chr3L 2880767 3' - gypsy5 6893 1 75.25 AAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGGGCAACGCACAATTGAGTTCAATTGAAGGCAGAATTGATTGTTTAACCTTTCCCATGGTAG:1 + chr2R 17269804 3' - transib2 1 1 73.03 CGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAGAAAAACACCACCCAACCAACAAGCTGGCTATCCACCTCTGCTTTTGGCCATTGTTTTGTACCGG:1 + chr2R 17346154 3' + hobo 2672 1 72.00 ATTATTATTATTATTATTATTATGCATATTCTTTGTTATTAAAATGAGATTCGATTGCTTCAGGAATTTGGAACGAATGCATATATATGTATGTGAAATTC:1 - chr3R 4230200 3' - mdg1 7065 8 59.41 TAATATTGCATAGGCACATACTACACCCACGAGGTCTGTCAATTTCTGGGCTCTACGCCCCTCGTCCGTTGTCGTTTTATTTTTAATTTCGTCTGAGCGAG:1 - chr2L 16396539 3' - 412 4 2 76.24 GTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATA:1 - chr2L 15019892 3' + BS 5058 1 58.42 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTCCTCGGACATGGCCAGCAATTTTCACTCGATGCATTGACAGGTGG:1 - chr3L 14284971 3' + roo 402 1 68.32 GTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGTATAAGCCCTAAACGAGGCG:1 - chr3R 20869514 3' + hobo 373 1 80.20 GATGGGCGTGGTGAGTTAGTTTATAATTTATATCAGTACACCCATGCAAAAAGTTAGCACACGATTTGAGTTATATATTGGTTTTGATTAAGCCATGCTAT:1 - chr2R 17840614 3' - HeT-A 5914 1 84.16 GAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAATTAATTATACGTAGTCGTTGCCTTAAATGCTTATCAATTAACTTGCTCTTGCATCTTT:1 + chr3L 17664988 3' - jockey 490 1 49.50 CCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACACACATCGTCATCGCCATCGATTCCCCCCTTTCATCTTTGGGAAA:1 - chr3L 13097465 3' + I-element 423 1 55.56 TGCGAATGGTTTACGGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAATTCTCTAATTCAGAAATCCCAAAAATAAAGAAGAGAATCGTAGTTTTT:1 + chr2R 3914418 3' - diver2 4811 2 52.48 ATCTCTTAATGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGAGATAGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTAATGTGTCTGCATCAGGTACTCTCCTCT:1 - chr3L 1189454 3' - invader3 113 2 73.27 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTCGTTTGGTTTTCAGTTCGCTTTCCAGCTCAGTCGCTGTCAGTCGCTCTGCGCGCTCTTTTCTCGACGG:1 + chr2L 9437523 3' + P-element 2883 2 76.24 TTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTCAGCAGTAATTCATATTATATTGTATATTAGTATAAATCTGAATATTCTTTAAACGCCACCTGGCG:1 + chr2R 13805760 3' - Ivk 5323 1 66.34 CCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGTTGGCAACGAACTCTGATTTGAGATTAATATTTACCGTACATTCATCT:1 + chr3L 25936823 3' + accord 7010 2 54.46 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTTCTCC:2 + chrX 16217536 3' - P-element 16 1 63.37 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCTGCCGAATCCAGAGAGAGTTCGGGGAAATGAACTTCC:1 - chr3R 15666050 3' - P-element 39 1 41.58 CTTTATGGTTCTTCGTCTCCTTTTAGTTATGGGGCGGCTTGTAGTTGTTGTGTTCATTAATTGTTCTATTAGTTTTAATTGATGGTGGCACTTGCAAATGT:1 - chr3R 12320004 3' - HeT-A 259 1 56.44 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCGCTTAGCATGCGCCGCTGGTCGT:1 + chr2R 17346033 3' - hobo 8 1 69.31 GTTAAACCAAAGACCCTAGAATAACTATTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTGATTTATTTATTTACCACATCCCTATTTTGCTTTATTTAACTTTTATAC:2 + chr3L 18209355 3' - Tc3 317 1 57.43 GAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTAGCACTAGCCTAAGTCGAACCAGTTATTCTAGTCATTTTCTTTAC:1 - chr3L 15902867 3' - accord2 7282 1 55.45 CACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCGACTGATTACTTAGATCAATGCTATCCCTAAG:1 - chr3L 26380519 3' - transib2 2724 1 68.00 CGTTCGTTTGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGAGAGAGAATGAGTCGCTCATTTGCAGCTAAGCTACTTTC:1 - chr2R 4271889 3' - Ivk 4994 1 63.37 AAATTAAAAAAAAAATTAAAAATTAAAATCTAAAATCCCGTCTGACCTTATGATAAACTTAGAGTTTTGTTTTTCATTCATTTCGATTCTTCTTGGGTTTT:1 + chr3R 26800456 3' + Doc 4699 2 54.46 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAAAATAAAACCCGCAAGGTATGCTCTATAAAATTT:1 + chr3L 13365588 3' + jockey 4951 1 72.28 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTGCGAGATCAGCTGCTCCCGTGCCTGGATGCGCAGGTCAATGGCCGGCTGACCAGTTAGCAGGTGAC:2 + chr3R 28880005 3' - roo 10 2 67.33 GTATACTGTGGTGTCGTCTAAGTCTATCACTATATCTGCTAGTGTGACTGGAGATCTGCTCTTCACGACGAGTCAAAAGATTTAAGCGTTCATTAAGATTA:1 - chr3L 15118548 3' - BS 4864 1 61.39 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTCGGGATTTTACATGCATAATTACGGGAAATATTTATCGCTTAGATACGGCCAGCGA:1 - chr2R 16338085 3' + roo 9036 1 58.42 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCGGGCAACAATACAGAAGAAAATAAATAAACA:1 - chr3R 20396528 3' - I-element 27 1 50.50 AACATTTCGTAAACCGATTTCTGGCCTTTGTCGTGACTCTTGTTAAAATTTTGATTTGTTTCTCTTGGATCGTTAAAGACTGGTTTGTGTGAT:1 + chr3L 10743758 3' - mariner2 731 1 53.76 AAATCAAATAAAATAAAATCAAATATTCCCCTGAATTGATGTAGATTAATATGAACGCCTTATGAAAATTGATGGGTCCATTTTACACAGTTTATTGATTT:1 + chrX 12431284 3' - transib1 1897 1 73.27 ATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTGGCGGGCACTCAAGCGTATCTAACACACCGTGTGTGGCATGCCCCACATGCACTTTCACCTTTAACTT:1 - chr2R 11042182 3' + invader2 4921 2 76.24 GCAGTAGCCAAAGATTCATCAGCCGCACTTCAATAATATCAAATATGGCAGTCTTTTATCTACTTATTTCCATTTCAATATAAATTCGGTTTCCTCATAAA:1 + chr2L 7396735 3' - X-element 350 1 65.35 AAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATGAGGAGAAATAATGAGGTAAGTCTAGAAATATTAATCAGTAGATAAAGATTTATCTAGGATACATTTACGTTGT:1 + chr2L 12648425 3' - INE-1 302 1 51.49 CAAAACGATAACCAAATGGTTAAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCTATATCGATGGAGGCGCGGCCCATTTAAAATTCAAGTGCGTTTTCATTTGGGAACG:1 + chr3R 7512820 3' - Circe 7274 2 57.43 AAGCGGATATAAAAGCAGCTGGGCGGGAGAAGAGGGCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCACGAAGTCCAATCAAAAAAAATTGT:1 - chr2L 21795562 3' + opus 284 2 76.24 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACGACAACGACCGGAGTGTCCGAAGTACGGGTGCGGATAGGCG:1 - chrX 2797077 3' - Doc 57 1 59.41 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATGACTTTTTATATACGATTAATTCTAAAAAAATAATTAAAA:3 - chr3R 21998393 3' + 412 7511 2 59.41 TTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATTATGAGGTGTAATCATTGCTGGATTGGGTAATGCACAAACTTGACCCACT:1 + chr2L 9333060 3' - hopper 1193 1 55.45 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCTAACTAAAAAAATTATGCAAAAGTAAATTATCGACTAAATAAGAGAAATGGAAGAAATGAA:1 + chr3L 25971495 3' + copia 242 1 66.34 AAAATATCATTATATAAGAGAATTGTATAAGAACAATATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACATGATGAATGCAGTGGGCATTAGAGGAAGG:1 - chr3L 14256064 3' + Dm88 4138 1 76.00 TTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACTAAATTCCTCTTGGCAGATAAAAGTTGTCGGCCATTTCACGGCGCAGTGAGCTCGG:1 - chr2L 7168541 3' - Bica 81 1 64.29 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCTAATGGCGTCAGTCTTAAATGCCGCCACATGACACGAATGCGTTAAGTCGCTTGGGGTTAAAAGGT:1 + chr3R 23243947 3' - jockey 13 1 62.92 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATCAGGAGCAGAACGAACTTCCTGCTGCCTGAATGCGCCTGAGTCAATGCAGCT:1 + chr3R 29661751 3' - 412 21 2 59.41 ACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAAGTTTTTGCATAACAAATAAAACGAATCAAATTAAGAGGTTAT:1 - chr2L 3988499 3' - I-element 13 1 76.24 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTTGCCCTTTAGGATTTGCGGAATATACATA:1 - chr3L 9505836 3' - P-element 47 1 33.66 TGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATTAATGCATTTAATACTCGTACTCGGTTACATTAATATACGAGTGAGAATCCTTAAGAACCTTATGCTCA:1 - chr3L 7412395 3' - invader3 5194 2 65.35 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAGGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAAATGTCAGCCAAAGTATTTCGCATTCATAA:1 - chr2R 16980064 3' + opus 458 2 68.32 GAGTACCGAGTGTTGATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCATTGCACATGCCAAGTTTCAATACCAACAGCAAATATCA:1 + chrX 19820034 3' + hobo 2902 1 64.29 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAGTCTTAACAAAGCAGCTGCCAG:1 + chrX 17283993 3' + roo 356 2 76.24 ATATTTATAATTAGGATTTACATAGAATTTTTGATCTTGAAAGCTGCTGCAGCAAAGCAAACGAGGGAAAATGCGCTGCAGAGGGGCTTGCTGGGAAAAAA:1 - chr2R 12253591 3' - transib4 2566 1 63.37 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTGTATTTCA:1 + chr3L 11257428 3' + 1360 3386 2 76.24 GAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTGTCAATTCCTTTAAGGCCAGAAGCGCCAAACTATCT:1 + chr3R 4796312 3' - 1360 3256 1 64.36 TCCGAAAATCAAAAATTTCACTTTTTTCAATTAACTAACTGCTTAACTATCAGACAGTATAGCAATGCGCCTCCATAAAGCGATGCATCGAGACATCCCAA:1 - chrX 8759118 3' + FB 153 1 66.34 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATAATGATTTATTTTCAAAAACAATTTTATTACTTGGATGAAAGTGATGTGCAATACATCAAAATATC:1 + chrX 14521745 3' - roo 8673 2 58.42 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCACAATTTCTAACTCCGCTCTCCCAAGGTT:1 + chr3R 21969108 3' - hobo 48 1 73.27 GATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGCTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATGCTGGAGGGGAAATAGAAAGAGGATTTGGGCTGTGGGC:1 - chrX 15484975 3' - Idefix 439 2 60.40 TACATATATATATATACATATGTATGTGTGTGTTTGAACAACTTCTAGTTTGGTTTTGTTTTTGCTCTGTGCAAATCGGTTGGTGGGTCACGTATTGGAGC:1 + chrX 8222594 3' - Stalker 247 4 56.44 CGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACTCTTATATGTGTATTTTTTGGTTGCATTTTCTTGTTTTGTGTTCTGACC:1 + chr3L 4580489 3' - Stalker4 7238 4 62.38 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACAACTAATAGGTGCGTAAACGATGTTTTCCACAGCATACTTTGCGGCGAC:1 - chrX 5275509 3' - jockey 4692 1 55.56 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAACATACTAGTTTCGTCTGTGGCTATTGACAAGCAAGAGACAGCTTGGATA:1 + chr3L 20286680 3' + mdg1 7430 2 53.47 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCTTTACCTTATGCCTCTTGACTTTTATCCCTAATTATTTCTCTTGAA:2 + chr4 1234593 3' - 412 29 2 54.46 GACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTAT:2 + chr3R 1977617 3' + micropia 5406 2 57.43 GCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATTTAAGCCTTGGAGCCAAATGCATTTTACTTAGCATTCGTTTTAAAATGCAAAAAAAAAAATAAGGGAAATCC:1 + chr3R 16394178 3' + invader1 402 2 78.22 GTAGTGTATGTGTGTGTGTGTGCCGAAGAAAGAGAGGGACACAAGGAAACAGGTAGTAAATCTACCTTTTGCGGCTGACAGCTTAACGCCTTCAAATCATA:1 + chr2L 9834774 3' - Quasimodo 40 2 79.21 GTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCACTCAATGCAATTGCGGTATTTATAATGCAGCAGAACGCGTTCGATGCAGTTCGTTTTGCTTCCAGCGATTTTCGG:1 - chr2R 15451529 3' + roo 9070 1 77.23 CGCCAGTAACAGCAGCGTAGAAATCATCCAACGAGCCCAATCGAAAACCCTAAGTACCATCACCGGCGCACCGAGTTCCTTAATTGCGAGACAGGTAAGCG:1 + chr3L 15756663 3' + Fw2 3577 1 72.28 ATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATTTTGCTATCTCCAAAGGCATAGGGCAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' - G2 448 1 33.66 GAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAA:1 - chr2L 3988541 3' - I-element 55 1 68.32 TATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGAAGCGTTGCAAATGTGCCTTTTTCCTCATCCATCTTAGTTTTTACTTAAAAGTGAAATAT:1 + chr2R 2092807 3' - Doc3-element 68 1 57.43 AGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCGCGAATTCTCAAGCAATCAAATATTGTAATGACTCCTAAAAATGGAAGTAATT:1 - chrX 5865600 3' - opus 105 2 54.46 GTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATAACACAGCTACCAAATGAAATATATTCCACACAATACATATATTAA:1 - chr3R 3920675 3' + 1360 3359 1 69.31 CTTAAAACGGACTTGTGTTGTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCTAAAGAAAATATAATTTTTGACTTATTAATAATAATTGCAGTCTATCCTTGCGGA:1 + chr3L 14886279 3' + 412 473 2 58.00 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCAACAATACA:1 - chr3R 20396546 3' - I-element 45 1 65.35 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAGCGGAACACAAACGCACACAGGCACACTTGTTTGCCAGCCCAA:1 + chr3R 18448999 3' + hobo 2910 1 56.38 GCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAATTATTCCTACGAAAATCCTTTTAAATAATTTCTTATAAGCTGTTAGCTCAATCTGAATACA:1 + chrX 4412098 3' + I-element 5059 1 74.26 GAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTACTCGAATAACCCGGCAGGTATATGGAAGAACGTGCTCTTACTGGCGGCAATACGTCCAGGAAGCCATCAACAAA:1 + chrX 5378337 3' + Stalker 7161 4 78.22 TACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGCGTCACACAAGCGTCAGTTCCGCATGAAATGTGTACTATGTGCAAATATGTGAGCGGGAAAAGGGAA:1 - chr3R 27435011 3' - jockey 4651 1 68.32 CCACGTTGGGCGCCAGTTAATGTTGCTTTTTATTGCAATTAGAATGTTTTGGGGATTGTAAGTTGAAGCCGGCAAACAATAAACCGAAACAATGCACTCAA:1 + chrX 10128990 3' - gtwin 488 1 70.30 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTAACTGTTCGTTGACCTTAAAATATTTTCACAAACCTTTTGGCCATTTTGCATACATCTATATGCAGGGCTCA:1 + chr2L 1795832 3' - copia 4873 2 50.50 TTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAG:1 + chr3L 19339421 3' - Tc1 34 1 53.47 GCCGACTTTCATAAAATAGGTTTTGTCCAAAAAAGGGGTAAATTTCCACATAGTGCACCCTACCGCAAACACCCACACTAAACTTTGTAAGCGACCCTCGT:1 - chr3L 19125973 3' + Transib-N1_DM 459 1 78.22 CAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTCGCATTAATGGGAGCATCTGCATATATAGATGATTTCATAA:1 - chr3R 26871034 3' - hobo 35 1 60.40 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTATGTTACTAGTTTTTTGTTTAATTTTTCTATTGTCCGGACAAAATGACTCTC:1 - chr2R 9865501 3' - jockey 31 1 56.44 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCATTACATTAGCGTTAAATGGTGTTAACTTACACACACATACACACACTTCGGCC:1 + chrX 12276842 3' + hobo 2927 1 64.52 TGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTAAGTCATTTGACTTAATGGAAGTTTCAAATAGTTTCATGCCCAAGACGTCGGCAAATTTATGGTCA:1 + chr2R 3171007 3' + 1360 199 1 40.59 AGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGTTCTTATTCTATTGTTGCGCAGAAATGTTCGAATACCGAATCGTGTATTACA:1 + chr2R 1076546 3' + FB 282 1 67.33 ATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTCTATTTTACTTTCTTCTCTGATTTTTAGATTGACAAGTTTAACTGCGTTTTTGCTAAGAATTTATTGCCTTGAT:1 - chr2L 1657502 3' - Doc3-element 4512 1 56.44 CTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCCCCATTTCAAACGGTGTAAAGCTCTTCCTTCGTAACACAGACAATGGGCTCGGCGAAACCAAATTCACTACAATAC:1 - chr3L 25310192 3' + Doc3-element 432 1 57.43 ACATAAAAACAGTACAACTACACATATATTACATATATACGTTAAAAACATCATACCTTTCGTTCATTATCAATTTAACGACATTAAAAATAACTCAAAAG:1 + chr3R 14049047 3' - transib2 324 1 58.42 CAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAGAAGTAAAACCAAAAAACGTAGCAAATAAAATAAAAGAACTCCAGACAACGATGCAGACGACGAAG:1 - chrX 4467163 3' - copia 4746 1 75.25 TTTTAACACTGGTCTGAAACTATGGTTTGTGTCGAAGATGTACATGTTCCTCTCTTCCCTGTCCTTCCTCTCGCTTTTTCCCTTTCTTCTCTTTGAGGCTG:1 - chrX 5735581 3' - gypsy6 478 1 58.42 TATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAAGACTTCAATTTTCCTAGTTTCTCAGCTGTAGCATACATTTAGTTGCGCGCTCTAATG:1 + chr3L 5267291 3' + Juan 4200 1 62.38 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGAACAATGAAAATGCACTGCCGAAGG:1 + chr2L 19629670 3' - hobo 50 1 76.24 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCCTGCCGCAGCACGTTTTTAACCGAAGCGATCGACGGCGAATTTGGCGGCGAAGAGAA:1 - chr3L 9763483 3' - P-element 19 1 60.40 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACACCTGATTTTCGATTGACGTGCAGCT:1 - chr3R 9606224 3' + roo 360 2 76.04 ATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTTAAGATATAATCCATTTGTTGAATTATTTTTTTTATTTTCTTATTTAGTTTTAGGCATTTATAACTAATTTTGCTG:1 + chr3L 20615294 3' + Tc1 1350 1 73.27 GGTGGGTCTGTCATGATTCTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATCATTTTTTACAGTGTGTTGTTGGTTGTTTGGCTTATAACTACGCTTTGT:1 + chr2R 10523225 3' - I-element 179 1 60.40 AGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAAATGAATATAAGCCAAATAAATAGAACGAGTTTTCTCCT:1 - chr3R 20220920 3' + invader2 246 1 74.26 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCATC:1 + chr3L 9174730 3' + 412 7493 2 80.20 ACACACACACACACACATATGCGCATACATGGATAAGCCGAGACCACAAAGGTGGTAACACAACGAAGAAATGCAACAATGAATGTAATTTATAACCAAAG:1 + chr3L 11273810 3' + accord 7031 2 70.30 TATATTTATACATATACATATATACAGATAAATATGTATAGGGGGCTGGGCGATCGCCTAGCGGTAACTGGCTGGAGTAACGCCCGCCGCTGGAATTCAAT:1 + chr3L 722374 3' - Stalker 7096 4 79.21 TTCCGATGCCTAAAATAGTATTCAATGAGTTCTGAAGAAAGAATATTATGCTGCCGCACCCTGTATTTCGGTCATGATACTTGCAGTATCTGCTGTCTTCG:2 + chr2L 21687121 3' + mariner2 850 1 61.39 TAAGAATTCTTTTTAACATGTATGCACATAAACATAAGCATAAGCAACAACAACCAGACTCCCGGCAACAACAACTGGAAAATATCAGAAGGAGCTTAAGC:1 + chr2L 1844391 3' + Tom1 168 1 58.42 AACACTCGAGTATTTTGTGTTGCCTGTACTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTC:1 - chr2L 15832983 3' + hobo 2845 1 71.29 AATACGCCAGTTAGCCAGCCAATTTTCCACAACAGTTAGGTGACCAGCCAGTTGCGCTAATGTTTACAGAGGGGTCTGTGGTCAGCAAACGTGGTCTCCTG:1 + chr3R 1027747 3' - Doc4-element 2301 1 72.28 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGCACAGAAATATCGCCTCGACTATATAATTTAG:1 + chr2R 10345664 3' + roo 9029 1 70.30 TTCTAATATGGAGTTTAGACTTTAGGATTCTTGCGTCATAAACATGACTAGGGAGCCATTAAAATTTAATAATTTGCATGTCACTTGTGCACCGTAAACGA:1 + chr2R 25223359 3' - Idefix 7221 2 77.23 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAAGCAAAAAGTCCTTGGTTGGAGTCACTCAGAATGTCTTCTTAAAGTTAACCGGAAGTT:1 + chr3R 12058701 3' + roo 390 2 63.37 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAATTTATTCCATGGCAGGAATAAAGTTCCATTGCCGTT:1 + chrX 5152008 3' + 297 6943 2 67.33 TTTAAATAAAAAATAAAAGGATATTTTAAAGGCCACAAGAGCCCTGTAATAATAATAATAATATATCTTATGTGTGTACTAACCATCATGATAGTACAAGT:1 - chr2R 13283141 3' + G2 3054 1 76.24 CGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGATCGGCGCGACCAAGACCACTTCAATGCAAGAACATCCCCCCTTAAACTCT:1 + chr3L 2938403 3' + Ivk 5045 1 63.37 ATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTTCTCTCTTGTAATTTTGTGGCCGTTGCTGTGGCACAGTCTGTGCCAAAAGTAAGCTACCATTACA:1 + chr3L 10470370 3' + diver 5955 2 50.50 AAAACCAAAAAAAAAACATTATTTGTTTGCTCTGACATTTTGAAGCTGTCTTATTAAGATCGGTGTGTGTAGATGGGAAAGGACCTGAGGGTAAGGTAAC:1 + chr3L 10449355 3' - Tc3 86 1 91.00 TTTACATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGACTGCCAGAA:1 - chrX 10445558 3' + INE-1 537 1 71.29 GTTGATTGTTGATGTTGAAGGAAAATCCGCAGCTGAAATGAAGACGCCAAGTTTCAGCAGGATATGGCAAGGGATGCGGAAAAGGATGTGTAAGAAATGAA:1 - chrX 9942967 3' - gypsy7 321 1 76.24 AATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTCTTAATGGAATTTATGCGAGTGTGAAATTTATGTTTGTGCACAGATAGAGAACGCAAAACTATTCTTA:1 - chr2R 12129832 3' - hobo 2538 1 78.22 AACATAACCCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATCTATATAATTTACACATACGTAAACTGTAGATGTGTCTGTGTACGTGTAG:1 - chr2R 16160222 3' + gypsy 7435 2 49.50 TATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTCGGCATTTCGAGGGTGGATCG:1 + chr2R 22373462 3' + Doc 4285 1 68.89 CCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTTGGCTTTGACTACTGGGACTGTCAGTTGGAAATCGCTTCGT:1 + chr3L 22165961 3' + F-element 332 1 63.37 GAAAGAAGGGCAGAGCGAATTGGATCATCGAACGCGACGGTCGTCGCTACGCAGACATTGATTCAATAAACTAGAACACACTCAAAATCAGTAAAAGCAA:1 - chrX 13868369 3' + gypsy7 5336 2 69.00 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGGATAAGTGGCCCATCCCCAA:1 - chr3L 11367473 3' + roo 399 1 67.33 CAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTGTCTTAAGATCTCGGTTAACTCCCCCAGTTCTTCGCTCCTCTATTTCTTT:1 - chrX 9911035 3' - accord 256 2 56.44 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGCACAGAAATATCGCCTCGACTA:1 + chr2R 10345654 3' + roo 9019 2 80.20 GAAAACATCCAAAGAGACTTTAATATTCCGCCAGTCATTAATGCAATCACAGAACTCAAAGGATATGAGCTGCCCACGCAAAGAAAAATGCTGAATTCCCA:1 + chr2R 16028341 3' + F-element 4382 1 55.45 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGGGGATATACTGTCCGCTTGCTTAAAAATGTCTTTCATGGCTCCATATTTCAGATCT:1 + chr2R 6041649 3' + opus 7487 2 65.35 TTGCCGGATCATCAATTTGGATTTCGAAAGGGACACCGAGAACCGTGCCACAGTGAAGTTGGCCCAGGCCGTCGCCGAAGTACAGAAGTTGCTCGTGCCGG:1 + chr3R 22070927 3' + Helena 277 1 70.30 TGACGTAATATATCTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTCTATCTAAAGGTAACGAAATTATTAATAATTTTAGGAACATCGTGTAACTCACTGGA:1 + chr3R 21585176 3' - Stalker 6810 3 53.47 TACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGAC:1 - chr2L 14074958 3' - jockey 250 1 59.34 AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAATAAATAAAAATTTGGATATATGTTCATTATACCTTTACTTTGCTAA:1 + chr3L 4267223 3' + Juan 4175 1 64.36 TGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCCTGTTAATAAAAACCAAAACAAATCAAATCAATTTGCGCCGCGCACACATACATACAT:1 + chrX 7604409 3' + I-element 337 1 61.00 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACTTTGCAACCCATATCAATTAAGCCAAAAGACCGAGAGAGTGGTCAATAATTTTTC:1 - chr2L 2912009 3' + 297 6960 2 65.35 ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACATACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGAGTCTTACATTCACTTGTTTAAGTAAGTCAAG:1 + chrX 21945947 3' - F-element 24 1 61.39 CCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCT:1 - chrX 15408751 3' - INE-1 536 1 82.18 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTATGTTCCAGTTTAACGAACTGATC:1 + chr2L 5269848 3' - hobo 48 1 72.73 ACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACACAAATTATGGCCTAAATATGAAACTAGAACTAATTATATATGTAGCTTTTTGTTTTAGTTTCACCTGAGTGCATCG:1 + chr3L 22933858 3' + G2 3076 1 48.51 TCCAAATCGCGTACTTCTCGCCAAGCAACGGAGACAACAACAATGTTGCCAGAGAACGGGATACAGCGAAGTATGAAGAGAGATAGTCGTACAGAGAACAC:1 + chr3R 6424374 3' - copia 468 1 81.19 CCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGATCTTGAAGTGTAATATCTATGGAT:1 - chr3L 21912277 3' - Bari1 26 1 74.68 AAAGAAACTCTTATGTTGAAACTCTTAATATTGAATGCTTCAATATTAATATTTGTTTTATAAAACAGTACATATCTAAAAGTTCCTATAATTCTTGTACA:1 - chrX 16765112 3' + Bari1 1418 1 68.32 CTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTTCTGCAATTCATGGGAAATTAATGTTATTAAT:1 - chr3R 19445661 3' - Tabor 46 2 68.32 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGGAATCGTAGGAATCAACTCATCATTGAACGAAGGTGGATTGAAGG:1 + chrX 1252849 3' - hobo 31 1 53.47 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACAATGTATCACTATGAACGGCAGTCCTCGTAGTGACGAAGCGCACCAGAAGACTT:1 - chr4 1234515 3' + 412 7520 2 52.48 ACAACCGATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAACTCTAAGCCAAAGGTGTAAATGCGAGGAAGAGGACAGGACATAAATCGCTAGAGTGGGGAGGGAGCT:1 - chr3L 25262985 3' + Burdock 6049 1 70.30 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGAGAAAGGTAAGAGGCGGCGACGACGTCGATAAGGACGCACCTGCTCCGCCTGCGG:1 - chrX 9416036 3' + hobo 2920 1 62.38 AATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTCCACCACAGATTTCCACCTCCAATTCTCGAGAACATCAGACTGTGTCAC:1 + chrX 8985043 3' - invader4 2637 1 51.49 ACAGCGATATGATTGTTGATAAACTCCATAGTAACTGAATGGCGGTTCCTAACTGGCCAAAGCATAGAAACTACAGACACAGTCAGACCAGACA:1 - chr3L 9507151 3' - P-element 2770 1 71.28 CAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTATCGCTTTAGGCCCATAACAATATCGTGCATCAAATGATCAGAAAGTGCTGAAATACATAAATTG:1 + chr3R 10222064 3' + hobo 2536 1 53.47 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTAAAGCCAAAATAGTTAATGATCCCGTCTTGATTTAACTTCAAAATCTCCCCACCAGCATTCGTAAGCTT:1 - chrX 7741674 3' - roo 8670 2 71.29 GCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGCTACGGTATAAACAGCCGGGCATTTGATTTTTACTTACTTTGCTAAGCATAACT:1 - chr3L 9856052 3' - hobo 102 1 60.40 AAATATTAAAAAAACAAAAAAAAAAACGGAAAAAGTTCCAGAAAAAGTAGAGCCCCAGCAAGAAGGCGAAATTCTGGCAGTCCTACATCAGGTCCCTGAAG:1 - chr3R 15179040 3' + TART-B 10629 5 52.48 CGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTAGTTGAGTGGAAATATGACAAGGTT:2 - chr3L 3635436 3' + roo 355 2 75.25 ACAAGGGGCCATTGAAACTACTATGCGACAATCTGAGCGCCTCGAGTATTGCCAAAGGGCAGATAAATCACAGCGAAACAAAACAATTCCCAGCTCTCGTG:1 - chr3R 11250196 3' - frogger 457 1 54.46 AGATAAAGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCTATACTTATTACTCTGAACTGTTGAAAACCAAGT:1 - chr2R 12263655 3' - Cr1a 4127 1 66.34 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGTAGTAAGACCCCATGGAAGAACTCTTCCTCTATCACCAGTTTAATGTTAGCTA:1 - chr3R 15631097 3' + opus 7483 2 57.43 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTTATATGAACTGGGTGCACTAATCACCTCA:1 - chrX 4056243 3' - roo 10 2 69.31 ACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGAAAGGCGTTGAGAAAGGGAAGGCCTCGA:1 - chrX 9392945 3' - P-element 2837 1 33.66 GAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCACTGACGGCTCTTGAATAACAATTTGTTGACAAGG:1 - chr2R 2645466 3' - HMS-Beagle2 31 2 62.00 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACAAAACAGATGTATAAAAAGTCAACCAGAAAAACGTAATAAATTGATAAGAAC:1 - chrX 12890890 3' - pogo 22 1 57.43 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAGAGTCTTAACAAAGCAGCTGCCAGAGACCTTCGT:1 + chrX 17284003 3' + roo 9030 1 66.34 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATCAAGAGTTTCAGTCATTGCAATGTTTTTGTGCCGGAAAATATACTTAATGTAGTCGGATGTAGAGTATAT:1 - 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chr3R 27386269 3' - hobo 16 1 63.37 CTTAGTGGCTCAAAATCTCGGAGCAGACTTTGTGTTGTTTTCCAAAATAAACCAGGTTCTCGGAGATAGAAAAGCATAGCGGAGCATATAGCCAGACTTCT:1 + chr2R 16580594 3' + G3 386 1 59.41 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGCCAATCAAGAATACAACGGAGCCGGAGATGTGGAAATGGAGATGTGGAGAGGCCA:1 - chr3L 813800 3' - roo 20 2 59.00 TAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTAGATATTAGGTCCGTTGCCAAAGGCGCGACGTTGT:1 - chr3R 395280 3' - Doc 4560 1 65.35 CTTAGTTGCTAGGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATTTATAATGGTGTGCGGTCGCTTTGACGTAACACATTACGACAAACGGGCAGCGACGT:1 + chr2R 16160298 3' - gypsy 18 2 61.39 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGGATCTAAAATAGCATTTTATCGTGACTTAGAGG:1 - chr3L 18034182 3' - Doc 48 1 64.36 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAAGTGCTGTCTAGTGTTAATTAACAGCCACGCATCAAGCCAAACATGAAATGGGATGGAC:1 + chrX 13641433 3' + jockey 4985 1 57.43 TTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGATTTTCTTCATATACGAGTCCGGTCACGAACTTTTGTAAATACTATAGGATATTTACATAAA:1 + chr3R 23259275 3' + Rt1a 10 1 64.36 TTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATATACATATAGCCATTTGATCATGCAACACGCA:1 - chrX 15174632 3' - 1360 3198 1 68.32 GCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTATTTGACACTCATACATTTGACAGACATACACT:1 - chr3L 21912241 3' - Bari1 12 1 68.32 AGCCGTGCGACCAAAACGCCACTGCACATGTTCTATGTAGATATTGAGCCTAACAACATAAACCGAGACAATGTAAAACCAACGGCTCCATGATGCTGTAC:1 + chr3R 5673699 3' + G4 485 1 79.21 TTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCAGCTGTGGGAGTTTCCAGTGAAATGCAACGAATATCACAGAACTCGGGAACTATTCACTGTTTAGTTACA:1 - chrX 7609998 3' - hobo 134 1 74.26 CGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAATAAA:2 - chr3L 19951170 3' - Ivk 2 1 77.23 TCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATAAAAAAACATAAAAATTAAGAATAGACACATGTACATATGTATGTATGTATAAGACACATAACCAAGTTGGCAGATA:1 - chr3R 18467067 3' - 1360 3296 1 78.22 ACTCCTTATCTATAGTTCCGATTGGCCATCTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGGTGACGATGATAACGTTTCTGCTCTACCCCAAAACTCATCAAAG:1 + chrX 16188433 3' - Rt1a 4767 1 70.30 CTGGTACTGCGTTAAACCATCGAAGGGAAGGCAGCTCTGTGGGCCAACTAATGCATAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' - Burdock 6003 1 39.39 TTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTTCTCAAAATCGATGATACGGTCTGTTTATAGTTATTTCCTATAAATTTCCTGCCTTGTATTCAGAACCACT:1 - chr3L 23873170 3' - Doc 4441 1 76.24 TAAATTGTGAATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAAACAATAAAACAAATTAAATAAATAAATTAAACTAATTAAA:1 - chr2R 24345877 3' + TAHRE 10390 1 78.00 CCTCCACCAGCAAAGTTAAACCTACTTATAAGGCGGAAAAACAAAAGCTAGCGGCAAACAACATCGACACAAACGAGTATCCGAACACTCGGACAAGCCGC:1 - chr2R 13106364 3' + HeT-A 6061 2 51.49 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGCTTGTTTTGCCCTCTCAACGAGTGCCAGATTACGCATACGCAATGTG:1 - chr3L 5387790 3' - mdg1 7067 2 57.43 AATATGTAAAAAAAAAAAGAAACATTAAA:1 + chr2L 19325102 3' + TART-B 10630 1 89.66 GGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTAAAACTAGATGACATGTCGGAAGGAAACGAGTACAG:1 + chr2L 5269391 3' + hobo 2635 1 65.35 CATTTCTCGATATTGCCCATCCACTCAAGCCGTAATCAAAACCCAGTCACTAGGCAGGCACATGTCCTTGCCAGCGTGTTGGGGCAGAAAGTTGCTAAAAA:1 + chr3R 12105799 3' + Tom1 91 1 62.38 TGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACAGATGTCTGCTATCACTTTTGGTTTTGTGCATTTTTAATTATTGGC:1 - 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chr3L 19697774 3' + Idefix 397 2 62.38 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACCGAAACGCCAACGGCTTGGAGCACAAGCTCCCCAAAGGCGCGAGCGAGCTGGGG:1 - chr2L 9437415 3' - P-element 13 1 63.54 ATTCAGATCGCGTTCGATATCTCTGATCCTCATGTACCACGGAGAGCCTGTAATCTTCCCCGATCTCCTTAGCTAATCTTTTGCATAGGACGGGATCATCG:1 + chr3R 4504983 3' - jockey2 3020 1 58.42 GATAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATTACGTTTTCCAACAAAAGCTGGGAGTTTTCATCACAATTGTAATTGTAGTAAAGAAAACATCAATAC:1 - chr2L 21272369 3' - Cr1a 4147 1 71.00 ACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAAAGGAAGTTATGCTGCCGCACCCTGTATATGAGCTGGAATCCACTTTAAAACTTTTTTAAAACTTAC:1 - chrX 22674500 3' - mariner2 37 1 72.28 AAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATCGGTTTCCCACCGCCGCTCCCCACATGTCCAAGCAGTTCTTCGAGCCATCGCTGGTGGAGATTCG:1 + chr3R 21175254 3' + Juan 358 1 73.27 ATGCAAATTGGATTGAGGAAAAGTCTCAGTATTTGAATAATATTTGTATTTCGGGAGAGTCTCGCTCTTGTGTTCTTAGCTACTTAGTGGGCTTAACCTGT:1 + chr4 633830 3' - 297 251 2 78.22 ACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCATTCTACGCACTTTTCTCCGCTCAGCAGGACATCCTTTTCCTTGTTATTGTTGTTTGACAACATTTGTTT:1 - 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I-element 33 1 59.41 CTAGCTTCTATAGTTCCTGAGATCGAGGCGTTCATACAGATAGACGAACGGACAGGGCCAAACAACGGTGCAGTACGAAGCGGTAGAGCGGCTTGGCACAG:1 - chr3R 1848686 3' - INE-1 152 1 61.39 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATATTACTTTCTTCAATAGTAAGTAACCTTAAAGTATTTGGAGCATATGTATAGTGTA:1 + chrX 7741782 3' + roo 390 2 58.42 GGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAACGTGCCTGCTTGCATGGTAACTTTTAC:1 - chr2R 3293760 3' + 1731 4578 2 71.29 TGCGAATGTGTGTGTGTGTGTGCCTCGGGGTGTGTGTGCATCCCAAAGGACACTTTAAACTGCCGCATGCTAAATCCTCGAGAACAACAACAACTGCTAAC:1 + chrX 15482891 3' - accord 188 2 58.42 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACTGACTTCATCAATATCCTCGGGAAGGTCTTGTAGCTCTTCGTAGCACCGCTCTTGGACATCCGCATGCAG:1 - chr2L 5269774 3' + hobo 2933 1 73.27 TTCAGTGTAGTCCATAGGGGCTCCTTCTTCCACCCTTTAGACGCCTCTTCCTCCTCGCACATTTCACGAACTTCCTCGTCTGATAATGTTTCATGGTCCCT:1 - chr2L 16177334 3' - Rt1b 4919 1 57.43 AATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGGGGAGGGCAAGTTTATCTGCTCGAAACTTATTCAATCTCTGGAGAAATTATCCATTTGCCATTTTTG:1 + chr3R 22232475 3' + Doc 166 1 76.24 AAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCCATTGCTGCGACCGTGTGGGTATTTTGATGTATTCTATGCGGTAGCAATTAATTGCTTTCAAATCCTTTT:1 - 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chr2R 5269070 3' - Cr1a 4222 1 59.41 CACAGGTAGGGTGGGAATAGAATATGGCCAATAACATCTGGGTCTGGTTCAATTTAATGAGCAGACGTCGCAACTTTCCGCTACGTTGGACGCGTTAAA:1 - chrX 7472184 3' + Circe 7195 1 56.57 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGAACCGAGTTTTCCCGACCAAATCGTTCAAAGTTTTTTTTTCGACTGACGCG:1 + chr2L 9699278 3' + P-element 2863 1 55.45 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAAT:1 - chr2R 19209491 3' - Doc 89 1 73.27 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCACGAGGTCTGTCAATTTCTGGGCTCTACGCCCCTCGTCCGTTGTCG:1 - chr2L 16396566 3' - 412 7084 2 54.46 TCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAGATACAATAGTTACAGTCCTCTCACAGAGATGGAAATAGTGATAGATACAGATGGAGG:1 + chr3L 16680759 3' - FB 18 1 61.39 AAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTACAAAAGTAATATCAAAGA:1 - chr2R 15082000 3' - 1360 207 1 73.27 CTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATTTATAATGGTGTGCGGTCGCTTTGACGTAACACATTACGACAAACGGG:1 + chr2R 16160289 3' - gypsy 7005 2 57.61 CCCATGAGCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCAACAGATATAAACATCCGCGGCCGCATTCGTGACTCCCACCAGAGGCTATTAATAATGTGAATATC:1 - chrX 19077537 3' + Quasimodo 265 2 80.20 AAACTTGATCTTTTAGGTTTCCCTGTTGATCTTTTAAATTGGATTTCAAGCTATCTGAATGACAGGACGCAAGTTCTGTAGCTCTTGGATCGGTCCTTCCA:1 - chr3L 25727201 3' + Q-element 364 2 71.29 ATTGAAAGAAATCTTCGAGCTGGTGCGGAGGAATATGGAAAAGGCGGTCCAGGATAATGGCAACGGTGTATTGCTTCATGTTTGATACTTTAGCTTCTGCT:1 - chrX 9191663 3' + Osvaldo 1200 1 55.45 GAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACAACCCAGGACTTGACCATCAACACAGCCCAATTGACCGCAAATGCCCTGACATAAGCGCCTAAAAACTCTGGCCAAA:1 + chr3R 15298325 3' + I-element 341 1 71.29 TTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTAAGCTAATTCCTGATGGATACCAAACAGGGTCAGGTAATCATGACC:1 + chr4 255847 3' + 1360 3328 1 54.00 AAATAAGTAAGGAATTGAAGGTTCAAAACAAAAAAATTGTATAGAAAAAAACGCAATTGGACCAAAAACAATCGAACGAAGAATGCAGTTTTGAAAAATCA:1 + chr3R 4575247 3' - Tc3 110 1 65.35 AAAAGTAGGAAGGGCCTTCAAGTCGTTCTAAAGGGTATAGAGCCTGAAGTAACACCTCCCCTCACGCAGGACAACTGAAACGAGTCTTATTATCACAGGAT:1 - chr2L 18232361 3' + Fw3 179 1 57.43 GTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGGGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTGCATTTGTGGGTCTTCCGCATCCCTCT:1 + chrX 14094372 3' - F-element 382 1 73.27 TTGAGATCTCGACGTTCTTACGGACGGACACACATGGACGGACATGCAAGTGAAAGGCATATACAGATGCCCGCTAGCACAATCATCACCGTCAATAATAT:1 - chr3R 32008578 3' - INE-1 136 1 56.44 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATCGCCCTTCTCTTGCCTTTTGTGTAAGCCCGAACAATGAA:1 - chr2R 14744229 3' - roo 1 2 67.19 ACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAAATGTTCCGTAACTT:3 - chr3L 17215705 3' - Ivk 17 1 62.38 ACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCTATCGCGGGCACATGGCGTGACGACCTCCATCGACGGGCAGACTGATTCCCGTGGTGAAGC:1 - chr3R 5633108 3' + 17.6 6949 1 68.32 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTCTTTGTTGCACTTGGAT:1 + chr2L 16818829 3' + pogo 2049 1 82.47 GAAAAAATGCAATTATGCTGCCTGTGTGTATATGAGTGGGCGTGGCTTTTGTTGGCAGCAGCACAAAGTACGGTGCAAAAAAGATGAAAATAGCACGATGC:1 + chr3L 21233520 3' + mariner2 883 1 56.44 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCGCTTAGTATCTGTATCTGTGTGAGTGACTGATCAAGGCAGCGCAGTCGGCG:1 - chr3R 18448929 3' - hobo 24 1 55.45 TGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGTTGCGTTTCATTTCGGCATTCGATTAAGCAGATCAAAGGGAACCTTAATACGCTTATTAACAAGTAGCTGCTGCTGT:1 + chr3L 16023187 3' + diver2 159 2 77.23 ACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCATGAGTCGTATGTACTTAAGGAGCTGCCGGAGGAACAGGAAATATTGCCTGTAACAATGCCCAC:1 - chr2L 8217437 3' + mdg3 5397 2 73.40 ATCAGTACCCATGAGGGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCTTTTAATTCGGTTGTGTGCTTAGGTGGTAACTTAAAT:1 - chrX 1641234 3' + Quasimodo 258 2 61.39 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCTAAGTGTTTCGGATCGT:1 + chr2R 9129692 3' - P-element 59 1 20.79 CAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATACCGGCAGCCAGGAGAACTGCAGTCAAAGTCAGGAGATAAGACGACTGGCTAACTGACTGGCTGACTGGGTGTATTTC:1 - chr3R 16429024 3' - 3S18 5766 2 77.23 GGCCGTAATGGGAAATGGCCGGATCGGAGCAAGGTGATTAGGCGGCGTTGGCCGTTGGGAGCTGGTGACGATTCCGCTGCTGCTGGAACTGCTGGAGCTAA:1 - chr3R 16142936 3' + accord2 259 1 60.40 CTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGTGTAAATATATGGTTCAGCTGCAGGACGAGAACATCGTCTT:1 + chr3L 4106229 3' - accord 7343 2 59.41 CACCTTATGTTATTTCATCATGGCAGGAACTGTAAATCATTACGTTCGGAAACGAGCTGCTGCTCG:1 + chr3L 9763558 3' + P-element 2886 2 65.15 GGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAAACGACGGAGGAGCAAAACGTGTGCCGATGGTCAGCTATGCTCCTCTCAAGCTGAATCCAAAAATCGACCCC:1 + chr3L 18382646 3' + I-element 376 1 76.29 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAATCGTGGCTTCATTACGAATTCTTCGAATGGTCCGCACCTTTTGGTGAAAAA:1 + chr2R 11086481 3' - Doc 31 1 52.00 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGG:1 - chrX 4056286 3' - roo 53 2 79.21 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCACTCAATGCAATTGCGGTATTTATAATGCAGCAGAACGCGTTCGATGCAGT:1 - chr2R 15451554 3' + roo 9045 1 52.48 AGGTACATAATCGTCATTTACGCTTTATGCGTTGCGTGGGTGACCGATTTTTGTTTCAATTTGTTCGTGCTTGTTGTCGACTCGAGCTGGTGTCCCATCCT:1 + chr2R 19859126 3' + S2 287 1 52.48 TAGAAACATAAGTAATATTAAATGCCGTGCGATCAAAACGCCACTGAACATGTTTTAACCGAAAGAAAGAGAACACTACTCGCTCAGCCAGGTCACTTCAT:1 - chr2R 5832738 3' + G4 463 1 56.44 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCAAACACCTTGATGTATTTGCCTTGTTATAGCTTGTTTGTAGTTTGCACT:1 - chrX 12276759 3' - hobo 27 1 52.48 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTTGTACTACAAAATAGTAATAAATCCAAA:1 + chr2R 14796214 3' - hobo 63 1 72.28 CTTCAACTAGGGTCCCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTCCTTCCTTTACCGTTTTTCGCGGCTCATTTTAGAAAATTTAGAATACAAAAGAATTAACTCTT:1 - chr3R 4576748 3' - Tc3 1307 1 51.49 CCGGCATGCTGAGGGAAAATGGACGCGGGTCGGGCAGCGAAGATTTATGGGCTTTGTGTGTCTAATTTCGATTTAACGAAATTTATTTTTGATCGCCCGAC:1 - chr2R 20440438 3' - Circe 7372 1 79.21 TAACTTAATAATTGTTTAATTTACATGACCAAAGAGGGAAACTAGACAAAAAACGGTGGCCAACCAATCCAAGTTCAAATTGGACAAGGTTTCTAAGAAAA:1 + chr3R 25832483 3' + gypsy9 316 1 61.39 CAGCACAGCTGCCTCTCTCACAACTGCAATCTCATCGACAAAAAAAAACCCCCCTAGCCAGGCACAGCAACAAAGCGAAACACAGTTAAGAATTGGAATAT:1 - chrX 5095900 3' + Doc4-element 279 1 57.43 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACAGTGTAGCACAGACAGTCAAAAACGCAGCATTGGGTTGTCTGTTTCAAC:1 + chr3L 10554841 3' - roo 8690 2 51.49 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAAACTGCCTTTCGTTGCTGGACATTTTTAATAATACATAATATACTTGACTTCG:1 - chr3L 10554755 3' + roo 9052 2 52.48 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAATCAGGTTGTTGGATGGCATGGGTTAAGGGAAGTCG:1 + chr2L 7971041 3' - blood 7047 2 59.60 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCTCGATTATCTTACTTGGCCCAAACAAAAATGGAGAACTT:1 - chrX 15259031 3' + roo 9035 1 68.32 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATGCATAGAAGAACCAAAAGGTGAAA:1 - chrX 8447151 3' + opus 449 2 78.22 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTTGAAAATTAGTTGCTACTTATATGCTTCACTTAGTTTTTCTTA:1 + chr3L 13366454 3' + hopper 1408 2 72.28 TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACATACTTTACTTTAAAGTTAATACTATGCACATTCAACTCAGCATTTCCCCTCTGTTCA:1 + chr2L 4750056 3' - Quasimodo 12 2 65.35 GTATAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGTGAGGTTGGCTCGAAAATCTGT:1 + chr3R 19496693 3' - accord 185 2 73.08 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAATCAGGTTGTTGGATGGCATGGGTTAAGGGAAGTCGGCGGAAGGAG:2 + chr2L 7971051 3' - blood 28 2 50.50 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACAGGGGTTGGTACGGGGTCGGATCCTGGCTACCT:1 - chrX 409599 3' + P-element 2844 1 37.62 TCTGTATGCTGAATCTCAACCTTTCAGCTTTTAATTCAATTGAACCAATTGTAATTTAATGCCCACACTTGCAACTAAACTACAACTTTGAAATGTTAACA:1 + chrX 19810408 3' - INE-1 175 1 67.33 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTTCTC:1 + chrX 16217535 3' - P-element 6 2 70.00 GTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACAGCAAAAGGTAAACAGCGGAAAAAACCGTTCGAAAAAAGAATGTAAAATTGTGTGAAGTGAAGTGAA:1 + chr3R 6209514 3' - hobo 265 1 72.28 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGAAAAAAAAAATTATTTTTACCAAATCATCTAAAA:2 - chrX 6897370 3' - Ivk 44 1 66.34 GGCCCCAATCTCAAAAATCTCGAAATCACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTG:1 - chr3L 23773901 3' + Transib5 2873 1 73.27 CTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTAATCGCTCTTTTTAAGGGTTTAAGCACTGATTGTTCGGG:1 - chr2L 7745912 3' + I-element 5318 1 66.34 ATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATTTATAATATATAGTTCACTTCCAATGCAAATGTGAGAAAAACGATTATAATATTGGTAATTTTTTATGTA:1 - chr2R 19244473 3' + Burdock 250 2 68.32 TAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGACGATATATAACTGGGATCGGAAACCATC:1 + chr3L 21271429 3' + Quasimodo 17 2 72.28 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTCTATAAATAAATACCACAAA:1 + chrX 12818872 3' + roo 9018 2 78.22 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACCATTCAGCCAAAAGTGTGCCACCAGCTAA:1 + chr3R 23080882 3' + 412 7498 2 73.27 CCAGACCACAAGGCTGGCAGTAAAAAGAAGAAAGTTCCTCTCAACATAAATAAGAATCTTCTGCTCCCCGGACTCCCTGGCGCGTCTGAAAGGGTCAGTGG:1 - chr2R 1037007 3' + Gypsy6A_LTR 254 1 76.24 CACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCCAAGGTGGCCACCGTGCCCGGCCAGCGGATGAGTTCCCATTGGTCGCCG:1 + chrX 21335907 3' + 412 64 2 54.46 CGCTGCTTCAGAAGACGGGATACTTCATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTGCATCTGCATTGGAGGCACAACAGTTACAATATACAA:1 - chr3L 20149947 3' + gypsy4 6732 2 66.34 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGACTCTATCAATCCGGGATGGCCACTCCACTG:1 + chr3L 11367550 3' - roo 8710 2 72.28 TTTTTCATAATTTTATTAGTTGTGTCAATTTCTATACATTTACCAAAAAACTTTTTGGAACGAGTGGTTAATTACGCGGTCCATGGCATCTCTCGTGG:1 + chr3L 24186636 3' + INE-1 403 1 63.27 AAAAATGGAAACTATGCTGCCGCAACCTGTAGATTTGGCTCGCCTTGCAGATGGTATTTTGATTTCAGTTGAAGAGAAGAAAAGCTTTTTGCGCTCTTAAG:1 + chr3R 14064869 3' + mariner2 884 1 73.27 TGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAGGAGTATCTTAAAGAACTCATTCATTTACATTGAGACACGTCAGTTGTACTGCCTTAAATAATTGATATGGG:1 + chr3R 23605155 3' - Tabor 6846 2 58.42 CTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTCTTCACCACAGACAGTATAATTGGCATCCACACCAGTGCCATAATGCCCACTGCCACAAGCACTTCTC:1 - chr2L 10065259 3' + Max-element 107 2 67.33 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCATCGGCGAGTCCTTGACATTTTGCAATATAAACAGCTGGCTGGCAGGCGA:1 + chr3L 9174777 3' + 412 487 2 72.28 AAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATCCTACGCACCAGTTTAGATTTAAATTCAGGACTTCACATTCCACATATAG:1 - chr2L 12802182 3' + invader3 251 2 50.50 TCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGCAAGGTGTGGTCCCTAAAGAAACAAGTGGACAATGCCATCAAGCTGGCCAAGAAGATCCCGCAAACC:1 - chrX 17283920 3' - roo 8662 1 76.92 TCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTC:1 + chr3L 23678154 3' - Osvaldo 19 1 71.29 ATTTATTTTGCCTTTGATTACATAGAATGCAATATGTAGGTACAATTATTTGATATGGGATACTCATCAGTTTGCTTTTCCAGATCTTTTGGTACCTGATT:1 - chrX 14837010 3' - HeT-A 6004 2 52.48 TGCGCAAAAAGGGAAATACCTGTTATTTCCCTGTGGCCTATAAGGGGTCGGCGCGAGCACGGATGCGAGGCAGTCAGCATTCGTCACTTCACTTTTCCTGG:1 + chr2R 7884240 3' + gypsy8 309 1 76.24 AGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACACAGACGCAGCACAAGTTGCCACAAGGCGCCTTATATTGCTACGGCAATTTAATTTAATTTAATTT:2 - chr3R 7739990 3' + INE-1 172 1 52.48 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATAAAAACTTAGGTAAGGTTCTCTGGAAAATACACTGGTTT:1 + chr3L 17652772 3' - pogo 34 1 63.37 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGATTAGGTGGCGTTTTCTTTAAGTCCTCGGCGGTAATATCCTTTTCCTCGCCTGCCCACTTTTGAACTGCCATCTCGA:1 + chrX 7331644 3' - Tirant 8137 2 78.22 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGAACTGAGGCCATTAAGTTATATTATGCTTAATTTCTATCCCATTCAGTGTGGAGACA:1 + chr3R 28678256 3' - I-element 28 1 50.50 CTATAAAAGCTAGAAGGTTAATATTTAGCATACATATTCTAGAGAGAAAGACGCAAGTTGGTTCACATACAAACATAAGCAAATACATCAACAATGTTATA:1 + chr3R 12083734 3' + INE-1 161 1 62.38 CAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGTTTTAGAATTTAAGCAACTCGAATTCCGAATGCCCTGGAATTGGTTTGGATTCTATAATCT:1 + chr2L 20478947 3' + F-element 403 1 69.31 TCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACCCACACAGACCCGTTAGTCGACGAGAGTAATCACAAATCGATTCAGCGAAAGCA:1 - chr2R 23995127 3' + 1360 3176 1 58.42 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCAACAATACAGAAGAAAATAAATAAACAATGTAGGAAT:1 - 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chr3R 16074105 3' - invader2 375 1 54.46 CTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCATTTTCCTTTCTGCAATCCACAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGA:1 + chrX 9167856 3' + hobo 345 1 37.62 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGCATGCGGACGAGTATTGGCACCCAGCGGAGCG:2 + chr2R 20544047 3' + 297 359 2 66.34 GTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACATGATTAAAATTACGAAATAATTTGATCTTTTTGGAACACAT:1 - chrX 6156168 3' - 3S18 36 2 57.43 CGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGACAGATAATGACATCTTAATTTATAAACGTTATAAAACAT:1 - chr2R 2947734 3' - 1360 3216 1 62.38 CTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTATTTTTTACACATTTTTAATTTTATGCAGCAAGCG:1 + chr2L 13683233 3' - 1360 490 1 75.25 ACAGTGCGTTAGTCATTACCCACGAACACAAAAAAAGTGCAAAACAAATTTAAAATGGCAATTTTTTTTAACACACAACTGCTCCAATTTTCACGCCCATT:1 + chr3R 26611860 3' + gypsy2 376 1 62.38 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGTTTGTGTTAATTGAGTTTATGTTATCAAA:1 - chrX 12881947 3' - hopper 46 1 70.30 TTAATTGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGGACGAATTGACCAAAGCTGGTGAAAACGGCGAGATCAAACCGAGGAGTTCG:1 - chr3R 24142594 3' + 412 7546 2 76.24 TTTATGACTTATATCCTAAGGCAATCTATGATTTTGTGTATGGCCGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGCTTGTGGGGAAATTAAAAACGCTCGTTTAAGCC:1 - chr3R 29965292 3' - Quasimodo 96 2 65.35 AATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAACACGAAAATGTTT:1 - chrX 10119540 3' + FB 26 1 69.31 TTACATTTTATTAAATATACATATATTTTTACGATTTTAGATATATTTTGAGGAATCCATATATTTAAAGCCCTACGTCAACGGTATTCACTCTTACGTAT:2 - chr2L 18576469 3' - Dm88 26 2 44.55 TTTTACGAGTTATCATATATTTGTATTTATTATATTTTCTCTCAAATTTGTTATACTTCGCCCACTGTGTTGTGACTCTGACTTAGCTACAAGTGTTGGCC:1 + chr3L 26511548 3' + transib4 125 1 72.28 TTGCAACCCCAGTGATTGCAAGGGGGGCGTGACTGTTTTAGGCGTGACCATAGTATTTTTGGTATACCGAAAGGAATTGGCATGACAAACAATAAAAGCAA:1 - chr4 845619 3' + GATE 8204 1 76.24 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGAGACGAAGGATCACGGAGGACATCGAGGGACACTCGACTCG:1 - chr3R 10978699 3' + roo 9038 1 59.41 TACATTCTACTTTTTCACGAACAAAATGATACTTAATATCTATGTGCTTAGTGCGTTTATGGTGTACTGGATTCTTCTCCTTTTTGGAGTAGGAATTAAAT:1 - chrX 3060597 3' - Copia1_DM 4154 1 76.24 TTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGGTCAAAGCCCAAAACAACAAAAGAATTAATGGCGCCAAAACGTATAAAGCTAGCC:1 + chrX 6171577 3' + Idefix 217 2 63.37 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTTATGCCGGCCAGCCATATAAGGTCCTCGGACATGGCCAGCAATTTTCACTCGATGCATTGACAGGTGGCCA:1 - chr3L 14284968 3' + roo 405 1 71.29 CCCCAAAACCTCCACGCCAAAACTGTTCGCTCTTTTTTTTTCTTACAGATTCCGACTCCACAGAGAACGATGCCGTGGCCACACAGGACATCCTCACGTG:1 + chrX 7232394 3' + gypsy5 30 2 78.00 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAAATAACAAAACTATTAACGGAACTAAATAACCCAAACATGGTGAATGCAATACGATACAAC:1 - chr3R 545165 3' - Transpac 9 2 77.23 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGCATAAAAAATTGAATTGCATCGGCGAGTCCTTGACATTTTGCAATATAAACAGCTG:1 + chr3L 9174765 3' + 412 7528 2 60.40 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGGGCCTTAAAAACGTTTCACATTTCACATGACTCATCCGGCGGGCGAAGACTAACCAACTTGTGA:1 - chr2R 9001620 3' - mdg1 7052 2 65.35 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTTGGTGCCGCTGCTTAACATTCACCTACTTTTCACCTTGTTAGCCACGTTTGAACAG:1 - chr3L 4713750 3' - transib2 15 1 61.22 ATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCAACAATATATTGTAGTAATGCGTACGCTTAAAAGGTTTCCTAA:1 - chrX 8393259 3' + X-element 4571 1 57.43 GTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGATTAGAGAGTGTGTTTGTGATAGATGATGTGTTAAAGGCATGGACTTACCCTGCCCACAAGCCACCTCCTAAAA:1 - chr2L 1423252 3' - 297 223 2 78.22 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGCCCCCCTCCGATCGACCAACACATAGA:1 + chrX 10629252 3' + P-element 2840 1 32.67 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAAAGATCATCAGTAGACTGTGCGTTGATATTGTGGTTCTTATCTGCTTCCACCCT:1 + chr2L 901816 3' + jockey 4954 1 53.47 AATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGGAACAGCAGCGGAGGCAGATCAGCAAAAGGCCGAGAGTCATTCACATTAC:1 + chr2L 18231850 3' + 1731 4599 1 51.49 CGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTGGAGACATAAAATGTGGGAATCCCACTTATGTAACTCTAGAGGGTAT:1 + chr2R 1986270 3' + INE-1 147 1 60.40 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTAGCCCTACGTTACGTAGCGCCCGCTACGTTAGTGCGAGGAAATG:1 + chr3R 28330916 3' + P-element 2857 1 47.96 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCTAAGTGTTTCGGATCGTGTCATTACTCAATTTAATATGCAAAGTCAGGCGGCGCACA:1 + chr2R 9129732 3' - P-element 19 1 58.42 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCTGGCCAGGTGTTTCTGGGAAATTAAGAGAAAATGTCACGCGAATGATACCACTTCGAAATGCTATCG:1 - chr2L 19629599 3' + hobo 2932 1 71.72 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTGACTCGAACACTGGCACTTTTCTCGTAATCGATGCTTGGCTTGGT:1 - chr3R 24172975 3' - pogo 28 1 53.47 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCCAATGCAGGGGCAGACATATAGAGCTGTTATATCGAATAAAATCGGACGTTGT:1 + chr2R 10191790 3' + 297 6957 2 62.38 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAATCGTGGCTTCATTACGAATTCTTCGAATGGTCCGCACCTTTTGGTGAA:2 + chr2R 11086478 3' - Doc 35 1 51.49 TGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAAGAATGGAAGACAAAAGCATTTTTTTTTGTCTTATTATATCATAAATAATTCTGAGTA:1 - chr3R 28206145 3' + micropia 5019 4 58.42 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGACCCGTCTCGAGATCGCTTCCCGCCTGGCCCCCATCTTCTCTGTT:1 - chr2L 7970976 3' + blood 347 2 54.46 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAAGTTTTTGCATAACAAATAAAACGAATCAAATTAAG:1 - chr2L 3988506 3' - 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baggins 4955 1 72.28 CGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACTAGCTGAGTAACGGATATATTATTGATTACATTCGCACATCTGAACTCATGCACTGCTGCACTT:1 + chr2R 2954809 3' + F-element 4431 1 70.30 AGCCGCAAATTTTGGTATAAATGTAATTTTTTTTGTGACTGATATTTTAATGCTGCTTTCATTTTTGGATTCCTAATTTTTTGCATAAAAATATTTTGCAT:1 - chrX 12767362 3' + transib4 15 2 78.22 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGGATAAGTGGCCCATCCCCAATCCGACCC:1 - chr3L 11367465 3' + roo 407 1 75.25 AGTATACTAAGGCAACATTAAAGTTTCCTCTGCTGAATACTGCAAAATACTTATGTACAACTGATTTTCTTATAAACAAGGTCTTTTGATTGCTTGCCAAA:1 + chrX 7379812 3' - G5A 319 1 63.37 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTTATATGAACTGGGTGCACTAAT:1 - chrX 4056250 3' - roo 17 2 62.38 GAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAGAGAAAAACAGGCACGAGTCCCTCATTCTCCGCGTTGCCTTCTTCTATAGTATATGTATATAATACTTCTTTTTTT:1 + chr3R 28373852 3' - jockey 4760 1 74.26 AATAATAATAATATTAAAAATATTAACGTACAAATATTTGAAAGCAACGAGTGTTAGAACTAGTATTTTATTTAACTAACGACGAACTGAATTAAATAATA:1 - chrX 10329982 3' + mdg1 40 2 79.21 CTTAATGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGAGATAGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTCTGAATTTCGGATGCTTAAAGCTG:1 - 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Doc3-element 64 1 42.57 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTG:1 - chr3R 14049361 3' - transib2 46 1 71.29 CTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCTGTAATTTCTACACTATATAAATTTTCCGTAA:1 + chrX 17972914 3' - hobo 109 1 68.32 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTACCAACCGCCGAACGAAACCGCCTGTCTTTCCTGCGACTGCTACTCCAT:1 + chr2R 10712877 3' + blood 349 2 53.47 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGGGTATTATTTTATTAAGACTACAATCGATATATAGTTACTTACGCAGGCTCTAGCCCTCC:1 + chr3R 16487411 3' + roo 394 1 63.37 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGGTGCTGCCAACGCGGCCCAAAACCGACCAAAA:1 - chr2R 10823335 3' - P-element 44 1 35.64 CAAACATCCGTCTCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCTCCTCCATCATTTCGGTGAATGTTTTCGACTTTCGGCGCAACCGATCATGCTCCTCC:1 - chr3R 4699800 3' + Idefix 190 1 61.39 ACTGTTTCAATGCAGCTTGTAACCAACTCAAGGAACATAACTGTGAGTTCTACACGTACGATATTATGAATAATATACGATTTTGGTTTTCGATTTCCAGA:1 + chr2R 12750317 3' + Juan 459 1 62.38 CAAATAAAATCAGTTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTA:1 - 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chr3L 14886207 3' - 412 7093 2 66.34 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATTTTCAATTTTTGATGTCATCGAGCGCACCGCACGGCTATATTTATTT:1 - chr3L 21992732 3' + 412 7518 2 51.49 GGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAAATTATTTTTAGATTATGAATTTTTTCTTTGTCAGAAAATTCAACGACGGCGTGTTCAGGATTTGTGC:1 - chr2L 21607464 3' - Ivk 179 1 71.29 GTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAATTGTATTTAAGCGTAACATAGTCACATCTATATTAGCGTTTATCTTAATCGTAC:1 + chr3L 27383518 3' + 1360 190 1 55.45 AAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAAGATGCTGGGCAAATGAAGAAGAGGAAGCTGAAATTCTTCAGGCCGTCGAGAAGTGCAAG:1 + chrX 11545346 3' + Bica 297 1 68.32 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGGGTATTATTTTATTAAGACTACAATCGATATATAGTTACTTACGCAGGCTCTAGCCCTCCAGAATACGGCTCCA:1 + chr3R 16487425 3' + roo 408 1 77.23 ATCCCCATGAACTCCTTACACGTAAGATAGTATAATCTCTACATACGTATACACTATAATTGAGTTTACGCATAATCCAGCACTTTCGTTATTACTATTAC:1 + chr3L 6549623 3' + G5A 2696 1 63.37 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTATGTTCCAGTTTAACGAACTGATCCACTTGGAGTGCGTCATCAAGGAATCACTG:2 + chr2L 5269878 3' - hobo 20 1 59.41 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATTCAAGCGCGAAAGCATCAACAAATCGTACAAGTT:1 - chrX 6739611 3' - roo 8706 2 67.33 CCAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTGTGTAATTAAGTTCGGGATGCTCACAAAACAGACTCTTAGTTGCCCAGGG:1 + chr2R 13672211 3' - jockey 4667 1 54.46 CACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGACAGTTTTGTTTGTCTTTTTCACTTTTTTGCTTTGGTTGGCTATTCCTAGCGCTCTTCCTCTCTCTCCAGCAT:1 - chr3L 4189731 3' - hobo 2548 1 75.25 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCCATCAATTCGCCTAAATATTTATGC:1 + chr3L 4637338 3' - hobo 51 1 72.28 TTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAAAAGAAATAACTTGGTTGATTGCCAGTTTTATCAAAAATGTACTTA:1 - chr3L 7966904 3' + G4 3531 1 63.00 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGACTGCAAATTTATGCCTTTTGTACAGTCTGAAACTGACTTTCCTCGGGGATACTACAAATACGTTGAATTC:1 - chr3R 9081903 3' - hopper 1 2 76.24 GGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGATAAACAGAAAAAAAAAACAGGAGGGATAAAGAAGTTTCGAGCTGCTTTAATTGAATTGCCA:1 + chrX 20999753 3' + Cr1a 4424 1 51.49 AAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCAGCCTGCGCCAAATAATTGGCGCATAAATCGGTC:1 - chrX 19487388 3' + opus 284 2 66.34 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGACTCACCTATGAATAGTCGTTGTTGTCGACGTCGTCG:1 - chrX 2125574 3' - P-element 38 1 41.58 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGGGCTGGTTGTATCGTTGTCTTGTTTGTGCCCCGTTTTCCCCCAAAAAGCTCCATTCAATATGCAGAGCATG:1 - chr2L 4234276 3' - hopper 3 2 75.79 AATTAAGAATGCAATGATTGTTTGTAAAGTTACAAATATAACATATATCTAAATATTTAATTTGAAAACAACGATTGTATCGAAGTATCAGCAAATTCAAA:1 + chr3L 6401928 3' + 1360 442 1 43.56 TGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTATTTTCCAACCCACCGTCCCTCTGCAATCTCCAAATGCATTTTCT:1 + chrX 12800303 3' + invader3 247 2 56.57 TGAGCGCCCACCCGAACACGTCGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCATCTGACGTCTGAAGAGAATACACATCGGACCATAAACAACATTCAAGGCA:1 + chr3R 19406869 3' + G5A 2624 1 64.36 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTAAATCGAAAAACAGGTTAAAAGGCTCATAAAATCTGAAAAATACAAAGAAATAATTTCTGTACTATATTTA:3 - chr3R 6425806 3' - copia 4 2 73.27 CTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTATCATAATGATAATAAACACTTTCGCACGAATTGGTCGCGTGAAGAAAGCGTAGCATACATTTTGGGGCACCA:1 + chrX 12135737 3' - jockey 12 1 71.29 TGGATAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGAGTGAGTTTTGAGAACAATCCGAATGGTATAAATAACCAGGTTCTG:1 + chr2R 11146258 3' - Quasimodo 258 2 53.47 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCGCTTAGTATCTGTATCTGTGTGAGTG:1 - chr3R 18448954 3' - hobo 40 1 72.83 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGAGGACGCACCTGGAGTCGTAGCCGAGCATAAGGATATGTGCATAACGGCTTCAATGACTTTGCCA:1 + chr3R 9082026 3' + hopper 1408 2 71.72 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCGATGCGAATGGGCTGACAGCCCGGGTTTTATCTT:1 + chr2R 21415174 3' - jockey 63 1 74.26 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATCGATGAATCCACCCTAACACAACATCAATGTGTTCCAAAATCCACCCCCTTTAGGGGTTTCAGCA:1 - chr3R 17846850 3' + roo 399 1 67.33 TTATTTTACATTATATTCAATTCAGATATATTATATTTGTAACCAAACAAATAACCGAAGAGGCACAGAAAGACGCCAGTAGACGAGAATGAATCGAAACG:1 - chr3L 74203 3' + Cr1a 4323 1 56.44 CTAAAAGATTGGCTACGTATTCTGGGCCAAAATACGGAGGGCATCATCATCTTTGGCTCTCAGCTGCATACGCATTTGCGTGGCGTTCGCGTCCTAACC:1 + chrX 8023896 3' + mdg3 338 1 59.60 GGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTCCATATCGACCAAGTTATCCACAATATCCTCAACCCTTTAAATTTAATTTTAATCAATGCA:1 - chr3L 1136880 3' + 1731 4457 2 70.30 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGCATGCGGACGAGTATTGGCAC:1 + chr2R 20544036 3' + 297 6929 2 77.23 AATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACCAGAAATCAGGGCGTTGAGGTGGTATCAAATAGATTAGA:1 + chr3R 7832931 3' - 3S18 39 2 60.40 CATGGCGACCGTGAGGCAGGAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' + blood 397 1 76.81 TTTGTTTTTATTTTTATTATTTTGTTTATTTATTTTTTAGCACACCAAGCGTACCTTCCACGACGCCCAAAACAAAGTGCGCCGTCAGGAATCTGGTTACT:1 + chr2R 19361436 3' - BS 5098 3 66.34 TCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTAGACATATTGATTTTATATCATCATCGATGGGAGGGATATATATTAGAATTCCATTAAGGCACTCGGTGCGTGCT:1 + chr2R 19658388 3' + 1360 3388 2 79.21 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACAAGAAATGGGCGGTGGTTGTTGAGGCAGTGCCTCTAACATCAAAAGCAGGAGTGGCAGC:1 + chr3R 15714221 3' - jockey 25 1 57.43 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTAGACATATTGATTTTATATCATCATCGATGGGAGGGATATATATTAGAATTCCATTAAGGC:1 + chr2R 19658374 3' + 1360 3374 1 65.35 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGTGCTAGTTACGCGAAGCGCGCAGTTTTTAATTAAAGCAGCATCAAAGCGAACTTTTTCCGCAGTAAATACCC:1 - chr3R 30655311 3' - roo 8669 2 74.26 CTCCAGCATTGGAGGGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGAAAAGGTCTGATCAACCAAAAAAAATAAAAGAAAACCCAAAAAAAAAA:1 - chr3L 6342457 3' + Porto1 362 1 47.73 TTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTGCCAATCGTTAGCATAGGATTAAATGGCCATGTATATAAAACGATATTAGGTATATTAATAGACAA:1 + chr2L 16316586 3' - Copia1_DM 141 1 72.28 TCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCCAATAGCGTAAATTATAAAAAGAATATCAAAAGCCATTGAAACGGGTAGGAAACAAAAGGGGAGTGAC:1 - chr2L 9298677 3' - 1731 4561 1 73.27 GTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACCCACTTATAGTATTAACTTATAACCCT:1 - chr2L 16456787 3' + BS 5041 1 73.27 GCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTA:1 - chr2R 5284547 3' + Doc4-element 2629 1 57.43 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCTATGGCCATCGAACTATTACCAGA:1 + chr3L 14285053 3' - roo 51 2 79.21 TATCAGATACCCGTTATTCAGCTAGTGTGAATTTTGCGAGCGGTACCGCTGCGTCTGTTTACTCGCCTTTAAAGTTCATCGAAAACTAATTTCGTTTCGAT:1 + chr3R 17900960 3' - INE-1 546 1 70.30 GCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGCAGGGATCCGGTTCCAGTTTTGCCGCTGTAGGATAACAG:1 - chr2R 14770754 3' - F-element 311 1 58.51 CACGGCGATGGTGACGCCGCTGCACTATGGGCCAATGACCCACCTTTTGCACGGCGCACAGTAAACATTCAGTATTATGTCCTTTAATTTCCTGCACCTTT:1 - chrX 20888223 3' - gypsy4 6418 1 52.48 GATGTTTACGTTGAGGAGAGCCTCAGAGAGAGCAGACGAAACTGCTAGGTCAGGCTTGGAATTTTTCCTGTTACAGTTTAACAACACTTTAAAAAGTAGTA:1 - chr4 482894 3' - McClintock 88 2 60.40 TTCTGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATAGTTTACTCATTGAACCGCTACATATGATATTTTAGTCGCTTTAGTTAGGCGTTCGAACAA:1 - chr2R 13747772 3' - I-element 4950 1 70.30 CTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGGAGGGAGTGGGCAAACTCGCTCTACAGCTACTCGCTGTGAGCTTAACCCTGCAC:1 - chr2R 9515660 3' - G6 1862 1 56.00 TATGGTTACTCTGCTTATTTAAAAGTGTCAGATGGGTGGTGTTTTTACGTAAGACGTAGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGAT:1 + chrX 9167857 3' - BS 374 1 50.50 AGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTGAAAATCAAATACTTAGGAGGAAATAATGGAAAAATTTCTAGGAGA:1 + chrY 382926 3' - 297 6896 2 63.37 GAGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATC:1 - chr3L 15452874 3' - accord 40 2 61.39 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTCAATGGGCCGCAACGACAGCTTTAC:1 - chr3R 23080847 3' - 412 49 2 71.29 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGACTGCAAATTTATGCCTTTTGTACAGTCTGAAACT:1 - chr3R 9081939 3' + hopper 1378 1 60.40 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATACACATATATAGATATATTTATTTGGGTGTATTGTTGTGTTATATAATCATGACTGCTCCAC:1 + chr3R 29408593 3' - jockey 22 1 63.37 CATGAAGCTGTGGCCGCGTCAGGTTTAAAAAGAAAGCGCCAGAGCAGCAAGTGGTAACCCCAACCTACCAGAATCCCAACGAAATGCAGTCGTTGTGGCA:1 + chr3R 29415785 3' + pogo 496 1 61.00 ACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACTAACACATGAACCTCAGCAAAAAAGCGACAAGAAAAAAGAA:1 + chr3R 11392514 3' + I-element 4917 1 65.35 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTGTATGCCAAGCGTAAGCGGAATTGCTTCAATTTTCGTTTTGCTTAACGGCCA:1 - chr3R 27386277 3' - hobo 24 1 55.45 GAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGCGGATTTCTGATCGCTGTTAGCCAGAAGCCAATCAAACCTAACGA:1 + chr2R 11686858 3' - I-element 146 1 55.45 TTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTAAACCCTTGAACAAGAAGGATTGTAAGAGAATGATCCGATCTAGTGAGTCACTGTGTAGTA:1 + chr2L 9706815 3' - mdg1 339 2 64.36 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTGTAT:1 + chr3L 11257424 3' + 1360 3382 2 72.28 TTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCCATTCTATTGCGCTTGCCATTTATCAAAACTTTGGCCACAGCGTTATTTATTATACCGTTTT:1 + chr2R 8580368 3' + diver2 4690 2 71.00 CACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGGGAAAAATTGCAGCTGAGGTAGTTAGTGAAATCAGTTTTCACATTTTCC:1 - chr2L 2694578 3' + Transpac 285 2 51.49 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGTGCAGAAACATTTGGCTGCAAAAAAGA:1 - chr3L 21967036 3' - Doc 21 1 67.14 GGATGCTGGTCGGCGGCCGTGATCTGTGCGAGATAGGGTAATCTCAAGGAAACCGTCCTTGTTATATTGACATTCAACTCCAACGTACTCGCTAAATATGT:1 + chr2R 4579624 3' + Chouto 64 1 62.38 TAACATTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAAGTGTGGCTTGGAAAA:1 - chr2L 7171734 3' - 17.6 7274 2 69.64 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGGGTATTATTTTATTAAGACTAC:1 + chr3R 16487373 3' + roo 9020 2 79.21 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGTGTGATTGATGTGGACGACAATGGCACTCGGGGATGGAGGGATGAGG:1 + chr3L 21852565 3' + 1360 3361 1 58.42 AGAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGACGTTTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTCTGTGGAGCGAAAATATAAATATATATCATATC:1 + chr3L 12292109 3' + 1360 400 1 68.32 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACCGAAACGCCAACGGCTTGGAGCACAAGCTCCTCAAAGGC:1 - chr2L 9437430 3' - P-element 33 1 47.52 CTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACAT:1 + chr3L 27415316 3' - transib2 15 1 64.36 AGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTTTGTTCTCGCTTCAGCTGGCTGGGTGCCAGTGGTTGAGGATATGTATCCGTATCTGTGGCGGATT:1 - chr3L 796925 3' - I-element 212 1 74.26 CATACTTTTTCGGGGGGAAGAACATTGAATTCCTTCGAGCGGCGCCTACAGTTGCAATCGGGCCATCAGCTTTCACATGATCGGATCGGGTCCTTGGCCCT:1 + chr2R 7273279 3' + Transib5 2820 1 73.27 GTAAGTACGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTCCTTCCGCAGGAGTTTCGAGGAGCCGAGTCGAGCGAGACATCAGCAAAAAAATAGATTCC:1 + chr2R 13307147 3' + Stalker 7115 4 63.37 TTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATTCTTTCAAAACTTCATTAGCAATCCA:1 + chr2R 17688661 3' - 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baggins 5112 1 61.39 ATGCTTACATTGCAGAATGCCGTTGTTGCCGTATTTAACTTAAGTTAACTAAACCCCCCCAACAGACGGCCACGACGGAAGCGCACATTCCCA:1 - chr2R 5657813 3' - gypsy2 6540 2 64.52 AGTCTTTTTATTTGGGATTTTAGACAGTCCAATGACAGCGCCTATGTCCAGCGACTGATGCGTCTGTCCAAGTCCGCCGAAATGCGGAGCTATATGCAGCA:1 - chr3R 28879885 3' + roo 406 1 74.26 TCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCGCAAATGGGAACAGTTTTCCCCTAGCCACAGCTACCTTGCTCTACCCTC:1 - chr2L 19629418 3' - P-element 315 1 50.50 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACAGCAAATTTAAAAGAACAACAATTAGAAAACGCAATTAAAAG:2 - chr3R 31188739 3' - I-element 34 1 60.40 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATTCTGAGTGAGTGCGGCATTGAATTTTCACACAATCAGAAACCAGTTTGAACGCATCCGCTTCCGCTTTTGCATGGCGG:1 - chr2R 23106448 3' - jockey 9 1 78.22 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGGTCTATAAATAAATACCACAAATATACTACACAGCCACCAAA:1 + chrX 12818892 3' + roo 9038 1 60.40 TCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTGCAGACTAAGTTTCAAATAAGAGATTCCTCGAATTCAGGTTACAACGCAATCGCA:1 - chr3L 19922586 3' + F-element 4277 1 63.00 AGCGGAGAGGAACTACTATGCAACGGAAAAAAAATGTTGAGCAGCTATTAAAAACAGATTGGCCAGTATGTTAAAAACACATTAATACAAATTCTCCTTTA:1 - chr2R 9592954 3' + Osvaldo 33 1 65.35 TCTGCTTGAAGCGGTTTATTAGAATGAATTCACATTGCTGTTCTTGGGTACAGCCACCCGCACATGGCGTGCTTAAGACTTCATAAAACTCACAACTTTCA:1 - chrX 9746589 3' - Stalker3T 292 1 79.21 TTTCTCAAAAGTGTGGCCGTGAACGTTTTCGGCGTTTTGTAGTTGTGGGCCAGTGATTGAGATGTGTGCTTTTATCAGCGAAGGAACTACTATCAGCTGGC:1 - chr2R 24848940 3' - INE-1 252 1 56.44 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTAATATCTTTGCAAGAATGCAGTGCCGCTCTATCAACGAACTCGACATTTTATCTCGT:1 - chr3R 29710961 3' - mdg1 7057 2 54.46 TTTGGGCGATTTTAGGGCGTTATAGTGGGCTTGACAACATGGGTCAACAAACTGGCGCTGCGTCTTTGTGTCTTTGTGCTTTTTTCAACGAATCTAGTATA:1 + chr2L 21794173 3' - INE-1 343 1 60.40 AAAAGGGAAATATCGGGATCCCTGCGGCCTCTAAAGGGTCAGCGCAAACACGGATGAGGGTCATGGCGTCATCCGCGGTGGTGTTGGTGGCGGTGACTGC:1 + chr3R 3382112 3' + gypsy8 315 1 62.00 GTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTTTATTTGTTCTTGTTGTGCATAAGTTGGCCTGGAAAGTTGAAGCCTTGCATGGCCAAAGGACATTCCAAACGGAATT:1 + chrX 18562085 3' - gypsy5 364 2 35.64 TCTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTCTACATTCCCAGCGTTTTTTTTTTCCCCGACCAGCTAATCTGTTCCAGCGTTTGTTCTCCATTCCTCCAGCATTTCG:1 - chr3L 7066137 3' - Doc2-element 218 1 78.00 AGGTAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATTATATGACCGTTAATGAGCTAGAGAGAATACGAACGAGTCAGCGAAACAACCAATAATAAACACAAAT:1 - chr4 120424 3' - INE-1 576 1 68.32 TATGTATATACTATGTATGTATGTATGTATATCTATATATTTACTAAGTGCTATTATACCTTAATACACTTTGAGCCGAGAAATCGATTTAGACTCAAAGA:1 - chrX 9442880 3' + Dm88 4370 2 73.27 TATCCATTAGATCTGTTACTATTTTTGTTATTTCGGTTTAATGGCGTTTTCTGTTTTGTTATCTGACATTTCCTTGCTTCCTGCTAGCGCTTTTTCCGTCC:1 - chr3R 15121381 3' + Tc1 1509 1 68.32 GTTTATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTGAAATCCTTCAAATGGCAGCCAACCGTAATGTCGAGCATGTCAAGGTCTTAATGCG:1 + chr2L 21060439 3' + rover 7261 2 61.39 GTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTGTTTCGCTATTTGTTTGCATTGTACTTTTGTTTCGCTCTCGCGTCAGCTTTATATACAGAGACACATA:1 - chrX 20494825 3' - I-element 4951 1 60.40 TCTGTTAATTTAAGATTAATATATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGGAAAAAATAATAATAAAAAAA:1 - chr2L 19817862 3' + G4 3786 1 83.00 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGCATGACTGCATACGTGTCTTACCATGCGAACATTGCCCAGTACTGTTCAGGTTCCAAAGCTTCGTC:1 - chr2R 5200910 3' + 1360 3380 2 67.33 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATTCATTACTTTGAAATGCATTGAATGAAATCAGATGGGCTGTAATTTAATTTAATTCTCTTCT:1 + chrX 12954270 3' + pogo 2092 1 66.34 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAAACATCATCAGTAAACTGTGCGTTGATATTGTGGTTCTTATCTGCTTCCACCCTTATACATAT:1 + chr2L 901825 3' + jockey 4963 1 52.48 AGTTGTACAGGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCACGTGGCCAAGAGACAGACAGGCCTGTTC:1 + chrX 12424294 3' + Bica 418 1 69.31 AACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATCAGATCTTAGTTTGTGTGATGTGATTTTTACTT:1 - chr3R 7876969 3' + jockey 4860 1 67.33 AGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGGAACAGCAGCGGAGGCAGATCAGCAAAAGGCCGAGAGTCATTCACATTACAAAGA:1 + chr2L 18231855 3' + 1731 4604 2 54.46 CGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAAATGCCAGCCGTCGAATGAAATATGGCA:1 + chr3L 3004504 3' + invader2 473 1 65.00 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGTGGTGGAGCTTCGGCAGTCTGGAGGGCCAAAGGATATGGCCAAAAGTCTGCAGAAGTAGCAGCTA:1 - chr3R 28940697 3' - hobo 13 1 65.35 TGTGCGATGCACCATCGCTCGAATACATAGTCTGTGTTTGAAATAGTATAAGCCAGACGTTTTGTTTCTTCGCAAATTTAAGTTAAGACATCGCTGATGAC:1 - chr3R 6039553 3' + Doc2-element 127 1 55.45 CAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGGCCACCCCCCACTGATTGTTGGCATTGTTTCAGCCTTGATTCGATGCAAAA:1 + chr3R 19050677 3' + Doc 276 1 54.46 TAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGGTTTATCTATGGAAATGAAGCGTAGGATAAGGCAAAAAGCAAATTAAATAAA:1 - chr3R 15678570 3' + Juan 4141 1 57.43 GACCGGCAATTAAAAGGTATGGAGATTTCGTACTTATCTTATAAGTTGGTCGCTGAAGGACAAACTTGGAACGAAATTGGCCTGATTAGCGGAAATTGGCC:1 - chr2R 6282504 3' - GATE 352 1 67.33 CCTACACCATCAAGCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCGCAGAAAATACTCTACGAACTGGATCGTATCGGACCCAAAGTGGTTGG:1 + chr2R 12356036 3' + G2 29 1 60.47 CAAAATGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTCTGGATGCGTCGGAAGCTCGTCAAGTTGGTGTACGTATGTGATGGT:1 + chrX 17945543 3' - I-element 4999 1 52.48 GCCGCCGACATCCGCCCAAAAAGCTGACACCACATTCTTTTCGCTCAGACAGGGCAGTGGAGTTGGTCTTTTTGGGCGGACAGCGGAAGAGCACAGGAAGA:1 - chr3L 6770409 3' + ZAM 127 2 55.45 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCCTACTACGAGTATAGTTTTGAGATAACAA:1 - chrX 1252797 3' + hobo 2892 1 70.30 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCACTCTACGCAAAATGGGAGAAGAAGCCAGAAATTA:1 - chr2L 17283473 3' - hobo 41 1 63.37 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAGCCAAGCGGCCACGAGAGGACAACGAGGCTACTTCGGATACGGACTCGGCTAGCGCCGAGCTACCC:1 - chrX 20330468 3' + P-element 2879 2 67.33 CAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTACTGGGAGATATAGCCCAAGTGCAGTGCCCTTGACTTAGGTCAATAACACGATTTGT:1 - chr3L 18037117 3' - Doc 4637 1 51.49 TCGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTATGAAAATTAATCTAATCCCGGGGGCATAGTTTTAATTCCCAATACAAATATCACTACA:1 - chr3R 28962561 3' - G5 4578 1 61.39 AACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACATTTATTCAAACTGCAGACTGGGTCCCTTAAAGTCGTTAAAATCGTTAAAATTAAA:1 + chr2L 13731349 3' + Juan 301 1 51.49 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCCAATCTCATATGTTCATGGGGAGTTCAGCACGATT:1 - chr2L 16818785 3' - pogo 40 1 65.35 TTATTAAAACACAGAGTGCATTTCGGAACAAACAAAACATGCGACTAATGTGCAGCCAATATTTATTGTCTTAACAATATATTTATGCAATAATTGCACCG:1 + chrX 11520302 3' + mariner2 198 1 69.31 CCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCCGAGATATAGGTGCTCATGCAAATGCAGATACACACATCGGTTATATGCGAGTTGGCAACTTGAAATATTTC:1 - chr3L 9120411 3' + Tirant 396 2 30.69 TGTTGGGCCGCTTCTTTTTACCTTATTCATTAACGACCTCCTACGACTGCATCCTTTTTCCCACGTCCGACGGCTGGCTGACAATCGTCGACACCACGGA:1 - chr2R 13157268 3' + Q-element 504 2 65.00 AATCAGTTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGG:1 - chr3L 11367498 3' + roo 374 1 57.43 AGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCTAAAGCTCGGGCTGGCTGCGATGACAAAGCAGTTAATGAATGAATGCCTCGCCATGT:1 - chr2R 11111247 3' - 1360 3216 1 65.35 ATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGACCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATAGTATTCCCCTACAGCCTTTT:1 - chr2L 20520666 3' - 1360 3211 1 79.21 AGTGTAAGCAAAAATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATAAGTGAAAAAAAAAACAAAAACACGCACACAATAAACCGCAA:1 - chrX 6640840 3' - rover 7038 2 71.00 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCACACATTATTTATGCACTTCATTTGAAAGAAGGTTGGAAAAACC:1 + chr2L 13711455 3' + hobo 2922 1 55.81 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATAATTGAGAACTTTGAACTTTTATTTCCTT:1 - chr3R 7883142 3' + roo 9026 1 76.24 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCAACACTGCAGCTGAGGTGTTAAGGGATA:1 - chr3R 24229100 3' - 1360 48 1 74.26 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCACAACAACAACTATTGACAACTATTTAACACGTGTCCGGCAAGTTCTTTGGTTACAAATCAC:1 + chr2L 1195126 3' + hobo 2926 1 62.63 GTAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTCGAAAATATAAACAAAATTAAGTTAAACAAAATGCATACCAAAATAAACTACAATAAAAGTCAACTAGAAGT:1 - chr2L 23373020 3' + gtwin 6915 1 77.23 GATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGAGTGTCTGTGAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGCTGGGGCTACGAATATGTCACGT:1 + chrX 14399741 3' - hobo 93 1 65.35 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATACATTTCCCTATATATATCTGCGATTTGTTATGATAGCAT:1 + chrX 14041205 3' - 297 15 2 63.95 AGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGNACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATGTTTATCTTCCGGCTCAAAGATAATTGAGGTCATCCCTCATAAATTCG:1 + chr3L 20198848 3' + 297 427 1 55.45 TTTTTGGGGTTTTATTTTGCGACGCCAAGGCTCAAAGGTTCACAACAATTGTGCTCATTAGGTGGCAATGAGCAATGGGCGTGAGCGGCGTGGATGCGACA:1 - chr3R 7178647 3' - BS3 231 1 67.33 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTATCATAATGATAATAAACACTTTC:1 + chrX 12135688 3' - jockey 62 1 77.23 GCTTGAAAAGTAGTCATCAACGGCAAAGGCACGCTCCGCTCCTCAGTATTCCCACGCTTCTTAAAAGCTTTTAGCTACCACAATTGGAAAAATCCAAATGT:1 - chrX 13092644 3' - mariner2 166 1 55.45 AAATCAGTTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGG:2 - chr3L 11367499 3' + roo 373 1 58.42 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCACAACAACAACTATTGACAACTATTTAACACGTGTCCGGCAAGTTCTTTGGTT:1 + chr2L 1195117 3' + hobo 2915 1 52.48 GAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACCGTATTGAAATTGACAGGACTTCGCAAACGTTCTAGTTGTGTATCAACCTGCACCATATTCTTGACAGATTTAAG:1 + chr2L 7461848 3' + Doc 53 1 79.21 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTGTTTCGCACCCTTTAAGACCAGGAATTGGGTTACTTGTCCCCCTGGGATCTACATCGTTCGGGC:1 - chr2R 10345586 3' - roo 8675 2 68.00 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGGATCTAAAATAGCATTTTATCGTGACTTAGAG:3 - chr3L 18034183 3' - Doc 49 1 65.35 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCCTACAAATCTCCCTCGAATGGGTTAATAATGTAGTGTAACCTTTCTTGTGAATATTTAAAT:1 + chr2R 16902946 3' + flea 244 2 61.39 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCAGATACGACCGGCTGTTGCCGGTTGCCTTTTGTCTCAGGCGAATCG:1 + chr2R 17346011 3' - hobo 29 1 53.00 TTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAGCCATGGCAGGAGCTGGCAGGGAGGAGCTGATGTTAAAGCCAAGGCAATAAGAGAAACAAAAGTG:1 + chr2L 4134414 3' - copia 4881 2 65.35 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTCATTGCTAATTAAGCCAAAGATGGGACAGTATTTTGGAAAGGAGTCAATATGTCAGCTACCT:1 + chr3L 16449818 3' + roo 396 1 66.34 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTAGAGCTAAATAGGCGCACGGTTGTTAAATATTCACCG:1 + chr2R 20996489 3' - P-element 40 1 40.59 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAATTATCATGATGATCAAATAGCT:1 - chrX 3358722 3' - roo 54 2 83.17 GTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATTGGGGACACGAACCCCGGCCGGCATCGAAC:1 + chrX 12716038 3' - accord 484 2 70.30 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCTATTAAACTCCCCAAACGGCCACGCCCCCTGTCTGTGTGAAAAG:1 - chr2L 9330218 3' - hopper 30 1 55.45 GTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGTTTACAATTTTGTCATTCCCTGACTTGCATTTCCGCGGGAGTCCTCTCGCTAATTAGATTCAT:1 - chr2R 8537821 3' - flea 10 2 67.33 ATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGGAAGATGAAAAAATCGGAAATTTGGATAGGTGGAGACTTATCCAAAAAATGAAGAAAGATTTCTGGGT:1 + chr3R 19447844 3' + roo 57 2 69.31 TATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGTTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTTTTTCATTAACGGACTAAAAACAACAAAGATCGACGATCTGTG:1 - chr3L 8013665 3' - transib2 2471 1 65.35 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAAAGTATTTCTATATTTGCCTGTTGTAAGAACATTTTTTCTCAGTGCTGTGCTGTCTATATTCAGCTT:1 - chr3L 10545097 3' + 1360 3381 2 49.50 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACGGCAGCACTTGACGTATTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAG:2 - chr2R 19209464 3' - Doc 62 1 52.48 AAGAAGCCCGAAGGACATGGAAGGACGATCACCACAAGCGAGGAGAGATCCTGGGATGATATTACTACCTCAATCCAAAATATCGATCCGGAGAACGCGCT:1 + chr3L 3645968 3' + gypsy8 493 1 55.45 ACACTTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAAAAGTAACTATAAATCAAGTACACAACAAGTACAAACTAACAGAGCACAATTTGCATGGCATCAAACCTA:1 - chrX 9023061 3' - Quasimodo 7274 2 72.28 TTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGGA:1 - chr3L 11367491 3' + roo 382 1 52.00 ACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCATTGGCTAATCAACTCTAACCTAAAAAATAAAAATTTATTGCCTCTCAAACACTTTTTTGCGCTTTTT:1 + chr2L 4073755 3' + Burdock 329 1 69.31 TTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCAAGTCAATACGCGTGGCCCACATGCGGCCGATTAAA:1 + chr2L 12155849 3' - I-element 379 1 63.92 GACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACAGTACTGCTGCACTGCCAGCGCACAAAAATTAATATGCAATTAAATGAAAATTAGCAAAAATG:1 - chr3R 10912887 3' + F-element 491 1 60.00 ACAACAACAAAATGAAGGAGTTAGTATACAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATACCTTCGGGGCGGAGGACTGTGGAAATTCACTGAAACTATGGA:1 + chr2R 8301017 3' - gypsy12 10045 2 63.16 ATGCGGGGCAGTCAGTTGGACAGCAAGATCGCGAGTGGAAGGAGATAGTGCGTCGGCCCGGCCAGGATTAGGATGGTATGGGACAGGGTGTATCGTTTTGG:1 - chr2L 22407365 3' + gypsy8 368 1 55.45 GTATGAATAGATAAGTCATTTGTTAAATAGCAAAGTTTCTGATTTCTTAAATTTGTTTTTATATCATTTTGTTTTTGTTTTTCAATTCATTCATTTTTTTT:1 - chr3L 2401765 3' - Tc3 1625 1 72.28 GGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCAGGCCATCTTTTGAGTTGCGGGTTTACTCTTTTGAATT:1 + chr3L 15452338 3' + accord 497 2 62.38 TGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTAAATCGAAAAACAGGTTAAAAGGCTCATAAAATCTGAAAAATACAAAGAAA:1 - chr3R 6425826 3' - copia 24 2 53.47 ATTTTTTTTTTGTTTATTGTGTGCTCTCTTCAATGTACGCAAAGTTTAATGATTCCTTTGGATTAAGTTCTATTTTCCATAATCACAGGTATCG:1 - chr2R 16289001 3' - Porto1 189 1 80.85 CGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGTTTTCATCGGGCAGATGTTCGCCAATTGTCCAGTTGAGCTCCAGGGACAGCTCATCCTCCTGATC:1 - chr3R 23354257 3' - opus 491 2 71.29 AAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCTGTGCATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTGTGGCATGCCACGTGTAGCAACTAAAAAGTATCCAACTGTTACAAGG:1 + chrX 13890293 3' + Stalker4 7080 4 47.52 AAAGCATAAAAAGTAACTCCTAATCTTTAATTGTCATATAGATTTTGAGATCATTTTTTTTAAAGCACATAATTGGAGAATCGTAAGTCCGAACAAAAATA:1 + chr2R 4138737 3' + gypsy2 6738 2 74.26 CAAGAATTCTGAGAATTATCACTGTCGCCTTTCAGAGGATGTAGATTTTTTTTTTGCCATTTGAGCTCGTTTTTTTTCTCCGTCCTGGCTAATTCTCCTGC:1 - chr3L 480254 3' + Doc 4359 1 48.51 TATATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTG:1 + chr2R 4023375 3' - Doc2-element 69 1 56.16 CAATTTATCTGACTCTCCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAATGATGGTGTGCTGGTGGTGTACCGATGGTATGGCTGCCTGAGTCGGCCAGACAAACAGAG:1 + chr3R 11200306 3' - Bica 4701 1 73.27 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCAATGATTTTTAACTTGTTTTGACGTTCTGACATCATAAA:1 + chr2R 15451624 3' - roo 8688 2 57.30 GTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAG:1 - chrX 6417730 3' - accord 7025 2 70.51 CAGCTGATTGAGAGAATGCAATTCCCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTGCACGTGGTACGATCGTTAATACGCATCGATTTTTCCAACCAACTCTCATTAG:1 - chrX 23004164 3' + transib2 177 1 75.25 ATAGGGTAATCTTAAGCTCTCTCTCTTTGTATTATTTAGTTCTGATTTCGCTTGTCTGATAGTTTTGGCCTAGGCTTAAGGTGTATGGTAGTACGTATGTA:1 + chr2R 17976202 3' + Chouto 96 1 61.39 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCAATGATTTTTAACTTGTTTTGACGTTCTGACATCATAAAATCGCGCTTCACTTCTGTCTCGCGAAA:1 + chr2R 15451651 3' - roo 9 2 64.36 TCATTGCCTTATTAATTTTTCTCTAACCCGTCAGCCTCAATCATTTTAAATAATAATAAATAATTTACATATTGTTTCACGCGAGCAATGCATAAAGAACA:1 + chr2R 23127341 3' - 1360 437 1 65.35 ATATTGCATAGGCACATACTACAATTTACCTCACCTCGTCCGCTCAGCTGGCGCATAAGTTCGAATTTGGTATAAGGATGGGGTTGAATTTAATCAAATGC:2 - chr3L 9174652 3' - 412 2 2 77.23 TCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCTCTGCCCGTCTTGACCTGCCCCAAAAA:1 + chr2R 15610032 3' + F-element 465 1 77.23 TCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTT:1 + chr2L 15019969 3' - BS 4810 1 63.37 TTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAGCATAGAAACAGTCAACGAAACTATTTAAAAAAAAAGGTCCGAAAGGCAGACAGATAGGCTG:1 + chr3L 2897094 3' + Porto1 4378 1 71.74 TTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAGAGTCAATATAATCTTCAATTTGAATTTAGCATTAG:1 - chr2L 18773314 3' - Max-element 43 2 67.33 AACCAAATTATCCCTGAACTTTCCGTGTGCAGCTGATAAGGGTTGCATCTCGTATACTATATTCCAGATGCATAATACTGCATTTAATATGACTTTAAATT:1 - chr3R 21152831 3' - Gypsy12A_LTR 162 1 82.18 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGAGTCACCTTGTGTGTGTCGTCTCTT:1 + chr3L 14152142 3' - blood 7064 2 78.22 GACTCGGCCATTGATCCTGATCAAGAATATATATTTTTTATATGGTCGAAGGGGCACAAGGAAAATGCAGTTTTAATGGAACTGTGCTTAAAACAATCTCA:1 - chr3R 4690345 3' - INE-1 92 1 69.31 GGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCATTTGCTTATGCTATATGCGGTTGGCATT:1 - chr3R 22877042 3' - X-element 4483 1 71.29 GACGGTTTTTTTTTTTGTTTTTGTCCTGGGCCTGGCAATTTTGCGG:1 - chrX 17001297 3' + Tc1 1471 1 91.30 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCACTGTGTAGTTTATAAATGGCTGGCAACAATACAGAAGAAAATAAATAAACAATGTAGGAATT:3 - chr3R 20396517 3' - I-element 16 1 63.37 AAACAAATGGAAAAATATCGCAACAAGCTACGTGCCCATCTGAACTGGCTTGAGAGATTTTTAACACGGCTATCTAGCCGAACTACCTCCTCTTGTAGCT:1 - chr3R 11140329 3' + Fw2 3716 1 81.00 TTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTCAGGATGATTTTATCGTCCATTTTGGATTATTAATCCCACTTTTGAGCTTTTCGGCCGCCTTCATCGAGCTGGA:1 - chr3L 3025694 3' - mdg3 322 1 80.20 CATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCAATCCCCAGATTCATGCATATTTCACCTACCAAACTCATTTTATTTGCAGATTTTATTGAAGCACTCA:1 + chr2L 16032376 3' + 297 6972 2 70.30 TGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATTTGACGCTAGAAAGAAAAGAGGCAAAACAATGTGCAGA:1 - chr3R 9214990 3' + Transpac 452 1 62.38 GTTGAAATGTACACGGGGCACTTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 + chrX 10664376 3' + invader6 4750 2 73.42 TTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTGTCATCATTCATAAGGAGTTTATGTTTTTGGAGTAGTTGATTTGTAATTGTAAAAAAACCCTGTGTTTCCTTTA:1 + chr2L 8463295 3' - Juan 5 1 61.39 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGAGGACGCACCTGGAGTCGTAGCCGAGCAT:1 + chr3R 9081990 3' - hopper 46 1 68.32 CGTAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCCATTCATTGAAAAGCAGCAGGAGAAACCACACACCGAGAAGCTAGCGAACGG:1 + chr3L 2463684 3' + invader1 327 2 61.96 CACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGAATGGGCAGTCTCAATGCGGCAGTGTGTCTCTCTTGGTCTGATGGAATTGCATAATCGCTTCCAGTTGTTGC:1 - chr3R 14931091 3' - BS 4780 1 65.35 ACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAAGATTTTTATATTTCATATAGAGTTGCATTTTTAATTTATTTTTCAA:1 - chr3L 17215719 3' - Ivk 31 1 53.47 CATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCAAAGTTTTTTGGAGAAGAAAACCCAAACCTCTTCGAAGGAGAGAAAATCCACCGAAAAACA:1 + chr3R 21967835 3' - hobo 228 1 57.43 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTATAGTTTTTCTTTTCGCGGAAAACCCTCTCTTTTCCATTTTCC:1 - chrX 7823180 3' - Transpac 30 2 60.40 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTGGCAAATTATAATTACGGCCATTAATGCG:1 - chrX 10210962 3' - I-element 49 1 68.32 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATATATAGAAATTCAGAAACGATACAAAA:1 + chr2L 17066860 3' + copia 209 2 76.00 GCTGATCCGTTATTTGGCGGTGAATCGCCACGCGTTTCTGGGGAAATGGCCTGCATACGAGCTATTTGTACTCGAAGCTTAAGGCAGATTAAACACGAA:1 + chr3L 13543369 3' - invader3 463 1 55.56 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTTTTTTTACATTCATAATACACATAGATATAAATGT:1 - chr2L 17066815 3' - copia 40 2 66.34 TTCCTAGCTGCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTATTTTTAGGCTAAGCCCGACACAAAACACTATATTTTGCCGGACTATAAGTAATGATGTGACGATTT:1 - chr2L 12942173 3' - jockey 4682 1 65.35 GAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATTTCCTTTACCAAGACAAGCACATTGCAACAGGTTGCACGCAGACTG:1 - chr2R 6735254 3' - Burdock 6159 2 56.44 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACCGAAACGCCAACGGCTTGGAGCACAAGCTCCTCAAAGGCGCGAGCGAGCTGGGG:1 - chr2L 9437415 3' - P-element 12 1 66.32 ATAAAATCAAGAAGATAAGATGATAAAGATCAATGTCACGTCGGACGATGAATGTGAGCGTAATGAAGCGCTTAATGTGGTGCAAAATTGGGAAAGGGGTG:1 + chr3L 9526260 3' - Ivk 115 1 65.35 CTATCAGTGAAATAATAGTGAAACGTAAACATTTTTATTCAAAAAAGACAGAGTTACAGACAGACAGGAACGCCTCTAAAGACGCCCTAATTAATGGGATT:1 - chr3L 4566109 3' + X-element 136 1 66.34 GGGCGGTGAATAAGCTGTGTCTGCTTAAGGATGCTCCACTCAAAGGATCCACTCGAATATCATGGCATTGGGCACAATTGTTGTCTGTGGAGAGCTGCGCC:1 + chr3L 11911562 3' + diver2 4461 1 74.26 TTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGCGTCACACAAGCGTCAGTTCCGCATGAAATGTGTACTATGTGCAAATATGTGAGCGGGA:1 - chr3R 27435019 3' - jockey 4659 1 60.40 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCATTTATCTGGTACTTGGCTTTATGAATAATTCAATATTTGCCTATTCCCCAACCAGTTCA:1 + chr2L 5741394 3' - 412 17 2 60.40 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTGTATTTC:1 + chr3L 11257427 3' + 1360 3385 2 75.25 TCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTGGGAAAAACAAAAGCAAAATGGCAACAGCACCAACAATGACAATAA:1 + chr3L 4713838 3' + transib2 2797 1 53.47 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATAATTACGGGAAATATTTATCGCTTAGATACGGCCAGCGAGCACGAAACACAATCGTCGGGG:1 - chr2R 16338063 3' + roo 395 1 65.35 GTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGCCAAGCCACCCGGCTAGTGTATCTGATAGATACAGATAGAAAACATATGATGCTCAC:1 - chr3R 9144318 3' + P-element 51 1 65.35 GTTGGATCTACAATGATTTAAGATACGGGGTATATAGTTTCCACGTGGGGTCTAAGCGAGCACCTATTACCACGGTGTGGGTCAAGTTTTGCGGCATCCAC:1 + chr3L 24939185 3' - Cr1a 4147 1 62.38 TTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCCATTGACAATTGCCCATTGTCGTTGAATAATTAAGCGGGGGCACGG:1 - chr3L 11367492 3' + roo 380 1 50.50 GTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATTTAAGTTGGAAACGAAGGA:1 - chr3L 3363874 3' - accord 179 2 81.19 TATATCTTAAGAACTATTTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGTTTGCTTGTGTGCGTGTGGTGGCCCCTGTATATGTGTCTCTTTTTTTCTCA:1 + chrX 11792850 3' - Tc1 1362 1 58.16 TATTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTACCAACAATCTTATTTTCAGTGCACTTTCCTTTCGACACAGTGGTGAATAATCGCTGCAGCATGAAAAATA:1 + chr2L 12567718 3' - 297 494 1 60.40 AACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATCGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCAATAGAACTCGGGAATAGACGGAGCTAGTCGG:1 - chr3R 2972480 3' - Cr1a 4155 1 68.32 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTGCATATTAAATATGCATTAACCGCAGTTCACTTTGTGCCTTTCCCTGCTTCTTGGTAACCACCGCATATCCGCA:1 - chr2R 9622539 3' - I-element 4 1 75.25 ATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTGCACGCAATTACCATGGGC:1 + chr2R 6482752 3' - gtwin 6934 2 61.39 CTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTCGTCGATGCCGAAAAGCAAACGATGTGCGTCAATCGATGTGG:1 - chrX 20985328 3' + 297 216 2 58.42 GCACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATACACACGTACAACAAAGCTTTTATCCT:1 + chr3R 18444078 3' - Tc1 1614 1 75.25 CACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTTGGGGAAAACGACTATAGCATTCTCTCTTTTTGTAGTTTTATAAAAT:1 - chr2L 22311781 3' + INE-1 539 1 79.49 TACAAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCCCTCTGGACATACGGCGCGTGCCTCTCAGAAAGCAACCCACCAGAGGCACAGTGCTCTAAACAATT:1 - chr2R 4739102 3' + Doc2-element 4324 1 56.44 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTATCTTTCCTACTCATCATCACTGGTAACGA:1 - chr3L 16680696 3' - FB 48 1 73.27 AACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACACATACTATAATATACTCACACACCCGCACTTAATCGTGTATAATTAAACCACGAAAGGACCTTC:1 + chrX 3697564 3' - invader1 223 2 69.31 AAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGACTGCAAATTTATGCCTTTTG:1 - chr3R 9081953 3' + hopper2 1557 1 74.26 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAGACAACATGATCTTGTGGCTCCCCATGGGGCACATAGTACAGTGGCTG:1 + chr2R 11380964 3' - mdg1 14 2 59.30 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTACATTTAAATCTATAATTTACAACG:1 - chrX 12401813 3' - I-element 52 1 77.23 AATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCGGGAAACACCTGAACACGGTAGCCTGTGCGTGATGTTTCAACTTAACGCAA:1 - chr3L 9318394 3' + jockey 378 1 50.50 AACATTGGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGCGTCACAATGCGATCGCCGCAAGTACAATTGCATT:1 + chr3R 21976747 3' - Max-element 8390 2 65.35 AGTTAACATGCCCCCTCTCTCCGACCACAGGGAAACAACACTTATTTAATGCATTTCTGGACCGGCTTTGGTGCGGCATCACAGGCTC:1 + chr2L 12175553 3' - accord2 203 1 55.68 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGGCTTGTTAGCACAAGGATAGTGATTCCAGATTCCGCAGGTGACACGCGTCACTCTCCACGTCCC:1 + chr3L 12724270 3' - roo 8676 2 65.35 CTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGATGAGGCACATCGTCTTAAGAATAGGAATTGCAAACTCCTTGAGGGTCTGCGACAG:1 - chr2L 235636 3' - Doc2-element 426 1 62.38 GGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCATTCAGAGCCTCCTTTTTGCGACACATCGCCGTTAGCTGATTGTG:1 - chr3R 24123575 3' + Cr1a 4293 1 59.41 CATCTTGTTATTAAAGTGTCTTTGATAAACCCACTCCGCGGATTCTAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' + 1360 3386 2 47.52 CATTTCCTCAGTAGTCCTCAGGTCGCAGGCTCCTGCCTCACAGCCGCACAATCACAAACAAACGTAGTTCATTTCAGTCAGACGTCGTCCTTGTCGTCTGC:1 + chr3L 13611966 3' - blood 426 1 65.35 ATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTCCTGCCTGTTACATACTTTTCATCGAA:1 - chrX 124083 3' + 297 392 2 67.33 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACCACAATTTTACTATATATGCTTGATAAAATAAATAATTGTG:1 - chrX 20982235 3' + 297 6924 2 80.20 TAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCCTGGCGTCAACTCCCAGAAGTATACTTAATTATATTGTCGTAACTTTAA:1 + chr2L 1238604 3' - F-element 4516 1 56.44 TCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCCCCGCTGCCTCCAACAACAACAGCAGGTGCAGCAACCTCTCCATCCGCAT:1 + chr3L 9427876 3' + F-element 359 1 70.30 CTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTAGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTGTTCATTCTTGTTTTTCCGGGTCCTTTCACTGATTTG:1 + chr2L 17007044 3' - mdg3 5139 1 71.00 CTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAGGCAGCGAGCATTTATGCCCCCAAAGGCAGCGCTGTCGGCAGGGATGGCAAAAAATGAGATGGGGGAGGGCA:1 + chr3L 10736905 3' + Doc 4288 1 74.26 TGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTTTTTTTACATTCATAATACACATAGATATAAATGTCTTTACGCAAGGACTGGCGCAAAACAACGATGGAT:1 - chr2L 17066780 3' - copia 5 2 74.26 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTCTTTCATTACCGATACTATTGGATCCGTAATGGTTTTATATGAA:1 - chrX 4056264 3' - roo 8695 2 57.43 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGTAAAATCACGTATTAATTATTCATTA:1 - chr2R 7242955 3' + 412 7498 2 75.25 AAGGCTCTGAGAACACGCAAGAGCAGCTCCAGCAGCAGCATTAGCACCATCGCCTCAGAAGAGATCAAATGACAGAGACCCAAGAACAAACACCGAAGGAC:1 - chrX 19378280 3' + G6 376 1 68.32 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAGTCAGCTACTAAGCGCTCTATCTCGC:1 + chr3L 3635468 3' - roo 48 2 75.25 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCACACGCACACACCCACACATAGCCACACACATACATCAAGTTTTCACAAAAAGCAACGCAC:1 - chrX 6146642 3' - hobo 15 1 64.36 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCAGAACCCACAAAAAACCCTGGTGACAAAACAAAGTTCAGTGTCTC:1 + chr2R 22404251 3' + hobo 2935 1 64.38 CAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATCGATAAAACTTAATTGCATGGCACTTAATGCATTTTAAGTTTTGCGGCCAGCGGAT:1 + chrX 5059595 3' + I-element 409 1 66.34 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGCTTTAATGAGTTCGGGATTTAAATTAAACATGTGCAATTTGAATTCCAGCGCAACTTAAAA:1 - 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chrX 2839912 3' - accord 7027 2 36.63 GTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTCCATCCGGACTTTGATTTTGATGTTTTACCAGAAAATGACTTGGCTCGT:1 + chr3R 25927259 3' - micropia 5225 2 52.48 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAATCCTCTATTAGGAGCATAATTTTCCACGGCCATAATCA:1 - chr3L 14887838 3' + jockey 4956 1 62.38 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTTGTATTTCCATTGTTTTAAACCAAATCAAGTTATTTCCTATCGGCG:1 + chr3R 27926643 3' - I-element 34 1 59.41 TTCAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCAGGAAACTTCAGGAGACGTTGCAGGTGAGTATTTGACGATTTTATAAAGACGGTGATCAGC:1 - chr2L 21255763 3' - HeT-A 5743 1 76.24 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGCGGCAACCGATGTCGATGTTGCTGTCGTGTTGTTGCCGCTGCAGATGTTG:1 + chr2L 610371 3' + P-element 2862 1 52.48 TAAAGGGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATCCTACGCACCAGTTTAGATTTAAATTCAGGACTTCAC:1 - chr2L 12802195 3' + invader3 5424 2 59.41 TTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGACGAGTTAAAGTTCAAGTATAAGTGCATATGCGAATACGAGCAAAGTAACAACACATCGTAAGGGG:1 + chr2R 18643534 3' - 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chr3R 14049349 3' - transib2 34 1 59.41 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGGTGCCATAATTTATGCCCAGACTAAGTGCATTATGTTTGGCACACGGGCTTTTAGTTACGCTG:1 + chr3R 22276936 3' - hobo 11 1 68.32 ATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTACTCTGATCTGCCCTGGGGCTGTGCCAATAAGTCGAGCAGCTTGTGATAAGAAATGCACAAGGTC:1 - chr2R 6783145 3' + Tabor 473 2 64.36 AGAAGGACGGAAGCACCAAGTCTTTGGAGGCCTCAGGTGACATTGCAGGTGAGTAAGTGTTGTACTTTGGCAGCGGACTACTTCAAGGCTTTTTAAAAGAT:1 - chr2L 13418860 3' - TAHRE 10091 2 64.36 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATTACGTATACGACAGCTAAGAGATATGTG:1 + chr2R 18400582 3' + pogo 2060 1 71.29 ATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGCGCCAAGATAAACACACAGTGCGCCAACATCTGCCACCAAATGTTGCAATCCC:1 - chr3R 9498198 3' - X-element 4375 1 56.44 GATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTGAAATTCATTGGGGGACGGACAACA:1 + chr3R 12123906 3' + roo 275 2 75.25 TAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTGATACTTTTTCTCCATCAGCACCTCAATCATTGCTGGCAAAAGATACTAAGCAAACTTTGTAGTTTTT:1 + chr2L 12239798 3' + I-element 5120 1 64.36 TCCGTGGCCAAAAGAAATAAAATGAATAAATTCAAACAAAATTCAAATTCAGATATATATAATTTTTTGTGGGCGCCACAGATTCTTTGTTGTTTTTATTG:1 + chr2L 20139969 3' + Stalker4 491 1 66.34 TACCATTCGGTTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTCTTTTTTTTTGTTTTGTTTCGGTCATTTGTCTTGGGACATTCAGCTGGGGTTTACTGTGCCGTTTTG:1 - chr3R 27570415 3' - Porto1 4354 1 57.43 AGAAGTTCGTTGACTTTAAATCTATAATATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGATTCTTGTTTTGCATAATCTTTCGTGATGTTATTCCTTACTTTAAAAC:1 + chr2L 2426665 3' + 1360 235 1 69.31 CCAGATCGACTCAGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACATCTTCTCATCGGTCCATTTGCCCAGGTAGTACTCCTGGAACTTG:1 + chr2L 12040048 3' - INE-1 99 1 52.27 TAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGAAATATGTAATTCATCTGTAAGGATATTTTGTAAAGTGCATTACTTTTACAC:1 - chr3L 8012025 3' - transib2 19 1 58.42 AAAGTTTTTTTTTATTTGTTTTGGTTTGGCTTGGCTTCGTTTTGTTTTTT:1 + chr2R 10914668 3' - HMS-Beagle2 491 1 90.00 TCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCACGTTACCTCCACCTCCGCTAACTTCATCCCATTCCCCACCTTTCGC:1 - chr3L 16758360 3' + Ivk 4940 1 54.46 TGGAAAACAGTAGCACAGGTATGTAGATTTGTAGTTACTTTAATCATTTTGTGCATATATTTGAGTGCGCTCCTGTGCTTGGCAATTTTCTTCGTAGGCAA:1 + chrX 13165573 3' + transib1 271 1 68.32 AAAAAAAAAAAGGAAAAGAAAAACAAACTCTGTTGCAACTCTGTGCAGCAGCGGCAGCAATGAAAGGAAACTTTTTGCAACTTAGCGCCAAACTTTATGCA:1 + chr3L 13653429 3' + Doc2-element 251 1 56.44 AAACAAACAAACAACGAACGAACGAATGAGCGTGCCACAGAACAAGATGAATCGGCGGAAGGGGAATAGGAAGTTCTCTTTGG:1 - 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Transpac 2 2 78.22 TTATTATTATTATTATAAAATTTCTAAAGCTTATATTTTCACCAAAACCAACAGGTGACAAGTTTTCTCTGAGTGCACCTGATAAGACGCCCCATTTGATA:1 + chr3R 20360102 3' - invader3 5054 1 78.22 TTATAAAAAAAAACAAAAGAAAAACAACTTTTCGTGGAAATGCCGTGGTGAAAATCGAAAACCGAGAAAAGCGAAAAACAAAAAATGCTATAACCACACAA:1 + chr2R 10796327 3' + HMS-Beagle2 481 1 77.23 ACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATTTTTGTAGTAATGGTTCTGTTGCTAATTGTACTGCCAATTACTATCTATAAGCTGCTTA:1 - chr3R 11152025 3' - mdg3 5041 1 61.39 CTCTCTCGCTCTCTATCAAAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 1982172 3' - 1360 98 1 50.50 ATTTAAAACATAGATTAATACTTGTAAGTATGGCGCACATATCTGCGGCCGTCGCTTGGATCGCTTGGAGCGTCCTAGAGGAACAACAATTTAGTAGCACG:1 + chr2L 12827376 3' + TART-A 13260 1 58.42 TGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTGAAGTGGTAAATGGGACGTCATGGCAACCGATGCCCTTTGTTCTCGATCCCCT:1 - chr3L 4354304 3' - F-element 37 1 61.39 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCCATCAATTCGCCTAAATATTTATGCTTTTATACATATTTTCCGGAGCCATTTTGGCATTCGTCT:1 + chr3L 4637377 3' - 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chr3R 26912919 3' - 412 7071 2 55.45 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTTCGTATATATGGGTAATAATAATATACTTCAAGTTTTTGCATAACAAATAAAAC:1 - chr2L 3988519 3' - I-element 33 1 56.44 TCGCAAGACGGTGCGATCTATCTTTAGTTAATTTACACACTCAAATAGTAACAAATGGATTTGACTTTAATAAAATCACCTATTTTGCACATAGCTTTTGT:1 + chr3R 756978 3' + Gypsy6A_LTR 388 1 67.33 AAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTCGGAGGAAAAGTGCAACATCTGGCGCACTTCGGATTGGTAAAACCAAACTGAGATAGCAAAATATTTG:1 + chrX 14991677 3' - accord 185 2 62.00 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTATGTTCCAGTTTAACGAACTGATCCACTTGGAGTGCGTCATCAAGGAATCACTGAGGTTG:1 + chr2L 5269884 3' - hobo 14 1 65.35 TTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTATCACATAGTTAGTATCACAGTTGAACCAGTACGAAATAATCATT:1 - chr3L 3317146 3' - 1360 33 1 57.43 TGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGATAAAGAGGGGAGCGGGCAGGGAACTAAAGGCTCGACTGCGACCTAATAAAATTCCGTTTTACAAATTGAGTTT:1 - chr2L 14074921 3' - jockey 217 1 77.89 TCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTATAAGTATGGCAAAAAAAGAGAAAAAGTTTTGCAAAAAAAAA:1 + chr3L 10804836 3' + Doc 4560 1 58.42 TTCAAAGCTCGGACTCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATAATATCAAAATTTCGTGCATAACACACACAATTCA:1 - 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