Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score GTATAATAATGATAATTTGAAGAAGGAGTATTGGTGTTACATGGATTGTGGATTGATAACAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3L 7345439 5' + pogo 11 1 68.32 GCCATAATCTCGCCGGAATAGACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATA:1 + chrX 4294749 5' + P-element 2834 1 24.75 GTACACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTACGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3R 30553602 5' + 412 49 2 70.30 ATGTCGACCTAGTGCATGCTGCTCGCATTACATTTCCGCGGCTAAACTGCACAAACAAGCTGAGCTTCATAGCTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 6107699 5' - roo 405 1 75.25 GTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:2 + chr2L 4063700 5' - roo 9029 1 66.34 TACAGGTAATATCATATTTCAATTAAACCTCAAGCCAGACTCTTCAGCACAATAATGCAAAACAAACAAAAAAAAAACCTAACTACAAGTTAATCAGACTC:1 + chr2L 18366749 5' + gypsy2 479 1 70.30 TCGTTGAATTTGCATTCGTTTTCGGTAGAATAATGTGAATTTTCGTTGACTCCCAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCG:1 + chrX 22636674 5' + flea 475 1 54.46 ATTTAACGTATTTTTATTATTCAATATATTTTGTAGCATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTAT:2 - 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chr2R 15788620 5' - Transpac 262 2 72.83 ATGTTTTGCACGCATATGTAATACATAATATATATGTACATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTT:1 - chr3R 12468333 5' - copia 253 1 58.42 ATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGGGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTT:1 - chr3R 25086141 5' - Bari1 1660 1 77.17 AGACGGCAGCTGCCCTCTCTTTCTGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCG:1 - chr3R 6234500 5' + Doc 431 1 76.24 CGATCACCGAGATCACCTGTCTTCATTTTATGGGCCGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr3L 3650049 5' - mdg1 7418 2 64.36 ACCGGAGGCAACAATTTCCATTTGGCGTTCGCTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTG:1 + chr2L 17994153 5' - roo 367 1 63.64 AAATAAATCAGCTTTATAGCTAATAAGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 16614299 5' + roo 48 2 75.25 TTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACA:1 + chr2L 14793506 5' + Stalker2 47 2 70.30 ATTTCAAAGTGTCTTAAATAACGCTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTC:1 + chrX 14524327 5' - Doc3-element 4494 1 78.22 AAACAACAACAAAACGATCCCTTTTAAATAAAATTCGTATCGGGCTGTTTTTGT:1 - chr3L 14111327 5' + invader6 4568 2 64.81 GGAAAAGTTAAAGTCAAATATTTCTTGTATTTTTATTTATCTTTTATTTATATTTTATATTTACACTAAATATGGGTCAATTACGAATGCATGCATTTAAT:1 + chrX 9727895 5' + Transib-N1_DM 424 1 73.27 TGAAAACCGCTAATCAAGTTCACAGGTATCGGTATCCCAGTAATCCGCCCCCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAAT:1 - chrX 9308161 5' - opus 234 2 53.47 AGCCAAGCGCTCGAGGCAACGCACAACTTCCGGCCGGATTGTTGGCCATTTTGTTTTTACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr2R 19560138 5' + Tirant 15 2 66.34 AGGGAAATTATTATATTTGAGGTTTTATTTCGGGAGTGTGAGCAAAGTATTTTTTTGTAAACTTAGGTTTTTGGCAGTAACATGGACTGGTAACATTATCA:1 - chr3L 2180999 5' - HeT-A 5853 1 56.44 GCTCTAGAATTTTGATTTAGTTTGATTGGATGTTGTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 9799678 5' + hopper 148 105 58.06 ATAGAGGGAAACCTATTAATTTTATAGCTTGTTATTCGGTTTATTATGATAATAAAAACTTTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr3R 17003279 5' + pogo 9 1 74.26 AAAAAGAATTGAAAACCCGAAAAAAACAGCAAAGCAAATGGCCTACAATAATTGAGATACTACTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCAATACAGCTG:1 + chr3L 15343543 5' - pogo 1857 1 71.29 ACGCACTTTTTGTCCATCGAAACAAAAAGTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 16750158 5' + Doc2-element 219 2 92.68 TCGGCTCCCGGACTTGGACCCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATAT:1 + chr2L 12808149 5' - Tirant 8485 2 56.44 TGTGAATGAATTATTAATGTTTCTAATAAGACTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:2 + chr3L 3757354 5' + roo 8708 2 75.25 GGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAAC:2 - chr2R 16185088 5' + 17.6 46 1 82.18 CTTGTATGGAATGAATAAAAAGGTTCCTTATTACGTAATTAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr3L 6033529 5' + 412 35 2 60.40 GCTGTTCTTAGCTTTTATTTCCAGTGTTTCATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTT:1 + chr2R 9950124 5' + 3S18 5811 2 68.32 AAAATAGTTTGCAACTCTCNCCCGGTTAGTTATCGATCGCCATCAACACCCGTAGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr2L 8176396 5' - 1360 3366 1 55.45 CACCGCAAGCGACGAATGGCGTATAAATTTGGCACACACCACGCTCCCTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3R 6086770 5' + Doc 36 1 52.48 CACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:3 - chr2L 7666158 5' - roo 9025 2 72.28 TTTTAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:2 - chr3R 8582601 5' - roo 9029 1 65.35 GAAATTTACAGCGCCGGCATTTGACATCGGCTTGGGTCAACTATTCGAAGATTTCACGCAGATATGTAAAGTAAAATAACTAAAAAAAAAATAAAAAAAA:1 - chr3L 3630889 5' + Doc 4701 9 63.00 TGTAATTCCATTGCTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 + chr3R 4971405 5' + F-element 27 1 52.44 CGCTCTCGCTTCGATGACACACTTTTCGACATATTTAAGTAGGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr3R 24767795 5' - P-element 2856 1 46.00 ATATGTATATATGCATATATAGCCAGATTCAGATTGAGATTCATAAGTTGTTATATGTACGTATGTAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCT:1 + chr3L 12644123 5' + diver 5899 2 71.29 CTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGA:1 + chr2L 23300000 5' + invader4 366 1 79.00 CTTTGACTTCGCAATCGCCACGCCCCCCACCCACGCATTTGTAAATGCTCTCGCCACCTATTCAAACTTTACTCTAAGTCGCCTAAAACTTCGTCTTCTTC:1 - chr3L 124700 5' - gypsy7 491 1 63.37 CAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chr3L 10474189 5' - copia 204 2 80.20 GTCGTGCAACAAACCCGAGATCTCACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTT:1 - chr3R 10391257 5' - invader4 3064 2 56.44 TAATATGTATTTCATTTCGTTAACCTATATAGATTTCAAATTCAGGCGGTAACAATAATAGCACTGCTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAATA:1 - chr4 126702 5' - Tc1 1407 1 66.34 ATACCGCTCCGTTCCGCTTNAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:1 - chr3L 6658208 5' - hopper 1362 1 79.21 CGGCCAGCAAGGAGCTAACCGGTTTGACGCACGAGTGCGGCGTTAGATTGACGGACATGGCTAGAACGACTCGGTTATTAATCCTGATCAAGAATATACAC:1 - chr3R 7911464 5' - INE-1 80 1 62.38 AAAAAATGAAACTTCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 + chrX 22789327 5' - Tabor 445 2 66.34 CTAATGATGACCTTTTCACTGCGGCACGACAACTTAAGGTCATAAACAATCAAAAGCGGCTCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTG:1 - chr2L 15351459 5' - roo 7 2 66.00 ATGAGCAATTCTGAGCTACCGTAAGCCACCCTAAACCAATTTCCCTAACAAAATCAAATAACACGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTC:1 + chrX 14983373 5' + mdg3 5118 1 40.59 TAACTATTAATATATTTCCACATATACACTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 12944665 5' - roo 387 2 61.39 TGAATGTTCGTTATGAGTTNATTAGTTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGATAGCTGGATAGGTCCAGGTCGGTTTTAGGACGGAGTTGTAGAGTA:1 + chrX 11972702 5' - Fw2 3519 1 76.24 CGAGGGTTTCTCTCAAAATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATCACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACG:1 - chr3R 10741143 5' + 1360 3364 1 40.59 AATTAAAATTAAAGTAAGCCATTTGCTCGCAACCGAATTATTTAGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTT:1 + chrX 20419120 5' - flea 4986 2 55.45 AGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATC:3 - chrX 983368 5' + Juan 3836 1 54.46 ATAAAAGGGAAGGAGAGCGGGCGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCAT:1 + chr2R 10525012 5' + R1A1-element 5331 1 82.00 CCATCTAGCTATCTAACTANCCAGCTATATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATC:1 + chr2R 18723048 5' + HMS-Beagle 6837 2 69.31 TATCCTGGCATATTGTTATTGCTGTTGCTGTTTGCATTTCCACCTGCAACGTCGCGTCGCACATTTTTGTTTTTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGA:1 + chr3L 10763926 5' - Rt1b 5134 1 60.40 CCCATCAGCAGATTGATTCGCATGTTTGGTGGCTTTTCAATTGATTCGATTCGATTTTAATTTGCAGAACTCGGCATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGT:1 + chr3R 10110396 5' + Doc 7 1 70.30 TACGGAAACCTAATTAAAATGCTTTCCCGCACAATATTTAGTTTGGAAAAATTATACGTATACGTGTATAATCCACACAAGCTGAATAAATATAAATAAAT:1 - chr2R 16726759 5' + Burdock 306 1 80.20 TCAGACTCTATTTTCAATTGAAAGTGTTCAGCTCTTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3R 29608868 5' + roo 10 2 70.00 TACTAGTGCCTTTTTTTGTTATCATTTTATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:3 + chr2R 16160733 5' + mdg3 5261 1 71.29 CAATCACCATGTGCAGCCAGCCAGTGGAGGGACCCTCTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 - chr2R 24278069 5' - 412 451 2 64.36 TCTTCTACAGACTGCTGCCGAGGCCAAAGTTCTTTTGGGTCTGCTAGCCATTTCGGACCTTTCCACCTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATT:1 - chr3R 19446575 5' - roo 8807 2 66.34 AGGCACCACCAACCACATCAAGTCCAGCACCCACCCACCCATTCCACCCGCTCGGACCTCACTCAGCTGTAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGC:1 + chr2R 22824809 5' - invader4 95 2 54.26 TTTTAATGTTATCTTGATCAAATTCTCATCAAGTTGTAAACCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 20354070 5' + 412 7090 2 60.40 TTTATCAAAATGTTGAATACAAATTCATAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAAT:2 - chr2L 14793543 5' - Stalker2 7602 2 71.29 TGAGCTCAGGAAACGCCCTAAATTCAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr3L 7300511 5' + Doc 55 1 78.00 CAGTATTTTGCTGCAAGCTTTCTTACTCCTCCTGCTATACAAACTTTCCACAGCACATATACAAATATACCAAAAAAAAGCAACAAAAAACAAA:1 - chrX 13789875 5' + Porto1 4435 1 53.19 GTATTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chr3R 20420926 5' + blood 7013 2 65.67 CGGTATTTCTCTTACTGCCATTTCGATTTTTCGCCAACATTTTCTTCTCCTCGTCCAAGGTGTCTGGAGCATCCAAAATATTAAGCATTGGATAGGCAACA:1 + chrX 15262690 5' + invader3 4998 1 56.44 GCCAACAAAAAAGAAATTATCCACAAAAGGCAACTTGAATAACAACTTGACGCAGGCAGCCAAACAAAAGGAAAATATCAGCGTATCCGACGCTCAAAATC:1 - chr3L 14211975 5' + Porto1 214 1 74.26 CAGAATGCCACCAAAAATTCCCAAACTCATCGTGAATTCATTAAAAAATGAATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTGAAAGGATGGTTGGGTGAAGTA:1 + chr3R 25236029 5' + invader2 341 1 58.42 TCACTTTATTTAACGAACTTCTTGTTTTATAAAAAAAAAAAGATTCTCAAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chrX 10286218 5' + roo 25 2 55.00 CGCACACACAAGGTCAATTAAATTTGCCCTTCACACATTATTAAGATTTTCCATCAGACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3L 9928618 5' + roo 17 2 62.38 TATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr3R 19987411 5' + Doc 44 1 64.36 GTTGCGTTTCAAATTTAATTTACCAACGCATAAACACACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2L 7666194 5' - roo 398 1 69.31 GAAGCCCAGCATAATAGCCCGAAGCTGCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chr3L 16891145 5' + P-element 39 1 33.33 TGCAACATAATTAAAAATCAATGGCATACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr3R 11321029 5' - hobo 2892 1 72.28 TGGAGCTCCTTTATGAAGGCGACGGAGCTGCTTTTTATCCGTGTAGCAAGCAGTAAGGCAATGCCAACGACGACAACATGAAAATGTAGAATGAAATGAAA:1 - chrX 19405223 5' + Copia1_DM 4160 1 76.24 GTAATTAAAGTGGCCAGAGGAAGTGAACTGAGCTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chr2R 6107781 5' + roo 2 2 57.14 GCCATTGGGATTTTAGGCCAGAATCAAATACATCTACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGC:1 - chr2L 19678175 5' + flea 35 2 67.33 TAATTTCGATTTGCCTTTTCAGCGCACAACATTTTTGATATATTTTCTTAATACTTTAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCT:1 + chr3R 2950220 5' - F-element 4576 1 55.45 GTATGCCTACGCTCAAGCTCACTAGGATATTCTGCCATATTTACACTCTACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATACACA:1 - chrX 5219768 5' - hobo 2912 1 54.46 ATGTGTGGGTCGTTTTCGTGGGCTGGTAGCAAAATGAAAAAATGAAACTTCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTG:1 + chrX 22789291 5' - Tabor 7320 2 70.30 TTTAGCAAAAAGGCAAAAGTTAACTTTGGGGCACCCTCTCCCCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATA:1 + chr2R 21747537 5' + mdg1 7075 2 58.42 TATGATTTTCCACTTTTTTGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr3R 14193900 5' + pogo 33 1 58.42 AGCGAGGAGGCGATAAAGGCTGAGAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr2R 22856608 5' - 1360 3372 1 62.38 GGTGCGATTCTCATACAGGTGACGGCCAATTCGTTAACCAATTACATGTTATTATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTATGTGTCCTAGTCG:1 - 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Idefix 7063 2 48.24 TCGTAGTCCTTTCTGGCTTAAAAGCAAAAGCCAACGGTCAGCTCTGCGGGCACAGCCACTAACACCGAAATCACCACTCACTTGTCCAACCGATTGCGATT:1 - chrX 20610235 5' - diver2 469 1 54.46 GGGGCTTTACTGTTGGTGTTGCAATATCCTGTAATGATGAACTCCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chrX 21060324 5' - 412 444 2 67.33 GGCAAGATTAGCCGGCTGAAGGGATGAAGATACAGCTGGTTTGCAAAAAGTATGTGTACCCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chrX 15287944 5' + hobo 14 1 61.39 AAAAATATTCCGTTTTTAGTATTCTTTGGAGTCTGGGCGAACTTTGTGACATTTTGCATTGCAATAAATGACTAGCTACTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATT:1 - chr3R 7392354 5' - rooA 7528 2 74.26 TTGCTAGTTAAATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chrX 13146912 5' - roo 9051 2 54.35 CAAGGAGCCAATATACATACATATACATGTACATATACATCCACGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr2R 15349495 5' - P-element 2854 1 47.00 ACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTG:1 + chr3R 6266310 5' - roo 367 1 70.83 TTCGCCACCACTTAGGTCCAGCGTGGAAACACAACTTGCTGGGTTTTCGGTGGACATTTTTTCAGACTGACCTACGCCCTCCAAGTGTGGGGAACAGCCTC:1 + chr3L 10223151 5' + G5A 2441 1 70.30 CCCGGTATGGGAAATATGGCTACAAACTTTTTTTCCATACACAATTACATATTTTGAAAAAACTCACGACATAGGAATCTAACTTGGATTTAGTTTTTTTT:1 + chr3L 1380588 5' - S2 176 2 76.24 AAGTGGGTATGTGAAAAGTGGCAATTGTGAACTTTTCTTTCGGCGTGGCCGATTTCGATACGAGCGAATGCGGCTGCGGATATTTATGTCTGTTGGATT:1 + chr3R 14350462 5' - Quasimodo 7023 2 67.68 TTCAACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:2 + chr2L 12958914 5' - roo 9038 1 61.39 GGACGCAGGGGGGATGGTTGGAGTAGATAGGGGAATACGTATTACAGGTGAGTCAGGTAAAACCAACATACACACACACACACACACACACACACATGTGC:1 - chr3R 18006525 5' + accord 7031 2 63.37 TAAAGCCTGGGTGGAGCAGCCAACGCACAGAGCGCAGCAAAACAAAAAAAAAACAATT:1 + chr3R 26786248 5' - Tc3 88 1 93.10 GAATATGCGTAACTACAACTAAGCTAATTGACTAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTA:1 + chr2R 24930111 5' - Cr1a 3993 1 67.78 CGGCGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3L 19349916 5' + 1360 1 2 74.26 TACGCATAATAATTAGAGANTTTAAACATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 + chr2L 6251682 5' + mdg3 52 2 72.28 CCCACGTACGCGGGAGCCCCATGCCTCATATGGTCGCTTGACATAACGTTACAATAGCGTCGCTGAGCAACAGTGTGGTCTGGCAGATCTTCCACCATATA:1 - 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roo 9039 1 58.42 AACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 + chr3L 5710255 5' - Transpac 265 2 73.27 GTACTTGACAGACCAAGCCTTTTCAACTTCATTCTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTT:3 - chr4 74319 5' + 3S18 42 2 64.36 TGAAATGGCATCCTTTTGTCAAGTCTGGCAATAAGTTTTTTGTCAAATCGATAGAAATGTAAGAGACTAATTAAATTATGAAAAAAATCCCAACAATTTTT:1 - chr2L 21767120 5' - INE-1 386 1 78.22 GATATACAAAAAATCAACAATTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:3 - chr3R 26317967 5' - roo 9019 2 78.22 TAGCCGCATTTTGTGAATTNCTCAAAATGTTACGTAGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr3L 20520689 5' - P-element 2847 1 38.61 GCGACTTGGCATGTCCTGGCACCCAAGTAATTCTTTTGATTGGATATTGGCAGTGTGACGTGCAAGGACTTTTCATCTGACGTCGATGCTCTCGGTGCGTG:1 - chr3R 27518882 5' - invader4 449 1 54.46 ACATTCGCGTCAACATAAGCTCCCACGCTCCTACACATAGATATTAAGTATCATTTTGTTCGTGAAAAAGTAGAATGTAATGAAATAATTCTTGAATATGT:1 - chr3L 18701867 5' + Copia1_DM 4176 1 67.33 AAACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr3R 7869105 5' + 297 18 2 62.00 GATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAAC:1 + chr3R 1418286 5' + BS3 223 1 63.37 GCAAAGTATGCTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:2 + chr3L 17181438 5' + jockey 4684 1 58.42 TGAAGCCAAAGCCAAGCCCCTCAAGGCGATTGTCGTTTCTTGGTAGGTGTTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:3 - 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chr2L 12511619 5' - copia 236 1 61.39 AACTCCCCTGACATGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 8765530 5' - roo 387 2 57.43 ATCAAACATACATTACCGACCCAGAGTTAACACTTAACAGCATTAACGTTAACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCT:1 - chrX 2757790 5' + Tirant 8187 2 63.37 TCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGTTAGATCAACTCGGCTATTGATCATGACCAAGAATATA:1 + chr2R 1751256 5' - INE-1 83 1 89.11 CAATTTCCCTGCGGAAGTGCTTAATTATTGGATATTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3L 12241875 5' + roo 8705 2 70.30 ATTGATGGGTTGTAGCATGTGGTTTGGTCACAAGGGGTGGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr2R 21351325 5' - mdg1 7421 2 58.95 GAATATTTTAACTCGATTCAAACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:2 - chr3L 8036445 5' - roo 9047 1 54.46 TTGCCATAATGATTCCGATNTTGGACATTCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACC:1 - chr3R 19448182 5' + roo 8862 2 53.97 GGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGG:1 - chr2R 2879464 5' - Stalker 6970 4 51.49 GACACCAATTGAGATATGTGAGTAACGCATGCAGACACACGTCAATGTAGACAGTGCACTATGGGGCATGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGGTGCATG:1 + chr2R 7546243 5' - hopper 93 1 55.45 CCCGCGCATAAATTGTCTCTCAATCTTGCACGTTTCCCTGCCCCAAATTTGACATTTCTCATATCAGCCATTTCCTTGTGTGGTAGGATGAACACTCATAA:1 - chr3R 24085404 5' + invader3 2 2 77.23 CTCTCTTTGTTTAAGCAACTTTTTGGTAGTTTCCGTTGCTGCTAATTGACCGGCTGTTTTAAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTC:1 - chrX 2823533 5' - hopper 1038 1 64.36 GTTACGTAAGCGTCTAAATTGTAGGGACTTAGGGCGAACCACCATGGGATGAATTCCTTTATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 - chrX 7157433 5' - blood 7356 2 61.39 CAAGAAACCACCGTGACACTTGTTACGCGATGGGCTACGTGTTAAACGCATTTCCGCCACTTGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAA:1 - chrX 9413886 5' - 412 7543 2 71.59 ATGTATGTACAAATGTATAGTATTGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATATTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 + chr3R 19216367 5' + 1360 54 1 79.21 CACTCCGTGGGTGCCGCGCCCCCAAACGTCAGTGCATTTTCAGGGCTCAAACATATGCGGTTTGAAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGCACT:1 - chr3R 19581423 5' + R1A1-element 152 1 56.44 TCTGGCTTTTTTTTTTAATTTTTATTGTTTT:1 - chr3L 18290274 5' - Doc 4689 2 80.65 ACACATAAATTTGGCCTCGCCAAGAACCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr3L 13785426 5' - pogo 2053 1 80.20 AGAAAAATGGTTATTTATANGCAGAAATAAGGCGAATGAAAATGTATTCATGTTATATACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCAC:1 + chr2L 13422233 5' + F-element 4335 1 53.47 GCATAACTAAACGGTGTACAATGAGTTATGTCTTAATCAGGATCCCCGAAGGCCCCTTGTTCGCGGCTATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCGGGGA:1 + chr2R 11321829 5' + Rt1b 4736 1 55.45 GCTAGCACCGGTACCACCATCATGTCCAGAGATTACAATGTGCTCGGCTTTGCCCTGTTTACACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTGATGACAAG:1 + chr3L 16792533 5' + Chimpo 4024 1 58.42 GAAAAACAAATACAATTTCACATTCCGAACCGTAGGTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGC:1 - chr2L 9696047 5' + FB 42 1 66.34 TCGCCATTTGAATATGGTCTTTTTATTTTACGCCCTTCAACAAACACAACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTAAAAATAGTAGACAGAGCGTGTTGGG:1 + chr3R 19757238 5' + Circe 7399 2 61.39 CCGATCCGTTTTCCTGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACC:1 - 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roo 9032 1 65.35 AAACGAATGGGAAATGGGATGGGATGCAAAAATATATGTACACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr3R 30553639 5' + 412 12 2 67.33 CAAATGCTTTTTTTATGCGCTAATGTTACTGCGGCTTCTGGTGACTTTAAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTGAATTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTTTA:1 + chr2L 19304546 5' - Porto1 4432 1 55.45 AGAAAAAATGGTTCTTTTCTAAGGATTTCTGTTCTGTAAACTACACTTCATGTTATTAAGGATTTATCGAAGATATATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTA:1 - chrX 13798935 5' + 412 73 2 69.31 CAAAAAAACGCTCGTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 + chr3L 5710236 5' - Transpac 5204 2 54.00 GTGACAACCTTATCTGGGANGACAAAAAAAAAAGGAAAAAAAA:1 + chr3L 19901788 5' + Doc2-element 231 4 86.05 ATCGAGGAAATGGAGTCCACAGAGTGAGAGTGAAAAGAAACAGCTCCTTACATATTCAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGG:1 - chrX 14439775 5' - Idefix 338 2 62.38 GTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCACCTATACTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chr3R 19450127 5' + roo 6 2 66.67 TCCATTACCCAATTTCCCCTTTGATTCGTTGCCATTCGGAGGCAACAACTTTTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTG:1 - 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gypsy2 454 1 71.29 ACACAATCGCCCTTCCACACTACCTCACACACACACACACACACACATACAT:1 - chr2R 23822994 5' + Quasimodo 37 2 86.54 ACGCGCTCTTTGCTATTTTCACTGCTCTTCAAGAGCTTTCTCCCGCTCTTTGTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3R 14580289 5' + blood 7036 2 54.46 TTTTCGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 - chr3R 7869187 5' - 297 6942 2 62.38 TCTTAAACAGTTTATTTCCTTTATATTGTAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTAGTGTGAATGAGA:1 + chr2R 6160437 5' - INE-1 532 1 72.28 ATCGTGGCTATCACTCGTGTATTTTTTGCAGCTGGAATATACTAATCGGGATGCAACCCTTATCAGCTGCACCCGAAAAGTTTTGGGATAATTCGGTTATC:1 - chr2L 3929513 5' + Gypsy12A_LTR 165 1 72.28 CTCAAGCGTTTGCCTTTATTTGATGCGGCAATTTATAAATGATGGGCGCCGATCTGTCGATGGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGC:1 + chr2L 9585707 5' - F-element 4506 1 68.32 GTGTTCGCAGTAAAATTGTGCTTAAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAG:1 + chr3L 5951140 5' - Ivk 4922 1 79.21 ACGAAGTCAATTGGGAAATGGAAATGGAAATGGCAGGGGGATCCCTCGCTGCTGTCCAATATATTAGGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTACCAGCC:1 - 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invader3 237 2 65.35 TTGCAGTCCCATTTTCGTGGCACTGATGATTTATTCATCACGAATCTCTAACCCACTGGCTTCCATAGAGCTTTAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGA:1 - chrX 15546249 5' + blood 7011 1 79.21 AGGACCGCAACAAGGACAATAGGCACACACACACACACACATAGTAATATGTGTAGTATAAGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAG:1 + chrX 9342307 5' + Burdock 6148 2 47.52 GCTCCTAATTCAATAGCGGGTGATAAACTTCTGTGAAAAAAAGCTCAAAAAAATCTCACAAAAAATAAAACTTCTGATAAAATAAAATAATTATTAAAAAT:1 - chr3R 1272035 5' - 1360 3091 1 41.58 ATAATGTAGTTCCCTTAATAGAGATTGCGACACATGAAAAGCGACCACAATGAACGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTC:1 + chr2R 14576494 5' + gypsy5 20 2 63.37 TATACAAATTTAATGCCCAAAGGAGGTAGTGCCCACGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chr3R 22238730 5' - hobo 2897 1 68.32 CCCTATGAAACTAAGAAAGGTGGTTAGTAGTAATAACTAAAATCAATTTTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr2L 3346249 5' + pogo 23 1 54.46 CGTTAACTCTGATTGCCACAATCAAAGGAGCGTCTGCCGTTGCACTGCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATAT:1 - chr3R 18787836 5' + I-element 84 1 53.47 AATGCGTGCTGAAATGCAGTGGTAATTAGATGCCGTTTAGCGCGTTGACAAGCCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACT:1 + chr2L 6354404 5' + F-element 81 1 60.40 TTTCCCTTCCGTTGGCCGTATATTTCTATTTCCATGCTGATTTCCAATCTTGTTTACTTTTGTTGCCGTTCCAAATGTTATTTGGTTTTTGGTTTTTTTTT:1 + chr2L 10615357 5' - 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Tabor 463 2 53.47 CTCGACGCCCGCGCTTCTGATTGATTTTTAATTAAAATATTTATTTATTTGTAATTAAGTTGATTGACTTTTCGATGGAAAATGAGAAAAAAAAATAAAAA:1 + chr2R 15649845 5' - INE-1 470 1 78.22 CTTATGATGTGGGAATTGGTATAAAATGAGACAGCTTCAGGATATAAGCTTTTATAAGAATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr3L 13773091 5' - pogo 2086 1 62.38 AAAATAAAAACCAAACATGGGGAACTGCAGCATGCCGCCTGTTATTTTTTGCTCTCTAATCAGAGCGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTG:1 + chr2R 13383485 5' - gypsy5 406 2 71.88 TGTTGGGTAAATAGATTTTTTCATATAAATAATCCAGTAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATT:1 + chr3L 20758941 5' - flea 4982 2 61.62 AATGATGGAAGAGCCAGTTTTAGCTATCATGCATTATCCATATAATTTTGTATAGTATGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3L 3209258 5' - roo 393 1 63.37 AAAGATCTGAAAGCTCTTGCCCCGAATTAGGAATTTTTCGCTGCTGCTAAGTCTGAACCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATAC:1 + chr2R 1725488 5' + Stalker 46 4 61.39 GCAACAGTACGTGATATCAATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAG:1 - chr3R 26765204 5' - mdg3 247 1 75.25 AATGTGGAAATTATTGAAATTACCACCACTAACTGAGTAGCTGCCAGTTAAGGAGCTCGTATATAAATATATATGTCGAAGAGTCATGAGAATGCCCTTCT:1 + chr3L 18122277 5' - invader1 4005 2 71.29 CTCAAAACATAGTAAGGGTAACATATCTTAAGGTTTAAAACGGAACGCAATGGAATACCAGTCTATGACGCTAAGAACAATCACAGGTGCTCCATGGTATA:1 + chrX 291690 5' + G3 4283 1 55.45 CACACTTTTTGATGTGGACAGCACAAAGTTGCGCATTGTTTGGAAATTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1 - chr3L 9907421 5' + jockey 4702 1 59.41 AAGTATTAATTATAATATTTCAAAAATGTATATGAACATAATGATTTTCATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTT:3 + chr3L 13000998 5' - invader3 251 2 54.46 CACCAATTCCCCCGCTGACATTTGCATGTTTTTTTTTTATCTTTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:2 + chr3R 23338270 5' + roo 8697 2 65.35 TTTTCAAGTGCCTTTATTANTAAGGGGTGTTAAAAAAACGCAAAGGTCAATTGTATTGGTACATATAGAATTATTCTTCAAATTAAGCATAGTTTAAAGAT:1 - chr3L 10784234 5' + Transib5 438 1 76.24 CTATCGCCGTTTCTTAACGGATGAGATATATAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACGGGGGGTT:1 - chr2R 4500918 5' - springer 336 2 75.25 AATCCTGAACAGTCTGGCACAAAAACATTGACTTAAATACCAATACATCTTCTGTGTCAGATAAGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCC:1 - chr2R 6727934 5' + I-element 4883 1 63.37 CTTATAAAAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 9278407 5' - roo 9051 2 60.40 GGTGTCACATTTCTTGGGTCTTTTATTAAGATTGACTACGCATAATAATTAGAGAGTTTAAACATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1 + chr2L 6251646 5' + mdg3 5268 2 64.36 TTGTCGTTTCTTGGTAGGTGTTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 - chr2R 15788620 5' - Transpac 5172 2 77.23 ATCGAACACCAAGTGCTTAATTAACAGTCAAAAGTACAAGCGAGTCGCGGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATT:1 - chr3L 22736971 5' + G-element 39 1 56.44 AGGACGGGGGGGAAATCCAGAATAACAAGCGGCGGCGATTCGAGTCGAGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3R 10488670 5' + roo 8691 2 52.48 AACCGGAAAAGAAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGC:1 - chrX 983381 5' + Juan 3823 1 59.41 TTGTACGTTGTACATTGCTGGTAAAAACGCGGCCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGT:2 - chrX 11025584 5' - hopper 1395 1 59.41 TATTTTTATGGCAAATATTTATCTAACAGTATTTCGGGACGATGGGGGTTTTTTGTTGGCTCCAGTTGTTTTTTTTTTGCTGTTTTT:1 - chrX 4338998 5' - 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HMS-Beagle2 7027 2 56.00 AGCTGCAGTTGCGCCAACAATATCTCCTTCTTCTGGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAG:1 - chr3R 25018163 5' + jockey 4781 1 65.35 CACATTTCGGGGGCTCATTAAAAAGCTATAAAGTGCTGCCATTAGACAATAACCCAATTTCAACCAATAATAGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3R 8582515 5' + roo 4 2 75.25 CTTGAGAGAATTCCATCCAGCATTCTTGCAGCATTCGTTGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATA:1 - chr2L 18246375 5' + blood 7301 2 61.39 TGTCTGTGACACTGATGAAGAGCAGGTGATGGCGATGCAAACTGGCCCCGCCCCTCACCACATTTCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 + chr2L 20238678 5' - hobo 2929 1 70.30 CTTCAGATATTTAAATGTTTGCCCAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGC:1 + chr2R 10000638 5' + F-element 4466 1 55.56 ACACACAACGCAGAGATATGTGTGGCGCACAGCAGCACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chr2L 10199011 5' + I-element 48 1 64.36 ACAATAAATTCCAGCAAATCATAAAAATAAACATTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCC:1 + chr2L 7328048 5' + F-element 389 1 66.34 AGCAAACAATGGGTGCAACAACTATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:3 - 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chr2R 10353313 5' + blood 37 2 62.38 ATATTTAAAGTGGAGAGTGGCAGTGCTTAAAGTGCAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 9278334 5' + roo 39 2 68.32 GTTAGTAGTAATAACTAAAATCAATTTTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr2L 3346271 5' + pogo 44 1 76.00 AGTCAGAGCAAATCGCAGATAGTCAGCTAGTCAGACGCAAAACCTCCTCCTTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATT:1 - chr2R 14997933 5' + McClintock 5970 2 60.40 TTTTCAATTGAAAGTGTTCAGCTCTTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 29608858 5' + roo 8685 2 59.41 TTTAGTTTACTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCCGCACCCGCTCACGGTCT:1 - chr3R 29359319 5' + F-element 469 1 63.37 AAACCAGCTTATTTATTTTACCGCTCAGTTGGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr3L 163228 5' - mdg1 377 2 67.33 GAACGTGGCTCAGCAGGAGCTAAGTATTGGGTTTATACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 - 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Porto1 279 1 78.22 GAACGAGGCGCCCTTCTGGTAGAGCACATCCTCGTCCGACTTGCCAGTCCATGTTGTCTCGGAGTAGTGAAGGAGGGGTGGAGGGCACGGTAAGTACCGTT:1 - chr2R 16040950 5' - G-element 273 1 57.43 GGGACATAATCGGAAGGGCTGTCGTCCTAACAGCCAATGCTGATGACCTGGGACGCGGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCA:1 - chr2R 10121893 5' + F-element 4309 1 63.37 GTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:6 + chr2L 13093790 5' - roo 9022 2 76.24 AAACAATGGGTGCAACAACTATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr2R 13653413 5' + F-element 43 1 52.48 GATAGCCTACCCAATCGATAGTCGCCGCTCATCGATAGGCAACAGCTGATTGAGTGATTTTAGCTGCAGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr3R 27116698 5' + P-element 9 2 66.34 AGGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr3R 5506829 5' + pogo 51 1 78.22 GTTATGACTCAACAAATATTGAGTTAATCTAGAAATATAGATTAAATAAAACCGTGTATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAGGTATAG:1 - chrX 15340486 5' - 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chr3L 20759036 5' + flea 4759 1 82.83 CTATTAGCAACCCCTATTTAGACAAAGTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATC:1 + chrX 9454830 5' - roo 359 2 75.25 TTCAATAAATGATTGCTTACTTTCGAGTGCTAAATTATTTGTGGCACTTTGGTACGAAAATTTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 + chr2L 6362823 5' + 412 11 2 66.34 GAGAAAAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 15037925 5' + roo 42 2 70.30 TCTTCGTATCTGGTATCTGCGGATCTGGGGGCTGACGTGGGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGAATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 + chr2R 15788556 5' + Transpac 12 2 66.00 AATTAACACAATAGAAAGAAAAAAGTTCTTTCAGATAATTTCTGTAAGAACTGTTAAGCAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAA:1 - chr3L 13096905 5' + I-element 447 1 57.43 TAGACTTTAGAGGCTAACTATTAATATATTTCCACATATACACTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 12944651 5' - roo 401 1 75.25 GTGGGAAGCGGAGGAAAAGTGGGTTTTCCGGCCGCAGCACATGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACA:1 - chr2R 6917502 5' - accord 156 2 58.42 TTTTCGGCACATTTCGCATGCAAATCAAATCTTCACTTAACGGGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTT:1 - chr3R 6105686 5' + R1A1-element 5041 1 57.43 GGTATTGGGCTTTGCGCAAACATTCATTACTCCTAAATGAACGCCTAAATTGGAATTTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chr2L 14761945 5' - mdg1 403 2 59.41 TCAAAGCCTTCAGTTATGAGTAATGAGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 + chr3R 27131921 5' - copia 205 2 78.22 ATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAATTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3L 7099641 5' - roo 9029 1 70.30 AAATTGTTTAATATTCTATTCGATGCGATTTTGTTTTGAGATTATGTGCTTTTGATAGTTGTCTGTAACGAAAAGAGATCTGTACAAGCAAGACCACCACA:1 + chr2L 7276285 5' + Gypsy12A_LTR 2165 3 60.40 ATACCGAGAGAGAGTGAGAAAGAATCGTGGAATCGGAACACGGGCGATCAGACGGCCCGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 + chrX 15024359 5' - P-element 2869 1 61.39 AATCCCGAAAACCGACTCCCAATTAGTAAAATACACATAAAATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr2L 17778695 5' - pogo 2070 1 62.38 ACATATGTGCGACAGGCTCAAATGCTGGAAAAGCGCTCGATGCCAAAGCAATTGGGTTTATGGTCGTTTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3R 6034045 5' - roo 405 1 78.22 TCGCCAGAGTCTTCAGCGGTACATTGAAACGCGGCATGGAGCTGTTTAATCTCTCACCCAAACACGATCCTCTTCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTG:1 + chr3L 16421259 5' + flea 48 2 75.25 ATTTGATATTATACTATAATAAGTAGGGTTACCATCCCAGAAGGGTCTGTCCTTAAAGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 20411882 5' - roo 400 1 67.33 GAGGACATCCTTGGGCCATTCGCCGGCTGATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:2 - chr2L 20045820 5' - roo 9055 2 62.38 CAAAGCGAAAGCTCGCAAGTGCTGTCTGCTTCCCCTTGAGGACTCTGTTGGAAGCCAAGCTTCCAGCGGGGGGAGGATTTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAA:1 + chr3R 1289798 5' + diver2 4535 2 78.22 ATACGAATGAAGCTCTTCGNTTTCTTGTACGCACATTTTTTAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3R 8582638 5' - roo 403 1 72.28 ACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr3R 11608007 5' - 1360 3345 1 71.29 AACCCGTCCGACTTATTCGACAATCTCAACTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAATTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTATTCTCTT:1 + chr2R 21267561 5' - BS 4918 1 74.26 TTGACATTCTGACATTCAAAGTCACATATTTGTTCAATCTACTGTGGGTTGACTGTAGTCTTAGAAGGCATTGACCACTTGAGCGGCAAAGTGCATGCTCA:1 - chr3R 13428463 5' - Stalker4 203 4 67.33 CCGAATCGAGGGTTTCTCTCAAAATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCC:1 - chr3R 10741149 5' + 1360 3358 1 42.57 TTAAAGATATTTAGAAGTTAGGTTTTTGATTTACCACTATATTAATACTACTATTGTATATTACTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:1 - chr2R 19089044 5' + Tabor 13 2 58.42 ATAAGTAAATTTTGTCGTTNGCGTAATATTTATAACCGTTACTGGTAGAGAAAAGGGTATGCTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGGAGAAGGAAGCA:1 - chr2L 22082518 5' + INE-1 30 1 79.21 GGGAACTCCCCTGACATGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 8765527 5' - roo 9053 2 60.40 ATCTATCGATAGCTTGTCATTCATTTGGCTTGCCCTCTTTCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCG:1 - chr2R 5152523 5' + INE-1 127 1 74.63 GAAAATTTATGTTGGATGCGTGACCGTAAATGCTGTGTTCGTGATAAATCAATTTTCATTGCACACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGA:1 - chr2L 16152804 5' + Doc 4425 1 72.28 AAGTCCAGATTCGGGCCCAATACGTTTTTAGCCCTCGGGTTGGGTTCTTTATTGTTTTCTCTGCTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCAC:1 + chr3R 9378769 5' + Doc 315 1 69.31 CACCAAGTGCTTAATTAACAGTCAAAAGTACAAGCGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGC:1 - chr3L 22736965 5' + G-element 46 1 64.36 ACTTCGATATGTAAGTTTAAATTTAACCAATATAAAAAAACATCCAAAGAAAAAAACAAAAAAAAAACTCAACAAGAGCATTAAGAGCGGGGTCCAAAGAG:1 - chr4 650018 5' - G3 4124 1 60.40 AAAGCGGGATCCTGTGGCAACCGAAGCAGAATTTTGTCTGCTGACGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAAAAG:1 - chr2L 12882806 5' - hopper 1385 1 52.00 ATAATATATCATTTTGGAAATTATTATAGCACTATATTTGTTACTAATTAGTATTGAATAAAATACTTCTGATATATGCATTTTATAAAAAAAATAATAGT:2 - chrX 17547109 5' + TART-B 10576 2 61.39 TGTTGAAAATATATATGTAATATGTATGTATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCG:1 - chr2R 4150647 5' - gypsy 414 2 78.22 ACCTTTGTTACATATCATTTTAAAAAATCAACTAAGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 + chr3R 5348666 5' - copia 216 2 67.33 AGCTGCCGTGAAGTTCCCGNCTTCCGTTCTGGAGCCGCACTTCGATCAGATATGGCAGGCTCTGAAAACAGAGACTTTCGCTTTATTTTTTGAAAGCGCTG:1 + chr3R 5233798 5' - X-element 403 1 76.24 TCATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGC:1 - chr3R 3268040 5' + mariner2 108 1 66.34 CCCTTTATAGACATATGTATTTATTTATGGAACGGGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACATATTACATGGCGACCGTG:1 + chr2L 15532698 5' + Stalker2 414 1 64.00 GCAAATCGCGAACAAAGACGATTGTAAGTATGCATTCTTCAACATCTGCGCGAGAGCGCCTCTTACTTATGCTTATGTGCATACATATGAAAAAGAATTCT:1 - chrX 11963182 5' - Tom1 170 1 57.43 AGATTCTATATAATCAAGATCGCTCATTCTCTCTCTCACTCCCACCACCACCACTACCAATGCACACGTAAGCACACCGACGAACACACACACACACACAC:1 + chrX 19129395 5' + accord 7027 2 58.42 AATTATGCTCATGCGGCAATTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGG:1 - chrX 8191200 5' - G6 1930 1 73.61 GAAACCATCGCTTCAAAGANCTTCCACGAATTATTGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 22930314 5' + roo 40 2 68.32 AGCTGCCGGTGGCCGTGCCAAATTGTCTTGTGATAAGAGTTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAATGCATTGTTACCCAT:1 + chr2R 21074154 5' - jockey 4969 1 56.12 TTTTATGCCACAAAAAAACGCTCGTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 + chr3L 5710226 5' - Transpac 294 2 63.37 AATGATTGTTTTCCAAATACATTGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3L 24766011 5' - 1360 3388 2 78.22 CCGAGCCGGTTGGTATATTTGGCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAA:1 + chr3L 15955090 5' + jockey 4617 1 78.22 CCTTTGTTACATATCATTTTAAAAAATCAACTAAGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 + chr3R 5348667 5' - copia 5084 2 68.32 TGTTTTAAAATTTGGCCGAATAGTTTGGGTTTGGTCAGTTGATTGTGGGTTGCTGCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chr2L 16139102 5' - copia 233 1 57.43 GGGGCAGGCGTTCACTTAGGTCGCGTTGGCTGCGTTGAAATGCGTCGCACGTAGCCATGTAGCAGATTTTATATTTGATCATAGCAATCTGAGTCCCTAGG:1 + chrX 20830085 5' + gypsy3 213 2 74.26 AACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAA:1 - chr2R 672816 5' + F-element 58 1 74.00 ACAGACTACATACAAACACGTTGGCATATAGGTTAATTTATTTATTTTGGGTGCACGCTTTTATTTGCATAAGCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCC:1 + chr3L 15039108 5' - roo 8963 2 77.23 CCGGATCTATCGGTCTTCCTCTCCCTGGTTGGCTCACAAGAAGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCT:1 + chr3L 1974021 5' + Doc 433 1 61.33 AATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGCGACTCTTTGCATTCCAGAAATTCTGTCGAGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGC:1 - chrX 21852440 5' + invader4 72 2 72.28 GTGGAAGATAGTCGGCTGGTGAACTCGATCCCTTTTGACATGTTTACACATTTAATTAACTTACACTAGCTCAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGTACT:1 + chr2L 12689642 5' + INE-1 557 1 63.37 TAGTTATCTACTTTGTTCTACAGGGTTTATATCGGAATTTTATGCACAATGACAGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 - chr2R 17459240 5' + Transpac 16 2 63.37 AGTTTTGCGGCTTACTCGATAAAATTGTGGTATAAGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chrX 5475453 5' + 412 7092 2 65.35 CAGTTTCCAGCAAAGTTGTCTCCTTCATTTTACGGCGCATTTAGACTGGCCTTCTTACGGGGCATGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTG:1 - chrX 6143136 5' + baggins 5167 1 66.34 CAGCGCGTTCACCGGAGGAGTCAGCCGTAAAAACAGTACAATAAATCGACTATAAATCTGATTTTTCCTGACGGCCCATACTATTGCTAAACATTTCTTTT:1 + chr3R 1432878 5' - Osvaldo 59 1 66.34 TAATGCAGCAAACAATGCGATTCACGATGTACAATAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr3R 23638096 5' - pogo 2072 1 61.39 CTCTTCCTTTTTATCCCGANATGGAGCAGCCCAACACACATATTAGTATGTATTTGTGTTTATGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr3L 14594205 5' + hobo 6 1 71.29 GTTGTGATGCACAAAAGTTTATAAGCTACTTAGGCATAGAGTAATCAAATAATATGCAAAGCAAAAGGGCAGAGGAAATATTGTATGTACATATGTATGCA:1 - chr3R 27571379 5' + invader3 5085 1 58.42 AGTGGAAAAGTTCAGACGGTGCTTGGAGGCCTCAGGAAACATTGCAGGTGAGTAATTGTGGCATTCTGGCTGGGGCTTGTTGTGGACTCTGGATGCGTGCC:1 - chrX 18064964 5' - TAHRE 10011 1 77.23 TATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1 - chrX 21668073 5' + Tabor 34 2 57.43 TCCCAGAACTCGTTTTAAANATTGTGTGTACAAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr3R 16601443 5' - roo 9029 1 67.33 CATAACTACAAAGACGCCGAGTAAGGTGAAAACTTTTGCAAACAATAAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3R 17660549 5' - roo 9043 1 55.00 GAAAGCAACGAATTTGCACACTGCCAAAAGGTGCAGCATGCTTTTGGGCTCGGGCTCCATAGTTCTGTTTTTTTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGAT:1 + chr2L 21215258 5' - BS 5085 1 68.32 TTCTTGCCGCCGACGTTGTCATCGATATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 + chr2L 17245020 5' - copia 213 2 73.12 TTGACTAAAAAAAACGTATATAGATAATAATATCGCAGAGATTCCCTTTTTTTGGCATAAAGTCAAATTATAAAGCTCTCTGCATTTTTGTAGAATTGGTG:1 + chr3R 1835369 5' - transib3 2805 1 65.35 TGATGAACATCTTTTTCCCGGTAAAACTTTGTTTAGATTGAAGACCTTTCTCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 - chr2L 3699481 5' + mdg3 27 2 54.46 AAAGTAACTATGTACTTCATTGCCCCTATTTTCGGTTACTTAAGGTATATGGTTAAGTGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGT:1 - chrX 19411230 5' - I-element 129 1 54.46 GTAGCATAATTTCAGGCGCTCCTCCCACAGTTCGCAGTATGTACTTTCAGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 + chr2R 11993979 5' + jockey 66 1 51.00 ATCTATAGCAATGTGCACAGCAATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 - chr2R 9631767 5' + F-element 41 1 62.38 ATTTACTTGTATTGTTGATAGTTTTCTTCGACAAATTTGCTGTGCCTTACTTAATTGGGATGCAAACCGTATACTACCTTCTTATTCCAGTAGACTACTTT:1 - chrX 13304335 5' + Cr1a 3971 1 55.45 TTAGTCCTTGTGTGAGCGGCTGCCAAAGTGCAAACAAGCCTGGAGATCCCCAGATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr2R 8311287 5' + opus 7023 2 59.41 TCAATTGAAGGGGTTCCTCCTAATGGCAATAGTTGTTTGTTTTCAATCGTTTTTATATGACTAAAAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCT:1 + chr2R 18188291 5' + Juan 4037 1 66.34 AAATGGGAAAATGGGAAAATGGGTGCACTGAAAAGCATTGAAGTTGGCCGAACAAAAAAACACACCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 9305201 5' - roo 398 1 68.32 TGTGAGTAAATTGTTCATCTCGGTTCATTTTGCTAGACCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr2L 7810697 5' - P-element 2850 1 41.58 ATTAGTTATGAGCTGATGCAGTGAATTTCATGATAAAACTCAATGCAACGCACGATCGCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGA:1 + chr2R 24334893 5' - hopper 318 1 56.44 AATGGTGCGGGGAGTAAGGGGAAAGCGGGATCCTGTGGCAACCGAAGCAGAATTTTGTCTGCTGACGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 - chr2L 12882827 5' + hopper 10 2 67.33 AAATACAAACACAATGGCCNCAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr3R 7869128 5' + 297 6623 2 67.33 AAATCGGACAACCAGGGACTGTTAATGCAGTTTTATCGCGTCAGTTTGTATCACCTGGATACGTTTATAATTAGATTCGGCTGCAATTCCCCAAATCTGGA:1 - chr3L 27058290 5' - Helena 1082 1 56.44 TTTTCTCTATTCGAGCCTACGAAATGGCGCCTAGAAGTAGGCAAATGTGTATTGTCTCGCAATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAA:1 - chr3L 8039428 5' + hopper 15 1 64.36 GATACATAGATTGATGATTTTTTTAATATACCCGTTACTCGTTGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGCAACAGGCAGAAGGAAGCGTT:1 - chr3L 23746102 5' + INE-1 32 1 76.00 CATGAGCCTATTGTCCTAAAAGTATGCAACACAAGGACCATCACTTTCGCCAGCGCGCTGGCAGGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr2L 10166077 5' + jockey 11 1 72.63 CGAGCAGCAACTAATGCAGCAGCCAAATTAATGTTTACATTTTTTCTCATTTGTTTACCCAATATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCAC:1 - chr2R 5320118 5' + INE-1 520 1 69.31 ATTTTGGCGCATGAAATCGNCGGATTCTCCGGAAGAAGCCGCCCGTAAATTGCGTGCGAAATCCACACTCTACTACATAACCGCGATCTTTAAGCTCTATC:1 + chr2L 5527167 5' + G5 305 1 78.22 ATTCCCAAGCTCTGGGGGCTGGATAGCTGGATCAATAGAAATATAGTTGGAGCAGATATGTATATATGTGCATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:1 - chr2R 21351074 5' - opus 498 1 36.63 GAGCCGCGTCATTTGTCATTTAATTGTTTTTCTTTTTCGTATAATTTTCCACTCCGCATCTGATCGGCATTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 - chr2R 12812356 5' - jockey 4985 1 77.23 AACGTCCAGAGATAATTATNCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:2 - chrX 21668089 5' + Tabor 6857 2 60.40 ATTGAAAGCACATTCAGTCTTCGACTGACACCAATTAGCCACACAATCGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGT:1 + chr3R 27221359 5' - micropia 5303 1 55.45 ACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 8036424 5' - roo 9026 1 75.25 GTGGTCAAGAACATCAACCGCTACGAGCGGGTGCACATTGTCAGTGTGGAAAGCAATGCCATGGTGTTGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAAC:1 + chrX 2723353 5' + R1A1-element 5292 1 70.30 CGTAGGTGGAAAAATAACCAAGACTTAAACTATGGTCCGTTTTGAACTGTAGCATTTTCATTTATTTATGCAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 - chr2L 16139205 5' + copia 4876 2 72.28 TTGAGTCCGTAAATCCGCTGTTATCAGTGCTTTTTCCGACCACTCCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:1 - chr2L 136337 5' - jockey 4917 1 56.44 AGGGGATGGGTCGAACTAACTGGCATAGGTCACCTGGATTAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGAC:1 - chr2R 24472705 5' - 297 283 2 61.39 TAAGTAATTTAAGTAATTTGTCAAAAATATTCACCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1 - chr2R 11030565 5' + F-element 65 1 76.00 AGTCCATTTCCATCAATCTGGCCATTCTGTTTCATCTTTCTCAGGACATAGGGCACAAAGGGGCCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGTAAGCGGTCATAGG:1 - chrX 18970033 5' + Gypsy12A_LTR 1940 1 64.00 GGTTTGTTTTCCTCGCTCCTCTGCAGATCCCTCGGTTGCCTTCTGTTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTAAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTG:1 + chr3L 10638397 5' - X-element 4437 1 76.24 CTTTTATAAGCAGGCCGAACGGTTGGAGAACGCGTATTTTTCGTTCGTCTCTACGGAAACGCTTAGTCCCCCCAAGACCCGAGAGCGCGCTCTTGCTCTCC:1 + chr3L 23087939 5' + Doc4-element 119 1 74.26 AGCGAGTCAACAATCTCGCAACACGCTGCAAGTGGCAGTGCACATTTTTATCAACATTTCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGA:1 + chr2L 17677691 5' - Tirant 8491 2 64.36 ATCACAAAACGCTCTAACTCAATAAACACCCGACTTCTTACACGATATTTTACAATTTATTTCCTTAGAAAATTATTTATGGAATCGTGTTCGCGGATTGC:1 - chr2L 22144995 5' - Gypsy12A_LTR 1971 3 56.44 CAAATACAGCAATGCGCAAGTTATTAGCAGTAAGCGAGCAAGCGAAAAATATTATGTTACAAGAAATTAAACTGAAATGTAATAATATTTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 13143360 5' + TART-B 10505 3 77.23 GAGAGTATCTAAATTGTTATGAATCGAGTAAATTTTAATGTGAATCTTAAATTAAAGGGAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 27248118 5' + Doc2-element 240 1 74.67 AATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACG:1 - chrX 18326219 5' + Doc 237 1 74.26 GGTTAATCTCGCTGAGATTGTGTATTCCTGGTGCTGACAGTGGGACAAGAAGAAGTGCGAGATGCTCAGGATATAATGCTAACAATAAACAATATAAGAAT:1 + chr2L 6019482 5' - BS3 1635 1 78.22 CGACTGCATTTCAGCGATATAAATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chr3R 5135511 5' + 297 48 2 80.20 CATATTTAACAGGATGCTCAACTGCAGTGTGAAAAACATAGCATAATATTACATCGCTTTTGAAATCATACAACAAGATATTGTAATGATGAACTCCAATT:1 - chr2L 6362952 5' - 412 495 1 79.21 CCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGGATACCGGAGGAAATGTTATGCTTTTATATGTTTTTTTTCTATCAGTTCGGTAATAATCGGACATTATTGTTAA:1 - chr3R 11062771 5' + Circe 457 1 72.28 ACAAACTGATTTGTCGCACCCCCACGGGAAAATACAGTTCTTGCGCGAGTTGAAAAGTCGATTTGATTGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAA:1 + chr3R 30627347 5' - 3S18 44 2 72.28 GAATGAGAGCGGGGCAAAATGGTAGGAAACCCCGGGATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAG:1 - chr3R 13739735 5' - Burdock 216 2 64.36 GTACGAGTTTGAAAACATAAATAACAACAAACATGTGGGGGTACTATATATCATCCTCTTATTTAAATAAAACACAAACGCAGGAGTTGGCCTCTTTGGTT:1 + chr3R 21374378 5' - invader2 5058 2 83.17 TATAATAGGATAAACCCTTAAAAATACGATATTGAATCAATGCTATGTTAAAATAAGAACTATAATTCCTAAGAACCAATTACTCAAATTAGAATGTTCTT:1 - chr2R 11197171 5' - Circe 483 1 68.32 AACTTTTGCTTTTCACCAACTTTTACTCTCGTCCTATGAGTTTTTAAACTAGAGACAGAAAACTTAAGCTTAATATGAAGTAGCCCGTTTCCTGAAGCAGC:1 + chrX 5151045 5' - gypsy4 6733 2 69.31 CACAATATTGTATCGATTGAGTGGAAAGATTTCTAAAACCGGCTATTTTTATACCCGATACTCGTAGAGTAAAAGGATATACTAGATTCGTTGAAAAGTAT:1 - chrX 21272399 5' + INE-1 10 1 69.31 TTATGGTGTGATTGTTTCGGCACTATTTAAACCTACATATATATTCATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTAT:1 + chr3R 22494095 5' + 297 20 2 60.40 AATTTGCCCTTTAAAAGTAATTTAGATCTGAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr2L 12866896 5' - mdg1 378 2 66.34 AATAAAAACGTATTTTTTAAGTGGAATATATAAATTGGGAAAAGAGAAACTACACAAAAATACGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1 + chr3R 27907605 5' - mdg3 233 2 62.38 AAAAAACCTTGAAAATTTGTGACGTGGGAAAAGCGAAAACCAACTCGAACACGAAAAAATTAAAAGGCAAGTAAGCAAAAATCATTTTCACAAAGTGC:1 - chrX 9831064 5' + Bari1 12 1 71.43 ATGATTTTCCACTTTTTTGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:2 + chr3R 14193901 5' + pogo 34 1 59.41 ATAGTTGGTGAAAATATTTATCTTCCTTGCAATGTAAAGCAGTGGTTATATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTAACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGA:1 - chr3R 9738906 5' + Circe 7200 1 66.34 AAATTTCCCAAAGCCATTCAGGAAAGTGCAAAATAAATTATGCTTTGTTTTTTTATGTATTTTATAATATACATATTATATACATATACATATATACATAT:1 - chr3L 19784674 5' - G3 4507 1 60.40 TTGAATAATCAGCAGCAGTAGCCGGGAGCTTCGCATAATCGTCATAATCATTTTATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr3R 20332863 5' + jockey 4694 1 54.46 TATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCG:1 + chrX 15148858 5' + micropia 4962 2 73.00 CTCAAGTTGTCGAGCTAAGAGTGCACTTGAGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2R 9649166 5' - roo 9045 1 52.48 GAACTAGCTGCAGCTTTATAACGCGAACACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAG:1 + chr2R 12611830 5' + F-element 342 1 72.28 CGCTTCCTCCATCGAAGTGGCAGTCTTAACCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2R 19840251 5' - roo 9026 1 68.32 TATTATTGATGATCAGTTCGATTATGATTGTTTCGTTTAGAATGCGTACTCCACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 3255961 5' - roo 386 2 56.44 TGCATCTTGATGATAAATTTAAAATTTATCTCTTTTCATATAACTCTCTGGTAATATATAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCC:1 + chrX 23283334 5' + I-element 4883 1 60.40 GGGGTATGCAAGGAAAATACGGGGAAAATGGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCAACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGC:1 - chr3L 20869066 5' + R1A1-element 5057 1 68.32 TGTCAACGGCGTTTCAGTCCCCGTATCTCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 9649225 5' + roo 48 2 74.26 AGTCCATATGGCCGAGTGGTTCGCCTTGACGGCTTTTGTGGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGGCAGCTTTTC:1 + chr3L 7301076 5' - Doc 4478 1 63.27 CGTTACTGGGCTTAAAACTAGAAGGGCAGAGTGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAA:1 - chr2L 10956764 5' + I-element 406 1 69.31 GAATAATCCGATTACAAGCCATACACGTACTCCATATATATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCG:1 - chr3R 25750230 5' - micropia 5408 2 62.38 CCTTTTTGCCTGGCCAACTTCCGCCTTCTCTTTGGAGGCGGGACAACTTCAGCTTTCGTTCAGTTAGTCTATGCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr3L 13773856 5' - roo 407 1 77.23 AGCTATGATTTGGGTGCATNATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAAC:1 + chr3R 10736047 5' - McClintock 6395 2 66.34 GGGAAAAAATCCCTAAAATTATTAATTATCCACAAATTTAATTACTTGAAAAGTACTCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACT:1 + chrX 4043856 5' - invader4 126 2 63.37 TCGCCGCAGATGTCACTAANATGACCGCAAATGCCCCCAAATGCAGTTTTGAATATCAAGTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2L 22197192 5' + roo 8679 2 62.63 CAATGGGTGCAACAACTATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 - chr2R 13653410 5' + F-element 42 1 53.61 AATATGAATACCTCTGAATTATTTCATATTCTCCGCTTGTGAAAACAACTATTTTTGATTGTGCGATTTAGGGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATAC:1 - chr3L 5710343 5' + Transpac 1 2 77.23 AATGTAATTGTGTCATAAAGTTAAAGTAAATAGGGTTTTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3R 11916642 5' - roo 400 1 70.30 GTTTGAAATTTAAAGACAAAACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 - chr2R 22051544 5' - Tabor 465 2 58.42 GCATATTTTGAGCGATTGTGATTTTTCCCTGTTGACACAGACATTTTGAAATGTCAGAGACATTTTGAAATGACAACTCTGCATTGCCCACTCGAAGGCAA:1 - chr2L 20570683 5' + 412 158 2 50.50 TGCCAAGATTATGTAGTGCACTTCTCAGGGGAGTTTTAGGCCGCTCAGATGCTTAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGT:1 + chr2R 10372101 5' + mdg3 21 2 53.47 CGTCTCCACCTCCGTTTTGGTAAGATTACTTTTATAAAACTTTTATATGATTGTAAAGATGTTCTAATATATTATATTGTGTTTAGAAAGGAAAAAATTTT:1 - chr3L 6259978 5' - Stalker 6767 2 77.23 ACCATAATTTTGATGAAAGAACGGTGAATGTTTAAAGACAAATTTAATTAATTTGAACTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:1 + chr3R 4474159 5' + copia 4889 2 59.41 ATTTTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTTTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAG:1 + chr3L 3766789 5' - 1360 144 1 68.32 TTATTCGCATTCAGCATATCAAATGCCAGGCTACTGGCTACTGTTTTCGTATCACTTGTTTGGCTGCCTAAGAGTATGCAATGCTATTTTTAAATTTCAAT:1 + chrX 15402697 5' + TAHRE 10146 1 71.29 AATGTATAACCACAAGGCANCGGGGCTAATAATCGAGTAGACGCCCCACGAAGCCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chr2L 20567809 5' + 297 6601 2 59.41 CAGCGTCATCAACACCACANTCCACTCATCCTTGCTGCCCTGCGAGGTACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGT:1 - chr3R 12980270 5' + accord 7233 2 54.46 CCGATGTACAGAATCATTTCGATATTCAAATTCAATCTCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 - chr2L 20367359 5' + Doc 42 1 60.40 TAAATACCTTTGTTACATATCATTTTAAAAAATCAACTAAGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 + chr3R 5348661 5' - copia 221 1 60.40 CATTAAGTCACATGATGTGGTAAGAACGTATTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATGGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 + chr3R 6947342 5' - I-element 5311 1 70.30 AATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 - chr2L 18655188 5' + Doc 57 1 74.00 TTAATTTCTACGATTAATCTCCCCTTGACCAAACATTCCGAGTTATTTGTGGTACTGATGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCG:1 + chr3R 1021924 5' - X-element 4643 1 64.36 ACAGCCATTAGCCCTACGCAAATGCCACTAGCGATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr2R 18432071 5' + 412 7094 2 69.31 TTTTTAAAAATTCGTTTGCCAAAATATTTTTTAATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr3R 15578974 5' - pogo 2060 1 73.27 GGGAAATTGGCCAAAACATCCAAGGCAACAAACAGGCAAAAACGGCCAAAAACAGCCAGAGGAGCTTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGT:1 + chr3R 23542928 5' - 412 7536 2 68.32 CAGCGTAACTACATTTAAATGAGCACCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGG:1 - chr2R 16467892 5' + F-element 4348 1 74.75 ATATTTTATCCTTTTTTCAATATGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chrX 12231630 5' + hobo 53 1 76.24 AGCACTTGTGGCTATAGCTCTACCCATATGGCTTAGTCGCTGGATCGAAATCGTGGTAGGTGTTCCCAGAAGGTTAGACGTTTTTCTTCCTCTAGTGATTT:1 + chr3R 27167792 5' - baggins 4990 1 52.48 TGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATT:1 + chr2L 22092967 5' + INE-1 548 1 50.50 ATTTATTGGTTGAATAGCTAGCTGGTGCTGTTCTCCCTTAAGTAAGTCACAAAAAACCTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACG:1 + chr2L 3408604 5' + G-element 21 1 58.00 TTCCACTCGGAATGCCTTCGGAGCAGATAGAGATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2L 2833916 5' + roo 8708 2 70.30 GAGCAAACACCACCAAATCNGGCCATAAAACCAGAGCAGCCTGCTATCATAAAGTACAAACTTAAATGCGCAAAAGGGCAAACAAGTGAATGCAAAGTCGA:1 - chrX 16890775 5' + Chouto 5946 1 70.30 ACAGTAATAAAAATTAGAATAAAAAAATTCTAATAAGAATAAAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 + chr3L 12303384 5' + blood 32 2 61.39 ACATGCAATTCATGCGAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATT:1 - chrX 8027504 5' + Juan 21 1 59.41 GCTCATCCACCTCTCCCCTCAGGACATTTCAAGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2R 19061280 5' + roo 8706 2 67.33 TCTTCATGATGATCTTTAAGACGATGCAACAGCACACACTTCAAGAGCATCGATGGCTTTTTTAAAGGGACACATTTTTCAGAGCGCCTTAACTCAATTTG:1 + chrX 21585429 5' + mariner2 525 1 74.26 GCACGTCTCCGATAGACAACCTACTGATCCACTGAATTTTCCACCGAACGAAATTTAAAAGTTATCAAAGAACAACTGTGTTGTATAACAGCACCTTGTAG:1 + chr2R 5535205 5' - Doc4-element 2559 1 77.23 CACGAAAAATGGTAACATCGAAACCACGAGCCACAAGAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:2 - chr2L 20328794 5' - opus 483 2 64.36 AAAATGTCCAACAGAAGCAAACAATTCCATTACCCGGTCGAAGAAAAGAGAAATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATT:1 + chr3L 8456284 5' + X-element 4598 1 59.41 TAGGTTAAGGTTATTTAATAATTGAACAGTCTAAAATGTACATCACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGT:1 + chr2R 6779748 5' - 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chr3L 16064582 5' + transib4 396 1 62.38 TAAAACGGGACCTAGGCCGGTGAAAAATTATAAAGGGGGCGGGGCATGCCACAGTAGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 + chr3L 19861766 5' - 1360 3369 1 64.36 AGTTTATTTATTATTTCTCTGTGCCTCATTCTTCTTCTGGCTTCTTTTCATTTTATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:1 + chr3L 13374679 5' - Transpac 5219 2 66.67 TGCAACTTATTTTCATCGTAACATCATGAGGTTGAGGAAATATGGTTTCCTTTGAGCCTGGCAAGCAAATGTCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 27056459 5' + jockey 20 1 65.35 ATGTTCATATGTGTTTGTTTGGCCAAGAAGAAAAAAGGAGCCAACAAACTTTTCAGTTTGAAAAGAGAAAGGGACGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTA:1 - chrX 7473113 5' + P-element 496 1 80.20 AGATGCGTAACGGCCATACCAAAGACCCTAGAATAACATACATTGGTTTGGCACACGATTTTTTCGCCTTGGCTCTAGAGGTG:1 - chr2R 2256418 5' + 1360 58 1 60.24 CTCACAATTAACCGAAGAACATCGCTTTCAAAGCAGCGCTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 - chrX 16671118 5' + P-element 38 1 40.59 TTCGTACCGACATCGACTAGATTGGGGTCAGTGATAACGTTATGATTATGACTGGATGACTAAACCTTTGTAGATATTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chrX 17569660 5' + roo 8667 2 45.54 ATTTTACAAAATTGATAAACTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2R 25203763 5' - 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chr2L 8622856 5' - 297 6968 2 74.26 TGGTGAGGATGAGGGATCCCCACTCCCGGTTCAGCATGTGGCGTCGATAGGAGAGGTAGGCGAGCAGGTAACAAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACC:1 - chr2L 2710905 5' + I-element 4984 1 73.27 GGCAGAAATCAAGCCCAGCGTCTGCATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTG:1 + chr2R 4500880 5' + springer 47 2 73.00 TAAGTATTTGACGTTTATTNCGTAAACTACTTGATAAAACCAAACACTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 - chr2R 10353345 5' + blood 5 2 71.29 AAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chr2L 16153377 5' + Doc 57 1 76.24 TGTATTAATTAATTAGCTAAATGCATTCCAACTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGTATTTTGTATGTTATCTGAATTGGGTT:1 - chr2R 21513629 5' - I-element 5125 1 66.34 TGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCA:1 - chr3L 19350030 5' + 1360 3195 1 63.37 CAGGCGCAGTTGTTGGCTGCCAATAATGATACTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGA:1 + chr2R 18837961 5' - I-element 4875 1 68.32 ATTAAGTTTTGTGGAAAGTCTGAAATAAAATACACTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr3L 19647314 5' + pogo 37 1 71.29 TTTCAAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 + chr2L 16153373 5' + Doc 52 1 72.00 TAGCTCACTGCGAAAAATCAGCGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGA:1 + chr3L 736041 5' + gypsy6 7467 2 79.21 CGAGAATTTCAATCATTTTCACATCACTTTCCCGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:1 - chr2L 15898844 5' + F-element 18 1 75.25 ACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1 - chrX 734964 5' + Tabor 46 2 68.32 TAATTATAATTATTATTATTATGATTATTACAAAAGGAATAGCCAGTCATTTGCATGATTCCATGCAATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 + chrX 13383538 5' + Doc 23 1 57.43 GGCCCAAGTTAGCCGCTGACCAGCTGGATATTTATTACCTCACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGTGAGTCGATCAGTCGATAAGTTTCTC:1 - chr3R 21703264 5' - mdg3 5376 2 59.41 TTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTAT:1 + chr3R 11151825 5' - mdg3 211 2 60.40 CATATATCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACT:1 - chr3L 19339446 5' + Tc1 9 1 74.26 ATCCGTTTATAAGTAAAAAAAAAATCGAAAATCGCATAGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr2R 14949650 5' - roo 9029 1 67.33 GATTGGGCATTGTTGTTACTCTTATTGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 - chr3R 7139291 5' - pogo 2054 1 77.23 GGTATTTTCTTGTATGGAATGAATAAAAAGGTTCCTTATTACGTAATTAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr3L 6033521 5' + 412 27 2 53.47 AAAAAAGCATACTGCACGGGGCACTCGAATAGGACTCAAGTATAAGAGTATAAATAATATGCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAA:1 + chrX 1706023 5' + Juan 4064 1 51.49 ACCGGTTGATACCGCTTCGAGTTGTTAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr2L 12459692 5' + blood 49 2 74.75 CGTGACTTTTTCTTGGGTGGCTCGGAGTTGGTGGTACTACTGTCACTGCTATCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAG:1 - chr2R 18975498 5' - GATE 71 2 58.06 AATATTGCAAGGGAAAATTTCTGTTACATATTTATCAGTACTTTAAACGAAATTCATTGTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGAT:1 + chr2R 9699789 5' + Transpac 4933 2 72.00 GTCTGTAAGGATTAAAGTTNGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGACAGAAGGGCGCAAACAGTT:1 - chr3R 20094521 5' + Max-element 7 2 63.75 TCCTAAAGACGCACCAAGCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCAAGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTG:1 - chr3R 12227602 5' - roo 132 2 80.20 ATTTGTTGGCTAGGGGAGTGCGTGGGGCTTAGCTGAAAAGAATGCTACCGAGCACTGGAAACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACA:1 - chr2L 11712910 5' + Quasimodo 10 2 62.38 TGCAATTAATCAGTGAGACNTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chr2L 17677775 5' + Tirant 32 2 60.42 AAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:2 + chr2R 5214987 5' + F-element 59 1 73.27 TGCTCTTGAAGAAGAACAACGGCTGGGTTAGAACACCACCACCACCTCTCCAAAAGCCGACAGCAAAGAAATTAATAATACAATTACTTCATATTGTAA:1 - chr3R 13740904 5' + Doc2-element 4674 1 66.67 ATAAATGTTTATAACGCGCACAAATTAAATTTTCATACAACTATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCT:1 - chr3R 3280823 5' + 1360 3188 1 58.42 AAAACCCCTAGATACTGGCGATGTATAGAAATCGCTTAATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTC:1 + chr2R 16185036 5' - 17.6 458 2 63.37 TGATGTCGGAGAACCCGAGCGCGACTTTTCATTCACTTTCGCGTCTTTATTCTTTTCATCTCAGCTTAAGATTAAAAATCAAATGTAAATTGGATTGAGGA:1 - chr3L 24486756 5' - 297 6835 2 60.40 AAAAAAAAAAGAGTATACATACGAAACCCCAAAGCACGTTCTTTTCTCGTGCGAAAAATATGCAAGGGAACGGAGCTCTCTGGATACCGTACTTGGCAGCA:1 - chrX 5808009 5' + Rt1c 5155 1 73.27 GATACTGGCATATACATACTACGAATATGCGTAGGCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 + chr2L 4134812 5' + Quasimodo 19 2 61.39 CAACGCGAGTGAGTCGTGACTCTGTGGCGTTAGAGTGGAAAAAATGTGTTTGGCAAATTAATACAAATTAAAACCACATAGAATGTTATAGTCGAGTTCCC:1 - chr4 802043 5' - INE-1 572 1 75.25 CATTTTGAGCATTAGGCAGTTCTTTTCCGAATGATATTTTGATGACAAATCCCTGAATCACAATATTTAAAGATGCCGAATATTCAAATTCGTTTA:1 + chr2L 1372289 5' - Dm88 241 1 59.38 AAAGCGAAAGCAAAAGTTGCGAATATCATTCGATTCGATTTATTGGCATTTTACGACAGACTATGTATTCGAGCGATGGTGCATCGCACAGAGCGTCACTT:1 + chr2R 14545784 5' - Doc2-element 116 1 54.46 GCATTTGATTCAAAAGGTACGAAGCACGGGACTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTT:1 + chr3L 21605345 5' + accord2 7592 2 68.32 CAACTCTTTCAGAGTCAACCGGTGGATCCGGAGGTGTCTTCCCTGGGGGATTTACGTGGTGAAGTGAGCGAAGTTAGGACACAAGATGCAAAAACCATTAT:1 + chr2R 22904060 5' - transib4 2317 1 61.39 TGTCGAAATCCCCATCTAGGTATTCTCAGACGCAGATCTTCTGCGCTCACTCACCTTTAAGCTCGCAAACAGCTGTTTGTGCGATCGCGTGGCAG:1 - chr3R 7225281 5' - X-element 221 1 57.89 TGGCCAAATATTGATCGACCGACGTGCTTGAGGTACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chr3R 7626390 5' - hobo 2899 1 65.35 TAAGATATATTATAGGTTTAAGAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGGTGACTTTACTCG:1 + chr2L 8577250 5' - roo 399 1 69.31 TTAAGCTGCCATTGCAAACAATTAAAATCATAAGAGACGCACATAAATTATTCATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGT:1 - chr2L 11362808 5' - copia 40 2 57.43 GTACTTCGCCACACTGGCTTATCAAACAAACAATTTGAATGCCCAGCGGAGCGATCTTTTTATTGATGCGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr2L 16358146 5' + hobo 8 1 69.31 AAATTCAATCACCATGTGCAGCCAGCCAGTGGAGGGACCCTCTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:2 - chr2R 24278074 5' - 412 7509 2 59.41 AACTTATTAATTTGCTTTATTTTCAGTACTATATATATACGGTTTAAACTGGCTGCTGGCCCGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCA:1 - chr3L 1697774 5' - Transpac 5216 2 64.36 AAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGT:1 + chr2R 5214983 5' + F-element 55 1 69.31 ATTTATATATATTTCCGTATTTTATACGGAACTGTACACTTCAGGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr3R 5506871 5' + pogo 9 1 70.30 ATGACAGGACATCTTTCTCATTCCTCCCCCTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATAT:1 + chr3R 12329612 5' + hopper 43 1 67.33 AGGACAAGACCAAATGAGGATACGACAAACTTCATTAGCAAACCCAATCCATTTAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAACTAAATTATACCAC:1 + chr2R 3640965 5' + I-element 5165 1 69.31 TACCACTATATTAATACTACTATTGTATATTACTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1 - chr2R 19089013 5' + Tabor 6879 2 67.01 CGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 - chr2L 15898812 5' + F-element 50 1 64.36 CAAAAATTAAATTTGTCAAATTCGAACACCAATCGATTGGGGATGTGATTACGAGCTCAACAAGGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chrX 3393435 5' + 1360 7 2 69.70 GCAGAAAGATTGCTGAATGCTTTAATGATTTTGTATTTATTCAACGCGTCACTGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr3L 1586709 5' + Tirant 21 2 60.40 TTTTTACAAATTAGGCCACTTAGTATTTTTTTTTTTGTTCTAGGAAACAAATTCTAAACTAATTATGTAAAAAGTCGATGCGATTGCGGTTGTGAGAGAGG:1 + chr3L 15453526 5' - Doc4-element 290 1 77.23 CCTTATCTTGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 - chr3L 6033587 5' - 412 7506 2 63.37 CAAATGGCCAGAACGGCGATTTAGATCAGGAACAATAGCCGAATCGATTTAGCAACACACTTTCTAACACTTTCGCATTTCGCATTTACACTAGCTGAGTA:1 - chr2R 10288161 5' + INE-1 532 1 74.26 AGGATGAAGACCAAACACACGCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 + chrX 14651105 5' - P-element 2832 1 22.77 AACCATCCAATGCAGGTGTAGCTCTATCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACAT:1 + chr2R 18723017 5' + HMS-Beagle 10 2 69.31 GCGATTTTTTCGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:1 - 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chr2R 13830870 5' + flea 4866 1 54.46 CTATTCAAGATGGAATAGTTATATGCTGCATCATCTCGTGTCTGACCAATAGATCCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1 + chr3L 4009411 5' - mdg3 226 2 50.50 TGCGGATCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr2R 15788573 5' + Transpac 30 2 50.50 ATATAGGTATATATATATATAGGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACAT:1 + chr2R 19857378 5' + invader2 90 2 76.54 ATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGAC:1 - chrX 18326229 5' + Doc 222 1 62.50 CTACGGCGAAATGTTTTCGCCAGAACGGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACT:1 - chr3R 7333644 5' + Circe 7237 2 73.27 CTAAAGAATAAAGGCAGTGCCGAATTGCACATACGCACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:2 - chrX 4792128 5' + copia 42 2 66.34 AGTTTATTTATTATTTCTCTGTGCCTCATTCTTCTTCTGGCTTCTTTTCATTTTATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 + chr3L 13374679 5' - Transpac 292 2 61.39 TACGCCCTGTGTGCTGAAAATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCT:1 - 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INE-1 259 1 55.45 TTTGTTATCATTTTATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1 + chr2R 16160747 5' + mdg3 5275 2 57.43 TATAGAAGGGCTCCAAAGGCTGGGTAGGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 + chr3L 3880999 5' - blood 7341 2 72.28 GGAAATTGTTTGTCAGCTTGCAGAATCGGATGTCAAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3L 12241796 5' - roo 397 1 68.00 TCTTGGATTTCTTGTCAATCTATGCATGCTATTTGATATATAATTAATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCG:1 - chr3L 19089668 5' - invader1 378 2 55.45 GGACTTTAAGGAAAAATTAGACCCTAATCAATGTAACTATTGTTTACTTTTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 + chr2L 10164990 5' + jockey 4699 1 56.44 ATCATTGCCATTGTGCATGATTTTATGATGAAAGCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGG:1 - chr2L 8622826 5' - 297 359 2 65.66 ATAGAACATTTTGATGTAGNTTAACCTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCAC:1 + chr2L 14341855 5' + copia 4921 2 73.27 AATATGCTACCAAATTTATTTTCCATCATTAATATTTTTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTGAAGCTTTTCCTTTAGTGTTAGTCCAACGA:1 - chr2R 19799008 5' - pogo 359 1 66.34 GCCGTGGCTGCCACTTGTTNTATTTATTGCTTTTTTAACCCTTTTTTTTTGGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 10488751 5' - roo 385 2 55.00 TCCTAAGCTCAGCCGAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 - chrX 1399922 5' - P-element 2850 1 42.57 GATATGGAATCGCGGATATTGATCTAAGAAGATAGCTTGTTAGTTACGATAAAATATTTCTTATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 - chr3R 17482095 5' - copia 242 1 57.43 AATGGTTCTTTTCTAAGGATTTCTGTTCTGTAAACTACACTTCATGTTATTAAGGATTTATCGAAGATATATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTATGAAA:1 - chrX 13798929 5' + 412 7131 2 66.00 GAATATGAATAATTATTCAAGCTAATATCGTGTTTCGAAGGCTTTTCAATATGCAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGT:1 - chr2L 14220224 5' + springer 7162 2 52.48 AGAACACACCTTAAACTGTTTTTCAGAACGCTTAGCTCACTGCGAAAAATCAGCGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGAT:1 + chr3L 736006 5' + gypsy6 16 2 53.47 AATGCCAATTTGCATCGCANAATTTTTTAATTTCACACATCGAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCT:1 - chr3R 14334813 5' + X-element 4439 1 58.42 AAGTAGTCTAGCAGCCGGCTTCTAAAAAGTACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:2 + chr2L 2833872 5' - roo 9027 1 70.30 GAACACCAAGTGCTTAATTAACAGTCAAAAGTACAAGCGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCG:1 - chr3L 22736968 5' + G-element 43 1 61.39 TAAACAATTTTGCAGCATTNAAATACAATCAGAATACACAGAAGATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 + chr2L 11478676 5' - opus 467 2 60.40 AAAATGGCAACTGGATAGCTTTCGTTGATTTCAGCTATTCTGGATTTTTTCCTCTTCACGTGCTGCTCATACATGTGTATATATAATATGTATGTATATTT:1 - chrX 16231221 5' + Dm88 14 2 71.29 TTCGAGTCAGATTACCGGGGTGTTGAACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr2L 19215008 5' - roo 9039 1 56.44 GGCAGCTCCATAGCCGAGTTGCTAGTTAAATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chrX 13146894 5' - roo 397 1 67.33 CGTGTGTATCTGTGAGCGTAGTTGTTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGA:4 - chr3L 5241197 5' + Ivk 10 1 69.31 GAATTCGCCCTCAAGTGCANGGACAACAAATGAAATCACAATTATCTCAATGTCTCACGTGCAGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTC:1 - chr2L 3429619 5' - R1A1-element 137 1 63.37 CTCCCACGCACACAGCAAGGCACTCTCACTCAAAACAAAAAAAAAAACCTGTA:1 - chrX 13839218 5' - Tc1 1470 1 92.45 AAATATGCATTTCAGAAATGTGCACAATTTTTTATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGAC:1 + chr3R 10087792 5' - roo 9070 1 77.23 CGTCATGACTAATCCACGTATGACTGCTCTCTTGCGGTTCTTTTAACAGTTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTAGTCTGATTTTAG:1 - chr3L 3083148 5' + Cr1a 407 1 77.23 GGCTCCTGATTGGAGTTCGAGTAAAAAGTGGAGACGGAACCGGAGTCGGAGTCCGACAGAGTTAGAGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGG:1 - chr3L 4910611 5' - Tirant 8107 1 53.47 GAAGAAGTGCACAAAGGCCACAAGCTGTAAGATATATGTAATGTAGAAGCAAAAGGAAAAATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 + chrX 13126191 5' - mdg1 7443 2 56.44 AGGCGAACTAGAGCGACATCGGGACTGACCAAGATCGGAATCATCATGGCAGTGCAGTTACCACTTATGCTGTCCAGTGACATGTTTATTGCAGCCCAT:1 + chr3R 19448152 5' - rooA 7292 2 47.47 AACGAATATACCTTTTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCTGAGAGCGTAAGAAGTCTA:1 + chr2L 22113015 5' - 1360 3284 1 61.39 TTACTTTTAATTGGCATCATTTGATGATTTTAATGATGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTTAGC:1 + chr3R 13913532 5' - mdg1 351 2 62.38 AACAGTGTATCCTTTTGTTTTATTTGGTTATTATTTGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chrX 4277525 5' + roo 38 2 65.35 AGTATTCCAACAACCAAAACGTTTGGCAGAGTGTGAACAATAGATTACGATGCTGCATTTCTAAAATTGTGGACAGGCGATCATCAG:1 + chr2R 6422512 5' - invader6 428 1 57.47 GACTTTATCCGCAATTTATTCGACTTTTCATTCAGCGAACCGAAGCAAGGGGGGGGAGAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTA:1 - chr2R 17948181 5' + Max-element 20 2 56.44 AAATATTTCGCACACACAAGGTCAATTAAATTTGCCCTTCACACATTATTAAGATTTTCCATCAGACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3L 9928626 5' + roo 8673 2 70.30 ACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr2L 23372624 5' + 1360 5 2 53.47 CTGAAGTTAAGATAATAAGCAGATCGGTAAAATACCTATTGGTTTCAAAAAGCGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3R 27169414 5' + 412 23 2 56.44 TGCTTAGCAATATTTGATTCAAGTTGAGCCCCATTTAAACGAGCAAAGTGAGAATAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2L 22241810 5' + pogo 18 1 61.39 GACAGGACCGCAACAAGGACAATAGGCACACACACACACACACATAGTAATATGTGTAGTATAGGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATA:1 + chrX 9342304 5' + Burdock 9 2 50.50 CGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTC:1 + chr2L 18213147 5' - hopper 1390 1 54.46 TTCGTGAACAGTTCGAACACGCAACGACCCAAATACTATAGTTAAGTTTTTCCTACTCCCTACACTCAAAACGTTTAACCAAAGACACTAAAATAACAAGA:1 - chr3L 23317615 5' + 1360 1 2 79.21 AATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCT:1 + chrX 22726198 5' - Helena 1270 1 45.54 GAAGAGGATTTCAGCTAGTTGGCGTTACATTTTTGAAACTACCAGCAAATATCAATCCACAAAAAGCAGAACTAGAATGAAGATGTGGACGATACTGAGCG:1 - chr2L 22241092 5' + pogo 1707 1 72.28 TTTAATGAGCTCAGGAAACGCCCTAAATTCAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr3L 7300506 5' + Doc 51 1 73.27 CAATTGATTTCCATTAACTATTGGCTGGCTGATAGAGGGGGCAAGTTGCAAGAGTAGTTTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chr2L 4239913 5' - HMS-Beagle2 490 6 68.42 ATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTT:1 - chr3R 10736131 5' + McClintock 14 2 64.36 GAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACTAACCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 - chrX 1135373 5' + P-element 30 1 49.00 GGAAATAAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGATGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGAGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 + chr2L 18247990 5' - blood 341 2 61.62 GGGCTGATTTAATGAATATNTACACTAATTGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTA:1 + chr3L 19249657 5' + Transpac 4930 2 67.33 TAATTAATAACGAATTTAACGTATTTTTATTATTCAATATATTTTGTAGCATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCA:1 - chr2R 10372200 5' - mdg3 225 2 53.00 GGGGGTGGTGTCAGTTGTTGGGCGTCTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chr3L 699756 5' - P-element 2838 1 31.68 AGATACACCACACAGCCGAAAAGCACACATACGCCGTGTGGGCCGTGCGGCAAGCAAAACAACCCCCAACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATT:1 + chr3R 9490888 5' - roo 198 2 70.30 CGGGGGCTCATTAAAAAGCTATAAAGTGCTGCCATTAGACAATAACCCAATTTCAACCAATAATAGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3R 8582522 5' + roo 8675 2 68.32 ATAATATTTCAAAAATGTATATGAACATAATGATTTTCATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTT:1 + chr3L 13001009 5' - invader3 240 2 65.35 CACAATTTAGAAAAATATTAGTAAATTAATCGTTTTTACCTTTACCTCAAAAACTATAAGCTTATTTTTTATTTTTATTTTTTATTATGATAGATAGAATA:1 + chr3R 16735025 5' - I-element 5346 1 63.37 ATATTTACAAACATAAAAGGAAAACATGAAACATGATGTAGACCAAAAACAAGAAGAAAAAAAAACGAAAAAAA:1 + chr3R 13020411 5' + mdg3 5103 1 75.68 AGAGAGAGTGAGAAAGAATCGTGGAATCGGAACACGGGCGATCAGACGGCCCGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chrX 15024365 5' - P-element 2864 1 56.00 ATAACTCTATGGAGTACTCTGCTCTTCAAACCGCCTGGCCCTTGGGTAATTTATATGCTATTACTAATTTTGGTAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGG:1 + chr3L 13569708 5' + invader3 4 2 74.26 TATCTTTCTAGAATGAGTTGATCAACAAACTTGCGCTGTGTTTATGTCTTTAGAATCTGTATGCTTGATCTCAACCTGCTAGCTTTCATAATTCCTGAGAT:1 - chrX 11764795 5' - INE-1 151 1 77.23 TTTATTCTCTCTCCATTATTTTGTGATGGTTTAACAACAAACTCGCATAAAGCAGACAGGCGGACGGACCAGGACACTATTGGGCATTTGGCCTGGTTTTT:1 + chr2L 19681390 5' + hopper 6 2 71.29 ATTGTGTTAAACAATAAATATCCTACATTTGGGGGCTCAACCGATAAAACAATAAAAAGATTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAG:1 - chrX 22426253 5' + 1731 19 2 58.42 TGCCTTCCGCCTTCTGCCGGCTCAGGATAAACAGCTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 27748998 5' - roo 9033 1 66.34 CAAGAGGCGACTTAAAGGGGCCGCATTCGCTTGAAATCAAGATGTGGCAACATTTTTCTGCTTGTATTGTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTACT:1 + chr3R 4695950 5' - F-element 4683 1 68.32 CTTATGGGCTGTCATTTATTTGACCCGACTCACTCACACATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCT:1 + chr2R 21433143 5' + HMS-Beagle2 32 2 57.43 AAACTCAAAACCTGGATTACTCGATTATTAATAAAATGTTTCGTATGAATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCA:1 - chr3R 25086194 5' - Bari1 1704 1 76.24 CAATTTTACTAGCTTATCGGTTTAACTTAAATGTTCTCAGCCCTTTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 13763257 5' + roo 8694 2 57.43 TAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3R 11608005 5' - 1360 3343 1 73.27 ATAATTGTAGTTTAATAGCTGATTAGAACCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACT:1 - chr2L 17079876 5' + jockey 4828 1 72.28 CTTTGTGGGTGGTTCCCTGNACGGGTGGGGTATGTAAACTGTTCGGCGGCTTTAGGGCGTGTGAGTGGGGATGGCAAAAAGTTTTTTTTGGCAAATCGATA:1 - chr3L 4493469 5' - INE-1 315 1 65.35 ACAACGGCTAAAATGGAGCAGGGGTGTCCTGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 + chrX 2841783 5' - hopper 1372 1 68.32 CGCTAATCGATGGGAAAGATTGACAAGAGAGTGACTTATGAATTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTA:1 - chr3R 25949872 5' + Cr1a 4205 1 57.43 GATGTTAAGCAAATAATTCCTGTGTTCCTCATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr3R 20905372 5' + pogo 10 1 70.30 ATTTAAAACCTTTGACTACAAAAAATATGTTCGATATGCATAAAAAGTCAGTATTTGCTGAAAGTCAGGGCAGTACTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chrX 17494719 5' + 1360 1 2 79.21 GTTTTAATAAATATTTTATCATTAAAATATTGATGATCGCCAACTCCCAATTTTACCAGCGCATTGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATTTGTACCT:1 + chr3L 18340391 5' - invader2 14 2 68.32 TTGGCTTCAAGTATTGCCACGCCTCCGCTTGCTTCTAGTTCTTCGTCCAGCTGTGTGTCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chrX 22593235 5' + 1360 17 1 61.39 GTTTGAAATTTAAAGACAAAACTAAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 - chr2R 22051544 5' - Tabor 465 2 56.44 ATAGTATCGTACACGAAAANAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 + chr3R 19987407 5' + Doc 22 1 51.81 TTCTGCTATTAAAGGTATTNTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3R 20420912 5' + blood 20 2 57.58 TTTGAATATGAACTTTAGTAATCAGCGACAGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATATTACAAGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2L 9045493 5' + jockey 20 1 65.35 ACAACAACAAAGAGGCGAAGATAGCCAAAGCAATTGTTGTTGTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chrX 2289333 5' - roo 9039 1 60.20 GCAAGGATGGTACATAACCCCTCCTCCTCCCTGTTTTTCTCCTGCCTTAAAACTTTTCCATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 8765625 5' + roo 8669 2 68.89 GGCTGCCAAAGTGCAAACAAGCCTGGAGATCCCCAGATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr2R 8311304 5' + opus 7151 4 64.65 GAAACATGTTTACAGACGAAATCAAATCTTTTCATGTGCTATCGATAGATCATTATTAATATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr2L 21190834 5' - pogo 2089 1 67.00 ACACTATAAATGCCACAGTCGCAATTGGATCCAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 + chrX 734921 5' - Tabor 442 2 65.00 TATGAATAAATACCATATATTGATGAACATCTTTTTCCCGGTAAAACTTTGTTTAGATTGAAGACCTTTCTCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTT:1 - chr2L 3699501 5' + mdg3 5259 1 74.26 TTACAAATGCGGCGGAGTAATTGGTGGCAGGATCATCACGTACCAATCTACGCGTCATCCATACCTTCGCTCTGGCCGTCACTTCGAACT:1 - chr3R 9355677 5' + Tirant 8077 1 66.67 TTTTGCTGACGGCTGACAATTAACCCCTTACGTGCCAATTGGTAGCTAAATAAATTAACCCACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTC:1 - chr3R 25576779 5' + accord 284 2 70.30 TTCCTGTGAAAACTTACTGGTCAGCACTGCAAAGTGCTCCTTGCCCGCTTGGACTGTCATAAAGTTGTCCGTCTCCTCGTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTAT:1 - chr3L 21430084 5' - HMS-Beagle2 483 8 83.17 TCAATCAAATTACGCACAAATCGATGACTATTCAGAGACTTCCCATGTTGCAGACGGTGCAAAAAATACTAATTATAAACTAACTCACCACGCCCAACCCC:1 + chr2L 6484240 5' + HeT-A 5917 1 66.34 TTAAACATCAATTATTTATNCCGAGCGATAAACGGGTTTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3L 13895422 5' + hobo 37 1 59.41 TTCTTCGGGTAATTAGGATCAAATCAGAAATTTAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAATAGACGAGAACGCGTATATGGGTGCGTGTTGTGCTAGAA:1 - chr3R 12663295 5' - 1360 3209 1 73.27 CAACGCACAACTTCCGGCCGGATTGTTGGCCATTTTGTTTTTACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:3 + chr2R 19560154 5' + Tirant 31 2 54.46 AAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCCGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3L 19349924 5' + 1360 4 2 67.71 TTTTGATTTTAATATTTAAAAATATATTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 - chr3L 20584068 5' + pogo 45 1 78.22 TTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 9278386 5' - roo 9031 1 68.00 TATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCC:1 + chr3L 15452886 5' + accord 33 2 69.51 TTTATTTGTCTGCCTGCCCTTTCACCCGCGTTTTATCTATCCAGATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - chr2L 20612029 5' + 297 6599 2 62.38 GTGTACTATACCGAGAGAGNGTGAGAAAGAATCGTGGAATCGGAACACGGGCGATCAGACGGCCCGATCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCC:1 + chrX 15024352 5' - P-element 2882 2 71.58 ATCACAATCTTAAAATATTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCT:1 - chr2L 20992747 5' + P-element 2850 1 21.78 CTCCATTATGCATGAGTGTAGCAGATTTCAACTTGTTGCACGCACATCCTTCCCCACAAACATGCCAGCATAGCCTCGTCACCCGCTACCTGAAACTCTGT:1 + chr2R 9374821 5' + accord 137 2 66.34 CAGACAATTAAAAAAGCATACTGCACGGGGCACTCGAATAGGACTCAAGTATAAGAGTATAAATAATATGCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATT:1 + chrX 1706014 5' + Juan 4055 1 67.33 TTCAACATAGCAGAAAATTATGAGTTAATGGATTTTGTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr3R 23638172 5' + pogo 36 1 67.33 TCCATCAAACTGCCGTTCAAGGATAATCCAAGCCAATTGTGGGGCCCATTCGATATAGCTCGTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCGAAATAAA:1 + chr2R 1318145 5' + diver2 286 2 60.40 TGGTGAATTGCACACATTTAGCGGCTGCATTGCACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAATCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chr3L 10363874 5' + P-element 39 1 40.40 GGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chr2L 13566498 5' + hobo 54 1 75.25 ATTCCGCAAACGCTGCTAAAATATACTTTAGTTTGCGATAGGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr2L 16680091 5' - P-element 2856 1 50.50 AATTTTCCACCTTTTATAGTACAGTTAATTTTCGTGCTCGTTTTCATTTTTTCAAATGCGCGCCATTCAGTTATTTGATGTCATAGCGGAGCGCTAGTGGT:1 + chrX 17389133 5' + mariner2 57 1 54.46 GAGTGCACAGGCACCGCAGCAGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTT:1 + chr3L 12238876 5' - F-element 4439 1 78.79 CTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTGCAGGAAAAGGTTCGAAAATCCAATTTCATTCAATTTGCTGTAAGATTTATTG:1 + chr3L 25373416 5' + GATE 406 1 53.47 GCTAAGTATTAATTATAATATTTCAAAAATGTATATGAACATAATGATTTTCATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAA:1 + chr3L 13000995 5' - invader3 254 2 55.45 TGTTATGAAAAGCAATTAAAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 - chr2R 672837 5' + F-element 38 1 53.47 CATACACGGCATCGAATTGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 29608761 5' - roo 395 1 69.00 AAACCCCATTTAAGATATATTATAGGTTTAAGAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:2 + chr2L 8577240 5' - roo 409 1 79.21 TGTTGACTCTTTCACCATAATTTTGATGAAAGAACGGTGAATGTTTAAAGACAAATTTAATTAATTTGAACTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 + chr3R 4474146 5' + copia 7 2 72.28 GTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGT:1 + chr3L 16282376 5' + gypsy5 6981 2 65.98 GTACGGGGGCGTATCGAAAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 10625661 5' - roo 388 2 59.41 TCGACGCATGCCATGTCCAGGAATTCATAAGTCGCAACCCAGGATTTATTTCTATGCAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 9290371 5' + G2 3077 4 74.36 CGAGGTGCGTGCCTTTCTCTCCTCTTCACCTCCAGTCACTTATCTAGTTCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAA:1 - chr2R 23528991 5' + jockey 4805 1 51.49 GGGGTGGTAGTGGGCGCTGGTGGGCTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCT:2 + chr3R 14916645 5' - R1A1-element 331 1 76.24 ATCCTTGGAACAGAGTCTTATGAATAGCATAAGAAGCTGATAAAGAATAACACAGTATAGTGAAGTGGGCACTTGCTGCAAAAGTGCGCGAAATTAGGCGG:1 + chr3L 17189682 5' + Tc1 188 1 74.26 TAACAGAATGTAAATTAAGTTTTGTGGAAAGTCTGAAATAAAATACACTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:2 - chr3L 19647327 5' + pogo 24 1 58.42 ATTAAGCATATAATTATATTTATGAATAGGAATAGGATACAAAATCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:3 + chr3L 17701536 5' + roo 8697 2 60.40 TACTTGTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGACTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATGTTAAGGATGGGTG:1 - chr3L 3517232 5' - mdg3 5348 2 74.26 AGCAAAAGACGTTATTTACATGTGTAAATTTTCACTTCCAACTGACACAGTATTATTTATATTTGTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTAT:1 + chrX 23035713 5' + HMS-Beagle2 6883 1 77.17 ATTATTAGTTTAATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAATTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:2 - chr3L 7099653 5' - roo 9041 1 59.41 ATTCAAACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:2 - chr3L 8036430 5' - roo 9032 1 69.31 GGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGTTCACATTGGTACGATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAA:2 - chr2R 10572710 5' + F-element 4382 1 60.40 CAACCGCTGGGCCTTATGCCCAGCAACATGTCTTATAGTTCCTAAGATCCCGTTCATACGGACAGACGGACATGACCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTG:1 - chr3R 5556819 5' - INE-1 95 1 70.30 ATTCTATAATTTAAATCATCTTTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chr3L 27357539 5' - mdg1 7440 2 57.43 CACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCAT:1 - chr2R 16185096 5' + 17.6 6965 2 74.26 TTTTTTTCTAATACTGTTAAAATCTGGGTTGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCT:1 + chr2R 19091597 5' - Stalker2 7625 2 50.50 AAACGCTTTAGCCGCCGTTGCACAGTACAAAAAGCCCCATGGAACATGATAATTTGTTAACTTCCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 4277441 5' - roo 398 1 74.26 CTGATTTAAAATCAGATTGTGAAATTCCAAAACATAGGCATTCCTAGCAAAAATAACACCTATAGTCCTATTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGA:1 + chr3L 15033283 5' - I-element 5349 1 66.34 CTTGCCCGTAATTAAAGTGNCCAGCGGAAGAGAACTGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr2R 6107788 5' + roo 8701 2 64.29 TTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTC:1 - chr2L 23295881 5' + micropia 4969 2 62.38 CATCTATAAGTTCATGTGCACATTTCAATTATTTTTTTTTAAATATACTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3L 10701781 5' - roo 9040 1 60.40 TTGTTTATTAGTTGTCCGTTGTTGATGTTGGATGTTTAATAAAATTTGAGTAATGGATGCGGTCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 - chr2L 126567 5' + Doc 17 1 60.40 TCCATCGTCTGCCGTCCCATTTTCCTTCCTTTTCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chr2L 7936710 5' + jockey 4688 1 68.32 TTGGCCGACAAAGTCGAAAGTAATTTTCAGCACACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 + chr2R 8526347 5' + I-element 46 1 67.33 GCAATCGGCATTTTGCCGCCGTGGTTGTTGCAGTTTCTTCCCGATTTTAATTAAAAAGGTATTTCCCTTTAAGGTTGTGATTTTATTTAGATCTCACTCCC:1 - chr2R 7772780 5' - gypsy5 7237 2 68.32 AATCCAGTAAAAAATACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 + chr3R 11052089 5' + blood 21 2 53.47 AATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3L 23456272 5' - 1360 3375 1 61.39 AGCTAACTCGGAAAATAGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr3L 7168324 5' + Doc 42 1 61.39 AATTTTTACAGGCAATTAATTTCTGCCAAATTGTAATAAACCAATATTTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr2L 7175614 5' - blood 329 2 73.27 TAGCGAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGGGATTGGTATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chrX 7111079 5' + Doc 55 1 71.29 GACCCCAACTGTATGTATCCGAGAATGCTATCCATCTGGCTTTGCTCATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCC:1 - chrX 2841847 5' + hopper 26 1 53.47 AAATATGGTGTTTATACGAACTGCCTGCCGGGTATCGTATGAGCATGCCTGATAAATATTATCGTAAGATACTTGCCGTGAATATCAAGTCGGAGCTACG:1 + chr3R 5026039 5' + Chouto 185 1 63.00 GACATTTATCAAAATGTTGAATACAAATTCATAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTT:1 - chr2L 14793547 5' - Stalker2 7606 2 67.33 AGTCCCTTCGGCTCTTTGGAAAATTTACAATGACAATTGGCACAATAAATAGTCTCAACTTACAAATATCTCAGCTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCCTT:1 + chr3L 18371272 5' + Cr1a 349 1 71.29 TAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 + chr3L 19349946 5' - 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opus 266 2 42.57 AGAGGGTATATTAGTGCAGNCATGAGGTTTGTCTGTAAGGATTAAAGTTTGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCG:1 - chr3R 20094551 5' + Max-element 8233 1 80.20 TAAGAAATGCTTTAATAAACAGGGAACCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTC:1 - chrX 21253939 5' - invader3 5415 2 73.27 AAATCTGATTTTAAAATTATTAACAACATGCAATGGCTAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:2 + chr3L 12438019 5' - I-element 5319 1 59.41 ATTTTCGATTTTCGCATCTACTTATGCTAATGAAGCCATCTGCAGACGTGGTTTTCGAACGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:1 + chr2R 9905334 5' - mdg3 231 2 65.35 AAGCATCACGTGGCTATTGTTGTGCCCTTCCGCGATCGATACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGA:1 + chr2R 14259826 5' + G2 2794 1 60.40 TAATTAGTATCAGGTATACAATTCAATTCAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - chrX 21583399 5' + F-element 54 1 73.27 ATCTTGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chr3L 6033583 5' - 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chr2L 6362910 5' - 412 7506 2 66.34 ATGATCGTTAAAGCCATATGTATGTAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGTGACGTATTTGGGAGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chrX 17104390 5' + 297 17 2 61.46 ATTAAATATTTCTCAATTTGTTGAATGGCCTTAGCAATTTTTCTGTTTATTGCTGTTCCTGTTTCTGTTTCTGTTTCCAATACTTTTAACCAATACTTTTA:1 - chr3L 18993587 5' - G4 276 1 43.56 ACAGCAGAACGGTAAGGTGCGAGAGCACTAGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACGTA:1 - chr2R 5089610 5' - blood 7176 2 70.13 GAAAGTTAAACTGCAAAAGTCAAACGGTTTCCAGATACGCGGCATTCAAAGCATCGTTTTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATT:1 - chr3L 10997752 5' - Cr1a 3994 1 50.00 AGAGGTAAGTGGACAAAGTTTTACAAAAGTTAAGGTTTTTTATAAGAATCAAGATATGTATGTACATATATTATT:1 - chrX 19344887 5' + 1731 4413 1 89.33 CGGATCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATAC:1 + chr2R 15788575 5' + Transpac 32 2 52.48 TCGGACGTTGCAGCCCAAGTCATAGCTAAAATTCTTATGATCCTTGGAGCTCGGACCTTCTTGGGGATCAGATTAATTTTCACAGCAGCCGTTATGCCGAC:1 + chr3R 902683 5' + G5 4554 1 64.36 ATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACAT:1 + chr2L 14793495 5' + Stalker2 36 2 59.41 GGCGGTTTTGGATGAGGAGGTAAGTGGAGTCAACTAGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGC:1 - chr3L 21140149 5' - jockey 4643 1 64.36 AGGGAATGGTGTGGGGTAGTGACTGCGGACAGGGGCATTAACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCTAATTCTAAAGAGGTATTGAACATGTGACGGCAGTG:1 + chr3L 12302947 5' - accord2 7361 1 64.36 GCATATGCATCGAATTAAGTTTTTGCAAATGTCAATTATTTTGTTATTATTTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATACGCTGA:1 + chrX 9752410 5' - Porto1 212 1 58.42 TCGCCGCTGGCCAAATATTGATCGACCGACGTGCTTGAGGTACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr3R 7626383 5' - hobo 2907 1 58.00 TTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGC:3 + chr3L 11474690 5' + gypsy 7126 2 69.31 TGTGTGAGAGCCTGCAAATGATCGTTAAAGCCATATGTATGTAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chrX 17104373 5' + 297 5 2 75.25 ATTACATGCACGTGTTTGTGTGTGTGTGTTTGTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTC:1 + chrX 7544699 5' - G6 1852 1 70.30 ACCAAAAAACGGAAGGGGATATGCTACATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2R 19102166 5' + opus 153 4 77.23 TCAACTTTTGAGATCAGAACAAAACAGGTATTTTACGACGCTTAGTCGTAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGATA:1 + chr2L 10240058 5' - Gypsy6A_LTR 182 1 63.75 ACAAATTTTGAAACCTAGACCTACGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 + chr2L 9696014 5' + FB 54 1 75.25 TATGGGTGTAAATCTGGTAGTTCCTATCAGTTTACTGGAACACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAAAA:1 - chr2R 19476243 5' - diver2 331 2 60.40 ACACAATTGCACCGTAATTAACTGCAAGCCACATGACGCCACTTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACT:1 + chr2L 23390349 5' + gypsy6 7447 2 56.12 CCGATAGACGACTAAGCTGATCTGAAATTTTGTTAAAAGGAGCTTTCAAAGCCGGGAGTATGCATCTTTGAATTTAAATCTGTATTATTTTTGATCAATTG:2 - chr3L 25996665 5' + 1360 256 1 74.26 GAAAACAACGCCCCGACCAGAAAACCAGCTCAAAAAATAGCACTGGCTAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTA:1 + chrX 9787449 5' + 412 305 2 53.47 CACACATGATTATAAATCGACGAAAAAAGGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTG:1 + chrX 20644603 5' + hobo 175 1 81.19 GCGATATAATTAATATTATACCAAAACAGAATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 - chr3R 7765010 5' - 297 354 2 78.22 CACCCTGGCTATTTTTCTGCCTGGCCATGAATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATAT:1 + chr3L 19215432 5' - R1A1-element 5257 1 70.30 ACTGGGATCACAAAGACGCGGGCGAGGGCAATTGCAATTACAGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTC:1 - chr3L 17080907 5' - G-element 4153 1 58.42 GAAACTTTCTTATTGCATACTTTCATTATACCTTTATTATTTTGAAGGGGCGGACACGATGCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 + chrX 15255331 5' + Tabor 6855 2 63.37 CAGAAGACGGCGGCGGAGTCGCGAAAGATCGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAA:1 - chr3L 17427977 5' - Cr1a 4278 1 72.28 GGGTGGGAGTGCAGGCGCGGGTAACCAAGTTTCAAATTCACTTTCCATACAAATTGCCCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGA:1 + chr3L 22091055 5' - Doc 363 1 67.33 GTATATTTGAATATTTTGGAAAACAATTGCTGTCGCACACTACGAAGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGC:1 - chr3R 19715914 5' - Stalker4 5 4 54.46 GCATAAAACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3R 7869100 5' + 297 6595 2 66.34 GCCGCCTGAATTCACAGGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 - chr3R 18399251 5' + P-element 30 1 52.00 TTTGATGCCAGCAAAATTCCAAGCAACTCATTATGTTACATGCTCTTTTCTCTCATACAACGCATCATTATAATAACAGCTGTTAAAGTCAGCTGTTGCGA:1 - chr2L 38443 5' - hopper 1259 1 64.36 GCGTAGCGGCCGGTTTCAAGCGCAACAGTTTGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chrX 1135319 5' - P-element 2842 1 34.65 GCAGAGGGGTGAGTTTATATACCATCTGCTCCCTCGTAGGCGCTGGTGTAGCCATCCTCTGTCTTGATGATCTCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chrX 18026590 5' - hobo 2935 1 55.45 GCAAAAATACGTCACTAAATACCTGTTACATACTTGGCAACGAATATACCTTTTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 + chr2L 21715756 5' - 1360 3353 1 52.48 CCTTTGCTTTTCGATTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTGCCAAATCATATCAGAATCAATTAATAGCAATACTTCGCACAAATGCGATTACCCAAAACAATCC:1 - chr3R 9170335 5' + I-element 4883 1 51.49 ATTGTTAGCGAGCCATTCGCAAAGTGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chrX 21217520 5' - pogo 2052 1 74.26 AAACATATTAAATCAGAGATATTAATGTATATATATATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATA:1 + chr2R 13622188 5' + Quasimodo 34 2 72.28 AGATGGCCAGCGCTAATGAATTTAATGGAAAGCATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:2 - chr3L 9910452 5' + 297 5 2 73.27 TTTCATTCGTTTTGCATGATTCACTTTCCCCGCCTTTCACTGGTCATTTAAGGGTAATGGGGTGTGCCCGATGCGTAGACG:1 - chr3R 31018793 5' - Ivk 5045 1 66.67 GCGCAAAAACTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 + chr3R 19505547 5' + mdg3 5293 2 64.36 AGGGAATCATAAGAAATTCTAAATAAAAAAAAAAATAAAAAAAA:1 - chr3L 12285448 5' + BS 5103 6 70.45 CACGAATCTCTAACCCACTGGCTTCCATAGAGCTTTAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 - chrX 15546211 5' + blood 38 2 61.39 AGTGTGCCCCTTCGCACAACCGAGAACAATCGCGCTTAGGTGCTAGCCGATACCTGCGCAACAACAAAAACAACACCACATACTAAAACAAAAACCTCCGT:1 + chrX 18783784 5' - Rt1b 5031 1 52.48 CCCCATTTAAGATATATTATAGGTTTAAGAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr2L 8577243 5' - roo 406 1 76.24 TTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTT:2 - chr3L 19349992 5' + 1360 3233 1 58.42 ATGAACTGATGCAATTATCGCATGTCTGAGGCTTCCGCAAAAAGGGGCATAAATTGTGTGCCACTATATGGGTGTGCGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTTGT:1 - chrX 6435914 5' - accord 181 2 72.28 AACCACAACAAAAAGGTCTTTCTACTTCACCAGCTGGCCGCTAGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACA:1 - chr2R 13243544 5' + blood 171 2 66.34 GTGGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTT:1 + chr2L 20360642 5' + micropia 24 2 58.42 TCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3L 2022250 5' - roo 9026 1 70.30 ATAAAAGACAAGGTTCGCATCAAGTACAAAACAGTTTCGTTCGAAACGCTGCCGTGTGAAGAGCGGTTTGCACTGTGGGCATCGCAACTGCTACCACTGAC:1 + chr3R 24846982 5' - diver2 4605 2 63.37 ATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGC:1 - chr3R 2689429 5' - diver2 4474 1 64.36 TAAATGCATATTTATCAAACAAAACTAACTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 872763 5' + 412 42 2 68.42 GTGGATGTAGCATAATTTCAGGCGCTCCTCCCACAGTTCGCAGTATGTACTTTCAGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chr2R 11993973 5' + jockey 61 1 56.44 GACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATAT:1 - chrX 21247575 5' + blood 170 4 71.01 CTTAAAGATTACATTCCCACGTGGCAAAGCACTTACTTCTATCTGTGGTCCACTTAGGCATTTCAGGTAGAGCGTTGCACCCGTCTGACTTGCTCGTGTTA:1 - chr3L 20777104 5' - gypsy10 5646 2 75.25 TCGTTCACGCACCTGACCTGCCTCATCCGGAAAAACCCACGCCCACGCCGTTTGTTATTTCCGACTTGACCGCGCGTTCTCACTCCCGAACTCCTTCTGGA:1 + chrX 14987050 5' - gypsy8 430 1 55.45 TTTAATTATTCAGCGACAGCTCAGTAAAACGGGAATCTGTGTTGTGTTGCGACTGTAGAGCGCAAAATTTAAAATTAAGCTTAAAATTAAACCGTTGAAAT:1 - chr2R 16400803 5' + Rt1b 106 1 62.38 GTAAGCCTACATCGCAAAATGTTGCATGTTTTAGCCCTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATCAACACTCGGTACTCT:1 + chr3L 14623931 5' - hobo 2901 1 60.40 CGAGTCCTGTGGCAAACACTGGGAATGAGAGCGGGGCAAAATGGTAGGAAACCCCGGGATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGC:1 - chr3R 13739757 5' - Burdock 6374 2 62.38 GCTGAATGTGCATTTTTACCCCACAGGGTTTGAATGTTTTTTTTTTCTTTTTGCTTT:1 - chr2R 7097132 5' - Doc2-element 240 1 89.47 AGGACGCTGGCGGGTGGCATGGATGACGACAAGTCACTGGTAGCCAGTTGGAGGCGATTAAACCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 - chr3L 11929354 5' + copia 4885 2 58.42 TGGTGTCACATTTCTTGGGTCTTTTATTAAGATTGACTACGCATAATAATTAGAGAGTTTAAACATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chr2L 6251645 5' + mdg3 5267 2 65.35 GTGTACAACAATTTGTGGCTTTTGGACTTTCTGGGTCCTTGAGTGACAGTTGGCCAGTTGGCCAGAAGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGA:1 - chrX 12768336 5' + FB 10 1 64.36 ATTTTTACATCACTTCTGTTTGCCTTTCTCCCAGAGCCACAGCTCCGCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 12199830 5' + jockey 36 1 50.50 TATTTTAAGTGGAAAATAAAACACAGAGCGTTTCAGAGGGCGCTAAATTGTTTTTTGCCCGTTCGGAACTGAGTAATAAGAATTTCACAATGACTTCTTAA:1 - chr3L 4542181 5' - Copia1_DM 67 1 75.25 TAGAACTTGAACTTAATATAAAGGGTTTTCGCATTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 - chr3R 11052171 5' - blood 7359 2 58.42 GCCACGTCGATGGCGATAATAACAAAGCATAATTCATAACAATAAAACGAGGCATACACGCACTGACTGCAATTGGGCGTTTGTATAATCCGTGAGCAGTC:1 - chr3R 27903082 5' - 3S18 5682 1 73.27 TTTCGCTTTTCATTTTTATTTTTGGGTTTGCCAGGCGTTTTTACATTTCATGTTTTCCTTTTTTTAT:1 + chr2R 22311098 5' + HB 154 1 88.06 CTCAGCCAACAAATCCTCTTCACAATCCCCCACCATTTCTCACTCGAAATATTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAA:1 + chr3L 3596667 5' - copia 231 1 53.47 CTCTTGTTTGTCAATAATANGAGCATTTTACACAATAAAACATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGA:1 + chrX 6415041 5' - Bari1 1633 1 64.36 AAAGGCGAATAAAAAAAAAACAGGCAA:1 + chrX 3591677 5' + Bica 335 1 88.89 ATATATAAACACACGTACGTTCATACAGACCCTGTGCTCTGTGTCCGCACGTCTGTTTGTTTTTACGGTACGTGCGTGCGTTTATGAATGTGTGTGTGTGT:1 - chr2R 17458455 5' - Quasimodo 41 2 73.27 GTTTAGAACCATCTGTGTAAATATATTGTTTCAACAATATTATTATTTACCAAACTTACGGCTAAGTTATTTTCATGTGTTCTTACTCTGTCTATATATTT:1 + chr3R 5453487 5' - G4 3609 1 63.37 CCTGACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACA:2 + chr2L 23372502 5' + gtwin 1 2 78.22 GGGGATGGGGGTCCTGCCGGCGGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAATCGGAACTATAGATAAGGAGTACTCCCGTATGTTGGCGGGGCAAGAACTCTA:1 + chrX 7166636 5' + Rt1a 4798 1 77.78 GGCCGGATATGGCAGCAATTGTGTCAACGCTGCAATAGTATTCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr3L 8268150 5' + hobo 33 1 58.42 CTACTAATATATTTGATATTATACTATAATAAGTAGGGTAACCATCCCAGAAGGGTCTGTCCTTAAAGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 - chr3L 20411892 5' - roo 410 1 79.21 TTCAGGAAACATTCAGCTGACATCAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr3R 14193953 5' - pogo 2051 1 77.23 GGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 13763186 5' - 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I-element 211 1 79.21 AAGATGAAAAAAACTTGGTTTCAAACATCCAACAAATCACACAATTATAACATACATACATATATAACAAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTCCGCGACTA:1 + chr4 195470 5' - INE-1 566 1 69.31 TTGTACTAAATATGGGGTACAAAACTGTAGTAAAAAAGTGGAGAATCGTGGGTGGAATTGATAAAAAAATATGGTGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTA:1 - chr3L 21953184 5' - 1360 5 2 71.29 TTTTCATTAACAAAATCGANTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 19061242 5' - roo 355 2 79.21 CAAAGGACTTGGTAGTATCAGAACTATTTTGAAACTTATAATTTAACGTAGATAGTTTTTTCAACAAAATGGATCTATTTTTAAAGTTTTTTTTTATTTT:1 - chr2R 10394119 5' + hopper 181 1 80.00 TTTTCGACATATTTAAGTAGGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 + chr3R 24767817 5' - P-element 2836 1 21.43 TCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr3R 19449463 5' - hobo 2901 1 69.77 TGTGATTTTTTGGTAAAGGTTCCTGAAGTTAAGATAATAAGCAGATCGGTAAAATACCTATTGGTTTCAAAAAGCGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATA:1 + chr3R 27169392 5' + 412 1 2 76.24 CATCTACTTATGCTAATGAAGCCATCTGCAGACGTGGTTTTCGAACGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTC:1 + chr2R 9905348 5' - 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R1A1-element 361 1 55.45 GGAAACACGGCTGATCGCCACCATCATCGTGCTCGTCATGATGGTCCTGACGTTCATCGCTGCTATTGTGGTAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAAT:1 + chr3L 20521708 5' + P-element 2569 1 74.00 ACACAGAGAAATAAATGTTTATCTTTTAACAATATTTCCTTATGCAGTATTTTATGAGCAGCTTTGAAAGATATCACTAGTTTTTAAAGTTTATTTATAAT:1 + chr2R 11571095 5' + hopper 179 1 58.42 CTAGACTACCTGAAAAGTCAAAAAGAAAACCTTTATTAGTAATCTATATTTCATTCATCATAACTAAATATGCATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCC:1 - chr3L 20454632 5' - invader4 322 2 76.24 ACCTTATTACATTTGCATACCCCGTAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAA:1 - chr2L 135221 5' + jockey 4890 1 75.25 AGTATGCTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 + chr3L 17181442 5' + jockey 4688 1 54.46 GCCCTCGTGTCTGCAGCATNTTCAAATTGAATTTCCATTTCAGTGGCCATTTTCCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGT:1 + chr3R 9088549 5' - hopper 1395 1 58.42 TAAATCATTGTGTTGGTAATGCGTTAAAACTGTTTAATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCA:1 + chr2L 20732779 5' - 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roo 9020 2 77.23 TTTGAGGAAAGCGACTCAGGCTGCTGCTTTCAAAACTACTAGATATTCCATAGAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chrX 17883710 5' + pogo 19 1 62.38 GTAAAAAAAATGTAGTACAACTTTCCAAATATTATTGTGGGAAGTATTGCCCTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 - chr3R 4474265 5' - copia 249 1 72.28 GTATTCGGCTTTCAAGAGCGGCAACGTGGTGAAAGGAATCCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCA:1 - chr3L 21146796 5' + jockey 4749 1 60.40 GTGCTTTATATATATATATATATATCTTATATGTATATGTATGTATTTTTGCACCTCATTGTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 - chr3L 20083827 5' - blood 362 2 37.62 ATTGTTTGTCAGCTTGCAGAATCGGATGTCAAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:2 + chr3L 12241800 5' - roo 392 2 63.37 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTATACATATATATAT:1 + chrX 12649915 5' + blood 7191 2 92.16 GAAATCCAGTAAAAAATACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:2 + chr3R 11052087 5' + blood 19 2 58.42 TCTTAGCTTTCGAATCGTATCAAACATTGATCGAACACCAAGTGCTTAATTAACAGTCAAAAGTACAAGCGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGA:1 - chr3L 22737000 5' + G-element 11 1 69.31 TAAATGTAATTGTGTCATAAAGTTAAAGTAAATAGGGTTTTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3R 11916644 5' - roo 402 1 72.28 GTTGCGTTTTTAGCCGCATTTTGTGAATTCCTCAAAATGTTACGTAGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chr3L 20520679 5' - P-element 2857 1 49.50 GCAAAAACAAAACAGCAATAAGGATACGAATAAGAATAAGCAGCAAAGGAGAAATAGTTGGAAAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGG:1 - chr3R 26316418 5' - roo 9018 2 73.91 TTGGATTACGCCCACTTGTTTCGGATTAGGTTACGGTGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 25021652 5' - roo 402 1 73.27 ATAGATCATGCTTGAAAGCCTTGATAACACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3R 17781561 5' + pogo 44 1 70.30 GTAGGTAGAGTACGAATACGTTAACTATTCATATAGATTTTTATTCATTTTCTGTGTTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTTGATTAT:1 - chr3R 31230955 5' - Juan 323 1 74.26 GAAAAATATTAACATCTGGTTTTTATGAAGCGACCGCTCAACTATTGCCCCGTAATTCGCATTGTTATTGATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr3R 12767249 5' + blood 7017 2 73.27 GAATGGCAATTCGTTTTGAGCATATACTTTTCTCCGATAACCGAATTACACCAAACTTATCGGGTGCAGCTAATAAGGGTTGCATCCAGTCTGGTATATTC:1 - chr3R 30658247 5' - gypsy12 112 2 75.25 CCATTTCAGTGGCCATTTTNCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAG:1 + chr3R 9088583 5' - hopper2 1555 1 76.00 ATAAGAATATTTATTATTTTTTGAGGAAAGCAAGGGAGAGGAAAAA:1 - chr3L 10606464 5' - Juan 4036 1 41.30 ATCCGTTTAGGGATTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2L 21086028 5' - roo 9043 1 61.86 ACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr2L 12958918 5' - roo 9034 1 65.35 ATTCTTGCATCACTCCTCTCCCCCAAATGGAGCATAAAAGTTTCAGTTAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGT:1 + chrX 4264337 5' - mdg3 5472 2 52.48 CATTTCTGCAACAATGCAATTAAAGTTTTTCGTTTTACAACACTATTTGATAATTATATTATAATATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCG:1 + chr3L 19089588 5' + invader1 3621 2 59.41 GGGGATTTTAGGGGTTAGGGTTTGATGTTTGGCTCAATATCTACATAGAACATGTTCAGTGGCGTTTTGGTCGCACGGCTACTAAGTGTTTTGACTAATTT:1 - chrX 10564153 5' - G4 311 1 76.24 AATCACCATGTGCAGCCAGCCAGTGGAGGGACCCTCTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chr2R 24278068 5' - 412 7503 2 65.35 AAATAAATCGAAGTTTATAAAACTATATAGTAAGTAGTTTATTTATTTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACA:1 - chr3R 27169517 5' - 412 7539 2 67.33 CTGTCGGTACAAGAGCCACTTTTGTGCGAGTATCTTCCTTTGTCTTGGCTGCCAGATATTTACACACCAAAACACACACATACATACACACAT:1 - chr3L 7292886 5' + Quasimodo 45 2 52.69 ATTGCGGCTAGCATCCTTGCTGTGGAAACATTTGAAGCACAACACTTGAAAATATTTTGTATATTTTGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr3L 10701689 5' + roo 9 2 70.30 GGTAAAAAGTCCTAATCTAATTTTATAGAATGATCTGCATCAATAAAGTTTAAAATCTCCGCTATTTCAATGATGGCTCCCTCTCGTTTTCTATTTTTATC:1 - chr3R 28782261 5' - Bari1 1249 1 53.47 TGCTCATTACAATTACAATGACAATTACATACAGTGCGCAATAAGATTTCTTGCGTTTGTTGTTATGTATTTCTTCTTGAATGTTGGTTTTCAAATCCTGT:1 - chr2R 8917946 5' - mariner2 652 1 73.27 CTCGTTCTCGCGCTGGCAAAGTTATTAACTAGTCGTTAATGAAAATCATCAATTTTCGAAGGGGGCGCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 14654730 5' + P-element 5 2 70.10 GTATCCCACTGTATCACCGACTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAA:1 - chr3L 21785622 5' - R2-element 3345 1 79.21 CACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:1 - chr2R 1982172 5' + 1360 78 1 77.23 TTGCCTACTCATGGTAGCGAGTTTTTGCCTTTTAAAACTTTAAATTTTTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 + chr3R 10782256 5' + Doc 35 1 57.43 AGAATATTTGTCAGATGTCGGAAAGTTCATAAAGTGCATTTTATTATGCCCATCCAATGAAACTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACAC:1 + chr3R 27804651 5' - 1360 180 1 76.24 AATCAAAGACATGACAAAATATTGAAGGCATTTGCCATTGTATATATGGTGCTGTTATTGGCACTAGTAAATGTCACCGTTGTTGTGGTGACGCTACTGCT:1 + chr2R 7879920 5' - BS 488 1 77.23 GCCACAGCCCGCTACTCATGGAGTAAATAGCAAAAAAGTGCAAAAATAAGGGATGCAACGCAGGGGGTAGGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2L 20238792 5' + hobo 6 1 73.27 GGATGGGTGCGGGAAAACCGAAAGAACCAAGTGGAACAGAGCTTACAAATAATTAAATGGCTATGATGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCG:1 - chr3R 7740648 5' + R2-element 3466 1 55.45 CAGAATAAAGATGGTGCTCTAACTATTCCGAAAGAATTAAAAGAATTAAAGAATTAAAAGAATTATAAGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTTACATAC:1 - chr3R 3854451 5' - INE-1 28 1 43.56 TGTATTCAATTAATTAGTATCAGGTATACAATTCAATTCAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chrX 21583409 5' + F-element 44 1 63.37 GGGACAACTTCAGCTTTCGTTCAGTTAGTCTATGCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3L 13773895 5' - roo 9031 1 65.35 GTTTCTAATTTCGATCTTGTACTAAGCTGTGTTGCGTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCA:1 - chr2R 4025833 5' - F-element 4357 1 68.32 CTGTCGTACCAACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATA:1 + chr2L 14793481 5' + Stalker2 22 2 57.43 TGATGTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCAATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTG:1 + chr2L 21735007 5' + 17.6 6954 1 58.42 CTGGCAGATCTTGATTAATTGTGAGTGGCATTATTTGACTTAAACGCCCCAAATGCTTAACCCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3L 11755775 5' + roo 8677 2 60.61 TTTACTTGACTGTACGCAAATTTTTGTTTAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chrX 15800907 5' - roo 9027 1 73.27 GTGCGAGAAGTGCCTGTGNACAGGGGCGAAATGCGAAAAGGNNNCGCCNNNTGGGAAAATGATACACTTNNNNNNACTTATTTTTACACACACACACACAT:1 + chrX 15362356 5' + Quasimodo 33 2 84.16 ACCGCATTTTGGATGTGGGTGATGTGAGGTGGGCAGGATTTTTCACCGTCTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:3 + chr3R 13739666 5' + Burdock 26 2 53.47 AAATGCTGGAAAAGCGCTCGATGCCAAAGCAATTGGGTTTATGGTCGTTTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 6034026 5' - roo 9049 2 59.41 ACACACGTCGTCAGCAAATGTGCCCACTATTGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAA:1 + chr2R 14521065 5' + jockey 4820 1 70.30 AAGAACTACATACACGGCATCGAATTGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 29608753 5' - roo 402 1 76.24 GTTTAGGGCTTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2L 21086032 5' - roo 9035 1 67.33 AGTTACCTATTAGCAACCCCTATTTAGACAAAGTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGA:1 + chrX 9454824 5' - roo 9029 1 69.31 TTAGAGGCGTGTGTTGTGGATTTAAGATCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chrX 13146966 5' + roo 8713 2 74.26 ATTAAATTTATTGCTCTTCTTCAACTTCCTCCTCTAAAAATATATTAAGGAAATTGAATTCGTCTTCCACTTCTTCTTCTTGTTCATTATTAGAATGATAA:2 - chr2L 9702376 5' - transib4 2182 1 87.13 AAGCATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 - chr3L 9910423 5' + 297 6614 2 69.00 ACCGTTCTCTAATTAAAAATTTATTTTTTTTTCTAATACTGTTAAAATCTGGGTTGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGC:2 + chr2R 19091573 5' - Stalker2 402 2 73.27 TGATGTGTTGGCCCACGCTTTATGCTCTAATTCAGATGGTTAGAAATCGATTGCAACAAAAGGAAAAACAACACCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAA:1 - chr3L 15591961 5' - Cr1a 228 1 75.25 TGTTAGTCGAGAACATTATNTTGGCATTTTAGCCCACACAGTACGCCCCTACGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chrX 10286136 5' - roo 387 2 52.48 CGCCTTTCACTCCACGCAATTGTACAATTGGGTAAAAATTTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 22180639 5' + TART-C 11092 1 59.62 AACATTTTCGAAAAACATATACATGCATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCGAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr2R 9699864 5' - Transpac 266 2 73.27 ACAGGGAGTTAGATCGATAAATTCTTAACAATATGTATGTATATATTTT:1 - chrX 1640687 5' + 1731 4410 1 91.84 TTTTCCGCGACAAACTTCCTGGCCGGCATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 + chr2R 12473073 5' + Doc 52 1 75.25 ATAAATTTGATGCCTTTTCCCTGTTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTTTTATATGTGTTGTTA:1 + chr2L 17735237 5' + BS4 670 1 72.28 AAAGATATCAAAATATTAAGGAGAATATCCCCAGGAAACAAGGATCTATATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 - chr3L 4009497 5' + mdg3 27 2 53.47 ATTCATCTTGACTGCGGTTGGTCGTATTCTGCTCCATTCCCTATATATATATTTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 - chr2R 19102243 5' - opus 7486 2 64.36 CAAATTGTTGTCAGAAGCATTCTGTTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chr3R 12333764 5' + P-element 47 1 31.31 TCACAGCACGTTCGACTCCATACACAATTAGCAGCTTCCTCCTCAGTTATTGATGATATTATGCGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGC:1 + chr2L 12888120 5' + hopper 377 1 52.48 TGGAAATGAGCAAAAAAAAGAAAAAACAAAAAAAA:1 - chrX 17345487 5' - hopper 144 109 80.00 GATTAAGATTAAGAAAACAAAAACTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATTTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTAT:1 + chr3R 4132578 5' - Bica 408 1 77.23 GGAAAATTTCCACAACATTTATTTGGCAAAGGTTTTCGCTTTGTTTATAGATACGGCTTATATGCTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAA:1 - chr3L 16563305 5' + 3S18 5779 2 66.34 CTGCACACAGAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 + chr3L 4665402 5' + G2 3076 2 85.29 CCCTGCGGAAGTGCTTAATTATTGGATATTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3L 12241869 5' + roo 47 2 76.24 TATTTGTGCTGGATGATTCATCCTCAAAGACTATATATGCAAAGTAAACCAAATACAATAGAACGCTAAAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGGTACCCGATA:1 + chr4 378981 5' - INE-1 552 1 65.35 CCCCAACTGTATGTATCCGAGAATGCTATCCATCTGGCTTTGCTCATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTA:1 - chrX 2841845 5' + hopper 28 1 53.47 ACCAATTCGATTTCCATTTCTACACAAAATTTATGCGCGAGTGCAATGCTGTTTTATTGCCATAGTATAGAAGACTATGTTGAATATAGGCAATGCCCACA:1 + chrX 22689998 5' + 1731 3 2 58.42 CGAAAAACTAAGAGCGATAAGTCCGCGTCCAAATCCTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTG:1 - chr3L 6736765 5' - Doc3-element 4481 1 64.36 AAGCGACTGGAACGAATTGACAACGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGC:1 - chr3R 21884221 5' - mdg3 5444 2 78.22 CATATCCTTGCCAACACTTTCCAAGCTGGACGCAAAATACATGTTCTATATACTTTGTCTGCGATATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 + chr2L 5419769 5' + 297 6580 1 79.21 TCACAAAGTAAGCTCCAGATGAACAGCTATGTATATAAAAAGAGAAGAAGAAGAACTGGCAGAATCAGAGAAAATAAACAATATTATATATACGTACATAT:1 - chr2L 3572324 5' - Dm88 4380 2 61.39 TATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTC:1 + chr3R 556456 5' - Tc1-2 1587 1 60.40 TTAGCCCTACGCAAATGCCACTAGCGATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:2 + chr2R 18432078 5' + 412 48 2 76.24 GTACCCTTTAAAATGGTGAATGAAAAGTGAATCGCCGGGCACAGCGAGGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 + chr3L 6838984 5' - hopper 1388 1 58.42 AGTGTGAACTCACGAACACACGCAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr2L 16683728 5' - P-element 2842 1 30.43 TGCAGGATAGTATCGTGTTGGGCAGTATGAAATTGATCTCTCTTTTTTTTGTTCGTTTCTGCTGGTGTTCAATTGTTGTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTT:1 - chrX 3060125 5' - gypsy9 459 1 72.00 AGGGCTTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2L 21086036 5' - roo 9031 1 71.29 TCTTCTGCCAGAAACTCTTTTTCAACGATTTTAGCATTTTCTTGTTTTTCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chrX 8503102 5' + roo 8687 2 52.04 TAAATCCGATGGGGTAAAAACGAAATAACGAAATTCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2R 17192317 5' + hobo 40 1 64.36 TAGTAACGACAAATCTGTAGCTTGAAGAATACCGTTAATTTGTTCCAGAATTTAAACAAAATATATGTTTAGACAAACTATAAATATGTTATATTTATGGG:1 + chr2R 5018781 5' + rooA 7275 2 67.33 CCGTTTAGGGCTTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr2L 21086030 5' - roo 9037 1 65.35 TTAACTCTTTGACTGGGTAGTTTGACAATTGGATTGGTATATTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTG:1 - chr3L 7194529 5' - I-element 167 1 71.29 ATACACTCCCTCAACACTTCCCCTTCCACTGTGGAGGAGTCCTTCCTGGACTGAGCTATAAATGCCAACGCAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3L 13773982 5' + roo 8669 2 72.28 TGTAGATATATCTCTTCATTAGAAGTTCTTTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 - chr3L 10474225 5' - copia 240 1 63.37 GGTGTCTTATTTATACCGTTACAAAATCCTAAATTTGTTAGATTTGTGTTTATAAAATATATGGTGGATTAGACACACAAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAA:1 + chr4 894217 5' + invader1 3583 2 66.34 CAAAAATAAATGCACAACAGCCAGGGGGTTGGGGTTGGGGGTGTAAGTAAGTGAGTGTGTGCGAGGAAAACACATACCAGCTTAAGGAAAACAGAGCATTT:1 - chr3L 21391800 5' + G4 361 1 72.28 GCTGTGCCCGCATAAAACGTTAAGCTCTGATGTAAATCATGTCGCTATTGTTAGTTCCGTAGTTTTGTGGCATAATTTAGTATGAGTTTTTGTATGTTAAG:1 + chr3L 2199638 5' - I-element 5136 1 68.32 CTGGCCACCGGAGGCAACANTTTCCATTTGGCGTTCGCTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTA:1 + chr2L 17994147 5' - roo 371 1 58.42 AATCGATCACGTCCTCGTCATCGTTGTCGTTGTTGATTTTGTTTAAGGCGGCCTCCAGGCTGTTGCTTGTGCTGTTGTTATTGTTATTATTATTATTGTT:1 - chr3R 30930017 5' - mdg1 34 10 63.00 AGCACTTTGGCAACACATTTTAAAAACCCTTTTTTTGTTTTTTTTTTAAAAAAAA:1 + chr3L 3495804 5' - transib2 2633 1 49.09 CGGTGACGAAGCAACCAGTNATATTGTACTGTATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 25021685 5' - roo 9032 1 67.33 TAAAGTGGCCAGCGGAAGTGAACTGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2R 6107776 5' + roo 52 2 78.22 GCCCAGGAAAAGGATAACTACAATAAGGCTATAGCAGAAATATTAAAATTGCAGCCGTATGAAAAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:2 - chr2L 23350538 5' + F-element 22 1 64.36 TGGATTTTCCAATTGTTTTCTATGAAAATAGAACATTTTGATGTAGTTTAACCTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 + chr2L 14341828 5' + copia 25 2 54.46 CAAACACTGGGAATGAGAGCGGGGCAAAATGGTAGGAAACCCCGGGATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTA:1 - chr3R 13739745 5' - Burdock 6362 2 54.46 CTACAACACAGTATATATATTATAGTGAAGTTGGGTGCAGTTCATGTTTAAATCTCTAGTTAAATTGCGCTGTGATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGAT:1 + chr3L 15056550 5' + BS 5061 1 63.37 AGGAAAGGAAATTTCTTAGTTGACGCAAGGAGATAAAGAAGTGCAGCGATCGGTACATAAAGAGGCTTCATAGGCATTCCAACATAACGGCCAACTTCCT:1 - chr2R 5532085 5' + G7 991 1 67.00 CCATATATAGTAATATAAAAAAGACTTTTGATACAATTTCAATCGATTTCCCAAAAAATTGTTGACACGCCCACTCGAACGCCCTAAAACCGACCAAAACT:1 - chr4 819877 5' + INE-1 346 1 66.34 ATTGAAAATGAAATTATGCAACTAAGCTTCATTAGTAATATTGTTGCTATTAACATATTTTTATATCTATGTATGTATGTATGTATATACTATGTATGTAT:1 - chrX 9443002 5' + Dm88 4370 2 72.28 CTGGCTCTGAATCCTGGCTCGTTCCTTCTTTGAGTTCTTCTGGGCTTCTGTGTGTATGTGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATT:1 + chr3R 25699434 5' - mdg3 54 2 65.62 AAATTTACCAAAATGTCTTTATAATTTAATATAATTACAAAGAAAATTGCAGCGGCACGACATGCATCTGGGCTACCCTGGTATGTGAGCAACAGAGTTAT:1 - chr2L 8573824 5' + G5A 2531 1 56.44 CAATAGTTGTTTGTTTTCAATCGTTTTTATATGACTAAAAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACA:1 + chr2R 18188317 5' + Juan 4063 1 61.39 TGGAAATGGAAAATTCAACAAAATGCATATTTACTGCTTGCTATAGAAGGGCTCCAAAGGCTGGGTAGGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 + chr3L 3880958 5' - blood 370 2 72.28 TTGCCTCCTCACTGCCTGCAACATTTCAAATAACATTTCAACTTTTCAGCACTCGCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAA:1 + chr2L 12882723 5' + hopper 19 1 60.40 TATTAATAAAATGTTTCGTATGAATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCA:1 - chr3R 25086169 5' - Bari1 1679 1 53.47 TTACCCTATTTTTTTCAAAATAATATACACCTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCG:1 + chr3R 30553533 5' - 412 7533 2 64.65 CTTAAGGCTTGCAATTAGAAAGTTGTATCTATAATATCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 - chr3R 27131963 5' + copia 4909 2 65.35 GCACGCACAGCGGAGAAAGCTTTCTCCCATGTTAACATGACAGCCTACAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 + chr3L 14594110 5' - hobo 2910 1 52.48 CCTGGCCGTTGGGAATTCGATGTTGCCTCTGTTGACTGTCAACTTATATGTACATATGTATGTGTATAAATGTTAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATG:1 - chrX 9428824 5' + Stalker 7123 4 63.37 GAGACTGTGGTCACGCTCAAATTCCCCGAAGTGGAACCCCTTAATCCTCCCGTGCTGGCATTTCTACAGTGCATTGGACTTCAGGGAGATCTTTGAGTCAT:1 + chr3L 19588148 5' + baggins 5369 1 62.38 AGCCCGCTACTCATGGAGTAAATAGCAAAAAAGTGCAAAAATAAGGGATGCAACGCAGGGGGTAGGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr2L 20238787 5' + hobo 10 1 69.00 TGACTGGAGTCACCAAGCATGAGACAGCAAATTCCGTCACTGTGGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATT:1 + chr2L 1241256 5' + P-element 2596 1 47.52 TTTGGAGCCACGTGGTCTCAGCACAATCTTGTCCTCCCCGTAGATCTTCTGCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGC:1 + chr2L 19526040 5' + opus 7175 4 54.46 GAAGGATGTGCGGCCAGAAAAAAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 - chr3L 25345139 5' + Doc 58 1 75.25 TCACAGCCCCACACCGGTTCCCCAGAGCAACAATCGAACAGTTCTAGAGCAGCCAAGTTGAAACGAGGAAATGAATGGAATGTAAAATAACTCTAATAAAT:1 - chr2R 6911772 5' - Cr1a 4312 1 61.39 GATCAGTTCGATTATGATTGTTTCGTTTAGAATGCGTACTCCACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3R 3255971 5' - roo 9039 1 58.42 ATGCTGCCAAAACCCACGGCACAGTGGAACAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGT:1 - chr2R 16160811 5' - mdg3 200 2 69.31 ATTCATTAGTCTTAAAGTCNCTTAAAGTCAGTTCCTTCTGAACTTATTAGGTTAAGTAGCTTAAGTAGCTTAAAAGATCATATTATGGATACTGTTCCTTA:1 - chr3L 27113949 5' - G5A 2756 1 79.21 TTCCTAATCGATCACGCATAAACGGAGATATAGTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chrX 19334594 5' + roo 40 2 65.00 GGTCAAAGCCTTCAGTTATGAGTAATGAGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1 + chr3R 27131919 5' - copia 207 2 76.24 AACATCTGGTTTTTATGAANCGACCGCTCAACTATTGCCCCGTAATTCGCATTGTTATTGATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr3R 12767259 5' + blood 7027 2 62.38 TGAGCCTATTGTCCTAAAAGTATGCAACACAAGGACCATCACTTTCGCCAGCGCGCTGGCAGGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGT:1 - chr2L 10166075 5' + jockey 13 1 70.53 CAAGCCAGCAAAACAAGCAGGACAGACAACAAGCGGCAATGTGGAAAACAATAAACAAAACGAAAATATCAGCGTATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAG:1 + chr2R 17943979 5' + Porto1 223 1 58.42 GCATTATAAATGCATATTTNTCAAACAAAACTAACTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 872769 5' + 412 7095 2 64.36 GAAGTGGTGGCTCCCTTTTGGGCAAACAATACCCCAAAAAAGCTCCAGGGCATGATCTGCAACTCCACTATAAAGGCACTACCGAGATGTGCGATCCTCTA:1 + chr2L 11507466 5' + BS3 297 1 76.24 AACGCATATTTTTACATCACTTCTGTTTGCCTTTCTCCCAGAGCCACAGCTCCGCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr3R 12199837 5' + jockey 29 1 55.45 ACCTAGTGGCATTTAAAGCATTTGCTCATTTAATGATTGGACTTGCCGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCC:1 - chr3L 1998888 5' + hopper 26 1 56.44 GAAAAGCTTGAAAATTTTCCACACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 - chr3L 5415382 5' + I-element 53 1 75.25 AGGGGAGTTTAGAGGACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr2L 17730445 5' - pogo 2063 1 63.37 CTATGATGAAAACTTACATATGTTTCAATGCCACAGTAAAATATAAAAAAATGTATATTTACAGGAATGATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 - chr2L 14262880 5' - pogo 2096 1 48.51 AAATATGTTCATTCATTTTCTAAGAACAAATCATCTATTAGTGCCTACATTTCGAACACTAATTACAATATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 + chr3R 5993086 5' + pogo 5 1 74.26 GATGCAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 330453 5' + Doc 4693 109 92.86 TTCCAGCTGGGCCTCTCGTTCATTCTCTCAATCAGCTGTTTAAAACTTCAACTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTGTTT:1 + chr3L 7746151 5' - transib2 114 1 80.20 ACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 - chr2L 18248037 5' + blood 48 2 77.23 TGGTCGGATAGAGAACGTCCGCCAGATAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr3R 28565256 5' + 412 26 2 53.47 TGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr3R 29608778 5' - roo 9040 1 57.43 AAGGGGCAATTAATTTAATTAGTCTGACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 - chr2R 23780061 5' - mdg1 7409 2 73.27 AAAACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr3R 7869104 5' + 297 6599 2 62.38 ACCAGTAGTACCGCGTATTTCTTTATGTTCCCACACACACACCTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATA:1 + chrX 9205508 5' - diver 191 2 56.44 CATTATTTTTTACTTACCCNATTTTTTTCAAAATAATATACACCTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGA:1 + chr3R 30553520 5' - 412 7544 2 75.25 ATTTTAACTCGATTCAAACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3L 8036441 5' - roo 9043 1 58.42 AGGGCGACAAACTAACGCTGCGAGCTGACTTTCTGAAAGGCTGGGAGAGGGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chr3R 7626458 5' + hobo 22 1 58.42 TGTCGATCGTAAATGATAGTGAAAGATTACAATTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2L 21086111 5' + roo 17 2 62.38 AAAAGTAAATCATTTTGATNTTAGAGATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATG:1 - chr3R 10914159 5' + F-element 122 1 73.00 ATTTTAGGCCAGAATCAAATACATCTACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATG:1 - chr2L 19678166 5' + flea 44 2 76.24 GCCTTCAGCCATTGCCCTGCCATCAAATTGTTTAAGCAAATATAAAACTTTAGAAATGCGAGGAAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTT:1 + chr2L 19642279 5' - Quasimodo 7361 2 74.26 GTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 10087839 5' - roo 359 2 70.30 GCATTGCGCGTTTAAAGTAGTGACGAAGCGCACGCTGACATAGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 + chr3R 5506775 5' + pogo 31 1 62.38 AGAACGATCGTCGAACGGTGTCATGCCATCGGCCTGCTACCGTCTCCATGGTCTTAGGAGCAGATGTTTATCCAAAGGTTATCCAATCGGGATTCCTGACC:1 - chr2R 3463430 5' + GATE 8099 1 75.25 CGATGCTCTTCCTTTTTATCCCGAAATGGAGCAGCCCAACACACATATTAGTATGTATTTGTGTTTATGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 - chr3L 14594210 5' + hobo 1 1 77.23 ATTTTCTTTATTTTTAGTCGCAGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGTTTGATATTTGTTTATCAAGGTTTT:1 + chr3R 16689687 5' - I-element 85 1 78.22 TTACTATCGCAGGGAATTTGTTTGAAATTTAAAGACAAAACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTT:1 - chr2R 22051563 5' - Tabor 7323 2 77.23 GTGGCCATGAACTATTGAATACGCCTGAAGTTGTTGTGAATTGCGAACATGATATTGATCCTGATCAAGAATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACA:1 - chrX 22896814 5' + S-element 5 2 60.40 CAAAAAACGGAAGGGGATATGCTACATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chr2R 19102168 5' + opus 7045 4 79.21 TGGCAGCTTGCTAATATGCGTGTTCTTAGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chr3R 20905453 5' - pogo 2055 1 69.31 AAGCGACCGCTCAACTATTGCCCCGTAATTCGCATTGTTATTGATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 + chr3R 12767276 5' + blood 33 2 57.43 AGACCCAATCATATCTTTTTTCCTAATATTAATTTGCGTCCTCTGATTTTGTATACTAGTTCCTCCATTTTGTTGTTGTAAGCACACTCAATTCTTGATCT:1 - chr3R 4721526 5' + Gypsy12A_LTR 2113 1 75.25 CCTCGAATATTTTAACTCGATTCAAACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3L 8036449 5' - roo 388 2 52.48 GAGTGCGAAGGAAAGCCAAATATAATATTGTTACTTACATAAATACACATAGAATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr2L 17778131 5' - pogo 2082 1 52.48 AACAATCTCGCAACACGCTGCAAGTGGCAGTGCACATTTTTATCAACATTTCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGA:1 + chr2L 17677699 5' - Tirant 376 2 56.44 CGTGACTTTAATGAGCTCAGGAAACGCCCGAAATTCAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr3L 7300500 5' + Doc 45 1 67.33 CCAAAAAGGACAGTCATATNTTATTCGAGCTTACTGTCGATTCTTCGGCGATTGTTCGTCACGTCTCTTGAGTGAAAGTTTGAAGACTAAATCGCTTGGAG:1 + chr2L 14389068 5' - Bica 4466 1 72.28 TTGCAGATGGCCAGCGCTAATGAATTTAATGGAAAGCATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 - chr3L 9910456 5' + 297 1 2 77.23 CGCTAATTTTCTAAAAACACACTCTCTGTCTTACTGATTACTAACTAATACTTAAAGAGAGAATGCTGTAGCCGAGTTCCCCGACTCTTAGATACCCGTTA:1 - chr3L 23494550 5' - INE-1 552 1 74.26 TATAGTTATGCATAATTATACTATAATACTTGTTCATTCGCCGGCTACCGCTCCCGATCCCGCTCCGGCCGCCGCTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGCTGCTG:1 - chr3L 12462804 5' - TART-B 155 2 59.41 GCAAGCGCTGCATACTTGGGGGCTGTCGACACCACGACCACAATCAAAATGAATGGTCACCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - 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Tirant 388 2 64.36 CCCAGAACCAAAGACTCCCCAGTCCGTTCACGTCTTGTACCAACAAATCATGAAAGAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACAATTCACCACCCCTCCCTC:1 - chr2L 22941653 5' + ZAM 18 2 68.32 TAACTATAATCGGAAATTTAATTTTATTTCAGCATGATAAAATAAATAATTTAATGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCC:1 - chr2L 20678963 5' + I-element 217 1 58.42 AAGTACTCTCCCCAGCTTGAAGTGTCCTCTCTGTATGTATGTACAAATGTATAGTATTGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3R 19216333 5' + 1360 20 1 57.43 TTTTATTTGTTCACTTTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAA:2 + chr3L 20049626 5' + jockey 4794 1 55.45 TTTATAGACTTTTAGCTCCAAGTTAAGCACACTATAAATGCCACAGTCGCAATTGGATCCAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTA:1 + chrX 734893 5' - Tabor 469 2 68.32 TTTTTTGTGTTTAACGTAANCTTTTTCAAATTTATTAAGGTTACGTTTATACTAATACACTAGTGGGCGTAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGC:1 - chr3R 556532 5' + Tc1-2 23 1 51.49 ATAAATCGCGTTTGGCCGACAAAGTCGAAAGTAATTTTCAGCACACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAGAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 + chr2R 8526336 5' + I-element 35 1 54.46 AGAAAGGTCGATATGGAATCGCGGATATTGATCTAAGAAGATAGCTTGTTAGTTACGATAAAATATTTCTTATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:1 - chr3R 17482104 5' - copia 251 1 66.34 ACGTTGCTGATTACGCTCCAAGGAGAAGCGAGTCCTGCGTCCTGAATTCTGACCTAGCGGGGATGGTGAATGAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAA:1 - chr3R 26252770 5' - 412 490 2 74.00 ACATACAAATACAAATAAGTAATCGATTTAAGTGAGCGCGTCTAAATTAATTGCACCTATACTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 25021764 5' + roo 14 2 66.34 TCCAAGAATCGAGGAACATTTTATTGGCGCTGGGAAACCGCCAGGAGATGATGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAA:1 + chr3R 6140627 5' + 297 414 1 60.40 CAGTCGAGAGAAAAATGCCACCAAGGAAACTGGCAATGCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTGTCCTC:1 + chr2L 7757361 5' + McClintock 6028 2 71.21 AGCTTAAGGGTAAAATCCACAGGGATATAGGTGAAGAAAGTAGTGGCTAAAAGGGGGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTA:1 + chr3L 3757058 5' - roo 109 2 60.40 GATTTAAAACTCTTAAGCATTCAAACCTTGATAAAAAAAAAAGAAAAAGAAA:1 - chrX 19332747 5' + BS 5103 9 53.85 ACACAATACAGGACGAATTCCGCCTCAAGTTGTCGAGCTAAGAGTGCACTTGAGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 9649143 5' - roo 405 1 75.25 TTAATGATCATTTGACTTCAATTCAAGATTTACGTTTTGTACCGTAAAAAATAATGGTAAACGCTATAATCAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTACTC:1 + chr2R 9236992 5' - INE-1 549 1 76.24 GTGCGAGTTGTACGACTGTCTGGATTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAGAACTTAAAAAAAAGATCGCAAAAGAATAAAATTTGAAATG:1 + chr3L 27413077 5' - hopper2 1367 1 73.27 ATTTTATTATAGTGTTTGGTAATTCTTAAGAATATTTCTCCACCCTGTGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chr3R 4575503 5' + 1360 28 1 53.00 TAACGTGAAAATGAAGCTTTGACAAGGGCACCTTAACTATACACGTCGCCGAACGATTTGATAAGACTAAGAATGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3L 14222428 5' - roo 408 1 78.22 ATAACTTTGATTTGCAAATTCACACAAGCCAGGTATTTCGGTACAAAATATCATTGATTTATACAAAATTCCACGGGCAACGGTGTATTACCAAATAAATA:1 + chr3L 20166166 5' + Tc1-2 467 1 69.31 AATTATAAAGTAAATCCATGCTTATAATTTGATCAATCAATCGTAAACAGTCACGTTGTGTGTTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCT:1 - chr2L 19417166 5' + BS 5008 1 59.41 AAATAAATGGATACGCAGGTACTTTGAAACGAGTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 - chr2L 7937275 5' - jockey 4944 1 67.33 CTCGGAAAATAGCTTTTCTCTATTCGAGCCTACGAAATGGCGCCTAGAAGTAGGCAAATGTGTATTGTCTCGCAATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chr3L 8039441 5' - hopper 1413 2 77.23 GGCAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2L 13093785 5' - roo 399 1 56.06 AGGATCCTGTCTAAGGATTTGGACAGCAGAATGCCTGGCATAAAACTATTATTTGATTGCATATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3R 19198594 5' + hobo 12 1 71.29 CGTAAATATTAAATATTTATATTGTTCTCTCTCTTTATTTTCTCTTTTTATGTTAATTAGGGCATAATATTTGGCTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAG:1 - chr3R 31882158 5' - HB 1313 1 57.43 TCATCGTTCCAAGAAGTATTTATTTGCAAGTATTACAGGCAAATAGTTCCAAAGTTACCATATAAATTTAAGGGTTACAAATTATTAAGTATAAAAGTAAA:1 - chr3L 19014112 5' - G5 4724 1 52.48 TCGTTATCTGATAGTCGGGGAACTCGATCATGTAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGCCGTCTGTCCGTGTGAACGTCG:1 + chr3L 23747147 5' + INE-1 127 1 76.24 ACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chrX 21087572 5' + mdg3 17 2 60.40 GGTTAAATTTAATTAATTTGTCTCGTCGCCCCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 + chr2R 22553096 5' - 1360 3344 1 71.29 TGTGAGGTAATTGTTGCGTTTTTAGCCGCATTTTGTGAATTCCTCAAAATGTTACGTAGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:2 + chr3L 20520667 5' - P-element 2869 1 61.39 ATTTGACTTCAATTCAAGATTTACGTTTTGTACCGTAAAAAATAATGGTAAACGCTATAATCAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTGGTGG:1 + chr2R 9237001 5' - INE-1 540 1 76.24 CGATTGCTATCCTCCTACACTTTAACATTTATTATCCCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 + chr3L 1697691 5' + Transpac 38 2 63.37 TTCGGGCATATATCGCCGACGGCAGACGGACTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chr3L 699793 5' + P-element 44 1 35.64 GTTCAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 13763179 5' - roo 9052 2 51.04 GATATTTTATGAAAAAAAACGTGTAATATCTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACAT:2 + chr4 194736 5' + Quasimodo 45 2 73.27 GAGGGGAGTTTCGTTGCGAAGGGAGTGGAATGGGAATGTGCCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:2 - chr3R 29287562 5' - hobo 2904 1 61.39 ATGGGTCAACAAACTTGCGCTTGGTCTTTGTCTCTGGAATCTGTACGCTGAATCTCAACATTCTAGCTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGG:1 - chr2R 5296378 5' - INE-1 135 1 87.00 TCTATTCCTATCAATAAACCGTTTAGAGTAATAAAACACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAAC:1 - chr2R 16185132 5' + 17.6 2 2 78.22 CATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:2 - chr2L 13566521 5' - hobo 2886 1 74.26 TAACTGCGCATTGGATTGGAACACGGTTGCGGGATAGCGGAGTTCCCAACCCAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGGG:1 - chrX 765253 5' - R1A1-element 5253 1 57.43 ATTCATACATACGAATTCATATACACCCCAGACTCATTGGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCA:1 + chr3R 9122922 5' + Quasimodo 7056 2 62.38 TGTCGGTAATTTGCATATTNGAGCTGGAAATTGTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTG:1 - chr2L 15531852 5' + Stalker2 7290 2 67.33 ATGCGCCTCCCAATTTTGTCATAAACGTTTCAAAAACCGGCAGTAGACTAATCTCATACTCTTTAATATTATAAGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGC:1 - chr2L 22725910 5' + diver2 4601 2 62.38 TTTTGGGTGGTTTCTGTAGGGTTTGCTGGCTTGGGCCTCCATCTGAATTTGGTTTTGATTAGCATCCATTTGATAGTTGCGACTGTTGTTGCTGCTGGTG:1 - chr2L 15237962 5' - TART-B 152 2 72.00 TGGACCCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTA:1 + chr2L 12808163 5' - Tirant 8471 2 62.38 CGCCACATGACGTGCCGTTGATATTTATGTCGTCGCCATTGTCGTCTCAGTTCTCGGAACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr3R 26252658 5' + 412 7070 2 62.38 ACACAGGGGACAATAAGGTNCTCAATATTATCGAAAATGAATTGAACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 19445756 5' - roo 9061 1 43.56 CGAAAAAAAAACAACACTGAAAAAGCTGCCAAGCGAGAAACGACGGAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTT:1 - chr3R 24393998 5' + F-element 4563 1 54.46 AATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 - chr3R 26765186 5' - mdg3 229 2 57.43 ACAACGAAAAAAGTGAGAAAAGATAAAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2L 13093751 5' - roo 398 1 68.32 CGTACGTGCCCTGGAATCCCTGCTAACTTTTTGGCATAACAAGTCGAATTTGTTGTAATTAAAAACCAAGAAACATACTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACC:1 - chr3R 26597437 5' + mdg3 5254 1 79.21 GAGTTAGGTTGGGACAACATTAAGAATAAAGTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTCTAGTCAGTAGACAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAAT:1 - chr3R 14233513 5' + Transpac 116 2 67.33 TTGCAAGAATTTTGCAATTAAGTATCGAATACCTAATAATTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTAT:1 + chr2L 20118387 5' - copia 5087 2 66.34 AGTTTTTAATAAATCAGAAATGTATTAAAACAAATGTTTTAAGATAGATCATGCTTGAAAGCCTTGATAACACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr3R 17782189 5' + pogo 1 1 48.51 GCCGGATCCCAAAGCAAGGATCCGAAACCAATCCAGTCATCGGCAACTAAGGAGCCCAGCTCAAGATCAACACTTTCAAGAGGCATTTTTCTTTTTGAAAA:1 - chr3R 27493166 5' + G5 390 1 58.42 CACAAGCTGTAAGATATATGTAATGTAGAAGCAAAAGGAAAAATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:2 + chrX 13126209 5' - mdg1 387 2 57.43 CTGTCGCGTTGCGACCCCATCCCCAACTCCCGTGCTCCTCTCCTGTGACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3L 20868998 5' + 297 52 2 59.79 TCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAA:2 + chrX 22789340 5' - Tabor 432 2 79.21 TACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 + chrX 15546168 5' - 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Transpac 261 2 73.27 TGTTTTTATATTTATACGTTTTATTTTCAAAAACAAATTTTTTTTTATGATTTTTGTGTTTGTTGTATGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:2 - chr3R 12063837 5' + 412 6 2 72.28 GATCGCGCAAGCAGCGGATNCTCCATATTGACCTCAGTGCACTGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGA:1 - chr3R 10641579 5' + 1360 320 1 58.42 ACTCCATATATATGTAGACACCCCCCACCTGAGCACATGTGTGTGTGTCCCTCTTTTTTTTTTGTTTAATTTT:1 - chr3L 7194040 5' - Doc 4698 1 61.64 GTGTCGATGAGTCAGGCGCTCCCATTCCCTTTAGTCCACCGCTTCTCCACTATTCTCGTCTGCATAACGTTTTCTGACGCGTGAGCGAGGCATGTCTGTTC:1 + chr3L 5364288 5' - invader1 329 2 57.43 CGTCTATTATAAATAGCATCAAACAAATCTGTTATTTTTAAAGTGATCTTCTTCTTGTAACAATAATTCATTGTGGCCAACACACACGCACACACACAACA:1 - chr3R 24668616 5' - Stalker 442 1 60.40 AAAATATTAAGGAGAATATCCCCAGGAAACAAGGATCTATATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATT:1 - chr3L 4009488 5' + mdg3 36 2 62.38 TGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3L 3757401 5' - roo 9045 1 68.60 CAGAGGGTTTCATTAATTAAACATATGTTCAGATCGCAGTCATGAACATCGTATACAATATGTACATATATGTGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATT:1 - 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chr2L 22497725 5' - HMS-Beagle2 7169 2 47.00 TAATGGAAAACAATGTTGAATAGCCAAAAGCCGGAATGTTCTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chrX 9774989 5' + 412 34 2 58.00 AGTGAAGCAGGCCAAATGACATCAGTGGATTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCA:1 - chr3R 29626580 5' - 412 190 2 71.29 AACGAGCCGGCAGCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGT:1 - chr3R 6362705 5' - blood 190 2 74.51 GAACGTTAAATGCCAGGCGCATATTAAACATCAATTATTTATGCCGAGCGATAAACGGGTTTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3L 13895445 5' + hobo 14 1 63.37 TGGGGGCGTGAGTGCCAGGATGCAGATACACTCCCGCCATTGTTTGCAGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCAC:1 - chr2R 13383584 5' + gypsy5 8 2 65.06 AATGATGAATCTGCAAATATTTCCTTGCTTTCAGTGCCTTTAACCCACACACACACACACTTGCTCACGCACTCACACACACACACACACATACGCA:1 - chr2R 16516491 5' + accord 186 2 89.69 GCTTAAATCTCACTCGCTCTTTGGGTCTAAAGAAATTCTGGCTAAAAAAGCAAAATAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3L 2176393 5' - roo 9054 2 61.39 TTAACAATAAATATCCTACATTTGGGGGCTCAACCGATAAAACAATAAAAAGATTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGCGTGTTGAATATAGGCCATTT:1 - chrX 22426246 5' + 1731 4338 2 49.50 GTAAATCGCCAAAAGAGGTACTCCCTTCGAGGAGCCCAATATGATTATGAGCATCCATAGGTCCGATCAGACAAGATGGCCAACAGAGTGGGTGGCTAAGC:1 - chr2L 11165410 5' + Rt1b 4807 1 67.33 ACTTTCTTTACATGTTAGCATAATAAATTTGAGTAATAATAATTTGAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1 - chr2L 16851794 5' + HMS-Beagle 6822 2 53.47 AAAGGGTTTTCGCATTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:2 - chr3R 11052152 5' - blood 7340 1 77.23 ACAATTCAAACACATATAGATCGTCGTGTACAATCAACTATCCATCTACCGAGTCTCCACTGTACACACCTCCCGCCCAACCGACCGATGGGCGCTGCCG:1 - chr3R 30781727 5' - Cr1a 4410 1 74.00 AATGCAATAGTCTATGCCGTTTAACGCCGTTTGCCTTGCGGAGCCTAAACTGGGATACAAACCATATATTTTACCTTATATTCATTTACCTTCCCTAGCTA:1 - chr3L 22318868 5' + Cr1a 3995 1 72.28 CTTGACGAATTTAATGATGATGATGAAAAAGACGCCACAGAGGGAGAAATCATTTCGATCGAGGCAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCCTAAAA:1 - chr3R 23419284 5' + Quasimodo 97 2 67.33 CTCAGGCAATTTCGCTTGTGGTTTTTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:2 - chrX 7996419 5' - hobo 2887 1 74.26 AAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr3R 19449508 5' + hobo 32 1 61.39 AATAGAGCCATCATCATTTCGCGCAAAGTTCCTCAGAATCATAATTCCCTTTGGCCAAATTCCGATTGGGTTTCGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGA:1 - chr3R 10085568 5' - accord 7220 2 78.22 GGCCAAATATTGATCGACCGACGTGCTTGAGGAACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr3R 7626391 5' - hobo 2930 1 55.07 TTACAATGAAACACGTAGATCAATAGCCAAATCAAAAATCGTGCACATAAAAATATTAGTTTCAAAATTTGTTAGTTAGTGCAAATTAAAATTAAATTAAA:1 + chr3L 22962724 5' - Rt1b 127 1 76.24 ATCGAGGGTTTCTCTCAAAATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTA:1 - chr3R 10741145 5' + 1360 3362 1 42.57 GCCGAGCTCAGTGCCCGCGNGGCAGACGAGAAGTCCAAAAAGGAAAAGCTTGAAGAGATGCGGGTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAA:1 + chr3R 27121363 5' - P-element 2769 1 65.35 TTTCAATCATTTTCACATCACTTTCCCGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 - chr2L 15898838 5' + F-element 24 1 69.31 TTCTCGGTAGCTGCACATTNTTATGGCGAAAACAATTTAATTGGCTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATT:1 + chr3L 13190094 5' - roo 9038 1 58.42 ACTATGTTTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAGAT:1 - chr3L 2022290 5' + roo 48 2 73.27 AAATGGATTTATAAATAGTATTTATGTTAAATGAATTTGTCATTAATAACCATCAATAACCTTCGTTAATGTAAAGGTCGTTATGAAAGTTAGAGATCTTA:1 - chr2R 9780743 5' - gypsy7 423 1 64.36 TTCGTATAATTTTCCACTCCGCATCTGATCGGCATTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATC:1 - chr2R 12812321 5' - jockey 4950 1 68.32 TAGATCATGCTTGAAAGCCTTGATAACACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 + chr3R 17781562 5' + pogo 45 1 71.29 GAAAAGAAAAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr3R 19449424 5' - hobo 2925 1 65.35 CCTCCCGTTTTCCGGCTGCCTTTAGCTAAATTAGCAAGACGACACTCTGGACGCAGTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCT:1 - chr2R 18747883 5' - Bica 8 1 56.44 GTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 + chr2R 5214965 5' + F-element 37 1 51.49 ATTTAAATATTTTTAAAAATTCCAAAAGAGTATTGCACAGTGGTAGTTAAAAAAAAAGATGAAAACAAAAGAAAATGAAAAT:1 + chr3R 11252987 5' - gtwin 228 2 81.71 ACCAATGCGAATTATTCCATTCCGAAGGCGAGCTCCGTAGTTCTGGCGGGTCTTAGCATGGCAGGTGATTTGGTAATGTGAATGTTGGTTTTCAAATCTTG:1 + chr3L 11562834 5' - mariner2 653 1 55.45 CAAAGACATCATTCGCCTGTTTGTTGCTGAATCGAAATATGTTTCCCATGTTTGCTTGGGTATTGAATATAGCCACAACTTTACAACTTTTA:1 - chr3L 5822166 5' - flea 364 2 76.09 AATTAACCGGAAAAGAAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGAT:1 - chrX 983385 5' + Juan 3819 1 63.37 TGACATAGGACATATAAGTATGTACATATATAAATATACATCATGACAGTTTTTTACTATTCGTGAAAAAATAAACTTGATCAACCGTTTGCGATTCTTTG:1 - chr3L 18074146 5' - Bica 481 1 80.20 ATTATTGTAATTTTCTCTGNTTTTGGAAAACGCCTCCTCCAGCACACCAACGGGTTCTGGCACTCCTTTCGAGGTAAGGGCAACCTGTTTCGCCTGCGTTG:1 + chr3R 24262570 5' - R1A1-element 488 1 67.33 GCCTGGAAATTTTAGCCGTACACTGAGAGAAAGGGGTAATAGTAATTGAAGGTAGTTGCTTAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATA:1 + chr3R 22869361 5' - Bari1 1692 1 62.38 ATGCATAACGAAACCAGAAACCTCTTCGAAGATGATTAGGCCATGCCCATTTCCGGACAAAATGTTATGCAACTTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCC:1 + chr2L 14220124 5' - springer 7514 2 71.72 CAGATATGTTTTATGCACTGAAAAGGAAGTAGTATTCACTTCGAAAATTCAATCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr2L 20328696 5' + opus 20 2 59.00 TCTCTGTATATTTTTATACCCATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATG:2 + chrX 15408720 5' + INE-1 505 1 88.12 TGGATTAATGTATATAACANCGGTAAGTATTAAATACCTGCACATTTAGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGATGATTTTCGGGCCGAAATCATTG:1 - chr2L 14845753 5' - 1360 3184 1 54.46 TTATCAAAATGTTGAATACAAATTCATAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATC:1 - chr2L 14793542 5' - Stalker2 7601 2 72.28 AAAAATGGTAACATCGAAACCACGAGCCACAAGAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr2L 20328790 5' - opus 7482 2 60.40 TTTGCCGCACCGGAAGCACTGCTTGTGCAAGACGGAAATTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAG:1 - chr3R 10926266 5' + roo 358 2 62.38 GTGCCAAGACTTGCGGATGCCGGAGCTGGAGCGTGCACGGAGTGAAGAGGCCGATCCTGCTGTCTAGCGGGCCATGGATACCTTTGCCTACGCAAGGGGGG:1 + chr3R 18359818 5' + Max-element 8208 1 75.25 GTGGTCGCCGGTCTGGTGTGCTATGCCTTTCTGCAGACCAAGCAAAACTACCACATCGTCCACTCCATCTGGCACATGGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGAAT:1 + chr3R 25213509 5' - ZAM 22 2 78.22 TATAAGCTAGCTGTTCATAAATTTTAAGGCTAACGTAAATGCAATGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAC:1 - chr3R 7869726 5' - 1360 176 1 57.43 AGAACTTATCAGCAATACGCAGTGACATACATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACA:1 - chrX 18326265 5' + Doc 191 1 69.31 ACGCGATGGGCTACGTGTTNAACGCATTTCCGCCACTTGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 - chrX 9413862 5' - 412 7506 2 63.37 TCCAAACCGAGTCGAAAGGNGCTTGCTTTCTCTTTATCTCTGTGCGCTGAGGCTTTTGTTTGGGCAACCTGAATGCGACAAATTTGGCTATCGCAAGCCAA:1 - chr2L 14788948 5' - BS3 1331 1 66.34 AAATTCTTGGTATTTTCTTGTATGGAATGAATAAAAAGGTTCCTTATTACGTAATTAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr3L 6033513 5' + 412 7072 2 61.39 TTGGCCGAATAGTTTGGGTTTGGTCAGTTGATTGTGGGTTGCTGCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGT:1 + chr2L 16139113 5' - copia 222 1 57.43 TCTCAAATGTAGACGCATTATAAATGCATATTTATCAAACAAAACTAACTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr3L 872783 5' + 412 7081 2 53.47 ACGCGCGGTGTAAATGGATTTTCGATATTAAGCCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2L 19854128 5' + roo 44 2 72.28 ATTTGTTCAAATGTCTCTTAACCTAGTTCCTAATCGATCACGCATAAACGGAGATATAGTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chrX 19334568 5' + roo 8679 2 63.37 CTTCCTACTCCCGTCAAACCCATCATCATAGCTCCTGTAACCACATCCACTACGACCGTTACGTCCACCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 + chr3R 11630639 5' - opus 440 2 71.29 GCTTACAGCTTTTCTTTCAGTGCACGTAGTGTGAAGAGAAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAA:1 + chr3L 17188694 5' + Tirant 8477 2 59.38 ATTTATTTAATTTTCATAATCGATACAGGATGCTATACGTATAAGTTAACACAATCACAAAAACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCAT:1 + chr3R 19450660 5' + Burdock 38 2 64.36 GACCGCAACAAGGACAATAGGCACACACACACACACACATAGTAATATGTGTAGTATAAGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTC:1 + chrX 9342309 5' + Burdock 6150 2 45.54 TTGGGAAATTGCGCCCTCACTGTGTATACATACGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 - chr3R 23641043 5' - 297 360 2 70.00 CAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 + chr3L 19349964 5' - 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mdg1 371 2 73.27 CCGCCGAACATCAAGAAATGCATCCAGTGTCTTCAAGCCCTGTTCACATTTATGCCGCCCTCGAAGGTCGAGGTTAAAGATCCGTTCGCTTTGCGAGTGAT:1 + chr3R 15209393 5' + Cr1a 125 1 72.28 GTTTGTGAGTGTGTGTTTATGTTTGATAAAATGCGATATGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr3R 29287502 5' + hobo 35 1 62.38 CAATAGGCAATTGAAGGGACCACTATCGCTCTGAAGAGTAACACTTCGTTGGTAAGGCTTAGCTTGCTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGG:1 - chr3L 23611081 5' - Bica 443 1 71.29 GCATAAAACCGCATGAACAATTCAGATCACAAAATTCAAGGACTCGGGCTACCTCATGTGCCAACCCTTGTTCACTTTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTT:1 - chr2L 11494712 5' - Doc 221 1 71.29 ATGATTGGAACGGTTTACAAAGCAGAAGATATAAACAACAAATGCTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGGAAAATTGAAAAGGTAAAAAGCAAAA:1 + chr2R 4546805 5' - Tc1-2 137 1 55.45 TAACGAAACCAGAAACCTCTTCGAAGATGATTAGGCCATGCCCATTTCCGGACAAAATGTTATGCAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGC:1 + chr2L 14220129 5' - springer 370 2 65.35 TTTGCTACTCTAAACAAAATTGTTTGAAAACCAAGACTTATCATTGCGCAATCTACAGGTAAATACAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 - chr3L 16546879 5' + pogo 8 1 66.34 TTTTTTATTTATTATCTCGNCTCTCGCGATCTTTTCGACGGCATTTTTCTTGTACAAGTTTTTGCTCGATCTATGTACGTTGTCAAGAAACTGTTTACACA:1 - 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roo 9021 2 75.25 AACAAATGATGCGTAAGAAATGCTTTAATAAACAGGGAACCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTC:1 - chrX 21253952 5' - invader3 5428 2 60.40 AGGGCGGGAGGATAACTGGGCACCCTGGGCTTCCTTGCCCAGCCAGGACGAGTGCAGCTCGAACTGCCGTTGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCG:1 + chr2L 20283184 5' - mdg3 388 1 61.39 GAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATATCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGCGTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2L 13093795 5' - roo 9035 1 65.06 AAAATTATAAAAGTAAATCATTTTGATTTTAGAGATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTA:1 - chr3R 10914167 5' + F-element 115 1 65.35 GTATAATTAATATGTAGCTCCTCACTAAAACTAACATATTTTTCATAGGTTGAAATCATAACTTGTTATCTACGGTATTATTTTAAATTTGTTTTCATTTT:1 + chr2L 14698105 5' + 1731 4264 1 71.29 GAGTATGGAATGCAAGTCATAAATGACATAGGGCCGAAATTGATTTCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr2R 17963209 5' + blood 6 2 72.16 AAAGAGCTTCAGTTACCTATTAGCAACCCCTATTTAGACAAAGTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCAT:1 + chrX 9454814 5' - roo 9039 1 58.42 AAGTTATATATAGGATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAA:1 + chr2L 22092952 5' + INE-1 533 1 64.36 ATATCGAAAGTTGGTTTTATTAAAAATATAAATTTAAATAAAATCCACCGCACTCATATTTGCTATTGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 + chr2L 22161310 5' + 1360 36 1 65.35 CAACCGCTTTGAACAAATGCAAACCGGTTGATACCGCTTCGAGTTGTTAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr2L 12459670 5' + blood 7040 2 53.47 ACTGGGTCCCGGAATATCANCATAAGGTTTGGCCTCTTCCAAGCTCACTGCTGTGGCCTATTGTTTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 - chr3R 10434970 5' + 1360 11 1 63.37 GTCGCTTCGGGCGCACAAAACTGACTGGCTCGAAGAAGCTGTTTCCATTCTGTAAATGTTTGGTGGGGCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGG:1 - chr3R 22331997 5' - I-element 171 1 54.95 AGGGGTCATAAACCGAGCATCAAATGTCTGGCAAATCGGGCAATTAAGTATCCGCTTTAAGAATATGTCTGCATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAA:1 + chr3R 8615953 5' + opus 7226 2 77.23 AGGATGGCTGCACTTGCCCGGCTTGCGCACTTACACTTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCAC:1 - chrX 2881004 5' + micropia 362 2 63.37 ATAATGAGGCCCGAGTACTGAGGTGATATTGAGCCTCCAGCAGTGATTGCACAGCGGTTCTAAGTCGGTCTAACAATCTTTTTTTTTTACTATATTTTTTT:1 - chrX 17224016 5' - BS4 728 2 71.29 ATAGTTTTTGCTTTCAAAGTAGGGAATGGAGTCCAAAAAAACTACTTAGCTCATATATTCATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 + chrX 22734027 5' + copia 16 2 45.54 CTTTAATGATTTTGTATTTATTCAACGCGTCACTGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 + chr3L 1586728 5' + Tirant 8127 2 58.02 CACGCTCAAATCTCAAATCTCTGGTCGCAATTCAACCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 + chr2L 10898402 5' + jockey 4711 1 64.36 TGAACTTAATATAAAGGGTTTTCGCATTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 - chr3R 11052164 5' - blood 340 2 65.35 CAAAGGGGCGCACGTCCAACAGGTTTTTTTTTAATCTACCGTATCACTGTCTACAGTATTGAAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCAC:1 + chr3R 29300564 5' + Circe 137 2 74.00 AGAGCTGTAATCCTGCTCCCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGATTGCATTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCA:1 + chr2L 20561342 5' - F-element 4381 1 48.51 AAATCCGGCGAAATAATTCGCGAGGAGGGCCGCTTCTTTAAGCAACGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTA:1 - chr2L 418610 5' + 17.6 175 2 53.54 CACAATACAAATTCTAGGGTGAAAGTTGCTTAATTATATTATTTATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 - chrX 4399586 5' + I-element 33 1 63.37 CTCGTGGGTCAGGTACCGGCCGGCACCCACCTGGGCCTCCAGGTTCCGGAGATCGCGGTACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAG:1 + chr3R 18303905 5' - G6 1834 1 68.32 ATAATGCAGCAAACAATGCGATTCACGATGTACAATAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr3R 23638095 5' - pogo 2079 1 60.00 AATGTAAATTAAGTTTTGTGGAAAGTCTGAAATAAAATACACTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3L 19647321 5' + pogo 30 1 64.36 TAGAGAATCAGCCACCTGGAGCTCCGATCCGTAGAGTGACTTGCAGCTCTTTTGGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 + chrX 19034099 5' + hopper 18 1 59.41 AAGGCATCGGGGCTAATAANCGAGTAGACGCCCCACGAAGCCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chr2L 20567822 5' + 297 33 2 60.40 CACTATTGGCTCTCCTTTAAATAAATTAATGAATTCCTTCTATAAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCAGTAA:1 + chr2L 22248557 5' - pogo 1878 1 56.44 AGGACACTGCCTTATGGGCTGTCATTTATTTGACCCGACTCACTCACACATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAA:1 + chr2R 21433133 5' + HMS-Beagle2 22 2 57.43 TAATTGTATCCGCGCAATCATCCCGCGGCTTCCATTGCCGCAGGATAAAAACCAAACTGCAACGAACAGAACAGTACTGTCCTCTACCCACTAAAATATAA:1 - chr3L 12172094 5' - HB 341 1 76.24 TTTTGGCATGCATTGAATAGTAAAATGATATAATTGCAGTAAGCTCATTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATG:1 + chrX 19033969 5' - hopper 1163 1 53.00 AATATCTTTATGCAACACTCATGAATCACTAGGGCATGCTGAAGGAAAGCCGTGTTTCCCAACTATAATTCTCAATATATTTTCGTTTTTTTTTTCTCTTT:1 - chr3R 9442335 5' - invader2 294 1 50.50 CGGGCTGATTTAATGAATATTTACACTAATTGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 + chr3L 19249656 5' + Transpac 4929 2 69.31 CATACAATTTTACTAGCTTATCGGTTTAACTTAAATGTTCTCAGCCCTTTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2R 13763261 5' + roo 26 2 53.47 TGTGCACAGCAATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr2R 9631756 5' + F-element 43 1 70.65 CGAAACTTTAAGGCATTTCGGACACTGAAATGGCACTCAAGCCTATTGGAGCATATGGACTTCGGTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAAC:1 - chrX 20357326 5' - hobo 2569 1 72.00 TGTCTTTGTTAATGGTATTCAGCTCACTTCCCCATCCGAAGCAAATAAAGTGTACAATTAAATGGCGACCGTGACAGGACTACTGAGGAAATGCTTCTAAT:1 - chr3L 13432873 5' + blood 434 1 42.57 TTGTTGACAGCAGGATCATTTGGATCATTTGGCGATGCGGCATATTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chrX 7788597 5' + 412 32 2 55.45 TGTTTGCCCACTCTGCCCGTAAACTCATAGATAATAGCTCTCAGCTTGCGCTGCGTCTTTGTGTCCAGAATCTATATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTT:1 + chrX 273858 5' - INE-1 166 1 56.44 TTCCATTTGACTCTTCACCGTCGTTCAGTCAGGGCTTTTTTTCCCCAGGCTACGTGTTTAAAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTA:1 + chr2R 19641824 5' - I-element 5341 1 64.36 TTAACTACCCACTGTACTAAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCG:1 - chrX 18206395 5' + F-element 205 1 81.19 CAATGTTAGGACATTTATCAAAATGTTGAATACAAATTCATAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCT:1 - chr2L 14793556 5' - Stalker2 367 2 58.42 CAAGACTGGAATCGCAAGTNCGTGAGTCTGGAGCCCAACTAGACAGCATGTCTGTTATGCGTAACGATCGAAAACTGACTGACTGATCTCTTCTTCACAAA:1 + chr2L 19785061 5' - invader1 285 2 59.41 AAGGGTTTTTAAGTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCC:1 + chr3R 20094460 5' - Max-element 8492 2 62.38 GGTTTTCAAGAGGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTAC:1 + chr3R 7783727 5' + rover 6971 2 60.40 AGAGTAAAGGAAAAAAGTGCCTTAATCTGTTATCGAAAAGCTTCAGAGTGCTTTGGTGTATATGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTT:1 + chr3L 6776615 5' + invader6 18 2 73.27 AACTGGTACTAAGGAGTACGTTAAATAGCATATATAGTATAATTCGCTTAGCTGAATCG:1 + chr2R 21151136 5' + pogo 4 1 61.02 TTTCAGTTCTCGAATAACTGTGCCGTTCTGCATTTGACCAAACAGTCACTATGTTTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr3L 2022337 5' + roo 1 2 77.23 TCGTTAATATGTGTGTGTACATTGTGTTCGCACACAGACACATAGGGGCAAAAAACGAAATTGGCTTCCTCCGATTTTTGTATTCTAGCTCCTTCATTTT:1 - chrX 14989139 5' + gypsy12 10037 2 62.00 AATAAGGGATGCAACGCAGGGGGTAGGAAACAGAGAGCTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr2L 20238748 5' + hobo 50 1 69.31 GCTTCGTCGAGCGTAAATCATCATCAGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGCTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAG:1 - chr2R 20148262 5' - mdg3 338 1 74.26 AATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 + chr3L 19349965 5' - 1360 3339 1 79.21 GTTGGTAACTGAGTGGTTGCTTATGTGTGCGTGTGTTTGTGTGTGGTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2R 23671773 5' - hobo 2909 1 67.33 TTTAGAAGTTAGGTTTTTGATTTACCACTATATTAATACTACTATTGTATATTACTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGA:2 - chr2R 19089035 5' + Tabor 22 2 50.50 TTGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr3L 3757406 5' - roo 9035 1 62.38 CTACTTTTATATGCAAATTGCTAGTCGAAGCCAGCTGCTGCTATCCTCTAGCCTCAAGTTTTCGGTTTTCGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGC:1 - chrX 532806 5' - I-element 384 1 74.26 TACTTTTAAAGCTTTGGTGCTAAAAATAGTAAGACAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAA:1 + chr3L 12431438 5' + I-element 5168 1 66.34 TGGGGTGTGTAAAATGTTCGACACGGATGTTTTCGAAAAATAATGTATTTTGGTTGAGCACCTGTTTGTTATTGCAAGATTAAAATTAAAAGATTTTATAA:1 + chr3R 11268869 5' + 1360 3029 1 69.31 TCCGCAGCTATTTTGTTGTGCTCTGTTTAGTTTTCTAGTTTTCTGCCTTTTTTTCGAATGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTG:1 - chr2R 9010114 5' - F-element 475 1 61.39 AAGATGATTAGGCCATGCCCATTTCCGGACAAAATGTTATGCAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGT:1 + chr2L 14220152 5' - gypsy6 7767 4 59.41 TAATTTAATATAATATAATATACAGCTGTGCTCATAAAATTAATAGTGCTTGAGACCTTCGAGTTTAAGATAAAAAATTTTTTTTTAATATCATTAGGTAT:1 + chrX 11496814 5' - HB 1539 1 45.54 CATGGCCCAAACAAAATACTTAAGTATGTACATATCCTCCTGCCCTTTGACAACTCATCAAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTA:1 + chr3R 13741542 5' - Burdock 6242 2 67.33 CCACTTTGTCCGTGGGCAAACCCTTTCTCCACTTCCTACAGTCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACAT:1 + chr2R 23108839 5' + G2 140 1 58.42 CCTGATATTGAAATTAGTTAAAGGCTTCGGCCAGAAACATTTTTTTAATGAAAACATCTATATCTATGAACTTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGA:1 - chr2L 21973175 5' + INE-1 153 1 66.34 GATATTTTTTTTTAATTGTTATTTTTTTTTTTAAATCTT:1 + chr3L 4262497 5' - TART-B 10509 1 76.92 CTGTGCGGTCTTTTTTCCAGCTTAAAAGTTTAGATTTTGTGTATCCGTGCACAGTGGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTT:1 + chrX 6137089 5' + Cr1a 440 1 79.21 CAAAATTAAATTCAATTTATCCATTTTGCATAACCCAATACGTTTTATTGCCATAGTATAGAAGACTATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTG:1 - chrX 22689627 5' + 1731 4324 2 64.36 CGAAGGGTTGGAAATCTATCTAAACTTTGCCTGCATTTGTTATTGTTGCAGTGCTTGGCAAACTTTACCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAG:1 + chr3R 14173175 5' + F-element 4525 1 65.66 CCTATGCGATTCACTCCTGCTAATTCGCAAATACTCAAAGCAAGCAAACTAATCCGAGTATGCAGCCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCA:1 - chrX 4150386 5' + Doc 4548 1 57.43 CAATTGGATATAAGTTCGTTCTAATGGAGTTGTAAATACTAAGGATAAAATTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1 + chr3L 15603519 5' + mdg3 67 2 54.46 GAAAATGTATTCAATTAATTAGTATCAGGTATACAATTCAATTCAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 - 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chr3R 6266358 5' + roo 8702 2 63.37 CAAATGTTAATCTGGAGCTGGGGAACGGGACTGGCGACAACTCCATTAGAATTCAATTTTCGAGGCAGTCGCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chrX 14651175 5' + P-element 5 2 74.26 AAACATTTACTTTCGCTTCCTCCATCGAAGTGGCAGTCTTAACCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2R 19840264 5' - roo 9045 1 54.74 GCCACTTGATGCCGTCGTTGAAAGCAAAAGGCTGCCACTTTAGCGCGCCCACTCAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCT:1 - chr2R 19582683 5' - R1A1-element 4965 1 59.41 TGCGTATGTTTACGTCTTGCTTTCGTGTCTTAATCACTGAGAAAAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3L 15037887 5' + roo 4 2 74.26 CTTCTTTTTTTGCTTTTCTGCACAGCCCAATCCACTGCCCATATTTGTAGCATGCTGCAGTTGCAGTTGCAGTTGTTGCCGCTGCTGCTGTTGCTGCTGC:1 - chr2L 14703272 5' - TART-B 154 3 64.00 AATATTAGATTCGACTTAGATACCGCATAAGAGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr2L 16597424 5' - roo 9029 1 68.32 TCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAAT:1 + chrX 21087604 5' + mdg3 5287 2 70.30 GATGTGGCAGTAAAAAGAGTTGAACGGATAAATGCGAACACAAGTTCTCCACAGACTGGTGTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr3R 19198490 5' - hobo 2925 1 65.35 CAAAAAATAGCAAACGAATAGAAACCAACACGCTCTATATATATAGTATATAGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAAT:1 + chr3L 14818709 5' + mdg1 7062 2 52.48 AATGGGATGCGTCGGAATACGCGGCCCGAGCCATTTTATTAGCAGTGCGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAATTAAATATATGGTGCAGATCCCTC:1 + chr2R 5850106 5' - springer 375 2 49.50 AAAAAGTTAAAATTAATTGCTTTCAGAGCGGCAGAGAGGCAAGATTACAGATAATTGGATAAAGTCTACTATAGTTAGAATAATACTCTGTAAGGGTCATG:1 - chrX 21506656 5' - Cr1a 4178 1 85.15 CATCCAAAGCTATTTGTTTTTTCCGCATCACAATTATTTTCACAACGCAATTTCTTCTTCAGTGATTGGTTTAGAGTGACAAGTGCCGGTTTGTTTGCTTA:1 + chr3L 6583170 5' + Bari1 292 1 77.23 GGTACTATATTTCATATATCTATGATAACGTTATGATTATGACTGGATGACTAAACCTTTGTAGATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3L 20411770 5' + roo 8676 2 65.35 GGTTATCGTTTTTTTTGAACCTACCGTATCACTGTCTACAGTATTGTAACTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACGAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAG:1 + chr2R 6433214 5' + Circe 153 2 90.10 CGTAATGTCCCAGCAAACCCTTAACTCCAGCATTATTACTAGCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCT:1 + chrX 6582241 5' + F-element 4214 1 58.42 GTTAGTGAACATCCGCAGTTCTTATCGTATCGTATATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCT:1 + chrX 22857659 5' + accord 6981 2 66.00 AAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 - chr2L 12808222 5' + Tirant 8149 2 64.36 TAATTGCAAATGGGATATGCTTTCTAAGTTCATTGTTATATTTACTTCTAAAGTGTAAAATCTCTGAGAAAATGGTACTATAAACTTAATATTATAATAAA:1 + chr2R 13750509 5' - INE-1 429 1 79.21 TTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2L 21086041 5' - roo 9028 1 73.74 CTTCACTTCTTTTCGGATGGATCCTGCGATAAAATGCCCTTCACCATCAAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGA:1 - chr2R 22857007 5' + 1360 267 1 67.33 CAGAAGGGTCTGTCCTTAAAGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 20411845 5' - roo 9026 1 71.29 CAACCGAGAGCCAAAAAACCAAGCTCAACCGAAGGCCATGATTCACGAAAAACATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:2 - chr2L 4063769 5' + roo 8685 2 58.42 AAAAGTAAACATCCCATTAAGATCGCTCGATTCACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCAC:1 - chr2R 12471910 5' + Doc 288 1 67.33 GTAAATCATCCAACAAATAAGTCCGATTGATAATATATGTATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGC:1 - 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chr2R 14997920 5' + McClintock 31 2 63.37 CCACTGCAATTATCAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 - chr3R 22494167 5' - 297 355 2 70.41 TGGTAAGATACAACCAAAAGCAGTCGAACAGTTCCGATCCATCCAACTAACAAATATGGTTCATATACATATACATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGG:1 + chrX 22634693 5' + flea 4759 1 75.25 TGAAATCCGTAGCGAGCAAAAATAGAAAATCCTGAGAACCATCACCGGCGCACCGTAGTACGTTCGAAGTGATAACTTACATAGGGATTTATTCATACTTC:1 - chr2R 1028481 5' + Fw2 3674 1 76.24 AGAGTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGT:1 + chrX 21852436 5' - gtwin 7378 2 70.30 ATGCTGCTCGCATTACATTGCCGCGGCTAAACTGCACAAACAAGCTGAGCTTCATAGCTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 6107714 5' - roo 390 2 58.42 CTTTTCGGTTCTCGGTCTCGGCTTTTCGGGAAGGTATCGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGT:1 - chr2R 5899909 5' - gypsy4 6477 1 80.95 GGGCCAAATATTGATCGACCGACGTGCTTGAGGTACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chr3R 7626390 5' - hobo 2899 1 65.35 AAAATGAAAAAATGAAACTTCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAG:1 + chrX 22789321 5' - Tabor 452 2 60.00 ATAGAACAGTTGAAAAATTGGAACAATTATCAGTTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 11916556 5' + roo 8702 2 64.36 TGGAGTGTCTCATTGCTAATGGAGTGCAGAGGGCTATCCACCCGATCAACGACCTGCAACACCTGCAGAATGCAAACGATCGCGGTCTTGCTCACCAATGC:1 + chr3L 7516216 5' + Doc3-element 380 1 65.35 AAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2L 13093796 5' - roo 9016 2 82.18 ATATACATACTACGAATATGCGTAGGCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACCCA:1 + chr2L 4134821 5' + Quasimodo 28 2 52.48 CTTATTTTCATCGTAACATCATGAGGTTGAGGAAATATGGTTTCCTTTGAGCCTGGCAAGCAAATGTCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr3R 27056454 5' + jockey 25 1 60.40 GTCGCATCAGATGCAATTAAAACTATGAGTCAGAACGATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACACCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGC:1 + chr2L 18851679 5' + F-element 247 1 77.23 TCTCTTGTCTCGTTTCAGGATAAATCTGGTCGCTTCTAATCTAACATACATACATACAATTCCATATACATACTCATACTTTCTGCTGTGTCAGATACTTT:1 + chr3R 14086958 5' + ZAM 225 2 65.35 TCATACCCAAGCAGCATCTTCAACGCTGCATTCTCACCGTCAACGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATA:1 - 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pogo 55 1 60.40 AAAGCTGGCAAGGACCCGTCGGAAAGCAGGATAGCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 - chr3R 23543038 5' + 412 13 2 66.34 AAAGATATAATATATTTATATGCTTAGTAGTTGAATGATCCCTTAGTGATAGTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGG:1 - chrX 11795341 5' - Doc 4558 1 59.00 ACTTGTCAGCAGGAATTGCTGGGGAAATTATTGAAATTAAAACCGTAAAAACTGTAAAGCGAATATATTAAGATTGAACACGTAATTATTATTATTATTTA:1 - chr3L 22250090 5' - invader6 4389 1 74.26 ATTTCTTTTGATTTTCCCAACTGATTTTCCCACCGTTCAAAGTGCTCGAATGCTCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:1 - chrX 8815009 5' - 297 6951 2 56.44 TCACCAAATATCGTTGCTGTCGCCGTGGCTGCCACTTGTTTTATTTATTGCTTTTTTAACCCTTTTTTTTTGGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTT:1 - chr3R 10488772 5' - roo 9068 1 76.24 CTAGCTGTAGTTCTATTAATTAATTTATCAATATCACTATGTTCGATATGCTAATGTTAAGTATATAATTTTCTTTTTTCAGAATTCAATGAAAACTATTG:1 + chr3R 31731329 5' - mariner2 862 1 59.41 TAGAAGTTCTTTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 - chr3L 10474206 5' - copia 221 1 63.37 AAATTGATAAACTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr2R 25203771 5' - 1360 3356 1 55.45 TTAAGGCGACATTGACAATNAGACGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTGGATGAA:1 - chr3L 6023330 5' + hopper 52 1 72.28 ATATTTAACAGGATGCTCAACTGCAGTGTGAAAAACATAGCATAATATTACATCGCTTTTGAAATCATACAACAAGATATTGTAATGATGAACTCCAATTA:1 - chr2L 6362951 5' - 412 494 1 78.22 TGGCATTGTAGTTTTTCACATTTGGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCGCTCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTCAATTAC:1 - chr3L 5137240 5' - R1A1-element 140 1 76.24 TATAACCATATACCAATTTCAATGAATTCTTATCTTAGCTCTAATATTATGATAAGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTA:1 + chr2L 11712805 5' - Quasimodo 7348 2 60.40 CAGAAGGTTTTGTTGACAGCAGGATCATTTGGATCATTTGGCGATGCGGCATATTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chrX 7788588 5' + 412 7076 2 56.44 ATGCGAGATCCCAAGCGTAGCACCAACTTTGGCCATAAAAACCCGAAAATAGCCATAATAATGATAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:1 - chr3R 12767370 5' - blood 7383 2 72.28 AACGCGTCGTATGCGCAATAAATAAATCTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTC:1 + chrX 15263445 5' - invader3 5413 2 76.24 TTTTGTATCCTACAATTTTCCTTATCCAGAATATTTTTACATTTGTTTGGCTATTTCATCTCTGACCGGAAGTATGAATAAATCCCTATGTAAGTTATCAC:1 + chr2L 4075452 5' - Fw2 3663 1 68.32 ACAAACTGCAAAATAACAGTGGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr2L 20045758 5' + roo 54 2 80.20 CATTTCTCATATCAGCCATTTCCTTGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCC:1 - chr3R 24085352 5' + invader3 54 2 76.24 TTCAGCAATTTCCACCGAGCACAACGTGGCAGCTGGTGTTCCACAAGGTAGTGTCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTA:1 - chr3R 19327190 5' - X-element 4462 1 59.41 TTGCAGCTGGACAGGGTTTGATAAGGCCAGGGAATGTTGAGTGGTATGTATTGAATGATTTTATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGG:1 + chr3L 5447525 5' + blood 484 1 62.00 TAGAGAAATAAATCGAATTTTATAAAACTATATAGTAAGTAGTTTATTTATTTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGA:2 - chr3R 27169522 5' - 412 491 2 74.26 GGGTAGAGTTAGAAAAGAAAAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr3R 19449413 5' - hobo 2937 1 77.00 CTGGAGAAATCGGGGAAAGTGGGTAGCGGCCGGGGAAAGCAGTGTGTTCGGAATGTGTTATAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCG:1 - chr3L 17140090 5' - F-element 240 1 58.42 ATTACCGATAACCATGGAAGAAAATATTTGATATAACTTTGTTAATTGATAATTTCAGCGTAACTACATTTAAATGAGCACCAGCAACAGCAATATTGACA:1 - chr2R 16467947 5' + F-element 4295 1 80.20 GTTGTTGTTGCTGTTGCTGTGCGTTTTCGTTTTATATGTTACATATAAACCGGCCGTGGTTTTTGTTTTTCACTCGCCTAGTGCAGTTGCACTAGGGTTTT:1 - chr2L 8984606 5' - gypsy9 488 2 62.38 TGTCAAAATATTTTGACATGATGTACGACAAGTTTATGGAGCGAGTGTGGGAATGATGGCACTTTAATTGGCGCTTGAGCGAGGCATGTCTGTTACGAGTA:1 - chr2L 7174248 5' - invader1 3932 2 76.24 CTCGACCAAGTCCTTTTGATTGTGTTTGTCTTTGTCTCAGTCTGGTAACGAAAGACACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2L 10625753 5' + roo 8684 2 59.41 CGTGTGTATCTGTGAGCGTAGTTGTTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 - chr3L 5241197 5' + Ivk 9 1 70.00 TTTCCTGCTACTTTTTTTTTTTCTTCGTTTTTG:1 - chrX 3555206 5' - gypsy7 5006 1 75.76 CAAAGTCCAACAAACTGCANAATAACAGTGGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGATCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2L 20045749 5' + roo 45 2 69.31 TATAGAGCTAACCAGTAACNATTCTTAAAACCAAACTGCAATTAATCAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTA:1 - chr2L 17677811 5' + Tirant 8108 2 79.21 TCGGTTTCTTAGACGTTAANTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGA:1 - chr3R 1844821 5' + Cr1a 154 1 69.31 TGCACCACTTGGCCATTTCAAAGCCCCACTTGAGTTTGGCCCGAAGTGCGCACGAAAAAAGCGAGTTTAAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAA:1 - chrX 4166465 5' - I-element 5348 1 71.29 CCAGAGATTACAATGTGCTCGGCTTTGCCCTGTTTACACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTGATGACAAGTTCTACATCATCAGCATTCATGGAC:1 + chr3L 16792558 5' + Chimpo 4049 1 67.33 ATTTTATTTTTATAGCCAATCGGTTCGAACACACAGACATCCACTTAGCACACCGAATGCATCTGCATCAGTACAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 - chr3R 19216443 5' + 1360 1 2 76.24 TGTACAGAATCATTTCGATATTCAAATTCAATCTCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr2L 20367355 5' + Doc 46 1 64.36 GGATCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACA:2 + chr2R 15788576 5' + Transpac 4952 2 53.47 GATTAGATTTACTGCCCATGTGCACACACACACACGCGCGAGTTAGAACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACAAATCATCGGACAC:1 - chr2R 9209488 5' + Tirant 34 2 56.99 ATGGAGCGGGCAATGGGATCCAGCTGGTGATGATTTTGAACAGCTGGTCGGAAGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATGGTGCTCG:1 + chr3R 28838831 5' - Doc 324 1 54.46 ATGAAATTCTTATTTAGTTTATTAAAAAACAAAACCGATAACTTTGGTGACAAAATAATTAATTATTTGTAATATACATATGTAATAATCGATACCCAGGG:2 - chr2R 5531616 5' - 1360 2916 1 63.37 GGGAGGGGGAATGCAGACCGAATGAATGGTGAGCATGGAAAGAATATATAATCTATATATGGTCGGAAACGCTTCCTTTTGCCTGTTACATACTTTTCAAC:1 - chrX 8638636 5' - INE-1 20 1 63.37 GAATATTTACACTAATTGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:2 + chr3L 19249670 5' + Transpac 24 2 55.45 ATCGCAGGGAATTTGTTTGAAATTTAAAGACAAAACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTT:1 - chr2R 22051558 5' - Tabor 7318 2 72.28 AAAGAAAGTAAAAAGGCAGAAAATGCTTAGTTTATATTTCTAGAGCGAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGGGATTGGTATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGA:1 + chrX 4937513 5' + Doc 12 1 69.00 CGTTCTGCATTTGACCAAACAGTCACTATGTTTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 2022314 5' + roo 8684 2 58.76 AAATAGAACTTATCAGCAATACGCAGTGACATACATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAG:1 - chrX 18326269 5' + Doc 187 1 73.27 AGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr3R 19449449 5' - hobo 2900 1 60.40 AATAATATAACATGGATAATGATACATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGC:1 - chr2R 12458001 5' - HMS-Beagle 223 2 56.44 AGATGTTAAGCAAATAATTCCTGTGTTCCTCATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr3R 20905371 5' + pogo 9 1 71.29 CGTCGGTGAACACTTATAAAAGCAAGGAATCACCTAAATAAGGTCGGGGTTCTACAAGCCAAGTCCCTAAGAAAAATTTCCTTGGTACATGAGAACCAG:1 - chrX 21157350 5' + jockey2 2998 1 23.23 GAAAAGCTGTGGCTTTTGTCTTGCGATTAGCCTGGAATATTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3R 23640975 5' + 297 31 2 63.37 ACATGTACATATACATCCACGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr2R 15349519 5' - P-element 2829 1 22.77 ACTTAACTGAGAATGCCATATTACTGATTTTTTCAAATGCGCGCCATTCAGTTATTTGATGTCATAGCGGAGCGCTAGTGGTGCCGTTCAATAGGGGCTAC:1 + chrX 22817676 5' + mariner2 76 1 72.28 CACACGCACGCACAGCGGAGAAAGCTTTCTCCCATGTTAACATGACAGCCTACAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr3L 14594105 5' - hobo 2915 1 54.46 CCTTGGCTCGATTTTTTCCAGTCCCTGATCTTAGAGTGTTTTTTTATTTCGTTTATTTAAAACTATAACTAACCATTTAATTTTTTAACATAGACTTAGCA:1 + chr3R 9107520 5' - G7 1102 1 58.42 TATTGCGGAATAACGCACCATAAATTTCAAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr2L 16153349 5' + Doc 29 1 55.45 AAGCTACCGTCTCGTCGATCGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chrX 15024415 5' + P-element 55 1 25.00 CATAAAAATGTTCGCAACTAATTAAATTGTGATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr3L 9928504 5' - roo 407 1 74.26 AGGGGAGCGATAAATAAATGTAAAAGTACGAGGGGAAAATTCAATGAAATATGTGAGCTTTTAAATTTCCAGTTATTCAAGAAACAAATTAAAACATATT:1 - chr2L 12275321 5' + HeT-A 5765 1 59.00 AATGGCAAACTGAAACAAAGGAGCACTGCCCCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCG:1 + chr3R 11607964 5' + 1360 44 1 69.31 AAAGGGTGTTATAAAACAAAGAGTCTAAGAAATATGAGTAATATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTC:1 - chrX 22734090 5' - copia 221 1 60.40 CTTAAGATTTTCGAAAAGTATTGAGTAATGCATTAAGTGAATTAACTTTTAGTGGATTCTTAACTATATTCTTTACTACATTCTTAATCAGGATCAATAGC:1 - chr2L 5608707 5' + INE-1 86 1 77.23 TAAGCGAAAGTCCAAATGCAGCAAACAAGGTAAGAGTAAGGCTATTCGGCAGACTACCACAATCTTTAACATTTAATTTCTCTTTAAGTCAAACGATTCAG:1 + chr2R 13136829 5' + Doc4-element 339 1 54.46 GTTCATGTCCATGTCCTTGCCAGTTAAGTTCTCTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGT:1 - chrX 5845013 5' + micropia 5050 2 73.27 TTGAATGTATATATGTACATACATTTCAAGTTATACCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCG:1 - chr3L 14720804 5' + Ivk 4963 1 74.75 TTTCAGCCCCGGATGACAGNAACTGTCACACGTTACGCATTAGCGATCTTCCCTCTCCATCTCTCCACGATTCCTGTCTTTTTTTTCTTTTGTATATCTTG:1 + chr2R 21874115 5' - Porto1 159 1 75.25 CGGATGCGTTTCTGTTTGTGCAGCTCACCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGCGGCGCTCCAGCCT:1 + chr3L 20322486 5' - X-element 4425 1 68.18 TGTCATAAAGTTAAAGTAAATAGGGTTTTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:3 - chr3R 11916632 5' - roo 9053 2 60.40 CACGTGTACGCACGAAGGGGCGTTGCGAAACGATTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAGCCATCTTGTATACAATTTTACCAAAGACACTAGAATAATA:1 - chr3R 4509764 5' + Tc3 240 1 64.36 CTTGCAAGAAAACAAAAAGAAGAAAACTTTTAATCGAGACACTAAAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTT:1 + chr3R 17662251 5' + Bica 400 1 55.45 ATAAAATAATTTTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTTTCTGCTATCACTGTATGCG:1 + chr3L 14971177 5' - 1360 152 1 59.41 AAGGATTGCAACTCATAAATCACTGCGGAAAAGCTTGAAAATTTTCCACACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 - chr3L 5415409 5' + I-element 26 1 48.51 CATTCTCAAACAATCTGATAAATTAACCCAAGAATGCCGCACTTTATAAAACATCGATTAACTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACT:1 - chr3R 10063893 5' - 297 6963 2 60.40 ATCGGCGTGAGAGCTTCACAATGGGTCATTCGAAAATCGGAGTGACGTGGGAGACCAACTACATGGAAATGGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr2L 5927030 5' + pogo 3 1 67.33 TTTTATGTTGGACATACCCTTATCTTGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 - chr3L 6033604 5' - 412 470 2 54.46 TTTTCGAACTGGGTGATTGTATATAAATGACAATTAAACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACT:1 - chrX 735001 5' + Tabor 6848 2 70.30 TTAAATAGAGCATATTCATNGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr2L 20560351 5' + F-element 59 1 72.00 GTGAAAGTCTTGGGAAAGTATTTCCCCCTCGATTCTGATGCTGCCCGATGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTT:1 - chr2L 21822953 5' - I-element 4896 1 53.47 TATCGATCCACGGGATTGCGTTTTCTAGTCTGTAGTTAAAGAATTTGGCAAACTGATTGTTGACATTTTGCGCGTCGAAATAAAAAAAAAAAGGAAAAACA:1 + chr2L 5764299 5' + Doc2-element 230 1 80.20 AAATAGATAGCAGCCACTCCCCGAAAATAGACCTTAAAGCGAGTCCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAAT:1 - chrX 10451425 5' + hobo 386 1 55.45 CAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGA:2 - chr2L 17677765 5' + Tirant 8154 2 72.28 GCCGCGCTTAACGCTTGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCATATATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTT:1 - chr2L 22383511 5' - Stalker 6983 4 43.56 TTAAAGGAGGGATTTATTGCACACCTTGTAATATCTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGA:2 + chr2L 9045427 5' - jockey 4952 1 66.34 GTTCCGGTTCAGGAAACATTCAGCTGACATCAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr3R 14193960 5' - pogo 2058 1 70.30 AAGTATGATGTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCAATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACA:1 + chr2L 21735002 5' + 17.6 6949 1 56.44 TTAATAAAATGTTTCGTATGAATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAAC:1 - chr3R 25086167 5' - Bari1 1677 1 55.45 CGTGCAGTCACAGCAACGGGCAAGCATTTATAGATAATTAAGGGAAATACGTTAAAAATGTTATGCCTATATATATGTAGTTGTACAAATTTTGTTTCAAC:2 - chrX 16815489 5' + flea 417 1 31.68 ATGGAAACTCACAACAAGATAGCATTTGGTAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATA:1 - chr3R 24683617 5' + copia 4860 1 76.24 AGCCTGGGTGGAGCAGCCAACGCACAGAGCGCAGCAAAACAAAAAAAAAACAATTAT:1 + chr3R 26786251 5' - Tc3 86 1 92.98 TTTGTTTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTGCATATCGATAGAAATTTACAATACTAATAAATATGTAAAAACATATCCACACGTTTTTCAAAAGTGTGG:1 - chrX 4666778 5' - INE-1 258 1 78.22 GACTAACTTTTTGATCCGCACTAATTGCAATCCGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 - chr3R 6143779 5' + Doc 49 1 69.31 GCTCCCTCAACTCGCCAGAAGTAAAAAAAAACATATCGTTTAAGTAACAATAAATGCACGCTGTGTTGTATTAACCGAACATCCGCTTAAAAAGTAGGCCT:1 + chr2R 9989864 5' - mariner2 171 1 57.43 GTTTTCGCTTTGTTTATAGATACGGCTTATATGCTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATT:1 - chr3L 16563274 5' + 3S18 45 2 66.34 GAGAGCCTGCAAATGATCGTTAAAGCCATATGTATGTAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 + chrX 17104378 5' + 297 10 2 70.30 TAAACACTAAGTTGTCCCANAATGGCTTTCATACCAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAA:1 - chr3L 9778051 5' + hobo 2582 1 65.35 TTCATTATGAAGCAGCAGCTAAAATCCTGCAACCCCACTCGTAACCCCTCGGTTGACATCTTCTGCTCGTTTGTAATATTTGCTGCTGCTTGCTGTCTTTT:1 - chr3L 15373305 5' - Bica 4570 1 64.36 TACGTGATATCAATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATAT:1 - chr3R 26765197 5' - mdg3 5492 2 68.32 AAAACCGGCCAACTCGTTAATATTTCGTATTTGTTTCGTTTTTGAAATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATA:1 - chr3R 18291778 5' - 297 343 2 54.46 AAAACACTGGCAGAAAATAATGGTGTTCTCAAAGTTCATAAGTTTAGAAGGTATTCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chrX 8316390 5' + hobo 22 1 55.45 GTTCCTCGGGATCCGCTTGGGGGAAGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCA:1 + chr3L 8475190 5' + F-element 4436 1 75.25 CATTTTTAGAAATCTACTTGACTCGCGCACACCAGGCACTAATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAG:1 - chr3R 17943233 5' - F-element 4493 1 66.00 AAAAAGTCTCAAAAAAGCACAAAACCAGCAATGTAACTCATTGCATAACAGAAGAAACTGAACTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr3L 21970780 5' + pogo 10 1 74.26 CCTTGTCTTCAAAATATTTTGGGAAGTAATTACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAA:1 + chr2L 16728704 5' + Stalker 326 4 77.23 GGAAAAAATCGGAGAAACAAAAAACTTCCGCTGTCAACGGCGTTTCAGTCCCCGTATCTCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 9649256 5' + roo 17 2 63.37 TTTACATGAATTATGCAAATTATTCATATATTGCTTTGTCTTTGCTTGGGGTTGTAAATGGGTTTTCGCAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACAC:1 + chr3L 18122479 5' - S-element 1710 2 69.31 GGCGCAGTGGCAAGGAGAGGGCGTGGCAGCATACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGTCTCTCCCTGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTAT:1 + chr3R 29382120 5' + blood 92 2 63.37 TTTTTGGCATTCGGTTGTACTGCTTTTGGCAGTAAATGAAATTAAATCGATATTTCTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGACAGTTAGCTGCAT:1 - chr3L 18762155 5' + pogo 18 1 61.39 AAACAAAAACAAAAAAAATCGTTGCCAAACGCAGACACAAGCATACATACATCTTCACTAAATCGTTTTATGAGCTTTTAAAGTTGAAGTTTTAAACAGCT:1 - chr3R 9909018 5' + transib2 160 1 56.44 ACGATATCAATAAAAACGTCGACAATATAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr3R 22238670 5' + hobo 28 1 53.47 TTAATAAGTAGAGATTTCTNCTATTAAAGGTATTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr3R 20420897 5' + blood 7017 2 72.00 TACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGA:1 + chr3L 3540143 5' - mdg3 5458 2 61.39 AATTGGGGGATCGAGGAGCCGGGCTAACAACGTGTTCCGGTTCAGGAAACATTCAGCTGACATCAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr3R 14193993 5' - pogo 2091 1 67.33 CAGATTCTGCGCTTTGTGCNCTGTAAAAAATGTATGTGTGTTATGTTATGTAAATGCTTACTGTTTGATTCATTGATCATTATTAATATTATTAAGATTAT:1 - chr2L 3845164 5' - mdg1 7076 2 59.41 GACGGCCATTTATTTGACTNAGGCAAATGCGTGCTTATATATATATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCA:1 - chr2R 21433214 5' - HMS-Beagle2 7173 2 60.87 TCATTAGAAGCTCGCTCACATACATGATAAACATAACTTAACATTGTTGGTCCTGAAAAAATATTGTGTAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTG:1 - chr3R 24314773 5' + X-element 18 1 52.48 GAAATGCCATTTGCACTATAAATGATTTGGCCAGCGGGCAGGGTCTAATCCATTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGT:1 - chr3R 10077282 5' - Doc 370 1 59.41 CTTAAAGTGTTCCGTAAGTTCAAGTGCCTTTGTCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCCTACTTGTTTAGTCGGCT:1 - chr3L 13551805 5' + Cr1a 4077 1 67.33 AATCGTATCAAACATTGATCGAACACCAAGTGCTTAATTAACAGTCAAAAGTACAAGCGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGG:1 - chr3L 22736988 5' + G-element 22 1 58.00 ACAAACATACACACAAATCTAAACCCTAACACACCATTTATGACAACCCGATCGAACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTCCCTCTGCC:1 + chr3L 24061872 5' - invader4 2856 2 72.83 TTAGCAGGCAATTGGATGAAGGAAATGCAGAATTCTTGAAACTCACCTCGTTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 + chr3L 6351111 5' + 1360 67 1 54.55 GTAACGACTGCGTAGAGTGGCAGCTGCATTTTCTAAATTGTAATGATGAAATCCAATTAAGAACACAAATCCGTTTT:1 - chr2R 18432122 5' - 412 476 2 49.35 TTTTTAGAAGAACTGCGACAAGGTAGTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chrX 17494640 5' + 1360 51 1 77.23 TGGGAAATATGTATTTGCCTGATTGTGTTCGTTCCGCTGGTTTTTGCCCAATGCCAGCTGATTTAACAAGGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATCTT:1 - chrX 11017084 5' + roo 5 2 70.30 ATTGTCATTATTTTTTACCACCAAGATTTCAGCCATAGGTAGGACATCCTACCGACTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGA:1 - chr2L 12816973 5' - Tirant 8488 2 64.36 GCTCTTTAAGCAACTTACAAAAAAAAAAAGAAACCTTTCAGGCGCGCTGGATAACAAAAGTTAGATGTAACAAAACAATAATACAAATATAACAATTAAAA:1 - chr3L 2872671 5' - BS3 1645 1 67.33 AAACACTCGACAGGCGCGTTTCGTCACTAAGTGAACTGTCATGCACGGCAGTCTGGTTCTTGTTTTGCCGCTGAGCACGCAATTCGAGTTGGCTCATTTTA:1 + chrX 18302284 5' - Doc3-element 217 1 59.41 TCCTACATACATATATGTATATGTATATGTTCACTGGCTAGCCCCGCTTTTCTGCGGAGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATT:1 + chr3L 23531758 5' + 1360 3328 1 61.39 TATATAAGTCGGAACGGGCAAGATCGGAGCACAAAACAACAAAGAAGGAAAAGACAGCACACATTAGCGATCTGAAGCCGGGAAGCGCGGACGCCGGCGGG:1 + chr3R 4342931 5' + Osvaldo 1485 1 67.33 AACTTAATATAAAGGGTTTTCGCATTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 - chr3R 11052162 5' - blood 338 2 67.33 TTCGGCAAGATTAGCCGGCTGAAGGGATGAAGATACAGCTGGTTTGCAAAAAGTATGTGTACCCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chrX 15287947 5' + hobo 11 1 64.36 AGCAAATTACATAATGAGGTAATGGTATATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCA:1 + chr3R 17482018 5' + copia 51 2 74.26 CTAGTCTTTCACTACCTTATGGTGTGATTGTTTCGGCACTATTTAAACCTACATATATATTCATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr3R 22494079 5' + 297 6585 2 76.24 GCTTGGTGAACTTTTCAATTGCCGGCAACTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTA:1 + chr2L 11569620 5' + 1360 3379 2 72.28 GCATTTCCATCATCGAAAGAGCGAATTCTCGTCAGAAGCCGACGTCTCCAATACGGTCTTCCATCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACA:1 + chr2R 14197482 5' + F-element 272 1 72.00 ATGTAGTGCACTTCTCAGGGGAGTTTTAGGCCGCTCAGATGCTTAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 + chr2R 10372111 5' + mdg3 19 2 51.69 TTCATGGAAGTGATCAATTCATCACAAGACAAGCAATTAATTGTGTCTCGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCA:1 - chr3L 27379984 5' - BS 5069 1 59.41 TTGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3R 14193917 5' + pogo 50 1 75.25 CGAATCACCGCTCTTCTCGTCTGGCAACTGGCAACAACTGCAAGTCAATCTTGTCTGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAA:1 + chr2L 18653142 5' + Doc 4444 1 60.40 TTAATTAAAAGTTCTGCCTCATCGGTCTTCGGCTTGAGGCTTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:1 - chr3R 18696101 5' - blood 7383 2 59.41 GAGATCACCTGTCTTCATTTTATGGGCCGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1 + chr3L 3650057 5' - mdg1 7410 2 72.28 TTTAAAGTGATATTTATTTGTAATTTAAGACAATTTTGACACACACGAACTCCTGTATGTAAATTCGTTTCTTGGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAAT:1 - chr3R 11882458 5' + 1360 3183 1 53.47 CATGCGACACGATCTGGCCATGATGAAACTGAAATCCCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3L 7541999 5' + roo 8703 2 64.36 CGGAAAAAGAAAGTAAAAANGCAGAAAATGTTTAGTTTATATTTCTAGAGCGAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGGGATTGGTATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chrX 4937508 5' + Doc 8 1 74.26 CACCAAACCGATGAACCTTTGAAAACCGCCAAACCCACACTTCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chrX 4277593 5' - roo 9025 2 56.44 TCCCATTTCTGCGCTTGCGAATCAAATTGAGGCTACCAACTGTCGGTAATTTGCATATTTGAGCTGGAAATTGTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTA:1 - chr2L 15531892 5' + Stalker2 1 2 78.00 CCAACCACTTTCTGTTAGCACTGCCAAATGGTTTTTCCCAACACCGCAAATTGTTGTCAGAAGCATTCTGTTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr3R 12333810 5' - P-element 2885 2 75.00 CCACCGAAAATTGGCCGAAATTCTTGTGGTTATGGTTGTTCTGTATGCATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:2 - chrX 6481092 5' - jockey 4961 1 55.45 CAAAGTCCATCCCGCAGCTTTCCGCAATGGGATACCAGGCAGGTCCGGGCGGAAATCGCTTGGGCTTTCGAACTCCTCCAAACAAGATGGCCAACAGAGTG:1 + chr2L 16293194 5' + Rt1b 4796 1 74.26 CAGGGAAGATTCGAAACTGTAACAAAGTGTGAAACAGTTTGGGCTGCAAAGTGGAGCCCGAATGGATTTCACAG:1 - chr3L 26022542 5' + Circe 7178 1 72.97 AAAGGCAGAAAATGTTTAGTTTATATTTCTAGAGCGAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGGGATTGGTATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 + chrX 4937524 5' + Doc 24 1 59.41 CACCAGCAGATCACTCTATATCCTGAGTATATTATTAAACCACTTTCCTTAAGAGCATAGCTCTAGCGGCCCCTTTAGTGCCCTACGTCAGGAGAAACATC:1 + chr2L 9104540 5' - gypsy12 9847 2 62.38 TAATTATGCCCGTGCTATTTGGCGGCTCCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCT:1 - chr2L 19642060 5' - Quasimodo 7118 2 76.24 GTCGAAGGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr2L 8622767 5' + 297 38 2 75.25 GCCGGCTGATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr2L 20045799 5' - roo 9034 1 64.36 CTCTCCTCGACGTCGTCTATTACATTTCATTTTGATTCCATTTCTGGTTTTTTGCTTTCGTGTGCTATTGCTCATTACACACACACACACACACACATCAC:1 - chr2L 14022152 5' + Quasimodo 40 2 79.21 CTGAAATTGACTAACTTTTTGATCCGCACTAATTGCAATCCGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr3R 6143787 5' + Doc 40 1 61.00 TGTTGCTGCAGAGATCCGGNTGGAACTTGCTGCGCTTAACTTTGGTGCGTGCCCTGCGATAGCCATTCGCCTCGCTCTCATCACGACAGAGCTAAGTCCCG:1 - chr2L 5281297 5' + diver 425 1 76.24 AGTCCGTAACAAGTGATAAACAAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGACAATTTTTTGGTGAC:1 - chr4 303777 5' - 1360 3336 1 94.06 TCGCACTCTCCTTGGCGCGAGGGGAGTTTCGTTGCGAAGGGAGTGGAATGGGAATGTGCCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:2 - chr3R 29287580 5' - hobo 2922 1 62.38 GGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr2L 13566497 5' + hobo 53 1 74.26 ATGAAAAAAGCACCATTCTGGTATAAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr3L 19647263 5' - pogo 2053 1 80.20 GAAATAAGTTTTAATTACGGGCATATGATGGTGCCCGATAATAATAATAATAATAATAACGGCGAGCGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCT:1 + chr3L 17186779 5' - Tirant 8498 2 71.29 CAGTCGGAGGCCCATTGCGGCGTGCCCAGCCAAATGGTCACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCAATGTCAGCATTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAGAAGACG:1 + chr3L 12131213 5' + gypsy4 157 2 75.25 ATTAATTAATATAATTATTAATGGGTTGCAAAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAT:1 + chr3R 22690402 5' + BS 4968 1 64.77 ACAAGAAACTATAAAACACTTAGATATACTTCGGATTAGATTTACTGCCCATGTGCACACACACACACGCGCGAGTTACCACCCAACCCCCTAAACCCC:1 - chr2R 9209521 5' + Tirant 8114 2 73.74 CCTCGTTTATTTGTTTGTTCACTGGTTTCATTTACTGAGAATTCGGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGT:1 - chr3R 28275391 5' + hobo 371 1 55.45 CCGCTAAGACCACCACACACTAAACGCAACTGCCACCCACTGAGCGCCACACAAGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATGC:1 + chr2R 22279278 5' + accord 185 2 75.00 CTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:2 + chr3R 20420933 5' + blood 7054 2 68.32 CAGACACACCGAGGGCAGTTTTTTGGTTTTTGGTTCGGCTGCTGGGAACTAATAGAAGGTTTAATAAAGTATTTTCCATTCCAGTTTTCCGGCTGCGCCAG:1 - chr3R 10183569 5' - ZAM 472 1 55.45 ACAGTCTGCTCTATTTTTGCCATAACTGCAATTATTAATGAGCATTCAGATACGTGAAAACATTTATTCACTCCGCATTATGCACACACACACACACACAT:1 - chrX 3110044 5' + accord 7027 2 51.49 CATACTTGGGGGCTGTCGACACCACGACCACAATCAAAATGAATGGTCACCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chr2R 23671846 5' + hobo 27 1 52.48 ATAAGAGGAAACCGAGAATAAAAGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTG:1 + chr2R 18887276 5' - I-element 144 1 77.23 CATTTCCGCTTTATTTGTCNGCCTGCCCTTTCACCCGCGTTTTATCTATCCAGATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr2L 20612038 5' + 297 9 2 70.30 AACATTTGCATAAGTTGTACATCGATTTTTTCGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGT:1 - chr3R 7869214 5' - 297 6969 2 73.27 GTAGTAATTCACAGTCACAAGCGATATAATTAATATTATACCAAAACAGAATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:2 - chr3R 7765030 5' - 297 6955 2 64.36 TATGCGCAGGGAAGTAGGCAACGTTTTTATTTGTTCACTTTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTT:1 + chr3L 20049602 5' + jockey 4770 1 68.32 CCAATCCGGCCAGCGAAATGCCGAGCAGCAAACGCTCACCAATACCACGAAAACTCCACAATACACAAGGAGCTTGGAATGCCATGGATAGCAGAGGAGAT:1 - chr3R 2687743 5' + G-element 4052 1 69.31 GAAGTGCCGACCTGCAGCTACCCTACCTAAAAGGTAAATATTTTCAAATGCCCATCCTTTAAAATCAGTTTTTAACGTTTACCCACCCTTTAAAAATAAAT:1 - chrX 21573203 5' + FB 687 2 52.48 GAGTTTGTCAGAATGTAAGGACACTGCCTTATGGGCTGTCATTTATTTGACCCGACTCACTCACACATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCC:3 + chr2R 21433116 5' + HMS-Beagle2 5 2 74.26 ACCCAAGCTCTGGGCATTTAGGAACCCACTTTGATCCCCTGAACAGCTAATGCCATTGAGCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAGCACAGCATATTTGCGT:1 + chr2R 20034590 5' + Gypsy6A_LTR 99 1 56.44 TTTCCACTCCGCATCTGATCGGCATTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTATTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATT:1 - chr2R 12812311 5' - jockey 4940 1 76.24 ATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTA:1 + chrX 21087558 5' + mdg3 5252 1 74.49 AATTAAAGTATTTAAAATCTACGCATTTATTGAATTTGATTGGATGAATGATTGAATGATGAGAATGAATGGACGTGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3R 20684826 5' - roo 409 1 79.21 TGTAAATTGAAATACACAAACATGGCTAAAATAGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - 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chr3R 8582621 5' - roo 386 2 56.44 TGCACGCGAGTGAAAATGGCTTAGGGCTTGTTTTTTAAGCTATTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCG:1 + chr2R 12227698 5' - F-element 130 1 58.42 TTCTGTATTGTTAAGTGGCACCGTTGCTTGGAACAGTGTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGTGAAATTGAGAGTCCCGACTTGGTTAGTCGGCTTAACTTC:1 + chr3R 1848488 5' + Cr1a 4084 1 76.24 AGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 + chr2R 5214964 5' + F-element 31 1 48.96 CTGTGACATACATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATAC:1 - chrX 18326246 5' + Doc 210 1 48.51 AGAAGGAGTATTGGTGTTACATGGATTGTGGATTGATAACAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr3L 7345419 5' + pogo 31 1 57.43 TCAAAATCCGAATAAGCTGNTTAATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 - chr2L 18655226 5' + Doc 20 1 59.41 AGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr3R 19449495 5' + hobo 45 1 74.26 ATAAAACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:2 + chr3R 7869102 5' + 297 6597 2 64.36 CGACGTTCTGTCTGGCACTGCAACCACTGTGCAAACATCCCGCACCCACACGCCTACGAAAACCTGGCCCACCTGCAACACAACAACACACACACACACAC:1 - chr3L 17923036 5' + gypsy3 420 1 73.27 GTGTGCGACGTGACTCGTAGCTGTTAATTCAATAGATGTAAATTAACACTCGGAAAATTAAATGGATAAAACTATAGTAAAAATGAAAAAAAAAAATAAAA:1 - chr3R 6532947 5' - INE-1 471 5 36.63 TCCGGTCCCTATCAACATTTACTCCCTATTACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAATAAATTTCA:1 - chr3L 2307754 5' + 1360 362 1 72.28 ACTTGATAAAACCAAACACTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chr2R 10353317 5' + blood 32 2 58.00 AAACGAATGGGAAATGGGANGGGATGCAAAAATATATGTACACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr3R 30553639 5' + 412 12 2 66.34 AGCACCAACCACCCTCGTAAGCCTACATCGCAAAATGTTGCATGTTTTAGCCCTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr3L 14623915 5' - hobo 2917 1 55.45 GTCTGGAAGTACAAACTATTGCAGATGTCTTGGCCTAAATAACTGCCGAAACATAAAGCTCCAGGAATTGACAGGATGTGCCATGCCACGCTAAAGGTTTT:1 + chr3L 18708325 5' + Helena 26 1 54.46 ATCCAATTAGGCGGGCAATTACCGAGCACCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:2 - chrX 19034168 5' - hopper 1369 1 69.31 TGCACTACCGCTCAGATCCGTTAATATACACACACACGTATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3R 16603386 5' + roo 8724 2 69.31 AATAAGATGATGGGAAATTAACCGGAAAAGAAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCAC:1 - chrX 983400 5' + Juan 3804 1 78.22 TCTACATTAAATGAATCTCAGTGTATTATGTTAACACTGACGTACTTGACAGACCAAGCCTTTTCAACTTCATTCTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTG:1 - chr4 74360 5' + 3S18 1 2 78.22 TGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 25021688 5' - roo 9032 1 69.39 ATAATTCTTGCAGAGCGGTAAAGACACAAAGTCAGTCATAAATGGAAGACAAAAAAAAAGGAAAAAAAAA:1 - chr3R 22820392 5' + gypsy7 5005 1 72.86 GGATATGTATCAGAAGTGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr3L 18174193 5' - roo 9040 1 61.39 TCGCCTGTTGAGTCCAGCAGAGAAGCACTCCACAACAGACGGTTAGATTTTACCTTCTAAATCAGTACGTTATAGATATATTATTCATACCTTGACCTTTA:1 - chr3R 28029954 5' - transib3 279 1 75.25 TTACGATCTATTCGGTTTTATGACAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTA:1 - chr3L 1586776 5' - Tirant 8459 2 75.00 TATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 9928559 5' - roo 351 2 80.20 AAACCAACAAAAACAACTCTAATTGCAGACACAATGACTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGT:1 - chr3L 7184859 5' + Stalker 279 4 67.33 TTAAGTTATTAAACTTACTAAATACAAAATAAATATTTTTTTAAAAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 26317918 5' + roo 8687 2 55.91 TTGGACTTTGCAAATTTTACGATATCAATAAAAACGTCGACAATATAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr3R 22238652 5' + hobo 9 1 70.00 TGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTG:1 + chr2R 15788595 5' + Transpac 52 2 72.28 CAGTCAGAGCAAATCGCAGATAGTCAGCTAGTCAGACGCAAAACCTCCTCCTTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAAT:1 - chr2R 14997934 5' + McClintock 17 2 61.39 GTGTGAACAACGGCTAAAATGGAGCAGGGGGGTCCTGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 + chrX 2841777 5' - hopper 1378 1 67.33 GGCCACAAAGTAATGTTGANTGTTTGCCTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGT:1 + chr2R 15098678 5' - Doc 471 1 72.28 TAATTACAAGTTCTCAAGCCGAGCCCAAATTTAAGGTGAATGCAATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTCCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGC:1 - chr3L 21811018 5' - roo 459 1 59.41 TGGAGGACCCGACAGATTATGTTTTTCAAATGTAGTTTGTAACCCCTAACTCGTGCTCGTTCATATCCTCAATGCTTTGAATTGTGAAAATTGGCAGAAAA:1 + chr2R 5460994 5' + transib4 187 1 74.26 GGAAGCGGGGGCATTTTATTTAAATATATACATCTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr2R 21962694 5' + 297 6618 2 74.26 TGCCAAGATTATGTAGTGCACTTCTCAGGGGAGTTTTAGGCCGCTCGGATGCTTAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGT:1 + chr2R 10372101 5' + mdg3 21 2 51.49 GCGCGTTTCACTTACTTTCTCATTACTCACTGACTGCCTGACCAAGCCAACTTCCTGGCTGCGTAACTTGCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCC:1 + chr3L 25255029 5' + GATE 8280 2 69.31 GATGTAAAATATATTTATTTATTTATGCTATTATCGAAATCATTTAATCGTGATATCATTACAATATTACGCCACTATTTTAGTTAATTATTTATTATTAA:1 + chr2L 6130777 5' + INE-1 418 1 52.48 TCTAGGTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTTTCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCA:1 + chr2L 8959892 5' + Ivk 5086 1 67.33 ATATGCATTTCAGAAATGTGCACAATTTTTTATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTT:1 + chr3R 10087794 5' - roo 9068 1 75.25 CATTGATTGCAGCGATGACTTTTGATTGGGAGTTTAAGCCACTTGAGTTGTACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCAT:1 - chrX 21020873 5' + P-element 448 1 59.41 TCTGGTGTTTTTCCAAGAATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chr2L 17730404 5' + pogo 39 1 67.33 AGAGGGAGGCGCACACGCACGTTAATATATGTATATGCAGTTCGGGAACAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr3R 24976728 5' - opus 476 2 58.42 ATAAATCAGAGTGCCCGAAAAGAGTGTGACTAAATCAACGAAAAAGTGCAGTGCGCTTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGATCT:1 - chr2L 18503052 5' + mdg1 213 2 50.50 CATTTCAGAAATGTGCACAATTTTTTATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:2 + chr3R 10087799 5' - roo 9063 1 70.30 AATACATGTTCTATATACTTTGTCTGCGATATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr2L 5419804 5' + 297 6615 2 75.25 TGATCTGCAAAGATAGATANGGATTCGGATTGATTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTAG:1 + chr3R 3854763 5' - Idefix 7155 2 95.05 CTGGAAATTTTAGCCGTACNCTGAGAGAAAGGGGTAATAGTAATTGAAGGTAGTTGCTTAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATT:1 + chr3R 22869363 5' - Bari1 1690 1 59.41 ATTTACTGGAGAAATCGATNGCTTGCACTGTGCATCCAGTTTTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 + chr2L 16680020 5' + P-element 28 1 51.49 AAGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGACGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGG:1 + chr3L 26852649 5' + 1360 47 1 66.34 GGCGTGGCACTCCCGCCCATCTGTTTGCACCGCGGGAATTGCCTGACTGCCACTCCATCAACATGTATATTTATCTTTATTATGACAAAGTGTCACAATGT:1 + chr3R 27452723 5' - Stalker 6915 4 75.25 TCTTAATATATTTCCACATATACACTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 12944669 5' - roo 9046 1 56.44 TAACCCGTTAATATTGCACTCTGTCCCGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAATACG:1 - chr2R 5172426 5' + accord2 7288 1 73.00 TTTTCATCACAGCATAAGTGGGTTAAAGAGAAAGCCTAGGACAGGGGCATGTGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACA:1 + chr2L 15567091 5' + 17.6 6949 1 57.43 TCTCACGATGAGTCTTAGCCAGGTAGTGGACTCTAATGCAGCCAAGCTCACTCGAGAAAGACTACAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACG:1 - chr2R 22921896 5' - F-element 37 1 68.32 CAGCTTATTTTACAATGATTAACTGATAAAGATATTATAAATTAATAATCTTGTTTCCAAACCACGTGGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATT:1 - chr3R 5508086 5' - pogo 86 1 74.26 ATTTAATTTACCAACGCATAAACACACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAACATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2L 7666182 5' - roo 386 2 57.43 TTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 - chr2L 18248035 5' + blood 50 2 79.21 AATACTTCACACTTGGCTAGGAATTAATATTATTCAAACCAGTAAGAACAATTTTTTTATTTGTTTTACTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr3L 16546752 5' - pogo 2095 1 74.26 GCCAGCCTGCGTGGCATATATGTTTATCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCCCTATATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGATCAAATGATCCGT:1 - chr2R 4287888 5' - rover 328 2 60.40 TTGCACTACGGAATGGTGCTGCTTTGATTAAATTTTTATGGACAACCCGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGT:1 + chr2L 17998256 5' + BS 25 1 55.45 CTACTTTTCAACTGGCGCAACTCTACAAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:1 - chr3L 3541213 5' - mdg3 5430 2 73.00 TAAATATACGATGATATATGATAATAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 14362811 5' + Rt1a 5070 1 75.00 TAAACAACAAATTGCATACTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAG:1 + chrX 15546145 5' - blood 7360 2 53.47 ACTATTTTGCATTTGTGGCACTTTTTTGTTCAGTTAGTATTGTTTTTATTCTTTTGGTTTTTTGCTTTTCGGATTTGACATAACTAAGAGCCTGTTTCCAT:1 + chrX 3054562 5' - baggins 113 1 79.21 TATTAAAGGTATTTTCTAANAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 + chr3R 20420918 5' + blood 7039 2 53.47 ACTGATTGTCCGTTTGCTGATTGGAATTGCGCGCTACCGCGAGATGTTCTACTGCTTTGATTCCCTGATTGAAAACGCGCGGGGTGGACTTCAACCTTTCG:1 - chr2R 22848970 5' - Max-element 219 2 76.24 TGGCTTTTGTTCGATGGTAGTGCAATCAATGAGCCGGAAATGTGTCCGTCTTTGTAGAATATATATATATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATT:2 - chrX 11262930 5' + invader1 3618 2 71.29 AATTTCTCTTAACCTAGTTCCTAATCGATCACGCATAAACGGAGATATAGTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 19334577 5' + roo 8688 2 56.44 CTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chrX 19106834 5' + blood 7036 2 49.49 TTCCTCAGTATGATTTAATATTGATAGTTTCAGCGGATCCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATT:1 - chr3R 19449684 5' - 1360 13 1 63.51 GAGCAAATTGAATTTTCATATGCGGAACGCAAAAGGTACAAATGCGTGCGCACATAGGGCACCTAAGGGGCCATTGGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGA:1 + chr2L 14822089 5' + Gypsy12A_LTR 1934 1 52.48 CTCGCCAAGGGGCGTTTGTTTTTGTATGGAAATCCGCCGGCGAGCCACCCACACGAAACTATGCAAAAAATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCT:1 + chr2R 8760241 5' + mdg1 477 1 73.27 AAATTTATCGAATTCCGTCGATATCTTGTTTAATTTCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCG:1 + chr3L 10631323 5' + opus 7460 2 65.35 TACCATTTACCAACAAAACCAGCGATTCTGGTCAATCGATTACCGAATGAAGTCAAAGGAAAACGAAGTCATGGAAAGGGACTCAGAGAAAGGCCAGCTCC:1 - chrX 12193363 5' + roo 485 1 68.32 CAACCCTAGGACCAAGCAGNAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr3L 18418890 5' + hobo 47 1 69.31 CGATTATTAATAAAATGTTTCGTATGAATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAAC:1 - chr3R 25086173 5' - Bari1 1683 1 55.45 AAATCTCACTCGCTCTTTGGGTCTAAAGAAATTCTGGCTAAAAAAGCAAAATAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3L 2176389 5' - roo 9050 2 57.43 GTGTTACATGGATTGTGGATTGATAACAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr3L 7345406 5' + pogo 44 1 70.30 GTTTCTAAACAATATTTTAATATTATAATTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr3L 10621702 5' + 412 7103 2 78.22 AATGATATTCACCATTTGAACGGTTTTTAATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAA:1 - chr2R 5772517 5' - HMS-Beagle 208 2 69.31 AACGAGCCAGTTGGTGGCCTTTCGATCCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 - chr3R 21297364 5' + P-element 48 1 31.68 ATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 19450180 5' + roo 39 2 61.54 CAAAATCCGAATAAGCTGCTTAATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 - chr2L 18655225 5' + Doc 21 1 59.41 AGGGATGCATATTAAGAAAGGCATCAAAATTAAATTCACTTTCAGGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGG:1 + chr4 956562 5' - 1360 3334 1 55.45 TGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATATCCCTATGTCCGTATGAACGTCGAGTTCTCAGAAACTATAAA:1 - chrX 21587703 5' + INE-1 146 1 75.25 AGAGTGCGGAGGAAGAGGAGGAGCTCCAAAAGTCGTAAAGAAGCAAAAGGAAAAATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr3R 8928164 5' - mdg1 399 2 49.50 CGTCGTGCAACAAACCCGAGATCTCACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACT:2 - chr3R 10391258 5' - invader4 3065 2 57.43 TTGGGAAATTTCGTTGTTTTGGTAGAGGGTAGCTTCACAGGCCTAACACATTTGCCAAAGTAGACCGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 7541916 5' - roo 398 1 68.32 TCTGAATTTGGAATCTGGATTTTCAAGGACCTTTTACCAACCCTAGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr3L 18418927 5' + hobo 10 1 69.31 TTTTCCCCAGGCTACGTGTTTAAAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 + chr2R 19641862 5' - I-element 5303 1 78.22 TGCAAATGGGGGTGGCAGGTGGAGAACACCTCTTGGGGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr3R 23338329 5' - roo 9032 1 62.38 CAAAAATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGATAAAAATATTATCCGAAAGGGTGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAAT:1 - chr2R 10920329 5' + Dm88 4387 2 52.48 AGAAAGTGATTTAAGTACGGCGATAGCTTATCATTGTTCAATACTTAAACACTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:2 + chr2R 22051457 5' + Tabor 6865 2 51.49 CAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr3R 19449487 5' + hobo 53 1 82.18 ATCGGAATTTTATGCACAATGACAGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:1 - chr2R 17459210 5' + Transpac 4965 2 75.25 GGTCCGCTTTTACCACTGGTGTAAAGCTTACTGTAAGCTTCTCCGTCTGGTCTGATAGTGCCTGTATTAAACGGTTGTTCGTCACGTCTCTTGGGTTAAAG:1 + chr3R 796976 5' - Bica 4488 1 53.47 TTAATTACTAACTTAAAGATTAGGTAGAAGATTTCATTAAATGGCCTTTTAAGCATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTAT:1 + chr3L 16563210 5' - 3S18 317 2 53.47 GTCATTAAAATTAAAACAAACACTTCGCGCTCTATTTTTATTTACTCTATTATATTTACCCTAAAAACTTGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGC:1 - chr3R 13766682 5' + micropia 5273 2 77.78 GAAATGCCAAAAGATACATTTGTATCTACGGGTGAAACATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCG:1 - chrX 3054492 5' + X-element 4426 1 62.38 GAAGCCATCTGCAGACGTGGTTTTCGAACGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGT:1 + chr2R 9905365 5' - mdg3 5452 2 70.30 AAAGAGTCATAAAAACTTACAACTAGATTATTTTTTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 + chr2L 7175576 5' + blood 17 2 50.70 AGTTCTGATTGAGACACTTNCAAGCCAAATGACTTTTCTTTGGCAATGCTGTTTTGTAGATATACCATAGACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTTT:1 - chr2R 11440526 5' + Tc1 11 1 69.31 AGGACGCATGCAAACACTCATGAAGTGCACGTGGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCTTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGA:1 + chrX 21009346 5' + hopper 40 1 65.35 CCGGCCATTATATAGATAGCAGTCAGCGCAGGGCGGCAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTTAATATTATTGTTAGTAGGATCTAATTA:1 - chr3L 11661651 5' - Cr1a 4288 1 65.35 CTATATAAATCCTTTTGTTTTTGCCACAAGANTGCCGAGGGAGAGTGGGAGAGCNNNNNGCGTAACTGCTGTGAGCGAGAGAGTTGAGAGTGTGT:1 + chr3R 14380325 5' - Porto1 467 1 52.63 CTGGAAAAGCGCTCGATGCCAAAGCAATTGGGTTTATGGTCGTTTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3R 6034021 5' - roo 9044 1 54.46 GATAGTAATTTGCCCTTTAAAAGTAATTTAGATCTGAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:2 + chr2L 12866890 5' - mdg1 7422 2 60.40 ATTCCATTTCCATCTCAATTTCTAGTGCTAATCTAGTGCTAATCAATTTCTAGACTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:2 + chr3L 17140596 5' + F-element 32 1 52.48 AGGGTTTTTAAGTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTT:1 + chr3R 20094461 5' - Max-element 260 2 61.86 AACTCAAAAGTGGCTTAAATAACGAATATGCGTCTATATCTGTGGTTTTATGTATGGTACCACGGTTTTCGTGCTTCCATTCATATTTAATGGCATTGGAT:1 + chrX 3547859 5' - HB 467 1 78.22 ACTGGCAAGTGTCACTTAAAGGCATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTT:1 + chr2L 10637232 5' - Stalker2 349 2 77.23 AGGCGGTGACGGGGCTCGGGTGAAAATTCAAAATAAAACTTAAAATGATTCTTATAGCTAACAAAGACTCACCGCGGCCACGCGAATATGCTGTGTTTGAC:1 + chr3L 9122643 5' - Gypsy6A_LTR 99 1 78.22 TCCCGATACACAGCGACCATGACTCGCTACGAGTGTGGATATGCATGTGGACTTATCACCCTCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAG:1 + chr2R 24539374 5' + roo 457 1 65.35 GATGATGGGAAATTAACCGGAAAAGAAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTT:1 - chrX 983395 5' + Juan 3809 1 73.27 TGAATTGCCATTTATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr2R 11941075 5' + 297 24 2 58.42 CAAGCCATTCATTCTATTTGGAATGAAAAGAATTTGAATGAATGGTCATAAATATCGCCCCAAAGAGTCTGTAAACAGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGA:1 - chr3R 14584553 5' + invader4 189 2 77.23 TAAATTTGCCCTTCACACATTATTAAGATTTTCCATCAGACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3L 9928600 5' + roo 35 2 66.34 TAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 - chrY 2720369 5' - 297 378 2 64.36 GGCAGAAAATGTTTAGTTTATATTTCTAGAGCGAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGGGATTGGTATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAC:1 + chrX 4937527 5' + Doc 13 1 65.52 TTTTAGGCCAAGTGACCAAGTTTTCTCACTCCACAGCGCTGACCGCAAAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGA:1 - chr3L 14905210 5' + Tirant 8491 2 53.47 TTTCCCCATGTTTCCTTGGCTAATAAAATTATAAATACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGATTTT:1 + chr3L 920577 5' + I-element 280 1 64.36 GGATAGTCTCATTTAATGTTGTTCACAGTTAGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3L 12112348 5' + 1360 46 1 72.28 ACGCAAAATACATGTTCTATATACTTTGTCTGCGATATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr2L 5419798 5' + 297 6609 2 69.31 AAAGGTATCACACGAAAGGTAAAACAACGGCAGACAGATATGAAACGAAGAAAGGGGTTCACCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAG:1 + chr2L 12489990 5' + F-element 105 1 54.46 GAAGCTATAATAATGTTCATTTGTAATATCGACCAACAAGACATAATTTTTTACAACCAATTTGGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr2L 21190720 5' + pogo 9 1 68.32 TGTGGCTTCTCCTCCTCTTTCTTGGCCTCTGTGGTTTATCGGGGTAAAGGTGTTAGTTTTGAACTAGCTTGAACGCAATACCAAAGACACTAGAATAACAA:1 + chr2R 22856493 5' - Tc3 312 1 63.37 GCCTATTGTCCTAAAAGTATGCAACACAAGGACCATCACTTTCGCCAGCGCGCTGGCAGGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr2L 10166072 5' + jockey 22 1 63.37 GACAATGAAACCCACTTGTTCGGTGGGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr2R 21040870 5' - P-element 2837 1 27.72 GTCAGCTGCGTCTGTTGTTTGCTCATCGCCGTCGCGACGGTCTGCTGCTGGCCAAATTAGAGGATTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:2 - chr3R 12329695 5' + hopper 7 2 70.30 AAAAATGGTTCTTTTCTTAGGATTTCTGTTCTGTAAACTACACTTCATGTTATTAAGGATTTATCGAAGATATATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTATGA:1 - chrX 13798932 5' + 412 76 2 66.34 CCCCATTTTTTGTGGCATAATTTAAGGCGACATTGACAATGAGACGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAAC:1 - chr3L 6023351 5' + hopper 31 1 53.47 CATCTCGTGTGTATTTATTCATACATTTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2L 12958971 5' + roo 8706 2 71.29 GAGTCAACAATCTCGCAACACGCTGCAAGTGGCAGTGCACATTTTTATCAACATTTCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGA:1 + chr2L 17677694 5' - Tirant 381 2 61.39 TATGCAACGCATATTTTTACATCACTTCTGTTTGCCTTTCTCCCAGAGCCACAGCTCCGCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr3R 12199842 5' + jockey 24 1 60.40 TGAAGTGGGCCAAGTAACTTAACCGATAATCCCCCGCCCTCGATCAATTTCAATTATATAATAATCATTTCCGTCTGGCGCCATTTGACTCGACTACCTAC:1 + chr2L 1314760 5' - hobo 299 1 79.21 TTAAAATGAATCGAATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGG:1 - chr3R 15790141 5' + flea 4711 1 40.00 GCGCGTTTGATGTTAATTCGATCGTTAAGCGGACTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 + chr2R 21351023 5' + opus 149 4 66.34 CTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAAGAGCTCATTACAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAA:1 + chr2L 19642360 5' + Quasimodo 7058 2 54.64 ACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGAGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr3R 7869107 5' + 297 6598 2 61.86 GAATTCAACTGAATTGAACAGAACTTAACAGTATACAAGCAAGCACGGCGTCAAGCGTCGCGCCGCGTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATAT:2 - chrY 1076852 5' - INE-1 82 1 63.37 TATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCAC:1 - chr3L 19350020 5' + 1360 3205 1 53.47 TAGTCGAAGGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:2 + chr2L 8622765 5' + 297 36 2 73.27 AAAACTTAATAGTTCACTATGATTGCAGTTGCAGTGCTTGTTGTTGTCACAGTACTAGTCACCGTAGGTAAGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAG:1 + chr2R 4551450 5' - Doc2-element 496 1 81.00 CTTTTTAAGATTTTAAATGAATTGCCATTTATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chr2R 11941092 5' + 297 6585 2 77.55 TCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAAC:1 + chr2R 18723051 5' + HMS-Beagle 6840 2 72.28 CCGGAGCCTTTTGGCTTTGCCTAACGCAACACGCCAAAAAACAAGCGGCATTGGCTAATCAACTCTAACCTAAAAAATAAAAATTTCCTTATTACATAAAA:1 - chrX 842270 5' + Burdock 392 1 61.39 TGGGGAGTTTAGAGGACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr2L 17730445 5' - pogo 2063 1 63.37 AGATGAGAGCCACGCGCTGTGCACCCGCCCTCTCTCACGTCCGCACCCTCTCGCTCGCACACCTGCCCGTTGTGCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chrX 4707808 5' + P-element 1 2 78.22 AAATGTTCCTAATACTAAGCTTTTGCCTGCTCTTACTGGACAGGCATTTCGTTTCAATTGAAAAACAAGACAGAATGCTATAGTCAAGTTCCCCGACTATC:1 + chrX 20381368 5' - INE-1 564 1 40.59 GTGCCACCATTTCCGCTTCCGTTTGTGTTGTGTCCGGCACTTGGTGCCTCGTCTAAAAAAGTCTTCACTGTAACGACTCGGACCTTGTTGTCGATTCCTGC:1 - chrX 19738607 5' - 3S18 5644 1 61.39 CACTGAGAAAAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 15037921 5' + roo 8702 2 66.34 CAGAACGAACGTATCCAGANCCTCCAGAATTTTAAGTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATGTAATATAGTTATTTTACATTCTATTA:1 + chr3L 10633271 5' + Cr1a 4319 1 73.27 ACAAGCAATATTCACAAGGAAAACAATGAAATAGCAAGTTTGACCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATA:1 - chr2R 12923905 5' - 412 7296 2 56.44 ACATGATGACTTTGAAAATTATAATAAAATAATAAATAGCAAGTTTTAAATGTAATCTTTGGTGTTTAAAAAGAATAAATTTTGATAATAAAACATATGA:1 - chr3L 8777488 5' + S2 1597 1 83.00 AAAAATCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTGTCAAAATTACAATCCATAAGCATACGTGTGCACACATCCAGTTGTCTGCTATCACTGTA:1 - chrX 16878696 5' - 1360 156 1 55.56 TTAGGAGTATCTTAGCTTTCGAATCGTATCAAACATTGATCGAACACCAAGTGCTTAATTAACAGTCAAAAGTACAAGCGAGTCGCGATCGAACACTCAAC:1 - chr3L 22737009 5' + G-element 2 1 78.22 TGAGCGCGGGTTCTGGATTGTGTTCAACATAGCAGAAAATTATGAGTTAATGGATTTTGTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr3R 23638194 5' + pogo 14 1 65.35 ACGGAACGGAGTTCTGTTCCTGACATCTCGTTTAGTTGCATTTATGCTCCTGCACATGCAATGTGCATTCCCAATCCAACACAGCAATCACGATATCTACT:1 - chrX 14966025 5' + Doc3-element 493 1 78.22 TGTGTGTGTGTACGTGTGTACGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGT:1 + chr2R 9680671 5' - accord 193 2 73.27 TTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTATGCCT:1 + chr4 1294990 5' - HeT-A 6013 1 82.18 GATAAAATTGAAGATCATCATGAACAATTCTTCTCACAGAACGCCGTGGCGATCCCAATATTGACGCTCTCACTGCTTCAATGTTCTCAGGTGATCTAACG:1 - chr2R 7394616 5' - mariner2 343 1 76.24 CTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGAC:1 + chr3L 16282387 5' + gypsy5 6996 2 78.22 AAGACTATCGCTAGATCAAGCTAAACTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 20400359 5' + Porto1 159 1 71.05 ACAGTACAACGGAGGCAGGGCGTTGCAGGAGAAACGCCGCAGGAGCAGCGAGATCGCTGGGGGAGTTATCCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACG:1 - chr3L 23312593 5' - Rt1b 5052 1 75.51 ATTTTCACCGTGGGAGATGATAAAACCATCAAGGTTTGGAAAGCAGAGGCTCCGGAAGTCGGCGAGTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCA:1 + chr3L 15499481 5' + invader3 5194 2 68.75 TGGCAAAGGTTTTCGCTTTGTTTATAGATACGGCTTATATGCTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTAC:1 - chr3L 16563282 5' + 3S18 36 2 58.00 TGAACCCAATTTTTAATATGCTTTATTATTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGGGTATAGATTCGTTGAAAGGTATGTAACAGGCAGAA:1 - chr2R 25211386 5' + INE-1 23 1 79.21 CACTCTTTTGTCCCGCAAGCAGAATGGTTGGAAACATCGATAAAATCGAACACATTTCTTCTTGTTCCACCCTACCCTAAAATTATTAATTAATAATTAAT:1 - chr2R 16571811 5' - Tc3 268 1 82.18 GCTCTTTGCTATTTTCACTGCTCTTCAAGAGCTTTCTCCCGCTCTTTGTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr3R 14580293 5' + blood 29 2 54.46 TGGGCAGGATTTTTCACCGTCTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTA:2 + chr3R 13739695 5' + Burdock 6191 2 79.21 TTCAAAACGTTATAAATTGATGTATATTTAAACCTACATCTTCAGCAACACCTACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGC:1 - chr2R 3504574 5' - GATE 8283 2 60.40 CTTTTCAAATTAGGCACACTTTAAGCTAGGTTATTGCGAATTATAGAATTATAAAGACATCTTTCACGAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCT:1 + chr2L 3699384 5' - mdg3 237 2 67.33 TCTTTAAATTCCTTATACATTTATTGGTTGAATAGCTAGCTGGTGCTGTTCTCCCTTAAGTAAGTCACAAAAAACCTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGA:2 + chr2L 3408586 5' + G-element 4 1 73.27 TAACATGGATAATGATACATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTG:1 - chr2R 12457994 5' - HMS-Beagle 235 2 60.98 TTTCTTCTGCTCGCTTCTTCTTGTTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTA:1 + chrX 18368482 5' - jockey 4846 1 76.24 GCAGGAGCTAAGTATTGGGTTTATACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr3L 171218 5' - 1360 3334 1 85.15 AAAAGGTACGCTCCTCGTAAAAGTCAAGTGTGTAGATAGTATTAGTCAACTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACTCCTTATTT:2 + chr2R 11983206 5' + Cr1a 4127 1 60.40 GTTGAGAGCTCGACTTATTGTGCCCTAATCTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chr3R 27495661 5' - 412 447 2 67.33 CCACTTTAAACTAGAGATACAAATTTCTTCAATCTGTTTATACATTTTCAACTAATTCTACTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCA:1 + chr3L 5478985 5' + 3S18 18 2 62.38 AATAAATCGAATTTTATAAAACTATATAGTAAGTAGTTTATTTATTTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAA:1 - chr3R 27169516 5' - 412 485 2 68.32 GCACGAACCATAAAGCCATTGGCGACCGACTGCATTTCAGCGATATAAATATTTTTATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chr3R 5135537 5' + 297 22 2 56.44 AATGGAGAATTGATGCTGTTTTAACATTACGTACTAAGTTGTGTAGGATGATATTATTGTTTTTGGCACAAGTTGGCACAAATCATTTTTCACTCCACAAT:1 + chr3L 25923916 5' - transib3 404 1 64.36 AGATGGTGCTCTAACTATTCCGAAAGAATTAAAAGAATTAAAGAATTAAAAGAATTATAAGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAAC:1 - chr3R 3854443 5' - INE-1 20 1 51.49 GTTTAACTTAAATGTTCTCAGCCCTTTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:2 - chr2R 13763238 5' + roo 49 2 76.24 ATAATGTCCGCTCATCCCTGAGCGGATAATGAGTTTGGATGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTCACGTATG:1 + chr3R 3847098 5' - P-element 2852 1 44.55 ATCTACTTGCGAGTGGAACGCATCTAACCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATAT:1 - chr2R 6779848 5' + 17.6 6952 1 56.44 AAAAAAACAAAAAAATTAAATAAAAATTTAAAATTTTACAATAAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTTGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAA:1 + chr2L 6641232 5' - transib2 19 1 58.42 AGCCCACCAACCACAGCGCCTGCAAAATAACGATCTCGAGGCGGTATCCCAATATCTGAACCAGCGTGACTATGTCTTTATTGTCACCAGAATTTGG:1 + chr2R 17492815 5' - Quasimodo 138 2 79.38 CACTGAAAAGCATTGAAGTTGGCCGAACAAAAAAACACACCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 19334650 5' - roo 9036 1 62.38 TCGGTTGCAACGTTTGCTCTAGTTTTTCCTCGGGTTTTTCCTCTTTTTTTTTTTGCCCAGCATTTCGGCTGTCTTTCCCGCCAATTACC:1 + chr3R 28042519 5' + diver2 197 2 73.03 AAAGCGAAACGCCAACATGAGCAGCTCATAAAAACCCAAGAAGGTATTGAAAAATGATAGGTTTTTAATGCTTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCA:1 + chr2R 12211722 5' + invader2 4983 2 62.38 GCACAGCAATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGT:1 - chr2R 9631753 5' + F-element 55 1 76.24 TGATGATGTCTCGACCAAAGTTGAGAGTTGGCTCTGCATATAAGGCCAGAGTTTGTTTGGACGTGGATTCTTCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 - chr2R 21040947 5' + P-element 3 2 75.25 AATGTTACGTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr2L 10792020 5' + 412 35 2 59.41 AATTATAATATTTCAAAAATGTATATGAACATAATGATTTTCATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATC:1 + chr3L 13001005 5' - invader3 244 2 61.39 AAATTCACCAACAGTTAATAAAGTTTATTATAATTCCATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATA:1 + chrX 21468554 5' + transib2 35 1 60.40 GTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2L 8577277 5' - roo 9035 1 66.34 TGCGCCAAGAGTCACGCAATTAAGACCCACCAGCGAATATAAATCATGGCCAAGACGAGGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCC:1 - chr2L 7079736 5' + invader2 240 2 63.37 CTGAACGAAATTGAACGCTAGTTGGTCGGAAAGCTTTCATTGGTACTGAAAAGCACTGCACATAAGCACTTTTTTTTATCAAACTTAAAAAAAAAAACACT:1 - chrX 3409070 5' + gypsy2 428 1 67.33 GATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3R 9278381 5' - roo 361 2 73.27 AGGTGCAACTCGGATTGATGGATGCGGTGAGTGTAGTTGCACTTCCCATAGTGTGTCACAATTACGGCGCGTACCACCGTTGGTGGCGCGTTGATCTCCTT:1 + chr3L 15671803 5' - baggins 25 1 72.28 ACGAAATAAAAGTGAAGCAGCAGCCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAA:1 - chr3L 16762856 5' - R1A1-element 4989 1 80.20 ACGGCAGTGCAAATATAGGCCATAACCCATGCCCTCGTATTCACACTAGCCGAGTAAGGGGTATTTGATAGTCGGTGAACTCGACTATAGCATTGTCTTTT:1 + chr2L 15015088 5' + INE-1 577 1 62.38 ACGTTGAGTGTGTTTTTTTTTTCATTTGGTAAGTGTGTAGATGTGTTTTTGGTGTGTTGTTTGTGGCACTTGGATAGACATGAGCGCATCTTTGTGGCTC:1 + chr2R 17530202 5' - G2 63 1 60.00 GCAAATGGAACGAAATCAAAAGATTATGTGATAAGGACTTGCATTTTAAGGAGTTCCGTTTAAATTCGAACGGGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCG:1 + chr2L 12897904 5' - INE-1 506 1 65.35 ATTTTTATTTAAATCAAGTATTAAGTATTTAAATAAAGTATGTGCAATCGAAAAAATGTTTGTTAAAGGTTTACTTAAGGGTGGGCAAACGATGAAAACTA:1 + chr2R 18516191 5' - FB 374 1 50.50 ATAGAAAAAGAAAAACTGAAGTAAATTGACATAACTTTACAACTTTAAAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGC:1 + chrX 22633784 5' - flea 462 1 71.29 TGGCAAAGCAACAAATGATGCGTAAGAAATGCTTTAATAAACAGGGAACCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTT:1 - chrX 21253961 5' - invader3 5437 2 54.46 ACTTCGCCACACTGGCTTATCAAACAAACAATTTGAATGCCCAGCGGAGCGATCTTTTTATTGATGCGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr2L 16358148 5' + hobo 9 1 68.00 CAAGGCAACCAAGCTCCTTATTGGCTTCTTTGCAAAATAGTTTGTGATGGTAAAATACAGTAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAA:1 - chr2L 12866969 5' + mdg1 7055 2 63.37 AAACGCTGTGTATTTATTTGCATTTCGTAACATTTCTCGCTGCTCTGTTTGAATCGGTTTATTCGAATGAATTCATATTGCTGTTCTTGGGTACAGCCACC:1 + chrX 16892977 5' - Stalker3T 256 1 59.41 AACTTAAATATGTTTTTTTTTTGTCTAACAATGGAAAAATATCGCAACAAACTACGTGCCCATCCGAACAGGTTTGCGAGAGACTTAACACGGCTATCTA:1 - chr2R 18315818 5' + Fw2 3770 1 71.00 TCCATTTCGGTCTTGGCTCCTGCGACATTTAGTGTCAGGCATAGTGGGTAATGACCACTTCTGATGTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTT:1 + chrX 13524894 5' - invader3 265 2 75.25 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAGCACAACCACACACACAAACAC:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 418 1 30.11 CTTACAGCTACTGTGTAATTCCATTGCTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 + chr3R 4971392 5' + F-element 33 1 55.45 AAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:5 + chr3R 19987422 5' + Doc 55 1 75.25 ATACTTAAATTTGAAATTAATATATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 - chr3R 18790115 5' - I-element 5306 1 73.27 ATTTCATTCATCATAACTAAATATGCATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTC:2 - chr3L 20454585 5' - invader4 275 2 79.21 TTCCGCGGACTGTTTAGCAAAAAGGCAAAAGTTAACTTTGGGGCACCCTCTCCCCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATA:1 + chr2R 21747525 5' + mdg1 7063 2 51.49 GAAATGGAGCAGCCCAACACACATATTAGTATGTATTTGTGTTTATGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr3L 14594188 5' + hobo 23 1 55.45 TTATCAATTTGATGGAAATGTATTAAACATTTAATTTGCCTAAGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGG:1 + chr3L 13376781 5' + hopper 341 1 62.38 AAAAATGCATATAATTTATGCATACGCCATTTTTTTTTTCCATCCAGCTGTTGATGATGTGCAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGC:1 + chrX 14462577 5' - accord 7025 2 65.66 GGTGGAGAGTGGCAGTGCTTAAAGTGTAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3R 9278342 5' + roo 47 2 73.27 CGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAG:1 - chr3R 1844855 5' + Cr1a 121 1 64.36 ATGCACACATAAATATACATATGTAGATGCTTACGATCTTTAACATCCTCAAAAGCACATGCACACACACACACACAC:1 - chr3R 23726396 5' + accord 7025 2 92.31 AATTAGGGGGCAGCATTTTAATTAGACTTAAGTGCTGCTGCCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chr3L 1998813 5' - hopper 1384 1 54.00 ATTAAGCAACAGTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 7101945 5' - HMS-Beagle2 492 1 82.76 TGATGTTTCTAATGCAATTTTACCATAAGTAGTCTAGCAGCCGGCTTCTAAAAAGTACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 2833846 5' - roo 390 2 59.41 CTAAGTATGTGCCACAAAATGTTATACAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATT:1 + chr2L 7462985 5' - Doc 285 1 74.26 AAAAATATATGTACACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATGAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3R 30553612 5' + 412 7092 2 60.40 GTTACCTATTAGCAACCCCTATTTAGACAAAGTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAA:1 + chrX 9454825 5' - roo 9028 1 70.30 GCTGCTAATGGGCTAAAAACCAATTCTTTAACTAAATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3R 17971656 5' - 412 7506 2 64.36 TCCATCGAAGTGGCAGTCTTAACCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2R 19840244 5' - roo 355 2 75.25 AACTAAGATGTATCCAAAGAATGCTTCCATAATATTCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 + chr3L 5702032 5' - I-element 5318 1 60.40 GGGGGTGGGCGGGACCCAGTCGAACCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chr3R 7139251 5' + pogo 49 1 74.26 TTCAATAAAGTCGAGGAGGTCAGCAATGCTCTTCCGAAATACAAATATTGTTAAAACACTGCAGCTTCTCCCCAATCCAATTTACATTTCATTTTTAGTCT:1 - chrX 22577717 5' + 297 265 2 75.25 ATTTATCAGTACTTTAAACGAAATTCATTGTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 + chr2R 9699818 5' + Transpac 44 2 70.30 GAAACCAAAAAACGGAAGGGGATATGCTACATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 + chr2R 19102163 5' + opus 10 2 64.86 ACACCATTTAATATAATATNATTTTATGTTACGTTAAGCAACCAATTGAATTGCTTTACAACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 - chrX 11088301 5' + blood 14 2 64.36 GGAAAATCTATGCACAAAAAGGGGTAATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 - chrX 9775035 5' - 412 7494 2 76.24 ATCTACGTATGTGTGTCTGNCCAAATTGAATTTGATTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chr3R 26291602 5' + roo 8741 2 64.36 GCTGTCAACGGCGTTTCAGTCCCCGTATCTCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 9649227 5' + roo 46 2 72.28 AGAAGGAGTATTGGTGTTACATGGATTGTGGATTGATAACAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3L 7345419 5' + pogo 26 1 55.21 GATTGGCACTTTAAATTATCTATAGCAATGTGCACAGCAATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 - chr2R 9631784 5' + F-element 24 1 62.38 CAGCATTCATCGAGGGGTTTTCAAGAGGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTA:1 + chr3R 7783712 5' + rover 6956 2 75.25 GAAAATAAATATTTTCCGGTTTCAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr3R 9224389 5' - pogo 2051 1 80.20 ACACAGTTTTATAGAGTACTTAGATGCACTCGAAAAAATCATATTAAATGATTCACACCGAAAATGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:2 - chr3R 17971739 5' + 412 10 2 73.27 AAAACACTGGCAGAAAATANTGGTGTTCTCAAAGTTCATAAGTTTAGAAGGTATTCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chrX 8316390 5' + hobo 21 1 55.00 CCAAAACCATTGACGACCTTTGTCATAAATGTGTTGTGCTAAGGTAATTCCCTTACGCATATTTGACATGGAAAAGTAGGTAAATTTAAGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 8998990 5' + TART-C 11095 2 54.46 AACAAGGACAATAGGCACAGACACACACACACATAGTAATATGTGTAGTATAAGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGC:1 + chrX 9342315 5' + Burdock 20 2 47.52 ATAAAGTACTCTTTAATAATATTTTAAAAAAAATTAAAAAAATTAAAAA:1 - chr3R 4577717 5' + HB 317 1 69.39 AATTATAAACTCGTTGTTGGTAAAGTGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 + chr3L 12468228 5' + jockey 4723 1 70.30 TCCTGTGGCTTCTCCTCCTCTTTCTTGGCCTCTGTGGTTTATCGGGGTAAAGGTGTTAGTTTTGAACTAGCTTGAACGCAATACCAAAGACACTAGAATAA:1 + chr2R 22856490 5' - Tc3 315 1 66.34 AGTGGAGTGGGCGGAATTGTTTGTTGTTGCGGCTAATTCCTCCAGACCGCGGAGTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAG:1 + chr2L 23506305 5' - Max-element 8336 2 56.44 AGGAAGTGTCGATGTGTCTATATACAGCTTGAACCTCTTCAATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCAC:1 - chr2L 16161395 5' + Doc 4359 1 59.41 AAGAAACTTCATATGATATAACAAGCGAAAGTTAACAAATAAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTC:1 - chr2R 4470912 5' + F-element 201 2 63.37 TATGGTGTTAGGCAGCGAGNCAGATCCCACTTCTGATGGCGG:1 + chrY 472526 5' - micropia 471 1 92.86 CATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr3R 7869109 5' + 297 17 2 61.05 CCATAAAACTTTTCTTTTAATTAAAACATATTTTACATACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr3R 12063747 5' - 412 454 2 68.32 ATTTTGGTAAAAGTTGTCACATTTGATTTTTGGCAATTGTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTTGT:1 + chr2L 4858993 5' + gypsy2 193 2 61.39 GATATTCAAAATGAATTGAACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAACTAATTT:1 + chrX 11016993 5' - roo 9037 1 58.59 ATGTGCAAGCAAATACCAACACGGGTAATATGCAAACAAAGGTATATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATG:1 - chr2L 15567176 5' - 17.6 466 2 60.00 TTCGATGTTTCTCTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGGC:1 + chrX 13264688 5' - transib1 2137 6 83.33 CACTGCCGGTCAGAACTTCGCGCCTTTCCGGTGTGAACTTTATTCACCCCAAAAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTAT:1 + chr3L 23144438 5' + hopper 338 1 58.42 TCACTGCTGTGGCCTATTGTTTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:2 - chr3R 10434926 5' + 1360 55 1 79.21 AATTTAATTACTAAATATTTGAAATATTTTCACTTCTTTCTGTCTTTGTAGCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTC:1 + chr2R 7608391 5' - 297 6827 2 63.37 ACGCCGAGTAAGGTGAAAACTTTTGCAAACAATAAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr3R 17660536 5' - roo 9029 1 68.32 CGGGTAATATGCAAACAAAGGTATATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTT:1 - chr2L 15567155 5' - 17.6 7386 2 77.91 TCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGT:1 - chrX 22386761 5' + hobo 86 1 63.37 TTAATTGCCTGATCGACCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGG:1 - chr3R 15790126 5' + flea 4726 1 50.00 ACAGGGTGGACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAG:1 + chrX 22726183 5' - Helena 1285 1 59.41 AACGGGGGCATGGAGCACAGAAGCAAAATGAATCCTAAACGGAAATCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCAACGATAAAATAAAGGAAAAATAATCAAGA:1 - chr2R 15106392 5' - Circe 6962 1 60.40 TTCGCCATCAATGGTACAAGTGTGCCACAGCCTTTTCTTTTTTTTTCTGCCGGGTCGTGTGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAAGA:1 + chr2R 8335159 5' - R2-element 3361 1 68.09 TAGCAGACTTGCCTGCTAANGCTGCAGTTCATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 + chr2R 21962637 5' - 297 354 2 73.27 AAATGGAGCAGCCCAACACACATATTAGTATGTATTTGTGTTTATGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chr3L 14594187 5' + hobo 24 1 54.46 GGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAA:1 - chrX 983351 5' + Juan 3848 1 69.79 TGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCA:1 - chr2R 12185424 5' + accord 9 2 66.00 ATGCAATTACATTCTTAAAAACACTGGCAGAAAATAATGGTGTTCTCAAAGTTCATAAGTTTAGAAGGTATTCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chrX 8316407 5' + hobo 5 1 72.28 AATTTCAAAACTAGAGCTCAACTAAAAATATAGGGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 + chrX 7157279 5' - blood 374 2 53.45 TGCTTGCTATAGAAGGGCTCCAAAGGCTGGGTAGGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 + chr3L 3880992 5' - blood 7350 2 64.65 ACTTTCGCCAGCGCGCTGGNAGGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr2L 10166035 5' + jockey 60 1 74.26 GACGAGGTTTTACGACTCGCATTGCCAACATGCATCGGCATCTAGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2R 19840196 5' + roo 32 2 56.44 CACCGAAACAGACAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 4203458 5' - hopper 147 109 76.32 CTCAAATACGGGCTGATTTAATGAATATTTACACTAATTGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACC:1 + chr3L 19249648 5' + Transpac 2 2 77.23 CCTAATCTCATACCCTAATTTTCTGGGTAAAAACCTTTGTTGACTGCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chrX 10451534 5' - hobo 2909 1 53.47 ATTATAATAATCATTTCATAATCATATTTTATTCTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTC:1 - chrX 8727915 5' + X-element 47 1 63.37 AATATAAAGGGTTTTCGCANTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1 - chr3R 11052157 5' - blood 7345 2 72.28 ATGTCAGACAATTAAAAAAGCATACTGCACGGGGCACTCGAATAGGACTCAAGTATAAGAGTATAAATAATATGCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAA:2 + chrX 1706010 5' + Juan 4051 1 71.29 ATAATTTTCCACTCCGCATCTGATCGGCATTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1 - chr2R 12812316 5' - jockey 4961 1 68.24 CATAACTTAACTTCGACAACATCGACACTACTTTCTTATGCATTCCCACGCTAACCAAATGCCGCTATGTACATAATGTGCGCACATAGCATTCTCTCTCA:1 - chr3R 2575957 5' + gypsy11 4201 2 61.39 CCAGCTTGGCTCGCTTCCTTTTTGAGGGGAAGCCGGCCAAAAGGACATTAAGGAAATTACTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAA:1 - chr3L 13569818 5' - invader3 5444 2 59.41 ACAAGAATGGAGAATGGGAACTCCCCTGACATGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 8765512 5' - roo 405 1 75.25 ACACAAATAACGTTGTGAGACGTGTTTACCGGATGGCAGTTCGTTTAGCTCTAAAGCTACCGTCTCGTCGATCGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 - chrX 15024468 5' + P-element 3 2 77.23 TTTACAATAGCAAAGCAATCTTATGTTTGATGGCACAAACTATACAATCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1 - chr3R 27907695 5' + mdg3 30 2 55.45 AATGCTGGTTTTTTTTTTATGCTTGGAAAGATAATTCGGTCATTGTCCCACATCTCATATTTCAACCACATTTCTGGGTAAACACAAGCGCCCAAAATGCT:1 - chr2R 1727908 5' + HMS-Beagle2 6941 2 62.38 CCTAAAAGTATGCAACACAAGGACCATCACTTTCGCCAGCGCGCTGGCAGGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr2L 10166063 5' + jockey 31 1 54.46 AACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGT:1 + chr2L 14793491 5' + Stalker2 32 2 55.45 CTGCAGTCATTAAAAATTGGTTCGAAAATATTTAATCTCATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGAC:1 - chrX 7292732 5' - 3S18 302 2 61.39 GTGAAATTATCATTATTCAATTGTGTTTTTGGGTAAAGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr2L 7666110 5' + roo 38 2 63.37 AGCTAGCACTAAATGCGCTTGAATTATTTATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTGTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATC:1 + chr2L 17309010 5' + opus 339 2 71.43 TTAATTCATGATTGCCCAGGTGAAAGCCGATTTTCTCAGGCTCCTCATGTGTGCTTTTCATGGAAAGCTAAGGTTAATTGTGTCTTCGTTTATTTTTCTT:1 - chr3L 12999742 5' - invader3 5019 1 78.00 TATACCTTTGGATCCACATGTAGGGGGTTGTTTATGGTTGCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr3L 9330230 5' - P-element 2851 1 41.58 GCTCTTCGCCTCCATCTGCATACACACACAGATATATTTTATCCTTTTTTCAATATGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chrX 12231663 5' + hobo 20 1 60.40 AGCGTTCTATGCTATCCCATATAGTCCTCCCCAGTCGTCTCCGCCCAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chrX 9891481 5' + F-element 86 1 61.46 GACGCTCCAAATTCAAAAGAAAAAAATGTTGCATACTTTTT:1 + chrX 20352457 5' + Transib5 2808 1 82.93 AATGCCGGAACGGCAATTGTTGAAAGTAGTTAAGAAAGGCTTGAGGGACGGGCGCTATTTCGGAGTTTCGGTCCTTTAGCAATTATTTTCTA:1 + chr2R 4511935 5' + transib2 61 1 61.96 CACAAAAATGCACTACTAAAATCAGGTTGGGTTAAGAAATTATAGATTATATATATCATAAACTATCACCTAAATAAAATTTTATTTTCATATATTTTAAA:1 - chr2L 4937099 5' + Cr1a 89 1 54.46 ACATAACTTAATTAAATCCGTCACCTCTATCAGCAAGCCCTGCACCACTCAGCTTCCAACAAATGTTTGCTCGCTTTGAAGGCATGGTCGAAAGAATGATG:1 + chr3R 15830313 5' + G2 186 1 38.61 ACTCTCTGAATTTGGAATCTGGATTTTCAAGGACCTTTTACCAACCCTAGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr3L 18418931 5' + hobo 6 1 73.27 GCTTCTACGACGTCTACAAAGTGGAAACGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCCCTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGATCTGCGTAAGCGGTTTT:1 - chr2R 20987326 5' - Quasimodo 6954 2 70.30 ACAGTCGAACGATATATTGCCATTTGTCATCCGTTCAGGTAAGGGAACATTCATTCCTTCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAG:1 - chr3R 13331500 5' + transib2 15 1 63.37 CGGAAACGGCGCCAACTGACAGCCCAAGCCAACAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGACCCGAAAATCGTC:1 + chr3L 15873141 5' + 1360 3187 1 69.31 ATAAAAGTAAATATTATGGCTGACACGCATTCTGTAAACAAACTGAAATATAAAGAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:2 + chr2R 17644855 5' + mdg3 5275 2 52.48 GTTAATAAATTTCCCAGCGGTCTAATCACAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTC:1 + chr3R 24766609 5' + P-element 2849 1 30.69 AATGATCATTAAGGATTTGTGGGGGGATATTCAAAATGAATTGAACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chrX 11016950 5' - roo 9060 1 46.53 AACTATTGAGACAGACTGTAATTAATTTGTTTGTTGACTTGGCAACCAAACTAAGCTAAAGGAGCAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTA:1 - chr2L 20520125 5' + mdg3 5468 2 66.34 ATTCAGGCAAAATTTTAATTAAATTCCGCGTCATCAATCGATCCATGACACTGACGCAGACATTGAACACATGGGTTTTTGCAAAAATACTCGGGTGGTCT:1 - chr3L 20080018 5' + hobo 276 1 72.28 GATTGTATATAAATGACAATTAAACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:1 - chrX 734987 5' + Tabor 6862 2 56.44 CCGGACTTGGACCCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGT:1 + chr2L 12808156 5' - Tirant 371 2 55.45 AGAGAGGAAAAGGCACTCAAACGGCAGGGGAAAAGATTCCCAAAACGTGGGTCATATAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr3L 171161 5' + 1360 19 1 61.39 CATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:2 + chr2L 14793494 5' + Stalker2 35 2 58.42 TAGAGTATTTTGTGAAAGTATCTTAGTCACATTTAAATCTGAATTTTCAATAACGTCATCAATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAGCAC:1 + chr2R 4727602 5' + Cr1a 4286 1 56.44 AAGATACAAAATAGCCAAGGAGCCAATATACATACATATACATGTACATATACATCCACGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 + chr2R 15349480 5' - P-element 2869 1 62.00 ACCACGTAGAAGGCCAACTGCAGATCCCCAATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACG:1 + chrX 11308612 5' + 412 307 2 70.30 AAAATCTCACCGTCACCGGNGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTC:1 + chr2R 4830336 5' + 1360 50 1 92.86 GTATTATTTTCATTTGTCATAATGTAAATCAGAATGGTATGAGAGAAATCTACACTAGTTATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr3R 15579057 5' + pogo 12 1 67.33 AGTTGTCGAAATTACGGTAAACGAGTGGCGTGATATAGGCTGTGCGTGAGAGTGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAATAAACAACAC:1 - chr2R 3705693 5' - Cr1a 255 1 54.46 ATTAAAATAATTTGCTGGACAACGAGAAGGCAAGGAATTTAAATGAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCATTGCAGT:1 - chr3R 14580366 5' - blood 7359 2 52.00 AAAACCGAATCCAAAGCCCGCCAAACGAGCTATTGAGCCACAGCCCAAAAATAAGAGAATATTTCCCAATGAGAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTT:1 - chr3L 14622760 5' - hobo 2601 1 76.24 GACATTTATCAAAATGTTGNATACAAATTCATAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTT:1 - chr2L 14793547 5' - Stalker2 7606 2 67.33 AAATAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 + chr3R 19987405 5' + Doc 38 1 58.42 TAGTGCAGCCATGAGGTTTGTCTGTAAGGATTAAAGTTTGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGA:1 - chr3R 20094540 5' + Max-element 9 2 70.30 CTGGAGTGTAACGAATTTCCCACGCTATGATTATGTCGATTGGGCATTGTTGTTACTCTTATTGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr3R 7139328 5' - pogo 2091 1 69.31 CTCCCATTTCTGCGCTTGCGAATCAAATTGAGGCTACCAACTGTCGGTAATTTGCATATTTGAGCTGGAAATTGTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACT:1 - chr2L 15531893 5' + Stalker2 7248 1 79.00 AATCCGTGACCTTGGCAACACCCACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCT:1 - chr2R 12366235 5' + F-element 4244 1 78.22 CTCAAGCTCACTAGGATATTCTGCCATATTTACACTCTACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chrX 5219757 5' - hobo 2901 1 62.38 CATGGACCTTGAGTGGAGTTGAAGTTGGGGCCAAGAGTGGTGCTGTACAGGGGAGCCACTTCAGACTGTCTCTCACATTTTGTTATGATTATTGTTATGAT:1 - chr2R 18022154 5' - mdg1 7055 2 58.42 TGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr3R 14193918 5' + pogo 51 1 76.24 GGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3L 19349920 5' - 1360 3384 2 70.30 GCAACCGACGTCACAAATANTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGGGTTTCTT:1 + chr3R 19987391 5' + Doc 22 1 54.55 TGGAGGAGATCATGGTGATCCTGCAGAGCGGCCAGCTGTGAAAGTTGCTGCTGGTATGTGGACGTCTGTTGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAA:1 - chr2L 12241573 5' + F-element 4424 1 68.32 CCTTCTTCCTGCCATTATACAAATGTATCTCTGCGCGGATACAGATACGACAGACCGGACATACGAACTGAATTGCGTCGCAGATTCGAAGCCGCAGGTGA:1 + chrX 20709811 5' + R2-element 3143 1 58.42 TTAGTTTGGGTTTTTCTGATTTTAACTTAAACTCATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATC:2 + chrX 4166391 5' + I-element 5333 1 66.34 CGGTAATAAAACACTTTAAGATTGGTTGGGTTTGTTTCTGTTTTTTATTATACCCATTACTCGTAGAGTAAAAGGGCAGACTAGATTCGTTGAAAGGTATG:1 + chrX 16541436 5' + INE-1 11 1 86.14 TAGAACAAATCCGTTTAGGGCTTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2L 21086020 5' - roo 391 2 59.57 TCCTCCCTTGAGAGCTCGAATGAAACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCT:1 - chr2R 4339531 5' - G5A 2806 1 76.24 TCTGTTTCATATCTCTGGGTCATTTCCTTAAGTTTTAATCTATTCGTACAAAGAGTACGAATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTA:1 + chrX 983296 5' - Juan 4202 1 60.40 TATGGAATGAATAAAAAGGTTCCTTATTACGTAATTAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:2 + chr3L 6033533 5' + 412 7092 2 64.36 ACCCCGAAATAAGTTTTAATTACGGGCATATGATGGTGCCCGATAATAATAATAATAATAATAACGGCGAGCGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAG:1 + chr3L 17186774 5' - Tirant 401 1 80.21 CTTCGGTCACATAGTTGAACTAAGCCAATATCTTTTAAACATGAAAGAACTGTACTCCCCTTACGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCA:1 - chr2L 22997192 5' + G2 3021 1 55.45 TGCCTGCCCTTTCACCCGCGTTTTATCTATCCAGATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chr2L 20612019 5' + 297 6609 2 66.34 AATTATGCACATGAATTTTTTAGTTTTAATTTGTCTTTAGTCCGCGAGCTTGCCCAGTACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTA:1 - chr2L 14067726 5' + 3S18 168 2 62.38 GTCACTCTTAAAAAGCATAAGAGCTCCTCATCCCAAGCTTTATCACCTGTAATTAGTCACTCTTAATCAGTTGCCCTCATGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 - chr2R 10957000 5' - copia 255 1 78.22 AATTATTTTTTTTTAAATATACTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3L 5060752 5' - roo 350 2 86.14 GGACATTCCCTGACCTCAGAAGCGTCTGTTGTTTTTCTTCATAATTGCCGCCGTCTTGGTGGATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACAAGCGGTTTCCT:1 + chr3L 8099066 5' - mdg1 488 1 69.31 GAAGAGGCTGTCCCAATTCCGCATCGTTACCGTTCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr2R 5374158 5' - 1360 3368 1 62.50 ATTGCGTTTTCATTTAAATGGCGTGCGGGAAAAGTTTTTCTGATTTAGTGAGCGCTTTGAAGCAAGCGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 + chr3L 8252168 5' + copia 11 2 68.32 TATAGTAGTATATGACAATAGAAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTT:1 - 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chr2R 15788674 5' - Transpac 309 2 77.78 AAGTAAATCATTTTGATTTNAGAGATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAA:1 - chr3R 10914157 5' + F-element 125 1 75.25 TTTGATAAAAACAAAATCGNAAATAAATAAACCCAAATAACGAATATAAATCAATGTCGAGGCTCACAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATAC:1 + chr3R 24085282 5' - invader3 5462 2 74.19 AAGAGAAAGCCTAGGACAGGGGCATGTGTATATAGTGACATATTCACATATAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCAGCATACGTAAACA:1 + chr2L 15567116 5' + 17.6 47 1 69.31 CGGTTGTCTTTTGCCTGCCACTCGTATTTGTTTGTCCTCCTGCACACAATTTGTTTCCCTTTCATTGATTCCCTCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTA:1 - chr3R 9273828 5' - roo 94 2 71.29 TTCACTTAGCTTGACGTTTTGAAATCTCTTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGCTGACACGGTGATATGATTGATC:1 + chr2R 1983321 5' - Q-element 188 2 71.29 ATGCGCATACGCAGCGTTGTACGTTGTACATTGCTGGTAAAAACGCGGCCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chrX 11025600 5' + hopper 4 2 75.25 AGGAATAAGGACCACTTCTAAAGAAAGATCCTTTTACCAATCAGTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTA:1 - 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chr2R 24842408 5' - gypsy7 5011 1 57.83 GAACTTGAACTTAATATAAAGGGTTTTCGCATTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 - chr3R 11052169 5' - blood 7357 2 60.40 AATCACTTCTAATTGTTAATTGTTTACTTGACTGTACGCAAATTTTTGTTTAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 15800885 5' - roo 9049 2 56.44 TCTTTGTTAAAACATTTTTGTTTATTTCAGCGGCGCGGTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chr3R 16241238 5' + Tirant 43 2 65.35 TGCCGCCATATTGGAGTTCNGTTGCTTTTCAAAAAACGGAAGCGGTTAGTGCATTTCGGTGCCAGCAGCTTAAGACCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr3R 20696560 5' + jockey 10 1 74.26 CTTGATGACAACTTCATACCCAACTCAGAAAAACTATGTTGAAATCTTTTTAACATGCATCACCATCTGATTAAAAATATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCG:1 + chr3L 20454501 5' + invader4 2758 1 80.20 TTCGCAGAAAAGCGTTCACCTTTAGCCCGTTTCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTTGCATGGTGCCAATTGATCAA:1 - chr3R 9301205 5' - 1360 267 1 68.32 GGGTGGTTCGGGTTAAAGAACGTATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr2L 9260343 5' + 297 49 2 78.22 CTTGGCTCGCTTCCTTTTTGAGGGGAAGCCGGCCAAAAGGACATTAAGGAAATTACTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAAT:1 - chr3L 13569814 5' - invader3 5442 2 56.57 ATTTAACAAATTGTTGACATATTGAATAAATTTAATTTAATTTTCTACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCA:1 + chr3R 11839836 5' + Doc 4548 1 54.00 TTTTTTTCGAAACTGGCTCTGGAGGAGCGGCTTTTGTTATCGAATGCAAAACTATTTAGCCATTGCTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 - chr3L 12438092 5' + I-element 13 1 65.35 CAAAGGCCATATAATGGCATTATGTTCTTACAGTATGCAATTCAGCGTACACCCAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGCTGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTC:1 + chr2L 22228216 5' + Bica 47 1 55.45 ATTGTATGTATAAAAGCCATACAAAGCGCGCTCAAAGTTCAGTTATACGCCATATTTTATGAACAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 + chr3R 27928892 5' - mdg1 410 2 63.37 CTTGTACTACATAAAAAACTCTCTAAGTGTACTTTTCTTACCCCCTATGAGCATGAATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:2 + chr3R 13353191 5' - 1360 3369 1 59.41 ATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr2L 20560350 5' + F-element 59 1 67.33 CAATTACCATGCCAAATATTCTCGATTGTCTATTAATAGGCGTGTTATATTGCACTCCCTCCTACTCGAAATTGTTTATCTTTTTTTTTTGAAAATTTTCA:1 - chr3L 7611917 5' - TART-A 13401 1 82.18 ATATATTATAGGTTTAAGAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2L 8577254 5' - roo 395 1 65.35 AATAAAATCTATATCGTGCCACCTCCAATTCACACAGGTCGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 - chr2R 9693370 5' + P-element 36 1 41.58 TCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 23456282 5' - 1360 3385 2 71.29 GCAACTGCCGCAAAGTCTGTGTTAGCCGGAATCGATCCGAAGAAACAATCCATTTTGATAGTACACTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGC:1 + chr3R 29193151 5' + Tc1-2 17 1 63.37 CTCCATACTATGTGAAGTAGACCCCATTTCGGATGTACATATTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAG:1 + chr2R 14091846 5' + F-element 310 1 61.39 TTTCTTCTCCCGCTTTTCACGGCACCACCTCCCCCACTTTTAAGCAATTTTTAATTTTTTTCTCACTTTATTCCCCGATATCTATCGATATTCCAGAAAAA:1 + chr2R 15479420 5' + INE-1 500 1 70.30 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTGTGTGTATCTGTGTGTGTAG:1 + chrX 12649914 5' - 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chr3L 13234895 5' + Tc3 86 3 70.00 ATTTACCAACTCCCCCCGACCCGAGCACAACAACTTTGAATTCGCGCATGCTAATTATGCTGACTCTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGG:1 - chr2R 24063466 5' - Tabor 137 2 58.59 ATTGCCATTTATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr2R 11941072 5' + 297 6608 2 60.40 AAGTGTGTCGATCGTAAATGATAGTGAAAGATTACAATTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2L 21086116 5' + roo 8673 2 69.39 CTAATTTATGCAGAAATACAAAAATATATTTAATATGTGCCGGAGCCTAATCACCTTGCTCCAATCCGGCCATTTCCCATTACGGCCTTCTCTTAGGACTG:1 - chr3R 12868033 5' - accord2 245 1 54.46 AATATAAAGGGGAATATCAAAACTTCGTGCATAACACAAACAATTCAAATCCAAGCACTACTCCAATACCCTGTGTCCCTCACCTTGGGTTTCCACGGCCG:1 - chr3R 3388143 5' - Osvaldo 1282 1 74.26 ATCTGAAAAGTATGCAGCAGACAAAAGCGGAACTAATAGTGCGTCTGCAGGCCATTTCCCCAGAAACGCGTGGCGATTCACCGCCAAATAACGGATCAGC:1 - chr3L 15879776 5' + invader3 463 1 80.00 AGGGGTGGAGTGAAAAAGATTTGATTTATATACACGGACTTGGCATTAATTTTTGCTGGAATTATTTTAATTTGTGTATTGAAATCGATATTTTTGTTTTT:1 - 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Tabor 431 2 76.24 CGTGTGAAATTATCATTATTCAATTGTGTTTTTGGGTAAAGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 7666107 5' + roo 35 2 60.40 TAGTTTAATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAATTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr3L 7099648 5' - roo 9036 1 61.39 GAATAAAAAGGTTCCTTATTACGTAATTAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3L 6033541 5' + 412 7100 2 72.28 CGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCT:3 - chr3L 25232908 5' + GATE 35 2 50.50 TGTTTTGATCGTGCATTGTTTTGAGTATGTATGTCATTAATAAAAAACAAGAGAGAATGCTATGCCCGACTATCAAATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAA:1 + chrX 22855440 5' - INE-1 537 1 69.31 CATTATCCATATAATTTTGTATAGTATGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 3209227 5' - roo 9025 2 71.29 GTTTGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTC:1 + chr3L 16282370 5' + gypsy5 6979 2 61.39 GGGCGTGACGCACAATCGCTACTCTCCAAACCGAAATGTATCTATCTATCTATAAGCACATGTGTATCTATATATGTATCTGTCGGAGCGCGACTCTTCGC:1 + chr3R 10391144 5' + invader4 2759 1 80.20 TGTATTGTTTTTAGGGGTGGTTTAGTCCTGGTCAAGTTTTCGTGTTGGACGAATATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAAT:1 + chr4 1248289 5' - mdg3 5033 1 58.42 CCCTATCAGACAGTTGGGATCTCTAGCCCCCAAGTTCCATCCGTCCCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAA:1 + chr3L 6906599 5' + I-element 204 1 54.46 ATATCGTCGTCCCTGGGATTTTGTTGTATGACATACTATAAAAGTCAACTTGAATGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCAC:1 - chr2L 12239695 5' - F-element 4380 1 55.45 GTTGTAATGAGCTCTTCGCATTTCCGCAGGCAAATGCGAATTCTTCAGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAC:1 - chr2L 19642386 5' + Quasimodo 21 2 57.43 GCGGAATGGATTTTGGGCANAGCAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAGAAAGATAAAAAAAGATTTTAAGTTAAAAAAAAAAGAAAAAAAA:1 - chrX 10836216 5' - hopper 152 7 88.51 TGATGTTAAAGCGATTACATATAGTGCGTATGTGAGATATACATTGGTGCCGATTTTATGTAACTCGCAAGATAAACCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATA:1 + chr3L 4133676 5' - Cr1a 117 1 75.25 AAGCGGCTTGTGGCTGTGGTTTCGAATTCAAATGGATTGTAAGTTGTTGCACAGGAATAATCACCTGGTCAATCTTCTTCCTTAGTGGCTCAAAATCTCGG:1 + chr2L 16812955 5' + G3 385 1 69.31 CTGGCCAACTTCCGCCTTCTCTTTGGAGGCGGGACAACTTCAGCTTTCGTTCAGTTAGTCTATGCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 13773865 5' - roo 398 1 68.32 CTGATAGCGCTGGAGTTCAATGGCCAGCATCTAGTCAAGAGTCATTCGAGCAACGGGCTGTCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCT:1 + chr3R 19477602 5' - F-element 407 1 56.44 ATTTTATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCT:1 + chr2R 16160756 5' + mdg3 32 2 56.44 CACTGCCTTATGGGCTGTCATTTATTTGACCCGACTCACTCACACATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATC:1 + chr2R 21433137 5' + HMS-Beagle2 6909 2 53.47 TTTACAAAATCCTTTCACTTCGTTTTCTGATGTTCTTCCAATTATGGCATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr2L 5926922 5' - pogo 2076 1 52.48 GCACAAATCGTGTGCAGTCTCGGAAAAGCAATGAAAATTGGAATGAAAATAGGAATAAATGTGTTTGGGCTTCAACTTTCATAAACATAAACATAAACATA:1 + chrX 13798787 5' - 412 75 2 80.20 CGGTCCAAAATCAACCAGGNCGAACCAAAAGCAACCCGACTCTTTGAGTGGACATGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGGTGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 6850426 5' - roo 389 2 58.42 GCTGAATAAATGCGATAGTAATTGGCTTTGGCAATTTATTAATTAACTATTAATGGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chrX 21060385 5' + 412 17 2 60.42 CATATACAATTTTAAGGTTAATAAGTCCCGAGGGACCTTTGTTCCAAACACAACTTTTGGCTGAGTGCATCGGAGCCAAGTCTATTAAATCAACTTCAAAA:1 - chr3R 18504458 5' + Stalker3T 324 1 70.30 ATCCTCGCGGATCCGACAACATGGCCATGAAGTCCTCAAAGCCGTCAGGTACGTAGATCTTTAGCTCGATCTATAAATAGGAAACACACTTGAGGCTTACG:1 - chrX 4359813 5' - Burdock 6171 2 67.33 AGATGCCTCTGGCCCGGCCAATCAATCCGATTTCTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACACTTTGTTTTTAAACCACAA:1 + chrX 21231022 5' - transib2 2754 1 69.31 TGCGCATACGCAGCGTTGTACGTTGTACATTGCTGGTAAAAACGCGGCCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 - chrX 11025599 5' + hopper 5 2 74.26 TACTGCACTGCAGAATAAGATCAGATAATCTTTAAAGATTTATTTAACATAATATAATAACAATTCAATTATCAATCAGTTTATTAATTTTAAAGTTTTTT:1 + chr3L 15708599 5' - 1360 3021 1 90.10 CGTAGGCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACAACATAGGAACA:1 + chr2L 4134841 5' + Quasimodo 52 2 70.30 CTAGAGTTAAGCTGAAATAGGTTGGCTTATGTTTCAAATCTTTCTAATAAATCGTAAATCTAAATTATCAATATCCAATAAGATCATAATTTTTAAAACAA:1 + chr3L 15125889 5' + Juan 3774 1 58.42 TAATAAACTAAATAATTACAGATGGTCTCTCGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGC:1 - chr3L 27396714 5' - invader4 3061 2 78.22 AAAATAAATGGAAATAAAACTGTGTATATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 + chrX 3356258 5' - hobo 2890 1 78.22 GAAATCGAGGGTTTTTTTTACCGCCGTCATTATTGAAAAAGTGCGAGGGGACAAGTGGCATAAGCCGGTAGCAGGGTCGTAGCTCCGACTTGATATTCACG:1 + chr2R 12765450 5' - Chouto 183 1 60.40 CGGATGTTGATGCATCCAATTAGGCGGGCAATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGT:1 - chrX 19034181 5' - hopper2 1562 1 70.30 TGGAGCTCTCGGATAAATGCAGATCACTTTGACGAATGTGACGGGATGGACGATGGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGT:1 - chr3L 15529170 5' + accord2 7401 1 78.48 TATGATTGTTTCGTTTAGAATGCGTACTCCACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:2 + chr3R 3255983 5' - roo 9027 1 70.30 GCGCGCAAATAAATGGAATAAATCATATAAAAAATTCGAAAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGC:1 + chr3L 15283162 5' - 1360 31 1 72.28 AAATTGCATCAACTTAAATGGGAAACGTGTCTACCCCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chr3L 18418847 5' - hobo 2899 1 62.38 AATGTCAAAACAATTTGCAAACGTGTGGGCGTTGCAGTTTTGTGTGAGCTGTGAAGCTGTGAGCTGTAAGCTTAATCTCAACCCTCTAGCTTTTATAGTTC:1 - chr3L 16803165 5' - INE-1 158 1 47.52 GCCAAGGGTGGGCAATGGCGGCAGAAGGGGCTAAAAAACACATCTCGAACGCGCATAGTCGCAGAATAAACCACAATAATTAAAATTGTTGTCTGTTAATT:1 + chr3R 18508243 5' + gypsy4 6831 2 61.39 GCGAGAGTACTTCCACTGCCACTTCGTGCGGCTGTCACTTGAGCGTCAATTAAGCGTAATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCA:1 + chr3R 27781838 5' - Ivk 4988 1 61.39 CACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCT:1 + chr3R 11151845 5' - mdg3 191 2 78.22 ATTTAATTGCTTAAATATAAACTAAGCATTATTAACATTTTCGAAAAACATATACATGCATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 - chr2R 9699897 5' - Transpac 299 2 66.34 GAAATGTATAAACCAATTANAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 - chr3L 3540209 5' + mdg3 5279 2 51.49 GTCTAGTGAAACTTTATTAGGCCGGCTTCATTAACTTGCTAGTTGGGGTTTGGCTTTCGGTATTTTCGATGTGAGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGT:1 - chr2R 25088366 5' - INE-1 576 1 71.29 TTTGGGTTTCCCTTGCTTTGTCTCCGCATTCCTCCGACTTTGCACATTCGACGATTTTTGTTGCGCCCAGCTCGCCATAGATAACAAAATCCTAAATATAA:1 + chr3R 8585163 5' - roo 87 2 76.24 ATTTAGGGTAAAAGAATTCGTGTTGCCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTACTGCTTCTTTCGCAATGCTGCTTTTTAAGGTTTTTTTTTTTCTT:1 + chrX 4081073 5' + Tc1 1468 1 69.07 AATTTAAAGTTTCTCCTCTACTTCCCTTTCATCTCGTTCTTTTCTATTGCTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACT:1 - chr2R 18733785 5' + copia 26 2 54.46 ATAATCACCTAATGTACATATTGCCCATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 - chr3L 11829086 5' - Transpac 264 2 77.23 GAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTGGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCT:1 - chrX 23108323 5' + BS3 1425 1 50.50 GTAAGGGGAAAGCGGGATCCTGTGGCAACCGAAGCAGAATTTTGTCTGCTGACGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 - chr2L 12882814 5' - hopper 1392 1 54.46 GTTTTAAAAGTGTAGTTTTTTTTTTTAAATATTTAAA:1 + chr3L 13215166 5' - TART-B 10626 2 78.38 CATTGTTTTAAAAATGTGATTTTTCCATTTTGAAATAAATTAATTGAATTAATTATTTATAAATTAATGTAAAGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGA:1 - chr3L 15925594 5' + Circe 7165 1 71.29 CAAGTCCTCCAAAAATACGGGGCAAAGTTTAATTTGAATTCGAATT:1 + chr2R 17999804 5' - Rt1a 310 1 91.30 GACATTGGGCGTGTGTGGGGAAACAACAAAAGTCAACTACGGAGAATAAAAAATCCTAGAGCACTTGTATCCAAGAGCGAATTCACTTGAAT:1 + chr3R 26104398 5' + Idefix 338 2 54.35 GGGCAAAGTCGCTCCACCCATTGGGTAACATGCAAGTTGACAGTTTGTCTTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGGTTTCTTACG:1 + chr2L 16018436 5' + 1360 3275 1 56.44 AATTATAATTGTTGCCTCTAAAAGTGCATATTGTAAAATTCTCACATGAAAAAAGCACCATTCTGGTATAAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr3L 19647218 5' - pogo 2098 1 76.24 GAGCCTATTGTCCTAAAAGCATGCAACACAAGGACCATCACTTTCGCCAGCGCGCTGGCAGGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2L 10166074 5' + jockey 18 1 64.65 GCTGATGCTGAGTCCCAGTTGGTTGCGATTGGGGCTGCTGGTTGATCCGCGCAGGTGCTGCAGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGAT:1 - chr2R 14511148 5' - F-element 4388 1 65.31 AATAACCCAATTTCAACCAATAATAGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 8582562 5' + roo 8714 2 78.00 TGGACGCAAAATACATGTTCTATATACTTTGTCTGCGATATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr2L 5419795 5' + 297 6606 2 66.34 CAAACTAGCATAAAACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chr3R 7869093 5' + 297 6588 2 73.27 GTCAGTCAATGGCCCGCAGAGAAAACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr3R 11608031 5' - 1360 3369 1 59.41 GTGCCAAAGATGATGCTGCATCATCGGGCGATGGATGAACGGCGTGGGGCAGGGGGGCCAGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAG:1 + chrX 2760383 5' + R1A1-element 42 1 63.37 TTATAAAAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 9278406 5' - roo 394 1 63.83 AGGAAAAACACATACGTTCCTGATATTTTCAATAGACGACCATAAACTATAGTCTTTTCGTGACTGATAAGGTCTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGAT:1 + chr3R 24541994 5' + 1360 2 2 77.23 TATTTTATACGGAACTGTACACTTCAGGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3R 5506854 5' + pogo 26 1 53.47 ATTCCGACCAAGCCAACGATAACGACAGTAACAGTGGGCTAAAACTGGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:2 + chrX 21229273 5' + transib2 26 1 51.49 CAAACAGCTGCCTGCATCCTTCGGCGACATTCGAAGAAATGAAAAATAAGCTGCAACGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCCTTGTAAATTTGACAAA:1 + chr3L 10074560 5' + 1360 197 1 62.00 AAAGTTGAACTAGAAATAGGCGACTCGATACAGCTTTTCTCAGCTAGATCCTCGTGGTGGTCTTCGCAAGCGTCAGCTTCAGCTAAGAAGGCAGGCTTGAG:1 - chr3L 20308844 5' - Chimpo 4097 1 56.44 TGCACTAAAGATGCGATTACAAATAAAAGTTTGAAAGCGTGAAGACTCATCTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACACATTGGCCTCATATGGTCGCTTG:1 - chr2L 22228186 5' - Bica 4838 1 55.45 AACTTTTGCGTTCCTGTTGTTGTTTTTTGTTGCGCATATATTTTTTGGTACTGCTCTTTGGCAGACATTTTTAACAGAATCACAAAGTTGACTAAAAGATT:1 + chr3L 15439654 5' - transib3 206 1 71.29 GAAAGTTCTATATATTATTTTCTTATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCC:1 - chr3L 13001051 5' + invader3 5240 2 77.23 CAAGGCAACCAAGCTCCTTATTGGCTTCTGTGCAAAATAGTTTGTGATGGTAAAATACAGTAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:1 - chr2L 12866969 5' + mdg1 7049 2 65.26 AAAAAATGTTGAATAGTCGTATAGATATAGCTGATATGACAAGAAGATAATGAGGTATGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAAT:1 + chr2R 5329558 5' + Bica 121 1 62.38 GAAAAAAAAACAAATTGATATACGCACCATTACTAAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGT:1 - chr3L 12694359 5' + Idefix 164 2 65.00 GCCTCAAGTTGTCGAGCTAAGAGTGCACTTGAGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2R 9649164 5' - roo 9047 1 54.46 ATGCTCATTTAACGACCTATGTTAAATAAAATCAGGCGAAATTTATTATGATGATGTTGTGTGTGCATAAAGCCAAGTAAGAAAAACAATAATAATAATAA:1 - chr3R 14772412 5' + mdg1 7067 3 68.32 TTCCTGTGTTCCTCATAACNTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr3R 20905388 5' + pogo 26 1 53.47 CGCGATTACGCCGGCCTAAAATACTTAATTTATACAATACATGAGTCATTGGGAGTTTTTGATAAAACACGACATATAATGCAGTGTAAGCATTATGCCGG:1 + chr2R 963303 5' + gypsy2 6548 2 79.21 AAAAAAAATGATAAATCGATACAGTATCAAAAATAATGAATTACAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGG:1 - chrX 3642127 5' + G2 3052 1 55.21 TTCTTAATTTCGTTAGTCCTTGTGTGAGCGGCTGCCAAAGTGCAAACAAGCCTGGAGATCCCCAGATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCG:1 + chr2R 8311275 5' + opus 8 2 71.29 GATGCCTCTTGTGTTGACTGTTGCTCATTGTGCTGCAAATGGGGGTGGCAGGTGGAGAACACCTCTTGGGGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:2 - chr3R 23338362 5' - roo 402 1 70.30 AGTCTAATGAAATAATTTGNGTACCCAAACTGGCAGGCAGCTGGGAAAATGCGAGCAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr2R 7838956 5' + pogo 17 1 61.39 ATTTATTTATTGGTTATTTCGTAGTACGTGAGTCGAATTTAAATTTCTTTGCCAAACACCTACATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCC:2 + chr3L 11828982 5' + Transpac 3 2 39.60 AGCAGAAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGAAGCAGCAACAGCAGTAGCAACAGCAGCAACAACAGCTGTCATTATAACGGTGCACTGTTAAATTAACTTTT:1 - chr2R 13181446 5' + hopper2 1488 1 65.35 CTTCCTCTTGGCTCTGCACNCTTGTTTCATTTATTTCTTCAATGTGCAAACTCAAACATTATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr2L 14262784 5' + pogo 13 1 63.37 GCTCGATTTTTGTCACTGCCATTACTTTTCTCTTTAAGTTTTTCATATTCATTTGGCCTTTGAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTG:1 + chr2L 23067909 5' - mdg3 67 2 66.34 GTTTGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGCAAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTA:1 - chr3R 20094505 5' + Max-element 8272 2 63.83 TCCTTTCACTTCGTTTTCTGATGTTCTTCCAATTATGGCATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 + chr2L 5926931 5' - pogo 2067 1 59.41 TATTTCGCACACACAAGGTCAATTAAATTTGCCCTTCACACATTATTAAGATTTTCCATCAGACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3L 9928623 5' + roo 12 2 67.33 AGATTCAGATTGAGATTCATAAGGTGTTATATGTACGTATGTAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAA:1 - chrX 9205572 5' + diver 35 2 58.42 CTGCTTCTTAAATATGCAGCCTTTTTTTTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTG:1 + chr2L 15220216 5' + invader4 2802 2 72.28 CTTTGGCTATTCTGTATTTNAATGGCGAGCGAGGTGGATTTTACTGGGTTACTTGGGCATGAGCGCCAGCGTTTGTGTGTGTGTTTTTTTTTTAAATATTT:1 + chrX 2510679 5' - TART-B 10508 2 75.25 AAATGATCTACGATTTTATTTTTTTTTAGGTTTTTCGTTCATTGCGAAAAACTAACGCCATGATGGTACTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr2L 20128937 5' + hobo 7 1 66.34 AAGAACATCGCTTTCAAAGCAGCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGAG:1 - chrX 16671104 5' - P-element 2837 1 26.80 ATTATTCTAGTGTCTTTGGNTCGGCGGTGTATGTCCGACGCTTCTCATTTGGAGTATCGCGCTGCGTCGCAAGGAATGCTGAGTCGGCTTGCC:1 + chr4 158200 5' + gypsy 153 2 64.52 AAAATTTAAAAATAAAATAAAAGTGATTTAAATCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3R 12944732 5' + roo 44 2 73.27 AATTAATTTGATTTTATTGTTTACAGCGCTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chrX 16671076 5' + P-element 47 1 32.00 AAAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 9278401 5' - roo 9045 1 59.41 CTTTTTGTGCTTTTTCCTCCTTTTTTAATTCAACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr2L 12958886 5' - roo 403 1 73.27 CGACGTCACAAATAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr3R 19987396 5' + Doc 29 1 49.50 TGAAAAAGTATAGAAACATGATTGTGAAATCCTGCGGGTGCCATTGAATTCAATTTACCACTTAGGCTAAGCACTATATATATAAAACAGAGAACAGAAAC:1 + chr2R 23853076 5' - 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chr2L 2484454 5' - G3 4509 1 66.34 AAAAAAAAAATTTTAAAATTTAAAAAA:1 - chr2R 3175955 5' + 1360 3038 1 92.59 TATTTATTTATATATATATATATATATCAGCACATGTTCTCCATATACACACACACACACACATA:1 + chr2L 4037126 5' + accord 7028 4 80.00 CATTGTCAGTTGCATTTTGNTAGTACGAAGTGACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCGGCGGC:1 - chr3L 27391129 5' - invader4 2851 2 62.38 AACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGAT:1 + chr3R 11151832 5' - mdg3 5456 2 65.35 TCCTGGACTGAGCTATAAATGCCAACGCAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3L 13773939 5' + roo 8712 2 74.26 ATGTGCACAATTTTTTATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 10087809 5' - roo 9053 2 60.40 GGGCTAAAAGTTCTGGGAAAAAGAGAATAACAAATAATTTCCTATGGCCTATCAACTCAATCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3L 12112419 5' - 1360 3375 1 65.35 CAATGTGTTTCGCGTGGCCTCCACGCACAGCATCAACAGCGAGAATCCGTACAACAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGG:1 + chrX 21094008 5' + invader2 4988 2 58.00 AGTACGGGGGCGTATCGAAAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2L 10625660 5' - 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hobo 2935 1 76.24 CCACCGTGACACTTGTTACGCGATGGGCTACGTGTTAAACGCATTTCCGCCACTTGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chrX 9413879 5' - 412 7525 2 56.57 CCTTATTATATTTAAATACCTTTGTTACATATCATTTTAAAAAATCAACTAAGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chr3R 5348649 5' - copia 233 1 58.42 GAAGACCGCCCACTTTTGGCCAGTATGTGCGCAATTAATGTAAAATATTTTACACTTCAGTGTAATGTTGTTCAATTGTATTAGAAAAGATTATTATATCA:1 + chr2R 17917341 5' - TLD2_LTR 51 1 61.39 TCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 - chr2L 12808212 5' + Tirant 8159 2 74.26 TTTAGTTTGCGATAGGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAGTAAGTGCGA:1 - chr2L 16680065 5' - P-element 2836 1 26.32 ATTTTTACATCACTTCTGTNTGCCTTTCTCCCAGAGCCACAGCTCCGCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 12199830 5' + jockey 36 1 50.50 GCGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr3R 18399229 5' + P-element 53 1 27.72 GAAGCATTGAACTGTCTTTTTATGGCTGGGAAAATAGTTTTGGTTTTTTTTGTTTTTTTTCAACCTGCAAAAACGGGTTGAAAACAAAAATCTTTTTTTTT:1 - 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chr3L 26022549 5' + Circe 7198 1 60.40 TCAAAATCACTTGGCTCTTAACGAATTTCTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chr3R 12321416 5' + jockey 4718 1 70.30 AAAAGAAAAAACATTTTCTATTTTTCCCATATCATTACCTATGACTACTTTCCTTAAGATCATGGGTCTTAAGGAGCCTTTGGTGCCCTATGTCCAGAGAA:1 + chrX 22824287 5' - Gypsy12A_LTR 1898 1 63.37 TTTACAAAAATTATGCCACAGCAAGAAGCAATACAAATTTGGTTCAGTTATAATTTCATCCCAAACGCCTTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1 + chr3L 14409362 5' + jockey 4745 1 41.58 TAAAGAATTAAATAGATCTCCTATATTTGTTTCCAGTGTCATGATGCGAAATTGACTTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTT:1 - chr3R 22869465 5' + Bari1 18 1 60.40 TACCAAAAAAAACATCGCAGCAATCGAATAGTCTTGAAGGGATAATAATTAATTTTTCACAGTAACATCAAAAATAATTATTAATAATATTAATAATTATT:1 + chr3R 24679680 5' + mdg1 7081 2 68.32 AAGGGCTTTGAAAATGTATNTCTGCGACGACAAGTTCTTAGCGCAGACTTTTCGCCCCAGCAAAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 + chr3L 9910330 5' - 297 6968 2 71.29 TTAAAGATTAGGTAGAAGATTTCATTAAATGGCCTTTTAAGCATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCA:1 + chr3L 16563222 5' - 3S18 6070 2 58.42 GGACGTAGACCCAGACGGCGACATGATCAGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATG:1 + chr3R 4348939 5' - roo 8781 2 71.29 GCTTTATTTTCACGCGCATNTGGCACAGTCACACACACACACACACACACACACGCACGAAAGAGAGAGTAAACAAAACACAAAGACAAAAAATGCAAAAG:1 + chrX 6496807 5' - Cr1a 188 1 58.42 GTTATTCCAGCTTGGCTCGCTTCCTTTTTGAGGGGAAGCCGGCCAAAAGGACATTAAGGAAATTACTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTC:1 - chr3L 13569824 5' - invader3 264 2 65.35 ACCATCCCTTCCTGACTGCGTTACATTCCTGTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCCAACTTTAAATGCAAT:1 + chr3R 29045194 5' - flea 392 1 69.31 ATCGCTGGGAATCGCAGTCTTGCAAGAATGTGGGCGTGGCAACAAACTTGCCATGCGTCTATGTCTCTGGAAAAATCTCAACATTCTTGCTTTTATAGTTC:1 - chrX 21181671 5' - INE-1 158 1 68.32 TATCTAAGCACACTTGCCGAACAGGAAGTAAATCGGCAGAAATCAAGCCCAGCGTCTGCATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACA:1 + chr2R 4500846 5' + springer 14 2 65.35 GGCTCTGCGTTTTGGTTTAGGTTAGTGTTGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGC:1 - chr2R 4580043 5' - Chouto 458 2 71.29 ATGCAAACACTCATGAAGTGCACGTGGCCATTGCACTATGGTGCATTTGGCTTGTTTTTTT:1 + chrX 21009353 5' + hopper 7 2 55.74 ACAACAAACTTAAACTTTTGTTTATTTCGTACACTAATAAAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGA:3 - chr3R 7513976 5' - diver 6076 2 65.35 TGATACAAATACATATAAGTTATACTTGGAGGCGCCAATTGCTGTGTGGTGCGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGATTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGT:1 - chr2L 21902105 5' + Cr1a 4089 1 60.40 CTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chr3R 19505556 5' + mdg3 5302 2 73.27 CAGTAGAGTTGTCTCGCTCTAGAGTTGTCTCCTCTCAATCTTCTCTTGGTAAATGGGTTCGGTATCGCATTTCTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTGC:1 + chrX 13518040 5' - gypsy7 5005 2 54.64 GTTTAGCAACTGTCTCGTCNTGCAACAAACCCGAGATCTCACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCA:1 - chr3R 10391273 5' - invader4 321 2 71.29 TACAAATTNCTTCAATCTGTTTATACATTTTNNACTAATTCTACTTGTTTGGGANNNNNACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTT:1 + chr3L 5479002 5' + 3S18 29 2 50.53 TTTCCGCAGGCAAATGCGAATTCTTCAGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACAT:1 - chr2L 19642366 5' + Quasimodo 45 2 71.29 TGGCAGAGTAAGGGGTATCGAAGGGCCGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTAACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCG:1 - chrX 437513 5' + 3S18 62 2 71.72 CTTCTAATTGTTAATTGTTTACTTGACTGTACGCAAATTTTTGTTTAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chrX 15800890 5' - roo 9044 1 58.42 GCCCCCACATCTTAAACAAAAAAAAACTTCTTGCCACCAAAAACCTCCCATTTTTCTCATTATATGTAGTCTCCAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATA:1 - chr3R 28635834 5' + INE-1 502 1 81.19 AACCAATTTAAGTTTAAGCGATATCAACTCTTAAAATATTAAGCCAATCTGTAATTGAGATCTGGATCCCGTATAACTACATCGGTACGATACAGTGCGCA:1 - chr3R 21793451 5' - Helena 1047 1 62.38 TAACATCTGGTTTTTATGAAGCGACCGCTCAACTATTGCCCCGTAATTCGCATTGTTATTGATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:2 + chr3R 12767258 5' + blood 7026 2 64.36 CCAAAGCCCAGAGTTTCAATAAAGTTGTATGTAAGTCGCATTTAAACTTGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACTCGACTCTAGCATTCTCTCT:1 + chr3R 20395638 5' + INE-1 576 1 73.27 GTGAAATGGAAATTATGTAAGCGTCCTTAAACTACATTTAACTTCCGTCACACTTAAAACTTCTTATGAACAGAATATAAATTTTAAATATAAAAAATATC:1 - chr2L 17104655 5' + transib4 2576 1 28.71 AAGGCATTTTTGAAGAGTATTACACAGAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCT:1 - chr2R 1922780 5' + F-element 4500 1 71.58 TAACATACTACTATATAGCGTTGTATTCTCGTGCAAGTCAGCTCTGTATAAAATGTCATAAATAATATGTTAAACTAAATAAATTTAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 13934749 5' + X-element 4718 3 51.55 AGCGACAACGCTACATTGTGGTACTAGCCTCACCACGCCCTATTTATTTTTGTTATTAAGTGGATTTGTATGTGTATATTGTACTAACCCTTCGTGACTCA:1 + chr2L 43370 5' - baggins 5383 1 66.34 CACTGCTCTTCAAGAGCTTTCTCCCGCTCTTTGTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr3R 14580308 5' + blood 7055 2 69.31 AATTGCTTATTTGATAAACTTTTTGATACTATATACATCACAAATTGGAAGAATTCATTTTAAACGTTTTTGTTGTATTAATAATAATAATTTATAATTAA:1 + chr3L 4144237 5' - Tc3 269 1 72.28 GATTTGACCTTTCTCAAAATCGGATAAAGTGTAGAATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATA:1 - chr3L 27357602 5' + mdg1 46 2 77.08 CTGAAAATGAGAAATCTCAGACGCTCTCCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACC:1 - chrX 8004243 5' + hobo 2723 1 71.72 GCGGCCTCCTCTCCCTGTTCCTCGGTTAAATGTCAATAAATATTGGCAATTCTCTGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGCACGGCGTTTTTCCCGTG:1 + chr2L 606959 5' - baggins 5104 1 59.41 AGGCCGCTCATAAATTGATTTCGATATCAATTGCTGAACTTTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 + chr3R 7469958 5' + Doc 43 1 59.41 TCCCGCTTCGAAATGCAGGCAAACTTCCCCCTTTCTATGGCTTAACCCACGACTGCCCGGAACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATC:1 - chr3L 15452682 5' + accord 306 2 69.31 ACTCAAAAGAAAAGGCGACAAAAATGGTCAATCAATCACTTGATTAATATATCCGTAGATATTATGGATTCTGTTCCTTAATTATAGTGTATACAAATGTA:1 + chr3L 16340329 5' - G5A 2735 1 61.39 AAGGCTGAACTGCTTGCGCTGGACGTTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTGACTTTTATAGTTCCTGAGATATCGACGTTCATACGAACAGTCGG:1 + chr2R 13136237 5' - INE-1 127 1 79.21 CCGTTACAGGACGTCAGGACATCAGGACTTGAGACTGAGTATCGCCACGCCAGTAGGTATCACAAGGGGATCAACGCGCCACCAACGGTGGTACGCGC:1 + chr3R 1252398 5' + baggins 38 1 57.14 AAGCGCGCTCAAAGTTCAGTTATACGCCATATTTTATGAACAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 + chr3R 27928915 5' - mdg1 396 2 53.26 CATCAAGCATTTCGTGCAGCTCCTTGAGGCTGTCGAGCGTAAATTCAATAAATATGAATATAAGTTGGGCTGTGGACTTCTTGACCCTAATGGCTCGTTGG:1 - chr2R 15109071 5' - gypsy3 6477 1 65.35 CATTTATATATATTTCCGTATTTTATACGGAACTGTACACTTCAGGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGTTGCATCGATAG:1 - chr3R 5506872 5' + pogo 8 1 71.29 GGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 + chr2L 13566499 5' + hobo 55 1 74.26 TACAGACAATAGTAATGCATTTGCTGAAAACAATCTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chrX 15800956 5' + roo 8703 2 67.33 AATGTGTAAAAAATATATATAAAGATGGCAAGAGACGTCAACCTGATAATAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCCTT:1 - chr2L 13683212 5' + I-element 405 1 65.12 AAACCCAGTCAACTACGTGTATATGTTGTGACATATCGGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGCACTACATACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCCTG:1 - chr3R 1939217 5' - baggins 5271 1 67.33 GTGGTTTTGTGTTCATTAAAATTATGTTATGTTTAGCTGTTTTCCTTTTGGTTTGCGCGTTTTTTTACTCTTGAATTTTTTGTGTTTGTATTTAAAAAAAA:1 - chr3R 25597068 5' + Stalker2 496 1 58.42 TATATGCCATGTTGTGGACNGGTTATATTCGGTTTTTAGATTATGCTTAGGTTGAGGTTGAGATCTTCCTTTATAGTTCCTGAGATATCAACGTTCATACG:1 - chr3R 31045889 5' - INE-1 136 1 80.20 ATGGGAACTCCCCTGACATNTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 8765525 5' - roo 394 1 62.63 ATATAAATATTTGGTTTAGTTTTATTTATCATACAAGTGAAACTTACTCTATCGAACGGTGAAAGGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACGT:1 + chr3L 19340462 5' + Tc1 212 1 71.29 TTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2L 21086079 5' + roo 8713 2 76.24 TTATAATTATTATTATTATGATTATTACAAAAGGAATAGCCAGTCATTTGCATGATTCCATGCAATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 + chr2R 11721486 5' + Doc 25 1 55.00 AAAACATAGCATAATATTACATCGCTTTTGAAATCATACAACAAGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr2L 6362920 5' - 412 463 2 56.44 ATCGAAAAATTTAAAAATANTTAAATAAATGGCAAATGTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 - chrX 22789381 5' + Tabor 6878 2 62.38 CACTCAAAAATTGTGTTTGCGTTACGCGCGAGTTAACATTACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTAAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGA:1 + chr3R 16137064 5' - accord2 7583 2 70.00 GCAAACAATTACAACAAAGGGAAAACTAACAAAATTCCACACAAATCACACACAGTAACTTGTTGGTATAATTGTTGTAAATTGTCCCGCACAAGCGATCC:1 - chrX 7926114 5' + accord2 7171 1 56.44 CCATATTAAACAAAACACAAATAAATATAAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACC:1 - chr2L 23369129 5' + Doc 4529 1 71.29 GAGCAAGAGATGAAGAAGTTGAGAGCTCGACTTATTGTGCCCTAATCTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chr3R 27495644 5' - 412 7517 2 50.50 AAGCGTAGCACCAACTTTGGCCATAAAAACCCGAAAATAGCCATAATAATGATAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGT:1 - chr3R 12767358 5' - blood 7371 2 60.40 CAGGAAATTGTTTGTCAGCTTGCAGAATCGGATGTCAAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAAAAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 12241794 5' - roo 398 1 69.31 ATTCATTAGGCAGACACCANGTCGCGCCTACATTACTGCTACCTATGCGATTCCAGAGATACCAGTCTATGACGCTAAGAACAATCACAGGTGCTCCATGG:1 - chrX 292372 5' + G3 4279 1 51.49 TCCTTGTAAAATATAAATATAAAAATATATAACTTTTTCTTTACCCATCTAAGAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACC:1 + chrX 7995237 5' - hobo 179 1 54.46 TCCCTTTTGTCTGAACCCTCAGCTTTGAGCCGCTCTTTAGTTTGGGTTTTTCTGATTTTAACTTAAACTCATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATAC:1 + chrX 4166355 5' + I-element 5297 1 67.33 AGGGTTTAATGTGAAGTTTAGCTTAAAGGAGGGATTTATTGCACACCTTGTAATATCTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 + chr2L 9045405 5' - jockey 4974 1 54.46 TTAAATTATCTATAGCAATGTGCACAGCAATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 - chr2R 9631774 5' + F-element 34 1 55.45 AGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:2 + chr3L 7168340 5' + Doc 58 1 77.23 GGATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGAT:1 + chr2L 22092964 5' + INE-1 545 1 52.48 GGTATTCTTGTTGTTTCTTAATAACAACTGTTTCCGCTATTCTTGAGTAAAATCACAAATTAGGCTGTTCCTAGGAATAGCAGCGTCTGGTTGTGACCAAC:1 - chr3R 19446793 5' + HB 223 1 62.38 GGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 - chrY 311346 5' + 1360 69 1 77.00 CGCGGGGGCTCCGAAGGCTCCTTCGACGGTCCACCCAAGAAACCACTAGCGCTCCGCTATGACATCAACCAACTGATTGGCTCGCATTTTAAAAAAGGAA:1 + chr3R 6046911 5' - mariner2 20 1 59.00 ATCCATACAATATTTCTTTTCTTTCATTCATCTTCTATATAAAGTCAGTGTAAGTGTAAGAGTGTAAGAGAGTATACATCAATTTTGCTTATCAACGATAA:1 + chrX 7794418 5' - Circe 6984 1 48.51 CCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATATT:1 - chr2L 7666154 5' - roo 9021 2 74.26 GGGGCATTTTATTTAAATATATACATCTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr2R 21962687 5' + 297 44 2 81.19 TTAGTTAGTTAAAAAAAGGCGTATTACTTTCACTAGCACCGTCCCTTCGAACCCAAAGCACATATTACACAAAACTATATACCCCTTATTTTAAATCATTG:1 - chr3L 2070027 5' + Cr1a 4137 1 74.26 AGAACAGAACGATAGTGAGGGCAATAAGCAATCTCGGACATAATGCTCATAAACAACAAATCATGCGCTTAAGTTTAAGCAAAAATGTAAATTGGTTTCAT:1 - chr2L 18230290 5' - rover 7030 2 59.41 CACTGCAATTATCAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 - chr3R 22494166 5' - 297 6932 2 72.28 CCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACA:1 + chr2L 18213150 5' - hopper 1387 1 51.49 ACGTTACATTTTTGACAATAAAACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTC:1 + chr2R 4746523 5' - flea 4863 1 78.22 CAGCTGCAGAGATTTTTCGGTCAGCGTTAATGCAGCAGTGTTACCCCCCTGAAGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGA:1 - chrX 20867200 5' + blood 454 1 62.00 TGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 + chr3L 25272558 5' + 1360 73 1 62.38 ATAGTTGGCATGCCCGCGCCGAGAGAGCCGCCTGAATTCACAGGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3R 18399277 5' + P-element 5 2 77.23 ACCATGTTTTTTACCCATCAATACCAAACCCATTCTCACATATCACGTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCC:1 - chrX 21378219 5' - I-element 4915 1 52.04 CAAAGTTGATGGTAAATATTTGCATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTT:1 - chr4 860429 5' + Cr1a 4343 1 78.22 TATTGGCAAAATACTTAAANTAAATCTTTTTGTTTCACTTTGTTGTGTGAACGTGTCTTGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCA:1 + chr3L 3580826 5' - Doc2-element 433 1 62.38 TCATTTACTATTGTTTTATATCGTTTTATCTTGTATACCACATAAATGCAATATCTCAATATGTTTTTTATTTCCTTGTAAAGTTTTTTTTGTTATTTTTT:1 + chr3R 23377011 5' - HMS-Beagle2 491 1 71.29 TGCAAATATATGGCATTCAAGGTTCTTAAGTGAAATGGAAAATCAAATCAAAATTTAAAGTTGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTAT:1 - chrX 17855934 5' - P-element 2712 1 59.41 ACAGAAATGGAAATAAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 + chr2L 18247982 5' - blood 7359 2 56.44 AATAAGTAGAGATTTCTGCTATTAAAGGTATTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr3R 20420899 5' + blood 7020 2 70.30 TTTAAAGACAAAACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAA:1 - chr2R 22051536 5' - Tabor 457 2 50.50 CAGCCCGGAAAATGGCGATGCTGGCATTTGGCACTCGAAAAAGCTAGGGTATTATTCATGCTTGGCCTATTTATTGAATCTTCCCTTTTACTTAAAAGACT:1 - chr2R 20876968 5' - Doc3-element 4689 1 68.32 TTTATAAACATTTTGATTAGTTTTATTATTGATTGATTATTGATTATTGATTAGTTTATTTTTACTATTACTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAAATCGA:1 + chr3L 15172633 5' + INE-1 560 1 33.66 TTACAAGCCATACACGTACTCCATATATATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATC:2 - chr3R 25750219 5' - micropia 412 2 73.27 GTCACCGACGTGGGTTCAACAACAACACAGGTTTCCAATGTATACCAACAAAAAGATAATATTCCAGCTATATATCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 + chr2L 5165631 5' + I-element 11 1 77.23 GTATTTTATACGGAACTGTACACTTCAGGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr3R 5506855 5' + pogo 25 1 54.46 TTCAAAACTAGAGCTCAACTAAAAATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 + chrX 7157282 5' - blood 7340 1 75.25 CTCCTCTTGGGCACTGTTGGATGGTGCCTGTGTGGTGGCCGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTACACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGG:1 + chr3L 8143909 5' - Doc 475 1 66.34 ACTTTGTTTGTCGTTCGGCTTTACACATTTTTGGTAACACCATTCGTTTATTTAAGATTAACAGATTAACAATGTAACAGTAAGGATGGCAAATCCAGGAC:1 - chr2L 20289830 5' - Rt1c 5360 1 59.41 ACACCACGTTTGGTATGGGGAAACATTTGGTTTAGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr3L 14623980 5' + hobo 43 1 65.35 TATATTCTGTAAAAATAATGATGTAACTATTTTTGTTGTTTTGTGATTGCTAAAAATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTT:1 + chr3L 12990730 5' - flea 239 2 49.50 AAAGACCTTATGACAATGAATGTGAATGAATTATTAATGTTTCTAATAAGACTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3L 3757334 5' + roo 8688 2 55.45 TTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3R 29608834 5' + roo 8709 2 72.28 CGCTTCTTGCCCCGCACTCGAAAAATCGAAAACTCAAACCGCATAAAATTCACAAGACCAATAAAAATTGAGGGACTAAGATCTCGACGTTCATAC:1 - chr3R 18372683 5' - INE-1 137 1 50.00 TAGTAACGAATAAGTTTGCTAAAGCAGTTAAATCTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCT:1 + chr2L 8226771 5' + invader4 3072 2 66.34 CGGCGCAACCAGAACTCCCCGGACCGAGTACAAACAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGAGAGTGTCGTATTTGAGTGGTCCAAACCGGCCAC:1 + chr2L 19495025 5' + 297 11 2 58.42 CAGCGAGAAAAACTCCATAAAACTTTTCTTTTAATTAAAACATATTTTACATACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 + chr3R 12063733 5' - 412 7521 2 54.46 TGGCCTATTGCAACTTATTTTCATCGTAACATCATGAGGTTGAGGAAATATGGTTTCCTTTGAGCCTGGCAAGCAAATGTCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3R 27056467 5' + jockey 12 1 73.27 TCTCACGCACACATGCTAGCACCGCAGGACAATGGCTGCCTTTGACGCGCGTACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAA:1 - chr3R 28010019 5' + jockey 4629 1 57.43 AGGCTGCCTTACTGTTGGTAAAACGAAACAGGCAAGTGAAAATACTTATAAAATACAAAACAAGCGAAAATAATATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAAATA:1 + chr2L 22753947 5' - INE-1 559 1 57.43 TTTATTTACGCTCTCAATATTGGCAACTTCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGAAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAAC:1 + chr2L 7122023 5' + invader2 173 2 69.31 GGCTGGCTTGTTTCGGCTGAGCGTGTGCACTGAATGCATAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATATTGAACTCGTCTGATGTTTCTCTGGACATAGGGCAC:1 - chr3L 17307920 5' + Gypsy12A_LTR 1895 1 55.45 GGTACAGTTGGCACCAAAATGTGCGCTCTATACATATGTGACGTGCGAAAGGGCTGCAGCCCAAAGATAAATCGTTTTTTTAGGCAGTCATATTTAAAAG:1 + chr2R 17338861 5' - jockey2 3240 1 59.00 CTTTGCTTTGTTGTTGCCCAGCTCATATTTTCACTCGTTTGTGTAGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAA:1 + chr2R 9191723 5' - Porto1 248 1 64.36 TAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr3R 28565282 5' + 412 7105 2 77.23 AGCGAAGGCAGCAACCATTTGACCTTTAGTCTGGATATCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTGGC:1 - chrX 6728900 5' + F-element 4464 1 59.60 CGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAA:1 - chrX 983342 5' + Juan 3862 1 80.20 GCTGAGCATCGGCCAATTTCGAGTTCAAAGGAAAGCAATGTAAGGGAAATGAAAAGATTTATCTATTGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAAT:1 - chr3R 19332564 5' - 1360 3109 1 73.27 CACTGTGAAAAAATGTGGCCAAAAGCTTAACTAACGAAATGAATCGCTGCAAGAGCCAAGAACCAATACTATAAATTATTATAGCAATAATAATAATAAT:1 + chr3R 19255381 5' + mdg1 7068 2 40.00 GTTGGGAAATTGCGCCCTCACTGTGTATACATACGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:2 - chr3R 23641044 5' - 297 6941 2 69.31 CCCATTTCTATGAATTTTAATTGACCACTTCTGAAAGGATGAATGTAGCCCAAAACCCTTATACGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGA:1 + chr3L 21859176 5' + I-element 98 1 54.46 TATTTGGCCAAGACAAACGNGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 13146936 5' - roo 354 2 77.23 AGGCCTGATCGTCTTGGGTTGGCTGCTCACGTTGATATTGAATTATAGAAGGCGGAGTGGGTGTGTAGCGATAGTTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTC:1 + chr3L 18159202 5' - G2 2830 1 78.22 CTGTCGAGCGAAATCTGGCGTGTCAAAGAAAGCTATGCATAAAAAGCACATTCAAATATAATAAAGGGTAGCTTAGTGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCT:1 + chr2L 3408915 5' - G6 2005 1 77.23 TCTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3R 6266291 5' - roo 9044 1 57.43 TTTATTTGGCCAAGACAAANGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chrX 13146934 5' - roo 9020 2 75.25 GGATGGGCGGATATTTACCNTGGGCTCGCATAGTTTTCGAATTGATTTCGCAAGTGCCTGAGGCTAATCGCTGACGCTCACCCATACCATGAAAACTCCGT:1 + chrX 20982545 5' + G-element 4010 1 56.44 AGTTAAACATAAGAAAACAAAACCAGACACACAAAAAAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGA:2 - chr3L 2052683 5' - diver2 49 2 64.36 TTTTCTAATATTAAAGATATAAATACATATTACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAAT:1 - chr2L 14010859 5' - flea 4968 2 78.22 ACTTTTCGCTCATTATTTATTTACGTCTAACTTTTGTTTTGGGTCTACGGTTTCTTTTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTGT:1 - chr2L 17599842 5' + S-element 319 1 64.36 TAAATAGCAAAAAAGTGCAAAAATAAGGGATGCAACGCAGGGGGTAGGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2L 20238769 5' + hobo 29 1 50.50 AAAAACTCCATAAAACTTTNCTTTTAATTAAAACATATTTTACATACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3R 12063740 5' - 412 461 2 56.44 GCTTTAAACCAAATTTTTTTTCAAATTCCAGAACAAAGGTATCAGAACGTCGATTTTTAGGACGCAAAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTC:1 + chrX 403380 5' + transib2 45 1 69.31 GCACGAGCCACAAGAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 - chr2L 20328771 5' - opus 460 2 67.33 GTGCTTAATTATTGGATATTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr3L 12241859 5' + roo 8721 2 86.14 ATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:2 - chr2L 13566520 5' - hobo 2885 1 75.25 CACTGCAGAAAAAATCGTGGCTTAAATTTAAGTCCTGCATTTCTTACTAAACTACCATACCTACACCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAG:1 + chrX 20359043 5' + hobo 270 1 65.00 TTTTCACTCAAACACATATGTACAGCGTGTGTGTGCTGGTGTTTACCCTTGTGTCTGTTTTTGTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCA:1 - chr2R 23116286 5' - jockey 4980 1 57.43 AAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 12241830 5' - roo 9025 2 74.26 TGGTGGAGGGCTTGCGAACTGATGATCGGGTTGCGATGATGCATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGCTTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTC:1 - chr3L 24761267 5' + 1360 50 1 63.92 CGAGCGATTAAGTTAATCCCCAAAGGTTTACCAGTTAATAAGCCCCTTATTTTCCTTCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 20568096 5' - Doc2-element 248 1 91.30 TAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAG:1 - chr3L 20224200 5' + Chimpo 52 1 79.21 ATAAAACCAAACACTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 - chr2R 10353312 5' + blood 7049 2 63.37 TGCAAACTAGTTAATGTATTTGGTTGTACTCTTGTTTTAGAAGTTTTTGCACGCAATTTTAATACATTTAATTTTTAAGTATTTTATTTGATTTATTTTAA:1 + chrX 20540457 5' - G7 1146 1 90.10 GATTACTCGATTATTAATAAAATGTTTCGTATGAATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATT:1 - chr3R 25086180 5' - Bari1 1690 1 62.38 TGGGTCGTGCTCTATAACATGTATAGGTATTTGTTGAACAGATATCTTTTCGTTACATACATTAATGAATAATATCAAGAAATTGAGCGTGCTTACAACAA:1 - chr3L 184361 5' - gypsy12 10063 2 63.37 TAAACTGCGAGCACTTCCGGCACGTTGAGCCCGGACCGACCACTTGGCTATATGCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 - chr2L 5419889 5' - 297 6958 2 61.39 ATATATATTTCCGTATTTTATACGGAACTGTACACTTCAGGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chr3R 5506867 5' + pogo 13 1 66.34 GTTAGTCGAGAACATTATATTGGCATTTTAGCCCACACAGTACGCCCCTACGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 10286137 5' - roo 9049 2 52.48 TTTTGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3R 14193915 5' + pogo 48 1 73.27 TGCATTTCCGATGTTAGCTGAACAACCGTATATATATATATATAGTATATATATTACATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAAT:1 + chr3R 5811463 5' - flea 5000 2 69.31 TTGGAATTTGTGGCGTGCTGTTTACTTTTGTAGTCTAGTAAACTGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3L 14222529 5' + roo 8696 2 55.45 ATTTCGCACACACAAGGTCAATTAAATTTGCCCTTCACACATTATTAAGATTTTCCATCAGACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3L 9928622 5' + roo 8677 2 66.34 CATTTCAATTAAAAACCAATTTCCCTGCGGAAGTGCTTAATTATTGGATATTAACTGTTCACACATGAACTCGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3L 12241891 5' + roo 8676 2 60.23 GAGGAAATTCGGGGAGGTGTAGACAATCACGGTCAATGTTTCGTTCGAAAGGGGTGATAATTCGTGACCATTGTTTTGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTA:1 + chr3L 398146 5' - rooA 7563 2 63.37 CTGACAAAGTACTTTTACTNAAAGTGCATTTCTATTTCACCATTTCACTCTTTCTCTGCGTTTCAAGTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTATTTT:1 + chrX 4855506 5' - F-element 4686 3 75.27 GATTACGCCCACTTGTTTCGGATTAGGTTACGGTGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 25021655 5' - roo 399 1 70.30 AGCTTCAGTTACCTATTAGNAACCCCTATTTAGACAAAGTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTA:1 + chrX 9454818 5' - roo 9035 1 63.37 TGCGTTTGCGAATTATGATGAACAAATCTAAAGTAAAAAAAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr3L 16153719 5' - pogo 2070 1 63.37 AATATTTAATAAATCATTTAATTTTTTATATAAAATATTTTAAAACAATTATTCGGTCTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTA:1 + chr2L 3700009 5' + mdg3 112 2 61.39 CGGCGTGTGCAAACAAAACGTCCAATTAAATTAGAACAACTTTTCTTTCAAGCCAAAGCATTTAATTAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr3R 22349569 5' + pogo 7 1 73.27 TCTAGCCTCCCTCCGTTGTACTGGACCTTCCTGATCGCAGTCTTCTCGTCTCACCTGATCTCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGT:1 - chr2R 4430721 5' + F-element 4562 1 62.38 TGGAACTGGGTTCCGTTTGCGTTAAGCGGGCGTGACAAGATGGGCTGCGACTATATCTCTAGAATGTGTATGCTTAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGT:1 + chr3R 15318389 5' - INE-1 160 1 81.19 AAAAGCCCAGTTTAGACTCNTTCAATCAGCCGCAGAGCTGGTCCTGTGAGTGTGGGTCTTAAGCCCACTTCGTGGCTGTGTAATATGTAATAAGTAATAGC:1 + chr2L 15531762 5' - Stalker2 7650 2 76.24 TATTTGATATAACTTTGTTAATTGATAATTTCAGCGTAACTACATTTAAATGAGCACCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGA:2 - chr2R 16467923 5' + F-element 4319 1 56.44 CAACGACTGTTGCGCACTCGAAATGACTTCAGCACTTTTTTTTTTGTTTTTTTAAACTTATTGAGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACA:1 + chr2R 5828145 5' - Doc2-element 4732 1 72.28 CATAGCTACAAAGCATCTGCTATAAGGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAA:1 + chr3L 2671088 5' + roo 8779 2 73.74 GCGCCGCCTCGACTGCGTTACGCATACGCCCTGTGTGCTGAAAATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:1 - chr2R 8526392 5' - I-element 5321 1 59.41 ATATATATATGTCGCATTACGGATGTATTCTGACCACTGTACGTGTCTGTCATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2L 2494323 5' + roo 8688 2 56.44 TAAAAAATATGTTTTCTTACTACACTGATTTATATTTCTTCACACTATATAAACTGGATAGCAATTCGAAAGAACGCGTATTTTTCGTTC:1 - chr3L 23082625 5' + Doc4-element 63 1 58.89 TTGTGTAATGTGTATTTTGGATTATTTGTATCACATGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAG:1 + chrX 22689518 5' - 1731 4622 2 72.63 TCGAGATAAGTGCTTCCTGNCTGTATCAAATTGATTTATTGCCAAATATAGTAAAAACAGTTTTTTGCTCTTCCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chrX 6457987 5' - hobo 2936 1 73.27 AGAACCATTAAAACTGTTTCTAGCTTTTCCCATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAAACTGGTGTCCT:1 + chr2L 7881834 5' + Rt1b 4822 1 72.28 TGCTATTAAAGGTATTTTCGAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3R 20420915 5' + blood 25 2 52.48 GATGTCGCAGAGGGCGCGTNTTAATTACGACAGATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTT:2 - chrX 15263483 5' + invader3 5243 2 70.30 TACCAGCATTTGTACAGCGAATAATAGCGCAAAAACTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chr3R 19505521 5' + mdg3 15 2 58.42 ACACTCTCCCTGAGCGAAAATGCACTCTTCAATGGACTGTATATGTGCGAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 16087662 5' - accord 186 2 70.30 AAAGCAAATACAGTGGTAACACGGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chrX 19308208 5' + P-element 53 1 26.73 TTTACACTCATAAGCACTCCCATCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTGTGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCT:1 + chr2R 19220915 5' - Porto1 4202 1 78.22 GACATTGCTTGTTCAGTACGAATAACCAACGTACGAATAACCAACAAGTCAGGTGTCAAACTTAAATAATAAAACAGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTC:1 - chr3R 2785278 5' + Idefix 7211 2 75.25 TGGAATCCAATCAGTCGAACGGTATTATTGAGTTTCGTAATGGAAAACCAATAGCAAAGGGTCACAGCCTTATCATTAAGATGATGAAGC:1 - chr4 186419 5' + Rt1b 4764 1 70.00 CATTTATTTCTTCAATGTGCAAACTCAAACATTATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr2L 14262811 5' + pogo 40 1 66.34 AAATGCTTTTTAAAATAATGGTGTTTTTCCTAGAAACATTTAAAGCTAATAGAAAAGGAACAACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCCCTCAGTC:1 + chr3L 13096935 5' + I-element 24 1 58.00 TTATTTTGAAGTTTATTCCTTTTTTGTTAAAAATTTAATTGTTTAACTATGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGT:1 - chr3R 3629165 5' + GATE 8275 2 58.42 GAGGGAGCCATAAATTCACGAATATACGCGACAAAGCCAGAAACTCTATTCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chr3R 13353274 5' + 1360 28 1 53.47 CCCAGTCACCCTCCCCTAGATGCCAATACACGACATCCATCCAATCACCCAACAACCAACCCCCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCG:1 + chrX 7628799 5' + F-element 4497 1 61.39 AGACTTGTCTTCAATTAAATGTTCTTTAAAACTAATTCATTGCGGAACTTGTAATATTTGCTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAATATCCGATTCTGAA:1 + chr3L 18943812 5' - Bica 4548 1 54.46 CGTATTTTTATTATTCAATATATTTTGTAGCATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGA:1 - chr2R 10372181 5' - mdg3 205 2 66.34 GAGAGAATGATATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATGCCCCTTACTTAGCTAGTGTGAATGCGAAGGCGAAATTTCTTAATTTTTCTGGTATATCGATAG:1 + chr2R 25106979 5' - INE-1 502 1 86.14 TTCGGTGCCAGCAGCTTAAGACCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - chr3R 20696506 5' + jockey 64 1 76.00 AAACCCAAACCCAAAACCACCTCACGTATGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTG:1 - chrX 18191070 5' - BS 4716 1 71.29 CAATTCCAGAGTAAGCCGGGGTGGCTTCGCTGGAGGGTCTGTGTGCCGGTTAGAACCGGTAACTCCTCCCCTCCCGGATTGAAGTGACGGCCACAACGAAG:5 + chrX 21939635 5' - gypsy5 6903 1 67.33 TGATAGTTTTTGCTTTCAAAGTAGGGAATGGAGTCCAAAAAAACTACTTAGCTCATATATTCATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1 + chrX 22734025 5' + copia 4883 2 47.52 GTGTGCTCGTTCTCGGTGGCCACCATCGTCTCCTGGCGGCGGGTGCGCAGCCGCACGTAACTCAGCTCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAA:1 - chr2L 19011240 5' - micropia 5400 2 71.29 AATTTGTGTAATGTGTATTTTGGATTATTTGTATCACATGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGT:1 + chrX 22689515 5' - 1731 307 2 71.29 TTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGATCCT:1 + chr3L 17181462 5' + jockey 4708 1 58.42 CATTGTCGTCTCAGTTCTCNGAACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr3R 26252694 5' + 412 7088 2 68.67 TTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3R 27169471 5' - 412 440 2 75.25 ACCGTCCCTGTTCTTTGCGCTCGCTTACTTTCTTTTGCCGCTGAGCACGCAATTCGAGTTGGCTCATTTTAGAACGATCGATTTGTTCGTTGTCTATTTTT:1 - chr3R 23213350 5' - Doc3-element 187 1 68.32 AAAAGCTATAAAGTGCTGCCATTAGACAATAACCCAATTTCAACCAATAATAGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 8582535 5' + roo 8688 2 55.45 TGGCGCATGTATGTCCCGACTCGTAATGCAAACTATATATGCATGCATTGGCATTGGAATAATCAGCAATCTAAACGTATACATTTCCATATACATACATA:1 - chr2L 15174326 5' + ZAM 8150 2 79.21 ATCCCTCCTCCAATTCGTTCTTTATCCATTGCTTATATCCATTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCAGCCCACTTCTGATAATGT:1 - chr2R 21441610 5' - invader2 264 1 68.29 GGAAAGCATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:2 - chr3L 9910426 5' + 297 31 2 66.34 TGAAATTAAGGGAAATGTGNACGCTGGTCCGGTGAAATAAAATAAAAATATAAAATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACA:1 + chr2R 4830296 5' - Tc3 313 1 76.24 GCAGTGGCCTTTGTGCGCAGACTTTTGGACCCCCGGGTCATGGATCATGTGCATGCATAATGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGC:1 - chr2R 8175708 5' + mdg1 463 1 67.33 GCCTGGATTTGATTTGCGCCACACCGGGCACCGTCAACTGGATAGCCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATAT:1 - chr3L 688808 5' + mdg3 222 2 55.45 CCCTTTATGTAGATATATCNCTTCATTAGAAGTTCTTTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 - chr3L 10474232 5' - copia 247 1 69.31 TTATTTAATAAGTAGAGATNTCTGCTATTAAAGGTATTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3R 20420893 5' + blood 7014 2 75.25 CTCTCGACGCTCATTGATTGTCGGATCCAGTGAACATTCACATACACACAAACATACATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:3 - chr2L 3978522 5' + 297 6592 2 69.31 CGAGCTGCCAGCGTTATCCTTATCGGCAGCTGCAGGGGCGTATTTGTTTCTTCCTCTCTGGTTGGAGCTTATTTTGTTGGTTTTTTTTT:1 - chr3R 8227044 5' - gypsy11 3934 1 73.03 AGCTGGAAATGTTTGAGGTGAATTAAATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 + chrX 12389077 5' + I-element 51 1 75.25 CTTAACAATATTTTACTAGCGCCACCTTGTACTATTATTTGGAAACTAATGGAGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTC:1 + chr3L 3616458 5' + jockey 477 1 58.42 TTTAATTATTTTTTTTTCCAAAATTTTTT:1 - chr3L 4168869 5' - HMS-Beagle2 397 1 79.31 GCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 9871053 5' + roo 8694 2 55.45 ACGGATGATGGTGATGATGATTGTGGTGGGGCTGATGGTGGTGCAGCTGCTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTT:1 - chr2L 12241470 5' - F-element 4257 1 58.42 GGTTGGCTTATGTTTCAAATCTTTCTAATAAATCGTAAATCTAAATTATCAATATCCAATAAGATCATAATTTTTAAAACAATTTTTAATCCAATATTAAT:1 + chr3L 15125908 5' + Juan 3793 1 77.23 TATTTATTTTTATTTATTTGGGCCCATTTGTCTCGGCTCCGAGTGCGTTTAAAAAAGCTATAAGTAAGCCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCT:1 - chr3R 18956783 5' + accord 321 2 77.23 GACAAGTCGCACTTTGTATGGCATAAATTTCGTTGGCATAAATCAAAATTCAGCAACTTCCGACTCGGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTA:1 + chr3L 6099747 5' + 412 393 2 63.37 AATCCTTAACAGAACAGTGTATCCTTTTGTTTTATTTGGTTATTATTTGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 4277537 5' + roo 8686 2 55.67 TTCTGTCGACGCCAGGCAAATAGACATCACACAAAAACAGCTGTTGGCCAATTGGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCG:1 - chr2L 9453226 5' - G2 2916 1 60.44 TGTGTCACCCTCCCACAGAAAGAACGCCAGGCCACCGTTACAGTATCAGCAGCGGGGTGTCTACTCATGCAACATTGCAATTAATTAAATTTTATTTTTAA:1 - chr2L 15993462 5' - NOF 3957 1 74.26 GCTTTCTCTTTTTGATATACAAAAAATCAACAATTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr3R 26317980 5' - roo 9032 1 65.35 GGCAGAAAGAGACAAGAAACCACCGTGACACTTGTTACGCGATGGGCTACGTGTTAAACGCATTTCCGCCACTTGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGA:1 - chrX 9413898 5' - 412 7544 2 75.76 TTCCTCCTAATTGTGAGCCTAATAGGATCGTATTAAATTTATTAAGCGAGTGCACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGCTCTTAGTGTGGTCTAC:1 + chr2R 8187012 5' - mdg1 297 2 59.41 AATTAAATGATTTTATGATGCCATTTTGGGGATTTTTACCCTCAGGCAATTTCGCTTGTGGTTTTTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCCCTCGCACTCTAC:1 - chrX 7996459 5' - hobo 2928 1 69.00 CCGCAGAAATATTTGAGGAGAAAACGCGCAATTCCTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGAGATGG:1 + chr2L 11490810 5' - I-element 5061 1 63.37 GTGAGGCGTACGTCCCACGGACCAAATAAAAATGCCATAAAAATCACTCATACGCTGTAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTT:1 + chr2R 20718814 5' + BS 5014 1 57.43 ACAGCTACTGTGTAATTCCNTTGCTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 + chr3R 4971395 5' + F-element 36 1 51.49 GCAAGTGCGGCATTTGAATTGCTTAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chrX 12906555 5' - P-element 2835 1 27.72 AAAAAAACGCTCGTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 + chr3L 5710237 5' - Transpac 5202 2 55.45 CAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2R 13763182 5' - roo 9044 1 53.47 AAAAGGATGAATGCATTTCAGCTAACAGTTTTTGGTGGAAACTATTTTACTTCTATCTAGCTGGAAGCTTTCCCGCTTCTGGACAAGAATTTAATTTTTTG:1 - chr2L 19203306 5' - G2 3021 1 79.21 ATGATGTGGGTTAATGAGAACTTTTCAAATGATTATTTCTAGATGTTATACAATAACATTTTTGCAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAAC:1 + chr3R 22331579 5' + I-element 183 1 65.35 CGATGGTGCTCTAACTATTCCGAAAGAATTAAAAGAATTAAAGAATTAAAAGAATTATAAGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAAC:1 - chr3R 3854443 5' - INE-1 20 1 51.49 ATTCATAAGTTGTTATATGTACGTATGTAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCG:1 - chrX 9205558 5' + diver 5937 2 72.28 GATGGGAATGCCTTCCCCTAACTGGTTTGCCAGTAACACTGGATTTATGAGCGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTTTAACTTTTTTAGTACATA:1 - chr3L 18299343 5' + Cr1a 4268 1 61.39 CGATTCAAACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:2 - chr3L 8036432 5' - roo 9034 1 67.33 CCCATTTGCTGCATGTCATTTTATATCTATTATATTAGGAGCCATACCGGAGGAAATGTTATGCTTTTATATGTTTTTTTTCTATCAGTTCGGTAATAATC:1 + chr2L 17249292 5' + Circe 442 1 63.37 GAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr2L 7175579 5' + blood 7061 2 72.28 TCTAACAAAACCACAAAGCAGCATCAGTGTTCCTTACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGA:1 + chr2R 24555631 5' + hopper 38 1 64.00 ACCCGATCCCCTGGGTGGCCTTCTCCTTGAAGTTCTCCTTCGTTTTCATTAACAAAATCGATTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:2 + chr2R 19061200 5' - roo 398 1 68.32 TAAAGGCTGAGAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr2R 22856595 5' - 1360 3363 1 58.76 GCGTGTTTGGACCGGGTTTGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGC:1 + chr3L 16282355 5' + gypsy5 25 2 55.45 GTATAAATTGGAAGCACTTAATCATTTCGATTTACATTTTAATTAAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 + chr2L 14581247 5' + Tirant 8111 2 53.00 ACTTGGACATCGTGTGCTGNCTGTATCGAAAGCAGAACCAATTAAGCAAGTTTGGGGCAAAATGGAAATGGGCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTT:1 + chr3R 13331385 5' - transib2 2821 1 75.25 ATCTCTATTCACAAAATAAAGAATTAAATAGATCTCCTATATTTGTTTCCAGTGTCATGATGCGAAATTGACTTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTT:2 - chr3R 22869481 5' + Bari1 2 1 76.24 TTAAATAAAAGTTTTACAAAGATTACCAAATTATTTATCTATTAAAAGAAAGATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCC:1 - chr3R 20421000 5' - blood 7366 2 49.50 TACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 - chr3R 7869177 5' - 297 6932 2 72.28 AAGCTTTTCATATTTTGCGATTGGATGGGCAATATAAAGAAAAATTCTGGCTTATCCTGCTTTCGATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCT:1 + chr2L 20622415 5' - Doc3-element 65 1 63.37 AAAACAACTATTTTTGATTGTGCGATTTAGGGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 - chr3L 5710302 5' + Transpac 42 2 66.34 ATGGCAGAAAAAGTGTAAATTGAATAAAAAAAATCAA:1 - chr2L 13039451 5' - Tc1-2 1397 1 89.19 AAATTATAAAGGGGGCGGGGCATGCCACAGTAGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 + chr3L 19861790 5' - 1360 3345 1 70.30 CTACTCTCGATGAAAATGCTCAATATATGAACAAAGCAAAGCAAATAAGTAACTTAGACGTAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGAT:1 + chr3L 10590604 5' + flea 4722 1 64.36 CCCCCAGTGTCGTCTGTCGCCAGTCATTTATCGGTGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 - chr3L 17942685 5' - copia 247 1 63.37 GACGCGTAATTACTCGTCAAAGTATTTTAATTTAGTAATTGAATTATTTATTTATTTATTTTGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTT:1 - chr2L 10474815 5' - Doc 4446 1 61.39 AACAAAGCGAGCGGAAAAATCTTTTCGAAAAGTGTCTGCAAATAATAATGAAGTTGCCAGTTTTCCAGTTGCCGCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 - chr3L 8252285 5' - copia 252 1 75.25 CAGAATATACATTTAAATGNGCACTCTTGTTTGATTTACTTTTGAGAATTAATTAAAGCGAAATACGTGGGCCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGA:1 - chr3R 13487824 5' + invader2 4695 1 70.30 AACGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTATATTATTTTATTGTTGTTGTGCTGCTTTTTGCATATTTTTGTACATACATACATACATATGCACTAT:1 - chr3R 19449956 5' + 1731 4393 1 71.29 TCTTTAGTTTGGGTTTTTCTGATTTTAACTTAAACTCATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCT:1 + chrX 4166388 5' + I-element 5330 1 63.37 CAGGAAATTGTTTGTCAGCTTGCAGAATCGGATGTCAGGAGCGTTCGACTGAGTGAAGGACTGGGCTAATGGAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr3L 12241794 5' - roo 407 1 65.22 CGGAGTGACGTGGGAGACCAACTACATGGAAATGGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr2L 5926993 5' + pogo 40 1 68.32 GACGTCACAAATAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCTCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGATTCTTTCAAGCTA:1 + chr3R 19987397 5' + Doc 30 1 48.51 CGATCCGTTGCCGTTGCCCACCGATCACCGAGATCACCTGTCTTCATTTTATGGGCCGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 + chr3L 3650028 5' - mdg1 401 2 58.42 ACGGTATCTGCGCCAATAAAGGGAATACTCGTTCTATGACAAAAATCCATTTCAATCACCATTCCTATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATA:1 + chr3R 26435386 5' + Juan 4042 1 65.35 AACAGACGGAAGAAACAATGGTCACAACAAACAAAAACACACAAAGACATGGAACTTCCCCTTGTTAAAGACAAAATAAAGTCAAATGTAGAGCGACACAT:1 + chrX 291776 5' + G3 4362 1 61.39 ATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTC:1 - chr3L 25232911 5' + GATE 30 2 54.55 TATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 13146936 5' - roo 354 2 77.23 CACACACACACTGTGGCACACTTGGTTTATTACATGGCGACC:1 - chr3R 20400082 5' + blood 385 1 69.05 GGACAACAAACTTAAACTTTTGTTTATTTCGTACACTAATAAAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAA:1 - chr3R 7513978 5' - diver 190 2 63.37 TTATTTCTTCAATGTGCAAACTCAAACATTATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr2L 14262814 5' + pogo 43 1 69.31 AAATGCCATAGGCAGGATTCGGTTTCATTTGAGTTAAATTTGCTGTTCCATGAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTAT:2 + chrX 7292664 5' + 3S18 5791 2 53.47 AGCTTGCAATGTAATCGCAATCGATCATCAGCCACACTGTGAAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATT:1 + chr3R 28621021 5' + 1360 35 1 63.37 ATGCAAGTGACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATAT:1 - chrX 21247583 5' + blood 170 4 70.37 GAGTTGGTAAATATGTATGTGTGTGGGCGACACTACCACCAAAGAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAA:1 - chrX 12912364 5' + G6 1998 2 56.44 AAGCAGAACACCAGCTGCACTGCGATAAAAAAAACGCATCAGAAATAAAAATTCTGGATGAATTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTG:1 + chr3L 15789146 5' + opus 232 2 50.52 GAAGATTCAGTCCACTTTCNGTGGTCATTTGGCACGCAAGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATACACATGAACTGT:1 + chr2R 15188775 5' + 1731 81 1 52.48 CTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAAAGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 + chr2R 16160764 5' + mdg3 5292 2 66.34 TCATAGTAAATCCCTCAGCATCCGACACAATTTATCGTTTGTTTAATATTCTTTAATTATCATATACTTTAAACATAATTATTAAAGATTCGTTCACTTCG:1 + chr2L 14053808 5' + Cr1a 117 1 57.43 TTTGAGCTACACCTTTGTCTGCTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGGT:1 + chrX 329343 5' - F-element 4224 1 76.24 CCTCAAAAGTATGCTACACNTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr3L 21144035 5' + jockey 27 1 57.43 CCACGTAAATGTTCCCGTCATTCCGTCCGGGCCGCTGCGGATAGATGGTACGTACTCCACCGGCGGCATATCGGCTGCTGTGGAAGTTTATTTAGTCTGCC:1 - chr3L 14941054 5' - G5A 2580 1 66.34 CGAAACTGACGTCCTTGGGCTTATCCTTTGCGAATCGGAACTCCTCCTCAGCGTCCCCGGCTCGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCC:1 + chr2R 14658119 5' + Rt1b 4903 1 56.44 CAAGGGTTTTTAAGTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGC:1 + chr3R 20094459 5' - Max-element 269 2 56.67 TGTAACCTACACCTTTGCCGAAGCGTTCTGCAGAACAACGGGGTCGTATTAAAAAATGATGACAATAAGTAAATTTTATGATTAATCTTAAATTAACAGAG:1 + chr2R 4901271 5' - G4 3785 1 53.47 AAAAGATTTAAAAATTTGTNAACACGGTATGTGTAAGTCGATTCCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAG:1 + chr3R 4976198 5' + Idefix 270 2 57.00 AGTGAGCGCGTCTAAATTAATTGCACCTATACTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3R 25021734 5' + roo 44 2 73.27 GGGAACAGTGCGAAATGCTTGGTTGCGTTGTTGCCCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3R 6961074 5' + 412 41 2 65.35 TATTTATCAGTACTTTAAACGAAATTCATTGTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:1 + chr2R 9699817 5' + Transpac 4962 2 69.31 TTTCCTAAATTAAAAAAAAACTATTTTCTTCAGGCTGTCTTATAATTATTATTATTGTAGGTGAAACTTAATATTATCATTATTTTATTTATTTACTAATA:1 - chr3R 7422494 5' - G7 1142 1 62.38 GAAAAAGAGAATAACAAATAATTTCCTATGGCCTATCAACTCAATCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr3L 12112403 5' + 1360 6 2 64.94 TTATAGTGTTTGGTAATTCTTAAGAATATTTCTCCACCCTGTGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 - chr3R 4575497 5' + 1360 35 1 59.41 CAACTAAAGGGCCCAGTAAAACCATATATTTATGTGGCAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 + chr2R 18766212 5' - hobo 2903 1 59.41 GCATTCGTCCTGATTGTCAAAGCTTGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 3757429 5' - roo 9058 1 66.34 TACATGTGTAAATTTTCACTTCCAACTGACACAGTATTATTTATATTTGTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACAT:1 + chrX 23035729 5' + HMS-Beagle2 6908 2 54.46 TGGCGCAAATTGAAAGCCCTAAAATAATTTATTGTTAATAACTTGCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTCCGCACCACTTCCACGGAACACTAA:1 + chr2L 18986362 5' - R1A1-element 81 1 74.26 TTATCCGTATTAATTGTTATTAAACTATTATGTTACTAATTTTTAATTTTAAATGTATCAAAAGTGTGGGCGTGCCAGTTTTGGGTGGTTTTAGGGCGTTA:1 + chrX 20668162 5' - INE-1 343 1 55.45 AGAAGGTGCAGATACAGCAAATTACATAATGAGGTAATGGTATATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 + chr3R 17482003 5' + copia 36 2 59.41 GACTCATTCAATCAATTGAAACACTGACACTGCTTTCTCTGTTTTGAAAATGTTATCACTTCTCATTTGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCG:1 - chr3R 6127597 5' + Q-element 183 2 58.59 ACTCTCTAAGTGTACTTTTCTTACCCCCTATGAGCATGAATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr3R 13353208 5' - 1360 3352 1 63.37 AATGGTTTCTTTTCCTTTGGATATGTAATCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCATTTGAGCTGCAAAGTGCATGCT:1 - chr3R 19444857 5' - Stalker 205 4 76.77 AATTTGGTGCTTCAAGTTTTCATAAGCTTAATTGAATTGAGTAGAGAACGTGGCATGAAAAACAGCTGGAAAGGGCTAAGAAAAAAAAAAACGAAAAAAAA:1 - chrX 14516557 5' + Doc2-element 250 5 50.50 TAACTTTGCCCTTTTTCGCCGCTGTCCATTTTAAATTCAATCACCATGTGCAGCCAGCCAGTGGAGGGACCCTCTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACA:1 - chr2R 24278106 5' - 412 7541 2 71.29 CCAAGGATCTACTTGACACCTCTTTGTTTTCGTGCCAGCATGGAGCAGATTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACC:1 + chr3R 30068340 5' - R2-element 3431 1 59.41 CGAATTTGCAAAGTTCGTTTTGGTGTGACCTCCTGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr3R 27116777 5' - P-element 2845 1 34.65 TTTATTACGTTACCTTTCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:2 + chr2L 20560331 5' + F-element 40 1 52.48 GCCACAAGTAGTCGAAGGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr2L 8622757 5' + 297 28 2 65.35 GAAGTAAATATGAGCAAAATACCCTAAACTTTTTATCGCACACATAAAAATTCGCAGAATTTTCCCTATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 - chr3L 3597165 5' - copia 223 1 67.33 ATGAAGCCATCTGCAGACGTGGTTTTCGAACGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCT:1 + chr2R 9905363 5' - mdg3 5454 2 68.32 TAAACTATTTTTAGTTTATTAAAACTTGTTTTATTAGTACATAGACTTTATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGATATTTAT:1 - chr3R 11602728 5' - 1360 374 1 49.50 TCTTCAAACCGCCTGGCCCTTGGGTAATTTATATGCTATTACTAATTTTGGTAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGC:1 + chr3L 13569730 5' + invader3 26 2 52.48 TTGAATTTCCATTTCAGTGGCCATTTTCCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTG:1 + chr3R 9088575 5' - hopper2 1563 1 68.00 TATCTTTTTACAACGTTTTAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTACATTTGTAGATAGATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTA:1 + chr2L 22750321 5' + I-element 5288 1 79.21 ATTCAAGTCATATTCTGTGCAATGTGATGAACAGAGTTACCAGTATTGTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr2R 20312580 5' + 1360 26 1 52.48 CCCGTCATTTCGCCCAGGCATTTTGCAATTGTTTCTATAAAGCAGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAG:1 + chr2R 12185248 5' - 297 6825 2 74.26 ACGATATATTGCCATTTGTCATCCGTTCAGGTAAGGGAACCTTCATTCCTTCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATT:1 - chr3R 13331492 5' + transib2 23 1 57.43 AACACAGACATCCACTTAGCACACCGAATGCATCTGCATCAGCACAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 - chr3R 19216414 5' + 1360 30 1 58.42 GCCTTGCAACCGGTTCGCATTTCCTAATAGAATTCTTTTTTTTTTTCGAAGGGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 - chr2R 21747607 5' - mdg1 7434 2 51.49 ACGAACACAGAGAGAGACAGTCACAGTTTGGGGCATGTTAATTTGTAGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTC:1 - chr2L 18213230 5' + hopper 25 1 54.46 ACGGCAGCCACCTATATACCTAATTTTTAAAATCTGTTTAGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACAT:1 - chr2L 107633 5' + 1360 341 1 67.33 ATTATTAAATACTTTAATTATTTTTGAAGTGTACATATGTGAGTAGTGCAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACAGCCATACGATT:1 + chr3L 21518974 5' + 1360 20 1 53.76 TGAAACTGGTTTTGCTCAAAGAAAGCAAAAACACTGATAATTAATTGCTTCGAATGCGGCTTATCCATTACTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 - chr3L 3242761 5' + diver 6 2 59.41 CTTGATATCCATATTGCAGGGTACGTCTCAAAATGTGTCAACAATAAACACACCCACACACCCACGCCGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCT:1 - chr2R 24471286 5' + diver2 495 1 76.24 CAGCACTCGAGCCACATCCACCACTCAATTACTTCAAAATTTTGAGACAATGGAACTCTTTGTCTAATATAATACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACA:1 - chr3R 7627689 5' - hobo 347 1 54.46 CTAATCTCATACCCTAATTTTCTGGGTAAAAACCTTTGTTGACTGCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chrX 10451533 5' - hobo 2908 1 54.46 AAACCAGTCGGAACCGGAAACGAAAACTACGGATGGAGCTGGGACGATGTGGCTTTTAAAAGGGTACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAAC:1 + chr3L 10474121 5' + copia 13 2 64.36 AGTAGTACGGGGGCGTATCGAAAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2L 10625657 5' - roo 392 2 63.37 CTTTTCTCCACTCCTTTTGTCGTGTTAATTCCCAGAACTCGTTTTAAATATTGTGTGTACAAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 16601414 5' - roo 395 1 67.33 GTCTGTAAGGATTAAAGTTTGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTAACGCCAGAAGGGCGCAA:1 - chr3R 20094521 5' + Max-element 8236 2 70.27 CTAGTTAAATCAAATTAGCTGAATCATTGCGATCGATCTATCTGGAAAGCAGGTGAATGGAAAGCAGCTATCTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGA:1 + chrX 18509283 5' + jockey 4712 1 72.28 ACAATTAAACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCA:2 - chrX 734972 5' + Tabor 6877 2 60.40 AGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAA:1 + chr2L 18213136 5' + hopper 14 1 65.35 TAATATAGGGATTTGAAAATTTAAAAAAAA:1 + chr2R 10160363 5' + TART-C 11089 1 66.67 CAGTACTATATATATACGGTTTAAACTGGCTGCTGGCCCGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATC:1 - chr3L 1697751 5' - Transpac 5193 2 60.40 AAAAGGGTTCGCACGAATCCGATTTAATGGCCTTAAACGGGCCTACAATGTAAGCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAAC:1 - chr2L 6709800 5' - BS 4937 1 60.40 CAGTTATATTCTGTAAAAATAATGATGTAACTATTTTTGTTGTTTTGTGATTGCTAAAAATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 + chr3L 12990726 5' - flea 243 2 53.47 CACCGCCTGGTCACACTAAGCGGCCGGCGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAA:1 + chr2L 20682358 5' - I-element 478 1 72.28 TATTTTCAGTACTATATATNTACGGTTTAAACTGGCTGCTGGCCCGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr3L 1697757 5' - Transpac 5201 2 53.54 AACAAAATGGCACGGGAACGGGAATGGGAATGGGGCGGAGAATCGGGGAGGCTGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGGTTTCTTGCGAGGGGATTTGTAG:1 + chr2L 12388168 5' - Doc 4494 1 52.48 CTGCGGATCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 + chr2R 15788572 5' + Transpac 4948 2 51.49 CTATATGTATATATGTAGTCGGGAATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATA:1 - chr2R 20675142 5' + G2 260 1 76.24 TATTATTTATATTATGTATACAACAATGTATTACGAAAAATGTATTCTTGATCAGGATCATTAGCCGAGTAGATTTGGCCATGCCCGTCTGTCCGTATGAA:1 + chr4 181524 5' + INE-1 122 1 69.31 ATATGTGTATATATGTGTGCGTGTTTGCATCCCATGGTGCGTATGTGTGGGGTAGATTTATTGCATGACATTTCAATTGTTAGACCAAAGACACTAGAATA:1 + chrX 5198029 5' - Tc3 316 1 77.23 TTTTACTAGCTTATCGGTTNAACTTAAATGTTCTCAGCCCTTTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2R 13763254 5' + roo 33 2 60.40 ATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGG:1 + chrX 13383540 5' - R1A1-element 5156 1 56.44 TGAGTGGCATTATTTGACTTAAACGCCCCAAATGCTTAACCCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3L 11755754 5' + roo 8700 2 61.39 ACAAAGACGTGAATAAAAATTTATGCGCACAAAAGTATGCCACACAACATGCACATAAAATGATTATTATACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1 - chr3R 20332951 5' - jockey 4986 1 69.31 GTGCCCATATGCCTAAAAGTATGCACGTATCTGGCGACATAGTCGTTTGATTAAACTTGTTAACACACATAGATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2L 10143726 5' + jockey 12 1 73.27 GGGCGTGCTTTATGACCAGNTTTCTACCGCCCCCCCAACCAATCCACACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 - chr2L 6276100 5' - copia 225 1 55.45 TGTTATCTTAGCCGTTGGGCGAACCATGGTTCCAGGTGCAGTGGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCC:1 + chr3L 6749114 5' + roo 165 2 62.38 TTTTATACTAAGCTCTACTTGAGCTCTGCTCCTATATTAAGCGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCC:1 - chr3L 2087322 5' + accord 6957 2 58.42 ATAATATACACCTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCTGTTTTAAGTTGATGGCAGCCGT:1 + chr3R 30553552 5' - 412 459 2 52.48 AAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACAT:2 - chr3L 3540208 5' + mdg3 5280 2 51.49 CTCGCTCCGCTCACCACGGCCACTTTGTTACACCAACGGCTTCTGGCACTCCATTCGAGGTCAGGGCAACCAGTTTCGCCTGCGTTGGCGCTGAGCTCTTG:1 + chr3L 13842155 5' - R1A1-element 474 1 65.35 AAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTTATCTTTGTTAAATGTTGATAACTGATTTCGGCTTAAAACTTTGTTCTATTAGGGCTCCTGATATTTCCTCAGGATTT:1 + chr2R 3579092 5' - Fw2 466 1 74.26 CAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:3 + chr2R 10315297 5' + Doc 81 1 72.28 ATTTAAAGTGGAGAGTGGCAGTGCTTAAAGTGCAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 9278336 5' + roo 41 2 70.30 AAAAATACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chr3R 11052098 5' + blood 30 2 59.41 GATGAATAAAAGTATGATGTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCAATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTA:1 + chr2L 21734993 5' + 17.6 6940 1 65.35 GATGTTACTGTTGTGCACTGAGGGAAAATATTATGAATACTACTATATGAATGAATACACTATACGACACCATGAATAGATATTACTATCTATAATAATAT:1 - chr2L 3588605 5' - Tc3 283 1 66.34 TGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTGCCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 - chr2L 17677762 5' + Tirant 49 2 73.00 AGAAGTTAGGTTTTTGATTTACCACTATATTAATACTACTATTGTATATTACTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 - chr2R 19089032 5' + Tabor 25 2 49.50 GAAGTTGGCCGAACAAAAAAACACACCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 19334636 5' - roo 9022 2 76.24 TGTTGACAGCAGGATCATTNGGATCATTTGGCGATGCGGCATATTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chrX 7788598 5' + 412 33 2 56.44 ATAACTACAAAGACGCCGAGTAAGGTGAAAACTTTTGCAAACAATAAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3R 17660548 5' - roo 9041 1 56.44 ACCACCTATAAGTAGGCCTACCTCAAAAACTGAAAGCGAACGTGGCTCAGCAGGAGCTAAGTATTGGGTTTATACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3L 171267 5' + 1360 5 2 74.00 TAGCGCAGTTTGTTTATTCCTTTCGCTGCTTTTTTGCTCAAGATTAATGACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTT:1 + chrX 4233467 5' + accord2 7255 1 58.42 ATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 19450176 5' + roo 45 2 59.41 TGCCGCTCACCCCCTCTCGNCGCATCTCTGCCCAACAATTTGTTTTACTGCTTTATTGTTTTCGTTTTTGTCGTTCCGAATATACCATGGAGCTCCAGTAA:1 - 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I-element 5304 1 84.16 TGTTGGGTAAATAGATTTTTTCATATAAATAATCCAGTTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 + chr3L 20758941 5' - flea 4980 2 62.38 AAGGAGGCCCCCAAATGTATGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3L 13895357 5' - hobo 2911 1 52.48 TTTATCAGCAAAATGCTTTGGTTGGGTTAGTCATTGAAATACATTTGGCCCGCTTTCAAAGTCAGCTGATTGAGATGTGCTTTGAATTGTGAAAATTGGCG:1 + chr2R 24642331 5' + transib4 182 1 57.43 CAACATAATTATGCGCAGGGAAGTAGGCAACGTTTTTATTTGTTCACTTTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCTAA:1 + chr3L 20049593 5' + jockey 4761 1 77.23 TAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:2 + chr2L 8577285 5' - roo 9027 1 74.26 GTCTCCGATTCCGATTCCAATTGCCAATTGTCAACCCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACAT:1 - chrX 1109613 5' - Doc 197 1 64.00 CCCAAGCCGAGAGGAAAACCCAGGCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTAAATTTAAAGGTTTTTATTTGTTTTACCAATTGTTTTTAA:1 - chr2L 14485229 5' + Tc1 1485 1 77.23 ATAATTAACTAAGTATACCAGCATTTGTACAGCGAATAATAGCGCAAAAACTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTA:1 + chr3R 19505506 5' + mdg3 5252 1 71.29 GTTGCGAGATATACCATCTGCTCCCTCGTAGGCGCTGGTGTAGCCATCCTCTGTCTTGATGATCTCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr2R 11259545 5' - 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chr3R 12063826 5' + 412 7069 2 61.00 GTCAACTTTTCGACTGTCCATTGTGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTTTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATT:1 - chr3L 19338094 5' - Tc1 1550 1 78.22 GATGTTAATTCGATCGTTAAGCGGACTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr2R 21351031 5' + opus 44 4 74.26 GTGGAAATCAGGCTGTTTGCCACGCCCCAGGCCGCCACTGCCACCAAAATGCAGGCGCTGGCCTTTATCTGTTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chr3R 11321110 5' + hobo 2 1 75.25 GAAAATAAAATAATAAAATCGAAACATGAAACATTCTGATTGTATGCATAAAGTTATAAACATTAATAAAAAAATAAAAAAAAAAACA:1 - chr3R 4975920 5' - hopper 150 13 52.27 TGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr3R 18399230 5' + P-element 52 1 30.69 GTGCTACAATTTAAAATGAATCGAATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCAT:1 - chr3R 15790151 5' + flea 4702 1 43.56 AAATGATGAATCTGCAAATATTTCCTTGCTTTCAGTGCCTTTAACCCACACACACACACACTTGCTCTCGCACTCACACACACACACACACATACGCA:1 - chr2R 16516492 5' + accord 7032 2 87.76 CTCTGGAGGAGCGGCTTTTGTTATCGAATGCAAAACTATTTAGCCATTGCTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 - chr3L 12438076 5' + I-element 29 1 54.46 TTATAACTAAAAAGATACANACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGT:1 + chr2L 23286585 5' + Tirant 417 1 60.40 TCTTTTTAATTGCTAAATTTGCTTCACTTTCTGCTTATAACGCACTAGGTTGCCTAAGGTTTTTACCACAGGCACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGTTTTT:1 + chr3L 11314397 5' + Tc3 315 1 43.56 TGCTCAACTCAAAGAATTTCGTTTTTAATGATGTTGGTTATTCCATTAAAAAAGGAAGAACGCTGTAGTTGGGTTTCTCGACTAGCTGATACCCGTTACTC:1 - chr3R 4637998 5' - INE-1 549 1 53.47 ATAAATGTAACAGAGAAAGATATTTAAGTTTGCTAAATAAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACAGG:1 - chr3L 23597296 5' + invader4 2712 1 82.18 CGCTGGTGTAGCCATCCTCTGTCTTGATGATCTCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr2R 11259577 5' - hobo 2895 1 65.35 ACTCCATACTCTTTTCTTGNCCATTCCATTTCCATCTCAATTTCTAGTGCTAATCTAGTGCTAATCAATTTCTAGACTAATCAATTCGATCGCCGACGTGT:1 + chr3L 17140574 5' + F-element 10 1 48.51 CTACCCAGTGCAACTTGGACTGATAAAGGGTTGCGCCAAACGTAAGATATTGCTATTGCTGCAGGCGTCGAGAATATGGTCAACGGCGAGCTCGTCCCCGC:1 - chr3L 13983696 5' - Ivk 5121 1 61.39 CCATGTAGCTCGTTTGTCGNAAAGCTCTCACTCTGCCAACTTGCTTCTCGCGCGAGTTACCTCCGGGGAGTCTTGCGGAGGGATTATCACTCAGAA:1 + chr3R 3753077 5' - ZAM 8394 2 55.21 TTAGAAGTTCTTTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGT:1 - chr3L 10474207 5' - copia 222 1 62.38 CAAGTCTATCGCTTTTATTNCTATGATGAGGTCGAGTGAATAGTAAACAGCAAAATGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGG:1 - chr3L 2022088 5' - roo 8598 1 56.57 TATGCAACGAATTCCTCAAGATGCCTTTACAATCGAGATTATTTTTCTTTCTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 + chr2R 24550657 5' - jockey 4974 1 51.49 AAGACCAGATGATGTTAAAGAATTCATTGCCTCAGCAAAAAGTTCTTAGGATGCATACGTACATATTGAGTCTTATGGGTCAAAAAAATAAAAAAATAAAA:1 - chr3L 10810226 5' + R2-element 3584 1 72.28 GTGCGAATTTCTGTGTGCAGCAGATGCATTTAAATGAAACAAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTATTTTTCTGATGC:1 + chr3R 29029522 5' + invader1 3673 2 79.21 ATACAATAAATGACTGGGTATAACTTAGTATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACTAAGCACTCCAGAGCCCCAGTAATACGATCTAAAGCTGATACA:1 + chr2R 545173 5' + Stalker2 7391 6 70.30 TAAAAATAAAATAAAAGTGATTTAAATCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 12944726 5' + roo 8714 2 79.21 TGATTGTCAAAGCTTGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3L 3757419 5' - roo 9048 2 56.44 CTTATAAATGCGGTTTAGCTTCCATCTGGTTTTGTCATAAGTGTGTGCAGAGCATACCCCCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr3R 19963468 5' + 1360 14 1 50.00 TTGTAAATTTCAACAATGGCTGTGAAACCATCGCTTCAAAGAGCTTCCACGAATTATTGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 22930291 5' + roo 17 2 62.38 AGCTCTCAGCTCCTTTTTAGGAAAAACCGTAAAGTGCTTCCAGTATTCTTACTCTCAAAGATGTTGGAACAAAGACCCTAGAATAACAAGACGCGTAACGC:1 + chr2R 2945289 5' + 1360 11 1 70.30 CTTTTCTCTTTCTCTCTTCNCTTTCGCACATTCTCACCACTTGAAAAAAAGCAACAACAAAACACACATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chrX 4293237 5' - roo 9046 1 61.39 GACGGCTTTCAAGCTCAAGAACACACCTTAAACTGTTTTTCAGAACGCTTAGCTCACTGCGAAAAATCAGCGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGG:1 + chr3L 735989 5' + gypsy6 7418 1 70.30 GTTTACTAGTTTTGCGGCTNACTCGATAAAATTGTGGTATAAGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chrX 5475460 5' + 412 7085 2 58.42 TCATTTTACCTTGATGAAGGTACTACCATAAGTTCTATTTCACATGAATCTCTTAGAATCCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACT:1 + chr3L 19484177 5' - Quasimodo 6974 2 61.39 CCATTGTATATATGGTCCCTGTTATAGGAAGGTTAAAAAAAACTTGAAGTGATAGAGACCCATTGTGGTGTAATAAAACTTGCATTTAGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 16997387 5' - Penelope 249 1 79.00 ATATTTAAATTAAATGTGCAAGCAAATACCAACACGGGTAATATGCAAACAAAGGTATATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGA:1 - chr2L 15567189 5' - 17.6 7405 2 66.34 AGATTAGCCGGCTGAAGGGATGAAGATACAGCTGGTTTGCAAAAAGAATGTGTACCCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chrX 15287940 5' + hobo 18 1 55.45 TTATCGGCGTGAGAGCTTCACAATGGGTCATTCGAAAATCGGAGTGACGTGGGAGACCAACTACATGGAAATGGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr2L 5927032 5' + pogo 1 1 69.31 GAGAAAATGTTTGTGGATAATTTTAAAGCGGAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGCCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCA:1 - chr3R 4577842 5' - Cr1a 4180 1 78.22 CACAACAGCCGCCGCGCGAACGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTAAATCCTATTTGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTA:1 - chr2R 4933202 5' + X-element 4594 1 70.30 GCACATTCCTCTGGCATACTCTAATCAAATACCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGCAAATTA:1 + chr3R 28184493 5' - Cr1a 3997 1 71.29 CTTGGCCCATGGTTTCTTGCGCTGCGTAGCCGGAAGGGTATCACATTTGCTTGCGGATATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGA:1 - chr2R 12332307 5' + micropia 5294 1 63.37 AGCCCCATTTTTTGTGGCATAATTTAAGGCGACATTGACAATGAGACGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAA:1 - chr3L 6023353 5' + hopper 29 1 51.49 CTGAAAAAAAAAGCCAAAATGTGTTATTTTGGAAATTCTGTTCGGGTTGTAATTTCTAAACTTGGCCATTAGTTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3R 28621116 5' - 1360 3388 2 68.32 CTAAAATTGCTGTTGAAAAATAAAATTAATGTATGTAACATGGGGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACAT:1 - chr3L 20758994 5' + flea 4800 2 72.45 CTTCATTAAAGAGGTATTGAATTATTCAGAGAATAGTTAAAACCCTTAAACACTTCCCCTAGTTTTTTATTAGTGGTTTTCTAATAGTCGGGAAACTCGAC:1 + chr3L 3706076 5' + INE-1 561 1 60.40 TAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 - chr3R 20094496 5' + Max-element 8288 2 77.23 CTCGCCTTGTCGCCGCTTAACATCCGAAGCGACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACA:1 - chr3L 6192999 5' + F-element 335 1 67.33 GTGTTTAGTTTGGCGATAGTTTAGTTTGACCAAAGAAAGTCAGCTATCACACTGAACTCACTAGGCACATAAAGTGGCATAAGATCCCACAACAATATGAT:1 - chr2R 24447036 5' + S2 1341 1 75.25 CTCAAAAAAGCACAAAACCAGCAATGTAACTCATTGCATAACAGAAGAAACTGAACTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr3L 21970787 5' - pogo 2084 1 67.33 AAACGATTTAAGAAATGTAAAAATACAGCATGCGGCAGCATAATTTCCTTTTTTTTCAGAACTCAATGAAAATCTATTGTAGGCATCGGAAAATATTTATT:1 + chr2R 7394123 5' - mariner2 840 1 76.24 ACTAACTGAGTAGCTGCCAGTTAAGGAGCTCGTATATAAATATATATGTCGAAGAGTCATGAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTC:1 + chr3L 18122304 5' - invader1 369 2 60.40 GATATGCATAAAAAGTCAGNATTTGCTGAAAGTCAGGGCAGTACTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chrX 17494687 5' - 1360 3356 1 62.38 AAAGCGCTCGATGCCAAAGCAATTGGGTTTATGGTCGTTTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr3R 6034016 5' - roo 9039 1 59.41 TATACATTTATTGGTTGAATAGCTAGCTGGTGCTGTTCTCCCTTAAGTAAGTCACAAAAAACCTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCC:1 + chr2L 3408599 5' + G-element 17 1 60.40 TGAGAAAAGATAAAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2L 13093764 5' - roo 9048 2 55.45 CCCAAGGGCTTTGAAAATGTATTTCTGCGACGACAAGTTCTTAGCGCAGACTTTTCGCCCCAGCAAAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGA:1 + chr3L 9910327 5' - 297 6971 2 75.25 GGATGCCTAAGTAAACAAAAGAGTTGTGCCATACGTACATATGTAACCCGAGAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGG:1 + chr3L 18728518 5' + Bica 380 2 58.42 AAAAGTATGCAACACAAGGNCCATCACTTTCGCCAGCGCGCTGGCAGGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr2L 10166060 5' + jockey 33 1 51.00 TTGGAATCTGGATTTTCAAGGACCTTTTACCAACCCTAGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chr3L 18418920 5' + hobo 17 1 62.38 CTTAATTCAAGTCATATTCTGTGCAATGTGATGAACAGAGTTACCAGTATTGTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr2R 20312576 5' + 1360 22 1 55.45 TTCTGCGGTGAAAGGGGTAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chrX 17858032 5' - P-element 2829 1 20.79 ATATTTAATTTTAATTGTCATAACTAAGTGATTGACTTTAAAGAATATTTGATTTTCGCCAGCTACATGGGATGCTAAAAAAATAACGTATTTAATTAAAA:1 - chr3L 10537299 5' - copia 4838 1 68.32 TATGTATTTGTGTTTATGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:2 - chr3L 14594159 5' + hobo 52 1 80.20 CGACCAGGTAATGTAAAGTTTGACTAATGGATTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATATTTACTGATTATTACTTGTTGTCAA:1 + chr2R 7401783 5' + invader4 2649 1 68.32 TATATACACTGGCGCAACCGATGTGGGCATATATTGTATAATGCATACGGTTTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chrX 12472617 5' + pogo 20 1 64.36 TTTGCTGGACAACGAGAAGGCAAGGAATTTAAATGAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 - chr3R 14580356 5' - blood 336 2 64.36 CCGAACCAAAAGCAACCCGACTCTTTGAGTGGACATGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGGTGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2R 6850445 5' - roo 9033 1 65.35 TTGACATTCACGTAGTACAATAAATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 + chr2L 20684292 5' + I-element 51 1 80.20 ATTCATGCGCCTATTAACTTTGCCTCCATGGAACAACGGACATTTTTCCGGTAAGCTTATATGTATATATACTTATATATTGTAATGATGAACTCCCATTA:1 + chrX 5475358 5' - 412 494 1 75.25 CCGTTGCCGGGGCGCCAAANGTTTTTCCAACGTTTCGTTTGGCTCGGTTTGGTTTGCTTTGGTTTCGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr3L 17186898 5' + Tirant 8 2 72.00 CTGCACGGGATGTCCAAGTGCGGCTGCTTCACGAAGAATTAGCCTTGCATTGGGTTGTTGCGCTGAATTGAAAGCCGGCGTTCGTCATGCTCACGCTGAC:1 + chr2L 97914 5' - F-element 220 1 61.00 GCTTGAAAGACATTTTATTATGTTTTTAAAGTGTATTCCTATTATTCTTAGGGATGTAAAGTTCTGTATTTGCATGTAGATAAACTGGACTTTTCGCTCTC:1 - chr2R 5582046 5' + Cr1a 275 1 75.25 GCCGCTCCTGGTTGTCTGTATATTTAAACTCAATTCTAGTGTAATGATGAACTCCCCTTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr3R 28565323 5' - 412 7511 2 55.21 ACCCACACTTTTTGATGTGGACAGCACAAAGTTGCGCATTGTTTGGAAATTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 - chr3L 9907424 5' + jockey 4699 1 56.44 GATGGATTAACATGGCCGCACGGGGCTCATTAAGTGCGTCGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGACATCCAATTTATGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAA:1 - chrX 21227819 5' + transib2 367 1 60.40 TTATCTCAACAGAACCTGTNTTGTTTTTTGTATTTTATTTATACTTTATTAAGTGGGTTTGCATGTGTACTGCGACTCAGTCGGATCTATTGTATTACCCC:1 - chr3L 24154908 5' - baggins 5394 1 59.41 AAGCAGGATAGCATGAGAGNTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3R 23543015 5' + 412 7089 2 61.39 CTTATAAATGCGGTTTAGCTTCCATCTGGTTTTGTCATAAGTGTGTGCAGAGCATACCCCCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 - chr3R 19963468 5' + 1360 15 1 49.50 CGTTTACGGCAATTACTAACCGGAGCAGAGGAGGTGACAAGCAATTAGGCGGTCGGCAGGCGGCGGCGGGGGGTTTTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTGGG:1 - chrX 20826421 5' + gypsy12 3 2 73.27 TCTCTTTCGCTGCTCTTAAAAAAACAGTTGAAGATATTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 3468307 5' - HMS-Beagle2 488 5 78.33 TGACGTCTTAATTTTTATTTCGGCTCCCGGACTTGGACCCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGG:1 + chr2L 12808130 5' - Tirant 397 2 75.25 TGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTA:1 - chr2R 16185091 5' + 17.6 43 1 79.21 TCGGGAAAGGGGCTAAACANAAGGAAAATGTACATATTTTTAATAAAAATTAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 14019297 5' + Doc 4693 1 62.90 AGCTATGAGTGCTGCAATGAGAGTTTGAGTTATCAAAAGTAGCGTACGTAGGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTTACTCCGAACGT:1 - chr2R 7203326 5' - F-element 4371 1 49.50 CTCGATTTGCCCCACTGTGCGGCTGGGCGGTCGCGTCATCTTCGTTATGGCCGTCACTTTATTCAAGGGGGGGAGGAGGTACCACCTCT:1 + chrX 6545965 5' + gypsy5 6931 1 51.69 CCAACTGTAAAAAAAAGGGTGTTATAAAACAAAGGGTATAAGAAATATGAGAAATATGAGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 - chrX 22734103 5' - copia 234 1 49.50 AAATGGCACTATGCACGTATCCAGGGTTTTAGTGACGGCCAAAATTTCTCTCTTTCCGCTAGCTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTG:1 - chrX 19218592 5' - 1360 3271 1 84.16 ATCGCTCGGCTCCATATCCGAAAATACGTTAACCCACCCAGTTTAAAGCCCCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATACGCAAAATCTTGATAAACA:1 - chr2R 22413205 5' + I-element 79 1 66.33 AATTCTCATCAAGTTGTAAACCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 - chr3L 20354050 5' + 412 57 2 80.20 ACAATGCGATTCACGATGTACAATAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr3R 23638107 5' - pogo 2061 1 72.28 TTAAGGCTATGTATAAACANTGGCTGTTGGAGTCTTATAAAATATATGTGTATGATAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCC:1 + chr4 74249 5' + 3S18 5786 2 57.43 CGCTCTCGCTTCGATGACACACTTTTCGACATATTTAAGTAGGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 + chr3R 24767795 5' - P-element 2855 1 45.54 GTAACAGTTGACTAACACTTTAGGTCGACCATAAGTACTCGACCATAAGACTCTTCAATAGCTTGATGATATTTTGTTTTCTTTTTTTTTTAT:1 - chr2L 16768961 5' - BS 5103 8 64.52 CATCGAGATCATGTTGTGGCCTTCACAGTACTTGCCCGTATAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCAC:1 + chr2R 15875244 5' - blood 376 2 60.40 CCAAGGTGATAGTTTTTGCTTTCAAAGTAGGGAATGGAGTCCAAAAAAACTACTTAGCTCATATATTCATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAA:1 + chrX 22734019 5' + copia 4877 2 53.47 GACGAATATGAGAATACCCAGTAATACTGAAAATTAATTTACATATTTATGTACTTTCGCAAATTTTTTAGTTGTTTTCGATGTATGTATTTATTTAAAAT:1 + chr3L 3037084 5' - G-element 4303 1 47.52 AAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACG:1 - chr3L 19350023 5' + 1360 3202 1 56.44 CTTTGTACGAGATGAGATGTCGTCGCAGAAATTGCGACCTCAGTTGGTTCCTTTCACCAACTGAAATGTGAGTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACT:1 + chr3L 11609012 5' - Doc 4438 1 79.80 AATGTGAAGTTTAGCTTAAAGGAGGGATTTATTGCACACCTTGTAATATCTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 + chr2L 9045412 5' - jockey 4967 1 51.49 GGCCAGGCAGAACAGAGGAGCTGTCGATGAAAGCGATTCATTAAATTTGATTGAAAAACATTCGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTC:1 - chr2L 8174139 5' - 1360 3183 1 66.34 ATGTAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chrX 17104411 5' + 297 43 2 78.22 TTCAGTCCCGAGGATTTTCCCACAGCCCCCAACCCTAAAATCGTTGGCGTCAATTTAAATTTTTATTTCTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACTATTGAAG:1 + chr3R 31898264 5' + HB 1478 1 68.32 ATAAATCCAACAGGACCTTGTGCGCCAGCTCCAAAATGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCG:1 - chr2R 23409802 5' - Rt1b 5003 1 64.36 TTTTAATTGTGAGCTGTCGCTTTTTATTTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACA:1 - chr3R 18739631 5' - flea 4806 2 72.28 ATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGTTAGATCAACTCGGCTATTGATCATGACCAAGAATAT:1 + chr2R 1751255 5' - INE-1 84 1 89.11 AGACATTAAGAAGAGAGATCAGCTTACTAAACAAGATATGTACAGACATAGAGTACTAAAGTTCTAGGACACTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGC:1 - chr2L 8176500 5' + 1360 4 2 75.25 ATAAATTTAAGCTTCAACGGCTTATCTTCGGGCCCGCTGTGGTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAAT:1 + chr2R 23780014 5' + mdg1 36 2 59.41 ATCTGCACATGAAAATCTGGTTAACTTCGTTTAGAAAAGAACCGCGAAAAGTATTGTGGGAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTC:1 + chr2L 9045780 5' + hobo 236 1 61.39 CCGCCCAAGCAGCGGCCATGGCAGCTGCCCAAGCTGCAGCAGCCCAAGCTGCTGCGGCGGAACAGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAAT:1 + chr3L 21435542 5' + F-element 274 1 65.35 GGAGCTTGCAGTGAAAATTTTCAAATATATGGCTATTTAAATATGTCTTTTTTCTAATATTAAAGATATAAATACATATTACATGTAAGATTGTTTATTAT:1 - chr2L 14010908 5' - flea 258 1 76.24 CACCTTTTGAAAAACATATNGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACG:1 - chr3L 20224218 5' + Chimpo 34 1 61.39 GGATGGCAGATCCTGACGAGAATGCGGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr2L 13566472 5' + hobo 20 1 55.91 CGGGCGAAATGAAAATGCCAAGAATAACGATGGTACAAAGAAAATCGGTGGAACAACACGTGACTTACCCTAAGGGTAAAATAAAATAAAAAAAAATAATA:1 - chr2R 19042295 5' - transib1 1896 2 78.22 TTCCGGCCGGATTGTTGGCCATTTTGTTTTTACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr2R 19560165 5' + Tirant 42 2 65.35 ATATTGGTTTTTGCGGTTGTAATGAGCTCTTCGCTTTTCCGCAGGCAAATGCGAATTCTTCAGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:3 - chr2L 19642401 5' + Quasimodo 6 2 74.26 AGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 9278374 5' - roo 354 2 80.20 GAATGGGGCATATTGCCACATGGCCAATTACCGTTTTATGAGGGTGGATCAGCAGTATCTCAGCCGGGATACCACAGATAATAGTCTTTAATATTTGTAAT:1 - chr3L 1320907 5' + gypsy7 5092 1 72.28 CGTTGCACAGTACAAAAAGCCCCATGGAACATGATAATTTGTTAACTTCCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:2 + chrX 4277456 5' - roo 9046 1 59.41 TGCGTGTGTATCTGTGAGCGTAGTTGTTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCG:2 - chr3L 5241199 5' + Ivk 8 1 71.29 ACTTTAGAACTTTTATTTTTAATGGAGGTGCGAGAGCATGAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 + chr3R 22349475 5' - pogo 2066 1 61.39 GTTTAAGAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 8577265 5' - roo 9047 1 54.46 CATATATTGCATAAATATCATTTAAGCCTTGAAAATGTTGCAAAACATTTAAAATAATTACTGGATATACAAATGTACTATAAATAAATATTTTCCGATTG:1 + chr3R 21094811 5' + mariner2 837 1 87.13 CGGCTCCCGGACTTGGACCCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATG:1 + chr2L 12808150 5' - Tirant 8484 2 55.45 TGCAACTCATAAATCACTGCGGAAAAGCTTGAAAATTTTCCACACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr3L 5415403 5' + I-element 30 1 53.54 ACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 29608795 5' - roo 359 2 74.26 AAGATTGCTGGCGAAAAACAAAAGGTATATTTGTATCTATGCATTTTGTATGCGGGTTTTCAGCAACTGTTGTCCACCTTTTTTTTTTTCTTGTTTATGTT:1 + chr2L 16026278 5' - Porto1 160 1 77.23 CTAATAGAATTCTTTTTTTTTTCGAAGGGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1 - chr2R 21747584 5' - mdg1 372 2 71.29 TAATAAATTTGAGTAATAATAATTTGAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAAC:1 - chr2L 16851774 5' + HMS-Beagle 44 2 70.71 ATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3L 9928535 5' - roo 9039 1 58.42 AGAATCCAACGCTTTACCAACTAAGAAAATTAAAACGCAGAACTCCAATTAAACTATTAATGTATTGTATTAGCTTATCCTTGCACTGTGAAGGGCCGCTA:1 + chr3R 6819304 5' + Porto1 4586 1 63.37 TTGTCCGTTGTTGATGTTGGATGTTTAATAAAATTTGAGTAATGGATGCGGTCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 - chr2L 126556 5' + Doc 28 1 52.48 ATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 + chr2R 16160761 5' + mdg3 37 2 61.39 CAGGTACACTTAGAAAACAGTTTACATGGGGATTCAAATTTGGCCAAAAGCAAATAATTTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr3R 22210937 5' - gypsy11 3935 3 56.76 AAGGTGTGGTTTCCCCACATCGATCGATATGCTGAAAATTGAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAA:1 + chr2R 2923333 5' - 17.6 366 2 70.30 ATTGTCAAAGGGTTTTTAACAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 3580918 5' + TART-C 11100 1 72.22 GAAAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr2L 10625676 5' - roo 9036 1 58.42 CTTGCCGCGTTTTTTGATAAGGGCATTATTCCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chrX 19308176 5' - P-element 2842 1 34.65 ATGTGTGTTCTTACAGCCCCGATCATTTGTATTTCCATTTGAGTGCGAGCGAAGACGAGGGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr3L 20353991 5' - 412 476 2 62.38 CTACTGCACTTGCCTTTGANCCCATTGGGACCCACACCACGTTTGGTATGGGGAAACATTTGGTTTAGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr3L 14624013 5' + hobo 10 1 65.35 AATGATGTTTCTAATGCAATTTTACCATAAGTAGTCTAGCAGCCGGCTTCTAAAAAGTACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:2 + chr2L 2833844 5' - roo 9055 2 61.39 GAAGGAAAATAGAAGGGGCAGGAGAAGTTGGACCTAGTGCGATTATTTGAAGCTTTTCCTTTAGTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTA:1 - chr2L 15289493 5' - pogo 336 1 61.39 CTAATACTGTTAAAATCTGGGTTGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCG:1 + chr2R 19091604 5' - Stalker2 7618 2 55.45 CGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 8765561 5' - roo 355 2 79.21 GGAAAGATACAAAATAGCCAAGGAGCCAATATACATACATATACATGTACATATACATCCACGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 + chr2R 15349477 5' - P-element 2871 1 64.36 GACTCTCTCTCTATCCCTTGATCTTGAACTCCAACACTGCAGCAATAGCAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAAT:1 - chr3R 4639821 5' - BS 5009 1 63.37 AGATATTGTAGAACGTGAAAAAAAACGAAAGAAACAATCTAGGTGCAAAATAGAAAGCAGAATAACGAGAAATGCAAGTTTGCACAGATTCGACACTGTCA:1 - chr2L 2917614 5' - S2 1517 2 77.23 CTTGAAAAATATAAAAATAGATGAAATAAATACGGTTCAGAAGTATATTCCAACACGCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATA:1 - chr2R 13262237 5' - copia 4824 1 59.41 ACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGGGACGTATTCGGGTGGCCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr3R 7869107 5' + 297 6599 2 61.22 CCAGCATCCCGAGTCAAGTGTCTGCCCTTCGGAACATCCCAAATCGGCTGAATCATTGCCACCAACGAACGCACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCC:1 - chrX 4488965 5' + Ivk 5024 1 65.35 GTGATATGAAGAAATGGTTAGCTAACTCGGAAAATAGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 + chr3L 7168305 5' + Doc 23 1 58.42 CGTTGTGTGCGGTAGTGTAGGTGTGAGTGTGTGCGCAGGTGGGCGGCATGATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGCGTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGGTGG:1 - chr2R 21502521 5' - TART-B 151 2 60.61 AAACATTTGAAGCACAACACTTGAAAATATTTTGTATATTTTGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:2 + chr3L 10701714 5' + roo 8698 2 67.33 TATCAATAAACCGTTTAGAGTAATAAAACACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAAC:1 - chr2R 16185124 5' + 17.6 10 2 70.30 GAACGATTTGATAAGACTAAGAATGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 14222478 5' - roo 9021 2 78.22 GGCCCAGTAAAACCATATATTTATGTGGCAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 + chr2R 18766221 5' - hobo 2894 1 68.32 TAAACCCTACTTTAATTTATATAGAGTATTACCACAAAATAGTGAACAACATGAACTTAAAAGGTATTAACTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAC:1 - chr3L 10448068 5' + INE-1 556 1 69.31 GTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr2L 17730499 5' + pogo 37 1 70.21 CTGTTAGTCGAGAACATTATATTGGCATTTTAGCCCACACAGTACGCCCCTACGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chrX 10286135 5' - roo 388 2 54.46 TAGGTATGTAGACACCATGGTTCGTCTTCTTTAGGTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTT:1 + chr2R 24946732 5' - FB 328 1 68.32 ATCAAGCGCTTGCACCCAGGGCTGCAATGTTCGGGAGTACAGTAGCTATAGGTATGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr3R 21365575 5' - P-element 2865 1 59.41 AGAGATTTGATTGGTCCTTACAGCTACTGTGTAATTCCATTGCTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACG:2 + chr3R 4971376 5' + F-element 17 1 71.29 CATTTTGTGAATTCCTCAANATGTTACGTAGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr3L 20520695 5' - P-element 2841 1 32.67 TAGTTAGTACTATTATCTTTTTTTTTACAGCCATTAGCCCTACGCAAATGCCACTAGCGATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr2R 18432045 5' + 412 15 2 64.36 CTGCAGCCATGCCATCGTATATAACCACCCAAGACTGCCACCCATTGAAGGTCGTTTACTGCGCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGGAGAA:1 + chr3L 11886810 5' - invader1 107 2 64.36 GTCGTCGCCATTGTCGTCTAAGTTCTCGGAACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr3R 26252686 5' + 412 7098 2 66.34 AGTCCTGCTAAATAATGCACGTCCTTGGGGGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr2R 24278024 5' + 412 46 2 70.30 AATTGGCCAGTGTGGGTGGCGCAAAAATACGTCACTAAATACCTGTTACATACTTGGCAACGAATATACCTTTTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATA:2 + chr2L 21715736 5' - 1360 3373 1 72.28 TCCCCAGCTTGAAGTGTCCTCTCTGTATGTATGTACAAATGTATAGTATTGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3R 19216341 5' + 1360 28 1 55.45 GACCTCGACCATCGAAATCCATCAACAATTCGAGCGCATAAAAAGTGGTTATGACCCAGCGTTCGCATCCACCATCCGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGA:1 - chrX 3235754 5' + INE-1 551 1 70.30 TAAGTATTTGACGTTTATTTCGTAAACTACTTGATAAAACCAAACACTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 - chr2R 10353345 5' + blood 5 2 72.28 TCTGTGAAGATGCCAGCATAATTATAATAATCATTTCATAATCATATTTTATTCTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGG:1 - chrX 8727935 5' + X-element 27 1 52.48 TACCACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTTCT:1 - chr3R 2533955 5' - gypsy8 4815 2 55.45 AAATTTTTTGATTTTAATANTTAAAAATATATTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr3L 20584073 5' + pogo 40 1 70.30 AAAAGCTGGCCACCGGAGGCAACAATTTCCATTTGGCGTTCGCTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAA:1 + chr2L 17994142 5' - roo 376 1 53.47 TATAATTGCCGGGTATATGCATTAAAGTGGGTCGCAGATCTAATTTTAACATCAGAGGGTATGACTTGATCCATACCAACCATCCATCTGGCTGAGCACGC:1 - chr2R 1439709 5' + G2 434 1 70.30 CATGGAGTGCGATTGGATATGTAGGCATTACTCACCTAATCCATCAATGACTAGCCCATGTAATAGTCTGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAAC:1 - chr3L 9569767 5' + jockey 4981 1 67.33 GGATTTAAATGTGTGTGTGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 - chr3L 3540227 5' + mdg3 5261 1 70.30 TTAAATCTATCTCATATAGAACGAAATAATTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGA:1 - chr3R 7867289 5' - 297 324 2 71.29 AGTTGTCGAGCTAAGAGTGCACTTGAGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 9649170 5' - roo 9041 1 56.44 TTGTATCTTTCGTTCGATTTGGCGACTTTGATTTCAGTCGCCAATCGTCAATCGCTGCGCCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr2L 8709394 5' - P-element 2872 1 64.36 TTATATTACTGCTCCCATATTCAGAGCACAACTCCGAGCACTAGCACACGAATAGATTTTCCACAACGTTGAGCATATGCCAGCAACAGCAATATTGACAT:1 + chrX 2330126 5' + F-element 4296 1 75.25 ACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3L 8036422 5' - roo 360 2 77.23 CGGAGAGAGGGGACATGTTAACTCCCGCGACATCCCCAACCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATC:1 + chr3R 2891753 5' - accord 166 2 60.40 GTCCCTTTCTTGACTTAAAATAGCTTTAGAAACCTCAGCATTGCCATCCGCCACCTGGCAACCCTGTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAA:1 + chr3R 7814253 5' - copia 145 2 71.29 GGTTAAGTTAATTATATAGTTATATAATGCGATTTTCGTTGGCATCATCTTATACGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGC:1 - chrX 22808701 5' + Max-element 23 2 56.44 TTCGAGCATGTTCGAATTTTCAAGAGCGACGTATCTGAGAGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTT:1 + chr2L 19854076 5' - roo 372 1 64.36 TCAAACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr3L 8036428 5' - roo 9030 1 71.29 ATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTC:1 - chr3R 25086146 5' - Bari1 1656 1 76.24 ATTAAGCGTTTCAAAGCGTGAAAAACGCTTCCTATTATTAGTTTAATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAGTTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 - chr3L 7099686 5' - roo 411 1 77.23 CACAATAACAATAAAAAATCAGAACTCAACTACAAACCCAAATAAAACCAAACAAATTTGTGGATCTACCCTGGCTCCAATGCATCACGCCATAAACCCAT:1 + chr2R 2017531 5' - gtwin 7102 2 58.42 GCCTCTTGTGTTGACTGTTGCTCATTGTGCTGCAAATGGGGGTGGCAGGTGGAGAACACCTCTTGGGGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3R 23338359 5' - 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P-element 2831 1 23.76 CATAGGTTGGGCAGCTAGCNAATTGTGTTCGGAGGCGGCATCGAAGGACTCGAAGATTTCTTTCAATTTCTCCGCGTTCTCCACCGGTGTCTGGGTGCACT:1 - chr3L 990763 5' - Osvaldo 1166 1 53.47 AGTATTACATATAGAAAGTGTCGAGTGAGTACGATTCTAATTACAATTTTGTACAGTTTTTTTTTTGGCATTTTATTT:1 + chrX 12780713 5' - Bari1 372 1 30.77 CAGTTATATATAATTTTCGTCTAAATTTAAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATTATTGTTGAATAAATTTTCAATATATTTATTAGTGTAGGTTTAT:1 + chr3R 30364791 5' - Burdock 228 2 71.29 GGCCGCTAAGCTGCAAATCTCTTTAAGATGATACTTTGCAACATTTACAAATGTTTTAGTGCCCCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTA:1 - chr3R 12876398 5' + hopper 10 2 69.31 AGCCTAATGCTACTAGACGNGATTGGGTAACCTGGACATCCACAAAGACATGGAACTTCCACTTGTTAAAGACGAAATAAAGTCAAATGCTGAGCGATACA:1 - chr2L 13658393 5' + G3 4361 1 66.34 ACCCAAACGAACGAAACGATCGCCGATCGCGAAAACAAGATACTGAAGTGTGACCGCGTTGGCTAGGTCGACTAGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATAT:1 - chrX 10086555 5' - INE-1 82 1 68.32 GAACAATTCTTCTCACAGAACGCCGTGGCGATCCCAATATTGACGCTCTCACTGCTTCAATGTTCTCAGGTGATCTAACGGGTCGAGGGACTCCAGTTCTT:1 - chr2R 4802887 5' - mariner2 322 1 77.23 TTAATCAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTAATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - 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mdg3 220 2 52.48 AGTTTTGCGCCTTAAGGAGTCCATCGTTGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTC:1 + chr3R 4588187 5' - Doc 4478 1 76.24 CAAAGAAAGCAAAAACACTGATAATTAATTGCTTCGAATGCGGCTTATCCATTACTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 - chr3L 3242745 5' + diver 6 2 51.76 ACAACCAAAGCCTGCTGAACTGCCAGTGGGGCATGGCAGCTGTTACCGCGCACCACGACCTACTCACAGCAA:1 + chr3R 4481429 5' - copia 5016 2 80.56 TGCCGCACCCTCACCGTAGCGCATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 - chr2L 16358213 5' - hobo 2884 1 79.21 CTCTTTTTGATATACAAAAAATCAACAATTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 26317975 5' - roo 9028 1 70.00 GGTGTATTCTTCTGAATGGNACTCGGCGCTTATCATCACGATTGTATAGGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr2L 109765 5' - 1360 3366 1 55.45 GTGGGAGAGAAAACATAACAATGCCAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 + chr3L 7307232 5' - hobo 2889 1 75.25 AGACCGCCTTTAAGTTTACTCACCATTCGCAGTGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTT:1 + chr3L 18482678 5' - I-element 85 1 67.33 GTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAA:1 - chr4 1294994 5' + HeT-A 6060 2 77.23 CACACTACCCAACTACGCCCTCTAAGCGAATCCGATAGCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAA:1 + chr3L 16068951 5' + Quasimodo 208 2 60.42 ACAATTTGGCAGCCGTCGCTGGGTTTACGAATAAAATAAAAAACAAATAAAAAA:1 - chrX 16851882 5' + F-element 4686 3 81.48 GTTGATATACTCATATCTATTAGGTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACAGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 4063677 5' - roo 9052 2 56.44 AGAATCGGTGCTCACTTTCAGGCGGAAAATTGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGC:1 - chr2L 3294099 5' + flea 375 1 69.00 GCTGACATTTGCATGTTTTTTTTTTATCTTTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 23338283 5' + roo 46 2 78.22 CTAGAGGGTGTTGGGTGGTTCGGGTTAAAGAACGTATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:2 + chr2L 9260331 5' + 297 37 2 66.34 TGTTGCCTCTAAAAGTGCATATTGTAAAATTCTCACATGAAAAAAGCACCATTCTGGTATAAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr3L 19647227 5' - 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copia 254 1 57.43 ATAAAACTTTTCTTTTAATTAAAACATATTTTACATACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 12063749 5' - 412 7505 2 70.30 AAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATA:1 - chrX 983370 5' + Juan 3834 1 52.48 AGTTTAGACTCCTTCAATCAGCCGCAGAGCTGGTCCTGTGAGTGTGGGTCTTAAGCCCACTTCGTGGCTGTGTAATATGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTA:1 + chr2L 15531770 5' - Stalker2 394 2 69.31 ACGATATAAAAAGTATATGTATCTAAAGAGAGCATGAGCAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAA:1 + chr2L 12459367 5' - blood 465 1 58.06 GAGACGTTCATACGGACAGACGAACATGGCCACATCGACTCGGTTAGATCAAGAATATATATACTTTATATAGTAAAAAACGATTCCTTCTGTCTGTTACA:1 + chr3L 23871822 5' - INE-1 31 1 79.21 CTTTGGCAGCTCCATAGCCGAGTTGCTAGTTAAATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chrX 13146890 5' - roo 401 1 71.29 TATCTTTTTATGCCATACCACATTGAATTAAGCTTATAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - chr3R 16735095 5' + I-element 40 1 62.38 GTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTT:1 + chr3R 19589941 5' + BS 5039 1 66.34 ATATGTGTAAATATATGAAAATTGAAAATCTTACATCCACTGCATATCACCACCAGACAAGTGGTCAATGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAA:1 + chr2L 13051744 5' + Stalker4 252 4 57.43 AGATGACGAAAAGGAAATTACTCCTGCACATTTAAACATTAAAATAAAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 + chr2L 7175530 5' + blood 7012 2 78.22 CCCGAGTTCTATAATAACCACTATGGAAGTGCGAACTTTTCCGCGACAAACTTCCTGGCCGGCATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr2R 12473037 5' + Doc 16 1 57.43 TTTTTTCATAATTTTATTAGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTTGGAGCCGCAATCCCG:1 - chr2L 9547551 5' + Idefix 259 2 81.19 CAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:1 - chr2L 15898807 5' + F-element 18 1 60.94 CAATCCCCCACCATTTCTCACTCGAAATATTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 + chr3L 3596689 5' - copia 209 2 72.28 TTATATCGGTGCGGTCTAAGCTTGGGTTGGTTATTACAGGGAGAGTAGTTGCTTCTTAGACTGCGGTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAG:1 + chr3R 851718 5' - F-element 275 1 74.26 ATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGG:1 - chrX 22824224 5' - Gypsy12A_LTR 2249 1 46.53 CAGTCTCTTTCCCCTGTCCTTTCCCCCTCGCCATCACTCCTTCTAGAGACGTGAAGTGACCACTCAGAATTTGTCACATCATTATTCTTATTTTTATTTTC:1 - chr3R 24046773 5' + invader6 4504 2 79.21 TATACACGTCGCCGAACGATTTGATAAGACTAAGAATGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3L 14222465 5' - roo 9034 1 65.35 GATTTCCGTCGGGAGTCTTTTGGCCGAGTTATTTATGCGACAGGCGATGGGGCAACTGCGTTATAAAAGGTCCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACA:1 - chr2L 20844838 5' + baggins 5084 1 68.32 ATTTGCATCTCATCATAATAATGTAAATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCGGTGACAACATGAAGTTGTGGA:1 + chr3L 20757861 5' + flea 4669 1 72.28 TTTAACTCGATTCAAACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3L 8036439 5' - roo 9041 1 58.42 TGAGTGTGTGTTTATGTTTGATAAAATGCGATATGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3R 29287507 5' + hobo 29 1 63.33 TTTTCCCCTTTATGTAGATATATCTCTTCATTAGAAGTTCTTTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 - chr3L 10474237 5' - copia 252 1 75.25 TAATGAAATGGTTTTTTGGAGAGTTTTGTTTTCTCAGTAATGACCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCA:1 - chr3R 14609447 5' - Doc 4529 1 61.39 TCTATTCGTACAAAGAGTACGAATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAAT:1 + chrX 983334 5' - Juan 4164 1 77.23 TGGGTCAACAATCCCAGAAAGTTGATTTGAAGAATAGTCCGATGTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTAAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTATTTTGTTAAG:1 - chr3L 26344958 5' - Porto1 254 1 56.44 ATTTATTTTTATTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTTTATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTA:1 - chrX 21025820 5' - HMS-Beagle 214 2 61.39 TTCCGCTATTCTTATCTCCTTTACTGAAATAATTGATGAATAGGCTTTATTTCTTGTTTTCATCTGCAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 19446762 5' - roo 9045 1 67.33 TGTAAGGACACTGCCTTATGGGCTGTCATTTATTTGACCCGACTCACTCACACATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1 + chr2R 21433129 5' + HMS-Beagle2 18 2 61.39 ATAATTGAAATTAAGTTAATTAAATTAGCTGAAGAAATTATAGCTCTTCTTCATGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCTCTTTTACTTAAGAGACTAGCAA:1 + chr2R 5339254 5' - Doc3-element 4684 1 54.46 TTCTATTATATATATCGGGAACCGAATCTCTGAAACAAAGGAGCACTGCCCCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAAGACATACG:1 + chr2R 4323161 5' + 1360 17 1 43.62 TTCAGTTAAATAATTAGTTCTAATTACCATTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr3L 21519032 5' - 1360 3344 1 72.28 AAATTTAGTTTCCTTATTATATTTAAATACCTTTGTTACATATCATTTTAAAAAATCAACTAAGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 + chr3R 5348638 5' - copia 244 1 69.31 CTTTTGGACAACAAACTTAAACTTTTGTTTATTTCGTACACTAATAAAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCA:1 - chr3R 7513983 5' - diver 195 2 58.42 AAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3L 21144040 5' + jockey 32 1 53.47 TTGTTGCTGGTGGTTGCAGCCGCCTCGGTAATCCCAATTTTGTATTATAATTTGCATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCT:1 - chr2R 20207298 5' - micropia 5331 2 56.44 AAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 + chr2L 20560353 5' + F-element 62 1 74.26 TGATTATTGAATTAAGTTAAACAGCGTTTGTCGTGGTCGGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTGTAGTTCCAATATGAA:1 + chr3R 28171189 5' - R2-element 230 1 67.00 CTTTCGTTAACATCAGGGATACTACCAGTGCTACTTGTACTGCCTGTCTATCTGTCTCTCACTTCCTTGGATCTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGG:1 - chr2L 11721732 5' - Quasimodo 14 2 77.23 AAGCACAAACCACTATTTCTAATAATTGCTTTTTAACTGTTTCATTATTATAATGTAATGATGAACTCCCCTTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:2 - chrX 7788672 5' - 412 467 2 53.47 AACTTCAGTCAGTTTCAGTTGTGCATTTTTCATAGTCTCTTTCGGTGTTCTGCAACCGGTTTTTCTCACTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGA:1 - chr2L 14061622 5' + blood 169 2 48.51 CCGGTATTGGGATCGACGCATTTGGTTCCTGATTACAGTTTACAGACAAACATACATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr3L 2124586 5' + 297 13 2 55.45 CTATTTTCTCCACTTTTTTTGCATGCATGCATACATACATACAGCACTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGC:1 + chr3R 11205080 5' - Doc 4551 1 57.43 AAAACGATGGCAGGTGCCCGCGCTCTTTCTCTCTCATCGAGGTGTGATATCCGGTCGGTGTGCGCTTTTCAACTTATCTACCATACAAACTAAAATTAATT:1 + chr2L 306508 5' - Chouto 5878 1 67.33 GAGTTGATTACCTTTGGCAGCTGATACGTGGGTTTTGGAAGCGGGGGCATTTTATTTAAATATATACATCTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 - chr2R 21962730 5' + 297 1 2 71.29 TTCGTAAAGAGCAAAATGTACTCATAACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chrX 3661400 5' + roo 51 2 77.23 TGGTCGCACAGTCGTCTCCNCTTGATGGCCATGGTCAGTGTTGGGCGTTTTAAGCAATCCACATGACCATAAATCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 - chrX 9403282 5' + 1360 3383 2 75.25 AGCACGTTTTGCTTTTAAGGCTTGCAATTAAATATGCAAGTGTTGCAATAGGCTAAAAGCTCACAAAGGCATAAGTCGAGACTATCAGATACCCACTACTC:1 + chr2L 3181988 5' - INE-1 549 1 84.16 AAATATGATTAAATATTTCGTAATGAGACTGCGGAATCCTTACGGCACCACTGAAAGCCAGAAAATCGTTGGGGAGCAAAAACATCTGGGCGCAAAAAAAA:1 - chr2L 17224565 5' - Cr1a 25 1 63.37 TGGAAGATTTCTTAGGATCTCTGACCACACCAGATTGTGCCGAAGCGGTCACCTGGACTGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATC:1 + chr3R 31263612 5' - jockey 103 1 59.41 CTTCCTGCGCTCTCTTCGTTCACTCTCTCTCTTCGGAGAACGGACCTAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr2R 18171582 5' - P-element 2878 2 59.26 TGGCACGTTGCTGATTACGCTCCAAGGAGAAGCGAGTCCTGCGTCCTGAATTCTGACCTAGCGGGGATGGTGAATGAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAA:1 - chr3R 26252774 5' - 412 7546 2 77.23 CTGTGAAGATGCCAGCATAATTATAATAATCATTTCATAATCATATTTTATTCTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGA:1 - chrX 8727934 5' + X-element 28 1 51.49 GGGCTTTCAATTATGCCGGGGAACCCCCGCCAAAGCGTATGCAAAGTCCAACAAACTGCAAAATAACAGTGGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr2L 20045707 5' + roo 4 2 76.24 AAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTC:1 - chr3L 15099647 5' + G4 3804 1 44.55 CTGAGATCACCGTAGGGCGTGAGGGGTGGCGATGAGTCCTTGGCGGAGGAGTCCAGCGACAAGACTGCCAATCACAATAATAATAATAACAATAATAATAA:1 + chrX 16120495 5' + mdg1 7064 2 77.23 AGAGCAGGTGATGGCGATGCAAACTGGCCCCGCCCCTCACCACATTTCCTACCAGAGAACTGCAGGCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2L 20238696 5' - hobo 2911 1 52.48 AAATTGAAATACACAAACATGGCTAAAATAGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chrX 8503164 5' - roo 9027 1 74.26 CTGTGCTTAGGCATTTATGAACTGCTTCGACACAAGGCTACTGCAACTGTGGCAGTGCATTTCATTTAATTTTTGTCCTTTCTATAACAATAATTATTATT:1 - chrX 12779928 5' - Juan 4064 1 73.27 ATAATTTCAGCGTAACTACGTTTAAATGAGCACCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCAC:1 - chr2R 16467899 5' + F-element 4343 1 68.32 ATTGCCATCCCTCCTTGGTNAAAATCACTTGGCTCTTAACGAATTTCTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATG:1 + chr3R 12321398 5' + jockey 4700 1 52.48 AAATGGCACGGAATTGATGATATGTGGGCGGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTT:1 - chr2R 14576560 5' - gypsy5 7301 2 76.24 TCATGCCAACCGTTAAAATAATTTATATTTTGATTTTGCAATGGACGAGCAAACATGTGCACACATACAGTTGTCTGCCATCACTGTATGCGTAGAAAAGA:1 - chr3R 3625900 5' - 1360 143 1 58.42 TTCCCAGAGGCATTCATTCTAATGCACAAGGTGGATAAGCGACTGGAACGAATTGACAACGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:2 - chr3R 21884257 5' - mdg3 5480 2 60.40 CATATCACTTTCACTTAACAAAGTCATCACTTTCAATTAGTTCGCATTGATCTGTTGTTCGATGAATATCAAATTTTTGACTTTTTTAGATCATTTGAACA:1 - chr2R 10617991 5' + Tc1-2 277 1 66.34 GTGGCCTTCTCCTTGAAGTNCTCCTTCGTTTTCATTAACAAAATCGATTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2R 19061214 5' - roo 9049 2 54.55 GGGGTGGGCGGGACCCAGTCGAACCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3R 7139252 5' + pogo 50 1 75.25 ATGTTTGGCTTAAACAATAAGATATGTTTATCTACATCACAAAATTTCTAGTGTCTTGAAATAAAAAAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAT:1 + chr3R 22351985 5' + Doc3-element 201 1 71.29 CATATTTTTCTTAAGAAGANTTCTGGCTACATTATCCCAAATTTACTTAATTACCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:1 - chr3L 19249756 5' - Transpac 286 2 52.48 TCTGTGAATTTTATGAGGAATGGTGATTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAA:1 - chr3R 26435445 5' - Juan 4165 1 75.25 ATTGGTGTTACCTTCCTGATCCTGGCCTGCGCCGTGTGGTCTACAGGCAGATCGCTCGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATG:1 - chr2R 24875544 5' - mdg1 7278 2 68.32 CACCACGAGTTTGCTTTAGNAGATGCCTTTCCGTTGAACTAAAACTAGACGAGTAAAGCGTATCTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 + chr3R 5594928 5' + 1360 1 2 75.00 CAGATCACTTAAAACTACATTAATATTTTAAGAGGTGAGAGTTTGGTGGGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr2L 16793644 5' - hobo 2912 1 57.43 ATAGAGAAAATGTGGCTGGGTTGCTGGAGGTTAAAAACCCATAGTTCAGAAAGAATAGGTATTAACAAATATTACAAAAAAAAAAATAAAA:1 + chrX 8095492 5' - hopper 153 1 85.71 CTGCAGCACGCCGCCTGTTATTTTTTGCTCTCTAATCAGAGCGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTT:1 + chr2R 13383509 5' - gypsy5 7316 2 58.42 TTAATGATGGAAGAGCCAGTTTTAGCTATCATGCATTATCCATATAATTTTGTATAGTATGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 3209260 5' - roo 395 1 65.35 GTTGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTACGTTTGAATCGTT:1 + chr2R 19091624 5' - Stalker2 350 2 75.25 ATAGTTAGAACAAACAGGTATATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGCGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGG:1 + chr3L 12302020 5' - blood 7145 2 78.65 ATCAGTCGTAAAAAGGGGAGTTCATTTTAATTACATACGAATTTCTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAG:1 - chr3L 11318735 5' - R2-element 3550 1 62.38 CATCAATCGCCTTTCCTGTTGACTTCCTGGGATAACCTGCCGCATTCCCCTTACTCTTCGTGTTACTTTTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTA:1 + chrX 16553589 5' + Cr1a 3995 1 60.42 AAACACACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - 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Idefix 251 2 59.49 AATCGTGGAATCGGAACACNGGCGATCAGACGGCCCGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chrX 15024381 5' - P-element 2847 1 38.61 CGTGACTCAGCAACAAAAACGGCTAAGAAGTTTTCCTTTTTCCCTTTTTTTTTT:1 + chr3R 26736845 5' - Doc2-element 232 1 92.59 ATTTAGGGTAAAAGAATTCGTGTTGCCTGCTGTTGGTGCTGCTGCTGCTGCTACTGCTTCTTTCGCAATGCTGCTTTTTAAGGTTTTTTTTTTTCTT:1 + chrX 4081073 5' + Tc1 1468 1 60.82 AGTGTCACTTCATCCGCCCCTCTATGATTTTAATTTTCATATTGCTACGAAATCGGCAAAAAACTACAATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAA:1 + chr2L 23374440 5' + 1360 3164 1 69.31 CCAGTTCGTGGAGCTTGGAGGTCAACTCCTGGTATGTTGGCGGGACAAGAACTCTACGACTGTACGCTCAGTTGGTCGTAAAAAGGCGCTGCTGTGCATCG:1 - chrX 2341192 5' + Rt1a 4843 1 72.28 TTGTATTGAGTAAAGTAATATGAGTTTACTGAGTGGGCTTCTTTTTTATTTTTCATTAACTCACGGGAGTTTCTTCGGCAGTAATTTAACCAACGAATTTT:1 + chr3L 25121849 5' - HMS-Beagle2 414 1 53.47 GGTTGCCACGGAACTAAAAACTTTTGGCTGCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 - chr2L 16683758 5' + P-element 46 1 33.66 ACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 - 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P-element 2846 1 38.61 TAACTAACTTGAAACTAATGCTTATTAACATTTTTAAATATATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAG:1 + chr2R 19088958 5' - Tabor 7291 2 59.00 TTTCTGTACAGAATTCTAATGTCCTTTGCTCACTGTACCTGCGTAACATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTT:2 + chr2L 7937241 5' + jockey 4550 1 53.47 TAAAGAAGCCAGAAGAGGATTTCAGCTAGTTGGCGTGTGAAGAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGA:1 - chr2L 22241103 5' + 1360 479 1 72.28 GCGGGGAAAATGAAGGAGGACGTGAAGAAAAACCTGAAGGAAAGAGCAGCAGCGCCGAGTGTCTTATTTTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:1 + chr2L 3980298 5' - Transpac 300 2 76.24 CATAATGAGACTCATATTGATGGTAAATTATCGAAAAGTGGGCATGAAGTGAACATTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr2L 20620083 5' + roo 8682 2 62.38 TTCAGCTCTTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3R 29608842 5' + roo 31 2 62.11 AAGCTCAAAAATAAAATATTTACCAAGAAACTACAAATATTTTCATTCATTCACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACCAACCCTCTAGACCTT:1 + chr3L 14279541 5' + I-element 5096 1 55.45 TCTAAATCGATTTCTCGGCTCAAAGTGTATTAAGGTATAATAGCACTTAGTAAATATATAGATATACATACATACATACATAGTATATACATACATACATA:1 + chrX 9442888 5' + INE-1 65 1 65.35 AGACTTTTTGGTGGTCAGTCAATGGCCCGCAGAGAAAACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr3R 11608044 5' + 1360 7 2 72.28 CTCGCTACGCCGCCTGCCGGACGAATGACGAATTGCCCGAAGATCGGGGATTCGAAACACTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chr2L 3632127 5' - P-element 2872 1 65.35 TGGACAAGGAATTCAATTCGATATTCCGACGAGCCTTCGCATCCCGTGTCTTCCCACCGGAACTGGTCGAGCAGCTGGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCG:1 + chrX 13260145 5' + invader4 399 1 80.20 CTTTTTCGTATAATTTTCCACTCCGCATCTGATCGGCATTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 - chr2R 12812325 5' - jockey 4954 1 64.36 AATTCGGGGCAGAAAAATACAAACGATACAAACGAGATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTG:1 - chr2L 10637262 5' + Stalker2 42 2 63.00 AGAATTTTCTTTCTTATTTTCAAATGAAAAACAACCAACCACACAAAATGCCGCCGGCTAAGCTCCAGAAAGAAACATTCAAAGGATTTTCAATATAACAA:1 - chr3R 28707575 5' + gypsy11 432 1 66.34 CACCAACTTATTGGAACTCAGCGTACAGTAACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATAT:1 + chr2R 8527303 5' + I-element 5011 1 70.30 CAATAAAAACGTCGACAATNTAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr3R 22238677 5' + hobo 35 1 60.40 CCATGACGATTCACTGCGACATTGTCGTGCTCTGTCGTTCTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTA:1 + chr2L 20371944 5' - 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F-element 4631 1 77.23 TCATTAATTATATATATTTTCTGTGGCTAACTAAATTGAAACTAATGCTTATTAACATTTTTAAATATATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTG:1 + chr2R 19088931 5' - Tabor 481 2 66.33 CTGAGAAAAGTTCATAAATCAATAGGAAACCGAAAACCACTTGAATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAA:1 - chr2L 18199775 5' - Ivk 5346 1 56.44 TGGACTTCCACTTGGCGGTTTTCTGCATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGGGTTTCTTTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATT:1 - chr3L 18615341 5' - Idefix 7136 2 78.22 TGCTCATTTGGAATCGGGTCAGGCTATTTGGTTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGG:1 + chr2L 16095080 5' - G2 97 1 72.28 GTGTGTGTTTATGTTTGATAAAATGCGATATGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3R 29287510 5' + hobo 43 1 70.30 GCAGAAGGCGAGGAAGAAGCCAACAAAAACGCATAAAAGAGAGTGAAAACTAAATGCGGGGGGTGTGGGTAGTTAACCATAGCTAACGTCGCTCCCACGGG:1 - chrX 11653494 5' + gypsy2 6498 2 64.36 TTCTTGGTATTTTCTTGTATGGAATGAATAAAAAGGTTCCTTATTACGTAATTAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr3L 6033516 5' + 412 7075 2 58.42 TGGGGTACTTGGCAATGAAGCTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGC:1 + chr2L 8169897 5' + Doc 444 1 79.00 ATGAAGAAGAAGTGCACAAAGGCCACAAGCTGTAAGATATATGTAATGTAGAAGCAAAAGGAAAAATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 + chrX 13126186 5' - 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chr3R 9255913 5' - R1A1-element 332 1 47.52 ATAATGCTTAATTCGTTTTTTATTTGTTCGATTCACATACGTGAACATGTTTTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATA:1 + chrX 3465738 5' - hopper 53 1 50.50 ATTTATTAAGGAAAAAACAGAATAGCATGTCCTATCAAGGGTTTTTAAGTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTT:1 + chr3R 20094424 5' - Max-element 293 2 71.29 TTACTATATGCCCCTATTAAAGTATCCCCTTTTTATCTTATTTTCTGTTTTGTGTAGTTTGATATGGTGGTGAATGAGAGGTACGAGTTGTTTTTGTTTTG:1 - chr3R 28743174 5' - Porto1 259 1 53.47 CATGTCCTTGTCATTCATANCATTTTTCATCTCTTTGTTTGCAGATATATGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTC:1 - chr3L 1342656 5' - Porto1 4413 1 50.50 TGTCATAATGTAAATCAGAATGGTATGAGAGAAATCTACACTAGTTATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3R 15579043 5' + pogo 26 1 53.47 GCAATAAAAAGTCTTCTGCTGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATG:1 + chr3R 30069685 5' + jockey 4831 1 81.19 CCAAAAAGAATGCTAAATCATGGATGAAGTGGATTCCGAGCTTCCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAG:1 + chrX 1804586 5' + Circe 7230 2 59.41 AGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:2 + chr3R 10741089 5' - 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chr2L 6251733 5' - mdg3 5468 2 52.48 GAGCAGATATAAGGAAATTCAGGAAAATGTATTCAATTAATTAGTATCAGGTATACAATTCAATTCAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACG:1 - chrX 21583436 5' + F-element 17 1 56.44 TAAATACAAAATGATTGGCAACATAAAAAAAAAAAGAAACGAAAACATACATAGAGACCTAAAAAT:1 + chrX 8297135 5' + Doc 4410 1 65.15 TATATGTAGTATGTATGCTAGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAA:1 - chr3R 27852855 5' - jockey 4885 1 80.20 TTTGCGGTTTGTTTGGTGCCGGTTTGGCAATTTTGTGATATCGCCCTCTCTATACCGCTCCGTTCCGCTTGAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chr3L 6658259 5' + hopper 2 2 77.23 ATGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGAGTTACCACCCAACCCCCTAAACACCCACGCCTCTAAAC:1 - chrX 19281157 5' + Tirant 8127 2 55.84 TACTTCGGATTAGATTTACTGCCCATGTGCACACACACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 - chr2R 9209495 5' + Tirant 35 2 59.41 GTCCTTACAGCTACTGTGTAATTCCATTGCTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 + chr3R 4971389 5' + F-element 30 1 58.42 CGACCTTTATTTTCGGCCAATTAATTAAACTCCTTATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACT:1 + chr2R 23445128 5' - 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F-element 22 1 53.47 TAACAAAACGCAACAAACACCCAGAGATCGTATCGCGTCGCATTTCAATGTCCACCACTGTCAACTGAAGGCGGAGATAAAAAAAAGAAAAAAAAATACAA:1 - chrX 9740891 5' + gypsy7 5009 1 69.31 TACACATTTGAAAGGCTAGTATACCCTATAAAGTATGTAACAGGCAGATCCAACCATATAAAGTATATATATTTTAGATCAGGAATAATAGCCGAGTCGAT:1 + chr3R 4191037 5' + INE-1 95 1 71.29 ACAAAGTACGGCGGCAAAGGTGACAAGTGGTGGAAAATGTACAAATTCTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATTACAACACATAATAAAA:1 - chrX 6166236 5' + hopper 1123 1 66.34 AATAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3R 19987406 5' + Doc 39 1 59.41 CAGGGTTCAAAATTGTCATTTGGCGGCTAAGCGGACATAGATACATAAATACCAAATTGCATATTAAATCATAACTTTAAAGCTTTTATAGTTCCTGAAAT:1 + chr2R 6048778 5' - INE-1 151 1 59.41 GAACAATATGATCTAGAGCGAAATCACAGGGCCCGCCACCAGCGAGACTTTCCAAGGACAGAGAAATCATCCAACGAACCTAATCGAAAATCCTGAGAACC:1 - chr2R 1027616 5' + Fw2 3613 1 65.35 TATGCGAACACAAGTTCTCCACAGACTGGTGTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCNNTNGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr3R 19198520 5' - hobo 2900 1 67.71 TCATATCTATTAGGTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2L 4063687 5' - 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Fw2 3691 1 75.25 GGGATATTATAGCCGCAGTCATAGCCACGGCAACAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGC:1 - chr3R 29090082 5' + F-element 4217 1 67.33 AGTTGATAGTCTGCGACAAGTAGTATGTGCAATGCTATGTGGCACCATAAATAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCT:1 + chr3R 29875615 5' - gypsy5 7317 2 55.45 ATTTTGGATTATTTGTATCACATGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTA:1 + chrX 22689531 5' - 1731 4603 2 55.45 GTTTTATTTATATGTATACGAGCAACTGTTTTGGTGCGTGTTGGAAGGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTT:1 - chr3R 21343239 5' - McClintock 6377 2 55.45 TATAAAGAAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATAC:1 - chr2L 7241330 5' - pogo 3 1 78.22 AAACTAAGTAAACGATTTGNAATTAATAATGATAACTAAAGTGTTCGTCTATTGTGAAGTGAGAAATGATTTGTGCCAGCTTGTGCCAAAAACTAATAAC:1 + chr3L 3294301 5' + transib3 432 1 66.00 TAAACTTGCCGACGAACGACTCAACTAACAAAACAAACCCACCAGACTAGAGCAGAAAAAGGCAGAGAATCAAAAAAGAAAAAAGGAAAAAAAAAACAA:1 + chr2L 12249309 5' + gypsy7 5009 1 59.60 TTCCTACGTAGGCTGCCGTTCACAATGATATTCACCATTTGAACGGTTTTTAATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1 - chr2R 5772540 5' - HMS-Beagle 7027 2 64.36 GACGAAATCAAATCTTTTCATGTGCTATCGATAGATCATTATTAATATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:2 - chr2L 21190820 5' - pogo 2074 1 57.43 TGGCATAACAAGTCGAATTTGTTGTAATTAAAAACCAAGAAACATACTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTA:1 - chr3R 26597406 5' + mdg3 33 2 53.47 GGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCT:1 - chr2R 3120304 5' - 1360 4 2 57.43 AAAGTTTTGATTCTTAAGATGTGGGTTCGAAGTTGAGATACTGTAACACACTTCATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCT:1 + chr3L 18385041 5' - mdg3 197 2 61.39 GAATACGACTAGCTCTCAGATACGAGCGCACACTCACACCCACCAACACACACACAAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACA:1 + chr3L 19072387 5' - Cr1a 209 1 57.43 CTAAGTGTACTTTTCTTACNCCCTATGAGCATGAATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 + chr3R 13353213 5' - 1360 3347 1 68.32 AAATGCAGCTTTGCACAAATTGCAGTGCATGGGACATCGTTCGTTCACATGGTCATGTATATTTTGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 22930398 5' - roo 400 1 70.30 ACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGACAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGG:1 - chr2R 2994305 5' + gypsy8 4768 2 43.43 GTTTCCTTTTCCATTTGACTCTTCACCGTCGTTCAGTCAGGGCTTTTTTTCCCCAGGCTACGTGTTTAAAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGA:1 + chr2R 19641816 5' - I-element 5349 1 72.28 TATGGCGCAATGCTTAAAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3R 19449524 5' + hobo 3 1 72.73 GCGCGCACACAAATCAAACAATTATAAACTCGTTGTTGGTAAAGTGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 + chr3L 12468209 5' + jockey 4697 1 51.06 CACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr2L 18248042 5' + blood 43 2 72.28 CTTAAGTTTATCTTTTGTCAAACAACATTTACAAATACATTAGTTAGGTGCTGCATTCTTTGGCCACATCGTTTGGTTATTGTTTTTATGTGT:1 + chr3R 4582083 5' - BS4 447 1 53.76 AACGGTAATCAATGGACCTTGGACCCCGGCAAAGCGGAGCGACCGTGAACTAACGGTACCGCGCTGGGTTGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr2L 22524522 5' + 1360 6 2 73.27 TTTTAATTCAACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 12958908 5' - roo 9044 1 55.45 TAGTAAGAAATCAAAATCCGAATAAGCTGCTTAATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGA:2 - chr2L 18655236 5' + Doc 10 1 70.30 AAGAGCTAAAACATATATAGGTTAAATGGATTAACGACGGACGTGCTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAG:1 - chr2R 17366327 5' + R1A1-element 42 1 74.00 GGGGACAATGTAAGCGAATGGGAAAGGGAAAAGTGCTTGTCTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3L 13190162 5' + roo 8695 2 56.44 TGTCAACACTTTATTCCATTGTAAATTATTTGCATTCATTTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTACCAGCAACTAGCA:1 - chr2R 18015931 5' + jockey 171 1 58.42 ATCTAATAATTTATGAAGGCATTTAAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGAT:1 - chr3R 13740593 5' + Burdock 6386 2 75.25 TAAATATTTATTTTTATTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTTTATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACC:1 - chr3R 18956787 5' - HMS-Beagle 7015 2 56.44 AACATGATAATTTGTTAACTTCCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chrX 4277483 5' - roo 9019 2 79.21 ATCAGAATGCAGAGCTGCACAACAGAACTCCATAGAAGTCGCCATATCTAGGTTCTGTAGCGGAAGGG:1 + chr2R 9835763 5' - X-element 495 1 69.12 AAGTATTAAAAAAACAATAAAAAAA:1 - chr3R 12251688 5' - hopper 153 1 76.00 AAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3L 15037930 5' + roo 8711 2 75.25 ATTCTGGCTACCAGGTAGAATACCTTTGGTGAAGGGTATTGTAATGATGAACTGCCTTTTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 - chr2L 10792078 5' - 412 7507 2 58.42 CTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCGGACAGGGCAGACGGACAGATGGACATGACCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAAT:1 + chr2R 1751257 5' - INE-1 86 1 95.51 TGTCTTTCCTTCAAATAAAAAAGAAAAAACAAAAATATTGAATGATGAGAATGAATGGACGTGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 20667233 5' - roo 395 1 41.58 AACAACTGTGCTAGATATGCTTATAAAAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr3R 9278426 5' - roo 407 1 79.21 AGAGTAATAAAACACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATT:1 - chr2R 16185108 5' + 17.6 6953 1 62.38 GACGGATCCCTCACCGGCGGTCATCGATGTGGACGTGTCGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAG:1 - chrX 10359700 5' - Idefix 181 1 66.34 TAATTGGTAAAACGAAAAAAAAAAACAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAATAAAAAAATAATTCAAAAAATGGATTATAT:1 - chrX 20590615 5' - Tc1 1379 1 85.15 GAACCGTTTTGTATATTTACGATTAAGTTTAAATACCTCTGAGCTTTATATGTTCTATATTAGATATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 - chr2L 11478772 5' + opus 7 2 68.32 CTGGCCTAAGCCACGGGGGGAACTTCTGGAGAAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTT:1 + chr3R 9746447 5' - 1360 2 2 71.29 CGTAATTAATACTTTATAAATATTGAACAAGTACAGGCAGACAATTTCGGGTAAAGGCGATTATATCAGTGTTTTATGTTCCGACTATAATAGACTTTATC:1 + chr4 1179585 5' + Cr1a 4202 1 71.29 ATGCTAAAACAAACACACTTGCTGAGGCGCGAATTCTTTAGAATTGACAGTTTGTTCGCTTGACGGTTTAGAAAATACAAGGGAGAAAGAAAGAATACAGT:2 + chr3L 2210920 5' - diver 87 2 77.23 GTACCATAACAAGCGTTTCCACAAGCTCCACCACAAGCACAAAAGCTCCAATGACCAGTGGTCGTGTCTCTGTGTACATTCACGTTCCGAAGATACCAT:1 - chrX 18485734 5' - Doc3-element 4422 1 68.69 CAGCAGGATCATTTGGATCATTTGGCGATGCGGCATATTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:2 + chrX 7788604 5' + 412 39 2 62.38 TTTCAAAGAGTGCCGCCTGCACAGAAAAAAACATGGCTAGAGTTTCTCTTAATTGAGAGGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAATATATATACATACATATT:1 + chr3L 1119911 5' - Dm88 19 3 40.59 GGGCCCAGTAAAACCATATATTTATGTGGCAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr2R 18766220 5' - hobo 2895 1 67.33 GCTTGGCAAGCTAGCCCTAGACAATCTAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr2L 109707 5' + 1360 50 1 77.23 ACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCC:1 - chr3L 20224205 5' + Chimpo 47 1 74.26 CTCTGACGGTAATTAGATGNAAATTTTACCCAAAAGAACACAAACGAGAGCAGTCTGCACTCTCAGAAATTTTAGATTTTGTGTGGGAGAACGAAAGAG:1 - chr3R 9155602 5' - Cr1a 306 1 62.63 ATCCATATAGTAGTTAATGTAATGCTGGTTATTTCAGCATTAGTACGTCCTTTTTGAAACTGCAGAGTCGATTTAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATC:1 - chr3L 25844228 5' - roo 421 1 62.38 ATTTGGATCGGGCTATGAATGGAACTGATCTCTGATAAGGATGAAGAGACTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGC:1 - chr4 1029268 5' - Quasimodo 320 2 56.44 TTCCGTTCATTAATGATATTTTTTGGGATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACAAGAGACCAGACC:1 - chr3R 10390860 5' + invader4 363 1 73.27 CAGTTCGAACAGGAGGGGCAGAACTTGACGCATCCTATTTGGAGTGTCGCGCTGTGCCGCAAGAAATGCTGAGTCGGC:1 - chr2R 14670394 5' + gypsy 148 2 66.67 ACCCACACTTCAGATAAGAAGAATAATCCTTAACAGAACAGTGTATCCTTTTGTTTTATTTGGTTATTATTTGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chrX 4277561 5' + roo 2 2 77.23 AAGAAAAGGAGGCCCCCAANTGTATGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr3L 13895352 5' - hobo 2916 1 53.47 CATGATGAGTCTGATTATTCAATAAGTGAAGAATCCGTACATCATAATATTGTATCTTAACATCACAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr3R 4575413 5' - 1360 3377 1 67.33 ACACTTGACGATCCGTTGCCGTTGCCCACCGATCACCGAGATCACCTGTCTTCATTTTATGGGCCGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 + chr3L 3650020 5' - mdg1 7447 2 66.34 GAAATATGTAAAATAAAAGGGAACTTTAAGGATTTCATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chr3R 17781615 5' - pogo 2063 1 69.31 CAGGAGCCGCAACATCGGGGTCAGAGACACCAGCAGCAACATCGGCCATCGGTCAGCTGAGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACCGCTAAGGATTGTGTCT:1 + chr3L 17542912 5' + R1A1-element 243 1 56.44 AAAGTGCAAACAAGCCTGGAGATCCCCAGATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr2R 8311311 5' + opus 7160 4 72.28 ATGCATTATCCATATAATTTTGTATAGTATGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACACGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 3209230 5' - roo 9028 1 66.34 GATTAAGTGCCCTTTTAATGTGGGAATATTGTGATGAACACGAAAATTATGGTTATCAGATGTGGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTT:1 + chr3R 29308250 5' + P-element 2575 1 57.00 ATAATCGTTAAAGCGACCATAAAATAATCACCTAATGTACATATTGCCCATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr3L 11829109 5' - Transpac 287 2 56.44 TAGGGTAACCATCCCAGAANGGTCTGTCCTGAAAGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCA:1 - chr3L 20411859 5' - roo 9040 1 55.45 GTATTAATATATTTAAAAATACTGGAATTATTTATGATCAAAATTACATATATTAAAACAGACAGACTGTTGATCGTGAATATATATTTACATTTTTTTAT:1 + chr3R 19474231 5' - G3 4501 1 56.44 TTTATGGCTCTTTAATTGGATTTAATATTTTTCGCAAAAAATTAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3L 7472685 5' + Doc 4697 1 60.34 ATATGGGTTTTCAGGCAACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:2 + chr3L 2022228 5' - roo 385 2 59.41 GCTCATTAAAAAGCTATAAAGTGCTGCCATTAGACAATAACCCAATTTCAACCAATAATAGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3R 8582527 5' + roo 8680 2 63.37 ATGCGGTACTATATTTCATATATCTATGATAACGTTATGATTATGACTGGATGACTAAACCTTTGTAGATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3L 20411766 5' + roo 8 2 69.31 TCAAATAATTCAACCGCTGCAATTTAATGTTAACTAATAAAAGTACTTCAAATTGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGG:1 - chr2L 20615472 5' + roo 8764 2 53.47 AGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1 + chr3L 25272556 5' + 1360 71 1 60.40 TATCGCCAAATACCAAACAGCCATTCTTTTTGACTTTCACCCCTCTAACTTGCTCGTGTTAACTCCTCCTTGTCTTAAGATGAATTCGTCCCCGGATTTAA:1 - chr3L 23529653 5' - gypsy10 5606 1 57.43 TGGATTAATTAAATACGAGACTTACATACTATATTATATATTTAATGTATTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACA:1 + chr3L 9951103 5' + roo 8797 2 56.44 CAAATTTAATTTACCAACGCATAAACACACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2L 7666185 5' - roo 9052 2 60.40 AGAATAACAATAATTTTACAACATTTTTACGAGTTATCATTTATTTTTAGCGCGCTTTCAAAGTCAGCTGATTCAGAGGGGCTTTGAATTGTGAAAATTGG:1 - chr3L 5254853 5' + transib4 180 1 80.20 TAGAAATTAAATTAATTAGTCAACCTTTCAATGCAGTAGACGTAGCCATAACTTTACAACTTTAAAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTAT:1 + chrX 22635411 5' - flea 479 1 79.21 GTTGCCGGGGCGCCAAAAGTTTTTCCAACGTTTCGTTTGGCTCGGGTTGGTTTGCTTTGGTTTCGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chr3L 17186896 5' + Tirant 8113 2 71.88 AAATGGAAATAAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:2 + chr2L 18247986 5' - blood 343 2 60.40 GCAGCTGCAACTCGAGCGATGCGATGCTGCCAAAACCCACGGCACAGTGGAACAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1 - chr2R 16160834 5' - mdg3 223 2 54.46 TTTTTAAAAATTCGTTTGCNAAAATATTTTTTAATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr3R 15578974 5' - pogo 2060 1 73.27 TTAATTGACTTTACAAAATGTTTTCACAATTTTCGGTAATTTCAATTCGTTTATTGTTGTTGTTGCACACGTCCACACACCACCCCCCATAATTCTGCATG:1 + chr3L 3268150 5' - Dm88 401 1 70.30 ATATTCTCCGCTTGTGAAAACAACTATTTTTGATTGTGCGATTTAGGGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1 - chr3L 5710318 5' + Transpac 4945 2 54.46 ACTTCATTTTCCATTATTCATATATATTATATGATTATTTTTTCCCCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 + chrX 23283834 5' - 297 6947 2 61.39 ACAGGAAGAAAAGGAGGCCCCCAAATGTATGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr3L 13895347 5' - hobo 2921 1 59.41 CGGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAA:1 + chr2L 20360643 5' - R1A1-element 144 1 71.29 ACGCCATGTGGGCAAATTTGTTGTGATTTATCTCGTTGACAACGTGCCAGCGACAGGGTCGCATTAATCTTGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGT:1 - chr3L 3753651 5' - Bica 4651 1 75.25 TGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr3L 3757405 5' - roo 9034 1 67.33 TTTTTGGGGCATAATTTAAGGCGACATTGACAATGAGACGGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTG:1 - chr3L 6023345 5' + hopper 36 1 59.00 CTGCTATCGTTTGGCAAAACCAATTGAATCATCCATTCATCTGCGCATAAAAAGAAGATCAATACCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAA:1 + chrX 4980090 5' - Quasimodo 7094 2 73.27 TGGGTATCTCGCAGTCGATGCACTGGACTTAGCTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATCAGTCGGCTTAACTTCTCG:1 + chrX 159011 5' + Cr1a 4087 1 67.33 ATGCCCCACATTTGTTCGCCATTGCCGATTCCGCCTACAGGGTGCTCAAGCAGCGCCAACAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACC:1 - chr2L 10498009 5' + Quasimodo 151 2 63.37 AATCTAAATATTAATTTGTTACGAAATAGAAAACTATTTTTATTATTAGATATTTACATATATATTCTATACATGTTATGTAATGTAACATGGAGTAAGGC:1 + chr2L 14010769 5' + flea 4753 1 77.23 CAGACAAGAGGGAGGCGCACACGCACGTTAATATATGTATATGCAGTTCGGGAACAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr3R 24976722 5' - opus 7485 2 63.37 AAGAGGGAGGCGCACACGCACGTTAATATATGTATATGCAGTTCGGGAACAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:2 + chr3R 24976727 5' - opus 7480 2 58.42 TTTTGGGCCATTTTCTTTTGGGAGCAGCCGTTCAGTCAGCTCATCTCGTATACATGTCATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCCTATC:1 + chr2R 13262357 5' - Stalker3T 205 1 65.35 GAGCGTCGGCCATTTAGCTGACTTCGGCTCATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chr3R 3847146 5' + P-element 47 1 34.65 AGTACAGCGCTTTAAGCGAGATGCTAGCTTTTATATTAAAGTAAGCCCTTAGTTTTTAAATCTGGCATAAAAGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3L 11755654 5' - roo 405 1 63.37 CGTTTTAAGGCTCAGACTTTGCCCAAACCCAAATGGAGACAACCACCACCGAAAACTCTCTTGCGACATTTCTCGCAGTCAAGGCCTGCGGTATGTTAATA:1 + chr3R 24368721 5' - baggins 418 1 57.43 AGATATATGTAATGTAGAAGCAAAAGGAAAAATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chrX 13126220 5' - mdg1 376 2 68.32 GTGTGTACTCCCAAGCTTTTCTTTTTGTTGTACTAAATAATTGTAGTTTAATAGCTGATTAGAACCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTA:1 - chr2L 17079912 5' + jockey 4792 1 63.37 GATCAAAGTCCCAACGGGGCAAAGAAATCTTAAAGTTCGTAAAGAGCAAAATGTACTCATAACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:2 + chrX 3661365 5' + roo 16 2 59.41 TGAATAACAACAAATTACGTTACTTATCGTTGTGGGTGATTACGTATTAACTCAAGGCTTCTACCAGTCCGGGACATTTTAAAATAGTTTTAGTTTTGAGG:1 + chrX 4817646 5' - Tom1 387 1 62.38 TGTCATATGTGCCAAGTACCAAGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTT:1 + chr3R 23963609 5' - I-element 5075 1 78.22 TAAATACGTATTGGAAAAAACTGTTCGTTTTCGACTCATAAAGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAG:1 + chr2R 10687761 5' - jockey 4907 1 58.42 TCTGTTCGTTATTTTTACACAAAATATTGCAATTTGCTTTGTGTGTACCCCTACACATACATATGTACATGTGTAGATGTATCACCGAAGTCATACCTTGA:1 - chr3R 10095135 5' + Rt1b 4971 1 79.21 GGATAATACAAATGAAATGAATATCAAGTAAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGTACGACAAATTTCATCATTTTTTTGGGGTATCGATAGATA:1 - chrX 16180054 5' - INE-1 499 1 70.30 TGTAACGAATTTCCCACGCTATGATTATGTCGATTGGGCATTGTTGTTACTCTTATTGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr3R 7139322 5' - pogo 2085 1 63.37 TCAATTAAATTTGCCCTTCACACATTATTAAGATTTTCCATCAGACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3L 9928605 5' + roo 8694 2 61.39 AGGGGCAAAATGGTAGGAAACCCCGGGATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 - chr3R 13739726 5' - Burdock 217 2 70.33 ATTGATACGGATAGATAGATAGATAAGTCCTCTAACGTGCTACCCATTTTTCCGCTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGG:1 + chrX 21235368 5' + transib2 2694 1 53.47 CAAAAACCGAACACAATCGCAAGTCAGGCAAACCAGTCCGAAACACACCCCCCCTAAAACGGAAATCAACGGGAACGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGT:1 + chr2R 613161 5' - 17.6 7290 2 75.25 TCAAAACTTGTCCAGCGACNGCAGTCCGAGAAGAAAGAGGAGCGGACCAGAAAAGACACTTCAACTAGCCCGTGTCAGTAAGCATACGATTGCTGGATTCG:1 - chr3L 20934795 5' + R1A1-element 330 1 67.33 ATTTTTATTTTCATTGGAAATTCAAATTAATGATTAAATTTAAAATCGCCCGATGCTTAAGAACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTT:1 - chr3R 20206032 5' + 1360 296 1 66.34 ACGCTGCAAGTGGCAGTGCACATTTTTATCAACATTTCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATG:1 + chr2L 17677713 5' - Tirant 8469 2 63.37 ATAAATCATTGGGAATCCATTTTTATTTTTTAAAAAAAA:1 - chr2L 19684159 5' - Tc3 1561 1 64.10 ATATAGCAATCTTAAGATTAATATCGAAATAAATAGGACTATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chr3L 15033364 5' + I-element 36 1 59.00 CAGCAATGGGCAAACAATTGCCGTCAAAGCAGGAAAAGCAGGTAGCAAGGATAACCCTCCGCCAGCCACCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTAC:1 + chr3L 6023258 5' - hopper 1406 2 70.30 CAAGCAAATACCAACACGGGTAATATGCAAACAAAGGTATATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGT:1 - chr2L 15567171 5' - 17.6 460 2 65.35 TACATCAAATGATATCTCACCTTCAAAAATACCATTGCCATTCCGTGTCCAAAGCTGTATTTTAGATTATTTTTTTAATGTTTGGCAAACACGAAATAGAA:1 - chr2R 19013432 5' - Cr1a 43 1 59.41 TAAAAAGGTGGCCCCGGTCCCGGGTCCAGCCCCCATTATAGTTCGATGTCCAGTCCACCAGGGAAGACACCTCCGGATCCGCCGGTTGAACCACAGACATA:1 + chrX 2055771 5' + transib4 2388 1 53.47 AAGAAATGATTTTATTTCCTTAGTGGACTTTGGTATAGGGACATTCACTACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGCCTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3R 18009771 5' + roo 8692 2 51.49 TGCAGCCTAAGAGTAGGCTACACAAATGTCACATTTGCTTGCCTTTTTTACAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:1 + chr3R 27056379 5' - jockey 4963 1 56.00 AAATATTGCATGAGCCTATTGTCCTAAAAGTATGCAACACAAGGACCATCACTTTCGCCAGCGCGCTGGCAGGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:2 - chr2L 10166085 5' + jockey 9 1 76.24 TACTATATTTCATATATCTATGATAACGTTATGATTATGACTGGATGACTAAACCTTTGTAGATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3L 20411772 5' + roo 8678 2 63.37 AGGGCGCGCTGATGAAGAAGTGCAGCAAGGTGTGAAGACCAGCGGCAGGACATAAAAAGGACATGGACCACTAGCGCTCCGCTATGACATCAACTAACTGG:1 - chrX 21167264 5' - mariner2 44 1 65.35 ATGTATACCAGCTTCTGACCCTTCCGGCTGACCACATGCAATATGGACGTATGGAATAGAACTCTAGGGAACTGCCAGTAAATCCCTTTTACAGCTAATTC:1 + chrX 288796 5' + Porto1 4305 1 63.37 AAAATTATTCAAAGGCGACCAAAGGATGCTAATCTGTAACTTAAAGCTGAAGAAAGACGTCAGAAAAAAAAAACTGTAAAATGGGAGAGACTCTGTAGACG:1 + chrX 15357061 5' + 412 366 2 78.22 TGGGATGTCAAAGGCGCGCTGCCGCGGGCCACGTAATTTAATTACCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:2 - 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chr3L 19249780 5' - Transpac 310 1 75.25 TTTTGATTTTCGAACATTTTTAAACTTTATTTGAAAATTCATATCTCAAAATTTGGACGTGCGCAAAAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAA:1 + chr2R 11101734 5' - FB 70 1 80.20 TGTTTTATATACATTTTTTAAAAAGGTTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 - chr2R 22134239 5' - opus 7463 2 76.60 CGCAACTAATTAAATTGTGATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 9928516 5' - roo 395 1 62.38 TATCCCCAGGAAACAAGGATCTATATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:2 - chr3L 4009472 5' + mdg3 52 2 78.22 GCAACGTTTTTATTTGTTCACTTTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAA:1 + chr3L 20049619 5' + jockey 4779 1 55.91 AGGAAAAAACAGAATAGCATGTCCTATCAAGGGCTTTTAAGTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGTAAAGATTCCTTT:1 + chr3R 20094432 5' - Max-element 8528 2 66.67 CCACGACGAGGTGTTGCGCAGACGCCGTGGGCCGTCGTTGAGAGTCTGTTGGGTCTCTCCCATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCGCTTTGAGG:1 - chr3L 787960 5' - Porto1 331 1 61.39 CGCGTTAAAGACACTGTAATTGCCACTTTTATAGTTTTTTCCATAAGTTTACTTGTTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2L 22197288 5' - roo 9052 2 61.39 ACATACTACGAATATGCGTNGGCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACA:1 + chr2L 4134825 5' + Quasimodo 32 2 56.44 CGCTCATAAATTGATTTCGNTATCAATTGCTGAACTTTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 + chr3R 7469962 5' + Doc 47 1 63.37 TTGTGTCTACCAAAAACATCAATTTTTAAACACCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATT:1 + chr2R 18763923 5' + hobo 2532 1 74.26 ATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1 + chr3L 3540115 5' - mdg3 234 2 67.33 CACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCT:1 + chr2R 12185315 5' - accord 7369 2 62.38 CTTTTCGTTATTAACATTAGCTCGATGCGATTTGTTGTTGCTGTCGTTTAACTCTAAGTACCTATTTGTTTACTTCCAAGTACGGAAAACTAAGTTCTTCG:1 - chr3L 7527798 5' - 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pogo 1910 1 59.00 GCGGGAAAGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGACGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCG:1 + chr3L 26852643 5' + 1360 41 1 62.38 GATGATATCAACACGATTGCGGATATCTGCCAGAAGTCGCGGAGACGTACGAAAAGTACGCGTTGTTTTGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTTGCTCG:1 - chr3L 4078964 5' - Doc2-element 317 1 73.27 ATCTTTTGAAAGAGTCTTTAAACTCTCCACAACTCTAGGTGATTGAGAGAGTTTCCCAGTATCAGAGTTGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 - chr3L 25876166 5' - copia 247 1 78.22 TTCTTTTGTTTTAACTTTTTTAGAACTTAGGATCTGTACCTGGACTCAAGTGCACACTACATGAGTCAGACACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTA:1 - chr2L 17993032 5' + roo 8839 2 48.96 GTGGGAAGTATTGCCCTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 - chr3R 4474229 5' - copia 5082 2 70.30 CTCTGGCCACAATGGTGTACACAAAATAGCACTGAACACCTATTTTCTGAATAAAATTAATAGGAGTGATTGCTTTGGGTTTTTTTCGACAAATTTTGAAA:1 + chr2L 7699234 5' + Tc1 273 1 78.22 CAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chr2L 18213135 5' + hopper 13 1 66.34 AATTGACTAACTTTTTGATCCGCACTAATTGCAATCCGATTCGTGGATTGCATGTAATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - 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Tom1 175 1 61.39 AACGCCAAACAAAGGCAATCACAAAAGCCCCACAGAAAACCAAACCGAACCGATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCG:1 + chr3R 17257345 5' + mdg3 128 2 55.45 CAAGTTGGCCGTGTAGGTACTGAGCATCATCAGGGCGAAGAACCACCACATGCCAGTGAGTATGCGCATGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGACAATGAAA:1 - chr2L 5557839 5' - aurora-element 4182 1 73.27 GGAGCACTATGCGAAGGCCNAGGACGATCGGGGGGCGCATGCGGAGCACACGGAGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTT:1 + chrX 625818 5' - accord 6922 2 56.44 AATTGGAACTCCTTCGATAATTATTTATATATATTAAGCATATAATTATATTTATGAATAGGAATAGGATACAAAATCTTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr3L 17701504 5' + roo 8665 2 71.29 GTTGCCTCTAAAAGTGCATATTGTAAAATTCTCACATGAAAAAAGCACCATTCTGGTATAAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chr3L 19647228 5' - pogo 2088 1 66.34 CAAGCACATTTGTAGCGATAAGCGTCATAAAGTTATCGTAAGTAAGCGACTTCGCGAGAGGATGTTTACTTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGA:1 - chr3R 6053222 5' - Doc2-element 4509 1 47.52 ATAAGTATGCAGTTTCAGGGGCGCTAACTTAGACACAGTGATTAATGCATATATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAAC:1 + chr3L 15452835 5' + accord 1 2 72.28 TGCATTTGCAGATATATGTTTATTTGTCTGTTCACGCCACGTGAGCGTGTGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTGTG:1 - 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Cr1a 4196 1 47.52 TGTGCCAGAGCGTGGTACGTTATGCCCGACCCCAGAAGGCCAAGTCAAAATGCGGACGCTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTTGAACCTTTTATGGT:1 - chr3L 4503628 5' - baggins 5075 1 65.35 AGTAATCAGCGACAGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATATTACAAGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2L 9045477 5' + jockey 35 1 53.00 TAAGATATAACCAAAAGCAGTCGAACAGTTCCGATCCATCCAACTAACAAATATGGTTCATATACATATACATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTG:1 + chrX 22634696 5' + flea 4762 1 74.26 ATAACTATTATATGACTGCTAAAATTAAAACTGCGCTGTTTGAATATTGTTGAACGGCATTCCTTTTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGGG:1 + chr4 826777 5' - Rt1b 4879 1 75.25 AAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1 + chr2L 18247996 5' - blood 7345 2 70.30 AAGTGCTGCCATTAGACAATAACCCAATTTCAACCAATAATAGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3R 8582545 5' + roo 25 2 57.61 CAACAAAAGCAACAGGGCGTGCTTTATGACCAGGTTTCTACCGCCCCCCCAACCAATCCACACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAA:1 - chr2L 6276114 5' - copia 239 1 62.38 GAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 6266312 5' - roo 360 2 74.26 CTGGGCAACAAGATCATCGAGTGCTTCATGAAAGAGAAGATCACAGGCGCTGCTTGGTACATGAGGACCAGAGATATCTAACATGATCTGAATGTGACAAA:1 + chr3L 19256022 5' + jockey2 3028 1 59.41 GAGATACAAATTTCTTCAATCTGTTTATACATTTTCAACTAATTCTACTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTA:1 + chr3L 5478998 5' + 3S18 5796 2 54.46 TGCGGAAGAGGAAGAGCAGGAAGATCATTACTGTTGTGGCCGAACCAACTACCGCGCGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACT:1 - chrX 10377912 5' - accord2 183 1 46.00 GCGGGCACATATAGTATACACATATATATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTT:1 + chrX 11262827 5' - invader1 359 2 73.27 TCGGGGCCGCCGACATTTTTAAAGCTTAACAGCATTTTTCCACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr2L 18248082 5' + blood 3 2 76.24 TAATGTTCAATGAGCCTTCTGGGCGTACCAAAATCAAATCAACTAATTCGATCGACGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 + chr3R 6701210 5' + F-element 48 1 62.38 ATAATAATAACGTTAAGGCAGTCAGACTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGTACAC:1 - chr3L 6630128 5' - 1360 180 1 74.26 ATTGGGGGATCGAGGAGCCGGGCTAACAACGTGTTCCGGTTCAGGAAACATTCAGCTGACATCAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3R 14193992 5' + pogo 11 1 66.34 TATTTCAGTGTTTTAGCATNCAGGTGCTGGTCCGCGTTGGCAATGCCCCATGGACATGCGTTAATAAAAAAAAGAGAAAGCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAA:1 + chr3R 15886610 5' + G-element 4325 2 73.27 ACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTA:1 + chr3R 6266301 5' - roo 371 1 63.37 ATTGTTATGTTGTTGAGGTTTTCCGTTTATTTATGATGAATGGTGAAAATCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCA:1 + chrX 4268496 5' - I-element 246 1 75.25 GCATATTTTTACATCACTTCTGTTTGCCTTTCTCCCAGAGCCACAGCTCCGCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr3R 12199834 5' + jockey 31 1 53.00 ATAGAGCTAACCAGTAACAATTCTTAAAACCAAACTGCAATTAATCAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTA:1 - chr2L 17677810 5' + Tirant 1 2 80.00 CAAAGTAAACTAAAAAGACCTTATGACAATGAATGTGAATGAATTATTAATGTTTCTAATAAGACTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr3L 3757321 5' + roo 8673 2 69.70 TGGTTGGGTTTGTTTCTGTNTTTTATTATACCCATTACTCGTAGAGTAAAAGGGTAGACTAGATTCGTTGAAAGGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTT:1 + chrX 16541458 5' + INE-1 33 1 90.10 GACGCCGGCTATTCGCCCCGAAAAGTACGTGTGAAATTATCATTATTCAATTGTGTTTTTGGGTAAAGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr2L 7666080 5' + roo 8672 2 71.29 AAAGGAAGTAGTATTCACTNCGAAAATTCAATCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chr2L 20328717 5' + opus 7158 4 68.32 CGGCCAAGATCGTGTTGGCTGATAGGCATCCTAAGATGTCTGTTACTTAAATTTTGTACAGCAAAGATTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAA:1 - 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copia 244 1 45.26 ATGCGGTACTCACACTCGCTCACACACTTGCAGAGCACAGTGACATACGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr3L 8268219 5' - hobo 2911 1 51.49 ATCCCACCCCAAATTTCTTAAGGTCCATCCTCCACGGTAGCGATCACTTTCCTATTACCATCGACTTATTCCCGAACATGCGAGAATCCTATAGTCGAGTT:1 - chr2R 19825068 5' - INE-1 575 1 47.52 CGTTATTTTCCGTTACAAATCAATTGCCAACTTATGGTCGTGACGAGCCTTTCGTCGCAAATCTCGGTAAAGACTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTCTT:1 + chr2R 5919472 5' + diver2 248 2 65.35 CTGTTTCAGTATCTCCTGTTTGTTCAGTTCCTTCTGTTTTGTCGTATCCTTTGGTGGAGTTGAGAGTCCCTACATGGTTAGTCGGCTTAACTTCTCTGTTC:1 + chrX 15244138 5' + Cr1a 4091 1 50.50 ATTTACGACCAGACATTTGCATCTGTGGTTAGGTACATCGACCCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 - chr3R 22330775 5' + I-element 53 1 57.00 GAAAATACGTAAATGAAACAAAACTACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGAC:1 - chr3R 16658541 5' - invader4 2844 2 75.25 GATACCGTCGCTTCACCTTGGCAACCTGCTCTTAGAGTGCTCTTAGATTCATATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTC:1 - chr3R 31586795 5' - Idefix 7084 2 75.25 ATGCTTAAAGCACAAGTTTTTCATGGAGCTAAGGGAGGGGGGGGGGAGAGAGGGATTCCGGGGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCAGAATAAGGGCAGAA:1 + chr3L 14593199 5' + hobo 450 1 63.92 CAGTCGATTAACACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGT:1 + chrX 20361956 5' - hopper 1397 1 61.39 GTAGCATGTGGTTTGGTCACAAGGTGTGGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr2R 21351336 5' - mdg1 366 2 75.25 CATCGAGGGGTTTTCAAGAGGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTAC:1 + chr3R 7783719 5' + rover 12 2 68.32 CAGTGAATACAAGGATATTTGTACAAAATTTCTTTGATTACTCACATTAAGGCCATCTAAGCTGTGGTTTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr2R 10826042 5' + 297 6602 2 71.29 CACTGCACTTGTCTCCCTATTTGTTTGCCTTGTCACCGAGTCATGAAAACAATCGGAAAAAGAAATTTGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAAACCTA:1 + chrX 12150260 5' + Tc1 411 1 58.42 CGGGAAGAGCCGATCTTGCTTTTGAGGAGGCTCGAATCTAGTATAGCCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTA:1 - chr3R 4587931 5' + Doc 73 1 53.47 GGCGAAGTTATGCATGCTAAATCAAGCGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGACCGTATATGTGTACATCAAACGCTGATAAGGCACCGGGATCGCT:1 - chr2L 17016388 5' - accord2 7185 1 74.26 ATATAACCTGAAGCTTGAAAACTAAAAAAAATTTCAGATGTGGGGGTTACAGCAAGGGAACATAAAAGATTAAATTTCTCTAAGGGAGGTATTT:1 - chr2L 7660276 5' + I-element 481 1 71.28 TGCACTACGGAATGGTGCTGCTTTGATTAAATTTTTATGGACAACCCGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTG:1 + chr2L 17998257 5' + BS 26 1 56.44 GAAATACCAGTGAAAATGGTAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2L 20620020 5' - roo 9021 2 79.21 TGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACAC:2 - chr3L 19350018 5' + 1360 3207 1 51.49 GCATGTGTGGCAGCTAATATGTTGGCTTGGCAGTGTCGCCTCTTGGAGCCGTTGAAAAATGCACTGACATGTGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATT:1 - chr3L 14731815 5' + copia 76 2 77.23 CCGCTCGAGTCGCTGGCAAGGAATCAATTCCGACATCGATACACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 10080972 5' + Doc 4585 1 59.41 CATTGCAAAATAAGAACTTGAAATAGAATAAATCGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAA:1 + chr3L 18063338 5' + G2 108 1 66.34 AAAGGTAAACAAATACCTTTAAAAAAATTTTAATATATTCCATTCCATATTCAAATAACAAGAGAAATTGCCATAGTCGAGTTCCCCGACTATTAGATACC:2 + chrX 21388005 5' - INE-1 557 1 47.52 CATGTCCTATCAAGGGTTTTTAAGTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGC:1 + chr3R 20094449 5' - Max-element 8513 2 51.65 ATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 - chrY 2720366 5' - 297 6956 2 61.39 ATCCATCAGCTTTGTTTGTTTTCACTGGCCAAAACACCAATTCCCCCGCTGACATTTGCATGTTTTTTTTTTATCTTTCCCTGTTCACACATGAACACGAA:1 + chr3R 23338236 5' + roo 8663 1 77.23 TTCAAAAATGTGTATGTTTNAGGAAGTTTGGGGGAAGTTTGCGCCGCGTCTTTAAAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTCAAGCTTTTATAGTGCCTGAGA:1 + chr2R 5185196 5' - INE-1 152 1 62.38 TTAGAATATAGGGTTCCAAATTTTTTGATTTTAATATTTAAAAATATATTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3L 20584090 5' + pogo 23 1 56.44 ATTCATAATAAGACAACAAGATTATTATATGTACGTTCAGTAGTCTTCTCTCATTTATGCGTTTCCTCCGGATATAAATGACCAATATAATTATGATAATC:1 + chr2R 913749 5' - rooA 7155 1 65.35 CCCCTTCACACACTCATACTAAATGAAAGTTGTTGCCAAAGGAAGATGAGAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTG:1 - chr3L 1218220 5' + mdg3 5184 1 56.44 GCTCCAAGTTAAGCACACTATAAATGCCACAGTCGCAATTGGATCCAAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAAT:1 + chrX 734907 5' - Tabor 456 2 53.00 CCAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3L 12241829 5' - roo 9026 1 73.27 GGCAAACTGAAACAAAGGAGCACTGCCCCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGG:1 + chr3R 11607967 5' + 1360 47 1 72.28 TCACAAGGATTTCTCTACCTTGCTTTAAAAGGACAAGAGAAGAGAAACTATTTTATATACGTATTCGAATAACGGAATAATTCGAGTGGAAAATAAGTTAA:1 - chr3L 6013413 5' + 297 457 1 78.22 TTTTGCATAACCCAATACGTTTTATTGCCTTAGTATAGAAGACTATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTG:1 - chrX 22689604 5' + 1731 4347 2 57.43 ATTCGTTTTCATTTTCGATTTTCGCATCTACTTATGCTAATGAAGCCATCTGCAGACGTGGTTTTCGAACGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATA:1 + chr2R 9905324 5' - mdg3 241 2 75.25 TATCATTGTTCAATACTTAAACACTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTG:1 + chr2R 22051485 5' + Tabor 54 2 75.25 ACTTCTATTTTATTTCTATTTTTTGCATGGTGTCAATTGATCAATAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAA:1 + chr3R 1510317 5' - 1360 210 1 79.21 TTGCAACTGGTGGCTCCTCCGTGTCCGTCATGTCCAAATGAATGAAATCTCGCGTTCGCTTTCGCACTAGCTGAGTAGCGGGTATCTGTTAGTCGGGGAAC:1 - 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chr2L 11018875 5' + Gypsy6A_LTR 28 1 67.33 TCAGCGAGTATCTGTGGATTCCTGTCTGAGACCCATAAACCGACTGACCAACAGATTTCGCAGCCACCTAAACCGCCGAGCCCTGCACCTGCAGCTCCAGA:1 - chr3R 20918684 5' + Chimpo 4194 1 63.37 GATGGATGGATTTGCTGGTCGTGTGAATGTTGGACAATGAAACCCACTTGTTCGGTGGGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 + chr2R 21040839 5' - P-element 2869 1 55.45 AGTGCGAAATGCTTGGTTGCGTTGTTGCCCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 6961080 5' + 412 7100 2 71.29 AAACATTTTATCACAATTCCAAGACTGGTACAGGGTGGAGCGATTTTTGAAATTATTCGAAATTATATATATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGA:1 - chr3R 7783835 5' - rover 341 2 73.27 CAAAAAATTTCCACACTGCCAAAAAAATTATAGGATAAAACACCAAAACTATTAATATATATGAAAAACCAATATGGACGTATGGAATAGCACTCTGGGGA:1 - chrX 7001370 5' + Porto1 4274 1 66.34 AATTCGCTTCGCAACACTCNGTGCCGCGGGCTGTTGTCGGATTTGAGCGGAATGGAAGTGATGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAG:2 - chr2R 5883065 5' - Tirant 344 2 62.38 ATGTGTCCTATTGCACAAATCAATGTTTTGCAATTGTAGAGCGACACATAAGTAAACTACACGACTATGATAATGTCCTAGCACTAGGCCTACTAGATATC:1 + chr3L 10613533 5' + G3 4414 1 66.34 ACCATAATCCAAAACTCACTCACTCCGGAAGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 - chr2R 23519264 5' - jockey 4944 1 70.30 AAGCCAGGCAAGGATACCAATGGTGGCAAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAGGG:1 - chrX 8543302 5' - hopper 140 2 60.38 GAAGACAACTGAAAACATGTTTCCCAACACTGGGCGCACACATAGTACTGCTCCACTGGTTATTATTTACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chrX 17857968 5' + P-element 8 2 66.34 AGTGACATACATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACG:3 - chrX 18326245 5' + Doc 211 1 49.50 TATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTG:1 - chr2R 12457975 5' - HMS-Beagle 197 2 78.22 GAGTGCAAGTGCTCCCATGTGGCGAGAAATACGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAAT:1 + chr3R 5355898 5' + Ivk 422 1 69.31 AGCGAGATGGCAGTATGCAAAGAACCGAGACAAAGCAAATATATTCGTACATATAAGTTAAAGCAAGTTCCACTTGC:1 + chr2R 17392607 5' - opus 7500 2 71.43 TTCCCCGATTTCTCCAGCACTTTCCGGGCACGACATGCAATAAATGCATTTTGCATGGTGTGCACGTAAATGACCGCCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATT:1 + chr3L 17140095 5' - F-element 293 1 78.22 TTGAATTTAAGACCACGCAACATTTCGAGTTGCATAACATAGAGGAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 - chr3L 27412306 5' + jockey 95 1 55.45 CTCATTGATTGTCGGATCCAGTGAACATTCACATACACACAAACATACATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr2L 3978513 5' + 297 6601 2 60.40 GCGCAAAAATACGTCACTAAATACCTGTTACATACTTGGCAACGAATATACCTTTTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr2L 21715754 5' - 1360 3356 1 55.00 CACATAAATACAGACAATAGTAATGCATTTGCTGAAAACAATCTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chrX 15800964 5' + roo 8695 2 59.41 ATATAATATAATCTAATATAATATAATATAATATAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr3L 20525229 5' + blood 7052 2 70.30 CATTTATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:2 - chr2R 11941067 5' + 297 32 2 62.38 TAATGTGCGGTTACCTGGCCCGAAAACCCTCACACCAGAGCTGCTAGTTCGTCGCACTCTCATGTTGCAACATTGTCGGCGGAAACAGCTCAGCA:1 - chr3R 17983481 5' + gypsy5 166 2 76.84 TGTATTTATAAATATGGTTAGTCATCTTTTGATTTGATTTTCAGGAGTTGAGCTGGAATTGTATTTACTGTTATTAATTTTCTTTTATTTTTTTTTTTAA:1 + chr3R 8364667 5' + hopper 151 6 65.00 GGACGAATGCAAAATGTTCGACTTTTGGACAACAAACTTAAACTTTTGTTTATTTCGTACACTAATAAAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGAC:1 - chr3R 7514004 5' - diver 216 1 64.36 CCGCTTTCTAAGCCAAAAGGTATCCTGGTCCGATTCTGAGTACTAGTCCGTGTGAGAAGGGTTTGTCGATGTGTGCGGATGAATAGATGAATTATCTATGA:1 - chr3R 11371937 5' + micropia 5146 2 75.25 TTTTATGCCACAAAAAAACGCTCGTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAACATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATA:1 + chr3L 5710226 5' - Transpac 311 1 73.81 ATCTTTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr3L 27357556 5' - mdg1 7423 2 56.44 AGGCGCAAATGAACAGGAAGAAAAGGAGGCCCCCAAATGTATGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr3L 13895335 5' - hobo 2933 1 71.29 AATTAAAAGTAATTTTTGGATGGTTCCATTTGTGTTTAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 - chr2R 8682405 5' - pogo 2065 1 64.36 GCATACTTTCATTATACCTTTATTATTTTGAAGGGGCGGACACGATGCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGG:2 + chrX 15255345 5' + Tabor 6869 2 52.48 GTTTTTGTTGAGTTTACGTTTCCGAGTTACGTTACATTTCCGTTGCGTTGCCATTCCGTTACGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGTGCTGCGAGAGGAGCCG:1 - chr3L 9112097 5' - Doc 450 1 66.34 TAATAACTGGCCCACTCATCACTGACTCTGGCCATATCCGTCTGTCCGTCTATTTGAACGTAGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTA:1 + chr2L 21293841 5' + INE-1 165 1 65.35 TGGAAAACCGAAAGAGGGTAAACAACAAATTGCATACTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 + chrX 15546127 5' - blood 366 2 68.32 GCATTTTAAATGGTGGCGGAGCAGCTGGTCTCTCACGTGGCTGAGCCGAATGTAGCTGTTGATACCGATAACACGCACGTACGAGTGCGTTGGTAGTGGTA:1 + chr2R 18681806 5' - G-element 160 1 68.32 AATGCAACTAATATACTAATGTACTTTTTCAAGTGCTGCACTTAAATGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 19450179 5' + roo 24 2 62.89 GCAACGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCG:1 - chr3R 1844859 5' + Cr1a 117 1 68.32 TTGGTAGTTCAGTTCTGTCTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:2 + chr3R 6266274 5' - roo 398 1 68.32 TACGATCTATTCGGTTTTATGACAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAG:1 - chr3L 1586775 5' - Tirant 8457 2 76.24 TTTTTTTTTCATAATAGTGTTGTTACGGTCAGATTTTCTATGTATTTCATTTTCTTCTCAGTTAGTACTTCGATTACTAATTTGGTTTTTAGGTCTCTGTG:1 - chr3R 1136624 5' - Doc 4415 1 74.26 TCACCATGTGCAGCCAGCCAGTGGAGGGACCCTCTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:2 - chr2R 24278066 5' - 412 448 2 67.33 CTAATTAACACAATAGAAAGAAAAAAGTTCTTTCAGATAATTTCTGTAAGAACTGTTAAGCAAAGTAATAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAA:1 - chr3L 13096907 5' + I-element 327 1 67.33 TCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr3R 19987413 5' + Doc 46 1 66.34 CATGCAAAAGCTGCAAAAACACACTATATAAATATTTTAAAAGTTGAAAAATGCAACTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGT:1 + chr3R 7568137 5' - copia 45 2 61.39 TCATGCTCATAAATGTGGCTAATTTGCAGCGAAGCTCTGGCTATGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAG:1 - chr2R 15746525 5' + R1A1-element 5224 1 57.43 TATACCAGAAAACTGATGAAATTTCGCGTTCGCATTCCCAAAATACCAATGTATTATCAAATGGTTTAAGTGCTGACGCATCTGATGGTCGGGGAACTCGA:1 - chr4 897558 5' + INE-1 560 1 68.32 AGCAACCGCTTTGAACAAATGCAAACCGGTTGATACCGCTTCGAGTTGTTAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr2L 12459668 5' + blood 7038 2 52.48 AATTTTGGCAATGCCAATTTGCATCGCAAAATTTTTTAATTTCACACATCGAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGG:1 - chr3R 14334822 5' + X-element 4427 1 52.04 CGTGGCTAGACTACCTGAAAAGTCAAAAAGAAAACCTTTATTAGTAATCTATATTTCATTCATCATAACTAAATATGCATATGTCGGCGAAACAGGAGTCT:1 - chr3L 20454637 5' - invader4 327 1 81.19 AAATTTAATAGCATTTGGCTTCCTTTTTTGTTAAGTACTTATTGAAATTTATATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr3L 15788415 5' + opus 7026 2 54.46 GGGTTCAATGCCAAACATTTTTGCCATCCTTTGTTTTCTCGGTTTTTGTTGTTAGGCTCAATATCTACATAGAACATGTTCAGTGGCGTTTTGGTCGCACG:1 - chr2L 8143030 5' - G4 488 1 64.36 TTAAAATCTGGGTTGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTACG:1 + chr2R 19091613 5' - Stalker2 7609 2 64.36 CTATCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCG:1 + chr2R 18723040 5' + HMS-Beagle 33 2 61.39 TAGTCCAATGTAAATTGAAATACACAAACATGGCTAAAATAGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chrX 8503175 5' - roo 9038 1 63.37 TTCATAATCGATACAGGATGCTATACGTATAAGTTAACACAATCACAAAAACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 + chr3R 19450672 5' + Burdock 6186 2 76.24 GAGACCAAACCGTATCTGAGTTAAAGAATTAAAACTTATTATATTCGCTTGAAATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGA:1 + chr3L 20755336 5' - I-element 5331 1 57.00 GTGGAGGAGTCCTTCCTGGACTGAGCTATAAATGCCAACGCAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3L 13773952 5' + roo 8699 2 61.39 CCAAATGTTCAAACATGACTCGCATTCACAATTGGCCAATCGAAACGCAAGGCAACAACAAAGCAAGTAAGTCACGCTCAAAAGAGAGAGCGAGAGAGAGC:1 - chrX 10937669 5' - blood 7179 2 59.41 ATGAACTTTTGCCTTTTTTTTTTTAGTTTTTCCGGTTTTTTTCGGTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTTT:1 - chr3R 29383048 5' + hopper 146 106 80.88 TGTATCTTCGTATCTGGTATCTGCGGATCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:2 + chr2R 15788552 5' + Transpac 4928 2 71.29 GATCCTGTGGCAACCGAAGNAGAATTTTGTCTGCTGACGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAAAAGTATGCAAA:1 - chr2L 12882799 5' - hopper 1377 1 59.41 TTGAAGTGATGTTATTTTGTTATGAAAAGCAATTAAAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 - chr2R 672854 5' + F-element 21 1 65.35 AGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr3L 18418883 5' + hobo 54 1 76.24 ATTCCATTAATAAGAAATCCAGTAAAAAATACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr3R 11052074 5' + blood 6 2 71.29 ACGCCTTTTTGGCACTATTTTTATTTCTATAGGTAAGTAAAGTACATACACTTGTGAATGCAAACTCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGAT:1 + chr4 843958 5' - INE-1 500 1 49.50 AAATATTATGGCTGACACGCATTCTGTAAACAAACTGAAATATAAAGAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCT:1 + chr2R 17644863 5' + mdg3 31 2 51.49 CACTTCCCAGAGGCATTCATTCTAATGCACAAGGTGGATAAGCGACTGGAACGAATTGACAACGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:1 - chr3R 21884260 5' - mdg3 231 2 63.37 CAGGATCCGAAAAGGAAGACCGCACGCTGTGCTTGCGGACTAGGGAAAAGACAGTCAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTG:1 + chrX 880375 5' + opus 396 2 43.43 GGAGAGTGGCAGTGCTTAAAGTGCAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 9278345 5' + roo 50 2 79.21 TAAGATGTATCCAAAGAATGCTTCCATAATATTCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1 + chr3L 5702035 5' - I-element 5315 1 63.37 CTTGAACTTCTTGCCGAAATATCCATCCAAATAGGCCTCGAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACG:1 - chr3L 11077848 5' - R1A1-element 5002 1 60.40 TGCTGCCCACCTCGCCGCGGGCCAGTTGATAGGCAATGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTT:1 + chr3R 21006239 5' - accord 7176 2 64.36 AGAGCGGGGCAAAATGGCAGGAAACCCCGGGATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGG:1 - chr3R 13739730 5' - Burdock 215 2 68.04 GTCGCGACGGTCTGCTGCTNGCCAAATTAGAGGATTGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGCATGCAA:1 - chr3R 12329665 5' - hopper 1378 1 59.41 GACAGACATTTGTTGGCTAGGGGAGTGCGTGGGGCTTAGCTGAAAAGAATGCTACCGAGCACTGGAAACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAA:1 - chr2L 11712917 5' + Quasimodo 3 2 69.31 CCAATTTTCGGAACTAAACTTTCCGCTCAATCGAAAAATTTAAAAATATTTAAATAAATGGCAAATGTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 - chrX 22789410 5' + Tabor 10 2 67.33 GCTAGCATCCTTGCTGTGGAAACATTTGAAGCACAACACTTGAAAATATTTTGTATATTTTGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 10701695 5' + roo 15 2 64.36 ATGGAAGTGCGAACTTTTCCGCGACAAACTTCCTGGCCGGCATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 + chr2R 12473059 5' + Doc 37 1 61.00 ATAATCAAAAATATTTCGCNCACACAAGGTCAATTAAATTTGCCCTTCACACATTATTAAGATTTTCCATCAGACATATTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr3L 9928634 5' + roo 8665 2 77.23 TAACTGCTCGTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3R 10741064 5' + 1360 1 2 75.25 ACTGGGAAAATCATACTGGGTCGGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 - chr2R 22553128 5' + 1360 54 1 79.21 TCTTGTTTTTCTTTTTTTTTGAAAATTTACAAGACAAATAAAAATGTGAAAAAATATCAGAACGTTTTTCAAAAGTGTGGACATGGCTAGATCGACTCGGC:1 + chrX 3348129 5' - INE-1 106 1 76.24 TTTATTAAGGAAAAAACAGAATAGCATGTCCTATCAAGGGTTTTTAAGTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTG:1 + chr3R 20094425 5' - Max-element 292 2 70.30 TCATATGTGTCATTAAGGATGCCCACTTACATACATATATGAAGGGAAATCAATCAAACAGATAAAAACAGAAAAGCGAAAAACAAAAGAAAAAAAAAAC:1 + chrX 3342334 5' + HMS-Beagle2 488 5 54.00 GAGAAATTAATAAATTTAATTTTATTACAAATTAAACTCAGCTATCTTTAGTATTCTTAATTTCAACAGATACAAATGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 - chr3L 10110644 5' - roo 411 1 44.55 AAATCAGAATGGTATGAGAGAAATCTACACTAGTTATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr3R 15579032 5' + pogo 37 1 63.37 TTGAGAGCACTTAACACTATACAATGGCATGTTTATGTTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCCTACTTTTGTAGGCGTGGTGGTTT:1 + chr2L 12973921 5' - ZAM 8003 2 70.30 ACAAATACAAATAAGTAATCGATTTAAGTGAGCGCGTCTAAATTAATTGCACCTATACTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 25021760 5' + roo 8681 2 63.00 CATTAGTTTTCCACACACACACACCACATATGTTCAACCTATTTTTTTGGTGCTGCCTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr2R 18766286 5' + hobo 20 1 55.45 TACATAATTCAAGTAACTGCCCAAATAAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 - chrX 22574722 5' - 297 6956 2 61.39 TAATCAAAAATGCAATGCAATGCACTAGGTGCATAGCAAATTTGCCAAAATTTACCAAAACAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAA:1 + chrX 3663567 5' + Porto1 4320 1 64.36 AGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2L 13093777 5' - roo 9035 1 63.37 TCCTGTGAGTGTGGGTCTTAAGCCCACTTCGTGGCTGTGTAATATGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTACG:1 + chr2L 15531803 5' - Stalker2 7609 2 61.39 CATAGCAAATACAATAGATNCTAAAATTTCAAATTAGTTAGTTGGTTAGGTATAGCACTAGTTTCAGACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 - chr3R 21849737 5' + S-element 8 2 68.32 CGTTCCGACTGCGCGCCCGCGTCCTGACCGCGCGACTCGTGCTTGTACCTCGCGAACGTATGGATCGCGCATGGGTACTGATCAGCCGAG:1 - chr2R 2109914 5' - Quasimodo 250 2 70.00 CTATCCAATAAGCATTAATTCACGCTCTCACACGGCGCCATTATCATTAGCAGACAAAGAGACCAAGCCAAGCCTCTCCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGAAT:1 - chr3L 14277182 5' + G4 1 1 61.39 GAAATCGGTTCGAAATCGGGTTATGGGACAGGATTTGTTGTCACAGTACTAGTCACCGTAGGTAAGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAAATTGGGG:1 + chrX 7114164 5' - Doc2-element 489 1 66.34 TGTAAGCTCTATTATCTGANTAATATAAAAATATTTTTAAAAAAAAAA:1 - chr3R 5864724 5' - hopper 161 2 56.25 ACTGATGATTTATTCATCACGAATCTCTAACCCACTGGCTTCCATAGAGCTTTAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - chrX 15546228 5' + blood 7032 2 58.42 ATGAAAAGGTGGATCCTGCGTCGATTAATAATTTTATTGATCTTCCCGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGCATAGCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 2819649 5' - 1360 11 1 56.44 TTGACTAACTTTTTGATCCGCACTAATTGCAATCCGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - chr3R 6143781 5' + Doc 47 1 67.33 CGCCACACTGGCTTATCAAACAAACAATTTGAATGCCCAGCGGAGCGATCTTTTTATTGATGCGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr2L 16358152 5' + hobo 14 1 63.37 CTCAACATAATTATGCGCANGGAAGTAGGCAACGTTTTTATTTGTTCACTTTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCT:1 + chr3L 20049591 5' + jockey 4759 1 78.22 CAATCATCGCCGCTAATCAAGTGTTTCAAACAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:2 - chr2L 17994199 5' + roo 8707 2 69.31 TCCGCCTTCTCTTTGGAGGNGGGACAACTTCAGCTTTCGTTCAGTTAGTCTATGCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 13773875 5' - roo 388 2 57.43 CACCCTCTAAGAGCCTCCCCAAAGTGCCTGCACCGGCAGCCTTATCAAAAGTATCAAAAGTAACAGAACTATGCCCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAA:1 - chr2L 21215366 5' + BS 4976 1 72.28 TGGTTTCAGCAGGGTAGTTACTCTCTATGTGGTTTAGTTTTAGGTTCACATAAATGCCGGATGGAAAAGCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2L 8577367 5' + roo 6 2 74.26 AATACATGTTCGAGCAATGNTATTAATCACCGTCAGTTGTCAATATTTGTATTATTGTTTTGTTACAGCTAACTTTTGTTAGCCGACGCGCCTTAAAGGGC:1 - chrX 16480109 5' + BS3 1693 1 63.37 ATACGTGGGTTTTGGAAGCGGGGGCATTTTATTTAAATATATACATCTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr2R 21962707 5' + 297 24 2 61.39 CAATTATGGTGCAACCTGCGGCCTCGCCCCCACTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACAC:1 - chrX 7862803 5' + accord 187 2 74.07 AGTTTCTCCAGTAAAGAAGAAGCTATCGCCGTTTCTTAACGGATGAGATATATAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGT:1 - chr2R 4500940 5' - springer 358 4 53.47 AATACAAACACAATGGCCANAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr3R 7869129 5' + 297 34 2 65.22 TCGCTTTGTTCGTCAGCAGATTTTGGATGCTGCAACATCTTTGGTTACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCG:1 - chrX 6458269 5' + hobo 132 1 54.46 AAGGTAGGGATGGATACTCACCAAAGGTCCATGTCAACTCTGGTTTGGTGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTGTCTACTGACTAAAA:1 - chr2L 8107173 5' - Transpac 5010 2 51.49 CTCTGCAGCACAGCGCGCTTTCTTCGTTCGGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 + chr3L 16891109 5' - P-element 2840 1 30.69 AATTTATCTAAATAGGGGTTGTCTACTAACTAACTTCGTTTCTAGTCACACGTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr3R 24542121 5' - 1360 3366 1 53.47 TTAGTTGCCGCAGTGTCTTTGATATGGCCATTGTTGTGTCTTCCTCGCAGTAGGCCTCAGACAGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGG:1 - chr2R 7168566 5' - Idefix 235 2 78.00 TTTTTATTCGGAGTATTTCATACTTGTTGCTAATCTCATGTGGGATTGAATTTATTTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGAC:1 - chrX 12389132 5' - I-element 5330 1 53.47 AGATTGAAATGAAATTGATTGAAATGGTTTCACTATTCATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAACCTCAACAACAAA:1 + chr3R 11256110 5' + I-element 120 1 60.40 CAAGAAACCACCGTGACACTTGTTACGCGATGGGCTACGTGTTAAACGCATTTCCGCCACTTGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTT:1 - chrX 9413886 5' - 412 477 2 62.38 AAAATACGATCCTTCATTAAATAGGAAGAAACAAAAATTCCTAAGAGATCAAAAAATAATTTCAAGAAATATATCCAACCGAAATAAAGTTATGTTATCT:1 + chr3L 2818428 5' + Chouto 149 1 49.00 TAGAGAGGGCACGTAAATTGCGGATGACAGTTGAGGCGATGTCGCAGAGGGCGCGTTTTAATTACGACAGATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCA:1 - chrX 15263520 5' + invader3 5194 2 72.28 TAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:2 + chr3R 19450177 5' + roo 46 2 58.42 TGCCCTTGGGGCGAATTTCGCTGTGCAAGAACAAGATGGAAAATCTATGCACAAAAAGGGGTAATGAAATGATGAACTCCAATTCAGAACACA:1 - chrX 9775072 5' - 412 486 2 68.82 TCATTAACCCAAGGGCTTGAATTAATATCGGACAGCATTAGGCGGCGTAAGTCAGCGACTGAAGGACACCATTTTAATAACTTTGTGCCATAAGAAACAAA:1 + chr3R 14188962 5' - pogo 311 1 73.27 AGCACTGCCCACAAACAACNATCGCTGCCAAAGATAAACGAATGCTGCGCAGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGA:1 - chr3L 9917933 5' - 297 6624 2 78.22 GGAATTCTATGCAGTGACTACTAGTTTCATCAAATTGAATTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATG:1 - chr3R 31021999 5' - Ivk 5339 1 65.35 TTTTCAAGCATATCCTTTCAAAACCTCAACATAATTTGGCCACCAAACTTCCGACACCTGGGGAAATCAGCCCCCAACACTCCTAATCTTTTATTGTCACG:1 + chr3R 13402447 5' + gypsy2 6754 2 78.22 CATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3L 9910420 5' + 297 37 2 72.28 TGTTTGATGGCACAAACTATACAATCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAG:1 - chr3R 27907672 5' + mdg3 5305 2 78.22 GGTATCTAGAAAGTGGAGTNGCGTAGCCCAAAAAGCAAACTGGGCCAGCTAATCGGGGGGCGGAAGTGCAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAG:1 - chr3L 7099909 5' + roo 144 2 72.28 AAGATGATTAGGCCATGCCCATTTCCGGACAAAATGTTATGCAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGG:1 + chr2L 14220152 5' - gypsy6 7768 4 59.00 AATTTACATGAAAATAAATATTTTCCGGTTTCAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr3R 9224398 5' - pogo 2060 1 71.29 TTGCTAGTTAAATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chrX 13146912 5' - roo 9042 1 57.43 AACGCCTCCAGCATGTTTTGTTCAGCTCTACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chr3L 20520731 5' + P-element 44 1 32.99 TTTGAGTTGCACGAATATTTCACTGGTAATTGTACCAGTTCCTAAAAATGGTGAAATACCAGTGAAAATGGTAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:2 + chr2L 20619968 5' - roo 409 1 73.27 ATCATACTAACTAACATATCTTTCATCATACATAACACATGTCTGTTATAGCAGCAGTTGCACTATGCTATTTTCAGACAAACCCAATTTATTCTGTGTTT:1 - chr3L 9506375 5' + McClintock 341 2 73.27 CTAACCCTTCTTTCACCTGTTACGGAATTTTCCGAACGGCAGTTCAATCCGTCAACTCTTTTCTCTCAGACAGGGCAACGCATACAATTCCATATACATAC:1 - chr2R 11697360 5' + ZAM 185 2 65.35 TCGCGCTTGGAGTGTTACTTGCAGACCACGTGGCAGTTCCTTCGTTTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACAGAT:1 + chr3L 19796689 5' + hopper 1379 1 53.47 CTGCTCTTGTTGACGATCACCCATAATCAATATAAATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTACTTATACA:1 - chr2R 9905411 5' + mdg3 41 2 60.40 CACCGCAAATTGTTGTCAGAAGCATTCTGTTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chr3R 12333769 5' + P-element 44 1 35.64 GAAAAGTATATTTCTTTGTTTTGAAATACCGGGCAAATATTTGAGAACCTTAAATTGGATTTTTAGGTCAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGT:1 + chr2R 8267361 5' - Doc 308 1 76.24 GTGTTATCGCGCTGCCATGACCATCATTGTTTACATATACATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr2L 21708347 5' + 297 6607 2 66.34 GATTATTTTATTTACCTGTATATAGCAATCTTAAGATTGATATCGAAATAAATAGGACTATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 - chr3L 15033383 5' + I-element 18 1 61.39 TCAACCTTCTAGCTTCTATAGTTCCTGAAATAACAACGCTTATATGGACGTAAAGACAGACGGACATGATCAGATTGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAA:1 + chr2R 1751258 5' - INE-1 89 1 67.33 TTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chrX 13146938 5' - roo 9025 2 79.35 TGGGAGCGCACTTTGTTATTGCTGTGGGAAACTATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTGCGACTGCCTTGTACTTGGTC:1 + chr3R 23313224 5' - Tabor 341 2 65.35 CAACAAAATGCATATTTACTGCTTGCTATAGAAGGGCTCCAAAGGCTGGGTAGGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 + chr3L 3880973 5' - blood 355 2 57.43 ATATCGGAATTTTATGCACAATGACAGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 - chr2R 17459212 5' + Transpac 44 2 73.27 GTATTTGTGATTGCAGAAAATATTTGGATGTTTACAAAAGCCTTAAACCAATGAAGCTATATATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATG:1 + chr3R 17147939 5' - blood 7174 2 74.26 CTATTATCTTTTTTTTTACAGCCATTAGCCCTACGCAAATGCCACTAGCGATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr2R 18432054 5' + 412 24 2 55.45 TCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 - chr2L 18655195 5' + Doc 51 1 67.33 GGAAACTGCATTCTAGATGNGTCTATGCTTACTGGTGAAAGTGTGCCAGTGACCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAA:1 + chr4 137972 5' + Porto1 4239 1 58.42 GTGCAAACAACTAAAAAGGTACTGAACTTAGACGAGGTTTTACGACTCGCATTGCCAACATGCATCGGCATCTAGGGGTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr2R 19840166 5' + roo 8666 2 76.24 GCACATTTTTTGTATATTGTAACTATTTAAGTAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAA:1 + chr2R 18005989 5' + Doc 4516 1 68.32 ATGTACAGACATAGAGTACTAAAGTTCTAGGACACTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:1 - chr2L 8176463 5' + 1360 41 1 66.34 TGGAGGAAGTCGACGCCCACAAGCCCATCAACATAAGCATCAATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGC:1 + chr3R 10245699 5' + opus 490 2 58.42 GTGCCTCATTCTTCTTCTGGCTTCTTTTCATTTTATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 + chr3L 13374699 5' - Transpac 272 2 72.28 TTTCCGTTCTTATTTTTATNTTTATATATGTACCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACA:1 + chrX 13462762 5' - G6 1847 1 72.28 TAAAACACAGTGCGGTTTTNTTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGC:1 - chr2R 16185101 5' + 17.6 6960 2 69.31 GTGGTTACCATTATCATTTGTTGCCTGGCTTCACTTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAACAAAAATAGTAACAGATCTAATGGATATTTTGAA:1 + chr2L 18351411 5' - Tc1 1502 1 65.35 GGGCACACTAAGAACTCACTCTGCCTGATTGGCGCTTGTCATGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTATCCTTTGT:1 + chr2L 15581421 5' + accord2 7252 1 60.40 CGGAGATAAGGCTACGGGGAGTCGCATTTCATTTGGCCCACAGTCGTACTAAGTTGCGACGTGTCCGCCGCTGTTACATATATGTATGTATATATTTTAAT:1 + chr2L 11329522 5' + Dm88 20 3 77.23 AAAAGAGATCTATACACCCATGTGATGCGCATATTTCCGGATTTACATTGAACTTTTCTTGTAAATATTACACATTTGAAACCTTAAAATTATAATAAATA:1 + chr3R 13135814 5' - INE-1 427 1 64.36 TTGAACTTGGCTCGCTTTCCGGATTTTGGCGGCAGACTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTT:1 - chr3R 24608395 5' - mdg3 128 2 64.36 GATCACGCATAAACGGAGATATAGTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 19334603 5' + roo 8714 2 76.24 TTAATGTTTAATGAAAGAAGAGCTTAGCTTCTGCTTTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGATGTAGTGTATCTACCCTTAATATGCA:2 - chr3R 210309 5' + Stalker3T 5 1 72.28 ATCGAGTGCCAAGTAGTACGGGGGCGTATCGAAAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr2L 10625646 5' - roo 403 1 74.26 ATTGGCTGTTGGAGGCTTATAAAAAATATGTGTATGATAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATT:1 + chr4 74267 5' + 3S18 39 2 65.35 AAAAAAACGCGCGCTTGTCAACCAAAATCATTGCGGACGACACATTATCCTCACGGCAAATCATCGGAGACTGCAGCGAGGGACCCCCTGCAGCACCCCC:1 + chr3R 13941316 5' + gypsy3 364 2 60.00 CGTGAAAGCCGTCGGTCCCCAAAGGATAAGAATCCACTCCACTGGGCCGCAAAACCATTCGACAGCCACGAAAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTG:1 - chr2R 19560257 5' - Tirant 8504 2 77.23 AAATTAGAGATGTTGATATACTCATATCTATTAGGTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 4063666 5' - roo 400 1 67.33 AATGAACAGGAAGAAAAGGAGGCCCCCAAATGTATGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 + chr3L 13895342 5' - hobo 2926 1 64.36 TTAGTAATCAGCGACAGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATATTACAAGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:2 - chr2L 9045479 5' + jockey 34 1 51.49 CCTTCAGCCATTGCCCTGCCATCAAATTGTTTAAGCAAATATAAAACTTTAGAAATGCGAGGAAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTA:1 + chr2L 19642280 5' - Quasimodo 7360 2 73.27 CCTCCGGATAGTGTTTGCTTAGCATGACGCCGCGCCTAGACAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTGCAGCT:1 - chr2L 22162703 5' - 17.6 7284 2 58.42 TGTTAATTAAAATTAAAGTAAGCCATTTGCTCGCAACCGAATTATTTAGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 + chrX 20419116 5' - flea 231 2 53.47 TAAAGCCATTGGCGACCGACTGCATTTCAGCGATATAAATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr3R 5135527 5' + 297 6613 2 64.36 CCATCTGCTCCCTCGTAGGCGCTGGTGTAGCCATCCTCTGTCTTGATGATCTCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr2R 11259558 5' - hobo 2914 1 50.50 CTTGGCCGCATAGAATATTNACTATACATATATATGTATGTATGTATGTATGTATGTTCCGCTGCGAAGAGAGTCGGCGCTCGTCTTGGTCTTTTTGCCGC:1 + chr2R 13802822 5' - Doc3-element 247 1 60.40 ATATACGAAATTTGTATCAAAATATAGAAGGCAACAAAAATCAAGTAGCGAGTGGAAATTGCATAAGGACAGGGGAATCAAATAAAAATTATTTAATTTTC:1 - chrX 3592682 5' + McClintock 6370 2 88.12 CCTGTTGTTGTACTTGTGTNGTTGTTGGTGGTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCA:1 + chrX 2138666 5' + R1A1-element 5116 1 71.72 GTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCT:1 - chr2R 12185415 5' + accord 19 2 56.44 GCTAACAGCCGGAGTAGCAACAGCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCT:1 + chr2R 14315468 5' - F-element 4236 1 76.24 AAAATGGTTCTTTTCTAAGGATTTCTGTTCTGTAAACTACACTTCATGTTATTAAGGATTTATCGAAGATATATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTATGAA:2 - chrX 13798931 5' + 412 7130 2 67.33 AAACTCCGGTCTACTTGATTTCTTAAAATTATAGTTTCAGCCATAGCTCACAATCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTGCTCAAA:1 + chr3L 13365861 5' + R1A1-element 5154 1 45.45 TGATGTGGAAAACCGAAAGAGGGTAAACAACAAATTGCATACTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:1 + chrX 15546122 5' - blood 371 2 73.27 CTGAACGCGAAAATTCCATTAAGTTTCCTCCAGTGGCATACTCATATACTTTATCGACGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACA:1 - chr2L 14036184 5' + flea 42 2 72.94 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTT:1 + chr2L 19479165 5' + micropia 4998 4 57.00 GTTGAATGCATATGTCTTTATATGGGTGTTTTGCGAGTCTGTGGGTTTCCTTAGTGGGGCGCCAATTAATCTAATGATTGATCGCACCGTCTTGCGATACT:1 - chr2R 5953690 5' - Gypsy6A_LTR 384 1 61.39 AACCATCCCAGAAGGGTCTGTCCTTAAAGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr3L 20411853 5' - roo 9034 1 63.37 AGTGTACCGCATATCAAACGATGATAGATGTGTGAGCGGAGACGGAAGAGAAGTACGCG:1 - chr3L 13403120 5' - Doc2-element 356 1 66.10 ATAATTTTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTTTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAA:1 - chr2R 16523686 5' - 1360 147 1 65.35 TATAATCAGCATCAAGTATACAGTCTTCATATCTCATTCTCAGTTTTTAGTTTCAATATTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTA:1 - chr2R 14824493 5' - invader2 254 1 63.37 CCGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chr2L 15898813 5' + F-element 49 1 63.37 CTCTGCGCTTCGTTGGCCCGTTATAATTGCGACCAGAGTTGTTGCTTGTTTTCGGTTTATATTAACAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCTCTCAAC:1 - chrX 12621822 5' - I-element 349 1 53.47 GTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 + chr3L 5710249 5' - Transpac 5191 2 67.00 TCCTCGGTTAATGCAATCAGAGTTTTTTTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1 - chr2R 15652311 5' - jockey 4948 1 77.23 AAAAAAGTGAGAAAAGATANAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2L 13093757 5' - roo 395 1 63.27 AAATACCTTACCAATTAAACGCTGGAAATGTTTGAGGTGAATTAAATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 + chrX 12389058 5' + I-element 32 1 56.44 AGTAATCAGCGACAGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATATTACAAGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2L 9045477 5' + jockey 36 1 53.47 TTGGCCAGTGTGGGTGGCGCAAAAATACGTCACTAAATACCTGTTACATACTTGGCAACGAATATACCTTTTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATACA:1 + chr2L 21715738 5' - 1360 3371 1 70.30 CTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTA:1 - chr3L 19339423 5' + Tc1 32 1 51.49 CTTCCCACCCAATTTTCCACCCTGCAACTTACCTCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCT:1 + chr2R 9920487 5' - F-element 404 1 66.34 ATATATGGCTATTTAAATATGTCTTTTTTCTAATATTAAAGATATAAATACATATTACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTA:1 - chr2L 14010884 5' - flea 234 2 59.41 GAATTGAGGCATGCTAACGAGTCTGCCCGTGAATCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTC:1 - chrX 4947151 5' + Doc 4255 1 67.33 TATATTTACGATTAAGTTTAAATACCTCTGAGCTTTATATGTTCTATATTAGATATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCA:1 - chr2L 11478761 5' + opus 18 2 57.43 TAGGATATACATACAGCGCAGATAGATACATGTAACATGGAGTAAGGCTAAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGT:1 + chr2R 10014807 5' + flea 4806 2 76.24 GCAGATTAAGCGCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chr2L 12808238 5' + Tirant 8133 2 55.45 ATAGGTTTAAGAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 8577261 5' - roo 388 2 58.42 GTTCCTGTGGCTTCTCCTCCTCTTTCTTGGCCTCTGTGGTTTATCGGGGTAAAGGTGTTAGTTTTGAACTAGCTTGAACGCAATACCAAAGACACTAGAAT:1 + chr2R 22856488 5' - Tc3 317 1 68.32 AGATGAAGAAGTTGAGAGCTCGACTTATTGTGCCCTAATCTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:2 + chr3R 27495651 5' - 412 7510 2 57.43 TTATCGAGCTATAATTCCTAACGGTTAAGGTCTATTGGGGTCTCGAGGTTAATACGAACGGATAGACGGACATAACTATATCGACTCGGCTATTGATCCTG:1 + chr2L 21795607 5' - INE-1 95 1 64.36 AGAGATGAGGGACAACGAANAAAGTGAGAAAAGATAAAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr2L 13093740 5' - roo 409 1 78.22 AAATAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3R 19987405 5' + Doc 36 1 57.58 CTCATTCTTCTTCTGGCTTCTTTTCATTTTATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:1 + chr3L 13374703 5' - Transpac 268 2 76.24 CAAGTGAAATCAAAAAAAAAATAAAAAAAAA:1 + chr2L 12874363 5' + R2-element 3584 1 90.32 AGATATTGCTTAGCAATATTTGATTCAAGTTGAGCCCCATTTAAACGAGCAAAGTGAGAATAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr2L 22241816 5' + pogo 12 1 67.33 AATGAATAAAAAGGTTCCTTATTACGTAATTAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3L 6033538 5' + 412 42 2 68.69 AAATATGTTGCATACACGANGGAGCCCATCAACGCACTATGGGAAATTTTGTTGGCTCTTTTTTGGCCAAAAACCATTTTATGAAAG:1 + chrX 22937376 5' - Transib-N1_DM 464 1 91.95 TAAACAATAAATATCCTACATTTGGGGGCTCAACCGATAAAACAATAAAAAGATTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGCGTGTTGAATATAGGCCATTT:1 - chrX 22426246 5' + 1731 26 2 51.49 AGGTTTTGTGCGGTTTTTGGAAACGAGAACGCACTGCAATCCACCTTTAGAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTAT:1 + chr2R 13309891 5' - Quasimodo 33 2 78.75 TTATTCGGTTCAGTCGTTACATGCTTTGTCTTCTTTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTC:1 - chr2L 15026919 5' - Doc 4369 1 66.34 CCCTTTTTTTTTTTATTATTTGACTTAAGGTAGGAAAATTAAAATTTTCTAAAGATACCACCTACCGT:1 - chr3L 12682800 5' - Rt1b 5101 1 92.65 CGTTACTAATACTTTTTGGTCAATTTCCTTCGAATTTGCTTGGCCAGTCGATCTGGCTGGACAAAAAGCGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATT:1 + chr3L 17134486 5' + hopper 323 1 74.26 GGTTCAGGAAACATTCAGCTGACATCAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGAAGGTAACTTA:1 - chr3R 14193955 5' - pogo 2062 1 70.65 AATTTGGTGGGGCATCATTAGGGGCACTACTAAAAATTTGATCGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGAACTTAGT:1 + chr2R 21737689 5' - mdg1 306 2 59.41 GTGCTGCAAATGGGGGTGGCAGGTGGAGAACACCTCTTGGGGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr3R 23338333 5' - roo 9036 1 58.42 ATTTGCTGGGAATTCTTACCGCCGGATTTGTTTTATTTTTTTATTTTTGCGCAAGTGCAAAAGTCGCTGCAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGC:1 - chr2R 8641135 5' - roo 8743 2 71.29 TCTAAGCACACTTGCCGAACAGGAAGTAAATCGGCAGAAATCAAGCCCAGCGTCTGCATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGC:1 + chr2R 4500848 5' + springer 11 4 66.67 CCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:2 + chr2R 9871006 5' - roo 354 2 79.21 AAACGATAAAACCCATTTTTTAAGTGTGGGCAAACTTTTTTAATGGAAAATATTTATTTTTAAAAGATGGCCTAAAAACTGGACGTGGGCAAAAGAAACTA:1 - chr2R 5180266 5' - FB 93 1 65.35 TACTAAAATCGATTCCAGGATAAAATTTAGAATTATATTAAATATATTTTAGATCATCATCATATCCCGGCTCTCGTCAAGGGGGACCTTATGATAAGGTC:1 + chr2R 5616618 5' - BS3 1580 1 55.45 TATCGATGGCAGCCGCAGTAGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAA:1 - chr2L 9287190 5' + X-element 4602 1 80.20 TGTGAAAACAACTATTTTTGATTGTGCGATTTAGGGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 - chr3L 5710306 5' + Transpac 38 2 62.38 CGTATGTCGCAAGTCCATTAGCCGCCTTTCTTTCGTGATCGAGGGAGAAGGAGCAGCTAGATGATTTCGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTT:1 - chrX 21203758 5' + hopper 142 9 70.79 AAAAAAATGAAACCTTCAANTGAATTTCAGCTACGGGTACAAATTGGCTTAGAGATTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGC:1 - chr3L 9949973 5' - Quasimodo 320 2 57.00 TAAATACAAAATAAATATTTTTTTAAAAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 26317936 5' + roo 49 2 77.23 GCTATTCGCCCCGAAAAGTACGTGTGAAATTATCATTATTCAATTGTGTTTTTGGGTAAAGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2L 7666087 5' + roo 14 2 65.00 GCTGCACGAGAACCTGGAGCCGGGTCTCAGGCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGA:1 + chr3L 19069047 5' - HMS-Beagle 6857 2 71.00 ACCATCTGCTCCCTCGTAGGCGCTGGTGTAGCCATCCTCTGTCTTGATGATCTCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr2R 11259557 5' - hobo 2920 1 54.17 CGACGGCTTTCAAGCTCAAGAACACACCTTAAACTGTTTTTCAGAACGCTTAGCTCACTGCGAAAAATCAGCGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGG:1 + chr3L 735988 5' + springer 7135 3 71.29 TTATAAAACCGTTTTTGCCACAATGTCTTAAGGCTTGCAATTAGAAAGTTGTATCTATAATATCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1 - chr3R 27131989 5' + copia 14 2 63.37 ACACAAATATTGCATGAGCCTATTGTCCTAAAAGTATGCAACACAAGGACCATCACTTTCGCCAGCGCGCTGGCAGGACATCATTCGCGTGGGAGATGAGC:1 - chr2L 10166089 5' + jockey 5 1 80.20 TATCAGATTTTCTGACATTGGCCCGTTATCATGGCATTTATGTGTGTGTGTGTACTTCACACAATCATTACTAAGTGTTTTGACTAATTTTCTGAATTCTT:1 - chr3R 25659092 5' - G4 300 1 54.46 AACTATGTTGAAATCTTTTTAACATGCATCACCATCTGATTAAAAATATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATAT:1 + chr3L 20454532 5' + invader4 2789 2 51.49 ATTTCCGTATTTTATACGGAACTGTACACTTCAGGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr3R 5506861 5' + pogo 19 1 60.40 ATTAAAGACAATAGCTTCTTATTAGAATTATCAACTATTGAATTCAATGGTAATTTGTTGGCAGTTTGGAATTATTACTTGCAACTTTGTATCGCAGAGTT:1 + chr3L 6435207 5' - ZAM 8044 2 86.14 TATATATTTTAGCTTTCTCTTTTTGATATACAAAAAATCAACAATTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAA:1 - chr3R 26317991 5' - roo 9044 1 56.00 CTTACCCTATTTTTTTCAAAATAATATACACCTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGT:1 + chr3R 30553532 5' - 412 7532 2 64.36 CCCAAAAAAAATACAGGTATGCGTCTCTGTCAAATGAGTGTTTTGCAGCAGCAGCTGCTGTGGGAGGGTTCGAAATGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAA:1 + chr3R 6979807 5' + hobo 2866 1 75.25 TTCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chr2L 20560346 5' + F-element 54 1 67.00 CACACTTAAGGCCCTAGAAACTGTTGAACATACTAATATTATATGGGTTTTATGAAAGACACTAGAACAACGAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGC:1 + chr3R 19650516 5' - 1360 3362 1 66.34 TTTAAAGGCAAGTCCCATTTTGATGGATAGCGCGTAGACGTCAAGAAATCAATTTATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAA:1 + chr3R 15924580 5' - Quasimodo 7352 2 63.37 ATTGAAAATAACATTTGATTTGCACTTAAATCAGATATATTTTTCCTTTATTTTATCGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGGATGTAAAGCAGTGGTTGTATTA:1 + chr2R 7540438 5' + Circe 7152 1 61.39 AAATTAAATTAAATTAAATTGCCGTAGCAATATAAGGCGCCTTGTGGCAACTTGTGCTGCGTCTGTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCT:2 + chr3R 7739990 5' - INE-1 172 1 52.48 TTAGAGATGTTGATATACTCATATCTATTAGGTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2L 4063669 5' - roo 398 1 65.00 TAAACAATTTTGCAGCATTTAAATACAATCAGAATACACAGAAGATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:2 + chr2L 11478676 5' - opus 7470 2 60.40 TGTCACCGTCGTACTGCCTTGTTTGTCTTTTAAAGGTTTGTCGTCCGCGCATTTCTTAGACCGTCACGACCGCCACCCATACAAATTTTATGAGTACAAAA:1 + chr3R 29612068 5' + hobo 2684 1 51.49 ATTGTTCGGGCTTAAATCTCACTCGCTCTTTGGGTCTAAAGAAATTCTGGCTAAAAAAGCAAAATAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 2176402 5' - roo 400 1 70.30 GATGCACCTCCAATTATTCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACACGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTT:1 - chr3R 24395375 5' + mdg3 5117 1 81.19 GATCTGCGACATCAATGTCCTCGCCAGACTAGCGTCCATCAAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAAT:1 - chr2L 4971135 5' + pogo 194 1 59.41 AGTTCTGTCTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 6266284 5' - roo 9051 2 58.42 TAAAGATACAGCAAAAATGNTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTAT:1 - chr3L 19350014 5' + 1360 3211 1 46.53 TAATAATGAAGTTGCCAGTTTTCCAGTTGCCGCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 - chr3L 8252243 5' - copia 244 1 67.33 TTGAACTTAATATAAAGGGTTTTCGCATTAATGTTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 - chr3R 11052165 5' - blood 7357 2 61.86 CAAAGCAAAGCTATTGAAAATCTTATATTGGTAGAAGTTGTTGAACTTTGCTGTGCTTGTTTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:1 + chr2R 17459132 5' - Transpac 5219 2 69.31 GAAAAACATAAGAAGTGCTATAAGAAATAGAAATAGGCTACCCAGGAAATCTTTACATAAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCG:1 - chr3L 4893951 5' + McClintock 6083 2 64.36 TATCCATACTTATATATGTATGTAGAAATTCTGCAAGTGCAGTTAGACTCCAGACTCAGGTGATATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACC:1 + chr3L 13238966 5' - G2 2810 1 71.29 ACCAACGCATAAACACACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr2L 7666173 5' - roo 9041 1 57.00 CAAAGTCTTTTAGCGACCTTAAGAAAGGACCCTCCTTGCAATCTCTGTCGGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGA:1 - chr3R 10010274 5' - R1A1-element 5028 1 59.41 ATGCCGCTCGCGGCGTGAGCGAAAACATCTGCCCCGGTTTTTCCTTCTGTTTCTGTTTCGCTTTTGGTCACGCACTCATCGCTCAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 - chrX 7115637 5' + G-element 4324 2 66.34 TAAGGAACACACACTTTAAGAAGGATATGGAGAAAAAGTGTCAGAAAATAAAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTAC:1 - chr3R 7039357 5' + Tc1 1635 1 67.33 TTGAAGGGGCGGACACGATGCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAA:1 + chrX 15255372 5' + Tabor 57 2 79.21 TTTTGGAACAAATTAAAAAAAACCTTTAATGAAACTAATTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAAACCAAAGCAATCACCCCTATTAATTTTATTCAACAAA:1 + chr2R 4608375 5' - Tc1 235 1 82.18 GTTTTTCTCCTGCCTTAAANCTTTTCCATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 8765593 5' + roo 48 2 77.23 TTAAGTTAAATGCTATGACGGATATTGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2L 13093824 5' + roo 8713 2 76.24 GATTATGCGCTGGTGATGCGTGTACCCGAGGGCAATGAAATGCAGATCTTCCGAACCAAGTTCGCTGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAG:1 + chrX 21342472 5' - 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roo 397 1 67.33 ATTTCAGGCGCACACGCACACACACACGCACGCACAGCGGAGAAAGCTTTCTCCCATGTTAACATGACAGCCTACAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr3L 14594083 5' - hobo 2937 1 75.25 CGGTGGGCGGGGCGTGCCACAAATGGCAGCGTCCGAGGCGTTAGTGAGCTTATTGTTGTTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCAT:1 - chr3L 17141818 5' + F-element 4332 1 60.40 TACAACACCCTTTTTGTGGCCCGCATAAAGCATTTCGCTCGTAAGTAATTTAAGTAATTTGTCAAAAATATTCACCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 - chr2R 11030606 5' + F-element 25 1 67.33 GGTCGCGATCGGTGCTCTCCTTGCCGCGCTGCCAACTGGTTGTGGAAGCGGACAGCTTTGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTGGTTG:1 + chrX 10469892 5' - G4 3376 1 64.84 GTGCGCAAAAAAAACAAAAAAAAAAGNAAAATAAAAC:1 + chrX 11172179 5' + Doc2-element 252 1 91.89 TTATTTAAATATTGCCTATTTATTGCGGCATTGCGCGTTTAAAGTAGTGACGAAGCGCACGCTGACATAGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr3R 5506748 5' + pogo 4 1 73.27 GAATTAGAATTGTACTCTCTGTGCTCTGCACTATGCGCTCTTCTCGATTCGACCATTCGGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATAC:1 - chr2L 13041837 5' + X-element 4397 1 66.34 GTTTGCCCTTGGGGCGAATTTCGCTGTGCAAGAACAAGATGGAAAATCTATGCACAAAAAGGGGTAATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCC:1 - 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hobo 2911 1 52.48 TCTTCTTTTGTTTGTTGTTNATGATTTTCCACTTTTTTGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr3R 14193881 5' + pogo 14 1 66.34 TTTGTGTTTGGTAGTTCAGTTCTGTCTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAACATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 6266267 5' - roo 405 1 75.25 AAACTGGCAAACCACGAAACCAAAAAACGGAAGGGGATATGCTACATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:2 + chr2R 19102148 5' + opus 7025 2 59.41 AATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 - chr2L 18655204 5' + Doc 42 1 58.42 ATTGCTGAATGCTTTAATGATTTTGTATTTATTCAACGCGTCACTGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 + chr3L 1586717 5' + Tirant 8136 2 55.45 GTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAA:1 - chr3R 2416146 5' + TART-B 10507 2 51.55 TAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr3R 19987426 5' + Doc 59 1 79.21 TAATGTTTCTAATAAGACTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCTGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3L 3757368 5' + roo 8722 2 83.17 AATAGAAGACAAGCATACTTGGACATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTT:1 + chr2R 4161562 5' + 1360 3234 1 78.22 AAACAAAGGTCTCTTCTCTTCAAATCGTATGTCATTCTATATATGCAATTCTAGGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 - chr2L 14341912 5' - copia 232 1 56.44 TGGCAACAAGGGGTTAATATTTGTGCCGCACCCTCACCGTAGCGCATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr2L 16358236 5' - hobo 2907 1 56.44 CAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAA:1 - chr2R 22051509 5' - Tabor 430 2 77.23 TGGGATGTTTTCAGTTACTNGATGGTGTAAAAATGGGTCAGATTGTGCTTGAAAAATCTTTATTTATAAATAAAAAACATATTGTTCACACATGAACACGA:1 + chrX 7797619 5' + roo 8662 1 67.33 CTGCTGCTGCGGCCGCCGCTGCCTGCTGGTGGTGCAGGACATGTCCGTGATGCGAGTGGTGTCCTCCGTGTGCGTGGCTGCTGACGGCCACTGCTTCGCTG:1 + chr3L 21005162 5' + HMS-Beagle2 7040 2 75.25 TAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTGGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAG:1 - chrX 23108306 5' + BS3 1441 1 60.00 TTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAGTCTTAGGAATAAAAAATATATAGACAGACTAAGAACACATGAAAATAACTTAGCCTTAAGTTTGGTAAAT:1 - chr3L 20095766 5' + G4 3644 1 62.38 AACATTTAACATCAAGTAATGTGATATCACTACTACTACTACTTTCGAAAATATATATTAAAACAACATAACAGGCAGAAATTCTGGTGTTCACTAAAATA:1 - chr3L 23123148 5' - HB 1433 1 58.42 TTGGACCCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGT:1 + chr2L 12808162 5' - Tirant 8472 2 61.39 GCAACGGCGACAAAGCAGCAACCAATATGCAGTTGCCATGTGAGGGTGTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 + chr3L 10363812 5' - P-element 2860 1 52.48 AATGTTGTGTGTAATTTGTTGTTGGTTGCGGCATTGGGGAAGCGCACTCTTCGCTCTAAGATTTTGGAGCTTGTCAACGACGAAGAGCAAGAGTGAGCTCT:1 - chr2R 18885050 5' - Doc4-element 121 1 81.19 CTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 + chrX 15546163 5' - blood 330 2 71.29 TGACTTCATTTTCTAATTTCCAATTGAGAAATTGCATCAACTTAAATGGGAAACGTGTCTACCCCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr3L 18418819 5' - hobo 2927 1 68.32 TATTAAGGAAATCCCTATATACATAAATCTATCGCTCCATCAAAATGTTTTATTGTAGTTAATTAGCATTCCTATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chr3R 13912999 5' - mdg1 7433 2 51.49 GAACCTTTGCACCTCAACCGAACCAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCC:1 + chr2L 13240452 5' - BS 4821 1 76.24 CTAAAGAAATTCTGGCTAAAAAAGCAAAATAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr3L 2176367 5' - roo 9031 1 70.41 CGCTGCTAAAATATACTTTAGTTTGCGATAGGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:2 - chr2L 16680081 5' - P-element 2846 1 40.59 ATGCCGAGCGATAAACGGGTTTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr3L 13895405 5' + hobo 54 1 76.24 ATGAATAGTTATTGTCGCTTACGACTCAAAAAAAAAAAGGTTGTTGAATATGTTCTAAATTGATATACGTTATAACCATTATGTATATATGTATGTATATG:1 - chrX 2581794 5' - ZAM 196 3 70.30 TGGCAGCCACGCACTCGGTGAAACAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCTGTTTAAAACTTCAACTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAG:1 + chr3R 8124456 5' - transib2 138 1 80.20 ACATGGCGGCATTATGGATTAGATGTGTAAAACGGGTTTCGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTT:1 + chr2L 2322946 5' - Doc 4475 1 64.36 TATGGGGTTTGGTTTTTTAGATATGGTTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr3R 24174524 5' + 412 7101 2 74.26 CAGTGACATACATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATAC:1 - chrX 18326246 5' + Doc 210 1 50.50 CCAAAAAACCAAGCTCAACCGAAGGCCATGATTCACGAAAAACATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 4063759 5' + roo 31 2 61.39 CGAAGGAAAATGAGGAGTAGGAATATCTCACAGTTCCCATCCTTTCGGCCAACAATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCG:1 - chr2R 22286853 5' - invader2 282 1 58.00 TTAAATGAATTGCCATTTATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr2R 11941080 5' + 297 6600 2 63.37 CACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:2 + chr3R 7869137 5' + 297 51 2 76.24 AATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3R 9278393 5' - roo 9037 1 61.39 TTCCTTTTTGAGGGGAAGCCGGCCAAAAGGACATTAAGGAAATTACTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATC:1 - chr3L 13569804 5' - invader3 244 2 55.45 AATAACAATGTTGGAAGTAAAAATAATGCCTTGAAAGGAATTCAAATTGAATATAAATATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAA:1 + chrX 7036641 5' - Quasimodo 7357 2 73.27 TCTCACCAACACACAGACAAATATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGG:1 + chr3L 5241139 5' - Ivk 5324 1 81.19 CCATCCATATATCCTTTTTTTCGGTCCGTTTTCCCCACACACACACACACACACAATCGCATGCCACAGAGTTGCATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chrX 12231558 5' - hobo 2938 1 73.27 ATTTAACATTAGCATTTAAAAATGGAATAAATACTTACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAA:1 + chrX 3370110 5' + S-element 36 2 64.00 TAGTCTTTCACTACCTTATGGTGTGATTGTTTCGGCACTATTTAAACCTACATATATATTCATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chr3R 22494080 5' + 297 6586 2 75.25 ACATACTTGTTCTTGGGCGCGTTCTTTATGTTTTATTGATGTTCTCGGAATGGTTTAATATGCTGTAAAATCAGAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGA:1 + chr2L 19846560 5' + 412 375 2 67.33 TTCTTCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCCTGGGATTTCGGATCCTAATGGATCTGTTCCTTAATTATAATGTGTAC:1 + chr3L 11837724 5' - G5A 2742 1 58.42 AAAAATTTACAACAATGCGGAATTTAAGCAAATATTATAAAAAAACCAGGCCATTTGAAACAAGAAAAGGTTTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 + chr3R 7513887 5' + diver 5894 2 69.31 GGACAACCACATGCACACTATGCGCGCACACAAATCAAACAATTATAAACTCGTTGTTGGTAAAGTGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 + chr3L 12468188 5' + jockey 4683 1 68.32 ACTCAACTCACATTGCTGCCAATGGCTAAGCCAATATCCTTGGTCCTCCTACGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCT:1 - chr3R 25362285 5' - gtwin 427 2 55.45 TGCCACATTTTAATTTCTCTGCATTTCTCTACTTGGAGCTGGGCGGTTTCGATGGTTGAAGTGGTACTGATGTAAATGTTTTTAAATATCGTTTTGGTGCC:1 + chr2L 8563063 5' - transib3 100 1 57.43 TCTGAAAACTCACACACCACAACCTAAATCTGGCAGAATCTCAACTTTTTGCTTTTATAGTTCCTATGATCTATCTAGACGTTCATACGGATAGACGGACA:1 + chr2L 2585787 5' - INE-1 124 1 72.28 ATACATACTACGAATATGCGTAGGCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACA:1 + chr2L 4134823 5' + Quasimodo 26 2 53.61 CGAAAAGCAAATCGGTGACCAAAAGACAAGAAACAAACTGTACGTACTATGTACAACAAAAGTAGTTTGAGGTGTGAAATGAGAATAATAATGAATTCTTT:1 - chr2R 14975844 5' + accord2 73 2 71.29 AGTCGTCGAGTGCCTCCACTATCCCGATACCAACAGGGGGAATCCGAGATTCAGATCCAGACGAGTTCCCCGATTGTCAGATAAGCGTTACTCAGCTAGTG:1 + chrX 21131467 5' - INE-1 541 1 56.44 AGTCCCATTTTCGTGGCACTGATGATTTATTCATCACGAATCTCTAACCCACTGGCTTCCATAGAGCTTTAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGT:1 - chrX 15546245 5' + blood 7015 2 75.25 GGATGTGCGCATCCTCTACCAAGTGGGGGTGAGTAGCTAGCAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAAT:1 - chr3L 16482687 5' + I-element 102 1 59.41 ATATGGGATGAATCTTGGATTTCTTGTCAATCTATGCATGCTATTTGATATATAATTAATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCT:1 - chr3L 19089680 5' - invader1 3999 2 57.43 TATCCATTAAATGTGCCAGTAGCAGACTTGCCTGCTAAAGCTGCAGTTCATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCG:1 + chr2R 21962618 5' - 297 373 2 54.46 CAATGAATGTGAATGAATTATTAATGTTTCTAATAAGACTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3L 3757347 5' + roo 27 2 64.84 ACCTAATCTCATACCCTAATTTTCTGGGTAAAAACCTTTGTTGACTGCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 - chrX 10451535 5' - hobo 2929 1 62.20 TGCAAAAATATATGTACACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3R 30553615 5' + 412 7089 2 59.41 TAATTTATATGCTATTACTAATTTTGGTAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATAT:1 + chr3L 13569754 5' + invader3 50 2 71.29 GCGTCGTATGCGCAATTGTTTTAAGCAATTCTGCAGATAGATCGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAA:1 - chr2L 1677319 5' + flea 462 1 75.36 TTAGTTGTCACCTTAGGTGCACTGCACGAAAATTTGTCACTTAATTCCCTGGAGTTAACCAGCAGGAGAAGGTTACCATCGCTAAGATTAGAGATGGATAT:1 - chrX 17034284 5' - Ivk 429 1 71.29 CAACTTAAATGGGAAACGTNTCTACCCCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 + chr3L 18418856 5' - hobo 2890 1 71.29 GATTAGTCAAAGCATTTGCTAAGGAAAATTCCCAATTAAGCGTCTGCCGAGCCAAACAATGTGAAACGGGCTGTAGATTGTGGACGCCGAAAAATGAATAC:1 + chrX 11032154 5' - invader3 276 2 68.32 TGGCCGCATAATGTAGTTCCCTTAATAGAGATTGCGACACATGAAAAGCGACCACAATGAACGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCT:1 + chr2R 14576487 5' + gypsy5 13 2 70.30 TCTGCGCCTGCTTTTTTTTTCTGGACTCGAATTGTTTGCACAATTTTCATTGCAATGTCTTTTTTATGCGTTATACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAA:1 + chr3L 13288001 5' + hopper 97 1 67.33 AATACAAAAGGTATTATCTCAACTTTATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACT:2 - chr3L 15452944 5' - accord 7360 2 55.45 GAGATGCCCACGAAAATTATGTTAACCAGCCAGTTGTGTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTT:1 + chr3L 16212372 5' + F-element 4441 1 62.38 AAGTAATCGATTTAAGTGAGCGCGTCTAAATTAATTGCACCTATACTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 25021748 5' + roo 8694 2 59.41 CCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - chr2L 15898808 5' + F-element 54 1 68.32 TGCCTCATTCTTCTTCTGGCTTCTTTTCATTTTATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTT:1 + chr3L 13374700 5' - Transpac 5190 2 73.27 CAAACATGTTACGACATGTTTAATTTAGTTGACAATGACTATTAACCTTTTAGGGATATACCATTTCTATATAATCTAGATTATCTCAATAATTAAATAAC:1 - chr2R 21379843 5' + HeT-A 25 1 76.24 CAAAACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATT:1 - chr2R 22051528 5' - Tabor 7288 2 58.42 CCACAAGACATAATAAAAATCTCTTCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATACGTAGGCGGATGAAGGTCGCGCACTTCCGTTTATGTACG:1 - chr3L 10929743 5' - Ivk 5014 1 81.19 CATTGTCACTTTTGTGTGCCTTCTACGTGCGGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGC:1 - chrX 20832199 5' - Ivk 62 1 69.31 ACACACACAGGCACATTACTACATGTGCACCTAACCACATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 + chrX 17030002 5' - flea 4979 2 62.38 TAACAGCAACTGATTTTCACAAGCGTCCTTTTCCTTTCGAATATGTTACTTAGTGCTAGGACATTATCATGGTTGTGTAGTTTACTTATGTATCGCTCAGC:1 + chrX 14984908 5' - G3 4370 1 57.43 GGCAATGGGCGCTGGCAACTTGGGAATGGGCACGAATGGGAGCGGGTGGTCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 - chr3R 6961140 5' - 412 468 2 51.49 CTTTGACAAGGGCACCTTAACTATACACGTCGCCGAACGATTTGATAAGACTAAGAATGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 14222444 5' - roo 9055 2 61.39 AATCGACACCCGATCCCCTNGGTGGCCTTCTCCTTGAAGTTCTCCTTCGTTTTCATTAACAAAATCGATTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 19061193 5' - roo 405 1 74.26 TATAGAGTGACGATGACATTCCCGTTTCTTAATACTGGAATAGATTACGCAGGTCCATTACCAAGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAAT:1 + chr3R 19447186 5' + R2-element 3235 1 58.42 ATAAGCATGTGCGGCAGCAAACAATGGGTGCAACAACTATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 - chr2R 13653431 5' + F-element 25 1 59.41 TAAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 - chr3L 25059140 5' - mdg1 385 2 61.39 CGAAAATTAATTTTTAATTTGTTCTGTAACTATAGAGTATTGTTCGTTCACATTTATGCGTTGCCTCCGGATTTAAATGACTAATATAATTATGATAATCG:1 - chrX 21521500 5' - rooA 7154 1 58.42 TAAAAATAATAACATATTAAGTGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATT:1 - chr3L 20522118 5' - P-element 142 1 27.72 AAGATTGGCCAAGAATGATTACCGGCTGCGAATGGTAAGTAAGAAACACAACCATGCACAAAGACCTCAAGTTAGCCACTGTCGTTGAGGCAATAAATATG:1 + chr3L 1794079 5' + BS3 1453 1 72.28 TATGGCAACAGCAGATTAAGCGCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAACCCCACGCCTCT:1 - chr2L 12808248 5' + Tirant 8123 2 64.36 ATGTATCTCCAGCCAAATGGCAAACTGAAACAAAGGAGCACTGCCCCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3R 11607949 5' + 1360 29 1 56.44 ACCCTATTACTCTACGAGTACCTGGTATAAATATAAACAATGTGAAAACAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 + chr3L 25245598 5' + copia 28 2 58.42 GCCCAACGATTGACATGTGTGTTATTGACACATCGCCATTGTAATTTTTCCATTTTCCATGTGCTGAAAAGAAACACCCGAAGAAAAGCGAACACTAGACT:1 - chrX 3264864 5' - GATE 8429 2 61.39 GGCGCCTGCTACGTGCTCCTGGTCGGGCATCGCGGCCCAAAAAACAGTTCATCTGCAAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAG:1 + chr2L 3780390 5' - R1A1-element 5041 1 58.42 TTTTGAGTGGATTAAAGCTGTCTGTTTTTTTATGGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCATCACCTTCAACTAACTCGAAAC:1 + chrX 18328758 5' + Doc 333 1 66.34 CTTAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTT:1 - chr3R 19449429 5' + roo 8624 1 61.39 GCACCATAAATTTCAAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr2L 16153363 5' + Doc 42 1 62.00 ACAAATTTTAACAAAAACTTTGCTTCTCGGACAGTGAATACTCAAAGAGTTTTCACGCCAAAAAAGAAGATTCCGTTCAGTTCAGTTTGTTATTTTTTTTT:1 - chr2L 13927823 5' - gypsy7 5019 1 60.40 GAGCATGTTCGAATTTTCAGGAGCGACGTATCTGAGAGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATT:1 + chr2L 19854079 5' - roo 369 1 62.38 ACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chr3R 7869132 5' + 297 6627 2 71.29 TGCCTGGCCAACTTCCGCCTTCTCTTTGGAGGCGGGACAACTTCAGCTTTCGTTCAGTTAGTCTATGCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:2 + chr3L 13773862 5' - roo 402 1 72.00 TGGGCAGAAGCCAAATCAATTCACCGCGCGGGTGTTTTGTGTTTTAAGTGTATAAAATGTTGAGTAAAACTAACAAAGTGGCACGTGTTTATATGGTGGGC:1 - chr2L 5099208 5' + NOF 4315 2 76.24 CTATGATAACGTTATGATTATGACTGGATGACTAAACCTTTGTAGATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 20411789 5' + roo 8695 2 56.44 AGAAACTTTGGCAGCCAACTGCTGGTCACATTCGCGACATCTGGCAACGCCTCCAGCATGTTTTGTTCAGCTCTACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 - chr3L 20520776 5' + P-element 3 2 76.24 AGTTCGCCGATGAGGACACGCACTGTTGACAAATCGTCGGCTGTTGTTGGATGAGTAACCTGAATCAGATCGATAAGCTGGAGGATGGATCCTATGAAACG:1 - chrX 11670435 5' + 1731 460 1 55.45 GGCCAAAGATGCCGTTCAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2R 13763166 5' - roo 397 1 61.39 ATTGTCGTTTCTTGGTAGGTGTTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 - chr2R 15788621 5' - Transpac 254 2 76.24 GCAGGATACTGATCACGCANCCAATTGCAGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGGAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGA:1 - chr3R 7409993 5' + invader4 237 2 71.29 CAGCGCTAATGAATTTAATGGAAAGCATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr3L 9910445 5' + 297 6593 2 66.34 GCCTTTGGCATGGGCGTGTCCTTCAGCTCAGTTGAGTTGAGTTGAGTTGAGTTGAGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGT:1 + chrX 20550253 5' - Ivk 5036 1 55.45 CCAACTGGCAAGTTTGTCTTGTGATTTCTCTTTTATTTTAGAGAATTCCTCTATTTGTTTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTGC:1 + chr3R 7660160 5' + 1360 282 1 66.34 AGGAATTTGAACGATTGAATAATGAAATTAAATTTATGAAAGAGAACCATCAAAAATTGAAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGC:1 + chr3R 19449701 5' - roo 8659 1 62.38 TTCCCACTTGGCCCCCCAAACTAAAACCTCCCAACTGGTTATAACTGAGCCGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATT:1 - chr2R 18723133 5' - HMS-Beagle 238 2 71.29 AACTCACAAGTGTCCAGTGTGCATGAGCTGAAGCCAAAGCCAAGCCCCTCAAGGCGATTGTCGTTTCTTGGTAGGTGTTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAG:1 - chr2R 15788677 5' - Transpac 310 1 79.21 TGCGAAGTGGTGGCAGGATGGCAGATCCTGACGAGAATGCGGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chr2L 13566457 5' + hobo 11 1 67.68 TCTTTCCACCTGGTCGTGTAAATATTAAATGAACAAACTTTAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1 - chr3L 7882294 5' + FB 36 1 61.39 AATTATAATAATCATTTCATAATCATATTTTATTCTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTT:1 - chrX 8727916 5' + X-element 46 1 62.38 AGAAATGTGCACAATTTTTTATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 10087805 5' - roo 9061 1 67.01 TAACTGACATCGGAATCGATGTCTACAAGCGATGTTTATCTTTGATGTCACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTG:1 - chr3R 27103437 5' + P-element 2843 1 51.49 TGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTT:1 + chr3R 10087829 5' - roo 9067 1 61.19 GACTCGCATTGCCAACATGCATCGGCATCTAGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2R 19840209 5' + roo 8709 2 69.31 ATCACATTGCTGCCAGGTGAAATTATCCGAGTAACGGATCAAACACCCAATTGAGTTCGCATTCAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAA:1 - chr4 163711 5' + INE-1 555 1 48.51 TGAAACTTTGTGGCTTTGCAAAAATTAAAAATAATTTTTAAACAATTT:1 + chrX 16992481 5' + transib4 106 1 83.33 GGAGAGTCCTTTTACGAGTTGGACTTGAAGTTGAGCGAGTACCTTTCTAAATTGGAGCCAGAGTTGCAAGATCCCACAGGCCGCGCTTCCGTGCAGCTTGA:1 - chr3R 12873925 5' + hopper 471 1 67.33 CCCCTCAGGACATTTCAAGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2R 19061266 5' + roo 8720 2 81.19 ATCATTGTTCAATACTTAAACACTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:1 + chr2R 22051486 5' + Tabor 6894 2 76.24 TTCCACTCGAGAGAATATAGTGCATAAATTGGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATT:1 + chr3R 14860118 5' - Stalker4 7042 4 77.23 GTATCTGGTATCTGCGGATCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chr2R 15788561 5' + Transpac 4937 2 62.38 ATTTCTGTTAATGTGGGGACATTAGAGGCGTGTGTTGTGGATTTAAGATCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chrX 13146987 5' + roo 8687 2 54.17 AAACTTTTGTATTGGAGTTGTATTTTACTCTTACAAGTTTTAAGCAGTTCTTTTAAATAATGATTATTAAAAACATAAATTTAAAATCACTTGGATTTTTT:1 - chr3R 19511495 5' - frogger 251 1 90.10 TGGTGGTCAGTCAATGGCCCGCAGAGAAAACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:2 - chr3R 11608036 5' - 1360 3374 1 64.36 TTAAGATTTTAAATGAATTGCCATTTATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr2R 11941088 5' + 297 11 2 71.29 AAAAACACTGGCAGAAAATAATGGTGTTCTCAAAGTTCATAAGTTTAGAAGGTATTCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 - chrX 8316391 5' + hobo 4 1 67.86 AAAAGTACCGTGAGAAGAGACTGTCAGAAGTTCAGAATCGGTACAGAAGCTCACATGCGTCTTTGTTTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTC:1 + chr2R 16443187 5' - INE-1 157 1 55.45 AATTAGTTATGTTCATTTTAATTACATTTTTCTTGTACCTCAAGGCCCCCTTCCACTGCAGCTGAACTATCGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACT:1 - chr2L 17830520 5' + Doc 327 1 37.62 CTGCACAAATATGAGCGAGCTAGCACCACATAAATACAGACAATAGTAATGCATTTGCTGAAAACAATCTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chrX 15800990 5' + roo 8669 2 75.25 ATCTTAATATATGCTCTTAAATTCCTAATGCATATATATGTATCAGCTACCAATACTTTACTAAATATTAGTTTTATTATGATTTTTAAATATTTTTTTTA:1 + chr3L 13391459 5' - gypsy10 406 1 46.53 TATTTGTGGCACTTTGGTACGAAAATTTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr2L 6362858 5' + 412 46 2 71.29 AATCCACCATCGACCACTCTGAATTTAGAAGAGTATGAACGTACAGGATCACAATCACCACCTGCCTATTTACGCTCCAGCAATACCTTCGCTATGGCCG:1 + chr4 533058 5' + Tirant 8065 1 62.00 CCCGAATCGAGGGTTTCTCTCAAAATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGC:1 - chr3R 10741150 5' + 1360 3357 1 42.57 TAAAGCCCGATCAAGTGGCTCTCATAAATTGTGAGAAACTTAAAGCTACTCGAAGTAGACTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCG:1 + chr3L 2323641 5' + F-element 295 1 61.39 ATTGCTAATAAATAACGCCGCACTTAATAACTATTCTCGCCATATTTCTTTCATAACCCAACCAACCTAGTCACAACGTTCTAGCTTTTATAGTGCCTGTG:1 + chr2L 21720246 5' - INE-1 153 1 60.40 CAAATGATCTGCTTGTAGCCCTCATTGTCGGCGGTGAAGCAAGCGTTTTGAATCTTCTCCGGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAA:1 - chr2L 8332554 5' - Doc 12 1 63.16 GCGCAGTTTTCCTTTTTATTCCCACCTCTTGTTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCG:1 + chr2L 7557185 5' - invader4 107 2 69.31 ATCGCCGACCCACTAAGTGGCATCTCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACC:1 - chr3R 29003092 5' + Chouto 494 1 75.25 GCCATTTGCACACGCTCAAATCTCAAATCTCTGGTCGCAATTCAACCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 + chr2L 10898392 5' + jockey 4701 1 54.46 ATCGAGTGCCAAGTAGTACGGGGGCGTATCGAAAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2L 10625646 5' - roo 404 1 75.00 TTTTTATTTCCAGAATCCCAGGCTGCTAATAGACTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTAAGCTGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGTTGCACATAG:1 - chr2L 22216560 5' + diver2 4612 2 53.00 GCAAAGAACCGAGACAAAGCAAATATATTCGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chr2R 17392623 5' - opus 457 2 77.23 CTTTAAAAGCTACGCAAATACGTGTGGAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCGAGTGTCTCGGCTGGTAATTGCGCCTTTTT:1 - chrX 8592269 5' + hobo 368 1 77.23 CTCAAAGTTCATAAGTTTAGAAGGTATTCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:2 - chrX 8316363 5' + hobo 49 1 75.25 TTAAATTTAAAAATCTAAAACTGGTAACTATCTTGGCAAACCGGATGTCGTTACGTAGCCGGGAGACACAGCATTCGTGCGTGGCCGCTACGAATATGAAA:1 + chr2R 15817792 5' + gypsy2 117 2 63.37 CGCGAGCGTTTCGCAGAAAGATTGCTGAATGCTTTAATGATTTTGTATTTATTCAACGCGTCACTGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 + chr3L 1586697 5' + Tirant 9 2 72.28 TTTTCTGTACAGAATTCTAATGTCCTTTGCTCACTGTACCTGCGTAACATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGCCTCCT:1 + chr2L 7937240 5' + jockey 4549 1 50.50 AATTGTGTCATAAAGTTAANGTAAATAGGGTTTTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 11916637 5' - roo 395 1 64.36 GAAGTGTGCACGCAACATTTGCACTGCGGCCAAAACGCAAATTTCGAAGAACAAAAATTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGA:1 + chr3R 9936006 5' - G2 2785 1 63.37 TTCACTTTCTCTTATTGATTTTGTCTGTTTGTGTTTTGCAACTGGGCAGAGTTTATAAAACACAAACAGACAAAATCAATAAGAGAAAGTGAAAGTTGCTA:1 - chr2L 17597683 5' + NOF 433 1 64.36 TTTTTCCCAACACCACAAATTGTTGTCAGAAGCATTCTGTTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chr3R 12333779 5' + P-element 34 1 43.56 TTTCTAACTATAACGAATCCAATTCCAAATTCCATAATCATCATCATCATCATCAACACAACAACAACAAAAAAATTTAAAAGTGTGGGCGTGACCGTTTT:1 + chrX 5065941 5' - INE-1 245 1 69.31 CAATCTCCACTCTCATGGCTAGCAAAATAACGAAACATCTTTCAGATGACAGTCGGGGTCACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGA:1 - chr3L 7197331 5' - diver2 350 2 54.46 AAATGCGATAGTAATTGGCTTTGGCAATTTATTAATTAACTATTAATGGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chrX 21060378 5' + 412 29 2 52.48 CAAATCTTCAGGATCTAAGNCGGCACATAGTAACCGACTAATAAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCA:1 - chr3L 21488979 5' - Cr1a 4029 1 66.34 TTGTACATCGATTTTTTCGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGTCCC:2 - chr3R 7869200 5' - 297 6955 2 59.41 TTGTTGAGTATTTTTAAAAATTCGTTTGCCAAAATATTTTTTAATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr3R 15578964 5' - pogo 2070 1 71.29 ATTCAATCACCATGTGCAGCCAGCCAGTGGAGGGACCCTCTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:2 - chr2R 24278072 5' - 412 454 2 61.39 TAAAGAAATGCTATGGTGTNGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAA:1 - chrX 983365 5' + Juan 3839 1 57.43 AAAACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr3R 11608010 5' - 1360 3348 1 68.32 CAAACAATGTGAAACGGGCTGTAGATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACT:2 + chrX 11032206 5' - invader3 5410 2 76.24 TTTGCCTACTCATGGTAGCGAGTTTTTGCCTTTTAAAACTTTAAATTTTTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:2 + chr3R 10782255 5' + Doc 34 1 56.44 AAAAATTGCATTCCCTAAAACTTGTATTAAATGTATTTTGTAACTACCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 - chr3R 25581104 5' - pogo 2074 1 52.48 GAGCCACAATACTGAATGCTGCTTATCGCCGATGCTTATCGTTATTTTCGTTATCGTCTTGGTCCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCCTCGCC:1 - chrX 17017112 5' - Bica 479 1 70.30 TTAAATGGGCAACATCATTTTGAACTATAGTGCAATTGTTTCAAACAAAACCAAGCAACAGCAACAACAAGTTAAACAAAAAAATAAAAA:1 + chr3R 22010722 5' + TAHRE 10442 2 74.44 TTGCGGCTTACTCGATAAAATTGTGGTATAAGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chrX 5475449 5' + 412 7096 2 69.31 TTGGCCAAAACATCCAAGGCAACAAACAGGCAAAAACGGCCAAAAACAGCCAGAGGAGCTTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chr3R 23542934 5' - 412 7530 2 62.38 CCTTGCAGACGGACTTTGTGCCGACGAAGTTCAAAATCAGTGTGTCGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAG:1 - chr3R 10781804 5' - Tirant 8325 2 73.00 CACACAGGCACATTACTACATGTGCACCTAACCACATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTGTTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1 + chrX 17030005 5' - flea 217 2 63.37 GGAATATTTCCCAGAGGCGGGGATGTTGTTTTAGAGGCAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTTGTT:1 + chr3L 20317814 5' - 3S18 6077 2 54.95 ACTCGGAATGCCTTCGGAGCAGATAGAGATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2L 2833912 5' + roo 48 2 74.26 CAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr2R 10315297 5' + Doc 80 1 72.00 TAACTTCAACTTTTTCTTCTGACATTTTCTGACTTTCTGTGGAAACTGATGAAGACTTGCCATTCGATTCGGCCTGAGTTTTTTTTTTCTTTTCCTTTTT:1 + chr3L 12777230 5' - Doc2-element 238 4 80.00 TCGAACAGCTGACATACCTTCAGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCA:1 + chr3R 18403292 5' - P-element 2676 1 23.76 ATTTTCTAATTTCCAATTGAGAAATTGCATCAACTTAAATGGGAAACGTGTCTACCCCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr3L 18418826 5' - hobo 2920 1 61.39 AAGCTGGCCGAAAACCTATTCATAGCCCTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAA:1 + chr2L 7819521 5' - 1360 393 1 75.25 TGCCATAAAGTAAGTACACAAATAGTTGACACTAACAATTTCCCCATTTATACAAATCGTAGAAGTTACAAGGAAATGCTTTTATTTTTACCGCAACTGTA:1 - chr2R 15313991 5' + Tc1 1645 1 75.25 AGAGGCGTGTGTTGTGGATTTAAGATCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chrX 13146964 5' + roo 8715 2 76.24 CCGCCGCCTGGCAGACCGCACCCTCGCAGCAGCAGCAGCACCAACAGCACACCGACCGGATATCATACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGCC:1 - chr2R 12117855 5' + Chouto 5944 1 52.08 ACAGGACATTTTCATGAGGTAAGGCCGCACCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTT:1 + chr3L 13295229 5' + hopper 45 1 69.31 TATACTTAGCAGATCGGGGAGTATGTATAAAGGCTATATAACTATAAAAGCTTCATAGCGGCATCTGCCAATGTGCAGAGCTTTTGCCGGCTATGCAAGAG:1 - chr2L 8667224 5' - springer 77 2 65.35 CAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chrX 13146927 5' - roo 9027 1 70.30 CTACACATACATATGTACATGTGTAGATGTATCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTTTTT:1 - chr3R 10095085 5' + Rt1b 5021 1 69.31 TCTAACCCACTGGCTTCCATAGAGCTTTAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 - chrX 15546203 5' + blood 7057 2 69.31 TTTGTGAAAGATGTTGTAAACAGCAATATTAATCTAGCAAAATACGTTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTT:1 + chr3L 6659368 5' - 1360 2980 1 55.45 GCATTTGACCAAACAGTCACTATGTTTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3L 2022308 5' + roo 30 2 57.43 AGGAAATTACTCCTGCACATTTAAACATTAAAATAAAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr2L 7175541 5' + blood 7023 2 67.33 TTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAA:1 - chr3L 19350028 5' + 1360 3197 1 61.39 GAAACCAGAAACCTCTTCGAAGATGATTAGGCCATGCCCATTTCCGGACAAAATGTTATGCAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTC:1 + chr2L 14220133 5' - springer 366 2 61.39 TATTAAGTACTTTCACCGATTCCGAAACAGACTGGGTTAAGAGCAGAACGAAATGAAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAA:1 - chr2L 11853388 5' + F-element 279 1 61.39 TAAGCCGGTGATTCTATGGTGACTGTCGAGTAAACAACATCTCTTCAAAATTCTCTTATTCCAGATTTTTATATAATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:1 - chr3L 15788526 5' - opus 498 1 68.32 ATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTA:1 + chr3R 4973103 5' + 1360 3379 2 43.56 CAAACTAAATTTATGTAAACTTACAAATTGAAATCCAAAGTCGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTCAAAAACCAACTTTGAAATCATACAG:1 - chr3L 18151542 5' + Doc2-element 4401 1 58.42 GTTAAAATGTCGATATTAATTGCAGAGTGGCAGCAGCACTTGTGGTAGGACTACAATTCAAGTGGTAGCCAAAATAATAAACATTGGCTAGGG:1 + chr3L 7598268 5' + invader2 4700 1 81.72 GCAGGCAGTTGCATTTGCATGCCACAAAAAAACGCTCGTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGG:1 - chrX 10252923 5' - Transpac 308 2 59.41 TCCTTGGCGCGAGGGGAGTTTCGTTGCGAAGGGAGTGGAATGGGAATGTGCCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr3R 29287572 5' - hobo 2915 1 55.00 ACGTTCACGGATATGGGTTTTCAGGCAACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 2022218 5' - roo 395 1 67.33 CATTGATGTCTCCTTATACTGGCAATTACACAATACAAATTCTAGGGTGAAAGTTGCTTAATTATATTATTTATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 - chrX 4399614 5' + I-element 5 1 76.24 CTTGAGATTGTGACCACTTCATATGGCATTGGCCCAACTCAACTATCTGCTTCAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCT:1 + chrX 6093521 5' + Doc 4524 1 49.50 CACGAGTTTGTCAGAATGTAAGGACACTGCCTTATGGGCTGTCATTTATTTGACCCGACTCACTCACACATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCG:2 + chr2R 21433113 5' + HMS-Beagle2 2 2 77.23 CATTGGATAAAAAGCGGGGTATCAATAAAACGAAACTACATCTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAG:1 - chrX 11032249 5' + invader3 5223 2 62.38 TATGCGAGATCCCAAGCGTAGCACCAACTTTGGCCATAAAAACCCGAAAATAGCCATAATAATGATAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAAT:1 - chr3R 12767371 5' - blood 7384 2 73.27 AATACTGTTAAAATCTGGGTTGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTC:2 + chr2R 19091606 5' - Stalker2 368 2 57.43 AATTTGTTTACCCATCGTTTTCATGTTGTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGT:1 + chr3R 16938406 5' - G2 3076 1 68.52 ACGCCCACAATCATGGTTGGGAATAAATATTGGTATATTTTGTGAATTAAAGTTCTTAGAAATAAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTTTAT:1 + chr3L 6441193 5' - ZAM 8171 2 54.46 GAGCGTTTCGCAGAAAGATNGCTGAATGCTTTAATGATTTTGTATTTATTCAACGCGTCACTGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTCAACCCCC:1 + chr3L 1586700 5' + Tirant 8 2 71.13 CTAATCGAATTTTAAAAATNTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr3R 11052112 5' + blood 7055 2 70.30 TAGGTCTGGCCAAGAACCATCAGCTTTGTTGCTTAGTTGTATGATGAATTCTTTTACCTTATTTATACATATGTACATACAATATTAATCTGTTATTATTA:1 - chr3L 13569280 5' - invader3 5067 1 72.28 GAATAGGACTCAAGTATAAGAGTATAAATAATATGCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACA:1 + chrX 1706049 5' + Juan 4090 1 65.35 TCTCTTTGTGCGCTGCCTCNGCTTAACATTTGGGCCTGTAAGAAACACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCA:1 + chr3R 20622186 5' - R1A1-element 5234 1 55.45 CAGATTCACACACCGAAACAGACAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 4203468 5' - hopper 144 109 81.25 CTGGTGTATACCAAATTAAAGCAAATTTTCGCTGCCACCAGAAAAGAGGCTGCATAGAGCAAAAAAACAAAGTATGGCCGTTAATCATCTTGTTATT:1 - chrX 21166487 5' + 1360 3376 1 72.16 TACAGACATAGAGTACTAAAGTTCTAGGACACTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 - chr2L 8176460 5' + 1360 44 1 69.31 AATGGGGGGTGGGGCAGGACACGAGATATAGAGCTAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chrX 7996386 5' + hobo 39 1 62.38 CGTCTCCTTTGGCGGCTGTACGGAATAGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGAGCTCATCAGGCTCGAAGG:1 + chr2R 11604457 5' - Max-element 326 1 79.21 TAAAACAGGAAAATATATTCAGGCTTTTATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:2 - chr2R 5953164 5' + 297 42 2 75.25 ATCTGACATTTGATCTGCTAGAAAAGAGTGGTTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTG:1 - chr3R 22408788 5' - F-element 4303 1 68.32 CTGTACCCTATTGCTGAGCTTAAAAATGCGAAGATTCATTCTCTAATCCATTCTTACCTATTGGCTAATCTATGTACGAGACCCATTTTAAGCAGCGGCGT:1 - chrX 4532757 5' + gypsy4 6405 1 75.25 AACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chrX 11017011 5' - roo 353 2 78.22 AGCAAAGGGAGGACTTATGGCTGAGCAAGCGAAAGATATCCCATTTCGCCGGAGACGGGAACGG:1 + chr3L 18677317 5' - F-element 4510 1 71.88 ACACACACAATACAGGACGAATTCCGCCTCAAGTTGTCGAGCTAAGAGTGCACTTGAGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr2R 9649139 5' - roo 409 1 79.21 GAGTGCGAGCGAAGACGAGGGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTTGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAA:1 + chr3L 20354031 5' - 412 7489 2 74.26 AATTAAGTCATAATTTGATTTCGTTTTTATGTTTCTTCAGGTTCTGTTGCAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAA:1 + chr2L 14794079 5' + Stalker2 74 2 50.50 GCACAGAGCTCCGAAAATTNTACTACGCTTTTTATCCCGATTGATTGACCTGGCCTGAATAAATTCAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:1 - chr2R 10670057 5' + jockey 4773 1 65.35 TGTGAAGATGCCAGCATAATTATAATAATCATTTCATAATCATATTTTATTCTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGAT:1 - chrX 8727933 5' + X-element 29 1 50.50 ACTGTAACGTTTATTTTTCAAACAGATCTTAAAGGACATCTCCATCCAATTCCTCCAACTCTTCTGCTGCTGGTCCGTTATTTGGCGGTGAATCGCCACGC:1 - chr3L 10048918 5' - invader3 452 1 64.36 TTATTTCACCCTATTGCCCNCAAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr3L 21144018 5' + jockey 10 1 74.26 TTATTAAGTGGTTTTCATTTAATTCATTTCCTCAAAAACGGACATTCAGTCCTCTTAATTAGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr2R 21153795 5' - pogo 2090 1 58.42 TCGCTCACACACTTGCAGAGCACAGTGACATACGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chr3L 8268204 5' - hobo 2897 1 66.00 AAATGGTTAGCTAACTCGGAAAATAGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 + chr3L 7168316 5' + Doc 23 1 53.33 ACTGCGTTCGTTGAACTTGAAGGAGTCTGTTCCTCCTGATGGAAAGCGCAATGCATATAATATGTGCAGAAGAGACAGAGTTCACTGTCTGCAA:1 - chr3R 26492064 5' - baggins 5186 1 76.60 CAAAATGCAGGCGCTGGCCTTTATCTGTTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAACCTACAATTTTGTGTG:1 - chr3R 11321066 5' + hobo 39 1 64.89 CTCCATAAAACTTTTCTTTTAATTAAAACATATTTTACATACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 + chr3R 12063745 5' - 412 457 2 66.00 GTGCCATAAAAATGTTCGCAACTAATTAAATTGTGATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGA:3 + chr3L 9928500 5' - roo 411 1 78.22 GATAACTCAATTATTCGCGGCGTAAACAAATGCTGCCTTTCAGGGTTTTTAGCCAACATCCCGTCCATCTGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGG:1 + chrX 17753914 5' - R1A1-element 5040 1 76.00 GGCTAGACTACCTGAAAAGTCAAAAAGAAAACCTTTATTAGTAATCTATATTTCATTCATCATAACTAAATATGCATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCA:1 - chr3L 20454634 5' - invader4 325 2 79.00 TGTAGCTCTATCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1 + chr2R 18723033 5' + HMS-Beagle 26 2 54.46 CATGGGGAACTGCAGCATGCCGCCTGTTATTTTTTGCTCTCTAATCAGAGCGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTT:1 + chr2R 13383500 5' - gypsy5 386 2 55.45 AGTTGAAGGGGTTCCTCCTAATGGCAATAGTTGTTTGTTTTCAATCGTTTTTATATGACTAAAAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTA:1 + chr2R 18188293 5' + Juan 4039 1 62.38 GACTTCGGCTGACTTTGAAACTTTTGCCCAGCACAAAATACAAAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTAC:1 - chr3L 13599974 5' - hopper 1020 1 57.43 GGGTCGAGCCCTTCAGCTCTTAGTGACTTGAAAATAGAAAAAACCAGGCGTTGCTTACACACATTCATAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTG:1 - chr3R 24817866 5' + I-element 4999 1 70.30 TTTAGCTCCAAGTTAAGCACACTATAAATGCCACAGTCGCAATTGGATCCAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGA:1 + chrX 734903 5' - Tabor 7298 2 58.42 GTGTGCGCACCGAACTCATTACGTTCGTCGCCAAATAAGCGTGTCTGTGTGCCAAAAGTGAAGTGCTAAATAACCAAAAAAATAAATAAAAAAAATTAAAG:1 + chr3R 23143581 5' + HeT-A 2 1 74.26 AACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3L 2022244 5' - roo 9032 1 64.36 TAAACAATGCGTCGCGTTATCAACTTAGATTATAACTCCGCTTAACTAATTTAACGAATTTCACAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACT:1 + chr3R 22701247 5' + hopper 1365 1 66.34 CACGTTCAGATATGTTTTATGCACTGAAAAGGAAGTAGTATTCACTTCGAAAATTCAATCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGAC:1 + chr2L 20328690 5' + opus 15 2 64.36 CCGCTCCGATCTTAAAAAGCACACAATCGCTGACGGCGTGTGGCCGACGTTTGACCTGAAATGGAGGATAAAAGGATTAAAGAGTGTTATTTACTGTAACG:1 + chr2L 8465498 5' + I-element 490 1 73.27 GAACTGAAGTATCGACTATAAGGGGACAGGCTGTATAAAAGCGTTTCCGTAGAAACGAACGAGAAATACGCGTTGTTTTTGATTGAAGAGAGCCGACGGTT:1 + chr2R 5205486 5' - Doc4-element 40 1 58.42 AGAGATTACAATGTGCTCGGCTTTGCCCTGTTTACACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTGATGACAAGTTCTACATCATCAGCATTCATGGACAA:1 + chr3L 16792560 5' + Chimpo 4051 1 69.31 AGAAGTGCCCCGTCCGACTGCAGCAGATTGTGTTTTAATGTTATCTTGATCAAATTCTCATCAAGTTGTAAACCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 - chr3L 20354102 5' + 412 5 2 75.25 GTGTTTACACGAAAGAAGGNAGAATGCGAAAATGTAAGAGTAACATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATA:1 - chr2L 8403015 5' + invader1 3843 2 56.44 AAAAAACCAAGCTCAACCGAAGGCCATGATTCACGAAAAACATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2L 4063757 5' + roo 33 2 63.37 AATGGGAACTCCCCTGACATGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 8765524 5' - roo 393 1 63.37 ACGAATATTTCACTGGTAATTGTACCAGTTCCTAAAAATGGTGAAATACCAGTGAAAATGGTAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2L 20619978 5' - roo 399 1 63.37 CAACACACAGCGACCGGAAACCAGAAAAAAGTGTTGACATTTGTAATCAAATTTTTGGGCTGTAAATGGTAAATGATGACAGCGCAACTGATTCTGCTAAG:1 + chr2L 12892913 5' + G4 142 1 67.33 AATTGGTATAACAAAGGAGGTTGACTTGTACAAATTGCTGTGTCGACACATACATACATATATATGCACACATACACACACACACACACACACACACTTTC:1 - chr3R 14049560 5' + accord 185 2 78.22 CAGCTAAAGCGGTTTTATCTCCCCAAAAATAGTCAAATGCTGCAAGATGGGCTTGTAGGTGTACTGTATGTAGGTGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGTA:1 - chr3R 29340269 5' - baggins 5401 1 55.45 TACCACAAAAACTCCCATACAAAACTATCAGCTGAGAACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATC:1 + chr3R 23873764 5' - 297 295 2 63.37 TTTACAAAATCCTTTCACTNCGTTTTCTGATGTTCTTCCAATTATGGCATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr2L 5926922 5' - pogo 2076 1 51.49 CACGCGAAACTTGTCGGTGAAATGTAATAAATTTCGAAAACTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACCCACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATAGTG:1 - chrX 20819731 5' + TAHRE 10377 2 61.22 ATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:3 + chr3R 7869118 5' + 297 32 2 57.43 AGAAGTATATATAACGATCAATTCAATGTGGGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGTTGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACC:1 + chr3L 20266888 5' - F-element 4368 1 69.00 ATCAACCAAATCAAGCGAATTTAATTGAATTTCATGCACGTCTCTGTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTT:1 - chr2R 23759542 5' + blood 7202 2 73.27 TATTGCATTCGAGATATGAGCACAGTACCGATGTACAGAATCATTTCGATATTCAAATTCAATCTCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 - chr2L 20367386 5' + Doc 14 1 64.00 TCAAATTTCTCTTAACCTAGTTCCTAATCGATCACGCATAAACGGAGATATAGTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 19334574 5' + roo 8681 2 61.86 AAGAAGTCGAAGGACCGGCATTGCGGGAATGGCCTTTTCTTAATCAGCTGTTTAACACGGCACCTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTAGA:1 - chrX 11487005 5' - transib2 126 1 73.27 GTTGAATGTTTTATATACANTTTTTAAAAAGGTTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2R 22134245 5' - opus 459 2 72.28 GGAGGATGATGTCGATGTTNTTGGTATTTTCTATTGATGCCTCACTGGGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAAT:1 + chr2L 16972173 5' - invader2 63 2 54.46 ATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGC:1 - chr3R 14860186 5' + BS 5050 1 79.21 CGACGATTGCTATCCTCCTACACTTTAACATTTATTATCCCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 + chr3L 1697688 5' + Transpac 4954 2 60.40 GGAGTGGTCAGCTGCGTCTGTTGTTTGCTCATCGCCGTCGCGACGGTCTGCTGCTGGCCAAATTAGAGGATTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 - chr3R 12329701 5' + hopper 1 2 76.24 CATTTATGAATGTTCTATCACAAGGCAGAAGTTATACATATTATTTTTTTTTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTAC:1 - chrX 1706098 5' - Juan 4189 1 52.48 CTTCTTACAAAAAATGCGAAAATTGATCCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATA:1 + chr3R 29617750 5' + P-element 2710 1 37.62 CTACTTCACTTATTTTATTNTAGTGTTTGGTAATTCTTAAGAATATTTCTCCACCCTGTGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 - chr3R 4575514 5' + 1360 18 1 60.40 AATGTAACAACTATTTTTATAAATACGTTCTTGAGAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGGCGAGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - chr3R 6947373 5' + I-element 45 1 59.18 GTAGGCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGA:1 + chr2L 4134842 5' + Quasimodo 49 2 74.26 TGATAATAATATGTTAAACAATGATATATTTTACTCAAAAAATACCCAGACAGAGAGCATGGATTCCTTTCAACATTTGCATTTATTTATTTATATCTTTT:1 + chr2R 15313771 5' + S2 106 1 65.35 CTTGTTTATCTCAACCTCCTTCCCCGAACAGCTGAACAAAAGTAGGCCTCAATGGCAAAGGCAGGCACCTCACTATTTCAACGCATGATGGCGACTGAACT:1 - chr3R 12718004 5' - mariner2 119 1 73.27 AGTAATGCATTTGCTGAAAACAATCTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chrX 15800946 5' + roo 8706 2 73.40 AGGGCCAACTTCCTTTGCATATTCTCTTATTTAGTTGCCATTTCTGACATTGATTTAATGTGGCTTCCGTCATTATCGTTCTCGATTCATATACATAAGAT:1 - chr3R 19449292 5' - roo 57 2 75.25 GCGTCCTGCATTCTTAGATTCGAACACACTTAAACTCTTTTTTGATTTATATCAAATTTTGCCCAATGGTTTAGCTAGCTGAGTAATGGGTATCTGATAGT:1 - chrX 15932426 5' + INE-1 548 1 79.21 CATTAATTGCGATCGTTTAAAAACCAAGTTCAATTACCATTAATCCTTTTGAAGAATACTATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chrX 2530441 5' - pogo 2093 1 69.00 TCTCTACACCGATTTAAATATCTCGCGTCTCTCGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTC:1 + chr3L 8547594 5' - invader4 304 2 74.26 GTTCATAAAATTTATCTAAGTAGGGGTTGTCTACTAACTAACTTCGTTTCTAGTCACACGTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3R 24542129 5' - 1360 3374 1 45.54 TTTCCCGGTAAAACTTTGTTTAGATTGAAGACCTTTCTCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chr2L 3699468 5' + mdg3 40 2 61.39 GGGGCACAGAAATGTTGTTAGTGGATTTCGAACTGCACGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCT:1 - chr3L 16282423 5' - gypsy5 369 2 63.37 AATTTTAAAGCTTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr2L 17955514 5' - roo 9029 1 72.28 CCAGAGGTCCCAGAAAAATACATATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTG:1 - chr2L 20044069 5' - F-element 4507 1 67.65 TATTGTTGCAACAATTGTCGCGTGTTTGGGCCGGGTTTGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCC:1 + chr3L 16282336 5' + gypsy5 6 2 76.24 CATAGAGCAATAATAAGTGCGAATAAGTGTCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 10087876 5' + roo 46 2 75.00 TTTACGATTCTTTTCCTCTCGTCCTGTATTTACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCC:1 + chr3L 14593401 5' + hobo 2522 1 70.30 TGAAAAATTTTTGAATATTTTTCATACTTTTATTAGTCGCTTATATTTCGATCGATACGCATAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGC:1 - chr3L 23648183 5' + invader1 3956 2 55.45 TACAAGAATTATAGGAACTTTTAGATATGTACTGTTTTATAAAACAAATATTAATATTGAAGCATTCAATATTAAGAGTTTCAACATAAGAGTTTCTTTTT:1 + chrX 16765114 5' - Bari1 1416 1 66.34 AAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTTTCCATTTAACAAAGTCAGTTTCCAAATGCTTTCCAAAGTGTAACACGCATATTGCAAAATATTTTGCATATTTG:1 + chr3L 20289114 5' - Cr1a 174 1 79.21 TAGGTATCGGGTACAACAATAGAGAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr2R 5720514 5' + pogo 63 1 54.46 CAAGAGGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAAT:1 + chr3R 7783733 5' + rover 6977 2 56.44 TGGAGGTGCGCATCAAGGAGGAGCGTGTGGAGGAGCAGGAACAGGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTG:1 - chr2L 11438475 5' - accord 194 2 56.00 CACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 - chr3R 30553599 5' + 412 52 2 75.25 TGCACTGTCGCACTCGGCATATCAATTTTCCCGCTCATCCACCTCTCCCCTCAGGACATTTCGAGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2R 19061312 5' + roo 8674 2 67.33 CTGTGACACTGATGAAGAGCAGGTGATGGCGATGCAAACTGGCCCCGCCCCTCACCACATTTCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr2L 20238681 5' - hobo 2936 1 74.73 TTCTGCTCGGCGCAGAAGGGACTGGGAGGAAAAAAGTGCGCAAGCCAAAATTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAG:1 - chr3R 26759510 5' - mdg3 5304 2 49.50 ACCATATATATATTTTTTTTTTAAATTTCTTTAATGCCCCTTTTAAATTAGGATATAGTTTATTAATAAATCAATATTAACAAGAGAGATTGCTATAGTCG:1 - chr3L 14915873 5' - INE-1 579 1 84.16 TGTTGTGCTAAAGGGTAATTTCGGAACAAGTGGATTTAAACTATGCTGGTAATTACTTTCACTGAGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGG:1 + chr2R 10372734 5' - mdg3 5440 2 40.59 GTGGATTTTAAATTCCTGAAAGTGAAATCATTTGCACTTACTATGGCTAACTTAGTTAATATTCTATAAATTCTGGCTATTAATTTATCTAATATCTAATT:1 + chr3R 22091698 5' - I-element 5242 1 82.18 ATTGTGATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3L 9928529 5' - roo 405 1 64.10 TCGAAATTGATCAAAAGCTTTTCAAGACTATTCTGTTGTACAATAAACTTTAGATGTAAATACAAGATGTGAGTAACATCAGGAAAAGCTGCGTGTGACGA:1 - chr2R 4470665 5' + Chouto 17 1 67.33 TATAAAACATTTTTAGTTATGTAACGGTCATAACGGAGCGCTAGTGGTCCCGTTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTTCAGTCGCCA:1 - chr2R 2947722 5' + mariner2 110 1 79.21 CCTGCACTCTAAGTGCTGCTGAAGCCAAGGCAAGGACTAAGCCAGGATGATTACCGGCTGCGAATGGTACGTAAGGAACACAATAAACGTGCACTCCAGCC:1 - chr3R 7462066 5' + BS3 1463 1 60.40 ATATCGTTCTTTATTTTCCAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAA:1 + chr2R 13751546 5' - 1360 3381 2 53.47 AGTAGGAACTGACTACATGGACTCCGGCTCGCAGAACAAGCAATTTGGACATTTCTATCTTTTAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATAC:1 + chr3R 5347122 5' + Stalker 46 4 69.31 AGGATTATTTTATTTACCTGTATATAGCAATCTTAAGATTGATATCGAAATAAATAGGACTATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chr3L 15033385 5' + I-element 9 1 68.09 CACACTATAAATGCCACAGTCGCAATTGGATCCAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 + chrX 734920 5' - Tabor 7281 2 64.36 AGACAGAAGGATAAACAGAAGGACAAACACGCATTATCCCATGCTCGGCTCCAATTTCGAAAAGCCATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAAC:1 - chr3L 10281787 5' + I-element 278 1 74.26 CCATTCCATTAATCAAAATATTTCGCGATTCTTGAAATGTGTAGAAAGTTCTATATATTATTTTCTTATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGA:1 - chr3L 13001094 5' + invader3 5197 2 68.32 TTTGATTGACCGACCGCCCTCGTGTCTGCAGCATTTTCAAATTGAATTTCCATTTCAGTGGCCATTTTCCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 + chr3R 9088534 5' - hopper 1410 2 74.26 ATTTTATGAAAAAAAACGTGTAATATCTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGG:1 + chr4 194739 5' + Quasimodo 48 2 76.24 AATATGAATAATTATTCACGCTAATATCGTGTTTCGAAGGCTTTTCAATATGCAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGG:1 - chr2L 14220223 5' + springer 7161 2 54.55 GGAATAACGCACCATAAATTTCAAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:2 + chr2L 16153355 5' + Doc 35 1 54.46 CCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAA:1 - chrX 18326226 5' + Doc 230 1 67.33 CGGAAAAGCTTGAAAATTTTCCACACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr3L 5415384 5' + I-element 41 1 70.33 AAAAAAAAATACATAAATAAAAATATATAAATATA:1 + chrX 11509535 5' + Stalker 88 4 85.71 AAATAATGCACGTCCTTGGGGGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 + chr2R 24278033 5' + 412 7108 2 79.21 TGAATGGAATTTGTGCTCCNATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTC:1 - chr3R 25086149 5' - Bari1 1659 1 73.27 ATACTTCGGATTAGATTTANTGCCCATGTGCACACACACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 - chr2R 9209496 5' + Tirant 8141 2 58.42 AAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr3R 20420942 5' + blood 7063 2 76.24 TATTGCGACTTGATAACCCCGTTCATGTCCTACAGGAAGAGAATTGTAACTGGATTTTGAAACTTTCTAGCTTGTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCAT:1 - chrX 336491 5' - INE-1 139 1 64.36 GATCATTTGGCGATGCGGCATATTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chrX 7788619 5' + 412 54 2 77.23 ATTTTGAAAGGATTGCGGTCGAAGCAATATACTAGTCGGCTTATTCAAGTGTACTGGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1 + chr2R 10353259 5' - blood 358 2 47.52 ATTAAGGGAAATGTGCACGCTGGTCCGGTGAAATAAAATAAAAATATAAAATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 + chr2R 4830300 5' + 1360 2 2 77.23 CATTTGGATCATTTGGCGANGCGGCATATTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chrX 7788613 5' + 412 7101 2 71.29 TATTAGAAGGAAATATGAATGAAAACTATAGACACTGAAGCCCCTTCAGTCCGAACAAATCGTTTGTTTTCCTTCACTTCACTTTTCTTTTGTTTTCCATT:1 - chr3R 16936896 5' + S2 232 1 70.30 ATCCGAATAAGCTGCTTAANATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 - chr2L 18655221 5' + Doc 25 1 56.44 TCTCTGGGATGTCAAAGGCGCGCTGCCGCGGGCCACGTAATTTAATTACCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 - chr2R 6847333 5' - mdg1 7432 2 51.49 GGATCGGGATCTAGTTTTATCTACGGATTTGTTAGGGAGCACTACCGCCCCAATAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATT:1 - chr2R 16014183 5' - Stalker4 104 4 63.37 GGAAAATTTCTGTTACATATTTATCAGTACTTTAAACGAAATTCATTGTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1 + chr2R 9699800 5' + Transpac 26 2 60.40 AAAATTAATTATTCTAAACAATTTTGCAGCATTTAAATACAATCAGAATACACAGAAGATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 + chr2L 11478662 5' - opus 7484 2 62.38 CTCTCTTCCGATCCGATGCNACCGGCGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr2R 17420884 5' + pogo 49 1 74.26 AACAATTTAAACAAATTAGAGTTTAAGATAGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAAACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACA:1 - chrX 4591077 5' + F-element 243 1 70.30 AACTCATTGATCATCTGCATGTGGTTGTAGTTGCGATGAAACAGACTCTCCAGCTGATGCGGGACCTTAGGCCATCCTTCAGTTGATGGACAGCGCAGTGG:1 + chr3R 22764958 5' + Rt1b 377 1 63.37 TATGATGTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCAATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATAT:1 + chr2L 21735005 5' + 17.6 6952 1 56.44 TGTTGGCTGTGGAACCAGATCGAATTTGTCAGGCTAAACCTTGGACTTTTGCTTTCGCTGACTCAGTCAGAGCGTGAGCGGGTGCGGCCGATGACGAGG:1 + chr3L 8155814 5' - F-element 460 1 53.54 CTTTCAATGTGCAAGCTTGTTGGGAAATTGCGCCCTCACTGTGTATACATACGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 - chr3R 23641062 5' - 297 378 2 67.33 TTTAACAATTTTCAGGCGGAACGAAGTCACACATTCACACTAGCTGAGTACCGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTA:1 + chr2R 5528741 5' + INE-1 582 1 74.00 AAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACA:1 + chr3R 14860154 5' - BS 5063 1 59.41 TTTTCTTATTGCCCTCGCTNTGGATTGCATCGGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCGTCGGAGCGTTACTAGAAGGAGTTCGGGACTGAGAACGCGCGGTCAAG:1 + chr2R 677152 5' + gypsy8 445 1 53.47 AGGGGTTTTCAAGAGGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACT:1 + chr3R 7783724 5' + rover 6968 2 63.37 AGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chr3L 19274861 5' - transib2 2779 1 71.29 CTGCCGAGCCAAACAATGTGAAACGGGCTGTAGATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGA:1 + chrX 11032197 5' - invader3 5419 2 67.33 CTGTTTTGTGTCGCCGTCCAATTAACAGATTCCCGCTCTCCGCCGCATGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTT:1 + chr2R 23666863 5' + jockey 4768 1 52.48 CGTGCATCTTCTCTTCCCGCCCGAGAAAAGTGTGAACTCACGAACACACGCAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chr2L 16683700 5' - P-element 2861 1 55.45 GTAAGCACCGCGTTTCCCCTCATTTCAGCTCCTCCACTTTTCCCAATTACTTTCCTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAGGAGGATATATAATACCC:1 + chr3L 21870775 5' + invader2 5098 2 60.40 TCTCTTTAGCTGGCCATTGGGATTTTAGGCCAGAATCAAATACATCTACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:1 - chr2L 19678187 5' + flea 4770 2 60.44 CTACCAGCCCGCACCACGCATTCTGACCAACAGCACACAAACAACCGGCTCGATTGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGAAGTGACATATTCACATACAAAACC:1 + chr3R 20235608 5' + 17.6 3 2 58.42 ATTAATGGTTTCTTCTTTTTAATTCACTTTTCATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 - chr3R 19450716 5' - Burdock 6350 2 68.32 CAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTG:1 - chr3R 26765178 5' - mdg3 5473 2 52.48 AGTGCCCTCCTGGCTAAAAATGCCAGCTACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 - chr2R 14349171 5' + mdg3 5301 2 72.00 ATCAACACGTGCCACATCATCTTCAGCAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAA:1 + chr2R 13535628 5' - copia 4947 2 74.26 AGTTACGGCAGAAGAATTGCATGCACCAACAGTTTTTCCTCTCGCTCACGCTGAGAACGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAA:1 + chr3L 14224491 5' - 1360 3253 1 64.36 GCAAATTCAGCTCATAGAGAGCCAGACTATTTTTAAACGATTGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCGAAA:1 - chr2R 10453364 5' + Doc2-element 492 1 58.42 CGGAAAGCAGGATAGCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr3R 23543019 5' + 412 32 2 60.40 GTCGATAGATTTTTGTATCGTTGAATGTGGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAAT:1 + chr3L 11231388 5' + 1360 77 1 67.78 AAAAAATTAAATTTTTTTACTAAATTCAAAGAAAACAAGAGAGAGAGGGATCACAACGATAGCATTCGTAAGAAACGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 + chrX 16285420 5' - INE-1 548 1 72.73 CTGGGTGATTGTATATAAATGACAATTAAACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:1 - chrX 734993 5' + Tabor 17 2 62.38 TTCAACTATTTACTAGAACGCAAGTCAAGCTTGGCACTTGCCTATAATGGATAATCCCTATCTCTACTGCACACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGA:1 - chr3R 23316619 5' + Transpac 330 1 75.25 ATGCGATTGTTACTTACCTAAAAATGACAAAATCAAAACACAAAGTTAGTTTAGGAATATTATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chr3L 13772982 5' + pogo 12 1 67.33 CTATTTGGCTCGTATAGCTCGCAAAATTTCGCACCTCACGCTGAGAACAAAAGAAATCTAAAA:1 + chr2L 15548132 5' - 1360 3281 1 57.14 ATTTCGGGGGCTCATTAAAAAGCTATAAAGTGCTGCCATTAGACAATAACCCAATTTCAACCAATAATAGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3R 8582518 5' + roo 8671 2 72.28 GTGTATCTGTGAGCGTAGTTGTTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGT:1 - chr3L 5241194 5' + Ivk 13 1 66.34 TTCTTCAAGGACCCGTGGAACATATTCGATTTTACACCACTACATTTCGTTATCAATTTCAACAAATCATTTCAAATCAAAATAAACTCAAAAAATATATT:1 - chrX 11962079 5' - hopper 174 1 71.29 AATGATCGTTAAAGCCATAGGTATGTAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chrX 17104389 5' + 297 21 2 57.43 TTTTTAAAGTTTTCGGTTTNAAAAACATTCAGATACCAAAGATATGCGAAAACCGAGTTAAGCATTTTAAAAGATAAAACCAACCCTCTCACTAATCATGT:1 + chr2L 13252551 5' - BS 5004 1 70.30 ACGGGTCATTTCATACACGAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACATAAGGGAGAATAAACAAAACACAAATATATTGTGTATATGTTTAAACTACTGCA:1 - chr3L 26762978 5' - Cr1a 160 1 56.44 CTGGGCACCACATGCCCACCCGGGTTAATTGATTATAATTACATACATGTCCTAATGCAATTCATCAAACGATTTAGTTAACGACCTCACCGGCTTTTGCA:1 + chr3R 6625719 5' + Doc4-element 363 1 68.32 AAAATGGCTCCAGCAGCAAAAGATACAGCCAAAAAAAAAACAAATAAAAAAAAAA:1 + chr3R 25721867 5' - hopper 149 109 63.64 ATTATCATTAATTATATATATTTTCTGTGGCTAACTAACTTGAAACTAATGCTTATTAACATTTTTAAATATATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGT:1 + chr2R 19088927 5' - Tabor 7321 2 70.30 TAACATTATGAATTATGTCCGATGGCGGGCGTGGCCGATTTAAGTGCGTTAGAGTGGACGTGGCAAACAATTTTTTGCTAATCGATAGAAATTTACAAGAC:1 - chr2L 18048764 5' - INE-1 301 1 65.35 TCCAGGCCTATTTCACCGATGTTCTATAACCCAACTGACCTCTTAGCCCTCGACACAGTTGCGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr2L 22631356 5' + 1360 15 1 52.00 CGAAGATAGCCAAAGCAATTGTTGTTGTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chrX 2289318 5' - roo 9021 2 76.24 CGTATCTGGTATCTGCGGATCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 + chr2R 15788560 5' + Transpac 4936 2 63.37 CATTTGAACTGCTAAGCTAGATTCAAATGTTTACAAATGACTTTAATGAAAGATTATTAGGAAAGCATCTTTTTTGGACTGAGCTCGCTTTATGATTTCAA:1 - chr2R 11094477 5' - Doc2-element 4409 1 76.24 AACAATTATAAACTCGTTGTTGGTAAAGTGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTC:1 + chr3L 12468225 5' + jockey 4720 1 67.33 TTTTTAATTTTAATGCAAGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAA:1 - chr2R 19560028 5' + Tirant 276 2 80.20 CAATACACGCCACCCACGCTGCCCAAGCAAAAAACTGAAACCATAATCCAAAACTCACTCACTCCGGAAGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAAC:1 - chr2R 23519303 5' - jockey 4983 1 69.31 GCAAGTAAAATCAGTTCGTCCTAATGCAATAGATAATAATAGTAATAGGAATAATAATAATAATAATAGTAATAATAATAATAAAAATAAAAATAATAATA:1 - chr3R 2689697 5' + mdg1 7063 5 68.32 TCTGTTAGTCGAGAACATTATATTGGCATTTTAGCCCACACAGTACGCCCCTACGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chrX 10286134 5' - roo 9052 2 55.45 GCGAGCACTACTTTCAGGAGACGGACATGAACCACGACGGCTTAATCAGCATCGACGCTTCTGCGCTGCGCCGCGGCCGACGCCTGCTGCGCCGCTGCCG:1 - chr3L 17798900 5' + HMS-Beagle 117 2 57.00 TCAGCTCTTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3R 29608841 5' + roo 8702 2 65.35 AAACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1 - chrX 734966 5' + Tabor 44 2 66.34 GCCTCTTTCGCATATACCCAACATTTTTCTACCTTGCTTCCACCCCGACCTTTGGCCAATACAAATTGACATATTTTTATCTATTTGTAAATCTATATGGC:1 + chr3L 10124245 5' - G3 4480 1 71.29 TGCATTATCCATATAATTTTGTATAGTATGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 3209229 5' - roo 9027 1 69.31 TTCATGAATGTTTGTTCACTTCAGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGACGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGAT:1 - chr2R 6221781 5' - F-element 4496 1 75.25 ATTCTGTAAAAATAATGATGTAACTATTTTTGTTGTTTTGTGATTGCTAAAAATACATACATGTAAGCTTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAAT:1 + chr3L 12990733 5' - flea 4995 2 47.52 TGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 10087841 5' - roo 358 2 72.00 CTCGTGTTGTGACAGGCAAACAAAACGCAGCTCATAGTTTGGATTTCAGAATGGTGATGTCTCCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATA:1 + chr3L 10043550 5' + G6 1892 1 60.40 AGAAGCAGTTGGAGCAGTTGCAGCGCGGACAATGCCAGCAGTTTCCGCACTTCATGCACACATTTCCCCAGAAACGCGTGGCGATTCACCGCCAAATAACG:1 + chr3L 19984540 5' + invader3 456 1 66.34 GGATCAATAACATAACTTTGGTTACATTCAAATAATAATTGAAATAATACCCCAGAAACATGATAAAATTTCGCATTCGCATTCACACTAACTGAGTAACG:1 + chr3L 23324994 5' + INE-1 535 1 54.46 ATAGTAAAAACAGTTTTTTGCTCTTCCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chrX 6457940 5' - hobo 2889 1 75.25 CTGCATAGTGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTTTAGTGTCTTTGGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAG:1 + chr4 872519 5' - Tirant 382 2 62.38 ACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAA:1 - chrX 22574693 5' - 297 6927 2 76.24 CAGCTGTGCTGTGTTTTATGGCCATATGTGCTTGAGGGTGGGGTTAAAACGAGCAGAGATTTCTAAAATGTCCCACGGCCACACCTTCCGCCCAACCG:1 + chr3R 4675894 5' - Cr1a 4427 1 75.51 ACATTAATGAAAAATAACAAAAATAAAAAAAAA:1 + chr2R 21418291 5' + Doc 4690 6 72.73 CAAAAATGTATATGAACATAATGATTTTCATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACT:1 + chr3L 13001018 5' - invader3 5417 2 74.26 CCAGTTATCACTTGAAGATAATATCCAGAACATTGAAAGAGATACCAGTCTATGACGCTAAGAACAATCACAGGTGCTCCCCTTGTTAAAATCGAAATAAA:1 - chrX 7587106 5' + G3 4341 1 73.27 AGAAAAATACACAACAAAANAATACGGAGAAACGTTAATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATT:1 - chr2L 8708735 5' - P-element 2697 1 37.62 TTTCACACAGTTTTATAGAGTACTTAGATGCACTCGAAAAAATCATATTAAATGATTCACACCGAAAATGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 - chr3R 17971743 5' + 412 6 2 77.23 GTAGTGGACTGTATTTATTTGATAGACGTTAATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGCCCTAGTGAAATCTTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTG:1 - chr3R 19450150 5' - roo 8594 1 60.40 AAATCCAGTAAAAAATACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3R 11052088 5' + blood 7031 2 57.43 GAGTACAGGTTACGTATACGCCACCGTAGCCGCGGTGCTACTCGTATCGCAAATTGACTGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGC:1 - chr3L 15884996 5' + Doc 4550 1 69.31 TTCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:2 + chr2R 17963253 5' + blood 7065 2 82.18 GCACGAATATTTCACTGGTAATTGTACCAGTTCCTAAAAATGGTGAAATACCAGTGAAAATGGTAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:2 + chr2L 20619976 5' - roo 401 1 65.35 TGGCAAACTGAAACAAAGGAGCACTGCCCCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3R 11607966 5' + 1360 46 1 71.29 GTGCCAAAATGTGTGTCAATGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAG:1 + chr2R 16217472 5' + roo 358 2 80.20 ATGAGATATTATTGCCGGGCATCGAAAGCGTTTTATTGAATGACATCATTGAATGCTGATGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAG:1 - chr3L 20600275 5' - Chimpo 4014 1 59.41 GCCGCCATATTGGAGTTCAGTTGCTTTTCAAAAAACGGAAGCGGTTAGTGCATTTCGGTGCCAGCAGCTTAAGACCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr3R 20696559 5' + jockey 11 1 74.26 GTAAATGAGACTTTGAGAAAAATGGTTATTTATATGCAGAAATAAGGCGAATGAAAATGTATTCATGTTATATACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGAT:2 + chr2L 13422218 5' + F-element 4320 1 69.31 GCATTCCTTTGGTTTGTCCATTTGATTTGATTTGCCTTTTCCTGCATTCCTCGCTTAAGCCCTCGCACCACCGCCACGTTCCCACGTTCAAAGCTC:1 - chrX 11506332 5' + Idefix 7061 2 55.21 AACTCCTTCGATAATTATTTATATATATTAAGCATATAATTATATTTATGAATAGGAATAGGATACAAAATCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3L 17701510 5' + roo 7 2 65.35 CACACTCTACTGCATTTTAAGTGTTAAGCAGCAAAAACAAAACACTCACGGCACTCACACACCAATCGCAGCCGCTGAAGAGAAAGAGCGAGAGAGAGAGA:1 + chr2R 14711398 5' - Cr1a 293 1 69.31 ATCGTAAAACCCACACTGACTCCTAAAAAAGTTCACACGCTGAAGGGGAAAACAAACATATAATTAATAACAAAGGCTAAGAGGCCAAAAATCAAAAAAAA:1 + chr2R 21886452 5' + Transib5 16 1 53.47 TGCATAACTCTATGGAGTANTCTGCTCTTCAAACCGCCTGGCCCTTGGGTAATTTATATGCTATTACTAATTTTGGTAATGTGGTAGGATGAACACTCATA:1 + chr3L 13569705 5' + invader3 5187 2 76.24 CCAGGCCATTTGAAACAAGAAAAGGTTTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGAT:1 + chr3R 7513931 5' + diver 5939 2 73.27 CAATTTGAATGCCCAGCGGAGCGATCTTTTTATTGATGCGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chr2L 16358176 5' + hobo 38 1 59.41 TGATGACAACTTCATACCCAACTCAGAAAAACTATGTTGAAATCTTTTTAACATGCATCACCATCTGATTAAAAATATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCA:1 + chr3L 20454503 5' + invader4 1 2 78.22 TCCTCCTCTTTCTTGGCCTCTGTGGTTTATCGGGGTAAAGGTGTTAGTTTTGAACTAGCTTGAACGCAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr2R 22856502 5' + 1360 8 2 56.44 TGGTTATTGCATTCGTCCTGATTGTCAAAGCTTGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTA:1 - chr3L 3757437 5' - roo 9066 1 74.26 TTAACTAGGGTCCCAGTGTGACTAAATTGTCTTCCTCCTTCGTACATTATCATGGTTGTGTAGTTTACTTATGTATCGCTCAGCATTTGACTTTATTTCGT:1 - chr3L 27358392 5' - G3 4353 1 56.44 CATTTTCACATCACTTTCCCGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:2 - chr2L 15898831 5' + F-element 31 1 62.38 CGTACGGTGTAAGTGGTTTGAAGCTAAATAAATGACTGGGAACAGCCTAGAAGAATGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAGGTATAACTTGATTCGA:1 + chr3L 18461337 5' - Ivk 4906 1 52.48 ACGTAGAGATCATGCGAGAAAAAATCGGTGAGCGTCGGCCATTTAGCTGACTTCGGCTCATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - chr3R 3847175 5' + P-element 18 1 63.37 TTCCATTTCCATCTCAATTNCTAGTGCTAATCTAGTGCTAATCAATTTCTAGACTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 + chr3L 17140597 5' + F-element 33 1 53.47 GGGAAATCTGTACGATGTAAAACAATAAATTTATCATTTGCATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATAT:1 - chrX 18321449 5' + invader2 37 2 62.38 AACTTGGTCTTAAGGCATATGTGACAGGTGGCATCGGGGAAGATGTGTGTACCGATCG:1 + chr3R 17908075 5' + Osvaldo 454 1 60.34 AATATATTTCCACATATACACTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3R 12944673 5' - roo 9042 1 60.40 ATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGG:1 + chr2R 6085998 5' - 1360 3147 1 69.31 ATGCAGCTAGACTTTAGAGGCTAACTATTAATATATTTCCACATATACACTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:2 + chr3R 12944644 5' - roo 408 1 82.18 AAAAGGGCGAATAACGGGGTGTTCGAAAGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGAAAGATCGCTTAAT:1 + chr2R 9633232 5' + F-element 136 1 69.00 ATTATAAAAATTTAAAAATAAAATAAAAGTGATTTAAATCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3R 12944738 5' + roo 8702 2 67.33 TGCAACGCATATTTTTACATCACTTCTGTTTGCCTTTCTCCCAGAGCCACAGCTCCGCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr3R 12199840 5' + jockey 26 1 58.42 AGAAAGGGGTAATAGTAATTGAAGGTAGTTGCTTAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTT:1 + chr3R 22869388 5' - Bari1 1670 1 60.40 AGTATAATAATGATAATTTNAAGAAGGAGTATTGGTGTTACATGGATTGTGGATTGATAACAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chr3L 7345440 5' + pogo 10 1 68.32 TTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr2R 9870994 5' - roo 366 1 67.33 CACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr3R 8765550 5' - roo 9030 1 68.32 TTAAGATCATTCTTAAGATAATTTCTTTTTAAGAAAATCTCTCGTGTTCATATTAACTATATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAA:1 - chr3R 19507431 5' + mdg3 5181 1 67.33 AAATTTAGCAACATAACCGAATCAAAAAAGGGACCTTTGCGCACACGGACATAGACATCCTCCTGATATCAGAAATCCTTTTCTCCTCCCGGTCCAACTTC:1 + chr2R 14626992 5' + G5A 132 1 54.46 TGATCAAATTCTCATCAAGTTGTAAACCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3L 20354056 5' + 412 7104 2 74.26 TCAGTTAAATAATTAGTTCTAATTACCATTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3L 21519031 5' - 1360 3343 1 74.26 ACGACTGCTGTTGCTCCTTGGAGGAATTCTGCACCACGATTTCAATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATG:1 - chr3R 24039013 5' - F-element 4351 1 56.44 CCATTCATATCAGTACAGAATATTATCAATAAAACAAAAGGGTTAAAATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 - chr3L 12303454 5' - blood 351 2 53.47 CTGACAAAAAGGTGCAGAAATTTTGTTCTACATTGATTACATTAAAAATACTTACCACTTAATATTAATACTAAATCTATGTCCAATCCCCAAACTCACCC:1 + chr2R 18922385 5' + TAHRE 10297 1 60.40 AACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTATTGTCTTATAAATTTTTCACACGCCGCGAGATGAATACTCTAATGACAAA:1 + chr3R 22232287 5' - 1360 406 1 96.88 CTACTTGATAAAACCAAACACTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 - chr2R 10353319 5' + blood 7042 2 56.44 GAAGTGATGTTATTTTGTTNTGAAAAGCAATTAAAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 - chr2R 672852 5' + F-element 23 1 62.38 TGCCCAGGAAAAGGATAACTACAATAAGGCTATAGCAGAAATATTAAAATTGCAGCCGTATGAAAAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 - chr2L 23350539 5' + F-element 21 1 65.35 GTCAGTTGTTGGGCGTCTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr3L 699765 5' - P-element 2829 1 22.77 CAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3R 7869133 5' + 297 6628 2 72.28 GGACACTGCCTTATGGGCTGTCATTTATTTGACCCGACTCACTCACACATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAAC:1 + chr2R 21433134 5' + HMS-Beagle2 23 2 56.44 AAGGATCCATTTTGAAAGGATTGCGGTCGAAGCAATATACTAGTCGGCTTATTCAAGTGTACTGGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 + chr2R 10353251 5' - blood 7378 2 39.60 TACATTGCTGGTAAAAACGCGGCCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chrX 11025574 5' - hopper 1409 2 64.94 CTGCCGCAGCCATTTGCACACGCTCAAATCTCAAATCTCTGGTCGCAATTCAACCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 + chr2L 10898384 5' + jockey 4693 1 57.43 TGACAATATATGTATATGTATATAAATATTTATAATAATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 - chr2L 20118442 5' + copia 40 2 72.28 TTCGCAACTAATTAAATTGTGATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3L 9928514 5' - roo 397 1 64.36 CCAGGTAGCCAGCCAAGCGATAATTATGTCTGAGTAGCAATGAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAA:1 + chr3R 30915758 5' + HMS-Beagle 6683 1 58.42 TATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACT:1 + chr3R 23020835 5' - INE-1 557 1 48.51 CCAACAAAGCAGCTAGACGNCAAGAAATAATAAAGATAACTGAGCAGTTGATTGAAGCAATTAACAGTGGCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTG:1 - chr4 1038425 5' + Tc1 205 2 72.00 TCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGG:1 + chrX 23280906 5' - 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chr3R 17660540 5' - roo 9033 1 64.36 TTTTGGCTGTTGACAGTTCTTTGCTTCATTGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAG:1 - chr2L 5403656 5' - HMS-Beagle 6674 1 71.29 TTGAGATGCTAATGGTACAATTTGAACCTATAGTTAAAGTTTTCTTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCT:1 - chrX 4022946 5' - Porto1 214 1 55.45 TTCTCAACTTTTGATACCGCTTTCTCAGATAATGAGAGTGCATGGTAAATTATAATATAAAACAAGAGGGAACGCTATATCAACACATTTTTTAAAAGTGT:1 + chr2L 21284560 5' - INE-1 260 1 75.25 AGTCCTTTTCCGAAATTCCCCGGTTTCAGATGAATGCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTAT:1 + chr2L 14812781 5' - Stalker2 7518 2 69.31 TACGACTCGCATTGCCAACATGCATCGGCATCTAGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr2R 19840206 5' + roo 42 2 66.34 TCGGTTTATTATGATAATAAAAACTTTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3R 17003314 5' + pogo 44 1 70.30 AATAAAGCCATTTACGGTCTATGGGCACACAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr3R 1694017 5' + F-element 56 1 95.83 AAGGCAGGTGTTCCCAATCGACAGCGCCCCCTACCCCGACTCCCCCTCTCCCACTCCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTC:1 + chr3R 23330578 5' - accord 476 2 57.43 GGTGGTGTCCTGTGAGCAGGGTTGCGATCCTTGTAATGAGTTGCTAATTAGATTTGGGGAATGTCTCCGACTTGCTGAGCTGTTTCCGCCGACAATGTTGC:1 - chr2L 5933419 5' - gypsy5 7098 2 53.47 TTTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCG:1 - chr3R 15021690 5' + invader4 2746 1 45.00 CCGCTGACATTTGCATGTTTTTTTTTTATCTTTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 23338281 5' + roo 8708 2 76.24 CTAGACCGATTTTGGAGAGAGATGAAACTCCTGAGATAAAAGCACCGAACAAATACTAAAAGCAAGCTTCGATAATTCTTAAAAAACAAAAAAAAAAACA:1 + chr3L 1008985 5' + Doc 4702 5 46.00 ATGCTCTTCCTTTTTATCCCGAAATGGAGCAGCCCAACACACATATTAGTATGTATTTGTGTTTATGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3L 14594208 5' + hobo 3 1 75.25 GCACAACACTTGAAAATATTTTGTATATTTTGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 + chr3L 10701725 5' + roo 8709 2 78.22 GCAATATTTTCGGTGCTTTTGGCTTTTGTCCTCAAAGTCGTGGCGGTTACTGCCGATGACCCCATGGATGACCCAGGGTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAA:1 + chr2R 14349087 5' - mdg3 248 1 76.24 AATTCAACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2L 12958912 5' - roo 9042 1 56.57 TGACCGCAGTCGGTAAAGGTAGCGTTAGTTGGCCCATACAATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr3L 13785370 5' + pogo 32 1 60.40 TTTTGTTTATTTCGTACACTAATAAAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTA:1 - chr3R 7513961 5' - diver 6061 2 80.20 ATGGGGGCAATAACGTAATNTCTTTCCAAAAATTATACCTGTTACTCGTAGAGTAAGACGGTTATACTATTAGGCATCGAAAGATATTTATTTATTTTTAT:1 + chrX 22516497 5' - mariner2 831 1 67.33 TTTGGGTCATCAATATTTAAATAATAATTCGTTTCTAGATCTGTACGCTGAATCTCAACCTTCTATAGATCCTGAGATCTTGACGTTCATACGGATAGACG:1 - chr2L 21370248 5' - INE-1 128 1 67.33 TATCTATTAATTAAATAAACGCTTTAAAGGTGGCAATTAGGGAGGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCT:1 - chr2R 7546325 5' + hopper 27 1 52.48 AGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGG:1 - chr3R 15790061 5' + flea 4745 1 71.13 AATTCCCAATTAAGCGTCTGCCGAGCCAAACAATGTGAAACGGGCTGTAGATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTC:1 + chrX 11032180 5' - invader3 5436 2 50.50 CAGAATCGAAACGTAAACAGTAAACACTCCATATCAACGTAGTACATAAGAATTATTTTTCCATATGTATGCACATAAGCATAAGCAAGAAGCGCTCTCGC:1 - chrX 18702092 5' + Tom1 200 1 64.36 GCGCTGCAAAGTATGCAACNCATATTTTTACATCACTTCTGTTTGCCTTTCTCCCAGAGCCACAGCTCCGCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAG:1 - chr3R 12199853 5' + jockey 12 1 71.00 ATAATTTCCCCCAGTACAGTATTCTTAATCTTTTCACTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAA:1 - chr3R 12285474 5' + I-element 205 1 63.27 AAAGGGGTAATAGTAATTGAAGGTAGTTGCTTAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTG:1 + chr3R 22869390 5' - Bari1 1668 1 62.38 GTGTTGCAGAACAGTGTATATCGAAGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGA:1 - chr3L 23773409 5' - Tirant 88 2 75.25 ATTGGAACAATTATCAGTTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 11916572 5' + roo 52 2 79.80 TGTTTGTGAGTGTGTGTTTNTGTTTGATAAAATGCGATATGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr3R 29287501 5' + hobo 34 1 61.39 TCTACGGTTAAGCACAGTACAGTTTTCTTTGGCTCCTCCAGCATTCCATCCTTCTTATCTGTTCCACTGAAATAAGCAAAAGTAAAGTAAAAAAAAAGAA:1 + chr3L 25255303 5' + F-element 4681 1 65.00 AACGAAAACTACGGATGGAGCTGGGACAATGTGGCTTTTAAAAGGGTACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 + chr3L 10474139 5' + copia 31 2 59.41 TGGGAAATGCCTCATAATGGGCTCGACACCGGAAAGAGACCCAATAAAATACACAACACAGATATTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACC:1 + chr3R 18542177 5' + pogo 1906 1 74.26 GCCTTAGTTCAAACTTTCTTTTTACCCTTCAATCACCTGTGCTTCGCTAAATTATTAATGACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCA:1 - chr2R 17558511 5' - Stalker4 227 4 60.40 GTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr2R 11941055 5' + 297 44 2 74.26 AAAACAAACAATAAATTCTAGCCGATGGTACGAAGGCAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGTTGTGCGTGTTTTGCGTCGAACGTAATT:1 + chr2L 5428504 5' - Bica 4620 1 80.20 CTCGACCACAACGACAACTGAGGAACCCGCATCCACAATAGCACTCCGTTTGGAAAAGTACTGGGCAAGCTCGCGGACAATTACAGCGGTGCGATGCTT:1 + chr2R 17136638 5' - 3S18 5872 2 59.60 GGAATGTCTGTCTGACTGGAATGTTGGTATTTAATGGGCATCGGCGGTGGTGGTGTCGGGTGAAGTGTGTGTTTATTGGTGTAGCGGAAGTTGTTGTTGG:1 - chr3L 24054224 5' - Porto1 439 1 68.00 ATTGGTTCGAAAATATTTAATCTCATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTA:1 - chrX 7292717 5' - 3S18 6052 2 76.24 CCTTCTCGCAAATCCGGCACTTGTAGNTGATGATGTAGANCTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATNAGGTCCCGTGTAAGGNGGCTCGAGTGGTTTC:1 - chr2L 15110479 5' - Chimpo 3985 1 71.29 ATTCTTAAAACCAAACTGCAATTAATCAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACACCCACG:1 - chr2L 17677791 5' + Tirant 8118 2 67.03 GTTGTCCGTACCGACTTATAAATGCGGTTTAGCTTCCATCTGGTTTTGTCATAAGTGTGTGCAGAGCATACCCCCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3R 19963482 5' + 1360 1 2 63.37 AGAGATCAGACACTATTATGTTCGTCGTATTTTTCACTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTATCGCGTATTCCTCTTTTCTTATG:1 + chr3R 30779608 5' - invader3 173 2 63.37 TGTTGGTTTTGGGTGCCCAATTGAACCGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACT:1 + chr3L 807028 5' - Chouto 1 1 75.25 AGCCATCGTGCTAAACGCGCATAGACAAGTGTGATCCCCTGCGGATGCCAACAGAGAGGTTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGAT:1 + chr3R 12136782 5' - Quasimodo 125 2 64.36 TAAGAGGCACAATTGCTGCCGCTGACAGAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGG:1 - chr2R 6918632 5' + accord 44 2 72.28 TCTTCTTTATAGCTTCCTTCATTTTGATTATAATCCTTTCGAAACTAAAATTATATATTAATATATTGCCTTTTTAAATATACGAATTAACTTAACCAATC:1 + chr2R 25086336 5' - HB 283 1 70.30 ATGCAACTTCGAATATAAGCATGTGCGGCAGCAAACAATGGGTGCAACAACTATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTG:1 - chr2R 13653445 5' + F-element 11 1 73.27 AATCTATCGCTCCATCAAAATGTTTTATTGTAGTTAATTAGCATTCCTATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 + chr3R 13913024 5' - mdg1 370 2 73.27 AAATATTGAATAATTGTGCNCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr2R 13763188 5' - roo 9038 1 57.43 AAAAACAAATTTTTTTTTATGATTTTTGTGTTTGTTGTATGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:2 - chr3L 3849614 5' + 412 7087 2 59.41 AGCCGCACGAGCGATCCCTGGTTTTCGAGATCTGCTGCAACGATGTGGATGGCGAGGATGTGGAGGAGCAAGACAAACGAATAATCATTAATATTATATAT:1 - chr2R 9688841 5' - Tc3 259 1 59.41 AGTTACGAGTAAACTCAGGGCACGTCGCTTGATTACATTAATTATTCCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 17660474 5' + roo 28 2 57.43 GAGTGTGGGTCTTAAGCCCACTTCGTGGCTGTGTAATATGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTACGTTTGAA:1 + chr2L 15531809 5' - Stalker2 355 2 67.33 GTATTGAGTAATGCATTAAGTGAATTAACTTTTAGTGGATTCTTAACTATATTCTTTACTACATTCTTAATCAGGATCAATAGCCGTG:1 - chr2L 5608690 5' + INE-1 90 1 75.00 TACTATAGTATTACTTTGCATGCACTGCCTAGTTTTAGCACTCAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 14088952 5' + R2-element 3585 5 78.12 TGTCATTTATTTGACCCGACTCACTCACACATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACA:1 + chr2R 21433152 5' + HMS-Beagle2 41 2 66.34 ATGGGTCAACAAACTTGCGCTTGGTCTTTGTCTCTGGAATCTGTACGCTGAATCTCAACATTCTAGCTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGA:1 - chr2R 5296378 5' - INE-1 134 1 86.14 AACAAATCCGTTTAGGGCTTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:2 + chr2L 21086023 5' - roo 9044 1 58.42 AGAATTTCAATCATTTTCACATCACTTTCCCGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 - chr2L 15898842 5' + F-element 20 1 73.27 ATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCTGTTTAAAACTTCAACTTTAAA:1 + chrX 12657098 5' - transib2 157 1 57.43 TTAGTTGTCTTTACATAACATTAAACGAAAAGTTTTAGTTTAATGTTATGTAAAGACAACTAAAAACAAGAGAGAACTCGACCATAGCATTCTCTCTTGTT:1 + chr3R 6136461 5' + INE-1 580 1 53.47 GAAAATCTTGAATTGGGTTCATTTCACTTTATTTCGTGCGAATAGAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGT:1 - chr2L 5510549 5' + F-element 4212 1 55.45 TACATCTTAATAATCTTAATTTCTAGTCCTGTTCAAAAATTTCTCATGCAAAAAAGATTTATCTTGGATTTAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTGACTAT:1 + chr2L 4224118 5' - Tc3 1713 1 63.37 AGAAAAGGAGGCCCCCAAATGTATGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr3L 13895353 5' - hobo 2915 1 53.47 GGCCGCCGACATTTTTAAAGCTTAACAGCATTTTTCCACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:2 - chr2L 18248078 5' + blood 7 2 72.28 TTTCCAGTGTCATGATGCGAAATTGACTTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGC:1 - chr3R 22869436 5' + Bari1 47 1 72.28 AGCTCAAGTTGAGATTCAAACTCTATCGCGGGCCTGTATGCCTGTATAGATATCCGAGTTTCGATGGAGTGTATGAGTGTGTAAGCTTATGAC:1 + chr2R 9341280 5' - mdg3 74 2 67.74 GCCGGGTTTGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCA:1 + chr3L 16282365 5' + gypsy5 6972 2 55.56 AGTCCTGTGGCAAACACTGGGAATGAGAGCGGGGCAAAATGGTAGGAAACCCCGGGATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1 - chr3R 13739755 5' - Burdock 6373 2 61.00 AATTACCACCACTAACTGAGTAGCTGCCAGTTAAGGAGCTCGTATATAAATATATATGTCGAAGAGTCATGAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTC:1 + chr3L 18122294 5' - invader1 3988 2 54.46 TTGCACTTCTTATTGATATTAGGCAAAACGCATCGGCCGAATCACACGCACACAAATCATTTCTCACTCCACAATAGACGAACACTTTGGTTAGATTTTGC:1 + chr3R 21349213 5' - transib3 378 1 55.45 AGGCAAACAAAACGCAGCTCATAGTTTGGATTTCAGAATGGTGATGTCTCCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATATA:1 + chr3L 10043563 5' + G6 1905 1 50.50 GTAGCACCAACTTTGGCCATAAAAACCCGAAAATAGCCATAATAATGATAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 - chr3R 12767354 5' - blood 355 2 56.44 ACGAGTTTTTAGAAAATGGATGGGTAGCACCTCTTACTCATCCTGAAGATATACTACCATATAACCTATATATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTG:1 + chr2L 5423704 5' + gypsy10 5648 2 79.21 GCGAGAAAAACTCCATAAAACTTTTCTTTTAATTAAAACATATTTTACATACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr3R 12063735 5' - 412 466 2 56.44 GACCGCCCATACAATTTGTTTCCCATATTAATTTATCATTTATAAACGATTATTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3L 7099575 5' + roo 8688 2 57.43 TTGCGAACCCAATGAGAATCGAGCTGGTATTTGTTGCCAGCCTCACTATTTGTACACCGCCAGGACACGATATTTATCTGTGGTTTTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 5045951 5' - Quasimodo 44 2 73.00 TTTAACACTTCAAACTTAACTTAGATACAGCTTGATCAGTACAAAAAAAATCGTTAAGTTTTATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chr3R 25580995 5' + pogo 12 1 46.53 AAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGGTTTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCATTTAAGACGCCGCAG:1 - chr2L 23390132 5' - rooA 7468 2 53.47 AATTATTATATCTAACCTAATGTAATTAAAGGCTAAGTTCATTCGAAAGAGCTACAGCGACCAAGAGAGAAAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCG:1 - chrX 10237066 5' - blood 167 3 49.49 GAGACCTCGACCATCGAAATCCATCAACAATTCGAGCGCATAAAAAGTGGTTATGACCCAGCGTTCGCATCCACCATCCGAGTAACAGGTATCTGATAGTC:1 - chrX 3235756 5' + INE-1 549 1 70.30 AATCTATATTTCATTCATCATAACTAAATATGCATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAG:1 - chr3L 20454592 5' - invader4 282 2 72.28 AATTGCGTTTTCATTTAAATGGCGTGCGGGAAAAGTTTTTCTGATTTAGTGAGCGCTTTGAAGCAAGCGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAAT:1 + chr3L 8252167 5' + copia 4879 2 69.31 AGGGGTTCCTCCTAATGGCAATAGTTGTTTGTTTTCAATCGTTTTTATATGACTAAAAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAAT:1 + chr2R 18188299 5' + Juan 4045 1 58.42 CTTTTGCCACCTCCTGCTCNTTTGTGGCACACACACAAACACATATAATAAATAGGTTTTTCGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCTTTGTCAAAGGAGAT:1 - chr3R 13629413 5' - X-element 4523 1 62.38 CATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATT:1 - chr3L 3540186 5' + mdg3 36 2 70.30 ATTGAACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:2 + chrX 11017007 5' - roo 357 2 74.26 AACAATGCGATTCACGATGTACAATAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr3R 23638106 5' - pogo 2062 1 73.27 CAGAGAGTTTCCATGGTTTACTGGGTTAAATTTAATTAATTTGTCTCGTCGCCCCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 + chr2R 22553073 5' - 1360 3367 1 56.44 GCTAGAAACACAAGCAGGATATATCAAGGAACTGTTTTGCTGTGCGGACTATTTTGTATGAAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATTAAAA:1 + chrX 21101928 5' + S-element 124 2 56.44 GATGATGTTTTACTAAATCGAATAAGTTATGATGGACTCAGAGAGGAAGATTTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGG:1 + chr3L 16250532 5' - G2 89 1 55.32 GTGCCAACGCTTGGATTGTTTAGCAATAAGTGCTTAGCATTTGGAAGGCAAATATATCCTGATCTCCCTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTT:1 + chr2R 8087005 5' - flea 251 2 74.26 GGGTTGTCTTAAAATCCGTNCAGGCAAATCGCATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 + chrX 21584049 5' + F-element 66 1 74.26 AAACTTCACCCCCACCCTANTCCTGTGGGTCAGCAGATTCGCGACAACACAGAGCCATACATAATACTTGATTCTCCTTTGTAATAAGTCAGTCTTAAGCT:1 - chr3R 28043299 5' + gypsy5 7206 2 75.25 GATTTCGAGTCATAATTCTTGCATCACTCCTCTCCCCCAAATGGAGCATAAAAGTTTCAGTTAATTGGTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAAT:1 + chrX 4264323 5' - mdg3 5494 2 72.04 ACTTGCAGAGCACAGTGACATACGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 - chr3L 8268194 5' - hobo 2886 1 76.24 ACGCGTCCAAAGTTTTGTTTATGCCCCGTCATTTACCCAGATACATTGTCCCTATCTACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTC:1 - chr3L 1121114 5' + R1A1-element 1 1 60.40 AAGGAATCCCTGGAACCACNTCATTTCGTAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAACACGGTTTTATGAAAAGCAGATCAACAACAACTAACC:1 - chr2R 17097199 5' + Q-element 226 2 73.27 GCAGGTAGCAAGGATAACCCTCCGCCAGCCACCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTA:1 + chr3L 6023295 5' - hopper 1368 1 69.31 AGTCAAAGCATTTGCTAAGGAAAATTCCCAATTAAGCGTCTGCCGAGCCAAACAATGTGAAACGGGCTGTAGATTGTGGACGCCGAAAAATGAATA:1 + chrX 11032158 5' - invader3 5463 2 68.75 GAATGTTTTATATACATTTTTTAAAAAGGTTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGA:1 - chr2R 22134242 5' - opus 7459 2 75.25 GTGGAAGGTCTTTTGCTGGTTCTTGTGTATTTTATTGGTATAGCGAAAGTTGTTGTTGGTGCACGTGCAGATGGATTTGGCGCACATTCTGCGCTCCTGTG:1 - chr3R 21360282 5' - Porto1 397 1 73.27 ATTACGATCCTGTAACTTGNGAACTACGGAAATTTGATTATGTCGCTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTG:1 + chr3R 25086224 5' - gypsy11 4024 2 55.45 CAAACTAACTTATAGATATTAAAAGCGATATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAA:1 + chr3R 19137094 5' + Bari1 52 1 96.88 GAATAAGCTGCTTAATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 - chr2L 18655217 5' + Doc 29 1 51.49 CAAAGCTTTAAACAAGCCTATATACTATACTGCTGTTATTTTTTATATAATTTTTTTTT:1 - chrX 18209900 5' + Tc3 77 1 89.83 ATTGCTAATTTTGTGGCCATTACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTATCAATTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 + chr3L 8039335 5' + hopper 18 1 47.52 CACACACACACCACATATGTTCAACCTATTTTTTTGGTGCTGCCTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr2R 18766273 5' + hobo 33 1 59.41 GCCACTGCCACTGCTCAACTCAGCGCCCTCCTGGCCCCGTTAACATTTCACGAGCGCCAATTTCTTTCCTTCATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGAT:1 + chr3R 7305405 5' + Rt1b 4773 1 72.00 TTTTGGAACTCGCTGCCTAAGCTTCTTGTTTTGCTGGTAGTGCAGTAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCG:1 - chr3R 3617173 5' - F-element 479 1 71.29 TAAGCTTTTAAAATAAAGAGAACTTTTTAAGTATAAGTGTGCATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAACAAAAATTCGAGAGGGCCTGGAGCC:1 - chr4 424925 5' - 1360 79 1 68.32 AACAATATCAAACAATAAAAATAAAAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAACCGGAAGCGATATATGATCGCCCACTTATGAAGCACACTACATAAATGC:1 + chr3L 14166059 5' + gypsy11 156 2 63.37 ACAATTAATTATAAAATTCATAAAACAAAGCCACAGGCATAAAAACGTACAAGAAGGGAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTA:1 - chr3R 17249848 5' - copia 4956 2 58.42 AATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATT:1 - chr3L 3540207 5' + mdg3 29 2 50.50 TTTTTGGCATTCGGTTGTACTGCTTTTGGCAGTAAATGAAATTAAATCGATATTTCTTATTACAGTATAATGCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr3L 18762155 5' + pogo 14 1 63.92 CCACTGGCTTCCATAGAGCTTTAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chrX 15546197 5' + blood 52 2 75.25 TAGTTAGCCAGAGTGGAAAAACAAAAAAAAAACAAAGGCAACCTGAGATGGAAAGTCTGTGGGGGTTGGGGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 - chr2L 12511632 5' - copia 249 1 74.26 AGGTTTAAGAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2L 8577263 5' - roo 9049 2 56.44 GGTCGTCGTTCCCGTTGTCGGTTATTACCGTTACTCTTTGGCGGGTGATTTTAGGGGGTGGCGCTTGGGGTCCACTTGGAAAAAAAAGAAAAACAAAATCA:1 + chrX 6523374 5' + gypsy7 5008 1 54.46 TCTGAAAGCGGGGATGCTGTCTTTGAAAGATACTGTCCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 - chr3L 19861838 5' + 1360 39 1 66.34 TGTTAGTCGAGAACATTATATTGGCATTTTAGCCCACACAGTACGCCCCTACGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chrX 10286136 5' - roo 388 2 54.00 TTTGCTTTTCGTCGTTTTTAAGAGACTTGAGCTGAATGAGTCGCTACCAACTGTTGCGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTAC:1 + chrX 5678813 5' - opus 7114 2 60.40 TCAAGCGCAAGGCATCTGGCCGAAACAATGAAAACAGCAAAGCTCAGAAACAGCCAGCCATCGTGCCAAAGTTAAGTACATAAGAGCAAAGCAACGTCTCT:1 + chrX 736308 5' + Tabor 7100 2 67.33 ATTCAAATGAGCACTTCAAGGCTGAGATTTGAGACCATTAACTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1 - chr3L 12634221 5' + BS 5032 1 63.37 CTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 2022249 5' - roo 9028 1 69.00 ATGATATTATTGTATGTATAAAAGCCATACAAAGCGCGCTCAAAGTTCAGTTATACGCCATATTTTATGAACAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1 + chr3R 27928884 5' - mdg1 7456 2 71.29 ATGTGAACGCTGAGAACGTTCGGTGAGATTTCCACTTGGTGGGCGAGATCTGTTAAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGG:1 + chr3L 7180365 5' - X-element 4418 1 66.00 CATTTTTAAAGCTTAACAGCATTTTTCCACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chr2L 18248069 5' + blood 7027 2 63.37 ATTAGAAGTTCTTTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 - chr3L 10474208 5' - copia 223 1 61.39 TTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTC:1 + chr3R 11151819 5' - mdg3 217 2 54.46 AAACCTCCGTACAACGTTGATATAATTCAGTGTACAATTGTGTGAGTGCAGTGCTAACAGTGTGTGTGTTGTGTGTGTTACAATGTTAAAATTCTTAGAAA:1 + chr3R 10112406 5' - ZAM 8210 2 54.46 AGTTTATTTATTTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:2 - chr3R 27169482 5' - 412 7504 2 64.36 TTGGTCAAAATCACTTGGCTCTTAACGAATTTCTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACT:1 + chr3R 12321412 5' + jockey 4714 1 66.34 GTCACTCCAAAATACAAAAGGTATTATCTCAACTTTATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATC:1 - chr3L 15452954 5' - accord 7381 2 73.33 AATCTGTTAAAACCAGAAATAGATTTGGCACCACTATACAAATTAATTAAATATAAGGAGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAAC:1 - chr2R 3111995 5' - springer 7481 2 62.38 TTATAGAATTATAAAGACATCTTTCACGAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCC:1 + chr2L 3699424 5' - mdg3 198 2 72.00 AAGTTCACGGATATGGGTTATCAGGCAACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 2022218 5' - roo 395 1 67.33 TAACTTTCTTCGACTAGATAGATGTTCGTCCTGATATGATATAATATGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAT:1 - chrX 9628987 5' - mdg3 5251 1 66.34 GTTACGTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr2L 10792023 5' + 412 38 2 62.38 AAAAATTTTTTTGAAATTGATTTTTCTTATTAATTATTAGCAATGTTTTGGCTCAAAGTATTTTTGTATAATGACAGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCAG:1 + chr2R 11983046 5' + Stalker3T 296 1 77.23 CAGGCAGCTGGAATGGGTTCCTAATTTCAAGCAGAGAGCAACTTTTATTATCATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATT:1 - chr2R 17322970 5' + Cr1a 126 1 58.42 TGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAA:1 + chr2R 5674666 5' - S-element 1673 1 73.74 ACACTGATAATTAATTGCTTCGAATGCGGCTTATCCATTACTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAAC:1 - chr3L 3242731 5' + diver 5924 2 58.42 CCAAACAGTCACTATGTTTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3L 2022300 5' + roo 8702 2 65.35 GTTAATATATGTATATGCAGTTCGGGCGCCAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 + chr3R 24976748 5' - opus 7457 2 80.00 AATGATTACCAAATTATTTATCTATTAAAAGAAAGATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 - chr3R 20420983 5' - blood 7349 2 64.36 AAACCGAAAGAGGGTAAACAACAAATTGCATACTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 + chrX 15546131 5' - blood 7374 2 64.36 ACCCGAGTACTTCCTCTCGTAACTCCTCCCTTCCCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCTACTGTTAGTGTTAAGGTAGTTGTAAT:1 - chrX 10042413 5' + Max-element 8410 1 81.82 GAAGCTCTTCGATTTCTTGTACGCACATTTTTTAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 8582630 5' - roo 395 1 65.35 TGTTCTCCCTTAAGTAAGTCACAAAAAACCTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAA:1 + chr2L 3408632 5' + G-element 50 1 69.31 ATTTTTATTATTCAATATATTTTGTAGCATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCT:1 - chr2R 10372178 5' - mdg3 5454 2 69.31 AAACATTGCAAAATGCAGTTTACATAACTATAGGATTGGATTGTATCATGTGTTTGTGACTGCCAAACTACCAAAAAAAAATCGTGTTGTCCCTTTAATAC:1 - chrX 2081939 5' - Transib-N1_DM 179 1 58.42 ATAGGGCCTGCGTTCGCAAACACCACTACATGTGCAAACGCATAACATGTGATAAATTCAATTTCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chr2R 17420806 5' - pogo 2092 1 66.34 TCACAAGTCGGACTAAGAAAATATTTCGAGGCGGGGAAGGAACTCAAAACCAGAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATA:1 - chrX 3491468 5' + invader2 390 1 51.49 ACTCTCTTTCGCTCTCGCTTCGATGACACACTTTTCGACATATTTAAGTAGGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr3R 24767786 5' - P-element 2864 1 54.46 TTGGCTTCCTTTTTTGTTAAGTACTTATTGAAATTTATATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr3L 15788429 5' + opus 37 4 68.32 AACCAGAAATTCCATTTCAAATGCCTGCGGTTCATCAACATCCGATTCAGATACCACCCACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGG:1 + chr2R 9872282 5' - roo 49 2 59.41 TCATCGAGGGGTTTTCAAGAGGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTA:1 + chr3R 7783718 5' + rover 11 2 69.31 AATAAAAAATGTTTTTACGTTTGTCCGCATTTTTTGTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 12520931 5' - gypsy11 3933 9 88.00 ATTCGGCATGCCGAATAAGCATAATATTCGATTCTGTTGGAGTTCCGCGTTTTAATCTTCTTGCTTTCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAG:1 + chr2R 24399318 5' - Porto1 4482 1 70.30 AATATTTTGTTAAATCCCCATAAATAACTTCAAATAAATAAATCATTTTTGTGTAGCCGGCAAAATGCAGCAGGCAGCGCGAACATCACTTGCAGCACAGT:1 - chrX 5032133 5' - Stalker 487 1 64.36 CGGCGGCTGCAGCAGCGGCGAAGAGCGATGCGGACGGTGAACTGGGCATGAAGTTCACATTGATGTTGATGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTTATAG:1 - chr3R 10399159 5' - Ivk 4974 1 67.33 TCAAATACGGGCTGATTTAATGAATATTTACACTAATTGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACCC:1 + chr3L 19249649 5' + Transpac 3 2 76.24 TAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 8582598 5' - roo 9026 1 68.32 TATACGCGACACGCAGTGAAACCGCAGCAAATCCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCT:1 - chr2R 13623470 5' + Quasimodo 336 2 67.33 TTGGTACCATTTCTGGTACTTTTTGGCTCATTTCTACGCATACAGTGACAGCACACTAAGCCAAATTTACAATGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 + chrX 3464188 5' + hopper 5 2 55.45 CAGTTTCAGGTGCGCTAACTTAGACACAGTGATTAATGCATATATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAA:1 + chr3L 15452844 5' + accord 10 2 65.35 GATCCAGTCCAGGAAGAACAGGATCAGCGAGAGAAAAAACCACCATTGTGGAGTAAGTGAATGAGAATGCTATAGATATCAGATACCCGTTACTAAGCTGG:1 - chr2R 17493819 5' - INE-1 543 1 62.38 TCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCAATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACG:1 + chr2L 21735021 5' + 17.6 6968 2 72.28 CACTCTCCCTGAGCGAAAATGCACTCTTCAATGGACTGTGTATGTGCGAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC:1 + chrX 16087663 5' - accord 183 2 69.31 ATGGAGGAAGAAATAGCCACCGCCGTTGTTGAGCACGCCGACGATGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAAGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTGG:1 + chrX 20473818 5' - Idefix 189 1 53.47 AAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCT:1 - chr3L 19350000 5' + 1360 3225 1 50.50 CGAGTTTTTGGCCTATGGGAACTGAAGAAACCTTACAGTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 - chr2L 20323004 5' + opus 7063 4 62.38 GTTCATTTCTCATCGTTGGAGGCAGCAGCCTGCGTCACTTTTATCTCAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATG:1 - chr2R 15295670 5' + 1360 478 1 53.47 TCGCAACACGCTGCAAGTGGCAGTGCACATTTTTATCAACATTTCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAA:1 + chr2L 17677706 5' - Tirant 8476 2 56.44 TGAGCTTGTTCCACATCAACTGGCCCACACACACACACAGGCACATTACTACATGTGCACCTAACCACATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTT:1 + chrX 17029972 5' - flea 5009 2 68.32 TTCCAGCCAAGCGCTCGAGGCAACGCACAACTTCCGGCCGGATTGTTGGCCATTTTGTTTTTACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCACCTAAACCCCCACG:1 + chr2R 19560134 5' + Tirant 11 2 70.30 ATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr2R 13763192 5' - roo 9034 1 61.39 TGAATATTTGATTATATTTGAAATTGATCGTTTTTAAAATTTTTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 9077247 5' + TART-B 10626 2 60.00 TTAAGCCTAAAACAGGATTNTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTA:1 - chr3L 19274857 5' - transib2 2775 1 72.28 AATATTTTTAAGGTACTTTTACAATAATTCGAATTTTTTAAAAAATTGATAGTGGTGCTATTTTTTCGCCTTATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTAC:1 - chrX 21100338 5' - S-element 38 2 81.19 CTTCGCATAATCGTCATAATCATTTTATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAA:1 + chr3R 20332891 5' + jockey 4722 1 73.27 TCTGGAAACCCTTCGAATCCAGCGAATGGCCATTGCCTTCGCCCGCACTTTTCGCTATATACACACTCCTATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATT:1 - chr2L 14035626 5' - flea 254 2 75.25 AATCATCCTAATTCTGGCCTGTATATTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chr3R 18549964 5' + pogo 47 1 79.21 GCTTTGAGCCGCTCTTTAGTTTGGGTTTTTCTGATTTTAACTTAAACTCATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTT:1 + chrX 4166376 5' + I-element 5317 1 51.00 CGCTTTGTTTATAGATACGGCTTATATGCTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCT:1 - 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McClintock 127 2 52.48 TCACTTTATTTAGTGCATAACTGAGTGGCCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTATCTGTTCCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGA:1 + chrX 6896984 5' + invader2 120 2 71.29 GGCTGAGAATCTAACTAAATTATCTGAGGTTGTACACGGACAGGAAACTACATCGCCTCTCAAGTATTAGACCCTAATTAACACATTAAAAAGAAAAACTA:1 - chr2L 21671283 5' + HB 1360 1 61.39 TTACGCATACGCCCTGTGTGCTGAAAATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:1 - chr2R 8526375 5' - I-element 5304 1 76.24 CACCCAAGTAACGGAACCCACGACACTAAAACTTCAGCTCCGCGCGCAACAAGCTTACGGCATAAAATAACAAGATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGG:1 + chr3L 26852169 5' + Chimpo 166 1 75.25 ATGGGATGCAAAAATATATGTACACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chr3R 30553621 5' + 412 30 2 53.47 CAAAAATCCATCTCACTAACCAGTAAAGTGTACCTAAAGGGTAATATATAATATGAGAAACTTACATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCG:1 + chr3R 17439778 5' + 1360 212 1 61.39 ATACTCATATCTATTAGGTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:2 + chr2L 4063683 5' - 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Cr1a 4301 1 61.00 CAGCCGGCGGCGAGAAGAACAACGATGCGATTGCAGAGGGGGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATC:1 - chrX 15780599 5' + Rt1b 4947 1 62.00 GAGAGATAGTACAGGTGTCNTGGTGAGGTAGCGAATAACAATTAACGAGAATTGTGGTGTCTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCT:1 - chrX 14998801 5' - 1360 3182 1 60.40 GCGGAAAGTCTGAAATAAAATACACTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chr3L 19647304 5' + pogo 47 1 81.19 GGCAAATGCGAATTCTTCAGTAATATCTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAG:1 - chr2L 19642358 5' + Quasimodo 47 2 76.00 AGCGGAGAAAGCTTTCTCCCATGTTAACATGACAGCCTACAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr3L 14594118 5' - hobo 2902 1 60.40 GTATGAATTTGCCAACGTAGGTGACGAGGCCCAAAAAACTACGATTCTCTTCTTTATTTTTGGGATTCCCAAGTTTTTATGGATACTTGCATTTGAAATAT:1 - chr2R 3914451 5' - G4 3535 1 66.34 GAAGAAGCTATCGCCGTTTCTTAACGGATGAGATATATAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACG:1 - chr2R 4500925 5' - springer 343 2 68.32 GCTATAGAAGGGCTCCAAAGGCTGGGTAGGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1 + chr3L 3880997 5' - blood 333 2 69.70 AATATTTTCAGACTCTATTTTCAATTGAAAGTGTTCAGCTCTTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3R 29608875 5' + roo 4 2 76.24 TAAGATGATCTCACTCTTCTGCCAGAAACTCTTTTTCAACGATTTTAGCATTTTCACTTTTGCCTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chrX 8503088 5' + roo 8676 2 51.49 GAAATTTAATTAAACTACGCTACTTGAAGAGTGTTTGCCTTGGCACTTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGATTGTAATCATTTAGTGAAAT:1 + chr3R 15657584 5' + Idefix 7345 2 54.46 ATAAAATGTTTCGTATGAATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTC:2 - chr3R 25086164 5' - Bari1 1674 1 58.42 TAGTTTAATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAATTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:4 - chr3L 7099648 5' - roo 9036 1 63.37 ACGAATAAATAAAGGGACTTTATTACGTTACCTTTCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTT:1 + chr2L 20560313 5' + F-element 23 1 59.41 GAAATTTCACAAACTTTTTATTTAAAACTTTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGCTGCTCCAAGTGTGGAACAC:1 + chrX 22426155 5' - 1731 300 1 66.34 AGCTGTATCTCAAAAATATGAATCCACACTTGACATTCACGTAGTACAATAAATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 + chr2L 20684263 5' + I-element 22 1 57.43 GCAGGAGATTGAGACCAATTGACAAGTCGTCAGCCGGAAGCCAATCTAATGCCATAATTTCTGGTCATACTCAGGCAGCAACAATTTTTTGTTTCAAGTTT:1 + chr3L 19641628 5' + Juan 3982 1 66.34 GGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chr2L 13566499 5' + hobo 54 1 76.00 GTAAACATAAATAATTTTTTTCAATACACTTATTTTATTTCTGTGCATAAGAAAAACATAAAAATATTTTTATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACA:1 - chr3L 3596771 5' + copia 5 2 65.35 TTGCTATCCTCCTACACTTTAACATTTATTATCCCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 + chr3L 1697694 5' + Transpac 4960 2 66.34 TAGTAATCAGCGACAGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATATTACAAGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:3 - chr2L 9045478 5' + jockey 35 1 52.48 AGCTATTACTTATTACTTATTACAAAGGGACATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTAAATCTACTTGGA:1 + chr3R 16611514 5' - Cr1a 4111 1 74.26 GGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTAC:1 + chr3R 19589943 5' + BS 5041 1 68.32 GATGTATTGTTATTTGAAAAGCAAATTTAGTCATTCGAAAATATTGCTTAAGTAATATACTAATATTCTTGAAGCTTTTTTGAATTACAATTAACTTAAAA:1 - chr3R 19533313 5' - Juan 4008 1 73.27 GGCAGTGCACATTTTTATCAACATTTCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAA:1 + chr2L 17677724 5' - Tirant 351 2 74.26 TCTCGCTAGATTTGAAACAATACTAAGTAAATCTAAAGATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACAC:1 - chr2R 4673652 5' + Quasimodo 29 2 63.00 ATGCCATAAAAATCACTCANACGCTGTAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTT:1 + chr2R 20718845 5' + BS 5045 1 73.27 AGGGAAGTAGGCAACGTTTTTATTTGTTCACTTTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 + chr3L 20049609 5' + jockey 4777 1 61.39 ATGTCCTTCATTGAAGAACTTTTCGCAGCCTTTTTTACATTGGTGCACAGCAAAAAGAATAAGATCTTCGAAAGTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chr3L 4565442 5' - copia 252 1 74.26 CACTTGACATTCACGTAGTACAATAAATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chr2L 20684289 5' + I-element 48 1 77.23 GCTGCACAGATAGAGCGAGAACGAACGAGAAGGGGCATTGCTTACAACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACATTAATTAAACAAAATA:1 + chrX 600673 5' + Juan 341 1 54.46 GCTATCATGCATTATCCATATAATTTTGTATAGTATGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr3L 3209236 5' - roo 9034 1 64.36 TAATTTACACCAAACTATGCATTTGTTGTGCAGGATGTGCTGAAAACCCGTTTTGATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCA:1 + chr3R 19483871 5' - X-element 4620 1 52.48 CTAAGCACACTTGCCGAACAGGAAGTAAATCGGCAGAAATCAAGCCCAGCGTCTGCATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATC:1 + chr2R 4500849 5' + springer 5 4 70.79 ACAATTGGTAATCTACATCAAAATATTTATGACAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTT:1 + chr2L 8282111 5' - 297 6496 1 67.33 ATACCCACACCTCCACTCATTTTTTTCTCAGCACACCCCACACACACACACACATGTACACA:1 - chr3L 10052989 5' + accord 7034 2 82.26 GTCAAGATGAGTCAGCAAAAACGCACTATCAAAATATATTTCGTGTAGTTCACCAATTTTCGTAACACCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr2L 16793739 5' + hobo 7 1 72.00 TTTCTTATTGCATACTTTCATTATACCTTTATTATTTTGAAGGGGCGGACACGATGCATTGTAATGTGCGCACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1 + chrX 15255336 5' + Tabor 21 2 58.42 AGTGGCTTCGAGCTGATCTACTTTCTGGTCTTTCTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGGACTCAGAGAAAAGCCAGCTCCTTT:1 - chr3L 3753743 5' + roo 488 1 55.00 TCAGTATTTGCTGAAAGTCAGGGCAGTACTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chrX 17494672 5' - 1360 3354 1 73.86 GGAAACAAACATCCTTCTATTCAAGATGGAATAGTTATATGCTGCATCATCTCGTGTCTGACCAATAGATCCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAAT:1 + chr3L 4009395 5' - mdg3 242 2 66.34 CGGACTACCTGATTGGTCCACCGATACTTAGTACAGTAGACAACATAGCAGCCCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCCGGACGAGATAAAGC:1 + chr2L 22256745 5' + G6 430 1 54.46 ATTCCCTAAAACTTGTATTAAATGTATTTTGTAACTACCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 - chr3R 25581095 5' - pogo 2065 1 59.41 GAGGCCTTAAGGGCCCAAAGAATCCGAGCCTTTCAGCCGGAGCATAAGGGTTTTGGCCTAGCTGCCGCAGTGGATATTCATTAGAATAATCAAATAAATAA:1 - chr3R 20208782 5' + jockey 4820 1 78.22 TGCTGCAGTCATTAAAAATTGGTTCGAAAATATTTAATCTCATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAG:1 - chrX 7292734 5' - 3S18 6069 2 59.41 CGGTGGTAGTGTGATATTTTTTTTTTGTCTTTCATATCTGACATATATACATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 - chrX 17030101 5' + flea 4775 2 54.46 TAAACTGTCAAACATTTACNTTCGCTTCCTCCATCGAAGTGGCAGTCTTAACCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2R 19840273 5' - roo 386 2 55.00 AGAGGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTG:1 + chr3R 7783735 5' + rover 6979 2 58.42 CCATTTGGAATTGATAATAAATTTTTGTTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACCGCCATGCCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCTCTGCCGTGTATCGTAC:1 - chr2R 3550648 5' - Cr1a 4400 1 65.35 AGCTTCTTATAATAGCAATAACATTCAAGAAGCCGAAAAATACTATTAACAAAATTAAATTCAATTTATCCATTTTCATAAATCCATTATGCTTTCCCTT:1 - chrX 22689676 5' - 1731 4237 1 74.00 TCAATTTCGTGAAAACGGGTATCTGCTAGTTCCATCATATAACTGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTG:1 + chr2L 12885765 5' - hopper 1107 1 60.40 GGGGGTGGCAGGTGGAGAACACCTCTTGGGGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTCGGAAATA:1 - chr3R 23338322 5' - roo 361 2 67.33 GTGCGTGCCTTTGAAAAAAAAAACCGCTTTTGTTTTTATTTGAGTTCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTA:1 - chr3L 698648 5' - P-element 2713 1 43.56 GTAGATCCCGAACGTGAACCCGTGGCTATCCTGAAGTCCGAGATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTAACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chr2R 11259628 5' + hobo 27 1 50.54 TACTTAACTTGAGATTTTTTTATTTGAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTT:1 + chrX 3243803 5' - F-element 4475 1 74.26 GTTTTTCCAAGAATTTTTTTTAACAGCTGCCCAGCTGGGGAGTTTAGAGGACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:2 + chr2L 17730410 5' - pogo 2098 1 74.26 AAACAATTGCCGTCAAAGCAGGAAAAGCAGGTAGCAAGGATAACCCTCCGCCAGCCACCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAATAATGTGTT:1 + chr3L 6023269 5' - hopper 1394 1 59.41 ATTGCGATCTAAAGAGTGGGTCAACTTGGGCTAATTGACACCGAAGTCATTTGGAGTGTTGTAATTATATTATGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAAT:1 + chrX 10451562 5' - hobo 2557 1 71.29 CGATTCAACTCCATCTACTAGCTTTCTGGTCCTCAGATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCA:1 + chr2R 10452922 5' - Quasimodo 7335 2 64.36 TATATATTTTTAGTCAATTTCGTTAATACTGTCTGTTCTCCCTAAGTTTTTTTTTTTAATTTTATTTTCCAATTCGATATTTTTAAAATGCGCGCCATTTC:1 + chr3L 25255875 5' + mariner2 25 1 68.32 GTGCGGCTCCATTGAAATATCAATTATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:3 - chr2R 6850489 5' + roo 8715 2 82.18 TAGGCCATGCCCATTTCCGGACAAAATGTTATGCAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACGGGGG:2 + chr2L 14220160 5' - springer 7476 2 67.33 AGTGTCAGCCTTACTGCGCTGCAAGCTTCTGTCTGAAAAAAAATGTTCTCTGTTAGGGTATGCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:1 - chr3L 19483039 5' + Quasimodo 6 2 52.00 ACGGCGACAAAGCAGCAACNAATATGCAGTTGCCATGTGAGGGTGTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chr3L 10363815 5' - P-element 2857 1 48.51 CAATTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:2 - chr2L 21086082 5' + roo 8710 2 73.27 ATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr2R 11941062 5' + 297 31 2 65.26 CACCAAAGTGTGCGAGAGCGAATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTCTGCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTC:1 - chr3L 22390619 5' + GATE 8265 2 79.21 AGTCAAAAAGAAAACCTTTATTAGTAATCTATATTTCATTCATCATAACTAAATATGCATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCAC:1 - chr3L 20454617 5' - invader4 307 2 61.39 CTAGTTTAGCAGTGTAGGGAGAATATTTTTGCACGCGACAAACGGCCAACGTGCGGGATTAAGGATCTGGCGCACCGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 - chr3L 13295316 5' + hopper 1 2 76.24 TTATCAACTGACATTTGGCAAAAAGTTGTGGAATTCCACGAAAACCAAACACTAGTGACAACACACATATACGAGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACAC:1 - chr3R 18094128 5' + 1360 3242 1 52.48 TGAAGAAGGAGGAACCACCNTTGTGCGGGATTCTGTGCGGAAGCCTTGTGCAAGCCCCTACTGAAACTATTTACCGTATCTCTGGAATCTTTACAGTTCCC:1 - chr3R 13932812 5' + Q-element 20 2 72.28 TTGGCCATCTACCCAGCTAGCCATCTAGTCAGCTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAA:1 + chr3R 10913154 5' + F-element 4508 1 67.33 GGAAGAAAAAGAGTAACTCTACGACTTTTTTTTCATATGTATCTTGTGCTATTCAGCGCTTCAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTA:1 + chr3R 10088682 5' - roo 480 1 57.43 AAAATCCATTATGCATCAAAGAGTATTACTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTCTTTTGCATTTTTTGTCTTTATGTTTTGTTTACT:1 - chr3R 2743420 5' + Cr1a 200 1 72.28 ATAAAAGTAAATCATTTTGATTTTAGAGATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCT:1 - chr3R 10914161 5' + F-element 114 1 69.15 CCTCAGTGGCACTGGGTGTGGTCGATTCGGTGGACTTTTTCGTTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAAC:1 - chr2L 16782161 5' - F-element 38 1 58.42 GGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTA:1 + chr2L 20360644 5' - R1A1-element 145 1 71.72 GTCCTATCAAGGGTTTTTAAGTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAA:2 + chr3R 20094452 5' - Max-element 265 2 54.46 ATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATC:1 + chr3L 16282383 5' + gypsy5 53 2 74.26 GGTTACCTCTTGTCGCAAGTGCCCCAACTCCGCCCCATTTTTTTTTATTTTTTTTAATAATATATTTTTAAGGTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATAAT:1 + chr3R 8548091 5' + hopper 195 1 80.20 TTTTATTGCCGGTGCTCTCNCTACCTTTTTCGGTTTGGAGATATATTTTTTTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGTTT:1 + chr3L 14158232 5' - G2 119 1 56.44 TATCGAGGGGTTTTCAAGAGGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTAC:1 + chr3R 7783719 5' + rover 6963 2 67.33 CAGAAAAATACAAGTCGAAAGTAGTGGAAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGC:1 - chrX 7460931 5' + micropia 5184 1 72.00 CGTCAATGCAAGGAATAGGTGAGGAATAAGGACCACTTCTAAAGAAAGATCCTTTTACCAATCAGTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 - chr3R 5348748 5' + copia 11 2 69.31 ATATGGGTTAGCCGCACTAACCAGAGAAGAATGCCCGGATAATTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATT:1 - chr3L 15701775 5' + diver2 4767 2 57.43 CGGAAATGTGGGAATGGGGAAAGCAAAACGTATTTCGTGTTGTTTTCCAACAGGAAACGGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTA:1 - chr3R 30976187 5' + Doc 4498 1 62.38 CTGATTTGCATAAATAGTTTGTTGCCCTATGGAGCTGCGAGAATGCTTAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCAG:1 - chr3R 8210803 5' - Stalker4 281 4 56.44 AACTGTCTCGTCGTGCAACAAACCCGAGATCTCACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATT:1 - chr3R 10391266 5' - invader4 3073 2 65.35 CCATAATGGAAAGTTTCTCCTTTGACAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGG:1 - chr3R 7597191 5' - Quasimodo 7021 2 86.14 TGTGTTTGAAAACACTGGGAAAAACGAATAGATTCCTTTTAGTTATTTATTTCATTATATATAATCAATTATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chrX 22666327 5' + Doc 9 1 70.30 TCCTGCGAGGATACACTGTGAATGGCAGTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGT:1 - chr3R 30620138 5' - Doc 242 1 72.28 TGTGCACAGCAATGTTTATNTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 - chr2R 9631756 5' + F-element 52 1 72.28 TGCTGCTGCCAGCCAAATTACTGGCAAAGTGTCCACTGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTT:1 + chrX 7078654 5' - I-element 141 1 64.36 ATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr3R 11052108 5' + blood 37 2 68.37 CCGTCGTGCGGTGTATAATTTTAGACCATCAACGATGCACCACATATAGCACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGA:1 + chr2R 19636369 5' + I-element 4901 1 52.48 GCCCTTAATTATCTTTACTTTATGTTTTCGTTTTTTCGAAATCCTTCTTGAGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:1 + chr2R 10956895 5' + copia 27 2 50.50 ATTACGTTACCTTTCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr2L 20560334 5' + F-element 43 1 55.45 TTTCACTTCCTTCAATTCCAATCTTAAATGGAATTAAAATTAATATGAAATTGCGATTTTATTTTAATTTTTTTTTAATTTT:1 + chrX 22735941 5' + Rt1b 125 2 58.54 TAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1 - chr3R 11151907 5' + mdg3 5268 2 61.39 CCAATGCGGCTAAAAATCCATGCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGT:1 + chr3L 6964757 5' - P-element 2834 1 26.73 TATGTTTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 2022288 5' + roo 50 2 77.23 TAAGGCAGGCCGCTCATAAATTGATTTCGATATCAATTGCTGAACTTTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3R 7469952 5' + Doc 36 1 53.00 AGGCTTGAGGGACGGGCGCTATTTCGGAGTTTCGGTCCTTTAGCAATTATTTTCTAATAGAAATATGATCATATGACGAAAACCAAAAACAAAATTGACCG:1 + chr2R 4511971 5' + transib2 107 1 79.21 AAACCCCAAATTCCAAAGAGCAAGAGATGAAGAAGTTGAGAGCTCGACTTATTGTGCCCTAATCTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCC:1 + chr3R 27495627 5' - 412 481 2 67.33 TCCAGGAGCTAGCACCGGTACCACCATCATGTCCAGAGATTACAATGTGCTCGGCTTTGCCCTGTTTACACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTGA:1 + chr3L 16792526 5' + Chimpo 4017 1 65.35 CAGATTCTTAAAGTGGTTAACGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATT:1 - chr2L 23295846 5' + micropia 48 4 74.26 CATTGCCCACTCCTCCGTAACATAATCCTGCGTCCCCTATCCAATTCGGTTCGCTTCGATCTGGTCTCGATGTGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGA:1 - chr2R 7362976 5' - baggins 5050 1 74.26 TTGATTTCTCGTGTATATCATTGGGTATATTATATATATATACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:2 + chr2L 6569164 5' + 297 6610 2 72.28 AATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATC:1 + chr2R 7727126 5' + BS 4677 1 55.45 CTAAACTCCCCTGCTTAATATCGAAGCGGACATCGACTGTTCTTATGTAATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATA:1 - chr2R 4571613 5' + Transpac 448 1 64.36 ATTCGAGTGCGGCTTGTGCCTGCTCAACTGAAACATTTCAAATTAATTGCGCCTGGGAATCGAAGTAACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAA:1 - chr2R 12463011 5' + Doc 4426 1 69.31 CAGAAACACGTCCGCTCAAATCAATAAAATCTTATCGTTCGAATTAACTGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATCATAACGTTAAGGCAATGC:1 - chr2R 946724 5' - 1360 302 1 51.49 GAAGTGGTGGCTCCCTTTTGGGCAAACAATACCCCAAAAAAGCTCCAGGGCATGATCTGCAACTCCACTATAAAGGCACTACCGAGATGTGCGATCCTCT:1 + chr2L 11507466 5' + BS3 296 1 76.00 AAAATGTTTCGTATGAATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTT:1 - chr3R 25086162 5' - Bari1 1672 1 60.40 AATTTAATAATTTATTTGTTGATAGACTTTTACTTATACTATTACAAGACACTGTTTTTATTGCTTATCTTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATT:1 + chr3L 23382366 5' - F-element 320 1 70.30 CGCACTTTTATTACCACCAACCTAAGAAAGTGAAATTCATATGTGTAATTCCTTATTTTTTCCCCGTTACTCGCCATGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCA:1 - chr3L 22982922 5' + INE-1 135 1 64.36 TTTTATGTTCGTTCCACATATGCAGTTTTAATATTACAAAGCCAAAAGCATGTGTAGACATTGGCGCAGTGTATAATGTTTTTTTTTTTGTTTT:1 + chr3L 23912346 5' + Tc3 86 1 75.53 GGAATTTAAGCAAATATTATAAAAAAACCAGGCCATTTGAAACAAGAAAAGGTTTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAA:1 + chr3R 7513905 5' + diver 5912 2 51.49 TGGCTGTGCTACAATTTAAAATGAATCGAATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATT:1 - chr3R 15790156 5' + flea 4697 1 48.51 ATTTCAATCATTTTCACATCACTTTCCCGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 - chr2L 15898839 5' + F-element 23 1 70.30 CGTGCATCTATCCATATCGCATTTTCAGCGAATATGTGTACGTGCCTAGGCGACGACAACGTCGAGCATGAGAGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAAC:1 - chr2L 20915395 5' - R1A1-element 5015 1 62.63 CTTATAAAAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 9278407 5' - roo 9053 2 61.62 TACACGGCATCGAATTGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 29608763 5' - roo 394 1 67.68 ATAATCCCCTTTTGAATATGAACTTTAGTAATCAGCGACAGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATATTACAAGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2L 9045503 5' + jockey 10 1 75.25 ATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGT:1 + chr3L 20224154 5' - Chimpo 151 1 62.38 TGGAGTGTCTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAACAA:1 - chr3R 16533699 5' + X-element 4381 1 28.71 TGTTGATAACAGTTGCGGCTGAAACTGATTTTCACTAATCAATTTGTACAGCTGCGCGCATTTAACGAGTCCACTTGCAGCAACAGCTTTATCGCTCTCAT:1 + chr3L 26541167 5' - micropia 5184 1 75.25 ATGTCCGAAAGGGGTAGGGGTTTATGGGTGCCGGAGTTGGCGTAGAAATTGCTGATGTGGTAACTCGTGTACTGTAAGATTGGAAGAGTAGTTGATGTTTC:1 - chrX 5369638 5' - jockey2 47 1 68.32 CGAGCTAAGATGAAGACCAAACACACGCGACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chrX 14651099 5' - P-element 2843 1 32.29 ACAATTCTTAAAACCAAACTGCAATTAATCAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 - chr2L 17677794 5' + Tirant 8125 2 63.37 GGTATACGTTATGCGAATTTTTTCACTTTATTTAACGAACTTCTTGTTTTATAAAAAAAAAAAGATTCTCAAATACTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chrX 10286240 5' + roo 2 2 67.68 GCACAAACAAACAAATGCAAGAAAATGACAATATTTTTATGCAAGTGGAACAAGTTATCACGTGACGACAGCGAGCCAACAAAAAGCGCAGACTTTTAAAA:1 - chr3L 17403623 5' + Penelope 21 1 81.19 CTTGGTCAGCCTCATTTTTGTCAACAGACTTTATTCCTTCCAAGGGACAAATTTTAGTAATGGGTGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCAC:1 - chr3R 19448122 5' - roo 122 2 64.36 TATTTGAGGCCCCGGGTCGGCGGCTAGGATAACGCTTTCCATTCATGTGGCGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAA:1 + chr3L 22363170 5' - FB 734 2 61.39 GAGCGAGAGCCGCACAAAAAATGTAGCAAAGTGCTTAAGGTAAAGGATTAGTGGTGGTTAAACCTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAA:1 + chr3R 23037768 5' + 1360 196 1 70.30 TAAGTCGATAACCCTTTGTTCATCCACGATTTCACTCCATCTTGCCTTTATATCGACACGTCGACGTTCTTCATCAAGTTCGTCTGGGTGCCGAGATCGCA:1 - chr2R 22484419 5' - R2-element 419 1 75.25 AAGTTGTCAACAATTCTGGCCAAATGCCGCTGCCTGGGAATTGGGATGCATAAATTATTCAGCATTCATAGAGTGCTATCTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr2L 10138134 5' - accord 7104 2 75.25 AAATCTACTAATATAGATACCGTATTATAAGAGTGCAATCTCTAAAGAGAAATAGCTACTATATGATCATGATATATGTTATAACATACATACATACATAT:1 - chr2R 10546417 5' + 412 224 2 77.23 CTTTAAGTGTGTTCCTGTGTGTGTAGGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 + chr3R 17053077 5' - hopper 1369 1 69.31 TGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1 + chrX 8027431 5' - Juan 4186 1 53.47 GTACACTGAGAGAATGCTTTGCTCTTTACAAAGTTTATAGTTTTATCTGTAAAAAATGTAACCATTGCGCGATGTATACGACTTTATAAAAAATGAAATA:1 - chr2R 16725213 5' + Tc1-2 379 1 65.00 TTGCGGCTCTTTAAGCAGGTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTGCATCTTTATT:1 - chr2R 8177748 5' - mdg1 7404 2 74.26 ATCGAAGGAGTTATCCCTTAAAGTGGATTCAAATGAGCACTTCAAGGCTGAGATTTGAGACCATTAACTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTT:1 - chr3L 12634247 5' + BS 5006 1 66.34 CCTATACCCCCTTGCATGCCATTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAG:1 - chr3L 22349285 5' - BS 5068 1 67.57 GCTGCTGCTGACAATTGAAATTTGTATTCCGCTGCGGAGCAGGTAAGGCCAAAATTACTCTCTTTCGGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAA:1 + chr3L 11055718 5' - 1360 3281 1 54.46 ATACACTCCCGCCATTGTTTGCAGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCT:1 - chr2R 13383559 5' + gypsy5 6958 2 63.77 ATAGAGTTAGTACTTTTAAATTGGCCACCTGCTGCAGTCATTAAAAATTGGTTCGAAAATATTTAATCTCATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACT:1 - chrX 7292763 5' - 3S18 6098 2 71.29 TTGCGAGTGGAACGCATCTAACCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAA:1 - chr2R 6779842 5' + 17.6 6958 1 60.40 ACCGACGTCACAAATAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr3R 19987394 5' + Doc 27 1 51.49 AATTTTTTCTGCTCTTTGNCTGTTATAGCTCAGATTGCGCCNNNAAACNNNTATAAATCAATAGAAAGCNNNNNNAGAACACACACACATATACACACATA:1 + chr2R 14964422 5' + accord 192 2 61.39 TAAATTTGAACAACTCTTTAATCAGGAATCAGAATTTTAATCAGAAACTTATTTGCCAATAGATAACACAATATAATAATAATAATATTAAAAATAATTAT:2 + chr3R 6769713 5' + mdg1 45 2 55.45 TAAATTTAATTTTATTACAAATTAAACTCAGCTATCTTTAGTATTCTTAATTTCAACAGATACAAATGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:3 - chr3L 10110634 5' - roo 401 1 43.56 GAAATGAGTTGCCACTTTTTATGGCCAATGCCGTTTTATTGAAGCAACGAAAACTATTCGGTGCAGTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCT:1 + chr2L 14010206 5' - flea 4953 1 69.31 AGTTGCGTTGCACCTGATGCACAGATGAGTGTCCTCGAGATGGTCTTCTTGTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATG:1 + chr2L 21775387 5' - Transpac 55 2 59.41 ATCTCAGTGTATTATGTTAACACTGACGTACTTGACAGACCAAGCCTTTTCAACTTCATTCTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAG:1 - chr4 74346 5' + 3S18 5780 2 64.36 CTCCTTCGTTTTCATTAACAAAATCGATTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr2R 19061234 5' - roo 9027 1 71.29 GAACCGATCAAGTAGTCATCAAGTCTTTATTAAAAGCAAATACATCTTAAGTTGCAACACTGCATTTTTTATGCGATATCAAAATCATATGTTTGATCAGC:1 - chr2R 5468384 5' + transib3 159 1 60.40 TCGGATGTCAAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3L 12241821 5' - roo 9034 1 65.35 TAATTATAAAGTAAATCCATGCTTATAATTTGATCAATCAATCGTAAACAGTCACGTTGTGTGTTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTC:1 - chr2L 19417167 5' + BS 5007 1 60.40 ACTAGAAGGTAAAACCAATTGCACAATGGTTTTAGTGGATAAAAGGCAATACGTTATTCTGATTGGAATAAAACGGAAGAGAGCGAGAGAAAGAGAGCTTA:1 - chr2L 15746441 5' - blood 7176 2 68.32 ACAACGATTCTGCGGCTGATGTCGCAGTCATTAAAGTTTTTTGTGGTTTTGGTGTCAAGCACAGTGAGCAGGAACTGTGATTGATAAAAAAAAAA:1 - chr3L 20284417 5' + looper1 1687 1 70.53 CGGCTATTCGCCCCGAAAAGTACGTGTGAAATTATCATTATTCAATTGTGTTTTTGGGTAAAGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2L 7666085 5' + roo 8677 2 66.34 TCATCGCAGGATGCTGAATCCTTATTATCCTGCCACTTTCCAGTTGAGGGTCTTATGCCTCCTCCACCATCGTCTCGAGTTTCCCGAATATCAGATGCCCG:1 + chr2R 20360881 5' - INE-1 555 1 79.21 AGACTAGCCATTGACAAAGTTCAATATTTTCTACGCTGCTACCCTCCTTTCAATACTAGTATTTAGTTTAGTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCT:1 - chrX 1127080 5' + mdg3 5258 1 72.28 GAGATAGGATTATTTTATTTACCTGTATATAGCAATCTTAAGATTGATATCGAAATAAATAGGACTATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 - chr3L 15033390 5' + I-element 11 1 68.32 CCGGCCGGATTGTTGGCCATTTTGTTTTTACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr2R 19560167 5' + Tirant 38 2 65.26 CAAAGTATGCAACGCATATTTTTACATCACTTCTGTTTGCCTTTCTCCCAGAGCCACAGCTCCGCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAGTGGACG:1 - chr3R 12199847 5' + jockey 18 1 66.00 AAATAGAACATTTTGATGTAGTTTAACCTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCC:1 + chr2L 14341853 5' + copia 50 2 74.26 CCGTTGCCGGGGCGCCAAAAGTTTTTCCAACGTTTCGTTTGGCTCGGTTTGGTTTGCTTTGGTTTCGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTCAACCCC:1 - chr3L 17186898 5' + Tirant 7 2 73.74 GCCTCTGAAAACGGTATCTGCGCCAATAAAGGGAATACTCGTTCTATGACAAAAATCCATTTCAATCACCATTCCTATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTT:1 + chr3R 26435376 5' + Juan 4032 1 75.25 TTGTTTATGCCAATAATAAATAGATAATTTTGAAGGGTCTTAAACATTTTTTAGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTT:1 - chr3R 22450570 5' - mdg3 5070 1 75.25 TAATGGAAAACAATGTTGAATAGCCAAAAGCCGGAATGTTCTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:2 + chrX 9774989 5' + 412 35 2 58.42 TGTTTTCCTCAAGCGGCTGCCACTTTGTTGACTATAAATAACAACGGAATCATGTAAGTGGGATTCTCAACTTAAACACTACTCCAAACTGCGTCTAGAAT:1 - chrX 825097 5' + springer 472 1 54.46 AGTTAGCGACTGGGACTCCTGTGACCGAAGCTAGGTGGTTTGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGAATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACT:1 - chr3R 4927199 5' - F-element 4414 1 71.29 GGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTT:1 + chr2R 12185347 5' - accord 7337 2 71.29 TACAAGTATGTACACTTTTTGATCTGTGGATGGTTAGACTGTCGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGA:1 + chr2R 20628214 5' - Quasimodo 203 2 57.43 GTCGGCTGAAGTTACTTTCTAATGCTGCGTCTCTCTGATTTTACAGTTTTTTAATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGC:1 - chr3R 27168145 5' - 412 7359 2 72.28 ATTGCCGTCAAAGCAGGAAAAGCAGGTAGCAAGGATAACCCTCCGCCAGCCACCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1 + chr3L 6023274 5' - hopper 1389 1 54.46 GAAATGGAAATTTACTATTTTAATGTAACAACTATTTTTATAAATACGTTCTTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 - chr3R 6947394 5' + I-element 27 1 52.48 CAAAGAAAATTATAAATTAATAAGGGGAAAAATTCCGTTTGCTCGAACTTGCCTATATAAAATCAAATTTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGAT:1 + chrX 21228775 5' - transib2 496 1 59.41 AGAAGAAAGCCCAGAATGAGATGGCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACA:1 - chr3R 10926400 5' + I-element 4939 1 75.25 CTTCCGACTCGAGCTGCTGGTCGGATGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTT:1 + chr2R 6438343 5' - Stalker 7231 4 54.46 AAAAAAATGACCAACTGTAAAAAAAAGGGTGTTATAAAACAAAGAGTCTAAGAAATATGAGTAATATGTGTTGTAATTTATAGTTTATATTTCCTTTCTTA:1 - chrX 22734113 5' - copia 244 1 58.42 TTTAACCCTTTTTTTTTGGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGAAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3R 10488718 5' - roo 350 2 82.18 ACATTAAGAATGCGACGCAGCTGTTGAAGAAAGTTAATTGTTGTTCTTGCCGCCGACGTTGTCATCGATATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chr2L 17244977 5' - copia 252 1 72.16 GATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 + chr2R 15788599 5' + Transpac 4975 2 76.24 TTTTAAACTCGGGCGTAAAAAATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTGGTTGTGATC:2 + chr2R 12812287 5' + jockey 62 1 71.29 ATTGTTGATTAAATATATTTGTCATGTATTTTATCATTGTATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCT:1 - chr3L 11409941 5' - micropia 5189 1 68.32 TCGAGCTCAAATTTGAGACNTATGCAATTGTCGTTTTTCTTATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCC:1 - chr2L 9144015 5' - micropia 5326 2 60.00 GGTGGAGAACACCTCTTGGGGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 23338312 5' - roo 351 2 79.21 AGTTGCAAGTATAGGTCAAAGCTATAAAGAATATTTGGACCATAAATTGTGTTAAGGGAAAACATTTGCCATTCAATCTGTAGTATATACGAACATAATAA:1 + chr2R 12525559 5' + mdg1 7040 2 54.46 ATTAGATAGATTCGATTAAAGGTATTTACCAGACAGTAGGATGCCTGTTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAG:1 - chrX 18753597 5' + roo 9044 1 53.47 GTTCCTTAATGAAAAGGTTTTAATGTGAAGTTTAGCTTAAAGGAGGGATTTATTGCACACCTTGTAATATCTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGA:1 + chr2L 9045391 5' - jockey 4988 1 70.30 TTTGTGACCATATAAATGTCCGTCTGCCCGTCTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTTTTCGCATAACTCTTTCTTTAGTTGAGTAACGGGTATCCGATAGTC:1 - chr3L 22030149 5' + INE-1 549 1 70.71 TAGCTATTTTTTTTTTCTTTTTTTTTAGGCTAATTCCTCCAGAAATGAAACGCCCGGGATCGCCTTCAATTGGGTTGCACTTTATTCTCGCACTTGTAAAT:1 - chr2R 17249790 5' - Max-element 8430 2 73.27 GAGAGGGAGATGGAGCTCTAACACAGAGAGAGAGAGAGTGCAAGAGAGAGACGCACTTTACGACGTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr2R 15349583 5' + P-element 5 2 71.88 CTGCAGCACAGCGCGCTTTCTTCGTTCGGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr3L 16891111 5' - P-element 2847 1 31.52 CATTTCTCACCACCGATTGCCATTTGCGTAATGTACGCCTTATGGCCAGCAGGCAAGTGACAGTTCTGTCGCTGTTTTCGTATCTTTTTCCTTTTTTTTTT:1 - chr3L 16311810 5' - Doc2-element 233 1 67.33 CGCTGCCTAGTACTTTGCTATTGTAAGCTCCAATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr3R 18549915 5' - pogo 2061 1 68.32 CCTGCATATGTCTTTTACAGCTCATATTTGATGTCATCTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACATAAAAATTGGT:1 + chr3L 20316795 5' + 3S18 351 1 63.37 AATATTCTGCCATCAGCATTCACAGTTCTTGTTAATTTTTCGATGCGTAAACGAGAATTCATTCCAAAACAAATACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAA:1 + chrX 11836271 5' + gypsy7 5009 2 74.26 AGGGTCCCACGGAATTTAGCCAGTTTTCTTTTTCTTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTCA:1 + chr3L 15536987 5' - invader2 439 1 76.00 TATTCCAATTGCCACAGAANTTGAGGTTTTCAAATGACATTGAACCTTGTTTACTTCTTTGGCTAGTTTATTAATACCATTTTGTTTTACCTTTTTTTTTT:1 - chrX 7372607 5' - Doc2-element 233 1 80.20 TCAAGAGCGAGGAGGCGATAAAGGCTGAGAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr2R 22856613 5' - 1360 3377 1 67.33 TCACTAGCAGCTGAAAGAGTTCACAGCGGGGCTTTACTGTTGGTGTTGCAATATCCTGTAATGATGAACTCCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTT:1 + chrX 21060297 5' - 412 7530 2 56.84 GAATAAATAAGTTGACTTTATTTATCCAATGTAAAAGATTCGTAGAATTAGAAAAGTAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATCGAAAGT:1 - chr3L 6131365 5' + mdg3 5041 1 65.35 ACATGTGATTTTCCAATATGGATCTTATGAAAGAACTGAAAATGGTATAGTAAAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCAT:1 + chr3R 25086084 5' + Bari1 24 1 56.44 AACCAAAGGGCATAGCCACGAACTCTTAAAGACAAGGGACTGTAAATGCGGATTTATCATGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAA:1 + chr3L 25059060 5' + mdg1 7055 2 62.38 CACAGATATACTTACAAGTACATATGAATAATCTTCAAAATAAGCCCTCAACAATCATTGCACAATTTTTCACACGTCACAAGCTGGATACTCTAATGACA:1 + chr3R 16818330 5' - 1360 408 1 59.41 CAGCTTGCAGAATCGGATGTCAAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3L 12241809 5' - roo 9046 1 54.46 CTGCAATTAATCAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:2 - chr2L 17677776 5' + Tirant 36 2 61.39 AAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGAT:1 + chr2R 4260432 5' + micropia 5133 2 82.18 CACCTTATTGCCCACAAATTTTAACTAGAATATATTTAACCCTCTGTGTGAACATCGACATCTCGCTCGCACTAGCTGAGCAACGGGT:1 - chrX 21332576 5' + INE-1 538 1 78.41 AGTGCTGAAAGTTGAGTTCCAGCAATTAATTCCTCTCTGTCTATATGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACA:1 - chr2L 10101899 5' + Quasimodo 24 2 58.42 CTCAAAGAAAGCAAAAACACTGATAATTAATTGCTTCGAATGCGGCTTATCCATTACTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTC:1 - chr3L 3242747 5' + diver 5908 2 45.54 TACGTGCCAAGTTATACTTTCGGCTCTGACTGTAAATAAATATTCGGACTGCATAATATTTATTTTACCAATTAAAGAACATTTTTTTTTTAAATATTTTC:1 + chr2R 23114342 5' - TART-B 10627 2 58.42 TGAGTCTAATGAAATAATTTGTGTACCCAAACTGGCAGGCAGCTGGGAAAATGCGAGCAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:2 + chr2R 7838954 5' + pogo 15 1 64.36 GGCGATGTTAGTCCTTTTTATTTCATTTCATTTCTACCGTGGCTCGGACACGCGGCTCAACTTTTTATTTCGCGTTTACTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAAT:1 - chr2R 17814768 5' + 1731 232 1 57.43 AAACCAAACAAAACATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:2 - chr2L 13566534 5' - hobo 2899 1 67.33 CGACGGACTGCCCTCCATCCAGAGCGGCACAGGCTACGGACTGCTTTACATTTTTTTGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAA:1 + chr2L 11730615 5' - 1360 3297 1 57.43 CATTAATAAGAAATCCAGTAAAAAATACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 + chr3R 11052078 5' + blood 10 2 67.33 CACAAAAAAACGCTCGTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 + chr3L 5710234 5' - Transpac 287 2 56.00 TTCCTATTTGCACCATACCNCTACTCGCAAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATA:1 + chrX 14312567 5' - F-element 4271 1 71.29 ACGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATAT:1 - chrX 983369 5' + Juan 3835 1 53.47 TAAGCCCTAAAGTTACAACTTAATATACATAAAATAAAGTTTTCACATATTATATTTTCTGAACATCTCTTTTTAGACACTTTCTTAAAATATAAATAAAT:1 + chrX 17560470 5' - copia 230 1 65.35 ACAAAAACAAAAAAGGTATCCCTATTTTAACAACGATAGCCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAAGAA:1 - chr3L 9448263 5' + Tc1-2 1578 1 80.20 AAAGTATGCTAATAAAAGATATCAAAATATTAAGGAGAATATCCCCAGGAAACAAGGATCTATATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTA:1 - chr3L 4009511 5' + mdg3 5265 1 66.34 TACATACTGGGAAAACCGCAGATCGGTTTCTAAATGATTCTATATTGAGATATTCTTGTAACTTGTTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAA:1 - chr3R 17286364 5' + Burdock 6248 2 60.40 CCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGG:1 - chr3R 10736102 5' + McClintock 5994 2 75.00 TACAAAATTTTACAACTCACAGATAACCATCGCTAGTGTACGTATGTGTAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCG:1 + chrX 21939048 5' - HMS-Beagle2 282 2 57.43 ACTTAGTGTTATTTTTATCTGCACACGATACTTTCCGTGGGAGGTCTTCCTTCGGCGTAGTATACGTTATAATAAACAATTCTTTGGCAACGGCACTTAGC:1 - chr3L 25800559 5' + 17.6 7104 2 60.40 TTGAAAGTTACTCTTAATTATCAGTAGATGTCACTAGTATATCACTAGATATATGTATAATCAAACAAATAGTTTAGTTAAGAAAATTATCCTAATATCTT:1 - chr2L 12331895 5' - Transib-N1_DM 58 1 19.80 CAAAATGAATTGAACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chrX 11016999 5' - roo 9029 1 67.33 TTCTCGATGTTTAGTTTGTTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 + chr3R 384719 5' - blood 7348 2 79.78 ACTTAAAATACATTGCACTTCGACTGAAGGAACGAGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACG:1 - chr3R 20281602 5' - accord 134 2 65.00 TTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGTCGA:1 + chr2R 5206895 5' + Doc4-element 20 1 58.42 TGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr3L 6033579 5' - 412 7498 2 71.29 CAGAATCTAAGGAAGTTTTTGTACGACAATTCCACTGAAGACACTATATCGACTTATTTCGCTACTGACATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAG:1 + chr2R 1319449 5' + 17.6 7264 4 71.29 CGCTGATTTCTTGCCGGCTAAAATTCGTTTGCCGTATTCGGTTTGTTTGTTTATTTGTTTCTCCGGTTTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACT:1 - chr2L 8798157 5' - Quasimodo 109 2 77.23 CTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:3 + chr3L 2022249 5' - roo 9027 1 69.31 ATGGACCAATGAGATGAAAAGTGTGCGGTGTGCGGCAGCGAATGTTTATTTATTTTGATGAATTCCGCCGAAGGCAATCATAAACTATAAAAATATATAAT:1 + chr3L 15073248 5' - hopper 172 1 76.24 GGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:2 + chr2R 13763184 5' - roo 9042 1 55.45 AAAAAAAATTCAAGAATAATACATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTTTGCGTGGACGCTGCGAG:1 + chr3R 3269646 5' + Gypsy6A_LTR 111 1 61.39 GAGGAGACTGAATCCCCCGATCGGTCATATCGACTATATTCCCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 - chrX 4707905 5' + P-element 30 1 48.48 GAACTAAACTTTCCGCTCAATCGAAAAATTTAAAAATATTTAAATAAATGGCAAATGTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 - chrX 22789400 5' + Tabor 20 2 57.43 GGTTGTAATTTCTAAACTTGGCCATTAGTTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr3R 28621072 5' - 1360 3344 1 74.26 ATGGGGTTTCTTTTTCACTGCTCCCGAATTTTGATTATGTTATTGTGATTATGTTTTGATTATGTTCGTTGTAGGAATGCTCACATACCAGGGTAGCCCAG:1 - chr2R 80820 5' - G5A 2519 1 67.33 TCATGCGCCTATTAACTTTGCCTCCATGGAACAACGGACATTTTTCCGGTAAGCTTATATGTATATATACTTATATATTGTAATGATGAACTCCCATTAGG:1 + chrX 5475360 5' - 412 492 2 73.27 TAGTCGTGTGAACTTGAAGGATTTTCTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTT:1 - chrX 19821710 5' - F-element 33 1 80.20 TGAATGAATTATTAATGTTTCTAATAAGACTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3L 3757356 5' + roo 46 2 77.23 AAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 + chr3R 10741080 5' - 1360 3372 1 61.39 GGCGGACAGGAAGTCACGCAATTGTTCCATTTCCCACAAAAGTAGGCAACAGATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTACAGCC:1 + chrX 21256130 5' - hopper2 1513 1 59.41 TGGCGAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGGGATTGGTATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chrX 7111079 5' + Doc 55 1 71.29 AATGAGTTTTACATGTGTATTTACATATTTTTCTTAAGAAGATTTCTGGCTACATTATCCCAAATTTACTTAATTACCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGG:1 - chr3L 19249779 5' - Transpac 5228 2 74.26 ATTAATTATTCTAAACAATTTTGCAGCATTTAAATACAATCAGAATACACAGAAGATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 + chr2L 11478665 5' - opus 7481 2 59.41 ATAATGTCCGCTCATCCCTGAGCGGATAATGAGTTTGGATGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chr3R 3847098 5' - P-element 2852 1 44.55 TTGGGTTTCATGACGGGTCNCTGGCCGTCGCTTGTTGGGCTCATGGACAGTTCACATAAATACGGGAATTCAAAAAAATCCCATAGAAGAAAATCACAAG:1 + chr3R 27814102 5' - mariner2 588 1 55.00 CCCTTTCCCAATGAAAAACATTAGGAAAATCCATTAGAAATTTGCGCAAATATAAAAAACGACTGAGTAGTTTGAGTTGTGAAATGAGAATGATAATGAAT:1 + chr2L 18240891 5' + accord2 68 2 56.44 TAATTGTGTCATAAAGTTANAGTAAATAGGGTTTTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 11916638 5' - roo 396 1 65.35 CGAAAGGTATGATAATTGTAGTGCAAACCCATGGATTTTAATGTCTCAACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATT:1 + chr2L 8579998 5' - roo 8702 2 50.50 GTGATCTGATCCCTGTTTTGCGATAATTATAACCAATCCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAAAATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTCAACAA:1 + chr3L 16396248 5' + I-element 116 1 63.37 TTTTAAGTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGG:1 + chr3R 20094466 5' - 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chr2R 672859 5' + F-element 16 1 69.31 GACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGGCCGTCCGTCCGTCCATATCA:1 - chr3R 1977622 5' - micropia 426 2 50.50 CCAAAATGTGTTGTAAAATCTGTTTATACATTTGAAAAGTTATCAAAAATAAGAGAGAATGTTATAGTCGAGTTCCCGACTATCAGATACCCGTTGT:1 - chr2L 21981472 5' - INE-1 551 1 52.58 ACCAATTAGGCAGGAAAATGTAACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 - chr3R 1292535 5' - opus 450 2 79.21 CGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATA:1 - chr3L 3540183 5' + mdg3 39 2 73.27 AGGCAGAAAATGTTTAGTTTATATTTCTAGAGCGAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGGGATTGGTATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 + chrX 4937526 5' + Doc 26 1 57.43 ATTGTGAAAGATGTTAAGCAAATAATTCCTGTGTTCCTCATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr3R 20905363 5' + pogo 1 1 79.21 CGACATGGTTGTTTGGGGATAGCCATAGCCAATGCACCGTTTTTATTATCAGTGTTTAATTGTGTGTTCGTTTTTTTTCTTGTTGCCTATCCAATGTTTAA:1 - chr3R 7195570 5' - invader3 4999 1 61.39 CCTCCAAGCCGGCTCCGAAGCTGGAGACGGCGGCGCTGCACGACTAGATCCATCCTCTTAAGGAATGTGGTCATAGGTAGGGTAGGGCA:1 + chr2R 6808930 5' + Gypsy12A_LTR 1952 1 52.81 TTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 29608828 5' + roo 8715 2 78.22 CGAATAAATAAAGGGACTTTATTACGTTACCTTTCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTA:1 + chr2L 20560314 5' + F-element 24 1 58.42 TTTAAAACCTTTGACTACAAAAAATATGTTCGATATGCATAAAAAGTCAGTATTTGCTGAAAGTCAGGGCAGTACTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chrX 17494718 5' + 1360 1 2 79.00 TATTAATATATTTCCACATATACACTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:2 + chr3R 12944669 5' - roo 9046 1 57.43 ATAAACTTTACTTCTGGCTNGTGGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chr3R 22238696 5' + hobo 54 1 79.21 CGGTGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:2 + chr3R 25021685 5' - roo 9032 1 67.33 CTTGATAAAACCAAACACTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGAACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr2R 10353316 5' + blood 34 2 57.43 ATATGAACACTGATTGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGAC:1 + chr2R 8312215 5' - opus 71 4 70.21 ACAAAGACGCCGAGTAAGGTGAAAACTTTTGCAAACAATAAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr3R 17660542 5' - roo 9035 1 62.38 CAAAGAAAGCAAAAACACTGATAATTAATTGCTTCGAATGCGGCTTATCCATTACTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTT:2 - chr3L 3242745 5' + diver 5910 2 44.55 GCCAATGCAGCGGCAGCAATCCACACATGAGCATATGCAAACACGATTCCACCTGTGTTTCGCAGGCGAAAAATTCTCAAACTTTCCTCCCATTCTAGAAC:1 + chr3L 7259263 5' + gypsy12 9975 2 61.39 TCTGTCTGTTGCTTTTTATCGATATTTGTTTTACGACACACCCACACACACACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGATCTAACGCTTA:1 - chr2L 12813270 5' + Stalker2 139 2 55.45 CTTTAAGATGATACTTTGCAACATTTACAAATGTTTTAGTGCCCCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAA:1 - chr3R 12876378 5' - hopper 1386 1 56.44 TTAACCTCCTTAAGCTACCTATATCCAAAGTTAAGGTATACTGCTTTAAATATGTCCAATTATATTTCAAGCGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 - chr3L 20755432 5' + I-element 6 1 73.27 CAAAGCGATTATAAGTTGTATCGATTTATGAATTTAATGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGA:1 + chr3R 11054794 5' - blood 301 2 62.38 TATGAAGAAATGGTTAGCTAACTCGGAAAATAGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr3L 7168309 5' + Doc 27 1 54.46 GTGTCGGCTGAAAATCGGATCGGCTCACATTTTATCCAAAGCGCTCTCCCCCGCCAAGACGGCCTCTTTCATGAGCATCAGCACTCTCTCTCTCTCTCTTT:1 + chr2R 15032239 5' + blood 7178 2 63.37 CAACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACG:1 + chr2L 14793490 5' + Stalker2 31 2 54.46 CGCTGGTTGTAAGGCTAGATATTGAGAATTGTTGTAGTTTTTGTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTGCTGGTAGCTAAAGAACT:1 - chr2R 4579081 5' - Doc3-element 476 1 72.28 GGAAATAAAAGAAAATTAATCTTTGCTCACATATTGTGCTTGCGCATAAATAACAAGAACAACACAATGGGCTACACAGTTTTTTCCCATTATTTTTTTTT:1 + chr2L 8230769 5' - Tc3 138 1 89.11 ATCGCCGCTAATCAAGTGTTTCAAACAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2L 17994194 5' + roo 48 2 74.26 TGATCAACATGATAAACTTTTCTTTTTTACTGCTTCTTAAATATGCAGCCTTTTTTTTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCC:1 + chr2L 15220187 5' + invader4 14 2 53.47 ATGTTGGCCAGTCTTTGTGGCCAACTTTGATTGTCGGCTGGTCCGGAAAACGTGCGCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAAT:1 - chr2L 10897474 5' - jockey 4618 1 64.36 AGCCATGACATAATTAGGGAAACTATAAAAACTTTCGCTCCCATTAATGGTTTCTTCTTTTTAATTCACTTTTCATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATT:1 - chr3R 19450758 5' - Burdock 256 1 76.24 AAAAAAATGGAAAAAATGACGCCTGAGGTGGGGGCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCTTCATTTACCATTTCGGGATATTCGTTTTTGTT:1 + chr3L 13179284 5' - G4 107 1 72.53 TCATTTGGTCAGGACGGGGGGGAAATCCAGAATAACAAGCGGCGGCGATTCGAGTCGAGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 10488660 5' + roo 8681 2 62.38 CATTTTGTGAATTCCTCAAAATGTTACGTAGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr3L 20520695 5' - P-element 2841 1 33.66 CACAAAATGAACTGTGAATGTCAAATGTATTTTAAAACATAAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTGCACGGCTATCAGATACCCGTTACTCAGCTATTGTAAAT:1 - chrX 21421870 5' - INE-1 536 1 86.14 ATTATTGTGGGAAGTATTGCCCTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTA:1 - chr3R 4474235 5' - copia 219 2 64.36 CGTGGCACTGATGATTTATNCATCACGAATCTCTAACCCACTGGCTTCCATAGAGCTTTAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 - chrX 15546234 5' + blood 7026 2 63.37 TGAGAGTGGGATCCTTCGCCGCTTAAGAGGACATTTTCCTTATTGAATAAATAAAAATAATTATTATTTGAAATAACTTAATAATTGTTTAATTGGCGCCC:1 + chr2R 14036412 5' + gypsy9 322 1 57.43 ACCAATCGTCGACGCGATCGGGTGTGCGCGCACTCTTTGTGTAATCCGAAACCGATTTTGTGATTCAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTTTACGATGCA:1 - chr2R 5395191 5' + Doc2-element 116 2 76.24 CATCTGGCGACTAGGCCAAAGGCCCAAAACCACCCAAAACTGCCCCGAGCACATTTTTCGATACATTTTCGTAATTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCG:1 + chr2R 20517798 5' + INE-1 298 1 78.22 GCAGTGCACATTTTTATCAACATTTCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAG:1 + chr2L 17677725 5' - Tirant 350 2 75.25 CACTAATTGTCAATTCTGTAGCTCCATCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTA:1 - chr2L 7086760 5' + Doc 4452 1 74.26 TTTTCAGTACTATATATATACGGTTTAAACTGGCTGCTGGCCCGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 - chr3L 1697755 5' - Transpac 5198 2 56.00 TACAATTCTTTTTTTTTATTTGCATTATTATTAATTTTTCCGCAATTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chrX 5244152 5' - Transpac 282 2 54.46 TTTGCACTAGAGAAAACTTTCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chrX 9413825 5' + 412 7109 2 84.16 TTTCATAGGAGACAAATTCCCTTGGAAAAGTTGTGTTAACTATTACTTGTTACTTGTGTTAACGTATTCATGTAATTATATAAAATATTTTTGAAAAATTC:1 - chr3L 5428028 5' - 1360 3089 1 80.20 AACAAACGAAGACCCAACCACAGTACCAACCGATGTCCATTAGCCAAACAAGCCCATGTCGAGCGTAGTATCCAACCTATCCCAACCAAACCCGTCAAACC:1 - chr2L 1009736 5' + G2 111 1 76.24 ACATGGACAATTTGATAAGATCGCTAAATTATTAAGCTAAGAAGAAACGAAAAACATACAGGGACATTTAAAAAATCGTTGAATGTTCTGCCCAAATGGTA:1 - chr3R 4512477 5' + HB 446 1 74.26 CAAAATACATACATATTTTTTCTTTATTCATTTAAACATTAAAATAAAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 - chr3R 11405115 5' + blood 7012 2 50.50 TTTCTTTACATGTTAGCATAATAAATTTGAGTAATAATAATTTGAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:1 - chr2L 16851792 5' + HMS-Beagle 6824 2 53.47 TTAGTCTAATAACACACTACTACTACTATAACACACTGCCTCCAGTACGAATGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCC:1 - chr3R 23818120 5' + F-element 4495 1 57.43 ATTTGAGTTGCACGAATATTTCACTGGTAATTGTACCAGTTCCTAAAAATGGTGAAATACCAGTGAAAATGGTAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr2L 20619967 5' - roo 410 1 74.26 AATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr2R 13763189 5' - roo 9037 1 56.44 TAATTGATATTTGGTGGGGTCATTGAACTTTGGCGCGCAGAACGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCT:1 + chr3L 6680656 5' - Porto1 348 1 75.25 TTTCATTTTAATTTGTGTAATGTGTATTTTGGATTATTTGTATCACATGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGC:1 + chrX 22689506 5' - 1731 316 1 80.20 TTCATATTTTTTCACATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGAAAAAATAAATTTTTGCCACGAAGCGCAGAAAAAACACGACCGTTCGCTTTC:2 - chrX 6688963 5' - Cr1a 9 1 60.40 CTGAATAATAAAAAAATACCCAGCACATACATTGCTTATATCTATGCATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACT:1 - chr3L 21204488 5' - Stalker4 225 4 81.00 ACTGCTGGTTGCGTATAAATTCTAGCGTCCGCTTAATCTTGTTAACGGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTATAATAAACTGCACTTTTCGCTCT:1 - chrX 6269988 5' + Cr1a 274 1 53.47 AATGTTTTATATACATTTTTTAAAAAGGTTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 - chr2R 22134241 5' - opus 7458 2 76.24 GAAAATTAAAATCGAAATANGTAAAATAAAAGGGAACTTTAAGGATTTCATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3R 17781628 5' - pogo 2076 1 56.44 ATTATCTTTTTTTTTACAGCCATTAGCCCTACGCAAATGCCACTAGCGATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:2 + chr2R 18432056 5' + 412 26 2 54.46 TAATGAATCATTTTTGCCAACCCACTGACCGCAGTCGGTAAAGGTAGCGTTAGTTGGCCCATACAATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:2 + chr3L 13785345 5' + pogo 7 1 70.30 AATAAGTAGGGTAACCATCCCAGAAGGGTCTGTCCTTAAAGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3L 20411865 5' - roo 9047 1 53.00 TTTTCGTGGGTCAATTGTTAGCGAGCCATTCGCAAAGTGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chrX 21217507 5' - pogo 2065 1 61.39 GTGCGAAGAAGGGCAGATAAGAAACTTGCGAGATAAGAACAAGAGCAAAGAATTTGCTTTTAAATTACTTGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGG:1 + chrX 12739262 5' + jockey 4766 1 67.33 TTCGATCTGCAGTTGACCCTGTTGTTTGTAGGCACAGATGGCCTGCACGGGTCTCACGGCCACACCTCCCACCCAACCGACCG:1 + chr2R 13903087 5' - Cr1a 4423 1 61.45 AGGGGCAGTGGGTGTTGGGGATGGGTGGCATAAGAGGCACAATTGCTGCCGCTGACAGAAAGCGCGAGATACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAA:1 - chr2R 6918662 5' + accord 13 2 66.00 CATTCTGTTTGGTAAAGATCCTAACTGTGCGTATGTGTGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chrX 15287867 5' - hobo 2900 1 66.34 AAAGCATTAACATTTTTGTTTACTTTCGAATACTTTACTTTAAATTAAGAAGAACACTTCTAAAAAATATTAGAAAATTTGTAATTTGTATGTATATTTAA:1 - chr2R 10564119 5' + Dm88 4376 2 39.60 AAACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr3R 7869105 5' + 297 19 2 61.39 GTAGACAACCCAATACAAAACGATTCAACATTGAAATCGTACAGCGAGCCCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGCACCATGGTACCTACGCAGC:1 - chr2L 22558202 5' + Doc2-element 4458 1 75.25 AAGACCTTGGTTCTATGGTACTTGCAGGGACCCGTATGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1 - 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chr3R 17660575 5' - roo 405 1 73.27 TCAGCAATGTAAATGTTAAGTTTTGGGGTTCCAGTAAGCATTTTTCAGACTAACAGAAGTGGGATTTCTTTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAA:1 + chr3R 20166579 5' - F-element 70 1 77.23 CACGGTGGGTTAAGGAGGTGGTACCACTGTAAGAATGGATAAGTACTTTTCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTA:1 - chr2R 14580513 5' - GATE 416 1 69.31 AAATGCGCGCATTTCTTCGGAATTCGACACCAAAAGGAAGCACTAAAACTACAAGTCAAATAAAAAAACAAAAA:1 - chr2L 10987120 5' + F-element 4682 2 79.73 ATGTCCTTTGCTCACTGTACCTGCGTAACATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAG:1 + chr2L 7937259 5' + jockey 4568 1 71.29 TCCACTTTCACCAGGTTTCNCATACAATAGTTTGAAAAAAAAAATAGAAAAATCTATTTATTTGTCATTGGGACATTTGTTAAATTTGAAAAATATTTATT:1 - chr2R 9058966 5' - copia 4668 1 78.22 AGGCAACCTGAGATGGAAAGTCTGTGGGGGTTGGGGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 - chr2L 12511597 5' - copia 214 2 65.35 TAAAAGCGATTGATTTAGAGATAAGTCGATGGGACGCAACAATGACGTGGCCCAAAGCAAACCAACCACTTGGCTTCGAGCTCCGTATAAAATCACTTGAT:1 + chrX 2273953 5' + Doc3-element 35 1 70.30 GTGACTTTAATGAGCTCAGGAAACGCCCTAAATTCAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr3L 7300501 5' + Doc 46 1 68.32 AAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATA:1 + chr3R 10741078 5' - 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chr2L 12286072 5' - INE-1 91 1 64.36 GCGCTAATGAATTTAATGGAAAGCATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr3L 9910443 5' + 297 6595 2 64.36 ACATCGTTCGTTCACATGGTCATGTATATTTTGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr3L 22930365 5' - roo 9031 1 67.00 AAAGGTTCCTTATTACGTAATTAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chr3L 6033547 5' + 412 7106 2 78.22 ACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATGTAGCTTA:1 - chr2R 4339507 5' - G5A 2782 1 80.20 TGTATGTTATGTTTTTGTTACTCGATACAGTTCACCCAGACATCGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATG:1 - chr2R 5108532 5' - Doc 4493 1 56.44 ATTACCGATTTTCCCCCAATTAAAATAATTCATTCATTTATTGTTTTCCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:2 - chr3R 11092017 5' + P-element 73 1 51.49 ATTAGGAGAGCAAACAAAGCTTTAACCCTTAACCCTAACCAACATCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chrX 21217580 5' + pogo 27 1 54.46 ATTGAAAGAAACTAATGGATAGTTTGGGGAGATGTACATATGTACATATTTTGTCAGGCTGGTCATCGGCTTGACTTTTACGTTGAAAGAGGGCAGTCAAA:1 + chrX 22575891 5' - 297 163 2 72.28 CGTTCTAACTTTTTGATTTNTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1 - chr4 311571 5' + 1360 47 1 71.29 TATATATAGGATGTTCGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGG:1 + chr2L 22092956 5' + INE-1 537 1 58.42 TTAAATTGTGATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 9928525 5' - roo 386 2 53.47 TTATCGCCCATGATGTTGTTGCCATCTTTCATTAAAAAAGACGTCGCTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATG:1 - chr3L 19253540 5' + Tirant 174 2 54.46 AGGGGCAGTTGCTGAATAAATGCGATAGTAATTGGCTTTGGCAATTTATTAATTAACTATTAATGGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chrX 21060395 5' + 412 12 2 67.33 ATCGATAATTTCGATAAGTTATAACTAGTTGGCAATGAAGACCGACAATGTTGTGAAGGACATAATCTGGTCAACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTA:1 + chrX 17492328 5' + FB 351 1 79.21 ATAGTTTAGTTCATATGACTTAGGCATGATGTGGCAAGTTTCGAGCTCGCCCCGCTCTTTCGGCACATTGACCGCCTGAATTTGTTTAAATTTTTAATTTC:1 - chr3R 12716756 5' - frogger 236 1 66.34 ACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCGCCCGTGCTGGGCAAGCAGCCATGATGGCAGAGCTGTCGGCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGG:1 - chr3L 11115123 5' - R1A1-element 4962 1 71.29 CGCAGTGCACTCCTCACTCNTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGT:1 - chrX 4264390 5' + mdg3 5306 2 76.24 CTCATAGTTTGGATTTCAGAATGGTGATGTCTCCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAATAC:1 + chr3L 10043580 5' + G6 1922 1 67.33 AGATATTTAGAAGTTAGGTTTTTGATTTACCACTATATTAATACTACTATTGTATATTACTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:1 - chr2R 19089040 5' + Tabor 17 2 55.45 ATTTCCTAATAGAATTCTTTTTTTTTTTCGAAGGGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 - chr2R 21747589 5' - mdg1 378 2 65.35 TCCTACGTGCGTATGACCCCGGCTCTATTGCTTTGTTTTTTTGCTTCGTCCGTGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGA:1 - chrX 20253473 5' - 412 253 2 57.43 TAAGAACACACGAACATTGTAATTTAAGGAAGAATATAATAGAATTCATCATGTAAATTCGTTTGTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTT:1 - chr3L 27383209 5' + 1360 3189 1 57.43 ATTGAAGTTGGCCGAACAAAAAAACACACCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chrX 19334639 5' - roo 9025 2 73.27 AAGTCGTTGATTACGTCATAAAAATGTATGTTTAGTCAAATATTAACGGCACAATATGTGGACCTTGTACCCGGGCGGGCCGTGCGCAAAAAGGGAAATAA:1 + chr3R 7400725 5' + gypsy8 306 1 59.41 TCTGGCTAAAAAAGCAAAATAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 2176357 5' - roo 9018 2 81.19 TCACATCACTTTCCCGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chr2L 15898826 5' + F-element 33 1 59.18 TTAGAATTATTGTGTTATCTTACTTGTCTAGCTCTTAGTTAGGAGTTGCATGAGCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCAAGTAT:1 - chr3L 5385987 5' + Cr1a 4209 1 53.47 GCAGGGTAGTTACTCTCTATGTGGTTTAGTTTTAGGTTCACATAAATGCCGGATGGAAAAGCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2L 8577359 5' + roo 14 2 66.34 CACACTAGAGGGTGTGAAAGAGTGAAAAGCCCCCTCCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGTGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTT:1 - chr3R 7444130 5' - baggins 5089 1 64.36 CGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 + chr2R 17963256 5' + blood 57 2 85.15 ACAAGGAATAAAATTCAAAATCAAACCTTGTATAATTAATTATGTCTTAGACCTTAAGTTTTGCAAACAAATAATGTATAAAAAAATAAATATAAATTAAA:1 - chr3L 12731852 5' - S2 97 1 34.65 GCGACTTGGGCTTGCCGCAAATTGAACTAATTTGATGTGTGAACAACGGCTAAAATGGAGCAGGGGTGTCCTGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 + chrX 2841741 5' + hopper 1 2 78.22 TTGAGCTGTGCTTTTTAAGAACCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 + chr3L 16562307 5' - pogo 2050 1 76.24 TCTTTCATCACCCTGCACGNCCTCGTCCGCGTTTCTCTGCGCAATATTCTCTGTTCGTCTCTTTATATATATATATATAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 8010416 5' - accord 184 2 53.47 GCAGTGCTCAAACTGCAGCCAAAGCACAAAACCAAACAAAACATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chr2L 13566562 5' - hobo 2927 1 70.30 ACAGCGCTTTAAGCGAGATGCTAGCTTTTATATTAAAGTAAGCCCTTAGTTTTTAAATCTGGCATAAAAGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3L 11755657 5' - roo 402 1 60.40 CACATACATGATAAACATAACTTAACATTGTTGGTCCTGAAAAAATATTGTGTAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAA:1 - chr3R 24314757 5' + X-element 32 1 46.46 TGTGTAATGTGTATTTTGGATTATTTGTATCACATGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAA:2 + chrX 22689519 5' - 1731 303 1 67.33 AGCGGGGCTTTACTGTTGGTGTTGCAATATCCTGTAATGATGAACTCCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chrX 21060321 5' - 412 7500 2 64.36 TTAAAAAGCATAAGAGCTCCTCATCCCAAGCTTTATCACCTGTAATTAGTCACTCTTAATCAGTTGCCCTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 - chr2R 10956993 5' - copia 248 1 71.29 CGGTGTCAATTGAGTTTATTTTTTTGTTTTTTTT:1 - chr3L 9288066 5' - HMS-Beagle2 489 1 67.65 TAAAATCAGATTGTGAAATTCCAAAACATAGGCATTCCTAGCAAAAATAACACCTATAGTCCTATTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 + chr3L 15033289 5' - I-element 5343 1 57.43 AAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATG:1 - chr2L 21570245 5' + Dm88 37 2 62.38 CGGAGTCCGCCGACGCCTCGGAAGCGCTGTGCTGGGAGTGATCCGACGATTTCCCGAACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCGAAATTT:1 + chr2R 7496195 5' + Doc2-element 495 1 59.41 TGATAGTCAAGCAGCCATAAAGACGCTCAGCAAAGCTAAGATAACATCTAAGCTAGTAAATGAAGTGAGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGG:1 + chr2R 4330780 5' + baggins 5231 1 69.31 TCTCTCCTGCACTCTCTTTCGCTCTCGCTTCGATGACACACTTTTCGACATATTTAAGTAGGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr3R 24767776 5' - P-element 2874 1 64.36 TGAAAACAACTATTTTTGATTGTGCGATTTAGGGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 - chr3L 5710304 5' + Transpac 40 2 64.36 TGACATAGTGATAATAACTATAGAGCATATCTGCAAACAGGTTTAAACCAAAGACACTAGAATAATATATTGTAATAATAATAATATTCTAGTTTCTTTG:1 + chrX 21097429 5' + Tc3 310 1 74.00 GGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGATCCTCGGACT:1 + chr3L 17181468 5' + jockey 4714 1 64.36 GGGAAAAGATTCCCAAAACGTGGGTCATATAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3L 171188 5' + 1360 46 1 71.29 ACAAACTTGGAGCTGGAGANCTTTTTCTTCAGTTTGGCACTAGTGCGAACGGTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCG:1 + chr3L 6034210 5' - 412 298 2 55.45 CCAAGTAGTACGGGGGCGTATCGAAAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:2 + chr2L 10625654 5' - roo 395 1 66.34 TGCCGCGGGCCACGTAATTTAATTACCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 - chr2R 6847310 5' - mdg1 7409 2 74.26 GGTGAATGTTTAAAGACAAATTTAATTAATTTGAACTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 + chr3R 4474181 5' + copia 4911 2 72.28 AACCATAAAGTTTATAATTACCATAAAATTTACTTGTTCGGTTCGTTTTTGTCCTGAGGTTTCTTCATGATGGGAGCAAAAAAAGAAGAAAAAAAAACTTT:1 + chr3L 5711409 5' + HMS-Beagle2 491 1 59.41 GGGGTAGAGTCGTTTATGTCACGTCCTCGACCTTTGTGCCTTTTCCCCTT:1 + chr3R 7304467 5' - Rt1b 182 1 56.00 AAAATCAAATAGAATCAAATTTAAGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTAC:1 + chr2R 10558108 5' - Bica 231 2 76.24 GCCTTATTGCAAGTCTTTATTGATTTAATTGAGGTAATAATAAATTTGTGGGCCTACTTAAAGAAGAAGGTTGCAAAAAGGGGCCCCAAAACACGACAACA:1 - chr2R 18304096 5' + S-element 1290 1 57.43 GATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTC:1 + chrX 21087585 5' + mdg3 30 2 54.46 ATTTGCACACGCTCAAATCTCAAATCTCTGGTCGCAATTCAACCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:1 + chr2L 10898395 5' + jockey 4704 1 57.43 GTGTCCTTTCTGCCAGCCAGTCCCATTGTCGAGCCCACTTGAGAAGAAATGTCTGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCAC:1 + chr3R 18704807 5' + 412 7168 2 59.41 GATGCCAAAGCAATTGGGTTTATGGTCGTTTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr3R 6034007 5' - roo 9030 1 68.32 TGCTCTTGCCTTTGACCCCATTGGGACCCACACCACGTTTGGTATGGGGAAACATTTGGTTTAGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGAACTTTTT:1 - chr3L 14624009 5' + hobo 6 1 65.59 ATAGCGGGGCAGCCGTGTCCTTATCAACAAAATCAACCGCAATACCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCA:1 - chr2R 18680547 5' + F-element 332 1 62.38 TTCGTGTGTTTCTCAAGCCCTGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chr2L 7810735 5' + P-element 55 1 24.75 TTAAAGGTGAGCACACGAGCGGGCGGGTGTCATTACCCACTATGCCTGACACTAAATGGAATCAATTCTCAGTAACCCAACTAAAGAAGTGGTTGGAAGCT:1 - chr2R 17845280 5' + invader3 362 1 72.28 CTGAGACTGTGATTGTTATCAGAGCTAAACAATCCCGTTATGTTAACCTAGGCAAAGAGAATTAAGTTTTATATTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 - chr2L 22925406 5' + 412 77 2 79.21 CAAGCGCTGCATACTTGGGGGCTGTCGACACCACGACCACAATCAAAATGAATGGTCACCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr2R 23671855 5' + hobo 18 1 57.43 ACTTGTTTCGGATTAGGTTACGGTGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 25021665 5' - roo 9052 2 60.40 TATGTAAAATCAAGAAAAAAATTAAAACATGGATAGGAAAATAATTTAATAAAAAAATAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCC:1 + chr3R 2527744 5' - INE-1 556 1 55.45 ACAGAGTAACAGGAGAGCAAACCAGCGAATTGAAACACAGCTGAAATGGCAAAAATGAATCCGATTCAATAGGTTTATCATCATTATCATCGTCTAAAGTT:1 - chr2L 12956883 5' - Juan 265 1 39.60 AAAATAATATTTTTATTGAGATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 9278398 5' - roo 9042 1 56.44 GATTTCTTGTACGCACATTTTTTAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 8582620 5' - roo 385 2 55.45 ATCAATGGCAATTAGTGCGGAAAATAACGCGGAATTTAAATTTAATTCCTTTCGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 - chr2R 1737826 5' + I-element 23 1 55.45 TGCCCGCTCCGAGATTTCCCTTTATCTAATTTAATGAGCAGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTATTCTTCTT:1 - chr3R 6154016 5' - mdg3 5155 1 60.40 CATTGCCCGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGGAGATCTGTTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAA:1 + chr2R 4906444 5' + INE-1 146 1 60.61 CAACCAGCGAGACAACCAGNCTGGCCACATGGTACAGTGTTAAAGTGGTAACAAAAGATCACCAGACGCGGCACTGAGGATGTGGATGTAGATGTGGTAAC:1 - chr3R 19287909 5' - gypsy5 6941 2 80.20 GGGGCGATCGAGCGAGGTAAGTCAAGACTGAAAAATATTACTACGAACTATGATGAAACATAATATCATTTTATTATATTTTTATTGTTATTATTATTATT:1 + chr2L 14853265 5' - mdg1 22 3 70.30 GGCGACAACTCCATTAGAATTCAATTTTCGAGGCAGTCGCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 - chrX 14651143 5' + P-element 37 1 42.57 TCTGGGTGAACCAAGCGGGCATCCCTCACATTCTTTGTGGATTAGAATTCCCCAATTTACAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGA:1 - chr3R 5691033 5' + FB 18 1 61.39 GATCTCAGCCAACAAATCCTCTTCACAATCCCCCACCATTTCTCACTCGAAATATTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 + chr3L 3596664 5' - copia 234 1 55.45 ACCACAAACACTATACTATATGATCGGATCGATTTTAAAACACATCTACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTTGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACT:1 + chr2L 19549941 5' - hopper 369 1 55.45 TGGCTGCTTATGTACCTGTTTACATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 - chr2L 20567876 5' - 297 6928 2 79.21 GCGTTTGTACTTCAAAAGTCTGTGTTTGCCCAGGTTGTGGGTTCCGAAGGTTCTAGAGGTTCATTCCGGTGGATCTGGATGTGAGGCTAGTATTTCATTGT:1 + chr3R 24299034 5' - Doc3-element 4505 1 75.25 CTAAAGAATATTTATACGAGAAAGTGATTTAAGTACGGCGATAGCTTATCATTGTTCAATACTTAAACACTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 + chr2R 22051439 5' + Tabor 7 2 70.00 GATTGTGTTCGTTCCGCTGGTTTTTGCCCAATGCCAGCTGATTTAACAAGGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATCTTTAAAGACTTACAATTTTGGG:2 - chrX 11017064 5' + roo 25 2 51.49 GCACAAACCACTATTTCTAATAATTGCTTTTTAACTGTTTCATTATTATAATGTAATGATGAACTCCCCTTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chrX 7788670 5' - 412 7518 2 51.49 TATCAATAATTTCTTCAACAGCTCTGTTTTCGTCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGC:1 + chr3R 10800076 5' - Tirant 8269 2 75.25 TGATTGGTCCTTACAGCTACTGTGTAATTCCATTGCTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 + chr3R 4971383 5' + F-element 24 1 64.36 CATTCTCTCGAAGCTTGGTNATTGCTATTGGCTGCACCCATGGAAGGCCTAGCTCTAGTGTTTGCAGCGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCG:1 + chr2R 13985425 5' + R1A1-element 110 1 70.30 AATGGAAAACAATGTTGAATAGCCAAAAGCCGGAATGTTCTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chrX 9774990 5' + 412 36 2 59.41 ATGCGAATTTTTTCACTTTATTTAACGAACTTCTTGTTTTATAAAAAAAAAAAGATTCTCAAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - 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jockey2 256 1 54.46 ACTTGCCATATTTTTTTTTTAATTTTCCCCCTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTACTTTTATTTTTAACGAAATCAGCC:1 + chr2L 13566353 5' - hobo 474 1 66.33 TTAGATATTGCTTAGCAATATTTGATTCAAGTTGAGCCCCATTTAAACGAGCAAAGTGAGAATAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chr2L 22241818 5' + pogo 10 1 67.33 CAGGGTCTGCCAGCACTTAAGATCATAATTAGTGTTTCTTGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 - chr2R 24555708 5' - hopper 1398 1 62.38 GAAAGAAATTTCGCTTACACCATTTTGTATGTATATAATATTATTCTGTGTGGTGATGTTGAAGGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAACGGAG:1 + chr2L 7964800 5' - gypsy7 291 1 59.38 TCCTCTCCCCCAAATGGAGCATAAAAGTTTCAGTTAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTT:1 + chrX 4264350 5' - mdg3 207 2 61.39 TGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCAAAACTTCAACTAAAAAAAAAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTA:1 + chr3R 23020830 5' - INE-1 574 1 47.19 CCGTGAGAGCTGAAATGAAAAGCAACAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chrX 2530554 5' + pogo 44 1 74.26 TTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCTCACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - 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mdg1 387 2 63.04 ATACCCAATTTTGATTTACCCATTAATGCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTA:1 - chr3L 27355327 5' - mdg1 308 2 72.28 ATAAATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 + chr3R 11151808 5' - mdg3 228 2 61.39 CATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2R 9870968 5' - roo 391 2 61.39 TTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCT:1 - chr3R 2689428 5' - diver2 4473 1 63.37 AAATGTGCAAGCAAATACCAACACGGGTAATATGCAAACAAAGGTATATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAA:1 - chr2L 15567178 5' - 17.6 7395 2 58.00 AATCGACTCAATACACCATTTAATATAATATAATTTTATGTTACGTTAAGCAACCAATTGAATTGCTTTACAACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - chrX 11088313 5' + blood 7013 2 75.25 TTACCTTGTTTTTGGCCAGTCACCAGCGTGGACAGTAGCCCTCGTGCCAGTTCCAATTTGTCGAGCGCTTTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAAT:1 + chr3R 11662103 5' + FB 7 1 72.28 GAAATCTCGGCCAAAGATGCCGTTCAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 13763158 5' - roo 405 1 69.31 TTTGTTCGTCACTTTGCTGTTGTTTCGCTCTGTGTTTTAGCTTAGTCTGGGAATTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 17356350 5' + hopper 144 111 71.43 TTTCTGTACAGAATTCTAATGTCCTTTGCTCACTGTACCTGCGTAACATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCT:1 + chr2L 7937241 5' + jockey 4549 1 53.00 AATTCCTGCGTTTTTCCAGGAATTCACTCAATAAACTCAAACAAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTCCAG:1 - chr3L 609491 5' + Stalker2 114 2 57.43 CTCTGTTATTTTGAATTTTCACTTCATTTTGCACAACTTAATTTAATTTAACGACAAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTT:1 - chr3L 14003388 5' - Quasimodo 349 2 65.35 CTCTTAACCTAGTTCCTAATCGATCACGCATAAACGGAGATATAGTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chrX 19334582 5' + roo 29 2 55.45 GCGGCGATTCGAGTCGAGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 10488701 5' + roo 8722 2 82.18 ACTCTTCTGCCAGAAACTCTTTTTCAACGATTTTAGCATTTTCTTGTTTTTCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 8503100 5' + roo 8688 2 51.49 CACTTAAGAAGGAACTTGCGCTCAGCTGCTCAGTTTGGGTTCAATATACAAAATAAACATGAAGATCAACCTGAGAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCAT:1 - 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chr4 74348 5' + 3S18 5778 2 66.34 TGATCTGCCACAGCAAATCATAATTGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAG:1 + chr2L 21073403 5' + F-element 4469 1 75.25 ACATACCCTTATCTTGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr3L 6033593 5' - 412 7513 2 57.00 CATTATACCTTTATTATTTTGAAGGGGCGGACACGATGCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 + chrX 15255354 5' + Tabor 39 2 61.39 GAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2L 8577271 5' - roo 9041 1 60.40 AATTCAAGTCATATTCTGTGCAATGTGATGAACAGAGTTACCAGTATTGTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:2 + chr2R 20312579 5' + 1360 25 1 52.48 GTGTGTACCCCTACACATACATATGTACATGTGTAGATGTATCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACGC:1 - chr3R 10095095 5' + Rt1b 5011 1 59.41 ACGCAGTATCTAAATTTAAATTCGGTTTATTTTCACACGAAGTGGTGTGTGAAATTTAGCAGATTCGGTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 + chr3L 11929246 5' - 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I-element 5310 1 68.32 CTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTGTGGGCGTGATAATTTTGTGTTGTTGAGAATGATGTTGAGAATCCCGACTTGAATAGTCGGCTTAACTTCTCTGT:1 + chr3R 2473817 5' + Cr1a 4089 1 53.47 GCAAATGAACAGGAAGAAAAGGAGGCCCCCAAATGTATGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 + chr3L 13895339 5' - hobo 2929 1 67.33 TTTTTGCTTTCAAAGTAGGGAATGGAGTCCAAAAAAACTACTTAGCTCATATATTCATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 + chrX 22734031 5' + copia 4888 2 48.00 CATATTCAGTATCACGGATCGGACGAGCTTCTTAAACCGAATCTTGGTTTACAATCTTATCGTTCTTACATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCC:1 - chrX 16006301 5' - invader4 3081 2 58.42 TCGATTCTAATAATGCTGATCACTCGAGAGGTCTTGGGAGTAGGCCGATCCCACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 + chr3L 17874108 5' - mdg1 7412 2 62.63 GGTATGTGAATCTAATCCCTAACCCAATCGACGCGCCCCCTCCAACCCACCATCACTCCGCATGGTAGTCGAAAGAAGGGAACGATTCTATACGATGTAG:1 - chr2L 20876891 5' - 3S18 460 1 56.00 TTATTTTTGAAGTGTACATATGTGAGTAGTGCAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGT:1 + chr3L 21518991 5' + 1360 45 1 70.30 ATCGAGTACTACGTTGAGTGCCTTCCGCCTGACTTTCAGCTGAAGTCCTATTTGATTTAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAG:1 - 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chr3L 14594203 5' + hobo 8 1 70.30 GGCTACAAAAAATATGTTCGATATGCATAAAAAGTCAGTATTTGCTGAAAGTCAGGGCAGTACTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chrX 17494706 5' - 1360 3375 1 64.36 TGGATGTTTAATAAAATTTGAGTAATGGATGCGGTCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 - chr2L 126539 5' + Doc 45 1 69.31 AAATGGGATGTCAGTTACTATTATTGGGCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTAT:1 - chr3L 21609249 5' - 412 7238 2 72.28 ATCACAAGACATGACTGTTCAAAAAAAATTCGTCTTAAGGCGATAAAATTCTATATTGAAACCAATCTGGTCCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCC:1 - chr3L 11718887 5' + F-element 4276 1 54.00 GCTTTCGGCAAGATTAGCCGGCTGAAGGGATGAAGATACAGCTGGTTTGCAAAAAGTATGTGTACCCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chrX 15287950 5' + hobo 8 1 67.33 TGAAAAAATGAAACTTCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:1 + chrX 22789325 5' - Tabor 7287 2 64.00 TTAAAATAACGAACTGTGACTTGGAATTAAAGGTATAGATTCAATAGTACTGCTTTTATGTTCAAAAAATAATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2L 8574548 5' - roo 8996 2 77.23 CCAGCGCTAATGAATTTAATGGAAAGCATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:2 - chr3L 9910446 5' + 297 11 2 67.33 GAACTCTTTAGCGAGGACGAAGACTGTGATGGCTACATTTCGGAGCCGACCACACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAG:1 - chrX 7957907 5' + jockey 169 1 56.44 GTCATAGATATCATAAAATNTGTCATCGATGCGGCGAGAATTTTGGGGGGATTTTCGGTGTATCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCT:1 - chrX 2107189 5' - hobo 2694 1 65.31 AAAAAACCAATTACTGTGGAATCGCAATGCAATTTTTCAACTATTTTGTCGGCTTTTTATGCTACCGCCAGTGCTGCGGCTTATATATTGATATTTAATAT:1 - chr2R 14090154 5' - Dm88 4134 1 65.35 AAAAGGATGAATGCATTTCNGCTAACAGTTTTTGGTGGAAACTATTTTACTTCTATCTAGCTGGAAGCTTTCCCGCTTCTGGACAAGAATTTAATTTTTTG:1 - chr2L 19203306 5' - G2 3021 1 78.22 ATATTATGATTTTTCGCCATCTAAATTAAATTTAAAATTTAATCTAGAAACTGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 11260243 5' - roo 9045 1 55.45 CAGATAGTCAGCTAGTCAGACGCAAAACCTCCTCCTTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCAC:1 - chr2R 14997918 5' + McClintock 5985 2 65.35 AGTCCTTAACCAATAAAAGAAATTATAAATATGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGA:1 + chr2R 4164560 5' + 1360 93 1 68.00 TATATCACTCGTACATGCTGGACACAACGCCTTCTGGGGTGTGTGTGTACGAGTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:2 - chr2R 8311382 5' - opus 479 2 60.40 ACAACAACAACGCCTCTTAAAGGCGAAGAAAAGAGCGAAAGAAGAGATAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCT:1 - chr3L 4543168 5' + 1360 51 1 56.44 CTGACAACAGAACCTTTGCCATCACCACACTTAGTATGCAACATTCTATCACATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACA:1 + chr2L 1204753 5' - Cr1a 471 1 79.21 CCAACGCATAAACACACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:2 - chr2L 7666172 5' - roo 9039 1 58.42 AATACCAACACGGGTAATANGCAAACAAAGGTATATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCC:1 - chr2L 15567165 5' - 17.6 7384 2 70.41 AATTGGCCACCTGCTGCAGTCATTAAAAATTGGTTCGAAAATATTTAATCTCATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTG:1 - chrX 7292745 5' - 3S18 6080 2 53.47 GCAGCTCTGGGATCAGGAGGCCCAGGAATATAACCACTAGACAGTACAGCAGGCACAGACACTCGACGGTGTTATTGTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTT:1 + chr3L 678196 5' - Doc2-element 236 2 55.45 GTTTGTGTGTGTATGTTTCCTATACAACCCCTGACCCCCTTGATATTTATTTACCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGGT:1 - chr3L 21471678 5' - I-element 5182 1 58.42 GGCATCACCCTGCCTCTGTTCCATCTACGCTAGATACACTTATAATGATGTCGCTTTCTCAATCTAAACAAGAAGCGTAAGTGGCCACGTCCAGCAACAGC:1 + chr2R 14812115 5' - micropia 5198 1 64.36 TACGCTTCATCCAGTGCATAATGTAATGTTAAACTGAATGTCTTTCTTGTGATAACCAAAGAGATAAGTCCCGTTGCCCTTCGATTCCGTTAGATTTGCCG:1 - chr3R 8376534 5' + diver 453 1 71.29 GGTTATTTCGTAGTACGTGAGTCGAATTTAAATTTCTTTGCCAAACACCTACATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGA:1 + chr3L 11828993 5' + Transpac 13 2 42.00 ACGTGTGAAATTATCATTATTCAATTGTGTTTTTGGGTAAAGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr2L 7666106 5' + roo 8698 2 59.41 GATCCGTTGCCGTTGCCCANCGATCACCGAGATCACCTGTCTTCATTTTATGGGCCGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr3L 3650029 5' - mdg1 7438 2 56.44 AACGCTGCGAGCTGACTTTCTGAAAGGCTGGGAGAGGGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr3R 7626445 5' + hobo 35 1 60.40 CAACAAGTCAGCGGAATCTAAAACCGAATAATCCGATTACAAGCCATACACGTACTCCATATATATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCC:1 - chr3R 25750255 5' - micropia 447 2 71.29 GCGCGCTTTAAGTGTGTTTCTGTGTGTGTAGGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 + chr3R 17053072 5' - hopper2 1567 2 64.36 GTGGAGAGCGGCCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGA:1 + chr3L 25272521 5' + 1360 11 2 73.27 GGCCTGAATGATAGGGTGGATAAGGTTGCCGACATGCGTTAAATCCTGTCGGCATAACGGCTGCTGTGAAAATTGATCTGATCCCCAAGAGGGGTAACTTT:1 - chr3R 19405673 5' - G5 4522 1 56.44 TATTGTGGGAAGTATTGCCNTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATG:1 - chr3R 4474233 5' - copia 217 2 66.34 CGCAGCCATTTGCACACGCTCAAATCTCAAATCTCTGGTCGCAATTCAACCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 + chr2L 10898388 5' + jockey 4697 1 53.47 ATTAATTTATTTCAATTCACTTCGCCATCTATCATTTCCAATATTGCATTGAACTGAGCCCACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:2 - chr3R 20684943 5' + roo 8680 2 63.37 CACACGAAGTGGTGTGTGAAATTTAGCAGATTCGGTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr3L 11929279 5' - copia 248 1 63.37 ATCCACCATTAAGTGGAGGTTGTTTTTTTTATTTTTTTTTTAAAA:1 + chrX 5507695 5' + hopper 153 7 80.00 AGGTCATCTAGAGTTAAGCTGAAATAGGTTGGCTTATGTTTCAAATCTTTCTAATAAATCGTAAATCTAAATTATCAATATCCAATAAGATCATAATTTTT:2 + chr3L 15125882 5' + Juan 3767 1 59.41 CTAAGCGGATTATTTGGGAAATATTTATTGAATGCCAGCTAAAGATAATTGGGTATGTATTGTCTTCCCGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGA:1 - chr2R 15003324 5' - McClintock 213 2 73.27 ATTTTGAAAACTTTCTGCTTGCATAAGCCTGAGTGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTA:1 + chr3L 15029620 5' - Ivk 337 1 66.34 CTGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAACCCGCCACTCGCAC:1 - chr2L 13566520 5' - hobo 2933 1 56.60 AATTCGCATTACTTTCGTGGCATTATGCTAATTGTCATTTATGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGC:1 - chr2R 23669944 5' + hobo 2922 1 57.14 ATCCAGAATAACAAGCGGCGGCGATTCGAGTCGAGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 10488684 5' + roo 8705 2 65.35 ATGACATATATATATATATATATATATATATATATATATAAGAATATGTGCGATAGTATAAAACCACATATACATACACACACACACACACA:1 - chrX 13399979 5' + Quasimodo 34 2 65.22 CGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACT:1 - chr3R 10736145 5' + McClintock 5952 1 76.24 CAGCTCCATAGCCGAGTTGNTAGTTAAATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chrX 13146896 5' - roo 395 1 64.36 ACCGTGTGGCGGCTAATGGGTTAATTAAAGCGATGCCACTGCTTAAAATGGGTCTCGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGGTGGAGGTTCTGC:1 - chrX 7839871 5' - gypsy4 6358 1 67.33 CACTTGCCAACACCATTTTAGTCCGAGAGTTGACAGACATTGTTAAGCACTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCC:1 + chr3R 26761735 5' - mdg3 168 2 55.45 ATTATTCTAAACAATTTTGCAGCATTTAAATACAATCAGAATACACAGAAGATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr2L 11478669 5' - opus 474 2 55.45 AAATTGTCTTGTGATAAGAGTTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1 + chr2R 21074173 5' - jockey 4948 1 80.00 CTCCGGGCAGCAGGCTGACCAGGCATTTAACCAAAATGCCCGTCTTCACAAAGGCATAGATGAAGAAGATAAGATGATGAAGATCAATGTAACGACGATA:1 + chr2R 16588593 5' - Ivk 91 1 67.00 TTAGCTGTATAGATTAGTAAAGCCACATGTTATTTATTGTTGTGCAAATGTTTTGCTGGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTA:1 + chr3L 13299202 5' + F-element 4462 1 53.47 CGCCGCTGGCCAAATATTGATCGACCGACGTGCTTGAGGTACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr3R 7626384 5' - hobo 2907 1 58.59 ATATTTTGATCTTTAGATACTACCTATTAAATTCTTAAGATTTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTT:1 + chr2R 21364841 5' + mdg1 7411 2 59.41 GCTCCGCCGCAACAACCGACAGGCCTACGCCGTCAGCGAGCTGGCTGGTGAGTAAACTGTTTATAACTCCTCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCG:1 + chr3R 27923259 5' + mdg1 152 2 69.31 ATCAATCAGTTGAGACGTTGAGTGTGTGGGATGTGCGCCAGCTGCCGGATGCTAAAACATATCCGGAATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCA:1 + chr3R 21003521 5' + Doc 4333 1 73.27 TTGCCAACACTTTCCAAGCTGGACGCAAAATACATGTTCTATATACTTTGTCTGCGATATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:2 + chr2L 5419776 5' + 297 6587 2 72.28 CACACTACGAGCACTTGATGAGCAGCCCATTGTGCGTTGCGTTGGAAAAATCAGTATCTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCG:1 - chr3R 4541495 5' - opus 80 2 64.36 CGAGGAGGGAAAAAATCGCGTACGCCCGAAAGTATGCAACATAATTAAAAATCAATGGCATACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 + chr3R 11320995 5' - hobo 2926 1 66.34 CGTCTTAAGCTGAGAATGGTCCTCTGAGGGGACGGCCTATCAGGAGAAATGAATAACAATTCTTAAGCTTAGAAAGGAAGGAAAAACATATAAGGACATTC:1 - chr3L 13749723 5' + HB 414 1 61.39 CTTAACCCTAACCAACTTCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chrX 21217553 5' + pogo 7 1 62.96 TATTACAAATTAAACTCAGCTATCTTTAGTATTCTTAATTTCAACAGATACAAATGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 10110622 5' - roo 389 2 55.45 GCCGGCTCTTTGGCGAGGTGTTGAGCATTTTGTTGGAGTTGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTA:1 - chr3L 21113644 5' - Doc 274 1 61.39 GATTTGTACGTTTTGTGCCTGCACATTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 + chr3L 18762082 5' - pogo 2056 1 72.28 AGTTTGCTCAATGAGGATGGGGTGTAAATATTAGTTGATTATATTATGGGATCCGAAGTATCCTTTGCTCTGTGAAAGAGATCTGCGAAGCTACAAATACG:1 + chr3L 17863647 5' + hopper2 230 1 69.31 TCTGTTGCAAACTCCGTGCNCCGCTCCTGGTTGTCTGTATATTTAAACTCAATTCTAGTGTAATGATGAACTCCCCTTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGT:1 - chr3R 28565342 5' - 412 7525 2 56.44 TTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAG:2 - chr3L 10474196 5' - copia 211 2 73.27 ACAAGAGGTAATTAATGTTGGAAAATAGTAATTAATATTTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGG:1 - chrX 14173055 5' - 412 456 2 60.40 TGTCACTTAGCAGCCTTGCCACTTTACTGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTC:1 - chr3R 10110175 5' + Doc 423 1 72.28 TTTGCTTCGGCGGTGGTGGTTTTCTCAAGTGGTGAATTGCACACATTTAGCGGCTGCATTGCACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:2 - chr3L 10363903 5' + P-element 12 1 68.32 CACCCTCGTAAGCCTACATCGCAAAATGTTGCATGTTTTAGCCCTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chr3L 14623924 5' - hobo 2908 1 55.45 GTTATTCTAGTGTCTTTGATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTAGCGAAACAGAGAGAATGCC:1 + chr3L 11474689 5' - invader2 4946 2 79.00 TATATATATTTGTGCATTTATGTTTGCTGAATTGCTTAATGTTATGCCTTATTTCAGAAATGAATAATATAATTTGAATAATTTTTTTTTCGAGTGCACAC:1 - 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chr2L 7666168 5' - roo 9035 1 62.38 AGGCCCCTTGAATTTTGGCCTCTCTTCCCTTTTAAAAAGCACAAAATCTCCTAAATATTACAGCCTAAACATTCAATTTCTTAAATACTCTTAATCATATA:1 - chr3L 28046547 5' + jockey2 3272 1 58.42 GAGTATATACATATAAATTTATAAATCTGGCTAGTAGAGATGCTTAAAAATCAGATACATCGGATATGAAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAATAAA:1 + chr2L 12766063 5' + Burdock 305 1 69.31 ATATAAGTAGCAACTAATTTTCAAGCTGATGCAATCAGTCTGATTGGCCGGTGGGACCCGTGTTCTTTTCAGGCTTTCGAGGTTTGTGAATCATGGAGATA:1 - chr3L 13366434 5' - BS3 385 1 64.36 GATAGAACAGTTGAAAAATTGGAACAATTATCAGTTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 11916555 5' + roo 8701 2 63.37 AAGTTTCCCAGAATAGAGTTCTTGTGCACCTATTCTCTCGCTCCCACTCTTTCGCTCTCCCACGCAAAATCTAAAATTTCTGACTGCTCTCTTGCGGTTCT:1 - chr2L 20792860 5' + Cr1a 347 1 76.24 TCTAAGCACACTTGCCGAACAGGAAGTAAATCGGCAGAAATCAAGCCCAGCGTCTGCATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACAC:1 + chr2R 4500848 5' + springer 15 2 64.00 TAGATGGCTAGATGTCGCACTCGGCCCAAAGGACCAAAAGACGTCGAGGAGGAGAGTGCTGGCCTGAAGCCAAAAGAAGGCCCTAAAGCCGCCCAAAACT:1 + chr3L 22703035 5' + INE-1 346 1 76.00 CTGTGAATGCCTGCCATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTA:1 + chr2R 9870954 5' - roo 9068 1 75.25 ATTTGAATACTGTCGTACCAACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCT:1 + chr2L 14793472 5' + Stalker2 7261 2 66.34 TTCTAATTGTTAATTGTTTACTTGACTGTACGCAAATTTTTGTTTAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 15800891 5' - roo 9043 1 59.41 GCGAATCTAAATTAGCGGAGACACCATACCATGTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGG:1 - chr3L 17669767 5' - R2-element 3339 1 67.33 GAGGGGTTTTCAAGAGGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTA:1 + chr3R 7783723 5' + rover 6956 2 72.22 TTAATTACAAGCGGCCGCCAAAATTAGAGTTGTGCGCGTTTACCGTGAGTAAAATTGTGTGTATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCG:1 - chr3R 10229681 5' + accord 7043 2 63.00 TCTTCAAAGTTTAAATTTAAATAAAAGTTTTACAATGATTACCAAATTATTTATCTATTAAAAGAAAGATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 - chr3R 20421016 5' - blood 370 2 65.35 TGCTGATACTAAGTTAGCGNGAACTACATAGAAGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAT:1 - chr3R 4355452 5' + gypsy4 47 2 94.00 ATTAAGCAGATAATTCCACCCATGAAGTTGTCATCTTTATGATAAATGGCTGGGAAATGTGGAAGCGGATTTCTGGCTTTTGTTTTTCCTTCTTTTTTTTT:1 - chr3R 17174416 5' - Doc2-element 231 1 65.35 GTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2L 4063710 5' - roo 355 2 76.24 CTGAACCTGGCCAGGTAACCACACTCACAGCTCCACTGGTTGTCGGCCAAGCTGATCTCCACCAGGTAGGGATTAGGCACTTGTCGTTTGACAACCGAGCT:1 - chr3L 15340208 5' + Circe 290 1 79.21 ATGAGACCATCTTGAAAATGAGCAGGTTGAGGAGGCTGATGATATAGGAAATGCTCACAAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTT:1 - chrX 14873801 5' + FB 16 1 51.49 CAGAAACGAGTTTCCTGTCTCTGAAATGAAATTTAAATAATGACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCACCTGATCAAAAATAATATAGATTTAAA:1 + chr3L 5620834 5' - 1360 249 1 66.34 TAATTTGATTTCTCGTGTATATCATTGGGTATATTATATATATATACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr2L 6569160 5' + 297 6606 2 68.32 TGCTTAGCTTGCTTTTGGTNGAAACCACCTGGACATCGGAGGGTATGATCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGTTGTTGGGGTGTACATTAAGC:1 + chr3R 9471229 5' - jockey 4663 1 50.50 TATCCTTTCAGTCTTAGACGTTTTTACGGCTAGAGAACCTCTTTGAAAACTCCCAATTTAATCAGATGAATCATATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTT:1 - chr2L 8880100 5' - I-element 97 1 77.23 GCTAAAGAATATTTATACGGGAAAGTGATTTAAGTACGGCGATAGCTTATCATTGTTCAATACTTAAACACTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 + chr2R 22051438 5' + Tabor 6846 2 68.32 CAAAGCTTGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3L 3757412 5' - roo 9041 1 62.38 ATTTCAGTAACGCTAAAGGTGAGCCAGATTGTTTCAGAACTAATTGTAAGCGTGCCTTTTGCTCTTATCTGCTCATTCTTTATTATAACG:1 + chr4 718725 5' + looper1 82 1 64.44 GTTTGGCTTCGTGGCTTAGTCAGCTGGCGTTTATTTATTTTTTTTTTTGTTTTTATTTTAAATTT:1 - chr3R 18841325 5' - TART-C 11097 1 70.77 AATTAATCAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 - chr2L 17677772 5' + Tirant 8142 2 63.54 CGCTCCTCCCACAGTTCGCAGTATGTACTTTCAGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTCGCGCAG:1 + chr2R 11993995 5' + jockey 82 1 63.00 TCCGATTACAAGCCATACACGTACTCCATATATATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTC:1 - chr3R 25750224 5' - micropia 417 2 68.32 AGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3R 29608788 5' - roo 9031 1 67.00 CTTGGCTTAGGCTTCGCCTCTTGCCCGTAATTAAAGTGGCCAGCGGAAGTGAACTGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2R 6107807 5' + roo 8678 2 63.83 GTTAATAAACATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTTCGTTCATATC:1 - chrX 23280958 5' + roo 8702 2 65.35 CAATTGTAACATCAATTTACTATCTGAAAGCATGCAAATACAGAACTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGGGCTGTATGGTGTTGTTTTTTGCA:1 + chr2R 5581962 5' + Cr1a 248 1 54.00 TGAAAATGAAGAGAACTGCTAACTTGTCTAGATTAGCCACACACGTACCAGAGAAATGCAAGGGAGCCATTTTTTGCCACTCGACTCACACTCAACAATTT:1 - chr2L 15081560 5' + hobo 33 1 74.26 TGTGTGATAGAAATCTAAAGCAGCCGTCTTTGTGGGGAATTTTTTGAGGGAGAATGAAACCCTTTGCTGCCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTA:1 + chr3L 13572000 5' + Doc 4498 1 75.25 GGGAAAGCGGGATCCTGTGGCAACCGAAGCAGAATTTTGTCTGCTGACGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAAA:1 - chr2L 12882809 5' - hopper 1387 1 49.50 CCGAAATGGAGCAGCCCAACACACATATTAGTATGTATTTGTGTTTATGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr3L 14594190 5' + hobo 21 1 57.43 AAGTGTATCATCGATTGCTAATGGGGCCCAAACTATTGATGCAACTGCAAATGCAACCAGCACCGTAACTAAAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCG:1 + chr3R 14253758 5' - R1A1-element 5029 1 56.44 GCGTCGCATCTTGGACGAACTGGAGGAGGAGGCATCTCGCGCAGATTGACAATGGAAATGAGGTACCAAGTGGCCGGCATACACTCGCGGTTTTATTTATA:1 + chrX 11150650 5' + 3S18 336 2 72.28 CTGCCAGACAGCTCGGAAAATTAAAAATTGCATTCCCTAAAACTTGTATTAAATGTATTTTGTAACTACCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 - chr3R 25581126 5' - pogo 2096 1 74.26 TGCAATTTAAGAGAGTAGAGAGAAAGAGACCTACTAGGTTATCAGCATCATTTGTAAATAAAAACAAGAGAGAATGCCATAGTCTAGTTCCCCGACTATCA:1 + chr3R 18346623 5' - INE-1 563 1 44.55 AATTTTAAATCTCTTAAAATAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:2 - chr3L 15037961 5' - roo 9017 2 82.18 GGAGGAGTCCTTCCTGGACTGAGCTATAAATGCCAACGCAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3L 13773950 5' + roo 8700 2 63.00 AATTGTTGTGAAATAAATAATTTTAAATAATTTTCACTCTCCATGACTGCGTGTGTACATGTGTGAGCCAAGTGTACGTGTGGATATGTGTGTGTGTGTGC:1 + chr3L 6620557 5' - accord 187 2 63.37 AAGATTTATCTGTGCGCGTTTATTTTAATGTTACGTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 + chr2L 10791994 5' + 412 9 2 70.30 CATTAAGCGGCCGGATATGGCAGCAATTGTGTCAACGCTGCAATAGTATTCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3L 8268142 5' + hobo 25 1 54.46 GATCGTTAAAGCCATATGTATGTAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chrX 17104392 5' + 297 24 2 59.41 GGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2L 13093794 5' - roo 9018 2 80.20 GACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGAAATGATGAACTCCACTTCAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chr3R 30553567 5' - 412 475 2 51.43 TGCATCAAAGGTGTGTCATTCTTTCGGATCAACGGAAGACTTGCGTGTGTCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr4 301791 5' + jockey 31 1 54.46 ACCAAAGTCCATTTGGCCTNTGAAGTAGCAGTCTATGTCTGATGAAAAAAAAAGGAGTAAATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr2L 13186227 5' + pogo 9 1 69.00 CTGGTAACGAATGTGATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCA:1 + chr3R 1418272 5' + BS3 209 1 47.52 TCCTATTATTAGTTTAATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAATTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3L 7099657 5' - roo 9045 1 56.44 AGACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr3R 7869105 5' + 297 19 2 59.41 ATGTGTGCGTATGGATTCATTTAAATAAAACCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAA:1 + chr2L 11711942 5' + Quasimodo 136 2 73.27 CTGGCCAAATATTGATCGACCGACGTGCTTGAGGTACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr3R 7626389 5' - hobo 2900 1 64.36 TATATATATACGGTTTAAACTGGCTGCTGGCCCGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:1 - chr3L 1697745 5' - Transpac 268 2 66.34 TCATTAGTCAAAGCATTTGCTAAGGAAAATTCCCAATTAAGCGTCTGCCGAGCCAAACAATGTGAAACGGGCTGTAGATTGTGGACGCCGAAAAATGAATA:1 + chrX 11032153 5' - invader3 277 2 70.30 TTTGAATGCATTTCAATTTTCCCTAAAAAAAAGTGCAAAACAAACTAAAATAAATTCTAAAAATCTAAAACCTAACTACAAGTTAATCAGACTCAGCCACA:1 - chr3L 20155360 5' + gypsy2 486 1 72.28 CGCAACAACAACAAAGAGGCGAAGATAGCCAAAGCAATTGTTGTTGTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chrX 2289337 5' - roo 9040 1 57.43 CGTTTACAGTTAGTGCGCTGACAGTAGCAAAGGTGAAAGACCAACAGCAATTATTGTACAGTGGAGCACCCCCAGAAAAACGCTCCACCAGGAAACGACAT:1 - chr2L 9327155 5' + mdg3 462 1 64.36 AATCAATGTAATACTAATATGCATAAAAAAATGAATGAATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTT:1 - chr2L 23369638 5' + Idefix 35 2 65.35 TGATTTCGAGTCATAATTCGTGCATCACTCCTCTCCCCCAAATGGAGCATAAAAGTTTCAGTTAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAA:1 + chrX 4264322 5' - mdg3 235 2 65.35 ATATATAAATTGGGAAAAGAGAAACTACACAAAAATACGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTT:1 + chr3R 27907630 5' - mdg3 208 2 68.32 ATACTATCTATACTATCTCTTTTTTTACAAGTGATGATGATTTGCGTGATCATAAATAGTATAGATAGTATTGATTATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGA:1 - chrX 15963964 5' - Ivk 4953 1 64.36 TGGCCAGTGGCTTAGTTTTTAGTGGGCACCCATTTTGTGGGCATTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAG:1 - chr2L 14480785 5' - Tirant 75 2 57.43 CAGGATGCAGATACACTCCNGCCATTGTTTGCAGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCG:1 - chr2R 13383569 5' + gypsy5 41 2 65.35 AATAACGCGGAATTTAAATTTAATTCCTTTCGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 - chr2R 1737804 5' + I-element 44 1 67.00 CTTGCAGAATCGGATGTCAAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3L 12241812 5' - roo 9043 1 56.44 TATCGCTTGGTCCTGGATTATCCTTGATTGACCTCAGCCTTGGCGTAATTAACTTGGAAATTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAA:1 + chr3R 4855188 5' - 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chr2L 18248073 5' + blood 11 2 68.00 GATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr3L 3757400 5' - roo 9029 1 72.28 TGAAATGTTTTATTCTGCGGAACTTAAATTTAAATGTTTTATATACATTTTTGTTAACGGTTAAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTA:1 - chr3R 20515802 5' - 1360 2970 1 67.33 ATCACATGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTA:1 + chrX 22689547 5' - 1731 4587 1 62.38 GGAAGTAGTATTCACTTCGAAAATTCAATCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chr2L 20328720 5' + opus 7045 4 70.41 ACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 6266310 5' - roo 362 1 72.28 GCGAGAAGGAGCCAAGGAGAAGGGTGGGTAATATGGCGGCGCCCGTGAGAATGGATAAGTACTTTTAATTAAATAAATCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTA:1 - chr3R 28986406 5' - GATE 435 1 75.25 GTGATGTGTCATTTGAAGAGGGGAAAAGAGCAGTTAAACCCCAAAAGACTGTGCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGG:1 + chr3L 14569390 5' + Doc 4270 1 60.40 CAATATTGTTCTTGAACAAGTCACTCATGAAGGCTTCCGGCGTCTAGGCTGGGAACAACAACAGTATAGACGAAGCAAGCAGTGAATAAACTGTGTCTGCT:1 - chr2R 5471151 5' + diver2 4464 1 53.47 ACAGCAGGTCGATGGGGGGCACCTCATCCTCGCTGGTTTCGTTCTGCGGTGAAAGGGGTAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chrX 17858073 5' - P-element 2870 1 58.42 GCCCACGCAGTATCTAAATTTAAATTCGGTTTATTTTCACACGAAGTGGTGTGTGAAATTTAGCAGATTCGGTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:1 + chr3L 11929242 5' - copia 251 1 72.28 ACTTGACTGTACGCAAATTTTTGTTTAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chrX 15800910 5' - roo 9024 2 76.24 AAGTTGGCCGAACAAAAAAACACACCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 19334635 5' - roo 358 2 77.00 TCAACGGCGAACAACAGCTGCAATAAAATTGTATAAGCTAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 + chrX 12906514 5' + P-element 37 1 42.57 TGTAAGTAAACAAATATGTAACAAACAGAGTTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGG:1 - chr3L 27391856 5' - Porto1 330 1 67.71 GCCGCGGCTAAAGTCGTTCTTTTGCCGACTTTTCCTGGCTGCCATTACGCAAGTCACGGCCATATTTTCATGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTGA:1 - chrX 13842002 5' + Ivk 5243 1 78.22 CTAATGCGTTGGTCGCCGCNAACTTGTCACCCACGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTAATTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAAC:1 - chr3L 5408347 5' - R1A1-element 46 1 67.33 CACAGTTCATCAATTTGGTTACCTCCTAGATTATTTAGTATGAATAAGCAGTCTCTTAAAGCAATCAATTTTAACTTTTTTGGTACATAATTAGATCCTAC:1 - chr3L 290540 5' + Cr1a 4280 1 59.41 AGCGTGAAAAACGCTTCCTATTATTAGTTTAATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAATTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3L 7099672 5' - roo 397 1 65.35 TTTTCTAATTTCCAATTGAGAAATTGCATCAACTTAAATGGGAAACGTGTCTACCCCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 + chr3L 18418827 5' - hobo 2919 1 60.40 CGCTGCCGGAAAAATAAGTTGCGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATTGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCTTACTT:1 - chr3R 11949049 5' - ZAM 59 2 75.76 GACAAAAATGTTATTGTTGNGTATTTTTAAAAATTCGTTTGCCAAAATATTTTTTAATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3R 15578951 5' - pogo 2083 1 60.40 AGATATACTTCGGATTAGATTTACTGCCCATGTGCACACACACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chr2R 9209500 5' + Tirant 28 2 53.54 TGAGTTGCACGAATATTTCACTGGTAATTGTACCAGTTCCTAAAAATGGTGAAATACCAGTGAAAATGGTAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr2L 20619970 5' - roo 409 1 72.73 TGACAATCAAATGTTTTAAGATAGATCATGCTTGAAAGCCTTGATAACACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3R 17781541 5' + pogo 24 1 55.45 TTTGACAGCACAGAGCTCCGAAAATTATACTACGCTTTTTATCCCGATTGATTGACCTGGCCTGAATAAATTCAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGG:2 - chr2R 10670064 5' + jockey 4766 1 73.27 GCAATTTGGCAGTTGGTTAGATCTTTGAATACTTGGTAAAATTGTTGATCTTCGTGAATTGGTAGCCCTTCTGTGTAAGAAATGAATTTACATTGTACATA:1 + chr3L 8757042 5' - 1360 3152 1 78.22 AATCTCTAAACAAAGCTAGTTAATTTCGTACTAGAATCGATGCGAATAGCTCCCACATTGAACTCTATCGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGT:1 - chr2L 18006567 5' - roo 8680 2 75.25 TTGAAATCTTTTGCAGATATGCATTAGGCATACATAAATAAATCATAGATATTGGGGTTTTTTTTAACAATCTTATTCTTTCTGGTATCTGTTGGGTACAT:1 - chr2R 2119239 5' - Idefix 95 2 54.46 CATAATCATTTGTAAAAATATATGAAGAAAATAATAAATAGACAATTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATA:1 - chr3L 13101074 5' + I-element 5067 1 55.45 AACGCCGCATGAAGCTCCTGCAGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTG:1 + chr2R 23249114 5' - jockey 4717 1 75.28 TTGGCAAAGGTTTTCGCTTTGTTTATAGATACGGCTTATATGCTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTAC:1 - chr3L 16563283 5' + 3S18 36 2 57.43 GAGTGTGTGTTTATGTTTGATAAAATGCGATATGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr3R 29287508 5' + hobo 41 1 68.32 AGTCAATATGCTGCTTTCCATTCAAATGCGCTTAGCTATGCAGTTTGGCTCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGA:1 + chr2L 12351309 5' - F-element 4239 1 54.00 GAAACAGAAAAAAGCTGAAAGAAAAAAAATTGTAAGAAAAAAATAAAGGAAAGAGACAGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCA:1 + chrX 10114658 5' - Doc 4529 1 62.38 TTGATTCGCATGTTTGGTGGCTTTTCAATTGATTCGATTCGATTTTAATTTGCAGAACTCGGCATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 + chr3R 10110408 5' + Doc 19 1 58.42 TATCGCCCTCTCTATACCGCTCCGTTCCGCTTGAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chr3L 6658221 5' - hopper 1375 1 67.33 ATTCTTATGTTGGGTAAATAGATTTTTTCATATAAATAATCCAGTTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 + chr3L 20758934 5' - flea 228 2 55.45 GTCTCATTGCAGGTATGTATCTATTGATGGGAGCACATAGAGTGCACTTGAGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr2R 9643467 5' - roo 403 1 43.56 GGACGTTTTGGAGGGTTTTTTAAAAACAACGGAACGAAAAATTGTACAATTTTTTAAAATTGGTCAAAAAATAAAAAAAAAAATA:1 - chr3L 84249 5' + R2-element 3584 2 75.29 TTTCAAGAGGAAAGAAAAGNGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACT:1 + chr3R 7783730 5' + rover 6974 2 56.44 TAATTTTTCTTAATTTCGTTAGTCCTTGTGTGAGCGGCTGCCAAAGTGCAAACAAGCCTGGAGATCCCCAGATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGC:1 + chr2R 8311269 5' + opus 2 2 77.23 ATTGCCTAGTAGGGCAAACACAATTAGGGGCCATCCACAAAACTAAAAAAAAAAATCGAATAGTAGTAAAAAGACAATAAGTTTACAAATCTTAAA:1 + chr3R 10922452 5' - Fw2 3893 1 80.21 AAAGAATTAAAACTTATTATATTCGCTTGAAATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAATTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTA:1 + chr3L 20755358 5' - I-element 5308 1 66.34 TAAGAAGAGAGATCAGCTTACTAAACAAGATATGTACAGACATAGAGTACTAAAGTTCTAGGACACTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACG:2 - chr2L 8176494 5' - 1360 3379 2 69.31 TCCTTCGTTTTCATTAACAAAATCGATTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 19061235 5' - roo 9026 1 72.28 TGGGCTACGTGTTAAACGCATTTCCGCCACTTGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 - chrX 9413856 5' - 412 7500 2 69.31 GGAGAATGGGAACTCCCCTGACATGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 8765520 5' - roo 401 1 70.10 AGAACGACGGCCATTTATTTGACTTAGGCAAATGCGTGCTTATATATATATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCG:1 - chr2R 21433219 5' - HMS-Beagle2 286 2 59.41 TAACATCGAAACAGCCTGTTTAATTTTTTTTATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACA:2 - chr3R 25370522 5' - BS 5040 1 77.23 AAGTTAACACCAAATGCAANTGATCTGCAAATGGCAAACAAACGAGCAGACGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATA:1 - chrX 17993874 5' + hopper2 1170 2 52.48 TCTTTTCTTGCCCATTCCATTTCCATCTCAATTTCTAGTGCTAATCTAGTGCTAATCAATTTCTAGACTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:2 + chr3L 17140583 5' + F-element 19 1 40.59 ACGCTGTATTTAAGTACACCCCACCCTACTTTATATTCGGTATTTTGTGTGGTTGTTGTACCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAG:1 - chr2L 18249769 5' - blood 434 1 67.33 GATTCGCTGCGCCGGCGGCCTGGCATTCGATGTTTTGCGCCAACTTTGCGACGGAATGGAATAAAGGGAAAGATGAATATTTGCTTAATAAATAATAAAAA:1 - chr3L 19692788 5' + Juan 4053 1 54.46 CAGTGTGCCCCTTCGCACAACCGAGAACAATCGCGCTTAGGTGCTAGCCGATACCTGCGCAACAACAAAAACAACACCACATACTAAAACAAAAACCTCCG:1 + chrX 18783783 5' - Rt1b 5032 1 51.49 TCTTTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 - chr3L 10474199 5' - copia 5084 2 70.00 ACGACAGTAACAGTGGGCTAAAACTGGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTA:1 + chrX 21229294 5' + transib2 47 1 72.28 AATAATAATGAAGTTGCCANTTTTCCAGTTGCCGCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 - chr3L 8252245 5' - copia 246 1 65.35 GAAACAAACTATTGCCCTTTCTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCC:2 + chr2L 22939674 5' - invader2 156 2 80.20 AGGGTCCACTACGCTTTTGGTTTAACAAACATACTAACGTTATTTCCCTGTTAAATGGAAGTACTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3L 7307300 5' + hobo 12 1 65.35 CTGCCCTGATGACCTTTTTGAAATTCAAAACGTTGGTAACATTCCAAATAGTCAAAATATTTCCAGCCAAAACCAGTTTTTGCTTCAAACCTAACGGTTCT:1 + chr3L 23784606 5' + Transib5 113 1 50.50 ATTAACTAAGTATACCAGCATTTGTACAGCGAATAATAGCGCAAAAACTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCC:1 + chr3R 19505509 5' + mdg3 5255 1 68.32 CACTCCTCTCCCCCAAATGGAGCATAAAAGTTTCAGTTAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATT:1 + chrX 4264347 5' - mdg3 5462 2 58.42 CAGCTGGTAGCCAAGTGGCATTTTTCCAACTTCTCGCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTG:1 - chr3R 21421045 5' - jockey 4922 1 64.36 CGCAGAGAAAACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr3R 11608017 5' - 1360 3355 1 61.39 CCGACATTTTTAAAGCTTANCAGCATTTTTCCACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr2L 18248073 5' + blood 12 2 66.34 GAAAAACTCCATAAAACTTTTCTTTTAATTAAAACATATTTTACATACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3R 12063739 5' - 412 7515 2 60.40 TATGTATAAACATTGGCTGTTGGAGTCTTATAAAATATATGTGTATGATAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCT:2 + chr4 74256 5' + 3S18 28 2 51.49 CTCCCTCGTAGGCGCTGGTGTAGCCATCCTCTGTCTTGATGATCTCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2R 11259565 5' - hobo 2907 1 53.47 CGACTCTTTGAGTGGACATGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGGTGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2R 6850462 5' - roo 352 2 82.18 AGTAGTATTCACTTCGAAAATTCAATCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 + chr2L 20328723 5' + opus 7164 4 74.26 CGTCAATGTCATCATTGCCATTGTGCATGATTTTATGATGAAAGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 - chr2L 8622836 5' - 297 6957 2 57.61 TATAACATGGATAATGATACATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCG:1 - chr2R 12457996 5' - HMS-Beagle 218 2 57.43 ATAAAAGATATGGGCTTACNTAACCCAATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTA:1 + chr2L 21735023 5' + 17.6 43 1 74.26 CTTGCTGGGCAAACTTTGCACTCACTCACTGGGCAAATAATCTTGTTTTTAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGAC:1 - chrX 993924 5' - Juan 4000 1 50.50 ATACACTTATTTTATTTCTGTGCATAAGAAAAACATAAAAATATTTTGATAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:1 - chr3L 3596748 5' + copia 4896 2 51.49 TTGCATAAGCTCAATTCTAAGCAGTACTGAATAGATATATAAGTATATGTATATTTTCGTGGGCATCACTGCAAGGACGAAAACAAGGGAGAAAAAAAAA:1 + chrX 18738504 5' - Juan 4035 1 70.00 GAAATTCGCCACATACCAGNGAGCAGTGAATGAAATATGCTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:1 - chrX 15255409 5' - Tabor 446 2 63.37 TGGTCGGATGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCT:1 + chr2R 6438360 5' - Stalker4 365 2 69.31 AATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 - chr3L 25059121 5' - mdg1 366 2 80.20 AACAAGGACAATAGGCACACACACACACACACATAGTAATATGTGTAGTATAAGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGC:1 + chrX 9342315 5' + Burdock 20 2 47.52 CAAAGTTGCCAGTCAGAGCAAATCGCAGATAGTCAGCTAGTCAGACGCAAAACCTCCTCCTTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACG:1 - chr2R 14997943 5' + McClintock 5959 2 71.00 AAATAATAATATAACATGGATAATGATACATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1 - chr2R 12458005 5' - HMS-Beagle 7023 2 60.40 CGCAAACACACTCGCACACCCACGTTCAAATTCAAACTGGTGGAGAAGAGAACCCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 + chr2L 8709300 5' + P-element 16 1 63.54 TCAGTTGGCATTTCCACTCNGAATGCCTTCGGAGCAGATAGAGATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2L 2833927 5' + roo 8697 2 59.41 GCGATTTAGGAGTGCCCTCCTGGCTAAAAATGCCAGCTACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chr2R 14349181 5' + mdg3 5292 2 62.38 TATTTCGGCTCCCGGACTTGGACCCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTT:1 + chr2L 12808145 5' - Tirant 388 2 64.21 AATCGCAAGAGAAGAAAAAAAGGAAACAAAAGACGCACGTGGTTGCCACGGAACTAAAAACTTTTGGCTGCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr2L 16683797 5' - P-element 2882 2 72.00 TGTGTACACACACGTTTACCCTTGCCTGAAAGTTGTACTTGTATCTAAAATCTACACTCAAAGCGTATATTTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAG:1 - chr3R 14860894 5' - F-element 278 1 80.20 GTCCCGTACTCGGTCCCGTACTGGTCCCCTACTCGGTCCTGTACTGGTCCGGTACTCGGCACCGTACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGT:1 + chr3L 16047626 5' - Cr1a 4409 1 56.57 TTTCCAACAAATACTTATTCATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTC:1 - chr3R 3268058 5' + mariner2 90 1 51.49 TTAAAGGAAACGGATGTATGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGATGATTTCGGTAAAAATAAAATTAAAAA:1 - chr3L 8016057 5' + hobo 482 1 69.51 GTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 - chr2R 9871038 5' + roo 8709 2 70.30 TAAGGGAAATGTGCACGCTGGTCCGGTGAAATAAAATAAAAATATAAAATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:2 + chr2R 4830302 5' - 1360 3385 2 77.23 CTGATACGTGGGTTTTGGAAGCGGGGGCATTTTATTTAAATATATACATCTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr2R 21962710 5' + 297 21 2 58.42 ACAATCGTCTTTGTTCGCGATTTGCGATAGAGCAAACAACTAACTAAAATAGCTTCAATTATTTACTTTAATTGTAACGTACAACTAACCAAAAAAACAAA:1 + chrX 11963179 5' - Tc1 1405 1 76.24 GGGTTGCTCCTTCTTGAAGCTGATTGATAGGGGGGTTGCCTTCAGCTCTTCCTTCCTTCTTGGTGTTGATTTTTACGTTTGTTTTTTTTTTGTTTTAATT:1 - chr2R 7666471 5' - Doc 4700 2 71.00 AGCATGGTTTTATCTGCGTCTGATTTCGCATTCAGGCTGCCCAAACCAAAATCGCCAGGACGATTACCGGCTGTGAATGGTACGTAAGAAACACAACCCTG:2 - chr2R 5617246 5' + BS3 1408 1 75.25 CTTTTCATAATTTAAAAACATGTTTTTAGGCATTTCACTTGGCACTCTACGCGACTACCATTAAGCCATTAGAAATGCTTTTTATTATTTAATTTATTTAC:1 - chr3L 16423184 5' - X-element 4717 1 59.41 GCCAGCAGAGTTAGTGAGTGAGTTGTCACTCACAATTAACCGAAGAACATCGCTTTCAAAGCAGCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chrX 16671146 5' - P-element 2875 1 67.33 ACCGGCACTCATTCCAGTCTTTTGGCTCTTAATAAGCAAATTAATGAATGCGTGGAAGTGCAAATTTGTTTAAAGAACGAATTAGATAATAATAATAATAA:1 - chr3R 11289715 5' + invader3 5054 1 70.30 AAAGTCCATTGTGTTGCCTACGTTCTGCTCCAGTTTCTCCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCT:1 + chr3R 24256339 5' + blood 7210 2 60.61 GCATCGCCCAAGACTGATTTGTTTTCTGTGCCTTGTCTATGCTGCTGCTCCTGATGAGGGTCAATTGTCCATTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATGTC:1 - chrX 543406 5' - accord 178 2 62.38 ACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:1 + chrX 21668011 5' - Tabor 7287 2 59.41 CAATTGATTCGATTCGATTTTAATTCGCAGAACTCGGCATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr3R 10110433 5' + Doc 44 1 65.35 GGTTGGTCGTATTCTGCTCCATTCCCTATATATATATTTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr2R 19102228 5' - opus 7471 2 67.33 TGACCCACTCTTTAGATCGCAATCCTTAACCTAATCTCATACCCTAATTTTCTGGGTAAAAACCTTTGTTGACTGCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 - chrX 10451563 5' - hobo 2938 1 78.22 ATGAAACACGCGCTTTTGTCGACCCAGGAGCCAGTTAGGTCTATGCTGTTTGTCATGGTACCTGCTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCG:1 - chr3R 7472972 5' - X-element 4376 1 57.00 AGGGACCTCGAAGAGCCACAAGTAGTCGAAGGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr2L 8622743 5' + 297 6595 2 66.34 GGGAAAGTCGGGCATCCCGGCTATTATGCTCTCTATGTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3L 2176315 5' + roo 37 2 62.38 ACAGCCTGAAAGTATTTTGCTGTCTCTCTGCGTAACGGCCATACAGTGACGGCCAAAATTGCCCTCTGTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAAT:1 + chr2R 19859850 5' - 1360 3287 1 71.72 AGAGTGAAGTACGTACACTTCATTTGCAATGGGTATGTTAGGCAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGC:1 - chrX 14618692 5' + HMS-Beagle 207 2 60.40 CAGTGGTGGGGGATGTGGGGGGCGAGTCACGTGTAGAGCGGCGAACCAAGTGATCAAAACAAAAACCTTCATAAATTTACACATCATATCTTCACAA:1 + chr3R 16231487 5' + Tirant 368 2 67.01 GTTTCTAATGCAATTTTACCATAAGTAGTCTAGCAGCCGGCTTCTAAAAAGTACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2L 2833850 5' - roo 386 2 55.45 GCAAGAACCTTGAAAAATGGCAACAGCAGATTAAGCGCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTA:1 - chr2L 12808263 5' + Tirant 8108 2 80.20 AAAGACACTGTAATTGCCACTTTTATAGTTTTTTCCATAAGTTTACTTGTTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2L 22197282 5' - roo 9046 1 56.44 TACTACTACGCTACTTTTTACTTGAACTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGG:1 - chrX 16518901 5' + G2 2790 1 73.00 TGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 + chr3L 19249686 5' + Transpac 40 2 71.29 AATCTAAGAAGGAGCCGGAGAAATTCCAGCTGCACTGACTGCATGGCGCTTTCCATCAGGAACAGATTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAAT:1 - chr3R 28161299 5' + baggins 5297 1 65.35 ATGAAAAAATGAAACTTCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:1 + chrX 22789324 5' - Tabor 448 2 63.37 TGACATTTTTCATTGGTGTTGATTGGATATTTGTGTGTTTTTGCTTCGATTGGTACCTTGTCCCTTGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTT:1 + chr3L 198582 5' + hobo 375 1 71.29 TCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTG:1 + chr2R 18723043 5' + HMS-Beagle 36 2 64.36 AAATTATCGAAAAGTGGGCATGAAGTGAACATTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2L 20620059 5' + roo 8706 2 70.30 AAAATAATGATGTAACTATTTTTGTTGTTTTGTGATTGCTAAAAATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 + chr3L 12990741 5' - flea 228 2 57.43 GCTTTTTATCCCGATTGATTGACCTGGCCTGAATAAATTCAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCA:1 - chr2R 10670031 5' + jockey 4799 1 65.35 TGCTTTTCAAAAAACGGAAGCGGTTAGTGCATTTCGGTGCCAGCAGCTTAAGACCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr3R 20696538 5' + jockey 32 1 53.47 AATCTTAAAGATAGCTCTGATAGTAGAAAAGAAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCT:1 + chr2R 14997856 5' - McClintock 440 2 67.33 GGCTTGTTTGTTTTAAAATTTGGCCGAATAGTTTGGGTTTGGTCAGTTGATTGTGGGTTGCTGCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1 + chr2L 16139094 5' - copia 241 1 65.35 AGTATGGAATGCAAGTCATAAATGACATAGGGCCGAAATTGATTTCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr2R 17963210 5' + blood 11 2 68.32 TTTATTCTAGTTGTTTCGATTTGCTTTGCTTTTCTCACGATTCTTTGTTTTCTTCGAAAAGGGGAGGTTCAACTTTTTCCGCCAATTTTCACAATTCAAAG:1 + chrX 4561688 5' - transib4 182 1 69.31 CTGGATTTTCAAGGACCTTTTACCAACCCTAGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:2 - chr3L 18418913 5' + hobo 24 1 55.45 AATCGTCTAGGATGTGGGGAATTGTCATGTTGTCAATAAGGCAAGATTCATCTTATTTGATTTCTTATTTTACTTGGCCAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAT:1 + chrX 17592902 5' + Doc2-element 237 8 65.35 AAACAAAATCGAACTTGTATATACGCTGCTTTAAATAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAA:1 + chr2L 15900846 5' + F-element 4209 1 66.34 TAAAAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 9278403 5' - roo 9047 1 57.43 GCAGCACAAAAAGGTAACCCAAGGAGTCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTT:1 - chr3L 6586951 5' + 297 266 2 82.18 GAAATATCGAAGGTATCCCATTTATATCGAATCGATCCAAGTCCATCCAATTCGTAATTCGGCTCGTCGCAAAAATCTCCACAACCACTGCCGTCACATGT:1 - chr2L 3198561 5' + accord2 7355 1 78.22 TGTGTGCATTTAACCCCACCCCAAATCGTCGGCTGACCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGT:1 + chr2R 8312745 5' - opus 7244 2 64.36 GATGCCGTTCAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 13763173 5' - roo 390 2 54.46 GCAACACTTGAATCAATCCGGTGACTTGCTACGTGGGAAGTTTCGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGA:1 + chr3L 24362792 5' - Quasimodo 334 2 68.60 GAATTGCGGAATGCATCAGACTCAGACTAAATGCCGTCGCAGCAGAACAGCAAAATCACAGCAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 26346632 5' - hopper 145 103 64.77 ATAAATGCGTAACATAATAATTTGAAAATTTGAACTGCAGTCTGCGTTAGCCAATCAAATTAAGAAATATGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 - chr2R 12525665 5' - mdg1 7454 2 60.40 ATTTTTTAAATTTAGTTTCCTTATTATATTTAAATACCTTTGTTACATATCATTTTAAAAAATCAACTAAGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:1 + chr3R 5348631 5' - copia 251 1 76.24 AAGATCTACAGTATATCATCGCCGCAGATGTCACTAAAATGACCGCAAATGCCCCCATATGCAGTTTTGAATATCAAGTAATGTTCACACATGAACACGAA:1 + chr2L 22197174 5' + roo 8663 1 78.22 CGACACACCAATATACGCTATATGCGCTATATGAATGGTTGATGAGAGATATTTAAACTAACAAGAATCGCCGCACCTCCGTGTTGGCTGTCATCCGG:1 + chrX 16873671 5' - G5A 190 1 67.35 ATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chr2L 12808225 5' + Tirant 8146 2 61.39 AATCGGAGTGACGTGGGAGACCAACTACATGGAAATGGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr2L 5926996 5' + pogo 37 1 65.35 AAAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGCAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr2L 13093775 5' - roo 9037 1 61.39 AGAGAGATCAGCTTACTAAACAAGATATGTACAGACATAGAGTACTAAAGTTCTAGGACACTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr2L 8176489 5' + 1360 14 1 65.00 GTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTAAAAA:1 + chr3R 20094472 5' - Max-element 8480 2 73.27 TTTGCTTTTCTATTGCCACTCTGAATAATGTGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATC:1 - chr3L 5873272 5' + R2-element 3249 1 69.31 AGCATAAGAGCTCCTCATCCCAAGCTTTATCACCTGTAATTAGTCACTCTTAATCAGTTGCCCTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 - chr2R 10956987 5' - copia 242 1 65.35 CTGTTTAAGTCACTTATATAGCTGTCCTCCCACCCACTACCCCACCTCCTTTCCACCCCTCTGCATACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAA:1 - chrX 17528712 5' + F-element 4550 1 72.28 GAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1 - chr2L 17677761 5' + Tirant 8158 2 76.24 TCTCATTATGTTAAGCATTTCAAAGCGATTGTCGCGTACTCGTTTTAACTATTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGC:1 - chr3R 29734356 5' - Bica 463 1 58.42 ACCTGCGATCAGCCGCGTTNAAGACACTGTAATTGCCACTTTTATAGTTTTTTCCATAAGTTTACTTGTTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr2L 22197301 5' - roo 402 1 73.27 TTGTTACGAAATAGAAAACTATTTTTATTATTAGATATTTACATATATATTCTATACATGTTATGTAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 + chr2L 14010784 5' + flea 4768 2 64.36 TAATTATTATTATTATGATTATTACAAAAGGAATAGCCAGTCATTTGCATGATTCCATGCAATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr2R 11721489 5' + Doc 29 1 51.49 TTAATATAATATAATTTTATGTTACGTTAAGCAACCAATTGAATTGCTTTACAACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:2 - chrX 11088294 5' + blood 7032 2 58.42 GCTGTGAAACCATCGCTTCAAAGAGCTTCCACGAATTATTGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3L 22930309 5' + roo 8699 2 63.37 ACAAGATGGAAAATCTATGCACAAAAAGGGGTAATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 - chrX 9775042 5' - 412 7501 2 69.31 CAATTATGAAAGGAAGTGATTTAGGGGGACAAGGAAATAATGAAGATTTTTGTTTTATTGGCAGCTTCAAAGGACTTTAATAAAAAAACAAATGAACAAAT:1 - chr3L 3529797 5' + S2 1603 1 45.54 GATTTGACCTTTCTCAAAATCGGATAAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATG:1 - chr3L 27357602 5' + mdg1 51 2 80.20 ACCTGACTTTTTACATATGGCGGGATAGTCTCATTTAATGTTGTTCACAGTTAGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 + chr3L 12112326 5' + 1360 24 1 55.45 GGATGGGTGAGTTCTGATGCGGCTTCTGCTGAGAGTAACTGTTGGGTCTCTCCCATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCGCTTTGAGGGTGTAAG:1 - chr3R 22787089 5' - Porto1 324 1 74.26 GAACGTCCAGAGATAATTAGCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:1 - chrX 21668090 5' + Tabor 17 2 60.40 AACAATTTTTCAATTTAATGAAAGCGGAGTGAAAAAGACGGATCACATCCGCCGTCCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCG:1 + chr2R 8183103 5' - blood 461 1 63.37 AAATGGAAATAGGTGACATTATGTACATAGATTCGGCTATTACTATTTCTAAGCTATATTTAAATAATAACATTATTATTTGAAAATAGATTATAAATAGC:2 + chr4 212861 5' + 1360 326 1 76.24 TATATTACGTTATGTTTTGTTTCATGTCAGATATTCTTCTAAGAAAATTAGACATGAAACAAAACATAACGTAATATAATATAAAAAAAAAAACAAAAAAA:1 + chr2R 2745331 5' + gypsy11 3930 3 73.27 CTTGCTGGGCTGCTAGGCTGCCACCAAACTGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAAT:1 - chr3R 29829333 5' + X-element 4283 1 79.21 GAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACATTGATATGACAAC:1 - chr2L 20328758 5' - opus 7450 2 78.22 TAAAGCAACAATGTTGAAAACCGACCATCATAAAATATTTTAAGAACTTTGCCGAACGAAAAGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTG:1 + chrX 8659910 5' - HMS-Beagle2 6991 2 67.00 GTATTTGACGTTTATTTCGTAAACTACTTGATAAAACCAAACACTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 - chr2R 10353342 5' + blood 7019 2 69.31 TTCAGAGTAATCTTATGCTAAAAGGCGGTTGTTACATTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATA:1 + chr3L 23277062 5' - invader2 4703 1 72.28 GCTTTTCAGTTCATTTGTTTTTTTTTGTATTGGTTCCGAATAACTTCTAAATGCTATTGAACCTTGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTG:1 - chr2L 9411517 5' + blood 329 2 69.31 TATGTTTTTTATGTTGGACATACCCTTATCTTGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTT:2 - chr3L 6033610 5' - 412 7529 2 60.40 ATCGGACAGGAAAAAAATGGGGGGTGGGGCAGGACACGAGATATAGAGCTAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chrX 7996371 5' + hobo 24 1 46.53 TAAATCATCTTTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr3L 27357550 5' - mdg1 7430 2 50.00 ATTTTTAATTCATAGGAGATTCCCCTATAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAG:1 + chr3R 6980776 5' + F-element 4434 1 72.28 TTTCAAATTGAACATGGTGTTCACCTTGTTCTTCAGCTCCAAGTGCGCTTCCTCACGCTTCTTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATT:1 - chr2R 9887857 5' + diver2 4704 2 65.35 TGTTTTTATTTGTCCTGCTGCCGTTTCCTCTTCCTGTTTGCAAACGCGCTGCATTGTTTATGGCCGACCGTGAATTTTGTTTGTTAATAACTCGCGGGAGT:1 + chr2R 12457537 5' - HMS-Beagle 380 1 64.36 GAGCGAACGAGACGGGAAAGGACCTTTCTCGTTAGCCGTCTCGCTCGCAGCCTATACCTGTCTCTATCTGTGTCTGTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCGCT:1 - chr3L 10811437 5' + Cr1a 294 1 75.25 TAAAAGCGTTGGTTATTAAAGACAAGTTGTGTTTATTTAAGCCAGTTATTATTTATTTATTGGCGCTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGA:1 - chr2R 17644955 5' - mdg3 236 2 68.32 GGTATTATCTCAACTTTATNCATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAG:1 - chr3L 15452935 5' - accord 7351 2 54.46 TTTAATGTGAAGTTTAGCTTAAAGGAGGGATTTATTGCACACCTTGTAATATCTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1 + chr2L 9045409 5' - 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chr2L 19642356 5' + Quasimodo 55 2 81.19 CTTCAATCAGCCGCAGAGCTGGTCCTGTGAGTGTGGGTCTTAAGCCCACTTCGTGGCTGTGTAATATGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGA:1 + chr2L 15531781 5' - Stalker2 383 2 58.42 CGTCGTATGCGCAATAAATAAATCTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTGGACTTCTCCCTT:1 + chrX 15263449 5' - invader3 223 2 76.24 ATGCCCTATCAATAGGAATGGGATACCACAGCTTTATTCGCCACCATAAAAACGAATTATTGTGGTTGGAGTTTAGTTTTTTTATTATTATTTGACTTACG:1 + chr2R 6247400 5' - Rt1b 5140 1 79.21 GCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:1 - chr3L 19274853 5' - transib2 2771 1 79.21 CCGTTGCGGGCCACAATTTTCACACACACACACACATATATAACCACATAGGAACAGCCATACACTAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAT:1 + chr3R 18360648 5' + Quasimodo 97 2 80.20 ACATATATCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTAC:1 - chr3L 19339447 5' + Tc1 8 1 75.25 CAGCATAAGTGGGTTAAAGAGAAAGCCTAGGACAGGGGCATGTGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAA:1 + chr2L 15567100 5' + 17.6 6958 1 58.42 AGTTGCTGAATAAATGCGATAGTAATTGGCTTTGGCAATTTATTAATTAACTATTAATGGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:2 - 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chr3R 10539961 5' - Doc 4557 1 77.78 AAGCATGTGCGGCAGCAAANAATGGGTGCAACAACTATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 - chr2R 13653429 5' + F-element 27 1 56.44 GCTTTTCCACTTGTGTTTATTATGATTTTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCG:1 - chr3R 26230388 5' - invader2 476 1 73.27 TTTATATATATTTTTTTTTCACTTTCGCATAATTGTGGAACCTCGGTGTTTCGCTTGTCTCTTTCTGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTG:1 - chr3R 23428491 5' + Quasimodo 384 2 75.25 TTCTTCTTCACCCTCACTCCGAATTTCAGTCTTTGCCATCAACTTCGATTCATTTTTCTGTACGCTTCCGTTATTCCTGCAGACATCTACTTCCCCCCGCT:1 + chr2L 21807649 5' - invader1 3749 2 50.50 CTTATCCTTGGCAAGCAAAAGAGCAACCCTGTGCCGAGCTAAGATGAAGACCAAACACACGCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chrX 14651065 5' - P-element 2872 1 64.36 GCAGGATTCGGTTTCATTTGAGTTAAATTTGCTGTTCCATGAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACA:1 + chrX 7292675 5' + 3S18 5802 2 57.43 TCGCCAGACTGAACGGGGGTGGTGTCAGTTGTTGGGCGTCTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chr3L 699742 5' - P-element 2852 1 45.54 ACCGAGAGAGAGTGAGAAAGAATCGTGGAATCGGAACACGGGCGATCAGACGGCCCGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chrX 15024361 5' - P-element 2867 1 59.41 ACATACACCTCCATCCGCAGTTTTCTTCTTGAACTGTGGGGTCCAGGAATCACTAGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGGTCTTG:1 - chr3L 22440461 5' + F-element 4216 1 53.47 TCGCATAATCGTCATAATCATTTTATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1 + chr3R 20332893 5' + jockey 4724 1 75.25 AATACAATTAAAAATGTATGCTATCTTAAAGACAAAACCATGGATGGCCGAAGTATTGGGTCTAATCCTCCAAATAGATTTCTTTCGCTTTCGATTTCTTT:1 - chr2R 14498594 5' - Doc2-element 99 2 64.36 CATTCTCATCATCATCATTGGGGCGCCCCACTTTACCGGCCATTTCGACTGGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATT:1 + chrX 9406469 5' + 17.6 181 2 51.49 TGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTA:1 - chr2L 23373495 5' - Tc1-2 1575 1 72.28 ATAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:2 + chr3R 28565281 5' + 412 7104 2 76.24 AAAAGCTACTGAAAAAGGCCAAAGAGCTGAGGAGAAGATAGACTTATAGACCAGAACAGGGAGGGGTTGCAGCCAGTGAAACCTACTGGCTTTCAGCTTCA:1 - chr2L 12408177 5' - Doc4-element 2498 1 73.27 ATAGAATTTCACTTCAGGATCATGTTTAATAAGTAAGTCGCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACG:1 + chr3R 851806 5' + F-element 282 1 60.40 TGATTAACTTTTAACAACCGCTTTGCATTAAAAAAAAGAAAGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCTTTGGCTGAGCTTAT:1 - chr2L 19674657 5' - Quasimodo 7223 2 59.41 ATTTTAATGTTACGTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr2L 10792015 5' + 412 30 2 54.46 TCGTGTAGTTCACCAATTTTCGTAACACCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr2L 16793699 5' + hobo 47 1 74.00 TGTTAAAAAATGTGTAATTNTTAACATATTTTTTTTTGATTTTTTTTTTA:1 - chrX 10293631 5' + hopper 150 11 88.00 TATCCGTCGCCGGAATGGGTATCTCGACCTGGTCCAAAGCCACTGGTCGCTGGTTGCTGGCTAGTGTTATCGCATGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCT:1 + chr3L 20164074 5' - I-element 5084 1 69.31 TTGTGGCCCGCATAAAGCATTTCGCTCGTAAGTAATTTAAGTAATTTGTCAAAAATATTCACCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:2 - chr2R 11030593 5' + F-element 38 1 54.46 TCAAATTGAATTGTTATTGNCTATTGTAGGCAAGTGGAATATTTTTTTTTTAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - 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Tc3 1677 1 61.39 TACCTTGTTTAAGGACTAAGGACCTCTTTACAATAGCAAAGCAATCTTATGTTTGATGGCACAAACTATACAATCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCT:1 - chr3R 27907721 5' + mdg3 5256 1 76.24 CTTGTTATTCCAGCTTGGCTCGCTTCCTTTTTGAGGGGAAGCCGGCCAAAAGGACATTAAGGAAATTACTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCC:1 - chr3L 13569827 5' - invader3 267 2 68.32 CTCCAACAGTTGCAGACGCACAACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATTTTTACCA:1 - chr3L 12305860 5' + Juan 430 1 78.22 GGCGATAAGCAGTTGACCAGAAAAACTCGACTAAATGTTGATTTAAGCAAGTGCGAATGCGAACGCGAAATTGTATGATGAATCTCAACCTTCTAGCTTTT:1 - chr3L 18543121 5' - INE-1 165 1 53.47 TGCTAACTTTTTGGCATAACAAGTCGAATTTGTTGTAATTAAAAACCAAGAAACATACTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTC:1 - chr3R 26597417 5' + mdg3 5274 2 59.41 TTTTAATGTTACGTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr2L 10792016 5' + 412 7084 2 55.45 TAACGTAACTGAATAATAACATGATTATATTTGACTAATTTCAAAACTAGAGCTCAACTAAAAATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 + chrX 7157243 5' - 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chrX 8027505 5' + Juan 20 1 59.41 CAGCCCCACAAGATCGTAGCATAAGTTGAAGGATCAAGAAAAAGTAGGAAAAAAACAAGAGGGAATGCTATAGGCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGT:1 + chrX 198738 5' - INE-1 554 1 52.48 AGGCTGGGGCGAGCGAAGAGGGTTGCTGGGGTGGCCTTAACTAGTTTCAGCCGGCCGGTGTCGTTGCATGTCAGCTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAC:1 + chr2R 14030585 5' + blood 7179 2 66.33 AACTAGTTTTTAAATAAACATCAATTAAAATGAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCT:1 + chr2R 5772461 5' + HMS-Beagle 35 2 68.75 TGATGAACAAATCTAAAGTAAAAAAAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 - chr3L 16153704 5' - pogo 2062 1 76.60 AAACACATATGTACAGCGTGTGTGTGCTGGTGTTTACCCTTGTGTCTGTTTTTGTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 - chr2R 23116277 5' - jockey 4971 1 58.42 AAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3R 9278399 5' - roo 9043 1 55.45 GTATTAAAAATCACGTTTTCTTGATTTCTTTTGGAAGTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTA:1 + chr3R 26402932 5' - mdg1 7346 2 63.37 AAAATCAATAAAGATACGACTTCTTTGTCAGTGATACATGAAAACAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATT:1 + chr3L 15418404 5' - Porto1 232 1 55.45 AACACTCCTCTGGAAAATAGATGTAATTTCCCCCTTATAAAAATCAAAAACAAGGTAATATGCTAAAGAAGTCGGATTTCCCGACTATCAGATACCCGTTA:1 - chr2R 5786621 5' - INE-1 552 1 63.37 TCGATTTTTTCGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:1 - chr3R 7869193 5' - 297 367 2 56.44 GCTTGCCTGTCGAATGTTTAGGGGATGACAATAACTTTAAAACACTATGATCATTTGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATA:1 + chr3R 5513011 5' - pogo 1940 1 52.48 CTTTTAATTTGAATACTGTCGTACCAACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTC:1 + chr2L 14793466 5' + Stalker2 7 2 72.28 TTGATTTAATTTTTAAATTTTAAATGTGTGGTCGGTGTCAGTGGCAACATGTCCATGTCTATATGCTAAATCTCAACCATCTAGCTTTTATAGTTCCTGAT:1 + chr3L 23948280 5' - INE-1 153 1 80.20 CATATCATTTTAAAAAATCAACTAAGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:3 + chr3R 5348676 5' - copia 206 2 77.23 GCAAATAATAATGAAGTTGCCAGTTTTCCAGTTGCCGCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 - chr3L 8252248 5' - copia 249 1 62.38 CCGAGTTCAAACTTTTTTTCCAGTGCAGCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATAC:1 + chr2L 17229750 5' - R1A1-element 5238 1 72.28 TATGTACATACATATCTCCTGCTTCCGTTTCCGTTCCGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGG:1 + chrX 16964504 5' - opus 321 2 63.37 TAAACGCAACTGCCACCCACTGAGCGCCACACAAGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATGC:1 + chr2R 22279298 5' + accord 7031 2 68.75 TAAGTTTTGTGGAAAGTCTGAAATAAAATACACTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr3L 19647312 5' + pogo 39 1 73.27 CGTTTTCTTTTCTTTTTTTTTGGTTTGCACTAGAGAAAACTTTCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:2 + chrX 11525517 5' + 412 7086 2 61.39 TCAGCTTGCAGAATCGGATGGCAATAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 12241808 5' - roo 9048 2 52.00 TTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 9871008 5' - roo 9017 2 81.00 CGTGTTCTTTGAAAGATTAAAACGAATCATAATTTGTATAAATTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATT:1 + chr3L 21146885 5' + jockey 4537 1 57.43 GAACTAATTTGATGTGTGANCAACGGCTAAAATGGAGCAGGGGTGTCCTGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1 + chrX 2841764 5' - hopper 1391 1 54.46 TGTTAAGTACTTATTGAAATTTATATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr3L 15788443 5' + opus 7052 4 81.82 AACTTTTATTTTTAATGGAGGTGCGAGAGCATGAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr3R 22349482 5' - pogo 2059 1 68.32 CATTTATTTGACTTAGGCANATGCGTGCTTATATATATATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTG:1 - chr2R 21433208 5' - HMS-Beagle2 7158 4 70.30 GCAAAACACAACTAGTTTTTAAATAAACATCAATTAAAATGAATATATAAGTTATTGTCCTGCAATTGATT:1 + chr2R 5772452 5' + HMS-Beagle 6797 2 69.01 GAATTGTAACTAATTATGTTTTTTATGTTGGACATACCCTTATCTTGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAA:2 - chr3L 6033624 5' - 412 490 2 72.28 AAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 - chr3R 11151885 5' + mdg3 38 2 62.38 ACCCCACCTCAAATGACACATTTCTGTACTTTTATTACTTACTCTGCCGGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACAAAAATAATA:1 - chr3R 3260679 5' + Gypsy6A_LTR 287 1 71.29 TGTAAGAACATAATGCCATTATATGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCAC:1 - chr2L 22228226 5' - Bica 4862 1 76.24 AGCGACCATAAAATAATCACCTAATGTACATATTGCCCATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 - chr3L 11829098 5' - Transpac 281 2 63.54 CTTACGAATTGATCAGAGATCTTTCGTAGTGGAAAATACAACATTTTATTAACCTACCCACAGGCATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGC:1 - chr2R 8087127 5' + flea 4764 1 72.28 AAAAAAAAAGCAACCGACGTCACAAATAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 + chr3R 19987382 5' + Doc 15 1 63.37 TAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 - chrY 311342 5' + 1360 13 1 50.50 ACGAGTTTGTCAGAATGTAAGGACACTGCCTTATGGGCTGTCATTTATTTGACCCGACTCACTCACACATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCG:1 + chr2R 21433114 5' + HMS-Beagle2 2 2 77.00 TGGCACACAAAACGGCTGGTACTTCCACAGTGGCCTCCGCCTCCTTGGAGGGGCCCTCCTGATCCGCTCGATCGCCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAG:1 - chr2L 1062871 5' - Doc 293 1 73.27 GATAGCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 23543009 5' + 412 7095 2 70.30 TTAACTTTGCTGGTCGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294994 5' - HeT-A 6061 2 64.00 CACCCGCCCTCTCTCACGTCCGCACCCTCTCGCTCGCACACCTGCCCGTTGTGCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chrX 4707829 5' - P-element 2865 1 57.43 TGTTAATGAAAATGTGGCACATAAAACGCATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTG:1 + chr3R 21454919 5' - Quasimodo 340 2 71.29 AACATTTCTGCAACAATGCAATTAAAGTTTTTCGTTTTACAACACTATTTGATAATTATATTATAATATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACG:1 + chr3L 19089586 5' + invader1 3613 2 65.26 GGTCGGATAGAGAACGTCCGCCAGATAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr3R 28565257 5' + 412 7080 2 52.48 ACTTATGCTAATGAAGCCATCTGCAGACGTGGTTTTCGAACGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTA:1 + chr2R 9905353 5' - mdg3 5464 2 58.42 GTTCAACGGACGAATGCAAAATGTTCGACTTTTGGACAACAAACTTAAACTTTTGTTTATTTCGTACACTAATAAAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTG:1 - chr3R 7514011 5' - diver 223 1 71.29 TATGATAACGTTATGATTATGACTGGATGACTAAACCTTTGTAGATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 20411790 5' + roo 22 2 52.75 AACAGCGCGGATGGATATCCAGATGGTGGATCGGTGTTGTTTCCCTGTGGTCGGAGAGAGGGGGCATGTTAACTAACGCAGTTGAATCCAAGAGAAACGTA:1 - chrX 16234672 5' + Idefix 352 2 74.26 TTGTAAAGTAATGCCATTTTCCGTGCTTGCCTAAAATTTAAATTTTTATTTTATTTTTTTTTTAATCGGGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAA:1 - chr2R 1965177 5' + Cr1a 483 1 80.00 AATCAACACAATTATGGTGCAACCTGCGGCCTCGCCCCCACTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATTTACAC:1 - chrX 7862811 5' + accord 187 4 76.40 GAGTGAACAGTGAAATAAATGATTAAATATTAACGACGCTAATAAGAATGCATCCCCGACATGTATAAATTAACTAAAGATAGATCGCACCGTCTTGCGAT:1 - chr2L 23390439 5' - Gypsy6A_LTR 387 1 64.36 CCATTAGTCATACGCCGTGATCAGTCAGGATGATATATTCTTCTATGTGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCTTCGGTTGCCTTCTATTG:1 + chr3R 12658997 5' - X-element 4490 1 54.46 TTTTTTTGATTTCCGGTTCTGGTTCGAAACAAAGGCAACGCTTTATAATTTGATATTTTTAAAAAGCGCGCAATTTGATCATATTGCTACGAAATTGGACA:1 - chrX 15161559 5' + 1360 3116 1 58.42 TGTTGAATTTCCGTCGCTTTCGACTCAATTAAAACACAAACAGAAGATGATAAATGCATTGCTTTAGTCTGTCTTCAGTCTGCACTTGTGCTATTATTTTA:1 - chrX 9007985 5' - Tc1 13 1 66.34 GAATGGAGAATGGGAACTCCCCTGACATGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 8765516 5' - roo 401 1 71.29 ATCTCTTTTTATCTTCTGTTTTCGAGGGAATTTACATGAAAATAAATATTTTCCGGTTTCAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 - chr3R 9224426 5' - pogo 2088 1 66.34 TCCTATGGCCTATCAACTCAATCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:1 - chr3L 12112380 5' - 1360 3336 1 80.20 TGGTGGCACGACGGACGGGTCGAGAACTTCCCTCCGCTGATTCTGAAGACAGTCCATTGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAG:1 - chr2L 21339249 5' - BS 4833 1 65.35 CAAGGCTGAGATTTGAGACCATTAACTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1 - chr3L 12634205 5' + BS 5017 1 70.00 ACTAAGTATACCAGCATTTGTACAGCGAATAATAGCGCAAAAACTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTT:1 + chr3R 19505513 5' + mdg3 5259 1 64.36 AACATGAGGCACTGGCTTCACACACCGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAA:1 + chr3L 19274786 5' + transib2 13 1 64.36 TCTCATACAATTTTACTAGCTTATCGGTTTAACTTAAATGTTCTCAGCCCTTTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2R 13763264 5' + roo 23 2 51.49 AGCCACAAGAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 - chr2L 20328766 5' - opus 455 2 72.28 ATTTACACTGAAAATCTCGTAAAACTTCAGCCATATCTAAAATGAAATTGTATGAAGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGCTT:1 + chrX 10608804 5' - 17.6 284 2 63.37 ATTTTTATGGCGAAAACAATTTAATTGGCTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 13190110 5' - roo 9022 2 74.26 ATACCACCCCACATACTCCAAAAAACATTTACGGTCGCTCAAAAGTGTGACTGACTTCAGCTTTGGCTGTAATCATGCCATACGATTAGTCTAGCATAAGA:1 + chr3L 5489852 5' - 3S18 192 2 58.42 TTATTTTAATGTTACGTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:2 + chr2L 10792013 5' + 412 7081 2 52.48 TGAACACGCCACAGAGTGTCCGCCACTCTGCAATATGGTTGCGAGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAACAAGCAAATTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTC:1 + chr2R 4544232 5' + 1360 3278 1 56.44 AAGTCTTCGGAACTATTCTTATGTTGGGTAAATAGATTTTTTCATATAAATAATCCAGTTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 + chr3L 20758920 5' - flea 5002 2 68.00 TTCTTCGAGTGTTGACAGTACCATCAATTTCCAAGAAGACAATTAACTCATCTTACACTCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr2R 20312669 5' + 1360 16 1 61.39 AGCCGCGTTTTCCTCCTGCCGTTGTTGTAGTTTATTTCCCCTTGGCTTGATCTTTTCCTTATTATTATTTTTATTATTGT:1 + chr3L 16454801 5' - mdg1 7064 7 70.00 AACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAA:1 - chr2L 15898793 5' + F-element 69 1 81.19 GTCAATGTCATCATTGCCATTGTGCATGATTTTATGATGAAAGCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 - chr2L 8622835 5' - 297 366 2 57.43 TGAAGCGACCGCTCAACTATTGCCCCGTAATTCGCATTGTTATTGATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chr3R 12767274 5' + blood 31 2 55.45 TGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAG:1 - chr3R 15790056 5' + flea 4751 1 76.53 GTAGTTATTATAACCATCCAGTCCATCATGGTTCCATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGTCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATT:1 + chr2L 23170880 5' - 1360 3346 1 73.27 TTCCCACTTTACCTAATCGTTTGGGCCAATCAAAACGCGCGACAAGATCACGCGACGCGAAGTGGCTGGGCACAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAA:1 + chrX 8125828 5' - G6 55 1 79.21 TCTATGGTTCCATGATTATTAATGCTTCTTTCCATTTCTAAGCACAAATAAGTCAAAAACAGTATGGCTCTATGGCTCTATGATTATTAAGTGAGTTTGTA:1 - chr3L 11622354 5' - baggins 5432 1 58.42 ATACATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCA:2 - chrX 18326239 5' + Doc 217 1 54.46 TGGCCAGTGCCTCGCCCACCATCTTGTAGCCCCGTTCGCATGACATAGGTCTATCCATATACCGCATAATCTATTATTATTATTATTATTATTATTACTAT:1 + chrX 11994863 5' - mdg1 41 8 70.30 ATATTTAAAATGTTTACCCAACGACGAAAGCTGAGTTAGTTACATTTGTAAATCGCATGCTAAAATATTTTTTCACAAATATGCAAATG:1 + chrX 5570814 5' - hopper2 1568 1 61.80 CAAAAATATTTCGCACACNCAAGGTCAATTAAATTTGCCNTNNNCACANNNTTAAGATTTTCCATCAGNNNNNNNNTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr3L 9928629 5' + roo 8667 2 61.22 ATATTTATATAGATAGGCCACCTTAGAATCTTTTACATGTTAAAGAATAGTAAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGTTCGAA:1 - chr2R 20921003 5' + Quasimodo 7058 2 53.47 TGCAGCTTTGCACAAATTGCAGTGCATGGGACATCGTTCGTTCACATGGTCATGTGTATTTTGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3L 22930395 5' - roo 397 1 65.35 TGAATGTATAACCACAAGGNATCGGGGCTAATAATCGAGTAGACGCCCCACGAAGCCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr2L 20567807 5' + 297 6599 2 61.39 GCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCAGCTCCCTCT:1 - chr3L 25232907 5' + GATE 8270 2 50.00 AAGAAGGCGCATCTGAAGAAGTCGCATCGGCTAAGGAAGGTAAAGAATTTCAAATACTGCACAAATCCGAAAGGAATCACTCTCGAAGCGAACGCATCTTT:1 - chrX 14954664 5' - Cr1a 121 1 56.44 CAAATCGCAGATAGTCAGCTAGTCAGACGCAAAACCTCCTCCTTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTC:1 - chr2R 14997925 5' + McClintock 5978 2 58.42 GATGCTCTTCCTTTTTATCCCGAAATGGAGCAGCCCAACACACATATTAGTATGTATTTGTGTTTATGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chr3L 14594209 5' + hobo 2 1 76.24 GATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3L 3757391 5' - roo 9020 2 81.19 GATTTCGATATCAATTGCTGAACTTTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACTAC:1 + chr3R 7469974 5' + Doc 54 1 71.88 TTTTTTTGCTGGCAAAGCAACAAATGATGCGTAAGAAATGCTTTAATAAACAGGGAACCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTT:1 - chrX 21253970 5' - invader3 5446 2 62.38 CTTTTTTAATTCAACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 12958905 5' - roo 9047 1 54.46 AAAAGCCATACAAAGCGCGCTCAAAGTTCAGTTATACGCCATATTTTATGAACAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chr3R 27928903 5' - mdg1 7444 2 56.38 AAGTAAACACCGCAAACTGNTGCTGCGCTGCCTCCTGGTGCTGCCCCTCATCCTCCTGGTGGAATCCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCTA:1 + chrX 4104491 5' + Gypsy6A_LTR 386 1 59.41 CGTAGGCTGCCGTTCACAATGATATTCACCATTTGAACGGTTTTTAATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1 - chr2R 5772534 5' - HMS-Beagle 227 2 59.60 AAAAAATGGTTCTTTTCTAAGGATTTCTGTTCTGTAAACTACACTTCATGTTATTAAGGATTTATCGAAGATATATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chrX 13798933 5' + 412 7128 2 69.31 ATAAAGACAGAAAAGTAAAAGATTTTCTTAAAGTATTTAAGAAAATAATAATTATGTATAATTCGGAGGAAATGAAAGGAACGACCGTTCGCTTTGAAACA:1 - chr3L 24796697 5' - Cr1a 4 1 54.46 AGAAATCAAAATCCGAATAAGCTGCTTAATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 - chr2L 18655231 5' + Doc 14 1 66.00 TTGAAATTACCACCACTAACTGAGTAGCTGCCAGTTAAGGAGCTCGTATATAAATATATATGTCGAAGAGTCATGAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTA:1 + chr3L 18122290 5' - invader1 3993 2 59.00 ACTGTGCATCCAGTTTTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 + chr2L 16680046 5' + P-element 54 1 26.73 TCCCACACAATTTCCCCGAGTGTACGTTACTTTGTTTCAGATTCGCCTGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGA:1 + chr3L 18326693 5' + Quasimodo 7196 2 52.48 TTACAAAAACCCAGATATTGCAAAGTCCTATACACCACCGAAACAAACACGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAGAAGTATCTCCAC:1 - chr2R 5509760 5' + mdg3 5132 1 56.44 TTTGCGCAAACATTCATTACTCCTAAATGAACGCCTAAATTGGAATTTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 + chr2L 14761955 5' - mdg1 393 2 51.49 GTGCATAATATAACACAGCNCATGAATATATTTTCAAAAAACTGAACCTTCTCCAGTTTCAGTCATTAGTCGGTAAAATGGATTTACATTTATTTTTAGAA:1 + chr2L 6235950 5' - looper1 1807 1 63.37 CGGGACAACTTCAGCTTTCGTTCAGTTAGTCTATGCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3L 13773894 5' - roo 9033 1 64.00 CCCCAAACCCCTTGCAGATAGACTAATATTTTTCCCCAATGGTCTGCCAAAATTGAAGCAACCGAGACCGAAAGCAAAGCCGCAAGTACAGGTTCCCTTCC:1 - chr3R 20399963 5' + Gypsy12A_LTR 2228 1 80.20 TGTCTTAGCAATAAGGTCACAACAAATTTTGGCTGATTGTCTTTAAATACTACCGTTTAGATAAGTTTCTTATAATGTCGTTGATCCAATTGGCAATAAGT:1 + chr2L 18538498 5' - Helena 231 1 62.38 GGATGAGTCATGTAGACGTCAATACCGCACGATATCGGGGAACTCGAGCAATGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGC:1 + chr3R 29761841 5' + F-element 4404 1 65.35 ACGGACTGCGTGTGCGAGTGGGAGGGCAGACTGGTGATGATTATTAAGAAGAAGGGTCAACCTTGGCGGCGACTTAAAATGCTGTTGATTCTCCATGTCAT:1 - chrX 18013200 5' - Burdock 5934 1 81.19 TACCAGGTAGAATACCTTTGGTGAAGGGTATTGTAATGATGAACTGCCTTTTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:2 - chr2L 10792070 5' - 412 446 2 66.34 TGCTTATTATGTGAATATGTCACTTATTGATTGTATATTGATTGTATACAATCAGTGGATGTGGATTATGTGGATTTTTCCGACGGCGTTTATTCTTTCCT:1 - chr3L 25008288 5' + Max-element 432 1 76.24 AATTCAGGAAAATGTATTCAATTAATTAGTATCAGGTATACAATTCAATTCAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 - chrX 21583421 5' + F-element 31 1 51.00 CTTTAGTAATCAGCGACAGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATATTACAAGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2L 9045481 5' + jockey 30 1 54.55 CGTCAAAAAACACATTATGATCAAAAACAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGCTGCGCCGCGGCCGACGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACG:1 - chr2R 5774369 5' + HMS-Beagle 120 2 73.27 CTATCAAAAGTTAATGCATTGCATGTTAAAACTGAACATTTGATGGATAAATCGCTGAGTTGACGCAACTGTGCTCTCCCTACGCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 - chrX 1235182 5' + blood 164 2 74.26 TCCTGTGGCAAACACTGGGAATGAGAGCGGGGCAAAATGGTAGGAAACCCCGGGATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAA:1 - chr3R 13739753 5' - Burdock 6370 2 58.42 ATCCGTTTAGGGCTTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr2L 21086028 5' - roo 9039 1 63.37 AAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:2 - chr2L 12808221 5' + Tirant 8150 2 65.35 TTATGAAGTATGAAAACAGAAGTACGTAAAGCAGATGGAGTCGTTTCCTACTCTATATAGCCCCTATATATATATATATATTCTTGATCAGGATCACTAGC:1 - chr3R 7436651 5' + INE-1 86 1 74.26 AGTCTAGATATTCAGAATACTCACCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGA:1 - chr3L 6114356 5' - I-element 308 1 76.24 TCCAATCAATGTGCTCAGCAGCAGTACAAAGTAGTTGAAAGGCCCATGTCTCCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGC:1 - chr2R 7943828 5' + accord 61 2 58.33 GCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTT:1 + chr2L 18213131 5' - hopper 1408 2 70.00 GTACAGAATTCTAATGTCCTTTGCTCACTGTACCTGCGTAACATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTAT:1 + chr2L 7937246 5' + jockey 4555 1 58.42 TACTGGGTCCCGGAATATCAGCATAAGGTTTGGCCTCTTCCAAGCTCACTGCTGTGGCCTATTGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3R 10434971 5' + 1360 10 2 64.36 TTATCAATATTTATTTTAAAATGGTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTCAGGATGAT:1 - chr3R 11166141 5' - mdg3 308 1 76.24 ATGAACGAGCAGGAGTGGCTGTGGGCTGGCAGCGAAATTAAAGGGAAAAGGAGAAAATGAAGTAGTGGTGGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCA:1 + chr3R 28621325 5' - 1360 3187 1 74.26 ATGGATCAGTAAGGGCTAAGCACATACTCTTAAGTCCCAGACCAAAGACACTAGAATAACACGATGCGTAACGCCATACGCTTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr2R 4560442 5' + 1360 38 1 64.36 AGGGGTAATAGTAATTGAAGGTAGTTGCTTAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTT:1 + chr3R 22869392 5' - Bari1 1666 1 64.36 AGGCGCATATTAAACATCAATTATTTATGCCGAGCGATAAACGGGTTTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr3L 13895431 5' + hobo 26 1 50.51 CCTTGGGCCATTCGCCGGCTGATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2L 20045812 5' - roo 9047 1 54.46 TAAGATATATTATAGGTTTAAGAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:3 + chr2L 8577250 5' - roo 399 1 69.31 TCATTACATTGTCCACTTTTTAGTGAGTAGTGAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chrX 8316325 5' - hobo 2897 1 70.00 GCCAGATAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr3R 28565276 5' + 412 7099 2 71.29 ATATTATACTATAATAAGTAGGGTAACCATCCCAGAAGGGTCTGTCCTTAAAGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:2 - chr3L 20411877 5' - roo 395 1 64.36 AAAACAATTCCTTTAATAAAATACAATACATTTTTCTTCATCTTTGTTTTTGTCTTCCTTTGATATTGAATATGAATGGAAGCCCGAAAACCGTGGTACC:1 + chr4 516533 5' + HB 491 1 71.00 GTACCGACTTATAAATGCGGTTTAGCTTCCATCTGGTTTTGTCATAAGTGTGTGCAGAGCATACCCCCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr3R 19963475 5' + 1360 8 2 56.44 TAAACTAAATAAAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGTTCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTA:1 + chr3L 387464 5' + F-element 153 1 75.25 AAACGTTTGCCCTTGGGGCGAATTTCGCTGTGCAAGAACAAGATGGAAAATCTATGCACAAAAAGGGGTAATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAA:1 - chrX 9775079 5' - 412 485 2 70.30 ATATTTCTCTTCATTAGAAGTTCTTTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 - chr3L 10474220 5' - copia 235 1 53.47 TGGGGATTTTTACCCTCAGGCAATTTCGCTTGTGGTTTTTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chrX 7996433 5' - hobo 2901 1 60.40 GCCCGCAGAGAAAACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - chr3R 11608020 5' - 1360 3358 1 58.42 TGGGATTTCCAATTTCCGAAAAACCACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTC:1 - chr3R 1849060 5' - Cr1a 340 1 78.22 TAAGTTACCACATTATCAAGCATTTTTCGCAGTGCACTCCTCACTCATGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 - chrX 4264417 5' + mdg3 5279 2 52.48 TTAAGCGTTTCAAAGCGTGAAAAACGCTTCCTATTATTAGTTTAATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAATTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 - chr3L 7099685 5' - roo 410 1 78.22 AAAATGGGGGGTGGGGCAGGACACGAGATATAGAGCTAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chrX 7996384 5' + hobo 37 1 58.42 TCGACAGTTCCTCTGTCGCATCCGTCAGGGACCAGACTTCGGACATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCTC:1 - chr3L 14050431 5' - 1360 126 1 58.67 TGATTAAGAATAACATGTTGGCATTGACTTAAAATTTAAAGTTCGAACTCAAAGCCTTTCCAATTTTATATTAAAACTGTAAAATCAGAGAGACTCTGTAG:1 + chr3R 17970092 5' + 412 363 2 79.21 AATGGGGACTGGGCCACAAAAGTGACAGGGAGCAAAGCTAAGGCAAACCTTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTC:1 + chrX 6515154 5' + Stalker 433 1 51.49 ATCTTTCATAATTTTTACGTTCTGGGGGCTATTTACGAAATAGTTGTTTTTCGCGTTCATTGTTAATAGTTTTATTATTTTTTTACATATTGATAATAAAC:1 + chrX 5477740 5' - S2 123 1 60.40 TAGCCTCGCTTATTTTCCGCCACCCAGCCCCATTTTTTGTGGCATAATTTAAGGCGACATTGACAATGAGACGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr3L 6023378 5' + hopper 4 2 75.25 AATGGGTGCAACAACTATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTT:1 - chr2R 13653409 5' + F-element 46 1 56.00 TCAAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr3L 12241828 5' - roo 9027 1 72.28 CAATCGCATCGGATCGGATGCAGTGCAGCCAGCTGGCAATAAATCAGCGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCC:1 + chrX 19231023 5' - 297 248 2 52.00 GACTTGGGCTTGCCGCAAATTGAACTAATTTGATGTGTGAACAACGGCTAAAATGGAGCAGGGGTGTCCTGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:2 + chrX 2841743 5' - hopper 1412 2 76.24 GTAAGCGTGTATGTATTTTAAGATAATATTAAATATAATTTAAATCATCAGACGCAAGGTCTGTGCCACCCACTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTGGAC:1 - chr3R 5225579 5' - INE-1 145 1 60.40 CACCCACCCGATCCAGCGACTCTGACACGAGTTCAATGCTCCTTTGCAAACATTATTTTGTCGTTATCTGAGTTATCAAAAATTTAAATGATTTTTGTAAA:1 + chr2L 18362199 5' + HeT-A 5793 1 57.43 TAAATAAACATCAATTAAAATGAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAAC:1 + chr2R 5772471 5' + HMS-Beagle 6846 2 80.20 AAAGAAATTCTGGCTAAAAAAGCAAAATAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 2176365 5' - roo 9026 1 75.25 TATTATTTACATTTATAAANAAAATGGTGCATGCCTAACTAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCT:1 - chr3R 17656615 5' + roo 174 2 65.35 GAAAGAGGCGAGCTGGCCAAGATGACAACACGGATGTTGATGCATCCAATTAGGCGGGCAATTACCGAGCACCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chrX 19034211 5' + hopper 3 2 76.24 GTTTATTGTTGCAACAATTGTCGCGTGTTTGGGCCGGGTTTGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTC:1 + chr3L 16282333 5' + gypsy5 3 2 79.21 TATGGGACCTCCTGCCTGGGGGAAGCTGTACCCAAAAGCTGGCCACCGGAGGCAACAATTTCCATTTGGCGTTCGCTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr2L 17994108 5' - roo 409 1 79.21 TACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGCGACTCTTTGCATTCCAGAAATTCTGTCGAGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTG:1 - chrX 21852438 5' + invader4 2833 2 70.30 AGAGATTGAAGAGAGAATAATAATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAA:1 - chr2R 2118120 5' + 17.6 7126 2 78.22 GAACCCAAGATTGTGGAAGAAACGACCGTGGAAACTGCAATCAAACAGAAAAAGACGAAAAAACCGAAGAAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCG:1 - chr3L 2049603 5' - McClintock 6018 2 71.29 ACACCTTAAACTGTTTTTCAGAACGCTTAGCTCACTGCGAAAAATCAGCGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCC:1 + chr3L 736011 5' + gypsy6 7440 2 52.48 TAAATGCGAAGTGGTGGCAGGATGGCAGATCCTGACGAGAATGCGGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr2L 13566453 5' + hobo 9 1 70.30 TGGAGACGCTGTGTTAATTCAAAGTGCATCGGCGGTGACCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACAT:1 + chr2R 6420463 5' + Stalker2 7288 2 61.39 TGTGGCCCGCATAAAGCATTTCGCTCGTAAGTAATTTAAGTAATTTGTCAAAAATATTCACCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 - chr2R 11030592 5' + F-element 39 1 53.47 AATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3R 7869129 5' + 297 43 2 68.32 TGTTATAGTAATACCAATCGTTTGCCACTATAATCACAACGCGTTTATACTCTCTCCGCCTCCATCCAATTTAAGCCAGCGAAGGAAGCCGTTCACCTCTG:1 - chr2L 21872630 5' + Gypsy6A_LTR 343 1 77.23 TCGGCTTGGCCAAATCGTCCAAAATATATATTCCATCAAAAATATATATACTTTAAATATATAAACTTACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chr3R 7764921 5' + 297 6586 2 73.27 TTTGGCTTTATGACAAAGTTCTAATAAACTTTTAGTGTTGTTGCGCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATT:1 + chrX 19970164 5' - R1A1-element 149 1 55.45 GCCGTTGCACAGTACAAAAAGCCCCATGGAACATGATAATTTGTTAACTTCCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chrX 4277454 5' - roo 9048 2 61.39 ATATCCCCAGGAAACAAGGATCTATATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCT:1 - chr3L 4009473 5' + mdg3 51 2 77.23 CTAATATATTTGGTATTATACTATAATAAGTAGGGTAACCATCCCAGAAGGGTCTGTCCTTAATGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr3L 20411889 5' - roo 409 1 73.74 CTTAACCTAGTTCCTAATCGATCACGCATAAACGGAGATATAGTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:2 + chrX 19334584 5' + roo 31 2 57.43 GCTATACCTTCCTCCTATGTAGACAACTCGGAAGCAGCGCCGTCATGACTAATCCACGTATGACTGCTCTCTTGCGGTTCTTTTAA:1 - chr3L 3083188 5' + Cr1a 352 1 81.40 TGTTCCGTTCAAAACTTGCAGAAAACGCAGAAAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACC:1 + chr2L 10028335 5' + I-element 230 1 68.32 GCGGGGAGTAAGGGGAAAGCGGGATCCTGTGGCAACCGAAGCAGAATTTTGTCTGCTGACGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAT:3 - chr2L 12882821 5' - hopper 1399 1 61.39 TTGAACAATTTATAAATTTCTTCTCATTTTATTCCCCAATATCTGTGGATATCTCAAAAAAAAGATGAAATTTGCGTTCGAATTCACACTAGCTGATTAA:1 - chr3L 20033440 5' + INE-1 533 1 75.00 TTTAAATAAAACAATTTAATAGAAAAACATACATGTTGCCACGTTCACTTTAACGCCCACAAACCGCAGAAAACTTCCACGCCCACACTTTTGAAAACTGT:1 - chr2L 22095411 5' + INE-1 255 1 69.31 TGGTAAGCGGTGAACAAGCCCAAAAACTGAAAAATACATAAATTGTAATAACAATCATAATAATACTAATAAATAAAAAAAAAAGACAAAAAAAAAGGAAG:1 - chr2R 7042584 5' + Doc2-element 245 1 65.35 TACAACTGAACTTTTTTTAATATCAAAATATAAAATCCATTCACGATCAGCTGATAACCAAATTATCCCAAAACTTCTCGGGTGCAGCTGATAAGGGTTGC:1 - chr2L 21368311 5' - gypsy12 130 2 60.40 AGAGAGCGTGCTATTTAGCGATTAAACGGAAATTAACACGGACTCTATGCATCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACC:1 + chrX 10473718 5' + G2 2748 1 55.45 AAGAGCCACAAGTAGTCGAAGGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr2L 8622753 5' + 297 6605 2 61.39 AATTAATCAAAATAAATCGAGTTTGGCCGACAAAGTCGAAAGTAATTTTCAGCACACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 + chr2R 8526325 5' + I-element 22 1 57.58 ATTTATTGGTTGAATAGCTAGCTGGTGCTGTTCTCCCTTAAGTAAGTCACAAAAAACCTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGG:1 + chr2L 3408604 5' + G-element 22 1 57.43 TTATGAGTGCTCTATCATATGTGAAAAAATAAGCTAAACGCTTGATGTTGTGTAAGGAGTCTTAAAACTCCCCACAAATCTCGTGTAGGGAAG:1 + chr3L 19998013 5' + gypsy8 20 2 53.76 CATCCTAATTCTGGCCTGTATATTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr3R 18549961 5' + pogo 50 1 82.18 CCCGAAAATAGCCATAATAATGATAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 - chr3R 12767329 5' - blood 7342 2 73.27 TTTGATTTATTGTTTTTTTATTTAAATATTT:1 + chr3L 27287392 5' - TART-B 10629 2 77.42 TTTTTGAAATTCAAAACGTTGGTAACCAAATTGTCTCCAAATAGTCAAAATATTTCCAGCCAAAACCAGTTTTTGCTTCAAACCTAACGGTTCTTTCTAAA:1 + chr3L 23784620 5' + Transib5 120 1 72.28 ATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3L 9910419 5' + 297 38 2 73.27 CCAAGCGCTCGAGGCAACGCACAACTTCCGGCCGGATTGTTGGCCATTTTGTTTTTACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 + chr2R 19560140 5' + Tirant 8124 2 64.36 TTGACTTAGGCAAATGCGTGCTTATATATATATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGT:1 - chr2R 21433201 5' - HMS-Beagle2 268 2 77.23 AGAAATTATAATATCTTCGGTTCGCTATGCTGCTGCTTTGTACGTCGATTGAATGCAGCCATTCCTGAACAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCT:1 + chr2L 5800688 5' + Cr1a 357 1 56.44 CTGTATGTGTCTCTCGTTTATCATTGTTGTTCGTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGA:1 - chr3R 21326586 5' - F-element 197 1 67.33 GCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr2L 23372626 5' - 1360 3352 1 67.33 ATCTCCATAGTTCCTCCACATCAAACGTGCCTCCTCAATTAGAGGAGAACTATCCTTTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACGAC:1 - chrX 749320 5' - Tabor 7207 2 65.62 TTATACACATAGTGAGTATAAGAACCTGTTTAGCAATGAAAATAGCTAAAATAAACTTCATATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGC:1 - chr2R 5653443 5' + Tabor 489 1 65.35 CTTTCCAAAGTGATTTTCAGTCACAAAGTATATAAGAAAATAGCCCCAATTTGTTCAAACTTTGCTGATCTGTATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCG:1 + chr3R 20867508 5' + Quasimodo 7146 2 51.49 TAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCAATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAA:1 + chr2L 21735024 5' + 17.6 44 1 75.25 AAAGGAGATCTATTTTCCAGCAAGCACTGTTCCCTCCCACGTGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGA:1 + chr3L 15452424 5' - accord 7000 2 55.07 CAACCAGGCCGAACCAAAAGCAACCCGACTCTTTGAGTGGACATGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGGTGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 6850437 5' - roo 9041 1 57.43 TTATAACTGACAAATAGAACTTATTGTTCCTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAA:1 + chr3L 15099527 5' - G4 3829 1 85.15 TCCAGCCAAATGGCAAACTGAAACAAAGGAGCACTGCCCCTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 + chr3R 11607956 5' - 1360 3353 1 63.37 TGAATTTTGCGTGATGCCCAAATAAACAAACTGGTTGGACCCTAAACTTCTTCTCACTCCTGGCCGAGGATCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCT:1 + chr3L 17179550 5' - jockey 4695 1 69.31 ATGCAAAACCAGTCGGAACCGGAAACGAAAACTACGGATGGAGCTGGGACAATGTGGCTTTTAAAAGGGTACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAA:1 + chr3L 10474116 5' + copia 4877 2 71.29 ATTGTTACTTACCTAAAAATGACAAAATCAAAACACAAAGTTAGTTTAGGAATATTATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr3L 13772987 5' + pogo 16 1 63.00 ACTTATTCATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGC:1 - chr3R 3268046 5' + mariner2 102 1 60.40 CCTCCGCTTTACGAATGTCTTTCTGCTTTATCAATTAAATATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr3R 17003375 5' + pogo 31 1 62.38 CATTTTTGCTACTCTAAACAAAATTGTTTGAAAACCAAGACTTATCATTGCGCAATCTACAGGTAAATACAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 16546883 5' + pogo 4 1 70.30 TTTGTGTACCCAAACTGGCAGGCAGCTGGGAAAATGCGAGCAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr2R 7838971 5' + pogo 32 1 60.40 TAACCGTGTGTTGTCGTCTATCGTCTGCCAGTGTTGTCGTCATATTCTAAGTGTTTGTTCAATTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:1 + chr3L 3835547 5' + GATE 34 2 64.36 AACTCTTAAAGACAAGGGACTGTAAATGCGGATTTATCATGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATA:1 + chr3L 25059080 5' + mdg1 7075 2 63.37 GTTTTTTACAATATTTCATAATTTTAAATCTCTTAAAATAATATTGTAAAATACCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr3L 15037980 5' - roo 9036 1 62.38 TGATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAA:1 + chr3R 1418285 5' + BS3 221 1 62.00 AGCAACCCTGTGCCGAGCTAAGATGAAGACCAAACACACGCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chrX 14651086 5' + P-element 9 2 59.46 ATCTCTAACCCACTGGCTTNCATAGAGCTTTAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chrX 15546206 5' + blood 43 2 66.34 AGGTAAATTGGAAATTTATTATTATAAGTCAATAAACAAACAAAAATCGACTCTGTTGTGATGTTATAATCGACTTTCCCTACTATCAGATACCCGTTA:1 + chr2R 4699316 5' - INE-1 552 1 54.55 TCAAAAATGTGTATGTTTTAGGAAGTTTGGGGGAAGTTTGCGCCGCGTCTTTAAAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTCAAGCTTTTATAGTGCCTGAGAT:1 + chr2R 5185197 5' - INE-1 151 1 63.37 GATGCTGCATCGTTAATCTTCTGAAATTCGAATCCTCTTGCTCTCTTTCCCAAGCTCCAACCTCCTTCCATCTTGCTCCAATAATCTCTCTCTCTCTCTCT:1 - chr2R 23305415 5' + blood 7174 2 64.36 TGCATTTGTTGTTGCGCCGCCTTGCCGCGTTTTTTGATAAGGGCATTATTCCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chrX 19308156 5' - P-element 2862 1 54.46 CCGATGACTCCGCGATTACCGCATATCGAAAAACTCAACGGCGAACAACAGCTGCAATAAAATTGTATAAGCTAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 + chrX 12906480 5' + P-element 3 2 76.24 ATGAAACTTCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGAT:1 + chrX 22789332 5' - Tabor 7279 2 71.29 AAATGTATGCATGTTTTTATTCATTTTTAATTAGATATACAAATGTGTAGCTTTGACTTTGCTTTATATATTTTGAGCCAAAATACATGAATTTTTATTAT:1 + chr2L 10302181 5' - S2 1633 1 55.45 AACTCGTCAATGTCATCATTGCCATTGTGCATGATTTTATGATGAAAGCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 - chr2L 8622840 5' - 297 371 2 58.42 GTTACCTTTCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 + chr2L 20560339 5' + F-element 45 1 59.18 AAAAGAGATCTTCGATGTAAAGCTAAATTAATTAATGAAAAGAAAAACCAACTAAGAATTTATAAGAATTTAATAAAAAATTTACCCTACCTTAGCGTCTA:1 + chr3L 13311543 5' - Tc1-2 1347 1 63.37 TTTACGTTCTGTTATGTTAATTCTAGCTGGTAGTTCGCTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAG:1 + chr2L 13084081 5' - hopper 1177 1 64.36 CAACAATCTCGCAACACGCTGCAAGTGGCAGTGCACATTTTTATCAACATTTCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATAT:1 + chr2L 17677698 5' - Tirant 378 2 58.00 CTGGGGGTCTTACACGGTGGGGCGCTCGGGCTTTTGGTGGTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACG:1 - chr3R 24172724 5' - Stalker 6908 4 69.00 GAGCCTACGAAATGGCGCCTAGAAGTAGGCAAATGTGTATTGTCTCGCAATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGGTTTTCAC:1 - chr3L 8039416 5' - hopper 1388 1 52.48 GCAAAGTCCAACAAACTGCAAAATAACAGTGGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr2L 20045748 5' + roo 42 2 69.70 GCAAAAATGACTCTGTCATCTTTTTGTTCCCATTTTGGGGCCCAGCACGCTTGCCACAGATTGAACCCCGGAGACAATAGTTTTTGGAACGCCCAAAAATA:1 - chr3R 17082865 5' - jockey2 342 1 65.35 CTCCGCTTGTGAAAACAACTATTTTTGATTGTGCGATTTAGGGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATA:1 - chr3L 5710313 5' + Transpac 31 2 55.45 AAATGTGCCAGTAGCAGACTTGCCTGCTAAAGCTGCAGTTCATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGA:1 + chr2R 21962626 5' - 297 365 2 62.38 TTTTACACATTTTTATTAGTCTTGTAAATAGTCATCGATTTGCAAAAAAAAAATTCTTGCCACGTCCACTGTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTACCAC:1 + chr2L 22063438 5' + INE-1 351 1 68.32 GGTAATCAAAAGACGTAGTNTCCCTGCGAAGATCAAAGGCTCTGCTTGAAGCGGGTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCG:1 + chr3L 9987011 5' - Stalker 302 4 62.38 AGTGACTACTAGTTTCATCAAATTGAATTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTAC:1 - chr3R 31021987 5' - Ivk 5327 1 77.23 AACTTATCTATCTGACTTCTTTAACTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGACGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGT:2 + chr3L 12905101 5' - Quasimodo 352 2 75.25 TTGATTTCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chr2R 17963248 5' + blood 43 2 75.79 CCAAAACCCACGGCACAGTGGAACAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTA:1 - chr2R 16160805 5' - mdg3 194 2 75.25 ACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGT:1 - chr3R 10391229 5' - invader4 277 2 76.24 TTTAATTTTACTCACAGTTTATTCAATCTACGAGCTGAAGCACGGACATCTAAAACAAAAAAATGCTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATGCCCACAGTGCA:1 - chr3R 30637187 5' + diver2 4616 2 45.54 CTGGAAATGAATCTTTTCCGGTGTAAAAGCCTGAAGCTGAGTGAAAAATTTGTGCAGATGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGG:1 - chr2R 10000239 5' - F-element 4419 1 62.38 ATATATTGTGGAAGCAAACAGCGCGATGTGAGGGGCTCCCATTTTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCA:1 + chr2R 9640987 5' - jockey 4705 1 56.44 TCATGGTAAAGTCAAGGGGNAAAGTCATTAAATTAAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 + chr3L 23646289 5' - hopper 152 2 79.25 TTGGGCATTGTTGTTACTCTTATTGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 - chr3R 7139289 5' - pogo 2052 1 79.21 ACTTGGACCCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAA:1 + chr2L 12808160 5' - Tirant 8475 2 59.00 CCAGCTATCCGTGATCAAGTACGACTGCGTTAAGTGCGGCTATGTGCTGGGTCCCTTCGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAATACGAAGTTAAC:1 + chr3R 8266015 5' + Bica 4647 1 67.33 ATAATAAAACTGAAAGGCAAAACGCATAGAGCAATAATAAGTGCGAATAAGTGTCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 10087900 5' + roo 8687 2 56.44 GGATGGGATGGGATGATGACGGAATGTAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCC:1 - chrX 13341380 5' - invader3 267 2 55.74 GGAACCTAATAAATCAATGNCCAACAGGAACGGCGCATAACTCGGCTGGAGCACTTTGACTTGGGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1 + chr2R 6847242 5' + mdg1 7052 2 64.36 CAGTGTGATGATCAGCGTTTGATTTCACACTAACGCGGCAATACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACT:1 - chr2L 23281114 5' - 1360 3323 1 58.42 ACATGCCACAAGCTGAGATTCATTTGGCATTTTGAACGGCGTTTATTCGCTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTAG:1 - chrX 977579 5' - HMS-Beagle 7031 2 60.40 TATACACCTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGATGGCAGCCGTCGGG:1 + chr3R 30553556 5' - 412 7508 2 58.42 GGAGAGCGAGAGAGCGGAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACC:1 + chrX 19718595 5' - 1360 2983 1 51.55 GAATTGCTGGGCACAGAAANGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3R 29608774 5' - roo 9044 1 54.46 TAACTAGCACTTTAATTGGNAATTTTCCTTCAGAAGTTCTGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACCAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 - chr3L 20882851 5' - 412 459 2 55.00 CCCATTGTTGGGCTTGTTTCTTTGTGGCCCCCATATCTTTGCCCACTTTCGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTT:1 + chr2R 23721573 5' - Quasimodo 140 2 75.90 TGGGAAGTATTGCCCTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGA:1 - chr3R 4474228 5' - copia 5081 2 71.29 ATACTCTTTTCTTGCCCATTCCATTTCCATCTCAATTTCTAGTGCTAATCTAGTGCTAATCAATTTCTAGACTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 + chr3L 17140579 5' + F-element 15 1 44.55 ACAATGGGTGCAACAACTANGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 - chr2R 13653411 5' + F-element 45 1 54.46 AGGGTTTTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr3R 11916611 5' - roo 9032 1 63.37 ATTTACGAATAAATAAAGGNACTTTATTACGTTACCTTTCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 + chr2L 20560309 5' + F-element 19 1 62.38 GGTTCCGATTGGAACGAGTTTTGCCCAGTTCCCGCTAAACCGTTGTTATTCACGGGCTGTCGTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr2L 18142817 5' - roo 8984 2 41.58 CCGCATTTTGGATGTGGGTGATGTGAGGTGGGCAGGATTTTTCACCGTCTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGT:1 + chr3R 13739667 5' + Burdock 6163 2 52.48 CCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACG:1 + chr2L 14793493 5' + Stalker2 31 2 56.12 GTGTGGGGTAGATTTATTGCATGACATTTCAATTGTTAGACCAAAGAAACTAGAATAACAAGATGGGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chrX 22593157 5' - 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X-element 4415 1 64.36 TATCACTCGTACATGCTGGACACAACGCCTTCTGGGGTGTGTGTGTACGAGTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 - chr2R 8311380 5' - opus 7480 2 58.42 CCTCCGAGTGATTACATAATTTACAGCCCCGTTAACCAGATGTCGGTAGTTCCAGCCGCTTTCACTTTGTAACGTGTTACGAAATAAATTGATGAAAGGCA:1 + chr3R 4719372 5' - Gypsy12A_LTR 2247 1 77.23 GAAGTATCTGTTTCCAGTGCTAAAAAATGTCTAAAAAATCAGATCTGCGACACGGCCTTCCTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAACAGTCTCTCAAT:1 + chr3L 19089768 5' - invader1 3561 1 59.41 ATACCGAGAGGGACATGGGTGCGTACCAGAGGGGTTCCTTGCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTA:1 + chr2R 12215185 5' + Quasimodo 7150 2 62.38 AAATAATATACACCTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGATGGCAGCC:1 + chr3R 30553550 5' - 412 7514 2 52.48 ATATCACTCGTACATGCTGGACACAACGCCTTCTGGGGTGTGTGTGTACGAGTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr2R 8311381 5' - opus 478 2 59.41 CGAGAGGCTTCTACATCTCTGGTGTGTTTTCTTTCTTGTCCCCCCCAGTTTATGTAGGTTTTCTTCCTACATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 19026813 5' + hopper 146 105 56.99 AACGAAAAAAGTGAGAAAAGATAAAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 13093753 5' - roo 396 1 66.34 AATTATAGTAGTATATGACAATAGAAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTT:1 - chr2R 5924420 5' - jockey 4742 1 38.78 TCAATTAAAAATAGGAGATAAAGTTATACTAAGGAACGAATCGGGTCATAAGTTAGATCCAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr3R 28395317 5' + pogo 15 1 64.00 AAGGCTATGTATAAACATTGGCTGTTGGAGTCTTATAAAATATATGTGTATGATAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTT:1 + chr4 74251 5' + 3S18 23 2 56.44 CCACTGTGGAGGAGTCCTTCCTGGACTGAGCTATAAATGCCAACGCAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3L 13773957 5' + roo 8688 2 53.68 GTTTAATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAATTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3L 7099646 5' - roo 9034 1 65.35 AAAGAGCAAGAGATGAAGAAGTTGAGAGCTCGACTTATTGTGCCCTAATCTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3R 27495641 5' - 412 467 2 53.47 TAAATAAGGCAGGCCGCTCATAAATTGATTTCGATATCAATTGCTGAACTTTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3R 7469948 5' + Doc 33 1 51.49 TTCAACGGACGAATGCAAAATGTTCGACTTTTGGACAACAAACTTAAACTTTTGTTTATTTCGTACACTAATAAAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGC:1 - 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Stalker2 7609 2 62.63 TTGTCACTCACAATTAACCNAAGAACATCGCTTTCAAAGCAGCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chrX 16671124 5' - P-element 2853 1 44.55 TCATCTTTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chr3L 27357554 5' - mdg1 387 2 54.46 CGGGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1 - chr3L 24761241 5' + 1360 80 1 64.36 CAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:2 + chr2L 13093787 5' - roo 361 2 73.27 TTCGCACGTTGCTTTGCAANCAGTTCCCTTCTACGTACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATAAACAAATATACAAAAATACCACCAAAAACTA:1 + chr3L 21449814 5' + Stalker 109 4 63.37 ATACTAGTTGAGCCAAGCGTATGGAGCTCGATGTTTTTAGTACGTTTAAATATTGTAAAATATCTGGAACAGTCATGCAACTCATATTTAGATCTACAATG:1 - chr3R 24675250 5' - Cr1a 4154 1 76.24 GTTGAAAGATTATTACAATAGTTATATAGCAGACAAAACCGATACAACTACACAAAAACATAACATACACAAAAATGTTAGTGAACTACAAATCTACATAC:1 - chrX 18922769 5' - transib1 289 1 67.33 ATGGGCTGTCATTTATTTGACCCGACTCACTCACACATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGG:1 + chr2R 21433146 5' + HMS-Beagle2 35 2 60.40 TCGATAATTTAATTTATCATAAAAAAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 + chr2L 16851733 5' - HMS-Beagle 199 2 77.23 GATGGAAAATCTATGCACAAAAAGGGGTAATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 - chrX 9775038 5' - 412 7497 2 73.27 GAATATATCGAAGGAGTTATCCCTTAAAGTGGATTCAAATGAGCACTTCAAGGCTGAGATTTGAGACCATTAACTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGT:1 - chr3L 12634253 5' + BS 5000 1 72.28 TGTTGAAAATGCAAATCCCGGACATTAAGTCACATGATGTGGTAAGAACGTATTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 + chr3R 6947320 5' - I-element 5333 1 56.44 CTTGGGCTTGCCGCAAATTGAACTAATTTGATGTGTGAACAACGGCTAAAATGGAGCAGGGGTGTCCTGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 + chrX 2841745 5' + hopper 5 2 74.26 CACTTGGCTACTCGAAATGTAGCATTCACAATGCGAACATTTTATGAGAGAACACAGGGTCATCACACACAGTAACTTGTTGGTATAATTGTTGTAAATAG:1 - chr2R 21402516 5' + accord2 7154 1 61.39 ACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chrX 13146926 5' - roo 9028 1 69.31 CAACCACCCTCGTAAGCCTACATCGCAAAATGTTGCATGTTTTAGCCCTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr3L 14623920 5' - hobo 2912 1 51.49 CAATTTGTATCTTTCGTTCGATTTGGCGACTTTGATTTCAGTCGCCAATCGTCAATCGCTGCGCCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr2L 8709398 5' - P-element 2876 1 68.32 GCGATGCGATGCTGCCAAANCCCACGGCACAGTGGAACAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTT:1 - chr2R 16160819 5' - mdg3 5460 2 62.38 AAATTAGCATAAATTTAAGCTTCAACGGCTTATCTTCGGGCCCGCTGTGGACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 + chr2R 23780006 5' + mdg1 28 2 50.50 AAACGAAAGGGTAATAAAAATGCTCAGGTTAACGAAACAATCGTACAACACACATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTAT:1 + chrX 11967273 5' + 1360 3257 1 54.46 AAAAATTGATAAATGCTCCACATTTCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTTTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGT:1 - chr3L 6379298 5' - roo 159 2 75.25 ACATACATGTATCTAAAGATCCCTGTTTAAACCGCGCACTATGGGTAAAAAGCCGGAAATTTTGGTATTAATGTAATTTTTTTTGTGATTGATATTTTAAT:1 + chr2R 4547798 5' + transib4 44 1 66.34 AGTCAGATGACATTATTTGNTTATTTTTGGTCAATGAAATTTAAGTTAACTTTTCGAAACTTTATGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAG:1 + chr3L 22519189 5' - 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chr3L 25059147 5' - mdg1 392 2 54.46 AAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATT:1 + chr3R 4357553 5' - Tc3 1667 1 70.30 GACAGTAACAGTGGGCTAAAACTGGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGC:1 + chrX 21229296 5' + transib2 49 1 74.26 CGCCGACATTTTTAAAGCTTAACAGCATTTTTCCACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:2 - chr2L 18248075 5' + blood 10 2 69.31 AGAGTGCACTTGAGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 9649183 5' - roo 9028 1 69.31 CGTGATGAATAACAAATATTTTAAGGTTCTGTGTTTATCCCCTACGTACGAGTTGGCAATTCAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAA:1 + chr3L 27331969 5' - hopper 1300 1 67.33 AATATTTTCGGTGCTTTTGGCTTTTGTCCTCAAAGTCGTGGCGGTTACTGCCGATGACCCCATGGATGACCCAGGGTAGTTTAGCCGCCGTTTCCAGAAGT:1 + chr2R 14349089 5' - mdg3 246 2 74.26 GTAGACGCATTATAAATGCATATTTATCAAACAAAACTAACTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3L 872775 5' + 412 36 2 58.42 TTAATGAATATTTACACTAATTGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGT:1 + chr3L 19249665 5' + Transpac 19 2 60.40 CGTGTCCCTGTCAAAGTGTTGGTAACTGAGTGGTTGCTTATGTGTGCGTGTGTTTGTGTGTGGTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 + chr2R 23671756 5' - hobo 2926 1 68.32 AAGAGGGACAACGAAAAAAGTGAGAAAAGATAAAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2L 13093744 5' - roo 405 1 73.27 ACCTTCGGAGCGGGAACAGTGCGAAATGCTTGGTTGCGTTGTTGCCCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr3R 6961063 5' + 412 30 2 54.46 CGACGTTCCCTTCCAGGATNTATTGTACGCGAAGAATGCAATTGTAATTTTGAAAGTTTTTATTAGCATTTTATAGATTTTAATAAGGCATACGGGGTAGC:1 - chr2R 2074033 5' - BS3 1752 1 72.28 TTGCAATGTAATCGCAATCGATCATCAGCCACACTGTGAAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr3R 28621024 5' + 1360 38 1 66.34 ATGTACACAGACCTGGTGTTGTTGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCA:1 + chr3R 24002410 5' - Tirant 8424 2 77.23 TTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr3L 21144066 5' + jockey 59 1 76.24 TAGGCGTGGCACCAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTG:1 + chrX 21667978 5' - Tabor 481 2 68.32 ATTTTTAAAGCTTAACAGCATTTTTCCACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 - chr2L 18248068 5' + blood 7028 2 62.38 CCATGTTGGCTCTCCGCTTGTTTGTACTGCTGCAGTGCAGCCTGTTGGTTCTGGCTGGCGTTAGATCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAAGTGT:1 - chr2L 3510053 5' - Stalker3T 97 1 62.00 AGTGCAGCTTATTTATTTACTGCTGTAACAATATAGTTCACCACTAGTTAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr3L 20882777 5' + 412 24 2 52.48 TCTCTCTCCCTCTGTGGCTCTGCCCCACACGGACATGGAAATTTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAA:1 + chr3R 11377893 5' + I-element 4950 1 60.40 AAAAATGCGCAAAATGGTTGCCCAAATGGAAATGGAAAATTCAACAAAATGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCT:1 + chr3L 3880932 5' - blood 410 1 55.45 ACATTTAGCGAAACACAAACTATTGTACGTATAGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCG:1 - chr3R 2769888 5' - Quasimodo 400 2 67.33 CTTGATTCGTACTGAAACATGAATTCATTGCTATAATATTATTTTTGCTGTGAAACCAACTTTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCA:1 + chrX 18771138 5' - jockey 4785 1 75.25 TGCGACGTCAGTGGCTTCGATGCGTAAGAGAGTGACTGCCAGAGCGGGACGGCATGTGGCCGACAGAGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTC:1 - chr2L 8346539 5' - Doc 429 1 74.26 TGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCT:1 + chr2R 12185321 5' - accord 7363 2 56.44 AAATTGGCCGAAATTCTTGTGGTTATGGTTGTTCTGTATGCATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAA:1 - chrX 6481085 5' - jockey 4957 1 61.22 GGCGAGTACACTGCACTTTCCTTGGCTTTGGAATAGGGTCAAAACCGCAACAAATTCCGCGTTCGCATTCGCTCTAGCGAGTAACGGGTATCTGATAGTCG:1 - chr2R 21673990 5' + INE-1 550 1 62.38 TAGGATCTCCATTCAGATACTTCCTTCTGTTGGGCAGTCGGGAAAACTGCATGACAAATTCTCCTGCACACACACACACACACACACATT:1 - chr2R 15889905 5' + accord 184 2 67.78 TAATTATAATTATTATTATTATGATTATTACAAAAGGAATAGCCAGTCATTTGCATGATTCCATGCAATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chrX 13383538 5' + Doc 18 1 60.42 ATATGCCAAAAGCAGTTAAACTAATGCCAAGTCGGCGATTTATGCTGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGACC:1 + chr2L 19933725 5' - R1A1-element 4970 1 53.47 TTGACAGCACAGAGCTCCGAAAATTATACTACGCTTTTTATCCCGATTGATTGACCTGGCCTGAATAAATTCAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGT:1 - chr2R 10670063 5' + jockey 4767 1 72.28 TTCCTAATACTAAGCTTTTGCCTGATCTTACTGGACAGGAATTTCGTTTCAATTGAAAAACAAGACAGAATGCTATAGTCAAGTTCCCCGACTATCAGATA:1 + chrX 20381373 5' - INE-1 559 1 45.54 AATATGAATCCTGACTGCTTTTTATGAGCACAAACGCTTTAAACTATACTATGCAACACTGTAAATGAAGTAGAACAAATACAATAAAAAAAATAAAAAAA:1 + chrX 8943391 5' + G2 3075 2 71.29 TGTCATCGTGGCATTGGCATTGGCATTTGCCTTGATTGACACCCAGCTGACCGCATTCACACTAGCTAAGTAAGGGGCATCTGATAGTCGGGGAACTCGAC:1 + chr3R 31140136 5' + INE-1 561 1 56.44 ACTCTTTGACAGCGCCCTCTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAAC:1 + chr3L 10281988 5' - 297 105 2 81.19 CACAATAAAAACCCCAAATTCCAAAGAGCAAGAGATGAAGAAGTTGAGAGCTCGACTTATTGTGCCCTAATCTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAAC:1 + chr3R 27495619 5' - 412 489 2 75.25 CCTCCCACCGCACTTCCACGGCGTAACCCACTATGGCGACAACATCAGCGACGAGTGGTTCGTCGTCTATCTGCTCACGCCCACACTTTTGAAAAACGTGT:1 - chr3L 2265397 5' + INE-1 257 1 76.24 TAAAATTAGAGATGTTGATATACTCATATCTATTAGGTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2L 4063664 5' - roo 404 1 70.71 AACCATTTGGGGTGTATTCTTCTGAATGGCACTCGGCGCTTATCATCACGATTGTATAGGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr2L 109775 5' - 1360 3376 1 66.34 GTACGATTTATGCTTTTGANATTATAATAGTTAATAGGAAAAATAAATGTCAAGGTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTGGTTGTACTG:1 - chr3L 13214344 5' + transib2 315 1 69.31 ACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:2 + chr3R 19450185 5' + roo 8718 2 50.50 ATTAGTGCAGCCATGAGGTTTGTCTGTAAGGATTAAAGTTTGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTT:1 - chr3R 20094542 5' + Max-element 8242 2 72.28 ACATATCCCGAAAAGTATGCAGCACTATTTTGGTTCGGAAGATACAATGTTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3R 5595024 5' - 1360 3365 1 55.00 AGCTCAAAAATATGGACTTAATAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTTCTAAACTATTAGAGATATTTGGATGAATT:1 + chrX 21254732 5' + hopper 54 1 93.07 AAAATAAGCTGAATAAAATTGATATATGAGTAACACGTTATAAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAA:1 - chr3R 19215554 5' + Doc 4490 1 58.42 CAAATTCCACTCGTCATACGGAGCCACTCAATTTACGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTCGGTG:1 - chr2R 10196126 5' - Quasimodo 6942 2 62.38 ACCATTTGGAATTGATAATAAATTTTTGTTTTTTTTCGCATTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATCT:1 - chr2R 3550649 5' - Doc2-element 4716 1 71.29 GCCACTGCCACCAAAATGCNGGCGCTGGCCTTTATCTGTTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr3R 11321077 5' + hobo 35 1 58.42 TATGCTATACTTTGATGTGCTTAGTTGTGATTTGGCCAAAATGCTTGACTCGCAGCTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3R 31264161 5' + jockey 29 1 56.44 GTTGCGCAAAATCGGCTATATTGCATCGCGTGTGCGCTGCCTGTCCAAGTACTACGGTGACTTATCTAGAATTCGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATA:1 - chrX 12831079 5' - Idefix 6949 2 62.38 ACTAACTTGAAACTAATGCATATTAACATTTTTAAATATATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATT:1 + chr2R 19088960 5' - Tabor 449 2 61.39 CTTTGACCCCATTGGGACCCACACCACGTTTGGTATGGGGAAACATTTGGTTTAGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr3L 14624000 5' + hobo 23 1 53.47 TTTATATCGGAATTTTATGNACAATGACAGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 - chr2R 17459215 5' + Transpac 39 2 69.70 AACAATAGAGGGGATACCCGACTTGGACGACTGGACCAAGTAAGGTTAAGTGAAATATGAATTTTTCTAGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTC:1 + chr3R 3845144 5' + rover 170 2 76.24 GTTGCGAAGGGAGTGGAATGGGAATGGGCCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr3R 29287550 5' - hobo 2911 1 63.41 AAAGAAATAAACTTAAATTGGTGATATACAAGACGACCATGTATGCTCAAAGTGTGTGTGTAACATGTGTATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3L 27390367 5' + 1360 5 2 41.58 AATGACAAAATCAAAACACAAAGTTAGTTTAGGAATATTATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chr3L 13773004 5' + pogo 34 1 64.36 TTACTTGAGATGAGAATGATAGGTATTTCCCGGATATTGTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGA:1 - chr3R 29912450 5' - TLD2_LTR 144 1 65.35 ATCCCCCCAAATGGGCTAGACAATTTTGGCAATGCCAATTTGCATCGCAAAATTTTTTAATTTCACACATCGAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTG:1 - chr3R 14334843 5' + X-element 4409 1 71.29 ACCAGCTGGCCACGAAAGGAATTGGGTTATGACCTCGAATGCGTGTCGCCACGCCAGTAGGTACCACACGGGGATTAACGCGCCACCAACGG:1 - chr3R 19377598 5' + baggins 28 1 57.61 ATAAAATGCTGAACGGAATAAAAGAACGACTTAGAATTTTGTCTGTCGTACGCGTTATTCGC:1 - chr2R 21433241 5' - HMS-Beagle2 352 1 58.06 GACAACGAAACGGGAAGCCCCACTCTGCTTCCGCATATAACAACTAATTGCTGCTGTCAAGTGCCTTGAATTTAGATACGGCACCTTGGAAACGTGCCGAG:1 - chr2R 4932001 5' + G7 213 1 59.41 ATATAATTTTTGGTACTTAAAATTTAATTTAATTCAAGATTTTATAAAAAATATTACTAAGATCTAATTACGTGTTGGAAAGAGCGGCAGAGGGTCAAGAT:1 - chr2L 6109029 5' - Cr1a 4236 1 57.43 CACACACCACATATGTTCAACCTATTTTTTTGGTGCTGCCTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr2R 18766269 5' + hobo 35 1 62.63 TTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 11916605 5' - roo 9026 1 69.31 TCATACACTCCCTCAACACTTCCCCTTCCACTGTGGAGGAGTCCTTCCTGGACTGAGCTATAAATGCCAACGCAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr3L 13773984 5' + roo 3 2 74.26 GTTAAGATTTAGTAGGAGAGACTTCCACGCCCACACTTTTGAAAAACGTGTTGATATTTTTTTTATTTTATTTAGATTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATC:1 - chr4 88178 5' + INE-1 297 1 80.20 ACCGTGGCCAAGTGCCAAATACACGTGCACCTTCCGTGCACGGACGTCCTACGTCCAAAGTCCCCGCGCACCACAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAG:1 - chr3R 6137420 5' + F-element 4480 1 69.31 AAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 - chr2R 672819 5' + F-element 56 1 71.29 ATTATCTTTTAAATTACATTGAACCTATTAGAACAAAGTTCACACCCACTGTTTGCAAGCAATTCTAATTTAGTTGCTAGCATTATATAAATAAATAAATA:1 + chr3R 17764198 5' + mariner2 826 1 75.25 AGCTGGGAAAATGCGAGCANTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 + chr2R 7838994 5' - pogo 2041 1 47.52 GCAAACAAAGCTTTAACCCTTAACCCTAACCAACATCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chrX 21217571 5' + pogo 36 1 63.37 GGACTGCGGCGACGGCAGTGACGAGTTGAGCTGCGAACTGGAAAAGGGCCATCACAATCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGATTCTCCAGCCCAG:1 + chrX 14197693 5' + Doc2-element 4623 1 69.15 TGTTCTACGTTTCCGCAAAACACAACTAGTTTTTAAATAAACATCAATTAAAATGAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGG:1 + chr2R 5772438 5' + HMS-Beagle 17 2 62.38 TCATACATAGTTGGCATGCCCGCGCCTCGAAATGCCTCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr3R 18399283 5' - P-element 2849 1 25.74 GATTGCAAGTATGCATGGCAAACTGAAATAGGATATACATACAGCGCAGATAGATACATGTAACATGGAGTAAGGCTAAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGG:1 + chr2R 10014779 5' + flea 21 2 61.39 AGTTCGAGAGGCTGTGATGCCCAGAGAGACACAATCCAGAATCGAGGGCTCAGCTAGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAG:1 - chr2R 15033031 5' + 412 7183 2 61.00 ATGCTTGACACCACTTTATTTAATTGATTAAAGTGGGTACATAGCTTTTATGTTATATCAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chr2L 20128831 5' - hobo 2923 1 55.45 GCAAACTCAATTCGATTAGCGATAAATGCGAGATGCGAAAAATGCTCGGCCAGCTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAA:1 - chr3L 10458595 5' + copia 187 2 65.66 AAGAAAAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:2 + chr3R 19449427 5' - hobo 2922 1 62.38 TACCTTAACTACTTGAAAATTATTTAGAAAATATTTCGATAAATGTCCGAGCATTGAGCGACACCGTAGTGTCCAAGTACAGGGACATCATGCTGGCGGAT:1 + chr3R 18321910 5' + GATE 8015 1 57.43 CTACTTTTTATTTCCAGAATCCCAGGCTGCTAATAGACTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTAAGCTGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGTTGCACA:1 - chr2L 22216564 5' + diver2 77 2 61.39 TTGGCATTTTAGCCCACACAGTACGCCCCTACGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chrX 10286156 5' - roo 9030 1 67.33 GCGTACGTGCCCTGGAATCCCTGCTAACTTTTTGGCATAACAAGTCGAATTTGTTGTAATTAAAAACCAAGAAACATACTGTAGTAGGCTGCTACTTCTAC:1 - chr3R 26597438 5' + mdg3 5253 1 80.20 AAGCTGCAAAAAATTATTTGAGGGGGCTGAAATAAATTGGAAAATAGATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1 - chrX 3113422 5' + jockey 4684 1 57.14 GCCGGGTTTGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATT:2 + chr3L 16282365 5' + gypsy5 6974 2 56.44 ATTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAGAA:2 + chrX 7480760 5' + Doc2-element 231 2 63.37 CCAAGCTGGACGCAAAATACATGTTCTATATACTTTGTCTGCGATATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr2L 5419789 5' + 297 19 2 60.40 ATGGTACATAACCCCTCCTCCTCCCTGTTTTTCTCCTGCCTTAAAACTTTTCCATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 8765619 5' + roo 21 2 56.00 AAAGAGTTTCGTGTTTTTTACAATATTTCATAATTTTAAATCTCTTAAAATAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3L 15037992 5' - roo 385 2 54.46 AAATAATTCCTGTGTTCCTNATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr3R 20905382 5' + pogo 20 1 59.41 GATCTTTTGAATCCAAACTTTCTGTCCGGGGTTAATAACATGCAGCATAGCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAAT:1 - chr2L 13568745 5' + hobo 483 1 56.57 ACGTGACTCAGCAACAAAAACGGCTAAGAAGTTTTCCTTTTTCCCTTTTTTTTTT:1 + chr3R 26736844 5' - Doc2-element 232 1 92.73 TGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAA:1 - chr3R 10736124 5' + McClintock 5973 2 57.43 GAAGAAAGTTAATTGTTGTTCTTGCCGCCGACGTTGTCATCGATATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 + chr2L 17245002 5' - copia 223 1 57.43 CGACAACTCCATTAGAATTCAATTTTCGAGGCAGTCGCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chrX 14651141 5' + P-element 39 1 40.59 AAAGGTCTCTTCTCTTCAAATCGTATGTCATTCTATATATGCAATTCTAGGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 - chr2L 14341908 5' - copia 228 1 56.44 GTTGGCTTATGTTTCAAATCTTTCTAATAAATCGTAAATCTAAATTATCAATATCCAATAAGATCATAATTTTTAAAACAATTTTTAATCCAATATTAATG:1 + chr3L 15125909 5' + Juan 3794 1 78.22 CAACTGTCTCGTCGTGCAACAAACCCGAGATCTCACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTAT:1 - chr3R 10391267 5' - invader4 315 2 66.34 CAATGTTAATTAAAATTAAAGTAAGCCATTTGCTCGCAACCGAATTATTTAGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTA:1 + chrX 20419113 5' - flea 234 2 56.44 ACGAGGACATCCTTGGGCCATTCGCCGGCTGATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2L 20045822 5' - roo 9057 2 64.36 CCCGATTCCAGCTGCATATCAATGAGCTTGCCAGGACTTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGCTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTT:1 - chr3R 20194415 5' + 1360 245 1 61.39 ACAGAGAGCTGGCGACGTGTATTTAGATAGTGGAAAACAAAGCAAGATAACAATAAAGCCATTCTTCTAGTATAGCAGCTTTCAGTGCTGCTCGGTTGTTT:1 + chr3L 19929931 5' - S2 1296 1 62.38 TAGCGGGAAATAGCCATTACTAGCGGGAAATATATTACCACCCTTAAGACCTGACTGACCGGGACTTGACATAAATCATACTTAATTATAATCTTCTAAAT:1 + chrX 15746292 5' + jockey2 3227 1 54.46 GCAATCCAGCAAGGTGACGCTACCGAAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTG:1 - chr3L 17874031 5' + 1360 46 1 71.29 ACAATATTCAATCAATTTTTATCAAACAACATATTGTAGGCGTTTTTCATTGAAAAAATATCTTTTCCATTTCATATTGTTGTGGGATCTTATGCCATTCT:1 + chr2R 3904580 5' - S2 1332 1 73.27 CCCCATAACATCGGTTTTAGCTTTTTCGCGCTCGGACATTTAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACAT:3 - chr3R 7783434 5' + rover 14 2 46.53 CGGAAAATTAAAAATTGCATTCCCTAAAACTTGTATTAAATGTATTTTGTAACTACCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 - chr3R 25581113 5' - pogo 2083 1 61.39 AAGAACACTCAAACTGTTTACTAGTTTTGCGGCTTACTCGATAAAATTGTGGTATAAGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chrX 5475475 5' + 412 7070 2 60.40 GGACATACCCTTATCTTGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr3L 6033595 5' - 412 7514 2 55.45 ATTTTCGATATAATACCATGATCGATCCGTGCGGATCACTATTTGGTTTTCTACAAAACATAATAATTATGCAATACAAAATCTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2R 13864068 5' - accord 185 3 60.00 TGGTCTATCGCAATAATTAACAGTAAAATGCGCGCGGACAGACAGACAGATGGACAGACGGACGCACAGGGTCAGAACAACTCGGGTATTGATCCTGATCA:1 - chr2R 17810328 5' - INE-1 91 1 72.28 GCGGAATGTAATGGGCAGGNCAGCGGCGCTAAGGGGCGTATTTTTTTTTTGCGCCCCGATTTTTTATTTTGTGTTTGTCACTCTTCCCTTTGTGCGTTGTT:1 + chr2L 738810 5' + Cr1a 219 1 39.60 CTTTCGAAGGATGATCTGCGTTTGCGGACTGATGGCCGCATCAAAGCTGTCCGGCATTTGTTCGGCGCCGGCGGCTCAGGAGACTTCGAGGAATAAACAAG:1 + chr3L 19551976 5' + Osvaldo 1511 1 70.30 ACTATACACTTGGTCTCTGGGAATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTGGATTCACCAGAAACTATA:1 - chr3L 19575492 5' + Cr1a 4115 1 78.22 ACCACTGTAGGTGAAGGCACACAGACACACACACTAATGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chr3R 17059158 5' - hopper 1379 1 61.39 CTAAAAGTATTCACTCTAGNTTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAA:1 - chr3L 19339436 5' + Tc1 19 1 63.37 AATTTAAAGACAAAACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGA:2 - chr2R 22051538 5' - Tabor 459 2 52.48 ACAAGAAACTGCTATAACTTATTACCTACTCTAAAGTGATTGTAATAAGTTCTCAGCATTTTTTTTCCAAGTGTATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTT:1 + chr3R 24854711 5' - F-element 123 1 58.42 TAGATTAATAAGAAGTTGCAGTGTTTTAAATAAAAATCAACATCGCATGAAGTTTCTCATGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTG:1 - chrX 11796056 5' - Quasimodo 340 2 66.34 CGAATAAGCCAGGGTCAGGCTGCCCAAAAAAAAAGGAGTTCACATTGCATAACCCTCAAAAAACAAGTACCAGCTTCAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATA:1 + chr3R 30460803 5' + invader3 5355 2 73.27 TTTAATAAGTAGAGATTTCNGCTATTAAAGGTATTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr3R 20420896 5' + blood 7017 2 72.28 TAGCCGCTTGGCTAGATCCATTGCTTCATGTCCGTCTGTCCGTCTGTCCATCTGTCCGTATGAACTTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGCTG:1 - chrX 22498450 5' + INE-1 159 1 68.32 GCTGTGGTTCGTCGTCGTCGTTGTCGCCTGTGCAGCGGCGGTGTGGTGCAGAGTGCGGATCGGGATCAGGTGGTGTCCACGATCGGTGACTATAGCTGAAG:1 + chr3L 2566742 5' - Chouto 237 1 81.19 AAACCTAAAAAATTAAATTTTTTTACTAAATTCAAAGAAAACAAGAGAGAGAGGGATCACAACGATAGCATTCGTAAGAAACGACTATCAGATACCCGTTA:1 + chr2L 21392457 5' - INE-1 552 1 76.24 TTTAGAGAAATAAATCGAATTTTATAAAACTATATAGTAAGTAGTTTATTTATTTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAG:1 - chr3R 27169524 5' - 412 7546 2 76.24 ATGCCGTTCAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 13763174 5' - roo 9052 2 53.47 GCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr3R 23543005 5' + 412 46 2 74.26 TCTGTCTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 6266287 5' - roo 9048 2 55.45 AAGATAATAAAACTGAAAGGCAAAACGCATAGAGAAATAATAAGTGCGAATAAGTGTCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 10087903 5' + roo 20 2 57.43 GTGAATTCTTGGCAATATAGTGCGTCATTGCTAATTTATCTCAATTTTCGGATGCATTTATACTCCTGGAGGAACCCCTCGAGCACGCTGAGCCCATACCA:1 + chr2R 9660841 5' + G7 128 1 58.42 GGGGAAGGAAACGAGAACGAGACGAGAATGAAGCGACGAAGCCGAAAACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTT:1 + chrX 13211585 5' + Quasimodo 79 2 53.47 AGGGGAGAATTTTGATTGCAATTGTGGCCAAGATGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTC:1 - chr3L 13771160 5' + pogo 81 1 67.33 AAATACCAGGCGACTGAACGTGGAATCGCCAGACTGAACGGGGGTGGTGTCAGTTGTTGGGCGTCTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr3L 699717 5' + P-element 10 2 70.30 GTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGT:1 + chr2R 15788596 5' + Transpac 4972 2 73.27 ACTTTAAGCTAGGTTATTGCGAATTATAGAATTATAAAGACATCTTTCACGAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGT:2 + chr2L 3699401 5' - mdg3 220 2 50.50 ATCTTATGATTGAAGTGATGTTATTTTGTTATGAAAAGCAATTAAAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGA:1 - chr2R 672863 5' + F-element 12 1 74.26 GCCACACCCTCCACTAAGCCGCATAGTCCTTCTCATACCCATTTTCCCCAGCTACAGCCTGCTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCG:1 - chr3L 6338763 5' - Doc 4400 1 66.34 TGATTAATGCATATATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCG:1 + chr3L 15452873 5' + accord 39 2 62.38 CTTACTTTAATATACATACATATATACCTTCTTATATTCTAGCTTCATTTGCCACTCAAAGTAGTGAAGCATGTATACGAAGTTATGTACACAGTTCAGTT:1 - chrX 16672193 5' - frogger 74 2 56.44 CCATGGAACATGATAATTTGTTAACTTCCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:2 + chrX 4277477 5' - roo 361 2 73.27 GTTCATTCTTATTAAAATCATGATATACACAGCGGGAAGAACTCGCCGTTTGTCGATTTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTAT:1 + chr2R 21239868 5' - Bica 408 1 59.41 TGGCTTCCATAGAGCTTTAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 - chrX 15546193 5' + blood 56 2 79.21 ATTTTTTTTGATGTTGAAAATATATATGTAATATGTATGTATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCT:1 - chr2R 4150658 5' - gypsy 425 2 67.33 TTACTTTTGTAGTCTAGTAAACTGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3L 14222508 5' + roo 53 2 76.24 TCAACTGCCCGCTACTAAAAATCAAACGTAATCCATGGAAGGGAGAACTGAGATATTTCTTTTACCTAAGCGCTAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATG:1 - chrX 8441164 5' + diver2 4605 2 75.25 CCACTATGACAGCAAGTATTTCAAGGATTTCGATTTTATGGCCGCCACTGATTCGGCACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGA:1 - chr3L 11321294 5' + copia 4801 1 59.41 TTTCTCTGCGTAAGCATTATTTTTTTTTTTGCTTTTTTTTT:1 - chr3L 18090975 5' + hopper 145 109 73.17 GCCATGATAATTGTTTATAACTGTCGCGCTAACACATATATTTCTTTCATTTTGACAATTTCTATATAGATAGAAGCAATTGTTGAGTAACGGGTATCTGA:1 - chr3R 7043078 5' + INE-1 544 1 80.20 CATTTAAACATTAAAATAAAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:2 + chr2L 7175558 5' + blood 7040 2 51.49 ACTGGCTTCACACACCGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1 + chr3L 19274796 5' - transib2 2796 1 54.46 TTTGCCACAGCCCGCTACTCATGGAGTAAATAGCAAAAAAGTGCAAAAATAAGGGATGCAACGCAGGGGGTAGGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr2L 20238795 5' + hobo 3 1 76.24 GAAAAATGGCAACAGCAGATTAAGCGCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACAACCCCACCCCCTAAAC:1 - chr2L 12808252 5' + Tirant 4 2 75.27 TTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTAT:1 + chr3L 20729694 5' + micropia 3 2 74.26 CAGAGTTGCCAGATCAAGCGCTTGCACCCAGGGCTGCAATGTTCGGGAGTACAGTAGCTATAGGTATGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3R 21365587 5' + P-element 10 2 71.29 AAGAATTCAACTGAATTGAACAGAACTTAACAGTATACAAGCAAGCACGGCGTCAAGCGTCGCGCCGCGTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATAT:1 - chrY 1076854 5' - INE-1 84 1 65.35 TTCTAGGAAAAACACCATTATTTTAAAAAGCATTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACT:1 - chr3L 13096948 5' + I-element 265 1 67.33 CCTAAGGTTTGAATATATCAAAATCCGAGTTGCCCGGCAGCCAGGCAGCCGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGA:1 + chr3R 29603534 5' - 412 247 2 57.43 GTCGCCATCGGCATAGAGCTTTCTCTGGTTTACTTCGTGTTCGACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGATTGCCGTGACCCAGAGATCAGAAGAGATTTTAG:1 - chr3L 23401456 5' + R1A1-element 5099 1 68.32 CATATTGCGGAATCCCCATTTCGGGCTGACTAATAAAATGCTGATACTTTTACGGGTGGAAGAATATTTTGTTTGCCGAAAAAATGGGGTTGGAGGGCCTC:1 - chr2R 19789563 5' + Transib5 2857 1 63.37 CAAGTCGGAAAAGCCTAACAAAATTATATTTCCTGATTTGTAAGCCTTGTTTTTAATTTGAGCCGATCATTTTGGAAGATTAGAAGCGTCGGTCATCGCCA:1 + chrX 17706216 5' + Burdock 153 2 73.27 TTCCTTAAGTTTTAATCTATTCGTACAAAGAGTACGAATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAA:1 + chrX 983319 5' - Juan 4179 1 62.38 GTTCACTTTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTA:1 + chr3L 20049634 5' + jockey 4802 1 63.37 ACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGG:1 - chr3L 19339437 5' + Tc1 17 1 66.00 TATCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCG:1 + chr2R 18723041 5' + HMS-Beagle 33 2 62.00 TTTGAAAACTATTTTACAAAATTGATAAACTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 + chr2R 25203753 5' - 1360 3374 1 64.36 ACGATAAGTTCTGCGGAACACTTATGCAGACATATTAACACCCACATATCCTTCGCCACCCATCCATCTCCCTTTAAAACAGCTTTCATTTGTATATAAAT:1 - chrX 6756891 5' + transib4 2455 1 74.26 AGAAGAAAATCGCAGGATTCCACTGGAAGGATGTGCGGACAGAAAAAAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 - chr3L 25345164 5' + Doc 33 1 50.50 GGATAGAGAACGTCCGCCAGATAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3R 28565261 5' + 412 31 2 56.44 GATGATTTAAACTTAAAAACAATTTTAAAATCATTTAAAATTAATTGGTTTTTTTTTGTGGAAAACATTACCTGCCTAAAATATAAGTGAAACATTTATT:1 + chr2L 4031086 5' + HB 1500 1 79.00 GTTGAGCCCGGACCGACCACTTGGCTATATGCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 - chr2L 5419866 5' - 297 354 2 73.27 AGGGGAACTTTGGTGGGCCGTTGGGATGCTATCAGGACCCGCGGACTTGCAACAGGCGACTCCTGGAGCGCACTTTGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAG:1 - chr2L 4749682 5' - G2 66 1 76.24 AAATGATCGCACCGACACAAATAACCACTTATACCAATACCATGACATGACAACACACACCAAGACAGACCGGACATACGAACTGAATTGCGTCGCAGATT:1 - chr3L 6951671 5' + R2-element 3128 1 66.34 AACTTCGGCAGCCGTTTTGCATTTTAAAGAGCGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACA:1 - chr3L 3641380 5' - mdg1 278 2 73.27 GAAGTGGTGGCAGGATGGCAGATCCTGGCGAGAATGCGGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 + chr2L 13566460 5' + hobo 16 1 61.39 ACACAATATATTAACACTAAAATCAAATGACTACATATCAGAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATTAGTATATTTGTCATTAGAGTAATCAGTTTGC:1 - chr2R 2745246 5' + 1360 409 1 69.31 AAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATC:1 + chr3R 4357548 5' - Tc3 1672 1 65.35 AGCCCCATTTAAACGAGCAAAGTGAGAATAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr2L 22241784 5' + pogo 44 1 69.31 TATTGTCTATACATATAATNAGTGGGTTATACCAAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTC:1 - chr4 613439 5' + 1360 50 1 98.02 ATTAAATGCCATGACTCCTCGTGCTGCATTAAATTGTAACAGTAAGCTGCCTACGTACATATGTACTATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTC:1 + chr2L 9817078 5' + 1360 3172 1 68.32 TAATTTAGATTTACGATTTATTAGAGGGTACAGTGTGCAAATAATTTTATTAACTTTCATAATTGTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAG:1 - chr2L 18471704 5' - Juan 3864 1 65.35 GTACGCGAATTGGGCTAAATACGGTAAGATATGCAAGTTGCAAATTGGCACGAAGAAAAATCTAAATGTGTGAGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGC:1 + chr2L 2786677 5' - INE-1 347 1 64.36 GAAATTGCATCAACTTAAATGGGAAACGTGTCTACCCCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr3L 18418846 5' - hobo 2905 1 59.38 CTTGCATAAAACTTTCACATATGTACATCTTAAGCTTTCTTTCTTTGTATTACTTTGTTCTAAACGGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCGTACGATAC:1 - chr2L 16267066 5' + Chouto 157 1 70.30 CAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr2L 8577282 5' - roo 9030 1 71.29 GGCGTTGTGGGGGCGTGAGTGCCAGGATGCAGATACACTCCCGCCATTGTTTGCAGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTA:1 - chr2R 13383591 5' + gypsy5 14 2 63.54 ATTTATATGCTATTACTAATTTTGGTAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCC:1 + chr3L 13569756 5' + invader3 5238 2 73.27 CGACTTACCTGTAACACTAGCCGCCATCATCACGCCCTTTCAGCCTTTGCTCTCAATTCGCTGAGTTTGCGTGAAGATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGT:1 - chr3R 25219641 5' + 1731 4588 1 64.36 TTGCATAAAACTCGAAGACGCTGAATAAAGCGGCTGAAATACTTGCACACAAAACGTATACGTAAAATGTAATGAAATGAAATAAATAAAATAAAATAAAG:1 + chr2R 12101685 5' + HeT-A 2 1 72.28 TGAAATGTTGATGAGGGACAGATTAGAGGTTACAAATTAGACATTCCACCGGGCGAATAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGA:1 + chr3L 17187244 5' + Tirant 8329 2 60.40 TTAATGTTGTTGTTCTGCTTTTGACTTCACTTCCGGTCCGACCCATTTATAAGCGGACACAGAAAGCTGGGGAAAAAGGATAAGTCAGCATTATTTGAGTC:1 + chr2R 16480268 5' + Transib5 2518 1 64.36 CACGCTGAGCAACTGCGTCTGCTAAAAAAAAAAAGTTAGCCCATCGACACACATATCATACCCTACACAAAAAAAATAGCAGTGCGAGGGAAACAAAGTAA:1 + chrX 18444028 5' + HB 27 1 66.34 AAAGAAGGATCCATTTTGAAAGGATTGCGGTCGAAGCAATATACTAGTCGGCTTATTCAAGTGTACTGGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 + chr2R 10353247 5' - blood 370 2 35.64 ATATATTGGCATATACTTATAGTGAGGCGTACGTCCCACGGACCAAATAAAAATGCCATAAAAATCACTCATACGCTGTAGTAAGTCCTCACATGATTAGT:1 + chr2R 20718793 5' + BS 4993 1 78.22 TCTTCCCAGTTAAATACCATTACAAATGAACCAAAAGAAGTTAATGAAAAGTCGCGACACATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCC:1 + chr2L 8394454 5' + INE-1 101 1 62.38 AATGCATCTCCCACGCACTCACTTTAGCTGAAATTAAGTTTGTTATATTATTAAACCTATCGAGATTCGTTGAAAAGTATGTAATAGGCAGAAGGAAGCGT:1 + chr2L 21243472 5' + INE-1 31 1 61.39 TCAAAAATTGCATTCCCTAAAACTTGTATTAAATGTATTTTGTAACTACCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3R 25581106 5' - pogo 2076 1 52.48 GCTGAAAATAAATGAAGGGNAAACGCAAATCGAAATTCCCTGCCAGACCATCAACAATGGAAGTCGGGCAAATAACAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTC:1 - chr3L 10482239 5' + F-element 113 1 78.22 TTAAAAGTTTAAAAGGGTATAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACA:1 + chrX 9543275 5' + HMS-Beagle 6724 1 80.20 TATATCCAATCACCATGGAACATATTGCGGAATAACGCACCATAAATTTCAAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chr2L 16153327 5' + Doc 6 1 78.00 CGAACGCTGCAAAATGATAGAATCCTCAGTTAGGAAAATAATAATGACAACGTCAGAAGACTTAAAAGATTTCTCGTGCTAGATATCCCCGACAGGTTTTA:1 - chr3R 20295893 5' + G4 3706 1 71.29 TTTGATATATGGATAAAGAATAACTAACGAGATGGAAATCCAAACAAACGAATGCTGCGCAGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTG:1 + chrX 18170487 5' - 297 53 2 55.45 TCAACGCAGATAGCGTCGCCGAAAAATGAGTAATAATATCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAAC:1 + chrX 3643542 5' + Juan 4084 1 62.38 AATTTGATGGCGCAAAACATTAATTGAAGTCAACCACGTCCTGCCTGGCTGCCTTCATATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTA:1 - chrX 9342404 5' - Burdock 6376 2 64.36 ATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCT:1 - chr3L 19349998 5' + 1360 3227 1 50.50 GTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCC:1 - chr3R 20094501 5' + Max-element 48 2 72.28 ACATGTGTATTTACATATTTTTCTTAAGAAGATTTCTGGCTACATTATCCCAAATTTACTTAATTACCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 - chr3L 19249769 5' - Transpac 5218 2 61.39 GTCGTGATTTGCATACGCATCGATATCAATGGTCCTGGAATTCGTGGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 - 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copia 257 1 79.21 TTATTTTATACGCAATTGAATTGTCAGGTTGTTCTTCATGTTTAATCTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCT:1 - chrX 13503478 5' - Bica 102 1 77.11 TAAAACAAAAAATAACGAAACGTGTTCCCCCCCTCGCGCCTTCTCTGCGCCCATCACCAACCGCCGTGCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATG:1 - chrX 11620817 5' + accord 148 2 67.33 CTATTTCAAGGTACATGCACAGTTCGTAATCTTCAAAATGTCAGCATAATTGAGCATGAAGTTCCTGATGCTGTTTGTCGAAAAGAACGAAACGCGGCGAG:1 - chr4 1022988 5' + Tc1 497 1 74.26 ATTTCAGAAATGTGCACAATTTTTTATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 10087800 5' - roo 9062 1 69.31 AAAACCAGGCCATTTGAAANAAGAAAAGGTTTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATAT:1 + chr3R 7513927 5' + diver 47 2 69.31 TTGTTTTTCGAAGAGCCAACTTGTTTAAGTTAGAAGCTTAATTGAATTAATAAATTTTATTTTAATGATCTATGAGTTGTTTACAAAAATTATATGATTAA:1 - chr2R 9050363 5' - jockey2 3283 1 64.36 AAATTGAACTTTTATTATGCCCTTCTTTTTGCTCTCTTCTATTTTATCTGCGCTCCTAGATACACAAATATAAAACAAAATAAAAATAATAATAACAATAA:1 + chr2L 12771488 5' + mdg1 7058 2 58.42 AAGGTGACCGCCACCAATGAGTCGGGCACTACGTACGTAGAGGGCACTGTTCAGAGCTCGCCCACCAAGAAGGCTCCACAGAAGACAGC:1 - 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mdg1 7454 2 73.27 ATTTCCACCAGTTGCCACCATCCCAGAGTATGGAGCACGGAGTACATAGTACGGAATACCCCTCCAATCCGGCTAGAAGGAGTTACCCTGAATCAACCGCT:1 - chr3L 5877908 5' + Helena 869 1 46.53 AGAACTTGCAGTAGTTTTGCAACTTTGCTACTTTGTTATTTAAAAGGGCAAAAAATTAAAAAAAAAATTTTAAATTATATTTTAGTGGGTGGAGGACAGCA:1 + chr3L 9297008 5' + HB 346 1 64.36 CGGGTGGGCGAGTCCGTCAGAAGCGTATCATTGGACTTGCTCATATAGACGATCGGTGACTATAGCTGAAGTGACCAACTGGAATAAGCCGGTAGCAGGG:1 + chr2R 6058855 5' - Chouto 208 1 52.00 GATTACGCCCACTTGTTTCGGATTAGGTTACGGTGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 25021655 5' - roo 402 1 72.45 CGAGTTGCTAGTTAAATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chrX 13146908 5' - roo 9046 1 53.47 TTCCAATTGCCACAGAAATTGAGGTTTTCAAATGACATTGAACCTTGTTTACTTCTTTGGCTAGTTTATTAATACCATTTTGTTTTACCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 7372605 5' - Doc2-element 232 1 83.00 TTTAAGAAATTATTTTCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGG:1 + chr2L 8959916 5' + Ivk 5105 1 45.83 CATATCGCTCCTTTTCATACTTCTTGATATGCTTTATCCAGTGTCCGCGCACTTTCTTCCAGCGATCCACTCACGAGGGCACCCAATCCAACAGAAATAAA:1 + chr2R 19291335 5' + Quasimodo 290 2 63.37 CGATATTTTATGAAAAAAAACGTGTAATATCTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACA:1 + chr4 194735 5' + Quasimodo 34 2 69.23 AACTCGGAAAATAGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:2 + chr3L 7168328 5' + Doc 46 1 65.35 GAAGCCAATTTTTACAGGCAATTAATTTCTGCCAAATTGTAATAAACCAATATTTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - 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copia 234 1 76.24 TTCCAATATGGATCTTATGAAAGAACTGAAAATGGTATAGTAAAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAA:1 + chr3R 25086094 5' + Bari1 34 1 61.39 AAATCAAGAAACCGACGAAGGCCTGGAAGTTAGAAAAGATGAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATC:1 + chr3R 12042039 5' + P-element 446 1 41.58 TTAAATTTCAAAATATATANACTGGCGCAACCGATGTGGGCATATATTGTATAATGCATACGGTTTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chrX 12472630 5' + pogo 7 1 76.24 CGATTTCCCACTTTGATTCCATTGCAGGCCTTGGTGATGACCGCAAAAAGCGAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGT:1 + chr2R 20558060 5' + F-element 151 1 53.47 AGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATCTAGCCACGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGG:1 - chr3R 4947764 5' + INE-1 137 1 84.16 AATGCGGTCGTTCGCGATGGGGAAAAGTGTGTGCCCCTTAATGCATTTCAAAAACAATCTGAAACCGCAGACAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAATACAAC:1 + chr3R 9196184 5' + gypsy7 5010 1 71.29 TACTCATGGAGCAAATAGCAAAAAAGTGCAAAAATAAGGGATGCAACGCAGGGGGTAGGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr2L 20238780 5' + hobo 18 1 59.41 AACAAAGCTTTAACCCTTAACCCTAACCAACATCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - 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Stalker2 353 2 72.28 GGGCGGAGGCAGGAAAGATACAAAATAGCCAAGGAGCCAATATACATACATATACATGTACATATACATCCACGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:2 + chr2R 15349466 5' + P-element 5 2 75.25 TGTTCAATTGAAAGTGTTCAGCTCTTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 29608858 5' + roo 21 2 57.43 GGCCATTTCAAAGCCCCACTTGAGTTTGGCCCGAAGTGCGCACGAAAAAAGCGAGTTTAAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAA:1 - chrX 4166455 5' - I-element 5338 1 61.39 CCCGTAGCAAAAGACGTTATTTACATGTGTAAATTTTCACTTCCAACTGACACAGTATTATTTATATTTGTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTC:1 + chrX 23035708 5' + HMS-Beagle2 6887 2 75.25 AAGTAGAATGAATCTAGCCCAAAGTTGCGAAAGTGAAAAAGAAATTCGAGGTGGCACTCTGGTAGGCCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAAT:1 - chr2R 16613816 5' + roo 8843 2 73.27 ATTTATTCATTCCCATTTTCCTCAATTGCTGGCTGGCTTTGGGGTCTGGCTTCTGTTGAAACTGTTCAGTCAATTAAGAAAATCAATTCGGTTTTGTTTTT:1 - chr2R 10339066 5' - McClintock 6286 2 66.34 AAAGCAAAAACACTGATAATTAATTGCTTCGAATGCGGCTTATCCATTACTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAG:1 - 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Quasimodo 217 2 78.57 AATATAACATGGATAATGATACATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAC:1 - chr2R 12457998 5' - HMS-Beagle 220 2 55.45 CTCCGCTTGGCTGCTTGGCAGGCTCGGGATGCACATAAGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGC:1 - chr3R 28127885 5' - F-element 4506 1 66.20 TCAAGGAGCGATTGATGAACACTATGCCATTTGCTTATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGA:1 - chr2R 10520422 5' - roo 48 2 62.50 TCATTTGGCCTTGGCTTCAAGTATTGCCACGCCTCCGCTTGCTTCTAGTTCTTCGTCCAGCTGTGTGTCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chrX 22593245 5' - 1360 3382 2 71.29 CAGAGTCTTGCTCTTTTTATAACAGATACTTTGATCAATCGATTGAGAGAGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTATCG:1 + chr3L 25628053 5' + 1360 3222 1 54.00 CCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAAAAAA:1 - chr3L 24916685 5' + Porto1 154 1 61.39 AATTGTTATAATATGGCCATGAAGATAGTAATTTGCCCTTTAAAAGTAATTTAGATCTGAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr2L 12866867 5' - mdg1 7445 2 66.34 AATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGGGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chrX 17104419 5' + 297 46 2 83.33 AAGTATATATATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCT:1 - 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chr2R 17392672 5' + opus 7160 4 70.30 CTAATGCACAAGGTGGATAAGCGACTGGAACGAATTGACAACGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATT:1 - chr3R 21884239 5' - mdg3 210 2 60.40 AATGAATCTCAGTGTATTATGTTAACACTGACGTACTTGACAGACCAAGCCTTTTCAACTTCATTCTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGA:1 - chr4 74351 5' + 3S18 10 2 69.31 TTGTATAAACAACACACAANGCAGAGATATGTGTGGCGCACAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTT:1 + chr2L 10199000 5' + I-element 37 1 57.43 TGAACAAACCAATTGGCCTATGAAGCTATCAAATAAAACGTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTACCCTCACATC:1 - chrX 13841530 5' + Doc3-element 4507 1 70.71 TAAATACACAAATCGATGAATGAGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAG:1 + chr2R 13986803 5' - McClintock 6129 2 77.00 GTGCGTGTTTGCATCCCATGGTGCGTATGTGTGGGGTAGATTTATTGCATGACATTTCAATTGTTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chrX 22593129 5' - 1360 3378 1 66.34 AGCCGCCTTTGTGGGATATACATATAAAAAACCAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCGGATACCCGTTACTCAGCTAATGTGAATGCGAAC:1 + chrX 10445565 5' - 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chrX 17334905 5' + R2-element 401 1 65.35 AAATCGCAGGATTCCACTGGAAGGATGTGCGGCCAGAAAAAAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:2 - chr3L 25345158 5' + Doc 39 1 56.44 AACTGCACAAACAAGCTGANCTTCATAGCTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2R 6107743 5' - roo 360 2 74.26 TTGACCAAACAGTCACTATGTTTAACAGGTTTTGGCATTAAAGCTAGGATCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3L 2022304 5' + roo 8682 2 48.24 GGTGAGCGTGTCCTGATCCTTTGCCTGTTTGTTATTGTTTTCATTGAACGGGCTGCCGGCGGCCAAATGGGATTTAACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAG:1 + chr3R 30761751 5' + Circe 7199 1 75.25 CTTCAACTTTGGCTCCTATGTAGTATCTATATATCTGAATCAGTATCTGCGATTCGGTATCCACACACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGT:1 - chr3L 13293440 5' - mdg3 5218 1 68.32 ATTTAATTTAATATGCTAATTGGATGTGATCTGAGTGTGTGGGCGTGTGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTG:1 - chr3R 24494238 5' - Quasimodo 6988 2 55.45 TTTGTGGCACTTTGGTACGAAAATTTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2L 6362860 5' + 412 7101 2 73.27 TTTTTGAGGGTCTTATACCCTTTTCGGAAGTGTTTGGGTTGAGGTGGTGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGTCGTCACACG:1 - 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chr2L 23295858 5' + micropia 4992 2 62.38 GAATCAGAATAAAGATGGTGCTCTAACTATTCCGAAAGAATTAAAAGAATTAAAGAATTAAAAGAATTATAAGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTTAC:1 - chr3R 3854455 5' - INE-1 32 1 44.55 ATTTAAGTTATTAAACTTACTAAATACAAAATAAATATTTTTTTAAAAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 26317916 5' + roo 29 2 57.43 TACTAACTAAATAAAGAAATATGCTCAGACCTCACCCTCAGCATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATC:1 - chrX 4454493 5' + mdg3 5374 2 58.42 GTGAATAATGCCTTCGAAGGACAATTGCCCATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:1 + chr3L 11860551 5' - Transpac 5187 2 70.30 ATCATATACTCAAGAATCTAGAATCGAATAGGTGCTTGAGAATTGCCTGTAATGCGCATCCCTACCACGAGAATGTCGCCATACATAGGGAACTTGGAATC:1 + chr2R 12560586 5' + G6 1740 1 75.25 CCAGCAATGGCCAAAAAAAGAAAAAAATTACCAAAAAAAAAAGAAAGGAAAAGAAAAACAAAAAA:1 - chr3L 5853021 5' + Doc2-element 219 2 84.62 ATTTTGCAGCATTTAAATACAATCAGAATACACAGAAGATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:2 + chr2L 11478682 5' - opus 7464 2 66.34 TTTTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTAATTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTC:1 + chr3L 24996098 5' - 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chr3R 27131973 5' + copia 4899 2 55.45 TTACATTGGTGCACAGCAAAAAGAATAAGATCTTCGAAAGTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chr3L 4565476 5' - copia 252 1 59.41 AATTTGTTTCCCATATTAATTTATCATTTATAAACGATTATTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 7099587 5' + roo 8700 2 69.31 ACACCTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGATGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 30553559 5' - 412 452 2 61.39 TTAGCAATCAGCACTTGGAACCCATTTATAAGTGCCCGCCCACTTCCTGCCTCCCGTAAAGACAATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCT:1 - chr2R 20312092 5' - 1360 493 1 56.44 CATTAATGTGTATGTGTGATTGTTTACTTATTCCTAATTTTTCATTTTCAATTCCTCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGAGACCAAGTG:1 - chr3L 26007750 5' - G5 4753 1 53.47 CTCTAAACAAAAAATGAGAACGATCTACTACAACTTAAGTGCTCTTCAAACTAAACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr2L 16755114 5' + Tirant 40 2 56.44 TGAAGAAGAAGTGCACAAAGGCCACAAGCTGTAAGATATATGTAATGTAGAAGCAAAAGGAAAAATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:2 + chrX 13126187 5' - 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1360 3353 1 69.79 GGGCGGCACGAACCATAAAGCCATTGGCGACCGACTGCATTTCAGCGATATAAATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr3R 5135542 5' + 297 6598 2 63.37 AGAACATCGCTTTCAAAGCAGCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chrX 16671103 5' - P-element 2832 1 24.75 ATGCCTCTTGTGTTGACTGTTGCTCATTGTGCCGCAAATGGGGGTGGCAGGTGGAGAACACCTCTTGGGGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 23338361 5' - roo 401 1 67.33 GAAGAAGTACTTCATCTGCTAACAGAACCAGATGAAGTGCGCCGTTCCCGCCGAGGACAGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTT:1 + chr2R 9817912 5' - blood 98 2 65.35 TTTGTAATTGAATTGAATTGATTTAGTGGATTTCGTGAGCCTCCATGGACTACACTGAAGGGAGGGAGTACGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAG:1 - chr3L 22319879 5' + Rt1b 4960 1 64.00 AAGATTGATATCGAAATAAATAGGACTATACAGTACCACTTCAACCTCNGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAANCCTCGCTTCG:1 - chr3L 15033351 5' + I-element 39 1 66.67 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGA:1 + chr2R 11367658 5' + Tc3 475 1 66.34 TGAAGAAAATCGTGGCGTTGGCGGCCTACAATGACTACACCATGCGACACGATCTGGCCATGATGAAACTGAAATCCCCGGTGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr3L 7542039 5' + roo 8663 1 81.19 ATTCAAGTAAATGGGTAAAAGAAGTGGAGCCACAGCTAAAGTAGCTGATTTTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTG:1 + chrX 15434984 5' - Stalker4 7058 4 60.40 ATCGTAACATCATGAGGTTNAGGAAATATGGTTTCCTTTGAGCCTGGCAAGCAAATGTCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 27056445 5' + jockey 33 1 53.00 TTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 11916602 5' - roo 359 2 72.28 CATTTAAATTGATTACAATTTCAGTGCGTTTAGAATCACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCT:1 + chr2R 16477203 5' + F-element 4440 1 63.37 CATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr2L 13566521 5' - hobo 2907 1 67.50 GACGTGACTTTAATGAGCTCAGGAAACGCCCTAAATTCAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:2 + chr3L 7300498 5' + Doc 43 1 65.35 AATTAAAACCAGCACTAAAAGACACATCCCTAAAAAAATGAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 3528409 5' + gypsy7 5006 2 64.71 CGATCAACGCCTGATAAAAAAATGTACAAACGATGAAAACAAATTTAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 16627847 5' + gypsy2 424 1 66.67 AACTAGTTACTACTGCTGCAAGGGCAGAGCACTTGCCATGCTCACTGCCTCTCATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATGTACATA:1 - chrX 4984678 5' - G3 4508 1 62.00 CGTATGAGGAAATAGTGTTCCAGGAGCCCACCCAGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCGAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCG:1 - chr2L 6949671 5' - hopper 398 1 64.36 GCCACCCCTATATCTATGTAAATCCCACCCAGCGACTTTAAGATTTAAGGGAAAATCGGTACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAGATATTCGTGTTC:1 - chrX 11014594 5' - roo 12 2 63.37 GTAGCAGACTTGCCTGCTAAAGCTGCAGTTCATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 + chr2R 21962636 5' - 297 355 2 72.28 TATTTTTATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAA:1 + chrY 104335 5' + INE-1 154 1 79.21 GTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGC:2 + chr3L 16282376 5' + gypsy5 46 2 67.33 CATTTAGCCACAACAAAAAGTAAAGGTAGAATAAAACGACGAGGGAAATGAAAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTGATTT:1 - chr3R 9344514 5' - 412 365 2 57.43 TTCAAAAAAGGTTATAGAACGATTTTTTAGAAAGATTTAATTAATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCT:1 - chr3L 15125940 5' - Juan 4175 1 67.33 AATTGAACTCGCTCTTGGCAATCTTCGTGTTTACTAATCATAGTTTTTTTTATCAAGCTTTCCCTCGTCGCAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCC:1 + chr2R 10540849 5' + Cr1a 4399 1 75.25 GATACATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTAT:1 - chr2R 12457981 5' - HMS-Beagle 6999 2 72.28 CACAAATGATAACACTCTAAAGAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 17701582 5' - roo 9019 2 77.23 GATATGTGAGTAACGCATGCAGACACACGTCAATGTAGACAGTGCACTATGGGGCATGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAA:1 + chr2R 7546255 5' - hopper 81 1 49.50 GTGTAAATGGATTTTCGATATTAAGCCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2L 19854121 5' + roo 8715 2 79.21 GTTAACGGCAACAACATCTNTGAAGATGCCAGCATAATTATAATAATCATTTCATAATCATATTTTATTCTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATAC:1 - chrX 8727951 5' + X-element 11 1 67.33 CCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACAT:1 - chr3R 15790067 5' + flea 4743 1 66.34 ACATATTTGCAAGTGTGTGTTTGCTGTGCTGGTGTTTCTGTGTTAATGAGCAGCCCTGACTATTATAACTTGAAAGTTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATA:1 + chr3R 26642412 5' - 1360 3002 1 55.45 CGTCTAAAATCAAACTTAAACTGCCTGCGCGAATTCACGGCTGTGTTTTGTGTGATTAGCGCAAAAAAAATTGAAAGGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAG:1 + chr2L 3880046 5' + mdg3 5236 1 80.20 ATAACGTGAAAATGAAGCTTTGACAAGGGCACCTTAACTATACACGTCGCCGAACGATTTGATAAGACTAAGAATGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3L 14222427 5' - roo 409 1 79.21 ATAGCATCGCAATAAAATCTATATCGTGCCACCTCCAATTCACACAGGTCGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr2R 9693380 5' + P-element 26 1 51.49 CTTGATTACATTAATTATTCCTTTATGTTCACACATGAACCCGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3R 17660501 5' + roo 8718 2 82.00 TGATTCGAAGCTGATTAATNTGTTCCAACTTCTCATTTCCTTAGATGCATTCAAACTTTGAATATATTCTGATAACTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTC:1 + chr2R 21737755 5' - mdg1 7324 2 76.24 AGATGGATACCTGTTGGCTGCCACGCCCTACGCCCACTCCCAATTTCTCTAAGGTAACACCAAACAAAACTGCGAACAACGCACAAAAAGGAGGGTAAACA:1 + chr3R 6536775 5' - Cr1a 214 1 66.34 GAAGAGCAGGTGATGGCGATGCAAACTGGCCCCGCCCCTCACCACATTTCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr2L 20238694 5' - hobo 2913 1 54.46 TGTACATATACATCCACGTCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 + chr2R 15349522 5' - P-element 2832 1 21.05 CCAACAATAATGGCCAAAGCCCAAACAGCCAAACAATCTGATGACGACCCGACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGAGGACCAATATGAACCAAA:1 + chr3L 13333503 5' + R2-element 317 1 65.59 AAAAAAAATTATAAAAGTAAATCATTTTGATTTTAGAGATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGC:1 - chr3R 10914171 5' + F-element 111 1 61.39 AAAGCTTGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr3L 3757411 5' - roo 9040 1 62.38 CTTAGATACATTCAAAAAATGAACATTCCGACACACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATT:1 + chr3L 13778772 5' - pogo 79 1 67.33 CTAGTGCATGCTGCTCGCATTACATTTCCGCGGCTAAACTGCACAAACAAGCTGAGCTTCATAGCTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2R 6107707 5' - roo 397 1 67.33 TTATCTGGCTTTTCCTTATCTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTTATTTGGCTGTCGCATGCCAAGC:1 + chr3L 10660614 5' - BS3 1329 1 80.21 GAAAAGCGCTCGATGCCAAAGCAATTGGGTTTATGGTCGTTTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - 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chr3R 22659480 5' - INE-1 32 1 53.47 CTCCAATAGGCTTGAGTGCCATTTCAGTGTCCGAAATGCCTTAAAGTTTCGTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGG:1 + chrX 20357297 5' - I-element 68 1 55.45 AGCCACGAACTCTTAAAGACAAGGGACTGTAAATGCGGATTTATCATGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAAT:1 + chr3L 25059073 5' + mdg1 7068 2 56.44 AACCCGACTCTTTGAGTGGACATGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGGTGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:2 + chr2R 6850458 5' - roo 356 2 78.22 GCGTGATTTTATAATAAAAGGAAAACACTCGACCGAAGTAAGAGAATGCTTTTGAACATCAGAAACTACTGTTTGTTTGGTTTTAAAATTTTTTAATTTAA:2 + chr3R 28704430 5' - 1360 3030 1 60.40 GAGCAGGTGATGTCCGAGCGCAAAGCTAAATGAATAACATTGTTAGTCATGCATCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTG:1 + chr3R 10783006 5' - flea 4656 1 67.33 CACACAGACACACACACTAATGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:1 + chr3R 17059175 5' - hopper 1362 1 78.22 GACTTTTAGCTCCAAGTTAAGCACACTATAAATGCCACAGTCGCAATTGGATCCAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTA:2 + chrX 734899 5' - Tabor 7302 2 62.38 TGATCGACCGACGTGCTTGAGGTACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTT:1 + chr3R 7626401 5' - hobo 2888 1 76.24 CGATCTTCAAATATTAAGGAAATCCCTATATACATAAATCTATCGCTCCATCAAAATGTTTTATTGTAGTTAATTAGCATTCCTATACTTCTGATGTAGTT:1 + chr3R 13912988 5' - mdg1 406 2 62.38 ATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr2L 20560350 5' + F-element 59 1 71.29 ATGACTACACCATGCGACACGATCTGGCCATGATGAAACTGAAATCCCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3L 7542009 5' + roo 13 2 61.18 AGAAATCAAAATCCGAATAAGCTGCTTAATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 - chr2L 18655231 5' + Doc 15 1 65.35 CGACGTGACTTTAATGAGCTCAGGAAACGCCCTAAATTCAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr3L 7300497 5' + Doc 42 1 64.36 GACTCGAGCTGCTGGTCGGNTGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTC:1 + chr2R 6438348 5' - Stalker4 381 4 55.67 CGATTACATTTTGCTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3R 11916600 5' - roo 357 2 74.26 CCCAGCTGGGGAGTTTAGAGGACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr2L 17730439 5' - pogo 2070 1 57.00 GTTGCTGAATAAATGCGATAGTAATTGGCTTTGGCAATTTATTAATTAACTATTAATGGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chrX 21060388 5' + 412 19 2 60.40 TTTTTTCAAAATAATATACACCTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr3R 30553542 5' - 412 7522 2 54.46 TATTTATTGCAGTACTGGTAAGGTATATATATATATATATATATTTTATAAAAAA:1 + chr2R 7925078 5' + TART-B 10567 2 70.91 AATTAGTTATATCTAGAACNTGAACTTAATATAAAGGGTTTTCGCATTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr3R 11052184 5' - blood 7372 2 60.40 TGGCTAAAGAATAAAGGCAGTGCCGAATTGCACATACGCACTGTTGGAATATACTCTTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:1 - chrX 4792131 5' + copia 27 2 56.18 AAATCTCGGCCAAAGATGCCGTTCAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:2 + chr2R 13763159 5' - roo 404 1 68.32 CTCTGGGATGTCAAAGGCGCGCTGCCGCGGGCCACGTAATTTAATTACCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:2 - 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chr3R 18605905 5' - INE-1 550 1 64.36 ATGTAAGAAGATAACGGTCTACGCAGTCCAGCACCAGAACAAGAACAAGATCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr3L 25883749 5' + Doc 31 1 51.49 TGCATTCACGTTCAGATATGTTTTATGCACTGAAAAGGAAGTAGTATTCACTTCGAAAATTCAATCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGT:1 + chr2L 20328684 5' + opus 9 2 70.30 GAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3R 10087837 5' - roo 9031 1 66.32 TTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGCG:2 - chr3R 15021689 5' + invader4 2748 1 45.54 CGATGGGTTCCTATTTTACACTATTTGCTCTGGTGAAAAAAGATGCACATGCACTTAAAATGCTGTTTGTTAGTAAACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAA:1 + chrX 3763812 5' + INE-1 14 1 68.32 ATATTTCATAATTTTAAATNTCTTAAAATAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 15037970 5' - roo 9026 1 74.26 ATGTGATGAAGCAATTGTTCTAAAAGGTGTTTCATTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGGACTCGAA:1 - chr2L 10134339 5' + Max-element 43 2 65.35 AAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - 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chr3R 15196781 5' + G4 3758 1 71.29 CAGCCCCACCCCCGATTTTCCCAGCCCCTCGCCATGACTGGCCGTAATTATCATTATCCTTTCGGCTCTCTCGTTTTGCGCAACCAGAACCGTAACTCAAA:1 + chr3L 5977809 5' - R1A1-element 5055 1 80.20 GCACTGTTTGCTGTCTAACGAGCATGAAAATGAAATTGAAAGTCGCCTAAAACTTCCTCACTTTCATGCATCTATTTGTCATTAATAACCTTCAATAACCT:1 + chr2L 1600216 5' - gypsy7 462 1 61.39 AAACCGTTTTTGCCACAATGTCTTAAGGCTTGCAATTAGAAAGTTGTATCTATAATATCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 - chr3R 27131984 5' + copia 19 2 58.42 TGGTGAAGCCAATTTTTACAGGCAATTAATTTCTGCCAAATTGTAATAAACCAATATTTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCA:1 - chr2L 7175624 5' - blood 339 2 63.37 GCAGTGGACGAACAGATACAATGCATCTTAAAACTATATTTATTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAA:1 + chr2R 16207352 5' - Juan 4178 1 63.37 GTTGTTGATGTTGGATGTTTAATAAAATTTGAGTAATGGATGCGGTCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr2L 126550 5' + Doc 34 1 58.42 TAGGGAGAATATTTTTGCACGCGACAAACGGCCAACGTGCGGGATTAAGGATCTGGCGCACCGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAA:1 - chr3L 13295302 5' - hopper 1400 1 62.38 CATGCGCACGCCAATGGAGCGCCAAATTTGCTGTCAAGTTGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCA:1 - chr2L 10053714 5' + F-element 4479 1 60.00 GACGCATCCAATGTACCTAAAAAAAACTATATACAAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATA:1 + chr3R 4711643 5' + I-element 4913 1 65.35 ACCACTCCGCACTAACCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 - chrX 1135345 5' + P-element 59 1 20.79 CTGCGTTCGCAAACACCACTACATGTGCAAACGCATAACATGTGATAAATTCAATTTCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:2 + chr2R 17420813 5' - pogo 2085 1 59.41 GTGTTAAGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTA:1 + chr3L 3540105 5' - mdg3 244 2 77.23 ATATATTCTTCCAGCTGGAGGACCAATTAAAGGCCTCTCTGACGGAATTGCAATCCGCCGACGTGGGCAAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGAACG:1 - chr2L 20921209 5' + Ivk 5077 1 73.27 CTGTGAATGCCTGCCATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 9870954 5' - 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chr3L 13987245 5' + pogo 47 1 81.19 ATTTGCAGGCTAAGAAGGCNAAACAGGCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAAACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATA:1 - chrX 18113562 5' - INE-1 85 1 73.00 GTCTGCAAGCATCTTGGTCCCATGTCCATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCCTTTTTTTT:1 - chrX 22733670 5' + copia 366 1 76.84 GGCGATGTCGCAGAGGGCGCGTTTTAATTACGACAGATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCC:1 - chrX 15263486 5' + invader3 5240 2 67.33 AAATGCCAGACAGCCGGCAGCGGAATATGGAACTGGTATGAGGATGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAG:1 + chr3L 5861235 5' - G2 2919 1 55.45 TGCGCGCTTTAAGTGTGTTTCTGTGTGTGTAGGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 + chr3R 17053071 5' - hopper 1375 1 63.37 ATTATATATATTTTCTGTGGCTAACTAACTTGAAACTAATGCTTATTAACATTTTTAAATATATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATA:1 + chr2R 19088937 5' - Tabor 472 2 62.38 AACTGATACTATGCGAAAGTACTAGAAAGCCAGCCAACTGTAAAGAATCGCAAAATACCCTGAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chrX 17883602 5' - pogo 2092 1 70.30 TTAAGACGAGGGAGCCATAAATTCACGAATATACGCGACAAAGCCAGAAACTCTATTCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chr3R 13353281 5' + 1360 21 1 56.44 CGTCTCTGTGCCACTAACCTTTGTAGGAGCTTACTTTGGATTCCGCAAGCGCGTGAGTATATATTTAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAATCCTAAAGTCT:1 - chr2L 20731594 5' + Idefix 7205 2 69.31 TCCTGGAAGGCGTTACCTTTAGCATCGACAAGGAGGTGGGTCGCGGCGTCTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTT:1 + chr2L 5281838 5' - INE-1 159 1 56.44 TGGTGGCTTTTCAATTGATTCGATTCGATTTTAATTTGCAGAACTCGGCATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3R 10110422 5' + Doc 33 1 54.46 TGGTCATACTATATTCCCAATTGCATTTACGACCAGACATTTGCATCTGTGGTTAGGTACATCGACCCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr3R 22330799 5' + I-element 30 1 68.32 AAATTAAAGTATTTAAAATCTACGCATTTATTGAATTTGATTGGATGAATGATTGAATGATGAGAATGAATGGACGTGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr3R 20684825 5' - roo 410 1 80.20 AACAGCTGATTGAGTGATTTTAGCTGCAGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr3R 27116738 5' + P-element 49 1 28.71 TTCCAGGGATTAAAAAGGGCTTTGTTTTGGTTAGAAGGTAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAA:1 + chr2R 8248584 5' - Doc 294 1 61.39 GGGGAAATTCGCCACATACCAGCGAGCAGTGAATGAAATATGCTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATT:2 - chrX 15255412 5' - Tabor 7288 2 60.40 AAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGAC:1 - chr3L 19274870 5' - transib2 2788 1 62.38 TGTGTATCTGTGAGCGTAGTTGTTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:2 - chr3L 5241195 5' + Ivk 12 1 67.33 AATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAAT:1 - chr2L 21570255 5' + Dm88 4387 2 56.44 AAAAATCATATTTAAACACTTTCTTTTGCATTTTTTAAAGATTTAAAAAGTTATAAATGTATAAAAGCTTGCATATTTGTTATTGTTTTTTTTTTCTTTTA:1 + chr3R 21656315 5' - transib2 2640 1 62.38 GACCAAGCCAACGATAACGACAGTAACAGTGGGCTAAAACTGGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTACATTTTTATGTC:1 + chrX 21229278 5' + transib2 31 1 54.46 AGAAATATAAAAATAGAATTTGTCTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAA:2 - chr3R 20683402 5' + Burdock 25 2 54.46 AAAGCGTTAATTCACATTCTATAAATGTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATATATATAGGTATATATATATATAGGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGC:1 + chr3L 23271734 5' + invader2 58 2 50.50 CGTGTTTCGAAGGCTTTTCAATATGCAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGA:1 - chr2L 14220196 5' + springer 7190 2 79.21 TAAGAACAAATGCTGACAGAAACAACTTCGTCTAAGGATACACAGACTGTTGGTCAGAATAAAACGTGTTCTACTACCACGGATTAGTCTGCCCTTTCTTT:1 - chr2L 4399857 5' + aurora-element 35 1 57.43 TTAAGCAAATATAAAACTTTAGAAATGCGAGGAAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAAC:1 + chr2L 19642310 5' - Quasimodo 7330 2 67.33 GATTTACATACATGTATCTAAAGATCCCTGTTTAAACCGTGCACTATGGGTAAAAAGCCGGAAATTTTGGTATTAATGTAATTTTTTTTGTGATTGATATT:1 + chr2R 4547793 5' + transib4 39 1 73.27 GGGAAATGGTTACGAACGAGATTAGGGCAGTGTTTCGCAAGTTTCAGAGTTCTATTTTATTAGATTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTT:1 - chr3L 23324402 5' - I-element 362 1 69.31 TGCCAGATATAAAAGCATGGACGCTCAATCTCCCGCCATCACCCAGGACGCCAGTTTGGGCTTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACA:1 - chr3L 4236178 5' - Rt1b 4787 1 69.31 TTTTTTGTGTTATTGCCGAGCACAAATTGAAAACGATTTTTACTATTTAAGTTATTTAAAAAGATTATATGATTATGAGTATTAAAGAAATGAATTGTTTA:1 + chr3L 6520215 5' - jockey2 3258 1 68.32 TTAAAAATAAAATAAAAGTGATTTAAATCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3R 12944727 5' + roo 49 2 78.22 AGCAACAAAAAGCAATGAAAAATGCGAGCAGACAGGACAGAAAAATCACGAAACACGCACACGATCTGCGCGAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTT:1 + chr3R 18884692 5' - jockey 68 1 61.39 TGGCCAGTGTTGCTTTTGAAAGCCTTCGTTCACAGTGGACACCCTGTATGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTTGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGG:1 + chr2R 17803971 5' - F-element 376 1 53.47 TATATTTTAGCTTTCTCTTTTTGATATACAAAAAATCAACAATTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr3R 26317989 5' - roo 9041 1 57.43 ATTATCATCCGTCAATGCAAGGAATAGGTGAGGAATAAGGACCACTTCTAAAGAAAGATCCTTTTACCAATCAGTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCT:1 - chr3R 5348757 5' + copia 4871 2 72.28 TCCACGCTTGCGGCTGTCTATGCGGAATTCCACACGGCAATGATCGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTTGTGCTTTGTATGACCAAAGCAAAGACACTTGA:1 + chr3R 3626774 5' + 1360 498 1 67.33 CCCGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGTTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAAAGCTAGA:1 + chr2R 4906449 5' + INE-1 153 1 56.44 GGAAGCGCCCTTCAAACGGGCGGCACGAACCATAAAGCCATTGGCGACCGACTGCATTTCAGCGATATAAATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 - 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roo 9036 1 63.37 AACTGGATCCCCTCCGAAAATCCCCAGTACGTGCCATTCTGTTTGGTAAAGATCCTAACTGTGCGTATGTGTGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chrX 15287833 5' - hobo 2936 1 71.72 GCTGGGGAGTTTAGAGGACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr2L 17730443 5' - pogo 2065 1 61.39 GGGAGAGCGCCCTACAGTATGCAGCCAAATAAGGCAAGTCTGCAGAGAGTTTCAACTCTCCTCATTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAAC:1 - chr2R 12252916 5' - jockey 4983 1 48.51 TCCTGATTGTCAAAGCTTGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3L 3757422 5' - roo 9051 2 59.41 ATCCATCTAATGGTGCCTAAAGGTATGAAGTGAAAATATTCGTCTCTGGAAATGAATTTAAATGTGCAACTTTTTTTTTTTCCTTTTTTATTATTTATTT:1 + chr2R 17331551 5' - BS 5094 2 73.00 ATCACGTTCCGTCTTCTTTTCTGGTTCCCGATGTCGGACTCCAATTGCCGGTATCCTTTTCATCAAATTCCTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGA:1 + chr2L 19476236 5' + 297 6856 2 74.26 GAATAAGATAACAAAAGGTAAGACACGAAAGCAACGATAACAGCAGAAAATAGCTTTAAACGGAAAAATCATGT:1 + chrX 882256 5' - McClintock 120 2 66.22 TGTGTATTTTGGATTATTTGTATCACATGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGAC:1 + chrX 22689526 5' - 1731 296 1 60.40 AAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 + chr2L 7175576 5' + blood 47 2 69.31 AGCCTTCCATTAAAAAATATCATAATCAATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGG:1 - chr2L 17245054 5' + copia 4917 2 73.27 CAGTCACTCCAAAATACAAAAGGTATTATCTCAACTTTATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGG:1 - chr3L 15452956 5' - accord 7377 2 70.83 ACAATTTCAGTTAAATAATNAGTTCTAATTACCATTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 - chr3L 21519037 5' - 1360 3349 1 67.33 TCCTTGTGTGAGCGGCTGCCAAAGTGCAAACAAGCCTGGAGATCCCCAGATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr2R 8311291 5' + opus 24 4 55.45 GTTGGTGCCATTGTTGCTTNATGTATCTTATCAAAGACCCTAGAATATTCTAGTGTCTTTGATGCTACTACATGGTACAGTGGGCCTTATGAGTGTTCATC:1 - chr3R 4600543 5' - invader3 9 2 69.31 TTTGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAG:1 - chr3R 20094504 5' + Max-element 8279 2 69.00 TCATCTTTCAGCCTTCCATTAAAAAATATCATAATCAATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGA:1 - chr2L 17245063 5' + copia 4908 2 64.36 TGACCACGCAGAAGCAGTGCATCCATTGCTGGATTCGACAAAAGGGGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGC:1 + chrX 5329110 5' + R1A1-element 394 1 73.27 GGCGCGCGTGAAACTCGTCGTACGTTTTTTTTTAATGCTCTTCTTCGTTTCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAA:1 - chr3L 8450326 5' + Circe 132 2 63.37 CCCATTATTTAACAAGAATTATAGTAATATACAAGAAATGAAAAACATTTGTTATTATCTAGTCAGTAGGCGTGTGTAGGCATGTGCTTAAGTCTAAGGGA:1 - chr3L 23771465 5' - Idefix 17 2 53.47 GGATTAGGTTACGGTGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGGATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 25021674 5' - roo 9043 1 57.43 AAAATACAAGCAAACCAAAAACATGTCAGTTCCACTACTCACGGTACAATAAACCGCGCGTTTAATTCAGATTCTCGAAATAAAAACAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3L 603425 5' + HMS-Beagle2 483 6 70.30 CAGGCAATTAATTTCTGCCAAATTGTAATAAACCAATATTTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTT:3 - chr2L 7175606 5' - blood 7333 1 81.19 CCAGCTACAGTGGCAAAGAAAAAGCCCAAAAGGGACCGACTAGCACATGCAAAGAAAAATAGTGGGATCAATACGATGAGTGATATTTTCCACAGAGCGAT:1 - chr2R 4511436 5' + transib2 2368 1 74.26 TTTCGATTTTATAGTGAATTTTAGATTAATTGACATATGCATATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAA:1 - chrX 20886036 5' - Ivk 5347 1 59.00 AGCAGGTGATGGCGATGCAAACTGGCCCCGCCCCTCACCACATTTCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2L 20238698 5' - hobo 2909 1 55.45 TTTATTCATCACGAATCTCTAACCCACTGGCTTCCATAGAGCTTTAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chrX 15546220 5' + blood 29 2 52.48 AAATATGAGCGAGCTAGCACCACATAAATACAGACAATAGTAATGCATTTGCTGAAAACAATCTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chrX 15800984 5' + roo 8675 2 69.31 GGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr2L 17730503 5' + pogo 40 1 68.32 GCAGCATTTTAATTAGACTTAAGTGCTGCTGCCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:2 + chr3L 1998822 5' - hopper 1374 2 63.37 AACGCCTGTATAGATTTCAAGTTCACGACTCGGCCATTTCAACTCGTCCGCTCCGCACAACCGCACAAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCC:1 + chr3R 8931805 5' + F-element 4495 1 73.27 GCTTAGGTCAATTGAAGGGGTTCCTCCTAATGGCAATAGTTGTTTGTTTTCAATCGTTTTTATATGACTAAAAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTG:1 + chr2R 18188284 5' + Juan 4030 1 73.27 GTTAAAACATAATTTGGAANCAGGTTTATTCAACCTAAATATTTTAAACGCCTAGTGACATTAAATCTTAATTTATTTGTATTTGTTTAAATTTTTAA:1 + chr2L 5339122 5' - frogger 240 1 86.73 CATTCAGCCGCCGATAAACGGCCTATAAATCAGCCAGTTGGCCAGCGATCGCGTCAATATTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCA:1 + chr2L 2659467 5' + Quasimodo 6998 2 65.35 ATTATCTTTTTTTTTACAGTCATTAGCCCTACGCAAATGCCACTAGCGATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr2R 18432056 5' + 412 23 2 53.06 TAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chrX 17104414 5' + 297 46 2 81.19 CAGCCTTACTGCGCTGCAAGCTTCTGTCTGAAAAAAAATGTTCTCTGTTAGGGTATGCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATA:1 - chr3L 19483034 5' + Quasimodo 12 2 46.53 TACATAAATCTATCGCTCCATCAAAATGTTTTATTGTAGTTAATTAGCATTCCTATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chr3R 13913018 5' - mdg1 376 2 67.33 AAAATCAAACAATAGAATCGAATCACACAACACAATTGTCAGCAGAGTAAAATTTGTTAGCATCAATAGTTTATTATTTATTGGACTGTACTATGAA:1 + chr3R 20779203 5' - Tc1-2 57 1 61.86 GACGGGGGGGAAATCCAGAATAACAAGCGGCGGCGATTCGAGTCGAGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 10488672 5' + roo 29 2 53.47 ACTTTTCCCGTCCGTTTTTCTGTTTTTGCACTGCTCGTTTCATTTATTAAATCACCCTCGTCAATCATTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3L 18977428 5' - roo 9036 1 71.29 TACTTATTCATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTG:1 - chr3R 3268047 5' + mariner2 101 1 59.41 AAACAAACAAGTTTGTAAGGTGGGTTACAAACACACTGGTACACACACACACGCACACACACACACTGGTAACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATA:1 + chr2R 8177677 5' + mdg1 7 2 70.30 ACACTTGCAGAGCACAGTGACATACGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTT:1 - chr3L 8268196 5' - hobo 2888 1 74.26 AATGTAGACGCATTATAAATGCATATTTATCAAACAAAACTAACTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:2 - chr3L 872778 5' + 412 33 2 55.45 AAAAGAAATTCCCAGATGCACTAAACTTCTACGACGATCTGTCGCATCCGTGCTCGCGCCTACCCTTTATAGGCCGCAGGAATCCCGTTATTTCCCTTTTT:1 + chr2L 20765810 5' - gypsy8 314 1 58.42 ATCGTCAATCGCTGCGCCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr2L 8709351 5' - P-element 2829 1 21.78 CGATATAGGTGTATATTACAATCCGGTCGCTCTTTGCGCTGCTGTTATCCAAGTTTCTGATGTGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCC:1 + chr2R 21076707 5' + jockey 4594 1 64.00 CTTTCCATTGTCTTCTTTCCCCCATCGAAAGTGATAACGAGAGCAGTTATGAGAAATGCGCATATATATACATATATATATATATATATGTATATGCGAGA:1 - chrX 19221380 5' - blood 180 2 65.35 ACAATGATATTCACCATTTGAACGGTTTTTAATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGC:1 - chr2R 5772519 5' - HMS-Beagle 210 2 67.33 CAAATATTGATCGACCGACGTGCTTGAGGTACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr3R 7626394 5' - hobo 2895 1 69.31 ATTTGTCATAATGTAAATCAGAATGGTATGAGAGAAATCTACACTAGTTATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3R 15579046 5' + pogo 23 1 56.44 AATAAGAATAAAAACGTATNTTTTAAGTGGAATATATAAATTGGGAAAAGAGAAACTACACAAAAATACGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATT:1 + chr3R 27907599 5' - mdg3 239 2 67.33 GGTAATTTACAACACCCTTTTTGTGGCCCGCATAAAGCATTTCGCTCGTAAGTAATTTAAGTAATTTGTCAAAAATATTCACCGCCGACGTGTGAAGACGT:1 - chr2R 11030613 5' + F-element 18 1 74.26 TTATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3R 10087823 5' - roo 9039 1 54.46 CCATCTTGGTTTAATGTAATTTAATCTTAATGACAACAAATACGTTGTACAAATATAACTATCTGTACTAGATTATTACTAGATTCCTTGAAATGAATGTA:2 + chr3R 31953790 5' + INE-1 13 1 25.74 ATCGGGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:1 - chr3L 24761243 5' + 1360 78 1 62.38 AATAACGCGGAATTTAAATTTAATTCCTTTCGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - chr2R 1737804 5' + I-element 45 1 67.33 TAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAA:1 - chrX 22824226 5' - Gypsy12A_LTR 2251 1 44.55 TTCAGGCAACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3L 2022237 5' - roo 9039 1 57.43 CAGGTAGTACAGCTTCAATGCGGTGGCCAAGGACACCAGAGCCTCTGCTTAGGCACCTGCACGGTGAGAGGATGATATTTGGTCTGTCCTCGACCTTTGTG:1 + chr3L 21138990 5' - Rt1b 194 1 68.32 TGATGGAAGAGCCAGTTTTAGCTATCATGCATTATCCATATAATTTTGTATAGTATGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3L 3209256 5' - roo 9054 2 61.39 ATTGTTGCGTTTTTAGCCGCATTTTGTGAATTCCTCAAAATGTTACGTAGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 + chr3L 20520676 5' - P-element 2860 1 52.48 AACATTAAAATAAAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:2 + chr2L 7175564 5' + blood 35 2 57.43 TGTCAGGGTCTGCCAGCACTTAAGATCATAATTAGTGTTTCTTGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:1 - chr2R 24555711 5' - hopper 1401 1 65.35 CAAACAAGAGGTTAGTTAGTACTATTATCTTTTTTTTTACAGCCATTAGCCCTACGCAAATGCCACTAGCGATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATT:1 + chr2R 18432033 5' + 412 3 2 76.24 TCACTCCTCTCCCCCAAATGGAGCATAAAAGTTTCAGTTAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTT:1 + chrX 4264346 5' - mdg3 5467 2 55.67 ATGTCAGTTCTTCTTGGGGAATACCCCAACTTTACTACGGTTGAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTG:1 - chr2L 18371502 5' - Doc 281 1 60.40 CCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 2022248 5' - roo 9028 1 68.32 CAATATTGCAGAAACAGCATTGGCTGTAGATTGACTGGAAGAATCGGTGCTCATTATACTACAATAGATTCGTGGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAG:1 - chrX 19821228 5' + INE-1 28 1 76.24 GAAAATATAAAGAAAGTTTTTTTTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGT:1 + chr4 382915 5' + 1360 3285 1 82.93 TAAATTTAATTAATTTGTCTCGTCGCCCCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr2R 22553099 5' - 1360 3341 1 74.26 AGTCGTAGGTGGAAAAATAACCAAGACTTAAACTATGGTCCGTTTTGAACTGTAGCATTTTCATTTATTTATGCAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTAC:1 - chr2L 16139208 5' + copia 4 2 75.25 TTATTAATTTGCTTTATTTTCAGTACTATATATATACGGTTTAAACTGGCTGCTGGCCCGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 - chr3L 1697771 5' - Transpac 294 2 61.39 TTTGGATGATTCTGGACATTGTTTTGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCT:1 + chr2R 11994212 5' - jockey 4691 1 75.25 AAACGGGTTCAGCAATCATAAACTTGTTGTGCAGACAGTCAGATATACCGGGGCGTCTTGTGGGCGTTGACGTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGA:1 - chr2L 20321656 5' - Gypsy12A_LTR 2252 1 54.46 CCACGAAACCAAAAAACGGAAGGGGATATGCTACATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chr2R 19102159 5' + opus 33 4 70.30 CGTGCTCAAGATTTATCTGTGCGCGTTTATTTTAATGTTACGTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATAT:1 + chr2L 10791987 5' + 412 2 2 77.23 ATACATAAATCTATCGCTCCATCAAAATGTTTTATTGTAGTTAATTAGCATTCCTATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGTTCATT:1 + chr3R 13913017 5' - mdg1 377 2 64.36 CAGTAAAAATGAACTTAAAGCCGAGCTCAACGAGTTGGAAACATTGAACGTCTGACAGAACCATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAA:1 - chr3L 7291702 5' + Doc 4426 1 64.29 TGTTGTGGCCTCTGGCATANACAAAAAACTTTAATGAAAATTTAGCAATAAAATTTTTTTTAATATGGCAATGTTTTAATTTTATTTTCATTTTTTTATTT:1 - chr2L 174707 5' - Doc2-element 251 1 72.28 TCAAAGAAAGCAAAAACACTGATAATTAATTGCTTCGAATGCGGCTTATCCATTACTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTC:1 - chr3L 3242746 5' + diver 5908 2 45.00 ATTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr3R 20420928 5' + blood 38 2 63.37 TACATTCTGCACAACTTTGGAGCCAAGACTTTTTACAATTGGCAAGCTAGAAGGTTTTTGGACCATATAAATTTAATATATTCTTGATCAGGATCAATAGA:1 - chr2R 5198487 5' + INE-1 86 1 56.44 GGGCACTTTGGGGCCACTCGAACACACATACAGTTTTTCCCTCGAATTTTCCACCACCCATCCTTACTATATACATACATACAAATATTATCGAGAAACTT:1 - chr2R 17644185 5' + mdg3 111 2 54.46 TGAGATCGGTTTAGTTGATTTTCAAATGGGACTCGATAGCAAACTTCGTTGTGAAATTCCTATTACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAACTACACCACTAC:1 - chr2L 21931529 5' + Copia1_DM 108 1 58.00 GCAGCTGATACGTGGGTTTTGGAAGCGGGGGCATTTTATTTAAATATATACATCTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr2R 21962714 5' + 297 17 2 55.45 ACACACACACACACGAATATACGAGACACCCACAACACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGA:1 + chrX 2290860 5' + copia 4841 1 68.32 AAGCGGGGCATCAATAAAACGAAACTACATCTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGA:1 - chrX 11032238 5' + invader3 32 2 68.24 ACATTATTGTTTTGTGATTGAGTTCCACTGTGCGGCGGCGGCTCAGATGGCAAATAGCAAATGGCAAAATTGGAAACCTTCTTTTACCAACAAATC:1 - chr3R 21931384 5' + F-element 339 1 81.25 AATTTAAGGTACATTCTTTTTGAGCGCCAAACTAAAAAATCTAACAAATTCTTATATGGTGCCAATTGATCAACAATTATAGAGATTTAAAGTCTAAGAAC:1 + chr2L 12260853 5' - 1360 239 1 59.41 TTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr3R 20420929 5' + blood 39 2 64.36 TACTAACGAGATGAAAGATGAGCACGGACAACCTAGCCAGGAAAGGTGCAGAGAACCCTCTATGGGGTTGGTCACCACAGAGTACTGGGCTTACTTAAGTC:1 - chr2L 12802831 5' + baggins 4973 1 42.57 CCCGCTCTCTCTGCAGCACAGCGCGCTTTCTTCGTTCGGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chr3L 16891101 5' - P-element 2848 1 38.61 ACAAATCAAACAATTATAANCTCGTTGTTGGTAAAGTGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 + chr3L 12468217 5' + jockey 4711 1 59.00 AATATAAATCAATGTCGAGGCTCACAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTCTTCGACTTCTCA:1 + chr3R 24085324 5' - invader3 5412 2 73.27 CTAAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - chr3L 25059141 5' - mdg1 386 2 60.40 ATCAATGTCGAGGCTCACAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATACCTTCACAATCTCTTTCTTCGACTTC:1 + chr3R 24085331 5' - invader3 5415 2 75.82 CAACCTTCTAGCTTCTATAGTTCCTGAAATAACAACGCTTATATGGACGTAAAGACAGACGGACATGATCAGATTGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAAA:1 + chr2R 1751259 5' - INE-1 88 1 66.34 TCTTGACTGCGGTTGGTCGTATTCTGCTCCATTCCCTATATATATATTTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr2R 19102238 5' - opus 7481 2 59.41 ACTATTTGTATTGTTTAATACTCACTTAGAGCAGCTTGCCTTGAAAGGTTTATAATTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTTCTTCCGTCGAAATCATCT:1 + chrX 17260931 5' - invader2 464 1 64.36 CTGCTGCCCTACACATAACCATTTCCTTGGCGATTTAATGGAGGCATCAGCGTTACCATTTTGAACGCACGCAACAATAATCACCTTGCATTCAAACCATT:1 + chr2R 12133473 5' + HMS-Beagle 6669 1 64.36 AAGATGCCGTTCAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2R 13763171 5' - roo 396 1 58.76 ATTCTCGCTCCCACTCCCGCACTCGCTCGCAGCCCCCTCCCTGGTGGACTCTCTCCTTCTCTTCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTATTCACCAC:1 - chr2R 12438934 5' + Max-element 8362 1 59.00 TATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATG:1 - chrX 18326230 5' + Doc 226 1 63.37 GTACAGCGTGTGTGTGCTGGTGTTTACCCTTGTGTCTGTTTTTGTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1 - chr2R 23116267 5' - jockey 4961 1 68.32 AACTCTTCCCAACAACGATGAAATTCCTAGCTAACCTTAGAACTATGCTTGGAACAGTCCTTATTTGTAAGCTTATTTGTGGTGAAGTTGAGAGTCCCGAC:1 + chr3L 21610504 5' + Cr1a 4063 1 75.25 TCAATTGGCGTTTTATTGCTTTTGGTTTACTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTC:1 - chr3R 22728915 5' - F-element 25 1 80.20 CCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGA:1 + chrX 21668006 5' - Tabor 7292 2 54.46 ACACAGGACATTTTCATGAGGTAAGGCCGCACCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATAT:1 + chr3L 13295227 5' + hopper 43 1 67.33 GAAAATAGCCATAATAATGATAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr3R 12767326 5' - blood 7339 1 76.24 ACCAAGACTTAAACTATGGTCCGTTTTGAACTGTAGCATTTTCATTTATTTATGCAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAAC:1 - chr2L 16139189 5' + copia 4892 2 56.44 CAGTGAGGCGTGCTTTCGAGGGGGTGGTGTTTCCGGCCCGATGCTGGGGTCAGCACTTTAACGTAATGGTATTAAATTTCGTGCACTGAGCCAACTGGTCT:1 + chr2R 14788087 5' - Gypsy6A_LTR 23 1 72.28 TTGCTCACTGTACCTGCGTAACATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGA:1 + chr2L 7937266 5' + jockey 4575 1 78.22 TGAAGAGTCAAAGATATCAGGCAATATGGGGTACCACCGTGATTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAA:1 - chr2L 18240208 5' - 17.6 7090 2 58.42 TCGTACTTCGCCACACTGGCTTATCAAACAAACAATTTGAATGCCCAGCGGAGCGATCTTTTTATTGATGCGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr2L 16358144 5' + hobo 6 1 71.29 GAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTA:1 - chr3R 15790060 5' + flea 4749 1 73.00 AAGAGATGAAGAAGTTGAGAGCTCGACTTATTGTGCCCTAATCTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:2 + chr3R 27495648 5' - 412 460 2 54.46 CCAATTTCGTTCCAAATGAGCAAGCCGGTGTTCAAAATTTCCCATCTTGGCACCGTTTAAAGTCACTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAG:1 + chr2R 6282525 5' - Stalker 433 1 57.43 CTTGCAAATGCTTCTTTTTNGCGCAGAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 + chr2R 8682350 5' + pogo 45 1 74.26 AAAATCAACGTTATCCTTATCTATTAATTAAATAAACGCTTTAAAGGTGGCAATTAGGGAGGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 - chr2R 7546342 5' - hopper 1405 2 69.31 ACCTAACCACCATTCTACCAAAGACATTAAAATTGGAAACAAGATTCAGAAAATAGCGAAAAAATACAACGACAGACTAGAATCTCATCCTAATAGTCTAG:1 - chr2R 4879460 5' + jockey2 3099 1 72.28 ATTGCAAGGACAAGGAGTCGCTAATAGAACTCAACAGCATAAAGATATTATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATAC:1 + chr2L 19342971 5' + pogo 85 1 56.44 TTTTTGTGGGTTTCAGGTAACGGATGAACAAAGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGG:1 + chr3R 26385814 5' - 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roo 9052 2 59.41 TTCTCTGGCAATTTCCTTACATTTTTTGGTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 6893635 5' + hopper 149 103 61.82 GATGTTTCTAATGCAATTTTACCATAAGAAGTCTAGCAGCCGGCTTCTAAAAAGTACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 2833847 5' - roo 9052 2 56.44 ATACTATAATAAGTAGGGTAACCATCCCAGAAGGGTCTGTCCTTAAAGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:2 - chr3L 20411872 5' - roo 9053 2 59.41 GTGTGCGTGTTTGCATCCCATGGTGCGTATGTGTGGGGTAGATTTATTGCATGACATTTCAATTGTTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chrX 22593127 5' + 1360 8 2 69.00 AATAAAAAAAATAGAGAAGAAAGTCATTATAATAAGGATTTGGAAAATTTAATATTACCTATAGACATTTGAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTT:1 - chr2R 2498835 5' + hopper 302 1 69.31 ACTTGGCTAGGAATTAATATTATTCAAACCAGTAAGAACAATTTTTTTATTTGTTTTACTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3L 16546762 5' - pogo 2085 1 64.36 TTTAATTAAAACATATTTTACATACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 + chr3R 12063762 5' - 412 439 2 78.22 AACATTTTTATGCCACAAAAAAACGCTCGTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:2 + chr3L 5710221 5' - 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mdg3 5487 2 79.21 CCAATCATTTTAGAAAAATGCCACCTAACAAGCTTATCTTAAATCATTGTTGATCTAACTATGCATGACCCTTAAAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAA:1 + chr3R 19446967 5' + Cr1a 4194 1 63.37 CGTAGGCTGCCGTTCACAATGATATTCACCATTTGAACGGTTTTTAATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTT:1 - chr2R 5772534 5' - HMS-Beagle 236 2 65.56 CCCCCCGCTGCCAGTTTCCAATTCCTAATTACCTGGCTGGCGAAATAATCAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTG:1 - chrX 4692335 5' - 412 7071 2 54.46 TCACCTTCGTGCACGTTATGGAGGCACCGCTGTCCTCCATCCTCCGTCGTTAATACATTCATGCGCGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTC:1 + chrX 17816953 5' - R1A1-element 5335 1 56.44 AGGGCACCTTAACTATACANGTCGCCGAACGATTTGATAAGACTAAGAATGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 14222452 5' - roo 9047 1 52.48 ACCGATTAAAAGGTAGCAATAGATATGTTATTATTGTAAAACTACGTTTCAGCTTTACACAAAAATTGCAGATGTGGATGTTACAGCAAGTGAACATAAAA:1 + chr3R 4091258 5' + I-element 454 1 63.37 CGTTTGCCATTCGTGTTTCGCTTCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAA:1 + chr2R 13035493 5' + copia 4802 1 77.23 CGAACGTTGCCAGTCGATTAACACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chrX 20361946 5' + hopper 8 2 71.29 TTTGCGGCTCTTTAAGCAGGTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTGCATCTTTAT:2 - chr2R 8177749 5' - mdg1 7405 2 73.27 TATACCAAATATAGAACAGNAATACAGGAAAACATATTAAATCAGAGATATTAATGTATATATATATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGA:1 + chr2R 13622159 5' + Quasimodo 5 2 74.26 ATTATTGAAAATAAATATGCATATGCATTTTTAAATTCTCATCAATCAGCTGGTGGAAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGGCAG:1 + chr3R 25793752 5' - INE-1 502 1 61.70 TCTATGATAAATAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTC:1 - chr3R 11151918 5' + mdg3 5257 1 72.28 TGATCCCCCCAAATGGGCTAGACAATTTTGGCAATGCCAATTTGCATCGCAAAATTTTTTAATTTCACACATCGAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGC:1 - chr3R 14334845 5' + X-element 4407 1 73.27 CTATTTTATTTCTATTTTTTGCATGGTGTCAATTGATCAATAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTTTAAGGTGAAGAGCATATTTTGTCAAATTTA:1 + chr3L 18672151 5' - 1360 206 1 79.21 AGATTTGATTGGTCCTTACAGCTACTGTGTAATTCCATTGCTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 + chr3R 4971378 5' + F-element 19 1 69.31 AAGGGTGCAGCAGTGAAACTCGCTGAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTCAAGCAAAATGATCTGCAA:1 - chr4 1047958 5' + Tc1 459 1 67.65 GCTTCACACACCGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTA:1 + chr3L 19274800 5' + transib2 27 1 52.48 TATTGATAAGCAAAATGTACGAATTAGGATGGGGGTTTATTAGGTTTATTACTTTGAATTTTACTTAAAAGCACAGAAATATATATTTTTATAACAGAAAA:3 - chr3L 15035794 5' + TART-C 11034 1 62.38 CTGTGGCGCCTACAAGAGATTCAATCGCACCGAGCACATTTCCATAAGATATGAACGGAGTCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGT:1 - chr2L 12172220 5' - roo 6 2 62.38 TGTGGAATGAAACCACAAGNCTAACAAATCCCCTTCCTTCCCTGATTGTGATAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTT:1 - chr3R 31994734 5' - Doc 4620 1 59.41 ACTTAGCAGCCTTGCCACTTTACTGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTAC:1 - chr3R 10110171 5' + Doc 427 1 76.24 CCAAAATCCCATGCACAAATTTTATGAGCCAGCCCATAAAAATGCCTTTTACCGTTCTCCGTTTTTGTTATTTGATTCACATTAGCATGGTGGTCACTTAT:1 - chr2L 7262565 5' - 17.6 6996 2 71.29 TTAACCGAAGAACATCGCTTTCAAAGCAGCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 - chrX 16671111 5' - P-element 2840 1 32.67 TGTGAGACGTGTTTACCGGATGGCAGTTCGTTTAGCTCTAAAGCTACCGTCTCGTCGATCGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 - chrX 15024455 5' + P-element 16 1 64.36 TTAAACTGGCAAACCACGAAACCAAAAAACGGAAGGGGATATGCTACATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr2R 19102146 5' + opus 20 2 59.41 CAAAAGCAGAATACATTACAAGTCTTGATCTAAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chr3L 25059170 5' - mdg1 415 2 74.26 AACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 - chr2R 672816 5' + F-element 59 1 74.26 CGCAGGATAATTTTATATAATTTTTCTTTTAGTTTGTGATGATGCCACTCCATTAGACTGTATGACCCCAGTACTATTTTTATTTGGTATATTTGTATTAT:1 + chr3R 32039366 5' + BS3 1647 1 58.42 CCTCCTTACCACGGCACCAAGTTTTTTTATTTTTTATTATTAGACTTACGGGAGGAAAATTAAAATTTTGTACAGATACCACCTACCGTCCGTATGTGGCT:1 + chrX 17539341 5' - Rt1b 5089 1 77.23 TACTATAGAACACATTGCAGGAACGTCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTA:1 + chrX 1661667 5' + mdg1 389 2 79.21 GAGTCCATAAAATCTATAAAACCCACTATTTTAATATAAAGAGAAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATT:1 - chr4 408357 5' - BS 4738 1 56.44 AGAGTTTGTTTGGACGTGGATTCTTCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:2 - chr2R 21040900 5' + P-element 50 1 30.69 TATTGTTTTTGAATATGCTTGGTTTTAGAGCTGAGCAAGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAA:1 + chrX 4275741 5' + roo 474 1 62.38 TCATTTGTATAAACACCTCGGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 10613778 5' + hopper 146 105 61.36 TGACGCAACTTTTGTGCGGGGTAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAA:1 + chr3L 11867943 5' + Doc 4654 1 78.22 ACTGTGCTAGATATGCTTATAAAAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - 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copia 5088 2 60.40 AAGCTATTTCATTGAACTCCGCAAAAGAAGATACTATAATCATACCTACTTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAA:1 + chrX 20885965 5' + Ivk 5371 1 54.46 CTTCAACTAAGATGTATCCAAAGAATGCTTCCATAATATTCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 + chr3L 5702028 5' - I-element 5322 1 57.43 TTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACAC:1 + chr2L 14793507 5' + Stalker2 7296 2 71.29 AGATAATTATCCCACCTACNAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATT:1 - chrX 21668080 5' + Tabor 6866 2 51.49 ATTTCCTTGTCATTTGCATTTATTACAGATTTGTGAATTTACTCCGTTTAATGATTGATGAAGAAATTTGGGTTGTGATACAAAAAAAAAAGAAAAAAAA:1 - chr2L 8089541 5' + G2 3075 1 59.00 AAATTTCAAAATATATACACTGGCGCAACCGATGTGGGCATATATTGTATAATGCATACGGTTTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chrX 12472628 5' + pogo 9 1 75.25 GGTCAAATCTGATTGATTTTCGGTGTGGAAATTAATTAAAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATC:1 + chrX 21194615 5' - mdg3 344 1 61.39 CACAAAAAAACGCTCGTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:2 + chr3L 5710234 5' - Transpac 286 2 55.45 TTATGATGCCATTTTGGGGATTTTTACCCTCAGGCAATTTCGCTTGTGGTTTTTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chrX 7996447 5' - hobo 2919 1 58.76 ACAAAAGGTATTATCTCAACTTTATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTC:1 - chr3L 15452941 5' - accord 7359 2 53.54 TTAATATTTATATACATACCATTACTCCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTCTCCTTGTCTTAAGATGAAGTCGTCCCCGGATTCAATGGTC:1 + chr3L 4281429 5' - gypsy10 5601 1 71.29 CTGCTTTTCATTAGTTTAACAACTTCTTGAAAATACCAAAATATTACTTTAAGGACAAGTTCATCCATAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr3L 16562385 5' + pogo 7 1 72.28 AAATTGTTTGTCAGCTTGCAGAATCGGATGTCAAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 12241798 5' - roo 394 1 65.35 GGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr2L 8622773 5' + 297 44 2 81.19 TTCCCGAAATACATTGGCGAATTATTTTCGTACACTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCA:1 - 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blood 379 1 74.26 GCTGTGAGCGTAGTTGTTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 - chr3L 5241189 5' + Ivk 9 1 66.30 GAACTGGGTGATTGTATATAAATGACAATTAAACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:2 - chrX 734996 5' + Tabor 14 2 65.35 ACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3R 8765551 5' - roo 9029 1 69.31 CCGAGTTCTATAATAACCACTATGGAAGTGCGAACTTTTCCGCGACAAACTTCCTGGCCGGCATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 + chr2R 12473038 5' + Doc 17 1 56.44 CAACGTTCTTGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGAACGGACAGACAGACGGATTATAATCACCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGTTAAA:1 + chr3L 5157923 5' + INE-1 153 1 69.31 CTTAAATGGGGTTAGGGGGTTAAAGTGGGGGCTCGGGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGG:1 + chr3L 15457030 5' - accord 44 2 68.32 TCAACTTTCCTCTAGGATATTAATGATATTTTACTCTGTTATATTTTAAACTGCATCTTTAGCTAGTAACCTTCACTGCCCAGGAGTCTGTTCCTCCTGAA:1 - chr2L 5971025 5' - baggins 5269 1 75.25 CCTCGTGTTGTGACAGGCAAACAAAACGCAGCTCATAGTTTGGATTTCAGAATGGTGATGTCTCCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAA:1 + chr3L 10043549 5' + G6 1890 1 62.00 ACATGCGCACGCCAATGGAGCGCCAAATTTGCTGTCAAGTTGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCA:1 - 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chr2L 1071255 5' + FB 77 1 55.45 TTACTTAAATAAGAAAAAAATATGAACAATGGAATATATACCTCTAAGAACACTTTTAGGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr3R 5993203 5' - pogo 2087 1 63.37 GATCCTCAACCACACCTGAGGATCGGGCAGAAGTATCTAGTTTCTACCAAAGACAGTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3L 24504937 5' + 1360 9 2 83.12 AAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAC:2 + chr2R 9870971 5' + roo 9041 1 59.41 TCTACGCCCAGTGTTTTTGGTATTTTTGTGGGTGGTTTTGAGCTAGGAAGTATCCTTAGCCTTACAGAACTGATGTTAAATTAAAAAGATTACAAAAATT:1 - chr2L 7565985 5' + HB 321 1 54.00 GAGAACCAGCACCAGCAACACTTGTGGGAATCATGCATCCACCGAGAGCATCGGCGTCAAATGAAAAGTCCTTGCACGTCGCACTGCCAAAATTCTGCGCT:1 - chrX 17138813 5' + invader4 493 1 65.35 TCATTTGGCAGCCCAAAAAACAGGAACAAAAAAGGTCCTATGCAAAATTCGTAACAACAATGTTGTATGTTTCTTTTGGATGTGTGTGTGTGTGTATTCAG:1 + chr3R 20362831 5' - accord 7027 2 78.22 GCAATTGCAGCGCCATAAATTATGCATAAACATCCATGCAAATCAACACTGCCAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTAT:1 - chr2R 5813044 5' - F-element 328 1 55.45 CTATCGACCGCCCATACAATTTGTTTCCCATATTAATTTATCATTTATAAACGATTATTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 7099570 5' + roo 8679 2 63.92 ACCCTTGACAGAGTTGACCAATAGTTTTCCTCTTGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1 - chr3L 3650828 5' - mdg1 7456 2 71.29 TACAATTACCTCACAATTTTAAGAAAAAAAAAAACAAGTGAAAACAATAAACAAACTAAAATATGAGCGCATCTGACGATCAAAATCAGAAGCGAGAGCTT:1 + chr2R 14934394 5' + Porto1 228 1 77.23 AAACACTTAGATATACTTCGGATTAGATTTACTGCCCATGTGCACACACACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr2R 9209508 5' + Tirant 15 2 63.83 TAGAGTCACTTTGCTAACAATATGTATTTTAAGTTCGCCAGCTCAAGTCTAAGGATGATATTATTTAAGCTGTTGAAATTATAATTATATGAATATTATAT:1 - chrX 11461329 5' + transib3 2622 1 65.35 ATAAACAAAAACAAAGGCCAGGCGACAAGGTAGTTGGCTTAGTATTTAATATTATATTTTATGTAATAAGGAAATTTTTATTTTTTAGGTTAGAGTTGATT:1 - chrX 4644442 5' - Burdock 369 1 71.29 TGATATTTCAAAATATCAGCGGATTATTATTTAGATATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATG:1 + chr2L 9734678 5' - roo 138 2 64.65 TTGGACAGGTTTATTGGGTGTCCACTGCTCTTGTTGACGATCACCCATAATCAATATAAATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 - chr2R 9905435 5' + mdg3 5269 2 62.38 AACGTCCGCCAGATAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr3R 28565269 5' + 412 39 2 64.36 CCGGTCTCCTCCCCAAAACATTCAATGCAACCGAAAACAATCAAATTTCCGTTCAGTCCGAAGAGAAGTCCGTAATGGAAAATGGCCGGATCGGAGCAAGG:1 - chr3R 28696446 5' + accord2 271 1 56.44 TGACGAAACAATTCCTGCCAGAGATATTCCGAATCAAGTGAATGGCATTCCGAACACAGCCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCAG:1 - chr2L 20318418 5' + F-element 4491 1 64.36 TACCGCTTTAGCTCTCTCTCTCGCTATGCGATACAGTTTTATATCTTGGGGTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT:1 - chr3R 19322072 5' + blood 7179 2 77.46 GCCGCTAGTTTCTTGAACTCTACTGTATGAAGGGCTGTGCAAATGGGTGTCGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTG:1 + chr2L 13482515 5' - F-element 260 1 62.00 CGGAAAAGCCAGGGCACGTCGTTCGCCTGTCGCCGTCCCACTCTAGCCGATTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGC:1 + chr2R 21504856 5' - R1A1-element 376 1 51.00 CATGTGATTTTCCAATATGGATCTTATGAAAGAACTGAAAATGGTATAGTAAAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATG:1 + chr3R 25086085 5' + Bari1 25 1 55.45 GTAACGGGAGAGCGCCCTACAGTATGCAGCCAAATAAGGCAAGTCTGCAGAGAGTTTCAACTCTCCTCATTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGA:1 - chr2R 12252921 5' - jockey 4988 1 53.47 ATTTTCTTCTTGCCCCGGGGCGTTTTTCCATGTTTTGTCCTTGAAGTATCCTCAGTGGCTGCAGGCCAAGAATGTTGAGTAAAAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 + chr2L 16643910 5' + Doc 4703 10 64.36 TCATAAAGTTAAAGTAAATAGGGTTTTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:2 - chr3R 11916630 5' - roo 388 2 58.42 TGACAACCTGCCCATTAATGGGTCTCATAAATAATCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTA:1 + chr2R 16609427 5' + jockey 4802 1 67.33 CCTTTAACTCCGATACGCATACTAGCATTTGACTTTATTTCGTCTTTAACAAGTGGAAGTTCCATGTCTTTGTGGATGTCATGATTAGTCATATACCATGG:1 + chr3L 21744570 5' - G3 4295 1 77.23 TGAGGAAATAGAACTTATCAGCAATACGCAGTGACATACATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGA:1 - chrX 18326274 5' + Doc 182 1 77.23 TTTTTAATTTAAAATTATATATTTTATGAATATGATATATGTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 + chr3R 12468272 5' + copia 35 2 66.34 GTTTGTGTCATTTTGTCACATAGTTTTCATGTTTTATTTAGCCGTGTCTGACAAGGAACCACGCACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCA:1 + chr3R 8427150 5' - invader2 4649 1 66.34 AAGGAAAAAACAGAATAGCATGTCCTATCAAGGGTTTTTAAGTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTG:2 + chr3R 20094431 5' - Max-element 286 2 64.36 CAAATGACGCTATTCAGCGCGGATGTCCTTTGTACACTCAGCCAAACAACAGTATATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAG:1 - chr2R 16475384 5' - Tirant 331 2 56.44 TTCCAATCGCTTAAGCCCCGTTTCCTTACTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTTATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAG:1 + chr2R 4756269 5' + Stalker 6886 4 72.28 CTGCAGCAGATTGTGTTTTAATGTTATCTTGATCAAATTCTCATCAAGTTGTAAACCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 - chr3L 20354085 5' + 412 22 2 58.42 TGTGGAAAATATTTATGAGCTCGGTAGACGTTGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACCGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATAT:1 + chr2L 8638448 5' - 412 7403 2 68.00 AAACAGGCAGACCATTCTTATAAAATATAAAAGAGTTCATTTAAGGAGGAGTAATCATTTGATTACTTAAATGGCTCCAAGTGCAAAGTAATGACCTTTTG:1 - chr2R 2562435 5' + Q-element 672 2 85.15 ATTTAATTTAATATGCTAANTGGATGTGATCTGAGTGTGTGGGCGTGTGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTA:1 - chr3R 24494238 5' - Quasimodo 263 2 56.12 GGTTTGTTTGATGTCTTGCCACACAAGTGGAGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCT:1 + chr2L 23389608 5' - Ivk 5130 1 69.31 GCAAAGCAATCTTATGTTTGATGGCACAAACTATACAATCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATA:1 - chr3R 27907686 5' + mdg3 39 2 64.36 TTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3L 8036418 5' - roo 9020 2 81.19 ATTCAGTACCCCGATTTGGCACGTGCACCCACGCCTCTAGTATTTACAGTGTTCATAAAAATAGCATTGCGAGGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTTTT:1 - chrX 22883570 5' + HB 42 1 65.35 CTCAAACACATATGTACAGCGTGTGTGTGCTGGTGTTTACCCTTGTGTCTGTTTTTGTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 - chr2R 23116280 5' - jockey 4974 1 55.45 AAAGGTTCCTTATTACGTAATTAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3L 6033547 5' + 412 7076 2 69.01 AGCAGTTTATTTTTCTTATCTTCACAATACGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGTTGACCTTACTCAACATACTTA:2 + chr3L 21815428 5' + G2 2938 1 49.50 GAATGCAAGTCATAAATGACATAGGGCCGAAATTGATTTCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr2R 17963216 5' + blood 7027 2 63.00 AAGACGCCGAGTAAGGTGAAAACTTTTGCAAACAATAAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr3R 17660539 5' - roo 9035 1 64.29 TACGCCCACTTGTTTCGGATTAGGTTACGGTGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 25021658 5' - roo 396 1 67.33 TCATTATTGCCGTTGTTGCCGTTCGTGTTGTCGTCGTGCCGCCTCGTTTGCTACTTTTTCCAGCTCACACAGATACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGT:1 + chr3L 12693295 5' - rover 328 2 79.21 CTATTTTCAATTGAAAGTGTTCAGCTCTTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3R 29608861 5' + roo 18 2 62.38 AAATGTGCACAATTTTTTATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 10087807 5' - roo 9055 2 62.38 AAAATTAAAAATTGCATTCCCTAAAACTTGTATTAAATGTATTTTGTAACTACCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chr3R 25581110 5' - pogo 2080 1 58.42 AGAGGAACCCAGACCATCTAACTAATGAGCAGGCAAGCACTCACTTACCAAGCCGCACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCT:1 - chr3R 13985492 5' + accord 210 2 75.25 CAAAAAATGACGGACGCAAGGCTTCAATTTGCCCTCAACCTGCTGCAAATGGAATCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCAC:1 + chr3L 20342828 5' + Idefix 225 2 62.38 GTTTTCCATATTTTCATTCCCATTTTTGGATTTGGCAATGCATTATTTTATGGCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGGCTTTTTTTCTT:1 - chr2R 21792314 5' - Ivk 258 1 61.46 AATTAGTGTTTCTTGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 - chr2R 24555682 5' - hopper 1372 1 66.34 TTCTAGCATGTTGGTACGCCCAAGTTGGTAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGGTGTCGGTCAAAATTGC:1 - chr2L 22256359 5' - 1360 3324 1 78.22 TGTTAGGACATTTATCAAAATGTTGAATACAAATTCATAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGT:1 - chr2L 14793553 5' - Stalker2 7613 2 61.00 ATATATTTTAGCTTTCTCTTTTTGATATACAAAAAATCAACAATTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 26317990 5' - roo 9042 1 57.43 TTACCCTATTTTTTTCAAAATAATATACACCTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTT:1 + chr3R 30553533 5' - 412 478 2 63.37 GCGAGGATCTGGGCATCAANCTTCACCACTGGCATTGGCATCTCCCTCTAACACACTATTCTTGACAACCCAATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGT:1 - chr2R 9044004 5' - invader4 2869 2 66.34 CAGATAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:2 + chr3R 28565278 5' + 412 7101 2 73.27 GAAGATCCGCAAAGTGCTTTTTTCGAAGACTGGAATACGAAAGAGCGAGAGAATAGGTGCACAGCGCAGTTTATGTGCACTGCGAACAACGCACAAAATGA:1 + chr2L 17128309 5' - Cr1a 224 1 63.37 ACGCTAACTAATCTCCCAATTTCTAAAAGTCAAAGTCCCAAAGGTTCTATTCATGACAAACGGACAGGCGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTA:1 + chrX 179503 5' - INE-1 104 1 57.45 TAATTAAAGTAATTGCAAATGGAATTTCTTCTTGTGTCGCTTGAAGGCGGCGATTAAGCCATTTATGCCATGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGT:1 + chr2L 19675246 5' + flea 4806 2 69.31 GCAAGTGGCAGTGCACATTTTTATCAACATTTCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 + chr2L 17677718 5' - Tirant 8464 2 68.32 GGTAGGTTCGCGGCACAATGGCCAAATACAGTGGAGTAAATGTTTTGAAAAGCCAGCGAAAGGAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAG:1 + chr2L 15480990 5' - mdg3 5043 1 72.28 CGAAACGAATGCTAATCTCTGGGGAAATGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTG:1 + chr2L 2869517 5' - accord 7304 2 72.28 AATTATATATATTTTCTGTGGCTAACTAACTTGAAACTAATGCTTATTAACATTTTTAAATATATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTAT:1 + chr2R 19088936 5' - Tabor 7312 2 63.37 ATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGA:2 - chrX 18326235 5' + Doc 221 1 58.42 TAGTCATTAGAAGCTCGCTNACATACATGATAAACATAACTTAACATTGTTGGTCCTGAAAAAATATTGTGTAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCAC:1 - chr3R 24314776 5' + X-element 15 1 54.46 AGAAATGCATTTCCAACATGACGCTGATTACAGAGAAAGCGGATGAAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCT:1 - chr2L 15566740 5' + 17.6 304 2 54.46 GCAAGGGAAAATTTCTGTTACATATTTATCAGTACTTTAAACGAAATTCATTGTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:1 + chr2R 9699795 5' + Transpac 4940 2 65.35 GACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 29608794 5' - roo 360 2 73.27 CGAAAGTATGCCCCAAGATGAATAGAGCTGCTGACAACCTGCCCATTAATGGGTCTCATAAATAATCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTG:1 + chr2R 16609396 5' + jockey 4771 1 67.33 GAACAGTGTATCCTTTTGTTTTATTTGGTTATTATTTGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chrX 4277526 5' + roo 8701 2 64.36 CACCACGGTGGCCAACGGAACACTTAACACCACTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAA:1 - chr2R 24614210 5' + X-element 4381 1 56.72 TAAGAAGATAGCTTGTTAGTTACGATAAAATATTTCTTATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 - chr3R 17482071 5' - copia 252 1 64.36 CCTATATTTGTTTCCAGTGTCATGAAGGTAGTTGCTTAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTATATTTGCAAACTTCAACTTCT:1 - chr3R 22869446 5' - Bari1 1673 1 57.43 AAAGCCTTCAGTTATGAGTAATGAGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGA:1 + chr3R 27131923 5' - copia 5072 2 80.20 AAAAAAGCGACCTGCCTCATTTTCGTAGGCCCGACGAGAGATATAAACAAAAGAAAACGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTC:1 - chr3L 1585744 5' + Tirant 8346 2 69.14 ATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCA:1 + chr3L 16282383 5' + gypsy5 33 2 67.90 AAAATCGCAAATAAATAAACCCAAATAACGAATATAAATCAATGTCGAGGCTCACAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAAT:1 + chr3R 24085294 5' - invader3 5442 2 57.43 TTATAAAATAAAACAAATGCATATGCATACATATTTCTGGAAATGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCC:1 + chr2L 20330590 5' + opus 301 2 56.44 GCGTGTTTGGGCCGGGTTTTTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGC:1 + chr3L 16282355 5' + gypsy5 25 2 55.45 GGGATGCTGTCTTTGAAAGATACTGTCCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCT:1 - chr3L 19861828 5' + 1360 49 1 76.24 ATTTGCATGTTTTTTTTTTATCTTTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:3 - chr3R 23080433 5' + roo 8716 2 84.16 TGCTTTTTCCTCCTTTTTTAATTCAACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:2 + chr2L 12958893 5' - roo 396 1 66.34 GGGGCATTCACTAGCAGCTGAAAGAGTTCACAGCGGGGCTTTACTGTTGGTGTTGCAATATCCTGTAATGATGAACTCCCCATTAGGAACACAAGTCCGTT:1 + chrX 21060290 5' - 412 7531 2 60.40 ATAAAAGTAAATCATTTTGATTTTAGAGATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGAT:3 - chr3R 10914161 5' + F-element 121 1 71.29 GTGAAATGCCCAAAGTGTGTTGTGAACAAAGCACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCG:1 - chrX 1776685 5' + X-element 4437 1 68.32 TTCTTCAGTTAATGGAATATTACAAGAAAAGCAAATCCAATGAATCGCATTTCGGGAAACGAATATGGTTTTATCAGTATAAGATTGTTGTTGTTTTTTTT:1 + chr2R 19478907 5' - gypsy7 5017 1 69.31 TGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr3L 13895376 5' - hobo 2892 1 71.29 CAACACGAAATTAGAAACCTATTCCAGTGTTTGTGAGAACGACAATTGGAGCAATGCCTGCTGATTGATAGCAAACCAAAAAAAAAACATATAAAGGAA:1 - chr3R 20307077 5' - Circe 422 1 72.73 CAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr3R 7869126 5' + 297 6621 2 65.35 TATGTCTATTATTGGGCAATGACATATTTTCTACCATTGTTAATCTATTTATTTACATTCTGAAACAACATACTTCCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGG:1 + chrX 17530239 5' - Doc 4522 1 82.18 ATTGACACGATTGCCGAAATATGGGTCGCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAAT:1 - chr2L 13998819 5' - mdg3 5202 1 41.58 AAGAGGGAAGCAGAACTTGAGCGATTAAAAGGGGTTCGGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTGAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGA:1 + chrX 17522784 5' - 17.6 325 2 62.38 GTGTATGTACTTACTTGACCCTTGAGTCTTGGGTCTATCTTCTTTTCTTGCCGAGTTGAGATACTTTGCGCTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 + chr3R 10820550 5' - 412 449 2 78.22 CATAAACACACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr2L 7666166 5' - roo 9033 1 64.36 TGAATTGTCCGCCCTTCTGGCATTCGAATTGTGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTTTATCTTGAAGCTCTCGCTTCTG:1 - chrX 5163056 5' - Porto1 235 1 73.27 CACGAAAATGGCAGTGGCAGTGGCAGTGGCAAAAAAAAAAAGAACAAGGAAA:1 - chrX 12964713 5' + transib2 2642 1 53.85 CCTCCATTCACTTCCTGTTTTGCCTAATTACGCCCTGTGGAAAATTCATTAAATGCCCGACACCCCAATCCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATAAGCAGAA:1 - chr3L 20063781 5' - Tc1-2 164 1 80.20 CTGTCCACGCTGTAAGTCCAACTAGGCCTAACACCTTTATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGCTCTCTTTTTTATATCGCG:1 - chr2R 15877020 5' + Cr1a 4353 1 73.27 TTGAAGAAAGTAAGTCAGGCCCGAAATTTCAGCACTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTT:1 - chr2R 7351659 5' - gypsy4 446 1 65.35 TTAAACTTTTGTTTATTTCGTACACTAATAAAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATAT:1 - chr3R 7513967 5' - diver 179 2 74.26 TGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:2 - chrX 734957 5' + Tabor 53 2 75.25 GGACTAGTACGCTTTTCTTCGAGTGTTGACAGTACCATCAATTTCCAAGAAGACAATTAACTCATCTTACACTCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGAT:2 - chr2R 20312683 5' - 1360 3387 2 73.27 TTCGATTTCTTGTACGCACATTTTTTAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 8582623 5' - roo 9052 2 59.00 GAAATGTGCTTAGCAATTATTTTAAAAATGCAAACTACTCGAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAA:1 - chr3L 13895267 5' - hobo 338 1 59.41 GGTTTTACGTACCATACCTGTGCACGCCTAAATACAGAAACATATATACGTTAAAAACATCATACCTTGACATTTATTTTCCATATTTTACTATAATTTTT:1 + chrX 21233161 5' - transib2 254 1 61.39 AAGATCCAAGAAACTGCATGTATATTACTAAAAAATGTGGTCAACTTATTTACTTTAAGAATGAGGATCTTGTGAAAAATATTTGTATTTAATTAAATAAT:1 - chr3R 18862648 5' - transib1 1939 1 46.53 GCGGTTAGTTCAGTATTTAAACTGATGAACTATCTTTACCAATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTA:1 + chr2R 18296011 5' - S-element 1682 2 61.39 ACAAATGCGCACTAAATAAATATCCCAAGTCTTTTGGTCCGTGAGAGCTGAAATGAAAAGCAACAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chrX 2530592 5' + pogo 6 1 58.42 AAAAAAAATCGTTACATTTNACAACACAAAACCTCATCACTTTTAAAGAACATATTCTGTCAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3R 16601520 5' + roo 8677 2 81.19 TAGATCAGATAAAAGGATTGCATTTTATAGTATAAACGAAAGCAGTCGGTTTTAAAAGCAAAGAGTACTTAACTTTGGCAGCGAGAGCGCCGCTGTCTAAG:1 - chr2L 3568461 5' - Tabor 224 2 75.25 CACTGATGATTTATTCATCNCGAATCTCTAACCCACTGGCTTCCATAGAGCTTTAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAGG:1 - chrX 15546229 5' + blood 20 2 58.42 GTCGTCTCAGTTCTCGGAACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr3R 26252698 5' + 412 56 2 78.00 AAGATCAAAAAGTTGAAGGGGCAAATCTTTTGTGGGTATTAGAGGGGGCGTAGAATGTGTATGCTTATTCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGAT:1 - chr2L 7906056 5' - INE-1 151 1 73.27 TATATAAATGACAATTAAACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:2 - chrX 734982 5' + Tabor 28 2 51.49 GAATGGGAAATGGGATGGGATGCAAAAATATATGTACACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 30553635 5' + 412 16 2 63.37 GATTCGGACTCGAAGGAGATGTCCTCCGTCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTT:1 + chr2L 12301974 5' - I-element 390 1 71.00 CCCTGAGCGGATAATGAGTTTGGATGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 + chr3R 3847113 5' - P-element 2873 1 46.15 TCTCACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCG:1 - chr3R 10391237 5' - invader4 285 2 66.34 TTACGGTGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr3R 25021682 5' - roo 9035 1 63.37 ATTTGAATACTGCCGTACCAACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCT:1 + chr2L 14793472 5' + Stalker2 7261 2 64.36 AACGGGAGAGCGTCCTACAGTATGCAGACAAATAAGGCAAGTCTGCAGAGAGTTTCAACTCACCTCATTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1 - chr2R 12252919 5' - jockey 4986 1 47.52 TGCCATTAACAAATGGTCGGTAAAACGAAAACATTAAATTAAATTGTCAACAAGGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - chrX 7157345 5' + blood 7032 2 49.50 ACCAATGAGTGCGTGTGAGTGTGTGCTGGCTGTTTTTGTACATTTTTGGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAAACTGGTGTCCTGGGTGACAG:1 + chr2R 10551345 5' + Rt1b 4831 1 50.50 ATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:1 + chr2L 14793512 5' + Stalker2 7301 2 76.24 AAAACTTTGTTTAGATTGAAGACCTTTCTCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 - chr2L 3699459 5' + mdg3 5301 2 70.30 AAACTGTAGACTTTTCAAATTAGGCACACTTTAAGCTAGGTTATTGCGAATTATAGAATTATAAAGACATCTTTCACGAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAG:1 + chr2L 3699374 5' - mdg3 247 1 77.23 TAATATTATTTTTAATTTGAAAACAATAATTTTAATGGCAAAATGTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGG:1 - chrX 20903336 5' - I-element 68 1 54.08 TCTTAAATCAACTGATGGTGATTTCGTGATTGCTGTACTGGTAGCTAAAGAAATTGTCACAGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGT:1 - chr2L 14782922 5' - Doc3-element 431 1 74.75 ACACATTCGACATAATGAATATTGACTCAAATACCATTTAGTAATTATACAAGCATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAA:1 - chr2L 6569267 5' - 297 6965 2 70.30 AATTGTAACTAATTATGTTTTTTATGTTGGACATACCCTTATCTTGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAAC:1 - chr3L 6033623 5' - 412 489 2 71.29 AAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGA:1 - chrX 18326221 5' + Doc 235 1 72.28 ATGAAAAACCAGAAATCGTATGTGGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 - 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chr2R 10353327 5' + blood 17 2 57.89 CACTCCCGCCATTGTTTGCAGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCT:1 - chr2R 13383556 5' + gypsy5 54 2 78.22 AATTGCGATTTCATTACGATTTTATACTTAAACTAAGCTTGCCGTTCTTGCACGAGCTGTCGCTGCAGAACCTCCAACATATTGGTAGTCTGAAATCTGAC:1 - chr2R 9603379 5' + gypsy4 6373 1 70.30 ATAAATCGAGGAGAACCACTCCGCTTCCACAGTGAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 14690331 5' - hopper 146 105 76.12 TTATTTTTTTTTTAACTCCAAAAGAAACAAAAAAAAAAGAAAAA:1 - chrX 9032256 5' + Doc2-element 227 2 68.18 AATATCGATAGCATCGCAATAAAATCTATATCGTGCCACCTCCAATTCACACAGGTCGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAA:1 - chr2R 9693387 5' + P-element 19 1 58.42 ATGTAATTTAAATAAAATATATTCGTAGAAGAGAAAGATACTCTAGTGTAGCCCCAACTACTTACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 + chr3R 31371320 5' + Doc 15 1 72.28 CAGGCCATTTGAAACAAGANAAGGTTTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATG:1 + chr3R 7513932 5' + diver 5940 2 74.26 TATGTAGTGCACTTCTCAGGGGAGTTTTAGGCCGCTCAGATGCTTAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1 + chr2R 10372110 5' + mdg3 5282 2 53.47 ATTTTAAATATATATTTATATGTGTATGTAGCATAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 + chr2R 19397070 5' - 1360 3348 1 69.31 AATCGCTTGAAAGTTTTCTGTGAGTTTTTTCCTCTTTTAATATAAATTTTCTTGTTTTTTGCTCTTTGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATTACCGTGT:1 - chr2R 9701124 5' + Q-element 186 2 73.27 GGCGGGGGCTTTGCGCCCTGGGGCTTCCACCTGGTCAACAATCTGCTCCACTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCG:1 + chr2L 951741 5' - R1A1-element 445 1 55.45 TAGCACTGTCCAGAGCAGCCGGGTTCCGTTGTGCTGGTTAACCGAAGCTCATAAAATAGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGT:1 - chr3R 29844674 5' - roo 427 1 61.39 CTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACAACTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCC:1 + chr3L 16282378 5' + gypsy5 6987 2 67.33 GGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chrY 311345 5' + 1360 10 2 53.47 ATTATATCTTGTATGTCTTCAAGCTATTATTATTTTGTTTTATGAAAGTATCTTTTGCTTTTTATATTTATACTCTGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAA:1 + chr2L 7529727 5' - roo 463 2 53.47 TACCCTGGTCGACGAAAGGCAATCATCTGCATGACAATATATGTATATGTATATAAATATTTATAATAATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAA:1 - chr2L 20118473 5' + copia 4878 2 70.30 ATATATAGCCCAACTTAACTTTAATAAATAAAGTTGGGAGGGCTTGAGCTTTTCCGTAGAAACGTACGAGAAATACGCGTTGTTTTTAATTGAAGAGAGCC:1 - chr3R 3187392 5' - Doc4-element 47 1 67.33 AAAAGATATGGGCTTACGTAACCCAATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAA:1 + chr2L 21735025 5' + 17.6 45 1 76.24 GATGTAGAATTCAATAATTACGCAGTAAGTAGCGCCACCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 + chr3R 8979990 5' - transib2 2787 1 60.40 AAAGTGTGTCGATCGTAAATGATAGTGAAAGATTACAATTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr2L 21086117 5' + roo 8675 2 68.32 TGAGATCGATAGGAAGGTGGAAAAGCAGGAACTGCAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGT:1 + chr3R 9741547 5' + invader3 228 2 65.35 AATGAAAATGTATTCATGTTATATACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATC:1 + chr2L 13422267 5' + F-element 4369 1 76.24 CTTGCAATTAGCCTTTATGCACACCCCACCACTCCTTCTCCCCTTTTTTTTACCCCTTTCCTGCCTCTCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCAC:1 - chrX 14981295 5' - S-element 1258 1 77.23 CTCTCTGAATTTGGAATCTGGATTTTCAAGGACCTTTTACCAACCCTAGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr3L 18418930 5' + hobo 7 1 72.28 CGAGAGGAGTCCAGGCACAGGACACGTAGTCGGTTGTGCTGGCCCAGGACAATTTGCGTAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTT:1 - chr3R 19498230 5' + micropia 36 2 66.34 TTGGGTTTGGTCAGTTGATTGTGGGTTGCTGCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTT:1 + chr2L 16139126 5' - copia 220 1 66.67 GCCACACACGTTTTCTCGCTACGCCGCCTGCCGGACGAATGACGAATTGCCCGAAGATCGGGGATTCGAAACACTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr2L 3632113 5' + P-element 1 2 79.21 TATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGT:1 - chr3R 1977618 5' - micropia 422 2 56.44 CGTTCCGGTTACTAATGTAATGGAAATAATTCTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGA:1 - chrX 6933239 5' - hobo 359 1 74.26 CCGCGGGCCACGTAATTTAATTACCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 - chr2R 6847308 5' - mdg1 369 2 76.24 AGAGGCATTCATTCTAATGAACAAGGTGGATAAGCGACTGGAACGAATTGACAACGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1 - chr3R 21884252 5' - 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jockey 4913 1 76.24 ATAAGTGGGTTAAAGAGAAAGCCTAGGACAGGGGCATGTGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCG:1 + chr2L 15567104 5' + 17.6 35 2 62.38 TTGCGAAATCTCGGCCAAAGATGCCGTTCAGGGGAAATATTGAAGAATTGGGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr2R 13763154 5' - roo 409 1 69.31 ACTGCAAAATGTGTTAATTCGTTGTACATAGCAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGT:1 + chrX 10451479 5' + hobo 44 1 80.00 TCCACTTTAAACTAGAGATACAAATTTCTTCAATCTGTTTATACATTTTCAACTAATTCTACTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTC:1 + chr3L 5478984 5' + 3S18 5782 2 63.37 CATTTCATTGTCATAATGAACGAGATATATATGGTTTTTAACACAGATAAATATGTGTTAGTGCCTTTTCGCTATTATATGATGGTTGGGCTTGGGCTTGA:1 - chr3R 6041333 5' - Porto1 73 1 79.21 GAGGCAGCGACAATAAATTTTAAACGTCCTATTGTCGGGAAAATTTACGAAAAATAAGTGGGATAAAAAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATA:1 - chr3R 19819996 5' - HB 57 1 51.52 ACAATTTAAAATGAATCGAATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCC:1 - chr3R 15790146 5' + flea 4704 1 40.82 GTTGTTGCATTTTTTAATTAATTTAAATAACCCTCCTGGAGTCCCGACTTCGATGCCGCTGCTGCTGCTTTTCCGGGTGCAGCTGATAAGGGTTGCATCCC:2 + chrX 17068650 5' - 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roo 9034 1 63.37 GACGTAGTCAACAAAAACCCAGCAGGCTGGGAGCGAGATGACGAAGGCCTTGAGCCAAAATGTAGCAATTTGTTGTGCTTACTTCCACAAATACG:1 - chrX 18948644 5' - G3 215 1 78.95 TTTCCAAATCTGTATTCGGTTAATTTTAATAACTTGTCCAGTTAAATTTAAAACCAGAGAGAATGATATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATGCCCCTTA:1 - chr2L 18102068 5' - INE-1 552 1 46.53 TATAGAATTATAAAGACATCTTTCACGAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTT:1 + chr2L 3699425 5' - mdg3 196 2 73.27 ATTTGATGGCGCAAAACATTAATTGAAGTCAACCACGTCCTGCCTGGCTGCCTTCATATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAG:1 - chrX 9342403 5' - Burdock 239 2 63.37 CAAGCGGAAGCGCCTAAAAGCGGGCAACACTTTTTTAACTGCTTATTAAACGCTCACGGCAGAACGCTGACATTGCGCTTCACACGCTCCGGGCAGTAGAA:1 + chr3R 26612945 5' - gypsy4 6684 2 53.47 ATTTCTTGTTGCATGTGCGNGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 10625689 5' - roo 359 2 71.29 TGGGCCGGTTCGATTTCATTTGGTCAGGACGGGGGGGAAATCCAGAATAACAAGCGGCGGCGATTCGAGTCGAGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr3R 10488645 5' + roo 1 2 78.00 AAACAATGTTGAATAGCCAAAAGCCGGAATGTTCTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chrX 9774996 5' + 412 7095 2 65.35 AGAAAAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 15037926 5' + roo 8707 2 71.29 GATGAGTCTGATTATTCAATAAGTGAAGAATCCGTACATCATAATATTGTATCTTAACATCACAGCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3R 4575416 5' + 1360 1 2 74.71 AGAATGGTATGAGAGAAATCTACACTAGTTATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:2 - chr3R 15579027 5' + pogo 42 1 68.32 GCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 13093792 5' - roo 9020 2 78.22 TCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 + chr2L 20560347 5' + F-element 53 1 67.35 ATTTGCATTTGACACTGGCTAAAAGCAAGAAATCATTTCCGTTAGGTAAAAGTGAGCCGGCCACAATGCAAACACATAAATAATGAAAAAAAAAAACAAAA:1 + chrX 13144864 5' + Rt1a 5076 3 69.31 TGTATGTACATAATATGTGTTTGCTGTGCACAGACGAGTACTTGTAAATTTTAAATCTCTTTATTGATTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCG:1 - chr3L 20317899 5' + 3S18 9 2 68.32 ACACAGAAAAACCTTCATTAAGTGCGTCATAAGTTGGAAAGATGGACAATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTAGCTCAAT:1 - chr3L 18271609 5' - R1A1-element 4974 1 53.47 TTTTGTTTTATTTGGTTATTATTTGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chrX 4277513 5' + roo 8714 2 77.23 TATTTTATACATTTTTCAGAATTCATTTTTAACGAAAAACCCTTAAGAAGGCACTGGCATCTGTTGAATCTCGTAGCTTTACATTTTCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 8618764 5' - Doc2-element 251 2 91.00 GAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr3R 19449496 5' + hobo 35 1 70.65 GTCGATCGTTTCGTTGGCACCGGAGGCGGTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGG:1 + chrX 16099788 5' - micropia 5215 1 71.29 AGTAGTCTAGCAGCCGGCTTCTAAAAAGTACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2L 2833873 5' - roo 405 1 55.93 GCGGATGAGTCATGTAAACAAATCCAGCGTCAGTTCCCGATGGTCAGGTGTGAGAACTGCTTCAAATTTATGTGTGTTTTTGCGTGTTGTGCTAGAAGACG:1 - chr3R 28534243 5' - 1360 3205 1 79.21 GGTTAATACGATATCCTTTAGCTGCAACCTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTG:1 - chr2R 24114821 5' + Tirant 498 1 71.29 CATGTTGTGGCCATTCTGGCAGTCAGACGTGTGGATCGCAAGTCCGGAAAACCAAGAGCCGTAGCCCCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chr3L 914052 5' + hopper 7 2 72.28 CCTCCTCTTTGTTGTTTCCTGGCATAAAAAGGGCCAAAAAACATTTAAGCACACAAAAAGACTCGCAGCTGCCACGCAAATATTCTGTGTTTGCCGGCTGC:1 + chr3R 18511004 5' - Gypsy6A_LTR 93 1 58.42 ATTTGATTGGTCCTTACAGCTACTGTGTAATTCCATTGCTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 + chr3R 4971380 5' + F-element 21 1 67.33 CTGTCTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 6266288 5' - roo 9047 1 54.46 GCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - chr2L 12808227 5' + Tirant 37 2 59.41 GGCTATACTCTAATTTCTTCCAATTATGGCATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr2L 5926397 5' - pogo 2058 1 68.32 AATCCTTAACTTCCTATCGCAGAAAATGTACATTTTAACCATTAACAATGGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAA:1 - chr3R 19508250 5' + mdg3 5101 1 53.47 GCTACTACTGCTGGCTGCAGCGCTTGGTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTACAGC:1 + chr3R 19316527 5' - hopper2 1514 1 73.27 CATAACAGAAGAAACTGAACTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:2 + chr3L 21970823 5' - pogo 2048 1 80.20 CCAGCCGTTTATTCTTACCNCTTTAAGATGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAA:1 + chr3L 13262889 5' - Doc2-element 432 1 72.28 ACATCTCTTCAAAATTCTCTTATTCCAGATTTTTATATAATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chr3L 15788490 5' - opus 7466 2 66.00 TTACATTTTTAGAAGAACTGCGACAAGGTAGTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chrX 17494635 5' + 1360 46 1 72.28 AAAGGACTGCAGTGTGTGTGGAAAGTCAGCAAGTGAAAGACAAAAAAAATATATATGTAGAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTC:1 - chr3L 9105984 5' - R1A1-element 5173 1 64.36 ATTGAATTTCCATTTCAGTGGCCATTTTCCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTG:2 + chr3R 9088574 5' - hopper2 1563 1 67.33 TTGATATTCAGACTTTGTATTTAATAATACAAAGTTTAAACATAACTTTAAGATTGAAACACGATGGAAAATCTGAACTAAATTTTAATTTAATTTATAAA:1 + chr2L 7047876 5' - 1360 3044 1 42.57 TGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCA:1 + chr2L 23372625 5' - 1360 3353 1 64.36 TAATGGTTTCTTCTTTTTANTTCACTTTTCATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCT:1 - chr3R 19450714 5' - Burdock 6348 2 70.30 AGGCCACGAACTTACATCAAGGGCTTACATCATTTGTTAAATTGTTTGAAATTAAATACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAAT:1 + chr2L 21670087 5' + HB 1564 1 69.31 AAGGAAAGAAATTGGCGCTCGTGAAATGTTAACGGGGCCAGGAGGGCGCTGAGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTC:1 - chr3R 7305454 5' + flea 4834 1 58.42 TGTTGTTTTGCGCTCTGCTTCTCGTGTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGG:1 + chr3L 5365416 5' - Idefix 7053 2 74.26 ATATAAACTAAGCATTATTAACATTTTCGAAAAACATATACATGCATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACAGTTG:1 - chr2R 9699883 5' - Transpac 5206 2 53.54 GACAAGTTCTTAGCGCAGANTTTTCGCCCCAGCAAAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGG:1 + chr3L 9910358 5' - 297 359 2 66.34 AAATGTGCAAGCAAATACCAACACGGGTAATATGCAAACAAAGGTATATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGCCTATTAAAT:1 - chr2L 15567178 5' - 17.6 467 2 56.44 TATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 - chr2R 13653394 5' + F-element 62 1 71.29 GCTGTAGCCGTAGGGACACACAAGTCCTTTCGATTGAGCGCGGGTAAATATGTTGTTTTAATTAGGCTGGGTCTATGTTGCAGGCGCTGGATGCGCGCCAC:1 + chr2R 8386134 5' - HeT-A 5646 1 58.42 CTTTTAATCGCTGCCTAGTACTTTGCTATTGTAAGCTCCAATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr3R 18549907 5' - pogo 2069 1 60.40 CAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAA:1 - chr2L 21403551 5' + G5 4401 1 53.06 CAGGGCATTGGCTGGCCGAGGGTCATTTGTTAATTCCCAATGTTGATTAATTTTGTAAGATGCTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACT:1 + chrX 16460746 5' - hopper2 1301 1 66.34 GCTCCGCTCTACCTAGCTAGTATTGGAAAAGCCTCTAAAATTTCCATTTTCTCATCTTCCTCCAGTCCAGACATATAAGATACCCGTTACTCGGCTAGTGT:1 - chr2L 12085136 5' - INE-1 540 1 69.31 TGGCTTTGGCAATTTATTAATTAACTATTAATGGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chrX 21060363 5' + 412 7095 2 66.67 ATCCAATCACCATGGAACATATTGCGGAATAACGCACCATAAATTTCAAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 + chr2L 16153330 5' + Doc 10 1 74.26 AATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTG:1 + chrX 22726195 5' - Helena 1273 1 47.52 CAGAATTCTAATGTCCTTTGCTCACTGTACCTGCGTAACATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATAT:1 + chr2L 7937249 5' + jockey 4557 1 61.00 AATCCCAGACTCGAGTTTTCCCGCTCGCCCCCTCCGGGATGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCTAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAG:1 + chrX 4965464 5' + Cr1a 3992 1 65.35 GCCCAACCATAAAACGACCGAAAACCACCGAAAAAATTGTCTCACGCAAAACGGTTGTACAAGATCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAATGGCGA:1 - chr3L 3581338 5' + Bica 445 1 55.45 GCTAATGAATCATTTTTGCCAACCCACTGACCGCAGTCGGTAAAGGTAGCGTTAGTTGGCCCATACAATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 + chr3L 13785343 5' + pogo 5 1 72.28 ACTGCGTCTGTGGCTTTGTCTGTCTGCCTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCA:1 - chrX 755121 5' - Doc 4529 1 72.28 AACAGCAACAACAGCAAAGTGCAACATGCGTCCGGGCCGAAAGTCGTTAAATAAAACGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTC:1 - chr3L 6472498 5' + blood 7359 2 57.43 GCTGCCATTAGACAATAACCCAATTTCAACCAATAATAGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 8582549 5' + roo 8702 2 65.35 AGAAAATCAAAATGGCTATGGCAGCATCTAATTATCATTATTTATTATTTTGTTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTACTTCACTAAAATCAAGTGAT:1 - chr2R 22865081 5' - Doc3-element 47 1 48.51 TAGATAATTCCATTTCAATCCTCTCTTCAGACCAGATGCGCTCAGAGCTTTTACGAAATGGAGTAGGAGGCAGTCAGTGAGACAGCAAGATCGCACGTGGA:1 - chr2R 4704637 5' + gypsy8 385 1 61.39 AAATAGGGTTTTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:2 - chr3R 11916615 5' - roo 9036 1 59.41 ACAATTTCCATTTGGCGTTCGCTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2L 17994163 5' - roo 354 2 76.24 ATACCTGTCGGTGCGCCGAGATTCAAACAAAGGCACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCT:1 - chr3R 5320762 5' + Tirant 8206 2 73.27 CGAATCGAGGGTTTCTCTCAAAATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCG:1 - chr3R 10741148 5' + 1360 3359 1 42.57 ATCAAAACCGCGACAGATCTACAGAGGCTGAAGCTGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTTTTGGATTC:1 - chr2R 16185847 5' - 17.6 259 2 65.35 AATACAGGTGGTGCAGGTGGGTTATATATATATGTGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGG:1 + chr3R 7599227 5' - Doc 330 1 58.33 ACAACGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTATATTATTTTATTGTTTATTTACTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAA:1 - chr3R 19449958 5' + hopper 366 1 64.36 ATTTAACAGGATGCTCAACTGCAGTGTGAAAAACATAGCATAATATTACATCGCTTTTGAAATCATACAACAAGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAG:1 - chr2L 6362949 5' - 412 7545 2 76.24 TAACGTATTTTTATTATTCAATATATTTTGTAGCATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTT:2 - chr2R 10372184 5' - mdg3 208 2 63.37 TTAACACTTCAAACTTAACTTAGATACAGCTTGATCAGTACAAAAAAAATCGTTAAGTTTTATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3R 25580996 5' + pogo 13 1 45.54 AAAATCGTGGCGTTGGCGGCCTACAATGACTACACCATGCGACACGATCTGGCCATGATGAAACTGAAATCCCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3L 7542034 5' + roo 4 2 76.24 AATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCT:1 + chr3L 3540157 5' - mdg3 191 2 76.24 GGCAATGCCCGTGACAGAGTTCCTGGCACGAGCGATACGTCCTGCGATACAATCTCAATTTCGGGTGCAGCCACGTGGTATGTGCTCGCAACAGCTGACTT:1 - chr2L 18775682 5' + hopper 1253 2 73.27 AACCATTAATAAACATTTTAGTGCAAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGG:1 - chr3L 14556156 5' - accord 6985 2 72.83 AAATATCTTTATATGGCCCTGAAATGCTGTCATATCCAAGCCATATTCCAGTTGCACTTCCCTGCAGGGGGAGTGATCGAAAATAAACAAACAAAAATGTG:1 - chr3L 15763763 5' + Fw3 3058 1 76.24 TTTGCGCCTCATTGGCTTTCAGCTATTTGTATACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 - chr2R 11160579 5' + jockey 4721 1 72.28 ATGAGGTGAAATTAACGTANAAATCGATAATTTAATTTATCATAAAAAAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCG:1 + chr2L 16851710 5' - HMS-Beagle 7018 2 54.46 GACCGAAAAGCATGTGCTTGTACAAAACCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTT:1 + chr3R 28562778 5' - 412 7093 2 73.27 GACACACTTTTCGACATATTTAAGTAGGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 + chr3R 24767810 5' - P-element 2840 1 30.69 CTTTTCTCGGGCGGGAAGAGAAGATGCACGCGAAAATAAACGGGAGAGAAGCAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chr2L 16683708 5' - P-element 2862 1 56.44 GGCAGGATGGCAGATCCTGACGAGAATGCGGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr2L 13566468 5' + hobo 24 1 55.45 GCTCGTGCGAAAATCTGACTGGCAACGACATCTGAGCCTCGGCTATCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTT:1 + chr2R 13077852 5' - jockey 4744 1 55.45 GTGACACCTCGGCCTGTCGGCCGGCATTAGCGGGCTGTCACAATGTTGTTGTTGGCACATCCGGTCTTGGATGGCACTTCGGCGGGTCGTTGCACCCCTCT:1 - chrX 1296035 5' - gypsy10 5661 2 58.42 AACAACTATTTTTGATTGTGCGATTTAGGGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 - chr3L 5710300 5' + Transpac 4963 2 68.32 AAATCCCTATATACATAAATCTATCGCTCCATCAAAATGTTTTATTGTAGTTAATTAGCATTCCTATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chr3R 13913007 5' - mdg1 7425 2 56.44 CCACCCACGGTGGCCGCCCATCTGCGGCACCCATCCACACCCACTGAACCACCCACTTGTTCGGTGGGAAGCATGATGAAATAACATACGGTGGTCCCGTC:1 - chr3R 29406281 5' + P-element 9 2 60.40 AACTGTACACTTCAGGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:2 - chr3R 5506842 5' + pogo 38 1 65.35 ATTAATAAATGTTGAATTCCTTCAATGCGAAATAAAGAATTTAGTATACGTAAAATCAGGAGTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGAC:1 - chr2R 5223855 5' - X-element 429 1 65.35 CTTTCGTTCGATTTGGCGACTTTGATTTCAGTCGCCAATCGTCAATCGCTGCGCCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr2L 8709388 5' - P-element 2866 1 58.42 TTTCATAATAATAAACACCCATAAAGAACCACATTCTGGGTAAATATCATTATCATTATTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chr3L 13987283 5' + pogo 10 1 62.63 ATATCGATCTTTAAATGTGAAAAAGCCAACCATAAGCTAACAGGATAAATATTAAATCTCAATTCATTACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTC:1 - chrX 15940769 5' + I-element 5014 1 56.44 TTTTCAGGCAACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3L 2022235 5' - roo 9041 1 55.45 TGAGAGTCCAAGTATAGTTGCGTTGCACCTGATGCACAGATGAGTGTCCTCGAGATGGTCTTCTTGTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAA:1 + chr2L 21775372 5' - Transpac 4989 2 62.38 TCGGACAGGAAAAAAATGGGGGGTGGGGCAGGACACGAGATATAGAGCTAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chrX 7996372 5' + hobo 25 1 48.51 CTATAAAACACTTAGATATACTTCGGATTAGATTTACTGCCCATGTGCACACACACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 - chr2R 9209513 5' + Tirant 17 2 64.36 CTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr3R 4971418 5' + F-element 59 1 74.26 CTATTATCTTTTTTTTTACNGCCATTAGCCCTACGCAAATGCCACTAGCGATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr2R 18432054 5' + 412 24 2 54.46 TCACTAGTTGGCGTTGGCGNTTCGTGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGA:1 - chr2L 20750494 5' - F-element 133 1 75.25 ATGTTGGGTAAATAGATTTTTTCATATAAATAATCCAGTTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTC:1 + chr3L 20758940 5' - flea 4981 2 61.39 CTATAGATTTAGAATATAGGGTTCCAAATTTTTTGATTTTAATATTTAAAAATATATTTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr3L 20584098 5' + pogo 15 1 59.41 CGGCGATTGCTTGTCGGTTGCAGTTGTTTTTTGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAAT:1 + chr3L 1861362 5' - Doc 4343 1 69.31 ATTTGGCCTTGGCTTCAAGTATTGCCACGCCTCCGCTTGCTTCTAGTTCTTCGTCCAGCTGTGTGTCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chrX 22593243 5' + 1360 9 2 69.31 AAAGACGTGAATAAAAATTTATGCGCACAAAAGTATGCCACACAACATGCACATAAAATGATTATTATACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAA:1 - chr3R 20332949 5' - jockey 4984 1 67.33 GTCCGACTGCAGCAGATTGTGTTTTAATGTTATCTTGATCAAATTCTCATCAAGTTGTAAACCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3L 20354091 5' + 412 16 2 64.36 CTCCTTTTTTAATTCAACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 12958902 5' - roo 9051 2 58.00 AGAATTGCAAGAATTTTGCNATTAAGTATCGAATACCTAATAATTATGNTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTANTAAATAAATAAAT:1 + chr2L 20118383 5' - copia 230 1 56.99 AGACACGGACACGCACAAAAATGGCACAAAAAAAAAAAGGGGAAAAAACCCCGAGGAAAACAGTTAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAGGGG:1 + chr3R 18942385 5' - hopper 139 2 65.22 ACAAAATTGTTTGAAAACCAAGACTTATCATTGCGCAATCTACAGGTAAATACAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGA:1 - chr3L 16546866 5' + pogo 21 1 53.47 TTTCGCATTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTT:2 - chr3R 11052145 5' - blood 7333 1 84.16 GTTTCTGTTTCTGTTTCTGTTTTTGGATGGATACAAATTGCAATTTGATTGCTTCAAGCTGTTCGAGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATT:1 - chrX 2989699 5' + 17.6 7305 2 69.31 ATCCACTTAGCACACCGAATGCATCTGCATCAGCACAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr3R 19216405 5' - 1360 3350 1 65.35 CACCTTCTTCAGCACTTTCTCTTGTAATGCGATTTCGGGTTTTGTTGACTGCCGGCCGCTGCAACTGATTGAACCCCGGAGACAATAGTTTTTGGAACGCC:1 - chr3R 23618389 5' - jockey2 350 1 69.31 AGCATCACCACTGAAATGCCATCATTCAAGGGAGCCACAAAAAAAAATTATAAAAGTAAATCATTTTGATTTTAGAGATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAA:1 - chr3R 10914211 5' + F-element 73 1 75.25 AAATGTTATCAAACTCTTATCCAGCGAATTTTTGGGGACAATGTAAGCGAATGGGAAAGGGAAAAGTGCTTGTCTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGA:1 - chr3L 13190195 5' + roo 8662 1 77.23 TAATCCCCTTTTGAATATGGACTTTAGTAATCAGCGACAGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATATTACAAGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr2L 9045502 5' + jockey 11 1 72.28 CAGCAACATGCAATGCAATTCCCAAGTTTGAATTGTGTGTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATG:1 - chr2R 19559698 5' + Tirant 416 1 61.39 GACAACAATAATCAAATCCTGGAACATTATTATATGGTCGACTTGGGGAACCAGATGGTGCAATTAAAAAAGCCTGGACAACAATTTCACTAAACGAAATT:1 - chr2R 9442581 5' + Tc3 1348 1 56.44 TTATCGAATGCAAAACTATTTAGCCATTGCTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 - chr3L 12438056 5' + I-element 49 1 74.26 AAGGATTAGCAATGAATATCGAAATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 - chr2L 9260381 5' - 297 347 2 77.23 ACATCACTAATGACGACAGGAAGTCAACAGGCAGTGAGAACGCGCTGTCAAGTCGGAAATAACAAAGAGCGGAAGCGTCGGGCGGCAAGAAGCCCGAAGGA:1 - chr3R 22092454 5' + gypsy8 486 1 62.38 ACATATACACTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:2 + chr3R 12944684 5' - roo 9031 1 71.29 ATTTTGAATCCGGAATTTGAGGAAAGCGACTCAGGCTGCTGCTTTCAAAACTACTAGATATTCCATAGAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chrX 17883725 5' + pogo 4 1 77.23 TCAAAGTTTAAATTTAAATAAAAGTTTTACAATGATTACCAAATTATTTATCTATTAAAAGAAAGATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 - chr3R 20421013 5' - blood 7379 2 62.38 ACTCGAAAAAATCATATTAAATGATTCACACCGAAAATGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:2 - chr3R 17971712 5' + 412 37 2 61.39 TATAAAAAATGAAATATAACAGTTTTTGAGGGACATTAATTCTGATTATAAAACTAATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCAT:1 - chr3L 15088967 5' - Stalker2 241 6 58.42 TGAGGGACAACGAAAAAAGTGAGAAAAGATAAAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:2 + chr2L 13093745 5' - roo 404 1 74.26 AATTTTAAACTTACATAGCACTGTATGTGCATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAG:1 - chrX 842781 5' + Doc 4549 1 70.30 GGTGTAAAAATGGGTCAGATTGTGCTTGAAAAATCTTTATTTATAAATAAAAAACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chrX 7797642 5' + roo 8685 2 52.48 AATGCGCACTAAATAAATATCCCAAGTCTTTTGGTCCGTGAGAGCTGAAATGAAAAGCAACAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chrX 2530589 5' + pogo 9 1 55.45 TTTATATAGCAAGAATAAGTTGAAAGTAACCAAAAATCGCTAGTTACAATTAACAATTCGGTAAGGAAAGGTAAATTTATTAAAAGTAGTCTACTGG:1 - chr2L 21272322 5' - Cr1a 3978 1 54.64 TCCTAGCCACTTTTCGCGGACTTTTTCAACGACAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 + chr2R 12457929 5' + HMS-Beagle 6835 2 66.34 ACTTCAACTTTTTCTTCTGACATTTTCTGACTTTCTGTGGAAACTGAAGAAGACTTGCCATTCGATTCGGCCTGAGTTTTTTTTTTCTTTTCCTTTTTGTT:1 + chr3L 12777232 5' - Doc2-element 254 1 76.24 CTGAATATAATGGAAATGAAGATGAAGAAACGGAGTCCACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAAT:1 + chrX 10039076 5' + invader2 413 1 62.38 AGCTAAGTAGACGGCCAACGACAGAGCCATGACCCAAATGTGCAGCAAAAATAGACGCTCGTACTTTTAAATACCAAAGAAATAAAAAAAAAAATAGAAAA:1 + chr2R 17909972 5' + F-element 4687 3 78.22 TGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3L 19349936 5' + 1360 8 2 64.77 ATTCTTAGTTACTTAAGTTTCTAAACAATATTTTAATATTATAATTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chr3L 10621718 5' + 412 7087 2 62.38 AACTGTACAACATAGGCATCACGTGAATTTACATTGCTAAAACTCAACTTATTACACATGTACATGCAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 + chr2R 1521636 5' - opus 493 2 74.26 ACCCTGACTTGTTGTTATTCTCGATCAACAATTATCTTAAACTTGGTTGGTCTTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGCT:1 + chr3L 9068042 5' + 1360 3277 1 57.43 ACAAATAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3R 19987403 5' + Doc 36 1 56.44 TAGAGCTAAAGTAAAAATATGGAAATTAAAATCCTAAAAATATGGACGAGGGGAAATATTAGGAAATATATTTTTTAAATATTTTAAAATTCTATACACA:1 - chr2L 2538520 5' - springer 482 1 43.00 TCCCAACTTTCGGTGGACTGTTGTCCCGCCAGTCCGCCTGTCAGCCGGTAATCGTCCTGGCGATTTTGGTTTGGGCAGCCTGAATGCGACAAATTTGGCTA:1 + chr2L 14425833 5' - BS3 1342 1 59.41 TTTGCCAAAAAAATTGGGTTGGAGGATCCCACTCACATGTTTTTATGAGCTCTTTTAGATGCCTAAAACAAAATCTTAGGCTTGTAGCTATATTGGAAGT:1 - chr2L 22983957 5' + Transib5 2942 1 55.00 AAAATTGATTGATGATTGATGGCAATACAAAAAGGGCGACGTATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGT:1 + chr3L 13777095 5' - pogo 1884 1 62.38 TCCCCATCCAAGGTGATAGTTTTTGCTTTCAAAGTAGGGAATGGAGTCCAAAAAAACTACTTAGCTCATATATTCATATTGTTGGAATATACTATTCAACC:1 + chrX 22734012 5' + copia 4870 2 60.40 AAGCTATGGGGCTTTCTATTGGCAGCTTGCTAATATGCGTGTTCTTAGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 - chr3R 20905472 5' - pogo 2074 1 52.48 GCATGGCCATTTGTTACGTATACTTGTGCGCAGGACTGTCGTACTCTCTGCACTGTAAACTTTTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACC:1 + chr2R 12252846 5' + jockey 4774 1 43.56 AATTCGCTTGTGGCTGTACCGCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTA:1 - chr2L 1174945 5' + R1A1-element 5102 1 79.21 TCAGTGGATCAATTCAATGNTCATTGGTTTTGGAAGGCGTCCAGGACCTTGGTGAGCGCACCTTGCTCCGATCCGGCCATTTCCCATTACGGCCTTCTC:1 - chr3R 20927506 5' - accord2 254 1 66.67 GATAGGATAGTCATCGCTCGTAAAACACACAGCAAGCCAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAACAAAAA:1 - chrX 6465227 5' + gypsy7 5012 2 74.68 GCAAATCTCTTTAAGATGANACTTTGCAACATTTACAAATGTTTTAGTGCCCCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1 - chr3R 12876386 5' - hopper 1394 1 56.44 TTACACTTTGACGCATTTAAAACAAAGAGAGCGGGCGATACAACAACAACAACAAGAACAACAATACCTCTAA:1 + chr3R 23302636 5' + I-element 137 1 80.82 TAGAAATGAGAGGCTCCGCCCGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCACATATTAATGTAGATGTACACACAGATGTATATGTATATA:1 - chr2R 8310861 5' + Stalker2 251 2 70.11 GAATATGAACTTTAGTAATNAGCGACAGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATATTACAAGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr2L 9045490 5' + jockey 23 1 61.39 TGAAGTTATAACGACGAGGGAAAAGTGTTTTAAATTTTATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCA:1 + chr3L 17181675 5' + jockey 4861 1 69.31 ATGAAGCTTTGACAAGGGCACCTTAACTATACACGTCGCCGAACGATTTGATAAGACTAAGAATGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3L 14222438 5' - roo 402 1 71.13 CTCGGCCCTAAAGTGCTTATTGACTAGTTTATTGTAGCGCTTGTTAACACCAATTGTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGC:1 + chr2L 7888691 5' - Bica 463 1 60.40 TCCATTGTCGCTGCTACAATCGTCGTAGTTATCGCTATTCTCACTCGAATTGTCATCCTCAACGTCCCGAAGTCCACACCGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr3R 24561112 5' + 1360 11 1 68.32 CCGCCAATAAATATTATCTACATTGTTTCTACAAGGTGCGCACAAGTTCCAATTTTGGCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGT:1 - chr3R 8980070 5' + transib2 16 1 61.39 CACCATAATTTTGATGAAAGAACGGTGAATGTTTAAAGACAAATTTAATTAATTTGAACTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 + chr3R 4474158 5' + copia 19 2 60.40 TATAGAGTACTTAGATGCACTCGAAAAAATCATATTAAATGATTCACACCGAAAATGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - 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F-element 4259 1 64.36 TCTGTAAATTGGCATAAATAAAGCCGGCAGTCTTAACTAAATCAACGCACACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCT:1 - chr2L 18090926 5' + Doc 312 1 56.44 ATTACATTGTCCACTTTTTAGTGAGTGGTGAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 + chrX 8316327 5' - hobo 2894 1 73.27 CGGAAAATAGATAACGAATGGTGGGAACGCATTTACTTCTATTTATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 3209172 5' + roo 31 2 60.40 ATGAAGTTGCCAGTTTTCCAGTTGCCGCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTCTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAA:1 - chr3R 12882768 5' - copia 239 1 70.30 CACCAACTTTGGCCATAAAAACCCGAAAATAGCCATAATAATGATAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 - chr3R 12767350 5' - blood 352 2 53.00 TTTCGCATTTCCTTTTTTACACTGTGTGCAATAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATA:1 + chrX 1134020 5' + P-element 2710 1 39.60 GAGACGTAAGTTCCTCCAGTTATCACATCGGCGATTGTTCACTCACTTTTATGCCTGAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCT:1 - chr3L 7001736 5' + mdg3 5314 2 61.39 GACAGCTTAGATTGAAGTANGATGACTGAGTGAATGGAAAACGCTGACTGGAGATTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3R 11917921 5' - roo 8987 2 58.42 TGTTTTGGTAGAGGGTAGCTTCACAGGCCTAACACATTTGCCAAAGTAGACCGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 7541930 5' - roo 9047 1 54.46 GGGCAGGCACAAAGCAGCATCGTCGCAATCAACATGGGTCAACAAACTTGCGCTTGGTCTTTGTCTCTGGAATCTGTACGCTGAATCTCAACATTCTAGCT:1 - chr3L 18849950 5' - INE-1 168 1 61.39 CTTCGAAGATGATTAGGCCATGCCCATTTCCGGACAAAATGTTATGCAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTT:1 + chr2L 14220147 5' - gypsy6 7773 4 54.00 GCTTTGCCGGGCATTCCTTTTTTTTTTAGCCCCCCGGTTGGGGGGGGTTTTCTCTGGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 7643645 5' - Porto1 171 1 79.41 ATATCCTTAACAAATACTTTTAAAGTGTCTTGGCTGAAATTATAATAATAACCATTCACC:1 - chr3R 16398548 5' - Doc2-element 71 1 90.00 CTTACTAAATACAAAATAAATATTTTTTTAAAAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 26317931 5' + roo 43 2 72.00 GCTCGAGTCTGATTCGGATGAGGAGCCCGATTCGCTGCTGCTGTCTGAGCTGCACTTGCGCCGTCCCTTTATGGGCCGCGGGGATCCCGTTATTTCCTTTT:1 - chr3R 15964468 5' - gypsy8 316 1 55.45 TTGAAAGAGTCTTTAAACTNTCCACAACTCTAGGTGATTGAGAGAGTTTCCCAGTATCAGAGTTGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 - chr3L 25876161 5' - copia 242 1 72.28 CAATGGGTCATTCGAAAATCGGAGTGACGTGGGAGACCAACTACATGGAAATGGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr2L 5927012 5' + pogo 21 1 49.50 TCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGA:1 - chrX 14317414 5' - 1360 3300 1 79.21 CAAAAATGTGTATGTTTTAGGAAGTTTGGGGGAAGTTTGCGCCGCGTCTTTAAAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTCAAGCTTTTATAGTGCCTGAGATC:1 + chr2R 5185198 5' - INE-1 150 1 64.36 ATCATTTCTTTGATAGACAAATCTAATCAATCAAAAGGGCAACAGCCGCCACACACTCAACTCTCCCGCGGACAACAGTTTCGCTCTCAGCTCTCCCACCC:1 + chr2R 15384480 5' + Porto1 498 1 52.48 GAATGAAACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATG:1 - chr2R 4339514 5' - G5A 2789 1 80.20 CCAAGCTGCAGGGATTCATTCAACTGAACAACAAGACCTACCGAGTGGAATGCCCCACTCGGGTGCTCATCGGTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTA:1 - chr3R 27250492 5' + G2 2603 1 68.32 GTTTTATAGAGTACTTAGATGCACTCGAAAAAATCATATTAAATGATTCACACCGAAAATGATATTGAAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr3R 17971734 5' + 412 7068 2 65.35 GGATGCAGTGCAGCGAGCCNTGCGGATTTCCGTTTTGCCAGCCGCAGAAATTACGTATGGTAGCTGCTCAGTATGCGTTTTGATAAACAAATTCTTTGACA:1 + chr3R 24885871 5' + 17.6 165 2 66.34 GAAAAAAATAAATAAATAAATAAACGCAACAATTTTTTTTTGTGCGAGGGTTGAAGTGCTGCCCCATGACGTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 + chrX 736770 5' - hopper 1413 2 62.38 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAAGGCAGAGAGAAGAGTGGGAGAGAGAAGAGTGGGAGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCT:1 - chrX 9023556 5' + P-element 22 1 44.55 TATACATACTACGAATATGCGTAGGCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACAT:2 + chr2L 4134822 5' + Quasimodo 29 2 53.47 AGATAAATATGGATGGATGGATTTGCTGGTCGTGTGAATGTTGGACAATGAAACCCACTTGTTCGGTGGGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr2R 21040828 5' + P-element 7 2 66.34 CCTCAGAAATAAAAGATATAAGAATAAATTATATTAGATTATAATAGTTCTTCTTTTTCTAGTTCTACATTATAAATTTCCGAATCTGAACTCGAATCAAA:1 - chr2R 4514906 5' - transib2 2547 1 52.48 ATTTCATATTCAGATATTTATAGCGGCACTTCTGCCACTATTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACTTCTCACGCCACAACGTCCAGAATGCTAACGCTGC:1 - chr2L 224842 5' - gypsy9 130 2 90.10 CCATTAAAACCACAGCAACGCCTAGTACGACGGTGAAACCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACG:1 + chr2L 12127427 5' + G2 2645 1 61.39 AGTAGAGATTTCTGCTATTAAAGGTATTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:2 + chr3R 20420903 5' + blood 7024 2 66.34 TAGATAAGGAGACGCACAAATATTTCTGGAAGTGTAGAGAGAGGAATACCCATTGATCGATAGTTTTTAATCAATGGAAAATGCTATGAAATATAAATGGA:1 - chr2L 1628403 5' + HB 471 1 81.19 GGTCGCAACCGGTCCAAAATCAACCAGGCCGAACCAAAAGCAACCCGACTCTTTGAGTGGACATGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGGAGACTTTACTCG:1 + chr2R 6850417 5' - roo 399 1 69.00 CCTCATGAATCATTTCCTGGTTCGGATTCTGACATCTGGCAATTAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAG:1 - chrX 17981853 5' + mdg1 7155 2 57.43 TACTCATATCGTTCATTACATTGTCCACTTTTTAGTGAGTAGTGAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chrX 8316313 5' - hobo 2908 1 58.42 AAAGAGCAGAGAGAAGTTATGCTAGAAACGAGTATTATTTTGTATATTTATTTTAAAAATGGATAAAAAAAAAAACAAAAAAA:1 - chrX 6873771 5' + HMS-Beagle2 482 12 60.24 GAAATTCAGGAAAATGTATTCAATTAATTAGTATCAGGTATACAATTCAATTCAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCT:1 - chrX 21583423 5' + F-element 30 1 47.52 AGCGTAGTTGTTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTC:1 - chr3L 5241183 5' + Ivk 24 1 55.45 TGGCTGGTCAGTTGAGCTGAATATACATCGGCCAAAACATAGGTCGCTGCTATCCAATACACTATGGTCAAAAACTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTA:1 + chr2L 22196647 5' - Stalker4 476 1 74.26 CGCACGTTAATATATGTATATGCAGTTCGGGAACAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr3R 24976743 5' - opus 461 2 73.27 AATGTCAATCTGGCAAGGATGGTACATAACCCCTCCTCCTCCCTGTTTTTCTCCTGCCTTAAAACTTTTCCATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3R 8765637 5' + roo 8668 2 73.27 TTGAATATTTATAATTAAGTAAATATTTAAAGTGGAGAGTGGCAGTGCTTAAAGTGCAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 9278312 5' + roo 17 2 66.34 GACCAAGCCAACGATAACGACAGTAACAGTGGGCTAAAACTGGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTC:1 + chrX 21229278 5' + transib2 31 1 56.44 CCCTCCGAAAATCCCCAGTACGTGCCATTCTGTTTGGTAAAGATCCTAACTGTGCGTATGTGTGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chrX 15287842 5' - hobo 2925 1 61.39 GAGTGGCCGAGAGCAACCCTCGATTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTT:1 + chrX 5579444 5' + hopper 147 112 60.87 AGAATATATCAATTAATGTATAAAATTCGAGCTAAGAAACATAGACAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGGTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAA:1 + chr2R 5374327 5' - 1360 3004 1 54.46 TGTGTCCATGGAGAGACCAGATATAAAACGGGTGAACGAGAACATAGGCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCGAGATT:1 - chr3R 19611098 5' + R2-element 3325 1 55.45 AGTTGGCCGAACAAAAAAANACACCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:2 - chrX 19334634 5' - roo 9020 2 77.23 ATTATTAAAGTAAACAGCAAAGTTTGCACTACGGAATGGTGCTGCTTTGATTAAATTTTTATGGACAACCCGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGG:1 + chr2L 17998233 5' + BS 2 1 50.50 TGGGCAGCCAATTATGTACATGAAAACTTAGCAACTAGGCAGAAATACCAAGCCATTAAATAGAATTTTCATAATTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCG:1 - chr3R 15939954 5' + INE-1 298 1 73.27 CATCCAAATGCCATAATACGTTGTACTGCCTGTCAGGTAAGTGCAACGTATTATGGCATTTGGATGTATGGAGATATACATATATAGTATATACATATATG:1 - chr3R 4976852 5' + INE-1 61 1 78.22 GGCTTTCAAGCTCAAGAACACACCTTAAACTGTTTTTCAGAACGCTTAGCTCACTGCGAAAAATCAGCGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGA:1 + chr3L 735992 5' + gypsy6 2 2 67.33 TTTTATTTCCAGAATCCCAGGCTGCTAATAGACTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTAAGCTGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGTTGCACATAGTG:1 - chr2L 22216559 5' + diver2 4614 2 56.44 AGTGTGTGTGAGTGCATGACCCGATTCGCACACGCACACACACACATACAAACATGTTTGCATGCGTCAAGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCT:1 - chr3L 13374793 5' + Transpac 4923 2 75.25 AAATTTTACGTTTATCTATAAAACATTGTTTTTCGATACTTCAGCACGGAAATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAA:1 - chr4 424639 5' - R2-element 3390 1 54.46 AAGGAAATTCAGGAAAATGTATTCAATTAATTAGTATCAGGTATACAATTCAATTCAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 - chrX 21583426 5' + F-element 27 1 46.53 TGACATTCAATGCCTTCCAACTGGAAACCATATTAGTTATAGATTTTTTCATTGGTCAGCCCAACTACGATTAGCTAGCACTCTTAGCAGAGATATGACCT:1 - chr3R 18611399 5' - baggins 133 1 61.39 CGGAAATATTTGTGCGTGCATAAAAAAAAAAAGGAAAAAAA:1 - chr3L 2325277 5' + HMS-Beagle2 483 12 65.85 GGCTCCAGGATATCACGATACTTGGATTTTTGTTTTTTTTTTGCTTTTT:1 - chrX 5238187 5' - gypsy7 5011 1 53.06 GCCCTTCTTGTATACTATTTCATAGTCATATTCCAACATCTGGAGTCTCTATCTTATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACT:1 + chr3R 1849151 5' - Tabor 7306 2 58.33 TTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAACTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3R 8765545 5' - roo 9037 1 60.61 GAAAACTATTTTTATTATTAGATATTTACATATATATTCTATACATGTTATGTAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 + chr2L 14010797 5' + flea 24 2 53.47 AACCTTGAAAAATGGCAACAGCAGATTAAGCGCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chr2L 12808258 5' + Tirant 6 2 75.25 GTATGGGTGTGTGTGTGTGTGTTTAAAAAAAAA:1 + chr2R 16150602 5' + Stalker2 497 1 72.73 TGATGAGTCTGATTATTCAATAAGTGAAGAATCCGTACATCATAATATTGTATCTTAACATCACAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chr3R 4575415 5' - 1360 3375 1 65.35 ATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:3 + chr3R 7869110 5' + 297 6605 2 56.44 TCTGCGGATCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 + chr2R 15788571 5' + Transpac 28 2 52.48 ACAACTGACAATTGACATTTGCATGGAGGAGCGACGGTTGAATTGAAATGAAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGCACGGCGTTTTT:1 + chr2R 11469414 5' - baggins 5110 1 58.42 AGTTCTTTAACTGCTGCTAATGGGCTAAAAACCAATTCTTTAACTAAATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr3R 17971644 5' - 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P-element 2879 2 71.29 CAGGCATTAAATCAACACTCTGTCACAATTCATTAAATTTAATTAATGCACCCACCTGTAAGGAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGC:1 + chr3L 3727322 5' + Tirant 479 1 60.64 AGTATGCTATACTTTGATGTGCTTAGTTGTGATTTGGCCAAAATGCTTGACTCGCAGCTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chr3R 31264159 5' + jockey 26 1 59.00 CACAGCATGGCCATTGCAATTATCCTCTCGATGGAAGCAAACCGCGCCCATTTAGGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTG:1 + chr2R 19109416 5' + micropia 5290 1 58.42 AGTGTCTGCAAATAATAATGAAGTTGCCAGTTTTCCAGTTGCCGCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATA:1 - chr3L 8252255 5' - copia 256 1 55.45 ATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGT:4 - chrX 18326229 5' + Doc 227 1 64.36 TATCAGATATGATATCAGGGCTTCGGGAAAGCATAAGCCAGAATAAAAAATAATAAAAGAGTACAAAAAAAAAA:1 + chr2R 5093423 5' + G2 3066 1 70.27 ATAATTTGCCTGAAATCACNTACATAGAAATATTTTCCCCCCATTGCCAAATGAATTTAAGGCAGTCAAGCGTTCTGGCTTACGTAATTTTTAATTTATAA:1 + chrX 16773970 5' + blood 6928 1 31.68 GGATAGCGCGTAGACGTCAAGAAATCAATTTATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTT:1 + chr3R 15924604 5' - Quasimodo 7328 2 70.30 ACAGCAACCAAAGCCACAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCGACAGAAAT:1 + chrX 17262726 5' + X-element 4424 1 67.92 TATTTAAAACTTTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAA:1 + chrX 22426173 5' - 1731 4594 1 55.45 AGATGGCTTGCGGTACGAGGCAAAGTACTCATCTTCCCACCTAAGTAGGTATTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGTTTCACTTTTATTTCTTCAATAGT:1 - chr3L 19271230 5' - HB 1490 1 55.45 GGCGCGAGGGGAGTTTCGTTGCGAAGGGAGTGGAATGGGAATGTGCCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3R 29287567 5' - hobo 2909 1 56.44 CTTCACTGACCTGACTTCGCAGAGGAGAAGGAAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 4285791 5' + Doc2-element 218 2 51.06 TGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2L 13093791 5' - roo 9022 2 77.00 TGTTGATGCGGGCCTGCGCTGGTGTGCGTGCGAATCGCTGGTCGTCTAAACCGTCACTCCAGCTCCGGCAACTCTCTAGCTGGCCGTCTAAACCGTCATTC:1 + chrX 17702249 5' - aurora-element 160 1 65.35 TGAAAGATGTTAAGCAAATAATTCCTGTGTTCCTCATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTACATCGA:1 + chr3R 20905367 5' + pogo 5 1 75.25 CCTCTGAGCTTTATATGTTCTATATTAGATATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - 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chr2R 6607345 5' - INE-1 563 1 66.34 TCTATTCAAGATGGAATAGTTATATGCTGCATCATCTCGTGTCTGACCAATAGATCCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 + chr3L 4009410 5' - mdg3 5479 2 51.49 AGACAACTTACCAGTAGTACCGCGTATTTCTTTATGTTCCCACACACACACCTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGT:1 + chrX 9205499 5' - diver 6088 2 52.48 ATAATAATGTTCATTTGTAATATCGACCAACAAGACATAATTTTTTACAACCAATTTGGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr2L 21190726 5' + pogo 15 1 62.38 GCAAATGTTTTATAAGACATTTTTATGCATTTTTTCCTGTACGGATATTTCCCTGGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCA:1 - chr2R 10667958 5' - F-element 76 1 65.35 TCGCTGTCCGGTAAGAATCTTCTGGCCGAAATCGGCTCGATTCGCCAGAAGATAGACGCGATATAGAAAAGGGAACAGAAACGAGGAAATTAATATAA:1 - chr2R 7152356 5' - Cr1a 4333 1 67.35 TGACGAACAAGTTCGGGGACGGGCGGGCCCCGTACTGCACTGTACTGTACTGTACTGTGTGGATGGATCGTATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAA:1 + chrX 2462005 5' + FB 6 1 71.29 ACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 + chr3R 7869136 5' + 297 6631 2 75.25 ATCGAATTTTATAAAACTATATAGTAAGTAGTTTATTTATTTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCG:1 - chr3R 27169511 5' - 412 7533 2 63.37 CAAAGATGCCGTTCAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2 + chr2R 13763169 5' - roo 394 1 58.42 ACAGAGCACAAATTCTACGGAGAATCGCGTGATATTTTTTAATCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCGGTGACAACATGAAGTTGTG:1 + chr2L 13206393 5' + flea 4667 1 55.45 TTTATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr2R 11941065 5' + 297 34 2 64.36 AACCGCAACCATTACGCCCGACCAAGGTTTTTTGCTTGACACACAGTCAACGGAAATCTACATTCTGAAATGAAATAAATAACAAAAATTACAAA:1 - chrX 4947333 5' + Doc 4687 1 75.79 TGAATAAGATTCGCCGATTAGGAGAGCAAACAAAGCTTTAACCCTTAACCCTAACCAACATCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chrX 21217596 5' + pogo 11 1 66.34 GGTTTCGTGTTGGACTTTGTAAATTTTACGATATCAATAAAAACGTCGACAATATAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chr3R 22238643 5' + hobo 1 1 76.24 GTTAGAGCCATGAATTTATGATACTAATGCGTGATTATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTC:1 - chr2L 11411227 5' + P-element 2771 1 48.98 CGTCTGTTAGTCGAGAACATTATATTGGCATTTTAGCCCACACAGTACGCCCCTACGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:2 + chrX 10286132 5' - 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hobo 2922 1 58.33 TACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTATTATTATTATATTATTATTATTGTTTAATTGTGTCTTCGTTTATTTTTCTTGTTGCCTAT:1 - chr3R 19449973 5' - invader3 5010 1 67.33 GCTTAAAAGTATGACGCGCGGTGTAAATGGATTTTCGATATTAAGCCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAAAATTTTGGGCTC:1 - chr2L 19854141 5' + roo 28 2 56.12 ACATGTGCAAACGCATAACATGTGATAAATTCAATTTCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr2R 17420833 5' - pogo 2065 1 63.37 TGCGGAATGGGGCGGAACTGGAACTAGTGCCACGTTCAAGCAATTATAGTCAAAGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACA:1 - chr3R 19512783 5' + mdg3 248 1 63.00 GACGTTTTGTTTGACGTACAAATTAAAATGAGAGCCATCCCCGAGATCAGAGGGTAAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 - chr2R 5737906 5' + Tirant 45 2 63.37 ATTCTTATCTTAGCTCTAATATTATGATAAGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGC:1 + chr2L 11712830 5' - Quasimodo 7324 2 74.00 CCTGCTAGTTCAATTTGCACATGAAACATACAGTGTGTGTATATGTATATTCGAGTACCACCAACACATATAAATCTATATATATATACATATATTCATAT:1 + chr2R 22063098 5' - G3 4507 1 70.30 TCCATCACGTTCACCTAAATAAGCCATGTAGCTCGTTTGTCGCAAAGCTCTCACTCTGCCAACTTGCTTCTCGCGCGAGTTACCTCCGGGGAGTCTTGCGG:1 + chr3R 3753054 5' - ZAM 8412 2 76.24 TAATTTGCTGGACAACGAGAAGGCAAGGAATTTAAATGAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCA:1 - chr3R 14580359 5' - blood 339 2 61.39 TGTTTGCCACGCCCCACGCNGCCACTGCCACCAAAATGCAGGCGCTGGCCTTTATCTGTTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chr3R 11321097 5' + hobo 15 1 63.37 GTCGCCATCATCAATAATGCACACACGGAGCCCCTGAGATACAAAGTGCCCTCAGCTTTAAGGGTCGAAACTTTCCACATAGCTCAAACTCGGCTGATCTG:1 - chr3L 15702627 5' + Quasimodo 389 2 56.44 CACGGTAGGCTAAATACAAATATTCTCAGGCCATCCTTTGTAAATATTTGAGCGCTCGGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGCCATA:1 + chr3R 19448914 5' + 1360 15 1 76.24 AAACGAATAGAAACCAACACGCTCTATATATATAGTATATAGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAA:1 + chr3L 14818720 5' + mdg1 35 2 58.42 CCACATGAGCGACAGGCACCTAATTCCATGAAGGCAATCAAACTCCATATGGCAACTAAGGCTCTTTTAATAAAAGCCATATTAGTTCCAACACTGACCTA:1 + chr3R 23588773 5' + G5A 2414 1 66.34 ATTAATCAAAATAAATCGCNTTTGGCCGACAAAGTCGAAAGTAATTTTCAGCACACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chr2R 8526326 5' + I-element 24 1 57.00 GTGGGGCAGCCAAATGAAATTACTTTGGCTTAATTAATGGCCAACAAATGTCGAAGCGTCCTCGCCCTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGC:1 - 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Transpac 5195 2 62.38 GGTACTCGTGAGAACGTACTTGAGCCACAGCTGACCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAAGCACGAAGTACGGACAC:1 - chr4 953687 5' - 1360 472 1 65.35 ATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCA:1 - chrX 734961 5' + Tabor 48 2 71.00 GAAAAGCATTGAAGTTGGCCGAACAAAAAAACACACCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chrX 19334646 5' - roo 9032 1 66.34 CGATATTGAAGACTACTAAAGATTACAAGGCCAAATTGGTAGACTATCGTTGTTAAATTAGCTAACATAAACATATGGATAACTTCATTGTTGATTTAACA:1 - chr4 214568 5' - Tc1-2 1480 1 68.32 AATGATCTAAGGGTTAAGGGTATATTGAAAATATTAGTAATTTTATTTGCTGTTTTCCACAAATTTAGATGAAATTAAAAGTGATGTAGAGTCAAAAGGCC:1 - chr3L 18279020 5' + G4 434 1 54.46 ATTCTTAAAAACACTGGCAGAAAATAATGGTGTTCTCAAAGTTCATAAGTTTAGAAGGTATTCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chrX 8316397 5' + hobo 15 1 62.38 CAAGCCTTTTTCAAAAGTATGGATATAACAAATTTGTGCGAATTTGGTCAGTGTTTATCTGAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTT:1 - chr3L 25106706 5' - Cr1a 386 1 55.45 GTTGGCAACAGCATAAAAAACAACGTAAAAATGTCAGAAAAAATATGCACAGAAAAATCACTGCAAACAAATTTACAATGCATGAGCATACTTGTGCACAC:1 + chr3R 20284179 5' - 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hobo 415 1 75.25 AAATAAAACAGGAAAATATATTCAGGCTTTTATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chr2R 5953167 5' + 297 6620 2 72.28 AGAACATGATGAGTCTGATTATTCAATAAGTGAAGAATCCGTACATCATAATATTGTATCTTAACATCACAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3R 4575409 5' + 1360 8 2 71.29 TGCATTTACCTGGCGCCGTCGCGAAATTCAATTACTCGTGCACCATAAACCGATTAACTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 + chr3R 5135441 5' - 297 378 2 64.36 ATAGCGCAAAAACTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 + chr3R 19505544 5' + mdg3 5290 2 61.39 TTTCTCTTTTTGATATACAAAAAATCAACAATTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3R 26317978 5' - roo 9030 1 67.33 ATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTC:1 + chrX 22726199 5' - Helena 1269 1 46.53 CATTTGTACAGCGAATAATAGCGCAAAAACTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGT:1 + chr3R 19505527 5' + mdg3 21 2 52.48 ACACACAATACAGGACGAATTCCGCCTCAAGTTGTCGAGCTAAGAGTGCACTTGAGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr2R 9649141 5' - roo 407 1 77.23 CCCTCAACCCAAATTGCCGNTCGTCTTGGTGGCCACTTAACAGCTCGTAAAGCCAAAGGCCGTCACACCTAATAAATATTGTAATTGTAAAATAAAA:1 + chrX 4763238 5' - P-element 2593 1 63.92 GTGCATGAGCTGAAGCCAAAGCCAAGCCCCTCAAGGCGATTGTCGTTTCTTGGTAGGTGTTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr2R 15788659 5' - Transpac 5211 2 61.39 GTTATTACACACGTTGATTGCCTCTTCCTGGGTAAAAGAAACTAGCAGCCAAAATCGTTTCCACATTCTTCGCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCC:1 - chr3R 12735148 5' + Ivk 375 1 72.28 TTAATGGTAAATATTCAATATTGCAGTTACTGAACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAG:1 - chr3R 30528247 5' - I-element 382 1 66.34 CCTTTACCATACCAAGTCAGCCACTTATTCGAAGATTCGCGATAATAGTAAAACAACGGTCCATGGTAAAGATGTACTAAAAAAGAGGGAATGCTATAGAC:1 - chr3L 22954626 5' - INE-1 580 1 56.44 ATTGAATATTTATAATTAAGTAAATATTTAAAGTGGAGAGTGGCAGTGCTTAAAGTGCAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3R 9278311 5' + roo 16 2 67.33 TGGCAAGGACCCGTCGGAAAGCAGGATAGCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3R 23543033 5' + 412 18 2 61.39 AGGGTTTTCGCATTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCAC:1 - 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chr3L 12634226 5' + BS 5027 1 58.42 CTCTCTGGGATGTCAAAGGCGCGCTGCCGCGGGCCACGTAATTTAATTACCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr2R 6847334 5' - mdg1 7433 2 51.49 TGTTAAGTACTTATTGAAATTTATATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3L 15788443 5' + opus 7156 4 80.00 CAATAAACCAATCTGAAAAACATTTTAGAATTTTTTTTCAAGGCTGTCTTATCAAGACATCAGATTAGTTCATTTTGGATACCATATAATTGAAGATAAAG:1 + chrY 3271615 5' - Circe 7087 1 67.33 AGCAGCATGTTTAACTCCGCGTCGTTGCGGATGGCCAGGTGCAAATGGCGAGGAATAATTCTAGTCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTA:1 + chr3R 2156980 5' - Quasimodo 7265 2 66.34 TTCTGGCATATCGATAGATATTGGGGAATTACATTTTTTAACTTTGCTTTTATTTATTAAATCTTCTTGAATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTA:1 + chr2L 9778711 5' - F-element 4625 1 64.36 CAAACAAATGTAGGTGGAATGTCGGGCTCGTATATATATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:1 + chr2L 20611932 5' - 297 367 2 71.29 GGGTCAACAGCAAATGCTACAAATACGCAATTGGTTAAAAGTACTGAGTTGTTTTTGAGCAGTTTCATAGAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTG:1 + chrX 11434426 5' - F-element 4465 1 76.00 TGTGGCGCCTTTCGATTGCTTGACATCAGTTTGTATTTCTGTTTTATTTTTGTTTCTTTATTTTGTTTTGTATATTTCTT:1 + chr3R 21248989 5' - Penelope 618 1 90.00 AGTTTTAAGGCTATGTATAAACATTGGCTGTTGGAGTCTTATAAAATATATGTGTATGATAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTC:1 + chr4 74245 5' + 3S18 17 2 62.38 TAGCCAAAAGCCGGAATGTNCTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chrX 9775009 5' + 412 51 2 77.32 TACAGCAACGAGGTGCCCCTGATATTGATGCACAGTACATCCTAAATATATATTGATATTAACCACACTATACATTCTCTCTAACACACTATTTATGACCA:1 - chr3L 17852671 5' - invader4 2902 2 75.25 GTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:2 - chr3R 11916603 5' - roo 9024 2 71.29 ACACCAATCCGAAGACTAGCGGTCTTAGGCCAAAATTACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAATCAAATAAATAAGTAAACT:1 - chr3L 26717853 5' + Tc1-2 66 1 63.37 GATAAAAAGCGGGGTATCAATAAAACGAAACTACATCTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATAC:1 - chrX 11032244 5' + invader3 42 2 67.33 TAGACCTGTGTTTGATCGAGAAACTCTACTATGAACAATAGACCAAAAAACATTAAAAATGTCGCAAGACAATTCGAGGACCGTCTCCTTGACGGAGAGCG:1 - chr4 706818 5' + baggins 471 1 42.57 TCTGTAAAACACTTTTTGTGTTTTCAATTGCTTTTCAGCTCAATAGTTAATTATTTCAGGCACTCCTCAAGAAGAAAGAAATCTATCAGATTTGAAAATAT:1 - chr2L 12583344 5' + TART-C 387 1 59.41 TTTGTTTCCCATATTAATTTATCATTTATAAACGATTATTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 7099589 5' + roo 38 2 71.29 TTATGTTTGATAAAATGCGATATGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr3R 29287518 5' + hobo 51 1 78.22 TGAACAGACAAACCCCAGCCATAAAGGTTATACTAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAAA:1 - chr3R 8856342 5' + Doc2-element 254 1 82.46 AAACTTGCGAAATTTCACANACTTTTTATTTAAAACTTTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTG:1 + chrX 22426147 5' - 1731 4620 2 73.27 AGTCTTCTGATCGAGGAGGTTTCGTTTTCGTCGAGCTCGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAG:1 - chr3L 22393929 5' - copia 22 2 62.38 AAAGGTTTTCGCTTTGTTTATAGATACGGCTTATATGCTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCT:1 - chr3L 16563278 5' + 3S18 5806 2 62.38 AAACAATTTTCAAAATTTTGGGCGTTATTGGGCAGTTTGTGGGAGTTGAAAGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATTCGTTGTATATT:1 + chr2R 19896649 5' - Cr1a 176 1 51.49 GGATTACTCGATTATTAATAAAATGTTTCGTATGAATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATAT:1 - chr3R 25086181 5' - Bari1 1691 1 63.37 ATAAGCATGTGCGGCAGCANACAATGGGTGCAACAACTATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 - chr2R 13653431 5' + F-element 25 1 58.42 TGGGGAGAGGGAGATGGAGCTCTAACACAGAGAGAGAGAGAGAGTGCAAGAGAGAGACGCACTTTACGACGTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chr2R 15349587 5' + P-element 4 2 75.25 TCGTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:2 + chr3R 10741071 5' + 1360 8 2 70.30 CATCGAGGGGTTTTCAAGANGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTAC:1 + chr3R 7783719 5' + rover 12 2 67.33 GTGTATTTTGGATTATTTGTATCACATGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACA:1 + chrX 22689527 5' - 1731 295 1 59.41 CATTGCTGGCTGAAGGCTAGTTAATACTTTATACATATATATATAGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAC:1 - chrX 17104462 5' - 297 364 2 47.62 AAAATAAAAACCAAACATGGGGAACTGCAGCATGCCGCCTGTTATTTTTTGCTCTCTAATCAGAGCGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTC:1 + chr2R 13383485 5' - gypsy5 7340 2 68.32 CTCTTCAAGAGCTTTCTCCCGCTCTTTGTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr3R 14580313 5' + blood 49 2 74.26 TCACTCTCAGCTGGCCTTCNACCCCCGGAAAAGCCACCCACCCTCAACGCCCCATTTTCCACATCCTTTGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr2R 24281936 5' - 412 442 2 65.35 ATATGTGTTTGCTGTGCACACACGAGTACTTGTAAATTTTAAATCTCTTTATTGATTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCC:1 - chr3L 20317887 5' + 3S18 21 2 58.42 GGTTAGCTTGGGGCACTTAGAAAAATCGGTGCTAATAGTAGGTAAATAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr3L 20584017 5' - pogo 2076 1 59.00 AAAGCAAAATAAAAACCAAACATGGGGAACTGCAGCATGCCGCCTGTTATTTTTTGCTCTCTAATCAGAGCGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTG:1 + chr2R 13383480 5' - gypsy5 406 2 73.27 GGCTGCCACTGGAGGAGTCNCCGTCTCCAAGAGACTCATCTTCCTTTTGTGTGCCTGTGTTTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCC:1 - chr2R 15012016 5' - accord 7069 2 64.36 AACGACAGTAACAGTGGGCTAAAACTGGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1 + chrX 21229293 5' + transib2 46 1 71.29 AAAGGGATTTCAATCAATTGTTAGGCGAACTGAGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTC:1 + chr3L 17183228 5' + Tirant 8223 2 67.33 GATAAGATTATAACCATTCTGTATGGATATATATTGTATATACACTTTGTACGTCGATCTTATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTT:1 + chr3L 6962113 5' + FB 16 1 58.42 AAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGCCATCATGCGT:1 - chr3R 3268030 5' + mariner2 118 1 76.24 GATGGCAGTTCGTTTAGCTCTAAAGCTACCGTCTCGTCGATCGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 - chrX 15024437 5' + P-element 32 1 47.47 GTCCCTCCCGATCCTCGGTGTCCTCGCTGCCGCCCTCGCCCGATCACAACAAGATCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTC:1 + chr3R 25966731 5' + I-element 4929 1 59.41 ACAACGAGAAGGCAAGGAANTTAAATGAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAG:1 - chr3R 14580348 5' - blood 7360 2 65.43 TGCGTGATGGGAAAGCAACATCCCCAACCCCCCATTCCCATCTACGTCCAAAGGTCAGAGCACCAGACCCACGGCGATGGCAAAACAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 6384687 5' + gypsy2 422 2 52.48 CCGGCCATACTATCACCCACGAAATCAAGGAGCCGAAGCTAAGTGCTATGTAACGGAGGTACGACCGATAGTCCCTATCAACTTCACCACGAATAAGCTTA:1 + chr2L 11124609 5' - Cr1a 4051 1 66.34 GCTAGATATGCTTATAAAAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 9278417 5' - roo 398 1 70.30 ATGGCAGGACGTTGCAGGAAGGAAGCCTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTT:1 + chr2R 17138710 5' + 3S18 46 2 69.07 AACTGTGAAGCAGTTTGGAATTCACCATTTACTTTGGGTGCGCTGCGTCTTTTCCCTAGAATCTCGTTGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCC:1 - chrX 21504649 5' - INE-1 157 1 61.39 CAAATTGTATCTTTCTGGCTTTGCGTTTTTCTTTTCTTTTTGCGGCTCTTTAAGCAGGTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTA:2 - chr2R 8177787 5' - mdg1 7443 2 58.42 TCTTGGCTCCTCGCTTTCAGCGGGCACATATAGTATACACATATATATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCG:1 + chrX 11262808 5' - invader1 3987 2 54.46 TTTCTAAAGCGGCTCCTATGTATTCTGCGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCAT:1 + chr2R 10352051 5' + blood 144 2 72.28 CTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:2 + chr2L 12958919 5' - roo 9033 1 66.34 AGTTCCAAACTCTTTGGTCGCTGCACTTGAAAAATTATGTGTTATGTAGTTGGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chrX 6457884 5' + hobo 24 1 55.45 AGCCGAACGATTTGATAAGACTAAGAATGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 14222474 5' - roo 361 2 74.26 CGGGAAAATTCCATGGGGAAATTCGCCACATACCAGCGAGCAGTGAATGAAATATGCTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTA:1 - chrX 15255426 5' - Tabor 463 2 55.45 TCATATTAAATGATTCACATCGAAAATGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr3R 17971701 5' + 412 7101 2 72.28 ATAAATCACTGCGGAAAAGCTTGAAAATTTTCCACACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - chr3L 5415395 5' + I-element 40 1 62.38 AAGAAAAAAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 - chrX 11967088 5' - copia 209 2 72.73 CAGCAGTTGAGAGATGAGTTCCTTTCGCAGAGCCTCAATGACATTAATAATGGAAATGCCTTTCAGCCGTCTCTAGTCATGGGTCGGGGAAAGCATTGTAC:1 + chr3R 28253257 5' + Tc1 360 1 73.27 AATTGAAAGTAAAGAACGTAAGAATTTCCCTTGCAAATGCTTCTTTTTGGCGCAGAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr2R 8682321 5' + pogo 16 1 59.41 CAAATTAGGCACACTTTAAGCTAGGTTATTGCGAATTATAGAATTATAAAGACATCTTTCACGAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATAC:1 + chr2L 3699389 5' - mdg3 5484 2 62.38 TGCTATAGTCTAGGATATCAGTTGTGACAATTTATGGTGATTGCCAATACTTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAA:1 + chrX 7619512 5' - R2-element 3378 1 57.58 GCATATATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCG:1 + chr3L 15452881 5' + accord 46 2 70.00 GATTCTGTGAATTTTATGAGGAATGGTGATTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTA:1 - chr3R 26435448 5' - Juan 4168 1 72.28 AAGTTGTACATCGATTTTTTCGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGT:1 - chr3R 7869203 5' - 297 377 2 62.38 ACTCAGGGCCTTTAAGATCCCAGGCTACTTGCTGCAGAACCGAGAAGCAGAAAGTCAAAGCGTTCGCCGACCATCTGAAAAACGTCTTTATCCCTTATTGC:1 - chr2R 4932287 5' + G7 58 1 64.36 TTAAGAAAGGCTTGAGGGAAGGGGGCTATTTCGGAGTTTCGGTCCTTTAGCAATTATTTTCTAATAGAAATATGATCAT:1 + chr2R 4511964 5' + transib2 77 1 64.56 ACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGT:2 + chr3R 11151816 5' - mdg3 5472 2 53.47 TTCTCTTAAATGTATGAAATTTCACTACTTTTCTCCTTTTCAGTTTCCGTCAAGCTTTTTTTAAAGAGTTATCTAATTGTAATGTTGTTTAAGGTTATTTT:1 - chr2L 10672776 5' - copia 27 2 86.14 GGCTAGTTAATACTTTATANATATATATATAGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTT:1 - chrX 17104448 5' - 297 333 2 69.31 CGACCTTACAAGTCCTTCTCTGAGACCTTGAGCCACGGCCGAATCCACCAGCACGGTGAGAGGATGATATTTGGTCTGTCCTCGACCTTTGTGCCTTTTCC:1 + chr3R 21404866 5' - Rt1b 186 1 55.45 GGTCCACTACGCTTTTGGTNTAACAAACATACTAACGTTATTTCCCTGTTAAATGGAAGTACTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3L 7307298 5' + hobo 14 1 62.38 ACAAGACGAAGTTTGATCTCAGCCAACAAATCCTCTTCACAATCCCCCACCATTTCTCACTCGAAATATTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr3L 3596650 5' - copia 248 1 69.31 CCAAAGGAGCTCGTGTGGTGTGCTATGTGGCAGTTGGTTATCTTGGCACGAAACGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGG:1 + chr2R 24860709 5' - Tirant 210 2 59.41 TCGATCGTCCAATGAACGTGGCCCTCCGTGCGCTCAGCTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGGGACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCG:1 + chr2R 4736775 5' - Doc2-element 4444 1 62.38 TCTATTCCGTAATGTGTTCTTTCCATGTGCGTTTCGGACTCCGTTTACGTTTTACAAAA:1 - chr3R 1614204 5' - Doc4-element 492 1 57.63 CAAACTCTTATCCAGCGAATTTTTGGGGACAATGTAAGCGAATGGGAAAGGGAAAAGTGCTTGTCTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr3L 13190186 5' + roo 8671 2 68.32 GTGTTTTCTGAGTGGGTCTCACTATCTGAGTAATATCCGTCGAGGGTGAACCCTATTGAACGGCACCACTAGCGCTCCGCTATGACATCAAATAACTGAAT:1 + chr2L 3127088 5' - 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roo 394 1 64.36 TTTTACAAAAAAAAAAGGGGGAATAAAAAGTCGATCCCGAAAAGGGAAATGGAAAAA:1 + chr3L 950747 5' - HB 59 1 82.46 ACTCGTGGGACTTAACTGCTGATTTTTCCATAATTTTTCCCGTTTTATCATGCTTAACGACGTAAGTACACAGACGAAGTGAAATAAATATTTTTTAAT:1 - chr3L 7944604 5' - S-element 112 2 56.57 TCTATTTCCATTTACGATTTCCTTTGAAATATTTATTCCTTTGTTTTCATATATATTGTTTATTGTGTGCACCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAA:1 + chr2L 2609250 5' - hopper2 1277 2 52.48 CCTCTGCCCACATATGACTCCCTTTTTCACTGATAATTTCGGGACTTTACGTTGGTCAAAACCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGTCTAAAACTTGTGA:1 - chr3L 19334073 5' - HB 194 1 68.32 ATTAACCGGAAAAGAAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATG:1 - chrX 983384 5' + Juan 3820 1 62.38 CATTACTATGTGAAATTTAGGCAATGCTTTAAGCAAATAAAATATAGTTTTACTAAGTTGAAAAAAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAA:1 + chr4 416152 5' - BS 5059 1 64.00 GACAAGGGCACCTTAACTATACACGTCGCCGAACGATTTGATAAGACTAAGAATGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3L 14222448 5' - roo 399 1 64.44 TTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAA:1 + chr2R 7727165 5' + BS 4716 1 88.12 TAAATTTCAAAATGAAGAAGGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr2L 16153369 5' + Doc 49 1 68.32 AAAGCTCAATGAGCAAAGAAGGCGATGCAGTTGCAATTGTGAAACATTGAATTCTTCCAGAATAAAACGTGTTCTACTACCACGGATTAGTCTGCCCTTTC:1 + chr3L 13730526 5' + aurora-element 32 1 72.28 AAATTCGCCACATACCAGCGAGCAGTGAATGAAATATGCTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 - 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hopper 1375 1 65.35 GGACGAGGACATCCTTGGGCCATTCGCCGGCTGATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2L 20045824 5' - roo 9059 2 66.34 CATTTAGACAAATTACGAAAACATAACTACAAAGACGCCGAGTAAGGTGAAAACTTTTGCAAACAATAAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3R 17660570 5' - roo 400 1 68.32 TGTGAAAATTAATTATTCTAAACAATTTTGCAGCATTTAAATACAATCAGAATACACAGAAGATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTC:2 + chr2L 11478658 5' - opus 485 2 66.34 CCACAGAAATGGAAATAAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCA:2 + chr2L 18247980 5' - blood 7361 2 54.46 TATAGAAAGAAAAAAAAAACAATGCAA:1 + chrX 11518008 5' + transib2 2642 1 88.89 GTGGTCCATGTGGCTAACAATTTTTCGGTACGTCGAGCATGAAGGCTCTACTCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACTACGATACACCCACCAGGGGGC:1 - chr3L 23723909 5' - R1A1-element 4984 1 65.35 TATGTAATTAGATTCTGCCAGGGATCTGGGCTGGGCATGATTAACTCTTGAGTTTAGTTAAGAAAACTATAGCGTCTATGGGGTACAGAAATAAAGAATAG:1 - chr2R 22141514 5' - McClintock 215 2 43.56 AGCGACAAAACATGTGTGGCACACAAAAAACGGCATTGAGTAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTT:1 - chr3L 5479063 5' - 3S18 6072 2 64.29 ATTCTAATGCACAAGGTGGATAAGCGACTGGAACGAATTGACAACGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTT:1 - chr3R 21884242 5' - mdg3 5465 2 57.43 GTGAAATTGTTATCAGTGTNCTTATTGATAGCCTGGCGAGGCGCGTTGGGTGCTGTGGGATTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTT:1 + chr3R 6087964 5' - Doc 4498 1 62.38 CCCAGATATCTTGAGGCTGGAGAGGAAACGACGAACTGAATATGGACAGACGGACAGTCGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCC:1 - chr3L 19562875 5' - INE-1 97 1 57.14 GACGTTATTTACATGTGTANATTTTCACTTCCAACTGACACAGTATTATTTATATTTGTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATA:1 + chrX 23035720 5' + HMS-Beagle2 6899 2 62.38 AGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2R 13763183 5' - roo 9043 1 54.46 TTAGAGGACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chr2L 17730453 5' - pogo 2055 1 71.29 TAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTTGTGCGCATATA:1 - chrX 9023559 5' - blood 155 2 78.57 CCAGTGATGATAAAATATTTGCAAAACAAAAATGTTTGGGAAACTAAAATTTATGAAAACTATGTCTCTTGTTCTCATGTTCTCATGTACCAAGGAGCCCC:1 + chr3R 18518074 5' - jockey 4562 1 62.38 TCTTAAGAAGATTTCTGGCTACATTATCCCAAATTTACTTAATTACCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 - chr3L 19249748 5' - Transpac 279 2 56.00 GGCAAGATCGCAGGGTTATGGGCGGGGGGCGGCGACATAAGTAAGCTAACAAGCTCTTTTTGCACGCTTGATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTA:1 + chr3R 16422534 5' - INE-1 154 1 75.25 GAAGTGGGCTAAAGCGAAATAAGCCACAGAAATGGAAATAAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAAT:1 + chr2L 18247957 5' - blood 7384 2 73.27 ACAATTTTTTATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:2 + chr3R 10087815 5' - roo 9047 1 54.46 GTCTGGCAAAGTTGCCAGTNAGAGCAAATCGCAGATAGTCAGCTAGTCAGACGCAAAACCTCCTCCTTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCA:1 - chr2R 14997949 5' + McClintock 5954 2 75.25 ATAGCAAGAGCAACGCACCGAACAAAATGTTAGGCAATCGAGTATAAAATGCAGCCGGAAACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAAC:1 + chr3R 5458275 5' + Bica 422 1 63.37 CATTTTCATCCTGTAGGGANAAAAGCAAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATT:1 - chrX 9551811 5' - Doc 285 1 73.27 GGATGACGACAAGTCACTGGTAGCCAGTTGGAGGCGATTAAACCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 - chr3L 11929334 5' + copia 36 2 62.38 CTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chrX 22386762 5' + hobo 80 1 60.42 ACATAGATAGATATCTTGGTGAAGCCAATTTTTACAGGCAATTAATTTCTGCCAAATTGTAATAAACCAATATTTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 - chr2L 7175640 5' - blood 355 2 54.46 GCGCAAATGCCATAGGCAGGATTCGGTTTCATTTGAGTTAAATTTGCTGTTCCATGAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCT:1 + chrX 7292660 5' + 3S18 5787 2 57.43 AAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATA:1 - chr3R 11151884 5' + mdg3 39 2 63.37 AATTAATAAATTTAATTTTATTACAAATTAAACTCAGCTATCTTTAGTATTCTTAATTTCAACAGATACAAATGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:2 - chr3L 10110640 5' - roo 407 1 40.59 AGAGAGAGAGAGTGCAAGAGAGAGACGCACTTTACGACGTGGATCGTGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 - chr2R 21475164 5' + P-element 36 1 43.56 CCGTATATGAACGCCTAAATAAGGCTATAAAGCCTTACTGTCTTCCTTCCTGTTCTAAGTCATGTTGAATTTTGTTAATATTTTTCATAGCACTGCTATTT:1 + chr3R 4558831 5' + HB 1416 1 54.46 TTTTATTCTCTCTCCATTATTTTGTGATGGTTTAACAACAAACTCGCATAAAGCAGACAGGCGGACGGACCAGTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 + chr2L 19681389 5' - hopper 1410 2 74.26 GCTGAGATCACTAGCAGCCGGTTTTATGAACAAACAATTCCGGTATAAAAATTCAATTTCTTTAATACTCTTAATCATATAATCTTTGTAAATAACTTATA:1 - chr2R 9242295 5' + jockey2 3292 1 55.45 CACAATTGAAAGTAAAGAACCTAAGAATTTCCCTTGCAAATGCTTCTTTTTGGCGCAGAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:2 + chr2R 8682318 5' + pogo 13 1 64.36 GAAACCACCGTGACACTTGTTACGCGATGGGCTACGTGTTAAACGCATTTCCGCCACTTGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 - chrX 9413883 5' - 412 7527 2 59.41 TCATTATACCTTTATTATTTTGAAGGGGCGGACACGATGCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCA:1 + chrX 15255353 5' + Tabor 6877 2 60.40 ATTTCACGAAATTCGTACACATGAACGAATATTTCTGCTGTCCAGAGAGAAAGCTGGAAAAGGGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTA:1 + chr3R 5931913 5' + pogo 176 1 73.27 AGCGGGTAGTTAAAAATCTTAAAGATAGCTCTGATAGTAGAAAAGAAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAA:1 + chr2R 14997842 5' - McClintock 387 4 54.46 CTTGACTGCGGTTGGTCGTATTCTGCTCCATTCCCTATATATATATTTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 - chr2R 19102237 5' - opus 477 2 58.42 AACCCAAATAACGAATATANATCAATGTCGAGGCTCACAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTT:1 + chr3R 24085311 5' - invader3 5425 2 62.38 ATATATACGGTTTAAACTGGCTGCTGGCCCGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 - chr3L 1697742 5' - Transpac 277 2 65.17 GATTGAGAGAGTTTCCCAGTATCAGAGTTGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1 - chr3L 25876126 5' - copia 5076 2 73.27 GGGCTTGCCAATTCGGTTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATATAATACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGG:1 - chr3L 14581461 5' - hobo 322 1 52.48 AGTTCATGTGCACATTTCAATTATTTTTTTTTAAATATACTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr3L 10701773 5' - roo 9032 1 68.32 TCCAATAATGCATTGAACTGAGCCCACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3R 20684907 5' + roo 52 2 80.20 TTGCCGAACAGGAAGTAAATCGGCAGAAATCAAGCCCAGCGTCTGCATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCA:1 + chr2R 4500859 5' + springer 7164 2 52.48 GAACAACAAACAACAATTCCCATAAAGAGACACAAACCATTTGGCATTTCCATCATGGAGCAACTCACTCACATCTCACAACTGCAATCGCATCGGCAACA:1 + chr3R 18550326 5' + Doc4-element 300 1 74.26 TGAATTGCCATTTATTTGANGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr2R 11941075 5' + 297 24 2 57.43 AAAGTTTGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCG:1 - chr3R 20094508 5' + Max-element 8276 2 66.34 CGTCCTATTCCCTTTTTCTCACTTCAGAGTTAATTATGTTGACATAGTCAGTTTCCGTTATTTCTTACTTTTAACTTTTATAAAAAAAAAATTGGGGCGGA:1 + chr2R 23257957 5' - hopper 135 1 83.17 TCACTTTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACAACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTAAGTTTTAAAATTCATTAG:1 + chr3L 20049636 5' + jockey 4803 1 59.00 TTTAAACTGGCAAACCACGAAACCAAAAAACGGAAGGGGATATGCTACATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr2R 19102145 5' + opus 7022 2 60.40 AGCAATGTGACTCCAAAGGCCGCTTGAGAAGAGCAGAGAACCCTCTAATTCGGCCCGAACCCTTCTGGTGTGTTGGTCACCACAGAGTACGGGGCTTACTG:1 + chrX 21976895 5' + baggins 4968 1 69.31 TACAATTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2L 21086084 5' + roo 8708 2 71.29 ATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2R 9871073 5' + roo 8674 2 69.31 TGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2L 8577276 5' - roo 9036 1 65.35 TCTTAAAGTTCGTAAAGAGCAAAATGTACTCATAACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chrX 3661392 5' + roo 43 2 69.31 TGTGGGAGAGAAAACATAACAATGCCAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3L 7307231 5' - hobo 2893 1 73.47 ATTATTGATTTAGATAAAATATGAAGGGGAAAAGGGCAAATATCAGACAGTGCGCTCAGTAGAAGAGTATTATTATTTATCAAAACATCATAAAAATAAAA:1 + chr3L 14602937 5' + jockey 4996 1 30.69 CCAATTTTTTTATGAGAATTAATAAATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATA:1 + chr3R 21589014 5' - flea 4964 2 80.20 AGTAAATATCGGCACCATTCTTATCTAGCTCATCATCCTACAGAATCGATTTCCTCCGGACCTACATAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCAT:1 - chr2L 8935999 5' - R2-element 3429 1 72.28 CTGGATGCTGATGGTCATTAAGGTGGGATTTGCTTTAAGTTTTTGGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr2R 7065845 5' - 412 437 2 56.10 TGTGTAATCCGAAACCGATTTTGTGATTCAATCCGAAATCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACTGCAAAATTTTCTGTGTGTGGAATA:1 + chr3R 3528046 5' + Doc3-element 147 1 60.40 ATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTAAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1 + chr3L 3540115 5' - mdg3 5486 2 65.35 TGTAATTATTATTTTTATTNCCCTTCGGCCATCGGGCACCGCTCCACACTATTCGGACACACTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 6033930 5' + roo 14 2 64.36 CTTCGTTCGTTTTCTTACGTGCCAGAAAGTTACGAGTAAACTCAGGGCACGTCGCTTGATTACATTAATTATTCCTTTATGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr3R 17660447 5' + roo 1 2 75.25 GATTTAAACATGTACTTTCAACTTTAATCTTTTTATTTCTTTGCCAAAATGGGTGTCCAAACTCTCTCGCTCTCCCACAGAAA:1 - chr3R 26776897 5' + Cr1a 306 1 78.31 AAGAGAATAACAAATAATTTCCTATGGCCTATCAACTCAATCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr3L 12112399 5' - 1360 3355 1 61.39 AATGCTATATACGAAAACGAAATGAAACAGTCGCCGTCTTCGTTGTTGCATTTCAAGTGAACAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCGTATAAAATCACTTGAT:1 - chr2R 17826721 5' + Doc3-element 35 1 59.41 TAGGCAAATGTGTATTGTCNCGCAATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 - chr3L 8039391 5' - hopper2 1558 1 75.76 GCCGACATTTTTAAAGCTTAACAGCATTTTTCCACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 - chr2L 18248074 5' + blood 7022 2 68.32 GTTGGCCCCTGACATTGTTATATGTTCAACAATATATGTCGATATCCCACAAAAATTATGATATTTCGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGTAACGGG:1 - chr3L 13346932 5' + INE-1 537 1 73.47 TGAATAATCAGCAGCAGTAGCCGGGAGCTTCGCATAATCGTCATAATCATTTTATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGT:1 + chr3R 20332864 5' + jockey 4695 1 54.46 TTAATAGCATTTGGCTTCCTTTTTTGTTAAGTACTTATTGAAATTTATATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr3L 15788419 5' + opus 140 4 58.42 CATACACGGCATCGAATTGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:3 + chr3R 29608761 5' - roo 394 1 68.32 GAGGCGCACACGCACGTTAATATATGTATCTGCAGTTCGGGAACAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr3R 24976733 5' - opus 471 2 61.39 TTTACCATTTTTTTTTTTGCCATTCTGTTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTAAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATG:1 + chr3R 12756643 5' - X-element 4419 1 82.18 ATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:2 + chr2R 13763200 5' - roo 9026 1 69.31 TTTAGCTTAAAGGAGGGATTTATTGCACACCTTGTAATATCTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTA:1 + chr2L 9045421 5' - jockey 4958 1 60.40 TAAAGACAAAACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:1 - chr2R 22051534 5' - Tabor 455 2 52.48 TATCGAATCTAGTATACCCTTTTACTTTTACCCTGTAACGGGTATAAAAAGTTAGAATTGATTGCTTTAAGAGCGGCAAAGAGTCAAGATTACAGATAATA:1 - chr2L 20491469 5' - Cr1a 4225 1 51.49 GAGCTCGAATGAAACTTCANTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCT:1 - chr2R 4339520 5' - G5A 2795 1 79.21 CAATGGGTTCATAAGGGAAAAGTAAACATTTTCACTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAG:1 - chr3R 25368386 5' + BS 4826 1 65.35 ACTAGGGGTCGTAGTTTGGTGAGTTTTTGTAGATGTTGTAACTCGTGTACTGTAAGATTGGAAGAGTAGTTGATGTTTCACTACAAAAAGACTAGGCAATC:1 + chr2R 17879295 5' - jockey2 25 1 69.31 CTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATTACGTAATATATCTAGTCAATGACTAGATCTCAATATACTAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAG:1 + chr2R 2745199 5' - Stalker 6782 2 74.73 GCGGCAAAAGAGGCGTTCGAACTTCGAAAACCCTAATTTACGATCTATTCGGTTTTATGACAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTT:1 - chr3L 1586813 5' - Tirant 388 2 66.34 TATGTGGTTATGTAACAGCCCTTTAGTGCGAATTAAATGGACTTTAAAGCGGATAAACCAATGATAATTATGATAATCGTTGTCAACCCTAGAGCCGAGTG:1 - chr3L 20439721 5' - rooA 7132 1 48.51 CCATAAAGCCATTGGCGACNGACTGCATTTCAGCGATATAAATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chr3R 5135530 5' + 297 6610 2 61.39 AATCGGTGTCCCGCAATATACACAGCTTCCACTAAGCGAAATTTTAGCATTTTGGCATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAA:1 + chr2R 22122587 5' - 297 42 2 61.39 GCAAAAATCTGGGAAAACANACCATTTTCCGGCCTGGCTCTGGGCAAAATCAACTCTGTCACTCACACTCGTTTGGTAAACAGAAAAAAAAAAAGGAAAAG:1 - chr3L 4562309 5' + Doc2-element 247 1 89.11 AATAATGCTACACACACAGCAACATGAAATGCAATAATAAATGAAACATGTGCATAATAACTAACAAATACATACTTTTATTTTTCATTTCAATTTTTTTT:1 - chr3L 19831028 5' - P-element 2637 1 76.24 AAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3L 19349924 5' - 1360 3380 2 66.34 CATTAAAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGAAACGTATTCACGCCAACTCATCAC:1 - chr3R 10736100 5' + McClintock 5958 2 56.45 ATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTC:1 - chr2R 545172 5' + F-element 442 1 57.43 TATGTCGAAGTGTCAATGTGAATAAATGTTAATCAAACCGAATTCGGTTCGGCGAGGAAGGCTGTTACATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGCACA:1 - chr2L 6492992 5' - mdg1 342 2 74.26 TATACTTTTCTTGGCTTTTCCCTTGCTGTGTGGAAATTCCACAGCTCTTTTTCCGATGCTGCACGCTCAGAAATTTTAGATTTTGTGTGGTAGAG:1 - chr3L 14921425 5' - Cr1a 314 1 62.11 GTTGTCTGTATCTCTGTATCTTGTATCTCAAGATTCGGGACGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTGTCGAACAGGAGCTGACACAAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 + chrX 2982590 5' + G2 3075 7 73.27 TTTCGCAGAAAGATTGCTGNATGCTTTAATGATTTTGTATTTATTCAACGCGTCACTGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 + chr3L 1586705 5' + Tirant 8124 2 63.37 AGAATTCTAATGTCCTTTGCTCACTGTACCTGCGTAACATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGA:1 + chr2L 7937250 5' + jockey 4559 1 62.38 ACATGAGTTGTCTAAAATAGTTAAAACATCTGGGTGCTACTACAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCACAGTAGTT:1 - chr2R 21878272 5' + Porto1 477 1 56.44 CGTTGCGTTTGTATCCTTTTCCGCGGAGCGAGCAGGTCCCGGGGTCAAGAGGGGCTACTGCAAAATTTTGTCTCGACACGGTTCAGTCGCCATAATGCGTT:1 - chr3R 11500308 5' + mariner2 119 1 71.29 GTTTACGTCTTGCTTTCGTGTCTTAATCACTGAGAAAAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3L 15037894 5' + roo 8675 2 68.32 TTTAGAGTAATAAAACACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACAT:1 - chr2R 16185111 5' + 17.6 6950 1 59.41 TTGAACAGTCTAAAATGGACATCACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGG:1 + chr2R 6779769 5' - 17.6 465 2 60.20 AAAAATTGCGGGTATAGAACGGCAGAGGATGTTTGACAGGTGTGATTCGGGCTCAACTCGATTTGATACTTATCTCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 - chrX 22791020 5' - Tirant 8492 2 44.55 TTACAGTTGTTCCAGCCAANCGCTCGAGGCAACGCACAACTTCCGGCCGGATTGTTGGCCATTTTGTTTTTACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTA:1 + chr2R 19560125 5' + Tirant 1 2 79.00 TTATCATTGTTCAATACTTAAACACTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:1 + chr2R 22051484 5' + Tabor 6892 2 74.26 CTATAGTCTTTTCGTGACTGATAAGGTCTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACGATTTTTTCGCCGTGGC:1 + chr3R 24542040 5' + 1360 48 1 70.30 ATCTTCGCATCAACTCTGTCTGTATTTTCCTTTGGAGCATTTTTCGGCCGTTTAAAGTATAACAAGAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGA:1 + chr4 843743 5' - INE-1 561 1 59.41 TTTATACGGAACTGTACACNTCAGGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr3R 5506851 5' + pogo 27 1 55.56 CTTGCGGTTATTTTGTTTCGGGTTTTTAACAGCCATAAATGAGCCCGGCCTTGAGCAGTGGGAAACTGTCAGCTCTTTCTCTTTTTTTTTTCTTTAAATTT:1 + chr2L 19870316 5' - TART-C 11097 1 77.23 AACGCACAACTTCCGGCCGGATTGTTGGCCATTTTGTTTTTACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr2R 19560155 5' + Tirant 32 2 55.45 CACCTATATTATCTTAGTGAGTCAGAACTCAAAGTTGATGAAATTATAAATATAATTTGTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGG:1 + chr2R 21945568 5' + F-element 4421 1 64.36 CAAATGTGAGCAGACAAGCGACACCAATTGAGATATGTGAGTAACGCATGCAGACACACGTCAATGTAGACAGTGCACTATGGGGCATGCCCACTTTTCCA:1 + chr2R 7546224 5' - hopper 112 1 74.26 CCCAACAATTAAGAGTTTTTAATCATCGACTAGTCTGCCACAGCAGCAGCAGCGGAGGCCCAATGGGGCCCAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTG:1 + chr3L 11866986 5' - F-element 4474 1 77.23 TACGTTTTCCTTCCCTGTTTTCCTTGGGCTTTAATCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGT:1 + chr2L 12809355 5' + Tirant 444 1 63.37 ACCAGAATACACTAGAAATAAAGTTCTTTAACTGCTGCTAATGGGCTAAAAACCAATTCTTTAACTAAATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 + chr3R 17971623 5' - 412 486 2 71.29 AGCCAACAGGTAGAACACCCACTGCAAGCCAGCAAATGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGTGCAGA:1 - chr3L 12671242 5' + P-element 225 1 42.57 GTGGCTAACTAACTTGAAACTAATGCTTATTAACATTTTTAAATATATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAAT:1 + chr2R 19088953 5' - Tabor 7295 2 54.46 TTGTTTCCAGTGTCATGATGCGAAATTGACTTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTG:1 - chr3R 22869439 5' + Bari1 44 1 69.31 TGACTCTTCACCGTCGTTCAGTCAGGGCTTTTTTTCCCCAGGCTACGTGTTTAAAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1 + chr2R 19641831 5' - I-element 5334 1 57.43 TTTGAATATTTAAAATTCATAAAACCTACCCAATCTTTTCTAGTGAAAATACTACCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAA:1 - chr3L 6378121 5' - Quasimodo 326 2 60.40 TAAACAGCAAAGTTTGCACTACGGAATGGTGCTGCTTTGATTAAATTTTTATGGACAACCCGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCG:1 + chr2L 17998243 5' + BS 12 1 42.57 AGTCTTGATCTAAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr3L 25059150 5' - mdg1 395 2 54.46 TTCCTACGTACATTTTGCAATTGTTTATGGGCAAAGCAACAGACAGAGATGTCGAAAAAGTCAGTTACCTGTTGAAATGGCGGTGTTCTTGTTTTTGTTGT:1 + chr3R 14722294 5' - I-element 134 1 51.49 TTGAAATTTAAAGACAAAACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTA:1 - chr2R 22051542 5' - Tabor 7302 2 56.44 CTTAATGGTCGTGATATAATATTGACACAGAGCACAAGAGTTGACTGGAAAATAAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTT:1 - chr3R 11904723 5' - transib2 469 1 61.39 TTTTTTACAATATTTCATAATTTTAAATCTCTTAAAATAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr3L 15037979 5' - roo 9035 1 65.35 CTGTGGCTTTTGTCTTGCGATTAGCCTGGAATATTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:2 + chr3R 23640981 5' + 297 6618 2 69.31 AATACTAATATGCATAAAANAATGAATGAATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATAT:1 - chr2L 23369629 5' + Idefix 44 2 72.28 TTAAAGGCAAGTCCCATTTTGATGGATAGCGCGTAGACGTCAAGAAATCAATTTATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAA:1 + chr3R 15924581 5' - Quasimodo 7353 2 63.64 TAAACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 - chrX 734967 5' + Tabor 6882 2 65.35 GCTCATGTATAGCGAATAGCGTTTAACAGAATGTAAATTAAGTTTTGTGGAAAGTCTGAAATAAAATACACTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr3L 19647350 5' + pogo 1 1 79.21 TTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCT:1 - chr2L 23295849 5' + micropia 45 4 71.29 GTTATTACTATTACCTCAGACACCGATTCAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 + chr3L 6549631 5' + jockey 4679 1 71.29 ACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAACTGCGAAGGAAAAATGCTGTCATATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 - chrX 15903342 5' + Transpac 17 2 41.58 GGCAACCTGAGATGGAAAGTCTGTGGGGGTTGGGGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 - chr2L 12511596 5' - copia 5082 2 66.34 TTTGTTAGCCGAGCGGTATNGGCTTCGGCCAACACGAAACTGAGCGTTCTTACGTGGCCTCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCG:1 + chr3L 25515122 5' - invader4 186 2 59.60 AGTTTACCAATTTAGTTGTTTGAGGGGTCCGCGAACCTCCATCAAAAAATTTGCATAAGTCGACGACACCACAGTATACTTGCCAGAGGCTTACTCCC:1 + chr4 405267 5' + BS 4883 1 67.35 TACTTAACAAAATTAAATATATTGTAGTATACAATAGGCTACGGAGCCTTCGACTCGAGCCTTATGGGTTAATTACTATATAATAAACTTAGCTTTT:1 + chr2L 3813588 5' - Ivk 5269 1 53.61 CCAAGCATATTTATGAATTGACAACACTGGAGGAAATGGCTGATTGCGAAAGTTAATTACACTAGAAAATATCATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTG:1 + chrX 8334264 5' - flea 253 2 78.22 AAAATAAATTTCTTAGTTGTTCTATGAAAAAAATACTCTCCTCACATAATTTCCCTCCAAGAAACACATATAAGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTA:1 + chr3R 4095193 5' + gypsy4 6578 2 73.27 TTTCGTCTTAGCTTACAAGTGCCGAATCAACTACATGTAAGGATTAGCAATGAATATCGAAATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGA:1 - chr2L 9260419 5' - 297 385 2 68.32 TGGAAATCAAAGAACCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGACCCAGT:2 - chr3L 25350821 5' - baggins 5414 1 44.55 GCTGTCCATCCAGGGAATACGGAGTTTCGGCACCTATGCCGACGATCTTCAGAGTATAAAGTTTTCCTCGCCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTT:1 + chr2R 22421116 5' - 1360 2 2 75.25 CTTAAAGAAGGATCCATTTTGAAAGGATTGCGGTCGAAGCAATATACTAGTCGGCTTATTCAAGTGTACTGGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 + chr2R 10353244 5' - blood 7386 2 39.00 ACGTCCGCACCCTCTCGCTCGCACACCTGCCCGTTGTGCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chrX 4707844 5' - P-element 2850 1 42.57 ATGCTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chr3L 17181445 5' + jockey 4691 1 51.49 TTAATTTTTTTTTCTTTTTAAACTTAGACTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chrX 8996956 5' + roo 47 2 73.27 GAAAATCTCGCGATCGCCTCGAAATGCCTCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:2 + chr3R 18399198 5' - P-element 2841 1 33.66 AATATTTTTGCACGCGACAAACGGCCAACGTGCGGGATTAAGGATCTGGCGCACCGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 - chr3L 13295295 5' - hopper 1393 1 55.45 CAGCTCTTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGAGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3R 29608840 5' + roo 8682 2 51.25 AGTGTGAAAAACATAGCATAATATTACATCGCTTTTGAAATCATACAACAAGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 - chr2L 6362927 5' - 412 470 2 54.46 CTAAAGAAATTCTGGCTAAAAAAGCAAAATAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:2 - chr3L 2176367 5' - roo 9028 1 71.29 AGCGGGCGGAGGCAGGAAAGATACAAAATAGCCAAGGAGCCAATATACATACATATACATGTACATATACATCCACGTCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr2R 15349463 5' - P-element 2885 2 77.23 AGCCAAGCCCCTCAAGGCGATTGTCGTTTCTTGGTAGGTGTTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATC:1 - chr2R 15788640 5' - Transpac 5193 2 57.00 AATATGAATAATTATTCACGCTAATATCGTGTTTCGAAGGCTTTTCAATATGCAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTC:3 - chr2L 14220223 5' + springer 7163 2 53.47 GGCTTGTTTGTTTTAAAATTTGGCCGAATAGTTTGGGTTTGGGCAGTGGATTGTGGGTTGCTGCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1 + chr2L 16139094 5' - copia 241 1 61.39 GATCCCCTGGGTGGCCTTCTCCTTGAAGTTCTCCTTCGTTTTCATTAACAAAATCGATTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 19061204 5' - roo 394 1 64.36 CGAAACCACGAGCCACAAGAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 - chr2L 20328776 5' - opus 7468 2 62.38 GACCCCATGGATGACCCAGGGTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCAGTCCTTT:1 + chr2R 14349143 5' - mdg3 5447 2 76.29 GAGAAACAGATACTGGCATATACATACTACGAATATGCGTAGGCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACAT:1 + chr2L 4134804 5' + Quasimodo 11 2 69.31 AGGGAAAATGGCAGGAAAAGCGGCGGGGGAAAGTCGGGCATCCCGGCTATTATGCTCTCTATGTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATAAATTTAAAGA:1 + chr3L 2176290 5' + roo 8675 2 66.34 TTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAATTTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTCGTGTCCGCAATTCGTGCCTCAAGATATGAAC:1 - chr2L 17599966 5' + 1360 481 1 55.45 ACCCGTCGGAAAGCAGGATAGCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr3R 23543025 5' + 412 7079 2 54.46 CGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:2 - chr2R 22856580 5' - 1360 3344 1 75.25 CGCATAGAGCAATAATAAGTGCGAATAAGTGTCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3R 10087878 5' + roo 8709 2 73.27 TTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 19450174 5' + roo 8707 2 61.39 TTAGTTTCCTTATTATATTTAAATACCTTTGTTACATATCATTTTAAAAAATCAACTAAGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 + chr3R 5348642 5' - copia 240 1 65.35 TAATTAATGGCGTAGGTTTTTGGTAAGAATTGCCGCCATATCTAGGTTCTGTAGCCGAAGGGTTTTCCCCTTGTTTGCCGATGGTTGATTTGGGTTTTTTC:1 - chrX 576353 5' - X-element 456 1 74.26 ATAGCGTTGGCGATGTCAAAGATCGTCTTTGGAGCGTGACTTGTGCGGGTGACGACGAGAATGATGAACTTGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAA:1 - chrX 20418953 5' + invader4 2733 2 65.35 CTGCAGTCCTGTAGTCCTGCAGTCCCTCGGGCAACGCGTCGTATGCGCAATAAATAAATCTTGTGGACGCCGAAAAATGAATAAACGTGCTCCTTCCTTTA:1 + chr2R 23516950 5' - invader3 259 2 58.42 GCAAATAAAGTGTTAATAATATAGATGGCAGCGGCGGTGCAGTTTGCGCTTAATAATGCATAAGCCAGGTAAAGAAGTCACTTTGATAAATTTGTCACTAA:1 - chr3R 8172070 5' - Ivk 487 1 59.41 GAAGGCAGAAAGAGACAAGAAACCACCGTGACACTTGTTACGCGATGGGCTACGTGTTAAACGCATTTCCGCCACTTGTGTAATGATGAACTCCAATTCAG:1 - chrX 9413901 5' - 412 492 2 77.23 ATCAAACTCAGCCTGATTGATAGTCCTAACAATATGAACGTTTCTGCATAAGCAAGAAGCGCTCTCGCGCAGATCAAGGAAACAACCCACTAACCCAGTAC:1 + chrX 9654029 5' + Tom1 233 1 55.45 TGTAAGTAGATGTGTCAGCTATCCCCTAACTTTTATATATTCAGTAGCCTAGTACGTACTGACCTACATTAACATTGGACCTTCCCTTTTACCCTTCATTT:1 - chr2R 23664939 5' + hobo 2637 1 80.20 TTTTACAATGATTACCAAATTATTTATCTATTAAAAGAAAGATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:2 - chr3R 20420989 5' - blood 343 2 58.42 AAAGCTAGCCCGTCTTCCTCCTTCTCCTCCACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGA:1 + chr3R 6141731 5' + Doc 4536 1 70.30 CAACTTCATACCCAACTCAGAAAAACTATGTTGAAATCTTTTTAACATGCATCACCATCTGATTAAAAATATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAG:1 + chr3L 20454509 5' + invader4 2766 2 72.28 GGTGAATGCCTGCCATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2R 9870955 5' - roo 404 1 73.27 ATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3R 7869122 5' + 297 36 2 61.39 TCGAACGCACACTCACACANTTGCACCGTAATTAACTGCAAGCCACATGACGCCACTTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATC:1 - chr2R 982195 5' + gypsy6 7436 2 59.41 ATGCGTGCCGGCAAACAGCCTGGCCAGCACAAAAGCAATAAGCAAAAGCTTTATGAACTAAAAACATTATAGAAGCTATTTATTTAAACAAAAAAAAAAAG:1 + chr2R 24375155 5' + transib2 2635 1 74.26 GCTGGAGGAGCCAAAGAAAACTGTACTGTGCTTAACCGTAGAGTCGAGCCGGGCAAGGGCACAGAAGTCGAATGGAAATTTCGTACTTATCCTATAATTTG:1 - chr3L 25255323 5' - GATE 326 1 74.26 ATGGGCTGAAAAGTCGAATTGATTTTTCATTATGTATTTTTCTCACGCATATCCTAGCTTAGATTTGTATTGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAG:1 + chr2R 12150752 5' - mdg1 7242 2 44.55 GTTTAAGAAAATCGACCCGAAATAACCAATTACACACACACGCTTAAGTTGAGAGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCGCAGGCAAAGTCCACCGATTTT:1 - chr2L 7191022 5' - I-element 318 1 57.43 ACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr3R 11052104 5' + blood 36 2 65.35 GGTGCACAGCAAAAAGAATAAGATCTTCGAAAGTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 + chr3L 4565483 5' - copia 245 1 66.34 TAATGAGCTCAGGAAACGCCCTAAATTCAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr3L 7300508 5' + Doc 50 1 74.49 TATATGTATATATATATGTATATATGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCA:1 - chrX 4486479 5' + HMS-Beagle 48 2 75.25 CAGTACTTTAAACGAAATTCATTGTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTT:1 + chr2R 9699824 5' + Transpac 50 2 76.24 ATAGAGTACTAAAGTTCTAGGACACTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr2L 8176453 5' + 1360 51 1 76.24 TTTACACTAATTGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 + chr3L 19249675 5' + Transpac 4948 2 60.40 TGAAGCACAGACAACTGCTAGTTCTCAAAATTATGTTTATAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAG:1 - chr3R 21701154 5' + F-element 143 1 60.40 TTTGTTTTAAAATTTGGCCGAATAGTTTGGGTTTGGTCAGTTGATTGTGGGTTGCTGCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 + chr2L 16139100 5' - copia 235 1 59.41 AAGTCAACATTTATCTTGCNATATACGAAGCGGAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGATTGGCAGTCCCGGTGAGCG:1 - chr2L 7902427 5' + Rt1b 4990 1 72.28 TATATGTTTATTTGTCTGTTCACGCCACGTGAGCGTGTGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTGTGGTTGTGTGTGTC:1 - chrX 12135316 5' - gypsy3 413 1 64.36 TTTCTAAACAATATTTTAATATTATAATTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3L 10621701 5' + 412 51 2 79.21 AGGAGTGACTGCAGGTGTTCGCAATGCACTTCTGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTTGGAAAAATCGAATTTTT:1 + chrX 12768254 5' + FB 16 1 54.17 ATTTCCACATTTTTTGATTAGGCAAAAGGCTTAAAAAACAGCCCGCAACCTTGGTGTTAATAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAAC:1 + chr3L 8667149 5' + Doc 4456 1 60.40 CAAACGGAGGTGATACGAAGAAGACTGCTCAAAATGAATGATAAAATTGTTTAACAAACAAAAATATTAAAACATTTTTCAAAAGTATGGGCGTGACAGTT:1 - chr3R 26503991 5' - INE-1 247 1 66.34 TGTTTAAATGGCGGTGCCTGCTTGCCGTATTTGATCAACGAGGTAACTCATCTGTACAACTGCACTGCTCCAGGTTCGCCGAGGAGAGGGCGCAACTCGTT:1 + chr3R 24310064 5' + Rt1a 4618 1 64.36 GTCATGTGTGAATGTCACGGGATGCGCGTACCAATTGGAAGTGCAGTTCGAAGTGCGAGCATATAAGTGTCAGATTCGGTGCAAAAATAAGCGAATAATT:1 + chr2R 7016509 5' - transib2 207 1 77.00 TAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 9870970 5' - roo 389 2 59.41 TAATTTAAATCATCTTTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:2 + chr3L 27357545 5' - mdg1 396 2 51.49 AGGGGCAATTAATTTAATTAGTCTGACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 - chr2R 23780060 5' - mdg1 370 2 74.26 AAGCACAACACTTGAAAATATTTTGTATATTTTGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 10701723 5' + roo 8707 2 76.24 AAACACACACACACACACACACACGGGAGGCATAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATACACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATCTC:1 + chrX 7978950 5' + 412 7278 2 67.00 TATTTATATATATTAAGCATATAATTATATTTATGAATAGGAATAGGATACAAAATCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 17701525 5' + roo 8686 2 52.48 TGGTGATTAGGCCTCCCTTNCATGTCTAGAGTGTGGAAATGTATTGATATGCATCCCCCATGATTTGGACTCACACTGCGGTGAGCTAATAAGTTAAGTTA:1 + chr3R 12823351 5' + aurora-element 4217 1 74.26 ACCAGATCCAACTTGGAGACGATAGCCTGCAGCTGGGAATACTCCTCGCCTGATCCAATACGCAGGTGACATTGAATTCCATTCTGCCACCCTGAACTGG:1 - chr2R 21317328 5' + R2-element 3174 1 64.00 GGATAAAATTGAAGATCATCATGAACAATTCTTCTCACAGAACGCCGTGGCGATCCCAATATTGACGCTCTCACTGCTTCAATGTTCTCAGGTGATCTAAC:1 - chr2R 7394617 5' - mariner2 344 1 76.24 TTGCGTCTGGACAGAAAGCTGGACGAGATCGCAAGTCGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATTGTCTAGAAGGTTGATGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTC:1 + chr3L 14940153 5' - G2 2859 1 63.37 ATTGTGCTCACGCACAAGGNAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 13763200 5' - roo 9026 1 69.31 CGAATTGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 + chr3R 29608773 5' - roo 9045 1 56.44 TGCGAACCGTACCGTACCGCACTGAATGGAACCCGAACAGAGGGCAATTTTGGCCGTCACCAGAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTACGG:1 + chr3L 15189656 5' + 1360 3356 1 65.98 TTTTGTGCTTTTTCCTCCTTTTTTAATTCAACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2L 12958888 5' - roo 401 1 71.29 ACAGGCAAACAAAACGCAGCTCATAGTTTGGATTTCAGAATGGTGATGTCTCCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATA:2 + chr3L 10043561 5' + G6 1903 1 49.50 ACTTTTTGGTGGTCAGTCAATGGCCCGCAGAGAAAACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:2 - chr3R 11608042 5' + 1360 9 2 70.30 TGGTGAAATACCAGTGAAAATGGTAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2L 20620016 5' - roo 362 1 75.00 TTAATGGAAAGCATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:2 - chr3L 9910431 5' + 297 6607 2 61.39 GTAGTTACTCTCTATGTGGTTTAGTTTTAGGTTCACATAAATGCCGGATGGAAAAGCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2L 8577354 5' + roo 8683 2 61.39 CAAATTGAATTTCCATTTCAGTGGCCATTTTCCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 + chr3R 9088571 5' - hopper2 1566 2 64.36 GGACACTCTTCTCGGACTCTTCGCTCATATTTCAGCAGCTCATTGGAGCGGAAACATTTCGTCTGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2L 1783280 5' - roo 398 1 68.32 CCTTTATGCCTTTGTGTAATTAAAAGTAATTTTTGGATGGTTCCATTTGTGTTTAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr2R 8682422 5' - pogo 2082 1 60.40 CCGACCTGAGGGACCAAATAGTGTTGCTCGAGTTGCAGAATTGAGGACCAAGTCTGGAGTAATAATGCGGGCAGTGAACAAGCTGTGTCTACTTCCCCTTG:1 - chr2L 22745326 5' + diver2 4472 1 75.25 GATTACAAGCCATACACGTNCTCCATATATATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAA:2 - chr3R 25750221 5' - micropia 414 2 71.29 GCAATTAATCAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 - chr2L 17677774 5' + Tirant 8145 2 63.37 TACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 + chr2L 17730462 5' - pogo 2046 1 78.22 TTAGACAATAACCCAATTTCAACCAATAATAGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 8582556 5' + roo 8709 2 72.28 CTTCATCAATTATTTCAGTAAAGGAGATAAGAATAACGGAAACAGTTGTTATTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAG:1 + chr3R 19446743 5' - Doc 4231 1 53.47 CTAAGTTATGATGAATTAATATTAAATGTTTTTTAAAGTAATATTTGCTTCACTGAATAGCAATATAACATTCTAAAATGTTTTATTTGTTAATTTATTAT:1 + chr2L 8330331 5' - HeT-A 309 1 81.19 GAACGAGAGCGCTGCAAATTGTGTACATATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGT:1 - chr3R 8444446 5' + roo 8813 2 72.28 ATGTTAGTTACTACTTCAGTAGATCACCGTACTTATTGTCGAACTGCATTTTCCTTGTGCCCCTCCGACCATATAAAAAATATATATTCTTGATCAGGATC:1 - chr2L 22930393 5' + INE-1 80 1 68.32 TCAATAGACGACCATAAACTATAGTCTTTTCGTGACTGATAAGGTCTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACA:1 + chr3R 24542022 5' + 1360 30 1 52.48 ACAAGGAAGCTATAATAATGTTCATTTGTAATATCGACCAACAAGACATAATTTTTTACAACCAATTTGGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr2L 21190715 5' + pogo 4 1 73.27 TTATTTTAATTTCGTACGACAAACTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTT:1 - chr3R 18059032 5' + invader3 265 2 76.24 TTTACCCTCAGGCAATTTCNCTTGTGGTTTTTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chrX 7996425 5' - hobo 2893 1 68.32 TGTATGTGTGGGTCGTTTTCGTGGGCTGGTAGCAAAATGAAAAAATGAAACTTCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTT:1 + chrX 22789288 5' - Tabor 7323 2 73.27 TCAAACTGTGTACAAACAGCTTTGGCCTTAACGACATATGTGTGTGTGTGCGGGTTGTGCGGGTGTTTGTGCACGTGTGTGAGCATGTGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 9955473 5' - accord 187 2 48.00 TGGATGTAGCATAATTTCAGGCGCTCCTCCCACAGTTCGCAGTATGTACTTTCAGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr2R 11993974 5' + jockey 62 1 55.45 ATTGGGCGTCCGGCTTTAGCCAGGGTGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGGTCTCGCTTCTGATTTGGAGCGTCGGATGCGTTCA:1 - chr2L 19185147 5' - Porto1 212 1 74.75 CTTCTCCCCACGTTTTTGTCGACTACATTAAATAAGTTTTCCTCCTTGTCTTCTTAATTTCTCCTGGTTTACTTTCTCCTCTTCGTCTTTTGGCTTCTTCT:1 + chr3R 27505959 5' - TAHRE 289 2 48.51 TGCGTTTCCTTCCCATCCTGTGATTGGGATTAGGCGGAAGCGATCGGCTGGAGGTCGGTGAACCAGGAGTCAGTTGTGCCGTGCGCAAAAAGGGAAATA:1 + chrX 7787670 5' + gypsy8 305 1 80.81 GCTTGTTGACGACGTGACTNTAATGAGCTCAGGAAACGCCCTAAATTCAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3L 7300488 5' + Doc 33 1 55.45 TGCTGAATGCTTTAATGATTTTGTATTTATTCAACGCGTCACTGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 + chr3L 1586719 5' + Tirant 8138 2 57.43 AACCATTTGGAATTGATAATAAATTTTTGTTTTTTTTCGCATTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATC:1 - chr2R 3550650 5' - Doc2-element 4717 1 70.30 TAATTTCAGGCGCTCCTCCCACAGTTCGCAGTATGTACTTTCAGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr2R 11993985 5' + jockey 73 1 55.45 TATTGCCACGCCTCCGCTTGCTTCTAGTTCTTCGTCCAGCTGTGTGTCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - 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chr3L 22736997 5' + G-element 5 1 72.83 ACAACATTTTATTAACCTACCCACAGGCATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATG:1 - chr2R 8087090 5' + flea 44 2 72.28 ATTCTTTCCTTTAAAGTTCCAAACTCTTTGGTCGCTGCACTTGAAAAATTATGTGTTATGTAGTTGGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:2 + chrX 6457870 5' + hobo 10 1 69.31 TTATTCACAATGATATAGGNTAAAATCAATAGAGTACAAGTTAACAAGTAACATCAGGAAAAGCTGCGTGTGACGACGAACGACACATGAAGCTATACTTC:1 - chr3R 5027287 5' + Chouto 42 1 95.05 GAGTCCCATCAATCAAAACATATAAAATTAGAGGACATTGCACCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTG:1 + chr4 1065629 5' - S-element 1 2 59.41 CGAAGAGAAAAAAACTGAGACTGAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 + chr3L 16162132 5' + FB 54 1 78.22 AAAACCAAACTGCAATTAATCAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr2L 17677785 5' + Tirant 8134 2 54.46 TTACCCTATTTTTTTCAAANTAATATACACCTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTT:1 + chr3R 30553533 5' - 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chr3L 18328851 5' - Doc2-element 235 1 70.27 GATTCGATCAGATTGGACAAAATCAAATGCGTCTTGTTCTGTCGTCGGGTGATGTTAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 + chrX 8038596 5' + 297 9 2 71.29 AGTTCTCGAATAACTGTGCCGTTCTGCATTTGACCAAACAGTCACTATGTTTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATT:3 - chr3L 2022333 5' + roo 5 2 73.27 TGCCAATATTGCAAGGGAAAATTTCTGTTACATATTTATCAGTACTTTAAACGAAATTCATTGTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 + chr2R 9699785 5' + Transpac 4929 2 76.00 TTTCGGGCAACGTGGCAACGCTAATAAAGTCAACACTAAAAGCCTCGTTCAATATTCAATTAGACGCACAACACACACACACACACACACACACATACATG:1 + chr3L 9324606 5' + Quasimodo 38 2 80.20 TTAGGCCTTTTTCAAGGCCCTGAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGAC:1 + chrX 17397114 5' + opus 175 4 78.22 GTTGGCGGCCTACAATGACTACACCATGCGACACGATCTGGCCATGATGAAACTGAAATCCCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3L 7542023 5' + roo 8677 2 66.67 ATTTTCTACAGACTGGGATTTTTTAATATTCTGAACTTTAGGGTAGGGCAATCTGCGAACACAATTACACCTGTGTTTCGCAGGCAACAAATTCGCATGCT:1 - chr3L 23740565 5' + Gypsy12A_LTR 2003 1 62.38 CAGCAACAAAAATGTATTTCTTATTAAGTATAATTTTACAATATAACTACTGCGTTTGGAAGTGAAGTAATAGACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAA:1 - chr2R 16748888 5' - McClintock 6096 2 63.37 TGTCTCGCATATTTTGGCCATAATCTTGGTTGCAATTAAAAGGACCCAATTTGTAGCTGGCCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCA:1 - chrX 20418080 5' + flea 4570 1 74.26 ATTGTACACTCTTTTTTTTTCATTTTATTTCTTAATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGA:1 - chr3L 15439339 5' + INE-1 544 1 61.39 AATAATATAAAAGATGGCCAACGATAGGGGTGAGGAGTTTGAGCTGAAAAGTGTTTCCAAGTTAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGA:1 - chr2L 14754413 5' + invader1 3983 2 65.35 AATCTGTAGCGGTCGAGTTTACATTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTACTAAAGGGACCACTAGAGCCAGGCTCTTAAGGAAAGTGGTCAAAGGTAGGGT:1 + chr3R 29078016 5' + Gypsy12A_LTR 1946 3 76.00 AAATGGATTTTTGCATTTCAAACAAAGGGATAATTATAAATTACAACAGGTTATGGGCCCAGTCCATGACTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGAT:1 - chr3L 3612875 5' + copia 307 1 67.00 AACTGCTGTTATTTTCTTTAGATATATTGGGTTGTAAGACATGTAAGAAACCTAAAATAATTTCACTAAAAAAATTCTAAAAGCAATTGTAAAAAAAAGA:1 + chrX 15910374 5' + mdg3 5071 1 67.00 TGTTTTCTTAATAACTCAATATGATTTCGTGTGATTCTTATATAGTTTCCATTTAGCTTTATATACGATGAACGATATTCAATAATAAAAAAAAATAAAAA:1 - chr2L 11810408 5' + gypsy7 5000 7 79.21 TATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGC:1 + chrX 13383542 5' - R1A1-element 5154 1 54.46 CAGAAAAACTATGTTGAAATCTTTTTAACATGCATCACCATCTGATTAAAAATATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATT:1 + chr3L 20454526 5' + invader4 24 2 55.45 CAATTAAGTATCGAATACCTAATAATTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 + chr2L 20118401 5' - copia 204 2 80.20 CACTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 12944691 5' - roo 360 2 78.22 AATTAGGGGGCAGCATTTTAATTAGACTTAAGTGCTGCTGCCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTA:1 + chr3L 1998813 5' - hopper 1383 1 54.46 GGAAGCCAGCCCAGCAGTTCTAATTTGAATATTCTGCTGATGCTTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTGACCAG:1 - chr3R 21440975 5' - Quasimodo 145 2 55.45 TTGCGAGATATACCATCTGCTCCCTCGTAGGCGCTGGTGTAGCCATCCTCTGTCTTGATGATCTCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chr2R 11259546 5' - hobo 2938 1 70.79 AGCAAAGTTCATAAAAAATACAATTTTGTTTTAAGCTTTTTTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCA:1 - chr2L 23320316 5' - 297 6826 2 63.37 CCACTGCTGCAAGATGCCCTCGATGATGAGCTGTCCGGCGATTATAACAATAATAATAACAAT:1 - chrX 7687128 5' + mdg1 7056 2 90.48 TATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACT:1 + chr3L 27356075 5' - Tc3 1687 1 63.37 GGTGAAAACTTTTGCAAACAATAAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 17660525 5' - roo 9018 2 79.21 TCCGAAAATCCCCAGTACGTGCCATTCTGTTTGGTAAAGATCCTAACTGTGCGTATGTGTGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chrX 15287845 5' - hobo 2922 1 58.42 AAACAAAAAACTTCCGCTGTCAACGGCGTTTCAGTCCCCGTATCTCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2R 9649242 5' + roo 31 2 57.43 TCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr3R 10741096 5' - 1360 3356 1 62.38 ATTCCTCCTTCGACAAGTTTTCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATA:1 - chrX 3013401 5' + accord 192 2 76.14 ATCCCTCTCTATCTATTTGTGTGTCTGCCTGTGAAACACCGGTGTAATCGTGTCCGCGGATTGACGTACCCTACCGATGACCACTTTCCTTAAGAGCATGG:1 + chr3L 10162337 5' - Gypsy12A_LTR 1934 1 80.20 GTGCACGTTACATATGGGTTTTCCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATAT:1 - chrX 21500751 5' + X-element 4560 1 78.22 TGCGTTTATGTGAATACATTAAACCATTTTCGGATGTCTTGTTGGGAACCAAAGGGTATGTAAAGCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCA:1 - chr3R 12340895 5' + transib2 10 1 71.29 TGTGCCGTTCTGCATTTGACCAAACAGTCACTATGTTTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3L 2022319 5' + roo 19 2 61.39 TGGGCGATTCGATCAGATTGGACAAAATCAAATGCGTCTTGTTCTGTCGTCGGGTGATGTTAAAATATATATATATAGTGACGTTTTTGGGTGGTCCAAA:1 + chrX 8038591 5' + 297 3 2 77.00 GCAATTTTACCATAAGTAGTCTAGCAGCCGGCTTCTAAAAAGTACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr2L 2833859 5' - roo 9040 1 57.43 TAGCAAAATGAAAAAATGANACTTCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:1 + chrX 22789317 5' - Tabor 455 2 56.44 AAATTGGTTTGCCGCCCCCGGAAACGCTTGAAAGTCCAGCGTACAGTTAAGGCCAGTTGAGTTTTGGTGGCTAAATAGTTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGC:1 - chrX 8961747 5' - Porto1 4442 1 59.41 TGTATCAAGTCAAGCTCAATTACAATAAGTGTTGTTCCTCCGTGAATATAACAATAAAAGGATCAAGACCCTAATGACACACCTGAAAAACACCGTGCGCA:1 - chr3R 8237249 5' + baggins 5104 1 65.35 CAATTTATTAAAAAAAAATATATATACAATGGTCTTTATTTACTACGGATTACTGGAGTTAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGG:1 - chr2R 5954077 5' + micropia 5330 2 55.00 AATACATATATGGAACAGCACTCCAACCAACTCTATGGTTACACCCACCCACAGCTCCTTCCACACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT:1 + chrX 4696099 5' - accord 7030 3 69.77 TAAATGTGTGTGTGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTAC:1 - chr3L 3540222 5' + mdg3 5266 1 65.35 AGCAGCAGCAGCTGGCTGTGTTTAGTGCGCTCTGTTGGCCGAAAGCAGAGCTGCTAGCGCTGGCCACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGT:1 - chr2R 6846980 5' + mdg1 399 2 71.29 CGTTTAGAGTAATAAAACACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAAC:3 - chr2R 16185113 5' + 17.6 6948 1 59.41 TATCAGCAATACGCAGTGACATACATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAAT:1 - chrX 18326259 5' + Doc 197 1 63.37 ACGGGGGCGTATCGAAAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 10625663 5' - roo 388 2 58.59 CGCCACACAACCCCAGTCCACTCCACTTTGCCACGCCGCTTTTTAACAGAATCACAAAGTTGAGTAGAAGTTTTGCGGCAATTTTGCTTGAACAAACAGCT:1 - chr3L 1085126 5' - transib3 178 1 59.41 AAAGCTCTCAGAAAAAGTATTAATCCAGAGCGGAGAGCGCTACAGCAAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACG:1 - chr3L 14131532 5' + 1360 169 1 74.26 CAGGCTCTGACGTTGGCTGACGTCGTCCTGGGTCTCTACTCTACCAGGCTGTTCACTGAACTGCAAAAGTGCGCGAAATTAGGCGGTAACAAAAA:1 - chr2L 1137261 5' + Tc1 197 1 73.68 ACAGCAGATTAAGCGCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACCAA:1 - chr2L 12808241 5' + Tirant 8130 2 58.42 AACATCCAAGGCAACAAACAGGCAAAAACGGCCAAAAACAGCCAGAGGAGCTTGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr3R 23542942 5' - 412 7522 2 54.46 GACTCTGTGTGTTTAGGGTACGCGAAAAAATGGCAACACACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTTAAATCTTTTATGGTTATATTCACGGAGCAG:1 + chr2L 1937850 5' - baggins 5059 1 67.33 TAATGAATTTAATGGAAAGCATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:2 - chr3L 9910439 5' + 297 18 2 60.40 CACATACAGGCGCAAATGAACAGGAAGAAAAGGAGGCCCCCAAATGTATGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCA:1 + chr3L 13895328 5' + hobo 2710 1 78.22 AATAAAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chr2L 7175572 5' + blood 7054 2 65.35 AAAAGATAAAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 13093768 5' - roo 9044 1 54.46 TGTGCCATAACCAGCACACACACATACACACACACACATTC:1 + chrX 14346194 5' + accord 185 2 73.17 TTGGCGCGAGGGGAGTTTCGTTGCGAAGGGAGTGGAATGGGAATGTGCCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr3R 29287569 5' - hobo 2911 1 54.46 GCTATCTGAAAATTTTCTGCTATTCTTCGCTCGCAAGTCAGGCCAACTGATATTTAAATTGGTTAGGCCACACAGCACGAATCATTTCATAAAATGATACT:1 - chr3L 12910847 5' + Doc3-element 4631 1 62.38 AATTTGAATACTGTCGTACCAACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTC:2 + chr2L 14793471 5' + Stalker2 7260 2 67.33 AATATGAATATTTACCATAACTACGCAAACAGACGCACACACGCACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCGTACCATCGGC:1 - chr3L 12287930 5' + Bica 4679 1 66.34 GTTGGGGTACAAGCATGGCTAAAAATTCCGGCTACCCGTTGCCGAGATGCCGAAAAGGTAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGC:1 - chr3R 5942410 5' - Doc 359 1 56.44 ATTTGATCAAATCGAAATGAAACCCGTTTCATTTTTGGGCAACGTTTTATGCTAGCATTCGGCTGTTGGTATTAATATTATTATTTGTATTATTATTATTA:1 + chr2R 12542366 5' - mdg1 39 2 79.21 ATCGGAAATGGATAAATGAATGAATTCCCATGCCTTTTTTATTAACGACCTTCCTTTAGGTATAAAACATTCGTGAGTACGCAGACGATGTTAAATTTTGT:1 - chr2R 5154980 5' + Q-element 579 2 48.51 CATAAAATGTGCGCGTTTGATGTTAATTCGATCGTTAAGCGGACTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr2R 21351013 5' + opus 23 2 55.10 AAACGCAATTATGTGGAAAAGTGAAAACTCATTTGGACTCATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAG:1 + chr3L 15039030 5' + roo 8821 2 61.39 ATAGCAAAAAAGTGCAAAAATAAGGGATGCAACGCAGGGGGTAGGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr2L 20238766 5' + hobo 32 1 53.47 ACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGTTAACATTTTTTTTCTATTTACTTAAACATATTTCCCATAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAA:1 - chr3L 10574322 5' + Rt1a 5080 12 47.52 GGAGAATGGGAACTCCCCTGACATGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 8765520 5' - roo 397 1 67.33 GAAATAGAACTTATCAGCAATACGCAGTGACATACATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTA:1 - chrX 18326270 5' + Doc 186 1 74.26 TCGGGGAAGTGAAGGCGGGACTACACGCTTTTTGTATGAATGCTGATCGGCACTCGTTTCTAATCTCGTGAGGTAATTTGCCAGCTATTGAGAACATTGTT:1 - chr2R 8514432 5' - BS 397 1 63.37 AAGCAGCCGCAACAACAACNAAGAGGCGAAGATAGCCAAAGCAATTGTTGTTGTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 2289344 5' - roo 9047 1 54.46 TAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTG:1 - chr3L 19274850 5' - transib2 2768 1 82.18 CTCGAGCACCGTATATCCCAGAAAGTCCAGGGTAAGTTCACCGGGTAAAATCACCTCCATTCGGACTCCACCCTAATATAACCACTGCTTTACATACCCTT:1 - chr2R 12362388 5' - Circe 7146 1 61.39 CTGATTGTCAAAGCTTGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3L 3757420 5' - roo 9049 2 57.43 AACAGAATAGCATGTCCTATCAAGGGTTTTTAAGTGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTG:1 + chr3R 20094439 5' - Max-element 8514 2 57.00 AGAAATGTGCACAATTTTTNATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 10087805 5' - roo 9057 1 63.37 ACGTTCTGGCATCTTTGCTNAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr2L 10792026 5' + 412 7094 2 65.35 CGGTGATTCTATGGTGACTGTCGAGTAAACAACATCTCTTCAAAATTCTCTTATTCCAGATTTTTATATAATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 - chr3L 15788521 5' - opus 7498 2 64.65 CTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr2R 4939191 5' + roo 8706 2 69.31 TGCGGTGTACAAATTTGATACATTTCGTGGTTTAGAATGTTGGTAACTGATTTCGGCTTAAAACCTCGTTTTATTAGGGGTTCCTGAAATTTCCTCAGGGG:1 + chr2R 21445298 5' - Fw2 468 1 64.36 AAAGCTATTGAAAATCTTATATTGGTAGAAGTTGTTGAACTTTGCTGTGCTTGTTTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 + chr2R 17459138 5' - Transpac 294 2 63.37 CATTAAGATCTTAATGCACTTTTATGATGTGAAAATCTACTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTT:1 - chr3R 23164720 5' - invader3 5425 2 62.38 ATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 9278384 5' - roo 9028 1 70.30 ATCTGTGCGCGTTTATTTTAATGTTACGTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr2L 10792001 5' + 412 7069 2 63.37 ATGGTAACATCGAAACCACGAGCCACAAGAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 - chr2L 20328786 5' - opus 475 2 56.44 TGGTCATACTATATTCCCANTTGCATTTACGACCAGACATTTGCATCTGTGGTTAGGTACATCGACCCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr3R 22330799 5' + I-element 30 1 67.33 CAATACCCGTGGCTTGGGCACATCCAGATTGGGTGGTATGAACACCCCCAGAAAAACGCTCCACCAGGAAACGACATTTTTTCTTCACTGGATTTTCAGAA:1 - chr3R 23847049 5' + mdg3 486 1 58.42 TATGCAGCAATGGGCAAACAATTGCCGTCAAAGCAGGAAAAGCAGGTAGCAAGGATAACCCTCCGCCAGCCACCGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTT:1 + chr3L 6023254 5' + hopper 5 2 74.26 ATCTCAGATCGGTCCGTGCACATCGAAGCCACATAGCATCCGGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCG:1 - chr2L 19524003 5' + X-element 4484 1 58.42 AGCTCATGGGCTGTTATGGCAGGGAATAGGTGCATTTTTCACTTCTTTGTTTTTTTTT:1 - chr3L 4774902 5' - Porto1 169 3 79.31 TTATACATTTATTGGTTGAATAGCTAGCTGGTGCTGTTCTCCCTTAAGTAAGTCACAAAAAACCTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGC:1 + chr2L 3408598 5' + G-element 16 1 61.39 CTGGCCACGACAGTTACCTNGCCTTCCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCTCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTG:1 + chr2R 24870657 5' + Max-element 345 1 75.25 GTTAGGAAACAATTTGTTGGCGCTTATTATAATCGGCAAGGCCACCGAAAATCAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 17496900 5' + R2-element 3584 1 65.75 TTCTTTTTGCGGCTCTTTAAGCAGGTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTGCATC:1 - chr2R 8177754 5' - mdg1 372 2 67.33 GTTGCTATAACTTTGAAAGAAGCTATTAGTGTTTCGCAACAGAAAACCAAATCGTGCTGAATTCGTCATTTAATATTACTTTATTACTTTTACTGAAATAG:1 - chr3L 13337259 5' - Tabor 454 2 34.65 GACATGCGCACGCCAATGGAGCGCCAAATTTGCTGTCAAGTTGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCC:2 - chr2L 10053716 5' + F-element 4478 1 58.42 TTTGATTGGTTCAGTGAGTNGATATATAAATATTTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 11960504 5' - gypsy11 3937 2 95.74 CTCAAATGTAGGAAAAAGCGGGTCAAAACAAGAGAGCATGGTATAGTTGATTTCCCCGACCATCAGATACTCGTTACTCAACT:1 + chrX 22741653 5' - INE-1 545 1 54.22 GATGTGAGGTGGGCAGGATTTTTCACCGTCTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGAT:2 + chr3R 13739686 5' + Burdock 46 2 70.30 CAATATTGCGACTCAGTGTGAGTGGGTGAGTCCCCTTTTTTATTTACATTCTTGAGCAAATTCACAACAACGTAAAGCCCCGAAATCATCAATATTTTGTA:1 - chrX 4065413 5' + HB 253 1 67.33 AATGAAATATGTATTGTGAACATGAAACAGTATTAATCAGAATTTCATTTGAATCCGAATTCCCTAGGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTA:1 - chr2R 17138781 5' - 3S18 329 2 67.33 CCTAGCCACTTTTCGCGGACTTTTTCAACGACAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCAT:1 + chr2R 12457930 5' + HMS-Beagle 6836 2 67.33 CCAAACATGGGGAACTGCAGCATGCCGCCTGTTATTTTTTGCTCTCTAATCAGAGCGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGG:1 + chr2R 13383495 5' - gypsy5 392 2 59.00 ACGGCAACAACATCTGTGAAGATGCCAGCATAATTATAATAATCATTTCATAATCATATTTTATTCTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCAC:1 - chrX 8727947 5' + X-element 15 1 64.36 ACGAGTACTTGTAAATTTTAAATCTCTTTATTGATTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTT:1 - chr3L 20317866 5' + 3S18 42 2 63.37 GTTGGGTAAATAGATTTTTTCATATAAATAATCCAGTTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 + chr3L 20758942 5' - flea 220 2 63.37 ACGTCCGCCAGATAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr3R 28565270 5' + 412 40 2 65.35 ACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr3R 11052104 5' + blood 7046 2 65.00 CTTTACTCATAAAAATATTTAAAAGTTCAAAAAAGAAAAAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATTGCCA:1 - chr2R 4269712 5' + 1360 328 1 78.22 TATTTTTGGTCAGAATCACATAATAGTAGAGTTGTCCGTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTC:1 - chr3R 6612577 5' + I-element 5088 1 62.38 GACGTGAATAAAAATTTATGCGCACAAAAGTATGCCACACAACATGCACATAAAATGATTATTATACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGC:1 - chr3R 20332946 5' - jockey 4981 1 64.36 AAAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3L 15037929 5' + roo 46 2 72.28 GCCGATTAGGAGAGCAAACAAAGCTTTAACCCTTAACCCTAACCAACATCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chrX 21217584 5' + pogo 23 1 54.46 CACCGGAGGCAACAATTTCCATTTGGCGTTCGCTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr2L 17994152 5' - roo 366 1 63.37 TATTCTAAACAATTTTGCAGCATTTAAATACAATCAGAATACACAGAAGATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chr2L 11478671 5' - opus 7475 2 55.45 GGCAGATAACCCACCCAATGTGGGTCTTTCGATTGAGTAAGAGCGCTCTGAACTTCCGCCAGCAGAATGCGGACCACTGAAACTCTCGCTCCTGATTTTGA:1 + chrX 6633490 5' - Porto1 228 1 62.38 CTTGGTGAAGCCAATTTTTACAGGCAATTAATTTCTGCCAAATTGTAATAAACCAATATTTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 - chr2L 7175626 5' - blood 7353 2 61.39 CAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATG:1 - chr3R 15790066 5' + flea 4744 1 67.33 GAAAGAGGGTAAACAACAAATTGCATACTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1 + chrX 15546136 5' - blood 357 2 59.41 TGGAGAGTGGCAGTGCTTAAAGTGCAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:2 + chr3R 9278344 5' + roo 49 2 78.22 ATTCAAAATGAATTGAACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:2 + chrX 11016996 5' - roo 9032 1 64.36 TTGTAGATTTAAGAAATTATTTTCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGG:1 + chr2L 8959909 5' + Ivk 5103 1 50.50 ATAATTTCCTATGGCCTATCAACTCAATCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:2 - chr3L 12112386 5' - 1360 3342 1 74.26 GTGAATGAATTATTAATGTTTCTAATAAGACTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3L 3757355 5' + roo 8709 2 76.24 TTCATTCGAATGGTCACCCCAAAATGGTCGGTTGTAAGCCGTGTTATTATTATTATTACTTGTGTTTATTATTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTG:1 - chrX 12130333 5' + 3S18 5766 2 78.35 GGGCGCATCCCATCAATGATGTTTCTAATGCAATTTTACCATAAGTAGTCTAGCAGCCGGCTTCTAAAAAGTACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr2L 2833830 5' - roo 406 1 75.25 CAAGTGTAAGTCACTCAGTTCTGAATAAGAGTGCTGACTAATCGTAGTTCGGCTGGAGCTGGTAACTCTCAAAAATTT:1 + chr4 712669 5' + baggins 179 1 73.08 TGGTCATAAATCAAAACTTGTTCCCCAGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGAC:1 + chr2L 18655626 5' + F-element 4378 1 73.27 CCAAGTAAATGAGACTTTGAGAAAAATGGTTATTTATATGCAGAAATAAGGCGAATGAAAATGTATTCATGTTATATACATCATTCAGCGAGCACAATCAA:1 + chr2L 13422214 5' + F-element 4316 1 73.27 AAAAAAAAACCTAACGTCAACGAAAAGGGCTACAGGAACAGGGAAACAGACGAATCAGAATGTGAAA:1 - chr3L 70770 5' - INE-1 285 1 91.04 GTTCCGCAACCGATTCCGCNGATATAACAATATACAAAATAATTAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 12479488 5' + jockey2 3406 1 94.55 TCCCCTCCGCCCCCGCCATCTGTTCATTTTCGTGCACCTTTACCTGTACTTAATTGAGTTACCAAAGTATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGT:1 + chr2L 12809397 5' - Tirant 8306 2 74.26 TTAAACTCGGGCGTAAAAAATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTGGTTGTGATCCA:2 + chr2R 12812289 5' + jockey 64 1 73.27 CAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 8765557 5' - roo 359 2 75.25 GAACGTCTTTTGTTGCCCGCGCATAAATTTTCGGCTTGGCACAACGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCT:1 - chr3R 31381751 5' - flea 4811 2 56.44 GGATTGGATATGTGTTTTTCACCAGAGTATGCAAATTTGCTGTAATTTACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTA:1 - chrX 8200882 5' + hopper 1386 1 53.47 TATTACGTTACCTTTCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chr2L 20560333 5' + F-element 42 1 54.46 AAATAATTTGCTGGACAACGAGAAGGCAAGGAATTTAAATGAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGT:1 - chr3R 14580362 5' - blood 7354 2 58.42 AAATATAAAACTTTAGAAATGCGAGGAAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAA:1 + chr2L 19642316 5' - Quasimodo 7352 2 63.01 ATGTTTCGTATGAATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAATAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTT:1 - chr3R 25086159 5' - Bari1 1669 1 61.39 GAGTTCCAAAAACATCTTCTCGTCGTTCTACAAACTCTGTTTTCCTGTTCGGTCCCGGGAAACAACTAGCCCAGTCGCTAACGGAGAGTCCGGGCAAGTGG:1 - chr2R 13564883 5' + baggins 290 1 55.45 AAGCAAATACCAACACGGGTAATATGCAAACAAAGGTATATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTT:1 - chr2L 15567170 5' - 17.6 7386 2 66.34 TATATGAATAATATCGAAATACAATTTCAGTTAAATAATTAGTTCTAATTACCATTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr3L 21519057 5' - 1360 3369 1 57.43 CGGTTAAAGTTATGTTGCACCTGGTTTGGTATAAAAACTCTCGCTGCAGTCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTG:1 - chrX 267064 5' - Gypsy6A_LTR 260 1 61.39 AATGAAGTTCGTGATTCGGAGGAAAATGGACAACGACTGCGTTCTAAAACATATTTTTATTACTTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGG:1 - chr2R 2972231 5' + Gypsy6A_LTR 262 1 66.34 AAATTCTAGGGTGAAAGTTGCTTAATTATATTATTTATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chrX 4399578 5' + I-element 41 1 71.29 TAAACAGCAGCCACCGTACGCTATTTCGGTTTATGTTCTCACATTTGCATCTGCTTAAATGCGATACTTTCCCAAAAACCAAAAGAAAAAGAAAAGATAAA:1 - chr3R 21933529 5' + Doc2-element 217 1 57.43 TGCCAGTCAGAGCAAATCGCAGATAGTCAGCTAGTCAGACGCAAAACCTCCTCCTTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTT:1 - chr2R 14997937 5' + McClintock 14 2 64.36 CTAAGTGCTGCAATTATGCACTCGCTTAAGCAACGCTGCGTAAACGCAATTCCAATGTATGCATTGTTCCGCTGCGAAGAGAGTCGGCGCTCGTCTTGG:1 - chrX 18414806 5' - Doc3-element 259 1 61.62 TTTATTGTGGGATTGCATATGGTCGAGCCATGAAATGCTAATTAGCTAAATTGATTACACAGCGAGAAATGGGGTCGATGTTATTATTATTATTATTATTA:1 + chr3R 22330682 5' - mdg1 7080 8 80.20 GCTGGCAAGGACCCGTCGGAAAGCAGGATAGCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 23543035 5' + 412 16 2 63.37 AAAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAG:1 - chrY 2720380 5' - 297 389 2 75.25 TTGTATGTATAAAAGCCATACAAAGCGCGCTCAAAGTTCAGTTATACGCCATATTTTATGAACAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 + chr3R 27928893 5' - mdg1 412 2 64.29 TGGGATTGAAGCAAATAGAGCCCGCAAGAGTGAGGAGCGCGCCTTTGCCGTTGTGGCCTACTTTTCAAGCGGATGTTCGGTTATTAAAACACAGCGTGCAT:1 + chr3R 28820690 5' + mariner2 197 1 72.28 CAAAAGGGTAAATAATTTAGATTTCAAATTTCAATCAAATACGAATGCATTTCCTGCCATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTG:1 - chr3R 15715471 5' - F-element 55 1 62.38 ACGCAGAAGTCTGTATGTGTGTGGAAAATTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATT:1 + chr3L 5415362 5' - 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HB 399 1 73.74 TGTTTGTGCAATCAATTTGATATTATTTGTGTTATCCAAGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTG:1 - chr3R 12157820 5' + McClintock 129 2 65.35 GGCGCGTGTTTGTGAGTGTGTGTTTATGTTTGATAAAATGCGATATGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr3R 29287495 5' + hobo 28 1 55.45 CAGCTCACACTCGAAGGTCGAGTTAACATATTCACCAGGACTTACTAGGATGTAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATA:1 - chr2L 14762034 5' + mdg1 25 2 54.46 CCATAATCTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGCTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAA:1 + chrX 22398527 5' - Gypsy6A_LTR 163 1 66.34 TGCATATCCAGATAATAATGTTGGATCTGTGTTCGCTACACGACCTCATCATGCGTTTCGCCATTCTATTTATGAGTTTCTTGTTTTTTTTTTTCTTTCT:1 + chr2R 11626304 5' - gypsy7 5011 1 75.00 AGTGCAATTCACTGAAATACTTGTTTTTCGTTTGCTGGATCGGTGTTGTTTCCTTGTGGCTGGAAGAGGGGGCATGATAACTCCTC:1 - chr2L 2599565 5' + accord2 207 1 74.42 ATTATTTTATTGTTTATTTACTATTGATATTTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTTTCGAGCCTTTTCAGGTATCTCTCGCTGAGCCTGGAGATTTCAT:1 - chr3R 19449921 5' - G6 1775 1 69.31 CTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr3R 10741087 5' - 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roo 9050 2 54.46 GTGAATTGCACACATTTAGCGGCTGCATTGCACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 - chr3L 10363872 5' + P-element 43 1 37.62 AGCTAAAAATATGTTAGACAAGGCAAAAGCCGATAGAAAGATAAAATATGATAGAAATATTAGTAACTTAGTTATATGCGATCCGATTTAAGCGAAATAA:1 + chr3R 27843010 5' - Tc3 1655 1 69.00 AATTCACTTCGCCATCTATCATTTCCAATATTGCATTGAACTGAGCCCACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3R 20684930 5' + roo 8693 2 57.43 AGCAGAGGCGAGGGCGACAAACTAACGCTGCGAGCTGACTTTCTGAAAGGCTGGGAGAGGGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr3R 7626468 5' + hobo 7 1 71.88 GAAGTGCACAAAGGCCACAAGCTGTAAGATATATGTAATGTAGAAGCAAAAGGAAAAATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:2 + chrX 13126194 5' - mdg1 7440 2 53.47 TAGCAAAATGAAAAAATGAAACTTCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:1 + chrX 22789317 5' - Tabor 455 2 56.44 GCACAGAACGAGTCCTGTGGCAAACACTGGGAATGAGAGCGGGGCAAAATGGTAGGAAACCCCGGGATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATAT:3 - chr3R 13739765 5' - Burdock 246 2 70.30 TGGGGAGTTTAGAGGACTANGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr2L 17730445 5' - 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roo 391 2 64.36 GTGTTGACAGTACCATCAATTTCCAAGAAGACAATTAACTCATCTTACACTCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr2R 20312661 5' - 1360 3365 1 53.47 ACTGCTGTTGGTTGGCCATCAAATCCTATCCTCACCCGCAGAATAAGGATAAATCAAATTTCGCGTTCGCATTTCCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGAT:1 + chr3R 31966412 5' + INE-1 545 1 54.46 GTTTTTATTTTTTTATAATGTCCTCGAAAAATGAGCGCCATACTTAATGGGTGCGTATCTATGCACTCGACAAAATAAATCCAAAAAATATAATATTAATT:1 + chr3L 10483695 5' + Burdock 405 1 52.48 CTTGTATATATTTTTAGTCAATTTCGTTAATACTGTCTGTTCTCCCTAAGTTTTTTTTTTTAGGTTAGAGTTGATTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGTCTCC:1 + chr3L 25255871 5' - Burdock 344 1 61.39 ATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 - chrY 2720345 5' - 297 355 2 73.00 AATGAAGAATGTCACTCAGNTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr2L 16153379 5' + Doc 59 1 74.26 ACTACCTTATGGTGTGATTGTTTCGGCACTATTTAAACCTACATATATATTCATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3R 22494089 5' + 297 6595 2 66.34 GCACTCGCCAACTCTCTAATTTCTTCCCACACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATT:1 + chr3L 12106826 5' - 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1360 3333 1 81.19 CCAACGAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAA:1 - chr3R 29759843 5' - hopper 149 110 85.71 TACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr3R 7869131 5' + 297 44 2 70.00 TACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2R 9871056 5' + roo 8691 2 52.48 ACTGTACTTGCCCAACGACCGGCCAGCAACGACCACTTTAAAATCTACCACGCCTACACAAGTGAAGACATCGAACCGGGAAGCGTTGCGATACAAAGTCG:1 - chr2L 30915 5' + ZAM 80 2 54.46 ATGACAGTTGAGGCGATGTCGCAGAGGGCGCGTTTTAATTACGACAGATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACG:1 - chrX 15263497 5' + invader3 43 2 56.44 CAATGAATGTGAATGAATTNTTAATGTTTCTAATAAGACTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3L 3757347 5' + roo 37 2 67.33 CGGCTCTCTTTCGGGCTTCTTCAGCCAATCGGGCGCACTCTTGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCT:1 - chr3R 7063193 5' - jockey 4608 1 57.58 TATTGCGAATTATAGAATTNTAAAGACATCTTTCACGAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTG:1 + chr2L 3699415 5' - mdg3 206 2 63.37 TTACTGGGTTAAATTTAATTAATTTGTCTCGTCGCCCCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr2R 22553090 5' - 1360 3350 1 65.35 CAGAGGTGATTCTCACTCGAACAAGCTGGAATAAATCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGG:1 + chr3R 20273534 5' + roo 9062 1 67.33 TAGAAGTTGTTGAACTTTGCTGTGCTTGTTTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 + chr2R 17459163 5' - Transpac 5188 2 66.34 ACTCCTTCAATCAGCCGCAGAGCTGGTCCTGTGAGTGTGGGTCTTAAGCCCACTTCGTGGCTGTGTAATATGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATA:1 + chr2L 15531777 5' - Stalker2 7635 2 62.38 GCTAGTTAAATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chrX 13146914 5' - roo 9040 1 59.41 TTTATGGCGAAAACAATTTNATTGGCTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 13190113 5' - roo 9019 2 74.26 GGTCATGCCGCTCCGCCTCCTGCCGCTCCTGCTGATCCTTCGGCTCCTGCTGGTCGAATCGGTTTTGTTTTTTTGTTGTTTCGTATGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr2R 16470420 5' - Quasimodo 39 2 74.00 GACTTGGACCCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAA:1 + chr2L 12808159 5' - Tirant 8476 2 58.00 CTTTTTTGGGTCCTTCAAACTTTTGTCGTAAATAGATAGTTAGATCATTCTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAG:1 + chr2R 4743528 5' + Cr1a 103 1 66.00 ATTCGGTCGACTGCAAACANCAACAACAGCAAATAAAAAACAAAACAAAAAT:1 + chr2L 1912134 5' + Porto1 189 1 82.69 ATCCTGTAAGACCTGCACAAAAGTTGCCCAGCTGGATGTCGTTCCTTTGTTCGCGTATCCTTACTACTGAATAAATTACAAAAGACAATGCTATAGTCGAG:1 - chr3R 12330853 5' - INE-1 577 1 61.39 TTATTAACATTTTCGAAAAACATATACATGCATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCGAAAGATCGT:1 - chr2R 9699869 5' - Transpac 5191 2 68.00 ATCTTCGCCCCCACTTATTTCCTGATCTGTGTCGTAAGACAACAAAATTATGAAACTGCGTTCGTATTCCCACTAACTGAGTAACGGGTATCTGTTAGTCT:1 - chr2L 21272986 5' + INE-1 550 1 80.20 GCAATATTTGATTCAAGTTGAGCCCCATTTAAACGAGCAAAGTGAGAATAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 - chr2L 22241804 5' + pogo 24 1 55.45 TCAAGAGGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAA:1 + chr3R 7783732 5' + rover 25 2 55.45 AAGGCCCAAAGTGGGGAAGTGAAGGGAGGATATCAAGGAGGTATGTATTTAAATTGCACGGCGACACCAGCGAAGCCCCATTTTTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 + chr3R 9206112 5' + hopper 143 7 51.49 ATGGAGTGTCTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAACA:1 - chr3R 16533700 5' + X-element 4380 1 29.70 AGAACACTCAAACTGTTTACTAGTTTTGCGGCTTACTCGATAAAATTGTGGTATAAGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chrX 5475474 5' + 412 7071 2 59.41 GAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr2L 8577273 5' - roo 9039 1 62.38 TGCGACGACAAGTTCTTAGCGCAGACTTTTCGCCCCAGCAAAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGA:2 + chr3L 9910352 5' - 297 365 2 60.40 AGGCAAATTCAGCGAAATAACTAAACCAAAAAGTCAGGCCAAACATAAAACGGCAAAGGCAAACAAAACAGAGAGGCGAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2R 18941082 5' - accord 7030 2 76.24 TTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATA:1 - chr3R 1844817 5' + Cr1a 158 1 73.27 TGTACGCACATTTTTTAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr3R 8582613 5' - roo 9041 1 54.46 TCTCAAACGAAAAAAAAAAGAGGAAGGGTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGG:1 + chr3L 8036817 5' - hopper 46 1 69.70 AAAAGGTTGTTGAACTGGTNCCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTACGTTTGTTTGTGTGTTCTGATGTTGTTATTTTTATT:1 - chr2L 14674655 5' - G4 3663 1 75.82 ACTAAGTGCTCTAATCGAAAGCAAAAATGTGGGCGTATTTCCATGGGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTCG:1 - chr2R 16967001 5' - invader4 371 1 63.37 GTCAATTGAAGGGGTTCCTCCTAATGGCAATAGTTGTTTGTTTTCAATCGTTTTTATATGACTAAAAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCC:1 + chr2R 18188290 5' + Juan 4036 1 67.33 AATTTGTAGTAAACCGAATTTGCGCTCTTGTATTACTTATAAAGAAATAAGTAATTACACTCAATACGGTAACTACTTGATTAATAATAAAGACAATAAAC:1 + chr2R 15800602 5' + Transpac 4753 1 63.37 ATAATATGGCCATGAAGATAGTAATTTGCCCTTTAAAAGTAATTTAGATCTGAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:2 + chr2L 12866874 5' - mdg1 7438 2 59.41 TATCAAGCATTTTTCGCAGTGCACTCCTCACTCATGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chrX 4264404 5' + mdg3 5292 2 62.38 AACCCAACCAACCAATGCAAAACAAAGACAAGCCGAAAGACAACTCGAAAGTTCAGGTTTTAGATATTGCATTTGGATTTCGTTAATGTTGTTTTGTTT:1 - chr3L 16811138 5' - gypsy9 454 1 75.76 GTTCGAGGTTGCTGGCACACTGAAATATTGCGTATACGCAATGGGGTATGCCATATAGTGCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGC:1 - chrX 3110339 5' - Tirant 143 2 71.28 ACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATTTGTGGCGAGTACTTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCC:1 + chrX 23439054 5' - R1A1-element 5235 1 61.39 AACAAAATTAAATTCAATTTATCCATTTTGCATAACCCAATACGTTTTATTGCCATAGTATAGAAGACTATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGT:1 - chrX 22689629 5' + 1731 10 2 66.34 TTCCGAACACTCTGCTGCTGTTTAGCGCCAATGATACACCCGCTCCTTTGCAAACGGATATAAACTACTTAAAGGAAGACTATAATTTGAAATGGATAATC:1 - chr2R 18658622 5' - hopper 1156 2 79.21 TCACTCTTATTCGTTCACTCAAGTGCACACAATTCAGCGATTCAACGTCATCAGTGCGGGGAAAGGCGATATTATGAGCTACAAATATATGTATATTAAAT:1 - chrX 11320597 5' + transib3 2622 1 64.36 GATCGACGCTTACGTTTAACACGCATGGAAAATCAAAAAATCAAAAAACCAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 2831598 5' + R2-element 3583 2 70.49 CTGCATACACACACAGATATATTTTATCCTTTTTTCAATATGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chrX 12231648 5' + hobo 35 1 58.42 CGCATCAGAAAATATTGAATATGAAAACTTAAATACCATGCATTCCAAATCTTAATTATTTTTCCTTTATTTTGTCGTGGATAAGCAAAATTACTCAATAA:1 - chr3R 17055302 5' + Circe 6992 1 74.26 TGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAG:1 + chr3R 11151843 5' - mdg3 5445 2 76.24 GCGTGAGTGCCAGGATGCAGATACACTCCCGCCATTGTTTGCAGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAAC:1 - chr2R 13383579 5' + gypsy5 6970 2 55.45 CAGGGCAAGAGAATTATTGGCACAAAACGCGCGCCCAATGCCCCACATAGCCACACATAAGAGGGAAAACCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACAT:1 - chrX 840879 5' + Porto1 4376 1 68.32 TTTCAGGCAACTCCTCAGCATAGAAGGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 2022236 5' - roo 9050 2 54.95 CCTGCAAATAAACAGAAACCCGACTTTGTCTCTCGGTGTGCGCCTGCGCGTTTTCTGGCGCTTGAGCGAGGCATGTCTGTTACGAGTAACGATCGAAAACT:1 + chr3L 9171900 5' - invader1 3919 2 53.47 AGAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr2R 22856586 5' - 1360 3350 1 69.31 ATTGCATCGCCAAGGTCGCTCTATAGATAGGATTGCTCAACGACGATCAAAACAAATGTCGCCAAGTTATAAAGCCTGAGGAGCCAAAAATGACTTGTTGG:1 + chr3R 14495755 5' + Cr1a 494 1 54.46 GTGAGAAAAGATAAAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2L 13093763 5' - roo 9049 2 56.44 ACCCCACACCCACACTGCCATCCAATTTCTCTTTTTCGGTCATTTGCACTGTGTAAATAATTTTGACGTGTAAAAATTGTGTGTAAATACTTTTGTCAACA:1 - chr3L 18652069 5' - Bari2 70 2 57.43 TTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 3757389 5' - roo 354 2 81.19 CAACTCACGTCCTACTCCTTGACCTTTATCGAAGGTAAACAAACCCAACTAAACTGTGGGCTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGC:1 + chr3L 6038640 5' - 412 302 2 66.34 GGATGGATGGATTTGCTGGTCGTGTGAATGTTGGACAATGAAACCCACTTGTTCGGTGGGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr2R 21040838 5' - P-element 2870 1 56.44 TTGGTAATGTAGTACATGAGGTGAAATTAACGTATAAATCGATAATTTAATTTATCATAAAAAAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTT:1 + chr2L 16851695 5' - HMS-Beagle 237 2 70.30 GTATCTTTCTGGCTTTGCGTTTTTCTTTTCTTTTTGCGGCTCTTTAAGCAGGTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 - chr2R 8177781 5' - mdg1 7437 2 52.48 TCTCATTATGTGCTCGAGCTCCGTCTTGGGTTACATATTTTTCATAAGCATATGTATGTGCATAATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAA:1 + chr2R 18952217 5' + F-element 4287 1 68.32 GAAATGGAAAATTCAACAAAATGCATATTTACTGCTTGCTATAGAAGGGCTCCAAAGGCTGGGTAGGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAG:1 + chr3L 3880960 5' - blood 368 2 70.30 AGATGCACTCGAAAAAATCATATTAAATGATTCACACCGAAAATGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr3R 17971718 5' + 412 31 2 55.45 ACTACACCATGCGACACGATCTGGCCATGATGAAACTGAAATCCCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3L 7542006 5' + roo 32 2 57.43 TCGAGTAGACGCCCCACGAAGCCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr2L 20567841 5' + 297 52 2 79.21 CGTAATGAGTGGGTGGCTGGCTGGCGGTGTGGTGTGGTGTGAGCCCGAGGGGTCATCCAGGCATCAAAAGAGAAGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAAT:1 + chr2L 21933126 5' - Copia1_DM 77 1 79.21 CCACCTTGCGCTACTTTTTATTTCCAGAATCCCAGGCTGCTAATAGACTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTAAGCTGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTT:1 - chr2L 22216574 5' + diver2 67 2 71.29 TGGCACCTGAAATCCACCCAAGTGCAGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAG:1 + chr2L 23048361 5' - McClintock 6047 2 74.26 TTTCGTTACTTCCTGGGCCGATGAGGTGGGCGAGGTCTGTTAAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTG:1 + chr3R 20408335 5' - X-element 4404 1 76.24 TTCAAGTGCCCAAGTGCAAATCCCCGAGAGAAATGTATAAGACTAATATAAACGTGAATAAATATCAACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGTAATTTT:1 + chrX 9429850 5' - INE-1 245 1 78.22 CTCATTGTGCTGCAAATGGGGGTGGCAGGTGGAGAACACCTCTTGGGGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 23338339 5' - roo 9042 1 54.46 GTGGCACCAAAAAATCGTCCAGCAAATGTCCAGGAATGCAATGGGCAGCAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr3L 872706 5' - 412 7526 2 49.46 GCCAACTTCCGCCTTCTCTTTGGAGGCGGGACAACTTCAGCTTTCGTTCAGTTAGTCTATGCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 13773868 5' - roo 396 1 66.00 TATTGACTCTCAAGAGCGAGGAGGCGATAAAGGCTGAGAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr2R 22856622 5' + 1360 3 2 76.24 GCTCGAGTCGCTTGACGGTTCCAATAATCGTTAAAGCGACCATAAAATAATCACCTAATGTACATATTGCCCATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAG:1 - chr3L 11829132 5' - Transpac 310 1 79.21 AACAGGAAAAAAAAAAGGAAAAATAAA:1 - chr3R 27422834 5' + Doc2-element 250 2 85.19 ACTTGAGTTTGGCCCGAAGTGCGCACGAAAAAAGCGAGTTTAAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 - chrX 4166438 5' - I-element 5323 1 58.59 ATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGATCCTCGG:1 + chr3L 17181465 5' + jockey 4711 1 61.39 AATTATTGGTGAGACACTTTCTAGAGTCCGTCATTTGATGAACGAAAATGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTGAATTTTCCG:1 - chr3R 20095120 5' - Max-element 367 1 60.40 CCGTAGTGCCAGTTGCCCTAGTTGACCAACTCAAATCGCTTCCTAGTTGTACACAAATCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAA:1 + chr3R 18968785 5' - R1A1-element 5016 1 60.40 GGTGCGGGGAGTAAGGGGAAAGCGGGATCCTGTGGCAACCGAAGCAGAATTTTGTCTGCTGACGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1 - chr2L 12882824 5' - hopper 1402 1 64.36 TGGTACTCTGCTTTTGCCTACTCATGGTAGCGAGTTTTTGCCTTTTAAAACTTTAAATTTTTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 + chr3R 10782243 5' + Doc 22 1 57.43 CAACGCCGAGCGAGAAATTACAAAAATGAGAGAACGCTGAAGTCGAGTTCTTCGGCTATCAGATACCCGTTACTCCGATAAAAAGCCGGAAATTTTGGTAT:1 - chr3R 4681804 5' - transib4 2625 2 70.30 CGCGCAAAATTCAATTAGCCAACCTTGTTATCTTCCTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 12605908 5' - Doc2-element 251 1 91.49 TTTAACAACTTCTTGAAAATACCAAAATATTACTTTAAGGACAAGTTCATCCATAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - 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chr3R 10087901 5' + roo 22 2 57.43 CAAAAAAACGCTCGTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 + chr3L 5710236 5' - Transpac 5203 2 54.46 TAAGTGAGGAAGACTGGAATGCCTAGATCGACTTGGCTAGTTATCCGGCTAAAAGAGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGCCATCAAA:1 - chr2R 8158576 5' - copia 462 1 55.00 CTTTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGAATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCAATGTCCGTATGAACGTCGAGATCTAAGGAACTATAAAAGCTAGAAGG:1 + chr2L 17268903 5' + INE-1 156 1 90.10 TGGCCGCTGTCCTTGCGTAGTTGGTCATTCTCCTTGGCGAATTGGTCGTTGTATCGATGCAGGGTGGCTAATCGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCA:1 + chr2R 15688601 5' - accord 475 2 77.23 CTCATTGGCTTTCAGCTATTTGTATACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAG:1 - chr2R 11160572 5' + jockey 4728 1 79.21 GGGGTTGCTGGTCGGCTGATTGTCGCTCTTTTGGAGAGCTCGACAAAAAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTC:1 + chr3R 19499429 5' - F-element 337 1 52.48 ATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGGTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr3R 11608002 5' - 1360 3350 1 71.43 AGAAGTTCAACGGACGAATGCAAAATGTTCGACTTTTGGACAACAAACTTAAACTTTTGTTTATTTCGTACACTAATAAAACTGAATAGTTGTGATGCCTC:1 - chr3R 7514015 5' - diver 227 1 75.25 TACGTTTTATTTTCAAAAACAAATTTTTTTTTATGATTTTTGTGTTTGTTGTATGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3R 12063823 5' + 412 20 2 58.42 ACAACAATAAGATCGTTTGTAAACAATTAAAATAATTTGCTGGACAACGAGAAGGCAAGGAATTTAAATGAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:1 - chr3R 14580391 5' - blood 7383 2 72.28 AATATGTAAGGTCTATGAAAAATGTAGTAGTAGTAGCCTCAAATATGTAAACATCCCTAATTTTTTGTACATTATTCCATTTTTTAAATAACATATTTTTA:1 + chr2L 18603552 5' + hopper 164 1 69.31 CTTCATCTAACTCAAGGAAATTATTCCTTTATGAACTTATTGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGAC:1 - chrX 15078226 5' + Bica 39 1 72.00 AACTTCGAATATAAGCATGTGCGGCAGCAAACAATGGGTGCAACAACTATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 - chr2R 13653441 5' + F-element 15 1 69.31 CAGGACTCCGAGGACTCGCAGAATGCGAAGGACTCTCCCCTTCACTCATAACCAACGAATGATGGAGGACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGA:1 - chr2R 13653779 5' - F-element 16 1 69.31 TATCTACTTTAATGGAAACAAATATATCCCCTTTATTGCCAATTGAAAATATAGAACATTATATGTACATTCTCTTATTACTTTAAATTTGAAAAATACAT:1 - chr3R 14611890 5' - copia 4671 1 77.23 GTTGAAAGGTCAAAAAATCAATTTACCTGTAAGCGCCTGTGATAAATGTATATTTTAATGCTTTATGTAAGTATAATACTTTAATAATATAATAATAATAA:1 - chr3R 4543755 5' + invader3 5051 5 81.19 ATAATACCCACGAGATATATAGTATTTTTGGTGCGAACTTAAAAGTTGCCCGCACTGTGCCCCAAACTCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAA:1 - chrX 9627490 5' + HeT-A 5955 1 63.00 AAAAGGAGGCCCCCAAATGTATGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:3 + chr3L 13895355 5' - hobo 2913 1 51.49 TCGTAACATCATGAGGTTGAGGAAATATGGTTTCCTTTGAGCCTGGCAAGCAAATGTCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3R 27056444 5' + jockey 35 1 50.50 GAGAGCGGGACAACCACATGCAGAGTATGAGCGCACACAAATCAAACAATTATAAACTCGTTGTTGGTAAAGTGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 + chr3L 12468181 5' + jockey 4675 1 70.00 TTTCAATTTACGAATAACCGTTCAATCATCGCCGCTAATCAAGTGTTTCAAACAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 17994221 5' + roo 8685 2 58.42 AAGCTGCACTAATAATATTTAATTTCAGAGCACATGCGTTGTAGACCAATTCACGAGCCTCTTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACACCTGGATGG:1 + chrX 1400320 5' - G5 4394 1 61.39 CGTTCACAATGATATTCACCAATTGAACGGTTTTTAATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTT:1 - chr2R 5772524 5' - HMS-Beagle 215 2 62.38 ACATCGATTTTTTCGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:1 - chr3R 7869196 5' - 297 6951 2 55.45 TTGTGATGGTTTAACAACAAACTCGCATAAAGCAGACAGGCGGACGGACCAGTACACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTTCAATAATGTGTTTTT:1 + chr2L 19681410 5' - hopper 1391 1 54.55 CCAATTCAAAAGGCGGAGACGTTCGATGAAAATAAGAAAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTAT:1 + chrX 9177138 5' + 297 6513 1 72.28 GAAAAAATCATATTAAATGATTCACACCGAAAATGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3R 17971708 5' + 412 7094 2 65.35 TTCGCTGCCAATTAAAAGAAGCAAATAGAACACACATACGAAAAAAAAAAGGAAAATAAAAAT:1 - chr3R 14069686 5' + Doc2-element 253 1 73.02 CCTGATTGTGTTCGTTCCGCTGGTTTTTGCCCAATGCCAGCTGATTTAACAAGGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATCTTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 11017067 5' + roo 8686 2 53.47 TATAATGTGGAAATTATTGAAATTACCACCACTAACTGAGTAGCTGCCAGTTAAGGAGCTCGTATATAAATATATATGTCGAAGAGTCATGAGAATGCCCT:2 + chr3L 18122274 5' - invader1 399 2 74.26 GTGTCAGTTGGCATTTCCACTCGGAATGCCTTCGGAGCAGATAGAGATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 2833930 5' + roo 8686 2 53.76 GTGAACATTTACGAATAAATAAAGGGACTTTATTACGTTACCTTTCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAA:2 + chr2L 20560303 5' + F-element 13 1 69.31 CCCACGCCGCCACTGCCACCAAAATGCAGGCGCTGGCCTTTATCTGTTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chr3R 11321085 5' + hobo 27 1 52.48 AAGAATGGAGAATGGGAACTCCCCTGACATGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr3R 8765514 5' - roo 404 1 74.00 CTTCGAGCGGCTTAATTAATTAAAGTCAATCTCGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGC:1 + chr3R 13929730 5' - Quasimodo 96 2 67.33 AATTGCATTCCCTAAAACTTGTATTAAATGTATTTTGTAACTACCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chr3R 25581101 5' - pogo 2071 1 53.47 CGCGAATATATAAATATGCACGCTCATGAATAGAGGAAACACTATTTCAATGAGGTGCAAAAGAGCTGTGTATCGTACCGATGTGGTTATACGGGATCGAG:1 + chrX 21639364 5' + Helena 1065 1 75.25 TCAACTTACAGGGCCTCAACGCCTACGGACGATAATGTGGGCTACAAATTAGCTGAGCACAGCAGACAAAACAAAGCAGCTATCAGGTGGGCATCGAGCCG:1 - chr2R 9760429 5' + Bari2 273 1 75.25 TACTAATATATTTGATATTATACTATAATAAGTAGGGTAACCATCCCAGAAGGGTCTGTCCTTAAAGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr3L 20411891 5' - roo 409 1 78.22 AAAAATAAAACAGGAAAATATATTCAGGCTTTTATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr2R 5953169 5' + 297 6618 2 70.30 ATTCCATTCCATGTCTATGTTGAATGTTTTATATACATTTTTTAAAAAGGTTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 - chr2R 22134263 5' - opus 7480 2 56.44 CGTCTAGTTATCGTTAGAAAGATTACAAATTGTTCTAGATGTTCTGACATGTTCTGAAAACATCGGTTCAATATTTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAA:1 + chr3L 23419717 5' + FB 3 1 44.55 ATCTCACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTC:1 - chr3R 10391238 5' - invader4 3048 2 62.24 ATTGTGATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3L 9928529 5' - roo 9045 1 52.48 TCATATATCTATGATAACGTTATGATTATGACTGGATGACTAAACCTTTGTAGATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3L 20411781 5' + roo 8685 2 55.56 TATATAAATTGGGAAAAGAGAAACTACACAAAAATACGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTT:1 + chr3R 27907631 5' - mdg3 207 2 68.32 TGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGC:1 - chr3R 15790056 5' + flea 4753 1 77.00 AGAAAACTCCTAGTCCGGTAAGGGGTAACTATGCGATTGACATCAAAACAAGAGAGAATTCCATAGTCGAGTTCCCCGACTATTAGATACTCGTTACTCAG:1 + chr4 515580 5' - INE-1 547 1 65.35 ATCCTACTGCCCGCAAACATCCATGCCCATAAATGGCCTACGGTGGGTTATTTTCGCCATTGATGCGGTTGTGGTTTGATTCGCTTTTTGTTTGTTTAATT:1 + chr3L 14911947 5' - invader2 411 1 62.38 TTTTCCATTCATATCAGTACAGAATATTATCAATAAAACAAAAGGGTTAAAATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 - chr3L 12303458 5' - blood 7367 2 52.48 AATGTAAATTGAAATACACNAACATGGCTAAAATAGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chrX 8503169 5' - roo 9032 1 69.31 TGGATTGTGGATTGATAACAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr3L 7345398 5' + pogo 52 1 78.22 ATAGCAGGCGTTGGGGTTCNAGATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTTGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCC:1 - chrX 9836388 5' - F-element 244 1 76.24 TTACACTAATTGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr3L 19249676 5' + Transpac 30 2 61.39 CCACATATACACTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr3R 12944682 5' - roo 9033 1 69.31 ATATGAGCGGACCAGTAGATATTACCAATTTACCCGCTGGGCACAATTCCCAGAAAATAATGTCACATATTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCT:1 - chr3R 25751035 5' + micropia 5185 1 79.21 GAGGTTTGTCTGTAAGGATTAAAGTTTGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAA:1 - chr3R 20094528 5' + Max-element 8256 2 58.42 AAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATAACTTTTGTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr3L 21144040 5' + jockey 11 1 65.00 CGGATCAGAACATCGACTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAAT:1 - chr2L 2544133 5' - gtwin 407 2 80.61 AGAATAACAAGCGGCGGCGATTCGAGTCGAGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 10488688 5' + roo 45 2 69.31 GCTTGTAACTGTTCTCGCAGGGTGTTCGCTTTGCCTTCTCTCTCACACTCTCTTCCGATCCGATGCAACCGGCGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 - chr2R 17420931 5' + pogo 2 1 77.23 CCTGCGAATTCAAAAGTCCNTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chr3R 19449454 5' - hobo 2899 1 63.92 TGGCGCAATGCTTAAAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3R 19449522 5' + hobo 18 1 61.39 GTAGCTCTATGGCAAACAATAAGAAAAATTATTTAATTTAATTACAGTTTTGAGTAAACACATCAGTTATTAGTTTTGGCACAAGCTGGCACAAATCATTT:1 + chr2L 16414038 5' - transib3 417 1 65.35 CAAACAAAACAAAATGGCACCCATAAATTTAAATACCAGTATTTGCATTCCTATCTTGATTTTTCCTTTATTTTATCGTTGATAAGCAAAATTACTCAATA:1 + chr3L 2920766 5' + Circe 6991 1 84.16 GGACAGGTTTATTGGGTGTCCACTGCTCTTGTTGACGATCACCCATAATCAATATAAATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 - chr2R 9905433 5' + mdg3 5271 2 60.40 TTAATTACTGGGGCATTATCTGTATTCACTCTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAA:1 + chr2R 19234931 5' - Stalker 69 4 79.21 TAAGTTATGATGAATTAATATTAAATGTTTTTTAAAGTAATATTTGCTTCACTGAATAGCAATATAACATTCTAAAATGTTTTATTTGTTAATTTATTATT:1 + chr2L 8330332 5' - HeT-A 308 1 80.20 ATCGCTTAACACCTTGTTGGCCCCCGGGGCTATCGATTCGCTTTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGC:1 + chr2R 16576488 5' + R1A1-element 5048 1 57.00 AGTACAGTGAGATAGGCCGGTAAGAGTTTAGCATGGTTTTATCTGCGTCTGATTTCGCAATTGCTGTTTTGGTATCGAGAATATACTAAACGAGATGCACC:1 - chr2R 5617275 5' + Gypsy12A_LTR 120 1 75.25 ACATATGTATGTATATGCACATACACATATACATATATATATATGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTC:1 + chr3L 20248320 5' - 3S18 6071 2 61.39 ATATTGCGGAATAACGCACCATAAATTTCAAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 + chr2L 16153348 5' + Doc 28 1 56.44 AGCGCTGGGCGGGGGGTAGCTTTGCATAAATCGATCTGAGGTCTGAGCCTGTCTCGTCTTGACACCTTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACACT:1 - chr3L 13260309 5' - R1A1-element 400 1 54.46 AGTTTCCGACTGCGCGAGAGTGTGTTTGACTTTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTACGTGTGTACGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGT:1 - chr3R 6419107 5' - accord 7100 2 56.44 TGGGCGATGTTTACCAACATTGAGCACAAACTGCGCAGTTTGCGTTTTAATAAACATTTCTTTGGCAACAGCACTTAGCCGTTCTTGTAAACAAATCCTAA:1 - chr3R 19246549 5' + 17.6 199 2 68.32 GCTATCGACAGCCGCTTTTTCGATTTGTGCATCTAGTTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCAC:1 + chr2R 5642017 5' - invader3 209 2 63.37 TTATACGGATAAAATTGAAGATCATCATGAACAATTCTTCTCACAGAACGCCGTGGCGATCCCAATATTGACGCTCTCACTGCTTCAATGTTC:1 - chr3L 9833294 5' - mariner2 358 1 70.97 GAAGGGAGCCTGCAGCTGCAGGGACTTGAAGCTCAGGGTGTGTGTGTTTGAGAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATA:1 - chr2R 9208874 5' - Tirant 8486 2 50.50 CACAATACAGGACGAATTCCGCCTCAAGTTGTCGAGCTAAGAGTGCACTTGAGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 9649144 5' - roo 405 1 75.00 TCTAACGCCTCTGAAAACGGTATCTGCGCCCATAAAGGGAATACTCGTTCTATGACAAAACTCCATTTCAATCACCATTCCTATTAAGGTTTTTCTTCTCC:1 + chr3R 26435370 5' + Juan 4026 1 77.23 AAAATGTGAAAAGACGCAAAGAACTGGAAAACTTCATGGGAAAGACACCAAATAATTTAGAACGGTACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTG:1 + chrX 13250594 5' - McClintock 439 2 59.41 CTTCCGATATCAGTGAGGATATAGTTGAATCTCAACCGAAAGAGCAAAAGAACACCATGGATCAAAATTCCTCAATAACGGTGCCAGGACTTGGTGGACTC:1 - chr2L 12404083 5' + Tc1 1275 1 57.43 CGTCATCGCTGGCTTAATGACTTTTTGACTCCCCTCGCACGCAGTTTTCCGTATGACTTTATGCTCTCTCAAAAGAGAGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTT:1 - chr3L 22381522 5' - invader3 135 2 66.34 TGGCTTGTTTGTTTTAAAATTTGGCCGAATAGTTTGGGTTTGGTCAGTTGATTGTGGGTTGCTGCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:2 + chr2L 16139093 5' - copia 242 1 66.34 TGTCCCGATAGGCACTCAACAGCCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGT:1 + chr3L 1877365 5' - F-element 239 1 79.21 CAGCTTGCTAATATGCGTGTTCTTAGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 - chr3R 20905450 5' - pogo 2052 1 72.28 GTACAACTTTCCAAATATTATTGTGGGAAGAATTGCCCTCACCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 - chr3R 4474251 5' - copia 237 1 55.56 GGAGGGATTTATTGCACACNTTGTAATATCTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGC:1 + chr2L 9045432 5' - jockey 4947 1 71.29 CGAGCAAAGCAGCAACAACGAAACGCAGTTTAGGGCCTGCATTTTTGCGATAGTGTGAAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACACAAGAACAAAACTT:1 + chr2L 2226707 5' - Cr1a 386 1 62.24 TTCGCACAATAGAAAAGTGTTGCATACTCCAAGGTCAGTGGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGAGTTCGCGTGTGTGTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 - chr3L 9775735 5' + hobo 2708 1 74.26 ATTTACACTAATTGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 + chr3L 19249674 5' + Transpac 4947 2 59.41 AGACTTTGATAAAAGGAAANTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGT:1 + chr3R 4357537 5' - Tc3 1683 1 54.46 GGTAACATTTTTAGCAAAANTGTTCCAATTATGCGGGCCGTTCGAGTCAAGTCGTGAAAAGTAAGTTTTGTTGTAAAATTATAACCTGCGGGCGTGTCAAT:1 - chr2L 13869035 5' + Gypsy12A_LTR 320 1 57.43 ATATATAGACGGAAGCCCCTCTACAAAAAACAAAATAATCATTGAATCACAAGATGCAAATCCCACTGCATCACCAAGATTACGGCCATCAACA:1 - chr3R 14236725 5' + rover 6884 1 70.21 ACAAGTTAGGTATGCAAAGNAAAGGAAACTAAAGATTGATCGCACCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGCGAAGGGCTTCCTTCGC:1 - chr2L 22323300 5' - Gypsy6A_LTR 342 1 73.27 AATCCTTAACCTAATCTCATACCCTAATTTTCTGGGTAAAAACCTTTGTTGACTGCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chrX 10451543 5' - hobo 2918 1 58.42 TGTTTACGGACGTACAGACATTGCGATGAGTGTGTGTGTGCGTGTCGAGTTAAAATGGAGGGGGCTAGAAATTCAGATGACAAAGTTAAAAAAATAAAAAA:1 - chr3L 11004266 5' + TAHRE 10439 1 54.46 TAATCCATCTTTTGTATCAGCGCAAATGCCATAGGCAGGATTCGGTTTCATTTGAGTTAAATTTGCTGTTCCATGAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTA:1 + chrX 7292641 5' + 3S18 3 2 76.24 AGTTTATGACTTGTCGTGGGAGTTTGTCTACTCATGATTCTGTGAATTTTATGAGGAATGGTGATTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 - chr3R 26435483 5' - Juan 4203 1 65.35 TTTAGGGCTTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr2L 21086033 5' - roo 9034 1 68.32 AATTAAAAAAGCATACTGCACGGGGCACTCGAATAGGACTCAAGTATAAGAGTATAAATAATATGCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTAT:1 + chrX 1706019 5' + Juan 4060 1 62.38 ACCAGAGTCCAGAGTCCAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTGTATACCCCTTATCATAAATCATTGTAGATCTAACTATG:1 + chr2L 3380374 5' + Cr1a 4151 1 81.11 TAATTTCAAAACTAGAGCTCAACTAAAAATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCA:1 + chrX 7157278 5' - blood 332 2 71.29 GGGCCGGGGTCATAAACTGTCAAACATTTACTTTCGCTTCCTCCATCGAAGTGGCAGTCTTAACCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:2 - chr2R 19840285 5' - roo 397 1 65.35 CAACGAGACCATAGACCAGAGACCAAATCGAAATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGTAACCTCATGGAAATAATAAGAACCATGCACGCAC:1 - chrX 3002436 5' + invader4 434 1 74.26 GTTCGCATTGGTTTTCCATTAAAATTCAATTATATTTATTGCACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTATGTCTTTCCAATTGTGTGCGC:1 + chr3R 15868294 5' + Ivk 37 1 79.21 ATGAATGTGAGATATGTACTTTTGTGTCTCTGTATACATGTTATTGTATGGTATTACTTTTGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGG:1 - chr3R 29128162 5' - Ivk 232 1 67.33 TGTTGGCTTGTATCGAAACAAAATAAAATGTAGTTATGCATTGCATACAAAGTACTAACTTGGATACCATTTACCAAAGAAATAGATATAAA:1 + chr3R 28403335 5' + Tc1-2 475 1 77.17 AACCTATGGCATCTGTAAGATAGATCGCAAGATTCAGGCAAAATATTCCTAAGCATAGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3L 7345324 5' - pogo 2083 1 58.42 AAGGGCTCCAAAGGCTGGGTAGGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 + chr3L 3881004 5' - blood 7349 2 73.86 GCTTCCCTGTCAGAGTCAGCACGCCGGAGTCGGCCTGGCCAAAGACACTGGGATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTGCACACGATTTTTTCG:1 - chr3L 23773862 5' + 1360 41 1 74.26 TATACTTTAGTTTGCGATAGGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr2L 16680070 5' - P-element 2835 1 29.70 GTGAAATAAATGATTAAATATTAACGACGCTAATAAGAATGCATCTCCGACATGTATAAATTAACTAAAGATAGATCGCACCGTCTTGCGATACTGTCGTC:1 - chr2L 23390430 5' - Gypsy6A_LTR 378 1 57.43 TTTTTGGCCGCCAAAAGGAGGCTAATTCAATTAAAGAAAACTTTCAAAACATGGCAAGCCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACG:1 - chr3R 10183071 5' - R1A1-element 90 1 63.37 TCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCAC:1 - chr3R 19449404 5' + roo 8650 1 75.25 ATATATGCTTACAAAATAGTAAAAAAAAAAAGAAAAAA:1 + chrX 9020654 5' + BS 5101 4 92.11 CCCCTGACATGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 8765534 5' - roo 9046 1 53.47 AAACAAAAACGTTACTTTCTAATCGAAACAGCGAATTTAAATTAGACACCTTTGAAACAAAAAAAGAGAGAAACCTATAGTCCAGTTCCCCGACTATCAGA:1 + chr2R 5217683 5' - INE-1 561 1 63.37 ATGCAGAAATAAGGCGAATGAAAATGTATTCATGTTATATACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGT:1 + chr2L 13422251 5' + F-element 4353 1 60.40 AGCGTCCGCTGCAGCAGCAGCCTCCGCTCTCTCTCCTCTCCTTGTCAAACTTACCGGGACTGCCAGTCAAAGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGGGATGCC:1 + chrX 4111382 5' - Rt1b 4958 2 82.18 CATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCA:1 - chrX 22824222 5' - Gypsy12A_LTR 2247 1 48.51 ATTTTGGGCTTCTTGCTCCGTTTCTTCTTCTCCAGGTTGGGTTTCGTCACTCCGTACATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCT:1 - chr3L 2373989 5' - Transpac 473 1 78.79 TTATATTGGCATTTTAGCCCACACAGTACGCCCCTACGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:2 + chrX 10286151 5' - roo 9035 1 62.38 CCTGAGCGGATAATGAGTTTGGATGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 + chr3R 3847114 5' - P-element 2836 1 28.71 CGCCGCCTTGCCGCGTTTTTTGATAAGGGCATTATTCCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chrX 19308170 5' - P-element 2848 1 40.59 CTTTACTGGAAATCAAAGANCCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGA:1 - chr3L 25350827 5' - baggins 5420 1 37.62 AAGCTGTGGCTTTTGTCTTGCGATTAGCCTGGAATATTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr3R 23640978 5' + 297 34 2 66.34 GTATATAAATGACAATTAAACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 - chrX 734983 5' + Tabor 25 2 53.54 ACTCATAATTCGCATAATGACAGGACATCTTTCTCATTCCTCCCCCTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCT:1 + chr3R 12329596 5' + hopper 27 1 52.48 AAACTGATTCCCCACACAATTTTCAAACCGTAACACACTGTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCCCACACACAATCTAAACTTCTCAGCGTGC:1 + chr2L 12186341 5' + Cr1a 326 1 61.39 CACCCTCTCGCTCGCACACCTGCCCGTTGTGCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chrX 4707851 5' - P-element 2843 1 35.64 TGTTGGCATTGCATAACAAACGTTTTCTAAATGAGGTGGCGATGGGCACCTGCCCGCTGTGCCACTTCACCGGCCGGCAGAGGGGACAGATCGGAAGAGCG:1 + chr3R 16699672 5' - mariner2 569 1 43.56 TTAAATGATTCACACCGAAAATGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr3R 17971696 5' + 412 53 2 77.23 GCCGCAAAACCATTCGACAGCCACGAAAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTA:1 - chr2R 19560212 5' - Tirant 8459 2 72.28 GAGGACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chr2L 17730456 5' + pogo 49 1 79.21 AACTCATCCCTATCAATGGATGGTTGGCGTCGACATGATGAGTCCCTTGGATCTTATGCCGACCACAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATG:1 - chr4 656338 5' - 1360 411 1 68.32 ATGTGGTTTAGTTTTAGGTNCACATAAATGCCGGATGGAAAAGCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr2L 8577341 5' + roo 8696 2 57.43 CACACACACCACATATGTTCAACCTATTTTTTTGGTGCTGCCTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr2R 18766271 5' + hobo 35 1 61.39 GCTTAGTGTCATTCTTTGTACTGTAATGATGAGCTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1 + chr2L 20570632 5' - 412 7488 2 79.21 GCAAGTAAAATGTCCAGCATGTGTTCTTCGATTCCTACTCACATTGTAGGCCTCCTTCCATAAACTTGATTTGTAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAG:1 + chr2L 3712456 5' + mdg3 5448 2 77.23 AACTTATAGTCACTCTGGCAAGGCCCGGTGAGCTGTCACTTAGCAGCCTTGCCACTTTACTGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTT:1 - chr3R 10110208 5' + Doc 387 1 68.37 GGCTTCGCCTCTTGCCCGTAATTAAAGTGGCCAGCGGAAGTGAACTGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2R 6107798 5' + roo 8692 2 55.56 CACATAGTACTGCTCCACTGGTTATTATTTACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chrX 17858006 5' + P-element 46 1 31.68 TTATGTAGTGCACTTCTCAGGGGAGTTTTAGGCCGCTCAGATGCTTAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATA:1 + chr2R 10372109 5' + mdg3 5281 2 52.48 CACAAGGTCAATTAAATTTGCCCTTCACACATTATTAAGATTTTCCATCAGACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3L 9928612 5' + roo 23 2 56.44 TGCTTTTTAACTGTTTCATTATTATAATGTAATGATGAACTCCCCTTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 - chrX 7788646 5' - 412 7494 2 74.26 ATCTATTTGATGATTTTTGCTTGGCAAATATAAATTTACAAGAATGTGAAATATATGAAACAAGAGAAACAATGTGATCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTTA:1 - chr2R 5743576 5' - INE-1 351 1 48.51 AACTTTAGTAATCAGCGACNGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATATTACAAGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2L 9045483 5' + jockey 30 1 54.46 TAGTGAGCGCTTTGAAGCAAGCGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCT:1 + chr3L 8252213 5' + copia 4925 2 78.22 AGCGCACATCAGGCAGAATTTTTGAAACTATAAACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGG:1 - chr2R 10827733 5' - 297 359 2 69.31 TGTCTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 6266289 5' - roo 9046 1 55.45 TTATGCATCTGCATCGAATTAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chrX 7304411 5' + Doc 4700 1 60.53 AATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:3 - chr3R 29608831 5' + roo 48 2 75.25 CCGAGGCATTGTTGAGTTTTGTTTGGTTGATTGCTGGCTGCTCGGATCGTGGGTGGTTTGGGCACCGCGTCAATGGTTTGAATGCCAGGTGCGTCGATTTG:1 - chr3R 11087462 5' - HMS-Beagle2 6748 1 56.44 TAGGGATACCTCGCTCTTTCACTTAGCTCATAATCAACACCGGCTTTGTTCCTAACTAAAAGCCATGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGT:1 - chr2L 19904228 5' + Doc 4370 1 69.31 ATTTACAGTGTCAACAACAAATGCCTAAAAACTAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGT:1 + chr3R 31237046 5' + roo 8794 2 68.32 ACAATGTTGAATAGCCAAAAGCCGGAATGTTCTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chrX 9774998 5' + 412 7091 2 65.26 AAATTTAAAAATAAAATAAAAGTGATTTAAATCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3R 12944731 5' + roo 45 2 74.26 TAAACCCACTTAGTATCGATAACCCTATGGTTTTTTGACAATGGACAACCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGACGCCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTGGA:1 + chr2R 3119184 5' + rooA 310 2 55.45 AAATTAAAAATTGCATTCCCTAAAACTTGTATTAAATGTATTTTGTAACTACCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr3R 25581109 5' - pogo 2084 1 60.42 CGTCTAAATGCAGCTAAACGATCCAAGAAGGCCGCCAACCGAAAACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATTCTCTAATG:1 + chr3R 14517347 5' - 1360 411 1 56.44 CCAGCGAATCCATCGAGCGCATGCCGCTGCTCCGGCAGAATCATTCACCCTGTCAGCGGCAACCAGTTTCACCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCA:1 - chr3R 5179925 5' - R1A1-element 467 1 62.38 CATATAGTATCCTATATAAAAAAAAGTGTACATATTGAAAAAATAATATGTAAAAAAAAAA:1 - chr2L 12643294 5' + BS4 728 3 70.49 TGAAGGCTAGTTAATACTTTATACATATATATATAGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAT:1 - chrX 17104452 5' - 297 337 2 68.32 AACTACTTGATAAAACCAAACACTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr2R 10353321 5' + blood 29 2 54.46 TACAGCTAGATTGTAATTTACAAAATCCTTTCACTTCGTTTTCTGATGTTCTTCCAATTATGGCATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGATAGT:1 + chr2L 5926906 5' + pogo 9 1 68.32 GCTAAGTATTAAATATACACTAAAACAGAAATATATATACAATTTAAATACGGCATCACCAGTCACACAGACATACACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTC:1 + chr3R 28090130 5' + Quasimodo 7042 2 76.24 TCGTTTACGCGTTAAAAGAACCACTATGGCTATACTCTAATTTCTTCAAAATTATGAAATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - 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Doc 4408 1 67.33 CCCCCCGTTGTCGTGACCATTGTTTGTTTTTAGGCACTTGCTGTAAAAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTT:1 + chr2L 6550003 5' - accord 7357 2 52.48 AACACTTCTCCGCCTCAGCGGCCATTAGGTCAGTACTACGTTGTACCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACA:1 - chr3R 23282550 5' - opus 217 2 55.45 AAAATTCTATAGAGATAACCATGTTCTGTAGATATATCTATCTGCTATCGGTAGGTACTACTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAACATTAATAATGAA:1 - chr3R 18237644 5' + Juan 3883 1 49.00 GCCCTGGAGTCCATCTTCGATAAGGCGTACGAGGAGCGCGAGGCGAATCGCGTGTGGAACAAAAACCTCCGTGTGCTCTGCTAGTCAAGGTATGACTTCG:1 - chrX 10898552 5' - Rt1b 4977 1 60.00 TTGTAAACAATTAAAATAATTTGCTGGACAACGAGAAGGCAAGGAATTTAAATGAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 - chr3R 14580375 5' - blood 7367 2 56.44 ATTTTATTCTAAACAATACTATAATAAAAGAGGATGTTTAGAATTCTGAAGGTATGTGCTCGCAACAGCTGACTTTAACAGCTGTTATTATAACAGTGCAT:1 - chr3L 27412453 5' + hopper 1279 1 56.44 GCACTTTAAATTATCTATAGCAATGTGCACAGCAATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 - chr2R 9631779 5' + F-element 29 1 57.43 TTGTGTAAAATCAACTACCGACAGGAGCAAACCTACTACATACCCTACTCATATTATGTTTTAATACTTAAAACCTGTCGGGGAGATCTAGCACGTGAAA:1 + chr3R 6684444 5' - 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roo 9033 1 66.00 CTTTTTTTGTTATCATTTTNTACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTT:2 + chr2R 16160742 5' + mdg3 18 2 61.39 TCCGTTTAATAACAAATAAATCGCATAATCCTTAGGATAATATTATCACAATTAAAATTTTAAATTTAATTTTGAATTGCGCGCCCTACAGTCGCAACACA:1 - chr3L 21461493 5' - Rt1b 69 1 67.33 CAACAGATGGAGCCACAAAGTTAAGCGCAAAAAAAATCTAAACATTTTTTAAAATCGTGGGCGTGTTAGTTTTGAAACGGACATGGCCAGATCGACTCGGC:1 - chrX 20996625 5' - INE-1 106 1 70.30 ATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCAC:1 + chrX 15546167 5' - blood 7338 1 75.25 CAAGAGGGAGGCGCACACGCACGTTAATATATGTATATGCAGTTCGGGAACAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:2 + chr3R 24976726 5' - opus 7481 2 59.41 GACCACACAAGTTCGAACGCACACTCACACAATTGCACCGTAATTAACTGCAAGCCACATGACGCCACTTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGG:1 + chr2L 23390323 5' + gypsy6 5 2 72.28 TGTCAACTGCGGAAGAAGGGCCTGCCTGTTGCCAGTTAAGCAACAAATAAGAGCGTAGTAAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAA:1 + chrX 21183958 5' + Juan 18 1 60.40 CTGGGAATTTGTTTGAAATTTAAAGACAAAACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTT:1 - 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chr3L 11829084 5' - Transpac 5181 2 79.21 ATCCGAATAAGCTGCTTAATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:3 - chr2L 18655221 5' + Doc 25 1 55.45 CCGACTTAACGATGGGCTAAAGTCGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGCTTCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCTGGC:1 + chr3L 6068506 5' - G2 301 1 74.26 CAAGCTCAACCGAAGGCCATGATTCACGAAAAACATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGATCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 4063750 5' + roo 8704 2 68.32 CAAGCCAAAAAAAAAATTCAAGAATAATACATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTTTGCGTGGAC:1 + chr3R 3269638 5' + Gypsy6A_LTR 103 1 69.31 TTTGAGTGCGAGCGAAGACGAGGGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTTGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:2 + chr3L 20354028 5' - 412 7492 2 71.29 TTTCCCGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 - chr2L 15898817 5' + F-element 15 1 69.01 CAATTATAAAAAATATATGTAAATTAGAACTTAAATTTTTGCCAATGCTCATTGTGTATAGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATT:1 - chr3R 7965882 5' - hobo 282 1 63.37 CGCCAATAAGCTGACCCGTCGAGCGGTCATTAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGA:1 - 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invader1 3880 2 65.35 TATTATGATAATAAAAACTTTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3R 17003320 5' + pogo 50 1 76.24 TTAGGCCAGAATCAAATACATCTACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATT:1 - chr2L 19678163 5' + flea 47 2 79.21 TAAGGTTATTCCCCTGCTTTTATTTACCTCCATCAGATAATTTTTGTTTGCTCTTTAATGTAATCACGTGGCCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGT:1 - chr3R 20787556 5' - hobo 2700 1 48.51 CAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATT:1 - chr3R 10736120 5' + McClintock 5977 2 57.43 GACAGACCAAGCCTTTTCAACTTCATTCTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGT:1 - chr4 74313 5' + 3S18 48 2 70.30 TAGTTCCTAATCGATCACGCATAAACGGAGATATAGTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chrX 19334591 5' + roo 8701 2 64.00 GCTTATCAAACAAACAATTTGAATGCCCAGCGGAGCGATCTTTTTATTGATGCGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr2L 16358162 5' + hobo 24 1 53.47 TCAAACTGCAGCCAAAGCACAAAACCAAACAAAACATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - 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chr2L 3978517 5' + 297 6597 2 64.36 TTACTGCGCTGCAAGCTTCTGTCTGAAAAAAAATGTTCTCTGTTAGGGTATGCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTT:1 - chr3L 19483029 5' + Quasimodo 17 2 45.54 CTAACTTTTTGATCCGCACTAATTGCAATCCGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 - chr3R 6143777 5' + Doc 51 1 71.29 GATTCGATTCGATTTTAATTTGCAGAACTCGGCATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3R 10110438 5' + Doc 49 1 70.30 AATGGTTAGCTAACTCGGANAATAGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr3L 7168317 5' + Doc 34 1 54.00 AGACAGCTCGGAAAATTAAAAATTGCATTCCCTAAAACTTGTATTAAATGTATTTTGTAACTACCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr3R 25581121 5' - pogo 2091 1 69.31 TAAAATCTGGGTTGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTACGT:1 + chr2R 19091614 5' - Stalker2 360 2 65.35 TTCGTGGGCTGGTAGCAAAATGAAAAAATGAAACTTCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACT:1 + chrX 22789305 5' - Tabor 7306 2 58.42 ACACAAGTTCGAACGCACACTCACACAATTGCACCGTAATTAACTGCAAGCCACATGACGCCACTTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTAC:1 + chr2L 23390327 5' + gypsy6 9 2 68.32 AACTATAAAACACTTAGATATACTTCGGATTAGATTTACTGCCCATGTGCACACACACACCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr2R 9209515 5' + Tirant 15 2 64.36 CATTGGTGAAGAGCTTAGCCTTCTCGCCCAGCTCCTTCTCGCGCTCCTTGCGCGGGATACACTCACCTATAATAGGCTGCTTGCAGCGCTGGCCGGACATG:1 - chr2R 18143778 5' + TAHRE 9977 1 57.43 TACTAAATATGCGAATTCANCATGTACGCCTTTAGGGGACGCACTCGAATCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTAATA:1 + chr3L 13355428 5' + mdg1 218 2 91.14 CTAACACTTACAATTATTATAAAATATATATTTTTATAATATTATATTATAATTTAATATAATAATAATAATATATATATGTCGTGTATTCCTTTTTAATT:1 - chr3L 23392849 5' + invader5 3687 2 78.22 GATAAGCTCGAGTGACACATTGCGCATTCGAACTGTGGGCCAAATGGCACGGAATTGATGATATGTGGGCGGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCT:1 - chr2R 14576601 5' - gypsy5 403 2 72.28 TCTTTTTCTGTATTCAATGTGAATAAGTGGAATTTAAATATTTTGTGTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGAT:1 + chr3L 2081384 5' - Idefix 7110 2 55.45 CTTCACCACATCTGTATGTAAAAGGCGAAGAGAAAAAAACTGAGACTGAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 + chr3L 16162107 5' + FB 29 1 53.47 TTACCTCTGTGGTTATTGCATTCGTCCTGATTGTCAAAGCTTGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAG:1 - 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chr2L 22197285 5' - roo 9049 2 58.42 CTTCATCTCGGAAATTCCCGTCACCGAGATATTGCTTCCTAAAACATAATATTTCTCAAAAAACCGCAAACGCACATAGAGACTACATGATATGAGCTAAG:1 - chr2R 14741485 5' + hopper2 1143 1 76.24 GCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3L 2022253 5' - roo 359 2 73.27 GAAATGGCTGATTGCGAAAGTTAATTACACTAGAAAATATCATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 + chrX 8334296 5' - flea 221 2 62.38 GACGAGAATGCGGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:2 + chr2L 13566486 5' + hobo 42 1 63.37 TTTATTATTATTTTTTTTTTTATTATATACGGCA:1 - chr2R 13478079 5' - Rt1a 5065 1 94.12 TATAAAGGGTTTTCGCATTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr3R 11052155 5' - blood 7343 2 74.26 CACAAGGGGCCTCCCTGCACTGGTGATTTTCCGAAGTTGTGCAAATGAAATTTCATTCAATTAGTGTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2L 1783392 5' + roo 8673 2 70.00 TCTATACTATTTTATTTTATAATGCTAATTAAGTCGGCTTGGCAAGCTAGCCCTAGACAATCTAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 + chr2L 109671 5' + 1360 3 2 74.44 GATCGTCGATCGCCTATCTTTAAGTACATGTATTGGTTTTCGATAATTCGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTT:1 + chr3R 4578074 5' + 1360 306 1 55.45 TTCTTCAATCTGTTTATACATTTTCAACTAATTCTACTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTT:2 + chr3L 5479009 5' + 3S18 5807 2 65.35 TAAAATGAAAGTTCCATAGCCGCCACCACGCCCAACATTCTTCATCAATGTATAATCTAGTGGTTTTTGCGAGTTTTAGGTCTTTGTGCAGGGTGGTGATT:1 + chr3R 26153939 5' - X-element 4346 1 68.32 CAAAATTTACAACGTTTATAGAGAGAATTATATAACACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGA:1 + chr2L 2998565 5' - opus 54 4 65.35 TTACATGTCTCACAACCCGCGCTTTCCACGTAGAAGAGGCTGTCCCAATTCCGCATCGTTACCGTTCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr2R 5374126 5' + 1360 10 2 66.34 ACGTGAAAAATAGTTCCACTTATTTTTACACATGTTTATGTTAAATAGGATTTGAGCTTCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAGTCGTGAATGCGGC:1 + chr3R 9097679 5' - Quasimodo 320 2 54.46 TTTTCTTTTCTTTTTTTTTGGTTTGCACTAGAGAAAACTTTCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr2L 17837075 5' + 412 35 2 63.37 GCTCATTTTATGCGCTAACTGAATCAGCCCGACAACAATTAACAATATAACAATTTTAGATCATCATCATATCCCGGCTCTCGTCAAGGGGGACCTTATGA:1 - chr3L 17106707 5' - BS3 1587 1 67.33 GCATGCGATAAGGCATAGTNCTTTATCCTGGCTGGCTCTTTGCCAGCTCGTGGTGTGGGTTGAAACATAACAGTTTAGAGTATTTCCAATATATTAATACT:1 - chr3L 6011296 5' + hopper2 1535 1 62.38 GAGCTTAGATGCTCACCCAGCTTTATGCACAAATAACAAAAATAATGCCAACACTGGAGACAAAGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3L 23489423 5' + 1360 9 2 56.44 TTTTATTTCGGCACACAAAAGCTAAAGAAAAAAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 + chr2R 18733701 5' - copia 232 1 50.50 CTTATTTTATTTCTGTGCATAAGAAAAACATAAAAATATTTTGATAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTA:1 - chr3L 3596743 5' + copia 4901 2 56.44 CATTTGCTAAGGAAAATTCCCAATTAAGCGTCTGCCGAGCCAAACAATGTGAAACGGGCTGTAGATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTC:1 + chrX 11032166 5' - invader3 264 2 57.43 CAGTTCTTTTCCAAACTTTGAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATG:1 - chr3L 23873997 5' - 1360 154 1 87.13 AACTGTTACTTTGGCAATGGCACACAACACCACTAACATTCCGCCCCACCTTGAACTCTCTTTACTTCTCATTAATTCGAATGATATAATAATAATAAAAA:1 - chrX 20132558 5' + invader3 5054 2 57.43 TTTTATGAGAGTAAAGTGCTTTTAGTACTTGAGATGCGAGGGTTGAAGTTGTATATGTGATAAAGTGCTCATTTATTGTGTTCAAAACAAAAAACAAAGAA:1 + chr2L 10209801 5' - Tc3 90 1 81.19 AATCTCGATCAGTAAAAAATGGGATTCCTAACAAAAAAGTTTAAGATCAATTGCTTAAAGCGCAAATTACTATTTATTATTATAAATATTATTGTTATTAT:1 - chr2L 7588328 5' - mdg1 7076 5 70.30 CAATTGGAGATAAAAAGCAAGCTGAAAAGTATGCAATATTTTTCTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGCTTGTCTTCTATT:1 + chrX 17262291 5' - X-element 4491 1 93.07 TAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAG:1 - chrX 18326222 5' + Doc 234 1 71.29 TCGTGGCACAAAAAGAACACACGAATGGCATTACATGGGGTAGACTTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCA:1 - chrX 10089502 5' - 17.6 7086 2 55.45 TAATTTGTGTACCCAAACTGGCAGGCAGCTGGGAAAATGCGAGCAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr2R 7838968 5' + pogo 29 1 57.43 ACTTTGGTACGAAAATTTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr2L 6362868 5' + 412 7109 2 81.19 ATACGTTTTATTTTCAAAAACAAATTTTTTTTTATGATTTTTGTGTTTGTTGTATGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:2 - chr3R 12063824 5' + 412 19 2 59.41 GGATGAAGATACAGCTGGTTTGCAAAAAGTATGTGTACCCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chrX 15287923 5' + hobo 35 1 65.35 AGGACATCCTTGGGCCATTCGCCGGCTGATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2L 20045819 5' - roo 391 2 61.39 GGAACATCTAATGTCGTAGGCGACGCATTATCTCGAATAAAAACAAACAGGAAACACAAGCCGAGGTGTAGGCCATCGGCGGAAATCACGATCAGCTGAAA:1 - chr3L 27881861 5' - Gypsy12A_LTR 201 1 65.35 CTTCCTCCATCGAAGTGGCAGTCTTAACCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr2R 19840249 5' - roo 9024 2 70.30 ATAATGGAAGGCAGAGCAGCATTCATGTTTACAGTTAAATAAATTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTGG:1 + chrX 6590587 5' - Quasimodo 441 2 56.44 CAAAATATCAGGCAATACACATCTTGTATGATATAATTCTTGTTTCTCTTCGGTTTTCTATTATGTTGAGGTCTGGACCTTGAGGTGGCTAATCCAATGTG:1 - chr3R 7173136 5' - Tc1-2 1147 1 58.42 CGACGCTAATAAGAATGCATCTCCGACATGTATAAATTAACTAAAGATAGATCGCACCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAAG:1 - chr2L 23390406 5' - Gypsy6A_LTR 354 1 70.30 CTATGGAAGTGCGAACTTTTCCGCGACAAACTTCCTGGCCGGCATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr2R 12473057 5' + Doc 36 1 59.41 AATTCCCAGAACTCGTTTTAAATATTGTGTGTACAAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3R 16601440 5' - roo 9032 1 64.36 ATCTTATACCTATCTGCGTNATATGGCGTTGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTGGTGGTCTTTTTGGGTATTTGTATATTTAT:1 + chr3R 16119078 5' - Stalker 6942 4 71.29 TTGCAGCATTTAAATACAATCAGAATACACAGAAGATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chr2L 11478685 5' - opus 7461 2 69.31 TCGAGATAAATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1 + chr3R 11151803 5' - mdg3 5485 2 66.34 CTATGGCCTATCAACTCAATCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAATGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr3L 12112378 5' - 1360 3348 1 77.01 GTTTCATTTATTTCTTACTNATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr2R 11941055 5' + 297 44 2 74.26 TTTAAGCAAATATAAAACTTTAGAAATGCGAGGAAAATATATATAATTACAACTTCGCGGATTGTTGGTTTATAAAAAAAAGAATTATTATTGATCAAAAA:1 + chr2L 19642309 5' - Quasimodo 7331 2 60.40 AACAAAAGCAAAAACGAGGCTTAAGTCCGATCCGAAACCGGCTGCCGTCACTACCAAGACTATCATGACTACCGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAG:1 + chr2L 13247889 5' - BS 4885 1 75.25 TAAAATTGAAAAATAATGTNTAATAAGAGCACTATTATTGCGCACAGAAATAGTTAATGCATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAG:1 + chr3L 15058311 5' + 3S18 5780 2 63.00 CAATTACCAATTCGTTTCATAATTGATTTGTAGTGGAATTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGTTTAGAGA:1 + chr3R 24709791 5' - ZAM 7998 2 58.42 TAACAACTATTTTTATAAATACGTTCTTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 - chr3R 6947369 5' + I-element 48 1 70.10 GTTCAAATTCAAACTGGTGGAGAAGAGAACCCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 + chr2L 8709323 5' + P-element 44 1 37.62 AGGCTATGTATAAACATTGGCTGTTGGAGTCTTATAAAATATATGTGTATGATAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTT:1 + chr4 74252 5' + 3S18 24 2 55.45 GCGAAAACAGGGAAATTGGCCAAAACATCCAAGGCAACAAACAGGCAAAAACGGCCAAAAACAGCCAGAGGAGCTTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAG:1 + chr3R 23542919 5' - 412 7545 2 77.23 GAAGAGAGATCAGCTTACTAAACAAGATATGTACAGACATAGAGTACTAAAGTTCTAGGACACTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr2L 8176491 5' + 1360 9 2 69.07 CACACGTCAATGTAGACAGTGCACTATGGGGCATGCACACTTTTCCAAAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATT:1 + chr2R 7546278 5' - hopper 72 1 65.52 ACCCTGGATACTCACAAATGCGGGATCTCAACGGCCTGCGCTCACTTCGTATGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGA:1 + chr2R 673650 5' + F-element 286 1 51.49 TATACTCATATCTATTAGGTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:2 + chr2L 4063682 5' - 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invader3 5435 2 52.48 GTTTATGGTGGAGGGCTTGCGAACTGATGATCGGGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCT:1 - chr3L 24761272 5' + 1360 49 1 68.32 TTAGGTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGGTGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2L 4063696 5' - roo 9033 1 60.40 TGGAAGTAAAAATAATGCCNTGAAAGGAATTCAAATTGAATATAAATATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAA:1 + chrX 7036652 5' - Quasimodo 7351 2 64.58 GAGGAATAAGGACCACTTCTAAAGAAAGATCCTTTTACCAATCAGTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 - chr3R 5348728 5' + copia 4900 2 56.44 GTTTTGCTCCAGCTTGTCAGCCAGCAATGCCTTGTCTAATCAAATAACATTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCT:1 + chrX 6544281 5' + roo 171 2 58.42 CAAAATCCAGCGGTAGCGATCCTTCTCAAATTAAAGTATACACCCCTCTTCGCTTTTCGGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGGCGTCACCAAA:1 - chr2L 11172979 5' + 1360 3323 1 61.39 TCGTAAATATGCCAGAATGCGCTCGGATGCATCAATGAATGTGTCAATGATTAAGCCGCATAATCAAAACAAAAAACAGGAGAGAACGCTATAGGCGAGTT:1 + chr2L 12971092 5' - INE-1 575 1 52.48 GGATATTGGCTTCGAACGCACTCGGAGAAAAGTCCCTTGTACTCGGTCTTTGTCTATTATTTTGACTTTAAAGGGCTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTA:1 + chr3R 26765070 5' + mdg3 5252 1 76.24 GGCGTGAGAGCTTCACAATNGGTCATTCGAAAATCGGAGTGACGTGGGAGACCAACTACATGGAAATGGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chr2L 5927027 5' + pogo 6 1 63.37 GAGTGTGTTGAGGTGAACAACGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCA:1 + chr3R 3931684 5' + diver2 4730 2 80.20 AATATATTATAAAGAAAANTAATAGAATTAAATAACTACACNNNGTTANNNTATTTTTTAAAAGGATGGNNNNNNGTGGTATGCGTACATATACATTTATA:1 - chr3R 2581998 5' + gypsy11 6 2 85.15 TTGGTGCTTGACTGTTTTATTTTGAATTTAAAAACAATAGAAAAACAATTTTAAAACAAAGTCGAGTTCCCCGACTAACAGATACCCGTTACTCAGCTAG:1 + chr3R 23891176 5' - INE-1 543 1 81.00 AAACGACCAAAGCAAGGTCAAGTAAAGAGACTCACTATCTCTGTCTCGCTCTACTCTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCTCATGGATACT:1 - chr3L 7435479 5' - Quasimodo 6989 2 63.37 GGATTCGGATTTGGTTTGGTTTTGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTA:1 - chr3L 14843833 5' - Idefix 82 2 77.23 CGTTGTGAGACGTGTTTACCGGATGGCAGTTCGTTTAGCTCTAAAGCTACCGTCTCGTCGATCGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - chrX 15024458 5' + P-element 8 2 70.83 TAAAGTAATTTGGCTGGATNTACAGGATTGTTTGTTTAAAAAAAAATAAAAA:1 - chr2R 10342355 5' + transib2 2634 1 80.77 GAGAAGAAATCGAAACGCAATCTAGAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATT:1 - chr3R 17844836 5' - 1360 253 1 81.19 TGCTCCTCCAAATCCGCGTACGTGTTGGCATATCAATTCACATTACGGTCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGA:1 - chr3L 8231374 5' + Osvaldo 19 1 52.48 CTATTCTTCAACATGTGATTTTCCAATATGGATCTTATGAAAGAACTGAAAATGGTATAGTAAAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCAT:1 + chr3R 25086074 5' + Bari1 14 1 66.34 TAATTAGGGGGCAGCATTTTAATTAGACTTAAGTGCTGCTGCCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chr3L 1998812 5' - hopper 1384 1 53.47 GATATTATACTATAATAAGTAGGGTAACCATCCCAGAAGGGTCTGTCCTTAAAGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATCAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 20411878 5' - roo 398 2 66.67 CTGGGTTAAATTTAATTAATTTGTCTCGTCGCCCCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2R 22553093 5' - 1360 3365 1 61.45 CCTTCTTCGCTGGGCTTGTCATTGATTTATTGGCTTTCAGCCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCACAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCC:1 - chr2L 11918376 5' + Max-element 8384 2 59.41 ATCGAATTGCTGGGCACAGNAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 29608771 5' - roo 9047 1 57.43 CAATATGGATCTTATGAAAGAACTGAAAATGGTATAGTAAAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAG:1 + chr3R 25086097 5' + Bari1 37 1 64.36 ACAATTTTATGATTTGTTCAATTAAAACTGAGCCAATTTGTAGCTGGCCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGTCAAAGA:1 - chr3R 19984895 5' + flea 4583 1 75.25 GCTTGGGGCACTTAGAAAAATCGGTGCTAATAGTAGGTAAATAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr3L 20584022 5' - pogo 2070 1 64.36 AACTCCGCCGGTCCAGTGANGGGCCAGTAGATCAGGGGAGTGCCTCCGTCTCCGTAGCAGGTCTTAACCTGAGAGCACACACACACACACACAGATATTCG:1 - chr2L 322837 5' + accord 7032 2 76.24 CACAGGGCACAGATCCTTGCACATGCACAGCGAACAAAAAAAAAAATAAAAA:1 + chr3L 13237712 5' + gypsy2 398 2 94.23 TTTGATAGGAGCTCTCTCTTGCTTTAAATTCAATTTTGGTGTTTCTTGACTGGGTTGACTTGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAA:1 - chr3R 7720951 5' - roo 99 2 68.32 ATCACTGCGGAAAAGCTTGAAAATTTTCCACACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 - chr3L 5415391 5' + I-element 44 1 66.34 AGCGAAGTGGTGGCAGGATGGCAGATCCTGACGAGAATGCGGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr2L 13566457 5' + hobo 13 1 65.35 AATAGGATATACATACAGCGCAGATAGATACATGTAACATGGAGTAAGGCTAAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATT:1 + chr2R 10014805 5' + flea 47 2 74.26 CATAATGTAGTTCCCTTAATAGAGATTGCGACACATGAAAAGCGACCACAATGAACGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCT:1 + chr2R 14576493 5' + gypsy5 19 2 64.36 AGTTGAGCCCCATTTAAACGAGCAAAGTGCGAATAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr2L 22241789 5' + pogo 39 1 64.36 CTTTTGTTTAACCAGCGCTTCTTCAACTTGCCTACTTAAGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACGACACACTGATTTTGAACTTCAAGAAAG:1 - chr3L 17185342 5' + Tirant 8385 2 59.41 CTTAACGAGCGGCATGCATAAAATAAAATATGCGCAATTACCAGCCGAGACACTCGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTC:1 - chr2R 17625534 5' - 1360 438 1 67.33 TAGTTGACGCAAGGAGATTCAGCAAGTAAAAGGGAGTGAACCGTAGTTATGCTATGTTTAAACCAACAACAAATTACACACATACTCCGTTAACCATTGTA:1 - chr2R 5532069 5' + Doc4-element 219 1 63.37 ATCAGAAGGTTTTGTTGACAGCAGGATCATTTGGATCATTTGGCGATGCGGCATATTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chrX 7788586 5' + 412 21 2 58.42 TACCACATTATCAAGCATTTTTCGCAGTGCACTCCTCACTCATGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCT:2 - chrX 4264412 5' + mdg3 32 2 55.45 TTGGTAAATAGAAATTGAAGACCCACCTTCAATAACACTAGTGGTCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTACCGGGCTATGCTGTTCATAGTAC:1 - chr2L 4411249 5' + Tc1-2 45 1 66.34 AATCTTGGATTTCTTGTCAATCTATGCATGCTATTTGATATATAATTAATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCT:2 - chr3L 19089670 5' - invader1 380 2 53.47 AAACTTTTTATTTAAAACTNTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCAT:1 + chrX 22426165 5' - 1731 4602 1 55.45 TTGTAGCATGTGGTTTGGTCACAAGGTGTGGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 + chr2R 21351334 5' - mdg1 7406 2 73.27 GGCTCCCTGTAGCTACCTCATTTGGACGGCAATCCTTTTCCTGGGAAAGCCCTTCACCTCTGGAGAAAATCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGGTGCGA:1 - chr3R 30147653 5' + Gypsy6A_LTR 382 1 55.45 TGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr3R 7869112 5' + 297 6607 2 54.46 TTATCAAACTCTTATCCAGCGAATTTTTGGGGACAATGTAAGCGAATGGGAAAGGGAAAAGTGCTTGTCTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr3L 13190190 5' + roo 8667 2 72.28 TAAAACCGTAATTTAAAATTATAGGAAAATTCGTTTGTTACCTAAGTATATGCAGTTCATTATGTGGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 + chr3R 19949283 5' - mdg1 7442 2 53.47 GCCGGGTGTACACCTCGGTCATTCCGTGCAACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAA:1 - chr2R 22888163 5' + gypsy 7412 2 72.28 TGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAG:1 + chr3R 19589898 5' + BS 4996 1 73.27 CAGCGTGTGAACAAGAAAGAAAAAAAAAAATCTACTGCCAAGAGTATCGATCTAGTGAACCTGCAACAACTCTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATAT:1 - chr2L 21394522 5' + FB 106 1 76.24 GAACTATTCTTATGTTGGGTAAATAGATTTTTTCATATAAATAATCCAGTTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTAT:1 + chr3L 20758929 5' - flea 233 2 58.42 AAGAGTTGCTTGTTCTAACCCAAATGGTACCTACTGTACTTGCCAACTTGAACCCATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGT:1 + chr2L 4140470 5' - accord 181 2 79.22 TAGGCGTAAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAACAAACTTCTGTATGCTGAATCTTGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGA:1 + chr2R 543216 5' - INE-1 100 1 85.88 GACGTCACAAATAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:3 + chr3R 19987397 5' + Doc 30 1 50.50 CAGTTTTAATTTTTAAACATTAGCTGGCTACAGAAGCTAGCCGCTAGAATCACAACTTTCTAGCGTTCTTATTCCCGAATTCTCGACGTTAATACGGACAG:1 - chr3R 6032367 5' - INE-1 131 1 61.39 CTCATCCATTTTTCATTTTTCCTTTAATATAAATATTTAACACATTATTATATTACACATAGGAACAGCCATACACTAAATCATAGAATGCCTTAGGATAT:1 + chrX 20888412 5' + Quasimodo 86 2 54.46 ACTATGGAAGTGCGAACTTTTCCGCGACAAACTTCCTGGCCGGCATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 + chr2R 12473056 5' + Doc 35 1 58.42 TCGTGGGTGTGAAAACAGCNAAGGAAAGCGGAGCAAAATAAATGAAAACTACGCACGAATCGTGTTGGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTG:1 - chr3L 1569252 5' - accord 7007 2 72.28 CTCTCTCCATTATTTTGTGATGGTTTAACAACAAACTCGCATAAAGCAGACAGGCGGACGGACCAGTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 + chr2L 19681396 5' + hopper 12 2 67.33 TCTCTTCTAAGGTCACTTGGTGGGATGTGTACTCTACTAGACGGCCTGACTCGGTTCATTCCTCTCTTTCTGTCCGTCTAAAAAGTTAGAGCCTT:1 + chr3R 14304671 5' - Gypsy12A_LTR 485 1 50.53 CTGGCCAAGATGACAACACNGATGTTGATGCATCCAATTAGGCGGGCAATTACCGAGCACCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAA:1 - chrX 19034199 5' - hopper 1400 1 63.37 AATGTAATCGCAATCGATCATCAGCCACACTGTGAAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGC:1 + chr3R 28621028 5' + 1360 42 1 70.30 AACATCTTATTGTTATCGANTCGTTGAACTACCTCCCCCCCCCCC:1 - chr2R 16308308 5' - gypsy2 6474 1 93.33 ACCAGCAGAAACGAACAAAAAAAAGAGAGATCAATTTCATACTGCCCCCCCTTCGAACACTTGCAAACCGCCACCCACTCACACACACACACACATACTCA:1 + chrX 3060081 5' + accord 7032 2 53.47 ACAAATGTTTACTTTTAGTGTCACGATTAAAATGTGTTTGACTCTGTTTGTCCACGGATCGAATTGTTTGTTCCACTTATTTCTGTAAAATGGAATGTGTA:1 + chr2R 23832343 5' + HB 102 1 63.37 TGACACGAGGACGAGGACATCCTTGGGCCATTCGCCGGCTGATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTT:1 - chr2L 20045832 5' - roo 404 2 74.26 AGCTGTGGCTTTTGTCTTGCGATTAGCCTGGAATATTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 + chr3R 23640979 5' + 297 35 2 67.33 AATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAA:1 + chr2R 5674663 5' - S-element 1674 1 71.29 ATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 3757396 5' - roo 9025 2 76.24 CGGTTGTACTGCTTTTGGCAGTAAATGAAATTAAATCGATATTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3L 18762144 5' - pogo 2072 1 64.36 TTAACGTGACAGCCTACAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCAAACTCTACG:1 + chr3L 14594141 5' - hobo 2927 1 60.38 TCTGTGCAATGTGATGAACAGAGTTACCAGTATTGTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr2R 20312593 5' + 1360 39 1 65.35 ATACGTGGGTTTTGGAAGCGGGGGCATTTCAGCGATATAAATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 - chr2R 21962707 5' + 297 6611 2 62.38 TACCCCTTTTTTTCTTGTCGACTGCACTTTTTCCAGACATTTTTCCAGTTTGGGTACCGTTACCGCATTAGTTTAGTGCTGGGTGTGTTGGTCTTGCTTGT:1 - chr3R 17336834 5' - Gypsy12A_LTR 2169 1 58.42 AGCCAGCCCAGGCAGAAAAACAGAAACAATGCCAGTTCGATCGAAACTTTGCGACAGCCATACACCAAATCATTGAATGCCTTACGATATAAGTCATAAAT:1 + chr2L 15455789 5' + Quasimodo 97 2 56.44 AAATGCACAGGGTAGAGATGGGTTCGAGATGAAAGGCAATTTGGTAACTCCCGCGAGTGCCAAATCATCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATG:1 - chr2R 3877680 5' + Doc3-element 351 1 68.32 ATGTCTTAAAGCCGCCAGTATTAGCTAAACGCCGCTTACCTTAAACGCCTCCAATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGA:1 + chr2R 9755813 5' - R2-element 3369 1 62.24 AATAAAGAAAGCTATTACACTGCTTAAGTTACAACTATAAATTACTACTGATTCAACAGTACATAAGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAG:1 - chr2L 1559247 5' + R1A1-element 386 1 61.39 GGGTGGACAGTTGCTGAGCGTAAACGTGACATAGGTGGGACAACATATAGACACCGCAACGGGTCCCACCGCCACACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTG:1 + chr2R 1956856 5' - Cr1a 4413 1 66.34 ATTTCGTAAACTACTTGATAAAACCAAACACTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - chr2R 10353329 5' + blood 21 2 56.44 GCAACGACAAAATTGCATTTGCAGACTGCAGCGCTTGTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTTAATGCAGCTAAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGA:1 - chr3R 10515480 5' - rooA 7417 2 74.26 AAGCCCCCCAAGATCCCCCGAACTCCACTGTCGAAAGCTGCATAATTAACACAAAATAATGATAAAGTTCATGGCGAGCAGCTGCTTTACTAGAAGAGCGG:1 + chr2L 17113569 5' + S2 1317 1 78.22 TAAACTTTCCAACTCAATANGGCTGAAGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGA:1 + chr3L 13316646 5' - Quasimodo 243 2 76.24 ACATTATAAAAATTTAAAAATAAAATAAAAGTGATTTAAATCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:2 - chr3R 12944740 5' + roo 36 2 65.35 TATGGAATATTTCCCAGAGGCGGGGATGTTGTTTTAGAGGCAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCA:1 + chr3L 20317811 5' - 3S18 305 2 58.42 GGATTGTTGGCCATTTTGTNTTTACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 + chr2R 19560173 5' + Tirant 50 2 73.27 CCAGGTGTCGAATGCACTTAGGACACTGTATTCGATTCCGTTATATCTGATACTTCTCGGTTCAGTACTACCCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCA:1 - chr3R 13227869 5' + I-element 48 1 54.46 CTTCGTATGGACTTATCGANGCGATGGTCAAGTGTGCGGGGCTCGTCTTCGGTATTTGTCTTAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGATGATTTGTGTGT:1 + chrX 22856946 5' - Porto1 4452 1 52.48 GGGGCGTGAAGCCACGCCTACTTTGCCAGACGATATCTCTGGAATCTTCACAGTTCCCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATTCCTCTTCATAAAAAA:1 - chr3R 18564582 5' + Q-element 63 2 67.33 TTTATTTTATACATTTTTCAGAATTCATTTTTAACGAAAAACCCTTAAGAAGGCACTGGCATCTGTTGAATCTCGTAGCTTTACATTTTCCTTTTTTTTTT:1 - chr3R 8618766 5' - Doc2-element 252 2 90.10 GTAATTTGCCCTTTAAAAGTAATTTAGATCTGAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr2L 12866894 5' - mdg1 380 2 64.36 TCACTAATCACGCAATTAGAGTTTAATTAAAGAAGCCGAATCCGAAAAGGAATACCTTTGTATTGTACCTTAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTCATTGAAC:1 - chrX 7247257 5' + HB 1424 1 59.41 CCTTTAAATAGATCATGCCCTCAGTACGATATGTAAACACTTTTAACAAATTAGAAACGAAATAATAATATAAGATAGAAATTAAGTAAACAAAAT:1 - chr3R 2744159 5' - accord2 433 1 68.75 CGTAGATTTTGTATACCCCTTTGCTTATCAATTAAACATTTACGTTGCAGACACGCACCTCTGTCACTGGGAGGCAGGGCGGTTGCCGCAGACCTCTTCTC:1 - chr2L 14222383 5' - gypsy6 7730 4 60.40 AGTGAGCACGGCGGTGGCGGCACCTGACCTGCTTAGCACGGCGGGGAATGGTAGTTGCGATCGGCGATCAGAAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCC:1 + chr2R 16126368 5' - Ivk 5057 1 73.27 GGAAATCAGGGGTTTGCGCCAACTGAGTGTTTCGAGTTTTTCGGATTTAGGTGTATCATTGCTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCATTAAGAGATAAG:1 + chr3R 5329714 5' + invader3 5302 2 58.42 TTTCTGTGGCTAACTAACTTGAAACTAATGCTTATTAACATTTTTAAATATATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 + chr2R 19088948 5' - Tabor 7300 2 51.49 CCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTAATCT:1 - chr3R 433124 5' - 1731 271 2 65.35 TTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chr2R 11941054 5' + 297 45 2 75.25 TATTTGAGTTGCACGAATATTTCACTGGTAATTGTACCAGTTCCTAAAAATGGTGAAATACCAGTGAAAATGGTAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 + chr2L 20619966 5' - roo 411 1 75.25 ATCGAAGGAGTTATCCCTTAAAGTGGATTCAAATGAGCACTTCAAGGCTGAGATTTGAGACCATTAACTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGG:1 - chr3L 12634247 5' + BS 5004 1 67.68 TCGTCTACATTTTAACGAAGCTATTTTAGAGTTGGAAATCATTTAGAGCTTGTGGCATAGCTGTAGTAACTACCAGCAGGGTTGCCTCTCTCACAACTGCA:1 - chr3R 8873721 5' + Doc4-element 285 1 59.41 TTTTAATCTATTCGTACAAAGAGTACGAATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGG:1 + chrX 983328 5' - Juan 4170 1 71.29 GAGAATGTTTATTCAGTGGGTTTTCGCGCACCCCACCGTTCTTTCAAAACGAGAAGTAACAAGAAAGAATGCTATATTCGAGTTCCCCGACTATCAGATAC:1 + chrX 22599914 5' - INE-1 558 1 49.50 GGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 - chr3R 18399235 5' + P-element 46 1 36.00 GCTGGCGAGTTTCGCTAACCACCGCAAGCATCCATGCACAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1 + chr2R 17943553 5' + jockey 4677 1 61.39 TACCACTACGAAAAATGTTGGGAATGTTTCGGGCGCCTGGCGGTATGCACCATTTTTTCTCCGCCGACTCTCTTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAA:1 + chr2L 2317640 5' - 1360 427 1 62.38 ACTGCGGAGGAGTGACTGCAGGTGTTCGCAATGCACTTCTGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTTGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 + chrX 12768247 5' + FB 38 1 59.41 TTTCGAACTGGGTGATTGTATATAAATGACAATTAAACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 - chrX 735000 5' + Tabor 10 2 69.31 ATGATTGAAGTGATGTTATTTTGTTATGAAAAGCAATTAAAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGA:1 - chr2R 672858 5' + F-element 12 1 72.92 GAGATTGCAGATTCAATGGACGGTGCGGCTCCATTGAAATATCAATTATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr2R 6850511 5' + roo 8689 2 58.76 CCGCCGCCTTTCATCGCGCTGTGCCACTTCTACTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGGGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTG:1 - chr2R 15267887 5' + micropia 95 2 75.00 ACATTTTATGTTCACTTTAGCGCCGATTCGCGTGGTTCAATCTTAAAAGATACGCTTGGTCGTAAAAGTCCACACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAG:1 + chr2R 892117 5' + I-element 4 1 67.33 TCAATAGGATTCCATTCCATGTCTATGTTGAATGTTTTATATACATTTTTTAAAAAGGTTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chr2R 22134271 5' - opus 7488 2 64.36 ACTACACATTTTATACGGCCTAAGAATATATTTCAAGGCCACGATAAATGAACAAACCCATTTAGTAAAGACAGCAACATAGCATTCATTCAAATAAAACG:1 - chr2L 14794179 5' + Stalker2 332 2 74.26 CTCTCTGAATTTGGAATCTNGATTTTCAAGGACCTTTTACCAACCCTAGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr3L 18418930 5' + hobo 7 1 71.29 AAAACACTTAGATATACTTCGGATTAGATTTACTGCCCATGTGCACACACACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr2R 9209509 5' + Tirant 8128 2 60.40 ACGGATATGGGTTTTCAGGCAACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3L 2022224 5' - roo 9052 2 63.37 GTACGAACAAATAATAATATAACATGGATAATGATACATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTG:1 - chr2R 12458013 5' - HMS-Beagle 7031 2 68.32 TTTAAAAAGTCAAAGCTTAATTTGGTTTCCTAAGCTCAGCCGAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chrX 1399949 5' + P-element 10 2 69.31 AATTGGCCAAAACATCCAAGGCAACAAACAGGCAAAAACGGCCAAAAACAGCCAGAGGAGCTTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 + chr3R 23542932 5' - 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roo 357 2 76.24 GCCATTCTCATCGTCCGCATCATCAGCAATTGCATTTAGATTCTGTTTGCAGGTTGCCGCCCTGCTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAAT:1 + chr3L 16997677 5' - copia 120 2 67.33 TCCAGCTCGTGACAGATCATATTAGCCCAGTCGATCTGGCACTGTCCGTCTGTCCGGCCGTATAACGTCGACATCTCAGGAATTATAAAAGCTGGAAGG:1 - chr2R 5779248 5' + INE-1 156 1 77.78 AGGATTGAAGTGCCACCCAGACAAGTATATAAATATGTATATTTATTTTTTTTTTATATGGTAACAAGTTGCGCTTAGCTAGTGCTGAAAAATAATATTAG:1 + chrX 10680483 5' + Gypsy12A_LTR 348 1 70.30 CTTTCGCTTCCTCCATCGAAGTGGCAGTCTTAACCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr2R 19840255 5' - roo 9030 1 64.36 AGAAGTTCTTTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTT:1 - chr3L 10474205 5' - copia 220 1 64.36 CTTCAAATATTAAGGAAATCCCTATATACATAAATCTATCGCTCCATCAAAATGTTTTATTGTAGTTAATTAGCATTCCTATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chr3R 13912992 5' - mdg1 7440 2 58.42 CTATATGTGTCACCAGTAATAAATACATATGTATGTATATTGAAAATCGCTTCGGGAGCCTACATCTTGTAGTCAAGTTCCCCGAGTATCAGATACCCGTT:1 - chr3L 16001835 5' - 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roo 112 2 56.44 GCTTAATTTGCAAATTTTGAAATTTTTTTTCATTATAGTTGTTTTTAGTCATATTTAATTTAATTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:1 - chr2R 18188377 5' - Juan 4196 1 53.47 TCACGCATACGCCAAGTAGNCCAAAGGAATGCTAAGAATAGCTGTAGCGTCAAGCGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr3L 21970887 5' + pogo 19 1 59.41 TCTAAAACAAAATATAGGCAAACGCCAGCGAATCCAAGTGCTCGGGCTAAACTTTATTGTTAAAATGCAAGCTTAGAACTGAATACAAAAGAATATGAAAA:1 - chr2L 5813414 5' - gtwin 7145 2 55.45 ATCCCGAGCATGCATGCCACCAACCAGAACAACACCGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGGTGGACAACGCTCT:1 - chr2L 7643793 5' + Circe 7413 2 67.33 GGCAAAGAAATCTTAAAGTTCGTAAAGAGCAAAATGTACTCATAACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chrX 3661382 5' + roo 33 2 59.41 CACTCTCTGAATTTGGAATNTGGATTTTCAAGGACCTTTTACCAACCCTAGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chr3L 18418932 5' + hobo 5 1 73.27 GGAACAAGAACGTGTTCTAAAGCAGAAGGCACACAACACCCAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAAGAACAAGGAATAAGCGCCGTACAGATAAATGCG:1 - chr2L 21140063 5' - diver2 4654 2 55.45 AAAAACTCCATAAAACTTTTCTTTTAATTAAAACATATTTTACATACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3R 12063740 5' - 412 7515 2 61.00 CATTGGTTACAAGTGGGTCGAATGCAAGACAATGTTGGTGTAGTTTTTCTCTTCCAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCTACTC:1 - chr2R 4578736 5' - Tirant 247 2 74.07 TGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:1 - chr2L 12808218 5' + Tirant 44 2 67.68 GAAAGCAGGATAGCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chr3R 23543017 5' + 412 34 2 62.38 CTGATCGAAAAGCAGGCGATGTTGCTTTCGGGAAGGGGCAAGTCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTC:1 + chr2L 18388788 5' + roo 150 2 57.43 ATCATGAAATTGTGTGCAANATTCATATTAATTGTTACTAATCAGGCAGATCAATTCATAAATTCCTTAAAAAATTGTTAGTAATTTTTACACTCTCAATG:1 - chrX 2841069 5' + Tc1 133 1 87.13 ACAAAAAGCCCCATGGAACATGATAATTTGTTAACTTCCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chrX 4277467 5' - roo 9041 1 61.05 GCCATATTGGAGTTCAGTTGCTTTTCAAAAAACGGAAGCGGTTAGTACATTTCGGTGCCAGCAGCTTAAGACCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr3R 20696556 5' + jockey 14 1 69.31 ATGTCGAGCACCGTAGGTGCCCAAAACGAGTATTTGAGCTCCGATTTTTATTTTGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAAGTATCATATATTTTAAACAT:1 + chr3R 2532190 5' + Cr1a 92 1 68.32 TAATGGATTTCTACTAGTAACCGAAGCGGGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 + chr2L 16840549 5' + Tirant 8157 2 71.29 TATTATTTTTTAAGGGTAACAACGAGCTAATTAGCGTAGTTTCTGCTAATCACCTATTACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAACTACACCACTACGTTCCTG:1 + chr2L 19875686 5' + Copia1_DM 115 1 57.43 CCACTTCAAACAAATGCTGTAACTATTTTATGTGCGAAATTTCTAACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTA:1 + chr2R 13764578 5' - roo 35 2 53.47 GTGACACTGATGAAGAGCAGGTGATGGCGATGCAAACTGGCCCCGCCCCTCACCACATTTCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr2L 20238683 5' - hobo 2924 1 65.35 TTCACAATCCTGGGAAATAACTTCAGCATTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAGGAAACAAATATAACAAAAACGAAGATCTCGAAATGGTAATTGAAG:1 + chr3R 4063946 5' + G4 119 1 72.28 TTTGGTGGTCAGTCAATGGCCCGCAGAGAAAACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3R 11608038 5' - 1360 3377 1 67.00 CCATCATTCAAGGGAGCCACAAAAAAAAATTATAAAAGTAAATCATTTTGATTTTAGAGATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:1 - chr3R 10914193 5' + F-element 91 1 57.43 TGAAGCTACCTAAGCACAATATGTTTATAAAAATTGTGCCAAAATAGTTTGAAGTCTCAAATAATATTCATTAGTAACTATC:1 + chr3L 3792214 5' - copia 4808 1 71.95 ATTTAAAATCAGATTGTGAAATTCCAAAACATAGGCATTCCTAGCAAAAATAACACCTATAGTCCTATTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATA:1 + chr3L 15033286 5' - I-element 5346 1 63.37 ACTGTGCCGTTCTGCATTTGACCAAACAGTCACTATGTTTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3L 2022321 5' + roo 17 2 63.37 ATTGCTCACACTGTAGAGGGGACTTACCCCCCGGCGTTTTTTCTTTTTAAATATTTTT:1 + chr3L 7087525 5' - TART-B 10506 2 81.03 TAGCAACAAGTCAGCGGAATCTAAAACCGAATAATCCGATTACAAGCCATACACGTACTCCATATATATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTC:1 - chr3R 25750258 5' - micropia 450 2 74.26 AATAGCGTTTAACAGAATGTAAATTAAGTTTTGTGGAAAGTCTGAAATAAAATACACTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr3L 19647336 5' + pogo 15 1 65.35 GCCACGCCCCTGCTGTTTATGCCCGCTGCTTTTTGACGGTTTTCGCTGCCTTCCCTATTTTCTCTCTTGGATTTTGTACTTAATAAAGAGCGCATCGCGCC:1 - chr3L 10760970 5' + springer 7305 4 74.26 TTTTTTTGATGTTGAAAATATATATGTAATATGTATGTATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTC:1 - chr2R 4150656 5' - gypsy 423 2 69.31 TCTATGTCTGATGAAAAAAAAAGGAGTAAATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr2L 13186258 5' + pogo 41 1 72.28 TCCCCAAAGGATAAGAATCCACTCCACTGGGCCGCAAAACCATTCGACAGCCACGAAAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAG:1 - chr2R 19560242 5' - Tirant 8489 2 62.38 ATCACGTGAATTTACATTGCTAAAACTCAACTTATTACACATGTACATGCAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr2R 1521653 5' - opus 476 2 57.43 GGTCCTGGTTGGCCTGATCGTTGGCCTGCGAGTGTATATGTGTGTAGTTGTCCTTTTATCCTGTCCGCTGGTGTGTAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 7879869 5' - accord 184 2 73.74 TTTGTGCACATGTCCAGCTGGTAGAGATCGGCGATGCGCTCGTCCATCATCTTTTCGATCTGCCAAATTCTGACAAAGACATTAAGAAGACCCCTAAGCCG:1 + chr3R 4505293 5' + Fw2 190 1 58.42 CAATAGCAAAGCAATCTTATGTTTGATGGCACAAACTATACAATCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAA:1 - chr3R 27907691 5' + mdg3 5286 2 59.41 GAAACAATATAACTTTCAACTTGCCTCACATTCCCTGGAAATTAAATGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCT:1 + chr3L 12895954 5' + Rt1b 5075 1 54.46 GAATGTGAATGCCGCCCCAGCGAAGCCGTATTTGTAGTCCTGGCATTTTCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTC:1 + chr2R 6918567 5' - accord 7359 2 54.46 TTATAAAAGTAAATCATTTTGATTTTAGAGATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCG:1 - chr3R 10914163 5' + F-element 119 1 69.31 AAATTATTTTCATCACAGCATAAGTGGGTTAAAGAGAAAGCCTAGGACAGGGGCATGTGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAG:1 + chr2L 15567085 5' + 17.6 6943 1 63.37 GATCATAATTAGTGTTTCTNGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 - chr2R 24555688 5' - hopper 1378 1 61.39 TCAGTTCTGTCTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:2 + chr3R 6266282 5' - roo 390 2 60.40 GCAAGAAAAAGTTGAGTGCGCCATCTTTTGCTTGACTTTAATAAACGAGTACGACACGGTGCACCATCTATTGGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAAC:1 + chr2R 25085556 5' + R1A1-element 5292 1 78.00 ATTCCAGAGTAAGCCGGGGTGGCTTCGCTGGAGGGTCTGTGTGCCGGTTAGAACCGGTAACTCCTCCCCTCCCGGATTGAAGTGACGGCCACAACGAAGG:2 + chrX 21939637 5' - gypsy5 6902 2 68.00 GCCATTTGAAACAAGAAAAGGTTTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTA:1 + chr3R 7513935 5' + diver 55 2 77.23 ACTAGTTTTTAAATAAACATCAATTAAAATGAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATC:1 + chr2R 5772462 5' + HMS-Beagle 6837 2 71.29 CTGAAGTTGGATTAACATTAACATTATAAAAATTTAAAAATAAAATAAAAGTGATTTAAATCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3R 12944760 5' + roo 16 2 64.36 AAGTGATGTTATTTTGTTATGAAAAGCAATTAAAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 - chr2R 672851 5' + F-element 24 1 62.38 CCTTTGCGGAGGTTAATTTTCTTGGAGTTTCGTAGAAAAACAACCTCATTGTTTACTCGTATATCGCTCATATGCTCTTCAATATTTGTTACACTGAGCT:1 - chr2L 21037253 5' + Stalker2 383 2 62.00 AGGTGTAAAAACGCATAAATCACAATTTAAAGACCCGTAAGAATGGTATTATTATAATCTCTGTAATCTTGAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGTTGTTAT:1 + chr2L 6706065 5' - hopper 1126 1 78.22 TTTTTATTCTCTCTCCATTATTTTGTGATGGTTTAACAACAAACTCGCATAAAGCAGACAGGCGGACGGACCAGTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 + chr2L 19681388 5' - hopper 1411 2 75.25 AGATGAGGGACAACGAAAAAAGTGAGAAAAGATAAAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr2L 13093742 5' - roo 407 1 77.23 GGGATTTTATGAAACAGTCCTTAATGTAATACTTTATACTGTTTAATAACTAATAAACTTGCTGTACAAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 10104076 5' + roo 49 2 73.27 ACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chr3R 7869116 5' + 297 6611 2 55.45 AAATAATTAGTAATCAGATTAATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAA:1 + chrX 21229988 5' + transib2 2803 2 79.21 GGTCTCTTCTCTTCAAATCGTATGTCATTCTATATATGCAATTCTAGGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 - chr2L 14341905 5' - copia 225 1 59.41 TAATTATTTTTGAAGTGTACATATGTGAGAAGTGCAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr3L 21518988 5' + 1360 38 1 67.01 CATTAATTGAAGTCAACCACGTCCTGCCTGGCTGCCTTCATATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATT:1 - chrX 9342387 5' - Burdock 223 2 60.40 AAAACATCTGGAAGGAAAACTCTAGAAATGCCAATATGTTCATAGCTGTCTTGAGGATCATATAAGAATGAGACTGTGTTATTCTTATCTGGTATCTATTG:1 - chr3L 1070484 5' - Idefix 6918 2 59.41 CGAAACCGAATCGAATTGAATCGAAGCGCAGCGAATCGGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGT:1 - chr2L 17492188 5' - Transpac 5167 2 62.38 AGAATAACAATATTACATATATATTCTCAGTGCGTTTGTGTGTGTATATAGTGTATATGGTGTAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chrX 5219678 5' + hobo 12 1 65.00 TGAGCGAAAATGCACTCTTCAATGGACTGTGTATGTGCGAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 16087672 5' - accord 7032 2 68.54 TGCATGCTGCTCGCATTACATTTCCGCGGCTAAACTGCACAAACAAGCTGAGCTTCATAGCTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2R 6107711 5' - roo 393 1 63.37 TGGGAGAGAGCGGCAAAAGAGGCGTTCGAACTTCGAAAACCCTAATTTACGATCTATTCGGTTTTATGACAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTG:1 - chr3L 1586822 5' - Tirant 397 2 75.25 CCATTGTCGTCTCAGTTCTCGGAACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:2 + chr3R 26252693 5' + 412 7105 2 73.27 TCGGCGGTAAACGCAGCTCTGGCACAAGATCGCACGTGGAAGAAGATAGTGCGTCGGAGCGTTAAAGGAAGGAGTTCGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGT:1 + chr2R 4658071 5' + gypsy8 446 1 76.24 TAAAAGCTGCAGTCTCCAGGGGCCTTTAGTTGTCTGAAAACATTAGATGATTTAAGATAAGGGGTA:1 + chr3R 27478576 5' - Cr1a 4137 1 77.27 TAGGTTACGGTGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTTTTTTATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 25021678 5' - roo 387 2 56.52 TTCACATGGTCATGTATATTTTGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:2 - chr3L 22930355 5' - roo 356 2 77.23 CGAAAGTTGGGTGGTTGGGNGGTTATAGCCATTCATATCGATGGCTCAAAGCCGCTTGACAGTTGAAAGATGAAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTT:1 - chr2L 5687755 5' - opus 380 2 80.20 AGGAGGCGATAAAGGCTGAGAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr2R 22856604 5' - 1360 3370 1 59.60 TACGCATCTTGTTATTCTTGTGTCTTTGCTTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTGCAAATCGTATTCTAAACTACCTAAATATCATTTTATGAAATGA:1 + chr2R 1982172 5' - Doc3-element 4633 1 81.19 AAAAATATTAACATCTGGTTTTTATGAAGCGACCGCTCAACTATTGCCCCGTAATTCGCATTGTTATTGATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 + chr3R 12767250 5' + blood 7 2 72.28 ATCTGCGACATAAAACACGAAAAATGGTAACATCGAAACCACGAGCCACAAGAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:1 - chr2L 20328809 5' - opus 498 1 79.21 ATTCAAAATCATATTTGATTGAAAGACACTAGAATAATAAGATGCGTAACGGCCATACATTTGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 - chr2L 8991458 5' - 1360 3329 1 79.21 AAACTGGCTCTGGAGGAGCGGCTTTTGTTATCGAATGCAAAACTATTTAGCCATTGCTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 - chr3L 12438083 5' + I-element 22 1 56.44 GTGCAAGAACAAGATGGAAAATCTATGCACAAAAAGGGGTAATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chrX 9775050 5' - 412 456 2 61.39 GGCACATTATGCTGATGCCCATTGTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTATTCTATCACTATATC:1 - chr2L 17872514 5' - BS 4850 1 74.26 ACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 - chr2L 12808214 5' + Tirant 8157 2 72.28 CGTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3R 10741072 5' + 1360 9 2 69.31 TGAAATTAAGGGAAATGTGCACGCTGGTCCGGTGAAATAAAATAAAAATATAAAATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACA:1 + chr2R 4830296 5' - Tc3 313 1 77.23 GGCGCAATGCTTAAAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3R 19449521 5' + hobo 19 1 60.40 GACTTGTCGTGGGAGTTTGTCTACTCATGATTCTGTGAATTTTATGAGGAATGGTGATTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:1 - chr3R 26435476 5' - Juan 4196 1 58.42 CACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr3L 8036423 5' - roo 9029 1 75.26 GTCCGATTTGCATAATATTATTAGTAAACACTCGTTATGAAGTCAGCCACGCCCACCGACCACCGGCCACCGATGTCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTG:1 + chr3L 22241507 5' - Cr1a 4413 1 81.19 TTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACCCCTACCGCCCAACCGACCG:1 - chr2R 1949128 5' - Cr1a 4423 1 76.71 CTTATGAGGTGCTTAAGCAGATCACTTAAAACTACATTAATATTTTAAGAGGTGAGAGTTTGGTGGGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr2L 16793627 5' - hobo 2930 1 70.00 GTATTGATTTAGAGAGAAAAGAAAACACTGTAGCAGCTGAAGAGTAAACATAACACAAGGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACT:1 + chr2L 17987744 5' - Cr1a 163 1 60.40 ACCCAAACTGCGCTCAACTGCCGATAATTTGTGCAATTTGTTGACACACATTTTAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTT:1 + chrX 16814684 5' - micropia 351 2 59.41 CGACTCTTTGAGTGGACATGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGGTGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 6850462 5' - roo 9017 2 82.00 CGGTTGTACTGCTTTTGGCNGTAAATGAAATTAAATCGATATTTCTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3L 18762144 5' + pogo 29 1 59.41 TCTAAATTCTTGTGGGTGCAAAATACGTGGGAAATAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGACCGTATATGTGTACATCAAACGCTGATAAGGC:1 + chr2L 9808316 5' - accord2 7197 1 69.31 TCATTTTCATAATGTCCGCTCATCCCTGAGCGGATAATGAGTTTGGATGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 + chr3R 3847090 5' - P-element 2860 1 52.48 CAAAATCCTTTCACTTCGTTTTCTGATGTTCTTCCAATTATGGCATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr2L 5926926 5' - pogo 2072 1 54.46 AATAATCGAGGGTGCAGAAGGGGAAACTGTGAGCCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2L 18218837 5' - roo 9050 2 74.26 CAACTAAATCTCCCAGCTCTAACACCTTAAACTGTTTTTCAGAACGCTTAGCTCACTGCGAAAAATCAGCGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGG:1 - chr3L 735340 5' + gypsy6 7418 1 49.00 AGTTTCTAAACAATATTTTAATATTATAATTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:2 - chr3L 10621703 5' + 412 49 2 77.23 GAAAATATTTGATATAACTTTGTTAATTGATAATTTCAGCGTAACTACATTTAAATGAGCACCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATC:1 - chr2R 16467928 5' + F-element 4314 1 61.39 ATCTGCGGATCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1 + chr2R 15788570 5' + Transpac 4945 2 54.00 TTCACAATCCCCCACCATTTCTCACTCGAAATATTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 + chr3L 3596685 5' - copia 213 2 68.32 TATGAACACTACTTAAATTTCCAGAGAATTTGGCATTTAAGTATCTCTTTTTTTGGGATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 - chr3R 19505619 5' - mdg3 5480 2 40.59 AATTACTGGGTTCTATTTCTAACTCCTTTTCTTTTTAAATATGACCAGAGGTTTTCTATTATGTTGAGGTCTGGACTTTGAGGTGGCCAATCTAATGTGTT:1 - chr3R 6592428 5' - Tc1-2 1145 1 78.22 CATTAACCAAGTAAATGAGACTTTGAGAAAAATGGTTATTTATATGCAGAAATAAGGCGAATGAAAATGTATTCATGTTATATACATCATTCAGCGAGCAC:1 + chr2L 13422208 5' + F-element 4310 2 79.21 AAGAGCAAAGATTGGCACTTTAAATTATCTATAGCAATGTGCACAGCAATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 - chr2R 9631793 5' + F-element 15 1 71.29 CGTTTGGCAAGGACGAACGAGGGGGAGGGGTTGAGTGGTGCCAAAACGAGAGGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAACTAAAATGGCGACCACG:1 - chrX 8211409 5' - Max-element 409 1 57.58 GATCAGCATTATCACGTTAAGTAATGACTTTTAACCGCAAAAATATTCAAAGTCGTAACTGAACGAGCTCTTTAACTGGGCTAAACCAAAGACACTAGAAT:1 + chr2L 17593392 5' - Tc3 317 1 78.22 GCAAACAATGGGTGCAACAACTATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 - chr2R 13653415 5' + F-element 41 1 50.50 ATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCGTTCGAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTC:1 + chrX 22596361 5' - INE-1 580 1 47.42 TAGATGAGTTGCGAATCCCAAACACCCCAATATAAATACTCTCGTCGTTTCGATTTTTCCTTTCAGAGAATCCTTGCTAAGCCACTCCCCTGCACGAGATT:1 + chr3R 4585410 5' - gypsy8 4676 2 80.20 GGTGGTACCATGATATTGTTAAATAGTTAAGTTATTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAATTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTG:1 - chr3L 15376469 5' - Porto1 384 1 65.66 TACGAAGCGTTTTCGATCCTATCAAATATATATTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAG:1 + chrX 14980197 5' - Doc2-element 382 1 68.00 TTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAGAATA:1 + chrX 7480762 5' + Doc2-element 233 2 61.39 GACATAAAACACGAAAAATGGTAACATCGAAACCACGAGCCACAAGAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 - chr2L 20328803 5' - opus 7495 2 73.27 TTATGAAAGAACTGAAAATGGTATAGTAAAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCA:1 + chr3R 25086108 5' + Bari1 48 1 75.25 GTTGCACCCTCTGCATTTTTCGCTGTTATCTTTGAATGTTTAATGCAAAATGATTTACCTAGTACTGTTTGGTTGTTTTTTTTTTTCTTT:1 + chr3R 12898204 5' - gypsy7 5013 1 81.11 AACAGAGAAACCACATACANAAACATTGACTATTTCCCCTCACTAAGTAGCAAAGTGCGTGATGTTTACTACCAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCC:1 - chrX 17032308 5' + I-element 5045 1 74.26 ATCATAATTAGTGTTTCTTGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:1 - chr2R 24555687 5' - hopper 1377 1 62.38 ACTGTGAAAAAATGTGGCCAAAAGCTTAACTAACGAAATGAATCGCTGCAAGAGCCAAGAACCAATACTATGAATTATTATAGCAATAATAATAATAATCT:1 + chr3R 19255382 5' + mdg1 32 2 38.61 TTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:2 - chr3R 11916597 5' - roo 9018 2 77.23 TGTGGAAAACGGTTGAATCGCTTATGACTCAGCATTTCTTGCAGCGTGAAGCAACACTCCCGATAGGAAGTGTCAGCTTTCCGCTGACAGGCGTTCTTCG:1 + chrX 5346639 5' - gypsy 7079 2 73.00 AGAAAATCGCAGGATTCCACTGGAAGGATGTGCGGCCAGAAAAAAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - chr3L 25345161 5' + Doc 36 1 53.47 TAAAGATCCTAACTGTGCGTATGTGTGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTT:1 + chrX 15287879 5' - hobo 2888 1 78.22 GAACTGTAGCATTTTCATTTATTTATGCAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCC:1 - chr2L 16139162 5' + copia 4919 2 77.23 GTGGACAAGTGGCGTCGATTGGATTTACGTTTCGTTTGGCTCGGTTTGGTTTGCTTTGGTTTCGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr3R 13657951 5' + Tirant 12 2 43.56 CAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACTAGACTACTTTTAATTAATTTACTATCCCTAGCTAACCGTAGAAATATGC:1 - chr3L 19457487 5' + Cr1a 4010 1 47.47 CAGGCTCTCAAGCTAGTGACTGCCTTCCATATCAGTTTTTTCTTCTGTTTTTTTTTTCTTCACTTCTTATTATTTGTTGTTTTTTTTTCTTTTTTTTT:1 - chr2R 10497124 5' - Doc2-element 219 110 78.57 TATTAAGTTACCACATTATCAAGCATTTTTCGCAGTGCACTCCTCACTCATGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCAT:1 - chrX 4264420 5' + mdg3 24 2 51.49 ACGTGTGTTTGAAAACACTGGGAAAAACGAATAGATTCCTTTTAGTTATTTATTTCATTATATATAATCAATTATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chrX 22666324 5' + Doc 6 1 73.27 CTCCAACTTCCGTCAGGCGATGACGCAGTCTAATAGAAAAACAAATGCACTAAGCAAAACAATTAAAAGCTACAACGCAACAGAAAAAGACAAAAAAAAAA:1 + chrX 14762308 5' + Doc2-element 219 1 64.36 AAAAATCATAAAAAATTAAAAGTGTACCCACACAGATAGTACATATGTATGTGCATAGTACATATATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chrX 3356330 5' + hobo 11 1 64.36 GAGTGCTTTCTAGAGGGTGTTGGGTGGTTCGGGTTAAAGAACGTATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr2L 9260322 5' + 297 28 2 57.43 CGCATAAATAAGATTGTACTGAAGTATTACATGCGATAAAACTGTACTTTTAAAGGAGGCATCAAGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTC:1 + chr3R 19719202 5' - 412 7225 2 79.21 TAAGAGATTTGATTGGTCCTTACAGCTACTGTGTAATTCCATTGCTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 + chr3R 4971374 5' + F-element 15 1 73.27 TTTACCGGTTTTAAGATGGTCTATAATTTTTCAGTAGTTTTGCGCATACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAG:2 + chr3R 21365497 5' + P-element 30 1 49.50 AATGCAAACCGGTTGATACCGCTTCGAGTTGTTAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr2L 12459685 5' + blood 7055 2 68.32 TTATTTTGAAGGGGCGGACACGATGCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTT:1 + chrX 15255367 5' + Tabor 52 2 74.26 AATCTCTTGAGAACCGGTTGTCTTCAATTTGCTGTTCTTAGCTTTTATTTCCAGTGTTTCATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAG:1 + chr2R 9950094 5' + 3S18 15 2 60.00 GATGGATGTATCTTCGTATCTGGTATCTGCGGATCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCC:1 + chr2R 15788546 5' + Transpac 4922 2 77.23 TATATGAACATAATGATTTTCATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTT:2 + chr3L 13001026 5' - invader3 5409 2 80.20 GTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATTGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAG:1 + chr2R 19091627 5' - Stalker2 372 2 68.42 TCGTGGGTGTGAAAACAGCGAAGGAAAGCGGAGCAAAATAAATGAAAACTACGCACGAATCGTGTTGGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTG:1 - chr3L 1569252 5' - accord 7007 2 73.27 TGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr3R 20905413 5' + pogo 51 1 75.25 ATCGGCACAACACTGGTAAGTTTCCATGGCCAACAGAAGCTCAACTTGTTTATTCTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTC:1 - chrX 611404 5' - invader3 5239 2 68.54 AGCCATCTGACGACCACATTTACCCATTCGATTTGGCCTTCCGATGGGCCATCAATTGCTCCCGCTTCCGGAGTGAGTCACCACCCTCATGACCTCCCTA:1 + chr2R 23519191 5' + jockey 4760 1 78.00 TTTTCAAGTTCCACACTATTTACAAATTAGTAATCTCATAGAAAAATATCATTAGCGTCCAGGTCATGAGAGGCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATG:1 - chr3R 9133224 5' + R2-element 3300 1 55.45 GGCTGCTATATTAAAACAGATATAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAA:1 - chr2L 127337 5' + F-element 159 1 79.21 CGTGGCTGCCACTTGTTTTATTTATTGCTTTTTTAACCCTTTTTTTTTGGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 10488749 5' - roo 9045 1 54.46 TTGTATTTGATCATAAATTNTTCTTATTCTTTTTATAAAAAAAATTATTAAATGTTTATTTTTTTTAAGTCAGATTTCATGAATAATAAGTTCCATATGTT:1 + chr2R 5413048 5' + Tc1 98 1 61.39 ATTTGTTTTCATTTGGTTTCTCTGCTGACATTGTTTACAGTTCAACTTGGTTGGAAAATTACGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAATACGAAGT:1 - chr3R 24378048 5' + Bica 4643 1 56.44 TATCACATGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCC:1 + chrX 22689546 5' - 1731 4589 1 61.00 AGGACATCTGAGAAGGATTGCAACTCATAAATCACTGCGGAAAAGCTTGAAAATTTTCCACACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr3L 5415421 5' + I-element 14 1 60.40 CCGCCAAAGCGTATGCAAAGTCCAACAAACTGCAAAATAACAGTGGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr2L 20045734 5' + roo 29 2 56.00 TAACGGAAAATCGAGCATTNCATTGACTGTCACTCCCGTTTTCTGCCCTAATCATAATACCAAATAAGAATAATAACAAATAATAATAATAATCTAAATAA:1 - chr2R 23126055 5' + mdg1 7076 2 75.25 ATCGCAGGGAATTTGTTTGNAATTTAAAGACAAAACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTT:1 - chr2R 22051558 5' - Tabor 7318 2 71.29 TCATCACAGCATAAGTGGGTTAAAGAGAAAGCCTAGGACAGGGGCATGTGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATAT:1 + chr2L 15567094 5' + 17.6 6952 1 54.46 ATTCAGACGGCAGAAAATCNCTGCGAAACGAGTCTATTTAGTTTATTTGATCATTCGCCAACGTGTTCGGGTGGGCGCTAAGTCTGTCTGCATATCGGCTG:1 - chr3L 2429714 5' - G5A 2604 1 54.46 GGATGTTTTCAGTTACTAGATGGTGTAAAAATGGGTCAGATTGTGCTTGAAAAATCTTTATTTATAAATAAAAAACATATTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chrX 7797621 5' + roo 8664 1 66.34 TTTCCTGCAGTGTTGCCGCATGTGTTATCGCGCTGCCATGACCATCATTGTTTACATATACATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr2L 21708326 5' + 297 4 2 76.00 AAGTGTTACAGCTAGATTGNAATTTACAAAATCCTTTCACTTCGTTTTCTGATGTTCTTCCAATTATGGCATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr2L 5926900 5' - pogo 2098 1 73.27 AATTTGTTATTATTATTGTATGATGCATAATAATAATAGATGTTGCAATTATTAAATAAACATTAAAAACACCACAGTGTTTTTTTTTCTTTTTTTATTT:1 - chrX 14023222 5' - HMS-Beagle2 488 7 55.00 GTTTCGAACACTCTGTGTTGAACGTTCGTTGGCGTCTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr3L 699021 5' - P-element 2848 1 33.66 AAAGTGGAGAGTGGCAGTGCTTAAAGTGCAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 9278340 5' + roo 8709 2 74.26 AAAAACCACAGCTCGATGTTTGCCGTGTTGCCAATAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAA:1 - chr3R 26083700 5' + Doc2-element 480 1 72.16 ACAAAAAGGATCCGGAGCTCGTAAAAAAAAAAATTGGAAAAAAA:1 + chrX 14479868 5' - FB 173 1 93.18 CGTAAGAAATGCTTTAATAAACAGGGAACCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACT:1 - chrX 21253941 5' - invader3 231 2 71.29 AATAACGAAGATGAGGAAGACACATTAAAGAACAAGGAACCTACCCCAAAAAAAAGGAAGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chrX 16523361 5' + blood 7027 2 60.40 CGAAAAATTGGTTTAGGTGGGGCATCATCAGTGGCTGCCTCTTTTTTTGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATG:1 + chr3R 23900017 5' + G2 186 1 52.48 ACAATGAAACCCACTTGTTCGGTGGGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 + chr2R 21040871 5' - P-element 2836 1 26.73 TTTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTACGTGTGTACGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGT:1 - chr3L 11913082 5' - accord 7039 2 67.82 TGGCAGTTTTGGTCGGTTTGTGGTCGTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAAGCGTCGGCAG:1 + chr3L 24159153 5' - HMS-Beagle2 176 2 72.28 GTTTAATTAATTAGGGGGCAGCATTTTAATTAGACTTAAGTGCTGCTGCCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:2 + chr3L 1998805 5' - hopper 1391 1 55.45 TTCACAAAAATCTGTTGCTCACCTGCAAATAATATTCCGTAAGGTCGACGTATTAGTATATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGT:1 - chr2R 16551557 5' - hopper 1311 1 54.46 CATTAGGTATAACAATTTCCTGTGTGATGGAAATGGAAGGCAACGAAGAATAACAGCAACTCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATT:1 - chr3L 13786424 5' + pogo 2094 1 62.38 GTGGCCTTCTCCTTGAAGTTCTCCTTCGTTTTCATTAACAAAATCGATTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAG:1 + chr2R 19061214 5' - roo 9047 1 54.46 ATTCGCGGATTCAACGTCATGACAACAAATTGCTTGTCGGCAACAAAAGAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 20424721 5' + BS 5112 102 60.56 GCTCTTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3R 29608838 5' + roo 41 2 68.32 TTTTATTTAAAACTTTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGG:1 + chrX 22426170 5' - 1731 4597 1 52.48 TAGTTGGCCTCTCATTAAGACGAGGGAGCCATAAATTCACGAATATACGCGACAAAGCCAGAAACTCTATTCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr3R 13353295 5' + 1360 7 2 70.30 TGCGGAGGGCAAATGTTAAGCGCTTAAAGAAAAGTCGATGGCGCAGTGGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTC:1 - chr2R 13599839 5' + flea 162 1 58.42 CACGCCTACCTTCCACTCTCGTCGACCCAACGCCCACTGAATTTTCACAACCGTTACATAGTGTTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTG:1 + chrX 16998702 5' - invader4 2933 2 66.34 GAATCTTGGATTTCTTGTCAATCTATGCATGCTATTTGATATATAATTAATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTC:1 - chr3L 19089671 5' - invader1 381 2 52.48 AGTGTTGCCGCATGTGTTATCGCGCTGCCATGACCATCATTGTTTACATATACATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr2L 21708334 5' + 297 13 2 63.37 GGCAGTTGCTGAATAAATGCGATAGTAATTGGCTTTGGCAATTTATTAATTAACTATTAATGGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chrX 21060392 5' + 412 7068 2 64.36 GTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2L 4063708 5' - roo 9021 2 74.26 GAAGTTTAAGAGAATAAAGTTTTCAACGTCTATTCTCCCGAAAAGAGATGTGTCTATTCTCCCGTTAAGAGAGTTTCTCCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGG:1 - chr3L 26003710 5' + invader1 3721 2 75.25 TTGATTTAATTGAGGTAATAATAAATTTATGGAATTGGGGGAAGGGAAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAATGTAGAGTAAACATATTGAAAAGC:1 - chr2R 18304077 5' + 17.6 33 2 62.38 ACTGGCCAACGCATTTGTTTTCTATATACACATTGTATAATACACTACGCTCATTCAAGGTATATAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGGTG:1 - chr3R 24686206 5' + I-element 226 1 74.26 AGAGGCAGGAAGAACTGCAGATGGCGGAAGCGAAGAACCGCGCGTCCTGGAGAAAGGTGGCCTGGCAGTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATAGAAGGC:1 - chrX 21175413 5' - Gypsy12A_LTR 2248 1 88.12 ACTAGCATAAAACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 + chr3R 7869096 5' + 297 10 2 70.30 TATTTGGGGGGTGGCGGTTATATTTTAAGGTGTGACAGACATCGCAATTATTTATAGTCTGAGCAATCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGA:1 - chrY 132157 5' - Idefix 294 2 64.00 AGAGCTTCAGTTACCTATTNGCAACCCCTATTTAGACAAAGTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTT:1 + chrX 9454816 5' - roo 9037 1 58.42 CTCAACTTTATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCC:1 - chr3L 15452927 5' - accord 497 2 62.38 TAAAGCTAAATTCTAGGGCGACGTAACACTATTGGGCCCTTATGCTCAAATAAATAAAACGTTATATAATAATCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTT:1 - chr3L 14928920 5' + 1360 3087 1 36.63 AACAAGGGCCCAACTGCGGAGGAGTGACTGCAGGTGTTCGCAATGCACTTCTGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTTGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 + chrX 12768235 5' + FB 26 1 51.49 GTCTACAACTGATACTAACTACCGACCATGATGTGGGCCGGTGCTCCCGTTCGTGTTTACCACGCTGGCCATGTTGAGGCCATTGATGCTGCAGGGCGAGG:1 - chr3R 16259497 5' + Rt1c 5200 1 62.38 TAAACTAAATATCTTTCTGCGCTCTGGAGTTACCAACTAAAAAATATATAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3L 23277328 5' + roo 58 2 55.45 AGTCCTGCAGTCCTGTAGTCCTGCAGTCCCTCGGGCAACGCGTCGTATGCGCAATAAATAAATCTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTC:1 - chr3R 4845047 5' - invader3 5450 2 63.00 AATGCCCCCATATGCAGTTTTGAATATCAAGTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr2L 22197221 5' + roo 8706 2 71.13 GTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGC:1 + chr3R 19589932 5' + BS 5030 1 57.43 TTGTTTCTTTTTTGGGGCGATTGCAATCGCAGCTGTCAGTTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTT:1 + chrX 2382692 5' + 297 462 1 60.40 CAGGCCATGCGTGGCGTAAACAAACTCGGAAAATGCAAAACGGATGTGTAAATAATTTAGACGAGTTGCCAGATCAACCGTGTGATCAGTGTTGTGTTGCG:1 - chr3L 7410025 5' + Rt1b 56 1 82.18 AAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCG:1 - chr3L 15099646 5' + G4 3805 1 43.56 AAATCCGAATAAGCTGCTTAATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCCTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 - chr2L 18655223 5' + Doc 23 1 57.43 ATCATTTAATTAAGCCCCCCCACTGAACCGCGGCCCAGAAAAAAAAAACAAAAGAAAA:1 + chrX 16101139 5' + Doc2-element 227 2 58.62 CATGCATAACGAAACCAGAAACCTCTTCGAAGATGATTAGGCCATGCCCATTTCCGGACAAAATGTTATGCAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCT:1 + chr2L 14220123 5' - springer 7513 2 71.29 TAACTACTAAATAGAAATGCTAAATTTCTCTATGTGTAAACATCCACTCATCCACCCGTGCCGAGAGTCTGCCAGGCTGAGGGCCCGGGAAACAACTAGCC:1 + chr3R 9185141 5' + baggins 260 1 56.44 TCCAATAATCGTTAAAGCGNCCATAAAATAATCACCTAATGTACATATTGCCCATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACC:1 - chr3L 11829113 5' - Transpac 5210 2 59.41 GGCGAACAACAGCTGCAATAAAATTGTATAAGCTAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chrX 12906519 5' + P-element 42 1 37.62 CATTTAATGATAATTTTTACCCTTTTACGTTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATCCCACTTATTTTTGTTAAATGCAATGTGTAGATAGGG:1 + chrX 20621562 5' + HB 109 1 71.29 TGATATTATTGTATGTATAAAAGCCATACAAAGCGCGCTCAAAGTTCAGTTATACGCCATATTTTATGAACAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:1 + chr3R 27928885 5' - mdg1 417 2 70.30 AATTATATATGTATGTTACAATACCACACTTTAAGGGAAGGGGAGGTGGTACGTATTTGGGTGGTCCAAATCGGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAAACAG:1 - chr4 1231032 5' + 297 6615 2 70.30 ATTAGTTAGATTTCAAATTAGTTGGTATTTTATCTCTCAGTGTAGTCTTTTATTCAACAATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGA:1 + chr3L 12706764 5' + Burdock 290 1 52.48 AGGACATTTATCAAAATGTTGAATACAAATTCATAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGT:1 - chr2L 14793549 5' - Stalker2 7608 2 65.35 CAAGTTGCTTAAGACGCAAGGCGCAGACATGGCAAAGTGGGCGGCGGGCGTTGGGATGTGTAGGCCAGGCGGAGGGTGGGTGTATGAGTGGATAAGCTT:1 - chr3L 3535781 5' - mdg3 79 2 72.73 TTTGCACTTGTCGTATATGAACGTTTCCGACCAGTTCATTCCCAATATCTATTAATATCTCAGAATTCACACTAGTTGAGTAACGGGTAACTGATTGTCGG:1 - chrX 22673702 5' + INE-1 551 1 71.29 TACTACTACTCAGCTGCTCCACCGGCGTGGTGGACAGCTCCCTGTCCCTGTCCCGCTCACGCTCTCTTTCTCGCTCTCTTATACATATATATATACGCTGC:1 + chr3R 18434321 5' + blood 7198 2 75.25 AAAGAAAACCTTTATTAGTAATCTATATTTCATTCATCATAACTAAATATGCATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:1 - chr3L 20454611 5' - invader4 301 2 55.45 TCGTTGAAAAGTATGTAAAAGGCAGAAGGAAGCATTTCCGACCATATAAAGTATATATATCTTGATCAGGATATCCGTATGAACGTCGAGATTTCAGGAAC:1 + chr3L 19471445 5' + INE-1 140 1 79.21 AAAGGTGTGAAAAGCTGTGGCTTTTGTCTTGCGATTAGCCTGGAATATTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:2 + chr3R 23640967 5' + 297 6604 2 55.45 GGGCAATTTTTGGTGTCGATTTGTGAAAAAATAATATAGATTTAAAGTTTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCGAATTTACAATGCAT:1 - chr3R 8976804 5' - 1360 198 1 73.20 TCAAAGCGGATATTCATACACACCAGTTACTGCACTACTTCAAAATTATATATTAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 + chr3R 18790065 5' + I-element 23 1 56.44 GGTGTAGTTTGAGTTATTTTAAGTTCGACCTCATACTGTTCTGGCTTCTGTTGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTG:1 + chr3L 2050067 5' - F-element 352 1 54.46 TAAATGAAGTTACCACTGCGGTTCCTTACGGATTTTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCA:1 + chr2L 20239149 5' + hobo 423 1 66.34 AAATTTAATTTACCAACGCATAAACACACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2L 7666184 5' - roo 389 2 60.00 GGGAGTTTGTCTACTCATGATTCTGTGAATTTTATGAGGAATGGTGATTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1 - chr3R 26435466 5' - Juan 4186 1 54.46 GCCGGCTATTCGCCCCGAAAAGTACGTGTGAAATTATCATTATTCAATTGTGTTTTTGGGTAAAGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2L 7666083 5' + roo 8675 2 68.32 TCAAGGGAGCCACAAAAAAAAATTATAAAAGGAAATCATTTTGATTTTAGAGATGGGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAAAAAAAAA:1 - chr3R 10914186 5' + F-element 91 1 52.13 ACAAAAATCCATTTCAATCACCATTCCTATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGT:1 + chr3R 26435424 5' + Juan 4080 1 72.28 AGACAGACAAAAAGATGAGAGAGGAGAGGGCGAGGTTAGCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 - chrX 5904524 5' + F-element 52 1 60.40 GTATTGTATAATTTACAAAATCTTCAGTGCATCTTTGTATTTATTTTTAATATTTCCGATTGTTAATATCAGTAGCATTATCGGCATTCCACAGTCTTCGG:1 - chr3L 5269363 5' + Doc 5 1 46.53 ACCGACTTATAAATGCGGTTTAGCTTCCATCTGGTTTTGTCATAAGTGTGTGCAGAGCATACCCCCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3R 19963473 5' + 1360 10 2 54.46 AGAAATCAAGCCCAGCGTCTGCATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGC:1 + chr2R 4500883 5' + springer 49 2 75.76 GGTAGTTACTCTCTATGTGGTTTAGTTTTAGGTTCACATAAATGCCGGATGGAAAAGCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2L 8577355 5' + roo 8679 2 64.29 CGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 6266311 5' - roo 9025 2 73.27 CAAAAGTATCAAAAGTAACAGAACTATGCCCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGT:1 - chr2L 21215321 5' + BS 5021 1 72.28 GGCCATTGGGATTTTAGGCCAGAATCAAATACATCTACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTT:1 - chr2L 19678176 5' + flea 31 2 65.31 GGAAAGTCTGAAATAAAATACACTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr3L 19647302 5' + pogo 43 1 82.11 ATAAGAATTAGTTATATCTAGAACTTGAACTTAATATAAAGGGTTTTCGCATTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 - chr3R 11052189 5' - blood 7377 2 65.35 CACACTTACGCACACCACACCCTCTCCCACACTAACACACACACACACACA:1 + chr3R 8415227 5' + accord 7026 2 92.16 TACGAATGAAGCTCTTCGATTTCTTGTACGCACATTTTTTAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3R 8582637 5' - roo 402 1 72.28 AGCATGCCGCCTGTTGTTTTTTGCTCTCTAATCAGAGCGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCC:1 + chr2R 13383513 5' - gypsy5 373 2 62.38 GATATCAATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAA:1 - chr3R 26765192 5' - mdg3 235 2 63.37 TAAAACTATATAGTAAGTAGTTTATTTATTTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chr3R 27169500 5' - 412 469 2 52.48 CGGCTCATAACTCGGCTGGAGCACTTTGACTTGGGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTA:1 + chr2R 6847272 5' + mdg1 44 2 68.32 AGATGCATGAAAATCAGTTCAGTATTGAGTTAAGTCTTAGAGGCTGTACCCCGCACTTGGATGGCGTAGGTCAGTGTTGGACCTAATATGGCTTTTATTAA:1 + chr2L 1363849 5' - G5A 2401 1 70.30 CATGCATTACAAAATACAANCACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3R 7869117 5' + 297 31 2 56.44 GATGGCAGTTCGTTTAGCTCTAAAGCTACCGTCTCGTCGATCGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chrX 15024437 5' + P-element 34 1 46.53 TGCGGCTGTGGAGCATAGCGTGGCCGTGCGGGGTATGCGAGCTTCGATAGAGTCCGATTCTTTTTCTTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAA:1 - chr2L 1154292 5' - invader2 470 1 69.31 TCTCTCTTAAGATTTTCTTCATCAACTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGT:1 - chr3R 29599157 5' - Tirant 412 1 74.26 TCACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCA:1 - chr3R 10391235 5' - invader4 3042 2 68.32 AAGCGGGGTATCAATAAAACGAAACTACATCTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCAT:1 - chrX 11032238 5' + invader3 5234 2 73.27 TCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTATGGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTG:1 + chr2R 18723051 5' + HMS-Beagle 16 2 58.90 CACATCACTTTCCCGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 - chr2L 15898825 5' + F-element 28 1 61.96 ATGCCAACCGTTAAAATAATTTATATTTTGATTTTGCAATGCACGAGCATACATGTGCACACATACAGTTGTCTGCCATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGC:1 - chr3R 3625898 5' - 1360 141 1 64.36 ATTTTTCCACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGAATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chr2L 18248049 5' + blood 36 2 63.37 TACGTTTGTAAATTCCACTAGGGAATAAACCTAAAAGAAGCTTTTAAAATATGACATTTCAGTTATAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAA:1 - chr2R 12522143 5' + mdg1 7373 2 68.32 TGTGTATGTTTTAGGAAGTTTGGGGGAAGTTTGCGCCGCGTCTTTAAAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTCAAGCTTTTATAGTGCCTGAGATCTCGACG:1 + chr2R 5185204 5' - INE-1 144 1 70.30 ACGTGGCACGCACAGAACGAGTCCTGTGGCAAACACTGGGAATGAGAGCGGGGCAAAATGGTAGGAAACCCCGGGATACAAATTATCATTTTAGTAGATTT:1 - chr3R 13739774 5' - Burdock 255 1 79.21 CATGTTCTATATACTTTGTCTGCGATATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr2L 5419808 5' + 297 38 2 79.21 GAAAGACCCTTTCGTCCTGCACTCGTCCTCTCCCTAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTGATGAAGGGGTAG:1 - chr2L 15523158 5' + baggins 5379 1 69.31 TGTTGCTCATTGTGCTGCAAATGGGGGTGGCAGGTGGAGAACACCTCTTGGGGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 23338344 5' - roo 9047 1 52.48 CTGCTGATGCGTAAGTTGTCAGTTGCTGAATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGATCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGACG:1 - chr2R 20674882 5' + G2 210 1 69.31 TTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:3 - chr3R 9278383 5' - roo 9027 1 71.29 GTTCGTTTGAGATTTCAAACAGAGGAGAAGAGATGAAATCGATTTTTTCGAGTCATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTC:1 + chr3R 29305002 5' - hobo 289 1 60.40 GCCAGCCGTGATATATTCACCCGGATATATGTATCTGTATTGTGTGCAGTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGC:1 - chr3L 4563330 5' + opus 266 2 61.39 AAGGAGACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGACAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAA:1 - chr2R 2994311 5' + gypsy8 4764 2 45.54 CGCCTGAGTGCATATGCCACAAGCTTCCCCCGCCTCCCCCCCCACCCCCCCC:1 + chr2L 7081265 5' + accord2 223 1 71.15 TATGTGGCTTTCGGCAAGGAGCAAGCAGCAACGAGCAGCAAAAACCCTCCCCAATCTCGAGCCGTGGATAGAACGGAATCATGGCGAAATAACGTTCCAT:1 - chr3L 5174260 5' + Rt1c 4974 1 56.00 CAGGGCACGTCGCTTGATTACATTAATTATTCCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 17660489 5' + roo 43 2 72.28 CCAGATAGGCAACAATAATNCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 28565277 5' + 412 7100 2 72.28 GCTGCAAAGTATGCAACGCATATTTTTACATCACTTCTGTTTGCCTTTCTCCCAGAGCCACAGCTCCGCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAGTGG:1 - chr3R 12199851 5' + jockey 15 1 69.31 AAGAGATGAAGAAGTTGAGAGCTCGACTTATTGTGCCCTAATCTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3R 27495648 5' - 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accord 495 2 69.31 AAACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:2 - chr3R 11608009 5' - 1360 3347 1 69.31 AGGTTCGGTTTTGGATTTGAGTTCTGTGGAACATGGAATGGAATGGAACGATGCGATACGGGTACGCGTGGTAATGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGAC:1 + chrX 3995335 5' - F-element 4491 1 78.22 AATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 + chr2L 20560354 5' + F-element 63 1 75.25 GCTTTATTTGTCTGCCTGCCCTTTCACCCGCGTTTTATCTATCCAGATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr2L 20612031 5' + 297 6593 2 67.01 AGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTGGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTG:1 - chrX 23108315 5' + BS3 1433 1 51.49 GCCAGTGTGTGTGCGTGTTAAAATAGCACCTTGTTTGTACATAAATTAGCCTTAGTCGCTGTTATTTATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 + chrX 12472508 5' - pogo 2094 1 72.28 ATTATTGTCGCATCCTACACCGCAAATCTAGCAGCTTTTTTGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTC:1 - chr4 639721 5' - 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roo 371 1 58.42 AACGGGACCTAGGCCGGTGNAAAATTATAAAGGGGGCGGGGCATGCCACAGTAGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGC:1 + chr3L 19861769 5' - 1360 3367 1 61.00 TCATTTTCTAATTTCCAATTGAGAAATTGCATCAACTTAAATGGGAAACGTGTCTACCCCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr3L 18418824 5' - hobo 2922 1 63.37 GCCTACTCATGGTAGCGAGTTTTTGCCTTTTAAAACTTTAAATTTTTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 + chr3R 10782258 5' + Doc 37 1 59.41 ACAAATGCAAACCGGTTGATACCGCTTCGAGTTGTTAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr2L 12459682 5' + blood 7052 2 65.35 GTGGTTTAGTTTTAGGTTCACATAAATGCCGGATGGAAAAGCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2L 8577339 5' + roo 8679 2 57.32 TCATGTGCACATTTCAATTATTTTTTTTTAAATATACTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3L 10701770 5' - roo 9033 1 67.01 GTTAAGATAATAAGCAGATCGGTAAAATACCTATTGGTTTCAAAAAGCGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr3R 27169419 5' + 412 7081 2 56.44 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCAACCCAGCGCGGTACCGTTAGTTCACGGTC:1 - 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chrX 8508834 5' - Porto1 172 3 22.77 TTATTTCATATTCTCCGCTTGTGAAAACAACTATTTTTGATTGTGCGATTTAGGGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGT:1 - chr3L 5710325 5' + Transpac 4938 2 61.39 CAAGTTAAGCACACTATAAGTGCCACAGTCGCAATTGGATCCAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGA:1 + chrX 734911 5' - Tabor 7290 2 55.45 CCCTCTTATCACCCTATACNTAGAAGAAGCCCTTCTAGTGACATACTCTAACTACGCCTTAGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTG:1 + chr2R 4440150 5' - F-element 430 1 71.29 TCTCTCTGATTAGTGTTTTNTGCAATTGCTGCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAACTCGGCCATCCT:1 - chr2R 22250328 5' - invader3 5174 1 67.82 ATTAATGTCAACCATTTGGGGTGTATTCTTCTGAATGGCACTCGGCGCTTATCATCACGATTGTATAGGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr2L 109784 5' + 1360 4 2 75.25 TCATCTCTAGCGGGCGCCGTGTGGCACCAAAAAATCGTCCAGCAAATGTCCAGGAATGCAATGGGCAGCAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAA:1 + chr3L 872686 5' - 412 485 2 65.35 AACAGGAAGAAAAACAGGAGACAGAGCTGTAAAAGAAGGGGAAAATTGTTTAGCCGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTT:1 - chr2L 21328709 5' - 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Tabor 451 2 59.41 GGCCAAGACAGACCAGTCAGTCCACACACCTGGCTAGCTATCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTTCTTGTGT:1 + chr3R 30357838 5' - gypsy3 418 1 67.90 AAACTGGCAGGCAGCTGGGAAAATGCGAGCAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr2R 7838982 5' - pogo 2058 1 73.27 TATAATGATCATTAAGGATTTGTGGGGGGATATTCAAAATGAATTGAACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACT:1 + chrX 11016947 5' - roo 9069 1 49.47 ATGAATAATTATTCACGCTAATATCGTGTTTCGAAGGCTTTTCAATATGCAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCA:1 - chr2L 14220220 5' + springer 20 2 55.43 TAGCCTGGTACATAGTATCTACTAACATAACTCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTC:1 - chr3R 20082891 5' - roo 8925 2 68.32 TTGTCTTTTTTTTTATTTTTTTTAGGG:1 - chrX 11762021 5' - G-element 4324 2 85.19 ACTTCCACGGAGTCGCGAACCTGGCCAACAGGCCAAATGCAAATTTCCAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAACAAAGGAAAAAGCAAAAA:1 + chr3L 3712508 5' + Doc2-element 235 1 65.00 ATTAACTCGCAAATGCAACTGTTTTCGAAGTTAGGAAGTAATTACACACACGTAAGCTTTATATACATATAAAGAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 3294256 5' + BS 5094 2 68.18 TATTGCTAATTTTGTGGCCATTACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTATCAATTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATT:1 + chr3L 8039334 5' + hopper 17 1 48.51 TCCTTAATCACAGGCTGCTGGCCTAGGAAACACAGCTGGTACGCGCACTACCCACTACCCTATACCCCCTTGCATGCCATTTTTTTATATTTATATTTATT:1 - chr3L 22349343 5' - Stalker 6935 4 80.20 TTGACAGCAGGATCATTTGGATCATTTGGCGATGCGGCATATTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chrX 7788600 5' + 412 7088 2 58.42 GCCATCATTCTTGGGTTGGGTTTTCAGTGACTGAGTGCTTTGGTTTGCATTTCAAGCCGATTGAAAGTGAGAGGACAGCCAATGTTACCCGTAAGATCCGC:1 + chr3L 6785344 5' + Burdock 6054 1 78.22 GAAAAGAAATCAATGGCAATTAGTGCGGAAAATAACGCGGAATTTAAATTTAATTCCTTTCGAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 - chr2R 1737834 5' + I-element 15 1 63.37 CAAATGCGGAAAACATATCTTTCTTTTCGTATGCCATGGAAAAGCTTGAGAATTTTGTCGCCTGCGAAGCACAGGTGGAATCGTGTTCGCGTATTGCCCT:1 - chr3R 25658323 5' - Gypsy12A_LTR 1968 1 63.00 GAACTCCGGCCTAGTTGCTTAATTATAAATGACACACGTACTTCTCGTATCCCAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCA:1 + chr3L 15726117 5' + Doc 4551 1 57.43 ACAGTAAAATATAAAAAAATGTATATTTACAGGAATGATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 - chrX 399426 5' - pogo 2064 1 66.34 ACTGCTCACATTCTGTCCCTTTTTTTTCCGACCAAGAAAAAGGGGGAAATGGGGAAAAAGGGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGT:1 + chr2L 2943828 5' + invader4 2779 2 65.35 TTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACCGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGCCAT:1 - chr3R 3268037 5' + mariner2 111 1 67.33 TCCTGATTCTTTATACTGCAGTATATTTTTATTGGGTATATTATGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAA:1 + chr3L 20778597 5' + flea 430 1 57.43 ATTGCATTTTGATGGTACGAAGTGACACACTTAAAACCGGAACATTAACTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAAATAACATACAAAAACTCATACAG:1 - chr3L 25910222 5' + I-element 5138 1 56.44 GTGGAGCTGTATGTGTGTTCTTACAGCCCCGATCATTTGTATTTCCATTTGAGTGCGAGCGAAGACGAGGGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACA:1 + chr3L 20353981 5' - 412 7539 2 70.30 ACTTCGAATATAAGCATGTGCGGCAGCAAACAATGGGTGCAACAACTATGCGGCCACTATGGCACAACATTTTAGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 - chr2R 13653440 5' + F-element 14 1 69.70 CCGGGCAGACACGGAAAAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAA:1 - chr3R 30880459 5' + Doc 4583 1 70.69 GCTCTTCCCGTAGATCCCGAACGTGAACCCGTGGCTATCCTGAAGTCCGAGATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chr2R 11259637 5' + hobo 16 1 59.34 ATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2L 8577293 5' - roo 9019 2 82.18 GATTGCGAAAGTTAATTACACTAGAAAATATCATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGT:2 + chrX 8334305 5' - flea 4971 2 71.29 CAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 + chr3R 19449464 5' - hobo 2885 1 75.25 GGTGTGTGCGTGTGTTTGCCTCCGTTTTCATATGCCGTCCGTCTGTTTTTCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGC:1 + chr2R 22135282 5' - opus 75 4 57.43 GACTTTGGCTAATAGGTTGGCATACAACTTCCCCCCCACCACCTACGTTCCCGACTCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAA:1 + chr2L 7541806 5' - I-element 299 1 59.41 GTTCTACGTTTCCGCAAAACACAACTAGTTTTTAAATAAACATCAATTAAAATGAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:1 + chr2R 5772439 5' + HMS-Beagle 6814 2 61.39 TTTGCAAAATAGTTTGTGATGGTAAAATACAGTAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTAT:1 - chr2L 12866941 5' + mdg1 45 2 70.30 TGATAAAATATTTGCAAAACAAAAATGTTTGGGAAACTAAAATTTATGAAAACTATGTCTCTTGTTCTCATGTTCTCATGTACCAAGGAGCCCCCGAAG:1 + chr3R 18518081 5' - jockey 4557 1 56.57 ATGTTGTTAGTGGATTTCGAACTGCACGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTC:2 - chr3L 16282412 5' - gypsy5 358 2 74.26 GAAACTGCATTTCAGTGTGGCGAGTCGATTAGGCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTAT:1 - chrX 1110289 5' - mdg3 5337 2 78.82 GCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTA:1 + chr3L 27356097 5' - Tc3 1665 1 72.28 GTTAGAGTGGTCGTGGCAAAAAGTTTTTTTGTCAAGTCAATAGAAATTATCACGAGTTATAAAATTATGAAAAAATATCAAAACATTTTGCAAAAGTGTGG:1 + chr3L 26710196 5' - INE-1 258 1 70.30 AAGCGAAAGTGTTGTGTGCATTTGTGAAAAAGGGTGAGTGATAAAGATATTTAATTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACG:1 - chr2L 8506646 5' - Tirant 8412 2 61.00 GAATTGCAGTGGCTACTTATAAAATTTATTATAATTCCATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 - chrX 21468693 5' + transib2 34 1 62.38 TAAAGTTACAGTCATGCTGGACAACATAATTTTGTATACATGCTTCACTACTTTGAGTGGCAAATGAGAGCAAGAGAAGCTTGCTCTCTGAGAGAGTAATA:1 - chr2L 22319007 5' + frogger 2423 1 68.32 CCATAAAATAATCACCTAATGTACATATTGCCAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATA:1 - chr3L 11829093 5' - Transpac 311 1 63.93 CGAGTACGGGACCGAGTACGGGACCTAGTACGGGAACGAGTACGGGACCTGTAAGTTAACACGGGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTGCACGAAAT:1 - chr3L 16047628 5' + Gypsy6A_LTR 27 1 56.44 TTGTGAAAACAACTATTTTTGATTGTGCGATTTAGGGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 - chr3L 5710307 5' + Transpac 37 2 61.39 CGAAATCTCGGCCAAAGATGCCGTTCAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr2R 13763157 5' - roo 406 1 70.30 ATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:2 - chr3R 9278395 5' - roo 9039 1 59.41 ATATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCACCCGGTAGGCGACA:1 + chr3L 15452885 5' + accord 49 2 71.72 TTAATTACGGGCATATGATNGTGCCCGATAATAATAATAATAATAATAACGGCGAGCGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGA:1 + chr3L 17186789 5' - Tirant 8488 2 60.40 CTAATGGGTTGTTCTACCAAGTCATTGACACTAAAATATGCTAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCT:1 - chr3L 16286407 5' + accord 474 2 63.37 GATAACGACAGTAACAGTGGGCTAAAACTGGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 + chrX 21229290 5' + transib2 42 1 68.00 GGGGGTGGCAGGTGGAGAACACCTCTTGGGGAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:2 - chr3R 23338322 5' - roo 9025 2 69.31 AAGGACCTTTTACCAACCCTAGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:2 - chr3L 18418903 5' + hobo 34 1 56.44 AATTACGAAAACATAACTACAAAGACGCCGAGTAAGGTGAAAACTTTTGCAAACAATAAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:2 - chr3R 17660560 5' - roo 9053 2 58.42 ATTTTATGAGCTTCCTTTTCACTGCGCGCATTTTCGCAGCTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATATTATGTACATATATTTGGCTATTTCTAATCTATT:1 + chr2L 2330485 5' - 1360 331 1 58.42 ATTTGCTGGGAATTCTTACNGCCGGATTTGTTTTATTTTTTTATTTTTGCGCAAGTGCAAAAGTCGCTGCAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGC:1 - chr2R 8641135 5' - roo 8743 2 70.30 GTGAAAGATTACAATTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2L 21086093 5' + roo 8699 2 62.38 TATTACATTTTTAAACAATATCCATTAAATGTGCCAGTAGCAGACTTGCCTGCTAAAGCTGCAGTTCATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 + chr2R 21962600 5' - 297 6972 2 72.28 GTATGGAATGCAAGTCATAAATGACATAGGGCCGAAATTGATTTCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr2R 17963211 5' + blood 12 2 67.33 TATTTGTTCACTTTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATA:1 + chr3L 20049629 5' + jockey 4797 1 57.43 ATAGAACGATTTTTTAGAAAGATTTAATTAATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTA:1 - chr3L 15125927 5' - Juan 4162 1 80.20 CACAAATACTTAGTTGCAGTTGCAGATACATAGCTCCAATTACAGATACACTTAAGCCACACTGAATACAACTAATTTTGCAGAATAAAAAAAAACGCTTT:1 - chr2R 9232410 5' + Transib-N1_DM 264 1 61.39 ATTGAACTAATTTGATGTGTGAACAACGGCTAAAATGGAGCAGGGGTGTCCTGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1 + chrX 2841761 5' - hopper 1394 1 58.42 CTCCATAAAGCAAAACAAAATGCTAAGAATATTTCAACAAACTTTTAAAAGTTGACTCTCGTTTATCTGATAGTCGGGTAACATGACTATAGCATTCTCTC:1 + chr2L 21390460 5' + INE-1 575 1 74.26 ATGCATTATCCATATAATTTTGTATAGTATGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 3209230 5' - roo 9028 1 68.32 TACATGTGCAAACGCATAACATGTGATAAATTCAATTTCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 + chr2R 17420832 5' - pogo 2066 1 62.38 AGCGTCGCAATGCGCTTTTTCACACACACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTT:1 + chrX 10201807 5' + accord 322 2 78.22 GCTTAGGCGCGCCTATGTANGTGTTTGTGTTGGCCATCCATCATTATGAAATGTTTGCCAGTGTGTTCGTGTTTTTTTCTTGTTGCCTATCCAATGTTTAA:1 - chr2R 15027653 5' - invader3 4999 1 63.37 GTTCTTGCTGGCTGCTAATCGGTAAGATACACGTACTTCTGCCGCCGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTT:1 - chr3L 18174802 5' - F-element 4457 1 55.45 TGGCAAACACTGGGAATGAGAGCGGGGCAAAATGGTAGGAAACCCCGGGATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTA:1 - chr3R 13739748 5' - Burdock 229 2 53.47 TGCAGACCCTTAACTTCAGCTCCGCCGGCGAAGACTGGAAGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGGACAGTTCTAGAATGGGAGGAAAGTTTGAGAATT:1 + chr3R 29936670 5' - gypsy12 9967 2 62.89 GCAATTACTCATCTCTAGCNGGCGCCGTGTGGCACCAAAAAATCGTCCAGCAAATGTCCAGGAATGCAATGGGCAGCAGTGTAATGATGAACTCCCATTAA:1 + chr3L 872678 5' - 412 7546 2 72.28 AAATTCGTAGATTTTGTTATTGTTTGAAGTTTTGTAAAATCAATCGGTTTTCTCATTCCAATTTTGGATTTTTTTTTTTGTTCTTTTTTTTTTTCTTT:1 + chrX 5005328 5' - gypsy7 5013 1 55.10 TCATCGTAACATCATGAGGTTGAGGAAATATGGTTTCCTTTGAGCCTGGCAAGCAAATGTCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr3R 27056447 5' + jockey 32 1 53.47 GTCGTGTTAATTCCCAGAACTCGTTTTAAATATTGTGTGTACAAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3R 16601432 5' - roo 9041 1 57.00 AGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGTGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCT:1 - chr3L 3540237 5' + mdg3 5251 1 80.20 TTATGCGAAAGAATTTTTACTTTTGACTGAACCACATTTGGGAGAGGGGGTGGCGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr2L 4924505 5' + hobo 23 1 52.48 TTCTAATTAAAAAGAGCTTCAGTTACCTATTAGCAACCCCTATTTAGACAAAGTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 9454804 5' - roo 9049 2 56.44 CTTAATCACTGAGAAAAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3L 15037915 5' + roo 8696 2 60.40 CTGCGGGAACTAATGCAAACGGATCCCTATGCCTACTATCTCAGTCCCAAAATTGTAAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTG:1 - chr2L 2239233 5' - roo 8669 2 55.45 TGGGCTATGACAATGATCGATATTTTATGAAAAAAAACGTGTAATATCTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACAC:2 + chr4 194718 5' + Quasimodo 27 2 57.43 ACCCAATGGCTAGGACCCCCGCCGCCCACTGCCACGCCCGCTCTTGTCAAACGCCCACCACTTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATT:1 + chrX 11025488 5' + hopper 17 1 62.38 CAGTTTTGTTTTCAATATGCGAGTCGTGAATTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCCTTTTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCC:1 + chr2R 19952969 5' + GATE 8266 2 69.31 TAAGAGTGCACTTGAGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2R 9649181 5' - roo 9031 1 67.00 CGACCCGGGGTGAGCGGTGGAAAAGCGAAAGAGACGCTCTGTGCGATGCATCATCGCTCGAATACATATTCTGTGTTTGAAATAGTATAAGCAAGTATTTT:1 - chr3R 9102344 5' + Doc2-element 187 1 79.21 ACCACATATACATACACACACACACATATCCATAACCACATAGCAACAGCCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAA:1 + chr3R 8176875 5' + I-element 104 1 53.47 GCGCCAAATTTGCTGTCAAGTTGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGT:1 - chr2L 10053696 5' + F-element 4498 1 78.22 TCATATATTTTTGTTTATATCTATAGTAGGTATTAAATATTCTCAATTTCTAATAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACA:1 - chr2R 7416388 5' - Stalker4 7221 4 60.40 AAGCCTCAGAAATGGAAATAAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 + chr2L 18247977 5' - blood 7364 2 51.49 AATCACCATGGAACATATTGCGGAATAACGCACCATAAATTTCAAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACG:1 + chr2L 16153334 5' + Doc 14 1 70.30 TAACGCCAACAACAATAGAAACAAACAAGATTGTAAGGTGGGTTACAAACACACTGGTACACACACACACGCACACCGACCGGATATCATACCTCGATGAA:1 + chr2R 8177659 5' + Chouto 5925 1 71.29 AATTCAATCAGACATCAAGCATATACAATTTTCACTCGCAACACAAGAATTATACAATCAATGTCTGCGTGGCGACGACCGTCGCGTTCGATGATCCAATT:1 - chr3L 13612212 5' - gypsy7 5353 2 60.40 CCGACTCTTTGAGTGGACATGCAATTGAAAAATCACAAATAAGGTGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2R 6850461 5' - roo 9043 1 69.33 CGAGAGAGCCGCCTGAATTCACAGGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:1 - chr3R 18399258 5' + P-element 24 1 58.42 GGTTTTTCTGATTTTAACTTAAACTCATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAA:1 + chrX 4166399 5' + I-element 5341 1 74.26 CGGGTTTATGGATGTCGGCGGATTTATGGCATTAATTAAGTACTTTTTCAAGTGCTGCACTTAAATGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chrX 9454905 5' + roo 9 2 71.29 CATATAATGTATATGTTTAAAAAACAGTCTTTGGATTTGGAGAAAGACGTTTCATTTGTATTCTTTAAATATAGTTCTTAAGGTATAATCCATTTGTGGAA:1 + chrX 10628923 5' + Tc1 1376 1 67.33 TATTTATTTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 - chr3R 27169478 5' - 412 447 2 68.32 CAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 8765557 5' - roo 9028 1 73.96 GATTACCTTTGGCAGCTGANACGTGGGTTTTGGAAGCGGGGGCATTTTATTTAAATATATACATCTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr2R 21962725 5' + 297 6 2 65.35 AATTTAGAATGGGCTAAACGAAATTGGAAGAATTAGTTTTGTTTTAGAAAAGGTATTGATTGACTCGTATGGAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCA:1 - chr2L 12781337 5' - Tirant 8449 2 54.46 CATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCCCGCCTCTAACCAAATCATCGGACACTCAA:1 - chr2L 12808226 5' + Tirant 38 2 56.44 TAATATTAACGAAAGACATCCCAATCCCTCAGCAAATCAGAGGACAGACGTTCATGGCCAGATCGATTTGGCTATTGATCCTGATCTAGAATATATATGTA:1 - chr2R 5133787 5' - INE-1 77 1 68.32 GGCACAATTGCTGCCGCTGACAGAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACA:1 - chr2R 6918627 5' + accord 49 2 77.23 GTAGCCTCGCTTATTTTCCGCCACCCAGCCCCATTTTTTGTGGCATAATTTAAGGCGACATTGACAATGAGACGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chr3L 6023379 5' + hopper 3 2 76.24 ACCAAGTTCAATTACCATTAATCCTTTTGAAGAATACTATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chrX 2530463 5' - pogo 2070 1 60.40 TTCCGTTGAACTAAAACTAGACGAGAAAAGCGTATCTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr3R 5594956 5' + 1360 38 1 64.36 TTAATTAGCATAGCAAAAGGAAAGGGTTTGCAAATGCAAAATATATTAATATACATATAGTTTATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAA:1 + chr2L 12814622 5' + Tirant 466 1 65.35 ATCATGGACAGCGTTTTAGTAGGATTCACAGGGTTCAGAGAGTCAAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAA:1 - chrX 1390219 5' + P-element 432 1 49.50 TGGCTCTTCTCGGATTTCCNTGCCTGTTTTTTATTTGTATTTTTTTTTTGGTTTTTATT:1 - chr2R 20553928 5' - transib2 102 1 96.61 TCAATTGCTACAGTTCATTGTTATACAGAGATCGAGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1 - 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roo 9044 1 58.42 GTCGACGTCTTTCAGCCAGCAAGCGACTTGCAGAGCAGATGGGAGTAAAATCGGAAGGATTTCAAAGTTCTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGG:1 - chr3R 5586376 5' - accord 146 2 76.53 GATATGAAGAAATGGTTAGCTAACTCGGAAAATAGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 + chr3L 7168307 5' + Doc 25 1 56.44 AATGCGTGAAAGCCGTCGGTCCCCAAAGGATAAGAATCCACTCCACTGGGCCGCAAAACCATTCGACAGCCACGAAAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAG:1 - chr2R 19560261 5' - Tirant 401 1 81.19 CTCTTTGGAGGCGGGACAACTTCAGCTTTCGTTCAGTTAGTCTATGCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3L 13773883 5' - roo 9043 1 53.47 TGCACATTTTTATGGCGAAAACAATTTAATTGGCTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAA:1 + chr3L 13190105 5' - roo 9027 1 69.31 CCTGAATTCACAGGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 - chr3R 18399247 5' + P-element 23 1 53.93 GTCCTTTGCCGGACTGCGTTCGTCGGAGGATTGTCGACTTGGCTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTG:1 - chr2R 15830389 5' - Quasimodo 7068 2 57.43 CTGATGATATAGGAAATGCTCACAAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 - 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G6 1764 1 57.43 AATAAGCTGCTTAATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 - chr2L 18655216 5' + Doc 30 1 50.50 AATTTATACCACTCTTCGCACCAACAAAATATTATTTTAGTTGACAAGGACACGAATCTAAAATCGATAGCTCTCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTA:1 - chrX 23045383 5' + blood 167 4 71.29 CATTATGCCTCTCGACGCTNATTGATTGTCGGATCCAGTGAACATTCACATACACACAAACATACATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr2L 3978530 5' + 297 3 2 76.24 CCTGTGGCAAACACTGGGAATGAGAGCGGGGCAAAATGGTAGGAAACCCCGGGATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 - chr3R 13739752 5' - Burdock 233 2 57.43 GTGCAAACGCATAACATGTGATAAATTCAATTTCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr2R 17420837 5' - pogo 2061 1 67.33 TTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 - chr2L 18655197 5' + Doc 49 1 65.35 CATTACTCCTAAATGAACGCCTAAATTGGAATTTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr2L 14761969 5' - mdg1 380 2 65.00 TTTTTACGTTCTTGTTTTATTTTTATTTTTTTTTATA:1 + chr3R 6978075 5' - 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chr2L 12511620 5' - copia 237 1 62.38 CAGACAAGAGGGAGGCGCANACGCACGTTAATATATGTATATGCAGTTCGGGAACAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr3R 24976722 5' - opus 7485 2 62.38 GAACATTTACGAATAAATAAAGGGACTTTATTACGTTACCTTTCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 + chr2L 20560305 5' + F-element 15 1 67.33 AAATGGTCGGTAAAACGAAAACATTAAATTAAATTGTCAACAAGGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:2 - chrX 7157335 5' + blood 31 2 55.45 GCAGCTTATGAATTTTTGCAATATACAGCATTATGAATACTGGGCCAGATTATTTTTTAATTTATTTTGACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGACAGA:1 - chr3R 16580805 5' + Doc 356 1 78.22 GACGCCACATGACGTGCCGTTGATATTTATGTCGTCGCCATTGTCGTCTCAGTTCTCGGAACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr3R 26252656 5' + 412 7068 2 64.36 TCCAAGGAGCACCCTGTCAGCCAAGATGACCACGACATAAGTCAGCGTTGGCGCCAAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGATT:1 - chr3L 8202236 5' - R1A1-element 437 1 54.46 CGTTGTCAACATAAATTTTCGAGGCACCAGCCATGAACTACTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAA:1 + chr3R 25568144 5' + F-element 4520 1 60.40 CGGGTTTTTGGACAGGTTTATTGGGTGTCCACTGCTCTTGTTGACGATCACCCATAATCAATATAAATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1 - chr2R 9905442 5' + mdg3 5262 1 69.31 GACATGGCTACCCAATTCANAGACTAACACAACACATAAAACATTTAACGCTTAATCCGATACCCCCAGGTCCCCGAAAGAAAGGGCAGACTAATCCGTGG:1 - chr3L 15956133 5' - aurora-element 32 1 74.26 AACTAAAGAAAACTTTAGACAAAAAGGAGATGAGCCAGACAACTGTCTATAAATTGACAAATGAGAAGGTAATAGGGTCAAAGGAAAAACAAAATAAAAAA:1 + chrX 12945866 5' + Doc2-element 240 1 95.05 AAATGTTAAAATTATTAGANCAAATCCGTTTAGGGCTTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2L 21086005 5' - roo 399 1 69.31 GCTATACTTTGATGTGCTTAGTTGTGATTTGGCCAAAATGCTTGACTCGCAGCTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3R 31264164 5' + jockey 30 1 54.55 TGAATATTTATAATTAAGTAAATATTTAAAGTGGAGAGTGGCAGTGCTTAAAGTGCAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3R 9278313 5' + roo 18 2 65.35 TGGGGAATCTTTTCTCTGCTTTTTTTTTTTGCACTTCTTTTTTTT:1 + chrX 12416342 5' - gypsy2 409 1 93.33 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTTTATTTTTATTATTATTAATCTTTTTCCTATTGGTTTTATTATTATTTTTATTATTATTGTATTATTATTATTT:1 - chr2R 3262652 5' - invader3 5047 6 72.28 TCTTATGATGTGGGAATTGGTATAAAATGAGACAGCTTCAGGATATAAGCTTTTATAAGAATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr3L 13773092 5' - pogo 2087 1 63.37 GCGGAGAGAAAAGCCGAAACAGGAGCTTAAAAGTCCGGCGAAGAGATTGAGTCAGTTAGTGATCGATCGTTGAGCAGAACAGACATGCCCCGCTCACGCGC:1 - chr2R 9443226 5' + invader1 3941 2 59.41 TTTATGGTAAATTATTTCTNAACTAAATCTTTTATAGAGTTCCACGATAAACAATTGCAGCCCTGAACCCCAATTAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATT:1 - chr3L 4821985 5' + baggins 5343 1 66.34 TCATTACTTTTTTTGGCTGAATAGCTTTGACCACTAAAGCAATTAAAAAAACATGGGCAACAAATTCACTAAATTAAATTAAAAAA:1 - chr3R 4577329 5' + Tc3 1354 1 51.16 ACAGCTGCAGCTAGTGTTGCAATTATCATACACTAATCAAATAGTCACAACCCTCATTATGGTGAGTACAAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTA:1 + chr3L 3271219 5' + mdg3 5028 1 72.28 AAATCGAATTTTATAAAACTATATAGTAAGTAGTTTATTTATTTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTC:1 - chr3R 27169513 5' - 412 7535 2 65.35 CTCACAATTAACCGAAGAACATCGCTTTCAAAGCAGCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chrX 16671118 5' - P-element 2847 1 39.60 ATATTCATACACACCAGTTACTGCACTACTTCAAAATTATATATTAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 + chr3R 18790074 5' + I-element 32 1 62.38 GGCAACAGCAGATTAAGCGCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAA:1 - chr2L 12808245 5' + Tirant 8126 2 62.38 GACATAATTAGGGAAACTATAAAAACTTTCGCTCCCATTAATGGTTTCTTCTTTTTAATTCACTTTTCATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCAT:3 - chr3R 19450752 5' - Burdock 250 2 70.30 ATTAAATTTAATAGCATTTGGCTTCCTTTTTTGTTAAGTACTTATTGAAATTTATATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr3L 15788412 5' + opus 20 2 54.46 ATAATCAAAACTAAGACAAAAATGCGGTATTTTATGTAATCTAGGTTTCATTGTAGTAACCTTTAGACATAGATCAACTGTGTAAAGAAAGATCACCTTGG:1 + chr3L 14282517 5' - I-element 5021 1 53.47 TACACAATGTGCAATCACGGAACAATGCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATA:1 - chr2L 23371062 5' + Doc 4245 1 68.60 TTCCTCTCAAAATGTTGTTAGTAAATAGTATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAGTGTACGCACAAGTTTATAGTGTGACAGTCTCAAAAGTATGTAA:1 - chr3L 9919458 5' + S-element 1519 1 71.29 TGATAAAGACAAAGTAAACTAAAAAGACCTTATGACAATGAATGTGAATGAATTATTAATGTTTCTAATAAGACTATTTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr3L 3757312 5' + roo 2 2 77.23 GTATTTTGATATTTGATTTAATTTGTAGCAGACTTGGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGT:1 + chr3L 2872161 5' - I-element 5140 1 64.36 GGACGAGTGCATCGCCGGCGGCTTTGTGGGCGCTGAAAGGGCACTGCAGTCTGAGTCCGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACG:1 + chr2L 566182 5' + F-element 261 1 60.00 CAAGTCAGCGGAATCTAAAACCGAATAATCCGATTACAAGCCATACACGTACTCCATATATATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTC:1 - chr3R 25750252 5' - micropia 5435 2 72.63 AAGAACTAAAAGTGTCTTAAAAAATTAAACGAATATTGTAAAATATATAATAAGAGCACATACTACACCAAATATGGCTTTTAGTAAAAGAGCCTTAGTTA:1 - chr3L 11774929 5' - G5A 2387 1 59.41 ACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGT:1 - chr3R 10391229 5' - invader4 277 2 74.26 TGTCAGAATTTATAAAAATGTATTTCGGCAAAAGTGAAAAATCATTCACATAACCCATAGCCAAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGA:1 + chr2L 13746931 5' + F-element 343 1 61.29 ATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCTATCTTACGCTCTCTCGCCCTTCACCTCAG:1 - chr3R 19449970 5' + GATE 8295 2 70.30 TTCCTCCTTTTTTAATTCAACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTGAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2L 12958899 5' - roo 395 1 63.54 ACAAGTTGGCAAAGGGAAAATACAATACAAGGAAAATCTTTGTCCCAAACATACACACACACACATGCATAACCACATAAGAACAGCCATACACAAAATCA:1 + chrX 18032751 5' + Quasimodo 68 2 62.38 TTGCACACATCTAGGGCTAAAATTGCTGTTGAAAAATAAAATTAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 - chr3L 20759010 5' + flea 4787 2 59.41 CGTCTGTTAGGTCAAGGCAACGATCTTCTCAGGACCACCTTCGCCGACAACTGACTCCACTGTCCCTTCCAACCATTTCTTTATTTGGAGCACTGAGAATT:1 + chr3L 24290412 5' - invader3 346 1 72.28 AAAAAAGAAGAACTTGGTAAGGGAAATACTCAAAAAAGCTTTGCGGCTTAGTGGAAAAAGTAGCCGGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCC:1 - chr2L 2069172 5' + Ivk 375 1 72.28 ATTCGATTTTAATTTGCAGAACTCGGCATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr3R 10110444 5' + Doc 55 1 76.24 ATTTTTTTCTCGCTTTTTTTTTGCTGCTCTTCGTTTTTATTTCAAGTACCGGCAGTGGGCGTGGCAACAAGTTAATTATGCGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr3L 18080219 5' + 1360 3383 2 70.30 GATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:2 + chr3L 9928534 5' - roo 9041 1 57.00 ACCATCCAATGCAGGTGTAGCTCTATCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATC:1 + chr2R 18723018 5' + HMS-Beagle 11 2 68.32 GCGCTTGCGAATCAAATTGAGGCTACCAACTGTCGGTAATTTGCATATTTGAGCTGGAAATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTC:1 - chr2L 15531882 5' + Doc2-element 451 1 62.38 TACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTAGCGCCACCCAAACTGG:1 - chr3R 10736097 5' + McClintock 42 2 76.84 TCATTCCTTTGCCAGATTTCACATATGCATAATCGAGAAGCGTCGTCCTCCATCATTCGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chr2R 13653687 5' + F-element 86 1 70.30 CGCTTTCGAAAATGAAATATTGGCTGTGCAAAGGGTAAACACAAACATAACCCACCAACACTGCCTAAATCCCAATCCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCC:1 + chrX 18683450 5' + I-element 5001 1 62.38 TTCGCCGATCCGGAGAAAAGTTACGTACGTTAAAGGAGTCTAACAATACGCACCTGACGATGTGGATAAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTAT:1 - chr2R 5772084 5' + X-element 63 1 66.34 GTTGTGCGGAGTGGAAATGGGCGACTCTGAAGACATTGTGCATTTTTCTGGTCATGTTGACAATCCAAGCGAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGCC:1 + chrX 4151418 5' - diver 5767 1 36.63 AGCATTTTAATTAGACTTAAGTGCTGCTGCCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 + chr3L 1998824 5' - hopper 1372 1 65.35 CGTTTTTATTTGTTCACTNTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTT:1 + chr3L 20049623 5' + jockey 4790 1 52.00 CGTTTATTTTAATGTTACGTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:2 + chr2L 10792010 5' + 412 25 2 54.46 TAGTCTAGCAGCCGGCTTCTAAAAAGTACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2L 2833875 5' - roo 9024 2 73.27 AGAATAAGAGATTTGATTGGTCCTTACAGCTACTGTGTAATTCCATTGCTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTG:2 + chr3R 4971370 5' + F-element 11 1 77.23 TTTTTGTGTTGCAATTCCTGTGTGAGAGGGTTCGGTTAGCGTGCATCTGCTGACCCAGCGGATTTGGGGAATGCCTCCGTTTTGCTGAGCTGTTTCCGCCT:1 - chrX 13506707 5' - gypsy5 169 2 54.46 GCTTAATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - chr2L 18655208 5' + Doc 36 1 53.54 AATCCGTGGAACTTCCAACCGCCACGTCCCCTAAAGATACTCATCCATGGCTACACAGGTGACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTG:1 - chr2L 2419434 5' + F-element 358 1 63.37 TCCTTATACATTTATTGGTTGAATAGCTAGCTGGTGCTGTTCTCCCTTAAGTAAGACACAAAAAACCTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACG:1 + chr2L 3408595 5' + G-element 13 1 62.38 ATGTACATAATATGTGTTTGCTGTGCACACACGAGTACTTGTAAATTTTCAACTTCATTCTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGT:1 - chr3L 20317896 5' + 3S18 16 2 48.51 GCTAACCAGTAACAATTCTTAAAACCAAACTGCAATTAATCAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr2L 17677805 5' + Tirant 7 2 74.26 CGTAGGTGGGCCTACACAAAATATATACCCATGTGTACATAGGTACATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:2 - chr2R 10014862 5' - flea 4985 2 58.42 GGAAAGTTATATATTACTACTAGGAGCCAAGGAATTTTGGCTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCA:1 + chrX 3282656 5' - Porto1 212 1 59.41 AACAAACAGGCAAAAACGGCCAAAAACAGCCAGAGGAGCTTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGTAGCCGTCG:1 + chr3R 23542954 5' - 412 457 2 59.41 GGTGCGGACATTGTGTATGATGGTTCTGAAGGGCTGCTTACACAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCA:1 - chr2R 18973824 5' - Stalker4 7028 4 62.38 GTAAGGACTTATTGCAGTCCCAACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACACA:1 - chr2R 2495140 5' + hopper 1115 1 78.22 CTGCCAATTTCCTGTGACGAACCGAACCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATT:1 + chr3L 10128429 5' + Doc 4354 1 73.27 CGTTCAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:2 + chr2R 13763178 5' - roo 385 2 49.50 ACGAAAACATTAAATTAAATTGTCAACAAGGCTATTGTAGTATGAGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 - chr2R 12234753 5' + blood 45 2 67.33 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGAT:1 + chr2R 1982173 5' + hobo 409 1 81.19 TTCGTGGGTCAATTGTTAGCGAGCCATTCGCAAAGTGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chrX 21217509 5' - pogo 2063 1 63.37 GCTCTCTCTGCAGCACAGCGCGCTTTCTTCGTTCGGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 + chr3L 16891104 5' - 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roo 345 2 78.22 GCTTCCTCCATCGAAGTGGCAGTCTTAACCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2R 19840250 5' - roo 361 2 69.31 TCAAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr2L 16153375 5' + Doc 55 1 74.26 GTTGAGAGCTCGACTTATTNTGCCCTAATCTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chr3R 27495661 5' - 412 447 2 67.33 AATAGAACTTATCAGCAATACGCAGTGACATACATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGA:1 - chrX 18326268 5' + Doc 188 1 72.28 AAAAGCTGAACGTTAAATGCCAGGCGCATATTAAACATCAATTATTTATGCCGAGCGATAAACGGGTTTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr3L 13895452 5' + hobo 7 1 70.30 CTAGCAAATATTTGATCGGCAAATTTGGCGCTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAG:1 + chr3R 18296338 5' + F-element 4540 1 69.31 GCCAAAAAATACTGGGGAAGACCGAAACAACCGCAAAACGATGCACAAGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGGTTGTGTGA:1 - chrX 5544599 5' - Doc2-element 480 1 50.54 CGAATATTACATTTGTGGCCAAGAACAAACGCACAAATTTATTATGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - 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INE-1 552 1 70.30 AAAACCAATTCTTTAACTAAATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTC:1 + chr3R 17971671 5' - 412 7491 2 79.21 TTAAAACTTTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGAC:1 + chrX 22426176 5' - 1731 4591 1 57.43 TGGCTTGTGTGCCTGTCATTAGTTTTCCACACACACACACCACATATGTTCAACCTATTTTTTTGGTGCTGCCTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 - chr2R 18766302 5' + hobo 4 1 69.31 AAGATCTCGATATATGTATGTTTCGCGTCAATACCATAAATAAACTTTTGAAAGATCTCGATATCTTGACATTCATGGCTAGATAGACTCGGCTATTGATC:1 + chr2R 2641785 5' - INE-1 98 1 63.37 CATGAATTGCACCAAACTGCATCTTCCCGTTCGCTAGCTTTCAATTTTAAATCATTTTCTAACAGTATCCTCTCATTTGACAACAACAATAATAATAATAA:1 + chr3R 27057271 5' + mdg1 7067 3 73.27 CATATCACATGAATCGAGTGCCCCATGATTTATTTAGAATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTAC:1 - chr2L 4751984 5' + roo 139 2 74.26 AATTATAAAAGTAAATCATTTTGATTTTAGAGATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATG:2 - chr3R 10914165 5' + F-element 117 1 67.33 GTGGAGAAGAGAACCCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 + chr2L 8709339 5' + P-element 60 1 21.78 CTTATAACTAAAAAGATACNTACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGATG:1 + chr2L 23286584 5' + Tirant 416 1 59.41 AGTCTAATGAAATAATTTGTGTACCCAAACTGGCAGGCAGCTGGGAAAATGCGAGCAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr2R 7838956 5' + pogo 17 1 62.38 AGTTAAGATAATAAGCAGATCGGTAAAATACCTATTGGTTTCAAAAAGAGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr3R 27169418 5' + 412 27 2 55.45 ATAACCCAATACGTTTTATTGCCATAGTATAGAAGACTATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATG:1 - chrX 22689598 5' + 1731 41 2 63.37 AGAGCCACAAGTAGTCGAAGGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:2 + chr2L 8622754 5' + 297 25 2 62.38 GGGTGTTGGGGATGGGTGGCATAAGAGGCACAATTGCTGCCGCTGACAGAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGC:1 - chr2R 6918653 5' + accord 23 2 56.44 CCTAAATGCCCAAAAATAAAAAAAAATAAACAATTAA:1 + chr2R 22301708 5' + HeT-A 8 1 72.97 ATAATAAAGCTTATAAGCTCAAAATTTAGTGGCCTCGACGTGATTTGTACCTAACAATAAATAGTGTATAGTATAGTATTAATAATAATAATAATAGTATT:1 + chr3R 2559970 5' + mdg1 7071 4 65.35 ATCCTTGCCAACACTTTCCAAGCTGGACGCAAAATACATGTTCTATATACTTTGTCTGCGATATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr2L 5419772 5' + 297 6583 2 76.24 AGCAGGCCATTTGAAACAAGAAAAGGTTTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGA:1 + chr3R 7513930 5' + diver 50 2 72.28 TTTTTCGGCTTGGCTGGGTAACTTTTGCGTGGCCCAAAGAGATCATAATGTGGTACCGCCCCCGGTGGCTTATTAAAAAATAAAGAAAAAA:1 + chr3L 10547600 5' - hopper 154 1 84.62 GGTTTTCTCAAGTGGTGAATTGCACACATTTAGCGGCTGCATTGCACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - 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gypsy3 6630 2 56.44 TTCTGGGAAAAAGAGAATAACAAATAATTTCCTATGGCCTATCAACTCAATCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3L 12112409 5' - 1360 3365 1 55.45 TTCGTTTTGTTTGTTTTTCNGTTTGTCGCAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAA:1 + chr2R 10454259 5' + invader4 2816 2 75.25 TTAATTAATTTCACGTCTGGCCAAACTAGTACATTAATCAGTTGGATAAATTCGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTTGCGAATTG:1 + chrX 20634897 5' - diver2 292 2 56.44 CATTAACCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTT:1 - chr3R 26346685 5' + hopper 148 116 90.91 GAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:2 + chr2L 13093780 5' - roo 9032 1 66.34 CCACAAAAAAACGCTCGTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 + chr3L 5710233 5' - Transpac 5206 2 56.44 GCTCAGCCATTGTCTGTGTAAATCCCCCTTCTTCTATATGTGTGTGTGTGTGGGGAGTCCCTAAAGTTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAG:1 - chr3L 5209387 5' - Stalker4 391 1 70.30 AAAAACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCT:1 - chr3L 20224209 5' + Chimpo 43 1 70.30 CCCCTAGAGAATCAGCCACCTGGAGCTCCGATCCGTAGAGTGACTTGCAGCTCTTTTGGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAA:1 + chrX 19034095 5' + hopper 14 1 63.37 GTTCGAGATAAATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAA:1 + chr3R 11151801 5' - mdg3 5487 2 68.32 TTAATGCAGTTTTTACAATGTATTTTACATTTAATTTTTATTTGGCTTTAATTGATTTAAATTCTTTTTAAAAAACGGAAAGTATTGTATTTATATTAAAT:1 - chr3R 18433620 5' + Bari1 1396 1 84.16 AAATAATATTTAAAAATGGTCTTTATTTTTCTTACGCATTCTTAACATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTG:1 + chr3L 13094274 5' - I-element 69 1 62.38 TTTAAGATTTTAAATGAATTGCCATTTATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:2 - chr2R 11941089 5' + 297 10 2 72.28 GAATGTTGAAGAAGTCGATCGCCACAAGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTT:1 - chr2R 5674728 5' + S-element 33 2 54.46 CCAGAGCCACAGCTCCGCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAACCATCA:1 - chr3R 12199802 5' + jockey 67 1 78.22 CGCGCCTGAAATTGCTAAAGGAAGTTGTTACTTTGTAATTAAAATTTGAGATTGATTAACTTATTGTTCGTGTGAGTTTTGATTATGCTCGTTGTATTATT:1 - chr2L 11335897 5' - Doc4-element 2649 1 79.21 TTGACATGTGATTTGCCTTAATTACAGTGGGACAGGCCCATTTCGGGGGAACACTAAAAACGATATTGCACACAAGTAAAAATGAATATAATATAAATATA:1 + chr3R 13439583 5' - gypsy7 5068 1 51.49 AAGATGAACTCAAAAGCTGTACTCATATCGTTCATTACATTGTCCACTTTTTAGTGAGTAGTGAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chrX 8316294 5' - hobo 2927 1 66.34 CTTCTTTCCTTCTCGCCTTTCTCCATCGAGTCGTTTCTGTTGCTGCCACAATTGTTGCGTGCCCCGTCAGTCAGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chr3R 17815529 5' + opus 7038 4 77.23 AAAAGCTAAAGGAGATGAAAAAAATAACTGGAGCAAGCCCTGCAACAATTCGCACGCAGATGTTACCAACACCATAACCACGACCCAAGCTAGT:1 + chr3L 28008121 5' + jockey2 283 1 50.00 CAACATAATTATGCGCAGGGAAGTAGGCAACGTTTTTATTTGTTCACTTTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCTA:1 + chr3L 20049593 5' + jockey 4760 1 78.00 AACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2L 12958917 5' - roo 9035 1 64.36 TTCGAAATAAATTAATAAATACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTT:1 - chr3L 4853165 5' + 1360 247 1 86.14 AAACGGCAGGGGAAAAGATTCCCAAAACGTGGGTCATATAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1 + chr3L 171179 5' + 1360 37 1 62.38 ATGGTGTTTTTCCTAGAAACATTTAAAGCTAATAGAAAAGGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 + chr3L 13096952 5' + I-element 42 1 60.40 AAAAAAAGATAGCAAATTCAGAACCCACAAGAGCAGAATTCAAATTAAGTTTTATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGA:1 + chr2L 20062350 5' + FB 25 1 54.46 CTATGACGAACAACACATANGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGATGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr3R 30553563 5' - 412 450 2 64.65 CTTGAACTTAATATAAAGGNTTTTCGCATTAATATTTTCTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGT:1 - chr3R 11052166 5' - blood 342 2 63.37 GTAATAGTAATTGAAGGTAGTTGCTTAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATAT:1 + chr3R 22869396 5' - Bari1 1662 1 68.32 CAATTAGAAGGTGCAGATACAGCAAATTACATAATGAGGTAATGGTATATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1 + chr3R 17481998 5' + copia 30 2 54.00 AAGATGCCTTTCCGTTGAACTAAAACTAGACGAGTAAAGCGTATCTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3R 5594947 5' + 1360 29 1 55.45 CAAGGATGGTACATAACCCCTCCTCCTCCCTGTTTTTCTCCTGCCTTAAAACTTTTCCATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 8765624 5' + roo 8681 2 60.40 AACTACAAAATTTATTATACGCGGCGAAACTACTTAAGTCACACACATCTGTGTATGTGTGTCTGCCTGCCTCGCGCACTGAATGTGTGTGTGTGTCTGTG:1 - chr3L 6539884 5' - accord 7032 2 54.46 GCTATGACAATCAAATGTTTTAAGATAGATCATGCTTGAAAGCCTTGATAACACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr3R 17781537 5' + pogo 20 1 59.41 ATTTGATGTGGAAAACCGAAAGAGGGTAAACAACAAATTGCATACTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 + chrX 15546119 5' - blood 7386 2 76.24 AGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAGTTTTTGGAGAAAGAAGACGTTGCAGACTGTGCAAAACTGCAACGCCGATG:1 + chr3L 26696871 5' + looper1 1559 1 87.13 TCAAAAATGTATATGAACATAATGATTTTCATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTAT:1 + chr3L 13001017 5' - invader3 237 2 71.88 GCCCGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGTTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAAAGCTAG:1 + chr2R 4906448 5' + INE-1 152 1 57.43 ATGCGTAATTTGTGGCATCATCATCCGTGAATGATGATGGTTCTTAACAACTCAGACAGTCAGTATTGTCTTCTAGTCAACCAATTACTTATTGTTATTTT:1 + chr3L 27770827 5' + Porto1 4631 1 74.26 AATGGAGATTGGAGGATGGAGTGCAGCGATGGAGGAGGATTGCAGACTTAAATGGAAGGGCACCGCTGAATGGCTTTTTTTTGTGGGCACTTGCTGCAAAA:1 - chrX 6003555 5' + Tc1 170 1 68.32 TACATTTGTATGTATACATATATATATTTTGTTTTGCACCCATGTTGTCTCAGATTATGCATTCAAATATTTCCTTTTACTTTAGAGACTAACAATACGTT:1 - chr3L 6649318 5' - Doc3-element 4678 1 66.34 AAGATTCGCCGATTAGGAGAGCAAACAAAGCTTTAACCCTTAACCCTAACCAACATCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chrX 21217591 5' + pogo 16 1 61.39 TTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 - chr3L 9910417 5' + 297 40 2 75.25 TCGCTGATGGAGTACCGAANGTCCGGCCCGTTCAGCTCGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTAAGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGG:1 + chrX 19681856 5' - mdg1 7249 2 62.00 GTTGCCTGCAACGAGGCACAGCAGATAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGA:1 - chr2L 17726027 5' + pogo 1686 1 75.25 ACTAAGTGATAGATATACCCCTATATATGGGCGTGGCAATTTCGGGCGGTGTTAGGGCTTTATAGTGGGTGTAGCAGTTTTGGGCGGTTGTAGGGCGTTAG:1 + chr2R 1369367 5' - INE-1 342 1 73.27 AAAACATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGGCCGATCGTTGACTGTGCGTCCACTCACCCAT:1 - chr2L 13566525 5' + hobo 2759 1 69.00 TGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTATTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAA:1 + chr2L 22121351 5' - I-element 5338 1 73.27 TAGGAGTATTATTTTTCGATGAAATGGGGGCCAGAAGCGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCC:1 + chrX 1710200 5' + Tirant 8180 2 54.29 TTCTTGCCGCCGACGTTGTCATCGATATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 + chr2L 17245020 5' - copia 5074 2 75.25 CTTGCTACCGCTCAGCCCGTCTCTTTCTTTTATTGCCGTGTCATGTGGAGTGTCTGTATATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 - chrX 12824324 5' + flea 11 2 47.52 TCCATACTCTTTTCTTGCCCATTCCATTTCCATCTCAATTTCTAGTGCTAATCTAGTGCTAATCAATTTCTAGACTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGA:2 + chr3L 17140576 5' + F-element 12 1 47.52 CATTCAAGGCTTGTACTACNTAAAAAACTCTCTAAGTGTACTTTTCTTACCCCCTATGAGCATGAATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chr3R 13353182 5' - 1360 3378 1 67.33 TTAAAATTATAAAAGTCTTATTCTCTCGTAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATC:1 - chr2R 675878 5' + Bica 482 1 71.29 TGTACTGGAGTGTCCTGGGGCAGGATATCAGCCGAAACGGTGGCAATTGCCAAGACCAAGACAGCAAAAACCTTCATCTGGATAAGATATACATAAGAACG:1 + chr3L 6034529 5' + 412 7323 2 76.24 GTTTATGAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGTCTTTGTGGATGTCATGATTAGTCATATACCATGGAGCACCTGTGATTGTTCTTAGCGTCATAGACTGGTA:1 - chrX 292415 5' - G3 4259 1 72.28 TAGTTGGCATGCCCGCGCCNAGAGAGCCGCCTGAATTCACAGGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3R 18399276 5' - P-element 2882 2 76.00 ATATCTTGGAGAGCGAGCGCTCTGCTATCCTTGCTGGGCTTATTTGTTTTTGGGCCTACTAAATGGCCAGCAGTTCGCTTTTTTTTTTGTTTTACTTTACT:1 - chr3R 27790074 5' - F-element 4678 2 50.50 CATTTGCTAAGGAAAATTCNCAATTAAGCGACTGCCGAGCCAAACAATGTGAAACGGGCTGTAGATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTAC:1 + chrX 11032166 5' - invader3 5450 2 54.46 AGGCCAGGCAAAACACAAGCAACAACAACCACAACTTTAGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCC:2 + chr3L 21008378 5' + accord 325 2 61.39 CTTATTAACTACATTTGTATCCATATTATTGGTTTGTGGTTCTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACC:1 + chrX 8039734 5' - Quasimodo 147 2 59.41 ACAACCATACTCACACTAACACACTCACTGTGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTCAAGGATCCCCCTGAA:1 - chr2R 4387438 5' - baggins 5369 1 71.29 AAAAAAATTCAAGAATAATNCATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTTTGCGTGGACGCTGCGAG:1 + chr3R 3269647 5' + Gypsy6A_LTR 111 1 60.00 TACTGCACTTGCCTTTGACCCCATTGGGACCCACACCACGTTTGGTATGGGGAAACATTTGGTTTAGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chr3L 14624012 5' + hobo 11 1 65.35 TATGCCCTATCTGATGAGCCCACAATCTGTAAAATAAAGCAGCAGCCACTCCACCACCTGCCTCCCGATGTCCATACGTTATACATATACATGTGTATACA:1 + chr3R 22066723 5' - Stalker2 249 2 68.32 AAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGACAGCTATCAGCCCAAACTCGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATA:1 + chr3L 20049647 5' + jockey 4822 1 57.43 ACAAAACCAAACAAAACATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 - chr2L 13566537 5' - hobo 2906 1 62.89 GCATAAAGCATTTCGCTCGTAAGTAATTTAAGTAATTTGTCAAAAATATTCACCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 - chr2R 11030584 5' + F-element 47 1 57.43 AATTTTCCGAACTGTCCCTTTTCATTTTGCCATTCGTGTTTTTTAAATTTTTTTTTTTATTTTTTATATATT:1 + chrX 4766705 5' - BS4 733 2 75.00 ATGGAAGTGCGAACTTTTCNGCGACAAACTTCCTGGCCGGCATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 + chr2R 12473059 5' + Doc 38 1 61.39 ATGGCAACAGCAGATTAAGCGCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:2 - chr2L 12808247 5' + Tirant 17 2 64.36 AAAGGAAATTACTCCTGCACATTTAAACATTAAAATAAAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 + chr2L 7175539 5' + blood 10 2 69.31 GCAGATTCAATGGACGGTGCGGCTCCATTGAAATATCAATTATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 6850505 5' + roo 8685 2 60.92 CCTTAATGAAAAGGTTTTAATGTGAAGTTTAGCTTAAAGGAGGGATTTATTGCACACCTTGTAATATCTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 + chr2L 9045394 5' - jockey 4985 1 67.33 GATCAAATCGAAATGAAACCCGTTTCATTTTTGGGCAACGTTTTATGCTAGCATTCGGCTGTTGGTATTAATATTATTATTTGTATTATTATTATTATTGT:1 + chr2R 12542370 5' - mdg1 7073 2 79.21 ATTTTCATCACAGCATAAGTGGGTTAAAGAGAAAGCCTAGGACAGGGGCATGTGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTA:1 + chr2L 15567090 5' + 17.6 6940 1 63.44 ATATGAAATTCCTTGTTCGCAATGATTCTAGTTTACCCTATCTCGCACAGATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGTCG:1 - chr3R 21547074 5' - Chouto 36 1 68.32 AAAACCTTTGACTACAAAAAATATGTTCGATATGCATAAAAAGTCAGTATTTGCTGAAAGTCAGGGCAGTACTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrX 17494715 5' + 1360 5 2 75.25 TAGAAGGCGCATCGGATGTTGCCGTAAAATCCCTTTTCCTTTAGAGCTAAGAGAGCGGGAGAGCAGGCGCGCGCTCTTTCTT:1 + chr3R 9357418 5' - F-element 361 1 45.12 ACATAATTTTTTACAACCAATTTGGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chr2L 21190760 5' + pogo 49 1 76.24 GTTCCCCTATAAATTTGTTNTATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 + chr3L 3540120 5' - 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jockey 4767 1 63.37 AATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTGAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 + chr2R 9408194 5' + FB 37 1 67.03 TTCGATTTATAGTCTACTCTAAGTTATGCCATTTACCTAAACCGCTGGCCAAAAGGCAAAATAAAAACAAAAAAATAATAAAATAATACAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 15013811 5' + Rt1b 5146 3 62.00 ACATACATATACATGTACATATACATCCACGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 + chr2R 15349509 5' - P-element 2839 1 32.67 TAGTTTAGCAGTGTAGGGAGAATATTTTTGCACGCGACAAACGGCCAACGTGCGGGATTAAGGATCTGGCGCACCGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chr3L 13295315 5' + hopper 2 2 75.25 GTCAACTTTCAAAACAAATAAAGTTGCCATTAATGCCGCACGCTGAGTACGTTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGT:1 + chr2L 19948018 5' - hopper 1084 1 56.44 CAGGGAAAACACTGAGAAAATTGAAAATCATTTTACTTTCTTAGGGTACCCACCTGGTCTAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTAGGTGAATGTTGGGCGCC:1 - chr3L 2219377 5' - gypsy7 252 1 65.35 TATGTATAAAATGTTTGTTCTAGATTTCCTTATTGCATATTACTCTAAGTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTA:1 + chr3L 8214945 5' + Doc 471 1 54.46 GAAATTGTTATTTAAGTTATTAAACTTACTAAATACAAAATAAATATTTTTTTAAAAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 26317907 5' + roo 8684 2 59.41 GACAGAGGAAAAGCACAATATATCAAAGTTACAAGGAAGCTAGTTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAT:1 - 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chrX 21060377 5' + 412 30 2 53.47 CTGGCCGGGAATGCCCGGCATCGCCGATGTTGTCGTCTTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTGTTAAATTAGATTGGTGGGTTCAGATTGTTGGTTGGGCGCC:1 - chr2R 8078114 5' - gypsy 483 1 62.38 GTATACTAGATTCATAGGCCTGTATGTACTATAAGAGGTAGAAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr2R 5143497 5' - 1360 3354 1 96.04 CATTTTTAAATGCTTATGAGGAGCACTTATGTTTTTTTTTGTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 10110194 5' - gypsy11 3933 2 87.27 TTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTGGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAA:1 - chrX 23108303 5' + BS3 1445 1 63.37 AAGACCAGGTGCTCAGATACGCTGTTATTAAAGATTATAATGCATATTTGTCACTCCATCAATATAATATCTATAATGCTTAATTTTAATTTTGATTTTAG:1 + chr2R 23000872 5' + Rt1b 133 1 52.48 ACTGCCGCCATATTGGAGTTCAGTTGCTTTTCAAAAAACGGAAGCGGTTAGTGCATTTCGGTGCCAGCAGCTTAAGACCATTCGCTTGGGAGATGAGCAAT:1 - chr3R 20696562 5' + jockey 8 1 77.23 GATGATCTGTCGATCTCGGGATCTTAAGATCTCGCGTCTGGCCTCTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAAC:1 + chr2R 24276922 5' - 412 90 2 55.45 TATATATATAGATATAGATATTAATAGTGATATCCCAGAAAAATTATGAAATATCGCGTTCACATGAACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGG:1 - chr2R 15330145 5' + INE-1 552 1 92.08 AACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGATGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTCGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 + chr3L 5710251 5' - Transpac 5188 2 65.35 AGGTCTAGTCGGCGATTTTAAGCAAGCCATTAGCACCGCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chr2L 4924574 5' - hobo 2901 1 62.38 GCCTGCAAATGATCGTTAAAGCCATATGTATGTAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chrX 17104382 5' + 297 6595 2 66.34 GTGGGTTAAAGAGAAAGCCTAGGACAGGGGCATGTGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATA:2 + chr2L 15567108 5' + 17.6 6966 2 65.35 AGCCGAACTGCTAATTTGTTTTATATCTTTGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 - chr3R 1518726 5' + 1360 73 1 71.29 ACTTTATAATTGATATACGGTATAAAAGAATAAACAATATTCTATTATATAAAAGCATATTGTTTTTGCTCCTATTATGGTTAAAATATTTTAATTCCATT:1 - chr2L 9635357 5' - Juan 428 1 87.13 TGGACAACAAACTTAAACTTTTGTTTATTTCGTACACTAATAAAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATA:1 - chr3R 7513979 5' - diver 191 2 62.38 CCTCTGAGCTTTATATGTTCTATATTAGATATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 - chr2L 11478737 5' + opus 42 4 79.21 TTTGGATTATTTGTATCACNTGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATA:1 + chrX 22689533 5' - 1731 4601 1 52.48 CTTTCACAAGAAATGTGTGAAGTGCAAAGAGGAGAGCAAACGAATCAGAAGAACGCAAGTACATAAGATGTATATACACACACACACACACACTCACACAT:1 - chrX 4586488 5' + accord 191 2 72.28 TCAAGGACCTTTTACCAACCCTAGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:2 - chr3L 18418905 5' + hobo 32 1 54.46 ATCAGAAACAGAATCCCAAACTGAGGCAGACGGGGAGCGAACGGCAGAAATCGGGTGCAAAAAAATCGTACGGCGTTACGCGTCTTGTTATTCTAGTGTCT:1 - chr2L 17733011 5' + 1360 3385 2 57.43 ATGCATTTCAGAAATGTGCACAATTTTTTATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTA:1 + chr3R 10087796 5' - roo 9066 1 73.27 TTACGTCCTGGTTGTTGCCATAATAATCGATTATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTCAACAACACCAACCCTCTAGAC:1 + chr2L 10207964 5' + I-element 5093 1 66.34 TCAATGAGGACATCCTCAAGCACTACGCAGTAAAATATTAATAAATATCAATATCATTAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTG:1 + chrX 20016216 5' - diver2 4652 2 63.37 GCTATCCGACTTGGATTTACCCCGTTCCCGCTGTTCCCGCTTCTCCTCTATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGT:1 - chr3R 8120858 5' + 297 290 2 60.40 GAAACCACAAAACGGCAATTACGTTGCCAATAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGC:1 + chrX 18925115 5' + Doc2-element 488 1 77.23 ACAAAAATGGCAAATGGATAATTTCTCCAGAGATTGAATAAGTTTCGAGCAGATAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr3R 22232476 5' + 297 6628 2 57.43 AAATGGACTCAAGTCTCTTCGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAGA:1 + chr2R 4954517 5' + invader4 2973 2 78.22 TTTAACTTTTTTGGTAATTTTAGAGGTTCTATACAGCACTTCCCAATTCCTGCAGTGTACCCGTGCACCCACTACCCTCAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCG:1 + chr2R 5932875 5' + jockey 4737 1 79.21 TTGACTGTACGCAAATTTTTGTTTAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chrX 15800912 5' - roo 9022 2 78.22 ACAATTCCGGTCTTTCGAAGGATCAAATGAGCTCCACTTATTGAGAATTAATTGTTCTAATTGGTCCTAGTCGTAGTCGTATTATTTTTATTTG:1 - chr3R 19813833 5' - I-element 4929 1 76.60 TTTAAATTTTTTCTCATTTTATTCCGCAAGATCTATCGATATCCCAGAGAAATGATGAAATTTCGCGTTTGCATTCACACTAGCTTAGTAACG:1 - chr3L 24731967 5' + INE-1 535 1 86.02 TGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTTGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chr3R 30553566 5' - 412 446 2 64.00 AGCCTTAAAAGCGTTGGTTATTAAAGACAAGTTGTGTTTATTTAAGCCAGTTATTATTTATTTATTGGCGCTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACA:1 - chr2R 17644960 5' - mdg3 241 2 73.27 ATAATCGAGAAGCGTCGTCCTCCATCATTCGTTGGTTATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCT:1 + chr2R 13653715 5' + F-element 112 1 62.38 ATTCGCATGCAATGGCTCGATGGCTCTGCTGCCGTTGGAAAATGGGAAATGCATATTTATGTGATACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTG:1 - chrX 14984594 5' + accord 7045 2 75.25 TGTGAAAATTAATTATTCTNAACAATTTTGCAGCATTTAAATACAATCAGAATACACAGAAGATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 + chr2L 11478658 5' - opus 7488 2 65.35 TTTCCAATATTGCATTGAACTGAGCCCACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 20684909 5' + roo 8714 2 78.22 GCTGTGCAAGAACAAGATGGAAAATCTATGCACAAAAAGGGGTAATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 - chrX 9775053 5' - 412 7512 2 58.42 CTGCTGCAGTCATTAAAAATTGGTTCGAAAATATTTAATCTCATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTT:1 - chrX 7292735 5' - 3S18 307 2 57.58 AGATTAAGCGCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chr2L 12808236 5' + Tirant 28 2 53.47 GTCAACAACTTGGAGTTGGTCAAGCAATGGGTTTTCCGGCCATTCCTTACCTGACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCA:1 + chr2L 4064715 5' - roo 8707 2 59.41 CAATTTAAAATGAATCGAATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGT:2 - chr3R 15790145 5' + flea 4708 1 39.60 ACGAAAAATGGTAACATCGAAACCACGAGCCATAAGAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 - chr2L 20328793 5' - opus 492 2 68.13 TTTCTCATCGAAGCTTCATCTTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCATATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGAC:1 + chr4 956756 5' - 1360 3195 1 80.00 CCATGGAACATACTATGGATGTATGTATGTACCTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTCCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAA:1 + chr2R 16007413 5' - Quasimodo 381 2 67.33 ATTTAATATAATATAATTTTATGTTACGTTAAGCAACCAATTGAATTGCTTTACAACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chrX 11088296 5' + blood 19 2 60.40 CTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCG:1 - chr2L 23295840 5' + micropia 140 4 80.00 TTCTGCCCCCCGAGTTGGGATGCCAGTGATTTATTTGGCCATAATTAATTTGATTTTATTGTTTACAGCGCTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:2 + chrX 16671034 5' - P-element 2881 2 73.27 GAGGTGTGAGTCTAATGAAATAATTTGTGTACCCAAACTGGCAGGCAGCTGGGAAAATGCGAGCAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr2R 7838948 5' + pogo 9 1 70.30 AGTGTTGGCCTGCTTTCGGCTCCAAAAACTTTGAGCATTATAAACGAACGCATAAAAAAAAATTCATCAAAATATCTCCAATAG:1 + chr2L 2791946 5' - hopper 52 1 63.10 AAGTGAGAAAAGATAAAGAGAAATGACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 13093761 5' - roo 9051 2 58.42 CGTGTATACAGATTTGAAAAAGAGGTTGAGTAAATTGGCTGAAACCCTTTTATTTGAGTAAATGAGAAAACAATTTAAAAATTTTTCAAAAGTGTGGGCGT:1 + chr4 628433 5' - INE-1 254 1 67.33 GATAATAAATTTTTGTTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACCGCCATGCCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCTCTGCCGTGTATCGTACGGCTC:1 - chr3R 4583046 5' - Cr1a 4395 1 75.53 CATTATGCCTCTCGACGCTNATTGATTGTCGGATCCAGTGAACATTCACATACACACAAACATACATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 - chr2L 3978530 5' + 297 6581 1 78.57 GGGATATTCAAAATGAATTGAACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chrX 11016991 5' - roo 9037 1 58.42 GCTATGATTATGTCGATTGGGCATTGTTGTTACTCTTATTGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3R 7139305 5' - pogo 2069 1 63.00 ATGTATGTACATAATATGTGTTTGCTGTGCACACACGAGTACTTGTAAATTTTAAATCTCTTTATTGATTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGC:1 - chr3L 20317900 5' + 3S18 5773 2 71.29 GCTTGGTTCGGATTGAAGGAGTGGAAGTTCGCCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCACCCACAACCAAAGGAATCTTTC:1 - chr3L 5504054 5' + Max-element 8519 2 67.33 ATTACCATTAATCCTTTTGAAGAATACTATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chrX 2530473 5' - pogo 2060 1 70.30 CGATGACGAAAACACAGCGATTGGGATGTCGGTTTTCAGATATCTCGTAACCCATACCAAGGTGTCTGGAGCATCCAAAATATTAAGCATTGGATAGGCAA:1 - chr3R 16834242 5' + invader3 4996 1 70.30 CGTATGCAAAGTCCAACAAACTGCAAAATAACAGTGGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2L 20045743 5' + roo 39 2 65.35 ATGTTTGAAATGAAAATGTGACCTCTGGCCTGTTGGTTTGTTGCCTTGTTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCTCATTGTCGCTGAGA:1 + chr3R 6086701 5' - Doc 234 1 58.42 AAGTTAAATGCTATGACGGATATTGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2L 13093822 5' + roo 8715 2 78.22 CTGTATATAGCAATCTTAAGATTGATATCGAAATAAATAGGACTATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 - chr3L 15033368 5' + I-element 33 1 55.45 TTGTGTGCCTGTCATTAGTTTTCCACACACACACACCACATATGTTCAACCTATTTTTTTGGTGCTGCCTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr2R 18766298 5' + hobo 7 1 66.00 AACAAATCCGCCCATTCGCCGCCCACCACCTACCGAAAGCCAAGTACACTCGATTTACTCCCCTTACGTTAATGTTTCCCTCCATAAAATTTAATTATTGT:1 - chr3R 11059042 5' + G2 3018 1 61.39 GCGTAAAAAGTACCGCTGTAGTACACACACACACATGGGCACCAAAGGGGCCACTGAAGCCATGCTCTTTAGGAAAGTGGTCATAGGTAGGGAAGGGAAAT:1 + chrX 17826775 5' + Gypsy12A_LTR 1954 1 64.36 ATTCAATTAATTAGTATCAGGTATACAATTCAATTCAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chrX 21583406 5' + F-element 43 1 64.95 GGAAATGTCCAGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr2L 17730521 5' + pogo 22 1 57.43 GTCTTTCACTACCTTATGGTGTGATTGTTTCGGCACTATTTAAACCTACATATATATTCATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chr3R 22494082 5' + 297 7 2 73.27 TCTAGAAGCAAGCGTGCTCCTTTCGAATTTATGGGTTCCTTGTATCATATATAATCCAACTTAAATCCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGTGTAA:1 + chr3R 19448527 5' + Doc 4296 1 55.45 CTCTAATTACCTACTGACTNCGCTTATTATTAAATACTTTAATTATTTTTGAAGTGTACATATGTGAGTAGTGCAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr3L 21518949 5' + 1360 3 2 73.27 ACTTGGTTTACTATGCGATGGAGGCTCTAGATATATACACTATAAACGTTAATCCAACCACGGAGAACGCTTAAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCC:1 - chr2R 5203861 5' - INE-1 556 1 61.39 TAAAAAGAGCTTCAGTTACCTATTAGCAACCCCTATTTAGACAAAGTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chrX 9454811 5' - roo 9042 1 58.42 GCCGAGCGATAAACGGGTTTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chr3L 13895403 5' + hobo 56 1 78.22 TTCTGTTCTATATGTGGTTAAAATTGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCG:1 - chrX 16555492 5' - Quasimodo 237 2 74.26 ACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr3R 30553598 5' + 412 7106 2 76.24 TGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTT:3 + chr2L 14793509 5' + Stalker2 50 2 73.27 TGCCAAGTAGTACGGGGGCGTATCGAAAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 10625652 5' - roo 397 1 68.32 CTTCGGGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chr3R 5506833 5' + pogo 47 1 74.26 CCATCTGACGACCACATTTACCCATTCGATTTGGCCTTCCGATGGGCCATCAATTGCTCCCGCTTCCGGAGTGAGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 + chr2R 23519193 5' + jockey 4763 1 75.25 CCATATTGGAGTTCAGTTGCTTTTCAAAAAACGGAAGCGGTTAGTGCATTTCGGTGCCAGCAGCTTAAGACCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr3R 20696555 5' + jockey 11 1 73.20 GAATACTTTAAATGATTGGTTAATAAATCAAGGAAATTACATAAGAAAATAATAAAAAATACAATAAAAAAGCACACCCTATTTAATAAATCAATTCATTT:1 + chr3L 18091325 5' + HeT-A 365 1 64.36 TTAAATATTGCCTATTTATTGCGGCATTGCGCGTTTAAAGTAGTGACGAAGCGCACGCTGACATAGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr3R 5506752 5' - pogo 2098 1 72.92 AGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 + chr2R 5214954 5' + F-element 25 1 57.00 AGGAGCAGCGAGATGGGCCCGCTTGGAGGGGTGAGGATTGGCTTTCGTCTACTTGTTGTGCTATTGTGCTGGCATCTGGCGGAGCTAATAGAGCGGG:1 + chrX 1502090 5' - F-element 384 1 78.35 TTTAATGAGCTTGTTCCACATCAACTGGCCCACACACACACACAGGCACATTACTACATGTGCACCTAACCACATATACATGTAAGATTGTTTATTATTAT:1 + chrX 17029967 5' - flea 255 1 73.27 TTTTTAATTGACACACATCCACGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAATGCAATCACGGAACTT:1 - chr2L 20562586 5' + F-element 4417 1 76.24 CTCAAAGGCGGTGGCAATCAAGGAGCAGGGAGCAGCCAGGATCAAAAGGAGCGCAGATCTGATCAGTATATGGCTGTTTTGGAAACACAAAACCGTAACCT:1 - chr2R 20054575 5' + invader4 405 1 56.44 GTCTGAACCCTCAGCTTTGAGCCGCTCTTTAGTTTGGGTTTTTCTGATTTTAACTTAAACTCATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAG:1 + chrX 4166363 5' + I-element 5305 1 61.39 AAATTTTTACCTTTAACGAGTGGCGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGC:1 - chr3L 4969779 5' - F-element 413 1 76.24 AATTTGCATATTTGAGCTGGAAATTGTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACT:1 - chr2L 15531845 5' + Stalker2 7297 2 74.26 ATTAGCCCTACGCAAATGCCACTAGCGATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr2R 18432077 5' + 412 7100 2 75.25 AAGCAGCAGGGTATGCGTAATAAGCAAAAGGCATCCGCCTCCAAGTGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTT:1 + chr3R 10392803 5' - invader4 2682 1 54.46 TGCAATGGCTGGCTAAGTTTGCTTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3L 14222562 5' + roo 8697 2 61.39 TTATAGCCGCCATGTCTCCTCTTTCTTTGCTGAGCTGTTCTAAGTGTGTAAGTGGGGGAGCTTGAAAGAGACGCTCTCTGTGCGTTCGGGTTCATTTCGTG:1 + chr3R 21799679 5' - Doc3-element 411 1 57.43 TGTTGCTGCCGCATAATTATTGCCATTAGAGTGCGTCTCAATTGAGCCCCTCTACTCCCCCCCGCCCGCGCATCTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTA:1 + chr2L 20945190 5' + micropia 136 4 76.24 GTAAAGACCACCGACTGATTACTCGTTACGATTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTT:1 + chr3R 21367694 5' - P-element 2696 1 38.61 CAGATCCTAAAAATAATTCNAAATTAAATAGATTGGAGGAACAAAAAAAAAATGAGACTAATAA:1 + chrX 19110892 5' - invader6 11 2 76.56 GGGAAGCTGTACCCAAAAGCTGGCCACCGGAGGCAACAATTTCCATTTGGCGTTCGCTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 17994128 5' - roo 390 2 63.37 ACATAGTCCCAAGATTTCCACGTTTATACGGACGGACAGATCAAGAATATACTTGTAAGGGTCGGAAAAGTTTATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATAT:1 - chr2L 21378475 5' - INE-1 498 1 70.30 ATGAATTATTAATGTTTCTAATAAGACTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3L 3757359 5' + roo 49 2 80.20 GTCAAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 12241827 5' - roo 9028 1 71.29 TATTGATCGAACACCAAGTGCTTAATTAACAGTCAAAAGTACAAGCGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGAC:1 - chr3L 22736976 5' + G-element 28 1 50.00 GGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:2 - chr3R 5506828 5' + pogo 52 1 79.21 AATGTGTATTTTGGATTATTTGTATCACATGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTG:1 + chrX 22689524 5' - 1731 298 1 62.38 CATCGAATTGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 29608770 5' - roo 9048 2 59.41 TACTGTTGGTGTTGCAATATCCTGTAATGATGAACTCCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chrX 21060331 5' - 412 437 2 74.26 AGCGATAAGCTTTAAACTGCGAGCACTTCCGGCACGTTGAGCCCGGACCGACCACTTGGCTATATGCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAG:1 - chr2L 5419901 5' - 297 389 2 73.27 CGACTCGCATTGCCAACATGCATCGGCATCTAGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr2R 19840208 5' + roo 44 2 68.32 AACCGACGTCACAAATAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 + chr3R 19987393 5' + Doc 25 1 53.00 TATCTGAGTATATATCCGTCTGTTAGTCGAGAACATTATATTGGCATTTTAGCCCACACAGTACGCCCCTACGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chrX 10286116 5' - roo 407 1 73.27 TAAATGCCGTCGCAGCAGAACAGCAAAATCACAGCAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 26346659 5' + G2 3077 4 70.00 CATAAAATAAATAATCTCAATACCAAAAAGTTCTAGTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTAATTTTGCGGTCATAGCGATCAGACGTGATTT:1 + chr3L 3249665 5' + diver 122 2 64.36 ATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 9278380 5' - roo 9024 2 74.26 TTTCCTGCGCTTCGCAGCCGCAGCAAATCGCCGATTTATGTGCATTCGTTGAAGATTAGGTAACAGGTCGAAGTAACGAGTAACGGGTTTCTGATAGTCG:1 - chr3R 5987417 5' + INE-1 550 1 61.00 TTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chr3R 10741074 5' - 1360 3378 1 67.33 AAATAGATTTTTTCATATAAATAATCCAGTTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 + chr3L 20758949 5' - flea 213 2 70.30 ATTGTCAAAGCTTGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3L 3757417 5' - roo 9046 1 57.43 ATGTGTCATTCCACTATTAATAGAGGAATTCATTACTATGTTATTATTGTTGTTGTTTATTTTATTTTATTGACTAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAA:1 + chr3R 8263752 5' - jockey2 3352 1 57.43 GCACTTGGCTGTCTATGGCGTTCACCAAAACCGTATCAGATGAGCAGCTATCCAAGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGC:1 - chr3L 3648980 5' + R1A1-element 4989 1 58.00 TTATTTGTGTTCCCAGCTGCCGGTGGCCGTGCCAAATTGTCTTGTGATAAGAGTTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAA:1 + chr2R 21074140 5' - jockey 4984 1 55.67 CCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAG:1 - chr2R 6779821 5' + 17.6 52 1 80.20 TTCTACATTGCAGCCGTTCCGAAGAGTCTGGCTAATCGTAGTTGGGCTGGAGCTCTCAAAAATTTCCACATCTCCGGGCCGGTCTAAGGTGTCATTCGACC:1 + chr2R 10117221 5' + baggins 215 1 78.22 AGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACGG:1 + chrX 15408751 5' + INE-1 536 1 82.18 CAAATTAAGTACAAAGTTGGAAATTATAATATGCTTTCGGAGGAACATGTGACATTCACAAGCGTTACACAAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCGTGCT:1 - chr2L 8461690 5' - 1360 16 1 75.25 CTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 12944693 5' - roo 9022 2 80.20 GATTTCAATTGGAAGGAAAACCTATTAGAAATTATTTCCCTTCACTAAATATTTGCTCGATTGTGCTCTCCATTATTGTTGTTGTTATTATTATTGTTGTT:1 + chr3R 17180115 5' - mdg1 19 5 62.38 AATTGTCGAAACTGATAAGAAAAATGCTCAACTGATAAAGGGTGGAGAGCACCAACACACACGCACACTCACACAAACTCACACACACACACATACATACG:1 + chrX 6601592 5' + Quasimodo 40 2 70.30 GTCATTGTCTATTTATATGGTTATAGGCACAGGCCTCTAAGGTGAAGGGGTTAGCCAAGGGGACAGCGCGAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAAA:1 + chr2R 8580706 5' + Quasimodo 7156 2 77.55 CGACCGCTCAACTATTGCCCCGTAATTCGCATTGTTATTGATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr3R 12767279 5' + blood 7047 2 60.40 TGTAGACTTTTCAAATTAGGCACACTTTAAGCTAGGTTATTGCGAATTATAGAATTATAAAGACATCTTTCACGAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAA:1 + chr2L 3699378 5' - mdg3 243 2 73.27 AAAACCAGTTGGATAACCAGTAGAATTGCTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAG:1 + chrX 15368659 5' - Quasimodo 7061 2 60.34 GTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTT:1 + chr3R 19589936 5' + BS 5034 1 61.39 GGATTCCAAGAAATAGAAAACCTTTCAAATGCCAATTTTTAAACAAAAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 10796437 5' + R2-element 3585 5 60.00 CGATGGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr2L 8622769 5' + 297 40 2 77.23 TAGGTGAGAATGGTTTGGGAGGCCGGTCAGATCTACCAAAGTTTAAAACGTCGATCAGGTTTACCGAAGTGACAATGAACATCGAGATCTCACGAACTATA:1 + chr2R 2110126 5' + INE-1 144 1 75.25 TGCTAACTGCTCGTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACA:1 + chr3R 10741061 5' + Tc3 240 1 78.22 CGTTCGGAGCGACAGTTCGCTTTCGAGTTCGCTAAAACACAACGTAGAAAGGCCTTAGCTCCACTGAAAAATCAGATTAAGCTTGTTTAATTTCAAAACTT:1 - chr3R 30387848 5' + invader6 4433 1 79.21 TACCCTTATCTTGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chr3L 6033590 5' - 412 7509 2 60.40 GTTTGGTAGTTCAGTTCTGTCTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3R 6266272 5' - roo 400 1 70.30 CCCCTCGAATATTTTAACTCGATTCAAACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 8036451 5' - roo 9053 2 54.46 TCATATTCTGTGCAATGTGATGAACAGAGTTACCAGTATTGTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGA:1 + chr2R 20312587 5' + 1360 33 1 59.41 CACCCCTCGTCCCATCACTCTTTCTCATTCTCAACCGTCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTT:1 + chrX 3954160 5' + Idefix 7053 2 63.00 CCAGGTAGAATACCTTTGGTGAAGGGTATTGTAATGATGAACTGCCTTTTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 - chr2L 10792068 5' - 412 444 2 68.32 ACCGAAGTTAGAAGTAGGTCAGGGATTTGCATCTTACACAATTACCATAACCAAGTCTTCCCACAGAGGCAAGAGATCATCATCATCTCCTGGTTCTCGTC:1 - chr2L 4690549 5' - BS3 1603 1 75.25 GGCTTAGGCTTCGCCTCTTGCCCGTAATTAAAGTGGCCAGCGGAAGTGAACTGAGCTGTTCACAAATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 6107804 5' + roo 22 2 57.58 ACCCGGCACACCTCCTACTGCAGCCTCAGACCCCCTCGTGGTTCCCCCAGCTCCTCCCTAACCACCGCCTTGTGAATGGCATATTTTGTCAAATTTACAAT:1 + chr3R 26009330 5' - 1360 202 1 79.21 TTATTTAGTTGTATAACTAATGGCGAGAAATTTGTTGAGTTGGATTTTTATTTGCGCAGCTAGCTCACTTGTGTTTTCAGTTTTCATTTATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 7486969 5' - Porto1 171 1 81.19 ATCGTTCTTTGGCATTATTTTCCGTTTTTCTTGTCTCGTTCCTTCCGAGCGTTTTTTTTATTTTTATTTTTTTTTGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGACAGA:1 + chr3L 11239681 5' + 1360 3300 1 76.24 GACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGA:2 + chrX 14317418 5' + 1360 54 1 69.31 CAGAATATTATCAATAAAACAAAAGGGTTAAAATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 - chr3L 12303439 5' - blood 7348 2 68.32 GTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAAAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATATATATTATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATAT:1 - chr3R 4487816 5' + Quasimodo 13 2 67.33 AAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 - chr2R 672817 5' + F-element 30 1 63.01 TTAGCGAGCAGAACCAAGANAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:1 + chr2R 5214968 5' + F-element 40 1 54.46 TGGCAGCTCCATAGCCGAGTTGCTAGTTAAATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 13146893 5' - roo 398 1 68.32 TCTCATTTGGCCTTGGCTTCAAGTATTGCCACGCCTCCGCTTGCTTCTAGTTCTTCGTCCAGCTGTGTGTCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrX 22593247 5' - 1360 3384 2 73.27 GGCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATG:1 - chr3L 27382762 5' + 1360 3 2 76.24 CTTTTTAAGATTTTAAATGAATTGCCATTTATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 - chr2R 11941092 5' + 297 7 2 75.25 GTAAAATACCTATTGGTTTCAAAAAGCGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:2 + chr3R 27169440 5' + 412 49 2 77.23 ATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTA:1 - chr2R 12457976 5' - HMS-Beagle 204 2 75.79 CGGCTGATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr2L 20045797 5' - roo 9032 1 66.34 GTGGCAGTGCTTAAAGTGCAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3R 9278350 5' + roo 8719 2 84.16 CGACCATAAAATAATCACCTAATGTACATATTGCCCATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 - 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roo 358 2 71.29 GTGGGGCAACAAAGGCGGCTGCATCGCCGCCCAGTTCCTTGTAATGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGG:1 - chr2R 16190055 5' - 17.6 6950 1 56.44 GTGAGTCTAATGAAATAATGTGTGTACCCAAACTGGCAGGCAGCTGGGAAAATGCGAGCAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr2R 7838953 5' + pogo 14 1 63.37 GAGTCTGATTATTCAATAAGTGAAGAATCCGTACATCATAATATTGTATCTTAACATCACAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:2 + chr3R 4575419 5' - 1360 3371 1 61.39 AAATGTTGTATATATTGTATGAATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTTTTGATCAGGATTAAT:2 - chr2L 21302596 5' + INE-1 83 1 93.07 GTGCCGTTAAATAGATGGTNAATCGGGGATAGATATCCCTATATCGAGGATCTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAAC:1 + chr3L 15021018 5' + I-element 4951 1 56.44 AAGGCAGGAGCTCTCTTTGTATGGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAA:1 + chr2R 16957019 5' + roo 8870 2 77.23 ATGTATAAAAAATATGTTTTTTATTATTTTCCTTTTTTTTT:1 - chr3R 18404990 5' - Doc2-element 253 1 63.41 TAAATAATATAAATATTTCATTAATTTGCCACAGCTTATTTCTTTAATTTATTTTGTTATTATTTTTGCTCCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGC:1 + chr3R 22069568 5' + Cr1a 4368 1 77.23 TTTGGATGGTAAAGCTGATGGTATAGCTGGTGTTTGCTGGTGTTGCTGTTGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGTGAAT:1 + chr2L 16629012 5' + frogger 42 2 59.55 GAGTTGATTTCGGTGCGCAATTTATTGTATTTACATACATACATATATACGAGAACGAGTACGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAA:1 - 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pogo 2059 1 74.26 AAGGCTTCCCCGCATTGGCAATGTCTTCGCACCGAATTGGACTTTGGAAGTGCACGCACCGCTCTTGATGATGAGATCAATGTAACTACGATAAGCTGGGC:1 - chr3L 20388039 5' - Ivk 83 1 79.21 CCATTTTAAATTCAATCACNATGTGCAGCCAGCCAGTGGAGGGACCCTCTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr2R 24278081 5' - 412 463 2 52.48 CATTAGAATATTGGCAATCNCCCCCGCAATCACAACAATCTGCTTAATCTCTACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGCGATCTCGTCGTTCATACCGACAGA:1 - chrX 693916 5' - INE-1 130 1 55.45 GTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTATCCAT:1 - chr2L 17730497 5' + pogo 46 1 72.28 TGGCGACAACTCCATTAGAATTCAATTTTCGAGGCAGTCGCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAGAAA:1 - chrX 14651144 5' + P-element 36 1 43.56 ATGCCTGCCATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2R 9870960 5' - roo 402 1 71.43 CAAGGATAACCCTCCGCCAGCCACCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGT:1 + chr3L 6023303 5' - hopper 1361 1 77.00 TGAAGTTGGCCGAACAAAAAAACACACCTACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chrX 19334637 5' - roo 9023 2 74.26 CAGTAGTTTAAATTTTTTTTTGAATATACATATGTACATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGT:1 - chrX 23035800 5' - HMS-Beagle2 7157 2 66.34 TTTGAATGCCCAGCGGAGCGATCTTTTTATTGATGCGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr2L 16358179 5' + hobo 39 1 61.62 TACATTTTGATCCCCCCAAATGGGCTAGACAATTTTGGCAATGCCAATTTGCATCGCAAAATTTTTTAATTGCACACATCGAGCACTCGAGCAGATACCAT:1 - chr3R 14334852 5' + X-element 4400 1 78.22 GACTATGGGCTGGCCGCGTTCCTCACACTGCAGTCCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACTACTT:1 - chr3L 23678123 5' + Osvaldo 29 1 70.30 CATTTGACTTCAATTCAAGATTTACGTTTTGTACCGTAAAAAATAATGGTAAACGCTATAATCAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTGGTG:1 + chr2R 9237000 5' - INE-1 541 1 76.24 AAAGGCCGTTTCAAATGCAAGGCAAACCGGTCGAGACTACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAAACCACAAACACTAC:1 + chr3R 4127153 5' + I-element 4964 1 50.62 ATTCTTTTTAAGTAATTTTTGTATAAACAACACACAACGCAGAGATATGTGTGGCGCACAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 + chr3L 9502690 5' + I-element 19 1 58.42 CAGTTTAGACTCCTTCAATCAGCCGCAGAGCTGGTCCTGTGAGTGTGGGTCTTAAGCCCACTTCGTGGCTGTGTAATATGTAATAAGTAATAGCTCAGTGT:1 + chr2L 15531769 5' - Stalker2 7643 2 70.30 TTCAATGTTTTGCATCAAAGGTGTGTCATTCTTTCGGATCAACGGAAGACTTGCGTGTGTCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr4 301801 5' + jockey 21 1 64.36 GACAGGCAAACAAAACGCAGCTCATAGTTTGGATTTCAGAATGGTGATGTCTCCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACAT:1 + chr3L 10043560 5' + G6 1902 1 50.50 ACGACAAAACTAATTACAACAACAGTAAAGCAAATACAGTGGTAACACGGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chrX 19308234 5' + P-element 27 1 52.48 GTGAAATACCAGTGAAAATGGTAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 20620018 5' - roo 359 2 77.23 AAAGCTATTTTATTTCAGCTTTTGTCTATTGCTAAAGTCGGTGTTTTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTA:1 - chr2L 16031668 5' + 297 394 1 54.46 ATTAGTGAACATTTACGAATAAATAAAGGGACTTTATTACGTTACCTTTCCATTAAATAGAGCATATTCATGGATTCGGATTCAATTCGATCGCCGACGTG:1 + chr2L 20560299 5' + F-element 9 1 73.27 TCCCAGTCCCAAACACCCACACTTTTTGATGTGGACAGCACAAAGTTGCGCATTGTTTGGAAATTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 - chr3L 9907438 5' + jockey 4685 1 62.38 TATAGAGAATGGCAGTGCTCAAACTGCAGCCAAAGCACAAAACCAAACAAAACATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCATCCCGCCACT:1 - chr2L 13566573 5' - hobo 2938 1 81.19 AATGCCAATTGACAGCAACAAATGAGCACAACATATGTACCTCTCGCGTGTAACTGTAATTGAACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACTTATTTATTT:1 - chrX 11365287 5' - Tc1-2 71 1 76.24 CTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr3L 17181448 5' + jockey 4694 1 48.51 TCGGCGGCGATTCGAGTCGAGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3R 10488698 5' + roo 55 2 79.21 TCTTGCTTTCGTGTCTTAATCACTGAGAAAAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3L 15037901 5' + roo 18 2 61.39 GGTGCTGTCTCGATTGAAAATTTGGCACGTGTATGCTGAAATTGTAATATTGCGGTAAAAGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGGACGAACAGCCTCTGCAGCTG:1 - chr3L 24059504 5' + invader4 104 2 76.24 CGAAAAGTACGTGTGAAATTATCATTATTCAATTGTGTTTTTGGGTAAAGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr2L 7666098 5' + roo 8690 2 53.47 AATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:2 + chrX 13146922 5' - roo 9032 1 65.35 GATATACTGGTTGGAAGGGNAGATCTAGAAAATTGTTTGTATGACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCT:1 - chr4 264777 5' - 297 27 2 57.43 GAGTTCATTTTAATTGCCAGCACATTCCGCTGTCCGCACACAGATACTCACTACTCACCACTCACTACTCACTACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGCCTTTT:1 + chrX 14813444 5' - rooA 7531 2 81.19 TTTTTTTATTTGTTGGGTTTTATTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAACTGAGCGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCT:1 - chr2R 611754 5' - F-element 223 1 78.22 TTTTGCATATATTATATTATATATATGTAAATAAAAAATGCCCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chrX 16734028 5' - roo 9038 1 67.33 AATTAAGTTTCATGCACGCAGAAGTCTGTATGTGTGTGGAAAATTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 + chr3L 5415347 5' - I-element 5324 1 64.36 ATTAATTATAATATTTCAAAAATGTATATGAACATAATGATTTTCATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACA:1 + chr3L 13001002 5' - invader3 5433 2 58.42 CGCAGCTGTTGAAGAAAGTTAATTGTTGTTCTTGCCGCCGACGTTGTCATCGATATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chr2L 17244992 5' - copia 233 1 54.46 CAGCTGGAAACACTTTTGTAGCCTCCACCATATGCATATGGATGTGTGCAACGGACTCTTAAGTCCCTTTCAATAGCTCGGTTGCTCACTTACCAGGGTAG:1 + chr2R 14540631 5' - G5A 2524 1 52.48 TTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:2 + chr2L 21086041 5' - roo 9026 1 76.24 CCAACATGAAAAAATGGACCAAACAAAATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTC:1 + chr3R 25514896 5' - invader3 5415 2 72.28 TGGATTTTTTGAGAATAATTAAGCCTGGTCAGGATATATTAGGTCCATAAGATAAGCTGTATCCGTTTGTCATCGAGATCGCATTCACACTAGCTGAGTAA:1 - chr2R 5747587 5' + INE-1 533 1 76.24 AAAATTAAGCGACAAAACATGAGTGGCACACAAAAAACGGCATTAAGTAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTA:1 - chr3L 5479070 5' - 3S18 6076 2 58.42 TTCTTCAATGGCCTTTTGGATTACCTTGAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAA:1 - chr3R 6496709 5' + I-element 253 1 72.28 AGAGCTTGCAGTGAAAATTNTCAAATATATGGCTATTTAAATATGTCTTTTTTCTAATATTAAAGATATAAATACATATTACATGTAAGATTGTTTATTAT:1 - chr2L 14010908 5' - flea 258 1 76.24 AACTGGAAAGATTCCCCCATTTTTTTAAGCCTGACTGCTGATACAATTTTCATATTATTATCCAAATTTTTAAAACCACATTAATTTTTGTAAAAAATATA:1 + chr3L 18799549 5' - hopper 20 1 63.37 ATAGTTGCGCGCCTGTGTCTTTTTGGCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAA:1 - chrX 21009390 5' - hopper 1371 1 70.83 TATGATTATGACTGGATGACTAAACCTTTGTAGATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 20411801 5' + roo 43 2 68.32 CTGCTGGCCAAATTAGAGGATTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTT:1 - chr3R 12329651 5' - hopper 1364 1 74.26 CGCAGAGATATGTGTGGCGCACAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 + chr2L 10199019 5' + I-element 56 1 76.24 ATTTAATAGCATTTGGCTTCCTTTTTTGTTAAGTACTTATTGAAATTTATATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr3L 15788417 5' + opus 7028 4 56.44 TTGGGAAAAGAGAAACTACACAAAAATACGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTC:1 + chr3R 27907639 5' - mdg3 199 2 75.25 CCTGCTGGAGGTGGCTGTCGCCCTGAACCTCTGGCTCTTCTGCGAGTCAGCTAATTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAG:1 + chr2R 16956082 5' - I-element 424 1 62.11 ATATTGCAGCACAGTGGGGCACAGAGGAATAACCCATTTGTCCTGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTCGCGCAGATCGTGTG:1 - chr2R 11992757 5' + jockey 90 1 54.46 TTTCAAAAAAAATATTTCGCTTTTAAAAAATTGTCAGATGAAAGACAAAGAAAAACACACGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAAT:1 + chr2L 2436615 5' + 1360 3014 1 68.32 AAGGACCCGTCGGAAAGCAGGATAGCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr3R 23543029 5' + 412 7074 2 58.00 GTAAAATTTTTATATTCTTCCTTGACAAAACAGGAAACAAATATAACAAAAACGAAGATCTCGAAATGGTAATTGAAGACAGCGCAACTGATTCTGCTAAG:1 + chr3L 23702535 5' + G4 142 1 75.25 TGTGTGGATGTAGCATAATTTCAGGCGCTCCTCCCACAGTTCGCAGTATGTACTTTCAGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chr2R 11993970 5' + jockey 58 1 59.41 CCTCTAACTAACGGTTTCTAAATATGTAGTATGTGGTGGAAAATATATCTATACAGCTAACAAATGAAGCATATTACTAAACAAGTGCACAGCTGGCGGGG:1 + chr2L 20493846 5' - jockey 449 1 57.43 ATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATA:1 + chr3R 19449915 5' + flea 336 1 73.27 AAGCCAAAGCCAAGCCCCTCAAGGCGATTGTCGTTTCTTGGTAGGTGTTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr2R 15788647 5' - Transpac 5211 2 56.18 TCTCTTCTGTGTCCAGAATTATGCAAGTTAGGTATTTCTCTCCTGTGTCCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCA:1 - chr3R 2971842 5' + accord2 168 2 58.42 TTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATG:2 + chr3L 17181454 5' + jockey 4700 1 52.48 TGAAAAATTGGAACAATTATCAGTTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 11916566 5' + roo 8712 2 74.26 CAAGACTTGTATGTAAGCCCTTATACTTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTT:1 - chr3R 26477090 5' + hobo 415 1 73.27 GAGCCGCTCTTTAGTTTGGGTTTTTCTGATTTTAACTTAAACTCATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAA:1 + chrX 4166381 5' + I-element 5323 1 56.44 ATCGGTTAGCTAAAAGGCCCGGATGATCCTTGACCCATTGGCAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAGGAAGTAAACGGCGACTA:1 + chrX 13224612 5' - micropia 117 1 61.39 AGTTATAAATATTTCAAGATAAAAAAGTAGTTGCTTCACAGCTAAGCTGTGAAATTATTTAAAAAAAAAA:1 + chr3L 14191887 5' + TART-B 10504 2 68.57 GTTCACTGAAAATCGCCGAGTTGACATCGATCACAATCCGTTTGGTAATCCGACGCAGCTCCAGGCCCAATTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATA:1 + chr3R 22707049 5' - 1360 3108 1 80.20 ATCGTTATCAATACAGTTTATTAGATCTTAATAGCACTTAGTGAGTAGTGTGCAAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCGAAATTTATAATTATTA:1 - chr3R 14054552 5' + I-element 247 1 62.38 CATTGAATGACGACAGTGGCATGCAGCACAAGACACAAGACACAAATGATAACACTCTAAAGAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3L 17701615 5' - roo 396 1 56.44 CTAGCCATTTTAAGAAGGGGACCTTCAAACAATGAAGCTCGAAGCTGATAAAAATTCTTCAGACTCTACTGATTGTGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTAT:1 - chr3L 22537351 5' - hopper 212 1 60.40 CTGGATCCCCAGCGCCACGGAACCGCATCAAGGCGGAAGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCA:1 + chr2R 23456617 5' - Quasimodo 6984 2 66.34 ACAAAATATTGCAATTTGCNTTGTGTGTACCCCTACACATACATATGTACATGTGTAGATGTATCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGC:1 - chr3R 10095117 5' + Rt1b 4989 1 60.40 AAATGGGGATATACTTGCACAGCTGGGTGGGTGGGGTATGGGTATCTCAACGAACTCTCAACACAAACTCAACAAAATGACACTTTCCATGCACGTAGTAA:1 + chr2L 9470847 5' + Dm88 4104 1 80.20 AAATCACTTGGCTCTTAACGAATTTCTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:2 + chr3R 12321419 5' + jockey 4721 1 73.27 GAAGATGATTAGGCCATGCNCATTTCCGGACAAAATGTTATGCAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGG:1 + chr2L 14220151 5' - springer 7485 4 58.42 AGTGCATGGGACATCGTTCGTTCACATGGTCATGTATATTTTGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3L 22930375 5' - roo 9040 1 58.42 TTGAAACTAATGCTTATTAACATTTTTAAATATATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:1 + chr2R 19088966 5' - Tabor 446 2 66.33 TTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3L 23456283 5' + 1360 3 2 72.28 ATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:2 - chrY 311343 5' + 1360 12 1 50.50 AGACTCTGGAGTGGCCCTTGGCCGCCTGGCACTCGCTCTCCACTTAGGCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAAACTATCTGGA:1 + chr2R 21354408 5' + Doc 4271 1 63.92 TAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGCGACTCTTTGCATTCCAGAAATTCTGTCGAGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGA:1 - chrX 21852423 5' + invader4 88 2 56.00 AACTCCCCTGACATGTTGGNCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 8765530 5' - roo 387 2 56.44 CGTATTAATTTGATTTCTCGTGTATATCATTGGGTATATTATATATATATACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chr2L 6569155 5' + 297 6601 2 63.37 GCAGTATAGAATTCGCAGTAGTGTGGCCGCGGCTCTTGAAATTGGCAAGCCTGCCCAGTGTGACCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr2R 9693287 5' - P-element 2876 1 68.32 TTTTTCTAATACTGTTAAAATCTGGGTTGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCA:2 + chr2R 19091599 5' - Stalker2 375 2 50.50 CAATAAGATCGTTTGTAAANAATTAAAATAATTTGCTGGACAACGAGAAGGCAAGGAATTTAAATGAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 - chr3R 14580387 5' - blood 367 2 67.33 ACCTTTTACCAACCCTAGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr3L 18418899 5' + hobo 35 1 59.18 CCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGACTATTCGCG:1 - chr3R 10736101 5' + McClintock 29 2 69.77 CCTACACATACATATGTACATGTGTAGATGTATCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTTTT:1 - chr3R 10095086 5' + Rt1b 5020 1 68.32 CAGGTTTTCTTTTATTTTGAAAAGAATGCACACATATAATACACATTCAAACAGATACATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCA:1 + chr2R 23935432 5' + springer 17 2 60.40 GTTTGGCCGACAAAGTCGAAAGTAATTTTCAGCACACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 + chr2R 8526345 5' + I-element 44 1 65.35 GAGGGTTTCTCTCAAAATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGC:2 - chr3R 10741142 5' + 1360 3365 1 42.57 TGTGTGTTGTTAGTGTGCCAAGGACCGCACCGTGACCTGCTCAATGCCGCTCCCTCGAGTGTGCTCGACTCACACAAGCAAGCAAATTATTTTTTTAGATT:1 + chr3R 21739866 5' + 1360 3268 1 75.25 CGTCCGCCAGATAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:2 + chr3R 28565271 5' + 412 41 2 66.34 TTAACTCGCAAATGCAACTGTTTTCGAAGTTAGGAAGTAATTACACACACGTAAGCTTTATATACATATAAAGAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 3294255 5' + BS 5094 2 67.82 ATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chrX 13146937 5' - roo 353 2 78.22 TCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chr2R 17963254 5' + blood 7066 2 83.17 GCAAAATACATGTTCTATATACTTTGTCTGCGATATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chr2L 5419800 5' + 297 6611 2 71.29 CGACCAAGCCAACGATAACGACAGTAACAGTGGGCTAAAACTGGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGT:2 + chrX 21229277 5' + transib2 30 1 55.45 ATGAAATTCCCCATTTGCGTTGTAGAGTATATTTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCG:1 + chrX 3491231 5' - hopper 1103 2 75.25 AAGCAACTGCAATTTTGTTGAAATATACACTTCACCTCAAAATGTTGTTCATGATTTCGTTTGGGTAGTGGCTAACCAGGACCCCCCGCGGTATGGCTGTG:1 + chrX 14766111 5' - Rt1c 5341 1 73.27 CTAAGCTTCTTGAATCAACNCCCTTTCTTTCTGTGTACGTTTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAA:1 + chr3L 3596874 5' + copia 5050 2 72.28 ATGCGCGCACACAAATCAAACAATTATAAACTCGTTGTTGGTAAAGTGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 + chr3L 12468207 5' + jockey 4681 1 62.50 CAAAAACCTTGTAATTGTGTCAATAAATGTTTTAAATAATATTTCCTTTGGGAAAGGCACCGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGC:1 - chr3L 18820295 5' + R1A1-element 199 1 64.36 CAATCTACTTATTGTCATGNGGAAAGAACCAAAAGCCAGCTGGTCAAGTGAATCAAGTGAATCGATGGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTG:1 - chr3R 10644538 5' - F-element 483 1 69.31 CCCATCTCAGAGCCTCTGTTTGCGTGCATGTTTACTTCCTCAAAGATAGTGGATAACTTGAAATCTTTGTGCATTGTTGTGTTTCTTACGTACCATTCGCA:1 + chr3L 20863440 5' - BS3 1400 1 77.23 ATAATACTCCGTTGGGTATCTAGAATGCTTTCTGTTCAAAAAGAATACACCGCAAGAATTGATACGATGGAATATATATATTGTTGTTGGCACATCCGGTC:1 + chr2R 461327 5' - gypsy10 5696 2 68.32 ACACTTATTTAATCCTAATAAGTAAGGACACTCCACACACACACCCAACAAATGAATCCCTGCGCATACATAAACATATAAAAACACACACACACACACAT:1 - chrX 7288731 5' + accord 7027 2 51.49 GGACATGCCGCAGGACAATAGGCCTGGGAGGGAAATAGGGTCGACAAGATTATTCGCCAACGTGTTCGGGTGGGCACTAAGTCTGTCGGCATATTGGCT:1 - chrX 7427213 5' - G5A 2605 1 73.74 ATTTATAATTAAGTAAATATTTAAAGTGGAGAGTGGCAGTGCTTAAAGTGCAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 9278318 5' + roo 23 2 60.40 GTTCATTACATTGTCCACTTTTTAGTGAGTAGTGAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 + chrX 8316323 5' - hobo 2898 1 68.32 TTTTTATATATAAAATGTAAGACATCACCAAGCAACATAATAATAACATATCTAAAATCGAAACAGACAGACCAGGTTAGCGACTGGGCTAGTTGTTTCCC:1 - chr2L 23076469 5' - baggins 267 1 63.37 ATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 9278380 5' - roo 396 1 60.61 CATTCATTGTCATTTGTTTCATCTCGTGTGTATTTATTCATGCATTTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2L 12958990 5' + roo 8687 2 58.42 ACCGAGATCACCTGTCTTCATTTTATGGGCCGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr3L 3650054 5' - mdg1 375 2 69.31 TAGAGGGAAACCTATTAATTTTATAGCTTGTTATTCGGTTTATTATGATAATAAAAACTTTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr3R 17003280 5' + pogo 10 1 73.27 TAGCATAATAAATTTGAGTAATAATAATTTGAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATC:1 - chr2L 16851779 5' + HMS-Beagle 6837 2 66.34 AAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:2 - chr3R 9278398 5' - roo 9042 1 56.44 ATACTTTCAATATTAAATGNACTTGGTCGTTTTACTTAAAATAAGATAGGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACT:1 - chr3L 25670959 5' - Cr1a 4091 1 59.41 GTAGGTGGAAAAATAACCAAGACGTAAACTATGGTCCGTTTTGAACTGGAGCATTTTCATTTATTTATGCAGTGGTGGAAGATACTATTCAACCTACAAAA:1 - chr2L 16139204 5' + copia 8 2 67.33 ACGAGGAAAGTTTTCGCAGCCTAAGAGTAGGCTACACAAATGTCACATTTGCTTGCCTTTTTTACAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGT:1 + chr3R 27056365 5' - jockey 4976 1 54.46 GGCGTGGATGAGCAACCGCAGGCCAAGTTTTGTCACACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCT:1 + chr2L 11723188 5' - Quasimodo 6948 2 62.38 AACTCACAGATAACCATCGCTAGTGTACGTATGTGTAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTG:1 + chrX 21939061 5' - HMS-Beagle2 7152 2 70.30 TATAGGTTTAAGAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 8577260 5' - roo 9052 2 59.41 AGTATTAAAGAAGAGCTATATAACCATATACCAATTTCAATGAATTCTTATCTTAGCTCTAATATTATGATAGGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTT:1 + chr2L 11712787 5' - Quasimodo 7366 2 76.24 AAATATGCATAAATCAAGCAAAATTAAATTTTATAAGAGCAGCGGGAAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTT:1 + chr3R 23609911 5' - X-element 4464 1 58.42 TGTTTAAACATACATATACATACAAATACTCTTTTTTTGGCTCAAAAAATTTCAAGGCACTGGATAGTTTAAATAATAAAAGGCCCTGTTTTAGCATTATT:1 + chrX 15870901 5' - Tc3 1444 1 66.34 ATGTACACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr3R 30553604 5' + 412 47 2 70.30 AATACTAGGGTAATCAACCGAAACTTATAATGGATTTAAGTTAACTCATTAACAGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTG:1 + chr3L 27381320 5' - BS 5003 1 50.50 TTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGT:2 + chr2L 23286585 5' + Tirant 417 1 60.40 TTTGTGGCGTGCTGTTTACTTTTGTAGTCTAGTAAACTGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3L 14222523 5' + roo 38 2 61.39 GAGTATAAAATTGATTGCCTGGGACCAAAGACACTAGAATTATTCTATTGTCTTATAAATTTTTCAAACGCCGCCAGATGAATACTCTAATGACAAATAT:1 - chr2R 15374792 5' - 1360 403 1 70.00 TGTATGTGAATCAGCGGTTTACTCTTTCGCATTCAAGTGTCCAAAGTCTCCGTTTGCGTTTCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTT:1 - chrX 7190162 5' - Idefix 7122 2 58.42 TCAAACTGTGTACAAACAGNTTTGGCCTTAACGACATATGTGTGTGTGTGCGGGTTGTGCGGGTGTTTGTGCACGTGTGTGAGCATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 9955473 5' - accord 186 2 46.53 GCGAAGGCGTGATGTGGGCGTGGCGTGGCCAGATGTGCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGA:1 - chr3L 9474395 5' - jockey 4858 1 67.33 GCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 19450182 5' + roo 8715 2 53.47 TGTGTGTGTGTGTGGGCGTTGTGTGCATGTATGCATATGTGCCTGTGTGGGTGTGTGAGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCG:1 - chrX 6497606 5' - I-element 4925 1 53.47 GCCAGCCAACGGAGAGTTTNCATGGTTTACTGGGTTAAATTTAATTAATTTGTCTCGTCGCCCCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr2R 22553064 5' - 1360 3377 1 67.00 TTCCTGATATTTTCAATAGACGACCATAAACTATAGTCTTTTCGTGACTGATAAGGTCTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 + chr3R 24542010 5' + 1360 18 1 61.39 TCCATGGAACAACGGACATTTTTCCGGTAAGCTTATATGTATATATACTTATATATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chrX 5475382 5' - 412 7524 2 55.00 GACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAATGGCCAGTCGCTGGGTGATTAGCACCCCAAGTAGTTAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAA:1 - chrX 13126478 5' - jockey 135 1 69.31 AAAATAAAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr2L 7175570 5' + blood 7052 2 63.37 AAAAACTTGCGAAATTTCACAAACTTTTTATTTAAAACTTTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAG:1 + chrX 22426145 5' - 1731 310 2 74.26 TGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTT:3 + chr3L 16282373 5' + gypsy5 43 2 64.36 CGAGGCGAGACGTTCATATTTACTTCTGTGCAAAAGCAGCGCCAACTCATCACGCTCGGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTA:1 - chr2L 17211833 5' + McClintock 51 2 57.14 ACTAGTTAAACTGACAAGTNTTAAGGCTATGTATAAACATTGGCTGTTGGAGTCTTATAAAATATATGTGTATGATAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTG:1 + chr4 74229 5' + 3S18 1 2 77.23 TGGGGCATGGAGCATGGAGCTAGCTTGGTGTCTCTGTTTCGCCCGGGTTTGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTG:1 + chr2L 2903441 5' - F-element 292 1 58.42 CGAATGGTCACCCCAAAATNGTCGGTTGTAAGCCGTGTTATTATTATTATTACTTGTGTTTATTATTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAA:1 - chrX 12130327 5' + 3S18 11 2 68.32 AATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTT:1 - chr3R 25086147 5' - Bari1 1657 1 75.25 ACAGAGTCGTTAAACAAGATTTACATATGAAAATAACAAAATATTTAACAGCAGCCGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGC:1 + chr3L 9027321 5' + G2 328 1 66.34 ATGGGGCGCAACAGTAAAANGAAGCCATGAAAAGAAAAAAAAAAAGGAAC:1 + chr2L 11491657 5' + Doc2-element 245 1 84.00 TAAATTCCTTATACATTTATTGGTTGAATAGCTAGCTGGTGCTGTTCTCCCTTAAGTAAGTCACAAAAAACCTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGC:1 + chr2L 3408590 5' + G-element 8 1 69.31 ACTAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACATAATTCGTGAGCAGCGTCAGCGTGAACAAGACGAGCGTCAGCTCTCTTCACTCAAAAACAACGCGTATTTC:1 + chr3L 16995275 5' + Doc4-element 57 1 80.20 AAATGCCGTCGCAGCAGAACAGCAAAATCACAGCAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 26346660 5' + G2 3077 4 71.19 CAATTTCTGCACGTGTCGCGATTAGTGTGGCTGTAGTGAGCTGTGACCGTTACGTTAGGGTATGCTAAAAATACCAAAAATAAACAAGAAGATCAAACTG:1 - chrX 10083179 5' + Bica 140 1 80.00 ACTAGATTCGTTCAAAAGTATGTAACAGAGACCAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGGCCCCTGTTGCCACGCCCACTCGAACGCCCACATTTTTGAAAATTG:1 - chr2L 22211545 5' + INE-1 254 1 74.26 AACAAAATTAAATTCAATTTATCCATTTTGCATAACCCAATACGTTTTATTGCCATAGTATAGAAGACTATGTTGAACATAGGCAATGCCCACATGTGTGT:1 - chrX 22689629 5' + 1731 4322 2 66.34 TATTTAATAAGTAGAGATTTCTGCTATTAAAGGTATTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3R 20420894 5' + blood 3 2 76.00 CCACCACTAACTGAGTAGCTGCCAGTTAAGGAGCTCGTATATAAATATATATGTCGAAGAGTCATGAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTAT:1 + chr3L 18122299 5' - invader1 3983 2 55.45 GCGTGCATCTTCTCTTCCCGCCCGAGAAAAGTGTGAACTCACGAACACACGCAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chr2L 16683699 5' - P-element 2862 1 56.44 TTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2R 9871040 5' + roo 8707 2 68.32 TTCTTTTTATCAGATTGGCAAGATATAGTCAAATACTACTTACTTTTATAAAATATATGGCCAATGATACATTTGGATATGAAGTCTCTTTGGATGTTTTC:1 + chr3R 4976103 5' - F-element 4382 1 80.20 TAATTATAGTAGTATATGACAATAGAAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTG:1 - chr2R 5924421 5' - jockey 4741 1 39.00 GCATATAACAGACGAGATAGAAGCTCCAAAGGACGAAGACAGTAGACAGGCGACAGGAGCGACAATGGATGACGCGTAGATTGGTACGTGATGATCCTCG:1 - chr2L 12807031 5' - Tirant 8035 1 68.00 TATGCGATAAGCCCGACTATAAAAAGCGAGTGACATACCCACACACTCGCAGCAGCTGACGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1 + chr2R 19087411 5' + Tabor 6865 2 68.69 AATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr3R 9278396 5' - roo 9040 1 58.42 GGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGG:1 - chr3R 20094494 5' + Max-element 55 2 79.21 ACCTCTTATGGAAGCCTATTAAACTAATTATGCCCCTAATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTA:1 - chr3L 17444328 5' + I-element 487 1 62.38 TTTTTTTTCGAAACTGGCTCTGGAGGAGCGGCTTTTGTTATCGAATGCAAAACTATTTAGCCATTGCTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr3L 12438093 5' + I-element 12 1 66.34 AAAAATTCGTTTGCCAAAATATTTTTTAATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chr3R 15578979 5' - pogo 2055 1 78.22 ATGCAAGTCATAAATGACATAGGGCCGAAATTGATTTCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr2R 17963218 5' + blood 19 2 60.40 TAACTAAGTATACCAGCATTTGTACAGCGAATAATAGCGCAAAAACTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTC:1 + chr3R 19505511 5' + mdg3 5257 1 66.34 CGCTTTGAATGTATAACCACAAGGCATCGGGGCTAATAATCGAGTAGACGCCCCACGAAGCCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr2L 20567802 5' + 297 13 2 67.33 AAATAACAATACTTTCTTTNTTGATGCCCAACGTAATTTAATTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATAC:1 - chr2L 12058229 5' + copia 4957 2 59.41 CGTCTTTCAGAATTGCAAGAATTTTGCAATTAAGTATCGAATACCTAATAATTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAAT:1 + chr2L 20118375 5' - copia 230 1 59.41 CTATCAATAAACCGTTTAGAGTAATAAAACACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACAT:1 - chr2R 16185125 5' + 17.6 7 2 72.73 TCAGTATTTGCTGAAAGTCAGGGCAGTACTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chrX 17494672 5' - 1360 3341 1 77.23 TATTATGAGAATAAATATTATTATTATTATTATTATTTTTGGGAAGCCTGTCCTATTGAGCTGACCTCAAGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTG:1 + chr2R 22558142 5' + 1360 443 1 61.39 AACAGCATTTTTCCACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr2L 18248055 5' + blood 29 2 59.00 CGTGTCTTAATCACTGAGAAAAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3L 15037910 5' + roo 8691 2 55.45 AGGGTATCCCTTTTGTCTGAACCCTCAGCTTTGAGCCGCTCTTTAGTTTGGGTTTTTCTGATTTTAACTTAAACTCATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATG:1 + chrX 4166349 5' + I-element 5291 1 73.27 AATATGCCGCAAAAAGGGCAAACATTATAAGGAGGTGGCCCAACACCTGCCGCCGATCCTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAATCGGAACTATAGATAAG:1 - chr2R 15063261 5' + Rt1a 4763 1 65.00 TAATTGTTATAATATGGCCNTGAAGATAGTAATTTGCCCTTTAAAAGTAATTTAGATCTGAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 + chr2L 12866866 5' - mdg1 7446 2 66.34 AATCGAAAGTAGACCCAACAAATTTGCACGCACCAAATGCAGGTGCAAAAAACTATGCAAGCCTAACTAATTAGAATAAGCATCAGTGTAAAAACTAACC:1 + chr3R 19288722 5' + GATE 8365 2 69.00 TTACTCCTGCACATTTAAACATTAAAATAAAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr2L 7175547 5' + blood 7029 2 61.39 CATGTATCTAAAGATCCCTGTTTAAACCGTGCACTATGGGTAAAAAGCCGGAAATTTTGGTATTAATGTAATTTTTTTTGTGATTGATATTTTAATGCTCC:1 + chr2R 4547803 5' + transib4 49 1 70.30 GTTCTCGATCCGTTTCTTGGTACTCTCGTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chr3R 21884192 5' + mdg3 5302 2 72.28 TACAGCCTGACCCCTGTAAATTTGACTGAATTTAATTAATTAGCATTACAAAAAAGCTGACGTCAATCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACA:1 + chr3R 32008339 5' + Quasimodo 7068 2 70.30 AGATTGCCTTTCCTTGAGAATTCTGCCAGGAAAATACTTGTGCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAGATCTCGACGTTCATACGGACAGTCGGACA:1 + chr2L 10902247 5' - INE-1 124 1 62.38 ATGGGATTTCTATACCAGAAAGCTTAATGACTGCAATGCATACTCTTTAGGGCCTCAACTGTTTAATATTTTGACTACTCCATACACCTTGATATGGATTT:1 - chr2R 8073767 5' - invader2 4670 1 67.33 CTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chr2R 5214967 5' + F-element 39 1 53.47 AAGTTAAAGTAAATAGGGTTTTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 11916625 5' - roo 9046 1 53.47 AACATAATTATGCGCAGGGAAGTAGGCAACGTTTTTATTTGTTCACTTTCCCCAAGTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 + chr3L 20049594 5' + jockey 4762 1 76.24 GTCACATGATGTGGTAAGAACGTATTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 + chr3R 6947348 5' - I-element 5305 1 78.22 GTGCCCTGGAATCCCTGCTAACTTTTTGGCATAACAAGTCGAATTTGTTGTAATTAAAAACCAAGAAACATACTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTT:2 - chr3R 26597432 5' + mdg3 5259 1 74.26 GACATATCGATCTGAAGCAAGTCCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTACCTGCTTCG:1 - chr2L 13427034 5' + Doc 389 1 75.00 CGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chrX 20361993 5' - 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chr3L 27729145 5' + 3S18 5640 1 75.53 TCAACACAATTATGGTGCAACCTGCGGCCTCGCCCCCACTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACATTTACAC:1 - chrX 7862809 5' + accord 187 4 77.65 TCACTCGAAACTTTCTTATTGCATACTTTCATTATACCTTTATTATTTTGAAGGGGCGGACACGATGCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 + chrX 15255325 5' + Tabor 10 2 69.31 TAAGAATTTAACTTAACTTCGAAACGTGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGATA:1 - chrX 16287334 5' + F-element 186 1 69.57 GCGCGTGAGGCCGTAAAAAAGTAGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAA:1 - chrX 6273334 5' + Stalker3T 61 2 80.20 GGCCAGCGCTAATGAATTTAATGGAAAGCATTTTCTAATCGAATTGTGGAAAACAATATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr3L 9910448 5' + 297 9 2 69.31 AAGCCGCATTTTCACTAAAAGCTGCTGGTGCTGCAGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCT:1 + chrX 17556171 5' - F-element 404 1 65.35 ATTTACTTCCTCATTGTTTGCCGATGCTGCGAAGAGAGTCGGCGCTCGTCTTGGACTTTTTGCCACTGAGCGCGCAATTCGCGGTGGCTCATTTTAGAACG:1 + chr2R 18923347 5' - Doc3-element 212 1 80.20 ATTGTCTTCGTCTTTTCAGTTGTTATCTTCTTTGGTCAAGTGTTGGATCGTTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGTGTGAAGATTTCCAATAAAGA:1 + chrX 7563362 5' - Tirant 8417 2 50.50 ATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTT:1 + chr3L 27356076 5' - Tc3 1686 1 62.38 GCTGGGATGTTTTCAGTTACTAGATGGTGTAAAAATGGGTCAGATTGTGCTTGAAAAATCTTTATTTATAAATAAAAAACATATTGTTCACACATGAACAC:1 + chrX 7797617 5' + roo 8660 1 69.31 TTTGGGCACGCAAGTGACAACGGCAAAGCAAAATCTAGAAAACAAATCTTGTGTGTGAACACACACACACCCACATT:1 + chr2L 11744388 5' + accord 182 2 87.01 CAGGGCAGGCACAGACAGAAGTTGAAGATGGTTTATTTTCAGTAGTAGTGGAGTTGTAGTAGATGAGGAATATATATACTACAACTCGGCCGTCCTGACA:1 + chr3R 31882033 5' - mdg3 5236 1 79.00 GGTTCCTGTTGCAGGGGCGNTACAGGAGGATGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCG:1 - chr2L 16003321 5' - Quasimodo 6980 2 69.31 CAGGCCGCTCATAAATTGATTTCGATATCAATTGCTGAACTTTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr3R 7469957 5' + Doc 42 1 58.42 AGTGGCCAGCGGAAGTGAACTGAGCTGTTCACACATTAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - 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Tirant 8473 2 60.40 CTTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGATG:2 + chr2L 23286584 5' + Tirant 416 1 59.41 CATACGCTTGTGCCTAAAAATAATCCAGGAAAGCGTAAGGAGCCGCCACCCAATGCACACTGGTTTTTTATGTGTTTTTTTTGGCAGAAATTTGAAATGAT:1 + chr2R 6482831 5' - transib1 2121 1 57.43 TTTTTAAAATAATGGTGTTTTTCCTAGAAACATTTAAAGCTAATAGAAAAGGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 + chr3L 13096941 5' + I-element 31 1 53.47 TTATGGGCTGTCATTTATTTGACCCGACTCACTCACACATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 + chr2R 21433144 5' + HMS-Beagle2 6916 2 58.42 GACAGGAAAAAAATGGGGGGTGGGGCAGGACACGAGATATAGAGCTAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chrX 7996375 5' + hobo 26 1 50.51 AAGGTCGATATGGAATCGCGGATATTGATCTAAGAAGATAGCTTGTTAGTTACGATAAAATATTTCTTATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:2 - chr3R 17482101 5' - copia 248 1 63.37 GAGTTTCTTCTTAGATTACGATCCTGTAACTTGAGAACTACGGAAATTTGATTTTGTAACACCACCTTTGGCATCAATAACTGCTTGAAGTCTTTTTGGTA:1 + chr3R 25086210 5' - Bari1 1343 1 52.48 GTGTTTGGGCCGGGTTTGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCC:1 + chr3L 16282357 5' + gypsy5 26 2 56.00 CAACAATTGTCGCGTGTTTGGGCCGGGTTTGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTA:1 + chr3L 16282344 5' + gypsy5 6953 2 68.32 CTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTAT:1 - chr3R 4474214 5' - copia 5067 2 85.15 AAATAAATAAACCCAAATAACGAATATAAATCAATGTCGAGGCTCACAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCA:1 + chr3R 24085302 5' - invader3 249 2 53.00 TATGGGGTTTTGTACCCTCAATGACGAACGGTCTTAAACATTTTTTAGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTCTTTTCTTTGTTTTACAATTGCATCTTAAATTA:1 + chr2L 11309245 5' - mdg3 5064 1 71.29 CGCAGCTCATAGTTTGGATTTCAGAATGGTGATGTCTCCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACA:1 + chr3L 10043575 5' + G6 1917 1 62.38 CTGTTTGCCACGCCCCACGCCGCCACTGCCACCAAAATGCAGGCGCTGGCCTTTATCTGTTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3R 11321098 5' + hobo 14 1 65.35 TTCATTCTAATGCACAAGGTGGATAAGCGACTGGAACGAATTGACAACGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:2 - 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mdg1 7451 2 70.30 CTGTGTAATTCCATTGCTCNTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr3R 4971402 5' + F-element 43 1 58.42 AGTCGGCTTGGCAAGCTAGCCCTAGACAATCTAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1 + chr2L 109702 5' + 1360 45 1 72.28 TATTATTAGTTTAATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAATTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 7099654 5' - roo 9044 1 58.59 CTTTTTCATATTTTTTTTTTAATATCATTTTTTTTTTT:1 + chr3R 32042403 5' - Tc3 1570 1 89.47 CAGGACGCGTTTGGTCAGTTGGCTGGTTTCCGTTGCACACGCGGCGTATGCGTAATATGTGCACATGCAAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAA:1 + chrX 20616269 5' + I-element 407 1 73.27 AATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAA:1 - chrX 8027467 5' + Juan 38 1 60.40 ATCTTATAAAGTATTTTATCCATATTTATCGGTCTTGCTCACCAATGCTTATGACTCCACGAAATTAACCCGAACGCACTGAGAGCGTATCTCTCAAGCTC:1 - chr3L 15344027 5' + Doc3-element 433 1 71.29 CAGCAAGGATAACTGCCTTAGCGACGACAATGGGCAGAACTCTGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCAC:1 - 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roo 387 2 56.44 CACAGAGAAATAAATGTTTATCTTTTAACAATATTTCCTTATGCAGTATTTTATGAGCAGCTTTGAAAGATATCACTAGTTTTTAAAGTTTATTTATAATA:1 + chr2R 11571096 5' + hopper 180 1 57.43 AGGTGATGGCGATGCAAACTGGCCCCGCCCCTCACCACATTTCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2L 20238701 5' - hobo 2907 1 58.00 ACAAAATGCATATTTACTGCTTGCTATAGAAGGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 + chr3L 3880975 5' - blood 352 2 68.32 GGCCAAATAGAATCGAGCGCACCAGATGGGGAAAAAAAAAGGAAAAAGAAAAA:1 - chrX 12921756 5' + Doc2-element 234 1 86.79 ATCCCGGAGTGTTTTTCAAATGGAAATCCGCGTCGCTCCCAGTACTCATAGTGGCGCTTCAGATAGAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCT:1 - chr3R 22698490 5' + G2 2981 1 70.00 GCGTGACAGGACAATGCAATTGCTCTGATTTGGTTGCAGTTGCAGATGATAATGTTGCACGTAGCCTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGC:1 + chrX 12269425 5' + pogo 178 1 66.34 TATGACTGGATGACTAAACCTTTGTAGATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3L 20411807 5' + roo 49 2 74.26 GTGCCGCCTGTCTCGCTCGCACTCTCCTTGGCGCGAGGGGAGTTTCGTTGCGAAGGGAGTGGAATGGGAATGTGCCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 - 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chr3R 12199841 5' + jockey 25 1 59.41 ATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 + chrX 15546165 5' - blood 7340 1 73.27 GCCTCGTTTAAGCGAAAGGAAAACAGTTCATATTTCTTTGTGTTAGCGTGGGCTATGATGGCGAACAGGGGGGCTTGGGAGCGGGGACACAGCATTATCAT:1 - chr2L 18192537 5' + Rt1b 4750 1 53.47 CGCCCTGCGACGATCCCTGGGATTGGGCAGGCAGCAGCTGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTG:1 + chr3R 29794659 5' - Tirant 8408 2 62.38 AATCATTTCATAATCATATTTTATTCTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTT:1 - chrX 8727907 5' + X-element 45 1 68.13 CGGGTCTCGAGAAGGAGCTGATCCGAAAAATCGAAAAATCAGACCACTGTACACGAAAACACAAGATCAAAACATTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCA:1 - chr2L 15360715 5' - Cr1a 360 1 66.34 GTCTAAAATGTACATCACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGA:2 + chr2R 6779776 5' - 17.6 7382 2 68.32 TTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTG:1 - chr3L 5241173 5' + Ivk 34 1 61.39 AGTGTGTGTGAGTGCATGACCCGATTCGCACACGCACACACACACACATACAAACATGTTTGCATGCGTCAAGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACC:1 - chr3L 13374793 5' + Transpac 4921 2 78.22 AATTTATAAGTGCTGCTTATCTTAAATCGTTGTAGACTCATCGTTAGGAGTTGCATGAGCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCA:1 + chr3L 8453549 5' + Cr1a 4204 1 64.36 TGGGTGGTTCGGGTTAAAGAACGTATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTACAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr2L 9260342 5' + 297 32 2 70.59 TTGAAAAGCTGAACGTTAAATGCCAGGCGCATATTAAACATCAATTATTTATGCCGAGCGATAAACGGGTTTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 - chr3L 13895455 5' + hobo 4 1 73.27 CAGCAGGAGCAGAAGTCCGAGCGGCGTCATCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCA:1 - chr3R 24962426 5' - invader4 256 2 71.29 TCCCGGCTTTTTATCTTCGCCTTCACCTTGCCGCAGAAGTGCAAAAGCCAAAAGGTTCACTGCCTTTGAAGAAATTACAGAAATTACAATGCATGCAATTT:1 + chr2L 2692845 5' - Transib5 183 1 56.44 AGATAGTCAGCTAGTCAGANGCAAAACCTCCTCCTTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACC:1 - chr2R 14997917 5' + McClintock 5986 2 66.34 AACAAAATGTATTATAATGACTCTTTTTTTTTAAAAACAGGTCAACTAGACATACTTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATAC:1 - chr3R 556450 5' + Juan 4139 1 67.33 AGTAAGGTGAAAACTTTTGCAAACAATAAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 17660530 5' - roo 359 2 74.26 TAGCTTCCATCTGGTTTTGTCATAAGTGTGTGCAGAGCATACCCCCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 - chr3R 19963453 5' + 1360 30 1 56.44 ATGCCACACAACATGCACATAAAATGATTATTATACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATC:1 - chr3R 20332915 5' - jockey 4950 1 67.33 AGGTTATAGAACGATTTTTTAGAAAGATTTAATTAATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTAT:1 - chr3L 15125932 5' - Juan 4167 1 75.25 GAATTCTTCATGATGATCTNTAAGACGATGCAACAGCACACACTTCAAGAGCATCGATGGCTTTTTTAAAGGGACACATTTTTCAGAGCGCCTTAACTCAA:1 + chr2R 4802900 5' + mariner2 521 1 70.30 CCGCAGTGCCCCCCAAATTCTGCTCTTCGTGATGCGAGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGTGCATATT:1 - chr2L 14460180 5' - 1360 218 1 63.37 AAAAAGTTTTGCATATTTAATAAAACCAATTATGTATTTTTTATGTTTTCGTAGCTATAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGG:1 + chr2R 12138215 5' + Cr1a 4014 1 67.00 CTAGGACCAAGCAGCAGAAGGTCGGGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chr3L 18418885 5' + hobo 52 1 74.26 TGGGTACAACTCGGTTAAGTCACTGGCATTCCGAGAGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTA:1 - chr3L 886086 5' - R1A1-element 4857 1 64.36 CTGCGGGGAGATGATGAAGGAGTGCTTTCTAGAGGGTGTTGGGTGGTTCGGGTTAAAGAACGTATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 + chr2L 9260303 5' + 297 6590 2 71.29 TTTTATCACAATTCCAAGACTGGTACAGGGTGGAGCGATTTTTGAAATTATTCGAAATTATATATATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAA:1 - chr3R 7783830 5' - rover 7287 2 68.32 TTACGAGTAAACTCAGGGCACGTCGCTTGATTACATTAATTATTCCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 17660476 5' + roo 29 2 59.00 TGTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCAATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAA:1 + chr2L 21735010 5' + 17.6 6957 1 61.39 AAAACATGACACACAAAGAAGGGTGCCAGGTGAGCGAAGAAAGGTATACGAAATATACGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTT:1 + chr3L 13897109 5' + hobo 2625 1 56.44 GTCGCTGCACTTGAAAAATTATGTGTTATGTAGTTGGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chrX 6457900 5' + hobo 40 1 63.37 TTTCGTTAGGGGTTGAAAGAGCGAAAAGAAGTACTTCCTAGATCCTTGCACCCGCTCTGGAAAATAAAGTCCGTTTATACAAAGCTATACTAAAGCCCGTG:1 - chrX 12940580 5' + G4 3407 1 52.48 GACAAACGGCCAACGTGCGGGATTAAGGATCTGGCGCACCGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 - chr3L 13295280 5' - hopper 1380 1 59.60 GATACAGATACGGCACGACGTTCTTCTTTTGAGCGCGTCTGTCTGTGTGAGTGTGTGGACTCTGTGCGTGCCCCCCTGCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGG:1 - chr2L 14045895 5' - accord 256 2 68.32 GTTGTTCAGATCTATATTGNTGTTTATCGTGGGAGGCGGCTTGGGTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTGTACAGAGTGGCGAGTGGATCAGTC:1 + chr3L 20456204 5' - mdg3 136 2 58.33 ATGTGGAGAGAGGAAAAAACATTCTTAACTGACTTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTCAGGATGATTTTGTC:1 - chr3L 20513711 5' - mdg3 302 1 65.35 CTTATTGCATACTTTCATTATACCTTTATTATTTTGAAGGGGCGGACACGATGCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1 + chrX 15255339 5' + Tabor 24 2 55.45 CATTCGCGACATCTGGCAACGCCTCCAGCATGTTTTGTTCAGCTCTACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 - chr3L 20520748 5' + P-element 30 1 49.00 CCCGACACCGCCAACACCCNTACCACCCCCTATAAGCCACCCTCGAAGGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAG:1 + chr3R 19755513 5' - invader4 2650 1 52.48 CTAACAAAGTTCCACTTGGNAGGCGCTAAACTTGTCCCAAGACTCAAACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAA:1 - chr3R 15734690 5' - R1A1-element 209 1 64.21 TACATACAGTTGCAACGGTGCGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 + chrX 4792095 5' - copia 232 1 78.22 GTTTGATTAAACTTGTTAACACACATAGATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr2L 10143682 5' + jockey 57 1 75.25 ACAATGCCAAATCTTCACAGTTCTCTGATAGCCTTTAACATGTCAATAGATTGTAATTATCGAAGTGAAAATGAGTTCATCAATAAACCAAATAGAAAAAC:1 - chr3L 14903619 5' + Dm88 326 1 63.37 TGTGGTTTCAGTTTCATTTAAACTTTGCGTTGCGGACACGGTGATATGATTGATCTACAAAGGTGCTGCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTT:1 - chr3R 4250053 5' - Q-element 142 2 66.34 GCAAAAGCTGGTAGCCAAAGAAGTTTAAAGAAAGGCGAGGGAACAAGGGGTTACACACAAAGAAATATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTC:1 + chrX 17468453 5' + Doc 4486 1 47.52 CTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCC:1 + chr3R 11151838 5' - mdg3 198 2 71.29 AAAAAAACAAAAATTGTAAAATTGAGCGGAAATATTTCGTCCCGATGAGCCGTATATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGT:1 - chrX 12685343 5' + McClintock 5965 2 49.50 GCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATTCTAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTT:1 - chr3R 28666930 5' + Rt1a 32 1 63.64 TAACACACAAAAAAAAAACAAAAAAACAACAAAC:1 - chrX 12038851 5' + gypsy7 5014 2 88.24 AACAAAAAAATATGAATTTTATTGAATTGTAAATGTAACAAATTTTTTACACTTTTAACTATATAAAATATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTC:1 - chr3R 7604847 5' + jockey 4585 1 75.25 CAGATGCAGATGCCTAAAATCAGGTGTCTTGCCAGCATTCGCATATGAAATTCAGAAGCGAGAGCTTCAACCTAAACAAAACAAAAACCACTCCTACCTCT:1 + chrX 22819448 5' + Porto1 262 1 55.45 ATTGCTTTTTAAACACTTGAAAGAAGGACATGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGT:1 - chr3L 18116401 5' - jockey 4696 1 68.32 AGAGGGATTGGGTCTTCTGATCATTTCCGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTG:1 - chrX 6021803 5' + Stalker 6899 4 74.26 AAATCTAGTAGAATTAGGAAATTACAACTACCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGGTGGACTTCAACCT:1 - chr2L 8331486 5' - Max-element 223 2 68.32 TACATATATACAGTGTAGTATAACGCTGGCCCTGTTGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTC:1 - chr3L 3998523 5' - mdg3 5451 2 64.36 ATTTTCAAAAACAAATTTTTTTTTATGATTTTTGTGTTTGTTGTATGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr3R 11253181 5' + 412 28 2 53.47 GTGTGGAAGAATATGGCCAAGTGGGTGGTGGGTGGGTTGGCTCGGTCACCCGATAAGGCAGAATCCCAACAAATATACATATATTTATATATATACATATG:1 + chr2L 12531431 5' - Stalker 247 4 64.36 GGCCAGCAAACAAAGCCCAACTGCAGTCAGCTGCAATTTGTGGCCGTTTTTCAAGTTTTGCACTCGAACTTGAATTCTATGGAAGACAAGCTGTTTAATTT:1 - chr3L 9549684 5' + pogo 1824 1 74.26 CACTCAAAGCGGATATTCATACACACCAGTTACTGCACTACTTCAAAATTATATATTAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chr3R 18790062 5' + I-element 20 1 59.41 GGGCCTCCCTGCACTGGTGATTTTCCGAAGTTGTGCAAATGAAATTTCATTCAATTAGTGTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2L 1783386 5' + roo 16 2 63.37 AGTGCCATCACATCACACATTGTCGCATTATGAAATTTTTCTTCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTT:1 - chr4 1104754 5' - accord 490 2 57.43 CGACTGTGGGCAAACCAAGTGGCGTCTTAAAGAGCTCCAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATC:1 + chr3R 28909409 5' - opus 7292 2 62.38 GGAGGAGTGGCTATTGCTCACACCCCTATAACGACATCGTAAAATGAATGAGATGCTTCACATATTACGCTTACATAAGCATTGTACATACGATCTTGCAC:1 - chrX 22260223 5' + rover 6996 2 49.50 AGTATTTTATTTTTAACAANTTCTAATCAACAATTGGTTTTTATAAACATATTTCACATATATGTGTATTCGTGCTCACGGACACCACCCTCATGACCTCC:1 - chr2L 134242 5' + jockey 4757 1 76.24 GCAGGAGTAAAATCCAGTGACCACCACTGACAAGGCAAAACACAAACATGCTTTTCCATTCAGATCCACCCAAAAAGTTTTGGGATAAATTGGTAATCGTA:1 - chr3L 25237651 5' + Gypsy12A_LTR 168 1 63.37 ATGAAAAGCAATTAAAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 - chr2R 672833 5' + F-element 42 1 57.43 TGAGCGCGGGTTCTGGATTNTGTTCAACATAGCAGAAAATTATGAGTTAATGGATTTTGTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr3R 23638194 5' + pogo 14 1 64.36 CTGAAAAGAATGCTACCGAGCACTGGAAACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCA:1 - chr2L 11712878 5' + Quasimodo 42 2 74.26 CAGATTCTGCGCTTTGTGCACTGTAAAAAATGTATGTGTGTTATGTTATGTAAATGCTTACTGTTTGATTCATTGATCATTATTAATATTATTAAGATTAT:1 - chr2L 3845164 5' - mdg1 7076 2 60.40 ACATTTATAATTCACTTCCCTTCCGTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGC:1 - chr2R 8522802 5' + mariner2 108 1 68.32 ATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCT:1 + chr3R 11151818 5' - mdg3 218 2 53.47 AAATCACTCACACACGTATCGCAAAATATTTATAATTTAATAATTAAATCTCACATAAAAAAAATTAAAAACAACAAAAATTAAAAATTAAAATCATC:1 - chr3L 25342858 5' + TAHRE 158 1 74.49 GATATCTTGGTGAAGCCAATTTTTACAGGCAATTAATTTCTGCCAAATTGTAATAAACCAATATTTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1 - chr2L 7175631 5' - blood 346 2 56.44 TTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGCAAGTCGTTTTCGTTATTTCGAATGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATAATGAAAAAG:1 + chr3R 6729439 5' + Tc1 1572 1 60.40 AACGGACGGAGAATAAGTGCATTATAGTGGATGTAGGGGATTGGAGGAGATGCGAAGGAAGCAGCAGCCGCAAAAATTCCCGGACTATTTGGAGGAAGACG:1 + chr2L 7580140 5' + Osvaldo 379 1 63.37 AATGCACATGTGAGTGTCTAATTGCCACCCCGTTGTCTGCTTTTATACAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGGTAT:1 + chr2L 13509922 5' + Cr1a 498 1 69.31 GCTGGCAGTTTTTGGCATTCGGTTGTACTGCTTTTGGCAGTAAATGAAATTAAATCGATATTTCTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - 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roo 394 1 65.35 AAACTAAAACCTCCCAACTGGTTATAACTGAGCCGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGA:1 - chr2R 18723116 5' - HMS-Beagle 7017 2 55.45 TTTTTATTTTTATTTTTTTTTTTACTTTGCGTTTATTTATTGAATCTTCTTGAACTAGAACAAACAATAAGTATAAAAATCTTAACTATAACAAG:1 + chr3L 5569643 5' - F-element 4614 1 83.16 TCCTACTACTACTCCTACANCCTGTGCAACTAATTTAGCCCAAAGTGCACTAAAATTAGTATACGATGGCAGTGCTATTAATCTGAACAC:1 + chr3R 25239210 5' + HB 1622 1 68.89 GTTTATACATAATAAATGACAGTAGATAAAGCCAAACCAAATCTACACAAAAAGATTCCGCTGGGCTGCGCAAAACAAAAAATTAAGAAAATTACAAAAAT:1 + chrX 9471792 5' + HB 320 1 71.29 ACTGGATCCCCTCCGAAAATCCCCAGTACGTGCCATTCTGTTTGGTAAAGATCCTAACTGTGCGTATGTGTGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chrX 15287834 5' - hobo 2933 1 69.31 CCTTTCGTCCAGTTTTTGCCCTTCAGGACCCCAGTCAAAGTGTAGACAGAAAGCGAACCGTCGTGGAGCGAAGAGACAGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTC:1 + chr3L 6809415 5' + Doc 439 1 56.44 CAGATAGCACACGGACCAANGACTAGTGGTTATAATCTAATTAAGCCTTAGAAGTCGTAACCCTCGTAACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAA:1 + chr3L 9873616 5' + Cr1a 4253 1 63.37 ATCATATTGCAGCTTATTTGATTTTTATTTCGAAAATAACTAAGTGAAATCCAGATGCTTAAAAAATTTTGTCTCTCTCATTTTACAGTTTTTAATATATT:1 - chr3R 30555909 5' - 412 347 2 69.31 AAAACAATGCGGAATTAGCATACGGAACATCCCTCGCCAGTCCCCAGGATTTTGACGCGACTCACGACCAGCTGTCCCAAGCGCTCCAAATGGACTTGCCG:1 + chr3L 2012712 5' + BS3 172 1 69.31 GGTTTTCGAATTCGAGGCTGGGCTGCTTGGCCAGCAATCGTACGAATGTTTAAGAAAATAACTAAATATTTACCGAT:1 - chr3L 4382253 5' + mariner2 835 1 61.04 ATTGTTATAATATGGCCATGAAGATAGTAATTTGCCCTTTAAAAGTAATTTAGATCTGAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:2 + chr2L 12866868 5' - mdg1 7444 2 65.35 AGGAGTTTTTTGGCGTGGCTCAATTCGATTTTCCCTCGCCTGCTTCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTATTAGCCGCTA:1 + chr3L 8513636 5' - invader2 4778 1 54.46 GCGTCGTATGCGCAATAAATAAATCTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCT:1 + chrX 15263448 5' - invader3 5410 2 77.23 AATGTCTAGGGAAACGATTTAAGAAATGTAAAAATACAGCGTGCGGCATATAATTATTTATTTTCTAATTTCCTTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAG:1 + chr2R 7394112 5' + mariner2 30 1 79.21 CAAAATTCAACTCGTCAATGTCATCATTGCCATTGTGCATGATTTTATGATGAAAGCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chr2L 8622848 5' - 297 379 2 66.34 TAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:2 + chr3R 7869114 5' + 297 6609 2 53.47 CGTTTGATGTTAATTCGATCGTTAAGCGGACTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chr2R 21351026 5' + opus 7155 4 69.31 TATTTGATATTATACTATANTAAGTAGGGTAACCATCCCAGAAGGGTCTGTCCTTAAAGAAGGATCTATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3L 20411883 5' - roo 401 1 69.31 GAAAGTTTTTATTATTTTCATATACAAAACTGAAAAAAAACTGAACAATTTGGGGCAAGCGTAACAAAACGGAGACGAAGAGTCATAAAGAACAAAAGCTA:1 - chr3L 3402470 5' + HeT-A 270 1 67.33 TTAAAAGGGATCGATTCTTCCCCTTGGCATTCCTCCCCTCCCTTTTTAAAGAAATGACTTAATATATGTATTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGAGAT:1 - chr3R 13934251 5' - Stalker 6785 2 58.42 ATTTAGCAACTTCTTCTTATATTCTGTTAGTTTTCATAACAATACTGACATATTTTCAACTGAATTATATTTTTTGAACAATTAATTTAATTTTCTTTATA:1 + chrX 13522142 5' - NOF 3958 1 88.12 TGACTGACCCACATTTGGGAGAGGGGGTGGCGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr2L 4924528 5' + hobo 43 1 68.37 CCCTACGATTAAATGCAGGAACAAATCGTATACTCAAATTGTTTTTAAATTTAATAGCGGCTTAACACTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACAC:1 + chrX 16893383 5' + accord 167 2 74.26 TTAGACAAATTACGAAAACATAACTACAAAGACGCCGAGTAAGGTGAAAACTTTTGCAAACAATAAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTT:2 - chr3R 17660567 5' - roo 397 1 65.35 CATGAGCTGAAACATTATAACTTTCGAAAGCATCATGACTTCTGCAAAAAGAGCAAGACGAGCGCCGACTCTCTTTGCAGTGGAACAATGCATACTT:1 + chr3L 568996 5' + Doc3-element 282 1 55.67 GGCTTTTGTCTTGCGATTAGCCTGGAATATTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3R 23640985 5' + 297 41 2 73.27 TTAAATCTAAATAATTGCAATATTCGAATATATATTTGGTAATCTATGCTGTTACTATTGTAACAACTTAAATACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAA:1 - chr2R 16206510 5' + Juan 4115 1 49.50 TATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 9278379 5' - roo 359 2 75.25 AATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr3R 11052114 5' + blood 7057 2 75.25 CTGGAAAATAGATTAACATTAAGAATAATGTGGCATTATTTCGCATGTCCGCTTTCATTTCGAGTGCGTGTCCTGGTTTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2R 10507893 5' - accord 7029 4 76.24 AAAACTCACTCACTCCGGAAGTTTACGATGATGTTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTT:1 - chr2R 23519254 5' - jockey 4935 1 79.21 CCCACAAGGCTCTGTCCTGGGACCGCTGCTCTCCTGCTGATGCAGTCATTTATACTCCTGGAGGAACCCCTCGAGCACGCTG:1 - chr2R 4932206 5' + G7 117 1 70.73 AAAATTAATGGCTTTGGTAAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAA:1 + chr3L 10367271 5' + P-element 438 1 28.71 TTTATTTCGTAAACTACTTGATAAAACCAAACACTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr2R 10353332 5' + blood 7029 2 59.41 TATTTTCAATAGACGACCANAAACTATAGTCTTTTCGTGACTGATAAGGTCTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 + chr3R 24542017 5' + 1360 25 1 53.47 GTAACCTGCTGCCCTTGGGTCAAAGTGTAATCGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAAC:1 + chr2L 11706928 5' - Quasimodo 247 2 68.32 AGCTCGTAGGCATCTGTGTNTGTGTGTGTGTGTGTGAG:1 - chr2L 13731805 5' - Quasimodo 36 2 63.16 CGGCTAAACTGCACAAACAAGCTGAGCTTCATAGCTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGG:1 + chr2R 6107737 5' - roo 9030 1 68.32 GTGCACAGCAATGTTTATCNTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 - chr2R 9631755 5' + F-element 53 1 69.31 ACTGCTACGACTCAAATCTNACAGAATGTGTCACTATGTTTTTTGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAG:1 + chr2R 8245455 5' - 17.6 7151 2 63.37 AAAGCAACCGACGTCACAANTAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGAGGAGACG:1 + chr3R 19987388 5' + Doc 14 1 60.64 ACTCAAACACATATGTACAGCGTGTGTGTGCTGGTGTTTACCCTTGTGTCTGTTTTTGTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACG:1 - chr2R 23116281 5' - jockey 4982 1 56.38 CAAACTAATCGCATTAGCGAACGAGAGCTCTTCTTGGGAATGGGACAAAGTGAGATGTGGGTGTGTGTGTTACTGGGAAATGTTTGCTTTTCCTTTTTCCA:1 - chrX 18732896 5' - Penelope 548 1 64.36 CTAGGCGGGGTGCATTGAACCAATCGAAATTGAATCGAACAAATTAAGCAACATCAGTCCTAAATTTCAATGTTTTTCTGTAAAATAATTTAAATTGTTAA:1 + chrX 2358789 5' + HeT-A 5810 1 63.37 TGTTGGAAAATAGTAATTAATATTTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 - chrX 14173040 5' - 412 442 2 75.00 TCATTTTAAATAAATGGATACGCAGGTACTTTGAAACGAGTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 - chr2L 7937282 5' - jockey 4951 1 60.40 TCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCAT:1 + chr2L 8959931 5' + Ivk 5125 1 62.38 TGCCCAAATAAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 - chrX 22574705 5' - 297 358 2 64.36 AAGTTCTTGACATTTACTCCACCTCCATCAATTAAAAATTGCTTAAGGGCTCCATTTCGGCGGACTTTGATTGATGTTTACTTTTTTTCATCTGAATTTCC:1 + chr2R 10189547 5' - Doc2-element 4521 1 67.33 CCTCTTCACAATCCCCCACCATTTCTCACTCGAAATATTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATG:1 + chr3L 3596681 5' - copia 217 2 64.36 GCCCACACAGTACGCCCCTACGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chrX 10286167 5' - roo 9019 2 78.22 CCGGAAAAAGAAAGTAAAAAGGCAGAAAATGTTTAGTTTATATTTCTAGAGCGAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGGGATTGGTATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chrX 4937507 5' + Doc 6 1 77.00 TTAAAACTCCACAAACCTGGTTGCGGGGAAGCGGCACGACGTGCATCTGGGCTACACTGGTATGTGAGCAACTGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTTTT:1 + chr3R 2446812 5' + G5A 2552 1 69.31 CAAAAATTGGTAATTTTTCCCGAAACTGTAGAACCATCCTTAAGAGAAAAGGAGAAAAGAGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGCCATC:1 - chr3R 1015039 5' - copia 465 1 60.40 GCTGAAGGCTAGTTAATACTTTATACATATATATATAGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAA:1 - chrX 17104454 5' - 297 339 2 73.27 GGAGCCAATATACATACATATACATGTACATATACATCCACGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr2R 15349498 5' - P-element 2850 1 43.56 ACGGCCATTTATTTGACTTNGGCAAATGCGGGCTTATATATATATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGA:1 - chr2R 21433213 5' - HMS-Beagle2 285 2 63.54 CACAGAGCTCCGAAAATTATACTACGCTTTTTATCCCGATTGATTGACCTGGCCTGAATAAATTCAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACC:1 - chr2R 10670056 5' + jockey 4774 1 65.35 AATTAAATGCCGCACACACACACACACACACATAAATTA:1 + chr3R 27805178 5' + Quasimodo 39 2 76.92 CGAATTTTATAAAACTATATAGTAAGTAGTTTATTTATTTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTT:1 - chr3R 27169509 5' - 412 478 2 61.39 CGGGGCGCCAAAAGTTTTTCCAACGTTTCGTTTGGCTCGGTTTGGTTTGCTTTGGTTTCGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:4 - chr3L 17186891 5' + Tirant 16 2 65.35 AGAAGTAGGCAAATGTGTATTGTCTCGCAATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTA:1 - chr3L 8039396 5' - hopper2 1561 1 71.29 TAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1 - chr3L 6033569 5' - 412 435 2 81.19 AACTTTCGCTATCGAGAACGCCGCAAACCCCAGTGTGGATTTGCAGGTTTTTGTAGCAGTGTACCGCTGACCGGACTCGTATATGTCGAAATTCGCGCAGC:1 - chrX 19457244 5' - Rt1a 41 1 77.23 GTCGCAGTGTACTATACCGAGAGAGAGTGAGAAAGAATCGTGGAATCGGAACACGGGCGATCAGACGGCCCGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 15024346 5' + P-element 5 2 74.26 TGCTCCACTGGTTATTATTTACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:2 + chrX 17858016 5' + P-element 56 1 22.77 TAAATATTTTGCTATCAATTACAATAAGTTTAGAGTGACATCAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGG:1 + chr3R 20422230 5' - blood 134 2 56.44 GCGGACGATGTGAGGAAGACATTGCCGAGGGTAAAATATTATAACAAACTACCTTTAAGTCGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr2L 13186341 5' - pogo 2089 1 67.33 ATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAG:1 + chr2R 4860116 5' - micropia 36 2 64.29 AAGCTTTCAATGTGCAAGCTTGTTGGGAAATTGCGCCCTCACTGTGTATACATACGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 - chr3R 23641065 5' - 297 381 2 70.30 TAATTTAGTCGGCTTGGCAAGCTAGCCCTAGACAATCTAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGCTTTTTT:1 + chr2L 109696 5' + 1360 24 1 58.14 TGGTTTAACAAACATACTAACGTTATTTCCCTGTTAAATGGAAGTACTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr3L 7307283 5' + hobo 29 1 50.50 CGCCCTGAACTTTTTTAATNACGAATAGCGAATAACGATTTTCCGCATATCTATTTAAGCTGATTCCTACGTGTTTAAGTTTTGTCTTTCGTTTGTGTTTA:1 + chr3L 2012930 5' - HMS-Beagle 291 1 58.42 GTATTACTTACATTGAATAAGACATATCCCGAAAAGTATGCAGCACTATTTTGGTTCGGAAGATACAATGTTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3R 5595045 5' + 1360 4 2 75.25 CAGAAATGTTGTTAGTGGATTTCGAACTGCACGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTT:1 - chr3L 16282417 5' - gypsy5 363 2 69.31 ACCTATTGACACTTCTAATCATAGGCCATAGCCATCTACAATTTGCAGTGAAGCCAAATCCGGGTTTGAGTGTCACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGT:1 + chrX 10886857 5' + Cr1a 4042 1 65.35 ATCCCGCCTACAATTACCCATACGCCACCACCTATCCGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATC:1 - chr3L 16725786 5' + Ivk 5057 1 69.31 TCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 + chr3R 11052106 5' + blood 7032 2 60.71 ATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATACCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGA:1 - chrX 22824227 5' - Gypsy12A_LTR 2252 1 45.54 GTAATTTACAAAGTTATCAACAATAGTTAAGTAGTTCGTATTGTGCAGCAATGGGTCTTCTAAATTGGATTTCAAGCTATCTGAATGGCAGGACACACCAA:1 - chr3L 18693420 5' + Q-element 417 2 58.42 ATATCGCATTACCGAAAGCAAGCGCACATGCGTTAATAAACAAAATCTGTTGCTAATGTACAAAATAAGTTAATTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTA:1 + chr3R 17342136 5' + 1360 3379 2 78.22 AAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:2 - chr3R 19449491 5' + hobo 49 1 78.22 AAAAGGGTATACTAGATTCGCGGAAACGTTTCCGACAATATGAAGTGTATATATTCTTGATCAGGAATATCAGGATATTGAGATCTCAGGAACTATAAAAG:1 + chr2R 4618506 5' + INE-1 148 1 53.47 AATCGATACAGGATGCTATACGTATAAGTTAACACAATCACAAAAACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTA:1 + chr3R 19450677 5' + Burdock 6191 2 81.19 AATGTCCGCTCATCCCTGAGCGGATAATGAGTTTGGATGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr3R 3847100 5' - P-element 2850 1 42.57 AACGCAATGGAATACAAGAAATTACGCTAAGAACAATCACAGGTGCTCCATGGTATATGACTAATCATGACATCCACAAAGACATGGAACTTCCCCTTGTT:1 + chrX 291733 5' + G3 4327 1 77.23 GGGTGTTCGCTTTGCCTTCTCTCTCACACTCTCTTCCGATCCGATGCAACCGGCGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr2R 17420912 5' + pogo 21 1 58.42 CAGGAAAAAAATGGGGGGTGGGGCAGGACACGAGATATAGAGCTAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chrX 7996377 5' + hobo 30 1 53.47 TAATCATCGCCTGGTGTAATAAATCTAATTTCCCCCCCAAGAGGTAACTTTCAGATCTCCTTCGATTACCTGGTTCGTCACGTACCAGGGGAGCCCAGAT:1 + chrX 3457918 5' - G5 4473 1 66.00 CTTAAAGAAGGATCCATTTTGAAAGGATTGCGGTCGAAGCAATATACTAGTCGGCTTATTCGAGTGTACTGGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAA:1 + chr2R 10353244 5' - blood 7385 2 38.61 AGAAGCTCGCTCACATACATGATAAACATAACTTAACATTGTTGGTCCTGAAAAAATATTGTGTAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAA:1 - chr3R 24314768 5' + X-element 23 1 47.52 GGAAACATTTGAAGCACAACACTTGAAAATATTTTGTATATTTTGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:2 + chr3L 10701712 5' + roo 32 2 65.35 GAGCACAAGGCCGCACGCACGCTCTTGTCAAACGCCCACCACTTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTG:1 - chr3R 12553821 5' + hopper 36 1 56.44 CACCTTAACTATACACGTCGCCGAACGATTTGATAAGACTAAGAATGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3L 14222456 5' - roo 9043 1 56.44 GTCCGTAATGGAAAACAATGTTGAATAGCCAAAAGCCGGAATGTTCTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chrX 9774984 5' + 412 7083 2 53.47 ATAAAAAATAAGTACAATTGTTCTATGAATTCTTAACTTAACTAAGGAACTTTATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTAC:1 - chrX 21100646 5' + S-element 1678 2 56.44 TTTTTTAGATACAATATTGGTAATATATTCATTTATACATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAAC:1 - chr2R 705703 5' + 297 6879 2 57.47 TAAATAAAAATTATATATTTTAGCTTTCTCTTTTTGATATACAAAAAATCAACAATTCTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 26318002 5' - roo 391 2 66.34 TACATGTTAGCATAATAAATTTGAGTAATAATAATTTGAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 - chr2L 16851786 5' + HMS-Beagle 6830 2 59.41 CATATTTTTAAAGAAAAAANAAAATAATAGGAAAAAAAACACTTTCGATGACAGTAATAATTCCTTTGAAAATACAGTCTAATTTAAAACCTGATCCATCA:1 - chrX 15871807 5' + transib2 2498 1 77.23 AAAAGACGAACTAGAGCGANATCGGGAATGTCCACCGGAGCACCCCCAGAAAAACGCTCCACCAGGAAACGACATTTTTTCTTCACTGGATTTTCAGAATT:1 + chr3R 19448149 5' + mdg3 488 1 72.28 ACTACGAATATGCGTAGGCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAAC:1 + chr2L 4134829 5' + Quasimodo 40 2 60.40 ACCTATCAGTTCGCCATTTAATCCATGTCATTGCAATTTGCTTATTTTGTATAATTTTAGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATT:1 + chr3R 19996534 5' - Burdock 241 2 56.44 ATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chrX 13146933 5' - roo 357 2 75.25 CTCCCATGTTAACATGACAGCCTACAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 + chr3L 14594133 5' - hobo 2887 1 75.25 AGTGAGAAGGATGTGGCAGTAAAAAGAGTTGAACGGATAAATGCGAACACAAGTTCTCCACAGACTGGTGTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chr3R 19198481 5' - hobo 2934 1 74.26 GGGCCGCATCACCTTGGTGGATGTGATGACCCATTATTGGGTGAAGGCGGGAATGGCCGAAAGGGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATA:1 - chr2L 10856969 5' - Quasimodo 6936 2 70.30 AGACAAATAGTTTTAATTGTTACTATTGTCACAACTTAAATACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTAT:1 - chr2R 16207416 5' + Juan 4147 1 59.41 CAAATCCACTGACTGCCAACTGGCTGAGCCGCGAAATTGGGCAACGCCAACGCCGGATGTAAAAAACGTTTGTCCTTTTGAAAACACCTACCAGGACTTAG:1 - chr3L 17563510 5' + baggins 5024 1 65.35 ATACAAACTCCCATCACGTTAAATTATTAGGCAATCTACTAGTAACGAGTAACGAGAACTGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTA:1 + chr3R 21587182 5' + flea 4950 1 69.31 TATATTGCTCACAAACATATGGAAAATATATATACTGTAGTTAATTAGCATTCCAAAACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 - chr3L 14818772 5' - mdg1 7415 2 66.34 GTGGGGGGTGGGGCAGGACACGAGATATAGAGCTAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chrX 7996387 5' + hobo 40 1 63.37 GTCTGCAAACCTTTATTCTNTAGGCGGTAAACACTGACTTGGGTGAAAGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACATGTGCCCACATAAAGT:1 + chr2R 2510125 5' - 1360 173 1 59.41 TGTTGTGAAATAAAAGCTTTTGGGGTATATAACATTATCCTGGAAAATATGTATAAATAACTGCATGCTCTGTACTACATAGCCTCGGTTCGACGATGCGT:1 - chr3L 7055421 5' + invader6 4661 2 76.24 CCTACTGTTGTTTTTGCTGATTGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCT:1 + chrX 7517099 5' - invader2 4870 2 79.21 TGTAGATTAAAAGAGCTTAGTAGGAAATAAATTAAAAAATCCCGTTAGTTTTTCATGCTATCCTTTTTTTATTTACATTCTTGAGTAAAATCACAACTTT:1 - chr3L 23747203 5' + HB 182 1 72.00 AGATTTTTTCATATAAATAATCCAGTTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAAT:2 + chr3L 20758953 5' - flea 209 2 74.26 AAGAAACAATAACGATCAAATATTTGCTTTAAGTCTTTATCTTCATTACGTTTGTTATATGTATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCTAAGTGCA:1 - chr2R 1007212 5' - Stalker2 198 2 53.47 GGAACCTAATAAATCAATGGCCAACAGGAACGGCGCATAACTCGGCTGGAGCACTTTGACTTGGGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1 + chr2R 6847242 5' + mdg1 7052 2 65.35 GAAATCAAGCCCAGCGTCTGCATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGG:1 + chr2R 4500884 5' + springer 7189 2 77.23 ATATATGAATAATATCGAAATACAATTTCAGTTAAATAATTAGTTCTAATTACCATTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3L 21519058 5' - 1360 3370 1 58.42 GGCCATTCGCCGGCTGATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr2L 20045807 5' - roo 9042 1 55.45 ATAGCCAAGAAAGTGAGAGTGAAAGTAAACAAAAGCGAAAAGAAGAACAAGGACGGCAATCATATGAAAACCGGAAAGCTTTCAGCTGAAAGCACTCACA:1 - chr3L 18801167 5' - G5 234 1 59.00 ACAGTTTCATGCATTTCTCAATTATATCCTGATCTCCCTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 - chr2R 8077181 5' - flea 221 2 62.38 GCATGTGGTTTCCGGTTAANATGTTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCG:1 + chr3R 28287061 5' - gypsy4 448 1 76.24 GTCATTCCGTGCGGCATAGNCACCAATACTTGTGCACGACCAAAGAAGATGGCGCCCACACACATGCTTACACATTTATCATTTTTTTTTTGTTTTGTTTT:1 + chrX 11042487 5' + hopper 142 2 72.28 CTAAAAAGACCTTATGACAATGAATGTGAATGAATTATTAATGTTTCTAATAAGACTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:2 + chr3L 3757330 5' + roo 8684 2 59.41 ATAATGAATATTGACTCAAATACCATTTAGTAATTATACAAGCATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 - chr2L 6569256 5' - 297 6959 2 62.50 GAAAGTACTAGAAAGCCAGCCAACTGTAAAGAATCGCAAAATACCCTGAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chrX 17883616 5' - pogo 2078 1 56.44 TTCGAGTGCGCGTAATTCGATTAGCAGTCCAAAAGCCAAGCAAAAAATAAATAAGAAATAGAGAAGAAAATTACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAGA:1 - chrX 15378737 5' + 17.6 6959 1 74.26 GATATTTTTTAATTGTTATTTTTTTTTTTAATCTTTAT:1 - chrX 16797315 5' - Doc 4695 1 78.95 TATAATCCCCTTTTGAATATGAACTTTAGTAATCAGCGACAGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATATTACAAGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chr2L 9045504 5' + jockey 9 1 76.24 TTTGAAAGGATTGCGGTCGAAGCAATATACTAGTCGGCTTATTCAAGTGTACTGGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 + chr2R 10353261 5' - blood 356 2 49.50 CACTGTTGTTGGAGCTGGTACTCTGCTTTTGCCTACTCATGGTAGCGAGTTTTTGCCTTTTAAAACTTTAAATTTTTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chr3R 10782228 5' + Doc 6 1 73.00 CCCATGGTCGCCCGGAAATGGGAAATCATTTTGGCCAAATGTCAAAGCAAGAGCACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCG:1 + chr3L 11186637 5' + Bica 4669 1 57.43 GTTTCTCGGCTCGAGTTTCNCGTCTCTGGGAGCTTTTTCTTTCTTGTTTTCCTTGCAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCA:1 + chr2R 23195384 5' - Tirant 419 1 53.47 GTGGGCAAATGAAAACCACAACATTGCATGGCACAAATACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAA:1 - chrX 12992588 5' + I-element 4986 1 62.00 CCAAAATGAGTTTGCCCACGCCTTCAAGCGGGGGAAGTCTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr2R 5720461 5' - pogo 2065 1 61.39 ATGCAGATGTCAACTGCGGAAGAAGGGCCTGCCTGTTGCCAGTTAAGCAACAAATAAGAGCGTAGTAAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGT:1 + chrX 21183951 5' + Juan 11 1 67.33 AAATCATCTATATATCACTNGTACATGCTGGACACAACGCCTTCTGGGGTGTGTGTGTACGAGTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 - chr2R 8311392 5' - opus 7492 2 69.31 CTAAATGGTTTTGGTTCACATGAATTAATATCTCTTAATTAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACAT:1 - chrX 7036734 5' + Quasimodo 29 2 60.40 CGCTTTTTATCCCGATTGANTGACCTGGCCTGAATAAATTCAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTC:1 - chr2R 10670032 5' + jockey 4798 1 64.36 TCCAATTTCTTTCAGTGCGTCATTTGAAAGCGACTCTCAAACTGTTGTTGTCTTTTGTTAGCATAGCAGGTGTTATGTTGGCAATTTCTTCTTGAATGTTG:1 + chr3R 13818142 5' - mariner2 667 1 49.50 TGCCTGCCATTTTTGGGCCCACGGCAATTGATATAGGAGGTCGGCCTCGAAGGGGACAACGAACTAGCGGCTCAGCGTGGAGGTTTAGGGGGGCGGGGAAG:1 - chr2R 13384376 5' - gypsy5 102 2 54.46 TATACCAGCATTTGTACAGCGAATAATAGCGCAAAAACTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTC:1 + chr3R 19505519 5' + mdg3 5260 1 63.54 TGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr2L 17730524 5' + pogo 19 1 62.38 GTCGTTGAACACGTTGCGGATTTCGTTGACCATCTCCAGGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCC:1 + chr3R 4721285 5' - Ivk 5098 1 61.00 CTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2R 9871048 5' + roo 8699 2 60.40 CGTAAACAGAAGTAGAGCAAAGTTAATTGTGAGATAGCTTTCTTGGGAAAGCCAATCGGATAAGATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATT:1 - chr3L 6962214 5' + FB 13 1 66.34 TTACAATTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGATCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2L 21086085 5' + roo 8706 2 68.00 AAGTCATCGCTGAAAAGGGAATGGATAATAAAACTCAATTAAGATTAAATAAAATATTGTTGTTTTTGTTGGTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGA:1 + chr2R 18709798 5' - I-element 105 1 54.46 CCTACAGTATGCAGCCAAATAAGGCAAGTCTGCAGAGAGTTTCAACTCTCCTCATTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 - chr2R 12252906 5' - jockey 4973 1 46.53 ATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCAC:1 - chrX 734961 5' + Tabor 6888 2 71.29 ACTGTCTGGGCGTTCATGTATAAATAATTTGAAATTAATTACATGTAACAGACTACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATAC:1 - chr2L 19681495 5' + hopper 22 1 57.43 TCTTCTTTTGTTTGTTGTTTATGATTTTCCACTTTTTTGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr3R 14193881 5' + pogo 4 1 74.73 TCTTCTGAATGGCACTCGGCGCTTATCATCACGATTGTATAGGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr2L 109758 5' - 1360 3359 1 56.44 GTTATGATTATGACTGGATGACTAAACCTTTGTAGATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3L 20411799 5' + roo 41 2 66.34 GGTAATCTATAGTCTTGCTAAGTAGCGCCAGAGGGCGCTTTTCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGG:1 - chr3L 10886151 5' + invader4 2870 2 75.71 AAGTGGGCTAAAGCGAAATNAGCCACAGAAATGGAAATAAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:1 + chr2L 18247958 5' - blood 371 2 71.29 GAATAAATACCATATATTGATGAACATCTTTTTCCCGGTAAAACTTTGTTTAGATTGAAGACCTTTCTCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1 - chr2L 3699498 5' + mdg3 5262 1 71.29 GGGTTCTGGATTGTGTTCAACATAGCAGAAAATTATGAGTTAATGGATTTTGTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:2 - chr3R 23638187 5' + pogo 21 1 58.42 TTTAATTTTTCGTCTTAGCTTACAAGTGCCGAATCAACTACATGTAAGGATTAGCAATGAATATCGAAATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTAT:1 - chr2L 9260426 5' - 297 6973 2 75.25 TTTAATTTTCATAATCGATACAGGATGCTATACGTATAAGTTAACACAATCACAAAAACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:1 + chr3R 19450665 5' + Burdock 6179 2 69.31 GTACGCTCAAAAGAGGACCGAAAAGAAGCAGAGTGGGGTTGGAGAGGCGGTCACTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGG:1 - chr3L 22241406 5' - Doc 393 1 61.29 GGTACTACTACTAAATATGCACTAAAGTCAGATGGCTATGTCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCT:1 + chr2R 15074183 5' + blood 153 2 62.38 GTGTGGATGTAGCATAATTTCAGGCGCTCCTCCCACAGTTCGCAGTATGTACTTTCAGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr2R 11993971 5' + jockey 59 1 58.42 GTTGATTTTTACGAGTCTGCCGCCCAGTTTTTTGTGCTCCCCCCCGCCCCCCCCCC:1 + chr2R 15598599 5' + accord2 224 1 89.29 GATCCCGAACGTGAACCCGTGGCTATCCTGAAGTCCGAGATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr2R 11259625 5' + hobo 37 1 59.00 GTACTTCAATGGTGGAATAATAAATCGAAAATTCACTGGCCTTGAAATAAGTTTTTAAATAAAGACCGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGAACA:1 + chr3R 15541139 5' - Cr1a 4005 1 60.40 TAAAACACATTTTACTGCATTGCACACATCTAGGGCTAAAATTGCTGTTGAAAAATAAAATTAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 - chr3L 20759029 5' + flea 4768 2 74.26 CCAACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAC:1 + chr2L 14793489 5' + Stalker2 30 2 53.47 GATAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3R 28565280 5' + 412 7103 2 75.25 AAATCTCTTTAAGATGATACTTTGCAACATTTACAAATGTTTTAGTGCCCCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 - chr3R 12876384 5' - hopper 1392 1 55.45 TACGAGAAAGTGATTTAAGTACGGCGATAGCTTATCATTGTTCAATACTTAAACACTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1 + chr2R 22051453 5' + Tabor 21 2 56.00 CAGACATTTGTTGGCTAGGGGAGTGCGTGGGGCTTAGCTGAAAAGAATGCTACCGAGCACTGGAAACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGA:1 - chr2L 11712915 5' + Quasimodo 5 2 67.33 TTATGCCGGGACATACGTTTTGAAATTCCATTTCTGCGTAGGTTTTTTGTTTATCTTGTTTACAGAGATATATATGGTTTTTAACACAGATAAATATGTGT:1 + chr2L 5751213 5' - Porto1 116 1 55.45 AGGTGAGGAATAAGGACCACTTCTAAAGAAAGATCCTTTTACCAATCAGTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:2 - chr3R 5348732 5' + copia 27 2 53.47 TATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAA:1 - chr3R 11151875 5' + mdg3 48 2 72.28 ACACTTAGATATACTTCGGATTAGATTTACTGCCCATGTGCACACACACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTATAAACAAAT:1 - chr2R 9209506 5' + Tirant 24 2 57.43 TAAACTTTCTTTAATCATACTTCCCAACTATAAAAGCTACTAGGTCCATTTACACTAGCTGAGTAAAGGGCATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCA:1 + chrX 10953541 5' + INE-1 568 1 71.29 ATGAAATACATTCACCAAAAACTAAGTTGTCATCTCATTTACATAAATTAGAAGTCATAAATTTGAAGTGAGCGGAGTCACCCGGTGCTACAGCTGTCATA:1 + chr3R 31127353 5' + diver 23 2 67.33 TCCCAGAACTCGTTTTAAATATTGTGTGTACAAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr3R 16601443 5' - roo 9029 1 67.33 TACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATT:1 - chr2R 4785307 5' + Quasimodo 165 2 58.42 AATCCATCCCTGCAATTTAAGATAGTTTAGATACTGAGAAATTGATAAAGTATTGCTATATCGTTGTAGATTTATATCCGGAGGCAACGCATAAATGAGA:1 - chr3L 13032713 5' + rooA 7186 1 67.00 TCATAAAGTTAAAGTAAATNGGGTTTTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 11916630 5' - roo 9051 2 57.43 ACTTCAAGTCTTTCGCAATCCTCTGCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCGAGATTGGACTTAGCTAAATCGTTTGGTT:1 - chr3R 27042113 5' + R2-element 3348 1 76.24 ATTAGAGATGTTGATATACTCATATCTATTAGGTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:2 + chr2L 4063668 5' - roo 398 1 65.35 ACCAACGCATAAACACACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr2L 7666173 5' - roo 9040 1 57.43 TTGCGTCTGGGGATTACCAAGAAATATGGTAGCCAAATTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 + chr3L 3345135 5' + FB 40 1 67.33 ATGCTTTTTAAAATAATGGTGTTTTTCCTAGAAACATTTAAAGCTAATAGAAAAGGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chr3L 13096937 5' + I-element 27 1 57.43 AAGTAGAGATTTCTGCTATTAAAGGTATTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr3R 20420902 5' + blood 11 2 68.00 AGCCAGTCTTAAAGTCGCGCCTCGAAAAGAACAAGGAGCTGAGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGGGG:1 - chr3R 6137483 5' - F-element 4477 1 55.43 CTATTATTTCATCAATTTTCGCTCTCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGAT:1 - chr2L 16799183 5' - hobo 2531 1 75.25 AATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:4 + chr3R 7869140 5' + 297 6635 2 79.21 TAATAGCATTTGGCTTCCTTTTTTGTTAAGTACTTATTGAAATTTATATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr3L 15788420 5' + opus 23 2 57.29 CCTAACAAATATTACTGAAATGATAAGCAAAAAGAACGAATGCAGAACGATAGAGATCGATCAGAAAGCTAAGAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATAGAG:1 - chr2L 7255854 5' + INE-1 174 1 72.28 AGCGATAGACATCAATTTGAAAAATGGGCCAAGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACC:1 - chr3R 7627559 5' - hobo 230 1 68.32 ATGCAGTTTCCATATAGATAGACACGCATACATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATAC:1 - chrX 15545168 5' + mdg3 5344 2 70.30 CATATGAACACTACTTAAANTTCCAGAGAATTTGGCATTTAAGTATCTCTTTTTTTGGGATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAA:1 - chr3R 19505621 5' - mdg3 5482 2 41.58 CACTGTGGACGAGAGTCCACGTCGTTATGAATCGCTTCAGGACAGTGTGCGAAGGGGAATTCTATACAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATT:1 + chr2L 22139598 5' + 1360 3376 1 65.35 CAGTTGAAAAATTGGAACAATTATCAGTTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 11916562 5' + roo 44 2 70.30 GTTTGGTCAGTTGATTGTGGGTTGCTGCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 + chr2L 16139130 5' - copia 5074 2 74.26 GAAACACAACGTCCGGAGGNTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAC:1 + chrX 21087613 5' + mdg3 44 2 78.22 GCTCATCGAAAATGAGTGGGTTGCCACCTTGGTGGTGCTCGACGTGCTGGAGAACTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCC:1 - chrX 3280211 5' - jockey 4700 1 62.38 ATTCTCAACTTTTGATACCGCTTTCTCAGATAATGAGAGTGCATGGTAAATTATAATATAAAACAAGAGGGAACGCTATATCAACACATTTTTTAAAAGTG:1 + chr2L 21284559 5' - INE-1 261 1 76.24 CATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 - chr2R 12457977 5' - HMS-Beagle 6995 2 76.24 CAGTGCTCAAACTGCAGCCAAAGCACAAAACCAAACAAAACATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 - chr2L 13566561 5' - hobo 2926 1 69.31 GAACGATGGAGGAAATGGAAATTTACTATTTTAATGTAACAACTATTTTTATAAATACGTTCTTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 - chr3R 6947405 5' + I-element 16 1 63.37 CTCAAGCTGTCCCGCATCCAAAGCCAAAAGGGCGATGTGACCCACGCCAAGCCTGTCCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTTATCAAGC:1 + chr3R 28692915 5' + G4 22 1 68.32 ACGACGCCGCCAGCTACGTGCGATCCAATGTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAG:1 - chrX 7734092 5' - Doc 4484 1 70.00 AGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGGAGTTACCCACCCACCACCTAAACCCCCACG:1 - chr3R 4604451 5' + Tirant 11 2 65.56 ATGGTGCAACCTGCGGCCTCGCCCCCACTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACAC:1 - chrX 7862798 5' + accord 189 2 70.51 GCTTCTCACCAACACACAGACAAATATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTAC:1 + chr3L 5241136 5' - Ivk 5327 1 78.22 AATAAGCAGATCGGTAAAATACCTATTGGTTTCAAAAAGCGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr3R 27169427 5' + 412 36 2 64.36 CATTTTTTATGCATTAATAAAAACGTAGAAAAAAAAACTAATTTTTGGGCAAAAAAATCCGCAAACGATTCAAGCTTTTAAATTTAAAAAATTCGATTTTT:1 + chr2L 21392423 5' - FB 23 1 70.30 AAAAAAAAGACAATTTCCAGATTTTCATCTGTTTTTGTGCAAGTGTGTGTGTGCGCTTGTGTGTGTGCGCTAAATTCAAAATTAAATTTAAAATTAAACCG:1 + chr3L 11609197 5' + Rt1b 99 1 70.30 TATAGCAATCTTAAGATTGATATCGAAATAAATAGGACTATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 - chr3L 15033363 5' + I-element 38 1 60.40 CTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chr2R 10353299 5' + blood 51 2 76.24 CGTTCAGGGGAAATAGTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2R 13763178 5' - roo 9048 2 49.50 CGCGGCGAGGCAGGATTCGGTTCCACCGGAGTCAAGGATCTGCCGGCAGCCAAGGCGCAGAACGCCGTTGGAAAAAACGAAAATGGCGACCACGGACGGAA:1 + chr2L 11011885 5' - Max-element 402 1 63.37 CCATGATTCACGAAAAACATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2L 4063734 5' + roo 8718 2 85.86 CCCGTTTCTGGCCGCTGTTTTCGCTTTCTGCATGTTTGTTTTGAGTGGCCCGGGGACTATGTGCAATGCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAA:1 + chr3R 11294766 5' + TAHRE 10317 1 69.31 ATTATTTGTGGCACTTTGGTACGAAAATTTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr2L 6362856 5' + 412 7097 2 69.31 GGCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr2L 18213130 5' - hopper 1407 2 71.29 TATGGCGCAATGCTTAAAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chr3R 19449524 5' + hobo 16 1 63.37 CCTCCTCGTTGCGAGATATACCATCTGCTCCCTCGTAGGCGCTGGTGTAGCCATCCTCTGTCTTGATGATCTCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chr2R 11259538 5' - hobo 2935 1 71.00 TTTGGCAATGCCAATTTGCATCGCAAAATTTTTTAATTTCACACATCGAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCC:1 - chr3R 14334819 5' + X-element 4433 1 52.48 CAAATTGCATACTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 + chrX 15546152 5' - blood 7353 2 60.40 CAACAATCTCGCAACACGCTGCAAGTGGCAGTGCACATTTTTATCAACATTTCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATG:1 + chr2L 17677698 5' - Tirant 8484 2 57.43 CAGTTTGTAACGCCTTCTTATTTATGCACGCGGGAGTTTAATGTGATAATTTGTATAGATGGTGTCATTATAGCCCAAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGT:1 - chr2R 11469512 5' - accord2 201 2 73.27 GTAATCTATATTTCATTCATCATAACTAAATATGCATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGC:1 - chr3L 20454594 5' - invader4 284 2 70.30 CTGAGGGAAAAATCGAGGAAAATTTTGAAGCCAAACAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGA:1 - chr2R 14005725 5' + micropia 346 2 64.36 TGCCACGCCCCACGCCGCCACTGCCACCAAAATGCAGGCGCTGGCCTTTATCTGTTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3R 11321093 5' + hobo 19 1 60.40 GACAACTATATGTATATCTTTTAAAAGCTTTTAACACACGGTCTTAGAGTGGGCATGGCAAAAAGTTTTTTTTGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTA:1 + chr2L 22718275 5' - INE-1 299 1 57.00 CAGAGTGACGTATACGCAATATCAACTAAATAATTGCACACACCCTGGGCCAACGGCGTATGTTTATTCGGTGTGGTTAGTTTTTACACTGCCGCTTATTC:1 - chr3R 19436340 5' - GATE 8360 2 60.40 ATTGCCTAAGTTGAATTCGTTCAGCACAGGAAATACTCGAAATTGGCCAAAACTTCCCAAATATCTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCC:1 + chr2L 10926073 5' + 1360 3177 1 63.37 TAAGCAATTCAAGCAAAGTTGCCAATGGTCGCGGCACATTTGGGCGGTTTAGGGCGTTAGAGTGTGTGTGGCAAAAATTTTTTTTTGCAAATCGATAAAAA:1 + chr2R 19948331 5' - INE-1 311 1 71.29 ATAGTCTGGCAAAGTTGCCAGTCAGAGCAAATCGCAGATAGTCAGCTAGTCAGACGCAAAACCTCCTCCTTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAAC:1 - chr2R 14997952 5' + McClintock 5951 1 79.21 CAGTGTTGCCGCATGTGTTATCGCGCTGCCATGACCATCATTGTTTACATATACATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chr2L 21708333 5' + 297 6593 2 64.36 GTTAAAATTTGTTTATTGGTGTAATATATATTTGATTGTTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCG:1 + chr4 48772 5' + 1360 3284 1 66.34 CTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr2R 15788580 5' + Transpac 4956 2 57.43 TATTGTCTCTGCCGCAGCCATTTGCACACGCTCAAATCTCAAATCTCTGGTCGCAATTCAACCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr2L 10898376 5' + jockey 4685 1 65.35 GCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAA:1 - chrX 983356 5' + Juan 3848 1 66.34 TAAAGAAGAGCTATATAACCATATACCAATTTCAATGAATTCTTATCTTAGCTCTAATATTATGATAAGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTT:1 + chr2L 11712792 5' - Quasimodo 7361 2 73.27 GCTGGCAACTTGGGAATGGGCACGAATGGGAGCGGGTGGTCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAAGCAGCCGTC:1 - chr3R 6961130 5' - 412 7511 2 59.41 TCAGATTGAGATTCATAAGTTGTTATATGTACGTATGTAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATT:1 - chrX 9205568 5' + diver 39 2 62.38 ACATACCAGCGAGCAGTGAATGAAATATGCTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGACATCA:1 - chrX 15255399 5' - Tabor 7275 2 71.29 AAGCCATTAAAATTAAGCGACAAAACATGAGTGGCACACAAAAAACGGCATTAAGTAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTT:1 - chr3L 5479078 5' - 3S18 6084 2 55.45 AAGTTTGTATTTAGGTAATNTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGA:1 - chr3R 20094507 5' + Max-element 42 2 66.34 GGACCGGCATCGGCGAGTATACCAAATTTATGGACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1 - 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pogo 2060 1 69.31 CTTAAAAGCTGGCAAGGACCCGTCGGAAAGCAGGATAGCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 - chr3R 23543042 5' + 412 9 2 70.30 AGAATCTTGGGACGGTTTTGTGCAGATCAGCTCGGTCATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTGTATGTTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACA:1 + chr2R 5644479 5' - INE-1 31 1 63.37 GATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr2L 20045792 5' - roo 9027 1 71.29 TAGATCTCGAGTGGCTTAACAACAGGCGTGGTTTCAGTGGGTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAAT:1 - chr3L 18418710 5' - hobo 2463 1 59.41 CGATCAATCTCCGATGTCTTAATTACTCAATTCGGGAGCGGGAAACGCGCCGAGCCGCTGCCTTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTAT:1 - chr2R 8036598 5' + 1360 243 1 65.35 TTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 9871037 5' + roo 46 2 71.29 ATTACTTTTAATCGCTGCCTAGTACTTTGCTATTGTAAGCTCCAATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr3R 18549903 5' - pogo 2073 1 56.44 CTACGCTTTTTATCCCGATTGATTGACCTGGCCTGAATAAATTCAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAA:1 - chr2R 10670035 5' + jockey 4795 1 61.39 GCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAA:1 - chr2R 16185090 5' + 17.6 44 1 80.20 CCTATTAGCAACCCCTATTTAGACAAAGTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATAT:1 + chrX 9454829 5' - roo 360 2 74.26 GCAATTAAAAAACAACACANAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chr2R 672826 5' + F-element 36 1 59.09 CAATGCTTATGCTAAGCCTAAAGCCTAAGAATATATTAATTACCAAATGTTCAAATGATCTAAAAAAAACTCAAAAATTTGATATTCTTCGAACAACAGAT:1 + chr2R 12298839 5' - Tc1-2 247 1 62.38 TTTGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCG:1 + chr3L 16282371 5' + gypsy5 41 2 62.38 CACATCACTTTCCCGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAAG:1 - chr2L 15898825 5' + F-element 37 1 56.44 TAGTACAAGTTAATGTCCCTTTAAAAAACTAGAAAACAAAATGCAGATCGTGTGCCTGGCTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACT:1 + chrX 16456051 5' + opus 7243 2 70.30 CGGTGATTCTATGGTGACTGTCGAGTAAACAACATCTCTTCAAAATTCTCTTATTCCAGATTTTTATATAATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:2 - chr3L 15788521 5' - opus 7496 2 63.37 TTTAACTATCCACCACCCACGTTCAATTTGTATGAGCTTTTTTTTACTGTTTCTTTTTCTTTTACTGTTTACTTTGTTATTTTATTTTATTTTATTTTCGT:1 + chrX 582819 5' + transib1 1901 1 68.32 TGGCCAAAGAACCGGTCACAGAGAAGAACCCACCCGTGGTGGAGGAACCATCCAAGCAGGAGGATAAGCCAAAGGTGGAGCGGCGATCCTTGTTAGATCAA:1 - chrX 7869029 5' + G5A 214 1 79.21 AAATTTCACACTGCAGCCAAAACAGATGCTGAAACTGTACACTATGGGGCACTTGGCCTGATTTTTTTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGAT:1 - chr3R 1273085 5' - HMS-Beagle2 6913 2 73.47 TATCATTTATCATATGGGAAAAAGTCGGTTGGTTGGCTTGAGCGGAACGAAACGAAATGCGTTTATTGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAAT:1 + chrX 6028822 5' - Porto1 422 1 68.32 AATTACGGTCCCATAGTAAGCCTCCTGCTAAGTTGTTCAAGACGGCTCGGGCGGAATGTATAATATGCATAATATGCACATATAATATGTGCAGAGCTCTC:1 - chr2L 2659827 5' - baggins 5227 1 61.39 ATTGTTGACCAGGCTTTTTTAATTGCTTCAACTAAGGCCCCAGTGGTCAAATTGGTTTAAGTGGTTATCTTTTTACAACGTTTTAAACCTAAACAAATAGT:1 - chr2L 22750090 5' + Tc3 1696 1 59.41 TTTTCATTTAAATGGCGTGCGGGAAAAGTTTTTCTGATTTAGTGAGCGCTTTGAAGCAAGCGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 + chr3L 8252174 5' + copia 4886 2 62.38 TATCATGGCGAAAGGAGTGTGGTGTCTTGGCCAATAATCGTTCACCCTTGAAAAGCAGCATTCAATTTGCAAAAAAACAAAAAAAAAAATGAAAATGAAAA:1 - chr3L 2387160 5' + Doc2-element 252 2 51.49 CCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 19450165 5' + roo 34 2 70.30 GGTCGCAGCTCATCCACGCCCACGCTACATAAGCACATGAAATCTTTTAAGTCTTCTGACGTTGTTATTATTATTTGCCAAACTTAAGGCTAAGTTA:1 + chrX 21074377 5' - G4 3641 1 68.04 GTTGTAGCGTCCGCTGGCGGTGCTCCTACTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTG:1 - chrX 12598452 5' + R1A1-element 5054 1 72.28 TTGTATGATTGCTTCTAATAAGTAAAGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAA:1 - chrX 7385453 5' + invader4 2990 2 74.26 TTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:3 - chr3L 2022283 5' + roo 8719 2 82.18 TGGTTTGCCTAATTTTCTGCGCCCCATTTAATTGGCTTGAATTTAAGCTGGGTCCGTACACCAAGGCAACTTTCCATTTTTTTTTTTATTTTTGTTATTTT:1 - chr2R 21418369 5' - F-element 4686 2 65.35 AAACCCTTCGAATCCAGCGAATGGCCATTGCCTTCGCCCGCACTTTTCGCTATATACACACTCCTATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTA:1 - chr2L 14035621 5' - flea 249 2 70.30 AGCAATATCGCCTACATTTATCGTGGGAACTTCCCCGATTCGCAGGTGATGCGCATATGACGCCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCC:1 + chr3R 16603199 5' - G2 2670 1 45.54 CAGGGTTTTATTGTTCGGAACGCATTGATTCTTCTACGAACTGGTGTTCGTCGGTTAAGTCAAGTTTCTTAAGTTCAATTTGAAGACTAAATCGTTTGGAG:1 + chr3L 25456139 5' - Bica 4466 1 68.32 TTTCAAAATGTTATTCGAAAGCTAATTCAATGGCGAAAAGTTAACGTACATATATTTTATGGTTTTTTTTAATTTAGTGCTGAGTAATGGGTATCTTATAG:1 + chr3R 19440267 5' + INE-1 547 1 86.14 AAGATATACGAATGAAGCTCTTCGATTTCTTGTACGCACATTTTTTAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr3R 8582643 5' - roo 409 1 79.00 AACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTATTGTCTTATAAATTTTTCACACGCCGCGAGATGAATACTCTAATGACAAATATTC:1 + chr3R 22232287 5' - 1360 401 1 97.03 AAATATTAAGGAGAATATCCCCAGGAAACAAGGATCTATATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 - chr3L 4009487 5' + mdg3 5289 2 63.37 TAAACTAAATATCTTTCTGNGCTCTGGAGTTACCAACTAAAAAATATATAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3L 23277328 5' + roo 58 2 55.45 TTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTT:1 - 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chr2L 23295891 5' + micropia 3 2 72.28 ATATGGATCTTCTGAAAGAACTGAAAATGGTATAGTAAAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAA:1 + chr3R 25086099 5' + Bari1 34 1 64.58 GGCAAGAAGTACAGTTGAACAACTCTAAATGGTTTTGGTTCACATGAATTAATATCTCTTAATTAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGA:1 - chrX 7036758 5' + Quasimodo 5 2 75.25 TGGTACTGAGTATATATATATATAGTAAAGTAACTATGCCTTTCTTATAATTCACTTATACAAAAGACCGACCGCGGTG:1 - chrX 3626213 5' + Tom1 35 1 65.82 GCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chr3L 3540182 5' + mdg3 5292 2 74.26 GAAAGCAGAACCAATTAAGCAAGTTTGGGGCAAAATGGAAATGGGCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCT:1 + chr3R 13331412 5' - transib2 2794 1 56.44 AAGCGTCTGCCGAGCCAAACAATGTGAAACGGGCTGTAGATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTT:1 + chrX 11032191 5' - invader3 5425 2 61.39 CTGCCTCAACTGATTGACGGCGTAGTTCTCGATCCGTTTCTTGGTACTCTCGTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATAC:1 + chr3R 21884168 5' + mdg3 5278 2 53.47 TGCTCTTGTTGACGATCACCCATAATCAATATAAATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 - chr2R 9905410 5' + mdg3 5287 2 67.02 GGAGGAAAACCACAAAAGCCGAGCTCACTTCAACTATTTCAAGTAGCCAAAAGAGCCGTGTCTTACCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTT:1 - chr3L 19336417 5' - Tc1 1609 1 71.29 ATTTTATTTTATTTGATTTTCAATTTTGATAGATACAAAATTTTTTTTTCTTTGGTAAGGTAAATATTTTTATGGCATATCGGCCAGATCGTTTATATGGC:1 + chr3R 29291782 5' + transib1 2005 1 68.32 AGCAGATTAAGCGCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATC:1 - chr2L 12808239 5' + Tirant 25 2 56.44 AAATCGTTACATTTAACAACACAAAACCTCATCACTTTTAAAGAACATATTCTGTCAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3R 16601515 5' + roo 18 2 77.23 AACGGCAACAACATCTGTGAAGATGCCAGCATAATTATAATAATCATTTCATAATCATATTTTATTCTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCA:2 - chrX 8727948 5' + X-element 14 1 65.35 AGTTCTCCTTCGTTTTCATTAACAAAATCGATTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2R 19061230 5' - roo 9031 1 67.33 CGGAATGGTGCTGCTTTGATTAAATTTTTATGGACAACCCGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATT:2 + chr2L 17998264 5' + BS 33 1 63.37 GCAAAAATAAGGGATGCAACGCAGGGGGTAGGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr2L 20238753 5' + hobo 35 1 62.64 TACCCCGAATTTATAATTAGAATGAGGAGATTGTGGCAGACCCCCCGTGCAGTGCACTAATTAAGTGAAGAGATTAAGATTTGTAATCTTAATGTTAGTCT:1 + chr3R 31197765 5' + Fw2 3900 1 72.28 CAACACGATAAAACGGACGAAGCAAGCAAAACAAAAAACGAGTGCATAAAAACAAGAAATCGTCTGAATAAACGTATTTAATTATAAAAAAAAA:1 - chr2L 20917072 5' + Rt1a 5068 1 58.51 CCAAGCTCAACCGAAGGCCATGATTCACGAAAAACATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 4063751 5' + roo 39 2 69.31 GGATTTTCAAGGACCTTTTACCAACCCTAGGACCAAGCAGCAGAGGGTCGGGGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3L 18418911 5' + hobo 14 1 57.30 TTAAACTAGATCGTAACAGCAAATAAATCAGCTTTATAGCTAATAAGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:2 - chr2R 16614319 5' + roo 8692 2 55.45 ATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACAC:1 + chr2L 14793512 5' + Stalker2 48 2 75.00 GGTTGTGTTTAATTATTTANAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTT:1 + chr2R 12185347 5' - accord 7337 2 71.29 TTTCGTGTGTGTGCTCAGATTATTAACGCTCGTGTGGGCTTCACGCCATCAAAATCAAATGGGACATCGTGTGGGTTCCTGGAGTTGGGTGCCAATTAATA:1 + chr3L 12894888 5' - springer 397 1 72.28 TACAAATATAAGTGGCAAAAAAAGAAATGATTGCTTAAATTCATGTAGTACAATTTGTTTTCAATTTACATTTTCGGATTTCTTGGCCGCAGATATGTGCG:1 - chr2L 10886409 5' - TART-A 13293 1 66.34 AACTTGTTTCCATCTTGTATTAAAGCTCGAATATAAAGTTGCAGTTGTTTTTTTTTATTTTTTTTT:1 + chr2L 4164592 5' - gypsy7 5009 109 75.76 ACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:3 + chr3R 19987417 5' + Doc 50 1 70.30 GTGAGCTTCAATCCAGTCTTTGCCAATTAAGTTTTCTTACTCACATAACACAACTTTTTAAGAGATAAGCAAGAGTCGAGACTATCAGATACCCACTACTC:1 - chr3R 18643503 5' - INE-1 549 1 66.34 CGGTCACACGTTTGCGAATAATAGGATCTCACGGCCCAACCAACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTA:1 - chr3R 3398276 5' - Cr1a 4401 1 66.18 GCTGATTGAGTGATTTTAGCTGCAGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 + chr3R 27116742 5' + P-element 53 1 24.75 CAAGTGAAATTGTTATTTAAGTTATTAAACTTACTAAATACAAAATAAATATTTTTTTAAAAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:3 + chr3R 26317902 5' + roo 15 2 64.36 TGCACTATAAAATGGGTTACAATGGGATATATAGTACGCACAAGTGGTTCGTTCGCCGCTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTT:1 + chr2L 2174664 5' + hopper 145 112 70.93 TGTCAGTTGGCATTTCCACTCGGAATGCCTTCGGAGCAGATAGAGATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 2833929 5' + roo 8695 2 57.43 TTTGTATGGAAATTGGCGCAAAATACGCCCAAAACCGAATTCAAGTCCCCAGTTAGTTATGTGCAGCCGGCTGTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCT:1 - chr2R 18717047 5' - Doc 4511 1 67.68 GTGTGGGCGTCGCTTTTGTTGGCTTATTTTGTGATTCTTGTGGGCGTGGCAACACGGACATGGCTAGATCAACTCGGCTTTTGATCTTGATCAAGAATATA:1 + chr2R 23782187 5' - INE-1 83 1 75.25 TTTTATGTACATAAAACTAGCTTTTTACATTCTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCTCCCTTTTTAGAGAAATGACG:1 - chr2L 16041413 5' - Stalker2 7226 1 69.31 CTAGTTTTTTGCTGAGGAAGTGGCCCAAAGAAATAAAACATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTC:1 + chrX 541386 5' - mdg1 7147 2 62.38 ACTTCAGGAAAAACCAATAATTCGACTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3R 5506834 5' + pogo 46 1 73.27 ATATGGCCCATTGGGCAATCAGAGCTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 - chr3L 3644399 5' - mdg1 351 2 75.25 GTCCTTGCCACGAAAATCTCGCCACAAAATTCCGCTTGTTTGTTTGCATTTTTTTTTGTTGTTTTCCCTTTTTTTTTTTGATT:1 + chrX 12706083 5' - Bica 337 1 87.95 TCAAATGTAGACGCATTATAAATGCATATTTATCAAACAAAACTAACTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chr3L 872781 5' + 412 7083 2 52.48 TTTAATTTATTTTATTTTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTATAAATTCTGTTCCGCATCC:1 - chr3R 18052449 5' - TAHRE 10398 1 70.30 AAATACCATTTAGTAATTATACAAGCATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCTAACTAATGTC:1 - chr2L 6569239 5' - 297 376 2 69.14 CTTATTTATTTACTGCTGTAACAATATAGTTCACCACTAGTTAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3L 20882784 5' + 412 7084 2 54.46 ATGAATTGCCATTTATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 - chr2R 11941076 5' + 297 23 2 59.41 AGGCGTTCATCCATATTGTAAGGTTACAGGAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACA:1 - chr3L 27396584 5' - S-element 1503 1 70.30 CGCTCATCCACCTCTCCCCTCAGGACATTTCAAGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr2R 19061281 5' + roo 8705 2 66.34 GCGCTCTTTGCTATTTTCACTGCTCTTCAAGAGCTTTCTCCCGCTCTTTGTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr3R 14580291 5' + blood 27 2 52.48 TTTGTGCTTTTTCCTCCTTTTTTAATTCAACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 12958889 5' - roo 400 1 70.30 TTGGGAAAATAGAGTCTGGAGTGTTATATCCGTTACTCGATTCCGACCATATAAAGTATGTATATTCGTGATGATATTCGTGATTAGGATCAATAGCCGAG:1 - chrX 158247 5' + INE-1 90 1 75.25 AGCCTGAACTCAGCTTTCCGATCCGGACACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTTGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAA:1 + chrX 21312602 5' + Idefix 7102 2 73.27 GTTCATACGGACAGACGGAAAGACGGACATGGCTAGATCGACTAGGCTAT:1 + chr3L 23871827 5' - INE-1 103 1 88.00 CATCATTTTGAACTCCCAATCTCCGTTCATTTCGACGGCAAGTTTCGTTTTCTTGACGGCAAATTTCTTGTTCACTCGCCGCAAGATGAATACTCTAATGA:1 + chr3L 15652018 5' - 1360 410 1 74.26 ATAAAGTAAATGTTTCATGGTTTTTAAGTACAATGATACAGACAACTTCTAATATTAATACAAAATGGTAAATAGCGAGGAAAAAAAAAATATGAAATATT:1 + chrX 17745886 5' + P-element 141 1 58.42 GATGATCGGGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1 - chr3L 24761247 5' + 1360 74 1 58.42 CAGATACAGATACGACTGCCAGTGTGCGGAGCGAACCAGTCAGCCAACATCTGAGATACAGATACGACCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTT:1 + chr3R 16241155 5' - Tirant 389 2 69.31 GCCGTTGAGAAGAGTAGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTAATTAACAATAA:1 - chr2R 23881269 5' + R1A1-element 132 1 75.76 CATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr3R 7869121 5' + 297 34 2 60.00 GGTAGAGTTAGAAAAGAAAAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chr3R 19449414 5' - hobo 2935 1 75.25 GATTTGAAATTTAGAAAATAAAACCCTGTGTTGGGTTTTGTTTTGCGGAGGACTGCAACTTTAAATGAAAAATTGTAAGTGTTGGAAATATAAGATTGCAT:1 + chr3L 19157527 5' - frogger 184 1 76.24 CAGGCCCAGCATAGCAAACNCTACTTCCTCAATGATCAAATCGCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTTTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTG:1 - chr3R 14699724 5' + G2 2641 1 55.45 ACATGTTGGGGGTGAAGCAGGCTGACATATTTGATGAGGTTGATTTATCACATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGG:1 + chr2R 3603567 5' - Doc2-element 488 1 74.26 ATCGAAAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr2L 10625673 5' - roo 9039 1 55.45 AGTAGTTTAAATTTTTTTTTGAATATACATATGTACATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTA:1 - chrX 23035799 5' - HMS-Beagle2 273 2 67.33 ACTGTCATTCTGGCAATTGAACTAAATCCTTTTCCGCACAGGCTTACGAAAAACAGGCTAAAAAAATTAGGTTCGTCGCAAAACACGCACAACCAACAAAA:1 - chr3R 5331335 5' + Bica 4635 1 72.28 ATTCTTCTTCTGGCTTCTTTTCATTTTATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 + chr3L 13374706 5' - Transpac 265 2 79.21 TTATCAGTACTTTAAACGAAATTCATTGTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:1 + chr2R 9699820 5' + Transpac 4965 2 72.28 TCCATGCTGATGGACATGAAGCGCATCTCGACGAACCACAGCCTCAACAGCATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAAGCATAGAATGCCTTAG:1 + chrX 10704384 5' + Quasimodo 81 2 57.43 ACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATG:1 - chr3L 15452916 5' - accord 487 2 73.00 TATTATCAATAAAACAAAAGGGTTAAAATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr3L 12303434 5' - blood 7343 2 73.27 CATTAACAAATGGTCGGTAAAACGAAAACATTAAATTAAATTGTCAACAAGGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:2 - chrX 7157342 5' + blood 7035 2 48.51 CACTCACACTCGTTTGGTAAACAGAAAAAAAAAAAGGAAAA:1 - chr3L 4562250 5' + Doc2-element 246 1 87.80 CAATCGAACATAATTAGGCTAAAGTGCTGCGGATAAAGGCGACTAAAGGGAGAAAGGAGGTGCCCCCATGGACTACACTGAAGGAAG:1 + chr2R 21899337 5' + Rt1b 4924 1 54.02 ACACAACATGCACATAAAATGATTATTATACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTT:2 - chr3R 20332910 5' - jockey 4945 1 72.28 CCAACTGTCGGTAATTTGCATATTTGAGCTGGAAATTGTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTA:1 - chr2L 15531857 5' + Stalker2 33 2 60.82 TACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAAC:1 - chr2R 12185433 5' + accord 1 2 74.26 ATCTTATTGCGAGTTGGTTTCGAGCATACCTTTCCTTGTCCCGAGGAGCAAATAAAATGGAACATAAAGGTCAAGGTATGAATAATATAGATATAACTTAC:1 - chr2L 12094719 5' + transib3 294 1 66.34 GCCCACATAATCGTTGGCATCGCCCTTCAATGTCACATCAACACCCCGCGGCCACAGGATTGTAACTGGCGCAGCTGGACTACGGACAAGGGATTAACAAT:1 + chr3L 16790805 5' - accord2 7403 1 56.44 TTCTTTTTCTCGTTTTGTATAGCTATGTATACCCGAGCACGTCCAAAAAAATGCCTCTGCCACTTCTTCGTTTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATTCG:1 + chr3R 6316928 5' + diver2 237 2 63.37 AACAAATTGCATACTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:1 + chrX 15546150 5' - blood 343 2 58.42 AATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACA:1 + chr2R 4260436 5' + micropia 182 2 80.20 AAAGCGTATGCAAAGTCCAACAAACTGCAAAATAACAGTGGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 20045739 5' + roo 35 2 61.39 TTCAAAGTTTAAATTTAAATAAAAGTTTTACAATGATTACCAAATTATTTATCTATTAAAAGAAAGATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAG:1 - chr3R 20421014 5' - blood 368 2 63.37 TGAGTCTATTATCAAACCCNGGCCGGACGGTTGTGTCAGCGGGGATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAGAACCA:1 - chr2L 14512791 5' + F-element 4331 1 41.84 AAATACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr3R 11052100 5' + blood 7040 2 60.20 CGTATTCCCGCTCAACTATTTCCCGTAATGACAGGATTTGGTCTAAGCGGATCTGGTAGCTATAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATC:1 - chr3R 2932209 5' + copia 4704 1 64.36 GCCAGGACACACAGATACAAAGCTCGTAACTCGTATCTCCATATATATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAAGTGGGATCTGTGCCACACCCTGCATT:1 - chr3R 11322959 5' + micropia 487 1 37.62 GGGATGTCACCACTGTTACGGACTTTTGGTTCCTGCCTGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACC:1 - chr2R 7194347 5' - R2-element 3332 1 63.37 AGGCAACGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTT:1 - chr3R 1844861 5' + Cr1a 115 1 70.30 GTGAAAAACGCTTCCTATTATTAGTTTAATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAATTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 7099669 5' - roo 395 1 63.00 GAAATTAAGATTTCCCTCGCACAAATCTCACTTCAATTTTAAGTAGATTTAATGAAAAATCGATAATTAACCTATTGGTAATATGTTTTAATTTGTTTCTT:1 + chr2L 12275130 5' - HeT-A 5765 1 61.39 AATAAACCCAATAAGCTTGTCAGAGCGAGAAATTTATGTGGATCAGATTGCTGCTTCCTTAGTTTCTATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTTA:1 - chr3R 28824522 5' - accord 180 2 48.51 ATAAATGGAAATAAAACTGTGTATATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 + chrX 3356261 5' - hobo 2898 1 78.89 CGGGAGTATGGAATGCAAGTCATAAATGACATAGGGCCGAAATTGATTTCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 + chr2R 17963206 5' + blood 7018 2 72.28 CAGCTCCAAAAACTCAAACNCGAAAACAAACATCGGGCGAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGA:1 + chr3R 31142138 5' - R1A1-element 119 1 47.52 TGGTCGTGTAAATATTAAATGAACAAACTTAAAGTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 - chr3L 7882284 5' + FB 44 1 70.30 GAAGAACACTCAAACTGTTTACTAGTTTTGCGGCTTACTCGATAAAATTGTGGTATAAGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chrX 5475476 5' + 412 16 2 61.39 ATACAGCCAAAGAAAACAAAGGTCTCTTCTCTTCAAATCGTATGTCATTCTATATATGCAATTCTAGGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 - chr2L 14341925 5' - copia 245 1 69.31 CAAATATCGTTGCTGTCGCCGTGGCTGCCACTTGTTTTATTTATTGCTTTTTTAACCCTTTTTTTTTGGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 10488768 5' - roo 9064 1 72.28 GTGTCGCAAGTGGCAAGCAAGAGATGCATAAATTTTTTTTTTAAATATGTCAAGAGAACTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCG:1 + chr2L 20031384 5' + 17.6 7313 2 60.40 AGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGATGTTTTGAGTGAAG:1 - chr2L 15898803 5' + F-element 59 1 71.29 GTCCAGTGTGCATGAGCTGAAGCCAAAGCCAAGCCCCTCAAGGCGATTGTCGTTTCTTGGTAGGTGTTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 - chr2R 15788666 5' - Transpac 5218 2 68.32 TTAGGATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCT:1 + chr2L 22092961 5' + INE-1 542 1 54.46 AATTTTCCGCCGACACTCACCTTTCTTGGGCGCCTCTAATCCAATCGTTTACTATTCCTCATTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGT:1 - chr3L 9588443 5' - Bica 180 1 70.30 TTTAATTAATTAGGGGGCAGCATTTTAATTAGTCTTAAGTGCTGCTGCCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1 + chr3L 1998806 5' - hopper 1390 1 52.48 CCAAAATATTACTTTAAGGACAAGTTCATCCATAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr3L 16562350 5' + pogo 42 1 70.30 GCCAAAAGATGCAAGTGTGCAATGCAAATTCATGGTATTTGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 3256036 5' + roo 35 2 63.37 ATAGCTTATCATTGTTCAATACTTAAACACTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCA:1 + chr2R 22051479 5' + Tabor 6887 2 69.31 AACTTATTTTCATCGTAACATCATGAGGTTGAGGAAATATGGTTTCCTTTGAGCCTGGCAAGCAAATGTCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTAC:1 - chr3R 27056456 5' + jockey 23 1 62.38 AACTCGATTCAAACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr3L 8036436 5' - roo 9038 1 63.37 CAGACGACAAATGAGCCGANATTGATAAGCCCCCATTAATATGTAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3R 14463150 5' - Tc1 1477 2 84.75 TTTTAAACAAATTCTAATAGATCAAACCTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGG:1 + chr2R 12020802 5' - F-element 4480 1 72.28 CAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 + chr3L 19274815 5' + transib2 42 1 67.33 CTTGAAGTGTCCTCTCTGTATGTATGTACAAATGTATAGTATTGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATA:1 + chr3R 19216348 5' + 1360 35 1 61.39 ACCTCGACCATCGAAATCCATCAACAATTCGAGCGCATAAAAAGTGGTTATGACCCAGCGTTCGCATCCACCATCCGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGAG:1 - chrX 3235753 5' + INE-1 552 1 70.30 ACAACGGAAAGCCCAACAACATTGGAGTGCAAATATGGTGATCAATGTATCCGGCTCGAAGGACCAACA:1 - chr2L 3666521 5' - GATE 273 2 65.22 CAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCAC:1 + chrX 22689555 5' - 1731 4579 2 70.30 AAGCTTGTGTAAATCAACGAGGAATTAAGTAATTAAAAAAAAAAATAAAATAATACTAATCAGCAAATACGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCAT:1 + chr2L 9232323 5' - Tc1 201 1 60.40 CTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:2 - chr2L 12808211 5' + Tirant 52 2 75.00 TAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAA:1 - chrX 983365 5' + Juan 3839 1 57.43 CTATAATCTGCCCAACAAGGTTAAAACCGAGGTGTATATAGTGTGCACGGATTCGGTGCCCAGTGAAATACTCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAG:1 + chr2R 13202180 5' + Porto1 326 1 73.27 ATTTTCCTTTATTTTTGATGAGACAAGTGATTTGCAGCTTGGGCCTGCACCGGACACGATCCACCCAAACACGGTCTTTTGAGCGACCGGCATTCCCTCGT:1 - chr2R 21018605 5' - GATE 8125 1 54.46 AGGGTGGACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAA:1 + chrX 22726185 5' - Helena 1283 1 57.43 ATGTTTCTAATGCAATTTTACCATAAGTAGTCTAGCAGCCGGCTTCTAAAAAGTACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 2833848 5' - roo 9051 2 57.43 GCAGTGGGTGTTGGGGATGGGTGGCATAAGAGGCACAATTGCTGCCGCTGACAGAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACC:1 - chr2R 6918658 5' + accord 18 2 61.39 CACTCGGCATATCAATTTTCCCGCTCATCCACCTCTCCCCTCAGGACATTTCAAGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2R 19061302 5' + roo 20 2 59.41 TCTGGCTTTGCGTTTTTCTTTTCTTTTTGCGGCTCTTTAAGCAGGTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 - chr2R 8177774 5' - mdg1 392 2 52.48 TTCTTTTGTTTGTTGTTTATGATTTTCCACTTTTTTGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr3R 14193883 5' + pogo 16 1 65.35 AGGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr2L 8622772 5' + 297 43 2 80.20 AATAAAAAAAATAAAAAAATCCCCCCGTAGAAGTATGCAACATTTTTTAAAATCAAATATAACATGACCATACATCATAGAAGACTGATAAAACAATAACT:1 - chrX 3403807 5' - Transib5 2756 1 70.30 AGAAAATGTTTAGTTTATATTTCTAGAGCGAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGGGATTGGTATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chrX 4937530 5' + Doc 30 1 53.47 GAATAGGGTGCTGGATACCNGAGCAGTTGTAGTTTTCTGCGGCTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTTACTCCGAAC:1 + chr3L 15801502 5' - F-element 4373 1 57.43 CCGTTTCGCTCACCCCCTTTCTGCCACCAACCACCGCCCATGGCCCATTGCATGTGGCCCGATTTCGTTTTTTTCTCATAGCTGTTTTTTTTTATTTTCGG:1 + chr2L 18464350 5' - Transib5 21 1 57.43 ACGTAAAATGAGCACTCAATTGGCAGGATAATGTCTCACTGGATTGGCTTGAATGTGAAAATGAGAAAAAAAAAAGAGGAAAAA:1 + chrX 16528499 5' + Doc2-element 228 1 55.95 TTTTTGACTTTCGACAGGACATGGAAATTTCGTACTTATCTTATAATTTGTTCGCTTGTGGACAAACATGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAA:1 + chrX 20325368 5' - GATE 275 1 79.21 AATGAGTAGTAATTCACAGTCACAAGCGATATAATTAATATTATACCAAAACAGAATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chr3R 7765035 5' - 297 6960 2 69.31 ATTGCTCACAAACATATGGAAAATATATATACTGTAGTTAATTAGCATTCCAAAACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 - chr3L 14818769 5' - mdg1 374 2 69.31 CTGAATACTCAAATAACAAGAGACACCCGCCTTCCTGACCAGCACACGTCCTCGTGTGTAATATAAGTTTTGAAATTAAACAAGCTTAATCTAGAAAGATA:1 + chr2L 10936002 5' - invader6 4418 1 75.25 ACTTTAATTATTCACTCCCTTTGGAGTTCTGAAAAATGGGGATTCTTTTTCACTGCTCCCGAATTTTGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCT:1 - chr2R 80855 5' - 297 160 2 71.29 AATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2L 8577286 5' - roo 9026 1 75.25 CTTTGTTCTACAGGGTTTATATCGGAATTTTATGCACAATGACAGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1 - chr2R 17459230 5' + Transpac 26 2 55.45 GTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr2L 17730499 5' + pogo 44 1 72.28 GAATATTTCTGTGTGCCCTGGTGGTTGTAATAAAATGAAGGAATTCATGTCACGTTTGTATCGCTCCACACATGTGATTGTGTGTGTGTGTGTGTTCACGC:1 - chr2R 20588020 5' - accord 7025 2 60.40 AATAAACATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTTCGTTCATATCTTA:1 - chrX 23280955 5' + roo 8705 2 68.32 TATTCACCATTTGAACGGTNTTTAATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTAT:1 - chr2R 5772512 5' - HMS-Beagle 203 2 74.26 GCTAACAACTCCCCAATCATAAAAAATATTAAAATCATACCGCTCATCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCG:1 + chr4 194964 5' + Bica 444 1 53.47 CATTATTCATATATATTATATGATTATTTTTTCCCCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 + chrX 23283845 5' - 297 355 2 72.28 AGAGATTCTTAAACAAAATGTTTTGTATTGCTTTAATTAGCGCGTATAAGAAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTA:1 - chr2L 12870000 5' - Cr1a 4302 1 52.48 GCCAGCCATCTGACGACCANATTTACCCATTCGATTTGGCCTTCCGATGGGCCATCAATTGCTCCCGCTTCCGGAGTGAGTCACCACCCTCATGACCTCCC:1 + chr2R 23519188 5' + jockey 4758 1 79.21 TTTCGTTCGATTTGGCGACTTTGATTTCAGTCGCCAATCGTCAATCGCTGCGCCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr2L 8709387 5' - P-element 2865 1 57.43 TGATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3L 9928533 5' - roo 9041 1 56.44 GAAAAGAAAAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr3R 19449424 5' - hobo 2930 1 68.75 TAAAATTAGAGATGTTGATATACTCATATCTATTAGGTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2L 4063664 5' - roo 402 1 69.31 AGAAGTTTAATGCCCGGCAGGCCATTAAAATTAAGCGACAAAACATGAGTGGCACACAAAAAACGGCATTAAGTAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGT:1 - chr3L 5479096 5' - 3S18 337 2 71.29 CTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCGGACAGGGCAGACGGACAGATGGACATGACCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGA:1 + chr2R 1751257 5' - INE-1 94 1 95.06 ATATATATACGGTTTAAACTGGCTGCTGGCCCGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:1 - chr3L 1697744 5' - Transpac 5187 2 67.00 GTTATCCAATATAGCTTAGTGTCATTCTTTGTACTGTAATGATGAGCTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 + chr2L 20570619 5' - 412 448 2 71.29 AGAACGCAAACTGAAGCAACGAATCACTCCACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGAGGACAAGCGTCGATTAAGAGGGG:1 - chr3R 30207386 5' + HMS-Beagle2 6859 1 76.24 TAAACGAATGAAATGGTTTGGATAGTGCCACATTTCACCATCCTTAATATATAACAATTATGGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCA:1 + chr2L 3495031 5' - blood 65 2 66.34 GTTTATAGATAGATGTTGTGGCTGCAGTTAGTAAGCTATACAACAACTGAGTGCCGAAGTAAGTCACTTACCTAGTGTAGGGGTACTATATATCCTCTTAG:1 + chr2L 19474534 5' - invader2 5099 2 68.32 TTTGACTTAGGCAAATGCGTGCTTATATATATATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTG:1 - chr2R 21433202 5' - HMS-Beagle2 269 2 76.24 GGAAAACCGAAAGAGGGTAAACAACAAATTGCATACTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chrX 15546128 5' - blood 365 2 67.33 GGCTGCCAAGTCATAATTTTGTTAAGAATAGTTTAGCTGCTGCAAGGAGCAAGTTCCTGAAGGAGACAAGTGAACGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTT:1 - chrX 19423934 5' - F-element 361 1 77.23 GAGTTGTGGTCATGTTATATTCAACGGACAAGAGACGAGAACTCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATC:1 + chr2R 15668659 5' - 1360 3178 1 73.27 ATGGGATGGGATGATGACGGAATGTAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCAC:1 - chrX 13341378 5' - invader3 225 2 75.25 GCAAACAGTTTTTATTTCATTGATCAACAAAAGTAGGCCTCTGGCAACTGCATAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGG:1 - chr3L 14506448 5' - jockey 4765 1 50.50 CGATCTTCTCAATTGCGCAACAATATGTGAACAATAACAATTTTAAGATATTTACATTGAAGGTGCACAGTACATACTTTAAGAGCATCGATGGCTGTTTT:1 - chr3R 23272480 5' + mariner2 489 1 66.34 CTTTAATGATTTTGTATTTATTCAACGCGTCACTGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr3L 1586728 5' + Tirant 8147 2 66.34 GATTAAAGCTAGTCAGTTTGTTGAAAGAAGTTCGAAAAGCTTGAAGGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGG:1 - chr2L 13589155 5' - G6 1931 1 56.38 TCTCGCGTTCAGATTGCGTTAGAATTATTTGCTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTG:1 + chr3L 9839823 5' + S-element 311 1 72.28 TGTGTGAGTGCATGACCCGATTCGCACACGCACACACACACACATACAAACATGTTTGCATGCGTCAAGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCT:1 - chr3L 13374789 5' + Transpac 6 2 74.26 GGAAGTAATTACACACACGTAAGCTTTATATACATATAAAGAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 3294223 5' + BS 5094 2 67.27 ACTAGATGAACTAAACTACCGTATTCGCATGTGTATACGTATTAATTTGATTTCTCGTGTATATCATTGGGTATATTATATATATATACATATATATAGTG:1 + chr2L 6569130 5' - 1731 4409 1 82.18 ATGGAGAATGGGAACTCCCCTGACATGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 8765518 5' - roo 399 1 69.31 AAGTCGACCCATGAAAATGTTAGAGATCTAAATTAAATGTGATAAGAAATTAAAGACTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACA:1 - chr3L 4565550 5' + copia 21 2 49.50 TGGTTAAGGACAGTACAAANGGCATTGGGGGCACAGGTACCGGGGCAGAGATCCCTCTAATCGGGCCCGATTGGTCAACACAGAGTACTGGGCTTACTAAA:1 + chr2L 4505862 5' + baggins 4970 1 59.41 CACACTCGGACACACTGATGCAATGACTAAATGCGGCGGCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAA:1 - 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chr3R 17406455 5' + R1A1-element 5018 1 56.44 GTTCGAATCCTTTTGCTCCTTGTGAAATATGTTGTTGCACTGGCTTCGTTTTTTGGAAAGCTTTAATTTGTAGTTAGATTTTTTTAGTTTGTTTTCCACTT:1 + chr3L 11625985 5' - gypsy2 418 2 67.33 GCATTATAAATGCATATTTATCAAACAAAACTAACTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 872769 5' + 412 7095 2 64.36 ATGGTGGATGTGGATGAGGCTAGCCCATTGAAATCCGTCCCAATCGCGGGGAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGGGTTACGGGGCTGGTTGCGCAAAACT:1 - chrX 15100138 5' + R1A1-element 5063 1 55.00 ATAATATATATTATATAATATATAATATATAATATATAATATATAATATATAATATATTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCC:1 - chrX 248307 5' + 1731 4334 2 61.39 TTGAAAATTACACTTTTAAAAATATAAGGACATGAAAACGAACAAAAATAATACCAATAAAGAAGTCAAAATGTAACAACAATTGAGAACAATAAACAAA:1 - chrX 11656040 5' + Porto1 181 1 69.00 GCAGCTTGGCACGGTTATAGCCATTGTCTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCG:1 + chr2L 11963774 5' + Transpac 184 2 72.28 GTATTTGTGTTTATGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr3L 14594156 5' + hobo 48 1 81.91 TGAAGAAGTTGAGAGCTCGACTTATTGTGCCCTAATCTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr3R 27495654 5' - 412 7507 2 60.40 TCAGCTAGTCAGACGCAAAACCTCCTCCTTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACT:1 - chr2R 14997911 5' + McClintock 40 2 72.28 CTAGTACCTTGTTTAAGGACTAAGGACCTCTTTACAATAGCAAAGCAATCTTATGTTTGATGGCACAAACTATACAATCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTA:1 - chr3R 27907725 5' + mdg3 5252 1 80.20 AAATATTTAAATTAAATGTGCAAGCAAATACCAACACGGGTAATATGCAAACAAAGGTATATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTT:1 - chr2L 15567191 5' - 17.6 480 2 68.32 GAACCAATTAAGCAAGTTTGGGGCAAAATGGAAATGGGCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 + chr3R 13331419 5' - transib2 2787 1 63.37 AATGTGCACAGCAATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:2 - chr2R 9631758 5' + F-element 50 1 71.29 TGCAACACTTTCTGCTGCCACTTGAGCAATCTCGTGCCCACTGCCCCCTGTCCGAATCATCCGAGCCTTATCTTCAATAGGTACACTTTTTTGTCCGCTTC:1 - chr3L 3644294 5' + Circe 7251 2 73.27 AATCTGACTTCACGCGGCGGCGGAGCGACAGTAACTACTACCAATGCGGCTAAAAATCCATGCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr3L 6964717 5' - P-element 2874 1 66.34 AAAAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3R 19449430 5' - hobo 2924 1 62.50 TATTCAAAATGAATTGAACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chrX 11016995 5' - roo 9033 1 62.38 TAGCCTGGGTTAACTGGACATGATAGTAAAGTTAATTTACTTAAACAAGAGGGAAAGCTTTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCATAACTCAGCTA:1 + chr3R 14576789 5' - INE-1 544 1 76.24 CAAAATGCAGGCGCTGGCCTTTATCTGTTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr3R 11321066 5' + hobo 46 1 69.31 CTATGATGTTCAATGCAATATTATTTCGTTTTTATAAATGCGAAAATTATTTTACTATCTTATTACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAG:1 - chr3R 25563416 5' + Doc 4505 1 65.35 ATTTCGATTTCACTCAAAGCGGATATTCATACACACCAGTTACTGCACTACTTCAAAATTATATATTAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 + chr3R 18790052 5' + I-element 10 1 69.31 CTTTATTTTCAGTACTATATATATACGGTTTAAACTGGCTGCTGGCCCGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 - chr3L 1697760 5' - Transpac 283 2 51.49 TAATGTGAAGTTTAGCTTAAAGGAGGGATTTATTGCACACCTTGTAATATCTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATG:1 + chr2L 9045411 5' - jockey 4968 1 50.50 CGACTCCACCCATGTGGATGTGTGGCTGAAATGAGTTCAGCGAGAAATGTTTATATCCGTTGCAATTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGA:1 + chr2R 22965269 5' - F-element 419 1 74.23 TACATTGTCCACTTTTTAGTGAGTAGTGAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 + chrX 8316329 5' - hobo 2896 1 73.20 GACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATTTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTTTCACGCCCTCTCTGGTTCTCCGCTCAGCTTAGATCACAAGGTCTTGC:1 - chr2L 22319333 5' + F-element 4217 1 69.31 CTGCCTTCAGCCATTGCCCTGCCATCAAATTGTTTAAGCAAATATAAAACTTTAGAAATGCGAGGAAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGT:3 + chr2L 19642277 5' - Quasimodo 7363 2 76.24 ACGACAGATGTGTGTGCTCGAGAGGCGACTTTAAAATCTGTGTGCTGAAGTGCAAACTTCTAGCTTTTACAGTTCCTGGGAACTCGACGTTCATACGGACA:1 - chr3R 17211440 5' - INE-1 132 1 72.28 ACTTGCCTTTGACCCCATTGGGACCCACACCACGTTTGGTATGGGGAAACATTTGGTTTAGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:2 - chr3L 14624006 5' + hobo 17 1 59.41 TTTTATTTATTGCTTTTTTAACCCTTTTTTTTTGGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGA:1 - chr3R 10488734 5' - roo 9030 1 67.33 ATAAGTCCGGTTACTAAATGCCAACTTTTATTTTTTTCCGCAAGATGTATCGCTTTTGCATTTCGACTATCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAATG:1 + chrX 20779664 5' + INE-1 556 1 72.28 TTACTAAACAAGATATGTACAGACATAGAGTACTAAAGTTCTAGGACACTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - chr2L 8176477 5' + 1360 27 1 52.48 AAAAGGAAATTACTCCTGCACATTTAAACATTAAAATAAAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr2L 7175538 5' + blood 9 2 70.30 TAAGTAATTGTTATAATATGGCCATGAAGATAGTAATTTGCCCTTTAAAAGTAATTTAGATCTGAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 + chr2L 12866862 5' - mdg1 7450 2 71.29 CAACGCATAAACACACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr2L 7666171 5' - roo 9038 1 59.41 AATAATCAGCAGCAGTAGCCGGGAGCTTCGCATAATCGTCATAATCATTTTATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 + chr3R 20332866 5' + jockey 4697 1 52.48 GGTTTTGCGCGCATTGTGGAGTAACCAAACTGGTTTTGGTATATTAATGTGGGTTAATGTATTTTTTAAATATGATATATATATAATTTGACTTTATGCCA:1 - chr3R 4567489 5' + transib3 2836 1 68.32 CGCTCATCTGTGAAACTGTACATACATGCATCCCACTCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTG:1 + chrX 13808946 5' + Doc 4269 1 63.37 AATTAGTATCAGGTATACAATTCAATTCAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - chrX 21583398 5' + F-element 54 1 74.00 AATAGGTATTATTAAATATAATACGTTCTCGACACAAAATCGTTGTTAAATTAGCTAACATAAACATATGGATAACTTCATTGTTGATTTAACAAAAATTA:1 + chr4 221349 5' - Tc1-2 1473 1 62.38 ACTATTTTAATGTAACAACTATTTTTATAAATACGTTCTTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - chr3R 6947381 5' + I-element 40 1 59.41 CGAGAGCCAAAAAACCAAGCTCAACCGAAGGCCATGATTCACGAAAAACATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:2 - chr2L 4063765 5' + roo 25 2 55.45 CCTACATCGCAAAATGTTGCATGTTTTAGCCCTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 + chr3L 14623936 5' - hobo 2896 1 67.33 GTTAACATATTCACCAGGACTTACTAGGATGTAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATA:1 - chr2L 14762013 5' + mdg1 49 2 70.30 AGGCATCCCGGTAGATGTGCATATTCATTAACCCACGATCAAACTACCTGCTACGCCAGCTGGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCATCCAGCGCCTGCA:1 - chr3R 21790518 5' + HeT-A 5647 1 69.31 TGCAGAAAATTCGCAAATATATAAGGGAATCGTTCGTTGGCAGTGCGGTACTTCGTATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACACACAG:1 + chr3L 15462521 5' + R2-element 3517 1 54.46 AAAATCGCAAGAGAAGAAAAAAAGGAAACAAAAGACGCACGTGGTTGCCACGGAACTAAAAACTTTTGGCTGCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chr2L 16683799 5' + P-element 4 2 73.27 TTAACTGGTCCCGATTGATATTCAAACCTTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTG:1 + chr3L 12312714 5' - invader2 4698 1 72.28 ATTTTAAACTCGGGCGTAAAAAATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTGGTTGTGAT:1 + chr2R 12812286 5' + jockey 61 1 70.30 TAATATTAACTGACGATAATTTTAGCAGCATTGTTAAAGCTGTAATGTGGGGACGCAACGTTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTTATATTTATTTATTTGGAA:1 - chr4 349875 5' - Tc1-2 476 1 60.40 CAACGGCTAAAATGGAGCAGGGGTGTCCTGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1 + chrX 2841784 5' - hopper 1371 1 69.31 GTCGCGTGTTTGGGCCGGGTTTGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCC:1 + chr3L 16282352 5' + gypsy5 6960 2 61.00 ATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTG:3 + chr3L 3540128 5' - mdg3 5473 2 54.46 TTCACAATGATATTCACCATTTGAACGGTTTTTAATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 - chr2R 5772522 5' - HMS-Beagle 7009 2 64.36 AAACGTCAAATTGCAACACCTCGCGGGCAGATACAGATGCAGGGGTAGAGATACAGATACACGGCATACACAGACAGGCACAAAGCTTTGTCCACTTCCTG:1 + chr3R 13938847 5' + diver 5788 1 71.29 ACCACTTTCTGTTAGCACTGCCAAATGGTTTTTCCCAACACCGCAAATTGTTGTCAGAAGCATTCTGTTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3R 12333807 5' + P-element 6 2 71.29 CCTAGTGTGAGAGAGAAACNCGAAAGGTGCCAAATCTGGAGCTTGGCATACGACAGCCAAAATAAGGTCGCAAGACTCATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGT:1 + chr3L 11596681 5' + X-element 4321 1 75.25 TTTTCTTTTTTACTGCTTCTTAAATATGCAGCCTTTTTTTTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATT:1 + chr2L 15220204 5' + invader4 2790 2 60.40 CAGGCGAATGTGGGTGGTGGTAACTGGAAGTGGTAACTGAAAAAGTTTAAAAGCTGTAAAACAATACAGCTTCCGATAGACAAACTTTAGGAAGCTTGCGC:1 - chrX 12167736 5' + Gypsy12A_LTR 44 1 65.35 CCATTTAATATAATATAATTTTATGTTACGTTAAGCAACCAATTGAATTGCTTTACAACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 - chrX 11088298 5' + blood 7028 2 62.38 GTTCCTACGTAGGCTGCCGTTCACAATGATATTCACCATTTGAACGGTTTTTAATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 - chr2R 5772541 5' - HMS-Beagle 232 2 65.35 TACAGAAATTGTAGCAAATAGTAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACA:1 + chr3R 22248596 5' - hobo 2568 1 78.22 ATAAAATTATAGTGCCATCGCTCGCGTTTATAATAATAATAAAAGAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCATGGCTATCAAATAACCGTTACTCAGCTAGTGT:1 - chr2L 22130742 5' - INE-1 540 1 90.10 AACAGGTGCGGAAGTCGAAGTTAAAACACACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr2L 13093785 5' - roo 9027 1 71.29 TTAGGTTTTGCCATTCGATGTCAATTTAAAGTTTCTCCTCTACTTCCCTTTCATCTCGTTCTTTTCTATTGCTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTAC:1 - chr2R 18733807 5' + copia 4 2 74.26 AAATAGGAGGTTATAGCACAAAAAAACAGCAAAAAAAAAAAGGGAAACAGAA:1 - chr4 105308 5' + Doc2-element 231 1 65.38 CCGTCGGAAAGCAGGATAGCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr3R 23543023 5' + 412 28 2 56.44 TGCCTGGAGCTCACCTTCTGTATGCCTACGCTCAAGCTCACTAGGATATTCTGCCATATTTACACTCTACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chrX 5219787 5' - hobo 2931 1 73.27 GAATCGAGGGTTTCTCTCAAAATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGT:1 - chr3R 10741147 5' + 1360 3360 1 42.57 TCCTTATTTATGGAGAGCATTTGGCGTAATCCACCATCATTTATACCAATTTGCGGGCAAATTAAGTTGCCGCCTGGGTAACAGTGCGTTGATCA:1 - chr2R 23115862 5' + jockey 4969 1 71.58 AAAAATATGAATCCACACTTGACATTCACGTAGTACAATAAATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 + chr2L 20684274 5' + I-element 33 1 62.38 CAAATGAGCATAGACGGCGATGCAGATAAGAATGAAAAACTAAGTGCAAAAAAGACTAAAGTAAACCAAAAGTAACAAAAATACAAGAAAACAAACAACAA:1 + chr3L 15457745 5' + S-element 166 2 62.38 ACTATTTTAATGTAACAACTATTTTTATAAATACGTTCTTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 - chr3R 6947381 5' + I-element 20 1 49.38 AAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACC:1 - chr3R 11151892 5' + mdg3 5283 2 55.45 AAAATACCTATTGGTTTCANAAAGCGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr3R 27169442 5' + 412 51 2 75.25 CATTTTTTATGTGTGGGAGAGAAAACATAACAATGCCAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr3L 7307220 5' - hobo 2901 1 66.34 AAGAACAAAAATATAATCCTTAGAATGCGTTCTTGGACGTCGTGCACACACCAGAACAGGTTCCCTTGCCTTCCATAAATTTATTTCGTTACACGTTAAA:1 + chr2L 21647437 5' + Gypsy12A_LTR 2259 1 60.00 CCAACAGATGGAGCCACAAAGTTAAGCGCAAAAAAAATCTAAACATTTTTTAAAATCGTGGGCGTGTTAGTTTTGAAACGGACATGGCCAGATCGACTCGG:1 - chrX 20996626 5' - INE-1 107 1 70.30 CAACGGCGTTTCAGTCCCCGTATCTCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2R 9649222 5' + roo 51 2 77.23 TACTCATATCTATTAGGTTTTAAAGTGTTTCTACAAGTTTAACCGTATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 4063684 5' - roo 9045 1 52.48 ATTTACAAGCGTCTAGCGCCTCAGTCGCGGCTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCT:1 - chr2L 3838647 5' - Stalker4 7175 4 69.31 ACTTTCTGAAAGGCTGGGAGAGGGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chr3R 7626431 5' + hobo 49 1 74.26 TTTGGGCTTTCGCATTACGCATACGCCATGCTGGCTTTGATTTCCCATATTAATTTATCATTTATAAACGATTATTGTTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chr3L 7099234 5' + roo 8666 2 43.56 AAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chrY 311341 5' + 1360 14 1 50.50 CTTTGGCAGCCAACTGCTGGTCACATTCGCGACATCTGGCAACGCCTCCAGCATGTTTTGTTCAGCTCTACGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr3L 20520771 5' + P-element 1 2 76.60 GACGTCTTTCAGAATTGCAAGAATTTTGCAATTAAGTATCGAATACCTAATAATTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 + chr2L 20118373 5' - copia 232 1 61.39 TCGCTCCTTAAACCTGCAACACACTGTTGGAATTGATTTTCAAACCTCGATATATTCGCTTTTTATTATTAAAATAAAAAAAA:1 - chr3R 16847077 5' - hopper 158 1 78.31 GCGAGCTGACTTTCTGAAAGGCTGGGAGAGGGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr3R 7626439 5' + hobo 41 1 66.34 CTCGCTGTGGAAGCTCTTTGTTTGCCTAATTTTTTTTTTAACCGTTATCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTT:1 - chr3R 24724993 5' - Bica 475 1 69.31 GTTAACTTTCCGTAAAAAAAAAGCAACCGACGTCACAAATAGTATCGTACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTT:1 + chr3R 19987368 5' + Doc 2 1 75.25 TCATAGGCCTGTATGTACTATAAGAGGCAGTAGTAATCCATTAATCCAAAGACATTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr2R 5143486 5' - 1360 3378 1 71.79 ACCCATTTGAATATTCAATTAAGTCTAACTGGCATATCGATAACAATTTACAAAACTAATAAAAATATGAAAAAATATTAACACGTTTTTCAAAAGTGTGG:1 + chr2L 18117705 5' - INE-1 258 1 71.29 AGTGCCAACAAACAAACAAACACTGGCACACACGCACGCACACAAGCGCAGGTGATCGTTTGCTCACCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGA:1 - chr3R 24767882 5' + P-element 11 1 66.34 AGGCATGTATGTATGTAAACTCCTTGAAATTGTTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTT:1 - chr3L 23288842 5' + invader2 4910 2 72.28 TGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTACGTTTGAATCGTTTT:1 + chr2R 19091626 5' - Stalker2 348 2 77.23 CACTTTCGCAGCAGCTTTTTGCTGGTATCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTTATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCC:1 - chr3R 6032553 5' + Quasimodo 301 2 74.26 TGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGACCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chr3R 7869119 5' + 297 33 2 61.39 TAACTGTGCCGTTCTGCATTTGACCAAACAGTCACTATGTTTAACATTTTTTGGCTTTAAAGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3L 2022323 5' + roo 8679 2 65.35 TTCTTCCGACTCGAGCTGCNGGTCGGATGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGT:1 + chr2R 6438341 5' - Stalker4 384 1 55.45 CATCGCCGCAGATGTCACTAAAATGACCGCAAATGCCCCCATATGCAGTTTTGAATATCAAGTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2L 22197190 5' + roo 15 2 62.38 TTTCAGTCACTGACAGTTAATCAAGGCGTAGGGAAGTGAAGCTGGGACACGAAAATTGCCCACTGTCTGGACAACAACCAACAAAAAACAAAAAAAGGAAA:1 - chr3L 16174708 5' + Doc2-element 226 1 54.46 TGGACACAACGCCTTCTGGGGTGTGTGTGTACGAGTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr2R 8311364 5' - opus 7464 2 65.35 GGTATTATCTCAACTTTATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAG:1 - chr3L 15452935 5' - accord 7351 2 54.46 CTCACTTTGTACTCGTTAAATTAAACTCAGCTCTTCGGTTTGTTTGCATTTCGGGTTCTGTTGCACATGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTC:1 - chr3R 17348364 5' + F-element 177 1 77.23 TTATTCAATCGTTCAAATTCCTCAGTATGATTTAATATTGATAGTTTCAGCGGATCCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTC:1 - chr3R 19449701 5' - roo 8741 2 58.42 CGTCCTTCGTCCTCAATCCGCAATCCACAATCCTTTCAACATCGGCCATACACCGATTACCATTGCCATGCTCTGTACTGAACTGTTTAAAACAACCGAGA:1 + chrX 10154725 5' - R2-element 3297 1 82.18 TAATATTTTTATTGATATTNAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr3R 9278394 5' - roo 9038 1 60.40 TTATTGCAGGAGGCAGTTGCCACTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATCAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCG:1 - chr3R 22494201 5' - 297 6967 2 70.30 AAATGATAGTGAAAGATTACAATTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2L 21086101 5' + roo 8691 2 54.46 AATAATATAATAATGACATAATGACAAAAAAAGTGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGTCAAGATCAGGTGATC:1 + chr2L 18067237 5' + invader2 4815 1 75.25 AACGAGGAAAAAGAATGAANCGAAGGAAAAACACATGCTGAAAAGTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTAAATATTTTCATTT:1 - chr2L 7569049 5' - TART-B 10623 2 61.73 TGGATTACCAGGGTAAAACCAAAGACACGAGAATAATGTCTTTATTCTAATGTTTTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGACTTGGGATTTAGGTAGTGT:1 - chr2R 5952579 5' - I-element 4979 1 62.38 TAAAAGTGTTTAAAAAAATATTTCGCTTTTAAAAAATTGTCAGCTTGGTGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTATGGAATTGG:1 + chr2R 21963199 5' + 1360 3113 1 64.36 ACACAATAAAATATAAATGCTTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATGATATGTACATAGATTTCGCTATTTCTAAT:1 + chr3R 2449046 5' - 1360 336 1 79.21 TTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2L 12958924 5' - roo 9028 1 71.29 CAGAAATCTTCCTTGTTCCCCCAGTGCGTATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCACATCCTTTGGGTTCTTATTGGATACACGATTTTATGACTTATATCCTA:1 + chr2L 1143582 5' - Quasimodo 100 2 57.43 TGAGAGGGAGCATATGGGGCTGGCTCAGGCGAGAGCGAGAAAGTGCGACATGAGGAGGCGAATGATTGCCCATGGTGCAGAAGTGGATGGAGCGAAACAGC:1 - chr2R 10100915 5' + Rt1c 5084 1 52.48 TGCTTGCTATAGAAGGGCTCCAAAGGCTGGGTAGGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 + chr3L 3880992 5' - blood 7348 2 65.35 TCTCTCCCACTGTCACGCCCACTTGTTTCGGATTAGGTTACGGTGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chrX 6118979 5' - roo 409 1 66.34 ACATTAAAAAAAATATGAAAATTTATTCTTTAAAATTGAAAACTAGAGGGTTAGTGACCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGC:1 + chrX 21218805 5' + pogo 429 1 51.49 CCACTTGTTTTATTTATTGCTTTTTTAACCCTTTTTTTTTGGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:2 - chr3R 10488741 5' - roo 9037 1 61.39 TCAGTAATTTTAGCTTTTCNCTTGGCGACAGGGTTTTTTATTCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 12935179 5' - Doc2-element 251 4 90.91 CGAACTAAGAATATCCATAAATAGAGTCAGAACAGTGTGAACGAAGGCAAATGGAGTTTAACGAATAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATC:1 - chrX 18210961 5' + HMS-Beagle 6696 1 75.25 CATAAAAAACTCTCTAAGTGTACTTTTCTTACCCCCTATGAGCATGAATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr3R 13353200 5' - 1360 3360 1 55.45 ATGACCAACTGTAAAAAAAAGGGTGTTATAAAACAAAGAGTCTAAGAAATATGAGTAATATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 - chrX 22734107 5' - copia 238 1 52.48 GCTCCGGTTTTTACCTGTTCAGGGAAATTAAGTTGTAGGTGGGCGAAAAAAAAAACGAAATAAATACACGTTAAAAGATCGCAAAAGAATAAAATTTGAA:1 + chr2R 6047861 5' - hopper2 1370 1 76.00 TTGCTTTGCTTTTCGGGTCAATGTCAACAATTTTTTTTTTTGGGTGGGACGCACTGTTCGAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTC:1 + chr3L 22860667 5' - Doc 4619 1 62.07 TGCTTGAAAAATCTTTATTTATAAATAAAAAACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chrX 7797664 5' + roo 43 2 74.26 CCGTTTATTGTTTGTGTACGCACGCATAACGCCTGCAAATAAAAAAAGAAATTACAGCTCATTAGAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGAT:1 + chr3R 5993707 5' - pogo 38 1 76.77 GATGGGTTGCCGTTTTAATAATTTTGGTACGCGGCCTTGTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCGGTTTCTTATTTTATTCTTCTTAGTAGAGATACTTTT:1 + chr2R 22413832 5' - mdg3 5140 1 60.20 TTTCTCACTTCTGCCGCTTCGCCCGCTTATATTTCTTTTATAATTAATCGTCGTGGAATGAAGTCGTGAAATGTTCGTGTTGTTGTAAAATTATAACCTGC:1 + chr3L 23773453 5' + Gypsy12A_LTR 308 1 74.26 GTTTTCGCAGCCTAAGAGTAGGCTACACAAATGTCACATTTGCTTGCCTTTTTTACAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 + chr3R 27056374 5' - jockey 4967 1 51.49 GAAACGTGAATTTATTGCTTCTTCTTTTGCGACTTTTTATATGGTATTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATT:1 - chr2L 12611681 5' - mdg3 5077 1 54.46 GAAAAATCCGCATAATAAAGTGGATCCGCATGTATCCGTTGCTCTGTAAAATACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAA:1 - chrX 11021501 5' + hopper 418 1 71.29 AAATAAAATAAAAATATAAAATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 - chr3R 4511651 5' + 1360 29 1 73.27 CTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGG:1 + chrX 21852452 5' - gtwin 7362 2 54.46 ACAACATGATTGCAAAAGAGGAGCACATTTAGTACATACCAATATTTTTTATTTTTGGTTAAACAAGCAACTCACTCTCTCATGCTCTTCCTCTT:1 - chr2R 4626697 5' - Bica 5 1 70.53 AAATAAGAGCCCTTACGATTATCCTCATTGTACATATGTATTGCCCAATTTTGGGTTATCACATGTCTTTAAATTTGCTGAATGAAATTTTTATATATATT:1 + chr3L 17946933 5' + copia 4656 1 72.28 CAAAGTAATCACAAGGTTGTCGCTTTTTGTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAA:1 - chr3R 10605702 5' + 1360 102 1 72.34 GCAGTTTATTTTTCTTATCNTCACAATACGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGTTGACCTTACTCAACATACTTAA:1 + chr3L 21815429 5' + G2 2939 1 49.50 CAAAACCAAACAAAACATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chr2L 13566536 5' - hobo 2901 1 65.35 CAGAGCAATGAGAAGGGCATATGGAGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCC:1 + chrX 4403002 5' + I-element 216 1 75.25 ACTGTCAAACTTACGACCGCCCTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTT:1 + chr3L 7296654 5' - Doc2-element 218 1 53.49 TACAAATAATCAAAGAATATGACATACTTATAATAAATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGC:1 - chr2R 5738052 5' - invader4 113 2 64.36 TAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGA:1 - chr3R 3268035 5' + mariner2 94 1 64.63 GACACAAATGATAACACTCTAAAGAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3L 17701584 5' - roo 9021 2 75.25 TTTAAGAGGAAATAAACCTTTAAAGTTGTTTAAATACATTGCAATAAGCAAAATGCAGAACACCGGAGATTGTTTGCCTGCACCGCCCACTTCGCCTGACT:1 - chr3L 13411325 5' + Chimpo 258 1 60.40 TACGCACATTTTTTAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr3R 8582611 5' - roo 9039 1 55.45 CAGTATGAATATTTTAAAGCAAGCATATCGATATCCCATATCCCTATCTAAAATTTAATTCAATCGACTTGCATGTAGACTATCCCGAAACTTTTTGAAAA:1 + chr2L 12880096 5' + Q-element 134 2 71.29 ATATATTTCCACATATACANTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3R 12944674 5' - roo 9041 1 61.39 CAGAATTCTAATGTCCTTTGCTCACTGTACCTGCGTAACATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATG:1 + chr2L 7937249 5' + jockey 4558 1 61.39 TATTAGTATGTATTTGTGTGTATGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr3L 14594165 5' + hobo 46 1 74.26 TCGCTTCCTTTTTGAGGGGAAGCCGGCCAAAAGGACATTAAGGAAATTACTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCAC:1 - chr3L 13569808 5' - invader3 248 2 51.49 TTAACACTGACGTACTTGANAGACCAAGCCTTTTCAACTTCATTCTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTA:1 - chr4 74330 5' + 3S18 31 2 53.47 ATAAAAATTTATGCGCACAAAAGTATGCCACACAACATGCACATAAAATGATTATTATACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 - chr3R 20332939 5' - jockey 4974 1 59.41 ATAATAATGATAATTTGAANAAGGAGTATTGGTGTTACATGGATTGTGGATTGATAACAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTATC:1 - chr3L 7345437 5' + pogo 13 1 65.35 AGATAAGTGCTTCCTGTCTGTATCAAATTGATTTATTGCCAAATATAGTAAAAACAGTTTTTTGCTCTTCCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chrX 6457984 5' - hobo 2937 1 74.23 GGTGGGGAGGCAATGGGCGCTGGCAACTTGGGAATGGGCACGAATGGGAGCGGGTGGCCCGGTGTAATGATGACCTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chr3R 6961148 5' - 412 476 2 57.43 TTGGTAAAGAATTCGTTTTAAATGCCCTTTTTTTGTGTCTTCCTAAACCTCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACC:1 - chr3L 3233509 5' + 1360 261 1 57.43 CCGGATCGGGGTTGATTACCTCCCCGCGTCCGCCTGGAAAAACCACCCCCGTCCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAAT:1 + chr2L 16131871 5' + copia 4823 1 48.51 GTGGGTGGCGCAAAAATACNTCACTAAATAGCTGTTACATACTTGGCAACGAATATACCTTTTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATAC:1 + chr2L 21715747 5' - 1360 3372 1 64.84 ATACATGAACTAGTGCATTTCCATTATGTATTCGATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACT:1 - chr3L 13896272 5' - hobo 341 1 66.34 CAGCAGCGATGTCCACGCATCTCGGTGTGCCTCGCTCTGCAAACTCAAATAGTAGCCCAGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATG:1 - chr2L 13798875 5' + Bica 4882 1 64.36 ATATCTAACAAAACCACAAAGCAGCATCAGTGTTCCTTACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chr2R 24555628 5' - hopper 1379 1 58.42 CTCTTCGCTCATATTTCAGCAGCTCATTGGAGCGGAAACATTTCGTCTGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 1783296 5' - roo 9045 1 53.47 CCTTGGGTAATTTATATGCTATTACTAATTTTGGTAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACG:1 + chr3L 13569747 5' + invader3 43 2 64.36 TGTTGACGACGTGACTTTAATGAGCTCAGGAAACGCCCTAAATTCAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 + chr3L 7300491 5' + Doc 35 1 58.00 CATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:3 + chr3L 27357565 5' - 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Stalker2 357 2 63.37 ATGCATGGCAAACTGAAATAGGATATACATACAGCGCAGATAGATACATGAAACATGGAGTAAGGCTAAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTT:1 + chr2R 10014789 5' + flea 31 2 53.47 ATTGACTAACTTTTTGATCCGCACTAATTGCAATCCGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr3R 6143782 5' + Doc 46 1 66.34 GCAGTTTATTTTTCTTATCTTCACAATACGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGTTGACCTTACTCAACATACTTAA:1 + chr3L 21815429 5' + G2 2939 1 49.50 CGTACAGACTGGACTGCAGCAAGGCCTTGGCATCCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCAC:1 - chr3R 9566386 5' - roo 265 2 66.34 CTGTTCGGGTTGTAATTTCTAAACTTGGCCATTAGTTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr3R 28621079 5' - 1360 3351 1 67.33 ACTCGATCCAGTCGATCGGTAATGGTGCGGACTTTGGACGCGCACAAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTTTCC:1 + chr3R 2533865 5' + Max-element 8326 2 54.17 TTATAAAAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 9278406 5' - roo 387 2 59.41 TTAAGAGTGAATTTGTTACAAAAGCCCGTGTCGAGAATTAAAGTAGGTATAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCT:1 - chr3L 4554993 5' - invader1 4001 2 61.00 CGAATACGTTAGAATGAAGGGTATAGGAGAGTCAGCTAGCACATCTATAAGTCGATTTCATGCGCGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCC:1 - chr2L 20875249 5' - R1A1-element 5334 1 63.37 ATGGGATTATCTTTTTTATAACTCAATTGAAGAATCAGCGCAGTCGATCTGGCCATGTTTGTCCGCATGAACGTCAAGATCTCATGAACTATAAATGCTAG:1 - chr3R 4713048 5' + INE-1 152 1 71.29 GTCAAAGTGTTGGTAACTGAGTGGTTGCTTATGTGTGCGTGTGTTTGTGTGTGGTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr2R 23671765 5' - hobo 2917 1 59.41 TTTATTTATGCAAAACAAACCGAGACCTTTGCCATTCGCTCGCCACTCGTTTTGATTCATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATAC:1 + chr2L 2546529 5' + Doc 210 1 56.44 TAACATAGCAGATTTTCACTGACACCAATAACTAATTCACTTAATTGTTCAACAGTGACCCGATTGCGAGAGCACTGGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGC:1 + chr3R 19506193 5' - mdg3 81 2 79.21 ACTTTAATGATCATTTGACTTCAATTCAAGATTTACGTTTTGTACCGTAAAAAATAATGGTAAACGCTATAATCAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTA:1 + chr2R 9236989 5' - INE-1 552 1 72.28 TTGTATCACATGCAAAGTTTTCAGACTAACGAGAAATATAGTCTGTTGTTAGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGAT:1 + chrX 22689543 5' - 1731 4591 1 58.42 TTTATTAATTTGTTATAATTTTTTAGTTGACTTTTTTTCTTTTCAATTTATAACATTTAAATAACTCGTCCAAATACTAATTTGTAAAAAAGTAGTTTTTG:1 + chr3L 20029233 5' + Tc1-2 1460 1 71.29 CAATTTTCTTGCATAAATCGCTTAAAGAGCAATTGCCAAGTTTTCCCCCAAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGA:1 + chr2R 16908402 5' + Doc 4504 1 52.48 TTTGCATATTCTCTTATTTAGTTGCCATTTCTGACATTGATTTAATGTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3R 19449279 5' + roo 76 2 54.46 ATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGATATTTCGTGTTTCTGATGCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGA:1 - chr2L 22762327 5' + invader1 117 2 62.38 CAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTC:1 + chrX 14317414 5' + 1360 50 1 69.31 CTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:2 + chr3R 29608801 5' - roo 353 2 80.20 CGACGACGAAGGACACTCTCAGGCAGATTAAACAATCCCGCTCTGCGCTTAATTAAGGATGCACAGAGCTGTGCAGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCT:1 - chr2L 2535481 5' + blood 277 2 78.22 CCATAATGTAAATCAGAATGGTATGAGAGAAATCTACACTAGTTATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr3R 15579041 5' + pogo 28 1 54.46 TTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2L 17730525 5' + pogo 18 1 63.37 TCTTGATGACAACTTCATACCCAACTCAGAAAAACTATGTTGAAATCTTTTTAACATGCATCACCATCTGATTAAAAATATGTGTCGGAGCGCGACTCTTC:1 + chr3L 20454500 5' + invader4 2757 1 81.19 ATTCATAAACCTGGTTGACACTGAATACCTTGTCTCAATGCTTCGCGGCAAATTTATATTACATCAACACGGATTTACTGGAAGTTCCCCAGAGTTCTATT:1 + chrX 368860 5' - Porto1 4280 1 75.25 GCTTCGTCACTACGCCAACGGCATTTCCTGATAATAACAGGAAAATTTTACTTGCGCTTTTTCTTACAATCTGTGTAGCGGGTATCTGATAGTCGGGGAAG:1 - chr2R 6206200 5' + INE-1 556 1 71.29 ACATGACGTGCCGTTGATATTTATGTCGTCGCCATTGTCGTCTCAGTTCTCGGAACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:2 + chr3R 26252662 5' + 412 7074 2 58.42 TTTTTTTTGCGCCTCATTGGCTTTCAGCTATTTGTAAACCCCAACAGCCTAGCA:1 - chr2R 11160584 5' + jockey 4669 1 64.81 GTGCTTGAAAAATCTTTATTTATAAATAAAAAACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chrX 7797663 5' + roo 8706 2 73.27 CTGAAATTGACTAACTTTTTGATCCGCACTAATTGCAATCCGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:2 - chr3R 6143787 5' + Doc 41 1 61.39 TGTGAGCGTAGTTGTTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTC:1 - chr3L 5241187 5' + Ivk 20 1 59.41 TTTGTCTGTAAGGATTAAANTTTGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGG:1 - chr3R 20094524 5' + Max-element 8260 2 53.47 CTGCAATTAATCAGAGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr2L 17677776 5' + Tirant 8 2 60.27 TTTGTAAAAGAACTTAGTGTTAAACATTGCTGGCTGAAGGCTAGTTAATACTTTATACATATATATATAGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 - chrX 17104486 5' - 297 371 2 63.37 CAGACGTGGGATTCAGATTTATCAAAGTATATATTCAAATCGTTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGC:1 + chr2R 24432699 5' + flea 327 1 57.43 TTTTTAAATCTACAAAATAGATACAATATACAATATACAACACAATATACACACATATAAATAAATAACAAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAATAAA:1 - chr3R 2259923 5' - transib1 1897 3 62.38 GTCATTTTCGTGCCAAATGNGTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAA:1 + chr3L 20049649 5' + jockey 4817 1 78.22 CTATAACTTCACTTTGGACNAAGACGACTACGACTACCACCTGGCAAGGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACA:1 - chr2R 16407063 5' + Bica 4619 1 52.48 TTTGCGTTTTTCTTTTCTTTTTGCGGCTCTTTAAGCAGGTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 - chr2R 8177768 5' - mdg1 389 2 57.14 GCATCAACTTAAATGGGAAACGTGTCTACCCCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:2 + chr3L 18418852 5' - hobo 2894 1 67.33 TTTCCGCTTTATTTGTCTGCCTGCCCTTTCACCCGCGTTTTATCTATCCAGATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr2L 20612036 5' + 297 11 2 69.31 CCTATCATGTTGGACATGTATGGATTGCCTATCGCCTATTGCTTATAGCCAGAGCTCCTGGGGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAG:1 + chr2R 19904440 5' - R1A1-element 5215 1 67.33 CTCGTTGCCTGCCATTCAGTTTTGTTCTTTTCATGTTGCAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAG:1 + chr3R 26658864 5' - Porto1 4468 1 61.39 AAGTTAATATAACAAAACATTATTTAAAAATGTGGGCAAGACAGTCTTGGATAGTCTGTGAGGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTT:1 + chr4 339558 5' + Doc 335 1 65.35 GAGAGTAAGTACCGTGAAATTTATCAGAACACATATTGGATATTCACGNAAAACAAGAGAGTATGCTATAGTCGAGTTCNCCGACTATCAGATA:1 + chr3R 19978309 5' - INE-1 559 1 50.00 TGCTGTACACGCTGAAATTGACTAACTTTTTGATCCGCACTAATTGCAATCCGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 - chr3R 6143798 5' + Doc 30 1 50.50 GCGGTCGCCGATCGGTTGGATCGCAGCGACGAGGAGCTGAAGCGCCAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAA:1 + chrX 4266280 5' + mdg3 235 2 55.45 ATATATGGCATATATAGCATATGGTATGGTATATGGCTGGGGGGCGATTTATGCCACAAAAAAAAAATACAAAAAAATGGG:1 + chrX 11686598 5' - hopper 140 1 95.06 TTTCTGTTTCGACACGAGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGGTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAA:1 + chr2R 24965025 5' + flea 203 2 79.35 TGATCGCGAGATATTAGATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTC:1 - chr3L 20224247 5' + Chimpo 5 1 75.25 TTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAAT:1 - chr3R 19449410 5' + roo 8644 1 69.31 TTCTTGTACGCACATTTTTTAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 8582617 5' - roo 9045 1 52.48 TATAGCCACAACTTCTGATCAATCAGCGGATCCATTAAGATGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTA:1 + chr2L 12241041 5' + F-element 4251 1 59.41 GCCGCCTGTTATTTTTTGCTCTCTAATCAGAGCGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTC:1 + chr2R 13383518 5' - gypsy5 7318 2 63.33 AGAGGGCGCGTTTTAATTAGGACAGATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAA:1 - chrX 15263475 5' + invader3 65 2 75.25 TGGATTTTGTGCGGCTTAATTTTATTTTGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAG:1 - chr2L 18589945 5' - copia 4882 2 77.23 TGACACGAGGACGAGGACANCCTTGGGCCATTCGCCGGCTGATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTT:1 - chr2L 20045832 5' - roo 404 2 73.27 AAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr3R 19987423 5' + Doc 56 1 76.24 ATTTTCGTATTGCTAATTTNGTGGCCATTACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTTCAATTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr3L 8039327 5' - hopper 1407 2 48.48 CTCCCATGCATAACGAAACCAGAAACCTCTTCGAAGATGATTAGGCCATGCCCATTTCCGGACAAAATGTTATGCAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGG:1 + chr2L 14220119 5' - springer 7518 2 76.00 CGAATGGTCACCCCAAAATGGTCGGTTGTAAGCCGTGTTATTATTATTATTACTTGTGTTTATTATTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGC:1 - chrX 12130327 5' + 3S18 8 2 71.43 CCGTACTACTTGTTGAACCTATCACATGGCGACCGTGACAGTGTTCACGTGTGCATGAAGTTAACGATTATAATAAAAGCATGAAGTGTCCGTGGCCAAAG:1 - chr3L 24104300 5' + Stalker4 482 1 76.24 AGAAGAAGTGCACAAAGGCCACAAGCTGTAAGATATATGTAATGTAGAAGCAAAAGGAAAAATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chrX 13126190 5' - mdg1 7444 2 57.43 GATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 + chr3L 19349934 5' - 1360 3372 1 57.58 AATTTAAAAATATTTAAATAAATGGCAAATGTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1 - chrX 22789374 5' + Tabor 46 2 69.31 AACGCTTCGCTTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3R 8765559 5' - roo 9029 1 75.27 TTTAAATGTGTGTGTGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTT:1 - chr3L 3540224 5' + mdg3 5264 1 67.33 TGCAAGGATTTCACAAAGTTATGTAAAGTTAGTATTCCATCGTTATAAAGGTTAAATTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTC:1 - chr2R 9715461 5' - P-element 7 2 62.38 CAAATCGTTTGGGTCCCCATTGTCCCTTATTTGTCTTTCAGATTCCTTGCTCAGATGCAGTTTTTGAATATTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCT:1 + chr2R 5494572 5' - Doc 4569 1 74.26 AGTAAAAAATACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr3R 11052094 5' + blood 7037 2 55.45 CCTTCGTGAGTTGAACAATNTGGGCTTCCCTGCCTTTTTAAGTACGTTTTTGTTTTGTTTTTCATTTTATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTT:1 - chr2L 15123967 5' - R2-element 3407 1 67.33 TTTCCTCCTTTTTTAATTCAACTTTGTTTGCACATAATTTTTCGGAAACAAGCGTCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2L 12958898 5' - roo 9054 2 61.39 ACTGAAAAGATACTTTTTACTTGTTTTTCGAGCATAAAACAATGATACTACTACATAATGTATAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAGATC:1 - chr2L 18181791 5' + copia 472 1 66.34 TTTTCTTTTTGCGGCTCTTTAAGCAGGTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTGCA:1 - chr2R 8177756 5' - mdg1 374 2 67.33 CCCGGACTTGGACCCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:2 + chr2L 12808155 5' - Tirant 8479 2 54.46 TTTCTGATGTTCTTCCAATTATGGCATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr2L 5926945 5' - pogo 2053 1 73.27 TTTGTCTGTATAAAATCCTAAACCTTTTGTTTTCTTCCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGA:1 - chr3L 12586337 5' - R1A1-element 299 1 63.37 ATGGTAGTGCAATCAATGAGCCGGAAATGTGTCCGTCTTTGTAGAATATATATATATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCT:1 - chrX 11262917 5' + invader1 22 2 58.42 CTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGATGGCAGCCGTC:1 + chr3R 30553563 5' - 412 7511 2 61.54 TCATTAGTTTTCCACACACNCACACCACATATGTTCAACCTATTTTTTTGGTGCTGCCTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr2R 18766287 5' + hobo 19 1 55.45 GCCATTTACATAAATGCTTTGAATGCATTAATTAAAGTCCAAATGCCCTGACTCCCTCTTGCTCCATCCAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCG:1 - chr3L 10435653 5' - R1A1-element 5031 1 70.30 CGTTTGCCCTTGGGGCGAATTTCGCTGTGCAAGAACAAGATGGAAAATCTATGCACAAAAAGGGGTAATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTC:1 - chrX 9775076 5' - 412 7535 2 67.33 AGATATGCTTATAAAAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:2 - chr3R 9278414 5' - roo 395 1 67.33 AGCTGTGCCGTGGACAAGGAAAAGCGGGAAAAACGAAAGGGAAAATGGGCGTGGCTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGA:1 - chrX 13447338 5' - Circe 108 1 61.39 TTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAGATTGTAGCACT:1 - chrX 734960 5' + Tabor 6889 2 70.30 TTTCATTATACCTTTATTATTTTGAAGGGGCGGACACGATGCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 + chrX 15255351 5' + Tabor 6875 2 58.42 TAATTCTTCACTGCCCAAACCAATCCCATAATAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACA:1 + chr2L 23174304 5' + diver2 4896 2 70.30 AACAAATTTTTTTTTATGATTTTTGTGTTTGTTGTATGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - 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Tirant 8470 2 63.37 GTTGCCCACCGATCACCGAGATCACCTGTCTTCATTTTATGGGCCGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:2 + chr3L 3650040 5' - mdg1 7427 2 55.45 AGTCTGATAGTAAGCTTGCAATGTAATCGCAATCGATCATCAGCCACACTGTGAAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3R 28621009 5' + 1360 23 1 57.43 GCCATCCGGAAATGAATTGCGGAATGCATCAGACTCAGACTAAATGCCGTCGCAGCAGAACAGCAAAATCACAGCAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 26346619 5' + G2 3077 4 68.00 CAAAACGGAATTATCCAAGGGATGCATATTAAGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCACACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCAATTTTTTA:1 + chr4 956545 5' - 1360 3341 1 65.35 CCCTAATTTTGTTAGCTTTGCGGCTTTTTTTCCACTTCAATAACTTAATTAATATTGTTGGGTCATGCAGCTCATAGTTAGATCTAGAATGATTTAAGATA:1 - chr3L 24809342 5' - Cr1a 4144 1 70.30 TTTTACATCACTTCTGTTTGCCTTTCTCCCAGAGCCACAGCTCCGCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr3R 12199828 5' + jockey 26 1 52.81 TTGCACGGGAAGCTATGTGTGTACTCCCAAGCTTTTCTTTTTGTTGTACTAAATAATTGTAGTTTAATAGCTGATTAGAACCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 - chr2L 17079928 5' + jockey 4776 1 79.21 CGAACGTGGCTCAGCAGGAGCTAAGTATTGGGTTTATACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr3L 171231 5' - 1360 3347 1 72.28 TAGGGTCCACTACGCTTTTGGTTTAACAAACATACTAACGTTATTTCCCTGTTAAATGGAAGTACTGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chr3L 7307301 5' + hobo 11 1 66.34 ATATACATACATATACATGTACATATACATCCACGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chr2R 15349505 5' - P-element 2843 1 36.63 TCTCCATGATCGCGCGCAAATCTTTTATTTCGCATTAACTTTGTCCAAACTTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATCCTGAATCTTAACCTTCTCGCTTT:1 + chr3L 7338885 5' - INE-1 166 1 55.45 CTAAGAGTGCACTTGAGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr2R 9649180 5' - roo 9032 1 64.00 ACACACACACACACACACACGCAAATACAGACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr3R 9418240 5' - 1360 3345 1 70.30 GGCTCGCTTCCTTTTTGAGGGGAAGCCGGCCAAAAGGACATTAAGGAAATTACTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTT:1 - chr3L 13569811 5' - invader3 251 2 52.48 ATTGGCATTTTAGCCCACACAGTACGCCCCTACGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chrX 10286155 5' - roo 9031 1 66.34 TTACTTCTACAGAACCCCCCTCCGTATCCTGGCCACATCCTTGCCTAAAACCCTTAAGTAAGTCACAAAAAACCTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAG:1 + chrX 4147283 5' + G-element 5 1 59.00 TATATTTTAAACGCAATATTCAACCTTGCAGGTTAAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGG:1 + chr3R 26134953 5' - Quasimodo 339 2 65.35 AGAACAGTGTATCCTTTTGTTTTATTTGGTTATTATTTGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chrX 4277527 5' + roo 36 2 63.37 GCTTTGAATGTATAACCACAAGGCATCGGGGCTAATAATTGAGTAGACGCCCCACGAAGCCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr2L 20567803 5' + 297 14 2 64.36 GGGTATATTAGTGCAGCCATGAGGTTTGTCTGTAAGGATTAAAGTTTGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAA:1 - chr3R 20094548 5' + Max-element 1 2 78.22 AAGGGGTAATAGTAATTGAAGGTAGTTGCTTAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTATATTTGCACACTTCAACTTCTTTT:1 + chr3R 22869391 5' - Bari1 1670 1 60.20 CAGCGAATAATAGCGCAAAAACTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATA:1 + chr3R 19505535 5' + mdg3 5281 2 52.48 TTGCATGAGCCTATTGTCCTAAAAGTATGCAACACAAGGACCATCACTTTCGCCAGCGCGCTGGCAGGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2L 10166080 5' + jockey 14 1 71.29 AATACCTATTGGTTTCAAAAAGCGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chr3R 27169444 5' + 412 53 2 81.19 ATGGCAGAAATTCCCACCTCATGACGCAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAAGATTTTACTTGTTTATCA:1 + chr3L 18675321 5' - P-element 2574 1 34.00 AATCCACTCCACTGGGCCGNAAAACCATTCGACAGCCACGAAAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATAT:1 - chr2R 19560227 5' - Tirant 8485 2 52.22 CAAAATAACCCAGCCGAACGAATGTCGAATGTTGCCCGAGATCAAACGCAGAGCATTGGGGCATGTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAAC:1 - chr2L 684219 5' + R1A1-element 481 1 66.34 TGTTAATTCGATCGTTAAGCGGACTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chr2R 21351033 5' + opus 42 4 75.26 TAACATTATAAAAATTTAAAAATAAAATAAAAGTGATTTAAATCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3R 12944742 5' + roo 34 2 63.37 CATATCTGCTGGTACTTTACGAATGCATTCCGCCTTGCTGATATTTGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACAT:1 - chr3R 15574016 5' - 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roo 9042 1 57.43 CAGCTGATTGAGTGATTTTAGCTGCAGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 + chr3R 27116740 5' + P-element 51 1 26.73 CGTATGTGAAGACGAATTTCTCAACCAATTCCATTTTTAAGTCAATGATTTTTTTTTTGTTTTTCTTATA:1 + chr3L 8561617 5' - HMS-Beagle2 482 2 85.71 ATTTTTGTGAAGTAATTTAAGTCGACCCATGAAAATGTTAGAGATCTAAATTAAATGTGATAAGAAATTAAAGACTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTA:1 - chr3L 4565568 5' + copia 4872 2 67.33 AATATTAAGTTACCACATTATCAAGCATTTTTCGCAGTGCACTCCTCACTCATGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACCCTTAGTC:1 - chrX 4264422 5' + mdg3 5274 2 56.44 TTCAGCGACATGGCGGCGGAACAGAGAGGCAGAAATTAAGCCTGACAACTATTTTCACTATTCCATTTTTCACTGTTGGGTGTGTATGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 3001632 5' - Quasimodo 40 3 60.00 TAGCAACAAGTCAGCGGAANCTAAAACCGAATAATCCGATTACAAGCCATACACGTACTCCATATATATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTC:1 - chr3R 25750258 5' - micropia 450 2 73.27 GATCTTCGATTATTCGGATNTTGTATTTTTTTTTTTATTTTTTTTTT:1 - chrX 2667430 5' + hopper 145 102 87.23 CCTGTTATTTTTTGCTCTCTAATCAGAGCGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCATTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGT:1 + chr2R 13383522 5' - 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chr3R 19216422 5' - 1360 3367 1 57.43 TCGATTCTGCTCGGTTTTANTTTTCTTTATTTAAGACTGTACCAACTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAAC:1 - chrX 1133473 5' - Quasimodo 7330 2 57.43 TCCTTCGCTTGCTTGGCTCCCGTTTTTAGTGGCGAAGAGCTTAGGGGCGAGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTAATTTCGTGGAGTCATAAGCATTGGTGAGCA:1 + chr2L 20472146 5' - Doc3-element 389 1 54.46 CTGTTTGAAGCTCTCTGTGATTCGCTACCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCAT:1 + chr3L 23080082 5' + 17.6 7028 2 72.28 TCCGAATAAGCTGCTTAATATTTTTTCTGCAGAATTCAAATGGCGTTAATGCACTTATTTATGCTTTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 - chr2L 18655220 5' + Doc 26 1 54.46 GGCTCACTAGCTCGAACTCNAGAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATCAGAA:1 - chrX 8564513 5' + micropia 461 1 78.22 GTTGCTAGTTAAATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 13146911 5' - roo 9043 1 56.44 ACTTTTCACTCAAACACATATGTACAGCGTGTGTGTGCTGGTGTTTACCCTTGTGTCTGTTTTTGTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACG:2 - 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chr2L 6251723 5' - mdg3 5458 2 62.38 GTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGT:1 - chr2R 16185092 5' + 17.6 6969 2 78.22 ACCCACACTTTCCTGCAACCCAATCAAATAGTGATAAATTTAGAACTGTTTGTAAGCACTTTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTC:1 + chrX 18740163 5' - BS 4920 1 67.33 TAAAAGATAGTTCTGAAAGNGGGGATGCTGTCTTTGAAAGATACTGTCCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chr3L 19861849 5' + 1360 28 1 57.43 TTTTAAGTACTCTCCCCAGCTTGAAGTGTCCTCTCTGTATGTATGTACAAATGTATAGTATTGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr3R 19216329 5' + 1360 16 1 61.39 GGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr2L 17730508 5' + pogo 35 1 63.37 CATAAATTGATTTCGATATCAATTGCTGAACTTTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr3R 7469966 5' + Doc 51 1 67.33 AATTATACCAAAAAAATTTGTTCCCAAAATTACCAAGATTTTTTCTATGTCGTTTATAAGTTAGGTTTTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 + chr3L 13987160 5' - pogo 2096 1 74.26 GCTAGACAATTTTGGCAATGCCAATTTGCATCGCAAAATTTTTTAATTTCACACATCGAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAA:1 - chr3R 14334829 5' + X-element 4423 1 57.43 AAGAGTGCACTTGAGTTGANAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr2R 9649182 5' - roo 9029 1 68.32 AAGGACTTTTCACTCAAACACATATGTACAGCGTGTGTGTGCTGGTGTTTACCCTTGTGTCTGTTTTTGTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1 - chr2R 23116292 5' - jockey 4986 1 63.37 AGGCTAAATAGTAGTCTTGNAAAATGATTTGTACATATATTTTTAAAGGGCCTTACTCAACAGTAGCACATTATAAGTTTGATGCGCTTGAGTGTAAGTAA:1 + chr2R 20962952 5' - rover 98 2 81.19 GATTTATAGTATAAAGAAATCAAGAGGAATTCCAGCAGAAAGGTAATACATGGTGCGGCAGCATAAGTTCCTTTTTT:1 + chr3L 23569289 5' - mariner2 884 2 53.25 ATGGAGTAAATAGCAAAAANGTGCAAAAATAAGGGATGCAACGCAGGGGGTAGGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2L 20238775 5' + hobo 14 1 60.87 TTAAGTGATAAGTATCTTTTTATGCCATACCACATTGAATTAAGCTTATAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 - chr3R 16735107 5' + I-element 28 1 51.49 ATTTGCACGGCAATTTTAACGGCTGCTGAGCTGGGTTAGACCTCGCGCTAGGGGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTTCTTAA:1 + chrX 21071639 5' - F-element 4437 1 75.79 GAAGTAGCAGTCTATGTCTGATGAAAAAAAAAGGAGTAAATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 + chr2L 13186248 5' + pogo 31 1 62.38 GAAGGACACCAAGGGCGGGATGACCACGCAACTCTGCTCAATTACGGCCACCAATTTCACTACGCCGCACGACCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAA:1 + chr3R 10838536 5' - Circe 7193 1 74.26 AATGAACAGAAAAGCTCAAACATTCTTTCGTTAAAAAATAAATTACAGACCTCATAATTTAATATTATTTTAATATTTATTTAAATATTAATTTAAATTTT:1 + chr3L 21634745 5' - 1360 3047 1 76.24 TATCAAGCATTTTTCGCAGNGCACTCCTCACTCATGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chrX 4264404 5' + mdg3 5292 2 62.38 TTATCGACATGCCATACTCATGTTGCTATAAAATCTATAAGTTAAAGATGCACAATCCAAAATTTCGCAATTGTAGCGTTTCTGCTTGGCACGCACCATGC:1 + chr2R 18640101 5' + invader1 37 2 76.24 ATTTATTTGGCCAAATAATAATTTTAATACTAGTGCTATTGTTATTCCCGTTTTAGAAAAATGTTTATTATTGATTTGCAATGTAAAAGTTTTTAGAAATA:1 - chr2L 11644655 5' - ZAM 246 2 73.27 GTTCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 + chr2R 15788577 5' + Transpac 24 2 49.45 TTATAATTTCAAAAATGTACATAAACTTTTGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGT:1 + chr4 87597 5' - 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roo 408 1 77.23 TTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCGTTCGAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAG:1 + chrX 22596362 5' - INE-1 577 1 48.48 TTAAATTAAATGTGCAAGCAAATACCAACACGGGTAATATGCAAACAAAGGTATATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGA:1 - chr2L 15567185 5' - 17.6 478 2 64.95 AACAGTAAACAGTGGAAAAACTAAGGGAAAAACGATGGCAAAAACAAAAGCACAGCCTGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAA:1 - chr3L 3021906 5' - jockey 4926 1 62.38 AGCGACGTCTTTCAGAATTGCAAGAATTTTGCAATTAAGTATCGAATACCTAATAATTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 + chr2L 20118370 5' - copia 235 1 64.36 TGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTAC:1 + chrX 21087556 5' + mdg3 5253 1 74.26 TTCACAATTTCTATCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAAAGTTACAAATGTTCAAAATATCCCTGGGGGCCTGTGTAACCCATTAAAAAAAAT:1 + chr2R 5237743 5' - hopper 73 1 62.38 TATTGGAAAAGTTTATCCGAAGCAAAAATCTATTAAGAAAGTTTTCCCACAACGCAGCAGTTTGTTGCTGGGCTGGGAGTTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTT:1 - chr2L 17758733 5' - Doc 4537 1 63.37 AGTTCGGTCTGCAGTTTAATGAAATTCCTCAAGGGTAAGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCT:1 + chr2L 11721108 5' + Quasimodo 7208 2 62.38 CTTCCATGACGCTGGCGTTTTCCGCAGTATCCTCCCCCCTTTTAAGATTCGGAGATTGAGTTAAATTTGCTGTTCCATGAGTGTTTGGGAACGAGACACCC:1 + chr2L 18900548 5' + 3S18 5764 1 62.38 CAACAATTGTCGCGTGTTTNGGCCGGGTTTGTGTCTGGAATTTCTGATTTGATTTCATGTTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCC:1 + chr3L 16282344 5' + gypsy5 6951 2 68.69 AGTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGG:1 + chrX 21852438 5' - gtwin 7376 2 68.32 TGCCGATAAGGAATAAGTAGGGCCAAGTTTCAGATAAATCCAAAGCCACTATGGGGAATTTAACATGTTTTATTGGCATAAATTAATATCTCGTAAACTAT:1 - chrX 281218 5' + hopper 34 1 72.28 AATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTGGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAA:2 - chrX 23108334 5' + BS3 1414 1 61.39 GACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTT:1 + chr2L 18213173 5' - hopper2 1557 1 73.27 CCTAGATACTGGCGATGTATAGAAATCGCTTAATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATA:1 + chr2R 16185042 5' - 17.6 7379 2 69.31 CTCGAAATGGGAATGTGCCAAACTGTCGGCTGCAATTTTGTCGGCGGGGGCTTCAAAAAATAAACAACAAAATAA:1 + chr2L 14722881 5' + gypsy11 3933 1 80.00 TATTTCTGATTAACTTTCTCACTTCTGCCGCTTCTCTCAGCCTACATATTGTGTTATTTCACCTGTGAACTTAGGTAAGGATTGTAGGGGTACTATATATC:1 + chr3L 23773439 5' - invader2 248 1 75.25 CTGGGGCTGCTGCTCCACTTTAAAATCGTCCATTAATTATATTCTATATTCATATTCTGGCGCCACCGGCGGTAATCCACGTAGCTAATGCTATACTATTT:1 - chr3R 15446414 5' + I-element 5302 1 76.24 GCCTTTCCTTTCAGCAAAGCCCGCTCGGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTTATAATATTTGGTTTTAAGAGATGG:1 - chr3L 22752323 5' - FB 319 1 71.29 TATTTTATATAGCAAGAATAAATTGAAAGTACCCAAAAATCGCTAGTTACAATTAACAATTCGGTAAGGAAAGGTAAATTTATTAAAAGTAGTCTACT:1 - chr2L 21272325 5' - Cr1a 3980 1 61.22 ATTCCAGAGTAAGCCGGGGTGGCTTCGCTGGAGGGTCTGTGTGCCGGTTAGAACCGGTAACTCCTCCCCTCCCGGATTGAAGTGACGGCCACAACGAAGGA:1 + chrX 21939637 5' - gypsy5 6901 1 68.32 CATGTACGTACGAACAAATAATAATATAACATGGATAATGATACATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTT:2 - chr2R 12458020 5' - HMS-Beagle 7038 2 75.25 GCTTTCGTGTCTTAATCACTGAGAAAAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 15037905 5' + roo 22 2 57.43 GCGGGCGGAGGCAGGAAAGATACAAAATAGCCAAGGAGCCAATATACATACATATACATGTACATATACATCCACGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 + chr2R 15349464 5' + P-element 3 2 77.23 TCAAGATTTATCTGTGCGCGTTTATTTTAATGATAAGTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGA:1 + chr2L 10791992 5' + 412 7 2 68.32 CATCGTTCGTTCACATGGTCATGTATATTTTGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3L 22930364 5' - roo 9029 1 68.32 AATACGGGCTGATTTAATGNATATTTACACTAATTGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCT:1 + chr3L 19249652 5' + Transpac 6 2 72.28 TTGTCAAATGATTGAGCAATCACGACTATTATGTTCTGTTCTAATAAAGCATTCACCCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCGCGGCGGCACT:1 - chr3R 28935827 5' - frogger 2293 2 72.28 CCCACTCTTTAGATCGCAATCCTTAACCTAATCTCATACCCTAATTTTCTGGGTAAAAACCTTTGTTGACTGCTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chrX 10451560 5' - hobo 2935 1 75.25 TGCATCTGTGGTTAGGTACATCGACCCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTT:1 - chr3R 22330758 5' + I-element 71 1 74.26 GACTGCTTTTCATTAGTTTAACAACTTCTTGAAAATACCAAAATATTACTTTAAGGACAAGTTCATCCATAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 - chr3L 16562387 5' + pogo 5 1 74.26 TCAATAATCATAAAAATAACACGCAAAATAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTG:1 - chr2L 16357736 5' + hobo 252 1 71.29 TTTTCTCGGTAGCTGCACATTTTTATGGCGAAAACAATTTAATTGGCTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCA:1 + chr3L 13190092 5' - roo 9040 1 56.44 GCTCAACTGCAGTGTGAAAAACATAGCATAATATTACATCGCTTTTGAAATCATACAACAAGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chr2L 6362937 5' - 412 480 2 64.36 ATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCA:1 + chr2R 7727164 5' + BS 4715 1 87.13 CAGGGAATTTGTTTGAAATTTAAAGACAAAACTGAGCTATAAAATCAAATTAGCTGTCATAAATTGAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTT:1 - chr2R 22051554 5' - Tabor 475 2 68.32 AATTGGGATAAAAGTAAATATTATGGCTGACACGCATTCTGTAAACAAACTGAAATATAAAGAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1 + chr2R 17644848 5' + mdg3 16 2 57.43 GGTGTAGTAGCGCGCCTGTTTGGCCAACTGGGGTGAGCTAATAAGTTAAGTTAGTTGCAATTGTGAAACATTGAATTCTTCCAGAATAAAACGTGTTCTAC:1 - chr3L 19546283 5' + aurora-element 8 1 73.27 AGAATAATTATATTTTCACTAAAAATTAACACACCAACTCGTTATTTAAGTTAAATGCTATGACGGATATTGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2L 13093868 5' + roo 4 2 68.32 ATCGAAATAAATAAATAAATAAATAATAAATAAATCGAAATCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACGGCAAAATTTTCT:1 - chrX 17501198 5' + Doc3-element 135 1 74.73 TCCAAGAATTTTTTTTAACAGCTGCCCAGCTGGGGAGTTTAGAGGACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chr2L 17730415 5' - pogo 2097 1 72.16 AATATTTTTGAGAAAATATAAAAAATAATTGAGAGGCTGAGGCGAGTCTAAAAACAATGCCTTGCCTAAGAATTCGTAGCTTTTATATATTTTTTTTTTA:1 + chr3R 16899341 5' + Circe 423 1 89.00 TGGATACACTCGAATTGCAATCTCGACGGCAAGCCAGTTTTGCCGATCGATCCGCTTTCGACGGCTCGAGATTCGCGAGAAGATATAGACGCGATATAAAA:1 - chr3R 23035640 5' - Cr1a 4363 1 77.23 TTCACAATTTCAATGGTAATACTCAGAGAGCGGCACAGAAAGAAATTAAGTTCGTAGAACTTAATGCAGCAGGATGAACAGGAGCTGGAGGAGAAGTCAAG:1 + chrX 13537769 5' + G6 479 1 59.41 TCTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAAACATAA:1 - chr3R 433141 5' - 1731 288 2 52.48 CAGCAGAGAACAACAACAANAAAAAAAGGAAAACGGCTGGCAAGGGGGCACCCAAAAACAAAAAAAAAGAGAAAAAAA:1 + chrX 3088792 5' + gypsy7 5004 1 52.56 GCAGAAGAGCAGAAAAAGGTATAAAAGATTTATGACTCTGGTCCGCCGGCGAGAGAGCTCTCCTCCTCCGTGCAGCAGAAGTCTTCAATGCCAATCTTGTG:1 + chr3R 30693636 5' - baggins 5173 1 59.41 AAAGCTAAAGAAAAAAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:2 + chr2L 7487739 5' - copia 215 2 65.35 TTAGTATGTATTTGTGTTTNTGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr3L 14594163 5' + hobo 48 1 76.24 GCGTTAAAGACACTGTAATTGCCACTTTTATAGTTTTTTCCATAAGTTTACTTGTTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr2L 22197287 5' - roo 9051 2 60.40 GAGGCAGGAAGAACTGCAGATGGCGGAAGCGAAGAACCGCGCGTCCTGGAGAAAGGTGGCCTGGCAGTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATAGAAGGCA:1 - chrX 21175412 5' - Gypsy12A_LTR 2247 1 88.12 AAGTAAGCATCCATTTTTTTTTTCCTTGTTTACTTTATTTCCTCTGAA:1 + chr2R 15715611 5' - Doc2-element 4526 1 79.17 AATTCCATTGCTCCTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 + chr3R 4971408 5' + F-element 49 1 64.36 GTCATTTTCGTGCCAAATGCGTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAA:1 + chr3L 20049649 5' + jockey 4817 1 78.22 CCAGCGACTATGGGCTGGCCGCGTTCCTCACACTGCAGTCCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGAGGAAC:1 - chr3L 23678128 5' + Osvaldo 24 1 72.28 ATTTGCCTAACCCGACCTGGCCACCGCCACCCCCTGCCATCCATGTGCCACGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGT:1 - chr2L 20040207 5' - F-element 4314 1 50.00 GTTTTATTTATTGCTTTTTTAACCCTTTTTTTTTGGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 10488735 5' - roo 9031 1 67.33 GAGGGAGGTGTGAGTCTAATGAAATAATTTGTGTACCCAAACTGGCAGGCAGCTGGGAAAATGCGAGCAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr2R 7838944 5' + pogo 4 1 75.00 TTGTAAACCAAATGTAACGAGCAGGTACATATTTTTTGTATAATGTTGTACTATTTTTCATATAACAAAATTCTAGCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAA:1 + chr3R 21014126 5' - 17.6 319 2 74.26 ACTTCAAAGGCGAGCAGAGCAGCTGAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAG:1 + chrX 22789337 5' - Tabor 7274 2 76.24 TAAAAGTATGCTATACTTTGATGTGCTTAGTTGTGATTTGGCCAAAATGCTTGACTCGCAGCTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 31264155 5' + jockey 23 1 62.38 GGCTGTTGGCAGCTGAAATGGGGGGCGTGGCATTGTGGGGCTTCGCCGTCGCATGTGTTTGGCAGGCAATTTGCAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAAA:1 - chr3L 17138400 5' + Doc2-element 254 1 64.95 ACATAATTAGGGAAACTATAAAAACTTTCGCTCCCATTAATGGTTTCTTCTTTTTAATTCACTTTTCATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATA:1 - chr3R 19450751 5' - Burdock 6385 2 69.31 GAAAAACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACC:1 - chr3L 20224210 5' + Chimpo 42 1 69.31 CTGTGCTGTGGGTTCGTTCTCCTTCTTCAATTTTTCTAAAACACATCCACTCTCTCTTTCGTTCACGTGTGCATGAAGTTAACGATTATAATAAAA:1 + chr2R 19842256 5' + Stalker4 459 1 67.71 AATAGTTTGAAATTGATTTTTTCCATTAAAATTTAAAAAATTTTTTTTT:1 - chr3L 21764803 5' + HB 328 1 55.10 CAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGC:1 - chr3R 10736115 5' + McClintock 5982 2 62.38 CTGAGTGGGTGGCTGTGTTTCAGGCTCTGGAGCCGGTGTGGTTGTTGTTGTCGTCGTCGTTGACGTGGAGAACAGTCTATTTCCTGAGGTGAATGCG:1 - chr2R 5925738 5' - Bari2 877 1 70.10 CCAGCAGCGCAATTGTCAGAGCCAGCTCCAAGTTCCATTCCTCTCCCTTTAAAACCGCTTTCATTTGTATATAAATACATTTTTCACTTTATTTTCAAGG:1 - chrX 18269507 5' + transib4 2479 1 59.00 AACTTGAGACTCGTATGGTCACGGCAACCGGGTGGTTATAGTACTAAAAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGCCAGATTTCGTCTTTAATGTAACCA:1 + chr3R 7514798 5' - diver 5744 1 56.44 AGCAGAGGCGAGGGCGACAAACTAACGCTGCGAGCTGACTTTCTGAAAGGCTGGGAGAGGGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3R 7626468 5' + hobo 12 1 68.32 ACTTTTGGGAATGCCATTAATTTATTTCAATTCACTTCGCCATCTATCATTTCCAATATTGCATTGAACTGAGCCCACATGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr3R 20684958 5' + roo 8665 2 78.22 TGTACTTTTACGTAATTACTTTAAAGCTATTAATATATGTACATTTTTTTATAAGATAAACAAATATATATTCTTGACCAGGATCAATAGCCGAGTCGATC:1 + chrX 6080124 5' + INE-1 96 1 67.33 AATAGTACAGCGCTTTAAGCGAGATGCTAGCTTTTATATTAAAGTAAGCCCTTAGTTTTTAAATCTGGCATAAAAGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3L 11755651 5' - roo 409 1 67.00 TAAAATTATTAGAACAAATCCGTTTAGGGCTTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2L 21086011 5' - roo 393 1 64.36 ATAGAGCTGAATCGATTATGTAACAATACTGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATAT:1 - chr3R 21760076 5' + 412 224 2 70.30 TCTCTTCATTAGAAGTTCTTTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAAT:1 - chr3L 10474215 5' - copia 230 1 54.46 GATTATTTATGCTTTTTTCTATGCTTGTTCCTGCCGCTCGTCGTCAGTGTTTATGTTTAGTTATAGTCAAAACGCAAAACCAATTTGTGGCCGTTACGCAT:1 + chr2R 13192086 5' + 1360 3367 1 61.39 CAGCTTTTAAGCGTTCAAATATTTATAAAGCGAAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAA:1 + chr3R 23543053 5' + 412 410 2 69.31 ATAAACTAAGCATTATTAACATTTTCGAAAAACATATACATGCATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 - chr2R 9699881 5' - Transpac 5202 2 58.42 AAATTTTTTCCCCCAGAAAACTGATGAAATTTTGCGATCGCCTTTCCACTAGCTAAGTAACGTGTATCTCATGGTAGGGGAAGTCGACTATAGCATTCTCT:1 + chr3L 22848566 5' + INE-1 574 1 74.26 AATTTCATTTTGCCCATAAATAAATTCCGCACAAGTTAGTGTTTATAATTAGGTTTTTGCTTTTAGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGAT:1 + chr2L 2059080 5' - Doc 4442 1 67.33 GTGCTTTCTAGAGGGTGTTGGGTGGTTCGGGTTAAAGAACGTATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chr2L 9260324 5' + 297 30 2 59.41 CACTAATGTTCGCTAATTACCCAGTGAATATCTATATAAACTCGTCAGTTGAACTAGGCAGTAACAACCTTCGCTTGAATCATGTAAGTGGGATTCTCAAC:1 - chr3L 9601366 5' + springer 442 1 80.20 ATTAAAACTAAATATGAGACTAGAGACGGACCCAAATCGGGCCCGTCCATCATCTAATGTATATTCACTGTATGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTAGGTAGAT:1 - chrX 9932487 5' - Quasimodo 31 2 62.38 AAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTG:1 + chr2R 5214939 5' + F-element 11 1 71.29 ATATCGAAGGAAAGCTTGAAGCTAAGCAAGAAAATAAATATATGTATAGCGGCGGAAAAAGAAAAGAGCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGT:1 - chrX 10206026 5' - invader4 290 2 74.26 TAAGCCACAGAAATGGAAATAAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 + chr2L 18247976 5' - blood 7375 2 60.44 ACATAGCTGCCATAGCACCATTGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTAGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGT:1 + chrX 7176881 5' - accord 7202 2 76.24 TCCATTCTTTGAATACACATCAAATTGTTTGTGGTCTCATAAATATATATACATACATACAGTTGCAACGGTGCGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chrX 4792042 5' - copia 252 1 74.00 AGATTTGATTTTACATTACTTTTACGGTTACATGTGCTTTCGTCACACAGCTGTGATCAACGCGAAAATTATTTATGGAATCGTGTTCGCGGATTGCCCTA:1 - chrX 13507201 5' - Gypsy12A_LTR 1967 1 68.32 CAACAATGCGGAATTTAAGCAAATATTATAAAAAAACCAGGCCATTTGAAACAAGAAAAGGTTTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAG:1 + chr3R 7513896 5' + diver 15 2 60.40 GATTGGCCAAGCTATGTATGTACCTCCACTGGACCAAAGACACTAGAATAACAACATAATGGCCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCA:1 - chr2R 4324191 5' + 1360 209 1 72.16 GAAATATCAAAATTAAATTGAATAATCAATAAAAATGAAAAAAAAATTTAGAAATGGTTCAAAAGTGTGGGTAAAAGTTTTTTTTTTGCAAATCGATAGAA:1 - chrX 13502204 5' - INE-1 312 1 64.36 TCAGTCGCCAATCGTCAATCGCTGCGCCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chr2L 8709361 5' - P-element 2839 1 31.68 TCTTGCATCACTCCTCTCCCCCAAATGGAGCATAAAAGTTTCAGTTAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCT:1 + chrX 4264339 5' - mdg3 5470 2 50.50 CCGAACGGCCTCAGCATAGAGCGTTTAACTCTATTATGACGCGTCAGCGTTACTTTTGCTAGGCTACTTAGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCAT:1 - chr2R 1276186 5' - gypsy2 6523 2 74.26 GATTCGATTTTAATTTGCAGAACTCGGCATTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTATTTCAAGCTACTAATAGCAAGGTCTAAAAACTAT:1 + chr3R 10110443 5' + Doc 54 1 68.32 GCACACGCACGTTAATATATGTATATGCAGTTCGGGAACAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chr3R 24976738 5' - opus 7469 2 68.32 TACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr3R 7869124 5' + 297 6619 2 63.37 AGCGTTTAACAGAATGTAAATTAAGTTTTGTGGAAAGTCTGAAATAAAATACACTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr3L 19647333 5' + pogo 18 1 62.38 AATATTCTACAAATTGGCCAGGAGGAATCAACAGTCCAGGATGCAAAAGGGGGAGGCCCAACGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAA:1 - chr2L 18065838 5' + R1A1-element 4944 1 56.44 ATTCGAAAATCGGAGTGACGTGGGAGACCAACTACATGGAAATGGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr2L 5927003 5' + pogo 30 1 58.42 AAATAGCACCTTGTTTGTACATAAATTAGCCTTAGTCGCTGTTATTTATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chrX 12472528 5' - pogo 2074 1 55.45 TTTTGGCCATAAAAAAACCCTGGGACCTCATATATTCTAGATCAGGATCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAG:1 + chr4 591555 5' - R1A1-element 5041 1 53.47 TTTTTTTCCGAATGTTTTGCCAATATTTTTGCCAATCGACTCACACTCAATAATTTAAAGTGCGGGTGCCACTCACCACTCACATCGCGGGTACTTACAAC:1 + chr3R 27610371 5' + hobo 78 1 74.26 AATGTATGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 + chr3L 13895370 5' - hobo 2898 1 65.35 CGAATCTTGTATACCCTATTACTCTACGAGTACCTGGTATAAATATAAACAATGTGAAAACAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 - chr3R 5467578 5' + copia 16 2 64.36 AGTTTATGCTAAAATTTTTTTTGGTTTTTAATTATGTTACGATGTTAAAGTAATCATCGTAATTCTCCAACTGGATTTATCACCCTCTTCCCCTGTAAGAG:1 - chr2R 5581892 5' + gypsy3 6875 2 51.49 GGCAGTTCTCGAAGGTGGGGAGGCGATGGGCGCTGGCAACTTGGGAATGGGCACGAATGGGAGCGGGTGGTCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 - chr3R 6961161 5' - 412 7542 2 70.30 TGCCAATATAGCGGCACAATAGCCCCACAATTTCCACCCAATGTCCTTTTTTTTTACCTAATTGTACACAGTTTTACGTGATATTTTGTATAACTCAGCTA:1 + chrX 3637994 5' - Bari2 337 1 63.37 TTTCACCATAATTTTGATGAAAGAACGGTGAATGTTTAAAGACAAATTTAATTAATTTGAACTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 + chr3R 4474155 5' + copia 4885 2 63.37 CTTTTGTATCAGCGCAAATGCCATAGGCAGGATTCGGTTTCATTTGAGTTAAATTTGCTGTTCCATGAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAA:1 + chrX 7292649 5' + 3S18 5776 2 68.32 AACTGATGATCGGGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chr3L 24761251 5' + 1360 70 1 54.46 TATTTTAACTCGATTCAAACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 8036442 5' - roo 9044 1 57.43 GCTCGATGCCAAAGCAATTNGGTTTATGGTCGTTTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr3R 6034011 5' - roo 9034 1 64.36 GAGCTAACCAGTAACAATTCTTAAAACCAAACTGCAATTAATCAGTGAGACGTGCCCCGCCCACATTCATGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 - chr2L 17677807 5' + Tirant 8112 2 76.24 CATCTATTGTTCGGGCTTAAATCTCACTCGCTCTTTGGGTCTAAAGAAATTCTGGCTAAAAAAGCAAAATAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3L 2176407 5' - roo 405 1 75.25 GGTTGCATAATTCTAATTGATTTGGGAACGCTAATTGTGCAACATTTATTTAACAAATTGGTTTACTGGCGATCAATAAACAATATATTAATAACAACACA:1 - chr2L 5412473 5' + hopper 1115 1 50.50 GTGCCAAGTAGTACGGGGGCGTATCGAAAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2L 10625651 5' - roo 398 1 69.31 TGTTTTTTATGTTCTTTGTCAATTTTCGTTTGTTTATATTTTCAATTTGGTTACAAAAGCTTTTCGTTTATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr2L 18935177 5' - roo 9009 2 76.24 CAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATT:1 + chrX 21667990 5' - Tabor 7309 2 59.00 TTGTGTTTGGTAGTTCAGTTCTGTCTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr3R 6266268 5' - roo 404 1 74.26 TTTCCTCAAATGGCAGATTCATTGCAAAAAGGTGGATTCGAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr2R 11168552 5' - blood 7180 2 89.83 CGGATTTAAATGTGTGTGTGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:1 - chr3L 3540228 5' + mdg3 5260 1 71.29 CGATTTTTACAAGCTGATACCTAATTTTCTTTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGT:1 + chr3L 18124560 5' + Cr1a 237 1 65.35 CAATAAAATGTGTCTATCAAATGTATCTATTTATTCATATGTTTTTCATCAATATGTAAAAAATAATAACAAAACTATTAACAATGAACGAGAAAAACTAC:1 - chr2L 14965785 5' + S2 163 2 77.23 TAATTATGGCACATTGGGTTGGTTGGTTGCTTTTGTTGTCTTACATTTCTCGGCTTTTTGTTTGTGTTGTCGCGAATCTGCTGACCCAGCGGATTTGGGGA:1 - chr3L 16280135 5' - gypsy5 7139 2 67.33 AACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAAATCT:1 - chrX 22386753 5' + hobo 94 1 71.29 AGTTTTCTTCTTTTGTTTGTTGTTTATGATTTTCCACTTTTTTGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr3R 14193876 5' + pogo 9 1 72.28 AAAAAAAAAAATAAAAAAGGAAAATATATTAAGGCTTTTATATTAATATAGTGACGAATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr2L 8825014 5' + 297 29 2 61.62 CATCTATATATCACTCGTACATGCTGGACACAACGCCTTCTGGGGTGTGTGTGTACGAGTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:2 - chr2R 8311388 5' - opus 7488 2 66.34 GGCTGGCTAAGTTTGCTTTTCTTTTACTTGGAATTTGTGGCGTGCTGTTTACTTTTGTAGTCTAGTAAACTGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3L 14222556 5' + roo 5 2 74.26 AGCTGGCCACCGGAGGCAACAATTTCCATTTGGCGTTCGCTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTT:1 + chr2L 17994145 5' - roo 373 1 56.44 CCGGGTGTCTGTGCTTAATAGGCCACATGAACTTGAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATCCTTATGATGACCGTTCGAGGACAAGCG:1 + chr3R 29662657 5' + HMS-Beagle 6758 1 64.36 TATAATTGTTGGACATCTGAGCGTTGTGGGTGCTTACTTTTCTCAAGCAATCCAATTTATTTTATTTATTTATTATGATTGTCGTCGCGCATCCAGGGAGT:1 - chr3L 14436250 5' - aurora-element 91 1 62.38 TTTTTTCATATAAATAATCCAGTTATATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 + chr3L 20758956 5' - flea 219 2 73.86 GTACATTTCTCCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2R 9869496 5' - roo 390 2 49.50 CATTACATTTCCGCGGCTAAACTGCACAAACAAGCTGAGCTTCATAGCTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2R 6107724 5' - roo 9044 1 55.00 AGGAGTTTCTTAGTTGATAAGCTTCCAGCGGGTCAAAGGTCAAAAATCTTCGTTCTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATT:1 - chrX 11109902 5' - Idefix 215 2 64.36 CGTTTAGGTTAAGGTTATTTAATAATTGAACAGTCTAAAATGTACATCACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAA:1 + chr2R 6779744 5' - 17.6 487 2 72.28 ACAGATCATTACGTTCCAAGTCTTACTCTGCAAAGCATCCAATTTGTCTATCCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATT:1 - chr3R 27120250 5' + P-element 449 1 56.44 AACGTAGGCTGCCGTTCACAATGATATTCACCATTTGAACGGTTTTTAATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:2 - chr2R 5772536 5' - HMS-Beagle 7023 2 59.41 ATCGGTCGGTTGAAAACAGTTTTTTTTTTTGCGGTTCGCAGATAGTAGCAAAAAAAACGCAAATAGGTAAAAAAATTAATAATTATTTTTATGTTT:1 + chr3R 12586913 5' - gypsy9 289 2 81.25 CACTGACCGCAGTCGGTAAAGGTAGCGTTAGTTGGCCCATACAATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr3L 13785367 5' + pogo 29 1 57.43 GGTTACTGCCGATGACCCCATGGATGACCCAGGGTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTT:1 + chr2R 14349130 5' - mdg3 5459 2 65.31 TTGGCTTAGGCTTCGCCTCTTGCCCGTAATTAAAGTGGCCAGCGGAAGTGAACTGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 6107806 5' + roo 8686 2 58.42 CACTGGGAAAAACGAATAGATTCCTTTTAGTTATTTATTTCATTATATATAATCAATTATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chrX 22666339 5' + Doc 21 1 58.42 CATACTGCACGGGGCACTCGAATAGGACTCAAGTATAAGAGTATAAATAATATGCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTA:1 + chrX 1706030 5' + Juan 4071 1 51.49 TATGCTAATAAAAGATATCAAAATATTAAGGAGAATATCCCCAGGAAACAAGGATCTATATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 - chr3L 4009507 5' + mdg3 17 2 62.38 CCCTGCCATCTTACACACTTACTCACTCACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACAT:1 - chr3L 11365206 5' + accord 248 2 73.27 TTATCAGAAACTAAAATGTATCAGAGATGTGAATGGTCACTATTAATATTTATTAAAAAATTAAGATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTA:1 - chr2L 15220320 5' - invader4 316 2 35.64 TATTGTATAATAAGATATGTTAACACTTACCGTTGTTCTAGGGAATCGGCACGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGT:1 - chr3L 5676768 5' + F-element 4353 1 55.45 AAAATCTTTTGATTTCGGTTTTGTTCTCGGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACC:1 - chr2R 9777743 5' - R1A1-element 5005 1 75.25 ACAACCAGGAGCTGAGTTGGAAAAAATCGGAGAAACAAAAAACTTCCGCTGTCAACGGCGTTTCAGTCCCCGTATCTCCTGTGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr2R 9649274 5' + roo 8663 1 81.19 AAACCTCAACAAAAATTTAGAGAAACATATAGAAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chr2L 16426438 5' - hobo 2897 1 70.30 CCTTATTGGTGCAGTGCGTCGAGTTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACA:1 + chr3R 8645021 5' + I-element 5053 1 77.23 GACAGTTGAGAATGTGAGAAAGCGGCAATTGGTAAATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGACAGGACTACTGAGGAAATGCCGCTAATATTGCCGAT:1 + chr3L 13735922 5' + blood 443 1 69.31 ACTTTATTTAACGAACTTCTTGTTTTATAAAAAAAAAAAGATTCTCAAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chrX 10286216 5' + roo 8692 2 57.43 TTACACAGCGAGAAATGGGGTCGATGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 + chr3R 22330736 5' - I-element 5306 1 74.26 CATGCGGTACTCACACTCGCTCACACACTTGCAGAGCACAGTGACATACGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr3L 8268220 5' - hobo 2912 1 50.50 AGTTCGTTTAGCTCTAAAGCTACCGTCTCGTCGATCGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chrX 15024431 5' + P-element 40 1 40.59 TTAGCTTTCGAATCGTATCAAACATTGATCGAACACCAAGTGCTTAATTAACAGTCAAAAGTACAAGCGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACG:1 - chr3L 22736998 5' + G-element 13 1 67.33 CTCGCAACATGCGGCGTATACGTAATGTGCACAGCAATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 - chr2R 9627987 5' + F-element 27 1 48.51 TTCTTCGCAGCCATTTTCGGCCGCTCTTTGTTTGCCAATTTAGTGCCGCCTCTGTCATTTTTTTCTATTGGGTTTTTTGAAGTCCCGTGTTTATGTGAACC:1 - chr3R 23629185 5' + mariner2 617 1 64.36 TCCAAAATACAAAAGGTATTATCTCAACTTTATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCT:1 - chr3L 15452949 5' - accord 7365 2 60.40 ATTGGCATTTCAGCGATATTTTGTTTCCGTTTCGATTCCTCTGCCATTTTCGACGCCATTTAATACCCTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTTTTGTT:1 + chr3L 22979178 5' + INE-1 580 1 65.35 GTTATTCCATTAATAAGAAATCCAGTAAAAAATACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3R 11052071 5' + blood 3 2 74.26 TAGTTTGGGTTTGGTCAGTTGATTGTGGGTTGCTGCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 + chr2L 16139122 5' - copia 213 2 66.34 TTTGTTATTAATTAATTGTTTTGTTTGTGTATCCCGTCTGTTGCAGCGCGGCATTACTAGTAGATTGTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr2R 22978389 5' - HeT-A 6061 2 71.28 CCGTTGCTCATTTTTTTTTTGTTTTTAATTT:1 - chrX 19466794 5' - Doc 4699 1 70.97 TTTATGCCACAAAAAAACGCTCGTAACGAACGAACAATTGCTCAAAGGCTCAAAAATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 + chr3L 5710227 5' - Transpac 294 2 63.00 GCAAGAGGCACCAACCAGTATCCGCAGTATCCAGGAGGTAGGACAAGCTGACGGGGGAGCAAAATATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTC:1 + chr2R 19559610 5' - Tirant 346 2 69.31 TCGGCTCCCGGACTTGGACNCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATAT:1 + chr2L 12808149 5' - Tirant 8485 2 55.45 ACAGGCTTACCTATAAACCAAAATGAATGTCTGTTACTCTTTACTTCCTCTAAGATGATTCACATAGTTTCAAGTGATTTAGTCAACTTTCATATAGCTGC:1 - chrX 1102202 5' - transib1 2025 1 69.31 AAATTTGCCCTTCACACATNATTAAGATTTTCCATCAGACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3L 9928599 5' + roo 36 2 62.38 TCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2L 7666149 5' - roo 352 2 81.19 GTTGCGATGATGAATGGCTNAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGT:1 - chr3L 24761238 5' + 1360 83 1 67.33 TTTCATCTTTCAGCCTTCCNTTAAAAAATATCATAATCAATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 - chr2L 17245065 5' + copia 37 2 62.38 CGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3R 11916600 5' - roo 357 2 74.26 TTTATTTATAACATTAAATNGAAACTCATAGAATATAGTTTTGGCAGTACGCTTACAAAAACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGG:1 + chr3L 2355672 5' - Rt1b 5002 1 59.79 AAAATTAAAAATACATAGTGAAAAATGCAACAGCAGACCCAACGGCAAAGAATCGAGAAACAAAGAACACGCCGCCTAATCACCTTGCTCCGATCCGGC:1 + chr2L 16942578 5' - accord2 276 1 57.58 AATTTCATATAATATAAAAAAAAGTCAAAATGGCAAATCGGTTATAATTGTTGGGCATGTTAGTTTTCTGTCTTCTTATGTCACAATTTATTTTTGATTTA:1 - chr2L 19255124 5' - Fw2 79 1 75.25 GGGTCATTTCCTTAAGTTTTAATCTATTCGTACAAAGAGTACGAATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1 + chrX 983312 5' - Juan 4186 1 55.45 TTTTTCCCAACACCGCAAATTGTTGTCAGAAGCATTCTGTTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chr3R 12333779 5' + P-element 34 1 45.54 CCGTTTAATTATGTAAAAGGACTCGTACACACACACACACACACACACACATATATAACCACATAGGAACAGCCATACACTAAATCATAGAATGCCTTAGG:1 - chr2L 11203080 5' + Quasimodo 82 2 75.25 GGATAGGGATAATACTTATTATGAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAAT:1 + chr2L 10165167 5' - pogo 58 1 77.23 ATGTGTGTTATGGAATTCTATGCAGTGACTACTAGTTTCATCAAATTGAATTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAAT:1 - chr3R 31022010 5' - Ivk 5350 1 54.46 AATGGAAATAAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 + chr2L 18247987 5' - blood 352 2 57.14 ATACCCGCTGATGACTGCGCTGGGCTAATGAACTCTGGCGAAGTTGGACTGTAGACCGCTATTGATAAGTGTTTAGTTTGTAGTATATACGAACATAATAA:1 + chr3R 27929019 5' + mdg1 7040 2 59.41 GTGGAGCGCAGTTTTATACTGAATTTAATTCGGTTCTAGCTCGTTGGCGAGGAGTTTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATACCTTTTCGCTACGGACATTAAT:1 - chr2R 5603162 5' - Gypsy12A_LTR 2140 1 74.26 TATGAAAAATGCACAATGTGCCATCAACACACCGAGCTTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTTGTGGCTTGTACATGAT:1 - chr2L 4249360 5' - Ivk 4991 1 59.18 GTTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGT:1 - chr3L 5241174 5' + Ivk 33 1 60.40 GTATCTTAGCTTTCGAATCGTATCAAACATTGATCGAACACCAAGTGCTTAATTAACAGTCAAAAGTACAAGCGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGC:1 - chr3L 22737003 5' + G-element 8 1 72.28 CAGTAGTACCGCGTATTTCTTTATGTTCCCACACACACACCTACTGAAAAGTTGTGATGCCTCCCTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAG:1 + chrX 9205510 5' - diver 189 2 54.46 CGAGCCACAAGAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr2L 20328768 5' - opus 7460 2 70.30 AAATTGCGAAAAAAATCAANTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTC:1 - chr2L 21570230 5' + Dm88 4412 2 77.23 ACAATCCTGAATGGGTTACTAAAATTTACCGCCTGTCTCCCAGAAGAATTATGAAATTTCGCGTTCGGATTTCTTCTAGCTAGGTAACGGGTATCTGATAG:1 + chr3L 25484802 5' + INE-1 547 1 63.37 ATTCCTTATACATTTATTGGTTGAATAGCTAGCTGGTGCTGTTCTCCCTTAAGTAAGTCACAAAAAACCTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAG:1 + chr2L 3408593 5' + G-element 10 1 67.00 AAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 - chr2R 22856574 5' - 1360 3338 1 81.19 ATGGGATGCAAAAATATATNTACACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3R 30553621 5' + 412 7082 2 53.00 CAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr2L 17730494 5' + pogo 49 1 77.23 GGGGGGGTGGTACCAGTGGCGGGGGGGCCCTATGGGGCGTTTGGCCTGTTTTTTTTTCAAAAA:1 - chr3L 6834999 5' + hopper 15 1 52.38 GCGTTGTGGGGGCGTGAGTGCCAGGATGCAGATACACTCCCGCCATTGTTTGCAGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACC:1 - chr2R 13383590 5' + gypsy5 6957 2 60.61 CAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 - chr2R 672814 5' + F-element 61 1 76.24 CAACCACATGCACACTATGCGCGCACACAAATCAAACAATTATAAACTCGTTGTTGGTAAAGTGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 + chr3L 12468191 5' + jockey 4686 1 65.35 AACCCTGCCTCGCTATGCCCAGATGCTATCTTGTCGCTGTCTCTCGCTCGACTTGCATTATTTTATTTATATTACTCGTATGATTATTATTATTATTATTA:1 - chr2R 13954123 5' - mdg1 7077 11 77.23 CCACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 - chr2L 18248043 5' + blood 7053 2 71.29 AACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr3R 7869135 5' + 297 6630 2 74.26 GCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:2 + chr3R 7869120 5' + 297 6615 2 59.41 CTTAAATTGGTGACTTCTTGACCATCTGAAAAACGTCTTTACCCCTTATTGCCGCTGCTCTCCTGCTGATGCAGTCATTTATACTCCTGGAGGAACCCCTC:1 - chrX 15256598 5' + G7 107 1 81.19 TATCAATAGGCATAATAGAAGTAACCTATTATTATAATATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA:1 + chr2L 5933053 5' + mdg1 31 10 72.28 CCGGCCGGATTGTTGGCCATTTTGTTTTTACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:2 + chr2R 19560167 5' + Tirant 44 2 67.33 GGGTTAAAGAGAAAGCCTAGGACAGGGGCATGTGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTG:1 + chr2L 15567110 5' + 17.6 6954 1 63.22 TTATAAAATATTGGATTATAATTTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr3L 10621675 5' - 412 7503 2 79.78 GTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCATTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGCATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATG:1 + chr2L 21936092 5' + INE-1 11 1 49.50 CAAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr2L 16153376 5' + Doc 56 1 75.25 TCCACCAGTTCAACCACTCCCATCGAGTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCT:1 - chr2R 12472474 5' + Doc 498 1 73.27 ATTGCGGAATAACGCACCATAAATTTCAAAATGAAGAATGTCACTCAGTTGACCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:2 + chr2L 16153350 5' + Doc 30 1 54.46 TATAATATTTCAAAAATGTATATGAACATAATGATTTTCATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCT:1 + chr3L 13001008 5' - invader3 5427 2 64.36 GTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1 - chr2R 9631743 5' + F-element 65 1 86.14 AAATTCACAAATCGTTCGATTTAACATTAAATTGTGAGTTCGGTACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTC:1 - chr4 408498 5' - BS 4825 1 57.43 TTGAATTATTTTTTTATTTTTTTGGTTAGTTTTAGCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTGTTTTTTTTTTTCGTTTTACCAATTATTTTTAAAATATCC:1 - chr3R 27223770 5' + Tc1 1492 1 88.12 TACGATATCAATAAAAACGTCGACAATATAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr3R 22238669 5' + hobo 27 1 52.48 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTCGGCCTATGAACACTGAATTAGGAAGATTACGTTGGAGGGCTTGA:1 - chr3L 11720528 5' - gypsy 364 2 55.45 GTAGGCGCTGGTGTAGCCATCCTCTGTCTTGATGATCTCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 + chr2R 11259572 5' - hobo 2910 1 56.04 CAAATGTAAAAGGGAAACAATCAGAACGTGATAATAGAATTTTGGTACATACCCGTTCAAGTACAATTAAACAAAATCAGTTGCACTGTCTTCATTTACC:1 + chr3L 4246692 5' - G4 130 1 74.00 CATCAAAGAGCAATGGCAACAAGGGGTTAATATTTGTGCCGCACCCTCACCGTAGCGCATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr2L 14098424 5' - hobo 2920 1 47.52 TGAAACCATCGCTTCAAAGNGCTTCCACGAATTATTGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 22930313 5' + roo 8703 2 67.33 GAGAATCGCTGTTGCCGGCNTTTTTATGATTTCTCTGTTTCCCCCATCCGTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGTTTCTTTTGTTTTATTTGCACTTGCACGTC:1 + chr3R 14654747 5' + accord2 7272 1 73.27 GTCTGTATGTGTGTGGAAAATTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGG:1 + chr3L 5415370 5' - I-element 5301 1 87.13 TTAATTTGGAATTTAAGCTTGGATTTGATCGTAAAACCCCCCAATTCAAAAAAAAAACCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTC:1 + chr2L 3230858 5' + Idefix 180 1 65.35 GAAACCAAAAAACGGAAGGGGATATGCTACATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 + chr2R 19102163 5' + opus 7152 4 74.00 GTCTTAATCACTGAGAAAAATCTGACTTTCTTTATTCACCAATGAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3L 15037913 5' + roo 8694 2 58.42 CTCTCTCCATTATTTTGTGATGGTTTAACAACAAACTCGCATAAAGCAGACAGGCGGACGGACCAGTACACTATGGGGCATTTTGCCTGGTTTTTTT:1 + chr2L 19681396 5' + hopper 8 2 70.10 TACATACACGGCATCGAATTGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 29608759 5' - roo 396 1 70.30 TCCGTATCCACCTAGGGGTGGCTACCGTGGACGTGGGGGATATCGCGGAAGAGGAAGAGGCATGTACCATTATCACATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTG:1 + chr2R 7964442 5' - Cr1a 495 1 76.24 GGAAATAGAGAGGGCACGTNAATTGCGGATGACAGTTGAGGCGATGTCGCAGAGGGCGCGTTTTAATTACGACAGATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAG:2 - chrX 15263525 5' + invader3 5189 2 76.24 AAAGCGTGGCAAACATCTTGTCAATCGATTTTCCATTGGGCTCGTTGGATAATTTCTACGCTGCTGTTACTGGCGTTCCCCAATAGCTGGGAACCATAGG:1 + chr2L 1054250 5' - Fw2 3552 1 64.00 ATTGATTGTTTGGCAAAGTTTGCATGATAATTGCCTTTATGGTGGCGCTAGGCAATTGCAAAGCAATAAAGCACACTAGAAAAGCAAAAACAAACATAAAT:1 + chr2R 16217961 5' + Penelope 552 1 59.41 CATCTTGGCATATTGCATTNGAGATATGAGCACAGTACCGATGTACAGAATCATTTCGATATTCAAATTCAATCTCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:1 - chr2L 20367396 5' + Doc 5 1 72.28 TTTGATGTGGACAGCACAAAGTTGCGCATTGTTTGGAAATTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 - chr3L 9907414 5' + jockey 4709 1 66.34 GGACTGAATGTTATGGTGGGCAACTAGAATTTTATCGTCGATGAATAAACCCCTGGCATAACAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 19449579 5' - roo 9057 1 39.60 ATTCCCAATTGCATTTACGACCAGACATTTGCATCTGTGGTTAGGTACATCGACCCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 - chr3R 22330787 5' + I-element 42 1 56.44 CATTCCAGAGTTTCTTTTGCTCGAACGTCAAAAAGTTTCCACAGGGTTTTCATATTTTGCGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 + chr2L 17581179 5' - 412 482 2 66.34 CTATGTTGAAATCTTTTTAACATGCATCACCATCTGATTAAAAATATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTC:1 + chr3L 20454534 5' + invader4 26 2 50.53 AAATTATAAAAGTAAATCATTTTGATTTTAGAGATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTAT:2 - chr3R 10914166 5' + F-element 116 1 66.34 TATGTAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chrX 17104410 5' + 297 42 2 77.23 AATCTATCGAGAGGCTTCTGTTTTCCGTTATTTCTTTTTCTTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTT:1 + chr3L 15322571 5' - invader2 452 1 78.49 GCGATTCACGATGTACAATAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:2 + chr3R 23638112 5' - pogo 2056 1 73.27 GAAATTGACAAGACAATTGCCGAAAAAATCTTAAAATGTATCCCTGGGACATTTATATCCGGAGGCAACGCATAAATGAGAGACGACTACTGGACGTACAC:1 - chr3R 4694430 5' + rooA 7206 1 55.45 AATGTAAGTTGCTCAGACAAGAGGGAGGCGCACACGCACGTTAATATATGTATATGCAGTTCGGGAACAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 + chr3R 24976709 5' - opus 7498 2 76.24 TTTTTTTTTAAACAAACTTAAAAAAAAAA:1 - chrX 22496861 5' + gypsy2 423 1 86.21 ATACATACTACGAATATGCGTAGGCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATA:2 + chr2L 4134823 5' + Quasimodo 30 2 54.46 TACATGTTCTATATACTTTGTCTGCGATATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:3 + chr2L 5419806 5' + 297 6617 2 77.23 AACATGTGGCGATATGTGTTGGCCCACATTCGCCTCGCAATTAACAGATCAGATCTGAGCTCTGAACCACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTT:1 + chr3L 17714216 5' - invader2 199 2 52.48 CAAGCCTTACGACCAAATTGAGAGTAGTTTTTGATGCTTCAGCAAAAACTACGAATAACAAAAGTTTGAACGGACTCAAAAACATCCCATCCTTATGATGA:1 + chr3R 19445231 5' + HMS-Beagle 6741 1 71.29 AAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGCGGACACAACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAA:1 + chr2R 5260084 5' + 1360 483 1 91.09 AAAATGGAACTCTTACAGCNCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 - chr2L 12808222 5' + Tirant 8149 2 64.36 TACAAAATGGGAAAGTGTGNCGATCGTAAATGATAGTGAAAGATTACAATTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr2L 21086128 5' + roo 8664 1 78.22 AACCATTTTGTACATTTATGTTCGAATTATTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:1 - chrX 734965 5' + Tabor 6884 2 67.33 CACCGTTTACTACGGGTTTTTCTACCATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGG:1 + chr3R 28409757 5' - roo 204 2 74.00 AATATTTTTGTGAAGTAATTTAAGTCGACCCATGAAAATGTTAGAGATCTAAATTAAATGTGATAAGAAATTAAAGACTTTGTTGGAATATACTATTCAAC:1 - chr3L 4565571 5' + copia 4869 1 70.30 CAGTATAGTCACACTCGCATCTCAGACTGGACTTGCATTAAGGTATGCTCCGTTAAGATACAGATTGGCACCGTAGTCTGGTCGCTGGTAGGAGCGGGGGG:1 + chr2L 1179896 5' + invader1 3734 2 69.31 ATCATTTTCAGGACGACACAGATCTCTCGCCAAGATGTTTGACTTGCGGCAGTATATGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAG:1 + chr3L 10111112 5' - roo 8654 1 64.36 TAATTAATTTGATTTTATTGTTTACAGCGCTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chrX 16671075 5' + P-element 47 1 32.67 ATTTTAGAAAGCTAAAGTCTAATAATAATATATTAAATAGGCTTACAAGTATTCAATACAAAAGAAAAGGAATTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAA:1 - chr3L 16534114 5' - pogo 1952 1 68.32 ACTTGGGCTTGCCGCAAATTGAACTAATTTGATGTGTGAACAACGGCTAAAATGGAGCAGGGGTGTCCTGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 + chrX 2841744 5' + hopper 4 2 75.25 CTCAGTTCTTGTTCTCCAAGTGCGGATAAGATAAAGTAGGTAGTAACACGTTATCAAGAACAAATGTTCAATTGATCTAAAAAAAGTCAAAAGTTTGATAT:1 - chr3L 17040979 5' - Tc1-2 263 1 68.32 CTCTGCCTCCAAATCACTGTCACCCCCATCGTCCTCACCATATCCAGCGCTGGGATCAAAATCATTCTGTATGTTCATGTTATGTTCTGACTATAATAGAC:1 - chr2L 11107274 5' + Cr1a 4196 1 64.36 CATGAGGTTTGTCTGTAAGGATTAAAGTTTGTATTTAGGTAATTTAGATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGG:1 - chr3R 20094531 5' + Max-element 13 2 64.58 AACTAAAAAGGTACTGAACTTAGACGAGGTTTTACGACTCGCATTGCCAACATGCATCGGCATCTAGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr2R 19840174 5' + roo 9 2 69.00 GATTAGGAGGGCGGCAACCAGAACGAAAACGGCGATGAAAGCTGCGGCTTTTTCTGGAAGCTGCATGCTTAATCTCAACATTCTAGCTTTTATAGTTCGT:1 - chrX 4920114 5' - INE-1 156 1 60.00 AAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAAAAGAGAGAATACTATAGTCGA:1 - chr2R 5260086 5' - INE-1 578 1 79.21 CGGAATGTTTCTTTCCCGACTTGCGACTGGATTTCTCTGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTGCATTGGTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACT:1 - chr3L 13378670 5' - Transpac 423 1 63.37 AGGTTCCGCCGCAAAGTGANAAGAGGGCACTGGAGTAGAGTTTTCATCGCTGGAGGATGCCCGGGCGGCTACGTCAAGCGCAAAAATTTGCGCACCACTTC:1 + chr3R 30944739 5' - R1A1-element 94 1 45.54 TAATACCGTTTTGCATTTTGTTCTAACCCCTTACTTCACAATTTATCAAATCTACTTTGATCTGTTTTCCTCTTGTTATGATTTGTGTGAGCGCAGCCAGC:1 + chr2R 11436756 5' + aurora-element 231 1 77.23 ATCTGTGAGCGTAGTTGTTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGT:1 - chr3L 5241190 5' + Ivk 17 1 62.38 AAATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGGAACTAAGTAATACAAAGGTATTTAATTTCAAACAATTCAAGAAATGTTTCACTTTTATTTTAT:1 + chr3R 26323210 5' - HB 1497 1 60.40 TCGGCAATAAATAAATTACAAACAGACCTTGGATCGAAATCAGAAGTGGGATCTCCCAAGCCTCACAACTGTGGATACAATCTGCGAACACTCTTCGAGTC:1 - chr2L 12205357 5' + invader5 393 1 76.24 TGTTTGTTCGAGATAAATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATAT:1 + chr3R 11151796 5' - 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chr2L 17677809 5' + Tirant 2 2 79.00 ATAATTATTATTATTATGATTATTACAAAAGGAATAGCCAGTCATTTGCATGATTCCATGCAATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:2 + chr2R 11721488 5' + Doc 28 1 52.48 TAAATAGTTTGGATTGTTAGAAATAATATTAAGTTACCACATTATCAAGCATTTTTCGCAGTGCACTCCTCACTCATGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTT:1 - chrX 4264446 5' + mdg3 5249 1 79.00 TGCCATAAAAATATATCCACACAACCGAGAGCCAAAAAACCAAGCTCAACCGAAGGCCATGATTCACGAAAAACATACAGTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr2L 4063790 5' + roo 8664 1 79.21 CTGCTCCCATTTCTGCGCTTGCGAATCAAATTGAGGCTACCAACTGTCGGTAATTTGCATATTTGAGCTGGAAATTGTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCA:1 - chr2L 15531896 5' + Stalker2 7246 1 81.19 ATTAACAAAATTAAATTCAATTTATCCATTTTGCATAACCCAATACGTTTTATTGCCATAGTATAGAAGACTATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTG:1 - chrX 22689632 5' + 1731 7 2 69.31 TCCACTGGAAGGATGTGCGGCCAGAAAAAAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 - chr3L 25345146 5' + Doc 51 1 68.32 AATGTGACATTAATTTGCCNTGTGTATAATCACCTGTTGTGGCCGTCGTGTAGTTTCTGTGGTGCGGATTTGATTCGTGTGAATGTGTGTGTGTGTATGTG:1 + chr3L 17565324 5' - 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412 7518 2 52.48 TTTTCTTTTAATTTGAATACTGTCGTACCAACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATA:2 + chr2L 14793462 5' + Stalker2 3 2 76.24 ACGCATGCAGACACACGTCAATGTAGACAGTGCACTATGGGGCATGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCAT:1 + chr2R 7546267 5' - hopper 69 1 61.39 TGTACTATATCCTAAACTCTACGTTCAATTCAAGCCCAACCATCATATAAAAGTGAAAAGACGCTAACACATATTTGTATGTGTTAAAAACCTTATGTCTC:1 + chrX 5334367 5' + Porto1 129 1 74.26 GCAAATTACATAATGAGGTAATGGTATATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCAC:1 + chr3R 17482019 5' + copia 4921 2 75.25 TCAATCAAAGTCAACAAAAAAAAAAGGAAAAACTAAAAAA:1 + chr3L 10998392 5' + Doc2-element 236 1 77.50 TGATTGTTGTTGGTTGCTGACTCGTTAACTGAATAATGTGGGTATACATGACTCCCCCAGCGTAAGTTTCAAGTATGTGGTTGAAATTATTTCATTAAGTA:1 + chrX 16463401 5' - Transpac 4872 1 61.39 TAAATGATAGTGAAAGATTACAATTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr2L 21086102 5' + roo 8689 2 54.00 ATTGTCATTAGTTTCATCTCGTGTGTATTTATTCATGCATTTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2L 12958985 5' + roo 28 2 57.43 GAGGTCTAGTCGGCGATTTTAAGCAAGCCATTAGCACCGCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr2L 4924575 5' - hobo 2902 1 61.39 CCAGCATAATCGTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATG:1 + chr3R 10736023 5' - McClintock 467 2 68.32 TTGGGGTTATTAATGGTTGCAATGTCCTCATTCCAAACACCTTCTGTGCTATCTCGATTATCAATTAGCTCTAACGCCCTAAAACCTCCCAAAA:1 - chr2L 22585352 5' + INE-1 344 1 80.85 GCCACTCCGAGAATCAAATGGCCAAGTGGAGAGCGAGAGCGAGCTTTTTTGAGAGCCAGAGAAAAAAATTGCCACTGGGAGAGAAAGAGAGAGAGAGCTTA:1 + chr2R 13897714 5' - blood 7176 2 76.24 GCCATTAAAAAAGGAACGGCAGAAGGAAAAGCGCTCGAATGGGAATTGAGGGAGCAGGAAATGACTGCCCGGGTGGACCGTTTATTTCTCTGCAAGTCGTG:1 - chr2R 15794283 5' + baggins 370 1 59.41 TGGCCGCGCGTGCAGGAGTGCTCCAACTTTGATTATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACT:1 - chr3R 11419980 5' + Stalker3T 318 1 75.25 CTCGCCACTTAACTCATTTGGGGCATTATTGGGGCTTCGTTTTTTTTTTTATCGTGAAGCTCGTATCAGTTGTAAAACTCGACTGACTCTTAAAGCTAACA:1 - chr3L 15295150 5' - gypsy11 347 2 55.45 AAATTCTCATCAAGTTGTAAACCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 - chr3L 20354051 5' + 412 7109 2 79.21 AACAAACCAGGCCAGAACCCAGAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAA:1 + chr3R 13446944 5' + Stalker 6941 4 78.22 TCAGGGGGATGCGCACCGGNAGGGGGCGTGGCACTGCGCGTGCTGGATCACTGTACAAAGACAGAAAATAAAAACTTGCAAGCGAGCTGTTGAAAGTACCG:1 - chr2R 8817510 5' - Cr1a 362 1 55.45 ATTGATGAACATCTTTTTCNCGGTAAAACTTTGTTTAGATTGAAGACCTTTCTCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1 - chr2L 3699483 5' + mdg3 5277 2 55.45 AAGTTAATTACACTAGAAAATATCATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATAT:1 + chrX 8334313 5' - flea 4963 2 79.21 TAACTCGGAAAATAGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr3L 7168327 5' + Doc 45 1 64.36 ATCCACCGAAAATTGGCCGAAATTCTTGTGGTTATGGTTGTTCTGTATGCATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:1 - chrX 6481094 5' - jockey 4963 1 53.47 CATTTCCGCTTTATTTGTCTGCCTGCCCTTTCACCCGCGTTTTATCTATCCAGATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr2L 20612038 5' + 297 9 2 71.29 TGCCACTAAGGTCCTGAACTACCCTAAGTAACCCTTTAGTTTCTGTCCATTTAGTGTACAATTCGAGTGTGCTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTA:1 + chr3L 18385453 5' - Gypsy6A_LTR 158 1 64.36 AAGACACTGTAATTGCCACNTTTATAGTTTTTTCCATAAGTTTACTTGTTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2L 22197281 5' - roo 9045 1 57.43 AGTCGAACGATATATTGCCATTTGTCATCCGTTCAGGTAAGGGAACCTTCATTCCTTCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTC:1 - chr3R 13331498 5' + transib2 17 1 63.37 GATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACC:1 + chrX 21087557 5' + mdg3 5254 1 73.27 CGTAAATACGTTGAGGGGCTAAAAACAAATGGCGCCCAACGTGGAGTACCATACGATTTGAAGGCAAAACGAAAGGAGAAAAGTAAAACAAAAAAACAAAT:1 + chr2L 16661757 5' + Doc3-element 171 1 68.32 AAAGTGATTTTGTCAGGGGTTTGGCGGCTGGGGTCGCTTTCTCCTCTCGGGCTAAAAACTTTGCAGTATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATT:1 + chr3R 26597316 5' - mdg3 5491 2 69.70 TAATTGTACCAGTTCCTAAAAATGGTGAAATACCAGTGAAAATGGTAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 20619994 5' - roo 9052 2 52.63 TGTAACTCTACCTTTTTAACCAAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTAC:1 + chr2R 11941894 5' + I-element 483 1 78.22 ACGGGGACCAGCGGCGAAAATAAAAGATAATTTAAAGATTTCAGCACCTTCTTTTTGGAATTTATTTTTTATAGAATATTTTTTTTTATTTTTTTAGATCG:1 + chr4 83392 5' - R2-element 3581 1 76.24 AAACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr2L 10625678 5' - roo 9034 1 60.40 CTCATCTTAAATAAATACTTTTGAACACCATCTACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAA:1 + chr2L 17789790 5' - Idefix 225 2 68.32 AGCTTAAGGCAACGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGT:1 - chr3R 1844867 5' + Cr1a 109 1 76.24 CCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGACGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTG:1 + chr3R 11151830 5' - mdg3 206 2 61.39 TTATGTTAAGTTAAGCAACACGAGGACTAGTTATAGTCAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCTAT:1 - chr2L 23390693 5' + Gypsy6A_LTR 387 1 62.38 GCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCAGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 + chr3L 13895377 5' - hobo 2898 1 68.09 ACAACTACTCAGACTTCAACGGCAGCACCGTCAACAACAACTACACCACCTTCCACAACATCCACAACACAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCT:1 - chrX 4245117 5' - R1A1-element 5123 1 75.25 ATATGTTCATTCATTTTCTAAGAACAAATCATCTATTAGTGCCTACATTTCGAACACTAATTACAATATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chr3R 5993088 5' + pogo 7 1 72.28 AGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTTGTGTCCGCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAAT:1 - chr2L 14588754 5' - 1360 412 1 91.09 AGCCGAATCTGCACTGAAAAAAATTTGAATTAAGATTTAAGTTAAAAAGCCAATAATGCATCGACGGCGCATTTGAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGA:1 + chr3R 13931888 5' + invader2 346 1 44.55 CTCAGCCCGAAGAGCCCTCAATTCCGGAGGAGGAGCACCCCCAGAAAAACGCTCCACCAGGAAACGACATTTTTTCTTCACTGGATTTCCAGAATTGTGAA:1 + chr3R 26597874 5' + mdg3 493 1 69.31 ATGCAAAATAAATGTAATGGAAACTGAGTATAGTAACTTCTACTCGTCACTCCAAGAGTAAAAGAGATTCGGTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGC:1 - chrX 20461114 5' + INE-1 29 1 54.46 CTGTGGCTAACTAACTTGAAACTAATGCTTATTAACATTTTTAAATATATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:2 + chr2R 19088951 5' - Tabor 458 2 52.48 CCACCCATCCATCCCAGTGCAGCCACAACAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTAAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTAAA:1 - chr3L 7062778 5' + invader2 421 1 72.28 ATGTATGTAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chrX 17104407 5' + 297 6620 2 74.26 GCTGCAAGTGGCAGTGCACATTTTTATCAACATTTCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 + chr2L 17677715 5' - Tirant 372 2 60.67 AGTATGCACGTATCTGGCGACATAGTCGTTTGATTAAACTTGTTAACACACATAGATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr2L 10143709 5' + jockey 29 1 56.44 CATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTACAAAAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCA:1 - chrX 22824222 5' - Gypsy12A_LTR 2247 1 48.51 CCTTTGACTACAAAAAATATGTTCGATATGCATAAAAAGTCAGTATTTGCTGAAAGTCAGGGCAGTACTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chrX 17494711 5' + 1360 9 2 71.29 TGGGCACCGTTGGGGGCATCTACTTGCGAGTGGAACGCATCTAACCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATA:1 - chr2R 6779865 5' + 17.6 8 2 73.27 ACCCGTAAAAATGAGCTCTAAGAAAATAATTAAATGGCAGGCATGCGAAAGAAAGACAGCCCCGCACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTC:1 - chrX 13888983 5' + R2-element 3549 1 70.30 ATTTAAATGGGTAAATTGAACCATCATAGAAACCGAAGCGGATATGCTCTTTCATAATATATAGTTAAATTCAAAATACAATTTACAACATTTTTAGACTT:1 - chr3R 28448662 5' - transib3 34 1 56.44 TAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTT:1 + chr2L 23295812 5' - micropia 5390 2 73.27 CTCTTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3R 29608837 5' + roo 42 2 69.31 GCGGCTGCCAAAGTGCAAACAAGCCTGGAGATCCCCAGATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:2 + chr2R 8311302 5' + opus 7038 4 63.37 CAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 + chr2L 12808170 5' - Tirant 8464 2 69.31 CATAACATATTTAAATGAAACTATTGCAAATTTCTCCACACCAACACTTAGGGAAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTT:1 + chr3R 15721609 5' + Doc 275 1 54.46 CCATTATCACACCCTACACCATGAGATAGACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAA:1 + chr3L 26820211 5' + I-element 248 1 71.29 TTATGTTGGACATACCCTTATCTTGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 - chr3L 6033602 5' - 412 7521 2 52.48 ATTTAAAAATATTTAAATAAATGGCAAATGTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGC:1 - chrX 22789373 5' + Tabor 47 2 70.30 AACTATTTTTATAAATACGTTCTTGAGAACCACTTCAACCTACGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 - chr3R 6947365 5' + I-element 56 1 70.30 AATCAACTGTGAGATGACAACAAAAATATGCAAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGC:1 - chrX 17325614 5' + F-element 349 1 61.45 CTCCAGCATGTTTTGTTCAGCTCTACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr3L 20520726 5' + P-element 53 1 26.73 AATAACCTTCAACAGCACAACTACAATAAATAATATTTGATACACCAATTTACTCACACAAGCAAACAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCG:1 - chr3R 3590229 5' + 1360 3284 1 59.41 CACTCAGTTGTGTGGTGAGAAAAGGTATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr3L 14589096 5' + hobo 35 1 52.13 AACAAAAACAACGAATTATACGGCAAGTGATACAAGGCACGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr3L 19896603 5' - P-element 2851 1 43.56 GAATGACCCGTGACATCTATGAGACGGATTACTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGATCTCCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAAAAT:1 - chr3R 21575189 5' - 1360 97 1 69.31 GCTAAGAGTGCACTTGGGTTGAAAGTACAGCAGATACAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr2R 9649179 5' - roo 9032 1 65.35 GATTGATATCGAAATAAATAGGACTATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 - chr3L 15033349 5' + I-element 52 1 74.26 GGCGGTTTTGGCAAAACGGCAACCGGCCAGCACCATGGACAACGTTGCAACATAAAGTCCCAAAATTATCAATATTTTCTAAAAAGTGTGTTTGGTTAAGG:1 - chr3R 16631447 5' + HB 273 1 66.34 AATCCCACGCTACCAAGTGCTCCTCCGGCATTGGACTTCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAG:1 - chr3L 6754424 5' - R1A1-element 5083 1 62.38 TATATTTTTTCAATTATTATTGTCTTATCACAAGCCTCAAAAACTGCCACACCCACATTTTTCATAATTTTTTGGATATTTTTTCATAATTTTAATAGTTT:1 + chr2L 23024753 5' + INE-1 403 1 59.41 GAAGGCGGCGGAAGAGAAAAAGAAGGAGGGTAGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTG:1 - chr2R 22856585 5' + 1360 40 1 67.33 ATGCAAAAAATACATCGCACATAGTTTTTTGCCCTCAAGACAGTTTTCTCAGTAATAACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTA:1 - chrX 10846724 5' + 1360 3235 1 67.35 CTCCAAACCCATAAAATCCGAAGTCCTCTGCACATCCGCATAAAGTGCACAATAGTTCACAAGTCGCATTCAGGCTGCCCAGTACAAAATCGCCAGGATGA:1 - chrX 1421642 5' + BS3 1370 1 65.35 CCATCGAATCCTTGGATAAGTGATGAAGTCATGAGACCGACATTCGATCGACGCCTCTGGATATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 + chr2R 13654367 5' - flea 4980 2 75.25 GTTGCAGGGACCTCGAAGAGCCACAAGTAGTCGAAGGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 + chr2L 8622738 5' + 297 6590 2 71.29 CTACCTGGTTGCATTTACCTGGCGCCGTCGCGAAATTCAATTACTCGTGCACCATAAACCGATTAACTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 + chr3R 5135432 5' - 297 6968 2 73.27 TGGTCGGTAAAACGAAAACATTAAATTAAATTGTCAACAAGGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chrX 7157332 5' + blood 7045 2 58.42 ATTCCAAAGAGCAAGAGATGAAGAAGTTGAGAGCTCGACTTATTGTGCCCTAATCTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3R 27495636 5' - 412 472 2 58.42 ATGGGGCAGTAAAAGTGGTACGCAAATGCCACTGAACAGTAAAGGGAAATACAAAGGCAGTCTAGAATATGGATGCTTAACGTTCTAGCTTCTATAGTTCC:1 - chr2L 17682084 5' - INE-1 157 1 79.21 CTTGATTGGAAATGACAGCGAAGAAACATAAATGCTATGTGAAAGTACGGCTGTTTTCCGCGAAAAGCCGTTGTGATGAGAATGTGGCACACGCCAGTGTG:1 + chr2R 8182592 5' + invader4 174 2 81.19 TTTCTATGTTTTCGTAGGGNACAAAAACTTTTATTGGCGCCATTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAAC:1 + chr3L 6553706 5' + hopper 1109 1 57.43 ATTCTCTTATTCCAGATTTTTATATAATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 - chr3L 15788477 5' - opus 7452 2 79.21 CAGCGGGAAAGCTTTTTTGGAGGCAACACCATTACCACAAAACAAAAACAACTTATACCTCTCATTCACACACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAA:1 + chr2R 23873839 5' + Porto1 301 1 64.36 ACAGAAGTGGGCTAAAGCGAAATAAGCCACAGAAATGGAAATAAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACC:2 + chr2L 18247954 5' - blood 375 2 76.24 AACATATATTGGTTAATAAAGTAAGAGAATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAG:1 + chr2L 2592728 5' + I-element 497 1 72.28 ATCTGCTTAAAACTGCAATTAATTTAAACGGTTCCTTTTTTTTGCCCCATTATAGCCGAAAACAGGTTATGGGCCCAGTCCATGCCTAATAAACAATTAAA:1 + chr3L 4841793 5' + copia 292 1 57.43 CCTGCACTCTCTTTCGCTCTCGCTTCGATGACACACTTTTCGACATATTTAAGTAGGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 + chr3R 24767781 5' - P-element 2869 1 59.41 GAGCGAATTCGTTTTTTATTGTCAGTCAGTCAGTCCCGAATGGGATTTTCTTCACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACA:1 + chr2R 22227785 5' + 17.6 153 2 60.40 ATCAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAA:1 + chr2R 9408181 5' + FB 34 1 59.41 GTAGAAGCTTAGCGCGATACTCTTTATTTAGGTTGTGTTTATAGGAGAAAATATCGTATAATACACTCTAAACAACTTGCAAACCATTTCCTATAACATTA:1 + chr3R 6890204 5' + Juan 328 1 52.48 CAAACAAGATACAAAAGATAAACACGACAAAAACAACCACAAATCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCT:1 - chr3R 12424696 5' + Idefix 200 2 57.43 ATTATTAATAAAATGTTTCGTATGAATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTT:1 - chr3R 25086171 5' - Bari1 1681 1 53.47 TATTTGATGTCCTGTGCGGTTTCTCGAAGGATCCCCTTCCATTTGCTGAGGCTCAGTCCGTTTTTACGAATCTCTCTTTTCTCTT:1 + chr3R 11475390 5' - Bica 290 1 70.59 CGCTACCATGTTTCGGTTCTGGCTTGTGATTTTTGGGCAACGCAGGTAGAAGGGTCTTTATCTTGCACAATAATCCAACATGCCATACTTTGTCGAAGGCT:1 + chr3R 18593422 5' - Helena 408 1 60.40 CTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 + chr2R 5214952 5' + F-element 24 1 58.42 GCAATCTATCTGTATAGCTNTTCTAGCACTAAATATCATCATTATGTCAAATATATCATACATCCAAGAAAAACCAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 14087189 5' + G2 3077 5 60.40 CATATGTATGTAGATTAGCACAGTGCAGGCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGA:1 + chrX 15944887 5' + blood 288 2 74.26 ATCATTGCATCCACCTGGACCCACAGGGTCTTCAACTGTCGAGGATCGTACCAGACCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCT:1 + chr3L 19485232 5' - Quasimodo 240 2 57.43 GTGACATACATACATATCCNTATAAAATACCATTAACCATAACACAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGT:1 - chrX 18326244 5' + Doc 212 1 49.50 TACACGACCACACACCCACTCATCCACTCACACATAAAGAAGGTCAGACCTTAAAGCACGTATCCGACGTGTGGGCCGACGACTTCACTTGATTGCTAGGG:1 + chr3R 28444534 5' + HMS-Beagle 140 2 83.17 AAGAATATTTATACGAGAAAGTGATTTAAGTACGGCGATAGCTTATCATTGTTCAATACTTAAACACTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 + chr2R 22051442 5' + Tabor 10 2 67.00 CGAAACACGAAAACTAGGTGAAAACTGTAAATGAACCAAACACAAACATACACTAACACTCACTATTGCAACTGATATGAGTTTGTGTAGCCCTAATAATT:1 + chrX 17991432 5' - Fw2 3834 1 62.38 TCCTCTTCGATTTCGGTATTTTGATCGGTTTTCCCACCCACCTCACGCTCTGGTTTAGCTTCGACCATACGAGGCGGTGCGATCAAAAAAAAATTAAAAAA:1 + chrX 20933110 5' + R2-element 3581 1 75.25 CAAAACGCATAGAGCAATAATAAGTGCGAATAAGTGTCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 10087883 5' + roo 8704 2 68.32 AAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGA:1 - chrX 18326220 5' + Doc 229 1 71.28 TCGTTGAAAAGTTTGTAACAGGCAGCTACGCATCTGTCGCCAAGAAGGAAGCGTTTCGTACTATATAAAGTATATATATTCCTGATCATGATCAATAGCC:1 + chr3L 19471445 5' + INE-1 87 1 78.00 TCAATGGGTATAATATTTCAAGCGCTCTGTAAGTCCTTTTGCCGCTGTTGTCTTTAGCTTTGGTTATTTAGAAGATTTTAATTAAGTAGGATTTTTGTCAA:1 + chr2R 19866232 5' - jockey2 3213 1 77.23 TTGTGGCCTGCAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTG:2 - chr3L 5241166 5' + Ivk 41 1 68.32 TTTTCGTTAATTATGTTATGAAAAAGTCAAACAAACGAAATCAAGTTTAAATTGCTTCACAGGCGACCGTACATCAAACGCTGATAAGGCACCGGGATCGC:1 + chrX 18545120 5' - accord2 7186 1 67.33 CTGCACCGGCAGCCTTATCAAAAGTATCAAAAGTAACAGAACTATGCCCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTG:1 - chr2L 21215339 5' + BS 5003 1 54.46 CTCCATGGCGTAAATCTAATTTTGCAGGACAAGTGACTGTCATTGATTGTCGATATTTAGGAGCCCGGCAACGCAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTC:1 + chr2L 21800567 5' - mdg3 238 2 80.20 TGAGGAGAAATCTCCCGAGTTCTATAATAACCACTATGGAAGTGCGAACTTTTCCGCGACAAACTTCCTGGCCGGCATTCATTAGGCATTCCACAGTCTTC:1 + chr2R 12473024 5' + Doc 3 1 70.30 CATTGAGGAGGCCATCGAGTTGGGAGTTTTTCAGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACT:1 - chr2L 4732882 5' + I-element 4962 1 67.33 ACAAATACTTAACTCCTAGTTTTCAAACAGTAACTGAGCAGACAACTGCGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACACGGCCTTCCTGACCAGCAC:1 + chr2R 15033398 5' - invader6 4474 1 58.42 CTTGTAGAAATTTTTACGTNTTTCTGATTACGGAGCCAAGCTTTCGTTGCCTGCTGCCTCTTTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGAC:1 - chr3L 7308860 5' - hobo 2668 1 65.35 GTTTAATGGTCACGGTCACGATCGGCTTGTCGGAAACTATAAAACTTGAATGGCTTAGTAATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGAC:1 - chr3R 8581932 5' + roo 434 1 72.28 CCAAGCCACAAAACCTCGCGTGCAGTACGCCATAGCTCCAAAAGTGGTGATTAAGATTTAATAAAATATACTTTTTCTATAAAATAACATAATAAATAAAA:1 - chr2L 2648441 5' + HeT-A 341 2 46.53 GCATATTTTAAATCTAAGAGTTTAGAAACGTGTAATGTACATAATTTTGATATATTTGGAAATTTGTCCAAGTTCCAGTTTTTTTATTCAATAGTTTCGAA:1 - chrX 10773377 5' - HB 1484 1 69.31 TCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr2L 8577281 5' - roo 9032 1 70.00 TACTTGGAATTTGTGGCGTGCTGTTTACTTTTGTAGTCTAGTAAACTGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3L 14222532 5' + roo 8693 2 52.48 GATATGGGTTTTCAGGCAACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:3 + chr3L 2022227 5' - roo 9049 2 60.40 CAGTAGATTTATTTATTATTTGTCTGTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGT:1 - chr3L 5241156 5' + Ivk 51 1 78.22 TTTTTTTCCCCCGTCTGGAAATAGAGCTATTATGTGTTGGGCGTGCATAATGTACATACATATGTACATCATGTACATATAAAACTAAATTATTAAAAAAA:1 + chrX 22637656 5' - hopper 164 1 82.18 CTTTATTTGTCTGCCTGCCCTTTCACCCGCGTTTTATCTATCCAGATATATATATATATATATAGTGACATATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr2L 20612030 5' + 297 17 2 63.37 GATTAGAATCGATGGCTGTGCCACACCTGACCGAGATATATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 - chrX 12992801 5' - I-element 5324 1 61.70 TGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3R 8765543 5' - roo 9037 1 61.39 CGTAGGCGTTATATAACACNCATATGATTGTATAAGTGCATGGTTAGCATAACCCACGCTAACCAAATGCCGCTGTATACATACTGTGCGCACATAGCATT:1 - chrX 1770002 5' + gypsy11 4193 2 69.31 CGTCGAGGAGCAAACCTTCCTGGTCTGCGAGTACTGGACTTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTGATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGCTTTT:1 + chrX 1180623 5' - Quasimodo 83 2 58.59 CGAAACCATAACGAACTTAATCATTCTAAAAATGTTGTTCAATCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATA:1 + chr2L 12511540 5' + copia 34 2 59.41 TAAGTAATTTAAGTAATTTGTCAAAAATATTCACCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 - chr2R 11030565 5' + F-element 66 1 76.24 CGGGGGTGGGCGGGACCCAGTCGAACCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3R 7139250 5' + pogo 48 1 73.27 CTCAATACACCATTTAATATAATATAATTTTATGTTACGTTAAGCAACCAATTGAATTGCTTTACAACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 - chrX 11088307 5' + blood 8 2 69.31 AAGTGTTTGCCTTAAAGTTGTTACTGCCAAATTACCTTTTGTTGTTTTTAACCCTGGTCTCTCGCACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACC:1 - chr3R 19203959 5' + Doc 289 1 66.34 TTATTCGATGAACCCATTAATCGATAGCTTTTACCACATTTTGTCGACTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAA:1 + chr3R 4191234 5' - INE-1 89 1 51.49 GTTAGTTCGTAAACCAGCTTATTTATTTTACCTCTCAGTTGGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAACGTCTCAAAAC:1 + chr3L 163218 5' - mdg1 390 2 54.08 ATTGCGCTCTCTGCGGTCTTTTAATTGCCTGGGGGATTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGAT:1 - chr3L 19331844 5' - G2 52 1 64.36 TGGAAGAAAGGTCGATATGGAATCGCGGATATTGATCTAAGAAGATAGCTTGTTAGTTACGATAAAATATTTCTTATACTGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 - chr3R 17482108 5' - copia 255 1 70.30 CGGAGGATGAAGAGCCAAAATAGATGGAAATGGTTTGTGTTATGTGCCCCCACAACAGGTAACGCTGATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAA:1 + chr2L 1071973 5' + FB 11 1 66.34 AATAGTTCAGATGGATAACGTAATTGAAAAAGTACAAGGAGAGACAATTTTCACAACATTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 1446199 5' - roo 391 2 43.56 GTATATGTGTCTCTTTTTTTCTCAATTTCCAACAGTGTGTGCTTCTTCTTGCTGCTCGGCACATTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCG:1 + chrX 11792848 5' - micropia 5222 2 66.34 TCAGAACGATGGAGGAAATGGAAATTTACTATTTTAATGTAACAACTATTTTTATAAATACGTTCTTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 - chr3R 6947408 5' + I-element 13 1 66.34 TGTACTTTGTAGACATTTGTTAGTGAAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTAAAAAC:1 + chr3R 20094473 5' - Max-element 8479 2 74.26 AGTCAATGGCCCGCAGAGAAAACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:2 - chr3R 11608028 5' - 1360 3366 1 56.44 AACTTCGTTTCTAGTCACACGTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 - chr3R 24542069 5' - 1360 3335 1 82.18 TGCACAAGTGAAATTGTTATTTAAGTTATTAAACTTACTAAATACAAAATAAATATTTTTTTAAAAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3R 26317898 5' + roo 8675 2 68.32 AAAAATGCCATAAAAATCACTCATACGCTGTAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTAC:1 + chr2R 20718841 5' + BS 5041 1 69.31 ACCAAGCTCAACCGAAGGCCATGATTCACGAAAAACATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr2L 4063752 5' + roo 38 2 68.32 AGATGAACTCAAAAGCTGTACTCATATCGTTCATTACATTGTCCACTTTTTAGTGAGTAGTGAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 + chrX 8316295 5' - hobo 2926 1 65.35 CGTTTATCGAAGGAATTTTAAAAGACGCACATGTGTGTGTGTGTTTGAGAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATG:1 + chr2R 9209417 5' - Tirant 377 2 53.00 AAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 - chr2L 17730536 5' + pogo 5 1 75.76 TGCACAGCAATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - chr2R 9631754 5' + F-element 54 1 75.25 CAGGGGAAATATTGAATAATTGTGCTCACGCACAAGGAAGTCGCCACTACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr2R 13763182 5' - roo 409 1 63.01 CTCAAATGTAGACGCATTATAAATGCATATTTATCAAACAAAACTAACTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3L 872782 5' + 412 29 2 52.48 TACTCATGCCCTGCGCATGAGTGCCGGCAGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTGTATCTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGT:1 - chr3L 23666155 5' - Stalker 74 4 67.33 CAAGCCTTTTCAACTTCATTCTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGC:1 - chr4 74306 5' + 3S18 5820 2 77.23 ACTTAGACATTAATGTGTATGTGTGATTGTTTACTTATTCCTAATTTTTCATTTTCAATTCCTCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGAGA:1 - chr3L 26007757 5' - G5 4760 1 52.48 AAACGGAAGACACATAAAAATCCATGTAAAATATTTAAAGAAATAATAAAATCATCCGAATGCCCATCATTCAACAACACAAACCCTCTAGACCTTCTTAG:1 + chrX 17004493 5' + I-element 5101 1 73.27 CCTCAGTCGATGCCTGTGTAAATGCAGTTAAGAACATTCGTATCGCCAACCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGC:1 + chr2L 16994769 5' - F-element 4237 1 51.49 TTTCTAATACTGTTAAAATCTGGGTTGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGA:1 + chr2R 19091601 5' - Stalker2 373 2 52.48 GAATAATTATATTTTCACTAAAAATTAACACACCAACTCGTTATTTAAGTTAAATGCTATGACGGATATTGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr2L 13093867 5' + roo 8669 2 67.33 CGCACTCGGCATATCAATTTTCCCGCTCATCCACCTCTCCCCTCAGGACATTTCAAGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2R 19061304 5' + roo 15 2 63.27 CTTCTGCCGTTGAGCGAACCACAAGCTTAATGCGGAACTTTAAGCAGTTTTACGACGGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAAT:1 - chr3R 9088646 5' + hopper 16 1 61.39 CGGATGTCCAAGAGAAATTACATAAAAAATTAACAATGCCCACTACGCTTAAAGAGGTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTG:1 - chrX 18193403 5' - accord2 7340 1 72.00 TTATAGTAGTATATGACAATAGAAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTT:1 - chr2R 5924418 5' - jockey 4737 1 35.64 GATGAACTCAAAAGCTGTACTCATATCGTTCATTACATTGTCCACTTTTTAGTGAGTAGTGAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:2 + chrX 8316296 5' - hobo 2925 1 64.36 AACATTGAATGACGACAGTNGCATGCAGCACAAGACACAAGACACAAATGATAACACTCTAAAGAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 17701617 5' - roo 398 1 57.43 TTTGCCTGATTGTGTTCGTTCCGCTGGTTTTTGCCCAATGCCAGCTGATTTAACAAGGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATCTTTAAAGACTTACAA:2 - chrX 11017071 5' + roo 18 2 57.43 TTGGGCGTTAAGGACCAAAGAAAAAAAAAAAGGGAAA:1 - chr3R 24677086 5' + Doc2-element 246 1 78.38 TTTTGCACCCTTTCTTTCGACTCCATTCATCGTACACGCAAAAAAAATCTTTGTTGAAATTTACGAGTGAAATATAAGTCATTTTAATAGATTTTCCATTT:1 - chrX 22694471 5' - Burdock 6384 2 71.29 ATTATTCTAGTGTCTTTGGTTCGGCGGTGTATGTCCGACGCTTCTCATTTGGAGTATCGCGCTGCGTCGCAAGGAATGCTGAGTCGGCTTGCCGCTCATG:1 + chr4 158200 5' + gtwin 7083 2 68.00 ATTTAAATTAAAACTGATAAAATGCACTCATAGTTTTTATATGTGAACGTATTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGT:1 + chr4 989011 5' - Stalker4 66 4 58.42 CATCCAGCACATTGTTCTCCGAGCAACGAAAGTCAATTACCAATATACAAACACAAAAACTCTTAAAACGAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTTACAGCA:1 + chr2R 25053292 5' + I-element 441 1 58.42 AAACTACACTAATTACATACCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAA:1 + chr2L 19646057 5' - Quasimodo 6935 2 76.24 TTCTCTCAAAATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTG:1 - chr3R 10741136 5' + 1360 3371 1 47.52 TGCAGTCGTCTGGGTCCACTGGTGGATCGCGAGAAGATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTA:1 + chr3R 24320713 5' - Cr1a 4315 1 74.26 GCGAAGAATGCGCCTGCACACATAAATTCCAATTAAACAAGGGCAAAGAAATTGAAGAACAGAAGGAGAGACCCAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTG:1 - chrX 17423311 5' + F-element 95 1 78.22 CCGACCGATTTGTTTGGGANAAGGGAAAATAATGGATTTTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAACATCAGAAGTG:1 + chr3L 19315499 5' + invader3 289 1 64.36 CATTTCAGAAATGTGCACAATTTTTTATTGTGTAGCTAGAGTTGATAAAGTTGATTTCACCGCTTTGCGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGA:1 + chr3R 10087799 5' - roo 9071 1 76.34 TTCGTATGAATGGAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTA:1 - chr3R 25086155 5' - Bari1 1665 1 67.33 TCCCGACCCAGGAGTATCTCAAAACACTTGATAATCAAATGCCATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 - chr2L 15898815 5' + F-element 47 1 61.39 CAGCCATGGAGTGCGATTGGATATGTAGGCATTACTCACCTAATCCATCAATGACTAGCCCATGTAATAGTCTGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAA:1 - chr3L 9569771 5' + jockey 4977 1 71.29 TCATCAGAAGTGACACCGGACCCAATGACATTGAGATATTCAAGTGAATTAACAATAGTTTTTTCGTAGATATATGACAATGAATGAAACACGTCTCCACC:1 + chr3R 21089292 5' - Doc 26 1 68.32 AAATGCATATTTACTGCTTGCTATAGAAGGGCTCCAAAGGCTGGGTAGGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGC:1 + chr3L 3880978 5' - blood 350 2 52.48 CTCGTCGTGCAACAAACCCGAGATCTCACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCA:1 - chr3R 10391260 5' - invader4 308 2 59.41 ATAAGCTCGAGTGACACATTGCGCATTCGAACTGTGGGCCAAATGGCACGGAATTGATGATATGTGGGCGGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCT:1 - chr2R 14576600 5' - gypsy5 403 2 72.00 CATTAATTACTAACTTAAAGATTAGGTAGAAGATTTCATTAAATGGCCTTTTAAGCATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTT:1 + chr3L 16563208 5' - 3S18 6084 2 55.45 GGCCATGCACTATGTGCACTGCAATGCCAGCCTCTTCTTGACCAGCAATCTGTAAGGGAATTCATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCCAAGTC:1 + chrX 6292618 5' + Stalker3T 305 1 69.31 TTTTCTTCTTTTGTTTGTTGTTTATGATTTTCCACTTTTTTGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGCATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr3R 14193878 5' + pogo 10 1 71.00 CGAAACCGAGGCAGAAATAATAGGGGACAAGGCGGAATTGCGAGAATGTTATTTGGCTTTTGCATATGTCACACGAATCTCTCTTGGGCCCACGCCAGCAA:1 + chr2L 17309808 5' - G5 463 1 71.29 GGATGGAAAAACGGCCCTAATAGCTCCGAACAGTCAGCAAACCGTACCAAGATTTCACGCCCACACATCTTAACAACCTAATAGTCGAGTTTCCCGACTAT:1 - chr2L 20922049 5' - INE-1 565 1 63.37 AACAGCAGATTAAGCGCATAAAAATGGAACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 - chr2L 12808242 5' + Tirant 8129 2 59.41 GTAGGCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAG:1 + chr2L 4134842 5' + Quasimodo 53 2 73.27 TCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTG:1 - chrX 18326228 5' + Doc 228 1 65.35 AAGAGCACGCTGTGTTTTTCGATGATTATCTCTTGCCATAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAA:1 - chr2L 7233614 5' + 412 414 2 61.39 AAGCTCTTCGATTTCTTGTACGCACATTTTTTAGGCCAATTTTTCACACTTAAGCTAATGAGGCTTTTAAAATCCCAAATAAGAAGACGTTACTCGTT:1 - chr3R 8582629 5' - roo 397 1 66.33 TGTTATCGAATGCAAAACTNTTTAGCCATTGCTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:1 - chr3L 12438058 5' + I-element 47 1 66.34 CGCTCATCACATTGCCAACAAATGGTCAAATGGTGAACAGATTTTTTTTTCGGACTGGTACCACACCTCCCACCCAACCGATCGAGGGGCGCTGCCGCGTA:1 - chr2L 22736460 5' - Cr1a 4406 1 60.40 CTGCTTTCAATTTCGGCGCCTTTTCGGTTTTAGCCTTTGGTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTG:1 + chr3R 5902032 5' - accord 271 2 60.40 GTTAAAATCTGGGTTGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTAC:2 + chr2R 19091612 5' - Stalker2 362 2 63.37 ATGCTGACAGTGGCGAAGACATCATAATAATCGCAGAGGGCGTTTGCATTGATAAGGTTAGGATCTTTTGTCGAGTCAACCCAATAAGCATGACTTACACT:1 + chr3R 13893371 5' + Q-element 703 1 62.38 AAACGCATAGAGCAATAATAAGTGCGAATAAGTGTCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3R 10087881 5' + roo 8706 2 70.30 TGCCATTTCCAATTTGTATCTTTCGTTCGATTTGGCGACTTTGATTTCAGTCGCCAATCGTCAATCGCTGCGCCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr2L 8709407 5' + P-element 2 2 77.23 GTACAACTTTCCAAATATTATTGTGGGAAGTATTGCCCTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 - chr3R 4474251 5' - copia 235 1 58.42 GTGCCAGACTCGGGAACGGAACTCACAATATCCGCCTCCACTGGAGCCTCTCTTGCTGTTAAAGGACCGGCCACATACTGTGCAGGGAACCCTAGATAG:1 + chr3R 7910501 5' - R2-element 352 1 53.54 TTACTTTAATTACGCCTGGGCAGATTTATTGGTTTGGGGCTTACCGATATAGATATATATATATATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTA:1 - chr2L 19675236 5' - flea 249 2 50.00 TCTCAGAGGCAAAAGGCACAGTATCTCTCTATCTCTAGACGATTCCCAAATGCTTCTCCGGTTTTTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTATACA:1 + chr2L 19949117 5' - 1360 2974 1 71.29 ATACTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:2 + chrX 15546160 5' - blood 7345 2 68.32 TGAGAAATTAATAAATTTAATTTTATTACAAATTAAACTCAGCTATCTTTAGTATTCTTAATTTCAACAGATACAAATGCTATTGTAAAATCCCAAATAAG:2 - chr3L 10110645 5' - roo 412 1 45.54 AAGGAATGAATGACCATGATTGGAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACT:1 + chr2L 7722211 5' + I-element 5131 1 77.23 TGCCATTTATTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr2R 11941070 5' + 297 6606 2 57.73 ACAATGGGAAAGCGTCGGACTTCTACCGCCGAACGGTCTCAGCATAGACCGAATAATACACACATGTTTTTTATTATTATATACGGCAGGGAAATG:1 - chr2R 1276214 5' - Rt1a 5057 1 53.12 TTTACCAACGCATAAACACACTCCCGTTCATGCAGATACATACACTCGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:2 - chr2L 7666176 5' - roo 9043 1 54.46 AAATATTGCAAGGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGC:1 + chr2L 3425355 5' - 1360 3270 1 49.50 AGTTCCTGGGCCGGGGTCATAAACTGTCAAACATTTACTTTCGCTTCCTCCATCGAAGTGGCAGTCTTAACCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2R 19840292 5' - roo 404 1 72.28 TATCTGCATTTTATTCTTGCATTCATGTGTTGCGTAGTTTTTACAAAACAACGAGTTGAAAGTTCAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 30741399 5' + TART-C 11092 1 64.47 AGGCATATATTTTAATTCTGTTAGTGATTTTATTGTTTGGTTTTTGTGTCAGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCT:1 - chr3L 15205464 5' - Doc3-element 4485 1 59.41 TTACGGGCATATGATGGTGCCCGATAATAATAATAATAATAATAACGGCGAGCGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATG:1 + chr3L 17186793 5' - Tirant 8484 2 57.43 AATTAAGTTGAGTACAAACTAAATAAGCAACTCCAGTGACGTTCCATGTCGTGGTTTTCTTTCATGACGCGCTGCCTCTGACCGATCGGTACACACATCTT:1 - chrX 19021791 5' - Osvaldo 457 2 56.44 AACCAGGACCTTAAGAACCATCTATACGTGATGTAAAAAACCCGATGTTAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTC:1 - chr4 97698 5' - Quasimodo 200 2 58.42 TTTTCCTTTGTCGTCTCCTTAATACTTGCCAGATACCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 - chr3L 3881043 5' + blood 7052 2 66.34 CGGAGGCAACAATTTCCATTTGGCGTTCGCTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chr2L 17994155 5' - roo 363 1 66.34 TACCCCTACACAAAATACTNGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTT:1 + chr2L 23295815 5' - micropia 5387 2 73.27 GCATAAACGGAGATATAGTGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chrX 19334609 5' + roo 56 2 82.18 TTATACGAGAAAGTGATTTAAGTACGGCGATAGCTTATCATTGTTCAATACTTAAACACTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:1 + chr2R 22051450 5' + Tabor 19 2 58.42 AATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTG:1 + chr2L 14793511 5' + Stalker2 52 2 75.25 GCGTAACTACATTTAAATGAGCACCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACG:1 - chr2R 16467890 5' + F-element 4352 1 77.23 AAACACATTCAGCTCTCGTTTAGGGTTGCAAATAGGAATAAAACACTCGAAGAAAAGCGAACACTAGACTTTTCGTAATTGCGCG:1 - chr3L 23665443 5' - GATE 179 2 62.35 TTTCGAGTGTTGCACAATGCCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCG:1 - chrX 12845602 5' - F-element 289 1 79.80 AAGGTGTCTAAAAGTATGCAACACAAGGACCATCACTTTCGCCAGCGCGCTGGCAGGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chrX 18815128 5' + jockey 12 1 51.14 GAAGGCCAGAGTCGAAGCGGGATGGCAGTATGCAAAGAACCGAGACAAAGCAAATATATTCGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 + chr2R 17392592 5' - opus 7491 2 67.33 AAAAACTTGGTACATGACCTTGCTTTTCGTTGTTAACTTCGCAAATGATATGGCCGAGGCTTCCACTTTCTTTATTTTATAATATTTTT:1 - chr3R 23591257 5' - TAHRE 27 1 59.55 AATAAATTTAATTTTATTACAAATTAAACTCAGCTATCTTTAGTATTCTTAATTTCAACAGATACAAATGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3L 10110636 5' - roo 403 1 41.58 TGTTGGTGCACTGGGAAAAGTAAGCGCGGAAATGGAACTCTCAAGAAACGTTGCTAGCATGTTGAATATTAAAATGTATAAATAGTATTAACGATTAGTGC:1 - chr3R 27384612 5' - Helena 73 1 82.18 CACTTGCTGGCTCATGCGTTTGGGCTTAATGCCTCCACTTGCGCAGCTTCCTTGGCCAGCATCTTAGTTTCTGTGGCCGTATATATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 27337076 5' - accord 7032 4 65.35 GAAAATTAAAAATTGCATTCCCTAAAACTTGTATTAAATGTATTTTGTAACTACCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:2 - chr3R 25581111 5' - pogo 2081 1 59.41 ATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAACATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAA:1 - chr3L 20224230 5' + Chimpo 22 1 56.44 AACCGATAATTCGGTTTATTACGCATACGCTACGTGAAACGTCAGTCCACCAACGCAATTAAGTAAAGCCCCAACTGACTTAAAAGACTGGGATTCAGCAA:1 - chr3R 4584805 5' + BS4 577 1 71.29 TACACGAAAATAAGTTCATATTAACACATCTTTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3R 19987416 5' + Doc 49 1 69.31 GCTGATCCTTACATCCTGCAATGTCGACAGCCAAAGACTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr2L 20045795 5' - roo 9030 1 68.32 TTTAGCTTCCATCTGGTTTTGTCATAAGTGTGTGCAGAGCATACCCCCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chr3R 19963455 5' + 1360 28 1 54.46 TTTACATATTTTTCTTAAGNAGATTTCTGGCTACATTATCCCAAATTTACTTAATTACCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 - chr3L 19249760 5' - Transpac 290 2 56.44 TGATTTCGGCTGCGGGCTTGCCGCCCTGCGACACGCACACATATACACATTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATT:1 - chrX 3129917 5' + 1360 3268 1 68.32 TGAAAACATGTTTCCCAACACTGGGCGCACACATAGTACTGCTCCACTGGTTATTATTTACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCG:1 + chrX 17857977 5' + P-element 17 1 57.43 CCAAACGACGCCATTTTGTATGAGGCAAACACACACTACTTACACACACACACACACACACACAAATAC:1 - chr3R 28314586 5' + accord 7031 2 89.86 TTCAAAATCACGCAACTATGACATACATTTCTTCTTTTGTAATATTCTTGCAGTTAAAACTTCGTTGATATTCATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTT:1 - chr3R 20477240 5' - Bica 4875 1 61.39 GGGGAGGCAATGGGCGCTGNCAACTTGGGAATGGGCACGAATGGGAGCGGGTGGTCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr3R 6961145 5' - 412 7526 2 55.45 CACTCTCAACAATGAAGAAAGAGCGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAA:1 - chr2R 3289595 5' - Cr1a 228 1 84.16 CATGTATATGTATATATATGTATATACATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAA:1 + chr2L 16627002 5' + Quasimodo 39 2 87.13 TGTACCTTTAGTTACCATACCCTTCGTTAACGTTTTAAGCTGATGACTTTACGTTGTTCAAAACCAAGCACTGCTTTTCTTATGAACATCCTAAAAGTTGT:1 - chr2R 16628453 5' - HB 196 1 56.44 ATTGTTGGCCATTTTGTTTTTACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chr2R 19560175 5' + Tirant 52 2 75.25 AACACTAAAGAAAAAAAAATATTTTTATGGGAGATCGATAGACATTGGGCAATAAAATGAGAAAACAATTTAAAA:1 + chr2L 23016147 5' - INE-1 471 1 74.67 GTGATTCGGTATATCTGGCCTAATTAAACAATTTCCACGATCGATATGTGTGATGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACATGTGA:1 + chr2L 9052253 5' - 1360 184 1 62.89 CAAAATGTGTTAATTCGTTNTACATAGCAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chrX 10451483 5' + hobo 49 1 76.24 CAAATGAGCTGGCATAAATCCTCGCCGCTGGCCAAATATTGATCGACCGACGTGCTTGAGGTACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr3R 7626362 5' - hobo 2936 1 75.00 AATTAACAAACGAATTTAAATTTAATAGCAGCCAATTTGATAGATATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACAT:1 - chr2L 18435398 5' + Quasimodo 6892 2 55.45 GACGACATTTCCTTTCGACATCGAGGATACAAAAGAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 14711444 5' + Porto1 158 2 80.00 GGGGTCACCTATTACGCTCCCATGGGTGCACAAGTGTACAGCGTACTTATCATCAGGGAATGATATGAGTTGAATTGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTC:1 + chr2R 22459239 5' - F-element 128 1 77.23 ACATGTAAGGATTAGCAATGAATATCGAAATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACG:1 - chr2L 9260387 5' - 297 6934 2 71.29 TTGAAAATGCAAATCCCGGACATTAAGTCACATGATGTGGTAAGAACGTATTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGA:1 + chr3R 6947322 5' - I-element 5331 1 54.46 GACACAGAATGCAACAGCAGCAGCAACATCGCAAGACGCAGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTC:1 + chr3R 8483771 5' + flea 162 1 70.30 TATACACTTTAATCAAAATNTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 12944687 5' - roo 9028 1 74.26 TGAAGAAAATGTTGTATTTGTTGTGTCTCTGGCAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGTTCAGTGATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCG:1 - chr3R 23861163 5' + mdg1 330 2 64.36 CCACGCCTCCGCTTGCTTCTAGTTCTTCGTCCAGCTGTGTGTCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chrX 22593219 5' + 1360 32 1 60.00 TGCCAGGATGCAGATACACTCCCGCCATTGTTTGCAGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGT:1 - chr2R 13383572 5' + gypsy5 38 2 62.38 TTTTAAAAAATCAACTAAGAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTA:1 + chr3R 5348683 5' - copia 5068 2 82.18 GTATAGCCCCCAAAAAGCCNCCTCTCCATATATACATACATACATATATCGTACATACAGACATACATACATACATATATACATACGTACAAACGTATCTC:1 - chr2L 16600353 5' + 412 227 2 88.12 CAATGATGTTTCTAATGCAATTTTACCATAAGTAGTCTAGCAGCCGGCTTCTAAAAAGTACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2L 2833843 5' - roo 393 1 62.38 CTGTTGGTTGAAGGATTCTATTACCACTTCATGGGGATATTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCTGATCGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGA:1 + chr3L 798652 5' - F-element 4342 1 62.38 GCTAAAAATATTCTATTTGGGATTCAAAAAAAGGGGAGAAAACCGCCTCAATTAGTTGGTATGTTAATTGCACGTGGAAACTGTCTTTCTCAATAAGGACC:1 - chr2L 9091077 5' - Fw2 265 1 77.23 TTGTATAAACAACACACAACGCAGAGATATGTGTGGCGCACAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTT:1 + chr2L 10199000 5' + I-element 37 1 57.43 TTGTTATTGTTATTGTAATTGTTAGTTCGTCGTTCGGTGTTGTATTGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCTTACTTGTGCAGGCGTGGTGGTTTAGAGGG:1 + chr2L 4595299 5' - ZAM 35 2 59.41 GAACCGGAATGGATCGCTTCTTAATGATGTTATTGTAAGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGG:2 - chrX 21939117 5' + HMS-Beagle2 6918 2 59.41 GGCACGGAATTGATGATATGTGGGCGGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTC:1 - chr2R 14576556 5' - gypsy5 358 2 80.20 TATTTCACCCTATTGCCCTCAAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr3L 21144019 5' + jockey 11 1 74.26 TCCCAGAGGCATTCATTCTAATGCACAAGGTGGATAAGCGACTGGAACGAATTGACAACGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 - chr3R 21884256 5' - mdg3 5481 2 60.61 GATGTGTTGAAGGGAGTTCCAAACTTTTGTTTGCTCCTTTCGCTTGTGTCGCTATAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTT:1 + chr3L 8046468 5' - hopper 32 1 58.42 AACCCTCAGCTTTGAGCCGCTCTTTAGTTTGGGTTTTTCTGATTTTAACTTAAACTCATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATTCTATCTAAGTTAGT:1 + chrX 4166368 5' + I-element 5310 1 56.44 TTCATTTCCGACGTTTCATTACGTATCACTGAACTTGGCGGTTAGAACATTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCCTATTATTTATTGATATCCCAGAAAAA:1 - chrX 18812326 5' + INE-1 500 1 55.45 AACTCCATCTCCATGCAAACATAGATAGATATCTTGGTGAAGCCAATTTTTACAGGCAATTAATTTCTGCCAAATTGTAATAAACCAATATTTGCCACCAA:1 - chr2L 7175658 5' - blood 7385 2 70.30 ATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAACTCACCGTTTAAATCACCAAATGTACCGAACATACAAGTCAACATTACTTTACTTTACATATTACTTACTTA:2 + chr3R 16041117 5' - Stalker3T 43 1 81.19 CTCGGGTTTTGTTTTCGTCTTGGGAAGTAGATATCGAAATTGGGAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGG:1 + chr3L 13776148 5' + micropia 5272 2 56.44 GAGGGGGAGAAGACAAAAACGAATGTGTGTCGCGAGGCGTATCATATGGATATTAATTGGAGCTCTGTTAAAAACACGTCCGTCGGGGTTGAAGTTCAAAC:1 + chr2L 15532082 5' - Porto1 2 1 59.41 AAATTGATTTCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr2R 17963245 5' + blood 46 2 74.26 ACATACACGGCATCGAATTGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:2 + chr3R 29608760 5' - roo 395 1 69.31 CAGAATGCTGGTAGCAATATTTCTAATCTAATTTCAGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGGTAACAAAACGGCACGGAATAGCAA:1 + chr3R 32025425 5' + Bica 257 2 63.64 GCGGGTATCTCAAAGTCGATGCAATCTACCTTAGATTTCTTGCTTGTTTTCGCAGCTTTTGTATTGTATTTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACAC:1 - chr3R 21612969 5' - S-element 1710 2 73.27 TTTGGTAGTTCAGTTCTGTNTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 6266273 5' - roo 399 1 68.32 GCATGATATATGAAAATCGTAATGCGCTTTGACAGCCGTAACCCTCGAGAGCCTCCCTCCATACAACGCATGATGGCGACAGAACCGTGTCGGGGCAAAAC:1 - chr3R 17507220 5' - mariner2 104 1 53.47 GCTGAAATGCAAAAGTGTGNGGGCAATGAAATATCGCGCATACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTC:1 - chr3R 5009385 5' - I-element 4957 1 68.32 CAGCCAAGATGGTCAAAGCTTCTGTTTCAGCTCTCGCTTCGGTTCCCACGAGTGGATAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCG:1 - chr2L 4134486 5' - Quasimodo 231 2 53.47 TTTATTATATTTATTATTATAGATCCAACACTGACCTACGCCATCCAAGTGTGGGGAATGTGACCAACGGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCA:1 + chr3R 11267322 5' + G5A 2556 1 56.44 ATAGAGAACGTCCGCCAGATAGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3R 28565263 5' + 412 7086 2 58.42 GGGAAATGGGATGGGATGCAAAAATATATGTACACAGAAAGAAACATTTCTAATTGCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3R 30553631 5' + 412 20 2 59.41 TGCGCAACGCCGAAAAGCGCGCTAAGGATTCTGGCCTCCACGACGAAGGAATCAAAAGGGTTGCAGCCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAA:1 - chr3L 18451589 5' + Bica 456 1 70.30 AAATTCCATGGGGAAATTCGCCACATACCAGCGAGCAGTGAATGAAATATGCTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:1 - chrX 15255421 5' - Tabor 7297 2 51.49 ATAATCTTATGATTGAAGTGATGTTATTTTGTTATGAAAAGCAATTAAAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTG:2 - chr2R 672866 5' + F-element 9 1 77.23 TGATAAAAACTCCCGTGATAAATCCGCATTTACGTACCCCTTATCTTAAATCTCTGTAGATCAAACTATGAGTTGCAAGACCCCTACAGAGTATTATGTTC:1 - chr3L 25059112 5' + Cr1a 4182 1 70.30 CAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTT:1 + chr3L 19274823 5' - transib2 2769 1 72.28 GAGGGGTACGATGGGTACGAGGGTCTCTTCTTACGCATATGACATATCATATGATGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGTCTCTCCTTTA:1 + chrX 1893352 5' + R2-element 96 1 58.42 GATAACAATTTGGACTAGATGTGGTTACTGGCATCAGTGTGAAGTAGTCGTTGAAGGTCTAGTAGACTGTAAGGCATACAAATATTATAATATCAT:1 - chr3L 20423305 5' - Transib-N1_DM 293 1 72.92 GAAATCAAATCTTTTCATGTGCTATCGATAGATCATTATTAATATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chr2L 21190817 5' - pogo 2071 1 60.40 CCTGCGCCGATTGGTGCTGCCTTCAATTTCGTGCAATTAGACGGATTTACATCATTGACCAAGTCGCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGA:1 + chr3L 17912928 5' - 297 6971 2 77.23 CAAAGCGTGAAAAACGCTTCCTATTATTAGTTTAATTTGTTTTGGGCGCGCAATTTAATTTATATAACAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:2 - chr3L 7099675 5' - roo 400 1 68.32 CTCCATGGAACAACGGACATTTTTCCGGTAAGCTTATATGTATATATACTTATATATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chrX 5475381 5' - 412 471 2 54.46 CGATGTCCTGGCTTCCTGGCAAGCAATGCGTGAAGTTCTCCTACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 - chr3R 11362675 5' + 1360 73 1 62.38 GCCACTTGTTTTATTTATTGCTTTTTTAACCCTTTTTTTTTGGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr3R 10488742 5' - roo 9038 1 60.40 GCATGCTATTTGATATATAATTAATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCT:1 - chr3L 19089645 5' - invader1 3964 2 77.23 CTGGGAATGATGCGTCTTGGTTATCTTATCGTGAAGCCCTCATCGCTGTGTGCTCTAATGGATATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATG:1 + chr2L 3715250 5' - invader2 21 2 64.36 AAAATGGTAACATCGAAACCACGAGCCACAAGAGGCATACATACAGATTAAAGACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr2L 20328789 5' - opus 7481 2 59.41 CACAGTGCACTAGCGCACAAGTTTAAGTTTCAGCTTGCTTTCTATTTCTCACTTTTTTCGTCCTTTCTCTCCCGTTTTTTTTTTGTTTTTTTT:1 + chrX 17975354 5' + hopper 141 1 70.97 TTCACGGATATGGGTTTTCAGGCAACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 2022221 5' - roo 9055 2 66.34 GAAAAAACATTTTATCTTTGTGTGTTCGTATTAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAA:1 - chr4 194786 5' - Quasimodo 7332 2 69.39 CACACCTGCCCGTTGTGCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chrX 4707865 5' - P-element 2829 1 21.78 AATCGAGACATATACTTTGTTGTCGTCATATGCATACAGCCGCGATCGAAATATTAGCTTTAATACTTGTAATGAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGT:1 - chr3L 16313139 5' - mdg1 282 2 80.20 CCTCGAAGAGCCACAAGTAGTCGAAGGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:2 + chr2L 8622748 5' + 297 6600 2 61.39 TTTTTTACTTACCCTATTTTTTTCAAAATAATATACACCTATGACGAACAACACATATGCTAAAATCACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACA:1 + chr3R 30553525 5' - 412 7539 2 71.29 CTTTATGTAGATATATCTCTTCATTAGAAGTTCTTTTTAAACAAGTTGCACAATATTTTTTGCAGTACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 - chr3L 10474230 5' - copia 245 1 68.32 ACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 + chr3R 7869132 5' + 297 6626 2 71.00 AACTAGGATACGAAGTCAAAAAACAGCATTTGCCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGG:1 + chr3R 29358599 5' - P-element 248 1 40.59 CCCAACAGAGAACATTATATTTAATGCAGGCAAAGAAACTTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAG:1 + chr2R 15808347 5' - F-element 4614 1 60.61 CTCCAATGGCATTAAGCGTTTCAAAGCGTGAAAAACGCTTCCTATTATTGCTTTTTTAACCCTTTTTTTTTGGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTT:1 - chr3L 7099696 5' - roo 9068 1 46.53 CTCTCCTTGGCGCGAGGGGAGTTTCGTTGCGAAGGGAGTGGAATGGGAATGTGCCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr3R 29287575 5' - hobo 2917 1 57.43 ACTCTCGCATCTATACCTTTGACTTAACGTTCTGCTGTTCGCTCTGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGC:1 + chr2L 22339919 5' + 1360 486 1 55.45 TGGGCCTGTTCTAACTTATCCTGAATTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAG:1 - chr2L 17408395 5' - Ivk 4939 1 74.26 AGCAAAAATATTTCGCACACACAAGGTCAATTAAATTTGCCCTTCACACATTATTAAGATTTTCCATCAGACATATTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3L 9928631 5' + roo 8668 2 73.27 GACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chr2L 17730459 5' - pogo 2049 1 77.23 TAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2R 9871003 5' - roo 9021 2 76.24 ATAAAACGGGACCTAGGCCGGTGAAAAATTATAAAGGGGGCGGGGCATGCCACAGTAGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr3L 19861765 5' - 1360 3370 1 65.35 TTTGTATTTAGGTAATTTANATAGACTATGCTAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGC:1 - chr3R 20094504 5' + Max-element 8280 2 69.31 CCTGACGAGAATGCGGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chr2L 13566483 5' + hobo 38 1 60.00 TTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGCCATAACTGTCTTTTATTGAAACTAACACGCACATAGTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr3R 4164263 5' - 1360 3378 1 71.29 TTTAATTTGAATACTGTCGTACCAACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTA:1 + chr2L 14793468 5' + Stalker2 7257 2 70.30 CACATTTACACGAGGCCATAAAAGATACAATAAAAATATGTAGCATAAACCAAAATCCTTAAAAGAAGCTGCATATACATATATATATATGTACATATAAT:1 - chr3L 2843945 5' - Juan 4182 2 67.33 CTCTCTTCTGTTTTCCGTTCAATAATTCAATTAAGCTTTATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTC:1 - chr3R 11274213 5' + Ivk 374 1 62.38 TAATGCGGTATGCGCACAAGTCTCACATTGAGCAAAGTCATGCCGGTTGCCCCTGCTTCCTATATAACCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACG:1 + chr3L 20593755 5' - opus 7252 2 75.25 ATATATCCACACAACCGAGAGCCAAAAAACCAAGCTCAACCGAAGGCCATGATTCACGAAAAACATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 4063780 5' + roo 8674 2 69.31 CTGCGCCTCTTGGTGCTGTGCATTGCTCTGCTCGAGCTGATGGTGCTTGCCCGGCAAGCACGTACTCGAATTGCTAC:1 - chr3R 27120076 5' + R1A1-element 5161 1 61.04 ATCAAAAGTATCAAAAGTAACAGAACTATGCCCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATAT:1 - chr2L 21215323 5' + BS 5019 1 70.30 CAGATTCAGATTGAGATTCATAAGTTGTTATATGTACGTATGTAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCG:1 - chrX 9205573 5' + diver 29 2 55.21 GTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:2 + chr2R 15788592 5' + Transpac 4968 2 69.31 GTCGAGCACAAGAGAGCAGTGCGATCCAGGTGAACTATGATTAAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTAT:1 - chr2L 12189649 5' + Stalker4 7107 4 54.84 GGCCACTCTTTTCTGGGGTGGCCCATCGCTCATCTCACTGGCTAATGGATTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATT:1 - chr3R 18721328 5' - F-element 4426 1 56.44 ATGCAGGGTTTACAGTATGAAAGTAATATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCA:1 - chr2R 12319458 5' + Tc1-2 50 1 79.21 AAAAAGAACTACATACACGGCATCGAATTGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:3 + chr3R 29608750 5' - roo 405 1 79.21 TTAATTAACTCGCAAATGCAACTGTTTTCGAAGTTAGGAAGTAATTACACACACGTAAGCTTTATATACATATAAAGAATAAAAAAAAAAATA:1 - chrX 3294259 5' + BS 5096 2 78.49 ATTAAGGCCACCGCTGCAGATTCGAACTGGCCGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATT:1 - chr3R 18100044 5' - blood 475 1 70.30 ATTCGTATGGGTGGAAGTTNGAGCTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTAT:1 - chr3R 20533369 5' - mdg1 7047 2 76.24 TGAAAATCCACTCCCTGATCTACGCATGGCCAAACAGCACTGCGAACACCGCGCAAAAAAGGGAGAGTAAAAAAAACACAAAGACGAAAAATGCGAAATAC:1 + chr2L 20623237 5' - Cr1a 186 1 71.29 CAGGGTGTTCGCTTTGCCTTCTCTCTCACACTCTCTTCCGATCCGATGCAACCGGCGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTCGCTGC:1 - chr2R 17420914 5' + pogo 16 1 62.24 ACTGCCATAAATGATGTTAACGATGCCCTTTGGGTGTTAATTACGAATACGATGTAATCTGGACAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGAACACATAC:1 - chr2L 11870740 5' - 1360 176 1 63.37 TTTGGGTTTTTCTGATTTTNACTTAAACTCATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATC:1 + chrX 4166395 5' + I-element 5337 1 70.30 CTGCCATTAGACAATAACCAAATTTCAACCAATAATAGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 8582550 5' + roo 13 2 54.67 TTTTAAAAGAAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 8036420 5' - roo 9022 2 81.19 AGGACGAAAAAAAAAAGAAAAAAGGAATGTCTTAGTCGAATGGTGTGACTATTAGATACCCGTTAGCCAGCTGAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAA:1 - chr2L 12547752 5' + F-element 341 1 76.24 CTGCGCTTGCGAATCAAATTGAGGCTACCAACTGTCGGTAATTTGCATATTTGAGCTGGAAATTGTCAGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTAC:2 - chr2L 15531884 5' + Stalker2 10 2 69.31 CAACTGTGCTAGATATGCTTATAAAAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:3 - chr3R 9278424 5' - roo 405 1 77.23 TAAATCGTTTGAGGATATGTATAGTCGAATTGGGGGAAAGTTATCGGGCCAATATATATATATTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAA:1 - chr3L 5849553 5' - G4 3831 1 52.48 CACCACCTCCGTTGACCTTATCTGGAGAATATGTTGTGGTAAAGCGCCGGCGACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCG:1 + chr3L 20452266 5' - GATE 8282 2 51.49 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAAT:2 + chr3R 9485833 5' + Tc3 477 1 64.36 TCCACTCCTTTTGTCGTGTTAATTCCCAGAACTCGTTTTAAATATTGTGTGTACAAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 16601420 5' - roo 9053 2 62.00 AGAAGCAATGGCAACAAGGGGTTAATATTTGTGCCGCACCCTCACCGTAGCGCATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr2L 16358244 5' - hobo 2915 1 48.51 CGGGAGAACCACGAAGGGACAACGCCAAACTCAAATGAAAATCTAATTTGTAGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAAT:1 + chr2L 18213003 5' + hopper 20 1 49.50 ATAAAATTGTAACATTATAATTATAAAATCGAAACATCTTAAACTTAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGT:1 - chr2R 20598838 5' + Doc 4229 1 75.25 TGGCAAAATGGATGCTGAGACGAAGAATCAAAAAGA:1 + chr3R 9996279 5' + HeT-A 260 1 72.22 TCATAAGCACTTTAGAAAAGCATGTGGCAGGCATTCCACCCTCTTATTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAA:1 - chr2R 5184227 5' + Tirant 451 1 53.47 AGACTGACGGCCACACGTTTCAGCGTCTTGTTGCCACAATTGGGGCAAAACACCTTGGTCATGATGCTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATT:1 - chrX 10084361 5' - Stalker 90 4 76.24 ACTTACACTTATGTATCTCCAGCCAAATGGCAAACTGAAACAAAGGAGCACTGCCCCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr3R 11607939 5' + 1360 19 1 59.41 TTTCAGCCCCGGATGACAGCAACTGTCACACGTTACGCATTAGCGATCTTCCCTCTCCATCTCTCCACGATTCCTGTCTTTTTTTTCTTTTGTATATCTTG:2 + chr2R 21874115 5' - Porto1 159 1 76.24 TTGAATGTATAACCACAAGGCATCGGGGCTAATAATCGAGTAGACGCCCCACGAAGCCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr2L 20567806 5' + 297 6598 2 63.37 CCTTTCACCCGCGTTTTATNTATCCAGATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr2L 20612012 5' + 297 34 2 73.00 GTATTCTATAATTTAAATCATCTTTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAA:1 + chr3L 27357537 5' - mdg1 7442 2 59.41 CGACGCTCCACTGTATTTCGATCAATTGCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGG:1 - chrX 16670365 5' - P-element 2684 1 26.73 CAAAGTTCATAAGTTTAGAAGGTATTCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chrX 8316361 5' + hobo 51 1 77.23 ATCAATTATTTATGCCGAGCGATAAACGGGTTTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr3L 13895416 5' + hobo 42 1 65.00 GTTAAAGCCATATGTATGTAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:3 + chrX 17104396 5' + 297 28 2 63.37 TGCAACAACTTTTCAATGAAGGTAAGTCGGCTTATGTGGCCAGTAACGGTAAATTTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTTGGGACT:1 - chr3L 2046857 5' - Idefix 15 2 59.41 TAGCGGAATTTTCCACCAGAAGCCGAAACAAAGGAAAATGAACGGAAAATGGTTGCCGGCGACGAGGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCG:1 + chr3L 17274076 5' - R1A1-element 350 1 56.00 CCACTTGAGTTTGGCCCGAAGTGCGCACGAAAAAAGCGAGTTTAAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 - chrX 4166440 5' - I-element 5323 1 57.43 ACCTTTCCACACGATCTCCTCTTTCACTTATTTTAACTCTCAATCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATAT:1 - chr3L 14419613 5' + Juan 422 1 56.44 GGTTTCTGCATTTTTCCCCTGCCGCTGCAAAGGGCTTTATTTTTCAAACTAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAAAAATGACTTAATGTTTATATACTAAG:1 + chr3L 9790832 5' - invader2 4907 2 56.44 ACCTGCAGGCAGCATTTGCCGAAACTTCCGTAGTAAGTGCGAATGCAGGGCGTAACAGAGATACGAGCACGAGTGTGGCAAAACAAAAAAAAAAAGTTTCA:1 - chrX 7792391 5' - Tc1 1470 1 68.32 TTCCTTTCCCTCGTCACGCTCAATTGTTAAAAATGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCACTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCCTA:1 - chr2R 9212493 5' + 1360 214 1 64.36 GCTAACTGCTCGTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAA:1 + chr3R 10741062 5' - Tc3 312 1 77.23 TATATGGCCGCCGTTGTACTGTCTTTTCCTGATCTATTAATCTAATTTCCAACTGCCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTGGATACC:1 + chrY 3271528 5' - Circe 7105 1 62.38 CATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chr3R 20905401 5' + pogo 39 1 70.30 CTGCAATGCCCCACACATATGACAGCGCATTTATTTACTACACCATTTTTGTTGTACTTTGTGCCCGTTTGTTGGCGTGGCAAAAAGTTGTTTTTTGGCAA:1 - chr2R 18727024 5' - INE-1 321 1 88.12 AAATTCTCTTATTCCAGATNTTTATATAATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 - chr3L 15788479 5' - opus 7454 2 76.24 AATTAGTATCAGGTATACAATTCAATTCAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGT:1 - chrX 21583398 5' + F-element 55 1 74.26 GGAGAGCAACAAAGTCAAAACATATATACATGCGGCAATCCAGCAGTTGTAGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATT:1 + chr2R 4187636 5' + 1360 305 1 50.50 CCATCATCGATCTGAGCCACAATGTTTATTGCGCTTCAAAAGTATTTTCACTCAACTTAATTTAGTAAATTTCAGCTTAACATCTAATTTCAACATAAGAA:1 + chr3L 12794197 5' - Bari1 1425 1 79.21 ACATTTATTATCTTTAAGATACCCACACGAGTTTGGTTGTTCATTTGTATCCCCGTAGAATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCA:1 + chr2R 17925503 5' + mdg3 5390 2 69.31 TACTGTTAAAATCTGGGTTGTCTTATATTATTTTTTGTGTAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTG:2 + chr2R 19091608 5' - Stalker2 366 2 59.41 GCAGCTACAATGGTCTGAAAAGCTTCAAGTCGAAAATGTAGTTGTATTTGTAGCGGCTTTTTCACGCGACGACTGGGCTTCATTTCAATTGGAAATTGGAA:1 + chr2L 10073518 5' + TAHRE 10181 1 65.35 CAAAGATTGGCACTTTAAANTATCTATAGCAATGTGCACAGCAATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 - chr2R 9631788 5' + F-element 20 1 65.35 TTATTTAATAATTGAACAGTCTAAAATGTACATCACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTA:1 + chr2R 6779758 5' - 17.6 473 2 59.41 GGTAATAGTAATTGAAGGTAGTTGCTTAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGC:1 + chr3R 22869395 5' + Bari1 50 1 72.28 TTTCAGCGTAACTACATTTAAATGAGCACCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTG:1 - chr2R 16467895 5' + F-element 4347 1 72.28 GCAGTTAATGCCAAGCGGCAGCAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCAT:1 + chr2L 4134846 5' + Quasimodo 57 2 77.23 ATGGCGCAATGCTTAAAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3R 19449523 5' + hobo 14 1 64.29 CAACAAACTCGCATAAAGCNGACAGGCGGACGGACCAGTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 + chr2L 19681424 5' - hopper 1375 1 64.36 CGATACTTTCGTGTGTTTCTCAAGCCCTGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 - chr2L 7810742 5' + P-element 48 1 31.68 AACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACG:1 + chr2L 14793491 5' + Stalker2 31 2 55.00 TTTGAGGTTTCATTTATTTCTTACTTATTGCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr2R 11941061 5' + 297 38 2 68.32 TGGTACGTGTTTGTCCGCTGTCTTCTCTGAAACGCTTAGTCGACAATCTTGGTTGCAGAGGGTTATTATTAGTTTCGGGGAGCAGAAGATTGTTATTTATG:1 - chr2R 4135595 5' - Gypsy6A_LTR 298 1 78.22 ACCGAAATTTACAATTTCATAACTTTAAGTGTCCCTCATCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTAT:1 + chr2R 21732754 5' - mdg1 319 2 62.38 TAATTGTGTCATAAAGTTAAAGTAAATAGGGTTTTGTTCGATTACATTTTACTTGTTTTAAGGGTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 11916638 5' - roo 396 1 66.34 GTCAGCTTCTCCACCAGCTGATCGTAGCTCCTGATTTTTCCTTTACATTATTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACA:1 - chr2L 2043122 5' - P-element 97 1 29.70 AAAAGGGAAGAATTTCCACTGGATTTTCCCCACGCCCTTACTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGA:1 + chr2L 16424378 5' - hobo 482 1 61.39 AGAAATTAATAAATTTAATTTTATTACAAATTAAACTCAGCTATCTTTAGTATTCTTAATTTCAACAGATACAAATGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 - chr3L 10110643 5' - roo 410 1 43.56 TTAATAAATTTAATTTTATTACAAATTAAACTCAGCTATCTTTAGTATTCTTAATTTCAACAGATACAAATGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:2 - chr3L 10110638 5' - roo 405 1 39.60 GGTGTAGGGGCGGGGCTGTGCTGCGTTTCTCGAGCTTGTTTCACTCATATTCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTT:1 + chr3L 12702298 5' - invader4 2868 2 65.82 AAACGACAAACAACGAGCGCAAAAAAGATCTTGCAATGCCCCTTAACGACTTTTGATTGCCGTTATTTTGTTTTGCACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAG:1 + chrX 14632118 5' + Doc 345 1 78.22 GATAGACATTAAAACCGTAATTTAAAATTATAGGAAAATTCGTTTGTTACCTAAGTATATGCAGTTCATTATGTGGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGA:1 + chr3R 19949274 5' - mdg1 7451 2 62.38 AGAAAGACCCACGGGAACCCACTTTCGAAGTAGTCTACGATGGCAGGGAGGAGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTATATATAATAATAATAA:1 - chrX 7013273 5' - Tc3 280 1 58.42 CCATATGAGCAAAATATATTACAGAACCAAATTGACTTACCAAAAGTCAAGATGTTCAAACACTTAAAAACAAGTTTATTGCAAACATTTTCTGCAAATT:1 + chr2R 23823622 5' - looper1 157 1 59.00 CAGAAACTGGCCAAGAGACCCTCGTAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCG:1 + chr3L 12260123 5' + X-element 4426 1 80.20 CTGGCAAACCACGAAACCAAAAAACGGAAGGGGATATGCTACATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr2R 19102151 5' + opus 25 4 62.38 TTTAGTCCAAATTATTCCTTCAAAGCCTTTACCTAAGGTATCTAAAAGTTCAATCTAAAGTGAAATTTAAACTCTTTTCAAAACAAAAAACATTCAAATTT:1 - chr3L 4807611 5' - Tc1 1465 1 74.26 ACTGAAACAAAGGAGCACTGCCCCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3R 11607972 5' + 1360 51 1 77.00 TGCCATCATGCCACCCGAANAAGGATAAAAAAAAAGAAAAAAAA:1 + chr2R 17348114 5' + Osvaldo 1522 1 88.64 ATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2L 8577287 5' - roo 361 2 76.24 AGACATTAAAACCGTAATTTAAAATTATAGGAAAATTCGTTTGTTACCTAAGTATATGCAGTTCATTATGTGGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 + chr3R 19949277 5' - mdg1 7448 2 59.41 CAGTCTTTAAATTGCTGCTGACGTCTCTTTAACTGAGTAACGGGCATCTGAAAGCCGGGGAACTTGACTATACTATAGTATAGTCAACTGACGGGACATTA:1 + chr2R 23489652 5' + 297 6942 2 71.29 TACATATATCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCNGCGGTTAAAATAATAGCACTA:1 - chr3L 19339448 5' + Tc1 7 1 76.24 GATAATATGCATAAAATGCTCAAGTTTATACGCACCAGTTAAAATGTCATTTCGAGCTTATGCGTGAGAGTTTGTGTGCGTCTGTGTGTGTGTGTGTTAGT:1 + chr2R 11075021 5' - Quasimodo 35 3 79.21 ACGACAGTAACAGTGGGCTNAAACTGGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTA:1 + chrX 21229294 5' + transib2 47 1 72.28 TCTATCTTTACGAAAGAATTGGAGAAGATTCGGATAAAAAAATTCTTCCGAGTTGATGTTTTGTAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGA:1 + chr3R 2158025 5' - FB 111 1 62.24 TTAAAGTGGAGAGTGGCAGNGCTTAAAGTGCAGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 9278338 5' + roo 43 2 72.28 AAACGAGAATAACAATATTGCATATATATTCTCAGTGCGTTTGTGTGTGTATATAGTGTATATGGTGTAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chrX 5219673 5' + hobo 8 1 67.33 GTGGCCATCGAGCACCAGAGCAACACCATCGCAACCACCTCATCCATCTCAGCCATCTCAGCAGCCACCTCTAGAGCCACGTCCAAAAAATCGTGTGCCAA:1 + chrX 10928019 5' - 1360 44 1 57.43 AAATTACCCATAAAAATCATCTTCCCCATTTTTAAAGACTCGCCAATGGTTGGCCGAAAAAAAAAAAGAATATTGGGTACCCCGTTCAGCCCTAGTGGCTT:1 + chrX 21000886 5' + Rt1b 4693 1 81.19 CTAAAAGTATGCACGTATCTGGCGACATAGTCGTTTGATTAAACTTGTTAACACACATAGATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr2L 10143714 5' + jockey 24 1 61.39 ATTGGCGACCGACTGCATTTCAGCGATATAAATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:2 - chr3R 5135520 5' + 297 39 2 71.29 ATCGTAATAATGCAGCAAACAATGCGATTCACGATGTACAATAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr3R 23638089 5' - pogo 2079 1 54.46 TTTGGTAGTTCAGTTCTGTCTTTGAGTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 6266273 5' - roo 399 1 69.31 TTTCGTCTTAGCTTACAAGTGCCGAATCAACTACATGTAAGGATTAGCAATGAATATCGAAATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 - chr2L 9260419 5' - 297 6972 2 72.63 ATTGCAACTCATAAATCACTGCGGAAAAGCTTGAAAATTTTCCACACTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr3L 5415405 5' + I-element 30 1 52.48 CGTTTAGGGCTTTTCATTTCAATAACTAACCCAATTAACATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2L 21086031 5' - roo 9036 1 66.34 GATAGTAATTGGCTTTGGCAATTTATTAATTAACTATTAATGGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chrX 21060372 5' + 412 35 2 58.42 AGTATATATATTCCTGATCATGATCAATAGCCTAGTCGATCTTGGCCATGTCAGTCTGCTCGTTCGTCTGTATGTCTGTCCGGATGAGCGTCGAGATCTCA:1 + chr2R 5720575 5' + INE-1 135 1 62.38 CGAGGTCATGCTTTTAGTTTTCTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chr3R 14409667 5' - pogo 2049 1 79.21 ACCTTTTGGGAAAATTATANTGAATACACAAATGCTAGAATGAAAGCGAAACATATTGTTCTGGTCTTATATTCGTAGCGGCCACGCAAATAAGCAGTGTC:1 - chr3L 25952243 5' - gypsy2 102 2 82.18 AAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATAC:1 - chr3L 19350012 5' + 1360 3213 1 45.54 AGGCGACATTGACAATGAGACGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGT:1 - chr3L 6023327 5' - hopper 1311 1 54.46 GCCCTCGATTCAATTTTTACCATGATAATTATGTTTTTTACTCTCGATGTATCTTCTTTTTTTCGTTTCGGTTTCTTTTTTTATTTTTTTTTTTAATTTTT:1 - chrX 8958633 5' - Doc 4697 1 74.26 CAAATCTTTTCATGTGCTATCGATAGATCATTATTAATATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 - chr2L 21190812 5' - pogo 2066 1 65.35 ATTCCGTGTTTTATTGTTGCAGTTCCCGCCCCGCCGCCGCTGCCCTCGCTGGTGCCAGTGAGGGCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTAC:1 - chr3R 11441247 5' - Doc 490 1 62.22 TATTTTGTTAAGCAGCCTAGCGTGCAATTCTGCCAGAAGTAGCTAAAGAACTTGACACCGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTTAGTGCTT:1 + chr3R 834284 5' - Doc3-element 427 1 62.38 TAAGGGTCTCGGGGTTTCCTGCAAATATTTGTTATCTGCCTGCCACAAGCCTTTCGTTAGTACATCTGCAACATTTTTATCAGTGGGTACATATTCAAGAA:1 + chr3R 16680276 5' - Copia1_DM 4185 1 57.43 GCCCCATGGAACATGATAANTTGTTAACTTCCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chrX 4277474 5' - roo 9028 1 70.30 CGACAAACGGCCAACGTGCGGGATTAAGGATCTGGCGCACCGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 - chr3L 13295281 5' - hopper 1379 1 59.41 CTTATTGCAGCCTACTTCCAGGCGTCGGTTGTCCATTTTTTTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAAC:1 - chr2L 17998321 5' - BS 5053 1 62.38 GAATAAAAACGTATTTTTTAAGTGGAATATATAAATTGGGAAAAGAGAAACTACACAAAAATACGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAA:1 + chr3R 27907604 5' - mdg3 5487 2 64.00 GACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGATTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAA:1 - chr3R 1844810 5' + Cr1a 156 1 76.09 ATTAATTAGTATCAGGTATACAATTCAATTCAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 - chrX 21583401 5' + F-element 52 1 71.29 TTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTA:1 + chr3L 3540137 5' - mdg3 5464 2 57.43 GTCAGCAGGATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTT:1 + chr3R 4973094 5' - 1360 19 1 46.53 ATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCC:1 + chrX 21087558 5' + mdg3 5255 1 72.28 ACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTT:1 + chr2R 12185316 5' - accord 7368 2 61.39 TTCAGCTTGCACTGTCTGGGCGTTCATGTATAAATAATTTGAAATTAATTACATGTAACAGACTACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:2 - chr2L 19681505 5' + hopper 12 2 67.33 GTACGTACGAACAAATAATAATATAACATTGATAATGATACATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGAT:1 - chr2R 12458017 5' - HMS-Beagle 239 2 70.30 TTTGCGTCTGGGGATTACCAAGAAATATGGTAGCCAAATTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 + chr3L 3345134 5' + FB 39 1 66.34 AATTTCTCTTATAAAAAAAAATTATTTAATAAAAAAAATTTGAAAAAAA:1 + chr2L 12928959 5' - FB 173 1 65.31 CCCATTCCATTTCCATCTCAATTTCTAGTGCTAATCTAGTGCTAATCAATTTCTAGACTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 + chr3L 17140593 5' + F-element 29 1 49.50 GTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr2L 10792028 5' + 412 43 2 67.33 TACTAGAAAGCCAGCCAACTGTAAAGAATCGCAAAATACCCTGAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGACTCGATG:1 + chrX 17883621 5' - pogo 2073 1 52.48 AACGACTTGTTACTGCAAGACTGCTCCATGGTGCAAGACTTGCGATATTTTATGTCGAGTTTATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGTAACAGACGCTC:1 + chr3R 5224966 5' + Stalker2 353 2 69.31 AACACCAACTATTTTGAGCGCAGAAGGAATCCTAAATTTATGATATTTTATAATTATTTTTTATATCAACAATATAAGGAACGCACTGTTACCTATGTGGC:1 - chrX 5672170 5' - jockey 4964 1 64.36 TTTTTCTTTACTTTTCTTACATTTTCCCCCTGCTCGTTGGGTGAGCGCAATTATCCGTCGCGTGGTGCGTACAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAG:1 + chr2R 18963705 5' - jockey 117 1 74.26 TTAAAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 - chr2R 672822 5' + F-element 22 1 54.29 ATTAATTAAATAAACGCTTTAAAGGTGGCAATTAGGGAGGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACT:1 - chr2R 7546320 5' + hopper 32 1 57.43 AATTGTGATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3L 9928528 5' - roo 9046 1 51.49 CTACGGTACAAGACGTTTGCTGATGCGGCACGTTGTCCGGAAAAAGGAGCCCAGATCCTGGCCTGACCGAGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGA:1 + chr3R 28564488 5' - 412 170 2 74.75 GGAACTTTTAAATTTGGCGGAAAACGGTGTGCCCAGGTATAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 4627301 5' + Osvaldo 1522 3 62.07 GAAGTATGAAAACAGAAGTACGTAAAGCAGATGGAGTCGTTTCCTACTCTATATAGCCCCTATATATATATATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCTGAG:1 - chr3R 7436647 5' + INE-1 90 1 70.30 CTGGCTGCGACAACAGGCTGTTAATGGCAGTCCATAAAATGGCGTTGTCTGTTCTCGATTGGCTGGGATTGTTTGTTTGATTGTACATACGTACATACATA:1 - chr2R 10348993 5' + 412 7276 2 53.47 AAATATTTTCAGACTCTATTTTCAATTGAAAGTGTTCAGCTCTTTAATTTATTTCAAATTCAATCTTCTTAGGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr3R 29608876 5' + roo 3 2 77.23 GGAATTATAGTCGCATTTCGAAATAGATACATGGTGTATAGATATACGGTTATTAAGTTCGTTGGTTTGTTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTC:1 - chrX 5383020 5' - ZAM 8035 2 67.33 ACTGAAAAGCATTGAAGTTGGCCGAACAAAAAAACACACCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chrX 19334649 5' - roo 9035 1 63.37 AGAGAGATCAGCTTACTAAACAAGATATGTACAGACATAGAGTACTAAAGTTCTAGGACACTACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr2L 8176489 5' - 1360 3374 1 64.36 CCACCGCAAGCGACGAATGGCGTATAAATTTGGCACACACCACGCTCCCTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 + chr3R 6086769 5' + Doc 35 1 51.49 AACGTCAATCGGGGTAATCAAGCGTTAAGTGATTCTGCGGAAGCACAAAAATGGATTGGCCAAGCTAGGTATGTACCTCCACTGGACCAAAGACACTAGAA:1 + chrX 3039783 5' - hobo 343 1 61.39 TTTATTAGTAATCTATATTTCATTCATCATAACTAAATATGCATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACG:1 - chr3L 20454601 5' - invader4 291 2 63.37 GGGCATCTACTTGCGAGTGGAACGCATCTAACCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAAC:1 - chr2R 6779852 5' + 17.6 6948 1 60.40 ACCCCATTTAAGATATATTATAGGTTTAAGAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr2L 8577242 5' - roo 407 1 77.23 CTATTATACAACAGAATTTTTTTGGCTTTAAACACTTTGAATAATTGTAAACAATTAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGG:1 - chr3L 21135010 5' - jockey 4965 1 55.45 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAG:1 + chr3R 17660025 5' - micropia 5410 2 55.45 ATCGTCATCGACTGACTGATAGCGATTACACCGGGAGAAACGCACGTCTTGTGTTAAGACCAACAAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTA:1 + chrX 9646015 5' - McClintock 456 2 71.29 GTTCAATTAGTCCAATGTAAATTGAAATACACAAACATGGCTAAAATAGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 - chrX 8503182 5' - roo 9045 1 56.44 CTTGGTTTAATGTAATTTAATCTTAATGACAACAAATACGTTGTACAAATATAACTATCTGTACTAGATTATTACTAGATTCCTTGAAATGAATGTAACAG:1 + chr3R 31953794 5' + INE-1 17 1 37.62 GGCCATAAAATGTGCGCGTTTGATGTTAATTCGATCGTTAAGCGGACTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr2R 21351010 5' + opus 23 2 53.47 CGTTGTTACCTTCGGAGCGGGAACAGTGCGAAATGCTTGGTTGCGTTGTTGCCCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3R 6961056 5' + 412 23 2 56.44 AGAACCATTATCCAGAGCAACACTCACATTGAGGCTTTAGACGGCGGAAAGCCAGATAACATACAAAACTCATACGTCTCCTCAAAA:1 + chr3L 21920375 5' + I-element 5148 1 62.07 ATGAAGAAATGGTTAGCTAACTCGGAAAATAGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 + chr3L 7168310 5' + Doc 28 1 53.47 AACGAATTCATTTCCACAAATATATATTTATACCCCTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTAAACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGT:1 - chr2R 4029358 5' + INE-1 31 1 74.26 CATTTGTTGGCTAGGGGAGTGCGTGGGGCTTAGCTGAAAAGAATGCTACCGAGCACTGGAAACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCAC:3 - chr2L 11712911 5' + Quasimodo 9 2 63.37 GGGAACTGGAGTCATTTTCACAGGCGATGTGGAGCTCCTTACACTGTGTACAGCCGCTAAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATT:1 + chr3L 14405840 5' - mdg3 5212 1 61.39 AATAACGTTTTCAAAACGAAATAAACACAGAAGCAGCCATAATCAGCAACAAAATTATTATACAAAGAGCACACCATTGTAGCATATTGGACTAATCTACC:1 - chr2R 5697471 5' + Stalker 3 4 30.69 GGTATGGGGAATGCATTTTAAAGTTGGCGCTGAAGACACGGTTGCGGTTGTTGTTGTTGCCGATGCGATTGCCATTGTAAGAGAGGCAACCGTGCTGGTGG:1 - chr2L 16400866 5' - Doc4-element 275 1 78.22 TAAAGTTGGGCAAATTGATTGGATTAAATTACACAGCTCGTAATTTATTTCGACAGAGATTGATGCTCTAGAGAAATGTACACACACACACACACATATCT:1 + chr3L 5267562 5' + accord 7031 2 67.33 CAAATGCTGGAAAAGCGCTCGATGCCAAAGCAATTGGGTTTATGGTCGTTTATGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 6034027 5' - roo 387 2 58.42 TATGATAAATAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTT:1 - chr3R 11151916 5' + mdg3 5259 1 70.30 ATGGAGCAGGATTACAGGGGATTTCGATTTATTTACACACATTAGCTGCATACAGGCCAATGATTCCTTACCAAACCGTATGTTTGAAGTAATTAAAAACA:1 + chr2L 17477289 5' + Tc3 1400 1 55.45 TCATAAATGACATAGGGCCGAAATTGATTTCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr2R 17963225 5' + blood 26 2 54.46 GCATATTTATCAAACAAAACTAACTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr3L 872758 5' + 412 53 2 75.25 ACACCACTTTATTTAATTGATTAAAGTGGGTACATAGCTTTTATGTTATATCAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:2 + chr2L 20128838 5' - hobo 2916 1 52.48 TTTCTCCCATGTTAACATGACAGCCTACAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 + chr3L 14594130 5' - hobo 2890 1 72.28 CAAGGTGCTGCTTCGGAGGAGCAGTCGAAAACTGCTAGGTCAGGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTAAATTAAC:1 + chrX 18361510 5' - McClintock 5985 2 78.22 CAAATGTAGGTGGAATGTCGGGCTCGTATATATATATATATATATATATATATAGAAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 + chr2L 20611936 5' - 297 6958 2 69.23 GGGTGGCGCAAAAATACGTCACTAAATACCTGTTACATACTTGGCAACGAATATACCTTTTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr2L 21715749 5' - 1360 3360 1 59.41 AAGAATTGTCAATAATTGTTTCAGCACTCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 + chr2R 11941012 5' - 297 6928 2 73.27 ATGGTGTTTTTTTCTCTTTTAGTTGCTGATCGACGACCAGACTCTGCAGAATGGTAAGATGATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATA:1 + chrX 7935153 5' - Stalker2 7635 2 53.47 TCTCAAATGTAGACGCATTATAAATGCATATTTATCAAACAAAACTAACTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr3L 872783 5' + 412 7080 2 54.00 TTTTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCAATCTGATCATGTCCGTCTGTCTTTACGTCCATATAAGCGTTGTTATTTCAGGAACTATAGAAGCTAGAAGGTT:1 - chr2L 21738001 5' + INE-1 158 1 66.34 GTGCAAAGATTTTTTCCGTATTCGAATTAGACACGCTGCTACCCCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGC:1 - chr3L 7169420 5' + Doc 4526 1 57.00 CTGAAAAGGAAGTAGTATTCACTTCGAAAATTCAATCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr2L 20328713 5' + opus 151 4 64.36 CCAAAGTGGAAGGTGCTATTAATCTGCAGCTGTGTGGGCTTGTGCGCTTCCAATCTGAGTGTTCCAATAAAGGTGCCACGTGCATTGGTTAACGTATTGAA:1 + chr2R 17004616 5' - Transpac 435 1 77.23 CATGTGTTATCGCGCTGCCATGACCATCATTGTTTACATATACATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr2L 21708344 5' + 297 22 2 64.00 CTATTCGAGCCTACGAAATGGCGCCTAGAAGTAGGCAAATGTGTATTGTCTCGCAATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTT:1 - chr3L 8039422 5' - 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17.6 155 2 74.26 ATTACAGCATTTTTGGCGATAATAAACTTTATTTTGGCGAGCGAATTTGCAAAGTTCGTTTTGGTGTGACCTCCTGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr3R 27116818 5' - P-element 2886 2 75.25 CTGTGCCACACCTGACCGAGATATATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 - chrX 12992786 5' - I-element 5302 1 75.25 ATTGTATTTGTGTCAGGGTCTGCCAGCACTTAAGATCATAATTAGTGTTTCTTGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr2R 24555721 5' - hopper 1411 2 75.25 TGAAACAATTGATTCCCAGCTATAGAATCACTTTTCAAATGCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAA:1 - chrX 11365359 5' + mdg1 7055 2 70.30 AATGAAAATATTCGTTTTCNTCATAAACATAGTTGGCCAAAAAATACGAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 20266534 5' + gypsy7 5006 1 91.53 CGCGAAGTGGTGGCAGGATGGCAGATCCTGACGAGAATGCGGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr2L 13566457 5' + hobo 13 1 65.35 TCCCGTCATTTCCGCTTAGCTTGACGCCTTGAATAAATGGGTGAGCGCCCCTCTCTTTCGCTCCCAATAGCCCCTCTTCCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTTT:1 + chr2R 12103002 5' + Cr1a 290 1 45.54 ATGACTTGTTGTTGGACCGCTTGTTTTGTTTTGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCG:1 - chrX 15091001 5' - F-element 479 1 78.22 CTACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 + chr3R 4971421 5' + F-element 62 1 77.23 ATGAATCTTGGATTTCTTGTCAATCTATGCATGCTATTTGATATATAATTAATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTAC:1 - chr3L 19089673 5' - invader1 383 2 50.50 CACTACAAAATATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGT:1 - chrX 3431967 5' - Ivk 5369 1 63.37 CGCACGCACAGCGGAGAAANCTTTCTCCCATGTTAACATGACAGCCTACAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3L 14594109 5' - hobo 2911 1 51.49 TTATGAAAAGCAATTAAAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCGGCACAAAA:1 - chr2R 672835 5' + F-element 40 1 53.47 AACTAAATACTATTCATATGTGAAAATGTACACAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGGCACTT:1 - chr3R 11608008 5' - 1360 3346 1 68.32 TGATGAGATGGGGCACACCGGCTGCCCATTGTCACGTGCCCTCGTGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAA:1 + chr2R 25024179 5' + G2 2885 1 55.45 CTCCAGTAAAGAAGAAGCTATCGCCGTTTCTTAACGGATGAGATATATAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTT:1 - chr2R 4500935 5' - springer 353 4 58.42 AATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr3R 20420939 5' + blood 46 2 73.47 TCTATGGAGTACTCTGCTCTTCAAACCGCCTGGCCCTTGGGTAATTTATAAGCTATTACTAATTTTGGTAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCAC:1 + chr3L 13569713 5' + invader3 5195 2 67.33 GCCTACCAATTATATGATTCATTTTCATAATGTCCGCTCATCCCTGAGCGGATAATGAGTTTGGATGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr3R 3847072 5' + P-element 9 2 70.30 CAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACG:1 + chrX 15408750 5' + INE-1 535 1 82.18 ATAAATGATTAAATATTAACGACGCTAATAAGAATGCATCTCCGACATGTATAAATTAACTAAAGATAGATCGCACCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAG:1 - chr2L 23390425 5' - Gypsy6A_LTR 373 1 52.48 ATAGAGATTGCGACACATGAAAAGCGACCACAATGAACGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAG:1 + chr2R 14576511 5' + gypsy5 37 2 59.41 TCAATACACAAGCCTGGAAATTTTAGCCGTACTCTGAGAGAAAGGGGTAATAGTAATTGAAGGTAGTTGCTTAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCAC:1 + chr3R 22869350 5' - Bari1 1703 1 71.29 AAAAAATAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3R 9278400 5' - roo 9044 1 54.46 GTAAGAGGTATTAAATAGTCGAGCACTCGAATGTGGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAA:1 + chrX 17438729 5' - roo 8756 2 68.32 ATGGGGGCAATAACGTAATTTCTTTCCAAAAATTATACCTGTTACTCGTAGAGTAAGACGGTTATACTATTAGGCATCGAAAGATATTTATTTATTTTTAT:1 + chrX 22516497 5' - mariner2 831 1 68.32 CTTTCTTCCTGGTTTTCGTCCCCTTTTTCCACATTCCTTGCGCGTCTGCTTATAAATATAATATAAAATGTAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCT:1 - chr2L 10264575 5' + G6 1946 1 75.25 GGACTTAAAAGAAGTTCGGAAAACGATGCCTCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCACATTAATGATAATGCTGTGTCCCCGCTCCCAAGCCC:1 - chr4 91482 5' - Rt1b 4741 1 65.98 GGGGAGCCCCAAAAGCGGAGGGGCTACAGCCGAAAAGTTCGACAAGCGCATTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGA:1 - chr2L 18881948 5' + BS 4742 1 56.44 TTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chr2L 21094952 5' - hobo 2889 1 73.27 TCAAGTGATGAAATTAAATTCAAATTTCGATTTTCCCCCGTGTATATGTACATACGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGG:1 - 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gypsy5 6900 1 72.73 TTGAAGAATAAGAGGCGAAGTTATGCATGCTAAATCAAGCGAAATCTTTCTTCAATTATATGGGGTCCAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACC:1 - chr2L 17016401 5' + Circe 7123 1 56.44 ATGCAGCTTTGCACAAATTGCAGTGCATGGTACATCGTTCGTTCACATGGTCATGTATATTTTGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 22930396 5' - roo 398 1 66.34 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAA:1 - chr2R 3262652 5' + Tc3 476 1 63.16 ATCTCACGCCCGCTCGGGTACAGGGTCAAACCTATTTACCGTTAGATCACGGAGCGTCCTCTTAGTGCGTCTTCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCT:1 - chr2L 22524638 5' - gypsy8 4787 4 68.32 CAAAACGTTGAATGCAAAATGCACGAAAACTCTAAGCTGCAGGAATATAGGTACAGCTGAAGATATATGCGGACGCTGTGGCAGATACTTTATTGC:1 + chr3R 15519507 5' + ZAM 8192 2 56.25 TGCCTGTCCAGGAGCTAGCACCGGTACCACCATCATGTCCAGAGATTACAATGTGCTCGGCTTTGCCCTGTTTACACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCG:1 + chr3L 16792520 5' + Chimpo 4011 1 71.29 GTTTTCAGTAGGATCCTGTCTAAGGATTTGGACAGCAGAATGCCTGGCATAAAACTATTATTTGATTGCATATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3R 19198603 5' + hobo 3 1 80.20 AAAGACTTTATTTACTTGGACAGATTAAATTGAACGGTTAATATACGTGACATTCGCATTGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2R 20906462 5' + jockey 36 1 49.50 GTTTTTTGGTATGTATGGTAAAAGTTCGTGAAGGTGACAATAAAAAGTTTCAAGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAG:1 - 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pogo 2086 1 64.36 ACACAAAACACATCGATGCNTTTGAGGATCGCTTCGAGTGCCTTGTCTCAATTAGAGGCGAATTGGAATGGCCGGCACGCTCTCGCGATCTGCCCCC:1 + chrX 16489775 5' + mariner2 567 1 55.67 AGATTTTCTAAAATAAAAAAATATGTTTTAGTTTTAAAAAGTTGAATTTGGCACTTCCGTTCAATTCTTGTATGAGAACATACATACATATACATGAACTG:1 - chr3R 4643413 5' + 1731 80 1 74.26 GTTCATCAAGACTCAGCTAATAAATTTTGCTATGAACTGACCGAGCCACACCTCGCAGTTTCGTCTGCTCTCTCTGAGGCTCTCCTCAACGTAAACATCCA:1 + chr2L 7535379 5' + McClintock 90 2 52.48 TTTAATTACGGGCATATGATGGTGCCCGATAATAATAATAATAATAATAACGGCGAGCGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAG:1 + chr3L 17186788 5' - Tirant 382 2 62.38 AGCAAGTTGTTAAAAGAAAACAAATAAGCCCGATATCGTTGCGTGCAGATGTGTGTGTGTGTATGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA:1 - chrX 15497425 5' - accord 182 2 47.52 CTTATGTATCTCCAGCCAAATGGCAAACTGAAACAAAGGAGCACTGCCCCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3R 11607946 5' + 1360 26 1 53.47 CACCGGCAGCCTTATCAAAAGTATCAAAAGTAACAGAACTATGCCCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTT:1 - chr2L 21215336 5' + BS 5006 1 57.43 AATGCGCTGCGCAAGTTCATTTTGTTGCAAAATAGCGAAATGCAAACAAACAAGAGACGGCAACCTGATAATAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAA:1 - chr2R 16521964 5' + I-element 398 1 61.39 GTTGTTGTAGTTCTTTTGTGGTGGCAAATATATAGAACACACAAGTAACATATGCAGAAAAACAGTGAAAAGTGAAAATTAAGTGAAAATATATAAGTACA:1 + chrX 13833532 5' + Max-element 472 1 67.33 CTCTGGATTTTTTCCTTTTGGCTATTGTTCGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAA:1 + chr2R 18764063 5' + hobo 2589 1 70.00 CCGCTTGTGGGCGTCTCTGTCCCCGGCACACACTGCATACGACTGGCAAATTGAGTTCTAATATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTC:1 + chr3L 20556840 5' - Cr1a 4172 1 61.39 AAACTTGCGCGAGTGTCAAAAAAAAATCTCCGCGAAATGGTCGCCAGTTGAGGCAAAGGGAATGGTTCCGAAGGAAAGAGAAAAAAAAAAGAAATGCAAAA:1 + chr2L 10114374 5' + gypsy2 406 1 73.27 GCCAACGATAACGACAGTAACAGTGGGCTAAAACTGGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 + chrX 21229284 5' - transib2 2787 1 59.41 ACAACACGGATGTTGATGCATCCAATTAGGCGGGCAATTACCGAGCACCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 - chrX 19034187 5' - hopper 1388 1 52.48 GTGTGCGTGTTTGCATCCCATGGTGCGTATGTGTGGGGTAGATTTATTGCATGACATTTCAATTGTTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chrX 22593127 5' + 1360 7 2 69.70 AACTGCAGTTCAATTCTTAAACCTATTTGATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:2 + chr3L 10110552 5' + roo 46 2 73.27 ATCGGGAGTATGGAATGCAAGTCATAAATGACATAGGGCCGAAATTGATTTCCGATCGATTTCAATCTCATCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 + chr2R 17963204 5' + blood 5 2 74.26 GACAACTCCATTAGAATTCAATTTTCGAGGCAGTCGCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chrX 14651140 5' + P-element 34 1 42.11 GCGGAAATGTAAGCACGACAGTTAAGAAGCCTCATAAACTTACTGAAACTAATTCTAAGTACATAAGTTGCAAGCAAAACGCTAAGAAAAAAAAAAAGAAA:1 - chrX 8696014 5' + G-element 4324 1 54.46 ATATGTTGACTGTTGGTTTTGTTCGCTTAAATACATAGTGAGTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGC:1 - chr2R 13673920 5' + F-element 204 1 75.76 ACTAAGCGACATAGCCAACGTAATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCC:1 + chrX 6457221 5' - hobo 447 1 78.22 GTTGGCCAAAACATCCAAGGCAACAAACAGGCAAAAACGGCCAAAAACAGCCAGAGGAGCTTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 + chr3R 23542933 5' - 412 7531 2 62.38 CGATTAAGGGGGGTAAGATACCATCTTCGTTAATATTCTTAGGGCATAATTATATTGGTCATTTATATCCGGAGGCAACGCATAAATGAGAGACGACTAC:1 - chr3R 10991698 5' + rooA 7195 1 56.00 CATCTATATATCACTCGTACATGCTGGACACAACGCCTTCTGGGGTGTGTGTGTACGAGTATAAGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chr2R 8311388 5' - opus 485 2 62.38 GTAATTGGCTTTGGCAATTTATTAATTAACTATTAATGGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chrX 21060368 5' + 412 39 2 62.38 ATTGACTTCACCACATCTGTATGTAAAAGGCGAAGAGAAAAAAACTGAGACTGAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 + chr3L 16162102 5' + FB 24 1 55.45 AACTATATAGTAAGTAGTTTATTTATTTAGCACTTCAACTAGTTTAAGACACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr3R 27169497 5' - 412 7519 2 49.50 CAAAAGTTCACGGATATGGGTTTTCAGGCAACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:2 + chr3L 2022215 5' - roo 398 1 72.28 GTAAAATTGCTCGCCTTTTTGTGGACATGGCCTGTTTTGTCGACTTAGTAGTATTGATGAAAATTTCACTTTAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAA:1 - chrX 159921 5' - Cr1a 4338 1 77.23 ATCCTCAACTGCAGGCGTTGCAGTGGATTCGCAAAAGGGAGTTCAAAAACACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATG:1 + chr3R 28511645 5' - Quasimodo 324 2 57.43 TTTTCAAATTAGGCACACTTTAAGCTAGGTTATTGCGAATTATAGAATTATAAAGACATCTTTCACGAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTA:1 + chr2L 3699385 5' - mdg3 5488 2 66.34 TTTATTGTTCGGGGCGACAGCATTTATGACTAAGTATTTTATAATGAATCGCTCTGTTGCTGCAAGAGTTCAAAGCTTGCTGAAAATTTTCAAAAAAAAAA:1 - chr3L 7608158 5' + TART-A 13400 3 53.47 AATGGGAAAATGGGAAAATGGGTGCACTGAAAAGCATTGAAGTTGGCCGAACAAAAAAACACACCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3L 9305202 5' - roo 397 1 67.33 AGTTAAACTGACAAGTTTTAAGGCTATGTATAAACATTGGCTGTTGGAGTCTTATAAAATATATGTGTATGATAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTAT:1 + chr4 74232 5' + 3S18 5769 2 75.25 TTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCAT:1 - chr2R 2868553 5' - Rt1b 4725 1 48.51 CGTAGGCGCTGGTGTAGCCATCCTCTGTCTTGATGATCTCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2R 11259571 5' - hobo 2907 1 56.84 ACATTGAAGATTAACTTATTTTATGAAAGGGTATTTATTTCATGAAGAGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTG:1 - chrX 18272540 5' - I-element 182 1 51.81 TCAGAGCTTCTTGGCACTGATTGATAGCCCAAACAAAACAAAAAAAAAAACT:1 - chrX 18397854 5' + HMS-Beagle2 489 3 59.62 AAGGGGAAAGCGGGATCCTGTGGCAACCGAAGCAGAATTTTGTCTGCTGACGATGCACTATGGGGCATTTGGCCGGTTTTTTTTACAATAATGGGTTTTTC:1 - chr2L 12882812 5' - hopper 1390 1 52.48 ATGCGGGGTATCAATAAAACGAAACTACATCTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATAGGAAGAAGCATACGAT:1 - chrX 11032238 5' + invader3 45 2 70.41 CGAAGGGAGTGGAATGGGAATGTGCCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTT:1 - 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chr2L 15898827 5' + F-element 35 1 58.42 CTGGACACAACGCCTTCTGGGGTGTGTGTGTACGAGTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 - chr2R 8311365 5' - opus 462 2 64.36 TCTGTGCGCGTTTATTTTAATGTTACGTTCTGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr2L 10792002 5' + 412 17 2 62.38 ATGCATATTTATCAAACAAAACTAACTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3L 872760 5' + 412 7104 2 73.27 GGCGTGCGAAAACTGGCTANCTTCTTGGTGGCGCGCGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTGGTAATTTTCTGTTCCGTGGAAGTGGTGCACAAATTTTCG:1 - chr2R 17774498 5' + R1A1-element 93 1 35.00 CTGGCGATGAGACCAAGACAAAACCCTACCTACCAACGGGTATGTAAAGCAGCGGTTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTA:1 + chr3L 18749441 5' + Circe 7233 2 69.31 ATTTGGTCGTCATCAACTTCATTTGGACGACCTGAACGTGGCTCATCTTTAAGTGAAAAATCTCCAGAACGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCAACA:1 - chr2R 2753540 5' - invader2 4646 1 73.00 GCCAGCCACATGAGTTTATCATAAAGCACCCACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGC:1 + chr2L 6371902 5' - Cr1a 346 1 71.29 GCAGGATAATGGCGACCAGGGCGGGACGGAAGGCCAAAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGC:1 - chr3L 10412176 5' - blood 168 2 93.33 GTTGGTTGGTGGAAAACCCCAAAGGTCTGCTGTCTGCTGGCTCTCTTCCTCTGTCGCTGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGC:1 - chr2R 7374323 5' + F-element 311 1 64.36 GAAGTGTTGCCTACATATGCCTGGAATCGATTCCCACATATCAACTAATAGATAAAACAACTTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCT:1 + chr2L 15265491 5' + R1A1-element 4951 1 67.33 ATATGAATAATATCGAAATACAATTTCAGTTAAATAATTAGTTCTAATTACCATTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3L 21519056 5' - 1360 3368 1 56.44 TTTTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTTTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGA:1 + chr3L 3766790 5' - 1360 143 1 69.31 AGGCAACAATAATGCACATGTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chr3R 28565283 5' + 412 7106 2 78.22 CGAACGATTTGATAAGACTAAGAATGATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 14222477 5' - roo 9022 2 77.23 TATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGC:1 - chr2L 1654716 5' + micropia 5 2 74.26 AACTACAAAGACGCCGAGTAAGGTGAAAACTTTTGCAAACAATAAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:3 - chr3R 17660546 5' - roo 9039 1 58.42 CATGAGTTCTGGCTCCTCGCGGGCTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTC:1 - chr3L 21974697 5' + baggins 5213 1 77.00 TTATATGTAGATATGGAATAACCACTTCTTTAGTTGGGGCACTGAGAATTGATTCCATTTAGTGTCAGGCATAGTGGGTAATGACCACTTCTGATGTTG:1 - chrX 10293520 5' - invader3 297 1 80.81 AAACTGGTATTTTAGCCAGCAATTTGCTATCGATTTTTAGTGGGTAGAGGACAGTACTGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTAAGAAAGGA:1 + chr3L 21416448 5' + HB 391 1 66.34 ACAAATAACTTGGTCGTGATAAGAGATAGGAAATTGGACACACTGAGTGTGTACAACAGATTCTATAGGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCGCACAAGC:1 + chr3L 14715356 5' + 1360 3246 1 62.38 TTGAAACAGATATTTTTTANCATTATATACGCTCACATTGAGTTTTCCAAACGAAAAGGTATTTAATGCGTGGGTATTTTAAAATTTAAAAATTTTCAAAT:1 - chrX 10893455 5' + 1360 3030 1 87.13 CCAATTGTTTTCTATGAAAATAGAACATTTTGATGTAGTTTAACCTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 + chr2L 14341836 5' + copia 4902 2 54.46 CATATGAACACTACTTAAATTTCCAGAGAATTTGGCATTTAAGTATCTCTTTTTTTGGGATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAA:1 - chr3R 19505621 5' - mdg3 5482 2 42.57 GCTTGTTTGTTTAAAATAATAAAAAGGGAACAAAGTTTTTATTAAACAAGTGGAAATGGGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCAT:1 - chr2R 1986576 5' + INE-1 170 1 62.38 TTTGGTTTTGCAATCATGGCCCAGATGGAGGTCCGTTCTTCATTCTGCGTTTGCTTTTTGGTTTCAGGCTCTTTTTTTCTTTTTCATTTTTTTTT:1 - chr3R 21724033 5' - Doc2-element 234 1 57.89 AATTAATCAAAATAAATCGCGTTTGGCCGACAAAGTCGAAAGTAATTTTCAGCACACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chr2R 8526325 5' + I-element 24 1 58.42 CAAGCAACTTAGCGTTCACTAATCTTTAAAGTTTACAAAATGTTATAAACAATAATAAAATTCAAAAACTTACCTTTTCTATTATTATTATTATTATTATT:1 - chr3L 13097043 5' - mdg1 7066 10 75.25 CCACACTGTCCCGATATATGGACTATATGTTCTGGTGGTTTCCTCAGTATTTTGTGGGCCGATTTCATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCCATCTTGGTCCGC:1 + chrX 17524985 5' + Q-element 493 2 70.30 GATTTGGCCAGACTAACCAATTTTTTTATGAGAATTAATAAATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 + chr3R 21588998 5' - flea 221 2 65.35 CATTATAAGATGCATTCACGAAATCGCGCACAACATCGTCGGGCGGTGTAATAACTCAGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAA:1 + chr3L 6301366 5' + blood 433 1 60.40 TGAAAGATGTTAAGCAAATAATTCCTGTGTTCCTCATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 + chr3R 20905367 5' + pogo 5 1 75.25 TCAAAATATTGTCACTTTGACATGCAAGTTTGAGCTACGTGGGAAGTTTCGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGG:1 - 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chrX 3356302 5' + hobo 41 1 72.28 CCGACCACTCCGCACTAACCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chrX 1135348 5' + P-element 56 1 23.76 TCGGTGTTCCTAATAAAGTTTACAAAAATATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTGCTGCTTTT:1 - chr3R 5811317 5' - flea 4626 1 72.28 TGGGTGGCGAGCTGTGCGTNGCTGCGGCATATTTGTCAAATTTAAAATGCATGAGCACACACACAGTTGTCGGCTATCACTGCATGCGGAGAAAAGAGCTG:1 - chr2R 16915729 5' - 1360 139 1 72.28 TTATTGCGGCATTGCGCGTTTAAAGTAGTGACGAAGCGCACGCTGACATAGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chr3R 5506767 5' - pogo 2078 1 54.46 GCAAACAGTTATCCTTTTCAACAAGAGGTAATTAATGTTGGAAAATAGTAATTAATATTTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chrX 14173075 5' - 412 476 2 61.39 GTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCA:1 + chr2L 18213148 5' - hopper 1389 1 53.47 AGTTTGTGTTTTTGCACTCGGCAAATTTGGCAATTTGTTCAAGCAAAAAAAAGTTAGCTGGCCTTTTTTTCTCTCAGCGATATTTCCAATAATTAACGTTT:1 - chr3L 2609891 5' + FB 482 1 50.50 ATGTCACAGTACCACTTGTNTACGACTGTAGCCATCTCGAATCCCCCCACATCGTTTCCGCTAAACTTCTCCTGCTGGTTAACTCCAGGGAAGTAAGTGA:1 + chr2L 15861543 5' + Ivk 472 1 70.00 TCATTGCTTTATCTGTTTTTCATCTCGAGCCGGTCAAGTTGGCAATTTGGCAAAGCGTGAAATGGACAGACACATCATCTTCAATAGGTACACTTTCTTGT:1 - chr3R 31323435 5' + Circe 7244 2 73.27 CCTACTTTTTGACGGTGCATCAATGGCTTATCACCCTCTTCCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCCAACCGGCAAATCATGGGAGACTGCAGCGAGGGACC:1 - chr2L 341192 5' + gypsy3 349 2 73.27 TTATAAACTCGTTGTTGGTAAAGTGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 + chr3L 12468230 5' + jockey 4725 1 72.28 AATTATGTTTTTTATGTTGGACATACCCTTATCTTGTTCTTATCTAAAACAAATATTTTGAGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGT:1 - chr3L 6033613 5' - 412 479 2 62.38 TGATGCGAAATTGACTTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTT:1 - chr3R 22869424 5' - Bari1 1654 1 77.23 TAAAAGTGATTTGGAAACATTTGATTTGTTTTTGAAAACGAGATAAGAACACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGG:1 - chr3L 20519641 5' + P-element 233 1 49.00 TAATAACTTTGCCCTTTTTAGCCGCTGTCCATTTTAAATTCAATCACCATGTGCAGCCAGCCAGTGGAGGGACCCTCTGTAATGATGAACCCCAATTAAGA:1 - chr2R 24278109 5' - 412 491 2 72.28 CTCCTTGTTGATGATGATGGAAATCCAGCCGAAAAGATGACGAAGGCCTTGAGCCAAAATGTAGCAATTTGTTGTGCTTACTTCCACAAATACGACAGCGA:1 - chr2L 11645251 5' - G3 208 1 66.34 TAGAACTTGCTTCCGCCATTTGACTTTAGTTTGATGTATTAAGCCATTGTTAACAAGAGCTTAATTAAACCGGCGAAAAGAAAAAAAAAATTATAGAAAAA:1 - chrX 16740460 5' - Tc3 79 1 58.42 TTTAATTTTTATTAACTTTTAACTTTGCTTTAACTTTGCTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCA:1 + chr2R 10912576 5' - TAHRE 10401 1 86.14 AATGTATATGAACATAATGATTTTCATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTC:1 + chr3L 13001022 5' - invader3 227 2 78.22 TGGCATCTTTGCTCAATTTTGCCTGCCGCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr2L 10792032 5' + 412 7100 2 71.29 CGTTAGTGTAAACTGACGTTTCAATTGCTACAGTTCATTGTTATACAGAGATCGAGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 - chrX 17489313 5' + FB 22 1 55.00 AGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTAATTCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTAATTAAAGTAA:2 - chr2L 22224555 5' - Rt1c 5392 1 65.35 ACAAGTCCGAGTGCTCACACTCAAAAAAAAAAGAAAAAGCTCAATACTCAATTACTTTTTATACTACTAATAATTTAAATAAAAAATTTTAAAATTTAAAA:1 + chrX 12862059 5' + 1360 3036 1 72.28 TCACTCGTACATGCTGGACACAACGCCTTCTGGGGTGTGTGTGTACGAGTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 - chr2R 8311378 5' - opus 475 2 56.44 ACAGCACTATGCAGACTTCCATCTCCGTTTCTCATTCGCATTGCCCCATGCTCTGCAGCTGGCCGTAGGATGGCTATGTTGCAACCCCAGTGATTGCAAGG:1 + chr2L 14117578 5' + GATE 8205 1 61.39 AATGCAGGCGCTGGCCTTTNTCTGTTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chr3R 11321063 5' + hobo 49 1 72.28 ACATGTTCTATATACTTTGTCTGCGATATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr2L 5419807 5' + 297 37 2 78.22 ATGCGGGCTGCACTAAGAGAAAAGTGGTAATAAGCAAATTATTATCCTAATTATTAAAGTAATTCCCCAATTTCAGATTTAAAGCCGTACTTCGCTT:1 - chr3R 10497015 5' - Max-element 377 1 64.95 CATGAGGTGAAATTAACGTATAAATCGATAATTTAATTTATCATAAAAAAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCG:1 + chr2L 16851709 5' - HMS-Beagle 7024 2 59.38 GCATCTACTTATGCTAATGAAGCCATCTGCAGACGTGGTTTTCGAACGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCT:2 + chr2R 9905347 5' - mdg3 5470 2 52.48 TCCTTCTTGTATCTAGATGCCAGCTTTGTTCTCATTCTTTTGTCGTTCTTTACGTAAAGTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGATCAAAAATGTG:1 + chr3L 27717097 5' - 3S18 244 2 58.42 ATCCCATGGTGCGTATGTGTGGGGTAGATTTATTGCATGACATTTCAATTGTTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chrX 22593141 5' - 1360 3366 1 56.44 TGGGTCAACAAACTTGCGCTTGGTCTTTGTCTCTGGAATCTGTACGCTGAATCTCAACATTCTAGCTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGAC:1 - chr2R 5296377 5' - INE-1 133 1 85.15 TACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCA:1 + chr3L 10596451 5' - transib2 2485 1 62.38 TCCGGTTCAGTGTCTCCTTCGAAGAAGTGATTAAAAATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCA:1 + chr2L 20046509 5' + I-element 5133 1 66.34 CACATTATAACATAGAAATTCGGTAGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTA:1 - chrX 17553787 5' + accord 288 2 74.23 CAAATATAAAACTTTAGAANTGCGAGGAAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTA:1 + chr2L 19642315 5' - Quasimodo 7327 2 71.72 ATTTGGCTTCCTTTTTTGTTAAGTACTTATTGAAATTTATATAGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr3L 15788427 5' + opus 7151 4 66.34 TAACAATATAATCATAAAAAAAAAGTTTAGTTGTGATATTTCAGTTATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 + chrX 12621093 5' + flea 4781 2 55.56 CAAAAAATATAAGCAACCTCAAAAAACACAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 8281296 5' + R2-element 3584 1 65.00 TCTTCCTTTTTATCCCGAAATGGAGCAGCCCAACACACATATTAGTATGTATTTGTGTTTATGTGCTTGTAGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr3L 14594204 5' + hobo 7 1 71.29 TAAGTAGAGATTTCTGCTATTAAAGGTATTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr3R 20420901 5' + blood 11 2 68.32 TAACAGGCATCGATTTGGGGCAGTCGGCTTTGGCTGCTTACTAG:1 - chr2R 9855077 5' - Doc3-element 4555 1 56.82 TTTTTCGAGCACTTTTTGAACATTTCTGATTCGGCGAGGCGAGGGTATTTATCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTGATTTGTGTGTTTTTTGC:1 + chrX 19413250 5' - Porto1 4445 1 55.45 ACTGCTAACTGAGTTTTTCNTGCCATTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGGATTTTCGAAAAAGT:1 + chr2L 15366965 5' + FB 122 1 75.25 TTCTACGTGCCCATATGCCTAAAAGTATGCACGTATCTGGCGACATAGTCGTTTGATTAAACTTGTTAACACACATAGATCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 - chr2L 10143732 5' + jockey 6 1 79.21 AAGGAAATTACTCCTGCACNTTTAAACATTAAAATAAAAGAGTCATAAAAACCTACAACTAGATTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr2L 7175540 5' + blood 11 2 67.33 TTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTGGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCA:1 - chrX 23108327 5' + BS3 1421 1 54.46 ATTCATTTTAAATCCGTTTTGAAAGTTTTTGACGGTTTTAAGGTGACAAGACGGTTTTTTTGTTAGTTTTGGCAGTCACAAACAAATAATACAAACCACAC:1 + chr2L 16687334 5' + Transib-N1_DM 225 1 68.32 TAAACATTATCAAACTAGTCAAAATTCTCCAGGCTTTAGACAACGCAAAGCTAGAATTGATTTTCATAGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGA:1 - chr3L 25623940 5' - 1360 3204 1 72.28 TGCTATTAAAGGTATTTTCTAATAAATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3R 20420915 5' + blood 25 2 54.46 CAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACT:1 + chr3R 23020825 5' - INE-1 567 1 49.50 GTCAGAGTCTTTGCTTTTATAGCCGCTCATAAGGATGATGAAATCGGAAGCTTCGCATGGTGCTATAGTCGCTCTAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr2R 18171482 5' + P-element 1 2 77.23 TTTAATAAAATTTGAGTAANGGATGCGGTCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 - chr2L 126533 5' + Doc 51 1 75.25 TATCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:2 + chr2R 18723041 5' + HMS-Beagle 34 2 62.38 CGGTTCCAATAATCGTTAAAGCGACCATAAAATAATCACCTAATGTACATATTGCCCATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 - chr3L 11829117 5' - Transpac 295 2 64.36 CTGGTGAGAAGCCTCCGACTGCGGACGACCGGATCACATGGGTTCCCAATCTAAAACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAA:1 + chrX 19193867 5' + gypsy 400 2 60.40 TGTGAAATTATCATTATTCAATTGTGTTTTTGGGTAAAGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr2L 7666109 5' + roo 8701 2 62.38 GAAGAAATGGTTAGCTAACTCGGAAAATAGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr3L 7168312 5' + Doc 30 1 51.49 TAATATTTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTAGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 9278394 5' - roo 9047 1 52.17 AACAGGAAGAAAAGGAGGCCCCCAAATGTATGCTATGCAAAAAGACTTGCTTTCAACGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr3L 13895346 5' - hobo 2922 1 60.40 CCATGAGCTAGAATCAAAAGACCTCAATGGATCCATTAAACTTCCCGCGATCATTACAAGTTTCCTGCTTCCCGTAATCTTGAAGGGGGAGTAGTTAACAC:1 + chrX 9059733 5' + gypsy 6975 1 76.24 TGTCAAAGCTTGACTGATGATGAAGATTGCAGTTATTAAAAAGTATCAATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 3757415 5' - roo 9044 1 59.41 AGAATACCTTTGGTGAAGGGTATTGTAATGATGAACTGCCTTTTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTC:1 - chr2L 10792062 5' - 412 438 2 74.26 AAAGATTACAATTTCTAGTGGTGGTCGTTTTTGCATAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr2L 21086090 5' + roo 8702 2 65.35 GCACGTAAACAGAAGTAGAGCAAAGTTAATTGTGAGATAGCTTTCTTGGGAAAGCCAATCGGATAAGATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGA:1 - chr3L 6962217 5' + FB 10 1 69.31 GGGGAGGCAATGGGCGCTGGCAACTTGGGAATGGGCACGAATGGGAGCGGGTGGTCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr3R 6961145 5' - 412 7526 2 56.44 GGAAATAAGAAATTTTCGCNTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 + chr2L 18247990 5' - blood 340 2 64.00 ATTAGAAGCTCGCTCACATACATGATAAACATAACTTAACATTGTTGGTCCTGAAAAAATATTGTGTAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGAC:1 - chr3R 24314771 5' + X-element 20 1 50.50 GCGTCCCAAAAAGTTTTACAGACAGGCATTTGAACAATTTCGGGTGGACCAATTGGGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACAC:1 + chr3L 15557976 5' - R2-element 3538 1 62.00 GGACTTGGACCCCAAATCCAATTTTCCGTGGCATCCCTTTCTGCCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAA:1 + chr2L 12808158 5' - Tirant 369 2 57.43 GGTGGGGCAAAGGTGTTGGGGCAGGTGGGACATGTTGGCGCCTCCGGTTTAGTTTTCCCTGCCACATGTGCGCTGGTATGCGTATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3L 12949942 5' - accord 185 2 70.30 GCCGCCTCCTGGCTCCGCCGACCGACCGACCTGGATAAGCAATACTCGACAGCACCTGGATCCCCAATCACGAGCCGTGGATAGAACGGAATCATGGCGAA:1 - chr2L 804524 5' + Rt1c 4962 1 60.40 GGAGTGTCTTTTTCAGAAANCTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAACAAG:1 - chr3R 16533698 5' + X-element 4382 1 26.73 ATCGAAAACTTTTGCCATTNCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr2L 10625673 5' - roo 9039 1 55.45 GGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAA:1 + chr2L 20360644 5' - R1A1-element 144 1 71.00 GACGCTCATTGATTGTCGGATCCAGTGAACATTCACATACACACAAACATACATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr2L 3978517 5' + 297 15 2 65.00 AAAACCGAAAGAGGGTAAACAACAAATTGCATACTATATACACTAATAGGTGGACAGGGATATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 + chrX 15546130 5' - blood 7375 2 65.35 TTATGGAATTCTATGCAGTGACTACTAGTTTCATCAAATTGAATTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTT:1 - chr3R 31022003 5' - Ivk 5343 1 61.39 CACAGATTTAACTTAATCAGACCTATCTTAATAGGAACCTTTTCATTACTTTTCTTAATATTTTACTGCTCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAAC:1 + chr2L 11600060 5' + invader1 96 2 69.31 GCGTAAGTTTTCGTATCTTAGACAGAAGTATTAAATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGATATTTCGTGTTTCTGATGCGCGGCAGACAACCGTTAGA:1 + chr2R 5044045 5' + invader1 3692 2 72.28 GTGCGCTACCCCATGGCTTTGATTACATAAATTGCGTATACGCAGTGTGTGCGTGTGTGTTCGTGTGTGTGTGTGTGTTCGTGTGTGTGTGTGTGTTCGTG:1 - chrX 8395478 5' - accord 7026 2 72.28 CCATTAATAAGAAATCCAGTAAAAAATACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr3R 11052077 5' + blood 7020 2 68.32 CAATCAACGGCGATTTAATTGGCGCGTCGCCATGAGCAGCACAGAAGCAGAGTACGTTGCTTTATCCACGGCTGCAAAAGAAGCGGTGTATCTTCGACGTT:1 + chr3R 10146471 5' + Copia1_DM 4001 1 74.26 AAAAAAGGTTATAGAACGATTTTTTAGAAAGATTTAATTAATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAAT:1 - chr3L 15125937 5' - Juan 4172 1 70.30 TAGCAACTGTCTCGTCGTGCAACAAACCCGAGATCTCACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATAT:1 - chr3R 10391270 5' - invader4 318 2 69.31 ACAAGAGAGAATGCTATAGTCGTTTTTCCCAACTATCAGATACCCTTTACTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTCATGAGAGGCAGTC:1 - chr3L 24797354 5' + R2-element 3277 1 52.48 CGTTAGAGTGGGCGTGGCAACATAGATCAACAAACTTGCTCTAGGATCGGTCTGCTTAATATCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTT:1 - chr4 71480 5' - INE-1 142 1 77.23 CCAAATCACAAAAAACAGATCGGACAGGAAAAAAATGGGGGGTGGGGCAGGACACGAGATATAGAGCTAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chrX 7996353 5' + hobo 6 1 64.36 AGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr2R 5214984 5' + F-element 56 1 70.30 GCTGCTGCAACCAGATTTGGCCTCCACTTTAAAGTTACATTTTCTCGGCTCACCACACTGAATGTTCATTCTATCGATGTTGTTGTTTTTTTTTATCCTTT:1 - chr2L 9283571 5' - gypsy7 5012 1 75.25 AGAGGCACAATTGCTGCCGCTGACAGAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCG:2 - chr2R 6918630 5' + accord 46 2 74.26 GAAAACGATTTACCGGTTTTAAGATGGTCTATAATTTTTCAGTAGTTTTGCGCATACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1 + chr3R 21365489 5' + P-element 22 1 57.43 AACACTTTTAAAAGTAATTTGGTTTAAAAAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 8036425 5' - roo 9027 1 74.26 TTGCCATTGTGCATGATTTTATGATGAAAGCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACG:1 - chr2L 8622822 5' - 297 353 2 70.30 AAATGCGACTTCAAAGAAAGGTAAAACGGCAAGCGGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATAC:1 + chr2R 16154175 5' + Doc 4394 1 65.35 GAGTAACGCATGCAGACACACGTCAATGTAGACAGTGCACTATGGGGCATGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAA:1 + chr2R 7546262 5' - hopper 74 1 56.44 CATTCAGTCAGATGGTCAACCCCCGGGGCCAAATAGAAAACCTCCCCCGAAGCCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCAT:1 - chr3R 20956807 5' + jockey 301 1 55.45 TCAAAACCATAACCATAACCAGAAACACAGATAAA:1 + chr3L 22680400 5' - Transib5 2644 1 88.57 GAATTTGTGCTCCAATCCCTAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTG:1 - chr3R 25086143 5' - Bari1 1653 1 79.21 CGACTGGTCGCAACCGGTCCAAAATCAACCAGGCCGAACCAAAAGCAACCCGACTCTTTGAGTGGACATGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGGTGACTTTA:1 + chr2R 6850412 5' - roo 403 1 73.27 GGGAGTAAGGGGAAAGCGGGATCCTGTGGCAACCGAAGCAGAATTTTGTCTGCTGACGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 - chr2L 12882818 5' - hopper 1396 1 58.42 CACTAAGGGCGATATCGCCGGCACGGGCGGCGGCTACCACGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGA:1 - chr3L 22799342 5' - blood 178 2 61.39 GCAATTCGCACTCCATTCAAAGTGTTTGGCCAGCAAGCTAGCCCAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCG:1 - chr3L 20069647 5' + 1360 3185 1 61.39 TCAGTAGCTATAGGTATGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 - chr3R 21365537 5' - P-element 2827 1 20.79 TGATACATTCGCGGGTTCTTCGGGATCTAGCGATGGGGTCAGGGATAGACGGGGCCTGCGCTGTTGCCGCGTTGAATTTCACCAGAGTCAG:1 - chr2R 10510742 5' - Chimpo 274 1 61.54 TCAAACTGCAGCCAAAGCACAAAACCAAACAAAACATGGCTAAATAGCAGGATGGCCATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr2L 13566555 5' - hobo 2920 1 63.37 TGGAGGGAAAGAGAAAGTTTATTAAAAGCAACAAAAAACAAAAAAATAAAAAACAAATGGATTATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTG:1 - chr3L 14307678 5' - Tc1 1345 1 61.39 CGTTGTCACCATGGAGGATAAACGATTCCACATCTCAGCCTGAAGCCATCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGCGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACG:1 + chr2R 16189350 5' - 1360 25 1 64.36 AGTTCAACGGACGAATGCAAAATGTTCGACTTTTGGACAACAAACTTAAACTTTTGTTTATTTCGTACACTAATAAAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACT:1 - chr3R 7514012 5' - diver 224 1 72.28 AATTATAATAATTTTAATTTTATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr2L 17778067 5' + pogo 41 1 88.89 AATAAGGCAGGCCGCTCATAAATTGATTTCGATATCAATTGCTGAACTTTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 + chr3R 7469950 5' + Doc 35 1 51.49 ATTGACACCTGTAAATGTTTCGCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGATCAGCATTGACC:1 + chrX 22462298 5' - jockey 4714 1 76.24 AAGCTGTAAGATATATGTAATGTAGAAGCAAAAGGAAAAATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 + chrX 13126212 5' - mdg1 384 2 60.40 ACGGCCAACGTGCGGGATTAAGGATCTGGCGCACCGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 - chr3L 13295275 5' + hopper 35 1 61.70 TCGGAAAGCAGGATAGCATGAGAGTTGCAATTGCAGTCGAGAGCTCCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:3 - chr3R 23543020 5' + 412 31 2 59.41 ACTTGTTGCTAATCTCATGTGGGATTGAATTTATTTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATT:1 - chrX 12389111 5' - I-element 5309 1 66.34 TTTCCACCCACTTGATTGTTGAAAATAATATAAATTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 - chr2L 18248046 5' + blood 39 2 68.32 CCGTTAATAAACATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTTCGTTCATA:1 - chrX 23280960 5' + roo 36 2 63.37 AGATCTCCTATATTTGTTTNCAGTGTCATGATGCGAAATTGACTTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCAC:1 - chr3R 22869452 5' + Bari1 31 1 56.44 TGTATATATTGAATTTTAAATTTTATATGTGCGTTGATTTTTTATGTATGGTGTATTTTAGATTTTAGGTGGCTAAAGAGGTGATTTGTGTGTTTTTTGCT:1 - chr2R 1000349 5' - Porto1 4444 1 67.33 ACACAGTGATTAATGCATATATATCAAAGTTTTTACTCCTTCGCAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCC:1 + chr3L 15452867 5' + accord 33 2 56.44 AAATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:2 + chrX 13146921 5' - roo 9033 1 62.38 TTGTTAGATATATGAATAATATCGAAATACAATTTCAGTTAAATAATTAGTTCTAATTACCATTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3L 21519065 5' - 1360 3377 1 65.35 TACAAATGTGAAGATAAGCCAATTCAAATGCCCTTAATTTTGGGTTTATTATTTTGCTCTCCCGCATTCTGGCAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATA:1 + chr3R 20343297 5' + INE-1 546 1 83.51 CTTTATCCACCTTATAAGCAGCAGGACCCGGACCAGGTTTTTCATCTCTTTTGCGTTGAGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCT:1 - chr2L 10790540 5' - G2 209 1 54.46 TTAATGATTTTGTATTTATTCAACGCGTCACTGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:2 + chr3L 1586730 5' + Tirant 8149 2 68.32 ATCTGATAGTGCAAAAAAAATGTTTAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATA:1 - chr3R 15924661 5' + Quasimodo 38 2 79.38 TTCAATTAGGAGGTGCCACCAAAGCTGCATCGCCCATTATCGCAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTC:1 - chr3R 26741281 5' - BS 5017 1 58.42 AAGTACTAGGTATAGTTTGTTATACAAATACTATACGTAATGGTTTATTATTAAATTCTATTAAACTT:1 - chrX 7775884 5' + Tc3 1523 1 82.35 CACAGTAATATGTTTTCTGGGTTGGAGGCTATACTGTCGGTTTATCTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAG:1 - chr3L 21087775 5' - F-element 457 1 55.45 AACAGGGAAATTGGCCAAANCATCCAAGGCAACAAACAGGCAAAAACGGCCAAAAACAGCCAGAGGAGCTTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 + chr3R 23542924 5' - 412 7540 2 71.29 ATATGCTATACAAATTTAATGCCCAAAGGAGGTAGTGCCCACGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 - chr3R 22238736 5' - hobo 2903 1 62.38 GTGAAAGTGAATAAGATTCNCCGATTAGGAGAGCAAACAAAGCTTTAACCCTTAACCCTAACCAACATCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chrX 21217603 5' + pogo 4 1 72.28 GTTAAGTTGAGTGCATTTGNCCGCAGTTGTGTTACCCAATGTTGATTGATATTTTTCATATTTTTATAAGTCTTGCAAATTTCTATCGATTTGGAAAAAAA:1 + chr3L 8168508 5' + INE-1 311 1 54.46 GCCTATATCCTATCAATCCTCTAACGTCCAGGACTTGTGTTTTGAAATTAGTGAAACATTGATAGTTGGTGATGAAATAAAGAGGGATAGTCATGCCACGT:1 - chr2R 3068143 5' + invader5 259 2 66.34 GAACTGAATGTAGGCGAAAATCGATTGCTTTCAGAGCGGCAGAGAGTCAAAATTACAGATAATAGTCAGAATTTAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACGTA:1 - chr2R 17077218 5' - Cr1a 4171 1 78.22 TTGCTAATTTTGTGGCCATTACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTATCAATTCACTATGTGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATT:1 + chr3L 8039336 5' + hopper 17 1 47.47 TATTACAAGAAAATATGAAAAAGTACTTTGAAAGTTTATTTTTGTTCTTCTTTTAGTTAAATAGTTTGCACCTTAGTATTAATTATAAATATTATTATTAT:2 - chr3L 7868493 5' - mdg1 41 3 59.41 AAATGCCGACGATTGCTATCCTCCTAAACTTTAACATTTATTATCCCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 + chr3L 1697682 5' + Transpac 29 2 54.46 GTGACGCCATAAATTCCCCCTCCCCCCCTGCCACCTACTGCTTTTAAACCCCCCTCGCAGACACAGAGAAAACCCAGCAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAC:1 - chr2L 9174046 5' + Doc2-element 253 7 62.00 AAAGTAAGGTTGCTGATGAGGTGCGTTCCAGCATTGGGGACTAGCTTGGCATCGTGGAGGAGATCTACAGCGGAGCTGATGGAGTTGTCAGACGCGCTAAG:2 - chr3L 15771430 5' + aurora-element 3923 1 53.47 TTCCGGAAACTTTTTCTCACCACCATGTTGTTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACGAATTTCACTTTATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGAC:1 + chr2L 16209525 5' - X-element 21 1 69.31 CAAAATAGTTTAAGTATAAACAATTCAGACGCAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAGCATAGAAACAGTCAACGAAAC:1 - chrX 11396921 5' + Porto1 4408 1 69.31 TAGAGAGGCATTAGTGAATAGAGGATGGCAACCAACTGTTGCCACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATA:1 + chr3L 17942629 5' - copia 256 1 57.43 GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCATCCGTCCGTCCATATCA:1 + chr3R 17660024 5' - micropia 426 2 52.48 AGGTGAAGGCACACAGACACACACACTAATGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1 + chr3R 17059166 5' - hopper 1371 1 69.31 AGAATGTAATAAAAATCATAAAAAATTAAAAGTGTACCCACACAGATAGTACATATGTATGTGCATAGTACATATATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 - chrX 3356340 5' + hobo 1 1 74.26 TTTATTTATTGCTTTTTTAACCCTTTTTTTTTGGGACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGAA:1 - chr3R 10488733 5' - roo 9029 1 67.33 AATTGGCATTAAAAAGTTGATAGACATATAAGTATAGTAAGGTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr3L 19249683 5' + Transpac 37 2 68.32 CAAGTTTCGTGCCTCTCTTGTCGTTCTGGGTGTTTGTAAGTATGCGCAATGTGAATGGTGAGTGCCACCCGCACTCAAAATTGTTGAGTGTGAGTCGAGTG:1 - chrX 22834904 5' - hobo 31 1 70.30 TGGGCTAAAAACCAATTCTTTAACTAAATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 + chr3R 17971664 5' - 412 7498 2 72.28 TTATTTACATGTGTAAATTTTCACTTCCAACTGACACAGTATTATTTATATTTGTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATAT:1 + chrX 23035724 5' + HMS-Beagle2 17 2 61.22 ATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGAT:1 - chr3L 15452918 5' - accord 488 2 71.29 GTGTGGGAGAGAAAACATAACAATGCCAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 + chr3L 7307230 5' - hobo 2891 1 73.27 AAATTATTAAAATGACATGGTTATCTGGCTTTTCAGTTGAGAATAAGGTCTATTCTTTTTTATAGATATTTTCTTTTATTTTTTTTTTCTTTTTATAATAT:1 - chr3L 18381416 5' + hopper 157 1 64.36 ATTTCCAATTGAGAAATTGCATCAACTTAAATGGGAAACGTGTCTACCCCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr3L 18418834 5' - hobo 2912 1 53.47 CAACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAACCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3L 2022243 5' - roo 9033 1 61.39 AATGCCCAGCTTAAAAAAAAAAAGGAAAAAGGAA:1 - chr2L 18656826 5' + Doc2-element 232 1 64.71 TATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGAC:1 + chr2L 23299990 5' + invader4 357 1 69.31 TAACTGGATCCCCTCCGAAAATCCCCAGTACGTGCCATTCTGTTTGGTAAAGATCCTAACTGTGCGTATGTGTGGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chrX 15287832 5' - hobo 2935 1 71.29 CCCGAAAGGAAACATGTTTACAGACGAAATCAAATCTTTTCATGTGCTATCGATAGATCATTATTAATATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 - chr2L 21190842 5' - pogo 2096 1 74.26 AATAATAGCGCAAAAACTATAGACCAAAACCTATACCAGACCCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAA:1 + chr3R 19505540 5' + mdg3 5286 2 57.43 AGGACGGGGGGGAAATCCAGAATAACAAGCGGCGGCGATTCGAGTCGAGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3R 10488670 5' + roo 8690 2 53.00 GTGGACACACAACGTATTAGTACATGAGAAATGATTGTCAGGCAGTGGACCAACCTTCAGTGTAGTCCATGGAGGCTCCTCCTTCCACCCTTTAGACGCCT:1 - chr3R 9786353 5' - Rt1b 4895 1 59.41 CATAAATGCGTAACATAATAATTTGAAAATTTGAACTGCAGTCTGCGTTAGCCAATCAAATTAAGAAATATGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:1 - chr2R 12525666 5' - mdg1 7455 2 61.39 CACTGGAAAACGAATCGAATCGGCTAACGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCC:1 - chr3R 8086923 5' - Stalker 303 4 65.43 CAAAACAATCTAATCCAATTGCATTAGAAGGCGATCAGAACAAAAAGAAACGAAGACAAGAACAGCTCGATACGAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTT:1 + chr3R 17661233 5' - invader6 52 2 60.40 TTTAAATATCTTTTCTCAATAGTTCTTTTTGGCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAA:1 - chr2L 10899778 5' + jockey 4813 1 68.32 CTCTGTGCGTTGGTCACAGCTTCCGGCTGCTCTGGGGAGTCCGGGGAGCAGAAGATTATTGTTTACGTTGAGAGGAACATTCCTCTTTTAACTGCCAGCCT:1 + chrX 18688884 5' - Gypsy6A_LTR 264 1 77.23 CACCTCCAATTCACACAGGTCGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chr2R 9693351 5' + P-element 55 1 24.75 TTTCAATTCACTTCGCCATCTATCATTTCCAATATTGCATTGAACTGAGCCCACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3R 20684934 5' + roo 8682 2 58.51 TGTATCTGCAAAAAGAGCGAGCGAGCGAGAGAGCGAGAAAGAGGGAGCGGGTCTGATAAAGAGTCATGGGATGGAAGGGGGTGGGGACGGTAAATTAATTA:1 + chrX 8058706 5' - Cr1a 3993 1 75.25 ATGTTTATCTTTTAAGTATCAACCTTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 - chr2R 9631745 5' + F-element 61 1 83.84 TGTGCTTACTAAGTGGACACCCACTAGTCCATTGCCGCCCATTGCCCTCCAATGAGGAGAGGGCGCAACTCGTGGCGCTCGCTGGGTCACCTCTCAGCCCG:1 - chr2L 6593639 5' + Rt1a 4644 1 49.50 TCTTCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCCTGGGATTTCGGATCCTAATGGATCTGTTCCTTAATTATAATGTGTACA:1 + chr3L 11837725 5' - G5A 2741 1 57.43 TGTTAAAAATTCAGGGGATACTGTTTTTCGTGGCCTTAAAGTCGTGCCCATATTTGCAAACTACTCGAGGACCGACTTATAGGAGGTGGTTTGATTATTAT:1 - chrX 21183655 5' - Juan 320 1 76.24 CCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAT:1 + chrX 21668009 5' - Tabor 450 2 57.43 ATATGGTCGAGCCATGAAATGCTAATTAGCTAAATTGATTACACAGCGAGAAATGGGGTCGATGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGT:1 + chr3R 22330698 5' - I-element 5344 1 64.36 CTAAGTATTAATTATAATANTTCAAAAATGTATATGAACATAATGATTTTCATAATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAAC:1 + chr3L 13000996 5' - invader3 5439 2 53.47 AGTCGAAGGAATCTAGAAGTGTGTATGTACATATATGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:2 + chr2L 8622766 5' + 297 6618 2 74.26 GCACATGGCGCCCGACCTCAATGAAGTGTTAGAGTACACTTCTACGAATGAGATGATAGCAGACATTATGACAAAGAATCTTTCAAAGGGAAAGCATAATG:1 - chr3R 7379061 5' + 1731 4231 1 75.25 CAATCGTAAACAGTCACGTTGTGTGTTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTT:1 - chr2L 19417129 5' + BS 5045 1 74.26 GGAAATCAGGCTGTTTGCCACGCCCCACGCCGCCACTGCCACCAAAATGCAGGCACTGGCCTTTATCTGTTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 - chr3R 11321108 5' + hobo 4 1 73.27 ATTTATAAACACAGGCTTATTTCACAATAAGCAAACAAATGTTAATTGCAACGTTTTAATTGCTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGC:1 - chr3R 24179728 5' + copia 63 2 53.47 TTATTGGTCGTTCTTTCTGCTGGAGTAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATGGTAC:1 - chrX 5736486 5' - 1360 3155 1 74.26 GCCCACCGATCACCGAGATNACCTGTCTTCATTTTATGGGCCGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr3L 3650043 5' - mdg1 386 2 58.42 AGCCCCGCCCCGGTAAACCATTGAATATTTAACCTGTTACAACGAACGAATCTAGTATATCCTGATTCAAATGCTGCTTCGCTTCTAGAACTGTCTTCCTC:1 + chr3L 5536267 5' + Gypsy12A_LTR 2032 1 71.29 TCTAGCTGAATTGGATGACTCGAGGAAATATATACTCTTATTCCTATCACACTCAAATGTTGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATA:1 + chrX 11323873 5' - 17.6 7338 2 57.43 ACTGTTTTGCCAGCAGAGTTAGTGAGTGAGTTGTCACTCACAATTAACCGAAGAACATCGCTTTCAAAGCAGCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chrX 16671154 5' + P-element 4 2 75.25 AATTATCTATAGCAATGTGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 - chr2R 9631771 5' + F-element 56 1 70.30 ATACTCATATCTAATCGAATTTTAAAAATTTTCAAAAAGAATGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr3R 11052102 5' + blood 7045 2 63.37 TACGGAAACTCACCGTCGAGAAGGTGGCCATGCTGGCCTCGAAAAAGTTTGAAGATGACCTGGTTGCTTGGACGAAAATCTGCACCCGCTCTGGAAAATAA:1 + chrX 10458402 5' + G4 3373 1 58.42 GAGAATGCAAGGATGTAAAAGATATATTTATAGAAATGAGCTATATGTATACATAATGACAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTC:1 - chrX 9503485 5' + hopper 1170 1 70.30 AATTTACGATCTATTCGGTNTTATGACAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 - 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chrX 9775052 5' - 412 7514 2 58.16 TAAAGCGAAATAAGCCACAGAAATGGAAATAAGAAATTTTCGCTTTTCTTCCTTGTTGTATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAGTTG:1 + chr2L 18247966 5' - blood 370 2 69.15 TCTCAACTTTATACATCATTGTAACTCAAAAGATGGCCTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGC:1 - chr3L 15452928 5' - accord 498 2 61.39 TGTGAGTGCATGACCCGATNCGCACACGCACACACACACACATACAAACATGTTTGCATGCGTCAAGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTT:1 - chr3L 13374787 5' + Transpac 4926 2 72.00 CTCTTCTCTGCGCTGCCGTTACTACGCTCTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAAT:1 - chrX 21184015 5' - Juan 4164 1 65.35 AACTATTAATATATTTCCACATATACACTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:2 + chr3R 12944666 5' - roo 9049 2 60.40 CCCTTTTGGATTCGAATGCCAAACTGCAGCCGCATATGAAATGAACACAGACATCCATTTGTGTGTGCTGCAGGGGGTCCCTCGCTGCAGTCTCCCATGAT:1 - chr2R 17982572 5' - gypsy3 345 2 67.33 ATGGTGTAAAAATGGGTCAGATTGTGCTTGAAAAATCTTTATTTATAAATAAAAAACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 7797640 5' + roo 13 2 50.53 GTTCTGCGTAAATGGTCCTAGTCATAGCAGCACAACTCAAACGATGAACACTAATCACGAATATTACCTCCTTATTCTAGTAGACTACTTTTAATTAATTT:1 + chr2L 4804226 5' + Cr1a 3981 1 60.40 ATTGGGGGATCGAGGAGCCGGGCTAACAACGTGTTCCGGTTCAGGAAACATTCAGCTGACATCAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr3R 14193992 5' - pogo 2090 1 66.34 CTATTAATATATTTCCACATATACACTTTAATCAAAATGTTCTATTATTATTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 12944668 5' - roo 9047 1 58.42 TAAATCACACACACACGTTTTGCTAAATATTAATAATAATTAAAAATTCACGCCGTTTTAAAGTTTTTAATATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTA:1 - chr3R 1438138 5' - 1360 2989 1 69.31 GGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chrY 311346 5' + 1360 9 2 61.39 TTTAAAGGCCTAATAAAGCCTTTAAGTGATAAGTATCTTTTTATGCCATACCACATTGAATTAAGCTTATAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 - chr3R 16735128 5' + I-element 1 1 76.84 TTTCGTAAACTACTTGATAAAACCAAACACTCATTATGCCTAAGGTTTAAGATTACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 - chr2R 10353328 5' + blood 22 2 55.45 GGGGCGCCAAAAGTTTTTCCAACGTTTCGTTTGGCTCGGTTTGGTTTGCTTTGGTTTCGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:2 - chr3L 17186890 5' + Tirant 17 2 64.36 CAGCTCGTTCCGTGTTAGAAAACGATTTACCGGTTTTAAGATGGTCTATAATTTTTCAGTAGTTTTGCGCATACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:2 + chr3R 21365472 5' + P-element 5 2 74.26 GCTTCAACCTTCAACCCACTCAGCAGTCAACAAAGTCATTGTAGGTTTTGTGGGCGTCTTGTGGGCGTTGACGTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGG:1 - chr2L 13053586 5' - Gypsy12A_LTR 2253 1 61.39 AGGCTCAAATGCTGGAAAAGCGCTCGATGCCAAAGCAATTGGGTTTATGGTCGTTTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 6034032 5' - roo 392 2 65.35 TCGGAAAATGTTTACATGAGCAGTTGACTCCTGCTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTA:1 + chr3R 23585733 5' + Doc 4563 1 67.33 GGCCATAAAAACCCGAAAATAGCCATAATAATGATAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 - chr3R 12767340 5' - blood 341 2 62.38 CCATAATGAATATGAATAATTATTCACGCTAATATCGTGTTTCGAAGGCTTTTCAATATGCAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAG:1 - chr2L 14220231 5' + springer 18 2 61.39 GGAACAATTATCAGTTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3R 11916575 5' + roo 8721 2 83.17 GTTCGTTTTCTTACGTGCCAGAAAGTTACGAGTAAACTCAGGGCACGTCGCTTGATTACATTAATTATTCCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr3R 17660451 5' + roo 8669 2 73.27 TTTAATGGGCAATTGCCCCNCTATGTCGCTGTTGTTGGTGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGATCC:1 + chr3L 17181461 5' + jockey 4707 1 57.43 ACTGGCAAACCACGAAACCAAAAAACGGAAGGGGATATGCTACATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr2R 19102150 5' + opus 7027 4 61.39 CACCACTGCATAGTGGTGGTGCTGCCAACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCT:1 + chr2R 8579359 5' + X-element 4429 1 63.01 AGCATAAATAAAATAATGTCATCGTCGTTGCCGCCCCCGCCACGCCCATCCTCTCTCTTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGAAACGGGTGTCTGATA:1 - chr3L 21318807 5' + INE-1 546 1 62.38 AGTTAGTTCATAAAATTTATCTAAATAGGGGTTGTCTACTAACTAACTTCGTTTCTAGTCACACGTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3R 24542134 5' + 1360 10 2 41.58 ATACGAAAACACACCTATATCCTATATACAATAATAATCCAGCTGTAGCTGCACTCACAAATCCTTCTCGCTGGCCGTCATTCCAGTGCAAGTTGCCCTTG:1 - chrX 11946210 5' - aurora-element 142 1 55.45 AGTAAATGTCTTATAATTATATATGTATGTACTTTAATCTGTGTGCTCTTACTTTGACCGTAATACTGCAATACTATGTCATATATACATATAAATGTAAA:1 - chr3L 9107481 5' - S2 102 1 72.28 TGCCACACCCTAATAAAAACTTCTGTCTATCGATTTTCAAACACATGTTTTTTGTTTTGGTGGCTTCCGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAA:1 - chrX 14603673 5' + invader2 412 1 66.34 CAAAATCAAATTATTTGGATTGTGTTAATCTCAATATGTAGGCTATAACTTATAAGCTGGTATTCATCAAACTGAGCACAAAAAAAAAAACACAATCAAAT:1 - chrX 11052429 5' + transib2 2643 1 48.51 TATAAACATTGGCTGTTGGAGTCTTATAAAATATATGTGTATGATAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTAT:1 + chr4 74260 5' + 3S18 5797 2 52.48 AATATCAGCCCTTTCCGGGGCTGCTCTGCTCGGAAAAGTGATGTCTTCAGCTAACCCCGAACTCCTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTC:1 - chr2R 19865397 5' - copia 154 2 70.30 GACTCGAGCTGCTGGTCGGTTGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAG:1 + chr2R 6438348 5' - Stalker 7226 4 57.43 CAATTGAAATTGTAAATCTTGTTCTTTAGTTTTTGGATTGGCACTTCCTTTAAATTGCCAGTGAAGGCAATCAACTTGGGTTTAACCAAAGACACTAGAAT:1 - chr3L 16047740 5' + Tc3 236 2 33.66 ATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAA:1 + chr3R 10736054 5' - McClintock 436 2 73.27 TAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCAATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGAAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAA:1 + chr2L 21735024 5' + 17.6 44 1 73.27 TCCGAGGAAAGTTTAATTCCACTTGCGCAAATAATACTTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAAAGA:1 + chr3L 6334244 5' - diver 5982 2 63.27 AAACACTTAGATATACTTCGGATTAGATTTACTGCCCATGTGCACACACACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACA:1 - chr2R 9209508 5' + Tirant 21 2 60.00 CCATTTTGAAAGGATTGCGNTCGAAGCAATATACTAGTCGGCTTATTCAAGTGTACTGGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 + chr2R 10353257 5' - blood 7372 2 45.54 TGGTATCTGTAATATATATATCTCCATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAG:1 + chrX 18192597 5' + BS 4741 1 75.25 GCCTCTTTAAATTCCTTATACATTTATTGGTTGAATAGCTAGCTGGTGCTGTTCTCCCTTAAGTAAGTCACAAAAAACCTCAGTCGCGATCGAACACTCAA:2 + chr2L 3408583 5' + G-element 1 1 76.24 TCGCGAGTGTGGATATCGTATCATGTACAAAAAGCGCACCCGCTTGACCTTAATCAACATAATTAATCATACTTAACCACTACCCAAGTACACTCG:1 - chr2R 15145204 5' + G2 2969 1 58.33 CGCTCTTTCGCCGCCTGTGTTTGTTGCTGTTGCGCTCTCCAGAGTTTTTTGTGTCCGTTTATTCTTTAAAGACTCCTGGCGCGCCGGCGCCCGCGCTTCCT:1 + chr3L 6263109 5' - Osvaldo 1485 1 48.51 GTTTCGTGTTGGACTTTGCAAATTTTACGATATCAATAAAAACGTCGACAATATAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr3R 22238644 5' + hobo 2 1 77.23 AAAACAAGAAGAGTTGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTT:1 - chr2R 17402790 5' - invader4 3064 2 56.84 CATTGAATGACGACAGTGGCATGCAGCACAAGTCACAAGACACAAATGATAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 17701615 5' - roo 398 1 41.58 GAGGGGAAGAGAGTGGGAAGAATACTAAATAAATAAATTAGAGAATCAAACAAATGAGCTAGCGGAAAGAGAGAAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGC:1 - chr3R 15130669 5' + 1360 3331 1 58.42 TACGACTAGTAAATATTTGTGTGGACTGAGAATATAGTTAATTTAAATATTAATTTGGGGGGGTGCTTCTGCCGGTACGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 11982821 5' - accord 188 2 66.34 TTCGATTTGATTTCGTAAAATTTTTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGA:1 + chr4 958817 5' + flea 202 2 76.00 ACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATA:1 - chrX 22386758 5' + hobo 89 1 66.34 TAAATTAAACAATTATTAAGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTC:1 - chr3R 1960332 5' - gypsy9 5239 2 89.11 CAATCAGGGCATCGTCCACACTGCACTTGTAGCCACGCAGACGGGTTAGCAAGGAGACGGGTCGGTTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTCCTCCCCGCGTTA:1 - chr3L 16774780 5' - gypsy4 6558 1 69.31 ATGGCACTCGGCGCTTATCNTCACGATTGTATAGGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr2L 109750 5' - 1360 3351 1 64.36 CTCTCTCTCACTCTCCCACNACTCCCACTACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGG:1 + chr3L 19087141 5' + copia 4845 1 71.29 CGTTATTTAAGTTAAATGCTATGACGGATATTGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2L 13093830 5' + roo 43 2 70.30 GTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTTAGACTTACAATCCGATCT:1 - chr2R 1234690 5' + Q-element 626 1 75.25 AGCAGTGTAGGGAGAATATTTTTGCACGCGACAAACGGCCAACGTGCGGGATTAAGGATCTGGCGCACCGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr3L 13295309 5' + hopper 8 2 69.31 TGGGTTATCGATTACTAATCGGACTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTC:1 - chr2L 18948822 5' - I-element 4916 1 70.00 GATGGACGAGCTGTTAATGGCGCCACCTATGACTGCCAGCACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGA:1 - chrX 2372632 5' + I-element 4937 1 60.40 TGCAGACACACGTCAATGTNGACAGTGCACTATGGGGCATGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATCCATCCAAA:1 + chr2R 7546272 5' - hopper 64 1 64.36 AACTTTTGCCATTTCTTGTTGCATGTGCGTGGGATGGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTAT:1 + chr2L 10625679 5' - roo 370 1 61.39 GGGATTCTGCCATTTTGTTCCTCCTTATTTAAGTATTATTTTTCCCTCTGCTTTTGTGGAGGCATTAAACGTGCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACA:1 - chr3L 3650137 5' + mdg1 7042 2 75.25 TATTTTTACACAAAATATTGCAATTTGCTTTGTGTGTACCCCTACACATACATATGTACATGTGTAGATGTATCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTC:1 - chr3R 10095126 5' + Rt1b 4980 1 70.30 AGGGAGTGAGCTGGGGTGGTTTTGGCCAACAATTTTTCATTTCTCCGGCCAAGACATGTACATGTATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATTTC:1 - chr3L 19330931 5' + 1360 3384 2 69.31 CCCGCCCTGCGCGCCTACGCTCCTCGTTCACGGCTCGCGTTGCCAAACATGTTTGCACCAACACTGAACGCATCTGGATGCTCCACGTTTCATAGG:1 + chrX 885228 5' - 1731 471 1 59.38 CATTTTTTATCGTGCTTTTTTTGTAGATCCTCATTGCTCTTCTTTTTCTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTAC:1 - chr4 91305 5' - F-element 4369 1 58.42 CTTTAAAGGTGGCAATTAGGGAGGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGA:1 - chr2R 7546304 5' + hopper 48 1 73.27 AGCACCGCCAAAGCGATACAAAATAGTTTGCAACTCTCACCCGGTTAGTTATCGATCGCCATCAACACCCGTAGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr2L 8176377 5' + 1360 4 2 75.25 CAAATGCCCCCATATGCAGTTTTGAATATCAAGTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2L 22197219 5' + roo 8703 2 68.75 CGCCAATTTTCGGAACTAAACTTTCCGCTCAATCGAAAAATTTAAAAATATTTAAATAAATGGCAAATGTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCAC:1 - chrX 22789412 5' + Tabor 8 2 69.31 AAAGTATGCTAATAAAAGANATCAAAATATTAAGGAGAATATCCCCAGGAAACAAGGATCTATATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTA:1 - chr3L 4009511 5' + mdg3 5265 1 65.35 TCCATTTGAAATGCGATTGTTACTTACCTAAAAATGACAAAATCAAAACACAAAGTTAGTTTAGGAATATTATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 + chr3L 13772972 5' + pogo 2 1 75.25 AAAGACATCTCATATTATACCAAACTGTTAAGTTATTACACTGGCGACGTAATTCATTTATCATTATATCTCCCGCACGATCCTCACTATTACAACGCATG:1 + chr2R 3288759 5' - mariner2 133 1 56.44 CGCTTCGATGACACACTTTTCGACATATTTAAGTAGGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr3R 24767801 5' - P-element 2850 1 40.00 TAATGTAAACATAAATAATTTTTTTCAATACACTTATTTTATTTCTGTGCATAAGAAAAACATAAAAATATTTTGATAATTGTTGGAATATACTATTCAAC:1 - chr3L 3596775 5' + copia 4869 1 75.25 TTTCAGGCAACTCCTCAGCATAGAAAGAGAAATGCCAAACCTGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr3L 2022236 5' - roo 9040 1 56.44 GGCGTTACTGAATACAGAANACATTTTAAATTTATGTAAATTTTGGTGCAAGTTTATGTTCAATATCTACATAGAACATGTTCAGTGGCGTTTTGGTCGCA:1 - chr2L 14787450 5' - G4 490 1 60.40 ATGAAATAATTTGTGTACCCAAACTGGCAGGCAGCTGGGAAAATGCGAGCAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr2R 7838962 5' + pogo 23 1 56.44 GAATAGTGAAAGACGGAAAGAAGTCGGAAATCGAGTTACTTGTATTATTGGGGGAAGATGAGAATTTCTTAAAGACTTGTGCGTTCCCAGTAACCAGAATC:1 + chr2L 19901687 5' - Rt1b 147 1 68.32 ATACTGTCGTACCAACCATTGCTACCATTTTTGAATAACCTTTAGTTTACCTATTTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACAT:1 + chr2L 14793478 5' + Stalker2 7265 2 61.62 TTGGCCAAAATGCTTGACTCGCAGCTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chr3R 31264192 5' + jockey 61 1 74.26 CATTTATAAACGGTGTCGAAGCGGTTTTAAAAATAGAAGACATTTTCGGTGCAGAAAATGCTAATGTCAAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTAATCAG:1 - chr3L 23006876 5' - INE-1 547 1 65.35 AGAGAGAGAGAGAGAGAGCAAGGCAGAGAGAAGAGTGGGAGAGAGAAGAGTGGGAGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chrX 9023555 5' - P-element 2864 1 43.56 CCACTTGTTTCGGATTAGGTTACGGTGACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 25021663 5' - roo 9054 2 62.38 AAAATCTAATTTATTACAATTTTATGTACTTATTATTAGTTACTATAAATATTGTTATTAATTATAAGTGACCAACATGAATACAAAAATTAATGTCTAAA:1 + chr2R 8524405 5' + Gypsy12A_LTR 1849 1 54.46 GAGCAGTAGACAAATCGAANTTGTAGCTCATTGAGCTTACGTTATAACGTATAACGTATGTTGTATTGGGGTTTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAG:1 - chr2R 3288053 5' - Idefix 39 2 57.43 TAATTGGGGGATCGAGGAGNCGGGCTAACAACGTGTTCCGGTTCAGGAAACATTCAGCTGACATCAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 - chr3R 14193994 5' - pogo 2092 1 67.33 ATACGCACTGCTCTCAATGCCTTGTAGCCGGTTCTTTTTGATTTTGTTAGGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCC:1 - chrX 14357010 5' + accord 325 2 50.50 GAAGTAATTTAAGTCGACCCATGAAAATGTTAGAGATCTAAATTAAATGTGATAAGAAATTAAAGACTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 - chr3L 4565560 5' + copia 11 2 59.41 TCCAAGGACCTTTCTTATGATTGATGTCCTCCGGGCGAAATGCGTGTTGTATGCTTTTAAAATAACTGCCGCGTGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAAT:1 + chr3R 31439778 5' + Cr1a 484 1 56.44 TCTTTAAACAATATTAGTGAATCATACATATATATTTTATACTACTTTTGCTTGTATCCTAATATTCTTCATGTGCATATTTCACAATTATGAAAATGCAG:1 - chr2L 2327078 5' - mdg3 494 1 85.15 TTATTGACGGATCATTTATTCGACTGACAAAGTTAATAACTACGTAAGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAC:1 - chr2R 3146361 5' + Quasimodo 21 2 59.41 AAAACAATACCAAAAGTACACATTGTTAAATTGAAAGGAAACAAATGTAAAATTTATACAGCTGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGA:1 + chr2R 21959578 5' + F-element 4306 1 72.28 AAACGGCCAACGTGCGGGANTAAGGATCTGGCGCACCGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - 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Ivk 5359 1 54.64 AAAGAAAAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chr3R 19449426 5' - hobo 2938 1 74.42 CGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAACTGCGAAGGAAAAATGCTGTCATATCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCT:1 - chr3L 23747151 5' + Transpac 4925 2 50.50 TAGTCTTTTCGTGACTGATAAGGTCTACGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCT:1 + chr3R 24542043 5' + 1360 51 1 73.27 ACGAATTTAACGTATTTTTATTATTCAATATATTTTGTAGCATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTT:2 - chr2R 10372191 5' - mdg3 215 2 56.44 AGACACACGTCAATGTAGACAGTGCACTATGGGGCATGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATAT:1 + chr2R 7546275 5' - hopper 61 1 69.31 TTTTTTTTTCGAAACTGGCTCTGGAGGAGCGGCTTTTGTTATCGAATGCAAAACTATTTAGCCATTGCTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 - chr3L 12438094 5' + I-element 11 1 67.33 AAAATGTGTATGTTTTAGGAAGTTTGGGGGAAGTTTGCGCCGCGTCTTTAAAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTCAAGCTTTTATAGTGCCTGAGATCTC:1 + chr2R 5185200 5' - INE-1 148 1 66.34 ATTGGCTTTGGCAATTTATTAATTAACTATTAATGGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:2 - 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F-element 4342 1 70.30 TAATATAAAAAGTACCAGCCAGTTAACATATAATTGTTCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTA:1 + chr2L 16244003 5' + BS 5073 1 63.37 ACACAAATAACGTTGTGAGACGTGTTTACCGGATGGCAGTTCGTTTAGCTCTAAAGCTACCGTCTCGTCGATCGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chrX 15024468 5' + P-element 2 2 78.00 AATGGAGAATGGGAACTCCCCTGACATGTTGGCCACATGTCAAACGCTTCGATTTTTTTGCCCTCTGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3R 8765517 5' - roo 400 1 70.30 TACACAAAAATGAAATTCAAAAAGAACTGAAGTAAAAACAAAGATTTTAAAGCAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAG:1 - chrX 20766612 5' + invader2 5073 2 62.38 TAATGATCATTAAGGATTTGTGGGGGGATATTCAAAATGAATTGAACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 11016949 5' - roo 9061 1 46.53 ATCAGGGTGGAATAGAAACTTAAAAGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr3R 20420940 5' + blood 7061 2 75.25 TAAATTCAATTTATCCATTTTGCATAACCCAATACGTTTTATTGCCATAGTATAGAAGACTATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATA:1 - chrX 22689621 5' + 1731 4330 2 58.42 ATGATGAGGAGGAACAAACCCAAAGGAAGAACAGAACGAAAAGAGATGCGAGCGCGTGAAAAGGAGACACAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTT:1 - 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chr2L 8577365 5' + roo 8672 2 72.28 TCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chr3R 19449453 5' - hobo 2897 1 64.00 AAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAA:1 + chrX 21668029 5' - Tabor 7270 2 77.00 ACCTTTGGCAGCTGATACGTGGGTTTTGGAAGCGGGGGCATTTTATTTAAATATATACATCTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chr2R 21962721 5' + 297 6591 2 62.38 GAGCATCGACTAACGGGATNAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATA:1 + chr2R 981617 5' + Tc3 237 1 72.28 ACATATGTATGCAAAACGAATATATTACATACATATGTCGCAGATCATTTAAATATAACGACATTTCTAGTAATTGCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCAA:1 + chrX 22560077 5' + invader1 35 2 79.21 ATTTACCTGGCGCCGTCGCGAAATTCAATTACTCGTGCACCATAAACCGATTAACTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 + chr3R 5135444 5' - 297 6956 2 61.39 TTGATGCGGTTCTTGGAGGTGCACTGCAAAAAAGTGGTACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTT:1 - chr3L 11374213 5' - rover 6951 1 62.38 CTGACTGGTCGGGCGATGCAGTGGATAGGCCCTTTGATAGGGATAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGAGGGTTCCACACTGA:1 + chrX 4798360 5' - R1A1-element 5302 1 59.00 AGACAAGAGGGAGGCGCACACGCACGTTAATATATGTATATGCAGTTCGGGAACAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 + chr3R 24976723 5' - opus 7484 2 62.38 TTTCATTTCTGCCTTGCTTTGCTTGACTGGCAAAAACAAAAACAACGAATTATACGGCAAGTGATACAAGGCACGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr3L 19896637 5' + P-element 2 2 77.23 TTTTATTGATATTTAGTAAGGTGAAAGTATTGAAACTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr3R 9278388 5' - roo 9032 1 66.34 GCTTGACTGTTTTATTTTGAATTTAAAAACAATAGAAAAACAATTTTAAAACAAAGTCGAGTTCCCCGACTAACAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGGA:1 + chr3R 23891181 5' - INE-1 538 1 81.00 ATTTACTTGCGTTGAACTGACCGGACGGTTGCCGACATGCATCGGCATCTAGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3R 23811587 5' + roo 8689 2 52.48 AAACATCCTTCTATTCAAGNTGGAATAGTTATATGCTGCATCATCTCGTGTCTGACCAATAGATCCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTA:2 + chr3L 4009401 5' - mdg3 236 2 59.41 CTAGCCATTGACAAAGTTCAATATTTTCTACGCTGCTACCCTCCTTTCAATACTAGTATTTAGTTTAGTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:2 - chrX 1127077 5' + mdg3 5261 1 69.31 ACTTGTTACCATCACTAATATCCAGGTTGTTCTTATGTTTGCGCGACAATTCCGGGGTAAGAGGCTGTCGATCTTCACTAACCTGTGACTGCTCCACTCGA:1 + chr3R 11792174 5' - Gypsy12A_LTR 429 1 72.28 CTCCATAGCCGAGTTGCTAGTTAAATGACAGGAAATTTATTTGGCCAAGACAAACGAGCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chrX 13146899 5' - roo 392 2 62.38 GACCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAAC:1 - chr3R 15790069 5' + flea 4741 1 64.36 GGATAGGATATAACCAACTACCTCTCATGGCTAACATCTGACAAGCTGGCTAAAAACGCAAAAAGAAACAAAAAAGCAAAGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 - chr2R 19557467 5' + Tirant 8156 2 61.39 TTTTTATATTTATACGTTTTATTTTCAAAAACAAATTTTTTTTTATGATTTTTGTGTTTGTTGTATGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 - chr3R 12063835 5' + 412 8 2 70.30 TGTTTTTCAACCACGTCCTCCTTCTCCACGACTACTACCGCCAGTCGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACTACTTTGC:1 + chr3L 23665649 5' + Osvaldo 32 1 55.45 TTTTGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3R 14193915 5' + pogo 48 1 72.28 TTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTT:1 + chr3L 25272564 5' + 1360 79 1 66.34 GCAAAAATAAGGGATGCAACGCAGGGGGTAGGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr2L 20238753 5' + hobo 45 1 66.34 ACACACACGCACGCACAGCGGAGAAAGCTTTCTCCCATGTTAACATGACAGCCTACAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 + chr3L 14594102 5' - hobo 2918 1 56.44 CACTGTTATGTACATATGTGTGAGTATCCTGGTATCTGGCATAGTGCAAAACCAATGTAAGACCGTTACGCATCTTGTTAT:1 + chrX 17955934 5' + 1360 3375 1 56.79 AATTGGAGAAGAAAGGTGAGTCTGTGTGCTGCTAATTGATGGGTTGTAGCATGTGGTTTGGTCACAAGGTGTGGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 + chr2R 21351291 5' - mdg1 411 2 75.25 CCAGGTATGTCGACTCGTGCTGGCTCAATTACTTGGTTTCCAGCCGATCGGTGGAGATTGCAGCCAGAGTTGGCTCTTTTTTCCTGTCAGTCTCTGGAGAA:1 + chr3L 16959881 5' - X-element 438 1 80.20 ACAGCGGAGAAAGCTTTCTNCCATGTTAACATGACAGCCTACAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 + chr3L 14594116 5' - hobo 2904 1 58.42 GGCATTCACAGGTTTTGTCAAAAAATTAAAATGTGGATAACAAATGGATTGGCGGTAATAAATACAAAAAAAAAAATAGAAAAAAACCAAATAAAAATAAA:1 + chrX 14586895 5' + mdg1 356 2 73.27 CAGATTGGACAAAATCAAATGCGTCTTGTAATTTTGCGGTCATAGCGATCAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATA:1 + chrX 8038604 5' + diver 162 2 77.23 TAACCCTCAAGTGGGCGGGCCTCAGTTCGTTACAGAAGTCAAGTGAAATGTAATATTTTCAGAAATAAACGTGGACAAAGCAAAACTAATTGGTGGGCAA:1 + chr4 158055 5' - FB 81 1 79.00 ATATTTTAGGTTTATGGTGGAGGGCTTGCGAACTGATGATCGGGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTC:1 - chr3L 24761281 5' + 1360 40 1 77.23 AATTAATTAAGAGCCATGTTTATCTCTTGTTGATTTTTGGCTTTACACCTGGTCCGTTTTTCGCATGAATTTTATCTATTTTATTTTATTTTATTTTTTAT:1 - chr3R 25933194 5' + transib1 1902 1 76.24 CGTCCAAACACGACTTTTCNGCCGTAGGATACCATTTTGTGCGTTTCGCTTTCCTTTTTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTGAAGCTTTTC:1 - chr3R 23024637 5' - pogo 379 1 57.43 GGCGGATCTGGGGGCTGACGTGTGTGGATTTCCTGGACAGCCAAGGCAACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr2R 15788573 5' + Transpac 4949 2 50.50 CTGGGCATGGACCTGGACCTTCTGCACGCATGTCAACTCGTTGACCGTCACGCATTCAACTTACTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGG:1 - chr3R 26598166 5' - G2 2934 1 67.33 GGTCAGCTGCGTCTGTTGTTTGCTCATCGCCGTCGCGACGGTCTGCTGCTGGCCAAATTAGAGGATTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chr3R 12329696 5' - hopper 1409 2 71.29 TGTGCTCCTCTTCAGAACCAGCTCCTGATTCTGCGGGATGCTGCCAGCTCCGTTTCCCATTCTCCTGCAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTG:1 + chr2L 4128567 5' + I-element 485 1 71.29 CATAACATGAAATTCCATGTGAAATCCCATTGTCAATCAAATGACAATGTTACTAATATTATCTAAAGAACTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTTAAATT:1 + chr4 375051 5' - 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INE-1 57 1 56.44 CATGCGGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chr2L 13566492 5' + hobo 48 1 69.31 CGAAAGTTTTTCCACCTGATGCCAAACAAACAAAAGCATTAATGTAAACTTAAATACCAGTATTTGCATTCGTATCTTGATTATCTTTCCTTTATTTTATC:1 - chr2L 7582142 5' + Circe 6967 1 76.24 AATCTGGAGCTGGGGAACGGGACTGGCGACAACTCCATTAGAATTCAATTTTCGAGGCAGTCGCGTGCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCG:1 - chrX 14651167 5' + P-element 7 2 70.53 TACATACATATCCCTATAAAATACCATTAACCATAACGCAGTAATTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAG:2 - chrX 18326238 5' + Doc 218 1 55.45 ATGTGAAGTTTAGCTTAAANGAGGGATTTATTGCACACCTTGTAATATCTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 + chr2L 9045413 5' - jockey 4966 1 52.48 GAATTACGTGTGGGGGGGTGGTTGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGG:1 - chr3R 16217130 5' - Idefix 7019 2 79.21 CCCAACTAAAGGGCCCAGTAAAACCATATATTTATGTGGCAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2R 18766210 5' - hobo 2911 1 54.74 GAAAAACGAAAATGTATTGGCATTTGAGCGGCGGTCAGGCAGCAGCTGATTAAAGCCATTCTCCACGATTTTCCCTTTTTTTTTTGTTT:1 + chr2R 23314261 5' - Doc2-element 247 1 71.91 CCAGCTGATTTATGGCCACCATTCACATGCACGTCTCCACCCACAGCGACGCACGCAGACCATCAAATACACCCACACACACTCACACACATATACA:1 - chrX 14422302 5' + accord 7032 2 67.01 GGAGGTCGAGGAGTCCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATG:1 + chrX 444583 5' + R2-element 461 1 78.87 CTATATATATCGGTTGCATTTTAAAATTTTTCTCAGTGCTTAAAGAAGCACCAACTAAACGATAAAAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 + chrX 12858870 5' - blood 7359 2 69.15 TCGCGTACGCCCGAAAGTATGCAACATAATTAAAAATCAATGGCATACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3R 11321010 5' - hobo 2911 1 53.47 CAAAGATCATTCCTTTTTGCTCGATTTAACAACAGTTTATAAATGTGCACCTAAAATAAACTAAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATA:1 - chr3L 15831732 5' - invader2 56 2 71.29 TTAAGAGAATGTAGTCAGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 8577267 5' - roo 9045 1 56.44 CCCACACCCATCGCTCATCCGCCCCGAGGTCTAGTCGGCGATTTTAAGCAAGCCATTAGCACCGCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chr2L 4924600 5' - hobo 2927 1 64.36 TGGATGGATCCACGAACTCGAGGAAGCCAAATGCCCGCTGACGTCCGTCTGTCCGTATAAACGTCGATATCTCAGGATCTATAAACGCTAGAAGGTTCAG:1 + chr3R 13655615 5' + INE-1 161 1 58.00 TGGGCACGCTGCGTATACGTAACGTAAATATAGTTTGGATTGCCCTTCATCACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTT:1 + chrX 8507428 5' - baggins 5338 1 58.42 CTTATTTTATTATAGTGTTTGGTAATTCTTAAGAATATTTCTCCACCCTGTGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 - chr3R 4575506 5' + 1360 26 1 50.50 ATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 + chr3L 19349932 5' - 1360 3372 1 58.42 CGATTAATGTATAAATATTTATTAGCCTATTGTATTGGCCCACCATGCAAGCGAGAATATTCCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATT:1 + chrX 2587916 5' - Circe 7039 1 62.38 TTCACCATTTGAACGGTTTTTAATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCA:1 - chr2R 5772510 5' - HMS-Beagle 6997 2 76.24 ACTCATGTTGGCACATATATATCGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAC:1 + chr3R 4971423 5' + F-element 64 1 79.21 TTTAAATCTGATTCAGAGCAATCAGGGATTCTTCGATCAATCTGCCATGCAGAGGGAATGTAAGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTC:1 + chr3R 31262316 5' - jockey 4732 1 68.32 TGCTTTTGCCTACTCATGGTAGCGAGTTTTTGCCTTTTAAAACTTTAAATTTTTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr3R 10782251 5' + Doc 29 1 52.00 TTCCAGTGTCATGATGCGAAATTGACTTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCA:2 - chr3R 22869435 5' + Bari1 48 1 73.27 AGCGGGGATTTCGAAAGGAATTTATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:1 + chr2R 1737783 5' - I-element 5300 1 77.23 CCTCTGTTGTCCTCTGAGTATCGTGGTCGTTTCGTGGTCCAGTGACATGTTTATTGCAGCCCATAATTAGAACATATATAGTTTGCCTACTTATCATGTCT:1 - chr3L 23453325 5' - rooA 18 2 64.36 GCGTCCCAATGTTAGGACATTTATCAAAATGTTGAATACAAATTCATAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGA:1 - chr2L 14793562 5' - Stalker2 7621 2 52.48 AGGGCTTGCGAACTGATGATCGGGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 - chr3L 24761261 5' + 1360 60 1 57.43 GCAAAGCTATTGAAAATCTTATATTGGTAGAAGTTGTTGAACTTTGCTGTGCTTGTTTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr2R 17459136 5' - Transpac 296 2 65.35 TAACAGTCTGTATTTCTCACAGACCAAGCGGCCTTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGC:1 + chr2L 746062 5' + hopper 467 1 70.30 TATGACATAGTGATAATAACTATAGAGCATATCTGCAAACAGGTTTAAACCAAAGACACTAGAATAATATATTGTAATAATAATAATATTCTAGTTTCTTT:1 + chrX 21097427 5' + Tc3 309 1 74.26 AAACTAACGCTGCGAGCTGACTTTCTGAAAGGCTGGGAGAGGGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr3R 7626450 5' + hobo 30 1 55.45 GAAAGACTACACAGAAGGGCCAACTCTTTTTGTTGTCGATGGTGTCGACAACAACAGCAACTACAACCAATATAATAATAATAATAATAAAAAAGAAAAAA:1 - chr3R 12254430 5' + Rt1b 5149 5 77.23 AAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3L 21144039 5' + jockey 30 1 55.00 TATAAACTCGTTGTTGGTAAAGTGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGA:1 + chr3L 12468231 5' + jockey 4726 1 73.27 TACATATTTTGAGATATAACTTTGAAAGTGCAAAAGACCACCAACACTTACATGAAATCTCCAGCTCTTGAAATACGATCGAGCGCTTAAACATAAGCCG:1 + chrX 4854778 5' + Stalker3T 132 1 71.00 AACCCGAGATCTCACTGACGCTTGACAACTCTGGACACTTTATAGATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGT:1 - chr3R 10391246 5' - invader4 3053 2 59.41 TGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACT:2 - chr2L 21403563 5' + G5 4392 1 63.37 TGGTCAAAATCACTTGGCTCTTAACGAATTTCTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTA:1 + chr3R 12321413 5' + jockey 4715 1 67.33 CAGCTGCCCAGCTGGGGAGTTTAGAGGACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr2L 17730433 5' - pogo 2075 1 51.49 TAAGATATATTATAGGTTTAAGAGAATGTAGTCTGTAATGCAAATTTCACGATGTTTTCTGTAAACGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2L 8577250 5' - roo 399 1 67.33 TCCAAAATCAACCAGGCCGAACCAAAAGCAACCCGACTCTTTGAGTGGACATGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGGTGACTTTACTCGTTG:1 + chr2R 6850429 5' - roo 396 1 62.64 AAATGTTCGCAACTAATTAAATTGTGATTATTTGAGGAATTTTGAGTAAATATTATGCTCGCACTGACATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3L 9928509 5' - roo 402 1 69.31 GTGATGTTATTTTGTTATGAAAAGCAATTAAAAAACAACACAAAATTTTATCTATTTAATCGTATTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chr2R 672849 5' + F-element 26 1 60.40 GCAAAGTTAAAACCAGCAAAGTTAAAAAGCAAAGTTTAAAAGTTTAAAAATATAATAAAATAAAGCAAATTAAATTTAATTAATAAAACAATTAATTTTAT:1 - chr2R 25286860 5' + TAHRE 61 1 66.34 GTAAGGATTAGCAATGAATATCGAAATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 - chr2L 9260383 5' - 297 349 2 75.25 AAAACGGCAAGGGGCAGTCACACGCCAAGACCGAAAAAAAAATATTTTTTAAAGTTCTGTGAACTTTAGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGC:1 - chr2R 1277263 5' + Rt1a 4965 1 72.04 ATGCGTGATATGAAGAAATGGTTAGCTAACTCGGAAAATAGCTGGGAGTTCAGAACGAATGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 + chr3L 7168301 5' + Doc 19 1 62.38 TTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTTTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCT:1 + chr3L 20431712 5' - 1360 140 1 72.28 TCTCGCTTTCCTTGCTTAGCAAACGAAAGACTTTATTTACTTGGACAGATTAAATTGAACGGTTAATATACGTGACATTCGCATTGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr2R 20906437 5' + jockey 11 1 62.38 CGCAGATGTCACTAAAATGACCGCAAATGCCCCCATATGCAGTTTTGAATATCAAGTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:2 + chr2L 22197196 5' + roo 21 2 56.44 GCTGAATGCTTTAATGATTTTGTATTTATTCAACGCGTCACTGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:2 + chr3L 1586720 5' + Tirant 32 2 58.42 AGATAACGGGCCATAACATGGTAGAAAGTTAAACGAAGATAAGAGCCAGAAGAAAGGAAGGAAGGAAGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCGA:1 + chr3R 11270804 5' + Quasimodo 329 2 71.29 ACTGTCGCACTCGGCATATCAATTTTCCCGCTCATCCACCTCTCCCCTCAGGACATTTCAAGGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:2 - chr2R 19061309 5' + roo 8677 2 66.34 AAGACTTCTGTAGAATCTTCAGCAGAATTGTTTCAAAACAGAGTTATATAAGAAGACTTTGTACTTCAGTCTTAGGGGAGAGCGAACGTTTATAGGCCAGT:1 - chr2R 21161452 5' - Doc3-element 4244 1 71.29 TCCTCAAAATGTTACGTAGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1 + chr3L 20520707 5' + P-element 79 1 22.00 TTTGTCAGCTTGCAGAATCGGATGTCAAGAGTGTTCGACTGAGTGAAGCTCTTGGCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 12241804 5' - roo 9051 2 59.41 AAAACGAAAGAAATGCAGCTAATTTCTTTATGCCGTTAACAAAAGCTTTCATGAATTTAATTTGAAACAAACCCTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTT:1 - chr2L 17189778 5' + accord2 123 2 78.22 CCCCAAAATCTTCGAGTGGGTCTTGTGGCCAGCTCCACGGTACATTTGTATACATCATAATTAAGGAACAGTATCCATAATATTATCTTTTAAGCTACACA:1 - chr2L 14260455 5' + G5A 2771 1 68.32 AATATAAAGAAAATGTTGCATAAACCCCTAAACAAAAACTTTGCCCAAAACTTTTGGCAGCGCCCAAAAACTCTATCTATCGATATCCCAGAAAAATATTG:1 + chr3R 11397506 5' + INE-1 505 1 69.31 TAATGCATTTGCTGAAAACAATCTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chrX 15800944 5' + roo 8715 2 79.21 CCAATCGACACCCGATCCCCTGGGTGGCCTTCTCCTTGAAGTTCTCCTTCGTTTTCATTAACAAAATCGATTTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:2 + chr2R 19061191 5' - roo 407 1 77.23 AAGGACCTCGGCGGGGGGTGTTAATGTTTACATTAGGGAAGGCTGGGTTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACA:1 + chr2L 20705854 5' - Quasimodo 109 2 77.00 TGAAAATAAATATTTTCCGNTTTCAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 - chr3R 9224390 5' - pogo 2052 1 79.21 TTGCACGCATTAATTGCGATCGTTTAAAAACCAAGTTCAATTACCATTAATCCTTTTGAAGAATACTATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 + chrX 2530434 5' - pogo 2099 1 75.25 CGGATCAGCTTTTCCCGAGATTCGTTTAGTCCTGATATACGTTTTTTTCGATTGTTATATGTTTTTTTGTTTGTCCAAAACGGTCACGCCCACACTTTTGA:1 + chr3L 25968127 5' + INE-1 248 1 59.41 TTACTGCTTCTTAAATATGCAGCCTTTTTTTTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAA:1 + chr2L 15220213 5' + invader4 39 2 69.00 AACGGCCGCTTTGCCTGCTGAATATGTCATCACATGGCGATGAATCCATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAAC:1 + chr2R 6800770 5' - BS 5025 1 64.36 TATACTGGCAATTACACAATACAAATTCTAGGGTGAAAGTTGCTTAATTATATTATTTATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 - chrX 4399600 5' + I-element 19 1 62.38 TTTGCCCCAAAAAGTATGCTATTAAATTTTAAACTCGGGCGTAAAAAATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2R 12812261 5' + jockey 35 1 50.50 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATT:1 + chr2R 11367657 5' + Tc3 473 1 68.00 AACCAAACCAAGCCGAACCGAATGCGAAACAAGAACATGTCAAGAAGTCCCGGACAAACTTGAAAAAAATCCAGGAGATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGT:1 + chrX 1626621 5' - GATE 270 1 60.40 AAGCCAACGATAACGACAGTAACAGTGGGCTAAAACTGGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATA:1 + chrX 21229282 5' + transib2 35 1 60.40 TGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr3R 21575930 5' + Doc 50 1 42.86 CCCAATGTTAGGACATTTATCAAAATGTTGAATACAAATTCATAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGT:1 - chr2L 14793558 5' - Stalker2 369 2 56.44 ATAACTAGCTGTGGTTTCATTGGACGATACCGATGGCCACTGCCTATGGGCTTAATTGTGGCCTTAAAATCAAATTAAATAAAATCATATTAAG:1 - chr3L 20387108 5' - transib1 1891 1 91.49 ACCCTCGTAAGCCTACATCGCAAAATGTTGCATGTTTTAGCCCTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr3L 14623925 5' - hobo 2917 1 51.65 TCAAGAGGAAAGAAAAGCGTCGTGTTTGAAAATCTTAGACTACATATGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTA:1 + chr3R 7783732 5' + rover 24 2 56.00 CGGTTAAGCCTTTAAGGGATTTAGTCTCCAGATAGCAGAATCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTAT:1 - chr2R 23336296 5' + BS 5010 1 59.41 AGTGAATTCATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCCAAGTCTATTATATCAACTCACAGTTTAAATGGGCTGCTCGTTTCACGTTTATGGA:1 - chr3R 18337497 3' + Stalker3T 280 1 61.86 ATTTCCCCGACTATCAGATACCTATTACTGAACTACTGGGAGTGCCATAAAATGCACAGCTTTTGGCCGAGAACATTTTGATCCAACAGAATGCGGAAAAT:1 + chrX 13844118 3' - INE-1 557 1 62.38 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGA:1 - chr3R 10110441 3' - Doc 50 1 72.73 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAGAGCGTAGTAACGGCAGCGCAGAGAAGAGAGT:1 + chrX 21184018 3' + Juan 4167 1 62.38 TAAGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACT:1 + chr2L 21400762 3' + Doc3-element 4667 1 69.31 ATAATAATAATAATAATAATAATGTAATAAATAAAATGAAATTTATTAGTTTCAAAACAAAAATATGTATAATTCGTAGATTTGTAGAGATAATTATAATT:1 - chr3L 13953527 3' + mdg1 29 8 78.22 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATGGCCAAAGTTGGT:1 + chr3R 12767349 3' + blood 7362 2 53.47 TACAGCAAATTTGCATACTNGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCA:1 - chr3R 9088576 3' + hopper2 1561 1 68.32 ATAATAAACAATCTTACATGTATGTATAGGAGTGTGTATATAGCGAAAAGTGCGGGCGAAGGCAATGGCCATTCGCTGGATTCGAAGGGTTTCCAGAGCGG:1 + chr2L 14035630 3' + flea 258 1 79.21 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTGGAAGAGCAAAAAACTGTTTTTACTATATTT:1 + chrX 6457944 3' + hobo 2897 1 65.98 CAGATATCTTGCCGATGCANCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTTGCTCT:1 + chrX 21217574 3' - pogo 32 1 59.00 ATTGACAAATTATTTAAATGTTTGCTTGAAGAACTGAATGTAATTTGTTAATTAGCATAAACAAACTGAAATACAATTTAGAGACTATGGTTAAAGCTAAG:1 - chr3L 10582875 3' - Tc1-2 1420 1 75.25 AAAGCTCACACAATTGGAANGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGGCCACAAA:1 + chr3L 5241167 3' - Ivk 40 1 66.34 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAATGTTCACTTCATGCCCACTTTTCGATAATTTACCATCAATATGAGTCTCATTATGGTTA:1 + chr2L 20620087 3' - roo 14 2 66.34 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGAGTGTAAGATGAGTTAATTGTCTTCTTGGAAATTGAT:1 + chr2R 20312647 3' + 1360 3351 1 64.36 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACGAATATATTTGCTTTGTCTCGGTTCTTTGCATACTGCCATCTCGCTTCGACTCTGGC:1 - chr2R 17392596 3' + opus 7487 2 65.35 TTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATTTCTTTTCTACTATCAGAGCTATCTTTAAGATTTTTAACTACC:1 - chr2R 14997846 3' + McClintock 450 2 57.43 CCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAACAAAAATTTATTATCAATTCCAAATG:1 + chr2R 3550647 3' + Cr1a 4398 1 67.33 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAAT:1 - chr3L 3540141 3' + mdg3 5460 2 61.39 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTACGTAACATTTTGAGGAATTCACAAAATGCGGCTAAAAACGCAACAATTACCTCACAAATA:1 - chr3L 20520663 3' + P-element 2873 1 65.35 TTATGGTCTAAAAAAATATTTTTTAAATGTAGTAAGAACATGTTTATAATTTGGCGTAATATACCTCCCCCAACTGGCTTCTAGGGCAGACTGTATCAAAC:1 - chr2R 1750568 3' - Transib5 2735 1 71.29 CAACAAAGTGCTGCCATAANTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGTTAGTTTTGTTTGATAAATATGCA:1 + chr3L 872759 3' - 412 52 2 73.27 CACACACACACACACACTTTCACTGCGGCAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGGAAAAGTAAATATCAGGTTAATGGATTTGACGCCGCAGTTTG:1 + chr3R 30665392 3' + accord 7032 2 83.84 CGGCCACGCAAATATGCTGTGTTTGCGCTCGGTCTGTTTTTTTCCTCATTTTTATTGCTCAGTTTTTTGGCACTTTATGCAAGTTTAACGTATTGAATGTA:1 + chr2L 17809112 3' - Gypsy6A_LTR 104 1 79.21 CGTAGCTTGAAAGAAACACNTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGTCAACTGAGTGACATTCTTCATTTTGAAATTTATGGTGCGTTATTCCGCA:1 - chr2L 16153352 3' - Doc 32 1 52.48 GTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGTTTTTTAATTGCTTTTCATAACAAA:1 + chr2R 672839 3' - F-element 36 1 51.49 ACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAGTAATGGATAAGCCGCATTCGAAGCAATTAATTATCAGTGTTTTTGCTTTCTTTGAGCAAAACCAGTTT:1 + chr3L 3242759 3' - diver 8 2 57.43 GAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTATTGCCATTAGGAGGAACCCCTTCAATTGACCTAAGCGGGTA:1 - chr2R 18188279 3' - Juan 4025 1 78.22 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTGTAATTAGTGTTCGAAATGTAGGCACTAATAGATGATTTGT:1 - chr3R 5993111 3' - pogo 30 1 59.41 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATTTATTGTACTACGTGAATGTCAAGTGTGGATTCA:1 - chr2L 20684281 3' - I-element 40 1 69.31 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTGTGTCCGGCT:1 - chr3L 13295221 3' - hopper 36 1 61.00 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATAATAATCATTTTATGTGCATGTTGTGTGGCATACTTTTGTGCGCATAAATT:2 + chr3R 20332934 3' + jockey 4969 1 54.46 TCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACCTAAATCAGGAGGAAACTTTTAAGTTAAAAGGCTTGTTAAATAAATTTAGAAATCTTGA:1 + chr3R 21207425 3' + 297 6624 2 61.62 TATAATCCATTTGTTGAATTATTTTTTCACGCTCTCTTGTGGCGTTATTAATAACATGGTTTACTATACATTCATTTACTATATTCATTAAGCGTTTCAAA:1 + chr2R 1074927 3' + Tc1 1380 1 79.21 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCTC:1 + chr2L 20045820 3' + roo 9055 2 62.38 GCAATATACAAGGCGATAATAAAACTATAATAATAATTCAACACACGCCACAAAAAACAACAACATCGACATCAGTGATACTAGAAACAATTCAATGAAA:1 + chr3R 30547256 3' + Porto1 4239 1 72.00 AATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAGCTGTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCACGAATTTCTGTCAAAACTTGCATT:1 + chr3L 168224 3' - 1360 3090 1 79.21 CAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCTCGTCC:1 + chr2L 20045824 3' + roo 396 2 66.34 CACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCTCGGCGGCACTCTTATGCAAACACACACCTACAGGAAAACCATAATTATACACTCTGCCCGTGGTTCAAGTCC:1 - chr2L 11675512 3' - frogger 30 2 70.30 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATACGTTCTTTAACCCGAACCACCCAACACACTCTAGAAAGCACTCCTTCATCATCTCCCC:1 - chr2L 9260307 3' - 297 13 2 65.35 AAAGTTGGTTTCCTAAAAACAATACATTCTCTTAAATCTTGAGTAAAATACAATGTCATTTCTTGCACACTATTTGAAGGGTAACAACTAAGTTTGTATTT:1 - chr3R 15879580 3' + Tc1 39 1 75.25 ACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACTACGTTCGGCAGAAACAGTTATTTGCCA:1 + chr2L 22497817 3' - Stalker4 7007 4 74.26 AAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATGAATTTGTATTCAACATTTTG:1 + chr2L 14793538 3' + Stalker2 349 2 76.24 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTTATGGCAGGCATTC:1 - chr2R 9870958 3' + roo 401 1 71.29 CCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATG:1 - chrX 3431880 3' - Ivk 5334 1 45.00 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGAATAGAGTTTCTGGCTTTGTCGCGTATATTCGTGAATTTATGGCTCCCTCGTCTTAAT:2 + chr3R 13353282 3' - 1360 20 1 57.43 AACAATTATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAAACGAGGAGCAACTGAAGATGCAAAAGTCGCTAGATACCATCAAACGGCGC:1 + chr3L 13970047 3' - 1360 442 1 63.37 TTTTTTTATTTTTTTTTTTATTTCGTGTCCCAACCAATTTACCCCACGTCTTGTTTTCGCATAACTTTTTTTTTCTTGCTCTATGGGACCTGAAGTGGCGG:1 - chrX 10345503 3' - Rt1a 5078 4 71.29 TATGGATGATATAATAATTTTTTCAAATACAAATGAACAACATTATACCATCATTAAAATAATTAATATTTTCCAAACTTTTGTTTGCCATTCAACTTGCT:1 + chr2L 10936521 3' + TLD2_LTR 45 1 71.29 TTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTACACAGAAGGGCTACCAATTCACGAAGATCAACAATTTTACCAAG:1 - chr3L 8757073 3' + 1360 3120 1 57.43 AGTTTTTATATATATTATTCAACTTTGTAAAGAGGAACTTTTAGTTTATATAAAAATGTTCATTAGCACAGAGTTTTCTAAATGTTTTTTCAATTATCACC:2 - chr3L 9920611 3' + copia 4662 1 74.26 CGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTAATTTTATTTTTCAACAGCAATTTTAGCCCTAGATGTGTGCAATGC:1 + chr3L 20759013 3' - flea 26 2 59.00 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAATCGATTTTGTTAATGAAA:1 - chr2R 19061243 3' + roo 9018 2 80.20 CTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATGTGTGGCGCACGTTCGGCCGCGATTAAGAAATCTTCGCGAGAAGAAAAGGCCAACCGACTCCG:1 + chr2L 10199071 3' + I-element 5345 1 65.00 ATGTCTCTTGCCGACGGGANCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCAGAGAGAGCGGGTGGTTGGGTTGCCGTTGG:1 - chr3L 16891083 3' + P-element 2866 1 56.44 GAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACTAACAAAAGTTGAGGGTGAAGCTTTCAGCAAAACACACGCAAAAAACCAGCAAAAGAAAACAA:1 + chr3L 15286987 3' + I-element 365 1 57.43 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATGAATTATTCAAAATGATCATAATAAATTGCTGCAGCCTTTTACGGCAGCTTAATTAAATTGCAATTTT:1 + chr2R 19198147 3' - 412 7101 2 56.44 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCCAGTTTTAGCCCACTGTTACTGTCGTTATC:2 - chrX 21229290 3' - transib2 43 1 68.32 AAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATATATATATAAGCACGCATTTGCCTAAGTCAAATAAATGGCCGTCGTTCTTTTATACCGTTCAGC:1 + chr2R 21433234 3' + HMS-Beagle2 7184 2 68.32 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGATGTACCTCAAGCACGTCGGTCGATCAATATTT:1 - chr3R 7626395 3' + hobo 2920 1 54.67 AGCTTTATTCTTAATGTATACGCACAAAAACCAGCAGTGCCGCCAACAACAAAAACGCCCGACGAGTGCGCCAAAGGTAGGCAAATATGCTAAAACAAAAA:1 - chr2R 8181259 3' - accord 351 2 79.21 TTGTTAAAAAAAAAAACATCCTATACATGTGAAAATCTTTCTATTGCCTTTGTTGAATTGAGTTACATGTGGATTATACCCCATATGATCTATGAGTACCC:2 + chr3R 23612381 3' + Circe 472 1 82.18 ATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACCTAAATCAGGAGGAAACTTTTAAGTTAAAAGGCTTGTTAAATGAGTTTTGACAGC:1 + chrX 15703984 3' + 297 37 2 45.54 TTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATATATCTCGGTCAGGTGTGGCACAGCCATCGATTCTAATCGAATTTCGGCGTCTCAT:1 + chrX 12992818 3' + I-element 5336 1 56.57 GAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTATTGCCATTAGGAGGAACCCCTTCAATTGACCTAAGTG:1 - chr2R 18188283 3' - Juan 4029 1 72.28 TAAAAATAATTGGTAAAACGAAAAAAAAAAACAAAATGGCAC:1 + chr3L 2148366 3' - Tc1 1484 1 78.57 CAGCGGGAAGCTGACACTTCTTATTCGTAGTGTTTCGATTAGTTTCGATTACTTTCAACTCCTAAGTCATAGTTTTGAAGTGCAATGAGCCACTGCACAAT:1 - chrX 3428634 3' + gypsy 7093 2 63.37 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTGAATTTAGGGCGTTTCCTGAGCTCATTAAA:1 - chr3L 7300506 3' - Doc 51 1 73.27 AAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTATGTTCATATATCGAACTATTTGTTTTCGATTTGTTGCATTGTGCCT:1 - chrX 1135463 3' + P-element 156 1 47.00 TGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTAGACCTCTCACATGTGGGCTACCGCGAAGACT:1 + chr3L 4183213 3' + jockey 4720 1 68.32 TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAATAA:2 + chrX 15546219 3' - blood 7041 2 53.47 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAGATTGTCTTGGAAACAAAGTTCAATTC:1 - chrX 11017005 3' + roo 9023 2 73.27 TTTGTGTATGGCTGTTGCTATGTGGTAATGTATGTGTGTGTGTGTGTGCCAGTCCTGGCTGTGCTTTACCAAGGTCATGAGTAAATACGTTTGGAGCATGC:1 - chr3L 13894055 3' - Quasimodo 64 2 66.34 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGNCCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTAACATCACCCGACGACAGAACAAGACGCATTTGATTTTGTCCAATCTG:1 - chrX 8038604 3' - 297 6598 2 63.37 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAACGACCCTCTTCCACACGCCATTGCCTGGTTCGACGCGAGTGCAAAAACGAATTTTACTCAGCGAAGCTACACAGA:1 + chr3L 153679 3' + 1360 3387 2 77.23 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTCATTTAAATTCCTTGCCTTCTCGTTGT:1 + chr3R 14580348 3' + blood 7340 1 72.28 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGTGATTTTGACCAAGGAGGGATGGCAATTTATCAC:1 - chr3R 12321391 3' - jockey 4693 1 53.47 TAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTAGTTTATATATATTTTTATACGTTGACAGCCGCGCCGGAATTTGGATTATCAGCTGCTGATTG:1 + chr3L 20220547 3' - I-element 5313 1 63.37 ATTGATATCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCTTTAGTCAACTGCCTTGAATTTTAAAACCATCTCTATATAAAAGTTG:1 - chr3L 21536673 3' + 1360 3185 1 52.53 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTACAAGCACATAAACACAAATACATACTAATATGTGTG:1 + chr3L 14594171 3' - hobo 40 1 68.32 AATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTATTAGGTCCCCCTTTTTATACATATAATCGTATTGTATATTGGTATGTTTTCATTTGTG:1 + chr3L 10677787 3' - mdg3 215 2 61.39 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCACCCTTAAAACAAGTAAAATGTAATCGAACAAAACCCTATTTACTTTAACTTTATGACACAA:1 + chr3R 11916635 3' + roo 393 1 63.37 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAG:1 - chr3R 4971418 3' - F-element 59 1 74.26 AACATTGAAATTTAAAACTNACATTGTTATTGATTTATTCTTTTCAGGTACCCCCGTCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCAGTGAGTCTGTAATTAATG:1 + chr3L 14640309 3' - TAHRE 10149 1 78.22 TAAGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTCAACAAACAATTTACAGCTGTTTACGCCTGTTGGACGCCCGCAACTAGGAGTTGGCAGGATATCACCATTC:1 - chrX 7082651 3' - gypsy3 426 1 65.35 GTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCAC:1 - chr3R 19589944 3' - BS 5041 1 69.00 TTTACTTTTATACTTAATAATTTGTAACCCTTAAATTTATATGGTAACTTTGGAACTATTTGCCTGTAATACTTGCAAATAAATACTTCTTGGAAC:1 + chr3L 19014107 3' + G5 4724 1 50.00 GTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTT:1 + chrX 18326220 3' - Doc 236 1 73.27 GTCGGGGAACTCGACTATAGCATTTTCTCTTGTTTTTTCGTATGTTTAAATACCTTAACACTCTCTTAAGACATTCCCGGCTTTGTTTTTCCGAACAGTTT:1 - chrX 274526 3' + INE-1 568 1 55.45 ATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTATTTCAGCTTAACTCTAGATGACCTTTTG:1 - chr3L 15125878 3' - Juan 3763 1 63.37 ACCTACACACACACAAACACACGGGCGCACACACAGCAAACAACTTTCGTTAAACACTATAAGATATCCCTTATTAAGATCGTAAGCGAAAAAATTGGTTT:1 - chr2R 17171102 3' + accord 7100 2 53.47 GAAATATTAACAAGGCAATGATTGTTGAGTGTTTGCAGCCAGATGTTCCTTACTTACAGTCGTAATTTCCGGACATGAATAACTTTTAGAAACAAATCCAT:1 - chr2R 6645540 3' + 1360 438 1 66.34 AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAGTCTAGAAATTGATTAGCACTAGATTAGCACTAGAAATTGAGATGGAACTGG:1 - chr3L 17140599 3' - F-element 20 1 47.67 CATACTTGTGAAAAACACANTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAAGTATCATCT:1 + chr3R 12876373 3' + hopper 1381 1 60.40 GCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTACGGATGTGGAGCTC:1 + chr3L 9473403 3' - F-element 4489 1 67.44 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCT:1 + chr2R 15788626 3' + Transpac 259 2 71.29 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGCGTTGCCTC:2 - chr2R 19560150 3' - Tirant 27 2 54.46 GTTAGGAGTCTTAAAACTCCCCACAAGTCCGGGCGCAGGAGAGCGGCCTAGCAACAGAGAAGAAGACTACCATGCGAGAGGAGTCAAGGGCGGCCAGGTCG:1 + chr2R 4997272 3' + gypsy8 4651 1 66.34 TTAAAAATTAAAAAACAAATTCCTGCTTCTGGTCTTCTTACCATGTGGTAAGATTAATTTAACCAATAATTTAACCAGTAATTTAACCAATTTTGGGTAAT:1 + chr2L 13626422 3' + S-element 133 2 48.51 TTGGGCGCCAATTAGTAAAAGCCGCGCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTCATAATTGGCGCCCAACGTGGGATGACAACATTTGCATTTGACATTGTT:1 + chr2R 6009606 3' - gypsy2 341 1 72.28 TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAACTAAACTAAATACTAGTATTGAAAGGAGGGTAGCAGCGTAGAAAATATTGAACTTTGT:1 + chrX 1127067 3' - mdg3 19 2 61.39 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCTTTATCGCCTC:1 + chr2R 22856602 3' + 1360 3366 1 56.44 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGGAAATGTGGTGAGGGGCGGGGCCAGTTTGCATCGCCATCACCTGCTCTTCATCAGTGTCACA:1 - chr2L 20238682 3' + hobo 2928 1 68.37 CACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGCATAGTTCTGTTACTTTTGATACTTTTGATAAGGCTGCCGGTGCAGGCACTTTGG:1 + chr2L 21215348 3' - BS 4994 1 54.46 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGTGCCGG:1 + chr2L 18213241 3' - hopper 14 1 65.35 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCT:1 + chr3L 18418883 3' - hobo 52 1 75.76 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGT:1 - chr3R 21365493 3' - P-element 26 1 53.47 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCC:1 - chr2L 16139128 3' + copia 5076 2 72.28 ATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGTTTGCCACAGGACTCGTTCTGTGC:1 + chr3R 13739765 3' + Burdock 6382 2 70.30 TTCCAAATAAAATTAGTTTNTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTACTTTTTAGAAGCCGGCTGCTAGACTACTTA:1 - chr2L 2833871 3' + roo 9028 2 68.32 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTAGCTTT:1 - chr2L 7487739 3' + copia 5086 2 64.65 ATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATTAAGCGATTTCTATACATCGCCAGTATCTAGGGGTTTTCATCTGAGG:1 - chr2R 16185027 3' + 17.6 467 2 55.45 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCATATCGCATTTTATCAAACATAAACACACACTCACA:1 - chr3R 29287505 3' - hobo 38 1 65.35 GCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAAGCGCTCGACAAATTGGAACTGGCACGAGGGCTACTGTCCACGCTGG:1 - chr3R 11662125 3' - FB 29 1 55.45 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACACATAGAGAGCATAATAGCCGGGATGCCCGACTTTCCCCCGCCGCTTTTCCTGCCATTTTCCCTGGATTTTTC:1 - chr3L 2176281 3' - roo 8666 2 75.25 CTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTTTTTGAGTCCGGCATGTGCGAAGAGCATTAAGCATGGCTAAAAAGGAGGATGCTGCGG:1 + chr3R 19346696 3' - mdg1 376 2 65.35 CGTGAGGGTAGATACACTACAGTAAGCCAAAGCCCAAACATAGACATAATTATTTCAGTCGCTCGGCGAGCCATACTACCCAAAATAAATTCCTCGAATGC:1 + chr2R 19091704 3' - Stalker2 7248 1 75.25 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCGCGTAACAA:1 + chrX 9413867 3' + 412 7511 2 58.42 ATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGTCGTTGAAAAAGTCCGCGAAAA:1 - chr2R 12457939 3' - HMS-Beagle 6796 1 55.77 ACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGCTGTTTGTTGTAGCCAGTGCCCCCTGTTAATGTCGCCGGCATTCGAGCCAAGCCCGGTT:1 + chr2L 8614791 3' - 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chrX 17166629 3' + Dm88 4373 2 73.27 AGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATTACGTAATATATCTAGTCAATGACTAGATCTCAATATACTAGTTCTCAATATTAATATTGT:1 + chr2L 15863377 3' - Stalker4 6956 2 77.23 GTATGTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCGCAACGCCCCTTCGTGCGTACACGTGGCGAATACGCTATATCATTTGCATAGACCTACGCAAACTG:1 + chr3R 4509804 3' + INE-1 28 1 75.53 AAATATATGTGGAATCAAATGGTATTAATGTTTTTTTGCGAAACATTTTATGTTGTTTCTACACATCCAAATGTTTTTGTTTAGCTTAGTTATATTCCATA:1 + chr2L 8073744 3' + transib4 469 1 64.36 TTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAATGCTGAAGTTATTTCCCAGGATTGTGAAATTGAAATTTGCTGACTGGTGCAGTTTG:1 - chr3R 4063918 3' - G4 91 1 61.39 GACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGTCTAGTCCACCAATCAAGTCCAAGCCGGCTGCCGAGTAGCTGATCCCAGGCCACCCCAGCGATG:1 - chr3R 31989961 3' - invader4 2742 1 59.41 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGTGCTGAAAATTACTTTCGACTTTGTCGGCCAAACGCGATTTATTTTGATTAATTCGCCGCTCCTTTTCCG:1 - chr2R 8526309 3' - I-element 8 1 74.26 CCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACACAGCCACCACGCATCGCCTTCTTTACATTGTTCTCGAACTGACGGCGGTTGGTCT:1 + chr3L 8196813 3' + Quasimodo 265 2 59.18 GTTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGCTCATGCAACAATGGAGGAGGCGATGGGGCCGAAGGGGGCGTGGCAAAGAGGGCTAAACGACAAAAGCTGA:1 - chr3L 15865257 3' + Stalker 443 1 79.38 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTGTTTGGTCAAATGCAGAACGGCACAGTTATTCGAGAACTGAA:1 + chr3L 2022336 3' - roo 8666 2 76.24 ATCAATACTAATGCACACCGCATTTTTCTGTACGCTTCCGTTATTCCTGCAGACATCTACTTCCCCCCGCTCTTTTAAAGATCAAAAGAAAAGCATGCAAA:1 + chr3L 4179728 3' - invader1 3798 2 71.29 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGATTGTATAGTTTGTGCCATCAAACATAAGATTGCTTTGCTATTGTAAAGAGGTCCTTAGTCCTTAAACAAGGT:1 + chr3R 27907720 3' - mdg3 5257 1 75.25 TATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGCCCATTTCCATTTTGCCCCAAACTTGCTTAATTGGTTCTGCTTTCGATACAGGCAGCACACGA:1 - chr3R 13331394 3' + transib2 2812 1 67.33 ATTCATTTACATAAGATATNAACGGAGCACAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATG:1 + chr3L 9928583 3' - roo 8716 2 80.20 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATTTCTCTTTATCTTTTCTCACTTTTTTCGTTGTCCCTCATC:1 - chr2L 13093743 3' + roo 406 1 76.24 ATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTCAATACAACGTTCTGTTTAGAAGGGGACCCCTACATTATGTGGGCTCTTCTGTGTTGCCTTTTA:1 - chr2L 20567690 3' - 297 6501 1 71.29 ACTCAAAACAACCGATTTTNTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTG:1 + chr2R 13653401 3' - F-element 55 1 63.37 GACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCC:1 + chr3L 25350820 3' + baggins 5413 1 42.57 ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGAATAGAGTTTCTGGCTTTGTCGCGTATATTCGTGAATTTATGGC:1 + chr3R 13353268 3' - 1360 34 1 58.42 GACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGGCCACAAAAATAAACAACTACGCTCACA:1 + chr3L 5241187 3' - Ivk 20 1 59.41 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTAAACTTCACATTAAAACCTT:1 - chr2L 9045404 3' + jockey 4975 1 57.43 GGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACTTTTGTCTATAGCCAACGATGAGAGCCAGCGGGGCATAGAATAAATGTTCAATTCAGTGCTGCCCTCTTTGTCTGT:1 + chr3L 14287815 3' - invader4 2764 2 58.42 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTACCTGCTTTTCCTGCTTTGAC:1 - chr3L 6023280 3' + hopper 1409 2 64.47 CGTTGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGGATTTTGATTAACACACTTTGAATTAGCACAGAATAGATAAGG:1 - chr3R 6478660 3' - mdg3 400 1 57.43 TTAAAATAAATCAAATAAAATACTTAAAAATTAAATGTATTAAAATTGCGTGCAAAAACTTCTAAAACAAGAGTACAACCAAATACATTAACTAGTTTGCA:1 - chrX 20540457 3' + G7 1146 1 90.10 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATTTTTGAGCCTTTGAGCAATTGTTCGTTCGTTACGAGCGTTTTTTTGTGGCATAAAAATGTTTT:1 - chr3L 5710219 3' + Transpac 5221 2 71.00 TAAAATACTTCAAATTTGCATACTTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCG:1 + chr2L 12882785 3' + hopper 1363 1 73.27 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCC:1 + chr3R 8582596 3' + roo 9024 2 70.30 CCCAGAAAAATTATGAAATTTCCCGTTCGAATTTAAACTAGCTGAGTAAAGGGGGCAGAGGGAACGGGAAGACCGTGCAGGACGACTCCATAATAATTTTA:1 + chrX 2968670 3' + INE-1 512 1 52.48 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGGAATGAAGGTTCCCTTACCTGAACGGATGACAAATGGCA:1 + chr3R 13331483 3' - transib2 32 1 57.43 TGGACCACCCAAATACGTCNCTATATATATATATATATATCTGGATAGATAAAACGCGGGTGAAAGGGCAGGCAGACAAATAAAGCGGAAATGTTAACAG:1 + chr2L 20612045 3' - 297 6582 2 79.00 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGAAGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTAGCTTATACAATTTTATTGCA:1 - chrX 12906532 3' - P-element 54 1 25.00 GTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTATGGGTGAGCGACTACGACTACGCTTGA:1 - chr3R 17897118 3' - hobo 98 1 77.00 TTGGTGGATCACAGTTTCTGTCAGGCCAGCCCGCAGAAAACCTTCTTTGGAGTGCTGCCTGGATATAGCAAAAACACTCCTTAAGAAATAAGGTAAACAAT:1 + chr2L 16851975 3' + HMS-Beagle 493 1 56.44 GTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTGTCGCGTATTTTTTGGCGATATTTTCGGCGTGTCTGTGGGCGTCTTCGCAGGAGTTTTCTCCGTAG:1 + chr2L 15835211 3' - F-element 4415 1 72.28 ACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGCGTCATTTGAAATATTTCAGATAATATGGTACTTTAAGTATTGGGGGCATGTCA:1 + chr2R 9950785 3' + S-element 1698 1 59.41 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTTTTTTATGATAAATTAAATTATCGATTTATACGTTAATTTCACCT:1 - chr2L 16851713 3' + HMS-Beagle 7015 2 57.43 AACCTTTGGGCGGACGTGAAAAAAAAGGTTTCAGAAAACCAATCCCATACTCGCAGCGTCGAATCGCTATATAAAAGAAATGCATCTAGATTAAAACTCTA:1 - chrX 22898875 3' + Tc1 1169 1 70.30 CCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTGGTAGTGTTGTTGTTGTTGTTGCTCTCTGCCAGAGAAAGGTTCATGTTTCCGTTTGTGGCGAGGACGTTCTT:1 - chr2L 6482205 3' + Idefix 7053 2 85.15 TAATGGGAGTTCATCATTACAATACTCAAAATATTTGTTTTAGATAAGAACAAGATAAGGGTATGTCCAACATAAAAAACATAATTAGTTACAATTCAGAT:1 + chr3L 6033628 3' + 412 494 1 76.24 CGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCGACTGAAAAAACAAGAAATCAGCTTAGTCACTGGGTAAAA:1 + chr3R 22172668 3' - 1360 107 1 65.35 ATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAAAGATCCCAAAGTTTCCTCTACAGGAACTGTGACGTCAGTAG:1 + chr2R 10480586 3' + jockey 4592 1 59.41 ATTGGGTGCATTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCTATAACGCTATATGCGTCTGCATTTTGAACTAATTGTATAATTTGGTTTTTTAGAAC:1 + chr3R 3320645 3' - Quasimodo 276 2 62.38 ATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACATTATGAAAATCATTATGTTCATATACATTTTTGAAATAT:1 - chr3L 13001012 3' + invader3 237 2 68.32 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGTTCGCTCAACGGCAGAAGCG:1 + chr3R 9088648 3' - hopper 14 1 63.37 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGAGTGCTGAAACAATTATTGACAATTCTT:1 - chr2R 11941012 3' + 297 347 2 73.27 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTTATTTATAAAGCCTTACAGAATTTATACAGTTAAACGCTTCAA:1 - chr2R 8743046 3' + roo 399 1 52.75 CACGCTTCATCATATTAATNATAATGCTGTGTCCCCGCTCCCAAGCCCCCCTGTTCGCCATCATAGCCCACGCTAACACAAAGAAATATGAACTGTTTTCC:1 + chr2L 18192520 3' - Rt1b 4767 1 68.32 AAGATATTATCCTATTATCNCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGTATCCACTGGCAGCGTTATCGTCATCAAGGAGGCAA:1 - chr2L 10667938 3' + gtwin 7318 2 61.39 CATTTACAAACGCATACTGCGGCGTCTAACAAGCGCTGCATTATATAACTGATATGTTTTTTTTTTCTGGTGGACCCCAATCCTAGCGACATTCTAGTGTA:1 - chr3R 18730934 3' + rooA 7452 2 52.48 TGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGATCAGAATAAATATGGCAAACTCTCAGGGTAGTTTATTACTGCTTTGAAGT:1 - chr4 1173675 3' - 1360 3195 1 52.13 TCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACATATTACACAGCCACGAAGTGGGCTTAAGACCCACACTCACAGGACCAGCTCTGCGGCTGATTGAAG:1 - chr2L 15531781 3' + Stalker2 383 2 58.42 AAAACTCAACGAGTAAAGTNTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAATCACAATTTAATTAG:1 - chr3L 9928521 3' + roo 390 2 57.43 TATATTCGTGTTCATGTGTNAACAAATATTCATTGGTGAATAAAGAAAGTCAGATTTTTCTCAGTGATTAAGACACGAAAGCAAGACGTAAACATACGC:1 - chr3L 15037888 3' - roo 8667 2 75.76 CAGAACATAAAACTCTGTAAGGATCATGCATTTTAGCAACAACTGTTGTCTGCCGTTGTTGTTGGCTTTGTGCTAATGCAGCATGCCCATTCACATCTGCC:1 - chrX 8011165 3' - Cr1a 4184 1 77.23 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGT:1 - chr3R 29608795 3' + roo 9023 2 74.26 TGTGCCTGACTTCAACTTTGGCGCAGTTCTCGAGTCGACTTAGAAAGGTTATTCTTCAGCTAAACCATTTAA:1 + chr3R 19599240 3' - 3S18 5991 2 88.89 TGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCATCAGCTGGAGTGGCGCAAGGAACTGGAGAAGGAACGTCAGCG:1 + chr3L 10642249 3' + flea 4825 1 63.64 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCGGTTCTCTGGTATTTCTATATGTTTCTCTAAAATTTT:1 - chr2L 16426448 3' + hobo 2899 1 75.28 GAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGCGGATGCCTCCTTCTGATTCTCCCCCATATGCATCCCCATATGGATCCTCC:1 - chr3L 17484185 3' - blood 160 2 54.17 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTACCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTTTGGCC:1 - chr3R 23542971 3' + 412 440 2 76.24 TTGGGCGGTTTTAGGGCGTGAGAGTGGGCGTGGCAAAAAGTGTTTTGGCAAATCGATAGAAATTAGTTACCTCGTTGCCTTCAATGGGAGGATCAGGGCAG:1 - chr3R 8144167 3' - INE-1 342 1 57.43 GCGACTTGTGGGATTCCAAGTTCCCTATGTATGGGGATGCATGCCGCCCAAATGG:1 - chr2R 11964398 3' - G6 1751 1 61.82 CCGAATGTGGAAGGATTTGTAAGCCCATATGGTCTGGGCACATTGTTTTTGGCCATTGAAAACATAGAAACTGCATTCTAAGGTACATATGTACAA:1 - chr3L 22794661 3' + aurora-element 4100 1 60.42 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATTTCGGCCCTATGTCATTTATGACTTGCATTC:1 - chr2R 17963216 3' - blood 7028 2 62.38 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTAGTCGAATTATTGGTTTTTCCTGAAGTGTACAGTTCCGTAT:1 + chr3R 5506848 3' - pogo 32 1 59.41 GTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTGTTACACACACATTGCGGCGGCAAACACATGTACATTCCGCTTTATTCGTTCATAATCTTTTATGATTTCTC:1 - chr2R 14526801 3' + Cr1a 235 1 78.22 GGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAACTTTTATCACAAGACAATTTGGCACGGCCACCGGCAGCTGGG:1 - chr2R 21074151 3' + jockey 4978 1 53.26 ATAGGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATGACATGTATACGAGATGAGCTGACTGAAC:1 - chr2R 13262386 3' + Stalker3T 201 1 64.36 ATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATTAAGCGATTTCTATACATCGCCAGTATCTAG:1 - chr2R 16185043 3' + 17.6 7378 2 70.30 GGGGTGAGTTTGGGGTATGGGCGTGGTGAGTTAGTTGTATTTGTAATTTATGTTACGAGTTTCCCAATTGTAAATCTAGTTTTATAGGCACAACAAAGTAT:1 - chr2R 14498706 3' - HeT-A 5929 1 69.31 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTACTTTTTAGAAGCCGGCTGCTAGACTACTTATGGTAAAATTGCATTAGAAACATCATTGATGGG:1 - chr2L 2833838 3' + roo 398 1 67.33 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAATATTCCTAAACTAACTTTGTGTTTTGATTTTGTCATTTTTAGGTAA:1 - chr3L 13772995 3' - pogo 25 1 55.45 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATTTCTCTTTATCTTTTCTCACTTTTTTCGTTG:1 - chr2L 13093752 3' + roo 397 1 67.33 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACCAGTACACTTGAATAAGCCGACTAGTATATTGCTTCGACCGCAATCCTTTCAAAATGGATCCTTCTTT:1 - chr2R 10353247 3' + blood 370 2 35.64 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATGGAGTCCTAGAAGTCTAGGCAGAATTATAGCCCACTGCATGGGTGGC:1 + chr3R 6266368 3' - roo 8692 2 53.47 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCGAGATCATCAAGACAGAGGATGGCTACACCAGCGCCTACGAGGGAGCAGATGGTATATCTC:1 - chr2R 11259550 3' + hobo 2923 1 59.00 TTGATATTATGTTTCATACACTGAGCCAATTGTTCTAGCACGGATGCGCTTTGAGGCTGCGATTGCGATTGTGATTGCAACTCCCAAATTGGTTTTGCTCA:1 - chr3R 27382135 3' - Gypsy6A_LTR 37 1 51.49 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGAGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAGAAAT:1 + chr3R 8582619 3' + roo 404 1 65.43 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGTACTTCCATTTAACAGGGAAATAACGTTAGTATGTTTGTTAAACCAAAAGCGTAGTGG:1 + chr3L 7307295 3' - hobo 17 1 60.40 TTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGACAGTTGGTAGCCTCAATTT:1 + chr2L 15531869 3' - Stalker2 25 2 54.46 GCATTGTGCAAAGTACTCGNGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCTGCATTATTACGATT:1 - chr3R 23638088 3' + pogo 2080 1 55.45 GGTTCCTCTAACCATGCTTGTCGGAGCAGAAGGGCGAGGACGGCATGGGCGGAGCTGGCCTGGGCGGCAACGTCTTCGAATTCGGTGTAGATCCCAACGAG:1 + chr3L 21537891 3' + R1A1-element 4882 1 70.30 CCGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGG:1 - 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297 6768 2 75.25 AAATTTTTTTTTTGGAAATCCACAAGTACCCATCAAATTGATAAGGGGGGACCGCATTTGGAGAACTTCAAAGTTGAATGAGATATCATGGTCCTCTTCAG:1 - chr2L 7509960 3' - INE-1 317 1 82.18 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGTGTAGATTTCTCTCATACCATTCTGATTTACATTATGAC:1 + chr3R 15579042 3' - pogo 27 1 53.47 ACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTA:1 + chr3L 3540201 3' - mdg3 35 2 55.45 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCTAAATACGTCACTATATATATATATTTTAACATCACCCGACGACAGAACAAGAC:1 - chrX 8038626 3' - 297 6620 2 69.31 TCGTTGCCAAGCACAGTTCCAAAATTTTGGAGTGAAGAGTGCGCTTTCCCAATGCACACAACCACCTGTTATCCAGAACCACTCCAACTCCTTGTCCATTA:1 - chrX 23155634 3' + Doc4-element 142 1 59.41 AATTTAAAAAATTAAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGAAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATT:1 + chrX 8958622 3' + TART-C 11098 1 69.79 AAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTATTATAATT:1 + chrX 8727916 3' - X-element 46 1 62.38 TGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCGATTTATTCTATTTCAAGTTCTTATTTT:1 - chr3L 18063344 3' - G2 114 1 72.28 GTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGCTGAGGGTTCAGACAAAAGGGA:1 - chrX 4166355 3' - I-element 5297 1 67.33 TGCCATATGGAGTTTGCTTGAGTGGAAAAGCCAGTCCAGCTTTTTCAGTTTCCAAGAGGATTTGATAAATGAGAAGGGTAAATGATTCCCCTTAAAAAG:1 - chr2L 15974944 3' - G5A 2367 1 64.65 GGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATACATACATATTACATATATATTTTCAACATCAAAAAAAATTTTTTTTC:1 + chr2R 4150666 3' + gypsy 7420 2 59.41 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCCTATCGCAAACTAAAGTATATTTTAGCAGCGTTTG:1 + chr2L 16680085 3' + P-element 2851 1 45.00 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTTCATTAGCATAAGTAGATGCGAAAAT:1 - chr2R 9905341 3' + mdg3 5476 2 58.42 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATACAACAAGGAAGAAAAGCGAAAATTTCTTATTTCCATTTCTGTGGCTTATTTC:1 - chr2L 18247972 3' + blood 357 2 58.42 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCCTCCCTAATTGCCACCTTTAAAGCGTTTATTTAATTAATAGATAAGGATAACGTTGATT:1 + chr2R 7546340 3' + hopper 1403 2 67.33 TACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAATAAATATAGTTTTAAGATGCATTGTATCTGTTCGTCCACTGCGTTCTTAAAATA:1 - chr2R 16207340 3' + Juan 4190 1 57.43 ATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTCCCTTATTTCATCCCGCCTTCCAGCCATAGAGACAA:1 - chr2L 15571956 3' - copia 237 1 70.30 ACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGAACTGCAGCTTTAGCAGGCAAGTCTGCTACTGGCACATTTAAT:1 - chr2R 21962623 3' + 297 368 2 59.41 GCATCCTGTAATTTCCCCACCATCTGTGTTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCAGTCTGCAAGGTAAAGCGAATGTGCTGTTCGGAAACCTTAATGAGATCTAC:1 - chr2R 5484561 3' - G5A 442 1 56.44 GGCAAAAAATGGGCAAACGNTTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGTAAATTGGGGAATTCTAATCCAC:1 + chr3R 5690997 3' - FB 54 1 79.21 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATT:1 + chr3R 23338325 3' + roo 9032 1 64.95 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGAGCGACTATAGCACCATGCGAAGCTTCCGATTTCATCATCCTTATGAGCGGCTATAAAAGCAAA:1 - chr2R 18171491 3' + P-element 2877 2 68.32 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCTTTTAAGTTTCTATTCCACCCTGATTTATTAGAAAATACCTTTAATAGCAGAAATCTCTACTTATTA:1 - chr3R 20420898 3' - blood 7019 2 71.29 AACGTGCACTGAATTTAAGNGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAACAGAATGCTTCTGACAAC:1 + chr3R 12333758 3' - P-element 55 1 24.75 ACCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGAAAATGCCAGGACTACAAATACGGCTTCGCTGGGG:1 - chr2R 6918581 3' + accord 7346 2 63.00 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCAAAATATACATGACCATGT:1 + chr3L 22930352 3' + roo 9019 2 79.80 AAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGCAAATGGGTGCCAAGATTACGTGCAGCTTCTTCGAAATCTATGG:1 + chr2R 23143286 3' - I-element 187 1 56.44 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTTCATTAGCAT:1 - chr2R 9905357 3' + mdg3 208 2 62.38 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGCAGCCAAAAGTTTTTAGTTCCG:1 + chr2L 16683750 3' - P-element 54 1 25.74 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTGTGTGTGCACATGGGCAGTAAATCTAATCCGAAGTATATCTAAGTGTTTTATAGTTTCTTGT:1 + chr2R 9209521 3' - Tirant 8118 2 69.31 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTTTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACA:1 - chr2R 5214960 3' - F-element 32 1 50.50 TAGCAAACTACGAGAAACATTTAATAATTTTTTTTCCACCTGCAATAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTATAACTAATTGTGTCGTTTATTATAGATT:1 + chr3R 4833018 3' + Tc1 1425 1 66.34 ATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCGGAACATAAAACACTGATATAATCGCCTTTACCCGAAATTGTCTGCCTGTACTTGTTCAATATTTATA:1 - chr4 1179599 3' - Cr1a 4216 1 57.43 GACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCAGGCTCGTGGAAACACAAAATTGAAAG:1 - chr3R 4585379 3' + Doc 376 1 62.30 AAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTTCACTAACAAATGTCTACAAAGTACACTTAAAAACCCTTGATAGGACATGCTATTCTGTTTTTTCCTTAATAAAT:1 - chr3R 20094424 3' + Max-element 8528 2 71.29 TGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCAAGTTCAGCCCAGACACCAAACAGC:1 + chr2L 20360288 3' - BS 4740 1 75.25 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAGTCCGCTTAACGATCGAATTAACATCAAAC:1 - chr2R 21351027 3' - opus 7043 4 70.30 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTG:1 - 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G-element 4009 1 57.43 ATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACACACACATTTACATACACACAAGCAGTATGTGTGTATTTTGTATCATTCCCCATTTCCATCAGTAAACAGGCAAA:1 + chr3R 14357369 3' + 1360 3203 1 76.24 CAATAGCCGAGTCGATCTGACCCTATATCGATCTGAGGAACTGTGAGAGCTAGAATGAAGTTTGCGCGCGCCAAAACAATTCCAAACCTACAAGAAGAAT:1 + chr2L 14657971 3' + INE-1 101 1 53.00 TTAGGCCTCTGCGTAGGCCNTTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCATCCGAAGCTCCGAAGCGAAGGAAAAAACGAAGTTGGCTTCGGGATCCAATAAC:1 + chr3L 7835025 3' + roo 296 2 54.46 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTACTTGATATTCAAAACTGCATATGGGGGCATTTGCGGTCATTTTAGTGACATCTGCGGCGATGA:1 - chr2L 22197189 3' - roo 14 2 63.37 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACATTTAAGTGCAGCACTTGAAAAAGTACTTAATTAATGCCATAAATCCGCCGACA:1 + chrX 9454893 3' - roo 8685 2 59.41 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATTTAACTAGCAACTCGGCTATGGAGCTGCCAAAGTCTT:1 - chrX 13146886 3' + roo 405 1 75.25 TCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAGCTATGAAGCTCAGCTTGTTTGTGCAGTTTAGCC:1 - chr2R 6107738 3' + roo 9029 1 69.31 CTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAGCATCATTTCTTAGGGCAGTACAAGTTTGATCAAAATCTTGTTTCAGCTTTGAGCTGAAACCGAATTCA:1 - chr2L 21364076 3' + HMS-Beagle2 11 2 72.28 TTATAATAAGAGCTGTTAAAGTCGGCTGTTGCGAGCATATACCACGTGGCTGTCTCTCCCATAGTCGATGTACTAAACATTTTTTAATGGCTTGTTTT:1 + chr2L 15636507 3' - hopper 1271 1 54.08 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAGCGCTGTAAACAATAAAATCAAATTAATTATGGCCAAATAAATCACTGGCATCCCAACTCG:1 - chrX 16671044 3' + P-element 2878 2 68.09 AACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCCACTCATGTTTTGTCGCTTAATTTTAATGGCTT:1 + chr3L 5479078 3' + 3S18 6101 2 66.67 GTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTTTGCTAATAGATATTTATCTGGGATTTTGTGGGT:1 + chr3R 7632974 3' + hobo 306 1 66.34 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTCCCGAAC:1 + chr3R 21365547 3' + P-element 2838 1 32.00 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTGCTTTGAAAGCGATGTTCTTCGGTTAATTGTGAGTGACAACTCACTCACTAACT:1 + chrX 16671138 3' + P-element 2867 1 59.41 GATAGTCGGGGAACTAGACTATGGCATTCTCTCTTGTTTTTATTTACAAATGATGCTGATAACCTAGTAGGTCTCTTTCTCTCTACTCTCTTAAATTGCAC:1 - chr3R 18346622 3' + INE-1 564 1 43.56 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAATATGCCGCATCGCCAAATGATCCAAATGATCCTGCTGTCAACAAAACCTTCTGATTTTTATTGTAATTT:1 - 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P-element 38 1 41.58 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAATTCGAACATGCTCGAATGGCATCCAATGACAACCT:2 - chr2L 19854057 3' + roo 9054 2 67.33 TTTTTTTTGGTTTTTATTTATGTTTCGTTGTTAAAGTAGTCGGCATATGCGCCAAG:1 - chr2R 5581844 3' - transib2 98 1 89.29 CCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAATAAGAACCAGCCATACGACAAATGCGCTTTCCACGAACCACAATCGGCAGCCTGGCTAG:1 - chr2R 7717722 3' + Transpac 317 1 56.57 CAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCACATTTCGGCTAACCACAGCCACTGCACTGTTCCTTACCCTTTGCCACTGCAATGTTCCTTACCC:1 - chr2L 2380706 3' - 1360 237 1 65.35 AAAAAATTTAAAAAATTAAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATT:3 + chrX 8958622 3' + HB 317 1 76.00 CCAACCGGGTTGTTGCCAGNCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATACATATATATGTATGTATATATATGTCAGATATGAAAGACAAAAAAA:1 + chrX 17030083 3' - flea 21 2 62.63 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACTGTCATTGTGCATAAAATTCCGATATAAACCCTGTAGAACAAAG:1 + chr2R 17459230 3' - Transpac 4945 2 55.45 GTTAGGAGTCTTAAAACTCCCCACAAGTCCGGGCGCAGGAGAGCGGCCTAGCAACAGAGAAGAAGACTACCATGCGAGAGGAGTCAAGGGCGGC:1 + chr3R 892424 3' + gypsy8 4651 1 64.89 GAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGATTATCAGCATGTGGATGAGCATATCGCGAGGATTGTGGGAC:1 + chr2R 21523115 3' - 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F-element 53 1 68.32 AAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTATATATATATAATTTCGAATAATTTCAAAAATCGCTC:1 + chr3R 7783798 3' + rover 7255 2 75.25 GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGTCACACTGGGCAGGCTTGCCAATTTCAAGAGCCGCGGCCACACTACTGCGAATT:1 - chr2R 9693296 3' - P-element 15 1 62.50 AAACAGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCTTTTATGCCAGATTTAAAA:1 - chr3L 11755714 3' + roo 9015 2 78.22 CATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCACGTTTCCAAGAATCAATATATTGAACCCAAACTAGACGTTGTTGATGCTACTTGA:1 - chr2L 14712287 3' + Quasimodo 76 2 56.44 CATATGCGAAGCTACTCATAGTTTTTGCCTTGGCTGGGTTCAATAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGTTTCAAAAGTCGATTCAT:1 + chr2L 16355627 3' + hopper 392 1 78.22 AATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATA:1 - chrX 3431866 3' - Ivk 5321 1 58.42 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAATTGTTGATTTTTTGTATATCAAAAAGAGAAAGCTAAAATATATAATTTTTAT:1 + chr3R 26317999 3' + roo 9051 2 63.37 AAAAAAAATAAAATAAAATCAAAAAAAAAAACAAAGCTCTGGTCCACGTTCTACGTGATTTATTTGCTGGCTCAATTGAATTGTTTTGGAGTGGACCCAAC:1 - 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transib3 2502 1 79.00 CAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTCAGCTCGGTTCCGCTACAATGCACGCTATTTAC:1 + chr2R 9408224 3' - FB 52 1 74.26 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATCATTCCTGTAAATATACATTTTTTTATATT:1 - chr3R 31621716 3' + pogo 2057 1 73.27 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGTACTGCCCTGACTTTCAGCAAATACTGACTTTTTATGC:1 + chrX 17494682 3' + 1360 3351 1 67.33 GAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCTCGTCCTCGT:1 + chr2L 20045828 3' + roo 9063 2 70.30 GTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCTCGTCCTCGTGTCAGA:1 + chr2L 20045834 3' + roo 9070 2 77.00 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACTGTTGCGCTTGAAA:1 - chrX 1135332 3' + P-element 2829 1 21.78 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGGAAAACAATAAATGAATGAATTATTTTAATTGGGGGAAAATCGGTAA:2 + chr3R 11092016 3' - P-element 74 1 50.50 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGTGTACATTTTCACATATGAATAGT:1 + chr3R 11608000 3' + 1360 3338 1 78.22 GTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTCAG:1 - chr2L 23372503 3' - gtwin 2 2 77.23 GATATGAACGGAGCCCAAANTTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACTTTACCCAAAAACACAATTGAATAATGATAATTTCAC:1 - chr2L 7666110 3' - roo 38 2 62.38 GAGCACACGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCTGTCATGCTCTTCCTGTCTCTGTTGCCCAGTTGCTCTTCTCGCTCACAGTGACAA:1 + chr3L 14063963 3' - Bica 47 1 60.40 GAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAATGCCCGAATGGGAAAAACATTTCAAACTTAATGTTTTATGAAAAAAAAGGTCAGAAAATCGTAAGTATGAAT:1 - chr3R 27203064 3' + Doc3-element 4675 1 71.29 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTACCGCGCCGCTGAAATAAACAAAAATGTTTTAACAAAGAGG:1 + chr3R 16241240 3' - Tirant 24 2 55.95 TCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGTCATTTTCATAAACATTACGAGATAAGCCCGACGCCCGCTCACTTCTCCCTCTTTGTCCCCTCCTT:1 - chr3R 21612850 3' + S-element 1705 1 68.32 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATAAGACGAAATCCCATTGAAGGCAACGGGGCGTATGCGCAACTCAG:1 + chr2R 7839045 3' + pogo 2071 1 55.45 TAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGGTGTCGCCTTCGCCTGATTCAATTACACAAGAGCCCGTAATCAGAGCAAAGGAAAT:1 + chr2R 15799703 3' + jockey 374 1 61.39 GAGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATGAATCAATCCATGCCATGTATGTCCAGTAGTTTCATCTTCTTCGATTGCAGAACTCGTTTGTGTATCA:1 - chrX 2135114 3' - blood 404 1 62.38 AATAAACAATAATAATAAANAATCTTACATACATGTACCTATGTACACATGGGTATATATTTTGTGTAGGCCCACCTACGCAATGCAATTAAGCCAACTCA:1 + chr2R 10014883 3' + flea 247 2 70.30 GGTGGTTTGGCAAACACAAAATTAGAATCGGGGCGCAAAAAAAAAACAGGGGAAAAAAAGCTGAAAAAAATGGCAAAGTTTTGTCCGCTGAGGGGGGCGGG:1 - chr2L 11251688 3' - Cr1a 47 1 61.39 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTTGCAGCACAATGAGCAAC:1 + chr3R 23338343 3' + roo 9046 1 51.49 GAATGCTGATGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGA:1 - chr3L 16792552 3' - Chimpo 4043 1 61.39 GCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGAAGCAGGAGGCCACACCAGACGGAGTGTCCGCCGAGTTGCA:1 - chr3L 7167458 3' + Doc 262 1 64.36 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCTTTATCGCCTCCTCGCTCTTGAGAGTCAA:1 + chr2R 22856620 3' + 1360 3385 2 75.00 TTATTAATATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTCGA:1 + chr2L 14762024 3' - mdg1 38 2 59.41 TCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTTCAAGCGAATATAATAAGTTTTAATTCTTTAACTCAGATACGG:1 - chr3L 20755345 3' + I-element 5321 1 55.45 TCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTACACTTTATGACATATAAATTGTCTGTTATAATTATTAAGAGGTCTTTCTGTTATTGAAATGTGATT:1 - chrY 373188 3' - G-element 11 1 55.45 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTTAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCTATCTGCGCTGTATGTATATCCTATTTCAGTTTGCCATGCA:1 - chr2R 10014790 3' - flea 4789 2 59.41 TCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCTCGTC:2 + chr2L 20045823 3' + roo 9058 2 65.35 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCAGAGAGAGCGGGTGGTTGGGTTGCCGTTGGTCAGGGGAG:1 - chr3L 16891074 3' + P-element 2875 1 65.35 CTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCC:1 - chrX 4264365 3' + mdg3 193 2 76.00 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTTTTAACGTCACGTCCTTTTCGCCCACAATTGCCGGCGATGTGGAACAAAGCGCTTTATATGCGCCATTGTCAGCCC:1 + chrX 14353633 3' - Quasimodo 36 2 56.44 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGA:1 + chr3R 27056412 3' - jockey 68 1 81.19 ACTCGCACTTATTGCAAGCNTACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGTCACACTGGGCAGGCTTGCCA:1 - chr2R 9693329 3' + P-element 2834 1 26.73 CCTGCATCGAGGCATTGTGNAAAGTACTCGGGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTAAAACAAATAAAAAAATTGTTCTTACTGGTTTGAATAAT:1 - chr3L 16546780 3' + pogo 2069 1 66.67 TGTAACAATTGATTTGCGGTCTGGGATCGCCAGCCACTCCAGACCTTTCTGCAGCTATATTCCAACGCAGAAAAGCCGCTCACCGACATCGAGATTGCGG:1 - chr2R 6972986 3' - mariner2 259 1 78.00 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATGCTTAGGAATATTTTGCCTGA:1 - chr3L 7345365 3' + pogo 2050 1 77.23 CTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTGTCCGTGTTGATGACGTGCCAACTTGTGTCAGGAAAAACTGAAAATGAATAACTGCTA:1 + chr3R 10722264 3' - hopper 98 1 77.27 CTTCTAGCACGACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTTTTGTTTACGGTCTCGGCCGGGCCCTTAAAGCTGATCAACAAGCTACTTAGTTGGCGCTGGC:1 - chrX 18699803 3' + 1360 3208 1 62.38 TTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTTGAGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGCGCCTATATGCGATATAGATAGTATTTGGTAGCAGCCATTCTG:1 + chr2R 20681560 3' - G2 257 1 57.43 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAAGAACATTCCGGCTTTTGGCTATTCAACATTGTTTTCCATTACGGA:1 - chrX 9774985 3' - 412 7084 2 54.46 CGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGGTGCGCGTTTGTGGAGAAAGTGCGTAGGCT:1 - chr2L 13567696 3' + hobo 368 1 70.30 CCTTCTAGCTTTTAAAGTTCGTGAGATCTCGACCTTCATGCAAACAGATCTACTCGGCTATTGATCCTGACAGAGTTGACGAAGGACCAAAATGTAGAGAC:1 - chr2R 4906452 3' - INE-1 156 1 53.47 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCAGGAGGTCACACCAAAACGAACTTTG:1 + chr3R 27116769 3' + P-element 2837 1 15.84 TAATTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGCATTTAATTGAGTTTAATTGG:1 - chr3R 27805166 3' - Quasimodo 39 2 79.25 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTACTTTGTCTAAATAGGGGTTGCTAATAGGTAACTGAAGCTCTTTTTAA:1 - chrX 9454810 3' + roo 9043 1 58.42 AGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGAATCTTGTCGCATCGAATCAATAATCATATTAATTGCAAAAGGCAACTTCTGGCAATCCAAACAATTGC:1 + chr3R 6143073 3' + Doc 4511 1 72.28 AGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCATTTGATTTGCTCTAAAAAATAAGGAAACGAATTAAAGGCAGACCCACTAGTATAGTTAGA:1 + chr3R 5935306 3' - 1360 3154 1 62.38 CCCATTTTTAATGTGATGGNGAGTAGTTAACAAGTAACATCAGGAAACTGTTCATCATGACACCAGACTATATAATATTCATGGTTATGTCCGTTTTTCGC:1 - chr2R 15452026 3' + Chouto 6310 1 60.40 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACACATAGAGAGCATAATAGCCGGGATGCCCGACTTTCCCCCGCCGCTTTTCCTGCCATT:2 - chr3L 2176296 3' - roo 17 2 60.40 CACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGAAAGTTAGGAAAAGCCTGGGAAACATTGCCTGGGGCGAGTGAAAAGCAAGGCAA:1 - chr3L 1279479 3' + Quasimodo 7154 2 57.43 TACAGGCAGGTGCACGCTTTAGAGCCCTGCTGTAGCTCGTCGGCGTTGGGAATGGGTGTGGTTGTTTCGTGATTTCGTGGTTTGGTGG:1 - chr3R 15305129 3' - Gypsy12A_LTR 2215 1 62.50 ATATCATACTGAATCTCTANTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAG:1 - chrX 734924 3' + Tabor 7277 2 67.33 ACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGATCTCGGGTT:1 + chr3R 10391246 3' + invader4 294 2 59.41 TTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATACATCTGTCTACTTCTAGACTCCGAA:1 - chrY 425011 3' + McClintock 6383 2 77.00 TTTTAAGTTAATTGTAATTCAAAAAAGCTTCAAGAATATTAGTATATTACTTAAGCAATATTTTCGAATGACTAAATTTGCTTTTCAAATAACAATACATC:1 + chr3R 19533313 3' + Juan 4008 1 73.27 AATATCTCCAATAGTTTAGAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGAAAAGTTGAAATGTTATTTGA:3 - chr2L 12882748 3' - hopper 44 1 67.33 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAATTTGGCTACCATATTTCTTGGTAATCCCCAGACGCAAATCT:1 - chr3L 3345131 3' - FB 36 1 63.37 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGACACATGTGCATTATTGTTGCCTATCTGGCGGAC:1 - chr3R 28565272 3' - 412 7095 2 67.33 AATTACCGCATTTAGAATTNAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCTAAATAATTCGGTTGCGAGCAAATG:1 - chrX 20419139 3' + flea 208 2 73.27 CCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGATCTTAACTTATATGCCAGCTAATGTGTGTGTAATTTTATTTTTATTTGTACAGCAG:1 + chr2R 17392684 3' - opus 29 4 55.10 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTT:1 + chrX 16758625 3' - roo 41 2 75.25 AGAAAAAAAATTATACAAAAAATTTGGTTTTGCACGTGTTTTGCTGGTCGCCGAAGTTTTGCGTGTTTTCTCACTAGCTTCACCAAGTTTAAAACGTATTA:1 - chrX 6532566 3' - Tc3 78 1 62.38 ACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAACCAAAAAATAACAAACACACGGAAAAAAACTCAACGCAATAACAACACAAAAAACAATGGCTACTTAAGC:1 - chr3L 2003308 3' + F-element 476 1 68.32 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTAGATGTATTTGATTCTGGCCTAAAATCCCAATGGCCAGCTAAAGAGATATCCTGT:1 + chr2L 19678195 3' - flea 15 2 62.38 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCATATCGCATTTTATCAAACATAAACA:1 - chr3R 29287515 3' - hobo 48 1 75.25 AAGGGGCCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGTAAGCGGTCATATGTAGAGCTTCGTAGGCAATAATGTGCACTTTTTGTTTCGCATTGGGTTTAATTGCCCTC:1 - chr3R 4721601 3' + gypsy12 9873 3 64.36 CCTACATACTAATACACTTNCAACATATACATCCCAATACAACATACACTGACGACACCTAGAATATTTGTTCTCATACTCAGAAGTGTGATATTTGCTAT:1 - chr3R 15179613 3' + Idefix 38 2 53.47 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATTTATTGTACTACGTGAATGTCAAGTGTGGA:2 - chr2L 20684285 3' - I-element 44 1 73.27 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTT:1 - chr3R 17971672 3' + 412 437 2 80.20 ATATTTTCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAA:1 + chr3R 10488728 3' + roo 9024 2 72.28 ATTTCATTCTTTTTTTTTTTGTGTACTTTGGATTATAAAATTGCAAGAAATACATACTTTGATAGCTCTACGACCAAGTTATTTATAGTTATTGGCCACT:1 - chr2R 10852479 3' - transib2 2643 1 77.00 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGGGCCAGCAGCCAGTTTAAACCGTATATATATAGTACTGAAAATAAAGCAAATTAA:1 + chr3L 1697768 3' + Transpac 291 2 58.42 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTGCAATAAAGTTTTTATTATCATAATAAACCGAATAACAAGCTATAAAATTAATAGGTTTCCCTCTATTTGGT:1 - chr3R 17003274 3' - pogo 4 1 77.23 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGCGGCAACTGGAAAACTGGCAACTTCATTATTATTTGCAGACACTTTTCGAAAAGATTTTTCCGC:1 + chr3L 8252275 3' + copia 242 1 65.35 TATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTATAAGCTTAATTCAATGTGGTATGGCATAAAAAGATACTTATCACTTAAAGGCTTTATTAGGCCTTTAAA:2 + chr3R 16735128 3' - I-element 7 1 72.28 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAA:1 - chr3L 20049641 3' - jockey 4808 1 70.00 TGCATGCTCAGCATTCCCACACTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTTGCATTGATTTTTACCCGTTTTTCGG:1 - chr3R 28325880 3' - Stalker4 191 4 74.26 CAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACGCGTGTTTTCTCGCTCGCACCTGCACGTTTTCACTGGCTC:1 - chr3L 3515915 3' - Chimpo 66 1 56.79 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACCGAATCTGCTAAATTTCACACACCACTTCGTGTGAAAATAA:1 - chr3L 11929272 3' + copia 255 1 56.44 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATGGCCATCCTGCTATTTAGCCATGTTTTGTTTGGTTTTGTGCTTTGGCTGCAGTTTG:1 + chr2L 13566554 3' + hobo 2919 1 62.38 ACCCCAACCACCCAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACTTATGTGCATCCCGAGCCTGCCAAGCAGCCAA:1 + chr3R 28127879 3' + F-element 4470 1 66.34 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCGCGT:1 + chrX 9413862 3' + 412 7506 2 63.37 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAG:1 - chr2L 18213176 3' + hopper2 1554 1 76.24 CACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTT:3 - chr2L 18213141 3' + hopper 1396 1 60.40 CAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGCATAGTTCTGTTACTTTTGATACTTTTGATAAGGCTGCCGGTGCAGGCACTTTGGGGAGGCTCTTAGAGGGTGGGT:1 + chr2L 21215369 3' - BS 4973 1 75.25 TAAAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTGAATCACAAAATCGGTTTCGGATTACACAAAGAGTGCGCGCACACCCGATCGCGTCGACGATTGGTATACGTT:1 + chr2R 5395198 3' - F-element 117 2 70.30 ACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAATCTTTTTATTGTTTTATCGGTTGAGCCCCCAAATGTA:1 + chrX 22426230 3' - 1731 42 2 63.37 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGTATAGGTGCAATTAATTTAGACGCGCTCACTTAAATCGATTACTTATTTGTATTTGTATGTGTA:1 + chr3R 25021767 3' - roo 11 2 69.31 TAAATTAACATAATTAAAAAAAAGCTTGGATTGTTAATGGAACTGATATGGCTTAGACTTTTTGGCAGTGCTGTTATGACTCCGCCTGCAGTTTCTCC:1 + chr2L 3923122 3' + HB 319 1 77.55 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAAATTGATTTTAGTTATTACTACTAACCACCTTTC:1 - chr2L 3346263 3' - pogo 37 1 68.32 TGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTGAATTCCTAAATCATCATCATTCGGATCGGAGCTCAGCCCCAGCTTCTTTGTGA:1 + chr2L 13926460 3' - hopper2 1195 2 61.39 CGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGGAATTATAATAAATTTTATAAGTAGCCACTG:2 + chrX 21468687 3' - transib2 40 1 68.32 CTAAGTGATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGGGACATTAATCAACATGTGTCGAAGAAGTCCTCGACTCCTTCAGCTGGGTGCATTGT:1 + chr3R 27779884 3' + HB 41 1 79.21 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTCTGCACTTTAAGCACTGCCACTCTCCACTTTAAA:1 - chr3R 9278337 3' - roo 8706 2 71.29 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTGATTATGATATTTTTTAATGGAAGGCTGAAAGATGCAAGGCCCCAAGA:1 + chr2L 17245075 3' - copia 27 2 52.48 TAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAATGAAACCGAA:1 - chrX 7292681 3' - 3S18 43 2 63.37 TCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCAAGAAGACTGGGTCAGAGTGGTAAATAAAAAAACATTTAA:1 + chrX 3049197 3' + jockey 4906 1 60.40 CCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAACAATACTGGTAACTCTGTTCATCACATTGCAC:1 - chr2R 20312596 3' - 1360 41 1 68.00 TACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTCAAGTGGTTTTCGGTTTCCTATTGATTTATGA:1 + chr2L 18199764 3' + Ivk 5335 1 67.33 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCAGAAAACGAAGTGAAAGGATTTTGTAAATTACAATCTAGCT:1 - chr2L 5926909 3' + pogo 2089 1 65.35 GAAGTAGCCCGTCTTCTGAAGCAGCGCTCACGGCAGAATGTTGACATTGTGCTTCACACGCTCCGGGCAGGAGGAAGTCTTGCCACTACAATGGCTACTGT:1 + chr2L 12911565 3' - gypsy4 6736 2 67.33 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAGAGCGTAGTAACGGCAGCGCAGAGAAGAGAGTTTGG:1 + chrX 21184022 3' + Juan 4171 1 58.42 TTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCC:1 + chr2L 12882808 3' + hopper 1386 1 50.50 ACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAGAAAGATGTCCTG:1 - chr3R 12329616 3' - hopper 47 1 70.30 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCAGAGAGAGCGGGTGGTTGGGTTGCCGTTGGTCAGGGG:1 - chr3L 16891076 3' + P-element 2873 1 63.37 TGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAAGAGCTCATTACAACCGCAAAAACCA:1 + chr2L 19642397 3' - Quasimodo 10 2 70.30 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCACCCTTAAAACAAGTAAAATGTAATC:1 + chr3R 11916599 3' + roo 9027 1 73.40 ACCATGGGCAATCATTCGCCTCCTCATGTCCAAAGCGCTTCACATATCTGCGAAAGCAACCGTGTCCACAAAGATCGGATTAGATGGGCACTTTGCTGGCA:1 + chr2R 6926323 3' - Rt1c 5059 1 68.32 TTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAAATGTCTTCATAAAAATCCAGATGGTCGGATGTGTCGCTGCAGTTGCATTTGTTTAATTAATTTAATTGGTCCCC:1 - chr2R 13800383 3' + invader2 4657 1 77.23 GGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATGCGTGTATGTGTGAATGTGTGTGTGAAGAACCCACCGAGCACCG:1 + chrX 18193450 3' + BS 4670 1 55.56 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTACTTTTTAGAAGCCGGCTGCTAGACTACTTA:1 - chr2L 2833871 3' + roo 9028 1 69.31 TTTTCTGGGGTATCGATAGATATTGGGGAACGTGCCGAGAAGTAGACAGAGACAGGCTGAGCGGGGCTGAAAGAGAAGGCATGAAAAAAGAAAGCAGACTG:1 - chrX 9391115 3' - INE-1 499 1 74.26 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATT:1 - chrX 20361976 3' - hopper 38 1 61.39 AATGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACC:1 - chrX 21087567 3' - mdg3 5264 1 63.37 ACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATACATATATTATCAATCGGACTTATTTGTTGGATGATTTACCATGTA:2 + chrX 20419195 3' - flea 30 2 61.39 AACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACACTAGAATTGAGTTTAAATATACAGACAACCAGGAGCGGCGCACGGAGTTTGCAACA:1 + chr3R 28565340 3' + 412 471 2 56.00 TAGTCAACTGACGGGACATNAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGAAAAA:1 + chr3R 7869188 3' + 297 6943 2 60.40 AAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAGGAAGGAAAGCCATCTTGCGGCTGTACAGTGGGGTTGGGATGGAGAAAATCACGTAAATTCCAGCATTGA:1 - chr3L 11905229 3' + Doc 4480 1 72.28 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTGATCGATTAGGAACTAGGTTAAGAGAAATTTGAACAAATC:1 - chrX 19334567 3' - roo 8677 2 67.00 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCGCCTCCAAAGA:1 - chr3L 13773884 3' + roo 9042 1 54.46 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTCTGCACTTTAAGCACTGCCACTCTCCACTTTAAATATTTACTTAATTATAAATATTCAATGCCTTTT:1 - chr3R 9278304 3' - roo 9 2 74.26 AAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCATTGGTGCCACGCCTACACT:1 - chrX 21667974 3' + Tabor 7324 2 72.28 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGTATTTACCTGTAGATTGCGCAATGATAAGTCTTGGTTTTCAAACAATTTTGTTTAGAGTAGCAAAAATGCCA:1 + chr3L 16546886 3' - pogo 1 1 73.27 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGGTTCTTGTTAGGAAGGGGAGATAAAAATCTTTTCCAGACTCGCCATCCAA:1 - chr2L 9490542 3' + pogo 2076 1 49.50 TAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCAAAAGTAATACCATACAATAACATGTATACAGAGACACAAAAGTACATAT:1 + chr3R 29128151 3' + Ivk 221 1 56.44 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCGCGTAACA:1 + chrX 9413866 3' + 412 457 2 59.41 TAAGTTACCTGCATCGAGGNATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGTAGTTACAAAATACATTTAATACAAGTTTTAGGG:1 + chr3R 25581092 3' + pogo 2062 1 61.39 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACGTACAACGCTGCGTATG:1 + chrX 11025595 3' + hopper 1406 2 70.30 CAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGTAGAATTAGTTGAAAATGTATAAACAGATTG:1 - chr3L 5479014 3' - 3S18 5812 2 70.30 TTTTCTTTTTTTTTTTAACTTTTCCCCAGCTATTTTCTGCGTGTAAGAACCCCTTCATTTTACACTTTGTCTACGACTGAGAGTTCTGTCGGTTCATTGTT:1 + chr2L 4102929 3' - TAHRE 10441 1 68.32 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTTTTTTATTTATAAATAAAGATTTTTCAAGCACAATCTGACCCATTTTTACACCA:1 - chrX 7797641 3' - roo 8684 2 51.49 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTTTTAAAAAAATATTTATTTTGTATTTAGTAA:2 - chr3R 26317932 3' - roo 8709 2 73.27 TTATTGTTATTATGTTCGTNTATACTACAATTAAAATGATTACTAAATTGATATCAGATTGGCAGATAATAGCAAATTGAATAAAAATTACTCATTTTAAA:1 + chr3R 19949391 3' - mdg1 7046 2 71.29 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGTGGGTTT:1 - chr2L 23189411 3' - 1360 55 1 92.08 CAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACTTAGCAATAATAGAATGTGAAACAAAGGTGTGAGAAGACCTGTCCAAATAATAATT:1 + chr2R 16533623 3' + Quasimodo 318 2 65.35 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTTGGGTGCTATACTATCTTATGTGCTTTCAAATATGCCTATAGCTTATCTCATTTGTTTTAATACAT:1 + chr3R 17782170 3' - pogo 7 1 70.30 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTTAATCGGTTTATGGTGCACGAGTAATTG:1 - chr3R 5135469 3' + 297 350 2 69.31 GCTAGCGACGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGTCGTTGGCAGTGGACTGAAAAATGGAAATGGGGTTAGATTTGAATCGCAATTATTGTGCCA:1 + chr3L 1617647 3' + 1360 425 1 59.41 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAG:2 + chr3L 2176375 3' + roo 9036 1 63.37 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTGTGTGTGTGCACATGGGCAGTAAATCTAATCCGAAGTATATCTAAGTGTTTTATAGTTTCTTG:1 + chr2R 9209520 3' - Tirant 10 2 71.29 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCTTTTCTATTAGCTTTAAATGTTTCTAGGAA:1 - chr3L 13096961 3' - I-element 51 1 69.31 CGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGC:1 - chrX 21217527 3' - pogo 20 1 70.77 TGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGGCAATAAGTAAGAAATAAATGAAACCTCAAATAAAT:1 + chr2R 11941066 3' - 297 6614 2 63.37 AATAAATAAAAAAAATTAAATAATAACTTTTATTATGTGACTAACCCACTGTGATAGTGTGTTTCAGAAATTTTTGCGCTCTGTCTGCAAATGAAGTCTGC:1 - chrX 2822535 3' + Doc 4687 4 80.20 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTGAATTTAGGGCGTTTCCTGAGCTCATTAAAGTCAC:1 - chr3L 7300501 3' - Doc 46 1 68.32 TTGTCATAATATATATAAAAATTATTGTTGTAGATAGAATTTTGAAACAGCAACCATACGACAGATTAGTAAGTTGAGAAAGTATCTTGAATGCTTAAGTA:1 - chrX 15598986 3' + Stalker4 7035 4 61.39 GAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGTGGAAAATTTTCAAGCTTT:1 + chr3L 5415380 3' - I-element 55 1 77.23 ATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGC:2 - chr2R 18723047 3' - HMS-Beagle 40 2 68.32 TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATTTATATTGATTATGGGTGATCGTCAACAAGAGCAGTGGACACCCAATAAACCTGTCC:1 + chr2R 9905433 3' - mdg3 19 2 60.40 AACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGGGCGTTCATTGTGGTCGCTTTTCATGTGTCGCAAT:1 - chr2R 14576517 3' - gypsy5 43 2 65.35 TTTTTTTTGTTTTTTGTTTTATTTTTGGACCCGCCTGGAACCAGACTTTA:1 + chrX 18301927 3' - HMS-Beagle2 483 6 86.00 ATGGAAAAATACCTTTGTATCACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTATCTGAACACCTCTGTATGTATGTATATGCAGCCCGGCCGGTGCCAAAATTTGC:1 + chr2R 4201178 3' - HB 46 1 64.36 GGGCCAGCCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTTGACAGCCGAGCATCCAAATAAACATTAATCACTGCCCTTGAAAGGCAGTCCAGAGGCGAGTTCT:1 + chr3L 5973019 3' + Circe 264 1 58.00 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAGAAATCGAAGAGCTTCA:2 + chr3R 8582631 3' + roo 396 1 66.34 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTGCTTTGAAAGCGATGTTCTTCGGTTAATTGTGAGTGACAACTCACTCACTAACTCTGCTGGCA:1 + chrX 16671147 3' + P-element 2876 1 68.32 GCCGACAATGTTGCAACATGAGAGTGCGACGAACTAGCAGCTCTGGTGTGAGGGTTTTTGGGAGACGGCGGAGAGTCCAGTTCTGATTGTCATTGAGGATA:1 - chr3R 5274746 3' - gypsy5 151 2 73.27 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAAGAGCTCAT:1 + chr2L 19642380 3' - Quasimodo 27 2 58.42 CAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGGGCGTTCATTGTGGTCGCTTTTCATGTGTCGCAATCTCTATTAAGGGAACTACATTATGCGGCC:1 - chr2R 14576488 3' - gypsy5 6953 2 69.31 CATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGGAGAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTT:1 - chr2R 21747551 3' - mdg1 7089 2 72.28 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACTGATTGGTAAAAGGATCTTTCTTTAGAAGTGGTCCTTATTCCTCACCTATTCCTTGCATTGA:1 + chr3R 5348746 3' - copia 4882 2 67.33 TAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTTATCATACACATATATTTTATAAGACTACAA:1 - chr4 74275 3' - 3S18 35 2 62.92 GGAAAAATAATGCAGATATGTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAAAAGG:1 - chr3R 14193911 3' - pogo 44 1 67.33 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTTAATCGGTTTATGGTGCACGAGTAATTGAAT:2 - chr3R 5135466 3' + 297 6934 2 66.34 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTCAGTCTCAGTTTTTTTCTCTTCGCCTTTTACATACGGATGTGGTGAAGTCAATAGAAGCGCCTA:1 - chr3L 16162091 3' - FB 13 1 64.36 GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGCGTGCGTGTGTGCCAGTGTTTGTTTGTTTGTTGG:1 + chr3R 24767878 3' - P-element 15 1 62.38 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCATGAAGGGTTACGAGGCGAAAAGCATATTTCAATACACA:1 + chr2R 2261405 3' + 1360 3350 1 64.36 GACTAAGAGTAAAGGAAGANGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACACA:1 + chr3L 3540214 3' - mdg3 22 2 57.43 GTAAGTCCTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATAACTGATAATTGTTCCAATTTTTCAACTGTTCTATCGAGGTGGAATGTACATAAACC:1 - chr3R 11916534 3' - roo 8680 2 63.37 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTAATGTCCCCACATTAACAGAAATTTGGACTT:1 + chrX 13146995 3' - roo 8684 2 57.43 ACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGAAAAAATCGATGTACAACTTATGCAACT:1 + chr3R 7869211 3' + 297 6969 2 70.41 GCTCAGTAACGGGTATCTGATAGTGGGGATCTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTAATGTGTCTACATAATAGCGTTCACCGGCTTCCATCTGGCTGCAT:1 - chr3L 8204128 3' + INE-1 546 1 55.45 TCCTAATCTTCACCCAAACTCTAGCTTAGAAAAACCATGGAAACAGCGAGGGGTTTTTCGAGGGGATGGGTGCTCCGAGGGGATGGGTAAATGACAAGCTT:1 + chrX 21241397 3' - 1731 258 2 65.35 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTT:1 + chr2L 12808223 3' - Tirant 41 2 63.37 AGTCGGGAAACTCGACTATAGCACTCTCTCTTGTTTTAAATTACATAGAACTTTATAACAACTGGAGCTTCACATTAAGTTTGCCCATGCGTTTGTCAAAT:1 + chrX 15925294 3' + INE-1 567 1 75.25 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGTTTACAGAAAACATCGTGAAATTTGCATTACTGACTACATTCTCTTAAACCTATAATATATC:1 - chr2L 8577253 3' + roo 396 1 66.34 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGAATGAGGCACAGAGAAATAATAAATAAACTACAGTTCATGTCATG:1 - chr3L 13374664 3' + Transpac 307 2 76.24 ATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGGGAGAGGTGTTGGGAATCCGGAATCGTTGGCAACATGATGGTGC:1 + chr2L 20618553 3' + Cr1a 4378 1 67.33 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTTTTTTATTTATAAATAAAGATTTTTCAAGCACAATCTGACCCATTTTTACACCATCTAGTAACTGAAAAC:1 - chrX 7797625 3' - roo 4 2 62.38 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACA:1 - chr3R 29608802 3' + roo 9016 2 81.19 GAAATATAAATTATAAATTACAACACCACCGATAAATGACTGGCGACAGACGACACTGGGGGCTGTTTTTTTTTTGGGGATGGGGGTGGGCAGATAAGGA:1 + chr3L 17942719 3' + copia 252 1 66.00 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAGTGTGTTTATGCGTTGGTAAATTAAATTTGAAACGCA:2 + chr2L 7666192 3' + roo 396 1 67.33 AGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATACAACAAGGAAGAAAAGCGAAAATTTCTTATTTCCATTTCTGTGGCTTA:1 - chr2L 18247976 3' + blood 7365 2 54.46 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTT:1 - chrX 4277469 3' + roo 9033 1 65.35 TTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTAGTCCAGCCACCCGAACGACGGCCTCCCGAGCCGGAACACGATCGCCTGATGTTCATTCCCGACCTAGACC:1 - chr3R 29296868 3' + F-element 4341 1 79.21 TTTCGTCTTTAATGTAACCACTCTGACTAGCGAGTCCGAAACTGTAGCGGGTCCGACCCCTAACCGATGTGGAGGTCAGTGTACTGTCCAGAGCTCCATT:1 + chr2L 3125981 3' - diver 5742 1 66.00 ACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTGGTCCAGCGCGCAATTCGACACCAGGAATAGGAGTATCGGAG:1 - chr3L 23591128 3' + jockey 4847 1 58.00 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAATCACAATTTAATTAGTT:2 - chr3L 9928519 3' + roo 9055 2 59.41 CGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTTCTGTCAGCGGCAGCAATTGTGCCTCT:1 + chr2R 6918630 3' - accord 46 2 74.26 GATTAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTCTTGTCTGGTTCATTTCCGTTTCATTTCAGGCGATAATGCAATAATGAATCAAT:1 - chr2L 14055678 3' + Circe 7214 2 58.42 CACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:1 - chr3L 23112570 3' - R1A1-element 4 1 58.42 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGAAAAGTTGAAATGTTATTTGAAATGTTGCAGGCAGTGAGGAGGCAACAGTAGCGGGAACAACA:1 - chr2L 12882706 3' - hopper 2 2 77.23 ATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTTATACTACACATATTACTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTATTGTCCTTGTTGCGGTCCTGT:1 - chrX 9342305 3' - Burdock 10 2 49.50 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATAGGAATGCTAATTAACTACAATAAAACATTTTGATGGAGCGATAGA:1 - chr3R 13913026 3' + mdg1 368 2 75.25 TCTGTCCGTATGAACGTCGNGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAAACAAAGACGCATGTGAGCTTCTGTACCGATTCTGAACTT:1 - chr2R 16443214 3' + INE-1 130 1 55.45 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCAATCTGTCCCCTTTTT:1 + chr2L 17730539 3' - pogo 4 1 77.23 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAGTGTGTTTATGCGTTGGTAAATTAAATTTGAAACGCAACGC:1 + chr2L 7666196 3' + roo 402 1 72.73 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGATTATTTATGAGACCCATTAATGGGCAGGT:1 - chr2R 16609432 3' - jockey 4807 1 72.28 CCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTTGAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAG:1 + chr3L 10590623 3' - 1360 257 1 65.35 TTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACA:2 + chr2L 18248030 3' - blood 55 2 84.16 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATTGCATGGAATCATGCAAATGACTGGCTATTCCTTTTGTAATAATCATAATAATAATAATTATAAT:2 - chr2R 11721485 3' - Doc 25 1 55.45 TCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGAAACAATTTTTATAAAAGCAGACAATATTTACGGTTTTCAAGTAATTAAAATAGCAAGC:1 - chr2R 7318943 3' - Cr1a 486 1 75.82 TAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACTAACAACAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTGCATGTGAT:1 - chrX 22689547 3' + 1731 4587 1 62.38 ACATCTGCAATTTTTGTTCGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGAAATGCAAACTTGATTTTTTCCATCCTCCTCCGCGGTGGCTTCTGTTTTTCTGGTCGGGA:1 - chr2L 3921639 3' - I-element 428 1 62.38 TCCTACACACACACACACACACACACAGGGGTTCTCCCCTATCGTCTATCGTAGTCCGCAAGGTCCTGTTGGTCGGGGGTGGCACTCAAATCCGTTGGCA:1 + chrX 17004334 3' + accord 7100 2 78.00 AAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGTGCAGTTCGAAATCCACTAACAACATTTCTGTGCCCCACTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGCCAAT:1 + chr3R 16591791 3' + gypsy5 7341 2 71.29 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGG:2 - chr2L 20560348 3' - F-element 57 1 69.31 TCAAAAATTCGATTTTTCCNACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTAAAGTTTGTTCATTTAATATTTACACGACCAGGTGGAAAGACAAACAGCCAGCGGTTGT:1 + chr3L 7882312 3' - FB 18 1 59.41 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATACACCAGTCTGTGGAGAACTTGTGTTCGCATTTATCCGTTCAACT:1 - chr3R 19198507 3' + hobo 2909 1 59.00 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTC:1 + chr3R 29287562 3' + hobo 2904 1 61.39 TATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGAAATGTTGATAAAAATGTGCACTGCCACTTGCAGCGTGTTGCGAGATTGTTGAC:1 - chr2L 17677696 3' + Tirant 8486 2 59.41 TCTTCATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCCATGTCCAACTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAACGGGTATCTGATTGTC:2 + chrX 1130845 3' + INE-1 88 1 73.27 GGGTGCCTAGAGTACCGAGNGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATGGCCATCCTGCTATTTAGCCATGTTTTGTT:1 + chr2L 13566528 3' + hobo 2893 1 72.28 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAA:1 + chr2L 17730496 3' - pogo 47 1 75.25 GTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAA:1 + chr2L 22224576 3' + Rt1c 5419 1 52.63 TCAGTCTGCCCGTATGAACGTCGAGAGCTCAGCAAGTATGTCTCATTGAGACTGTGGTATGATGGATACTGAAAAGGCCCACTGTACCATGCAATAGCATT:1 + chr2R 5043466 3' + INE-1 126 1 51.49 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATGAGCCGAAGTCAGCTAAATGGCCGACGCTCACCGATTTTTTCTCGCATGATCTCTACGTAA:1 + chr3R 3847177 3' - P-element 16 1 65.35 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGA:1 - chr3L 13773904 3' + roo 9022 2 74.26 GTACCCTCGATATATGCACNTACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGCTGTTAAGCTTTAAAAATGTCGGCGGCCC:1 + chr2L 18248079 3' - blood 6 2 73.27 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTTATTAATTCTCATAAAAAAATTGGTTAGTCTGGCCAAATCAGTCAAGGCAGAAC:1 - chr3R 21588984 3' + flea 235 2 60.40 CATAGTGCAAAAACAATGTATGGCCGTTACGCATCTTCTTATTCTTGTAGATTATGCCGTTTGCTTTTGTTATT:1 + chr3L 22110443 3' + 1360 3355 1 66.22 GTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTGCCTCTAAAACAACATCCCCGCCTCTGGGAAATATTCC:1 - chr3L 20317814 3' + 3S18 6067 2 61.39 CTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGGGAAAATTGTTCACAAGAGTAATATCAAAAATGACTAGGA:1 - chr2R 1571531 3' + 1731 310 1 74.26 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGTATATATTTTTGAGCCTTTGAGCAATTGTTCGTTCGTTACGAGCGTTTTTTTGTGGCATAAAAATGTTTTTA:1 - chr3L 5710217 3' + Transpac 303 2 69.31 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCTTCATCTCTTGCTCTTTG:1 - chr3R 27495640 3' + 412 468 2 54.46 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCCCTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTCCTTC:1 - chr2L 8622770 3' - 297 41 2 76.24 ACGAGAACTCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGAT:1 - chr2R 6085998 3' - 1360 3223 1 55.45 CGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGAATGAGGCACAGAGAAATAATAAATAAA:1 - chr3L 13374681 3' + Transpac 290 2 59.41 AGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAACTACAAAATGCCAATACACATAAAAGTTACACAAAATAAATAAAATTATCAA:1 - chrX 22119975 3' + Stalker 6906 4 62.38 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTAAACTTCAC:1 - chr2L 9045415 3' + jockey 4964 1 54.46 AAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTTGAGCTCCGATTTTTATTTTGCAACGACGACAGTTTTAAAATTCAGGGCATGTCCGCTGGCGTCTGACAGGCCCACTC:1 + chr3L 10475667 3' + Cr1a 11 1 63.37 GTGTACTTATAGGTACAGTNTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAACAAAGAGCGGGAGAAAGCTCTTGAAGAGCAGTGAAAATAGCAAAGAGCGCGT:1 - chr3R 14580289 3' - blood 25 2 54.46 AAATGGAAAAATAATGCAGNTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTGTTATCAAGGCTTTCAAGCATGAT:1 - chr3R 17781565 3' - pogo 48 1 73.27 AGTAACATAACAGCGCAATNAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGC:1 + chr3L 12634211 3' - BS 5042 1 72.28 CGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGGCCACAAAAATAAACAACTACGCTCACAGATACACACGCA:1 + chr3L 5241199 3' - Ivk 8 1 71.29 GAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGAAAGGCAATCCAAAAATGAAAATGGAAAAAATATACCACAGCAGCTGGCCAAAAGT:1 + chrX 13247610 3' - I-element 5088 1 56.44 ATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTACAACGAAAAGCTGACCACCCATAAAATCCCATAAAAGCATTCCAAAATAAGGGAAAGTGCTGCTAAAATAGCCTCAGA:1 - chr3R 4588896 3' + Doc 4451 1 58.42 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTTGCTCTCCTAATCGGCGAATCTT:1 + chrX 21217591 3' - pogo 16 1 61.39 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTAAAATGATTACTAAATTGATATCAGATTGGCAGATAATAGCAAATTGAATAAAAAT:1 + chr3R 19949378 3' - mdg1 21 2 58.42 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTCATGCTATCCTGCTT:1 + chr3R 23543015 3' - 412 36 2 64.36 AGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGCATAAATAAATGAAAATGCTACAGTTCAAAACGGACCATAGTTTAAGTCTTGGTTATTTTTCCACCTACGACTAA:1 + chr2L 16139210 3' - copia 2 2 77.23 AAAAAACTAATTCAATAAATCAAATTGTTCATTCGGTCCGTTTGCAAATACCAGAACGTCGCCAAAGAGCGATAAACGATAGACGACAACATTTAGAGCAC:1 - chr3R 24650057 3' + S-element 142 2 62.38 TTCGCTCTCCCACACAAAATCTAGAATTTCTTAGCGTGCAGACTGCTTTCGTGCGGTTGACGTTGACGGCGACGCGGTGGGCGATCATTAAGCGATCGTTC:1 - chr2L 18895345 3' + Cr1a 310 1 57.43 TAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGGGGGTAGACAGAATGAAAGGGAGGCGCAATCGGCGACTTGCAATGAATTTTAAGC:1 - chrX 4107225 3' - McClintock 6225 2 60.40 CAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCAGTGAAACCCAGTAATACTGCAAGCAGTGTGAAATGATCTGTTTACATCATAAACAATATCCATCCA:1 - chr3R 7326548 3' + R1A1-element 377 1 73.27 CTAAAATCAAAATTAAAATTAAGCATTATAGATATTATATTGATGGAGAAAAAAAGCTGCGTCGACGTCGCTGCCGGCAGCTTTATGGCGGAATTTACCTC:1 + chrX 6859059 3' - Rt1b 133 1 56.44 AGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCTAAATCGCACAATCAAAAATAGTTGTTTTCACAAGCGGAGAATATGAAATAATTCAGAGGTATTCAT:1 + chr3L 5710340 3' - Transpac 4923 2 74.26 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGCGTTGCCTCG:1 - chr2R 19560149 3' - Tirant 8131 2 56.57 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAA:2 - chr3R 4971415 3' - F-element 56 1 71.29 AGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATATTGGATATATCAAGGCTGCTTATGCAAGAGCATTATCAATTACTATTTGGGATTTCCAAAAGATT:1 - chr2R 9684993 3' - INE-1 111 1 70.00 ACTTTGAAGCGCTGTATTTTTCAGGCTAAAAGAAAGAAAATAAGAAAGAAGAAAACCCAAGCAATTCTGCGTGTTATGTGTTCACTTTCACTTGATCACTG:1 - 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hobo 52 1 73.27 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGTGGGCGT:1 - chr3R 25021659 3' + roo 395 1 66.34 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACGAAG:1 - chr2R 15788557 3' - Transpac 14 2 66.34 TACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCATACACATGTTACACACACACTTTGAGCATACATGGTCTCACAGCACTTTCCAGTTCTCTGCTTCTACGC:1 + chr3L 27390784 3' + 1360 3382 2 43.56 AAATTCAAAATGAAACTTATAAAGACTAGCGCAAAAAAATTAGTTTCGAAGTAATCATATATATGCAACGTCTGAAATCTTTGCAAATTTTAATAATGTTT:1 - chr3L 18104223 3' + Rt1b 91 2 84.16 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGGCAATAAGTAAGAAATAAATGAAACCTCAAATAAATGGCAATTCA:1 + chr2R 11941075 3' - 297 6602 2 60.20 TATTTTCTTTTGCTTTAAGCTTTGTACTATGAACCGTTATCTTTCGTATTTCTTTTCGACTACCTTCTGCAGAAAATCAGAGTATCAACCCCGAACACCAA:1 + chr3R 435983 3' + Bari1 1534 1 70.30 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATTTTCGAATGACCCAT:1 + chr2L 5927010 3' - pogo 23 1 51.49 TAAATTCCTCAAAAACTGTGCCAGGACAAGGACCACTAGCAGAAGCAGGAGGATACTTCTTTCACATGGACAGAGGCGGGG:1 + chrX 9927707 3' + Tc1 1259 1 59.26 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATTTAACTAGCAACTCGG:1 - chrX 13146907 3' + roo 9047 1 54.46 TGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGTTCATAGTCATAAAACATTAA:1 + chr3R 25370545 3' + BS 5063 1 55.45 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCGGTCTACTTTGGCAAATGTGTTAGGCCTG:1 - chr3L 7541953 3' + roo 360 2 74.26 CCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACATGCGCATTCCAGCGCACAAATATCCCACCCACGAAA:1 + chr3R 15935263 3' + 17.6 130 2 63.37 GATGCTGCTTATAAAGGACCTTATATAGTAACAAAGGTCCTCAACAACGATCGGTATATGGTCGAAATCCATGGATTCAGTGATGTCAGCATTGACGCATA:1 + chr2L 22227910 3' + Bica 4723 1 61.39 AATGGAAAAATAATGCTGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAA:1 + chrX 21217560 3' - pogo 47 1 72.28 TATCTCCAATAGTTTAGGANGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTG:1 - chr3L 13295230 3' - hopper 42 1 68.04 TTTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTTAGTAGTAGTGGCTTGTCATACTACGGAAACAAGGAGAAATCATATAGCGACGCATCAACACCAAATTCAATATAA:1 + chrX 12919076 3' - gypsy9 463 2 71.29 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTA:1 - chr3R 7869114 3' - 297 6609 2 53.47 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCCCTTCGAAAAAAAAAAAGAATTCTATTAGGAAATGCGAACCGGTTGCAAGGCCATTGAGTTATCAAGCCAAC:1 + chr2R 21747627 3' + mdg1 7455 2 70.00 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCCTATCGCAAACTAAAGTAT:1 + chr2L 16680069 3' + P-element 2834 1 28.71 AGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCCATGGGAACTGGGGAGCTATCCCCGCATTCTCGTCAGGATCTGC:1 - chr2L 13566477 3' + hobo 290 1 46.53 TCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCG:1 - chr2R 19560168 3' - Tirant 8151 2 68.00 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAATTGATAGCACACACACACACACACACACACACACACAGTAATGGCCACAAAATTAGCAA:1 - chr3L 8039336 3' - hopper 18 1 47.00 ACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGC:1 - chr3L 16973356 3' + S-element 169 2 65.35 ACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGGAGAGCTTAGATAAAGAAGATTTCACTGCTGACGTG:1 + chr2R 2094935 3' + Doc3-element 50 1 64.36 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTGCAACG:1 - chrX 4277456 3' + roo 397 1 68.97 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTG:1 + chr2R 13653398 3' - F-element 58 1 67.33 TAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATCGCTGATTTTTCGCAGTGAGCTAAGCGTTCTGAAAAACAGTTTAAGGTGTGTTCTTGAGCTTG:1 - chr3L 735998 3' - gypsy6 8 2 61.39 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACAATAAGAGTAACAACAATGCCCAATCGACATAATCATAGCGTGGGAAATTCG:1 + chr3R 7139317 3' + pogo 2080 1 58.42 GGCTCGATTTGCGAGAAGATATAGACGCGATATTAAAAAGAGAACAGGACTTCAACGACGACAAGTCATATCACTTACTTAACTACGAACTGACACAGACG:1 + chr3L 26386250 3' - Cr1a 4378 1 59.41 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAAATTGATTTTAGTTATTACTACTAACCACCTTTCTTAGTTTCATA:1 - chr2L 3346252 3' - pogo 26 1 57.43 AAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGCATCGTGTCCGCCCCTTCAAAATAAT:1 - chrX 15255366 3' - Tabor 6890 2 73.27 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTA:1 - chr3R 11151809 3' + mdg3 5481 2 61.62 TTTCACAGGTAGGGTGGGAATAGAATATGGCCAATAACATCTGGGTCTGGTTCTTAACCGTTTGGTTATTGTTTTGCATAATTGCATAATTAGTGGTTAGG:1 - chr2R 19648641 3' + Circe 7192 1 78.22 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAA:3 - chr3L 3757364 3' - roo 8718 2 85.15 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCTTTTAAGTTTCTATTCCACCCTGATTTATTAGAAAA:1 - chr3R 20420929 3' - blood 7050 2 64.36 CTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAATAAATCATCAGTGCCATGAAAATGGGACTGCA:1 + chrX 15546248 3' - blood 1 2 76.24 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTG:1 - chr3L 20049646 3' - jockey 4814 1 75.25 AAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAACTGAGGGAAATAAATTTCGTCGGAGGGGCGAGCTGTTCTCTTCCACTCATAAATTTTGTCACATCAAT:1 + chr3R 12197960 3' + jockey 4918 1 74.26 AAGTGGAAGTTCCATGTCTTTGTGGATGTCATGATTAGTCATACCATATGTACATACATGTGTGTGTGTCCAGATTCGGGGCCTCAAATTATGATTATCGA:1 + chr3R 13067785 3' - G3 4324 1 65.35 AGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGCCAAATATACCAACCGGCTCGGAAATCATACCAAACTGCATATGAGGTGGCATAC:1 - chr3L 15955057 3' - jockey 4584 1 51.49 TTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTGAATTTTCATTAACGGCTAGGCTTTAAGGAGTTTTTCCAGCTTTTAG:1 + chr3L 3401481 3' - P-element 441 1 52.48 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAAAACAATAGGCCACAGCAGTGAGCTTGGAAGAGGCCAAACCT:2 + chr3R 10434946 3' - 1360 35 1 60.40 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTGGCAACAGTTGGTTGCCATCCTCTATTCACTAATGCCTCTCTAAAAAGAGCGAAGGGAATG:1 - chr3L 17942611 3' + copia 240 1 61.39 GGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACCAAGTAAGTTATCTGACATGGCAATCTTGATTCGATAAGAAGTGAAACATATATAAAAACTGAGTA:1 + chr3L 12264117 3' - G-element 17 1 64.36 TATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACATATTACATGGCACCTCATGCCTACTCAGATGGTCATTGTAGCAAATACTAACATTAATTATTTAAAGA:1 - chr4 423060 3' + Stalker2 387 2 66.67 ATAATTATATTCTTATATTAATGCTTCTCAGTTTATTGTACAATTTTCGCCAATGCAAA:1 + chr3R 18431274 3' - transib3 2609 1 93.22 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTTATGAGTACATTTTGCTCTTTACGAACTTTAAGATTTCTTTGCCCCGTTGGG:1 - chrX 3661374 3' - roo 8689 2 51.49 AAATGTTCTCACAGATAATAGATAAATTTACTTAACTTACTATTATTGAACCAATTTGAAAAGAGGATATCTTAAGGATAAGGATATCCAGGATGAACACA:1 - chr3R 13937964 3' - Juan 43 1 44.55 GTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAGAAAATAAATGAGTATACCCAAGAACTGAGTTCATTTCAGTTAAATGACCTGCTTTCGATGAAGT:1 - chr3L 8864559 3' + X-element 4707 1 59.00 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATACTCGTACACACACACCCCAGAAGGCGTTGTGTCCAGCATGTACGAGTGATATATAGATGATTTGTATATGA:1 + chr2R 8311400 3' + opus 499 1 79.80 AATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTAACTAGTGGTGAACTATATTGTTACAGCAGTAAATAAATAAGCTGCACTCATAAAAATTTAATCAACCGT:1 - chr3L 20882756 3' - 412 3 2 73.27 AAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATATTAATTATATATCAAATAGCATGCATAGATTGACAAGAAATCCAAGATTCATCCCATA:1 + chr3L 19089679 3' + invader1 389 2 56.44 CAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTAC:1 + chrX 734956 3' - Tabor 54 2 76.24 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATCAATAACAATGCGAATTACGGGGCAATAGTT:1 - chr3R 12767288 3' - blood 7056 2 69.31 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGCGTGCGTG:1 + chr3R 24767852 3' - P-element 41 1 38.61 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACCTACATACGTACATATAACAACTTATGAATCTCAATCTGAATCTGG:1 + chrX 9205574 3' - diver 33 2 56.44 TAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGCTGAGGGTTCAGACAAAAGGGATAC:1 - chrX 4166352 3' - I-element 5294 1 70.30 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCGGAACACGTTGTTAGCCCGGCTCC:1 + chr3R 14193979 3' + pogo 2077 1 53.47 AACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAATAATAGGTTGGAATAAAGTAATAACCCGAATAATAGCATATGTCG:1 + chr2R 15796918 3' - F-element 4547 1 55.45 AAAAAGCAAAGACATGAGCACGACATTTTTCTTGGATGTTCCCTTTTGCCCTTCATATTTCTGACTGTGATCGCGCCATGGATACTCTGTAAATTCCCATA:2 + chr3R 22481884 3' + hobo 2601 1 59.41 TACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAAATCCTTAAAGTTCCCTTTTATTTTACATATTTCGATTTTAATTTTCCCAGCTATAGCATCCT:1 + chr3R 17781644 3' + pogo 2093 1 71.00 AGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTAATCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCAATAGATATAGATTATAAAAAAA:2 - chr2L 20716881 3' - INE-1 557 1 77.23 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACAATAAGAGTAACAACAATGCCCAATCGACATAATCATAGCGTGGGAAATTCGT:1 + chr3R 7139318 3' + pogo 2087 1 63.16 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCGAGATCATCAAGACAGAGGATGG:1 - chr2R 11259588 3' + hobo 2887 1 75.51 TTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTT:1 - chr3R 28240017 3' + Cr1a 149 1 72.28 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATTTCTCTTTATCTTTTCTC:2 - chr2L 13093765 3' + roo 9047 1 54.46 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTACCAGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTACCAGTGTGTTTGTAACCCACCTTACAAACTTGTTTGTTTCTA:1 - chr2R 8177674 3' - mdg1 7042 2 73.27 AAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCATATGTCCTCCAGCTGCTTGCTAATGATCTCGTCCTGTTGTCCAACGCG:1 - chr2R 23675524 3' + hobo 2623 1 51.49 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACGCTTTTTGAAACCAATAGGTATTTTACCGATCTGCTTATTATCTTAACTTCAGGAAC:1 - chr3R 27169410 3' - 412 7072 2 58.42 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAG:1 + chrX 9413852 3' + 412 443 2 73.27 ACAAATCCAGCCTGCCCTAATGTAAACATTAACATCCTTAGAACTTGCAGTTTCATCTAGCTACCACAAAGGAACAAAAAAAGGTAATCAAAAGCATTAAT:1 + chrX 21032586 3' + Quasimodo 157 2 36.63 AGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTATTGCCATTAGGAGGAACCCCTTCAATTGACCTAAGCGG:1 - chr2R 18188282 3' - Juan 4028 1 75.25 GACTGCAAGGGCAACTTGCACTGGAATGACGGCCAGCGAGAAGGATTTTTGGACTTGGGCCGGCAGTCGAGTCATCGTAGGACTGACCATTCCAGCTGTCT:1 - chr2L 20729097 3' + aurora-element 137 1 60.40 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACACTAGAATTGAGTTTAAATATACAGACA:1 + chr3R 28565311 3' + 412 441 2 69.31 GTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGATATCTTGATAATTTCGTATGAAGCAGCATTTCAAAAATAATTATTCTATG:1 + chr2R 14698872 3' - F-element 271 1 57.43 TTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTGCAGACTCTACCGTATGTAGTTTGGTAAAAGCAGTAACATTTAAATGTTA:1 - chr3R 18300870 3' - Tirant 23 2 56.44 TTTAATATCGCGTCTATATCTTCTCGCAAATCGAGCCGTACGATACACGCATACTTCTTCCAAAAAGGATATGATCCGGGCCACGGACTTTAATTTCATCA:1 + chr2R 16941442 3' + Cr1a 4363 1 60.40 AGAAGATTAATTTGGCGTAAGCACAATGAAGCCAAGAAAACGCATTTGAAGCTGAACGCCAGTAGGTTTCCTGCCTTCGTGACAATCCACACTTTCGCTCA:1 + chr2R 22058806 3' + Doc4-element 2452 1 69.31 TGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCC:1 - chr2R 15788576 3' - Transpac 4952 2 53.47 TGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:2 - chr3L 11115124 3' - micropia 32 2 54.46 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTGGCTCTCAAATTGAATTGTTTGATTTGCCTCAGCA:1 + chr3R 19449500 3' - hobo 40 1 69.31 CAATCACAAAAAAAATTACATTAAAACCCAAATTTCCGGGCTTTTACCCATAGTGCACGGTTTAAACAGGGATCTTTAGATACATGTAT:1 - chr2R 4547800 3' - transib4 34 1 65.17 TACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTTACACCTGCGCTCTTGTGGCGGTCAGTGATTCAACCATCAGATGAACCTAATTTATGGTTAATTG:1 + chr3R 20141071 3' + accord 355 2 68.32 GTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTAAGAAAAAATACATAATCGCGAAAAAAAGCCACAATGGCAGCGAAAATAAACAAAACAAATG:1 + chr3R 10085428 3' + roo 8972 2 61.39 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTA:1 - chr3R 4971400 3' - F-element 41 1 56.44 TTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAAACATTTTATTAATAATCGAGTAATCCAGGTTTTGAG:1 + chr3R 25086191 3' + Bari1 1701 1 73.27 ACATTATTGTAAAAAAAACNGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCATCTTGGC:1 + chrX 19034196 3' + hopper 1397 1 61.39 TTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTGGTAGTAAACATCACGCACTTTGCTACTTAGTGAG:1 + chrX 17032270 3' - I-element 5083 1 65.35 ATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTT:1 - chrX 8334313 3' + flea 204 2 79.21 ACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAAAGTTTACAGTGCAGAGAGTACGACAGTCCTGCGCACAAGTATACGTAACAAATGGCCATGCAAAGCAC:1 - chr2R 12252839 3' - jockey 4767 1 50.50 TGGTAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTAGAGTAGGCGTGGCAAAAATAATGAAGGCGTAGATTGAGCTACAGCATCATAAGATACTTCTGGACTTTATAC:1 + chr3R 5514917 3' - INE-1 350 1 62.38 GTCCAGGTTATGAGAGGCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCTTGTCGTAGCCGGAGCTGCTGCTGCTTCGTGCTGATCCGCCGCTGCCAACCATTTTCAG:1 + chr2L 6933798 3' + R2-element 3277 1 57.43 CGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGAAAATAAAAGGATATTTAGGAGTTATTTCAGGGACAACAATCTGCAAATAAAGGATTTTGGTATCAGTTTCCGG:1 + chr3L 14359361 3' + roo 260 2 74.26 CAGTTTTCTTACAAAAACTNAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTA:1 - chrX 23280895 3' + roo 377 1 52.48 GCAAGTTCCCAAAAACAAAAAGAACCGTTACATTGCAGGGTGTATATAAAAGGAATTATAAATATGTGTATTTGTACTCAGGTAAGTTTTGTGTGTGCAAA:1 + chr2L 23173799 3' - Tc1 163 1 67.33 GGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCCATCTACGCGGATGAATGAATTAACGACGGACGTGTTTTCG:1 - chr3R 2412143 3' + R1A1-element 99 1 65.35 GGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGGAGACATCACCATTCTGAAATCCAAACTATGAGCTGCGTTTTGTTTGCCTGTCACAACACGAGGCCCCTGTT:2 - chr3L 10043541 3' - G6 1883 1 69.31 CCAACTGTTCTAAGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGGTGGTAGGTCCTTTCGCAGGAGACGTGTAATCGAATGATCTATAGTGAAATCAGC:1 - chr3L 18169967 3' - F-element 4565 1 64.00 CGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGAATTAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTACTCGCCACAAATACGCACAACATACAT:1 - chrX 23439063 3' + R1A1-element 69 1 73.27 AAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTAGAAACCAATTGCTCATCCTCGGTTACCAAGCAATTAC:1 + chr2R 18523436 3' + mdg3 5083 1 63.37 GTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAATTACGGTGCAATTGTGTGAGTGTGCGTTCGAACTTGTGT:1 - chr2L 23390327 3' - gypsy6 7428 2 68.32 AGTCGAAGAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTGTGAGCCTCGACATTGATTTATATTCGTT:1 - chr3R 24085320 3' + invader3 5417 2 69.00 TGGGTAGGGGTTAAGTATGNTTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGACATCTGTTTGGTTGGACGTGCGCACGTTCTCGAGTGTA:1 + chrX 6223020 3' - G2 2959 1 60.40 CGGAAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGCACGTGGGACCCATGCGAAAAAAAAAATAAGGCGCAGGTGCTATGC:1 - chrX 3685528 3' + Cr1a 4410 1 71.95 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATACGTATGTATACACAGTGAGGGCGC:1 + chr3R 23641033 3' + 297 6930 2 80.20 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCGGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGT:1 - chr3L 19274784 3' - transib2 11 1 66.34 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACG:1 - chr3L 20049623 3' - jockey 4791 1 52.48 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTAATCTTAAACCTTAGGCATAATGAGTGTTTGGTTTTATCAAGTAGTTTACGAAATAAACGTCAAATA:1 + chr2R 10353341 3' - blood 7020 2 68.32 AACCAAAGACACTAGAATAATAGAAAGAATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTACGAACCCTGACACGAGAAAGATGATAAGCAAGGCAGGGCATTTTGCTG:1 + chr3R 7451618 3' - Tc3 313 1 49.50 AAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTCCCCCCGTCGGCTGCTCTGTTGATTAGGCTG:1 + chrX 6152625 3' - G-element 4220 1 67.37 AGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCATAATGGTCAAGAAATGTGATTTGAATTGGGTTGATGATGTAAGATTAGG:1 - chr3L 16918733 3' + invader3 184 2 56.44 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGTCTTTCGTTACCAGACTGAGACAAAGACAAACACAATCAAAAGGACTTGGT:1 + chr2L 10625749 3' - roo 24 2 55.45 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATTTCTCTTTATCTTTTCTCACTTTTTTCG:1 - chr2L 13093755 3' + roo 394 1 64.36 AAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCGTGGT:2 + chr3R 2533954 3' + gypsy8 251 4 54.46 CCTCTCTGCTGAACAACCGTTCAGGGGGGCCGGTATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAACTCCCCTTTCTAAATTGTACTATATATTTTT:1 - chr3L 5479814 3' + 3S18 5731 1 75.25 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACGAATATATTTGCTTTGTCTCGGTTCTTTGCATACTGCCATCTCGCTTCGACTCTGGCCT:1 - chr2R 17392594 3' + opus 486 2 67.33 GCTGATGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGT:1 - chr3L 16792548 3' - Chimpo 4039 1 57.43 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGCAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTAAGCATCTGAGCGGCCTAAAACTCCCCTGAGAAGTGCACTACA:1 - chr2R 10372112 3' - mdg3 32 2 53.47 CTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1 - chr3L 25232768 3' + accord2 178 2 51.58 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGTATTTACCTGTAGATTGCGCAATGATAAGTCTTGGTTTTCAAACAATTTT:1 + chr3L 16546864 3' - pogo 23 1 51.49 GCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTTGTTAAGCTATCCTTCAGGGATGCTGCCAGGGGCAACGAACTTCGTTGGCCTGCTTGATGATTTCGTTACGAATG:1 - chr3R 6701642 3' - F-element 499 1 76.24 GAAGAGTGTGAAAAGATCCCGCTTGAATACAACCCACAAGAAGAAGAAAAGAGAAAGGGGAAGTAAATTTTATTGTTACACCAGAAAAATA:1 + chrX 7589234 3' + S-element 1331 1 71.43 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCA:1 + chr3R 26258680 3' - hopper 46 1 70.41 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTTGATGTGGAA:1 - chrX 17029980 3' + flea 242 2 60.40 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAAGTT:1 + chr3R 11052162 3' + blood 339 2 67.00 TGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATGGCATTTGATTATCAAGTGTTTTGAGATACTCCTGGGTCGGGAAAGTGATGTGAG:1 + chr2L 15898827 3' - F-element 35 1 57.43 CAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCTCAAACACACACACACATGTGCGTCTTTTAAAATTCCTTCGATAAACGACATTTAGGGG:1 - chr2R 9209406 3' + Tirant 8494 2 63.37 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAA:1 + chr2R 10670029 3' - jockey 4801 1 67.33 CGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAAACCTTTTCTTGTTTCAAATGGCCTGGTT:1 - chr3R 7513929 3' - diver 49 2 71.29 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTGGGCTCAGTTCAATGCAATATTGGAAATGATAG:1 + chr3R 20684915 3' - roo 8708 2 72.28 GAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCCGCCAACTCCCCAGGATCGTGGTTGCTAAACTTGACATGACCGCTTACCGAGACTGGGGCGGAACC:1 + chr2L 7359848 3' - invader4 4 2 71.00 TTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAATTTGCATTAATTCCTGTGCCTATTTCTTATGATTTTACT:1 + chr3R 26361716 3' - Doc 265 1 46.53 ATTCTTTTGCAGCGGCACTTAGCTGTTCTTGTAAACATATAGGTAGGTAGGTAGTTCAGTTCGGCGATGGGGAGATGTTTGATTTACTAAATTGATTCAAT:1 - chr3L 6372500 3' + 17.6 176 2 66.34 AAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTGATGCAAAAAGTGAATTAAAATCAGAATCACAAATCGAATTGATATGTTGGGTAAACTACTTTTCG:1 + chr2L 19643501 3' + Quasimodo 140 2 65.35 CTGTGAACACGTCCACTCAATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGCGGAGCTGTGGCTCTGGGAGAAAGGCAAACAGAAGTGATGTAAAAATATGCGTTGC:1 + chr3R 12199839 3' - jockey 27 1 57.43 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTAAACTTCACATTAAAAC:1 - chr2L 9045407 3' + jockey 4973 1 55.00 TTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATATATTAAGTACATTCATATTTCAACTTATAAATAAAATAAAGTTTCGATCTGGAATTGTTAGTATTAA:1 - chrX 14172967 3' - 412 8 2 71.29 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGGAGTTCATCATTACAGGATATTGCAACACCAACAGTAAAGCCCCGC:1 - chrX 21060322 3' + 412 446 2 65.35 GACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGTTTTTTGTGACTTACTTAAGGGAG:1 - chr2L 3408636 3' - G-element 54 1 73.27 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACAT:1 + chr3L 3540206 3' - mdg3 5282 2 50.50 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAATAAATCATCAGTGCCA:1 + chrX 15546232 3' - blood 17 2 62.38 ATCTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCGCCTATTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATGATTATTTGAAAATAGGACAGTGTGTCAAGTCATTTTAA:1 - chrX 1193243 3' + 1360 248 1 77.23 ATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGAGTGAAAGTATGGCAAAATTCTGTCATTTATTTATAGCATGAATTGTGTG:1 + chr2L 15914182 3' - 297 6793 2 55.00 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAACTCTGATACTGGGAAACTCTCTCAATCACCTAGAGTTGTG:1 + chr3L 25876139 3' + copia 220 1 60.40 CGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTTTTTGCCACGCTCTTTATGGGATATATTTTTTAATAACATTTTTTACTGACCATATATGG:1 + chr3R 17195056 3' - invader1 399 2 71.29 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATATGACAGCATTTTTCCTTCGCAGTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGG:1 + chrX 15903345 3' - Transpac 7 2 47.87 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGTGCCGGAGTGTGAGTGTG:1 + chr2L 18213253 3' + hopper 1413 2 77.23 CGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAAACCTTTTCTTGTTTCAAATGGCCTGGTTTTTTTATAATATTTGCTTAA:1 - chr3R 7513910 3' - diver 5917 2 51.49 AATACGACCAATTTCAGCGTATTTTTTACCTTCAGAGATCATGTTTTTAATCAAATTTCTTTTTTCGCTGCTATGAAATTTTACTTTTGCATTTCCCGGTA:1 - chr3L 6988021 3' - Tc1 430 1 64.36 GTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAAAATAAAAACATTGTTAGGAAAAGTTCGTTTTTTTCGTTTATAGTTCTTTCTT:1 - chr2L 16678584 3' + P-element 474 1 50.50 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATATAGACAGATGCCGTGACATCTGCTCATCGGTTTGGAGTA:1 + chr2L 3633103 3' - P-element 31 1 48.96 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCCTTGTGCGTGAGCACAATTATTCAAT:1 - chr2R 13763192 3' + roo 9034 1 61.39 CACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAACCGAAATCGGAGGACACAGA:1 + chr2L 20997027 3' + hobo 2831 1 79.21 CGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGGCGACGTTTATGTCTCACAAGTGGGTGAAAGGGGACGGAAAGGAAAGGGAATGGA:1 + chr3R 15130221 3' - P-element 2860 1 60.00 TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATCCCAAAAAAAGAGATACTTAAATGCCAAATTCTCTGGAAATTTAAGTAGTGTTCATATGTAC:1 + chr3R 19505624 3' + mdg3 5485 2 45.54 GGGTACCAACCACAGCCACNACACTAACTATATAAATAAAACCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTT:1 + chrX 23280909 3' - R1A1-element 5003 1 69.31 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCTTGTAATATCGAAATCAATGAGATTCGT:2 + chr2L 9045458 3' - jockey 56 1 72.28 GCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCGTTAATGCACCGCCCATATCTGCGAATATAGCCATTACGAC:1 - chr2L 22016238 3' + jockey 4612 1 61.70 GATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTCTTCTATATCTGTTTGTGTTTGCACGCCTGTTTTCTGTGT:1 - chr3R 10095334 3' - Rt1b 5094 1 60.40 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCTATTATTGGTTGAAATTGGGTTATTGTCTAATGGCAGCACTTTATAGCTTTTTAATGAGCCCCCGAAATGTGCG:1 - chr3R 8582513 3' - roo 2 2 77.23 CAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGTAAGCAGATCAATAAACTCTCGCCTGTCCGTCT:1 - chr3L 570822 3' - BS 57 1 72.00 CCTCTCACACCTGTTGTCGNTGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAAATAATCCGCTGATTCTGCATTAATTCAGCGAAAGCTTGACCATTTCACTGCC:1 + chr2L 2691987 3' - blood 484 1 63.37 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGAT:1 + chr2R 10670024 3' - jockey 4806 1 72.28 AATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCCAAAATAAATAGAATGAATGATTAAAAAAAAATGATGATAATGGTCTGCTCATGA:1 + chr2L 22225074 3' + G5 4782 1 77.23 ACAAAGAAGACGCACCGTGAACTAAAGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAG:1 + chr3R 2533941 3' + gypsy8 4811 2 50.55 GAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGTTACTTGAATTATGTACATCTTCGTTGCAACCAAAACA:1 + chrX 22574744 3' - 297 6776 2 76.24 GGAGCACGATAAAAACGTCATCACACGTCGGCGATCGAATTATGGCATTTGATTATCAAGTGTTTTGAGATACTCCTGGGTCGGGAAAGTGATGTGAAAA:1 + chr2L 15898829 3' - F-element 32 1 61.00 AACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAAAGAAACAATTCCACACAGCAATTAGTGCGTGAAGTGTCGGCCAACATTTAAGCCAACAA:1 - chr2L 10035519 3' + R2-element 3397 1 62.38 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCCTTGTGCGTGAGCACAATTATTCAATATTTCCCCTGAACGGCA:1 - chr2R 13763175 3' + roo 388 2 52.48 GTCGAAGAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTGTGAGCCTCGACATTGATTTATATTCGTTAT:1 - chr3R 24085318 3' + invader3 232 2 67.33 AACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCGATTTGCAATTCTCCGGGCCAACAATTGCATTGCTGACAAATGCCATAACGAGCTTTACGTAATG:1 + chrX 3866562 3' + F-element 4385 1 70.30 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 11967085 3' + copia 242 1 60.94 TTGGTTAATTTCAGACACTTAATATTAATTAGTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCATATTAGTTTGAGCCAATTCCCAAGGAAGTTACTTATACTCTTAT:2 - chrX 919267 3' - 3S18 6061 2 55.45 CATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCATAACCTCAAAATGCTGAATAGAAAAACAGCAAAACAACAAAAAAGGGAGTTGAAAAAAGGAAACAGAACACG:1 - chrX 12249236 3' - opus 207 2 77.00 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTATAGCATCCTGTATCGATTA:1 - chr3R 19450676 3' - Burdock 54 2 80.20 TTACTTACTTACATATTAACTCTACTCTACATATTGAGGGTAGATACACACCCCCCCAACTATACTTACATACTCTGAGCATGTGAAATTAGATCGTAAGC:1 - chr2L 1517616 3' - Stalker3T 32 1 57.43 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCATTG:1 - chrX 21667990 3' + Tabor 469 2 58.42 TGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTTTCGTTTAAATTAATTAAATTCTCTGCACATTCGAAAATTGCCTGCTAGTATGCTAATTA:1 + chr3L 9758620 3' - roo 317 2 65.35 ATTGACATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATAACTAGGGGCCAACTTAGTACAAAACATTGAGTTACTCCTACAGCTAGGTGTATATG:1 - chr3R 24313942 3' + F-element 4310 1 62.38 GAGGACACACTGCGGTGAGCTAATATGTATATATGTAGTTGCATTTTTTCTATTCATTCATTTTCATTGCTTCAATTACTGGGAAAGTTATTTATAAACCT:1 - chr3L 2528408 3' + aurora-element 4204 1 79.21 TGGAAAGTTCATTTCCTAAAAATAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTCAGATTGCATGAAAAGTACCCGGAACAAAATGTCGACTAAGGGGATTGC:1 + chr2R 19092819 3' + Tc1 36 1 70.30 GTAACGCCATACGATTTTTTATTATAGTGTCTTTGGTATAACACTCAAGATTTGGACCTTAGAATCGATTTTTTTGGCTGAAATATCAAATTTTTGAGCAT:1 - chr2R 24270812 3' + 1360 26 1 62.38 GACACTTAATATTAATTATNTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGATCAAAATTGTGAGGCTTTCCCCCCATCACCCTTCG:1 - chrX 12115213 3' - 3S18 283 2 71.76 TACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCCAAAAAGACACAGGCGCGC:1 + chrX 21009384 3' + hopper 1360 1 78.22 GTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGTGCTCATTTAAATGTAGTTACGCTGAAATTATCAATTAACAAAGTTATATCAAATATTTTCTTCC:1 + chr2R 16467932 3' - F-element 4310 1 65.35 AGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAATGCTTTTTAAAATAATGGTGTTTTTCCTAG:1 + chr3L 13096946 3' - I-element 267 1 69.31 TTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTAACTCAAACACAAGCCTCCCATCCGCACACCTCCCCTGCTTTTGG:1 - chr3R 11058942 3' + roo 463 2 56.44 TCCTAATTTGGGCACCTTGNGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGCCAAATATACCAACCGGCTCGGAAATCATACCAAAC:1 - chr3L 15955076 3' - jockey 4603 1 63.37 AAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATCAGATACAATAAATAATAAATAATATTTAATAGTCATTATTTAGTTACCTTCAGCAAGT:1 - chr2L 9735864 3' + hopper 1078 1 70.30 CACAACCACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATTTTTTACGCCCGAGTTTAAAATTT:1 - chr2R 12812284 3' - jockey 59 1 65.35 ACGCTGAGAGCGTAAGGAATCTATAAATCGAATTTGCTTGATTGTGTGAGTAAAAAGAATAGACCCGAAACATAATTGTGAACGCATTTGCCTATATAAAA:1 - chr2L 18762482 3' - 1360 3285 1 67.33 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATTAAATTAAATATGACTAAAAACAACTATA:1 + chr2R 18188344 3' + Juan 4163 1 77.23 TATGTATATGTATATATGTATGTATATGTATATATGTATATATATGTGTATATATGCAGATTTATAAAAAAAAAGAACGAGAGAAGCAAGAATATTCCACA:1 + chrX 18340603 3' + Stalker4 249 4 62.38 GAGCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTGCACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATGCAATGACAACAGAGCCAAGGACCAAGTACCAAGAAC:1 - chr2L 15850684 3' + mdg1 7349 2 63.37 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGACAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTGGATCTGCTTGACTGGCGCA:1 + chr2R 7810342 3' - roo 22 2 78.22 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTGATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAATGGCAACTGCCTCCTGCAA:1 + chr3R 22494198 3' + 297 383 2 69.31 ACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTACATCTTCTTCAGCTTTGACTGTTGCCCCTGATCCCTGTGTTCCCTCTTTTTCGGCTTGTCAT:1 + chr3L 5906638 3' + 297 6733 2 70.30 TAACAGTAAGGATGGCAAATCCAGGACCCCCAGCGTATGGCCGCATTGCTTCGCGAGGAAATTACCCATATTGCCATATTACCCATATTTCACACTTTTGC:1 + chr3L 21695388 3' - Rt1c 5365 1 53.47 AATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGGCGTCGCCCGGGTAACTTAGTTAACTTATATATATCGCTGATTTTTCGCAGTGA:1 - chr3L 736045 3' - gypsy6 7462 2 77.17 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCCTTAC:1 + chr2L 12882814 3' + hopper 1393 1 55.00 TTTACATGAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATAACTGATAATTGTTCCAATTTTTCAA:1 - chr3R 11916565 3' - roo 8711 2 71.29 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATACAAAAACAGACACAAGGGTAAACACCAGCACACACACGCTGTACATATGTGTTTGAGTGAA:1 + chr2R 23116284 3' + jockey 4978 1 55.45 CAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATAGGAGTGTGTGTATAGCGAAAAGTGCGGGCGAAGGCAATGGCCATTCGCTGGATTCGAAGGGTTTCCAG:1 + chr2L 14035625 3' + flea 253 2 72.28 CGCCCACTTCGCCTGACTCTGGTGAAATTCAACGCGGCAACAGCGCAGGCCCCGTCTATCCCTGACCCCATCGCTCGATCCCGAAGAACCCGCGAATG:1 + chr2R 10510737 3' + Chimpo 262 1 54.08 ATCTTGTTATTCTAGGGTCNTTGATCTAACTGTGAACAACATTAAATGAGACTATCCCGCCATATGTAAAAAGTCAGGTTTGAAGATAACCAATGGAGATT:1 - chr3L 12112304 3' - 1360 2 2 77.23 ATACTAATAAAAATAATAATAATATCAAGAAATAGTATTATAATTCAATAAATTAATTCAATTTTTAAAATTGTAAGTTAATTTGTTTGGCAACT:1 + chr2L 3969211 3' + mdg1 26 2 68.42 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGGCGGGGG:1 - chrX 11025503 3' - hopper 29 1 51.02 TCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAGCAAGGCATGTCTGTTATGCCTAGCAATTAATTCAAATTGCGCGCCGTTGGCGTTGCCAACTTAATGAAGCGTGCA:1 - chrX 8265462 3' - invader1 349 2 61.39 GGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGTGTAGTTCGAAATCCACTAACAACA:1 + chr3L 16282411 3' + gypsy5 357 2 75.25 ACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCCTCTAAACTAATGAGCGGCATTGAACGCATTTCAAAGCATCATATAGGATCATTAAAACGGAGAAATAACTCAA:1 - chr3L 18317521 3' - hobo 408 1 78.22 GAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTGTGAGCCTCGACATTGATTTATATTCGTTATTTGGGTTTATTTATTTGCGATTTTGTTTTTAT:1 - chr3R 24085286 3' + invader3 5454 2 68.04 AATAATGCAGATATCTTGCCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCAGAAAACGA:1 - chr2L 5926941 3' - pogo 39 1 50.50 TCACGTTCCCACGTTTAAAGCTCGGACCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAAAACACGAACAGCGGCGGTTACTAAG:1 - chr2L 11906577 3' + Idefix 7060 2 74.26 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTAATGTCCCCACATTAACAGAAATTTCGACTTGGCTCTGCGGTTCTA:1 + chrX 13147010 3' - roo 8669 2 74.26 AAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGCTTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAGAGCGAGTGAGATTTAAG:1 + chr3L 2176392 3' + roo 390 2 60.40 TTCTTTTTAAATATGACCAGAGGTTTTCTATTATGTTGAGGTCTTTACCTGTCCTCTGCCATTAATTGAAATCCAATGCGGAAGGGGCGTAGTAAAGTGC:1 - chr3L 2163073 3' - Tc1-2 1196 1 57.00 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCATTTGTATCTGTTGAAATTAAGAATACTAAAGATAGCTGAGTTTAATTTGTAATAAAATTAAAT:1 + chr3L 10110631 3' + roo 398 1 46.53 CAAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAATGCCAGACTAGGAAGGGTTGGTGGGGAGACGGAGACGCAACAA:1 - chrX 21064574 3' + 1360 3310 1 57.43 ATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTAGCATGGC:1 - chrX 20885948 3' - Ivk 5354 1 71.29 TTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATTGGGTTACGTAAGCCCATATCTTTTATGATACCAAAAACATCATACTTTTA:1 - chr2L 21734999 3' - 17.6 6946 1 59.41 CGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTAGCGGCTCTTGCACCGGAAACTGCACTAATTGATGCTTAATTAGCGATTTCCTCAGCT:1 + chr3L 7154711 3' + Doc 257 1 61.39 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGTTTAAACTCTCTAATTATTATGCGTAGTCAATCTTAATAAAAGACCCA:1 - chr2L 6251660 3' - mdg3 30 2 52.48 AGGTACAATTATTTGAATTTATAGGTTTAACATTGCATGGGGTGAGCAGGGGAATTTTTCGCAGTTTAATTTAGTGGATGCAAAACTTGTGTCTGGATGGG:1 + chr2L 18246324 3' - HeT-A 5967 1 59.41 CCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGTGTGTGTTTTTGTCGTGGCAATGTGTGCGTGTTAAAAAAAGCGGCCGCC:1 - chr3L 15816138 3' - opus 7071 4 54.46 TTCGCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCCTGTATCGTACGGCGACAGAGCAACCACTGTAATAAAACCACGTAACAAAATGA:1 + chr2R 10696949 3' - Cr1a 4434 1 59.60 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATTTAACTAGCAACTCGGCTAT:2 - chrX 13146903 3' + roo 9051 2 58.42 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGTTCGCTCAACGGCAGAAGCG:1 + chr3R 9088648 3' + hopper 1408 2 68.09 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGGCGGGGGTC:1 - chrX 11025501 3' - hopper 30 1 50.50 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGT:1 + chrX 1399903 3' + P-element 2832 1 24.00 AGTGGCTGGTTTGGACCACNCAAATACGTCACTATATACATATGTATGAATATATATGTAGGTTTAAATAGTGCCGAAACAATCACACCATAAGGTAGTGA:1 - chr3R 22494087 3' - 297 6593 2 68.32 GTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTTTCGCACAATGCATATGCACACTATGCGAACATTCATCCCACTGT:1 - chr2R 10918770 3' - Transpac 5147 2 55.45 TTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCACCCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTTCACTAACAAATGTCTACAAAGTACAC:1 - chr3R 20094472 3' + Max-element 245 2 73.27 ACACGTCGGCGATCGAATTATTATTTTTCATACGGCTGCAATTTTAATATTTCTGCTATAGCCTTATTGTAGTTATCCTTTTCCTGGGCAACTTTTATTCT:1 - chrY 1733520 3' - F-element 10 1 76.24 TTACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGGAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGATGCACTGCCAGCCAAACAAAACGAAAACGGAAACAAAAA:1 - chr3L 1307195 3' + F-element 482 1 89.25 GGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGTAAAAATTGGCTTCACCAAGATATCTATCTATGTTTGCATGGAGATGGAGTTTG:2 + chr2L 7175660 3' + blood 7387 2 72.28 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTAATTAAATGCTTTGGCTTGAAAGAAAAGTTGTTCTAATTTAATTGGACGTTTTGTTTGCACA:1 + chr3R 22349564 3' - pogo 12 1 68.32 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGCGGCAGGCAAAATTGAGCAAAGATGCCAGAACGTAACATTAAAATAAACGCGCACAGATAAATCTT:2 - chr2L 10791994 3' - 412 9 2 70.30 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAAAGGTCCTTGAAAATCCAGATTCCA:2 + chr3L 18418919 3' - hobo 18 1 61.39 TTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTAGCA:2 - chrX 20885952 3' - Ivk 5358 1 67.33 CTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTTAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCTATCTGCGCTGTATGTATATCCTATTTCAGTTTGCCATG:1 - chr2R 10014792 3' - flea 4791 2 61.39 GTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAACCATGAATCCTTTCGATCATTTTATTTTTAAATGCAAGTTGAATGATTT:1 + chr2L 20781662 3' + Bica 93 1 56.44 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCA:2 - chrX 17029992 3' + flea 4989 2 52.48 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCCTTGTGCGTGAGCACAATTATTCAATATTTCCCC:1 - chr2R 13763184 3' + roo 9042 1 55.45 ATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGGTGAATA:1 + chr2R 5772512 3' + HMS-Beagle 6999 2 74.26 AAAGCTAGAAGGTTGAGATACATGCATACGTACATGCGACTCGGGGGGGCACTTACCCACACGCGGCCCAGGAGGCGGCACACCAGGAC:1 + chr2L 14875517 3' + INE-1 166 1 60.67 ATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAAC:2 + chr3R 1844818 3' - Cr1a 157 1 72.28 ACATAAACTTGACTATTTANTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTGGATTGGTTGGGGGGGCGGTAGAAACCTGGTCATAA:1 + chr2L 6276091 3' + copia 216 2 63.37 GGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACTTAAGATGCACTGCAAAAAGGAAATCTGTACAAAGTTATACATCAGTGAAGA:1 - chr2R 20930861 3' + accord 7069 2 61.39 TCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATGGCCATCCTGCTATTTAGCCCTGTTTTGTTTGGTTTTGTGCTTT:1 + chr2L 13566542 3' + hobo 2918 1 54.44 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAGTGTATTTTATTTCAGACTTTCCACAAAACTTAATTTACATTCTGT:1 + chr3L 19647325 3' - pogo 26 1 60.40 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGGAGTTGCCTGAAA:1 - chr3L 2022236 3' + roo 9041 1 56.00 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGTAGAGTGTAAATATGGCAGAATATCCTAGTGAGCTTGAGCGTAGGCATACAGAAGGTGAGCTCCA:1 + chrX 5219783 3' + hobo 2927 1 65.35 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACGTACAACGCTGCGTATGCGCAT:2 + chrX 11025600 3' + hopper 1411 2 75.25 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTCAGCTGCTCTGCTCGCCTTTGAAGTTTCATTTTTTCATTTTGCTACCAGCCCACGAAAA:1 - chrX 22789303 3' + Tabor 469 2 60.40 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGGGCAACAACAGCAGCCATGGCCAGTGAAACGTTTTTCGCTCGTGCAGCAGGT:1 + chr3R 23774045 3' - 412 7077 2 48.51 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCGGGCCGTCTGATCGCCCGTGTTCCGATTCCACGATTCTTTCTCACTCTCTCTCG:1 - chrX 15024363 3' + P-element 2865 1 57.43 AAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTTAAACTGAACTGAATTCAGTAAGTGCACCCAAATCAATAACAAATTTAAATCAATTCAAG:1 - chr3R 17875742 3' + I-element 212 1 67.33 ACGCATCTTGTTATTCTAGNGTCTTTGGTTTAACTTTGTCTCCAGTGTTGGCATGTTTACGTGACGGTTCTTGTTTATTGATGTTTGTCTGTCTCGGTCGG:1 - chr2R 16371572 3' - 1360 6 2 71.29 AATTCCTCTTTAACAATTCTTTCCCTTTTCGGTCATGTTGCGCATGCGATCAATATCGAGCTTCTCGCGTTCGACGCTGAAAGAAAAGGGAAAGAATTGTT:1 - chr3L 1942275 3' + Q-element 437 2 69.31 GGTACAATGCTTTATGCGACCCATGACTTGAGAATTTTGGGCCTTTGTTTGGAAAAAATTCAAGAGAATGTCGCCCGCAGTCCGCTTGGCACGGCTCTGCG:1 - chr3L 21440025 3' - Tc1 361 1 60.40 TATTTCAAAGAAATCAGTANTGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATGCCAAAATGCTAAAATTTCGCTTAGTGGAAGCTGTGTATATTGCGGGACACCG:1 - chr2R 22122590 3' + 297 6620 2 58.42 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCC:1 + chr3L 20411840 3' + roo 357 2 76.24 GACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAAGTTCAAGTTCT:1 + chr3R 11052170 3' + blood 346 2 58.42 GACCTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTAGCATTCCATAGCGAGTGCGTCGCATCACATTCGTTACCAGT:1 - chr3R 1418271 3' - BS3 208 1 46.53 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGACCTGTGTGAATTGGAGGTGGCACGATATAGATTTTATTGCGATGCTATCGATATT:1 + chr2R 9693387 3' - P-element 19 1 58.42 ATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAATCAATAAAGAGATTTAAAATTTACAAGTACTC:1 + chr3L 20317864 3' - 3S18 5809 2 65.35 GCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTATTCTCAGCAAGAATAAAAACAGAACAAGAGCTAAACAAGCGGCTTTCGTTGACAATTTGGACAACCTTTTTGATATT:1 + chr2R 4191988 3' + 1360 80 1 75.25 ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTC:1 + chrX 21668081 3' - Tabor 26 2 53.47 TCTTACACGACAATGAAAAGCTAAATTTTCCCGGCAATTTACAATGGCCAACAAACAAATGGACCACATGTAACCACTGGCGAGAGTGAGAAAGGTATGTG:1 - chr3R 12827577 3' - aurora-element 4178 1 56.44 AATTAATAACAATATTTATAACTGATAACAATAAGTACATAATAAATTTAAAGTTGGAGGATCCGACTGAAGCCAGGTGGTGCGGTGCCAAATACA:1 + chrX 22824965 3' - Gypsy12A_LTR 1811 3 61.46 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGC:1 + chr3R 20905448 3' + pogo 2050 1 74.26 AATAATTATTTAGCAAAGAGTTAACTAGACACTGGTTCGTCAATTAATAGCATGAAACAAAATTTCTTCAATTTCCCATTCAAACCTTCTAAAATAAAAGT:1 - chr2R 890937 3' + looper1 285 1 75.25 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTAGAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTTTAAAAAGAACTTCTAATGAAGAGATATATCTACATAA:1 + chr3L 10474228 3' + copia 243 1 66.34 CTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGTGCTCATTTAAATGTAGTTACGCTGAAATTATCAATTTGACTTCTTAATCTCTTTCGATAATTAATTT:1 - chr2R 16467732 3' - F-element 4307 1 37.62 ACGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAATTCCAGACACAAACCCGGCCCAAACACGCGACAATTGTTG:1 - chr3L 16282344 3' - gypsy5 6953 2 68.32 ATCAGGATCAATAGCGGAGTCGAATGAAGGATTCTAATTCGGTGTAAGTCCAGTTTTATGTATTATGTATTGATTGCTAAAATACTACATAAAATCTTAAA:1 + chr2L 12286074 3' + INE-1 93 1 65.35 GAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGG:1 + chr3R 1977611 3' + micropia 5402 2 62.63 TTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAATCGAGATTATAAGGCGTCATAAAAACA:1 + chr2R 24550694 3' - jockey 4812 1 71.29 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCCCCAACCCCCACAGACTTTCCATCTCAGGTTGCCTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTCCA:1 + chr2L 12511619 3' + copia 236 1 61.39 CAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCTGGGCTGGGGTAGTTGTGCTCTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGCAACTGGTGCTCCCTGGTGCGATTTCTCGCAC:1 - chr3L 17180518 3' - Tirant 325 2 76.24 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACGAAGATAC:1 - chr2R 15788553 3' - Transpac 9 2 71.00 GTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAGCTTTGACAATCAGGACGAATGCAATAACCACAGA:1 + chr3L 3757441 3' + roo 9070 1 78.22 TTGAAGTCCACCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCACCCACAACCAAGCCCACCCATTTAGCCAAGGCAACTTGGCAAA:1 - chr3R 12612999 3' + Max-element 226 2 66.34 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATT:1 + chr3R 23338325 3' + roo 9028 1 66.34 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTGGGCTCAGTTCAATGCAATATTGGAAATGA:1 + chr3R 20684912 3' - roo 8711 2 75.25 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTGTTATCAATCCACAATCCATGTAACACCAATACTCCTT:1 + chr3L 7345417 3' - pogo 33 1 59.41 ATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGTAGAATTAGTTGAAAATGTATAAACAGATTGAAGAAATTTGTATCT:1 - chr3L 5478999 3' - 3S18 5797 2 55.45 GAACCGAGTGTTTATCGGGNGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTAGAGTGTAAATATGGCAGAATATCCTAGTGAGCTTGAGCG:1 + chrX 5219759 3' + hobo 2904 1 57.00 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATACACCAGGCTGTGGAGAACTTGTGTTCGCATT:1 - chr3R 19198520 3' + hobo 2902 1 70.21 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGT:2 + chrX 21217556 3' - pogo 51 1 78.22 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAA:1 + chr3L 20354070 3' - 412 7090 2 60.40 TGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATCTTCTGTGTATTCTGATTGTATTTAAATGCTGCAAAATTGTTTAGAATAATTAATTTTCACAGTGTTTTACAG:1 - chr2L 11478647 3' + opus 496 2 77.23 CAAGTGCCCAAAATGCTGACTAAGAGGGCTGAGTCAAGTGTCAACTGCAAATGACATTTGCATTTCGCTGGCAGGGGATCAAGGGGCTGATGACGGGGGG:1 - chr3L 9332697 3' + HMS-Beagle2 63 2 71.00 CATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGAGATACAGAGATACATACATAGGTGCTGATCGGAGATACGCCG:1 - chr3L 8829927 3' + HMS-Beagle2 47 2 57.43 AGTACAGTTAGCACCGTTTNAAGTCACTCGCACCTACATGGACACACACACACACACATATATGCATTTATGTGCAATCTGCTATTTGTGTTTGTTTAAGG:1 - chrX 13282594 3' - Stalker 473 1 59.41 AATCAAAACGACATACGTTCTCGCGCAGCTCCTGCGGTGCCGGAGTGCGAATGGGACTCTGGG:1 + chr2R 15766944 3' + Doc 216 1 76.19 GACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGGGTAATTAAATTACGTGGCCCGCGGCAGCGCGCCTTTGACATCCCAGAGAGG:1 + chr2R 6847335 3' + mdg1 397 2 53.00 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTGCAACGGC:1 - chrX 4277454 3' + roo 9048 2 61.39 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAGTAATGGATAAGCCGCATTCGAAGCAATTAATTATCAGTGTTTTTGCTTTCT:1 + chr3L 3242742 3' - diver 5913 2 47.52 TACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACATGCATTATCATTCGCTGAATTCCAGGGCCAA:1 - chr3R 19449306 3' + roo 8602 1 69.31 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATTTCTCTTT:1 - chr2L 13093775 3' + roo 9037 1 61.39 CTCCTTGTCTTAAGATGAATTCGTCCTCGGATTCAATGGTCTTAGTTGGTTTGGCTTTCAAACAAGAAGAGGTAAAGTAGTTGTTCCATCGAAAAAGTCTC:1 + chr2R 3160554 3' - gypsy10 5620 1 62.38 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAGATGTATATATTTAAATAAAATGCCCCCGCTTCCAAAACCCACGTATCAGCTGCCAAAGGTAAT:1 + chr2R 21962724 3' - 297 6588 2 65.35 GGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTTTGGCCAAAGAAAACTGCGTTGGCAGGAGCAGACAGATGAGGCCTGCTATAACCGCCGGCTGCCAGTCCATT:1 - chr3L 3280561 3' + 1360 61 1 76.24 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTCGCGCCAAGGAGAG:1 + chr3R 29287575 3' + hobo 2922 1 60.42 AATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGGATGTAGACGCGTTAGCAGAAGTTTCGTTTCCTTTGTGAC:1 - chr3R 6266298 3' + roo 374 1 57.43 ACCCACTCTAACGCCCACAAACCGCAAAAAACTGCCATGCCCAAACTTTTGAAACATATTTCAAAGTTTGCTTATAATTTTATTTGCCCTGTAAATTTCT:1 - chr3L 25611148 3' + INE-1 218 1 71.00 AAAGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATATAAGGTAAAATAACTATTATTAATATTATTATTAGTGTGAGTAGGACCTAATTATGTAGTAAAAAATTTAAAA:1 + chr2L 259004 3' - Cr1a 4342 1 76.24 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCACAGCGGGCCCGAAGATAAGCCGTTGAAGCTTAAATTTATGCTAATTTGCGGCTAATA:1 - chr2R 23779996 3' - mdg1 18 2 61.39 GGAAGGAGCACGTGTATTCNTTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAGGGACTGCAGGACTACAGGACTGCAGGACT:1 + chr3R 4845047 3' + invader3 263 2 62.38 GTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAACGTTTTTTTTGTTTGTTTATTTGCTT:1 + chr3R 27640661 3' + 297 6816 2 74.26 GATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATGAATTTGTATTCAACATTTTGATAA:1 + chr2L 14793542 3' + Stalker2 353 2 72.28 CGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTCATTTAAATTCCTTGCCTTCTCGTTGTCCAGCAAATTATTTTAATTGTTTACAAACGATCT:1 + chr3R 14580382 3' + blood 7374 2 63.37 CAACGCAGGCGAAACAGGTTGCCCTGACCTCGAAAGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCTGGAGGAGGCGTTTTCCAAAAGCAGAGAAAATTACAATCAT:1 - chr3R 24262570 3' + R1A1-element 488 1 69.31 TCCCATGTGTCATTAAGGTCTTGAATCTTTTATGAGCACATTTACAGCTACTAATTTGCGCTCAAATTACCAGAAATTAACACAATTTCACTTGCGATAAC:1 + chrX 17729301 3' - baggins 5089 1 75.25 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATG:1 - chr3R 7869109 3' - 297 6604 2 57.43 ATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCGCTCAACACGTGACCCCGCGAGTTTATGGAAATTCTCTGGCACGTACATAAATGAA:1 + chr3R 24297809 3' - R1A1-element 213 1 56.44 TATTTCTATTAGAAAATAATTGCTAAAGGACCGAAACTCCGAAATAGCGCCCGTCCCTCAAGCCTTTCTTAACTACTTTCAACAATTGCCGTTCCGGCATT:1 - chr2R 4511935 3' - transib2 70 1 56.44 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATCAATAACAATGCGAATTACGGGGCAATAGTTGAGCGGTCG:1 - chr3R 12767279 3' - blood 7047 2 60.40 CAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTATCTCTGGATGTTCGATCTGCTCAAGTTCATCGGG:1 + chr3L 2050935 3' - Doc2-element 458 1 65.00 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAACTAAACACTTATCAATAGCGGCACTACTCAAAAACATACACGACTTTCCATATAAAAATATAT:1 + chr3R 27928999 3' - mdg1 7053 2 64.36 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCTCGAATA:1 + chr3L 8039421 3' + hopper 1393 1 57.43 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCTTGTAATATCGAAATCAATGAGATTCGTAATTCTGTCGCTGATTACTAAAGTTCATATTCAAAA:1 + chr2L 9045494 3' - jockey 19 1 66.34 CAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCTGGGACAACGGAAAGCAACTTAACTGGGCAAATGGCACATGGAGTAAACCAAGAACCCGCAACTTCGCT:1 - chr3R 30954448 3' + Doc 4535 1 73.27 GAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGAAAAGTTGAAATGTTATTTGAAATGTTGCAGGCAGTGAG:1 - chr2L 12882730 3' - hopper 26 1 53.47 CTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTGAGAGTGTAAAAAGTATGCTAATATAGCAAGTAAATAAGA:1 + chr3L 16546710 3' - pogo 2079 1 48.72 TTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTATATATATATAATTTCGAATAATTTCAAAAATCGCTCCACCCTG:1 + chr3R 7783805 3' + rover 7262 2 68.32 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATATAGATCCTTGTTTCCTGGGGATATTCTCCTTA:2 + chr3L 4009481 3' - mdg3 43 2 69.31 CTCGACTCTAGCATTTTCTCTTGTTTTCTAATACTTTTTCTCTGTTGGCTGGCTCATCAAGTTGTAATCGACAAAACACACAGAAACA:1 + chrX 22758617 3' + INE-1 577 1 77.27 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATTTTCGAATGACCCA:1 + chr2L 5927009 3' - pogo 24 1 52.48 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATCTCTATCTGCTCCGAAGGCATTCCGAGTGGAAATGCCAACTGACACACACCGCGCATGCGTA:1 + chr2L 2833946 3' - roo 8678 2 65.35 ATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTGGCTGAGATCAAACTTCGTCTTGTTAATGTT:1 - chr3L 3596643 3' + copia 255 1 76.24 TGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATATATATATACATTAATATCTCTGATTTAATATGTTTTCCTGTATTC:1 - chr2R 13622178 3' - Quasimodo 24 2 62.38 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTGTAATTAGTGTTCGAAATGTAGGCACTAATAGATGATTTGTTCTTA:1 - chr3R 5993106 3' - pogo 25 1 54.46 AAAGAAGAAAAAAAAAAAGNAAGGATCTCCATGCCGTCGGGCGACATCGAGGCGCGCTGCCACTGATTTATTTGCCAACGTGTGTTATTTATTTAATTTGT:1 - chrX 14708473 3' + Doc2-element 225 1 81.19 ATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTCCCCATTGACTCCGGCTCAGTTATAAC:1 + chr2R 18723096 3' + HMS-Beagle 239 2 60.32 TAAGATAACATAACTTTATTTCGGTTGGATATATTTCTTGAAATTATTTTTTGATCTCTTAGGAATTTTTGTTTCTTCCTATTTAATGAAGGATCGTATTT:1 - chr3L 2818429 3' - Chouto 151 1 47.52 CGACTTCGACTAGGACACANAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATAATAACATGTAATTGGTTAACGAATTGGCCGTCACCTGTATGAGAAT:1 + chr3R 31839582 3' + I-element 4944 1 55.45 TTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAACTCCGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAAGGAGGGAATAGTTAGTTAAAATCTCGCGCTCAACTGCTTCGGCTGTGC:1 + chr3L 25078682 3' + 1360 3248 1 52.48 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTCTGCTGGAATGTACAATATATTTTTTTGCCCATATTCTATAAATAAAAGTTT:1 + chr4 669091 3' - 1360 31 1 67.33 CTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTACACAAAAAATAATATAAGACAACCCAGATTTTAACAGTATTAGAAAAAAAAATAAATTTTTAATTAGAGAA:1 - chr2R 19091577 3' + Stalker2 398 2 69.31 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCACCGTTCCTGTTGGCCATTGATTTATTAGGTTCCGCCGTGC:1 - chr2R 6847235 3' - mdg1 7 2 70.30 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTA:1 + chr2R 9871056 3' - roo 8691 2 52.48 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAAC:1 + chrX 19034176 3' + hopper 1378 1 61.00 ACCACTAGCGCTCCGCTATGACATCAAATAACTGAATGGCGCGCATTTGAAAAAATGAAAACGAGCACGAAAATTAACTGTACTATAAAAGGTGGAAAATT:1 - chrX 17389133 3' - mariner2 57 1 54.46 TAATGGTATAAAAAGGTATTTATTTTAAAGCTTCCAGGTATTTTCTATCGTTGACCAGCAGTGTCTGCTCAAACTGGGCGGAGTACAGGCCATCGGCGGTC:1 + chr3R 24718132 3' - Juan 4154 1 53.47 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGTGTGGGTACACATACTTTTTGCAAACCAGCTGTATCTTCATCCCTTCA:1 + chrX 15287928 3' - hobo 30 1 60.40 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGT:1 + chr2L 18248037 3' - blood 48 2 77.23 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATAACTGATAATTGTTCCAATTTTTCAACTGTTCTATCGAGGTGGAATGTACATAAACCATTCTATGATCT:1 - chr3R 11916522 3' - roo 8667 2 76.00 TCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGAAACATTACAAATGTATGGCTCCCACTTGGTTTTAGGATGGAGCAAGAGCGGCAGC:1 + chr2L 10135964 3' + jockey 4898 1 66.67 AATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTACTATTTCTTTTTCTTAAGTGCGAATACGAATAATTTTTTTATGT:1 + chr2L 16748480 3' - 17.6 325 2 56.44 AAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACCATATGTAGTCTAAGATTTTCAAACACGACGCTTTTCTTTCCTCTTGAAAACCCC:1 - chr3R 7783725 3' - rover 18 2 62.38 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCACCTCACATCACCCAC:1 - chr3R 13739680 3' - Burdock 40 2 64.36 GGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAAGTTTTATGGAGTTTTTCTCGCTGGG:1 - chr3R 12063731 3' + 412 481 2 62.22 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTGCATCCCATC:2 + chr3R 30553622 3' - 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chr2R 6420464 3' - Stalker2 41 2 61.39 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATACTCGTACACACACACCCCAGAAGGCGTTGTG:1 + chr2R 8311360 3' + opus 472 2 63.95 CGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTTTGGACCAGGAAGACGAGCAGGTTCCAGAGACTGAGGAGGACTGAAGAACGACAGCTTAACTGCAGTT:1 - chr3L 19484260 3' + Quasimodo 252 2 69.31 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGGGTAATTAAATTACGTGGCCCGCGGCAGCGCGCCT:1 + chr2R 6847318 3' + mdg1 379 2 66.34 GAAAATAAAAAAAAACACTCTGTGCCTGTTAACGGACTTATAATGTTGAATATGCAATAAGTCGGTAAAATGTGCACTACTATATATGTAAATCTGTGTTG:1 - chrX 17565911 3' + Doc2-element 263 1 61.39 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATTTTTTACGCCCGAGTTTAAAATTTAATAGCATACTTTTTGGGGCAAAATT:2 - chr2R 12812258 3' - jockey 32 1 53.47 AGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCCTTTCCTGAGGATATTTTCCACAAAA:1 - chr2R 21948998 3' + F-element 4440 1 60.00 GTCAGCCCGACGGCTGCCTNCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAAGTTTT:1 - chr3R 12063751 3' + 412 7503 2 71.29 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAGGGGCTTGGCTTTGGCTTCAGCTCATGCACACTGGACACT:1 + chr2R 15788669 3' + Transpac 5221 2 71.29 ATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTTCCGTTTAAATAAATAAAACGCTGC:1 + chr2L 8622672 3' - 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chrX 18124111 3' - INE-1 550 1 59.41 AAACATAATTATTAAAGATNCCGTTCGCTTCGCGAGTGATCTGAATTATTCTGTAACTGATTCCATCGCGAAAGTGTCTAAATTAGATGATTGTACAGTG:1 - chr3L 20517192 3' + Cr1a 108 1 67.00 GCAAAGCAATCACGATATCTACTGCAACTCAGTAGCATCAACATCAAGCTGCCAACACCTGCCACTCACTGGAATCATCCGGGTTAGCATTTACCCATTTA:1 - chrX 4463325 3' + Doc3-element 492 1 60.40 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTAGAAAATGCAGCTGCCACTCTACGCAGTCGTTACAACTAC:1 + chr2R 18432128 3' + 412 7511 2 59.41 ATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCAATTGTAGGATTCTACTGTTCATAATAAATGTTAGTGTGTGTCCCAAATATCTTCTGCAATCTTGAT:1 - chr3R 14157538 3' - roo 8788 2 64.36 TGTGTATGTGTATGTGTAGNTTTTCGAAATCCATCGGAATAGTTGCGAATTATTCGGCGAGATGCGGAATTAATCATGGCCGTGATTCAGCTCGGTTCTGT:1 + chrX 16181660 3' - accord 7099 2 78.22 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATGTATATGTAAACAATGATGGTCATGGCAGCGCGATAACACATGCG:1 - chr2L 21708342 3' - 297 13 2 60.22 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAACTGGATGCGATTAGTACAGCTATCCTGTGTGAATATTTTCGATATGAAACACTATATTG:1 - chr2R 16668303 3' - Doc 46 1 66.34 CACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCCGCCCACATATCATCAATTCCGTGCCATTTGGCCCACAGTTCGAATGCGCAATGTGTCACTCGAGCTTATCGAT:1 + chr2R 14576604 3' + gypsy5 7345 2 75.25 CGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGTTTTTTGTGACTTACTTAAGGGAGAACAGCACCAG:1 - chr2L 3408625 3' - G-element 43 1 62.38 CACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTCATTACCTACCAGTACAGCCTCGTAAGAAACCAGTCACGAATAGAATTGGTCCTTT:1 - chr2L 4508679 3' + Doc3-element 430 1 63.37 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATA:1 + chr2L 12866951 3' - mdg1 7073 2 60.40 TGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTATCAAAATATTTTTATGTTTTTCTTATGCACAGAAATAAAATAAGTGTATTG:1 + chr3L 3596750 3' - copia 24 2 53.00 TAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTTGTGTTGTTGTTGACCATATGATGGCCAGTCGCATTGTTGCCCTTAGAATTTGGTCCATCGGCCGAGTTCAG:1 + chr3R 12069789 3' + 412 7077 2 77.00 CAATTCAACAAGTGTTTCACTTAAATTTCTTAAAAAGTTTCGAAAATATAGATTAATTCTGATGTTCACTGAAATAGCAGTGCTATAAAAAAATAATAACA:1 + chr3R 20668365 3' - 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McClintock 5994 2 74.26 CTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTCCTCGCGCTACAGAAATTCTCAGGATGTTGAGCTGCAGC:1 - chr3R 27567434 3' + jockey 4728 1 61.39 CGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTATTATAGAACTCGGGAGATTTCTCCTC:1 - chr2R 12473025 3' - Doc 4 1 69.31 AGTGCTCGAAGCAGCGGTATACTTGCAAAGCAGGTTGCCAATGTTGGCCATTGTTCCTTTTTGTGCTCGGCTAGCTCCACCAACGCCACCTCCTCCACATT:1 + chr2R 16078445 3' + G6 210 1 72.28 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTTGCAGCGCCACATACGCA:1 - chr3L 17181423 3' - jockey 4669 1 73.27 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAAGCATTCAGCAATCTTTCTGCGAAACGCT:1 - chr3L 1586701 3' - Tirant 13 2 68.32 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATATAGACAGATGCCGTGACATCTGCTCATCGGTTTGGAGTAGCGGACATCGGTGCTTCAGGTTAAGGAA:1 + chr2L 3633131 3' + P-element 2879 2 74.26 AAGTGGATGTCTCTTGCCGATGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGGCGCAGCGATTGACGATTGGCGACTGAAATCAAAGTCGCC:1 + chr2L 8709374 3' + P-element 2860 1 48.39 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTGCAACGGCGG:2 - chrX 4277452 3' + roo 9050 2 63.37 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTTATACCAGAATGGTGCTTTTTTCATGTGAGAATTTTACAATAT:1 - chr3L 19647245 3' + pogo 2073 1 61.62 ATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAACTCTTATCACAAGACAATTTGGCACGGCCACCGGCAGCTGGGAACACAAATAACAATTTGT:1 - chr2R 21074132 3' + jockey 4987 1 61.39 ACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTTGATGTGGAACAAGCTCATT:1 - chrX 17029970 3' + flea 252 2 70.30 CACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATATATATATATTCTACAAAGACGGACACATTTCCGGCTCATTGATTGCACTACCATCGAACAAA:1 + chrX 11262925 3' - invader1 3623 2 66.34 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTGCTCGCATTTTCCCAGCTGCCTGCCAGTTTGGGTACACAAATTATTTCAT:1 - chr2R 7838962 3' - pogo 23 1 56.44 CTTATGGCAGCACTTTGTTNCTATGTTTATGTTTATGTTTATATAAGTCTGTAGCGCATCGTTTTGTTTGTCGACGTAAAAGTCTGAAGTAAATATTGAAA:1 - chr3L 15076649 3' + 412 7107 2 65.35 TTAGCGGGAGACCACAGATNAGGCCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGATAGGAGAGAAGTTAAATATACCAAAAATCAACCGTTC:1 + chr2L 6923304 3' + roo 8871 2 58.42 TGGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCATGAGATCGTAAGTTACAGTTTGATTTTTCAGTTTGCCAGAAG:1 - chr2L 3017349 3' - Max-element 150 2 56.12 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGATTATTTATGAGACCCATTAATGGGCAGGTTGTCAGCAGCTCTATTCATCTTGGGGCATACTTTCGGGCCGAGCACAC:1 - chr2R 16609384 3' - jockey 4759 1 79.21 ACATTATTGTTAAAAAAAAGAACATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCGATTAGATATGAGTATTTTTTACTGGATTTCTTATTAATGGAATAACCCTCG:1 - chr3R 11052066 3' + Circe 466 1 76.24 CTACTAACACTAACATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCAATCCCTCCTTCCGAAAAAAGCACGAAAACCTTGCCTAGTGTAAGGCGCCCTCAAGTA:1 - chrX 7621277 3' + Cr1a 4298 1 57.43 AACTTTGTTTTATTCTGGGTTATTATCGAGGTTCCTCCTACTTGATCGCCGTCCCTGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCCCCACCTCCAGAACCAATCTGTGTA:1 + chr2R 21365081 3' + frogger 2178 1 79.21 CTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTA:1 - chr3L 27356099 3' + Tc3 1663 1 74.26 ATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAATGTGTACCGGACGAGCTGGAGGACCTGGTCACCGAGGTGGCCGGATGGCAGGCTAGTTCCT:1 + chr3R 14658866 3' + Ivk 5362 1 53.47 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATCGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCTTCATCTCTT:1 - chr3R 27495648 3' + 412 7513 2 54.46 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAAT:1 + chrX 15546217 3' - blood 7043 2 55.45 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTTAATTGACCTTGTGTGTGCGAA:1 + chr3L 9928620 3' - roo 15 2 64.36 AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCTCAAACACACACACACATGTGCGTCTTTTAAAATTCCTTCGATAAACGACATTTAGGGGCTA:1 - chr2R 9209403 3' + Tirant 8497 2 66.34 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAAGCAATTCAAATGCCGCACTTGC:1 + chrX 12906555 3' + P-element 2835 1 27.72 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGGGCAACGGCAACGGATCGTCAAG:1 - chr3L 3650023 3' + mdg1 406 2 63.37 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAA:1 - chr2L 20560346 3' - F-element 55 1 67.33 CAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTGTCC:1 - chrX 22726190 3' + Helena 1278 1 52.48 ATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGCATATTATTTATACTCTTATACTTGAGTCCTATTCGAGTGCCCCGTGCAGTATGCTTTTTTAATT:1 - chrX 1706019 3' - Juan 4060 1 62.38 AGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAAGTTCAAGTTCTAGATATA:1 + chr3R 11052177 3' + blood 7365 2 54.46 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGTGACCATTCATTTTGATTGTGGTCGTGG:1 + chr2R 23671825 3' - hobo 48 1 73.27 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCGCCTCCAAAGAGAAGGCGGAA:1 - chr3L 13773874 3' + roo 9052 2 59.41 AACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACCAACTAGGAACACACAAATTATACGAGACAAGACAGGACACTAATTACCAAATCTAGGACAATTAT:1 + chr3L 5343881 3' + hopper 1051 1 71.29 AAAACACGAACGTTCGCTTTGAAAGCTAATAGACTCTTTTGATAAGCTACATTAAATATGGATTCCCTTCGGATATCCTACTGCCAGAAAAATATTCAGAA:1 + chr3L 22488098 3' - Cr1a 8 1 53.47 GTAAGTCTTTAAATATATTNGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGGTTTTTTGGCTCTCGGTTGTGTGG:1 + chr2L 4063774 3' - 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INE-1 157 1 82.18 AGTTACCTGCATCGAGGCACTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATAAGACGAAATCCCATTGAAGGCAACGGGGCG:1 + chr2R 7839031 3' + pogo 2064 1 64.89 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGAGGCATTTCGAGGCGATCGCGAGATTTTCGAACCGA:1 - chr3R 18399191 3' + P-element 2848 1 40.59 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGCAATGCAGCCGCTAAATGTGTGCAATTCACCACTTGAGAAAACCACCACCGCCGAAGCAAAGA:1 + chr3L 10363905 3' + P-element 2877 2 70.30 ACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTAGAGGCTGAATCTCACATGCATTATCATTCGCTGAATTCCA:1 - chr3R 19449313 3' + roo 8600 1 58.16 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCT:1 + chr2L 20045819 3' + roo 9054 2 61.39 AGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCGGGTTGTCCATAAAAATTTAATCAAAGCAGCACCATTCCGTAG:1 - chr2L 17998261 3' - BS 30 1 60.40 GTTTGTCCACTCTTAAAAATAAATAAATTCGTTTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCTCATAATAAATACATCGGCTTCC:1 - chr3L 24751588 3' + FB 746 3 78.89 GTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAATATGCATATGTCAATTAATCTAAAATTCACTATAAAATCGAAACTAGTCGGGTATTTTTTCA:1 + chrX 20886055 3' + Ivk 5365 1 53.47 TCTCTAAAAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCGAGAGCGAACTACACTGAAGGGTGGATTTGCAAGATTCTGCGAAAGTCAGAAACACACGCAGCG:1 + chrX 2838188 3' - 1360 89 1 55.45 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATGGATGAACTTGTCCTTAAAGTAATATTTTG:1 + chr3L 16562349 3' - pogo 43 1 71.29 AAACGTAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTACACAAAAAATAATATAAGACAACCCAGATTT:1 - chr2R 19091616 3' + Stalker2 358 2 69.31 CAACGAGTAAAGTCTTCTCNTTTGGGATTTGACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAGCTTTGACAATCAGGACGAATG:1 + chr3L 3757428 3' + roo 9059 1 66.67 TCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAATCTCGTCTTCTTTATGAATTTCGAATAGAAATACGTACTCGTAGAACACGCATTGC:1 + chr2R 24911695 3' + rover 6968 2 61.39 TAGCCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAA:1 + chr3R 21666971 3' + INE-1 104 1 64.36 AAACCAATGTATGGCCGTTGCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGTGATGTTAAGATACAATATTATGATGTACGGATTCTTCACTTATTGAATAAT:1 - chr3R 4575426 3' + 1360 3364 1 54.46 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATAGGAATGCTAATTAACTACAATAAAACATTTTGATGGAGCGATAGATTTATGTATATAGGGATTTCCTTAA:1 - chr3R 13913001 3' + mdg1 7431 2 50.50 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAAAGGTCCTTGA:1 + chr3L 18418905 3' - hobo 32 1 54.46 AAGATATGAACGGAGCCCANAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGAAAGATAAAAAAAAAACATGCAAATGTCAGCGGGGGA:1 - chr3R 23338277 3' - roo 8704 2 71.29 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGAAATATCGATTTAATTTCATTTACT:1 + chr3L 18762125 3' - pogo 48 1 78.22 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAGAAAGATGTCCTGTCATTATG:2 - chr3R 12329608 3' - hopper 39 1 63.37 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGTTCGCTCAACGGCAGAAGCGTGTGCCC:2 + chr3R 9088655 3' + hopper 1408 2 70.30 TCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTACAAAATGGTTTAATTGTCATTTATATACAATCA:2 + chrX 734988 3' - Tabor 6861 2 57.43 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTAT:2 + chr2L 18213232 3' - hopper 23 1 56.44 TTAAAAAAAAAATAAATAAAAATATTTGATTGATATTTGATTGTTGATATTTTAAGCACACTCAATAATGAGACACGAATAATTTTTTTTTTTGGAAATTT:1 - chr3L 3530801 3' + mariner2 788 5 81.19 TGTGAGGGTAGATACACTACAGTAAGCCAAAGCCCAAACATAGACATAATTATTTCAGTCGCTCGGCGAGCCATACTACCCAAAATAAATTCCTCGAATGC:1 + chr2R 19091704 3' - Stalker2 7248 1 75.25 AAGCAAAATAAAATTTTGCAAAAAAAAATGTATTCTAACCCATCTCGGGCGGTTGAATTTTCTTTCTTTTTACGCTTCAATTAATACAAAAGTGTCTTCGT:1 - chr3L 18353368 3' + HMS-Beagle2 390 1 80.20 ATCAGTTTCTTACAAAAACNCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAAT:1 - chr3L 9928535 3' + roo 9039 1 57.43 AATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAAAAAAAAGGCTGCATATTTAAGAAGCAGTAAAAAAGAAAA:1 - chr2L 15220204 3' - invader4 2790 2 60.40 ATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACCAAATTGTGGCCAAAAGCATAAGG:1 - chrX 22666291 3' + Doc 167 1 76.24 ATTATTGTTATTATTATTGNTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTT:1 - chr3L 25059064 3' - mdg1 21 2 58.42 TACACACTGGAGTGTGCCACATTGTCTTGTTTAGTTATGTTGGGCATATGGTGTAAGCGCTGCTAGTAGTCTATTTGAGAGTCATTTGCTAGATTAAACCT:1 + chr3L 20434498 3' - invader4 2935 2 78.22 TATTCGTGTTCATGTGTGANCACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTAATGTCCCCACATTAACAGAAATTTCGACTTGGCTCTGCGGTTCTAATGA:1 + chrX 13147014 3' - roo 8665 2 78.22 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAAAACCTAACTTATAAACGACATAGAAAAAATCTTGGTAATTTTGGGAACAAATT:2 - chr3L 13987174 3' + pogo 2082 1 60.40 TTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTACTATATCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAACCGTATAAATCTGCAAACTCCTCGTTTCCTGCCATAAATTCCATCAC:1 + chr2L 12395249 3' + Cr1a 4342 1 69.31 CTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTC:1 + chrX 21668056 3' - Tabor 6885 2 72.92 CCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGCCTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTAGCCTAGATACTTCTGCCCGATCCTCAGGTGTGGTTGAGGATC:1 + chr3L 24504937 3' - 1360 59 1 73.27 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCGGGCCGTCTGATCGCCCGTGTTCCGATTCCACGATT:1 - chrX 15024381 3' + P-element 2857 1 43.96 TGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACTGCTGCCCATTGCATTCCTGGACATTTGCTGGACGATTTTTTGGTGCCACACGGCGCCCGCTAGAGTTGAG:1 - chr3L 872685 3' + 412 486 2 61.39 AAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATTAAGCGATTTCTATACATCGCCAGTATCTAGGGGTTTTCATCTGAGGCCATCTTTCTAAAG:1 - chr2R 16185013 3' + 17.6 481 2 69.31 TTACAAAAACTCAACGAGTNAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTCACCTTACTAAATATCAATAAAAATATTATTTTTTTTAT:1 + chr3R 9278404 3' + roo 9048 2 57.43 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGCGTTGCCTCGAGCGCTTGGCTGGAACAAC:1 - chr2R 19560130 3' - Tirant 6 2 75.00 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCCATTTGGGGGAGAGGAGTGATGCAAGAATTATGACTCGAAATC:1 - chrX 4264323 3' + mdg3 5492 2 70.53 AAGTTCAAAATCAGTCTGAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTAGGATTTAAAGCAATTGCTTACGTAT:1 + chrX 2667846 3' - Tirant 8377 2 71.29 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGTAAAAATTGGCTTCACCAAGATATCTATCTATG:1 + chr2L 7175639 3' + blood 7366 2 53.47 TGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGAGACGGATGTTTGGTCTACCAGTGGGTGACCCGATCTATTGTGGTTTGAACATTTAGA:1 - chr3L 25870556 3' - Idefix 7041 2 72.28 TTTCTTTTAATAATTATAAGTTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGCAGTATTTTATGGAGGAACAC:1 - chrX 13506300 3' - I-element 254 1 77.23 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCT:1 + chr2L 20328766 3' + opus 7458 2 72.28 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTTTCGCAATCAGCCATTTCCTCCAGTGTTGTCAATTCATAAATATGCT:1 - chrX 8334267 3' + flea 250 2 75.25 AAATATCCTAGTTAATCCCATCTCCCATCGAAGGCTGAAGAGGGAAGGGACGGGAGGGGGGGGTTGAGTGTTGGGAAATAGTTAACAGAAATTCAGGAAG:1 - chrX 11527622 3' + G5 4605 1 66.00 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTTCGATATTCATTGCTAATCCTTACATG:1 + chr2L 9260386 3' + 297 6933 2 72.28 AATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATGTTGACTTACTTAGTTTCAGTCCTATGCTATCTATTTTTCTATACTGCATACATTTATGGGGG:1 + chr3R 13837336 3' + invader4 3076 2 51.49 ACAAATGTTTCGCTTTTATTTCTTTAATAGTTTTGAAAATATAGCAAATACTAAGAAAAGACATTGGCTTCATTTCTAAGGATATTAAAGAGTATCCCGGA:1 + chr2L 8799827 3' - HB 1499 1 62.38 TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACCAAAAACTTAAAGCAAATCCCACCTC:1 - chr2R 7065864 3' + 412 7476 2 71.43 ATTTGGTCAATCGAGCCTTAAATCGCTTCCTCTACTGTTTCCCTTTCAATTTAGTGGTTTATCATTATTTCCCATGTTTTGATTCAAATTTTGTGGTTTTG:1 + chrX 4765273 3' + roo 429 1 81.19 AGATAGGCTAGCATTTCACTTATATCATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGTCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGGGGTTCGGTTAAGCATTCTCTTT:1 + chr3L 26291374 3' - G4 198 1 77.23 GGAAATAATTTCACAAGAATGTGAAAAAAAAAAAGGCTATTTCACAATTTATTTTCACAATCTTTAATTCACAATTCAATTCTATTTGCCAGCTGAACCCC:1 + chrX 22733468 3' - copia 389 1 72.28 CAATATGCCATACTTTGTCAAAGGTCTGTTGCATATCTAAACTAACCTTTCCATCTCAAGCCTTTGATTTATTTAGAGCCTGAGCTCCGGCTCATGGAATG:1 - chr2R 22351572 3' - Helena 412 1 53.47 TTTTAAAGTTTTTTAAATTCGTTTGTTAAGATCGCCCTCGTATACGTGCTACAGGCTATATTTTAGTTATAGTAATTGCTTATTCAATCAATCTGTTTTTT:1 - chr2L 22217257 3' - 1360 3013 1 68.32 CTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGCGGATTTGGATGTGAACCGCTTCGACTGGGACTGCTCTCCCAGTCATAATTTAAATATTGTCATCTGCTATA:1 + chr2L 20781392 3' - Doc3-element 4544 1 43.56 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTCAGCTGCTCTGCTCGCCTTTGAAGTTTCATTTTTTCATTTTGCTACCAG:1 - chrX 22789313 3' + Tabor 7305 2 54.26 ATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATATATATATGTATACATACAAATGTACGT:1 + chr3L 6649321 3' - Cr1a 98 1 73.27 CGTTTGCCCATTTTTGCCCACCAATTAATTTTTCATTTTGCCCACCTCCAGTACGAAAATTTCCGAAAATCAAACATTTCACTTTTTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr2L 19997887 3' + FB 212 1 43.56 AATTAAATTAAATTAAAAAAAAAAATAATATGGATAACTTCTGCCTTGTGATAGAACATTCATAAATGGAA:1 + chrX 1706101 3' + X-element 4719 1 66.20 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATACTTAAAGAAGAGCCACCTGACTATAAAGATGAGATTATGAAATCTAAAATTTTAACATTA:1 - chr3L 25504365 3' + copia 240 1 61.39 AGTTTTGTAAACTATTCTANCTATCATAATAAATAAATAAAAAATATATCTCGGTCAGGTGTGGCACAGCCATCGATTCTAATCGAATTTCGGCGTCTCAT:1 + chrX 12992818 3' + I-element 5334 1 55.45 CCTCCCGTCCAACCGACCGAGGTTATTATAACTCAGCATAGTTAGATTTACGTCAAATGGCATTCCCTGGCTTTAGGCCACTTCACTCATTCTGGCATGGA:1 - chrX 22938450 3' - Cr1a 4420 1 72.28 TCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCC:1 + chrX 11025554 3' + hopper 1372 1 74.47 CTCAAGAAAGAGCGCCTTCTTGCTCTTCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTGAAACCCGCGCGTGGCTATGGACGTGTGCATGTGGATATCAAG:1 + chr2L 7705847 3' + Doc2-element 442 1 52.53 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGGGCAACGGCAA:1 - chr3L 3650035 3' + mdg1 7432 2 51.49 ACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTCGCAAGTAGATGCCCCCAA:1 + chr2R 6779856 3' - 17.6 6944 1 64.36 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTTTCATCATAAAATCATGCACAATGGCAATGATGACATTGACGAGTTGAATTTTGAAAG:2 + chr2L 8622852 3' + 297 383 2 70.30 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATC:1 + chrX 23065112 3' + opus 490 2 71.29 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACACCCAATCCACTCGCATGTAATATTAAAGTGCGATTTGAAATGCCGCTTGCCG:1 + chr3R 20333073 3' - Quasimodo 37 2 71.29 GCAATCACGGAACTTAAGGATTTCCAAAACCAGTAGTAGTTGTTATTATGATTTCAAATAACTTATTATTCTAATAATAAATACGTCAAAATTATCCAAGG:1 + chrX 14422828 3' + F-element 4424 1 63.37 CAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGCTCTGATTAGAGAGCAAAAAATAACAGGCGGCAT:1 - chr2R 13383516 3' + gypsy5 7309 2 64.36 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATACATATATTATCAATCGGACTTATTTGTTGGATGATTTACC:1 + chrX 20419190 3' - flea 4792 2 66.34 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTACCAGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTACCAGTGTGTTTGTAACCCACCTTACAAACTTGTTT:1 - chr2R 8177681 3' - mdg1 7049 2 66.34 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGTGGGCGTAATCCAA:1 - chr3R 25021652 3' + roo 404 1 74.75 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTGTAGGCTGTCATGTTAACATGGGAGAAAGCTTTCTCCGC:1 - chr3L 14594119 3' + hobo 2901 1 61.39 AACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGCGTACAAAAATTGATTGAAGATATGGAGGAAGTGACAGAAGTTTGCAGAAAACCCAA:1 - chr3R 4581790 3' + Doc 282 1 69.15 TAATCATGTGAGGACTTACAAACACACAACGTGACTGTTTACGATTGATTGATCAAATTATAAGCATGGATTTACTTTATAATTAGTCAGATGTCTTAAAA:1 + chr2L 19417183 3' - BS 4991 1 76.24 TTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTAATACGAACACACAAAGATAAAATGTTTTTTCCAAGACTTTAAAAAGTGGTTGAACAAAAG:1 + chr4 194815 3' + Quasimodo 7357 2 75.25 GACGACTAATACAGCGATANGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAACACAAAATAAACCAAAAAGCAGCCAAGGAATTTAAAACAAGAACACCATG:1 - chr3L 609233 3' + R1A1-element 4862 1 57.43 ACTTTGAAGCGCTGTATTTTTCAGGCTAAAAGAAAGAAAATAAGAAAGAAGATAACCCAAGCAATTCTGCGTGTTATGTGTTCACTTTCTCTTGATCACT:1 - chr3R 30533197 3' - rooA 445 1 68.00 TATTTAAATCTTTTTTTTTATTAACACATTGTTTATCGAAATAGATTGAGATTGGAACCATCCCATTGCCAAAGTCCTCAAATCCCAAGCGTATC:1 - chr3L 3941254 3' - Transib5 26 1 76.84 GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGTCGTTGAAAAAGTCCGCGAAAAG:1 - chr2R 12457938 3' - HMS-Beagle 6825 2 69.51 TGACTAAGAGTAAAGGAAGNGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATTTATATTGATTATGGGTGATCGTCAACAAGAGCAGTGGACACCCAATAAACCT:1 + chr2R 9905429 3' - mdg3 5275 2 56.44 AGGTATGAGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAAGAATATATTTGCTTTGTATCGGTTCTTTGCATACTGC:1 - chr2R 17392616 3' + opus 7467 2 68.32 CCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAGCACTCTTACCAGCAAATAACTTTCTGCAGAACGTGATCCAACATAATCAAAGAATACGGAACACT:1 + chr2L 16359926 3' - hobo 401 1 68.32 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCAT:1 - chr3L 19349932 3' + 1360 3372 1 58.42 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGGACAGTATCTTTCAAAGACAGCATCCCCGCTTTCAGAAC:1 + chr3L 19861840 3' - 1360 37 1 62.38 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATATTAATACAATAATAGCGTGTAATTTAGTTTTACACTTATCCAGCTTTGATATCAGGAGAGGGAGACGACAGT:1 + chr3R 17452892 3' + mdg1 27 8 78.22 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGG:1 + chr3R 14860228 3' - BS 5008 1 65.35 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTTGCGATGTAGGCTTACGAGGGTGGGTGGTGCTTGGGGGAGTTTTCTAGGCG:1 - chr3L 14623896 3' + hobo 2937 1 73.00 CTGGGAGCGCACAAGTCTTTAAGAAAGGGAAAAAGGCGCAAAGGTCGCGGACAGACCAAATATCATCCTCTCACCGAAGCCGCCGCCGAAACCGTGTCCTC:1 + chr2R 11236319 3' + Rt1b 158 1 71.29 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATATCGCAGACAAAGTATATAGAACATGTATTTTGCGTCCAGCTTGGAAAGTGTTGGCAAGG:1 - chr2L 5419774 3' - 297 6585 2 74.26 TATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGACGCGGCGCGACGCTTGACGCCGTGCTTGCTTGTATACTGTTAAGTTCTGTTCAATTCAGTTGAATTCTTT:1 + chrY 1076855 3' + INE-1 85 1 66.34 TTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACTTGAAAATTTATATGGATAATCGATAGGACGGATCGAGCCAATAT:1 - chr2R 13037257 3' + copia 224 1 56.44 GCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCCCATACCGGATAAGGAAGTTCATAGTCCTGAACTGGCCCATAAGA:1 - chrX 12968432 3' - accord 7005 2 55.45 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCGCCACCCCCTCTCCCAAATGTGGGTCAGTCAAAAGTAAAAATTCTTTCGCATAACACGAACTGCGACGACGA:1 - chr2L 4924487 3' - hobo 5 1 72.28 CTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGGCACCGATGAGCAGACTGTTGCCATCCTTGGTGACGAGCTTGAAGTGATCCACAACACTTTCGTT:1 - chr2L 8631056 3' + accord 6960 2 70.30 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTGTGTGGTGAGCATGTAT:2 + chr3R 17059200 3' - hopper 55 1 81.19 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTGTTACATGTAATTAATTTCAAATTATTTAT:1 + chr2L 19681476 3' - hopper 41 1 64.36 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTATCATTTACGATCGAC:2 + chr2L 21086110 3' - roo 18 2 61.39 ATCGATTTCAATACACAAATTATAAGAATCTAAGAGTACTTGTATCCAAGAGCGAAATTAGGCACAATGATTAGGTGAAAAATGTTGTTAATAAATAAGTT:1 - chrX 3191107 3' + Idefix 7110 2 55.45 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTGCGTATGTGCAATTCGGCACTGCCTTTATTCTTTA:1 + chrX 4792127 3' - copia 4912 2 67.33 GTATGTAATATGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGAGAGAGTACCTGAAGATGAAGGCTGCCTTCAGTGTG:1 + chr3R 21215772 3' + Dm88 4373 2 64.36 CAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCCATCCCACGCACATGCAACAAGAAATGGCAAAAGTTTTCGATACGCCCCCGTACTACTTGGC:1 - chr2L 10625653 3' + roo 396 1 67.33 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGG:1 - chrX 11025524 3' - hopper 53 1 73.27 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAAACTATTCGGCCAAATTTTAA:1 - chr2L 16139106 3' + copia 229 1 53.47 TTAATAAAATGCCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACTCAATTAAGAAACTATAGTTGTACAAATATGTGAGTTACTTCAGTTAATCTAATGCCT:1 + chr3L 9096368 3' + S-element 396 1 58.16 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGCGACTGCCTCGAAAATTGAATTCTAATGGAGTTGTCGCCAGTCCCGTTCCCCAGCTCCAGAT:1 + chrX 14651166 3' - P-element 14 1 65.35 CGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCCGTTTCCTGTTGGAAAACAACACGAAA:1 + chr3R 30976155 3' - Doc 4530 1 73.27 AAAGATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCCTTGTTAAATCAGCTGGCATTGGGCAAAAACCAGCGGAACGAACACAATCAGGCAAATACATATTTCCC:1 + chrX 11017083 3' - roo 6 2 69.31 GTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTTAATGAGTGAAATTAAGTGGGATTCTTGAATGAGCCCGTTGACTGCGC:1 - chr2R 17254876 3' + micropia 5080 4 58.42 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACATGAATGTGGGCGGGGCACGTCTCACTGATTAATTGCAGTTTGGTTTTAAGAATTGTTACTGGTTAGCTCTATA:1 + chr2L 17677811 3' - Tirant 8108 2 80.20 CGCAAAATTGTAGGGTGTGNGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCAAACCCGTTTATCGCTCGGCATAAATAATTGATGTTTAA:1 + chr3L 13895422 3' - hobo 37 1 56.44 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATA:1 - chr3R 10087824 3' + roo 9038 1 55.45 TACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAA:1 - chrX 4166379 3' - I-element 5321 1 54.46 GTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTAATTGCCAGATGTCAGAATCCGAACCAGG:1 + chrX 17981838 3' - mdg1 132 2 72.28 CGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCAAAAAAAAGGGTAAAGGTAATAAATTTTATTATTGTTGTTGATATACAAATCCATGCCCA:1 - chr2L 15355525 3' + X-element 424 1 65.35 AACTATAAAAGCTAGAGGGTTGAGATTAAGCTTACAGCTCACAGCTTCACAGCTCACACAAAACTGCAACGCCCACACGTTTGCAAATTGTTTTGACATTT:1 + chr3L 16803166 3' + INE-1 159 1 46.53 AGTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATATATAAATAAATAAATTCGCCTAAGTATACGGAATTATTGAATT:1 - chr2L 23369572 3' + Idefix 7359 2 67.33 GTGTATGTATGTATGTTCTCATACAAAATTACTTATGCACATGTGGGCATTGCTTATATTCAACTTTCTAATTACTTATGCAAAGGAAAAACTTTTATTTT:1 - chr2R 13073606 3' - 1731 72 2 63.37 TCCATGTCCTTCGGGCTTCTTGCCGCCAGACGTTTCCACTGTTTGTTATTTCCAGACATTTTTTCCGTCGCAATTGCCACTTTTATACGGTAAACGTGTAT:1 - chrX 3448166 3' - gypsy8 492 1 51.49 AAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGAAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGGTGAATATC:1 + chr2R 5772514 3' + HMS-Beagle 205 2 70.30 TGGGGGAGTGGCGTGGGAGCGAAGTGTGACCAGGCTGTTGCAGTTTCGTGTTGAAACCAGTTTGAATATATTTATTTTTATTTCCTGCGTCCCCTTCCCAA:1 - chr3L 10991627 3' - transib4 2347 1 81.19 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCCTTACTCCCC:2 + chr2L 12882819 3' + hopper 1397 1 59.41 GTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGTCGTTGAAAAAGTCCGCGAAAAGTGGCTAGGACCATGAGGAATGGCCTC:1 - chr2R 12457912 3' - HMS-Beagle 6804 2 62.07 CAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCCAACCAGAAACCGAACCCATTCGCAGCCCGCCAACCTGGTATCCTAGCAGTATCCTGGTGCC:1 + chr2R 13383725 3' + gypsy5 395 2 63.37 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGGTTCTTGGCGAGGCCAAATTTATG:1 + chr3L 13785423 3' + pogo 2050 1 82.18 AACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTACAGCGTATGAGTGATTTTTATGGCATTTTTATTTGGTCCGTGGGACGTACGCCTCACTATAAGTATATGC:1 - chr2R 20718801 3' - BS 5001 1 70.30 GATCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGTACCCGAGTTTTGCTGACACAGCGGACCGTAGTAGTTCTCCGGACACTGGCACACTCCGGCGGAAATG:1 - chr3L 13847518 3' - R1A1-element 5102 1 59.41 TCCTCTCACCGTGCTGGTGGCTAAGCAGAGGCTCTGGTGATCCTCGTCCTTGCTGTTTATCTTCCGCTTTTTCTTCTTTGGCTTGTCCTTGTAAAGGGCGT:1 + chr3L 322563 3' + Rt1b 223 1 64.36 ACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGAATACTTATAATGCGCATCGATAATGATTTGTAATTTAAAGCTCAAACAAATTTCCG:1 + chr2L 2520904 3' + Chimpo 34 1 61.39 GGAAATATAAATTATAAATNACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATAAGAAATATTTTATCGTAACTAACAAGCTATCTTCTT:1 + chr3R 17482070 3' + copia 251 1 64.36 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATCATATAGAGATTCAGCTTTTAAAATTCCATA:1 + chr2L 3985137 3' + roo 9028 1 69.31 AAAAGTTTCAGAAAATGGAGAAACGCTGGGACAAACACAAAATGTGCTTATGGTGCTATTTTGTTACCGCAACTGTATATATATAAGTTTAAGTTTGTTTG:1 - chr3L 23619336 3' + Tc1 1589 1 79.21 CACATAAGCATAAGCAAGAGGCGTTCTCGCTCAGATCAAGTAAACAATGCTAGCAAAAAATATAATACTCATTACTAGTTTAAAAA:1 + chr3R 29004983 3' + Tom1 192 1 55.81 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATT:1 - chr3R 7869140 3' - 297 6615 2 71.60 TTTTAAATTTTAACACTTTGAAATTTAAGCTAAATTTTGCGCGTAAAAGCAACCACAACACCATTTCGGCACGCTTTCCATGGAATTGCGCTTTTCTGTAA:1 + chrX 10065009 3' + hopper 1193 1 56.44 AGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACC:1 - chr3L 26852651 3' - 1360 49 1 68.32 TGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGCATATTGAAAAGCCTTCGAAACACGATATTAGCGTGAATAATTATTCATATTCATTA:1 + chr2L 14220228 3' - springer 7157 2 59.00 TGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGAT:1 + chr3R 15924661 3' - Quasimodo 36 2 78.95 AGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGATGTCCTGGCGATGTCCTGGCGACGTCCTGGTGTCCCGCTGTCCTGCCGCGTCGTCGGCTGCCTTCGCGG:1 + chr3L 3966631 3' - Doc 468 1 74.00 CAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATTATGACTCAGTAATAAAATATAAGGTGTCATGGTAAAGTTGATTCAGTTATAAACGCGCTGCGATGCGATCA:1 - chr2L 6358287 3' + 412 7154 2 75.25 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCGCTTGAAATATAATTGGACATATTTAAAGCAGTATACCTTAACTTTGGATATAGGTAGCTTAAGGAGGTTAACT:1 + chr3L 20755434 3' - I-element 4 1 75.25 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGAT:1 - chr2R 10315295 3' - Doc 78 1 70.00 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATATTAATAATGATCTATCGATAGCACATGAAAAGATTTGATTTCGTCTGTAAACATGTTTCCTTTCGGGTT:1 + chr2L 21190844 3' + pogo 2098 1 76.24 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAGGGATAACTCCTTCGATAT:1 + chr3L 12634249 3' - BS 5003 1 69.00 CTTCCTTCTGCCTGTTACAGACTATTCAACGAATCCAGTATACCCTATTACTCTACGAGTAAAGGGGATAACAAACCTTTAGTTCGTAACGATGGACATAC:1 + chr3L 22721134 3' - INE-1 28 1 61.39 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTACTTATT:1 + chr3L 20411865 3' + roo 9046 1 52.48 TGTTATTATGTTCGTATATNCTACAGGGGAGAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTTGCCTTTTTGCTAAACAGTCCGCGGAAAAGTTTGCCGGCAACAAAGTT:1 - chr2R 21747504 3' - mdg1 4 2 70.30 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATATACAGGTAAATAAAAT:2 + chr3L 15033379 3' - I-element 22 1 57.43 GTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCATGCACGCGCCAACATAATATAAACCAAAATATAACAA:1 + chr2R 3545507 3' + Cr1a 344 1 66.34 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAGTGTATTTTATTTCAGACTTTCCACAAAACTTAATTT:1 + chr3L 19647316 3' - pogo 35 1 69.31 ACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTACAAATACCTCAAGATTATTTCAAGCTAAATAGAATTATCTTTAAAATTTCAGATTAAAATAAATA:1 - chrX 14296361 3' - Juan 4133 1 70.30 CTATTTTTAAACCCTAAACAGTTATTTTTTCCAGCTTTTTTTCTTTTTTATAAAAACAAAACTGTTTTATAGTCTTTCTGTGCACAAAATTATGTATATGC:1 + chr4 893361 3' + Bari2 1018 1 72.28 AATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTGTGCTTAACTTGGAGCTAAAAG:1 - chrX 734901 3' + Tabor 7300 2 60.40 CTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTA:1 - chr3L 16973393 3' - S-element 1584 2 72.28 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTTATTGTTTGCAAAAGTTTTCACCTTACTCGGCGTCTTTGTAGTTA:1 + chr3R 17660547 3' + roo 9040 1 57.43 ACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTG:1 + chr2L 21403531 3' - G5 4424 1 68.32 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTAGAAAATGCAGCTGCCACTCTACGCAGTCGTTACA:1 + chr2R 18432123 3' + 412 453 2 64.36 TGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAAGAGCTCATTACAA:1 + chr2L 19642385 3' - Quasimodo 22 2 58.42 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCTTGTGGCCTTTGTGCACTTCTTCTTCATCTCGA:1 - chrX 13126181 3' + mdg1 7453 2 66.34 GACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATATATATGGAGTACGTGTATGGCTTGTAATCGGATTAT:1 + chr3R 25750228 3' + micropia 5406 2 64.36 TCTCTTGCCGACGGGACCANCTTATGTTATTTCATCATGGCTGCGTGTGTTCGTGAGTTCACACTTTTCTCGGGCGGGAAGAGAAGATGCACGCGAAAATA:1 - chr2L 16683692 3' + P-element 2869 1 63.37 GCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAAACATTTTATTAATAATCGAGTAATCCAGGTTTT:1 + chr3R 25086188 3' + Bari1 1698 1 70.30 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTT:1 - chr3L 9928556 3' + roo 9020 2 78.79 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATAA:1 + chr2L 12866952 3' - mdg1 7072 2 59.41 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCAT:2 - chrX 13146923 3' + roo 9031 1 66.34 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAATACCTTCTAAACTTATGAACTTTG:1 + chrX 8316361 3' - hobo 51 1 77.23 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGAGAAAGGTCTTCAATCTAAACAAAGTTTTACCGGGAAAAAGATGTTCATCAATATATGGTATTTATT:1 + chr2L 3699497 3' - mdg3 5262 1 71.00 CATTGGTTTTGCACTATACAGCCAATATGCCGCAAGTCATTGGTGCTTTACTACAGACAACTGTGAGGTTTCAACCGGAAAACTGTGCCCCTGATCTGGAA:1 + chr2L 10988507 3' - 1360 3351 1 79.21 CACACACACACACACACATACCTCTGGAGCAATGTAATCGCTGTGTGCTGTAGCTTTCCATGTGTGTGTGTGTGAGAGAGCGTGCCTGAGACTGTGTGTGT:1 - chr3R 20431204 3' + Quasimodo 40 4 44.55 AAATCGCCAGGATGATTACCGACTGCAAAAGGCTAGAAAAACTAAAATCAAAAAAATCAAAAACCGAAGCGAGAGAGAGAGCTCCTAGAGACCCGAGTTAA:1 - chr3L 7615165 3' + BS3 1377 1 79.21 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTC:1 + chr3L 3757394 3' + roo 9027 1 77.32 TTTTTTTATTATAGAAAAATACTCATTATGGTTTAGTGAAAATCGCATAAAAATATGCGATAAATATGTACAGAAAAGTAATGTTTGTGTTGATTTCTACA:1 + chrX 8613745 3' - gypsy7 4992 1 91.09 CAAAAAATTAAATTCTTGTCCAGAAGCGGGAAAGCTTCCAGCTAGATAGAAGTAAAATAGTTTCCACCAAAAACTGTTGGCTTAAAATGAATAAATCAATA:1 - chr2L 19202043 3' + G2 3021 1 56.44 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCG:1 - chr2R 981623 3' - 1360 62 1 69.31 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACTATTTTAGCCATGTTTGTGTATTTCAATTTACATTGGACTAATTGAA:1 + chrX 8503181 3' + roo 9044 1 57.43 AGTTTGTCAAGAAATTGTTTGTACAATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTACTTTCAATATTCAAACAAAGTTAAAAACA:1 - chr2R 2961488 3' + S2 2 2 59.57 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAAATGCACTAACCGCTTCCGTTTTTTGAAAAGCAACTGAACTCCAA:1 + chr3R 20696550 3' - jockey 19 1 66.00 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTAATTACGTAATAAGGAACCTTTTTATTCATTCCATACAAGAAAATAC:1 - chr3L 6033522 3' - 412 28 2 53.47 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTAAACTTCACATTAAAACCTTTTCATTAAG:1 - chr2L 9045395 3' + jockey 4984 1 66.34 GGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTAGCATAGTCTATCTAAATTACCTAAATAC:1 + chr3R 20094501 3' - Max-element 8283 2 72.28 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTAATATATAATTTTGAAGTAGTGCAGTAACTGGTGTGTATGAATATCCGCTTTGA:1 - chr3R 18790065 3' - I-element 23 1 56.44 TTATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGCGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGACACAGCCGCGTTAAAGCTGCAAAACAAAAATGGTTA:1 + chrX 18201803 3' + I-element 308 1 65.35 ACACATAAAGTTGTCTGCTATCGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGTGACTGAATTCCTGAAGGATTTTTGGATTCGGAATCCCAATG:1 - chr3L 8837184 3' - 1360 162 1 57.43 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATTCTGTCTCCCTTTTCCTCAGCTTTTGTGCCGCGCATTTTCCGAGCTTGCAACTCAATTGGTTAAATTTATGCATTTTGA:1 + chr3R 7628865 3' + blood 7179 2 59.41 CGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGACCTGTATGAATTGGAGGTGGCACGATATAGATTTTATTGCGATGCTATCGATATTTC:1 + chr2R 9693389 3' - P-element 17 1 58.42 TAGCGACTCGGATTCGGATCACGATGTTCCATTTTCTATGCATTCGATAAGGCCTGTGTAGCACCATGTATCCCCAATTTCCTG:1 + chr4 904856 3' + transib3 2547 1 54.76 CTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAA:1 - chr2R 15788601 3' - Transpac 4977 2 78.22 AAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGCACGTTCGTTGGTGGCAATGCGTGCAATTAGCCAAGAGTGATGGAAGGGAATCTGGCTAATGGAGGATGAGTTTGGG:1 + chr2R 16372426 3' - Ivk 5020 1 67.33 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGCATAAATAAATGAAAATGCTACAGTTCAAA:1 + chr2L 16139165 3' - copia 47 2 74.26 TGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGAATGAAAGTTGGTGTAGGCCAGGCGAGTGGAAGTGGCAATTTCCAC:1 + chrX 12370451 3' - I-element 5166 1 55.45 TTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAAGTATCATCTTAAAG:1 + chr3R 12876378 3' + hopper 1386 1 56.44 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGAGATACGCTTTACTCGTCTAGTTTTAGTTCAACGGAAAGGCATCTTCT:1 - chr3R 5594945 3' - 1360 19 1 54.84 ATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAAAGGCAAATGAAGGGCGGGCGGAGCGATGAAATCGAGAAGATTTTCATTTCAGCACTTTAACCGAGGAGTATAAAG:1 + chr3L 5683485 3' + P-element 63 1 79.00 ATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAAGCAAAGCGAAAATTATGCATGAAATGTGGCATAAAAGTTGCATA:1 + chrX 3682039 3' - blood 144 2 56.44 CCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGGCTTTCATCAATTTACGGTATGTTTTTTTCCAAATTTATTTTCACA:1 - chr3L 15748772 3' + F-element 417 1 54.46 AAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAATAATAAACACAAGTAATAATAATAATAACACGGCTTACAACCGACCATTTTGG:1 + chrX 12130315 3' - 3S18 23 2 57.43 TGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTAATATATCTGCTAAACATGATTATCATGTTTAGCAGATATATTAAATTAGGACAAAAGAGAAATTAAGATAT:1 - chr2L 18569555 3' - 1360 214 1 52.48 TTTTGTTTGAACAACCGACAATGCGACCAATTTCATCGCAGGTGCTCGATGGGGAAATCCTTGAAGCGATACCGCAATGAAGCAGGCCGCCAAGAAGTGGC:1 - chrX 19752279 3' - Tc1 449 1 67.33 AATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCTTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGAATTCTAGAATAATTCTAGTGTCTT:1 - chr2R 6086002 3' + 1360 454 1 94.06 AATGAATTTACATTGTACAGATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAAAACTTTAACCAAAGCTTCACTCTTCGGTTCATAATAAGG:1 + chr3L 26002834 3' - 1360 3151 1 61.39 GTAAAGTCTTCTTATTTGGNATTTTACAATATTATTTTAAGAGATTTAAAATTATGAAATATTGTAAAAAACACGAAACTCTTTTTAAGATCACTTAAAGC:1 + chr3L 15038009 3' + roo 402 1 69.31 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGAAAATGCTGCAGACACGAGGG:1 - chr3R 9088550 3' + hopper 1405 2 65.56 AACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTTGATTAAAAGAACACATACGCACTATGATTAAAGAACATTTTCTGTAAGTGCAAGTGCAG:1 - chr3R 13477876 3' - accord2 7356 1 63.37 TCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGA:1 - chr3L 3540148 3' + mdg3 5458 2 64.58 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGGTTTAGAATACGAATATTATTAACTATTCGATATCTAACATGCATATTTGACTCAAATG:1 + chr2R 21351396 3' - mdg1 7056 2 61.39 AATATTATTATTGATAGTAATATTTTGAAATATAAATAAACAGTAGCAGCTCATAAATTTTTGTTATGCACACGTTATATGTAGTGTGCATGCTAAGGTTA:1 + chr3L 387509 3' + Tc3 282 1 48.51 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAATTCCTTTCGAAATCCCCGCTGTC:1 - chr2R 1737780 3' + I-element 5303 1 74.26 TGATACGGTAGATTAAAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCTGCCATTTAAAGTCAGTGGGC:1 + chr3L 19138652 3' - Circe 83 2 78.00 AAATTAAAAATATACTTTAAAAATTTTGACAAAATTTGGCTCTTCTCGGTTTAATCGGTCCTTATTGTTTTTCCTCCAATTTCCTCC:1 - chr2L 12148885 3' - hopper 181 1 80.46 TTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGC:1 - chr3R 29608779 3' + roo 9048 2 55.43 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATCTCTATCTGCTCCGAAGGCATTCCGAGTGGAAATGCCAACTGACACACAC:1 + chr2L 2833934 3' - roo 8688 2 54.55 CTTCGAGTGGGTGATCATGNTAAGTGCAGTGACAGGCGTGTAAACGCTTCCGACGGAAATGTAAATGATATCAATGCGGGAACTCGAG:1 + chr3R 23540701 3' - 412 7174 2 75.00 CCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATATATATGTATCAATAGTTATCTATATGCGAGGATCGATAATCATC:1 - chr3L 25777046 3' + diver 6089 2 54.84 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAAGGACCAATCAAATCTCTT:1 - chr3R 4971375 3' - F-element 16 1 72.28 ACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATAGGGAGATCAGGATATATTTGCCTTCCAAATGCTAAGCACTTATTGCTAAACAATCCAAGCGTTGGCACT:1 - chr2R 8087004 3' + flea 5011 2 75.25 TCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTTAATTGAAAGCAAATAAAAGACTCTATAATACATAATATGACAAGCCATAATCCTGA:1 - chr3L 2709586 3' + Idefix 257 2 60.40 TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAAGCAATAGAAAAGAACGAGATGAAAGGGAAGTAGAGGAGAAACTTTAAATTGACAT:1 + chr2R 18733790 3' - copia 4890 2 59.41 GCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTGTTGTGCGGTGTTTGTGGGTGGTGTCGATATA:1 + chrX 14758125 3' - Doc 4510 1 68.32 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTC:1 + chr2R 22856575 3' + 1360 3339 1 80.20 TAATAATAATATAATAATANAATATTTCAGCAAAGAGGGTTGAAAACATCCTTTGTATCTGAAAAAGGATGCAACAAATCAACACGCTGATGTTTGAAAAA:1 + chr2R 23206347 3' + invader3 5050 6 70.30 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTTGTACACACAATATTTAAAACGAGTTCTGGGAATTAACACG:1 - chr3R 16601434 3' + roo 9038 1 58.42 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCCAACTACATAACACATAATTTTTCAAGTGCAGCGACCAAAGAGTTTGG:1 - chrX 6457888 3' - hobo 28 1 51.49 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTACACCATATACACTATATACACTCACTCACGCACACGATCCACAA:1 + chr3L 20580836 3' - hobo 31 1 57.43 TGGGTCAGCAGATTCGCGACAACACAGAGCCATACATAATACTTGATTCTCCTTTTTTTTCTGTTGTATTGCCCAATGCTTTCTATTTTGTTGTTTTAATT:1 + chrX 7645148 3' + gypsy5 213 2 54.46 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATGGATGAACTTGTCCTTAAAGTAATATTTTGGTATTTTCAAGAAGTTGTTAA:1 + chr3L 16562370 3' - pogo 22 1 57.43 AAAAAGAAAAAAAAAATGGGGCTTCGCTGGTGTCGCCGTGCAATTTAAATACATACCTCCTTGATATCCTCCCTTCACTACCCCACTTTGGGCCTTGCAT:1 - chr3R 9206108 3' - hopper 138 1 64.00 AAAGACACTAGAATAATAATAGAATTCTAGTGTCTTTGGTTGGTGCCTATAAAAACTATCTTGAAAATGATTGTCTAAACCTTTATACAGAAATCTTTGTG:1 + chr2R 11728626 3' - Tc3 309 2 57.43 ATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAG:1 - chrX 4166387 3' - I-element 5327 1 61.62 TTTTTCATTTTATTATTTGACTTGCCAATTTCTATTGCCATGACAACGAAATGTTGAAATTTGTTGAGGAAATCAACGGCAGCGGGTGCAGCTGCCTACCT:1 + chr2R 7306804 3' - Rt1b 5144 1 73.27 TCTTCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAATACATGTCTGGGCATACCAGTCGGTATTAATGGAGGTCTCTCACCTTTCGGGCTTAAGG:1 + chrX 7593617 3' + G6 1899 1 56.44 TCGTTCTGACTCATAGTTTNATTATTTAAGATAACAAATCAGCTATTGAATTTTGGTTAATTGATCCATTGCTGGGATTCCTT:1 + chr3L 21545950 3' - F-element 184 1 59.04 TGCACTCACACTAGCTGAGTAAAGGATATCTGCAAGCTTAAATCAATTAAATTAATCCATTCATTAGTAATCTTAAATGTATACAATTTTTTTAATCACTT:1 - chrX 20578311 3' + INE-1 533 1 73.27 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATAAACCCAATACTTAGCTCCTGCTGAGCCACGTTCGCTTTC:1 + chr3L 171236 3' + 1360 3352 1 67.33 TTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTATATCTGCATGAATATCATCATCAATTGAAACAACTTATACAT:1 - chr3R 11663603 3' + FB 36 1 58.42 CGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATTTATATCAGGTGCATGGTGTGCGGAGCAAAC:1 - chr3R 25711836 3' - 1360 3214 1 72.28 CAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTGATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAATG:1 + chr3R 22494181 3' + 297 366 2 67.33 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTGACACACGCAAGTCTTCCGTTGATCCGAAAGAATGACACACCTTTGATGCAAAACATTGAAGCCGATAAA:1 + chr4 301810 3' - jockey 12 1 73.27 AAAAAAAAAAAGGAAAAGAAAAAAATAACCCCCGAAATTTTCCGGAAACACTGCCTGCAA:1 - chr3R 29633227 3' + Doc2-element 251 1 88.33 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTTTCATCATAAAATCATGCA:1 + chr2L 8622813 3' + 297 344 2 79.21 ATCTACACATTACATTTTACAAAAAAAATTTTTCATTGAACATATTTACATAAGCACACGTATGGATATAAACAGAGTAATGTCGATGCAAAACCCTTTGA:1 - chrX 22509750 3' - HB 105 1 73.27 AAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGTTTTTTGTGACTTACTTAAGGGAGAACAGCACCAGCT:2 - chr2L 3408623 3' - G-element 41 1 60.40 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGGTT:1 + chr2L 4063753 3' - roo 37 2 67.33 GTTATCATAAAGAATGAGCAAAAAAAAACAAAAAACGTTCATTTGGATCTATAGATCCTGGAATCCTTTGTGCAGATGATGATGATGATCGAAAGGGATTG:1 + chrX 19769272 3' - looper1 81 1 72.28 TTGACGTCAGATAGAAAGATAGGTGGGGGCTTAGCAAAATCAGTTGCACGTGTCTGCCAGCAACAACAACTGAAATGGGCGCACAGAGAAAACATAATTAT:1 + chrX 3558598 3' - G4 171 1 56.44 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGCGCTTAATCTGCTGTTGCCATTT:1 + chr2L 12808249 3' - Tirant 15 2 66.34 GCACACGGAGGTTTTTGTTTTAGTATGTGGTGTTGTTTTTGTTGTTGCGCAGGTATCGGCTAGCACCTAAGCGCGATTGGTCTCGGTTGTG:1 - chrX 18783798 3' + Rt1b 5027 1 62.64 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCT:1 + chr3L 20411844 3' + roo 361 2 72.28 ATTAACTACATCAGAAGTANTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACTTGTAATGT:1 + chr3L 25059158 3' + mdg1 403 2 62.38 CGATTTTTCCAACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCAGAAGTGCATTGCGAACACCTGCAGTCACTCCTCCGCAGTTGGGCCCTTGTTAATATTGATGGCCAAT:1 - chrX 12768219 3' - FB 9 1 67.00 GCAGAGTCAGATGAAAGAAGAATTGAAAAAATAACTGTTCCTATGCGCAAGGAAGAGGCAAGTGGAGGCCACACACTCACCTGCATTCTGCGCAAGTGGG:1 - chr2R 18616118 3' + Bari1 127 1 61.00 TTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATACCATTACCTCATTATGTAATTTGCTGTATCTGCACCTTCTAATTGTAGATCCCGCCGCGGGAATCGTGGA:1 - chr3R 17481973 3' - copia 4875 2 64.36 GCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAGTAATGGATAAGCCGCATTCGAAGCAATTAATTATCAGTGTTTTTGCTTTCTTTGAGCAAAACCAGT:1 + chr3L 3242757 3' - diver 10 2 55.45 TAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCAAACTTATCGCCTTTTGATTGATATATC:1 + chrX 23065694 3' - G2 317 1 76.24 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGCCTTGTTGACAATTTAATTTAATGTTTTCGTTTTACCGACC:1 + chrX 7157331 3' - blood 7045 2 59.00 GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACAAAAAGAAAAGCTTGGGAG:1 + chr2L 17079905 3' - jockey 4798 1 57.00 TTATTATTATTGTTGTTGTTATTATTGGTGGCTGTGGTTGAGGTGCGCTTTCGCTTTTTGTGCGTCGCGCCTTCGAGCTAGTAAACGACGATGAGCGCCAT:1 - chr2L 5993862 3' - mdg1 7067 5 66.34 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAATAACCTAGCTTAAAGTGTGCCTA:2 - chr2L 3699394 3' + mdg3 227 2 57.43 TTCACACTAGCTGAGGAACTGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACCATAGCATTCTCTTTTGTTTTTAAATATAATATTCTTAGTTGGATTATTACATTT:1 - chr2R 5341869 3' + INE-1 537 1 68.32 ACAGTTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTAACGTTCTTTACGCGTCTTTTACTC:1 + chr2R 10523802 3' - HMS-Beagle2 491 1 76.00 TCTGTGAACACGTCCACTCAATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGCGGAGCTGTGGCTCTGGGAGAAAGGCAAACAGAAGTGATGTAAAAATATGCGTTG:1 + chr3R 12199838 3' - jockey 28 1 56.44 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCCAGTTTTAGCCCACTGTTACTGTCGTTATCGTTG:1 - chrX 21229286 3' - transib2 39 1 64.36 TTTTTACATTATATTCATTTCCTCGCATTTTTGCCATATCAATAGAAACTACCAATACGAATTGGTAAATAATAAAAATACAATACGCGCTGCAAAAATGT:1 - chr3L 22940625 3' + Cr1a 4325 1 74.26 ATGAATTTTAAAACTAAGANTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAG:1 + chr2R 10670030 3' - jockey 4800 1 65.35 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTCGCGCCAAGGAGAGTGCGAGCGAGACAG:1 + chr3R 29287589 3' + hobo 2933 1 72.73 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACA:2 + chr3R 30553603 3' - 412 48 2 71.29 TTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGACCACTTGCTGTGACAGAGCGGGA:1 - chrX 8534166 3' + micropia 182 2 82.18 TATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATGCGTTACTCACATATCT:1 - chr2R 7546254 3' + hopper 82 1 48.51 TCGGCGCCAACGCAGGCGAAGCTGGTTGCCCTGGCCTTTGGTGCCACCGTGGCGCTGGCCCAACGTCGCCTGGCTC:1 + chr2L 7471597 3' + R1A1-element 481 1 60.53 TCTCAACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCACCGAAATTGTTCGTGTTTC:1 - chr2R 3146443 3' - Cr1a 4047 1 70.37 TGGGACAAAAGTGGGTTTCNGATACCAGTAGTACATCGATGGCCAAAAAAGTGAACATTTCGTTTAAATGCATAACGAATGACATGAAATAAAGTGTCAT:1 - chr2L 3404018 3' - G2 369 1 42.00 ATTTCTTAAAAACGTACAACTTTACCCTTGGTGCTTCTTTGTGCCATACAAATGTAATATTTCAGAGAACACTAGAACGTTTGTTTGCAAACAATTGAAA:1 + chr3R 26998561 3' - transib4 451 1 73.00 CTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCTTCGTCATTTACATTATTATGATGAGATGCAA:1 - chr3L 20757863 3' - flea 37 2 68.32 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTCAAGGCAAGGCCGTCCAAGAAACACTAATTATGATCTTA:1 + chr2R 24555691 3' + hopper 1381 1 58.42 GCATAGCCTCGTCCCCCGCNACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACTGTGTGATCTGTATGGATACACATATGGATACATATATG:1 + chr3R 5411608 3' + accord 125 2 60.40 CTGATGACGCCGCCTGAAGCCAAACTGGTGATCGGGAATCAGGCCAGCTTCGTCGGTCCCAAAGTCGGCCATTGCCGCCAACTGCTCATCGGTGGGCTCCG:1 - chr3R 16264783 3' - G7 374 1 53.47 AACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAAACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTA:1 + chr3L 11826438 3' + INE-1 142 1 65.35 AACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTATCCATCAAAATGGGACTTGCCTTTAAAGTTTTTATGA:1 - chr3R 15924570 3' + Quasimodo 7362 2 73.27 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCTTTTCTATTAGCTTTAAATGTTTCTAGGAAAAACACCATTATTTTAAAAAGCATTT:1 - chr3L 13096935 3' - I-element 25 1 59.41 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGTTTTCTAACACGGAACGAG:1 - chr3R 21365475 3' - P-element 8 2 71.29 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATTTCGGCCCTATGTCATTTATGA:1 - chr2R 17963225 3' - blood 25 2 54.00 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGGACAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTTGCCTTTTTGCTAAACAGTCCGCGGAAAAGTTTGCCGG:1 - chr2R 21747514 3' - mdg1 14 2 58.42 TCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGATCCGGGACTTTAAACGGTCTCCAACTGTTAGTATTTTGCAACTGGACATT:1 - chr2L 3542326 3' + G2 99 1 61.00 TAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAACTAAACTAAATACTAGTATTGAAAGGAGGGTAGCAGCGTAGAAAATATTGAACTTTGTCAATG:1 + chrX 1127072 3' - mdg3 5265 1 67.00 TGCAGAATAAAAAAAAACGCTTTGGTTTAAAAGATATTAAAATATTTATATCGATGGAAAAGCTTGCTGTGCGGCGAATTGGAGCGCGTGGGCGACCTCG:1 + chrX 2078859 3' + Transib-N1_DM 263 1 66.00 CGTATGGGTGAGTGGACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATGGCCATCCTGCTATTTAGCCATGTT:1 + chr2L 13566523 3' - hobo 2762 1 71.29 AATACACTTACAACATATACATCCCAATACAACATACATTACTCCAGATGTACCCAACAGATACAGATACAGATACAATTGCTAGACATCGCAAGTGGTCG:1 - chrX 17735968 3' + Idefix 48 2 67.33 TTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGCAGTAAAAGTTTGGTGCGCAGCGGGAAGTGCCAACAAGTTTGAGTGTAGGAAAAAGGGGA:1 - chr3R 1851091 3' - G2 2892 1 64.36 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATG:1 + chr3L 25059131 3' + mdg1 377 2 70.00 CCGAAAGAAAGGGCAGACTAATCCGTGGTAGTAGAACACGTTTTATTCTATCAGTAATTCAAGTAATTCAAAATTAAAACTTTTTAGAATGGTTGCATGAC:1 - chr2R 4918099 3' - aurora-element 38 1 55.45 ACGTTTTTTAATGTCTCAATCAATCAGAAAGCATTTAAAAAATCTATAATGTAAAATTTTTTATTTATTTTATTTTATGGTTTTAGAGAGTAATATCCTTT:1 - chr3L 14624205 3' - hobo 2505 1 80.20 TTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGCTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACA:1 - chr3R 4571527 3' + 1360 3209 1 70.30 TCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCTAAATCGCACAATCAAAAATAGTTGTTTTCACAAGCGGAGAAT:1 + chr3L 5710316 3' - Transpac 28 2 52.48 ATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGCATATTATTTATACTCTTATACTTGAGTCCTATTCGAGTGCCCCGTGCAGTATGCTTTTTTAATTGTCTGACATTTC:1 - chrX 1706007 3' - Juan 4048 1 74.26 TACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGAGTCTTGTGAAGAGGGTTTAAC:1 + chr2L 3825506 3' + hobo 397 1 78.22 CTATGTGGTTATGTATGTGNGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTTTCCAGTGCTCGGTAGCATTCTT:1 + chr2L 11712873 3' - Quasimodo 47 2 78.22 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAATCACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTCATTTAAATTCCTTGCCTTCTCGTTGTCC:1 + chr3R 14580350 3' + blood 7342 2 68.32 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCCCCAACCCCCACAGACTTTCCATCTCAGGTTGCCTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTCC:1 + chr2L 12511618 3' + copia 239 1 62.89 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTGTTATCAAGGCTTTCAAGCATGATCTATCTTAAA:1 - chr3R 17781555 3' - pogo 38 1 64.36 GAAGCACCGGGTGACTCCGNTCATAATCCGTACAAAAACCTTTTCTTGTTGCAAATGGCCTGGTTTTTTTATAATATTTGCTTAAATTCCGCATTGTTGTA:1 - chr3R 7513894 3' - diver 5901 2 60.40 AATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTACTTTGTCTAAATAGGGGTTGCTAATAGGTAACTGAAGCTCTT:1 - chrX 9454815 3' + roo 9038 1 58.42 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCAACTCAAGTGC:1 - chr2R 9649188 3' + roo 9023 2 74.26 GAGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAGTGTCCTTTGCTCTTTTGCGCCGTTTGCCACTTACGCAATTTAAATAACTCAAGT:1 - chr3R 17254638 3' + Bica 460 1 43.56 GTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGGGTAGTTCCATTTATCCATGCATCTCTGATTTTGTTGTCGGTGTATATCGATTGACCCATATATATTTCCCTG:1 - chr3L 14408861 3' - jockey 4741 1 73.27 ACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAAAATCACTTTAAAGCTGGCCAAAGA:1 + chrX 7036345 3' + G2 2951 1 76.24 GACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTTCCGCTCTTAAAGCAATCTCTAGGTTTAGATTTTCCAGGGCAATAAACTGCAATCCA:1 - chrX 7146119 3' + Cr1a 4205 1 61.39 AATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATAAGATAGAGACTCCAGATGTTGGAATATGACTATGAAATAGTATACAAGAAG:1 - chr3R 1849154 3' + Tabor 7300 2 53.54 CGAGGCATTGTGCAAAGTANTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGTAGTTACAAAATACATTTAATACAAGTTTTAGGGAATGCAATTTTTAA:1 + chr3R 25581106 3' + pogo 2076 1 54.46 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGGCTTAATATCGAAAATCCATTTACAC:1 + chr2L 19854121 3' - roo 8710 2 78.12 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATAAACCCAATACTTAGCTCCTGCTG:1 + chr3L 171220 3' + 1360 3336 1 83.17 CGCGCCGACACGGCCATCCTGACCATTACACGACCTCGTGCAATACTTCCAAAATATACTTTGCGATATACATAAAACATTTTTATTAACAAATTATAAAA:1 + chr3R 15021689 3' - invader4 2748 1 45.54 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTTGCAGCACAATGAGCAACAGTCAACACAAG:1 + chr3R 23338355 3' + roo 395 1 63.37 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTATA:1 + chr2R 10670039 3' - jockey 4791 1 57.43 TGTTTATTGTTTGCCTCTACTAAAAAAAAAAACTAGTTACAGACTATTTACATATATCTATAATAATTTCATGGGAGTTAACTGCCTTAATATAAATCAAA:1 - chr3L 11829205 3' - hopper2 1300 1 67.33 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTCATTTTAATTGATGTTTATTTAAAAACTAGTTGTGTTTTG:1 - chr2R 5772453 3' - HMS-Beagle 31 2 62.00 ACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCGTAGACCTTATCAGTCACGAAAAGACTATAGTTTATGGTCGTCTATTGAAAATATCAGGAACGTATGTGTTTT:1 - chr3R 24541998 3' + 1360 3383 2 73.27 AAAACATCATAAAAATAAAATAAAGTTAAATAATTCAGCTATTAAAAACAGGACACTAATAAATTTTACATTTACGTAAATTGGTAGAGCCGAACACATCG:1 + chr3L 14603156 3' + jockey 4998 1 41.58 GAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGCTCTGACTGGCAACTTTGCCAGACT:1 + chr2R 14997950 3' - McClintock 5953 2 77.23 GACGTGTGAAGACGTTTTTATAGTGCTCCGCACAAAATCGGTTATTTTATTACGTTTGTCCACGCAGTAACACGAACATTATAATATCAAAGATGCCGATT:1 + chrX 17395288 3' + F-element 25 1 60.40 GAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTACACAAAAAATAATATAAGACAACCCAGATTTTAACAGTATTAGAAAAAA:1 - chr2R 19091598 3' + Stalker2 7624 2 49.50 TCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATCTGTCTTAAAATAGAAAATGAACA:1 + chr2L 4134882 3' + Quasimodo 7322 2 75.25 TAATGACAATTTAGGTGTGGTAAGACAAAAAACAGTTTTTATCTTTATTGCAGCACAGATAGATTTAGCATTTAATTGAAATAAACCCGAAATGTTCAAA:1 + chr3L 23285790 3' - looper1 1645 1 75.00 CGAGTGCCGAGAACCCTGAGGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTCGTGGTTTCGATGTT:1 + chr2L 20328781 3' + opus 7480 2 55.32 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAAATTCCCTCGAAAACAGAAGATAAAAAGAGATAGGTGGGAAAC:1 + chr3R 9224437 3' + pogo 2099 1 77.23 TTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAATAAATATGTATGCATTTATAAAATTACAAAAGAACAATAACCCAAAATATATGTAT:1 + chr2L 20684346 3' + I-element 5336 1 59.41 GATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTTCCCTAAGTGTTGGTGTGGAGAAATTTGCAATA:1 + chr2L 7084893 3' - Doc 296 1 67.33 TTGGGCATTCGTAGTAATAATTTTTGTTTGCATTTAGATATGAGACCGAAAGTGAAAGGTTAATCCACTACAAAAACAACCGAACTGAACTGAACTGAGCT:1 + chr3L 21884286 3' + looper1 389 1 60.40 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCGTACATGTATTTATTAATTCTCATAAAAAAATTGGTTAGTCTGGCCAAATCAGTCAAGGCAGAACTAAA:1 - chr3R 21588980 3' + flea 4998 2 64.36 TAGTATAGCATTAGCTACGAGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGCTGAGGGTTCAGACAAAAGG:1 - chrX 4166357 3' - I-element 5299 1 65.35 AGCCGGCAAACACAGCATATTCGCGTGGGCGCTGCGAGTCTTTGTCAGCTATAAGAGCTCCCCAGCGCCGCAACAATTTAAGGGTCAGTTTGGGGCATGTG:1 + chr3R 31293268 3' + Gypsy6A_LTR 95 1 62.38 CAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATC:1 - chr2R 15788599 3' - Transpac 4975 2 76.24 TAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCG:1 - chrX 15263447 3' + invader3 5415 2 76.29 TCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGA:1 - chr3L 3596686 3' + copia 212 2 69.31 CTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAAACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTAC:1 + chr3L 11826439 3' + INE-1 153 1 59.34 TAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATTTTATAGAAATAGTTGAGAAGTGATGAAACTAAG:1 + chr2L 17732264 3' + pogo 141 1 66.34 GAAATTTTCCCCGAAATTAAAAACGCGCGTATAAGTCCTGCGTACCAAACCCCTTCTGTGCCCACCAAAAACACCTTTGGCATCATGGAAAGAAGTCAAAA:1 - chrX 21411704 3' - Max-element 8481 2 78.22 TCTTCAGTGAAGTTTGACTGGTTGAACTGTTTGGAACTGATTGGCACCAAAGGCCAAATCGATTATTCACTGACAGGATTTTCGAAAAGAAGTTGAGGTTG:1 + chr3L 26834422 3' + invader4 242 2 51.49 ATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTAACTCTTTTAAAAATTCTTTCTCAGTATTCGGTTTATTCTAGTTCTGGCCGTTATTGTTTG:1 - chr2L 23296057 3' - 1360 3336 1 68.32 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAATAATCGTTTATAAATGATAAATTAATATGGGAAACAAATTGTATGGGCGGTCGATAGCTCCGAGCTTA:1 - chr3L 7099559 3' - roo 5 2 72.45 AAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATAACCGCTGCTTTACATACCCGTTGGTAGGTAGGGTTTTGTCTTGGTCTCAT:1 - chr3L 18749447 3' - Circe 7239 2 75.25 TATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGATTGTATAGTTTGTGCCATCAAACATAAGATT:1 + chr3R 27907679 3' - mdg3 29 2 65.48 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGC:1 + chr3R 12876361 3' + hopper 1369 1 72.28 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGTCGTTGAAAAAGTCCGCGAAAAGTGGCTAGGACCATGAG:1 - chr2R 12457922 3' - HMS-Beagle 32 2 59.41 AAATTTTCCACTCCGCACGNGTTGCGAGGCGAGCTGGGGGAAATGGTGGGTCTGCCTCCTCCGATTTCCGTGGAAGTGCATTCGCCCAGAATGCCG:1 + chrX 19681446 3' + R1A1-element 162 1 68.75 ATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAACTTTTATGCTGTAAACTGCGAGA:1 + chr2R 16614877 3' + roo 72 2 77.23 TCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAGTGGCAGC:1 + chr3R 10488745 3' + roo 9071 1 70.42 TGATACTTATAGTTTTTTCGTTATTTTATTTGTGATACAGAAATTTAGCTAAAAATTTTAGATTTCCCTATTTTCCGAATTCGTAAGACTTGCGTAAGGCG:1 - chr2L 518958 3' - Transpac 4772 1 87.13 AGACCGCGGCGAGGGATCTGCACCATATATTTAATTAATTGGCGCTCAACTAGCGGGAAATACGCACTGCTAATAAAATGGCTCGGGCCGCGTATTCCGAC:1 - chr2R 5850116 3' + gypsy6 7785 4 39.60 TGTGCGGAGAACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATGGCATTTGATTATCAAGTGTTTTGAGATACTCCT:1 + chr2L 15898806 3' - F-element 37 1 60.98 AAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTGGTAAAGATAGTTCATCAGTTTAAATACTGAACTAACCGCTGCTCCG:1 - chr2R 18296004 3' + S-element 1689 1 54.46 TGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGA:2 - chr4 829445 3' + INE-1 81 1 81.19 AATAATAATTACGTTTATTATTATGTATTGGTTT:1 - chr2L 13733892 3' + invader6 4397 1 88.24 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGAAAGATGTGTTAATATGAACTTATTTTCGTGTACGATACTATTTGTGACGTCGGTTGCTTTTTT:1 - chr3R 19987385 3' - Doc 18 1 60.40 AGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGCGCCTGCAAACAATGGCGGGAGGGTATCTGCATCCTGGCACTCACGCCCCC:1 + chr2R 13383583 3' - gypsy5 13 2 58.62 TACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGTGGCTCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCAGTTCATCGTGAAGCTGTTCAAGACC:1 - chr2L 3623641 3' + R1A1-element 335 1 67.33 CAAATAAAATCAGTTTTCTNACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAATTCGAACATGC:1 - chr2L 19854081 3' + roo 367 1 68.32 GAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGCGGGCGGGCGTGAAAATCGGAGAGAATTTCCCACGGTGGAAAACGACAACAAACGAACGAATGCTGCCGCACACG:1 - chr3R 18849342 3' - blood 7179 3 80.00 TAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCGGCAAATTACACGGAACAAAAAAAAATGTGAA:1 + chrX 4005161 3' + I-element 314 1 68.32 ACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCAGTATTTGCAACTAGGTTTGTCTATACGTAC:1 - chr3R 7627411 3' - hobo 317 1 75.25 CCTGCGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCATAGGCTAATCAACGATAGTCAGATACTTTAGCGG:1 + chr3R 4315029 3' + Burdock 298 1 74.75 AGAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAGATCAAAT:1 + chr3L 15735034 3' - Tc1 1482 1 88.24 AAATTTGATGTTTTTTTTTTTCACTGAACGACCCCCGTTTTTTCCAAAAATCGTCAGGGGCAACAAATTCC:1 + chrX 13058965 3' - gypsy7 5016 1 83.10 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCAGTTTACTAGACTACAAAAGTAAACAGCACGCCACAAATTCCAAGTAAAAGAAAAGCAAACTTAGCCAGCCATTGC:1 + chr3L 14222561 3' - roo 8664 1 79.21 TCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTCTCTGCGGGAGCATCTTCAATGTCGCTGGTTGCATTGAGCGAGCTTTT:1 - chr2R 12279424 3' - Doc3-element 4524 1 57.43 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTGTATGGGCCAACTAACGCTACCTT:1 - chr3L 13785385 3' - pogo 47 1 75.25 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAA:2 + chr2R 10670028 3' - jockey 4802 1 68.32 CAAGAACACACACACACACACACACACACACACTGATAGCTAGCCAGGTGTGTGGACTGACTGGTCTGTCTT:1 - chr3R 30357842 3' + accord 180 2 73.61 TTTAGAGATCATGTTTTTAATCAAATTTCTTTTTTCGACGGTAAAATGCTTGCCGCGACCCAGACCCCAAACTGATTGGTAATCATGAAAAAGAGGGAAG:1 + chr2L 18114592 3' - Tc1 400 1 62.00 TAAAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTGAATCACAAAATCGGTTTCGGATTACACAAAGAGTGCGCGCACACCCGATCGCGTCGACGATTGG:1 + chr2R 5395190 3' - F-element 117 2 76.34 TTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAA:1 + chr2R 10670017 3' - jockey 4813 1 79.21 CAATTGGCCGGACAGACTGCCGAAAAATGCAGCGCCAAGCTTAACGTCATTAATATGAAAAATTCAGCTGAAGAGATTATTCCATCTTGATGGGG:1 - chr2L 12403212 3' - diver2 4727 2 51.58 ATTATAAAAAGAAAAAAAAAAATAAAAGAAAATATCTATAAAAAAGAATAGACCTTATTCTCAACTGAAAAGCCAGATAACCATGTCATTTTAATAATTTT:1 + chr3L 18381417 3' - hopper 155 7 65.35 ACCATCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCCCTCCCAGCATTTTGACTTACTCTGGCTTATA:1 - chr2L 22307333 3' + Doc 329 1 67.33 AACGGAGCCCAAAATTGTANGTCTTTAAAGATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCCTTGTTAAATCAGCTGGCATTGGGCAAAAACCAGCGGAACGAA:1 + chrX 11017057 3' - roo 8696 2 57.43 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATTTTTAGTTGAGCTCTAGTTTTGAAATTAGTCAAATATAATCATGTT:1 - chrX 7157260 3' + blood 7362 2 53.47 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACTTGTAATGTATTCTGCTTTTGGT:1 + chr3L 25059172 3' + mdg1 7455 2 76.24 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTCTTGACATCCGATTC:1 - chr3L 12241818 3' + roo 9037 1 62.38 CTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAAGGTTCAAAGAGAGCAGTCAAATTTCAGGACAGTTTTGCCATTCTGTTTAAGTATAATTTCTCTAAAGTCGCGGTT:1 - chr2R 4132255 3' - 297 6768 2 52.48 CAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAGATTATATAAAAATCTGGAATAAGAGAATTTTGAAGAGATGTTGTTTACTCGACAGTCACCATAGAATCACCGGCTTA:1 + chr3L 15788526 3' + opus 498 1 68.32 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATT:1 - chrX 21217519 3' + pogo 2059 1 71.58 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCG:1 - chr2R 12473068 3' - Doc 47 1 70.30 TGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACTTGGGTTTTGATTATTCTTTCTAGGCCGCTCTCC:1 - chr3L 25272523 3' - 1360 13 1 71.29 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATTACCCCTTTTTGTGCATAGATTTTCCATCTTGTTCTTGCACAGCGAAATTCGCCCC:1 + chrX 9775065 3' + 412 7524 2 56.44 AGATGAAAAAAAGCAAACATCAAGCAAAGACTCTAGAATATAATCTTAAGTAATAATATATGCATTTTCCAGAACCCTTCACCTTGATCAACTGCTACAAC:1 + chr2L 14344190 3' + Doc2-element 4529 1 77.23 TGATCCAGCATTTGCTGCAAAGGATTAGGGAAACCCAGTGTTCTTTTGTAAGCGCATGAATTCATTATTCTACTCAATTACAAATATATACCTTAGGTCA:1 - chr2R 19602374 3' - copia 4751 1 69.00 GCCGTTAAGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACTGTAAAGGTCCTTGCTAAAAAGCGTGAAAAATATGCAAATTAGCTGAGGGGTCGCAAACA:1 - chr3R 26826525 3' + 1360 3377 1 59.00 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAG:2 - chr2R 15788565 3' - Transpac 22 2 58.42 TGTTGAACTTTTTGTACACCTGCATTTCATGTTTTAAACACGACAGGTTGTGTCGTAAAAGTAAAAACTGTATGTTAATGTACATACATAGGTTCTTGATG:1 + chr3L 15122370 3' - Juan 3946 1 79.21 TTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGCGCTTAATCTGCTGTTGCCATTTTTCAAGGTTCTTG:2 + chr2L 12808262 3' - Tirant 2 2 79.21 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGA:1 + chrX 1399914 3' + P-element 2842 1 34.65 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGT:1 - chr3R 23638107 3' + pogo 2061 1 72.28 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTG:2 - chrX 4277461 3' + roo 9041 1 57.43 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATCATTCGTTCTGAACTCCCAGC:2 - chr3L 7168341 3' - Doc 59 1 78.22 TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTTTGTTGGGCTTTTCGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 3379574 3' + mdg3 244 2 56.60 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCC:1 - chr3L 13773896 3' + roo 9030 1 66.34 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGAT:1 - chrX 23280914 3' + roo 358 2 73.27 CGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGACCTACGGTTCGGAATGTGAAATTGTATTTGTTTTTCTTTGCTGAGTAAACCAACTGAGTTTTCTAGGCT:1 + chr2L 9696080 3' - FB 9 1 70.30 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAAACTATTCGGCCAAATTTTAAAACAAACAAGCCATGTT:1 - chr2L 16139089 3' + copia 246 1 70.30 TTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGGAGTGCACCGCGGCCAATATGCCACATATGGGGGTATGTAATTAGTGTA:1 - chr2L 19646061 3' + Quasimodo 6962 2 51.49 ACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGTTGTAAAGCAATTCAATTGGTTGCTTAACGTAACATAAAATTATATTATATTAAATGGTGTATTGAGTCGA:1 + chrX 11088311 3' - blood 4 2 69.31 GGAGCAAATAAAAAAGAGCTTGCAAAGTGAAGTTCCAGCCTTCGCTACTACCGGTATTTCAAACACCTACTGCAACACAGACCAAGTGCAAGGACCGTCGA:1 + chr3R 4417384 3' + G5 491 1 73.27 GCACTTCTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCCTCGCACCATAATCTTTACCAGCCGAACGGGAAGTCTTCGAAGTATCCGCCCACTTACCAGTAT:1 - chr2R 6182528 3' + Cr1a 282 1 69.31 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTAACTAGTGGTGAACTATATTG:1 - chr3L 20882805 3' - 412 52 2 75.25 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCGCCACCCCCTCTCCCAAATGTGGGTCAGTCAAAAGTAAAAATTCTTTCGCATA:1 - chr2L 4924506 3' - hobo 24 1 53.47 CTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCTCAAACACACACAAACATGTGCGTCTTTTAAAATTCCTTCGATAAACGACATTTAGGGGCTATTCTAAATGAA:1 - chr2R 9209392 3' + Tirant 401 1 75.25 ATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTATAGTTGGGGCATTTCTTTTTTGGCATTCCGGGCATTGAAGC:1 - chr2R 13700924 3' - Doc 4573 1 58.42 ATAACAATATTTATTATTTNTTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTATTGCCA:1 - chr2R 18188314 3' - Juan 4060 1 57.43 ATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCTTGGTCAGGATCAATAACCGAGTCGATCTGACCCTGTCCGTCCTTATTGACCATCGAATTTAACCTGGTGT:1 - chr2R 10776519 3' - HMS-Beagle2 6883 1 74.26 TTATCTTATAAGTTGGTCGCTGAAGGACAAACTTGACCAAAATGTTTCCATCTCCCCCACCCAGCCCACTTAATACCAACTCGTTGGCTTGCTCGACGATT:1 - chr2L 12801041 3' - GATE 319 1 64.36 GCACTAGGCTGTCCCAAGACACAAACCCGGCACTTTCCTCATCCACCCCAATCACCCCATGACCTCATCCCCTCCTTCTGCTTCTCCTCCTCGTCC:1 - chr3R 17815612 3' - R1A1-element 259 1 68.75 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGAAATTGAATTTATCACATGTTATGCGTTTGCACATGTAGTGGTGTTTGCGAA:1 - chr2R 17420818 3' + pogo 2080 1 54.46 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTACCATTTTCACTGGTATTTCACC:1 - chr2L 20620017 3' + roo 360 2 76.24 AGGCAAAATCGAACCAAAGTGTTCGTCTATTGTGGTGTGAGAAATGATTTTCTGATATTGCCTAGTCCCATCCATTATATTGCTTTGAGTTTCTTTCGAAT:1 + chrX 13639864 3' + transib3 376 1 60.40 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAATCTAGTTGTAGGTTTTTATGACTCTTTTATTTTAATGTTTAAATGTGCAGGAGTA:1 - chr2L 7175548 3' - blood 18 2 61.00 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACGTTGC:1 - chr3L 20049619 3' - jockey 4787 1 51.49 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGAGCTTAGGAAACCAAATTAAGCTTTGACTTT:1 + chrX 1399944 3' + P-element 2872 1 64.36 GGTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATACATACATATTACATATATATTTTCAACATCAAAAAAAATTTTTTTTCAAAAAA:1 + chr2R 4150672 3' + gypsy 439 2 56.44 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATTAAATTAAATATGACTAAAAACAACTATAATGAAAAAAAATTTCAAAATTTGCAAATTAAGC:1 + chr2R 18188377 3' + Juan 4197 1 54.00 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCAGACCGTCGCGACGGCGATGAGCAAACAACAGACG:1 + chr3R 12329687 3' + hopper 1401 1 63.00 AAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTAT:1 - chr2L 23295811 3' + micropia 5391 2 72.28 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTAAAAACCACAAGCGAAATTGCCTGAGGGGAAAAATCCCCAAAA:1 + chrX 7996436 3' + hobo 2929 1 57.89 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGACACATGTGCATTATTGTTGCCTATCTGGCGGACGTTCT:1 - chr3R 28565267 3' - 412 37 2 62.38 AGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTA:1 - chr3R 22869403 3' + Bari1 1655 1 75.25 GGGAGAGTGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGCTAAACCATTGGGCAAAATTTGATATAAATCAAAAAAGAGTTTAAGT:1 + chrX 15932399 3' - INE-1 575 1 52.48 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATTTTTGAGCCTTTGAGCAATTGTTCGTTCGTTACGAGCGTTTTTTTGTGGCATAAAAA:1 - chr3L 5710225 3' + Transpac 5214 2 64.36 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCAGTGAGAGCGGGTGGTTGGGTTGCCG:1 - chr3L 16891087 3' + P-element 2862 1 50.50 CAACAAGCTGCGTCATTTGNGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAAGCGAGCAAACAGGCAAAGATCAGCTGTTAGATCAATTAAA:1 + chr3L 16261495 3' - G2 220 1 70.30 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGGCTTAATATCGAAAATCCATTTACACCGCGCGTCATACTTTTAAGCATATGCT:1 + chr2L 19854148 3' - roo 24 2 56.44 TGTATGTGTGCACACGTATGCTTATGCATTGTAAATTTGACCCCCTTCCCCGATCTGTCTACCCAGCTTGGGTCATCTGCAGTGATGTGGTCTTAACGCTT:1 + chr3L 19667995 3' + 1360 175 1 61.39 GGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTATCTAAACTTATCCATCGCTGAATGGCTAATGTTATTGGCATCCGCAGTACGGTTCACTAATCG:1 - chr2L 20041671 3' - roo 334 2 72.28 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATGGTTGGTACGACAGTATTCAAATTAA:1 - chr2L 14793469 3' - Stalker2 7258 2 69.31 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTGCGACTCCGTTAGCTTAAACAACATTAACCAGTGGCTGGAGCTCATGAAAAGCTCACAACTCGCTGAACTCTGCGAA:1 - chr3L 9967917 3' + Transpac 307 2 76.24 GATCTTCTTCCTATAAGCCAATAATATTTCTTGAGGGGCTGGTTGCCTTGTTTGGCGTCTGATCAGGTCCTGGTACCTTTATGGCTTTAAGGCTCCTCGCA:1 + chr2R 4932759 3' - G7 781 1 61.39 CGTCTGTCCTTATGAACGTTGAGATATCAGGAACTATAAAAGATAGGTTGAGAAGCTCACAAACCACACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAATATTG:1 - chr2R 12521466 3' + INE-1 128 1 44.55 TAATGTGTGTGTTTGTGTGTGTTCGAGTGTCTGTGTTTGAACTTTGAAAAGTGGGTGAATGTACAGTAATGTTTGCTGCAGCGAAGTGCATTATAACCGTA:1 - chr3L 5613860 3' - gypsy3 426 1 79.21 ACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTTAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCCAATATGGATACATGAACATGCGATATGTTTCCTCGCTGAT:1 + chr2R 12654486 3' - Idefix 461 2 68.32 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACAATACTATACATTTGTACATACATACAGAGAGGACACTTCAAGCTGGGGAGAGTACTTAAAAAATATA:1 - chr3R 19216323 3' - 1360 10 2 67.33 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAAAGGTCCTTGAAAATCCAGATTC:1 + chr3L 18418917 3' - hobo 20 1 59.41 CTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTTGCAGCACAATGAGCA:1 + chr3R 23338341 3' + roo 9047 1 51.02 AAGAACACAGAAATGCATTACAATTATTACATAAGATAGAGACTCCAGATGTTGGAATATGACTATGAAATAGTATACAAGAAGGGCTCCTTGAACGTGAT:1 - chrX 19671326 3' + Tabor 476 2 69.31 TTTAAAGGAAGGAGCACGTNTATTCATTTTTCGGCGTCCACATTATGAAAATCATTATGTTCATATACATTTTTGAAATATTATAATTAATACTTAGCGCA:1 - chr3L 13000992 3' + invader3 257 2 58.42 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACTTCATTCACCATCCCCGCTAGGTCAGAATTC:1 + chr3R 26252727 3' + 412 7499 2 72.28 AAATCAGTTTCTTACAAAANCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTCTTGACATCCGATTC:1 - chr3L 12241818 3' + roo 9037 1 61.39 CTTGTCCAAATACTTATGCACACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGATTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAAT:1 + chr3R 15017464 3' + Tc1-2 1617 1 65.98 AACATAAACTTGACTATTTNTTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAAGAACAACAATTAA:1 - chr2L 17245010 3' + copia 215 2 64.36 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCCCGCCACTGGTACCACCCCCCCCC:1 + chr3L 6835001 3' + hopper 1375 1 74.44 TAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCACAAAAGGAAATCTTGTAGGCTGATGGAAATGATGATGGGTGAT:1 - chr3L 8041397 3' - roo 366 1 56.44 TATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGAAGAATAGAGTGGCAATTTGGGGGCAGTGGTTGTA:1 - chr3L 7300107 3' + Doc 176 1 66.34 ATTTTCAACTTTAAATAGANCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTGGGTTTGGGTGGCGAAAGGGGGGGGGGAAATAGG:1 - chr3L 22883115 3' - hopper 1022 1 63.37 CTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGAATTCGTTTCAATTTGTTTACCCTCCCAGCGGACCGGCAACATCTCTCCATTATAATGA:1 - chr3L 3761553 3' - I-element 325 1 67.33 ATGAAAAGTCCTTGCACGTCACACTGCCAAAATTCTGCGCTGACAGCGCTGGAGCAGATCCGGAATTTAGTCTGGCCAGTATGAGGAGACCAAACTATTCG:1 - chrX 15017099 3' + invader4 474 1 60.40 CCTTTTGATCGAGCATATTCCATCTTTCGGAATCTTCAGAGCCATCTTCTGGCTTTACATATTGACCACAAACTCTGCGGCCCCGCACTGTCCGATGCCAT:1 + chr3L 9798582 3' - Copia1_DM 482 1 72.28 TTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATGCAACAGTTCAGTGAGATAAGCACGAAAAAGCCAAGATAGTAAGGCAGGAACCCGG:1 + chr3L 21385444 3' + F-element 69 1 72.28 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAGTGGTGTCCTGTGGAGTGTGGAATGCGGAATGTATTAGA:1 + chr2L 1017651 3' + 1360 3353 1 69.31 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATGCATACAGAACAACCATAACCACA:1 + chrX 6481068 3' + jockey 4950 1 76.14 TGTACGTTACTTATATATANGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATG:1 - chr2L 14793494 3' - Stalker2 35 2 57.43 GACTCCGCTCATAATCCGTACAATAGTAATGGATAAGCCGCATTCGAAGCAATTAATTATCAGTGTTTTTGCTTTCTTTGAGCAAAACCAGTTTCAAGCCA:1 + chr3L 3242766 3' - diver 5889 2 64.36 GATTATTCTAATGAATTTTNAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCG:1 + chr2R 10670020 3' - jockey 4810 1 75.25 ATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCATATGAACTTCTCATGTTAAAATAGTTAATGGCTCAACTGATATTGGCTATAAAGT:1 + chrX 3148157 3' - Doc 4480 1 60.40 TACAATTACCAATTTACGTCAGTCAAAGAGCAATCCAAGAGGCCGCCCAAATTCGGTCAGGCAGACTGGTATGGATCGCTACGTTTTTGTAAAACGTAAAC:1 - chr3L 16730798 3' + Doc4-element 408 1 69.31 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGTACTTCCATTTAACAGGGAAATAACGTTAGTATGTTTGTTAAACCAAAA:1 + chr3L 7307286 3' - hobo 26 1 51.49 TAGATCGGATTGTAAGTCTAAATGGCACGAAGTGTCCTTGTACTGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATA:1 + chr2R 1234689 3' - Q-element 627 1 76.24 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATGGCATTTGATTATCAAGTGTTTTGAGATACTCCTGGGTCGGGAAAGTGATGTGAAAAT:1 + chr2L 15898830 3' - F-element 32 1 61.39 ACCGAGTGTTTATCGGGTGNACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCGTTGAAAGCAAGTCTTTTTGCATAGCATACATTTGGGGGCC:1 - chr3L 13895362 3' + hobo 2906 1 56.44 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATAGGAGTGTGTATATAGCGAAAAGTGCGGGCGAAGGCAATGGCCATTCGCTGGATTCG:1 + chr2L 14035613 3' + flea 5000 2 62.38 CAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGCACGAGAGCGTTCACGAGAGCGGGATCGCGATAGGGAGCGGGACAGAGAGCG:1 + chrX 22880512 3' - Max-element 8388 2 58.42 ATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCAACGGGTCTTCTGTGATTTTGGGACAGGCCATAAATCTTGGCCGAGAAGCCGTTTAA:1 + chr3L 12458070 3' - HMS-Beagle 154 2 65.35 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAGGGGCTTGGCTTTGGCTTCAGCTCATGCAC:1 + chr2R 15788659 3' + Transpac 295 2 63.27 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCGCCGTTCCTGTTG:1 - chr2R 6847263 3' - mdg1 34 2 59.00 AGCACCGGGTGACTCCGCTNATAATCCGTACAATAGTAATGGATAAGCCGCATTCGAAGCAATTAATTATCAGTGTTTTTGCTTTCTTTGAGCAAAACCAG:1 + chr3L 3242756 3' - diver 5899 2 54.46 ATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAATCCCCACCAGCTTTTCCCACCTTTCCGTTAACAGAGTACATCCCCCCCTACTTCTTGGGCAACCACCG:1 + chr3R 24744357 3' + P-element 2715 1 70.30 CCTGGCCGTCAACCTTCTANACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACGAGCCACTCTAAACCGGTCCAATCATCTA:1 - chr3L 17124352 3' + G2 2876 1 70.30 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCGCTTGACGCGACAGCTATTCTTAGCATTCCTTTGGCCTACTTGGCGTATGCGTGATGTT:1 + chr3L 21970891 3' - pogo 15 1 62.38 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTATATACAGACACCCACATACGAGCGCCAATAGAGCGAGATACACCCGTTTTTA:1 + chr3R 5811563 3' - flea 4776 2 60.40 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTACAAGCACATAAACACAAATACATACTAATATGTGTGTTGGGCT:1 + chr3L 14594178 3' - hobo 33 1 61.39 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTGTGTCCGAATAGTGTGGAGCGGTGCCCGATGGCCGAAGGGTAATAAAAATAATAATTACAACATAAA:1 - chr3R 6033923 3' - roo 8671 2 72.28 AGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGGTGGCCTAGAGAACAAGGTGGAAAATGAGTTCCG:1 + chr3R 13421153 3' + invader2 480 1 66.34 GGCAGAGGCACGAACAACCTCTGCAGCTGCGGGAGGTCCGATCGGGTTGTCAAGAATAGTGAGTTAGAGGGAGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' + invader4 2856 2 73.40 CGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACATTATGAAAATCATTATGTTCATATACATTTTTGAAA:1 - chr3L 13001015 3' + invader3 5420 2 71.29 ACTCGACTATCAGATACCCGTTTCGATTGTGCACGAAAGTATAACCAACCACATCACCCCAATCTCCCTGATCCTCTACGAGATCAACGACTCCCTGAGGG:1 - chr3R 20854317 3' - INE-1 553 1 76.24 AAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGGAATGAAGGTTCCCTTACCTGAACGGATGACAAATGGCAATATATCGTTCGACTGTGAACGCGGT:1 + chr3R 13331509 3' - transib2 6 1 74.26 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGTGATGTTAAGATACAATATTATGATGTACGGATTCTTCACTTATTGAATAATCA:1 - chr3R 4575424 3' + 1360 3366 1 56.44 CATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGTGGTACCGGTGCTAGCTCCTG:1 - chr3L 16792528 3' - Chimpo 4019 1 63.37 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGA:1 + chr2L 12882797 3' + hopper 1391 1 56.47 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTAATCTTAAACCTTAGGCATAATGAGTGTTTGGTTTTATCAAGTAGTTTA:1 + chr2R 10353323 3' - blood 7038 2 52.48 TAGTATTTCTTTTTAATTTGTTTTCCGGTGTCACTTCCTTATTTAGTTGTTCACGTTTGTTTGTTGTTTTGTGCTGTTGCCTGGCTTTTGGGTAGGATTTC:1 + chr2R 14030932 3' - HB 1360 1 79.21 AAAGCAAAAAGAAAATAAAAAACCCAAACAAAACGAGAGAAAGAACAAAGCAGCAGCAACGGCG:1 - chrX 14723607 3' + Doc2-element 240 1 90.62 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGACACATGTGCATTATTGTTGCCTATCTG:1 - chr3R 28565278 3' - 412 43 2 71.88 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATGTATGTTTGTCTGTAAACTGTAATCAGGAACC:1 - chr3L 2124609 3' - 297 6617 2 71.29 GGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGCATACTAATGGAAAGAGTTATGCCAA:1 - chrX 14873988 3' - FB 344 1 74.26 AACACACACACACACACATACTGGCATAAATGTGCACTAGGGCGTGGCACCCAACGCCCGCCCCTAAAACCTGATGTTTTCGTGTTGTTTTTGATTCACTT:1 + chrX 8810369 3' + accord 184 2 60.40 ATATTTCCAAATAAAATCAATTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAG:1 + chr2L 7666156 3' + roo 9024 2 72.00 TTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAAATTGTTATGATAAGCTATCTACAAGTTTGGGAAATGTTGGTTGGGAGAGAGCCTTTTCAATGGCCAAAAG:1 + chr3L 3345219 3' - FB 5 1 72.28 AAAAAAAATAAAAAAAAAAACATATGAAAATAGGCGATGCAAAAACAATGTGAAGATATTTTGCGGCGCAACCTTGAGGAGCACCACACCCACAGCCAACC:1 + chrX 5142557 3' + gypsy7 5008 2 63.37 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAAGAGCTCATTACAACCGCAA:1 + chr2L 19642391 3' - Quasimodo 16 2 64.36 TAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCCAAAATTGGAACTTGTGCGCACCTTGTAGAAACAATGTAGATAATATTTATTGG:1 + chr3R 8980067 3' - transib2 19 1 58.42 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAATAATGATAATGATATTTACCAAGAATGTGGTTCTTTATGGGTGTTTATTATTATGAAATTTGTACAAA:1 + chr3L 13987293 3' - pogo 2 1 72.28 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACG:1 - chrX 20361993 3' + hobo 2937 1 57.43 AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACGCACCGTTGCAACTGTATGTATGTATATATATTTATGAGACC:1 - chrX 4792074 3' + copia 253 1 57.43 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCACTCCGGAAGCGGGAGCAATTGATGGCCCATCGGAAGGCCAAATCGAATGGGTAAATGTGGTCGTCAG:1 - chr2R 23519197 3' - jockey 4765 1 72.73 GGGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAGTGGCAGCCACGGCGACAGCAACGATATTT:1 + chr3R 10488767 3' + roo 9063 1 71.29 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGTGGGCG:1 - chr3R 25021660 3' + roo 394 1 65.35 AAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTCCCCATTGACTCCGGCTCAGTTATAACCAGT:1 + chr2R 18723100 3' + HMS-Beagle 205 2 71.29 CAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTCGATGTGTGAAATTAAAAAATTTTGCGATGCAAATTGGCATTGCCAAAATT:1 + chr3R 14334822 3' - X-element 4430 1 50.50 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGAAATTGAATTTATCACATGTTATGCGTTTGCACATGTAGTGGTGTTT:1 - chr2R 17420823 3' + pogo 2076 1 53.00 TGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGATGTACCGATTGACGCTCTTATTACGAATAACATTATCTTGCGAAGGACG:1 + chr2L 20683994 3' - I-element 190 1 54.46 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGC:1 - chrX 21087570 3' - mdg3 15 2 60.40 TATTCTAGTGTCTTTGTTTTTACTATTTAAAAAAACTTAAAATATTTATAAATTTGTAACCATTCGTGCGACATGAGAGAAATGGCATACCCTTAGTAATA:1 + chr3L 11314527 3' + Tc3 316 1 40.59 CTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTATTGTCTTTGAGGAGGGTGTGCGACGAATGGCGCCAGTGCCATGTGCAGTTGGGTGCTCAGT:1 + chr2R 20311060 3' + 1360 489 1 50.50 TTCATTTACATAAGATATGNACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTACAAAGGTTTAGTCATCCAGTCA:1 - chr3L 20411809 3' - roo 51 2 75.25 AAATCTCGTGCAGGGGAGTGGCCTAATAACAGCCGCATTTATACAAGAACTCTAGGGCAGCCGGGTAATTTGCATCAGTAACCTCTGAAGCACTAACGGCA:1 - chr3R 2561533 3' + gypsy8 4675 2 62.38 CGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGCAACCGGCATATAAAAAAGAAACACTAAGCCGTGGAACAAGTGAAC:1 + chr2R 19099145 3' - 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pogo 8 1 71.29 CACGATAAAAACGTCTTCANACGTCGGCGATCGAATTGATTAGTCTAGAAATTGATTAGCACTAGATTAGCACTAGAAATTGAGATGGAAATGGAATGG:1 - chr3L 17140594 3' - F-element 28 1 48.48 TTCCAATTGTGTTCGTTTTGCTGTAGAAACTCCAAGCTCTGCTGCCCTTGCCCGAGGACATATCCATTGATGGCTTGGTTTTCCCCAGAGAAGGGGCGATC:1 - chr2L 288689 3' + Ivk 43 1 66.34 AAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGTAGAATTAGTTGAAAATGTATAAACAGATTGA:1 - chr3L 5479013 3' - 3S18 46 2 69.31 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGACTTCCCCCGCTTGAAGGCG:1 - chr2R 5720479 3' + pogo 2047 1 79.21 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCCTTACTCCCCGCACCATTCAA:1 + chr2L 12882830 3' + hopper 1408 2 70.30 ACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGAATATCAGATACCCAGTTACTGAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAAATAGTAACATAAAGAATAAAACA:1 + chrX 21279283 3' - INE-1 579 1 75.25 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCAGACCGTCGCGACGGCGA:1 + chr3R 12329670 3' + hopper 1383 1 55.45 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTCGAGTGTGAGCTGATATGAATTTG:1 + chr2L 14762045 3' - mdg1 7045 2 70.21 AACCACACACACACATACACACATACACACATACACACATACACACATACACACACACGCTCACGTGGCGTGAACAGACAAATAAACATATATCTGCAAAT:1 + chrX 12135325 3' + accord 7100 2 64.36 CACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCCCACCGAACAAGTGGGTTTCATTGTCCAACATTCACACGACCAGCAAATCCATCCATCCATATTTATCTGTAAC:1 - chr2R 21040823 3' - P-element 1 2 70.00 CCTTCCATGCGCGCCAGCCCACAATGGCAACACATAACAGGAGGCAACATGATGCTGCTACGGTCAGTGCCAAAATGGTTTGCGAACGCAATGGAGATGGG:1 - chrX 12258218 3' - gypsy2 6387 1 71.29 TTTTCGTCCTTGTGTTTAGTTTACTCTCCCTTTTGTGCTTGTTCGCGGTGCTGTTTGGTGTTGATTTTTGCATGCAATAAATAGTTATAGACTACGGCGGG:1 + chr3L 13597240 3' + Cr1a 197 1 79.21 GAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACGCCCCATCCATCTCACCATCTGCCACACCACCCCACCCCCTCCCACATTAAGCT:1 - chr3L 4493585 3' + Doc 4512 1 57.43 ATATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTATT:1 - chr3L 15125904 3' - Juan 3789 1 73.27 TGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAACAGAACTATGGAGCCCGAGCCCAAAAGCATGCTGCACCTTTTGGC:1 - chr2L 21215280 3' + BS 5063 1 52.48 TATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATGAATGTTCTCAAATGTACCAAACAAAACAAAATGAAGAATT:1 + chr3R 16197553 3' + G5 4765 1 43.56 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAAGGACCAATCAAAT:1 - chr3R 4971380 3' - F-element 21 1 67.33 ACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATGCGTTACTCACATATCTCAATTGGTGTCGCTTG:1 - chr2R 7546238 3' + hopper 98 1 60.40 TATTTCGTTTTCCTTTTTTTTTTCCACGCTCCTGTATTTTATGAAAGGAGAAAAGGAGAATTCCATGGCTGGAGCTTATGTGTGATTTATTGG:1 + chr3R 12321831 3' - Doc2-element 234 1 56.99 GTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTGCGAAAACCCATTTACAACCCCAAGCAAAGACAAAGCAATATATG:1 - chr3L 18122503 3' + S-element 1686 1 59.41 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAA:1 - chr3L 20049626 3' - jockey 4794 1 55.45 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTAAACTTCACATTAAAACCTTTT:1 - chr2L 9045402 3' + jockey 4977 1 59.41 TCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGCTCAGTGAGAGCCAAAGGAGCAGAATAAGTTAGGTAGAGGTAGTAGAAATATTACAGAAATGAA:1 + chr3R 16812424 3' + I-element 311 1 66.00 ATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAATATTCGTCGTAGTCACAACAGTGCTACTTTCGTCTGTTGTTGTGT:1 + chr3L 11968328 3' + McClintock 143 2 59.41 GGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGACTATGGCAATTTCTCTTGTTATTTGAATATGGAATGGAATATATTAAAATTTTTTTAAAGGTATTTGTTTACCTTT:1 - chrX 21388005 3' + INE-1 557 1 47.52 TGTTTTTTTTTTTATATTATTACATTACATGTGTTTTTAGAAATGCGAGTATGCCTTTACATACCACAAAACACTCTGAGTATGTTTGTTGCCAGAAGATT:1 + chrX 13932272 3' - Rt1a 5074 1 55.45 ATGCAGAAGGCATACATATGTTATGTATGGCTTGACCACTTGGCTTTGTTGCTACTGATGTTTTGTACTCATTTTGGGTTATTTAAGCTCTTCC:1 - chr2R 19089945 3' - Stalker2 7480 2 58.51 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTGATCGATTAGGAACTAGGTTAAGAGAAATTTGAACAAATC:1 - chrX 19334567 3' - roo 14 2 66.34 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAACCTTTTTAAAAAATGTATATAAAACATTCAACATAGACATGGAATG:1 + chr2R 22134259 3' + opus 7481 2 56.25 TAGGTTTAGGAAAATGTATCGAAATACTATCCTTATCTTCAATTATATGTGGTCGACAATTTTTCGGTACTTCGAGCTGTCTTTCGGCATTATTCTTACCC:1 - chr2R 6486748 3' + Circe 7057 1 53.47 AGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATT:1 - chr3L 3540157 3' + mdg3 5443 2 76.24 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTTTTAGCCCATTAGCAGCAGTTAAAGAACTTTATTTCTAGTGTATTCTGGTCAA:1 - chr3R 17971620 3' + 412 7543 2 75.00 TTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCAACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGGCAGCGGTGGCTGCGG:1 - chr3L 20599098 3' + F-element 348 1 79.21 TGCCGATGCAGCTAACTATTGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAATGTTTGAGTTTGCACATTGAAGAAATAAATGAAACAAGAGTGCAGAGC:1 - chr2L 14262794 3' - pogo 23 1 54.46 CAAGAACACACACACACACACACACACACACACACTGATAGCTAGCCAGGTGTGTGGACTGACTGGTCTGTCTTGGCCTGGCC:1 - chr3R 30357833 3' + accord 7026 2 74.70 ACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTTCGTGGCTGTCGAATGGTTTTGCGGCCCAGTGGAGTGGA:1 + chr2R 19560225 3' + Tirant 365 2 59.41 TTGTACACATTATAATTAAGGAACAGATCCATTAGGATCCGAAATCCCAGGGGTCAGAACCCGATGCAGCCTATCGCCATCAGCTGGAGGCGCCTCTGAAG:2 - chr3L 11837726 3' + G5A 2740 1 56.44 AACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGAAGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGAATCGAAGTTGATGGCAAAGACTG:1 - chr2L 21807675 3' + invader1 3724 2 75.51 TGCCTCCTAAACTATTGGANATATTTGGATGTATGTATGTACGTAAGGCTGGGGCTGTGGGACCCTAGGGAAACTTACTTGCATAATCGGTGTATACTCGT:1 - chr2R 24555549 3' + hopper 41 1 76.24 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGC:1 - chr3L 6834971 3' - hopper 52 1 72.28 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCT:1 + chr3L 20411858 3' + roo 9039 1 58.42 CCGTTACGCACCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCGGTTTCAGTTTGCATATGCATTGCGCAAAGTGCAAATCTCATCAGAAATTGGAAGCGGCGTCATC:1 + chr3R 25491536 3' + 1360 3378 1 75.25 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAAGCATTCAGCAAT:1 - chr3L 1586717 3' - Tirant 8136 2 55.45 TAATATGCTATTTTATTTANTTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTGCATCCCA:1 + chr3R 30553620 3' - 412 31 2 53.47 TGCTGTAATGGTAGCTTAAGAACTTGATACCGTTTGGAATGGGGGAACTTGAGGCGAAGCGCTGTTATAAAAAATTATTTTATGTGATTTTTGTTTTTATT:1 - chr3R 2211345 3' - Doc3-element 478 1 60.40 AATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATAT:1 - chr3L 3540139 3' + mdg3 5462 2 59.41 TTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTTGAATTGCGACCAGAGATTTGA:1 - chr2L 10898414 3' - jockey 4723 1 76.24 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAGAGGTGGATGAGCGGGAAAATTGATATGCCGAGTGC:1 + chr2R 19061303 3' - roo 8679 2 62.89 CACAAATTATTGTTGACAANTATCCATGGCTTCCCATGACAGCGACAGTCCACTGTACGATTTCTCTTTTCTTTTCCATCGCCTTTGTCTGGCTGATAAAT:1 + chr2L 12272512 3' - hopper2 407 1 56.44 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCCAACTACATAACACATAATTTTTCAAGTGCAGCGACCAAAGAGTTTGGAAC:1 - chrX 6457885 3' - hobo 25 1 54.46 AAAAAGAAAAAAAAAATGGGGCTTCGCTGGGGTCGCCGTGCAATTTAAATACATACCTCCTTGATATCCTCCCTTCACTACCCCACTTTGG:1 - chr3R 9206117 3' - hopper 138 1 68.13 TATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAA:1 - chrX 8027421 3' + Juan 4198 1 53.06 ATTTCTTTGAAATAATGGANGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTCCTTCGACTACTTGT:1 - chr2L 8622760 3' - 297 31 2 67.33 CGGTCTCTGCTCGGAAGGCNCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATTTTTGAGCCTTTGAGCAATTGTTCGTTCGTTACGAGCGTTTTTTTGTGGCAT:1 - chr3L 5710230 3' + Transpac 290 2 59.41 CACAAAATATTTATTTATTTTTCCAATGCTAAGAAATTGTTTACCAAGTTCGATCTGCCATTTTCTTCGCTTAACAGGAAAACTTTTGCCAACTCATCCAG:1 + chr3L 6397429 3' - mariner2 833 1 67.33 TTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAATTTCCAAACAATGCGCAACTTTG:1 + chr3L 9907398 3' - jockey 4724 1 80.00 ACGTCTTCACACGTCGACGATCGAAACGATGCCATCGTCGTTTCCTTGACGATGCCACCAACTGAGCCAGCTGTTATCCCGCTTTCCGATT:1 - chr2R 20231267 3' - F-element 18 1 70.33 GGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAATCTCTAATACTTGAATGCATCTGCGGATGAACATGAATCCGGCTTCATCCAGATGGTATGCCTCG:1 + chrX 15754362 3' + 297 465 1 70.30 AATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGATGTGTATTATCTCAAACGGCACATTTCCCTTTGGGATGCTA:1 + chr2R 13277272 3' + invader2 4797 1 59.41 ATTTCAAAAATTCGATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACGCTGATTAATCGGGGCAATGCTAAACACA:1 + chr2L 1072043 3' - FB 21 1 64.86 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGTCATTTTCATAAACATTACGAGATAAGCCCGACGC:1 - chr3R 21612881 3' + S-element 1674 1 68.32 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCGGCAAGTCCAATCATTAAATGAGCAAATGCTTTAAATGCCACTAG:2 + chr3L 1998886 3' - hopper 28 1 58.42 ACAATTCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCACAGCTAACTGCGGCTAACTGGAAAACTAGCGGCCGAGAAATAACGTAA:1 + chr3R 18496262 3' + Bica 4538 1 53.47 TATATAGAATTTTTTTTTTAATTTAATTCGGTTTTAGGAAGGGCAGCCTGTGACTGAAAAATGTAGGGATGCCTGAGAGACTTGC:1 - chr3L 3766243 3' - S-element 139 2 89.41 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCCTCCCTAATTGCCACCTTTAAAGCGTTTATTT:1 + chr2R 7546313 3' - hopper 39 1 64.36 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTG:1 - chrX 19334606 3' - roo 8717 2 79.21 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATTTTCGAATGACCCATTGTG:1 + chr2L 5927014 3' - pogo 19 1 51.49 GCCTGTTACATACTTTTCAACGAGTTTAATTAAATCGGACAAACTGCAAAGAAAAAATTCAGACTGCAAAATTCACATACTGAACTTTACTATTTTTTTTT:2 + chr3R 22865975 3' - INE-1 19 1 71.29 ATTCATTTACATAAGATATGAACGAAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAATTAC:1 + chrX 23280944 3' - roo 52 2 79.21 ATCGCCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAAGTAGGGCTATGATACCCAGCGACCAAATCAGTTGTGATCGCGGCTTCAAGAAGAAC:1 - chr2R 19647628 3' - I-element 5009 1 58.42 CTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTAAAACTATAATAAAAGTATGGATGTAA:1 - 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chr3R 30074860 3' - jockey 4687 1 56.44 TACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCCCGATAACAGAGACAACAGACGAGGCCACCCACACGACAATCGGAACAGGTATTGTGCTTTTCCGATTTCGAT:1 + chrX 13944262 3' + accord 355 2 75.25 TATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCACTCGCGTATATCATGAACCAATGGGAACACAAGGGTGCGGAGGATTCCACCCTATCCGCCCC:1 + chr2R 6922312 3' + accord 46 2 65.35 TAGCAATAATAATAATAATAATAATATTCAACATATTTTCAATAGTTTTAGAGATCTATATACGTTATAGCCCAGTGCTAATATATTGAAAATTAAGTGTT:1 + chrX 5063230 3' + mdg1 21 6 84.16 ATATAAATTATAAATTACANCACGCACCGTTGCAACTGTATGTATGTATATATATTTATGAGACCACAAACAATTTGATGTGTATTCAAAGAATGGAATA:1 - chrX 4792039 3' + copia 255 1 77.00 CGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTATATACAGACACCCACATACGAGCGCCAATAGAGCGAGATACACC:1 + chr3R 5811555 3' - flea 26 2 58.00 TGGGACGGGAGCCAAAGGGGCTAAACTAAAGCTGCACCAAAACGGCAGTGGGAAGGGAAAATGAAGGAAACTGTGCAGCTTTAATAAGAAATAAGTGC:1 - chrX 2524514 3' - mariner2 238 1 72.45 ACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTCCTTGCCATCTTTTGCTTTTTGCCTTCCCATCCCGGCTCAACCAGTCCTGCCCCAAA:1 - chr2R 7346545 3' - P-element 216 1 63.37 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTC:1 + chr2L 18213215 3' - hopper 35 1 63.54 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCT:1 - chrX 4277473 3' + roo 9029 1 69.31 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGTT:1 - chr3R 30553571 3' + 412 7493 2 73.27 AGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGG:1 + chr3R 1977610 3' + micropia 5403 2 62.89 GATCGTTTGCATTCTGCAGGTGCTAGGTTAAAAAAAAAGAAATCGTGGTTTAGAAAAAAAAAATATCCAAAGGTGTTTGACATTTGTAAACGTTGCAGCGA:1 - chr2L 2947528 3' - Doc3-element 360 1 78.22 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATTTTTAGTTGAGCTCTAGTTTTGAAATTAGTCAAATATAATCATGTTA:1 - chrX 7157259 3' + blood 351 2 52.48 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAACAATACTGGTAACTCTGTTCATCACATTGCACAGAATATGACTTGAATTAAG:1 - chr2R 20312576 3' - 1360 22 1 55.45 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGGGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTGTAGGCTGTCATGTTAACATGGGAG:1 - chr3L 14594133 3' + hobo 2910 1 65.38 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAGAA:1 + chr3R 8582617 3' + roo 9045 1 52.48 ATTCTGATGACTCTTCGACATATATATATATATATGTGTATACTATATGTGCCCGCTGAAAGCGAGGAGCCAAGAAAATATTGAAGAAGAAATAGTAAGAA:1 - chrX 11262782 3' + invader1 404 1 78.22 GGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTTCCCTGATCTCCTGCTGCGTTTCCGCTTCCTT:1 + chr2R 22648411 3' + X-element 4430 1 78.57 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCCTATCGCAAACTAAAGTATATTTTAGCAGCGT:1 + chr2L 16680082 3' + P-element 2847 1 41.58 ATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGC:1 + chr3L 3540187 3' - mdg3 35 2 69.31 GTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATCTGTCGTAATTAAAACGCGCCCTCTGCGACATCGCCTCAACTGTCATCCGCAATTTACGTGCCCTCTCT:1 + chrX 15263519 3' - invader3 9 2 71.29 ATGCTTCGTGGGCCTTATGNGTGTTCATCCTACCACACAAGGAAATGGCTGATATGAGAAATGTCAAATTTGGGGCAGGGAAACGTGCAAGATTGAGAGAC:1 + chr3R 24085390 3' - invader3 16 2 63.37 CACTGGCGGTTTTATTTATAAACACATATATATATATGTATATGTGTATGTGCATATACATACATATGTATTTATTGTTGTCAAAAAGACCGCAGAAAGAG:1 + chr2R 9950204 3' + 3S18 6103 2 71.29 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCATTTTCGGTGTGAATCATTTAATATGATTTTTTCGAGTGCATCTAAGTACTCTATAAAACTGTGTG:1 + chr3R 17971740 3' - 412 9 2 74.26 GAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAGCACCAGCAGTACCAGCAGCAGCAAGTGCAAGAGAGCAAAAAGAGCTCGCAAAAGAGAGCGTA:1 - chrX 2292854 3' - copia 5061 2 65.35 GCAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAATCAATAAAGAGATTTAAAATTTACAAGTACTCGTGTGTGCACAGCAAACACATATTATGTACATACATATATAC:1 + chr3L 20317906 3' - 3S18 2 2 77.23 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCACCGATAAATGACTGGCGACAGACGACACTGGGG:1 + chr3L 17942684 3' + copia 246 1 64.36 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATTTCGGCCCTATGTCATTTATGACT:1 - chr2R 17963223 3' - blood 7035 2 55.45 ACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATAAAAACCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTT:1 + chr3L 25350809 3' + baggins 5402 1 57.43 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAACAGAATGCTTCTGACAA:1 + chr3R 12333757 3' - P-element 56 1 23.76 AAAAAAAAAAAGGAAATAGTAAAAAAAACAAGCAAA:1 - chrX 12160053 3' + Doc2-element 232 1 77.78 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACACTTTAAAACCTAATAGATATGAGTATATCAACATCTCTAATTTT:1 - chr2L 4063665 3' + roo 401 1 68.32 CAAAATGAACGATAAAATCATCCTGAACGAATTTTGCACAATTCGAACACGAAAACCAACTCTCAAAAATTATGACAGAAC:1 + chr3R 26597628 3' + mdg3 292 1 61.73 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAA:1 + chr3R 20696506 3' - jockey 65 1 76.24 CACCAGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGAGGAACTGATTATAGCGTTTACCATTATTTTTTACGGTACAAAACGTAAATCTTGAATTGAAGTCAAATG:1 - chr2R 9237000 3' + INE-1 541 1 76.24 ACATCGACGTTTCGCGCTGNTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTTGTAATTTCAAAATGTAAAGGGGAATGCAAAAACAACGGCAGCGAGCGATGCGC:1 + chr2R 9691989 3' - P-element 2552 1 35.64 TCTCTAATAGTTTAGAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTAATGGTCCACATGTGCAGTGGCAAGTTCAATAAGGCTT:1 + chrX 21255303 3' - hopper 40 1 74.26 AGGTCCACAAATTTTCAATGGGGTTCAGATCAGGACTCTTCGGGGGCAGTGGGGTGTGGTCAGAGCAATTGCCGCTGCTTCTGCCGGTGCCGGGTAATTTT:1 - chr3L 19131149 3' - S-element 1244 1 42.57 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTCGTGGTTTCGATGTTACCATTTTTTGTGTTTT:1 + chr2L 20328798 3' + opus 7492 2 67.68 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTGGCATTGTTATGTTTTCTCTCCCACACATAAAAAATGGGGG:1 - chr3L 7307216 3' + hobo 2914 1 58.70 TGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCTCTCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGATTGTTAAAATCGCCTTTTATGCAAATGTTTTC:1 - chr2L 17697315 3' - 1360 3096 1 78.22 GATCTCGACGTTCATACGGCTAGATCGAATCGGTTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGTTATTTTCAGCGATGCCAGACCAATATGCCA:1 + chr3L 21883889 3' - INE-1 132 1 62.38 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTTATACCAGAATGGTGCTTTTTTCATGTGAGA:1 - chr3L 19647257 3' + pogo 2059 1 74.26 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCC:1 + chrX 19034180 3' + hopper 1393 1 51.69 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTACGTGTGACTAGAAACGAAGTTAGTTAGTAGACAACCCCTATTTAGATAAATTTTATGAACTAACTG:1 + chr3R 24542135 3' - 1360 9 2 42.57 TGGACTTTGCCTGTGGAAAAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCAGCTAATAAAAACCAAAATTAGTTCAAGTTGGATAGAAATATCT:1 + chr3R 2331621 3' + I-element 326 1 72.28 GAGTAAAGTCTTCTTATTTNGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCTGGCACTTCTCTTGCATAT:1 + chr3R 29608251 3' + roo 400 1 55.45 TTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTCCCTTCTTGTACGTTTTTATGCCTGTGGCTTTGTTTTATGAATTTTAT:1 + chr3R 17249838 3' + copia 77 2 68.32 AACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTAATTATGATATAAAAGTCGTACAGATA:1 - chrX 7568778 3' + copia 42 2 73.27 CGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGTATTGCCGGTGGGGGCGGTGTTCAAGTGACC:1 - chrX 14797364 3' + R1A1-element 4926 1 69.31 AAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAATAACCTAGCT:1 - chr2L 3699407 3' + mdg3 5466 2 55.45 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCACTTTACCAACAACGAGTTTATAATTGTTTGATTTGTGTGCGCGCAT:1 - chr3L 12468207 3' - jockey 4702 1 49.50 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGAGATACGGGGACTGAAACGCCGTTGACAGCGGAAGTTTTTTGTTTCTCCGATTTTTTCCAACTCAGCTCC:1 + chr2R 9649267 3' - roo 6 2 74.26 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGGCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGTTTGCGGTATCTATATATATTATATGTATGT:2 - chr3R 18407340 3' - I-element 48 1 65.35 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTACGTGTGTACGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTA:1 + chrX 12633082 3' - Quasimodo 36 2 79.00 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAGCACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGTGAGG:1 + chr2R 19061271 3' - roo 8715 2 74.26 TCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGTGCTCATTTAAATGTAGTTACGCTGAAATTATCAATTAACAAAGTTATATCAAATA:1 + chr2R 16467923 3' - F-element 4319 1 56.44 TTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGATCTATTGGTCAGACACGAGATGATGCAGCATATAACTATTCCATCTTGAATAGAAGGATGTTTGTTTCCA:1 - chr3L 4009394 3' + mdg3 243 2 67.33 CTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGCCGCCGGTGGTGCTGCTGGAGGCCAAAGTCTCGTTCGAATTGCT:1 - chrX 3246426 3' + R1A1-element 4958 1 56.44 GTACTCTGTGGTGACCAAGACCACAGAAGGGTTCGAGCCCAATTAGAGGGTTCTCTGCCCCTTTCCATCTATATCTATCCGCGTGCTAATGACGGCGACGG:1 + chr2R 20179494 3' - baggins 4957 1 65.35 TTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTAATTAAGAGATATTAATTCATGTGAACCAAAACCATTTAGAGTTGTTCAACTGTACTTCTTGCCGT:1 + chrX 7036760 3' - Quasimodo 3 2 77.23 CGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTACCAAAATTAGTAATAGCATATAAATTACCCAAGGGCCAGGCGGTTTGAAGAGCAGAG:1 - chr3L 13569724 3' - invader3 5205 2 59.00 TTCCTTGCTAGGCTGGTGGGGTGTACTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGTGATTTTGACCAAGGAGGGATGGCAATTTATCACTTTAGAATGTTGAGCAAG:1 - chr3R 12321373 3' - jockey 4674 1 72.00 AGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGGAGCCAGAGAAGGGGCTACGACAAAGACGAATACGCATAATCAGTCAAAATTTATGACA:1 + chr2R 20905653 3' - jockey 460 1 67.33 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATGTGCAAACAAAGTTGAAT:1 - chr2L 12958913 3' + roo 9039 1 60.40 AGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCTCGTCCTCGTG:1 + chr2L 20045829 3' + roo 9064 2 71.29 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGTACTTCCATTTAACAGGGAAATAACGTT:1 + chr3L 7307265 3' - hobo 47 1 68.32 GTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGACGAGTCGGCGTGGTTTGGGGAGAAAAGGATGCTTTTAGAGGTTTCCAGAGGCGTTCAACA:1 + chr2L 6321446 3' + R1A1-element 407 1 62.24 TTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGATTGAACAACATTTTTAGAATGATTAAGTTCGTTATGGTTTCGGGTTACAGAAACTCATAGCAGGAAAC:1 - chr2L 12511514 3' - copia 8 2 69.31 GTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAAGCCAAAGCCCAAACATAGACATAATTATTTCAGTCGCT:1 + chr2R 19091666 3' - Stalker2 15 2 53.85 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTGATCGATTAGGAACTAGGTTAAGAGAAATTTGAACAAATCGAATACTT:1 - chrX 19334559 3' - roo 8670 2 74.26 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTGTAGGCTGTCATGTTAACATGGGAGAAAGCTTT:1 - chr3L 14594125 3' + hobo 2897 1 66.67 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACCTACTTAAATATGTCGAAAAGTGTGTCATC:1 - chr3R 24767807 3' + P-element 2843 1 33.66 GGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGACGGCTTCCCCTCAAAAAGGAAGCGAGCCAAGCTGGAATAA:1 + chr3L 13569823 3' + invader3 5449 2 62.38 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAGCAGTCAACAAAGGTTTTTACCCAGAAAATTAGGG:1 + chrX 10451522 3' + hobo 2909 1 60.67 TTTTCGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGTTTTACACACTGCTTTCTGCACATAATGGATAACCTAATATAACCAAATTAAAATCTTAAAATTTGGCAGAATT:1 - 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chr3L 11477978 3' - roo 8729 2 73.27 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAAGAACGTATTTATAAAAATAGTTGTTACATTAAAATAGTAAATTTCCATTTCCTC:1 + chr3R 6947397 3' - I-element 22 1 56.57 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACTTATACCACAATTTTATCGAGTAAGCCGCAAAACTAG:1 + chrX 5475455 3' - 412 36 2 63.00 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGCATCGAGCGCTTTTCCAGCATTTGAGCCTGTCGCACATA:1 + chr3R 6034042 3' + roo 402 1 75.25 CGCCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAAAATAAATATACAAATACCCAAAAAAACGCAACAAAACACGTAATACTCGGTGGTAACAAGCAAAGCCG:1 + chr3R 9159546 3' + Stalker4 7015 4 55.45 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTTCCGAGAACTGAGACGACAATGGCGACGACATAAATATCAACGGCACGTCATGT:1 - chr3R 26252662 3' - 412 7074 2 58.42 GCTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTATAGAGACAAACCCCTTGTTTACACGCCCATTTCACAACTCCCCCGAAAGGAAACATCATCCAAGGACCTC:1 - chr2R 17717459 3' + INE-1 169 1 58.42 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGTGTAGATTTCTCTCATAC:1 + chr3R 15579021 3' - pogo 46 1 73.74 CGTGCGAGTGGCGGGCTGCNGTTCTCTGCCGAGATCATCAAGACAGAGGATGGCTACACCAGCGCCTACGAGGGAGCAGATGG:1 - chr2R 11259558 3' + hobo 2932 1 61.45 ACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGATGGGCTTAGCTCTCGAGCCATCGAGGGGCCGAAGGTGAAGTCACCTCGAAGTCAGCGTCAACATTATCGTCAT:1 - chr2L 2707659 3' + micropia 5303 1 74.26 AACCACTTCTTTAGTTGGGGCACTGAGAATTGATTCCATTTAGTGTCAGGCATAGTGGGTCTGGGAGTTGGAAGGACCTCCGACAGCTGCACAGGATTTTA:1 - chr3L 17286556 3' - invader3 355 1 59.41 GCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCCAAAATTGGAACTTGTGCGCACCTTGTAGAAACAATGTAGATAATATTTATT:1 + chr3R 8980065 3' - transib2 9 1 64.04 GGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAAATTGTTATGATAAGCTATCTACAAGTTTGGGA:1 + chr3L 3345181 3' - FB 43 1 71.29 GCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCACACTTACAACTTCGTGTGCCTGATTCCCACCGAATGTCCTTCGTCCTT:1 - chr3R 7785041 3' + rover 14 2 58.42 AGAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAGTGCCCACTTCCCACCACACCACACTGTGCAGTGTCTGCATGTGTGTGTGTAAGTAAGCAATTAGTTGCCTTTTCAGC:1 + chr3R 27422415 3' + 1360 3342 1 82.18 TTTTTCAATAGTTTCGAAANTATAGATTAAAACAACATAATGGGCAGAAATCGAAGTGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTCAATTTGA:1 + chr4 924101 3' - HB 1480 1 71.29 ATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCTATGTCCTATGTCCTGGGATCAGGCGATGGCTGGCCACGCGCATTGAATATGGAAT:1 - chrX 5193900 3' + INE-1 84 1 61.39 AGCATTGCTCTTAGATGCTTAAGTATTTTGAGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGACAGAGGCGGAGACAGATTCGGATACC:1 - chr3L 13364232 3' - 17.6 255 2 82.18 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATCCATTAATAGTTAATTAATAAATTGCCAAAGCCAATTACTATC:1 + chrX 21060372 3' - 412 35 2 58.42 GCGCGTTGTTTTTGAGTGAAGAGAGCTGACGCTCGTCTTGTTCACGCTGACGCTGCTCACGAATTATGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTAGTGATTT:1 - chrX 23155938 3' - Doc4-element 52 1 81.19 GGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGAATCTAAGAGATACAATAGATATCCCTTCCCTGAGCACCCAGCTCAAGATGATTACCATCGA:1 - chr2L 2651512 3' + R1A1-element 5065 1 66.34 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATGTATGTTTGTGTGTATGTGAATGTTCACTGGATCCGACAATCAATGAGCGTCGAGAGGCATA:2 + chr2L 3978527 3' - 297 6587 2 74.26 CTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATGTGTTGTTTGTTTAAAAAAAGACTCATAAATTATGGCTATCACGTTTGTTGTTTGCATACAAAGTGGTCGAAA:1 - chr3R 12680561 3' + Porto1 4197 1 77.23 CACGCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTTCTAATATGTATTACCAATAT:1 - 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Cr1a 4096 1 68.32 AAATTAAATTAAATTAAAAAAAAAAATAATATGTATAACTTCTGCCTTGTGATAGAACATTCATAAATGGAAATGATAATTTCACAGAATGTTTGCATGTT:1 + chrX 1706130 3' + TAHRE 48 2 75.25 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACTGTTGCGCTTGAA:2 - chrX 1135333 3' + P-element 2828 1 20.79 GGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCGGAAGAGCTGGAAGAGGACGAGGATAATACCTCTATTAGTACGACC:1 - chrX 7868884 3' - 17.6 7186 2 54.46 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCATTTTCGGTGTGAATCATTTAATATGA:1 + chr3R 17971701 3' - 412 48 2 72.28 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCGTCTGGCTGTTTTTGGCCGTTTTTGCCTGTTTGTTGCCTTGGATGTTTTGGCCAATTTCCCTGTTTTCG:1 - chr3R 23542920 3' + 412 491 2 74.26 TGTTACATACATTTCAACAAATCAGTATAAAAGGGAATACGAGTAACGGGTATAACATAAGAAAACGCCTAATTAGATTTTATCGATTGCCAGATAAATGA:1 - chr3L 22511793 3' - INE-1 16 1 53.47 TCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAACACACAACGTGACTGTTTACGATTGATTGATCAAATTATAAGCATGGATTTACTTTATAATTAGTCAGATGTC:1 + chr2L 19417177 3' - 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chr2R 13037245 3' + copia 236 1 44.55 GAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCACTGTGTCTAAGTTAGCGCACCTGAAACTGCA:1 - chr3L 15452842 3' - accord 8 2 67.33 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAACATACTATACAAAATTATATGGATAATGCATG:1 + chr3L 3209231 3' + roo 9029 1 67.33 ATAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCTCGTCCTCGTGTC:1 + chr2L 20045831 3' + roo 9067 2 74.00 GCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTACCAAAATTAGTAATAGCATATAAATTACCCAAGGGCCAGGCGGTTTGAAGAGCAGAGTACTCCATAGAGTTA:1 - chr3L 13569709 3' - invader3 5 2 73.27 ATTATCCCAAAACCTTCCGGGTGCAGCTGATAGAAAGGTGCATCTCGTTTAGTATATTCTCGATACCAAAACAGCAATTGCGAAATCAGACGCAGATAAAA:1 + chr2R 5617239 3' - Gypsy12A_LTR 156 1 66.34 GCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCGACTCCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAATCCATAATCACCCATACAGCAATCAGGGCTTCCACACACACA:1 - chr2R 12474346 3' + Doc2-element 357 1 56.44 GTGTATTCTAACATAACTTNATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCTAAATCGCACAATCAAAAATAGTTGTTTTCACAAGCG:1 + chr3L 5710310 3' - Transpac 34 2 57.43 TAAATAATATTTATTTTATTTAGGAATTTGTAGAATAAGTTGAACCTTTTTAATTCATAATATTGAACTTAACAATTGAACATAAATTGTATTGAGTAATT:1 + chr2L 16857584 3' + S-element 114 2 77.23 AAATTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAATGAGAGTAATTTTGGCCAGTTCGTTGCTGCCTGTGGGCACCACTTGCACAGTAG:1 + chr3L 2154654 3' + 1360 3272 1 62.38 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTTATAGTACACATATTACTATGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 12719631 3' - Burdock 6175 2 66.34 ATAATAATAATAATAATAATAATAATACAATGCACGCTTGGATGGACTCCGGCTCCAACCGTACGAATGCTAATTGTTATTGTACTTAAACCTGAAGCCTT:1 - chr2R 8322539 3' + mdg1 7067 8 59.41 CTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATTGGGTTACGTAAGCCCATATCTTTTATGATACCAAAAA:2 - chr2L 21735012 3' - 17.6 6959 1 63.37 CTATTTCTTCTTTAACAAAAGGGATTCCTAAGTCTTTATGGATACTTCCATGTAAATAAAATCACACCAAGTGCTGAAATGTACTTGCTGCAGCACGTGCT:1 - chr2L 268593 3' - G4 3573 1 54.46 TACAAAAATAACGTTAAACNACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAGTTGCATTTTTCAACTTTTAAAATATTTATATAGT:1 - chr3R 7568159 3' + copia 23 2 64.36 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTAAAATGCCAATAT:1 - 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chr3L 14279560 3' - I-element 5115 1 41.58 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCACTTTACCAACAACGAGTTTATAATTGTTTGATTTGTGTG:1 - chr3L 12468214 3' - jockey 4709 1 56.44 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCTTTTAAGTTTCTATTCCACCCTGATTTATTAGAAAATACCTTTAATAGCAGAAATCTCTAC:1 - chr3R 20420904 3' - blood 14 2 65.35 AATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAGTATGTTTCTTGGTTTTTAATTACAACAAATTCGACTTGTTATGCCAAAAA:1 + chr3R 26597410 3' - mdg3 5281 2 52.48 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAAAAAA:1 + chr2L 18655200 3' - Doc 45 1 62.00 AAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTACT:1 + chr2L 21400812 3' + Doc3-element 4716 1 31.68 TACCTCTCGCGTGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACGGAAACGGACGGAAAGACAGACGGACTGACATGGCTATATCGACTCG:1 + chr2R 8612519 3' - Tc1-2 113 1 53.47 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAAAAAATATTAAGCAGCTTATTCGGAT:1 + chr2L 18655221 3' - Doc 25 1 55.45 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAA:1 - chrX 21217521 3' - pogo 34 1 70.59 CATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGAAGTGACATATTCACATACAAAACCAATAAGAACTCGATCCGCCCGCCAATTACTCAC:1 + chrX 383830 3' + 297 6538 2 71.29 GAAATAATGGAAGTGGCTGNGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTTATAAAATCGATGAATAGCATTTATTACAT:1 - chrX 17104411 3' - 297 6604 2 69.14 TGATGAAGAGTCAAAAGGTCATGTTGTTAGAAACATAAGTAATATTAAAAGCCGTGCGACCAAAAACATTTTTGCCATTCGCTCGATGCCCCCACAAGTCA:1 - chr2L 10588302 3' + G4 436 1 64.36 CAAATAAAATCAGTTTCTTNCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGTTTACAGAAAACATCGTGAAATTTGCATTACTGA:1 - chr2L 8577281 3' + roo 9031 1 69.31 AAATATAAATTATAAATTACAACAAAACCGAATCTGCTAAATTTCACACACCACTTCGTGTGAAAATAAACCGAATTTAAATTTAGATACTGCGTGGGCGA:1 - chr3L 11929240 3' + copia 253 1 74.26 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATATACAGGTAAATAAAATAA:1 + chr3L 15033381 3' - I-element 20 1 59.41 CTGCCAGTAAATCCCACATACAGCTAATTCTAGGAACCAGAACGATGCAGGGAGATAGTTTCATATTGAGCCAAAATCGGAATAATAGTTACTATCTATTA:1 + chr2R 3515287 3' + Porto1 4297 1 75.25 AGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGACAACACACTAGTTTTGATTCCCCTCACTGTTTGTCGGCCAGCTCACTTTCGTTTTAAAGCTGCCAGTTGAA:1 - 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Bari2 275 1 73.27 AAAAAAATAAAATAAAATAAAAAGAAGAACAAATTATATTTTTTAGACATAATTGTTTAACAGCCATTTGACTAATAGACTACCATAAGCTTAAGTAGGAC:1 - chr3R 15295936 3' - transib1 1901 3 62.38 CCAATAGTTTAGAAGGTATNAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCC:1 + chr2L 12882800 3' - hopper 37 1 58.42 GATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCC:1 - chr3L 27356091 3' + Tc3 1672 1 66.00 TGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGCGT:1 - chr2R 19560156 3' - Tirant 8140 2 56.44 TTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTCAAGAAGGATTTCGAAAAAACGAAAACATAAAGTAAAGATAATTAAGGGCAATAATAGGTAAGGA:1 - chr2R 10956880 3' - copia 4881 2 65.35 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTCCGGCAGGCGGCGTAGCGAGAAA:1 - chr2L 3632124 3' + P-element 2875 1 68.32 GGAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCAAGTTGGGTACAATTGCGACCGGAGCGCAAGTTCAAATCCATGGCTTTTATGACGCGTCCCAGAAG:1 - chr2R 3173562 3' + baggins 5273 1 65.00 AAAAAAAACAAAAAAAAAATGTAGGAAGAAAACCTACATAAACTGGGGGGGACAAGAAAGAAAACACACCAGAGATGTAGAAGCCTCTCGGATAGCCCTCA:1 - 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Stalker2 178 2 73.27 ACCTACGCACACACACACACACACACACTGGCACACT:1 + chr3L 11292522 3' + accord 7100 2 86.49 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATCTCGGACTTCAGGATAGCCACGGGTTCACGTTCGGGATCTACGGGAAGAGCGTG:1 + chr2R 11259640 3' - hobo 18 1 57.29 ACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCCACTCATGTTTTGTCGCTTAAT:2 + chr3L 5479067 3' + 3S18 6073 2 61.39 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATAACTGATAATTGTTCCAATTTTTCAACTGTTCTATCGAGGTGGAATGTACATAAACCATTC:1 - chr3R 11916530 3' - roo 12 2 67.33 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCG:1 + chrX 9413859 3' + 412 7504 2 66.00 TAACTGGCTAATAGGAAGACACTCGAAACTAGAATTAGAATATACAGGGCGATAATAAAACATTGAGAGTATGGCATTTATAGAAAAATACCCAGCAAAAA:1 - chr2L 3934494 3' + Porto1 4190 1 58.42 ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAAATTGTGCACATTTCTGAA:1 - chr3R 10087802 3' + roo 9061 1 68.00 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATTTATATCGCTGAAATGCAGTCGGTCGCCAATGGCTTTATGGTTCGTGCCGCCCGTTTGAAGGG:1 + chr3R 5135552 3' - 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Tirant 2 2 79.21 TAATACCAAAGACACTAGAATTCTTATTCTATTGTCTTTGTTAATACTTTTTTACTATAATGTGAATGATTGGTTGAATTTAAATATAAAGCCACGAGAAG:1 + chr2R 19502125 3' - Tc3 316 1 64.36 ATGTAATTTAAGTCCGGAAATCGTTGCCAATTTCGACCATTTCCCTATGGCCAAGTTTGCGTGGCCAACTTCTTGGGGCAATCGCCGCAGATCGATGTCTG:1 + chr3L 13377086 3' + Transpac 413 1 80.20 TATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGATCTCGGGTTTGTTGCACGACGAGACAGTTGCTAA:2 + chr3R 10391271 3' + invader4 3078 2 70.30 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTTGTACACACAATATTTAAAACGAGTTCTGGGAATTAAC:1 - chr3R 16601437 3' + roo 9035 1 61.39 AAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGAACAACATTTCGCATCCCAGAAAGGTGTGGGAGGGGTGAGGGGGGGTTGCTTAACGGGGATGGGCAGTGGGATAATT:1 + chrX 19772782 3' - copia 126 2 83.17 TATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGTCAACAGGTAATAACGGTTGCACGATTGGCTGGCCCTGACAATTTCTGCTAGATTTACAACCCTAGTGGAAAGG:1 + chr3R 30630638 3' - Rt1b 4965 1 75.25 GTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACCCCAAGTTATCCCACGTCATTCTTATACTACTATTTATATCGCAACGTCAGCAGAAGGA:1 + chr2R 24312715 3' - hopper2 1179 2 65.35 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCAGAGAGAGCGGGTGGTTGGGT:1 - chr3L 16891092 3' + P-element 2857 1 47.52 TTTTGTGTTTGTCCCAGCGNTTCTGTGTTTTCTGACACTTTTTCTGTGCAGTTCGCTTGACTTTTCGGTTTCGGTTTGTGGGTTTTCCTTTAGATTTAGGT:1 - chr3R 10999063 3' - Tc1 1609 1 62.38 AATGAAATTGACCGAAAGCTTCACTAAATCGTTTTATGAGCTCTTAAAGGTTCGTTGGCTGGATGGATTTTGCCCGGCCTTTCGCCGCAATCACATTCGCC:1 - chr3R 18894561 3' + transib2 115 1 52.48 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTACAAAATGGTTTAATTGTCATTTATATACAATCACCCAGTTCGAAAA:2 + chrX 735001 3' - Tabor 6848 2 70.30 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAAAGTTTACAGTGCAGAGAGTACGACAGTCCTGCGCACAAGTATACGTAACAAATGGCCATGCAAAGCACGA:2 - chr2R 12252837 3' - jockey 4765 1 52.48 TAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATAAGTCACTATATATATTTGGCAATAAGTAA:1 + chr2R 11941041 3' - 297 19 2 79.03 ACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAAGAATGAAGTTGAAAAGGCTTGGTCTGTCAAGTACGTCAGTGTTAACATAATACACTGAGATTCATTTAATGTAG:1 + chr4 74359 3' - 3S18 2 2 77.23 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTACCTTACTATACTTATATGTCTATCAACTTTTTAATGCCAATTAGTGTAAATATTCATTAAATCAGCCCG:2 - chr3L 19249656 3' - Transpac 10 2 69.31 GTGGCACAGATCCCACTTCNGATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCTGCAGTTTTAAAGCATATTCCC:1 - chrX 6164236 3' - micropia 477 1 75.25 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTA:1 - chr2L 20560352 3' - F-element 61 1 73.27 ATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAGCCAATTAAATTGTTTTCGCCATAAAAATGTGCAGCTACCGAGAAA:1 - chr3L 13190093 3' + roo 9039 1 57.43 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACAAA:2 + chr2L 17079889 3' - jockey 4815 1 59.41 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCAT:2 - chr3L 10474153 3' - copia 45 2 73.27 GTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAATTCC:1 - chr3L 16282380 3' - gypsy5 50 2 71.29 AGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAACAATATATTGCATTACGCATACGCCCCGTTGCACGCTAAAA:1 - chr2R 9507731 3' + invader3 5368 2 59.41 GGGAGCAGTACTGTCCTCTACCCACTAAAATATAATTTTTTTTAAGCCACCAGGGGAAATGATAATCGAAATGTTCGCCGCACGAATCAACGCAAACAAGG:1 - chr3R 20413680 3' - HB 354 1 51.49 GTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAATTGCTCTATATGTTTGTAGATAAAGTG:1 - chr3L 20755733 3' - I-element 309 1 73.27 ACTTGGAGCACCTTTTCAACTAACAACAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTGCATGTGATACAAATAATCCAAAATACACATTACACAAATTAA:1 - chrX 22689513 3' + 1731 309 2 73.27 AATCAAGCTATACCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCCTTCCGAATTGGCATCAACCAGACTGTCCAGCTCCT:1 + chr3R 23807332 3' + Ivk 4909 1 57.32 TAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTTGAACTCCCCAATCTTTCGGTCAAGCTCGTAACACTTTCGT:1 - chr3R 28993197 3' + Idefix 205 2 64.36 CTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACTACGTTCGGCAGAAACAGTTATTTGCCACGCTGTTGCGAGG:1 + chr2L 22497830 3' - Stalker 37 4 61.00 CAAGTGTGGGGAACAGCCTCTAAACCTATTGAGCTGTGTCTTAGAGGCTGTTCCCCACACTTGGAGGGCGTAGGTCAGTCTGAAAAAATGTCCACCGAAA:1 - chr3L 10223195 3' + G5A 2443 1 62.00 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAAACTCTGGCCTTATA:1 + chr2R 21040909 3' - P-element 41 1 39.60 TACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTTTCCGGTTAATTTCC:2 + chrX 983388 3' - Juan 3816 1 66.34 TCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTGCACTTCCGCCCCCCGATTAGCTGGCCCAGTTTGCTTTTTGGGCTACGCCACTCC:1 + chr3L 7099895 3' - roo 8822 2 59.41 TAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGTAGAATTAGTTGAAAATGTATAAACAGATTGAAGAAATTTGTATCTCTAGTTT:1 - chr3L 5478992 3' - 3S18 25 2 55.45 TTTTTCTGTTATAAAAATATATATTTCTGTGCTTTTAAGTAAAATTCAAAGTAATAAACCTAATAAACCCCCATCCTAATTCGTACATTTTGCTTATCAAT:1 + chr3L 15035793 3' - TART-C 11035 1 63.37 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTCACCTTACTAAATATCAATAAAAATATTATTTTTTTTATAAGC:1 + chr3R 9278408 3' + roo 389 2 61.39 TGCTCTACAGTCCTTGCTCNCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGATACATCTACACATGTACATATGTATGTGTAGGGGTACACACAAA:1 + chr3R 10095098 3' - Rt1b 5008 1 55.45 ACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGTTGTCAATTCGTTCCAGTCGCTTATCCACCTTGTGCATTAGAATGAATGCC:2 + chr3R 21884249 3' + mdg3 5472 2 52.48 ACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAA:1 - chr3R 10736056 3' + McClintock 434 2 75.25 CCGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGGCGGCGCAGGACTCGGTTGTTGCCAAAGTTAATTGTTTGG:1 + chrX 3475205 3' - TART-B 154 3 91.04 CAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTCCACGCACACACACACAGGCACTCGCACCCATTGGCGTTTGCTTATTTTATGCTTTTTT:1 - chr3R 31874107 3' - accord 185 2 65.52 CATTTAAAAAATATATATTTAGGATGTACAAATACCTTATATGGTTACATTTAAAACGTAATCTGTTGGAAATTGAAAATAATTAGAATAGCGTGTAGTGT:1 - chr3L 10371877 3' + Transib5 2728 1 65.35 ACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAA:1 - chr2R 4673552 3' + Quasimodo 7363 2 74.26 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCCTATACAATCGTGATGATAAGCGCCGAGTGCCATTCAGAAGAATACACCCCAAATGGTTGACATTAA:1 + chr2L 109783 3' - 1360 5 2 74.26 TTGGAAGTAATTGACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGAGCGGGCCGCAGTATGTGTGCGTATGCACTGGTGTACTTTTTCCATACA:1 - chr3R 21224114 3' + R1A1-element 134 1 56.44 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAAATAACAGCGACTAAGGCTAAT:1 - chrX 12472552 3' + pogo 2050 1 79.21 GATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTTTCAATATCAAACCGAGCGGCA:1 - chr2L 15929319 3' + jockey 4889 1 71.79 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCGATCGACGAGACGGTAGCTTTAGAGCTAAACGAACTGCCATCCG:1 + chrX 15024439 3' - P-element 32 1 48.51 ATAAGATAAGATAAGATAANAAATATAAATAACTATATAAGTATCCAAACATTAAACCTGCTATGTTATTAAAGCGGAAATCTTAATGTATTTCCTTTTTA:1 - chr3R 15768200 3' + Stalker3T 206 1 68.32 TTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGTGATTTTGACCAAGGAGGGATGGCAATTTATCACTTTAGAATGTTGAGCAAGTGTTG:1 - chr3R 12321368 3' - jockey 4670 1 76.24 TTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCCAAAGACACTAAAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGC:1 - chr4 872518 3' + Tirant 383 2 63.37 TTGGCGTTGTCCTTAGTCANCTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATTCTGTTTTGGTATAATATTAATTAT:1 + chr3R 7765005 3' + 297 6930 2 82.18 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGCCTTGTTGACAATTTAATTTAATGTTTTCGTTTTACCGACCAT:1 + chrX 7157333 3' - blood 7044 2 57.43 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACTTGTAAT:1 + chr3L 25059156 3' + mdg1 7439 2 60.40 CTTTAAAAATACAATTAACAATTTTTAGTTTTGCTTATAAACTCAGCTATATAGTTTAACTAGCATAATTAATCACTTCAATCGTGCCTCAAATATTTCGA:1 + chr3L 9816899 3' + hobo 483 1 78.22 CCATAGGTCCAGATTGGTTNCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGTGTACTTAGCAGATGGCAGTAGTCGGTAGCTGTC:1 - chr2R 20728974 3' - F-element 4254 1 65.35 TGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCTTTGCCCTAGCATACCCCATAAATTGCAGGTAAATACTCTATGGCAAC:1 + chr3L 3963163 3' - roo 8815 2 56.44 ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCG:1 + chr3R 28797987 3' - BS 5005 1 64.36 ACACTCCATAAGGACCTCAATCTTTACACAGTTGAGGCACAAATGGGAAGACACACAAGTCGATGGCCGTCACCTGTCATCTGGGAGTGGGCCGAACTGAC:1 + chrX 18318780 3' + Helena 1189 1 62.38 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTTTAAATTGTAACAAACTGTT:2 - chr2R 5214989 3' - F-element 61 1 75.25 GGGTTGGGTTGGGTTTGGTTTGCTTCGGTTTCGGTTTCGGTTCCCCTTTTGGTGTTACCCATATCCCGCAATTTATCCTTTTTCATCGTGTAACCGCCTTG:1 + chr3R 19521401 3' - G2 103 1 59.41 CCGAAGTAGGCCGCTCTCCGTCAAGGAGACGGTCCTCGAATTGTCTTGCGACATTTTTAATGTTTTTTGGTCTATTGTTCATAGTAGAGTTTCTCGATCAA:1 + chr4 706807 3' - baggins 482 1 53.47 AACCATCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCGACGTTTAGTCGGACACGGCAGACGAACATATCGAATTGACTAGTGATCGTGATTAAGAATATTT:1 + chr4 419341 3' - INE-1 158 1 72.63 TTTCAACAAACAAATTTTAAGAATCTAAGAGTACTTGTATCCCAGATCAAATGCACTTGAATCTAAGAGAAACTACCCACCCGAATAGCCACCAGGTGGCT:1 + chr2L 4832003 3' + Idefix 298 2 72.28 TGTGTGTGTGTAAGTATATNTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGATCAATCAGCGCTGAA:1 + chr3R 15924675 3' - Quasimodo 28 2 65.35 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTACAAGCACATAAACACAAATACATA:1 + chr3L 14594159 3' - hobo 52 1 80.20 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGAAAAGTTGAAATGTTATTTGAAATGTTGCAGGCAGTGAGGAGGCAACAGTAGCGGGA:1 - chr2L 12882712 3' + hopper 1407 2 71.29 CGTTTGCGATCTGCCTCTATTCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACAAGACGGTTTTATATTTTGTTGGTGAAGGG:1 + chr2R 17268158 3' - invader2 129 2 68.42 CGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCAGTATACGCAAACATTCGCGCTCGCTCTCAGGTCCCGCGAGTTATTTTAAATGCGGTTTTCAAGTGCTTGTCTG:1 - chr2R 12906152 3' + diver 412 2 56.00 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGGAGTTCATCATTACAGGATATTGCAACACCAACAGTAAAGCCCCGCTGTGAACTCTTTCAGCTGCTAGTGA:1 - chrX 21060297 3' + 412 472 2 54.00 TGCTGATGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGG:1 - chr3L 16792549 3' - Chimpo 4040 1 58.42 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTAAGGAACACTGATGCTGCTTTGTGGTTTTGTTAGA:1 - chr2R 24555631 3' - hopper 39 1 64.36 AAGTGAACAGACGTGTTTTCATCAAGCTTCGTATAAAATCACTTGAGTAAATAATTAATAACATAAAATAATAATAAATAAATAATAATAATAATAAATA:1 + chr3L 4554306 3' + Doc3-element 10 1 75.00 CCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGA:1 - chrX 23280906 3' + roo 366 1 65.35 AGCAAATTATATTTTAAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGACTTGAGAAAGTGTTTGGAATAGGAATCGCGATCGG:1 - chrX 7463197 3' + 1360 3269 1 63.37 CCCGACGGACGTGTTTTTAACAGAGCTCCAGTTAATATGCGAAAGCAGAAAAACAAAAAATTTGTGCGTGTGTTAGTTGGCCATTGTGCAAACCTTTAATG:1 + chr2R 6245927 3' + Porto1 16 1 67.33 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCGATTTTTTATTCAAACGAATTCGTGTCAATATTTATCCCCAACAC:1 + chr3R 12322148 3' - jockey 4758 1 55.45 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTCGAGTGTGAGCTGATATGAATTTGGTGTTGG:1 + chr2L 14762052 3' - mdg1 7045 2 72.28 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGT:1 - chr3R 25021698 3' + roo 355 2 80.20 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGTGTTACCACTGTATTTGCTTTACTGTTGTTGTAATTAGTTTTGTCGTCGCAGACCCGATTATCAGC:1 + chrX 19308253 3' + P-element 2879 2 71.29 CACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTATATAACATGAATACATTTTCATT:1 - chr2L 13422267 3' - F-element 4361 1 74.19 GAGGGAGATGTAGTATATACGAACACAAAAAAAAAGTAATAAAATAAAACATACCCCTAACAAGCATGAAGAAGCGGACATAATTACGTTAAATGTGCT:1 - chrX 4138977 3' + mdg1 7031 1 77.78 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGCTGAAAATATTCCATGTCTATGTTTTTATAGACCCCAACACATTGTCCTTCTAACGTTTTA:1 + chr3R 13913092 3' - mdg1 7052 2 54.46 TTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGCTTGTCGGTGAAACGCGGTGGCTCGCTTCCGAAAACCCTT:1 - chr2L 4382562 3' - F-element 333 1 72.73 GATATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACACAATCT:1 + chr3L 20354078 3' - 412 7078 2 53.61 TTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATAATGAACGCATGGACAGGGCCAGATTCATTTATTCACAAAT:1 - chr3L 12993899 3' - flea 344 1 60.40 CAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGGTGTGACTAATTATTCAGCAGGTTGCTCTTCCTCTTGGCC:1 - chrX 18177400 3' + Circe 149 2 63.37 AAGCTACATTTTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGAATAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAAAAGCTTAATTAAGTGAAGTT:1 + chr2R 4339508 3' + G5A 2783 1 80.20 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAAACTCTGGCCT:1 + chr2R 21040905 3' - P-element 45 1 35.64 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTTAATCGGTTTATGGTGCACGAG:1 - chr3R 5135475 3' + 297 6925 2 75.25 GCTGACGTACAAAATCGCGNAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGA:1 + chr3R 10391237 3' + invader4 3045 2 65.00 CGTAGCTTGAAAGAAACACNTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAAAAATTTAAAGTTTTAAAAGGCAAAAACTCGCTACCATGAGTAGGCAAAAG:1 - chr3R 10782253 3' - Doc 32 1 53.47 TTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAATGGGGACGGGGAATTAATAAAATAAATACTCG:1 - chr3L 3598017 3' - copia 5063 2 68.32 TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTAGATGTATTTGATTCTGGCCTAAAATCCCAATGGCCAGCTAAAGAGA:2 + chr2L 19678187 3' - flea 23 2 55.45 TTTTCGCTTTTTGTTTTTTATTTTGTTTTTCCTTTGACCCTATTACCTTCTCATTTGTCAATTTATAGACAGTTGTCTGGCTCATCTCCTTTTTGTCTAAA:1 - chrX 12945879 3' - Bica 337 1 97.03 TTGCGCCTCGTGACTTCTCACGCCACAACGTCCAGAATGCTAACGCTGCGCCTACGTCTGCGTGAGTGCGAACGAGAGGGCATCGCACACGACGCGATAAC:1 + chr3L 17010249 3' - gypsy9 5170 2 52.48 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTAATCTTAAACCTTAGGCATAATGAGTGTTTGGTTTTATCAAGTAGTTTACG:1 + chr2R 10353325 3' - blood 25 2 52.48 TATATGTCAGCCCGACGGCNGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATTACCCCTTTTTGTGCATAGATTTTCCATCT:1 + chrX 9775039 3' + 412 445 2 71.29 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTT:1 + chr3L 25345138 3' - Doc 59 1 76.24 AACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGCTCTGATTAGAGAGCAAAAAATAACAGGCGGCATGCTGCAGTTCC:1 - chr2R 13383505 3' + gypsy5 381 2 54.46 AATGCATTACAATTATTACACTATATATTTAAAAATGTTAATAAGCATTAGTTTCAAGTTAGTTAGCCACAGAAAATATATATAATTAATGATAATGTAAG:1 - chr2R 19088922 3' + Tabor 487 1 75.25 ACCAGTTGTAAAAACTGAAATTGCCCAGCAGAAGGCTATATACCTAAAGCGACTTGCAACCCATCTCCTCGCTTTTAGTGGCCGGAAAACGAA:1 - chr2R 19341526 3' + Doc4-element 2742 1 61.29 CGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCCTGTTTCAGTATCTCCTGTTTGTTCAGTTC:1 + chrX 15244146 3' - P-element 475 1 32.67 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAATAT:1 - chr2L 17861775 3' - Doc 49 1 40.59 GCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCTTCTGACTTAGTTTTGCCTCTTAAAACGACATTATTTTTAACAGACAAAAATTAAGAAAAGTATAAA:1 + chr3R 5207073 3' + Stalker4 210 4 72.28 AAACAATAGAGGGAAAAGANACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGTGCAGTTCGAAATCCACTAACAACATTTCT:1 + chr3L 16282416 3' + gypsy5 362 2 69.31 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTTGCAGCACAATGAGCAACAGTCAA:1 + chr3R 23338349 3' + roo 389 2 57.43 GCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATC:1 - chr2R 22051478 3' - Tabor 47 2 68.32 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATTCTTATAAAAGCTTATATCCTGAAGC:2 + chr3L 13773058 3' + pogo 2053 1 74.26 GGCGTTGTTCAGTATTGTCCAGTAGGGAGATGGTCGTTACATGGCCAAATGAAATGGTCGGAATGAATATTTGACAATAAATAAATATGTTGTCAGTTAAT:1 - chr3R 18452180 3' - G7 1014 1 68.32 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGATTGAATTTTCGAAGTGAATACTACTTCCTTTTCAGTG:1 - chr2L 20328711 3' - opus 36 4 62.38 CAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGTCAGACAAGCGTCCCAGCCATTTGGAGCCACCCATTTGCAAAAC:1 - chr3L 5706251 3' - R1A1-element 5272 1 69.31 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATATTGTTTTCCACAATTCGATTAGAAAA:1 + chr3L 9910418 3' - 297 6617 2 71.43 TTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAAAAACTTATCGTACTCCCTCCGGCTGCGGCAAAGAATTACAAGGGAGGAGGG:1 + chr2L 14347438 3' - copia 201 2 55.56 TAATCTTATTATATATAGTGATTGGGATTCCCATTAGATTGTGGGTTACATTCACATATCACTTAGATACTCACCCACTAAAGTTAGGACTAGACTAACG:1 - chrX 19724114 3' + Tc3 281 1 79.00 TCTACAATGATTTAATATTAGGGGTATGTAGTTTCTAGTGAATCTTGTTCACATCGTTCATAAATCACGTTGAGCAGAGAAAATGTATTTAAATTTTCCCA:1 - chrX 14643849 3' - Cr1a 4141 1 66.34 CGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAAATTCCCTCGAAAACAGAAGATAAA:1 + chr3R 9224419 3' - pogo 20 1 59.41 CTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACCCTGACTTCCACTAATTGTGCAAATTATTACCAGCATGATTCATTGAGCAAA:1 + chr3L 12985484 3' - flea 4933 1 59.41 CCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAACATTCTACTGCCTCGTGCTAGCTAACAAATATTGCCAAGATCCCGACGCAGAAG:1 + chr3R 24691502 3' + gypsy4 65 2 57.43 AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGA:2 + chr3R 14860230 3' - BS 5006 1 67.33 TATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAGGGTGAAGGGCATATTTTGTCACATTTACAAAAGCAGATACTTACGCTCTCATTTCTCCTACAAATTTTTATTT:1 + chr2L 3172709 3' - 1360 239 1 57.43 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGATTATTTATGAGACCCATTAATGGGCAGGTTGTCAGCAGCTCTATTCATCTTGGAGCATATTAAGGGCGACATTAG:1 - chr3R 13865766 3' - 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I-element 1 1 73.27 GTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGAATTTTATTATGCAATGTTCATTAAATTATTTCAAAAATTGATAAAGCACTTAAAAATGTTACTTTTAAG:1 + chr2L 12816505 3' - F-element 4459 1 72.28 TTAAACATTGGATAGGCAACAAGAAAAAAAACGAACACACAATTAAACACTGATAATAAAAACGGTGCATTGGCTATGGCTATCCCCAAACAACCATGTCG:1 + chr3R 7195570 3' + invader3 4999 1 61.39 GCTAAAAGAGCCCTAATTCTAAATTTCAACGTAAATCATGTTAGCACCCCCATTCTCAGCTAATGAATTAAGTTTGCGACTCAAAGAGTTGTTATACTTGT:1 - chr3L 3581634 3' - copia 493 1 71.29 GAAGAGCGGGAGAGCGTAAAAGGGAGCGGAGAGCATAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACTGCTGGTGGTCAGTTGGAAGAGCGGCTGAGAGGCACCACCG:1 - chr3L 3837073 3' - GATE 53 3 55.45 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCAACTCAAGTGCACTCT:1 - chr2R 9649183 3' + roo 9031 1 68.37 CAGATGTTACCAACACCATAACCACGACCCAAGCTAGTTGTTGTTCGACTACAAACTCATATACTATGGTAGTAGCAGCAAGTTCCTATA:1 + chr3L 24710047 3' + jockey2 267 1 81.11 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTCTGCGCCAAAAAGAAGCATTTGCAAGGGAAATTCTTAGGTTCTTT:1 - chr2R 8682331 3' - pogo 26 1 55.45 TTGCAAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCA:1 + chr3L 23678118 3' - Osvaldo 34 1 71.29 TGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTGCTGCCGCTTGGCATTAACTGCCTACGCATATTCGTAGTATGTATATGC:1 - chr2L 4134819 3' - Quasimodo 26 2 54.46 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCGA:1 - chr3R 29608772 3' + roo 394 1 64.44 TTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCGCTTGCTTCAAAGCGCTCACTAAATCAGAAAAACTTTTCCCGCACGCCATTTAAATGAAAACGCAATTTC:1 - chr3L 8252165 3' - copia 7 2 72.00 TAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTGTTTTGAGATTGGATATTGGGGCTAGCTCACGTTTTTGTGGCTGTGTTTTTGTCGGC:1 - chrX 21180832 3' + 1360 3212 1 65.35 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACACAATCTGCTGCAGTCGGACGGGGCAC:1 + chr3L 20354098 3' - 412 9 2 71.29 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGACACATGTGCATTATTGTTGCCTATCTGGCGG:1 - chr3R 28565274 3' - 412 44 2 69.31 CAAATAAGCATACAAATAAAGACTCTTCAAAGCATCGTTTTACGGTTGATGTTCGAAATCATCCTCTAGAGCATAAAGATCCTGCATGATGAATATATTGA:1 - chr2L 21641088 3' - Cr1a 4041 1 61.39 TTCAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATAGATTATAGATTATTATATCCACAGCTTGGATTGAGGAGCTTGATCCAGTATTTCGGCCAACATTT:1 - chrX 20356780 3' + Tc1-2 1266 1 64.36 GCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATTCACTTTGCTGTTGCTGTTTTTGCATTTGCGTATTGTGTGTGTATTTTAATATTTAGATTTGCTTTTGTG:1 - chr3R 16000455 3' - Stalker3T 294 1 63.37 GTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTAAGTACGCCCACCAGAACATG:1 + chr2L 15403606 3' - roo 8963 2 79.00 ACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCTTTA:1 - chr2L 18213169 3' + hopper2 1562 1 69.00 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGACCGCATCCATTACTCAAATTTTATTAAACAT:1 + chr2L 126536 3' - Doc 48 1 72.28 TACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGCATCAAAGCGACTGTCGGACCGTGGACTACGTGATGTTGCGCGGAACTCCATTGGTATATTGTAGCA:1 - chr2L 11507715 3' - mdg1 165 2 65.35 TTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTACCGATGAGCACCCGAGTGGGGCATTCCACTCGGTAGGTCTTGTTGTTCAGTTGAATGAATCCCTGCAGCTTG:1 + chr3R 27250491 3' - G2 2604 1 67.33 ATTGTTTAATGTATTTTATNTATTTATTTAATGTTAACTTTGTTTTAACTTTGCTTTTATTTTAACTTTGTTTAACTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - HeT-A 5 1 74.49 AATATATTCGTGTTCATGTNTGAACAGCCATGGAAAAGTTTTAAGGCAGGAGAAAAACAGGGAGGAGGAGGGGTTATGTACCATCCTTGCCAGATTGACAT:1 + chr3R 8765636 3' - roo 5 2 72.28 AAATAACTCCCTTAGAGAANTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTCTTACATCTACATCTGCAATTTTTGTTACTTCTTTCTTCGCTGTTGATGAAGATTCT:1 + chr3L 19678778 3' - I-element 481 1 75.25 TTGTTACTATTTTTTCATAGCACTGCTATTTCACTTCGATTTCTGCCCATTATGTTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACTATTGAAAAAAATGAATGTGAA:1 - chrX 3036170 3' + HB 1407 1 74.26 TACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTAT:1 + chrX 8727909 3' - X-element 53 1 69.31 TAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGGGAGCGTGGTGTGTGCCAAATTTATACGCCATTCGTCGCTTGCGGTGGCAAAC:2 - chr3R 6086764 3' - Doc 30 1 53.47 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTTTTGGAATGCTAATTAACTACAGTATATATATTTTCCATATGTTTGTGAGCAATATAAATCATAGTT:1 + chr3L 14818782 3' + mdg1 7425 2 56.44 ATTAAATAATTAAATAAATAAATTAAATGCAACAAAAAAAAATGGTTTGTGGGTTAAATGAGGGGGGCGGCGAGTAAGTGAATGAAAAATATTTATGAATG:1 + chr3L 19242847 3' + HeT-A 29 1 77.23 ATTGGATAAAGCGTATTGAATAAAATAGGGGAATGCAGAGAGAGTGTCGTTGAAAACAAAAATCGCGTTCGCATGCGACACAATCTTTCAGCGAGTGTGTG:1 + chr3L 8753707 3' - accord2 7299 1 38.61 GAAAAAAAGCGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCGCCACCCCCTCTCCCAAATGTGGGTCAGTCA:1 - chr2L 4924528 3' - hobo 9 1 50.00 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCTACTGTGGCATGCCCCGCCCCCTTTATAATTTTTCACCGGCCT:1 - chr3L 19861779 3' + 1360 3356 1 60.40 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGGGCAACGGCAACGGATCGTCAAGTGTAA:1 - chr3L 3650018 3' + mdg1 411 2 68.32 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCTAGATGCCGATGCATGTTGGCAATGCGAGTCGTAAAACCTCGTC:2 - chr2R 19840196 3' - roo 32 2 56.44 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAATCAATTTATGAGCGGCCTGCCTT:2 - chr3R 7469953 3' - Doc 38 1 54.46 CTATGGCTTGTTGGTCCCCCGCTACCCATAAAAAATGTAAAATACACGAACGCTTAATTTCTCCTTTAATTATTCACACAAAA:1 + chr2L 9456331 3' - Rt1a 402 1 77.11 TGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGATCT:1 + chr3R 10391240 3' + invader4 288 2 61.39 CGTTGGCAGAGATTCCGGCAAATCTAACGGAATCGAAGGGCAACGGGACTTATCTCTTTGGTTATCACAAGAAAGACATTCAGTTTAACATTACATTATGC:1 + chr3R 8376519 3' - diver 468 1 56.44 TAGTCTTATAAATTTCTATCGATTTGCCAAAAAACTTTTTGCCACGCCCACGCTAACGCCCTAAACTGACAGTTCTCGGTCATGTTTTGAGGTCTTCTGGG:1 + chr3R 4550440 3' + INE-1 299 1 60.40 CAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTAC:1 - chr3R 4971406 3' - F-element 47 1 62.38 TCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAATTGTTTCATTAATTAAAAGTCGTTTATTTAGATATTTTTTTTTAATTTTACTGCCGTTT:1 + chr3L 10363678 3' - P-element 468 1 60.00 AGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACATTATGAAAATCATTATGTTCATATACATTTTTGAAATATTATAATTAATACTTAGCGCACATTTCCAT:1 - chr3L 13000983 3' + invader3 266 2 67.33 TAAAGGGAGATGGATGGGTNGCGAAGGATATGTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTGGCATTGTGTCGGACAAGATTGTCGCCAAGATGGGCATTCGAT:1 + chrX 6754778 3' - transib4 2430 1 54.64 ACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGATGGAGGTTGCAAGTATATATGGGGATGGATG:1 + chrX 17518129 3' - McClintock 141 2 69.31 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACTATATATATATGTATAAAGTATTAACTAGCCTTCAGCCAGCAATGTTTAACACTAAGT:1 + chrX 17104475 3' + 297 6941 2 52.48 AACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTTGAACGCTGGTTTTTACGTTCGCCGGACA:1 - chr3L 21434279 3' - F-element 4493 1 71.29 GTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATCATTATACATGTTAT:1 + chr2R 12457995 3' + HMS-Beagle 7016 2 57.14 TTTTCCTTTATTTTTTTTTTATTTTTTTTTTGTTTTTGTGTCCATTTTGTGTTTATGCGTT:1 - chrX 4654476 3' - Doc2-element 227 1 72.13 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTT:1 - chr3R 7869105 3' - 297 19 2 61.39 TAAGAAATCTAAAAAAATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr3L 18588195 3' - 1360 3273 1 81.82 GTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATTACCCCTTTCTCTCAGTGTACGGCTAAAATTTCCAGGCTTGTGTAT:1 - chr3R 22869353 3' + Bari1 1700 1 70.30 ATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTGGGCCAAACATCCACCTACTTACTATATTTCTCCCCTATTTTTTCCCATTCTTTCTTCTC:1 - chr3L 17942890 3' + copia 8 2 71.11 TAAGTGTTGCTGTGTACTTNTAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTC:1 + chrX 15546208 3' - blood 7047 2 61.46 AAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCCAAAATTGGAACTTGTGCGCACCTTGTAGAAACAATGTAGATAATATTTATTGGCGGACTTTTTAAAAT:1 + chr3R 8980082 3' - transib2 4 1 73.27 CATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTTGCATTCTGCAGGTGTGAATTGGCCCAGCAAAATTTGGGCCACACGGCATCTACAAAGATGCGGCACTCACGCAT:1 - chr3L 10449748 3' - Doc3-element 379 1 65.35 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTATGTCAGCGTGCGCTTCGTCACTACTTTAAACGCGCAATGCCGCAATAAATAGGCAATATTTAAATAA:1 - chr3R 5506748 3' + pogo 2097 1 73.27 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGAGGGTCCCTCCACTGGCTGGCTGCACATGGTGATTGA:1 + chr2R 24278070 3' + 412 7505 2 63.37 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAA:1 + chr3L 2176358 3' + roo 9019 2 80.20 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTCATTTAAATTCCTTGCCTTCTCGTTGTCCAGCAAATTATTTTAATTGTTTACAAACG:1 + chr3R 14580378 3' + blood 358 2 59.41 GGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGT:1 - chrX 15263446 3' + invader3 5412 2 76.24 ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACGTTGCCTACT:1 - chr3L 20049614 3' - jockey 4782 1 56.44 AGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCATAGATAATGATATAATAATAAATTATTAACAAACAGCAGCC:1 + chr2R 4138442 3' + R1A1-element 5102 1 59.41 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTGCAATCTTCCTCCAACTCTTAGAACCCCATCCTTGTCCAAAAATGG:1 - chr3R 19446889 3' + roo 9035 1 55.45 TATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTTTTATTAGTGTACGAAATAAACAAAAGTTTA:1 + chr3R 7513966 3' + diver 6066 2 75.25 TAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGAGGAGCTGTTGCCGGTGTGGGCTCTGTAGACGGAGCTGGAACTGCTGCCA:1 - chrX 2171570 3' - Idefix 382 2 50.50 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTG:2 + chr3L 20411845 3' + roo 9026 1 71.29 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGC:1 + chrX 11025568 3' + hopper 1379 1 64.36 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCCTTTTTAAACCAAATTACTTTTAAAAGTGTTTGAATCGAGTTAAAATATTCGAGGGGAATGAGAT:1 + chr3L 8036459 3' + roo 398 1 61.39 AGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCAT:1 - chrX 21087561 3' - mdg3 5258 1 69.31 CTCAACTATAGCTTTCTCTCTTTTGTTTATATTATTATTTTTCTGTTATATTATTCTTTAAAAAATGTAATTTTAGGCAGCGTCCCTTCTCTAGCAAATAT:1 - chr2R 951435 3' + INE-1 577 1 74.26 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTAGCTTTTGTGT:1 - chr4 488322 3' + copia 220 1 61.00 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCAGTTCACTTCCGCTGGCCACTTTAATTACGGGCAAGAGGC:1 + chr2R 6107792 3' - roo 8695 2 60.42 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCAGACCGTCGCGACGGCGATG:1 + chr3R 12329672 3' + hopper 1385 1 53.47 TAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAATCAAAGTACAACAAATAATACGTTAATTGTGCGTGGCTAAAAA:1 + chr2L 12288429 3' + F-element 4621 1 68.32 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAA:2 + chr2L 17079872 3' - jockey 4832 1 76.24 GTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTACAAAAT:1 + chrX 734961 3' - 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HeT-A 5968 1 54.46 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTGTTTGGTCAAATGCAGAAC:1 + chr3L 2022313 3' - roo 25 2 55.45 GGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAA:1 + chr2R 12185413 3' - accord 21 2 54.46 CAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTATCAATGACAATTGCAACGATGACCAAGCAATTTCATTCA:1 - chr3L 9019989 3' - Doc3-element 4519 1 71.29 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGGTTCTTGGCGAGGCCAAATTTATGTGTGTTTAAGCAACGAAGACCGTTAAA:1 + chr3L 13785457 3' + pogo 2077 1 55.45 TTGTATTAGAATATTAACTNCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCCATTTGGGGGAGAGGAGTGATGCAAGAATTATGACTCGA:1 - chrX 4264327 3' + mdg3 230 2 62.38 CCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCATTAGAATTTCGTACATATCCATGCCAGTTGCTTTGATA:1 + chr3R 7378363 3' - 17.6 221 2 66.67 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACATG:1 - chr3R 10110416 3' - Doc 26 1 51.00 AATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCACTAGTGTACTTAAACACCCTCGCATTGTTAATTTGGTCAATG:1 - chr2L 16220470 3' + HMS-Beagle 6665 1 59.41 AAATTAGTTTCTTACAAAANCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTTGCAGCACA:1 + chr3R 23338334 3' + roo 9037 1 56.44 CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTT:1 + chr3L 25059137 3' + mdg1 382 2 64.36 TCCTGAGATCTCGACAATCATACGGATCTCTGTCCGACAGAGACTTGGCTAGATCGACTCGGCCGTTGATCCGCTCAGCATTCACATATGATACGTTCGAA:1 - chr3L 21908519 3' - INE-1 138 1 69.31 TTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGCTGAGATCTTCGTCCTCATCCTCGCCGCGCTGACTCAGTTCCTCCAC:1 + chr3R 14817240 3' + BS 5022 1 53.47 AAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGAACCGAAAAAACCGAAGGGAAAGAAATAATCATT:1 + chr2R 10361252 3' + blood 443 1 66.34 CAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCGAGAAGGAAAAGCGCTGGAAAAACTGGCCAGCACGTGTGAGGCACCACCATAAACAACGTAACTCCA:1 - chr2L 19961444 3' + Quasimodo 7010 2 72.28 CGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCCACGTATATAGAGCTGAGCTGCAGCTGTATGG:1 - 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chr2L 19854083 3' + roo 365 1 71.29 TAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGTGATTTTGACCA:1 - chr3R 12321413 3' - jockey 4715 1 67.33 CGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGCTTACAAATCTCTCTTCAATTATTCATTCAACAACTCGGCTTGCTGAGTGTTTCGCGGGCATTAGGGGGGTAAG:1 - chr2L 3963074 3' - opus 7063 4 79.21 GTAAACATGTTACAGTTAGAAGGGAGTTAGAAGTTTATGAAAATACAGACAAAATAGAAAGACAAATCAAGGTCATTTCCGAGGCTAGTTTAATAGTGTGA:1 + chrX 2371538 3' - 3S18 5934 2 68.32 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACCTCAAGCACGTCGGTCGATCA:1 - chr3R 7626401 3' + hobo 2888 1 76.24 AAAGCAAAAAGAAAATAAAAAACCCAAACAAAACGAGAGAAAGAACAAAGCAGCAGCAACGGCGG:1 - chrX 14723606 3' + Doc2-element 240 1 90.77 TATTATTTAGATTATTATTATTATTTGTTATTATTCTTATTTGGTATTATGATTAGGGCAGAAAACGGGAGTGACAGTCAATGCAATGCTCGATTTTCCGT:1 + chr2R 23126053 3' - mdg1 40 2 77.23 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCT:1 - chr3L 3650058 3' + mdg1 7409 2 73.27 ATATATGTCAGCCCGACGGCTACCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTTTGGCCGTTT:1 - chr3R 23542967 3' + 412 7497 2 73.27 CTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTTATTTATACAATTTTTAAAAATGATAACCCCTATTAGATTAATTTAATACTTTATCGATTCGTTTGCT:1 - chr2R 11269161 3' - McClintock 283 2 73.27 CAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATAGCTTAGGATCGAAAGCTAAAGTGATGTACATTTTAGACTGTTCAATTATTAAATAACCTTAA:1 - chr2R 6779752 3' + 17.6 479 2 65.35 CACACACACACACATATCCACACGTACACTTGGCTCACACATGTACACACGCAGTCATGGAGAGTGAAAATTATTTAAAATTATTTATTTCACAACAATTT:1 - chr3L 6620556 3' + accord 188 2 64.36 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCAGCTAAAATCACTCAATCAGCTGTTG:1 - chr3R 27116737 3' - P-element 48 1 29.70 ATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCACATTGCGCCTCGTAAATGTGTGGAAAATGTT:1 + chr3R 30663487 3' - roo 8610 1 69.31 ATGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCAAAAAATAGTTACATATTATAAATACCAAATAAACA:1 - chr3R 25960616 3' + G2 214 1 72.92 GTTTTTCGTTTGTTAATTTATTTTCTGGGCTAAAGGAAACAAAAAACTGGGAAGTTATGACCGTTGGCAGATCCTAACTCTTGTCGTCTCGTGATCGCATC:2 + chr3L 17036938 3' - invader2 408 1 80.20 CATTATTCTTATTTTTATTTTCAATAATCATCTGTACTCGTGTATGCACGGTGTGGCTGCCGTAGACGACAGCGCGAAGAGCGTCTTCTGCACACACTATC:1 - chrX 16124207 3' + invader6 4504 2 59.41 TCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCACAGACACGTTCTCACCTGCCGTAGCCGTTGGGGAAGGTCA:1 + chr2R 9884966 3' + Doc 390 1 59.41 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGATGTACCTCAAGCACGTCGGTCGATCAATATTTGGCCAGCGG:1 - chr3R 7626386 3' + hobo 2930 1 56.76 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGGGGCAGTGCTCCTTTGTTTCAGTTTGCCATTTG:1 - chr3R 11607962 3' - 1360 42 1 67.33 ATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATTGTTCGTTGGCCGGTCCAGTCCTATCGCCATGTG:1 - chrX 5385980 3' - roo 8593 1 66.34 CTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGCTCTAACGCTTATACATATATGCATGCACTTT:1 - chr3L 19075389 3' + Stalker4 7084 4 75.00 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAAACTACTCATACGAGTGGTCGTCTCTTT:1 - chrX 21217481 3' + pogo 2094 1 71.43 TGCAACCATTGATTTGCAATTGGCGCAGTCGATGTGATCAGTGTTAAAGTTTCTCAAAAAGCGTAATGCGATTTACTCACCGGGCACTTCTATTT:1 + chrX 13206705 3' + 17.6 492 1 54.74 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTACCTT:1 - chrX 8334313 3' + flea 238 2 68.66 AAACAAGTTAAAACAATAAACAAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAAAAAAGGCCAACTCTCAGTGAAAACGAACCAAAAACAGGGC:1 + chr2R 20698927 3' + Porto1 179 1 59.41 TGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAGTAATCCCCTATACCCCTGAGATTTTCCTCGAAACGACGCCGGCGAACTTGAGCAAATC:1 + chr3R 30748431 3' + Stalker2 7312 2 64.36 CTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCAAAACAAATTAAACTAATAATAGGAAGCGTTTTTCAC:1 + chr3L 7099669 3' + roo 394 1 62.38 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCAGACGAAATGTTTCCGCTCCAATGAGCTGCTGAAATATG:1 - chr2L 1783305 3' + roo 9037 1 62.00 GTTTATCGGGTGGACGTAGNGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGGGGGAGACACGTTTCCCATTTAAGTTGATGCAATTTCTCAATTGGAAAT:1 - chr3L 18418834 3' + hobo 2913 1 52.00 TTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTCTGATTTTACAGCATATTAAACCATTCCGAGAACAT:1 - chr2L 19846598 3' - 412 7466 2 76.24 ACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGTAGATGATGTTACGCGAGTGCA:1 + chr2L 3623477 3' + Stalker 6969 4 76.09 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCAGACGAAATGTTTCCGCTCCAATGAGCTGCTGAAATATGAGCGAAGAGTCCGAGAAGAG:1 - chr2L 1783285 3' + roo 396 1 65.31 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGAATGAGGCACAGAGACATAATAAATAAAC:1 - chr3L 13374680 3' + Transpac 291 2 58.42 AGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAATGGCAAGCACTCCTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCGTTTGTGCACATGTATTG:1 + chr3R 20120239 3' + R1A1-element 5100 1 42.00 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTTGAACACAATCCAGAACCCGCGCTCAGCCCAAAAGTGTT:1 + chr3R 23638207 3' - pogo 1 1 78.22 GAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGAACTTGGGCCTCTGCGAGTTTAAAGTTTATTCAGTTTATTCAGAACGAAATCGAAT:1 - chr2L 6715639 3' - F-element 4501 1 66.34 AATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGCGGAGCTGTGGCTCTGGGAGAAAGGCAAACAGAAGTGATGTAAAAATATGCGTTGCATACTTTGCAGCGCCAAT:1 + chr3R 12199857 3' - jockey 9 1 75.25 GATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTGCGTTCGTTGGTGGCAATGATTCAGCCGATTTGGGATGTTCCGAAGG:1 + chrX 4488940 3' - Ivk 5049 1 69.31 TAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTCAAGAAGGATTTCGAAAAAACGAAAACATAAAGTAAAGATAATTA:1 - chr2R 10956900 3' - copia 4901 2 55.45 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATACCAATCCCCATATCTCTCTCTCTCTTTCTCGCTCTAGAAATATAAACTAAACATTTTCTGCCTTTTTACTT:2 - chrX 4937518 3' - Doc 18 1 65.35 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAATTGTTGATTTTTTGTATATCAAAAAG:2 + chr3R 26317973 3' + roo 9025 2 72.28 TTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACCTGGCACCCTTCTTTGTGTGTCATGTTTTTTGTAGCATACCTGAGGCGTTCCACTTCCCTGTTCAACTT:1 - chr3L 13897069 3' - hobo 222 1 63.37 CCGAGGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTG:1 - chr2L 17994164 3' + roo 354 2 71.29 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACC:1 - chr2L 16139129 3' + copia 5076 2 73.00 ACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTATTGGCTACATCCTGCTG:1 - chr3R 4973096 3' + 1360 17 1 44.55 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACTCGACTCGAATCGCCGCCGCTTGTTATTCTG:1 - chr3R 10488687 3' - roo 29 2 62.79 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGGTTTAGAATACGAATATTATTAACTATTCGATATCTAACATGCATATTTGACTCAAATGGAAGTAA:2 + chr2R 21351403 3' - mdg1 11 2 68.32 GGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGCCTTTCTATCTTGATCCTGGCATTTGCATGGTCGCGTTTAATTGCGAAAATTGTGCA:1 + chr3L 10320391 3' + 412 499 1 66.34 CCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATATTTGTCTGTGTGTTGGTGAG:1 - chr3L 5241140 3' + Ivk 5323 1 82.18 TAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACAATCGCATTAACAACAGCACTCCCAAATTAACAACGATCTTGACTTTTGAACTTACAATCTT:1 + chr2R 18226097 3' + mdg1 7346 2 59.41 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCC:1 + chr3R 14860193 3' - BS 5043 1 72.28 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGAGGGTCCCTCCACTGGCTGGCTGCACATGGTGATTGAATTTAAAATGGACA:1 + chr2R 24278084 3' + 412 466 2 49.50 AGTTGCCGGAGCTGGAGTGACGGTTTAGACGGCCAGCGAGGAGGAGGAGGAGACTTTAGCGAATCCTTGAGCATCGCTTCCGAGATGGTCGGAAAAGTTAT:1 + chr3R 8123148 3' + aurora-element 188 1 61.39 CTTTAAATATATTCGTGTTNATGTGTGAACAACATCTCTATCTGCTCCGAAGGCATTCCGAGTGGAAATGCCAACTGACACACACCACGCATGCGTACGTG:1 + chr2L 2833950 3' - roo 10 2 67.33 ATTACAATGATGGCAAAGCAGATAGGCATCACAACTATTCAGTTTTATTAGTGTACGAAATAAACAAAAGTTTAAGTTTGTTGTCCAAAAG:1 + chr3R 7513983 3' + diver 205 1 50.55 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCATCTTGGC:1 + chrX 19034196 3' + hopper 1397 1 61.39 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTCATGCTATCCTGCTTTCCGACGGGTCCTTGCCAG:1 + chr3R 23543034 3' - 412 7069 2 63.00 GTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATAAGAAAATAATATATAGAACTTTCTACACATTTCAA:2 + chr3L 13001063 3' - invader3 5228 2 65.35 TTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCAACTTTTCTCTCCACCACTCAAACCAAGAAGTGCAGCTCTTCCATAAATAAGAGCAGGT:1 + chr3L 18157035 3' + G2 3033 2 60.40 GACGTTCATACCGACAGACGGACATTTCCATATCGTCTCGGCTATTGATCCTGGCGAGAAGAAGGAGTTGAGTTGAATATGTGATGGTGTGTGGCGTGTGG:1 + chrX 668185 3' - INE-1 126 1 52.48 CTGCTCATATTTTTCAAGGTCTATAGGTAATAGACATGACAGACAATATTAATATTGAAAATTAACTTTAGAAACTTTTAACTTTTATAAAAAAAAA:1 - chr2L 7568518 3' + hopper2 445 1 58.76 GAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGGTTTTTGTGACTTACTTAAGG:1 - chr2L 3408639 3' - G-element 48 1 73.91 AATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCATTGCAATATGACTTGCCACCCTAATTGATTTGCGGCTTCTGCTAGGAACAGCCGAA:1 + chr2R 25120795 3' + Tirant 8203 2 59.41 TTTGTTGTTTTTTTTTTAATTTTTTTGTGATTTTTGTT:1 + chr3L 16616288 3' - Doc 4699 3 89.47 AATAATATAATAATAATATTAATGTTAATTATTACAATCTACTATAGCCTTAATTTAGATTAACCAGCCCTCTTTTGCGAGACGTTAATTTCGTTCTATTC:1 + chrX 7374239 3' + invader3 5054 1 59.41 ATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTCATTTTAATTGATGTTTATTTAAAAACTAGTTGTGTTTTGCGGAAACGTAGAACAAACGTAAGCTTATCTG:1 - chr2R 5772422 3' - HMS-Beagle 6796 1 79.00 CGTTGAGGCCTACTTTTTANGCGGATGTTCGGTTAATACAACACAGCGTGCATTTATTGTTACTTAAACGATATGTTTTTTTTTACTTCTGGCGAGTTGAG:1 - chr2R 9989869 3' + mariner2 166 1 53.47 TTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATTTTACTATACCATTTTCAGTTCTTTCATAAGATCCATATTGGAAA:1 - chr3R 25086093 3' - Bari1 33 1 60.40 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATAGGAGTGTGTATATAGCGAAAAGTGCGGGCGAAGGCAATGGCCATTCGCTGGATTC:1 + chr2L 14035612 3' + flea 240 2 61.39 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGGATGTAGACGCGTTAGCAGAAGTTTCGTTTCCTTTGTGACTCAAAGACAGAACTGAACTACCA:2 - chr3R 6266275 3' + roo 397 1 67.33 TTTTAAATAATTTAAAATAGATTTGTGTCATTTTTTCTCTCCGTGTATGTTCAGATTCAGGCGGCCGCTAAGCGCAAAACGCTCAAAATTACAGCAACAAA:1 - chr3R 29651536 3' + Transib5 257 1 72.28 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTGCTTTGAAAGCGATGTTCTTCGGTTAATTGTGAGTGACAACTCACTCACTAA:1 + chrX 16671136 3' + P-element 2865 1 57.43 AATAAAATCAGTTTCTTACNAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCC:1 - chr3R 8765547 3' + roo 9033 1 64.36 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACATGAATGTGGGCGGGGCACGTCTCACTGATTAATTGCAGTTTGGTTTTAA:1 + chr2L 17677787 3' - Tirant 8132 2 56.44 TTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCGCCTGGCAACACGCTGTCAACTGCAATGCCCAAAGGAAATGC:1 - chr3L 8253455 3' + copia 4946 2 58.42 ATAGTGAAACGTAAACATTTTTATTCAAAAAAGACAGAGTTACAGACAGACAGACAGCTGCCACGCGATCGCACAAACAGCTGTTTGTGATTTTAAAGCTT:2 + chr2L 17157843 3' + X-element 150 1 56.44 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGCACCGTCCATTGAATCTG:1 + chr2R 6850504 3' - roo 8700 2 67.33 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGC:1 - chr3L 25059074 3' - mdg1 7061 2 53.76 CATTTTTTATTTATTTTTTTTTAGTTTACAAACACCGTTTAACAATTACAGCACCTTATGCAAAAGGGTATGAAAACATAAACTTTCAGGCC:1 + chr2R 15052188 3' + hopper 142 3 88.04 AATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGCCCATTTCCATTTTGCCCCAAACTTGCTTAATTGGTTCTGCTTTCGATAC:1 - chr3R 13331407 3' + transib2 2799 1 54.46 ATGTTTATGTTTATGTTTATGAAAGTTGAAGCCCAAACACATTTATTCCTATTTTCATTCCAATTTTCATTGCTTTTCCGAGACTGCACACGATTTGTGCG:1 - chrX 13798786 3' + 412 76 2 81.19 TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCTAACTGTGAACAACATTAAATGA:1 - chr3L 12112356 3' - 1360 54 1 80.20 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTTAATTGACCT:1 + chr3L 9928608 3' - roo 8691 2 58.42 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTACCTTACTATACTTATATGTCTATCAACTTTTTAATGCCAATTAGTGTAAATATTCATTAAATCA:1 - chr3L 19249661 3' - Transpac 4934 2 64.36 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTC:3 + chr3R 23543001 3' - 412 50 2 77.23 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATCGCTAGTGGCATTTGCGTAGGGCTAATGGCTGTAAAAAAAAAGA:1 - chr2R 18432060 3' - 412 7082 2 58.00 AACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATAAATATTAATTACTATTTTCCAACATTAATTACCTCTTGTTGAAAAGGATAACTGTTTGCAG:1 + chrX 14173077 3' + 412 7531 2 63.37 GCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTGACCTAAAAATCCAATTTAAGGTTCTCAAATATTTGCCCGG:1 - chr2R 8267389 3' + Doc 280 1 59.41 ATTTGACTTTATGCCAAAAAAAGGGAATCTCTGCGATATTATTATCTATATACGTTTTTTTTAGTCAATTTGAAAATCCGGCGACGTTTATTATAATTAAG:2 - chr3R 1835336 3' + transib3 2842 1 67.33 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTGTAGGCTGTCATGTTAACATGGGAGAAAGCTTTCTCCGCTGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGTGCGCCTGAAA:1 - chr3L 14594084 3' + hobo 2937 1 75.00 AGATCGGTGGGGTGTACCCCCTTCAGCCTTTGGAGGGATATGGAATTAGCTAGGCATGTGCTTAGCAGCGGATTGACTGCCATGCCAACAGCTT:1 - chr3R 29429959 3' - G5 4643 1 55.32 AGAGTACCGAGTGTTTATCNGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTAGAGTGTAAATATGGCAGAATATCCTAGTGAGCTTGAG:1 + chrX 5219757 3' + hobo 2901 1 61.39 TTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGC:1 - chrX 4166383 3' - I-element 5323 1 57.58 AATAATAAATAATAATAATACAATAATAATAAAAATAATAATAAAACCAATAGGAAAAAGATTATACGAGATTAGCTATGCTTTAGTCATGCTCTTGTTA:1 + chr3R 12975530 3' + flea 5003 2 44.00 TTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATAATTTGATTGAGTTTGAGCTATCCTTTCTATCACAAGATATTTAACTTCATATTCTATT:1 + chr3L 18122593 3' + S-element 1700 1 61.39 GATTTGTTTAGAGGCGTGGNGGTTTAGGGGGTGGGGAGGTAACTCGCGCGTGTGTGTGTGTGCACATGGGCAGTAAATCTAATCCGAAGTATATCTAAG:1 + chr2R 9209503 3' - Tirant 8132 2 55.56 CGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATTTTGAGAGAAA:1 + chr3R 10741137 3' - 1360 3364 1 45.26 CCTGCCCTAATGTTAACATTAAAATCCGCTGCCGAATCCGTTATTCCCACCAAAGGGTTAAAACCGCACCCAAAATTGCAATTCACATGAAAATCTGCTGC:1 - chr3L 7468349 3' + Quasimodo 167 2 64.36 CGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAAAGTAAATTTGCACATACATGATAGGCGAAG:1 - chrX 18897413 3' + roo 74 2 70.30 GCTAACTATCGATGCAGCTNAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTTGAACACAATCCAGAACCCGCGCTCAG:1 + chr3R 23638195 3' - pogo 13 1 66.34 TTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGGGCAACGGCAACGGATC:1 - chr3L 3650029 3' + mdg1 7438 2 57.43 TTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAACCAAAATGCTCCGAAAAAAAAAACGAAATAAGTAAATAAAGAAGCACATTACGCATACGCCACCGAT:1 + chr2R 18602379 3' + G2 3029 2 70.30 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAATACCTTCTAAACTTATGAACTTTGAGAACACCATTATTTTCT:1 + chrX 8316379 3' - hobo 33 1 59.41 AATTATACTTTCGATTTCGNACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATTTACTTTTCTAATTCTACGAATCTTTTACATTGGATAAATAAAGTCAACTTAT:1 + chr3L 6131359 3' - mdg3 5047 1 59.41 TTTAATGAAATGTACATATNTATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATTAAATTAAATATGACTAAAAACAACTATAATGAAAAAAAATTT:1 + chr2R 18188358 3' + Juan 4178 1 62.00 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCATTAGTGTGTGTGTCTGTGTGCCTTCACCTACAGTGGTGGGCATGAGTATTGGCACAGCTGGC:1 - chr3R 17059133 3' - hopper 11 2 68.32 GGTGTATAGGGTGCCGTGGTTATATAACAAGATAACAACTTGTGATCTTTAAGAAAAAACAGTATTCTATCCTAAAAAAACCACAACAAATCAAGTTATTT:1 + chr3R 20506389 3' + R1A1-element 5272 1 81.19 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTATAATTTTCGGAGCTCTGTGCTGTCAAA:1 + chr2R 10670064 3' - jockey 4766 1 73.27 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTGTTCCCGAACTGCATATACATATATTAA:1 - chr3R 24976749 3' + opus 455 2 79.21 TAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGCTTAAAAGGCCATTTAATGAAATCTTCTACCTAATCTTTAAGTTAGTAATTAATGTAATCAGTTGAAATAC:1 - chr3L 16563192 3' + 3S18 6100 2 71.29 CCAGTAGTTAATATGGAAGGCAAGAGAGGGCGAGAGAGATGAATGTTTTATGGGACATCGCGCCTGCCTGACACTCGTTTATTTACCATTTTACGGCTCT:1 + chr3R 19054602 3' + transib2 2686 1 69.00 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATACAACAAGGAAGAAAAGCGAAAATTTCTTATTTCCATTTCTGT:1 - chr2L 18247982 3' + blood 7359 2 56.44 GTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCG:1 - chrX 15263440 3' + invader3 232 2 71.29 TATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACTTTTTCCTTCTGATTTCTTCCGCTTTTGGACAGTTGCAGTAAAAG:1 + chr2L 17242891 3' + copia 4748 1 55.45 CAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAATCTTTTTATTGTTTTATCGGTTGAGCCCCC:1 + chr2R 6416852 3' - 1731 49 2 70.30 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCGGCAACAAAGGGTCCTTTGCTCTCGCCCGATTTTGCCATATT:1 - chr3L 7047965 3' + opus 7481 2 63.37 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCA:1 - chr3R 19449412 3' + hobo 2937 1 77.23 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTACCTGCTTTTCCTGCTTTGACGGCAATTGTTTGCCCATTGCTGCATAA:1 - chr3L 6023253 3' - hopper 4 2 75.25 TTTATAAAAAAAAAACCAAAAAAAATGAAAAGGGAAAAAAAGGGGGTGAAAAAAAAGGATTTTT:1 + chr3L 13684200 3' + HMS-Beagle2 480 1 85.94 TCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCAAAGGAAAAGCCATTTGCCCATTTTCA:1 - chr3R 30093741 3' - accord 7067 2 74.26 ACAAAGTTGCAGCATAAACATCAGCGACCTTGTACCAGAGAATAATGTTGGGAAGCAGATCAATAGAAGTGGAGGCTAAGTTGATTAAGAGAATAGGAACA:1 - chr2R 2752413 3' + ZAM 93 2 55.45 AGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATCTACAGCCCGTTTCACATTGTTTGGCTCGGCAGACGCTT:1 - chrX 11032191 3' + invader3 5429 2 59.79 ATCGAGGGTGGAGCCTTTTNTGAAGATATGATGTGTAAATGTATAAGGCTTAAATTATTTCATAAAGGTTAAGAAACAAGTATTGTAAAATTCTTGATACT:1 - chr3R 16246563 3' - Tirant 8492 2 58.42 GTTTTATTTATCAACAAAAAAAGGTATTCTTTCACTCATGTCAAGTATTATCGCAATGAAGATAGTTAGTACTGTTACTGATAGTTTAACTACTTAATTTT:1 + chr2R 15778733 3' + 3S18 346 1 77.23 CTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTA:1 - chrX 734927 3' + Tabor 435 2 71.29 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCAAAACAAATTAAACTAATA:1 + chr3L 7099651 3' + roo 9038 1 59.41 GGAAGGCCCTATCAACCTTNCACATAACTACATATATGGGCAATATGTACATTAGGTGATTATTTTATGGTCGCTTTAACGATTATTGGAACCGTCAA:1 + chr3L 11829121 3' + Transpac 5221 2 68.37 GGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGCTCTGATTAGAGAGCAAAAAATAACAGGCGGCATGCTGCAGTTCCCCATGTTTGGTTTTTATTTTGCTTTGCTG:2 - chr2R 13383476 3' + gypsy5 410 1 77.23 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCTTAGTTGATTTTTTAAAATGATATGTAACAAAGGTATTTAA:1 - chr3R 5348660 3' + copia 222 1 59.41 CGATTCAAACAGAGCAGAGGCTCTGAGCTCCAAAACGAAATCTATTACATCTACTACATCTATACCTATTACATTTTTAAACTAAGTAAAACGAAAAATTA:1 + chr4 1076167 3' + Stalker4 7306 4 78.22 TGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTGCATACCCTAACAGAGAACATTTTTTTTCAGACAGAAGCTTGCAGCGCAGTAAGGCTGA:1 + chr3L 19483035 3' - Quasimodo 8 2 48.98 CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATTTATATTGATTATGGGTGATCGT:2 + chr2R 9905399 3' - mdg3 5305 2 80.20 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATCTGGGGATCTCCAGGCTTGTTTGC:1 - chr2R 8311316 3' - opus 7165 4 77.23 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCAGCACCAACACCAAATGCAA:1 + chr2L 13089782 3' + roo 9038 1 60.40 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATACGTATGTATACACAGTGAGGGCGCAATTTCCCAACAAGCTTGCACATTGAAA:1 + chr3R 23641061 3' + 297 6958 2 66.34 TCCTTCGTTGTGGCCGTCACTTCAATCCGGGAGGGGAGGAGTTACCGGTTCTAACCGGCACACAGACCCTCCAGCGAAGCCACCCCGGCTTACTCTGGAAT:1 - chrX 21939637 3' + gypsy5 6901 1 68.32 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTATAATTTTCGGAGCTCT:2 + chr2R 10670053 3' - jockey 4777 1 62.38 CAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCACGTCCGTCTGTACTGATTATTTTTAATGGTTTAGCATTCATTCTTTCACAACAATCTTATCTGTAACTAAGC:1 + chr2R 15686143 3' + INE-1 95 1 64.36 GTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATTAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAAGGAGAGGTCGAGAGAGCGATAGAGCGA:1 - chrX 19361286 3' + micropia 161 2 81.00 CACACACACATAATCACACACACACACATACACAGCCGCACAATGAAGCGGCTCTCTGCTGCCTAGCCAACCGCACATTTTAATTGTTCTCGTCATGAACA:1 - chr3L 17113031 3' + accord 7038 2 59.41 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGCATAAATAAATGAAAATGCTACAGTTCAAAACGGACCATAGTTTAAGTCTT:1 + chr2L 16139186 3' - copia 26 2 53.47 CACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACACTGCTGTCGCTCTCCATCGGCTCGTCGACGAAGAAA:1 + chr3L 6332552 3' - R1A1-element 406 1 75.81 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTGATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAATGG:1 + chr3R 22494182 3' + 297 6948 2 66.34 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATAAGAAATATTTTATCGTAACTAACAAGCTATCTTCTTAGATCAATATCCGCGATTCCATATCGA:2 + chr3R 17482097 3' + copia 244 1 59.41 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACG:1 - chr2R 15788591 3' - Transpac 43 2 66.67 TAATAACAATAATAATAATATTAATTAATAATAATTTTCATTATTCAATAAGCCCTACTTTGCTAACTTTTAATCGACTGTATTCGTCGCACATCATTGTT:1 - chr3L 14957618 3' + mdg1 7068 2 79.21 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATGCTGGTGGCTATCTGTGTGTGTGTGTAAACGATTTTTAGTTCTCTAAGTAAACGAAACAGAAAATAAGTATTA:1 + chrX 7923608 3' - accord 7027 6 63.37 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTAAAATGCCAATA:1 - chrX 10286154 3' + roo 9033 1 65.00 AAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTC:1 + chrX 21668056 3' - Tabor 51 2 74.26 ATTATCTATCGATATCCCAGAAAAATGCGTAACGTCTATCTGATAGCATTCCCTCTTGTTATGTTTAAAATTAAAGTTTATTATGTTATTAAATGAGTAAT:1 - chr3R 1839581 3' + INE-1 497 1 59.41 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATGCTACAAAATATATTGAATAATAAAAATACGTTAAATTCGTTAT:1 + chr2R 10372194 3' + mdg3 5470 2 53.47 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGCATCGAGCGCTTTTCCAGC:1 + chr3R 6034022 3' + roo 9045 1 55.45 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTGCTTTGAAAGCGATGTTCTTCGGTTAATTGTGAGTGACAACTCACTCACTAACTCTGCTGGCAAAACA:1 + chrX 16671152 3' + P-element 2881 2 73.27 TACTAATATAAATACATACATTTTTGTGTTCTTTAAGACACCTTTGTGATTATATAAATCCCATTCCAACTATAAATCGAGAACTAACAATATAAATAAAG:1 + chrX 19088905 3' - 1731 4414 1 58.42 GGTGAACAAATATTGTGAGTTCTATAATTCGCTTTGCACTTATAATTTGTTTGCACAGTTCACTTTGCACTTTGGTTAGTCCTTCGATTGTCCGCACACAC:1 + chr2L 4801728 3' - gypsy4 304 1 72.28 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCTAAACCAAATGTTTCCCCATACCAAACGTGGTGTGGGTCCCAATGGGGTCAAAGGCAAG:1 + chr3L 14624005 3' - hobo 15 1 60.20 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTTGTACACACAATATTTAAAACGAGTTCTGGGAATTAACACGACAAAAGGAG:1 - chr3R 16601424 3' + roo 385 2 57.43 GTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAACTTATAACTAAGTCAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCACGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACA:2 + chr2R 1234687 3' + invader2 4770 1 56.44 ATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTCCCCATTGACTCCGGCTCAGTTATAA:1 + chr2R 18723095 3' + HMS-Beagle 6996 2 76.24 CCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGAATGCGGATGCGAATACAAACGCACGCGTATCTCAAGGGCGAGCGCGAACTGTTCACGAATCGGGTTGC:1 - chr3R 5902586 3' + Doc2-element 106 2 75.00 AATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTACTAATCGCTTACAGGCGGAATGTT:1 - chr2R 23661943 3' + jockey 4667 1 57.89 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAGTGGCAGCCACGGCGA:1 + chr3R 10488753 3' + roo 386 2 57.43 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGG:1 + chrX 21668070 3' - Tabor 37 2 60.40 GGTTAAGTTCAGACACTTAAGATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTGTCGCAGATCAAAAGTGTGACTGACTTCAATACGTAATTGGCTTATCA:1 + chr3L 5479510 3' - 3S18 294 2 75.25 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCAGACCGTCGCGACGGCGATGAGCAAACAACAGACGCA:1 + chr3R 12329689 3' - hopper 12 2 65.00 AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTTTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCA:1 - chr2R 5214948 3' - F-element 20 1 62.38 TTTTATTACGGATTTTACGTTATTACGACACTTAACCAAACCCAGTCGAAGTCGGTTACATGATAAACGCCATGTGAATATGTTGTCATACAGAAACGTGA:1 - chr2R 7476413 3' - gypsy10 392 1 65.35 GTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTGATTGTAGAAAATACTGCGAAGCTGAAACTGATACAGCTTAAGATTCCTTTGCAATCTTAGCATTCC:1 + chr3L 2021292 3' - mdg3 5132 1 74.26 ATATAAACTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTATAAATTAATAAGGGGAAAAATTCCGTTTGCTCGGACTTGGTCATAATTGAGCACTTCTCTGTTACGT:1 + chrX 21228832 3' + pogo 1848 1 74.00 ATATCGCCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGTATAGTGGTAGGGGTGATGTCCAGCTCTCCAGGATCTTCGTCGCT:1 - chr2R 6744467 3' - I-element 5011 1 57.61 CTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTA:1 - chr3R 15924607 3' + Quasimodo 7325 2 73.27 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCC:1 - chrX 21217514 3' + pogo 2061 1 67.35 CAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGCTCTGAC:1 + chr2R 14997932 3' - McClintock 19 2 59.41 AGCAATCAATTTTAACTTTTTTAGTACATAATTAGATCCTACTAGCACTAATATGTGACAACAGTTATTATTTTTCTTGAATTAATTGGGTGGGTCTTTTT:1 - chr3R 2944497 3' + Cr1a 4260 1 55.45 GGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCATGAGTGAGGAGTGCACTGCGAAAAATGCTTGATAATGTGGTAACTTAATATTATTTCTAACAATCCAAACT:1 + chrX 4264441 3' - mdg3 5255 1 73.27 GCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTGAACGGATTCCCAAGCTTGAATTTACCTGCTTTGGACGAAG:1 - chr3L 14672205 3' + McClintock 15 2 74.26 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTC:1 + chr2L 4063739 3' - roo 8715 2 81.19 GGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAATTCCAGACACAAACCCGGCCCAAACACG:1 - chr3L 16282356 3' - gypsy5 6965 2 56.44 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGATTGAGTTGATAGGCCAT:1 + chr3L 12112376 3' + 1360 3339 1 80.85 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTGTATGCTGTGTGATGGTGGGTTGGAGGGGGCGCGTCGATTGGGTTAGGGGTTAGATTCACAT:1 + chr2L 20876888 3' + hobo 2922 1 66.34 TGTCTTTGCTGATATACTTATGGGCTCTATGGACGGCAAAGCAGTTATAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGAGTTCTCCCGAGACACTTTTATG:1 - chr3L 290844 3' - Ivk 405 1 78.22 ATTTCTTTTTATAATTATAATTATAATTTTTATATATTTAATACTTAAATAAATAAAACTCGAATGAAATATTAAATACAAACCTCTCGGTACTGCTCTTC:1 - chr3L 14230293 3' - I-element 255 1 74.26 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGGCGGTCTGATTGTGGCCCTTGTGTTTGTATTTTGTA:1 - chr3R 7869124 3' - 297 20 2 55.42 AAATAGAAAACAAAAGGAAAGTGTGCAAAGAATTTCTTGACAGTGTCTAACCAAAGACACTAGAATATTATTATATATATTATTATTCTAGTGTCTTTGGT:1 + chrY 932078 3' - S2 233 1 66.34 TGCTTTAAGAACAGCAGAGAGTCAAGAAGAGCCAGAAGATACACGAGCTGAACGCAATGAAGTCAGAAGATTAGAACAACGACAGTCACGCCGTTTCACTG:1 + chr3L 24008455 3' - Cr1a 4242 1 79.21 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTACAAGCACATAAACACAAATACATACTAATATGTGTGTTGGGCTGCTC:1 + chr3L 14594182 3' - hobo 29 1 57.43 GTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGCAGGTTTTTATATCCGTTTGGTCGCCTGGATTTATGGCATCAAAAATTTCATG:1 + chr2L 7713375 3' - Burdock 328 1 69.31 ATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGACCCGTTCGCTGCACAGGTAAAGACGTAAGTGAACTTTGGTCAGTAAAAAC:2 - chr3R 6800937 3' - 1360 172 1 59.41 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATGACGACATAACGAAGTTGAAATTTACTATACGGAAAATGAA:1 + chr3L 15288344 3' + copia 5079 2 66.34 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGTTAAGACTGCCACTTCGATGGAGGAAGCGAAAGTAAATGTTTGACAGTTTATGACCCCGGCCCAGGAACTC:1 + chr2R 19840293 3' + roo 405 1 73.27 AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTACAGCGTATGAGTGATTTTTATGGCATTTTTATTTGGTCCGTGGGACGTACGCCTCA:3 - chr2R 20718815 3' - BS 5015 1 56.44 TTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAAGCCAAAGCCCAAACATAGACATAATTATTTCAGTCGCTCGGCGAGCCATACTACCCAAAATAAATTCCTCGA:1 + chr2R 19091700 3' - Stalker2 7252 2 71.29 ATATCGACTCGGCTATTGATCTCGATCTCTGTTTTGGTACTGATTGTAATTTGGGCGAAAACGATCGTTTTGCCTCATTGGTTGCCTTTGTTGACTGTACG:1 - chr3R 773818 3' - INE-1 97 1 63.37 TCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCGTTGAAAGCAAGTCTTTTTGCATAGCATACATTTGGGGGGCTCCTTTTCTTC:1 - chr3L 13895351 3' + hobo 2918 1 54.00 TGCGCAGCCGGCAAACACAGCATATTTGAGTGGCCAGAAGTTCGGCTGAGTTCAGTTCCATCCTTGAACTAGCTTAAATCGTTGTGTATGCAAAGAACACG:1 - chrX 18455998 3' + Gypsy6A_LTR 90 1 75.25 TTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGTG:2 + chr3L 20224220 3' - Chimpo 32 1 59.41 TCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGCATCGTGTCCGCCCCTTCAAAATAATAAAGGTATAATGAAAGTATG:1 - chrX 15255346 3' - Tabor 31 2 53.47 AGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCACCCTTAAAACAAGTAAAATGTAATCGAACAAAACCCTATTTACTTTAACTTTATGACACAATTACATTT:1 + chr3R 11916643 3' + roo 401 1 71.29 TTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTGTTTGTCCGAAGGGCAAAATTTATGCATTAATCTTAACTTAATG:1 + chr2L 12882195 3' - hopper 1150 2 56.44 CCGTAATTGTGAAACACTACTGGACGTGCAACTACACGGGTTATCTCCCCACCGGAGCGCTTTCTTCCGTCGCATTTGTCTGTTTTTCCATGCCCAAGAT:1 - chr3L 10793447 3' + baggins 59 1 69.00 AACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATCCTGATGACTCTTCGACATATTTTCAACACTCCTTCTCAATGCAATATGTCAAC:1 - chr3L 26544687 3' + invader1 3968 2 68.32 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACTGAGAGCGACGGATCGAAAAAGAGATTGAGATTTGTTTAGCCAAAATAG:1 - chrX 21251033 3' + hopper 1364 1 58.42 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGTGGCGCTACTTACTGCGTAATTATTGAATTCTACA:1 - chr3R 8979992 3' + transib2 2790 1 61.46 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGTTCGTCATAGGTGTATATTATTTTGAAAAAAAT:1 - chr3R 30553540 3' + 412 472 2 57.00 GACGGGACCACCTTATGTTNTTTCATCATGATTCCGTGTTACCACTGTATTTGCTTTACTGTTGTTGTAATTAGTTTTGTCGTCGCAGACCCGATTATCAG:1 + chrX 19308252 3' + P-element 2878 2 70.30 ATTTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCATTAGATAGTGAAAGAGATAGAATAGCAAAGAGTGAATCAGCCAAGTAGAACCGTGAAAGGAGTTGAGAC:1 - chr2L 14537813 3' - 1360 2 2 71.29 AGCTGAGTTATGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTAAAGCTTTCCCTCTTGTTTAAGTAAATTAACTTTACTATCATGTCCAGTTAACCCAGGCTAA:1 - chr3R 14576788 3' + INE-1 545 1 76.24 ATAATAATAAAAAAAAAACAACAACAACAAAACAGCAACAACATCGCTTAATTAATCTAGAGAAGGCATTAAGAGGTGCGGCCAGTTGTAGTTTGA:1 + chr3L 14716322 3' + Rt1a 5073 1 55.21 AATGAAAATTTTAAAATTACAATAGAATTTGATTTAAAAAATTGAATGGAAATAGTTTTATTTCAAATTTTATTTTCCCCACTTTTTTAGAGGGCAATAAA:1 + chrX 5994821 3' + 1360 3055 1 67.33 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAGATTGTCTTGGAAACAAAGTTCAATTCATTTTGAATAT:1 - chrX 11016994 3' + roo 9034 1 61.39 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTCGTGGTTTCGATGTTACCATTTTTCGTGTTTT:1 + chr2L 20328798 3' + opus 499 1 77.53 CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCACTTTACCAACAACGAGTTTATAATTGTTTGATTTGTGTGCGCGCATAGTGTGCATGT:1 - chr3L 12468196 3' - jockey 4691 1 60.40 ATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTTTAAAATTAGTGTA:1 + chr3L 22016848 3' + INE-1 151 1 57.43 ATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTCTTTATATTTCAGTTTGTTTACAGAATGC:1 - chr2R 17644881 3' - mdg3 5287 2 69.31 TAAGCATGTAATATGTATGTATATTATATGTATATTATATGTAATCTAAAGATTACATTCGATTTCCTTTCCAGTTGAAACTGAAACCCAATCGTTTTAGT:1 - chrX 17166632 3' + Dm88 4370 2 70.30 GCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATGATGCTTGAAAGATAAATTCTGGCAAAGCTCTTGTTAACTGCCGCTGTCAA:1 + chrX 4984971 3' - F-element 349 1 54.46 CCGAGTGTTTATCGGGTGGNCGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAA:1 - chr3R 19449442 3' + hobo 2907 1 52.48 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACGAAGATACATCCATC:1 - chr2R 15788546 3' - Transpac 4922 2 77.23 TGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTTTCCAGTGCTCGGTAGCATTCTTTTCAGCTAAGCCCCACGCACTCCCCTAGCCAACAAAT:1 + chr2L 11712910 3' - Quasimodo 10 2 62.38 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCCTTACTCCCCGCACCATTCAATGTT:1 + chr2L 12882834 3' + hopper 1412 2 74.26 GCTAGAGGACGATATATTGNCATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGGAATGAAGGTTCCCTTACCTGA:1 + chr3R 13331466 3' - transib2 49 1 73.27 AAAATGCAGGGTGTGGCACAGATCCCACTTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATATATATGGAGATACGAGTTACGAGCTGTGTATCTGTGTGTCCTG:1 + chr3R 11322957 3' - micropia 489 1 37.62 TAGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTATACCTTCTCCCTCTTCTCTTTCCACATTTCGT:1 + chrX 728519 3' + TLD2_LTR 148 1 68.32 TATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAACTAAACACTTATCAATAGCGGCACTACTC:1 + chr3R 27928965 3' - mdg1 7087 2 71.29 CTAATTTGAGCGGCAAAACTTTTCCGATGGGCTGGTTCCCCAGAGGAAATTTATTCATATTGGAACTACAAGCATCGAAATAAGTACTATACCTTAAGTAC:1 + chrX 18524912 3' + R2-element 177 1 77.23 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTACCTATGTACACATGGGTATATATTTTGTGTAGGCCCACCTACGCAATG:1 + chr2R 10014867 3' + flea 4990 2 54.46 AAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACGTAAATAATAATCTTTCATATTTGTTATAAACCTTGCTAATTCTCATAGCTGCAGTTGGGAAATTTGGGCAAGGTACTG:1 - chrX 6125946 3' + Gypsy6A_LTR 277 1 75.25 GCACTTATTGCAAGCATACNTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTACGTAACATTTTGAGGAATTCACAAA:1 - chr3L 20520698 3' + P-element 2838 1 30.69 TAATAATTTTTATAATAATTATACATATTGCATATTTAAGTTTTTAGAATTTATTATTTTCATATTAAGGGATTTGAAATGTGCTATATTAACGCCTTTAC:1 + chr2L 18597690 3' + mdg1 45 2 50.50 GACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATAAATATTAATTACTATTTTCCAACATTAATTACCTCTTGTTG:1 + chrX 14173057 3' + 412 7511 2 58.42 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACTTATACCACAATTTTATCGAGTAAGCCGCAAAACT:1 + chrX 5475453 3' - 412 24 2 59.30 TAAATTTAATTAGGATTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTCAAGTGGTTTTCGGTTTCCTATTGATTTATGAACTTTTC:1 + chr2L 18199771 3' + Ivk 5342 1 58.42 GCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATACACTGGGCTCCATTGACATGAACGAATCCAGCTTGTTGTGATCTTGAACTTGCCC:1 - chrX 18646322 3' - Ivk 132 1 65.35 CATTATTGTAAAAAAAACANGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACGTACAACGC:1 + chrX 11025587 3' + hopper 1398 1 62.38 TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTA:1 + chrX 21668092 3' - Tabor 6854 2 64.36 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCAGACTAATTAAATTAATTGCCCCTGCGTAGCC:1 + chr2R 23780068 3' + mdg1 378 2 66.34 TTTATTTATGCAATGCAACNAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGA:1 - chr2R 17963254 3' - blood 7066 2 82.18 GTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGCATATTTAGTTATGATGAATGAAATATAGATTACTAATAAAG:1 + chr3L 20454602 3' + invader4 3051 2 62.38 TAAGTAAACAATGAGTTACNAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACA:1 + chr2L 23373495 3' + Tc1-2 1575 1 71.29 GGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAACTAAACTAAATACTAGTATTGAAAGGAGGGTAGCAGCGTAGAAAATATTGAACTTTGTCAATGGCTAGTCTGAAA:1 + chrX 1127084 3' - mdg3 5254 1 76.24 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACCCTCGTCTTCGCTCGCACTCAAATGG:1 - chr3L 20354025 3' + 412 442 2 68.32 ACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATAGTCTTCTATACTATGGCAATAAAACGTATTGGGTTATGCAAAATGGATAAATTGAATTTAATTTTGTTAATA:2 + chrX 22689633 3' - 1731 6 2 70.30 GCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGC:1 - chr3L 25232763 3' + accord2 177 2 49.50 TATTGTTGTTATGTTCGTATATACTACACCGCACGTTTAATGCCTCCACAAAAGCAGAGGGAAAAATAATACTTAAATAAGGAGGAACAAAATGGCAGAAT:1 + chr3L 3650134 3' - mdg1 7 2 72.28 ACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCATCCGTAGTTTTCGTTTCCGGTTCCGACTGGT:1 - chr3L 10474123 3' - copia 15 2 64.36 CTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATTATTAGGTATTCGATACTTAATTGCAAAATTCTTGCAATTCTGAAAGA:1 - chr2L 20118377 3' + copia 228 1 57.43 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTATTACTGGTTGGCCAAGTGCGTATCCATGTGATTTGC:1 + chr3R 20956451 3' - 1360 48 1 70.30 TCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATGAATTTGTATTCAACATTTTGATAAATGTCCTAACATTGGGACGC:2 + chr2L 14793562 3' + Stalker2 7621 2 52.48 AGACTAACAATAATTATTCAAATCTTATTATGTTATTGTTATTTTTATAATTTTGTGAATTGTTTCAGCAAACGTGAAGGCTCACTGTAGTCACAAGTATC:1 - chr2L 16918495 3' - Doc2-element 4719 1 71.29 CACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTAAGTCAATTTCGCATCATGACATTGGAAACAAATATAGGAGATCTATTTAATTCTTTATTTTGTG:1 + chr3R 22869472 3' - Bari1 11 1 67.33 AATAATAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTTTCGCAATCAGCCATTTCCTCCAGTGCTGTCAATTCATAAA:1 - chrX 8334273 3' + flea 254 2 74.73 TTAAAAGAACCGCAAGAGAGCAGTCAGAAATTTTAGATTTTGCGTGGGAGAGCGAAAAAGTGGGACCATTGAGCATCACAATTTGCTGATTGCTCGAGTTT:1 + chr3R 13440066 3' - Cr1a 352 1 60.40 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAATAGCCGGCAGCTGCCGCCTTTGGCCCTGGCTATGACGAATGAATCAAATGTCAGGAGCAG:1 - chr2R 24282982 3' + 412 443 2 63.16 CTTCTGTGAACACGTCCACTCAATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGCGGAGCTGTGGCTCTGGGAGAAAGGCAAACAGAAGTGATGTAAAAATATGCGT:1 + chr3R 12199836 3' - jockey 30 1 54.46 CAAATATCTCTAATAGTTTAGAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTATTAAGTCCATATTTTTGAGCTGCTGACTT:1 - chrX 21254724 3' - hopper 46 1 93.07 GCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTTTTCATACGGCTGCAATTTTAATA:1 + chr2L 23350498 3' - F-element 29 1 66.18 CCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTGTTGGTTATTTTTGCTAGCTAAAATTGTGTGCTCTTGCGCTTGTTCGATTTACTGTTGAGTTGAATGGCATGTCAG:1 + chrX 17966528 3' - 3S18 6087 2 77.23 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGCGTGCGTGTGTGCCAGTGTTTGTTTGTTTG:2 + chr3R 24767874 3' - P-element 19 1 60.40 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGACCACCCGCTCCCATTCGTGCCCATTCCCAAGTTGCCAGCGCCCATTGCCTCCCCACCTTCGAGAAC:1 + chr3R 6961157 3' + 412 486 2 69.00 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATTCACTACTCACTAAAAAGTGG:1 - chrX 8316337 3' + hobo 2891 1 80.85 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAG:1 + chr3R 7869169 3' + 297 6935 2 77.78 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTGATAATTGCA:1 + chr3R 22494163 3' + 297 6929 2 75.25 GATTTTCAATCAAAATAAAAAAATTAGTAACAGATCTAATGGATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAACCGAAAGAATAGCCAAAAACTCAG:1 + chr2L 6752329 3' - Tc1 1532 1 75.25 TAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCTGGTACATTCGGTAAAATCTGAAAAAAA:1 + chr3L 12991576 3' + flea 373 1 75.25 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACACCTTGTGACCAACCCACATCCTTCTGCCCCAGCCCTCCATCGCCTTCTTGGCTCCACCA:1 - chr2L 9311891 3' + mdg1 401 2 40.59 TATTTTTTGTTTTTTTTAATTTAAGCAATTTCTGTTAGTGCAAACTAATGAATGACTGGAAAATTGTGTGCTTGTATCAACTGAAGGGCTTACCTTCAAA:1 + chr2R 14690119 3' - Doc 4699 1 53.00 TTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGATTGCGTGATTGTGACAGGGGGTTCGGGTGGGGGGGGTTGGTTTACCTTACAAAATGAATAAAATAAATTAAAACTTCA:1 + chrX 10242462 3' - R2-element 3585 4 75.25 GAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTATTATAAT:1 + chrX 8727915 3' - X-element 47 1 63.37 GTGAAATTGTATTAGAATANTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGTTCCACTGTGCCGTGGGTTTTGGCAGCATCGCATCGCTCGAGTTGCAGCTGC:1 + chr2R 16160834 3' + mdg3 224 2 55.00 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCGTGGGCACTACCTCCTTTGGGCATTAAATTTGTATAGCATATTTCTAGGCGCACGTTGGTTTTAGTTCACGTTGTT:1 + chr3R 22238770 3' + hobo 2937 1 77.23 CTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTAATTTGCTTGGGCATACAGGGCATCACCAACCTCATCACTTCACACACTCATTCTATTTTCACTATTGGCTATTTAT:1 - chr3R 7512416 3' + diver 88 2 77.23 TTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACATCGTTTAAGTATATATAATTAAAGATTAAATCG:1 + chr2L 20683609 3' - I-element 107 1 66.34 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTGATTATGATATTTTTTAATGGAAGGCTG:1 + chr2L 17245055 3' - copia 47 2 72.28 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTCAGGGTATTTTGCGATTCTTTACAGTTGGCTGGCTT:1 - chrX 17883628 3' + pogo 2066 1 61.39 GGCGACTGCACCGTGTCGGGACAAAACTTTGCAGTAGCCCCTCTTGAATGGCGCGTATTTTAAAAAACGATCGGAAAAAAGGCAATATTTTTGTTTAAATG:1 + chr3R 3268039 3' - mariner2 109 1 67.33 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAAAACTTAAGGAAATGACCCAGAGATATGAAACAGAG:1 - chrX 983295 3' + Juan 4203 1 61.39 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCCATCCCACGCACATGCAACAAGAAATGGCAAAAGTTTTCGATACGCCCCCGTACTACTTGGCA:1 - chr2L 10625652 3' + roo 397 1 68.32 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCAAACGCCGCGTTTACCGGTAAGATGTGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAATAATTGGCAACATTTGCGC:1 - chr3L 6658132 3' + hopper 1413 2 72.28 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGAAAAGTTGAAATGT:1 - chr2L 12882755 3' - hopper 51 1 72.28 TTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAGGTGTGTGTGTGGGAACATAAAGAAATACGCGGTACTACTGGTAAGTTGTCTAATGGC:1 - chrX 9205493 3' + diver 206 1 58.42 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGATTGAGTTGATAGGCCATAGGAAATTATTTGTTATTCTCTT:1 + chr3L 12112399 3' + 1360 3355 1 61.39 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTCCTTCGACTACTTGTGGCTCTTCGAGGTCCCTGCAACG:1 - chr2L 8622737 3' - 297 8 2 72.28 TCGGGGAACTCGACTATAGCATTCAGTGAGTTGTTTTCTGTTGTATTGTATTGTACGAGTATTTAATTTAAAATAA:1 - chr3R 27929674 3' + INE-1 569 1 60.53 CAGAATGCTAAAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATATATAGGGCCACTAAAAGAAATCAAATAAATTCAATTACCTCCACGCAATATAGCGATCATAGCTC:1 + chr3L 23959871 3' - INE-1 573 1 71.29 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGTCTCATTGTCAATGTCGCCTTAAATTATGCCACAAAAAATGGGGCTGGGTGGCGGAAAATAAGCGAGGCTACCA:1 + chr3L 6023381 3' + hopper 1414 2 78.22 TTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATTATTGTTTGCCACATTGCGTTATACATATATTGAATTATGAATTTATAGGATCAATCTGTATGATGT:1 - chr2R 2261533 3' - INE-1 530 1 67.33 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTTTTAACGAGC:1 - chr3R 10741069 3' + 1360 3383 2 72.28 TTAAACATAATTATTAAAGATGCGTTCGCTTCGAGAGTGATTCCTTTCGGATTTGTGCAGTATTTGAAATTCTTTACCTTCCTTAGCCGATGCGACTTCTT:1 + chrX 14954649 3' + Cr1a 106 1 62.38 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACGAAACCAAAGCAAACCAAACCGAGCCAAACGAAACGTTGGAAAAACTTTTGGCGCCCCGGCA:1 + chr3L 17186894 3' - Tirant 12 2 69.00 TGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGAGGTATTCGTATTAATAGGTTGGTTCCATATCACAGCAAACCTTGCCGGAGGGGGAGCACTTGAATTATCGCACCG:1 + chr3R 27706374 3' - I-element 4879 1 61.39 CGGCCGGACCTATTTGTTGCAAGTGGCGCGCATCCAGCGCATGCAACATAGCTCCAGCCCAAGTAAAACAACAAGGATAAACAAGGAAAGTCCGAGGGCGG:1 + chrX 7588463 3' + HeT-A 5624 1 69.31 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTATTTCAGGGAAAATACAGTCACTTAACTTAGTTGACTTTAATCACAAG:1 + chr3R 31190850 3' - pogo 23 1 55.45 TGCAGATATCTTGCCGATGNAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCG:1 + chr2L 17730509 3' - pogo 34 1 61.39 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAGAGGTGGATGAGCGGGAAAATTGATATGCCGAGTGCGACAGT:1 + chr2R 19061309 3' - roo 8677 2 66.34 AAGTAACTATATTAAATATTACCATATTAATATTAAGCTAGGTATTAAGTGTATATTACTCCACCCAGTACGAAGATATATCTGAGTCAGTTCGGTTCTAC:1 + chr3R 16116264 3' - Cr1a 4307 1 66.34 TTACTGGGTTGCGGAGATTCACGTGGGGTTTGACGGGGTTGGAATGGAAATAGCTTATAAAAATTTATAATCTCCATATTGTTCATTCTTTAGGATTT:1 - chr3R 4531941 3' - G2 137 1 59.18 AAAATAACTTCATTTCTTTNCGTTATTTTAAAAAAGAGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAGTTAGTTGCTGTTTCGGTTTCGAT:1 - chr2R 12237508 3' + blood 6968 1 75.25 TACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACCCTTTGATATTAGTCACACATTTCAGTCGCTTCGTCTTATAACTCGGTC:1 + chr3L 7939613 3' + Stalker4 277 4 60.40 CTCTCGCGTGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATTATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTGTTCTACTGAAAAGGGTGTCAATTGCCAGTAAAACT:1 + chr3L 22607489 3' - Tc1-2 110 1 74.26 AAAGCATTAGCAAGTATAATGCATTAAGAGACTGTGAGACTGCTTAAGAGAGCATTTTGCGAATCATGTAGTTGAGGATTCCACCATTCTTGTAGTAGGTG:1 + chr3R 10408801 3' + Dm88 494 1 60.40 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCACCACACACAAACACACGCACACATAAGCAACCACTCAGTTACCAACACTTTG:1 - chr2R 23671767 3' + hobo 2915 1 61.39 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACGTTGCCTACTTCC:2 - chr3L 20049611 3' - jockey 4779 1 59.41 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTCTGCGCCAAAAAGAAGCATTTGCAAGGGCAATTCTTAGGTTC:1 - chr2R 8682334 3' - pogo 29 1 58.42 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATTTTTGAGCCTTTGAGCAATTGTTCGTTCGTTACGAGCGTTTTTT:1 - chr3L 5710238 3' + Transpac 282 2 56.44 GTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGAATCCTAAAACATATGATGTATTTTTGTGCTTTGAAATAAATACCTTTTGT:1 - chr2R 17877549 3' - Tirant 329 2 55.45 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCT:1 - chr3L 6023301 3' + hopper 1362 1 75.25 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAGTATGTTTCTTGGTTTTTAATTACAACAAATTCGACTTGTTATGCCAAAAAGTTAGCA:1 + chr3R 26597417 3' - mdg3 22 2 59.41 AAATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTGGCTGAGATCAAACTTCGTCTTGTTAATG:1 - chr3L 3596645 3' + copia 253 1 74.26 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCACAGCGGGCCCGAAGATAAGCCGTTGAAGCTTAAATTTATGCTAATTTGCGGCTAATATCCCCGGGG:1 - 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chr2R 10372110 3' - mdg3 30 2 53.47 CCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGATAAAAGAAAATTAGGCTGTATATTATCAGGACACTAGCGATTCGAGTCGCGATTCTCTGCCTATCCGATGTTTT:1 + chrX 21585889 3' + mariner2 858 1 86.14 GAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTTTCTTGAGCAGCTCTTCCTTCTCCTTGAG:1 - chrX 11831332 3' - hobo 494 1 71.29 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTCAGCTGCTCTGCTCGCCTTTGAAGTTTCATTTTTTCATTTTGCTACCAGCCCACGA:1 - chrX 22789306 3' + Tabor 7308 2 59.18 ACCACCTTATGTTATTTCANCATGATCCACGTCGTAAAGTGCGTCTCTCTCTTGCACTCTCTCTCTCTCTCTGTGTTAGAGCTCCATCTCCCTCTCCCCAC:1 + chr2R 15349588 3' + P-element 2884 2 76.24 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAA:1 - chr3R 10110429 3' - Doc 40 1 61.39 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGAATGAGGCACAGAGAAATAATAAATAAACTA:1 - chr3L 13374678 3' + Transpac 5213 2 63.00 GATGGAAGGCAAGGAAACCTGTTCTGGCGGGTGCACGCTTTAGAATACGGCTCTTTGAGGAGGTGTGTGTAAACGTTGCCAGGTTGCTGGGAAATCGC:1 - chrX 5569891 3' - Gypsy12A_LTR 2236 1 55.10 AATAATCTTAATAATATTAATAATGATCAATGAATCAAACAGTAAGCATTTACATAACATAACACACATACATTTTTTACAGTGCACAAAGCGCAGAATCT:2 + chr2L 3845163 3' + mdg1 37 2 59.41 CTTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTC:2 + chr2L 12882807 3' + hopper 1385 1 51.49 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAAGTTTTATGGAGTTTTTCTCGCTG:1 - chr3R 12063733 3' + 412 7521 2 54.46 ACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTAAATTATTTTTGATCATGAGTACGAGTATATCGAGGCAATTCAATTATATTTTTGCAATAATTTTCAATACAC:1 - chr3R 22877212 3' + 1360 230 1 57.43 AAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAGCTTTGACAATCAGGACGAATGCAATAACCAC:1 + chr3L 3757438 3' + roo 9067 1 75.25 TATATATACGCTGCTCTTCTGCCGAAGCCGCCAACGGCGCTGTGGCGCAGATCGAGGATGATGCCGAAAGTGATTCTGACGCCCTCAATTTTTTAGGGGAA:1 - chr3R 2687494 3' + blood 195 2 80.20 TATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAATGGACAACCGACGCCTGGAAGTAGGCTGCAATAAGCC:1 + chr2L 17998323 3' + BS 5055 1 60.40 TTACTCAACTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTGCGAAGGATGCTGTGAGAAAGATTTTTGCAATTTATTTAAGTCACGTGCCATATTCTCTGCCACCTC:1 + chrX 20348611 3' - INE-1 533 1 67.33 CAATTACTTATTTTTATTATTTTTAAACAAGTCTGTCTGAGAAAATGATAAGTTTTCATATCCCGAAGAATATCGAATTTTCAAATCTACATTTTAATCGA:1 + chr3L 18625846 3' + Porto1 4633 1 73.27 TAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGTTTGGGCGTTCGTCCAGCTCCCATTCCCGCACTGGCTGTG:1 + chr3R 8365517 3' + R1A1-element 5035 1 58.42 CTACTAGATAACACCAGCAACCGAAGGCGCCTAAGAAGATTTAGCACGTGGCTAGACTACCTGAAAAGTCAAAAAGAAAACCTTTATTAGTAATCTATATT:1 - chr3L 20454604 3' + G3 4424 1 63.37 AGTTTTGGGCTTACGCGAANCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTAATATATAATTTTGAAGTAGTGC:1 - chr3R 18790096 3' - I-element 54 1 83.17 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTGATCGATTAGGAACTAGGTTAAGAGAAATTTGA:1 - chrX 19334574 3' - roo 21 2 59.41 ATCGACAATCAGTCATCGANGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGAGTCGAGAGAGAAAAATGTGTGTCATTAATGTGGCCATTGCCTATGATATACCTCCA:1 + chr3R 10107642 3' + flea 4842 2 63.37 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCACGAGAACACCACGGCTCAGGGCGACGACATAACCTACGGCCTGGAATTGGAGCGCAACAAGCTGAA:1 + chr2R 18161696 3' + P-element 2819 1 68.32 GTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTTCAATGCCTCGACTCTGAATTTCACTTTGATTAATTGTGGGAGCCAAGAGTTCCCACTGCGCAAG:1 + chr3R 18076474 3' - hopper 975 2 72.28 CACAACACGCACACATATACGCGTTCTCATAGCTTTCTTTTCCTCTTTTTATGTTTTTGATGATATTCCACGTTTGACAGCACTGATAACGGGCTGCGTTT:1 - chr3L 10638133 3' + 1360 3215 1 74.26 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGTGATGTTAAGATACAATATTATGATGTACGGATTCTTCACTTATTGAATAATCAGACTCATCATGTTCT:1 - chr3R 4575409 3' + 1360 3381 2 71.29 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGAATACTATTGCAGCGTTGACACAATTGCTGCCATATCCGGCCGCTTAATGGCGCTTTTCTCGATGGTTGCG:1 - chr3L 8268121 3' - hobo 4 1 75.25 TGTTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTGGCTGAGATCAAACTT:1 - chr3L 3596658 3' + copia 241 1 62.00 TATGGCCGTTACACATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTGTTACTTTGCAGCGTTTTCTAAATTTATATTGAAAATTATATCTTACTGACAGTAAAGAAAC:1 + chr2R 3942440 3' + 1360 3373 1 65.35 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACTGTCATTGTGCATAAAATTCCGATA:1 + chr2R 17459211 3' - Transpac 4964 2 74.26 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTAATTACGTAATAAGGAACCTTTTTATTCATTCCATA:1 - chr3L 6033533 3' - 412 7085 2 61.70 TTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGCATATTATTTATACTCTTATACTTGAGTCCTATTCGAGTGCCCCGTGCAGTATGCTTTTTT:1 - chrX 1706023 3' - Juan 4064 1 51.49 TCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTTTTTATTTTTCTCCGTTTGTGATGTCTATTTTT:1 - chr3L 14449927 3' - F-element 381 1 63.37 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCGAGATCATCAAGACAGAGGATGGCTAC:1 - chr2R 11259584 3' + hobo 2888 1 72.28 TATATTCTTGATCAGGATCACTTGCATACCAAATAATAGCACTATATAACATTTTTTTTACACCAGAAATATAATGCTATTTTTGTAACTTACTTTTTAA:1 + chr2R 6234447 3' + INE-1 83 1 70.00 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGAAATGTTGATAAAAATGTGCACTGCCACTTGCAGCGTGTTGCGAGATTGT:1 - chr2L 17677700 3' + Tirant 375 2 55.45 TGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTATAATAGCATTTAATATGTGTAGT:1 - chr3L 15535530 3' + invader4 2686 1 76.00 CCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACACTTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAAGTTGGCACGTCGTCGTCATCGT:1 - chr3L 22802219 3' + I-element 195 1 77.00 GTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAG:2 + chr3R 10736112 3' - McClintock 33 2 65.35 TCGGGGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGCGCAACGGTATTCATTACCATGCTTTAGTTTTGAGAAT:1 - chrX 21254565 3' + invader3 206 2 68.32 ATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTTTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATTTCTTTTCTACTATCAGAGCTATCTTTAAGATTTTTAACT:1 - chr2R 14997849 3' + McClintock 447 2 58.42 GTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATTACCCCTTTCTCTCAGTGTACGGCTAAAATTTCCAGGCTTGTGTATTGA:1 - chr3R 22869350 3' + Bari1 1703 1 73.27 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGAACTGCAGCTTTAGCAGGCAAGTCTGCTACTGGCACATTTAATGGATATTGTTTAAAAATGTAA:1 - chr2R 21962602 3' + 297 389 2 70.30 CCTTCACCTTGTGTTTCCACGGTATATCCTAATTGATATTATAGGATCGCATTCGGGGTTGGAGATTTTTTAGGGGTTTATTGCGGCGTTTGCTTTGCTCC:1 + chr3L 8952591 3' - Osvaldo 1285 1 57.43 TGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACCATCGTAGATGTGCGATGGCGTGTCTCCAGGATGTGGATGTCACTCCCCTATCAATTTATTGATTTAGAGCTCCAGT:1 + chr3L 18190281 3' - S-element 5 2 77.23 ACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTCATACAAACAATTTTCTAGAT:1 + chr4 264755 3' + 297 5 2 79.21 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGTGTGGGTACACATACTTTTTGCAAACCAGCTGTATCTTCATCCCTTCAGCCGGCTAATCTTGC:1 + chrX 15287943 3' - hobo 15 1 60.40 AGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAAATAGGTTGCTTTGGGCCCACCGAATATCCGTCTCCGAATCCTGCTACTCCTAGGGGGCCCAAA:1 + chr2R 22437697 3' + Doc 254 1 52.69 TCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATA:1 - chrX 13146936 3' + roo 354 2 76.24 AAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAGGGGCTTGGCTTTGGCTTCAGCTCATGCACACTGGACACTTG:1 + chr2R 15788671 3' + Transpac 304 2 73.27 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAATCACAATTTAATTAGTTGC:1 - chr3L 9928517 3' + roo 394 1 61.39 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTATAAGCTTAATTCAATGTGGTATGGCATAAAAAGATACTTATCACTTAA:1 + chr3R 16735107 3' - I-element 28 1 51.49 AAGTCAAATAATAAAAAAAAATAAAAAAATCAAACTCCCATTGCCCATATAACACTGTTTACACTGTTTATGCTGTTTACACTTTGGTTTAAGAATAGCAA:1 - chr2L 10144358 3' + Rt1b 5143 1 73.27 TCCAGCAGAAGGCTAAATATCTAAAGCAACACATCCAAATCGATTGACCAAATCACTTATAGAAGTGAATAACAAAGACAGCGATTTGGGTGGCAATGGTT:1 + chr3L 16492188 3' + Doc4-element 2765 1 74.26 GTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTATGTATGTCACT:1 + chrX 18326245 3' - Doc 210 1 50.00 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAATGGTAATTAGAACTAATTATTTAACTGAAATTGTATTTCGA:1 + chr3L 21519044 3' + 1360 3356 1 60.40 GTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAA:1 - chr2R 18188330 3' - Juan 4076 1 74.26 TTATGTTATTAATTATTTACTCAAGTGATTTTATACGAAGCTTGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAGGTAAA:1 - chr2L 21400731 3' - Doc3-element 64 1 65.35 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAGATTGTTTTCAGCAAATGCA:1 + chrX 15800941 3' - roo 54 2 82.18 GCTGTTCATCGCAAAAGAAGATGGCGTGCGACTTGGCATAACACCCTGCCCACCGATAAAACGACAGGATAAGACACACACACACACACACGCATACTAGC:1 + chr3L 6945425 3' + Rt1a 4854 1 60.40 TAAAAAAAAAAATAAACAAGGACTTATTAATATAAATT:1 - chr3R 16387840 3' + transib2 2640 1 92.11 TTTTTTCTGTTTCTTTTTTTTTTCAGCGCATAAATGATAGATTCATTGAGGGGAGAGAGGC:1 - chrX 12296414 3' - Doc2-element 235 3 65.57 TAAACACACACACACACACACACGCACACGCACACACTCACATGCGGCGGTAATGTGCTCGTGCTTTGAGGTTAGACCTCCGCGCCCACTCCTCGATGCCC:1 + chrX 8436477 3' + accord 182 2 52.48 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATGGAAAAGTTTTAAGGCAGGAGAAAAACAGGGAGGAGGAGGGGTTATGTACCATCCTTGCCAGATTGACAT:1 + chr3R 8765636 3' - 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flea 32 2 60.40 GTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTTCGTTTCCCTCGTTCCCTTTTCCCTTTTATTTTAAC:1 - chr3L 17291511 3' + copia 4904 2 64.36 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAATCACAATTT:2 - chr3L 9928527 3' + roo 9047 1 51.49 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGAGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACAC:1 - chr2R 15788594 3' - Transpac 4970 2 69.31 GCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCAATTTACAAATGATTTCAAAAGTTAATGGTTTTTAG:1 + chr3L 18752956 3' - G-element 8 1 39.60 GGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAATGAATAAACCATTAGCTATTT:1 - chrX 13824965 3' - I-element 4956 1 77.55 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTAGCTCTGTTCTCCGAAGAGAGAGAGTGAACGAAGAGAGCGCAGGAAGAGAGTTCCAGGAA:1 + chr2R 18171595 3' - P-element 16 1 60.40 ATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCTGCCATCGTTGTGCATATTTGTTGCAGCAACAA:1 - chr2R 17629357 3' + 1360 395 1 55.56 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAG:1 - chr2R 12473057 3' - Doc 35 1 59.00 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGCGTGTGTTTGGTCTTCATCTTAGCTCGGCACAGGGTTGCTCTTTTGCT:1 - chrX 14651078 3' + P-element 2859 1 51.49 ACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAATCAATAAAGAGATTTAAAATTTACAAGTACTCGTGTGTGCACAGCAAACACATATTATGTACATACATATATAC:1 + chr3L 20317906 3' - 3S18 5767 2 77.23 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGTACATACTACAATGCATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCGATTAGATATG:1 - chr3R 11052107 3' - blood 32 2 63.83 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCA:1 + chr2L 18655193 3' - Doc 53 1 69.31 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTATTATAGAAC:1 - chr2R 12473042 3' - Doc 21 1 54.46 GAGTGTTTATCGGGTGGACNTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATTTCTATATGTTTCTCTAAATTTTTGTTGAGGTTTCTCCGATTGCG:1 - chr2L 16426427 3' + hobo 2909 1 58.00 GGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATGAATTTGTATTCAACATTTTGATAAATGTCCTAA:1 + chr2L 14793551 3' + Stalker2 362 2 63.37 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGTGCTGAAAATTACTTTCGACTTTGTCGGCCAAACGCGATTTATTTTGATTAATTCGCCGCTCCTTTT:1 - chr2R 8526312 3' - I-element 11 1 71.29 AAAATATTATAAAATAAAGAAAGTGGAAGCCTCGGTTCCATGAGTACCTACGATTATCTTCGCAAACACGCCGGCAATTATCGCTTCTTGGTGTGCCCGAT:1 - chr3R 20766218 3' + TAHRE 28 1 69.31 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCGATTAGATAT:1 - chr3R 11052108 3' - blood 7051 2 69.31 TTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATATTTGTCTGTGTGTTGGTGAGAAGCCAGCTGCCACTCAGCGATCAAATTCTCGAGTATCCTAGTTTTATACTCT:1 - chr3L 5241087 3' + Ivk 5376 1 72.28 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTTGAATTGCGACCAGAGATTTGAGATTTGAGCGTGTG:1 - chr2L 10898400 3' - jockey 4709 1 62.38 GGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCCACCAACACATATCGCACATATCAAGACCTAGGCATGAACACTTCATAGACAATAAATCAATTACCATAACGCA:1 - chr2L 18201161 3' + Ivk 4948 1 73.27 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGGAATAATTAATGTAATCAAGCGACGTGCCCTGAGTTTACTCGTAACT:1 - chr3R 17660474 3' - roo 8692 2 57.43 ACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAAGGAAATTAGAAAATAAATAATTATATGTCGCACGCTGTATTTTTACATTTCTAAAATGCCTTTGAATGAAAT:1 + chr2R 7395222 3' - mariner2 31 1 61.39 CGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATTCTGACATTGCCGCATATAAAAATATTGTTTGTTTTCGTTTTGTAATTAAAATTAT:1 - chr3L 11231130 3' - Porto1 4527 1 53.47 GAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTCGCGACGCATTCAACGCTCGCGGAAGGTGTTGTGCCCCACCAGTGTAGTGGTCCTCAAACGCAGCCGC:1 - chr3R 1922114 3' - diver2 312 2 71.29 CCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCAAAAGCTGCACGGGAAGAGAGCGGGAGCGCAAGAGAGTGAGTGCCCGCCATGTG:1 + chr3R 11604879 3' + F-element 326 1 60.40 TAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATGAGAAACAATTTAAACATTGGTTTGCCAGAGGCACGTATTCAGGTTTGTCTTTCAGTTTTG:1 + chr4 998702 3' - INE-1 503 1 59.41 ATCATACTGAATCTCTATTNCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTG:1 - chrX 734922 3' + Tabor 440 2 65.35 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGNGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGCGCTTAATCTGCTGTTGCCATTTTTCAT:1 + chr2L 12808254 3' - Tirant 10 2 70.30 TTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCCTCCGGTGGCCAGCTTTTGGGT:1 - chr2L 17994138 3' + roo 380 2 53.47 TAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGCATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGC:1 - chr2R 15788574 3' - Transpac 21 2 54.95 ATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAAAGAGGCAGCAGGCAACGAAAGCTTGGCTCCGTAATCAGAAAAACGTAAAAATTTC:1 + chr3L 7308854 3' + hobo 2662 1 60.40 AAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAACTTTATGGCTATGGAGAAACTGAGATCACTCGAACGGGCTTGAATGGTTTCAGCCTTTGTCCTGGCTTTTTCCCACAA:1 + chr2R 10130658 3' + F-element 4675 1 73.27 GGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATTTCTATATGTTTCTCTTAATTTTTGTTGAGGTTTCTCCGATTGCGCTTGTATATTTCT:1 - chr2L 16426414 3' + hobo 2930 1 64.13 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGT:1 + chr2R 672815 3' - F-element 60 1 75.25 ATTCCGTTATTTCCCCTTTTGCGCACAGCCCTTTCGGGTTGACAGTCCAACTAATTAGACTACTTCGCTTTATTTATTACGCATTTCCTAGCATT:1 + chr3L 14117707 3' - gypsy8 312 1 52.63 ATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATT:1 + chrX 8727907 3' - X-element 55 1 71.29 GAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATGTGTGAGTGAGTCGGGTCAAATAAATGACAGCCCATAAGG:1 - chr2R 21433142 3' - HMS-Beagle2 6914 2 56.44 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAATATCCAATAATTAAGCACTTCCGCAGG:1 + chr3L 12241868 3' - roo 48 2 77.23 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGTATGTAGCATATCCCCTTCCGTTTTTTGGTTTCGTGGT:1 - chr2R 19102158 3' - opus 145 4 69.31 CTTGTTAAAGACGAAATAAAGTCAACTCGCCAGCCACAGCAACCACAACCACTTTAGTACCAGCTCTCCACAACGCCAATAGCATCACCAACGACAACCAA:1 + chr3L 27361291 3' + G3 4343 1 79.21 ATATTATGGGATCCGAATTATCCATTGCTCTGTAAATTTTCTTTCTTTACGCTTAATTTCATAGAAACCGTCTGAATGAAATGTGGCAAAGGTGCAGCGAA:1 - chr3L 11393212 3' + hopper 353 2 62.38 GACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTA:1 + chr2L 15531846 3' - Doc2-element 460 1 68.92 CAAACTTAAAAAAAAAAACACTTTTTAATTCAGCTCATGATCAAGTACAATTTCCATTTGATCAAACCATTTGATCAAACCACTGAATAGATTTCTTCTTC:1 + chr3R 15952900 3' + gypsy2 428 1 73.27 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCA:1 - chrX 4277480 3' + roo 9022 2 76.24 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATGGAAAAGTTTTAAGGCAGGAGAAAAACAGGGAGGAGGAGGGGTTATGTACCATCCTTGCCA:1 + chr3R 8765627 3' - 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chr3R 15924595 3' + Quasimodo 7341 2 59.79 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAGTCCGCTTAACGATCGAATTAACATCAAACGCGC:1 - chr2R 21351023 3' - opus 7038 4 66.00 ACAACAAAACGGCACGGAAAAGCAAAACAGTTGTACAAATCCAAAAGAACAAAACAAGGAAAGAATTGGGACGATCGAGAAAGGAAACTTTTTAAAACAAG:1 - chr2R 4987295 3' + Bica 390 2 65.35 AAGTGATTTTGTAAATGTTTGGGCATTTCTGCATTCTTGTGGCGGCTTGGCATCGGCAGGGG:1 - chr2R 5750777 3' - I-element 199 1 59.68 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGAAATTGAATTTATCACATGTTATGCGTTTGCACATGTA:1 - chr2R 17420832 3' + pogo 2068 1 61.62 TTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAATT:1 - chr2L 23390364 3' - gypsy6 7460 2 70.83 AAAAATTAAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATTGAATCGAGGGC:1 + chrX 8958633 3' + Doc 4697 1 74.26 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATT:1 - chrX 21217519 3' + pogo 2053 1 73.27 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAATTATAAATTATATAAATTGAGCAAGGCCATGCGTAAATGGTTCAATG:1 + chr3R 27130663 3' + copia 202 2 63.00 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGGTTTTTTGGCTCTCGGTTGTGTGGATAT:1 + chr2L 4063778 3' - roo 11 2 68.00 ATTATGCCTTCCTCATAATTCACTTATACAAAAGAACGACCGCGGTGGTCCGCCGTATAGGCATCCACACTGGCCGCCAATC:1 - chr2R 17857184 3' + Tom1 10 1 70.73 TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCATTTTTTTTTCTCTATTTCGGCAAACGTTTGCATGTGCAGTGAAGCGTAGATCT:1 + chr3R 11050805 3' - blood 7033 2 54.46 CTCCAAACACTTGCGAAATTTCTTTACGCTTACCTACGGTGACTAGTACTGTGACAACAACAACCACTGCAACTGCATTTATGCAAATATTAATATAGATA:1 + chr3L 4842571 3' + Doc2-element 496 1 76.24 TATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTATCTTCTCCAATGTTGTTCTAGATTATGTTCTCATTTA:1 + chr2L 21086830 3' - 17.6 80 2 63.37 AAGTTACGTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAA:1 + chr3R 9224395 3' + pogo 2063 1 70.53 TATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAAT:1 - chr2L 14793504 3' - Stalker2 37 2 65.59 CTTGTCTGGAAATATTTTGACTATTTGGAGACAATTTGGTTACCTTATGCGTAAATATATTTAGCTGTTTTTCCAGATTTTCCAACTTTGGCATGTGGCAC:1 - chr2R 14659518 3' - Transib5 83 1 69.31 AACATCATCAATCATCATCAATTGTACATCAATCAAAATCAATTTGATCTACACGATCTTTCCTACTCTTCAATAAATAATCTCTAAATTTCGTTTGGCAA:1 - chr2L 9426134 3' + gypsy7 327 1 74.26 CAGTTGCGAGGCCCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTTCTTCATATTTCTCAACTGGTTTCACACAGTCGCTTTTGCAGGCTTACTT:1 - chr4 519728 3' + diver2 84 2 58.42 CACAGGAGACAGCCGAAGGACCTCATCATACGGTTCCCCTTGACGAGAGCCAGGACATTTAAGAGTGAATTGGAAGAGATCTTGGTAAGAAACGCACAGCA:1 + chrX 11383108 3' + BS3 1562 1 57.43 ACTCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCTCCGAATTTTCCTTATTATCGATAATATTCCGGATTCATATAGACGTGAAGTATAATGATTATGACGTGCTAGAA:1 - chr2R 5182968 3' - INE-1 538 1 74.26 ACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGTATGTAGCATATCCCCTTCCGTTTTTTGGTTTCGTGGTTTGCCAGTTTAAATGGAAATATT:1 - chr2R 19102135 3' - opus 9 2 70.30 GCAACTAACTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGAGTCCAAATCATGGGGGATGCATATCAATACATTTCCACACTCTAGACATGAAAGGGAGGCCTAAT:1 - chr3R 12823356 3' - aurora-element 4222 1 70.30 TGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGTAACTGCTACTGCATACTTTTAGGCAGACTGAAAAT:1 + chr3L 3594171 3' + copia 4864 1 63.37 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCGCTTGACGCTACAGCTATTCTTAGCATTCCTTTGGCCTACTTGGCGTATGCGTGATGTTCTCGTT:1 + chr3L 21970897 3' - pogo 9 1 70.30 TATTTGTATTTCGGCTGAGCCTCGCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAATATACAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACACAAATACGTCACTATATACATATA:2 + chr3R 2472940 3' - 297 6792 2 60.40 AGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGTTTCTTACGAATGCTATCGTTGTGATCCCTCTCTCTCTTGTTTTCTTTGAATTTAGTAAAAAAATTTAATTTTT:1 - chrX 16285421 3' + INE-1 545 1 70.30 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTA:1 - chr3R 25021683 3' + roo 9034 1 65.35 CTTTTTTAGAAAATAACAATAAGTAATTGGTTGACTAGATGTGTAATTTCTGAACAAAGGATAAAAGACTAAAGAAATCTAAATTGTTCGTTATATGTTGG:1 + chr2L 7642545 3' - Porto1 4640 1 62.38 TTTTTTTTTGTTTTAGTTTTTATTTACAGTCTGTCTTGGTAGACAATAAACAAATTTGTTACTTATTTAGTCTAAATGCTTATGAATGGGAAAGAAGAGC:1 - chr2L 14762742 3' - Doc 4696 1 58.00 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGTATGTAACTCAAGCACGTCGGTCGATCAATATTTGGCCAGCGG:1 - chr3R 7626386 3' + hobo 2906 1 58.16 GGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAAGCGCTCGACAAATTGGAACTGGCACGAGGGCT:1 - chr3R 11662139 3' - FB 43 1 69.31 TACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAACACACGAGTTTAGCAATTGCCTTGAAAG:1 - chr2L 10054439 3' + F-element 4595 1 72.92 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGCATCGAGCGCTTTTCCAGCATTTGAGC:1 + chr3R 6034030 3' + roo 390 2 63.37 GCAAAGACACTAGAATAATAATAGAATTCTAGTGTCTTTGGTTGGTGCCTATAAAAACTATCTTGAAAATGATTGTCTAAACCTTTATACAGAAATCTTTG:1 + chr2R 11728624 3' - Tc3 311 1 55.45 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATCCATTAATAGTTAATTAATAAATTGCCAAAGCCAATTACTATCGCATTTATTCAGCAACTG:1 + chrX 21060390 3' - 412 7070 2 62.38 TATTAATAAATAAAATAAAATATCCATAAATCAAGCGTTCTGATCTTTAGAAAGCATCAAAATCACCAACAGTAAGGTGAGATAACGCAAAGTGCTA:1 + chr2R 13540339 3' + G7 1146 2 69.07 CTGATTCGCGAGAAGATATAGAAGCGATATAAAAAGATAACAGGAACGAGGAAACCAAGAAAAACCGAGTCGAAAACCGAAATAAAAACGAAATGCAAGCG:1 + chr3R 10601411 3' - Cr1a 4375 1 54.46 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACTTTCGAAGATCTTATTCTTTTTGCTGTGCACCAATGTAAAAAAG:1 - chr3L 4565471 3' + copia 257 1 54.46 TGCTATTTTATTTAATTGTNCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAAGAACATTCCGGCTTTTGGCTATTCAACATTGTTTTCCATTACGGACTAGA:1 - chrX 9774980 3' - 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chr2L 4134805 3' - Quasimodo 12 2 66.34 ACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCTGGGCCCGCACACATGGCCAAGTGCTTTTGGCCGATTCTGGTTGCCTGCAATGTTTG:1 - chr2L 7172973 3' + R1A1-element 5096 1 60.40 ACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGA:1 - chr3R 23020811 3' + INE-1 581 1 59.41 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGTTTTCTAACACGGAACGAGCT:2 - chr3R 21365473 3' + P-element 2881 2 73.27 CTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCTATATGTTTTTCAAA:1 + chr3L 20224213 3' - Chimpo 39 1 66.34 TTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTACATGATACGATATCCACACTCGCGACAACGAATCGGATCCCTGGGGCGCATTTCGTTTTCATGAT:1 + chr2R 15145244 3' - F-element 69 1 71.29 GATGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGGTGGGAACCGAAGCGGTGGAAGCGATTTTGCTATCAATGAGGCGGTCTTTGAACAGGATC:1 - chr3L 21494998 3' - F-element 4486 1 64.36 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAATTACAGGTGATAAA:1 + chr2R 10956962 3' + copia 5086 2 63.37 TTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTAT:1 + chrX 22824221 3' + Gypsy12A_LTR 2246 1 49.50 ATTTGTTTATACATTAGGTGCTTATCAAGCGGTTATCTATGAGAAACGCTGAAAAAATAAGCAACGCTGCCGGTGCGCGGTGGGCGGATGAAAAATTGCGT:1 - 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chr3L 1697679 3' - Transpac 26 2 51.49 ACACACACACACACACACTGAGATAGCACTCTATGAATGCTGAATAATTTATGCATCCCAATTCCCAGGCAGCGGCATTTGGCCAGAATTGGTGACAACT:1 - chr2L 10138135 3' + accord 258 2 73.00 AATATAAATTATAAATTACAACAGTGTGGATTGGTTGGGGGGGCGGTAGAAACCTGGTCATAAAGCACGCCCTGTTGCTTTTGTTGTTTATGAGCGCCAGC:1 + chr2L 6276129 3' + copia 254 1 77.23 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACGACTTAAAGGTAGTTTGTTATAATATTTTACCCTCGGCAATGTCTTC:1 + chr2L 13186327 3' + pogo 2075 1 56.44 TAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGGGTGCGAAACCCACGCTGCGCTGCACACA:1 - chrX 9667116 3' + F-element 4621 1 59.72 TTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAATTCGAACA:1 - chr2L 19854084 3' + roo 364 1 72.28 ATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGCGAACAA:1 - chr3R 31887752 3' + HB 1564 1 75.25 AAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTTCATTAGCA:1 - chr2R 9905358 3' + mdg3 207 2 63.37 CGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCGTAGTGTCCTAGAACTTTAGTACTCTATGTCTGTA:1 + chr2L 8176460 3' - 1360 44 1 69.31 ATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTAAGTGTCTCGTTAGTAAATGGAAATAAAGATTGTCTAAGGAAAGCTTGATCAATGTTTTGCAGTTTC:1 - chr2R 9889538 3' - I-element 242 1 67.33 AAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATAAGTATATATACATATAAGCTTACCGGAAAAATGTCCGTTGTTCCATGGAGGCAAAG:1 - chrX 5475375 3' + 412 477 2 58.42 GTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACCGCCCACTCCCTGTTTTCTATTTACTCTTAGTCATTGTTTGCTGCTAAATGAATTTCCTTCTCACTCCGTTTTTT:1 + chr3R 25452647 3' - Doc 4537 1 77.23 AATGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTTAATTGACCTTGTGTGTG:1 + chr3L 9928616 3' - roo 8683 2 60.40 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCTAAACCAAATGTTTCCCCATACCAAACGTGGTGTGGGTCCCAATGGGGTCAAAGGCAA:1 + chr3L 14624004 3' - hobo 19 1 57.43 AGGCTCCACCCTCGATCACNGACTTAACTCGTGCGAAATGTTGATAAAAATGTGCACTGCCACTTGCAGCGTGTTGCGAGATTGTTGACTCGCTTTTATTT:1 - chr2L 17677684 3' + Tirant 8498 2 71.29 AACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCCATCTGCTTAAAAATGATCGCTTTA:1 - chr2R 16864428 3' - micropia 352 2 75.25 ACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATTTTGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATTTTGTAGACTCTTAATTTGGGACGATCAACTATGAAACAA:1 + chr2L 3693756 3' - mdg3 5027 1 76.24 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACACCTTGTGACCAAACCACATGCTACAACCCATCAATTAGCAGCACACAGAC:1 - chr2R 21351310 3' + mdg1 7430 2 56.44 AGAGGGAGAGCAAGAACGCGGCCTGTCGTCAGTGGGCAACTGAAAATGGAGCTTGAGAAGGAGCTCCAAAGCGCCTGGGAGCTGGGAGACGCCGCCCGCCT:1 + chr3R 6834041 3' - Doc 377 1 76.24 TGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCTGGCAGTGCATAAATATGCTAAAAATGTAAATATTTCGAGGAAAATATTGCACAA:1 - chr2R 14693778 3' - F-element 314 1 60.40 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGCATACTTTTGAG:1 - chr3L 21144036 3' - jockey 28 1 57.43 CAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTG:1 - chr3R 19589951 3' - BS 5049 1 76.24 GATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCGGCTCAAGTGGGCTTGATTCGATTGCAAGAGTTGGACAAGA:1 - chr3R 27554404 3' + Stalker 159 6 68.32 TAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCCCAGGATGCTCCTCCACTGCTGATGTTTTTTTGGCGGCGGAAGGACATTCACGTTCTGGGTGGCTGCA:1 + chr3R 12197625 3' + jockey 4735 1 73.27 GAACAAATATTCTGAGTTCTATAATTAGCTTTGCAGTTCCTTTCTACATTATTTTATTCTACAATTAAATGTAACTACATTTATGTAGTTATTTTTTTAAC:1 + chrX 10280758 3' - gypsy4 401 1 75.25 AACAAGAGAGAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCATGAGATACACGTTACTTAGCTAGTGGAAAGGCGATCGCAAAATTTCATCAGTTTTCTGGGGGAAA:1 - chr3L 22848572 3' - INE-1 580 1 74.26 CCCTGATGCAAGTGGAACTNGCGTTAACTTATATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATC:1 + chrX 23065112 3' + opus 490 2 71.29 AATATAACCATAAAAGATTCAAGGACACCCCTAGAAGCGCTCAGAATGCTGGAAAACAACGACATCTGTTGCCTAATGACAGGACCAATTGGGGTATCGCC:1 + chr3R 23002763 3' + baggins 5069 1 83.17 CTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGTTCATAGTC:1 + chr3R 25370533 3' + BS 5051 1 66.34 TATTATATTATTATTTTTGCTTCTTTTTTTTTTTGGGAAAATTTG:1 - chr3R 26046632 3' - invader3 5044 1 84.44 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGTGTGGGTACACATACTTTTTGCAAACCAGCTGTATCTTCATCCCTTC:1 + chrX 15287927 3' - hobo 31 1 61.39 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACGACTTAAAGGTAGTTTGTTATAATATTTTACCCTCGG:1 + chr2L 13186317 3' + pogo 2065 1 66.34 GATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAATGAGAACGCGAATTTTTACAATATTTTTGGGGCGTGACCGCTATTGGCGTTTTGAAAGGGTGAGCAATTCTCGTT:1 - chr3R 22021777 3' - INE-1 541 1 73.27 TATAAATTGAAAAAAAAAAATTAATTACTTTTTTATTATTTCTGAATATTTTATTTAATTGGCTGCTATTTCACAATCGAAAGGTGGACATTAGTGGGTG:1 - chr3R 21824112 3' - Tc1-2 1399 1 48.00 GAAGACGATTTTAACTTTTAATTTTTCAACTTGAAAGGCGAATTTAATAAAATTTGCGTTCTAGTTCTATTATTTTCCATTATTCCTCTCGTCGTTATATG:1 + chr3R 9826163 3' - TAHRE 161 1 46.53 TTTTTTTATTATTATTATGTACGTATGTATGGCAGGGGG:1 + chrX 12243834 3' - Rt1a 5069 1 92.31 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGCAATGCAGCCGCTAAATGTGTGCAATTCACCACTTGAGAAAACCACCACCGCCGAAGCAAAGAA:1 + chr3L 10363906 3' + P-element 2878 2 71.29 AATAATGCAGATATCTTGCNGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTT:1 + chr3R 23638169 3' - pogo 39 1 69.31 TCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACTTAAGGATGTAATTTTCTTTTCACATTCCAGCGTCGTTAACTTTTTAAATAGGATTTTTAAATATA:1 + chrX 20612661 3' - 1360 193 1 72.28 GTCGAAGAGTCATCAGGACGCTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGCTCCTTTGCTCCTCTGTTCCTCATTCTTCCCAATCCGAATCCTCGTTTGGGAC:1 - chr3R 21952629 3' - invader1 401 2 55.45 CATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAAAACTTAAGGAAATGACCCAGAGAT:1 - chrX 983306 3' + Juan 4192 1 50.50 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCGATTAGATATGAGTATTTTTTACTGGATTTCTTATTAAT:1 - chr3R 11052079 3' - blood 11 2 66.34 TTTTTTATTTTTTTGGTTAGTTTTAGCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTGTTTTTTTTTTTCGTTCCGTGGCCCCGACCGCAAGGTAAATAATTGACC:1 - chr2R 11007951 3' + Tc1 1402 1 55.45 GGTTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATGTACATATGTATATACTGTATATGGTCGGAAACGCTTTCTTCAGCCTTTTATATACCTTTCAACGAATC:1 + chr2L 21071990 3' - INE-1 92 1 82.18 ACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCAACTCCCACAAACCACCCAAATTTGCCATCTTGCCACCTGTAAGGCAACTTGAATAACCTAG:1 + chr2L 22157525 3' - F-element 4395 1 66.34 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAACCTTTTTAAAAAATGTATATAAAACATTCAACATAG:1 + chr2R 22134249 3' + opus 7466 2 68.32 TTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATTTCGTACAGAGAATTTTCGTTTTAAATATGATTGCCTTAGTATCCATATAACTGATAATTAATTGGT:1 - chr2R 19924832 3' - mdg3 5033 1 55.45 TGGAAAAATAATGCAGATANCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAAATTGATTTTAGTTATTACTACTAAC:1 - chr2L 3346271 3' - pogo 45 1 75.25 GTGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTA:1 + chr3R 1977613 3' + micropia 417 2 59.41 GTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACC:1 - chr3R 19589943 3' - BS 5041 1 68.32 AGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGCTCTGATTAGAGAGCAAAAAATAACAGGCGGCATGCTGCAGTTCCCCATGTT:1 - chr2R 13383498 3' + gypsy5 7327 2 57.43 TCTCGCTCTCCTCCCTTCCNGCAAGGTCTTCACCACTCCACTCCCACACATGACCTTAGTTTCTGAGCAGTTGGCTTTGTGTCTCGGGCTGAGCTGAGCAT:1 + chr2R 5850234 3' + Max-element 113 2 71.29 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGTGCTGAAAATTACTTTCGACTTTGTCGGCCAAACGCGATTTATTT:1 - chr2R 8526334 3' - I-element 33 1 54.46 AATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTATAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTT:1 - chr3L 20224132 3' + Chimpo 173 1 66.34 CTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTATATATATATAATTTCGAATAATTTCAAAAATCGCTCCACCCTGTACC:1 + chr3R 7783809 3' + rover 316 2 64.00 CAGGAACTATAAAAGTTAGAAGGTTAAGATTCAGAAAAGACGATTTGGCTGACCAAACAATGCAGGATTGTTTTGGTTTTAAATTCTTTCCATTGTTTAAG:1 + chrX 10615503 3' + INE-1 155 1 70.30 TTAGCTTAACCCCATCCCTTGGATACACTTTTCCTGTTTAAATCTATTCAAATTCTTGGTTAGGCCATCTTAGCGGGCCAACAAATGACTTGGTCTCGAAG:1 - chr2R 8291630 3' - Dm88 4264 1 67.33 TTCGTAGCTTGAAAGAAACNCGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAAAAAATATTAAGCAGCT:1 + chr2L 18655212 3' - Doc 34 1 49.50 TTAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAATAATGATAATGATATTTACCAAGAATGTGGTTCTT:1 + chr3L 13987257 3' + pogo 2061 1 54.46 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCCAGGTGGCTGATTCTCTAGGGGG:1 - chrX 19034094 3' + hopper 1404 2 65.66 TCCGTCTGTCCTTATGAACGTTGAGATATCAGGAACTATAAAAGATAGGTTGAGAAGCCCACAAACCACACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAATAT:1 - chr2R 12521468 3' + INE-1 126 1 45.54 ACAAATTGCTTCACAGGCGACCGTATATGTGTACACTGATACGCGCCTATGGCGGCAACCCACCCACTCGCCGCCGAGAATCAACGAACC:1 + chr3L 22051260 3' - accord2 7227 1 64.44 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGNGCAGCCTACTACACGAGAAAGGTCTTCAATCTAAACAAAGTTTTACCGGGAAAAAGATGTTCATCAATATATGGTATTTAT:1 + chr2L 3699496 3' - mdg3 12 2 69.31 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGACCGCATCCATTACTCAAATTTTATTAAACATCCAACATCAACAACGGACAACTA:1 + chr2L 126559 3' - Doc 23 1 53.54 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGGCCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCCCACCGAACAAGTGGGTTTCATTG:1 - chr2R 21040872 3' + P-element 2837 1 26.26 AGCGAGTGCCGAGAACCCTNATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTC:1 + chr2L 20328767 3' + opus 7478 2 63.41 CTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCCCGTGTTAACTTACAGGTCCCGTACTCGTTCCCGTACTAGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCGGTCCCATACT:1 + chr3L 16047626 3' - Gypsy6A_LTR 17 1 62.38 AATTAATAATAAACAATAANAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTTTCGCAATCAGCCATTTCCTCCAGTGTTGTCAATTCA:1 - chrX 8334277 3' + flea 240 2 65.35 CATTAATATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAAC:1 - chr3L 15125909 3' - Juan 3794 1 78.22 AATTTATAATTTTTTTTTCCTTAGTGAAACCTTGTGGATATTGTCCATTGCCCCTCAGGCGGTCAGACTCCCAGTGCAATTATGCTGCGGATTATCTTGGC:1 + chr3R 16838863 3' - copia 249 1 59.41 CAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATGCTACAAAATATATTGAATAATAAAAATACGT:1 + chr2R 10372182 3' + mdg3 5458 2 65.35 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGT:1 - chrX 17029990 3' + flea 232 2 50.50 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTCATGCTATCCTGCTTTCC:2 + chr3R 23543018 3' - 412 33 2 61.39 TTTTTCCTTAATTATAGTGTATACATATGTACCGTGGAGAGATTATACTATCTTACGTGTAAGAATTCATGGGAATCAGTAAAAAACCGCGAACTTATCCG:1 + chrX 2430645 3' - G5A 2744 1 73.27 GGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAATAGTGACGTATT:1 - chr3R 2472940 3' - rover 117 2 86.14 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATCAATAACAATGCGAATTACGGGGCAATAGTTGAGCGG:1 - chr3R 12767282 3' - blood 33 2 61.05 TTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAATGGACAACCGACGCCTGGAGGTAGGCTG:1 + chr2L 17998314 3' + BS 5046 1 69.31 CACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTTTTTTGACCCTTAAATATTGGAAACAACCAAGGTTTGCTTGTTCGTAATCGGTGTAACCACGCTTTTGGACT:1 - chr3L 16629265 3' - 1360 453 1 77.23 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCCTATCGCAAACTAAAGTATATTTTAG:1 + chr2L 16680076 3' + P-element 2841 1 35.64 TGGTGGTTCTCCAGTCTGCCAGCGAACTCACTCTTTAACTATTTACAATGCACTCTGAGCGAATCGAGTCCTATGTACACTATATTATCCAAGTATCAAC:1 + chr2L 1716677 3' - G2 2848 1 83.00 CAACAAAGTGCTGCCATAANTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTG:1 + chr3R 30553599 3' - 412 52 2 74.26 AATTTGCATACTTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGA:1 + chr2L 12882797 3' + hopper 1375 1 61.39 ATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATTCATTCATTTTTTTATGCATATTAGTATTACATTGATTTATTTATTTAGGTATATTACTT:1 + chr2L 23369660 3' - Idefix 13 2 66.34 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTTGTATTGTGTAATTGCC:1 + chrX 4399594 3' - I-element 25 1 56.44 AAAAATGTCGTTTCCTGGTNGAGCGTCCGGTGGACAATCGCCCCGAACTGCCGTTGGGATGTCTTGCACCTTTTGTTGGGCGCCATTGGGAATGGGTTACG:1 + chr3L 18182267 3' - mdg3 466 1 66.34 TGGATGCAAGTGCATTCGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGGTTCTTATAATTTATATTAGTATAGGTGTTCAAAAAATGAAACAGTGAGTTCTAGGCATA:1 - chr2R 577232 3' - Idefix 7158 2 53.47 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCGTAGGTCTAGGTTTCAAAATTTGTTTACTTCATAATTCATTCACTTTATTT:1 - chr2L 9695987 3' - FB 27 1 52.48 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTAGCCAGCACGCCCGTTTTAGAACTGATTTAATTGCATTTGTGCGGCGGTCATGCAATTGTTAT:1 - chr3R 8868644 3' + roo 395 1 65.35 TGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACTCAAAGCCGAGGGCATTGAAGTGCAGGAAGGTAAGTTGGAAGTAGTCTTACCTAGTCTA:1 - chr2R 16761639 3' + hobo 55 1 67.33 CACCTTATGTTATTTCATCATGATGCACACGAACTCTTAGTTTACGAACACGAAAAACAAGAACAACAAGGCTGGCCAATAGTAATTCAGTGTGACCGCGG:1 + chr3L 6964833 3' + P-element 2886 2 76.24 CAAAAAAAATAAAAAAAAACTTTAAAAATAGATCCATTTTGTTGAAAAAACTATCTACGTTAAATTATAAGTTTCAAAATAGTTCTGATACTACCAAGACC:1 + chr2R 10394115 3' + HMS-Beagle2 490 1 77.23 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGTGTAGATTTCTCTCATACCATTCTGATTTACATTATGACAAATGAAAA:1 + chr3R 15579051 3' - pogo 18 1 61.39 CAGTATATGATTTGCGATCTGAAGAATTGCCAGCCCAGTCTGCATCTACGTAGCAGTGAATGCTCTGCCCAGTTGTGGAGAGGAAATCCAGCTGACCTCAT:1 + chr2R 915536 3' - Copia1_DM 3866 1 73.27 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAG:1 + chr2R 10670035 3' - jockey 4795 1 61.39 AAGCTTAGCGCCATGTGTANTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGACAATGAATTTCGTTTAAAGTACTGAT:1 - chr2R 9699822 3' - Transpac 4967 2 73.27 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTACCTATGTACACATGGGTATATATTTTGTGTAGGCCCACCTACGCAATGCAATTAAGCCAACTCAA:2 + chr2R 10014884 3' + flea 5007 2 71.29 CGGATCGAATATTGTTTTCGATAGGCTCTAGTTAGTCTTTTGAGAAGTCCGAATGTTATTCCTGTTCCC:1 - chr2R 11467224 3' + aurora-element 4051 1 78.26 GGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAGTATGTTTCTTGGTTTTTAATTACAACAAATTCGACTTGTTATGCCAAAAAGTTAGCAGGGATTCCAGGGC:1 + chr3R 26597430 3' - mdg3 5261 1 72.28 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATTCATGCTCATAGGGGGTAAGAAA:1 - chr3R 13353224 3' + 1360 3336 1 79.21 TCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTCAAATAACTAACTTAAATCGCTTGCTATAATCTATCTATTCCTCTGTTTAGG:1 + chrX 14634945 3' - roo 9064 1 61.39 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGTACTGCCCTGACTTTCAGCAAATACTGACTTTTTATGCATATCG:1 + chrX 17494688 3' + 1360 3357 1 61.39 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAGACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACT:1 + chr3L 8039393 3' + hopper2 1558 1 72.28 GGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACACATCTGATTTATACGAAAAGAAAAGTTCTGTGAAGCAATATACGA:1 - chr3R 14480764 3' - roo 174 2 54.46 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTAGAGCTGAACAAAACCTGCAAACAAATTCGTCATGCTATCGCTATAAAACTAACTTGATTATAA:1 - chr3L 20521838 3' - P-element 13 1 55.45 TGATACGGTAGATTAAAAANAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCTGCCATTTAAAGTCAGTGGGCT:1 + chr3L 19138653 3' - Circe 83 2 76.24 AAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTTATTATCGATAACCACGTTCCCTTTCCCATGCTCACACACGCACTCACACACAAGCGCACTCAG:1 + chr3L 21840143 3' - P-element 2597 1 70.30 TTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTGCCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAATTTTGAAGCTGATCCCAAAGACACTGACAAAAC:1 - chr2L 15818432 3' + Cr1a 3973 1 68.32 GACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTT:1 - chr2R 9905366 3' + mdg3 199 2 71.29 CTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGGGTCACTGAGCAATCTTCTGGGCAATGACCATGGGCTGAGCAA:1 - chr3R 8836836 3' + F-element 414 1 57.43 CATACTTGTGAAAAACACANTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGTTCACACAT:1 - chrX 2841775 3' + hopper 1381 1 59.00 AGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGCATATGAAAGAGGTGAATGCTTTTTCACGCTATTATTAAATTTGGTTATTTCGCTGGGATTTGGCGC:1 - chr3L 11390568 3' - blood 199 2 69.07 AAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGTGCCATAGCAATTTCGCTGTACATCTTGTATCTCGCTTGTCTGTCTCGCATTTCACATATTTAAAATGTTCCAA:1 + chr2L 14405744 3' - Doc 274 1 77.23 GAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGCATCGCCGTCTCGAGCCTTCGCTCCTTCGTCTTCGTTTGGCTGCCAGGCAGA:1 + chr2L 21796596 3' + 412 390 2 56.44 CTTAATATGAAGTAGCCCGTTTTCTGAAGCAGCGCTCACGGCAGAATGCTGACATCGCGCTTCACACGCTCCGGGCAGTGACTAAAATTACTAAAACGGCC:1 - chr2R 4188259 3' - gypsy4 6744 2 77.23 TTTCTGACGATGAGGTTCACTCAATCTCCTCAAGCCCAGAACAGCGAAATTCACCATTCCACCTTGAAATATCGCCCATGTCCCATGAATGAAACGATTAT:1 + chr3L 21989719 3' + TAHRE 475 1 65.35 ACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGCTCTGATTAGAGAGCAAAAAATAACAGGCGGCATGCTGCAGTTCCCCATGTTTGGTTTTTATTTTGCTTTG:1 - chr2R 13383479 3' + gypsy5 407 2 74.26 CTGCTGCTACCCATGGCATTCCAAGCTCCTTGTGTAGTTTTCAAGCTATGATTTTGGTTTACATTCCACTTTTCCAGGCTTTTCCAGGAATTGCAGAATTT:1 - chr2L 14953932 3' - G-element 4048 1 64.36 TAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTACAGATACGTCCTTTACCCAAACTCAGCAAAAAAAAAATACATACGTATGTACATGTTGTAAGAGCTTTGC:1 + chr2R 10372917 3' - mdg3 216 2 75.25 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGT:1 + chr2R 10670033 3' - jockey 4794 1 62.24 TACGAACTGAATTGCGTCGCAGATCCTCGCCGTTGACCCAAATGGAAAAGCTTTCTGACTGAGAGGGTAGCAAGCCTATGGCTTCATCTCCTGGTAGTGGT:1 - chr3L 180788 3' + R2-element 3125 1 77.23 TGTTTAATATTTATTTATTTGGCTTCCATTTTGTTTGCGACTGCCGGCCTAGCATAACTTTTTGCCTTATTTACATTAAGCGAAGTTTAATTTTAGATCTG:1 + chr2L 3423589 3' - Tc1-2 478 1 52.48 AATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAATAACCT:1 - chr2L 3699411 3' + mdg3 210 2 59.41 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACTATTTTAGCCATGTTTGTGTATTTCAATTTACAT:1 + chrX 8503168 3' + roo 9031 1 70.30 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGC:1 + chr2L 12808205 3' - Tirant 48 2 78.89 TTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTAAACATAAGAAAACAAAACCAGACAACCACCCCTCCTCCCCCTCGGAATTCGTGCCTCAAACC:1 - chrX 4058586 3' - 1360 2995 1 42.57 GCCGCCCTCGGCCGTCTGTAGTTCAGCGATAATCTGCCTAACTTGGCCTGCAAAAATGGTTGCACAGATTTGGATTACTGCCAGCCGGATAAACTCTTTAA:1 + chr3L 5480896 3' - gypsy6 7380 1 60.40 ATATGATATGACTTACGAATTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCTCTCCAATACCCCATGATCCCCTAGTGCCGGACACCGTAGTGGTGGTGGCCCAGGAG:1 + chr3L 21757534 3' - R2-element 47 1 63.37 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATCATTCGTTCTGAACTCCCAGCTATTTTCCGAGTTAGCTAACCATTTCTTCATATCACGCATA:1 - chr3L 7168300 3' - Doc 18 1 63.37 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTTGTATTGTGTAA:1 + chrX 4399589 3' - I-element 30 1 60.40 TGATTGTGCTCGCTGAATGATGTATATAACATGAATACATTTTCATTCGCCTTATTTCTGCATATAAATAACCATTTTTCTCAAAGTCTCATTTACTTGGT:2 - chr2L 13422213 3' - F-element 4315 1 74.26 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATAATTTGATTGAGTTTGAGCTATCCTTTCTATCACAAGATATT:1 + chr3L 18122576 3' + S-element 1683 2 61.39 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGC:1 + chr2L 18248051 3' - blood 34 2 63.37 TAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCATCTCTAAAATCAAAATGATTTACTTTTATAATTTT:1 + chr3R 10914167 3' - F-element 115 1 65.35 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTGGCTG:1 - chr3L 3596669 3' + copia 229 1 52.48 GGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCCGCCCACATATCATCAATTCCGTGCCATTTGGCCCACAGTTCGAATGCGCAATGTGT:1 + chr2R 14576587 3' + gypsy5 7328 2 58.42 GCATTCACATTAGCTGAGTAACGGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTGGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCA:2 - chrX 10445561 3' + INE-1 534 1 70.30 GAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGAAAAACGAAGCCGCAGCCGAAGGATCGCAAGATGCGAACCCAGTGAT:1 - chr2L 8818002 3' - rover 170 2 56.44 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGT:1 + chr3R 30553600 3' - 412 51 2 74.26 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATCGCCGTACTTA:1 - chr2R 22051468 3' - Tabor 37 2 58.42 AGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:2 - chrX 12649915 3' - blood 7330 1 66.34 AGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCATTGTCGTGTTACCTTCTCGCTAGTT:1 + chr2L 9716983 3' - Doc 4268 1 75.25 AAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTGTGAGCCTCGACATTGATTTATATTCGTTATTTGGGTTTATTTATTTGCG:1 - chr3R 24085299 3' + invader3 251 2 52.48 AATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGCTTAAAAGGCCATTTAATGAAATCTTCT:1 - chr3L 16563235 3' + 3S18 6057 2 71.29 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATG:1 + chr3R 12767337 3' + blood 346 2 62.37 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATGGCCATCCTGCTATTTAGCCATGTTTTGTTTGGTTTTGTGCTTTGGCTGCAGTTTGAGCACTGCCAT:1 + chr2L 13566565 3' + hobo 2930 1 73.27 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATATTGTTTTCCACAATTCGATTAGAAAATGCTTTCCATTA:1 + chr3L 9910430 3' - 297 6608 2 62.38 CGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGATTGAATTTTCGAAGTGAATACTA:1 - chr2L 20328725 3' - opus 7053 4 76.24 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGAGACAAGCACTTTTCCCTTTCCCATTCGCTTACATTGTCCCCAAAAATTCGCTGGATAA:1 + chr3L 13190179 3' - roo 14 2 61.39 AAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAAGAGCTCATTACAACCGCA:2 + chr2L 19642390 3' - Quasimodo 17 2 63.37 AGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCGTAGGGCCTGGCACTGTAATAAATGTATATTTTATTAAGAAAAAATG:1 + chr3R 22224004 3' - hobo 246 1 53.47 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGTCAACTGAGTGACATTCTTCATTTTGAAATTTATGGTGCGTTATTCCGCAATATGTTCCATGGTGATTG:1 - chr2L 16153333 3' - Doc 13 1 71.29 TACAGCTGTGATCAAAATAATAATTGCATTGAACTTTAAAAATCTTCAGTACCTTTCTGCATATCAGCATTTGTACATATATATCATACCCTGTAAAGGTA:2 - chrX 14810332 3' - HB 1629 1 87.13 CATCCTTCGTCATTAGAAATATTCAATAGAAGTTAAAAGCCCGTTTAATTTGATTGCTTGACAAACCTTTCACTTTTGGAGCGGAAAGTTCCTAATAAT:1 + chr2R 14567963 3' - looper1 473 1 73.74 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTAATATATAATTTTGAAGTAGTGCAGTAACTGGTGTGTATGAATATCCGCTTTGAGTGAAATCGAAA:1 - chr3R 18790053 3' - I-element 11 1 68.32 TCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGGGAGGATCGATACCCCCAGAGATTTGGATCGAGAAGAAGGAAGTGGCTA:1 + chr3L 13495565 3' - I-element 4901 1 57.29 TATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTCACCGCCGATGCACTTTGAATTAACACAGCGTCTCCAACA:1 - chr2R 6420460 3' - Stalker2 37 2 58.42 CTGATAGTCGGGGAACTGGACTATAGGTTTCTCTCTTTTTTTGTTTCAAAGGTGTCTAATTTAAATTCGCTGTTTCGATTAGAAAGTAACGTTTTTGTTTG:1 - chr2R 5217682 3' + INE-1 562 1 64.36 GCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATATGATTTATGATTGTTTTTCCTTACAATACAAATCAAACTTATCGA:1 + chr3R 12758049 3' + blood 144 2 51.00 ATGGTGTCTAAATACTTATGCCCACTAATGTATACACTATAATATATAATTACAAGAACTTAAAAAAATTATCTTATTTGAGTATGTTATTGTCATTAGCT:1 - chr3L 26719133 3' - Tc1-2 9 1 51.49 GAATATTTGTCATAAGAGTATTCAGCTTACGGCATGTGAAAAATTAATAAGGCAATATGTTTTGTCAATATATGTGTTCAGTTCGGTTCAATTACTCCGAT:1 + chr3R 3353361 3' + 1360 401 1 51.49 GAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCGGAACATAAAACACTGATATAATCGCCTTTACCCGAAATTGTCTGCCTGTACTTGTTC:1 - chr4 1179609 3' - Cr1a 4226 1 54.46 GTGTACATTCCTGATCTATCCCTGATTTGAAACTACAACTTAGAATTGAAGACACAACATTCCACACAGGATTTCCACATCTACAGCTCAGCCCA:1 + chr3L 12565742 3' - mdg1 7365 2 77.89 TTATTGTTATTATTATTGTNATTATGTTCGTATATACTACAGATTGAATGGCAAATGTTTTCCCTTAACACAATTTATGGTCCAAATATTCTTTATAGCTT:1 - chr2R 12525577 3' - mdg1 7058 2 44.55 GCTGGTGGTAGATTATCATCCTTTATAATGGCAAGTGTGTTTGGGTATATCTTCTGGCTATTTATGGCCGGCATTATGTAACGTTTGGCAGCTCATTTAAA:1 + chr3R 12358928 3' - diver 5663 1 74.26 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGTAGTTACAAAATACATTTAATACAAGTTTTAGGGAATGCAATT:1 + chr3R 25581101 3' + pogo 2071 1 53.47 GACACGTAGATAACGCAGAAAATAGCCTAAAAGAAACAATTATTTTGTATTAGTAACATTCGCTCTACTCAACAGATAAAGCGGTTCGGTTGCCAAAACAT:1 - chr2L 120969 3' - McClintock 6096 2 74.26 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAA:1 - chr3R 25021670 3' + roo 9047 1 55.45 ATTTTTATTTCCATTCTTATTTGCGGTTAAATATCCTCTTGTAATTTATAGATATTAGGGGAGCTGATCGAGGTGGAAAATGGTTGTGGGGGCGGGGAAAC:1 - 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blood 7023 2 65.35 ACACACACACACACATAGATAGAAGCATGGGAAGCACCCCGGAAAATCGAGTACGAAATTCATTAATTAGCCATAATGGTCGCCCAGCCGCAGGGGGCGTG:1 + chr2L 1568420 3' + Quasimodo 39 2 65.35 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAAATTTTCGTACCAAAGTGCCACAA:1 - chr2L 6362861 3' - 412 49 2 74.26 CTGCTCTTTATTAAAGCTCTGGCTTAAGACTGAATACAAAAGAATATGAAAATGAGGAATATATACACACAGATTCACTTCTGGCGAAGTGCTCAACGTTT:1 - chrX 17984872 3' - gtwin 7175 2 58.42 TTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTTTTAACGAGCAGTTAGC:1 - chr3R 10741062 3' + Tc3 312 1 77.23 TGTTTACAAAAATAAAAATAAAAACTAAAGAAAATAAATGCAAAAAAAAAAGGAGAGAAGCTAAAAGAATGTTAAGTAGTATCACAAATTACTGGATCAGA:1 - chr3R 14083668 3' - 1731 4272 1 59.41 ATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTAC:1 - chr3R 26765108 3' - mdg3 38 2 62.38 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATTCTTATAAAAGCTTATATCCTGA:1 + chr3L 13773055 3' + pogo 2050 1 77.23 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGCGGCAGGCAAAATTGAGCAAAGATGCCAG:1 - chr2L 10792031 3' - 412 7099 2 70.30 TGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATACTCGTACACACACACCCCAGAAGGCGTTGTGTCCAGCATGTACGAGTGATATATA:3 + chr2R 8311384 3' + opus 7484 2 62.38 CTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTTGCAGCGCCACA:1 - chr3L 17181429 3' - jockey 4675 1 67.33 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTG:1 + chrX 19034186 3' + hopper 1387 1 51.49 TTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATACGTTCTTACCACATCATGTGACTTAATGTCCGGGATTTGCATTTTCAACACTT:1 - chr3R 6947317 3' + I-element 5336 1 59.41 CGTTCAGCTTAAGACTGAAAATCAAATGAAAGATATGAAAATGACGAGAACGCATCGATTATTCGGTATGTTCCATTCAGCCTCTGCTAATTGCTTGGAAA:1 + chr2L 13676276 3' - 17.6 344 2 74.26 GCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGCTTGAAATGGAGCCACAACATACAGTTGTTTTAAGCAGTAATTAAAATGTGCCATAAGCGTAAATTTTA:1 - chr2L 9143747 3' - accord 7251 2 74.26 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCAAAATATACATGACCATGTGAACGAACGATGTCCCATG:1 + chr3L 22930371 3' + roo 9036 1 61.39 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAG:1 + chr3L 3757402 3' + roo 9031 1 70.30 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCAAAATATACATGACCATGTGAA:1 + chr3L 22930355 3' + roo 9020 2 77.23 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGTCATAAGG:1 - chr3L 3757339 3' - roo 29 2 60.40 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACGTTGCCT:1 - chr3L 20049617 3' - jockey 4785 1 53.47 TGAATAGGGTTACTATCGCATCAACAAGTACTACATCCGAACCGACTAAAACGACCCAGAAAATAACAACGACGACTCCAAAGCCAACTACGTTGGAAACT:1 - chrX 1555203 3' - rover 396 1 70.30 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATAAGATAGAGACTCCAGATGTTGGAATATGACTATGAAATAGTATACAAGAAGG:1 - chr3R 1849153 3' + Tabor 7299 2 53.47 CTGGAGTTAACCAGCAGGAGTATGTTACCAACCTGTTATTAAAATCATAAATCTGCATTAGCCGAGACTGGGTGGGCAAACAAAACGGCTTTATCAGCT:1 - chr2R 14639154 3' - Ivk 460 1 71.72 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATATTGTTTTCCACAATTCGATTAGAAAATGCTTTCCATTAAATTCATTAGCGCTGGCCATCTG:1 + chr3L 9910453 3' - 297 4 2 74.26 TTTATTTAGAAGCGATTAATCCAACCAATGCCGTAATAGTAACATAACAGCGCATGTGAGGACTTGATCTGGGATCGTCTTGGTTTGGACCACATATGTAT:1 + chr3R 19108847 3' - BS 5079 1 64.36 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCAAATAGACAGCTCCAATAAATGCTTAAAATGAAGCAGAAAGCAATGAAATGGAATTGTCACGAA:1 + chrX 16507821 3' + opus 7488 2 67.33 AGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAATACAATACAAAAGCTGCGAAAACAAGCAAGAAATCTAAGGTAG:1 + chr3R 21612944 3' - S-element 31 2 62.38 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCATTTGATACCTTGCTTTATTTTGAAGACAATGGACGAAAGACAA:1 - chr3L 3654311 3' + mdg1 358 2 57.43 AAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAGAATGGAAACAGCTTCTTCGAGCCAGTCA:1 + chr3R 22331976 3' + I-element 140 1 71.29 TTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACAATACTATACATTTGTACATACATACAGAGAGGACACTTCAAGCTGGGGAGAGTACTTAAAAAATATAAT:1 - chr3R 19216321 3' + 1360 3381 2 69.31 CCGAGCGCTGGTGAGTCCTNACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAGTCCGCTTAACGATCGAATTAACATCAAACGCGCACATTTT:1 - chr2R 21351016 3' - opus 7145 4 58.42 CGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAG:1 + chr3L 5241159 3' - Ivk 48 1 75.25 GAAGAAGAAGTGGAAGACGAATTCAATTTCCTTAATATATTTTTAGAGGAGGAAGTTGAAGAAGAGCAATAAATTTAATAAAATATAAAAAAAAATTAT:1 - chr3L 14918216 3' + transib4 2207 1 83.84 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATAAATAGAAGTAAATGCGTTCCCACCATTCGTTATCTATTTTC:1 - chr3L 3209174 3' - roo 33 2 62.38 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTTATTGTTTGCAAAAGTTTTCACCTTACTC:1 + chr3R 17660531 3' + roo 9024 2 73.27 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTGCTATGTACAACGAATTAACACATTTTGCAGTTTGGTGGGGGATTCCAATTGGGGAAGCTTTA:1 - chrX 10451448 3' - hobo 14 1 65.35 CATTCTACCCGCCTAAAAAGTTAGAACCTTCGCGTCTACTAACATATTACTTTTCGTCCCAATAGCAACCAAAACTGGCGCCCACGCAACGCAACTCCAAT:1 - chrX 19606719 3' - Gypsy12A_LTR 493 1 47.52 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTTTTAACGAGCAG:1 - chr3R 10741067 3' + 1360 3387 2 75.76 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAAAGGTAACGTA:1 - chr2L 20560336 3' - F-element 45 1 57.43 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAACTGGATTATTTATATGAAAAAATCTATTTACCCAACAT:1 - chr3L 20758940 3' + flea 222 2 61.39 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCAGTTCACTTCCGCTGGCCACTTTAATTACGGGCAAGAGGCGAAGCCTAAGCCAAGCGATTTTCTTG:1 + chr2R 6107818 3' - roo 10 2 70.30 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTAATTAAGAGATATTAATTCATGTGAACCAAAACCATTTAGAG:1 + chrX 7036736 3' - Quasimodo 27 2 59.41 TATTAATAATAATAATAATATGATGATAGGGGGGTTACGGTAGTACGATTAAGAAAGTACGGGGACTGCGCAAGCTTAATAATGTTGCTTAGTTGGCGGAA:1 + chr2L 510265 3' + mdg1 51 2 72.28 GATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAAT:1 - chr3R 23020828 3' + INE-1 564 1 46.53 ATTTTTAGATTTTTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGACAGAGGGAAATGTGTGCCTCCGTTTTCTAGCCTTATTAATTGGCCCCGGCTTATCCAGTTTC:1 - chr3R 30750643 3' + 1360 3279 1 55.45 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTAAAAAACACAAACGAAATTGCCTGAGGGTAAAAA:1 + chrX 7996427 3' + hobo 2925 1 52.11 CTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTATAATAATAAGACAGTCCCCTGGCATGCCAGCAGATAAAATTAGAGTCCGAGGAGGGACTGGAGATATG:1 - chr2L 9008327 3' + Porto1 4188 1 73.27 TTAAAAAAAGAAAAAAAAAAACTGTAAATTCCTCAACTATGAAGGCAGGCATACTCATTTAGCCTATGACTAGCCTGATATGAGTCTTATCAGGTGATAAG:1 - chrX 7304289 3' - hopper 151 8 68.32 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATATACAGGTAAATAAAATAATCCT:1 + chr3L 15033385 3' - I-element 16 1 63.37 TTTATCAAAAGTGTGGGCGTGGCATCTTTGTGCGGTTTGAGGCGTTAGAGTGGGCCTGGCAACATGGGTCATGCTGAATCTCAACATTCTAGCTTTTATAG:1 + chr2R 1751257 3' - INE-1 252 1 72.28 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAATCACAATTTAATTAGTTGCGAACATTTTTATGG:1 - chr3L 9928503 3' + roo 408 1 75.25 AGGTGCTCAATGGTATATGACTAATGATGACATCCACAAAGACATGGAACTTCCCCTTGTTAAAGACGGCACTTGGTTTTTTGTTTCATTATTGTTTTGCT:1 + chrX 14200215 3' + G3 4288 1 67.33 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGCACCGTC:1 + chr2R 6850493 3' - roo 8711 2 78.22 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCT:1 - chr3R 29608788 3' + roo 9030 1 67.33 AAGATATTTCCAAATAAAANTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCA:1 + chr3L 7099633 3' + roo 9021 2 77.23 ATATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTCTATTGTATTGAATTAAATTGATATCTGCTAATAAAAGCCATAATAAGACAATTTCAATCGATTT:1 + chr2L 21781314 3' + INE-1 558 1 81.19 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTTGAATTGCGACCAGAGATTTGAGATTTGAGCGTG:1 - chr2L 10898402 3' - jockey 4711 1 64.36 TTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATAGTCTTCTATACTATGGCAATAAAACGTATTGGGT:1 + chrX 22689595 3' - 1731 4356 2 66.34 ACACAGAATATGTATTCGAGCGATGGTGCATCGCAAAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTTGTTTGTATTTTTAGTTGTACCGAGGGCTTGTCCCCT:1 - chr3R 904458 3' - Doc2-element 142 1 73.27 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGG:1 - chrX 4277477 3' + roo 361 2 73.27 TGGCATATATTGGTTTATTACAGTTCATTTAAATTCCTTGCCTTCTCGTTGTTGGTGGTGGTGTGCATGTGTTTCATAAATTTTGTATGCTCATTATTTTC:1 - chrX 9486788 3' + blood 377 2 53.47 CCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGCTTAAAAGGCCATTTAATGAAATCTTCTACCTAATCTTTAAGTTAGTAAT:1 - chr3L 16563213 3' + 3S18 314 2 50.50 AACAGTAATATTTAATATAGGTTTTTTACATTATATTCATTTTCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATACCAACACGTACAAACGTCAATTAAATAAATACAA:1 + chr3L 14652511 3' + Cr1a 4303 1 66.34 AGTTTTTATATATATTATTCAACTTTGTAAAGAGGAACTTTTAGTTTATATAAAAATGTTCATTAGCACAGAGTTTTCTAAATGTTTTTTCAATTATCA:1 - chr3L 9920613 3' + copia 4662 1 73.74 TTGTATTTTTGACTTTCGANGCAAAAATATAAAGGCCTTTTATTAAAATTCATTAATTTTTTTTATTAATATAATTATCTAGGATATAAGAGTGCAAAACT:1 - chr2L 1621528 3' - S2 1677 1 70.30 ACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTGTGCTTAACTTGGAGCTAAAAGTCTATAAAAAACCACCCAT:1 - chrX 734882 3' + Tabor 480 2 79.21 TAATAATTAAATTAATAATNAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAG:1 - chrX 17029991 3' + flea 231 2 50.50 TTCCAAATAAAATCAGTTTNTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGG:1 - chr3L 2022248 3' + roo 364 2 67.33 AGAGAACGACAGACCGCGTGCTTGCTCTCCCTCTAAAGCCACGCATTTGCCGCTGACAACTGGAAAAATTGCCGTTTTTATGGACCACTCCATTGGGAGAT:1 + chr3R 6084396 3' + Doc 365 1 63.37 TAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTCAAGTGGTTTTCGGTTTCCTATTGATTTATGAACTTTTCTCAGGT:1 + chr2L 18199777 3' + Ivk 5348 1 54.46 AAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACC:1 - chrX 21667995 3' + Tabor 465 2 54.00 AATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATATATATATAAGCACGCATTTGCCTAAGTCAAA:1 + chr2R 21433202 3' + HMS-Beagle2 7153 2 76.00 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGGTTTTTTGGCTCTC:1 + chr2L 4063764 3' - roo 20 2 56.84 AAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCAGGCCATCTTTTGAGTTACAATGATGTATAAAGTTGAGATAATACCTTTTGT:1 + chr3L 15452941 3' + accord 7357 2 52.48 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATC:1 - chrX 13126221 3' + mdg1 375 2 69.31 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACTTGAAAATTTATATGGATAATCGATAGGACGGATCGAGCCAATATTTGGTAATACATACATGTTT:1 - chr2R 13037237 3' + copia 244 1 47.52 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAGAAATCGAAGAGCTTCATTCGTAT:1 + chr3R 8582638 3' + roo 403 1 73.27 ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTCTATATAAATTTCAATAAGTACTTAACA:1 - chr3L 15788443 3' - opus 51 4 82.18 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAAAGG:1 - chr2L 20560343 3' - F-element 46 1 62.11 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAGCTATGAAGCTCAGCTTGTT:1 - chr2R 6107752 3' + roo 351 2 81.19 TCCACGCCACTACTTCCCCACCCCCCTAAACCTCCACGCTGAGCCGCTAGTTCATCTCGAATTTAATACACTTTCGTGTGGGGTGTGGGTTGTGGGTCCTG:1 + chr2R 24705584 3' + gypsy5 7029 2 52.48 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGGGTCGATGTACCTAACCACAGATGCAAATGTCTGGTC:1 + chr3R 22330769 3' - I-element 60 1 63.37 AATTAAAATCGGGAGCAAACAAAAATAATCAAATAATGACTGGCCCTTCTTGCTGGCCCCTCGAATCAGCCGACCAAGCGGAAAATCAATGCAATGGAAAA:1 + chrX 10068204 3' + gypsy5 7285 2 80.20 GACCAAAACGCCACTGCACATGTTCTATGTAGATATTGAGCCTAACAACATAAACCGAGACAATGTAAAACAATAATCACGGAAAATAGGGAAAATGCGAG:1 - chr3R 30235839 3' + G4 493 1 70.30 TCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCTTCTCGCGCTCCAACTGAGCCACCTGATGCATCAG:1 - chr3R 24125721 3' - opus 411 2 65.35 AAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTACACCTCGACGAAAAATAAGCCCGAAACACGCCGCATGGAAGTTGGAAATGACTGAC:1 - chr3L 959687 3' - G2 362 1 57.43 GCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGCTTAATTGTCATGGCACTCAAGCACATTACTTGGTTTGTCTCCGCTCGACTATTGGAC:1 + chr3R 19987266 3' - Doc 240 1 61.39 ACATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACCCAGAAGCAAAGGAGAGCGGTTGGTTAAAACGTTGGAA:1 - chr3L 16153651 3' - pogo 37 1 59.41 GGAGAGAAGCTCCAGAACATCCCCGAAAAATATATGGAACGACTTAACTCTTCGGAAAGCGGTGGCGCAAGCAACTCCGGGGAGGGTAGTGAACAGGAGGC:1 + chr4 714099 3' + jockey 4622 1 58.42 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCCTCCCTAATTGCCACCTTTAAAGCGTTTATTTAATTAATAGA:1 + chr2R 7546323 3' - hopper 29 1 54.46 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGGT:1 - chr2R 6850459 3' + roo 9019 2 75.25 ACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGACCTTAAAGCAGGTATTTTAACATTA:1 - chr3L 24012068 3' + hobo 48 1 73.68 CGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAAAGGTAACG:1 - chr2L 20560338 3' - F-element 43 1 57.73 AAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTTGATCAGCAAAATTTCACAGGCAAAGTCAAGGCCAGATTGCTGAAGAGGGCCAATGGCT:1 + chr3R 29025252 3' - S-element 405 1 71.29 TTCTTATTTGGGATTTTACACACCCCATCCCACGCACATGCAACAAGAAATGGCAAAAGTTTTCGATACGCCCCCGTACTACTTGGCACTCGATTTTATTG:1 - chr2L 10625639 3' + roo 410 1 81.19 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGACCTGTGTGAATTGGAGGTGGC:1 + chr2R 9693353 3' - P-element 52 1 27.00 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCGTATTTTTGTGTAGTTTCTCTTTTCCCAATTTATATATTCCACTTAAAAAATACGTTTTTATTCTTATTTTGCTAAA:1 - chr3R 27907591 3' + mdg3 247 1 76.24 TTTTATGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTTCTTCTTTCGCTCTTATCGGCCAGATAAACCCAACAGCATAAAGGGGGAGTTCTAT:1 + chr3L 11050881 3' + Cr1a 261 1 59.41 GATCTTCAAAATCAAATCGNTAACTGTAATTATTAACTTATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATCATTATCCATGTTATATTATTATTTGT:1 + chr2R 12458007 3' + HMS-Beagle 229 2 62.38 GCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACACTAGAATTGAGTTTAAATATACAGACAACCAGGAGCGGCGCACGGAGT:1 + chr3R 28565332 3' + 412 462 2 48.51 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGTG:1 - 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R1A1-element 255 1 64.36 ATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCA:2 - chrX 4166397 3' - I-element 5339 1 72.28 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGT:1 - chrX 15546162 3' + blood 7346 2 69.39 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGTCATAAGGTCTTTTTAGTTTACTTTGTCTTTATCA:1 - chr3L 3757312 3' - roo 2 2 77.23 GTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAATTCCAATATACAATTAGTTGTTTCTTATCTTTATTTGATTTACACGTGTACTTCTTGCTCCGTTCCTACTTCATA:1 + chrX 21555967 3' - mdg1 434 1 67.33 TCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCTCAAACACACACACACATGTGCGTCTTTTAAAATTCCTTCGATAA:1 - chr2R 9209420 3' + Tirant 381 2 53.76 CGTGTTAAAGACGAAATAAAGTCAAATGCTGAGCGATACATAAGTAAACTACACAACCATGATAATGTCCTAGCACTAAGTAACATATTCGAAAGGAAAAG:1 - chrX 14984935 3' + G3 4343 1 71.29 TAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAA:1 + chr3L 12634207 3' - BS 5046 1 77.23 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGCGTGTGTTTGGTCTTCATCTTAGCTCGGCACA:3 - 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roo 18 2 61.39 ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTACAAAATGGTTTAATTGTCATTTATATACA:1 + chrX 734984 3' - Tabor 26 2 53.47 CTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATTGCTAAGTTAATCTTGCATTACTATCGTCGTAGCAGTTGTGATTTTTGCTGTTGCTGCTGGCATGAACAATA:1 + chr3L 4704735 3' + roo 487 1 60.40 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGCATAAATAAATGAAAATGCTACAGTTCAAAACGGAC:1 + chr2L 16139171 3' - copia 4910 2 68.32 GTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCTGCCCTCGGACGACCCAAAATGAGTGACTAAGGCTGACGGCAAGGCAAACACCGTGACATTCG:1 - chr3L 6478356 3' - springer 7150 2 56.44 GAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTGTGAGCCTCGACATTGATTTATATTCGTTATTTGGGT:2 - chr3R 24085312 3' + invader3 238 2 62.38 TTTTTTTTATTATAGAAAAATACTCATTATGGTTTAGTGAAAATCGCATAAAAATATGCGATAAATATGTACAGAAAAGTAATGTTTGTGTTGATTTCTAC:1 + chrX 8613744 3' - gypsy7 4993 1 90.10 TTCTTACAAAAACTCAACGNGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAA:1 + chr2L 20045810 3' + roo 9045 1 53.47 TATATACATTATAATTAAGGAACGATATCCATAATATTATCTTTTGAGCTACACATCACGTTTGAAGCAATTGATTCCTTTAGCTATAATATATTTACCC:1 + chr3R 11357436 3' + G5A 2741 1 63.00 GATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCGAACTTTCGCATCCATACGAACATGCCGCTGCTCGCCAATTTTGTTTTTTTTTATTTTTCGCA:1 - chr3L 2551691 3' + hopper 60 1 57.43 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGTTCGCTCAACGGCAGAAGCGTGTG:1 + chr3R 9088652 3' + hopper 1405 2 67.33 TATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTATTTTAACGGCTCACGCTTTTGGACCCTGAAAACCGCGTTTAATGCCCCAAACGCGTCGAGCTAATTTTGTG:1 - chr3L 15278394 3' - accord 7095 2 74.26 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTGTTCCCGAACTGCATATACATATATTAACGTGCGTGTGCGCCTCCCTCTTGTCTGAGCAACTTA:2 - chr3R 24976713 3' + opus 7494 2 72.28 CCTTTTTTTTTTCTTCCTTTTTGCTGCTCTTGGTCTTAAAGAGTTATTTGATCTGATGTTTTCGAAC:1 + chr2R 20970093 3' - Doc2-element 223 1 58.21 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACGAAACCAAAGCAAACCAAACCGAGCCAAACGAAACGTTGGAAAAACTTTTGGCGCCCCGGCAACGGAGACG:1 + chr3L 17186903 3' - Tirant 1 2 79.59 GCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATTTTCAGCACACAGGGCGTAT:2 + chr2R 8526369 3' + I-element 5298 1 82.18 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAGAGGTGGATGAGCG:1 + chr2R 19061281 3' - roo 8705 2 66.34 AAACGTCTTCACACGTCGGCGGTGAATATTTTTGACAAATTACTTAAATTACTTACGAGCGAAATGCTTTATGCGGGCCACAAAAAGGGTGTTGTAAATTA:1 + chr2R 11030611 3' - F-element 20 1 72.28 TTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTATTGGTTTCATTAACTCGACTGCCGAGTCTTTAGCAGCTTGGAGCAGATTAGGCGCTTCTATGTCCGT:1 + chr3R 27839495 3' + Cr1a 3973 1 76.53 TTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAATTTGTTTTTAGGCGTTTCCTTTAGTCCGTCCTCCCTTCGTCCTGCTGCCCATGCTTG:1 + chr3R 7628516 3' + hobo 2645 1 61.39 TGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTGCGTTCTTTTCTCTGCGTACTTTTTCCTTCTTAGGTGCAAA:1 - chrX 19305918 3' - roo 9021 2 59.41 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAGTGTGTTTATGCGTTGGTAAATTAAATTTGAAACGCAACGCA:1 + chr2L 7666197 3' + roo 401 1 72.28 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAACAATACTGGTAACTCTGTT:1 - chr2R 20312609 3' - 1360 55 1 81.19 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCT:2 + chr2R 5674719 3' + S-element 1674 1 63.37 GGTTTGCACTATGTGCAACGCAACTGCTACCACTGACTACTTCAGCTTAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAGTCTATTAGCAGCCTGGGATTCTGGAA:1 + chr2L 22216553 3' - diver2 4620 2 52.48 ATTGAGCTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATTGTCCATCTTTCCAACTTATGACGCACTTAATGAAGGTTTTTCTGTGT:1 + chr3L 18271609 3' + R1A1-element 4974 1 53.47 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCCAACTACATAACACATAATTTTTCAAGTGCAGCGACCA:1 - chrX 6457898 3' - hobo 38 1 61.39 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTG:1 - chr2L 17994164 3' + roo 354 2 75.25 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGAAAAAAAAACCTGGGTATATGGTATATGTTTAATAAGTTACGAAAGGCAGATCTTCACTT:1 - chr2R 13087074 3' + jockey 4969 1 59.41 AGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGCTCTGATTAGAGAGCAAAAAATAACAGGCGGCATGCTGCAGTTCCCCATGTTTGGTTTTT:1 - chr2R 13383490 3' + gypsy5 7335 2 63.37 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATT:1 - chr2L 13093782 3' + roo 9030 1 68.32 ATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTGTTGACTTTGCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAATTATATGCTGCCAAAATTCCAACGACCC:1 - chrX 2992378 3' + S-element 308 1 72.28 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTGATAATTGCAGTGGAAAAAGCA:1 + chr3R 22494175 3' + 297 6941 2 73.27 AGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGAAAATGCCAGGACTACAAATACGGCTTCGCTGGGGCGGCATTCACATTCCCATTCCCGT:1 - 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chr3L 3596695 3' + copia 203 2 78.22 AAAAACGAAATAGAAAAAAAAATAAAAGTAAT:1 - chr2R 17485511 3' + Doc2-element 238 1 87.50 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGATTGAACAACATTTTTAGAATGATTAAGTTCGTTATGGTTT:1 - chr2L 12511542 3' - copia 36 2 61.39 CTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCCACCGGAGCCAACCAAATAGGTGACAATCGAGGGATGAGTCCAATGATGGGTCGTAAAACTGAA:1 + chr3L 18224613 3' + Quasimodo 6896 2 72.28 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAGAGGTGGATGAGCGGGAAAAT:1 + chr2R 19061288 3' - roo 34 2 59.41 CTTGTTCACGCTGACGCTGCTCACGAATTATGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTAGTGATTTATTTATTAGTTGATTATACATTAGTTGGAGATC:1 - chr2R 5206904 3' - Doc4-element 16 1 83.67 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGCGCTTAATCTGCTGTTGCCATTTTTCA:1 + chr2L 12808253 3' - Tirant 8118 2 70.30 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTTTTCGTGCGCACTTCGGGCCAAACTCAAGTGGGGCTTTGAA:1 + chrX 4166449 3' + I-element 5332 1 55.45 CCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATTATGTATAAACATTAAGTATATTGTATATC:1 + chr2L 15402439 3' + roo 469 1 70.30 CGTCAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAAATGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGTAAAAGTTTATGAAGTTGGCATCTTGAAATTCCATCAACC:1 - 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chr3R 6947313 3' + I-element 5340 1 63.37 AGAATATAAAATAAAATAATATTTCCTTAATTTTTTTGATTTTTTCCCAAAACTAAAGACACCAAATCTAATGTATTTCCTTGCGAGACCTTTGATTGCCA:1 - chr3L 10295017 3' - transib1 1900 1 85.15 CCGACTAACCAAGTCGGGACTTTCAACTTCACCACGAATAAGCTCTCAACTTGCGACTTTCAATCGCCCCAAATGAAACCCGGACCCAATCGAAGA:1 + chr2R 15362623 3' - Cr1a 4075 1 58.33 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGAGGGTCCCTCCACTGGCTGGCTGCACATGG:1 + chr2R 24278063 3' + 412 7499 2 70.00 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCAAACATTTTTGAATTCAAATTTGTCCAACAGGTTCCGATGGATGTTGACGAATGTCGCC:1 + chr3L 163300 3' - mdg1 17 2 62.38 TTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGAATGGGGAGCATGGAAACATGTTGCGCAACAAGGCAAAAACGTCCTGCAACGGTTGGGACATGTTTTATGC:1 - chrX 18561544 3' + Circe 7136 1 74.26 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGCTCATCATTACAGTACAAAGAATGACACTAAGCTATATTGGATAACTTCGTCGTTGGGAAAAATAATTATTCT:1 - chr2L 20570592 3' + 412 7528 2 60.40 CAAACAGCGCAAAACTATCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTGTTCTTTTCACATTCTGATTAGTCTTTTCCATTTTCCATTTTCCAATTGTGTTTGC:1 + chrX 15201370 3' + INE-1 235 1 76.24 AGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAAAAAAACATAAAAAAAAACGAGCAAAAATCAAAACCACTAACCACTCCAATAATATAGTTCAAGTATCCTAG:1 + chrX 15483120 3' + G6 2010 1 70.30 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGCAATGCAGCCGCTAAATGTGTGCAATTCACCACTTGAG:1 + chr3L 10363880 3' - P-element 35 1 45.54 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAACATACAAATACATAAGAATTAATATAACCCTTTCAGCCAAGTTTGGAATTAGACACCCA:1 + chr2L 19114624 3' + S-element 1702 1 63.37 GGGATTGTTTGAGGTAATCGCACGTGTGTTACACATTCTGTTTGGGTAAAAGTTGTTACACTTGCCCTGGGGGTAAACGCGAGGAATGGAGGAATCCTACA:1 - chr2R 3640134 3' - I-element 4884 1 57.43 CTGTACAGTCAGTCTTAAGCTGACAGTTTTAAAATAAAGACGCTCACATAAAAAATTATTCATAATCAAATCAAAAGCAAATCATACATAATTGGGTCTTC:1 - chr2L 3801091 3' + rover 7173 2 63.37 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAAGCATTCAGCAATCTTT:1 - chr3L 1586713 3' - Tirant 8123 2 61.96 TTTTTTTTTTGTTTTAATTTCTCTATGCTTTTGTTTATATGGCTCCCTTTGAGAGATCGCTTCAATTAAACAAGCCGCGACATCGACGTCGTCTCTAAACA:1 - chr2R 12664631 3' - Doc 4697 1 58.42 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCGGCAAGTCCAATCATTAAATGAGCAAATGCTTT:1 + chr3L 1998874 3' - hopper 40 1 70.30 GCACTGTGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTAGCATTTTTTTGTTTTAGATGTCCGTGCTTCAGCTCGTAGATTGAATAAACTGTGAGTAAAATTAAAA:1 + chr3R 30637188 3' - diver2 4615 2 46.53 AACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATGGCATTTGATTATCAAGTGTTTTGAGATACTCCTGGGTCGGGAAAGGGATGTGAAAATGATT:1 + chr2L 15898834 3' - F-element 19 1 69.57 AACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGATGACTTGCCTTTTGAATGGTGCACCTTTCCAGCGGTCCTGAGGGCCGGCAGAAAGTGTCCCTAGGCAG:1 + chr3R 18287640 3' - pogo 257 1 73.27 TTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAATCCTGCTCCCAAGGCTCTCACGGCTCCTTTGCATCCTTTGGCTCCTTTAACTAA:1 - chr3L 18706528 3' - Cr1a 4109 1 54.46 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTTTTGGAATGCTAATTAACTACAGTATATATATTTTCCATATGTTTGTGAGCAATATAAATCAT:1 + chr3L 14818778 3' + mdg1 7421 2 60.40 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGCATCGAGCGCTTTTC:1 + chr3R 6034018 3' + roo 9041 1 57.43 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACATAATGAACTGCATATACTTAGGTAACAAACGAATTTTCCTATAATTTTAAATTACGGTTTTAATGTCT:1 - chr3R 19949277 3' + mdg1 7448 2 59.41 ATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGAGGG:1 - chr3L 5651633 3' + McClintock 6381 2 80.00 GAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGATTCGTCGCACGTGAGAGAAAAGAGGGGACAGAGTTGGTGTTATGCCGTTTGGGGATGAGGCAT:1 + chr3R 10284379 3' + invader4 374 1 68.32 CAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCCTCC:1 - chr2L 17994156 3' + roo 367 1 65.62 ATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAGTTGCTTTAGGCGTATGTTGGCCATGGCAACCATCGTTTTCATTTTCATAAA:1 + chr2L 9036934 3' - G2 2608 1 71.29 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGTGATGTTAAGATACAATATTATGATGTACGGATTCTTCACTTAT:1 - chr3R 4575434 3' + 1360 3356 1 62.38 TTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAACAGAACTATGGAGCCCGAGCCCAA:2 - chr2L 21215301 3' + BS 5042 1 73.27 TAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGAGTCTCCCCGGAAAAAGAAAAACCCTCGACCGCCCATTTGAATGGCAGCGTGAAAG:1 + chr3R 16594918 3' + 1360 448 1 59.57 AAAGAAACACGTCTCCACCNGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAAAAAATATTAAGCAGCTTATTCGGATTT:1 + chr2L 18655223 3' - Doc 23 1 57.43 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGAAAAACAAGAAAATGCTAAAATCGTTGAAAAAGAGTTTCTGGCAGAAGAGTGAGA:1 - chrX 8503096 3' - roo 8684 2 47.52 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGGCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCT:1 + chr2R 22856586 3' + 1360 3350 1 67.33 GTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGAGGGTCCCTCCACTGGCTGGCTGCACATGGTGATTGAATTTAAAATGGACAGCGGCGAAAAAGGGCAAAG:1 + chr2R 24278103 3' + 412 7540 2 69.70 CGTACGGAATTCAGCTGTGAGGCACTGCGGTTTATTTATGACTGCAACGTTCGCTA:1 - 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hobo 22 1 53.47 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACGTACAACGCTGCG:1 + chrX 11025591 3' + hopper 1402 1 66.34 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTCGCGCCAAGGAGAGTGCGAGCGAGACAGGCGG:1 + chr3R 29287593 3' + hobo 2937 1 76.77 AACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCATAGCTTCGTTGCAGGTGTGTTGGTGCG:1 - chr2L 12968385 3' - roo 8827 2 72.28 TTTATTTTATTTTTTTAAATATAAAA:1 - chr3L 18459894 3' - TART-B 10631 2 88.46 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTTCGATATTCATTGCTAATCCT:1 + chr2L 9260380 3' + 297 346 2 78.22 TAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGACTGGCACAACATGAAGTCAATTAAATAATATCATATTCACAGACAGCTTCAA:1 - chr3R 8600414 3' + roo 8758 2 47.52 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATTTTCGAATGACCC:1 + chr2L 5927008 3' - pogo 25 1 53.47 GGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATTTTTGAGCCTTTGAGCAATTGTTCGTTCGTTACGAGCGTTTTTTTGTGGCATAAAAATGTTTTTAAAA:1 - 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chr2R 12812243 3' - jockey 17 1 68.32 AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGTATAGTTACATTATATAATCCAAGCGATTACAGTTAACTAATACAAAACGAA:1 - chr3L 14517648 3' - mdg3 5322 2 66.34 AAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCACAAAATTGCCAAA:1 + chr3L 6658237 3' + hopper 1392 1 55.45 CTATGGTGATAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGGCGTAGCAGGGTCTTCGATCATCGATCAATTCAG:1 + chr3L 14633281 3' - R1A1-element 290 1 66.34 GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTCAAATTATTATTACTCAAATTTATTATGCTA:1 + chr2L 16851779 3' - HMS-Beagle 41 2 66.34 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTGCAT:1 + chr3R 30553616 3' - 412 7088 2 58.42 CTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATAAATTGCCAAGAGGGCTTAGTTGTGGGCGCATTCTACTCGTATAAAGTGGAATTAGCACTTTCGTTCGCTTCT:1 + chr3R 4966158 3' + X-element 4294 1 78.22 CACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATTCCCTTACACTAGCAACTTAAATGAAAATCTAAATCAGTGGCTTATGCTTAATACGG:1 - chr2R 18976729 3' + accord 7054 2 61.39 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATAGCCT:1 + chr2R 15788626 3' + Transpac 259 2 71.29 TTTTTTTTATTTTGCATATTTTTGTATAGTTTTTAATGAGCTTTAAAGTCAATATTAATTATAATCAGCAAGGCTTGTATATAAATCGTTGGAATATGAT:1 - chrX 12850043 3' - TART-A 13403 1 73.00 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACGTTGCCTACTTCCCTGCGCATAAT:1 - chr3L 20049600 3' - jockey 4768 1 70.30 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATATAGATCCTTGTTTCCTGGGGATATTCTCCTTAA:1 + chr3L 4009482 3' - mdg3 42 2 68.32 GAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGAACACCGATACTGTCACACAGATAGCGGCCCACGCACACAGA:1 + chr2R 9626680 3' - opus 7244 2 54.17 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTTAGCTCTATATCTCGTGTCCTGCCCCACCCCCCATTTTTTTCCTGTCCGATCTGTTTTTTG:1 - chrX 7996361 3' - hobo 14 1 56.44 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGG:1 + chr2L 18248040 3' - blood 7055 2 74.00 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATTATTAGGTATTCGATACTTAATTGCAAAATTCTTG:1 - chr2L 20118390 3' + copia 5084 2 69.31 GAATACAGAAGAAATACCCAAACAAAACAGTAAAATGAGTTAATGGAAATTCTTAGCAAGTATTGTGATTTGACAGCTGCGTGTAAGCTTGAGAACAATAG:1 + chrX 22693804 3' - invader5 75 2 67.33 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAAT:1 + chr2L 20045803 3' + roo 9038 1 60.40 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTGGCTGAGATCAAACT:1 - chr3L 3596659 3' + copia 239 1 60.40 CGGAAGTGCGTTTCGTTCGGGCATTTGATTTTGATTATTGGCCTTTTAGAGTACCATTCTTTGTTTTGTGCCTGTTTCAGTATAAATTAATTATGCGCCTG:1 + chr4 69473 3' + 3S18 390 1 57.43 TTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGG:1 + chr3L 22349286 3' + BS 5042 1 75.25 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGCACCGTCCATTGAATCTGCAATCTCGACTGCTGCAAAACTCCTGTGG:1 + chr2R 6850533 3' - roo 7 2 72.28 GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCC:1 - chr3L 10474162 3' - copia 4923 2 82.18 ATTGCTTTAAGATCTGCAGAGAGAAAAAATTACAGATAATAGTATATAATAGACTTT:1 - chrX 15405442 3' - Cr1a 4244 1 82.46 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTTGCAGCACAATGAGCAACAGTCAACA:1 + chr3R 23338351 3' + roo 391 2 59.41 CAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATAATAATAATTACGAATTCATTTTTTTTAAATATGTAAATATGTATGTACATATGAGCATTAAGTTATAT:1 + chr3R 21589092 3' - flea 4762 1 74.26 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAACAAAGAGCGGGAGAAAGCTCTTGAAGAGCAGTGAAAATAGCAA:1 - chr3R 14580298 3' - blood 34 2 59.41 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAAATGCATGAATAAATACACACGAGATGAAACAAATGACAATGAATGCGAATGAGTGAATTGT:1 + chr2L 12959006 3' - roo 7 2 74.26 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAATTGTTGATTTTTTGTATATCAAAAAGAGAAAGCTAAAATATATAATTTTTATTTATAATAT:1 + chr3R 26318008 3' + roo 397 1 72.28 TAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTATTGGCTACAT:1 - chr3R 4973103 3' + 1360 10 2 43.56 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTACAAGCACATAAACACAAATACATACTAATATGTGTGTTGGGCTGCTCCATTTCG:2 + chr3L 14594189 3' - hobo 22 1 56.44 CCGGCAAACACAGCATATTTGTTAGCTCTAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTTTCCAGCACACTCGAATTGTACACTAAATGGACAGAA:1 - chr3L 18385493 3' + Gypsy6A_LTR 97 1 48.51 GCTGGTTTGGACCACCCAANTACGTCACTATATGTATACGTTCTTTAACCCGAACCACCCAACACCCTCTAGAAAGCACTCCTTCATCATCTCCCCGCAGA:1 - chr2L 9260302 3' - 297 6589 2 72.28 AAATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAATTACAGGTGATAAAGCTTGGGATGAGGAGCTCTTATGCTTTTTAAGAGTG:1 + chr2R 10956998 3' + copia 253 1 76.24 AGAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTGCACCCATTGTTTGCTGCCGCACATGCTTATA:1 + chr2R 13653432 3' - F-element 24 1 60.40 TCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCTCGTCCTCGTGTCAGACG:1 + chr2L 20045836 3' + roo 408 2 78.22 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATATATATATACATTAATATCTCTGATTTAATATGTTTTCCTGTATT:1 - chr2R 13622179 3' - Quasimodo 25 2 63.37 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCATCCGTAGTT:2 - chr3L 10474145 3' - copia 37 2 65.35 GACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACATATTACACAGCCACGAAGTGGGCTTAAGACCCACACTCACAGGACCAGCTC:2 - chr2L 15531796 3' + Stalker2 368 2 55.45 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAACAATACTGGTAACTCTGTTCATCACATTGCACAGAATAT:1 - chr2R 20312589 3' - 1360 35 1 61.39 CCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGAGTCAAAAATGACCTTGAAAACTTCAATGTTTCCTCATTCTCATTTTACACACAAAAATATCAATTGGGGA:1 + chr2L 15632500 3' + hobo 2680 1 63.37 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTGCAACGGCG:1 - chrX 4277453 3' + roo 386 2 62.38 ATATTTTAAAAATAATTGGNAAAACGAAAAAAAAAACAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAATAAAAAAATAATTCAAAAA:1 + chr4 972695 3' - Tc1 1490 1 84.16 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCTTTTCTATTAGCTTTAAATGTTTCTAGGAAAAACACCATTATTTTAAAAAGCATTTCA:1 - chr3L 13096933 3' - I-element 23 1 61.39 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTGTTCCCGAACTGCATATACATATATTAACGTGCGTGTGCGC:1 - chr3R 24976736 3' + opus 473 2 64.58 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGAGATACGGGGACTGAAACGCCGTTGACAGCGGAAGTTTTTTGTTTCTCCGATTTTTTCCAACTCAGCTCCT:1 + chr2R 9649268 3' - roo 8666 2 77.55 CTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGATAAAAGATGATTTAAATTATAGAATACAAAA:1 - chr3L 27357533 3' + mdg1 408 2 63.37 CTCGCTCTTGGGTTCTTAAGTTTATGCGGGGTGGTGTATATGTAAGTGTGAGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGCCGTTGAAGTGTAATCAACAGCA:1 - chr2R 14540186 3' - 297 191 2 77.23 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGAACATTCCCATTCCACTCCCTT:1 + chr3R 29287544 3' + hobo 2936 1 62.75 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTCCTTCGACTACTTGTGGCTCTTCGAGGTCCCTG:1 - chr2L 8622742 3' - 297 6594 2 67.33 TTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAAAATAAAGAGTTTTAAGGCCGAGTACGCATCACAAGCTCTAAAGAGAGAAGCTTAGT:1 + chr3R 3520074 3' + Bica 239 2 61.39 ATCAGTTTCTTACAAAAACNCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACTATTTTAGCCATGTTTGTGTATTTCAATTTACATTGGACTAA:1 + chrX 8503176 3' + roo 9039 1 61.39 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCATCCGTAGTTTTCGTTTCCGGTTCCGACTGGTTTTGCATCTTG:1 - chr3L 10474112 3' - copia 4873 2 75.25 TATTTACTTATTTATATACATATAATATATTAAACAATTGTTGGAGGTCAAAGATATTATATCTTAAATATGTTGAGTACATTACTGGTTTGAAGACAACT:1 + chr3R 7410538 3' - 1731 4418 1 46.53 AGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACACACACATTTAAATCCGATTTAAACT:3 + chr3L 3540237 3' - mdg3 5251 1 80.20 CATAATGATTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCATATATCTGCCACAAAGTCATGAAACTTGAGG:1 - chr2R 5010130 3' + Porto1 4395 1 67.33 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACCATACAGCCCTGTGTGGCAAAAATATAACAAAAAGTTTTGTTCATAAGATAATGATGCATTATGCATAAT:1 + chr3L 15008608 3' + 1360 3386 2 56.44 AAGTGGACCTGGTACCCGGGCGGGCCGTGCGCAGAAAAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGATACACACATCCGGGTATGAGGAGGTGGAAGGAA:1 + chr2L 23188592 3' + gypsy8 4933 2 69.31 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCACCCTTAAAACAAGTAAAATGTAATCGAACAAAACCCTATTTA:1 + chr3R 11916616 3' + roo 9038 1 58.00 AATTGTGTCTTCGTTTATTTTTCTTGTTGCCTATCCAATGCTTAATTGGGAATTTTCCTTAGCAAATGCTTTGACTAATGAGTTTTTGAGCAAGTGGGCA:1 - chrX 11032134 3' - invader3 5022 1 61.00 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGGTTCTTGGCGAGGCCAAATTTAT:1 + chr3L 13785422 3' + pogo 2049 1 82.18 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATTTATATTGATTATGGGTGATCGTCAAC:1 + chr2R 9905403 3' - mdg3 5301 2 76.24 CATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATTTTACTATACCATTTTCAGTTCTTTCATAAGATCCATATTGGAAAATCACATG:1 - chr3R 25086085 3' - Bari1 25 1 55.45 ACTATTAAAAAAAATCAGGAAAAAGCTTGCCGATGCATTTGCTTAATACAAAGCCTTATTATAAAAGTGAAAATTAAAAAACAATTTAAATTATCATTATA:1 - chr2L 14239744 3' + Porto1 4428 1 41.58 TTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTTTTCGGTACGTCTTGCATTCGCTCTGTCAAGAAAGAGGTCGCAC:1 + chr2R 2009125 3' - I-element 205 1 71.21 TCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAAGCATCATGTTATTCTAGGATCTTTGGTTCAGCGCTCTGTGCTGAGACCGT:1 + chr2R 1276182 3' - 1360 54 1 78.00 ATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAGCACTAACATATTCTTTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCTTCATACAATTTCATTTTAGATATGGCTG:1 - chrX 10608831 3' + 17.6 261 2 78.35 GATTATCGTTTGCCAAAAGCCCAAACTAAAAAATAAAATGCATATACCCCAGTCACTCGCCAGAGTAAACCACTAAATACAAAGCAAACTCGAAAAGGAAA:1 + chrX 7291645 3' - 3S18 429 1 78.22 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGATGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAG:1 - chr3L 10474159 3' - copia 40 2 74.44 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGTTAAGACTGCCACTTCGATGGAGGAAGCGAAAGTAAATGTTTGACAGTTT:1 + chr2R 19840272 3' + roo 9047 1 54.46 ATTGGAATTCTAATTAACTACAGGGTAATTAAATTACGTGGCCCGCGGCAGCGCGCCTTTGACATCCCAGAGAGGTCCTTTGTTCGGCTATTTATTTGCGA:2 + chr2R 6847361 3' + mdg1 421 2 76.24 CCCAACGTTGCTTGTGAGCAATTTCTACGTATAAAGACAATATACTCTTTATCAGTATCAACAGCTGAATCCGTCTGTATGCCCGTCCGTTTCTACGCAAC:1 - chr3R 4522828 3' + looper1 15 1 75.25 TATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCTTGTGGCCTTTGTGCACTTCTTCTTCATCTCGAATGCC:1 - chrX 13126176 3' + mdg1 7458 2 71.29 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGGGCAACGG:1 - chr3L 3650038 3' + mdg1 391 2 53.47 TAACGAAATCAGTCGTTTCTGCCATTATTGTGACCCTTTTCTTTGGCTTCGTTATTGACGGATCATTTATTCGACTGACAAAGTTAATAACTACGTAAGTA:1 - chr2R 3146334 3' - hobo 466 1 56.44 GCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATCGCTGATTTTTCGCAGTGAGCTAAGCGTTCTGAAAAACAGTTTAAGGTGTGTTCTTGAGCTTGAA:1 - chr3L 735996 3' - gypsy6 7425 2 63.37 CAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATCTGTCTTAAAATAGAAAATGAACATAAGGCGCACATTTGG:1 + chr2L 4134898 3' + Quasimodo 7339 2 62.00 AAAATTGTGTGCAAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAACTGTCTCAAACGTTGACATATTTATGAAGTAGAGATT:1 - chr2R 3336163 3' - 1360 37 1 65.35 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGATCTCAGCTATCGGCGCATCATCACACGGGACACGGAGGCCGCAGGCGCACCACCAGTTCCAATAGTAATGGGTGAGT:1 + chrX 3699012 3' - F-element 52 1 80.00 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTTAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCTATCTGCGCTGTATGTATATCCTATTTCAGTTTGCCAT:1 - chr2R 10014793 3' - flea 4792 2 62.38 ACTTATTGCAAGCATATGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGT:1 + chrX 1399899 3' + P-element 2840 1 22.73 AACTGATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCCTGAGTTTTTTTGTTCGCCCGGCTTTTATTGCT:1 + chr3L 13945114 3' - flea 398 1 67.33 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATGCAACTCTGTGGCATGCGATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGAAAACGGACCGAAAAAAAGGATATATGG:1 - chrX 12231562 3' + hobo 2937 1 71.43 GGAACTCGACTATACCATTCTCCCTTGACTATAGAGTTATATAGTTTTTTTAAATACATTCGTACGCACATACATCGAAGAAATATGTGAAACAAAATCAA:1 + chr2R 2959564 3' + INE-1 573 1 75.25 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAAAAGGTATATTCGTTGCCAAGTATGTAACAGGTATTTAGTGACGTATTTTTGCG:1 - chr2L 21715755 3' + 1360 3354 1 53.47 AAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAGGTTGAGCTCACAGCAAATGGATGTAAACACATTAACAACAACAGCAAGTGCAATAAAAGTCTGGTTGCGAA:1 - chr3R 20095972 3' + R2-element 491 1 68.00 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATAATAATCATTTTATGTGCATGTTGTGTGGCATACTTTTGTGCGCATAAATTTT:1 + chr3R 20332936 3' + jockey 4971 1 56.44 AACCAGGTTAGGGAGGGCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAG:1 - chr3L 20049639 3' - jockey 4768 1 51.61 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCCA:1 - chr3R 8765546 3' + roo 9039 1 62.50 TATAGGTCACTACATTCAGGCACCTGAGAACATTGAAGTGAGTGAGAGCGTCAATTTCTGTCCTTTGACTATGTGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCAT:1 + chr2R 4802889 3' + mariner2 279 1 37.62 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGA:1 + chr2L 20045782 3' + roo 353 2 81.19 ACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATACGCCCATGAGTCCAAATGAGTTTTCACTTTTCCACATAATTGCGTTTTTTATTTTCTTCTTTTTAATTATGAGT:1 - chr3L 15039003 3' - roo 130 2 67.33 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGT:1 + chr3R 24767845 3' - P-element 45 1 31.63 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCTAAATAATTCGGTTGCGAGCAAATGGCTTACTTTAATTTTAATTAACATTGATATTT:2 - chrX 20419107 3' + flea 240 2 62.38 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTACTACCTTGTCGCAGTTCTTCTAAAAATGTAAATGTAAAGCT:1 - chrX 17494625 3' - 1360 36 1 63.37 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATTTATCGATGTAAAAAGAGCAGTTAAGTTTTCACAAACTGTTG:1 - chr3L 21013133 3' - FB 34 1 58.42 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAAATCCTTAAAGTTCCCTTTTATTTTAC:1 + chr3R 17781608 3' + pogo 2056 1 76.24 ACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATAAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTAAACGAGAAGTTTATAATTAAATTATTGTGTTTTCAGAGACG:1 - chr2L 14089476 3' - Stalker 28 4 58.42 CAACAGCCTAGCAAGGAAGNTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGGATGTCATCTCTGCTGTATGTTGCTGGACTTTCAGAGATTTTGTTGCTGCTGCCGTT:1 - chr3L 14399685 3' + jockey 4678 1 58.42 CTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 5328 1 55.45 ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATCTGGGGATCTCCAGGCTTGTTT:1 - chr2R 8311318 3' - opus 7167 4 79.21 AAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAATCGCCGAACATTATTGCTACACGTGCACGGGGGCGTAAAGATAAATTTGATGTTAATTAAAGCCGGC:1 + chr3L 9602834 3' + F-element 299 1 76.00 ACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATAGGACCCTATACCTTCAACAGTAGATGGACCACAGCGTACTATTATGGAAATGCAAAAT:1 - chr3R 2109454 3' + Tirant 8114 2 61.39 AAAAGAGACACGTGAAATTNTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACC:1 - chr3R 11151823 3' + mdg3 213 2 57.43 CTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCCCGCTCCTGCTCTCCCGCCCATTTATGGCCATCGAAATAAAATCACGCCACCAAATATAATCAGTTGAGCTT:1 - chr2R 11031885 3' + F-element 342 1 51.49 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGTGGATGTATATGTACATGTATATG:1 - chr2R 15349514 3' + P-element 2834 1 27.72 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTGTGCTGATGCAGATGCATTCGGTG:1 + chr3R 19216393 3' + 1360 3339 1 76.00 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTACCTTACTATACTTATATGTCTATCAACTTTTTAATGCCAATTAGTGTAAATATTCATTAAATCAGCCCGTATT:1 - chr3L 19249652 3' - Transpac 5 2 74.00 ATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCACGAAGCAAATTATCTACAACTCTGGCGATAGTTTTGCTGCCTCACGCGGCCATCGC:1 - chrX 9839988 3' + Quasimodo 6889 2 65.35 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTCGCGCCAAGGAGAG:1 + chr3R 29287575 3' + hobo 2929 1 65.17 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATAAGATCGACGTACAAAGTATATATACAATATATATCCATACAGAATGGTTATAATCTTATCGGACG:1 - chr3L 6962108 3' - FB 3 1 70.97 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCCATGGGAACTGGGGAGCTATCCCCGCATTCTCGTCA:2 - chr2L 13566485 3' - hobo 41 1 62.38 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTAGCTGGCATTTTTAGCCAGGAGGGCACTCCTAAATCGCCTTTAGATAACTAG:1 + chr2R 14349195 3' - mdg3 5278 2 51.49 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTTAATTGACCTTGTGTGTGCGAAATATTT:1 + chr3L 9928626 3' - roo 9 2 70.30 CTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTGGGAAATGGGACAGCTCAAAAAAAAATTTAAGATATATGGGCGTGGGAGTTTTGTGTACCTTAAGGGTCTTAGA:1 + chr2L 21924949 3' - INE-1 547 1 72.28 AATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATTA:1 - chr3R 22869397 3' + Bari1 1661 1 69.31 TACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGCATAGTTCTGTTACTTTTGATACTTTTGATAAGGCTGCCGGTGCAGGCACTTTGGGGAGGCTCTTAGAGG:1 + chr2L 21215363 3' - BS 4975 1 72.16 GCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCCC:2 - chr3L 26852645 3' - 1360 43 1 62.38 TCTGGGATATCGATAGATAGAGTTTTTGGGCGCTGCCAAAAGTTTGAGACAAATTTGGAACATCTGTTTTTCTCCTCAAGTTATTGAATAATTGTCTTCTT:1 + chr3R 4133010 3' - INE-1 496 1 63.37 AAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAATTATCTCATTGAAACAACTCGGTGGGCAAAGGG:1 - chr2R 13817811 3' + TAHRE 10387 1 67.35 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGACACCCCCATTTGCAGCACAATGAGCAACAGTCAACACAAGAGG:1 + chr3R 23338358 3' + roo 398 1 64.36 AATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCCAGTCTATTGGGCACTTGGATGAAGCAGTAGAGCTGGC:1 - chr2L 555796 3' + F-element 320 1 68.32 TGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCTCGTTTGTATCGTTTGTATTTTTCTGCCCCGAATTCTTTTTGCACCGAAACTGCAATTCGAG:1 + chr2L 10637289 3' - Stalker2 7264 2 54.46 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAATAAATCATCAGTGCCAC:1 + chrX 15546233 3' - blood 16 2 63.37 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCAGACCGTCGCGACGGCGATGAGCAAACAACAGACG:2 + chr3R 12329687 3' + hopper 1400 1 62.38 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAGCGCTGTAAACAATAAAATCAAATTAATTATGGC:1 - chrX 16671071 3' - P-element 43 1 36.63 TGTTACATTCATTTCAAGGAATCTAGTAATAATCTAGTACAGATAGTTATATTTGTACAACGTATTTGTTGTCATTAAGATTAAATTACATTAAACCAAGA:2 - chr3R 31953793 3' - INE-1 16 1 37.62 GCCCGACTATAAGATACCCGTTACTGAGCTAGTCCAAGTGAGACCGACAATTTTCAACATTTTTAGGAGCAATTAAATTTTATCTGCAA:1 + chr3R 19197345 3' - INE-1 553 1 70.79 GTTATTGCAGTGTTACAGTNACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGACTTAGAGTAATATGCAATAAGGAAATCTAGAACAAA:1 - chr3L 8214958 3' - Doc 484 1 63.37 GTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCCACTGAGTGGTGAGTCACAAATTGCGCAAAATGCTTTTGTTAATTG:1 - chrX 7035241 3' - Quasimodo 7105 2 54.46 CTATCAACCTTCCACATAACTATATATATGGGCAATATGTACATTAGGTGATTATTTTATGGTCGCTTTAACGATTATTGGAACCGTCAAGCGACTCGAGC:1 + chr3L 11829132 3' + Transpac 310 1 79.21 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCACTTTACCAACAACGAGTTTATAATTGTTTGATTTGTGTGCGCGCA:1 - chr3L 12468208 3' - jockey 4703 1 50.50 CAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATATCGCTTTTAATATCTATAAGTTAGTTTGGTAAATCGATGAATTTA:1 - chr3R 19137077 3' - Bari1 40 1 97.03 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAAAACCTAACTTATAAACGACATAGAAAAA:2 - chr3L 13987200 3' + pogo 2057 1 72.28 GCTGGGGAACTGCCAGTAATTCAGCCAACATATCGGTGAGTAAAACACAACAACCACATTGCAAAAAAACGCGCGCAAAAAATCAACAAGAACGGC:1 + chr3L 8263159 3' + Porto1 4288 1 76.04 CTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCCACTCATGTTTTGTCGCT:1 + chr3L 5479063 3' + 3S18 304 2 65.35 GAAGATATTTCCAAATAAANTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAATAATAATAGAACATTTTGATTAA:1 - chr3R 12944695 3' + roo 356 2 81.19 ACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACAAGAGCGCTCTAAGTAAAAAATATTATTTTGCCAAGGC:1 + chr2L 3892178 3' + micropia 5184 1 62.38 ACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTTCTCCTCCCTGAAAACGCTTGATGGAGCTGGTAATCATTGACCTGAGATCCCTGGCAGCCCCC:1 - chr2L 9343492 3' - 1360 3328 1 68.32 CATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAACAGAACTATGGAGCCCGAGCCCAAAAGCATGCTGCACCTTTTGGCAGTGTGCAAATTCGTTGCTTT:1 - chr2L 21215259 3' + BS 5084 1 67.33 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAA:3 - chr2L 17994167 3' + roo 351 2 78.22 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGCACGTTTAATGCCTCCACAAAAGCAGAGGGAAAAATAATACTT:1 + chr3L 3650107 3' - mdg1 7072 2 56.44 AGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTTCTGTCAGCGGCAGCAATTGTGCCTCTTATGCCACCCATCCCCAA:1 + chr2R 6918648 3' - accord 25 2 53.54 CTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACCCAACACTCATCTACCAAGAACCCCAACCACTCGACACTCGAACA:1 + chr3L 4001747 3' + mdg3 35 2 55.45 AGCATCGGGCCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAACACAGATTAGGTTTGGTGCCCGTGTGGTAACTGCAAGTCCAGGCAAAAATCGTTTAGGAAACAAAA:1 - chrX 10851025 3' + Gypsy6A_LTR 70 1 65.35 ATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGTATTGTGAAGATAAGAAAAATAAACTGCTCTTCGTGCTCCATTTAACGTAAA:1 - chr3L 21815405 3' - G2 2825 1 53.47 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAAAAGTGGAAAATCATAAACAACAAACAAAA:1 - chr3R 14193886 3' - pogo 19 1 62.38 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTGTGTCCGAATAGTGTGGAGCGGTGCCCGATGGCCGAAGGGTAAT:1 - chr3R 6033946 3' - roo 30 2 56.44 AGTTCAATGCTTCTATTTTTAGCCAATAAACAGTTATTTTTTCACTTCTTAGTTCGATGCATTTTGTTAATGTGCAGCTAAGCAATAAAGCGACATCTTTT:1 - chr4 896609 3' - Bari2 38 1 50.50 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGAAAGATAAAAAAAAAACATGCAAATGTCAGCGGGGGAATTGGTGTTTTGGCCAG:1 - chr3R 23338260 3' - roo 22 2 55.00 CGTTTATGCACGTTCGTTGGTGGCTTAAACATGAGGCAAATCGAATTGACATAAATTGAGGGTATTTATGGCAGCGCTAGATGGGAAAACCGGCCTTAACT:1 + chr3R 31022410 3' - Ivk 5004 1 67.33 CTGGATGCGCGCCACTTGCAACATGTATGTCCAGCTGGCGTAGCAGGTAGTTTGATCGTGGGGGTAGCATCCCGCGCCACAAATACGCACAACATACATTA:1 - chrX 23439061 3' - HeT-A 5639 1 77.23 ACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTGCATTTTTGACTTAGTTTTCTTATGATTAAAATGATTTTAAATGTGCTAGAGATGGAAGTATGTTCGATTT:1 + chr2R 8127245 3' - HMS-Beagle 6677 1 75.25 ATTTAACCAACGGATTTTTTTTTTTCAAAATTATGATTTTGCTTTTGAAGTTTTGTGTAGTACACTTGGTCGTTTATTTGAACCTTATATAGTTCATGTCT:1 - chr3L 27970969 3' - HMS-Beagle2 410 1 63.37 TTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATCTACAGCCCGTTTCACATTGTTTGGCTCGGCAG:1 - chrX 11032197 3' + invader3 254 2 58.75 GTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGTTTTTAATGGTCTGCAGCACGGAAATTGATTCATTTCCG:1 - chr3L 10624522 3' - 412 7505 2 64.36 TTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTATAATTTTCGGAGCTCTGTGCTGTCAAAAAAAT:1 + chr2R 10670069 3' - jockey 4761 1 78.22 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTGATTAATAAGCTGGGGAGGGCAATACTTCCCACAATAATATTTGGAAAGTTGTACTACATTTTT:1 + chr3R 4474260 3' + copia 244 1 67.33 ACGTCCGTGGAAACCCAAGGTGGGGGACACAGTATGGGCCAAAGAGCACATCCTTTCAAAGGCAGCTGAAGGTTTTCCAAAGAGCCCAAAGATCTTCCTCC:1 + chr2L 136985 3' + Osvaldo 1281 1 75.25 CCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTGCACTACTCACATATGTACACTTCAAAAATAATTAA:1 - chr3L 21518987 3' - 1360 41 1 66.34 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCAGAAAACGAAGTGAAAGGATTTTGTAAATTACAATCTA:1 - chr2L 5926912 3' + pogo 2087 1 63.00 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTTGCGATGTAGGCTTACGAGGG:1 - chr3L 14623926 3' + hobo 2914 1 53.76 TCTTTGAATGTTTTCACTCNGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGTGCCGATTCCCTAGAACAACGGTAAGTGT:1 + chr3L 5676746 3' - F-element 4375 1 69.31 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTGATATAACATAAAAGCTATGTACCCACTTTAATCAATTAAATAAAGTGGTGTCAAGCATAAAGTGATTGGGTT:1 - chr2L 20128817 3' + hobo 2937 1 69.31 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTCGCATGGATTAAAGGGGTAAAAGGAGCAAGAGAGAGAATCGAATAAAAAGCTTTTCA:1 + chr2R 10151915 3' - jockey 4764 1 76.24 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCGATGCCG:1 - chr3R 29608767 3' + roo 388 2 62.38 ACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGTGGAAAATTTTCAAGCTTTTCCGCAGTGATTT:1 + chr3L 5415393 3' - I-element 42 1 64.36 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGGGCAACGGCAACGGATCG:1 - chr3L 3650028 3' + mdg1 402 2 59.00 AAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGTGCAGTTCGAAATCCACTAACAACATT:1 + chr3L 16282413 3' + gypsy5 359 2 73.27 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGTTCACACATCAAATTAGTTCAATTTGCGGCAAGCCCAA:2 - chrX 2841746 3' + hopper 1409 2 73.27 AGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATTATCATTTTTGTAGCTAATAATCGGTTTAAAAGGTTTTAATCATGTTCTTGTCTCCTAGATCC:1 - chr3L 16347846 3' - Burdock 288 1 49.00 CCGTAGGCACGTCTGCACTNGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGTTTTTTGTGACTTACTTAAGGGAGAACAGCACCAGCTAGCTATTCAACCAATAAA:1 - chr2L 3408605 3' - G-element 22 1 57.00 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACTTTCGAAGATCTTATTCTTTTTGCTGTGCACCAATGTAAAAAAGGCTGCGAAAAGTTCTTCAATG:1 - chr3L 4565450 3' + copia 244 1 66.34 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGGAGTTCATCATTACAGGATATTGCAACACCAACAGTAAAGCC:1 - chrX 21060326 3' + 412 7495 2 69.31 ACTGTCTTCGAGGCAATAATCATGCACTCCAGCCGGTACCATGGAACAGAAGCGACACGAGCGCCACAGAAATTTCTCTCCTTAAATGTAGCTTTGTTAGA:1 - chr3L 23434611 3' + BS3 1451 1 66.34 CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGCATCGTGTCCGCCCCTTCAAAATAATAAAGGTAT:1 - chrX 15255358 3' - Tabor 6882 2 65.35 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATAAACCCAATACTTAGCTCCTGCTGAGCCACGTTCGCTTTCAGTTTTTGAGGTAGGCCTACTTATAGG:1 + chr3L 171263 3' + 1360 3379 2 69.31 AATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCAACGAATTATAAAATCAAATTTACGGCGATTTTTCACTTAATGAATGTATACAAAAACAAAAAAAATTAAAAT:1 - 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1360 37 1 61.39 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAATTACAGGTGATAAAGCTTGGGATGAGGAGCTCTTATG:1 + chr2R 10956985 3' + copia 240 1 63.37 GTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTATCTGTGTGAGCTGGAAAAAGTAGCAAACGAGGCGGCACGACGACAACACGAACGGCAACAACGGC:1 - chr3L 12693303 3' + rover 320 2 71.29 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTTATTGTTTGCAAAAGTTTTCACCTTACTCGGCG:1 + chr3R 17660535 3' + roo 9028 1 69.31 GCAATGCATCGACGGCGCAATTAAAAGGATGGTTGAGGAGCGTCGCAAGAACAGCGAGCTGGAGAAGGAGCTCAAATTGCAGGTGTCCCTCAAGG:1 - chr3R 27232601 3' + invader2 319 1 69.47 CCGGAGCGTGTGAAGCGCAATGTCAGCATTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCGGAAGCGGGCTCTTCTCAGTGCTGCGCCGAAGATTTTTGCA:1 + chr2R 8957102 3' + gypsy4 123 2 66.67 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGACACATGTGCATTATTGTTGCCTATCTGGCGGACGTTCTCTATCCG:1 - chr3R 28565260 3' - 412 29 2 55.00 GCACAAGTCTTTAAGAAAGNGGAAAAGGCACAAAGGAAAACAAATACAGCCGAGCAATCACACACTCATTCGCACAAAATTTTTACGGGCAGTCACATACA:1 - chr3L 7405278 3' + Rt1b 166 1 77.23 GTGTACTTATAGGTACAGTNTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCTTTTAAGTTTCTATTCCACCCTGATTTATTAGAAAATACCTTTAATAGCA:1 - 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chr2R 16160768 3' - mdg3 44 2 68.32 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACACCATGCGCTCGTTCAGCAACACGCCCTTGACAATCTTCTCGGCCACATATGGTGT:1 + chr3R 23045049 3' - 412 7081 2 64.36 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCACAAAATTGCCAAACCGGCACCAAACAA:1 + chr3L 6658251 3' + hopper 1405 2 69.31 ATTCACATTAGCTGAGTAACGGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTGGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGA:2 - chrX 10445559 3' + INE-1 536 1 72.28 CAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTAT:1 - chr3R 4973112 3' - 1360 3388 2 52.48 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGG:1 - chr3L 2022248 3' + roo 9028 1 68.32 AAAAACAAAAAATTATAAAAAATGGTGGTAAGCATTTTGTCGCCTTCGGATTTGATGTCTTCATTAGGAGCCAGAATAGAATAGACAGAAACTTTGGCTGA:2 + chr3L 13234902 3' - Tc3 80 2 66.34 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGTTCGCTCAACGGCAGAA:1 + chr3R 9088645 3' - hopper 5 2 68.54 ATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAATATAGAGCAAAACAAGACCGGGAAATCGAG:1 - chr2L 14793188 3' + Stalker2 7285 2 69.31 TACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAACGGGCGCATGCATTATTCATATAGCACAAGAACACCATCAGACATTGACTTTGATGTCTACAAGGAATT:1 - chr3L 23979473 3' + F-element 279 1 69.31 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTATTTACCTACTATTAGCACCGATTTTTCTAAGTGCCCCAAGCTAACCCGAAATG:1 - chr3L 20584010 3' + pogo 2099 1 48.81 AAATTATTCAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCCCTACCTTCCTTTGCTGCTCCAACTCTACGATGGCCTTCCAATGGAATTACCGGCGTCATCGCA:1 + chr2L 18970340 3' - invader2 394 1 67.33 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGAAAAGTTGAAA:1 - chr2L 12882758 3' - hopper 54 1 75.25 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGTTGCTGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTGTGTC:1 - chr3L 13295226 3' - hopper 17 1 52.63 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAAATTCCCTCGAAAAC:1 + chr3R 9224409 3' + pogo 2071 1 60.40 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTATATTTAAAAAAAAATAATTGAAATGTGCACATGAACTTATAG:1 + chr3L 10701778 3' + roo 9038 1 63.00 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTGGCAACAGTTGGTTGCCATCCTCTATTCACTAA:1 - 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chr3L 27357561 3' + mdg1 7418 2 61.39 CGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGT:1 + chr3R 1844856 3' - Cr1a 119 1 66.00 CACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTATTATAGAACTCGGGA:1 - chr2R 12473036 3' - Doc 8 1 62.77 AACACTTACACACACACACACACACTCGCCTACTCGTCATTAATTAAGTCATCCGGGCGCACCCCTCGTGGTATGACTTACTTTCGGGGTCAAGAAGTGGC:1 - chr3R 11322884 3' + Quasimodo 32 3 54.46 TAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAA:2 + chr3R 25086155 3' + Bari1 1665 1 67.33 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCAGCTAAAATCACTCAATCAGCTG:1 - chr3R 27116740 3' - P-element 39 1 30.34 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCAAACCCGTTTATCGCTCGGCATAAATAATTGATGTTTA:1 + chr3L 13895421 3' - hobo 38 1 60.40 GAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTTTCCCCATTCTAGGAGTGACATTTCACAGCAGCGCCCACTAG:1 - chr3R 13993380 3' + X-element 4505 1 58.42 AGCTAGGGCCGACAAAGAGNTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGACAAACGAAGAAGTGGCAGAGGCATTTTTTTGGACGTGCTCGGGTATACA:1 - chr3R 6316953 3' - diver2 262 2 67.33 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAAACTCTGGCCTTATATGCAGAGCCAACTCTCAACTTTG:1 + chr2R 21040932 3' - P-element 18 1 62.38 TGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAAAGGTAACGTAATAAAGTC:1 - chr2L 20560328 3' - F-element 37 1 49.50 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAAACTCTGATTGCATTAACCGACGAGCTAGTGGCCATGCCCTGAAA:1 + chr2R 15652332 3' + jockey 4969 1 56.44 TTCTAACATAACTTAATCTNATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAG:1 - chr2R 15788572 3' - Transpac 4948 2 51.49 TTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGGTGTTTACACACAAACTACCGGATTGATGTA:1 + chr4 311610 3' + 1360 3381 2 71.29 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCAGTTTACTAGACTACAAAAGTAAACAGCACGCCACAAATTCCAAGTA:1 + chr3L 14222532 3' - roo 8693 2 52.48 TCCGGGCAGTAGAATGTTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCTGGAGTTACTGCGGCCGACATGGCGGATGCGGAATG:1 - chrX 15082862 3' - gypsy4 106 2 76.04 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGCAATCCAAACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACGAA:1 - chr2R 15788558 3' - Transpac 14 2 62.00 AAAGGCCAAATGCCCCATANTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCCTTACTCCCCGCACCATTCAATG:1 + chr2L 12882832 3' - hopper 1 2 75.26 TATTGCTATTATTATTATTATTATGTGTGGTAAATTCGCTGTGCAATGTGTCAAGTGTTCAATTGATATGACTGGCATATTGCCGATCAAATATCATTTAA:1 - chrX 7839516 3' - mdg1 7075 4 74.26 AAACAATGAACAGGACCTAACGCACGTCCCTTTCTCTTTTCAAACTGAAAAGTTTGTTGGCTCCTTTTTTCTTCTTGGCCAAACAAACACATATGAACATA:1 + chrX 7473114 3' - P-element 495 1 80.20 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAGGCAGCACCAAAAAAATAGGTTGAACATATGTGGTGTGTGTGTGTGGAAAACTAATGACAGGCACACAAGCCAG:1 + chr2R 18766303 3' - hobo 3 1 70.30 CGATATTGCGCATCCACTCAAAACGTAACCAAAATCCAGCCACTAAGCAGGCACATAGCCACGTAGTACATAAGAATTCTTTTTCCATATTTCCATAAACA:1 + chr3L 13281445 3' + Tom1 98 1 77.23 GATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTGCTGCCGCTTATGATGTTGCTCGGCGGTTTGACCTTGCCCTCATCGATCTCGCGTTGGAACGAG:1 + chr2R 6932621 3' - G2 2887 1 69.31 CCAGTCTATGATGCTTAGAACAATCACAGTGATGCCAATTTCATTTCTCAACTCGCCAGCCACAGCAACCACAACCACTTTAGTACCAGCTCTCCACAAC:1 + chr3L 27361264 3' + G3 4261 1 76.00 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTATAATTTTCGGAGCTCTG:1 + chr2R 10670054 3' - jockey 4776 1 63.37 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATT:1 - chrX 13146932 3' + roo 9034 1 69.66 GTAACTCAGCTAGAGTGAATGCGGACGCGCAAATTTCATAATTTTTCTTGGACATCCATATATATTAGGGAATACAATGAAAAAAAAATGAAAAAAAATTG:1 - chr3L 11276141 3' - INE-1 534 1 58.42 ATACAGCTGTGGTCAGAATAATAGTGGTGGGCAAAAAACGCATAAAGTGCCTAAAAAGACTTCTCATAAAGCCAATAAAAGCGTTTTAAAATATTTTTCAT:1 - chr2L 13261988 3' - HB 1630 1 70.30 TTTAAACTAACAAAAATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGATAAAAATATTATCCGAAAGGGTGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAAT:1 + chr3L 9663333 3' + Dm88 4276 1 61.39 TCGATTGCTCATCTCCCATNCGAATGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGCATACTTTTGAGGGCAATAGGGTGAAATA:1 - chr3L 21144019 3' - jockey 11 1 74.26 AATCACGGAACTTAAGGAAAAATTCCAAGCAGCTTCAAAACATCAACGGAAGCATTGGTTTAACCAACACTCGATAGAGCCTTTCCCAAAAAAAAGTTTGA:1 + chr2R 6561853 3' + F-element 4426 1 71.29 ACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGATCGACAGAATTCAATAAAAACAATTTCAGAAATCAAA:1 - chrX 10205771 3' - invader4 122 2 69.23 TACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTCGGAAATAGAGAACATGAATACAACAGCTGTT:1 - chr3R 27924055 3' - mdg1 165 2 68.32 AGTTAAGCCGACTAATAAAGTCGGGACTCTCAACATCCCTCGCTCTAGCTTAGATTAAGTTGTAAAGACTGGATGCATATTTAGCTGCAGTTCGTCTATCT:1 + chr3L 21493827 3' - Cr1a 4082 1 66.34 CTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCATGATGTTAATTACCGCTCGCGACTCC:1 - chr2L 3608962 3' + Doc 4227 1 73.27 CCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATTGACAGTTATAGCCGGGAGTGTATTTATACAACAGCGCAGATATGTGGAACA:1 - chr3L 14499020 3' + F-element 4269 1 60.40 GATTTTGCGAAAGAGTTGCGAATGGTTGATTATTGTTCGGATTCGTACGATTACCTTGATTGCCTCGCTCTACATAAGTTCTATCTCTCTTTCCTTGGTA:1 + chr3R 2838652 3' - G5A 253 1 75.00 AGATACCCGTTACTCAGCTAGATGGAAGTGCAGTGAAGTTGAAGAAATGCACTGCAATGCAAGTAAAGCGATTTCGATTTTGTTTATAACTTCCACTCTTG:1 + chr2L 20935286 3' - INE-1 542 1 44.55 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGTGTTACCACTGTATTTGCTTTACTGTTGTTGTAATTAGTTTTGTCGTCGCAGACCCGATT:1 + chrX 19308247 3' - P-element 14 1 65.35 TATAACATAGTAATTATTATAAACAACAAACGGAATTACGAAAATGTAATAAACGTTAAACGTTTAATTATAAACAAAAAATACGGCTC:1 + chr2R 24544113 3' - jockey 4836 1 77.53 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGGATGTAGACGCGTTAGCAGAAGTTTCGTTTCCTTTGTGACTCAAAGACAGAACTGAACTACCAA:1 - chr3R 6266274 3' + roo 408 1 75.82 CAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGGGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGGGCGTTCATTGTGGTCGCTTTTCATGTGTCGCA:1 - chr2R 14576519 3' - gypsy5 6983 2 65.00 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAACAGAATGCTTCTG:1 + chr3R 12333753 3' - P-element 60 1 19.80 AAAGTATTTTGCATCTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTCGTTCGCAGTGCTGGTTGTTTCTTTTTTGCCAAGGAATAAAAGCCAT:1 + chrX 10153555 3' + Cr1a 183 1 73.27 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGAAAATGCTGCAGACACGAGGGCGGTCGGTCAATC:1 - chr3R 9088537 3' + hopper 1407 2 71.29 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTACCCCTTTCACCGCAGAACGAAACCAGCG:1 + chrX 17858043 3' + P-element 2847 1 32.98 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTTCGTGGCTGTCGAATGGTTTTGCGGCCCAGTGGAGTGGATTCTTATCCTTTGGGGACCGACGG:1 + chr2R 19560249 3' + Tirant 8496 2 69.31 TTTTCTTTTGATCTCAGCTTAAGACTTAATTTTAGTGACAAAAATCTTTTTTATACTGCCCTATTGTTTACATTATCGCGGCAGCCCACTCCACGGACTAC:1 + chr2R 7053351 3' - 297 286 2 75.25 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAACAGAATGCTTCTGACAACAATTTGCGGTGTTGGGAAAAACCATTTGGCAG:1 + chr3R 12333790 3' + P-element 2864 1 54.46 ACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTATGTACATATGTATATTCAAAAAAAAATTTAAACTACTGGATGCACCATTATATTTTTTTTTA:1 + chrX 23035824 3' + HMS-Beagle2 7181 2 71.29 ATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAACCCTATGCCTACGTACATATGTGCTAAGTATCTTTTATTACACGATTTAG:1 + chrX 2707542 3' + mdg3 5300 2 56.44 CTCTGACTTGCTCATGTTAACTGACCCTTTCGAACACGTCAGATCCTTATCTGCCCTTCCCAAGGTCCTCCTGCCGGCTGGAACGGGCCTTC:1 + chr3R 1450370 3' - gypsy10 1 2 79.35 CTTAAAAGCCTTACATTTTCTGGAGTATAAATTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACTTGGGCAAACGATGTTATTGTGTTTTAAATAAAAATTTGAAAA:1 + chr2R 23809311 3' - FB 262 1 84.16 ATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATGTCGTAAATAAAAGAAATAATAGCATCAGGACATATAAAATATGCATGTAT:1 + chr3R 15151961 3' + X-element 4559 1 56.44 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGCGTGCG:2 + chr3R 24767850 3' - P-element 43 1 36.63 CACAATTATTTTCACAACGCAATTTCTTCTTCAGTGATTGGTTTAGAGTGACAAGTGCCGGTTTGTTTGGTTAAATACTTGCCGTGCAGGCCAGGCAACTA:1 + chr3R 22866760 3' + Bari1 241 1 75.25 AGAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCT:1 - chr3L 6023305 3' + hopper 1364 1 75.79 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAGAGCGAGTGAGATTTAAGCCCGAACAATAGATGAA:1 + chr3L 2176409 3' + roo 407 1 77.23 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTATAATTTTCGGAGCTCTGTGCTGTCAAAAAAA:1 + chr2R 10670068 3' - jockey 4762 1 77.23 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCT:1 - chr3R 27495657 3' + 412 451 2 63.37 GCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAAT:1 - chr3R 1875807 3' + Rt1b 4738 1 41.58 AAGAAGACTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTATGTTTTTATTATGTGTGCGTGTGTATCTGTGAGCGTAGTTGTTTATTTTTGTGGCCTGCAGTAG:1 - chr3L 5241172 3' - hopper 1163 1 54.46 AATATCTCTAATAGTTTAGAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTATTAAGTCCATATTTTTGAGCTGCTG:1 - chrX 21254728 3' - hopper 44 1 90.53 TGTAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGTATATTCCTTTTTAATTTCAAATTATAACGTACATTTTACTGTTTTGTTTGGGTCATCAGATAACTCTATCAATCTAT:1 + chr3R 10870705 3' + invader1 3592 2 76.24 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTATTATAGAACTCGGGA:1 - chr2R 12473036 3' - Doc 15 1 58.42 GGGAAAAACACCGTGCACATTTTGACTGGCCTTCTTCTCTGAACTCCTCTAAAACACCTCGTATTTTCAGTGCAACCGGCTCAAACTGTCGCCATAAATGT:1 + chr2L 5682246 3' + baggins 5107 1 73.27 ATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATATTCTCTCGAGTGGAAT:1 - chr3R 14860117 3' + transib4 2574 1 78.22 TACATTAATGTCTGTAGCGAAAAGGTATTTGTACAAGCCAGACCACACCCAACGCCATGAGCTAGAGCCGTATTCTAAAGCTATTTGAATGAAAGTACAGT:1 + chr2L 21734710 3' + Gypsy12A_LTR 2137 1 80.20 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAAATAACAGCGACTAAGGCTAATTTA:1 - chrX 12472549 3' + pogo 2053 1 76.24 CGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGCATTAAAAAATAGAAAAAACGGGTAAATTCGTGTTTATTTGATAAGGTATCTTGGAA:1 + chr3R 22325657 3' - G2 2769 1 66.29 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGACACTTATTCGCACTTATTATTGCTCTATGCGTTTTGCCTTTCAGTTTTATTATCTTT:1 + chr3R 10087904 3' - roo 8683 2 60.40 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTGCGTGTGTTCGTGAGTTCACACTTTTCTCGGGCGGGAAGAGAAGATGCACG:1 - chr2L 16683700 3' + P-element 2862 1 56.00 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAAA:1 - chrX 21217507 3' + pogo 2065 1 61.39 TATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAAACAAACCAACTACAGCGACAAAAAAATTAATAATAAAAAATAAAAAAACAAC:1 - chrX 12574477 3' + Doc 169 1 57.43 GAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTGCGCCACACATATCTCTGCGT:1 - chr2L 10199018 3' - I-element 55 1 75.25 ATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATTCTCTTAAATACTTTTTCAACGAATTTTTCAACCCGAAA:1 - chr3R 19447083 3' + roo 8613 1 61.39 CTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTGTTATTAAATGAAATTGCAATGTTTGCTGCTGACCACATTGGCGG:1 + chr3L 5960568 3' - I-element 352 1 60.40 AAAGAAATCGAAAGCGAAAGAAATCTATTTGGAGGATTAGACCCAATACTTCGGCCATCCATGGTTTTGTCTTTAAGATAGCATACATTTTTAATTGTATT:1 + chr2R 14498594 3' + Doc2-element 99 2 64.36 CGTTCTGGAGTTTTTAATTTTGGCCAGAAAAAGTGTTCAAATTTTCCATAGTCGACTGGCGACAAGAAATATGTAGACACATGTAGGCCGAGCCAGCAACA:1 - chr2L 21108692 3' - Transib-N1_DM 32 1 71.29 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCAGGACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAA:1 - chr3R 19449442 3' + hobo 2914 1 50.00 GCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATCGCTGATTTTTCGCAGTGAGCTAAGCGTTCTGAAAAACAGTTTAAGGTGTGTTCTTGAGCTTGAAAGCCGT:1 - chr3L 735990 3' - gypsy6 7419 1 69.31 TTCGACAAACAGCAGTGCTTTGCGGATCACTCAGCAAGGACGAACTAGTCATTCCACCAGAAAATATAAAACAAGAATTGAAAGCATAGCTCCACCTAGCG:1 + chr2L 18117120 3' - Tc1 478 1 73.27 TGTAAGTCTTTAAATATATNCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAA:1 + chr2R 9871066 3' - roo 8681 2 62.38 CACCCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTTCACTAACAAATGTCTACAAAGTACACTTAAAAACCCTTGATAGGACATGCTATTCTGTTTTTT:1 - chr3R 20094435 3' + Max-element 8517 2 60.40 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTACAAAGGTTTAGTCATCCAGTCATAA:2 - chr3L 20411806 3' - roo 8712 2 73.27 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCCCCAACCCCCACAGACTTTCCATCTCAGGTTGCCTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTCCACTCTGGC:1 + chr2L 12511626 3' + copia 243 1 68.32 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATC:1 + chrX 9413858 3' + 412 7502 2 67.33 AGCCCGACGGCTGCCATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGTTCGTCATAGGTGTA:1 - chr3R 30553558 3' + 412 7506 2 60.40 CATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCGTAGTGTCCTAGAACTTTAGTACTCTATGTCTGTACATATCTTGTTTAGTAAGCTGATCTCTCTTCTTAATGTCTG:1 + chr2L 8176501 3' - 1360 3 2 76.24 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTATTCTCACTTTGCTCGTTTAAATGGGGCTCAACTTGAATCAAATAT:1 + chr2L 22241801 3' - pogo 27 1 52.48 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAA:1 - chr3L 6834966 3' - hopper 46 1 67.00 TAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGAGGAGCAAACAATTTATGCAGGGACATGCTTAGTGCTGCAGA:1 - chr2L 10602204 3' + Quasimodo 174 2 58.42 ATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCAACCCCCCCCGTACAATCCAACCATTCCAAGCGTCGTAACGC:1 - chrX 17737628 3' + hopper 73 1 61.39 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGTATACCGTAAACCCTACAAATACCCTCAAAGCGATGACCAAGAAGTTAACAAACAAA:1 - chr2L 6239542 3' - roo 8682 2 58.42 ACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCA:1 + chr3L 9928594 3' + roo 8618 1 51.49 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTCTTGACATCCGATTCTGCAAG:1 - chr3L 12241812 3' + roo 9043 1 56.44 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAA:1 - chr2R 12473075 3' - Doc 54 1 77.23 AACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAACGAAAATAGAAACGAAGATAAAAGTACAACCAATAGCCAATAATGATGGCAAAGT:1 - chr3R 11188376 3' + opus 330 2 61.46 TCTTATTTGGGATTTTACANTAGCATTTGTATCTGTTGAAATTAAGAATACTAAAGATAGCTGAGTTTAATTTGTAATAAAATTAAATTTATTAATTTCTC:1 + chr3L 10110644 3' + roo 411 1 44.55 TTGGGCGTTTGTATAATCCGTGAGCAGTCTTCACTGTAACGACTCGGACCTTGTTGTCGATTCCTGCGTGCACCACCGCCAGCCCAAGTCGTGGCATCAAC:1 + chr3R 30840866 3' - 3S18 5689 1 72.28 CGGGTTGTTGCCAGCCTTTAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCTATCTGCGCTGTATGTATATCCTATTTCAGTTTGCCATGCATACTTGCAATCTCT:1 - chr2R 10014776 3' - flea 4773 2 65.66 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGC:1 - chr2L 13093792 3' + roo 9020 2 78.22 CAAAGACAGCAACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGAAGGGGTGAACCCAGCAGCAGCAGCAATCACAGAACTCTGCTGTTCGGCG:1 - chr3L 10330674 3' + Stalker2 318 2 55.45 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCGGAACACGTTGTTAGC:1 + chr3R 14193971 3' + pogo 2069 1 59.41 CTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATGTGGCATGCGAGTTGCAAGGTGTGACAACATGGAAATTTATCTGCACCATCTCT:1 - chr2R 23242784 3' - Rt1b 4792 1 55.45 TTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGATCTATTGGTCAGACACGAGATGATGCAGCATATAACTATTCCATCTTGAATAGAAGGATGTT:2 - chr3L 4009402 3' + mdg3 235 2 59.41 TGTAGAGGATCGCACATCTCGGTAGTGCCTTTATAGTGGAGTTGCAGATCATGCCCTGGAGCTTTTTTGTAGTTTTGTTCAGTGTAGAAAGTGAAGAAAGG:1 + chr2R 17253250 3' - BS3 299 1 74.26 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTTCCGGAGTGAGTGAGTTTTGGATTATGGTTTCAGTTTTTTGCTTGGGCAGCGTGGGTGGCGTGTATT:1 + chr2R 23519302 3' + jockey 4982 1 68.32 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGG:1 - chr3R 9088583 3' + hopper2 1554 1 76.24 GAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTGTGCGCGTGTATATTTCATTCTGCACTTTTGATTATAAAACTCCCCCGGAGGTCTGCAGTCGAGGGCAAGCGG:1 - chr3R 22870081 3' - Bari1 232 1 71.29 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTTTTTTTTAATGACAGAATATAACAATTCTTATCT:1 - chr3L 25782384 3' - F-element 53 1 71.00 ACTCATTTTATTTACATATGTAGGTTATAAAGACCAAAGTTGTCGCTTAAATCGACTTAGGTGCAAGCCCAGACTTCGTCATTATTTTGGCATTATGTGTG:1 - chr2R 21724471 3' + Transpac 4849 1 54.46 ATAAAAAAAAATGTAAAAACATAATTCCAATGTTGTT:1 + chrX 17972733 3' + looper1 1809 1 89.19 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCGCGTAACAAGTGTCA:1 + chrX 9413873 3' + 412 7517 2 52.48 TTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGACAGTTCCTATTGTTGTTTTCGCCAAAAAAAATATTTTATGTGCTTGGC:1 - chr2R 20403953 3' + hopper 262 1 60.40 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAATAACCTAGCTTAAAGTGT:1 - chr2L 3699399 3' + mdg3 5474 2 52.48 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTACTGGTCCGTCCGCCTGTCTGCTTTATGCGA:1 - chr2L 19681432 3' + hopper 1367 1 72.28 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCGAAAGGAATTAAATTTAAATTCCGCGTTATTTTCCGCACTAATTGCCATTGATTTCTTTTCG:1 + chr2R 1737835 3' - I-element 14 1 64.36 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCG:1 - chr2R 6850462 3' + roo 9046 1 74.65 GCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTCACTCAAACACCACACACACGTTTATATTTTCTTTGAGGATTTTTGGGCGAATGGGTGGGCGGGAAAAG:1 - chr2R 17793347 3' + 1360 3223 1 72.28 TTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAAAAACAGATCTAATGGATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACGAAAAAAAAAAACAAAATAGCACTG:1 - chrX 12038842 3' - Tc1 1546 1 85.15 ATCGATTTGCAAAAAAAAAATTCTTGCCACGTCCACTGTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTACCACGACAACATTTTTGAAAAATAGTTGGATATTTTT:1 - chr2R 4828129 3' + INE-1 316 1 72.28 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGAAACCATATTTCCTCAACATCATGATGTTACGATGAAAATAAGT:1 + chr3R 27056455 3' - jockey 24 1 59.41 AATCTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAATAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAA:1 + chr2L 22224572 3' + Rt1c 5409 1 46.53 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGAAT:1 - chr3L 13374706 3' + Transpac 265 2 79.21 ACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCAGTGTATCTAGAAAGCTGCGTAGACTTGGATTCCCTGCTCCTCTCGTACATTCTTTGCTCTAG:1 + chr2R 20990982 3' + roo 156 2 66.34 CAGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTAAAAAATATTTTGGCAAACGAATTT:1 - chr3R 15578981 3' + pogo 2053 1 78.22 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCG:1 - chrX 19034123 3' - hopper 30 1 65.17 CGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATCGCTGATTTTTCGCAGTGAGCTAAGCGTTCTGAAAAACAGTTTAAGGTGTGTTCTTG:1 - chr3L 736004 3' - gypsy6 14 2 55.45 GTTGTATTGGGAAATGCATAAATTGCTTGCTAAAGGATCCCTGTAGGTTCATCGTAATGCCTGTGTGAGTGTGTGATGTTTGAGATAATGCTAAAAACAAT:1 + chr3R 23264324 3' - Bari2 706 1 60.40 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAG:1 - chr2R 981626 3' - 1360 4 2 59.41 ACAAGATTCGTAACGCCATAGGATTTTTGGGCACACAATTTTTTGG:1 + chr3R 22264159 3' + 1360 17 1 91.30 CGTGCTCTTTGTAAAATATTAAAATCAAAGAAGAGCGGAAATTTAAATTCCTTGATTACTAATTTACAATTAATGTAAAATGTACAAATAGTGGAAAGGCA:1 - chr3R 7564383 3' - TLD2_LTR 112 1 90.10 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATAGGAGTGTGTATATAGCGAAAAGTGCGGGCGAAGGCAATGGCC:1 + chr2L 14035599 3' + flea 4986 2 56.44 AAAAAAAAAACAACAAGCTTTAAACGAGAGAGTTTCGAGCATTCTAAACATTTATACTGTCGTCCCTTATCATTCATTGGTTTAAAAAGTTGCTCTTTGCC:1 + chrX 5174324 3' + gypsy7 5018 1 73.27 TAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTA:1 - chr3L 6023300 3' + hopper 1363 1 74.26 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCATTGCCAAAAAGACACAGGCGCGCAACT:1 + chrX 21009388 3' + hopper 1379 1 69.77 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAATATTCCAGGCTAATCGCAAGACAAAAGCCACAGCTTTT:1 - chr3R 23640976 3' - 297 32 2 64.36 TATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTGCTGCCGCTTGGCATTAACTGCCTACGCATATTCGTAGTA:1 - chr2L 4134828 3' - Quasimodo 34 2 59.00 GCTGTATTTACCAACGCAGNCTGCAGCGTCTTACAAGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAGATTTTTATAAAATAGGGGGTAAAAAGGTGTTCGTC:1 - chr2L 10034119 3' + rooA 213 2 63.37 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGC:1 + chrX 22386763 3' - hobo 79 1 59.38 AGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGTTTTTTGTGACTTACTTAAGGGAGAACAGCACCAGCTAGCTATTCAACCAATAAATGTA:1 - chr2L 3408601 3' - G-element 18 1 59.00 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCAGACGAAATGTTTCCGCTCCAATGAGCTGCTGAAATATGAGCGAA:1 - chr2L 1783299 3' + roo 9042 1 56.44 AATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAAATTACCTCCAACAGTCGCCCTTACATCGATAACTCACTG:1 + chrX 4264012 3' + mdg3 5320 2 61.39 AGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAGGGACTGCAGGACTACAGGACTGCAGGAC:2 + chr3R 4845046 3' + invader3 262 2 61.39 CGATGCAGCTAACTATCGANGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAAATTGATTTTAGTTATTACTACTAACCACCTTTCTTAGTTTCATAGGGTAT:1 - chr2L 3346246 3' - pogo 20 1 52.48 GTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCATCTCTAAAATCAAAATGATTTACTTTTATAATTTTTTTTTGTGGCTCCCTTGAATGATGGCATTTCAGTGG:1 + chr3R 10914204 3' - F-element 80 1 68.32 TTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTTACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTTTTTTTTTAGCGGAAATGGGAGAACGAAC:1 + chr2R 18296070 3' + S-element 1672 1 69.31 AAGGAAACTTGATCTTTTAGGTTTCACATTTTCAAAGCGTCATTTTCCTCAGTGCAGAACTCAGGCAGCTTAACGTCAGCTGAGACAATCCTTTGACATGA:1 - chr3R 20689547 3' + Q-element 360 2 75.25 GTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATA:1 + chr2R 16185124 3' - 17.6 10 2 70.30 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGG:1 + chr3L 9928591 3' - roo 8708 2 75.25 TTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTCCGAAGGTGCTAACCAAACTCCAACTTCCACCTTGCTGGACAAATTTAATGAGTCTAGATGGGAC:1 - chr3R 31000933 3' - I-element 122 1 71.29 TGCAGCTAAGCGAATTATANTGTACTTTGTATTTACCTGTAGATTGCGCAATGATAAGTCTTGGTTTTCAAACAATTTTGTTTAGAGTAGCAAAAATGCCA:1 + chr3L 16546886 3' - pogo 1 1 73.27 TGCGATCTTCGTCAGGACTCACCATGGCACCACCTGATGTCCGAATGGCAAAAAACACTGTGTAGAACGTGACGCAATAAAATATATGCAAGTCAAAG:1 + chr3R 12829831 3' + opus 7135 2 81.63 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGACACACAGCTGGACGAAGAACTAGAAGCAAGCGGAGGCGTGGCAATACTTGAAGC:1 + chrX 22593232 3' - 1360 19 1 59.00 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGT:1 - chr2L 17730432 3' + pogo 2076 1 52.48 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGAACTAGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATTCTTATAAAAGCTTATATC:1 + chr3L 13773051 3' + pogo 2047 1 77.00 GTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAA:1 - chr4 1294992 3' + TAHRE 10427 2 77.23 ACCAGCACACAAAATTGTANGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTGCTATGTACAACGAATTAACACATTTTGCAGTT:1 - chrX 10451478 3' - hobo 44 1 76.24 CCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAAAAAGCAAAAAGATACAAAAGAATCATATTTTATGCTCTGTTTATTTGCGGAGTTGCACTCTG:1 + chr3L 2023794 3' + roo 466 2 67.68 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCC:1 - chr2L 13093794 3' + roo 9021 2 79.59 CATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCATTTGCCTGCACTGAAAACAACATTTTATTAACAAGAAAGCTTTCACTGCATCTCGCGTACTTTAACCCGATG:1 - chr3L 4802567 3' - 1360 3141 1 79.21 TGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCACTCCGGAAGCGGGAGCAATTGATGGCCCATCGGAAGGCCAAATCGAATGGGTAAATGTGGTCGTCAGATGGCTGG:1 - chr2R 23519189 3' - jockey 4759 1 79.21 CGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAGGGTCTTGAATCTTTTATGGTTATATTCACGGATTGGCACCATACAATTTCCTCGGAACCGATCCGTCTCTGA:1 + chr2R 4756549 3' - baggins 5102 1 60.40 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAA:1 - chrX 21217509 3' + pogo 2063 1 63.37 GCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAACTAAAAGCCAGCAGCAGACATTTGAATATGCCGTGCAAAGAGCAAATA:1 + chr3R 15593361 3' - 1360 3313 1 55.45 ATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGCCGGCTTCCCCTCAAAAAGGAAGCGAGCCAAGCT:2 + chr3L 13569816 3' + invader3 256 2 57.43 GCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGACCACGGACCGAATCCAGCGGCCCACAATT:1 - chr3L 26651390 3' + hopper2 1565 1 71.00 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACCCTCGTCTTCGCTCGCACT:1 - chr3L 20354032 3' + 412 435 2 75.25 GAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCACCTCACATCACCCACATCCAAAA:1 - chr3R 13739672 3' - Burdock 6159 2 52.17 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAGAGCGTAGTAACGGCAGCGCAGAGAAGAGAGTTTGGAGAGACAGAGTC:1 + chrX 21184034 3' + Juan 4203 1 61.73 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACGAAGAT:1 - chr2R 15788555 3' - Transpac 11 2 69.00 TTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr3L 11115124 3' + R1A1-element 141 1 71.13 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTTTTAAAAAAATATTTAGTAAGGCTTGAATCTCTAATCACTGCCTGGTGCGGTAAAAAATAT:1 - chr3R 19445196 3' - roo 15 2 48.51 TAATCTTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCCACTC:2 + chr3L 5479050 3' + 3S18 6056 2 73.27 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAATACCTTCTAAACTTATGAACTTTGAGAACACCATTATT:1 + chrX 8316375 3' - hobo 37 1 63.37 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTTATACCAGAATGGTGCTTTTTTCATGTGAGAATTTTACAATATGC:1 - chr3L 19647243 3' + pogo 2073 1 60.40 ATGGCTTCTACGCCTGCCTCGTCTGGATTTCCTCGAGGCAACTACTCGCCGCTCGCAAATCCTAAATGCACAAAATTTTCGAAATCTCGAAAAGGAAACAT:1 - chr2R 22388636 3' - R1A1-element 444 1 62.38 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTATCAAAATATTTTTATGTTTTTCTTATGCACAGAAATAAAATAAGTG:1 + chr3L 3596745 3' - copia 30 2 54.46 TACCGGCTGCGAATGGTTCNTAAGGAACACAACCCTACACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCCATCAGCGTCAGGTCCAGAGCCAACGTCAGATCGTG:1 + chrX 2064955 3' + BS3 1393 1 59.00 CAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGTTCCACTGTGCCGTGGG:1 + chr2R 16160799 3' + mdg3 201 2 78.41 TAAATATATTCGTGTTCATTTGTGAACATTGTTTTTATGGGCACATGCCAACAACACCAGCAACAGCAACAACAAAAACAAA:1 - chr3R 4798195 3' - roo 8671 2 65.85 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGGGGCAGTGCTCCTTTGTTTCAGTTTGCCATTTGGCTGGAGATACATAAGTGTAAGTGAAA:1 - chr3R 11607935 3' + 1360 3383 2 69.57 ACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTTGTATTGTGTAATTGCCAGTATAAGGAGA:1 + chrX 4399606 3' - I-element 13 1 68.32 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTACAAAGGTTTAGTCATCCAGTCATAATCATAACGTTAT:1 - chr3L 20411794 3' - roo 8700 2 61.39 TCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATCGCAACCCGATCATCAGTTCGCAAGCCCTCCACCA:1 + chr3L 24761267 3' - 1360 54 1 63.37 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGTCTGTATTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 9418240 3' + 1360 3345 1 70.30 CTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGATGTCACTAAAATGACCGCAAATGC:1 + chr2L 22197204 3' - roo 9022 2 76.24 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGTTTTTTAATT:1 + chr2R 672824 3' - F-element 51 1 66.34 GGGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACGAAGATACATCCA:1 - chr2R 15788548 3' - Transpac 5 2 75.25 GAAGCGATTAATCCATACAATGCAGTAACAGTACCAGCAGCGCCAATCCTTCTCGTTCAGCTCGATCACCTGGAGGACTGTGGAGAAGGTTTCCAGCTTGC:1 + chr3R 9655781 3' - BS 5071 1 70.30 GCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAAGGACC:1 - chr3R 4971388 3' - F-element 29 1 59.41 AATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATCTGAGGACCAGAAAGCTAGTAGATGGAGTTGAATCGCTTCATTTTGT:1 - chr2R 10452911 3' + Quasimodo 7346 2 53.47 AAAAATTTATTGACTTTTATTTCATAATAATAGTTTTTGCATCTTGTGTCCTCACTTCGCTCCCACGCCAGTCCACCAGGGTTTCCTTCTCCGTTCTGCCT:1 - chr3R 16563097 3' + transib4 2291 1 74.26 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTCAGCTGCTCTGCTCGCCTTTTGCGTGCTTCAATTTTTTCACGCTGCGCTGATAGATAGGT:1 + chrX 22781027 3' + Tabor 470 2 49.50 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACTGTCATTGTGCATAAAATTCCGATATAAACCCTGTAGAACAAAGTAGATAACTATATAAAGGG:1 + chr2R 17459249 3' - Transpac 4926 2 72.28 TGCCAATGCGCAGAGCTTCTGCCGGCTATTTGTTGCTCAGTTGAGTGTGCACTATTTGCGCTGTTACCTTTTTCAAATGCTGCTGCCCAGCAGTAGTTCAC:1 - chr2R 22966028 3' - springer 7228 2 76.24 CAAAAAATCGTATTGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTTTTTATTGGTACAATAGACTGTGGTCAATTTGTAAGGGTATTTAGAATTTGCACTGACT:1 - chr3R 21596191 3' - 1360 25 1 65.35 TTATTATTATTGTTATTATNATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATAAGGAGCTTG:1 + chr2L 12866960 3' - mdg1 7064 2 54.46 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATAGGAATGCTAATTAACTACAATAAAACATTTTGATGGAGCGATAGATTTATGTATATAGGG:1 - chr3R 13913011 3' + mdg1 383 2 60.40 AACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAGAAAGATGTCCTGTCATTATGCGAATTATGAGTGGGATA:1 - chr3R 12329590 3' + hopper 1394 1 56.44 AATATAAATATATAAATATATAAATATATATATATATGGCGAACATTCTAACATCCGCTTATATATATATATACTCGTAATACCCATTCAATCGTATTGTT:1 + chrX 4788311 3' + Stalker4 7046 4 55.45 GGGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAAGAACGTATTTATAAAAATAGTTGTTACATTAAAATAGTAAATTTC:1 + chr3R 6947388 3' - I-element 33 1 50.50 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATAAGGAGCTTGGTTGCCTTGCA:1 + chr2L 12866971 3' - mdg1 15 2 65.35 ACAACAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAATAAATGCGAACATAATGTTAACGTAGCCGATTAGCCTTTAGATCACATATAGCGCATATTTTACACA:1 + chrX 18881737 3' + gypsy4 488 1 77.23 GCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAAACGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCGCTGCAAACACTAGAGCTAGGC:1 - chr2R 13985471 3' - R1A1-element 156 1 76.24 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTAC:1 + chr3L 20411860 3' + roo 398 1 59.26 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACAAAAAGAAAA:1 + chr2L 17079896 3' - jockey 4808 1 52.48 TTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTAACCCTTTTTTAAGAATTTTTCCTGCCC:1 + chr3L 17122671 3' + hopper 150 11 85.71 ACAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGCACTCTCCACATCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTGGCCAAGTCAACGGTCAACAAAGCGATA:1 - chr3R 18637584 3' - Cr1a 4087 1 76.24 ACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCA:1 - chr3L 27356068 3' + Tc3 1694 1 78.22 TGTGTAAACAGTTTCTTGANAAACTGTATGTAACATACAAATACATAAGAATTAATATAACCCTTTCAGCCAAGTTTGGAATTAGACACCCAAACTGCAAT:1 + chr2L 19114633 3' + S-element 1711 2 72.28 AGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCG:1 + chr3L 25232908 3' - GATE 35 2 50.50 AATATATGTGGAATCAAATGGAATTATTATGTTACTTACTTCTAACAGTTGAACTGATATAATAAATGCTATTAAAGACAAGTAGTTTTAATTCGCTGAAA:1 + chr3R 8882167 3' + transib4 470 1 37.62 ACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTTACCTCTCTGTATTTGGCCTTCAGCTCCTCCAACCTGGCTGTCTTCTGCT:1 + chr3L 6968534 3' + hopper 2 2 55.45 TGAACCCACACACACACACACACATACACTCACGCACTGCGTGCTTAATAAGCAGCACACACACACGCACACATGCGAAAGGCCAAGGAGTAAGCCCAAA:1 + chrX 5284704 3' + accord 7028 4 64.00 AGACATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATTATAATTAGAGATAAAAAACAAAAGAAACAG:1 + chrX 2787898 3' + I-element 5084 1 65.93 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTGCGCCACACATATCTCTGCGTTGTGTGTTGTTTATACAAAAATTACTTAAAAAGAATAATAATAATAATT:1 + chr2L 1654719 3' - I-element 6 1 71.29 TTCACTAGAAACTATATACCCCATTTTGCCACTGCTGTCTCCTGTCTGTTGCATAATTTGCACCACAAGCTTCTTTTGGCCGGGACTTCCCCTTTGGCAGT:1 + chr3R 14135856 3' + Cr1a 4121 1 74.26 GGCCTGACGGCTGCACCCANCTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTT:1 + chr3R 11052152 3' + blood 7340 1 76.24 TTGTGCGGAGCACGATAAANACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGTTTTTTAATTGCTTTTCATAACA:1 + chr2R 672837 3' - F-element 38 1 52.48 CTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAAAGTCTACGTACTCTGCTTCAAGCATCAAAAATAATTGACAAATTGCTTG:1 - chrX 5134946 3' + TAHRE 10431 2 43.62 CCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTATATAACATGAATACATTTTCATTCGCCTTATTTCTGCATATAAATAACCATT:1 - chr2L 13422238 3' - F-element 4340 1 49.50 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCTATTATTGGTTGAAATTGGGTTATTGTCTAAT:1 - chr3R 8582555 3' - roo 33 2 67.78 TTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATCATGATGACCAGATATAACTGGTTACCTTATCATTACGATAGTAATATTATAAAAGGATG:1 + chr2R 10809265 3' - mdg1 7077 10 81.19 ATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTT:1 - chrX 17029989 3' + flea 4992 2 51.49 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTGTTTGAAACACTTGATTAGCGGCGATGATTGAACGGTTATTCGTAAATTGAAA:1 + chr2L 17994221 3' - roo 8684 2 59.00 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAATGAGGAGAGTTGAAACTCTCTGCAGACTTGCCTTATTTGGCTGCATACTGTAGGGCGCTCTCCC:1 + chr2R 12252916 3' + jockey 4983 1 48.51 CAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACAGCAGGGTTCCCAATCTTCCAGCTCCACCATTTGCATACTCATCGAAATAGTTGCCATAT:1 + chrX 6194875 3' - springer 363 2 62.38 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGCACCGTCCATTGAATCTGCAATC:3 + chr2R 6850509 3' - roo 31 2 62.38 GGAGGCAACGATCTTTTGGNCACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATTTTTGAGCCTTTGAGCAATTGTTCGT:1 - chr3L 5710256 3' + Transpac 265 2 73.00 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTAATCTTAAACCTTAGGCATAATGAGTGTTTGGTTTTATCAAGTAGTTTACGAAATAAACGTCAAAT:1 + chr2R 10353340 3' - blood 7020 2 68.00 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAATGCCGATCAGATGCGGAGTGGAAAATTATACGAAAAAGAAAA:1 + chr2R 12812329 3' + jockey 4958 1 60.40 TTCCTTCTTTCCTTCTTGNACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTTAGTTATTTTTAACGGCTAGCAGCCTGTTGCTCGCTGTTGCTGAGTTATTTTACTT:1 + chr3R 27292181 3' + copia 121 2 60.00 TCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTTTCCTGTGTGAGTGCGGTGTCCTCTTCTCTGCGGGATTACATCGGCTTAGCTTGTCTCAGCTGGAATACTTG:1 + chr2R 16891970 3' - Quasimodo 38 2 80.20 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTCGCGCCAAGG:1 + chr3R 29287571 3' + hobo 2920 1 57.45 AATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTCTTTAAATAAGTTTTATTTTTAGCACTTTTAGTTATTTTTGTGTATATGTTTTTTTTTTGTT:1 + chr2L 1186893 3' - copia 211 2 65.35 TACTAGAGTGCATTACTGANTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAATATTCCAGGCTAATCGCAAGA:1 - chr3R 23640993 3' - 297 49 2 80.20 GCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCT:1 + chr3L 12634203 3' - BS 5050 1 79.21 GTTTTGGCATATTTGAAGTNTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTGGCACATCACACCCGTGAACTATCTTGTCACCGTAGTGCGTATCAGCCTATTGTAT:1 + chr2R 5065002 3' - Juan 3860 1 60.40 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACTCGACTCGAATCGCCGCCGCTTGTTATTCTGGATTT:1 - chr3R 10488682 3' - roo 8703 2 63.37 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAATTTCCAAACAATGCGCAACTTTGTGCTGTCCACATCAA:1 + chr3L 9907413 3' - jockey 4710 1 67.33 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAGCTTTGCCAAACGAATGACTAAGA:1 + chr2L 19871769 3' + roo 9059 1 57.43 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCGATGCCGTGTA:1 - chr3R 29608763 3' + roo 9055 2 66.34 GCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATATATATGGAGTACGTGTATGGCTTGTAATCGGATTATTCGGTTTTAGATTCCGCTGACTTGTTG:1 + chr3R 25750255 3' + micropia 448 2 72.00 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGTTTACAGAAAACATCGTGAAATTTGCATTACTGACTACATTCTCTTAAACCTATAATATAT:1 - chr2L 8577254 3' + roo 395 1 65.35 AATCTGTTCCTCCTGATGGAAAGCGCCTTCCAGCCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCTCCAACAAATTGTAAGTATTCTTAGCTACTTCTTA:1 - chr2R 5242361 3' - baggins 5264 1 63.37 GATCAGGATCAATAGCCAAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCGCCAGTCACTCCACCAAATCCCGAGTCCCGAGTACAGAGTCCCGATCCCGTCCCATAATA:1 + chrX 3039352 3' + INE-1 92 1 59.41 CTAAATATGCGAATTCAGCNTGTACGCCTTTAGGGGATTTTAATCGTGTTTCTATGAATTCGTATCGTATGCGATGGGGTTCGTCGTACTCTTTTGTGGCC:1 + chr3R 29274960 3' + mdg1 7201 2 75.25 GAAATATAAATTATAAATTACAACAATCCCCAACCCCCACAGACTTTCCATCTCAGGTTGCCTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTCCACTCTGGCTAACTAATG:1 + chr2L 12511635 3' + copia 252 1 77.23 GTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCCAAAATAAATAGAATGAATGATTAAAAAAAAATGATGATAATGGTCTGCTCATGATTCCC:1 + chr2L 22225079 3' + G5 4787 1 80.20 CGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGTATCTTAAAGTTATCAAACTAAACCTAATAAAC:1 + chr2L 10624161 3' + roo 8938 2 63.74 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATTTTTTACGCCCGAGTTTAAAATTTAATAGCATACTTTTTGGGGCAAA:1 - chr2R 12812261 3' - jockey 35 1 50.50 TTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTCTTATAGTTTGTTTGTATTGATTTTGTTTTTTGGTGGCCGGAAAACGGAATATGGTTCAGTTGACGTCGACT:1 + chrX 2627414 3' - I-element 5155 1 76.24 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAAATTTTCGTACCAAAGTGCCACAAATAATT:1 - chr2L 6362855 3' - 412 7096 2 68.32 CATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTACCAGTCGATAACATAAATTATAAAATTAGTTTGCCAATGTGTCTGGGTCTGAGAACTGCGAAC:1 + chr3R 9275387 3' + roo 8718 2 66.34 TAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTGTGCTTAACTTGGAGCTAAAAG:1 - chrX 734901 3' + Tabor 7302 2 61.62 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTA:1 - chr3L 17181456 3' - jockey 4702 1 54.46 AAATATCTCCAATAGTTTAGAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGAAAAGTTGAAATGTTATTT:1 - chr2L 12882750 3' - hopper 45 1 69.00 AAAAAAAAAGAAAAAAAAAACGAAATCATCGAGCTGCTCCTTCTCCCTCGATCACGAAAGAAAGGCGGCTAATGGACTTGCGACATACGACCTCCCCA:1 + chrX 21203767 3' - hopper 142 9 71.43 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTATATTTAAAAAAAAATAATTGAAATGTGCACATGAAC:1 + chr3L 10701772 3' + roo 9031 1 69.31 GCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGAAGATTCATTTCAAAAATTGCTTT:1 - chr2R 17347111 3' + Tirant 162 2 76.24 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGA:1 - chr3L 13295240 3' - hopper 16 1 67.21 CAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTAACTTGGGACATAAAATGCTGTCTGTGTGATTTCTAAATGAGGTAACAAACTTGAGCTCCC:1 + chr2L 10197998 3' - I-element 485 1 68.32 AATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGGTTATGATTTAGCGTTAAATTGGGTGTGCCGATCTTTTGAAACAAATACATGTGCGTTT:1 + chrX 22581240 3' - 297 6794 2 61.39 AATTGTAGGGTGTGAGTCGNGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAGTCAGCTCGCAGCGTTAGT:1 + chr3R 7626448 3' - hobo 32 1 56.44 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATAGGAATGGTGATTGAAATGGATTTTTGTCATAGAACGAGTATTCCCTTTATTGGCGCAGATAC:1 - chr3R 26435389 3' - Juan 4045 1 62.38 ATCCGGAGGTGTCTTCCCTNGTGGACTGGCGTGGGAGCGAAGTGAGGACACAAGATGCGATGAGAAGCTAGTTAGCTGTGGTATTGCATAGAGTTGCTGAT:1 - chr2R 8677894 3' - transib4 2365 1 55.45 TGCATCTTGTGATTCAATGATTACTTTGTTTTTTTTTTGTTTTAATAAACTACATTGAAAACAAATCCCAGAAGTTCGGCTAATTTCTTGAAGTTAGCTCT:1 - chr3R 7783210 3' - rover 6848 1 60.40 TTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCCGTTGGTCACATTCCCCACACTTGGATGGCGTAGGTCAGTGTTGGATCTATAATAATAAATATAATAAAAAAAAAAT:1 + chr2L 12246066 3' - G5A 2547 1 63.00 CACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATGAATTTGTATTCAACATTTTGATAAATGTCCTAACATTGGGACGCCGAGCACAAGCTCA:1 + chr2L 14793576 3' + Stalker2 396 2 68.48 AATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTATTTCAGCTTAACTCTAGATGACCTTTT:1 - chr3L 15125879 3' - Juan 3764 1 62.38 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTATTTCAGGGAAAATACAGTCACTTAACTTAGTTGACTTTAATC:1 + chr3R 31190845 3' - pogo 27 1 57.00 ACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGATCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGAAACCATAAAGAAGTCCGGGCTTAGGCC:1 - chr2R 7242422 3' + G2 150 1 70.30 AATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAACACCATCAGACATTGACTTTGATGTCTACAAGGAATTTG:1 - chr3L 23979471 3' + F-element 293 1 58.14 AAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTATTATAATTA:1 + chrX 8727917 3' - X-element 45 1 61.39 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACCTACCTTGATAGTTTCAGGAGGGTTATCTCAATCCAATTGATGGCAGTCAGAAGTTT:1 - chr3R 1445209 3' + 1360 3373 1 62.38 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTTTTTTTACTTTAGATTTGTTCATCATAATTCGCA:1 + chr3L 16153713 3' + pogo 2064 1 69.31 AGGCCAATTGCATTAAGGANGACAGTCATCTTCCCAACGGTTCTAGTTAACAATTACCGAGCCCCAGAAAAATCGATAATTACTAATGTAACTAAATACAA:1 - chr2R 10607267 3' + gypsy3 232 2 67.33 AACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTATATATTTAAAAATGTTAATAAGCATTAGTTTCAAGTTAGTTAGCCACAGAAAATATATATAATTAATGAT:1 - chr2R 19088930 3' + Tabor 479 2 67.33 TAAACATAAACATAAACATAAACATATATCTTCGATAAATCCTTAATAACATGAAGTGTAGTTTACAGAACAGAAATCCTTAGAAAAGAACCATTTTTTCT:1 + chrX 13798935 3' - 412 7126 2 69.31 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGTGATGTTAAGATACAATATTATGATGTACGGATTCTTCACTTATTGAATAATCAG:1 - chr3R 4575423 3' + 1360 3367 1 57.43 AAAAATAAAAGAGACACGTNAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCGTATTTTTGTGTAGTTTCTCTTTTCCCAATTTATATA:1 - chr3R 27907631 3' + mdg3 207 2 67.33 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCAGACCGTCGCGACGGCGCTGACGGAGGCG:1 - chrX 2944455 3' + hopper 1401 1 47.87 CTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGGCGAGGTCACTTGTTGCCCCGCCTCGGAATCGCTGGGATCTAAT:1 + chrX 18197019 3' + BS 4804 1 55.56 TGACAACAAGTAATAATCAGTAAATATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTTACAAATCCATTAGTCAAACTTTACATTACCTG:1 - chr2R 7401787 3' - invader4 2648 1 71.88 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGTCATAAGGTCTTTTTAGTTT:1 - chr3L 3757327 3' - roo 17 2 62.38 TTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTATCATAATATTAGAGCTAAGATAAGAATTCATTGAAATTGGTATATGGTTATATAGC:1 - chr2L 11712801 3' + Quasimodo 7352 2 64.36 GATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAGACTATTACATGGGCTAGTCATTGATGGATTAGGTGAGTAATGCCTACATATCCAATCGCAC:1 + chr3L 9569761 3' - jockey 4987 1 61.39 TAACAATTGATTTGCGTTCAGGGACAGGAGCCAACAGTGCTAAATTAAAGCGATACCGAAATGCACGCTGTGTTTTATTCAGACGATAAACAGTACTATCA:1 + chr2R 24968496 3' - mariner2 257 1 76.24 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGTGTTACCACTGTATTTGCTTTACTGTTGTTGTAATTAGTTTTGTCGTCGCA:1 + chrX 19308238 3' - P-element 23 1 56.44 ACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTCTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTG:1 - chrX 20361956 3' + hopper 1397 1 59.41 GATGCTTGGAACATTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTAGTGAAGTTGATAGTCCCAACTTGGTTAGTCGGCTAACCATCTCCTCTAATACAACAGTCACTG:1 - chr2R 4886773 3' + Cr1a 4027 1 73.27 GTCTTTGTGTTTCTTTTACTCTTCCTTTTGTGCGTTGTCCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTACTGTGCTTATTGTATTTCTTGTATTTATTGTATTTATTG:1 - chrX 4731468 3' + Cr1a 202 1 60.40 TGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGGAGTTCAGTCGCAAACTTTTAAAACGGACGGGCATGGAAGGCTTCAAAC:1 - chr2L 3032951 3' + invader4 2714 1 62.50 GTATGTTAGTTTTAGTTTCAAATGATCAGTTACAATAAACGGTCGAATCAAGGCACTAGCCTGTTATGGCCACATAACTCAATAGTTCCGCACCGTCGCCC:1 + chr2L 135539 3' + HMS-Beagle2 243 2 60.40 TTGCGATGCCCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTAATGATATTGATATTTATTAATATT:1 - chrX 20016249 3' + diver2 87 2 76.24 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTACTAGATATTCAAAACTGCATATGGGGGCA:1 - chr2L 22197223 3' - roo 48 2 74.26 AATGTGTGTGTGTGTGTGTATTCCGCAAGCCTCTCTCTTGATGTTTTATTTTTTTAATATAATTGTTTGCGTATTTAGCACAAGGCCAAGCGCCTAGCGTT:1 + chr3R 23569839 3' - accord 184 2 70.30 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAAACCTTTTCTTGTTTCAAATGGCCTGGTTTTTTTATAATATTTGCTTAAATT:1 - chr3R 7513907 3' - diver 5914 2 49.50 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTT:1 - chr3R 25021693 3' + roo 9024 2 75.25 TTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCCATACGCCACTGCAACCACCCACTTACCCTCGCGGGTGTGTGAAAATAATAAAC:1 - chr3R 14193496 3' + copia 4739 1 56.44 TTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTATCTGTATCGCCTCTTTTGTTTGACAGCTATGACAGCGACCTGCGAGAGAGCGCCATTGTGGCAG:1 - chr3R 17482331 3' + copia 4986 2 75.00 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTATATACTATATATATAGAGCGTGTTGGTTTCTATTCGTTTGCTAT:1 - chr3L 14818715 3' - mdg1 30 2 53.47 TTTTTTTTTATTTTTTTATACATTTTTTATTATACATTTATTCATTTAGATACAGTATACAGTCAATTAATTTAATTTAATATTACAACTTATTTTCGAAT:1 - chr3R 13659729 3' - HMS-Beagle2 480 1 38.61 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTTGCGATGTAGGCTTACGAGGGTGGTTGGTGCTTGGGGG:1 - chr3L 14623909 3' + hobo 2929 1 65.26 GGAGCGAGGCTTTAGACTGNGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTATAAGCTTAATTCAATGTGGTATGGCATAAAAAGATACT:1 + chr3R 16735097 3' - I-element 38 1 57.43 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGTCAATGCGAATGCCCTTGCTTTTTGGCTTCTTTGCGTTT:1 - chrX 15319544 3' - jockey 4685 1 66.34 TGCACACACACACACACACACACACACAGACGAACACTTAGAGTC:1 + chr3L 7036621 3' + accord 182 2 68.89 AGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCTTACATTCCCTCTGCATGGCAG:1 - chr3R 31262357 3' + jockey 4691 1 78.22 AGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTCACTCAATCAATTCAATTTGGTGGA:1 + chr3L 16247562 3' + mdg3 175 2 75.25 TTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATGTATGCAAGTATGTATAGTGGCATGTATATGCTTCTAGCAGCTAAATTTCATGTTCATGTTGTTTA:1 + chr2L 5656954 3' - invader4 10 2 51.00 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCGCTTGAAATATAATTGGACATATTTAA:1 + chr3L 20755387 3' - I-element 51 1 77.23 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAAAAGTGGAAAATCATAAACAACAAAAA:1 - chr3R 14193889 3' - pogo 22 1 57.43 TGTGCAAAGGACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCTGCATTATTACGATTTGCA:1 - chr3R 23638084 3' + pogo 2084 1 54.46 CACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATCGCATAGTCGTTAGACGCAGCGTCGTTAGACACATCCCTTA:1 + chr4 135123 3' + BS 4795 1 59.41 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTGATTATGATATTTTTTAATGGAAGGCTGAAAGATGAAAGGCCCCAAG:1 + chr2L 17245074 3' - copia 28 2 53.47 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACACT:1 - chr2L 4063707 3' + roo 358 2 73.27 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTAC:1 - chr3L 9928554 3' + roo 9020 2 77.23 CACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTATATAACATGAATACATTTTCATTCGCCTTATTTCTGCATATAAAT:1 - chr2L 13422245 3' - F-element 4347 1 54.46 AATATGTTCTACATTTGATGCATCTAAAAGATTCATGACTTCTTTCGGCAAAGCGATTATTTTGTTTTGAGGCGTTTTATATGTAGCGATTTTGAACAATT:1 - chr2L 22678449 3' - transib3 2496 1 82.18 TATTTATAATTATTCAGTTNTCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATTATTGTTGAATAAAAGACTACACTGAGAGATAAAATACCAACTAATTTG:1 - chr3L 12706777 3' - Burdock 303 1 64.36 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTGCAACGGCGGCTA:2 - chrX 4277449 3' + roo 9053 2 66.34 TTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAA:1 + chr2R 5674745 3' + S-element 1700 1 68.32 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCTGCATTATT:1 - chr3R 23638094 3' + pogo 2074 1 61.39 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTGATAATTGC:1 + chr3R 22494162 3' + 297 347 2 76.24 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACAATAAGAGTAACAACAATGCCCAATCGACATAATC:1 + chr3R 7139300 3' + pogo 2074 1 64.44 TTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCTGATAAGAAGAAATCAATTCGTAAGTAAAATGTATCAGTCTTAATCCTTAACTTAAACAATAAATCAAAAGAACCCA:1 - chr3R 25964937 3' + HMS-Beagle 261 2 66.34 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCTTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGAAGCCGCACCGTCCATTGCATCTGC:1 + chr2R 6850505 3' - roo 31 2 62.89 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGCATCGAGCGCTTTTCCAGCA:1 + chr3R 6034023 3' + roo 9046 1 56.44 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGTTTTCTAA:2 - chr3R 21365486 3' - P-element 19 1 60.40 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAAAAGTGGAAAATCATAAAC:1 - chr3R 14193897 3' - pogo 30 1 55.45 CGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGCGGGTCTGGGTGGCTTACTGATATAAGTTGTTATTTCGCGGGGGTCTCTGTC:1 - chr2R 13223393 3' - I-element 226 1 54.46 TTTGATGCGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGCGCCCGGATGAAGCTTGATTTCTGCAACACAGAACCACAGG:1 + chr3R 28925800 3' + invader1 78 2 59.41 ATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATGGTTGGTACGACAGTAT:1 - chr2L 14793478 3' - Stalker2 7267 2 60.40 TGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGCGCTTAATCTG:1 + chr2L 12808237 3' - Tirant 8133 2 55.00 CTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATA:1 + chr3R 1977618 3' + micropia 425 2 55.10 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAATATTCCTAAACTAACTTTGTGTTTTG:1 - chr3L 13773015 3' - pogo 45 1 75.25 AAGTCGGCTGTTGCGAGCATACACCATGTGGCTGCTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAACACGCAGCACTTGCTTCCTCCTCTATTG:1 - chr3L 27328213 3' - hopper 1253 1 72.28 CCGAAGACTAGGCGGCCTTAATAAATTTGATTTGTAGTTAGTTCGTAACAGACCAGAATTCAGAGCAGTTGGGCGCCAGATGTAAGAAACAGTTTTTGCTA:1 - chr3R 1433034 3' + gypsy10 246 2 72.28 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCGTTGTGCGTGAGCACAATTATTCATTATTTCCCCTGAACGG:1 - chr2R 13763177 3' + roo 9049 2 48.51 AAATAATATAATAATATTTTACTTGTTCATATGCTTCCTTATTGCAATCATGCTAAATTATAAAACAATAATAGTCGAATAGTTTTGAATATTGTTGTTTC:1 + chr3L 18490633 3' - gtwin 303 2 60.40 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATC:1 - chr3R 25021675 3' + roo 9045 1 56.12 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCGGAACACGTTG:1 + chr3R 14193966 3' + pogo 2064 1 64.36 TAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGCGGCAGGCAAAATTGAGCAAAGATGCCAGAACGTAACATTAAAATAAACGCGCACAGATAAATCTTGAGCA:2 - chr2L 10791989 3' - 412 4 2 75.25 GTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGTGTCAGCGTAACTATAAACAGC:1 - chrX 12959971 3' - I-element 4961 1 78.22 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCGTTGAAAGCAAGTCTTTTTGCATAGCATACATTTGGGGGGCTCCTTTTCTTCC:1 - chr3L 13895350 3' + hobo 2924 1 57.89 ACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTTCATTAGCATAAGTAGATGCGAAAATCGAAAATGAAAACGAATTAGAA:1 - chr2R 9905319 3' + mdg3 5498 2 80.20 TTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGC:1 + chr2L 19642361 3' - Quasimodo 50 2 76.24 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCCTTGTGCGTGA:1 - chr2R 13763207 3' + roo 9019 2 76.24 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAACGAGAGTACCAAGAAACGGATCGAGAACTACGC:1 - chr3R 21884187 3' - mdg3 5297 2 67.33 ACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATACATTTTCTCACCTTTTCGAATGGCTCCCCGCTGACTAAGCC:1 - chr3L 5252667 3' - diver 5896 2 66.22 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAAATCTTCTCTATAAGACATGTGAAATTTGTACATAAATTTTATCGC:1 - chr2R 22462020 3' - hobo 29 1 52.48 AGATTGAGATAAGGCGCTCTGGAAAGTGTTAATGCTCTTAAAGTGCACCGTCTCGAGAAACAAGTCGTATATTCTAGTCTAGTATAGTCTGATCGAGGTAT:1 + chr3L 25846836 3' - mariner2 524 1 60.40 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTACAGCGTATGAGTGATTTTTATGGCATTTTTATTTGGTCCGTGGGACGTACGCCTCACTATAAGTATAT:1 - chr2R 20718803 3' - BS 5003 1 68.32 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATTATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAG:1 + chr3L 12634231 3' - BS 5022 1 51.49 AGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCTATATGTTTTT:1 + chr3L 20224209 3' - Chimpo 43 1 70.30 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCCATTTGGGGGAGAGGAGTGATGCAAGA:1 - chrX 4264339 3' + mdg3 218 2 50.50 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAACTCTGATACTGGGAAACTCTCTCAATCACCTAGAGTTGTGGAGAGTTTAAAGACTC:1 + chr3L 25876155 3' + copia 236 1 67.33 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAAACTACTCATACGAGTGG:1 - chrX 21217491 3' + pogo 2081 1 59.41 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAGCAATGGCTAAATAGTTTTGCATTCGATAACAAAA:2 + chr3L 12438061 3' - I-element 44 1 69.31 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTTATTGTTTGCAAAAGTTTT:1 + chr3R 17660521 3' + roo 9023 2 81.52 CTCAGCTGAGGGTTATGAATCGAGCATGCCATATAAGGACGATAGATATCTTAAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGAATATAATAATAAAAAAAAAACTA:1 + chr2R 18392279 3' + Rt1a 4993 1 83.84 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCGCGTA:1 + chrX 9413863 3' + 412 454 2 62.38 ATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCCAACGCCATGAGCTAGAGCCGGTCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGAAAAAATGCGACGCCCACAAGGGACTGCAC:1 + chr3L 5758038 3' + Gypsy12A_LTR 2163 3 70.30 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACGAAACCAAAGCAAACCAAACCGAGCCAAACGAAACGTTGGAAAAACTTTTGGCGCCCCGGCAACGGAGACGG:1 + chr3L 17186904 3' - Tirant 8108 2 79.80 CGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTACTTTAGCGTTCCGTGGAAGGTGAGGCACTTGGGATCGATGGTCACGCGCCCATTGGTC:1 - chr3L 15549592 3' + R1A1-element 35 1 57.43 CATAGACACACACACACACACATCCATTGTCGGGCGCAGTCAACAGGCCCCTAATTATGTGTAAAGGTGTTGCATGTGCTCCTCGCCCCAAGAT:1 + chr3L 1430066 3' + accord 7026 2 79.79 AACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATAGGAATGGTGATTGAAATGGATTTTTGTCATAGAACGAGTATTCCCTTTATTGGCGCAGATACCGTTTTCAGAGGC:1 - chr3R 26435376 3' - Juan 4032 1 75.25 CTCCTTCTCTTCTCTCGCTNTCCTCCTCCTCGCTGGCCAAACAGCACTCATCAACGGGCCATTATAGATGGCTAAATTATTTATTGTCAACAGTGTATGGT:1 - chr3R 28593758 3' + Max-element 101 2 79.21 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAAACTCTGATTGCATTAACCGACGAGCTAGTGGCCATGCCCTGAAA:1 + chr2R 15652332 3' + jockey 4970 1 56.00 CACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGAGCGACTATAGCACCATGCGAAGCTTCCGATTTCATCATCCTT:1 - chr2R 18171512 3' + P-element 2886 2 67.61 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGAGATACGGGGACTGAAACGCCGTTGACAGCGGAA:1 + chr2R 9649231 3' - roo 8706 2 68.32 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTAATCTTAAACCTTAGGCATAATGAGTGTTTGGTTTTATCAAGTAGTTTACGAAATAAACGTC:1 + chr2R 10353336 3' - blood 14 2 63.37 ATTGAAATATTGCAGAGATACCAGTCTATGAAGTCCGTGCGGCATTTCGGTTTGGTTTGGCTTGGTCTTTGGAGGACTGCTGCTGCGTTGGGAGATTGCTT:1 - chr2L 21005788 3' + G3 4241 1 80.20 TTGCAACATTGTTTATTTAAGAGTTCCACTCGTCGTTTTTGGTGAACGGGTGTGCATAGTAGCTGCATACTTTGCTGCGTAGTGCTTTCAATTAAAGTTTA:1 - chr2L 7634965 3' + Tabor 6912 2 59.41 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAATAATGATAATGATATTTACCAAGAATGTGGTTCT:1 + chr3L 13987256 3' - pogo 36 1 70.30 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGTTTTCTAACACGGAACGAGCTG:1 - chr3R 21365472 3' + P-element 2882 2 74.26 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATAAAACTTAACGATTTTTTTTGTACTGATCAAGCTGTA:1 - chr3R 25581020 3' - pogo 37 1 69.31 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACATTATAATAATGAAACAGTTAAAAAGCAATTATT:1 + chrX 7788652 3' + 412 7500 2 68.32 TCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGTTTTCCCATTTAAGGAAAAACCTAAAAACCTGAAAACGCATTTCCAAATGCAAATCAAATTGCTACCATTTCCGC:1 - chrX 520857 3' + INE-1 546 1 75.25 GTTTTATATGTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGGAGACATCACCATTCTGAAATCCAAACTATGAGCTGCGTTTTGTTT:1 - 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invader3 5223 2 62.38 TGTCACCGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGAAATTGATTGATTCGACACTGGGT:1 - chr3L 20767113 3' - flea 4654 1 75.25 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGTATTTACCTGTAGATTGCGCAATGATAAGTCTTGGTTTTCAAACA:1 + chr3L 16546859 3' + pogo 2073 1 53.47 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTACCAGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTACCAGTGTGTTTGTAACCCACCTTACAAACTTGTT:1 - chr2R 8177682 3' - mdg1 12 2 65.35 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAAGTTCAAGTTCTAGATA:1 + chr3R 11052175 3' + blood 7363 2 54.46 AGCTTGAAAGAAACACGTCNCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGACCGCATCCATTACTCAAATTTTATTAAACATCCAACATCAACAACGGACA:1 + chr2L 126555 3' - Doc 29 1 52.48 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCATCTCA:1 - chr2R 9649193 3' + roo 354 2 82.18 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGTGTTTGGCAGACATGGGCAAGGCA:1 + chr3R 17053151 3' - hopper 13 1 66.34 CATGAACACGAATATCTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACCAAGAGTTTTGGATTATTAAGAAA:1 + chrX 23050360 3' + roo 8673 2 73.27 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGGGGTTGCTCACGAGAATA:1 - chr3R 21297338 3' + P-element 2831 1 24.75 AAAAGACATCTGCAAAGCGACTAATAGTTTTTGCCGGGGCTGGGTTCAACAAAAGAATGTTAAGTTCCTGCACAGAAAAGAAAG:1 + chr3R 17059461 3' + hopper 386 1 67.86 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCA:1 - chr2R 15788581 3' - Transpac 4957 2 58.42 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGAACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGCCC:1 - chr2L 17730458 3' + pogo 2056 1 77.89 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGGTTTTTTG:1 + chr2L 4063758 3' - roo 8696 2 62.38 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTGCTCGCATTTTCCCAGCTGCCT:1 - chr2R 7838990 3' - pogo 51 1 79.21 TGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGT:1 + chr3R 11151896 3' - mdg3 27 2 52.48 ATTTGTATACACTATAATTAAGGAACAGAATCCATAATATCTTATAAGCTGAACGATTCCTACTGCCATGAATAATTTGTATTCACCCATATATCGCTGGA:1 - chr2L 16925493 3' + G5A 2738 1 72.28 TGAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAAT:1 + chr3R 19449936 3' - hopper 388 1 64.36 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGTAGGTGTTTGGCAAAGAAATTTAAATTCGACTCACGTACTACGAAATAACCAATAA:1 - chr3L 11828988 3' - Transpac 9 2 39.60 CTGCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTGTGTGGCGCTCAGTGGGTGGCAGTTGCGTTTAGTGTGTGGTGGTCTTAGCG:1 - chr2R 22279279 3' - accord 187 2 73.27 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCTAAATCGCACAATCAAAAATAGTTGTTTTCACA:1 + chr3L 5710306 3' - Transpac 4957 2 62.38 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCAAAACAAATTAAACTAATAATAGGAAGCGTTTTTCACGCTTTG:1 + chr3L 7099675 3' + roo 400 1 68.32 AAAGATGCAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACATAACACCTGCTTAAAGAGCCGCAAAAA:1 + chr2R 8177751 3' + mdg1 369 2 71.29 ATGTGGAAGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCCGGGCACAGTGTTTTTGGCCATTTTTACAAGTGACTTATGAATTATTCCGTGCACTTGCTCCTGTCCATC:1 + chr3R 30384451 3' + aurora-element 4104 1 51.49 TATATTAATTGGCACCCAACTCCAGGGACCCTAACCCGACCCATGGAGCAACCCAACAAGGTGCAGGAGATGGCCAGCAAGTGGACCAGTTACGCCTTCTA:1 - chr2L 2572120 3' + springer 395 1 76.24 CTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATGTTTTTTGTGTTAGTCGTTCCATTTGACCCTTGCG:1 - chr2R 17447671 3' + Quasimodo 7120 2 65.35 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAGATGTATATATTTAAATAAAATGCCCCCGCTTCCAAAACCCACGTATCAGCTGCCAAAGGTAATCAA:1 + chr2R 21962727 3' - 297 6585 2 68.32 AGATACCAGATAAGAATAAGACTGTCATATGATCCTCAAGACAAGGAGGATGTGGCAGAGGATCGGGAACAGGA:1 - chrX 13884639 3' + Idefix 6922 2 62.16 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTATATTTAAAAAAAAATAATTGAAATGTGAACATGAACTTATAGATGAAC:1 + chr3L 10701784 3' + roo 9043 1 59.41 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATTGCTGT:1 + chr2R 9631751 3' - F-element 57 1 78.22 TTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATAATAAGCGTAGTTCTAATATCTCAAATACCTGTTAACTTTATCGCTATGTATTTTATGCAACCCCGGGTT:1 - chr2L 20585424 3' + 297 6623 2 76.24 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTAGCTGGCATTTTTAGCCAGGAGGGCACTCCTAAATCGCCTTTAGA:1 + chr2R 14349188 3' - mdg3 5285 2 55.45 TGCACAAATCACAAAGAATCACTCGCGAATCAGCGAGTTCGTTTCCTGGTGTGACGTGGTTTTGGGCTTGAAAGACATTTTATTATGTTTTTAAAGTGTAT:1 - chr2R 5582032 3' - Cr1a 142 1 71.29 AGTTAGCTGCATTTTTAAGNTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAAATCCTTAAAGTTCCCTT:1 + chr3R 17781599 3' + pogo 2047 1 82.18 GATCGTCCTCGCGAAGCAATGCTTCACAGCCATACCGCGGGGGGTCCTGGTTAGCCACTACCCAAACGAAATCATGAACAACATTTTGAGGTGAAGTGTAT:1 - chrX 14766135 3' + Rt1c 5317 1 51.49 TAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCGGTGTGAAAAACTATCAAAAGCAAGGCGATAAAATAACGAGG:1 - chr2L 10301596 3' + Ivk 257 1 58.42 AATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATATTCTCTCGAGTGGAA:1 - chr3R 14860118 3' + Stalker 86 4 77.23 TTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCTTTTCTAGGTATACATAACACATACACCCTCCATTCGATCGGCAAAATTTATCTTTCGGCAACA:1 + chrX 4268728 3' + mdg3 31 2 66.34 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTC:1 + chr3L 20411843 3' + roo 360 2 73.27 TTATTTGTCACAGCTGTGGCTGGTGAACAAATATTCTGAGTTCTCTAATTATCTTCGGGGGTCATCATCTTATAATATTGGCCTTTCCGACATGCAATAAA:1 - chr3R 27801047 3' - gypsy4 325 2 52.48 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTCTATGGAATATCTAGTAGTTTTGA:1 + chrX 17883681 3' - pogo 48 1 78.22 TCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGCCTGCACTGTGCTAATCTACAT:1 - chrX 15944894 3' - blood 7304 2 80.81 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAAAGGTCCTTGAAAATCCAGAT:1 + chr3L 18418915 3' - hobo 22 1 57.43 TTTTTATTCTTTTTCTTTTCAATTTATATTTATCGGTTCTCATGGGATCTATATAAATTCAATAAAGTCAATCTTAGCTTGAACTTACTTGAAAATTCAAA:1 - chr2L 21387259 3' - Doc2-element 215 1 59.41 AATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCCGCCCACATATCATCAATTCCGTGCCATTTGGCC:1 + chr2R 14576564 3' + gypsy5 7305 2 72.28 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCGTTGAAAGCAAGTCTTTTTGCATAGCATACATTTGGGGGCCTCCTTTTCTTCCTGTT:1 - chr3L 13895346 3' + hobo 2928 1 64.21 ATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACCATATGTAGTCTAAGATTTTCAAACACGACGCTTTTCTTTCCTCTTG:1 - 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Porto1 4309 1 73.27 ATGAACGGAACCCAAAATTNTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCAGTTTACTAGACTACAAAAGTAAACAGCACGCCACAAATTC:1 + chr3L 14222526 3' - roo 8699 2 55.45 TTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGTATAGGTTTTGGTCTATAGTTTTTGCGCTATTATTCGCTGTACAAATG:1 - chr3R 19505527 3' - mdg3 5272 2 53.00 GAAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGAACTTGATTTTTATTATCATACGTGATTTAATGAACAATGACGCCTGCTTAGGACACGAG:1 - chr3L 1729568 3' - Doc2-element 448 1 68.32 AAGTTGAAAAATTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTGTTGAATGGAGGGATGTATTGCATACCATGTACCTTTTATTTTGTCGCCTCTGGTG:1 + chr3R 25510825 3' + hopper 1033 1 64.95 ATATTATCCACAAAAAAAGTTTTCCCCAACATTTTTTTTAGTTTTTTTTGTTTGCCCACCCCTTTAAAAAACCTTTACAAAAAATTTTTTT:1 + chr3L 4714885 3' + FB 336 1 45.05 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAAT:1 + chr2L 17079873 3' - jockey 4831 1 75.25 AAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGCATATAAGCCGTATCTATAAACAAAGCGAAAACCTTTGCCAAATAAATGTTGT:1 + chr3L 16563294 3' - 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Doc 4518 1 79.21 CGCGTCTGAAGTAATAAGGCGGCTTTTCATATTTTTATGGTGGTGGGATCGTCACACCACTGCGACCGTGCGCATGTGTTAGATCTCCTAGTGGTGGTGG:1 - chr3L 11832741 3' + diver2 4441 1 74.00 CCAGCGCCCCAGTAATACGATTTAACGCTTTTACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAAAGAGACGCAATTATCATGTGATCGGAATTTGAGATAAGTGA:1 + chr2L 16648523 3' + Stalker 141 4 59.00 AGATCTCAGGAAATATAGAAGCAAGAATGTGAAAGTTTTCAAATAAGTGGCTACTTATAGCGATAATTGCATACTTCCAGGTACCATTTTCAAATAGCTAT:1 - chr2R 8713023 3' + INE-1 149 1 68.32 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGGATGTAGACGCGTTAGCAGAAGTTTCG:1 - chr3R 6266311 3' + roo 361 2 73.27 ATTTCCAGAATTGTGAAATTAACACCGATCACGTAAGTGTGAAAGCGAAACAGATTGAGTCGACTCTTCCTACTCCCACGGCACTTGATCCGCCCAAGCCC:1 + chr3R 26597749 3' + mdg3 498 1 62.38 AATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAATTGAAATTCAAGAGCAGAAAAACCAAGAACAACAAAAGCATGCCGGGGGAAAAGCGGGAAAA:1 - chr2R 10911728 3' + Stalker 232 4 68.32 AAATTTTAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGCCTACCGTGATTAATATCAATCAACAGGCTTATAATGCCTGCTTGAATTTTTTCGCCTT:1 - chr3R 19448864 3' + 1360 376 1 72.00 GCTCTCCTCCTCGATTCTCATCAGAGCAAAGGAGGTTGGTAGTTTTGGAAGATGCAGAACCCGAATGAAACTCGGGAAACCAAGATCAAATGTGAGCTAGT:1 + chr3L 8109630 3' + NOF 295 1 60.40 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGCGACTGCCTCGAAAATTGA:1 + chrX 14651123 3' - P-element 57 1 22.77 TTAGTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAGTTGAATTATGTAACATTATTAACAGCCTTCTCTGTTTGCAATATAGAGCAAACCTAATACAAA:1 - chr2R 2565649 3' + Cr1a 4280 1 63.37 TCCCAAGACAGTGGAAGATGGCAGCTATCTTAAATAATTCATAACCATATTGTATTATGTCCTCAGAAAATTGCCGCCACAGGACAACGCCTGCTGCAGTT:1 - chr2L 10186030 3' + Helena 110 1 75.25 CCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATA:1 - chrX 983336 3' + Juan 4160 1 78.22 AGAGGTATGTTTTGCTTTTTACCTTTTCAATTTTCCTTCTGCTTTCTTCTTATAAAAATGTTTTTGGAAATTTAAAGATGTTGTGCCATACTAAAATGTCG:1 - chr3L 19133633 3' + Tc1-2 128 1 60.40 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCTTAGTGAATTAATCCAAAGACTAAAAGGATCAATTGACAATATAATGGAGATCTATGCTT:1 + chr3R 19446319 3' - I-element 17 1 62.38 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCCATCCCACGCACATGCAACAAGAAATGGCAAAAGTTTTCGATACGCCCCCGTACT:1 - chr2L 10625660 3' + roo 9052 2 60.40 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGTTGTCAATTCGTTCCAGTCGCTTATCCACCTTGTGCATTAGAATGAATGCCTCT:1 + chr3R 21884252 3' + mdg3 223 2 55.45 GGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACAAAATGGGAGCCCCTCACATCGCGCTGTTTGCTTCCACAA:1 - chr2R 9640992 3' + jockey 4700 1 61.39 GGAACCACTATTATCAACAATTTGTTTAAAAGAAAAAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAAAACACTTTCGATCGAACAGATGAGCTCATTATTGAATCTCAAC:1 + chr3L 14949988 3' + transib2 2399 1 61.39 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCATCTTGGCCAGC:1 + chrX 19034200 3' + hopper 1401 1 65.35 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACATTATAATAATGAAACAGTTAAAAAGCAATTATTAGAAATAGTG:1 + chrX 7788662 3' + 412 7510 2 58.42 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGGGGGAGACACGTTTCCCATTTAAGTTGATGCAATTTCTCAA:1 - chr3L 18418842 3' + hobo 2904 1 57.43 AATGGTTATTTTAAAAAGAATTTAAAGTATGCCTCTTTAGTTATAGATATCCGTGGGGCAATGTCTTTAATGATTGCTAATACTGTTGTACTTGTAGTTGG:1 - chr3R 13353310 3' - Tc1 1495 1 57.43 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCGCCACCCCCTCTCCCAAATGTGGGTCAGTCAAAAGTAAAAATTCTTTCG:1 - chr2L 4924510 3' - hobo 28 1 51.49 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCTTGTAATATCGAAATCAATGAGATTCGTAATTCTGTCGCTGATTAC:1 + chr2L 9045476 3' - jockey 36 1 54.00 ACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTGATTAATTTCTGGTAAACTAGTTCCAGAAAAC:1 - chr2R 4545533 3' + Quasimodo 361 2 68.32 GTCGAAAATTAGGGAAAACCTTTGTTTTAAATGTATATAGTCCCTTTATAAGAGTCCCTTCTAAATCTAAATAAATTACTTACTGGAGAGGAATGTTAAAG:1 - chr2L 922456 3' + G-element 3853 1 54.46 CGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTGTAACTGCCATATACGAGCTGATGGGCCGCCTGCCGGACGAGTGTCCCGAGGAGGAGAAGA:1 - chrX 11225895 3' + Doc 4303 1 66.34 CGGGAAACACGAGCCGGAATTCGTGGAGTCAGCGGAGGAAGCAAGAGTCGGACGACTGCAGGCAAGCAAAATTGTAAACAGAAAATTTATTTAGTTACTC:1 - chrX 20983842 3' - gypsy12 389 2 81.00 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTGGGATTGTTATGTTTTCTCTCCCACACATAAAAAATGGGGGAAATT:1 - chr3L 7307211 3' + hobo 2919 1 53.26 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGATAGGGCTGAGAACATTTAAGTTAAACCGATAAGCTAGTAAAATTGTATGAG:1 + chr2R 13763263 3' - roo 8684 2 51.55 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATTGCTGTGCACATTGCTA:1 + chr2R 9631762 3' - F-element 46 1 67.33 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCAAATAATAACCAAATAAAACAAAAGGATACACTG:1 + chrX 4277523 3' - roo 40 2 67.33 TCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGAGGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCTCTCTCAATCTATCTATCTATACGTAGATACATATCTC:1 - chr3L 5245199 3' - Ivk 355 1 60.40 AAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGGCCACAAA:1 + chr3L 5241167 3' - Ivk 40 1 67.33 AACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTCTCCTTTTCTCTTAAGGATGGTTCTACAGTTTCG:1 + chr3L 25730446 3' + copia 445 1 66.34 ATAATATATGAAAAAATAAAAAGTTTCATTAAACATTTGTGACTTTGTGCAATTTTT:1 + chr3L 15645306 3' + BS4 731 1 89.47 TAGACTGAGAGGCACGACTNATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTTGTATTGTGTAATTGC:1 + chrX 4399593 3' - I-element 26 1 55.45 AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTA:1 + chr2L 17079879 3' - jockey 4825 1 69.31 CCTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTAGGCACTCACTGAGGGCTAATTGCTAAAACTTAAATTTGATCGGTTCGCGAA:1 - chrX 20375788 3' + baggins 5018 1 64.10 CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGCCAGCTAATGTGTGTGTAATTTTATTTTTATTTGTACAGCAGTGT:1 + chr2R 17392687 3' - opus 7144 4 55.00 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACTTTACCCAAAAACACAATTGAATAATG:1 - chr2L 7666120 3' - roo 8712 2 73.27 CATCAGGATCACTAGCCGAGTCCATCTGGTCCATGTCCGTCTCTGCAGAATCGGACGAACATGATGCATGAAAGCCTTGTAGGTCGTTAGGCTCTGCAGCT:1 + chr3L 19888011 3' + INE-1 92 1 59.41 AAATTAAAAAAATTTTTTTTTTTCAAAAACAACAAAGTGGTGTTAGGGACAGTAACTATAGATTATCAGCACCACAAAACAGTTGTTCTTGCCTCTGTGTG:1 - chr3R 22343541 3' + HB 329 1 76.24 ATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCCGGCTACTTTTTCCACTAAGCCGCAAAGCTTTTTTGAGTATTTCCCT:1 + chr2L 2069153 3' - Ivk 394 1 53.47 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAGTGTATTTTATTTCAGACTTTCCACAAAACTTAATTTACATTCT:1 + chr3L 19647323 3' - pogo 28 1 62.38 TAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCAT:1 + chrX 3431956 3' + Ivk 5358 1 52.48 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTG:1 - chr3L 3650046 3' + mdg1 7445 2 53.25 AAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTAGACTATCGTAGTTAAATTGGGTAACATAAACATATGGATAACACACAGTACAGATTGAAGGGGAA:1 + chrX 6548704 3' - Tc1-2 1554 1 77.23 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTT:1 + chr3L 20354051 3' - 412 56 2 79.21 TTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGACTGCGCGAAATAGTGTGTTCGTATATGGAAATTGATATATATGTATAT:1 + chr3L 1584138 3' - Tirant 458 1 56.44 GCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCATCTCTAAAATCAAAATGATTTACTTTTATAATTTTTTTT:1 + chr3R 10914171 3' - F-element 111 1 61.39 AACGGGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGACTATGGCAATTTCTCTTGTTATTTGAATATGGAATGGAATATATTAAAATTTTTTTAAAGGTATTTGTTTAC:1 - chrX 21388009 3' + INE-1 553 1 51.49 TTTTAATGTATGTACTTAATATATGTATAGTTTTACTGTTTTTGTGTTGTGTAAGACACATAAATTACGTTTGATTATCAAAAACAGTTACCAAAACTACT:1 + chr3L 14846659 3' + transib2 299 1 55.45 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTACGTAACATTTTGAGGAATTCACAAAATGCGGCTAAAAACGTAACAATTACCTCACAAATACGAAATCT:1 - chr3L 20520655 3' + P-element 2881 2 71.29 AAAATAAAATAAAATAAAATAGATAAAATTCATGCGAAAAACGGACCAGGTGTAAAGCCAAAAATCAACAAGAGATAAACATGGCTCTTAATTAATTTTGT:3 + chr3R 25933198 3' - transib1 1898 1 80.20 CAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATGCTCCTGGGAGTGAAAAGCACTCATTATTTTAAAGAAAATGATTTCATTGAAACAAAAGGGCTATCACATGT:1 - chr3R 12332423 3' + hopper 1130 1 79.21 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCCACGAGCCAGAAGTAAAGTTTATATTGTCGACGTTTTTATTGATATCGTAAAATTTGCAAAGTCCAACACGA:1 - chr3R 22238647 3' - hobo 5 1 74.26 GTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATT:1 - chr3L 27356105 3' + Tc3 1657 1 79.21 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGAAAGATAAAAAAAAAACATGCAAATGCCAGCGGGGGAATTGGTGTTTT:1 - chr3R 23338266 3' - roo 8693 2 61.39 GGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGCAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGTA:1 + chr3L 25350824 3' + baggins 5417 1 40.59 TCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTGCACTTCAACCTTCCTTTTGGTGGCCATGCAGTGAAAGTATTAAATATTTCCAATAAACTTGAAAGTACCAAGC:1 - chr2L 18514308 3' + gypsy10 339 2 77.23 AAAAATGCTCAGAATAATTACAAAGCAGGCAGGTCCTTCATACGTTAAAACCTAAATAAACATCAAATCTCAGTACTTTCCTTCTCTTCGTGCGATACGCA:1 - chr2L 1026883 3' + Porto1 4340 1 74.26 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCC:1 - 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P-element 18 1 58.70 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACGAATATATTTGCTTTGTCTCGGTTCTTTGCATACTGCCATCTCGCTTCGACTCTG:1 - chr2R 17392598 3' + opus 7485 2 63.37 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTAAAACAAATAAAAAAATTGTTCTTACTGGTTTGAATAATATTAATTCCT:1 - chr3L 16546770 3' - pogo 24 1 56.44 AATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGACAGATCCGAGGTGGGGCTGAGCCCTTGAAATTACCATAAAAAGATGCACTTAA:1 + chr3L 906947 3' - McClintock 6134 2 62.38 ATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTCAGCTGCTCTGCTCGCCTTTGAAGTTTCATTTTTTCATTTTGCTACCAGCCCACGAAAACGAC:2 - chrX 22789299 3' + Tabor 7312 2 62.38 TATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACG:1 + chr3R 25086153 3' + Bari1 1663 1 69.31 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCGAT:1 - chr3R 29608771 3' + roo 9047 1 58.42 ATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAAGTTAATAAATAGATTCACAAAAATTTGCAGG:1 - chr2L 2798245 3' + mdg1 7285 2 75.25 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTAAACAAAAATTTGCGTACAGTCAAGTAAACAATTA:1 - chrX 15800901 3' + roo 9033 1 67.33 CTTAAAACGGACTTGTGTTNTTAATTGGAGATCATCATTACACCGGACCACCCGCTCCCATTCGTGCCCATTCCCAAGTTGCCAGCGCCCATTGCCTCCTC:1 + chr3R 6961145 3' + 412 473 2 54.46 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGAGTGTAAGATGAGTTAATTGTCTTCTTG:1 + chr2R 20312638 3' + 1360 3342 1 72.28 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACA:1 - chr2L 4063709 3' + roo 9020 2 75.25 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGCTGTTAAGCTTTAAAAA:1 + chr2L 18248067 3' - blood 7024 2 62.50 CGGTAAATTAATTAAAAGAAGTCTACTAGAATAGGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCAGCAAGGCAAACAGACACAGCAGGAAGTCGC:1 + chr2L 9226477 3' - Cr1a 3985 1 78.22 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAAATAACAGCGACTAAGGCTAATTTATGTACAAACAAGGTGCTATTTTAACACGCACACACACT:1 - chrX 12472511 3' + pogo 2098 1 74.47 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGGTTAAGCATTTGGGGCGTTTAAGTCAAATAATGCCACTCACAATTAATCAAG:1 + chr3L 11755766 3' - roo 8688 2 50.50 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCAATCGAGCCAACGTTACTTACTTTTCTTATTCTCAAATCTTAAGGTGCTCAGCATAAGGACACCAAA:1 + chr2R 17799898 3' + Tirant 367 2 72.28 ACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGGGCCAGCAGCCAGTTTAAACCGTATATATATAGTACTGAAAATAAAGCAAATT:1 + chr3L 1697766 3' + Transpac 5208 2 56.44 GAGCAGAGCCAAGTCTATTATATCAACTACAAAAATAACGTATAACCTTGAACCAGGCCGTCCATTCCGTCCTGGAAGATGGGGTGCAGATTACTTCCGTC:1 - chr3R 25310757 3' + Stalker3T 312 1 53.47 CGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGATACATCTACACATGTACATATGTATGTGTAGGGGTACACACAAAGCAAATTGCAATATTTTGTGTAAAA:1 + chr3R 10095123 3' - Rt1b 4983 1 67.33 AATACACACACACACACAAATTTGCATACATAAGGAAACATATGGACTCGCAGCACAATTTGAATGCCAAATCATTCAAATTGATCACATATATAGAAATT:1 + chr2L 936684 3' + accord 184 2 52.48 TATACGGAGCTCGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAGTGACACAGACATGCCTTCTCTTATCGCAAAGTTAATCAGATATTCGG:1 + chr3R 5607798 3' - Doc3-element 23 2 66.28 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGGTTTAGAATACGAATATTATTAACTATTCGATATCTAACATGCATATTTGAC:2 + chr2R 21351389 3' - mdg1 25 2 54.46 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCC:2 + chr2L 20045807 3' + roo 9042 1 55.45 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCTT:1 + chr2L 21086089 3' - roo 39 2 66.34 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAAAAAATATTAAGCA:3 + chr2L 18655209 3' - Doc 37 1 53.47 ACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAAAGGTAACGTAATAAAGTCCCTTTATTTATTCGTAAAT:1 - chr2L 20560309 3' - F-element 18 1 64.00 GAGTTCCCCGACTATCAGATACCAATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCT:1 - chr2R 10552702 3' - INE-1 558 1 85.37 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTGGCATTGTTATGTTTTCTCTCCCACACATAAAAAATGGGGGAAATTGTAGGTAGCTCGTCGCTTAATTGCT:1 - chr3L 7307186 3' + hobo 2935 1 75.25 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATA:1 - chrX 15546166 3' + blood 7339 1 74.26 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATA:1 - chr2R 15788569 3' - Transpac 26 2 54.46 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGGAGTTCATCATTACAGGATATTGCAACACCAACAGTAAAGCCCCGCTGTGAACTCTTTCAGCTGCTA:1 - chrX 21060301 3' + 412 7524 2 51.55 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAACAAAGAGCGGGAGAAAGCTCTTGAAGAGCAGTGAAAATAGCA:1 - chr3R 14580299 3' - blood 7046 2 60.40 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTCCCGAACATTGCAGCCCTGGGTGCAAGCGCTTGATCTGGCAACTCTG:2 + chr3R 21365587 3' + P-element 2877 2 71.29 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCGATTA:1 - chr3R 11052113 3' - blood 7056 2 74.26 TGTCAGTGTTCCACACTTGNAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAGATGACCCATTTGTAAAGTGCAAAAAGTTGTAAAGTTTTAAATAAAAAGTTTGTGAA:1 - chrX 22426160 3' + 1731 295 1 61.39 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGGGCCAGCAGCCAGTTTAAACCGTATATATATAGTACTGAAAATAAAGCAAATTAATAAG:1 + chr3L 1697772 3' + Transpac 5214 2 62.38 TAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGACCCCTCGTAAGTGGCGACAAGATTTTTGCCCT:1 + chr2R 17306042 3' + roo 8773 2 68.32 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTTTGGCCGTTTTTGCCTGTTTGTTGCCTTGG:1 - chr3R 23542947 3' + 412 7523 2 52.63 TTAAACCGAAGATATTTCCNAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAG:1 - chr2R 6850465 3' + roo 349 2 84.16 ATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAA:1 + chr3L 19274882 3' + transib2 2800 1 52.48 TCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAATATAGCTTAGAACTAGCCGAATCAATGTACATAATTTTAAAAACTAAATTTCAGGCAGCGGACTCGGTTCGG:1 - chr3R 9634298 3' + 1360 302 1 79.21 AGTTTCATATTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGATTTTGTTTTTGGATAGCAGACCAGGCCGCCCAGGCATTTGTCATCAAGTGCTGGCCATCTCTTTGT:1 - chr2R 20578096 3' + gypsy6 7553 2 65.35 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGTTCACACATCAAATTAGTTCAATTTG:1 - chrX 2841758 3' + hopper 1398 1 62.00 TCGCATTCACACTAGCTAAGTAACGGATATCTAATAGCCGGAGAACGCGATTGTAGCATTCTCTCTTCTTTTTTTTATATCGTCTGGGGTACAGCATGGTT:1 + chrX 658318 3' + INE-1 532 1 77.23 GGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAAT:1 - chrX 21087586 3' - mdg3 31 2 55.45 CTGCCCCTTCATGACTCATAGATCCCCCTTAAGTCCAATGCACTGTATAATCTATCTGCATTTGCAGCGCCAGCAGCGGCGGCAGAAACCGAAACGAGACG:1 + chrX 17686054 3' - baggins 5379 1 58.42 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTGAGAATCTTTTTTTTTTTATAAAACAAGAAGTTCGTTAAATAAAGTGAAAAAATTCGCATAACGTA:1 + chrX 10286236 3' - roo 8 2 64.36 CTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGCGCGGCTCAAAGCTGAGGGTTC:1 - chrX 4166367 3' - I-element 5309 1 55.45 AAAAAAAAAAACAGGGAAAAAGCTGAGAAAAACAAATAAAACATCAAAATCCTGTGAGCATGGGATTGAAATATATTCTCATTTCCTTACCTTGGAAGG:1 + chr2R 9367376 3' + Doc2-element 229 1 87.88 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCACCCTTAAAACAAGTAAAATGTAATCGAACAAAACCCTATTTACTTTAACTTT:2 + chr3R 11916626 3' + roo 9047 1 54.46 ACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCCAGGCGATGACTCTTGAGCTCCTTCAATGCGCCATGGCCATTGCTGATGCTCAGGCTAAGT:1 + chr2R 14910300 3' - TAHRE 10401 1 65.35 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCAT:1 + chr3L 3757399 3' + roo 9028 1 73.27 AAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCT:1 - chrX 4166382 3' - I-element 5317 1 54.26 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAAAACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTTGATGG:1 + chr3R 20905481 3' + pogo 2085 1 60.61 TTTTTTTTTTTAAATTTTAAAAAAATTTTTTTTTTT:1 + chrX 21592685 3' - TART-C 11092 1 83.33 CTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTGGTGGCCAGCGTTTTGTTCAATTTTGCTAAATCAAAAATAAAAACCCACGCGGAGAAGGCGAAGGGG:1 - chr3L 2906742 3' - F-element 105 1 76.24 CTTTTATTTTATTTATTTATTTTATTGTATCCAACAAAAAATTGAGTGAGACCGTATAATTAATCGCGGAATTCTTCGTTTTATACATTTTATAAGCCGCG:1 - chr3R 26168560 3' - HeT-A 314 3 73.27 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGATATTATAGATACAACTTTCTAATTGCAAGCCTTAAGACATT:1 + chr3R 27131968 3' - copia 4904 2 60.40 TGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATACATATATATGTATGTATATATATGTCAGATATGAAAGACAAAAAAAAAA:1 + chrX 17030086 3' - flea 4765 1 64.04 AAAAAATCGTATGGCGTTANGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTGAACTCTATTATGGCGCGTCAGCATTGTTTATGCGAAGCTACTTAGTTGCTAA:1 - chrY 475865 3' - 1360 24 1 53.47 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATTTCGGCCCTATGTCATTTATGACTTGC:1 - chr2R 17963220 3' - blood 7032 2 58.42 TTTGTTATCTATAAGAATCATTTTAAGTTTCTGTATTGTGGGCGTGTTCGACATTGTTAATTGTCATTTTCTATACGTATGTATGTATGTATTTGTGTACA:1 + chr3L 17495994 3' + Gypsy6A_LTR 135 1 80.20 TCTGGAGGCAACGATCTTTNGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAGGTAATTAAGTAAATTTGGGATAAT:1 + chr3L 19249726 3' + Transpac 5181 2 75.79 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACATAACACCTGCTTAAAGAGCCGCAAAAAGAAAAGAAAAACGCAAAGC:1 + chr2R 8177770 3' + mdg1 388 2 56.44 GTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTAATTACGAGAACACAATAATAATAAAAAATCAGAACTCAACTACAAACCCAAATAAAACCCAACAA:1 + chr2R 611745 3' + I-element 43 1 72.73 TATTATGTTCGTATATACTACAAAGGTTTAGAATACGAATATTATTAACTATTCGATATCTAACATGCATATTTGACTCAAATGGAAGTAACTATAAGGGT:1 + chr2R 21351413 3' - mdg1 1 2 78.22 TTCCTCCGATTTTGTATACTAAAAACCAATTTACAATCTACTATGTTTTTATTATTAGGCTTCTGAACCAAGCTCTATGCTATATTTTCTGAAT:1 - chr3R 3286350 3' + Gypsy12A_LTR 2071 1 79.79 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTTGTACACACAATATTTAAAACGAG:1 - chr3R 16601451 3' + roo 9021 2 75.25 AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGCATATAAGCCGTATCTATAAACAAAGCGAAAACCTTTGCCAAATAAATGTTGTG:1 + chr3L 16563295 3' - 3S18 5789 2 56.44 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATG:1 - chr2L 12958930 3' + roo 9022 2 77.23 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCC:1 + chr2R 22856582 3' + 1360 3346 1 73.27 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAAAAATAGAAATTGGCGGTAGGAAGCACACTTTCCCACCGTGTAACGTCCTCGGTTGTCGCAATTTTGG:1 - chr3R 29441097 3' - S2 234 1 74.26 TAAAGTTTTGTCATCGAAAACTCCCTTTATCCTGTCATATCCCCCATGGCTTTATCTATTTCACCTTCGCACCCCTCCGTGCTGTAAAATAAACTTTATCG:1 - chr2L 10795178 3' + transib1 258 1 81.19 ATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGGACCTAATTACATTTCAATTAAAGCTACACATTCCATCAGGAGGCGCCCTATCTCAAAATGACA:1 - chr2R 24493806 3' + X-element 4566 1 70.30 AGGACATATTGTATATACATATGTATATAAAGAATAACCTTCAACTCCATGCCAAAAAAAACAAGAAAAGTGCTCAATCTGCTCGCGATAAACCCCGAATA:1 + chr2R 21177596 3' - Stalker2 262 2 76.24 ACGGCATACGATTTTTTGGCCCATAATTTTTTGCTCGTAATTGCCATTGCCGAAAAAATATCTCAAAAAAAAGGGGGCGGGGGGAGGGGGAAGGGAAATAT:1 - chrX 17182049 3' + 1360 29 1 71.29 TAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACG:1 + chr3R 14860213 3' - BS 5023 1 52.48 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTTATACCAGAATGGTGCTTTTTTCATGTGAGAAT:1 - chr3L 19647255 3' + pogo 2061 1 72.28 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGT:1 - chr2R 19560163 3' - Tirant 40 2 63.37 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAATATATTTTTAAATATTAAAATCAAAAAATTTGGAACCCTATATTCTAAATCTATAGTCCTTAAA:1 + chr3L 20584106 3' - pogo 7 1 67.33 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTTT:1 - chr3R 7869104 3' - 297 6598 2 63.00 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAA:1 + chrX 21217559 3' - pogo 47 1 75.00 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTGCTTTCATAGCCCAAAAATAGTTTAAAACAATATT:1 - 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INE-1 157 1 42.57 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTGCGCCACACATATCTCTGCGTTGTG:1 - chr2L 10199014 3' - I-element 50 1 71.00 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGGGTAATTAAATTACGTGGCCCG:1 + chr2R 6847305 3' + mdg1 7404 2 79.21 CCACTCTTTTTATTCCTTCTTTTCTTCTTGTACGTTTTTTCCAGTGCATTGGTTTACTTCGCGATTCTCCGAACTGACTCACTGACTGCCAACGCTTGTAA:1 + chr3R 18442061 3' + copia 4978 2 65.35 AGGCCATCTTTCAGTTGATNGACAGCGCAGTGGGGGGCAGTCCCCCTGATCGCATCCACCACCGCCCGACTCGTCTCCTGATTCTCTGTCCTCCGCTCAAT:1 - chr2R 24243961 3' + Rt1b 366 1 50.50 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCC:1 - chrX 1399883 3' - P-element 54 1 25.74 CGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTTCTGTCAGCGGCAGCAATTGTGCCTCTTATGCCACCCATCCCCAACACCC:1 + chr2R 6918653 3' - accord 22 2 57.00 TTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACTGATTGGTAAAAGGATCTTTCTTTAGAAGTGGTCCTTATTACTCACCTATTCCTTGCATTGAC:1 + chr3R 5348747 3' - copia 12 2 66.34 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACTTTACCCAAAAACACAATTGAATAATGATAATTTCACACGTACTTTTCGGGGCGAATAGCCGGCGT:1 - chr2L 7666081 3' - roo 6 2 72.45 TCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCAGTGATCCGTAGGCCTCGAAGATATACGCGTAATCCCCTCCAGATTTTGGTATCGCAGTACCAAGTTC:1 + chr3R 27111359 3' - P-element 220 1 67.33 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCATCCGTAGTTTTCGTTTCCGGTTCCG:1 - chr3L 10474129 3' - copia 4889 2 59.00 AAGCCGAGTAACGGGTATCTGATAGACGGGGAACTCGACTATAGTTACTGGATTTTAAACTTCGGCTTGCCGAAAATAGCTTTCTTTTGAGTTTAATTTTC:1 - chr2R 5492128 3' + INE-1 544 1 71.29 TTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCAAT:2 + chr3L 24916694 3' - Porto1 145 1 55.45 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGTATGTAGCATATCCCCTTCCGTTTTTTG:1 - chr2R 19102168 3' - opus 155 4 79.21 TAAATATATTCGTGATCATGTGTGAACACCTACCAAATAATAACCAAATAAAACAAAAGGATACACTGTTCTGTTAAGGATGATTCTT:1 + chrX 4277543 3' - roo 8671 2 65.91 AATAGTCAAGTCTATGTTTGAGTTCCATGACTTATATTCAATAAGTTTACTTGACATTGCCAAGTTGTGGATGTGTGGATGTTTTCCAGACAATGGAG:1 + chr2L 2531675 3' - copia 211 2 64.29 GTATGGGTGTGTGTGTGTATGTGGGTGTGTTTATGTTTTCCATCGGCCACCAGTGATTGATGCGCTTTAAATAGCCCACTGAAGGCTGCCACTTTTTCGAG:1 + chr3L 4297691 3' - Quasimodo 35 2 77.23 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGGCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGGCGCAGCGATTGACGA:1 + chr2L 8709350 3' + P-element 2828 1 20.79 GAGGGTTGCGCCAGAACATTAGATACTTCAGTCACTATCAGCCACCAACTCGAATACAACAACAGCCACCGGATTCCCTCGAACAGCCACCGGAACCCTCA:1 + chr2R 19175224 3' - Chimpo 493 1 71.29 ATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTA:1 + chr2R 16185109 3' - 17.6 6952 1 61.39 ATTCATTTACATAAGATATNAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGCTTATTAGCTATAAAGCTGATTT:1 + chr2R 16614295 3' - roo 8716 2 78.22 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCTCGAATAGAGAAAAGCTATTTTCCG:2 + chr3L 8039439 3' - hopper 4 2 75.25 TAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTATCCTTCATCTCCAGACTACGGCCAGAAAGCATACATATATAGAAGCACAAGTCCAAGTCCAGAGATGAAGGATAG:1 + chr3R 18178182 3' + mdg3 5022 1 64.36 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCTTGTAATATCGAAATCAATGAGATTCGTAATTCTGTCGCTGATTACTAAAGTTCATATTCAAAAGGGGA:1 + chr2L 9045499 3' - jockey 14 1 71.29 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAG:1 + chr3L 6658214 3' + hopper 1385 1 67.86 AAGCGTCAATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTGCAATTGATTGGATTACACTCCACTTCGCTGCACTCCCCTTCTCAGCCATCTCAGGAAACTCACTCA:1 - chr2R 12458494 3' + HMS-Beagle 6775 1 59.41 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATATCGCAGACAAAGTATATAGAACATGTATTTTGCGTCCAGCTTGGAAAGTGTTGG:1 - chr2L 5419779 3' - 297 9 2 69.31 TTCACTCGCACTTATTGCANGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGTGGATGTATATGTACATGTA:1 - chr2R 15349518 3' + P-element 2831 1 24.00 ATAACGATCCTCTGTCACGGTCGCCATGTGGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAATAAAAACATAACTAAATCTTAGAA:1 - chr3R 19952123 3' - mdg1 447 1 69.15 AATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAATGAGTGAAGAAGGCCGGAATGCGAAAGGAGTCAAGGG:1 - chr2R 322784 3' - 1360 3147 1 62.38 GTTAAAATTCTTAGAAATAAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTATATGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTTCATTGTTTTCGTAGCTCATTCC:1 + chr2R 21469052 3' - ZAM 8205 2 77.23 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACTTTCGAAGATCTTATTCTTTTTGCTGTGCACCAATGTAAAAAAGGCTGCGAAAAGTTCTTCAATGAAG:1 - chr3L 4565447 3' + copia 247 1 69.31 TCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGA:1 - chr3L 25232766 3' + accord2 174 2 52.48 TAATTTTAACGCTTTTTTAATTGAAACAACAAACACTTAATTCGGGTTTCTTTTATACTTAACAAATCAATTATTTACTGCGAATATTTTGGTCAGTAATC:1 + chr2R 5857678 3' - 1360 3016 1 62.38 TTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGGATGATTGGAAGTGTAATTCAGAATCGCATTGCCATTTTAATGGCCAAGAAAATGGA:1 - chr3R 19986356 3' + Doc 205 1 59.00 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAAAACCTAACTTATAAACGACATAGAAAAAATCTTGGTAATTTTGGGAACAAATTT:1 - chr3L 13987173 3' + pogo 2083 1 61.39 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCATATCGCATTTTATCAAACATAAACACACAC:1 - chr3R 29287510 3' - hobo 43 1 70.30 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAGAGGTGGATGAGCGGGAAAATTGATATGCCGAG:1 + chr2R 19061300 3' - roo 8686 2 57.43 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGGGTCGATGTACCTAACCACAGATGCAAATGTCTGGTCGTAAAT:1 + chr3R 22330775 3' - I-element 54 1 57.43 GAAGATATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTTGTTGGCAGGACATTATGGAGTGCCACACACGTGCCAC:1 - chr3L 1046819 3' - R2-element 294 1 61.22 CGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAAGAATGAAGTTGAAAAGGCTTGGTCTGTCAAGTACGTCAGTGTTAACATAATACACTGAGATTCATTTAA:1 + chr4 74354 3' - 3S18 7 2 72.28 TAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCCAT:1 - chrX 4264363 3' + mdg3 194 2 74.26 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAATGCAGTGGAGGGGGGGGAATGAGAAAGATGTCCTGTC:1 - chr3R 12329614 3' + hopper 1389 1 62.20 GGGGTGGTAACTCCCCCCCCCCCAGTTCGAAGTGACGGCCATAGCGAAGGCATTCTCGATCTCCTCGTAGGATTGAACGTTCTCCGTCTCTTTG:1 + chr3L 1779466 3' - Tirant 8100 1 51.06 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTACCTATGTACACATGGGTATATATTTTGTGTAGGCCCACCTACGCAATGCAATTAAG:1 + chr2R 10014875 3' + flea 4998 2 62.38 AGAGCCACGGCCAAAAAATNGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACCCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTTGTTTTCACAATGAGTGGTCGACTTCGAGA:1 + chr3R 4075440 3' - 1360 51 1 71.29 GGGATGCAACCCTTATCAGCTGCACCCGGAAAAGCAGCAGCAGCGGCATCGAAGTCGGGACTCCAGGAGGGTTATTTAAATTAATTAAAAAATGCAACAAC:1 - chrX 17068650 3' + gypsy12 125 2 69.31 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATGCTTGTATAATTACTAAATGGTATTTGAGTCAATATTCATTATGTC:1 + chr2L 6569259 3' + 297 6957 2 62.38 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATGGCCATCCTGCTATTTAGCCATGTTTTGTTTGGTTTTGTGCTTT:1 + chr2L 13566542 3' + hobo 2908 1 59.00 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCGGCAAGTCCAATCATTAAATGAGCAAATGCTTTAAATGCCACTAGGTAGAGCTATAAGATGCGTGGG:1 + chr3L 1998908 3' + hopper 1409 2 70.30 GGTGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCAAGGGTCTTTGGGTACACCCATGCCTAACTACATCTATTGGCTACATCCTGCTGAC:1 - chr3R 4973094 3' + 1360 21 1 43.43 GTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACATTATGAAAATCATTATGTTCATATACA:1 - chr3L 13001024 3' + invader3 225 2 78.22 AACTGAAAGCCGAAATAAAGAGACGTAATTGTAAAAAAAGCGATTAGAAATCTGTATCCAAGGGATGTTAGCCACTTGAAGATACAAATCGATGATACCAT:1 - chr3L 11419825 3' + Chouto 140 1 68.32 AATCATTACCTTTTAATAAGAAAACTTGATCTTTTAGGTTGATCTTCTAAATTGGATTTCAAGCTATCTGAGGCACATCCACACGCTACTTCACATGGCAT:1 + chr2R 6904231 3' + Q-element 343 2 70.30 ATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATTTATATTCAATTTGAATTCCTTTCAAGGCATTATTT:1 - chrX 7036661 3' + Quasimodo 7337 2 69.31 CCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATCTGAGGACCAGAAAGCTAGTAGATGGAGTTGAATCGCTTCATTTTGTGTTTGATGTTGTCGTCGC:1 - chr2R 10452893 3' + Quasimodo 7364 2 71.29 TCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTT:1 + chrX 11025561 3' + hopper 1372 1 69.31 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGCGGCAACTGGAAAACTGGCAACTTCATTATTATTTGCAGACACTTTTCGAAAAGATTTTTCCGCTCGCTTTG:1 + chr3L 8252283 3' + copia 250 1 73.27 ACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTAAGTCAATTTCGCATCATGACACTGGAAACAAATATAGGAGATCTATTTAATTCTT:1 + chr3R 22869463 3' - Bari1 20 1 58.42 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCAGACGAAATGTTTTCGCTCCAATGAGCTGCTGAAAT:1 - chr2L 1783308 3' + roo 9033 1 63.37 AATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTTTTGTGATTTGCGCAGTAGTTTCAAATATTCAACGTATTTTTCATTTCTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTC:1 + chr3L 24796712 3' - 1360 241 1 76.24 GAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGATGTCTTTCCAAGCGAACGGTATCAAAATGTGTTAGTGACAAATCGCTTATAAAGGGCT:1 - chr4 962599 3' + flea 4830 1 63.37 TAAAGCTCGATCTATAGATNGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCA:1 - chr3R 13739695 3' - Burdock 55 2 78.22 TATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATATTTGTCTGTGTGTTGGTGAGAAGCCAGCTGCCACTCAGCGATCAAATTCTCGAGTATC:1 - chr3L 5241102 3' + Ivk 5361 1 59.41 GACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTGTATGTCTGTGTGACTGGTGATGCCGTATTTAAATT:1 - chr3R 28090170 3' - Quasimodo 7082 2 72.28 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCTCCCCCCCCAGTTCTTCGTGATGATCTCCACATGCGTCTTGTGGCTGGG:1 - chr3R 29728651 3' - Tirant 11 2 55.56 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATAAGAAATATTTTATCGTAACTAACAAGCTATCTTCTTAGATCAATATCCGCGATTCCATAT:1 + chr3R 17482094 3' + copia 242 1 57.00 CAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATATATATATAAGCACGCATTTGCCTAAGTCAAATAAATGGCCGTCGTTCTTTTATAC:1 + chr2R 21433226 3' + HMS-Beagle2 7182 2 64.21 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTTTATAGTTTCAAAAATTCTGCCTGATGTGCGCTGTT:1 + chr2R 10827736 3' + 297 362 2 64.36 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTC:1 - chr3L 12241832 3' + roo 359 2 76.24 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACTTGTAATGTATTCTGCTTTTG:1 + chr3L 25059170 3' + mdg1 415 2 74.26 GGTGTGGGCCAACGAACTANTGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAAT:1 - chr3L 16282383 3' - gypsy5 6992 2 71.29 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACTTTCGAAGATCTTATTCTTTTTGCTGTGCACCAATGT:1 - chr3L 4565478 3' + copia 250 1 61.39 GTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTATATATTTAAAAATGTTAATAAGCATTAGTTTCAAGTTAGTTAGCCACAGAAAATATATA:1 - chr2R 19088941 3' + Tabor 7307 2 58.42 GGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGCCTGCTGTATCAGCAGGAGATCTCTGGGCCTATCCGTTGTGGCGG:1 + chr2R 10233298 3' - F-element 4487 1 60.49 GAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATCTACAGCCCGTTTCACATTGTTTGGCTCGGCAGACGCTTAAT:1 - chrX 11032188 3' + invader3 242 2 58.42 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTAAAATGCCA:2 - chrX 10286157 3' + roo 9029 1 68.32 CTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTATTTAGTAAAGATTTCGTTTCCTAATTTATTGTGATATCTCTGTGGACAACGGCAGCAGAAGCGC:1 - chr3L 12456967 3' - Ivk 279 1 77.23 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAAATTCCCTCG:1 + chr3R 9224404 3' + pogo 2066 1 65.35 AGCACGATAAAAACGTCTTNACACGTCGGCGATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGTTTTTTAATTGCTTTTCATAACAAAATAACA:1 + chr2R 672845 3' - F-element 30 1 56.44 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCACAGGGTGGAGAAATATTCTTAAGAATTACCAAACACTATAA:1 + chr3R 4575497 3' - 1360 35 1 65.35 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCCTTTTTAAACCAAATTACTTTTAAAAGTGTTTGAAT:1 + chr3L 8036430 3' + roo 9032 1 69.31 AAAAAAAAACAAAAAAAAAATGTAGGAAGAAAACCTACATAAACTGGGGGGGACAAGAAAGAAAACACACCAGAGATGTAGAAGCCTCTCGGATAGCCCT:1 - chr3L 19026804 3' - hopper 142 2 50.00 CTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATCTACATCCCCGTCGAAAAACCTCAAAAATGAAACGCATAAAAGCGAAAAATAAATGCAAATTAAAAGAAAA:1 + chrX 15805897 3' + Stalker 77 4 71.29 CAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCAGACTTGATTGATTGAAGGCGCAAACAGTTGGG:1 - 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transib3 142 1 59.60 AAGCTAGAAGGTTAAGACTCAGCGTATAGATTGTAGAAACAAAGACGCACAAACCGCACAAAACTGCCACACCCACACTTACCTTTCATAGCTGTAAATAT:1 - chr3L 19604785 3' + INE-1 167 1 77.23 ACTTACTAGCATGTTAGGATTCAGTATGGTTTCGAAGCCAAAGAATCGTAAGAAATCGAGTGATTTTATAAGCCGCAGCATCGAATCGTTCTCGGGGGAAT:1 - chrX 2984688 3' + hobo 405 1 57.43 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACTATATATATATGTATAAAGTATTAACTAGCCTTCAGCCAGCAATGTTTAACACTAAGTTCTTTTACAA:1 + chrX 17104485 3' + 297 371 2 63.00 AGTGAACAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCGTATAAAATCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAGTAAATAACAAAAAATAATACGTATACGCCATGTGTTAC:1 - chr2R 9328728 3' + Doc3-element 11 1 77.23 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCGCTTGAAATATAATTGGACATATTTAAAGCAGTATACCTTAACTTTGGATATAG:1 + chr3L 20755414 3' - I-element 24 1 55.45 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTGAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACC:1 - chr2R 15788567 3' - Transpac 4943 2 56.44 CGATTGCTCATCTCCCAAGNGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAAATGCACTAACCGCTTCCGTTTTTTGAAAAGCAACTGAACTCCAATATGGCGGCA:1 + chr3R 20696560 3' - jockey 10 1 75.25 TTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGTAGGATTAGAGATAGCATATACTTTATTGGTTCTAATACTTTG:1 - chr3R 12771940 3' - I-element 4890 1 57.43 CTGCGTGAACGATGAAGGCNGATGTATACTGAAGACTTATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGATACTAAGTAAATCCTAATCTTATTAGTTAA:1 + chrX 8442162 3' + Bica 70 1 69.31 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACAC:1 + chrX 13146958 3' - roo 57 2 82.18 CACGTCGGCGATCGAATTGATTAGTCTAGAAATTGATTAGCACTAGATTAGCACTAGAAATTGAGATGGAAATGGAATGGGCAAGAAAAGAGTATGG:1 - chr3L 17140577 3' - F-element 9 1 48.45 GGGCGGGCTTCATAGGCGGNGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTTCTGTCAGCGGCAGCAATTGTGCC:1 + chr2R 6918627 3' - accord 38 2 73.33 CCCGTTACTCAGCTAGTGTNAATGCGAATGCTCAATTTCATCATTTTCTTAGTATAATTAATAGTCCAGAAATCTCTGGATCTTTTTGAATGATTTCCAAA:1 + chr3L 22021453 3' - INE-1 537 1 57.43 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCT:1 + chr3L 8039415 3' + hopper 1387 1 53.47 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAAACTCTGGCCTTATATGCAAAGCCAACTCT:1 + chr2R 21040924 3' - P-element 25 1 53.00 TTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAATTTCGAAACAATGCGCAACTTTGTGCTGTCCACA:1 + chr3L 9907409 3' - jockey 4674 1 52.46 AAGTAAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATTGGATAAAGTCTATTATAATAAAAGAAACACATAGTCGAGCTCATAAGA:1 - chr3R 2379797 3' - Cr1a 4256 1 68.32 GATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGATCTCGGGTTTGTTGCACGACGAGACAGTTGCTAAACCC:1 + chr3R 10391275 3' + invader4 3082 2 74.26 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACTGATTGGTAAAAGGATCTTTCTTTAGAAGTGGTCCTTATTCCTCACCTATTCCTTGCATTGACGGATGATA:1 + chr3R 5348755 3' - copia 4873 2 74.26 TTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCTCGAATAGAG:1 + chr3L 8039424 3' - hopper 19 1 60.40 CAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCCAATCATATGCGTTCCCACTATACGGCCTCGAATGCAGTGAATGCAGCCTTGGCGGCTGCCAATCGAATGA:1 + chrX 16433359 3' - Doc 380 1 75.25 TGGATAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCCCCACCTATAACCCACTGTAATTGCAATTGCCCTCGCCCGCGTCTTT:1 + chr3L 17080896 3' + G-element 4142 1 69.31 AAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAACTCCTGATTTTACGTATACTAAATTCTTTATTTCGCATTGAAGGAATT:1 + chr2R 5223841 3' + X-element 415 1 52.48 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTG:1 - chr3L 20049637 3' - jockey 4805 1 66.34 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTACCCCTTTCACCGCAGAACGAAACCAGCGAGGATGAGGTGCCCCCCATCGACCTGCTGTGGATCTCGGGCAG:1 + chrX 17858086 3' + P-element 2883 2 71.29 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCTAAATCGCACAATCAAAAATAGTTGTTT:1 + chr3L 5710301 3' - Transpac 43 2 67.33 GGCCAGATTGACTCGGCTATTGATCCTAATCACGAATATCATCACGAATATACATACTTTATATGGTCGGAATCGAGTAACGGATATAACACTCCAGACTC:1 + chrX 158236 3' - INE-1 101 1 75.25 GAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACTGAAAGTACATACTGCGAACTGTGGGAGGAGCGCCTGAAA:2 - chr2R 11993988 3' - jockey 76 1 57.43 GGCCATTCATATCAAATATAAAGATATTTATGAAAGCGTTCTTGGTAAATGGTTCCTTGTAGTACTCGATCCACTGAGC:1 + chr2R 16865395 3' - copia 50 2 78.48 CGCGGTGAGTCTTTGTTAGCTATAAGAATCATTTTAAGTTTTATTTCGATTTTCATTTTTCGGCCCTGGAAGTTATTGTTGCCAGACACTCCCGCCTTTTG:1 - chr2L 6920255 3' + Gypsy6A_LTR 124 1 57.43 AATGACCAACTGCGTTTTGNGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGC:1 + chr3L 25059132 3' + mdg1 7415 2 68.32 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTGCACCCATTGTTTGC:1 + chr2R 13653415 3' - F-element 41 1 50.50 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTATTTTAAGAGATTTAAAATTATGAAATATTGTAAAAAACACGAAACTCTTTTTAAGATCACT:1 + chr3L 15038003 3' + roo 396 1 63.37 TTTGTTACTTTCCGTGTTCNGCTTTAGCATTCGACTGACTTCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGAAGTTGCCAATATTGAGAGCGTAAAT:1 - chr2L 7122026 3' - invader2 176 2 71.29 CAGCCCGACGGCTACCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTTTGGCCGTTTTTGCCTGT:1 - chr3R 23542959 3' + 412 452 2 64.36 AATAAAATAAAATCAAATCAAGTAATATAATATATATGCGATATTTCAGTGCGTTGTGTGAAAAGCAGCGTAAAAAAAAGCTTAAGCTAAAATGGGATTA:1 - chrX 6440876 3' - transib1 1891 1 65.00 ATTTCTAATACAAAACGTTTTCTTCATGTGGAAAGGCACCTGGACAGTCCGTTAAATTACATAAGAGCTAAATTCTTTGAGCTTGG:1 - chr3R 18706567 3' + FB 484 1 90.70 TGGTGGTCTTTTGCTTACTTACATATTAACTCTACTTTACATATTACCAACTTATTTATGAGTGTCATCAATTTAAGCCTTAATGTTATGCCCCCTTCAGG:1 - chrX 17228499 3' - Stalker3T 75 1 62.38 TAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATACGTATGTATACACAGTGAGGGCGCAATTTCCCAACAAGCTTGCACATTGAAAGCTT:1 + chr3R 23641065 3' + 297 381 2 70.30 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTATGTCAGCGTGCGCTTCGTCACTA:2 - chr3R 5506792 3' + pogo 2053 1 75.25 TAAGATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTCACCTTACTAAATATCAATAAAAATA:1 + chr3R 9278391 3' + roo 9035 1 61.39 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATGGAAAAGTTTTAAGGCAGGAGAAAAACAGG:1 + chr3R 8765596 3' - roo 45 2 75.25 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTTCCGGAGTGAGTGAGTTTTGGATTATGGTT:1 + chr2R 23519265 3' + jockey 4948 1 68.37 ACGTCACCAGTAATATGCGTCCTGGAACACAAAACGACCAAGAAAGAAAAGACAGCACACATTAGCGATCTGCTCGCCAGATGGGAGTTACGTTTTCCTCA:1 - chr3L 25846966 3' + Osvaldo 1408 1 71.29 TGTATATTGCTATTTTATTGTGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCGAAATTTGTTTTACACGGCCGGGCACTGAGACTG:1 - chr2L 11655027 3' - Porto1 4227 1 78.00 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTGGAGTACGCATTCTAAACGAAACAATCATAATCGAACTGATCATCAATAATACTGTCACCGAAGCA:1 - chr3R 3255947 3' + roo 400 1 70.30 AATCTCAACCTTCTATCTTTTATAGTTCCTGAGATTGAGGGGACATGGCAAGATCGACTCGGCTACCGATATTGATAAAAATATATAGATATATTTTCAAC:1 + chrX 17499894 3' - INE-1 164 1 48.51 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACAATCAAACTTTTCCGACTTTTTCTATACATTATT:1 + chr2R 14554550 3' + Tabor 448 2 59.41 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTAATATATAATTTTGAAGTAGTGCAGT:1 - chr3R 18790093 3' - I-element 51 1 81.19 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGCAATGCAGCCGCTAAATGTGTGCAATTCACCACTTGAGAAAACCACCACC:1 + chr3L 10363892 3' - P-element 23 1 57.43 GCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGCTCTGACTGGCAACTTT:1 + chr2R 14997942 3' - McClintock 5960 2 70.00 TAAGAAACTGATTTTATTTNGGCCTGGAGAAAGTACACAGTTCCCAACAAATAACCACATTTTCAACTTGCTATAAGTAGAAGTGCAGCAGGAGAAGATTA:1 + chr3R 29608430 3' - roo 9029 1 73.27 AACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTGCACCCATTGTTTGCTGCCGCACATGCTTATATTCGA:1 + chr2R 13653437 3' - F-element 19 1 65.35 ATCTGTTACTCAGCTAGTGTGAATGATATCGATAGAGAATGAGAAAATATATAAAAACTGGCTGCTCAGTACAATTTGAGAACACGGCCAAGAAGTCTTTC:1 - chr3L 25675212 3' - INE-1 538 1 59.41 GTTTTTGATTAGCTTTATTTTAAGGAAGTTAAAGGTAATTGATACATTTCATCTGAGTATGTAATGTATCTATTACCTTTAACTTCCTTAAAAACTAT:1 + chr2R 12694004 3' - opus 374 2 54.08 AAACACATTTTTGTAAAAANAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCG:1 - chrX 20361960 3' + hopper 1393 1 57.43 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGGTTATGGAAAGGTATACAAATTATAATGCGCTAACTAAGTCTTCAATAAATGACCTTTCTTAGGG:1 - chr2L 789659 3' - roo 8687 2 56.44 ATCGCAATAACATCGTTTGCCCACCCTTTAGAGTTCTTTCCAAAAATCAAATAAAGCGAAGAGGGCCACCGAGTGCTGTCAATGACCCACGTCGCTTGACT:1 + chr3L 22774686 3' + FB 199 1 74.26 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTTTTTTTTTAGCGGAAATGGGAGTACGAACCTGTATTGATATTAACCACCTCTTCGGACGACAGTCTA:1 + chr2R 18296108 3' + S-element 1710 2 72.28 ATAATTAAATTAATAATAANCAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAACTGGATTATTTATATGAAAAAATCTATTTACCCAACATAAGAATAGTTC:1 - chr3L 20758929 3' + flea 4992 2 58.42 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAATCGATTTTGTTAATGAAAACGAAGGAGAACTTCAAGGAGAAGGCCACCCAGGGGATCGGGTGTCGATT:1 - chr2R 19061193 3' + roo 405 1 75.25 GTGGTAAAAAAGTGCCACCNTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAGTCAGCTCGCAGCGTTAGTTTGTCGCCCTCGCCTCTGCT:1 + chr3R 7626468 3' - hobo 12 1 68.32 CGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTCCGTTACGTCGAACCAAAGCAGACTCCTTACA:1 - chr2R 5214732 3' - F-element 352 1 71.29 ATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAGCGCCAATAAATAAATAATAACTGGCTTAAATAAACACAACTTGTCTTTAATAACCAACGCTTTTAAGGC:1 + chr2R 17644959 3' + mdg3 240 2 72.28 TGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACTTACGTAGTTATTAACTTTGTCAGTCGAATAAATGATCCGTCAATA:2 + chr2R 3146360 3' - Quasimodo 22 2 60.40 GTTGCTGTGTACTTATAGGNACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTTTATTCTTATTAGAATTTTTTTATTCTAATTTTTATTACTGTG:1 - chr3L 12303383 3' - blood 31 2 59.41 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGGCTTAATATCGAAAATCCATTTACACCGCGCGTCATACTTTTAAGCA:1 + chr2L 19854142 3' - roo 30 2 58.42 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACCTACTTAAATATGTCGAAAAGTGT:1 - chr3R 24767813 3' + P-element 2838 1 28.00 TAAGGGGAGTACATCTAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTCTTAGGGATTGGCTATGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGG:1 - chrY 1428635 3' - G2 2983 1 52.48 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCATATCGCATTTTATCAAACATAAA:1 - chr3R 29287517 3' - hobo 47 1 76.53 GAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTATGCCTCCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT:1 - chrX 7978951 3' - 412 227 2 72.28 CCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGTGCCTAGCACAACATATGCATATTTATGGCAGCTATTTTACTTGAGGATAAATCGAAATTA:1 - chr2R 20723277 3' - Doc 4565 1 60.40 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAATTCGAACATGCTCGAATGGCATCCAATGACAACCTG:1 - chr2L 19854056 3' + roo 392 2 68.32 TGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGCTCTGACTGGCAACTTTGCCA:1 + chr2R 14997946 3' - McClintock 5 2 73.27 CTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTACACTGGAACAGGTATTTATTGCAAATTTGCCGTGCAGGCTAAAAGGTGGGCATCCATCACCTGCTCTCGATTT:1 + chr2L 2611961 3' + Cr1a 3989 1 75.25 CTTCCTCTACTGACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGGGCGCAAGTGCAATGAGAGAGCGGGAATGGAGAAAGAGAGAAAGGTAAAAGGTAGCGAGCGAC:1 + chr3R 6997008 3' - 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chr2R 9693322 3' + P-element 2842 1 34.00 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAAAAACAAGCACAGCAAAGTTCAACAACTTCTACCAATATAAGATTTTC:1 - chr2R 17459147 3' + Transpac 5213 2 59.78 TGTGTTTGTAAGTACCCGCNATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGGGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTC:1 + chrX 22386755 3' - hobo 82 1 64.84 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCG:1 + chr3R 17053113 3' - hopper 51 1 80.20 CACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTGGTCAAACTGGAATGATTAATG:1 - chrX 19216858 3' - invader4 2895 2 78.22 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACATTTAAGTGCAGCACTTGAAAAAGTACTTAATTAA:1 + chrX 9454874 3' - roo 40 2 67.33 TGATCCTGATCAAGAATATATATAGCTTATATGGTCGGAGACGCTTCCTTCCTCTACGAGTAACGGGTATAAATATAGAAACAATAATTTCTTTTTAATAT:1 + chr2R 5492908 3' - INE-1 81 1 70.30 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTGTAAAAAAGGCAAGCAAATGTGACATTTGTGT:1 - chr3R 27056398 3' + jockey 4944 1 75.00 TATATACACATATGTACATATTTATAGTATACCCAATACTTTCGTGCACTCGTAAATCGCACACAGTTAATATTATCACTGGGCCATATCGCGCGGGTCAC:1 - chrX 18130285 3' - G3 4506 1 71.29 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATTTCGGCCCTAT:1 - chr2R 17963236 3' - blood 7048 2 65.35 TTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTGTGCTGATGCAGATGCATTCGGTGTGCTAAGTGGATGTCTGTGTGTTCGAACCGATTGGCTATAAAA:1 + chr3R 19216436 3' - 1360 8 2 71.29 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGGGGTAGACACGTTTCCCATTTAAGTTGATGCAATTTCTCAATTGGAAATTA:1 - chr3L 18418832 3' + hobo 2914 1 55.45 TTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTGCTGCCGCTTGGCATTAACTGCCTACGCATATTCGTAGTA:1 - chr2L 4134828 3' - Quasimodo 35 4 59.41 TAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAAAAACACAAAAAATTAGGTTGATTACTACTAGGTAAATTTGTTTTAAAGTGCG:1 - chr3R 31118631 3' + HMS-Beagle 6667 1 55.45 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCAGTTCACTTCCGCTGGCCACTTTAATTACGGGCAAGAG:1 + chr2R 6107790 3' - roo 8 2 60.56 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAAACTCTGGCC:1 + chr2R 21040904 3' - P-element 46 1 34.65 TAACAAAAAGAAGTTGAAGNTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAA:1 + chr3R 25086155 3' + Bari1 1665 1 66.34 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTACCTGCTTTTCCTGCTTTGACGGCAATT:1 - chr3L 6023273 3' + hopper 1390 1 55.45 GATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTT:1 - chr3R 4357548 3' + Tc3 1672 1 65.35 ATGCAACTAAGTGTTGCTGNGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATTTCGG:1 - chr2R 17963242 3' - blood 43 2 70.30 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATTTATATTGATTATGGGTGATCGTCAACAAGAGCAGTGGACACC:1 + chr2R 9905419 3' - mdg3 5285 2 60.40 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCTATTATTGGTTGAAATTGGGTTATTGTCTAATGGCAGCACTTTATAGCTTTTTAATGAGCCCCCGAAATGTGCGG:1 - chr3R 8582512 3' - roo 1 2 78.22 AATCTTTGTAAATAACTAAGATAATAGGAATTGATACCGATTAGATTAAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAATAATTTCCTTAGAT:1 - chr3R 3784524 3' + jockey2 3293 1 90.10 CCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGATAGAGGAGCGGAATCGGCTAAGGG:1 + chr2L 20678640 3' + F-element 288 1 79.21 ACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAATCAGCACATCAATCGTGTACCAATCAATCAACCAATCTCCATCTGTTTGATGGATTCA:1 + chr3R 15053690 3' + G6 2008 1 58.42 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGAATTGTTGATTTTTTGTATATCAAAAAGAGAAAG:1 + chr3R 26317979 3' + roo 9031 1 64.36 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATTTAAC:3 - chrX 13146918 3' + roo 9036 1 59.41 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTGCAAC:1 - chrX 4277457 3' + roo 9045 1 58.42 ACTCTGCAGTTTCCCCCTANCAAAGGTAAGGGACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATTGCATTCACCTTAAATTTGGGCTCGGCTTGAGAACTTGT:1 + chr3L 21811013 3' + roo 454 1 63.37 AGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTGAATACCTTATCTTCAATACAGTAATTTAGCAC:1 - chr3L 5480622 3' + 3S18 13 2 62.07 CCTTGAAAAATATGAGCAGCTTTGTCATACAACTGCACAAATTATTGTTGACAAATATCCATGGCTATTTCCAAAAATTAACAATTTCTAAATTATAAACA:1 + chr2R 10898982 3' - hopper2 442 1 65.35 AAAAAGATTATATGATTATGAGTATTAAAGAAATGAATTGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTATAATTAACTTTCTCACTTCTGCCGCTTCGCCCGCT:1 + chr3L 23773458 3' - jockey2 3280 1 72.28 TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGTTTTTTAATTGCTTTTCATAA:1 + chr2R 672835 3' - F-element 39 1 55.00 TATTATTCTCATTTCACACNTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACG:1 + chr3L 25232820 3' - accord2 62 2 79.21 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTAACAACTCGAAGCGGTATCAACCGGTTTGCATTTGTTCAAA:1 - chr2L 12459677 3' - blood 36 2 60.40 AACTGATTGGCGCGCATTTTAAAAAAGGAAATTATGCTGCTGCACTCAGTTACTTACAATATATATGAGTTCATATAACATAAAAAAGGAAATGACCATT:1 - chr4 647191 3' - mariner2 28 1 58.00 CAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGATATAAATCAAGATCTCCCAATATCTAATACATACACGTATAAAAAAGATTTAAAACAATAAAGTCT:1 + chr3R 7998842 3' + mdg1 283 2 59.41 CATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGTTCGAAACACCACCCTGCACAGAGACACGAGCGCAACACTGCAAGCTTCTCCATTGGCAATTATCTGCGGCGCCATTG:1 - chr3L 22821553 3' + X-element 4319 1 56.44 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGTTAAGACTGCCACTTCGATGGAGGAAGCGAAAGTAAATGTTTGACAGTTTATGACCCCGGCCC:1 + chr2R 19840285 3' + roo 398 1 66.00 ACGGAATCCCTGCGGCCTATAAAGGGTAGGCGCGAGCAGGGATGCGAGGCAGTCAGCTGGATCAGCGGCAACGTCGGACGAGCGGGGCAGGAAGAGCCTG:1 - chr3R 29112417 3' + gypsy8 327 1 60.00 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTGTTTGGTCAAATGCAGAACGGCACAGT:1 + chr3L 2022321 3' - roo 16 2 64.00 GCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAGCATTGCCATGATCAGCTGTTTGAATTTTATAGCTTGGAAGATAATTTTCAAGCTTATGCTTTCTC:1 + chr3R 16481225 3' - jockey 4736 1 65.35 ACGGCAGGTATCTTAAGATAACATCACTTTATTTCGGCTGTCATATGATCTTCCAACTAAAGATCCAATATTCTTCTTCTTCCTTTTTTGTTTGC:1 - chr3R 24063834 3' - Chouto 164 1 49.47 CCCATTGGCTTAAGCTACAAGTTGAAGCCTTTTTTTCATGAAATGGACTGCGGACTAGGTTATTAGTCACACCTTTAACTAAATTGTACTTTCAATTGCA:1 + chr3R 4492762 3' - S-element 1402 1 60.00 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCACTCCGGAAGCGGGAGCAATTGATGGCCCATCGGAAGGCCAAATCGAATGGGTAAATGTGGTCGTCAGA:1 - chr2R 23519196 3' - jockey 4766 1 72.28 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATCTTCTGTGTATTCTGATTGTATTTAAATGCTGCAAAATTGTTTAGAATAATTAATTTTC:1 - chr2L 11478661 3' + opus 482 2 63.37 CGAAGATATTTCCAAATAANATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTCACCTTACTA:1 + chr3R 9278375 3' + roo 355 2 78.22 AAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAATAAAACTGCAACCAGCATCACGAGTTCAACCCGAGGAGGATAAAGCGGTAAA:1 - chr3R 16367411 3' + Porto1 4478 1 61.39 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCTGCATTATTACGATTTGCAACAAGCCGAAAAGTG:1 - chr3R 23638069 3' + pogo 2099 1 74.26 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGTTTACAGAAAACATCGTGAAATTTGCATTACTGACT:1 - chr2L 8577279 3' + roo 9045 1 64.04 TTTTGTCTTTTTTTTTTGTAGCCTTTTGGATGCGTCTAGCG:1 - chrX 12094571 3' - G2 3073 1 82.93 TTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATGTTACGCAGGTACAGTGAGCAAAGGACATTAGAATTCTGTACAGAAAACAAAAGTATTTAGAAAAAATGACATAAT:1 - chr2L 7937212 3' - jockey 4521 1 71.29 TTGTTCTAGTCCGCATGCACCAATACTCATACGCCACCGATATCGCTGCTATTTCCCTCCGCTCCTCACTCTCTCTGCCTCTCGCTCTATTCAGTCATCCT:1 + chr3L 17947379 3' - invader1 207 2 77.23 TTTTTTCAATTTATAAAATTTTTCGATCTTATGAAGAGGGCAAATAAAAATCACACGGCTCACGCACGGAGCTTTAATCGTCCTGCCACACACACACGCAC:1 + chr2R 15436499 3' + Tc1-2 1406 1 68.32 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCCTAAAAGTGTTCTTAGAGGTATATATTGCATTGTTCATATTTTTTTCTT:1 + chr3R 5993193 3' + pogo 2077 1 55.45 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCATATCGCATTTTATCAAACATAAACACACACTCACAAACAC:1 - chr3R 29287500 3' - hobo 30 1 59.18 CTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTGTTGGCAATGACAGCCGCGCCTCGATCCAAATGAAGTTGTTAAAATAACAACA:1 + chr4 769029 3' - Tc1 1357 1 67.33 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCCTTGTGCGTGAGCACAATTATTCAATAT:1 - chr2R 13763190 3' + roo 9036 1 59.41 GGGCCTTATGAGTGCTCATCCTACCACAATCTGTCGTAATTAAAACGCGCCCTCTGCGACATCGCCTCAACTGTCATCCGCAATTTACGTGCCCTCTCTAT:1 + chrX 15263521 3' - invader3 5193 2 73.27 CTTTTTCTTTTTTTTTTTGTTTGCTTCGGGGTCGCCTGGGGGTCATTATCAATACTATGGTCG:1 + chrX 7966441 3' - Doc2-element 229 3 90.48 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACTGTCATTGTGCATAAAATTCCGATATAAACCCTGTAGAACAAAGTAGATAACTATA:2 + chr2R 17459242 3' - Transpac 14 2 65.35 GATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATTTTGAGAGAAACC:1 + chr3R 10741139 3' - 1360 3368 1 44.55 CCACAGCTGCAGTTCCTAGGTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAATTTCCAAACAATGCGCAACTTTGTGCTGTCCACATCAAAAAGTGTGGGTGTTTG:1 + chr3L 9907429 3' - jockey 4694 1 53.47 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATTTCGGCCCTATGTCATTTATGAC:1 - chr2R 17963224 3' - blood 25 2 54.46 ACGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGC:1 + chr3R 9088622 3' - hopper 28 1 58.43 TGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAAATTCCCTCGAAAACAGAAGATAAAAAG:1 + chr3R 9224422 3' - pogo 17 1 62.38 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACT:1 + chr2L 17730493 3' - pogo 47 1 77.55 ATTATTGTTGTTGTTATTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGGCGCAGATCATGAGAGAGGCGTGGCTTGG:1 - chr2L 5937066 3' - mdg1 27 2 76.39 CAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAAT:1 + chr2R 19502068 3' - 1360 3388 2 64.36 TGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACATCGAAGAAGACAGTATCTAAACACAAACAAATAGCACA:1 + chr2R 2144829 3' + I-element 449 1 74.26 TGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCAATGTATAATTATATAGCATGTATCACTTCGATTATTAT:1 - chrX 11948991 3' - F-element 284 1 61.39 CCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGTTCATCTTTATGCTCATTCAATTGGAAGAACTCGAAGTCTTGGAAATTACATCGACCCATTACGCAGC:1 - chr3L 12858560 3' + X-element 4436 1 69.31 ACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATAGTCTTCTATACTATGGCAATAAAACGTATTGGGTTATGCAAAAT:1 + chrX 22689605 3' - 1731 4346 2 56.44 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGTGTAGATTTCTCTCATACCATTCTGATTTACATTATGACAAATGAAAATA:1 + chr3R 15579053 3' - pogo 16 1 63.37 TAAATTATAAATTACAACAGTATAAGAAATATTTTATCGTAACTAACAAGCTATCTTCTTAGATCAATATCCGCGATTCCATATCGACCTTTCTTCCACGA:1 + chr3R 17482111 3' + copia 258 1 71.29 GCTTCCTTGCTAGGATGTTGGGGTGTACTACACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTTGCAGCGCCA:1 - chr3L 17181431 3' - jockey 4676 1 66.00 GCGAACAAGTACTTAATGTTTATATACCTATATATATATATACCTATATATATGTGTACCTCTAGCCTACTACACATTTATAGAATGTGAATTAACGCTTT:1 - chr3L 23271734 3' - invader2 4916 2 50.50 GTGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCGTGAAATTCAAATTAAATGAAACTCAATTATCATAATAAAAGTATTCTGTTTTA:1 - chr4 814036 3' + Stalker 191 4 59.41 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCGATCGACGAGACGGTAGCTTTAGAGCTAAACGAACTGCCATCCGGTAAACACGTCTCACAACGTTATTTG:1 + chrX 15024465 3' + P-element 2884 2 76.53 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGC:1 + chr3R 11151881 3' - mdg3 5294 2 66.34 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGCGCTTAATCTGCTGTTGCCATTTTTC:1 + chr2L 12808252 3' - Tirant 12 2 69.31 TTGCTCATCTCCCATGCGAATGATCTATGTGTGTTAACAAGTTTAATCAAACGACTATGTCGCCAGATACGTGCATACTTTTAGGCATATGGGCACGTAGA:1 + chr2L 10143731 3' - jockey 7 1 78.22 TTGATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTAATTTATTTATTTATTAACTTTGTTTAACTTTGCTTTTCTCATTTGCTGGTGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGG:1 + chr4 1294988 3' - HeT-A 8 1 63.37 AGTAGATTTACATTTTCATATTCTTTTGTATTCAGTCTTAAGCCAGAGTGACGTGACTGGTTGACTCGAGTAAACGCTCGAAAAATCAAACATTGCGATAA:1 + chr2L 802718 3' + gtwin 7133 2 61.39 GCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACTGACGCGCTTATGTTAAATTTACCAAACAACCGATTTGTATGCAATTTTGAGATC:1 - chr3R 13845743 3' + 1360 87 1 59.41 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTAT:1 + chr3L 15033362 3' - I-element 39 1 61.39 CTGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGTCATTTTCATAAACATTACGAGATAAGCCCGACGCCCGCTCACTTCTCCCTCTTTGTCCCCTCCTTCTG:1 - chr3R 21612847 3' + S-element 1708 2 71.29 ACAGAGAAGTTAAGCCGTCTAACCAAGTCGGGACTCTCAACTTCACCACGAATAAGCTTACAAACAAAAACACTCAAACTATCTTGAAAAATGTACCCCTG:1 - chr3R 3773418 3' - Cr1a 4089 1 63.37 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAAATGCACTA:1 + chr3R 20696514 3' - jockey 57 1 68.32 AATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATGAAAAGTGAATTAAAAAGAAGAAACCATTAATGGGAGCGAAAGTTTTTATAGTTTCCCTAATT:1 + chr3R 19450747 3' + Burdock 245 2 65.35 TCATCACCAAGAATGACCAAAACAAGCGTTTCCCTTTCTCATCACAAACTTTACCGAATCAAGGTTTTAGGTTAATTGTATTCCAAGAAAACAATATAGAA:1 + chr3L 15888719 3' - invader5 3919 2 67.33 AATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAGGGTTAACAATCAATAGTTTCACAATTATCTGTAAACAACGCTCA:1 - chr2R 7839430 3' - pogo 2094 1 55.45 AGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTTCTATCCACCAGCCGGGAACTGCTCACCCTCTACTCCGAGCCAGAAGTGCGATC:1 + chr2L 5200745 3' + R1A1-element 4965 1 59.41 GTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGCTTAAAAGGCCATTTAATGAAATCTTCTACCTAATCTT:1 - chr3L 16563225 3' + 3S18 302 2 61.39 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTTG:1 - chr3L 14623945 3' + hobo 2888 1 76.00 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCTTAGTTGATTTTTTAAAATGATATGTAAC:1 - chr3R 5348672 3' + copia 210 2 73.27 GTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGAACTGCCAGGAGCATGCATGTAATTGACTTTTGTGCCCGGCATTTTT:1 - chr3L 14136200 3' + gtwin 7341 2 53.41 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGC:1 - chr2R 15788574 3' - Transpac 25 2 52.63 CTCTCCCATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCGCTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTTTAGTTTGGAGAACCATTCATTTGGAGTTC:1 - chrX 17655619 3' - Porto1 356 1 78.22 ATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTTAAGTGCTGAGGAGGCATTAAACAAAACCACGACGACAACAGCCAGTTTCGACACCTATCCCAAT:1 - chr3L 12068437 3' - Quasimodo 69 2 68.32 TTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAAAAATCGAAGGGTATCGTAAAAACTAACGAGAATGCATACCAACACTTAATAGTTTACGAG:1 + chr2L 38958 3' + Bica 125 1 63.37 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACGTTGCC:2 - chr3L 20049618 3' - jockey 4786 1 52.48 ATATCACCGTGTCAGCACGGTTTTATGAAACGCAGATCAACAACCACTACCGTACGTGTCTCATTGTCGAGATGTGATCGCCGCACCATGATCGACTAATT:1 + chr3R 7846327 3' + Q-element 196 2 58.42 GTAGGATCTAATTATGTAATAATAAAGTTAAAATTGACTGCTTTAAAAGCGGCAGGATTGATTGGCATTTTATTCCCCCGGCA:1 + chr3R 19447536 3' - Cr1a 4280 1 66.27 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGG:2 - chr3L 25059062 3' - mdg1 19 2 60.40 ATCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGCTAAATTCATAAGTAAAAGGAAAAAAGACAGATCTA:1 + chr2L 22754281 3' - Cr1a 4048 1 71.29 CTAAAAGAAAATTATTAAACGTGTTGCATTGCTTAACCTGAAAGCACACAAACGACGGCCAGCTAGTCCATAATCCCGTATTCTAGAGTTTAATTTA:1 + chr3L 20315741 3' + Tc1 51 1 63.92 ATCGACGGCGCAAATAAAAGGGTGGATGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGCCACTCAAGTTGAAGGGTCCTGGCCAACTTC:1 - chr3L 21858129 3' + invader2 326 1 69.31 TTAGTTTCTTACAAAAACTNAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAGAGCG:1 + chr3L 2176379 3' + roo 9040 1 58.42 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTCATTGGTGAATAAAGAAAGTCAGATTTTT:1 - chr3L 15037928 3' - roo 8709 2 73.27 TTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTATTACTTTGCTTAACAGTTCTTACAGAAATTATCTGAAAGAACTTTTTTCTTTC:1 + chr3L 13096892 3' - I-element 342 1 52.48 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTG:2 + chr3L 2022295 3' - roo 8707 2 70.30 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACACACCCTCACATGGCAACTGCATATTGGTTGCTGCTTTGTCGCCGTTGCAGCTTTGTCGCCCAACATGACGCAA:1 - chr3L 10363787 3' + P-element 2885 2 77.23 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTATATGACCCACGTTTTGGGAATCTTTTCC:1 - chr3L 171189 3' - 1360 47 1 72.28 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGTCTGTATTTGCGTGTGTGTAAGTGGTGGCTGGGGGCGGACATTCTATTATTGTGAGTGAGCCAAG:1 + chrX 5935819 3' + 1360 3380 2 54.00 ACCGAAGATATTTTCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAGGGTTAAAAAAG:1 + chr3R 10488722 3' + roo 353 2 79.21 GCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTGAGAAGCCTAACCAAACAGCGCCTACCCCCATC:1 - chr2L 12810128 3' - Tirant 323 2 71.29 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCTTCATC:1 - chr3R 27495652 3' + 412 7510 2 58.00 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTCTTGACATCCGATTCTGCAAGCTGACAAACAA:1 - chr3L 12241801 3' + roo 391 2 62.38 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTAAAACAAATAAAAAAATTGTTCTTACTGGTTT:1 - chr3L 16546787 3' + pogo 2060 1 77.23 TTCCAAACGGTGTCAAGCTCTTCAGCTACCAGCACAGCAATCACGATATCGACTGCAACTACACCTTAAAGGGTAATTATGCACAACAGTCTCTAGCAAAT:1 - chr2R 24875736 3' + Doc3-element 461 1 66.34 CTTTCTAGGTCAAAACCAGNTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTATAATTTTCGGA:1 + chr2R 10670048 3' - jockey 4781 1 58.00 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTATAGCATCCTGTATCGATTATGAAAATT:1 - chr3R 19450668 3' - Burdock 46 2 72.28 AGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTG:2 + chr3L 12634205 3' - BS 5048 1 77.23 CACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGCAATTAACTTGGCTAAGATCAAGTTACCAAGCTACGCGTTTTCACCATCTGGACAGGTGC:1 + chr2L 5284382 3' + Idefix 67 2 68.32 CTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTAAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGGGGGTATCATCATTATATGTTCATCAT:1 + chr2R 4545750 3' - Quasimodo 264 2 73.27 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCAC:1 + chr3R 23338311 3' + roo 350 2 80.20 GCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGCGCATCCGTTGCCATCTTACTTTCTCCCATCCTTCCATTCCCATCACCACACCATCCCAC:1 + chr3R 28707683 3' + 17.6 7078 2 65.66 CCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAAAAAAATAATAAACGCAAGATTATACAAACGAAAAACGATCTTCTGAGTGTGAACAATCATTAACAAGCG:1 - chr3R 18480446 3' + I-element 195 1 74.26 CAAACTAAGAATACTTTATGTAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATATCCAGAGGCGTCGATCGAATGTC:1 - chr2R 13654405 3' + flea 4946 1 74.23 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATAGTATTCTTCAAAAGGATTAATGGTAATTGAACTTGGTTTTTAAACGAT:1 - chrX 2530452 3' + pogo 2081 1 57.43 GATTTGGCAAGTTGTGCAGGATGCATGGGCAAAAATTCCTCCCAAACGTTGCCAGGACCTGGTGGACTCCTTGGAGTGACCGAATTTAACATCTTTATTCG:1 - chr2L 21678214 3' + HB 1224 1 69.31 TTAAAAAAAAATTCACAGTAAAGTTTCTTTTTCTAGAACTAGTGATATAAATATATATAAAGAACGCAATTAGCATAAATTCAACCGATTACTTACAGAC:1 - chrX 19279986 3' + HB 1555 1 78.00 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGATTGAATTTTCGAAGTGAATACTACTTCCTTTTCAGTGCATAAAACATATCT:1 - chr2L 20328697 3' - opus 22 2 57.43 GAGCGTGATGAGTTGGCGTNAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGCTCTGACTGGCAACTT:1 + chr2R 14997941 3' - McClintock 5962 2 68.32 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAATTACAGGTGATAAAGCT:1 + chr2R 10956965 3' + copia 220 1 60.40 TTTTTGTGGTTTTTATTTATATTGGTATAAACTAATTCAGGATAATGTATATGTATGAAATTTAATAAAAAGCGAGCAACAGATATAGGAAGTGTTTTTTT:1 + chr3L 18042072 3' - transib2 97 1 57.43 CATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATATACACGCACGCGAACTGGGCAAAACATAGGGCTATATACATATAGGGATAAGGCTAAACATCCTTGTAGTCCA:1 + chrX 7315130 3' - micropia 5043 1 80.20 ATACCTGGAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTACACCAACATAATTAGTTTAATTTGTATAATCGTGTGACCAACGCGAATCTCCTGCCGTTTG:1 + chr2L 13392356 3' + gypsy6 346 2 68.32 CTATTGAGCTGAGTCTTAGAGGTAGTTTCTCACACTAAGACTAAGAGTAATATTTTACGAATATGAATAGAACAGATATTTATTTTTAAAAATCAGTACCT:1 + chrX 21453003 3' - G5A 2459 1 72.28 TTTAAATTTGATTTTATTTTATTTCCGCGGAAAGCGTATTAAAATGAAGTTAATCAATTTATAGTGGATTAACCAGTGCTTTTAATTGTCCGATAAATTTG:1 + chrX 11046346 3' - HeT-A 324 1 76.24 AGAGAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCATGAGATACACGTTACTTAGCTAGTGGAAAGGCGATCGCAAAATTTCATCAGTTTTCTGGGGGAAAAAATTT:1 - chr3L 22848566 3' - INE-1 574 1 74.26 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAAATGTGCAGGCACAAAACGTACA:1 - chr3L 18762086 3' + pogo 2052 1 76.24 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGCAATGCAGCCGCTAAATGTGTGCAATTCACCACTTGAGAAAACCACCACCGCCGAAGCAAAGAAACCCA:1 + chr3L 10363911 3' + P-element 2883 2 76.24 ATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATATATATGGAGTACGTGTATGGCTTGTAAT:1 + chr3R 25750220 3' + micropia 413 2 72.28 ACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAACGTGCGATTAATGGGAACAGTTGGCTGGGTGCTGTGGCGCCCCCTGGCGTTGAAATTGTCATTGC:1 + chr2L 14211561 3' - 1360 83 1 71.29 AAAGTACTCGAGGCAGCTANGCGAATTATACTGTAGTTGTTGTTTTAGTTTATTTTTATTTAGTTTATTTTTATAGGAGAATCTTATGAGAGACCTAAGTT:1 + chr2L 3346343 3' + pogo 2089 1 58.42 TTTAACAAACAAATTTTAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGTCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTCTTCACCACAACGATCAAACTGAGTCCT:1 + chr3L 23773358 3' + 1360 3005 1 71.29 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATATATTAAGTACATTCATATTTCAACTTATAAATAAAATAAAG:1 - chrX 14172993 3' - 412 34 2 63.37 TTCGACTCATAAATAAAACTATATATATATGTATAAAGTATTAACTAGCCTTCAGCCAGCAATGTTTAACACTAAGTTCTTTTACAAAGTGAAAAATATGC:1 + chrX 17104499 3' + 297 6965 2 76.24 TGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAATTCCAGACACAAACCCGGCCCAAACAC:1 - chr3L 16282357 3' - gypsy5 27 2 55.45 AACAGCAAAGTGAATTCATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCCAAGTCTATTAAGCAGGCAAAGCCAAAATGGCAACGTGGCGCTCCGATTTAA:1 + chr2L 2560065 3' + Stalker3T 272 1 59.41 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATAAAATGATTATGACGATTATGCGAAGCTCCCGGCTACTGCTGCTG:1 - chr3R 20332872 3' - jockey 4703 1 54.46 AACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGCATGTATATGTTTTTCGAAAATGTTAATAATGCTTAGTTTATATTTA:1 + chr2R 9699886 3' + Transpac 288 2 55.45 GTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCGCTTGTACTTTTGACTGTTAATTAAGCACTTGGTGTTCGATCAATGTTTGATA:1 + chr3L 22736983 3' - G-element 28 1 52.48 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAGAGCGAGTGAGATTTAAGCCCGAACAATAG:2 + chr3L 2176404 3' + roo 402 1 72.28 AAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAA:1 - chr2R 6438338 3' + Stalker4 387 1 59.41 TCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGATATGGCAAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATACTCTAAAAAGTCAAACGTTTCT:1 - chr4 52525 3' - INE-1 138 1 76.24 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAACTAAACTAAATACTAGTATTGAAAGGAGGGTAGCAGCGTAGAAAATATTGAACTTTGTCAAT:1 + chrX 1127071 3' - mdg3 5267 2 65.35 TACGCCTAAAATTTGTATGGGTGTGAAGGTGGCATGTGGGTAATCTCGTTGGTGTTTGAGAGCAGTCTGTTTGTGCTGAACGTTGTCTATGCCTGTCTTA:1 - chr3R 24441586 3' - hobo 2679 1 66.00 CAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTTTTATTAGTGTACGAAATAAACAAAAGGTTAAGTTTGTTGTCCAAAAGTCGAACATTTTGCA:1 + chr3R 7513997 3' + diver 209 1 57.43 AAATAAAATATAATTAATTATTAAAGCTCTGAGTTGTAGGATTTTTTTTACTATTTCCTGGGCTTGCTACCTAGTTTACATTGTAGTATGCTCTTGGCTTA:1 - chr2R 21792891 3' + NOF 3961 1 53.47 TACAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGGCAAAACTTCGTTAAACAATAGTGTAAGCTTTTCCATTGGCTGGTCCATAGAAACTTTTT:1 - chr2R 4546860 3' + Quasimodo 7066 2 58.33 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTGTTTGAAACACTTGATTAGCGGCGATGATTGAACGGTTATTCGTAAATTGAA:1 + chr2L 17994220 3' - roo 22 2 57.43 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTTTTTTATTTATAAATAAAGATTTTTCAAGCACA:1 - chrX 7797662 3' - roo 8705 2 72.28 AAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAAACACACAATCTCAGAGCTGAGCACAAATGAATGCGAAACACCAAATAAATTAG:1 - chr3L 12200418 3' + F-element 4443 1 61.39 AACACAGCATATTTGCGTTCCCGCTGCGAGTCTTTGTTCTTTGGGTCTCTGAAAGATCGTATGACGTAAATATTATCGGATA:1 - chr2R 2944575 3' + Gypsy6A_LTR 103 1 57.32 GCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGGCCACAAAAAT:1 + chr3L 5241170 3' - Ivk 37 1 64.36 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATA:2 + chr3R 11052155 3' + blood 7343 2 74.26 AACATTTTTCAACAGTGTGGGCGTGGTAGTTTTGGGCGGTTTGTGGGCGTAAGAGTGGACGTGGCATATCGATAGAAGTTTTATAGTTGTTTGTCGAAGTA:1 + chr2R 6727603 3' - INE-1 256 1 80.20 CAAAGAGACTTAAATATCCCATTGATAAGCTTAGCTCCAACGCACACTTCTCGTCATAGGTGCGCAAATTAATATCAATATTAGGCACTTTAAGCAAAAGC:1 - chr3R 3864790 3' + F-element 4391 1 83.17 CATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTCCACAAAACCTCTAATTAAATAGCAAAACCAAAACTAAAACTAATCA:1 - chr2L 2931409 3' + 297 6851 2 53.47 TATATGCATATGTATATGTATATGTATATATGTATGTATATGTATATATGTATATATATGTGTATATATGCAGATTTATAAAAAAAAAGAACGAGAGAAGC:1 + chrX 18340589 3' + Stalker 7090 4 59.41 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCCAGGTGGCTGATTC:1 - chrX 19034103 3' - hopper 21 1 56.00 AATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGACAATCATTTGCTCTGGTGTTGCCTCGAACTTGTTCCTTGTACTATGGGCATTACGTGAAGAACGAGCAG:1 + chr3L 3595893 3' + copia 29 2 73.27 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAGTCAGCTCGCAGCGTTAGTTTGTCGCC:1 + chr3R 7626456 3' - hobo 24 1 56.44 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTATATACAGACACCCACATACGAGCGCCAATAGAGCGAGATA:1 + chr3R 5811551 3' - flea 31 2 62.38 AGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGATGCAACGCAAAATATATGTATATTCCAAACAAATTTAAATTTCAACAAAATTATAATACTTTCAAGCA:1 - chr3R 18032781 3' + 1360 3319 1 44.55 TAGAAGGTTGAGATGCAGCATACAGATTCTGTCGATGCAACGGTAGCACCACCATTTTTAAACGTTTCTGGTTTCCTGGAACCACTTGACTGCTGATCCAC:1 - chr2L 13162060 3' + INE-1 171 1 77.23 TCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATGGAAAAGTTTTAAGGCAGGAGAAAAACAGGGAGGAGGAGGGGTTATGTACCATCCTTGCCAGATTGACATTGCCTGT:1 + chr3R 8765643 3' - roo 8662 1 79.21 CGGTGCCCTCCACCCCTCCTTCACTACTCCGACACAACATGGACTGGCAAGCTCCCCCGCGACCCACCAAGCTGACCAAAGCGCCTAGAAAGAAGGCGCTC:1 + chrX 17945085 3' + G-element 284 1 90.10 GAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACATATTACACAGCCACGAAGTGGGCTTAAGACCCACACTCACAGGACCAGCTCTGCGGCTG:1 - chr2L 15531788 3' + Stalker2 7624 2 51.49 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATGTGTGAGTGAGTCGGGTCAAATAAATGACAGCCCATAAGGCAGTGTCCTTACATTCTGACA:1 - chr2R 21433121 3' - HMS-Beagle2 6893 2 69.31 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAATATCCAATAATTAAGCACTTCCGCAGGGAAATTGGTTTTT:1 + chr3L 12241881 3' - roo 35 2 64.36 ACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATATTTAATTGATAAAGCAGAAAGACATTCGTAAAGCGGAGGCTGGTCGTCTCTCAGCGATAA:1 + chr3R 17003396 3' - pogo 9 1 69.00 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTT:1 - chr3L 25059064 3' - mdg1 21 2 58.42 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTTATAAAATCGATGAATAGCATTTATTACATACATATGGCTTTAACGATCATTTGCAGGCT:2 - chrX 17104381 3' - 297 13 2 67.33 TAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTAATTAAGAGATATTAATTCATGTGAACCAAAACCATTTAGAGTTGTTCAAC:1 + chrX 7036745 3' - Quasimodo 18 2 62.38 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTATCATTTACGAT:2 + chr2L 21086106 3' - roo 22 2 57.43 CTTGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTCTGTAGTGTAAATGTGTATGTATGTTTTAGA:1 - chr2L 3870094 3' - Idefix 124 2 80.20 GCTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGTAAAAATTGGCTTCACCAAGATATCT:1 + chr2L 7175632 3' + blood 7359 2 54.46 TACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTATTTAAGTTGTTACAATAGTAACAATTAAAACTATTTGTCTGTGACACATTAAC:1 + chr2R 16207429 3' - Juan 4134 1 60.40 CAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGGACCAAGACGATAACGAAAATAACGATAAGCATCGGCGATAAGCAG:1 + chrX 17017094 3' + Bica 444 1 65.35 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGTGTACATTTTCACATATGAATAGTATTTAGTTTTCTCT:2 + chr3R 11608014 3' + 1360 3352 1 64.36 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTGTGTGTGTGCACATGGGCAGTAAATCTAATCCGAAGTATATCTAAGTGTTTTATAGTTTCTT:1 + chr2R 9209519 3' - Tirant 10 2 71.00 TCAGAGGAACCCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTATATATCTCATCCGTTAAGAAACG:1 + chr2R 4500911 3' + springer 7466 2 79.21 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATACTCGTTTCAAAGTACCTGCGTATCCATTTATTTA:1 + chr2L 7937276 3' + jockey 4945 1 66.34 AAACAATTTATAATTTTTTTTTCCTTAGTGAAACCTTGTGGATATTGTCCATTGCCCCTCAGGCGGTCAGACTCCCAGTGCAATTATGCTGCGGATTATCT:1 + chr3R 16838859 3' - Tc1 53 1 63.37 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATATAGATCCTTGTTTCCTGGGGATATTCTCCTTAATATTTTGATATCTTTTATTAGCATACTTTACAG:1 + chr3L 4009515 3' - mdg3 5260 1 71.00 TATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGACAGTTGGTAGCCTCAATTTGATTCGCAAGCGCAGAAATGGG:1 + chr2L 15531891 3' - Stalker2 3 2 76.24 GAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAACAAGCTAAAATGATATTAACAGTG:1 - chr2R 13869360 3' + I-element 352 1 76.24 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACCTACTTAAATATGTCGAAAAGTGTGTCATCGAAGCGAGAGCGAAAGAGAGTGCAGGAGAGAGTAG:1 - chr3R 24767772 3' - P-element 9 2 68.32 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAGCTGCGAGTCAAGCATTTTGGCCAA:1 - chr3R 31264192 3' - jockey 61 1 74.26 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGTATGTAGCATATCCCCTTCCGTTTTTTGGTTTCGTGGTTTGCCAGTTTAA:2 - chr2R 19102146 3' - opus 20 2 59.41 TGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGA:1 - chr2R 25203796 3' + 1360 3331 1 77.23 GATGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATCATTCGTTCTGAACTCCCAGCTA:1 - chr3L 7168339 3' - Doc 57 1 74.26 TCTTCTAGCACAACACGCACCCATATCGCGTTCTCGTCTCTTGTCTAGTTTCCATTCCCAAAACTTTGCACCGCATCGCATTTATCCGCCAAAACCCTGAA:1 - chr2R 17530969 3' + 1360 3207 1 60.40 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAAACTCTG:1 + chr2R 21040901 3' - P-element 49 1 31.68 TTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTATTATATATAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCTCCTCCCTGCCATCGTAGACTACTTCGAAAGT:1 + chrX 7013253 3' + 1360 299 1 68.32 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTTTTCATACGGCTGCAATTTTAATATT:1 + chr2L 23350500 3' - F-element 60 1 75.25 CCCCCTATTATATCTGATGGACAGAACAGGAGGAGTGGTAGGCTATCGAGGTCCCCTATAAGAGGAGTCGGAACCCCAATCCAGGAAGTGGAGGTGGGAGG:1 - chrX 10680093 3' + Rt1a 425 1 63.37 TCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGCTAGAATGCGTTTCTTTCCTCACTTTTT:1 + chr3R 10779430 3' + Tirant 8502 2 48.51 TCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAGGGATAACTCCTTCGATATATTCCAATG:1 + chr3L 12634258 3' - BS 4995 1 77.23 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCGAAAGGAATTAAATTTAAATTCCGCG:1 + chr2R 1737799 3' - I-element 50 1 72.28 TCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTAACTTCTTTCGTAAGAACCACTTGGATACATAGATTAAAAAGGACATCCAA:1 + chr2L 17023509 3' + Tabor 459 2 63.37 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGTCAACTGAGTGACATTCTTCATTTTGAAATTTATGGTGCGTTATTCCGCAATATGTTCCATGG:1 - chr2L 16153339 3' - Doc 18 1 66.00 GCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAATGTTATTGAAAAAATGCTGGTAACAAAACCCGTATTCC:1 - chr3R 4970627 3' + F-element 450 1 62.38 TGTTTGTATTATATTAATAACCATTCACTTGCAAAAAAAAAACAAAGAGATACCTGCTGCTCTGTACGGTTAATTCGATTTTTTGCTGATAAGTGCACT:1 + chrX 8923889 3' - Doc2-element 78 1 56.57 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTTATGGCAGGCATTCAC:1 - chr2R 9870956 3' + roo 403 1 73.27 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATTACCCCTTTTTGTGCATAGATTTTCCATCTTGTTCTTGCAC:1 + chrX 9775050 3' + 412 456 2 61.39 TTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACGGACATGACCAGTTCGACTCGGCTATTAATCCTGATCAAGAATAAAAATACTTTATA:1 - chr3L 19555065 3' - INE-1 147 1 81.19 GCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCTTAGTGCCAAAGACCCTACAATGTAGATATCCAGCGACCAC:1 - chr2L 22996098 3' + 1360 3296 1 71.29 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCTTAGTTGATTTTTTAAAATGATAT:1 - chr3R 5348677 3' + copia 5074 2 78.22 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGCGCTTAATCTGCTGTTGCCAT:1 + chr2L 12808247 3' - Tirant 8118 2 68.42 TGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATTACCCCTTTTTGTGCATAGATTTTCCATCTTGTTCTTGCACAGCGAAATTCGCCCCAAGGGCAAACGTTTTCT:1 + chrX 9775082 3' + 412 488 2 73.27 ATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGATAATCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCACAAGGTATGCAGTTGGTGGAGGGGCATT:1 - chrX 11340570 3' + Doc 4451 1 74.26 ATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTCTGGAGTTCGAGCTAGTGAGCCGTGGTATCGCCGAGGCTTGTACGGTGCGTGTTCTGGACAAGGCATCAGTGCC:1 + chrX 8564565 3' - micropia 5395 2 73.27 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTAAAACAAATAAAAAAATTGTTCTTACTGG:1 - chr3L 16546790 3' - pogo 44 1 74.26 GGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAA:1 + chr2R 12185430 3' - accord 2 2 72.73 TGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGGGTGATTTCAATTTTCTTGTTGTTCCTTGGAGAGGGATATCGTCGGGGTTATTGTTAGTTGGTACTGATGAACTCG:1 - chrX 17095938 3' - G4 3387 1 66.34 CAAACCAATGTATGGCCATNACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCAGG:1 - chr4 311203 3' + 1360 3363 1 52.48 TACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTTGACTCCCAGAGGATTTCTATCCAAGGCCAGTGATT:1 + chr3L 10152414 3' + Quasimodo 263 2 77.23 GGCCAAGGTGACAAAGGGGTTTGCAGCTACCCCGTATGCCTTATTAAAATCTATAAAATGCTAATAAAAACTTTCAAAATTACAATTGCATTCTTCGCGTA:1 + chr2R 2074008 3' + BS3 1727 1 69.31 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTCAGCTGCTCTGCTCGCCTTTGAAGTTTCATTTTTTCATTTTGCTACCAGCCCACGAAAACGACCC:1 - 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chr2L 16679993 3' - P-element 1 2 79.21 ACTAATAAGTAAACTTAGGNCCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGTTTTATTTCTTTGGGCCACT:1 - chrX 541404 3' + mdg1 7129 2 79.21 AGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGATTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGAATGTTTGGAGAAAGCTATTGGAAGTT:1 + chr2R 2617442 3' - Max-element 49 2 96.00 AATGATAAATTGCAATAAANGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGG:1 + chr2R 5772506 3' + HMS-Beagle 199 2 78.79 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGGCAATAAGTAAGAAATAAATGAAACCTCAAATAAATGGCAATTCATTTAA:1 + chr2R 11941080 3' - 297 6600 2 63.37 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTGCTGGGGCGAAAAGTCTGCGCT:1 - chr3L 9910369 3' + 297 348 2 77.23 ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAGCTTTGACAATCAGGACG:1 + chr3L 3757424 3' + roo 9061 1 66.67 ACGTGGAAGATGTGTGTACCGATCGGTCAGAGGCAGCGCGTCATGAAAGAAAACCACGACATGGAACGTCACTGGAGTTGCTTATTTAGTTTGTACTCAAC:1 + chrX 19021785 3' + Osvaldo 451 1 60.40 AAAGAAAAAGAAAAAATAAAATGAAGGGATTTGTGACTTTTCCGAAACTATTTAAAAATTTATTCAAGTTTGTCTGACCCAATCAACAATGAGTGCA:1 - 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chr3R 13912994 3' + mdg1 400 2 56.44 TATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTCGAGCACATTGACCTCCTGCACCACATTGTAGACCTCCTT:1 - chr2R 21204759 3' + Transpac 4960 2 60.40 TTTATCCTATTATCTGTAATCTTGATATCTGTGTGCTTTCTCTCCAGGCTGTGAATCTGTCTGCAGAACAATCCTTGAGCATATTTTTCAT:1 - chr2L 1289108 3' + Cr1a 4218 1 75.82 ATTGGTCCTGATCAAGAATNTATATACCTTAAATGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTATCATACTTTTCAACAAGTCTAGTATACCCTTATACTCTAC:1 + chr3R 2473817 3' - INE-1 83 1 78.22 TAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAAGATAAATATACATGTTGATGGAGTGGCAGTCAGGCAATTCCCGCGGTGCAAACAGATGGGCGGGA:1 - chr3R 27452733 3' + Stalker4 56 4 65.35 ATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCGTCTCCATCTCTCCGGGCTTTAACAATGGGGGTCCGCCGTGA:1 + chr2R 14290247 3' + Doc 4473 1 58.42 GCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCAACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCAGAAGTGCATTGCGAACAGCTGCAGTCACTCCTCCGCAGTTGGGCCCTT:1 - chrX 12768238 3' - FB 29 1 51.49 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCAACTCAAGTGCACTCTTAGCTCGACAACTTGAGGCGGAATTCGTCCTGTATT:1 - chr2R 9649147 3' + roo 401 1 71.29 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAAAACTTAAGGAAATGACCCA:1 - chrX 983311 3' + Juan 4187 1 54.46 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACTCGACTCGAATCGCCGCCGCTTGTTATTCTGGATTTCCCCCCCGTCCTGACCAAAT:1 - chr3R 10488662 3' - roo 8682 2 61.00 GAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGAAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGATTTTCGCTGACTGTTTGTCTGCC:1 - chr3L 8325519 3' - F-element 4219 1 76.60 CTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAGAGAACTTAACTGGCAAGGACATGGACAT:1 + chrX 5845009 3' - micropia 98 2 77.23 ATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATGTGTGTTGTACGATTGTTTCGTTAACCTGAGCATTTTTATTAC:1 - chrX 11967283 3' - 1360 3267 1 63.37 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGTTCA:2 - chrX 2841780 3' + hopper 1375 1 65.35 CGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGTACTTAAGTAGCTTGAGATTCTTGCTGGTCACAAAA:1 + chr2R 12576607 3' - accord 7054 2 64.36 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGCGTTGCCTCGAGCGCTTGGCTGGAACAACTGTAAA:1 - 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chr2R 7727162 3' - BS 4713 1 85.15 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGGTTCTCTTCTCCACCAGTTTGAATTTGAACGTGGGTGTGCGAGTGTGTTTGCGTGAGAGAGCGGGTTCA:1 - chr2L 8709284 3' + P-element 2882 2 76.24 TAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAGGCAGCACCAAAAAAATAGGTTGAACATATGTGGTGTGTGTGTGTGGAAAACTAATGA:1 + chr2R 18766287 3' - hobo 19 1 56.44 CATAGGAACAGTTATTTTTTCAATTCTTCTTTCATCTGACTCTGCATAGGTTACTGCATCTTAAAAACATTTTAAAACTAATATAGAGTTTAATATTTTCT:1 - chr3R 25087660 3' - Bari1 150 1 55.45 GAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAAAACAATAGGCCACAGCAGTGAGCTTG:1 + chr3R 10434931 3' - 1360 50 1 75.25 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTGTTGCTTTTCATTTCAGCTCTCACGGACCAAAAGACTTG:1 + chrX 2530567 3' - pogo 31 1 61.39 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCTGCATTATTACGATTTGCAACAAGCCGAAAAG:1 - chr3R 23638071 3' + pogo 2098 1 73.00 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAGTGTGTTTATGC:1 + chr2L 7666167 3' + roo 9035 1 63.00 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTACTTTTTAGAAGCCGGCTGCTAGACTACTTATGGTAAAATTGCATTAG:1 - 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Cr1a 3974 1 72.28 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGTCGTTGAAAAAGTCCGCGAAAAGTGGC:1 - chr2R 12457934 3' - HMS-Beagle 6840 2 71.29 TCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTATTATAGAACTCGGGAGATTT:1 - chr2R 12473031 3' - Doc 10 1 63.37 CATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATGTCTAAGTACG:1 + chr3L 26007760 3' + G5 4763 1 55.45 CTCAAGTGATTTTATACGAAGCTTGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAGGTA:1 - chr2L 21400733 3' - Doc3-element 35 1 65.00 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGCGGCAGGCAAAATTGAGCAAAGATGCCAGAACGTAACATTAAAATAAACGCGCACAGATAAATCTTGA:2 - chr2L 10791992 3' - 412 7 2 72.28 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTTTAAAAAGAACTTCTAATGAAGAGATATATC:1 + chr3L 10474221 3' + copia 236 1 59.41 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCCT:1 - chr2L 17994158 3' + roo 9024 2 69.31 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCA:1 + chr2L 17730524 3' - pogo 19 1 62.38 AACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGTTTGCCACA:2 + chr3R 13739750 3' + Burdock 6367 2 55.45 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAACTCTGATACTGGGAAACTCTCTCAATCACCTAGAGTT:1 + chr3L 25876136 3' + copia 5086 2 63.37 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGACACATGTGCATTATTGTTGCCTATCTGGCGGACGTTCTCTATCCG:1 - chr3R 28565260 3' - 412 7083 2 55.45 GTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGATCTCGGG:1 + chr3R 10391244 3' + invader4 292 2 59.41 ACGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACAACATGACTTTATTGACGGCTTGCT:1 - chr4 1150741 3' + 1360 3294 1 65.28 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATAATAATCATTTTATGTGCATGTTGTGTGGCATACTTTTGTGCGCA:1 + chr3R 20332928 3' + jockey 4963 1 54.46 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTCAAGAAGGATTTCGAAAAAACGAAAACATAAAGTAAAGATAATTAAGGGCAATAATA:1 - chr2R 10956888 3' - copia 20 2 57.43 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTT:1 + chrX 21217569 3' + pogo 2063 1 66.34 GCGGAAGTGGACGGATCGAAAAAGCAGAGCACGTTAAATATGCAAGGGAGCGGAGCTCTCTGGACTATATGATACCCAGTAGCTTTACTAACTACAGTTTA:1 - chr2L 1347897 3' + Rt1c 5081 1 61.39 ACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGTAATGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTG:1 + chr3L 829958 3' - G6 37 1 57.43 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCTTTTAAGTTTCTATTCCACCCTGATTTATTAGAAAATACCTTTA:2 - chr3R 20420921 3' - blood 7042 2 56.44 TGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTCCAAAGGCAGAGCTGTACAGGAAAAGCAGCTCCCCTGGGTA:1 - chr2L 19101833 3' - I-element 177 1 59.41 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTTCATTAGCATAAGTAGATGCGAAAATCGAA:1 - chr2R 9905337 3' + mdg3 228 2 62.38 GGCGAGTAGCACCCGCACANAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGATAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCA:1 + chr3R 7626425 3' - hobo 54 1 77.00 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGAGAGTGCTGAAAAGTTGAAATGTTATTTGAAATGTT:1 - chr2L 12882742 3' - hopper 6 2 57.97 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGTGCGCCAGATCCTTAATCCCGCACGTTGGCCGTTTGT:1 + chr3L 13295279 3' + hopper 1377 1 61.39 GAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTATTGGCTACATCC:1 - chr3R 4973101 3' + 1360 12 1 40.59 AATAATAATATTCTAGGGTCTTTGCTCGCACCGTAAAAGCCGTGTGCAAAGAGCGCCTTGAAATGTAACAACAAAAAGTCAAGCTTATTTATACCGCATTA:1 + chr3R 30387135 3' + Tc3 308 1 68.32 GCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGATACAAAATTAACTAAAAACAAATAGAAAATA:1 + chr2R 17799461 3' + TAHRE 10384 1 67.33 TCGGTGGACTTTGCCTGTGNAGGAGAAGTTTAAAGTCAATTGTTTTCAACAATAAAAGGTAGTACGCAAGCATGAATAACTCATGCCTGTATCATAAAAAG:1 - chrX 12860739 3' + I-element 322 1 66.34 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCGGAACACGT:1 + chr3R 14193964 3' + pogo 2068 1 64.21 GCGGAAAGAGAGAAATTTTGGCCGTCAGCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAGTGTGTATGGGCGTTTCGATCTTACCCCAGTGGCCAGAAG:1 - chr2L 18853911 3' + 1360 3313 1 74.23 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGGCTTAATATCGAAAATCCATTTACACCG:2 + chr2L 19854123 3' - roo 49 2 77.23 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACACA:1 + chr3L 3540214 3' - mdg3 5274 2 57.43 CTAGAGGACGATATATTGANATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTC:1 - chr3L 19274821 3' - transib2 48 1 72.28 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGGGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAAAGCGAACCGTTGATCACGTTTGGCGCAGGC:1 - chr3L 6834936 3' - hopper 17 1 61.39 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGTGTTTGGCAGACATGGGCAAGGCAA:1 + chr3R 17053152 3' + hopper 1403 2 67.33 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTACTTTTTAGAAGCCGGCTGCTAGACTACTTATGGTAAAATTGCATTAGAAACATCATTGATGGGA:1 - chr2L 2833837 3' + roo 400 1 69.00 ACTCCGCTCATAATCCGTACAAAAACCTTTTCTTGTTTCAAATGGCCTGGTTTTTTTATAATATTTGCTTAAATTCCGCATTGTTGTAAATTTTTTGGATA:1 - chr3R 7513881 3' - diver 5888 1 75.25 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGAAAGATGTGTTAATATGAACTTATTTTCGTGTACGATACTATTTGTGACGTCGGTTGCT:1 - chr3R 19987390 3' - Doc 23 1 55.45 TTTGTTGGTTGTGCGTGTTTTGCGTCGAACCTAATTTTCCATTTCTTTTGCCGTTGATGTAATGAAATTTGTTGAATTCTAAAGACCAAAATGGGAATCGA:1 - chr3L 10616748 3' - Bica 4634 1 53.47 GGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGGCAGCAGATCAATATCGCACAACGTCTCGAAGCGACTCAGTGCCAGCAGGGCCCACCTCTCGGCC:1 + chr2L 2764588 3' + R1A1-element 361 1 71.72 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGCCCATTTCCATTTTGCCCCAAACTTGCTTAATTGTTTCTG:1 - chr3R 13331417 3' + transib2 2789 1 61.39 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAGAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCCAGTGTCTATGGGCCATCAGACATCAGACATCAG:1 + chr3R 21432595 3' - transib2 38 1 59.00 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAACATTTGCCATTTATTTAAATATTTTTAAATTTTTCGATTGAGCGGAAAGTTTAGTTCCGAAAA:1 + chrX 22789406 3' - Tabor 14 2 63.37 AAATAACAAAAATAAAAAAAAAAATGGAAAGTTGCCTTGGTGTACGGACCCAGCTTAAATTCAAGCCAATTAAATGGGACGCAGAAAATTAGGCAAACCAC:1 + chr2R 21418370 3' + BS 5098 6 68.32 AAATAAAATATTAAAAAAAAAAATATTTTTAAAGACTTCAAATTGTTGTGTAGTTGATGATAGATGAACACAAAATCTTAGAAAAATGCTTAAAAACCCTC:1 + chr3R 15764434 3' + BS4 729 1 77.23 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACCACTGTTATTTTGCAGTTTGTTGGACTTTGCATACGCTTTGGCGGGGGTTCCCCGGCATAATTGAAAGCCCAT:1 - chr2L 20045705 3' - roo 2 2 78.22 CATATTGCTACAAAATTGGCCAAAACTCCCCAAATATGTAAATTCGTTTCTTCTCAAGTTTTCTGGGCGCATTAAAATTTACAACACGCATGTGTGGCAC:1 - chr3R 4917427 3' + 1360 3116 1 53.00 TCTAATGACCATCCAATCTCTAAAAGCAAACGGCGAAGATACACCGCTTCTTTTGCAGCCGTGGATAAAGCAACGTTAATCAGATCTAGTTTCGATTGGGT:1 + chr3R 19813238 3' - Copia1_DM 4029 1 75.25 CGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTGATGTCACTGCAGTAGGATCGATTGTTTTT:1 - chr3R 17713624 3' - 1360 266 1 74.26 CAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACAAGCCACAACGACGAGGCAGCGAATTTTACATTTGTCACGTTTAGGCAAATTGCAAGGACAAAGGACA:1 - chr3L 5843718 3' + mdg3 114 2 71.29 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGGGTAATTAAATTACGTGGCCCGCGGCAGCGCGCCTTTGA:1 + chr2R 6847322 3' + mdg1 7421 2 62.38 GTTTAATTTCCTTTATTTATTTCCTAAATTTAATTAATTATATTCTGCAAACACACTCAGTCTCAAGTCGGTGAAAATTTAAATGTTTGTTTATTGAATTT:1 - chr3L 3116374 3' - HeT-A 2 1 61.39 ATCTTAAGTTTGATATTTATATGATATAGCGCCAAGGGATTATTATTACATTAAGAGTTTGCTATTGATTTGATTTTATATGCAATTTGTTTTTGTTTCGT:1 - chr2L 15929599 3' - Transpac 4806 1 59.41 CCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAAACCCACATTGAATTACTTTCTGCTTGACTTCGGCACTAACCACCCAACAGGGGAAAACA:1 - chr3L 15881887 3' + HMS-Beagle2 25 2 64.36 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTCTTGACATCCGATTCTGCAAGCTGACAAACAATTTCC:1 - chr3L 12241796 3' + roo 396 1 67.33 GTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAATTGACATTGAAATTGAAGTGGTGAAAAAGAAAGAAAG:1 + chrX 13146188 3' - roo 8598 1 63.00 TTATGTGGAAACTGTCTTTCCCAATCAGGTCCATTATTTTGCTTACGAGGACCCTTATATTTTAGAGGCCCATTTGAATTTTCGCCGCTTGGCCTATGGGC:1 - chr2L 5417410 3' - Fw2 275 1 49.50 TAAATATATATATATAAATATATATATATATAAGATAACTGAATATTCCACCTGCTCAAAAGCGCTAACTTTCATATAAAATAATTGTCACACGTTGTTGG:1 + chrX 14772822 3' + Stalker 6937 4 63.37 GACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAAAATGTACTTGAAAAACTAAAAATTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAA:1 + chrX 9456174 3' - HeT-A 6033 1 51.49 CGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGACTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGTTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTGTGAGCTCGAATATGTG:1 + chr3L 25323831 3' - Doc3-element 4567 1 59.41 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATGTG:1 - chr2L 12958928 3' + roo 360 2 75.25 CACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTTACGTCAGCCCGACTGCAACTAAGTCGCTAGCTATATATGACTCTTTGACCAAATATACAACAGAAACAATCAC:1 - chr2L 15364196 3' + gypsy4 6604 2 70.30 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTCTATGGAATATCTAGTAGTTTTGAAAGCAGCAGCCT:1 + chrX 17883693 3' - pogo 21 1 60.47 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGCTCGCCGTTATTATTATTATTATTATTATCGGGCACCATCATATGCCCGTAAT:1 - chr3L 17186792 3' + Tirant 380 2 59.60 TTCCTTCTGCCTGTTACATNCCTTTCAACGAATCTATACCCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACATATATAATAAAGCATATTAAAAATTGGGTTC:1 + chr2R 25211385 3' - INE-1 27 1 79.21 ATTTTAACAGCTTGTTTTGNCATATTTGAGTAGTACCTACCGATAGCAGATAGATATATCTACAGAACATGGTTATCTCTATAGAATTTTCTAATATTCTA:1 + chr3R 18237655 3' - Juan 3873 1 59.41 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGA:1 + chr2L 20045813 3' + roo 9048 2 55.45 ATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGCCTAATGTTATTGAAAATAAAGTGT:1 + chr2L 14578662 3' - micropia 5133 2 75.25 AGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGCCTGTGATCGATGCCCTTTGTGTCGGAGGGCTGGCTATTCACGTTCG:1 + chr2R 21394982 3' - F-element 328 1 53.47 ATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTGTGCTCTGTCAAATATGTTCGAATTTTCTA:1 + chr3L 15790145 3' - opus 7438 2 70.30 AACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGCTG:1 - chrX 4166374 3' - I-element 5316 1 50.50 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTACCTGCTTTTCCTGCTTTGAC:1 - chr3L 6023280 3' + hopper 1383 1 54.46 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTGTGTCCGGCTTCCTGTATGCCGTCCCCTGTC:1 - chr3L 13295200 3' + hopper 1410 2 71.11 GCGATCGTCTTGCTCGCGTTGTCGCTGAACGCGAGTGTCGTTCTGGCTCATAGTGTTTTTTCTTTGCTTTATTACCCGTTTTAACTGTTCTTCGGGGCATT:1 + chrX 12247578 3' - Doc2-element 311 1 60.40 TTAGTCTAGTTTTGTAAACAATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAATTCCTTTCGAAATCCCCGCTGTCGCCAGACACC:1 - chr2R 1737770 3' + I-element 5327 1 58.62 GTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTTACTACGCTCTTATTTGTTGCTTAACTGGCAACAGGCAGGCCCTTCTTCCGCAGTTGACATCTGCATTTGTG:1 - chrX 21183946 3' - Juan 6 1 72.28 GTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTATGTATGTCACTGCGTATTGCTGATAAGTTCTATTTCCTC:1 + chrX 18326273 3' - Doc 183 1 77.23 AGTGTTGTTGTTAATTTGTTTGGCTGTGGCGCGCATTTTTCACACACTGCGGCTTTAATTGAATTTGTTGCATTTTTTACTTTGCTCTTTTATAAGTTACA:1 + chrX 9449045 3' - Penelope 629 1 56.44 TTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGATCTACGACACTCGCGGACATTCAGATACCAGTAGTAGAAGTACA:1 + chr3R 18564631 3' + 1360 41 1 56.00 CTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATCTGACTTTTGCGTAGCGACCACATGATGCACATGCGGTGCACGTAGACGAACCCCTCGTCAAGAAATTCG:1 - chr2R 23898978 3' - invader2 324 1 77.23 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCAAAACAAATTAAACT:1 + chr3L 7099647 3' + roo 9035 1 64.36 CTGATGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGTG:1 - chr3L 16792547 3' - Chimpo 4038 1 56.44 AATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACACACAAACTTTGGAGGATCTCAGCGAGCTGCAGATGGACCAC:1 + chr2L 16881732 3' + Stalker4 63 4 59.41 TTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATAGTTCCGCAGATCACTACGTTCATACGTTTTTTTTCGATTCTTGGTAAACAAATTTGTTTTCATATTTG:1 - chr2R 9520521 3' - Quasimodo 7194 2 46.53 CCTTATCAGCTGCACCCGGAAAAGCAGCAGCAGCGTCAGTCGATTTATGAAAGCGAGAGTGTGCAGTTGTTCTTACTATAAAGAATCATAAAAAGAAAACA:1 - chr2R 4271768 3' + Gypsy12A_LTR 143 1 71.29 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTATATATTTAAAAATGTTAATAAGCATTAGTTTCAAGTTAGTTAGCCACAGAAAATATATAT:1 - chr2R 19088940 3' + Tabor 7308 2 59.41 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAAT:1 - chr3R 7469975 3' - Doc 60 1 76.24 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATGAGAAAATGCAAAGGGAGAACTACTACAAA:1 + chrX 13126261 3' - mdg1 47 2 72.28 CAAAATTCTGATTTTGTGAAAAGAGATTGGGTCAGTCAGTCAACAGTTAACTGAGAAAGTTAGAAAAGAAATTGGCAGAAAGAGTAGACCATTTTATGGGA:1 - chr2R 23626217 3' + invader1 3882 2 66.34 TAAGCAGATCAAATTTTGTTGCCACATAGGTAACAGTGCGTTCCTTATATTGTTGATATAAAAAATAATTATAAAATATCATAAATTTAGGATTCCTTCTG:1 + chrX 5672150 3' + jockey 4944 1 54.46 CAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTGCACATGAAAATCTGGTTAACTTCGTTTAGAAAAGAACCGCG:1 + chr2L 9045804 3' + jockey 65 1 64.58 CAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCCTCCGGTGG:1 - chr2L 17994151 3' + roo 367 1 62.38 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTACTTATTATAGTATAAT:1 + chr3L 20411875 3' + roo 393 1 62.38 GACGGCTGCCTTAAACTTANAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATAAATATTAATTACTATTTTCCAACATTAATTACCTCTTGTTG:1 + chrX 14173057 3' + 412 7511 2 57.43 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATACAACAAGGAAGAAAAGCGAAAATTTCTTATTTCCATTTCTGTGGC:1 - chr2L 18247979 3' + blood 7362 2 53.47 AGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCCGCTTTTTGCCCGAACTCTGGAATGTCAACCACAATGCCGATC:1 - chr3R 11433642 3' + Doc 4511 1 57.43 TAAATAAATTATAAACAAAAAAAAAAATAGGGTTTAACTGT:1 - chr3L 10580941 3' + BS 5093 1 92.68 TTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAA:1 + chr3R 1844823 3' - Cr1a 152 1 69.31 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATACTCGTTTCAAAGTACCTGCGTATCCATTTATTTAAAATGACAAACCTTTGCGATTCTTCATTGCCT:1 + chr2L 7937308 3' + jockey 4977 1 48.51 GTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTCGGATATATATATATCTGTATCTGTATCTACTGCCCTACCTCAGTGAGAAAGCAAAAGTAAAG:1 - chr2L 1540169 3' - roo 267 2 65.35 TGATCATATTTCTATTAGAAAATAATTGCTAAAGGACCGAAACTCCGAAATAGCGCCCGTCCCTCAAGCCTTTCTTAACTACTTTCAACAATTGCCGTTCC:1 - chr2R 4511941 3' - transib2 76 1 50.50 CGGAGAGAAGCTCCAGAACATCCCCGAAAAATATATGGAACGACTTAATGCGCACCCAAACAGCCTGGCCAGTCAGAGCGAATAAAGTAAGGGACTAATGC:1 + chr2L 9290403 3' + jockey 4621 1 75.25 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTTTTAACGAGCAGTTA:1 - chr3R 10741064 3' + 1360 3388 2 75.25 TCAACCTTCTAGCTTCTATAGTTCCTGAAATAACAACGCTTATATGGACGTAAAGACAGACGGACATGATCAGATTGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAA:1 + chr2L 21737999 3' - INE-1 160 1 67.33 AAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGACAGATATTGGGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTTTTCATCATCTTAAATCTAAATTGGTGGTGGTGG:1 + chr4 702198 3' - INE-1 511 1 69.31 AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTTTCGCAATCAGCCATTTCCTCCAGT:1 - chrX 8334289 3' + flea 4987 2 55.45 GGACTATTTACTTAGGCCTNTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATTCCCGATTCCCCTTGTCGGACGTCCGGATGCTCTTTTTGTGCGTCC:1 - chr3R 7402945 3' + roo 285 2 56.44 CGCTCAAGCCCTTTCAAGACCAGAGAGCGAACTCTTGCTCTCCGTCGTTGCCAAGAATGGATGTCAAAAAGGTAAAGCACCAAAAGTACTCTCTGTCACTC:1 - chr2L 4547975 3' + Doc4-element 98 1 56.44 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAAT:2 - chrX 20361962 3' + hopper 1391 1 55.45 AGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCCCCGTGTTGTACATGATAGGCATGTTGTCTGAGTTATTAGTTCCTTATTTTAATCGAAAAACAT:1 - chr3R 9267081 3' + R1A1-element 139 1 70.30 CTCCACCCGAAGACTGTGGNAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAAAAAATATTAAGCAGCTTATTCGGATTTTGATTTCTTACT:1 + chr2L 18655235 3' - Doc 11 1 69.31 GATTCATTTACATAAGATANGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGAAAGGGCTGAGAACATTTAAGTT:1 + chr2R 13763234 3' - roo 8717 2 79.21 TGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAAAACTTAAGGAAATGA:1 - chrX 983315 3' + Juan 4183 1 58.42 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTGTTCCCGAACTGCATATACATATATTAACG:1 - chr3R 24976747 3' + opus 7460 2 77.23 TAAAATAAAATAAATAAATAAATAAATAAAATATCTTTAATTGACACGAAAAATCTTTCATGAATATGGACAGCTGTCATTCAAAAAAGACTCTTTGAACT:1 - chr3L 16075050 3' + Doc3-element 78 1 70.30 CATTAGTTCGACTCATAAANAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTTTATAGTTTCAAAAATTCTGCCTGATGTGCGCTGTTTGAACTACAGGTCGAT:1 + chr2R 10827752 3' + 297 378 2 64.36 TCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGGTGACTTTAATTAAATCAGGACAAATACCCATCCTTATTTGCTCATTGGATTGGATAGGTGG:1 - chr3R 8559395 3' - F-element 422 1 81.40 CAGTGTACCCTCGATATATNCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAATAAATCATCAGTGCCACGAAA:1 + chrX 15546237 3' - blood 10 2 68.69 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTAGCTCCGTTCTCCGAAGAGAGAGAGTGAA:1 + chr2R 18171564 3' - P-element 47 1 31.68 TGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGTATTCAAAAAAGGTACGATTAATT:1 + chrX 7442831 3' + Cr1a 345 1 78.22 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGTAGTTACAAAATACATTTAATACAAGTTTTAGGG:2 + chr3R 25581092 3' + pogo 2062 1 62.38 CAGGTGCGTATTATTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTATTATAATTATGCTGGCATCTTCACAGATGTTGTTGC:1 + chrX 8727944 3' - X-element 18 1 61.39 TCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAA:1 + chr3R 12876364 3' + hopper 1372 1 69.31 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATAAAGTTTTTATTATCATAATAA:2 - chr3R 17003319 3' - pogo 49 1 79.21 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGTTTTCTAACACGGAAAGA:1 - chr3R 21365476 3' + P-element 2878 2 68.32 AAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAATTATCTCATTGAAACAACTCGGTGGGCAAAGGG:1 - chr2R 13817811 3' + TAHRE 10386 1 67.68 CGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGTAGAACGCCTTATGAAGGAGCTGACTGCTATTTACGATACAAGCGATATTACCGGTAAG:1 + chrX 6635680 3' + F-element 85 1 62.38 TAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGATTGAACAACATTTTTAGAATGATTAAGTTCGTTATGGTTTCGGG:1 - chr2L 12511538 3' - copia 32 2 57.43 ATAATTTAAGAAACTCTGTACAAAATAGAAAGAATTAACTAGGGCTAACTTCATTGTCTCGTTAATAAGTGACTTTTTAATGATAGATATAGGACT:1 - chr2R 12264602 3' + mdg3 5030 3 75.00 TTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCA:1 + chr3L 19274864 3' + transib2 2782 1 68.32 TGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGCGCTTAATCTGCTGTTG:2 + chr2L 12808243 3' - Tirant 8128 2 60.40 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATAAAATGATTATGACGATTATGCGAAGCTCCCGGCTACTGCTGCTGATTATTCAAGGATGT:1 - chr3R 20332857 3' - jockey 4688 1 59.41 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACATAACACCTGCTTAAAGAGCCGCAAAAAGAAAAGAAAAACGCAA:1 + chr2R 8177767 3' + mdg1 385 2 59.41 TTCTTATTTTGCTTTTTTTTTTGGGCGGCCAAAAAGAGATTTTGTTTATCCCGTCGGACTATACGAGCTGTTAGAAAAAAACCGCCATGGGCAGAAATAAA:1 + chr3L 3456641 3' - Doc2-element 252 1 89.11 TAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTATTAAAGTAGTAAGTATTAAATTAAAGTAACCCCGATTTGTTTCAATAAAGATGAGACTTGGCTAATTTAGTCAAGAATT:1 + chr2L 6296800 3' + TART-A 13126 10 54.46 TATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCTGCTCATTAAATTAGATAAAGGGAAATCTC:1 + chr3R 6154006 3' + mdg3 5145 1 70.30 GAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTTCTGTCAGCGGCAGCAATTGTGCCTCTTATGCCACCCATCCCCAACACCCACTGCCCCTCCCGCA:1 + chr2R 6918668 3' - accord 8 2 71.29 GACTATCAGATACCAGTTACTCAGCTAGTGTAGTGTTTTTGCTGTTATCGGTTCCTTCTCTTTCCATTGACTAAGGTTCTCAGTTTTTATGTATTGTACTA:1 + chr2R 5790110 3' - INE-1 549 1 72.28 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACATGAATGTGGGCGGGGCACGTCTCACTGATTAATTGCAGTTTGGTTTT:1 + chr2L 17677785 3' - Tirant 27 2 54.46 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACAAAA:1 + chr2L 17079890 3' - jockey 4814 1 58.42 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGTGCCGGAGTGTGA:1 + chr2L 18213248 3' + hopper 1408 2 72.28 CACACACACACACACACACATTGGGATACCCGCGCACACACATATACACCCCCACACACACACACACACCCACACACACA:1 + chr3R 28240377 3' + accord 184 2 86.25 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATGTTAATTGGGTTAGTTATTGAAATGAAAAGCCCTAAACGGATTTGTTCTAATAATT:1 - chr2L 21086014 3' + roo 9053 2 61.39 ACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTGTCATAAAACCGAATAGATCGTAAATTAGGGTTTTCGAAGTTCGAACGCCTCTTTTGCCGCTCTCTCCCAT:1 + chr3L 1586823 3' + Tirant 8505 2 76.24 GCAGCTATCAGGTGGGCATCGAGCCGAGATTGTCTCTAAACTTAAGACTTGTACTTCTGCATCCCAACCGTAGGGTTTAGCATATCTGCAAGAGATGGCCC:1 - chr2L 16726086 3' + Bari2 269 1 63.37 TGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAACGAGAGTACCAAGAAACGGATCGAGAACTAC:1 - chr3R 21884189 3' - mdg3 47 2 69.31 AGTTGCCGCATGGGTAGCAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAGAAAGAAAAATAATCTCGATTGTAAAGGCATCTTGAG:1 - chr2R 24550671 3' + jockey 4960 1 63.37 TAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATCTGTCTTAAAATAGAAAATGAACATAAGGCGCATATTTGGCATATTTTATGAGGATATATAA:1 + chr2L 4134920 3' + Quasimodo 7360 2 70.30 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCCTGCCAGCGCGCTGGCGAAAGTGATGGTCCTTGTGTTGCATACTTTTAG:1 + chr2L 10166062 3' - jockey 32 1 53.47 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCGCGTAACAAGT:1 + chrX 9413869 3' + 412 461 2 56.00 TTGCCTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACCAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAA:1 + chrX 23108293 3' - BS3 1445 1 80.22 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGTGGATGTATATGTACATGTATATGTATGTATATTGGCTCCTTGGC:1 - chr2R 15349493 3' + P-element 2855 1 48.51 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGTGCCGGAGTGTGAG:1 + chr2L 18213249 3' + hopper 1409 2 73.27 GAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAAGTTCTCAATGGAAGCTACCGACTTGTAATATAATTAGCAGTTTCAATGGTTTTTCTGCG:1 - chr3L 7645584 3' - hopper 1167 1 62.38 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAATGTTTGAGTTTGCACATTGAAGAAATAAATGAAACAAGAGTGCAGAGCCAAGAGGAAGTGGCAT:1 - chr2L 14262778 3' - pogo 7 1 70.30 ATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATCGCCGTACTTAAATCACTTTCTCGTATAAATATT:1 - chr2R 22051445 3' - Tabor 6852 2 64.00 TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACTACAAAAAGCAAAGGCCTTTTTATCTGTGTGTTTTCTTAT:1 - chr3L 7793104 3' + copia 219 2 61.39 GTTAGATGTAACAAAACAATAATACAAATATAACAATTAAAAATATATCAATTCGGAATTTTCATCTGTCAGCTTTAGGTGCCATTTTTACAAGTTTTACA:1 - chrX 19548030 3' - BS3 1665 1 52.48 GTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTTAGTATCTCTGTTGGTTGGCACTGGCATTAGCATAAACAAGAGCCGCCTG:1 + chr3R 8964272 3' + R1A1-element 4949 1 52.48 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACCACTGTTATTTTGCAGTTTGTTGGACT:1 - chr2L 20045752 3' - roo 48 2 74.26 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGTTACTTGAATTA:1 + chrX 22574718 3' + 297 371 2 57.43 AAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATAAGTATATATACATATAAGCTTACCGGAAAAACGTCCGTTGTTCCATGGAGGCAAAG:1 - chrX 5475375 3' + 412 7530 2 56.44 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGAC:1 + chr2R 15788618 3' + Transpac 5193 2 73.08 GCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAGATGCAAACCACGATTACAACGCGACGACTTGGCCTTCTC:1 - chrX 17223748 3' + R2-element 3421 1 60.40 TTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTATGTATGTCACTGCGTATTGC:1 + chrX 18326254 3' - Doc 202 1 58.42 AACCAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGAAAGGTTCCATGTTGAGTTAACTAAGGCATGACGTTGAAGCTAGTCTTGCAATTAGTTTGATTTTGAT:1 + chr3L 3673267 3' + Cr1a 4035 1 72.73 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCTAAATCGCACAATCAAAAATAGTTGTTTTCACAAGCGGAGAATATGAAATAATTCAGAGG:1 + chr3L 5710333 3' - Transpac 4922 2 73.12 TATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTCTGTTGCAATGTGTACATAAACAGTCCAGCCCAAGTGTATACGTAATACGA:1 + chr2R 4794618 3' + blood 7017 2 54.46 ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGGAATGAAGGTTCCCTTACCTGAACGGATGACAAATGGCAAT:1 + chr3R 13331485 3' - 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Cr1a 4158 1 69.31 CTGCCAGACCGGGGTGCTTTAGCCGTTTACCAGCACCGCTTTCCCAGCTGCTACGCTGCAACCGTCTCACTTCAGAGGGATTTGAGGCATTGACCCAAAAC:1 - chr3R 14105826 3' - Rt1c 346 1 66.34 GTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCACCCTTAAAACAAGTAAAATGTAATCGAACAAAACCCTATTTACTTTAACTTTATGACACAATTACATTTAAATCC:1 + chr3R 11916649 3' + roo 407 1 77.23 TTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCACCTCACATCACCCACATCCAAAATGCGGTGCTGTTACCCATTTCCGCT:1 - chr3R 13739647 3' - Burdock 6143 2 72.28 ATCATACTGAATCTCTATTNCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGATTTTATAGC:1 + chr2R 22051519 3' + Tabor 7279 2 66.34 TACCCGTTACGAAGCTAGTGTGAATGAAAAATTTTTTAATTGTTCAAAAGTGGCGTGACCGTTTTGTAGGTGTAAAGTGTTTTTGGTATACCTGTAGAAAT:1 + chr3L 100312 3' - INE-1 539 1 74.26 AAAAGATAAAACCAAACCTNTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAGGGATAAC:1 + chr3L 12634238 3' - BS 5015 1 57.43 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCATTCTTAGTCTTATCAAATCGTT:1 - chr3L 14222479 3' + roo 9047 1 68.92 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATCATTCCTGTAAATATACATTTTTTTATATTTT:1 + chr3R 4394582 3' + pogo 2059 1 71.29 GCAGTCAACGAAACTATTAAAAAATGGCAGCAAAAAACACACAAATCACCTCTTTAGCCACCTAAAATCTAAAATACACCATACATAAAAAATCAACGCAC:1 + chr2R 1000321 3' + Porto1 4416 1 65.35 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCA:1 - 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roo 8708 2 71.29 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTCTATATAAATTTCAATAAGTACTTAACAAAAAAGGAAGCCAAATGCTATTAAATTTAA:2 - chr3L 15788413 3' - opus 21 2 53.47 GGTTTGGAAGTAATTAACAATAAATTATTGAAAATTTTCCACTCCGCACGTTATGCGTAGCTAATTAATCAGGTATACTTTTGCATTTAGAGGTCATAAAA:1 + chr2L 3494360 3' + R1A1-element 131 1 53.47 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCACGTGCACTTCATGAGTGTTTGCATGCGTC:1 - chrX 21009348 3' - hopper 42 1 67.33 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACTTATACCACAATTTTATCGAGTAAGCCGCAAAACTAGTAAACAGTTTGAG:1 + chrX 5475468 3' - 412 24 2 53.47 TTATTGTTGTTGTTATTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGGCGCAGATCATGAGAGAGGCGTGGCTTGG:1 - chr2L 5937066 3' - mdg1 26 3 77.46 TCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCGAAAGGAATTAAATTTAAATTCCGCGTTATTTTCCGCACTAATTGCCATTGATTTCTTTTCGAGTGATAAG:1 + chr2R 1737844 3' - I-element 5 1 73.27 GTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTAATTAAGAGATATTAATTCATGTGAACCAAAACCATTTAGAGTTGTTCAACTGTACTTC:1 + chrX 7036753 3' - Quasimodo 6 2 73.20 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGACTTCCCCCGCTTGAAGGCGTGGGCA:1 - 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chr3L 11082602 3' - baggins 5121 1 73.27 TTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTAGTGAAGGGCTCCTTGATGACGCATTACGTACTCGGTCCAGTAGAT:1 - chr2L 16798043 3' + hobo 2502 1 50.54 ACAACTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCA:1 - chr3L 17181446 3' - jockey 4692 1 50.50 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAAGAACGTATTTATAAAAATAGTTGTTACATTAAAA:1 + chr3R 6947377 3' - I-element 44 1 63.37 TGACCTTACTTATGATAACTCCTCCCTTAGTTAAGCACGCCGAAGCAATGTTTCTCTCGGTGTAAATCGAAATTGTCGAGTGTTAAACTGTGGGTTAATAA:1 + chrX 3696863 3' - gypsy9 5012 1 68.32 GTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTATGTATGTCACTG:1 + chrX 18326246 3' - Doc 210 1 50.50 TTATGAGTGTTCATCCTACNACAAGATGTAGTTTCGTTTTATTGATACCCCGCTTTTTATCCAATGCTCCAAAGATGCTAAATAATTTGTAATGTTCAAAT:1 + chrX 11032281 3' - invader3 5188 2 64.36 AAAAAAGGTAAAATCAATTGCTTTGTGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATATTAGGATTCAAGTCAGTATTCTAGACAGTCTATTGAATTCTGTCTGC:1 - 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Doc 12 1 68.32 TACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATATAGGGAGATAACATAATATAAGCTTTTAATTGCTCCATACAAATTGATGA:1 - chrY 485458 3' - Quasimodo 7200 2 54.46 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAAGTTCAAGTTCTAGA:1 + chr3R 11052173 3' + blood 7361 2 56.44 GTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGGAGACATCACCATTCTGAAATCCAAACTATGAGCTGCGTTTTGTTTGCCTGTCAC:1 - chr3L 10043558 3' - G6 1900 1 52.48 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTACTTATTATAGT:1 + chr3L 20411870 3' + roo 388 2 57.43 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATCTCTATCTGCTCCGAAGGCATTCCGAGTGGAAATG:1 + chr2L 2833919 3' - roo 41 2 67.33 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTTTCGCAATCAGCCATTTCC:1 - chrX 8334295 3' + flea 222 2 61.39 TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTATTCGCCGCTTTCGGAGGAGCGTGTGCA:1 - chrX 4167351 3' + I-element 5319 1 61.39 CAGACTGCGGCGTCTTACAAGCGCTGCATTACAAATTAAATGATAAGAACCTTCTGACAATTTTATCGAATACCAACTCGCATCGCCAATTCAGTGGCTTT:1 - 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Doc 4479 1 68.32 AAAATCGTATGTCGTTGCGCATCTATTATGCTATTACAGTAAACATACTTTTGAGTCCATAAAAAATCACCATGACTTCACTACGCATTCCAGTTCTTATA:1 - chr2L 8721621 3' - 1360 22 1 65.35 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTC:1 - chr3R 27495664 3' + 412 7497 2 70.30 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCT:2 + chr2L 21086088 3' - roo 40 2 67.33 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATATACAG:1 + chr3L 15033368 3' - I-element 12 1 58.75 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTGTGTCCGGCTTCCTGTATGCCGTCCCCTG:1 - chr3L 13295202 3' - hopper 11 2 65.96 GGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGGGTGTGAGTGGCGATGTGGAGGGCTGTCATGTTGCACATCCCAACTTCTTGGCTAACCCACGCACGTCTGC:1 - chr2R 8510323 3' - F-element 268 1 77.23 TATAAAATGGAGCATTAACAATTTGTCTTAATATTCATTGATAAATCCTTCGCTTAGCGGCCTCATGATATTGGTAATTGTTTTTGAATCCCCAAGTATAA:2 - chr3L 3973679 3' - G4 3516 1 66.34 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTTAATTGACCTTGTGTGTGCGAAATATTTTTGAT:1 + chr3L 9928631 3' - roo 8668 2 75.25 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAA:1 + chr3R 11052159 3' + blood 7347 2 70.30 TTCTGAATTGGAGTTCATCNTTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAAGTTTTATGGAGTTTTTCTCGCTGGGCCCCTTTTGAGCGCTTGCTG:1 - chr3R 12063711 3' + 412 490 2 75.25 CCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGGATGTAGACGCGTTAGCAGAAGTTTCGTTTCC:1 - chr3R 6266306 3' + roo 366 1 68.32 CACAGTTTTGGCGGCTGCATTACCCAACAATTACTATTGCACAAAATCAGATTTATTAACGATGTAAACATGTACATTACAAATATCAAATGCTCACCGAA:1 + chrX 2372749 3' - diver2 4540 2 54.46 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAAATAACAGCGACTAAGGCTAATTTATGTACAAACAAGGTGCTATTTTAAC:1 - chrX 12472524 3' + pogo 2078 1 56.44 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATACCAATCCCCATATCTCTCTCTCTCTTTCTCGCTCTAGAAATATAAACTAAACATTTTCTGC:1 - chrX 4937528 3' - Doc 28 1 55.45 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTGTGTCCGGCTTCCTGTATGCCGTCCCCTGTCGACGTGCC:1 - chr3L 13295192 3' + hopper 1407 2 71.29 TTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGTTTGCCAC:1 + chr3R 13739749 3' + Burdock 234 2 56.70 ACCGTTGGTATGGGCTCAGNGTGCTCGAGGGGTTCCTCCAGGAGTATAAATGCATCCGAAAATTGAGATAAATTAGCAATGACGCACTATATTGCCAAGAA:1 - 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mdg1 7080 2 65.35 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAACAACAACAATTGCTTTGGCTATCTTCGCCTCTTTGTTGTT:1 + chrX 2289331 3' + roo 9034 1 63.37 GAAAAATAAAAGTCAAATAAAAACAGTGCAAAAATGCCAAAAACTGTCGTAGAAAAATGCAGCGACGTTGACGCGGGCAGAGGTGCATTAGAGCCGAGGAG:2 - chr3R 11303534 3' - Tc1-2 1391 1 60.40 TATTTTTAAGTTTGTTTAAAAAACTGAATGGATTCATCTAATAAAAGTATCTGTTACTATAGTTTAACTAACTAACTATTAAGAACCTTTTCTGGTCTAAT:1 + chr3R 18478792 3' + pogo 1886 1 87.13 GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGTT:1 - chr3R 21365492 3' - P-element 25 1 54.46 ACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAAAGGTAACGTAATAAAGTCCCTTTATTTATTCGTAAATG:1 - chr2L 20560308 3' - F-element 18 1 64.36 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATAGTATTCTTCAAAAGGATTAATGGTAA:1 - chrX 2530474 3' + pogo 2059 1 71.29 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATGAGCAAAGCCAGATGGATAGCATTCTCGGATACATACAGTTGGGGTCAAGAAAATACGAGTAT:2 + chrX 2841863 3' - 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I-element 11 1 68.32 CTGTAGACAGAGATACGGTAGATTAAAAAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGAACAATGAATACAACAGAGACATACTTTTCCAGAAAACTT:1 + chr3R 31838102 3' - Circe 93 1 61.62 TACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGAAAAGTTGTA:1 - chr2L 12882759 3' + hopper 1360 1 78.22 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACACATACAACAAACACAAAAATCATAAAAAAAAATTTGTTTTTGAAAATAAAACGTATAAAT:1 + chr3R 12063828 3' - 412 15 2 63.37 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATC:1 - chr3R 21365495 3' - P-element 27 1 52.00 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGACCAAGAAAGATTCTTGTGACGCCGAAAAGGAAACTGATCCTTGCA:1 - chr2R 16498001 3' + 297 387 2 53.06 TCATCCATACCTTCGCTATGGCCGTCACTTCGAACTGGGGGGGGAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCATTCCAAGGAGAGCCCATAGGC:1 + chrX 6220101 3' + Tirant 8063 1 78.22 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAGTCTAAGTTTAAAAAGAAAAAAAAATT:1 - chr2L 16772642 3' - 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Juan 11 1 68.32 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATCTGGATAGATAAAACGCGGGTGAAAGGGCAGGCAGACAAATAAA:1 + chr2L 20612029 3' - 297 6597 2 63.64 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAACAAAGAGCGGGAGAAAGCTCTTGAAGAGCAGTGAAAATAGCAAAGAGCGCG:1 - chr3R 14580290 3' - blood 26 2 53.47 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTCTGCACTTTAAGCACTGCCACTCTCCACTTTAAATATTTACTTAATTATAAATATTCAATGC:1 - chr3R 9278309 3' - roo 8678 2 69.31 GGGGGCTCCTTGGTACATGAGAACATGAGAACAAGAGACATAGTTTTCATAAATTTTAGTTTCCCAAACATTTTTGTTTTGCAAATATTTTATCATCACTG:1 - chr3R 18518075 3' + jockey 4561 1 61.39 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCT:1 + chr2R 22856592 3' + 1360 3356 1 61.39 GTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGTAATTAAGATAATTATAGAAGAATACGCTTGTCGGTTACCTT:1 + chrX 11933172 3' + Ivk 317 1 58.42 CATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCAATAGCACAAATATGTCTATATGCGTGTATGTGTGCATGTGGAGCATGTACAATGTTCTTGGATTGAAGGCAAGGG:1 - chr2R 14548091 3' - mdg1 354 2 76.24 TTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTGCTGTGATTTTGCTGTTCTGCTGGGACGGCATTTAGTCTGAGTCTGATGCATTCCGCAATTCATTTCCGGATGGCC:1 - 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chrX 3685509 3' + Cr1a 4410 1 58.42 GTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTTAAATTAGAGAATTAAACTATGGAAAGACACTTA:1 - chr2L 2022067 3' + 297 463 1 66.34 GCATTCATAACAGTAGTGGNCTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAGTCTTATTATATCTTCCCAACATACTGCATCCAT:1 + chr3R 12206978 3' - roo 8595 1 65.35 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCACCCTTAAAACAAGTAAAATGTAA:1 + chr3R 11916597 3' + roo 354 2 77.23 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTG:1 + chr3R 30553613 3' - 412 38 2 61.39 GCTGTTATGTTACTGTTACNGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAATGGACAACCGACGCCTGGAAGTAGGCTGCA:1 + chr2L 17998316 3' + BS 5050 1 65.66 ACTGAGCTATTACTTATTANTTATTACATTATGAATTTGTATTCAACATTTTGATAAATGTCCTAACATTGGGACGCCGAGCACAAGCTCAGCGGCAGGA:1 + chr2L 14793585 3' + Stalker2 397 2 72.00 AAAAACAATCCTTGAAAATAAAGTGAAAAATGTATTTATATACAAATGAAAGCGGTTTTAAAGGGAGAGGAATGGAACTTGGAGCTGGCTCTGACAATT:1 + chrX 18269497 3' - transib4 2488 1 68.69 TATTGACCGCTCAATGTCTGCGTTTGGGATCCACTGACTATAGCGATAATGAAATGGCAATCAAACAGTTTTCCGTCGCAAATCTTGAACTGAAT:1 + chr2R 22388860 3' - F-element 302 1 70.53 CCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGATGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTTTTGATCAATATGTTCTCCTGGTATGGAACAAT:1 + chr2R 7260511 3' - HMS-Beagle2 6838 1 67.33 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTACCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTT:2 - chr3R 23542976 3' + 412 7488 2 81.19 TAAATATAGATATACATATATATATATTTGTTGATGCTCATATTTGCATGCACATATCATATGAAGGACTATATTCTGCA:1 - chr2R 20906330 3' + Stalker 88 4 87.50 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGTGCCGGAGTGTGAGTGT:1 + chr2L 18213252 3' + hopper 1412 2 76.24 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATAAGACGAAATCCCATTGAAGGCAACGGGGCGTATGCGCAACTCAGGTAGAAAAGCCCTTCCATAAAATGAGC:1 + chr2R 7839072 3' + pogo 2098 1 74.26 AGTACCCTACGTCCGGAGAAACATCAGCCAGGTGTAGGTGCGAAACTAATAGAGTGATCGTGAGAGAGGGGATCTAAGAACCCGAAGATATTGCTGCACAG:1 + chr2R 924869 3' - gypsy12 9850 2 74.26 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGTTAAGACTGCCACTTCGATGGAGGAAGCGAAAGTAAATGTTTGACAGTTTATGACCCCGGC:1 + chr2R 19840283 3' + roo 395 1 63.37 GCGATAAGCAAAGCTCACANAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCA:1 + chr3L 5241158 3' - Ivk 49 1 75.25 ACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGCATTTAGTGAGCAGTTGCTGCAGGTGGCAAGAAAGAA:1 + chr3R 13352325 3' - 1360 3276 1 63.37 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAA:1 + chr2L 17730505 3' - pogo 37 1 66.00 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGA:1 - chr3L 3650061 3' + mdg1 368 2 76.24 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACCCTCGTCTTCGCTCGCACTCAAATG:1 - chr3L 20354026 3' + 412 441 2 69.31 AAGAGATCTGAATGTTACCCCTCTTGGGGATCAGATCAATTTTCACAGTCGCTGTTTTGGACTGAGCCCACACCCAACCGCATTCTCATCCTCATCCTCAT:1 - chr3L 18733675 3' + G5 4512 1 54.46 GGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGTTTGCCACAGGACTCGTTCTGTGCGTGCCA:1 + chr3R 13739771 3' + Burdock 6388 2 76.24 TACATAATTATTATTATTATTTATAAATCCAAAATTACTTGTTGTAAAGTCATGCTCGATTATTCATAGATTGCGACCTATTGTTTCGACCACTGCTGTGG:1 - chr2R 9738328 3' - invader6 4390 1 36.63 TATAATTATTATTAATATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCG:1 + chr2L 14762016 3' - mdg1 7084 2 67.33 CTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATTTTACTATACCATTTTCAGTTCTTT:1 - chr3R 25086113 3' - Bari1 53 1 80.20 AGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCAATTCAACTCATATCATTCCCTGATGATAAGTACGCTGTACACTTGTGCACCCATGGGAGCGTAATAGGTGAC:1 - chr2R 22459242 3' + F-element 125 1 74.26 GCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGACCCTCCTAATAATTTCCCCAGCCCCCACGACACTCTCTCCCGCTTTTATGGTCCT:1 + chr2L 17262759 3' + Tirant 138 2 59.41 TCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCTATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAAACAAAAGAATTATTGTGCATTTTTATAGAAA:1 - chr2L 18944128 3' + F-element 498 1 75.25 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTAAAATGCCAATATAATGTTCTCGACTAACAGACGGATATAT:1 - chrX 10286125 3' + roo 399 1 65.00 TCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATACAATATACAATACAATAAATGATTGGTCATAACGTTGTCCTTTCCATAAGTCATTATAGTTTTAT:1 - chr2R 3205665 3' + Stalker 6834 2 59.41 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGT:1 + chr3R 13739740 3' + Burdock 221 2 59.41 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGAAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATTCTTATAAAAGCTTATATCCTGAA:1 + chr3L 13773056 3' + pogo 2052 1 74.00 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATACCAATCCCCATATCTCTCTCTCTCTTTCTCGCTCTAGAAATATAAACTAAACATTTT:1 - chrX 4937532 3' - Doc 32 1 51.49 AGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTCCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGTTCATCCTTCCAATTTTTATTTTACTCAGTGAACCGATTCCTCGGTTG:1 - chr3R 17907123 3' - Rt1b 4952 1 64.36 CCGAGAGCCGAGCGCTGGTAAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATCTGGGGATCTCCAGGCTTGTT:1 - chr2R 8311319 3' - opus 36 4 72.94 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGCTTTATATATACCGCTCACCGGCTAATCTTCAATTATTTTATCCGGCAAATGGATGGTCACTTTTTAAAAT:1 - chrX 19196214 3' - pogo 1 1 73.27 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTATATGAAAAAACAAGCACAGCAAAGTTCAACAACTTCTACCAATATAAGATTTTCAATAGCTTTGCTTTG:1 - chr2R 17459132 3' - Transpac 4966 2 69.31 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTATTTTAAGAGATTTAAAATTATGAAATATTGTAAAAAACACGA:1 + chr3L 15037984 3' + roo 9040 1 60.40 TCAATATGTTTACTCTACGTTATGGGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATGTATATATATTCGTAAGAGAACACACGGAAAGCTGCTTATGATCAAAA:1 - chr3L 23079927 3' - 17.6 6955 1 61.39 CTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTTTACTTCCTGCGTGTCTCTTTTATCCAGAATTTCTTCCTTTACGG:1 - chr4 733320 3' + McClintock 6109 2 57.43 TAAATAAAATTAATAAAAAAAAACTTTCCAAAAAGTAAGCAAAGGCGGAGACGCGGAAGCGGAATCGAAATGCGATTCGAAAACGAATATCATTTTTGGCC:1 + chr2L 18136587 3' + X-element 4718 1 76.24 TTTTTTTTTTTCGTATTTTTTGGCCAACTATGTTTATGAGGAAAACGAATATTTTCATTATAAACCAATGTGTATGCATATATTTTGGGGGATTATTTTT:1 + chr3R 20272993 3' - gypsy7 5006 1 66.00 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCAGAGAGAGCGGGTGGTTGGGTTGCCGTTGGT:1 - chr3L 16891082 3' + P-element 2867 1 57.43 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTACACCATATACACTATATACACACACAAACGCACTGAGAATATATATGTAATATTGTTATTCTCGTT:1 - chrX 5219674 3' - hobo 9 1 68.32 GCTCTCCGTTCTCTCGCTCTCTAACTCCCTCTCTCTCTCTCTTCTCTCTTTCAATTAGAATGCCAAAAATCATGTCAGCAGCCATTATAATTACTTCCGTT:1 - chrX 6509049 3' - 1360 106 1 51.49 TGTTCTTAATTGGAGCTCATCATTACAGTACAAAGAATGACACTAAGCTATATTGGATAACTTCGTCGTTGGGAAAAATAATTATTCTCGACTTGAAATAA:1 - chr2L 20570579 3' + 412 7541 2 73.27 CTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGATCGGCTCTTATTGAGTCGCGAGAAACGGAAATGTTTTTGTCAGCATTTTTATTTTAT:1 + chr3R 10800810 3' + rover 7248 2 60.40 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTTTTTTATTTATAAATAAAGATTTTTCAAGCACAATCTGACCCATTTT:1 - chrX 7797648 3' - roo 27 2 58.42 GGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTTCCCCATCCTTTAAATTTAGCCTGTCCAAACATTTTCGCTTGAGAA:1 - chr2L 11190197 3' - Quasimodo 34 2 80.20 TATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACTAACAACAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTGCATGTGATACAAATAATCCAAA:1 - chrX 22689533 3' + 1731 4601 1 53.47 ACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATATATATATAAGCACGCATTTGCCTAAGTCAAATAAAT:1 + chr2R 21433207 3' + HMS-Beagle2 274 2 71.29 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGGGCTTGAGAAACACACGAAAGTATCGAT:1 + chr2L 7810744 3' - P-element 46 1 33.66 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTGTTCCCGAACTGCATATACATATATTAACGTGCG:1 - chr3R 24976743 3' + opus 463 2 72.73 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAAGGACCAATCAAATCTC:1 - chr3R 4971377 3' - F-element 16 1 71.72 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCTTTATCGCCTCCTCGCTCTTGAGAGTCAAT:1 + chr2R 22856621 3' + 1360 3385 2 75.25 TGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACCCTCGTCTTCGCTCGCACTCAAATGGAAATACAAATGATCGGGGCTGTAAGAACACACATACAGCTCCACGC:1 - chr3L 20353979 3' + 412 488 2 72.28 TTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACTCTTCGGTTTTTGGAGAACTGACTGTTTCCCTAATGGGTACACCTTGTGACGTGG:1 + chr2L 6763917 3' - 297 378 2 53.47 AGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGATGATACAAAACACTCGAAAAAATTGGAGTATTTTAAAGAAAGTA:1 + chr3L 15034387 3' + I-element 348 1 56.44 AAAAGAAATCGAAAGCGAAAGAAATCTATTTGGAGGATTAGACCCAATACTTCGGCCATCCATGGTTTTGTCTTTAAGATAGCATACATTTTTAATTGTAT:1 + chr2R 14498593 3' + Doc2-element 98 2 63.37 AAATTCGCGCAGCGCAGAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACA:1 - chr2R 2666337 3' - Rt1a 32 1 51.49 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTGTTGCTTTTCATTTCAGCTCTCACGGACGAAAAG:1 + chrX 2530562 3' - pogo 36 1 66.34 GAAGATATTTTCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTAAAAAA:1 + chr3R 10488720 3' + roo 9020 2 79.38 CCGACGGGACCACCTTATGCTATTTCATCATGGCACACACCCTCACATGGCAACTGCATATTGGTTGCTGCTTTGTCGCCGTTGCAGCTTTGTCGCCCAAC:1 - chr3L 10363796 3' + P-element 2876 1 68.32 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGGATGTAGACGCGTTAGCAGAAGTTT:1 - chr3R 6266313 3' + roo 360 2 75.00 CAAGGAAAACACGTGTTCTNAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATGGCCAAAGTTGGTG:1 + chr3R 12767350 3' + blood 351 2 52.48 TGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGTGAATAAACGAAATGGATTAGACTCCTGCCTCGCCGACATATGTATATTTAAGTCTGTATGTCTGTAC:1 + chr2L 22640103 3' - invader4 2786 2 70.30 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCATTTGTATCTGTTGAAATTAAGAATACTAAAGATAGCTGAGTTTAATTTGTAATAAAAT:1 + chr3L 10110626 3' + roo 394 1 51.00 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCG:1 - chr3R 11052117 3' - blood 7060 2 78.22 TTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGTTCAGAATAATCACAAAAGCCGAAGCCATTAGCAAGTGATTTGGTGACTTTTTCCAATCTAATTGAAT:1 - chr2R 15787536 3' + Porto1 4314 1 60.40 GATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAATCGATAAAGAGATTTAAAATTTACAAGTACTCGTGTGTGCACAGCAAAC:1 + chr3L 20317881 3' - 3S18 27 2 50.50 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGTACGTTAGTTATTGGGCACATATTGCAGATGGCCAGTATAAAATGATAACAAAAAAAGGCAC:1 - chr2R 16160738 3' - mdg3 5266 1 66.34 CTGCCTGTTACATACTTTTCAATCCTTTTACCCTTTTACCCAACGAGTAACGGGTATAAAAATTCCAGCATCTATTCTTAATAATTCACTGGCAGACACGT:2 - chr3L 11893100 3' - INE-1 21 1 48.51 GGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCACAGAGCAACAGTGCCAAAAAAGAACGGCTACCGTGGTAATT:1 + chr2L 17076889 3' + opus 7347 2 58.42 AACGTCTTCACACGTCGGCNATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGTTTTTTAATTGCTTTTCATAACAAAATAACATCACTTCAATC:1 + chr2R 672856 3' - F-element 19 1 67.33 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTGCGTATGTGCAATTCGGCACTGCCTTTATTCTTTAGCCAAAATAACAATGAATATGAGCCACATATAAAGGTGT:1 + chrX 4792166 3' - copia 4 2 76.24 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACTTTACCCAAAAACACAATTGAATAATGATAATTTCACACGTACTTTTCGGGGCGAATAGCCGGCGTCCATTT:1 - chr2L 7666075 3' - roo 8667 2 76.24 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCCAGGTGGCTGATTCTCTAGGG:1 - chrX 19034096 3' + hopper 1400 1 62.38 ATTGATTTATTCTATATTTTCGTTACGTTTCACATTTTGAACAAAAACGAAAAGTATATAACACAGGCTAGGCACCTTGACCTTAACGGGCACATGGATGT:1 + chr2L 13922679 3' + HB 1466 1 73.27 TTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGACCACCCGCTCCCATTCGTGCCCATTCCCAAGTTGCCAGCGCCCATTGC:1 + chr3R 6961139 3' + 412 7520 2 51.49 TATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAGCCATTGCATGTTGTTAATAATTTTAAAATCAGATTTCCGCAAGTTTGACGCAGACACGAAGGTAGTCGGCA:1 - chr3L 12437984 3' - copia 229 2 77.00 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGACACACAGCTGGACGAAGAACTAGAAGCAAGCGGAGGCGTGGCAATACTTGAAG:1 + chrX 22593231 3' - 1360 21 1 57.43 TTGCCTGACGGCTGCACCCNACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGTAAAAA:1 + chr2L 7175612 3' + blood 327 2 72.28 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAAAGCGAACCGTTGATCACGT:1 - chr3L 6834947 3' - hopper 28 1 52.48 ATCAAAACATCATAAAAATAAAATAAAGTTAAATAATTCAGCTATTAAAAACAGGACACTAATAAATTTTACATTTACGTAAATTGGTAGAGCCGAACACA:2 + chr3L 14603153 3' + jockey 4995 1 40.59 CAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAACACACAACGTGACTGTTTACGATTGATTGATCAAATTATAAGC:1 + chr2L 19417147 3' - BS 5027 1 56.44 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAGCGCTGTAAACAATAAAATCAAATTAATTATGGCCAAATAAATCACTG:1 - chrX 16671057 3' - P-element 29 1 50.50 AAAAGATTTTTTCTTTTTTTTTTTGAACTCATTTGTCTATTAGGGAATATGTTTCTTTCCCTTGTCATTCGAAAAAGAACCAAATGATAATTTTTTATTAC:2 + chr3R 12928595 3' - HMS-Beagle2 492 1 72.28 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATAAACCCAATACTTAGCTCCTGCTGAGCCAC:1 + chr3L 171226 3' + 1360 3342 1 77.23 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAGAGGTGGATGAGCGGGAAAATTGATATG:1 + chr2R 19061295 3' - roo 13 2 60.92 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGAATATAGTCGATATGACCGATCGGGGGATTCAGTCTCCTCGCGATGCTCTGCCGTTGATC:1 + chrX 4707925 3' - P-element 12 1 65.35 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCAATTTGTTGTTTACCCTCTTT:2 - chrX 15546137 3' + blood 7368 2 58.42 CGCCCACAAACCGCCCAAAACTACCACGCCCACACTGTTGAAAAATGTTTTGTTTTTTGTATAGTACTTGATTTGAAAAAGTTCGTCTGACCCCACATCAT:1 - chr4 978112 3' + INE-1 346 1 78.22 AACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCTTCATCTCTTGCTCTTTGGAATTTGGG:1 - chr3R 27495631 3' + 412 478 2 64.00 TTTACTTTAGATCTTTATTTCTTCGTTGTCGGCTTAAGACTTACTGGCCTGGTATTCACTGACTTGTGCTAGCCCTCGGACTCTGTTCCGTCTGTCTGGCC:1 - chr3L 25847117 3' - rover 251 2 54.46 GGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAACCCTAAAGAAACCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTTCTCACAGTGCTCGCATTTCTCGG:1 + chrX 18192787 3' + BS 4935 1 74.16 ATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAACTGTGGTGGAGGGTGCTCGGCAATAGTATGCAGCCGATCGCTAAACGCCTTTACTCTTGAA:1 + chr2R 4627389 3' + Bica 165 1 70.71 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTCACCTCCACATCCACTTTCCCATTTCTCGGGGCAATTTCTTTCTTGTGGCTG:1 - chr2R 17348660 3' + blood 304 2 68.29 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTATGCCATTGATTTTTAATTATGTTGCATACTTTCGGGCGTACGCG:1 - chr3R 11321011 3' + hobo 2910 1 54.46 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCCCGCGG:1 - chr3L 26852641 3' - 1360 39 1 60.40 GCGATGACCGACGCTTCTAATCTTCCAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGATGGGGATTCCGACGCACTTAATTGTGTTTAATGGCATTGAATTTCAT:1 - chr3L 10030397 3' - Burdock 151 2 54.46 CTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACCGGTACTGCAAAAAATATTGGGCAACTTGTTTAAAAAGAACTTC:1 + chr3L 10474204 3' + copia 228 1 52.17 ATTGCAGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCGGCACCCTTGGACTCCTTCGAGCGGCATCCAAACATTCCCAAGGCGCCAGCATGGGC:1 + chr3L 4024106 3' - pogo 1737 1 60.40 TTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATTTTTAGTTGAGCTCTAGTTTTGAAATTAGTCAAATATAATCATGTTATTATTCAGTTACGTT:1 - chrX 7157244 3' + blood 366 2 63.37 TCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTTTTGCCACATTTCCCCGCCAGCGACAACAATTCATAAGCGACGTCATCATTAGGGAAACATTTGCC:1 + chr2R 7103394 3' - F-element 4235 1 73.27 GACTCGGCTATTGATACTGATCAATAATATATATACTTTATATAGTGCAAGCGCCCTTCCTTCTTCCTGTTGCAGACAGTTCAACCAATCTAATGCGTGTA:1 - chr4 700663 3' - INE-1 92 1 56.44 CTTGCCGATGCAGCTAACTNTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTCTGCGCCAAAAAGAAGCATTTGCAAGGGAAATTCTTAGGTTCTTTA:1 - chr2R 8682330 3' - pogo 25 1 53.47 GAAAACAAAAAACAAACCAAAAACGGGGAAAAAATAGAAGGGGATCCGACCGAAATACGCACGCTTTATAATTAGAATTTAATCAAGCGCAAATCGCAAAC:1 - chr3L 22322520 3' + Porto1 187 1 68.32 CTGGAGTTGGGTGCCAATTGATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATATCTATTGTATCTCTTAGATTCTCTGTGGTGTCTATTTGTTGACCTTGAACC:1 + chr2L 2651583 3' - springer 398 1 56.44 CACTATGGGGCATTTGGCCTGAGAAAAAATTTATAGCATTTTAATTGCTTAGACTTTCGATTGCCTAACAGCTCGGTCACATGTGTACAGTTCCTGACACT:1 + chr3L 7426112 3' - hopper 1414 2 81.19 TTTGTATTTTGTTTATTTTTTTTACAAAACTAAAATAATATATTGGACTGATTGAATAATTGAATGAATGCATTAGTGAATGGGATTATATTCATGGTCAG:2 + chrX 15902682 3' - transib4 2538 1 70.30 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATCATTCGTTCTGAACTCCCAGCTATTTTCCGAGT:2 - chr3L 7168329 3' - Doc 47 1 66.34 ACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTTC:1 - chr2R 9905365 3' + mdg3 200 2 70.30 CCGGAGCAGCCGGCGAATGAAGCCCTTTACCTCTGGAGGAAACCTAACGGAATATCGCATGAAGGTCGAACGATCATAAATTTGGTGGGACGAAAACACCA:1 - chr2R 3097655 3' + Gypsy6A_LTR 330 1 58.42 GTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCTGCATTCATTTGCAGACCCAGACCCACTGCGAGCCACACCCACGCGGCACGACCAAGTGGCGCTGC:1 + chr2L 4373827 3' + Doc 477 1 73.27 AAATTGGACCAGACTCGACCAAATAATCCAGGCGTTTACAAAAT:1 + chr3L 279692 3' + I-element 4910 1 59.09 AAATGTCAAATGCATCAAATCTAAAAAACACGATCAGACTAATTAAAGAAAATAAACAACTAGCCAAGGGGGAGCATAAAAAACAAGTGTTTAAATGTCAA:1 - chr2R 15012169 3' + transib3 2793 1 78.22 TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACAC:1 - chr3L 3540105 3' + mdg3 5496 2 77.23 CGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTATTATAA:1 + chrX 8727914 3' - X-element 48 1 64.36 CTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCAACACAACACGAGTGGTAGTATCGCTGTGAAAAATGTCAACAC:1 - chr3R 4952487 3' + Quasimodo 242 2 61.39 TATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAACTAGCTTCCTTGTAACTTTGATATATTGTGCTTTTCCTCTGTCGATTTTT:1 + chr2R 8560701 3' - BS 5018 1 53.47 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAACATACTATACAAAATTATATGGATAATGCATGATAGCTAAAACTGGCTCTTCCA:1 + chr3L 3209253 3' + roo 388 2 58.42 CTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCAACTTGACAGCAAATTTGGCGCTCCATTGGCGTGC:1 + chr2L 10053709 3' - F-element 4485 1 65.35 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCCAGTTTTAGCCCACTGTTACTGTC:1 - chrX 21229296 3' - transib2 49 1 74.26 TCAAATTTGCATACTTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTT:1 + chr2L 12882788 3' + hopper 1372 1 68.42 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGTTCACACA:1 - chrX 2841776 3' + hopper 1379 1 61.39 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGTTCAC:1 - chrX 2841779 3' + hopper 1377 1 64.00 TTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAGAAATCGAAGAGCTTCATTCGTATA:1 + chr3R 8582639 3' + roo 410 1 78.95 TGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGTATAGGTTTTGGTCTATAGTTTTTGCGCTATTATTCGCTGTA:1 - chr3R 19505533 3' - mdg3 27 2 50.50 ATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGGGCGTGAGAACGGATGATGATCGGTGCCGGAATAATAATAGAAATC:1 - chr2L 15408688 3' - GATE 8336 2 54.46 AGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACACAAATTTCAAACTTTTTTATTAGTCGTGTAAATTGCCCCAGAACGTTGCACTCACCGCAACTCAACAC:1 - chrX 21420949 3' + INE-1 175 1 70.30 ATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGAATTTACTACGCTGAATGCAGAGAGAAAACGATTTAGAACTTTGTCGATCAAAAAACCTA:1 + chr3L 14124062 3' - I-element 4918 1 61.39 ATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAGCTATGAAGCTCAGCTTGTTTGTGCAGTTTAGCCGCGGA:1 - chr2R 6107733 3' + roo 9034 1 64.36 TATCCAAGAGCAAATGCAATTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCTGGTACGAAAAGATAGAAGCCCCTATCTTAGCATTGTACAG:1 - chr3L 23579628 3' + Idefix 335 2 57.43 AAATTTGCATACTTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGT:1 + chr2L 12882787 3' + hopper 1374 2 68.48 ACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAGTAGACTATGCGTTCTTCTCGTTGTCTTTTCATTTTATTATTAGTTTACTAACTGTTGTTATGTCAAACCTAGCTAAT:1 - chrY 1738415 3' + INE-1 554 1 56.44 TTAAAAAAGTACGACAATANGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTC:1 + chr3L 15099634 3' - G4 3816 1 38.00 AGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAGATGTATATATTTAAATAAAATGCCCCCGCTTCCAAAACCCACGTATCAGCTGCCAAAG:1 + chr2R 21962719 3' - 297 12 2 60.40 ATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAAATTCCCTCGAAAACAGAAGATAAAA:1 + chr3R 9224420 3' - pogo 18 1 61.00 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACTATTTTAGCCATGTTTGTGTATTTCAATTTA:1 + chrX 8503165 3' + roo 9028 1 73.27 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGAGGCATTTCGAGGCGATCGCGAGATTTTCGAACCGAAGTCGCGGCAGCGAG:1 - chr3R 18399176 3' + P-element 2865 1 56.57 GTAACAGGCAGAAGGAACCGTTTCCGACCTTATAATTCTTTTAATTCTTTAATTCTTTTAATTCTTTCGGAATAGTTAGAGCACCATCTTTATTCTGATTC:1 + chr3R 3854455 3' + INE-1 32 1 44.55 GGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACACAGACGCAGCACAAGTTGCCACAAGGCGCCTTATATTGCTACGGCAATTTAATTTAATTTAATTTTATT:3 + chr2L 11050 3' + INE-1 176 1 48.51 CAAAAAAAAAGGAAAAAGTAAAAAAAGGTGAGAATTTTTATTAAGTATTAAAGATAATTTTAGAACAAACTTATGCATACAGAAAATCCAGGTAGTTTGAT:1 - chr2L 19648360 3' + Doc2-element 233 1 88.12 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGC:1 - chr2R 9871005 3' + roo 355 2 78.22 CTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAAGAGA:2 - chr2R 6438334 3' + Stalker4 391 1 63.37 AAAACTCAACGAGTAAAGTNTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTACTTTGTCTAAATAGGGGTTGCTAATAGGTAACTGAAGCTCTTTTTAATTAGAAGATG:1 - chrX 9454800 3' + roo 390 2 60.40 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCGCCTCCAAAGAGAAGGCGGAAGTTGGCCA:1 - chr3L 13773866 3' + roo 397 1 67.33 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTCCGGCAGGC:1 - chr2L 3632138 3' + P-element 2861 1 54.46 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGTTAGTTTTGTTTGATAAATATGCATTTATAATGCGTCTACATTT:1 + chr3L 872779 3' - 412 7073 2 56.18 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACCTAGAATTGCATATATAGAATGACATACGATTTGAAGAGAAGAGACCTTTGTTTTCTTTGGCTGTATACT:1 + chr2L 14341928 3' + copia 248 1 72.28 TATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTGTGGTATATTTATATTTATGATGGTAAATATTAAAGCATATTAAAATAAAAATTTAGTCTG:1 + chr2L 19906380 3' - 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chr3R 892288 3' - G5 4702 1 56.44 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGTAGTTAAAAAATACATTTAATACAAGTT:1 + chr3R 25581086 3' + pogo 2056 1 72.28 AATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTCAACAGCTGTGCCGGGAAAAACTGGATGGACCGGAGTCTGGGATAATATGTTTAATTTTCC:1 - chr3R 22307252 3' - I-element 5212 1 67.33 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCGGCAAGTCCAATCATTAAATGAGCAAATGCTTTAAATGC:1 + chr3L 1998880 3' - hopper 34 1 64.36 CATTTTGTTGTTAAATCACAATGTTTGCACACAAAATTTGGTTTGTGCGACCATGCACCTCTCTTGCCTCCCATCGTAGGTGTGTGCAAGTTTCCAAAAGA:1 + chr2L 5478988 3' - transib2 2753 1 73.27 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTACCTATGTACACATGGGTATATATTTT:1 + chr2R 10014845 3' + flea 4968 2 75.25 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCCATGGGAACTGGGGAGCTATCCCCGCATTCTCGTCAGGATCTGCCATCC:1 - chr2L 13566472 3' - hobo 28 1 51.49 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTCTGTACATCGGTACTGTG:1 + chr2L 20367366 3' - Doc 35 1 53.47 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGAAAAACAAGAAAATGCTAAAATCGTTGAAAAAGAGTTTCTGGCAGAAGA:1 - chrX 8503102 3' - roo 8683 2 50.00 GTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGAAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCAACACGGGACCTGTGGTAAGAG:1 - chr3L 3654546 3' - micropia 422 2 79.21 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACATAACACCTGCTTAAAGAGCCGCAAAAAGAAAAGAAAAACGCAAAGCC:1 + chr2R 8177771 3' + mdg1 7427 2 55.45 TGACACTTTGTCATAATAGATATCTATATACAATATATTCCCCAAAAACTCCCAGCTCTAGTTATCTAGAGCATAGTCCACAGAAAACAAAAAACATTTTT:1 - chr2L 9809604 3' + Stalker4 7028 4 79.21 GGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAGAGCGTAGTAACGGCAGCGCAGAGAAGAGAGTTTGGAGAGACAGAGTCTGTAAAGAGGAGGTTCG:1 + chrX 21184051 3' + Juan 4205 1 69.79 CACGAGCTCTCTCTCTCTCTCTGTATCTCAAAAATATAAAGTAAATGCCCCTATCGGGCACCGCCTGGTTCTGTTACGAAGGTAAGAAGGCCGAATTTCAT:1 + chr2R 8620674 3' + blood 163 2 51.49 CCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTGCTTTGAAAGCGATGTTCTTCGGTTAATTGTGAGTGACAACTCACTCACTAACTCTGCTGGCAAAACAGTAT:1 + chrX 16671156 3' + P-element 2885 2 77.23 AAGTGTGGGCGTGACCGTTTTGTCGTTTTGCAGGCGAAAGAATGGGGGTGGCCAAATAACGGCACTCAGTCACTCAGTGCGGTTGCTTAGCCTTTCAGCTA:1 - chr3L 19461609 3' - INE-1 244 1 56.44 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGTATGTAGCATATCCCCTTCCGTTTTTTGGT:1 - chr2R 19102166 3' - opus 153 4 77.23 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATATCTAATATAGAACATATAAAGCTCAGAGGTATTTAAACTTAATCGTAA:1 + chr2L 11478756 3' - opus 22 2 60.00 GCACCCGCTCACGCTCTGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGCGTCCCAAAAATAAAGAGCCAAGTCCCGCGGGCATGATAAATCATT:1 - chr3R 18245714 3' + F-element 474 1 54.46 TTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTAAATAATAACCAGTGGAGCAGTACTATGTGTGCGCCCAGTGTTGGGAAACATGTTTT:1 - chrX 17857979 3' - P-element 19 1 55.45 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGTGGAAAATTTTCAAGCTTTTCCGCAGTGATTTATGAGTTGCAATCCTTCTCAG:1 + chr3L 5415414 3' - I-element 21 1 53.47 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATTTAACT:1 - chrX 13146917 3' + roo 9037 1 58.42 AATAATAAAAAATAATAAAAAATGCTTCAGATGGGAGAGGAGAATATCTCTGTAATAATAGATGCAAAGAAAAGTTCATGCCTTGCCCACATAATATGATT:1 + chr2R 22144405 3' + flea 244 6 68.32 TGCGCATTGTTAGACACGCACCTTTTCCTAGAGAGAGAGAGAGAGAAATCCGGGAACTGAGACTAGTCTAAGGGTTAGCTTTAAGGACGCATTCGGTATTA:1 + chrX 18210609 3' - X-element 14 1 69.31 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTTAAATGACGC:1 - chr3L 25059050 3' - mdg1 7 2 72.28 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTTTTTTATTTATAAATAAAGATTTTTCAAGCACAATCTGACCCATTTTTACACCAT:2 - chrX 7797640 3' - roo 8683 2 50.50 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTT:1 - chr3L 14623946 3' + hobo 2888 1 76.77 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTGCTCGCATTTTCCCAGCTGCCTGCCAGTTTGGGTACACAAATTATTTCATTAGACTCACACCTCCCTCTC:1 - chr2R 7838942 3' - pogo 2 1 76.00 CCACACTTTTGAAAAACGTGTGGATATGTTTTTACATATTTATTAGTATTGTAAATTTCTATCGATATGCAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAAA:1 + chrX 4666778 3' + INE-1 258 1 78.22 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTAT:1 - chr3R 19589923 3' - BS 5021 1 50.50 CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGTAGAATTAGTTGAAAATGTATAAACAGATTGAAGAAATTTGTATCTCTAGTTTAAAGTGGAATTGCAAG:1 - chr3L 5478976 3' - 3S18 9 2 69.31 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGTGCCTTGTATCACTTGCCGTATAATTCGTTGTT:1 + chr3L 19896597 3' + P-element 2845 1 37.62 ATATTGGTATATATATATTTATATATTGATTGACAAGCAATTGTTTCTCCATACATTCTCCATACCATCCATTTCTTTTACCCCCCTAAATTTCATCTCGC:1 - 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chr3R 19450173 3' - roo 8706 2 62.38 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAA:1 - chr3R 29608777 3' + roo 9041 1 56.44 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAATAATAATAGAACATTTTGATTAAAGTGTATATGTGGAAATATATTAATAGTTAGCCTCTAAAGTCT:1 - chr3R 12944652 3' + roo 400 1 74.26 TAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACCTGTAGCGTCGTCTTCTTGCT:1 + chr3R 6757472 3' + blood 7268 2 79.21 TGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTAC:1 + chr2L 15531847 3' - Stalker2 7295 2 72.28 TGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAATTAATTTAGTGTTCCGTTGGAGAGCGAGTTCGTTCTGAACCAGCGCGATGACTCGAAAG:1 - chr2R 7667661 3' + R1A1-element 33 1 56.44 GTATAAATTGAAAAAAAAAAATTAATTACTTTTTTATTATTTCTGAATATTTTATTTAATTGGCTGCTATTTCACAATCGAAAGGTGGACATTAGTGGGTG:1 - chr3R 21824112 3' - Tc1-2 1400 1 48.51 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTAAGCATCTGAGCGGCCTAAAACTCCCCTGAGAAGTGCACTACA:1 - chr2R 10372112 3' - mdg3 5284 2 55.45 CGCACTTCGTGCCTTAAAATATGAAAAGTGTCTATTGCAAAAGTCATATCTTAAGGCACGAAGTGCGGACACAACCTCTTCAGCACATTTCTCCTTTAATT:1 - chr2R 13670145 3' + 1360 477 1 63.37 GCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAGTCTAGAAATTGATTAGCACTAGATTAGCACTAGAAATTGAGATGGAAATGGA:2 - chr3L 17140598 3' - F-element 34 1 54.46 TGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTGTTTCGAACCAAGTGATCAAAACAAAAACCGACAAAAAA:1 + chr3R 16231541 3' - Tirant 8474 2 53.33 AATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTCAATTTGATGAAACTAGTAGTCACTGCATAGAATTCCATAAC:1 + chr3R 31022004 3' + Ivk 5344 1 60.40 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTTAAATGAC:2 - chr3L 25059052 3' - mdg1 7047 2 70.30 CTCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCGAAGACAATCACGGAAACGTAAACAAAATTGATGTCGTGATTCAGGAGGG:1 + chrX 16304698 3' + G6 1813 1 58.59 GGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTGAGCCACGGAGCAGATGAGGTTCTTGCGCTGTTGCTGGAGGTAATCCTGGCGAGCTG:1 + chr2L 19492313 3' + Stalker4 47 4 76.40 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAGAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCCAGTGTCTATGGGCCATCAGACATCAGACATCAGACA:1 - chrX 13439321 3' + transib2 2788 1 59.41 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACAATAATTCGTGGAAGCTCTTTGAAGCGATGGTTTCAC:1 - chr3L 22930312 3' - roo 33 2 64.58 TATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAAACATTTTATTAATAATCGAGTAATCCA:1 + chr3R 25086182 3' + Bari1 1692 1 64.36 TTTTATTTGGCGTTCACTTNACTCATCTCTAAAATCAAAATGATTTACTTTTATAATTTTTTTTGTGGCTCCCTTGAATGATGGCATTTCAGTGGTGATGC:1 + chr3R 10914210 3' - F-element 75 1 73.27 TCATAAATAAAAAAACAATTTTACTATATATATGCATGTAGCCAAGTGGTCGGTCCGGGCTCAACGTGCCGGAAGTGCTCGCAGTTTAAAGCTTATCGC:1 + chr2L 5419900 3' + 297 6971 2 71.72 ATAAAAATTACAAAAAAAAAAAGAATTCGCCCGCCTTTTTGG:1 - chr2L 15203546 3' + Doc 4695 1 90.48 TCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCGTTCTTTTTATTATTTATTTACACGGCGCTCCTTGGACTGGGTAACTCTTCGCAGGGGCGT:1 - chr3R 24001120 3' + opus 143 4 69.00 CTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTATGTGCGTTATGAATGTTATGAATGTGGCCTATT:1 - chr3L 6693019 3' + opus 7049 4 71.29 AATATCAAACACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAAAAATTCCCGCTATAGAAGACCCAACCATTGAGCTTACGAACAGCTTGAGTTTC:1 + chr2L 10537745 3' + I-element 101 1 53.47 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTATAGTGTATTATTTTTCTACCACTATTTGTACTCAATTAACTTATT:1 - chr3R 19450024 3' + roo 9041 1 62.38 ATCGGTGAGCAGGATGTGATGCCAAGTCGTACTCCATCTCCGGCAGTCCCGTCCACACACTGTTGACTCCGCCAAGTGGAAAATTCAACTGCGACTACGTC:1 - chr3L 1215936 3' - Rt1a 4888 1 65.35 ATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTACCGAACTCACAATTTAATGTTAAATCGAACG:1 + chr4 408486 3' + BS 4814 1 69.00 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTGACCCTGTCCGTCCGATTGCTCCGAAACTTTCGTCATGAAATTTAAGTAAAAGCCTATC:1 + chr3R 4191184 3' - 1360 17 1 63.37 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGCACTCTCTGTTACTCAGCACACACACCCTGTGAATTCAGGCGGCTCTCTCGGCGCGGGCA:1 + chr3R 18399267 3' - P-element 15 1 67.33 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAAAGTTTACAGTGCAGAGAGTACGACAGTCCTGCGCACAAGTATACGTAACAAATGGCCATGCAAAGCACGAACG:2 - chr2R 12252834 3' - jockey 4762 1 55.45 TTGCAACATAAACATCAACGACGAGTCAGCCGCCGACATCCGCCCAAAAAGCATACACCACATGGCTTAAGCTTAGAAAAAATATCTTTATTTTTTATTGT:1 + chr2L 22312824 3' + ZAM 8061 2 62.38 CAAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCT:1 + chr3R 4604451 3' - gypsy 151 2 58.42 AGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCATCGGTATTGGCGGATTGGGACAAGTCGTTGCCGGACGTAAAGATGTCACCCACGCC:1 - chr3L 851616 3' - F-element 328 1 62.38 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCTAACTGTGAACAACATTAAATGAGACTATCCCGCCATATGTAAAAAGTCAGGTTTGAAGATAACCAATGGAGATT:1 - chr3L 12112304 3' + 1360 3387 2 77.23 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTAGTCGAATTATTGGTTTTTCCTGAAGTGTACAGTTCCGTATAAAATACGGAAATATA:1 + chr3R 5506864 3' - pogo 16 1 63.37 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATACGTTCTTACCACATCATGTGACTTAATGTCCGGG:1 - chr3R 6947336 3' + I-element 5317 1 66.34 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCA:1 - chr3L 10474160 3' - copia 52 2 80.20 CGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCCGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACTGAAGGGTTGTTCAAGTGCCAGCCAACCAA:1 - chr3R 11051515 3' + blood 423 1 68.32 AGGATAACAAGAAAAACTAACCTATCTACACATTCCGGGAAAGCCGCTTTCCGTCCGCCCGTCACACAGGGCAAACACAATCAAAGCGCTTCAACAGGCTA:1 - chr3R 31902293 3' - HB 146 1 68.32 TGGCGTTACGCATCTTGTTNTTCTAGGGTCTTTGGCTAGATTGTCTAGGGCTAGCTTGCCAAGCCGACTTAATTAGCATTATAAAATAAAATAGTATAGAA:1 - chr2L 109670 3' - 1360 13 1 67.33 CGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGCGGTACACTGCTACAAAAACCTGCAAATCCACACTGGGGTTTGCGGCGTTCTCGATAGCGAAAGT:1 + chrX 19457243 3' + Rt1a 40 1 78.22 ACAGGCCAAATGCCCCATANTGCTGTGGCGGCAAGTCCAATCATTAAATGAGCAAATGCTTTAAATGCCACTAGGTAGAGCTATAAGATGCGTGGGTTGCT:1 + chr3L 1998913 3' + hopper 1414 2 75.25 AGAATGCTATAGTGGAGTTCCCCGACTATTGGATACCCGTTACTTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTGTAGGTGAAAGATGGGCGTGGCCACAGTGTTTT:1 + chr4 976480 3' - INE-1 572 1 69.31 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTGAGAATCTTTTTTTTTTTATAAAACAAGAAGTTCGTTAAATAAAG:1 + chrX 10286215 3' - roo 8693 2 58.42 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTTTCGCAATCAGCCATTTCCTCCAGTGTTGTCAATTCATAAATA:2 - chrX 8334271 3' + flea 246 2 71.29 CTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACACAATCTGCTGCAGTCGGACGGGGCACTTC:1 + chr3L 20354101 3' - 412 6 2 74.26 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATACATATATTATCAATCGGACTTATTTGTTGGATGATTTACCATGTACATATATAATACTCGATCACACAGACTTC:1 + chrX 20419228 3' - flea 4758 1 77.23 CGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGATTAAGCATCACTATTTTTCGTAAAAACCTAAAAAAGGTACCGACGGCGCTTT:1 + chr4 275556 3' + I-element 246 1 58.00 CGACATGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATATATTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTGTTCCTGTTATATACTTTTCAACGAATCTAGTTTA:1 - chrX 16116149 3' - INE-1 93 1 75.25 GGGTGCGTGTGTAGCTTGCTATGGTATTTTTCCCGCAGAAACAGATTGGTGGCCTCCACTGTGAAATAAGAAACGATATTGAAATCTCACATTTTGGCAGG:1 - chr3R 4968055 3' - F-element 4452 1 73.27 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGTCAACTGAGTGACATTCTTCATTTTGAAATTTATGGTGCGTTATTCCGCAATATGTTCCATGGTGATTGGA:1 - chr2L 16153331 3' - Doc 11 1 73.27 GAATGTTAATCCGCTGTTATGACAGCTGTAGCACCGGGTGACCAGTGAATCCCCGACGATGGCTTTCAGGCGACTAGATACCTCTTCCGGTACCACATCTC:1 - chr2R 11224894 3' - diver 40 2 67.33 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGC:1 + chr2R 6850487 3' - roo 8717 2 84.16 AGGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAGTGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCATTTTTAACAATTGAGCGTGACGAGGGAAAGGAAA:1 + chr2R 9212494 3' - 1360 213 1 63.37 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCGCGCATGGCTAGAATCCTTTTGGCCAGTTGTCGCCAAGTGTCACCGGCATTTCAAGCGATTTTA:1 + chrX 3544171 3' - hobo 13 1 69.31 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGTCATAAGGTCT:2 - chr3L 3757336 3' - roo 8690 2 57.43 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTGCATCCCATCC:2 + chr3R 30553623 3' - 412 28 2 51.49 TTATAAATATTATTGTTATTATTACTAAGGTAAATATTATTTATAATGGAAATTAAAGGAAGTAGGATTCCATAAACATACGAACCATTTATGTCAATATA:1 - chr2L 7588181 3' - mdg1 38 5 84.16 TTGCGGTTTTGCTTTCTCTGACTGTCAGAGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCAACTAGCTCCTGTTCCGGGGATCGGTGTGGGAGTGG:1 - chr3L 17340383 3' - F-element 497 1 47.52 AAGGAAACTTGATCTTTTAGGTTTCTCTGTTAATCTTCTAAATTGGATAAAATCGGAATAAGGCTGCATTATCTTCTCCACGAGAAGAGGAAGCAGCAGCA:1 - chrX 17077128 3' + Q-element 360 2 59.41 TTTGGGCGGTTGTAGGGCGTTAAAGTGGTCGTGGCAAAAAGTTTTTGCCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTATGCACATACATTTTTTAAATTTAAGTT:1 - chr2R 5119906 3' - INE-1 343 1 61.39 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTT:1 + chr3R 6034000 3' + roo 9024 2 73.00 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCTAAACCAAATGTTTCCCCATACCAAACGTGGTGTGGG:1 + chr3L 14623983 3' - hobo 40 1 62.38 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAGTTCAGTTTCTTCTGTTATGCAATGAGTTACATTGCTGGTTTTGTGCTTTTTTGAGACT:1 - chr3L 21970784 3' + pogo 2087 1 70.30 TGACACCACATTCTTTTCGCTCAGACAGGGCGCGAAATCAAACAAGTTGCCACCACAATGGGAGGACATGGGCAGGAGGATCTTCTGTTCAGCAGGATGGC:1 - chr3R 12284307 3' + ZAM 8113 2 71.29 TCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATG:1 + chr3R 14860203 3' - BS 4995 1 65.08 GCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAAAAGCCAGCCATGTGTAAGCGC:1 + chr2R 13709587 3' - R2-element 3360 1 79.00 CCGTCTGTCCGTATGAACGTTGAGATATCACGAACTATAAAAGCTACTAGGTCCATTTACACTAGCTGAGTAAAGGGCATCTGATAGTCGGGGAACTCGAC:1 + chr3L 23747153 3' + INE-1 127 1 71.29 TATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGAGTTGAATATGATCGATAGCGGCGAATA:1 - chr3R 15866483 3' - F-element 309 1 77.78 TTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTGTATACTATAGAGGATACTTTATGCATGCCTCTGTTGATATTGAAATGCCGAGCAGGTTGAACTTTGAA:1 - chr3R 27332576 3' - R2-element 3585 4 55.56 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTGTTGCTTTTCATTTCAGCTCTCACGGAC:1 + chrX 2530556 3' - pogo 42 1 72.28 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAGAAA:1 + chr3R 8582618 3' + roo 9046 1 53.47 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTTGAACACAATCCAGA:1 + chr3R 23638183 3' - pogo 25 1 56.44 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAGCTGCGAGTCAAGCATTTTGGCCAAATCACAACTAAGCACATCAAAGTATAGCATACT:1 - chr3R 31264159 3' - jockey 27 1 58.42 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAATAATAATAGAACATTTTGATTAAAGTGTATATGTGGAAATATATTAATAGTTAGCCTCTAAAGTCTAG:1 - chr3R 12944650 3' + roo 402 1 76.24 GAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACCAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATT:1 + chrX 23108310 3' - BS3 1438 1 56.44 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAAAGGCAGTTCATCATTACAATACCCTTCACCAAAGGTATTCTACCT:1 + chr2L 10792066 3' + 412 442 2 70.30 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTTAATTCGCAGGAACCCTAAACAACC:1 - chr3R 19449440 3' + hobo 2909 1 51.49 AGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCATCTCTAAAATCAAAATGATTTACTTTTATAATTTTTTT:1 + chr3R 10914170 3' - F-element 112 1 62.38 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCAGTTCACTTCCGCTGGCCACTTTAATTACGGGCAAGAGGCGAAGCC:1 + chr2R 6107798 3' - roo 8694 2 56.44 CCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGCGGTAACTCACGCACATGAATGTGGGCGGGGAACGTCTC:1 + chr2L 17677761 3' - Tirant 8157 2 74.00 GTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCCCACACCCAGCTCCTGTCACATTGTCCTGGTCACCTTTTGATGTTACATTTAT:1 + chrX 20312231 3' - 1360 210 1 53.47 GACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCATCCAACCCAAAATGCCCCACACTCCGCGGCCAACCATTCCAGAGTCATTTCA:1 - chr2R 16505903 3' - invader4 2742 1 53.47 ACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGTTTTTTGTGACTTACTTAAGGGTTTTAGGCAAGGATGTGGCCAGGATACGGAGGGGGG:1 - chrX 4147297 3' - G-element 14 1 47.37 CGATAAAAAAAAATAAAAAAAAACACATACACGAGATGGGAAACCGACAACAAAAATAAAGGAAACTAAAA:1 - chrX 4528191 3' + R2-element 3581 2 70.42 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAGATTGTTTTCAGCAAATGCATTACTATTGTCTGTATTTATGTGGTGCTAGCTCGCTCATATTT:2 + chrX 15800984 3' - roo 8675 2 69.31 TGTGAAAAACACATTTTTGNAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGT:1 - chrX 20361966 3' + hopper 1387 1 52.48 CAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTTGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAAACTGGGTAGTACTGAACCGAGAAGTATCAGATATAACGGAATCGAATACAGT:1 + chr3R 13227845 3' - I-element 72 1 72.28 GCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACTAATCAAATTCAATTAAATACTACCTTGTTGA:1 + chr2R 10340037 3' + R1A1-element 5252 1 68.32 ATTGGCGCCCAACGCGCTTAAGTGTCGTAAAACCGTAAAATCCGTAGTAAAAAGACCACGGGGGCAAAGTCACGCCCTCCATCCTAATCTTCCTAAGACGT:1 - chrX 22114203 3' + gypsy10 362 1 54.46 TGTTAAATAATTTAAATTGTTCTTTTCATAAAAATCATCCTTTCGAAATGCGTGTGAATATTTTTCTGAGAAATCACATTTGCTTGTCAGCTGCAGCAGAT:1 - chr3L 18022325 3' + HeT-A 5809 1 66.34 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGGATTAGAATACGAATATTATTAACTATTCGATATCTAGCATG:1 + chr2R 21351379 3' - mdg1 35 2 57.43 ATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCCTTGTTAAATCAGCTGGCATTGGGCAAAAACCAGCGGAACGAACACAATCAGGCAAATACATATTTCCCATATT:1 + chrX 11017088 3' - roo 8664 1 75.00 CAGTTCCCTAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGCTATAGTTATAGTTTTGAGTGTTTCGTTTTCACGATCTGATGTCCGTACGGTGTGTTCTTCTTTT:1 + chr2L 10329822 3' - Porto1 4278 1 59.41 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGAACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACAATAAGAGTAACAACAATGCCCAATC:1 + chr3R 7139291 3' + pogo 2071 1 70.24 CTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTGAA:1 + chr3R 19450031 3' - roo 9044 1 64.36 AAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCTTGAAGGAACTCAATTTCAGCCACAAAGCGAAAAGCACGCACACATGAGCTTTGTAATGTTAA:1 - chr2L 11713288 3' + Quasimodo 6973 2 60.40 GTCTGTAGCTCAATTTTTANACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTT:1 + chr3L 19274870 3' + transib2 2788 1 61.39 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCATCTTGGCCAGCTC:1 + chrX 19034202 3' - hopper 11 2 68.00 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCCCCAACCCCCACAGACTTTCCATCTCAGGTTG:1 + chr2L 12511594 3' + copia 211 2 68.32 ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTTTTCGTGCGCACTTCGGGC:1 + chrX 4166427 3' + I-element 5310 1 70.30 TTAAGAATAAAACTCAGCTGCATTTACCAACGCAGCGATATCGAGAGCCTGTACCAGCAGCTCACTAATCTTATCAACGGAAAGGTAAGTACCTTTTGCTC:1 + chr3L 20312113 3' + rooA 197 2 70.30 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTTCATTAGCATAAGTAGATGCGAAAA:1 - chr2R 9905342 3' + mdg3 5475 2 57.43 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTGATCGATTAGGAACTAGGTTAAGAGAAATTTG:1 - chrX 19334575 3' - roo 8678 2 63.44 GACGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACGACTTCACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAACATTTTTTATTTAGCCCGCGCCTGCCAAATGAAAAAACTTTTTC:1 + chr2R 10983920 3' + HMS-Beagle 6913 2 62.00 GAAAAATGAATATATGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTTAAGCTCTTGATTTTCTTAGTGTATGCCTTATTCG:1 + chr3L 13871024 3' - invader3 5453 2 70.30 TTGTGCGTACACTTAATGCGTTCAATTCGGGTGTTTGGAATGTTTGGTTTGAGCGTCAAGGGGGGACTTTTGAAGTTTAGTTAGGCTTTGGACTTTTTGAC:1 - chr2L 12266130 3' - rooA 7584 2 59.41 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCTTTATCGCCTCCTC:1 + chr2R 22856605 3' + 1360 3369 1 59.41 TGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAAAGAAACGCTGGGCAAACAACCGGCTAGAAATGCCTCAGACCACGATGATGGCAACGGTGATGGCGATGATGATGATG:1 + chrX 17780648 3' + Tc1 1583 1 69.31 AAAAATTATGCAATTTCGCGTTCGCAATTCACACTAGCTGAGTAACGTTGAACACACTCAAAGAAAAGTTCTAAAAATTAAAATCTATTAATGTAGCAGGC:1 - chrX 21131543 3' + INE-1 517 1 53.47 GATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGGCAATCGGGCAGGATTAAAGCTGAAATGTTTTCACCTTTTGTCT:1 - chr3R 19261858 3' - F-element 339 1 56.44 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCTTGTAATATCGAAATCAATGAGATTCGTAATTCTGTCGCTGATTACTAAAGTTCA:1 + chr2L 9045485 3' - jockey 28 1 57.43 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAGATTGTTTTCAGCAAATGCATTACT:1 + chrX 15800946 3' - roo 8713 2 77.23 GGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTAGCCGAAACCAAAACTCATTTGTCCGCCCACTCAGCCATCAACGAAATAGAGATACTCAGAGTGGAGTCCTAAG:1 - chr3L 11145395 3' + R1A1-element 4915 1 76.24 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGCCTTTTGTATCACCTGGTTCCCTTTGTTTGGTTTCGCATTAGAA:1 - chrX 14809022 3' + 1360 3347 1 65.35 ATTGTAAAAAAAACAGGCCNAATGCCCCATAGTGCACAGCGGCAGCAGCACTTAAGTCTAATTAAAATGCTGCCCCCTAATTAATTAAACAAATTTTTGGG:1 - chr3L 1998794 3' + hopper 1402 1 66.34 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTTAATTGAC:1 + chr3L 9928606 3' - roo 29 2 60.40 GTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATTGGTCAGTTTTACACTTATGTACGTACTGATTCCAGCCACTATTGTATTTTCCAGTGTTAAGCACGG:1 + chr2L 499797 3' + S-element 1537 1 69.31 CGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCCCCGAAAAGAGGCGACACCAACCGCAAAACAAGACGTCAAAGGACATCGAGGACCTTGAAAACGGGCGGCAGAG:1 + chrX 20018104 3' - rover 175 2 79.59 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGCATACTTTTGAGGGCAA:1 - chr3L 21144031 3' - jockey 23 1 62.38 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTTGGTCAATCGCTTCATTAATTCGCCTTTATATCTCAGTTAATCAAC:1 + chr3R 20657162 3' + roo 9040 1 69.31 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGC:2 - chr3R 10110427 3' - Doc 38 1 59.41 AAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATAAATATTATTGCAAATGAGAAAACATTTTATTGCATACCT:1 + chr3R 5348389 3' + copia 4760 1 69.31 CTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTTATTTTTTTT:1 + chr2L 10304047 3' - P-element 2600 1 56.52 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTACCATTTTCACTGGTATTTCACCATTTTTAGGAACTGGTACAATTACCAGTGAAATATTCGTGCAACT:1 - chr2L 20619972 3' + roo 406 1 70.00 AATCATGTGAGGACTTACTACAGCGTATGAGTGATTTTTATGGCATTTTGTTAAATTAAATCAGAGCGGCTAGCAAAAACGCCCGCTCTATGTAGTATATG:1 + chr2R 20719425 3' - BS 4990 1 59.41 AATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTAAAGTATTAAGAAAATATATCAAAAATGTTGTGC:1 - chr3R 2950243 3' + F-element 4553 1 71.29 ATTGCAATAAACGGTCGCTNGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGGTGAATATCAT:1 + chr2R 5772516 3' + HMS-Beagle 207 2 69.31 CGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCATATAGCCAAGTGGTCGGTCCGGGCTCAACGTGCCGGAAGTGCTCGCAG:1 + chr2L 5419885 3' + 297 373 2 57.43 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACCTAAGAAGATTGAATTTGAAATAAATTAAAGAGCTGAACACTTTCAATTGAAAATAGAGTCTGAA:1 + chr3R 29608869 3' - roo 8674 2 70.30 TGTGTGTGTGTATGTGTTCGTGGGGAAGGGAATGCCTTGGCTGATAAATAAAAAAAAAAAGAGAATGGCGAAAA:1 - chrX 14979241 3' - accord 180 2 77.03 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAATTGTTGATTTTTTGTATA:1 + chr3R 26317965 3' + roo 353 2 80.20 CGTTACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGCCATGCAGGCCCAATAAAGATTCAC:1 + chr3R 22548597 3' - INE-1 535 1 37.62 GTCCTGATCGTACGGTAAATCACTAACAAAGATATTAAAGCGGGATTTTGGTTACTTAAACAGTGCCCACCACAATGGCATCGAAGGATAACAGAAGCGCC:1 - chr2L 21934234 3' + Copia1_DM 176 1 71.29 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTTCCGAGAACTGAGACGACAATGGCGACGACATAAATATCAA:1 - chr3R 26252675 3' - 412 32 2 54.55 CTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCGGGTCGACATACTTGCATAGATTTGGAGGAGCAGAATTGGTGGGTGGGCAGGACAAGA:1 + chrX 11041842 3' + blood 437 1 63.37 TACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATATTTGTCTGTGTGTTGGTGAGAAGCCAGCTGCC:1 - chr3L 5241128 3' + Ivk 5335 1 70.30 AAACAATTTATAATTTTTTTTTCCTTAGTGAAACCTTGTGGATATTGTCCATTGCCCCTCAGGCGGTCAGACTCCCAGTGCAATTA:1 + chr3R 16838844 3' - Tc1 53 1 74.42 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGTGCGCCAGATCCTTAATCCCGCACGTTGGCCGTTTGTCG:1 + chr3L 13295281 3' + hopper 1380 1 59.00 CTATCAGATACCCTTTACACAGCTAGTGTGAATGCAATCGCGAAATTTCATAATTTATCCCAGAAAAATGGATATTGGAGAATAAAAATTGTTCAAAATTA:1 - chr3R 5083662 3' - INE-1 547 1 57.43 GTTTAGTTTTACTTTACTATTCAATGAAAGTGTTCGCCCACCCTGTGAATAATGCCCGCTTGGGTCTTCCATGAAGTAATTGTTTTAAAAACAAAGTGACT:1 + chr3L 18965344 3' - Doc3-element 164 1 78.22 GCCCAACCGACTGAGGGGCGCTGCCGTGTATAGTACGGCTCCATTCGCGAGAAAATATAGACGCGATAAACGGAAAAGAGAAAAAAGGCAAGG:1 + chr2L 20867701 3' - Cr1a 4414 1 78.49 CGGTGCGATCAATCTTTAGTTAATTTGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGACATTGATTTGAAATCAAACATCATCTGCAAGGAACTAAAGA:1 - chr2R 10252582 3' + Gypsy6A_LTR 396 1 58.42 CGAATATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCAA:1 - chr2L 22092969 3' - INE-1 550 1 52.48 CGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACACACCATACTTTGACTAATTGCTCGGACTGGTCCATA:1 - chr3L 7966632 3' + Doc 481 1 64.36 GAAAGTGCTAAATTAATAGCGACCAAGGTGACAATGGGGTTTTCAGCTCACGCCGCCACACAGCACTCGCTTCTATCCCGCTCCCATGGTTCACAATATTG:1 + chr2L 566090 3' + BS3 1707 1 52.48 TTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTAATTAAATTTGCAAAAGTTTGT:1 - chr3L 6570171 3' + 1360 3175 1 78.22 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGACTTTGATCTAACTGTGAAAAACATTAAA:1 - chr3L 12112359 3' - 1360 55 1 80.81 GAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATGACAATGCAGCTGCTGATGATGATGGCATGAGAGGATGGCACTCGTTGTTTTG:1 - chr2L 17677465 3' + Tirant 8106 1 56.00 TGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTGCTGCTTTTTTAAAGTTTTTGCCATCTTGCAGTTATCTTTTTTTTTTTAAGTAGCAAACGAGTCAGTAAATGGCAA:1 + chrX 17018994 3' - flea 4638 1 69.31 TGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATGTGTGAGTGAGTCGGGTCAAATAAATGACAGCCCATAAGGCAGTGTCCTTACATTCTGACAA:2 - chr2R 21433120 3' - HMS-Beagle2 6892 2 70.30 GATTGCTCATCTCCCATGCNAATGATCTATGTGTGTTAACAAGTTTAATCAAACGACTATGTCGCCAGATACGTGCATACTTTTAGGCATATGGGCACGTA:1 + chr2L 10143729 3' - jockey 9 1 76.24 TTGTAAGTCTTTAAATATANTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCAGTTCACTTCCGCTGGCCACTTTAATTACGGGCAAGAGGCGAAGCCTAAGCCAAG:1 + chr2R 6107807 3' - roo 8682 2 61.22 TTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATAC:1 - chr2R 15788561 3' - Transpac 4936 2 63.00 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGG:1 - chrX 4277475 3' + roo 9028 1 71.00 CGTCTCCGCGACTTCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATTACCCGCTGTCCCCTGGCATCGCCAACTGTGGAGCATGTTTAAATGATGATATACTTA:1 + chrX 18975398 3' + Doc2-element 371 1 66.34 TCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAATGCTGTAGTCGAGTGCCGTTGTACATATCTGATAGTCG:1 - chrX 20447137 3' + mdg3 102 2 61.39 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCT:1 + chrX 21217563 3' - pogo 44 1 71.29 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCTAAATCGCACAATCAAAAATAGTTGTTTTCACAAGCGGAGAATATGAAATAATTCAGAGGT:1 + chr3L 5710334 3' - Transpac 10 2 68.32 AGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATACGATTGAATAGCACTGTTGCTATGGGAGAAAGAGCCATTTCCGCGACTTATGTTCTCCCTTGTTTGGGTT:1 + chr3L 20350275 3' + 412 7375 2 77.23 AACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTTTGTATTTTGTGCTGGGCAAAAGTTTCAAAGT:1 + chr3L 13599963 3' + hopper 1009 1 68.32 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAGTCAGCTCGCAGCGTTAGTTTGT:1 + chr3R 7626452 3' - hobo 28 1 53.47 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTATTCTAGTGTCCTTTGCTGTGCTGATGCGATTTTTCCCTAATCCCCACTGGAGGCTGCGTGATTTACGTCTCTCGTTTA:1 + chr2R 630628 3' + 1360 3372 1 73.27 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTCTT:2 - chr3L 12241830 3' + roo 9025 2 74.26 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATACGTTCTTTAACCCGAACCACCCAACACCCTCTA:1 - chr2L 9260332 3' - 297 38 2 67.33 ATAGTTAATAACATAAAATATATAAACAAATCGAAAACATTTGTTGCATGGAGGATGACGTTATACTTTGTGATTCCCCTGAGCCAGATAACAAAAGTGA:1 - chr2L 10229053 3' + Doc3-element 70 1 69.00 AGAGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACCTACTTAAATATGTCGAAAAGTGTGTCATCGAAGCGAGAGCGAAAGAG:1 - chr3R 24767789 3' + P-element 2861 1 51.49 TATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCAAAAATAGCTTGAGGTAAAGAAAGAGATCAGAATGGTATGTACGTGTTTCGTAGATCTGCTCAGAACCTAA:1 - chr3R 5456935 3' + micropia 5025 2 62.38 CACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCGGTAGTGGGCGGTCCAGGAGGTGGAGCGGTACTGCCACAG:1 + chrX 8188757 3' + copia 4979 2 60.40 CACAACCACACACACACACACACACCCACGAATATTAAATAGATGTACAATAGTTATAAAAAAAAACACAACCATGTCTCAATTCGATATAGAACAGATGC:1 - 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diver 5887 1 65.66 CGCAAAACCATTTAATTATCGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAATCAGCACATCAATCGTGTACCAATCA:1 + chr3R 15053658 3' + G6 1978 1 68.00 TTTCTTGTTCCCTTTTTTTTTTTCTAATTGAGCCATCTGTGTGTGCGTGCGTCTGCCATCGTTTGTTTTGGCCTCAATGCTTGCCACCCACCCG:1 + chr3L 9925916 3' - Doc2-element 232 1 77.66 GTCGACTTGAGTAAAGGAGAGACTTGTGAGTTACAGAGTAAAATTCCCCTTCCGCACATCATATGATATGTCATATGCGTAAGAAGAGACCCTCGTACCCA:1 - chrX 1893363 3' - R2-element 107 1 69.31 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGGGGCAGTGCTCCTTTGTTTCAGTTTGCCATTTGGCTGGAG:1 - chr3R 11607955 3' - 1360 35 1 60.40 TCTCTTCACGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATAGCGAGTCTCAAAAGTCAGCAAAGGCGCGCATGCAAAACAAAATCAAA:1 + chr3L 15581635 3' + Idefix 382 2 56.44 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGTGGGCGTAAT:1 - chr3R 25021656 3' + roo 398 1 69.31 CCTTTAAGGTTGTGATTTTATTTAGATCTCACTCTCATCGAGTGTAGCTTAAGACTGACTTATTACAAAGTTTCCCCTCATTTTCTGCCTGTGTCTC:1 + chr2R 14575093 3' - gypsy5 7251 2 72.16 GCGGACACGATTACACCGGTGTTTCACAGGCACAAGAAAATCGCCACACGAGGTCCGCTGTGTAAAAGGGGATTGGGTGGGGCATTCTCGCCTGGGTGGGC:1 - chr2L 7135552 3' + Gypsy12A_LTR 1978 1 69.31 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAGATTGTCTTGGCAACAAAGTTCAATTCATTTTGAATATCCCCCCACAAATCCTTAATGATCATTATAA:1 - chrX 11016946 3' + roo 9064 1 44.55 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACGACTTAAAGGTAGTTTGTTATAATATTTT:1 + chr2L 13186309 3' + pogo 2057 1 74.26 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACTGATTGGTAAAAGGATCTTTCTTTAGAAGTGGTCCTTATTCCTCA:1 + chr3R 5348729 3' - copia 30 2 55.45 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATAATAATCATTTTATGTGCATGTTGT:1 + chr3R 20332908 3' + jockey 4943 1 74.26 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTGATATAACATAAAAGCTATGTACCCACTTTAATCAATTAAATAAAGTGGTGTCAA:1 - chr2L 20128835 3' + hobo 2919 1 51.49 ATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTGTGAGCCTCGACATTGATTTATATTCGTTATTTGGGTTTATTTA:1 - chr3R 24085305 3' + invader3 5431 2 56.44 CGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATATTATAATATAATTATCAAATAGTGTTGTAAAACG:1 - chr3L 19089618 3' - invader1 3651 2 70.30 ATAGAACATTTTTATAGTTTGCCTACTTATCATGTCTAAAGTCAAACACATTCACCCATGGCCACGTTTTCATCCACATGCACACATGGTAGAAAGGTGAA:1 + chrX 4025181 3' - rooA 33 2 65.35 GATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAAGGAAATTACTATCTATTTTCCATTTCCTTTCCCGGCGCTTGTTTTCCTATTTTTTTTTGGCTGATGGGTTTTCC:1 - chr2L 16125150 3' + GATE 440 1 63.00 AGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCCATTT:1 - chrX 4264361 3' + mdg3 5454 2 70.53 TTACTTACTTACATATTAACTCTACTCTACATATTGAGGGTAGATACACTACAAAGGTGATTTGGACGGTCTTATTATGCCCATCAGAAATCAAAGCCTTA:1 + chr3R 27710765 3' - Stalker3T 32 1 80.20 CTCAAAGGTGTCAAGACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGTGGAGCAGATTGTTGACCAGGTGGAAGCC:1 - chr2L 951762 3' + R1A1-element 429 1 69.79 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAACAAGTAAACTTATGGAAAAAACTATAAAAGTGGCAATTACAGTGTCTTTAACGCGGCTGATCGC:1 + chr2L 22197297 3' + roo 399 1 71.00 ACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCATATATCTGCCACAAAGTCATGAAACTTGAGGTCATCTGCGTAAC:1 - chr2R 5010117 3' + Porto1 4408 1 55.45 ACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCAGCCTCCCCGATTCTCCGCCCCGTTCCCATTCCCGTTCCCGTGCCATTTTGTTA:1 - chr2L 12388167 3' + Doc 4496 1 51.00 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTCGAGTGTGAGCTGATAT:1 + chr2L 14762038 3' - mdg1 7059 2 58.42 AATTAACATTAATATTATTATTATATTATTTCGTAGACAAGTAATTCCATAAAATCGTTATAAGAATTGAACTTCAAAATGCCTATAATCACTGTTTTGTT:1 - chrX 7374075 3' - mdg1 7081 2 55.45 GGCTATTGGCAGGCTTTTTTTCATTGGCTTCTGTGGGATTAGCAGTACTCCCGCATTTATCACTTGTTAACATTTTTT:1 + chr2R 9434891 3' - TART-C 497 2 71.79 ATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGATATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCTTCAAAGCTATGAAGTCTTTCGCAAACTT:1 - chr3R 19448411 3' + roo 8726 2 69.00 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCTTTTCTATTAGCTTTAAATGTTTCTAGGAAAAACACCATTATTTTAAAAAGCATT:1 - chr3L 13096936 3' - I-element 26 1 58.42 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGG:2 + chr3L 5241160 3' - Ivk 47 1 74.26 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATAGGGAGATCAGGATATATTTGCCTTCCAAATGCTAAGCACTTATTGCTAAACA:1 - chr2R 8087021 3' + flea 4994 2 60.40 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTCTTTAGAGTGTTATCATTTGTGTCTTGTGTCTTGTGCTGCATGCCACTGTCGTCATTCAATG:1 + chr3L 17701615 3' + roo 396 1 56.44 AAAATTGTAAGTCTTTAAAGATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCCTTGTTAAATCAGCTGGCATTGGGCAAAAACCAGCGGAACGAACACAATCAGG:1 + chrX 11017067 3' - roo 8686 2 53.47 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAATCAATTTATG:1 - chr3R 7469966 3' - Doc 51 1 67.33 TATCAGAACTCAATGAAAACTATTGTAGGCATCGGAAAATATTTAGTTATTTACTTGGCGTTTGTATGCCCTACCCTTTTCAGCCACCCTGGCCTTCTTTT:1 + chr2R 24462667 3' - mariner2 865 1 55.45 TCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAAT:1 - chr2L 3699416 3' + mdg3 205 2 64.36 CTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCGCTTGCAAAAAGATAAACGAAACAAGAGAATCCACGAAGACAGTCTCCACAACA:1 - chr3L 14224695 3' + hopper 1024 1 54.46 AGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAAC:1 + chr3L 19350017 3' - 1360 3208 1 50.50 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCTTGTGGCCTTTGTGCACTTCTTCTTCATCTCGAA:1 - chrX 13126180 3' + mdg1 7454 2 67.33 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAA:1 + chr3R 8582602 3' + roo 9030 1 64.36 AGTGGGATTAATAATCCAAAATGGACGATAAAATCATCCTGAACGTCTTTGTACATTTTAAAGCCAACTTGTGGCCGGCCACCGTTGAAACGCCTCACGCA:1 + chr2L 20283027 3' + mdg3 276 1 58.42 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTAC:1 + chr3L 20411860 3' + roo 9041 1 56.44 AGGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCGTAAAGGGTCACACTACAGCGGAGCGATAGATCGTTATCGCTCGACCAGGG:1 - chr3L 14002096 3' - Cr1a 4219 1 60.40 TTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATGAATATATGAGCTAAGTAGTTTTTTTGGACTCCATTCCCTACTTTGAAAGCAAAAACTATCACCTTGG:1 - chrX 22734019 3' - copia 8 2 53.47 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAATTACAGGTGATAAAGCTTGGGATGAGGAGCTCTTATGC:1 + chr2R 10956986 3' + copia 241 1 64.36 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTA:1 - chrX 10286165 3' + roo 357 2 76.24 GCTATTTTATATAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTTCCGAGAACTGAGACGACAATGGCGACGACATAAATATCAACGG:1 - chr3R 26252672 3' - 412 25 2 51.58 AATATTAAGACAAATTGTTAGTGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAAACTTGGGAATCCCAAAAATAAAGAAGAGAATCGTAGTTTTT:1 + chr2R 3914418 3' + G4 3503 1 79.00 TAAATTCTGGAGCTGCAGGTGCAGGGCTCGGCGGTTTAGGTGGCTGCGAAATCTGTTGGTCAGTCGGTTTATGGGTCTCAGACAGGAATCCACAGATACTC:1 + chr3R 20918679 3' - Chimpo 4199 1 68.32 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTAGACTGTCTAGGGCTAGCTTGCCAAGCCGACTTAATTAGCATTATAAAATAAAATAGTAT:1 - chr2L 109674 3' - 1360 17 1 61.39 TTCACGATGATTACGTTGGGAAGATGACTCTCTCCCAGCGGTTCTGCTCATGGTGGGGGCTCTGATTCCGGCGGTTCTTCGCTCGCCAGTACGCTCCACTC:1 - chr3R 30450403 3' - gypsy3 262 2 73.27 GCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGAAGTGTAATGGAGAAAAATTAAGTCACCAAGATTACAAAGCCACTAGATTTTCAGGCTA:1 - chr2L 1526448 3' + invader3 212 2 65.35 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTGCTTTGAAAGCGATGTTCTTCGGTTAATTGTGAGTGAC:1 + chrX 16671122 3' + P-element 2851 1 43.56 TGTGTATATGTGTGTGTGTGTGAGCGTAATAGCTTTATGCCTGCCGGCTGTGTGAACATCAAGCTGTGCGAGGATGGATTCATTTACCTAAACGACACCTA:1 + chr3L 13852726 3' - accord 188 2 61.39 ATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGTTTGCAGACAAGGTGACGCTATTCTTTCAGCTGCTGCTGGAGGTGGTGCCCACCTCATCG:1 - chrX 14586384 3' + hopper 264 1 65.35 CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAGTATGTTTCTTGGTTTTTAATT:1 + chr3R 26597381 3' - mdg3 5296 2 78.22 ATCGATGCAGCTAAGCGAANTATACTGTACTTTGTATTTACCTGTAGATTGCGCAATGATAAGTCTTGGTTTTCAAACAATTTTGTTTAGAGTAGCAAAAA:1 + chr3L 16546881 3' - pogo 6 1 68.32 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAA:1 - chr3R 12063758 3' + 412 7496 2 74.26 ATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATAATCAAGATAACTTATATATATATTTTTCTGATCGATCTAATGTTGTCTCA:1 - chr2L 16805224 3' - hopper 352 1 55.45 ACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTTTCCGGTTA:1 + chrX 983382 3' - Juan 3821 1 61.00 AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGCGGCAACTGGAAAACTGGCAACTTCATTATTATTTGCAGAC:2 + chr3L 8252252 3' + copia 253 1 58.42 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAACAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAATCGATTTTGTTAATGAAAACGAAGG:1 - chr2R 19061236 3' + roo 361 2 71.29 GTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGTCCGAGTAGGTGGTTGTTTATTTGAGCCTCGTGACAGCAGCTGGGGATCTTTGGACTAACACGTGCC:1 + chr3L 6263395 3' + R1A1-element 5121 1 69.31 TTTCATTTAAATGATCTGCGACACGGCACTTCCGTTGCGTTATAAGGGCTGGGGAAAGCCCCCCAATCAAAAACAATTACTCTCAGTGTGCCAGCGAGCT:1 + chr3L 19091011 3' - invader1 3611 2 74.00 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAAACTA:1 - chr2L 16139122 3' + copia 213 2 66.34 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTATATGACCCACGTTTTGGGAA:1 - chr3L 171197 3' - 1360 55 1 80.20 ATTTCTCCGCGTTCTCCGCCGGCATCTGTGTGCACTGGAGTTGTGTGACAATTGAATCATGTTAATTGCCTGATACATCTGCTGTTGATCCTGCCGAATCC:1 - chr2L 16080853 3' - Osvaldo 1180 1 69.31 GTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAATACACTTTTGAGTCCTTTCCATTTCCCGTTTTCGCGGTCCGGAACTATGCTTCA:1 + chrX 393986 3' + accord2 7259 1 61.39 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGCTGTTAAGC:1 + chr2L 18248059 3' - blood 7037 2 55.45 CTCTCGAGCCCCCAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTTTCAAAAAATAAAGAGATTCTTGGCGAGGCGCTTAGAAAAGCCGTCAATCAACATGTGACGA:1 - chr3R 1994919 3' + X-element 376 1 61.46 AAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCTATCAGTTACATAAGGCTTATGAAAAAGGAAAGACAATAAAGGGAAATATAAATACATTTTATGT:1 - chr4 110844 3' - diver2 4669 2 70.30 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGGAATAATTAATGTAATCAAGCGACGTGCCCTGAGTTTACTCGTAACTTTCTGGCACGTAAG:1 - chr3R 17660460 3' - roo 8678 2 64.36 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGTGGGCGTAATCCAA:1 - chr3R 25021652 3' + roo 402 1 73.27 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGCAGCCAAAAGTTTTTAGTTCCGTGGCAACCACGTGCGTCTTTTGT:1 + chr2L 16683773 3' - P-element 31 1 48.51 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGCAGCTTCGGGCTATTAT:1 + chr3L 16891135 3' - P-element 57 1 16.83 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAA:1 + chr3R 8582601 3' + roo 9036 1 62.77 GATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCGGAACATAAAACACTGATATAATCGCCTTTACCCGAAAT:1 - chr4 1179628 3' - Cr1a 4245 1 73.27 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTGTTACATGTAATTAATTTCAA:1 + chr2L 19681467 3' - hopper 50 1 73.27 GCGCTGCGGGAATTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGCCTTAAACTGCTACCAATATTACCCATCCCG:1 + chr2L 15150060 3' + Rt1a 39 1 75.00 TAATACCAAAGACACTAGANTAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTT:1 - chr3L 22065791 3' - Tc3 316 1 56.44 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTATTGCCATTAGGAGGAACCCCT:2 - chr2R 18188299 3' - Juan 4045 1 58.42 TATTACGTTTAGCCTTGTCCATTTTTCACTCAAATTCTGAGAAGGAAATAATTTCACAAGAATGTGAAAATCTGTGACGCGAAAATCTTGAAATGCAAACA:1 - chr3L 3590514 3' - copia 432 1 69.31 TTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTGCTCATGCAAACTATCCTACCTAACTAATTTTCTTGTTTCACAGCAAAAGGATATTA:1 + chr3R 5433125 3' - Doc 4576 1 61.39 CAACCCTAAAAGATTGGCTACGTATTCTGGGCCAAAATACGGAGGGCACAAAAACCGAATTAATCGCGAGGCTTTAATTAATTTCCACACCGAAAATCAAT:1 - chrX 21194626 3' + mdg3 333 1 72.28 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATG:1 + chr2L 18248050 3' - blood 35 2 64.36 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAAATAACAGCGACTAAGGCTAATTTATGTACAAACAAGGTGCTATTTTA:1 - chrX 12472526 3' + pogo 2076 1 54.46 TTGTGTGAGTAAAAACAAGAACGAAAACGAGGCGTCAGGACACAGGACTCGAGCAATTTGCAGACGGCGTCGCTCGTTGAGAAACG:1 - chr2R 22945643 3' - 1360 3244 1 36.05 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATAGGAGTGTGTATATAGCGAAAAGTGCGGGCGAAGGCAATGGCCATTC:1 + chr2L 14035603 3' + flea 231 2 54.46 CATAAAACTCAAACATAAAGTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 11967084 3' + copia 5073 2 74.26 GTTACATACTTTTCAACGAATCTATTATGCCCATAACGATCTTACCTAAGCGTAAGTCCTATCGTAAACTTTTGTTTCGTTTCGATTAGTTATCATATTCC:1 + chr2L 19720059 3' - INE-1 15 1 75.25 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTTAAT:1 + chr3L 9928602 3' - roo 8697 2 64.36 CTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACAATATCTATACTATTACTATTATACTATTATTTTATGACAATTTAAAAGTTTTTTAAAAC:1 + chr2R 21751748 3' - mdg1 7144 2 62.38 AGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACC:1 + chr2R 3120304 3' + 1360 4 2 57.43 CGTAGCCGTCACCCGGTTAACTTAGTTAACTTATAGCCTGACAGTTTTGTTGTTAGTTTTTCCTCACAACTTGCAATCCATTGTCTTCGCTGCGGTTTCCA:1 + chr3L 11378274 3' - gypsy6 10 2 41.58 TAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGCTGAGGGTTCAGACAAAAGGGATACCCTT:1 - chrX 4166348 3' - I-element 5288 1 75.76 TGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTCGGTAAGTCCTTGCATCTGATTAAGTCTGTAAAGTCGAGCAT:1 - chr2R 19643053 3' - I-element 5002 1 58.42 GTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATAT:1 - chr3L 27356074 3' + Tc3 1688 1 64.36 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTGCTATGTACAACGAATTAACACATTTTGCAGTTTGG:1 - chrX 10451475 3' - hobo 41 1 76.24 GCAGATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAG:1 + chrX 22386751 3' - hobo 96 1 73.27 TACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGTAATCGCTTGTTTTGTCAAATAACACTTAGAAAAAGAGAAGTTTAAAA:1 + chrX 18884359 3' + Cr1a 4002 1 52.48 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACCAACTGAGCGGTAAAATAAATAAGCTGGTTTACGAACTAACGAGTCTTACACTACTGCGGTGTAAG:1 - chr3L 163193 3' + mdg1 417 2 72.92 TAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGTGGTACCGGTG:1 - chr3L 16792538 3' - Chimpo 4029 1 53.47 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGTGTTTGGCAGACAT:1 + chr3R 17053141 3' - hopper 22 1 57.00 AACTCAACGAGTAAAGTCTNCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACACTTTAAAACCTAATAGATATGAGTATATCAACATC:1 - chr2L 4063674 3' + roo 392 2 61.39 TTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTAGCTTAGATTGGAAAAGTTTCGACAGTCCAGTTCAGCTGGGTGA:1 + chr3R 8460263 3' + copia 181 2 57.43 TTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATACTCGTACACACACACCCCAGAA:1 + chr2R 8311351 3' + opus 448 2 78.22 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGTGGGCGTAATCCAATTG:1 - chr3R 25021649 3' + roo 405 1 76.24 ATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTACACTTTAAGTTTGCGTGTTAAGTGGATAAATTAATTGCTTGGAACTGTTTCAGTGCTATCAAATTTATTGC:1 - chr2L 20271071 3' - mdg3 121 2 78.22 GCTGCCATAAGTTAATATGNTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAATTATAATATTAAAATATTGTTTAGAAACTTAAG:1 + chr3L 10621707 3' - 412 43 2 71.72 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGGTTAAGCATTTGGGGCGTTTAAGTCAAATAATGCCACTCACAATTAATCAAGATCTGCCAGACAATCATTT:1 + chr3L 11755785 3' - roo 8669 2 69.31 TAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATA:1 + chr3L 6658209 3' + hopper 1363 1 78.22 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTGAGAATCTTTTTTTTTTTATAAAACAAGAAGTTCGTTAAATAAAGTGAA:1 + chrX 10286219 3' - roo 11 2 55.17 CAGCCTGACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTC:1 + chr3R 15790055 3' - flea 4755 1 76.24 GTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGAATACTATTGCAGCGTTGACACAATTGCTGCCATATCCGGCCGCTTA:1 - chr3L 8268145 3' - hobo 28 1 51.49 CGAGAAACGGGAATGTCTANTCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGTCACATGTAAACAAAGATGTACGA:1 - chr2L 2494561 3' - rover 7124 2 78.22 AAAAAAACAAAAAAAAATTGGGGACTGGAACCCAGAGCAC:1 - chr2L 19685818 3' - hopper 140 2 90.00 AGTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAG:1 + chr3R 12329648 3' + hopper 1361 1 75.25 TTTATAAAAAAAAATATTTTTTGATGGCAATATTCAACTCACTTATATATTTTCTTTGTGCAACATGGGGTGGTTTGCAGATGTGTGTGTATTTAAAAGTA:1 + chr2L 17745845 3' - Quasimodo 7342 3 73.27 CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAATCAATAAAGAGATTTAAAATTTACAAGTACTCGTGTGTGCACAGCAAACACATATTATGTACATACA:1 + chr3L 20317899 3' - 3S18 5774 2 70.30 CAAAACAAAAACGATAACAAAATCGGCTTTTATGTGCTTAAAAAAAAATATGCATAATTATGCAAGACCTGATAATTGCAAATTAATTGCAAATTAATTAA:1 + chr3L 12258086 3' - Circe 7280 1 53.47 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGGGGCAGTGCTCCTTTGTTTCAGTTTGCCATTTGGCTGGAGATACAT:1 - chr3R 11607949 3' - 1360 29 1 56.44 ACGTCGAAAAAAGAAATTTGATTAAAACAGCGCCTGGTTCTATAGCAATTTACCTACAACCCCAAGTGTATACTTATTTCATGGAGTAATTTACAGAATAT:1 - chr3R 10138426 3' + Tc1 381 1 76.24 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACACTTTAAAACCTAATAGATAT:1 - chr2L 4063689 3' + roo 9040 1 55.45 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATATTTAATTGATAAAGCAGAAAGA:1 + chr3R 17003358 3' + pogo 2053 1 79.21 TCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAGGGGCTTGGCTTTGGCTTCAGCTCATGCACACTGGAC:1 + chr2R 15788666 3' + Transpac 5219 2 69.00 AACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGAT:1 + chr3R 14860202 3' - BS 5034 1 63.37 TTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTAAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGCCCGAGATCCCGTTAAAGGAGTCAACTACGT:1 - chrX 20556088 3' + invader2 399 1 69.31 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTGATTATGATATTTTTTAATGGAAGGCTGAAAGATGAAAGGCCCC:1 + chr2L 17245071 3' - copia 31 2 56.44 TTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATCGCCGTACTTAAATCACTTTCTCGTATAAAT:1 - chr2R 22051448 3' - Tabor 6856 2 60.40 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCCAACAATTGACCCACGAAAACCACTCATACGAG:1 - chrX 21217494 3' + pogo 2089 1 58.89 AGTAAGAAAACTTGATCTATTAAGTTTCCCTGTTGATCTTCTAAATTGGATTTTAAACTATCTGAATGGCACGAGGACGAGGAGCCATTTCAGAAAATTTT:1 - chr2R 5177088 3' + Q-element 357 2 68.32 ACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCTAATTACCACTTCTTCGTCTGTTGCAGTGACTCCCGTTCCTCTTTCTTCTTCCTCCT:1 + chr2R 22477195 3' + diver2 167 2 64.36 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTAATTACGTAATAAGGAACCTTTTTATTCATTCCATACAAG:1 - chr3L 6033529 3' - 412 35 2 60.40 GTGCTGGCTAACAAAGGCTATCCAGCCAAATATTATGCCCTAATTAACATTAAACTGAAAAAAAAGTCCAGTTCTTTTTTAATTTTAAGCAAATTTATAAT:1 + chr3R 31884909 3' + HB 1315 1 55.45 GTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTGTGAGCCTCGACATTGATTTATATTCGTTATTTGGGTTTATTTATTT:1 - chr3R 24085302 3' + invader3 5434 2 53.47 TTTTTATAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTGAAATCAGACCACAGGTGTGCTCGATAAGTTGGTAGATTTTTGCGATTAGAAACAACA:1 - chr3L 25107823 3' - Cr1a 448 1 59.41 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAAGTTCAAGTTCTAGATATAA:1 + chr3R 11052178 3' + blood 354 2 55.45 GGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGCGCTTAATCTGCTGTTGCCATTTT:1 + chr2L 12808250 3' - Tirant 8121 2 67.33 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACACCTTGTGACCAAACCACATGCTACAACCCATCAATTAGCAGCACACAG:1 - chr2R 21351312 3' + mdg1 390 2 54.46 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTTTTCGTGCGCACTTCGGGCCAAACTCAAG:1 + chrX 4166437 3' + I-element 5320 1 60.40 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGTGTACATTTTCACATATGAATAGTATTTAGTTTTCTCTGCGGGCCATT:1 + chr3R 11608024 3' + 1360 3362 1 54.46 CTATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCGCCGTTCCTGTTGGCCATTGATTTATTAGGTTCCGCCGTGCGGCAT:1 - chr2R 6847230 3' - mdg1 7040 2 77.23 TTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTGCGCCGGATTGTGACCACCGACATTGACCCTGCCCTGG:1 + chr3R 9735229 3' - Idefix 269 2 62.38 TGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCT:1 + chr3R 11151882 3' - mdg3 5293 2 65.35 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGAAATGTTGATAAAAATGTGCACTGCCACTTGCAGCGTG:1 - chr2L 17677712 3' + Tirant 8470 2 62.38 ATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAACAAAAACATTAAATGCAACAACAAGTCGGTGTCCCATCGCGCGTTTT:1 - chr2L 613248 3' + F-element 4340 1 53.47 TGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATTCATCTAATAGATACGAGTGCGAGCCATGAATACGACAATTAATGTCATCCACCATTCATGATTTGCTCCTTCT:1 - chr2R 18663370 3' - I-element 5062 1 77.23 AGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGAAAATGCCAGGACTACAAATACGGC:1 - chr2R 6918591 3' + accord 7346 2 72.22 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCGTAGTGTCCTAGAACTTTAGTACTCTATGTCTGTACATATCTTGTTTAGTAAGCTGATCTCTCTTCT:1 + chr2L 8176492 3' - 1360 12 1 67.33 CGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCAACGACAATCCCCTTAAACATTCGGTAGTAATATCCACATGTACTTAGCTTTAATTT:1 - chr2R 13986873 3' + F-element 243 1 53.47 AACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGCTCTGATTAGAGAGCAAAAAATAACAG:1 - chr2R 13383523 3' + gypsy5 363 2 72.28 TAAATTAAAATTAAAAATCAAACTAAAAAAGGAATTTCCTTAAAGCAAAGGTTCCATGATCTTCGACTTGATTTTCCTCCCGGTGCTGGGAAAACTGCGAT:1 + chr3R 18525688 3' + P-element 2641 1 79.21 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAAAAGTGGAAAATCATAAACAACAAACAAAAGAAGAAA:1 - chr3R 14193879 3' - pogo 12 1 69.31 CGTTCTGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACTGCAATCAAGGCGTGTTGAAAATGACCGAAAGCGATTCGCGCATGAAAC:1 - chr2R 10653380 3' + F-element 4372 1 56.44 CTGTTGGTTGACGCGAAGGCTCTAACATTTTAGGCGGACAGAAAGATGGATGGCTATCAATAAAAACTAAATTACAAATACATAACAGATGCAAAAATAGC:1 + chr2L 2919407 3' + Gypsy12A_LTR 470 1 55.45 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTCTTACATGTAATTAATTTCAAATTATTTATACATGAACGCCCAGACAGTGCAAGC:1 + chr2L 19681501 3' - hopper 16 1 61.39 GTTTTGCTAGAAGACGATTNTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAA:1 + chr3L 19350026 3' - 1360 3199 1 59.41 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAGATTGTTTTCAGCAAATGCATTACTAT:1 + chrX 15800948 3' - roo 47 2 75.25 TTAATATGAAGTAGCCCGTCTTCTGAAGCAGCGCTTACGGCAGAATGCTGACATGGCGCTTCACACGCTCCGTGGCGTTACTTTGATTTGCAATCGGTGTC:1 + chrX 13736093 3' - gypsy4 6743 2 71.29 GTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCTATCTGCACTGCTCGTATTTACTGTGTGTGGTGTGGCCATAAAAACCGCAATTCCACAAA:1 - chr3R 8394826 3' - opus 380 2 63.37 GGTGGAGCGTTTTTCTGGGGGTGCTCCGGTGGACAATCGCCCCGAACTGCCGTTGGGATGTCTGCATTGTTGACAGAAGTTCCGGATGCTATTAGAGGTCG:1 + chr2R 19598633 3' - mdg3 450 1 62.38 CAGCTAACTATCGATGCAGNTAAGCGAATTATACTGTAATATAAATATATTTTTAAATATTAAAATCAAAAAATTTGGAACCCTATATTCTAAATCTATAG:1 + chr3L 20584098 3' - pogo 15 1 59.41 TGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGGTTGTTTCGTGATTTCGTGGTTTGGTGGTGGTTCAAGGGGT:1 - chr3R 15305116 3' - accord 229 2 59.00 TGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTATATACAGACACCCACATACGAGCGCCAATAGAGCG:1 + chr3R 5811546 3' - flea 36 2 67.33 CCAAAATACGGAGGGCACAAAAACCGAATTAATCGCGAGGCTGCAAGACATCCCCACGGCAGTTCGAGCTGCACTCGTCCTGGCTGGGCAAGG:1 - chr2L 20283216 3' + mdg3 364 1 68.82 AAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGAGACGGATGTTTGGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCTCTTTTAGGAACTATTGCATTTAT:1 - chr3L 25873946 3' - Idefix 7022 2 76.24 CACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTGTAGCCGCTTATTGGACGATCGGTAACGATTAAATGGAAAACTGGCACACACGTAACAAA:1 + chr3R 11619795 3' + Doc 414 1 64.36 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAAGAACAACAATTAACTTTCTTCAACAG:1 - chr2L 17244997 3' + copia 247 1 60.98 CATTCTGCGCTTTTGTGCTGAGAGTAACTGTTGGGTCTCTCCCATGCTGGAGAGCAAGGCATTCTGGCTGTCTTTCTTCTGCGGATCGGCCTTGGTATTGT:1 - chr3L 3210813 3' - Porto1 392 1 57.43 CATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAAACAACACAATCATATATATATATATGTATGTATATATATACGAGCAACCAACATTTGCTCGCCTTAAAA:1 - chr2L 19634978 3' + Quasimodo 112 2 70.00 AAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTTAACCGTTAACAAAAATGTATATAAAACATTTAAATTTAAGTTCCGCAGAAT:1 + chr3R 20515791 3' + 1360 2959 1 56.44 TAAAAAAGTACGACAATAANTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCAC:1 + chr3L 15099636 3' - G4 3815 1 33.66 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGCTCATCATTACAGTACAAAGAATGACACTAAGCTATATTGGATAACTTCGTCGTTGGGAAAAA:1 - chr2L 20570602 3' + 412 465 2 54.46 ACGTGGGATTTACTGGCATTTCCCCAGAGTGCTATTCCATACGTCCATATTGGTTTTTCATATATATTAATAGTTTTGGTGTTTTATCCTATAATTTTTTT:1 + chrX 7001351 3' - Porto1 4294 1 50.50 GCTATACTATCTAAGTTAGNCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTTTTCGTGCGCACTTCGGGCCA:1 + chrX 4166429 3' + I-element 5312 1 67.33 CATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTAGAAAGTTGTCCGGTCATAAAACGGATTTTGCACGAGGACAGCTGCTTCCATGGCATTTTTAG:1 + chr2R 4558411 3' - Doc2-element 4512 1 68.32 GCTATTTCTGGACGTTAGAGTGGGAGGGGCAACATGGGACGTGTATGTAAACAAAGCATTATTTTGGGCGGAAAGGTGTTTGGCTATGGTTTAATTAAAAA:1 - chr2L 21683581 3' - INE-1 221 1 69.31 GGTTTGCTAAGAAGGTCTAGTGGGTTGGCATATGCCCTATAGAAAATCCAGATGCAGCAACTTGTTGTGGTGTCATCGGATTTAACAGACCTGCACTTGCA:1 + chr4 51488 3' - I-element 5107 1 78.22 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTGTGTCCGAATAGTGTGGAGCGG:1 - chr3R 6033968 3' - roo 52 2 78.22 AAGAGGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATCCGCGACTTCCACCAGAGGGTCAAAAATGCTTTCAAGCCCAGTCCGAGCCAGCCACA:1 - chr2R 18887391 3' + Quasimodo 7011 2 75.25 CTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGCACCATGGTCCCTACGCAGCGAAAGCATCCAAGCGACCATCATATAGCTTTATTTTCTTCTGGTTG:1 - chr2L 13530232 3' + Doc2-element 4427 1 64.65 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTAGCTCCGTTCTCCGAAGAGAGAGAGTGAACGAAGAGAGCGCAGGAAG:1 + chr2R 18171582 3' - P-element 29 1 49.50 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCANCTAAGCGAATTATACTGTATATCGAAATTGAATTTATCACATGTT:1 - chr2R 17420849 3' + pogo 2056 1 76.60 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAAATTGTGCACATTTCTGAA:2 - chr3R 10087802 3' + roo 9060 1 67.33 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACAATAAGAGTAACAACAATGCCC:1 + chr3R 7139287 3' + pogo 2050 1 81.19 TGGACACAACGGTCTCTGCNCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAGGTAATTAAGTAAATTTGGGATAATGTAGCCAGAACCACAGGGAAGTTTC:1 - chr3R 30608382 3' + Transpac 5200 2 52.48 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTAAAGCAATAATTAATCCAGCATGTCCGGAAATATGATGGAA:1 - chr3R 19449772 3' + roo 8990 2 60.40 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGAAACCATATTTCCTCAACCTCATGATGTTACGATGAAAATAAGTT:1 + chr3R 27056456 3' - jockey 23 1 62.38 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCATCCGTA:1 - chr3L 10474148 3' - copia 4909 2 68.32 CAACCTCTGCAGCTGCGTGAGGTCCGATCGGGTCGATTGATAAATGGATGGTAGATGGTGGGTTATGTCAGTGGATTAGCTATGGGGTGGTGGAGTAA:1 - chr2L 17119160 3' + invader4 111 2 67.35 AACTTAAAAACCTTCATACNTTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGGCAGAAAGGGATGCCACGGAAAA:1 - chr2L 12808179 3' + Tirant 8455 2 77.23 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTTCGCC:1 - chr3L 19349920 3' - 1360 5 2 70.30 TGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTTTCATCATAAAATCATGCACAATGGCAATGA:1 + chr2L 8622825 3' + 297 6937 2 67.33 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCCTACCCAGCCTTTGGAGCCCT:1 - chr3L 3881005 3' + blood 7335 1 78.22 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATAAAATGATTATGACGATTATGCGAAGCTCCCGGCTACTGC:1 - chr3R 20332877 3' - jockey 4708 1 59.41 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTT:1 - chr3L 25059060 3' - mdg1 17 2 62.38 CGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGAC:1 + chrX 21087679 3' + mdg3 5489 2 61.39 TGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTAC:1 + chr3L 16047625 3' - Cr1a 457 1 58.42 GCACTGAATTTAAGTGTATNCTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCGATCGACGAGACGGTAGCTTTAG:1 + chrX 15024418 3' - P-element 50 1 28.57 GTCTTGTACATAAGCACATAGGATAATCGTATAATATGTATTCTATTTATAAGCTACAAATATATATAAAGCAGCTTCTCTTACTAGACAGCCCACTGCTA:1 + chr2L 2416202 3' - Tirant 210 2 69.31 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGTGTGGGTACACATACTTTTTGCAAACCAGCTGTATCTT:1 + chr3R 29977036 3' - hobo 40 1 70.30 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGGAGTTGCCTGAAAACCCATATCCGTGAACTTTTGCT:1 - chr3L 2022213 3' + roo 400 1 74.26 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATCGCTAGTGGCATTTGCGTAGGGCTAATGGCTGTAAAAAAAA:1 - chr2R 18432063 3' - 412 7072 2 55.17 TAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACGCGCATTCATTATTTTTGCATATTTTACAGTCCAACCCACCGCCCTTTAGCCGCCAATTCG:1 + chr2L 19239280 3' - micropia 46 4 57.00 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAAT:1 - chr3R 11151812 3' + mdg3 5480 2 59.79 TTTGGGAAGCGATGATAGCGACTCGGATTCGGATTACGATGATCCATTTTCTATGCATTTGGACGTAGAAAGTTTTGATGAACATCATGTAAATCGCCCAG:1 - chr2R 20155060 3' + transib3 2532 1 78.22 CCCCCCGTTACCTGCAACCNACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGCATAACATTTTGTCCGGAAATGGGCATGGCC:1 - chr2L 14220162 3' + springer 338 2 68.00 TAATAATAATAATAGCAATAATAATAATAAAAGAACAATAGATCCTGACTGCCGCTGTATTCACTTGGCAATTACTGCTTTATTTATTATGCCGAAATGGA:1 - chr3R 22910747 3' + mdg1 39 5 63.37 ATAATAATATTCTAGGGTCTTTGCTCGCACCGTAAAAGCCGTGTGCAAAGAGCGCCTTGAAATGTAACAACAAAAAGTCAAGCTTATTTATACCGCATTAT:1 + chr3R 30387136 3' + Tc3 309 1 69.31 GCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAAACAAAAA:1 - chr3L 1307195 3' + F-element 454 1 65.59 TCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCACTCAACAACCAGATCAGACCCT:1 + chr2R 16058725 3' + mdg1 235 2 65.15 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGTGATTTTGACCA:1 - chr3R 12321413 3' - jockey 4714 1 67.00 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACGAAGATACATC:1 - chr2R 15788550 3' - Transpac 7 2 73.27 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACAATAATTCGTGGAAGCTCTTTGAAGCGATGGTTTCACAGCCATTGTTGAAATTTACAA:1 - chr3L 22930291 3' - roo 17 2 62.38 AGCTATTACTTATTACTTATTACATTACACAAAAAATAATATAAGACAACCCAGATTTTAACAGTATTAGAAAAAAAAATAAATTTTTAATTAGAGAACGG:1 - chr2R 19091574 3' + Stalker2 7649 2 72.28 ATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGGTGAATATCATTGTGAACGGCAGCCTACGTAGGA:1 + chr2R 5772539 3' + HMS-Beagle 230 2 63.37 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATTCATGCTCATAGGGGGTAAGAAAAGTACACTTAGAGAGTTT:1 - chr3R 13353206 3' + 1360 3354 1 61.39 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAACAAGTAAACTTATGGAAAAAACTATAAAAGTGGCAATTACAGTGTC:1 + chr2L 22197279 3' + roo 9043 1 59.41 AATATTGCATAGGCACATACTACAATCCATTAATAGCTAATTAATAAATTGCCAAAGCCAATTACTATCGCATTTATTCAGCAACTGCC:1 + chrX 21060392 3' - 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I-element 40 1 62.38 GTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTA:2 + chrX 18326234 3' - Doc 222 1 59.41 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCAT:1 + chr3R 9224391 3' + pogo 2064 1 75.56 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATTTCTCTTTATCTTTTCTCACTTTTTTCGTTGTCCC:1 - chr2L 13093748 3' + roo 401 1 71.29 AACCTATGTAAAAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGTAGCTAGTCATTTATTGCAATGCAAAATGTCACAAAGTTCGCCCAGACTCCAAAGAATACTA:1 + chr3R 7392338 3' + rooA 277 2 58.42 TAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAA:1 - chrX 4166390 3' - I-element 5331 1 65.00 AAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAAACAT:2 + chr3R 25086159 3' + Bari1 1669 1 63.37 CCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTACAAAATGGTTTAATTGTCATTTATA:1 + chrX 734980 3' - Tabor 6869 2 52.48 GGAGACCGCGGCGAGGGATCTACACCAACATAATTAGTTTAATTTGTATAATCGTGTGACCAACGCGAATCTCCTGCCGTTTGCCCAACAACTGGAGGCGT:1 + chr2L 13392374 3' + gypsy6 7783 2 54.46 TTTTTTCTTGTTTTTTTTTTAAGGTTTTT:1 - chr2L 9857786 3' + hopper 151 4 86.21 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGCAGCCAAAAGTTTTTAGTTCCGTG:1 + chr2L 16683752 3' - P-element 52 1 27.72 AGATATTTCCAAATAAAATNAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGC:1 - chr3R 25021695 3' + roo 9022 2 76.24 AATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCGTATCAAACTACAACTAATGAATATTCCTACTGCGTTCAG:1 - chr2L 16336371 3' + Quasimodo 85 2 60.40 TACGTGGTCTTATACTATGNCACATATGCTACTATATTGCTGCCGCTTGGCATTAACTGCCTACGCATATTCGTAGTATGTATATGCCAGTATCTGTTTCT:1 - chr2L 4134805 3' - Quasimodo 12 2 68.32 GGGTTATGTTTGTGTGTCCNAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTTATATAGTTTGCATTCATTACAAAAATCATAAGAGCGTTTTCGGTT:1 + chrX 17938531 3' - I-element 4953 1 53.47 TGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCCAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTATTATAATTATGCTGGCAT:1 + chrX 8727926 3' - X-element 21 1 51.16 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAAATGCACT:1 + chr3R 20696513 3' - jockey 58 1 69.31 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCACAAAATTGCCAAACCGGCACCAAACAAAC:1 + chr3L 6658253 3' + hopper 1407 2 71.29 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCGGTCTACTTTGGCAAATGTGTTAGGCCTGTGAAGCTACCCTCTACCAAAACAACTAAATT:1 - chr3L 7541922 3' + roo 9055 2 56.44 GTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACTTACGTAGTTATTAACTTTGTCAGTCGAATAAATGATCC:1 - chrY 473357 3' - Quasimodo 29 2 67.33 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGATTGAGTTGATAGGCCATAGGAAATTATTTGTTATTCTCTTTTTCCCAG:1 + chr3L 12112407 3' + 1360 3363 1 53.47 TTGAATCCAAAAGAAACCCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAATTCTAAAGTCTAAAGTCCATAGGTCACATAACAAAAACAAGTCACACAAGTCTAAG:1 + chr3R 20804797 3' + Idefix 354 2 65.35 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGGATGTAGACGCGTTAGCAGAAGTTTCGTTTCCTTTGTGACTCAAAGACAGAACTGAACTACCAAAC:2 - chr3R 6266272 3' + roo 400 1 70.30 TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAATAACCTAGCTTAAAGTGTGCCTAATTTGA:1 - chr2L 3699388 3' + mdg3 233 2 63.37 TGTAAACTATTCTATCTATNATAATAATGATAATAATAATAATAGAAAAGGTAAGTTTTTGAATTTTATTATTGTTTATAACATTTTGTAAACTTTAAAGA:1 + chr3L 13097021 3' + I-element 5339 1 55.45 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTAGATTGTCTAGGGCTAGCTTGCCAAGCCGACTTAATTAGCATTAT:1 - chr2L 109689 3' - 1360 32 1 59.41 GTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATAACATATATCTACAACATATACCTGCCACTTTATATATTCTTTTACTTAGCAACAATAGAACATAGAACC:1 - chrX 22000062 3' + Quasimodo 2 2 76.24 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGGGGCGACGAGACAAATTAATTAAATTTAACCCAGTAAACCATGGAAACTCTCCG:1 - chr2R 22553073 3' + 1360 3367 1 58.42 ATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTGATATGGTCGAAAACGCTTTATTCTACCTATTAAATACTTTTCTACGAAGGTGTAAAATAAACAATAGAAAG:1 + chrX 21448637 3' - INE-1 83 1 71.29 CACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTATTATAATTATGCTGGCATC:1 + chrX 8727927 3' - X-element 35 1 51.49 ATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGGTTCCCTGTTTATTAAAGCATTTCTTACGCATCATTTGTTGCTTTGCCAGCAAA:1 + chrX 21253966 3' + invader3 256 2 59.41 CTTAGCAGGGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGCCATGAAAAATAATTGAAATATGTAAACAACTCAC:1 + chrX 2572289 3' - R1A1-element 233 1 51.95 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCA:2 - chr3R 10110437 3' - Doc 48 1 69.31 CTCGATATATGCACATACTACAATGCATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCGATTAGATATGAGTATTTTTTACTGGATTTCTTATTAATGGAATAACCC:1 - chr3R 11052069 3' - blood 7012 2 76.24 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATGCTTAGGAATATTTTGCCTGAA:1 - chr3L 7345364 3' + pogo 2051 1 76.24 ATGTTCTGATTTGATACAGNGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTACAAAATGGTTTAATTGTCATTTATATACA:1 + chrX 734984 3' - Tabor 6865 2 53.47 ATATATTTTAAACATAATTATTAAAGATTCGTTCGCTTTACATTCGGCTTGGCTTTTTCGTTAAGTAGCAGAGCCATTAGGTGGTGCATTATGGGAAGTTT:1 - chr2R 22486991 3' + Cr1a 99 1 65.35 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAATGGGAGCACCGAGATTCTACGTATCTCTACCACTGCGCTGG:1 + chr3L 14227517 3' - roo 18 2 59.41 TACAGCAAATTTGCATACTGGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCTTTA:1 - chr2L 18213169 3' + hopper2 1561 1 67.33 ATCAATAAAAATACTTTTTNTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAA:1 - chr2R 4673578 3' + Quasimodo 7337 2 63.37 GAATAGTGATAACATTTTCAGAAATCTCAGAAATGCCCTGCTTGTGAACTGCACTCTGTTGTCCGTTATCATCACCTTCTCCTCCTTTTAAAACATATATT:1 - chr3L 14485724 3' - Q-element 148 1 57.43 TGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCAACAAGATCATGTTGGTCGTGTCATACGAAAAGAAAAATAGCACAGTGA:1 + chr2R 25110888 3' + Quasimodo 7001 2 53.47 CTCGACGTTCATACGGACAGATGGACATGTCCAGATCGACTCAGCTATTGATCAATTTCAAATACTTCTGTTAATTAGGTCTATTGTCGATGTTTTGAGTT:1 + chr4 179767 3' - INE-1 129 1 52.48 AATCGATTGCTTTAAGAGCNGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCGGAACATAAAACACTGATATAATCGCCTTTACCCG:1 - chr4 1179632 3' - Cr1a 4249 1 76.24 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTCACCTTACTAAATATCAATAAAAATATTA:3 + chr3R 9278394 3' + roo 9038 1 60.40 CATGGACACACACACACGCACACCCACTCACACGTACATATCCTGCGATCGACCGCATTATTGTCACAGGGGCTTCTCGTACGTTATAATA:1 - chr3L 5505072 3' + accord 180 2 65.93 TGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCGTTGAAAGCAAGTCTTTTTGCATAGCATACATTTGGGGGCCTCCTTTTCTTCCTGTTCATTTGCGCCTGTATGTG:1 - chr3L 13895328 3' - hobo 2710 1 78.22 TGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATAAACCCAATACTTAGCTCC:1 + chr3L 171215 3' + 1360 3331 1 88.12 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACGCTTTTTGAAACCAATAGGTATTTTACCGATCTGCTTATTATCTTAACTTCAGGAACCTTT:2 - 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blood 7035 2 53.47 AAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGAGGTTCAATCGATTCATTTTAAAATTCTCACACCAATAA:1 + chr3R 16925802 3' + Doc 4360 1 62.38 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGGATCATAAATAAAACTATATATATATGTATAAAGTATTAACTAGCCTTCAGCCAGCA:1 + chrX 17104459 3' + 297 6926 2 54.00 GCCATTAGAGTATTCAGCTTGCGACGTGTGAAAGAGTATATATTGTCTAGTAACTATCAATTATGAAGAAGTAATAGAAACAAATCATGAACTTGATGATC:1 - chrY 3271669 3' + 1360 409 1 59.41 GAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTTCCGACTCAACGCTGATTATTAGGTCCATTCTTCAAGAATACAGTTCAAACGACTGTTGAAAAC:1 + chr2R 4235487 3' + Doc 4524 1 75.25 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATTTATATTGATTATGGGTGATCGTCAACAAGAGCAGTGGACACCCAATAAACCTGTCCAAAAACC:1 + chr2R 9905440 3' - mdg3 5264 1 67.33 GGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAGGGACTGCAGGACTACAGGACTGCAGGACT:1 + chr3R 4845047 3' + invader3 263 2 62.38 TTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGGGTAATTAAATTACGTGGCCCGCGGCAGCGCGCCTTTGACATCCCAGAGAGGTCCT:1 + chr2R 6847339 3' + mdg1 400 2 56.44 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATCTTTCTTTTAATAGATAAATAATTTGGTAATCATTG:1 + chr3R 20420984 3' + blood 338 2 63.37 ACTCGGACCTTGTTGTCGATTCCTGCGTGCACTGCTGTTGCTGCTTTTGCTGCTGCGGCTTAAGTGCATAAATAAACAGATTTTAATTTAATTATTATGAA:1 - 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FB 157 1 57.43 TGAACTTTTTGTTAGTTCTTATTCAATAAATTGTAAATAAATAAAAAAAGATTCAATAAATAAAATCAAAGTTTAAAAACATGTCGTTCCGCCCGAAATCA:1 + chr3R 17980576 3' + F-element 4634 1 78.22 TATCTCCAATAGTTTAGAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGGAAAGTTGAAATGTTATTTGAAA:1 - chr2L 12882746 3' - hopper 42 1 65.35 AAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAG:1 - chr3R 12329628 3' - hopper 55 1 80.41 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGT:2 - chr3R 8765560 3' + roo 9020 2 78.22 TTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATGAATTTGTATTCAATATTTTGATAAATGTCCTAACATTGGGACGCCGAGCACAA:1 + chr2L 14793571 3' + Stalker2 382 2 55.45 GCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAATTTATGTGCAAAAAAGTCTTAATCATATATAATGTGTACAAAACTAATGATCAATGCTAGGCAATAACTT:1 + chr4 1096450 3' + mdg1 483 1 78.22 TATGTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCGCAACGCCCCTTCGTGCGTACACGTGGCGAATACGCTATATCATTTGCATAGACCTACGCAAAATGAGGATGAT:1 + chr3R 4509812 3' + INE-1 29 1 76.24 CATGATTTTACGATTTAGGATTTACATTGTGTTAGAATTTGTTTTCGGGCTATGGGAAAGTAAACTTGGGCAAATAAATTTAAATGGGGGCGTTGAGTTGA:1 + chr3R 16684268 3' - TART-B 10300 1 62.38 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCCATTTGGGGGAGAGGAGTGATGCAAGAA:1 - chrX 4264338 3' + mdg3 5471 2 51.49 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACAAATACCATGAATTTGCATTGCACACTTGCATCTTTTGGCGT:1 + chr3R 3256038 3' - roo 28 2 59.38 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATGAGAAAATGCAAAGGGAGAACTACTACAAACTACATTTGG:1 + chrX 13126271 3' - mdg1 7075 2 62.38 CGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATATATATATACATTAATATCTCTGATTTAATATGTTTTCCTGT:1 - chr2R 13622182 3' - Quasimodo 28 2 65.35 CGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAG:1 - chrX 15263438 3' + invader3 234 2 69.31 AAAAATAAAATAAAATAAAATAGATAAAATTCATGCGAAAAACGGACCAGGTGTAAAGCCAAAAATCAACAAGAGATAAACATGGCTCTTAATTAATTTTG:3 + chr3R 25933197 3' - transib1 1899 1 79.21 TTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGCTGAACAAGAAGCCCAAACTGGACGTGAGCAAGGCTGTATCGATGGAGAAGCGCGACAATCGCTTGGCGTAAGT:1 + chr3L 5900593 3' + Stalker4 169 6 78.22 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCAGAAAACGAAGTGAAAGGATTTTGTAAATTACAATCTAGCTGTAAC:1 - 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chr2R 19641846 3' + I-element 5320 1 62.00 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGACCTGTGTGAATTGGAGGTGGCACGATATAGATTTTATTGCGA:1 + chr2R 9693374 3' - P-element 32 1 45.54 CGAGGCATTGTGCAAAGTANTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGACTTCCCCCGCTTGAAGGCGTGGGCAAACTCATTTTGGTATACTTG:1 - chr2R 5720453 3' + pogo 2076 1 53.06 AGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAATCTTCTTAAGCAACCGAACAGG:1 - chr2R 17392771 3' - opus 472 2 78.22 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATAGGAGTGTGTATATAGCGAAAAGTGCGGGCGAAGGCAATGGCCATTCGCTGGATTCGAAGGG:1 + chr2L 14035618 3' + flea 246 2 67.33 GTGAAAAAATAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCGGCACTTGGCCGCGAAGAGAGGTGTCTTCTTGGCGGGTCCTGGTAATGGATTCGG:1 + chrX 11375797 3' + 1360 436 1 67.42 GTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTCTCTTTGGCACTTTATTTTTTACTATGTGATAAACACACATTAAATCATCTTCATTTGTTTTAATTTATC:1 + chr3R 4051580 3' - invader2 310 1 66.34 AGTTGGTTATGGGCCTTCAGTAAGCTAAGTTTTTAGTATTTAGCAATGACCGAACTTCTTAATGCATTTCATTTTCGTTCCTTGCTTGTTGAAATAGACGT:1 - chr3L 3233275 3' + Copia1_DM 203 1 72.28 GCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTGAAGGGAATCCTTTGGAGTAACCCTATATACCCCTTTGAGCAACAGATGGCCCTGGAGAA:1 - chr3R 20998548 3' - G2 2882 1 61.39 GCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCA:2 + chr3L 24916692 3' - Porto1 147 1 55.45 TTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAAACTATTCGGCCAAATTTTAAA:1 - chr2L 16139105 3' + copia 231 1 55.00 GGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCGTATTCTGAGCGGAGTTGCTTAGACCGCCACTGGAGCTCGTGTGTTGGGTGCGGTTTTCGTCTGGG:1 - chr3L 2592548 3' - Stalker 127 4 70.71 TATCCAATGCCATTAAATATGAATGGAAGCCATTGCTGGAAAGACCGTTCTCGTCGGTGACCAAGCTGGGCGTGGAGTCCAGTGTCTGGACATCTGTGCAG:1 - chrX 22881375 3' + HB 466 1 79.21 CCCTCTTCCTTTACTCTTAGTGGGTAAATTCTGGGAATGATTCCACCAATAACACAAACACTCATCAGCCTTAGTCATCGCTTAGGAATTTTTAAGATTTT:1 - chr3R 21868763 3' + mdg3 5274 2 80.20 CGAGGCTTTAGACTGAGAGNCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGTGGAAAATTTTCAAGCTTTTCCGCAGTGATTTATGAGTTG:1 + chr3L 5415401 3' - I-element 34 1 55.45 TGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATTACCCCTTTCTCTCAGTGTACGGCTAAAATTTCCAGGCTTG:1 - chr3R 22869358 3' + Bari1 1695 1 65.35 TCACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCCTTGCGAGGCTGTCTTATTTATATGTATACATCCTTTTACATT:1 + chrX 3365418 3' + McClintock 6131 2 58.42 GCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGGCGGTGGGTGGTGTTCGGTGTGTGGTGGTCGTTGAGAGGCCAATGTGTACGTCATCGAGAG:1 - chr3L 632218 3' + R1A1-element 4970 1 67.33 TTTTAATTCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTATTTTTTAAAGTGTAGAAGTGCTACTCACCCGCAGGGCTTGCAGTGCGTCATGT:1 + chrX 12564305 3' - R1A1-element 103 1 55.45 ATGAGCCACCGCGAATTGCGCGCTCAGTGGCAAAAAGTCCAAGACGAGCGCCGACTCTCTTCTTGCGGTGTTTTTTTTTCTTGTAATGGTATTAGATAGAT:1 - chr2L 15406733 3' + Doc3-element 221 1 61.39 AAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTAACTCGTTAATTCGCGCGCTCTGATTAGAGAGCAAAAA:1 - chr2R 13383530 3' + gypsy5 375 2 71.95 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGACTTCCCCCGCTTGAAGGCGTGGGCAAACTCATTTTGGTATACTTGTAGAAA:1 - chr2R 5720447 3' + pogo 2079 1 57.43 TACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTTCGTGGCTGTCGAATGGTTTTGCGGCCCAGTGGAGTGGATTCTT:1 + chr2R 19560230 3' + Tirant 370 2 54.46 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGAGATACGGGGACTGAAACGCCGTTG:2 + chr2R 9649222 3' - roo 8715 2 77.23 GAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAGAT:1 - chr2R 1982169 3' - hobo 405 1 79.21 ACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCGATTTGGTGGGCATTGCCCAGACCGGTTCAGGCAAGACGCTGGCATACATGCTGCCTGCCATCGTGCACATTGGC:1 - chrX 7929403 3' + R1A1-element 5169 1 80.20 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGATGTACCTCAAGCACGTCGGTCGATCAATATTT:1 - chr3R 7626395 3' + hobo 2905 1 62.22 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCAGTTCACTTCCGCTGGCCACTTTAATTACGGGCAAGAGGCGAAGCCT:1 + chr2R 6107799 3' - roo 29 2 55.45 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTACTGGTCCGTCCGCCTGTCTGCTTTATGCGAGTTTGTTGTTAAACCATCACAAAAT:1 - chr2L 19681407 3' + hopper 1392 1 56.44 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGACATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACA:1 - chr3R 11151800 3' + mdg3 236 2 67.33 TTCAGTTTGAATTTGCATTTTCCAGCACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAGATTATGG:1 - chrX 22398527 3' + Gypsy6A_LTR 163 1 66.34 TATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGGTGAATATTTTTGACAAATTACTTAAAT:1 + chr2R 11030559 3' - F-element 72 1 82.18 TCAAAATACTTATGCCGACTAGTGTACATCACATTATATTGAGTTTTGAGTAAAGCACTAATAAGTGGTAAGTGGTAATATAGCGCCAAGAGGATTTTTTT:1 - chrX 21398169 3' + Tc1-2 1621 2 70.30 AAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGC:1 - chr3R 31887758 3' + HB 1558 1 69.31 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATGGCCAAAG:1 + chr3R 12767344 3' + blood 347 2 57.58 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGT:1 + chr2L 18213230 3' - hopper 24 1 55.00 CCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACGTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTATCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCATTACGTAGCCAGTCTAGGCAATCG:1 + chr2R 15950767 3' - R1A1-element 5123 1 71.72 ACCTTATCTCTGAAATCTTCACAGTTCCCCCATCTAAGTCATTTGACTTAATATGATGTAACATTAACATTAAAAGTGTTTCAAAAAAAATATTTCGCTTT:1 + chr2L 2436616 3' + Q-element 13 2 66.34 GAAAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACCAACTGAGCGGTAAAATAAATAAGCT:1 - chr3L 163233 3' + mdg1 7410 2 70.30 TTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTTAAACTTTTAAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTTATCTTTATCGCGTTC:1 - chr3R 13941068 3' - TAHRE 34 1 55.45 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTACCTGCTTTTCCTGCTTTGA:1 - chr3L 6023281 3' + hopper 1382 1 55.45 AGATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTT:1 + chrX 22386753 3' - hobo 94 1 71.29 GTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTG:1 + chrX 21668083 3' - Tabor 24 2 55.45 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCTTTATCGCCTCCTC:1 + chr2R 22856605 3' + 1360 3387 2 72.29 TATTACACTGAGCTATTACNTATTACATATTACACAGCCACGAAGTGGGCTTAAGACCCACACTCACAGGACCAGCTCTGCGGCTGATTGAAGGAGTCTAA:1 - chr2L 15531773 3' + Stalker2 391 2 66.34 TTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTTTTAGCCCATTAGCAGCAGTTAAAGAACTTTATTTCTAGTGTATTCTGG:1 - chr3R 17971624 3' + 412 7538 2 70.30 CTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGATCTATTGGTCAGACACGAGATGATGCAGCATATAACTATTCCATCTTGAATAGAAGGATGTTTGTTTCCAAAACAGG:1 - chr3L 4009387 3' + mdg3 250 1 74.26 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATGGCCATCCTGCTATTTAGCCATGTTTTGTTTGGTTTTGTGCTTTGGCTGC:1 + chr2L 13566548 3' + hobo 2913 1 56.44 CGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAACTCCTAGAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTAAGAGCAATCAGCTGGGAAACTTGGCCGGCAAA:1 - chr3R 30690756 3' + I-element 375 1 75.25 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGTCACACTGGGCAGGCTTGCCAATTTCAAGAGCCGCGGCCACACTACTGCGAAT:2 - chr2R 9693297 3' + P-element 2866 1 58.42 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTCAAGAAGGATTTCGAAAAAACGAAAACATAAAGTAAA:1 - chr2R 10956908 3' - copia 4909 2 63.37 GTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGGCGTGATGATCTTGCGCCGGCGGTGCCACTTGCGTCCG:1 + chrX 2161753 3' + invader4 2696 1 62.38 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTACTTATTATAGTATAATATC:1 + chr3L 20411878 3' + roo 396 1 65.35 TATGTCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCAGAGCCATGTGTGCATTGCCATCCTGGGCGGAGTGGAGGGACATCGCGATGAGGTGC:1 - chr2L 11828080 3' - Porto1 4373 1 57.43 ACAGACACACACACATACACAAATACACAGATATACTAGCGAATTTCACATTGCGAATTCTCTGTTCAATTGCGGCAAAAGTTAAAGCGGATATCCTTTGG:1 - chr3R 28939853 3' + Quasimodo 39 2 42.57 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCCCACCGAACGAGTGGGTTTCATTGTCCAACATTCACACGACCAGCAAATCCATCCA:1 - chr2R 21040841 3' + P-element 2867 1 51.49 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAATGTTCACTTCATGCCCACTTTTCGATAATTTACCATCAATATGAGTCTCATTATGGT:1 + chr2L 20620085 3' - roo 16 2 64.36 CTGCTCTTGCGTGTTCTCAGAGCCTTTTTGCTCTTATTCGGGTCCTTGTCGCGTATATAGTACTACACTTCTTATTTATACAAGCCTGCGAATTAACTCTT:1 + chr2R 16341076 3' - G6 380 1 76.24 ATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTG:1 - chr2L 18213178 3' + hopper2 1552 1 78.22 GTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGAATAAGTTTGTAAGAGTTCAAGTTACACAGAGAGTTCGTTTCTGTATCACGGGTAGATTCAAAAGTCCCCTAAGCGGTA:1 - chr3L 4286614 3' - I-element 5183 1 80.20 CTCTGTATGTACCCAACAGATACCAGATAACAACAAGGGAGCTGTAGCACTGAGAGTTAATTAGGAACAAGATCGCTAGGTCGAGACGTTCGGGGCACGAA:1 - chrX 21400564 3' + Idefix 89 2 66.34 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGTCGTGGGCACTACCTCCTTTGGGCATTAAATTTGTATAGCATATTT:1 + chr3R 22238738 3' + hobo 2910 1 56.25 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATAAAACTTAACGATTTTTTTTGTACTGATCAAGCTGTATCTAAGT:1 - chr3R 25581013 3' - pogo 30 1 62.38 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACACTTTAAAACCTAATAGATATGAGTATATCAACATC:2 - chr2L 4063674 3' + roo 392 2 61.39 ATATATTCTTGATCATGATCAATAGGCCAGTTGATGTGGCCAAGCAATTCTATTTGGATTTTCAGCGCCTCCAGAGTTTTGTGGGCATTGGACTTCAGATG:1 - chr3R 11239945 3' + INE-1 82 1 64.36 ATAATGGAAGTGGCTGGTTNGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAATATTCCAGGCTAATCGCAAGACAAAAGCCACAGCTTTTCACACCTTTAAT:1 - chr3R 23640964 3' - 297 20 2 58.42 AAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCTATATGTTT:1 + chr3L 20224207 3' - Chimpo 45 1 72.28 AGGCATGTGTAACGCATAAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGTGCGCCAGATCCTTAATCCCGCACGTTGGCCGT:1 + chr3L 13295275 3' - hopper 78 1 47.52 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCCCCAACCCCCACAGACTTTCCATCTCAGGTTGCCTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTCCACTCTG:2 + chr2L 12511624 3' + copia 241 1 66.34 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGGTTTAGAATACGAATATTATTAACTATTCGATATCTAACATGCATATTTGACTCAAAT:1 + chr2R 21351395 3' - mdg1 7057 2 60.40 CTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGGTCATACATTTGTAACAAACATAAGTTAAT:1 - chr2R 3492380 3' + 1360 92 1 77.23 TGTAAATAATAATAACAACGTAAGAAGACTTAAAAGATTTCACGTGCTCTATCTCCCTGACAGGTATTGCGGTTACAAACTTTTTCGAATTGTATTCTCGT:1 + chr2L 8621222 3' + G4 3659 1 74.26 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCACTTTACCAACAACGAGTTTATAATTGTTTGATTTGTGTGCGCGCATAG:1 - chr3L 12468205 3' - jockey 4699 1 52.00 ATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCGTGATGACTAGTTAGATGGCTCAAACTGCGGCCAATATGAAAACAATAAACAAAGACAAA:1 + chr3R 10734947 3' - McClintock 306 2 60.40 ACAGCTGATCAAACATATGNTTTTGATATCGCATAAAAAATGCAGTGTTGCAACTTAAGATGTATTTGCTTTTAATAAAGACTTGATGACTACTTGATCGG:1 + chr2R 5468381 3' - transib3 162 1 62.38 CGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTTATACTACACATATTACTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTATTGTCCTTGTTGC:1 - chrX 9342313 3' - Burdock 15 2 43.88 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGCGTGTGTTTGGTCTTCATCTTAGC:1 - chrX 14651102 3' + P-element 2835 1 27.72 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAACAATTGAAATGTCATGCAATAAATCTACCCCACACATACGCACCATGGGATGCAAACACGCACAC:2 - chrX 22593127 3' + 1360 3380 2 68.32 TCGCTATCGTTTTTTTTTTAATAATTTCGT:1 + chr3L 10033008 3' + Circe 72 1 93.33 TCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGAAAAAATCGATGTACAACTTATGCAAAT:1 + chr3R 7869211 3' + 297 6966 2 70.30 TCATATTGCTGGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATGCGTGTTCGACGTTCTAGCTATTAGTTCAACAAATTATACACACTGATTC:1 - chr2L 108221 3' + 1360 3115 1 53.47 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCCTTTTTAAACCAAATTACTTTTAAAAGTGTTTGAATCGAGTTAAA:1 + chr3L 8036439 3' + roo 9041 1 60.40 GCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTTATCATACACATATATTTTATAAGAC:1 - chr4 74280 3' - 3S18 52 2 72.28 GTGTGGGACAATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCTTGGTCAGGATCAATAACCGAGTCGATCTGACCACTGTCCCTGTCCCTGCCGCTTCTCCGC:1 + chrX 17353014 3' - HMS-Beagle2 10 2 76.24 ATGATTTAAGATAAGGGGTATGTAGTTTCTAATTAATCGGACTGGAACAGAGAAGTTTAGCCGACTTAACATCAGTCTCCCATAAATTACCGAAGTGTGTG:1 - chr2R 4816380 3' - Cr1a 4135 1 65.35 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTGTGTCCGAATAGTGTGGAGCGGTGCCCGATGGCCGAAGGGTAATAAAAATAATAATTACAACATAAAT:1 - chr3R 6033922 3' - roo 8669 2 74.00 CTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTTATACTACACATATTACTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTATTGTCCTTGTTG:1 - chrX 9342314 3' - Burdock 19 2 46.53 ATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCAACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACATACAGGGTGTCCACTGTGAACGAAGGCTTT:1 - chr2R 17803989 3' + F-element 358 1 69.31 GCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATCTGTCTCGCCTCTAATAAGTTTAAACAAGAATCCGCATAATGA:1 + chr3R 20959351 3' - Stalker2 382 2 57.43 CAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTTACAAAGACATCTCCAATTTACATATCAAAACTTCAAACTATTTACACTTTCCATTGATTTATGCCGACCGCG:1 + chr3L 9290743 3' - invader4 2613 1 80.20 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGAGCGACTATAGCACCATGCGAAGCTTCCGATTTCATCATCCTT:1 - chr2R 18171512 3' + P-element 2856 1 47.52 AAATTTCAGAAGCAAAGTCAAAAAATTTCAATAGAAGCATTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAAACCGAAACCAAAACGCAACAAAGTATACGAAACAA:1 - chr3R 16734001 3' - S-element 339 1 64.36 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTGTAAAAAAGGCAAGCAAATGGGACATTTGTGTAGCCTACTCTTAGGC:1 - chr3R 27056383 3' + jockey 4960 1 59.60 GAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGCCAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGAGAAATAAAATATCCATAACAT:1 - chr2L 15197776 3' - GATE 66 2 76.24 CGCAAGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATGCATACAGAACAACCATAACCACAAGAATTTCGGCCAATTTTCGGTGGATTTT:1 + chrX 6481097 3' + jockey 4966 1 54.46 CCACTATCAGATACCCGTTAGTGTGAACGCGAAATGTTATTATTTTCCTGCTAGGCGAGACAGCAGTGGACAACATAAGTCCACGAGGGCGAAACGCTTCA:1 + chr2L 23012648 3' - INE-1 550 1 59.41 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAAACTACTCATAC:1 - chrX 21217497 3' + pogo 2077 1 54.55 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATGTTAATTGGGTTAGTTATTGAAATGAAAAGCCCTAAACGGATTTGTTC:1 - chr2L 21086022 3' + roo 9045 1 57.43 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCCCCAACCCCCACAGACTTTCCATCTC:1 + chr2L 12511588 3' + copia 205 2 74.26 TGAGACGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGAGGTTTGGGCACCGCATTAATGGTTTGAATGCCATGTGCGTCGATTTGATGAATCACCTATTTTTCCTCT:1 - chr2R 23566187 3' - HMS-Beagle 6718 1 74.26 AAAAATATATATATTTAATAATTGATATGGTATCACACAGTTTACTCCTTTCGCTATTAGCCACCGTGCTTCTGAGCCTTAATCATCAGCGGCACCATTCG:1 + chr3L 19671526 3' - Tc1 61 1 59.41 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCGTGGGCACTACCTCCTTTGGGCATTAAATTTGTATAG:1 + chr3R 22238731 3' + hobo 2898 1 67.33 GAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAAACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTT:1 + chr3L 11826437 3' + INE-1 141 1 64.36 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCA:1 + chr3L 8039404 3' + hopper 1376 1 64.36 GAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCAAAACTAACACGCCCACGATTTTAAAAAATGTTTAGATTTTTTTTGCGCTTAACTTTGTGGCTCCATCTGTTGG:1 + chrX 20996626 3' + INE-1 109 1 69.70 CACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGAAAAGCGCCCTCTGGCGCTACTTAGCAAGACTATAGATTA:1 + chr3L 10886149 3' - invader4 138 2 57.89 CGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATAAATATTAATTACTATTTTCCAACATTAATTACCTCTTGTTGAA:1 + chrX 14173059 3' + 412 460 2 56.44 CCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACATGCGAATCAATCTGCTGATGGGC:1 - chr3R 10110395 3' - Doc 6 1 71.29 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTTC:1 - chr3L 19349923 3' - 1360 8 2 67.33 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGC:1 + chr3L 25345153 3' - Doc 44 1 61.39 CTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATCCCAGAGACCAAGACGCAGAGCACCCAGCCTGCCACGCCCACTCATTGTTTTAGGCCCAGCAAAATGGCATAA:1 - chr3L 5208251 3' + INE-1 170 1 64.36 CTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGAACTTGCTGCAGACGCTCAAGGCGGTTCGGGCAGAAGGTCGACGTCCCTCCGGTTTCGAGGACTGTTCG:1 + chrX 1015788 3' + Tc1 146 1 62.38 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATTCTATACTTCGACTGTGCTAGCTATTTGTGCTAAAATACTCG:1 + chrX 3370178 3' + S-element 1685 2 60.40 GAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTCCATATTTTTACACGTATATTTACATATAATAAACAACATTTTGTTTAGCTATCATTATACGTACATTGTATAGAATAA:1 - chr2R 5780149 3' - INE-1 34 1 53.47 AGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTTTCTCGGGATGATGTTTGGGTGCCAATGCCGGCGGCGTTGCAACTTTGCGCCGGACTTCATAAT:1 + chr3R 6989882 3' - I-element 5089 1 69.31 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATTTTCGAATGACCCATTGTGAAGCTCTCA:1 + chr2L 5927023 3' - pogo 10 1 60.40 TTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTTCTAAACTACAATCACTATTTTAGTACATGTTTCACTCACTCACACACGAACAACTA:1 - chr3L 16067176 3' - I-element 122 1 64.36 TCCTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATACCCATAACGGCCGGCGGAAAGTTAAAGGCGCCAAACGGAGCAGG:1 - chrX 10851599 3' + R1A1-element 5150 1 52.53 TCTTCTTTAATTATCATATATCTGAAACATAATTATTTAAGATCCCGTTGATGGTTCGGAAGGCGTTGTTGAGCCTTCCCCGTCTCTTGGTGTAGTCGTCG:1 - chr3L 5482408 3' + Cr1a 84 1 62.38 CTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTCCCGAACATTGCAGCCCTGGGTGCAAGCGCTTGATCTGGCAAC:1 + chr3R 21365583 3' - P-element 14 1 67.33 TCTCGCAAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCTGGAGGTGTGGCCGTGGGAGCTGCCTGGAATGCTGGACGCCATTCTGCA:1 - chr3R 22030517 3' + Cr1a 4384 1 70.30 ATCGAACCGGGAAGCTTTGCAATACAAAGTTGCAACATAAACATCAACGACGAGTCAGCCGCCGACATCCGCCCAAAGGAAAGTCCAAGACTCGTCGGGC:1 + chrX 3556470 3' + ZAM 8032 2 75.00 AAAGGGGAAAAGGCAAAAAGGTTCGACTAAACGATTCAGGGATTCAAGCACAGAAATCAAGAGCAGCAAGTTTTCAATGAACCTTTCAGTGTGGGATTTCT:1 + chrX 6851254 3' + Rt1b 181 1 67.33 GTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGTTCATAGTCATAAAAC:1 + chr3R 25370540 3' + BS 5058 1 59.41 GCTGTCTCCTGTGGAGCCTTCTTGGTGGGCGAGCTTTGGACAGTGCCTGTCGTGGTACCGGCTGGAGGGTATTTATATACGATTTCTATCATTTTTTGCAC:1 - chrX 19907055 3' - BS3 1553 1 69.31 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCGCTTGAAATATAATTGGACATATTTAAAGCAGTATACCTTAACTTTGGATATAGGTAGCTTAAGGAGGTTAACTTTA:1 + chr3L 20755437 3' - I-element 1 1 78.22 TTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAAACACTTCGAAACACTCACACACCTTATTTATGTATTTTGATTTG:1 + chr3R 13982967 3' - I-element 5345 1 55.45 TTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAGAAATCGAAGAGCTTCATTCGTATATCTTAT:1 + chr3R 8582645 3' + roo 410 1 80.20 TAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGGCC:2 + chr3L 5241162 3' - Ivk 45 1 72.28 TAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGC:1 - chrX 21087606 3' - mdg3 37 2 72.28 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATA:3 - chrX 13126223 3' + mdg1 373 2 71.29 CCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCTATATATTTCTTGTTTCTTATGCTTTTTCATATATTTC:1 - chr2R 13964388 3' - Doc 4565 1 67.33 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGCAATGCAGCCGCTAAATGTGTGCAATTCACCACTTG:1 + chr3L 10363878 3' - P-element 37 1 43.56 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCC:1 - chr2L 17730447 3' - pogo 40 1 68.32 TTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTGTTTATATTAAACAGCTGTTTCCTATCTGCATACGAGATTGGCTTCAAT:1 - chr3L 11789136 3' - hopper 1021 1 59.41 TGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCAGAAGTTGGCAGTCATCATTAAGAGGCACTTAGGCAGTTGGCCAATGAATAGGAGTTGCAGTTGGGTGGA:1 + chr3R 14492928 3' + R1A1-element 380 1 75.25 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAAGTATCATCTTAAAGAGATTTGCAGCTTAGCGGCCGCATGAT:1 + chr3R 12876405 3' + hopper 1412 2 76.24 TCAGGACCAATAGCCGAGTCGTTCTAGTCCTGTCCGTCCGTCTGTCGTTCGCATGGACGTCTAAATCTCAGGAATTATAAAAGGTTGAGATTAGCATACAG:1 + chrX 18414994 3' + INE-1 94 1 46.53 TGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTTTTTGAATTGAATTGTATACCTGATACTAATTAATTGAATACATTTTCCTGA:1 + chrX 21583418 3' - F-element 35 1 54.46 ATACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGTATGAATGTACGTACGTATTTTGTAGCACAAACTTGTGTTGACTTATGCAATAAAA:1 - chr3L 10572718 3' + Quasimodo 33 2 75.25 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATT:1 - chrX 21217519 3' + pogo 2071 1 67.47 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAGAAAGATGTCCTGTCATTATGCGAATTATGAG:1 - chr3R 12329597 3' - hopper 27 1 52.00 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCTCTAGAAATGCTTCTTGTTAAATGGTTTTTCTTTAACTTGGATCAAATAATTTGTAGTAACTTTGTAC:1 + chr3L 9831793 3' + roo 9027 1 46.53 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGTCAACTGAGTGACATTCTTCATTT:2 - chr2L 16153378 3' - Doc 58 1 77.23 AAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCCAAAATTGGAACTTGTGCGCACCTTGTAGAAACAATGTAGATAATATTTATTGGCGGACTTTTTAAAATGG:2 + chr3R 8980084 3' - transib2 2 1 75.25 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAAAGCGAACCGTTGATCAC:1 - chr3L 6834949 3' - hopper 20 1 56.04 TGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAATATGAAGCATATTGTTTCAGGCCAGTTCAGTCCAGCG:1 - chr2R 9324701 3' - Doc 314 1 63.37 GCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAG:3 + chr3R 1977620 3' + micropia 424 2 54.46 ACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATCTACAGCCCGTTTCACATTGTTTGGCTCGGCAGACGCTTAATTGGGAATTTTCCTTAGCAAATGCTTTGACT:1 - chrX 11032158 3' + invader3 272 2 65.35 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGG:1 + chr3L 8039399 3' + hopper2 1564 1 68.32 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTAGATATATGCACATACTACAGAACAAAGAGCGGGAGAAAGCTCTTGAAGAGCAGTGAAAATA:1 - chr3R 14580302 3' - blood 38 2 61.39 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCGCGCTTAGATGGCGACAGTATGCTTATTGGACACGCGCAAACGTAAATGCCAATTGGAAGCCTCGAATT:1 + chrX 7162774 3' - jockey 4756 1 63.37 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAAGTTTTATGGAGTT:1 - chr3R 12063743 3' + 412 458 2 64.36 AGGCTTTAGACTGAGAGGCNCGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTTGTATTGTGT:1 + chrX 4399587 3' - I-element 32 1 61.39 ATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGCCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 9 1 61.39 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCGGCAGCAGCACTTAAGTCTAATTAAAATGCTGCCCCCTAATTAATTAAACAAATTTTTGGGGCAAAAG:1 - chr3L 1998787 3' + hopper 1409 2 73.27 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGCATCGAGCGCTTTTCCAGCATT:1 + chr3R 6034025 3' + roo 9048 2 58.42 GTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTGTAGGGGTTCATGAAATTCGCATGCGATGAAGACGTCGGCTGTCAAAAGTTACTACTAACTAA:1 - chr3R 17436621 3' - Rt1a 5087 7 68.89 TAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATCATTATCCATGT:1 + chr2R 12457992 3' + HMS-Beagle 214 2 61.39 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTTGC:1 + chr3R 23338328 3' + roo 9031 1 63.37 TATGGATAATTAGGAATGTATGACTAAGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTCTTTATATTTCAGTTTGTT:1 - chr2R 17644891 3' - mdg3 43 2 72.73 GTATAGATCGATACATACAAATAAAGCGAAAACTAATCCGGAAAATTCTTCAATGGGTAATAAATCAAAAATAAATTGTGACTTTAAGGGCGACCCCATCA:1 - chrX 2508371 3' + Fw2 18 1 69.31 AAAAAAAACAAGAGAAAAAAATCCTAGAAAAGCATTTGCAATTTTATTGGACTGCAAACAAACTGAAAAGTAAACAAAGTGCCGCCAAATGTTAAATAGAA:1 - chrX 8506321 3' + Porto1 174 1 43.56 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAAGAACGTATTTATAAAAATAGTTGTTACATTAAAATAG:1 + chr3R 6947380 3' - I-element 40 1 60.00 AATAATGGAAGTGGCTGGTNTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTCCTTCGACTACTTGTGGCTCTTCG:1 - chr2L 8622751 3' - 297 21 2 59.00 AGTCTTTGTTAGCTATAAGAATCATTTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTACTCTGTATTTCGAATCGCCCTCATCCTTAAGCTGTTTCCACAAAACCA:1 - chrX 13702931 3' + Gypsy6A_LTR 131 1 52.48 GGAAGTGACTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATTTGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTTTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTTTATG:1 - chr3R 7869101 3' - 297 15 2 59.41 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCCTACCCAGCCTTTGGAGCCCTTCTATAGC:1 - chr3L 3880997 3' + blood 7347 2 69.07 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATTATTAGGTATTCGATACTTAATTGCAAAATTCTT:1 - 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Q-element 179 2 72.28 GTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAAAGTTTACAGTGCAGAGAGTACGACAGTCCTGCGCACAAGTATACGTAACAAATGGCCATGCA:1 - chr2R 12252845 3' - jockey 4773 1 44.55 ATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACGTATCAATGCAGTATATGCCAGAATTCAACATTTAATTTGCCCGACTTATTACACAATATATTGCAACATTT:1 - chr3R 5907200 3' + 1360 332 1 71.29 GCTATGTTATACCCAATAATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATAGAAGATAGCATAAATATTTTAGCATATTCCAGCAAATACATTACAGTCG:1 - chr3R 24826736 3' - Stalker4 38 4 55.45 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGTTCACACATCAAATTAGTTCAATTTG:2 - chrX 2841758 3' + hopper 1397 1 61.39 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAACACAAATGGAACCATCCAAAAATTACTTTTAATTACACAAAGGCATAAAGGTTACAAAGGCAATTG:1 + chr2R 8682437 3' + pogo 2097 1 75.25 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGA:1 - chr2L 19854095 3' + roo 9017 2 78.22 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGTGGTT:1 - chr2L 23189413 3' - 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jockey 24 1 61.39 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTGATCGATTAGGAACTAGGTTAAGAGAAATTTGAACAAATCGAATA:1 - chrX 19334562 3' - roo 8673 2 71.29 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATCTCGGACTTCAGGATAGCCACGGGTT:2 + chr2R 11259612 3' - hobo 51 1 72.28 ATTATTTTATTTGTTTATTTATTTTTGTTTACCGAATGGAGTGTCGGATCGGGTCTTCAAAAACTGGCGAACCCCAGGCAACTGGAGCGGGTGAGGGAAAT:1 + chr3R 11443478 3' - HeT-A 312 1 62.38 TTGAAGTTTGCTTTTGGAATGCAGAAATTACAATGCGTGCAATTTCGTAAATATATTTAGACGGTTTTTTTTAGCTTTGGCTTTCTTATTATTCGGTTTCG:1 + chr3L 9507967 3' - Transib5 206 1 76.24 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCTTCATCTCT:2 - chr3R 27495649 3' + 412 7512 2 55.45 TACTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTTTCATCATAAAATCATGCACAATGGCAATGA:1 + chr2L 8622825 3' + 297 6939 2 64.65 GTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACACATGCCCCTGTCCTAGGCTTTCTCTTTAACCCA:1 - chr2L 15567109 3' - 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mdg3 5293 2 75.25 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAATGGTAATTAGAACTAATTATTTAACT:1 + chr3L 21519029 3' + 1360 3341 1 76.24 TGAAGGAGCTAGAATACAAAAATCGGAGGAAGCCATTAAATGGGAAAGTTGCGGACTCGGCAGACTCTTGTCACCGTATTTACATAATTAATTGAGTTTAT:1 + chr2L 4747221 3' - gypsy12 10033 2 71.29 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAAATTGATATTAGTTATTACTACTAACCACCTTTCTTAGTTTCATAGGGTATTTCGTTGTGGTTT:1 - chr2L 3346233 3' - pogo 7 1 61.39 AACAAAAAATACGAAAAAAAAAGAACGACTTACAGACTGTCAGAGCCATCAACATGTGTGGCTCATTAAATATGCTGCGAACACACAGCAAGTACATGAAA:1 - chr2L 12120468 3' + gypsy7 5004 1 76.24 CAAGGCATTCTATGATTATGTGTATGGCACATATGCTACTATATGTATATAATTAAATGCTTTTAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTTCA:1 + chr3R 8963755 3' - Quasimodo 80 2 69.31 TACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGTTTGGAAACATAAAAGGCAGTCCTTTATAAACCTACTCCTTTCATTATGCAAATGAATAGACAAAATGTGA:1 - chr3L 7447888 3' - Stalker 7088 6 76.24 GTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTGCGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGGGTTGAGGGAAAACATTGCCGGAAGTCACTTTA:1 + chr3R 9116627 3' - I-element 4886 1 48.51 AAACGGTAGATAAGAAAGANGATGACCAGGGTTATTGAGGCTGTGGAGGATCTTTTTGTTTTGGTTGGGGAATGTCTTGAATTGATAGGGGCTAAAATGAG:1 - chr2L 7180345 3' - gypsy10 5561 1 59.41 CTACAGACATTAATGAATAAGATCAATAATTGAGCGTGCAAGAGAATATAGAATATAGCTAAAGCTAAATACCGCCGATGCGGAGGCGGTGGTAGTGGTTC:1 - chr3R 6870493 3' - Gypsy12A_LTR 2132 1 59.41 CTTCCTCCGAATTTGTATACCAGCTATATTCTATATTCTCTTGCCCCGTCATTCCTGATATTAGATAATCGCTGATCGGATCACAACATTGTTTGGCCACA:1 - chr3L 6725982 3' + Gypsy12A_LTR 2070 1 62.38 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGGTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTTTATGCT:1 - chr3R 7869099 3' - 297 11 2 66.67 AAGGAAATATAAATTATAANTTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAAGAACAACAATTAACTTTCTTCAACAGCTGCGTCGCATTCTTAATG:1 - chr2L 17244978 3' + copia 249 1 69.70 GGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCCATTTGG:2 - chrX 4264359 3' + mdg3 5450 2 70.30 GATCAGGATCAATAGCCAAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCGTCTGTCCGTATGAATGTCGAGTCCCGAGTACAGAGTCCCGATCCCGTCCCATAATATG:1 + chrX 3039354 3' + INE-1 92 1 63.00 TACAATTTCCAATAGATTACGATGCTGCATTTCTAAAATTGTGGACAGGCGATCATCAGTGATGGCTTGGGGCAGCGGGATAGGTGGTTAGTTAATAAGCA:1 - 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chr3L 17140586 3' - F-element 10 1 42.70 ATGTGTGTGTGTGTGTGTACAGTTAAACTTCTCGAAGTTCAACTGTACACACACACACATATCAAAACATGTGCCACCAACTTCCCCGCAACATTTCC:1 - chr2R 20227827 3' - accord 7027 2 45.92 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGACACATGTGCATTATTGTTGCCTATCTGGCGGACGTTCTCT:1 - chr3R 28565265 3' - 412 7088 2 60.40 AAGTTGAATAATATATATAAAAACTAATGCAAAATCTACTATTTTCCTGAAAAATAAAATTGCTTAATAAATTTACAGTTTTAGTCAGTAAGAACTCTAC:1 + chr3L 9920734 3' - copia 4665 1 58.00 GCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGGCCGATCGTTGCATTGTTAAGCGTTGTCGCTTTATTTGTTTTCATCTT:1 - chrX 17168539 3' + hobo 2696 1 63.37 TCTAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTATGGGGAATTAAGGCGATTCTGGTGGCAGTGGGAGGGAGAAAGCGGACGGAGGAACTGTGGAGATCCCCAT:1 - chr3R 19283107 3' + roo 8737 2 54.46 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTTCATTAGCATAAGTAGATGCG:1 - chr2R 9905346 3' + mdg3 5471 2 53.47 TAAATATATTCGTGTTCATNTGTGAACAGCGACACTTATTCGCACTTATTATTGCTCTATGCGTTTTGCCTTTCAGTTTTATTATCTTTCGCGCGAACACA:1 + chr3R 10087916 3' - roo 7 2 72.28 TAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTAAAAATGTTGTTTTGACCGATCCCGTGGAATGT:1 - chr3L 25607859 3' - F-element 153 1 68.32 GACATGCCTTGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCACGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGTAGCTATAATCCCAGACCACAGCGGGACTGCC:1 - chr3R 24562856 3' + invader1 3943 2 63.64 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTGCTTTGAAAGCGATGTTCTTCGGTTA:1 + chrX 16671110 3' + P-element 2839 1 31.68 TAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGTTGTCAATTCGTTCCAGTCGCTTATCCACCTTGTGCATTA:1 + chr3R 21884238 3' + mdg3 5464 2 60.20 GTGTAATATGTGTAATAATCGGTACCCAGGGAACACCACGGGGAGGCCATTACAATTGTAATGGGGAGTGTAGGTGTGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGC:1 - chr3R 443017 3' - 1360 2925 1 65.35 GGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCG:1 - chr2L 13093793 3' + roo 9019 2 78.22 TTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAATAACCTAGCTTAAAGTGTGCCTAATTTGAAAAGTCTACAGTTTT:2 - chr2L 3699373 3' + mdg3 248 1 78.22 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTACAAAATGGTTTAATTGTC:1 + chrX 734973 3' - Tabor 6876 2 59.41 TTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCTGTCTGCCAATCCCCCAGATTGCCCAACTCCCTTCCAGAATATATAGTACGGCTGCATTGTGTTCC:1 + chr3L 18413137 3' + hobo 2644 1 71.29 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATATAGATCCTTGTTTCCTGGGGATATTCTCCTTAATATTTTGATATCTTTTATTAGC:1 + chr3L 4009504 3' - mdg3 5272 2 59.41 TATTTAATATAGTTATTTTACATTTTATTCATTTCCTGTACGCTCTCTTTTCCCCTAGTTTTCATTCTCCTTCTTATCTCGACTGGGCTTCTGGTCTGGCG:1 + chr3R 1853683 3' + Cr1a 4311 1 68.32 AAGAAAAGTAAAAAAAAAATAAAAACAGAAAGGGGATT:1 + chrX 13956647 3' + invader2 4752 1 86.84 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTGTATGGGCCAACTAACGCTACCTTTACCGACTGCGGTCAGTGGGTTGG:1 - chr3L 13785361 3' - pogo 23 1 54.46 CTTTTCTTCGCATCTCCTCCACCCACTTGCATCACTATTGATTTAATCATTCAAACCAGAAGAAAAGGCCTCACTGACCTGAAATCGAACACCCTGTAGCT:1 - chrX 18229705 3' - Osvaldo 334 2 68.32 GCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCTTTAACCCTCGCTAAAATCCTAATCTAATCTCATTTGCCAGCAGCAGAC:1 + chr3L 15787152 3' - opus 7337 2 53.47 GCAAGCCCTGCACCATCAAGCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCAAGTGCCAATACAAGTGCCAATCCTGAGCGGA:1 + chrX 7309468 3' + G2 23 1 74.00 TATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCTATATCACCTCACGTCTGTTTCTGTACT:1 - chr3L 7375203 3' - 412 7276 2 72.28 TTATCATGTCTAAACACATACAGTCTTTGTGTGTGTAAACTCTCTTTGCGTGCGTGTGCGTGTGTGCGAGAGAGAATCCTGACTCTTGCTATCCTCACCAC:1 - chrX 15407502 3' - rooA 7 2 73.27 TCAAACTTTGCGGCCGGAAGACGATTTTAACTTTTAATTTTTCACACACAAATTCAAACAAATAAAAGCAA:1 - chr3R 15612848 3' - TAHRE 177 1 50.70 ATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTTCTCAAAAAAACCAAATTATACGAAAAAATCTGAAAACAAACCCAGGTCGCATGCAACCAAAATAAAAAT:1 + chr3R 13535768 3' + I-element 5131 1 74.26 AGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGATTGTGAAGACGAAGGATATGCGCAACTCGACAAACATCTTCCTCACCAACCTGAGCATCGCGGACC:1 + chr3R 21259528 3' + 297 282 2 67.33 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGAATCG:1 + chr3R 6034008 3' + roo 9032 1 67.00 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGCCGTAATGATGGCCAAAATGAATTAGGGC:1 - chr3R 23906264 3' + roo 9025 2 73.27 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTGCTCGCATTTTCCCAGCTGCCTGCCAGTTTGGGTACACAAA:1 - chr2R 7838971 3' - pogo 32 1 60.40 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGATTTTATAGCTCAGT:1 + chr2R 22051524 3' + Tabor 445 2 62.38 CATAGCCACGACATCTATAAAAACATAACTCTATTAACTGGCGCCCAACATACTATTTACGCACCTAATTACCCACGTTGTTCAAAACAAAACTGTTATAA:1 + chr2L 18659440 3' + gypsy7 213 2 66.34 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTACACATACGTACACTAGCGATGGTTATCTGTGAGTTGTAAAAT:1 - chrX 21939054 3' + HMS-Beagle2 276 4 63.37 GTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATACATATATTATCAATCGGACTTATTTGTTGGATGA:1 + chrX 20419184 3' - flea 4798 2 72.28 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGCTTCCTTCCTGCAACGTCCTGCCATGAGCTTGAGTCCTTCTGCACACTTGGGA:1 - chr2R 17138682 3' - 3S18 22 2 57.43 AAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCACATCGAGACCAGATCGAAGCGAACCGAATTGGATAGGGGACGCAGGATGATGTTACGGAGGAGTGGGCAATGAGA:1 + chr2R 7362979 3' + baggins 5053 1 77.23 GTCCACGAGCGCAACGAAANCACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 7 1 60.40 AATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGTTTGCCACAGGACTCGTTC:1 + chr3R 13739760 3' + Burdock 6377 2 65.35 CTTCCGACAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCCTGGTTAGTCCCGAAAACCGTGTTATCCGCTTCGATCCCAAGTT:1 + chr3R 22403705 3' - diver2 217 2 56.44 CAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACATATTACACAGCCACGAAGTGGGCTTAAGACCCACACTCACAGGACCAGCTCTGCGGCTGATTGAAGG:1 - chr2L 15531780 3' + Stalker2 384 2 59.41 TTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGCTGAGGGTTCAGACAAAAGGGATACCCTTG:1 - chrX 4166347 3' - I-element 5289 1 75.25 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCAGCTTTTCCATCCGGCATTTATGTGAACCTAAAACTAAACCACATAGAGAGTAACTACCCTGC:1 + chr2L 8577359 3' - roo 5 2 72.83 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTT:1 + chrX 4399578 3' - I-element 41 1 71.29 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCGAGATCATCAAGACAGAGGATGGCTACACCAGCGCCTACGAGGGAGCAGATGGTATATCTCGCAAC:2 - chr2R 11259545 3' + hobo 2927 1 63.37 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGAAAGGGCTGAGAACATTTAAGTTAAACCGATAAGCTAGTAAAATTGTATGAGAAAC:2 + chr2R 13763267 3' - roo 8684 2 53.47 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAATGTGCAGGCACAAAACGTACAAATCA:1 - chr3L 18762081 3' + pogo 2057 1 71.29 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTTGCAAAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTTTGCCCAGCAATTCGATGCC:1 - chr3R 29608768 3' + roo 408 1 70.00 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCACCTCACATCACC:1 - chr3R 13739683 3' - Burdock 43 2 67.33 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGAAGTGTGGGTTTGGCGGTTTTCAAAGGTT:1 + chrX 4277580 3' + roo 9012 2 69.31 ATCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAATAATAATAGAACATTTTGA:1 - chr3R 12944699 3' + roo 352 2 84.16 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGTGATTTTGACCAAGGAGGGGTGGCAATT:1 - chr3R 12321397 3' - jockey 4699 1 51.49 TACTTCTCCTACGTTTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAATGGAAAAGAGGCAGCCGAGCCAGTCAAGAAA:1 - chr2L 20559780 3' + F-element 270 1 69.31 ATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTGAAGATTTTATAGGAAGGTGAGGAGAGTAAGTGAAGCTTATATTTCTATCCAGTCGATCGTTGCCTAC:1 - chr2L 135801 3' - jockey 4818 1 71.29 AAGGCCCATAACCAACTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGAAAACCGAAACTGGGCCACACTTTAAAGCTAAGCGTGTGCGTATCTCTGTCCGTGTCGG:1 + chr3R 5799878 3' - Copia1_DM 198 1 60.40 CTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGATGAGCTAAAGGACCACAACTGCGTGCGGG:1 + chr3L 15957293 3' - jockey 4615 1 70.71 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTGATAATTGCAGTGGA:1 + chr3R 22494168 3' + 297 353 2 70.30 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATTATTAGGTATTCGATACTTAATTGCAA:1 - chr2L 20118398 3' + copia 5076 2 77.23 GATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCC:2 + chr3R 1977623 3' + micropia 427 2 51.49 CACTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCTCGTGTTAACCGCCTCCCAGCAGGTGCACGCAAAGGTTGAGCGGTCCATGTGATCGGTGTATAGTTTTCCC:1 + chr3R 10707559 3' - Gypsy6A_LTR 19 1 71.00 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCTAAAATTCATATTAGCATGCCAATTATCTCATTGCCAATTAATTCGAATGCTTTTGTACGCCATCGAA:1 + chr3L 10109493 3' - roo 8720 2 71.29 CCCATCCTCAATTTTTAGAAACCCCGGTTGGATCAAATTGGCATATACATCTGACTATCTTGTCCCTGTTAAACTTAACTTCTAATTGACATTCATTGTAG:1 - chr2R 3877357 3' - Max-element 8092 1 54.46 CGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATAGCTTAGGATCGAAAGCTAAAGTGATGTACATTTTAGACTGTTCA:1 - chr2R 6779770 3' + 17.6 461 2 62.38 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCGATTAGATATGAGTATTTTTTACTGGATTTCTTATTAATG:1 - chr3R 11052078 3' - blood 7021 2 67.33 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTTGAATTGCGACCAGAGATTTGAGATTTGAGCGTGTGCAAATGGCTGCGGCAGAGACAATAA:1 - chr2L 10898375 3' - jockey 4684 1 66.34 AGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGAGTAATTGCAAAATAAATGCAAGTGCTTGGCGCACGTCCCACAC:1 + chr2R 10695181 3' - Quasimodo 7116 2 56.44 TACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGG:1 - chrX 21668015 3' + Tabor 7283 2 63.37 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTCTCTTCTCTCTAGTGTCTCACGCTCTCTTGTGGAGTTATTAGAACCGACGACAACTTCGCGTCTCTC:1 - chr3R 4567267 3' + 1360 3357 1 70.30 TATATTTATATTTATATTTATTTCGTACTTTATTGGTTTTTTTCTCCTGTGCAGTGCTGGCCACACGCTGCGCCAGTTTGTCTGGCCGTGAGTGTGTTTGT:1 - chr3R 11487995 3' - Stalker 86 4 82.18 TTTAAAATTTAAATTAAATTAATTTAAATTAATTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGGTT:1 - chr2R 5883600 3' + NOF 3956 1 31.31 TAATTCTAAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGCCATCAAACGGCTTAATATTACGTTTTAAACTTGGTAAATGTGCAAAAAGTGTTTCTCGCTTTTGTGCG:1 - chr3R 31000441 3' - copia 480 1 57.43 TAGTCGGGGAACTGGACTATAGGTTTCTCTCTTTTTTTGTTTCAAAGGTGTCTAATTTAAATTCGCTGTTTCGATTAGAAAGTAACGTTTTTGTTTGACTT:1 - chr2R 5217678 3' + INE-1 566 1 68.32 TTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCCCTTTCGGCCATTCCCGCCTTCACCCAATAATGGGTCATCA:1 + chr2L 10856946 3' + Quasimodo 185 2 59.41 TGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCCATCAGCCGATTTATCAAAATAATTCCAAATAGTCGATTGCCCAATTTTAATTC:1 - chr2R 1069380 3' - 1360 3239 1 53.47 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGCACTCTCTGTTACTCA:1 + chr3R 18399223 3' - P-element 58 1 24.00 AGGAACTATAAAAGCTATAAAGTTGAGATTAAGCATACATTGATTTCAAATTTGATTAGTGCGAAGTAAGCGAAATTGAAGGCCAGCACAAGCCGTTGACA:1 + chr3R 11406532 3' + INE-1 156 1 71.29 CACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTTAAGTAGCAGCTCCGCCATAAGCGATCCGATATATTCCGTTTGCATGGCATCCCATTTGATTTAATTGACT:1 + chr3R 16765782 3' - Doc 228 1 76.24 AGATACTCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCTCCGAATTTTCCTTATTATCGATAATATTCCGGATTCATATAGACGTGAAGTATAATGATTATGACGTGCT:1 - chr2R 5182972 3' - INE-1 542 1 70.30 GTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAAACATTTTATTAA:1 + chr3R 25086167 3' + Bari1 1677 1 55.45 AAGGAAAAATAAATTATAAAATACAACAATAAAAAAGGAAAAATAAA:1 + chr2L 1185661 3' + copia 249 1 55.32 TCGAAACACCACCCTGCACAGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGTGTGCATTACAGGGGAACGGGATGATGAA:1 + chrX 8698195 3' + X-element 4343 1 71.29 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTGAATGGCAAATGTTTTCCCTTAACACAATTTATGGTCCAAATATTCTTTATAGC:1 - chr2R 12525579 3' - mdg1 22 2 47.52 TAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTAAACGCGAAAATGGAACCAAACATAACAAAGCTCTGAATGACATCTGTCCAAAC:1 - chr3R 25915509 3' - 1731 255 2 56.44 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAAGTTCAAGTTCTAGAT:1 + chr3R 11052174 3' + blood 7362 2 55.45 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTGGCTCTCAAATTGAATTGTTTGATTTGCCTCAGCAAGGAGTTTTAAGCATTGCGCC:1 + chr3R 19449521 3' - hobo 19 1 60.40 TTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTACCTTACTATACTTATATGTCTATCAACTTTTTAATGCCAATTAGTGTAAA:1 - chr3L 19249675 3' - Transpac 4948 2 60.40 GTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAAACACATAAATTTGCTGCATTTATTTAATGCT:1 - chr3L 8040712 3' + hopper 1062 2 75.25 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGAT:1 - chr2R 15788578 3' - Transpac 9 2 61.33 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTACCAGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTACCAGTGTGTTTGTAACCCACCTTACAAACTTGTTTGTTTCT:1 - chr2R 8177675 3' - mdg1 4 2 73.00 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGTGTGGGTACACATACTTTTTGCAAACCAGCTGTATCTTCATCCCTTCAGCCGGCTAATCTTGCCGAAAGCACGAGCA:1 + chrX 15287957 3' - hobo 1 1 74.26 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTCCCGAACATTGCAGCCCTGGGTGCAAGCGCTTGATCTGGCAACTCTGTTAAA:1 + chr3R 21365592 3' + P-element 2883 2 77.00 TGGAAAAATAATGCAGATANCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTATTTCAGGGAAAATACAGTCACTTAA:1 + chr3R 31190828 3' - pogo 45 1 73.27 ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCGGTGTGTGA:1 - chr3L 19274803 3' - transib2 30 1 55.45 CTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATGTGTGGCGCACGTTCGGCCGCGATTAAGAAATCTTCGCGAGAAGAAAAGGCCAACCGACTCCGACCGAG:1 + chr2L 10199077 3' + I-element 5350 1 70.30 CTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCAACATCTTTAATTAAAAACCCTTTCACCACATTTCTAAGCCTAGATTATGGATA:1 + chr3L 11767494 3' - invader2 4675 1 66.34 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCTACTGTGGCATGCCCCGCCCCCTTTATA:1 - chr3L 19861794 3' + 1360 3341 1 74.26 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGTGGATGTATATGTACATGTATATGTATGTATATTGGCTCCTTGGCTATTTTGTATCTTTCCTGC:1 - chr2R 15349474 3' + P-element 2874 1 67.33 TAAAATCAGTTTCTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTCACCTTACTAAATATCAATAAAAATA:1 + chr3R 9278391 3' + roo 9035 1 64.36 CATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCACTGTGTCTAAG:1 - chr3L 15452862 3' - accord 28 2 51.49 ATTTCTCAAATACTGAGGCTTCTCAATCCAATTTGCATTTAATTTTTAGTCTTAAGCTGAGTATTGAAATGGGCAGAGAAAAGACGTGGTTTCTACTATAC:1 - chrX 9635713 3' + 297 232 2 60.40 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAAAAAATATTAAGCAGCTTA:1 + chr2L 18655214 3' - Doc 32 1 48.51 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGAAAGATGTGTTAATATGAACTTATTTTCGTGTACGATACTATTTGTGACG:1 - chr3R 19987399 3' - Doc 31 1 52.00 GCAAGTGATCCTGATCAAGAATATATTGTACATATGAACATATGGTCCTTATAAAATCGAAAACGATTTAATGAAAATAGCACTTTATAATAATACCTTAA:1 - chr2R 6234303 3' - INE-1 86 1 73.27 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATTTACTCCTTTTTTTTTCATCAGACA:1 - chr2L 13186262 3' - pogo 45 1 76.24 GGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGTTTTTTGTGACTTACTTAAGGGAGAACAGCACCAGCTAGCTATTCAACCAATA:1 - chr2L 3408607 3' - G-element 25 1 54.46 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAATATGCCGCATCGCCAAATGATCCAAATGATCCTGCTGTCAACAAAAC:1 - chrX 7788594 3' - 412 7082 2 52.48 TAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGGTGAATATCATTGTGAAC:1 + chr2R 5772523 3' + HMS-Beagle 7010 2 63.37 ACGAGTAAAGTCTTCTTATNTGGGATTTTACAGTAGGTGTGTTTTTTTGTTCGGCCAACTTCAATGCTTTTCAGTGCACCCATTTTCCCATTTTCCCATTT:1 - chr3L 9305201 3' + roo 398 1 68.32 TCAGTGTAGTCCATGGGGGTTCATCCTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTTCTATGTTTGCTAAATAATTAATTCGTGTTGTTCTTTCTGCACATTCGCTCGA:1 + chr3L 15370640 3' - Rt1b 4918 1 57.43 CTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTTTTCGTGCGCACTTCGGGCCAAACTCAAGTGGGGCTTTGAAATGGCCAAGTGGTGCAAA:1 + chrX 4166467 3' + I-element 5350 1 73.27 AAGTATATATATGTATATATATATATCGGATTTCCAACTGGCAGGAGGTCACCTACTTATGCGTTGAATGTTTACGTTTTGCTTCGGTTTCTTTTGTTTTC:1 - chr3R 7837173 3' + 1731 4409 1 60.40 TTCTGGCGGGTGCACGCTTTAAAATACGGCTCTAGCTCTAATTGCGTTTGCGGAGATGGGACACTGTCGAATACTTGTCATTCAT:1 - chr3R 22717771 3' - Gypsy12A_LTR 2215 1 62.35 CGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAAATCCTTAAAGTTCCCTTTTAT:1 + chr3R 17781603 3' + pogo 2051 1 80.20 CGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATATTTCCTAGAGTGATTTAGTGTTTTTTCACTAGGCTGCATAAAATTAAAAGTTCCTAACGAAAAACCTTGCG:1 - chr3L 16400618 3' + Idefix 437 2 74.26 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTGTTATCAATCCACAATCCATGTA:1 + chr3L 7345402 3' - pogo 40 1 72.04 AACGTTAAGGCAATGCAAANCAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAACAAAAACGTAACGCTGCCGAAAAAAAACTTGGGGTAGGGAAAACGAA:1 + chrX 15216442 3' - 1360 296 1 55.45 TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATACAAATATAAATAATACTGTGTCAGTTGGAAGTGAAAATTTACACATG:1 - chrX 23035731 3' - HMS-Beagle2 6910 2 52.48 AAGTTACCTGCATCGAGACATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATTCTTATAAAAGCTTATATCCTGAAGC:1 + chr3L 13773058 3' + pogo 2063 1 69.23 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGCCCAGCAGCGATAAAGGTGAAAAATAAAATCATCCACATTTATTTACTGGGGA:1 + chr3R 30760623 3' - roo 15 2 54.46 TATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTATGTATGTCACTGC:2 + chrX 18326247 3' - Doc 209 1 51.49 ACCCTAATATGTACCATGTAAATTCCTTTCTTTTTCAGCTGACTTTGGCACTTTGCGTTGCACGTTGCGTATGCGTGATTTTAATTTTAAGTGGAACCACT:1 - chr2L 3409086 3' + 1360 3145 1 74.26 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACCATCGTAGATGTGCGATGGCGTGTCTCCAGGATGTGGATGTCACTCCCCTATCAATTTATTGATTTAGAGCTCCAGTT:1 + chr3L 18190282 3' + S-element 1712 2 78.22 CGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACTGACAATAAAACTAAGCGAAACAGCAACAACAAGGAACCAAAACCACATACCAAA:1 - chrX 13688494 3' + F-element 243 1 56.44 AATTGTAGGGTGTGGGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCCATGGGAACTGGGGAGCTATCCCCGCATTCTCGTCAGGATCTGCC:1 - chr2L 13566476 3' - hobo 32 1 51.49 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTGTAATTAGTGTTCGAAATG:1 - chr3R 5993133 3' - pogo 52 1 81.19 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGAGGGTCCCTCCACTGGCTGGCTGCACAT:1 + chr2R 24278061 3' + 412 443 2 72.28 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGAATATTATGGAAGCATTCTTTGG:1 - chr3L 5702045 3' + I-element 5305 1 73.27 GTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCGTCTGGCTTTTGGGAAAGATCCTGTCATGGCTGGCCACAGGCAAAGTTAATGTAATGCCAGCCAGGCAATACAAT:1 + chr3L 8247626 3' + Transpac 4992 2 73.27 ATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACTAACAACAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTGCATGTGATACAA:1 - chrX 22689543 3' + 1731 4591 1 58.42 ATGTGAACACCGAGTCCTCTCTTGCTGTTAAAGGACCGGCCACATACTGTGCAGGAACAACGCCCCAAGAAGCCCTCGACCCCCAAGCTG:1 + chr3R 27224154 3' - R2-element 398 1 61.11 CCTCAACGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATAATCAATACTATCTATACTATTTATGATCACGCAAATCATCATC:1 - chr3R 5836741 3' + Ivk 4921 1 57.43 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAATAATGATAATGATATTTACCAAG:1 + chr3L 13987245 3' - pogo 47 1 81.19 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTTTTAGCCCATTAGCAGCAG:1 - chr3R 17971654 3' + 412 455 2 62.38 AACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTGCACCCA:2 + chr2R 13653407 3' - F-element 49 1 58.42 GGAAGAGGGTAGAAGTAGCNGCCTACTACAGTATGTTTCTTGGTTTTTAATTACAACAAATTCGACTTGTTATGCCAAAAAGTTAGCAGGGATTCCAGGGC:1 + chr3R 26597430 3' - mdg3 5261 1 72.28 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGGCAGAAAGGGATGCCACGGAAAATTGGATTTGGGGTCCAAGTCCGGGAGCCGAAATAAAAATT:1 - chr2L 12808139 3' + Tirant 388 2 66.34 CTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAATTTCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTTTTGCCTCACTTCTGCTGCCTTTTATCCT:1 + chr3L 18059738 3' + Q-element 94 2 71.29 AACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTTGGGCATTGCGGTCACGTTCTCCTTTTGC:1 + chr3R 29786320 3' - micropia 36 2 62.38 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATTTTCGAATGACCCATTGTGAAGCTCTCACGC:1 + chr2L 5927026 3' - pogo 7 1 63.37 AACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAAAAGTTTTAAACCGAAATTGGTAGCAATCGTCCTTGGCTGCTCCATGAATTTCAAGCAGCAATAA:1 - chr3L 18643276 3' - Doc 4639 1 71.29 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCGATGCCGTGTATGTAG:1 - chr3R 29608758 3' + roo 402 1 75.00 AAAACAAATGGAAAAAGAAAAAATACAAAAACGTAACAAAAGAAAAGTAAGGAGGTGGTCGTGAACCGATTCTGGACAGGATCGTGAGGGACATTCGCCAG:1 + chr3L 14669703 3' + Doc2-element 234 2 48.51 CAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGCTTAGTTGAGTTCGTCTCGTCTGTCGGTTTGATTCTGCTTCG:1 - chr3R 11401562 3' - 297 6806 2 58.42 TCGCTTAAATCGGATTGCANATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAA:1 - chr3L 27356102 3' + Tc3 1660 1 76.24 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACACAATCT:1 + chr3L 20354078 3' - 412 7082 2 52.48 CGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAG:1 + chrX 22386762 3' - hobo 85 1 62.38 TTTTATTTAGATTTTTTTATTTATATATTTTATAAAACCGGACCAAAACTTGTACTGATTATGGATGCGGTTTAATTTTCAAAGGCTGCATAAGTAGGCGT:1 - chr3R 19374819 3' - gypsy2 436 2 46.53 GAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTT:1 + chrX 983373 3' - Juan 3831 1 51.49 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTATTTCAGGGAAAATACAGTCACTTAACTTAGTTGACTTTAATCACAAGAAA:1 + chr3R 31190853 3' - pogo 20 1 58.42 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAAATTCCCTCGAAAACAGAAGATAAAA:1 + chr3R 9224420 3' + pogo 2082 1 60.40 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTTTAAAAAGAACTTCTAATGAAGAGATATATCTACATAAAGG:1 + chr3L 10474231 3' + copia 246 1 69.31 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCAGAGAGAGCGG:1 - chr3L 16891102 3' + P-element 2847 1 37.62 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACCTAAGAAGATTGAATTTGAAATAAATTAAA:1 + chr3R 29608834 3' - roo 43 2 71.72 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATACGTTCTTTTACCCGAACCACCCAAC:1 - chr2L 9260340 3' - 297 45 2 73.00 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGTGTACATTTTCACATATGA:1 + chr3R 11607995 3' + 1360 3336 1 80.61 GACTATAATTGATTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCGCCGCTCGTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAAAAAAAAGAAAAAAATA:1 + chr2L 4015864 3' + Cr1a 4205 1 79.21 CTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGTATTACCTCATGACCTTTGGCTGCTTTTGTGGTATTTCCTATTACCATAAGAGTCAGGGAAGATGCCTTCGAAG:1 + chr3L 4621764 3' - 1360 88 1 78.22 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGGTTCTTGGCGAGGCCAAATTTATGTGTGTTTAAGCAACGAAGACCGTTAAAACA:1 + chr3L 13785460 3' + pogo 2080 1 53.47 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCTC:1 + chr3L 8039416 3' + hopper 1388 1 52.48 AAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCCATTTGGGG:1 - chrX 4264357 3' + mdg3 5459 2 65.96 TCTTTACAATAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGATATATATGTAAATGTGTGTATTGGAATATTATTTGTACGATTATTGCTGTTGGTGTGGCTGGC:1 - chr2R 15093042 3' - I-element 491 1 66.34 CTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTA:1 - chr3L 15452877 3' - accord 43 2 66.34 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACCGAATCTGCTAAATTTCACACACCACTTCGTGTGAAAATAAACCGAATTTAAATTTAGATACTGC:1 - chr3L 11929248 3' + copia 250 1 69.79 CAAAAAAGTGGCTGCATAGNGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGTACTGCCCTGACTTTCAGCAAATACTGA:1 + chrX 17494672 3' + 1360 3341 1 76.24 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCGCCGGTTGCATCGGATCGGAAGAGAGTGTGAGAGAGAAGGCAAA:2 + chr2R 17420902 3' - pogo 31 1 56.44 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACT:1 - chr3R 19589915 3' - BS 5013 1 58.42 TGTATTAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTATTAAAGTAGTAAGTATTAAATTAAAGTAACCCCGATTTGTTTCAATAAAGATGAGACTTGGCTAATTTAGTCAA:1 + chr2L 6296795 3' + TART-A 13146 1 49.50 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGAAAATGCTGCAGACACGAGGGCGGT:1 - chr3R 9088546 3' - hopper 3 2 72.41 AATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGACAACGACTAGTGAGGGGTGGTGGGGGGGGGAGGGAGTGAGTATGTGGGGATGAACGTACC:1 - chr2R 13653935 3' - F-element 4535 1 65.35 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTGCTGCCGCTTGGCATTAACTGCCTACGCATATTC:1 - chr2L 4134834 3' - Quasimodo 45 2 65.35 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCATCT:1 + chrX 19034192 3' + hopper 1393 1 57.43 GGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGTTGTCAATTCGTTCCAGTCGCTTATCCAC:1 + chr3R 21884227 3' + mdg3 198 2 72.28 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAATACTCAAAATATTTGTTTTAGATAAGAACAAGATAAG:1 + chr3L 6033586 3' + 412 452 2 64.36 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCTGCACGGTTGCATCATCAATTATGCTTATCAAAACAGTGGAGGGCTA:1 - chr2R 5865012 3' - jockey 56 1 53.47 GCCCACCAATTAGTTTTTTTTTTTGCGCACGTCCAAATTAGAGCGAGACGACGCTTGGGGAGATATGTCCGTAAGATAAGGCACGGTTTTATTATTGCTGT:1 - chr3R 26229555 3' + FB 83 1 69.31 TGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTATATATCTCATCCGTTAAGAAACGGCGATAGCTTCTTCTTTACTG:1 + chr2R 4500932 3' + gypsy6 7770 4 61.39 TTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGG:1 + chrX 21668069 3' - Tabor 35 2 60.20 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGGTTGCTT:1 - chr2R 6850454 3' + roo 9024 2 74.26 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGAGATACGGGGACTGAAACGCCGTTGACAGCGGAAGTTTTTTGTTTCTCCGATTTTTTCCAA:1 + chr2R 9649258 3' - roo 8679 2 65.35 AAAATAATATATTTGAAAAAAATGGAACTAAAAGTTACTATGTGTATTTGGATCATAGCCTTTCGGCTCCATGTCCTTAAATCCCAGACCAATCAACCCCT:1 - chr3L 3114364 3' + BS4 728 1 91.09 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGCATAGTTCTGTTACTTTTGAT:1 + chr2L 21215314 3' - BS 5026 1 78.79 TTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAATAACCTAGCTTAAAGTGTGCCTAATTTGAAAAGTCTA:1 - chr2L 3699380 3' + mdg3 5495 2 72.73 TGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCT:1 + chr2L 19642359 3' - Quasimodo 52 2 78.22 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAATTGATAGCACACACACACACACACACACACACACACAGTAATGGCCACAAAATTAGCAATACGAAAATTTGC:1 - chr3L 8039323 3' - hopper 5 2 60.00 CACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAACCAACTACCTCTCATGGCTAACATCTGACAAGCTGGCTA:1 - chr2R 19557421 3' + Quasimodo 48 2 61.39 GCCATCGGACAAGTACGAGAAGAAGATTAAAACACCACCTGTCTGACCGGAACTTGACATAAATCATACATAGACAACATCAAATTCCTACGAAATGAAAG:1 + chr2L 15033943 3' + jockey2 3148 1 68.32 TCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAAGAACAACAAT:1 - chr2L 17245013 3' + copia 212 2 68.32 CCATAATATCTGTTAAGCTACATTTTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGAATAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAAAAGCTT:1 + chr2R 4339494 3' + G5A 2769 1 80.20 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCGGGTTGTCCATAAAAATTTAATCAAAGAAGCACCATTCCGTAGTGCAAACTTTGCT:1 - chr2L 17998248 3' - BS 17 1 47.52 TTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTATGTACATATGTATATTCAAAAAAAAATTTAAACTACTGGATGCACCATTATAT:1 + chrX 23035815 3' + HMS-Beagle2 7172 2 62.38 GCCCAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAATTTATTTAACTGTAAACATGAATGCTGCTCTGCCTTCCATT:1 - chrX 6590589 3' + Quasimodo 7167 2 58.42 GCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTAAGTGATATTGGATTCTGAATAAAAGTTTATGATCAAGAATACAAATATAATCAAGGGA:1 - chr2L 117153 3' - 1360 2980 1 58.42 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTTTAT:1 - chr3R 7869102 3' - 297 15 2 65.00 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATT:1 - chr3L 3757358 3' - roo 48 2 79.21 CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAAATTGTGCACATTTCTGAAAT:2 - chr3R 10087800 3' + roo 9062 1 69.31 TTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGTTTACAGAAAACATCGTGAAATTTGCATTGCTGACTACATTCTCTTAAACCTATAATATATCTTAAATGGGGTTTG:1 - chr2L 8577239 3' + roo 410 1 78.22 ATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTATGTGTAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTTCACGGGAGTTTTTCACAGCCAGGGTAGCCAGGGTTG:1 + chrX 20798885 3' - Stalker2 7484 2 64.36 TTCTATTAGAAAATAATTGCTAAAGGACCGAAACTCCGAAATAGCGCCCGTCCCTCAAGCCTTTCTTAACTACTTTCAACAATTGCCGTTCCGGCATTGTT:1 - chr2R 4511932 3' - transib2 67 1 59.41 TTTTTTTTCTTTTTTTTTTTAACTTTTCCCC:1 + chr2R 10236544 3' - Doc 4702 4 83.87 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGT:1 - chrX 20361966 3' + hopper 1387 1 53.47 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACATG:1 - chr3R 10110416 3' - Doc 25 1 51.52 TAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAAAGGAGGAGGAGGCCGCTCGCCTTGAAGCCGAGCAGCAGGAG:1 - chrX 22995295 3' + S-element 114 2 60.40 TTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATGGTT:1 - chr2L 14793491 3' - Stalker2 7277 2 54.08 AAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAACAAACATTCAGACAAACAGCAAACAAACCCTTCGACACATTGCAGCCCAAGGAACAAGGGACAG:1 - chr2R 10373733 3' + mdg3 5058 1 74.26 TATATTTTTAATTATTATATTTTTTAAAGGTTTGTTCATTTATTTTATAATAATACATTGCCCCACATGAATTATTTATATTAATAATCTAAAAATCGTTC:1 + chr2L 1206272 3' + BS3 1640 1 36.63 AATTTCATTCTTTTTTTTTTTGTGTACTTTGGATTATAAAATTGCAAGAAATACATACTTTGATAGCTCTACGACCAAGTTATTTATAGTTATTGGCCACT:1 - chr2R 10852479 3' - transib2 2644 1 76.24 TTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTA:1 - chrX 21668028 3' + Tabor 431 2 76.24 ACTGACGGGACATTAGTTCNACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGAACTGCAGCTTTAGCAGGCAAGTCTGCTACTGGCACATTTAAT:1 - chr2R 21962623 3' + 297 6949 2 58.42 GGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGCAACATCGTGGGTCTTAAGAGTACCAACGCCGTGATA:1 - chr2R 23244705 3' + X-element 4426 1 61.46 GATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGCTGAGGGTTCAGACAAA:1 - chrX 4166360 3' - I-element 5301 1 64.00 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTCTTTGTCCACCGTCTCTCAATTGCCGCTAACCGAGTGATGCT:1 - chr2L 23313671 3' + S-element 1683 2 61.39 AGAAAAAGTAAAAAAAAAACAAGAAAGGCATGAACCGCATTAAGCTTATCAGTCAAATAGAAATTTATATTCTGAGTCACAGCAAAACAAAGATAAGCCTC:1 - chr2L 10859281 3' + gypsy7 5009 2 81.19 AATAAAATAAAATAAAATTATGGATATAGCGCTAAAATGTATCGCAGAAGCCAGAGTTATTTTTGGAGTCTTACAGAACTTGGCCGAAAATCGGCTAGCAA:1 + chrX 5895531 3' - transib1 1896 1 80.20 TGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTCGATTCATTTTAAATTGTAGCACA:2 + chr3R 15790152 3' - flea 4701 1 44.55 GTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATCTGGGGATCTCCAGGCTTGTTTGCACTTTGGCAGCCGCTCACACAA:1 - chr2R 8311294 3' - opus 7022 2 56.99 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAAT:1 - chr3R 9088579 3' + hopper2 1558 1 72.28 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGAAATATCGATTTAATTTCATTTACTGCCAAAAGCAGTA:1 + chr3L 18762138 3' - pogo 35 1 65.35 CTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGCATAGTTCTGTTACTTTTGATACTTTTGATAAGGCTGCCGGTGCAGGCACT:1 + chr2L 21215344 3' - BS 4998 1 50.50 CCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATTGTTAAGCATACCCATACCCACTTACACACTCATGCATCGGTCGTAGCTTTTAGACTTGTACTGAATTTTA:1 + chrX 19195659 3' + 412 7218 2 66.34 GGGAAAGATGCAGCATTTCCCCAGGAGGAGTGCCCGGCTGAACGGAGGAGAGCAGTCCCTTTCCGAGCAGCCAGCGGAGCAGGAACCTACGTACCCCACCC:1 + chr2L 2841161 3' + aurora-element 463 1 62.38 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGTTTAAACTCTCTAATTATTATGCGTAGTCAATCTTAATAAAAGA:1 - chr2L 6251664 3' - mdg3 5286 2 54.46 TGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGGGCAAACTGAAGGACGACAAGACCTTCGTGGTCAGCGGCTCCTACTCGTTCACCGGCGCCGA:1 + chrX 12488394 3' - R1A1-element 5330 1 66.34 GTTTTAAGTCCACATATAACAATTCCCAGAAACACTTGAATTGCATGATACGGTATATGATGATAGTCATGCAAGTATCATCCGCCCACTTGGTGAAT:1 + chr3L 12409981 3' - Doc 190 1 66.33 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACGTTGCCTACTTCCCTGCGCATAATTATGTTGAG:2 - chr3L 20049591 3' - jockey 4759 1 79.21 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATGGAAAAGTTTTAAGGCAGGAGAAAAACAGGGAGGAGGAGGGGTTATGT:1 + chr3R 8765614 3' - roo 8691 2 57.43 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTCTGTACATCGGTACTGTGCTCATATCTCGAATGCAATA:1 + chr2L 20367386 3' - Doc 15 1 63.37 TGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGTCGTTGAAAAAGTCCGCGAAAAGTGGCTAGGACCATGAGGAATGGCCTCATGGACACATGGA:1 - chr2R 12457899 3' - HMS-Beagle 6805 2 66.34 TATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTATAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGAT:1 - chr3L 20224154 3' + Chimpo 160 1 58.70 TTGTATGTCTCTCAATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTTAATTGCCCTTGTGTGTGCGAAA:1 + chr3L 9928621 3' - Helena 1225 1 63.37 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTCTATGGAATATCTAGTAGTTTTGAAAGCAGCAGCCTGAGTCGCTT:1 + chrX 17883702 3' - pogo 26 1 57.00 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAATCACAATTTAATTA:1 - chr3L 9928522 3' + roo 9052 2 56.44 CGGGACTCTCAACATCACCACGAATAATCCTGACCCCTAAACTATGCTTATCTCCCGGCTCTCAAATACACGTGTATTTCTA:1 + chr2R 16337144 3' - Cr1a 4061 1 71.95 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGTGTTACGAAAATTGGTGAACTACACGAAATATATTTTGATAGTGCGTTTTTGCTGA:1 + chr2L 16793728 3' - hobo 19 1 60.40 CCGACGGCTGCTTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGACCACCCGCTCCCATTCGTGCCCATTCCCAAGTTGCC:1 + chr3R 6961127 3' + 412 7509 2 62.00 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGCATAGTTCTGTTACTTTTGATACTTT:1 + chr2L 21215319 3' - BS 5023 1 74.26 ATAAAATGAGAAAACAATTTAAAAATAAATATAGTGTGGCAAGAGATATTTGTGAAACAACGGCAGATCTAGGGCATTCAGCAAGGTTTGTACGTTATATA:1 + chr2L 1394408 3' - INE-1 473 1 63.37 CTGCCCGGGTGGACCGTTTATTTCAGCATGACAGAACGAACTTCAAAGTGAAAGTTGCAAGGCCTTTGTATTTCCT:1 + chr2L 12745367 3' + baggins 355 1 76.32 GAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTAT:2 - chr3R 22869399 3' + Bari1 1659 1 71.29 TTTTAAAGTTTTTTAGTTTTAAAGATGACGGCATTTCACGTAGTGACGAAGGGCACCATATGATATTGTAACTCTTTTTTTTCAGCTGCATATTAAATTTA:1 - chr3L 11336539 3' - 1360 3029 1 74.26 CAGCGGTTTGCACTATGTGCAACGCAACTGCTACCACTGACTACTTCAGCTTAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAGTCTATTAGCAGCCTGGGATTCT:1 + chr2L 22216549 3' - diver2 92 2 51.49 CGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCACCAAATCAAAATGAAATTTCTGCCAAAAGCAGTCGAATGA:1 + chr3R 24682627 3' + F-element 485 1 70.30 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGAATATTATGGAAGCATTCTTTGGAT:1 - chr3L 5702043 3' + I-element 5307 1 71.29 AATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTGGGAACAAATAAATTGCTACAA:1 + chr2R 21351640 3' + 297 190 2 74.12 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCGTTGAAAGCAAGTCTTTTTGCATAGCATACATTTGGGGGCCTCCTTTTCTTCCTGTTCATTTGCGCCTGT:1 - chr3L 13895333 3' + hobo 2935 1 73.27 TCTCGCAAATCGAGCCGTACGGGAGGTGGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAATAATAATAACAACATAACATAATTTAAAGTGTTTT:1 - chr3L 26356740 3' + Cr1a 4384 1 73.27 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAGATATTACACGTTTTTTTTCATAAAATATCGATCATTGTCATAGCCCAGTTC:1 - chr4 194714 3' - Quasimodo 23 2 57.43 GCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGACTATGGCAATTTCTCTTGTTATTTGAATATGGAATGGAATATATTAAAATTTTTTTAAAGGTATT:1 - chrX 21388016 3' + INE-1 546 1 58.42 CGAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCCATCTTGGTCCGTATCTTTTTACCTTATTGATTAACGACCTCCCCTTCTAACAACTTAAATTAGTTACGTG:1 + chr3L 27174823 3' + Q-element 472 2 74.26 TAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGC:1 + chr3L 25232907 3' - GATE 8271 2 50.50 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTAAACTTCACATTAAAACCTTTTCATTAAGGA:1 - chr2L 9045393 3' + jockey 4986 1 68.32 TAATTAATCTTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCC:1 + chr3L 5479046 3' + 3S18 287 2 80.20 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAACAATTGAAATGTCATGCAATAAATCTACCCCACACATACGCACCATGGGA:1 - chrX 22593142 3' + 1360 3365 1 55.45 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATGCATACAGAACAACCATAACCACAAGAATTTCGGCCAATTTTCGGTGGATTTTAATTGAAGGACATCCGGTG:1 + chrX 6481116 3' + jockey 4985 1 73.27 GAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAACAGCTTTAAAATTCAATCAATTTTGCACTCATACGGGTTTACATTTGGGGTAATTGTACTTTAAATTACATT:1 + chr3R 13603099 3' + 1360 2995 1 63.37 TGTGAAGATTCCAGAGATAAGGTAAAGGTTTTAAATCCTGGGAGAACTGGAACTTACAACGGATTAAATAGTTTTTGCGAATCCAGCTAGTTTTATAATTA:1 + chr4 384464 3' - Q-element 14 2 74.26 CAAGGATCACCGACTAACCGAGCAACTACGTCAACATATCAGGGCAGCCCGACCCAGGATGCAGGATTCAGTTTGTATGTGGGCGTCGAAGGGCAGGGACA:1 + chr4 813260 3' + Chimpo 3838 1 55.45 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTGACACACGCAAGTCTTCCGTTGATCCGAAAGAATGACACACCTTTGATGCAAA:1 + chr4 301793 3' - jockey 29 1 56.44 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCACAGGGTGGAGAAATATTCTTAAGAATTACCAAACACTATAATAA:1 + chr3R 4575500 3' - 1360 32 1 56.44 CATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTGTGCTGATGCAGATGCATTCGGTGTGCTAAGTGGATGTCTGTGTGTTCGAACCGATTGGCTATAAAAATAAA:1 + chr3R 19216441 3' + 1360 3386 2 76.24 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGTCGTTGAAAAAGTCCGCGAAAAGTGGCTA:1 - chr2R 12457932 3' - HMS-Beagle 42 2 69.31 GAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCAAAGGAGCCATCCCAGAGATATCCCAGAGCACTGGACTAAAAGCGAAAAATACATCAAACAAA:1 + chr2L 9875466 3' + blood 442 1 69.31 CGGCTTATTGCCGAAGTGTCAAGAGATTTAACCTAGGGAGATGAAGCTGATCATCGCCGGTGGCCGTATTCGTCCTGCGCAATTTTCCCAAAACTTAAACT:1 + chr3L 23455916 3' + rooA 121 2 77.23 CCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAAGTAGCAAAAGTCGTTTGCAGTGTATTTCAATATGGATAATTATATATCTGTATGTAGAAATACACAAACAAGGT:1 - chrX 4445433 3' - mdg3 5204 1 75.25 CCCTCGGCCACGGGATTGTAACTGGCGCAGCCGGTCAACGGACAAGGGATTAACAATGCCCTTATCAATCCATTTGACTCTCGTTGAACTGACGCGTGTTT:1 + chr3R 14960740 3' - accord2 7 2 60.40 AGCTTCGGCTTTCGACGGGNCCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCAGCTAAAATCACTCAATCAGCTGTTGCCTATCGATGAGCGGCGACTATCGAT:1 - chr3R 27116711 3' - P-element 22 1 53.47 CGGACTTGTGTTCTTAATGNGAGTTCATCATTACACTGCTGCCCATTGCATTCCTGGACATTTGCTGGACGATTTTTTGGTGCCACACGGCGCCCGCTAGA:1 - chr3L 872691 3' + 412 480 2 60.40 AGTGGTAAAAAAGTGCCACNCTTGCAGTTCTCTGGTACTGGCTCTCAAATTGAATTGTTTGATTTGCCTCAGCAAGGAGTTTTAAGCATTGCGCCATATTG:1 + chr3R 19449527 3' - hobo 13 1 66.34 TGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAATGTATTTTGTATATTTATGCTATATTTCTCTACATGCATTATGGTTCTCACTCAAATTTCATTG:1 - chr2L 18655658 3' - F-element 4371 1 64.36 TATTGCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTCATGCTATCCTGCTTTCCGACGGGTCCTTGCCAGCTTTTAAGCGTTCAAA:1 + chr3R 23543050 3' - 412 1 2 78.22 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGAAATACCCCCTACATTGGCCAATGATGATGATGTATGATGATGGATTGTCAACATAATTACAACGGCAAACAATGG:1 + chr2L 16426524 3' - hobo 2 1 77.23 GGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATAAGAAATATTTTATCGTAACTAACAAGCTATCTTCTTAGATCAATATCCGCGATTCCATATCGACCTTTCT:1 + chr3R 17482104 3' + copia 251 1 66.34 GATTAAATTTAATTATTAAAACGACACATTTAGTTGCATCTATGTTCAAAACCATAAAATATTATTTTTAATAATGCATAAATATTATTTGAAATACTAAT:1 - chr2R 20177412 3' + TAHRE 49 1 88.12 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATAAGGAGCTTGGT:1 + chr2L 12866962 3' - mdg1 7062 2 56.44 TCTCCAATTTTTGTCACATTCAGATCGCTTTCGATATCTCTGGTCCTCATATACAAAGGAGCGCCTGTAATCTTCCTCCTCCTTTTTTGGATTTTTTGCCA:1 - chr3R 15786765 3' - jockey2 3037 1 75.25 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTTATACCAGAATGGTGCTTTTTTCATG:1 - chr3L 19647262 3' + pogo 2062 1 77.42 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTTGTACACACAATATTTAAAACGAGTTCTGGGAATTAACACGA:1 - chr3R 16601433 3' + roo 9039 1 57.43 TAGCTTTTCTAATTCCTGAGATATCGACGCTTTTATACAGCCTGTCCCCTTATAGTCGATACTTCAGTTCGCTCGTCTTATTTTCCATGTCTCTTCTCTTT:1 - chr2R 5205455 3' - INE-1 151 1 76.24 ACGAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGGGCGTGGCAGGAACAAAATGCGAACAAAACGCGTTTCATGCCCCATTGACGGAGTAAACCCCCC:1 + chr3L 6658335 3' - hopper 487 1 70.83 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTTTTTTTACTTTAGATTTGTTCATCATAATTCGCAAACGCATTTAATTAATGGGAAATCACG:1 + chr3L 16153740 3' + pogo 2091 1 69.31 TGACATAAAAATTTAGACTNTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCCAGTTTTAGCCCACTGTTACTGTCGTTATCGTTGGCTTGG:1 - chrX 21229280 3' - transib2 32 1 57.00 GCTCTTGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCAT:1 + chr3L 24761229 3' - 1360 91 1 74.00 AAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAGCCAATTAAATTGTTTTCGCCATAAAAATGTGCAGCTACCGAGAAAAGAAGGCGGTTGTGGTGGGGTAAAGTTT:2 - chr3L 13190065 3' + roo 404 1 71.29 ACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGGCCACAAAAATAAACA:1 + chr3L 5241175 3' - Ivk 31 1 59.00 TGGGATTTACTGGCATTTCCCCAGAGTGCTATTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCCATCCGATCGAAAGACACACGTTGCGG:1 + chrX 6423523 3' - Porto1 4291 1 69.31 TCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACATTTTTTTTTACTTTTCTCGGTTATATAAGGTGAATGAGGGGCTACATTACTCATCC:1 - chrX 4598826 3' - invader2 4792 1 61.39 CTTTTATAGTTCCCGAAATCTCCGTCTTTATTCTGCCTGTTGAAATTCTTTTAAAGGAATCTAATACACCGTCTTACTTTACTGGTAATAAACTGACAAAA:1 - chr3R 14384727 3' - INE-1 148 1 64.36 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATTTTCGAATGACCC:1 + chr2L 5927008 3' - pogo 21 1 51.55 AGTATTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGCATAAATAAATGAAAATGCTACAGTTCAAAACGGACCATAGTTTAAGT:1 + chr2L 16139183 3' - copia 29 2 54.46 TTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGGGCCAAATAATAAGTGTGTTCAAGCTTTAACTGAGCAAATAACAGCAAGAAAAGAAATGCAATTGTTC:1 + chr3R 17054654 3' + hopper 55 1 72.28 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAA:2 + chr3R 7869174 3' + 297 348 2 75.25 GAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACGACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTTTTGTTTTAACGATACACCAGCTACCTTCAGTAGCCC:1 - chr2R 3170310 3' + 1360 3183 1 71.29 TTTAACGCTGGGCTGGTTGGTCGTTTTGGGCACGCAGGCCATGTCGATCGAAGGACTCGCAGGCGGTGGACATGCTAATCCTGTCGAGAGCTGTTAGG:1 - chr3R 19590950 3' - Doc3-element 4588 1 79.59 AATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTCGGATGCAATGGGGGTTATCATCGTGTTTGGACTGCGAATCGCTCTATTC:1 + chr3R 17798116 3' + invader4 2672 1 63.41 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACATTTAAGTGCAGCACTTGAAAAAGTACTTAATTAATGCCATAAATCCGCCGACATCCATAAACCCG:1 + chrX 9454905 3' - roo 2 2 76.60 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTAATGTCCC:1 + chrX 13146972 3' - roo 8707 2 68.32 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTAAAAACCACAAGCGAAATTGCCTGAGGGTAAAAATCCCCAAAATGGCATCATAAAATCAT:1 + chrX 7996453 3' + hobo 2921 1 62.38 AAACAAACTCAAAAAAAATAAAATATTTGTCTGCGTTTGCAAGTATAAATTAATATTTTGCATTTTCCATGAAAATATTTAGATAAAGGAAACAAAAATAA:2 + chr2R 18897800 3' + gypsy2 425 1 88.12 ATTAATGATAATAAACAAAATGATAATAATTATTATCCCTCCTCTATTAGGACATATACACAACACTGCAGCATTACAGACATTGACAACTTGTCGCGGTT:1 + chrX 378266 3' - Transib5 2578 1 51.49 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGTTAAGACTGCCACTTCGATGGAGGAAGCGAAAGTAAATGTTTGACAGTTTATGA:2 + chr2R 19840276 3' + roo 9051 2 57.43 ATTGAAAGGGACTTAAAAGTTTTCCCATTGGCAGACTAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCGCCGGTGGAGTACGTACCATCTATCCGCAGCGGCC:1 + chr3L 14941025 3' + G5A 2551 1 66.34 ATAATTGCAATAATAATAATAACTGACCAAACACTGGGCGGCTGGAATCCTTCGCCTGCTGCCTTCATGCTTGCCTAAGTAAGTTAATATGCCATTTGAAT:3 - chr3R 11076943 3' + mdg1 29 3 59.41 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTGGAACCCTGCCATGTACGTGCTCATGTGTGCAATGCGATAGAATTTTCTTTT:1 + chrX 14730817 3' - 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X-element 37 1 54.55 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGACACACAGCTGGACGAAGAACT:1 + chrX 22593196 3' - 1360 52 1 80.00 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGCACCGTCCAT:1 + chr2R 6850496 3' - roo 8708 2 75.25 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTAACAACTCGAAGCGGTATCAACCGG:1 - chr2L 12459693 3' - blood 7063 2 76.24 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTTCCGAGAACTGAGACGACAATGGCGACGACATAAATATCAACGGCACGTCATGTGGC:1 - chr3R 26252659 3' - 412 18 2 61.39 TGAATTTTAAAACTAAGACNTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAA:1 - chr3L 20049631 3' - jockey 4799 1 59.41 GGAGGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGTATAGGTTTTGGTCTATAGTTTTTGCGCTATTATTCGCTGTACAAATGCTGGTATACTTAGTTAATTATTT:1 - chr3R 19505504 3' - mdg3 5250 1 73.27 AGGGAGGTCATGAGGGTGGNGAGATTATTTATGAGACCCATTAATGGGCAGGTTGTCAGCAGCTCTATTCATCTTGGGGCATACTTTCGGGCCGAGCACAC:1 - chr2R 16609384 3' - 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P-element 21 1 58.42 ATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCATCTGGGTTTGCAGCGTTTGAAGTGAGAGACTAG:1 - chr2L 7881916 3' - accord2 7285 1 66.34 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGC:1 + chr3R 20905474 3' + pogo 2076 1 54.46 GTATACACATGTATATGTATAACGTATGGACATCGGGAGGCAGGTGGTGGAGTGGCTGCTGCTTTATTTTACAGATTGTGGGCTCATCAGATAGGG:2 - chr3R 22066727 3' + Stalker2 7498 2 67.71 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGT:1 - chrX 2841786 3' + hopper 1369 1 71.29 AGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGCATAC:1 - chr3L 21144043 3' - jockey 35 1 52.48 AGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCACCCTCGCCCTTCGTTTCGGTCCAGCGCTTTGATCTTTCCTTTCCGTCCTCGTTTTTTTTTT:1 - chr2R 8654638 3' - flea 143 1 64.36 CGACTATCAGATACCCGTTACTCTTTTCAGTTAATTTTGTTCAGTAACGGGTATGAATAGTGACAAGGCGGGGAGGGTGTTGTGTGCCTGGCAAG:1 - chr3L 18044577 3' - INE-1 550 1 69.47 ATAATGCAGATATCTTGCCNATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAATGTTTGAGTTTGCACATTGAAGAAATAAATGAA:1 - chr2L 14262809 3' - pogo 38 1 63.37 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTTTCATCATAAAATCATGCACAATGGCAATGATGACATTG:1 + chr2L 8622833 3' + 297 364 2 59.41 TATTTAATAAATCAATTCATTTTTATTAAAATCGGAAGTTCTTTTGATATCATCAGACATTGATTGGACCAGAAATGATTCCTCGCCCCTAGCATCAGAT:1 - chr3R 31498149 3' + HeT-A 365 1 64.00 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGTCACACTGGGCAGGCTTGCCAATTTCAAGAGCCGCGGCCACACTACTGCGAA:1 - chr2R 9693298 3' + P-element 2865 1 57.43 TTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCCCACACAAAATCTAATTTATTTAAGTTTTGACATTATTTAATT:1 - chr2R 1007479 3' + Cr1a 261 1 72.28 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATCTGGGGATCTCCAGGCTTGTTTGCACTTTGGCAGCCGCTCACACAAGG:1 - chr2R 8311292 3' - opus 7024 2 56.70 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCATTTTCGGTGTGAATCATTTAATATGATTTTTTCGAGTGCATCTA:1 + chr3R 17971719 3' - 412 30 2 54.46 ACCGTGCAGGTGCCTAAGCAGAGGCTCTGGTGTCCGAGTCGAGGCGGTACAAACCTCCGGCGGCATTTGCATACCTGATGCTAAAAAACTATGTTAA:1 - 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chrX 13146892 3' + roo 399 1 69.31 CCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATAT:1 + chr2L 8959957 3' + Ivk 5322 1 80.20 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGAA:1 - chr3L 13374707 3' + Transpac 265 2 80.00 AATCATACTTCAATTGTTTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACACTCGCTTATGTTAACGCCAAGTGAGAAGTGATAAGCCATTGGGCGCCAGTTTCAAGTGG:1 - chrX 3443181 3' + Quasimodo 7279 2 51.49 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATAAGGAGCTTGGTTGCCTT:1 + chr2L 12866968 3' - mdg1 7051 2 65.62 CCCTACCTGTTAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATATAACCATGTAAAATAGACACTTTTTTTCTGCATTTTTCATTTGTTGATGGCAACTCAAAAGAAA:1 + chr3R 23980342 3' - Circe 7184 1 61.39 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACAAACAGATAAAGGCCAGCGCCTGCATTTTGGTGGCAGTGGCGGCGTGGGGCGTGGCAAACA:1 + chr3R 11321097 3' - hobo 15 1 64.36 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACGTACTACAGAATTAATTACGTAATAAGGAACCTTTTTATTCATTCCATAC:1 - 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pogo 48 1 74.00 AGACCTTGTGATCTAGGCTNAGCGGAGAACCAGAGTTGAAGTTATTGTTATGTCTTCGATCGTAAACAAGAAAAATCAAAATGATATCAACGAAACAAAAG:1 - chr3R 24681889 3' - F-element 4214 1 70.30 GTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCGACCGTATCCACTGGGGGCAGTTTGGTTGGCCGGCATCTGGTGCGGATGATGGTGCAGC:1 - chr2R 674592 3' - F-element 4398 1 58.42 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAAACTTATTTATCATAG:1 + chr3R 11151917 3' - mdg3 5257 1 72.00 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTG:1 + chr3L 9928587 3' - roo 48 2 79.21 CCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTGCTCCGTGGAGTCCGGGGAGCAGAACTGTGGAATGGAGTCGCCGGCACTGGCGACTTGCTTTAAATTAT:1 + chrX 6375645 3' - Gypsy6A_LTR 347 1 56.44 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTATATATATATAATATACCCAATGATATACACGAGAAATCA:1 - chr2L 6569165 3' - 297 6611 2 73.27 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTTTTCGTGCGCACTTCGG:1 + chrX 4166425 3' + I-element 5308 1 72.28 AGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCATCGTAATCGTTATCACAAGTGGTTTTGTTTTCCTTTTTGAT:1 + chr2R 7915143 3' + 412 188 2 58.42 GCCAAACCAATGTATGGCCNTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGCCTTTGCTATTCATGCTCATAGGGGGTAAGAAAAGTACACTTAGAGAGTTTTTTATGT:1 - chr3R 13353199 3' + 1360 3361 1 51.49 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTGTGTCCGGCTTCCTGTATGCCGTCCCCTGTCGACGTGCCACATTG:1 - chr3L 13295186 3' + hopper 1414 2 78.00 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAGAAATCGA:1 + chr3R 8582622 3' + roo 387 2 57.43 TACAATAAGCATATATGAAAATAAACATTCTCCAACATTTCGAATCAAAATGGAAATTTGCAAAATCAATGCGAAATGTTTCTACAATTTTACAAATTTC:1 + chr2R 17385449 3' + TLD2_LTR 121 1 49.00 GAATGTAAATAAAGATAAANGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAAGAATGAAGTTGAAAAGGCTTGGTCTGTCAAGTACGT:1 + chr4 74321 3' - 3S18 5805 2 61.39 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCGCTTGAAATATAATTGGACATATTTAAAGCAGTATACCTTAACTTTGGATATAGGTAGCTTAAG:1 + chr3L 20755424 3' - I-element 14 1 65.35 AAGACGACGCACCGTGAACTAACTGGACCTCGTAACCCAGCAGGACGTCCGCAAAAGGGAAAATAACGGGATCCCTGCGGCCTATAAAAGGACGGCGCAAG:1 + chr3L 24300074 3' + gypsy8 4902 2 55.45 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTGCTTTGAAAGCGATGTTCTTCGGTTAATTGTGAGTGACAACTC:1 + chrX 16671127 3' + P-element 2857 1 49.00 TCTCAGGAACTATAAACGCTAAAGGGTTGATATTGAGGTTAATGATAGAGACCACGACGCAGCGCCCACATTAGATTGTTCTTAGTTTTATTGTTCACCTT:1 - 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McClintock 5961 2 66.67 CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCTAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTA:1 + chr3L 19274880 3' + transib2 2798 1 50.50 AGTTGTTTACAAAAATTATATGATTAAAAAAGATACGTAGATCCACATGTATTAATAGATGTGTTTATGCTAGCTTAATATCCCTTATATATTCCCTTTAT:1 - chr2R 9050276 3' - jockey2 3288 1 33.66 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGAT:1 + chrX 15546206 3' - blood 43 2 66.34 TCATGTGTATTCTAACATANCTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACTGTCATTGTGCATAAAATTCCGATATAAACCC:1 + chr2R 17459218 3' - Transpac 38 2 65.35 TTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCACTCCGGAAGCGGGAGCAATTG:1 - chr2R 23519243 3' - jockey 4812 1 75.00 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTGCACCCATTGTTTGCTGCCGCACAT:1 + chr2R 13653425 3' - F-element 31 1 53.47 ATATGTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGGAGACATCACCATTCTGAAATCCAAACTATGAGCTGCGTTTTGTTTGCCTG:1 - chr3L 10043562 3' - G6 1904 1 49.50 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATAAGGAGCTTGGTTGCCTTGCAAATTC:1 + chr2L 12866976 3' - mdg1 10 2 70.30 ATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGCTCTGACTGGCAACTTTGCCAG:1 + chr2R 14997947 3' - McClintock 5955 2 75.00 AACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTAACTTAAATACGTGATGTATGTGATGGGGAGCAGTATGTGGGGAGGGGGTAAAGAAAATCAAAG:1 + chr3R 8391966 3' - Idefix 7045 2 66.34 TCTTGTTATTCTAGTGTCTNTGGACAGGGGGTATGCTCTGCACACACTTATGACAAAACCAGATGGAAGCTAAACCGCATTTATAAGTCGGTACGGACAAC:1 + chr3R 19963482 3' + 1360 3388 2 63.37 GGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTAGGAGGATATAGGAGTTTTCGTGTTGGTGAGTTGGTGATGTTCGTTAGTGATTGGTTAACTCT:1 - chr3R 25601608 3' - F-element 356 1 77.23 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTCCCGAACATTGCAGCCCTGGGTGCAATGTTCGGGAGTACAGTAGC:1 - chr3R 21365551 3' + P-element 2875 1 50.50 GGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCTGACTGGGTCGCAGTACCCCATCGGAGGGGAGCGGAACCCAAAGCCCCGACTTGATGATCGTCGA:1 + chr3R 5010724 3' + baggins 5376 1 54.46 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAGTGTGTTTATGCGTTGGTAAATTAAATTTGAA:2 + chr2L 7666187 3' + roo 9054 2 62.38 TAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGATACAATAGCTTACTCAAGTTTCGATTAGGTGTGCGAACAAACAAAGACTACGGTGCAAAGAATTATC:1 + chr3L 11178187 3' - invader2 4686 1 73.27 TTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCT:2 + chr3L 19339419 3' - Tc1 36 1 55.45 CGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGAGAGCGAGCGAGAGAAATGCAGAGGGGACTCTGGAGAAATGTTAATAATTACAAAAGCGATTAT:1 - chr3L 4430644 3' - Stalker2 31 2 73.27 CTAATATGTACAATGTAAATTAATTTCTTCCTGCCGAATCAACACCATTTTAAGGGTATAAAAGGCTTCTGCACTTCAATGACTCCCTGTTTTCTTTACGT:1 - chr2L 2328454 3' + 1360 3148 1 76.24 AGCTACAAGTTGAAGCCTTTTTTTCATGAAACGAAAAGATTTTTGCTAATGACAATGGACTGCGGACTAGGTTATTAGTCACACCTTGAACTAAATTGTAC:1 + chr3R 4492751 3' - S-element 1390 1 68.32 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCGACACACGT:1 - chr2R 15788590 3' - Transpac 4966 2 67.33 TTTTATTTTTTTTTAAATATAAGATCCAAGCAGCTTGTGTGTATGGTTCTGTGTAAGTAATCAATTGCATTAATTACTTTAAATGTTGGCCAAGACACAAG:1 + chr2L 15163016 3' - transib2 2633 1 65.35 ACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAATCTCCGAATCTTAAAAGGGGGGAGGATACTGCGGA:1 - chr2L 18900568 3' - 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Tc1 1628 1 53.47 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGA:2 + chr2L 18213210 3' - hopper 45 1 70.30 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATTTC:1 - chr2R 17963244 3' - blood 7056 2 73.27 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTAC:1 + chr3R 30553602 3' - 412 7102 2 72.28 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGA:1 - chr3R 11151814 3' + mdg3 5474 2 55.45 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGGTTAAACTACATCAAAATGTTCTATTTTCA:1 - chr2L 14341850 3' - copia 4916 2 68.32 TACCTGTTACATTCATTTCAAGGAATCTAGTAATAATCTAGTACAGATAGTTATATTTGTACAACGTATTTGTTGTCATTAAGATTAAATTACATTAAACC:1 - chr3R 31953797 3' - INE-1 20 1 28.71 TAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTCAGTCGATTTTGGGAGATTAGAAGCTTCGGTCCAACAGTTGGCGCATTTAATTTGCTGGTCTTATACTTTT:1 - chr2L 7168053 3' + Burdock 106 2 61.39 GTATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGTGCTATGTGTGCCCAGCTGTGCAATTGTTGACATTGACCCGAAAAGCAAAGCAAAGGCCGAAGCTCAA:1 - 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chrX 21009356 3' - hopper 50 1 73.27 TCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGCAGCCTTTTTGTACAGCTGGCGATCGATCTGCGCCCTGGGCCCCCAAACAGCTG:1 - chr2R 22492580 3' + 297 52 2 58.59 AGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCAAAACTAACACGCCCACGATTTTAAAAAATGTTTAGATTTTTTTTGCGCTTAACTTTGTGGCTCCATCTGTT:1 + chrX 20996624 3' + INE-1 105 1 70.30 TCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCAAATCCCAAAAACCAATCCAATCGCCATCATAAACAAAGGATAAAACTGAGGGCGAAACAATAGAGTT:1 + chrX 4187603 3' + F-element 295 1 70.30 TGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTCTGTAATTCAAAGAAATTTTTTTGAGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGG:1 + chr3L 5015860 3' - roo 410 1 61.39 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATATATTAAGTACATTCATATTTCAACTTA:1 - chrX 14173007 3' - 412 48 2 77.23 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTTAATCGGTTTATGGTGCACGAGTAATTGAATTTCGCGACGGCGCCAGGTAAATGCAACCAGGTAGCA:1 - chr3R 5135430 3' + 297 389 2 75.25 GTCGAATAAAGAGATTGTGNAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCG:1 - chrX 15263440 3' + invader3 232 2 70.30 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATCTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCC:1 - chr3L 25059067 3' - mdg1 24 2 55.45 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCAGACGAAATGTTTCCGCTCCAATGAGCTGCTGAAATATG:1 - chr2L 1783305 3' + roo 9036 1 62.38 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCTACTGTGGCATGCCCCGCCCCCTTTATAATTTTTCACCGGC:1 - chr3L 19861781 3' + 1360 3355 1 62.00 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGATTATTTATGAGACCCATTAATGGGCAGGTTGTCAGCAGCTCTATTCATCTTGGGGCATACTTTCGGGCCGAGCACACA:1 - chr2R 16609383 3' - jockey 4758 1 80.20 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGAGTGCTGAAACAATTATTGACAATTCTTATTTATTGGCTTAAAGC:1 - chr2R 11940995 3' + 297 6945 2 56.44 TGGTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCAGAAACTGCGGCGTCTGTCGGCTTGTTAAGTGGAGTGTTGGAGGTTGTCGGG:1 - chr3L 5866008 3' - HMS-Beagle 6640 1 57.14 TTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGC:1 - chr2R 6438355 3' + Stalker4 370 2 64.36 ACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAATGAAACCGAATCCTGCCTATGGCATTTGCGCTGATACAAAAGATGGATTAT:1 - chrX 7292640 3' - 3S18 2 2 77.23 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAATC:1 - chr3L 9928534 3' + roo 9040 1 57.43 GAGTGCCCGGCTGAACGGAGGGGAAGCCACCCCTATAACTAGGAAACGAAATAGATTAAATTTGTAATTTTTTATTATTCAAATAGAGTTGCATTTTGTAT:1 - chr3L 21783157 3' + aurora-element 490 1 65.35 CAGATATCTTGCCGATGCANCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGTGTAGATTTCTCTCATACCATTCTGATTTACATT:1 + chr3R 15579037 3' - pogo 32 1 57.43 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCAC:1 + chrX 4399568 3' - I-element 51 1 81.19 TAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGATGCTGGGCCGAATGCAGCCCTGTGCCCCCGCCCGACCAATCGCAATCGCGGCTCAGTTCCTGGAAAACCATGGC:1 + chrX 9026788 3' - opus 7335 2 74.26 AGCAAGACGATTCGTTTATCGTCCAGCCCTCCCACTACCGACTCTTACCCATAAAATATGCAAATAAGTGTGTGAATGCAGTTCAAACTTTACTTTTCAAC:1 - chr2R 13934397 3' + BS4 594 1 71.29 GACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAACGCGACAGTTATGGGATGTTTCTGAGAAATATAAATTAACATGACAAATAATTTAACAAAAATCAAC:1 + chr2L 21874821 3' - INE-1 549 1 65.35 CTAGAGTACCGAGTGTTTANCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTGTAGGCTGTCATGTTAACATGGGAGAAAGCTTTCTCC:1 - chr3L 14594121 3' + hobo 2899 1 62.38 TTTAAAAATATTTTATTTAAAAAATGGAATAATGTACAAAAAATTAGGGATGTTTACATATTTGAGGCTACTACTACTACATTTTTCATAGACCTTACATA:1 - chr2L 18603554 3' - hopper 166 1 71.29 TGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTATCTTGGATAGGGATGGTAGCCACGGTGGCTCAGAAAAATAA:1 + chr2L 5419037 3' - I-element 5109 1 65.35 TTGTCGTAATAATAATTCGTAAGCGTTTTAATTGAATGATCCGACGGTGGGGTTAACAAGCGTGGCGGCCCCAAAAGTTCGTCGCCTAAGTCTTTCGTTAG:1 - chr3R 13906827 3' - BS 320 1 58.42 CTTGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGAGTCAAAACGTAAATCTACCTGCATGTTTTACTAAGTACACGTATTTTATTGATTACGAAATTATGA:1 + chr3L 11820352 3' + Q-element 573 2 64.36 AAGCGAAAACTAAGCCCGCAAAATTATCTAATGGCATCGACATAAAAAGAGTTCAAAAACGAACAAAAGCCGAACAAAAACTTATCATTAAGACCATAAAT:1 + chr2L 20975382 3' + Fw2 41 1 71.29 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTT:1 - chr2L 20560353 3' - F-element 56 1 72.63 TCTACAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCTGATCACGGGGAATTTACTGGCACGTAGTGCA:1 + chr3L 24148665 3' - hopper 40 1 72.28 CAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGGTTTCCCCCCTTAAAACCATTGCGATCCAATTTGATTTAAG:1 - chrX 8094801 3' + copia 4910 2 59.41 TGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCCGAAGAAACTTCTTTCATAATTAAAAAATTGTTTATTGGAATGCAATATTTAGTG:1 - chrX 10451278 3' + hobo 477 1 55.45 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATTTCTCTTTATCTTTTCTCAC:1 - chr2L 13093763 3' + roo 386 2 56.44 TTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGCGTCCTCCGTTTTCAACTTATCATTGGTATCCTGTGCGTGTCTACTCCTCCTCTTCCAGCGACTTTTCGGGTAGTCC:1 + chrX 3478365 3' - Tirant 8355 2 64.36 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGGCAATAAGTAAGAAATAAATGAAACCTCAAATAAATGG:1 + chr2R 11941068 3' - 297 6611 2 61.00 TAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATAAACGAAAAGCTTTTGTAACCAAATTGAAAATA:1 + chr2L 18935141 3' + roo 309 2 67.33 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGAAAGATAAAAAAAAAACATGCAAATGTCAGCGGGGGAATTGGTGTTTTGGCCAGTGAAAACAAACA:1 - chr3R 23338248 3' - roo 8675 2 65.35 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATAC:1 - chr3L 1586741 3' - Tirant 8139 2 73.75 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGAGCGCCCAAAACAAATT:1 + chr3L 7099642 3' + roo 9030 1 69.31 AAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCATAAGGCCAAGGCACAAAAAGAGCCTTCCGTGGCCTTATAAATAGCCATGCTAACTGACTGACT:1 - chr2L 7541376 3' + jockey 4743 1 61.39 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTAAAACAAATAAAAAAATTGTTCTTACTGGTTTGAATAATATTAATTCCTAGCCAAGTGTG:1 - chr3L 16546759 3' + pogo 2088 1 67.33 ACGTACATACCAGGAACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGTGCGATTTTGTATCACCTGGATACGTTTATAATTAGATGCTCGCTTGGGAGGATTTGTGGATG:1 - chr2R 21500057 3' - Helena 1161 1 75.25 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGATTGAGTTGTTAGGCCATAGG:1 + chr3L 12112379 3' + 1360 3335 1 81.19 CTAGAGCCACGGCGAAAAAGTCGTGTGGCAAAAAATCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGAACTCTATGTATATATGTACTCTAAATATATATGTACG:1 - chr3L 24272121 3' - 1360 53 1 48.51 GGAGCACCGTGGTACGTTCGAAGTGATAAGTTGCATAGGGATTTATTCATAATTCCGGTCAGAGATGAAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAA:1 + chr3R 19446212 3' + Fw2 3641 1 73.27 TAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGCATATTATTTATACTCTTATACTTGAGTCCTATTCGAGTGCCCCGTGCAGTATGCTTTTTTAATTG:1 - chrX 1706018 3' - Juan 4059 1 63.37 GAGCCAGAACGACACTCGCGCCAGCTCTCAATTCATCTTAACGCGTACTTTTCTTATAACCGTGTTCGAGATGCCTAACACAAATACAATAATAACAGGAC:1 + chr4 1253220 3' + F-element 194 1 60.40 TAGTTCCTGAAATCTCGACGTTCATACGGATATCCTGATCAAGATATATATACTTTATATGGTCGGAAATGCTTCCTTCTGCCTTTTACATACTTTTCAAC:1 - chr3L 19471447 3' - INE-1 142 1 79.21 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTCATGCTATCCTGCTTTCCGACGGGTCCTTGCCA:1 + chr3R 23543033 3' - 412 18 2 61.39 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCTACACACACAGAAACACACTTAAAGCGCGCAGCGAGGATCGCATACCGCACTG:1 - chr3R 17053049 3' - hopper 12 2 67.37 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAAATCCCC:1 + chr3R 29287560 3' + hobo 2908 1 61.05 AGGGGTAGTGCAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACATAATAACAATTGGAGGGGAAGTAGGGCTTCCAGAGATCTCCTTTCGCTTG:1 - chr2R 1245228 3' + baggins 5393 1 56.44 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAA:1 - chrX 21217508 3' + pogo 2067 1 61.22 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTGCAACGGCGGCTAAAGCGTTTGGA:1 - chrX 4277438 3' + roo 403 1 78.79 TTTTTTTGTTTTTTTTTGTAAATTATGCACCTATTAATGTTTAAAATGCAAATGCCGGGACGGCACAGGACGACGACTAAATGGCTGCGAGACATTTGCG:1 - chr3L 6816865 3' - TART-C 11100 3 77.00 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCA:1 - chr3R 10110425 3' - Doc 36 1 57.43 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTGATCGATTAGGAACTAGGTTAAGAGAAATTTGAAC:2 - chrX 19334572 3' - roo 19 2 61.39 TAAGTTTCTCGATAATATTTGTATGTATGTACGTACGTACGTGCAGGGAGGTGGAAAATTCGAGGGAAAAACTGTATGTGTGTTCGAG:1 + chr2R 17644169 3' - mdg3 112 2 76.14 ACAAAGACAAAAAATGCAAAATACTTTATATATTTGTTTAAATCGGATTTAATCGGAGCGAAAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAA:1 - chr2R 3341947 3' - Cr1a 188 1 46.67 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGTTCACACATCAAATTAGTTCAATTTGCG:1 - chrX 2841756 3' + hopper 1399 1 63.37 GATGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACAGGATGGTGG:1 - chr3L 16792546 3' - Chimpo 4036 1 55.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCCAACATGTCAGGGGAGTTCCCATTCTCCATTC:1 - chr3R 8765516 3' + roo 401 1 71.29 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGA:1 - chr2R 18723043 3' - HMS-Beagle 15 2 55.00 TTTTTTTTTATTTTTGGCCCTTCTTTTTGGTTCGGGGTTTTCAGGATTTTTTTGTTTTTTGTTTTGGGTTTTT:1 + chr2L 20129372 3' - Transib5 16 1 52.05 GCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATACATATATTATCAATCGGACTTATTTGTTGGATGATTT:1 + chrX 20419187 3' - flea 38 2 69.31 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAAAGGTAACG:1 - chr2L 20560338 3' - F-element 46 1 59.00 AAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCTCCGTTTTGGTCAGGATCCAATCGCGATACTGGTGTGGTATATACTCCACCAGCTTGTCGGCGATGTCCGGATTC:1 + chr3L 9507696 3' - rover 317 2 80.20 GCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAG:1 + chr2R 14997907 3' - McClintock 44 2 76.24 TTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCA:1 - chr2R 7546272 3' + hopper 64 1 66.34 GGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGCTAAGAAGAAGGAGCGGCAACAGCTGTAATAAGACAGCTCGTCTGCCCCGGCTCTGTCTT:1 - chr3L 17779558 3' + Stalker 7037 4 66.34 ATGTTCTGATTTTATACAGTGCTTATTCGATATTTGTTTTTGCAAGTACTTTGCATGGGTGAAGATGCAACCGAAACCACCCACACACACACACACACACA:1 + chr3R 27499989 3' - Tabor 6865 2 74.26 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAG:1 + chr3R 20905457 3' + pogo 2062 1 64.29 CAATTTCATTGTTATTTTTTTTTTATTGAAAGTGAAAGATGGCTAGGGGTTACGGGTTACGGGATGCCAGCTAGCTGATTCCGATGGAGAGCGAGAAAAAA:1 + chr3R 27754059 3' - transib2 2645 1 59.41 CTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAAAAAATATTAAGCAGCTTATTCGGATTTTGATTTCTTACT:1 + chr2L 18655235 3' - Doc 11 1 69.31 AATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCTTTGGCTAATTAACTCTAACCAGAGTTCATAGAACAAGGAATTTTTAATTTAAAACAAACGAGA:1 + chrX 9339532 3' + Burdock 325 1 57.43 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGATTCGTATGTCACTGTGCTCTGCAAGTGTGTGAGCGAGTGTGAGTACCGCATGTGTGTGTG:1 + chr3L 8268228 3' + hobo 2920 1 56.44 TATTGAGCCTCCTTGGGGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGTTTGAAATTTAACGAATTTATTGTACCTTCC:1 - chr3L 1549001 3' - X-element 4473 1 54.17 CCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTATGCATACATAGAGCCTATCCCCCTGGTCCATTGACTGGAT:1 - chr2R 16528572 3' + Stalker 180 4 70.30 TTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAAGATATTATTACTTTAAAAACAATATAAGAGATCTCAACAGTTGTATCACAATATGTTTATATTCCAATC:1 + chr2R 20571438 3' - mdg3 5089 1 68.32 TCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAAAACATGTTCACGTATGTGAATCGAACAAATAAAAAACGAATTA:1 - chrX 3465746 3' + hopper 45 1 56.44 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCT:1 - chrX 21087566 3' - mdg3 5263 1 64.36 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCATACATATTCTACAAAATTTTGTTTCGAGTTTAT:1 - chr3L 18103036 3' + copia 241 1 38.61 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGAT:1 - chr3L 3650051 3' + mdg1 378 2 66.34 ATGGCCAGATTGACTCGGCTATTGATCCTAATCACGAATATCATCACGAATATACATACTTTATATGGTCGGAATCGAGTAACGGATATAACACTCCAGAC:1 + chrX 158234 3' - INE-1 103 1 75.25 AAATTTAAATTTATTTTTAAACATGCTTTCCTCGCACGCATGTATTCGATTGTCATGCATTCTTTTGGTATAAGTTCTAGAATTATACATGTGAACAGGCA:1 - chr3L 9824303 3' - NOF 3955 1 88.12 TTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATTTTATAAGGTTCAGAGA:1 + chrX 21587727 3' - INE-1 122 1 64.36 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTTATTGTTTGCAAAAGTTTTCACCT:1 + chr3R 17660526 3' + roo 355 2 78.22 CCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTCCTCGCATTTCTAAAGTTTTATATTTGCTTAAACAATTTGATGGCAGGGCAATGGCTGAAGGCAGA:1 - chr2L 19642276 3' + Quasimodo 7364 2 77.23 TCTCAACGTTCATACGGACAGACGGACATCCTGATCAAGAATATATATAATTTCTATAGTCGGAAACGCTTCCTTATGCCTGTTACATACTTTTCAAGGAA:1 - chrX 124083 3' - INE-1 130 1 81.19 GACGGGACCACCTTATGTTNTTTCATCATGGGTCGGTCACACTGGGCAGGCTTGCCAATTTCAAGAGCCGCGGCCACACTACTGCGAATTCTATACTGC:1 - chr2R 9693287 3' - P-element 9 2 69.70 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAATATATTTTTAAATATTAAAATCAAAAAATTTGGAACCCTATATTCTAAATCTATAGT:1 + chr3L 20584099 3' - pogo 14 1 60.40 ACCTTCAGAGATCATGTTTTTAATCAAATTTTTTTTCGGCGGTACAATGCTTTCCGCAGCAATTGCAATTTGATAATACCCCCTTTTTAAAGCAAGTAAAG:1 - chr2R 4877356 3' - Tc1 403 1 55.45 CCATGGATACGGTAGCAGGCCGATGGAACCCGTCATCCGCCAGCATGATGTCCCTGTACTTGTCCTAAATGGCAGGCCCCGTCCAAAAATCTACGCATCGA:1 + chr2R 92943 3' - GATE 8049 1 61.39 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTACAAGCACATAAACACAAATACATACTAATATGTGTGTTGGGCTGCTCCATTTCGGGATAAAAAGGAAGAGCATC:1 + chr3L 14594209 3' - hobo 2 1 76.24 TATGTTATTAATTTTAGTAATTAATCAACTGGATCCCAAGTAGAAATTCATCACAGAAAAATATATTCCCTTAGACAATAAGTTTCACTTTGATTATAAAT:1 - chr3L 18334406 3' - HeT-A 41 1 63.37 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGCGTGTGTTTGGTCTTCATCTTAGCTCGGCACAGGGTTGCTCTTTTGCTTGCCAAGGATAAGAAGAATGCT:1 - chrX 14651056 3' + P-element 2881 2 73.27 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGGGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCT:1 - chr2L 9045431 3' + jockey 4948 1 68.32 AGTTCAAATACGGATCATTTATTCGGCTCAGAACAATAACTATTGTACTTTATATTAAGTTTTGCGTAGATTCTGTCTTTTAATGGTAGTGAGTGTAGTGC:1 - chr2R 4820935 3' + Tom1 362 1 54.46 TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCGATTAGATATGAGTATTTTT:1 - chr3R 11052098 3' - blood 30 2 59.41 TATTGTTAGACACGAACCTNTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTATTATAATTATGCTGGCATCTTCACAGATGTTGTTGCCGTTAACT:1 + chrX 8727952 3' - X-element 10 1 69.31 AATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACACATTTCCCATCTGCCAGGATCTCCTGCATC:1 + chr2R 23175245 3' + 1360 3159 1 70.30 TACCCTCGATATATGCACATACTACAATATCAATAACAATGCGAATTACGGGGCAATAGTTGAGCGGTCGCTTCATAAAAACCAGATGTTAATATTTTTCC:1 - chr3R 12767248 3' - blood 5 2 74.26 ATAAATTGTTCTCCGCGATGCAGAAAACATTTCTGACAATTCCGTGACTGGTGGCCCGTAGTTAAATACAATAAATCCTCACGTGTCGCGTTTTTACGTGA:1 + chr4 123550 3' - S2 498 1 52.48 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTA:1 + chr3R 12767335 3' + blood 7348 2 67.33 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGGAGAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTTGCCTTTTTGCTAAACAGTCCGCGGAA:1 - chr2R 21747525 3' - mdg1 7063 2 51.49 AATTTTTTCATAGCACTGCTATTTCATTGAACACCAGAATTTCTGCCTATTATGTTGTTTTAAATTTCATAAAGACAGTATTTTCGATATTTCCCGCATAA:1 + chr2L 92102 3' + HB 1414 1 70.30 ATCTATTTTAAATTATTTAAAAATGTTTCCTATCTTCGTTAAGATAAATTTCCCGTTTAACAGTATAAACCAGTGTAAGCTAAAAATCGTAGAGCTTGTAA:1 + chr3R 29651683 3' - Transib5 257 1 74.26 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATTCTTATAAAAGCTTATATCCTGAAGCTGTC:1 + chr3L 13773062 3' + pogo 2057 1 70.30 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCGTATGTCACTGTGCTCTGCAAG:1 + chr3L 8268193 3' + hobo 2914 1 68.06 CATTAAGGTCTTGAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGAGAGTTGAAATTTGCAAATGCCAATTCTTGTTATCAGCCCCATAAATCAAAACATTTGATT:1 - chrX 11981943 3' - baggins 5079 1 63.00 TTTAAATATATTCGTGTTCNTGTGTGAACACATAGTATAGGTGCAATTAATTTAGACGCGCTCACTTAAATCGATTACTTATTTGTATTTGTATGTGTACT:1 + chr3R 25021769 3' - roo 9 2 71.29 ATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACCATTTTCGTAGATTTGTCAAAGACTTTGCAGTGACTCCTAAGC:1 - chr3L 23866785 3' - pogo 1737 1 57.43 TGTATAATTAGGTATGTATNACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTAAGCATCTGAGCGGCCTAAAACTCCCCTGAGAAG:1 - chr2R 10372121 3' - mdg3 5293 2 63.37 TCGGAGAGAAGCTCCAGAACATCCCCGAAAAATATATGGAACGACTTTTTGTGGTGGCGGCGGGCCGTATTTATTTAATATTGTATTTTTTCATACATTTT:1 - chr4 713051 3' + jockey 4620 1 53.47 TTTTTTTTATTTTTTTTTATCGACGCTCATCTGTCTGTCTGAAC:1 + chrX 4528251 3' - R2-element 3581 2 77.27 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCAACTCAAGTGCACTCTTAGCTC:1 - chr2R 9649177 3' + roo 9040 1 61.05 CATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCAGATCTGGTAACAAATGAAGTGACAAAATGT:1 + chr2L 21943661 3' + opus 7236 2 69.31 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGTGC:2 + chr2L 18213238 3' - hopper 17 1 62.38 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAGACGCCCAACAACTGAC:2 - chr3L 699765 3' + P-element 2829 1 22.77 AGCGATCTTGCATCACATAGAGCGTCTTTTTCACTTTCGGATTGAATCACAAAATCGATTTCGGATTACACAGAGAGTGCGCGAGTTACCATAACAGCGAC:1 - chr3R 442996 3' - F-element 132 1 63.37 GCACTATGCATACACTTTTTTGTGACGGCTAAAATTCCTCTCTTAGGAAACTTCCTGCATCTGAACAGTGGGAAGAAGTTCCAGCTTAGCTGGGTGTCCGT:1 + chr2R 13125103 3' - 1360 3341 1 55.45 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAAAT:1 - chr3R 10087818 3' + roo 9044 1 51.49 ACGCCTGCAGAGAACGCACNCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATTCACACAGGCAGCAACAACAAATGCGCCTATAGTGCCACAGCGAATGATAT:1 + chr2L 11963156 3' + G2 2915 1 61.39 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAATCAAT:2 - chr3R 7469971 3' - Doc 56 1 72.28 GAAGACAAGCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCAGGTGTATACATATGTGATCCATAAAGAAATTGTACAAATAAAGTGAAAAA:1 + chrX 17268059 3' + X-element 4495 1 55.45 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCTACACACACAGAAACACACTTAAAGCGCGCAGCGAGGATCGCATACCGCACTGAGAGAAAAG:1 - chr3R 17053040 3' + hopper 1408 2 71.72 TAATTGGTAAAACAAAAAAAAAGTTCAAATTTAGGCGTGAACTAAATAGAAAAAAAAAATCACTAAAAAAGCTCGGTAAATGAAAAAAAAGAAGAAAACGG:1 - chr3R 23560897 3' - Tc1 1478 1 65.35 AAACTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCAAAGTTTAGGAGAAAATGCTGGAAA:1 - chr2L 17734107 3' + pogo 1852 1 76.24 CTTACTCTACAACTCCGTCCTAAAACCGACCTGGACCAGATCCGTAAGCAAGCTTAGCCGAAACGACCAGTCCAGCTTGATCTCATCCATGATAAGCACAT:1 + chr3R 4496998 3' + Fw2 3517 1 67.33 GGACATGGCTAGATCGACTCGGGTATTGATCCTGAAAATGTTACACACATAAATACTTTTTAACTGATCTAGTATACCCTTTTAGTCTAC:1 + chr3R 2473817 3' - INE-1 107 1 68.89 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAGATTGTTTTCAGCAAATGCATTACTATTGTCTGTATTTATGTGGTGCTAGCTCGCTCATATTTGT:1 + chrX 15800986 3' - roo 9 2 71.29 TCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACTCATGAATTACAAATAATCGAATTAATTTTGTCACAGCTGATATCAACTAGATCAAAAAGGGTAATAAACGAGT:1 + chr2R 5398772 3' - 1360 320 1 77.23 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAA:1 + chr2L 7666150 3' + roo 358 2 79.17 AAAAACAAGGAAAAAGAAACAAACAAAAAACGAACACAAGGAGGAGACGCAATAATAAAACCAAAAAACCGCAGCGACTGCAAAAAGAGAGAAAAAACTTT:1 - chr2L 21030417 3' + Doc2-element 235 1 66.34 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCAACTCAAGTGCACTCTTAGCTCGACAACTTGAGGCGGAATTCGTCCTGTATTGTGTGTG:1 - chr2R 9649140 3' + roo 408 1 78.22 CCCGACTATCAGATACCCGCTACTTAGCTAGCGTAAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGGAAGAAGCTATGAAATTGTATTATCCTTGTGAAAGT:1 + chr2L 10982228 3' - INE-1 552 1 71.29 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTA:1 - chr3R 19449422 3' + hobo 2927 1 67.33 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCCATCCCACGCACATGCAACAAGAAATGGC:1 - chr2L 10625686 3' + roo 9026 1 68.32 CTAGACTATGGCATTCTCTCTTGTTTTTATTTACAAATGATGCTGATAACCTAGTAGGTCTCTTTCTCTCTACTCTCTTAAATTGCACCAAATAGACGACT:1 - chr3R 18346609 3' + INE-1 577 1 36.63 AGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGACTGCTTGTGGTCCCTGGCGCTGCTCTCTTTCCAATGGCCGCAGAATTCCT:1 + chr2R 17745553 3' + 1360 415 1 60.40 TTATGAAAATGTTAAATTTGTTTTAATTTATATATTGATAACTTTTGCAATTTGAGAATAAGATCAATGAGTAGACACCACATGTAGAGTCAAAATTGTGT:1 - chr3L 16415270 3' + 1731 4256 1 78.22 GCGTGCCCCAACTCCGCCCCAATTTTATGTTTTTTTTTTCTCCACAATGAAAAGCAACCTTTCCACTGCCGCTAAAATAAACCTTTTTATACCCACATC:1 - chr3L 6548246 3' + hopper 123 1 72.73 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATTTTAACCCTTTTGTTTTATTGATAATATT:1 + chr3L 12303436 3' + blood 7345 2 71.29 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGGAGAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTTGCCTTTTTGCTAAACAGTCCGCGGAAAAGTTTGCCGGCAACAAAG:3 - chr2R 21747506 3' - mdg1 7044 2 68.32 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACTACGGGTGTTGATGGCGATCGATAACTAACCGGGTGAGAGTTGCAAACTATTTTGTATCGCTTTGGCGG:1 - chr2L 8176381 3' + 1360 3381 2 71.29 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTTAT:1 - chr2R 9870969 3' + roo 390 2 60.40 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCAATATCCGTCATAGCATTTAACTTAAATAACGAGTTGGT:1 + chr2L 13093837 3' - roo 8700 2 63.37 ATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTTAGTGTGTCTTAAAACCATTTGATCTTAG:1 - chr3L 17190005 3' + Tirant 281 2 71.29 ATAATAATAATAATAATAATAGAAAAGGTAAGTTTTTGAATTTTATTATTGTTTATAACATTTTGTAAACTTTAAAGATTAGTGAACGCTAAGTTGCTTGA:1 + chr3L 13097044 3' + mdg1 38 11 76.24 TGCTAAAATGGGATCTGGGNCAAAAGTGGGTTTCTGCATTACTCGTTGGTGAAAGGACCCATGTGCTATGGTGAATGTTGGCTCTTATCAGTGGTGTTCGG:1 - chr2L 15552496 3' - G2 384 1 73.27 TTGTTATTGTTGTTATTATTGTTGTTGTTATTGTTGGCACAGGCTCCTGCCCGCCAGGACGAGCTGCAGCTGGGATGAAGTAGGAGTGCGGGGTCTCCGGG:1 + chr3R 6137567 3' - mdg1 7061 2 68.32 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCGTCTAATTGAATATTGAACGAGGCTTTTAGTGTTGACTTTATTAGCGTTGCCACGTTGCCCGAA:1 - chr3L 9324607 3' - Quasimodo 37 2 79.21 ACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGTTTGCCACAGGACT:2 + chr3R 13739755 3' + Burdock 6372 2 60.40 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGAAA:1 - 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P-element 53 1 29.70 TTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGTCGTTGAAAAAGTCCGCGAAAAGTGGCTAGGACCATGAGGAATGGCCTCATGGACACATGGAAA:1 - chr2R 12457897 3' - HMS-Beagle 7 2 68.32 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGGGATTTCAGTTTCATCATGGCCAGATCGTGTCGCATGGTGTAGTC:1 + chr3L 7542007 3' - roo 31 2 56.44 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATAAAGTTTTTATTATCATAATAAACCGAATA:1 - chr3R 17003311 3' - pogo 41 1 67.33 TTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGATCTATTGGTCAGACACGAGATGATGCAGCATATAACTATTCCATCTTGAATAGAAGGATGTTTGTTT:1 - chr3L 4009397 3' + mdg3 243 2 66.33 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGCGGCAGGCAAAATTGAGCAAAGATGCCAGAACG:1 - chr2L 10792027 3' - 412 41 2 66.00 AGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACGAAGATGACCCATTTGTAAAGTGCAAAAAGTTGTAAAGTTT:1 - chrX 22426179 3' + 1731 4588 1 59.41 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTTACACACGCGGCAAAAAA:1 - chr3R 14193913 3' - pogo 46 1 71.29 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACTTTCGAAGATCTTATTCTTTTTGCT:1 - chr3L 4565490 3' + copia 238 1 73.27 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTGTGC:1 - chrX 734919 3' + Tabor 7282 2 63.37 CACACTTTTGATCTGCAAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAATGGTCGATGGGGAAGCGCGACAAAATGTGCTATTCCCACTGACTCCTTACGAAGGGCGC:1 - chr3L 11471865 3' + 3S18 244 2 62.38 TCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGATTGAACAACATTTTTAGAATGATTAAGTTCGTTATGG:1 - chr2L 12511545 3' - copia 4908 2 64.36 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTTTTAGCCCAT:1 - chr3R 17971663 3' + 412 7500 2 71.00 TTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAAAAAGCAAAAAGATACAAAAGAATCTTTGTGTGCATTTTTCTTTATTTTTTACGAGGGCTTAG:1 - chr2R 13769216 3' + roo 464 2 65.35 GCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTTTAGTTCCTGAGATCTGACGAAGATATTAACACAACGACTACCACATCTTACTCTTCTGGGTTTCGTTTTACAACG:1 + chr2L 178602 3' - INE-1 168 1 64.36 CCTAATACTAAATATGTGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTGCATCACTGTCCAGGATGCTTGTAGAACAAACTAGTGATCTTTCACGCTCA:1 + chr3R 12554053 3' + mdg1 7194 2 57.43 TCTTCATAAAAAATGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGTTCGATGAGCTCCAGAAAGGAGCAAATGGGAGCTTCTCAGACAGATAACCGTAACCATA:1 + chr2L 11704194 3' + Q-element 72 2 67.33 TAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGAAAATGCCAGGACTACAAATACGGCTTCGCTGGGGCGGCATT:1 - chr2R 6918574 3' + accord 7352 2 58.42 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGTGCCTTGTATCACTTGCCGTATAATTCGTTGTTTTTGTTTTTGC:1 + chr3L 19896608 3' + P-element 2856 1 48.51 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAATGGTAATTAGAACTAATTATTTAACTGAA:1 + chr3L 21519032 3' + 1360 3344 1 72.28 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTTTTTTTACTTTAGATTTGTTCATCATAATTCGCAAACGCATTTAAT:1 + chr3L 16153725 3' + pogo 2076 1 57.43 TGACGGCTGCACCCAACTGNAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGTAAAAATTGGC:1 + chr2L 7175617 3' + blood 332 2 69.31 TTTCTTTTTTGAGTTTTTCTTTGGTGCAATTTCCAGGACATCACTCTCTTTCACGCTAGAACTGTATCTATATATTGTGAAATTTATGTATATCTTATTTT:1 + chrX 12624787 3' + Tc3 43 1 52.48 TAGTAAGGTCATGTATCTGCTAATCGTCGTAGCTGGCTAATCGTAGCTGGATCTGGATCTCTTTAAATTCCAGACTGAGAAGCCGCTGTTGTTGTCAGGAA:1 - chr2L 23076661 3' + baggins 128 1 68.32 AGTACAGCAAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAATCATTACTGGAGCTCCATGGTATCTTCGGAACGAGAATGCATAGAAAACCCAGCAGAATTAAGTTAAGG:1 - chr2R 23277916 3' + Doc3-element 4374 1 73.27 TATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGC:1 - chr2L 20360645 3' + R1A1-element 142 1 69.31 TGATAGTCGGGGAACTAGACTATGGCATTCTCTCTTGTTTTTATTTACAAATGATGCTGATAACCTAGTAGGTCTCTTTCTCTCTACTCTCTTAAATTGCA:1 - chr3R 18346623 3' + INE-1 563 1 44.55 GAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGGGCTACTGACCACAATGTGTACTTAAGCATGGGCCGCACGTGCTGCAATGAACTCGTCAAACTCCAGTCGACAGAC:1 + chr2R 19048973 3' + hobo 2580 1 78.22 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGTT:1 + chr3R 9088630 3' - hopper 32 1 57.43 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTAAAATGCCAATATAATGTTCT:1 - chrX 10286145 3' + roo 9041 1 57.43 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATACCATTACCTCATTATGTAATTTGCTGTATCTGCACCTTC:1 - chr3R 17482004 3' - copia 4906 2 60.40 AAATTAAGTTGCCGCATGGNTAACAGTGCGTTGATATTTGCTTGTTAATTTCTAAGGAAACTATTACCTTAAGCTGTTAGCTTTTAACAAATCTGATTTAC:1 + chr2R 11161967 3' + jockey 4954 1 70.30 TAGTTAAATATTTTTTATTTTTTTTATATTAAGTCCTTCTAAAACTATTTTAAGCATAAGCTTTCGCTATTATTTTGACCGCGAGTGTACGCACAGATGCG:2 - chrX 14153688 3' - McClintock 6368 2 67.33 TTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATGTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGCAAACATCCTGGAAAGCATTTAGGAAAATCTTCCTACCAGC:1 + chr2L 12239244 3' - F-element 4414 1 57.43 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTCTCTATTGTTGTACCCGATACCTATTACC:1 + chr2R 5720519 3' - pogo 58 1 49.50 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAAGAACGTATTTATAAAAATAGTTGTTACATTAAAATAGTAAATTTCCATTTC:1 + chr3R 6947394 3' - I-element 27 1 52.48 TTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAACATTTGCCATTTATTTAAATATTTTTAAATTTTTCGATTGAGCGGAAAGTTTAGTTCCGAA:1 + chrX 22789404 3' - Tabor 16 2 61.39 TTTATAAGTGTTTTTTTTTGGCTTT:1 - chr3L 21397516 3' + transib1 10 2 84.00 CCTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCC:1 + chr3L 8039389 3' + hopper2 1554 1 77.23 GTTCACTTCACTCAAAACANCCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATG:1 - chr3R 4971426 3' - F-element 64 1 80.61 TTTTTGTTTTTGTTTTAATTTTCCCACTTTTGTGAGTGCTTGGCTGAAATGAGAAAAAACGCTGCACAAAGGACCATTTAAATAGTGGGTAATGTTCTACA:1 + chr2L 20615781 3' - Doc 4698 1 74.26 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAAAGTTTACAGTGCAGAGAGTACGACAGTCCTGCGCACAAGTATACGTAACAAATGGCCATGCAAAGCACGAAC:1 - chr2R 12252835 3' - jockey 4763 1 54.46 TATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAAAGCAATGAAAAACCGATGTTTATGCGCTTAATCATAGTGAAGAAATTGTGATG:1 + chr3L 27366354 3' + mdg1 6 2 55.45 ACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCCAAAAAGACACAGGCGCGCAACTATATA:1 + chrX 21009393 3' + hopper 1369 1 69.31 CAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCAGCTAATAAAGTCCATACTTTTATTTTGTAAATAAGGCCTAAACGCTACACGATCATTACTCAATTGGC:1 + chr2R 6010260 3' + Cr1a 3979 1 75.25 CCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGCTTTCGGTGCGGTTGAGTTTTCCTCTTGCCTTCTTCTCGTTGGCAAACCCGTTTTGTTTGTGCTT:1 + chrX 11686297 3' + Doc 173 1 70.30 AGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCGTTCGGCAGCGAGCGAAGGGACTTGGCGCCTTCGGAGCAGCGATACTTCTCC:1 + chr2R 20317536 3' + blood 7295 2 55.45 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGGTTTAGAATACGAATATTATTAACTATTCGATATCTAACA:1 + chr2R 21351377 3' - 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chr3R 9088573 3' + hopper2 1564 1 66.34 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACACACACATTTA:1 + chr3L 3540222 3' - mdg3 5266 1 65.35 TGTAGGTTGAATAGTATATNCCAACATATACCATTACCTCATTATGTAATTTGCTGTATCTGCACCTTCTAATTGTAGATCCCGCCGCGGGAATCGTGGAA:1 - chr3R 17481972 3' - copia 5 2 65.35 TTTCGCTTTTTTCAAAATTTTTTTTTTTAAATCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCGATTTGTTGATTCAATTTTAATTAGTTGATGTGAG:1 + chr3L 16165830 3' + FB 168 1 63.16 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCTTGTTGTATGATTTCAAAAGCGATGTAATATTATGCTATGTTTTTCACACTGCAGTTGAGCATCCTGTTAA:1 + chr2L 6362947 3' + 412 490 2 74.26 GTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATTTTGAGAGAAACCCTCGA:1 + chr3R 10741144 3' - 1360 3363 1 42.57 TAAAAAAAATAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAGCTTTAAAATAATTAAGCAAAATAAATCGCATGTCTACCCAAAACCAATAAAATGGCCCTAACAAA:1 - chr3L 18922722 3' + TART-C 11102 14 69.70 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTTTTAGCCCATTAGCAGCAGTTAAAGAACTT:2 - chr3R 17971643 3' + 412 466 2 51.49 TTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGACTATTTGGTACTCACGCATTTGCGCTTATTGGGACTCAGTACATAATCAGCTCCGAACTTCTTCATGTCCT:1 + chr3L 7321978 3' + hobo 2552 1 72.28 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACAAAAAGAAAAGCTTGGGAGTACAC:1 + chr2L 17079910 3' - 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diver2 49 2 70.30 ACAAAAAGAAAAGAAAACCAACCACAGGGGGTGAAAAGTTGGACTGCAAGCCAAAACAGAAGCGGGAGGCTGGGGGCAAAAAGTTTCCTATTGCGTTTTGC:1 - chr3L 5724519 3' + mdg3 5099 1 61.39 TATTATTGTTATTATTATTGGTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTT:1 - chr3L 25059065 3' - mdg1 7060 2 57.43 GAAATTCAGATGAAAAAAAGTCAACATCAAGCAACATCCCCTGCTTATTTGAGTGATTGCATTTCAGGTTTGATATGAATGTTTTTCAGCTTAATTTCTAA:1 + chr2L 5397180 3' + Doc2-element 4522 1 58.42 GGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCGAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTCGATGTGTGAAATTAAAAAATT:1 + chr3R 14334793 3' - X-element 4459 1 76.24 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCAAACCCGTTTATCGCTCGGCATAAAT:1 + chr3L 13895409 3' - hobo 50 1 72.28 GTTAACAAAACACAAAGACAAAAAATGCAAAATACTTTATATATTTGTTTAAATCGGATTTAATCGGAGCGAAAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAA:1 - chr2R 3341947 3' - Cr1a 199 1 52.48 TGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTGATTATGATATTTTTTAATGGAAGGCTGAAAGATGAAAGGCCCCAAGAGATGAAAGAAACTTCATCGCGA:1 + chr2L 17245097 3' - 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roo 4 2 75.25 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTAATATATAATTTTGAAGTAGTGCAGTAACTGGTGTGTAT:1 - chr3R 18790080 3' - I-element 38 1 68.32 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTATTATAGAACTCGGG:1 - chr2R 12473037 3' - Doc 15 1 58.00 AGATATTTCCAAATAAAATNAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAGATTGTCTTGGAAACAAAGTTCAATT:1 - chrX 11017006 3' + roo 9022 2 75.25 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTGAATTTAGGGCGTTTCCTGAGCTCATTAAAGTCACGTCG:1 - chr3L 7300497 3' - Doc 42 1 64.36 GTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCAAGATTAATGCGACCCTGTCGCTGGCACGTTGTCAACGAGATAAAT:1 + chr3L 3753626 3' + Bica 4626 1 55.45 GTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACCATATGTAGTCTAAGATTTTCAAACACGACGCTTTTCTTTCCTCTTGAAAA:1 - chr3R 7783729 3' - rover 22 2 58.42 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAAATTGATTTTAGTTATTACTACTAACCACCTTTCTTAGTTTCATAGGGTATT:1 - chr2L 3346245 3' - pogo 19 1 53.47 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATCGCAACCCGATCATCAGTTCGCAAGC:1 + chr3L 24761258 3' - 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S-element 8 2 71.29 GCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCACAAGTAGCAAATGGCAAGTGCAAGTGTAACAGCA:1 + chr3L 21124707 3' - micropia 5158 2 73.27 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCATTTTCGGTGTGAATCATTTAATATGATTTTTTCGAGTGCATC:1 + chr3R 17971717 3' - 412 7082 2 55.10 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCGCCGTTCCTGTTGGCCATTGATTTATTAGGTTCCGCCGTGCGG:2 - chr2R 6847233 3' - mdg1 7043 2 74.26 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTT:4 - chrX 21087564 3' - mdg3 5261 1 66.34 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGTAAGCCACTGAGTAATTGCAAACTGGTTAAACCCAATTGG:1 + chr2L 8470915 3' + roo 9037 1 56.44 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTTATGAGTACATTTTGCTCTTTACGAACTTTAAGATTTCTTT:1 - chrX 3661385 3' - roo 8700 2 62.38 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCATACCCTGAAGAAAGTGGCCGCCCAGCGGGATCTTTGGCTG:1 - chr2R 21988919 3' - 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hobo 2769 1 77.00 AATTGGTGGCATATATTGGNTTATTACACCTCCTACCCAGCCTTTGGAGCCCTTCTATAGCAAGCAGTAAATATGCATTTTGTTGAATTTTCCATTTCCAT:1 - chr3L 3880957 3' + blood 371 2 73.27 AACTTGCTGCGCTGACGTANAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCG:1 + chr3R 10391228 3' + invader4 3035 2 74.26 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACACACACATTTAAATCCGATT:3 + chr3L 3540231 3' - mdg3 5257 1 74.26 AAATTAAACAAAAAAAACAAAAATATACCTGCGGCCTATTTATAAAATGTCTAGAATGGCAAAAACAATTAAATTAAATTTTGCTACGTAAATCTGGCATA:1 + chr3R 7405029 3' + Doc 4699 1 52.48 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATCATTCGTTCTGAACTCCCAGCTATTTTCCGAGTTAGCTAACCATTTCT:1 - chr3L 7168314 3' - Doc 32 1 51.49 AAATTTTTGTTCAAATTATTTAGGCTGTCATATAAGTTTGTCAGCTTGTTTGGCTGCGTGTTAAACAAAAACGTGGCAACAACTTTCAAGTCAAAGTTTTC:1 + chr3R 10992147 3' - Rt1a 336 1 78.22 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGCACGTTTAATGCCTCCACAAAAGCAGAGGGAAAAATAATACTTAAATAAGGAGGAACA:1 + chr3L 3650122 3' - mdg1 7057 2 60.40 GGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGCATAACATTTTGTCCGGAAATGGGCATGGCCTAATCATCTTCGAAGAGGTTTCTGGT:2 - chr2L 14220136 3' + springer 363 2 58.42 AAAATAAAATATGCATGTAAGTAGACAAATACAGGCCACACTGAGTAGCCTAAAGGATAATATCCCTGTTGTCACTACTGTAAGGGCAGAACAGTGACTG:1 - chr2R 16918539 3' - Bari1 1523 1 59.00 CATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTGTCATAAAACCGAATAGATCGTAAATTAGGGTTTTCGAA:1 + chr3L 1586791 3' + Tirant 366 2 60.40 GGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACTTGCTAAAAGCGTCATAAATGATGGCATCTATGAACTTTTGAGTTCAACAACATTATT:1 - chrX 20276902 3' - 17.6 7038 2 62.38 TTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTACACCCGTTGTGTTGACCATGCGATCGAATT:1 + chr2R 19110881 3' - opus 388 2 70.00 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAACAGAATGCTTCTGACAACAATTTGCGGTGTTGGG:2 + chr3R 12333774 3' - P-element 39 1 40.59 GGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGCATAACATTTTGTCCGGAAATGGGCATGGCCTAATCATCTTCGAAGAGGTTTCTGGTATCGTTATGCATGGG:1 - chr2L 14220121 3' + springer 378 2 71.29 CTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAACTCTGATACTGGGAAACTCTCTCAATCACCTAGAGTTGTGGAGAGTTT:1 + chr3L 25876147 3' + copia 228 1 59.41 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTTTATGCTAGTTTGTA:2 - 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chr3R 15764787 3' + G6 1863 1 69.31 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGGAGTTCATCATTACAGGATATTGCAACACCAACAGTAAAGCCCCGCT:1 - chrX 21060321 3' + 412 7500 2 64.36 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTCTCGATCTCCCGATCCCTGGAGCGTGGTCATCATCACCACTTATTCGACTCCGTCAAGGCAAGGCA:1 + chr3R 5507174 3' + pogo 2095 1 70.30 AACGGTCGCTTGCGATCTTNAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTCCCCATTGACTCCGGCTCAGTTATAACCAGTTGGGAGGTTTT:1 + chr2R 18723111 3' + HMS-Beagle 7012 2 59.41 TCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAAAATGTTGGCAACGGAGGGGGAAATGAA:1 + chr2L 17779663 3' + invader4 245 2 73.27 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATGTTAATTGGGTTAGTTATTGAAATGAAAAGCCC:1 - chr2L 21086037 3' + roo 9030 1 72.28 TACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACAAGCTGACGGGGGAGCAAAATATATGACACACAATTCAAACTTGGGAATTGCATTGCAT:1 + chr2R 19559691 3' - Tirant 457 1 67.33 GACCAACTGCGTTTTGAGANTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGGGTAATTAAATTACGTGGCCCGCGGCAGCGCGCCTT:1 + chr2R 6847319 3' + mdg1 380 2 64.36 AGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCAGTGACAGAGGAACCCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGAGGAGCGCTATGGACAAAAGGTGAAAATAGTGC:1 - chr3L 20374433 3' + gypsy6 315 4 67.33 TAAAGTCTTCTTATTGGGGNTTTTACAAGCCAATTAAATTGTTTTCGCCATAAAAATGTGCAGCTACCGAGAAAA:1 - chr3L 13190092 3' + roo 403 1 66.67 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTTATTAATTCTCATAAAAAAATTGGTTAGTCTGGCCAAATCAGTCAAGGCAGAACTAAAATA:1 - chr3R 21588977 3' + flea 242 2 67.33 ATTGAGTTCTGATAAAAGAAAATTAGGCTGTATATTATCAGGACACTAGCGATTCGAGTCGCGATTCTCTGCCTATCCGATGTTTTAATATCTTGACCCAT:1 + chrX 21585904 3' + mariner2 873 1 84.16 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAACTCTTATCACAAGACAATTTGG:1 - chr2R 21074171 3' + jockey 4951 1 77.78 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTATGATATAAACGAAGCGAAGCGTTACAGCATACCAAAACATATTTATGCGCGTAGCTATTAT:1 + chr2R 14299369 3' + 412 437 2 68.32 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGCTCATCATTACAGTACAAAGAATGACACTAAGCTATATTGGATAAC:1 - chr2L 20570619 3' + 412 7501 2 71.29 GATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCACATGTTCGCCCTGGCCAAGGCCATTTCCATGACATCC:1 + chr2L 21084726 3' + roo 8939 2 65.66 GGCCGAGCGCTGGTGAGTCNTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGATTGAATTTTCGAAGTGAATACTACTTCCTTTTCAGTGCATAA:1 - chr2L 20328706 3' - opus 7034 4 54.46 ATCTAAAATCAGACCACTGCGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAGTTTCTCCGAGAAGGCGGGTTACCCGTTATTGCTATTTATGGAGAGCATCGGA:1 + chr2L 20484766 3' - Cr1a 409 1 62.38 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAG:1 - chr2R 25203782 3' + 1360 3345 1 66.34 TAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATGCTACAAAATATATTGAATA:1 + chr2R 10372170 3' + mdg3 194 2 77.23 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGATAAAAGATG:1 - chr3L 27357555 3' + mdg1 7424 2 55.45 GCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTCTCTTTGGTCTTGTCAACGCATCGTTCGACTGCCATAATTCAAGTCTTTGCTGTCTGTTGGTGGCA:1 + chr3L 10561685 3' - invader2 313 1 71.29 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGGAGTTCATCATTACAGGATATTGCAACAACAACAGTAAAGCCC:1 - chrX 21060325 3' + 412 443 2 68.32 TTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTGCCTTGTTGTTAGTGAAAATCCTTTTGTCCTAGCCCAAAGGACA:1 + chrX 9391865 3' - Gypsy6A_LTR 372 1 58.42 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTACATAACATGTATAGAATATATATGTAAATATCTAATAATAAAAAT:1 - chr2L 14010804 3' - flea 4788 2 60.40 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATATATATCATTTAAACTATAATACACCTTTAAAGGTACGTAGCTCTTATATT:1 + chr3R 13910674 3' + mdg1 373 2 54.46 TTGTTATTATTATTATTATTATTCATTATTATTTAGTTTTGCCGCGTATGCAGAAATTCGTTGGGAAAGTCGGGGAATGGATATTATTTGAGTCCTGGCCC:1 - chrX 7277658 3' - mdg1 17 2 69.31 GGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAATCCTTTTACCCTTTTACCCAACGAGTAACGGGTATAAAAATTCCAGCATCTATTCTTAATAATTCACT:1 - chr3L 11893111 3' - INE-1 30 1 57.58 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATAAGTATATATACATATAAGCTTACCGGAAAATTGTCCGTTGTTCCATGGAGG:1 - chrX 5475380 3' + 412 7525 2 55.45 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAACTCTGATACTGGGAAACTCTCTCAATCACCTAGAG:1 + chr3L 25876134 3' + copia 5084 2 65.35 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTCATTGGTGAATAAAGAAAGTCAGATTTTTCTCAGTGATTAAGACAC:1 - chr3L 15037911 3' - roo 28 2 56.44 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACATGAATGTGGGCGGGGCACGTCTCACTGATTAATTGCAGT:1 + chr2L 17677777 3' - Tirant 35 2 60.40 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCGGGCCGTCTGATCGCCCGTGTTCCGATTCCACGATTCTTTCT:1 - chrX 15024375 3' + P-element 2853 1 45.54 AACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAACGTCGTTTTTTTGCCTACTCAGCTGCCTTGAATCTACGGATATCATTTTATTTTTTACA:1 - chr2R 5259773 3' - 1360 3231 1 59.41 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCC:1 + chr3R 29287558 3' + hobo 2900 1 65.35 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGTGACCATTCATTTTGATTGTGGTCGTGG:1 + chr2R 23671825 3' - hobo 47 1 73.00 TATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGTTTTCAGCTTGAGTTTCAGTTACGTTTTTGCACTATTCAAGAACTTCACTGGAGATTAGTTATA:1 - chr3R 20780582 3' + roo 8752 2 64.36 GATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGAGAGAACCATTGCTTCTCTCGTTGCTTGGCTGACAGCTCTCTCTGACCGG:1 - chr2R 3032121 3' - F-element 4243 1 58.42 TTGAAATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCCAAGTACAATCAGCGTAGGAAAACAAATTACACACTTTTCAAATTATGCCTCACCTTCGGAAAAGTCT:1 + chr3R 14016947 3' + Doc2-element 4409 1 71.29 ATTTAATAACAACTCTAAATGCTCTGTTTTCCTTAAGCTGGTATGTGTTTTCCTCGCACACACTCACTTACTTACACCCCCAACCCCAACCCCCTGGTTGT:1 + chr3L 21391784 3' - G4 377 1 58.42 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATCCATTAATAGTTAATTAATAAATTGCCAAAGCCAATTACTATCGCATTTATTCAGC:1 + chrX 21060385 3' - 412 22 2 57.43 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTTTAAAAAGAACTTCTAATGAAGAGATATATCTACATAA:1 + chr3L 10474228 3' + copia 244 1 67.00 AAAAAGACCACCAAGAACTNCGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGA:1 + chr2R 2879454 3' + Stalker 6960 4 56.44 GCTGATATGGACGGGCGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAG:1 + chr3R 1977620 3' + micropia 424 2 52.48 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGAGTGTAGTCAGCGAAATAAACAGCAACACATTGTTGTGCTGGGGGAAA:1 - chr2R 20312509 3' + 1360 3362 1 58.42 GTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGGCAACGACCAACAATAACAACAAGCAAAGAAGACGCAGCGCAAAAAAAAA:1 + chr3L 10363464 3' - F-element 4238 1 56.44 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCAACTCAA:1 - chr2R 9649192 3' + roo 355 2 78.22 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCATTCTTAGTCTTATCAAATCGTTCGGCGACGT:1 - chr3L 14222470 3' + roo 9029 1 70.30 TTTCATTTTCATTTTTTTTTTTGTTTTTTTGCAAATTGAATGCTGCTTTTCAAGGGTGAACGATTATTGGCCA:1 + chr3L 2387133 3' - Doc2-element 251 2 49.32 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGTCTTTAATTTCTTATCACATTTAATTTAGATC:1 + chr3L 4565526 3' - copia 45 2 72.28 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATCATTCGTTCTGAACTCCCAGCTATTTTCCGAGTTAGCTAACCATTTCTTCATATCA:1 - chr3L 7168306 3' - Doc 24 1 57.43 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCCATGGGAACTGGGGAGCTATCCCCGCATTCTCGTCAGGATCTGCCATCCTGCCACC:1 - chr2L 13566465 3' - hobo 21 1 58.42 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAAAGGCAGTTCATCATTACAATACCCTTCACCAAAGGTATTCTACCTGGTA:1 + chr2L 10792070 3' + 412 7499 2 66.34 GCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTGTCTTACACATTATAATGGAGTAAATCCTTCTGGCTGGCTTGCTTTTCCCCTA:1 + chr3L 19548401 3' + roo 46 2 60.40 TTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAATAATTCGAATGCCCGCCTTTGTATCTGCTGCATCCCGCACGCTCTCCTGATCGATCAGCGT:1 + chr2R 16949267 3' + R1A1-element 5042 1 69.00 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACAC:2 - chr2R 15788592 3' - Transpac 4968 2 69.31 AGTAAATATGTATAAGAAAATTTTAATATTTTTTGTTGACAACTGTTTACTTGTAAGATTTTATTTTTGTCGTACATAATCAGGTTAACAAATTTTAGGTT:1 + chr3R 31976553 3' - TART-B 10184 1 63.37 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTAACAACTCGAAGCGGTATCAACCGGTTTGCATTTGTTCAAAGCGGTTGCTAATGGCC:1 - chr2L 12459661 3' - blood 20 2 59.41 GTTGTTTTTAACGTATGTAGCTAATATGTGTGTTTGTAATATAATATATAATAGAAGCGCATACACCTTATCAGCCGACCGACAAGCCCAAGGTCGACGAT:1 + chr3R 10393485 3' + transib2 294 1 74.26 AAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTTTGGGGGGAAAGCTGCTCATGGCTTGTGAACAAATATGATTACGTA:1 + chr3R 10390787 3' + invader4 2606 1 52.08 GGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATAAATATTAATTACTATTTTCCAACATTAATTACCTCTTGTTGAAA:2 + chrX 14173060 3' + 412 7514 2 55.45 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTTGCAGCGCCAC:1 - chr3L 17181430 3' - jockey 4676 1 66.34 TAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAA:1 - chr3R 9088581 3' + hopper2 1556 1 74.26 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATGGATGAACTTGTCCTTAAAGTAATATTTTGGTATTTTCAAGAAGTTGTT:1 + chr3L 16562368 3' - pogo 24 1 55.45 AAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTG:1 - chr2R 12185317 3' + accord 7367 2 60.40 TACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTGTGCT:1 - chrX 734918 3' + Tabor 7283 2 62.38 AATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGCTCATGTGTGCAATGCGATAGAATTTTCTTTTTCCTCCTCATCTTCTTTGCATGTATTT:1 + chrX 14730844 3' - 412 7236 2 61.39 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTGCATCCC:1 + chr3R 30553619 3' - 412 32 2 55.45 CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAACGAGAGTACCAAGAAACGGATCGAGAACTACGCC:1 - chr3R 21884186 3' - mdg3 5296 2 66.34 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAAAAGTGGAAAATCATAAACAACAAA:1 - chr3R 14193891 3' - pogo 24 1 57.43 CGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAACGAGAGTACCAAGAAACGGAT:1 - chr3R 21884199 3' - mdg3 47 2 75.82 TCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCCAACATGTCAGGGGAGTTCCCATTCTCCA:1 - chr3R 8765519 3' + roo 398 1 68.32 AAGCCAGATTCAATATAGCCTTTGATTTGACCTTTCTCAAAATCGGATAAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 + chr2R 3262650 3' - Tc3 484 1 57.43 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAACCTTTTTAAAAAATGTATATAAAACATTCAACATAGACATGGAATGGAATCCTATTGAATGA:1 + chr2R 22134275 3' + opus 489 2 68.32 GGAGCCCAAAATTGTAAGTNTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTA:1 - chr2L 5307481 3' - roo 8693 2 62.38 ATACCCGTTACTCAGCAAGTTTAAATGCGACTTACATACATACTTTTCAACGAAACAATTTTCGATAGACAAAAAACCAACTCAAGTCAAACCCACACACC:1 + chrX 16251277 3' - INE-1 540 1 75.25 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAACAGAATGCTTCTGACA:1 + chr3R 12333756 3' - P-element 56 1 23.00 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAATGTTCACTTCATGCCCACTTTTCGATAA:1 + chr2L 20620056 3' - roo 45 2 73.27 AGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTATTGCAGATTTGTTAGATTGGGTGAATACG:1 - chr2R 16354826 3' - 17.6 7184 2 71.29 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATACACCAGTCTGTGGAGAACTTGTGTTCGCATTTATCCGTTCAACTCTTTTTAC:1 - chr3R 19198499 3' + hobo 2916 1 56.44 GGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAGTGTAGCTCACGTAAGACATAAGACTCGACATACTGTAGCAGTATGTGAACAATAAGAGTTTCCC:1 + chr3L 24347359 3' - diver2 4789 2 74.74 TGGATGGATTGTTTATTAACGGGAAGCTCGGTTGTCAAACGACATTACAGGTAACTCACGAGAGATGAGGATTAGCCTCACACCCGTCAACACTGTGTTTT:1 + chr4 1180490 3' - Circe 314 1 58.42 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATGAGCAAAGCCAGATGGATAGCATTCTCGG:1 + chrX 2841829 3' - hopper 44 1 69.31 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCA:1 - chr3L 10474154 3' - copia 46 2 74.26 ATAATATGGATGAGACTCCNGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGATCTCGGGTTTGTTGCACGACGAGACAGTTG:1 + chr3R 10391267 3' + invader4 3074 2 66.34 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCACTTTACCAACAACGAGTTTATAATTGTTTGATTTGTGTGCGCGCATAGTGTGCATGTGGTTGTCCCGCTC:1 - chr3L 12468183 3' - jockey 4678 1 73.27 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACTCGACTCGAATCGCCGCCGCTTGTTATT:1 - chr3R 10488690 3' - roo 8708 2 70.41 GCATATATTGGTTTATTACACCTCCTACCCAGCCTTTGGAGCCCTTCTATAGCAAGCAGTAAATATGCATTTTGTTGAATTTTCCATTTCCATTTGGGCAA:1 - chr3L 3880949 3' + blood 379 1 81.19 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAAATCCTTAAAGTTCCCTTTTA:1 + chr3R 17781602 3' + pogo 2050 1 82.18 AATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAATTACCGTTGATGATGGTTGTGCAGGAGGAAAATTAGACAACGA:1 - chr2R 6046934 3' + Juan 382 1 57.43 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTTATAAAATCGATGAATAGCATTTATTACATACATATGGCTTTAACGATCATTTGCAGGCTCTCACACAATCA:2 - chrX 17104369 3' - 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chr3L 3209158 3' - roo 17 2 60.40 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTG:1 + chrX 21217566 3' - pogo 41 1 68.32 TCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGAGGGTCCCTCCACTGGCTGGCTGCACATGGTGATTGAATTTAAAATGGACAGCGGCGAAAAAGGGCAAAGTTATTA:2 + chr2R 24278109 3' + 412 7544 2 74.26 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAA:1 + chr3R 29287554 3' + hobo 2898 1 68.69 TTTTGGGTTCTTAAGATTAGGAGAAGATTCAAAGAGAGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAACGAATTCTTGAATAGAAACGGAT:1 + chrX 22969928 3' - 297 6767 2 77.23 CATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTTTAAATGACATCTGCGAAGCTACTAATGGTTTTTGACTTTGGTGGTAGCTCATCACCACTGGCAAAC:1 + chr2L 12018495 3' + hopper2 190 2 67.68 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACAAACAGATAAAGGCCAGCGCCTGCATTTTGGTGGCAGTGGCGGCGTGGGGCGTGGCAAACAGCC:1 + chr3R 11321100 3' - hobo 11 1 68.00 TTAATCTGTTATTATTATTATTATATTATTATTATTGTTTAATTGTGTCTTTGGGGCCAGGTGTGGTTTGCACGTAGATCGCGCACGTATCTGAAATTTTA:1 + chr3L 12999297 3' - 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F-element 4517 1 66.34 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGGAGTTGCCTGAAAACCCATATCCGTGAACTTT:1 - chr3L 2022217 3' + roo 396 1 70.30 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAAA:1 + chr3R 20696507 3' - jockey 64 1 75.25 GTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCTTCTTCCTTTAGTCCCATATGTGGGAGTGGAGGTATACGTATATCGGTCGCTATAGCAAATTGGGT:1 - chrX 1450095 3' - Tirant 10 4 65.00 CTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTTTCCAGTGCTCGGTAGCATTCTT:2 + chr2L 11712873 3' - Quasimodo 47 2 79.21 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATATTAATAATGATCTATCGATAGCACATGAAAAGATTTGATTTCGTCTGTAAA:1 + chr2L 21190826 3' + pogo 2082 1 59.60 CTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTTTTCAAGAACGAGAGAGCGGAGAGAGCTCATGCATTGCAAATTTGACAAAATGTGCTCAACTTAGTGTTCTCTCATATC:1 + chr3R 9523943 3' + 1360 81 1 77.23 TAATAATAATAATAATAATAACAATCACGATGGAGCATCTGAGCTGAGTTTCCTTGCGGTCCGGAATGAGGCGCTTATCCATCGGACAGGGCGGGCGTTAC:1 + chr2L 7195561 3' + mdg1 30 8 66.34 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATTGATTATGATATTTTTTAATGGAAGGCTGAAAGATGAAAGGCCCCA:1 + chr2L 17245072 3' - copia 4899 2 55.45 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCAACTCAAGTGCACTCTTAGCTCGACAACTTGAGGC:1 - chr2R 9649164 3' + roo 9047 1 54.46 ATTAAAATTAATTTAAAATTTACTCGCCTGTGCAAATGAGTCACCTGTTCGTAAAAAGGAATTACACAAACTAAACACTCCTATCTAAGTTATTCAGCACT:1 + chr3L 20702644 3' - Rt1b 122 1 61.39 TAATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATAAACCTTTTACATTTACAATCAATACCTACCATGTAAGACCAGA:1 + chr3L 26013701 3' - S-element 1606 2 66.34 CATGTTGCTGCTCAACAGCNCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTAATTTTATTTTTCAACAGCAATTTTAGCC:1 + chr3L 20758996 3' - flea 44 2 72.28 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTG:2 - chrX 4277463 3' + roo 9039 1 59.41 GTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGTGTACATTTTCACATATGAATAGTATTTAGTTTTCTCTGCGGGCC:1 + chr3R 11608021 3' + 1360 3359 1 57.43 AGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGACACACAGGACACGACATCTA:1 + chr3R 25653414 3' - blood 7199 2 65.52 ATTCTTTGTTTTTTGTTTTGAACACAATAAATGAGCACTTTATCACATATACAACTTCAACCCTCGCATCTCAAGTACTAAAAGCACTTTACTCTCATAAA:1 - chr2L 10209802 3' + Tc3 89 1 80.20 TTAACTTTGCTGGTCGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - TAHRE 10427 2 64.00 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAAGCAATTCAAATGCCGCACTTGCAACGCT:1 + chrX 12906561 3' + P-element 2841 1 33.66 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAGCTTTGACAATCAGGACG:3 + chr3L 3757424 3' + roo 390 2 61.39 ATAAAATTAATTGTTTTATNAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTTAAACTTTTAAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTGC:1 + chr2R 25286860 3' - TAHRE 61 1 62.38 GATTCGGCTATTGATCCTGATCAAGTATATATATACATACTTTAAATAGTCGGAAACGCTGCCTTCTGCGGCAAATGTTCGAGATGAAAGTAATCTTGTGT:1 + chr2L 19269797 3' - INE-1 92 1 66.34 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATATTTAATTGATAAAGCAGAAAGACATTCGTAAAGCGGAGG:1 + chr3R 17003375 3' + pogo 2070 1 62.38 ATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATAT:1 + chrX 18326231 3' - Doc 225 1 62.38 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGAATATAGTCGATATGACCGATCGGGGGATTCAGTCTCCTCGCGATGCTCTGGCGTTGATCTT:1 + chrX 4707927 3' + P-element 2877 2 69.31 CCTCTAGCCTACTACAATTCGTCCAACCAAGCATAAATTTCGGCCAGAGAATTGTACTTCGTCCAACCAATGTCACTGCAGAGCTGTTCATCAGCAATGTG:1 - chr2L 7692325 3' - invader2 4853 1 51.49 AGATTTTTTTATATTTTATTTATTCTCCGCAAGTAGTTTTCTGATTAAAAGCAGTAGTACTTATCTCGCTGCACTTCCAATTCTAATATTGTCGATCTGTT:2 - chr2L 7029250 3' - transib4 2277 1 78.22 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATAGGGAGATCAGGATATATTTGCCTTCCAAATGCTAAGCACTTATTGCTAAACAATCCAAGC:1 - chr2R 8087013 3' + flea 5002 2 66.34 GAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATCTTCTGTGTATTCTGATTGTATTTAAATGCTGCAAAATTGTTTAGAATAATTAATTTTCACAGT:1 - chr2L 11478656 3' + opus 7490 2 68.32 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCAGTTCACTTCCGCTGGCCACTTTAA:1 + chr2R 6107777 3' - roo 51 2 77.23 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGT:1 + chrX 21217567 3' - pogo 40 1 67.33 AAGGGGCGCCGGCTAACAAAAGTTAGCTGTAACAAAACAATAATACATAATATTATAATATACAAACGTTCCCCGACGATTAGTTGAATCGAAAGCAGAGA:1 - chr2L 20768277 3' - BS3 1686 1 64.36 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGGTTGCTTTTGGTTCGGCCTGGTTGA:1 - chr2R 6850436 3' + roo 9042 1 56.44 TTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATCGGAGAAAAATCAGTACAAATCAGCGAATAGAAAGTGTAT:1 + chr3R 26967316 3' + 297 458 1 60.40 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACAC:1 + chr3L 20354073 3' - 412 7087 2 57.43 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCTCCCACTCTTCTCTCTCCCACTCTTCTCTCTGCCTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTG:1 + chrX 12649916 3' + P-element 2871 1 47.52 TTACAAACAAATATATTGAAAATATTTATTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTATACTATCAAAATGGATTGTTTCTTCGTTTGAGATTCAGATATGGTT:1 + chr4 347751 3' + Tc1-2 1590 1 67.33 CATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAATCTACTGGAATGAGGAGATAATTCTTGCTTGCTAAGTAGATTTTTTGTCCTAAAGA:1 - chr3R 1848287 3' - Cr1a 4009 1 64.36 CGAGACAGGAGTCTCATCCATTTCATTTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATGGGATGCAGATGTCGGGGGGTAGGGCAGACGGCGGCGCCGTGAG:1 + chr2L 21324781 3' - invader4 3078 2 56.44 TGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTATTATTGGCATTTTTGTGCCTCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTTTTGCTGCTGCGGCTTA:1 + chr3L 12449306 3' + 3S18 322 2 58.42 GAATGCTGATGATGTAGAANTTGTCATCAAACCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGA:1 - chr3L 16792552 3' - Chimpo 4043 1 58.42 TGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAGCGCCAATAAATAAATAATAACTGGCTTAAATAAACACAACTTGTCTTTAATAACCAACGCTTTTAAGGCT:1 + chr2R 17644960 3' + mdg3 241 2 73.27 TTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGG:1 + chr3R 1977611 3' + micropia 415 2 63.37 TATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAGTAGTACCTACCGATAGCAGATAGATATATCTACAGAACATGGTTATCTCTATAGAATTTTCTAATA:1 + chr3R 18237650 3' - Juan 3878 1 54.46 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACGTACAACGC:1 + chrX 11025587 3' - hopper 17 1 62.38 TTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCC:1 + chr2L 12882810 3' + hopper 1388 1 50.50 TCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTTTTGCATCCGGGGGGTGAATTAACTGCAGCCGAAACGCATTTACTTTAATTTATTTGTGGTTCCAGTGGG:1 - chr2L 8950027 3' + Max-element 8329 2 72.28 GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGATTTTAT:1 + chr2R 22051516 3' + Tabor 7276 2 70.30 GGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAAGTTTTATGGAGTTTTTCTCGCTGGGCCCCTTTTGAG:1 - chr3R 12063720 3' + 412 481 2 66.34 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAGATTGTCTTGGAAACAAAGTTCAATTCATTTTGAATATCCC:1 - chrX 11016991 3' + roo 9037 1 58.42 TCCAGTTTGCTACCTTTTTNATGAAGAGGAATCATACCCAGACTGCGGGTCCTCCCCCATCTGGAGACAAAGGAAACGGAAGCAACTGAACACACTTAAGT:1 + chr3L 22526424 3' - Q-element 77 2 73.27 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCGGCAGCAGCACTTAAGTCTAATTAAAATGCT:1 - chr3L 1998824 3' + hopper 1381 1 66.30 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTGATTAATAAGCTGGGGAGGGCAATACTTCCCACAATAATATTTGGAA:1 + chr3R 4474243 3' + copia 241 1 58.62 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCATTAGTGTGTGTGTCTGTGTGCCTTCACCTACAG:1 - chr3R 17059162 3' + hopper 1376 1 65.00 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTGCAT:1 + chr3R 30553616 3' - 412 28 2 55.32 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACCGAATCTGCTAAATTTCACACACCACTTCGTGTGAAAATAAACCGAATTTAAATTTAGATACTGCGT:1 - chr3L 11929246 3' + copia 247 1 68.32 CTCACTAATCATGTGAGGACTTACTACAGCGTATGAGTGATTTTTATGGCATTTTTATTTGGTCCGTGGGACGTACGCCTCACTATAAGTATATGCCAATA:1 - chr2R 20718796 3' - BS 4996 1 75.25 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACTGTGTAATAGCC:1 + chr3L 27357643 3' - mdg1 7048 2 69.31 TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACATCGACCCCATTTCTCGCTGTGT:1 - chr3R 22330738 3' + I-element 5304 1 76.24 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTC:1 + chr2L 20328767 3' + opus 7471 2 67.42 AATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAGTATGTTTCTTGGTTTTTAATTACAACAAA:1 + chr3R 26597389 3' - mdg3 36 2 70.30 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGAATGA:1 - chr3L 13374704 3' + Transpac 5186 2 77.23 AAATCAAAATCAAAATTTAATTTAATCTGCTGGCTGGGCAGCCGGACAACCCACACACAGTCTCCTCTACAAAAAATAATTCTCGCTTTCTCTCTCGCTCT:1 + chrX 17317953 3' + P-element 2655 1 75.25 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGCGGGACTCCTGGCAACAGCAATT:1 - chr2R 3171114 3' + 1360 3335 1 76.24 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTGTTATCAAGGCTTTCAAGCATGATCTATCTTAAAACATT:1 - chr3R 17781550 3' - pogo 33 1 59.41 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGCACGTTTAATGACTCCACAAAAGCAGAGGGAAAAATAATACTTAAATAAGGAGG:1 + chr3L 3650118 3' - mdg1 13 2 60.44 GATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTTTTATTAGTGTACGAAATAAACAAAAGTTTAAGTTTGT:2 + chr3R 7513973 3' + diver 185 2 68.32 AACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTACCTTTTCGGCATCTCGGCAACGGGTAGCCGGAATTTTTAG:1 + chr3R 5942392 3' + Doc 341 1 65.35 GTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTCATTATTGTAGGACTGTAATTATGTGCAATCTTTGCACACATATGCAAACAGATAG:1 + chrX 22667111 3' - Doc 4456 1 59.41 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAATTACAGGTGATAAAGCTTGGGAT:1 + chr2R 10956971 3' + copia 226 1 54.46 CGATTTGCCAAAAAAAACTTTTTGCCATCCCCACTCACACGCCCTAAAGCCGCCGAACCGTTTACTGCCACACAGTCGGTCCATTGTTTGCTTGTTTGACA:1 - chr3R 4863193 3' + INE-1 318 1 72.28 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTAGCTTTTGTGTGCCGAAATAAAAGT:1 - chr2R 18733699 3' + copia 236 1 53.54 ATAAATATTTTTCAAATTTAACAAATGTCCCAATGACAAATAAATAGATTTTTCTATTTTTTTTTTCAAACTATTGTATGAGAAACCTGGTGAAAGTGGAA:1 + chr2R 9058967 3' + copia 4669 1 81.19 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTGTTTGGTCAAATGCAGAACGGCACAGTTATTCGAGAA:1 + chr3L 2022331 3' - roo 7 2 67.33 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAAATAACAGCGACTAAGGCTAATTTATGTACAAACA:1 - chrX 12472539 3' + pogo 2063 1 66.34 ATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAATCGAATGGACTAATAGTCGAAATCTTAC:1 + chr3R 895427 3' + G5 4783 1 64.36 TTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGAAAGAGGTGAGAAAATTGTTGATTAGCTTCTATGGAGGCAGAAGTTCCCCTTGGACACTCATTC:1 - chr2L 5428072 3' - F-element 4423 1 66.34 TCGCATTCACACTAGCCGAGTAACGGGTATCTTATATGTCTGGACTGGAGGAAGATGAGAAAATGGAAATTTTAGAGGCTTTTCCAATACTAGCTAGG:1 + chr2L 12085125 3' + INE-1 532 1 60.20 CTTTCGCTGACTTAGTCACACCGTGAACAAACTTGAAATCCAAGCTGAAACAACTAAAAACGCTACCGAAAGCAGCGATGAAATGGGTTGGAAAATGCATT:1 - chr2R 16897166 3' - F-element 486 1 67.33 TATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGCCGGCTTCCCCTCAAAAAGGAAGCGAGCCAAGC:1 + chr3L 13569815 3' + invader3 5441 2 56.44 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGAAAGATGTGTTAATATGAACTTATTTTCGTGTACGATACTATTTGTGACGTCGGTTGCTTTTTTTT:2 - chr3R 19987383 3' - Doc 16 1 62.38 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTGCGTTGGCATTTATAGCTCAGTCCAGGAAGGACT:1 + chr3L 13773945 3' - roo 42 2 68.32 TCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGTGATTTTGACCAAGGAGGGATGG:1 - chr3R 12321402 3' - jockey 4704 1 56.44 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTTGATGTGGAACAAGCT:1 - chrX 17029974 3' + flea 248 2 66.34 AATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGTGCAGTTCGAAATCCACTAACAACATTTCTGTGC:1 + chr3L 16282420 3' + gypsy5 7305 2 66.34 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCTTGTGGCCTTTGTGCACTTCTTCTTCATCTCG:1 - chrX 13126182 3' + mdg1 414 2 65.35 CTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCAT:1 + chr2L 8959964 3' + Ivk 5370 1 55.00 ATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATATATATGTATCAATAGTTATCTATATGCGAGGATCGAT:1 - chr3L 25777053 3' + diver 186 2 65.35 CTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCCAAAAAGACACAGGCGCGCAACTATATAT:1 + chrX 21009394 3' + hopper 1370 1 68.32 TTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAGTAATGGATAAGCCGCATTCGAAGCAATTAATTATCAGTGTT:1 + chr3L 3242732 3' - diver 35 2 57.43 ACAGAGTTCACTGTCTGCAACGCCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCAACAATGCCCCAGTAAGTATGCTAGACATTTCTCGAGCACGGGTTAAGTGC:1 + chr2R 16036953 3' - baggins 5184 1 64.36 ACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATACATTACA:1 - chr2L 7958671 3' - G3 4507 2 84.16 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTG:1 - chrX 21668010 3' + Tabor 449 2 58.42 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCGGGCCGTCTGATCGCCCGTGTTCCGATTCCACGATTCTTTCTCACTCTCTCTCGGTAT:1 - chrX 15024359 3' + P-element 2869 1 61.39 AAAAAGGAAAAAGTAAAAAAAGGTGAGAATTTTTATTAAGTATTAAAGATAATTTTAGAACAAACTTATGCATACAGAAAATCCAGGTAGTTTGATCAAAA:1 - chr2L 19648355 3' + Doc2-element 238 1 90.10 TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAACAATACTGGTAACTCTGTT:1 - chr2R 20312609 3' - 1360 54 1 79.21 AACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAAGGACCAATCAAATCT:1 - chr3R 4971378 3' - F-element 19 1 69.31 AACCTTACAAATAAATACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAAGGTTAAGGAAAATTAATTAAAAGTAGTCTTATAAATCATTAGGGCTTTGCATACTGC:1 + chr2R 22509461 3' - Cr1a 4036 1 73.27 GATTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTAGTAATAGTAAAAATAAACTAATCAATAATCAATAATCAATCAATAATAAAACTAATCAAAATGTTTATAAAGA:1 - chr3L 15172631 3' - INE-1 558 1 32.67 AAATACTTCAAATTTGCATACTTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGT:2 + chr2L 12882787 3' + hopper 1365 1 71.29 GTATGGGTGGTCGGCTTTTCGTTATACTTCGTTTATTTCATTGTTCATATATATATATATTTACATATATATAAGTTCTCGTATGTTTGCATGTGTGTGTA:1 - chrX 10409604 3' - Doc 4476 1 75.25 GGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCCTTCGAACTCAATTACATAAGCGCAGCCAGCAGTTTGGCAGTTTGTAATTTTCGGCAA:1 + chr3L 12310192 3' + invader1 3697 2 65.35 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTC:1 + chr2L 20328767 3' + opus 471 2 66.28 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTTGGTATAACCCACTTATTATATGTATAGACAATAACTGCAAGGATA:1 + chr4 613451 3' + 1360 3350 1 77.23 TAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCACAAAATTGCCAAACCGGCACCAAACAAACCGCA:1 + chr3L 6658257 3' + hopper 1411 2 75.25 AAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATTACCCCTTTC:1 - chr3R 22869389 3' + Bari1 1669 1 61.39 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAAGCAATAGAAAAGAACGAGATGAAAGGGAAGTAGAGGAGAA:1 + chr2R 18733775 3' - copia 4905 2 62.38 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATAGGAATGCTAATTAACTACAATAAAACATTTTGATGGAGCGATAGATTTATGTATATAGGGATTTCCT:1 - chr3R 13913004 3' + mdg1 7428 2 53.47 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGTCACACTGGGCAGGCTTGCCAATTTCAAGAGCCGCGG:1 - chr2R 9693313 3' + P-element 2850 1 42.57 ACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGC:1 - chr2L 18213153 3' + hopper 1384 1 54.46 GATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGTGCTGCCGTATGTAGCTCTTGTATATATAATATCTGGTTTATGTAGACTTAGGAGCTAGTACATGCCTAG:1 + chrX 8757322 3' + invader4 2711 1 76.24 TTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGTTCAAATTAATTAAATTTGTCTTTAAACATTCACCGTTCTTTCATCAAAATTATG:1 - chr3R 4474161 3' - copia 22 2 57.43 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGCATCGAGCGCT:1 + chr3R 6034014 3' + roo 9037 1 61.39 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCA:1 - chr2L 5926949 3' + pogo 2054 1 76.04 AAATTAAAATTAAAAATCAAACTAAAAAAGGAATTTCCTTAAAGCAAAGGTTCCATGATCTTCGACTTGATTTTCCTCCCGGTGCTGGGAAAACTGCGATT:1 + chr3R 18525689 3' + P-element 2642 1 80.20 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTACGTAACATTTTGAGGAATTCACAAAATGCGGCTAAAAACGCAACAATTACCTCACAAATACGA:1 - chr3L 20520660 3' + P-element 2878 2 69.70 CCAATATCTCCAATAGTTTNGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCCTTCTGCTCTGTTTGTGTTTGTATTGGT:1 + chr2L 4234353 3' - hopper 46 1 68.00 CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTCTTCAAAAAATTGAATATTTTAAAATTAAGCTGCAGTCCATATTCTTTGCATGTCGCAATAACTTCCTTCAAGT:1 + chr2R 1338462 3' - 1360 56 1 74.26 ACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGAGATTAAATATTTTCGAACCAATTTTTAATGACTGCAGCAGGTGGCCAATTTAAAAGTACTAACTCT:1 + chrX 7292761 3' + 3S18 6096 2 69.31 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTCTCTATTGTTGTACCCGATACCTATTACCCATT:1 + chr2R 5720523 3' - pogo 54 1 45.54 TAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTTAGTCAATTATCTCCGTGTACTGAGATTAATAATTAACACCTTTTTGCCATCATTATTGCACAATTAAA:1 - chr3L 16885916 3' - P-element 201 1 78.22 GCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTCCTCGCATTTCTAAAGTTTTATATTT:1 - chr2L 19642316 3' + Quasimodo 7324 2 73.27 AACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTATTGCCATT:1 - chr2R 18188312 3' - Juan 4058 1 56.44 GCATCTTGTTATTCTAGTGNCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGA:1 + chr3L 23456282 3' - 1360 4 2 71.29 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGTAAAAAT:1 + chr2L 7175613 3' + blood 7351 2 71.11 GTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTCAGTGTGTTAGTCGAGCTCCAGCAGAGTGTACATCGTGATATCCCGCTACGTATCGCTCTG:1 + chr3L 9178228 3' - Quasimodo 61 2 68.32 TAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTATTATTGGCATTTTTGTGCCTCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTTTTGCTGCTGCGG:1 - chr2R 14592405 3' + 3S18 318 2 54.46 ATATATTTAGACGGTTTTTTTTATTTTTGGCCCTCTGACAGGCCCAAAAAGAGCTGCAGCTGTCAGCTTTGTTTGTTTTAAGCAGCGGGCTTAAGGCGTT:1 - chr2L 18768014 3' - Transib5 29 1 73.00 TACATATATATTCTTGATCAGGAGCAAGCTCTTGAACCAACCTAACCACGCCCATTACTAACAGATCCTGGTCATGTCAGCTAGGCTTATGATGTGCAGC:1 + chr2L 22031503 3' + INE-1 77 1 80.00 GCGTGGGGTGAGTTTGGGGNTTGGACATAGATTTAGTATTAATATTAAAAGTAAGTATAAAGAATATGGATATATGGATACGAAGGTAAATATGTTGTAAA:1 - chrX 8511124 3' - HeT-A 5933 1 56.44 TTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATATTTGGGGAGTTAGGCCTGTCATTTATTTTGTGCTGACAATTTTTGACACAGCTGAA:1 + chr2L 21888942 3' - 1360 3182 1 59.41 ATGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAGCAATGGCTAAATAGTTTTGCATTCGATAACAAAAGCCGCTC:1 + chr3L 12438068 3' - I-element 37 1 60.40 CAGCATTGACCACAGCTGCNGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAATTTCCAAACAATGCGCAACTTTGTGCTGTCCACATCAAAAAGTGT:1 + chr3L 9907420 3' - jockey 4703 1 59.41 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATACTCGTACACACACACCCCAGAAGG:1 + chr2R 8311353 3' + opus 7460 2 74.47 TTTGGTTTGTAGAAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCATTATGCGACACATACTATGCATACCAGATAAATCCATATGGACACTACACCCACCACTG:1 - chr3L 2797904 3' - I-element 5060 1 63.37 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTGAATGGCAAATGTTTTCCCTTAACACAATTTATGGTCCAAATATTCTTTATAGCTTTGACCTATACTT:1 - chr2R 12525565 3' - mdg1 7046 2 48.51 GAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTAGCTTTTGTGTGCCGAAATAAAAGTTTTGCGTGGCAAAGTTGG:1 - chr2R 18733681 3' + copia 252 1 70.30 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGCGGCAACTGGAAAACTGGCAACTTC:1 + chr3R 12882766 3' + copia 237 1 74.26 ACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACAT:1 - chr2R 6438367 3' + Stalker4 358 4 76.24 TGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAAAAAAAAAATAATATGTATAACTTCTGCCTTGTGATAGAACATTCATAA:1 + chrX 1706095 3' + Juan 4188 1 54.55 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATACACGAATTTGAATTTAGGGCGTTTCCTGAGCTCATTAAAG:1 - chr3L 7300505 3' - Doc 38 1 66.29 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACCTACTTAAATATGTCGAAAAGTGTGTCA:1 - chr3R 24767809 3' + P-element 2841 1 31.68 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACCACTGTTATTTTGCAGTTTGTTGGACTTTGCATACGCTTTGGCGGGGGTTCCCCGGCATAATTGAAAGCCCA:3 - chr2L 20045706 3' - roo 8667 2 77.23 TTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAACACATAGAAGAGTCCACACGTCTGTGTTCCTAAA:1 - chr3R 12068758 3' - copia 5049 2 65.35 CGCACCTCCGTGTTGGCTGTCATCCGGATAGTTCTTAGCCCGATGCCTGTCAGTTGGCCCAAACTGACAGGTTGTCTGCTTTATTCCATATTTAATGACAG:1 + chrX 11628504 3' - G5A 195 1 75.25 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCAT:2 + chr3L 3757396 3' + roo 361 2 76.24 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTCTATATAAATTTCAATAAGTACTTAACAAAAAAGGAAGCCAA:1 - chr3L 15788429 3' - opus 37 4 68.32 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCTATTATTGGTTGAAATTGGGTTATT:1 - chr3R 8582562 3' - roo 51 2 78.22 GACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGCTGAGGGT:2 - chrX 4166369 3' - I-element 5311 1 55.45 TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTTGTTTGCCTTTGCCTTGGGTTCCTTTCGTCCTATCTGTTGGCCATGGCAACCATCG:1 + chr2L 9036918 3' - jockey 4822 1 61.39 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACACCTTGTGACCAAACCACATGCTACAACC:1 - chr2R 21351332 3' + mdg1 7408 2 71.29 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAGAAAGATGTCCTGTCATTATGCGA:1 - chr3R 12329605 3' - hopper 36 1 60.40 TAATAATAAACAATCTTACATATATATAGGGAGATCAGGATATATTTGCCTTCCAAATGCTAAGCACTTATTGCTAAACAATCCAAGCGTTGGCACTTAAT:1 - chr2R 8087000 3' + flea 256 1 79.21 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAA:1 + chr2R 10670026 3' - jockey 4804 1 70.30 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGA:1 + chr2L 17730495 3' - pogo 48 1 76.24 GCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGCAGCATTCGTTTATCTTTGGCACCGCCACCGGTGTGTAGAAAACCCACA:1 - chr2R 18682929 3' + 297 60 2 68.60 GAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAAGCCAAAGCCCAAACATAGACATAATTATTTCAGTCGCTCGGCGAGCCATACTACCCAAAATAAATTCCT:1 + chr2R 19091697 3' - Stalker2 7255 2 68.32 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACACTTTAAAACCTAATAGATATGAGTATATCAACATCTCTAAT:1 - chr2L 4063668 3' + roo 398 1 65.35 AGTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGGCCAAGCAGATAAGGAACTGGATGAAGAGCAAGAAGTATC:1 - chr2R 24414825 3' + blood 372 2 58.42 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGG:1 - chr3L 20049643 3' - jockey 4811 1 72.28 CGCATTCACACTAGCCGAGTAACGGGGAATTTGACTATAGCATTTTTCTAGTTCTGTGTGCAATCAAATTTCTTCCAGTTTTCAGCAAAGGATTTCACCTT:1 + chrX 15572349 3' + INE-1 533 1 61.39 TAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTTTTCGTGCGCACTTCGGGCCAAACTCAAGTGGGGCTTTGAAA:1 + chrX 4166450 3' + I-element 5333 1 56.44 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACTTTACCCAAAAACACAATTGAATAATGATAATTTCACACGTACTTTTCGGGGCGAATAGCCGGC:1 - chr2L 7666083 3' - roo 8675 2 68.32 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGNGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGCGCTTAATCTGCTG:1 + chr2L 12808240 3' - Tirant 8131 2 57.43 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCATGAGTGAGGAGTGCACTGCGAAAAATGCTTGATAATGTGGTAACTTAATATT:1 + chrX 4264422 3' - mdg3 22 2 56.44 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAGGTAATTAAGTAAATTTGGGATAATGTAGCCAGAAATCTTCTT:1 + chr3L 19249744 3' + Transpac 5193 2 60.40 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAG:1 + chr3R 10488738 3' + roo 9034 1 64.36 TTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATCGAAATACATACATACATACGCACACATATATATATATAGATGTGCAGTGCGGAGTCAGAGCGTTATGAT:1 - chr2L 14035498 3' - flea 4757 1 71.29 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAGTC:1 + chr3R 7626432 3' - hobo 48 1 73.27 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCGCCTCCAAAGAGAAG:1 - chr3L 13773880 3' + roo 9046 1 53.47 GATGTCAATATTGCTGTTGCTGGTGCTCATTTAAATGTAGTTACGCTGAAATTATCAATTAACAAAGTTATATCAAATATTTTCTTCCATGGTTATCGGTA:1 + chr2R 16467945 3' - F-element 4297 1 78.22 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACGTTGCCTACTTCCCTGCGCATAATTA:1 - chr3L 20049598 3' - jockey 4766 1 72.28 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACACACACA:2 + chr3L 3540218 3' - mdg3 18 2 61.39 TGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCGATTAGATATGAGTATTTTTT:1 - chr3R 11052097 3' - blood 29 2 58.42 CTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATGAATTTGTATTCAACATTTTGATAAATGTCCTAACATTGGGACG:1 + chr2L 14793561 3' + Stalker2 7620 2 53.47 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAATTATAATATTAAAATATTGTTTAGAAACTTAAGTAACTAA:1 + chr3L 10621714 3' - 412 38 2 66.34 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACCTAGAATTGCATATATAGAATGACATACGATTTGAAGAGAAGAGACCTTGGTTTTCTTTGGCTGTATACTA:1 + chr2L 14341929 3' + copia 249 1 71.29 CGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTATTATAGAACTCGGGAG:1 - chr2R 12473035 3' - Doc 14 1 59.41 CCGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCAATTTGTTGTTTACCCTCTTTCGGTT:1 - chrX 15546132 3' + blood 7373 2 63.37 TGGATTGTTTATTAACGGGAAGCTCGGCTGTCAAACGCAGTAAAAACAAGTCATGACATAAATTAAATTAGTCCAAAACGAACATGGATTACTCTTTTAGT:1 + chr3R 15708197 3' - Circe 310 1 70.30 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTGAATGGCAAATGTTTTCCCTTAACACAATTTATGGTCCAAATATTCTTTATAGCTTTGACCTAT:1 - chr2R 12525569 3' - mdg1 7050 2 44.55 TACGCAGTGTGTGCGTGTGTGTTCGTGTGTGTGTGTGTGTTCGTGTGTGTGTGTGTTCGTGTGTGTGTGCCAAAGGGCAGGTGCTGTTTTGTGGCCTCTCT:1 - chrX 8395389 3' - accord 260 2 68.32 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATAAGGAGCTTGGTTGC:1 + chr2L 12866965 3' - mdg1 7059 2 59.41 GAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGTAGAATTAGTTGAAAATGTATAAACAGATTGAAGAAAT:1 - chr3L 5479007 3' - 3S18 40 2 63.37 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGTTCACACATCAAATTAGTT:1 - chrX 2841765 3' + hopper 1390 1 53.47 GATTTGATACAGTGCTTATNCGATATGTGTGCACATTACAATAGTAATATACAATAGTAGTATTAATATAGTGGTAAATCAAAAACCTAACTTCTAAATAT:1 + chr2R 19089038 3' - Tabor 19 2 53.47 TTTTACTTTTATACTTAATAATTTGTAACCCTTAAATTTATATGGTAACTTTGGAACTATTTGCCTGTAATACTTGCAAATAAATACTTCTTGGAACGATG:1 + chr3L 19014111 3' + G5 4723 1 51.49 TTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTCCTCCCCGCGTTAGGTTAAAGTCGTCCTCGGCTTTTCGAGAAGGGTAGACTAAGCTAAGAATATTGTCTGTACTTTAGT:1 + chr3L 25772981 3' - gypsy4 1 2 63.37 GGACTAATCCACCCTAAAAATACAATAAATGATTGGCAACATATGTGTGTGCCGCATACTTTGCATGCCAACTAAAACGACGGCAAACGAGTTGGGAAAGC:1 - chr2R 15777638 3' + Stalker 12 4 76.24 TCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGAACTGCAGCTTTAGCAGGCAAGTCTGCTACTGG:1 - chr2R 21962633 3' + 297 6939 2 69.31 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGGAGTTCATCATTACAGGATATTGCAACACCAACAGTAAAGCCCCGCTG:1 - chrX 21060320 3' + 412 448 2 63.37 TTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTATTAACACCAAGGTTGCGGGCTGTTTT:1 - chr3L 8667183 3' - Doc 4490 1 74.26 CTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCACTTTTACGAATGCCTCTGAACAGGCATTTAAA:1 - chr2L 20558949 3' + F-element 176 1 67.33 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGCTTGCTTAAAGTTTTGCATTGAACGCGTGCAAGCAATTTACAA:1 - chr3L 15777009 3' - I-element 36 1 55.45 TCTTGATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCACCAAAGCTCCACCCCTTAAGTGACCAA:1 - chrX 22654184 3' + Ivk 125 1 72.00 TGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTAGCTGGCATTTTTAGCCAGGAGGGCACTCCTAAATCGCCTTTAGATAACTA:1 + chr2R 14349194 3' - mdg3 5279 2 50.50 ATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACTCATGTACTAGCACTAAAGAGGAGGACGTGAGGGTTAGATAGAATACTTCTA:1 - chr3L 6440720 3' + roo 8624 1 54.46 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGGGCAACGGCAACGGAT:1 - chr3L 3650030 3' + mdg1 7437 2 56.44 GTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTATTCTCCCTGGGCTTGGATCCGCTCGAGGAAGACAACGAGGATGGCGACGATGAGATGCTTGAAAAC:1 - chr3R 7246559 3' - opus 327 2 64.65 TAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTT:1 + chr3L 10474191 3' + copia 206 2 78.22 TATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCCGCCTCTGACCATAACCAATCGCTTATAAACTCGCATATTTCAAGTGCCGGGCATGCATAACCACATCAGCAC:1 + chr3L 6901130 3' + Cr1a 4220 1 73.27 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGT:1 + chr3R 17053128 3' - hopper 36 1 65.35 TATTGTTATTATTATTGTTNTTATGTTCGTATATACTACAATACTATATACTATATATATAGAGCGTGTTGGTTTCTATTCGTTTGCTATTTTTTGGCACA:1 - chr3L 14818704 3' - mdg1 19 2 55.45 TTAAATTTATTAAATTAATTAATTAGCAACCACCAACCTTAGGATTGCACAATCGAAATGCTAATTGGTATATCAAAATTAAACTACAGATCCTTCAAATA:1 + chrX 12610058 3' + transib3 2666 1 58.42 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGTTGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTCTTTCATCATGACCCGGCGCAGCGATTGACGATTGGCGAC:1 + chr2L 8709358 3' + P-element 2837 1 29.00 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATTTATATTGATTATGGGTGATCGTCAACAAGAGCAGTGGACACCCAATAAACCTGTCCAAAAA:1 + chr2R 9905438 3' - mdg3 5266 1 65.35 CGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAGGTGTGTGTGTGGGAACATAAAGAAATACGCGGTACTACTGGTAAGTTG:1 - chrX 9205502 3' + diver 197 2 50.50 GCGGAGTGTGATTGAACAGCGGCAACGATTTTAAACAGTTTTTAAACAGTTATATGACGCTTCCTGCTGCTACCAA:1 - chr2R 2941264 3' + 3S18 499 1 72.37 ATGCAGCTAACTATCGATGNAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAGTGTATTTTATTTCAGACTTTCCACAAAACTTAATTTACATTCTGTTAAACGCT:1 + chr3L 19647333 3' - pogo 18 1 62.38 GACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCCATTTGGG:1 - chrX 4264358 3' + mdg3 199 2 69.31 TCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCCTCCGGT:1 - chr2L 17994153 3' + roo 365 1 64.36 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTGTTTGAAACACTTGATTAGCGGCGATGATTGAACGGTTATTCGTA:1 + chr2L 17994213 3' - roo 8693 2 55.45 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGAGATACGGGGACTGAAACGCCGTTGACAGCGGAAGTTTTTTGT:1 + chr2R 9649240 3' - roo 8697 2 59.41 CTAGAATAGCAAGATGCGTAACGGCCATAAATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTCGGTGACGGCCAAAATTTCAAATAACTAAAAAATTCGTTAAAA:1 - chr2L 9540093 3' - 1360 3380 2 74.26 AATAAACAATATATTAACAGGAACACATAATACAAACAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTTTTGCGATCTTCTTTTGGTCGTGTTAAGTACTCC:1 - chr3L 17884096 3' + hopper2 1314 1 81.19 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTGCGCCACACATATCTCTGCGTTGTGTGTTGTTTATACA:1 - chr2L 10199001 3' - I-element 38 1 58.42 GTAATGACTTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTTACCTCCAATAGCTACGGAACTAACAGCGCCACTGCTAATTGTGCTTGTTGTTT:1 - chrX 10044071 3' - I-element 4983 1 62.38 CTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTTTGCTTTGCTTGCTAGGAGGAACTTTATTAAGAA:1 + chr2R 5494690 3' - I-element 275 1 66.34 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGGAGTTGCCT:1 - chr3L 2022240 3' + roo 9036 1 60.40 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGGGCTTGAGAAACACACGAAAG:1 + chr2L 7810737 3' - P-element 53 1 26.73 TGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACAAATCTTGATTGTGTCTCCGACTCTGTTTG:1 - chr3L 13782693 3' + accord 120 2 71.29 TGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTTCAAGATTTCATCCTTGGACTATGAACAT:1 + chrX 12772900 3' - 1360 3318 1 71.29 AGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAGTAAACTAAATAAAAATAAATAAATAAATAATAAATAAA:1 + chr3L 18452047 3' + F-element 34 1 76.24 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAATCA:1 - chr3L 9928533 3' + roo 9041 1 56.44 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGC:1 + chr3R 29287547 3' + hobo 2889 1 76.24 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTTATTAATTCTCATAAAAAAATTGGTTAGTCTGGCCAAAT:1 - chr3R 21588999 3' + flea 4979 2 66.34 CTGCATGGAGGAGGAGAGCNCTGCACATATTATATGTGACTGCATGGCGCTTTCCATCAGCAGAGATGCTCGGCAGGATACGAGCTGTGAGTCCTGCAGCC:1 + chr2L 1032265 3' + baggins 5214 1 61.39 ACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTCGCCCCCCCCCGGAATCCCCTTGATTTGTTTCGAAAACC:1 + chr3R 23426484 3' + Quasimodo 7363 2 74.26 CAAATACTAAATAATGCTANAACAGGGCCTTTTATTATTTAAACTATCCAGTGCCTTGAAATTTTTTGAGCCAAAAAAAGAGTATTTGTATGTATATGTAT:1 + chr3R 29487010 3' + Tc3 1435 1 74.26 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATC:1 + chrX 19034179 3' + hopper 1380 1 58.42 GCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATGCAGACGCTGGGCTTGATTTCTGCCGATTTA:1 - chr2R 4500874 3' - springer 7179 2 67.33 CTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGG:1 + chr2R 6779821 3' - 17.6 52 1 80.20 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAGAGCGAGTGAGATTTAAGCCCGAA:1 + chr3L 2176398 3' + roo 396 1 66.34 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGGGAAAAAATAATCATATAATATATATGAATAATGGAAAATGAAGTG:1 - 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chr3L 13561844 3' - Cr1a 4292 1 59.41 CTTGCTATTCGTAGCTTGANAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGACCGCATCCATTACTCAAATTTTATTAAACATCCAAC:1 + chr2L 126541 3' - Doc 41 1 65.66 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGCACTCTCTGTTACTCAGCACACACACCC:1 + chr3R 18399235 3' - P-element 47 1 35.64 CGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGAAAATAATT:2 - chr2L 8959923 3' - Ivk 5117 1 54.46 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTAGCTTATACAATTTTATTGCAGCTGTTGTTCGCCGT:1 - chrX 12906517 3' - P-element 39 1 40.00 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTTTCGCAATCAGCCATTTCCTCCAGTGTTGTCAATTCATAAATAT:1 - chrX 8334270 3' + flea 5006 2 72.28 AATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGATTGGGCGGAAAGTGGTTGGACTTAAGACAGCCCCAGCAGGAGCAAAAAAGGATCAACGGAAG:1 + chr3L 22526558 3' + Cr1a 4391 1 60.40 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAATATCCAATAATTAAGCACTTCCGCAGGGAAATTGGTTTTTAATTGAAATGCGGAGCAGTGTGAAC:1 + chr3L 12241906 3' - roo 10 2 69.31 CTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCATTAGTGTGTGTGTCTGTGTGCCTTCACC:1 - chr3R 17059167 3' + hopper 1370 1 70.30 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCGTAGACCTTATCAGTCACGAAAAGACTATAGTTTATGGTCGTCTATTGAAAATATCAGGAACGT:1 - chr3R 24542007 3' - 1360 14 1 65.00 CAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCCAAAAGTCTCTGACAAATGCTCTTTGGCCAG:1 + chr2R 19695754 3' - blood 7331 1 69.31 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCAGAAAACGA:1 - chr2L 5926941 3' + pogo 2057 1 69.31 TTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCAGCGATCGCATGAATGCCACTGGCTGCTTGGATCACATTTGGTTGAAGGA:1 + chrX 11551798 3' + Cr1a 228 1 59.34 ACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTCACCGCCGATGCACTTTGAATTAA:1 - chr2R 6420476 3' - Stalker2 53 2 74.26 TAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTATAATCAAGTGTGAAAATCATAAGGAATACTCAGAAAAAAAAACAGTAAAA:1 - chr2L 8982735 3' - mdg3 5109 1 53.54 TATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAAGAGCTCATTACAAC:1 + chr2L 19642386 3' - Quasimodo 14 2 63.83 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATT:1 + chr3R 8582592 3' + roo 9020 2 74.26 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTCTTTAGAGTGTTATCATTTGTGTCTTGTGTCTTGTGCTGCATGCCACTGTCGTCATTC:1 + chr3L 17701611 3' + roo 9055 2 52.48 GCATACTTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCC:1 + chr2L 12882791 3' + hopper 1380 1 63.33 CTCCGTTCTGGAGTTATTAATTTTGGCCAAAAAAGAGGGTAAATTTCCCATAGTGCGGCGGTTCGGTCAAAGAAGATCGGTAGGAAGAGGAACAGAAGATC:1 + chrX 15553651 3' - Transib-N1_DM 35 1 80.20 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCA:1 - chr3R 10087841 3' + roo 9021 2 72.28 TGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGCTCAGATCGGCGCAGTGCACCAGA:1 - chrX 3338459 3' - I-element 4954 1 76.24 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGA:1 - chr3R 9088570 3' + hopper2 1567 2 63.37 ACAGCAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTT:1 - chrX 22726194 3' + Helena 1274 1 48.51 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTG:1 + chr3R 6034002 3' + roo 9042 1 67.86 ACAGTTACCCGGGACGGTCGTGCATTTTTTCCGCATGCATATTTATTGTTATTCAACATAACGCCACAAAGGAGATTGCAATGCCCGATGATGCAACGGCC:1 - chr2R 1684886 3' - Doc 470 1 64.36 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATT:1 - chr2R 17963246 3' - blood 47 2 75.25 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAA:1 + chr2R 15788620 3' + Transpac 253 2 77.23 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTGTGCTGATGCAGATGCATTCGGTGTGCTAAGTGGATGTCTGTGTGT:1 + chr3R 19216415 3' + 1360 3360 1 55.45 TCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGATTGTTCGGCCTGGCTCCC:1 - chr2R 9053212 3' - accord 206 2 81.19 CGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCCACTCTTTGCACTTGTCTCGATTTTTCCAGCTACCTTTGCGCTCGCTAAAAAAAACTCTCGA:1 - chr2R 13826490 3' + Doc 264 1 70.30 ACACTTTGGTAAGGTCAATACCAAAAAGACTTCAAGCAGTTATTGCACAGGTTGTGTTGCTTGCTGGTCAGATTG:1 + chr2R 16333320 3' + Bari1 1325 1 57.33 AGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCAAACTCCAAGTTCCAAGCTACAAGCTCCAATGCAGCTGCAATTAGAAGTTGCACAAAAAGCGCA:1 + chr3L 12438385 3' + Doc3-element 4485 1 66.34 GTACGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTACAAACTAAAATACCACCCACTTCATGGTTTAAAAAAAAATATATGAATATAAATATGGCATAAGTGAGCC:1 - chrX 17100975 3' - 1360 118 1 73.27 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCACGTGCACTTCATGAGTGTTTGCATGC:1 - chrX 21009351 3' - hopper 45 1 70.30 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAATATATTTTTAAATATTAAAATCAAAAAATTTGGAACCCTATATTCTAAATCT:1 + chr3L 20584094 3' - pogo 19 1 55.45 GCACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTGTTAACTTATATATATATAAGTAAAAATATATATATACATATATAGATG:1 - chrX 7471270 3' - opus 7154 4 76.24 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCTAGCCCACGCTCGCTCTCTCTTTTTCTGCATCTCTCTGCTAAT:1 - chrX 1399836 3' + P-element 2880 2 72.28 GAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCAT:1 + chrX 983358 3' - Juan 3846 1 64.36 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACACTTTAAAACCTAATAGATATGAGTATATCAACATCTCTAATTTTA:1 - chr2L 4063664 3' + roo 402 1 69.31 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGTGGAAAATTTTCAAGCTTTTCCGCAGTGATTTATGAGTTGCAATCC:1 + chr3L 5415407 3' - I-element 28 1 50.50 ATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATAAGAAAATAATATATAGAACTTTCTACACA:1 + chr3L 13001057 3' - invader3 48 2 71.29 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCAACCCAGCGCGGTACCGTTAGTTCACGGTCGCTCCGCTTTGCCGGGGTCCAAGGTCCATTGATTA:1 - chr2L 22524527 3' - 1360 11 1 68.32 TTATGGTCCACCCTAACCGACTAGCAAATATCCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGTCCTGTCCACTTGAGGTCCTGGCCCACCAACGTCTTTCACCG:1 + chr3R 23882880 3' + G5 4580 1 56.70 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAACAATTGAAATGTCATGCAATAAAT:1 - chrX 22593168 3' + 1360 3339 1 77.23 TTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCGCTTTTCCAACGACATCTGTGTGGGCAACAACCTGCTCCTGGGCACCTGCGTTATAAACGGAGAGTGCAC:1 + chr3L 8959870 3' - Doc 4495 1 74.26 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACAAAAAGAAAAGCTTGGGAGTACACACA:1 + chr2L 17079913 3' - jockey 4791 1 64.36 CGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGATAAATAATTAATATCATCTTTTTCTAAATAAGACTTCAATATACATTAACTTATGAGTTTTCTGAAAAAGA:1 + chr3R 16533692 3' - X-element 4388 1 28.71 AAAGTAAAGTAAAGTAAAGTATTAAAGTAGTAAGTATTAAATTAAAGTAACCCCGATTTGTTTCAATAAAGATGAGACTTGGCTAATTTAGTCAAGAATTC:3 + chr2L 6296801 3' + TART-A 13142 10 55.45 TTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGGGGCGCTGCGGAAGGGTTCATGACGAGACATTGGC:1 - chr3R 12201672 3' - jockey 4813 1 65.35 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAAGTATCATCTTA:1 + chr3R 12876375 3' - hopper 32 1 62.38 TATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCGCCGTTCCTGTTGGCCATTGATTTATTAGGTTCCGCCGTGCGGCA:1 - chr2R 6847231 3' - mdg1 7039 2 77.78 GAATGGTGAAATTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTGGCCTGCTATCATTGCCAGCACTTTGCTGGGGTTTTCCACGGGTTTTTCTGGGGTACAGGAG:1 + chr3L 14890174 3' - I-element 288 1 68.32 TACTTCGGTAAGCTTCGGCNTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCGATCGACGAGACGGTAGCTTTAGAGCTAAACGAACTGCCATCCG:1 + chrX 15024439 3' - P-element 32 1 48.51 GAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTA:2 + chrX 11025563 3' + hopper 1374 2 68.32 ATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACAGTTATGTAGTGTAACCGATGCCGTTAGATAGCTCCCAACTCTGATTTAGATCCATAACCGAAATCCCACCG:1 - chrX 159065 3' - Cr1a 4206 1 77.00 TTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATCTGTCTTAAAATAGAAAATGAACATAAGGCGCACA:1 + chr2L 4134893 3' + Quasimodo 7333 2 67.33 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGATTTTATAGCTCAGTTTTGTCTTTAAATTTCAAACAAATT:2 + chr2R 22051549 3' + Tabor 7309 2 63.37 AAATCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAACAAAGTTAAAACCAGCAAAGTTAAATTAAAAATAAACAAATTAAATAAATAAATAAAATAAATTAAACAATTA:1 + chr2L 14025654 3' + TAHRE 10429 2 83.17 CATAGCGCCAAACCAATGTAAGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTACACCATGGAATATCTTGTGTTTTTCAACAATTGATGATTGTG:1 + chrX 12131674 3' + 1360 3355 1 68.32 AAACTCAACGAGTAAAGTCNTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTACCATTTTCACTGGTATTTCACCATTTTTAGGAACTGGTACAATTACCAGTGAA:1 - chr2L 20619986 3' + roo 9054 2 57.43 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTGTGTCCGAATAGTGTGGAGCGGTGCCCGATGGCCGAAGGGTAATAAAAATAATA:1 - chr3R 6033936 3' - roo 8684 2 59.41 GTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAA:1 - chr3L 16282385 3' - gypsy5 6947 2 55.56 AATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGAGATTAAATATTTTCGAACCAATTTTTAATGACTGCAGCAGGTGGCCAATTT:1 + chrX 7292746 3' + 3S18 316 2 54.46 AAACAATAATAATAAACAATCTTACACATATATGTACATATTGTATACGATGTTCATGACTGCGATCTGAACATATGTTTAATTAATGAAACCCTCTGTAA:1 + chrX 22634819 3' + flea 250 2 75.25 TAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCCTCCGGTGGCCAGCTTTTG:2 - chr2L 17994141 3' + roo 377 1 53.47 CAGATATCTTGCTGATGCAGCTAGCTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTTGCTCTC:1 + chrX 21217575 3' - pogo 32 1 55.45 CACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTGTACTATGACGTTCTCTCGTTTTTTTAGTTAATATGCGATCGGCTTTAATAAAACATTAGTTT:1 - chr3L 19468172 3' + INE-1 541 1 62.38 ACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAGGAATACTAATTAATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTATTTCGTTATTTGTTTACGATCGATTCGC:1 + chr2R 6987614 3' + HB 5 1 71.29 TTAATGCCGCCAAGTCTTCGGTTGGAGGCAGCGGACTTAGCAGAGCGCTTAGTCGGCGCCTCGTGCCCTCTGGAGTACATATTTGTTGGGCCATATATCTT:1 - chr2L 10455869 3' - gypsy10 245 2 78.22 ATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAACATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGTATTGTGAAGATAAGAAAAATAA:1 - chr3L 21815434 3' - G2 2943 1 50.00 CTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACGGAACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGG:1 - chr3L 16047628 3' + Cr1a 4421 1 65.88 GTAACAATTGATTTGCGTTCAGGGACAGGAGCCAACAGTGCTAAATTAAACGAAAATAAAAAGCAAAAACTGTTTAGGGCGAAGTATAAAGCCTTGCGGAT:1 + chr3L 8340431 3' - mariner2 258 1 57.43 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGTCACACTGGGCAGGCTTGCCAATTTCAAGAGCCGCGGCCACACTACTGCGAATTCT:1 - chr2R 9693294 3' + P-element 2869 1 61.39 GAGGATCTACCGACTGACCAACAGATTTCTCCTCCGTGGGACTGTCCAGCTCCTTTTCTATCACAGCTAGGCCTTCCGCGGCGCTTGATTTTGGGATAGTA:1 + chr3R 8295370 3' + Chimpo 4145 1 75.25 GTAACATAACAGCGCAATTNACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGC:1 + chr3R 14860195 3' - BS 5041 1 69.31 AAACATCCGCAGCCGCATTNGCGACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAA:1 + chr3L 10795198 3' + Quasimodo 7037 2 77.23 ATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCACTGGCTAAGGAAGCCTCAGAGGGTAGTAA:1 - chr2R 16185405 3' - 17.6 365 2 70.30 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATTCTTATAAAAGCTTATATCCTGAAGCTGTCTCATTTTATACCAATTCCCACATCA:1 + chr3L 13773087 3' + pogo 2082 1 58.42 CTGTGTTAGCAGTTTCGACCCCCTGGCTTTTCATCATAATTGTCGTTGGGGTTTGGTGCGATTTGGTGCGGAAAAGGCCGGAGGAAATGCCAACCGAAATG:1 + chr2R 13752584 3' - Quasimodo 343 2 82.18 AATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTCACCCGAACATCAGGCGGATAAGAGATTACCATTCCAGTCGAGGCAAGTGCCAAGTCATGGATAAA:1 + chr2R 20612306 3' - Cr1a 4271 1 69.31 TCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACATATTACACAGCCACGAAGTGGGCTTAAGACCCACACTCACAGGACCAGCTCTGCGG:1 - chr2L 15531791 3' + Stalker2 373 2 50.50 TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGC:1 + chr2L 18248051 3' - blood 7041 2 61.86 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCTATTATTGGTTGAAATTGGGTT:1 - chr3R 8582565 3' - roo 8717 2 81.00 TATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATATTTCCAGAAATATGTATGCATATGCATTTGT:1 - chr2L 20330602 3' - opus 273 2 69.31 ATCATAATAATAATAATAATAACAATAAATATGTATGCATTTATAAAATTACAAAAGAACAATAACCCAAAATATATGTATATGCTCGCTCTGGGATGGCC:1 + chr2L 20684366 3' + mdg1 38 8 79.21 CAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATCGAAATACATACATACATACGCACACATATATATATATAGATGTGCAGTGCGGAGTCAGAGCGTTATGATTT:1 - chr2L 14035496 3' - flea 4755 1 73.27 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTACAGCGTATGAGTGATTTTTATGGCATTTTTATTTGGTCCGTGGGACGT:1 - chr2R 20718823 3' - BS 5023 1 51.49 CTGCATCGAGGCATTGTGCNAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAATGTGCAGGCACAAAACGTACAAATCAGGCAGCTAGCACT:1 - chr3L 18762068 3' + pogo 2070 1 57.43 GCTTTTAAAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATTCGGACAGAAGGACAGACATTGAATGACTCCACCTGCGGATTCGAATGGAACGAGCCACATTAGTCTGG:1 - chr3L 22534693 3' - INE-1 149 1 58.42 TACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTATATATTTAAAAATGTTAATAAGCATTAGTTTCAAG:1 - chr2R 19088965 3' + Tabor 444 2 66.34 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACCCAGAAGCAAAGGAGAGCGGTTGGTTAA:1 - chr3L 16153661 3' - pogo 47 1 71.29 GATTTATTTATTTATGATTTATTATTTATGATTTTTAAAAATATTTTTAAATATGTTACTCTATATGATGTACTTCAATACAGAAAACCCCAAAGCTTGAA:1 + chr3R 29259626 3' - G3 342 1 71.29 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATCTCGGACTTCAGGATAGCCACGGGTTCACGTTCGGGATC:1 + chr2R 11259625 3' - hobo 38 1 59.41 CTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAACTAAGCACAGTATATATCATCAACAAAGTATCTTTTAACTTATAACTTTCATTTACCATTCCAAAAT:1 - chr2R 19559900 3' + Tirant 8396 2 73.27 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGC:1 - chr3R 4971417 3' - F-element 58 1 73.27 AGATATATTCGTGTTCATGNGTGAACATTGATTTAAATCACTTTTATTTTATTTTTAAATTTTTATAATGTTAATGTTAATCCAACTTCAGAACACTTGCC:1 + chr3R 12944770 3' - roo 8670 2 74.26 CACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTTAAATTTATTTT:1 - chr2R 5260084 3' + 1360 3226 1 68.32 ATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTCG:1 + chr3R 15790130 3' - flea 4719 1 44.33 GTCTAGTTTTGTAAACTATNCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATTTTCAGCACACAGGGCGTATGCGTAACGCAGTCGAGGAGGCGCAAGGGGGCG:1 + chr2R 8526401 3' + I-element 5330 1 52.48 TCAATAGCCGAGTTGATCTGGCAAATGTCCGTCCGTCATATTTACGCTGTAAGTAAATAGGAAATGGAATGCATGACTTGCGCTAAAGAAAATGTCTACAT:1 - chr2R 21809084 3' + INE-1 100 1 52.48 TATCAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAA:1 + chr3L 12634207 3' - BS 5046 1 75.25 GTCAGGATGGCCGTGTCGGCGCGGGCAGTTCGTGCTGTGTATGAGTGTGAGGCAACTCATTTATGTTTGCGTCGAAATCCTGCAGGGATTTCACCTACTTA:1 + chrX 3305449 3' + invader4 2747 1 51.49 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGTGGCGCTACTTACTGCGTAATTATTGAATTCTACATC:1 - chr3R 8979990 3' + transib2 2787 1 60.40 GTTAATAGTACCCCATTCCATGGGCTGACAGCAACGCTTCTAGTTCGACCTTGAATTCATTTGTTTTCCACTTCCCATCGATTCCTGCCTCGGCAGCTCCT:1 + chr2L 6609508 3' - Chouto 5990 1 67.33 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTAACTAGTGGTGAACTATATTGTTACAGCAGTAAATAAATAAGC:1 - chr3L 20882783 3' - 412 7083 2 53.47 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCCAAAAAGACACAGGCGCGCAACTATATATGTATGTGTGTGTATGAG:1 + chrX 5185713 3' + hopper 1387 1 53.47 TTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATGATGTAAGGTACAGTGGTTTTAAG:1 - chr3L 6034732 3' - 412 327 2 76.24 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTACAAGCACATAAACACAAATACATACTAATATGTGTGTTGGGCTGCTCCATTTCGGGATAAAAAGGAAG:1 + chr3L 14594203 3' - hobo 8 1 70.30 TTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAGGTGTGTGTGTGGGAACATAAAGAAATACGCGGTACTACTGGTAAGTTGTCTAATGG:1 - chrX 9205494 3' + diver 206 1 58.00 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAGTTCAGTTTCTTCTGTTATGCAATGAGTTACATTGCTGGTTT:1 - chr3L 21970801 3' + pogo 2070 1 58.42 AAGACCACATATACTTACACACACACACACATACCGCTGTACATTCACACATGCACACTTACTACGCTTAATTGACTTTCATGT:1 - chr2R 17224302 3' + Quasimodo 23 2 75.00 TTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTAATCTTAAACCTTAGGCATAA:1 + chr2R 10353295 3' - blood 7066 2 80.20 AGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATATATATATGTGTATACTATATGTGCCCGCTGAAAGCGAGGAGCCAAGAA:1 - chrX 11262807 3' + invader1 382 2 55.10 ACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGCTTAAAAGGCCATTTAATGAAATCTTCTACCTAATCTTTAAGTTAGTAATTAATGTAATCAGTTGAAATACTAAA:2 - chr3L 16563188 3' + 3S18 339 2 75.25 AAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAA:1 + chr3L 19339427 3' - Tc1 28 1 55.45 ATAATTGTTATATTGTTAATTGTTAACTTCTTTATTACTGTTTGGCTTGAGTAGGTGTACCTCAAAATCTCTTATTTAAATATCTCTTCCTGTCTCT:1 - chr2L 19246764 3' + BS3 1632 1 79.38 GCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCCATTTGGGGGAGAGGAGTGATGCAAGAATTA:1 - chrX 4264335 3' + mdg3 222 2 54.46 AACCGATTTTGTGCGGAGCNCGATAAAAACGCCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAAT:1 - chr3R 4971409 3' - F-element 46 1 60.82 AGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAATATGCATATGTCAATTAATCTAAAATTCACTATAAAATCGAAACTAGTCGGGTATT:1 + chrX 20886049 3' + Ivk 5359 1 47.52 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAG:1 - chrX 11025528 3' - hopper 31 1 69.33 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATTACCCCTTTTTGTGCATAGATTTTCCATCTT:1 + chrX 9775040 3' + 412 7499 2 71.29 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTAACAACTCGAAGCGGTATCAACCGGTTTGCATTT:1 - chr2L 12459684 3' - blood 7054 2 67.33 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCTAGATGCCGATGCATGTTGGCAATGCGAGTCGTAAAACCTCGTCTAAGT:1 - chr2R 19840191 3' - roo 8691 2 51.49 GAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAAACTATATAGCACACTTATTTGGTGTCAGCCA:1 + chr3R 7596934 3' + F-element 4378 1 69.31 TACTCATTTTATTTACATATGTAGGTTATAAAGACCAAAGTTGTCGCTTAAATCGACTTAGGCGAGTGCTGCATGTTATTTATAGTTTACAAAATACACAC:1 - chr2R 21720875 3' + Transpac 4848 1 55.45 CGAGCAAAAATGGGCAAAAGCTATTACTTTTAGAGGATAAAAAAGACTGGCTCTTTGTATAAATTGCCTTAAGAGTATTGAGACAGTTCAGCTCCGGCCAT:1 + chr2L 22320284 3' - transib2 496 1 71.29 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAACAATACTGGTAACTCTGTTCATCACATTGCACAGAATATGACTTGAATTAAGACTAG:1 - chr2R 20312571 3' - 1360 17 1 59.41 AAAGTCTAAAAATGTTGTAAATTGTATTTTGAATTTAACTATATATTATGAAAGAGCATATCCGCTTCGGTTTCTATGATGGTTCAATTTACCCATTTAAA:1 + chr3R 28448661 3' + transib3 33 1 57.43 GTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGGTACGGCGACATGTATTTCATCATTATCAGCGATCGCTGACATG:1 - chr3R 8383142 3' - 297 6566 1 56.44 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTCCTTCGACTA:1 - chr2L 8622765 3' - 297 36 2 73.27 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTGCATCCCATCCCATTT:1 + chr3R 30553628 3' - 412 7076 2 56.44 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGCGGCAACTGGAAAACTGGCAACTTCATTATTATTTG:1 + chr3L 8252247 3' + copia 248 1 63.37 TATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACTGTCATTGTGCATAAAATTCCGATATAAACCCTGTAGAA:1 + chr2R 17459225 3' - Transpac 4950 2 60.40 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAAATTGT:1 - chr3R 10087815 3' + roo 388 2 56.70 AGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGCTCTGATTAGAGAGCAAAAAATAACAGGCGGCA:1 - chr2R 13383517 3' + gypsy5 7308 2 66.34 TTTACTTTTATACTTAATAATTTGTAACCCTTAAATTTATATGGTAACTTTGGAACTATTTGCCTGTAATACTTGCAAATAAATACTTCTTGGAACGATGA:1 + chr3L 19014112 3' + G5 4724 1 52.48 GAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTATTATAGAACTCGGGAGATTTCTCCTCA:2 - chr2R 12473024 3' - Doc 3 1 70.30 AAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAATTAGCGTCGTCCGCAGCTAATTATGATCCCATCGCCGCGGG:1 + chrX 4210290 3' + invader4 2691 1 58.42 TAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTCCCAATAATTTTTATCTTCTATGGATAATTCCTGATCCCATTCA:1 - chr3R 19445997 3' - P-element 2743 1 50.50 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGAAAGGGCTGAGAACATTTAAGTTAAACCGATAAGCTAG:1 + chr2R 13763249 3' - roo 8702 2 65.35 GGTTCAAGGTTATACGGTATTTTTGAAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTAATTATATGCAATTCAATTTCTGCCTTTTTCA:1 - chr3L 22246656 3' - Stalker3T 344 1 69.31 ATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGCTTACACCGCGCCTGATTGGCAAGCGTCCCAATACGTACACGTTTAC:1 + chr2R 16622110 3' - opus 7407 2 56.44 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGGTGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAAA:1 - chr3R 14193914 3' - pogo 42 1 68.75 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATGGCCATCCTGCTATTTAGCCATGTTTTGTTTGGTTTTGTGCTTTGGCTGCAGTTTGAGCACTGCCATTCT:1 + chr2L 13566568 3' + hobo 2937 1 79.38 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCGTATTTTTGTGTAGTTTCTCTTTTCCCAATTTATATATTCCACTTAAAAAATACGTTTTTATTCTTATTT:1 - chr3R 27907598 3' + mdg3 5492 2 69.31 CAGTCAATGCCTGCGGTTTTTTAGTATTTTTGGGGCTTTG:1 - chr2L 11502327 3' - baggins 422 1 72.50 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCAT:2 - chr3R 19589928 3' - BS 5026 1 53.47 CCAACAGCCTAGCAAGGAANCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGTTCTCCAGCACGTCGAGCACCACCAAGGTGG:1 + chrX 3280188 3' + jockey 4677 1 68.32 ATAACAAAAATAAAAAAAAAAATGGAAAGTTGCCTTGGTGTACGGACCCAGCTTAAATTCAAGCCAATTAAATGGGACGCAGAAAATTAGGCAAACCACAA:1 + chr2R 21418372 3' + Rt1a 5079 12 70.30 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCAACTCA:1 - chr2R 9649193 3' + roo 9018 2 79.21 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAGCTTTGACAATCAGGACGAATGCA:1 + chr3L 3757430 3' + roo 9059 1 67.33 GTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGCATATAAGCCGTATCTATAAACAAAGCGAAAACCTTTGCCAAATAAATGTTGTGGAAAT:1 + chr3L 16563300 3' - 3S18 5784 2 61.39 AAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCCTCCGGTGGC:2 - chr2L 17994150 3' + roo 368 1 61.39 TGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATATCGCATTTCGTTAAAATTCATGCGCACTGCAGTCTCCAGTATCGTCACG:1 - chr2R 16110004 3' + G6 1970 1 53.47 AAAAAAAAAAGAAAATGGGGCCAATGATGGGTAATTTTCAAACGTCAAGGGTTGACTAACG:1 + chrX 4930117 3' - hopper 137 1 57.38 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATATGGCTTAAAAACTG:1 + chr3L 27357633 3' - mdg1 6 2 66.67 GCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTAGTTGGTACTCCCGGAAAGTGACCCTGTCACCTATGGAC:1 + chr3R 28548093 3' + R1A1-element 19 1 61.39 CGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCAAAAGTTACAGGTGAATGGCCGCTCCCCGCTGTGCACC:1 + chr2R 14411051 3' - R1A1-element 352 1 62.38 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACATTTAAGTGCAGCACTTGAAAAAGTACTTAATTAATGCCATAAATCCGCCGACATCCATAAACCCGTC:1 + chrX 9454907 3' - roo 8671 2 73.27 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCAGACTAATTAAATTAATTGCCCCTGCGTAGCCTG:1 + chr2R 23780070 3' + mdg1 7418 2 64.36 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCAAACCCGTTTATCGCTCGGCATAAATAATTGATGTTTAATATGCGCCTGG:1 + chr3L 13895433 3' - hobo 26 1 51.49 AGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAATGAAACCGAATC:1 - chrX 7292679 3' - 3S18 5806 2 61.39 ACATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTCAAAACCAAAAATACGAAACCAAAATCAAAACAACGTCAGTCAATCAAATCCATCAATCATGCTGAAGAT:1 - chr2L 7568808 3' + Doc2-element 4366 1 72.28 GCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAACATTTGACATTTATTTAAATATTTTTAAATTTTTCGATTGAGCGGAAAGTTTAGTTCCGAAAATTGGCGAT:1 + chrX 22789414 3' - Tabor 6 2 69.31 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGAAAGATAAAAAAAAAACATGCAAATGTCAGCGGGGGAATTGGTGTTTTGGC:1 - chr3R 23338263 3' - roo 8690 2 58.42 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGTTACTTGAATTATGTACAT:1 + chrX 22574725 3' + 297 378 2 64.36 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTACTTATTATAGTATAATATCA:1 + chr3L 20411879 3' + roo 397 1 66.34 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTGGCAACAGTTGGTTGCCATCCTCTATTC:1 - chr3L 17942644 3' + copia 241 1 72.28 ACAACGATTATCATAATTATATTAGTCATTTAAATCCGGAGGCAACGCATAAATGTGTAAATATATGTACAACTTTCCTTTCGGGCAGTTTGGTCAATACA:1 + chr3R 20098143 3' + rooA 7150 1 54.46 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTTCTTCGACTACTTGTGGCTCTTC:1 - chr2L 8622752 3' - 297 23 2 58.42 GGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATATATATATAAGCACGCATTGGCCTAAGTCAAA:1 + chr2R 21433202 3' + HMS-Beagle2 7166 2 72.41 ACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGAATGAGGCACAGAGAAATAATA:1 - chr3L 13374687 3' + Transpac 284 2 60.40 ATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGCTTCAAGATAAGGGATATATAGTTTAAAAATTATGTAATTATGATTGTTATTTAG:1 - chrX 17124011 3' - Cr1a 4178 1 70.30 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAAATTTTCGTACCAAAGTGCCACAAATAATTTAGCACTCGAAAGTAAGCAA:1 - chr2L 6362835 3' - 412 23 2 54.46 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATAGGAATGCTAATTAACTACAATAAAACATTTTGATGGAGCGATAGATTTATGTATATAGGG:1 - chr3R 13913011 3' + mdg1 384 2 60.00 AGCAATCACGATATCTACTGCAACTGCACCTTTTGCAACAACAACTGCAACAGCATCAACATCAAACTCATTCAATCCACTCACCCATTAATCGTTCAATC:1 + chrX 5395320 3' + Doc3-element 496 1 67.33 AGCTGCATTTTTAAGTTACNTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATAAGACGAAATCCCATTGAAGGCAAC:1 + chr2R 7839025 3' + pogo 2051 1 74.26 GTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGACCTTGCTGCCTGCTTCCTCTTGTGAGTTTATGCTCTCTCTTAGCCTTTTCTCTTTCTCTATAAAAACCTTAATGTTA:1 + chr3R 1849023 3' + Cr1a 186 1 80.20 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATAAGAAATATTTTATCGTAACTAACAAGCTATCTTCTTAGATCAATATCCGCGATTCCATA:2 + chr3R 17482093 3' + copia 240 1 55.45 CGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTACACAATATTTTTTCAGGACCAACAATGTTAAGTTATGTTTATCATGTATGTGAGCGAGCTTCTAATGACTAATA:1 + chr3R 24314779 3' - X-element 12 1 58.42 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATATGACAGCATTTTTCCTTCGCAGTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATC:1 - chr3R 17733317 3' - Transpac 24 2 48.51 TTGAATAGTATATTCCAACATATACCATTACCTCATTATGTAATTTGCTGTATCTGCACCTTCTAATTGTAGATCCCGCCGCGGGAATCGTGGAACGGCGA:1 - chr3R 17481966 3' - copia 4868 1 71.29 CTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGACTACGAGGTTATCCAAGGATTAGATATGGTGTTGCCCATGCTGCAGGTCGGC:1 - chr2R 18631232 3' + R1A1-element 4958 1 63.83 AGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAAGCCAAAGCCCAAACATAGACATAATTATTTCAGTCGCTCGGCGAGCCATACTACCCAAAATAAATTCC:1 + chr2R 19091696 3' - Stalker2 7256 2 67.33 GTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGTACTGCCCTGACTTTCAGCAAATACTGACTTTTTATGCATATCG:1 + chrX 17494688 3' + 1360 3357 1 59.41 CTGCAGCCGGAAAGCTTTGGGATAATTTGGTTTTCGTAAATAGAGAAACATTCAGCTGATCGTTCTCGATTCTCTTTCATTTCCATTTGCGCAAATTATTT:1 - chr3L 15232286 3' + Gypsy12A_LTR 152 1 62.38 ACCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATGCGTTACTCACATATCTCAATTGGTGTCGCTTGT:1 - chr2R 7546237 3' + hopper 99 1 61.39 GAAGTCGTCCCCGGATTCAATGGTCTTAGATGGTTGTTGCCGTCTCCACACCGGCAAAGGCTCCAAACGGTTGTACAAATGGCATAATTATGGGATAGACA:1 - chr2L 12596190 3' - gypsy10 5604 1 66.34 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACATGCGAAT:1 - chr3R 10110411 3' - Doc 22 1 55.45 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCCTTACTCCCC:1 + chr2L 12882819 3' + hopper 1400 1 61.22 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTTATTAATTCTCATAAAAAAATTGGTTAGTCTGGCCAAATCAGTCAAGGCAGAACTAAAATAAATAG:1 - chr3R 21588972 3' + flea 5006 2 72.28 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATAAAACTTAACGATTTTTTTTGTACTGATCAAGCTGTATC:1 - chr3R 25581018 3' - pogo 35 1 67.33 TGCGTACATATATATTTAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGCGACATAATCAAATTTCCGTAG:1 - chr3R 25086247 3' + gypsy11 8 2 78.22 CCGTTCAGAAGTATCTCCACTAAGGAGAATAAAATAAGGAACAGGAACAGCTTATTAATATCTATTTGGATCTTAACTGAATAAGATACAAAAACAAAAAA:1 + chr2R 5491409 3' + mdg3 5134 1 63.37 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTCGAGTGTGAG:1 + chr2L 14762031 3' - mdg1 7059 2 55.32 GATCTTACTTATCATTAATAAATATTGCAGGAAATCTCTAAACAAGCTTTAAAAGCCTAGCAAGCTAAATACACTTTTCTTAATTCTCTGGTTCGTTTCGC:1 + chr2L 14249872 3' + pogo 1948 1 73.27 TAATATTAATTTTTTTTATCTTTGTTTTCAAGAGGTCTTTAATTATATAAGCTTATAACAAATTCATTCAATAGCTATTTTTTTAGGATAGACTAAACGCT:1 - chrX 12398899 3' - gypsy9 5303 2 66.34 ATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGGAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAAT:1 - chr2L 14793504 3' - Stalker2 40 2 64.58 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTCATGCTATCCTGCTTTCCGACGGGTCCTTGCCAGCTTTTAA:2 + chr3R 23543041 3' - 412 10 2 69.31 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTTTTAAAAAAATATTTATTTTGTATTTAG:1 - chr3R 26317935 3' - roo 48 2 76.24 CGTTTTGAGACTTTATTATCTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAAATTCCAATTTAGGCGTTCATTTAGGAGTAATGAATGTTTGCG:1 - chr2L 14761959 3' + mdg1 389 2 53.47 GTGTCCACAAACACACACACATATAATATACTCCCGATCCTGGTCTTTGAGTCCTTATTGATTTAAAAATGCAAATCGCATTTGGCCTCAAGATGTTTTCA:1 - chr3L 1928974 3' + G3 40 1 80.20 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCGCCTCCAAAGAGAAGGCGGAAG:1 - chr3L 13773873 3' + roo 390 2 60.40 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACCTAAGAAGATTGAATTTGAAATAAATTAAAGAGCTGAACACTTTCAATTGAAAATAGAGTCTGAAAATA:1 + chr3R 29608873 3' - roo 6 2 74.26 ATGTAAATAAAGATAAAGGNTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATGAAACACTGGAAATAAAAGCTAAGAACAGCAAATAGAA:1 - chr2R 9950116 3' - 3S18 38 2 59.41 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTAGTCGAATTATTGGTTTTTCCTGAAGTGTACAGTTCCGTATAAAATACGGAAATATATA:1 + chr3R 5506866 3' - pogo 14 1 65.35 AAAAATATATAAAAAAATATCACAAACGAAATAAAGTGCTGTGTTGTTGTGTTACTTGCGATGATTACCTTCTCATGTGTCTCTATTGCTTCTAAATGT:1 + chr3R 2833792 3' - copia 4659 1 64.65 CACAGCCAAAACGACACGAATTTGGCGGTAGGCAAAGAAGAAAGGAAAGCGAGACGGGTTATACTGCCGCTCGATGTTTCACACTTTTGCCCTTGGGCCTT:1 + chr3L 12649921 3' - G3 3 1 70.30 AAAAAAAAAACCAAAAAACAATAAAGTGCAACAGCTATCGGAGAAGAGTTTTTCTCCCACAAATAAGCAGCGGAAGCGAAAGAAATATATAAACCAAAAAT:1 + chr2L 13553166 3' + Bari2 911 3 74.26 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGAATAGAGTTTCTGGCTTTGTCGCGTATATTCGTGAATTTATGGCTCCCTCGTCTTAATGAGAGGCCAAC:1 + chr3R 13353293 3' + 1360 3380 2 68.32 GATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATTCGTCCTAATGCAATAGAATTCAAGAGAGAGATGGATGATATCCTA:1 - chr3R 2690364 3' - diver2 125 2 53.47 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTT:1 + chr3L 25059139 3' + mdg1 7422 2 62.38 TACTTCATATTGTAATTCATATAAGTTATATAATAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAA:1 - chr3R 15095973 3' + Doc2-element 4681 1 71.29 CGTTTATGCACGTTCGTTGGTGGCTTAAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCATTTGTTTCTGTATCCTGCGTGT:1 - chr3R 25782560 3' - Ivk 5004 1 73.27 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGG:1 - chrX 21668013 3' + Tabor 7294 2 57.61 TTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTACTTATCAGGCGAATAAGATTTCCCTACAAACCATTCCAAGCGAA:1 + chr2R 6512845 3' + F-element 15 1 55.45 ATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACAT:1 - chr2R 4260437 3' - micropia 5138 2 79.21 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACACTAGAATTGAGTTTAAATATACAGACAACCAGGA:1 + chr3R 28565318 3' + 412 7501 2 62.38 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTTGCTCTCCTAATCGGCGTATCTTAT:1 + chrX 21217593 3' - pogo 14 1 61.39 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGT:1 + chr3R 24767843 3' - P-element 50 1 29.70 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCAGCTTTTCCATCCGGCATTTATGTGAACCTAAAACTAAACCACATAGAGAGTA:1 + chr2L 8577349 3' - roo 8688 2 56.44 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCGCCTCCAAAGAGAAGGCGGAAGTTGGCCAGGCAAAAAGGA:1 - chr3L 13773855 3' + roo 408 1 78.22 TAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAAACAGAGGTCGAGAGCCAGGAGACGTTGTCCCTA:1 + chr2R 7659797 3' - F-element 4462 1 67.33 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAACAAAGAGCGGGAGAAAGCTCTTGAAGAGCAGTGAAAATAGCAAAGAGCGCG:1 - chr3R 14580290 3' - blood 7035 2 54.55 ATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTCGAATATATATTTGGTAATCTATGCTTTTGAATCTCTTTTTCGTCGCCTTTTTATCGCCGTGT:1 - chr2R 16206445 3' - Juan 4137 1 68.32 ACATTTTTCAAAAGTTTGGGCGTGGCATTTTTATGCCGTTTCTGGGCGCTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAAGCTGTTGGCGGAAAATATGTTAAGT:1 - chr2L 4711815 3' - INE-1 255 1 75.25 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACCTAGAATTGCATATATAGAATGACATACG:1 + chr2L 14341887 3' + copia 5076 2 77.23 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCC:1 + chrX 1399906 3' + P-element 2834 1 26.73 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATAACTGATAATTGTTCCAATTTTTCAACTGTTCTATCGAGGTGGAATGTACATAA:1 - chr3R 11916537 3' - roo 8683 2 60.40 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCTTTATCGCCTCCTCGCTCTTGAGAGTCAATA:1 + chr2R 22856622 3' + 1360 3386 2 76.24 TCAGGTTCAATTTCGCAAGCTAACATTTAAATGACTTCTGGTGGCTGGATTAGAGCTAGCAAGCTAGCAAGAGCTAGCAAAACAAGTTGAAAGGTGTTCCT:1 + chr3R 11368420 3' + hopper 265 1 43.56 TGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAGTGTCGCGAAATTTCTTCGCGCACCGTGATTGGCTCAGCCGGCCGCCAGCTGATGGCGCAT:1 - chr3R 24856307 3' + G-element 65 1 77.32 ATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAATGAAACCGA:1 - chrX 7292682 3' - 3S18 5809 2 64.36 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATGTGCAAACAAAGTTGAATTAAAAAAGGAGGAAAAAGCA:1 - chr2L 12958893 3' + roo 397 1 67.00 ATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGTGATTGATCTTCGGATGATATATCGAAACATTATGAAGGCGCTTTATGGGCG:1 - chr3L 15349688 3' + 1360 3277 1 71.95 TCTTGGATGCCAGACTTCCGGCACAAAAGCGGATATGAAAGTGCGTTTGGGGATAAGTTCACGGGTGGATTTTTCAAGCGGCATGAATTATGAGCCAATAA:1 + chrX 15264470 3' + invader3 383 1 71.29 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAGTGTGTTTATGCGTTGGTAAATTAAATTTGAAA:1 + chr2L 7666188 3' + roo 9055 2 63.37 TGACCTTCGACGAGGGAATGCCGGTCGCTCAAAAGACCGTGTTTGGGTGGATCGTGTCCGGTGCAGGCCCAAGCTGCAAATCACTTGTCTCATCAAAAATA:1 + chr2R 21018596 3' + GATE 8116 1 63.37 CGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTATATAACTCATCCGTTAAGAAACGGCGATAGCTTCTTCTTTACTGGAGAAACTGTCGACGTAGTCT:1 + chr2R 4500953 3' + springer 7508 2 64.36 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCGATTTT:1 + chr3L 25345159 3' - Doc 38 1 55.45 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCTACTGTGGCATGCCCCGCCCCCTTTATAATTTTTCACCGGCCTAGGTCCCGTTTTA:1 - chr3L 19861766 3' + 1360 3369 1 64.36 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTCGCCCCCCCC:1 + chr3R 23426456 3' + Quasimodo 7361 2 64.86 AAATAAACGAAGAAGTGCGAAGCAAACAAAGTGATAACAAGAATAAAAAAAAAGCTAAACCAACGGTTAAAATTCCTTGCGTCGGTGCATTTAACAAATA:1 + chrX 16787300 3' + gypsy4 341 1 72.00 TTTTACCAAAGACACTAGAATAGTGTCTTATTCTTGCTTTTACTCTACGAGCAACGGGTATAATCATATATAATAAAATATGTCATCAAAGTTAGGCTTTA:1 - chr2R 5249846 3' + Tc3 237 1 67.33 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGGTGAATATTTTTGACAAATTACTTAAATTACTTACGAGCGAA:1 + chr2R 11030573 3' - F-element 58 1 68.32 ATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTCCTCGCATTTCTAAAGTTTTATATTTGCTTAAACAATTTGATG:2 - chr2L 19642299 3' + Quasimodo 7341 2 56.44 GCGAATATTCAATTAACTGNGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAG:1 + chr3R 10736117 3' - McClintock 28 2 59.41 TCCAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGAGTGCGAAACGTGCGAAGAAACAACAAAATGGTTCATCAATAAGTTATCGATAACTTAAGTCGCACAACCGTTA:1 + chr3R 8932237 3' - accord 258 2 52.48 TTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATTTCGTTTTATTCGCACATCTGGTACTAGCAGTACAGTGTGTAGATACATTTGTAAGTGTTAGAAGTG:1 - chr2L 3697167 3' - mdg3 5033 1 67.33 TAAAAACACCCTCAACTCTCCCGCTCCCATCAGCTTCCTTCTTTGCACATTGGGTAGATATGTGACCCTGTTCACCGCACTTGTAGCAAGTTACACTTGAT:1 + chr3L 26057548 3' + Porto1 464 1 78.22 GTGTGGTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAAACCGTCTTGTCACCTTAAAACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAAT:1 - chr2L 16687334 3' - Transib-N1_DM 225 1 68.32 CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTACAAAATGGTTTA:1 + chrX 734967 3' - Tabor 6882 2 65.35 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAA:1 + chrX 15546216 3' - blood 33 2 56.44 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGAAATCGAATTTATCACATGTTATGCGTTTGCACATGTAGTGG:1 - chr2R 17420828 3' + pogo 2084 1 55.17 TGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAATTACAGGTGATAAAGCTTGGGA:1 + chr2R 10956970 3' + copia 225 1 55.45 AGAGAGGCCGTCGGCAGAGACGTTGCTTTGCTCTTATGTCCTCATCTTATGCAATGGAATGCTCCCACTGTCGTTTTTCTTTTCCTCTATGTTATGCAACT:1 + chr3L 27412279 3' - Tabor 276 2 68.32 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATCCCAAAAAAAGAGATACTTAAATGCCAAATTCTCTGGAAATTTAAGTAGTGTTCATATGT:1 + chr3R 19505622 3' + mdg3 232 2 44.00 ATTTTAATATAAGGCCTTTTTATTACCAATAACTAGGAAAGCGATGCATTTAAATGTAAACAAAATAAATAACGCTTATAAAACTTTATGCTCAGTGTACC:1 - chr2L 11940607 3' + S2 1650 1 78.22 TGAGGGGGGAGTAGTTAACNCACAATAATTCTTAGCAACTAAGTAGCTCTACATAAAGAGTGCTGACACGCCAGACGGTCAGTTTTTTGTGGAACTGGCAT:1 - chr2R 17681164 3' + gypsy3 6564 1 73.27 AGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCCCCAAAGTAAGCGTGAGTGAGTTCTTGTAAGAGATCTTCATATGAAGTATATACACTGCGCGTATATACAAA:1 + chrX 23037785 3' - mariner2 767 1 43.00 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTTTTAGCCCATTAGCAGCAGTTAAAGAACTTTATTTCTAGTGTATTCTGG:1 - chr3R 17971624 3' + 412 491 2 74.74 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCAAACATTTTTGAATTCAAATTTGTCCAACAGGTTCC:1 + chr3L 163277 3' - mdg1 7078 2 63.37 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTA:1 - chr2L 9045423 3' + jockey 4956 1 62.38 AGCCATACGTCAAGAAATTCATTCGGAACCACAGTAAGCTGTTCTTATGTAATTTAAGTCCTTAAAACATTTCAACTCTTTAATTACAACCACAAGCGCGT:1 + chr3L 5710475 3' + Transpac 367 1 60.40 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGTACATATATATTATGTATTACATA:1 + chr3R 12468319 3' + copia 239 1 72.28 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAAGCATTAAGCAATCTTTCTGCGAAACGCTCGCG:1 - chr3L 1586697 3' - Tirant 4 2 73.96 AACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTACTGCGCCTTTCGCGTATTTCGAGCTCATTTCTGACATTACAGATGCTGATAGGACACACAGCTGTC:1 + chrX 16508734 3' - hopper 936 1 72.28 AGCCCGACGGCTGCCTTCANCTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACATTATAATAATGAAACAGTTAAAAAGCAATTATTAGAAA:1 + chrX 7788657 3' + 412 7506 2 62.00 GCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCGGTGCTGTTGAAGTGGCCGTGTTGTGTTCATTAGTTCAGGTA:1 + chr3R 16798124 3' - I-element 314 1 58.42 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCCATCCCACGCACATGCAACAAGAAATGGCAAA:1 - chr2L 10625683 3' + roo 9029 1 65.35 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGAGCTTAGGAAACCAAATTAAGCTTTGACTTTTTAAAGGA:1 + chrX 1399952 3' + P-element 2880 2 72.28 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCACAGCGGGCCCGAAGATAAGCCGTTGAAGCTTAAATTTATGCT:1 - chr2R 23780011 3' - mdg1 33 2 56.44 CTGTAGCTCAATTTTTAGANTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGT:1 + chr3L 19274872 3' + transib2 2790 1 59.41 TACACATTATAATTAAGGAACAGATCCATTAGGATCCGAAATCCCAGGGGTCAGAACCCGATGCAGCCTATCGCCATCAGCTGGAGGCGCCTCTGAAGAAC:1 - 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blood 7065 2 83.17 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGTGGAAAATTTTCAAGCTTTTCCGCAGTGATT:1 + chr3L 5415392 3' - I-element 11 1 56.52 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAAAAATTTAAAGTTTTAAAAGGCAAAAACTCGCTACCATGAGTAGGCAAA:1 - chr3R 10782255 3' - Doc 34 1 56.44 AAAACGGAGTTATATAAGAGGACATTGTACTCCAGTCTTACTGTTTCACCCTTGTTCTAAGACCATGACATATTTTATGTTGGATTTACATACATTGCCTT:1 - chr3L 10019697 3' - Doc3-element 4289 1 62.38 TCGTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATTGTTATTAAAACATGGGTTCACAGGGGGGGAAGGGGGCGGGGTCAACTATGGAAAC:1 + chr2L 3182355 3' + Tabor 7197 2 57.43 ATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTTTTATTAGTGTACGAAATAAACAAAAGTTTAAGTTT:1 + chr3R 7513971 3' + diver 6071 2 70.30 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTAAAATGATTACTAAATTGATATCAGATTGGCAGATAATAGCAA:2 + chr3R 19949365 3' - mdg1 34 2 59.41 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTATCATTTACGATCGACACAC:1 + chr2L 21086114 3' - roo 8678 2 65.35 GTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCGTGAGTGTAAGCTGGCAGCCCGCTGTTTTTGTCACTGACATTCGAA:1 - 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roo 46 2 73.27 TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTGGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACAGAACTTCTGAAGGAAAA:1 + chr3L 20882829 3' + 412 436 2 77.23 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCT:1 + chr3R 8165793 3' - 297 13 2 97.03 ATCCCACTTCTGAATTGTCAGGATGATCTTCAGGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTTTATATAGAAAAATAAACTCTTGTATAACAATAAGACTTTTAA:1 + chr2L 15792689 3' - Bica 158 1 57.43 CCACGCACACAACAATGTATTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTAATGCCCAAATGTGCGACTTCAAGAGCTCACACATTAACACACAACGCGCTTTAAG:1 + chr3R 23635771 3' - flea 331 1 42.00 GGGGAACATCTAGGAACTCTAACATTGAAATATTGCAGAGATACCAGTCTATGATGCTTAGAACCTGAAAGGAAAACTCGCACATGGCTGATTAATCAGAC:2 + chr2R 23430931 3' + G3 4218 1 63.37 AAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGGAAATGCATATATAGATAGGTAAAGTGCTTGCCGGCAGTATAAGTGTCTGGGGAAAATGAAAATATCTGCGAGG:1 + chr2R 18507923 3' - Cr1a 69 1 79.21 AAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGCG:2 - chr3R 31887757 3' + HB 1559 1 70.30 AAATTTTAAAATTTAAATTAAATTAATTTAAATTAATTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGG:1 - chr2R 5883602 3' + 1360 3040 1 35.64 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGC:1 - chr3R 14193919 3' - pogo 52 1 77.23 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTTCCGAGAACTGAGACGACAATGGCGACGACATAAATAT:1 - chr3R 26252678 3' - 412 7088 2 57.58 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGTATAGGTGCAATTAATTTAGA:1 + chr3R 25021724 3' - roo 8718 2 83.17 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGAAGCTTTTACTG:1 - chr2L 18213135 3' + hopper 1407 2 67.71 ATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAAAAAAAAGGCTGCATATTTAAGAAGCAGTA:1 - chr2L 15220214 3' - invader4 2800 2 70.30 TAGCAGAATCAGTTGCGCTNTCTTCAATTCAAGCTTACCTAGTCCGAATTGTCGTCGCCGCGCCGTTCAACTTTGGGTCGCGAAAAGTTTGTTAGCCTGAC:1 + chr3L 23693384 3' - G4 140 1 70.30 TTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTTTCGCAATCAGCCATTT:1 - chrX 8334297 3' + flea 225 2 61.46 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCTTGTGGCCTTT:1 - chrX 13126203 3' + mdg1 393 2 51.49 CTTCTGTGAACACGTCCACNCAATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGCGGAGCTGTGGCTCTGGGAGAAAGGCAAACAGAAGTGATGTAAAAATATGCGT:1 + chr3R 12199836 3' - jockey 30 1 54.46 TGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGCTTCCGTGTGGATTGCGTTCCACTGGC:1 + chr2R 8996882 3' - I-element 166 1 56.36 ATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCT:1 + chr3R 19450190 3' - roo 8644 1 72.28 CCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATGCGTTACTCACATATCTCAATTGGTGTCGCTTGTC:1 - chr2R 7546236 3' + hopper 100 1 62.38 GAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAATTACGGTGCAATTG:1 - chr2L 23390352 3' - gypsy6 33 2 60.00 GCTAAGAGAAATGTACTAAGAAACAGGGCTGGTAGATACTAAAGCCAAAAGGTGTGGATAGTGAAGAAAAGTATCTTGCTCATTGTAACTCTTTGCAGTTC:1 + chr3L 8700867 3' + Helitron 468 1 64.36 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAGAGGTGGATGAGCGGGAAAATTGATATGCCGAGTGCGACAGTGCA:1 + chr2R 19061312 3' - roo 10 2 69.31 TTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAATAACCTAGCTTAAAGTGTGCCTAATTTGAAAAGTCTACA:1 - chr2L 3699378 3' + mdg3 243 2 73.27 GGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAAAACTTAAGGAAATGACCCAGAGATATGAAACAGAGGA:1 - chrX 983293 3' + Juan 4206 1 64.00 TATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCACCTCACATCACCCACATCCAAAATGCGGTGCTGTTACCCATTTCCG:1 - chr3R 13739649 3' - Burdock 9 2 70.30 ACTGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATCTACAGCCCGTTTCACATTGTTTGGCTCGGCAGACGCTTAATTGGGAATTTTCCTTAGCA:1 - chrX 11032170 3' + invader3 260 2 53.47 TTCCTTAGCTTAAGAATTAACAATCTTTTCTGCCCTCTACCCATTTAACTACAAGCCTACATCTACACAATATCATATATAACAGTGATGGGAATAAATAA:1 - chr4 127745 3' - HB 388 1 58.42 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCATATCGCATTTTATCAAACATAAACACA:1 - chr3R 29287513 3' - hobo 46 1 73.27 GTGTTCCCTGGGTACCGATTATTACACATATTACACATAAATAATACACATAAATCCAAATATTGTGTCTGCCAGACAGTTAATAAATGGCCGAATTTGCA:1 + chr3L 21703399 3' + 1360 2911 1 60.40 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGG:1 - chrX 21668014 3' + Tabor 7284 2 62.38 GATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAACTACAAAGATGTTACGAAGGATCTTTTAAAGATTCAAAAT:1 - chr2R 23194282 3' - copia 183 2 65.35 TTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATAGCTTAGGATCGAAAGCTAAAGTGATGTACATTTTAGACTGTTCAATTATTAA:2 - chr2R 6779762 3' + 17.6 469 2 55.45 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGCATAAATAAATGAAAATGCTACAGTTCAAAACGGACC:1 + chr2L 16139172 3' - copia 4909 2 67.33 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGGTTT:1 + chr2L 4063754 3' - roo 8700 2 66.34 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAAATAAGGCTGTGCGCGATAAAAAAAAAACAATATATATATCTAATAACGAGTGTTGAGAATT:1 - chr3L 19067519 3' + jockey 4917 1 62.38 TGAGCACACACACACACACACACCCACACACACTTCAAATGGCCTGCGCTGGGTGGACGCGACCTCGTCAAGTTTTAGTCGACTGCTCATGTGTGCGCTTG:1 + chrX 4741736 3' + accord 182 2 55.45 AGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAACACAATTATGACAGTTGTCATAGAACATCTAACCAAATAT:1 - chr2R 22738914 3' - invader1 3869 2 75.95 AAAACAACCGATTTTGTGCNGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATTGCTGTGCACA:1 + chr2R 9631756 3' - F-element 51 1 72.00 ATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACGAGTAAACGCTCTTTTGGGATTTAAGTTGCCCCGTTCGGTTCATCGTACTTTTCCCCACCATCGAATTTTGTA:1 - chr3R 10915574 3' + F-element 328 1 72.28 TTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACACTAGAATTGAGTTTAAATATACAGACAACCAGGAGCGGCGCACGGAGTTTGCAA:1 + chr3R 28565338 3' + 412 468 2 53.47 TACTTATGTATCGCTCTGCNTTTGACTTTATTTCGATTTTAACAAGGGGAGAAGCGATTAAGCTGACACCGAATCAAAGCACCGCCGGAAACACAATTTTT:1 + chr3R 892304 3' - G3 4367 1 57.43 GATAAAAATAAATTAATATTTTATAGAATGTCTTTATTAGTACATTCGCTTCCAAATTTTCAGCTGAGACCGGCTGTTAAATGTTGCCAGCCATCCACTCG:1 + chr3R 9133657 3' + mariner2 830 1 58.42 TTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAGATGTAGTTTCGTTTTATTGATACCCCGCTTTTTATCCAATGC:1 + chrX 11032250 3' - invader3 36 2 61.39 AATATATATACATATATATATTTCGAGGAGCAGGAAAAAAGGAGTAAAAAAAACACACACAGACACACACGCACTCCGCGGCTCTCTTCCACGCTCTCTTC:1 + chr3L 7189795 3' - 1731 4410 1 64.36 CTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCAAACAACTTTATAAATTAATGCA:1 + chr3L 18539429 3' + Quasimodo 7008 2 80.00 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCAT:1 - 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chr3L 9928519 3' + roo 392 2 59.41 AAGGAAGAGGGTAGAAGGANCAGCCTACTACACTATATAGATCCTTGTTTCCTGGGGATATTCTCCTTAATATTTTGATATCTTTTATTAGCATACTTTAC:1 + chr3L 4009513 3' - mdg3 5263 1 68.32 TTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATGCGTTACTCACATATCTCAATTG:2 - chr2R 7546248 3' + hopper 88 1 50.50 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTATATATTTAAAAATGTTAATAAGCATTAGTTTCAAGTTAGTTAGCCA:1 - chr2R 19088954 3' + Tabor 455 2 55.45 CTCTACCCGCGATATGGGTNCCAACCACAGCCACCACGATAGATAGATAGGGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 5018 1 54.46 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAAACTACTCATACGAGTGGTCG:1 - chrX 21217488 3' + pogo 2094 1 69.23 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCG:1 - chr3R 27495671 3' + 412 437 2 75.25 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACGTTGCCTACTTC:1 - chr3L 20049612 3' - jockey 4780 1 58.42 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAA:1 - chr3L 1586729 3' - Tirant 41 2 65.35 TCAAGCCATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGTACAATATGACCATGTTGGCCGGCCGAAAAGAGCAGCAAC:1 + chr3R 8069566 3' + Stalker2 219 2 75.25 AGACTACTGTTTCGCCGACATATGCATATTTAGTTATGATGAATGAAATATAGATTACTAATAAAGGCTTTCTTTTTGACTTTTCAGGTA:1 + chr3L 20454626 3' + invader4 327 1 76.67 CGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTTACTACGCTCTTATTTGTTGCTTAACTGGCAACAGGCAGGCCCTTCTTCCGCAGTTGACATCTGCATTTGT:1 - chrX 21183947 3' - Juan 7 1 71.29 GAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCAT:1 + chr3R 25086146 3' + Bari1 1656 1 76.24 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGC:1 - chr3R 29608800 3' + roo 9018 2 79.21 AAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCCGCCCACATATCATCAATTCCGTGCCATTTGGCCCACAGTTCG:1 + chr2R 14576573 3' + gypsy5 375 2 63.37 AATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGCGCCTGCAAACAATGGCGGG:1 + chr2R 13383552 3' - gypsy5 6974 2 76.92 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGTTTACAGAAAACATCGTGAAATTTGCATTACTGACTACATTCTCTTAAACCTATAA:1 - chr2L 8577259 3' + roo 9053 2 60.40 ACTCTAGTTCTTCGTTTTGTTGCACTTGCAGTTTGCCTGAATGTAGTCCCCATGTAACAATTGATTTTCGATTCGCAAAAAGCCATCGTCTTCTCTGCAAG:1 + chr3R 19132728 3' - mariner2 312 1 72.28 CGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCATCTTCGGATGCTTCACTTCCACGCGGCTTTATTTATTATCACGCTCTGACTA:1 + chr3R 15451680 3' + R1A1-element 130 1 58.42 GGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACTACTGGAACACGTTGAGAAATTATTTGGATTTCTTTTCAAAAGATTGTAATTTTTATTAAAGCATTTTATT:1 + chr2L 16425215 3' + hobo 474 1 76.77 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACGCTTTTTGAAACCAATAGGTATTTTACCGATCTGCTTATTATCTTAACTTCAGGAACCTTTACCAAAAA:1 - chr3R 27169398 3' - 412 7 2 70.30 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCAAAATATACATGACCATGTGA:1 + chr3L 22930354 3' + roo 9019 2 78.22 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTCTCTATTGTTGTACCCGATACCTATTACCCATTAAAGG:1 + chr2R 5720528 3' - pogo 49 1 46.53 GAGTCCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGAGGGTGATAAGTCCACATGCATATCCACACTCGTAGCGAGTCATGGTCGCT:1 - chr2R 24539385 3' - roo 468 1 54.46 GTATGCGTATAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTTGTGTGCGAGTTTAATTTTTCCATTTCGCCCAGCATCACCAAGGAGTCATA:1 + chr3R 22237327 3' + micropia 21 2 60.00 CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTGTTCCCGAACTGCATATACATATATTAACGTGCGTGTGCGCCTCCCTCTTGTCTGAGCAACTTAC:1 - chr3R 24976712 3' + opus 7495 2 73.27 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATAAATAGAAGTAAATGCGTTCCCACCATTCGTTATCTATTTTCCGAA:1 - chr3L 3209170 3' - roo 8693 2 58.42 TTTATTAACTACATAAGAAGTCTTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCTTG:1 - chrX 13126211 3' + mdg1 7438 2 47.67 GTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGATTGAATTTTCGAAGTGAATACTACTTCCTTTTCAGTGCATAAAACATATCTGAA:1 - chr2L 20328694 3' - opus 7022 2 60.40 CAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAAGCCAAAGCCCAAACATAGACATAATTATTTCAGTCGCTCGGCGAGCCATACTACCCAAAATAAATTCCTCGAATG:1 + chr2R 19091703 3' - Stalker2 7249 2 74.26 GACAACATGGACTGGCAAGCCGCCCCGCGACCCTCCAAGCTGACCAAAGCGCCTAGAAAGAAGGCGCTCAAGGAGAAGGTGAAAACCATACGCCCACACGG:1 + chrX 3020036 3' + G-element 316 1 78.22 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTT:1 - chr3L 3540130 3' + mdg3 5471 2 52.48 GTGGGTAGAGGACAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTCTTTAGCTAAGAAATTAAGCACAAGCATAAAATCATTTATAACAATTTAGAAAATA:1 + chr2R 18729574 3' + HB 351 1 69.31 CTGAATAGCGTGCATTTTAAAAAAAGGAAGTTATGCTGCCGCACCCTGTATTTCGGTCATGATACTTGCAGCATCTGCTGTCTTCGGTGTGGGTCCATTGC:1 + chr2L 21687136 3' - mariner2 26 1 51.49 TGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGACAGTTGGTAGCCTCAATTTGATTCGCAAGCGCAGAAATGGGAGCAG:1 + chr2L 15531896 3' - Stalker2 7246 1 81.19 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTATATTTAAAAAAAAATAATTGAAATGTGCACATGAACTTA:1 + chr3L 10701775 3' + roo 9034 1 63.37 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCTACTGTGGCATGCCCCGCCCCCTTTATAATTTTTCACCGGCCTAGGTCC:1 - chr3L 19861773 3' + 1360 3362 1 57.43 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCAAGAGGAAAACTATTGGTCAACTCTGT:1 + chr3L 3650821 3' + mdg1 7449 2 78.22 ATATCTTGCCCATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTGTTATCAAGGCTTTCAAGCATGATCTATCTTAAAACATTTGAT:1 - chr3R 17781546 3' - pogo 29 1 53.47 CACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTACATACCATTTTATATAATAGTCATTTTTGTGATGTCATCATCTCTACATTCTGATTGCCAAGCCCTTTTTTAA:1 + chr2R 6987165 3' - HB 10 1 55.45 AATTATAAATTACAACAGTATAAGAAATATTTTATCGTAACTAACAAGCTATCTTCTTAGATCAATATCCGCGATTCCATATCGACCTTTCTTCCACGAGT:1 + chr3R 17482113 3' + copia 260 1 73.27 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACTGTTGCGCTTGAAACCGGCCGCTACGCCTGCGCACGCGTCTGCCGTT:1 - chrX 1135299 3' + P-element 2862 1 54.46 GGAAACGCTTCAAAAACCAACATTGAAATCATACAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTTCTCACAAATATCTCATGTCTAGTCAATCCGCAAAATACGGCGCG:1 - chr2R 4739149 3' + Doc2-element 4387 1 55.45 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGGAATGAAGGTTCCCTTAC:1 + chr3R 13331462 3' - transib2 53 1 78.22 TCTACAAAAAAATAAAAAAAAAACATTCACAATGTTGCATAGACACCTTTGTTTGTTGAGCAATCTTAGAAATGAATATATGGCCTAAGCACTGAA:1 + chrX 5485028 3' + G2 3073 1 65.62 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGGACACAGGAGATACGGGGACTGAAACGCCGTTGACAGCGGAAGTTTT:1 + chr2R 9649236 3' - roo 37 2 59.41 CCAATTAATACTTTCGGAAGCGGACACTTAGATGTGAAACCAGAATTTTGAGGTGTATTTCAAAAAACCTTTAGTGGGTGGACGACCGTGGGAGAGACGAC:1 - chrX 16291651 3' - gypsy12 10001 2 79.21 ATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACTAGAATTATTCCTCGCCATTTGCACCTGGCCATCCGCAACGACGCGGAGTTAAACATGCTG:1 - chr3R 2156982 3' + Quasimodo 7263 2 64.36 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACTTTCGAAGATCTTATTCTTTTTGCTGTGCA:1 - chr3L 4565485 3' + copia 243 1 68.32 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGCCTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTTAATCGGTTTATGGTGCACGAG:1 - chr3R 5135475 3' + 297 344 2 73.27 TAAACCGCTTCAAGCAGAGAAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGACCAGTCTATTACATCAACTACCAAAATAACGTACTACTTGTTGAACC:1 - chr3L 24104303 3' + Stalker3T 296 1 88.64 AGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACCATTTCGGTTTTAGCCAACATTTTCTTCTACTGTAACCCCAATAGGGACTTAGG:1 + chr3L 7300769 3' - Doc 4464 1 46.53 AATGTGTTATGTTCACTTGCTCTTACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTCTAGGAGTTTTTTTTGCTTTTGGTTGGTATCTAGGCGAAAAAGGGCGAG:1 - chr3L 6457312 3' - I-element 458 1 70.30 TGTGAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCAGACCGTC:1 + chr3R 12329660 3' + hopper 1404 2 52.86 CATTTAGAATTAAACTAATNATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGT:1 - chrX 17030006 3' + flea 216 2 65.35 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGTGTTTGGCAGACATGGGCAAG:1 + chr3R 17053148 3' - hopper 16 1 63.37 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAAATCCTTAAAGTTCCCTTTTATTTTACATATTTCGATTTTAATT:2 + chr3R 17781625 3' + pogo 2073 1 59.41 CATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGATTTTATAGCTC:1 + chr2R 22051521 3' + Tabor 7281 2 65.35 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGCTGAAAATATTCCATGTCTATGTTTTTATAGACCCCAACACATTGTCCTTCTAACGTTTTAACATTTTT:2 + chr3R 13913100 3' - mdg1 7044 2 65.35 CACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAGGGATGTTAAAAAAAAGGAAAATGTTGAAAATCATTGGT:1 - chr3R 19985814 3' + Doc 15 1 61.39 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTTG:1 + chr3R 23338327 3' + roo 9030 1 64.36 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCC:1 - chr2L 17994159 3' + roo 9024 2 70.00 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAATACCTTCTAAACTTATGAACTTTGAGAACACCATTATTTTCTGCCAGTGTTTTTAAGA:1 + chrX 8316395 3' - hobo 17 1 60.40 TTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAG:1 + chr3L 24916689 3' - Porto1 150 1 55.45 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTGAATTTAGGGCGTTTCCTGAGCTCATTAA:1 - chr3L 7300507 3' - Doc 52 1 74.26 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGATGTACCTCAAGCACGTCGGTCGATCAA:1 - chr3R 7626400 3' + hobo 2912 1 62.82 TATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTGTTGGGGTGTTTTCGTGGTGCGGTGGCACTCTGTGGCTC:1 + chrX 19970486 3' - Idefix 113 2 68.37 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGATTGTATAGTTTGTGCCATCAAACATAAGATTGCTTTGCTATTG:1 + chr3R 27907691 3' - mdg3 5285 2 59.00 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAACAATTGAAATGTCATGCAATAAATCTACCCCACACATACGCACCATGGGATGCAAACACGCACACATAT:1 - chrX 22593123 3' - 1360 5 2 70.30 AAAACCCTTCGGCTACAGAACCTAGATATGGCGGCAGCAGGGATTGATGAAGTGCCGGACGCACAAGGATCTTTGTCCTACGAAGGATGCCAGCGGGAAA:1 - chrX 3120237 3' + X-element 491 1 75.00 TCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCACTCCGGTTAAGTGTCAATTTGATGCTGCTGCT:1 - chr3L 17188226 3' + 1360 422 1 67.33 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAAAAGGTATATTCGTTGCCAAGTATGTAACAGGTATTTAGTGACGTATTTTTGCGCC:1 - chr2L 21715753 3' + 1360 3356 1 55.45 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAATGTTTGAGTTTGCACATTGAAGAAATA:1 - chr2L 14262815 3' - pogo 44 1 70.30 CGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTGCACCCATTGTTTGCTGCCGCACATGCTTATATTCGAAG:1 + chr2R 13653439 3' - F-element 17 1 67.33 TCTATCGATATCCTAGAAANATTATGAAATTACGCTTTTGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTCAGTTATTGGCCTAAACCGACCAGCAGCAAAG:1 - chr2R 12652226 3' + INE-1 501 1 67.33 ATGCAGATATCTTGCCGATNCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAATATTCCTAAACTAACTTTGTGTTTTGATTTTGTCAT:1 - chr3L 13773005 3' - pogo 35 1 64.36 TTTTAAATTTTTTTTTTAATTTTTTTTTGAGGGCAACACTCTACTATCCCTTACTCCCTTTCTCCAGCTTATTGTCGGATTTTTCC:1 + chrX 7772511 3' + hopper 181 1 62.79 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCGCCTCCAAAGAG:1 - chr3L 13773883 3' + roo 9047 1 52.58 GGGGCATTTGGCCCGTTTTTTTCCCAAAAATCAATAACTCCCCGGCCGAACGTTTCCGCCAATTGTGTCCTATATCCGGTATCCATTTCCCTCTCCCTCTG:1 - chr3R 15119612 3' + hopper 7 2 74.26 CAAATAAAGATGCAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACATAACACCTGCTTAAAGAGCCGC:1 + chr2R 8177746 3' + mdg1 7402 2 76.24 TACACGGCATCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACGGGACCGAGTAGGGGAC:1 - chr3L 16047626 3' + Cr1a 4406 1 51.90 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTGTTCCCGAACTGCATATACATATATTAACGTGCGTGTGCGCCTCCCTCTTG:1 - chr3R 24976726 3' + opus 7481 2 59.41 AGTATGTTGAGTAAGGTCAACATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGTATTGTGAAGATAAGAAAAATAAACTGCTCT:1 - chr3L 21815426 3' - G2 2936 1 49.50 CGTTTACACATTTATATTTNTGTTTAATTCTAATTTGATCTGACTACCGTCAACATGAATGGAAGACAGAAGTGTAAATTTAACGCCTATGTAAGCATTCC:1 + chr2R 3175099 3' - 1360 2962 1 70.30 CACTAAGGAGAATAAAATAAGAAACAGGACCATTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCAATTAATCCTTAAACGTTTTTTAAAAGCATATAAT:1 + chr2R 21899010 3' + mdg3 5151 1 61.39 CGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTACTTTGTCTAAATAGGGGTTGCTA:1 - chrX 9454834 3' + roo 355 2 79.21 ATCGTCTTCTAGCACAACACGCACTCATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACGCAGCTGCGCAATGTCCTCTGGTTTCAGGGTCTGCGCTTCTC:1 + chr2L 6561224 3' + 1360 3203 1 58.42 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCA:1 + chr3L 3757398 3' + roo 9030 1 73.47 CAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACCGAACGACGAACTAACAATTACAATAACAATAACAACAACAAT:1 - chr3R 14330824 3' + G6 1865 1 57.00 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTTGCTCTCCTAATC:1 + chrX 21217581 3' - pogo 26 1 53.47 ATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATGTGTGAGTGAGTCGGGTCAAATAAATGACAGCCCATAAGGCAGTGTCCTTACAT:1 - chr2R 21433128 3' - HMS-Beagle2 17 2 62.38 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTGTTTGGTCAAATGCAGAACGGCACAGTTATTCGAGAAC:2 + chr3L 2022332 3' - roo 8670 2 72.28 ACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCCCCTTAGGGCTCCACTGACTATTTTTATCACTAATAGACGCCACTTTGTTGGGGATGTTGAAGATGGTCAAAAGTA:1 + chr2L 18418314 3' - Circe 7421 2 78.22 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATAGTAATATACAATAGTAGTATTAATATAGTGGTAAATCAAAAACCTAACTTCTAAATATCTTTAAAACA:1 - chr3R 9033860 3' - Tabor 6848 2 57.43 GGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAATTGGACTCTTTGATTTGTTTTTTGCCGTCCTATTTTTGCGCCTGTGCTGCGTCTC:1 - chr3R 27809069 3' - invader2 5097 2 61.39 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATCTTATCCGATTGGCTTTCCCAAGAAAGCTATCTCACAATTAACTTTGCTCTACTTCTGTTTACGTGCTGC:1 + chr3L 6962220 3' - FB 7 1 72.28 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGATTGAACAACATTTTTAGAATGATTAAGTTCGTTATGGTTTCGGGTTA:1 - chr2L 12511535 3' - copia 29 2 54.46 TAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTATTATAATTATGCT:1 + chrX 8727921 3' - X-element 41 1 57.43 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATATACAGGTAAATAAAATAAT:1 + chr3L 15033382 3' - I-element 19 1 60.40 CAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGAATTCGCCAATATCGGAGTGGTCCAAAATCGCTGGACTTACAATAGTTAATTTTGCTAGGGT:1 - chr3L 25883567 3' + Doc 499 1 68.32 GCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCATTTGAATGCCACGAACAGAAATATGACTGCTTAATACAGGGATCGTTCGCTAAAGGCAACCC:1 - chr2L 5007595 3' - hobo 2922 1 70.41 GTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAAAAAAACCAATGACAATCAAAGCCGCAAAGTGCAATATAAATTTGTTGAATTGTA:1 + chr2L 8581203 3' + F-element 4644 1 59.41 AATTTTAATTTATTTGTAATTTAAACAAATATTCCTTGAACTGTGCACAACTCACTTGATGTACACAACATTTATTTAAACAGTTAAATTAAATTTACATA:1 + chr2L 8329330 3' + Rt1b 124 1 60.40 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCA:1 + chr3L 3757395 3' + roo 360 2 77.23 AACTTACCAAAAAAATATAAAAAAAAAAATAGTAGAAAAGAAAGTAGTGACGAATCGAACTGCAGAGGTGTATGAGCTATGGAAATTATCATGAAGTCTTT:1 + chr3L 20273316 3' - Tc1 1402 1 67.33 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGATTGTATAGTTTGTGCCATCAAACATAAGATTGCTTTGCTATTGTAAAGAGGTCCTTAGTCCTTAAACA:1 + chr3R 27907716 3' - mdg3 5261 1 71.29 TAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATGTATATACCTTTGTTTGCATATTACCCGT:1 + chr2L 15567156 3' + 17.6 445 2 80.20 AGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCAGAGTTATAGAGGTCCTCGCCTTGAAAGATCTGGGCACTGGACACGCCCA:1 - chr3L 11829900 3' + Doc 365 1 52.00 TAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAGCAATGCAAAGGGAGCGAAATGAACGATGACGTTGGCG:1 + chr2L 2697280 3' - jockey 4829 1 65.00 CAAACAGTTGCTTGTGCAGCTCGAGGGCTGTAAATCACGAGAGGGTCGGGGAATTAAAAATCAAGCGCATTAGGGCAATATCTCATTTCAAGG:1 + chr3R 22869979 3' + Bari1 52 1 78.49 GGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATTCCTGGCATTGTTGTTCCTGCTCTTGGACGTTGAGC:1 + chr2L 15937299 3' - F-element 4239 1 64.36 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAGCTGCGAGTCAAGCATTTTGGCCAAATCACAACTAAGCACATCAAAGTATAGCATACTTTTAGGTGGAAG:1 - chr3R 31264147 3' - jockey 15 1 70.30 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCC:1 + chr2L 20045808 3' + roo 9043 1 55.45 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTGTTTGAAACACTTGATTAGCGGCGATGATTGAACGGTTATTCGTAAATTGAAAGCAGTGTTCT:1 + chr2L 17994231 3' - roo 8675 2 68.32 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCCTCCGGTGGCCAGCTTTTGGGTACAGCTTCCCCCAGGCAGGAGGTCCCATA:1 - 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roo 48 2 75.25 GTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAAAATTATTTCCCCGTTAAATGCTTGAATATAAAATGACTGCCTCTCATTCTC:1 + chrX 22383371 3' - invader1 3612 2 33.66 GTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGATGCCACC:1 - chr3L 11115124 3' + R1A1-element 140 1 66.33 AGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGACACAAAGAGGGATATTCGTCGCCTGGCAAATTGCCCGCTGTGAGCCAGGC:1 + chr3L 4835385 3' - Doc 375 1 57.43 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCC:1 - chr3L 19274812 3' - transib2 39 1 64.36 TTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAATACTAAGCATTTGCAGAGTTGCCCACTTTGATTCCTGTTTCGGGGACTGAG:1 - chr2R 24602402 3' - flea 390 1 57.43 AAACTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCAGCGAGAGGGACGGCATTGATGTGGTGCTAAGCAATGTGCCACCTCCGCAGC:1 - chr2L 10841069 3' + R1A1-element 499 1 52.48 AAGTCTTTAAAGATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCCTTGTTAAATCAGCTGGCATTGGGCAAAAACCAGCGGAACGAACACAATCAGGCAAATACA:1 + chrX 11017075 3' - roo 8678 2 61.39 AGGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGTATGTAGCATATCCCCTTCCGTTTTTTGGTTTCGTGGTTTGCCAGTTT:1 - chr2R 19102148 3' - opus 7025 2 57.43 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTTTTCATACGGCTGCAATTTTAATATTT:1 + chr2L 23350501 3' - F-element 59 1 74.26 AGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAACACGAAAAGGAAAGCGTTAGCGAGAGTTGCAACTGCATCTCATGCCAATGTA:1 - chrX 311280 3' + F-element 4379 1 59.41 GCAATCGGAAAATATTTATTTATAGTACATTTGTATATCCAGTAATTATTTTAAATGTTTTGCAACATTTTCAAGGCTTAAATGATATTTATGCAATATAT:1 - chr3R 21094812 3' - mariner2 838 1 87.13 AAAATTCAAATAATTGTACCTACATATTGCATTCTATGTAATCAAAGGCAACAGCGTGCAAAGTGTAAACGGTCAATATTGATTTTCGTTCCCACACAACA:1 - chrX 19409762 3' + HeT-A 5968 1 56.44 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATACTCGTACACACACACCCCAGAAGGCGTTGTGTCCAGCATGTACGAG:1 + chr2R 8311375 3' + opus 472 2 54.46 TAGTTATTTAGTTAGTTAGTTAGTTTAAGTTACCAATGAGTCGATAGACAATTGTAATGTATATGTATGTAAGTGATAATGCGAAAAATGTTAGGAGATCG:1 - chr2R 10028698 3' - HeT-A 27 1 75.25 CCAACGAATTTTTTGAATCGCACACTCCAACCGCCTTCAGCAAGGATCACCGCCTAACCGAGCAGCAGCAACATCTCCTGTCCAGTGTGACG:1 + chr3R 9987449 3' + Chimpo 3798 1 67.39 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTAACAACTCGAAGCGGTATCAACCGGTTTGCATTTGTTCAAAGCGGTTGCTAA:1 - chr2L 12459666 3' - blood 7036 2 54.46 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGAGAAAGGTCTTCAATCTAAACAAAGTTTTACCGGGAAAAAGATGTT:1 + chr2L 3699476 3' - mdg3 5284 2 53.47 ACAAAGAGCCATATCGAATGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTTCCTTTTACGATCAT:1 + chr3R 25753708 3' - diver2 251 2 81.19 ATTATTGTAAAAAAAACAGNCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCCTTACTCCCCGC:1 + chr2L 12882821 3' + hopper 1399 1 61.39 TGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAATACTCAAAATATTTGTTTTAGATAAGAACAAGATAAGGGTATGTCCAACATAAAAAACATAATTAGTTACA:1 + chr3L 6033620 3' + 412 486 2 68.32 AACGAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTTTTTGTCTCAGTGCAGCGCAGAGGGAG:1 - chr3R 17955800 3' + 1360 3012 1 73.27 GTGAATGAGCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAAT:2 + chr3R 2689421 3' + diver2 4466 1 56.44 TGTGTAAACAGTTTCTTGANAAACTGTATGACTGAAACTAGTGCTATACCTAACCAACTAACTAATTTGAAATTTTAGCATCTATTGTATTTGCTATGC:1 + chr3R 21849738 3' + S-element 1711 2 64.65 TGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTAC:1 + chr3L 16047625 3' - Cr1a 475 1 45.45 AACTTAAAACGGACTTGTGNTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCTTGTTGTATGATTTCAAAAGCGATGTAATATTATGCTATGTTTTTCACACTG:1 + chr2L 6362928 3' + 412 471 2 55.45 ATATATTTATCATATTTAAATTTCCCCCAAATCTTGTTAACATTGAGGCTTCCTTGATTCAACCAAAATGGAATCTCTGACTATAACATTTCGGGAAGGGT:1 - chr2L 19405830 3' + copia 4671 1 70.30 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACTTATACCACAATTTTATCGAGTAAGCCGCAAAACTA:1 + chrX 5475454 3' - 412 38 2 64.36 CGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTCGAAATCAATTCTGATCCATTGGAAGATATGTCGGCAATTTGCCGTCCTCAGTACGCT:1 - chr3L 22924283 3' - 1360 3216 1 60.40 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATACAACAAGGAAGAAAAGCGAAAATTTCTTATTTCCATTTC:1 - chr2L 18247985 3' + blood 7357 2 59.00 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTTTAAAAAGAACTTCTAATGAAGAGATATATCT:1 + chr3L 10474222 3' + copia 237 1 60.40 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTCATTGGTGAATAAAGAAAGTCAGATTTTTCTCAGTGATTAAGACACGAAAGCAAGAC:1 - chr3L 15037900 3' - roo 8681 2 62.38 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAACAATTGAAATGTCATGCAATAAATCTACCCCACACATACGC:2 - chrX 22593151 3' + 1360 3356 1 60.40 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATTTTTAGTTGAGCTCTAGTTTTGAAATTAGTCAAATATAATCATGTTATTATTCAGTT:1 - chrX 7157249 3' + blood 7373 2 58.42 GACGGCTGCCTTCAACTTANAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCTTGTTGTATGATTTCAAAAGCGATGTAATATTATGCTA:1 + chr2L 6362914 3' + 412 7511 2 61.00 AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAAAGGTAACGTAATAAAGTCCCTTTATTTATTCGTA:1 - chr2L 20560312 3' - F-element 22 1 60.40 CTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTCAAATTATTATTACTCAAATTTATTATGCTAACATGTAAAGAAAG:1 + chr2L 16851793 3' - HMS-Beagle 27 2 52.48 AAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCGTTCGAATTTTATGGCTTCCACAGAGGCG:1 + chr3L 2363400 3' - 1360 3263 1 74.00 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCCTGCCAGCGCGCTGGCGAAAGTGATGGTCCTTGTGTTGCATACTTT:1 + chr2L 10166059 3' - jockey 35 1 50.50 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTCATGCTCTCGCACCTCCATTAAAAATAAAAGTTCTAAAGTCTGTATGTTCAAGCTACTTTTTTGGCTGC:1 - chr3R 22349446 3' + pogo 2095 1 73.27 TATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATAATATGTACATAGTTTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATCGAAGTAATATCTTTGATAGGTATA:1 + chr2R 5401643 3' - 1360 378 1 75.25 TAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACCATATGTAGTCTAAGATTTTCAAACACGACGCTTTTCTTTCCTCTTGACAACCCCTCGATGA:1 - chr3R 7783718 3' - rover 11 2 67.33 CAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTGTACGTTGGTCTTTTTTGAATTAATTGTATTATTT:1 + chr2L 15940319 3' - I-element 363 1 65.35 TGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACGAAAAATGTGGTAAATATTGGGAGAATGGCGACAA:1 - chr2L 22150799 3' + R1A1-element 5292 1 64.29 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCAGCTTTTCCATCCGGCATTTATGTGAACCTAAAACTAAACCACATAGAGAGTAACTACAC:1 + chr2L 8577356 3' - roo 17 2 61.39 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACATTATAATAATGAAACAGTTAAAAAGCAATTATTAGAAATAGTGGTTTGTGCTT:1 + chrX 7788672 3' + 412 467 2 53.47 AATGAGAGGTAGGAGTGGTTTTTGTTTTGTTTAGGTTGAAGCTCTCGCTTCTGAATTTCATATGCGAATGCTGGCAAGACACCTGATTTTAGGCATCTGCA:1 - chrX 22819452 3' - Porto1 266 1 53.47 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTAGAGCTGAACAAAACATGCTGGAGGCGTTGCCAGATGTCGCGAATGTGACCAGCAGTTGGCTGCCAAAGTTTC:1 + chr3L 20520775 3' - P-element 4 2 75.25 TCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTGTGCTTAACTTGGAGCTAAA:2 - chrX 734903 3' + Tabor 459 2 58.42 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGA:1 - chr2L 18213146 3' + hopper 1391 1 55.45 CCACACTAAGAGCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTGCACTCGCACAAAGACACCAAATACAAATACAATCTCGGGCAGGAGTGG:1 - chr3R 26282198 3' + mdg1 7340 2 57.61 AAATTGTAAGTCTTTAAAGATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCCTTGTTAAATCAGCTGGCATTGGGCAAAAACCAGCGGAACGAACACAATCAG:1 + chrX 11017066 3' - roo 8685 2 53.54 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTTTGGCCGTTTTTGCCTGTTTGTTGCCTTGGATGTTTTGGC:1 - chr3R 23542937 3' + 412 7527 2 59.41 GGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGTAAAGAAAGCTGACCGAAATATTAAAATAATA:1 + chr3R 4882289 3' + R2-element 3409 1 68.32 AATCACACACACACACACATACGTATACATATACATAATATTAAGGCATCCAAACAACCAAACAAACAAACGAACGAACGAATCATAAGCAATAATAGAAT:1 + chrX 8430607 3' + Quasimodo 35 2 53.47 GAAGAAATAGCAAAACATATTAAAAAATATATACATACACGATGGAAACGGAGAATAATGAAGAACCTCAGATTGA:1 - chr2R 13251513 3' + G4 3585 1 68.42 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACTGAAAGTACATACTGCGAACTGTGGGAGGAGCGCCTGAAATTATGCTACATCCAC:1 - chr2R 11993973 3' - jockey 61 1 56.44 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGG:1 - chr3R 7869145 3' - 297 6639 2 82.00 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTATATGACCCACGTTTTGGGAATCTTTTCCCCTGCCGTTTGAGTGCCTTTTCCTCTCTGTTGTGCCTATGTGA:1 - chr3L 171146 3' + 1360 3385 2 76.24 GTGTGTGTGTGTGTGTTTATGTGTGTGAGGAAAAGAGAAGATTTGTTTGAATTATATCGAGAAGAAGCC:1 + chrX 11524011 3' - accord 179 2 72.46 CAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACAACATTAATCACAGTTTAATGGCGAATTAATC:1 - chr3R 30340121 3' + Quasimodo 6972 2 69.31 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTT:1 - chrX 4277483 3' + roo 9019 2 79.21 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCAGTTTACTAGACTACAAAAGTAAACAG:1 + chr3L 14222512 3' - roo 8713 2 72.28 CTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTAGATGTATTTGATTCTGGCCTAAAATCCCAATGGCAAGCTAAAGA:1 + chr2L 19678185 3' - 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hobo 28 1 51.49 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGTATAGGTGCAATTAATTTAGACGCGCTCACTTAAATCGATTACTTATTTGTATTTGTATGTGTACTAGTA:1 + chr3R 25021773 3' - roo 8669 2 75.25 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTTTTAAAAAAATATTTATTTTGTATTTAGTAAG:1 - chr3R 26317931 3' - roo 8708 2 72.28 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTGGAAAAAAAAAATTTTAAAGAAGTTCTTCATGATAAAAAGTAT:1 - chrX 17102027 3' + 297 352 2 57.43 CCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACCAAACCGCCCACCCCACCTTCATTAACCCACG:1 + chrX 4813864 3' + F-element 288 1 66.00 TCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACCTACTTAAATATGTCGAAAAGTGTGTCATCGAAGCGAGAGCGAAAGAGAGTGCAGGAGAGAG:1 - chr3R 24767775 3' - P-element 11 1 66.00 TCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGCATGTATATGTTTTTCGAAAATGTTAATAATGCTTAGTTTATATTTAAGCAA:1 + chr2R 9699891 3' + Transpac 5212 2 60.40 AAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAATATATAACGAAACGTACAAGTTGAATGCAAATCAAAATGACAGTATATCAAACACGTACATACAT:1 + chrX 11975968 3' - 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chr2R 17459123 3' + Transpac 309 2 78.22 TACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAA:1 - chrX 983330 3' + Juan 4168 1 73.27 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAGTTCAGTTTCTTCTGTTATGCAATGAGTTAC:1 - chr3L 21970812 3' + pogo 2059 1 69.31 GAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATAGAGGAGAAGCGGGAACAGCGGGAACGGGGTAAAT:1 + chr3R 8120844 3' - 297 6885 2 74.26 TTCGTCGTAATGATATGCCAACCCAACGATAATTATTAGGGCCACACAAACTCATAAGAGTTGGAGGAAGATTGCAAAACTCCAATGCAGAATTTAATGTT:1 + chr3R 19446939 3' + Fw2 3804 1 56.44 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAA:2 + chr2L 12866949 3' - mdg1 7075 2 62.38 TATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGG:1 - chr3L 16973359 3' + S-element 166 2 62.38 TGGCATTCAAAAGAGGTCAATCACAAAGCTTTGTCCATGTTTAGTGCTTTGGTCTTCATTCGAGTCGGTAAGTGCGCGGCGATGACGTCACAAAACACTTG:1 - chr2L 18604622 3' + diver 5766 1 73.27 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAG:1 + chr3L 2176367 3' + roo 9044 1 68.24 CCCCAAATCTGATGGGTCAGCAGATTCGCGATCACCAAGCAGAGTATTAATATATGTATACTCTGTGGTGCATCATACTTGTATACGTCAAAGGTCCTGCA:1 - chr2R 675266 3' + gypsy5 7140 2 65.35 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTCTCTATTGTTGTACCCGATACCTATTACCCATTA:1 + chr2R 5720524 3' - pogo 53 1 44.55 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGGA:1 - chrX 20361941 3' + hopper 1412 2 76.24 CGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATGTTTATCGAATTTGACTATTTGGCATTAGCCTGGGATTTCGGCT:1 + chr2R 9637981 3' + F-element 266 1 56.44 TGCCGCTGTTGTTGTTATGGTTGCTGCTGGGCCGCTTATGTGTGTATTTTAAACCAAAATTATTACGGCAATGTTCTTTAAACTTAATCACTGTAGACTGA:1 + chr2L 19159819 3' - TART-A 126 2 62.38 TTATTATTGTTATTATTATNGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAA:1 + chr3L 27357630 3' - mdg1 7061 2 56.44 GTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGTGGGTAGAGCTTCATGCTCGACGTTTGCAGAGCATGCGGTACAGGATTTGAATGCCATCAAACATGCGCTCCTTGT:1 - chr2L 19301286 3' + R1A1-element 5006 1 59.41 TATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATGAAAAGTGAATTAAAAAGAAGAAACCATTAATGGGAGCGAAAGTTTTTATAGTTTCCCTAATTATGT:1 + chr3R 19450751 3' + Burdock 6385 2 69.31 GAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTCAGCTGCTCTGCTCGCCTTTGAAGTTTCATTTTTTCATTTTGCTACCAGCCCACGAAAACGACCCA:1 - chrX 22789296 3' + Tabor 478 2 66.67 ATTCGCATTCACACTAGCTNAGTAAAGGGTATCTAATAGCACTCCCACTTGTTTATTTTGGTAAGTGAGCAATTATTTTCGGATTTGCATGCTCGTTGTG:1 - chr2R 20957229 3' + INE-1 530 1 62.00 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTGTATGGGCCAACTAACGCTACCTTTACCGACTGCGGTCAGTGGGTTGGCAAAAATGATTCATTAGCAT:1 - chr3L 13785341 3' - pogo 3 1 74.26 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGT:1 - chr4 158192 3' - Tirant 24 2 56.44 ATATATTTTTTAAATTTTAATTTGTTACTTAGGGAATATACGTATTAAATAAAGAATGCACTTTCACAAATTCAAAAAAAAACAACCTTTCTGCTCAGCAA:1 - chr2L 7111798 3' + copia 4671 1 77.23 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTACTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCTTGTGGCCTTT:1 - chrX 13126203 3' + mdg1 403 2 46.15 ATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCCGCAACTCGGTTACAAACTAATCAGTAGTGGGTTTGCTGAAACTGCTGAAATGG:1 + chr2L 2608621 3' + Circe 116 1 64.36 TAACTTTTATTATATTGTTTTTTTAGGATAAGCCGAATTTCAATGAAAATGTAAACCCCCCTATTTGAAAGCTGACATCAAG:1 - chrX 11872835 3' - Dm88 4166 1 60.98 TGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAAATGAATATAAGCAATGCATTGTTGGCCGAAAGGATGGGAACTGTGAGATATTCCTACTCCTCATTTTCC:1 + chr2R 22286849 3' + invader2 277 1 54.46 GAAGACTGTGGAATGCCGAGGGTCAACTGAGTGACATTCTTCATTTTGAAATTTATGGTGCGTTATTCCGCAATATGTTCCATGGTGATTGGATATAGATT:1 - chr2L 16153323 3' - Doc 3 1 81.19 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTACAAGCACATAAACACAAATACATACTAATATGTGTGTTGGGC:1 + chr3L 14594177 3' - hobo 34 1 62.38 GGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCCGCCCACATATCATCAATTCCGTGCCATT:1 + chr2R 14576559 3' + gypsy5 7312 2 74.16 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATGGCCAAAG:2 + chr3R 12767344 3' + blood 7357 2 58.42 CTGGTGAGTCCTGACGAAGNGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGATTGAATTTTCGAAGTGAATACTACTTCCTTTTCAGTGCATAAAACATATCT:1 - chr2L 20328697 3' - opus 22 2 57.43 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGTTGTCAATTCGTTCCAGTCGCTTATCCACCTTGTGCATTAGAATGAA:1 + chr3R 21884245 3' + mdg3 217 2 54.00 CGCTAGGTGGTTGGGGAGCGTGTGAAGCTTGCTATGGGATTTTTCCAACTTGACAGCAAATTTGGCGCTCCA:1 + chr2L 10053700 3' - F-element 4465 1 58.33 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAAGTATCATCTTAA:1 + chr3R 12876376 3' + hopper 1384 1 58.42 AAACTTGAGCAGCCAAAAANGATTTGTTGGCTATGTGATAGAAGGTGCATAGTAAGTGCGCTGGTTTTAAGCTTTCTAAAATCTTAGAGACTTTTGACAGA:1 - chr2R 6254947 3' + Cr1a 486 1 68.32 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGTACTTCCATTTAACAGGGAAATAA:1 + chr3L 7307261 3' - hobo 51 1 72.28 TATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCTATGTTTTTGATAATGTAAAACTACAATATTTATCATAATAACATAACATTAAATTACCTATTTTCTAATGCT:1 - chr3L 20051590 3' - jockey 4973 1 69.31 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTTATTAATTCTCATAAAAAAATTGGTTAGTCTGGCCAAATCAGTCAAGGCAGAACTAA:1 - chr3R 21588981 3' + flea 4997 2 63.37 AACTATATACCCCTTATCTNAAATCATTGTAGATCTAAATATGAGTTGCATGACTGTTCCAGATATTTTACAATATTTAAACGTACTAAAAACATCGAGC:1 + chr3R 24675225 3' + Cr1a 4130 1 53.00 TATAGGCCGCAGGGATCCCGTTATTTCCCTTTTTGCGCACGGCATGTATTTGGAAAACCATTTCGCTGGCTGCCTGGTCCTTTGTGAACCTTAAAGCTGCT:1 + chr2R 22500778 3' - gypsy8 326 1 64.36 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCACGTCGTAAAGTGCGTCTCTCTCTTGCACTCTCTCTCTCTCTCTGTGTTAGAGCTCCATCTCCCTCTCC:1 + chr2R 15349584 3' - P-element 7 2 72.28 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCCTTGTGCGTGAGCACAATTATTCAATATTTCCCCTGAACGGCATCTTTGGCCGAGAT:1 - chr2R 13763161 3' + roo 402 1 66.34 TGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAACTCATACGACCCGTACAGAATATGACACAAAAAGTTGGAGTAAGATTTGGTTTGGCG:1 + chr3L 4432480 3' + accord 7269 2 64.36 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTTAATTGACCTTGT:1 + chr3L 9928611 3' - roo 8688 2 55.45 AGTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACTCGCAAATAACTTTGATTGCATTTATGCCGTAACGAATAGGTAACC:1 + chrX 3338954 3' + baggins 5050 1 54.46 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACTCGACTCGAATCGCCGCCGCTTGTTATTCTGGATTTCCCCCCCGTCCTGACCAAATGAAATCGAACCGGCC:1 - chr3R 10488647 3' - roo 8668 2 75.25 CTTTTTTCGCCGGTACAATGCTTTCCCCGACCCATGACTAGAGACGGCTGAAAGGCATTTCCATTATTAATGTCATTGAGGCTCTGCGAAAGGAACTCATC:1 - chr3R 28253269 3' - Tc1 372 1 61.39 TTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTTTAGAACTTCATCTTGGTCAAGTTATTTTCGCTTTGAATTAAGTTTCCTTTGTTTGAAATATTAAGTTTAGGAT:1 + chr2L 3196703 3' - Transpac 4791 1 75.25 GGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGCGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAATTCCAGACACCAA:1 - chr3L 16282371 3' - gypsy5 6971 2 56.52 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCGGCAGCAGCACTTAAGTCTAATTAAAATGCTGCCCCCTAATTAATTAAAC:1 - chr3L 1998805 3' + hopper 1391 1 55.45 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAATTGTTGATTTTTTGTATATCAAAAAGAGAAAGCTAAAATATATAATTT:1 + chr3R 26317995 3' + roo 9047 1 59.41 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACCCTCGTCTTCGCTCGCACTCAAATGGAAATAC:1 - chr3L 20354019 3' + 412 7501 2 62.38 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAAATTCCCTCGAAAACA:1 + chr3R 9224410 3' + pogo 2072 1 59.41 TGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACACATGCCCCTGTCCTAGGCTTTCTCTTTAACCCACTTATGCTGTGATGAAAATAATTTTTTTTGCGCA:1 - chr2L 15567075 3' - 17.6 6 2 73.27 AAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATTCGCATTTATTGGGTCTATTTGATTAACTTGGTTAATGGGA:1 + chrX 3490942 3' - Juan 3810 1 44.55 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAG:1 + chr3L 27357606 3' - mdg1 7085 2 76.24 ATCCAAGTGTAAAGTTATGACCGTTTGTAGTATCAACCCAATACATGCTAATACATACATACTCTCTAAGTGGTTGGGCGTTATAAACAAAAAATTAAGCG:1 - chr2R 6587955 3' + Q-element 667 2 75.25 CAATAGCCGAGTCGATCTAACCATTTGCCGCTCCTTTTTTCCACAAAGCAAACAAGTACTACATTGCCAGCTCTCAGAAGGTAAAACAATAACTGACGTAC:2 + chr3L 12352040 3' + INE-1 101 1 76.24 GTGGACGGAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTTGCGGTGTAGGCTTACGAGGGTGGTTGGGGCTTGGGG:1 - chr3L 14623910 3' + hobo 2922 1 56.44 TATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAGTGCTGTATGTATGTATGCATGC:1 - chr3R 11205104 3' + Doc 4527 1 77.23 ATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTCACTCACACCAATCCGATCCTATAACAGTGTTTACCTTGGCAGCGCGC:1 - chr3L 2808298 3' - invader4 193 2 53.47 AACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAACTGTTTGCATTGCGACCGTGGCACTTGGCC:1 - chr3R 18562060 3' + Doc 282 1 70.30 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAAT:1 + chr3L 2176359 3' + roo 9020 2 79.21 TTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTCATTACCTTTTGTCTTGGTCCTTCTTCTTGTGCCAGTTTAATTTGGCGGAAAATT:1 - chr2L 20030692 3' - jockey 4640 1 60.40 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATGGCCATCCTGCTATTTAGCCATGTTTTGTTTGGTTTT:1 + chr2L 13566535 3' + hobo 2906 1 64.21 ATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCAAGTGAGTCCAAATGAGTTTTCACTTTTCCACATAATTGCGTTTTTTATTTTCTTCTTTTTAATTATGAGTCTCA:1 - chr3L 15038999 3' - roo 8788 2 69.31 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGGCTTCGTGGGGCGTCTACTCGATTATTAGCCCCGATGCCTTGTGGTTATACATTCAAAGCGGCAGACTCC:1 - chr2L 20567793 3' - 297 6582 2 76.53 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTAAAATGCCAATATAATGTTCTCGACTAACAGACGGATATATA:1 - chrX 10286124 3' + roo 399 1 65.35 TAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTAATCTCATTTCATCTCGATGACTTTAAATTATCCTTTTTGGCCAACTATAGT:1 + chrX 7989081 3' - hobo 2497 1 50.50 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATGAATATATGAGCTAAGTAGTTTTTTTGGACTCCATTCCCTACTTTGAAAGCAAAAACTAT:1 - chrX 22734027 3' - copia 16 2 45.54 GGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATGAAAAGTGAATTAAAAAGAAGAAACCATTAATGGGAGCGAAAGTTTTTATAGTTTCCCTAATTATGTCA:1 + chr3R 19450753 3' + Burdock 6387 2 71.29 GAAATAAATTTGTATGTATGAATGATCAGTCATTTGTTAAATATCAAAGTTTCTGATCTCTTCTCTTCAGACTGCGATTTGCCTGAGAACACATGACGTGG:1 + chr3R 4357634 3' - Tc3 1640 1 76.24 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTAAAAAATATTTTGGCAAACGAATTTTTAAAAATACTCAACAATAACATTTT:1 - chr3R 15578955 3' + pogo 2081 1 61.62 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACCACTGTTATTTTGCAGTTTGTTGGACTTTGCATACGCTTTGGCGGGGGTTCCCCGGCATAATTGA:1 - chr2L 20045713 3' - roo 10 2 70.30 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTACTTTTTAGAAGCCGGCTGCT:3 - chr2L 2833881 3' + roo 354 2 79.21 TATGTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTGGTGAACGGAAACAAATCAAAAAGGAAACAAGTAAAAATGAATGCGGCTCCTG:1 + chrX 21227529 3' + transib2 311 1 60.71 TTCACTCAAAACAACCGATNTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGGTGAATATTTTTGACAAATTACTTAAATTACTTACGAGCGAA:1 + chr2R 11030573 3' - F-element 58 1 67.33 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGTCGTATCTGTATCTCAGATGTTGGCTGACTGGTTCGCTCCGCACACTGGCAGTCG:1 - chr3R 16241167 3' + Tirant 8484 2 57.43 GAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAGTATGTTTCTTGGTTTTTAATTACAACAAATTCGACTTGTTATGCCAAAAAGTTAGCAGGGATTCCAGGGCACGT:1 + chr3R 26597434 3' - mdg3 5257 1 76.24 GGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATCTGTCGTAATTAAAACGCGCCCTCTGCGACATCGCCTCAACTGTCATCCGCAATTTACGTGCCCTCTATAT:1 + chrX 15263521 3' - invader3 7 2 71.29 TCAGGATCAATAGCCGTGCCGATCTGGCTCTCTGGACTTTAAATCAATATCTTCTGTACAACATCGTTGTTTTCTTATATGGGTACACAAATATTTTA:1 - chr2L 5608526 3' + INE-1 94 1 69.39 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATG:1 - chr3R 11151817 3' + mdg3 219 2 52.48 GTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGTATAGTGGTGTCAAATCTATTTCTGGTTTTAACAGATT:1 + chr2R 3111995 3' + springer 344 2 64.36 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCATCCAAACTCATTATCCGCTCAGGGATGAGCGGAC:1 - chr3R 3847103 3' + P-element 2847 1 39.60 CACGAATAAGCTTACAAATATAGACTGTTTCAAGCATCGTTCTACGGTTAGCTAGCGATTTTTATTTCAGCTTCAGTTTGTTTGGCCAGCATAATGATGCC:1 - chr2R 14113062 3' - Cr1a 4043 1 51.49 TTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATACCATTACCTCATTATGTAATTTGCTGTATCTGCACCTTCTAATTGTAGATCCCG:1 - chr3R 17481989 3' - copia 4891 2 48.51 ACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGCTCTGACTGGCAA:1 + chr2R 14997938 3' - McClintock 13 2 65.35 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCACCGATAAATGACGGGCGACAGACG:1 + chr3L 17942675 3' + copia 257 1 66.67 TATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAA:1 + chr2L 14762004 3' - mdg1 58 2 79.21 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAGCGCTGTAAACAATAAAATCAAATTAATTATGGCCAA:1 - chrX 16671068 3' - P-element 40 1 39.60 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGCGGCAGGCAAAATTGAGCAAAGATGCCAGAACGTAACATTAAAATAAACGCGCACAGATAA:1 - chr2L 10791999 3' - 412 14 2 65.35 TTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCTCGTCCTCGTGTCAGACGGC:1 + chr2L 20045838 3' + roo 410 1 80.20 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTTCGATATTCATTGCTAATCCTTACATGTAGTTGATTCGGCACTTGTAAGCTAAGACGAAAAA:1 + chr2L 9260421 3' + 297 6968 2 70.30 TATTCTTTTCCCTTTTTTTTTTGTCTGTCACATTAGCGACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGG:1 - chrX 7480777 3' - Bica 342 2 54.65 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGCGTGCGTGGGTGCCAGTGTTTGTTTGTTTGTTGGCACTTC:1 + chr3R 24767884 3' - P-element 9 2 66.34 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGA:1 - chr3R 20905397 3' - pogo 35 1 66.34 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTAAAAAATATTTTGGCAAACGAATTTTTAAAAATACTCAA:1 - chr3R 15578967 3' + pogo 2067 1 74.26 CCTTCTTCTTAGAAGGGGAGGGTTTACATATTCAACCAGCAGCGCCAGATCAGCGCCATTGTGGAGTACGACAAAGAAGATATTAAAATCGACGGCCTTAC:1 - chr3R 4426477 3' + Burdock 6116 1 64.36 AGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGCTAGAATTTTGTTATATGAAAAATAGTACAACATTATACAAAAAATATGTACCTGCTCGTTACATTTGGT:1 - chr3R 21014132 3' + 17.6 313 2 68.32 GTGAGCAACGTTGGGCAGTAGTGGTGTTTAAGCAGTGTTTTTTTTTTTAATGGTGATTTATCTGGAAAGCGAAAGTGAAGGAGTTTACGGGGG:1 + chr2L 12550467 3' - looper1 1724 1 55.91 ACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTT:1 + chr3L 3540200 3' - mdg3 5287 2 56.00 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAGCAATGGCTAAATAGTTTTGCATTCGAT:1 + chr3L 12438054 3' - I-element 51 1 76.24 CCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCAAAACTAACACGCCCACGATTTTAAAAAATGTTTAGATTTTTTTTTGCGCTTAACTTTGTGGCTCCATCTGTTG:1 + chrX 20996625 3' + INE-1 107 1 68.32 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATCTTTCTTTTAATAGATAAATAATTTGGTAATCATTGTAAAACTTTTATTTAAATTTA:1 + chr3R 20421005 3' + blood 7371 2 56.44 GGCTGCCATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGTTCGTCATAGGTGTATATTATTT:1 - chr3R 30553550 3' + 412 7514 2 52.48 GACCACCTTATGTGATTTCATCATGGCTCTACGTAACATTTTGAGGAATTCACAAAATGCGGCTAAAAACGCAACAATTACCTCACAAATACGAAA:1 - chr3L 20520658 3' + P-element 2883 2 73.96 ACCAATGTATGGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCGCAAGTTGTTAAGCTCTACAACTTGCGAACCCAAGACAGTTTTTAACAGCATT:1 - chr2L 13610904 3' + 1360 3366 1 51.49 AAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCGTATTTTTGTGTAGTTTCTCTTTTCCCAATTTATATATT:1 - chr3R 27907629 3' + mdg3 5466 2 65.62 GGTGCACACTTCAATATGAACACTTCAAATGAAACCGCTGCGGCTGATGAATCGTTGGATACTGCGTTATATAAGGATTGGTGCCCTCCAGCAATAATAA:1 - chr3L 23290044 3' + X-element 307 1 68.00 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGGAATTATAATAAATTTTATAAG:1 + chrX 21468678 3' - transib2 49 1 77.23 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTG:1 - chr3R 8765550 3' + roo 9030 1 68.32 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATGTGCAAACAAAGTTGAATTAAAA:1 - chr2L 12958908 3' + roo 9044 1 55.45 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTCTTGACATCCGATTCTGCAAGCTGACAAACAATTTCCTGC:1 - chr3L 12241793 3' + roo 399 1 70.30 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGT:1 + chr3L 19274872 3' + transib2 2790 1 60.40 TGACTATAGCTGAAGTGACCAACTGGAATTAACCTGCATGCAGCAATTGCCACCCACCCCCACCCTCATCGGGCTATCTCGCTCGCTCGCTGATGGGCATT:1 - chr3R 7109897 3' - Chouto 230 1 75.25 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGCACCGTCCATTGA:1 + chr2R 6850499 3' - roo 8704 2 72.00 GTGGGCGATCATATATCGCTTCCGGTTGAACATTATTGTTTATGCTAGCACTTTTATTTTTATTAATACATTGGATACCATAATTAGAGCAATTATAATTA:1 + chr3R 13033463 3' - gypsy11 132 2 48.51 CGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCTGGTGTATAAGAGGGTGTGGATCCATTCGAAGGACTGCCAAGTGTCC:1 - chrX 12192522 3' - F-element 291 1 53.47 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATT:1 + chr2L 17079874 3' - jockey 4830 1 74.26 TGGGATCTGGGTGAAAAGTGGGTTTCCGCTCCGACCAGGCAACTAAGCGTTCCGCAGAGTGGAAGCATTCTCCCGCCATTAGCTTTCTGGGTGGGACTTCG:1 + chr2R 12685441 3' - G6 1720 2 74.26 ACACACACACACACACATACTCACTTACCAAGGAAACATACACACGGGAGGAAAAACACGGCGATTAGACTCACACACACGCGCCGGTGATTATTCTCCCG:1 - chrX 6803798 3' + accord 185 2 65.35 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATGGTTGGTACGACAGTATT:1 - chr2L 14793477 3' - Stalker2 17 2 62.00 ATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATAGTCTTCTATACTATGGCAATAAAACGTATTGGGTTATGCAAAATGGATAAATTGAATTTAATTTTGTTAATAGT:1 + chrX 22689635 3' - 1731 4 2 72.28 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTCTATGGAATATCTAGTAGTTTTGAAAGCAGCAGCCTGAGTCGCTTTCCTCAAATTCCGGATTC:1 + chrX 17883720 3' - pogo 9 1 72.28 GTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGCTCTGACTGGCAACTTTGCCAGACTAT:1 + chr2R 14997952 3' - McClintock 5951 1 79.21 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGCTGTTAAGCTT:1 + chr2L 18248061 3' - blood 7032 2 57.14 TTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAGACAGCGACGCCGAAATATGCGTAGAAATTC:1 - chr3R 17557456 3' + Quasimodo 326 2 69.31 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCCTCCGGTGGCCAGCTTTTGGGTACAGCTTCCC:1 - chr2L 17994128 3' + roo 9055 2 64.65 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACACCTTGTGACCAAACCACATGCTACAACCCATCAATTAGCAGCACACAGACTCACCTTTC:1 - chr2R 21351301 3' + mdg1 7439 2 65.35 CAGCAATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAACCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATCGCTGATTTTTCGCAGTGAGCTAA:1 - chr3L 736040 3' - gypsy6 7466 2 76.24 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGA:1 - chrX 21667997 3' + Tabor 462 2 51.49 ACAATAATTAAATTTTATGGAGGGAAACATTAACGTAAGGGGAGTAAATCGAGTGTACTTGGCTTTCGGTAGGTGGTGGGCGGCGAATGGGCGGATTTGTT:1 + chr3R 11059042 3' - G2 3018 1 61.39 AAAAAAAAACAAAAACAACGAAAAAAAAAAATAGCACATAACAGAGCAGAGCAGAAAAACAATGAAAATAAATATGGGCGCTGGGAAAC:1 + chr3R 21343292 3' + transib2 2641 2 73.03 ACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACT:1 - chr3R 19589895 3' - BS 4993 1 76.24 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTAGCTTATACAATTTTATTGCAGCTGTTGTT:1 - chrX 12906523 3' - P-element 46 1 33.66 ATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTACAAAATGGTTTAATTGTCATTTATATACAATCACCCAGTTCG:1 + chrX 734997 3' - Tabor 13 2 66.34 CATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCCAAGTCTATTATATCAACTACAAAAATACCGTTACAGTCTATACAAATGTCGCCGACGCCGCACACGC:1 - chr2L 21865690 3' + Stalker3T 288 1 64.36 TGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCAGGAAAGATTTATAA:1 - chr4 311191 3' + 1360 3375 1 64.36 AAATTAGTTTCTTACAAAANCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCG:1 + chr3R 8582609 3' + roo 9037 1 56.44 CATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGAAATATCTTATTGAGAAATTTTTCAATCACGCATGACTTGTACTTTTGT:1 - chr2R 13188862 3' - Circe 7051 1 71.29 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCGCCGTTCCTGTTGGCCATTGATTTATTAGGT:1 - chr2R 6847245 3' - mdg1 17 2 62.38 ATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGTGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAACATACTATACAAAATTATATGGATAATGCATGATAGCTAA:1 + chr3L 3209239 3' + roo 9039 1 56.57 ATCTTGTTATTCTAGTGTCNTTGATTGCACTACTCACATATGTACACTTCAAAAATAATTAAAGTATTTAATAATAAGCGAAGTCAGTAGGTAATTAGAGC:1 - chr3L 21518948 3' + 1360 3387 2 77.23 AATGGGATCTGGGACAAAAGTGGGGCTAATGGTGGATGTTTTGGGTAGGTTTTGCTAGCTTTTTACGGGGAAAAGTGGGCCATGGGTGTGAAAGGAAGTGG:1 - chrX 13689300 3' - G2 378 1 79.21 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAAACTCTGGCCTT:1 + chr2R 21040906 3' - P-element 44 1 36.63 CTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGGAACAGCTAACCAATTGGGGCTGGGGAGTACACTGTTTATTGCCCACTCGATTAACTCAA:1 + chr3L 3653076 3' + mdg1 7298 2 65.35 TTTACATAAGATATGAACGNAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGA:1 + chr3L 9928588 3' - roo 47 2 77.23 CATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCGGCTGCTGTTGCGCAACAATTGTAACACACGGCACACAATATTTGTGCCATTTGACCGAA:1 - chr3R 10834369 3' + roo 428 1 69.31 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCAAATAATAACCAAATAAAACAAAAGGATACACTGTTCTGTTAAGGATTATTCTTCTTATCTGAAGT:1 + chrX 4277555 3' - roo 8672 2 71.29 ATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTGTTTGGTCAAATGCAGAACGGCACAGTTATTCGAGAACTGAAAA:2 + chr3L 2022338 3' - roo 8664 1 78.22 AAATAATAAAGCAAAAAAAAAAATAATTCAGAACAGACGACATGGCAAAGACAATGGCTCACTTACGGCTCTCAAACTGCTGGCTGTTGGCCAAAATGC:1 - chr2R 19045498 3' + Rt1b 5148 2 68.69 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATACAAAAACAGACACAAGGGTAAACACCAGCACACACACGCTGTACATATGTGTTTGAGTG:1 + chr2R 23116282 3' + jockey 4976 1 53.47 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAACATTACGTTTTTGTTGCACAAAAAATGTTGTAAAA:1 + chr2L 6251721 3' + mdg3 208 2 62.89 TTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTATATCTGTTTTAATATAGCAGCC:1 + chr2L 127337 3' - F-element 159 1 79.21 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGAAATTGAATTTATCACATGTTATGCGTTTGCAC:1 - chr2R 17420837 3' + pogo 2061 1 67.33 TTTGCTACCTTTTTTATGAAGAGGAATCACTGTACTTTGTTTGCGGAGTGAAGGCGAAAAGCCAACCAAAAAGATAGAACGGGTATTTTCGAGGTAAGCAT:1 - chr2L 12255294 3' - Q-element 72 2 47.52 TAATTTTGTTGTTTTTTTTTTCGCTTGTCTTCACCTTTTTTTTTTTGGCTTTTGGTTTTTTTGCAAGCGACGCGTGCTTCAAACTTTACGGCTGATTTTT:1 - chrX 16850550 3' - gypsy7 5017 2 86.00 TGAAAATTTTCAAAAAAAAAAGATAAACAATTTCGAGTAGGAGGGAGTGCAATATAACACGCCTATTAATAGACAATCGAGAATATTTGGCATGGTAATTG:2 + chr3L 7611917 3' + TART-A 13401 1 82.18 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTGCGTGTGTTCGTGAGTTCACACTTTTCTCGGGCGGGAAGAGAAGATGCA:1 - chr2L 16683702 3' + P-element 2859 1 53.47 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTA:3 + chr3L 25059140 3' + mdg1 7423 2 61.39 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGCGGCAACTGGAAAACTGGCAACTTCATTATTATTTGCAGACACTTTTCGAAAAGATTTTTCCGCTCGCT:1 + chr3L 8252280 3' + copia 247 1 70.30 TATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATTAATTAAATCTTTCTAAAAAATCGTTCTATAAC:1 + chr3L 15125930 3' + Juan 4166 1 77.00 GAGGCATTGTGCAAAGTACNCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGTT:1 - chr2L 17730431 3' + pogo 2077 1 53.47 ATAACACGCACACTCGGGTGTGCGATGGTGTTGTGCTAGCTCAAGTGGTTGATAGTGGTATTGTTGTAAATATTATTTTCAATGTTTCTATTGTTTTGAGT:1 + chr3L 11295455 3' - G6 173 1 75.25 TAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAAAGTTAAAAAACTCATATTTAGTAAGTGCTTGAGAGTCTAAAAATAATCATTGAATTACCATTTAATATTTATTTACT:1 + chr3L 19364880 3' + HB 308 1 68.32 GTGTATACACATGTATATGTATAACGTATGGACATCGGGAGGCAGGTGGTGGAGTGGCTGCTGCTTTATTTTACAGATTGTGGGCTCATCAGATAGGG:1 - chr3R 22066727 3' + Stalker2 7496 2 76.53 AACAAAAAAAAAAACCTTTATACATTTATTCAATTTTTGATGAATAAGAATATATTGCCAAAACCAACCGCCCCAAACTCCAGTGATTTTTGTATATGTTA:1 + chrX 4013666 3' - Tc1 1468 1 57.43 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTGGAGTACGCATTCTAAACGAAACAATCATAA:1 - chr3R 3255982 3' + roo 9028 1 69.31 CACACACACACACACATGCACACACGGACACACACAGTTGTTGTGAGCGTTTACAACGCTTTTTGCTGAGCAGCGGAGCGGCGACGTCATCCGCAGCAGAT:1 - chrX 19201563 3' + accord 7034 2 71.29 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACCAGTACACTTGAATAAGCCGACTAGTATATTGCTTCGACCGCAATCCTTTCAAAATGGATCCTTCT:1 - chr2R 10353249 3' + blood 7380 2 37.62 TTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTCTCGCAGACTCGTTATGCCTGGAGAGACAAAAAACAAATCAATTTAAGGTCTTTTTCTCCTAATTTCTTCACC:1 + chr2L 17981630 3' + McClintock 135 2 71.29 GAAACATTTGTTAAATTATTTGAAATTTAATACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTG:1 - 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pogo 39 1 68.32 CCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGGGCCTCCTTTTCTTCCTGTTCATTTGCGCCTGTATGTGTAGGCATTACA:1 - chr3L 13895317 3' - hobo 2615 1 56.00 AAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCC:2 - chrX 21667994 3' + Tabor 465 2 54.46 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGAAATATCGATTTAATTTCATTTACTGCCAAAAGCAGTACAACCGAATGCCAAAA:1 + chr3L 18762154 3' - pogo 19 1 60.40 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATAT:1 + chr3L 15033364 3' - I-element 37 1 59.41 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGAGCTTAGGAAACCAAATTAAGCTTTGACTTTTTAAAGGAAA:1 + chrX 1399954 3' - P-element 5 2 74.26 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCATTCTATGCTGA:1 - chr3L 2022250 3' + roo 9026 1 70.30 CGATCAAAAAAAAATAAAAACATTTTAATTCGCTTCCCTGCTAGCAAATATAAATTAAAAACAAGAATTTTTTCCATTTTACATACTAAACTCGAACAGCT:1 + chr3R 18815580 3' + R2-element 3581 1 82.18 CTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTATTTAAGTTGTTACAATAGTAACAATTAAAACTATTTGTCTGTGACACATTAACTGCAATTAAGCATGAATT:1 + chr2R 16207447 3' - 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Doc 55 1 75.00 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTC:1 - chr3R 29608794 3' + roo 9024 2 73.27 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATATAGACAGATGCCGTGACATCTGCTCATCGGT:1 + chr2L 3633095 3' - P-element 44 1 38.61 AGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTTCATTAGCATAAGTAGATGCGAAAATCGAAAATGAAAAC:1 - chr2R 9905328 3' + mdg3 5489 2 71.29 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACCCTCGTCTTCGCTCGCACTCA:1 - chr3L 20354030 3' + 412 448 2 70.00 CTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAACTAGCTTCCTTGTAACTTTGATATATTGTGCTTTTCCTCTGTCGATTTTTATTGCATAGTTTTGGCTGCT:1 + chr2R 8560719 3' - BS 4998 1 72.28 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTAATTAAATGCTTTGGCTTGAAAGAAAAGTTGTTCTAATTTAATTGGACGTTTT:2 + chr3R 22349555 3' - pogo 21 1 59.41 GTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGGTTGCTTTTGGTTCGGCCTGGTTGATTTTGGACCGGTTGCGACCAGTC:1 - chr2R 6850413 3' + roo 402 1 72.28 CTGGCTAACTGTCGTATTGCAATCAATGAGCAGATATTCAACACGTCACATTTACGCTTAATACGCGTAGCTGTCCCCCGTTTTGAAGGCAATGAACAGCA:1 + chr3R 1221650 3' + Doc4-element 2305 1 76.24 GGGGAACTCGACTATAGCANTCTCTCTAGTTCAAAATAGATAGATATTCTTTCTAGTTCAAAATAGATAGATACTCGAACGAAAACAGCGTACCATAAAGG:1 - chrX 22596366 3' + INE-1 571 1 48.51 AAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAAGTATCATCTTAAAGAGATTTG:1 + chr3R 12876385 3' + hopper 1393 1 56.44 CGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAGATTATATAAAAATCTGGAATAAGAGAATTTTGAAGAGA:1 + chr3L 15788487 3' + opus 459 2 68.32 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACCTCAAGCACGTCGGTCGATCAATATTTGGCCAGCGGCGAGGATTTATGCCAGCTCATT:1 - chr3R 7626364 3' + hobo 2931 1 70.53 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATGTAAACAGGTACATAAGCAGC:1 + chr2L 20567874 3' + 297 6926 2 81.19 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGAGCTTAGGAAACCAAATTAAGCTTTGACTTTTTAA:1 + chrX 1399948 3' + P-element 2876 1 68.32 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTGCAACGGCGG:1 - chrX 4277452 3' + roo 390 2 65.31 CTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTTCTATTGTCATATACTACTA:1 + chr2R 5924415 3' + jockey 4734 1 35.64 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGTACTTCCATTTAACAGGGAAATAACGTTAGTATGTTTGTTAAACCAAAAGCGTAGTGGACCCT:3 + chr3L 7307300 3' - hobo 12 1 65.35 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAATATCCAATAATTAAGCACTTCCGCAGGGAAATTGGTTT:1 + chr3L 12241879 3' - roo 8701 2 66.34 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTTGTATTGTGTAATTGCCAGTATAAGGAGACA:1 + chrX 4399608 3' - I-element 11 1 70.30 GTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAAACCCCCGGAGGGCAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCATTCACCGTTTCAATTTTCTGTGATAAAA:1 + chr3L 8703040 3' - hobo 23 1 74.26 TAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATCGCAACCCGATCATCAGTTCGCAAGTCCTCCACCATA:1 + chr3L 24761269 3' - 1360 52 1 63.37 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCT:1 - chr3L 2022257 3' + roo 9020 2 77.00 AGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATGATAAAGACTAAAGGCAAACGA:1 - chr2L 17868254 3' + roo 461 1 78.22 AATTAAAATTACAAAAAAAAAATATAAAAAAAAAAAGATGAAGAAAAGAAAAAAGTGGTCTCACGACCAAAGTGACCAGGGCGCACATTAACATGTCAGCT:1 - chr3R 8553276 3' + Doc 4694 1 70.30 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATACAAAAACAGACACAAGGGTAAACACCAGCACACACACGCTGTACATATGTGTTTGAGTGAAAA:1 + chr2R 23116286 3' + jockey 4985 1 60.42 TCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGGAAGTTTCGTCCCATCAATCAGTGTAACTCGAATGTGGGAGGTTGAATTTCAACGAAGAAGGATTGCATCTGCTGGAT:1 - chr3L 11909184 3' - Quasimodo 7113 2 67.33 TAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCA:1 - chr3R 13739695 3' - Burdock 6191 2 79.21 CCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCT:1 + chr3L 20224199 3' - Chimpo 53 1 80.20 TCTATGTATATATGTATAAATATATATATATATATATAATAGCAAAATGTTGTCATATTGTTTTTTATTTATATTTAGATAAATACTTTTAAAAACAC:1 - chrX 12915331 3' + invader3 5087 1 66.33 TGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGCATATTGAAAAGCCTTCGAAACACGATATTAGCGTGAATAATTATTCATAT:1 + chr2L 14220222 3' - springer 27 2 53.47 GGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATGTATATACCTTTGTTTGCATATTACCCGTGTTGGTATTTGCTTGCA:2 + chr2L 15567173 3' + 17.6 462 2 63.37 ATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCCAGATCCCACTTTAATATCAGCGGCATGTCAGGCCCGCCGAAGACT:2 - chrX 2991229 3' + G6 1678 1 78.22 CCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGAAATGTTGATAAAAATGTGCACTGCCACTTGCA:2 - chr2L 17677717 3' + Tirant 8465 2 67.33 AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGGGCAGCCTACTACATGTTTAAACTCTCTAATTATTATGCGTAGTCAATCTTAATAAAAGACCCAAGAAATGTGACAC:1 - chr2L 6251647 3' - mdg3 17 2 63.37 CCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCAACTGATCCTATAGTCTGAGAATCCTTA:1 - chr2L 12239921 3' - F-element 4338 1 76.24 TAGCATAGCAGGTGTTATGATGATGATGGTTTTCAACTCTTTTAGCGTTCTTGGACGGTTCACATAAACACGTTGGGGAAACCGCAGATGATGATGGTACG:1 + chr2R 9397912 3' - mariner2 688 1 74.26 TTAAAAAAATAATAATTATTTAGAATACTACTTTAGTAATGGAAACATATCTGGAAACAAAAAAAAAAACATTTTAAGGACAACCATTTATTTCATTGGTG:1 - chrX 11301040 3' + McClintock 6364 2 78.22 TACTCTCGCTTTCGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTCTTCGTTGGTTTTGAAGCTTCTGCAATGGGGCGCCTCTGTGGTTCTAAAGGGGGCGGAGTGTGGCT:1 + chr2R 14019896 3' + Cr1a 218 1 72.28 TTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGAGCAGTTGCTGCAGGTGGCAAGAAAGAAAGCCACTAACTTAATTGCAAGTTTCGCAG:1 + chr3R 13352354 3' + 1360 444 1 59.41 TAAATAAAATAAATAAAAATAATATTTTTAAAAATCGAGAACGGTACAAAGTAACAAACGTAATAATTTAGCGCGTGCGGCGGTGGGGCTGAAGTTTGGGC:1 + chr3L 10516214 3' + X-element 4718 2 76.24 GGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCA:1 - chr2R 18723045 3' - HMS-Beagle 6834 2 66.34 AAAATTAATTTAAAATTCAAAGAAACCTTTTTAATACTGCTATCTCCCAGTGTACCCTTCAC:1 - chr3R 15568705 3' - Rt1b 119 1 90.32 CCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTGTCTGCCGCGTATCAGAAAAATAAAAAGAGGCGTCTTTCAATGCAACTTTGATGCATCGGAA:1 + chrX 12815304 3' - invader1 112 2 74.26 AACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGA:1 - chr2R 4673553 3' + Quasimodo 7362 2 73.27 TGTACTCAAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCACCTTTCCTAAAGGCCATCTTGCAGGATGACAATTCTCATCCTTTAATAAA:1 - chr3R 19447953 3' + Max-element 55 2 54.46 AGTTATTGTTTTATCAGTCTTCTATGATGTATGGTCATGTTATATTTGATTTTAAAAAATGTTGCATACTTCTACGGGGGGATTTTTTTATTTTTTTTATT:1 + chrX 3403807 3' + Transib5 2756 1 70.30 TATGTGTGCGTGTTGTGATAGAAGACGATTTTCGGGCCGATTTACATATTTGTGGAAGTTGGCCAAGCGCCCGAAAGGTCGATTCAATTTCCGTTGAAATG:1 + chr3R 15120635 3' - 1360 3210 1 57.43 ATTTAATGACTTTGCTGATATAAAGTCATGTTTTTGCGAATATTTGTTTTTTTTTTAATTTATCCACTTTATCCCTCTGAGCTGCTCAGGTAATCCGAAA:1 - chr3R 20743551 3' - Ivk 411 1 77.00 GGAAGGCTTCACTCGCTAATTCCCGCCCACATGTCATCAATTCCGTGCCATTTGGCCCACAGTTCGAATGCGCAATGTGTCACTCGAGCTTATCGATCAG:1 + chr2R 14576607 3' + gypsy5 410 1 77.00 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATATTACTCATATTTCTTAGACTCTTTGTTTTATAACACCCTTTTTTTT:1 + chrX 22734095 3' + copia 226 1 56.44 GGAGAGAAGCTCCAGAACATCCCCGAAAATATATACCCACACTAGAGCACTTAAAAGTTTTTTAAACGCTTCAACCAAGACCGTAATTAGTATTGGATTAA:1 - chr3R 25864994 3' + jockey 4622 1 77.23 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAATTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAA:1 - chrX 3464218 3' + Transpac 5226 2 76.24 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTCTGTACATCGGTACTGTGCTCATATCTCGAATGCAAT:1 + chr2L 20367385 3' - Doc 13 1 64.29 CATGGGTAACAGTGCGTTGNTCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTAAACTTCACATTA:1 - chr2L 9045411 3' + jockey 4968 1 50.50 TCAGCATTGACCACAGCTGNAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAATTTCCAAACAATGCGCAACTTTGTGCTGTCCACATCAAAAAGTG:1 + chr3L 9907419 3' - jockey 4704 1 60.40 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAACGAATTATACTGGATAACTGCTCGCATTTTCCCAGCTGCCTGCCAGTTTGGGTACACAAATTATTTC:1 - chr2R 7838964 3' - pogo 21 1 55.67 CACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAAGAGCATAAGATGCACAAAAGTGCAAGCTGGTG:1 - chr3L 1585105 3' + Tirant 327 2 66.33 CCCTAGTAGATCTTTAGATNCACCCTAATACTAAATATGCTCGAGCTGACAGTCAGTTCTCCGTACGTGGATTTTATGAACCTAGCAAAAACTGAACAA:1 - chr3R 17772337 3' + mdg1 133 2 68.69 TGTAAACTAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGGGCAGAATTAATAGAAACCAATAAAACCTAATGATATGAAAAAATGCAATTTTCT:1 - chrX 7269795 3' + X-element 4612 1 62.38 AACAATTATTATTATATATTATAAAACTTACGAAAAAGTAGCTTAAACAAATAAATTCTCGTTTCAGAGAATCACAAATATTACTAGAAACAATTGATTTT:1 - chr2R 11930148 3' - Tc3 256 1 46.53 GCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATTTTGAGAGAAACCCTC:2 + chr3R 10741142 3' - 1360 3365 1 42.57 GCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCA:1 + chr3L 5241158 3' - Ivk 49 1 76.24 AGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATTAGGCAATGATTGTTGAGTGAGAGAGGTTTAATTTCGTGGAATTCTCTCAAAATACCTATCCGAATT:1 - chr2L 21400850 3' + 1360 415 1 53.47 TTAAATAAATATTTTATTGATTAGAAAAAAAGAAAAACAATGATAGAGTAGTCTTTTACAAGGCATTCCGCCATGGTCGTGGTATTTCGCCATCAAATGAG:1 + chrX 18740983 3' - transib1 1930 1 58.42 TGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATTTTGAGAGAAACCCT:1 + chr3R 10741141 3' - 1360 3366 1 42.57 TTTCACTCGCACTTATTGCNAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTG:1 - chr3L 16891119 3' + P-element 2830 1 22.77 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAATTCGAACATGCTCGAATGGCATCCAATGACA:1 - chr2L 19854061 3' + roo 388 2 64.00 AATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCTCCTACGATAATTGAAGTTTTTTCAATTCATTTCGATAAAAATT:1 + chr3L 27355383 3' + Tc3 1712 1 52.48 CCACCTTATGTTATCTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGTTTTCTAACACGGAA:1 - chr3R 21365479 3' + P-element 2885 2 74.73 TTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATCTGTCTTAAAATAGAAAATGAACATAAGGCGCACATTTGGCATATTTTATGAGGATA:1 + chr2L 4134915 3' + Quasimodo 7355 2 67.33 AGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGGTTGCTTTTGGTTCGGCCTGGTTGATTTTGGACCGGTTGCGACCAGTCGAGC:1 - chr2R 6850409 3' + roo 406 1 76.24 GCGTATACAGGGTGTCTCGNTCCCAAACAATAATAATAAACACAAGTAATAATAATAATAACACGGCTTACAACCGACCATTTTGGGGTGACCATTCGAAT:1 + chrX 12130330 3' - 3S18 5773 2 72.28 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATTTCTCTTTATCTTTTCTCACTTTTTTCGTT:1 - chr2L 13093753 3' + roo 396 1 66.34 ATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTTAACAATCTTCCTCCAACTCTTAGAACCCCATCCTTGTCCAAAAATGGATTCAA:1 - chr3R 19446883 3' - Idefix 175 2 56.44 TATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTCTCTATTGTTGTACCCGAT:1 + chr2R 5720509 3' - pogo 68 1 59.41 ACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGGCTAGAAAACACATTCGCATCAGTTGAATTGTAAAATCCAATA:1 + chr3L 4366579 3' - hopper 997 2 60.87 GTCAAAATACTTATGCCGACTAGTGTACATCACATTATATTGAGTTTTGAGTAAAGCACTAATAAGTGGTAAGTGGTAATATAGCGCCAAGAGGATTTTTT:1 - chrX 21398170 3' + Tc1-2 1620 2 69.31 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAATATTCCTAAACTAACTTTGTGTTTTGATTTTGTCATTTTTAGGTAAGTAACAATCG:1 - chr3L 13772985 3' - pogo 15 1 64.36 GTTTTTTTTTTCTTTTTTATTGCCATCCTACCGACTTTCGGATGTCTCATGCGATGCGAAATCGATGACAGGAACAACAAATGGTGACAGGGTGCCACAGG:1 + chrX 18034809 3' - gypsy7 5006 1 57.43 CTTTAGACTGAGAGGCACGNCTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTGCGCCACACATATCTCTGCGTTGTGTGTTGTTTATACAAAAATTACT:1 - chr2L 10198992 3' - I-element 29 1 48.51 AGAGTACGGGGCTTACTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGAAGGATGCAGGATTCCTCGTTGCGTCGAGAATTATACAAACTCTTGT:1 + chr2R 12405020 3' + baggins 4972 1 68.32 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGTTGGCCATGTTCATTCGTGTTTGGGCCGTGTTTAGTTTTCCGGCGTGCGGTTTTC:1 + chrX 4292331 3' - mdg1 22 2 57.43 GTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACGGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTTTCTGCTCAGCACAGAAAATGGATATACATTTAATTGC:1 - chr3L 16942495 3' - 1360 166 1 60.00 ACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAAATATAAAACCCTCGGTATAACCAGTACGATCACAAATTCATTA:1 + chrX 19192435 3' - INE-1 12 1 73.27 TTATTAACTACATCAGAAGNATTGGAATTCTAATTAACCACATAATGAACTGCATATACTTAGGTAACAAACGAATTTTCCTATAATTTTAAATTACGGTT:1 - chr3R 19949286 3' + mdg1 401 2 52.48 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTACTTCCTAGCACAAAGAGTGGAAGCATAAGAAGA:1 - 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chrX 17826566 3' - aurora-element 4196 1 66.34 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAAATGCAC:2 + chr3R 20696512 3' - jockey 59 1 70.30 GAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTACACAATATTTTTTCAGGACCAACAATGTTAAGTTATGTT:1 + chr3R 24314744 3' - X-element 47 1 60.40 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGTGTGGGTACACATACTTTTTGCAAACCAG:1 + chrX 15287909 3' - hobo 49 1 79.21 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAAACTACTC:1 - chrX 21217501 3' + pogo 2073 1 54.55 CCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCTCCCCTTCCATTGGGATCTGAAAATGATCCTAGGTCCGACAGGTACGCCCCACTCTGATCCGAATAT:1 + chr3R 31516736 3' + 412 7218 2 69.31 GTAACGGCCATACATTGGTCTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATTTTGAGAGAAACCCTCGA:1 + chr3R 10741144 3' - 1360 3363 1 42.57 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAAAGGTCCTTGAAAATCCAGATTCCAAATTCA:1 + chr3L 18418925 3' - 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invader1 28 2 62.38 GGTTCTTATTGGATACATGATTTTTATGATGTGTTTTGGTATCTTGGCTTTTTTCCAGTGGATGGATGATGGGCACAGCTGTTGCAGTTATTGCCGTCGTT:1 - chr3R 31961356 3' - Quasimodo 117 2 44.55 CATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGTACAATATGTAAGAACACCACGTAACACGCAAATCGGACTCAATTCAAGTGCACA:1 - chr3L 22570555 3' + Stalker2 7482 2 65.35 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCGAGATCATCAAGACAGAGGATGG:1 - chr2R 11259588 3' + hobo 2895 1 73.33 ATCGTAAAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTGAATCACAAAATCGGTTTCGGATTACACAAAGAGTGCGCGCACACCCGATCGCGTCGACGATTGGTATA:1 + chr2R 5395194 3' - Doc2-element 113 2 70.30 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGCACCGTCCATTGAATCTGCA:1 + chr2R 6850506 3' - roo 34 2 65.35 TTTAAAGTCTAAGAACCTCTAAGGTGAAGAGAGTTCCCTGAGCCAATCAATCCGCACTTTTAATGGGAATTCGATGCAGTTCATAAAATTCTAACCGCCTT:1 - chr3L 961475 3' - 1360 233 1 66.34 AATGTCACCTGCGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGATTACCAGACAAAGGACGGCGACTATCCCCAGAGAA:1 + chr3R 20216474 3' - R2-element 3147 1 53.85 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATC:1 + chr2R 10670015 3' - jockey 4815 1 81.19 GCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCCTCATTTTCCATTCTGGGAAAGTCTTCAACGCGTATTGTCCA:1 + chrX 1762111 3' + jockey 4721 1 58.42 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGA:3 + chr3L 25059124 3' + mdg1 7407 2 77.23 AACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTATTATAGTTTTAATGGGAGACATATGGA:1 + chrX 6125476 3' + I-element 136 1 73.27 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAACTGGATTATTTATATGAAAAAATCTATTTACCCAACATAAGAATAGT:1 - chr3L 20758931 3' + flea 4990 2 56.44 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAA:1 - chr3R 12063756 3' + 412 445 2 76.24 AGCCGCCGCAGCACCCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTTCACTAACAAATGTCTACAAAGTACACTTAAAAACCCTTGATAGGACATGCTA:1 - chr3R 20094446 3' + Max-element 271 2 49.50 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTGCGTTCAAGCTAGTTCAAAACTAACACCTTTACCCCGATAAACCACAGAGGCCAAGAAAGAGGAG:1 - chr2R 22856504 3' + 1360 3379 2 54.46 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGTGTAGATTTCTCTCATACCATTCTGATTTAC:1 + chr3R 15579034 3' - pogo 35 1 61.39 TTGGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAACAAAAAAAACACACAGGCTACGTGCTGTGCTGGCAAATGACTCAATAGTAGCTGCTGGTGGAACT:1 + chr3R 16119794 3' + Cr1a 4430 1 68.32 TACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTTACTACGCTCTTATTTGTTGCTTAACTGGCAACAGGCAGGCCCTTCTTCCGCAGTTGACATCT:1 - chrX 21183955 3' - Juan 15 1 63.37 CCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTTTTATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAAGGAAGGACGAGCAGTGGATCCTTGCA:1 - chr3L 27130699 3' + 1360 281 1 48.96 GTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAAACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACTT:1 + chr3L 11826441 3' + INE-1 145 1 63.37 CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATAATAATAATTACGAATTCATTTTTTTTAAATATGTAAATATGTATGTACATATGAGCA:1 + chr3R 21589081 3' - flea 16 2 63.37 TGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAAGGATCCGGGGGATGTGGGGGTGCTAATTAAAAGCGCAGTCCGCCTGATTGATCATCTGCTGCAGTTCC:1 - chr3L 9906257 3' - jockey 4799 1 75.25 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATCTCTATCTGCTCCGAAGGCATTCCGAGTGGAAA:2 + chr2L 2833917 3' - roo 43 2 69.31 CTCAGCACATATTATATGTGACTGCATGGAGGCTTGCTAGGCATGTTTGAGACGGTATATCACGGAGTACCCGTTGTTACAATGCCGGTATTCTGCGACC:1 + chr2R 5548498 3' + baggins 5232 1 74.00 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTCTGTACATCGGTACTGTGCTCATATCT:1 + chr2L 20367375 3' - Doc 26 1 52.48 ACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGATAACTGGTTTGGTCCGGGTAAAAAGGTAAGCAGCCTTTTCAAGAGGATTTTCCGGAGTTAGTGACTTCTCATCGGCCA:1 + chr2L 9831426 3' - Fw2 3562 1 73.27 AAAGTGCTGCCATAAATTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATCCATTAATAGTTAATTAATAAATTGCCAAA:1 + chrX 21060359 3' - 412 48 2 69.31 TCATATTTAATGGTATTGGATACCATTTTGGCAGCACATTCAAGAGTTTTTTGAATGTCCTTATATGCTTTTCCTTCACATTAAAGCCAACGAAAAGTGTT:1 + chr3R 4552054 3' - HB 466 1 76.24 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGA:1 - chr3L 27357564 3' + mdg1 377 2 64.36 CTGTTTCTATGCTTAAATCATTATGTATATCTTCGTTTCTAATGTACCTACGGATACGATTCTATTATATCTTTTTCTCCAAACTTGAATTCATTAGTGAT:1 + chr3R 2507586 3' - Porto1 4398 1 59.41 CAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAGAGAGCAAAAGTCTTCCCTTCCCTTTCGTCACCTTGACAACG:1 - chr3L 2304218 3' + G2 57 1 58.42 ATGGTATATGACTAATCATGACATCCACAAAGACATGGAACTTCCACTTGTTAAAGACGAAATAAAGTTCCTCAACCTAGTCATTGTTGGATTAGAGCTCG:1 + chr3L 27361809 3' + G3 4297 1 67.33 TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGCTGTT:1 + chr2L 18248055 3' - blood 7041 2 59.41 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGGTTCTTGGCGAGGCCAAATTTATGTGTGTTTAAGCAACGAAGACCGTTAA:1 + chr3L 13785456 3' + pogo 2076 1 56.44 GCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACCAACACGATTCGTGCGTAGTTTTCATT:2 + chr3L 1569212 3' + accord 6967 2 73.27 AACTTTGTATTTTTGAATGNAAATGTTTTCGTTTCACTATTATTTCACTGTTAGTGACTTGGGGGGTGCACCTAAAGAAAAAGAGATTACTTCTGGGTTAA:1 + chr2L 18733256 3' - X-element 168 1 65.35 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATAAACCCAATACTTAGCTCCTGCTGAGCCACGTTCGCTTTCAGTTTTTGAGGTAGGCCTACTTATAGGTGGTCTAGT:1 + chr3L 171272 3' + 1360 3388 2 78.22 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACATTTAAGTGCAGCACTTGAAAAAGAACT:1 + chrX 9454867 3' - roo 46 2 74.00 CTTTCAAAGTGTTAGAAATTAAAAAGAAGATCGCAAAAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTGTTTGTATTATGTGTCCCTGTAGTTGAGTGTTGT:1 - chr3L 17878527 3' - hopper2 1400 1 84.16 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTCCCGAACATTGCAGCCCTGGGTGCAAGCGCTTGATCTGGCAACTCTGTTAAAAT:1 + chr3R 21365594 3' + P-element 2884 2 78.22 TCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCTCAAACACACACACACATGTGCGTCTTTTAAAATTCCTTCGATAAACGACATTTAGGG:1 - chr2R 9209407 3' + Tirant 402 1 74.12 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAAATTCCCTCGAAAACAG:1 + chr3R 9224411 3' + pogo 2077 1 56.70 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTAGTGCGGAGTGGTCGGGAGGCGCGA:1 + chrX 1135357 3' - P-element 43 1 31.96 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACCTACTTAAATATGTCGAAAAGTGTGTCATCG:2 - chr3R 24767806 3' + P-element 2844 1 34.65 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGTGTTACCACTGTATTTGCTTTACTGTTGTTGTAATTAGTTTTGTCGTCGCAGACCCG:1 + chrX 19308244 3' - P-element 17 1 62.38 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTATTGAAAATTCGAACATGCTCGAATGGCATCCAATGAC:1 - chr2L 19854062 3' + roo 9049 2 60.40 TATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTACTTTGTCTAAATAGGGGTTGCTAATAGGT:1 - chrX 9454828 3' + roo 361 2 73.27 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAACGAGAGTACCAAGAAACGGATCGAGAACTACGCCGTCA:1 - chr3R 21884182 3' - mdg3 5274 2 54.22 TGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGTGCCAACAACGCGGTGCACTGCGTTCATTCGATTCATTTTGAGTGTAACCAAAGA:1 + chrX 6458232 3' - hobo 172 1 55.45 ATCAGGATCAATAGCCGAGACGATATGGAGGCGCTTACGATTCGAGCGGTCGAATGATATAGCCGTTCTACAGTGCGGACTCAAAACTGTTCGGCGCATTT:1 - chr3R 16634080 3' + INE-1 93 1 77.23 CAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAGACAAACTTCAGCAAATTACATTTGGGCACAATCTTTTATTACATTTTAAAGTTCAAGTCTCTAAGTAGGAAAGGA:1 - chr3L 2673325 3' - Tc1 1536 1 72.28 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTCGATGTG:1 - chrX 17029983 3' + flea 4999 2 56.00 GGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGCGCCTGCAAACAATGGCGGGAGTGTATCTGCATCCTGGCACTCACGCCCCC:1 + chr2R 13383583 3' - gypsy5 6951 2 61.63 GGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGGCAGGATGTGACTCGAATATCCCTTACAATATTTTAGGAAAAAAAAGAGAAGCGAAAACGACGAATG:1 + chr3L 18422994 3' + hobo 2635 1 67.33 CGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACCAGTACACTTGAATAAGCCGACTAGTATATTGCTTCGACCGCAATCCTTTCAAAATGGAT:1 - chr2R 10353255 3' + blood 7374 2 43.56 CAACCTTCTAGCTTCTATAGTTCCTGAAATAACAACGCTTATATGGACGTAAAGACAGACGGACATGATCAGATTGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAAA:1 + chr2L 21738000 3' - INE-1 159 1 66.34 TGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTCAGCTGCTCTGCTCGCCTTTGAAGTT:1 - chrX 22789336 3' + Tabor 7275 2 75.25 ACATTTTTAACTTTATTTTAAAATTAGTTTTAGTTGGCTTTTTATCTTATTCGCAAGGAGAAAAGTTTGCCGGGAATAATCCGAAATAAGTTGACACCAAG:1 + chr2L 19686382 3' + transib4 2477 1 50.50 TATATTCTTGATCAGGATCACTTGCATACCAAATAATAGCACTATATAACATTTTTTTTACACCAGAAATATAATGCTATTTTTGTAACTTACTTTTTAAA:1 + chr2R 6234448 3' + INE-1 83 1 70.30 AATTTACTTGGCTTTACTTTACTTTTCTTCTCTTTAATGAAGAAAAGAGTTTACTTATGCCAATGCCTGCAGAGCCTTGCTGTATCATCAGTTTCTGGATG:1 + chr3L 12805436 3' - TART-A 13130 1 57.43 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAGTGGCAGCCACGGCGACAGCAACGATATTT:1 + chr3R 10488767 3' + roo 9063 1 71.29 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGC:1 + chr3R 12329649 3' + hopper 1364 1 75.76 ACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCATTTGAGTTTCGTTTCTGTTCATTAACGATTGCAATTTGATACGTAATTTAAA:1 - chr2L 2931838 3' + R1A1-element 41 1 59.41 ATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACTAACCACAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTGCATGTGATACAAATAATCCAAAA:1 - chrX 22689532 3' + 1731 4602 1 54.46 GATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGTTGTCAATTCGTTCCAGTCGCTTATCCACCTTGT:1 + chr3R 21884232 3' + mdg3 203 2 67.33 CGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGCATGTATATGTTTTTCGAAAATGTTAATAATGCTTAGTTTATATTTAAG:1 + chr2R 9699888 3' + Transpac 5209 2 57.43 TTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCACAGCGGGCCCGAAGATAAGCCG:1 - chr2R 23780031 3' - mdg1 53 2 76.24 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCACAAAATTGCCAAACCGGCACCAAACAAACCGC:1 + chr3L 6658256 3' + hopper 1410 2 74.26 CACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGCAATGCAGCCGCTAAATGTGTGCAATTCACCACTTGAGAAAACCACCACCGCCGAAGCAAAGAAACCCACCA:1 + chr3L 10363914 3' - P-element 1 2 79.21 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACATGCGAATCAATCT:1 - chr3R 10110405 3' - Doc 13 1 63.27 TTTTATATGTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGGAGACATCACCATTCTGAAATCCAAACTATGAGCTGCGTTTTGTTTG:1 - chr3L 10043566 3' - G6 1908 1 53.47 AAGTGGGTTTCGGCTACGAGTAGGATATATACTGTCGGACGAACGACAGACGATGCTGACTGCCACATCGCTGATTGTCATCTTTACGGTTGTAATTCAGG:2 - chr2L 6681105 3' - G6 1705 1 68.32 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCGTGTTTGAAACACTTGATTAGCGGCGATGATTGAACGGTTATTCGTAAATTGAAAGC:1 + chr2L 17994223 3' - roo 8666 2 70.24 CACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTACACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTGAAGAAAAGGAGAAGGAGCTAGAAAA:1 - chr2R 17779658 3' + F-element 4429 1 72.28 CTAATTGGGATTGGTATGTNTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTGCAAAAATGTTATTGTATAACATCT:1 - chr3R 22331619 3' - I-element 223 1 74.26 ACCCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATC:1 - chrX 15408753 3' - INE-1 538 1 82.18 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAATTGAACCTGTCCGGATGGGAAGCATCCAAATGGCGTGCACAAAACGATGATGCGGGAGATAGGGGACA:1 - chr2L 14059078 3' + blood 7333 1 75.25 GAGGGTAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCCGCCCACATATCATCAATTC:1 + chr2R 14576550 3' + gypsy5 370 2 80.72 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGAAAATGCTGCAGACAC:1 - chr3R 9088555 3' + hopper 1410 2 67.50 TATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCACTTGAATTTTAATTAAACGCAACAGCTAGACAGGCAAGT:1 + chr3L 14593296 3' + hobo 2489 1 57.89 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTCGAGTGTGAGCTGATATGAATTT:1 + chr2L 14762044 3' - mdg1 7053 2 64.36 CATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATAGGGAGATCAGGATATATTTGCCTTCCAAATGCT:1 - chr2R 8087040 3' + flea 216 2 67.33 TACCATTTCGAGATCTTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGCAAACCGCCCATAAAAGTTATTAAAAATGGATTTTCCGAAATGAGGG:1 - chr3R 16475675 3' - G4 112 1 55.10 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTCGCCCAACTGCAATTTAAACTTTGTTTGCTGCCTTCGTTTACAACGCGTCGCCGGCTC:1 - chrX 21219937 3' - pogo 66 1 60.40 GCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAACAAGCTTTTGTGCTATTGGTGGGATAGATTTCATATATCAGCTTAAATAGTTTTTTATCTTGAGTAATATGTAT:1 + chr2L 13681121 3' - F-element 351 1 77.23 GGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAAACCACGAAACCAAAACCATTAAACAAAAAAACAATAATAAAAGAAAAATCACAAAAATATAA:1 + chr3R 14234503 3' + I-element 342 1 66.34 TTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTTTTATTAGTGTACGAAATAAACAAAAGTTTAAGTTTGTTG:1 + chr3R 7513975 3' + diver 6075 2 66.34 CAGAAGGCATTGACCACTTNAGCCGCAAAGTGCTCTTGGCCAAATACACATGTGCATGCTAATGTGCGTATCCGTTAGGTTGCCAA:1 + chr2R 11109162 3' - Stalker4 221 4 72.09 CGTGGTCGCCATTTTCGTTNTTTCCAACGGCGTTTGTGTGATATTTGTTTGTTGTCTTTGGATGAGAAGAGACTTGAATGAGTCTGAAATTCTGTAGTATG:1 - chr3R 20093464 3' + Max-element 409 1 58.42 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAAT:1 + chr3L 25059130 3' + mdg1 375 2 71.29 CAGCTAGTGTGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATATTGGGTAAACAAATGAGAAAAAATGTAAACATTAATTTGGCTGCTGCATTAGTT:1 + chr2R 5320110 3' - INE-1 528 1 77.23 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAACAGAATGCTTCTGACAACAATTTGCGGTGTTGGGAAAAACCATTTGGCAGTGCTAACAGAAAG:1 + chr3R 12333803 3' + P-element 2877 2 67.33 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCTTTATCGC:2 + chr2R 22856599 3' + 1360 3363 1 56.44 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATAAGGAGCTTGGTTGCCTT:1 + chr2L 12866968 3' - mdg1 18 2 62.38 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTCATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATG:1 - chr3R 7869109 3' - 297 6604 2 55.45 ACCTACATATAACATAAGTACACAATAAAGTCATCGCGCTCATACACACACTCAGACAGCCATACACGCATTCGAGGAGAGAGTCCTGCAGCTCAAGCGGA:1 + chr2L 14116229 3' + accord 7284 2 72.28 ATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAGCCAATTAAATTGTTTTCGCCATAAAAATGTGC:1 - chr3L 13190106 3' + roo 9026 1 70.30 TATTCTTGATCAGGATCAATATCGGCTATTGATATAGCAATAACCGCCTGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAC:1 + chr4 260889 3' + INE-1 85 1 69.31 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATAAATAGAAGTAAATGCGTTCCCAC:1 - chr3L 3209192 3' - roo 8715 2 80.20 CTTTTTTTTTTGTAGCCTTTTGGATGCTTCTAGCGGATGTAAGTGGAAACGGTTGCAACATCGCCTAGAACCGATGGAGAATTAAAGTGAATTATACACA:1 - chr3L 18176492 3' - G2 3067 1 55.00 TTTTTGTTTTTTTTACTTTGCTAAAATTCAATAACTATTCGGATATCCATGGAATGAAGTGGGTTCAAAAAGAAAAAAAAAAACATTTAAAAGTGTTACTT:1 + chr3L 4798544 3' - TAHRE 10438 2 69.31 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTT:1 + chr3R 30553612 3' - 412 7092 2 62.38 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGAAAATGCTGCAGACACGAGGGCGGTCGGTCAATCAAAGA:2 - chr3R 9088532 3' + hopper 1412 2 76.24 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTC:1 + chr3L 25345139 3' - Doc 58 1 75.25 CGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGACAGTTGGTAGCCT:1 + chr2L 15531863 3' - Stalker2 7279 2 56.44 AATTAAATAAATATTTTATTGATTAGAAAAAAAGAAAAACAATGATAGAGTAGTCTTTTACAAGGCATTCCGCCCACTGTGCCACAGAAACTCACCTCAC:1 + chr3R 17299450 3' - transib1 1932 1 87.00 TGCACTGAATTTAAGTGTANACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGCACTCTCTGTTACTCAGCACACAC:1 + chr3R 18399231 3' - P-element 51 1 31.68 ATTTGAGCGATCTTGCATCACATAGAGCGTCTTTTTCACTTTCGGATTGAATCACAAAATCGATTTCGGATTACACAGAGAGTGCGCGAGTTACCATAACA:1 + chr3L 23455997 3' - F-element 137 1 68.32 TTGTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCCCTAATTTGCAATGCAAATTTTTTTCGGCGCTCGCACTGTGACATTAACTCACTGCAGACCACGTCCCCGAAGGGTCC:1 + chrX 7191733 3' - mdg3 5098 1 64.36 AAGGTGGCCTGACGGCTGCNCCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATACAACAAGGAAGAAAAGCG:1 - chr2L 18248006 3' + blood 7335 1 79.21 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTAGAAAATGCAGCTGCCACTCTACGCAGTCGTTACAACTACAATGTTTTTACAAAAGAAAAAGGTCCCAT:1 + chr2R 18432157 3' + 412 487 2 72.28 AATAATCGAGTTAGTGACCAACAAAGTGGACCATCGTACACTTTCACATAGTCAAATGGGCAGCTGTTTAATTTGGTTTGGTTTGCAGTTGTGGTGGTGAT:1 - chr3R 18970593 3' + pogo 390 1 74.26 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCCAACATGTCAGGGGAGTTCCCATTC:1 - chr3R 8765523 3' + roo 394 1 64.36 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAAATGCATGAATAAATACACACG:1 + chr2L 12958966 3' - roo 8711 2 76.24 ATTTTAAAAATATATATAAATATTTTACACGTTTTTATTAATATTATTAGCACACAATTTTACATCACAACTATATACATCTCCACAGCCCCACTTACATT:1 + chr2R 15256224 3' - copia 4664 1 72.28 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATAAGACGAAATCCCATTGAAGGCAACGGGGCG:1 + chr2R 7839031 3' + pogo 2057 1 69.31 TTTCGGCAAACAAAATATTCTTCCACCCGTAAAAGTACCAGAAAGAAATCCAAAGCGATATACATGACCCCACAGGCATAAATCATAGCAGCCAGCGACAT:1 - chrX 14542441 3' - Transib5 2837 1 68.32 GTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAACAGTAGAAAGTGGAGAGTACAGGGCAGTAGAGGGACAAAAACAAAATGAAAGTGTGTTCGTGTGTGG:1 + chr2L 7652969 3' + pogo 1661 1 76.00 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATA:1 + chr3L 20354061 3' - 412 7099 2 69.31 AATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATA:1 + chr2L 22224562 3' + Rt1c 5399 1 58.42 GGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGTCGCGTAATTCAATAGCTTGAAGCATTTTTAATTG:1 + chr2L 12309081 3' + hobo 356 1 65.35 TAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTT:1 - chr3R 19589948 3' - BS 5046 1 73.27 TTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTTACTACGCTCTTATTTGTTGCTTAACTGGCAACAGGCAGGCCCTTCTTCCGCAGTTGAC:1 - chrX 21183959 3' - Juan 19 1 59.41 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCATCCAAACTCATTATCCGCT:1 - chr3R 3847118 3' + P-element 2832 1 24.75 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACTGTGTAA:1 + chr3L 27357638 3' - mdg1 15 2 64.36 CTCCGCCCCAATTTTTTTTTTATAAAAGTTAAAAGTTTCTAAAGTTAATTTTCAATATTAACACACTAATATTATAAAAACCACAGGAGATTTTTCATGTG:1 - chr2L 6591478 3' + hopper 134 1 60.40 ATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACACATGCCCCTGTCCTAGGCTTTCTCTTTAACCCACTTATGCTGTGATGAAA:1 - chr2L 15567092 3' - 17.6 6950 1 56.44 ATAAGTGCATTAATTAATGCATGCAAATTAACACGATCACGTCAGGGTCACCAATGTTGAGCTTATAAGCTTTTTAACTATCTGTTTTTAGCAATTAAAGA:1 - chr2R 4375000 3' - diver2 418 1 66.34 TATTTACTTATTTATATACATATAATATATTAAACAATTGTTGGAGGTCAAAGATATTATATCTTAAATATGTTGAGTACATTACTGGTTTGAAGACAA:1 + chr3R 7410536 3' - 1731 4418 1 45.45 ATTAAAATATTCAAAATATTACTATAAAATACTATTTAAAACTTGAGGTTACACCCCCTTTTCGCTCTCTGTAACAGAGAAA:1 + chrX 13249965 3' + jockey2 3232 1 73.17 GCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACTACGGGTGTTGATGGCGATCGATAACTAACCGGGTGAGAGTTGCAAACTATTTTGTATCGCTTTG:1 - chr2L 8176385 3' + 1360 3377 1 67.33 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTTG:1 + chrX 21217570 3' - pogo 36 1 64.00 ATTGTTATAAAGAAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAGTTGATATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCTTACGAAATATAGTCTCTCTGCGCCAAAGCT:1 + chr3L 21966720 3' + pogo 1998 1 60.40 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTGCTGGGGCGAAAAGTCTGC:1 - chr3L 9910372 3' + 297 388 2 65.52 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAGTGTATTTTATTTCAGACTTTCCACAAAACTTAATTTACATT:1 + chr3L 19647321 3' - pogo 30 1 64.36 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAGTTCAGTTTCTTCTGTTATGCAATGAGTTACATTGCTGGTTTTGT:1 - chr3L 21970798 3' + pogo 2073 1 56.44 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAACAAAGAGCGGGAGAAAGCTCTTGAAGAGCAGTGAAAA:1 - chr3R 14580304 3' - blood 7051 2 65.35 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAATCA:1 - chr3R 7469973 3' - Doc 58 1 74.26 ACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGCATATATCCCGCGACCGCCAGTATAAAGAT:1 - chr3R 31979739 3' - 412 214 2 70.00 TGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCA:1 + chr3R 13739738 3' + Burdock 6356 2 61.00 TTTTCACTGGTTTTTTTTTTGTTGTTGTAACCTCATGTCGTAGTTGTTGGGGTACACGTTGTTGTAGTTGTAGTGGTTGTAGTCGTTGTGGTGGTT:1 + chr3R 25399366 3' - Porto1 170 1 63.54 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACCACTGTTATTTTGCAGTTTGTTGGACTTTGCATACG:1 - chr2L 20045743 3' - roo 8703 2 65.35 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGCGCATCAATAAAAAGATCGCTCCGCTGGGCATTC:1 - chr2L 16358182 3' - hobo 44 1 65.35 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAA:2 - chr2R 22051484 3' - Tabor 6892 2 74.26 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTT:1 + chr3R 12876359 3' + hopper 1367 1 74.26 TTGCTTATCTTGTTCACAGNGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGT:1 + chr3L 24916690 3' - Porto1 149 1 54.46 GCGTAACGGCCATACATTGNTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATTTTGAGAGAAACCCTC:1 + chr3R 10741142 3' - 1360 3365 1 42.57 GTGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGGAATGAAGGTTCCCTTACCTGAACGG:1 + chr3R 13331470 3' - transib2 45 1 68.32 CAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATAAGCTACAATGTACTGGTCCCGTACTCAGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' - Stalker4 50 4 96.04 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGACTGATATAACATAAAAGCTATGTACCCACTTTAATCA:1 - chr2L 20128855 3' + hobo 2899 1 68.32 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTTGCTCTCCTA:1 + chrX 21217578 3' - pogo 29 1 56.44 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAG:1 - chr3L 3596684 3' + copia 214 2 67.33 TAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCATTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTCTTTTATTTCTATTGTTGTGG:1 - chr3R 19444883 3' + Cr1a 4090 1 79.21 TTACTGATATCATACTGAANCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAG:1 - chrX 21668027 3' + Tabor 7271 2 74.26 GCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGATCCAATGTCCAAGGCCAGGACTTTGTTTCGTCTTCCACGGAATGATCCTAATGGCATGTGAGCATTTTG:1 + chr2L 76605 3' - Rt1b 5037 1 72.28 CTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTAATAAGATAGTAAAATAATT:1 + chr3R 25563372 3' - Doc 4549 1 80.20 GATTGCTTTAAGAACAGCAGAGAGTCAAGAAGAGCCAGAAGATACACGAGCTGAACGCAATGAAGTCAGAAGATTAGAACAACGACAGTCACGCCGTTTCA:1 + chr3L 24008452 3' - Cr1a 4245 1 76.24 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGGTGAATATTTTTGACAAATTACTTAAATTACTTACGAGCGAAATGCTTTATGCGGGCCACAAAAAGGGTGTTGT:1 + chr2R 11030605 3' - F-element 26 1 66.34 AACTATAAAAGCTAAAAGGTTGATATTAAGAATGCAGATTTTAGAGACATAGACGCAGAGCAAAGTTGTTAAACCCGGTATGTATGTACGAGTATGTCCCA:1 + chr3L 22940022 3' + INE-1 159 1 69.31 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAGATTATATAAAAATCTGGAATAAGAGAATTTTGAAGA:1 + chr3L 15788485 3' + opus 457 2 71.29 AAAAAAAATAAAAAAAAATATGTTCAGATTTTCATCAAGCTCAGCGCTCGCCCACTCAGTCGCCCATTTTTCCCAGCCCCTTC:1 + chr3R 11004817 3' - hopper 142 3 71.08 ATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGG:2 + chr3R 1977609 3' + micropia 5398 2 65.35 TAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACACGATTCCACCTGTGCTTCGCAGGCGACAAAATTCTCAAGCTTTTCCATGGCATACGAAAAGAAAGATATGTTTT:1 + chr3R 25658314 3' + Gypsy12A_LTR 1958 1 72.28 TGTTGGCCAAATTAAACAAGGTCCTGATTATTTAACTTTACAAAAAACCCTTCTTGGTTAAGTTGGTTGGCGAAGGTATAAGTCTGCGGTCCCTAAACAAG:1 + chr2R 3393391 3' + G3 421 1 49.50 CACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATT:1 - chr2R 5260086 3' + 1360 3224 1 66.34 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTAATTAAATGCTTTGGCTTGAAAGAAAAGTTGTTCTAATTTAA:1 + chr3R 22349544 3' - pogo 32 1 65.35 GTGGTAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTACAGTGGACGTGGCAAGAATTTTTTTTTTGCAAATCGATGACTATTTACAAGACTAATAAAAATGTGTAAAA:1 - chr2L 22063438 3' - INE-1 351 1 68.32 TACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTA:1 - chr3L 15452877 3' - accord 42 2 66.00 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATACAACAAGGAAGAAAAGCGAAAATTTCTTATTTCCATTTCTGTGGCTTATTTCGC:1 - chr2L 18247970 3' + blood 7371 2 60.40 TAATATCTTTTGCCCATTTTTGCTCGTTTTCTTAAAAATTTGATTTTATATAGGCAAGTTCGAGCAAACGGAATTTTTCCCCTTATTAATTTATAATTTTC:1 - chrX 21228779 3' + transib2 492 1 63.37 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGAGACAAGCACTTTTCCCTTTCCCATTCGCTTACATTGTCCCCAAAAATT:2 + chr3L 13190169 3' - roo 24 2 51.49 ATACATATTTTCCGATGCCTAAAATAGTATTCAATGAGTTCTGAAGAAAGAATATTATGCTGCCGCACCCTGTATTTCGGTCATGATACTTGCAGCATCTG:1 + chr2L 21687112 3' + mariner2 841 1 68.32 ACACAAATCCTCCTCGCTGGCCGTCTAAACCGTCACTCCAGCTCCGGCAACTCTCAAGCTGCTGGTCCCGAGCACCTGTCCGGAGGGATTTAAGTTGCTGG:1 - chr3L 19627793 3' - aurora-element 218 1 58.42 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCA:1 + chr2L 18213202 3' - hopper 53 1 76.24 TGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCAAGGATGGAGGCCCTTAAATCATGTTGCATACAACTAGGCGCAGTGCAA:1 - chr3L 1928061 3' + 17.6 3 2 54.46 TTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATCGCCGTACTTAAATCA:1 - chr2R 22051463 3' - Tabor 6871 2 53.47 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTTTATGCTAGTT:1 - chr3R 7869095 3' - 297 9 2 71.29 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCGCACAACGGGCAGGTGTGCGAGCGAGAGGGTGCGGACGTCAGAGA:1 - chrX 4707838 3' + P-element 2856 1 46.53 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCGATGCCGTGTATGTAGTTCTTTTT:1 - chr3R 29608750 3' + roo 405 1 79.21 TAATAAATATAAAAATACAATTAAATAACTGCAACCAAACAAATAATCTTGCCGTGACCTAATTAATATTAATTATGCTAAACATT:1 - chr3R 6670565 3' + Stalker4 85 4 69.77 ATGCAGCTAAGCGAATTATNCTGTATTTTCCAAATTGGTTGTAAAAAATTATGTCTTGTTGGTCGATATTACAAATGAACATTATTATAGCTTCCTTGTAC:1 - chr2L 21190713 3' - pogo 2 1 75.25 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCATTGG:1 - chrX 21667989 3' + Tabor 7309 2 59.41 CCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGATCCTCCGGCCGGAGTCAGAGTCAGATTAGCTCGCAAAACCGCAGACAACAG:1 - chr3L 17180060 3' + jockey 4676 1 58.42 TTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTCACTATCGATATGATACGAACCCCCCACTTTTTTCAAC:1 - chr3L 4343111 3' + I-element 4948 1 62.38 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATAAACCCAATACTTAGCTCCTGCTGAGCCACGT:1 + chr3L 171228 3' + 1360 3344 1 75.25 CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGTACGTTAGTTATTGGGCACATATTGCAGATG:1 - chr2R 16160769 3' - mdg3 44 2 69.00 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCCTTACTCCCCGCACCATTCAATGTTG:1 + chr2L 12882835 3' + hopper 1413 2 75.25 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACAACGACATAGTGGACTGTATATATATTTTTTTTTGTTATATAATTTTATTTTTTATTTACTATTGATATTTA:1 - chr3R 19449910 3' + roo 326 2 77.23 TATTTTTCAAAGGTGTGGGCGTGACAGTTTTGTGCTGTTTGTGAACGTTAAAGTGGGCTTGTGGTGAAACTGTTGATAATGGATACACATTTTTGCGGTTA:1 - chr3L 20494614 3' - INE-1 254 1 57.43 TAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATTGCTGTGCACATTGCTATAGATAATTTAAAGTGCCAATCT:1 + chr2R 9631785 3' - F-element 23 1 63.37 CGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTCAATTTGATGAAACTAGTAGTCAC:1 + chr3R 31021986 3' + Ivk 5326 1 78.22 AAATAAAATATTTGAACTAAAAAAATATATAATAACTAGGTAACAATTTGTTGTTATATGCTGCCCTAAATCCTTGGCAGGAGGAGTCGGAATCTGGGCGA:1 - chr2R 4933566 3' + G7 1158 1 60.40 AACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGAGATTAAATATTTTCGAACCAATTTTTAATGACTGCAGCAGGTGGCCAATTTAAAAGTACTAACTCTATATT:1 + chrX 7292766 3' + 3S18 336 2 74.26 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCTTT:1 - chr2L 18213170 3' + hopper2 1560 1 70.30 TTTTTGCTTACACTTAAGCNCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTCGCGGCCCCAGCGCACTCTGCGATTGCTTCTCATTT:1 - chr3R 20428435 3' + rover 95 2 63.37 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAGTCAGCTCGCAGCGTTAGTT:2 + chr3R 7626449 3' - hobo 31 1 56.44 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACA:1 - chr3R 11151800 3' + mdg3 5488 2 69.31 TCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGTCCTCCCAGCTGATGTCCAGGTCAGTCATTCCCAGTTCCTCTCC:1 - chr2R 8466499 3' - F-element 483 1 64.36 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAGATTATATAAAAATCTGGAATAAGAGAATTTTGAAGAGAT:1 + chr3L 15788488 3' + opus 460 2 68.32 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGTTAAGACTGCCACTTCGATGGA:1 + chr2R 19840244 3' + roo 9019 2 75.25 TTTTCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATA:1 + chr3R 10488731 3' + roo 9027 1 69.31 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATGTGCAAACAAAGTTGAAT:1 - chr2L 12958913 3' + roo 9039 1 58.42 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAGCTATGAAGCTCAGCTTGTTTGTGCAGTTTAGCCGCGGAAATGTAATGCGAGCAGCATGCACTA:1 - chr2R 6107708 3' + roo 396 1 66.34 AAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTACCAAAATAAAAATATAGTGGAAAATCTATAATATTTATAT:1 + chrX 23211132 3' + roo 372 1 59.41 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGGAATAATTAATGTAATCAAGCGACGTGCCCTGAGTTTACTCGTAACTTTCTGGCACGTAAGAA:1 - chr3R 17660458 3' - roo 8676 2 66.34 CTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGCGCGTATGTGTGATATGCGTTTCGTTTTGTTTTAGCAAAGTGCGCGCGC:1 - chr2L 13415321 3' - F-element 4394 1 51.49 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATT:1 - chr2L 12958933 3' + roo 9019 2 80.20 TACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAGGAAATCGATGACATTACTCAGATAATATATTCCAAATATTTGATCAAAATCAAGACCAAAAAT:1 - chr3R 14582050 3' + Stalker4 395 1 68.32 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAACAGAATGCTTCTGACAACAATTTGCGGTGTTGGGAAA:1 + chr3R 12333777 3' - P-element 36 1 43.56 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGAGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGG:1 - chrX 11025513 3' - hopper 21 1 60.00 TACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTAGGCAGTTGAAGGCAATCCATCGTGTGCTCAGATCATCGTTGAAGAATGATATTGCGACTGGCAGG:1 - chr2R 14291803 3' - 1360 171 1 73.27 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTTTTTTATTTATAAATAAAGATTTTTCAAGCACAATCTGACCCATTTTTACACCATCT:1 - chrX 7797638 3' - roo 8681 2 49.50 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTATTGCCATTAGGAGGAAC:1 - chr2R 18188303 3' - Juan 4045 1 56.70 CGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACTTCATTCACCATCCCCGCTAGGTCAGAATTCAGGACGCAGGACTCGCTTCTCCTTGGAGCGTA:1 + chr3R 26252759 3' + 412 480 2 63.64 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTCTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCTTTTAAGTTTCTATTCCACCCTG:1 - chr3R 20420942 3' - blood 50 2 74.75 TCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGTTGACGCTCCTTCCGGCAATGGTTGGCTAA:1 + chr4 278883 3' - I-element 431 1 70.30 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGATTTAAATCACTTTTATTTTATTTTTAAATTTTTATAAT:1 + chr3R 12944738 3' - roo 8702 2 67.33 TTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACTTATACCACAATTTTAATAGGGATAGCATTCCCTCGGGATCCTCACTGCTGCAGGAGCAGTTC:1 - chr2R 17895089 3' - 412 11 2 59.41 TCCGGCCCGGAGATGTGGAAATTGAGATCTACCAGCTCCAGCCCAACTTCGATAAGCAGCAAACGCCCGCGGCCACGCCCACATCCGTACATTCGGTGGCC:1 - chr2R 20824839 3' - baggins 197 1 52.48 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTACAAAGGTTTAGTCATCCAGTCATAATCATAACGTTATC:1 - chr3L 20411793 3' - roo 35 2 60.40 CAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTGGGGTCTTTGGTGTAACCCTCCGCGAATTTTGAAAGTTCTTTGTTCTTTT:1 - chrX 12509997 3' - 1360 40 1 76.24 ACTAGCCTTAAGGGCACTCAACAACGGAGAGACGTTCTACCAACATATCCTACACTAAAATAAGAAATGCATTTTTATACAAAATTTAAAAAGTCGTAACA:1 - chr3R 5425416 3' + gypsy6 249 2 66.34 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGGTTTTTT:1 + chr2L 4063757 3' - roo 33 2 63.37 ACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATATAAATAATAGTGAGCTAAAAGGAATTTCTCTTAATGGTGTTGATGTAGCTTGATTTTTAAGGCGCATTTTAGAT:1 + chr2L 16358605 3' - hobo 2505 1 64.36 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTCGAAAGGAATTAAATTTAAATTCCGCGTT:1 + chr2R 1737801 3' - I-element 48 1 70.30 GTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCCACTCATGTTTTGT:1 + chr3L 5479059 3' + 3S18 6065 2 69.31 TTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTGCGTATGTGCAATTCGGCACTGCCTTTATTCTTTAGCCAAAATAACAATGAATATGAGCCACA:1 + chrX 4792155 3' - copia 8 2 70.21 TTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATTACCCCTTTTTGTGCATAGATTTTCCATCTTGTTCTTGCACAGCGAAATTCGCCCCAAGGGCAAACGTTTTCTTG:1 + chrX 9775084 3' + 412 490 2 75.25 AAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACATGAAGGCAGTAAGACAGTAACAAAGCACCAAAAACATGGCCTGTAATTGCTGTCAGCG:1 - chr3R 8764714 3' - Cr1a 9 1 66.34 AATTTATAATGTAGAACTAGAAAAAGAAGAACTATTATAATCTAATATAATTTATTCTTATATCTTTTATTTCTGAGGACAGTCGGGACTATACCAATTGA:1 + chr2R 4514929 3' + transib2 2570 1 50.50 GAAGTAAGCACCAAGAGGTTAGTGATTGTTGACCAGTGTTTTGGTTCTTTGCAATGAATTAAAACGCTCTTGCGATACTCTAAGTAGACTCGATTTCGTTA:1 + chr2R 5607788 3' - Q-element 242 2 70.30 ATAAACTTCCATAGCAGCCGATATGCAGACAGACTTAGCCCCCACCCCTTCACAAAGCGACATATTATTTTTTTATGATTTGATTTCCCTTTTTATACCAC:1 - chr3R 28800793 3' + G5A 2590 1 62.38 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATTTCTATATGTTTCTCTAAATTTTTGTTG:1 - chr2L 16426444 3' + hobo 2891 1 76.24 TGTGAAAATTGGCGGAAAAAGTTGAACAGGAGCTTAGTAAAAGGCTAAAGGAAATTTTTCATTACATTATACACATTAGGAATCCGGCCTTCCACAGAAAA:1 + chr2R 4550785 3' + transib4 190 1 78.22 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTATCATTT:1 + chr2L 21086101 3' - roo 8687 2 54.64 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTACCTTACTATACTTATATGTCTATCAACTTTTTAATG:1 - chr3L 19249689 3' - Transpac 4962 2 74.26 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTACTGGTCCGTCCGCCTGTCTGCTTTATGCGAGTTTGTTGTTAAACCATCACAAAA:1 - chr2L 19681408 3' + hopper 1405 2 64.37 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGG:1 - chrX 11025512 3' - hopper 30 1 56.67 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATACAAAAACAGACACAAGGGTAAACACCAGCACACACACGC:1 + chr2R 23116262 3' + jockey 4956 1 73.27 ACAGTCTTTATTTGTAAGCTCATTCGTGGTGAAGTTAACAGTCCCGATTACGTTTCGATTCTCCACCTAAATCTCTCTTAGCACTCTCAATATTTTTAAGG:1 + chr3L 20556986 3' + Cr1a 4037 1 58.42 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGAGAGTGTAAATATGGCAGAATATCCTAGTGAGCTTGAGCGTAGGAATACAGA:1 + chrX 5219771 3' + hobo 2923 1 58.06 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGCGGCAACTGGAAAACTGGCAACTTCATTATT:1 + chr3L 8252242 3' + copia 243 1 68.32 AAATATAAATTATAAATTACAACAATCCCCAACCCCCACAGACTTTCCATCTCAGGTTGCCTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTCCACTCTGGCTAACTAATGA:1 + chr2L 12511636 3' + copia 253 1 78.22 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGTAAAAATTGGCTTCA:1 + chr2L 7175621 3' + blood 336 2 66.34 TGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCTACTTTTGCATTTTGTCACATCAGTATA:1 - chr3L 639304 3' + flea 276 1 72.28 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGGAATAATTAATGTAATCAAGCGACGTGCCCTGAGTTTACTCGTAACTT:2 - chr3R 17660473 3' - roo 8691 2 56.44 AGATTATTATTATTATTGCTATAATAATTTATAGTATTGGTTCTTGGCTCTTGCAGCGATTCATTTCGTTAGTTAAGCTTTTGGCCACATTTTTTCACAGT:1 - chr3R 19255382 3' - mdg1 32 2 38.61 ATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTCAAGTGGTTTTCGGTTTCCTATTGATTTATGAACTTTTCTCAGGTTAATCGTTTCCTAC:1 + chr2L 18199791 3' + Ivk 5362 1 61.39 CCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATCAGGGATACTACCAGTGCTACTTGTACTGCCTGTCTATCTGTCTCT:1 - chr2L 11721695 3' + Quasimodo 6958 2 53.47 AAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGTATAGGTTTTGGTCTATAGTTTTTGCGCTATTATTCGCTGTACAAATGCTGGTATAC:1 - chr3R 19505518 3' - mdg3 5264 1 61.39 GCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAA:1 - chrX 3431855 3' - Ivk 5310 1 67.33 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTGCATCCCAT:1 + chr3R 30553621 3' - 412 7083 2 53.47 CAGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGCGTTGCCTCGAGCGCTTGGCTGGA:1 - chr2R 19560135 3' - Tirant 8119 2 69.31 TAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACACCGCGCGAGTTACCTATTTGGGACGAATATTTCGTTTTCTATTTGCTTAGCTTAATTTTTCTT:1 + chr3L 12883857 3' + baggins 5079 1 54.46 AAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAATCAATAAAGAGATTTAAAATTTACAAGTACTCGT:1 + chr3L 20317866 3' - 3S18 5807 2 63.37 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTGCGTGTGTTCGTGAGTTCACACTT:1 - chr2L 16683727 3' + P-element 2834 1 28.71 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGTTCGTCAT:1 - chr3R 30553565 3' + 412 446 2 67.33 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGTGTACATTTTCACATATGAATA:1 + chr3R 11607998 3' + 1360 3338 1 77.78 GCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATTGGGTTACGTAAGCCCATATCTTTTATGATACCAAAA:1 - chr2L 21735013 3' - 17.6 33 2 64.36 TAGGAGGTATTAATTTTTGTGAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGTTCGCT:1 + chr3R 9088634 3' - hopper 28 1 51.49 TTGATCTGCGCGAGAGCGCTTCTTGCTTATGCTTATGTGCATACATATGGAAAAATAATTCTTATAACCAGTATTTGATTGATTGATTGACGGTTAATGCG:2 + chr2R 11449716 3' - Tom1 209 1 64.36 TTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGCCCAGATTCAGATTCAGATTCAGATCAGT:1 - chr2L 10199192 3' - I-element 5276 1 71.29 GCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACTGCAGGAGCTTCATGCGGCGTTAGA:1 - chr2R 23249111 3' + jockey 4709 1 75.00 GAAAAATAAGTAAGTAAGTAATAAGTAATAATAAGTATAATAGTATACTAGACATTAATATATTTAACTTAAGCTAAACAAAGCTTAATTATTGT:1 + chr3R 6786888 3' + looper1 343 1 61.05 TCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGCGTGCGTGTGTGCCAGTGTTTGTTTGTTTGT:1 + chr3R 24767875 3' - P-element 18 1 60.40 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAACGACCCTCTTCCACACGCCATTGCCTGGTTCGACGCGAGTGCAAAAACGAAT:1 + chr3L 153656 3' - 1360 25 1 54.46 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCGGAACACGTTGTTAGCCC:1 + chr3R 14193973 3' + pogo 2075 1 55.67 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCATTCTTAGTCTTATCAAATCGTTCGGCGACGTGTATAGTTAAGGTGCCCTTGTCAAAGCTTCATTTTCACGTTAT:1 - chr3L 14222427 3' + roo 409 1 79.21 GGCGCAGCCGGTCAACGGACAAGGGATTAACTTGGACAGGAGTTGGGTATCGCTGGTGCTGCATGTGGGTTGGTGTGGCTCAAATTGGGGGCACATATGAG:1 + chrX 17395439 3' - accord2 7415 1 68.32 ATTTTTCGTTTATTGTATATATGTCATGTAAAAAAAATAAAATGGGGCCAAAAGGCAGCTGGGCTTGCATTGCATGTCCAGTCACAGTTTTGTCCCACAAT:1 + chr3R 25878649 3' - Transpac 4760 1 71.29 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTATAATTTTCGGAGCTCTGTGCTGT:1 + chr2R 10670060 3' - jockey 4770 1 69.31 GGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCAC:1 - chr2L 20360642 3' - micropia 4987 2 54.55 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTAAAACAAATAAAAAAATTGTTCTTACTGGTTTGAATAATATTAATTCCTAGC:1 - chr3L 16546767 3' - pogo 21 1 59.41 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCAGAGAGAGCGGGTGGTTGGGTTGCCGTTGGTCAGGGGAGTGCTCCA:1 - chr3L 16891067 3' + P-element 2882 2 72.28 CAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATGAAACACTGGAAATAAAAGCTAAGA:1 - chr2R 9950129 3' - 3S18 5816 2 73.27 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCCATCCCACGCACATGCAACAAGAAATGGCAAAAGTTTTCGATACGCCCCCGTAC:1 - chr2L 10625661 3' + roo 9054 2 61.22 CTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGTGTCCTTAAAGTCATTAAATACGTTTTATATATATT:1 + chr2L 18772118 3' - McClintock 68 2 64.36 CAAGTCGGAGCTACGACCCTGCTACCGGCTTATTCCAGTTGGCGCAATTGAACTTGAATACGCTGCCGCAGCGGCGTTTCAGTTTAGTTAGCCCGCCAACT:1 + chr2R 20209617 3' + Chouto 192 1 63.37 ACGATGATCACGTGAGCCCCATCCCAAACGATTTTGTCAGCACAAAAGCAACTGTTGCCGCACACACACTGGCTGTATGTAATAGCCATCTGGATTGGGT:1 + chr4 702161 3' - Rt1a 4708 1 66.00 AAACTCAACGAGTAAAGTCNTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAATTGTTGATTTTTTGTATATCAAAAAGAGAAAGCTAAAATATATA:1 + chr3R 26317991 3' + roo 391 2 62.22 GCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGCCAAGATTTCAAATAAAGAGTTTGGTCTTTCTGGCCGGACTTATAGTTTTGGTTGGGGAGGCTAA:1 - chrX 437342 3' - diver 10 2 71.43 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGTGTTTGGCAGACATGGGCAAGGCAATGCAACTGAT:1 + chr3R 17053162 3' + hopper 1413 2 77.23 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAAATCACCATTCCTCATAAAATTCACAGAATCATGAGTAGACAAACTCCCACGACA:1 + chr3R 26435472 3' + Juan 4194 1 55.56 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATAAAGTTTTTATTATCATAATAAACCGAATAACAAGCT:1 - chr3R 17003304 3' - pogo 34 1 60.40 TAGTTGATATAACATAGTAATTATTGTGTGGGGTTAGGGAAAGTTGATGCCAGAGTTCATTCGTCTGTAGACACATGTTGGGGCCAAAGGTCACAGCTGGA:1 + chr3R 27055212 3' - jockey 4843 1 74.26 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCTATTATTGGTTGAAATTGGGTTATTGTCTAATGGCAGCACTTTATAGCTTTTTAATG:1 - chr3R 8582530 3' - roo 19 2 60.40 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGAAAAACAAGAAAATGCTAAAATCGTTGAAAAAGAGTTTCTGGCAGAAGAGTGAGATCATCTTAGGA:1 - chrX 8503085 3' - roo 9 2 44.55 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATCTCGGACTTCAGGATAGCCACGGGTTCACGTTCGGGATCTACG:1 + chr2R 11259629 3' - hobo 30 1 53.61 AAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGGTGAATATCATTGTGAACG:1 + chr2R 5772524 3' + HMS-Beagle 7011 2 62.38 CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCATCTTGG:1 + chrX 19034195 3' + hopper 1396 1 60.40 TGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTTGTAGACATTCAGCTCCGGCACATGGATGCGCACCAGTAGCCATCGGTCCCGCGGCTCCGGCGGCG:1 + chr2R 14092108 3' + Idefix 148 2 67.33 TACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACATCGAGCCCATTTCTCGCTGTGTAATCAATTTAGC:1 - chr3R 22330726 3' + I-element 5316 1 64.36 AGATCAACGCCTTTAAAGANGTTTCGGATTTGAAAGCAAGACTCATGAGCGCCGCAGTTCGAATTCAGCTAATTCGTGCTCTTCATCAAATTTGGGAGG:1 - chr4 198653 3' - rover 296 2 71.72 ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATGTACAAATCACAATATAATTTCGTTAACCCCCATTTGGTTTCTGTGTATTATGCGAGAGATTCCTGGTTATGGC:1 + chr3L 12288164 3' + transib1 1900 1 47.52 TCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAAGA:1 - chr2R 6438336 3' + Stalker4 390 1 62.00 TCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCAATTTGTTGTTTACCCTCTTTCGGTTTTCCACAT:1 - chrX 15546124 3' + blood 369 2 71.29 GAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAATTCCAGACACAAACCCGGCCCAAACACGCGACAATTGTTGCAACAATAAAC:1 - chr3L 16282333 3' - gypsy5 6942 2 79.21 CGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAATAGAAACTGTGAGGCCACTAAAAAATTTGGAATTT:1 - chr2L 14637390 3' - 297 6567 1 65.35 GTCTCCGCGACTTCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCAATAACCCGGCAAGTTTATCATTGACAACAACTCAAGAAAGAATGGTAAAAATTTAACA:1 - chr2R 4550872 3' + Doc2-element 372 1 74.49 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAATCGATTTTGTTAATGAAAACGAAGGAGAACTTCAAG:1 - chr2R 19061225 3' + roo 9036 1 62.38 GGTGCATGCTTTAGAATCCGGCTCTAGCTCGATGGCATTGGGTTGCTCAGGTGACTCAAGCTCCTCATCTGGTTGTGGATCAACCTGTTCAGGACTCACTA:1 - chr3L 19982807 3' - Gypsy12A_LTR 2207 1 63.37 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATAAGGAGCTTGGTTGCCTTGCAAATTCCT:1 + chr2L 12866978 3' - mdg1 7046 2 72.28 GTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCGCATACATTGCTTAAATCTATGTATTTACTTACTGCTTATTCCTGTTTACTATCAATAGGTTTTTATTTCAGG:1 - chr3R 11515079 3' - Stalker4 307 4 57.43 CCTCAAAACTAAAACTATTTTAAAATGTCCCGGACTGGTAGAAGCCTTGAGTTAATACGTAATCACCCACAACGATAAGTAACGTAATTTGTTGTTATTCA:1 - chrX 4817646 3' + Tom1 387 1 62.38 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTNTCTGGTTTCCATGACTACGGCTGCATGCGTGTGTGTATGTCTGTGTCTGTTCATCCGTCTCCCGTTGTTGTT:1 - chrX 6932317 3' + hobo 2936 1 73.91 TATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTATTT:2 - chr3L 15125903 3' - Juan 3788 1 72.28 AGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCAGAACGTAAATGGAACTTAAAGTGAAAATTAATTGAACATCTTGTGCATTTCAGC:1 - chr3R 20306476 3' + jockey 4682 1 56.44 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGCAGACGCATTGTGTGCTGCCGCCGCGGATCACTTTGTTGGTTTTTAATTAAGGAGTTGAATGGGAATCAA:1 + chr3R 12321957 3' - jockey 4792 1 75.25 AAATTGGTCGAATTGTCGGGTGTTCAAACAAAATGTAACTAAATACTCTATATTCAGAAATTCCTGTTAAGAAGCGGTTTTTATTTATTTCGAAGTCCAAA:1 - chr3R 10635269 3' + Tc1 438 1 73.27 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACACACACATTTAAATC:1 + chr3L 3540226 3' - mdg3 5262 1 69.31 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGAAATATCGATTTAATTTCATTTACTGCCAA:1 + chr3L 18762130 3' - pogo 43 1 73.27 CTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTACCCTGGGTCATCCATGGGGTCAT:3 - chr2R 14349141 3' + mdg3 193 2 77.23 GCTCAGCGAGAGATACCTGAAAAGGCTCGAAAGCCACCCCAATCCTACCAAATCCAGCCCAAAAGCCACCCACATCACACATTTCATTCGAGCGCTTTGTT:1 - chrX 13462959 3' + G6 1788 1 73.27 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTT:2 - chr3R 20905369 3' - pogo 7 1 73.27 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAGTCAGCTCGC:1 + chr3R 7626439 3' - hobo 41 1 66.34 TGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATTTCGGCCCTATGTCATTTA:2 - chr2R 17963228 3' - blood 29 2 57.43 CAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTCAATTATGGCCAAAGTAAACGAACGGCTTGAAGCTTAATGCTCCCCTGCTCCCC:1 + chr3L 9489440 3' - jockey 4965 1 59.38 GCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATATTATAATATAATTATCAAATAGTGTTGTAAAACGAAAAA:1 - chr3L 19089613 3' - invader1 37 2 65.35 TCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGAATTTTTGTTTGATAAGTAATGA:1 - chr2L 14042030 3' - R1A1-element 399 1 77.23 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGA:1 + chr2L 20367346 3' - Doc 55 1 73.27 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAGGTAATTAAGTAAATTTGGGATAATGTAGCCAGAAATCTTCTTAAGAAAAATATGTAAATACAC:1 + chr3L 19249765 3' + Transpac 5214 2 61.39 ACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTACATGACATTAGAGAGATTGCTGTT:1 + chrX 9336761 3' + Burdock 21 2 75.25 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGACCGCATCCATTACTCAAATTTTATTAAACATCCAACATCAACAACGGACAACTA:2 + chr2L 126559 3' - Doc 25 1 52.48 AAAAAGGAAAAAGTAAAAAAAGGTGAGAATTTTTATTAAGTATTAAAGATAATTTTAGAACAAACTTATGCATACAGAAAATCCAGGTAGTTTGATCAAA:1 - chr2L 19648356 3' + Doc2-element 238 1 90.00 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTATGCTACATACACATATAAATATATATTTAAAATATATTTTCCTTACCTTTTGGGCCAGA:1 - chr3R 10434865 3' + 1360 3374 1 62.38 CCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCTTGGGCGAACCAAACCAGAAATCGTAGCAAAACTAAATTAGTTCTATAATAGGTGG:1 - chr3R 24698937 3' + Quasimodo 7020 2 63.00 GACGTTTTGCAAAAACGTAGCGATCCAGTCTGCATGACCGAATTCAGACGGCCGAAAGGAATTTTTCTTGGGAAAATCCCTTATAATCCGGATTTACGCAT:1 + chr2R 5205708 3' - Doc4-element 484 1 62.38 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATAGGAGTGTGTATATAGCGAAAAGTGCGGGCGAAGGCAATGGCCATTCGCTGGATTCGAAG:1 + chr2L 14035616 3' + flea 5003 2 65.35 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGGAGAGGTTGCCCCAAAGTTAAATTTTGCCTTTTTGCT:1 - chr2R 21747540 3' - mdg1 13 2 47.30 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAAAACCTAACTTATAAACGACATAGAAAAAATCTTGGTAATTTTGGGAACAAATTTTTTTGGTATAATTTTTT:1 - chr3L 13987156 3' + pogo 2100 1 78.22 ATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCCTTGGCTGAGCTAATTTACTTCTTCATATTGTAACGCTCTTTTTGAAACGCAACGTCCGTCTTTGCTTCTTCT:1 + chr3L 20403257 3' - Quasimodo 7243 2 61.00 ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACTATATATATATGTATAAAGTATTAACTAGCC:1 + chrX 17104448 3' + 297 334 2 69.00 AAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTTTTATTAGTGTACGAAATAAACAAAAGTTTAAGTTTGTTGTCCAAAAGTCGAACATTTTGCATTCGTCCGTTG:1 + chr3R 7514008 3' + diver 220 1 68.32 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTACCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTTTGGCC:1 - chr3R 23542971 3' + 412 441 2 76.00 ATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGCATATTATTTATACTCTTATACTTGAG:1 - chrX 1706057 3' - Juan 4098 1 73.27 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTGTTATCAAGGCTTTCAAGCATGATCTATCTTAAAACATTTGATTGTCATAGCTA:1 - chr3R 17781535 3' - pogo 18 1 61.39 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTGGAGCTTACAATAGCAAAGTACTAGGCA:1 - chr3R 18549918 3' + pogo 2058 1 71.29 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTAAATAATAACCAGTGGAGCAGTACTATGTGTGCGCCCAGTGTTGGGAAACATGTTTTCAGTTGTCTTCCCGCTT:1 - chrX 17857962 3' + P-element 2885 2 70.30 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATTTTTGAGCCTTTGAGCAATTGTTCGTTCGTTACGAGAGTTTTTTTGTGGCATAAAAATG:1 - chr3L 5710223 3' + Transpac 298 2 65.00 AAGGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGGTGCCTTGAAGGTCCGCTCTGGCCTGACTTGATCTCCGCTAGCAAATCGTAGTCTTCACTTAGGATCTAATAA:1 - chrX 8432190 3' - Rt1a 4898 1 69.31 ATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATGGGTGTTCTGTCACACTGTTATCAGTTTTGCTACCTTATTAAGGCAGCGAAGTAAGTTTATA:1 - chr3L 13291901 3' + hopper 69 1 68.32 GGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATCGCTGATTTTTCGCAGTGAGCTAAGCGTTCTGAAAAACAGTTTAAGGTGTGTTCTTGA:1 - chr3L 736003 3' - gypsy6 13 2 56.44 CATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAGGCTCAGTCACCGAAGCACAGCAACAATTGCTGCATATTAGGCAGTAAAGTAAAGTTAAACACA:1 - chr2R 10233851 3' + X-element 4277 1 67.33 GTTTATGTTTATGTTTATGAAAGTTGAAGCCCAAACACATTTATTCCTATTTTCATTCCAATTTTCATTGCTTTTCCGAGACTGCACACGATTTGTGCGAG:1 - chrX 13798784 3' + 412 78 2 83.17 CACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAAGGACCA:1 - chr3R 4971387 3' - F-element 28 1 60.40 AAAAAATAAAAAAAAAAACGGGGGGGCGAAGATTAAATAAATTT:1 + chr2R 18688597 3' - hopper 140 1 88.64 TAGGGTCGACAAGATCATTCGCCAGCTGCAAGGAGTCGGCCAACGAGGTTATCTCCTGGGCGGATGGCTTCGGCTGCTTGTGGAAGTGCTGCTC:1 - chr3L 6791783 3' - G5A 2647 1 77.66 GCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGCTTCCTTCCTGCAACGTCCTGCCATGAGCTTGAGTCCTTCTGCACACTTGGGATCCAGGTTGAAGAG:1 - chr2R 17138668 3' - 3S18 8 2 71.29 ACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACATTCATGTGTACATAGCTACCCAATTTACCCCCAGCTCGACAATTACGGC:1 - chr2L 3978421 3' + 297 372 2 58.42 TATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATTTCTCGTTTTCAGTCAACTTTATGTTTAAACAAAACATATACGTTCTTTTGT:1 - chrX 16911305 3' + R1A1-element 4999 1 57.00 GCGCAGTCGGTAGGATACANAAGTATCCGAATTTAATTCCAAAGTTAACCATATCCGAATAGCAAATTTACTCTTTTGCAACAATGACACAAGTACACAAA:1 - chr3R 7864118 3' + 297 416 1 69.31 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTGAATTTAGGGCGTTTCCTGAGCTCATTA:1 - chr3L 7300508 3' - Doc 53 1 75.25 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACACCTTGTGACCAAACCACATGCTACAACCCATCAATTAGCAGCACACAGACTCA:1 - chr2R 21351307 3' + mdg1 395 2 59.41 CTGAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACAACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGAACGCCAAATTGTTAGAAATGCTTCGAATTTTG:1 - chr2R 6488078 3' + G6 1804 1 68.32 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAG:1 - chr3L 3596682 3' + copia 216 2 65.35 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTGGAGCTTACAATAGCAAAGTACTAGGCAGCGATTAAA:1 - chr3R 18549909 3' + pogo 2067 1 62.38 TTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTAGGTCTCTGGTTTCGGCTTCTTCTAAAATCTCCCTAAGTGTATTTTCCATTCTTTTTATCGTTTCTTGATAT:1 + chr3L 27396553 3' + S-element 1515 1 73.27 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTTCCGAGAACTGAGACGACAATGGCGACGACATAAATATCAAC:1 - chr3R 26252674 3' - 412 7086 2 54.46 CTGTTGGGTACATCCGGAGTATTTTTGTAGTTGTATTGGGGTGTATTACTCGGCGCCATCGTCGCTGCCCTCTTCTTCGTTCTCATTCTCGATCATGTCGA:1 + chr3R 12427922 3' - Idefix 86 2 59.41 GTTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAAAGCAACCGCAATTACTGAGCCAACCGCACAATGCTGCAAAATACCCGCCCGAAA:1 - chr2R 22749725 3' + Stalker 298 4 56.44 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAAACTACTCA:1 - chrX 21217500 3' + pogo 2074 1 53.54 ATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTATCCAT:1 - chr3R 15924602 3' + Quasimodo 7337 2 65.96 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATGGTTGGTACGACAGTATTC:1 - chr2L 14793476 3' - Stalker2 17 2 62.38 CACTCTAACGCCCACAAACCGCACAAAATGGGCCACGCCCCAAATGAAGTTGGAAAATTGGCGAGGGAGTTAGGAACACGGAGGAGAAATATAACGCAGAC:1 + chrX 9725358 3' + INE-1 221 1 77.23 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTG:1 - chr2L 19854096 3' + roo 9016 2 79.21 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTGTATGTGCCAACTAACGCTACCTT:1 - chr3L 13785385 3' - pogo 47 1 75.25 TCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAATGATTGTCGTTAAATGAAATTGACGACGAGACAGCA:1 + chr3L 3307408 3' - 1360 3291 1 64.36 ACCAAACCTCTCACTAAACNTGTGAGGACTTACTACAGCGTATGAGTGATTTTTATGGCATTTTTATTTGGTCCGTGGGACGTACGCCTCACTATAAGTAT:1 - chr2R 20718805 3' - BS 5005 1 66.34 AGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACAAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGAAGAGTAAGCAAACACACTCATTAAAAATGTTCGCTCCCCGATC:1 + chr2R 24379231 3' - Cr1a 260 1 76.24 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTGATTAATAAGCTGGGGAGGGCAATACTTCCCACAATAATATTTGGAAAGTTGT:1 + chr3R 4474249 3' + copia 233 1 56.44 GTTTCTATGTTTAAATTATTATGTATGTCCTCATTCCCAATGGATTTGCTCGTGCGTGTCGACAAGAATTTCAATTTGCAAACAATAAATTTGAGCAGCCA:1 + chr3L 10624150 3' - Porto1 4396 1 69.31 TAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATAATTTTAATTAGAATTGTTAACAAGGAAACAAAACCAA:1 + chr2R 24920094 3' + I-element 5093 1 66.34 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGGGATTTCAGTTTCATCATGGCCAGATCGTGTCGCATGG:1 + chr3L 7542000 3' - roo 8701 2 63.00 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTATATACTATATATATAGAGCGTGTTGGTTTCTATTCGTTTGCTATTTTTTGGCACAGTTTTTAATT:1 - chr3L 14818694 3' - mdg1 9 2 65.35 TCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATTTTCGGCCTGCTTTTCGAGGTAGAAGTCACGGGTTTCCGA:1 - chr2R 18380817 3' + F-element 249 1 59.41 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCACTTTACCAACAACGAGATTATAATTGTTTGATTTGT:1 - chr3L 12468217 3' - jockey 4709 1 58.16 CAGTGGTAAAACTCGACTGATTCTCAAATCTTATAATAGCTTCTTTGTTAAATAGTGTTTGTTTGTTGATTTTTACTGTTATTTGATTTTCATTTTCTTTA:1 + chrY 1908898 3' - gypsy11 360 2 81.19 GTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCGCTTGTACTTTTGACTGTTAATTAAGCACTTGGTGTTCGATCAATGTTTGATACGATTCGA:1 + chr3L 22736991 3' - G-element 20 1 60.40 AACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGGTGAAGAAGACCAGAATGAATTCGCGACGGATTGCTCTGGTCC:1 + chrX 15024709 3' + P-element 123 1 48.51 GTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACTAACAACAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTGCATGTGATACAAATAATCCAAAATACACA:1 - chrX 22689526 3' + 1731 296 1 60.40 ACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTGTGTCAGCTTTTAGAAAACTATTTATTATTAATTTATTACAATTGTGTGTATTTTTAACGCCTACAGGACTGGTG:1 + chr2L 15090885 3' + micropia 5046 1 78.22 AGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGATTTTATGTTGTTTTTTTTTTATTTATTTTTTGGAGCTGCTGCGCCTAGGCCTCGCCCACATTTTC:1 + chrX 14483390 3' - F-element 437 1 74.26 TGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGTGGATGCGGGGCACTTGGTGCCAGGTCTTAAGTACAAGCCCGGCATGACCGACTGGAAG:1 - chrX 4112427 3' - accord 6987 2 64.00 TTTAGACTTTATGCCAGAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGAT:1 + chr3L 19274885 3' - transib2 21 2 55.45 AAAAAGAAAAAAAAACACAAGGAGCTGCAGAGTAAAAGCCGGCGATCCGACGAACATGTAAATCGAAGCTCAAATGGCAGCCCAAAGGCAGACAGCGACCG:1 - chrX 7372856 3' + Doc2-element 223 1 79.21 TACTTGTGAAAAACACATTNTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGA:1 - chrX 20361970 3' + hopper 1383 1 58.42 TCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCATTAACCCTTTCGATACCAAATAAAAATTTAAAATTAGGTTACTTGTGAGCACTTGCAGTGCCATCGTACTG:1 - chr3L 822720 3' - R1A1-element 6 1 68.32 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCACTCCGGAAGCGGGAGCAATTGATGGCCCATCGGA:1 - chr2R 23519230 3' - jockey 4800 1 62.38 ACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACACCCAAAAGGCAAAATGCATGCGATTCGCTTAAATAGGTCCCATATGATTTCTAACAAAAGAGGGCAACG:1 + chrX 308811 3' + Stalker2 7273 2 78.22 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACTGTGTAATAGCCAAGA:3 + chr3L 27357647 3' - mdg1 6 2 73.27 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTCTATGGAATATCTAGTAGTTTTGAAAGCAGCAGC:2 + chrX 17883691 3' - pogo 38 1 68.32 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCCTGCCAGCGCGCTGGCGAAAGTGATG:1 + chr2L 10166039 3' - jockey 56 1 70.30 CTGGTTTGGACCACCCAAANACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTTTATGCTAGTTTG:1 - chr3R 7869093 3' - 297 7 2 73.27 ATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAATGGCCCTAATAATTTATTCGGAATGGATTGGATTGGCTGGGTTTGGTATGGTTTGGTTTTGGTTTTGGTTT:1 + chr3R 10774059 3' - F-element 4571 1 54.64 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTTATTGTTTGCAAAAGTTTTCACCTTACTCGGCGTCTTTGTAGTTATGTTTT:2 + chr3R 17660553 3' + roo 9046 1 51.49 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCCTTGTGCGTGAGCACAATTATTCA:1 - chr2R 13763194 3' + roo 9032 1 63.37 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGGTTTTTTGGCT:1 + chr2L 4063761 3' - roo 8693 2 59.41 ATCATATTTCTATTAGAAAATAATTGCTAAAGGACCGAAACTCCGAAATAGCGCCCGTCCCTCAAGCCTTTCTTAACTACTTTCAACAATTGCCGTTCCGG:1 - chr2R 4511939 3' - transib2 74 1 52.48 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCCTTGTGCGTGAGCA:1 - chr2R 13763204 3' + roo 9022 2 73.27 AATTGAGAACACGTGTTTTTCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTATATTATCTTCGTATCTATTAACAACCATGTATTGCACAAAAAACATT:1 + chr3L 785153 3' - blood 353 2 63.37 TAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGGCAGAAAGGGATGCCACGGAAAATTGG:1 - chr2L 12808175 3' + Tirant 8459 2 74.26 TCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATGCATACAGAACAACCATAACCACAAGAATTTCGGCCAAT:1 + chrX 6481083 3' + jockey 4952 1 64.36 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCA:1 - chr3L 16891112 3' + P-element 2837 1 22.77 ACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGAGGCCACGTAAGAACGCTCAGTTTCGTGTTGGCCGAAGCCGATACCGCTCGGCTAACAA:1 - chr3L 25515123 3' + invader4 2942 2 58.42 TTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGTTTTTTGTGACTTACTTAAGGG:1 - chr2L 3408638 3' - G-element 51 1 73.96 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTGTTTGGTCAAATGCAGAACG:1 + chr3L 2022314 3' - roo 8688 2 56.44 ACTCAAAACAACCGATTTTNTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATTGCTGTGC:1 + chr2R 9631753 3' - F-element 55 1 75.25 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAAGCATT:1 - chr3L 1586724 3' - Tirant 36 2 62.38 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTGCGTGTGTTCGTGAGTTCACACTTTTCTCGGGCGGGAAGAGAAGATG:1 - chr2L 16683704 3' + P-element 2857 1 51.49 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGAAAGATGTGTTAATATGAACTTATTTTCGT:1 - chr3R 19987419 3' - Doc 52 1 72.28 ATTCAAAGCACCTCTGATTTAGCTGAAAGTGTCGCGAGTGTCGAACTCAATTTATGTTAGGTTGTTAAGATACCTGCTTCAAATTCGGCTAACTGATAATT:1 + chrX 6755528 3' - transib4 168 1 58.42 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATGAGAAAATGCAAAGGGAGAACTACTACAAACTACATTTGGTTATATATGGTT:2 + chrX 13126283 3' - mdg1 7063 2 55.45 GGTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAATGAAAGGGGGCTAATGAAATTTTAGTCTGTGTC:1 + chr3R 2474301 3' + invader2 4653 1 66.00 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTGGATTGGTTGGGGGGGCGGTAGAAACCTGGTCATAAAGCACGC:1 + chr2L 6276098 3' + copia 223 1 57.43 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATGTGCA:1 - chr2L 12958926 3' + roo 9026 1 73.27 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGTTC:1 + chr3R 25370527 3' + BS 5045 1 72.28 AGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTATCCA:1 - chr3R 15924603 3' + Quasimodo 7329 2 69.31 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGTGGAAAATTTTCAAGCTTTTCCGCAGTGAT:2 + chr3L 5415391 3' - I-element 44 1 66.34 TAGGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTGATTAATAAGCTGGGGAGGGCAATACTTCCCACAATAATATTTGGAAAGTTGTACTACATTTTT:1 + chr3R 4474260 3' + copia 244 1 67.33 ATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTC:1 + chr2L 20328767 3' + opus 495 2 61.29 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTCTTTATATTTCAGTTTGTTTACAGAATGCGTGTCAGCCATAATATTTACTTTTATCCCAA:1 - chr2R 17644850 3' - mdg3 5270 2 52.48 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAAGTATAATCT:1 + chr3R 12876373 3' + hopper 1381 1 61.39 CGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACACTAGAATTGAGTTTAAATATACAGACAACCAGGAGCGGCGCACGG:1 + chr3R 28565329 3' + 412 7513 2 51.00 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAAATCCTTAAAGTTCCCTTTTATTTTACATATTTCGATTTTAATTTTCCCAGCTATA:1 + chr3R 17781637 3' + pogo 2085 1 63.37 AACAAAAAGGAAAAGAAAAAAAAAACTCAGGCCGAATCGAATGGCAAGTCTTCATCAGTTTACACAGAAAGTCAGAAAATGTCAGAAGAAAAAGTTGAAGT:1 - chr3L 12777232 3' + Doc2-element 254 1 76.24 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAACTGGATTATTTATATGAAAAAATCTATTTACCCAACATAAGAATAGTTCCGAAGAC:2 - chr3L 20758922 3' + flea 4999 2 65.35 GGACAAAAGTGGGTTTCTGACCAGAACGAGTAGAGAAAAAATTGCGGGTCTGTCGCATTTTTTACAGCCATCCTCCTTCATTTTTCCACTTTGCTGCCATT:1 + chr3L 11314798 3' - G2 367 1 78.22 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAATTACAG:2 + chr2R 10956954 3' + copia 5078 2 71.29 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGTACGTTAGTTATTGGGCACATATTGCAGATGGCCAGTATAAAATGATAAC:1 - chr2R 16160750 3' - mdg3 26 2 54.46 TAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAAGCCAAAGCCCAAACATAGACATAATTATTTCAGTCGCTCGGCGAGCCATACTACCCAAAATAA:1 + chr2R 19091691 3' - Stalker2 7249 2 70.79 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGATTGAGTTGATAGGCCATAGGAAATTATTTGTTATTCTCTTTT:1 + chr3L 12112401 3' + 1360 3357 1 59.41 GCAAACAAGGGGAAAACCCTTCGGCTACAGAACCTAGATATGGCGACTTCTATGGAGTTCTGTTCTGCAGCTCTGCATT:1 - chr2R 9835768 3' + X-element 479 1 56.96 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACGTAC:2 + chrX 11025582 3' + hopper 1393 1 57.43 TTATACGCGTTCTTGTCTCTTGTTTTTACTCACAACCTAACAAATCAGCTGTGAGTTTGGCGTGTGGAAAAAGTTTGATTGGGAACAAATCGGACGTCTTT:1 - chr2R 12757448 3' + 1360 3229 1 68.32 AGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACACACACCCCCCCCTCTGTATTATGCATTGCGTGTCAGCTACACTGTGT:1 + chr3R 30076054 3' + jockey 4588 1 53.00 GTAACGCTATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTGAACTATGTATGTAAACGGCAGAAAAATTCTTGGATA:1 - chr3L 26663363 3' + 1360 26 1 63.37 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTGTCTTAAACTAGTTGAAGT:1 + chr3R 27169466 3' + 412 7488 2 80.20 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTT:1 + chr2R 13653397 3' - F-element 59 1 68.32 GTTGTCGTATTTCATACACCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTGATTTGCCGAGGAAAGTGTGCCAAGCTCTCCTTCTGCACAGTTTCTGGGATCGCATTTCC:1 - chr3R 16559583 3' - gypsy2 6516 2 61.39 TGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTAGCTGCATACTGAATGAATGAGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTTCTTCTCTGCTGTTGTAACAAGAAAG:1 - chr2R 12741130 3' - Doc3-element 4571 1 79.21 CTCATCTCCCATGCGAATGATGTCCTGCCAGCGCGCTGGCGAAAGTGATGTTCCTTGTGTTGCATACTTTTAGGACAATAGGCTCATGCAATATTTGTGTG:1 + chr2L 10166090 3' - jockey 4 1 79.21 ATTCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAAAATCCTGCGAGCAATAACTGGTTCGCCTTGGACTGCGTAATGACCAGGGAGCAGGTCAGCTGGAG:1 + chr3R 6907289 3' + Doc4-element 2631 1 68.32 AAAAACGTCTTCACACGTCNGCGATCGAATTGATTAGTCTAGAAATTGATTAGCACTAGATTAGCACTAGAAATTGAGATGGAAATGGAATGGGCAAGAAA:1 - chr3L 17140586 3' - F-element 22 1 41.58 TTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTTCTGTCAGCGGCAGCAATTGTGCCTCTTATGCCACCCATCCCC:1 + chr2R 6918646 3' - accord 30 2 58.42 TTGTAGGTTGAATAGTATANTCCAACAAAAAGCAATAGAAAAGAACGAGATGAAAGGGAAGTAGAGGAGAAACTTTAAATTGACATCGAATGGCAAAAC:1 + chr2R 18733803 3' - copia 6 2 73.74 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGTATAGGTGCAATTAATTTAGACG:1 + chr3R 25021726 3' - roo 8712 2 80.41 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACG:1 + chrX 11025579 3' + hopper 1390 1 54.46 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTGCACTACTCACATATGTACACTTCAAAAATAATTAAAGTATTTAATAATAAG:1 - chr3L 21518971 3' - 1360 25 1 54.46 ACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAAGAAATATAAATATAAAAAAATGGCATGCAAGGGGGGATAGGG:1 + chr3L 22349286 3' + BS 5061 1 67.07 ACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGACTGGTTGCAATGATGACGTGACAACTTAAATTGATGCTAAGCTGGGAAAAACACTTCAAAACGAATTAGGA:1 + chrX 4241350 3' + Stalker4 6970 4 73.27 ATGTGGATGTAGATGTGGTAACAAGAGCGAACCACAGCGCTGGGAAAGATCAAGTGAAAGAGGATTACCCCAGTGTAAAAGCCTTTTTGAAGGATAACTTT:1 - chr2L 20025692 3' - gypsy5 2 2 59.41 TAATGTTTTTTTTTAATGAAAATTCGACATAAATTCACGTTTCATGTCTCTTTTAAAAAATTATTAAAACTTTTTCTTTAAACTAG:1 - chr3L 7558820 3' - pogo 2025 1 86.05 TTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTAATGTCCCCACATTAACAGAAATTTCGA:1 + chrX 13146992 3' - roo 8663 1 74.03 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTCTTTAGAGTGTTATCATTTGTGTCT:1 + chr3L 17701585 3' + roo 358 2 74.26 ATTTACGGTTTCCATGTTTATCTAGCACAGTGTGGACTCGCCGATAACGATAACATTGGTATTTGTATTTTTAATAAACAGGTTATCTAGAATATGTGTCG:1 - chr3R 12850315 3' - Cr1a 428 1 53.47 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATTTTTGAGCCTTTGAGCAATTGTTCGTTCGTTA:1 - chr3L 5710250 3' + Transpac 270 2 68.32 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGTGCGCCAGATCCTTAATCCCGCACGTTGGCCGTTTGTCGCGTGCAAAAATAT:1 + chr3L 13295294 3' - hopper 23 1 54.46 ACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAAGTCATTACCAACTTGTCCAGTTGACTGTTGTTATTGCAGTGTACGGTGTGTTGACT:1 - chrX 9171032 3' + I-element 4952 1 62.38 TGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCAATTTGTTGTTTACCCTCTTTCGGTTTTCCACATCAAAT:1 - chrX 15546119 3' + blood 7386 2 76.24 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTGCGTTGGCATTTATAGCTCAGTCCAGGAAGGACTCCTCCAC:1 + chr3L 13773952 3' - roo 35 2 61.39 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTGTTCGTTTCGACATTCAAACTGTCAAAAAGTCAGCA:1 - chr2L 18932172 3' - jockey 63 1 64.36 TGCATCGAGGCATTGTGCANAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATAGTATTCTTCAAAAGGATTAATGGTAATTGAACTTGGTT:1 - chrX 2530462 3' + pogo 2071 1 58.42 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATATCTAATATAGAACATATAAAGCTCAGAGGTATTTA:1 + chr2L 11478743 3' - opus 7039 4 73.27 TTTAAAGTTTTTTAGTTTTAAAGATGACGGCATTTCACGTAGTGACGAAGGGCACCATATGATATTGTAAGTCTTTTTTTTCAGCTGCATATTAAATTTAT:1 - chr3L 11336538 3' - 1360 3028 1 75.25 GATATTTGACATTAATGTGTTTTGTACGCTTGTGATTAATTGGATTCTTGGCAATACTCGAGCGATTGAAGGTTGACAATTTATTGACAGCTTCACTAATT:1 + chr3L 18208416 3' + frogger 377 1 61.39 TCAGATCGCGTTCGATATCTCTGATCCTCATGTACCACGGCGATCCATACCCATTACTCAGCTAGAGACTCGAGACAGTGCGAAGTAGAACTTTCAAAATT:1 - chr3R 4507813 3' - jockey2 3018 1 63.37 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCTTCA:1 - chr3R 27495654 3' + 412 454 2 60.40 TCACAACCACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATTTTTTACGCCCGAGTTTAAAATT:1 - chr2R 12812285 3' - jockey 60 1 69.31 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCCAGTTTTAGCCCACTGTTACTGTCGTTATCGTTGGCTTGGT:1 - chrX 21229279 3' - transib2 32 1 57.43 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGACTTATTTGAGATA:1 - chr2R 9871009 3' + roo 9015 2 82.18 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACATGCG:1 - chr3R 10110414 3' - Doc 25 1 52.48 TGTTTGGCTATTGTCTAATAGGTTTGCGGCGAGGCTCACTTGCGGCATGCTCGGAGCAGGCACACACGAGTATCTCCTG:1 - chr2R 8825773 3' - G6 1845 1 81.01 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCTTGTAATATCGAAATCAATGAGATTCG:1 + chr2L 9045457 3' - jockey 57 1 73.27 ATAATGTAGAACTAGAAAAAGAAGAACTATTATAATCTAATATAATTTATTCTTATATCTTTTATTTCTGAGGACAGTCGGGACTATACCAATTGATAATG:1 + chr2R 4514934 3' + transib2 2575 1 55.45 TACCCATTACTCAGCTAGTGTAAAGGCAAACGCGAAAGTTCATAATTTTTGTGGGATATTTAAATATTGCTTAAAGACGCTGTTTTATTATGCCGTAACAC:1 + chr2R 5967612 3' - INE-1 539 1 74.26 CAGTTTCTTACAAAAACTCNACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCCAACATGTC:1 - chr3R 8765539 3' + roo 9041 1 56.44 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCAATTTCTTTTTTAAGCTGATTTGGCCTGAGAATATTTGTATTTAGCCTACCGTGATTAAT:1 - chr3R 19448908 3' + roo 404 1 65.35 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACACATAGAGAGCATAATAGCCGGGATG:1 - chr3L 2176327 3' - roo 42 2 72.34 TGTGCAGGGTGGTGTTTCGCACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTTAATCGCCTTCCTTTTTTCAGGCTGAACGCTCCAAGAC:1 - chr3R 7472831 3' - X-element 4341 1 62.38 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTCTCTATTGTTGTACCCGATACCTAT:1 + chr2R 5720515 3' - pogo 62 1 53.47 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTAGCTCCGTTCTCCGAAGAGAGAGAGTGAACGAAGAGAGCGCAGGAAGAGA:1 + chr2R 18171585 3' - P-element 26 1 52.48 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAAAAGTGGAAAATC:1 - chr3R 14193903 3' - pogo 34 1 60.61 AACAATAATAATAATAATAATAATAATGAAAAGTGGGACTGGGGGGGCTTAATCCTTATAGCCACTTGTGGCGTAATTAAGGACAAAAATCGGGGTTGAGC:1 + chr3L 5411412 3' + mdg1 7060 4 66.34 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAGTAATGGATAAGCCGCATTCGAAGCAATTAATTATCAGTGTTTTTGCTTTCTTTGAGCAA:1 + chr3L 3242750 3' - diver 5905 2 48.51 ACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGGCAGAAAGGGATGCCACGGAAAAT:1 - chr2L 12808178 3' + Tirant 8456 2 77.23 GTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGAC:1 + chr2R 14997912 3' - McClintock 39 2 71.29 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGATTTTATAGCTCAGTTTTGT:1 + chr2R 22051529 3' + Tabor 7289 2 57.43 TGTGGGCATTGCCTATATTCAACATAGTCTTCTATACTATGGCAATAAAACGTATTGGGTTATGCAAAATGGATAAATTGAATTTAATTTTGTTAATAGTA:1 + chrX 22689636 3' - 1731 4315 2 73.27 TTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTCAATTTGATGAAACTAGTAGTCACTGCATAGAATTCCATAACACACATTAGTTTTTATGAG:1 + chr3R 31022023 3' + Ivk 5363 1 65.35 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCT:1 + chr3R 9088623 3' - hopper 39 1 64.36 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCGCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGT:1 - chrX 15546162 3' + blood 7343 2 71.29 AATAAATGTATACTTTATTAAATAGTTTTAACACTTCCATAAAAATACGTATGTTTTAATAATAAAAGCAACCATTTGTGTATTACATGAATTTCATCCAC:1 - chr2R 4727956 3' + Tc3 1510 1 75.25 GTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCTTAGCTCATATCATGTAGTCTCTATGTGCGTTAAATTAGGACTACAATTTCTTAAAAATATAAA:1 - chr3L 15356201 3' - hopper 975 2 68.32 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGG:2 + chr2L 18248039 3' - blood 46 2 75.25 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGAAACCATATTTCCTCAACCTCATGATGTTACGATGAAAATA:1 + chr3R 27056452 3' - jockey 27 1 58.42 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCTTTTATGCCAGATTTAAAAACTAAGGGCTTACTTTAATATAAAAGCTAGCATCTCGCTTAAAGCGCTGTACTATT:2 - chr3L 11755651 3' + roo 408 1 66.34 AATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTGTCGGCGTGGCCATGTCAGCAGCTCGGTTTTTGTTTTCAAAACTGTGCAAGAGTTTGGATCT:1 - chr3L 18734556 3' + roo 8735 2 59.41 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAGTGTGTTTATGCGT:1 + chr2L 7666169 3' + roo 9037 1 61.00 GCCTCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTGAATGAGACGCGGAGGCAGCAGAAGGCGAGCAGGCAAAGGCGACCGATGTAAAAGTTCTTCGTGCGGCGCGT:1 + chr2L 11808209 3' + rooA 182 2 77.23 AGTTTAGAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGAAAAGTTGAAATGTTATTTGAAATGTTGCAGGC:1 - chr2L 12882736 3' - hopper 32 1 55.45 CGATGTTGAATGTTGATGTTGATGTTGATGTGGATACGTCCACCTGCCCCTCCTCCTCATCTTCAGTTTGGCATATTCCTTTGGCCGCTTTTGCCCCTTGC:1 - chr3R 31363654 3' - gypsy7 325 1 68.32 AAAACTAGAATAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGC:1 - chrX 4166376 3' - I-element 5318 1 49.50 ATATGTCAGCCCGACGGCTNCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACTTCATTCACCATCCCCGCTAGGTCAGAATTC:1 + chr3R 26252727 3' + 412 446 2 71.29 CGATGCAGCTAACTTTCGATGCAGCTAACCTCTGCAATTAAATGAGTTGGCAACGCCGGCAAGTACAGTTTACACAAAACACCCGCTAATACGAACTTGTA:1 + chrX 13834475 3' - pogo 20 1 76.24 AGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCTGATTTCAGAGAGGGTCACTTCAGCTTTTGTACCTTTCAAAACAATATGCAATCC:1 + chr2R 3066147 3' + Quasimodo 7162 2 59.41 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAAT:1 + chrY 2720339 3' + 297 348 2 79.21 ACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCGCTTGTACTTTTGACTGTTAATTAAGCACTTGGTGTTCGATCAATGTTTGATACGATTCGAAAGCTA:1 + chr3L 22736997 3' - G-element 14 1 66.34 AGGAATAGATCTGGAATGTGCACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATGTAACAGCCTTCCTCGCCGAACCGAATTCGGTTTGATTAACATTTATTCACA:1 + chr2L 6492976 3' + mdg1 7364 2 58.42 CTCCCGAAGACTGTGGAATNCCGAATGTGACCGCATCCATTACTCAAATTTTATTAAACATCCAACATCAACAACGGACAACTAATAAACAAAGCGGCTAA:1 + chr2L 126576 3' - Doc 8 1 69.31 TGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATG:1 + chrX 18326232 3' - Doc 223 1 61.00 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGTTAGTTTTGTTTGATAAATATGCATTTATA:1 + chr3L 872765 3' - 412 46 2 68.32 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGA:1 - chr2L 20560347 3' - F-element 56 1 68.32 TTGCAAGCATACGTTAAGTNGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACCTACTTAAATATGTCGAAAAGTGTGTCATCGA:1 - chr3R 24767805 3' + P-element 2845 1 35.64 GCCCCCAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTTTCAAAAAATAAAGAGATTCTTGGCGAGGCGCTTAGAAAAGCCGTCAATCAACATGTGACGATGAACG:1 - chr3R 1994913 3' + X-element 383 1 68.42 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAACAAAGAGCGGGAGAAAGCTCTTGAAGAGCAG:1 - chr3R 14580310 3' - blood 46 2 71.29 AAAAAAATAAAATAAAATAAAAGCTTTAAAATAATTAAGCAAAATAAATCGCATGTCTACCCAAAACCAATAAAATGGCCCTAACAAAAGTAACAGAAACA:1 - chr3L 18922709 3' - transib1 1901 3 73.27 ACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATATTAATTATATATCAAATAGCATGCATAGATTGACAAGAAA:1 + chr3L 19089661 3' + invader1 3980 2 61.39 TCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAAAAAAAAAGAGTCATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTCGGTAATATAAATAATATT:1 + chr3R 556479 3' - Juan 4110 1 59.41 AATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGATCGCCCGGGCAATTAGTGCCGGTTAAATCTGTAGGGCT:1 - chrX 18778741 3' + hobo 2575 1 61.39 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATCGCTAGTGGCATTTGCGTA:1 - chr2R 18432085 3' - 412 7108 2 83.17 ATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATTTTGAGAGAAACCCTCGATTCGGGTCC:1 + chr3R 10741153 3' - 1360 3354 1 42.57 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCAGTTTACTAGACTACAAAAGTAA:2 + chr3L 14222508 3' - roo 53 2 76.24 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGTAAATTGGGGAATTCTAATCCACAAAGAATGTGAGGGATGCCCGCT:2 + chr3R 5691020 3' - FB 31 1 57.43 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTCGACTGGGTCCCGCCCACCCCCGGATTCGACTCCCC:1 - chr3R 7139237 3' - pogo 35 1 60.40 TAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGTAGAATTAGTTGAAAATGTATAAACAGATTGAAGAAATTTGTA:1 - chr3L 5479002 3' - 3S18 35 2 58.42 GTTTAGTATTGTATACTATNTTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATG:1 + chrX 3431953 3' + Ivk 5355 1 49.50 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCGTTGAAAGCAAGTCTTTTTGCATAGCATACATTTGGGGGCCTCCTTTTCTTCCTGTTCATTTGCGCC:1 - chr3L 13895336 3' + hobo 2932 1 70.30 GCCCGACGGCTGCCATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGTTCGTCATAGGTGTAT:1 - chr3R 30553557 3' + 412 7507 2 59.41 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGCACC:1 + chr2R 6850490 3' - roo 8714 2 81.19 GCTCCAGAACATCGCCCAANAATATATGGAAAGGCCTTTGCCCAAACTGCTTAAGAAACCTTTCACAATGCCAGCCACAATTTGCTTAACAAAAAACCTTT:1 + chr3R 30075180 3' + jockey 4630 1 69.31 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATTTTCGAATGACCCATTGTGAAGCTCTCAC:1 + chr2L 5927024 3' - 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Quasimodo 22 2 58.42 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTCATGCTATCCTGCTTTCCGA:1 + chr3R 23543020 3' - 412 7084 2 59.41 CGTATAAGTGTGCGTGTTTNGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCT:1 + chr3L 19350011 3' - 1360 3214 1 44.55 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGAACACCCAAATACGTCACTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTCCTTCGACTACTTGTGG:1 - chr2L 8622758 3' - 297 28 2 64.00 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCC:1 - chr2L 9045436 3' + jockey 4943 1 75.25 GAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGTGAATGAAAACGAGAAATATCATAAATTTTCTAGGATTTCGATAGATATTGGGGAATGTGGG:1 - chrX 23078688 3' - INE-1 558 1 80.20 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGC:1 - chr3R 4971417 3' - F-element 48 1 70.33 ATTGTTATTATGTTCGTATNTACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTTAAATGACGCC:1 - chr3L 25059049 3' - mdg1 7044 2 73.27 AGTATATTGAATATATTTCTTATCCTGTTTGTCTTGTAGTAGTGCCCACTGTTCAATAGCTGCAGGGCAGTTGATTTTCGGATCGGCGTGGTTCGGGGCAC:1 + chr3R 16091222 3' + Tc1-2 1599 1 79.21 TAATATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTC:1 + chr2L 14762022 3' - 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roo 8665 2 77.23 GGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAATTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAA:1 - chrX 3464219 3' + Transpac 306 2 75.25 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGACACATGTGCATTATTGTTGCCTATCTGGCGGACGTTCT:1 - chr3R 28565267 3' - 412 36 2 62.00 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTTGTACACACAATATTTAAAACGAGTTCTGGGAATTAACACGACAAAAGGAGTGGAGAAAAGGTTCATAGT:1 - chr3R 16601405 3' + roo 404 1 76.24 CTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTACCAAAATTAGTAATAGCATATAAATTACCCAAGGGCCAGG:1 - chr3L 13569741 3' - invader3 37 2 58.42 CCAACTCCGCCCCATTTTTTTTTTTGGGCAAGAGACATTGAACTCGAAAGTGTGTGAAGGCATTTTATTTATTTGTTTCTGTTTCGGTTTCGGTT:1 - chr2R 18317355 3' + hopper 130 1 85.26 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCT:1 + chr3L 18418883 3' - hobo 54 1 76.24 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAAATAACAGCGACTAAGGCTAATT:1 - chrX 12472551 3' + pogo 2051 1 78.22 TAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTGCAAGAACTGGAACTGGGGAACAACACAAAAAAAAATTGATTAAAAGTCGTACAAAACTAA:1 + chrX 19080287 3' + Quasimodo 7036 2 63.37 CGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAA:1 + chr3R 1977619 3' + micropia 5408 2 55.45 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGGATGTAAGGGGCTACATGACTATATGGGATAATAAATGTTAAAGTGTAGGAGGATAGCAATCG:1 - chr3L 1697691 3' - Transpac 4943 2 50.57 TCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAATGTGCAGGCACAAAACGTACAAATCAGGCAGCT:1 - chr3L 18762074 3' + pogo 2096 1 62.32 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCA:1 + chr2L 12866939 3' - mdg1 7085 2 72.28 ATATTTCCAAATAAAATCANTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCATTCTTAGTCTTATCAAATCGTTCGGC:1 - chr3L 14222475 3' + roo 9024 2 74.26 CAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTACCAAATTGAAACTGCAAAATCGACTGCATAAATCAGTCA:1 - chr2L 6888297 3' - 297 6806 2 61.39 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCAC:1 - chrX 21217512 3' + pogo 2061 1 66.00 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGGTTCTTGGCGAGGCCAAATTTATGTGTGTTTAAGCAACGAAGACCGT:1 + chr3L 13785453 3' + pogo 2073 1 59.41 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTACCTATGTACACATGGGTATATATTTTGTGTAGGCCCACCTACGCAATGCAATTAAGCCAACTC:1 + chr2R 10014882 3' + flea 5005 2 69.31 CAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAG:1 + chr3L 8039398 3' + hopper2 1563 1 69.31 TGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGTATATTTTGGCTTTTTTGGCTTATCGCGATGGTCATTTAAATACACGTAGGAATCG:1 - chrX 10583403 3' - invader4 2921 2 62.38 ATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCAGACCCTGGCTATTAACTGGAATACCT:1 + chr2L 19621617 3' + Quasimodo 21 2 73.27 CTCTGAGCTATTCAATATCNATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTACACAAAAAATAATATAAGACAACCCAGATTTTAACAGTATTAGAA:1 - chr2R 19091602 3' + Stalker2 372 2 56.44 TGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTTGAAAAATATACAAATATACA:1 + chrX 7904712 3' - F-element 68 1 86.14 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTAAAATGATTACTAAATTGATATCAGATTGGCAGATAATAGCAAATTGAA:1 + chr3R 19949371 3' - mdg1 28 2 53.47 CTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAA:1 - chr3L 27356078 3' + Tc3 1684 1 68.32 GGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCTTGGTGTGTGTTGTCATGTCATGGTATTGGTATAAGTGGTTATTTGTGTCGGTGCG:1 + chr3L 6951664 3' - R2-element 3135 1 59.41 GAAAAATAATGCAGATATCNTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAATATATTTTTAAATATTAAAATCAAAAAA:1 + chr3L 20584070 3' - pogo 43 1 75.25 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAATGAGGAGAGTTGAAACTCTCTGCAGACTTGCCTTATTTGGCTGCATACTGTAGGGCGCTCTCCCG:1 + chr2R 12252917 3' + jockey 4984 1 49.50 AAAAACTCAACGAGTAAAGNCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCCTCCGGTGGCCAGCTTTTGGGTACAGCTTCC:1 - chr2L 17994129 3' + roo 9052 2 62.38 TGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGTGTATATGTGTGCGTACTTGTGTTAGTGGGTGTGTGTGCGTGCAAGAGTGGGTGCGTGTGCAGACTTACCGTAATA:1 - chr2L 3862819 3' - 1360 3239 1 58.42 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATT:1 + chr3L 2176360 3' + roo 9031 1 75.82 TAATAGTACGCTAGTCAATTAAATAAAATAATTTCGTTAATAAAATATCATAGTTTGATTGATTTTAATACCTTTTTTAACTTTTAAATTAAATACAGGG:1 - chrX 16723940 3' + jockey2 3366 1 56.00 ATTTCTAATACAAAACGTTTTCTTCATGTGGAAAGGCACCTGGACAGTCCGTTAAATTACATAAGAGCTAAATTCTTTGAGCTTGGGCGGTAGGCGGTCGA:1 - chr3R 18706552 3' + FB 484 1 92.08 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTAAGCATCTGAGCGGCCTAAAACTCCCCTGAGAAGTGCACTACAT:1 - chr2R 10372111 3' - mdg3 31 2 54.46 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCGCCTCCAAAGAGAAGGCGGAAGTT:1 - chr3L 13773871 3' + roo 9055 2 62.38 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAA:2 - chr2L 19854092 3' + roo 356 2 80.20 AACACAAAGACAAAAAATGCAAAATACTTTATATATTTGTTTAAATCGGATTTAATCGGAG:1 - chr3L 20401426 3' - Cr1a 191 1 73.77 GGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTG:1 + chr2R 14997910 3' - McClintock 35 2 71.58 ACACACACACACATACATAAGAATCGAGAGTGGGATCCCCCATAAAAGCCAACGTGAAACATGCAACAAGCTGGGTCAGGAAGCGGGCCAAAAGAAGGCCA:1 + chr3R 18954416 3' + Quasimodo 41 2 65.35 TGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGTGCTCATTTAAATGTAGTTACGCTGAAATTATCAATTAACAAAGTTATATCAAATATTTTCTTCCATGGTTA:1 + chr2R 16467939 3' - F-element 4302 1 73.00 CTTCTTATTGGGGATTTTACAAGCCAATTAAATTGTTTTCGCCATAAAAATGTGCAGCTACCGAGAAAAGAAGGCGGTTGTGGTGGGGTAAAGTTTCCCGA:1 - chr3L 13190060 3' + roo 409 1 75.25 AAAAATATATATATATATTTCAATACAATTTAGCAAGCATATACACAACATGTGGCAAGAGAATTGCCATAATAATTGCCACTTCTTTTTAACTGATTTTT:1 - chrX 14325081 3' - copia 4659 1 78.22 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAA:1 - chr3R 14193915 3' - pogo 48 1 73.27 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGTATTTACCTGTAGATTGCGCAATGATAAGTCTTGGTTTTCAAA:1 + chr3L 16546857 3' - pogo 30 1 57.43 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAAATTGTGCACATTT:1 - chr3R 10087807 3' + roo 9055 2 62.38 CCGAATATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCA:1 - chr2L 22092970 3' - INE-1 551 1 53.47 TGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAGTTTATCAATTTTGTAAAATAGTTTTCAAAA:1 - chr2R 25203752 3' + 1360 3375 1 65.35 TAGTACGTACGTACATACATATGCATTGATGTACAAAGTTGCCAGCCAAAATATCACTCTTAATGTCGAAGAACCCAAGCACATTTAAGCACTACGATGCC:1 + chrX 19823294 3' + 412 7277 2 68.32 ATCTTTGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAGACCGGTTCTTTTGG:1 + chrX 17559056 3' + Ivk 17 1 68.09 ATTATTATTATTATTATTGTTATTGTTGTTGCTGATACTGTTGTTGTTATTGTGGGTATTTTCAATGCTGAAGATCTTCCCGAGGAGCCCAAGAAGCCTGG:1 + chr2L 875407 3' - mdg1 21 4 69.31 AACCTCATGGAAATAATAAGAACCATGCACGCACGTGGAGCTACGGCCCATCTATAACTCGCGCACGCCCAATATATTCCTATCACGGATGTTGATGCACT:1 - chr3L 27382279 3' + invader4 422 1 66.34 TGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAA:1 - chrX 4166396 3' - I-element 5338 1 71.29 GACCATATATAGTATATATATTCTTGATCAGTTTCAAGCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTAGACTATGGCATTCTCTCTTGTT:2 - chr2R 3143646 3' + INE-1 57 1 56.44 AAACAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTAAAGCATTCTCTCTTGTTGCTCTAACTCAAATCGAATCTCAGATAAGATCTGTAGTT:1 + chrX 14815122 3' + INE-1 540 1 70.30 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGT:1 - chr3R 7869125 3' - 297 39 2 64.36 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCAAAACAAATTAAACTAATAATAGGAAGCGT:1 + chr3L 7099662 3' + roo 9050 2 56.44 TAGTGTGGGAAATGGAGTTNCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGATCTCCCATCTTCCATCCCCCGGCGATGATGAAAAATGTGCATATTTAACGGATGAG:1 - chr2R 16310602 3' - 297 6512 1 65.35 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGAATAGAGTTTCTGGCTTTGTCGCGTATATTCGTGAATTTATGGCTCCCTCGGCTTAATGAG:1 + chr3R 13353285 3' - 1360 16 1 59.00 TTTTTGTTTTTTTTTTTATGATACGTACAACGTTGGCATTCGCATCATCGTTTAAATCTTGCACATATGTAAACACTCATACACCACAGCATACATATCTA:1 + chr2L 12312148 3' - R2-element 3583 4 62.38 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAAATTCCAATTTAGGCGTTCATTTAGGAGTA:2 - chr2L 14761972 3' + mdg1 7414 2 68.32 CAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAACGAGAGAACCATTTCCGTGGAGAGAACACGATTCGGTGTATTTCCCTCACTTCGCAGAGAGAGTTTTCCCCAC:1 + chr2L 14410684 3' - hobo 352 1 72.28 GCGCCCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCAGCAGCAGCTAAAGCGCCCAGAAGCCAGCGAAACATGG:1 - chrX 8087104 3' + F-element 371 1 62.38 GCTGATAGCAACGCTTCTANTTCGACCATGCATTCATTTGTTTACTCTCCGGCCTCTGACTTTTCAAGTACTAGACATATAACGATTATGTGAAGCCCACA:1 + chr2R 7720277 3' - Chouto 5967 1 69.31 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGGTGTCAATTCGTTCCAGTCGCTTATCCACCTT:1 + chr3R 21884230 3' + mdg3 5480 2 56.76 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTTTAAAAAGAACTTCTAATGAAG:1 + chr3L 10474212 3' + copia 227 1 57.43 TGTGAAAAATTAATAAGGCAATGCTTGTTGATAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGAGGAATTTGTAGTATGCCCTGC:1 + chr3L 23061379 3' + 1360 435 1 77.00 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTACAAAGGTTTAGTCATCCAGTCATAATCATAACGTTATCATAGATATATGAAATATAG:1 - chr3L 20411774 3' - roo 16 2 61.39 GTTAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATGTGAGTATAAAAACATATGTATATTTTTAAAACCACGCTTATAAGAGGTTTTCAAAT:1 - chr2R 12257214 3' - jockey 4860 1 58.42 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACC:1 + chr3L 20411856 3' + roo 9037 1 60.40 CGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAGGGACTGCAGGACTACAGGACTGCA:1 - chr2R 23516951 3' + invader3 267 2 61.96 GATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAA:1 - chrX 4166391 3' - I-element 5333 1 66.34 TAAAAATTATGATCTTATTGGAAAAATTGGTTATAATTCTTGCTTTTGTTATACATAACATTTATGAGATCACGCAACTTGCTTGTTAGCTTACTAACTTG:1 + chr3L 15124386 3' - Juan 3768 1 46.53 TATCAACCTTCCACATAACTATATATATGGGCAATATGTACATTAGGAGATTATTTTATGGTCGCTTTAACGATTATTGGAACCGTCAAGCGACTCGAGC:1 + chr3L 11829132 3' + Transpac 311 1 78.00 TCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTGCCTCGCTTCGCATTTCATTTGATT:1 - chr3R 23543183 3' - 412 193 2 75.25 ATTATGTTCGTATATACTACACCGCACGTTTAATGCCTCCACAAAAGCAGAGGGAAAAATAATACTTAAATAAGGAGGAACAAAAT:1 + chr3L 3650126 3' - mdg1 7038 1 75.58 ATTCTTGATCAGGTTCAATNGCCGAATCGAACTAGCCATGCCTATATGAACGCCTCAACCCAGAGCCGGTTTAAACCGTAACGGAAACACGGACGCGAAGC:1 - chr2R 25032443 3' + INE-1 86 1 68.32 CTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAACTTTATGGCTATGGAGAAACTGAGATCACTCGAACGGGCTTGAATGGTTTCAGC:1 + chr2R 10130634 3' + F-element 4651 1 50.50 TTCCTGGGCTGACTCAGCGTCGTCGACTCAAGTAATTTCATTAGTTGCATTTTTAAGATGCACCCGTGGATGCAATACCTACTTATTGCGGATATCCCAG:1 + chr3R 14377213 3' - gypsy10 5723 2 82.00 GCTTACATTGATTCCGCTGATGTTGCTGAAGCATGCATCAGCAACATCAATGGGATGTGTAAGCCTTTGACTTGCCGGGGGGTTGCCTCGCGGCACTCGCT:1 - chr2R 6578321 3' - 3S18 5854 2 75.25 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGCATACTT:1 - chr3L 21144041 3' - jockey 33 1 52.48 TCTAGAAGTCGTGAAGAATCGAGGGCTGTAAGCTCGAAAAGCTGAAAATTTGCTCATGGTTTCGGGTTTAGCGGCGATCCGATGATGGCGTGCTTTGGCAG:1 - chr2L 23310077 3' + Tc1-2 1235 1 71.29 TCTGGGCCAAAATACGGAGGGCACAAAAACCGAATTAATCGCGAGGCTGCAAGACAGCTGAATGGAAAATGACAAAACACGACTTGAAATTTGACGTGCAC:1 - 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chrX 16499624 3' + P-element 26 1 72.28 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAAATTGTGCACATTTCTGA:1 - chr3R 10087803 3' + roo 9059 1 66.34 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCATTCTTAGTCTTATCAAATCGTTCGGCGACGTGTATAGTTAAGG:1 - chr3L 14222458 3' + roo 9041 1 58.42 GGTTTGCACTGTGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTAGCATTTTTTTGTTTTAGATGTCCGTGCTTCAGCTCGTAGATTGAATAAACTGTGAGTAAAAT:1 + chr3R 30637183 3' - diver2 88 2 41.58 CCTTAGTCAACTGACGGGANATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGCATCATCGAA:1 + chr3R 7869185 3' + 297 6940 2 63.37 ATCGAGGCATTGTGCAAAGNACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGAAATTGAATTTATCACATGTTATGCGTTTGCACATGTAGTGGTGTT:1 - chr2R 17420824 3' + pogo 2074 1 53.47 AGAATGTAAATAAAGATAANGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGCATATAAGCCGTATCTATAAACAAAGCGAAAACCTTT:1 + chr3L 16563278 3' - 3S18 5806 2 61.39 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGGTATCCTTGCTACCTGCT:1 - chr3L 6023294 3' + hopper 1375 1 66.32 GGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCGTTGTCATCGGCAATCTTGTGGTG:1 - chrX 16486715 3' - jockey 4664 1 76.24 TGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTGTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCGAAATTTAAAAGAGATGATCAGGTCTTTCCTCCTTCTGTCTACTTTTTAATTGCA:1 + chr3R 9365871 3' - Porto1 4207 1 52.48 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGTACATATATATTATGTATTACAT:1 + chr3R 12468318 3' + copia 238 1 73.27 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTTTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAAT:1 + chr3L 9928579 3' - roo 8707 2 77.27 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTATTTTAAGAGATTTAAAATTATGAAATATTGTAAAAAACACGAAACT:1 + chr3L 15037988 3' + roo 9044 1 58.42 CTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTTTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTG:1 - chr2R 5214982 3' - F-element 54 1 68.32 TTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTATGTATGTCACTGCGTATTGCT:2 + chrX 18326255 3' - Doc 201 1 59.41 AAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTG:1 - chr3R 31887759 3' + HB 1557 1 68.32 ACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGGGCACAATAAACTAAATCTCCAGACTTTAAGCCTGTTTAGTTGACTTTCGCTTTCGACTCGAAATTAGTT:1 + chr3R 22518177 3' + Cr1a 350 1 75.26 TACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGTCAGTTGGTAGCCTCA:1 + chr2L 15531865 3' - Stalker2 7276 2 54.00 GGTAAAAAAGTACCACCCTTGCAGTTCTCTGACCGCCACCCCCTCTCCCAAATGTGGGTCAGTCAATAGTAAAAATTCTTTCGCATAACACGAACTGCGAC:1 - chr2L 4924492 3' - hobo 10 1 65.35 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACA:2 + chr2R 9631744 3' - F-element 64 1 85.15 TTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACACATAGAGAGCATAATAGCCGGGATGCCCGACTTTCCCCCGCCGCTTTTCCTGCCATTTTCCCTGGATTTTTCTC:1 - chr3L 2176279 3' - roo 8663 1 78.00 CCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTAGTATATTGAGATCTAGTCATTGACTAGATATATTACGTAATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATAT:3 - chr2R 2745194 3' + Stalker 6777 2 77.23 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAATGGCACCCTTTATGCAATGCTATATGTAAAGTGTGTTGTTCTCCTCA:1 - chr3L 19598095 3' - roo 8720 2 58.42 GATGAAATATGACAGGTGACGTTTCCCATTCTCCATACATTGCGTAAACCGAATTTCAGCTATTGGACAAGGGCGATGAAAATTAAGGTTTTTTAAGTCC:1 - chr3L 9660473 3' - mariner2 766 1 55.00 CGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGCTCTGATTAGAGAGCAAAAAATAACAG:1 - chr2R 13383523 3' + gypsy5 7308 2 69.47 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTG:1 + chrX 19034183 3' + hopper 1384 1 54.46 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATTTAACTA:1 - chrX 13146916 3' + roo 9040 1 58.59 ATTAATTTTTGTAAAAAAANCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGTCTCATTGTCAATGTCGCCTTAAATTATGCCACAAAAAATGGGGCTGGGTGGCGG:1 + chr3L 6023362 3' - hopper 20 1 59.41 TTGCATACTTGTGAAAAACNCATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATT:1 + chr3L 8039406 3' + hopper 1378 1 61.39 GAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAATAACACCATAATCAAGTTTCTCAGAATTCCAAGGCCCCACGGCTTTTAAAAGTGACAAAAAAGTG:1 + chr3R 6792008 3' + X-element 425 1 70.30 ATTATTGTTATTATTATTATAACTCTAAGAAACCAGCAGGTCTTAAAAAATTGATAAACTAAGCGCACAATCAGGCCCACAAAATCTATCAAAAGTATACA:1 + chrX 21111323 3' - mdg1 7059 2 68.32 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCAAACATTTTTGAATTCAAATTTGTCCAACAGGTTCCGATGGATGTTGACGAATGTCGCCGTAGAGG:1 + chr3L 163307 3' - mdg1 7048 2 69.31 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGACACTTATTCGCACTTATTATTGCTCTATGCGTTTTGCCTTTCAGTTTTATTATCT:1 + chr3R 10087902 3' - roo 21 2 58.42 CTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTTTTTTTTCGGTAAAGAACTTCGGCCCTTAGTTTATAGATGTGGGAACCGTTGCGAGAGGGGCTGGAAAG:1 + chr2R 3288581 3' - Idefix 297 2 73.27 CAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTTTCATCATAAAATCATGCACAATGGCAATGATGACATTGAC:1 + chr2L 8622835 3' + 297 366 2 57.43 TAAATAAAATTAAATTTAATTATATTAACAATACCAAATTCATGGAATACTTTTAAAAGCATAACAAAATCCAATATTTTTAAAATTATTTAATGTACTTT:1 + chrX 21505837 3' + TAHRE 42 1 67.33 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATAAGATAGAGACTCCAGATGTTGGAATATGACTATGAAATAGTATACAA:1 - chr3R 1849158 3' + Tabor 7294 2 52.48 GGTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACTAACAACAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTGCATGTGATACAAATAATCCAAAATACACATTACAC:1 - chrX 22689520 3' + 1731 302 1 66.34 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAATGTGTTTTTTTTTTTGTT:1 + chr3L 16434915 3' - pogo 48 1 83.33 AAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGC:1 - chrX 4166376 3' - I-element 5318 1 51.49 CCTTATATGTTTTTCCTTCCTTTCTAAGCTTAAAATTTAACATTCTTTTCTCCTGGGAGCAGTGTTGTCCTCCACCCAACTTGCTTTTACCTGTCGCCACT:1 - chr2R 25097550 3' - HB 408 1 71.29 CGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGGATAGGATAGAAGTAGAAGTAGTGCACATTACTCATACGCCGCGTACATAAATTTTCCACCT:1 + chr2L 19646615 3' + R1A1-element 5050 1 68.32 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATGT:1 - chr2L 12958929 3' + roo 9039 1 71.76 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACAAAAAGAA:1 + chr2L 17079894 3' - jockey 4810 1 54.46 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTACAAGCACATAAACACAAATACATACTAATATGT:1 + chr3L 14594168 3' - hobo 43 1 71.29 TATGTATGTATGTATATACTATGTATGTATGTATGTATATCTATATATTTACTAAGTGCTATTATACCTTAATACACTTTGAGCCGAGAAATCGATTTAG:1 - chrX 9442889 3' - INE-1 65 1 65.00 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGGCAGAAAGGGATGCCACGGAAAATTGGATTTGGGGTCC:1 - chr2L 12808164 3' + Tirant 363 2 63.37 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTAAAACTAAATGCCGACCGACGCTGTCAAAGGCAGAAAAACGTGAAGACGAGCGGCGACT:1 + chr2L 17240131 3' + copia 229 1 65.35 ATATTTAATGGCATTGGATACCATTTTGGAAAACATTCAAGGGTTTTTTGAATGTCCCTTTATGTTTTTCCTTCCTTTCTTATAATCCGGGAAACTCCGCA:1 + chr3R 4186805 3' - HB 464 1 81.19 TGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAATATACAAAACCTGGGGCTTCAGTTACTCTTTAATAGTCTTGTCCTTGCAC:1 - chr3L 20325462 3' - Idefix 238 2 55.45 AAAAAAAATAAAATAAAATAAAAGCTTTAAAATAATTAAGCAAAATAAATCGCATGTCTACCCAAAACCAATAAAATGGCCCTAACAAAAGTAACAGAAAC:1 - chr3L 18922710 3' - transib1 1902 3 80.20 ATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGACAGAAAAGTGAGTGTGGGCAGAACGTAAGTGTAGGCCACAAAGCACGCAGAACATCATCGC:1 - chr3R 7686350 3' - blood 7191 2 76.24 GTGTGTATGTGTGTGCTCATGCAACAATGGAGGAGGCGATGGGGCCGAAGGGGGCGTGGCAAAGAGGGCTAAACGACAAAAGCTGACAAAG:1 - chr3L 15865252 3' - accord 179 2 78.02 ATTTATTTATTAAGGCATANAGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGTTAGCGCTTCGGGATTTTTGGGCG:1 + chrX 19124062 3' - X-element 4705 1 79.21 GGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGGTCTGTCTGGATGGGTGAGCCTTCCTCACTTGTTTGTTGTAAATTTCATTTAGATGTGCAATTAAATTTTA:1 - chr2L 15206227 3' - F-element 432 1 76.24 GTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAAAGCTTTTTCTCTTGTTTTAATAAACATAAGAGTGCTTATATTAGTTTCCTCAATTCGTATATATGTGATGCCA:1 + chr2L 178518 3' + INE-1 551 1 91.92 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAATGTTGTGAAAATTGTCTCTCCTTGTACTTTTTCAATTACGTTATCCATCTGAACTATT:1 + chr3R 1446199 3' + roo 9054 2 43.56 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAA:1 + chrX 21217560 3' - pogo 47 1 74.26 TAAATAATTTCGTTTAACAAATTTAATAAAAAAAGGAAACATAAATGTACACACTTTTCGAGAAAATATTTTATGTATATATTTTCGTCTCGGTCGCACTC:1 + chr4 625943 3' + jockey2 3390 1 78.22 GCATCGTAAAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTGAATCACAAAATCGGTTTCGGATTACACAAAGAGTGCGCGCACACCCGATCGCGTCGACGATTGG:1 + chr2R 5395190 3' - Doc2-element 115 2 73.74 GTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTATATGGATAAAACAACGTTGAGTGCCAAGGTCCGCAAAATGTTTTGAC:1 - chr3L 3892573 3' + copia 160 2 56.44 TAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAACCCAACCTGGAGAACAAGCCATAAACTCACAAACAGTCACGAGCTGCGCC:1 - chr3L 5718098 3' + Transpac 480 1 64.36 AGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGTTAAGCGCCAGTTTTTCGCGACCCTCTTCCGACTTT:1 + chr2L 6227205 3' + X-element 4482 1 64.36 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAA:1 - chr3R 27495662 3' + 412 7499 2 68.32 GGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTAAATAATAACCAGTGGAGCAGTACTATGTGTGCGCCCAGTGTTGGGAAACATGTTTTCAG:1 - chrX 17857976 3' - P-element 16 1 58.42 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATTTTCCACACACATACAGACTTCTGCGTGCATGAAACTTAATTAAATGAAAAACTCGTTTGTAGG:1 - chr3L 5415325 3' + I-element 5346 1 67.33 ACAACAAAACTACGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTCTTTCAACATCATCAATCAAAGGCAATCGGAAGGGCAAGTCGAGCTGCTGGAATGCCTAAT:1 + chr2R 12696443 3' + gypsy7 282 1 57.43 TGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTG:1 - chr3L 3596673 3' + copia 225 1 56.44 GCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGTATTGTGAAGATAAGAAAAATAAACTGCTCTTCGTGCTCCATTTAACGTAAAACAGCTGGC:1 - chr3L 21815396 3' - G2 2816 1 62.38 CTCTTGCCGACGGGACCACNTTATGTTATTTCATCATGGTCGCGTGTGTTTGGTCTTCATCTTAGCTCGGCACAGGGTTGCTCTTTTGCTTGCCAAGGATA:1 - chrX 14651067 3' + P-element 2870 1 62.38 TGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTACTTTGTCTAAATAGGGGTTGCTAATAGGTAACTGAAGCTCTTTT:1 - chrX 9454813 3' + roo 9040 1 58.42 AAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGCCGGCTTCCCCTCAAAA:1 + chr3L 13569799 3' + invader3 240 2 60.00 CCACCAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTTGCGACCCGACAGCCCAGAAAATAAAACACCAAACGAAGGAAAACTCACCCAATTGTGTGCCAATGGCAAA:1 + chr2L 19880171 3' + Quasimodo 298 2 67.33 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATT:1 - chr3R 19449460 3' + hobo 2892 1 70.41 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTGAT:1 - chrX 19334604 3' - roo 51 2 77.23 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCACACACACGCGAACTCACGCACACACACACACACACATCCACTGACCTTGGAGTATGCA:1 + chr3L 9775715 3' + hobo 2923 1 55.00 AAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAA:1 + chr2L 15531842 3' - Stalker2 51 2 77.00 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCC:1 - chr2L 17730446 3' + pogo 2062 1 64.36 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAG:1 - chr3L 17181453 3' - jockey 4699 1 51.49 TTCTTACAAAAACTCAACGNGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAGAGCGAGTGA:1 + chr3L 2176384 3' + roo 9045 1 55.45 CTTCATCGTTCACGCAGCGNGCACACGTCCGCACTCCCTGGCATCTTAGCTCTTTTCGTTTTCTATCTTTGGCAATTGACTTAAATGCTGTAGGCATTTCA:1 - chr3R 27663456 3' - Bica 65 1 57.43 ATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAAGTAAACATCAATCAAAGTCCGCCGAAATGGAGCCCTTAAGCAATTTTTAATTGATGGAGGTGGAGTAAATGTCAAG:1 - chr2R 10189552 3' + Doc2-element 4517 1 63.00 CAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAAGAACAAGGAATAAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGTATTGCACGTGGTTTCCTGGCCCGGA:1 - chr3R 24255729 3' - diver2 4693 2 77.23 ACACCTTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACACTGCTGTCGCTCTCCATCGGCGTTGCTCCCTTTGGTTGTCAACCATAGATTTTTTCCTCTACA:1 - chr2L 14940899 3' - R1A1-element 418 1 66.34 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTGACATGAGCTATGAAGCTCAGCTTGTTTGTGCAGTTTAGCCGCGGAAATGTAATGCGAGCAGCATGCACTAG:1 - chr2R 6107707 3' + roo 397 1 67.33 AGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACTTGGCCAAACATACATATGTACATACTCTTGTTGGCTTTGGGCCTGAGAGCGGTTCTTTTGAGGA:1 + chr2R 6158121 3' - accord 362 2 69.31 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCGGTCTACTTTGGCAAATGTGTTAGGCCTGTGAAGCTACCCTC:1 - chr3L 7541940 3' + roo 9037 1 61.39 GTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGTTCATTGCTACTCAGACATAATTATCGCTTGGCTGGCT:1 - chr3R 30915764 3' - HMS-Beagle 6688 1 64.00 CACCCCACCTCTGGTACACATCCTGCTATTTCCCCATCATTGAGTTTGCCGATAGTTTGCCAAATCCCCAACACTCCGCCTCCTTTCCATTGACACCGCCC:1 - chr3L 11859989 3' - G5A 459 1 70.30 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGT:1 + chrX 22574707 3' + 297 6942 2 62.00 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTCGACTGGGTCCCGCCCACCCCCGGATTCGACTCCCCTTGTCG:1 - chr3R 7139231 3' - pogo 29 1 54.46 AACAGACATAAACATCCGCNGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACATGAGAAACTTCATGCGATG:1 + chrX 11796016 3' + Quasimodo 300 2 79.21 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAACAATTGAAATGTCATGCAATAAATCTACCCCACACATACGCACCATGGGATGCAAACAC:1 - chrX 22593133 3' + 1360 3374 1 62.38 TTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATAAGTATATATACATATAAGCTTACCGGAAAAATGTCCGTTGTTCCATGGAGGCA:1 - chrX 5475378 3' + 412 7527 2 55.45 TACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAAAAGTGCTTACAAACAGTTCTAAATTTATCACTATTTGAT:1 - chrX 18740185 3' + BS 4898 1 61.39 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTACGTAACATTTTGAGGAATTCACAAAA:1 - chr3L 20520697 3' + P-element 2840 1 32.00 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAACTGGATTATTTATATGAAAAAATCTATTTACCCAACATAAGAATAGTTCCGAAGACTTTCA:1 - chr3L 20758917 3' + flea 245 2 70.30 GAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAACTTTATGGCTATGGAGAAACTGAGATCACTCGAACGGGCTTGAATGGTTTCAGCCTTTGTCCTG:1 + chr2R 10130644 3' + F-element 4660 1 59.41 CACGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAGAAGTATCTCCACTAAGGAGAATAAAATAAGAAACAGGACCAAGCAGTCAATGTCAAACC:1 + chr3L 4010091 3' + mdg3 5100 1 75.25 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAGATTGTCTTGGAAACAAAGTTCAATTCATTTTGAATATCCCCCCACAAATCCTTAATGATCATTATAA:1 - chrX 11016946 3' + roo 9064 1 46.53 GTTAAGTGGATGTCTCTTGNCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACACACCCTCACATGGCAACTGCATATTGGTTGCTGCTTTGTCGCCGT:1 - chr3L 10363815 3' + P-element 2857 1 49.50 CGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACCCTTTTTCCCCATTTCCCCCTTTTTCTT:1 - chr2L 2943861 3' - invader4 53 2 72.28 GACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCCGCCCACATATCATCAATTCCGTGCCATTTGGCCCACAGTTCGAATGCGCAATGTGTC:1 + chr2R 14576588 3' + gypsy5 7329 2 59.41 GACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACGGAGCACACTGGTCGTCATTACTTGAGCCACCTTCATAAAAATTGTTATTAAT:1 - chr2R 7987626 3' + F-element 401 1 58.42 AGATATAAATTATAAATTANAACACCACGGATAAATGACTGGCGACAGACGACACTGGGGGCTGTTTTTTTTTTGGGGATGGGGGTGGGCAGATAAGGAAG:1 + chr3L 17942721 3' + copia 253 1 65.35 GTTCAGATTTATACTGTGTNTTCCCGGTAACATATTCGTAAGTTGTAGTACAGTAAATGTTGCAATATAAAGTTTTGTTAAGGGATCTGCCAGCAGCCAAC:1 + chr2R 11258465 3' - hobo 98 1 78.22 GCGTTTCATAAAACCGTGTTGACACGGTGATATTGTGATTGATCTACAAAGGTGTTTCGTATTCAAGTTGATAACATTTTGGTTTGAATGCTTATTTTTAG:1 + chr3R 9502854 3' - Q-element 207 2 57.43 AATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACGATAATAACAGAAAAGTGCTGCCTCTTAGTTGACTATTTAGCTACTAGCTAGTACCT:1 + chr3L 19342063 3' + Tc1 1629 1 65.62 TTTCTATTCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTCCTTTTGTTCGCCATCGTTGACCACATTTAGTCGTTGTGTGCCTGT:1 - chr3L 12255797 3' - 1360 322 1 58.42 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCTTTTCTATTAGCTTTAAATGTTTCTAGGAAAAACACCATTATTTTAAAA:1 - chr3L 13096942 3' - I-element 32 1 52.48 TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTTTAAACACGTAGCCTGGGGAAAAAAAGCCCTGACTGAACGACGGTGA:1 - chr2R 19641838 3' + I-element 5327 1 54.46 TATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGATATCTGTTAAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTCGCGCTCCAGCCTGTCATGGAGATCTGTGGGTTTTTATGAAATG:1 - chrX 17260730 3' - X-element 4473 1 77.23 TACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGTTT:1 + chr2R 5674751 3' + S-element 1706 1 74.26 CTTTAATATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAAC:1 - chr3L 15125909 3' - Juan 3794 1 76.24 CTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTT:1 + chrX 11025559 3' + hopper 1370 1 71.29 GCGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGGGCGAGCATAAACACGGGCAACTTGCAGACGCGACAGGGGGCGCCACGGTTGGTGATGCGACCCA:1 + chr3R 14830461 3' - blood 170 2 54.17 ACAAGACATATTTAACAACACCTGCCCTCTTTACCATTCCCACCCTCATTGAATTAGCTAATGAAGTTGTTGTTGCCGACTGATAGGTGCACTGCTCAAAT:1 + chr2L 16937917 3' + I-element 5081 1 80.20 ATTTTACCTCGGCGGCACTCTTATGCAAACACACACCTACTTTATCATTGCTTTGCATTTTCAAGTTCACGAGTTTTTGATAAAGGTAACACTTTCTTTCT:1 - chr3R 1346396 3' - frogger 10 2 68.32 GTTTCTTACAAAAACTCAANGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAGCTTTGAA:1 + chr3L 3757414 3' + roo 9043 1 59.41 ACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATACATACATATTACATATATATTTTCAACATCAAAAAAAATTTTTTTTCAA:1 + chr2R 4150668 3' + gypsy 435 2 57.43 AATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTCGATTCATTTTAAATTGTAGCACAGCCA:1 + chr3R 15790156 3' - flea 4697 1 48.51 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCACTCCGGAAGCGGGAGCAATTGATGGCCCATCGGAAGGCCAAATCGAATGGGTAAATGTGGTCGTCAGATGG:1 - chr2R 23519193 3' - jockey 4763 1 75.25 TGATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGATACTCTGTGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGTTCCAGAGCAAGTTGGTTTTT:1 - chr3L 20657193 3' - GATE 115 2 79.21 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTCCCGAACATTGCAGCCCT:1 + chr3R 21365558 3' + P-element 2848 1 42.57 TAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTAGTTAAGTGACTTGAATGTCTGCTATCCCTTACTTTG:1 + chr2R 5996165 3' - I-element 222 1 68.32 GTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCTTCGCCTCAAACTCGAACTCAATGCTGCATAATGATGGATTATATTGCTG:1 + chr3R 5877305 3' - flea 164 1 54.46 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTGCTCGCATTTTCCCAGCTGCCTGCCAGTTTGG:1 - chr2R 7838980 3' - pogo 41 1 69.31 TCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTATTAAACCTAAAAAATCACTTTGTGCACTTGGCAGTTTTACAGATCCTGAGGTTCGTCCCATCGTCCC:1 - chr3R 5480063 3' + copia 161 2 76.00 ACAAGGGAGAAGAAAAACCNTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTATTGCCATTAGGAGGAACCCCTTCAATTGACCTAAG:1 - chr2R 18188285 3' - Juan 4031 1 72.28 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTACAATGC:1 - chrX 10286159 3' + roo 9027 1 70.30 TTACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGGAGCCATAGGTCCAGGTCGGTTTTAGGACGGAGTTGTAGAGTAAGACCTCACTATTTGACTTGGGGAGATTTTCATA:1 + chr2R 11781195 3' - Fw2 3564 1 72.28 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAGAGCGAGTGAGATTTAAGCCCGAACAA:1 + chr3L 2176401 3' + roo 399 1 69.31 TACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACTCGCAAGCTCGCCTCGCAACACTACGTCGCAGCATACGGGACCGGAAGTTAGAGAGCGCTC:1 + chr3R 25515514 3' - R1A1-element 221 1 59.41 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTCTTGACATCCGATTCT:1 - chr3L 12241817 3' + roo 9038 1 61.39 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTGCTCGCATTTTCCCAGCTGCCTGCCAGTTTGGGTACA:1 - chr2R 7838975 3' - pogo 36 1 64.36 CTGACGCTGAGCGCGAGTGTGACTCTCAACAAAAAGTAGTATAAATAAATTCAAACGAAATATTTTCCTCGCAATAAATATATATTCAAATGATAAGTGAA:1 + chr2L 19918429 3' - F-element 203 1 57.43 CAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATCGCGGCAGATAGGAATACGAGATACTCCGAAGAAAACGGCAGCTTTACGTTCCAGCAACC:1 - chrX 2334109 3' + Bica 4 1 64.36 AAAAAAAAGAAAGGGAAAAGTGCGGAGAAACTCCAGCATATGGCTGCGACCTATCTGTATCTGTATCTGTATCTTATCGAGTTTGCATTATGGAGTGCAA:1 + chr3L 13394902 3' + Bica 340 1 78.00 CGGGAAATGTAGGTGAATGTTGGGCGCCAGTTAGCTGCTAGGAAGAGTACACTCCCCCCCATCACCCCCCACCACCGCTGCTTTTCCCACCAGCCGCCTCG:1 - chrX 9720418 3' - gypsy7 258 1 63.37 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATTTTCCACACACATACAGACTT:1 - chr3L 5415368 3' + I-element 5303 1 85.15 ATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAATAACCTAGCTTAAAGTGTGCCTAATTTGAAAAGTCTAC:1 - chr2L 3699379 3' + mdg3 5494 2 72.28 ATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGATAGAGCTACACCTGCATTGGATGGTT:1 - chr2R 18723017 3' - HMS-Beagle 6806 2 69.31 TTCTTTTTTATTTTTTTTATTCTTCCGCGTCGGTGGCTGGGGAAACCCCCTCACTAAACCGGGGCTTAATAGTAGTAAGGGATTCGAGGGCCCACAAGGG:1 - chr3R 31629829 3' - Osvaldo 1522 1 79.00 CGATGCGCGGCTGTCATTGCCAACAAAGGTCACGCAACCAAATATTACGTTATCGAATATGAAAATCTGAAACTTCGTACATAAATGTATAATGAGCTTA:1 + chrX 17830499 3' + Tc1 1307 1 60.00 ATAAATTATAAATTACAACAAGCGGCAACTGGAAAACTGGCAACTTCATTATTATTTGCAGACACTTTTCGAAAAGATTTTTCCGCTCGCTTTGTTCCGGC:2 + chr3L 8252290 3' + copia 257 1 80.20 AGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAA:1 - chr3L 3540134 3' + mdg3 216 2 54.00 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCAAACCCGTTTATCGCTCGGCATAAATAATTGATGTTTAATATGCGCCTGGCATTTAACGTTC:1 + chr3L 13895445 3' - hobo 14 1 63.37 TTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTA:1 + chrX 8727908 3' - X-element 54 1 70.30 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGC:1 - chr3R 25021695 3' + roo 358 2 77.23 ATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGGGTTGTATGATTGCTTCTTCTTCTCTATTCCTCACGTATGTGTGTCGAA:1 - chr3L 3755962 3' - Quasimodo 74 2 56.44 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACCAGTACACTTGAATAAGCCGACTAGTATATTGCTTCGACCGCAATCCTTTCAAAAT:1 - chr2R 10353259 3' + blood 7370 2 47.52 GCGCGAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACTGAAAGTACATACTGCGAACTGTGGGAGGAGCGCCT:1 - chr2R 11993992 3' - jockey 80 1 57.43 AAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTCGCCCCCCCCGGAATCCCCT:1 + chr3R 23426466 3' + Quasimodo 7344 2 57.43 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATGGAGTCCTAGAAGTCTAGGCAGAATTATAGCCCACTGCATGGGTGGCGCGGATGCTTG:1 + chr3R 6266379 3' - roo 17 2 62.38 AGCCACCTCTAAAGCCACGCCAAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTATTGTCTTTGCAGGGAGATAATATACTAACTGTTGGTCGCAGTG:1 - chr4 1193745 3' - 1360 61 1 65.35 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTAACTAGTGGTGAACTATATTGTTACAGCAGTAAATAAATAA:1 - chr3L 20882785 3' - 412 32 2 55.45 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGTTAAGACTGCCACTTCGATGGAGGAAGCGAAAGTAAATGTTTGACAGTTTATGACC:1 + chr2R 19840278 3' + roo 390 2 58.42 CGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAATTACGGTGCAATTGTGTGAGTGTGCGTTCGAACTTGTG:1 - chr2L 23390328 3' - gypsy6 7429 2 67.33 TTTAGCCTTGTCCATTTTTCACTCAAATTCTGAGAAGAAAATAAGTAATCAGCCAGAAAGTAAGTCTGCTATGTGTATATATAGCATTAAAGATATTGAAG:1 - chr4 40632 3' - copia 425 1 65.35 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACCCTCGTCTTCGCTCGCACTCAAATGGAAAT:1 - chr3L 20354021 3' + 412 446 2 64.36 CAAAATCGGAATTATGCATAGTTCTTAACTCTACACGCATCACCAACACATTTTGGAGACCCACAAGCCCACAAGCTTTTGGAATATTTTTTTATATACC:1 - chr2L 22176147 3' - invader1 3876 2 62.00 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGCATAGTTCTGTTACTTTTGATACT:1 + chr2L 21215317 3' - BS 5013 1 73.03 TAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGCTTGCCACAGGACTCGT:1 + chr3R 13739758 3' + Burdock 240 2 62.00 GCACACGCACACACACACATATATACTCACACACACCACCCGTCAAGTGCCGGGTTACAAACTTTGCCCGTTGCAAGATTTAAAAAAAAAAAGGAAAAGG:1 + chr3R 15675455 3' + accord 183 2 70.00 GCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTGCTGTGTTGCGTTCCCGCCGACAACATATTGCTGACTGGCAGCG:1 + chr2L 18141776 3' - F-element 4489 1 56.44 TGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCC:1 + chr2L 19642358 3' - Quasimodo 52 2 79.00 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGTTAAGACTGCCACTTCGATGGAGGAAGCGAAAGTAAATGTTTGACAGTTTATGACCCCGGCCCAGGAACTCT:1 + chr2R 19840294 3' + roo 406 1 74.26 CCACCACCCTCAAGACCTGTCTGACCGGAACTTGACATAAATCAAACGTTAAAGGTGAGAATACAAAGCTCATTTCGGGGGATTTTCGGGAAGGCAGGGTA:1 - chr2L 5947393 3' + jockey2 3182 1 64.36 GAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACTTTTTAGTATATTCCATTACTATGAGGTATATATAAAC:1 - chr3R 5297527 3' - 1360 3278 1 63.37 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATACCTTGTTGAGCTCGTAATCACATCCCCAATCGATTGGTGTTCGAATTTGACAAATTTAATTTTT:1 + chrX 3393434 3' - 1360 10 2 67.33 AGGAAGTTAGCTCCAAAAGGTTGTCTGCAATTTATAATTAAGTGGACCATTTAGCGGACTCGTTATCGTTTGATGAGTTCGTTCTTCGTGAGAGGTGGGAG:1 - chr2R 5612260 3' - Q-element 244 2 78.22 GCATCCACGAAACTAAGGTCAAAGTAAAGACCGAAGAGAGCTTTAGGACGCTTACAAAACATGGCCAACAAAACAACCCGGTGACAATCAACTAATAACAA:1 + chr3R 4699676 3' + Fw3 87 1 58.42 TTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGGCTCCACTTTGCAGCCCAAACTGTTTCACACTTTG:1 - chr3L 24862794 3' - Circe 17 2 72.28 ACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTTGTTCCAACTTCTCATTTCCTTAGATGCATTCAAACTTTGAATATATTCTGATAACTGTGTGTGGTT:1 + chr2R 21737820 3' - mdg1 444 1 66.34 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTGTTTGAAACACTTGATTAGCGGCGA:1 + chr2L 17994193 3' - roo 49 2 75.25 TTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTGTGCTTAACTTGGAGCTA:1 - chrX 734905 3' + Tabor 7296 2 56.44 TTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTATCATAATATTAGAGCTAAGATAAGAATTCATTGAAAT:1 - chr2L 11712820 3' + Quasimodo 7333 2 64.36 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAATGAAACCGAATCCTGCCTATGGCATTTGCGC:1 - chrX 7292660 3' - 3S18 22 2 57.43 TTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGAT:1 + chr2R 22051511 3' + Tabor 7271 2 75.25 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAAAAGGTATATTCGTTGCCAAGTATGTAACAGGTATTTAGTGACGTATTTTTGCGC:1 - chr2L 21715754 3' + 1360 3355 1 54.46 TTTGTAATTTCAAAATTATTATTATTTGTATAATGCAAAAAATAGGGGTTAGGCAGACGTCCGAGGCGTAGGAGGAGTTCATGTGGGCGTTGAAAGTTAAG:1 - chr3R 27117053 3' - P-element 2507 1 63.37 TTTTCTTTTATTTATTTAAAAAAAAACCGGCGTAAATAAAGTGTCATTATAGCGAAGAAGATGCAGCTTGATGTATCTAAATATATTGGTGCATTGAAAAT:1 - chr2L 2124004 3' - G7 1144 1 75.25 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTATCAAAATATTTTTATGTTTTTCTTATGCACAGAAATAAAATAAGTGTATTGAAAAAAA:1 + chr3L 3596757 3' - copia 4887 2 58.42 TACTTATCCTATAATTTGTTCGCTGATGGACAAACTTGAAAATCCAGGTGATGCGACGGTACGGAGGGAAAGATGGGGGATGGGGCGCCTACAGAACCCAA:1 + chr2R 7365549 3' - GATE 322 1 51.49 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAGTGGCAG:1 + chr3R 10488744 3' + roo 9048 2 55.91 ACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAAT:1 + chr3L 17667614 3' + P-element 205 1 29.70 GGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGT:1 + chrX 18326233 3' - 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chr3R 10488660 3' - roo 17 2 62.38 CGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTCCGCTTTCGCCACGAATGTCACATAAAGCTGCGTGTCAACTGATTC:1 + chr2L 6546956 3' - G2 2896 1 56.44 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAAAAAATATTAAGCAGCTTATTC:1 + chr2L 18655217 3' - Doc 29 1 51.49 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCATTTGTATCTGTTGAAATTAAGAATACTAAAGATAGCTGAGTTTAATTTGTAATAAAATTAAATTT:1 + chr3L 10110633 3' + roo 400 1 44.55 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTATGTCAGCGTGCGCTTCG:1 - chr3R 5506798 3' + pogo 2047 1 81.19 TATTTATCGTTGATAAGCAAAATTGATGTATACTCTCTTACACTCTTACACTTACACTGACTTTATATAGAAGATGAATGAAAGAAAAGAAATATTGTATG:2 - chrX 7794421 3' + Circe 6981 1 45.54 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACGAAACCAAAGCAAACCAAACCGAGCCAAACGAAACGTTGGAAAAACTTTTGGCGCCCCGGCAAC:3 + chr3L 17186896 3' - Tirant 11 2 70.30 ACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCACAATAAATATCGATATAATTGAGTAAATAAAGTGAATCAAGTAGAGTGAACGAAATCT:1 - chr3L 14479720 3' - McClintock 6138 2 66.34 AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGTATAGGTTTTGGTCTATAGTTTTTGCGCTATTATTCGCTGTACAAATGCTGG:1 - chr3R 19505523 3' - mdg3 17 2 56.44 TCTCTTGCCGACGGGACCANCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGAGCTTAGGAAACCAAATTAAGCTTTGAC:1 + chrX 1399941 3' + P-element 2869 1 61.39 CTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCAGATGATTATTTAAATTTCGCATACAATTTACATAATGAAGGTCGCCCTTC:1 + chr2L 4135050 3' - Quasimodo 343 2 57.58 GAGAATACCACTCTTTTTANTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTTGAACTTGTTTTTCATTTTC:1 + chr3R 13775358 3' + copia 4971 2 79.21 TGTCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACGATTATTACAGCATATTTCATTCACTGCTCGCTGGTATGTGGC:1 + chrX 15255402 3' + Tabor 7278 2 68.32 AATATTGCATAGGCACATACTACAATATCATTTTCGGTGTGAATCATTTAATATGATTTTTTCGAGTGCATCTAAGTACTCTATAAAA:1 + chr3R 17971733 3' - 412 3 2 77.27 AGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGATCAATCAGCG:1 + chr3R 15924670 3' - Quasimodo 30 2 69.39 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTC:1 - chr2L 3632146 3' + P-element 2853 1 46.53 ACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTATTGAAGCAGCCTCCAGGACGGTGGGTGGTGCTCGCCGGTCGAGTCGTGGAGCGAGGAGGG:1 + chrX 1526534 3' + F-element 340 1 64.95 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTACTTTGTCTAAATAGGGGTTGCTAATAGGTAACTGAAGCTCTTTTTAATTAGAAGATGTTCTCAGACCT:1 - chrX 9454789 3' + roo 401 1 71.29 CAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAATAAAAGTTGAAAGGAAACAA:1 + chr2L 14093246 3' + I-element 238 1 80.20 TTTTCCTCCTTGTCTTCTTAATTTCTCCTGGTTTACTTTCTCCTCTTCGCGCCAAGTTGCCCACGTTGAGTTTTACCCCCAAAGTTAGTCCTTTTCCTGCC:1 - chr3R 18338200 3' - TAHRE 332 1 54.46 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTACAGCGTATGAGTGATTTTTATGGCATTTTTATTTGGTCCGTGGGACGTACGCCTCACT:1 - chr2R 20718813 3' - BS 5013 1 58.42 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTGTAGGCTGTCATGTTAACATGGGAGAAAGCTTTCTCCGCTGTGCGTGCGTGTGTG:1 - chr3L 14594103 3' + hobo 2917 1 55.45 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAACATTACGTTTTTGTTGCACAAAAAATGTTGTAAAAGCTAACAACATTT:1 + chr2L 6251734 3' + mdg3 217 2 51.49 GACTATCAGATACCCGTTACTCACCAAATGTAAATGCATAAACTTAAACGTAGTACTGTTTAATATTTTCTCTGTATGTATGCATTACGCTTTTCGAGTTT:1 - chr2L 21976605 3' - INE-1 549 1 73.27 TACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGAAGCAACACAACACACTAGTTTTGATTCCCCTCACTGTTTGTC:1 - chr3L 22349940 3' + accord 6961 2 57.14 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATC:1 + chr3L 12634222 3' - BS 5031 1 62.38 TGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGTAGCCTCGGTCATATATTCAGGTTTTCCCATCGAGAGCCGTTTAATCAACCA:1 - chr2R 6570915 3' - 412 7546 2 60.40 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGG:1 - chr3R 29608796 3' + roo 9023 2 75.00 CTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACGCCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGGAACGCCCGTCATTAAGCTGCAATGTGG:1 + chr2R 13749466 3' - R1A1-element 5284 1 72.28 ACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTCGAGCCTGGATCAAAGCGACATGCCCAGTACTGCCATCAATGCCGTGTCCGTGA:1 + chr3R 29809759 3' + G2 2833 1 65.00 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCG:1 + chr2R 9871061 3' - roo 8686 2 57.43 TTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAATGGACAACCGACGCCTGGAAGTAG:1 + chr2L 17998310 3' + BS 5042 1 73.27 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTAAAAACCACAAGCGAAATTGCCTGAGGGTAAAAATCCCCAAAATGGCATCATAAAATCATTTAATTG:1 + chrX 7996460 3' + hobo 2928 1 69.31 TGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACAACACACACACTCTCTACGGACACACACACTGCCTGTCAGACCTCAAATCACCATC:1 + chrX 2520486 3' + accord 7002 2 71.29 TTCATTTCAAGGAATCTAGTAATAATCTAGTACAGATAGTTATATTTGTACAACGTATTTGTTGTCATTAAGATTAAATTACATTAAACCAAGATGGGGCA:1 - chr3R 31953786 3' - INE-1 9 1 29.70 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTAAGGAACACTGATGCTGCTTTGTGGTTTTGTT:2 - chr2R 24555634 3' - hopper 42 1 67.33 AATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCT:1 + chr3L 25350811 3' + baggins 5404 1 54.46 TGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTATGGTAAATGGATGACGGAGCTGGAAGCCGGACAACTCAGACCCCACGAGGAGTACGAAA:1 - chr2R 22850479 3' + 1360 435 1 65.35 TCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGAGCGGTGGTTAGAGCACTCACAAATGGTGATTTGGGTCGGTAATCCTCCCTCAAATAGGGTTTCGTG:1 + chr2R 15768248 3' - Idefix 247 2 74.26 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAAACTCTGGCCTTATATGCAGAGCCAA:1 + chr2R 21040920 3' - P-element 29 1 51.00 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGCTGTTAAGCTTTAAAAATGTCGGCGGCC:1 + chr2L 18248078 3' - blood 7018 2 72.28 TGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATTTCCGTATTTAACGAGCAGTGTGACCATTGCCTGCCAAGTAGTAAGCTTTAGCTTT:1 - chrX 6523128 3' - Stalker 63 4 58.42 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCGCCTCCAAAGAGAAGGCGGAAGTTGGCCAGG:1 - chr3L 13773864 3' + roo 399 1 69.31 TGCATACTTGTGAAAAACANATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTT:1 + chr3L 8039407 3' + hopper 1379 1 60.40 ATTAGTTCGACTCATAAATNAAACAACAATTTTACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTGATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAATGGCAACTGCCTCCT:1 + chr3R 22494194 3' + 297 379 2 65.35 AGAAGTCAGAATGTGGAAGGATTTGTAAGCCCATATGTTTCTGGGCACTATGTTTGTACCCCATTGTACATCAACCGCAAGAACAACATCGGGAAGCTGAG:1 + chr2L 5261511 3' + aurora-element 4094 1 53.47 AGAGAGAATGCTATAGTCGCGTTCCCCGAGTATCAGATACCCGTTATTTAACAAGAATTATAGTAATATACAAGAAATGAAAAACATTTGTTAAAATTGTA:1 - chr3L 23771425 3' - INE-1 576 1 54.46 CTCGACGTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATTTTATAAGGT:2 + chrX 21587720 3' - INE-1 129 1 59.41 GAAGTCGAAGAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTGTGAGCCTCGACATTGATTTATATTCGT:2 - chr3R 24085321 3' + invader3 229 2 70.30 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGG:1 + chr3R 12767329 3' + blood 333 2 72.45 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATC:1 + chr2L 18248033 3' - blood 7063 2 81.19 TGTATAATTAATCTTAAATTAACTGTGGCACTGGGTCGACGGCAAGGAAGCCGCCTATAAAAGCCGATGTGAGTACCGTAGTGAACTTGGGTAAAATCAAC:1 + chr3R 6684437 3' - G4 3790 1 75.25 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTAAACAAAAATTTGCGTACAGTCAAGTAAACAATTAACAATTAGAAGTGATTTTCTT:1 - chrX 15800880 3' + roo 9054 2 61.39 AGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGCCCCTTTTGGGTTCATCAATAGTCTTTCTTTTGGAAGCCAACCAACCGCATCAATCGCTTAGTATACTT:1 - chrX 6516092 3' - Quasimodo 235 2 68.32 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAAGG:1 - chr3R 4971391 3' - F-element 32 1 56.44 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTGTTTGAAACACTTGATTAGCGGCGATGA:1 + chr2L 17994196 3' - roo 46 2 72.28 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCGCCGGTTGCATCGGATCGGAAGAGAGTGTGAGAGAG:1 + chr2R 17420894 3' - pogo 39 1 64.36 AAAATGTTCTCACAGATAATAGATAAATTTACTTAACTTACTATTATTGAACCAATTTGAAAAGAGGATATCTTAAGGATAAGGATATCC:1 - chr3R 13937976 3' - Juan 44 1 50.00 GCGTCTGACACGACGGTTAAGTATGCATTGTTCCGGTGGCAGTACTGGCTACGTACCCACCGGGCGTCCGCGCGGTCGTCCAAAGGCCAATGCTGCACCCG:1 - chr3R 9238896 3' - Doc3-element 300 1 65.35 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCTGC:1 - chr3R 23638100 3' + pogo 2069 1 65.00 TTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGAAAGTTATTAACAATAAATCTTTGGAGTTTTCCAACATGCGGGCAGATAGAGGTGGGTAGTCTTATAAATAGCTT:1 + chr2L 16461132 3' + R1A1-element 111 1 57.43 GAAAAGAGCTGTTCGATGTAGAGCTCTCCAATCTCTGCACCTCCGATTCAAGGCGCAACATTTTCCTGGTTTTGGCAATATTTTCGACAGGTTGACCACCA:1 + chr2R 13444662 3' - 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chr3L 7300121 3' + Doc 165 1 70.30 AGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAACTGGCAACTCAGGGCACTTAAACTATATACACGTGTTGTTTGCGTTGATTTTTTT:1 + chr2L 12868308 3' + mdg1 7370 2 60.40 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACAT:2 - chr3R 10110417 3' - Doc 28 1 49.50 TTATTGAAAACATTTAAGGACTTTTGTCCAGGAGAGTATCTGAAATCAGTGTTTTTCGGATTAAATTCCCTTTCTCGTTTTCAATGGCACGTATTGGTGCC:1 - chr2R 10560430 3' + Tc3 1245 1 68.32 TGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTATTTCAGCTTAACTCTAGATGACCTTTTGTAGT:1 - chr3L 15125874 3' - Juan 3759 1 67.33 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTA:1 + chr3R 11052158 3' + blood 334 2 71.29 TATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACAAGGAAATGGCTGATATGAGAAATGTCAAATTTGGGGCAGGGAAACGTGCAA:1 + chr3R 24085379 3' - invader3 17 2 58.24 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTACCATTTTCACTGGTATTTCACCATTTTTAGGAACTGGTACAATTACCAGTGAAATATTCGT:1 - chr2L 20619978 3' + roo 399 1 63.37 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTC:1 + chrX 1399908 3' + P-element 2839 1 29.59 CCGTAGCTAATGCTATACTNTCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAGCCATTGCATGTTGTTAAT:1 - chr3L 12438037 3' + I-element 5301 1 76.24 ACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7227 2 95.51 GGTGCCAATTGATCAAAAANAATACAGATTTAAAGTCTAAATATAATGAATTAAAGTTGGCAAAAGTTGACGACTTTTGCACCTATAATGTTATTTTGAAA:1 + chr3R 20459300 3' - 1360 261 1 69.31 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTACTTATTATAGTATAATATCAAATATATTA:3 + chr3L 20411888 3' + roo 406 1 75.25 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTATCATTTACGA:1 + chr2L 21086105 3' - roo 23 2 56.44 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCGGTCTACTTTGGCAAATGTGTTAGGCCTGTGAAGCTACC:1 - chr3L 7541943 3' + roo 9034 1 64.36 CCCCCTACCAAAGGTAAGGNACAGAGTATAAATATAAATAAGCGCGTTGTGTTATCAACGCTAGCAAAAATATTTGATCCGTTAGGATGGTTGGCACCAGT:1 + chr3R 19445927 3' + roo 466 2 71.29 TATTTTCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAA:1 + chr3R 10488729 3' + roo 9025 2 71.29 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCAGTTTACTAGACTACAAAAGTAAA:1 + chr3L 14222509 3' - roo 8716 2 75.25 GGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCTAAAAGCAATATTGTCCATCGATTA:1 + chr3L 10641470 3' + opus 7036 4 55.36 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTCTTTAGAGTGTTATCATTTGTG:1 + chr3L 17701582 3' + roo 355 2 77.23 TATTTGGCGTTCACTTCACTCATCTCTAAAATCAAAATGATTTACTTTTATAATTTTTTTTTGTGGCTCCCTTGAATGATGGCATTTCAGTGGTGATGCTG:1 + chr3R 10914212 3' - F-element 72 1 76.24 CCAAGAAGGATAATAGTACGCTAGTCAAATAAATAAAATAATTTCGTAGACAGTTGGCATAAGTGGCCGCTTTTCCCAACAGCGTGTGGGTTTTAATGCTT:1 - chr3R 4508559 3' + jockey2 3356 1 53.47 ACATTCCATTTTACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATTCCAAATAAGGAAATCGAAAAAAGAATAAATTAAATTGTGAATACCAAACAGATGATGTGA:1 - chr3L 16302475 3' - HB 99 1 57.43 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATTTTCAGCACACAGGGCGTATGCG:1 + chr2R 8526372 3' + I-element 5301 1 79.21 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAAAATAACAACAAAAAAGCGGCGACTAAAAATTGTTAAGCATCATAAAAACTACACAAAAAT:1 - chr3R 8959309 3' + 412 7528 2 60.40 TATGCGGGAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTGTTCCCGAACTGCATATACATATATTAACGTGCGTGTGCG:1 - chr3R 24976737 3' + opus 7470 2 65.35 TGCTCACGCACCGTCACCGTTCGACCTGCCCTCCCTTGGCCCTCGTCCTTTAGTCCTTCGTCCTGTGCCTAGGTATTAAAATTTATCGCCAGCTTGCGTAG:1 - chrX 14710027 3' - gypsy8 229 2 61.39 TATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATACGTTCTTACCACATCATGTGACTTAATGTCC:1 - chr3R 6947339 3' + I-element 5314 1 69.31 CTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAAACGTAGGAGAAGTGCGCGTGTGAACTGTTTTGCAACTGCAGTTCAATGCTCTGATATTGTTTATTTTGTTATATTTTG:1 - chr2R 3545516 3' - F-element 285 1 66.34 TTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATC:1 + chr3L 19339418 3' - Tc1 37 1 56.44 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTGTTACATGTAATTAATTTCAAATTATTTATACATGAACGCCCAGAC:1 + chr2L 19681492 3' - hopper 25 1 54.46 CTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTCACTTCGTACTATCAAAATGCAACTGACAATGCGTCGCAAAAACTTCTTTTACCTAA:1 + chr3L 27391154 3' + invader4 117 2 64.36 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTACCCTGGGTCATCCATGGGGTCATCGGCAGTAACCGCCA:1 - chr2R 14349126 3' + mdg3 208 2 62.38 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCC:1 + chr2L 17730508 3' - pogo 34 1 63.00 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCTTTTCTATTAGCTTTAAATGTTTCTAGGAAAAACACCATTATTTTAAAAAGCATTTCAT:1 - chr3L 13096932 3' - I-element 22 1 62.38 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGTGCTGAAAATTACTTTCGACTTTGTCGGCCAAACGCGA:2 - chr2R 8526341 3' - I-element 40 1 61.39 TTTTCTGGGATATCGAGAGATATTGGGATATAAAATAAGAAAAGTATTTAAAATTGTTCAGTTTTCAAGATTGTCCCGAGATGTATTCGAAGGAGGGAATT:1 + chr3L 11814463 3' - INE-1 499 1 66.34 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCTTTATCGCCTCCTCGCTCTTGAGAGTCAA:1 + chr2R 22856620 3' - 1360 5 2 74.26 GATGCAGCTAAGCGAATTAAACTGTACTTATGGATGAACTTGTCCTTAAA:1 + chr3L 16562338 3' - pogo 3 1 60.00 AAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCCTTGGACCACGGTACCCAGCTGCCTTATGTGC:1 - chr3R 12349631 3' + F-element 187 1 68.32 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCC:1 + chrY 311345 3' - 1360 71 1 78.22 TCATTTTCTTTTTCCTTTTTTTCAAAAAGCTGATTTGAATGATATCACATCTATTAAATTTCGTAATTCTACAAAGTAACTTGCTCTGTAATCTATAATTT:1 - chr3R 26979450 3' - Doc2-element 236 1 51.49 AGCCACCTCTAGAGCCAAGGCGAAAAAATCGTGTACCAAAAAATCAATAGCGATTGCCGCCGTATCGCAGTGTAGGTGGTCAAATGACCCCCGACTTGCCT:1 - chr2L 19923711 3' - 1360 61 1 62.38 AGGGAGAAGAAAAACCTTAATAGGAATGGTGATTGAAATGGATTTTTGTCATAGAACGAGTATTCCCTTTATTGGCGCAGATACCGTTTTCAGAGGCGTTA:1 - chr3R 26435372 3' - Juan 4028 1 79.21 TTGAGTACCGAGTGTTTATNGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACCCACCAAACTCTCACCTCTTAAAATATTAATG:1 - chr2L 16793661 3' + hobo 2900 1 69.79 AAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGCCGGCTTCCCCTCAAAA:1 + chr3L 13569799 3' + invader3 5425 2 60.40 CCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATGTGTGAGTGAGTCGGGTCAAATAAATGACAGCCCATA:1 - chr2R 21433145 3' - HMS-Beagle2 6917 2 59.41 GCAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAGTGAGTAGCGTAGTGCTAGCTAAAAAGTTC:1 - chrX 21133033 3' - INE-1 579 1 96.74 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTCACAGTGTGGCTGATGATCGATTGCGATTACATTGAAAGCTTACTATCAGA:1 - chr3R 28621011 3' - 1360 25 1 53.47 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAGAAATCGAAGAGCTTCATTCGTATA:1 + chr3R 8582639 3' + roo 404 1 74.26 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTCGAGTGTGAGCTG:1 + chr2L 14762034 3' - mdg1 7063 2 54.46 ACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTT:1 + chrX 18326220 3' - Doc 227 1 70.65 TGACACGGTGATATGATTGATTTACAAAGGTGCTGCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCTAAACGTAAATTGAAAGTCACTTTATTGAACACTTCCCCTCA:1 - chr3L 17821982 3' - Q-element 188 2 63.37 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTAGCTCCGTTCTCCGAAGAGA:1 + chr2R 18171555 3' - P-element 55 1 23.00 CTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATGCAGACGCTGGGCTTGATTTCTGCCGATTTACTTCCTGTTCGGCAAGTG:1 - chr2R 4500856 3' - springer 7155 2 58.95 CTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGTGGGTGACATTTGCTATTCCCGTCCCGTCGGTGCCGTCGGATGATCCCGTCCAATCAGGAGGCACATTGCAGCG:1 + chr2L 919338 3' + 1360 426 1 79.00 TCCGAAATAAATTAAACACTGAATAACTTCAGTTTTGGCTTTTAATTAAATAATTTCTGCCAACAATGTTGGACAGATGGCTGCATTTATTGTGCCACTAC:1 - chr2R 14997525 3' - McClintock 6306 2 76.24 CTGATTTTGAACCTCAAGAACGAAAGACGTGTTTTAATAAATGCATATTTAATACAACACAGTATGTGGATGCGATCCTAAATAATCTGACCCCCGATGAT:1 + chr2L 10993760 3' + Tirant 278 2 54.46 TGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCACCGCCAAAGAGAAGTTCACTAATTATGTTTGTGA:1 + chr3L 6583249 3' + 17.6 159 2 65.35 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACGAAGA:1 - chr2R 15788556 3' - Transpac 4931 2 68.00 GTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTTT:3 + chrX 983375 3' - Juan 3829 1 53.47 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGCGTTGCCTCGAGCGCTTGGCTG:1 - chr2R 19560137 3' - Tirant 14 2 67.33 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGTTTACAGAAAACATCGTGAAATTTGCATTACTGACTACATTCTCTTAAACCTATAATATATCTTAAATGG:1 - chr2L 8577245 3' + roo 404 1 74.26 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCCTAAAAGTGTTCTTAGAGGTATACATTGC:1 + chr3R 5993173 3' + pogo 2057 1 72.28 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTGTTTGAAACACTTGATTAG:1 + chr2L 17994187 3' - roo 55 2 81.19 TAGAAGGAGCAGCCTACTACAAACGAGAGTACCAAGAAACGGATCGAGAACTACGCCGTCAATCAGTTGAGGCAGTGCATCTTGGA:1 - chr3R 21884157 3' - mdg3 5252 1 75.58 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGACACACAGCTGGACGAAGAACTAGAAGCAAGCGGAGGCGTGGC:1 + chrX 22593220 3' - 1360 32 1 59.41 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAACTCTGATACTGGGAAACTCTCTCAATCACCTAGAGTTGTGGAGAGTTTAAAGACTCTTTC:1 + chr3L 25876159 3' + copia 240 1 71.29 CCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTCTGTACATCGGTACTGTGCTCATATCTCGAATGCAATATGCCAA:1 + chr2L 20367392 3' - Doc 9 1 69.31 ATGCGTAACGGCCATACATNGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATTTTGAGAGAAACCC:1 + chr3R 10741140 3' - 1360 3367 1 42.57 AAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGC:1 - chr2L 20360645 3' - micropia 27 2 57.43 TTATTTATTTATTAAGAAANGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTGGCTGAGA:1 - chr3L 3596666 3' + copia 232 1 53.47 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCAGCTTTTCCATCCGGCATTTATGTGAACCT:2 + chr2L 8577326 3' - roo 8711 2 72.28 GGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTTCTGTCAGCGGCAGCAATTGTGCCTCTTATGCCACCCATCCCCAACACCCACTGC:2 + chr2R 6918658 3' - accord 18 2 61.39 GTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGACTCCTCAAATAAGCTTGGCACACAAGAAATAAAA:1 + chr2L 15817873 3' + Doc 4617 1 66.34 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCAATTTGTTGTTTACCCTCTTTC:1 - chrX 15546136 3' + blood 7369 2 59.41 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAAACTACTCATAC:1 - chrX 21217497 3' + pogo 2087 1 60.67 AAATGGGCAAACGATTCCANCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACGCTGATTGATCGGGGCAATGCTAAACACA:1 + chr2L 1072043 3' - FB 48 1 68.32 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAGTGGCAGCCACGGCGACAG:1 + chr3R 10488756 3' + roo 9052 2 60.40 TTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTC:1 - chrX 4166381 3' - I-element 5323 1 56.44 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATTATTAGGTATTCGATACTTAATTGCAAAATTCTTGCAATTCTGAAAGACGTCGCTAAATTTCTA:1 - chr2L 20118361 3' + copia 244 1 73.27 TTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTATGCTG:1 - chr3R 10736024 3' + McClintock 6425 2 72.34 TTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGTTTTCTAACACGGAA:1 - chr3R 21365479 3' - P-element 12 1 67.33 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCGATGCCGTGTATGTA:1 - chr3R 29608759 3' + roo 396 1 70.30 GTGCCGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAAAATTCGCAGTTGGCATTTATAAAAAAAAAACCAAAAGAAAAGCGTTTCCTTTTGGCTCG:1 - chr3R 13974036 3' + HMS-Beagle2 434 1 76.92 TTTCTCTTTTTTTTTGTTTTTGGGTGCCCCCTTGCCAGCCGTTTTCCTTTTTTTTTTGTTGTTGTTCTCTGCTGGTGAACAACACAAAAATTATGTCATAA:1 - chrX 3088765 3' - gypsy7 5000 1 67.33 TGAATTTATATAATAAATTTAAATATTCTAAATCAATCACGTGAATCTTTTTCACAATTTACGTTGGCTGAATAAAAGTTAGCTTCGCAAGCTGGCTGATG:1 + chr3L 16651708 3' - transib3 2666 1 66.34 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGGAGTT:1 - chr3L 2022244 3' + roo 9032 1 64.36 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAATACCTTCTAAACTTATGAACTTTGAGAACACCATTATTTTC:1 + chrX 8316378 3' - hobo 27 1 57.45 CATTCTATGATTTTGCGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAGGCAGTACATCCAATAAATCCTCAATAATTTATATTGAGCT:1 + chrX 8015587 3' - Quasimodo 75 2 60.00 TCAACCAATCAACCAATTTAATAATGACAGCGGCTCGTCATCAAGCAGCTCGGCACAAATGGAACGCCAGTCGGTGAGCTTGTGCTGGG:1 - chr2L 13392459 3' - gypsy6 7647 2 65.17 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCCAAATTGGTTGTAAAAAATTATGTCTTGTTGGTCGATATTACAAATGAACATTATTATAGCTTCCTTGTA:1 - chr2L 21190714 3' - pogo 3 1 74.26 GATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTATCGATCGCGGAAGGGCACAACAATAGCCA:1 - chr2R 14259836 3' - G2 2804 1 70.30 AATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGCATATTGAAAAGCCTTCGAAACACGATATTAGCGTGAATAATTATTC:1 + chr2L 14220218 3' - springer 7168 2 57.43 ATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGATTGAACAACATTTTTAGAATGATTAAGTTCGTTATGGTTTCGGGTTACAGAAACTCATAGCAGGAA:1 - chr2L 12511516 3' - copia 4879 2 67.33 TGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTGTTATTGTTATAGTCGTTGACAACGCGTAGGCCAAAATATTTGAATGGAAGAAGAAGAGACTGAT:1 - chrX 9042336 3' + 297 245 2 79.21 AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAACACACAACGTGACTGTTTACGATTGATTGATCAAATTATAAGCATGGATTTACTTTATAATTAGTCAG:1 + chr2L 19417172 3' - BS 5002 1 65.35 CACTTCCGGTTATCCGGCTCGAAGGACCAATTTTGGAAGTAGTTGGGCTTTTTTTTTGTGAATTTCTGTGATTTTTCGCTTGCTTTTCTTGTTTCTATTTC:1 + chr3L 18622058 3' - 3S18 376 1 74.26 ATGTTACTGTTATTGCATTGTTTTTCTATTTTTTTTACTTAACCACATAGCCTAAGCGTGTTGTTAGAATTTATTTATGCAAATTTTGTG:1 - chr3R 27598558 3' + BS 5056 1 71.11 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTGATTAATAAGCTGGGGAGGGCAATACTTCCCACAATAATATT:1 + chr3R 4474238 3' + copia 222 1 61.39 TAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATA:1 + chr3L 3540203 3' - mdg3 5285 2 53.47 TATTTCCAAATAAAATCAGNTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATGTGC:1 - chr2L 12958927 3' + roo 9025 2 73.27 TATCAGATACCCGTTACTAAGCTAGTGTGAATGCAAACGCGAAATTTCATCATTTCTCTGGGATATCGATAGATCTTGCGGAATAAAATGAGAAAAAATTT:1 + chr4 809185 3' - INE-1 546 1 88.12 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCG:1 - chr2R 15788575 3' - Transpac 4951 2 52.48 CCGCAAAATTATCTAATGGGTAATAAATCAAAAATAAATTGTGACATAAGAAGACAGAAAAGACAACCAAGTACTCACCTGGATGAGAGGAATGCCTTGAA:1 - chr3L 7050673 3' + Fw2 56 1 54.46 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAAGAGCTCATTA:2 + chr2L 19642382 3' - Quasimodo 25 2 56.44 CAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTTTGCTGTTGTCGCTGTTGATGTGGCTGCCATTGGGTTTCTTTGGCTGCATTTTGAGAT:1 + chr3R 29043055 3' - I-element 247 1 61.86 TTCAAACCTAACGGTTCTTTCTAAAAATACAATTAAAGTTATGTTTAATGCGACTACTGATTTTTTTTGTAAGGCAGGCTTTTTTTGTTAAGCTTATTTTT:1 - chr3R 1166365 3' + Transib5 117 1 65.35 GGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTACACAAAAAATAATATAAGACAACCCAGATTTTAAC:1 - chr2R 19091612 3' + Stalker2 362 2 63.37 TTTTCAATATGTTTACTCTNCGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTC:1 + chr2R 6779838 3' - 17.6 6958 1 61.86 TAAAGTCTTCTTATTTGGGNTTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCGCCTCCAAAGAGAAGGCGGAAGTTGGCCAGGCAAA:1 - chr3L 13773860 3' + roo 403 1 73.27 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACGCTTTTTGAAACCAATAGGTATTTTACCGATCTGCTTATTATCTTAACTTCAGGAACCT:2 - chr3R 27169408 3' - 412 17 2 60.40 AGCGAATTGAGAGCAAAGGCTGAAAGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTTGAGCCGCGTGTCCGAGCCACGGTAGAAATGAAATGAAATAAAAAGGACTAACA:1 + chr2R 17814763 3' - 1731 237 1 62.38 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGGGGCAGTGCTCCTTTGTTTCAGTTTGCCATTTGGCTGG:1 - chr3R 11607957 3' - 1360 37 1 62.38 TATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTTTAAGTGCTGGTGGTTCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGGTAGGAAAATTCTTCACTGGAATTATGA:1 - chrX 14352339 3' + copia 119 2 33.66 CTCTGAATAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCTGAAGGGCAAAAGCGGCAGTGGCAAAAACATCATCATCATCCCTAAACAAGTCTGCCAGCAAATTGAGGCA:1 - chr3L 10049164 3' - FB 283 1 77.23 TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGC:1 - chr3R 4971398 3' - F-element 39 1 54.46 CTTACAAAAACTCAACGAGNAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATTTAACTAGCAACTCGG:1 - chrX 13146907 3' + roo 9047 1 54.46 AAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGTAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCTCGTCCTCGTGTCAG:1 + chr2L 20045833 3' + roo 9068 2 73.27 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCACAAAATTGCCAAACCGG:1 + chr3L 6658241 3' + hopper 1395 1 59.41 ACTATCAGATACCCGTTACTCGATGAACGCGAAAATTCATCAATTTTCTGGGATATCGACAGATTTTTGGAATTTTAAAATACGTTGGCAATTTCAATGCA:1 + chr3R 32045904 3' - INE-1 548 1 69.31 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGGGTAATTAAATTACGTGGCCCGCGGCA:1 + chr2R 6847310 3' + mdg1 371 2 74.26 TGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGTATTTGAAGTATGTATTATTGCTATTTTTATTTAATTTTTTTCTCAGTTTGTCATTCATTCAATATTATT:1 - chr3L 14077984 3' - ZAM 134 2 73.27 TCAGAGATCATGTCTTTAATCAAATTTCTTTTTTCGACGGTACAATGCTATCCGAAGCCGGTACACGTCCACACTTCTTGATAAACAAATGGTAGGTAAGA:1 + chr3R 5542814 3' - Tc1 399 1 58.42 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCGGTCTACTTTGGCAAATGTGTTAGGCCTGTGAAGCTACCCTCTACCAAAAC:1 - chr3L 7541931 3' + roo 9047 1 54.00 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAATGTTTGAGTTTGCACATTGAAGAAATAAATGAAACAAGAGTGCAGAGCC:1 - chr2L 14262793 3' - pogo 22 1 55.45 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTGACACACGCAAGTCTTCCGTTGATCCG:1 + chr4 301767 3' - jockey 56 1 72.28 CTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCACGATTGAGCAGTTGTCGGCTCAATTTACACGGCGGACTCCAA:1 - chr3L 20670135 3' + mdg3 5287 2 58.42 TAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGAT:1 - chr2R 9905371 3' + mdg3 5446 2 76.24 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCT:1 - chr3R 10741081 3' + 1360 3371 1 60.40 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACCAGTACACTTGAATAAGCCGACTAGTATATTGCTTCGACCGCAATCCTTTCAAAATGGA:1 - chr2R 10353256 3' + blood 361 2 44.55 AAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGAAATGTTGATAAAAATGTGCA:1 - chr2L 17677729 3' + Tirant 347 2 79.00 ATTCCACTTGGTCACTTCANCTATAGTCACCGATCGTGGCCACCACCTGGTCCTGATTGGGCATTAAATAAAACGATCTGATATATCTAAATATAGCGGCC:1 - chrX 8514812 3' + Chouto 223 1 55.45 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATGAGCAAAGCCAGATGGATAGCATTCTCGGATACATACAGTTGGGGTCAAGAAAATACGAGTATGCTAT:1 + chrX 2841868 3' + hopper 1410 2 74.26 CTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACGTTATATAATGTGGCATCATTTTGTG:1 + chr3L 5712161 3' + Transpac 434 1 74.26 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTAAAATGCCAATATAATGTTCTCGACTAACAGAC:1 - chrX 10286133 3' + roo 390 2 56.44 TATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATATATATGTATCAATAGTTATCTATATGCGAGGATCGATAATCA:1 - chr3L 25777048 3' + diver 191 2 60.40 GGAGCGGAGAGCGGGTGACNGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATA:1 + chr3L 25232912 3' - GATE 8266 2 54.46 ACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATATTTGTCTGTGTGTTGGTGAGAAGCCAGCTGCCACTCAGCGATCAAATTCTCGAGTATCCTAGTTTT:2 - chr3L 5241094 3' + Ivk 5369 1 67.33 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGG:1 - chr3L 3650045 3' + mdg1 7422 2 62.00 AACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAAAAGGTATATTCGTTGCCAAGTATGTAACAGGTATTTAGTGACGTATTTTTGCGCCACCCACACT:1 - chr2L 21715744 3' + 1360 3365 1 64.36 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAATTCG:1 - chr2L 19854088 3' + roo 9024 2 76.24 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGAGTGTAAGATGAGTTAATTGTCTTCTTGGAAATTGATGGTACTGTCAACACTCGAAG:1 + chr2R 20312667 3' + 1360 3371 1 59.41 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCAGAAAACGAAGTGAAAGGATTTTGTAAATTACAATCTAGCTGTAACACTT:1 - chr2L 5926900 3' + pogo 2098 1 74.26 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATATACAGGTAAATAAAATAATCCTATCTCCA:1 + chr3L 15033392 3' - I-element 9 1 70.30 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAAT:1 - chr3L 21144063 3' - jockey 56 1 73.27 AAACGTGCACTGAATTTAANTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCAGCTAAAATCACTCAATC:1 - chr3R 27116745 3' - P-element 56 1 21.78 TCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATATACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAAT:1 - chr2L 14793504 3' - Stalker2 7293 2 66.34 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCACACACACGCGAACTCACGCACACACACACACACACATCCACTGACCTTGGAGTATGCAACACTTTT:1 + chr3L 9775723 3' + hobo 2930 1 62.38 ATCAGATTTCATCTTCAAANAAATATAAATAAGAACTGTGTGTGGAATAATAACGTAAAACTAAAAAAAAAAATACT:1 - chr3R 22193512 3' + mariner2 775 1 80.52 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTCATTTAAATTCCTTGCCTTCTCGTT:1 + chr3R 14580346 3' + blood 7338 1 74.26 CCGTGAGTTAATAAAAAATTCGCTGCCGCGGGAAAAATTTACAGCGCATAATAAACCGCAAGGAAAAGGGGGCGTGGCGGGCGGCCATAAA:1 - chr2L 9276158 3' + HMS-Beagle2 449 1 81.32 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAAGTTGTTTTTTGTAGTTATATAAGTTATAAATAAAAGCA:1 - chrX 16878405 3' - F-element 55 1 71.29 GTTGTTTAACGTTATTTTTNTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATTATTATAAATATTTATATACATATACATATATTGTCATGCAGATGATTGCCT:1 + chr2L 20118457 3' - copia 23 2 55.56 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGTTCGCTCAACGGCAGAAGCGTGTGCCCTCCGT:1 + chr3R 9088660 3' - hopper 2 2 75.25 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGTATTTACCTGTAGATTGCGCAATGATAAGTCTTGGTTTTCAAACAATTTTGTTTAGAGTAGCAAAAA:1 + chr3L 16546881 3' - pogo 6 1 68.32 GCCGCATGGGTAACAGTGCNTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATGCATACAGAACAACCATAACCACAAGAATTTCGGCCAATTTTCGGTGGATT:1 + chrX 6481095 3' + jockey 4964 1 52.48 AAAATGGTATCCAATACCATTAAATATGAATGGAAGCCCGAAAACCGTGGTACCACCCGAGACTCCTGCACCATCTTTGGCACTTTAGCGTGTTGAATGCG:1 + chr3R 13912622 3' + HB 459 1 55.45 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGACAATGAATTTCGTTTAAAGTACTGATAAATATGTAACA:1 - chr2R 9699810 3' - Transpac 36 2 62.38 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCAAACATTTTTGAATTCAAATTTGTCCAACAGGTTCCGATGGA:1 + chr3L 163283 3' - mdg1 7072 2 57.43 CGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACATGCGAATCAATCTGCTGATGGGCTA:1 - chr3R 10110393 3' - Doc 4 1 73.27 CGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCC:2 - chr2R 15788583 3' - Transpac 40 2 60.40 TGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATC:1 + chr3R 7869182 3' + 297 6937 2 67.33 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGCACGTTTAATGCCTCCACAAAAGCAGAGGGAAAAATAATACTTAAATAAGGAGGAACAA:1 + chr3L 3650123 3' - mdg1 18 2 61.39 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAG:2 + chr3R 8582615 3' + roo 9043 1 53.47 GAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATGGAAATGTGGAGTTAAGGGGGCTTGGGAGGCCGGGGCCAGTTCTCA:1 + chr3L 3559687 3' + opus 239 2 54.46 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGCGTGCGTGTGTGCCAG:1 + chr3R 24767860 3' - P-element 33 1 46.53 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCG:2 - chr3L 13773894 3' + roo 9032 1 64.36 ATCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGT:2 - chr2L 23286583 3' - Tirant 415 1 58.42 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAAC:2 + chr3R 14193954 3' + pogo 2052 1 76.24 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGGAGTTGCCTGAAAACCCATATCCGTGAACTT:1 - chr3L 2022218 3' + roo 395 1 69.31 TGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATTTTAGGCTTCAAGGTTGGTCTGTCCAACGTGGCGTATACGTTTATTCCTGTATGTGTGG:1 - chr2L 17040710 3' - roo 9031 1 55.45 TAAACAAAACGAAAATATCAGCGTATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTTAACAAAATAATAACAAAATAATTGACATTTGCAAAAACT:1 - chrX 9752427 3' + Porto1 195 1 75.25 TCATTAAGTGTATGCACAAGTTTATAGTATGAACCGTATGTTTCCCCTGGAAGCTGTGGGTAGCAACCGAGCATTCTTTAGGAGTGACACGACGCTCCCAC:1 + chr3L 23455162 3' + rooA 7587 2 67.33 AAAGTGCTGAACCAGCATTGGGAAACCCGTGCGCAGCCAGCAAGCACTTGCTTTTGCTTTGCCAGCTCCATAGCCTTACAGTTGACCGATGTCATGGGGAA:1 + chr3R 28012299 3' + Gypsy6A_LTR 57 1 58.42 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATTTATTGTACTACGTGAATGTCAAGTGTGGGTTC:1 - chr2L 20684282 3' - I-element 39 1 69.70 CTTATATATATGTAGAGTANAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATGGTTGGTACG:1 - chr2L 14793485 3' - Stalker2 26 2 53.47 ATCTCAGGAAATATAAAAGCTAGGCTGAGATTCAGCATACAGATTCATAGAGTTTTATTGGCTGGCAGTGCACACATATGAAAATCAATTTATTTGGAAAC:1 + chrX 14724546 3' + INE-1 151 1 57.43 CGAGAAGTTAAGCCGACGAATCAAGTTAGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAACTAATACCGGGTTTTGATCTGCATCAGGTTCTACTGTTAG:1 - chr3L 11066647 3' - Cr1a 4087 1 60.40 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCGTAGTGTCCTAGAACTTTAGTACTCTATGTCTGTACATATCTTGTTTAGTAAGCTGATC:1 + chr2L 8176484 3' - 1360 20 1 59.41 GAATTTTTCTGGGATATCGATAGAATAAAATTATAAAATGTGGCAACATTTTATATATGCAAACCGATGAAATCTAGCAAATATAAAACCATAGTTTTGGG:1 + chr2L 22177110 3' - INE-1 503 1 53.47 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGCATCGAGCGCTTTT:1 + chr3R 6034017 3' + roo 9040 1 58.42 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTAGCTGGCATTTTTAGCCAGGAGGGCACTCCTAAATCGC:1 + chr2R 14349181 3' - mdg3 40 2 62.38 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGTTCACACATC:1 - chrX 2841774 3' + hopper 1388 1 56.38 GCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCTATTTAATAGACTCAAAACTATTTGTCGCGGCCTAATTAAATTAGCAATGCTA:1 - chr3R 8248351 3' + 17.6 7345 2 71.29 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGTGTTTGGCAGACAT:1 + chr3R 17053141 3' - hopper 23 1 56.44 TCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATTGGGTTACGTAAGCCCATATCTTTTATGATACCAAAAACATC:2 - chr2L 21735008 3' - 17.6 6955 1 59.41 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATAGTATTCTTCAAAAGGATTAATGGTAATTGAACTTGGTTTTTAAACGATCGCAATTAATGCG:1 - chrX 2530439 3' + pogo 2094 1 70.30 GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTTTTCGTGCGCACTTCGGGCCAAACTCAAGTGGGGC:1 + chrX 4166443 3' + I-element 5326 1 54.46 TTACAAATATTAAAGACTATTATCTGTGGTATCCCGGCTGAGATACTGCTGATCCACCCTCATAAAACGGTAATTGGCCATGTGGCAATATGCCCCATTCA:1 + chr3L 1320908 3' - gypsy7 5091 1 73.27 ACAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATACAAGGTATCAGTTGGAAATTAAAGTAAATTTAATTTAATTTAA:1 + chr3R 15768309 3' + 1360 440 1 57.43 TCGGCATGAACACACACCCACACCCACAAGCAGACACACACACACACTAACACGCACAGTCACCCACATAGACGACCGCTCAAAATGCAAAAGGCAAC:1 + chrX 12148720 3' + accord 7022 2 64.29 AACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAAACCGTTCTCTTTGAAAGCTTTACGTATTTCGATCTTTGAAATAAGCGTCACTCACACGCACGCAGAGAG:1 + chr3L 21479666 3' - Cr1a 35 1 59.41 GTTACGCATCTTGTTATTCNAGTGTCTTTGGTTTATATGACCCACGTTTTGGGAATCTTTTCCCCTGCCGTTTGAGTGCCTTTTCCTCTCTGTTGTGCCTA:1 - chr3L 171151 3' + 1360 3380 2 71.29 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAATAAATCATCAGTGCCACGAAAATGGGA:1 + chrX 15546243 3' - blood 6 2 73.27 CGGCTGCTTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGACCACCCGCTCCCATTCGTGCCCATTCCCAAGTTGCCAGCGC:1 + chr3R 6961132 3' + 412 460 2 57.43 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTCTGCACTTTAAGCACTGCCACTC:3 - chr3R 9278348 3' - roo 53 2 82.18 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATAGGAATGCTAATTAACTACAATAAAACATTTTGATGGAGCGATAGATTTATGTATATAGGGATTTCCTTAATATTTG:1 - chr3R 13912995 3' + mdg1 399 2 55.45 AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACCTACATACGTACATATAACAACTTATGAATCTCAATCT:1 + chrX 9205566 3' - diver 5928 2 64.00 CACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACATGCGAATCAATCTGCTGATGG:1 - chr3R 10110397 3' - Doc 8 1 69.31 TTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTATTTATTTATATTACACATATACACACATATATATATGCTTGCATTTATCAGACGCTA:1 + chr2R 12077971 3' - 1360 3002 1 84.16 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCCTGCCAGCGCGCTGGCGA:1 + chr2L 10166031 3' - jockey 56 1 76.34 GTCAACTGACGGGACATTANTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGAACTGCAGCTTTAGCAGGCAAGTCTGCTACTGGCACATT:1 - chr2R 21962627 3' + 297 6945 2 62.38 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCATTCTTAGTCTTATCAAATCGTTCG:1 - chr3L 14222477 3' + roo 9022 2 77.23 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGNCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGTACTTCCATTTAACAGGGAAATAACGTTAGTATGTTTGTTAAACCAAAAGCGTAGTGG:1 + chr3L 7307295 3' - hobo 17 1 60.40 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGTGGGCGTAATCCA:1 - chr3R 25021653 3' + roo 405 1 75.26 CCGCAGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTTACACAGCTTTAAGGGTCAAAAATGCTGATCAAAGAGGCAAAATAATACATATTTGAGCAG:1 - chr3R 22520880 3' + Quasimodo 318 2 61.39 TCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACTAACAACAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTGCATGTGATACAAATAA:1 - chrX 22689539 3' + 1731 4595 1 54.46 TGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAACGAGAGTACCAAGAAACGGATCGAGAACTACGCCGTC:1 - chr3R 21884183 3' - mdg3 5293 2 63.37 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGGAGAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTTGCCTTTTTGCTAAACAGT:1 - chr2R 21747533 3' - mdg1 33 2 54.46 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATGGCCAAAGTTGGTGC:1 + chr3R 12767351 3' + blood 7364 2 53.47 AACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATATTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTTTATTTTATCACATTGTTTTGACTTTTTGTCAAGTTA:1 - chr2L 8216939 3' + 1360 3008 1 77.00 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATGTGC:1 - chr2L 12958927 3' + roo 9048 2 66.67 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCTCGAATAGAGAAAA:1 + chr3L 8039428 3' - hopper 14 1 65.00 AATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTTTTACGATTATCGTCGCATGTGGA:1 - chrX 18772874 3' + jockey 4869 1 76.24 CAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATACATATATTATCAATCGGACTTATTTGTTGGATGATTTACCATGTACATATATAATACTCGATCACACAGA:1 + chrX 20419224 3' - flea 4762 1 73.27 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGAAAATGCTGCAGACACGAGGGCGGTCGGTCAATCAAAG:2 - chr3R 9088533 3' + hopper 1411 2 75.25 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGTTTTCTAACACGGAACGA:1 - chr3R 21365476 3' + P-element 2878 2 70.30 AGTTTTCATCGTTTGCCCANCCTTAAGTAAACCTTTAACAAACATTTTTTCGATTGCACATACTTTATTTAAATACTTAATACTTGATTTAAATAAAAATT:1 - chr2R 18516190 3' + FB 375 1 48.51 GCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTGTCCAAATATATTCAAAAACTGTAAAATCAGAGACACAGAGAGCAGCGAAAACTTAACTGCGAATTCAGCGGCTGA:1 + chrX 8410454 3' + 412 315 2 57.43 AGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCG:1 - chrX 15263440 3' + invader3 5427 2 68.48 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACAAAAAGAAAAGCTT:1 + chr2L 17079900 3' - jockey 4804 1 51.49 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATCGCCGTACTTAAATC:1 - chr2R 22051464 3' - Tabor 33 2 54.46 ACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATGGTT:1 - chr2L 14793491 3' - Stalker2 32 2 55.45 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGTCACACTGGGCAGGCTTGCCAATTTCAAGAGCCGCGGCCACACTACTGCGAATTCTATACTGCA:1 - chr2R 9693286 3' + P-element 2877 2 69.31 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGNTGCAGTTCTCTGATAGCGGTCAACAAAGGTTTTTACCCAGAAAATTAGGGTATGAGATTAGGTTAAGGATTGCGATCTAAA:1 + chrX 10451553 3' + hobo 2928 1 66.34 TTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAAACTATTCGGCCAAATTTTAAAA:1 - chr2L 16139104 3' + copia 231 1 55.45 TATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGCACCACCTCATCATATAATAATTATGTATTGTCCTGTTTCCACTCTCC:1 - chr3L 15630696 3' - Quasimodo 111 2 52.48 TTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCTGCAGATCTTGAATTTTTTGCACGCACATTAAAGCTCC:1 - chr2R 1725385 3' + Stalker4 416 1 62.00 TTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAAGGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTACAAACGACGATGGATCAAGAATTTGCCTATCTGCTTTCACCTTA:1 + chr3R 17412239 3' + HMS-Beagle2 6933 2 58.42 AATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGCAGGGGTAGTTCAATATCGAGTGACTGCAATATTTCCCATATTT:1 + chr2R 13620610 3' + baggins 5335 1 68.32 AATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGC:1 + chr2R 14997926 3' - McClintock 5977 2 57.43 TCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCC:1 - chr3L 25059095 3' - mdg1 7090 2 78.22 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACC:2 + chr3L 20411839 3' + roo 356 2 77.23 ATACATATTTGTAACAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACAACTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTATATTTGCGCAAATTTCTAATGGATTTTCCTAA:1 - chr2L 18240911 3' - accord2 7519 1 63.37 CCACTTGTTAAAGACGAAATAAAGTCAAATGCTGAGCGATACATAAGACACTGTCGCCATGGGATTCACGTCGAACTTCCACACAAAAAGGATGACGTCGT:1 + chr3L 27361895 3' + G3 4340 1 59.41 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGATTGAACAACATTTTTAGAATGATTAAGTTCGTTATGGTTTCGGGTTACAGAAACTCATAG:1 - chr2L 12511522 3' - copia 4885 2 61.39 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAGGCGAATTATACTGTAGTGGTTCTTGGCGAGGCCAAATTTATGTGT:1 + chr3L 13785426 3' + pogo 2054 1 78.00 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTATTATAGA:1 - chr2R 12473044 3' - Doc 23 1 52.48 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTCGACTGGGTCCCGCCCAC:1 - chr3R 7139255 3' - pogo 49 1 77.32 AACATTTCCTCACTTTGTTTATATTGTCTGGCTCTTACCGAGTTTCTTCGCCGATTTCATTGCCCGTTTCATCCCCTGTGCTTTGAATGTCGCCCTTATCG:1 + chr3L 23773540 3' + Transib5 2627 1 82.18 GACCCGACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGAGGACCAATATGAACCAAGATGGCATTATAACGATAGAGGAGTTTTTGGAGGCCTGCCTGAAGGACGACTTG:1 + chr3R 25869606 3' + R2-element 291 1 61.39 CACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCATTCTCGATGCGTGTCTTCTCGGTTGCTTCCCAGAACTCCTTGTCCTTAACCTGCTTTTCGGCC:1 + chr3R 4431429 3' - 1360 46 1 68.32 GAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTAC:1 - chr3R 22869402 3' + Bari1 1656 1 74.26 AACGAGTAAAGTCTTCTTAATTGGGATTTTACAGAAATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCATCTGGGATGGTTACCCTACT:1 + chr3L 20411861 3' + roo 397 1 51.81 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAGTTCAGTTTCTTCTGTTATGCAATGAGT:1 - chr3L 21970815 3' + pogo 2056 1 72.28 TCAAAAATTCGATTTTTCCNACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATCGTATTCGGTTCAGTTTTCAGCTTCTGCTGGCTTGGTTTGCCTTTCACATGAAA:1 + chrX 2462105 3' - FB 18 1 59.38 GTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCA:1 - chr2L 14793497 3' - Stalker2 7286 2 61.39 GAGAAGGCCGTAATGGGAAATGGCCGGATCGGAGCAAGGTGCGCTCACCAAGGTCCTGGACGCCTTCCAAAACCAATGAGCATTGAATTGATCCACTGA:1 + chr3R 20927506 3' + accord2 254 1 67.68 ACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAATAAATATGTATGCATTTATAAAATTACAAAAGAACAATAACCCAAAATATATGTATATGCTCGC:1 + chr2L 20684354 3' + I-element 5344 1 67.33 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCC:1 + chr2L 4063736 3' - roo 8718 2 84.16 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATTATTAGGTATTCGATACTTAATTGCAAAATTCTTGCA:1 - chr2L 20118388 3' + copia 217 2 67.33 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCGCTTGAAATATAATTGGACATATTTAAAGCAGTATACCTTAACTTT:1 + chr3L 20755406 3' - I-element 32 1 58.42 AACCCTTCCGGATAATATTNTTATCTTAATTCCAAAATCAAAATACATTTTTGTTAGTTTAACAACTTAATCTGTGTGCCGCCGATCCAGGCAGGGATCGG:1 - chr2L 17474605 3' - Dm88 4317 1 60.40 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGAATAGAGTTTCTGGCTTTGTCGCG:1 + chr3R 13353248 3' - 1360 53 1 78.00 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATAATAATCATTTTATGTGCATGTTGTGTG:1 + chr3R 20332911 3' + jockey 4946 1 71.29 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTT:1 + chr3R 12767331 3' + blood 332 2 71.29 CGTCATCGGCCGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAATCAATGCGGCAAGCGAACTGGAACGAAAAACACTCAGC:1 - chr2R 10013927 3' + F-element 463 1 60.64 CTGTAATCTTGACTCTTTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTCTAACTTTTTATACCCGTTACAGGGTAAAAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGATAAAAAGT:1 + chr2L 23075091 3' + Cr1a 4231 1 46.53 TAATATATTTTTAAAGTTTATTTTTAATTTCAATAAATCCGTGCAGCAGTCGTCGCACATCTTGTTTTCCCATTTACTTTATATATATTTTATAAACCACT:1 + chr2L 19681277 3' + hopper 173 1 64.36 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTCATGCTATCCTGCTTTCCGACG:1 + chr3R 23543022 3' - 412 29 2 57.43 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGACACACAGCTGGACG:1 + chrX 22593189 3' - 1360 13 1 75.93 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGTACTTCCATTTAACAGGGAAATAACGTTAGTATGTTTGTTAAACCAAAAGCGTAGTGG:1 + chr3L 7307295 3' - hobo 12 1 63.54 TCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTGGCCTGCCACCTGTTGCGCTGCGGCTTAAATGCCCTCGAAGTTGGCTAACAAA:1 - chr2R 21493658 3' - transib2 2445 1 75.29 TCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAGCCGGTTGGCCTTTTTTTCTTTTTTGGGTTTT:1 + chrX 10923445 3' - mdg1 7434 2 77.97 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTGTGTCATGCAGTTAAATAAATTTCCTCAGTTCCGCCACTGCGACTGCCATA:1 - chr3R 22063528 3' + roo 358 2 50.50 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGA:1 + chr2L 7666155 3' + roo 9022 2 75.25 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAGATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCCTTGTTAAATCAGCTGGCATTGGGCAAAAACCAGCGGAACGAA:1 + chrX 11017057 3' - roo 8696 2 58.42 CAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATA:1 - chr2L 3699425 3' + mdg3 5448 2 72.28 AACTGCTACCACTGACTACTTCAGCTTAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAGTCTATTAGCAGCCTGGGATTCTGGAAATAAAAAGTAGCGCAAGGTGG:1 + chr2L 22216574 3' - diver2 67 2 71.29 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAAATAAATTCAATCCCACATGAGATTAGCAACAAGTATGAAATACTCCGAATAAAAATGGCTGCAAA:1 + chrX 12389142 3' + I-element 5340 1 63.37 GTGGCGATGACCGACACTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTATATCTCTTAAGATAACCATACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTCT:1 + chrX 22576486 3' - Burdock 6290 2 71.29 CGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGACGGATCCAACTCGAAATGCCCTTCCCCTTCGGCTAACTCGGAATGCTCTTCAAACGGACGCCTCT:1 - chr4 377471 3' + R1A1-element 5053 1 65.35 TCCAGATGTCCACTACAAGCAACAAAAAATGCGGCTTAAGTTGAACTGCAATATCCGACGGTCATACGCTGCGAATGAGCAATATAGTACTGGCATTTTCC:1 - chr3L 5416997 3' + Fw3 2977 1 53.47 GACGTTCATACAGACAGACTGATCGACTCTTAAGGAAAACAATGCAAAGTAAGCCCTAGGTAGCCAGGCTACACTTTGCCTCTAGGCTTCGCCTTTTAAGG:1 - chr2L 19636900 3' - INE-1 126 1 78.22 CGCTAACGGAGAGTCCGTGCAAGTGGCGGACCACCTGGTCTGGTAAGCATTACCCGGGTAGCTGTGGTTCTTGCACGCACGCAGGAACCCGCGTTTCACCA:1 + chr2L 6677520 3' + baggins 286 1 59.41 CCAATTAAGAGAACCTAAATTTACTATTATTAAAGGCACTCCCGAAACTTAGTTCGTTTGCCATCCAATTCATCATTATCGGCTGTTTTTCAGTCTCATCC:1 - chr2L 14143184 3' + I-element 237 1 75.25 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGATATTATAGATACAACTTTCTAATTGCAAGCCTTAAGACATTGTGG:1 + chr3R 27131972 3' - copia 31 2 56.44 TACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCAACATCCTATATATAACTTG:1 - chr2L 22092951 3' - INE-1 532 1 65.35 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCGGCAGCAGCACTTAAGTCTAATTAAAATGCTGCCCCCTAATTAATTAACCAAA:1 - chr3L 1998802 3' + hopper 1394 1 52.48 ATAAAATTAATTAAAATTAATTGCCGCAGGCTGTGTGCTAATTATGCCGAAATATTGGGGATTTCATGGTTTGAGAATGCTCGGATTTTCCGGCTTAGAGA:1 + chr3R 7650152 3' - HeT-A 378 1 79.21 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCAATCTGTCC:1 + chr2L 17730532 3' - pogo 11 1 70.30 AATTAAATAATTATTAAGTATAACGCCGGTATTTCGTTACAAAATATCATTGATTTATACAAAATTCCACGGGCAACTGTGATTAATACTAAAAGATTGAG:1 + chrX 22928501 3' + Tc1-2 392 1 77.23 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACTACGGGTGTTGATGGCGATCGATAACTAACCGGGTGAGAGTTGCAAACTATTTTGTATCGCTTTGGCGGTGCT:1 - chr2L 8176377 3' - 1360 4 2 75.25 TCTTTTGCATTTCTTTTTTTTTTCTTTTTCCTTCGGAACCATTCCCTTTGCCTCAACTGGCGACCATTTCGCGGAGATTTTTTTT:1 - chr2L 10114392 3' - gypsy2 408 1 57.65 AGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGTATGTAGCATATCCCCTTCCGTTTTTTGGTTTCGTGGTTTGCCAGTTTAAATGG:1 - chr2R 19102142 3' - opus 16 2 63.37 AGATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAAAAGGTATATTCGTT:1 - chr2L 22113015 3' + 1360 3285 1 62.00 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTA:1 + chr3L 2176366 3' + roo 9028 1 72.00 GTGAAAAACACATTTTTGTNAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCTC:1 + chr3L 8039416 3' + hopper 1388 1 52.48 TCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATGTAAACAGGTACATAAGCAGCCAGTTCCAGGTATTTGCCACATGGGGCATCAACAGAGGGTTCCCA:1 + chr2L 20567919 3' + 297 390 2 77.23 TATATATGTATGTATGTACTATATAGCCATGTACATCAGGTGGATTCGCATGCAGATGAAGAGTCGGCAACGCCTCATGCCGAGCGCTTAACTTTT:1 - chr3L 1678154 3' - INE-1 65 1 69.79 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTG:1 + chr3R 20905450 3' + pogo 2052 1 72.28 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGGAGTTGCC:1 - chr3L 2022241 3' + roo 9035 1 61.39 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATTACCCCTTTTTGTGCAGAACTTTTCTATTAAACTTAACAAGCAAA:1 - chrX 9780440 3' + 412 7513 2 57.43 GCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAG:1 + chr2L 12808213 3' - Tirant 51 2 73.27 CGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCCGAGTCCTTTACCATAGTCCCTTTTCAAAATAAAGTACGACAAACAATCATAAACCCAGAGTTTAACTTA:1 - chr2L 23381888 3' + Ivk 328 1 74.26 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCGTATGTCACTGTGCTCTGCAAGTGTGTGAGCG:1 + chr3L 8268203 3' + hobo 2906 1 63.33 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTAGCTTATACAATTTTATTGCAGCTGT:1 - chrX 12906527 3' - P-element 50 1 29.70 AAGAAAAAAAAAAACCTTAAAAAGCAGCATTGCGAAAGAAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGCAACACGAATTCTTTTACCCTAAATAAT:1 - chrX 4081070 3' - Tc1 1468 1 67.00 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTGGTCAATGAGAGTGCGTTTTCTTTAAGTTG:1 - chr2L 20620120 3' + roo 355 2 76.24 ATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGCTCTGACTG:1 + chr2R 14997934 3' - McClintock 5969 2 61.39 CCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATGTGTGAGTGAGTCGGGTCAAATAAATGACAGCCCAT:1 - chr2R 21433146 3' - HMS-Beagle2 35 2 60.40 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAAGAACAACAATTAACTTTCTTCAAC:1 - chr2L 17244999 3' + copia 226 1 54.46 GCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTCAAAATAAATTAAAAAATAATCTGGCCCAGTATTCATAATGCTGTATATTGCAAAAATTCATAAG:1 + chr3R 16580801 3' - Doc 360 1 74.26 TAATTGTACAAGATTCAGTAATGAACATAGTATTTCCTAGTATTTTAGGTTAACAGCTGTGTTCAGTCTTAAGTATAAACTCCGTCGTTGAGACCAACATC:1 - chr3R 25397882 3' - Chouto 5861 1 58.42 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTAAAATGCCAATATAA:1 - chrX 10286151 3' + roo 9035 1 62.38 CAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTACCTGCTTTTC:1 - chr3L 6023290 3' + hopper2 1566 2 64.36 TGTTTTGCCGTTTACCTTTGCAATTATCCTTCTGCTTATAAGAAAGCTAGACAGACAACGGATTGGGGTGTCGGGCATTTAATGAATTTTCCACAGGGCGT:1 + chr3L 20063752 3' + Tc1-2 135 1 57.43 AAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGTTCGTCATAGGTGTATATTATTTTGAAAAAAATAGGGTA:1 - chr3R 30553534 3' + 412 7530 2 62.38 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTGTGTGGTGAGCATGTATTCGGTGGCGCCAGGGCACA:1 + chr3R 17059219 3' - hopper 36 1 62.38 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCG:1 + chr2R 10670032 3' - jockey 4795 1 63.27 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCGGAACACGTTGTTAG:1 + chr3R 14193970 3' + pogo 2074 1 57.89 TTTAATATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACATCCACGGTATGAAAGGCAACAGTCATGGGAGATTCCGTAGGCACACGTCGGC:1 + chr3R 1435386 3' - 1360 3003 1 49.50 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGGAATAATTAATGTAATCAAGCGACGTGCCCTGAGTTTACTCGTAACTTTCTGGCACGTAAGAAAACGAACGA:1 - chr3R 17660449 3' - roo 3 2 74.26 GTTTTTATTTTATTTTATTTTTTCTTTATTTTAGCAAACAGGTATATTTATACAGGTACTTGCAGCCCATTTACTACTCCTTACCGTGAAAT:1 + chr3L 15206420 3' + transib1 1899 1 82.61 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGC:1 + chr3R 6034004 3' + roo 9038 1 67.78 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATTTTTAGTTGAGCTCTAGTTTTGAAATTAGTCAAATATAATCATGTTATTA:1 - chrX 7157256 3' + blood 354 2 51.49 GGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGCTTTCCTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCTTGCTGCTTTGCTGGCTGCTCCTCTGGAAACGGGAGGCTGC:1 - chr2L 8915709 3' - R1A1-element 442 1 61.00 ATACTTGTGAAAAACACATNTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATG:1 - chr2L 18213155 3' + hopper 1382 1 55.45 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCACAGCGGGCCCGAAGATAAGCCGTTGAAGCTTAAATTTATGCTAATTTGCGGC:1 - chr2R 23780001 3' - mdg1 23 2 56.44 TTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGGCAGAAAGGGATGCCACGGAAAATTGGATTTGGGGTCCAAGTCCGG:1 - chr2L 12808156 3' + Tirant 383 2 56.18 AAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTGCCACGTTTACCCACAAATGAGCAGCATCTAGTTGGAAATTTGGGGATTCAATAGAATGAT:1 - chr3R 24745060 3' + Idefix 211 2 57.43 ATTATCTGTAATCTTGACTCTTTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTCTAACTTTTTATACCCGTTACAGGGTAAAAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGATAA:1 + chr2L 20491470 3' + Cr1a 4226 1 50.50 CGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAACAATGAGGTGCAAAAATACATACATATACATATAAGATATATATATATATATATAAAGCAC:1 + chr3L 20083827 3' + blood 7374 2 37.62 TTTCTCACGCCACTTGTTTCAGTCTTAAGCCGACAAATCAAATTGCAAAAAAGCGCACGCTTTTAACTCAAAAATGCAAACCGCCATGCAAAAGCGGAAGC:1 + chr2R 23106447 3' + Tom1 264 1 70.30 TGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCCTACCCAGCCTTTGGAGCCCTTCTATAGCAAGCAGTAAATATGCATTTTGTTGAATTTTCCATTTCCATTTG:1 - chr3L 3880954 3' + blood 7386 2 76.24 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATATTGTTTTCCACAATTCGATTAGAAAATGCTTTCCATTAAATTCATTAGCGCTGGCCATCTGCAA:1 + chr3L 9910456 3' - 297 1 2 77.23 CTCTCAATCAGCTGCTTAAAACTTGTTGATTTAGTGTTGAGTGAAGTGCTTCAAGAAAAATATCGATGAATCGTTATGTTTGCAAGTCCCAGCAATCGCAA:1 - chrX 23007700 3' - transib2 169 1 74.26 TATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATATATATATATATATACGTTCTTTTTACAAATAAAAATGAAAGTGAATTTTCATGTTCAACTAA:1 + chr2L 21090980 3' + 17.6 7412 2 73.27 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATGGAGTCCTAGAAGTCTAGGCAGAA:1 + chr3R 6266345 3' - roo 51 2 76.24 TGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACATGCAATATATATGTAGCGTGACTCTGGATGTACTAGGGATACCCCTCATACCAGTAACTGTAAGTTCAATG:1 + chrX 288881 3' - Doc 4397 1 76.24 GGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAATTACGGTGCAATTGTGTGAGTGTGCGTTCGAACTT:1 - chr2L 23390331 3' - gypsy6 13 2 64.36 AAAAATTCGATTTTTCCAACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCAGAAGTGCATTGCGAACACCTGCAGTCACTCCTCCGCAGTTGGGCCCTTGTTAATATTGATG:1 - chrX 12768225 3' - FB 16 1 61.39 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTT:1 - chr3R 7869106 3' - 297 20 2 60.40 CCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTCTGTACATCGGTACTGTGCTCATATCTCGAATGCAATATGCCA:1 + chr2L 20367391 3' - Doc 9 1 69.00 ATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGCGTTCCACTCTGCTTATCCAACTCCACCTCTTACCTTGGTGGCACCCACTCACAATTCCCGGCAAGTCGATG:1 - chrX 14117214 3' + R1A1-element 5277 1 46.53 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGGGGCAGTGCTCCTTTGTTTCAGTTT:1 - chr3R 11607970 3' - 1360 46 1 74.23 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGAGATACGGGGACTGAAACGCCGTTGACAGCGGAAGTTTTTTGTTTCTCCGATTT:1 + chr2R 9649251 3' - roo 8686 2 58.42 TAGCCGATGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGCGGAAATGAATCTTTATAAGGAGTCTGGTTGTATATATTTGGTCTT:1 + chr3R 833196 3' - Bica 4681 1 54.46 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAG:1 - chr3R 10087834 3' + roo 9028 1 65.35 ACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAAGCGCAGGAACTACATTGCCTCTGGATCTTTGCCCGGCTACTATCCGGCCAC:1 - chr2R 21347521 3' + F-element 4258 1 57.58 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGTCATAAGGTCTTTTTAGTTTACTTTGTCT:1 - chr3L 3757318 3' - roo 8672 2 71.29 AGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACTATGATAAGCT:1 - chr2R 22051481 3' - Tabor 6889 2 71.29 CACGTGAAATTGTATTAGANTATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTTCAATTCTATTAACCGGGGAAACCCACATCGCTGTGGAAATATGCGCTG:1 + chr3R 26765178 3' + mdg3 5473 2 51.49 AATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATTGTTTTAAAAAGTTCTTGAATGGGGACTGCGTTTTTCTCTGTATGGGAACTG:1 - chr3R 6837423 3' - Doc 4636 1 57.43 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAATGCCGATCAGATGCGGAGTGGAAAATTATACGAAAAAGAAAAACAATTAAATGACAAATGACGCG:1 + chr2R 12812352 3' + jockey 4981 1 73.27 TACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAGCGACATATAACTCAAATAAAATAAACATTGGCCAT:1 - chr2L 18498077 3' + roo 8957 2 73.27 TTCAAAAATTCGATTTCTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAAGAAGGAAATTTTTTAGCACA:1 + chr3L 22744719 3' - FB 19 1 76.53 GTGCTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGATACATCTACACATGTACATATGTATGTGTAGGGGTACACACAA:1 + chr3R 10095097 3' - Rt1b 5009 1 57.43 GGCAAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGT:1 - chr4 158192 3' - gypsy 7140 2 60.40 AATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAAGAATGAAGTTGAAAAGGCTTGGTCTGTCAAG:1 + chr4 74316 3' - 3S18 5810 2 67.33 GAGTGTTTATCGGGTGGACNTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTCGCGCC:1 + chr3R 29287567 3' + hobo 2909 1 55.45 GCAGTGGTTGTGGGTATTTTATTAGTGAGTGGGGAAATTAATATCAGCATTTCAAGGACACTGAACAAAAGGTATGCCAGTTATTTTTATGCTGATGATTC:1 - chr3L 5639768 3' - accord2 7345 1 67.33 TATTTTATTTAATTGTTCTNAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACTTATACCACAATTTTATCGAGTAAGCCGCAAAACTAGTAAACAGTTTGAG:1 + chrX 5475468 3' - 412 23 2 54.00 TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAAACTATTCGGC:2 - chr2L 16139116 3' + copia 5088 2 60.40 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCGGAACACGTTGTTAGCCCGGCTCCTCGATCCCCCAATTATCC:1 + chr3R 14193997 3' + pogo 2095 1 69.31 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGGAATTATAATAAATTTTATAAGTAGC:1 + chrX 21468682 3' - transib2 45 1 73.27 AATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGAAAAGGGTCTTTGCTCACTTTCTAACTCGCATTTTG:1 + chr2R 20300481 3' - flea 198 2 65.35 GCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAGATTGTCCTGTTTGAGTGGCTG:1 + chr3L 2656427 3' + Stalker4 217 4 48.86 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGACAATGAATTTCGTTTAAAGTACTGATAAATATGTAACAGA:1 - chr2R 9699808 3' - Transpac 4953 2 60.40 TGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAATCAATAAAGAGATTTAAAATTTACAAGTACTCGTGTGTG:1 + chr3L 20317871 3' - 3S18 5802 2 58.42 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAATCGATTTTGTTAATGAAAACGAAGGAGAACTTCAAGGAGAAGGCCA:2 - chr2R 19061215 3' + roo 9046 1 53.47 CTGTATGCTGAATCCCAACCTTGTAGTTCCTGAGTTCTTGACATTCTCCTGCAGGAACATATGCAGGCAGCGCTCGTTCTGCGCCAGCGGATGTCCGGCTA:1 - chr3R 12629349 3' - INE-1 174 1 67.33 AACCAACAAACCGCGAAGTNGTAATTATATATATTATCTGTCTTAAAATAGAAAATGAACATAAGGCGCACATTTGGCATATTTTATGAGGATATATAATG:1 + chr2L 4134922 3' + Quasimodo 7362 2 74.26 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGCTGTTAAGCTTTAAAAATGTCGGC:1 + chr2L 18248074 3' - blood 7022 2 68.32 GCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTCCACACATTCTCGCTTTCTTGGT:1 - chr3R 20064768 3' - I-element 422 1 77.00 CTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTG:1 + chrX 11025551 3' + hopper 1362 1 79.21 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGNCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCG:1 - chr3R 21365494 3' - P-element 27 1 52.48 TTTTTTTTTTCTTAATTTTTTTAGTTTTCAAGCCAGTTGCCTTTGGGCCACACTTGCCAGGGGGGTTGGCAATTGAAAT:1 + chr3R 30675893 3' - Doc 4695 3 91.14 GATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGGGCGTTCATTGTGGTCGCTTTTCAT:1 - chr2R 14576527 3' - gypsy5 53 2 75.25 TGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCATTTCAGCCAGCCATTATAATGCGTTATGTAAACTGTACTTAATTTATGTTCTTTTCCTTTTTA:1 + chr2L 1209941 3' + roo 8930 2 67.33 TAATAATAATACAAATAATAATATTAATACCAACAGCCGAATGCTAGCATAAAACGTTGCCCAAAAATGAAACGGGTTTCATTTCGATTTGATCAAATTTA:1 - chr2R 12542363 3' + mdg1 7080 3 79.21 TTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAAGCAATTCAAATGC:1 + chrX 12906546 3' + P-element 2826 1 18.81 TTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACAATAAGAGCCTAGGACATGTTTGTTTACAAAATAAAGTTTCGCCTAGCTCAAGACAATAGATATAAACAA:1 - chr3L 22778957 3' + INE-1 131 1 64.36 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGTCTTTCGTTACCAGACTGAGACAAAGACAAACACAATCAAAAGGACTTGGTCGAGGCG:1 + chr2L 10625756 3' - roo 17 2 62.38 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTATCAT:1 + chr2L 21086099 3' - roo 29 2 56.44 TGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAAAAGGTATATTCGTTGCCAAGTATGTAACAGGTATTTAGTGACGTATTTTTGCGCCACCCACACTGGCCAA:1 - chr2L 21715738 3' + 1360 3371 1 70.30 GAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 8269 2 51.49 TGATATTCACGGCAAGTATCTTACGATAATATCACTTTATTTCGGCAGTCAGCAACAGTGACAAAAAAAAAGGTGTAGAAACTCGATGATGTACCCGTAAA:1 - chr3R 5027704 3' - Chouto 172 1 62.38 GTCAGCCCGACGGCTACCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTTTGGCCGTTTTTG:1 - chr3R 23542964 3' + 412 7503 2 68.37 AAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTAGGGCGGCCTTATGACGTTTAAGTAGGGGTGGCAAAAAATTGTTTGGTAAGCGTTGGAAACGCTGGGAGCGTCCGTAGG:1 + chr3L 24789726 3' - INE-1 246 1 69.31 GATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCAGCCAAACAATAACAATGGCAGGCAGACAAATAC:1 + chrX 13703300 3' + accord 166 2 66.34 CGTGTGCTGGTCAGGAAGGNCGTGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCGCAGTTGTCTGCTCAGTTACTGTTTGAAAACTAGGAGTTAAGTATT:1 - chr2R 15033401 3' + invader6 4471 1 55.45 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACGGTATAAGAAATATTTTATCGTAACTAACAAGCTATCTTCTTAGATCAATATCCGCGATTCCATATCGA:1 + chr3R 17482097 3' + copia 246 1 60.61 ATAAAATATTAAAAAATATATTAAAAAAATATTCACCTTATGTGACTAGAAATGTGCAATAAAGTTGTTTCATCTTGCAGTGAAACAACAACCAAGAAATA:1 - chr3R 29554194 3' + transib4 2280 1 59.41 TCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACATGTAAAATAATAACAAGCGGACGCCGAGATGGAGATGGAG:1 - chr3L 4855252 3' + Doc 323 1 56.99 GCATTATTTAGAATTTGGTAAGGTCATCCTTGTTTTTAATTACTTCCAACATTCGGTT:1 - chr2R 4723153 3' - Tc3 1430 1 82.76 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCACCCTTAAAACAAGTAAAATGTAATCGAACAAAA:1 + chr3R 11916607 3' + roo 9028 1 67.33 AATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAGATACATATATAGATACACATGTGCTTATAGATAGATAGATACATTTCGGTTTGGAGAGTAGCGATT:1 - chr3R 10391157 3' - invader4 12 2 68.00 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAAACTACTCATACG:1 - chrX 21217496 3' + pogo 2076 1 54.46 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGCACGTTTAATGCCTCCACAAAAGCAGAGGGAAAAATAATACTTAAA:1 + chr3L 3650110 3' - mdg1 31 2 53.47 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCGGATTGCAATTAGTGCGGATCAAAAAGTTAGTCAATTTCAG:1 + chr3R 6143787 3' - Doc 41 1 61.39 GGCTGGTTTGACAGACACAAAATAAAAATCGAGGCCCAAAAAAAATGACAACAACAGTAACGGGCATATCAAGACATTACTCCGGAAATGCCAAAAAGTAA:1 + chrX 13087672 3' - Cr1a 48 1 70.30 CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGATTGAACAACATTTTTAGAATGATTAAGTTCGTTATGGTTTCGGGTTACAGAAACTCATAGCA:1 - chr2L 12511520 3' - copia 14 2 63.37 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAATATTCCAGGCTAAT:1 - chr3R 23641000 3' - 297 6590 2 77.78 TATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATCTACAGCCCGTTTCACATTGTTTGGCTCGGCAGACGCTTAATTGGGAATTTTCCT:1 - chrX 11032175 3' + invader3 255 2 48.51 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTTTAA:1 + chr3L 10474194 3' + copia 5078 2 75.25 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAA:1 - chr2R 25203783 3' + 1360 3344 1 67.33 AAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGATATAAATCAGGAATAGCTCTTATATTTCCAAATCCACCTGAGCAAACAGCTGAAAATAACCAACTTT:1 + chr3R 13910715 3' + mdg1 7322 2 50.50 AAACGCTTCCTTTTGCCTGTTACAAACTTTTCAACGAGTTGTTTCACCCCACGAGTAACGATTATAATTACTCCGAACTCGAAAAGCTTTTAAATCACTAA:1 + chrX 22642463 3' - INE-1 33 1 90.10 TTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTAGCATGTTGTTAGCTAACTTTCGAGTATCACTGTAAATTGAAACGATATTCATTTAA:1 - chr2L 21383175 3' - Quasimodo 331 2 59.41 CTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGAGGAGGTAAGTGGTTAGAGTGCCCAAATCATCCATTCAACCATCGTAATGTGTATACTCCATTGCCATAGCTGCT:1 + chr3R 14081480 3' + McClintock 141 2 77.23 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAAGA:1 - chr2L 17245021 3' + copia 5073 2 76.24 ACGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCTTGTAATATCGAAATCAATGAGATTCGTAATTCTGTCGCTGATTACT:1 + chr2L 9045477 3' - jockey 36 1 52.48 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCGATGCCGTGTATG:1 - chr3R 29608761 3' + roo 394 1 68.32 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGGATGTAGACGCGTTAGCAGAAGTTTCGTTTCCTTTGTGACTCAAAGACAGA:1 - chr3R 6266287 3' + roo 9048 2 55.45 AGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAAGCCATGCGTTTTTCGCCTCCGTTTTGGGCAATCCGTTC:1 + chrX 10229934 3' + roo 8694 2 61.39 ATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGCGGTAATATAAGACAGAAAATGAGAGGCAGTCATTATATATTGAAGACTCTTTTTGAGCCGGCCATTTTTTGCT:1 - chrX 22383047 3' + Quasimodo 6986 2 74.26 GCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGCGTGCGTGTGTGCCAGTGTTTGTTTGTT:1 + chr3R 24767872 3' - P-element 21 1 58.42 ATTGTTCTTATATGTTTTTCCTATTTCTTAAACAAAATTATTTACCCCATGCTAAAATTAATGTATTAATTGTTTTTGCTTTCAGATACGCCTTGTTTATG:1 + chr3L 1902376 3' - HB 413 1 64.36 TTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAAAGGTAACGTAATAAAGT:1 - chr2L 20560329 3' - F-element 38 1 50.50 CTAATATACTAATGTACATNTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCCAATTCGAAATGAAGATCGGATAATAATGGTGCATACAACGTCCGAATA:1 + chr3R 19449182 3' + roo 8619 1 56.67 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGGTGAATATCATTGTGAA:1 + chr2R 5772522 3' + HMS-Beagle 7009 2 64.36 TTTAATTTTATGTTTAAATAACCATTTAACATACCAAGACCCAAACAAATCAATTAAAGTGTGTTTTATTTTGTCAACAGCGGTAGCTATAATTTTTTCCC:1 - chr2R 19844747 3' - NOF 3952 1 53.47 TTTGCATTTCTTTTTTTTTTCTCTTTCCTTCGGAACCATTCCCTTTGCCTCAACTGGCGACCATTTCGCGGAGATTTTTTTTT:1 - chr2L 10114391 3' - gypsy2 405 1 61.45 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAGCAGTCAACAAAGGGTTTTACCCAGAAAATTAGGG:1 + chrX 10451522 3' + hobo 2928 1 51.43 ACTAAAACAAACAAAGGCAGGAATTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTCCCTGTCACTTGTCTTGAGTCAACTTGTCTTACCTAGCTCACGAAACGCAA:1 + chr2L 19162128 3' - invader2 216 2 53.47 TGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACATCAACTTCGTCAGCTGTGTCCAACGAAAACATAACCTCCGCTTCCCAGT:1 + chr3R 31900554 3' + Doc 497 1 65.35 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAGACGCCCAACAACTGACACCACCCCCGTTCAGTCTGGCGATTCC:1 - chr3L 699738 3' + P-element 2856 1 49.50 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACACTTTAA:1 - chr2L 4063703 3' + roo 9026 1 69.31 GTACTTGGGTAGGGGTTAANTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCCTTATTTTTTGATCCGGAGTTTTATTTTTTTATTCCTGT:1 + chr2L 9320012 3' - G2 2964 1 60.40 GCATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCAACACGCCATTCAAAATGACACTGATTG:1 - chr2L 21116008 3' + 17.6 7046 2 76.24 CCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGAGAAAGGGTAGATCCCGCGAGCAAAGCCAAAAACCAACCAATCGTACAAAGCTACCAAACAA:1 - chr2L 6764673 3' + Tirant 12 2 65.35 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGTGTAGATTTCTCTCATACCATTCTGATTTACATTATGACAAATGAAA:1 + chr3R 15579050 3' - pogo 19 1 60.40 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGAAAAGTTGAAATGTTATTTGAAATGTTGCAGGCAGTGAGGAGGCAACAGT:1 - chr2L 12882719 3' - hopper 15 1 64.36 GGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATATCGCAGACAAAGTATATAGAACATGTATTTTGCGTCCAGCTTGGAAAGTGTTGGCAAGGA:1 - chr2L 5419773 3' - 297 6581 1 77.55 ATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGCATAAATCTGATCTAATTAAATCCATTGAATCTATCACTGAACTTGAC:1 - chr2L 8748780 3' + Tirant 8278 2 55.45 AAAATTTGAAATATATATATAAAAAAAATATATTTATAATATAAAGTGTATGTTTTTGAAGAGCACATTCGAAAAGCTGG:1 + chrX 17447105 3' - copia 4667 1 76.25 CGACGGCTGCCATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGTTCGTCATAGGTGTATATT:2 - chr3R 30553554 3' + 412 457 2 56.44 TCCGGAGTAGTGTATGTTGNATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTACGGGGATTGTTGTTCTGGCCCTTGTCGAACGACTTGGCGTTGGTGGTCGCGCCCG:1 + chr2R 6705578 3' - Idefix 74 2 66.67 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGGTTTTTTGGCTCTCGGTTGTG:1 + chr2L 4063771 3' - roo 8682 2 61.00 ACTTGAATTTATGACTTATATCGTAAGGCATTCAATGATGTAGGGACTGTGTGTTAATCCGAAATATATTGACTTCAGTTTTCCCGCCAACCAGAATTTGT:1 - chr2R 3031227 3' - Quasimodo 103 2 67.33 CTTGGGAGCTTGATGGTGTAGGGTTTGCTGAAAGAATGAAAACTCAAACGTTTGTTCTCAAGGTTCAGGTAATCAATTTCTAGTCTTATCTGTTGCACTGA:1 - chrX 9184873 3' - G2 29 1 67.33 CATACACACACACACACACACTCAAAGTCGGGTTTATCTGCATTTCGGCCAGACGATTGTCAAAGTGACGTTTGCACCACATT:1 + chr3R 16014905 3' + accord 7101 2 78.31 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGA:1 - chr2R 18723043 3' - HMS-Beagle 36 2 64.36 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTGTTGCTTTTCATTTCAGCTCTCACGGACCAAAAGACTTGGGATATTTA:1 + chrX 2530576 3' - pogo 22 1 52.48 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATAAGACGAAATCCCATTGAAGGCAA:1 + chr2R 7839024 3' + pogo 2056 1 74.74 TTTTTTGTTAATTCGTTTTTTACACTTCAATGGAGAACGGAAATGTGCTCTTTTTCAATAGTTTTTCGACATTTTCCAGCTCGCCAGAGGAGGCGGCTTTC:1 - chr3L 3788477 3' - Rt1c 5422 1 68.32 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGTTAAGGCTGCCACTTCGATGGAGGAAGCGAAAGTAAATGTTTGACAGTTTATG:1 + chr2R 19840275 3' + roo 387 2 55.45 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATATACAGGTAAATAAAATAATCCTATCTCCAACAATCAC:1 + chr3L 15033400 3' - I-element 1 1 78.22 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGTCAACTGAGTGACATTCTTCATTTTGAAATT:2 - chr2L 16153371 3' - Doc 51 1 70.30 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAAGAA:1 - chr2L 17245020 3' + copia 5074 2 75.25 CAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTATATATCTCATCCGTTAAGAAACGGCGATAGCTTCTTCTTTACTGGA:1 + chr2R 4500934 3' + gypsy6 353 4 59.41 TGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACTGCTACTGCAAAGTTTGCCTGCCGTTAAGTCATTCTCGAGATACTCAATGCCTGATTTTCCACTCAAGT:1 - chr3R 31320317 3' - I-element 348 1 72.28 ATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATGCCTTTAAGTGACACTTGCCAGGAGGTTTTGTATTCCCGATGGGTGGAGTCCTTTTTGGTGGAGTG:1 - chr2L 10637189 3' + Stalker2 392 2 65.35 AAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCGCGTAACAAGTGTCACGGTGGTTTCTT:1 + chrX 9413885 3' + 412 477 2 62.00 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTGCTGGGGCGAAAAGTCTG:1 - chr3L 9910373 3' + 297 6929 2 80.41 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTTTCGCAATCAGCCATTTCCTCCA:1 - chrX 8334291 3' + flea 4985 2 57.43 CATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATTAAGCGATTTCTATACATCGCCAGTATCTAGGGGTTTTCATCTGAG:1 - chr2R 16185028 3' + 17.6 7393 2 55.45 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAACAATACTGGTAACTCTGTTCATCACATTGCA:1 - chr2R 20312597 3' - 1360 43 1 69.31 CCAAAAACAAGCGTTTCCCTTTCTCGTTCTTATCAATATCGATGTGCGTGGCTGTGCAGCCGCCCGATGATGGAAAATGTAAGTCAATCAAAGATGAGGGG:1 + chr2R 16226738 3' - invader5 217 2 78.22 TATTGCAACCATTTATTTGCAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCAGTTTGTACACAATCGTCTGACCTTAGGTCGTAAATTAATCAAGCTCCGAAGTGGGACC:1 - chr3L 18212751 3' + 17.6 489 2 56.44 TACCACGGTGCCCCAGGGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGTGCTCATTTAAATGTAGTTACGCTG:1 + chr2R 16467892 3' - F-element 4350 1 73.27 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCACTCCGGAAGCGGGAGCAATTGATGGCCCATC:1 - chr2R 23519233 3' - jockey 4803 1 65.35 AACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTCAAAGTAGGCAAGTTGCTCCGCCGAAGGACTTTTTGCTTGTTGTCGAAGTTAGAAAGGGGG:1 + chrX 18062868 3' - hobo 318 1 67.00 GCGGGAGGTGATTAGCGCGGTCATAGGCCTCAATGCGGTCTCGATTTATATACTTTATGCGAAAAGTTGGCCTTTGCAGAATTTGTCACGCACTCCAAAAA:1 + chr3R 13726770 3' + rooA 7391 2 70.30 AAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAAGAATGAAGTTGAAAAGGCTTGGTCTGTCAA:2 + chr4 74315 3' - 3S18 46 2 68.32 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAA:1 - chrX 20361963 3' + hopper 1390 1 54.46 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAATAATCGTTTATAAATGATAAATTAATATGGGAAACAAATTGTATGGGCGGTCGATAGCTCCGAGCTTAAAAC:1 - chr3L 7099555 3' - roo 2 2 75.76 AAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCTAGTTTTGTAAAAACTCATCATTATTGTAAAATATTAGTTTGACATTCAGTCGCATTGTCGCAGTGTAATGTCGCA:1 - chrX 21215541 3' - pogo 1819 1 53.47 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTTTTTTATTTATAAATAAAGATTTTTCAAGCACAATCTGACCCATTTTTACACC:1 - chrX 7797642 3' - roo 8685 2 52.48 ACAGATCAATGCGAACTAATGAAATGTGGTTTTCGTAAGTACCGTTTATTTAAAACACTGACGATTTTGACGACTCAAAATTAAAATGCAACTGAACAGAA:1 + chr3L 26711209 3' - Tc1-2 231 1 74.26 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATACAACAAGGAAGAAAAGCGAAAATTTCTTATTTCCATTTCTGTGGCTTATTTCGCTTTAGCCC:1 - chr2L 18247962 3' + blood 7380 2 69.00 GCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCTGTCCTAATAACTTCACC:1 - chr3R 12801162 3' - 1360 3283 1 82.00 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAGAAACAGTGAAGTCTAAAAAAAATATATTATAACTGAAACTATATTAAAAA:1 + chr3L 13316199 3' + roo 9047 1 52.48 TTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTA:1 + chr2R 10670037 3' - jockey 4793 1 59.41 TGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTGGTCAAGATTTTGCATCGATTTTACAATTTAAATTTGGCGTAAATATGGGAGGACGAACATAA:1 - chr2R 21325765 3' - gypsy4 89 2 68.32 CTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATAAAAATAATTTTATTTCATCTTACAAATGAAACGATTCCTAGAACGGTTTAGAAAGGTCAAAACGTTTT:1 + chr3R 7551360 3' + R2-element 3389 1 74.00 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTACCATTTTCACTGGTATTTCACCAT:2 - chr2L 20620015 3' + roo 362 1 74.26 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGTTAGTTTTGTTTGATAAATATGCATTTATAATGCGTC:1 + chr3L 872772 3' - 412 39 2 61.39 TGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAGTAATGGATAAGCCGCATTCGAAGCAATTAATTATCAGTGTTTTTGCTTGCTTTGAGCAAAAC:1 + chr3L 3242753 3' - diver 5902 2 49.50 TTAAAATTCATTTCTAACATTTTAGCCCGCTCTGCTCATCACCAACACATCGATTACTGCAGCAGTTGAATGCAGTCTGGAAAATTAGATAATCATAGTTA:1 - chr3L 19182395 3' + FB 666 2 55.45 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTAT:1 - chr3R 19450191 3' - roo 60 2 56.44 GCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATTTTGAGAGAAACCCTCGATTCGGG:1 + chr3R 10741150 3' - 1360 3357 1 42.57 CTAACTATCGATGCAGCTANGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGTGTAGATTTCTCTCATACCATTCTGATTTACATTATGACAAATGAAAATAATAC:1 + chr3R 15579057 3' - pogo 12 1 67.33 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCAAAATATACATGACCATGTGAACGAACGATGTCCCATGC:1 + chr3L 22930372 3' + roo 9037 1 58.42 TAGAATTTGCTTGCTTTTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGTGTGTTGTGGCGTCTGCTTGTGGTGGTGTATGTGTGTGTGCTGG:1 + chr2R 7737300 3' - 1360 3258 1 63.00 CACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATCTTTCTTTTAATAGATAAATAATTTGGTAATCATTGTAA:2 + chr3R 20420987 3' + blood 7353 2 60.40 TATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTATTTCAGCTTAACTCTAGATGACCTTTTGTA:1 - chr3L 15125876 3' - Juan 3761 1 65.35 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATG:1 - chr2L 20560349 3' - F-element 58 1 70.30 ACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTTGGTTAAAAATTGATAAAAGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCAGCTGTAG:2 + chr2L 15763115 3' + invader6 4386 1 41.58 ATCAAAATTAAATTTAAATAAACGGAACTTCTTTGTGCTAAGACTTGTCGTTGAAAGTGCCTTTAATCACTTTGTAATAAAACAATATATAGAACTTAATG:1 + chr3R 11810021 3' - Rt1b 128 1 78.22 CCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGTTTTTTAATTGCTTTTC:1 + chr2R 672831 3' - F-element 44 1 59.41 GGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCTGTTGCCGCTTGTTTTTTATCTACTTATATTTTAGCCCTAAACTCTTTTCTTGTTTTTTTTTGTTGTCTC:1 - chr2R 18718714 3' - Quasimodo 7026 2 72.28 GCCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAAATATTTTAGAATATTAGAAAATTC:1 - chr3R 18237659 3' + Juan 4159 1 73.00 CAATAGTTTAGGAGGGATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAG:1 + chr3R 9088621 3' - hopper 36 1 62.50 CACCATCACCTTCAACNAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGNGAACGAGAACGAGAAAAACGGCGAGCGGCTACGCAACGCTGATGTNTCTTCTCTTTGAGAA:1 - chr3R 10109543 3' + Doc 328 1 61.39 ATATTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATCTGTTGTGTTTTTAAGGCATTTCTAAGTGAAAGGTGGATTGGTTTTGGAGCTGGAGTAGTTAGTTTTTA:1 - chr2L 12522457 3' - HMS-Beagle2 6812 1 69.31 AAACCATAAATTCCAGGACGGAATATGAAATACCTAACTGAAACTAAAAGTGGATGGGAAGCTCGGCTGCAGTTTTGATGCTGCCACTTGCCCCGAGCGT:1 - chr2R 12445890 3' - Circe 364 1 69.00 GTGATGAAGATGTGGACGATGCTGAGGAAGCTAGGACGCGCAGCACTCTCAGCCCACTGGTCAAA:1 - chr3R 5584355 3' + pogo 1701 1 73.85 TCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGT:1 - chrX 2841783 3' + hopper 1372 1 68.32 TAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTCCTCAGCCCGGTGGCCTTGTCGTCCGAAAGTTGAAAACAGTATCGCATCATTTTTGATGGCCATTTGCG:1 + chr2L 21921270 3' - INE-1 563 1 70.30 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATATATATATATATCTATATCGGTAAGCCGCATTTCCACTTCTGCCATAGATATGCA:1 - chr2L 19678093 3' + flea 5000 2 65.66 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCACACATACGCACAGTTAGGATCTTTACCAAACAGAATGGCACGTACTGGGGATTTT:1 - chrX 15287849 3' + hobo 2934 1 67.06 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCAGCTTTTCCATCCGGCATTTATGTGAACCTAAAACTAAACCACATAGACTACATACTGCTTTTAACTTCT:1 - chr2L 8579113 3' - roo 6 2 52.00 CAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTACAGCGTATGAGTGATTTTTATG:1 - chr2R 20718849 3' - BS 5049 1 76.24 AACTGTATGTGTGCACACGNATGCTCATGCATTGTAAATTTGATTTAAAAATTAATATATGGCTAACAGCTGTGTTTCAGATTTTCTATTAAATTTAATAC:1 - chr3L 8449665 3' + 1360 172 1 54.46 CCTAATGTACCATTAGGCTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTTCAGTTACGCCAAGAGCTTAAAGTGGGAGGACTACATGGAAATAAATAAATAGAAATGT:1 - chr3L 12007541 3' - Porto1 4361 1 58.42 CCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAATACTAACACAACCCAAACCCAAACTTCCAAATATAAGGGAAAATATAAAAAAT:1 - chr3L 25912692 3' + I-element 4918 1 56.44 GAACGCAGGCGAAACTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCTGGAGGAGGCGTTTTTCTACTGATTGAGTGCTATGGTCATT:1 + chrX 4154946 3' + R1A1-element 488 1 73.27 GATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATGTGTGAGTGAGTCGGGTCAAATAAATGACAGCCCATAAGGCAGTG:1 - chr2R 21433137 3' - HMS-Beagle2 26 2 53.47 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTAAAACAAATAAAAAAATTGTTCTTACTGGTTTGAATAATATTAATTCCTAGCCAAG:1 - chr3L 16546763 3' + pogo 2084 1 63.37 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTGCATCCCATCCCATTTCCCATTC:1 + chr3R 30553635 3' - 412 16 2 63.37 TTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTAACAGGGCTCAAGTTTTAATTTCTTTTTT:1 + chr2L 9840190 3' - Doc2-element 246 1 78.95 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACTTG:1 - chr3L 25272554 3' - 1360 69 1 58.42 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAAATTCCAATTTAGGCGTTCATTTAGGAGTAATGAATG:1 - chr2L 14761965 3' + mdg1 383 2 61.39 TCTTGATCAGGATCACCAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCTCCGCCTGTCCGACTGTCTGTATGATCTTAGACATTGGTGGTAAATACATTATTG:1 + chr2L 22736615 3' + INE-1 88 1 72.28 CGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCAGCACACACATTCTAGGGCAGCAACATTTTATGCAGGCCTCATCCAGGGCTATGAATTATC:1 - chr2L 17966350 3' + INE-1 147 1 53.47 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTGGCATTGTTATGTTTTCTCTCCCACACATAAAAAATGGGGGAAATTGTAGGTAGCTCGTCGCTT:1 - chr3L 7307193 3' + hobo 2928 1 68.32 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATCTCGGACTTCAGGATAGCCACGGGTTCACGTTCGGG:1 + chr2R 11259622 3' - hobo 41 1 62.38 CCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCATTTATTCGCATTTAGAATATATACATACTTACTCACAATATTAAACGCTAGCTGCT:1 - chrX 5853249 3' - invader2 4810 1 61.39 GGAAACGCTTCAAAAACCAACATTGAAATCATACAGCGATCTTTGTACTGATTTTTCTAAATATGCTTACAATGGGCATCGAGCACTACGATCAGCCTCAT:1 + chr2R 24913730 3' + Doc2-element 4387 1 65.35 TTCTAGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAGACTAGACTTATCAGCGGTTCGATCCTTATCAAGTTCATCCACAGTAAAGCAGTATTATCAAATACTGTTAAA:1 + chr2R 5783739 3' - 1360 2 2 77.23 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTAAAGTTTGTTCATTTAATATTTACACGACCAGGTGGAAAGACAAACAGCCAGCGGTT:1 + chr3L 7882310 3' - FB 20 1 57.43 AAAACAAAAAAAAAAGAAAACTGTCTTTTGATGTCTTTTGTTAAATGTTGTAACATTCTTTCAATGTTGCAAATGCAATGTGTGGTAAGGTTCACGCGAAC:1 - chrX 1763015 3' + HMS-Beagle2 489 3 85.15 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATTTATTGTACTACGTGAATGTCAAGTGTGGATTC:1 - chr2L 20684282 3' - I-element 41 1 70.30 TATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTCGAGTGTGAGCTGATATGAATTTGGTGTTGGCATTTG:1 + chr2L 14762058 3' - mdg1 7039 2 78.22 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACA:1 + chr3R 8582613 3' + roo 9041 1 54.46 CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTA:1 + chrX 21668064 3' - Tabor 6882 2 66.34 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAATAAATATAGTTTTAAGATGCATTGTATCTGTTCGTCCACTGCGTTCTTAAAATAA:2 - chr2R 16207339 3' + Juan 4191 1 58.42 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCACAAAATTGCCAA:1 + chr3L 6658236 3' + hopper 1411 2 68.75 TACTGGGCTATGGGTTATTGGCCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTACATTGACTAGATATGAAATGAATTAGGTTTATAGGGAATTAATACATTTTACATT:1 + chr3L 4683895 3' - F-element 317 1 64.36 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCA:1 - chrX 15546157 3' + blood 7348 2 65.35 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGCATAGTTCTGTTACTTTTGATACTTTTGATAAGGATGCCGG:1 + chr2L 21215334 3' - BS 5008 1 59.41 TTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGGATACTCTAACGCCCACTTACCGGCCAAAACTTTAAATTTGTTTTCATTTTATTTGTCATTTT:1 + chr3L 24538218 3' - 1360 434 1 58.33 TGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGAGTAAAAAAACCACCCGAGGCCTGCTCCAATTACAGTTTGCATAGTTGAGTGTCGTCTGCGGAAATTTGTTT:1 - chr3R 11929516 3' - hobo 2827 1 57.43 AAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAAACCTTTTCTTGTTTCAAATGGCCTGGTTTTTTTATAATATTTGCTTAAATTCCGCATTGTT:1 - chr3R 7513897 3' - diver 12 2 61.86 CAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTACCATTTTCACTGGTATTTCACCATTTTTA:1 - chr2L 20620010 3' + roo 367 1 69.31 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGGGTTGCC:1 - chr2R 19560152 3' - Tirant 8123 2 57.95 CCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACAAACATGTATATGTATGTACATATGTACTTTTATT:1 - chr2L 15130896 3' - opus 268 2 72.28 TGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTCGAGTGTGAGCTGATATGAATTTGGTGTTGGCAT:2 + chr2L 14762055 3' - mdg1 7042 2 75.25 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATTTATATCGCTGAAATGCAGTCGGTCGCCAATGGCTTTATGGTTCGTGCCGCCCGTTT:1 + chr3R 5135546 3' - 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chrX 17326104 3' - Cr1a 4392 1 82.28 GGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGAGATGTGACATCTGTGGAGTGGGGATGG:1 - chrX 4095293 3' - accord 6908 2 72.28 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAAAAGAAAATTATTATGTTTATAAGGAATCAATAAAATTCTTTATGATTACGAAACAGCTACACT:1 + chr3R 19448830 3' + roo 355 2 63.37 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTGTTATCAAGGCTTTCAAGCATGATCTATCTTAAAACATTTGATTGTCATAGCTAGTACGATTTC:1 - chr3R 17781525 3' - pogo 8 1 71.29 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAACAAAAGGGATAGCGAGCAAATGGAA:1 - chr3L 21144066 3' - jockey 59 1 76.24 AAAGACCGTTCCAAGAATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACATAAAGTTAATTAAAAGTAGTCTGACAAGGACCAATTGGTAGTTCTAGGTGATTTTAATAT:1 + chr4 1266621 3' - Cr1a 4024 1 62.38 CGACCATGGGTTTATGGCGTGATGCTAGGGAAGATCCATATTTGCTCCATTGTATTTTTGGCACTCAATCAATACACTTTGATATGGACGTGCGGACGGGC:1 + chr3R 4284468 3' + gtwin 7097 2 55.45 AACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAACAGAAGATAATCAGGACAACTACGCCGAAGGAAGACCTCCC:1 + chr3L 25800521 3' + Idefix 6919 2 61.39 ATATTTGCAATATTTAAAAGTGACCCTAAAACATTTGCATAGGTTAATAGGACTAAGAAAATTGGAATTTAGTTATAAATTTGTAATTTTGTGAATGTGGG:1 + chr3L 18214986 3' - Idefix 7384 2 88.12 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTAACAACTCGAAGCGGTATCAACCGGTTTGCATTTGTTCAAAGCGGTTGCTAATGGCCTTTTGTATTTT:1 - chr2L 12459650 3' - blood 7020 2 68.32 GAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGCCGGC:1 + chr3L 13569787 3' + invader3 227 2 71.29 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCAGCTAAAATCACTCAATCAGCTGTTGCCTATCGATGAGCGGCGACTATCGATTGG:1 - chr3R 27116708 3' - P-element 19 1 56.44 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACT:1 - chr3R 10087838 3' + roo 9024 2 69.31 AGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACCGAATTCTCAGTAAATGAAACC:1 + chr3R 28275368 3' - hobo 394 1 78.22 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGCATACT:2 - chr3L 21144042 3' - jockey 34 1 52.48 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCACAAA:1 + chr3L 6658228 3' + hopper 1382 1 60.40 CTAACTTAATTTTTTTTTTTCTATTTTAATTTTCTATGGAGCAAAAGTTTAAAAAAAATATTTGTTATCAAGACAATAAATAATGTCTTGG:1 - chr2R 17445190 3' - pogo 2031 1 76.92 AATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCT:1 + chr2R 16185108 3' - 17.6 6953 1 62.38 ATTTTTGTAGGTTGAATAGNATATTCCAACAATATGAATATATGAGCTAAGTAGTTTTTTTGGACTCCATTCCCTACTTTGAAAGCAAAAACTATCACCAT:1 - chrX 22734021 3' - copia 10 2 49.50 CTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAAAAGAAATCCCACTTCTGTTAGTCTGAAAAATGCTTACTGGAACCCCAAAA:1 - chr3R 20166599 3' + F-element 50 1 57.43 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTCGGGCTGCGGTCGGCAAGCTAATTGTGGTTTATTACAAGGCAAACCAGCCAGTAGCCAGCCCTGT:1 + chr2L 6184477 3' - I-element 85 1 69.31 GACTATCAAATACCCGTTAGTCAGTTAGTATGAATGCTAATGCGAACTTTCAAAAGTGTGGGCGCAGGTGAGCTCATGGCGAGGGGCAAGTGCGAATCTGG:1 - chr4 528236 3' - INE-1 549 1 63.37 GCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGCATATTGAAAAGCCTTCGAAACACGATATTAGCGTGAATAATTATTCATATTCATTATG:1 + chr2L 14220230 3' - springer 19 2 60.40 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTATTTCAGGGAAAATACAGTCACTTAACTTAGTTGACTTT:1 + chr3R 31190841 3' - pogo 32 1 61.39 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACTTTCGAAGATCTTATTCTTTTTGCTGTGCACCAATGTAAAAAA:1 - chr3L 4565472 3' + copia 244 1 56.96 ATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAGACACACAACGTGACTGTTTACGAT:1 + chr2L 19417127 3' - BS 5047 1 75.25 TCATTTACATAAGATATGANCGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGGCTTAATATCGAAAATCCATTTACACC:1 + chr2L 19854122 3' - roo 8714 2 77.23 AATGCTATACTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGCGAATGTGGGCTGGACAGTTTTTGGTATATCGATACCCGGTACTCAGCTA:1 + chr2L 22067312 3' - INE-1 570 1 73.27 AGTCTTTAAATATATTCGTNTTCATGTGTGAACACGCACTTTACCCAAAAACACAATTGAATAATGATAATTTCACACGTACTTTTCGGGGCGAATAGCCG:1 - chr2L 7666085 3' - roo 8677 2 66.34 GACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGATCGCTTGATCTTTAGCTCCTCCTGCAGATAGTTCTCGAACT:1 + chr3R 20587208 3' - R2-element 3193 1 58.42 TAATATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTA:1 - chr3L 15125906 3' - Juan 3791 1 75.25 TATGCAATGCAACTAAGTGNTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCTTTTAAGTTTCTATTCCACCCTGATT:1 - chr3R 20420939 3' - blood 49 2 72.28 AGGAATTTTTGCCCATGCATCCTGTGTTGTTATGTAAGCTGCTTTTGTGTCGGCCAGACATTTCTTTCTTACTGCAAATATATAGAGTCGCATTACAGGCG:1 - chr3R 31887465 3' - HB 1242 1 60.40 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGAAAATGCTGCAGACACGAGG:1 - chr3R 9088551 3' + hopper 1403 2 63.74 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACCTAGAATTGCATATATAGAATGACATACGAT:1 + chr2L 14341889 3' + copia 5078 2 75.25 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAGATTGTCTTGGAAACAAAGTTCAATTCATTTT:2 - chrX 11017000 3' + roo 9028 1 68.32 CTCGTGCCGTCTGGAGTTCCATGCCTTCGACGGTCACCCAGCGCGCACATGCTGAATCCGCAAAATTAATTTGAATCTAAATAATGCATCAGCTATGACCG:1 - chr2R 6061558 3' - gypsy10 5828 2 56.44 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATCTGGATAGATAAAACGCGGGTGAAAGGGCAGGCAGACAAATAAAGCGGAAATGTTAACAG:1 + chr2L 20612045 3' - 297 6583 2 78.22 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACACACACATTTCAATCC:1 + chr3L 3540227 3' - mdg3 5261 1 68.32 GATAGAGAATTTTTAAAGAGGACTTGTAGCTTGAAATCCAATTTAGAAGATCTGTACTCAACTTAACATAAGCAATTGTTTCCTTCTTAATGTGTTCTCCA:1 - chr2R 1330221 3' - Q-element 440 2 54.46 GACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAAGAATGAAGTTGAAAAGGCTTGGTCTGTCAAGTACGTCAGTGTTAACATAATACACTGAG:1 + chr4 74344 3' - 3S18 5782 2 62.38 TCTCCAATAGTTTAGAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGAGTGCTGAAAAGTTGAAATGTTATTTGAAATG:1 - chr2L 12882744 3' - hopper 40 1 63.37 TTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATTACCCCTTTCTCTCAGTGTACGGCTAAAATTTCCAGGC:1 - chr3R 22869361 3' + Bari1 1701 1 68.48 CATGATGGCGACTGCACCGTGTCGGGACAAAACTTTGCAGTAGCCCCTCTTGAATGGCGCGTATTTTAAAAAACGATCGGAAAAAAGGCAATATTTTTGTT:1 + chr3R 3268033 3' - mariner2 115 1 73.27 GTTTTTGTTTTCTTTTTTTTTGTATTTTTTTTGCTTTTGGGGCTTTTAGGAGGTGAACCGAGGGGCAGGGCAGGG:1 - chrX 14426149 3' - gypsy7 5006 1 90.67 ATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCGTATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGTAGTCTTTGTAGTTTTGGGAGAAGTTGTT:1 + chrX 1556049 3' - Idefix 142 2 80.20 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAATCAATTTATGAGCGGCCTGCCTTATTTA:1 - chr3R 7469948 3' - Doc 33 1 51.49 TAATGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGCTGGAACAATGCCTCACAATATTATGTGTATAAATATAAATTTTTACTAGTCCAAACTGAGATAT:1 - chr2L 22687848 3' - INE-1 84 1 64.36 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATTATTAGGTATTCGATACTTAATTGCAAAATTCTTGCAATTCTGAAAGACGTCGCTAAAT:1 - chr2L 20118366 3' + copia 239 1 68.32 TTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTAGCTGGCATTTTTAGCCAGGAGGGCACTCC:1 + chr2R 14349173 3' - mdg3 5300 2 70.30 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGC:1 - chr2L 23372626 3' + 1360 3382 2 55.45 TGTCCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGGATCGCATGCAATAAGTATGACGTGGGAGAAACGAAAATGGCAATGCTGG:1 + chr2L 14747465 3' - Cr1a 4018 1 53.47 AATAATAAGATTCTTTAAACATAGTTTTTAAGATATAATCCATTTGTTGAATTCTGTTTTTATTTTTTTTTTTATTGATTCGAAATGGCATACTATTAACC:1 - chrX 13568490 3' + Tc1 1347 1 73.27 CTGTCGACGGCAGCGCAGTCGACAGCTTTCTATAGTACACATAACGTCGCCAGAGCTGGCTC:1 - chr2R 18974139 3' + blood 219 2 62.90 GTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCGCAGATTAAAATGTGAGAAATTGTATAAGTGTAATTGAAACTTGTCTAACCGCTGCACACACA:1 + chr3R 24487828 3' - Porto1 4526 1 66.34 CGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAAGAGCTCA:1 + chr2L 19642379 3' - Quasimodo 28 2 58.42 TGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGTGCTCATTTAAATGTAGTTACGCTGAAATTATCAATTAACAAAGTTATATCAAATATTTTCTTCCATGGTTATCGG:1 + chr2R 16467943 3' - F-element 4298 1 77.00 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACGCTTTTTGAAACCAATAGGTATTTTACCGATCTGCTTATTATCTTAACTTCAGGAACC:1 - chr3R 27169409 3' - 412 18 2 59.41 AACTAGTGGGCATAAGTATTAAGACAAGTAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTCATTTACTTACAGGATAAATGCCACAAAAGTCCTCGATATTCAT:1 + chr3R 15135262 3' + Tc1-2 1 1 73.27 TTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACCCTCGTCTTCGCTCGCACTCAAATGGAAATACAAATGATCGGGGCTGTAAGAACACACATACAGCTCCA:2 - chr3L 20353982 3' + 412 485 2 69.31 CTTTTAGTCGCCTTAGGTTGCTTTTGTTATCTAGTAGGCCTAGTGCTAGGACATTATCATGGTTGCTGATGCTCGCATTGGATTGATCGGCGTTATTGTG:1 - chr3L 27361319 3' - G3 4439 1 52.00 GACTCGAGACCAAGTCACGGTCGCCATGTAATATGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCCCGTTCCATAAATAAATACAT:1 - chr2L 15532712 3' - Stalker2 429 1 78.22 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCAGAAAACGAAGTGAAAGGA:1 - chr2L 5926931 3' + pogo 2067 1 59.41 TGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACATGAATGTGGGCGGGGCACGTCT:1 + chr2L 17677760 3' - Tirant 52 2 77.23 ACGATCTATTTATTAATTTAAAATCTGTCCATCTGGACAATAATTACATGTTTGGGTGGGGGGGCATATAGCCACTACGTTGGTGTAGTTATTGGTAAGAT:1 - chr3L 25515780 3' - G-element 4305 1 62.38 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCATTCTTAGTCTTATCAAATCGTTCGGCGACGTGTATAGTTAAGGTGCCCTTGTCAAAGCTTCATT:1 - chr3L 14222437 3' + roo 399 1 68.32 TCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTCAAGCCTTACGACCAAATTGAGAGTAGTTTTTGATGCTTCAGCAAAAACTACGAA:1 + chr3R 19445264 3' - roo 473 1 58.42 AAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACAATGTTGCCAAGGACGCAAAAGGCCAGGAAAGAAATCCGTCTGTCTCGAGTGCAGTTTTTATGGT:1 + chr3L 15464140 3' + accord 7299 2 70.00 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAAAGCGAACCGTTGATCACGTTTGGCG:1 - chr3L 6834941 3' - 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chr2R 16609398 3' - jockey 4773 1 65.35 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAGTGTATTTTATTTCAGACTTTCCACTTAACCCGCAGTTAAAACCGTCAGCGAGCTGTCATCCACCACAC:1 - chr3L 19652386 3' - pogo 3 1 49.50 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAGCTATGAAGCTCAGCTTGTTTGTGCAGTTTAGCCGCGGAAATGTAATGCGAGCAGC:1 - chr2R 6107716 3' + roo 404 1 69.41 AACGGAAAAAGAACGGTATNGATGCACAACAAATCATGCGATGAGAGGGCACAGAGATTGCTTTATCCAGCGAATGTCGACTTAAGTTCTCTGCCACCAGA:1 + chr3L 16420920 3' - rover 7082 2 68.32 TATTAATATTATTATTATTNTTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTAAAATGATTACTAAATTGATATCAGATTGGCAGATAATAG:1 + chr3R 19949362 3' - mdg1 7075 2 61.39 TTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTTCCGAGAACTGAGACGACAATGGCGACGACATAAATATCAACGGCACGTCATGTGGCGTCGAGG:1 - chr3R 26252652 3' - 412 8 2 70.41 ATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAATCTTTTTATTGTTTTATCGGTTGAGCCCCCAAATGTAGG:1 + chrX 22426232 3' - 1731 4352 2 61.39 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCC:1 - chr2R 12473061 3' - Doc 35 1 61.46 TACCACTCTTTTTATTCCTTCTTCCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCATTGAAGTTTATGCAAAAAAGGTATTTTTTGTTTAGTT:1 - chrX 2136000 3' + copia 4976 2 62.38 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTCTTTGTCCACCGTCTCTCAATTGCCGCTAACCGAGTGAT:1 - chr2L 23313674 3' + S-element 1680 2 64.36 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCA:1 + chr3R 12329653 3' + hopper 1414 2 54.72 TAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCAGACTGAACGGGGGTGGTGTCAGTTGTTGGG:1 + chr3L 699756 3' - P-element 397 1 35.64 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATATATTAAGTACATTCATATTTC:1 - chrX 14173013 3' - 412 7107 2 83.17 ATAAATAAAAGTTTAAGTAAAACTACGTATTGGCCCAACTACGTCGTTGCTTTTCATTTCCTGGGAAAACACTTATCTAATTGCACTTTATGTGTGTAATT:1 + chr3R 25275285 3' - Transib5 402 1 89.11 TTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCAAATGAGCAGAAATGTGAAGCAGGAAATTAAATTTACAAGAAATTGCACAATAGAAGAGCAAAACT:1 + chr2R 19556412 3' - Tirant 446 1 65.35 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCCTGCCAGCGCGCTGGCGAAAGTGATGGTCCTTGTGTTGCATACTTTTAGGACAATAGGCTC:1 + chr2L 10166074 3' - jockey 18 1 66.67 GCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGAATAGAGTTTCTGGCTTTGTCGCGTATATT:1 + chr3R 13353254 3' - 1360 48 1 72.28 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTATTTACCTACTATTAGCACCGATTTTTCTAAGTGC:2 - chr3L 20584029 3' + pogo 2063 1 71.29 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGCTGAAAATATTCCATGTCTATGTTTTTATAGACCCCAACACATTG:1 + chr3R 13913076 3' - mdg1 30 2 54.46 ACATATAACAAATAGGATTTGGGTAGCTAGCTATTGAAGAGTTTCGTTGCCTTCAAAGATAACAAACGGCAAAAAAAGTTGGGATAGAAGTGAACAACAGT:1 + chr3R 30328571 3' - X-element 4562 1 80.20 TATCCAATGCCATTAAATATGAATGGAAGCGGCGAAAGAGACGGAGACAGACGTGTGCGCGCACATTATGCTGCCAGCGGAAAAGGAAGCATCGCCTTGCG:1 - chr3R 10957785 3' + HB 466 1 75.25 AAAGCGAAATGCGTTACTGGGCTGGCTCAGCGTCGCCGATGTTATTGTTGGTCCATCCGGTCTTGGATGGCATTTCGCCTACCGTTCTATTTTGTACGTT:1 - chr2L 18460385 3' - gypsy10 5736 2 77.00 TCGATGCAGCTAAGCGAATNATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTTGAACACAATCCAGAACCCGCGCTCAGCCCAAAA:1 + chr3R 23638202 3' - pogo 5 1 74.00 TCCTATTCCGTCCGTGGTCGCCATTCTCGTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAGTGCCGACTTTAAATATAAAAGTGCTTTGGG:1 + chr3L 20128330 3' + Max-element 397 1 78.22 ATTTTATTAATTTATAAATATCTAAGATCTATTAGTCCTACTTTGTATTACCTAATTTTAGGTGTTCTATACAAGTATATTTAAAATTATTTAACTTTTTG:1 + chrX 16193526 3' - G7 1140 1 66.34 TCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGATTATCTTTCTGCCCAGAATAATGCCATTACCCTGGTCCAGTTTAAAGCGTCTGAAGCCGGTGATC:1 - chr2L 8782047 3' - roo 8896 2 70.30 AAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTTTCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGGGAAACAACCGAAATGGCCGCCCGG:1 - chr3L 10911339 3' + Idefix 7106 2 81.19 GCACATAGATATCAAATATCATTTTACCAGAGAACAAATTGAAAACAAACTAATTTGTGTTAAGTTGTGTCATATATCATTTGGCTTTCAAAGCGAACGGT:1 + chr2R 3341941 3' + Dm88 4126 2 64.36 CCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGAGAATCACCGTTGCCGGCAATTGCGATAGAATCCGGC:1 + chr2R 13622816 3' - Quasimodo 381 2 63.37 GCGATCGTCTTGCTCGCGTTGTCGCTGAACGCGAGTGTCGTTCTGGCTCATAGTGTTTTTTCTTTGCTTTATTACCCGTTTTAACTGTTCTTCGGGGCAT:1 + chrX 12247577 3' - Doc2-element 311 1 61.00 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTATCATTTACGATCGACACACTTTCCCAT:1 + chr2L 21086122 3' - roo 8670 2 73.27 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGAAAGATGTGTTAATATGAACTTATTTTC:1 - chr3R 19987421 3' - Doc 54 1 74.26 GCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCTTTAAACGCAAATGAA:1 - chr2L 18213157 3' + hopper 1380 1 58.42 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTAAAATGATTACTAAATTGATATCAGATTGGCAGATAATAGCAAATTGAATAAAAATTACTCATTTTAAATATT:1 + chr3R 19949395 3' - mdg1 7042 2 75.25 AACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATGGCATTTGATTATCAAGTGTTTTGAGATACTCCTGGGTCGGGAAAGTGATGTGAAAATGATTGAAATTCTC:1 + chr2L 15898843 3' - F-element 19 1 74.26 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTGTTTGGTCAAATGCAGAACGGCACAGTTATTC:1 + chr3L 2022326 3' - roo 12 2 67.33 TAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTT:1 + chr2L 22150624 3' + S-element 1669 1 82.18 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTTTA:2 + chr3L 10474193 3' + copia 208 2 76.24 AAAAACAAAGACACTAGAATATTCTAGTGCCTGTGGTAAAAACCTTAGGCAACCTAGTGCGTTATAAGCAGAAAGTGAAGCAAATTTAGCAATTAAAAAGA:1 - chr3L 11314397 3' - Tc3 315 1 43.56 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACACTTTA:1 - chr2L 4063704 3' + roo 361 2 70.30 TTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTG:1 + chrX 11025551 3' + hopper 1371 1 77.17 CAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATCAAAAGAAACTCAAAAAAAAAAAGAAGACAGAAAGATAAATTGGGAACTGTGAAATAAACCAAAT:1 - chr3R 22332757 3' + I-element 232 1 62.00 CACTTCTGCGCTGCGCCGCTGCGACGCTGCGGCTTGCGCTTTGCTGATTTCCTTTTGATTACGGCAAATTGTTTTT:1 - chr2R 18722127 3' + HMS-Beagle 94 2 77.63 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGCTGAAAATATTCCATGTCTATGTTTTTATAGACCCCAACACATTGTCCTTCTAACGT:1 + chr3R 13913088 3' - mdg1 7056 2 54.46 GAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGTGTGACTTTTTCGTTTGTATGTGTATACCGGGCATTCATTCGTATTGGTTGTGGTATTTG:1 - chr3L 15535901 3' - Idefix 198 1 62.38 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATTTTCGAATGAC:2 + chr2L 5927006 3' - pogo 27 1 55.45 ATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACATATTACACAGCCACGAAGTGGGCTTAAGACCCACACTCACAGGACCAGCTCTGCGGCTGATTGA:1 - chr2L 15531783 3' + Stalker2 7636 2 60.64 TAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATAATAACGATATATTTACTTCTGATGAAGACGTTCAAAGTCTGACAGGGTATGAATCGGGTA:2 + chr2L 14811662 3' - Stalker2 406 1 73.27 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAAAAGTGGA:1 - chr3R 14193908 3' - pogo 41 1 66.34 AAAATGGAAAAATAATGCAAATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACCCAA:1 - chr3R 20905416 3' - pogo 49 1 75.00 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTCT:1 + chr2L 20367350 3' - Doc 51 1 69.31 ACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACAATCAGCTTTTTATATTATGTACACAGAAAATGTTTCATTTTACGATATATATG:1 + chr2R 25132655 3' + accord 6998 2 64.65 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAACCTTTTTAAAAAATGTATATAAAACATTCAAC:1 + chr2R 22134245 3' + opus 7462 2 72.28 TTCATCCAAATATCTCCAANAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGC:1 - chr3L 6834971 3' - hopper 52 1 71.29 GATCGTCTCAAAATAAAAAAATCGTTTTGCCGAAAGAAGTCATCAAGATCAAGTCGTCTCAATGGAAAATAGCGCCAGTTTTGATTTAATATGAAATATGA:1 - chrX 2777766 3' + transib3 2441 1 63.37 ACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCC:1 - chr3L 24565355 3' + hopper 1414 2 17.82 AACGGTTTAATTTTAAGTTTAATTTTGAATTTCGCGCTCTACTGTCGCAACACAACACTGATACTCGCCGGTTTTGCTGGCAACTCGTCTAAATTATTTAC:1 + chr3L 7409978 3' - Rt1b 101 1 61.39 TTTTTTTTTTTATTGTTAAATTAACCTT:1 - chr2L 8914576 3' - TART-C 11098 1 85.71 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACA:1 - chr3R 20905394 3' - pogo 32 1 63.37 AAATAAAGTAAAGTAAAGTATTGAAGTAAAGTGAAGTCTCTGAACAGTTAGGGATCATTATTGAAGATACCATGTGGTAAAGTGACACACTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 3507553 3' + TART-A 13108 1 77.23 CACTCAACAATCATTGCCTAATTAATTTTTAAAACGCCGCCGAGTTGAAGCATGCAAATTTGATGCGCACATTAGATTAGTTTATTGTAGTGCTCTGTAGT:1 - chr2L 12136088 3' - 1360 447 1 72.28 GCGAAAGAGACGCTCTGTGCGATGCACCATCGCTCGAATACATATTCTGTGTTTGGTAATTGCTTGAATCTCGGAAGATAATTATTCGAGAAATACTCGAC:1 - chr3L 16426191 3' + Doc2-element 112 1 54.46 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTGCGTTCAAGCTAGTTCAAAACTAACACCTTTACCCCGATAAACCACAGAGGCCAAGAAAGAGGAGGAGAAGC:1 - chr2R 22856497 3' + 1360 3386 2 56.44 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGGCTTCGTGGGGCGTCTACTCGATTATTAGCCCC:1 - chr2L 20567830 3' - 297 26 2 62.79 AATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCGGGTTGTCCATAAAAATTTAATCAAAGCAGCACCATTCC:1 - chr2L 17998265 3' - BS 33 1 64.00 CACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAG:1 + chr3L 19339439 3' - Tc1 16 1 67.33 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGGCGG:1 - chrX 11025506 3' - hopper 35 1 55.45 CGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGGTAAATATTTTTAAACTTTTGCCAC:1 + chr2L 16128055 3' - Doc4-element 2 1 44.55 GCCATCAGCAGAAATCATGATCAGCTGAAAGTCACTCCATTCACGAAAACCTAATTATCCCAAAAATTATCAAATAATTTTAAAAAAAATAATACATATAT:1 - chr2L 6258817 3' - Gypsy12A_LTR 209 1 62.38 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAATGTTCACTTCATGCCCACTTTTCGATAATTTACCATCAATATGAGTCTCATTATGGTTAACCGAATAACT:1 + chr2L 20620098 3' - roo 3 2 77.23 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATT:1 + chr3R 25086147 3' + Bari1 1657 1 75.25 TTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATTGGGTTACGTAAGCCCATATCTTTTATGATACCAAAAACA:1 - chr2L 21735010 3' - 17.6 6957 1 61.39 ATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTAAT:1 + chrX 21668094 3' - Tabor 6852 2 66.34 AAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAAGTACACACAACCAACGACGAATGCACATAAACAAGAC:1 - chr3R 19093970 3' - hopper 60 1 62.38 GAGAGTAAAAATTTCTTGCGCAGAGAGCCCACACACTCACACCAACACACACACACCGACGCATCGAGGAAGGGACATGCTCAAGAAGCGCCAAGTCAAGT:1 - chrX 10911427 3' - Tc1 127 1 75.25 ACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGG:2 - chr2L 14793502 3' - Stalker2 7291 2 66.34 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGGATGTAGACGCGTTAGCAGAAGTTTCGTTTCCTTTGTGACTCAAAGACA:2 - chr3R 6266289 3' + roo 9046 1 55.45 AGGAGCGCAGAATGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACACTCAAATCTCCCGCTCACAGCAGTTACGACTTTATACTGGCCATAGCTGATAAGATGCGATT:1 + chr3L 16689770 3' + Porto1 400 1 66.34 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTATTTTAAGAGATTTAAAATTATGAAATATTGTAAAAAACAC:2 + chr3L 15037982 3' + roo 9038 1 62.38 TAGAATACAAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCCATCTGGACATACTATAGAACTAAAGCTTGAATGATGAATTTAAACATGTTGGTTTTAAAG:1 + chr3R 30539649 3' + Doc2-element 4319 1 55.45 ATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAAGAATGAAGTTGAAAAGGCTTGGTCTGTCAAGTACGTCA:1 + chr4 74323 3' - 3S18 38 2 60.40 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTTGTGTCTAGCTTTTGTGGATTAGAAAACAATGGCTTTCGATGTTTAAAAAGTATAGAAAATATGA:1 - chr3L 17316943 3' - 1360 25 1 65.35 GTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACATATAGACAGAGAGGAATTAATTGCTGGAACTCAACTTTCAGCACTAGCTC:1 + chr2L 10101904 3' - Quasimodo 19 2 59.41 CTATTTCATTTTTTATAAAGTCGTATACATCGCGCAATGGTTACATTTTTTACAGATAAAACTATAAACTTTGTAAAGAGCAAAGCATTCTCTCAGTGTAC:1 + chr2R 16725213 3' - Tc1-2 380 1 64.36 AATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAATTACAGGTGATAAAGCTTGGGATGAGGAGCTCTTATGCTTTTTAAGAGTGA:1 + chr2R 10956999 3' + copia 254 1 77.23 GTGTGTAAGTATATGTGGTNTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTGCTGCCGCTTGGCATTAACTGCCTACGCATATTCGTAGTATGTATATGCCAG:1 - chr2L 4134816 3' - Quasimodo 23 2 57.43 ATTTCAATAAAAGTAATATNAAGAACACAAAAATGCATTACGATTATTACAGCATATTTCATTCACTGCTCGCTGGTATGTGGCGAATTTCCCCATGGAAT:1 + chrX 15255419 3' + Tabor 456 2 52.48 CGAGGAGGTTTTTGTTTTANTATGTGGTGTTGTTTTTGTTGTTGCGCAGGTATCGGCTAGCACCTAAGCGCGATTGTTCTCGGTTGTGCGAAGGGGCACAC:1 - chrX 18783785 3' + Rt1b 5030 1 49.50 TATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATGTGTGGCGCACGTTCGGCCGCGATTAAGAAATCTTCGCGAGAAGAAAAGGCCAACCGACTCCGAC:1 + chr2L 10199073 3' + I-element 5346 1 66.34 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGCATCGAGCGCTTTTCCAGCATTTGAGCCT:1 + chr3R 6034032 3' + roo 9055 2 65.35 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGA:1 - chr3R 10741096 3' + 1360 3356 1 62.38 TTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGATATCAATTCTGATCACTTCAATTTACATTTATCACTTGATTTTATATAATATTAATACATAACGAAGCTGAA:1 - chr3R 23002593 3' - 1360 3198 1 56.00 GCAACTAAAATATTAAGATTCTACAACGCTCGCAACTGCAACATACAAGGTGTTTAATTTCAACTTTTGTCAAGAATAATAAATTACTTTCCAATAAATT:1 + chr3L 23100797 3' + G4 3463 1 77.00 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAA:1 - chr3R 19589933 3' - BS 5031 1 58.42 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCGCCGTTCCTGTTGGCCATTGATTTATTAGGTTCCGCCGTGCGGC:1 - chr2R 6847232 3' - mdg1 7042 2 75.25 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTGTGCTGATGCAGATGCATTCGGTGTGCTAAGTGGATGTCTGTGTGTTCGAA:1 + chr3R 19216420 3' + 1360 3365 1 55.45 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGTATTTACCTGTAGATTGCGCAATGATAAGTCTTGGTTTTCAAACAATTTTGTTT:1 + chr3L 16546868 3' - pogo 19 1 55.45 CGTGATCAATATATATATATACAGCATAGCCTCGTCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATA:1 - chrX 20119350 3' - 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chr3R 9206108 3' - hopper 139 1 63.37 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTATAGCATCCTGTATCGATTATGAAAAT:1 - chr3R 19450669 3' - Burdock 47 2 73.27 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACACCTTGTGACCAAACCACATGCTACAACCCATCAATTAGCAGCACACAGACTCACCTTTCTTCT:1 - chr2R 21351297 3' + mdg1 7443 2 69.31 CTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGCATATTTCATTTGACGTGAGGCAATAAATATTTCCGTTTTGGCCTGGTTTTCCTTTTTGTTTTGTCGCATCCTTTTT:1 + chr2L 13680767 3' - I-element 5185 1 80.20 AAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCCAATCCGATGCTCAGACTTTTCGAGGAGATCACCAAAAAATACACAAATACCAACCATAAATGTCCCTATGA:1 + chr3R 22331561 3' + I-element 127 1 73.27 TCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATACATACATATTACATATATATTTTCAACATCAAAAAAAATTTT:1 + chr2R 4150661 3' + gypsy 428 2 64.36 TCTAACGGTTGTCTGCCGCGCATCAGAAACACGAAATATCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATTTAATACTTCTGTCTAAGATACGAAAACTTACGC:1 - chr2R 5044045 3' - invader1 3692 2 72.28 CTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTATCCATCAAAATGGGACTTGCCTTTA:1 - chr3R 15924582 3' + Quasimodo 7350 2 62.38 ATTAAAACTGAAACTGAAAATGCCGGCCGCGCACACACCAGCACAGCGTTACTGGCTCCAGATACATGCGTAAATATATATCTAGTTAGACGGGTGTATAT:1 - chr3R 11771728 3' - Gypsy6A_LTR 153 1 66.34 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGGCCACCCAAAAACGTCACTATATGTATATGTATATTGTTTTCC:1 + chr3L 9910401 3' - 297 30 2 80.00 TACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCAAAGCAAGCGATTACTCACTACAGTTACAGTTACAGTTTGTAACTGTATAATTTCATAATAGATAT:1 - chr3L 18175622 3' + F-element 4417 1 58.42 ATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGACAGT:1 + chr2L 15531854 3' - Stalker2 7288 2 65.35 GAATAAAAAGAACAAAAAAAAAATTCAATCGCGGGTTTTGCCGAATCATTATTTTTTTTCGAATTTTT:1 + chr3L 9829616 3' + Osvaldo 1522 1 91.18 GTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATAAGAAAATAATATATAGAACTTTCTACACATTTCAAGAATCGCGAAATATTTTGATTAAT:1 + chr3L 13001087 3' - invader3 18 2 61.39 GGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTGAAAGGGTTGCAAGTGCAGGCAAACTATTTCAATTTACAAGTGATTTGTCCTGCCACACAAAACCGATTT:1 - chr3L 18414640 3' - hobo 2657 1 71.29 TAGAATTTGCTTGCTTGTGCGCACTTTTTAAATATATCAAATTGGAATAGACAAAAAAAACTGAAACTGAACAACCTAAGTCCTATATACATTTTCAGC:1 + chr3L 24532949 3' - 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chr2L 9260338 3' - 297 6625 2 73.27 AAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCCAAAAAGACACAGGCGCGCAACTA:1 + chrX 21009389 3' + hopper 1365 1 73.27 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATACAACAAGGAAGAAA:1 - chr2L 18248010 3' + blood 7336 1 83.33 TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTTTAAAAAGAACTTC:2 + chr3L 10474204 3' + copia 219 2 65.35 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTGGAGCGCAACACAGCCGTAAAATAACATTTCAAACTTAACTTAATTAACAATTTTTATAACCAGAGCATGCCGAAGTTT:1 - chr3L 22497098 3' - jockey 4736 1 78.22 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACGCTTTTTGAAACCAATAGGTATTTTACCGATCTGC:1 - chr3R 27169432 3' - 412 7094 2 69.31 CATTCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAGGAAGCCACACATACAGAGGGAACGAATAAGAGAGAGAGAAAG:1 - chr3R 14098774 3' + F-element 4387 1 55.45 ATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCGTATTTTTGTGTAGTTTCTCTTTTCCCAATTTATATATTCC:1 - chr3R 27907627 3' + mdg3 5463 2 65.35 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGGGCTTGAGAAACACACGAAAGTATCGATTAAATGCT:1 + chr2L 7810752 3' - P-element 38 1 41.58 TATTCTAATGAATTTTAAANCTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGATTATTTATGAGACCCATTAATGGGCAGGT:1 - chr2R 16609432 3' - jockey 4807 1 71.29 ATAATAAAACATTCGCGTGTACTTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCATCACAAGGACATTTCGGTGGTTCGGGAGGTCGAAGGTCCGGGTTC:1 + chrX 10654633 3' + Q-element 550 2 71.29 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACACTACCAATAATAAGAAGGAAGACCTCTGGA:1 + chr2R 1243236 3' + 412 7497 2 70.30 CCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTA:1 + chrX 21668077 3' - Tabor 30 2 53.47 TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAGTCTAGAAATTGATTAGCACTAGATTAGCACTAGAAATTGAGATGGAA:1 - chr3L 17140603 3' - F-element 39 1 59.41 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTAAAATGCCAATATAATGTTCTCGACT:1 - chrX 10286140 3' + roo 9047 1 53.00 CTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATGTGTGAGTGAGTCGGGTCAAATAAAT:1 - chr2R 21433156 3' - HMS-Beagle2 45 2 70.30 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAAACTACTCATACGAGGGGTCGTCTCTTTCAG:1 - chrX 21217478 3' + pogo 2094 1 70.30 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATATACAGGCCAGAATTAGGATGATTCTAGTTTCTAGCTTCAGTTTTACCCAT:1 + chr3R 18549991 3' - pogo 20 1 57.43 AATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACCATATGTAGTCTAAGATTTTCAAACACGACGCTTTTCTTTCCTCTT:2 - chr3R 7783734 3' - rover 6978 2 57.43 TTAATATTGCATAGGCACANACTACAGTATTAATTACGTAATAAGGAACCTTTTTATTCATTCCATACAAGAAAATACCAAGAATTTTAGAACGTTTTTTT:1 - chr3L 6033499 3' - 412 5 2 75.25 TTCTTTTTATTTTTCTTTTTCTTTACTCTTACACCAATTTATCAGAACAGTTCCGTTTTTCACTTTCCCACACAATTTTGTTATTATTCTTCCAGCAGGAG:1 - chr2R 8956577 3' - Doc2-element 221 1 79.21 ACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGT:1 + chrX 21668063 3' - Tabor 44 2 67.33 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGCGTGTGTTTGGTCTTCATCTTAGCT:1 - chrX 14651101 3' + P-element 2869 1 42.65 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTGCTATGTACAACGAATTAACACATTTTGCAGTTTGGTGGGGGATTCCAATTG:1 - chrX 10451459 3' - hobo 25 1 60.40 CCAAAAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCGTTAGATGTCAGATATATTGTTGAC:1 + chr2R 7535972 3' + 17.6 263 2 75.25 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGAAA:2 + chr3R 7869186 3' + 297 6941 2 63.37 AACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACATATTACACAGCCACGAAGTGGGCTTAAGACCCACACTCACAGGACCA:1 - chr2L 15531800 3' + Stalker2 364 2 59.41 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATC:1 - chr3L 3650050 3' + mdg1 7417 2 65.35 AGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCATAATAGTCAAATCGAATGCTGGGGATGCAATTGTGAATGCAAAGTATACTGCATTTGGGTTCAAACTCTGAGT:1 - chrX 16762988 3' - accord 255 2 67.33 GGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGCATAACATTTTGTCCGGAAATGGGCATGGCCTAATCATCTTCGAAGAGGTTTCTGGTTTCGTTATGCATGG:2 - chr2L 14220122 3' + springer 7514 2 72.28 GATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACTGTGCGGGGCTGTCTTTCTTTCGCATGCCTGCCATTTAATTATTTTCTTAGAG:1 + chrX 13888968 3' - R2-element 3564 1 55.45 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGTTTACAGAAAACATCGTGAAATTTGCATTACTGACTACATTCTCTTAAACCTATAATA:2 - chr2L 8577257 3' + roo 392 2 62.38 TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTGCTGCCGCTTGGCATTAACTGCCTACGCATATTCGTAGTATGTATATGCCAGTATCTGTTTCT:1 - chr2L 4134805 3' - Quasimodo 12 2 68.32 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAAGTTCAAGTTCTAGATATAACTAATT:1 + chr3R 11052184 3' + blood 360 2 61.39 TTTTATCTATTTTATTTTATTTTATTTTTGATCAGAATAAACTTGAAGGCAGAACTCTGCCAAGGCGTGTAAAAGTCGCGTCCTGATGCCTTTTTCTACGT:1 - chr3R 25932707 3' - F-element 89 2 69.31 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTTCTT:1 + chrX 11967088 3' + copia 208 2 72.28 CCCCGGTCTGGCAGCGCTGGTCGGATGCATGAGTCGCCAAGCACAGGTGCCGTTTTGAAAAAGCCGCAGGATTCATCGGCGTCATCGTTGCGTCGTCCTCA:1 + chr3R 6976618 3' + Rt1c 354 1 62.38 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCAAACATTTTTGAATTCAAATTTGTCCAACAGGTTCCGATGGATGTTGACGA:1 + chr3L 163292 3' - 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HMS-Beagle 6616 1 61.39 TATAGATGGGAAAAGCACTNGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCACCTCACATCACC:1 - chr3R 13739683 3' - Burdock 43 2 66.34 AACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCA:1 - chr3R 10736057 3' + McClintock 433 2 76.24 CCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTATTATAGAACTCGGGAGATTTCTCCT:1 - chr2R 12473026 3' - Doc 5 1 68.32 AATGATTAAATCTAATTTTTATTCAATAATTTAAATGTATTTAAGCAAACAAACCGGCACTTGTCACGAGTTTTACCGGCTGTTGGGTGATGGGAGTAGGT:1 + chr2R 19952634 3' - Bari1 333 1 66.34 TAGAAGATCAAAAGGGAAACCCAAAAGATCAAGTTTTCTTATACGAGAACATATCGCTGCGCATCGAGGGCCACATTGTGGGATTCGATGAGTACATGAAT:1 - chr2L 7885182 3' - Q-element 378 2 67.33 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCT:1 - chr3R 23638102 3' + pogo 2067 1 69.00 AAATATTACTGTTAGTAGGAACATTTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCTGTTGCAGGGGTTTCAATTGGAATCATATGGCAAA:1 - chr3R 2470869 3' - Cr1a 4294 1 59.41 AATCAGTTTCTTACAAAAANTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCCAACAT:1 - chr3R 8765542 3' + roo 9038 1 59.41 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAAACCGTATGCATTATACAATATATGC:1 + chrX 12472591 3' - pogo 46 1 79.21 ATAAAAACGTCTTCACACGNCGGCGATCGAATTATTATTTTTCATACGGCTGCAATTTTAATATTTCTGCTATAGCCTTATTGTAGTTATCCTTTTCCTGG:1 + chr2L 23350536 3' - F-element 24 1 62.38 ACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAATAGGACTATAGGTGTTATTTTTGCTAGGAATGCCTATGTTTTGGAATTTCACAATCTGATTTTAA:1 - chr3L 15033288 3' + I-element 5344 1 58.42 ATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTACCCTGGGTCATCCATGGGGTCATCGGCAGTAACCGCCACGA:1 - chr2R 14349123 3' + mdg3 211 2 59.41 TACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCTTACCCGGGGAGCTAACAATGTGTCCCTGAAGGTGGCAGACTTTGGGTAGTTAGCC:1 - chr3R 9333711 3' + blood 298 2 60.40 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTTATAAAATCGATGAATAGCATTTATTACATACATATGGCTTTAACGATCATTTGCAGG:1 - chrX 17104383 3' - 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roo 8701 2 63.00 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGGCAGAAAGGGATGCCACGGAAAATTGGATTTGGGGTCCAAGTCCGGGAG:1 - chr2L 12808153 3' + Tirant 374 2 52.48 CCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGTAGATTTAGAACATTACCAAACGACGAACGCCGAT:1 - chrX 18109625 3' + I-element 4881 1 65.00 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAGATGTATATATTTAAATAAAATGCCCCCGCTTCCAACACCCACGTATCAGCTGCCAAAGGTAATCAA:1 + chr2R 21962727 3' - 297 6585 2 66.34 AGCAATTCAACGCTTTTCAAGCCAGACTTATATCTTAAAACCTAATTGCAATCATAGCATATATGTATATTAGTTATGCCCACCTGAAATCCATCGTATGT:1 + chrX 8306641 3' + BS 454 1 66.34 AAATAAATAACAATTGCAACAATTTAACATTTTCTCACTTTGTTTATATTTGTTTATGGTAAGTTGCTCAAGGATATCGACGAAACAAAATGTTGAAATTT:1 + chr2R 14826623 3' + Transib5 2602 1 59.41 CGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCAAGACAAGACAGAGCCATGTCCGACATCAATATCAACCTCAAGTGCGCCGA:1 + chr2L 4007716 3' + Quasimodo 7147 2 56.44 TTTTTTTGTTTTGTATTTTACTCAACCCATACACGTTCAGTTACAAAGATACAGGCATCCACACATAAATAGATATAAAAACCAGCGACATCCTCGTGGCT:1 + chr2R 9522024 3' - F-element 4683 1 74.26 CGAAGCTGGTTGCCCTGGCNTCGAATGGAGTGCCGGAACCCGTTGGCACGCATAATTCAAACGGCGCAAAAGTTCAGAAAATGCCCGCCCCTCATTTGCAA:1 - chrX 7354466 3' + R1A1-element 497 1 62.38 TCCCACGGGAAACAATTGCAGCCCAGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGCTTGAATTTTTGGTTATAGGGATATGTGAA:1 + chr3L 23799428 3' + baggins 5303 1 70.30 ATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGGCGAGCGAAACGCGACTGAAGC:1 + chr2L 7054263 3' + Bica 243 2 78.22 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGGAGTTGCCTGAAAACCCA:1 - chr3L 2022231 3' + roo 9045 1 56.44 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCCAACATGTCAGGGGAGTTCCCATTCTCCATT:1 - chr3R 8765517 3' + roo 400 1 70.30 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAATGCCGATCAGATGCGGAGTGGAAAATTAT:1 + chr2R 12812316 3' + jockey 4945 1 73.27 CTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATCATTATCCATGTTATATTATTA:1 + chr2R 12458002 3' + HMS-Beagle 224 2 57.43 CACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAGTCGTACAACTCGCACAACTCAGGGCGATCTTTTAATTCAAATAACA:1 - chr3L 27413046 3' - invader4 2697 1 53.47 GCTGGGCTCTTGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCAAGCGTAAGACCCACCCACCGAGGGGGTGGTGCGTTGAGGGACGGGCGTGGGCGGTAT:1 - chrX 20621144 3' - invader4 361 1 61.39 TTACTAATTATGTTTAAAATATATGAGAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGCCTGGTTTGACAAACACAAAAAAAAAAATACAAGCCCACA:1 - chr3L 23936010 3' - Cr1a 101 1 81.91 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGTGTGTTTTTTTGTTCGGCCAACTTCAATGCTTTTCAGTGCACCCATTTTCCCATTTTCCC:1 + chr3L 494159 3' + roo 394 1 64.36 TTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATACCATTACCTCATTATGTAATTTGCTGTATCTGCACCTTCTAATTGTAGATCCCGCCGCGGGAATCGTG:1 - chr3R 17481975 3' - copia 4877 2 62.38 CGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATAAGTGACGTCATGTGGCTTGCAGTTAATTACGGTGCAATTGTGTGAGTGTGCGTTCGAACTTGT:1 - chr2L 23390329 3' - gypsy6 10 2 65.00 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTATTGCCATTAGGAGGAACC:1 - chr2R 18188302 3' - Juan 4045 1 57.14 CAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTTCATTAGC:1 - chr2R 9905359 3' + mdg3 5458 2 64.36 ACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACAATCAAGCAAATTATTTATTACCAGCAAGTGTCCTTTTTTGACCCCAATTCGCGACACCTGCTTCC:1 + chrX 4299828 3' + 1360 3227 1 58.42 AGTTGAAAATTATCACGAGCGGTTTCCTCGTTGCTCGGATTACACTTGACGATCCGTTGCCGTTGCCCACCGATCACCGAGATCACCTGTCTTCATTTTAT:1 + chr3L 3650058 3' - mdg1 494 1 76.24 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAAGAACGTATTTATAAAAATAGTTGTTACATTAAAATAGTAAATTTCCATTTC:1 + chr3R 6947394 3' - I-element 26 1 53.00 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTACAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAACAAGTAAACTTATGGAAAAAACTATAAAAGTGGCAATT:1 + chr2L 22197271 3' + roo 9036 1 65.00 TATTAAATTATTAAATTATTAAATTATCGTTCCCATTATTCGTCTACGATTTGACATACCCACGTGACTTATGGCCGAAACGTGCTGCTTCAATTATTAAG:1 + chrX 13804888 3' + Porto1 4550 1 60.40 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACGCTTTTTGAAACCAATAGGTATTTTACCGATCTGCTTATTATCTTAACT:1 - chr3R 27169418 3' - 412 27 2 55.45 TGCAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGGTGGTGCAGCTCAACTGACCAGCTTCGGCTGCTCCTTCGTATCCTGCAGCAGTGTCCTGCCATCTCCTT:1 - chr3R 18562946 3' - G2 49 1 58.42 GGTAAAAAAGTGCCACCCTNGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAGTCAGCTCGCAGCGTTAGTTTGTCGCCCTCGCCTCTGCTGA:1 + chr3R 7626470 3' - hobo 10 1 70.30 CGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTACTTTTCGCGACTTTAAGCCTTTGTCCGGCTGCAATTCTATTAACCGAATTCAGCCGCAAGTT:1 - chr2L 9047201 3' - jockey 201 1 66.34 CTGAGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGTATAGGTTTTGGTCTATAGTTTTTG:1 - 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mdg1 5 2 69.31 TTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCATTGCCGACTTCAGTGCTCTC:1 - chr3R 15943312 3' - BS 4907 1 78.26 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTCCGGCAGGCGGCGTAGCGAGAAAA:1 - chr2L 3632123 3' - P-element 7 2 72.16 TAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGATCTCGGGTTTGTTGCACGACGAGACAG:1 + chr3R 10391264 3' + invader4 312 2 63.37 AAACATATGAATTTGATATCGCATAAAAAAAATACGGTTAAAGTGGCCAAAGTCGATGAGGTCAGCGATACTGAGGAGCTGCAGTCAATTACCAATCGATT:1 + chr3L 23723666 3' - transib3 152 1 77.23 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGT:2 - chr3L 3757346 3' - roo 8700 2 67.33 TTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATATTATAATAATAGGTTACTTCTATTATGCCTATTGATAGCAGCAGCTTAGGA:1 - chr2L 5933039 3' - mdg1 7076 8 73.27 ATGTGCGCGCTGGGTGACCGTCGAAGGCACGGAACTCCAGACGGCGGTTCGTCGGGCTGGGGCCCACTGTTTATGCATGCGATGCGTTGTCTATATAAAGT:1 + chr2L 18460081 3' + gypsy10 158 2 44.55 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAAAGCGAACCGTTGATCACGTTT:1 - chr3L 6834945 3' - hopper 26 1 54.46 TCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATTTAGTGCCTCGGCGGCAACCTTCTTTCAGATTGGCGAAGACCGACCACCACCTCTGTCATTTTCCCTTTTC:1 - chr3L 1069683 3' - blood 204 2 77.23 GGATGCAACCCTTATCAGCTGCACCCGGAAAAGCAGCAGCAGCGGCATCGAAGTCGGGACTCCAGGAGGGTTATTTAAATTAATTAAAAAATGCAACAAC:1 - chrX 17068650 3' + gypsy12 126 2 70.00 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTGATATAACATAAAAGCTATGTACCCACTTTAATCAATTAAATAA:1 - chr2L 20128846 3' + hobo 2931 1 52.56 CTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGGGTGGTTGGCGGATGTATAAATACTTGGACTGCTCTCAGTTTAAGCAAATTAGTTCAATTGCCTGGCTAT:1 - chr2L 19645268 3' + Quasimodo 255 2 72.28 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAAAG:1 - chr3L 6834964 3' + hopper 1410 2 59.02 TATTGTTATTATTATTGTTNTTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATAAGGAGCTTGGTTGCCT:1 + chr2L 12866967 3' - mdg1 19 2 61.39 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGT:1 + chr3R 8582606 3' + roo 9034 1 60.40 CAAAAGCAAAAGCAAAAAAAAAATGGCATGGTGCTAAAATAGGATGACAGACAGACAGCCAAGTAAAAAATGGAGACACCAATTTGTACTTGGTGGCACAA:1 - chrX 14254395 3' + Doc2-element 217 1 49.50 TACGTTCGTTGGTGGCTTGNACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTCACAACTTATACACTTTGTTAAAGTAGTCAAAATTAAACGTAATC:1 + chr3L 6551395 3' - Ivk 4996 1 54.46 ATACATATATATATACGCTAGTATTTATATTTAAGCTGCATGAGCTCCGAACTCTGGCTGTGGACTTTCGGAGGGTTAATGTGATTGAAATCCTGCCAAAG:1 + chr3L 977905 3' + blood 188 2 55.45 AAAAGAGACACGTGAAATTNTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCGTATTTTTGTGTAGTTTCTCTTTTCCCAATTTATATATTCCAC:1 - chr3R 27907625 3' + mdg3 213 2 62.38 GAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTATTGCCACTCCGCTTTGATATATCTCAAA:1 + chr3R 22254740 3' - 1360 123 1 76.24 TATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTCCGTAGTTTTTTAATCATAGTTCACCTGGATCGCACTGCTCTCTTG:1 + chr2L 12189641 3' - Stalker4 7112 6 61.11 TAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGCTGAGGGTTCAGACAAAAGGGATACCCTTGC:1 - chrX 4166346 3' - I-element 5288 1 76.24 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTC:1 + chr2L 20328767 3' + opus 7475 2 65.88 ATCGATGCAGCTAAGCGAANTATACTGTATAATAAAACTTAACGATTTTTTTTGTACTGATCAAGCTGTATCTAAGTTAAGTTTGAAGTGTTAAATAAACA:1 - chr3R 25580989 3' - pogo 6 1 52.48 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTAAAACAAATAAAAAAATTGTTCTTACTGGTTTGAATAA:1 - chr3L 16546781 3' + pogo 2066 1 71.29 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGACATGAGGGGGGTGAGCAAGTAATTTAAAAGCAAATT:1 - chrX 12739312 3' - jockey 4810 1 80.00 AAGGCCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCCAGCCACTTTCCACAGAGAGAGAGAGAGAGTCATTGATGGCAGCAACAC:1 + chr2L 4632269 3' - Ivk 5019 1 50.50 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTTAATCGGTTTATGGTGCACGAGTAATT:1 - chr3R 5135470 3' + 297 6930 2 70.30 ATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTATCATAATATTAGAGCTAAGATAAGAATTCATTGAAATTGG:1 - chr2L 11712817 3' + Quasimodo 7337 2 61.00 TGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTCAATTTGATGAAACTAGTAGTCACTGCATAGAATTCCATAACACACATTAGTTTTTATGAGT:1 + chr3R 31022024 3' + Ivk 5364 1 66.34 TGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAATGCGAGATCGGCAAACAGAAGAAGACC:1 + chrX 10826768 3' + X-element 4429 1 73.27 GATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTCCCCATTGACTCCGGCTCAGTTATAACCAGTTGGGAGGTTTTAGTT:1 + chr2R 18723115 3' + HMS-Beagle 7025 2 58.70 TCCGTATGAACTTCGAGATATCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCCATTGCCGAAGAACATAGACGCTATTATACATACATATAATTACAAGA:1 + chr2L 21630774 3' + INE-1 134 1 54.46 AAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCGTATTTTTGTGTAGTTTCTCTTTTCCCAATTTATATATT:1 - chr3R 27907629 3' + mdg3 5461 2 67.33 GTGCCAAAAAATCGTATGGNGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTAGATTGTCTAGGGCTAGCTTGCCAAGCCGACTTAATTAGCATTATAAA:1 - chr2L 109686 3' - 1360 29 1 55.45 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGTCATAAG:1 - chr3L 3757340 3' - roo 30 2 61.39 AGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACATTATGAAAATCATTATGTTCATATACATTTTTGAAATATTATAAT:1 - chr3L 13001006 3' + invader3 5429 2 62.38 AAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACAGGACTCAAGTACACCAAGGCCTTTTAGTAGCCGATTGTTGGCTTATTTTTTAAAAATTGGTTCAGTAAGTAAAAAG:1 - chrX 1779678 3' + gypsy7 5004 3 84.16 GAACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTGCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAATGGCGCCAAACGCAGCTCATTCGCACGATGCAGGAATTCAC:1 - chr3L 7494459 3' + G6 1750 1 59.41 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTACGTAACATTTTGAGGAATTCACAAAATGCGGCTAAAAACGCA:1 - chr3L 20520681 3' + P-element 2855 1 47.52 TATTCGTGTTCATGTGTGANCAAATATTCATTGGTGAATAAAGAAAGTCAGATTTTTCTCAGTGATTAAGACACGAAAGCAAGACGTAAACATACGCTCAG:1 - chr3L 15037884 3' - roo 1 2 78.22 TAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATTATTATAAATATTTATATACATATACATATATTGTCATGCAGATG:1 + chr2L 20118450 3' - copia 4901 2 64.36 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGAGATACGGGGACTGAACCGCCGTTGA:1 + chr2R 9649223 3' - roo 8713 2 76.00 GCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACGAAGTCATTCAGTTTGTCAACGACAACGCCTCGCCCGCCAAGCGTCTAAGGGG:1 + chr3R 24154666 3' - Quasimodo 6997 2 62.89 TTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTACCCTGGGTCATCCATGGGGTCATCGGCAGTAACCGCCACGACTTTGAGGACAAAAGCCAAAAGCA:1 - chr2R 14349100 3' + mdg3 235 2 63.37 CCCACAAACCGCCCAAAACTCCACGCCTACTCTTTTATACACCTTACATTTTTTACTATGTTCGACACTTTGTCTTGTCTGTCATCTCCACTCGACAATTG:1 + chrX 17347549 3' + INE-1 348 1 73.27 TTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGTGCGCGAAATGAGGCGATAACGCTCTAAATTAGTCACGACACGTACATATTATTTCACCGCACTTTTATAGACTGCAC:1 - chr2L 18114998 3' + Tc1 170 1 64.36 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTGTGTGTGTGCACATGGGCAGTAAATCTAATCCGAAGTATATCTAAGTGTTTTATAGTTTCTT:1 + chr2R 9209519 3' - Tirant 8118 2 70.30 TGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGGAGACATCACCATTCTGAAATCCAAACTATGAGCTGCGTTTTGTTTGCCTGTCA:1 - chr3L 10043559 3' - G6 1899 1 52.53 GTGTTCATGTGTGAACAATATGTTTTTTATTTATAAATAAAGATTTTTCAAGCACAATCTGACCCATTTTTACACCATCTAGTAACTGAAAACATCCCAGG:1 - chrX 7797617 3' - roo 8660 1 70.30 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTTATACCAGAATGGTGCTTTTTTCATGTGAGAATTTTACAATATGCACTTTTAGA:1 - chr3L 19647234 3' + pogo 2082 1 60.40 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAAAC:1 - chr2L 16139124 3' + copia 5080 2 68.32 ACTCTACCAATAGGTGGAGCACTACCACCATAGCAACTAGACCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCGGACGAGGTCCTGGTGGCAGGTTAGCAATGGGTGCG:1 - chr3L 13790007 3' + R1A1-element 281 1 60.40 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGTGTGGAAAATTTTCAAGCTTTTCCGC:1 + chr3L 5415385 3' - I-element 50 1 72.28 GAGCTTGCCCAGTACTTTTCCAAAATTCTAACTCCACACTGACTTGTTGACTAGGCCAACTGTCTTGTCTAT:1 - chr3L 5479746 3' + 3S18 5899 2 58.33 CTGAGAGAAGCTTACTGGTGGTAGTCACCGCTAAGGATTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACAGATTTTAATCGCTTTTTGCGGCTTTATTTATGCATTC:1 + chr2L 2700620 3' + R1A1-element 220 1 60.40 TATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATATACAGGTAAATAAAATAATCCTATCTCCAAC:1 + chr3L 15033394 3' - I-element 7 1 72.28 TAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCCAAAAAGACACAGGCGCGCAA:1 + chrX 21009386 3' + hopper 1363 1 75.25 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCGTTGAAAGCAAGTCTTTTTGCATAGCATACATTTGGGGGCCTCCTTTTCTTCCTGTTCATTTGC:1 - chr3L 13895339 3' + hobo 2929 1 67.33 GATAAAGTCTTTTATAGTCAGAATATAAAACTCTGTAAGGGGCATTCCGAAAAGCGTTAGTCACGATAAAACGACCGGAAATGAAACCGTTTGCAATCGCA:1 + chr2R 5284435 3' - Cr1a 4202 1 62.38 GAGAGGGAGTCAGTCGAATNCTAAAGCTGAAGCAGTGGAAAAAGAAGTTACCGATGACGATAAAGGAGAAACGACAAAGCAAAGTGTAACCAAAAGAAAAA:1 - chr3L 2055226 3' + invader2 5009 2 74.26 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAAACTCTGGCCTTATATGCAGAGCCAACTCTCAACTTTGGTCGAGACATC:1 + chr2R 21040943 3' - P-element 7 2 73.27 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTT:1 - chrX 13126219 3' + mdg1 7415 2 67.33 ATTATTGTTATTATGTTCGNATATACTACAGATTGAATGGCAAATGTTTTCCCTTAACACAATTTATGGTCCAAATATTCTTTATAGCTTTGACCTATACT:1 - chr2R 12525566 3' - mdg1 7047 2 47.52 CGCATGGTGGCAACTGAACCGTGTCGGAAGCTGGGAGTTCTCTAAGACCTACTTTCGATGCATGATGCTTTTGATTTATTGACAGTATCGTTGGTTATCTT:1 - chr3R 29733687 3' - mariner2 117 1 71.29 GGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTATATATCTCATCCGTTAAGAAACGGCGATAGCTTCTTCTTTACTGGAGAAACTGTCGACGTAGTCTTCC:1 + chr2R 4500956 3' + springer 377 2 71.43 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATACTCGTACACACACACCCCAGAAGGCGTTGTGTCCAGCATGTACGA:1 + chr2R 8311374 3' + opus 7474 2 55.45 AGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATAGCTGCGGTTCGGTCACTTTCGATTATGCGAAATACGCTTGGCAGTCAGCCAGTAGCCAAAA:1 - chr2L 18761787 3' + 297 6786 2 73.00 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCCTATCGCAAACTAAAGTATATT:1 + chr2L 16680072 3' + P-element 2837 1 31.68 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCC:1 + chr2L 18213201 3' - hopper 43 1 76.67 AGACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATATTACTCATATTTCTTAGACTCTTTGTTTTATAACACCCTT:1 + chrX 22734089 3' + copia 220 1 60.40 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAA:1 - chr2L 17245023 3' + copia 202 2 78.22 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACCGAATCTGCTAAATTTCACACACCACTTCG:1 - chr3L 11929283 3' + copia 244 1 67.33 GTTTTTTTTTTTAAAATATTTTATAAATCTTTCGTGCAC:1 + chrX 13256864 3' - TART-B 10507 2 82.05 CTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTAATTTTATTTTTCAACAGCAATTTTAGCCCTAGATGTGTGCAATGCAGT:1 + chr3L 20759016 3' - flea 4781 2 61.39 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAAAAGTGGAAAATCATAAA:1 - chr3R 14193898 3' - pogo 30 1 56.00 AAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAATCAATAAATTCGAGCGGGGTCAAGAGGTGACGACATAGTCGAAAATGCCTATGACCTTCAGGCCCCTAGCTG:1 - chr3L 3517771 3' + S-element 1660 1 71.72 GCCTTCTCTTGTCCATGAATGCTGATGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTG:1 - chr3L 16792568 3' - Chimpo 4059 1 77.23 TGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTG:1 + chr3L 13569781 3' + invader3 221 2 77.23 AATTTAATAAAATTTAAAAAAAAATCACAAAGTTTTTATTGAACACTAATTTCTAGAAATTATATATTAAATTGAATGCGTTTTTCTTAAAATCTGAGTT:2 + chr3R 21945480 3' + transib4 2274 1 68.00 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGTGGATGTATATGTACATGTATATGTATGTATATTGGCTCCTTG:1 - chr2R 15349495 3' + P-element 2861 1 50.54 TGTGGAAGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCTGGGCACATTGTTTTTGGCCATTGTAAATTGCCGAGTTGCTGCCGCCTGAATTTAGCTACGTACTATTGTC:1 - chr3L 18656117 3' + aurora-element 4105 1 70.30 TAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACGCGATGACGATGGCGATATTTGCTTTCCTCGGAGCGAAGGAAG:1 - chr3L 19162867 3' + Ivk 245 1 57.43 GAAATATAAATTATAAATTGCAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTGGCTGAGATCAAACTTCGTCTTGTTAAT:1 - chr3L 3596646 3' + copia 252 1 73.27 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACATGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACGTTGCCT:1 - chr3L 20049617 3' - jockey 4785 1 51.49 CCTCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCACGGATGGGGAAGGATCCTGCAAAACTATCCTAAGTAGTGTTTAACTATTAGGGAC:1 + chr3L 19484091 3' + Quasimodo 7040 2 64.36 GTCATGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATGCCCTGTAAGCAGAGATGATGGATGGACTTTCACACATTTCCGACACCTTAAGTAAAGATAGAAACC:1 + chr3R 20153044 3' - Cr1a 4392 1 73.27 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATAGGAATGCTAATTAACTACAATAAAACATTTTGATGGAGCGATAGATTTATGTATATAGGGATTTCCTTAAT:1 - chr3R 13913000 3' + mdg1 394 2 50.50 TTAACTACATCAGAAGTTTTGGAATGCTAATTAACTACAGTATATATATTTTCCATATGTTTGTGAGCAATATAAATCATAGTTCAAGGCTGGATTTAA:1 + chr3L 14818797 3' + mdg1 404 2 61.62 AGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTCTGCGTTCTACTTCTACTTTTTTACAGCGTCTTTTCGGCGAAATTGCTGTTCTTCGTT:1 + chr2R 7779855 3' - I-element 316 1 62.38 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCTTGTTGTATGATTTCAAAAGCGATGTAATATTATGCTATGTTTTTCACACTGCAGTTG:1 + chr2L 6362934 3' + 412 7530 2 61.39 GAACGGAGCCCAAAATTGTNAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTAATGTCCCCACATTAACA:1 + chrX 13146982 3' - roo 8697 2 57.43 CTAGACAATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAAGCGCATGCACAAGGAAGACTCCGAAGAGGAATCCGTCGAGG:1 - chr3R 26912048 3' + G2 2892 1 59.41 TGGTAGCGTTGTAGAATCTCAATATTTAAACCCTAAAAAATGAAAATATTGTAAGTCCTGAAACAGACAATACGGCACCCCCAATACCCATGTATTGTACT:1 - chr3L 24234214 3' - G4 3475 1 73.27 TTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATGCGTTACTCACATATC:1 - chr2R 7546255 3' + hopper 81 1 49.50 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAACTAAACTAAATACTAGTATTGAAAGGAGGGTAGCAGCGTAGAAAATATTGAACTTTGTCAATGGCT:1 + chrX 1127075 3' - mdg3 5261 1 69.70 ACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTTATATCCAATGTGGTACCCGGATTTACATTTCCACCCTCATAATGTCTAATACCCTTTTAATTGGCATCA:1 + chr3R 9122738 3' - Chouto 10 1 59.41 CACCTGGCCATCAACCTTCTAGACAATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGCTCTCTTGCTGAATATGCGCTCTCCGCTCTTCGC:1 + chr2L 12854678 3' + G2 2874 1 66.34 AATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATCGCTAGTGGCATTTGCGTAGGGCTAATGGCTGTAAAAAAAAAGATAATAGTACTAACTAACCTCTTGTTTG:1 - chr2R 18432033 3' - 412 3 2 76.24 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATAAAGTTTTTATTATCATAATAAACCGAATAACAAGCTATAAAATTAATAGGTT:1 - chr3R 17003288 3' - pogo 18 1 65.35 AGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGGTGAAGCGGGCAAAACGCACAAGCAGTCAGGAATTTAAGACAATTAAAAATGAAAAACT:1 + chr2R 10984060 3' + HMS-Beagle 186 2 63.83 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCCTACCCAGCCTTTGGAGCCCTTCT:1 - chr3L 3881002 3' + blood 7338 1 75.25 TCAATGACCAGTCCTGGATAGCGGCTCATCCCATGGTACCGGTTAGTGATCGGTTGGCCCCCTCTTTCGGCACCGACAAGCCCG:1 + chr3L 25002446 3' - R1A1-element 4957 1 70.24 ATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATGCTACAAAATATATTGAATAATAAAAATACGTTAAAT:1 + chr2R 10372187 3' + mdg3 211 2 60.40 TAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATTAAAGATTATTATTTATGATGTTTTGCTGCTGAAGCAAAAAAAAGAGAAGCGAAAGCCTCAAACATTTCG:1 + chr2R 16574299 3' - Idefix 1 2 78.22 AGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAG:1 + chr2R 14997907 3' - McClintock 5963 2 63.24 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCCATGGGAACTGGGGAGCTATCCCCGCATTCT:1 - chr2L 13566490 3' - hobo 46 1 67.33 TTTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTTTACCACTGCGGCGGATCTCTAATCAACCATCGTTACGTTCTGACGGCGGCACACTGCGTCTCGGCTATTCCC:1 + chr3R 4308962 3' + R1A1-element 256 1 70.30 GCAGCTATATGAAAGTTGACCAAATCACTTGAAATTTTGTAAATCATCTTGGGGGAAGTAAAGAGTAACATGCAACTATTTTTAAATTACATGTAATAAA:1 + chr3L 19035617 3' + transib1 2025 1 70.00 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTT:1 + chr3R 23338326 3' + roo 9030 1 65.00 TTGTCAGATTTGGGGCTTGGCTTGCGATAGCCAAATTTGTCGCATTCAGGTTGCCCAAACAAAAGCCTCAGCGCACAGAGATAAAGAGAAAGCAAGCCCCT:1 + chr2L 14788932 3' + BS3 1315 1 60.40 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCCAATGGCTTGTTTCGACAACTTTTTTATAATCCTTTTAGGGGCTCTC:1 + chr2L 2470712 3' + pogo 2081 1 50.50 GAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGAATTGAACGCTTGCTAAACTCGACCAAATCTTCTGCTTTCGCTTTTAGGTGAAGACCACG:1 + chrX 6576780 3' - McClintock 459 2 68.48 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATATTTAATTGATAAAGCAGAAAGACAT:1 + chr3R 17003361 3' - pogo 45 1 76.24 GCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCTCCATTTAAAATTAAGAATTTGTGAACTTTTAGAGTTAAAATAGATTTAAAATTTATGCCAAACT:1 + chr2R 4917207 3' + S-element 348 1 69.31 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGTTC:1 - chr3R 30553570 3' + 412 7494 2 72.28 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGGAGAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTTGCCTTTTTGCTAAACAGTCCGCGGAAA:2 - chr2R 21747524 3' - mdg1 24 2 52.48 TTATTGTGTTGTATTTTTTTTTTATTTATTTTTTTTTTTGATTTTCTGCCCACCAAGATGCGGATGCAGAATTGGATAGTGCCTACGATCGGAATGCCCGA:1 - chr3L 6232633 3' - gypsy11 3933 1 56.44 CGGACTCCACGGAGCAGCCAGCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGACGACTGCGGCGGCGAACAATAAAAGACGGAAG:1 + chrX 12175458 3' + Gypsy6A_LTR 322 1 68.89 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGCGGCAACTGGAAAACTGGCAACTTCATTATTATTTGCAGACACTTTTCGAAAAGATTTTTCCGCTCGCTT:2 + chr3L 8252281 3' + copia 248 1 71.29 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTC:1 + chr2L 20328767 3' + opus 470 2 66.67 GAGAGAGAGAGAGAGAGCTAAGAGAGAGATTCCGCATACAGGGATAAACAACGCCATGACGCTCCATTATGCCGATTTTCTGCTGGGGCCTCAGGGCGAAG:1 - chrX 2810554 3' - blood 164 2 58.42 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCA:1 - chr3R 10087841 3' + roo 9021 2 72.28 ACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTAACTGAAACTTTTATGCTCCATTTGGGG:1 - chrX 4264357 3' + mdg3 5452 2 68.32 GAATACAAAACAAAATGAAAATTAGCGATAAACATTTGTCACTGGGCAAATGAAACACAACAGATACGTCCACTCACAACATATCCTCCTTTATTTCCAGG:1 - chr2L 330585 3' - gtwin 228 2 59.41 ACCAATCCTTATGACTACACGAAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCACCATTCCTTCGCTGCTGCTCATTCTGAACTGCTAGTA:1 + chr3R 24287154 3' + Doc3-element 394 1 68.32 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATTGCTG:1 + chr2R 9631750 3' - F-element 58 1 79.21 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGAGCTTAGGAAACCAAATTAAGCTTTGACTTTTTAAAGGAAAA:1 + chrX 1399955 3' + P-element 2883 2 75.25 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGTGGGCGTAATCC:1 - chr3R 25021654 3' + roo 400 1 71.29 TGACTGCCCTTAAGGCTAGCCAACCAATTCAATGATAACAGCAGTAGCTGGAGTTGATTGAAGGCGCGATGCGCTCTAAATAAAGATTTGACTAACTATCG:1 + chr2R 4481399 3' - springer 7367 2 76.24 CTCCTCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCTATCAATTACAGAAGAATCTCTAAATTTTCGGCTATCGATCTTTGGGGGAGCTTTCTCTGGAGCTTT:1 - chr2R 19126362 3' + Q-element 68 2 70.30 CGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTGCACCCATTGTTTGCTGCCGCACATGCTTATATTCG:1 + chr2R 13653436 3' - F-element 17 1 66.33 GCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATACCTGTGACCACATGCATGCTCCTCTAATGCCCTGACTATGGCCATATCCAAAATAGCAATTGACA:1 + chr3L 20080687 3' - Stalker2 290 2 69.31 AGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTCGTTCAAGGTGTGTGGTAAAAATTTGTAACTGCGCCTGAAAGTATGCGATGAAAACCTTTGTTTTAAA:1 - chr3L 18146034 3' + 1360 235 1 73.27 TTCATCATAAAAAAATCGGNGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATACTCGGGATATCAGGTCCTCAAAGCGATGTATTTTGTGTTTGGCTGGCA:1 + chr2R 6772815 3' + I-element 307 1 56.44 CAGATCAAATTAAGTTGCCNCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCT:1 - chr2L 9045431 3' + jockey 4948 1 69.31 CGACTATCAGATACCCGTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAA:1 + chr3L 24731967 3' - INE-1 550 1 81.19 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTTGAATTGCGACCAGAGATTTGAGATTTGAGCGTGTGCAA:1 - chr2L 10898397 3' - jockey 4706 1 59.41 ACTAAAATTGTTGTCTGTTAATTTGCTAGAAGCAAAAATCGCGAATC:1 - chr2L 12261847 3' + gypsy4 6830 2 76.60 TATTACTTATTACATATTACACAGCCACGAAGTGGGCTTAAGACCCACACTCACAGGACCAGCTCTGCGGCTGATTGAAGGAGTCTAAACTGGGCTTTTAA:1 - chr2L 15531760 3' + Stalker2 404 1 79.21 TAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCATCTGGCTGTTTTTGGCCGTTTTTGCCTGTTTGTTGCCTTGGATGTTTTGGCCAATTTCCCTGTTTTCGCAG:1 - chr3R 23542917 3' + 412 494 1 77.23 TTAAATTTTCTCTTATTTTATTATCCCCAATATATATATATATCCCAGAAGAAATTATGGAACTTTGCCTTAACATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATC:1 - chr3R 17733317 3' - HeT-A 323 1 68.32 CCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTATTATTTTCAAATTGAATTTGCATATCGTTAGTAACGGCAAAGGCCAAGGGAAATCGGAAAACGGATTGAAACTGC:1 - chr2L 18255044 3' + blood 7163 2 74.26 CAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTTTCCGGTTAATTTCCCATCATCTT:1 + chrX 983397 3' - Juan 3807 1 75.25 AAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTATTTTCATAATTTCCGCATCCGACCCAAGCCGAACATCCTGCTAACCTGCTTATTTATGGTTTAATAAGCC:1 - chr2L 7592891 3' - Cr1a 4175 1 73.27 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTCTGTACATCGGTACT:2 + chr2L 20367363 3' - Doc 38 1 56.44 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCTAAATAATTCGGTTGCGAGCAAATGGCTTACTTTAATTTTAATTAAC:1 - chrX 20419117 3' + flea 4989 2 52.48 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAACGAGAGTACCAAGAAACGGATCGAGAACTACGCCGTCAATCAGTTGAGGCAGTGCATCTTGGATGGCC:1 - chr3R 21884152 3' - mdg3 5262 1 69.31 AAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAGTCCGCTTAACGATCAAAGACGACGACATATTTACTAGCTCACTGACAAAAATAAACTTAAATT:1 + chr2R 21350449 3' - opus 6 2 50.50 TGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGCATATTATTTATACTCTTATACTTGAGTCCTATTCGAGTGCCC:1 - chrX 1706041 3' - Juan 4082 1 57.43 ACCTGTTACATTCATTTCAAGGAATCTAGTAATAATCTAGTACAGATAGTTATATTTGTACAACGTATTTGTTGTCATTAAGATTAAATTACATTAAACCA:1 - chr3R 31953796 3' - INE-1 19 1 35.64 AATATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTAT:1 - chr3L 15125905 3' - Juan 3790 1 74.26 GCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAA:1 - chr2L 12958935 3' + roo 9017 2 81.19 CACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTGGCTTGAATCCTTTACGGCCTTTACCC:1 - chr3R 16271906 3' + accord 7331 2 76.24 ATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTCTCTATTGTTGTACCCGATACCTATTACCCATTAAAGGGGTATACTAGATTTAGACCA:1 + chr2R 5720548 3' - pogo 29 1 66.34 CGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTTTGTAGATCTTTAACATATTTGCCCTTGTGCACCGTTAAGCAAACG:1 - chrX 7400057 3' + R1A1-element 5064 1 60.40 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGTACTTCCATTTAACAGGGAAATAACGTTAGTATGTTTGTTAAACCAAAAGCGTAGTGGACCCTA:1 + chr3L 7307301 3' - hobo 11 1 66.34 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCC:1 + chr2R 22856579 3' + 1360 3343 1 76.24 ATTCGATATGTGTGCACATNACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATCGCCGTACTTAAATCACTTTCTCGTATAAATATTCTTTAGCCGCAA:1 - chr2R 22051433 3' - Tabor 2 2 75.25 CTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGAAAATGCTGCAG:1 - chr3R 9088559 3' + hopper 1385 1 52.48 GTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGTCAGATAGCTTGAGCCTCTCCACTTTCATTGGCAGGCAATTCGAACTGGGAGTGTATCCATTA:1 + chr2L 10243579 3' - Quasimodo 412 2 68.54 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTGTTTGGTCAAATGCAGAACGGCACAGTTATTCG:1 + chr3L 2022327 3' - roo 8674 2 68.00 CTTTGCAGATATCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCAAAGGAACAGAGTTCCACAAAGAAATTACA:1 + chr3L 10816020 3' - hopper 381 1 69.31 ATGAATTTTAAATCGCATAAAATTGAAATTCTAAGTGGTTATGCTCATTTTTGTAATGTTATTATTTTTCAGATTTATCGGGATCGGGAGCGGGAAAGG:1 - chr3L 13890927 3' - transib3 146 1 43.43 TTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGGGCGTGGGCAGCTGCAGACGCGCTTTAAGTTGCTGTTTGGTCTGCGGACG:1 - chr3L 22913802 3' - I-element 5174 1 60.40 CGGCAGAGAGGCCGTCGGCAGAGACGTTGCTTTGCTCTTATTTACTTAACTTTGGCGAGAGAAAGATTGCTTTGTCTTATGTATGTGTGGGTCGTTTTCG:1 + chrX 22789287 3' - Tabor 280 2 58.00 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTCTGCACTTTAAGCACTGCCACTCTCCACTTTAAATATTTACTTAATTATAAATATTCAATGCCTTTTGTG:1 - chr3R 9278301 3' - roo 6 2 77.23 GTGCCTAGAGTACCGAGTGNTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCACACATACGCACAGTTAGGATCTTTACCAAACA:1 - chrX 15287872 3' + hobo 2895 1 70.30 ATTATGTTCGTATATACTACAGGGGAGAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTTGCCTTTTTGCTAAACAGTCCGCGGAAAAGTTTGCCGGCAACAAAGTTGGCC:2 - chr2R 21747500 3' - mdg1 7038 1 74.26 AAACACATAAAGTAATTGCAATTAAACACGGAGAACAATGGGCTACACAAAAGCAGGCGTAGAACATGAGGAATGGATTTGTTTTAGGATTTCGATTTGGA:1 - chr3R 7627449 3' - hobo 2551 1 73.27 ATGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAACAAATGAATTATGAGTTGCTGGCGGCGGCTGTGTGACCTGA:1 - chr4 907869 3' + 1360 3357 1 61.39 TGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGTTCATAGTCATAAAACATTAAATTTCT:1 + chr3R 25370551 3' + BS 5069 1 50.50 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGCAATGCAGCCGCTAAATGTGTGCAATTCACCACTTGAGAAAACCACCACCGCC:1 + chr3L 10363895 3' - P-element 20 1 60.40 GCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGTTTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTACACCTGTCCAAGGCTCCTTTGGC:1 + chr3L 5388630 3' - F-element 4526 1 55.45 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATATACAGGCCAGAATTAGGATGATTCTAGTT:1 + chr3R 18549970 3' - pogo 41 1 73.27 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATAAATTTGATCTTACTTTGACCACTGTTAATCCATGCTAAGGTAATCGTGGAATCACTCCA:1 - chr3R 19446340 3' + roo 9039 1 68.32 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAAC:1 + chr2L 7666151 3' + roo 9018 2 79.21 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACCTCAAGCACGTCGGTCGATCAATATTT:1 - chr3R 7626395 3' + hobo 2921 1 59.46 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATCGCTAGTGGCATTTGCGTAGG:1 - chr2R 18432083 3' - 412 53 2 81.19 CTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCCCGTTCGAATTTAAACGGAACTCCTTAAAATGCAAGTCCTTATCACATAATCTTTTGATTTCGTTCCAT:1 - chr2L 12897908 3' + INE-1 502 1 61.39 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATAAAGATAACATTAAAACACAATCTG:1 + chr3L 20354079 3' - 412 7081 2 51.49 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGCATA:1 - chr3L 21144044 3' - jockey 36 1 54.46 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAA:1 + chr3L 18418895 3' - hobo 42 1 64.36 AAAATCGTTTCTTCGCGACTTCTAAATAAGTTTGCATACATTACAGTTTTGAATTATCTGTTTTATTTTTTCTTTTATGTTTGGGAAATAGAACTCTCTTT:1 + chr2L 23374410 3' - Tc1-2 1239 1 70.30 GAAAAAAGCAAAAAAAAAACAAAAATCCAAGTTTATTCATAAAACCAGTAGGTGATCAATCCGTTGTCCAAATTGAAATGTGTTTTAATGTGCCATTTTAT:1 - chr3R 14506908 3' + gypsy7 5009 1 46.53 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATATATTAAGTACATTCATATTTCA:1 - chrX 14173012 3' - 412 53 2 82.18 AACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATTAAGCGATTTCTATACATCGCCAGTATCTAGGGGTTTTCATCTGAGGCCATCTTTCTAAAGC:1 - chr2R 16185012 3' + 17.6 7409 2 70.30 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACC:1 - chr3R 19449450 3' + hobo 2899 1 61.39 GCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGGTGAATATTTTTGACAAATTACTTAAATTACTTA:1 + chr2R 11030565 3' - F-element 66 1 76.24 ATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATGCGTTACTCACATATCTAAATTGGTGTCGCTTGTCTGCT:1 - chr2R 7546232 3' + hopper 106 1 65.66 TAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCCTGAATGGATTTGCATTTTAATGCAGAGCGAATTAATTAAACTATATAATTTTATC:1 + chrX 18308593 3' - I-element 5159 1 57.43 AAACGCAGAAAATTCAATTTATTACAATGGTGGGTGACTTCGAAAAACCTGTTGAAAAGCACTCAGCTGCGGACGTATGAAAACTAGTTTCGACGATTGAG:1 + chr2L 2861799 3' - S2 33 1 62.38 CCAAAAATTACTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAAGTGCGCTGGTTTTAATGGCCAGCAATTCGCGTCAAAATAGCCGGAACTAATTTAATA:1 + chrX 5476983 3' + Cr1a 498 1 63.37 TGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTGCTGCCGCTTGGCATTAACTGCCTACGCATATTCGTAGTATGTATAT:1 - chr2L 4134821 3' - Quasimodo 28 2 53.47 GTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGTGGATCGGACTAAGTGCCTCTGCGGCTGGTGGGGCATTTGGAGTTTTCAATATTTCAAATT:1 - chr2L 19292756 3' - invader4 2924 2 68.32 AGTCCTTGCTCGCTCACCGNGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGATACATCTACACATGTACATATGTATGTGTAGGGGTACACACAAAGCAAATTG:1 + chr3R 10095106 3' - Rt1b 5000 1 50.50 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCCATCCCACGCACATGCAACAAGAAATGGCAAAAGTTTT:2 - chr2L 10625677 3' + roo 9035 1 59.41 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGGTCTAGCAAAATGAACCGAGATGAACAATTTACTCA:1 - chr2L 7810699 3' + P-element 2848 1 39.60 TGTGTACTTAAATTACATGTTTTATGATTTTTATAATACTTTGTGAATATTTTTTGCCCCAACTCTTGTTTTAAATGTGTTATATTTGTTACTTATTAACT:1 + chrX 16197205 3' - roo 135 2 40.59 CTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGAGGGCCTGACTTCCAGCAATTCCCGTCTCCAATATCTGGTA:1 + chr3L 2277152 3' + R1A1-element 4933 1 59.41 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATAAACCCAATACTTAGCTCCTGCTGAGCCACGTTCGCTTTCAGTTTTTGAGGTAGG:1 + chr3L 171251 3' + 1360 3367 1 57.43 CAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCTATTCTCATAGGTATTACATCTACTTTGTGTAAAACCCTTTCAAGTCAGAAC:1 - chr2L 15989545 3' - 412 284 2 63.37 TATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCGCCGTTCCTGTTGGCCATTGATTTATTAGGTTCCGCCGTGCGGCATT:2 - chr2R 6847229 3' - mdg1 1 2 78.22 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGCATAAATAAATGAAAATGCTACAGTTCAAAACGGACCATAGTTTAAGTCTTGGTTATTT:1 + chr2L 16139194 3' - copia 4887 2 61.39 TAATAATAATAATAATAACAATAACCATAAAGCGCCATTTTGACAGACGTCGGGCTTAAGTTTCACAGACGGCTTAAAGTTATTGGGGCTATAAATTTAT:1 - chr3R 25666628 3' + mdg1 7056 2 73.00 ACTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTATGTAAGCACCTCAATTCTCGCTCTCCGGCAGCAGTGAAAAAACAAACCCGAGCTGAGGCAGGTCAATGAAC:1 + chr3L 18022761 3' - blood 169 2 56.44 CGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 5323 1 51.49 CTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAACATACAAATACATAAGAATTAATATAACCCTTTCAGCCAAGTTTGGAATTAGACAC:1 + chr2L 19114621 3' + S-element 1699 1 60.40 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTGAATTTAGGGCGTTTCCTGAGCTCATTAAAGTCACGT:2 - chr3L 7300499 3' - Doc 44 1 66.34 GATCCCGAAAAGGGACATGGAAAAATGCCTTCTATCGTTCTAACCTTTCGATGCTTTATTCTTACTTCAGACCTTACAACAGGAA:1 + chr2L 22996532 3' - HB 62 1 65.88 CAATATAGAATTGTAGAGCNAGAACTTGTGGTCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTAGCCAAAACAATAAACAAAATTAA:1 - chr3R 30991156 3' - F-element 4234 1 71.29 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAATGGAAATTAGAACTAATTATTTAACTGAAAT:1 + chr3L 21519034 3' + 1360 3346 1 71.29 CCATTTATTTGCAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCAGTGTTAAAGTTCCTTGATGCGGTAACCAGATTTGCCAACTGTACTTTCATTCAAATAGCTTTAGAT:1 - chr2L 21734703 3' + 17.6 497 1 72.28 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATTGCTGTGCACATTGCTATAGA:1 + chr2R 9631766 3' - F-element 42 1 63.37 ATCCCAACATTTTGGTCCTTCGAGCCGGATCACCTGGATTTTCAAGTTTGTACTAAGTATTTCAATTATTGCTAAAAATATTATTAAATTGTATAATTTCA:1 - chr3L 21809563 3' + GATE 264 1 61.39 GAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTG:2 + chr3L 19350006 3' - 1360 3219 1 42.57 TGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAATATTCCAGGCTAATCGCAAGACAAAAGCCACAGCTTT:1 - chr3R 23640977 3' - 297 6614 2 63.37 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGAAATATCGATTTAATTTCATTTACTGCCA:1 + chr3L 18762129 3' - pogo 43 1 74.00 TATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTCACCGCCGATGCACTTGTGCAATCCAACGTGCTGTTTCTC:1 + chr3R 10148842 3' - Stalker2 37 2 63.37 CGTTCGATGATCCGATTCGCTCTGCCCTTCTTTCTTAAGCTCGCCTTTGATCCCAAGCCAAAAGCAGCTTAAATCATTAATAAGTGAACTTAAAATAAAGA:1 + chr3R 20784546 3' - gypsy7 113 2 68.32 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTATATGACCCACGTTTTGGGAATCTTTTCCCCTGCCGTTTGAGTGCCTTTTC:3 - chr3L 171167 3' - 1360 25 1 55.45 AGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTTAACAATCTTATTCCTTCTGGTGACCAAACCGTATGGGTGGGTTG:1 + chrX 14129418 3' - Idefix 184 1 77.23 ATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTATGCTCAGGTTCTCCAGTAGGCCACCGTGCTTATGGAGCTGGTTCTTTAGCGCCTCGTAGGTG:1 - chr2R 16313070 3' + INE-1 16 1 85.15 ATCAAAACTTTCAAGCGAACTGTTAAAAGAACCGCAAGAGAGCAGTCATACGTGGATTAGTCATGACGGCGCTGCTTCCGAGTTGTCTACATAGGAGGAAG:1 + chr3L 3083181 3' - Cr1a 374 1 63.37 AGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAATTCCAGACACAAACCCGGCCCAAA:1 - chr3L 16282360 3' - gypsy5 13 2 63.10 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACACAATCTG:1 + chr3L 20354079 3' - 412 28 2 52.48 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATTATTAGGTATTCGATACTTAATTGCAAAAT:1 - chr2L 20118395 3' + copia 5082 2 73.47 GTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 1202714 3' - 1360 166 1 58.95 TTTGACTAAATATGTCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATATATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCCATTATATTATATTATTATTTAAA:1 - chrX 288504 3' + 1360 210 1 78.22 CTACAAAAAAATAAAAAAAAAACATTCACAATGTTGCATAGACACCTTTGTTTGTTGAGCAATCTTAGTAATGAATATATGGGCTAAGCACTGAATTTTAC:1 + chrX 5485034 3' + G2 3074 1 50.50 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCAC:1 - chr3R 19589936 3' - BS 5034 1 61.39 ACTTTCATATAGCTGCCATTTAAACGATTAGGCCGATATGCCATAAAAATATTCACCATTCCCTTCACATCCAATAGTTGTGACAAATGATCTTGTTTCTT:1 - chr3R 26013841 3' - transib1 2019 1 53.47 GATTCATTTACATAAGATANGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTCATTGGTGAATAAAGAAAGT:1 - chr3L 15037937 3' - roo 53 2 81.00 AAGCTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTATGGCATACATCTTCGGGGTACTGCCAGCAACTCATATATTGAGATTGGACAAAACTGCTTTTTGAAATAATGT:1 + chr3L 3443922 3' + G4 3409 1 73.27 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTTGTATTGTGTAATTG:1 + chrX 4399592 3' - I-element 27 1 57.43 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTCTTAGTTGATTTTTTAAAATGATATGTAACAAAGGTATTTAAATATAATAAGGAAACTAAATTTAA:1 - chr3R 5348636 3' + copia 246 1 71.29 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGTAAAAATTGGCT:1 + chr2L 7175618 3' + blood 7345 2 69.31 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAAACTATTCGGCCAAATTTT:1 - chr2L 16139108 3' + copia 227 1 52.48 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGTGTAGATTTCTCTCATACCATTCTGATTTACATTA:1 + chr3R 15579038 3' - pogo 31 1 57.43 AAAAAAAAAACAAACAATGGAAATAGATATTATTTTCGGGTTTCTTTCTTTTGCGCTGGAAGTAGTCATCATCAGCGTCTGATTCTTCGCATTGGCTTGGC:1 - chrX 12296761 3' + transib2 2642 1 74.26 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGCGTGTGTTTGGTCTTCATCTTAGCTCGGCACAGGGTTGCTCTTTTGCTTGCCAAGGAT:1 - chrX 14651068 3' + P-element 2869 1 61.39 GCTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATATCGCAGACAAAGTATATAGAACATGTATTTTGCGTCCAGCTTGGAAAGTGTTGGCAAGG:1 - chr2L 5419774 3' - 297 4 2 74.26 TATGTTTATGTTTATGTTTATGAAAGTTGAAGCCCAAACACATTTATTCCTATTTTCATTCCAATTTTCATTGCTTTTCCGAGACTGCACACGATTTGTGC:1 - chrX 13798787 3' + 412 7128 2 80.20 TGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAACGAGAGTACCAAGAAACGGATCGAGAACTACGCCGTCAATCAGTTGAG:1 - chr3R 21884172 3' - mdg3 23 2 53.19 AGTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTGTTTGCTTCGGGGTCGCCTGGGGGTCATTATCAATACTATGG:1 + chrX 7966438 3' - HMS-Beagle2 489 4 83.58 TAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCA:1 - chr3R 19589942 3' - BS 5040 1 67.33 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAGTTCAGTTTCTTCTGTTATGCAA:1 - chr3L 21970820 3' + pogo 2055 1 76.29 CAGATTCAGAAATTTATAATGTAGAACTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTAATGCTCTAATGTGTGGGGGGGGTTAGATTTGGCCTGTTTTAATCACT:1 + chr2R 2119486 3' + transib2 2560 1 53.47 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGCGTTGCCT:1 - chr2R 19560151 3' - Tirant 28 2 53.47 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTTGAACACAATCCA:1 + chr3R 23638181 3' - pogo 26 1 58.00 ATTCATCCAAATATCTCTAATAGTTTAGAAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTAATGGTCCACATGTGCAGTGGCAAGT:1 + chrX 21255291 3' - hopper 53 1 75.25 TACTCAGCAAGTGGGAATGCGAACTCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATTTCGATAAATATTAGGGATATAAAACGAGAAAAGCAGATCAGTGCGGCTGA:1 + chr3R 28271393 3' - INE-1 532 1 80.20 ATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATGAGAAAAAAATTAAAAATTGTTAAAAATATTATTGGCCATCTAGCTTTAACAGTTTTCTAAAT:1 + chrX 21030156 3' - INE-1 501 1 69.31 CCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTATACGGAGCTCGAAGAAAACACGTCTTCGATACCTCCACCCTAGCAACGGACGATTGTTAAACGACATTTT:1 - chrX 5896582 3' - Doc2-element 58 1 57.43 ATTTTAAATAAATACATACATCGAAAACAACTAAAAAATTTGCGAAAGTACATAAATATGTAAATTAATTTTCAGTATTACTGGGTATTCTCATATTCGTC:1 - chr3L 3037084 3' + G-element 4303 1 47.52 TGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTGTAGGGATATGTATGTATGTCACTGCGTATTGCTGATAAGTTCT:1 + chrX 18326265 3' - Doc 191 1 67.33 CTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTCTTAGAAAAAGCACCAATTAATAATCTGTTTACAAATTATTTCCAAATTAATTCTCTCTCGCACGC:1 - chr3R 12885149 3' + hopper 1056 2 63.37 ATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATAGAGATCAAAGCTGAATTTTACAAGATTTCTGCTCTTTCCATAATGTCACACATCCAATGCCTTTGGGTG:1 - chr2L 13976663 3' - 1360 3169 1 77.23 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCTTGTGGCCTTTG:1 - chrX 13126202 3' + mdg1 394 2 50.50 GCTCACACTTTTGAAAAATCTGTTGATATTTGTTTACATATTTTGCCATCGTAATGAGAGTAAATGCTGGTTGATGAATGACGTTTTGTTATACAAATGTT:1 + chrX 14335740 3' + INE-1 256 1 75.25 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTAC:1 + chr3L 20411855 3' + roo 9036 1 61.39 GTACCGAGTGTTTATCGGGNGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATTTCTATATGTTTCTCTAAATTTTTGTTGAGGTTTCTCCGAT:1 - chr2L 16426431 3' + hobo 2904 1 62.38 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTCATGCTCTCGCACCTCCATTAAAAATAAAAGTTCTAAAGTCTGTA:1 - chr3R 22349470 3' + pogo 2071 1 56.44 TGACGCAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATCTGGGGATCTCCAGGCTTGTT:1 - chr2R 8311319 3' - opus 11 2 63.33 AACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAATACGATCGCGGAGCGTGAGAATGCCGAGCAAAAACAAGTTGAGATAGTGATACGAACGGACAAACTGGCAT:1 + chr2R 1006716 3' + Stalker3T 96 1 57.43 GGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCA:1 + chr2L 23295863 3' - micropia 4987 2 57.43 TAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGGTGAATAT:1 + chr2R 5772513 3' + HMS-Beagle 204 2 73.27 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGCTCGGTGGGCAACG:1 - chr3L 3650039 3' + mdg1 390 2 54.46 CTGGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCCACTCATGTTTTGTCGCTTAATTTTAATGGCTTGCCGGGCATTAAACTTCT:1 + chr3L 5479096 3' + 3S18 6105 2 75.51 GCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGCCAGCTGATTGGCGAGAGAGAGAGGGCG:1 + chrX 11017636 3' - Cr1a 293 1 89.23 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGTGGATGTATATGTACATGTATATGTATGTATATTGGCTCCTTGGCTATTTTGTATCTTTC:1 - chr2R 15349478 3' - P-element 17 1 63.37 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTACTTATTATAGTATAATATCAAATATATTAGTA:1 + chr3L 20411891 3' + roo 409 1 78.22 AAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTAAAAGCCAATTAAATTGTTTTCGCCATAAAA:1 - chr3L 13190112 3' + roo 9021 2 71.00 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATTAATTAAATCTTTCTAAAAAATCGTTCTATAACCTTTTTT:1 + chr3L 15125937 3' + Juan 4172 1 70.30 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTA:1 + chrX 13146965 3' - roo 50 2 75.25 TTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACATAACACCTGCTTAAAGAGCCGCAAAAAGAAAAGAAAAACGCAAAGCCAGAAAGATACA:1 + chr2R 8177782 3' + mdg1 400 2 53.47 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTGCACCCAT:1 + chr2R 13653408 3' - F-element 48 1 57.43 AAATAAAAGGAGCAGTATGTCGGCCTAAGTCGACCACTTTTCCATTTTACTTCAGTGATTTCAAGTTACTTTTGCTTTTCCGCATCTGACATTCGTCTAAT:1 + chr2L 18584244 3' + BS4 507 1 45.54 TAAGATAAGATAAGATAAGAAATATAAATAACTATATAAGTATCCAAACATTAAACCTGCTATGTTATTAAAGCGGAAATCTTAATGTATTTCCTTTTTAA:1 - chr3R 15768199 3' + Stalker3T 202 2 69.31 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACACAATCTGCTGCAGT:1 + chr3L 20354086 3' - 412 18 2 61.22 TTTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCA:1 + chr3L 24916688 3' - Porto1 151 1 55.45 TAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTTCGTGGCTGTCGAATGGTTTTGCGGC:1 + chr2R 19560212 3' + Tirant 8459 2 72.28 AAGGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAATCCTTTTACCCTTTTACCCAACGAGTAACGGGTATAAAAATTCCAGCATCTATTCTTAATAATTCACT:1 - chr3L 11893111 3' - INE-1 32 1 57.43 GTCAAGATACCCCGTCGAGATGCCTAACGACAGGCTGAGACCAGAAGGACCAGGTCAACATGGGAGGGGAGAACTGAAGTGCAAAGTTAGTGACTAAGATA:1 + chr2R 12953677 3' + gypsy8 4503 1 59.41 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTAGCTTTTGTGTGCCGAAATAAAAGTTTTGCGTGGCAAA:1 - chr2R 18733686 3' + copia 245 1 63.37 TTTTATTTTTTTTTTTGTAATATTTGTTAATACCTATTCTTTCTGAACTATAGGGTTTTAACCTCCAGCAAACCAGCCATTTGTTATGCGTTTGTTTTAG:1 - chrX 8096455 3' + hopper 153 1 72.00 ATAGGTCACTACATTCAGGCACCTGAGAACATTGAAGGGAGTGAGAGCGTCAATTTCTGTCCTTTGACTATGTGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATG:1 + chr2R 4802890 3' + mariner2 280 1 38.61 TGGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGTAAAAATTGGCTTCACCAAGATATCTATCTATGTTTGCATGGAGATGGAGTTT:1 + chr2L 7175659 3' + blood 7386 2 71.29 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAATTATTAGGTATTCGATACTTAATTGCAAAATTCTTGCAATTCTGAAAGACGTCGCTAAATTTCTAAG:2 - chr2L 20118359 3' + copia 246 1 75.25 CTTTGAGTCATAAAAGGGTAGTACTATAGTCAATATCAACAACCATTTTAAAATATCCTTATCCTAATCTTAATCGTATTTCACTGAATGTTCGCAAGCCT:1 - chr2L 5563415 3' + baggins 5380 1 58.42 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGGGCAACGGCAACGGATCG:1 - chr3L 3650028 3' + mdg1 401 2 58.42 ATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAGGTGTGTGTGTGGGAACATAAAGAAATACGCGGTACTACTGGTAAGTTGTCTAATGG:1 - chrX 9205494 3' + diver 205 1 57.43 TCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCAGCCGTGTCCATTCGCCCGGGATGTTAATTTCTTGGACAAGCCTAAGCCGATCCGCGTCGGCTTAA:1 + chr3R 15579352 3' - pogo 1683 1 68.32 TTTTATAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGATCACTGTGCACAAAAACACGTCATGAAACGAAACCAAACCAAACCAAACG:1 - chr2R 16832137 3' - Cr1a 447 1 69.31 CGCTGTCCTTAGTCAAATGACGGGACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAA:1 + chr3R 7869172 3' + 297 6934 2 71.28 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATATTATTTGAAATATGTGTGCTGTGCGAATTCCATGATTGAGCATAAATAAAGTGTATAGT:1 - chrX 10456439 3' - roo 8722 2 64.36 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTATAAGCTTAATTCAATGTGGTATGGC:1 + chr3R 16735084 3' - I-element 51 1 73.27 AGATCCCTTCAGTGAAGTTGGACTGCTGACTTCCAAATGTGGCTAAGCTGTGCCTAATTTTATCGACGGCCAATCGCTGACAAACGACTCGTCTCCTCTGG:1 - chr2R 20951748 3' + invader4 237 2 72.28 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCNGCAGTTCTCTGGTTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTTGCGATGTAGGCTTACGAGGGTGGTTGGTGCTTGGGGGAGTTTT:1 - chr3L 14623903 3' + hobo 2929 1 67.33 AAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAAATTAATAAAAATGGCAAAAAAGTAGTCAGAGGCTACAGA:1 - chr2L 18882574 3' + Doc 4640 1 77.23 TTTATACACACATTTGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTATTTTTGGATCCAAAATAAATAGAATGAAATAAATAAAAAAAATAAAAAAATCCC:1 + chr2R 6222216 3' + G5 4771 1 78.22 CAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGGTGGTGGGAGGCAGCCTGCAAAAGTCCCAGTCTTTGGTATGAATAATCTT:1 - chr2R 14561708 3' - blood 200 2 59.41 ACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAACACGACACTTGCCCATTTAACGCTTTATGGC:1 + chr3R 26346964 3' + 1360 3145 1 75.25 ATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTTCCGAGAACTGAGACGACAATGGCGACGACATAAATATCAACGGCACGTCATGTGGCGTCGAGGAGGAAGTGG:1 - chr3R 26252643 3' - 412 2 2 77.23 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAGTTTTATTTATGTTTTGTTGAGATTATCAAAAAAGGTA:1 + chr2L 20062414 3' - FB 40 1 66.34 AAAGATAAAAAAAATTAATATTATTTCTTTATTATTACATCTCGGAGGAATA:1 + chrX 12399006 3' + gypsy9 289 2 63.46 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCACACACACGCGAACTCACGCACACACACACACACACATCCACTGACCTTGGAGTATGCAACACTTTTCTATTGT:1 + chr3L 9775730 3' + hobo 2937 1 67.33 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAATAATCGTTTATAAATGATAAATTAATATGGGAAACAAATTGTATGGGCGGTCGATAGCTCCGAGC:1 - chr3L 7099562 3' - roo 8675 2 67.33 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAG:1 + chr3L 3757407 3' + roo 9036 1 62.38 TGTATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTAACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGGGTA:1 - chr3L 25245597 3' + invader3 5087 1 70.30 CAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCTTCAATCTCATACGCATAAAGGCATTTTTCAACCTATTGGTAGGATAGAAACTGGATGATATCAAA:1 + chr2R 22060206 3' + Doc 4497 1 67.33 AACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATATATATATGTGTATACTATATGTGCCCGC:1 - chrX 11262827 3' + invader1 3968 2 73.27 GCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAAAGAGGGTTGAAACTGTCACCTTCTATAAGC:1 - chr2R 13566730 3' + 17.6 197 2 72.28 AAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTCACAGTGTGGCTGATGATCGATTGCGATTACATTGCA:1 - chr3R 28621025 3' - 1360 39 1 67.33 TTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATAGGAATGGTGATTGAAATGGATTTTTGTCATAG:1 - chr3R 26435419 3' - Juan 4075 1 67.33 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAAAACTTAAGGAAATGAC:1 - chrX 983314 3' + Juan 4184 1 57.43 CACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATAATGCTACTGATATTAACAATCGGAAATATTAAAAATAAATACAAAGATGCACTGAAGATTTTGTAAATTATAC:1 + chr3L 5269358 3' - Doc 8 1 47.47 AACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCGCTTGTACTTTTGACTGTTAATTAAGCACTTGGTGTTCGATCAAT:1 + chr3L 22736975 3' - G-element 36 1 54.46 ACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGCTTAAAAGGCCATTTAATGAAATCTTCTACCTAATCTTTAAGTT:1 - chr3L 16563219 3' + 3S18 6073 2 55.45 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATAGGAATGCTAATTAACTACAATAAAACATTTTGATGGAGCGATAGATTTATGTATATAGGGATTTCCTTAATA:1 - chr3R 13912999 3' + mdg1 395 2 51.49 GTTCATACGGACAGACGGACAGTCGGAAAGTCAGATATACGTGCATATATATATGCAACATACATAATTATGTATGTATGTACAAAAATCGCAAAGCTGTC:1 + chr2L 22134041 3' - INE-1 123 1 71.29 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATAAAACTTAACGATTTTTTTTGTACTGATCAAGCTGTATCTAAGTTAAGTTTGAAGTGTTA:1 - chr3R 25580997 3' - pogo 14 1 46.53 ATAACCTGCGGGTGTGGAAATTTTGTTAGTGCTGAAAGATATTGTTAGAGTGAGTTTTCCTCGTCATAATAACAACCAGCGGGCCAACGCAGGACCACCA:1 + chr3R 11320680 3' + Gypsy12A_LTR 321 1 66.00 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAGCTGCGAGTCAAGCATTTTGGCCAAA:1 - chr3R 31264191 3' - jockey 60 1 73.27 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTGTGCTGATGCAGATGCATTCGGTGTGCTAAGTGGATGTCTGT:1 + chr3R 19216411 3' + 1360 3356 1 59.41 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCACACACACGCGAACTCACGCACACACACACACACACATCCACTGACCTTGGAGGATGCAACACTTTTC:1 + chr3L 9775724 3' + hobo 2931 1 61.39 AATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTAACAATAGCCCGGCCACTTAGGGCTGCACTGCGA:1 - chrX 9010712 3' + copia 4761 1 67.33 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGGAGAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTTGCCTTTTTGCTAAACAGTCCGCGGAAAAGTTTGCC:1 - chr2R 21747516 3' - mdg1 16 2 58.42 AAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTTTGTATACTTTATTGTATTATGTATTTATACTTATTC:1 - chr3L 22016651 3' - diver 41 2 67.33 AGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAAAAAAAAGGCTGCATATTTAAGAAGCAGTAAAAAAGAAAAGTTTATCATGTTGATC:1 - chr2L 15220188 3' - invader4 2774 2 53.47 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGGCAGAAAGGGATGCCACGGAAAATTGGATTTGGGGTCCAAGTCCGGG:1 - chr2L 12808155 3' + Tirant 372 2 54.46 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTATATGACCCACGTTTTGGGAATCTTTTCCCCTGCCGTTTGAGTGCCTTTTCCTCTCTGTTGTGCCTA:1 - chr3L 171151 3' + 1360 3380 2 71.29 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTACTTCCTAGCACAAAGAGTGGAAGCATAAGAAGAATTC:1 - chr2R 9950700 3' - S-element 33 2 62.38 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATCATTCGTTCTGAACTCCCAGCTATT:1 - chr3L 7168337 3' - Doc 55 1 74.26 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCTACTGTGGCATGCCCCGCCCCCTTTATAATTTTTCACCGGCCTAGGTCCCGTTTTATTT:1 - chr3L 19861763 3' + 1360 3372 1 67.33 ATTATGTTGAAACAGGAAGTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGCCAGATTTCGTCTTTTATGATCCTCTGAGATCGTACTATAGATTCTCT:1 - chr2R 24546131 3' - diver 5800 1 65.35 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAAATATTGAACCGATGTTTTCAGAACATGTCAGAACATCTAGAACAATTTGTAATCTT:1 - chr3L 23419735 3' - FB 21 1 47.52 AGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATA:1 - chr3R 11151820 3' + mdg3 216 2 55.45 TCTCAAGAAGTCTGTGGACAGCCTTCGTCTTAGAAGGGAATGCTTAAAAACAAGAGTTTCATCAAGGGCAAGCAAG:1 + chr3L 9625307 3' + gypsy7 5194 1 56.58 CGCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACCTAGAATTGCATATATAGAATGACATACGATTT:1 + chr2L 14341891 3' + copia 5080 2 71.29 AGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATACATTTTTGCTTGTAATAATGACATGGAGGCAAATTCAAATACGAATACGTACGTACAGCACCAGCATG:1 - chr2R 24643331 3' - jockey 141 1 76.77 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACATGCGAATCAATCT:1 - chr3R 10110405 3' - Doc 16 1 61.39 CAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGATGACTTTCGTGACCCACAACTACTATGAAACAGAGTCACGCACTTGCAAACGCTGATGTCAGCAAAATTTCC:1 - chr3R 27029397 3' - 3S18 5812 2 76.24 AAAAAAAGGAAAAATAAAATAAACAGAAAATTTCATTTAAGTAGTTTAGATAGTATATGAATAATAAAGTAGTATTTGGTGTACTTTAAATTCCAAAATAC:1 + chr2R 19216637 3' + Doc2-element 236 2 69.31 CCGAATTGAACTCATTAAGTTTATAGTGTGAACAACATGTAATATTCGTAATATTCGGTACTCAAAGAACTCCACGGTATCCTTGTAATATCCCTAAAGCA:1 - chr3R 4923524 3' + rooA 341 2 74.26 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGAATGTATGCCTC:1 + chr2L 20328758 3' + opus 7494 2 64.91 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACACAATCTGCTGCAGTCGGA:1 + chr3L 20354090 3' - 412 7070 2 63.37 GACTTGTGTTCTGAATTGGAGTGGAGAAGTAACGACGTATTCCTTTGTCCCACCAACAGGATGTGACGGTCTGCAGGGCTCGTGTCGTGACCGCGGTGGAC:1 - chr3R 21354653 3' + 412 7535 2 74.26 TGGATTTTAAAAAATAACAATAAAATAATGGTACAATGCCATTCAAAAAACTTGAAAATTATCTTTTTTTTTGCAAAAGTTTCCTTCAAAATTGTTAAATT:1 - chr2L 9031340 3' - Porto1 4641 1 48.51 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCAATTTGTTGTTTACCCTCTTTCGGT:1 - chrX 15546133 3' + blood 360 2 62.38 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGTACTGCCCTGACTTTCAGCAAATACTGACTTTTTATGCATATCGAACA:1 + chrX 17494692 3' + 1360 3361 1 57.43 TCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGCCGCCCGCCAATGCGTCGTCCAGCACTATTGTATATTTTTTGGATAC:1 - chr3L 23636104 3' - diver 31 2 78.22 GTCAGCATTTTGGGCGCTTGTGTTTACCCAGAAATGTGGTTGAAATATGAGATGTGGGACAATGACCGAATTATCTTTCCAAGCATAAAAAAAAAACCAG:1 + chr2R 1727904 3' - HMS-Beagle2 61 2 66.00 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTTG:1 - chrX 17029988 3' + flea 4993 2 52.48 TTTAGTAATAATTACAATTTTAGAAAAATCTTAAACTCAACCACCATCTAGGACCTCCCCTTTTAAGAGCTTTTCGTCGTGCCGATCATTTCGAACCCATT:1 - chr3L 13188303 3' - transib4 2611 1 68.32 TGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTCAAATTATTATTACTCAAATTTATTATGCTAACATGTAAAGAAAGACA:1 + chr2L 16851796 3' - HMS-Beagle 24 2 53.47 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTA:1 + chr2R 9871035 3' - roo 8712 2 73.27 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAACAAGTAAACTTATGGAAAAAACTATAAAAGTGGCAATTACAGTGTCTTTAACGCGG:1 + chr2L 22197289 3' + roo 9053 2 62.38 TAGTTGTCAGGACGGCCGANTTGTAGTAGGACTCCTTAAACACTACGACCGCTGGCAGTAAATATTTAATAACATACCGAAACAAATAACGCAATAATTTA:1 + chr3R 20042418 3' + mdg3 5232 1 76.24 TCGCAGTGCTGTTTGTTGTTGTTTTTTGAAAGTTTCGCTTGAATGTTTTGATTTTGTGTTTCCCATCATTTAAGAACAGAAACAATAGTATTGAGTCATTG:1 - chr2L 5892961 3' + Cr1a 240 1 62.38 AACGTCTACAGAGTCTCTCCGTCTCTCTGATTTTACAGTTTTTGAATATATTGATAACAACGGTACACCCACAAGGACCTTTCGGCCCCAGATATGGGATC:1 - chr3L 871174 3' - 412 368 2 47.52 TTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGGAATAAAAGAAGAAACAATTTGAAAAATGTTCAATAGTGTGGGCGACTATGTCATTTAAGGGAGATAACGCCTG:1 + chr4 43286 3' - INE-1 499 1 71.29 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCCCACCGAACAAGTGGGTTTCATTG:1 - chr2R 21040872 3' + P-element 2838 1 26.53 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTATGTCAGCGTGCGCTTCGTC:1 - chr3R 5506796 3' + pogo 2049 1 79.21 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAACACAAATGGAACCATCCAA:1 + chr2R 8682390 3' + pogo 2050 1 79.21 TCATTAGAAAGGGAGGTGTAGCATATGGTAGCAATCCACCCTACCAATAAAACAATAAAAAGGCGACCCATTTGTAAAGTGCAGAAAGTTGAAGAGTTGTG:1 - chr2L 23353094 3' + Stalker4 6941 2 58.42 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGTACGTTAGTTATTGGGCACATATTGCAGATGGCCAGTATAAAATGATAACAA:1 - chr2R 16160748 3' - mdg3 24 2 56.44 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCACA:1 + chr3L 6658226 3' + hopper 1380 1 62.38 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGTCTTTCGTTACCAGACTGAGACAAAGACAAACACAATCAAAAGGA:1 + chr2L 10625743 3' - roo 8694 2 56.44 ACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCTCGAATAGAGA:1 + chr3L 8039425 3' + hopper 1397 1 61.39 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTATTTGGTATAATGGATGAAGATGATAGAGAGCAATTAGAAGAAAATA:1 + chr3R 19448605 3' + roo 400 1 48.51 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATATCGCAGACAAAGTATATAGAACATG:1 - chr2L 5419808 3' - 297 38 2 79.21 CTTATTGCAAATATTTATTTTGCTGTAAAAAAAATTGGGCAATTGAGAAACTGATTTTAGGACAACAAGGACAACATACAACTCACTTACTTGTTTAATCA:1 + chr3L 18471306 3' - FB 474 1 62.38 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCA:1 + chrX 11025569 3' + hopper 1380 1 63.37 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGCATCGAGCGCTTTTCC:2 + chr3R 6034019 3' + roo 9042 1 56.44 ATAAATTATAAATTACAACNGTGTGGATTGGTTGGGGGGGGCGGTAGAAACCTGGTCATAAAGCACGCCCGGTTGCTTTTGTTGTTTA:1 + chr2L 6276118 3' + copia 257 1 73.86 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCCCGCCACTGGTACCACCCCCCCCCCCACACTTCTGGGCCCCCTTCC:1 + chr3L 6835022 3' - hopper 2 2 60.81 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACAACCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTATCATT:1 + chr2L 21086100 3' - roo 8692 2 55.45 CTTTAATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGA:1 + chr2L 22224558 3' + Rt1c 5395 1 62.38 GCACACAAAATTGTAGGGTNTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCGCCACCCCCTCTCCCAAATGTGGGTCAGTCAAAAGTA:1 - chr2L 4924522 3' - hobo 40 1 62.38 AGGCAGTACAGCGATTTTGGCAATTGGGCGTTTGTATAATCCGTGAGCAGTCTTCAGTTCCGCTTTTGGCTTCTCGTTTATGACTTGAATTTTATTTCATT:1 + chr2L 10601387 3' - 3S18 5712 1 55.45 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTGCGTTGGCATTTATAGCTCAGTCCAGGAAGGACTCCTCCACAGTGGAAGGGGAAGTGTTGAGGG:1 + chr3L 13773975 3' - roo 8676 2 65.35 AGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGCAGGGTTTGCTGAAAGGGGTGGCCGGTCTGGGTTTCAGAGATCTCATCTAGTA:1 - chr3R 29021374 3' - G2 59 1 82.18 CTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAGTAGAAATCTGATATCGATCGGAGTATAGGCGGAACTTGGCCACTCACCCTGCGCTTGGAATCCAATTTTAGCA:1 + chr2R 9382259 3' - roo 338 2 74.26 GGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACGAAACCAAAGCAAACCAAACCGAGCCAAACGAAACGTTGGAAAAACTTTTGGCGCCCCGGCAACGGAG:1 + chr3L 17186900 3' - Tirant 8114 2 74.26 GAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAGCCAATTAAATTGTTTTCGCCATAAAA:1 - chr3L 13190112 3' + roo 9020 2 76.24 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTGCCTCCGGTGGCCAGCTTTTGGGTACAGCT:1 - chr2L 17994132 3' + roo 9049 2 59.41 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGTATCTGGCAAGTATTAAGGAGACGACAAAGGAAAATGATTTAACATCCTTAAACTGCGTTTTAATAAGCC:2 + chr3L 3881078 3' - blood 6 2 61.39 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAAGAACGTATTTATAAAAATAGTTGTTACATTAAAATAGTAAATTTCCATTTCCTCCATCGTTCTGAGTT:1 + chr3R 6947411 3' - I-element 10 1 69.31 AATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAAT:2 + chr3L 19339428 3' - Tc1 27 1 56.44 CAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCACGATTGTTTCGAGTGTAAGATGAGGTGATTTTCTTCTTATAAATTCTTAGTACTGAGTAATCTTCTTTGTTCC:1 + chr2R 20312820 3' - 1360 307 1 78.22 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTTGCAGCACAATGAGCAACAGTCAAC:3 + chr3R 23338350 3' + roo 390 2 58.42 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAACC:1 - chr3R 19449440 3' + hobo 2909 1 51.49 TGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGATTGTATAGTTTGTGCCATCAAACATAAGATTGCTTTGCTATTGTAAAGAG:1 + chr3R 27907698 3' - mdg3 27 2 53.47 GCACCCAACTGCAAGGAAANCACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCAATTT:1 - chrX 15546153 3' + blood 7352 2 60.40 TAGATCTGTTACTATTTTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAACAGTAAGCTAATTAGCGGCCAGAGAC:1 - chr2L 19845271 3' + Tc1 1516 1 74.26 TTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAATGAAACCGAATCCTGCCTATGGCATTTGCGCTGATACAAAAG:1 - chrX 7292649 3' - 3S18 11 2 68.32 ACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTATTTCCACGACTTTTTCCATTTTCCTTCGACATTCTGCCCGCGGGTCTTCCATTTGCCGCCTTGAAGAA:1 - chr3R 5769913 3' + Max-element 8522 2 69.31 GAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATAACCGATTTGCCGATGATGATCCGAATTTAGTTGGAA:1 - chrX 14086781 3' - Doc 364 1 72.28 GTTGGTATTGAATTGGTATTTAGGTAGTGATTGTGGGTTAACGATTTGTTGGAAGGTTTGTGCTCATGGAGTGTGTGGGTGGTTTTCGTTATGTATACATA:1 + chr3R 5227669 3' - I-element 4987 1 72.28 CTCTATTTCAATAAAAGAAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTGTGCTTAACTTGG:1 - chrX 734910 3' + Tabor 452 2 52.48 GTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTATTGCATATTAGGGACTGATGTTTT:1 - chr3R 17491529 3' + R2-element 3387 1 76.24 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGACAATGAATTTCGTTTAAAGTACTGATAAATATGTAACAGAAATTTTCCCTTGCAATAT:1 - chr2R 9699790 3' - Transpac 16 2 70.30 CCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCT:1 - chr2R 10614684 3' + copia 5000 2 76.19 TTATATTTAAGCAATTTTTATTAAGTACTCAAAAAGAAACCCTTTTATTAGGCATATTTATAATGACATAAAAAGTTGGAGTACTGAAACCTTTTCTTTTT:1 - chr3L 10614709 3' + blood 6922 1 79.21 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGNGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAAGCATTCAGCAATCTTTCTGCGAAACGCTCGC:1 - chr3L 1586698 3' - Tirant 8 2 72.73 TGCTACGAAATTGGCAAAAACTATCCTAATATGTACCATGTAAATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAGATGCTACTATTATTTGTTTGTAATT:1 - chr2R 18833289 3' + 1360 3121 1 73.27 ACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTATGCGTTATACATGCCTGCCAGCTAAACGAATTTTATGACTAGGCTTCC:1 - chrX 9541839 3' + hopper 30 1 69.31 CTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCGCTCGTCTAGAAAGAAAACAAAACCGTAGA:1 - chr3R 12059188 3' + 17.6 165 2 70.30 TGCCGATGCAGCTAACTATNGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAGTGTATTTTATTTCAGACTTTCCACAAAACTTAATTTACATTCTGTTAA:1 + chr3L 19647328 3' - pogo 23 1 57.43 TGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATTTATATTGATTATGGGTGATCGTCAACAAGAGCAGTGGACACCCAATAA:1 + chr2R 9905425 3' - mdg3 5279 2 54.46 CGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATAAGAAAATAATATATAGAACTTTCTACACATTTCAAGAATCGCGAAA:1 + chr3L 13001074 3' - invader3 5217 2 54.46 AACAATGCGTTTCAACATCATCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGAGGACAAGCGTCGATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCGGGGCAGACCGTTGGCATTTG:1 - chr3R 17292956 3' + HMS-Beagle2 6813 1 77.23 AGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATG:1 + chr3L 25232906 3' - GATE 8270 2 51.52 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGTATAGGTTTTGGTCTATA:1 - chr3R 19505557 3' - mdg3 51 2 74.26 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGTCATAAGGTCTTTTTAGTTTACTTTG:2 - chr3L 3757321 3' - roo 8675 2 68.32 CTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTGAACCCTCTTGTGGCTATCCGCATCATAGGCCTGCTGGAGCTCAGGAACATCAAGCGTATGCTTTGCGGGGACAACTCC:1 + chr3L 4201654 3' - Quasimodo 350 2 68.32 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACACAATCTGCTGCAGTC:1 + chr3L 20354087 3' - 412 20 2 60.40 TGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTTTCCAGTGCTCGGTAGCATTCTTTTCAG:1 + chr2L 11712878 3' - Quasimodo 42 2 74.26 TTTAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCTCTAGTGGTCCCAGTGTCAGGTGCAGGTGGAGCCGATTGAGGGGGCTTTTGAGGATGGAAGTGAAAGGTCCCCG:1 + chr3R 20187593 3' + mariner2 43 1 60.40 AACTCAACGAGTAAAGTCTGCTTATTTGGGATTTTACAATAGCATTTGTATCTGTTGAAATTAAGAATACTAAAGATAGCTGAGTTTAATTTGTAATAAAA:1 + chr3L 10110625 3' + roo 9055 2 50.50 TATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATTACCCCTTTCTCTCAGTGTACGGCTAAAATTTCCAGG:1 - chr3R 22869362 3' + Bari1 1692 1 62.00 AAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTT:1 + chrX 803430 3' - Ivk 5362 1 72.28 GGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACTTTCGAAGATCTTATTCTTTTTGCTGTGCACCAATGTAAAAAAGGCTGCGAAAAGTTCTTCAATGAAGGACA:1 - chr3L 4565443 3' + copia 251 1 73.27 AAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTATCATAATATTAGAGCTAAGATAAGAATTCATTGAAATTGGTATATGGTT:1 - chr2L 11712808 3' + Quasimodo 7345 2 57.43 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTAAAACAAATAAAAAAATTGTTCTTACTGGTTTGAATAATATTAATTCCTAGCCAAGTGTGAAGT:1 - chr3L 16546755 3' + pogo 2092 1 71.29 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTGTTTGAAACACTTGATTAGCGGCGATGATTGAACGGTTATTCGTAAATTGAAAGCAGTGTTCTT:1 + chr2L 17994232 3' - roo 9 2 70.00 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATGTATATGTAAACAATGATGGTCATGGCAGCGCGATAACACATGCGGCAAC:1 - chr2L 21708337 3' - 297 6596 2 65.00 ACACACACACACACACGTATTGAATGTCAATCGTCATTTGCAGCAATTTATTAT:1 + chr2R 11080229 3' + accord 185 2 92.59 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAGGGGCTTGGCTTTGGCTTCAGCTCATGCA:1 + chr2R 15788658 3' + Transpac 5210 2 60.40 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACA:1 - chr3R 10110418 3' - Doc 29 1 50.50 GCCTGACTCTGGTGAAATTCAACGCGGCAAGGTAGAGAAACAGAAACCGAGATGACTTCTGGGCTAGACTTATACAGAAAGAACCTGTTTTGGGCCCGG:1 + chr2R 12462151 3' + Chimpo 272 1 73.74 GTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGATTTTATATTCAATAAAGAGCGCAATGAATACCAAATTCACTTGGCCAGAAAGTCAACCACCAAATAAATAGTCGCCGAA:1 + chrX 9724438 3' + gypsy6 7566 2 59.41 TGAGCGCAGCCAGCGCTACGTACCGGCAGAGGAGTCGCAGCCAGCGACAGTGGCGTCGCAGTCAGCGACATAGAGGGAACTGGAGGTCAGCTGGTTGCCGC:1 - chrX 11074177 3' + aurora-element 239 1 77.23 AGACTACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAACTGTTAAAAGAACCGCAAGAGAGCAGTCATACGTGGATTAGTCATGACG:1 + chr3L 3083148 3' - Cr1a 399 1 75.27 TTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAACTACGCCTCGTTTGGAA:1 + chr2L 18788853 3' + hopper 1337 1 63.83 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAAAGGCAGTTCATCATTAAAATACCCTTCACCAAAGGTATTCTAC:1 + chr2L 10792064 3' + 412 440 2 70.30 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCGCACAACGGGCAGGTGTGCGAGCGAGAGGGTGCGGAC:1 - chrX 4707846 3' + P-element 2848 1 40.59 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCA:1 - chrX 21217513 3' + pogo 2062 1 66.33 CTCAACGAGTAAAGTCTTCNAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCAAGGATGTCCTCGT:1 + chr2L 20045822 3' + roo 9057 2 64.36 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGG:1 + chr2L 20045789 3' + roo 9024 2 74.26 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGTAAAAATTGGCTTCACCAAGATATCTATCTA:1 + chr2L 7175637 3' + blood 7364 2 51.49 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGTGCCTTGTATCACTTGCCGTATAATTCGTTGTTTTTGTTTTTGCCAGTCAAGCAAA:1 + chr3L 19896620 3' + P-element 2869 1 61.00 AAGAAAGGAAATATAAATTNTAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACCGAATCTGCTAAATTTCACACACCACTTCGT:1 - chr3L 11929282 3' + copia 245 1 65.35 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAAGTATCATCTTAAAGAGATTTGCAGCTTAGCGGCCGCATGA:1 + chr3R 12876404 3' + hopper 1411 2 75.25 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTAGATGTATTTGATTCTGGCCTAAAATCCCAATGGCCAGCTAAAGAGATATCCTGTTGTACAAACAGCAA:1 + chr2L 19678209 3' - flea 4758 1 76.24 CGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGAGAAGAAGTCTCGTCGTCTTTTGCTAATTGAAATGCTAAATTTCCGTTCATGCCTGTA:2 - chrX 7652651 3' + F-element 400 1 65.35 CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAATTTCCAAACAATGCGCAACTTTGTGCTGTCCACATCAAAAAGTGTGGGTGTTTGGGA:1 + chr3L 9907432 3' - jockey 4691 1 56.44 TATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACATGTTGCGAGGCGAATGTCTATTTAATTGTGTCTGCTACGGTGTCGGCATCTCGATGCATCGA:1 + chr2R 23316007 3' + R1A1-element 142 1 53.47 CTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAG:1 + chr3L 25350822 3' + baggins 5415 1 43.56 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACATGCGAATCAA:1 - chr3R 10110408 3' - Doc 19 1 58.42 GCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGT:1 + chr3R 10391233 3' + invader4 281 2 70.30 ATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATGTGTGGCGCACGTTCGGCCGCGATTAAGAAATCTTCGCGAGAAGAAAAGGCCAACCGACTCCGACC:1 + chr2L 10199074 3' + I-element 5347 1 67.33 GATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGGATGCTGGTCATCTTGTAGAGTTTGGATCTCCGTACGAACTTCTCACCTCC:1 + chr3R 11575469 3' - R1A1-element 5277 1 57.43 CGCCACGCGTTTCTGGGGAAATGGCCTGCAGACGCACTATTAGTTCCGCATTTTTTACTCTTCGTTATCAGGGGCGCGAATTGCTGTCAGTGTTATCGAGG:1 - chr3L 19672098 3' - invader3 438 1 57.43 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATACATACACATTCTTCACAAAACCGACACATTAGTTTTAGTTACTAGCCAGTTGTTGCAATCTTTGCCA:1 - chr3R 21849612 3' + S-element 1713 2 76.24 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATTTCTATATGTTTCTCTAAATTTTTGT:1 - chr2L 16426446 3' + hobo 2889 1 78.22 GTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGATCGCTTGACAAGCTACAATGATAAAGGGTTCCGAAAAGAGAGTTCACTT:1 - chr3L 25731389 3' - Cr1a 4284 1 52.48 TTTATCAGTCTTCTATGATGTATGGTCATGTTATATTTGATTTTAAAAAATGTTGCATACTTCTACGGGGGGATTTTTTTATTTTTTTTATTTATTTCATT:1 - chr4 300252 3' + Transib5 2765 1 65.35 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAACAGAATGCTTCTGACAACAATTT:1 + chr3R 12333763 3' - P-element 50 1 29.70 TGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGAATGAGGCACAGAGAAATAATAAATAAACTACAGT:1 - chr3L 13374674 3' + Transpac 297 2 66.34 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATTATATCGGTCGGTTGCATTTCGATACATTTGGTTGCCTTACGCCGCACACGACT:1 + chr3L 8713993 3' + I-element 5331 1 55.45 CTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTGTTACGACCTAAAGTTGAAG:1 - chr3R 2916241 3' + copia 4694 1 80.20 TCTAGGTCAAAACCAGGTTNGGGAGGTCATGAGGGAGGTGAAAAAGTTTACAGTGCAGAGAGTACGACAGTCCTGCGCACAAGTATACGTAACAAATGGC:1 - chr2R 12252851 3' - jockey 4778 1 40.00 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTCGCGCCAAGGAGAGTGCGAGCGAG:1 + chr3R 29287585 3' + hobo 2927 1 67.33 TCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCATTCTCGTCACTTTTATTTACCCACCCACCTGGCCGATTCCGATTGCGATTCGTTCGTCACTTTTGTT:1 - chr2L 3977363 3' + 1360 3204 1 60.40 AACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAAAAACAAGCACAGCAAAGTTCAACAACTTCTACCAATATAAGATTTTCAAT:1 - chr2R 17459144 3' + Transpac 5207 2 57.43 AAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGAATTTATGACTCACACGGTGGAAAGAGAAGCTGT:1 - chr3L 14635497 3' + 1360 3200 1 66.34 GCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTGAATAAAACACAA:1 - chrY 2346857 3' + micropia 448 2 69.00 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGC:1 - chr3L 16891116 3' + P-element 2833 1 23.76 ATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAATTCGAACATGCT:1 - chr2L 19854080 3' + roo 370 1 67.68 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTAGAAAATGCAGCTGCCACTCTACGCAGTCGTTACAACTACAA:1 + chr2R 18432130 3' + 412 460 2 57.43 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGGTTAAGCATTTGGGGCGTTTAAGTCAAATAATGCCACTCACAATTAATCAA:1 + chr3L 11755765 3' - roo 25 2 50.50 CTTCTAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGTTCATAGTCATAAAACATTAAATTTCTTTCAGTGCAAAGGCTGAATA:1 + chr3R 25370571 3' - copia 229 1 70.30 AGAGAGAATGCTATAGTCGACCTCTCACACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTAGTGGAAATGCGAACGCGAAACTTCACCGCCTGGTGCTGGAGGAGCTC:1 + chrX 9587499 3' - INE-1 576 1 73.27 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGCATGTATATGTTTTTCGAAAATGTTAATAATGCTTAGTTTATATTTAAGCAATTAAA:1 + chr2R 9699896 3' + Transpac 298 2 65.35 TAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAGTAGTACCTACCGATAGCAGATAGATATATCTACAGAACATGGTTATCTCTATAGAATTTTCTAATATTCTAAAA:1 + chr3R 18237658 3' - Juan 3869 1 63.00 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCAGACCGTCGCGACGGCGATGAGCAAACAACAGACGCAGC:1 + chr3R 12329691 3' + hopper 1404 2 66.34 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCAAAACAAATTAAAC:1 + chr3L 7099646 3' + roo 9034 1 65.35 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATAAAATGATTATGACGATTATGCGAAGCTCCCGGCTACTGCTGCTGATTATTCAAGGATGTT:1 - chr3R 20332856 3' - jockey 4687 1 60.40 TGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAACATTTGCCATTTATTTAAATATTTTTAAA:1 + chrX 22789372 3' - Tabor 6887 2 71.29 GTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAATTACGGTGCAATTGTGTGAGTGTGCGTTCGAACTTGTGTGGTCGG:1 - chr2L 23390321 3' - gypsy6 3 2 74.26 AACCTGTTAGACAATAGCCNAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACCGGAGATAGGGGACTTGGTCTCCAGCCAACCAGACCAGACCAGTTGCTCTTGCTC:1 - chr3R 13807672 3' + G6 1843 1 58.42 CACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCCTCTTTTCGAACCGTCTGGAACCGGCCAGGGACTT:1 + chr2L 16560410 3' + G2 2787 1 65.35 CTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAATAAGTGCATTTTATTATCTGTGCATATTGATTTACAGCCTTTTCCAATATACGAAA:1 + chr3L 4691940 3' + gypsy4 307 1 56.44 AACAAATTCTCAAGCTTTTCCTCCTCTTCTAGAACTGTCTCCCTCCGAATATATTAATTTGCTTCCTCCGTTTTGTTTTGAGTGGTTGCTGCTGGCCGAGG:1 + chr3L 14114345 3' + Gypsy12A_LTR 2009 1 73.27 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCA:1 - chrX 8027436 3' + Juan 4181 1 58.42 CGAAAAAATCGTGTACCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCGTAGACCTTATCAGTCACGAAAAGACTATAGTTTATGG:1 - chr3R 24542033 3' - 1360 41 1 63.37 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACACCTTGTGACCAAACCACATGCTACAAC:1 - chr2R 21351333 3' + mdg1 7407 2 72.28 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGGTTAAACTACATCAAAATGTTCTATTTTCATAGAAAACA:1 - chr2L 14341841 3' - copia 4907 2 59.41 ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTATAATTTTCGGA:1 + chr2R 10670048 3' - jockey 4782 1 57.43 AGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACATTATGAAAATCATTATGTTCATATACATTTTTGAAATATTATAATTAATACTTAGCGCACATTTCCATTTT:1 - chr3L 13000980 3' + invader3 5455 2 70.30 TCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATGCGGCACGTTTCCACATTGCACATTTTGCGTTGAATAAA:1 - chr3L 5100692 3' + 1360 3180 1 61.11 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAGTCCGCTTAACGATCGAATTAACATCAAACGCGC:1 - chr2R 21351023 3' - opus 7152 4 66.34 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACATTTAAGTGCAGCACTTGAAAAAGTACTTAATTAATGCCATAAATCCGCCGACATCCATAAACCC:1 + chrX 9454904 3' - roo 9 2 71.00 TGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTGCTGCCGCTTGGCATTAACTGCCTACGCATATTCGTAGTATGTATATGCCA:1 - chr2L 4134817 3' - Quasimodo 24 2 56.44 TAATACTGAATCCTAACAANCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCACTCACGACGCCTCATTAAAATTTAGGCCAAGTCATCCAGCCCACTC:1 + chr3L 8254632 3' - hobo 412 1 53.47 TATCTTTATTTGGTTTTTATTCAGCATGTGTACATTCCTGATCTATTCCTGATTCATAACTGAACGTGGTGTGGTCTGGTACAGGGAATTTTACAATTGAT:1 + chr3L 12902963 3' - mdg1 7392 2 80.20 TATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGTTCACATGTTTTCACTTTGTGCTTAATTTGCATTTAAATGGT:1 - chr3R 26684313 3' - F-element 4428 1 67.33 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATGTGCAAACAAAGTTG:1 - chr2L 12958916 3' + roo 9036 1 63.37 ATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAACTTTATGGCTATGGAGAAACTGAGATCACTCGAACGGGCTTGAATGGTTTCAGCCTTTGTCCTGGCT:1 + chr2R 10130647 3' + F-element 4664 1 62.38 CTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATATTTTCTTTTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATC:1 - chr2L 4123954 3' + 297 6795 2 62.38 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCTTTTAAGTTTCTATTCCACCCTGATTTATTAGAAAATACC:2 - chr3R 20420925 3' - blood 35 2 60.40 TAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCCACTCATGTTTTGTCGCTTAATTTT:1 + chr3L 5479070 3' + 3S18 311 2 58.42 CGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACACACACACACACACACACAGCCATAGCGACCCGTACATAACACACATCCAGACAGACTTTAATATGGCATAGGGCA:1 + chr2L 6302581 3' + accord 7071 2 74.26 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTGTTTGAAACACTTGATTAGCGGCGATGATTGAACGGTTATT:1 + chr2L 17994209 3' - roo 33 2 59.41 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATTTACTCCTTTTTTTTTCATCAGACATAGACTGCTACT:1 - chr2L 13186250 3' - pogo 33 1 64.36 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAAT:1 - chr3R 11151812 3' + mdg3 224 2 57.43 TAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTAGCATGGCCAC:2 - chrX 20885945 3' - Ivk 5351 1 74.26 ACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTACACAATATTTTTTCAGGACCAACAATGTTAAGTTATGTTTATCAT:1 + chr3R 24314750 3' - X-element 34 1 51.06 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATGAGCAAAGCCAGATGGATAGCATTCTCGGATACATACAGTTGGGGTCAAGAAAAT:2 + chrX 2841855 3' - hopper 18 1 61.39 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGAGACAAGCACTTTTCCCTTTCCCATTCGCTTACGTTGTCCCCAAAAATTCGCTG:1 + chr3L 13190174 3' - roo 19 2 54.46 TCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCCCAACCCGTTCCACCTCCGGGCTACAATGACGAAGAAATTAAAAAGAAGGTGGATTGTA:1 + chr3L 25112661 3' - R1A1-element 4957 1 60.71 CAGACGCTCTGAGCTATTCNATGTCTGTTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTG:1 + chr3L 15178898 3' + Stalker2 366 2 59.41 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCGGAACAC:1 + chr3R 14193962 3' + pogo 2060 1 68.32 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGCGTGCGTGTGTGCCAGTGTTTGTTTGTTTGTTGG:1 + chr3R 24767878 3' + P-element 2877 2 65.62 TACATATATATATAAGGGANAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAGAGCGTAGTAACGGCAGCGCAGAGAAGAGAGTTTGGAGAGACAGAGTCTGTAAAG:1 + chrX 21184041 3' + Juan 4190 1 56.44 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTAATATATAATTTTGAAGTAGTGCAGTAACTGGTGTGTATGAATATCCGCTTTG:1 - 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chr2R 17963245 3' - blood 46 2 74.26 CAAGTTTAAATTGCTTCACAGGCGACCGTACATCAAACGCTGATAAGGCACCGGGATCGCTGTGCTGTTGCCCCTTGCTCCTGCTACTTCTGCACCCCAAG:1 + chr3L 2824500 3' - accord2 7232 1 58.42 CGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACAAAAAAAATACAACAAGCGAAACAAAACCGAAAATCAATAAAACAAAAGTTCTCGAGGCC:1 - chr3R 19276562 3' + Stalker2 7299 2 59.41 AAAGTGCTACAATGTGATTNTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTACAA:1 + chrX 734958 3' - Tabor 6891 2 73.27 GTCAGCCCGACAGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACACTAGAATTGAGTTTAAATATACAGACAACCAGGAGC:1 + chr3R 28565320 3' + 412 7503 2 58.42 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGGTGAATATTTTTGACAAATTACTTAAATTACTTACGAGCGAAA:1 + chr2R 11030574 3' - F-element 57 1 67.33 CGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTGTCGAACGGACCGACGGACAACACATCGATAGTAATCGATAAACAAGTTTTCG:1 - chr2L 20329288 3' + opus 278 2 58.42 AAATTTATGGATATTGAATGTTTATGGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGATCAAGAAGTAAAATAAATATTGACATTGCGTTGTAATAACGCAGCATTAA:1 + chr3L 22391992 3' - Ivk 163 1 59.41 TAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAAACCTTTTCTTGTTTCAAATGGCCTGGTTTTTTTATAATATTTGCTTAAATTCCG:1 - chr3R 7513904 3' - diver 5911 2 52.48 TAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACT:1 - chrX 4166393 3' - I-element 5335 1 68.32 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGAAAGATGTGTTAATATGAACTTATTTTCGTGTACGATACTATTT:2 - chr3R 19987405 3' - Doc 38 1 58.42 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATGGGCAATATGTACATTAGGTGATTATTTTATGG:1 + chr3L 11829093 3' + Transpac 299 2 58.90 AAAAAAAAAAATAAATGAAAACTGAAAACACAAGTGAGCTAGCTGCGCAAATAAAAATCCAACTCAACAAATTTCTCGCCATTAGTTATACAACTAAATAA:1 + chr2L 7486969 3' + Porto1 171 1 81.19 AGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAATTCCAGACACAAACCCGGCCCAAACACGCG:1 - chr3L 16282354 3' - gypsy5 24 2 58.42 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTAGAGGGTAAATATGGCAGAATATCCTAGGGAGCTTG:1 + chrX 5219755 3' + hobo 2899 1 64.36 TCATTTCAAGGAATCTAGTAATAATCTAGTACAGATAGTTATATTTGTACAACGTATTTGTTGTCATTAAGATTAAATTACATTAAACCAAGATGGGGCAT:1 - chr3R 31953785 3' - INE-1 8 1 30.69 TAAAAAAAAAAAGGAAAACAAAAAAGAACAAGACTTTAAGTTTT:1 - chr2R 14964317 3' + Doc2-element 250 1 88.64 ACATAAGATATGAACGAAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGCGTTCATGTGTGAACAGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAATTACAAATGTTT:1 + chrX 23280952 3' - roo 44 2 69.31 GGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGTAGTGGTTTCCAGCCGCACGGCCAGGATGGTCCGGGCATCCTGGCGCGCCACCTCCTTTCCCCAACTCCTGCCT:1 + chr2R 9314122 3' - F-element 4370 1 76.24 GCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAAATTGAGACATAAAACGGTTCGATTTTTTGCTTTTATTTCCCAGTTTTACCCAATGCTCG:1 + chr2R 21439702 3' - HMS-Beagle2 6980 2 66.00 TTGTTTTGGTCATATCTTGNGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTGAGATAAAAGTGACGCAGGCTGCTGCCTCCAACGATG:1 + chr2R 15295660 3' - 1360 488 1 62.38 GTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTAATTCAGAATAAAAACGTTTAGAGTGTTCTTAGCATATATAG:1 + chr3L 20050546 3' - jockey 4956 1 58.42 CTTACAAAAACTCAACGAGNAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGACGCTTGTTTCCGAAAAATTATGTGCAAACAAAGTTGAATTAAAAAAG:1 - chr2L 12958905 3' + roo 9047 1 54.46 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTAATGTCCCCACATTAACAGAAATTTCGACTTG:1 + chrX 13146996 3' - roo 19 2 60.40 AAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTGCGGCGAATTTATTTGACAGAAAGGAATGGTAATGGTGGGCTTAATTCTAACAGGGATTTGTGCGTATTAATTAT:1 + chr3L 23486147 3' + 1360 19 1 70.30 TACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAGAACTATTTGACATACTAAAATCTTTGCTTTA:1 - chr2R 14629666 3' + hobo 90 1 68.32 TCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGCTATGGCAAACATTTTCAATGTCATGGGTCTTCCATGTGTTATCCATTCAGGAAGTGCTGTTCAATATGCCAACG:1 + chr3L 17943027 3' - copia 80 2 74.26 GTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAAGGTTTGCTAAGCTTGTGAATTTATTTGCAGGATCTAATCTA:1 - chr2L 10036399 3' + Quasimodo 450 2 76.24 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACTTATACCACAATTTTATCGAGTAAGCCGCAAAACTAGTAAACAGTTTG:1 + chrX 5475466 3' - 412 25 2 52.00 GATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACAGTCCAGGTGACCGCTTCGGCACAATCTGGTGTGGT:1 - chr3R 31263635 3' + jockey 80 1 64.36 ACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCAATTCCACGGGCCACGTGTTT:1 + chr3R 15188964 3' + Doc 377 1 79.21 AAATCGATTGCTTTAAGAGCGTGGAGGGTTACTCCGCCCTCAGTTAGGCTTCTGCCTAACTCGTTTAGCTGGCAGCTTCCATTTTATGCGCATACCAATCA:1 + chr2R 8824944 3' - Cr1a 4250 1 79.21 TGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACAAACACAGGCACACAAAAGGAAGATGAGTCTCTTGGAGACGGGGACTCCTCCAGTGGC:1 + chr2R 15012012 3' + accord 219 2 61.39 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGC:3 - chrX 21087579 3' - mdg3 24 2 53.47 GGCTGCTTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGACCACCCGCTCCCATTCGTGCCCATTCCCAAGTTGCCAGCGCC:1 + chr3R 6961133 3' + 412 461 2 56.44 GATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTCTAGTTGAAACTTTAAATCAATTACTCTT:1 - chr2L 10561048 3' - accord 469 2 77.23 AAGAACACACACACACACACACACACACACACACTGATAGCTAGCCAGGTGTGTGGACTGACTGGTCTGTCTTGGCCTGGCCTG:1 - chr3R 30357831 3' + accord 7027 3 76.19 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTCGAGTGTGAGCTGATATGA:1 + chr2L 14762040 3' - mdg1 19 2 60.40 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCTATTATTGGTTGAAATTGGGTTATTGTCTAATGGCAGCACTTTATAGCTTTTTAATGAGCCCCCGAAAT:1 - chr3R 8582518 3' - roo 8671 2 72.28 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAAGTTTTATG:1 - 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chr2R 19061215 3' + roo 9055 2 56.52 CTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACACATGGGTGCCTCATTTCCGACGATTCCACCGAATGCAAAGCACCTCGAACACGCACTCGCAAAT:1 - chr2L 20552908 3' + F-element 50 1 70.30 TACATACATGTATATTTTTTATAAATTACCGTTTCCCAATTGAAAATTATTTTGTTGTATGTACGGCGTGCAAATCATTTTCGTCATCATTAACTGGAATT:1 + chr2L 7419072 3' + INE-1 73 1 52.48 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCCAAAATTGGAACTTGTGCGCACCTTGTAGAAACAATG:1 + chr3R 8980050 3' - transib2 36 1 62.38 CTTAATGGGAGTTCATCATNACACTGCTGCCCATTGCATTCCTGGACATTTGCTGGACGATTTTTTGGTGCCACACGGCGCCCGCTAGAGATGAGTAATTG:1 - chr3L 872679 3' + 412 7545 2 74.26 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTATTTTAAGAGATTTAAAAATTATGAAATATTGTAAAA:1 + chr3L 15037977 3' + roo 9034 1 66.34 GATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATAAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAA:1 - chrX 4166395 3' - I-element 5337 1 71.29 TTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACAT:1 + chr3L 25232857 3' - accord2 25 2 55.00 AGGAAATATAAATTATAAANTACAACAACCTAGAATTGCATATATAGAATGACATACGATTTGAAGAGAAGAGACCTTTGTTTTCTTTGGCTGTATACTAA:1 + chr2L 14341930 3' + copia 250 1 74.26 GTCTTGCTGGTCAAGACGGCAACGCCAACTTCCGCTCCCCACGTTTCTACGATGGGCATTAGTATGCTTTCGTATTGTCCAGATAGTTTATTTAATTTAAT:1 + chr3L 4868197 3' - R1-2 2796 1 60.40 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGACACATGTGCATTATTGTTGCCTATCTGG:1 - chr3R 28565277 3' - 412 47 2 72.28 TTTTTTTTTGCACACAAACACACGCACTCACAGTCGCACTGTTTGCGTTCTCCAGCCGGCGAGAGTGTGTGTGTGCTTGCACAAAAACAATGCCGCCATTT:1 - chr3R 6932967 3' - Stalker2 497 1 63.37 CACCTGCACACAAAATTGTTGGGAATGTTTGCATAATGTTTACACGTTTTGCGAGTGGGTTGGGTTGGGATTATTTGCGTCTCCCCGTTGACCATTTCATA:1 + chr3L 10812684 3' - hobo 45 1 80.20 CAGGTGCGTCGATTTGAAGGACCACCTTTTTTCCTCTCCGGCAGCACCGATTTGTCACGAAGGGGCTGATCTTTGGCTGAACTTTCTGTTTAATCGGTTCG:1 - chr3R 28602294 3' - HMS-Beagle2 6742 1 61.39 CACACTTGGAGCACCTTTTNAACTAACAACAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTGCATGTGATACAAATAATCCAAAATACACATTACACAAAT:1 - chrX 22689516 3' + 1731 306 1 70.30 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCTAGCCCACGCTCGCTCTCTCTTTTTCTGCATCTCTCTGCTAATGG:1 - 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F-element 21 1 72.28 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATGGAAAAGTTTTAAGGCAGGAGAAAAACAGGGAGGAG:1 + chr3R 8765602 3' - roo 8703 2 69.31 AAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTACTTAATGTCCTTTTGGCCGGCTTCCCCTCAAAAAGGAAGCGAGCCAAGCT:1 + chr3L 13569816 3' + invader3 5446 2 57.73 GCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGGAAAGGTGCGAAGATGTGCATAAATTGGGCTTCAGATACAATGCAGAGGTGGC:1 - chr3R 13920920 3' - mdg3 61 2 56.44 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTAAAATGCCAATATAATGTTCTCGACTAACAGACGGATATATACTCAGATAA:1 - chrX 10286115 3' + roo 408 1 74.26 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATGCTTAGGAATATTTTGCCTGAATCTTGCGATCTATCTTACAGATGCCATAGGTTTCGG:1 - chr3L 7345320 3' + pogo 2087 1 62.38 CCAAGTAGATTTACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGTCCCTTTGTAATAAGTAATAAGTAAT:1 - chr3R 16611518 3' + Cr1a 4112 1 77.08 CGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATGGCAGGAAATGCATTCGTATTTGATTG:1 + chr3R 15715440 3' + F-element 24 1 73.27 AATACCTGCGTTATCTCAGAAGGTGTTACTTCAGGCTCTATAACCTACAACAACAACCAGCAGCTCTCGCTACCAATGTGAGTACTTCGTATTATTTATGT:1 + chr3R 15796894 3' - Fw3 233 1 60.40 TCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGG:1 + chrX 19034166 3' - hopper 48 1 68.32 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGACACACAGCTGGACGAAGAACTAGAAGCAAGCGGAGGCGTGGCAAT:1 + chrX 22593223 3' - 1360 29 1 56.44 AAAGAAAAAAAAAAACCTTAAAAAGCAGCATTGCGAAAGAAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGCAACACGAATTCTTTTACCCTAAATAA:1 - chrX 4081071 3' - Tc1 1469 2 68.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGTGGGCGTAATCCA:2 - chr3R 25021653 3' + roo 401 1 72.28 TAATAATAATAACAATAAAAATATAATAAAATGATATTATGTTTCATCATAGTTCGTAGTAATATTTTTCAGTCTTGACTTACCTCGCTCGATCGCCCCTT:1 - chr2L 14853263 3' + mdg1 7062 5 72.28 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACATAACACCTGCTTAAAGAGCCGCAAAAAGAAAAGAAAAACGCAAAGCCA:1 + chr2R 8177772 3' + mdg1 7428 2 54.46 GTTACTGAGCTAGTGTGAATGCTTCTTGGGAATATAAGCTGGGTAATTAAGCTGGGCAATGGCCCCCGATAGACATGCCCAGTGGATGGATGGACCCAGTT:1 + chrX 19350544 3' - INE-1 534 1 72.28 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGAAACACACTCACACACACACACACACACAAACTAACACTAACACAGACGGAGGCTGGGCACTACTACCAATGCC:1 + chrX 6932435 3' - hobo 2 1 76.24 AAATATCTCCAATAGTTTANGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTG:1 - chr3L 13295230 3' - hopper 45 1 69.00 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCGTTGAAAGCAAGTCTTTTTGCATAGCATACATTTGGGGGCCTCCTTTTCT:1 - chr3L 13895353 3' + hobo 2915 1 53.47 CTTGCCGATGCAGCTAACTNTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATT:1 + chr2L 17730518 3' - pogo 25 1 56.44 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGAAATTGAATTTATCACATGTTATGCGTTTGCACATG:1 - chr2R 17420834 3' + pogo 2072 1 61.29 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTGCGCCACACATATCTCTGCGTTGTGTGTTGTTTATACAAAAATTACTTAAAAAGAATAA:1 + chr2L 14192591 3' - I-element 17 1 60.40 CACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCAAAAAAAATGCGGTAGAAAAGTGTCGGAATTCATGCGTTTAGTTAAAGATTTTGGCAAAAATAG:1 - chrX 10177265 3' - hopper 100 1 65.35 TGCAGTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTTATACCAGAATGGTGCTTTTTTCATG:1 - chr3L 19647262 3' + pogo 2054 1 74.26 TCTCTATTTTCTGACACTTTTTCGTCATTTTACTCACTTACTCAACACCCAGCATTCCGTTTCCCTTTCCCTTCCTCTACTTCCACCCAGATCCTTTGGGC:2 - chr3R 27855960 3' - Tc1 1588 1 71.29 GCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTCTATATAAATTTCAATAAGTACTTAACAAAAAAGGAAGCCAAATGCTATTAAATTTAATGATAATTCTCATATTTCCCT:1 - chr3L 15788392 3' - opus 113 3 74.26 GTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAATCAATAAAGAGATTTAAAATTTACAAGTACTCGTGTGTGCACAGCAAACACATATTATGTACATACATAT:1 + chr3L 20317902 3' - 3S18 6 2 73.27 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCAATGCGAATGTCACGTATATTAACCGTTCAATTTA:1 - chr2R 20906487 3' - jockey 62 1 74.26 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTACCCCTTTCACCGCAGAACGAAACCAGCG:1 + chrX 17858043 3' + P-element 2840 1 30.69 ACAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAATACATATTTATACGTACATATGTATGTATGAAAATACATATATTTAATATAAATTGACGCAACCACGTAAAAGAGAG:1 + chrX 1569461 3' + G2 3076 4 61.39 ATCGGAAAATATTTATTTATAGTACATTTGTATATCCAGTAATTATTTTAAATGTTTTGCAACATTTTCAAGGCTTAAATGATATTTATGCAATATATGTA:1 - chr3R 21094809 3' - mariner2 835 1 87.13 TATATGTCAGCCCGACGGCNACCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTTTGGCCGTT:1 - chr3R 23542968 3' + 412 445 2 72.73 AGGCTCGTTATTTGTGCTTGCGCTTACTTGAATTTCTTCACTTTGACATTCAGAGCACTGGGCAGACCTTGAATATATTGGAAAACACTATAAATTCCGTT:1 + chr3R 28052189 3' - R2-element 243 1 46.53 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAAAGGTCCTTGAAAATCCAGATTCCAAATT:2 + chr3L 18418923 3' - hobo 14 1 65.35 TGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCTTAAATAGAAAACCCTTTTGGCCAAACTTGTGCTGCGGCCAGGCCAAAATGTTGCTTACCCTA:1 - chr3L 20757918 3' - Ivk 5114 1 66.34 CAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTGGCCAAAGAAATTTCGTTGTGGTGCTGATTTATGCTCGACTTCGACTTGGGTCCATTGTGTTGCAGTGGCCA:1 + chr3L 2391379 3' + 17.6 7310 2 44.55 TCAGAAACCTTTTTTTTCACGTCCGTTTTCGATTGGATTCAAGTCGGGTGACTGTTGACAGCTTTACCGTCACTCAGACCGACTTCGCTGGTTCTCCAGTT:1 - chr3L 12162135 3' - Tc1 1182 1 53.47 CTTAAATTAAAAAATTTTAAAACCAAACAAACAGTAGTTTCTGATGTTCAAAAGCATTCTCTTACTTCGGTCGAGTGTTTTCCTTTTATTATAAAATCACG:1 - chr3R 28704431 3' + 1360 3029 1 61.39 CTAGATAACAAATTACGGCTGCACAAAGTAGTCCTAAAGCGATGGATCATTTTGTTGGGTGAACAATCTTATTTATGACTATGAAAGTCCGTTTAGATATT:1 - chr3L 27361487 3' + G3 4151 1 60.40 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATC:1 + chr3L 3757397 3' + roo 9026 1 75.25 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAAATCCTTAAAGTTCCCTTTTATTTTACATATTTCGATTTTAATTT:1 + chr3R 17781626 3' + pogo 2074 1 58.42 AGGACAGATCAAAAATAAANGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACAACGTCTGCAGATGGC:1 - chr2R 9905368 3' + mdg3 197 2 72.28 TCGACGGTCACCCAGCGCGNACATGCCCGCCTCGCATTACGCTGGTTAATTGCGCATTTTTCTCATTTTCATTCACCTTGGGGACGAACGTATATGTATAG:1 - chr3L 8631777 3' - gypsy10 160 2 61.39 AAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGATGGGAATCGGAGAAGCGGGTGCCGGGTCCGGAGAAGGATGATGTACTGCCTGCGG:1 - chr2L 5281117 3' - Quasimodo 7090 2 55.45 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACTCGACTCGAATCGCCGCC:1 - chr3R 10488700 3' - roo 8721 2 81.19 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGTAGTTACAAAATACATTTAATACAAGTTTTAGGGA:1 + chr3R 25581093 3' + pogo 2063 1 61.39 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGAAATTGAATTTATCACATGTTATGC:1 - chr2R 17420845 3' + pogo 2053 1 75.25 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAAGGACCAATCAATT:1 - chr3R 4971380 3' - F-element 21 1 65.35 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTTCGCCGC:1 - chr3L 19349918 3' - 1360 3 2 72.28 GGGGTCACTATTTGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCTTAACTATTCACATTAAGCTTGCCATCTATGATATTCAGCTG:1 - chrX 8728664 3' - X-element 106 1 58.42 GTACAAAATCAAACTGAACTTAAGGCTAACAAAATATGAAACTCATAGCGGCCACTCCAACTGAACAACAACCATAAATCCCATCTCCCAATAGTTTGGCA:1 + chrX 4848644 3' - gypsy6 155 2 60.40 TATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTGTGAGCCTCGACATTGATTTATATTCGTTATTTGGGTTTATTTATTTGCGATTT:1 - chr3R 24085295 3' + invader3 5441 2 56.44 GCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAAAATTGCTGTGCACATTGCTAT:1 + chr3L 25606726 3' - F-element 34 1 62.22 CGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGTATAGGTTTTGGTCTATAGTTTTTGCGCTATTATTCGCTGTACAAATGCTGGTATACTT:1 - chr3R 19505516 3' - mdg3 5262 1 63.37 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATATACAGGTAAATAAAA:1 + chr3L 15033378 3' - I-element 23 1 56.44 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGTGACCATTCATTTTGATTGTGGTCGTGGTGTCGACAGCCCCCAAGTATGCAGCGCT:1 + chr2R 23671853 3' - hobo 18 1 57.58 GATGCAGCTAACTATCGATNCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAGTGTATTTTATTTCAGACTTTCCACAAAACTTAATTTACATTCTGTTAAACGC:1 + chr3L 19647332 3' - pogo 19 1 61.39 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCAACTCAAGTGCACTCTTAGCTCGAC:1 - chr2R 9649174 3' + roo 9037 1 60.40 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGTCTCATTGTCAATGTCGCCTTAAATTATGCCACAAAAAATGGGGCTGGGTGGCGG:2 + chr3L 6023362 3' - hopper 20 1 59.41 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAGCTTT:1 + chr3L 3757411 3' + roo 9040 1 62.38 ACATTATTGTAAAAAAAACNGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCCTTACTCCCC:1 + chr2L 12882819 3' + hopper 1397 1 59.41 TGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATAGGAATA:1 + chr2R 16185130 3' - 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Tirant 8137 2 54.46 ACTACGTGCAAAAGTAAACAAATAATTTGGCTGGTAGTTGGAATTGGGTTGTCAAGATAATAAGATAATCATGTAAGTATTTCAATTAAATACATGTAGCT:1 - chr3R 13326108 3' - transib2 212 1 73.27 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGACTGGCATTGTTATGTTTTCTCTCCCACACATAAAAAATGGGGGGAA:1 - chr3L 7307213 3' + hobo 2908 1 52.48 CAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATCTTATCCGATTGGCTTTCCCAAGAAAGCTATCTCACAATTAACTTTGCTCTACTTCTGTT:1 + chr3L 6962210 3' - FB 17 1 62.38 CCTTGTGGTCTGGCAGAGTGAGTAATAAGAATGTATTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGATGAGATCGGATTAGTTATGATCCCGAAACTCAGAACCCTTT:1 - chr3L 4476592 3' - Gypsy6A_LTR 245 1 61.39 TGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGGAGACATCACCATTCTGAAATCCAAACTATGAGCTGCGTTTTGTTTGCCTGTCACA:1 - chr3L 10043557 3' - G6 1899 1 53.47 GAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTAT:1 + chrX 18326235 3' - Doc 216 1 56.25 CAGAAAAATAGCAGTGCTTTGGTACTACGTGATCTCGAAAACCTTTCTGTTAAAATTATACATTTTATGCTAATCGTATATCAACTTAGGCAGATTATGTG:1 - chr2L 21673380 3' - HB 1617 1 79.21 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATATTACTCATATTTCTTAGACTCTTTGTTTTATAACACCCTTTTTTTTACAGTTGGTCATTTTTTTT:1 + chrX 22734114 3' + copia 245 1 59.41 GGTCACTACATTCAGACAAACTGCAAGTGCGACAAAACGAAGAACTGGAGTCTCTCGAGAGCCTGCTCATCCAGATCCCAAAGAACGAGAATATCCTGGCC:1 - chr3L 1774600 3' + mariner2 283 1 57.43 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCGGTGTGTGAAGCCAGTG:1 - chr3L 19274795 3' - transib2 22 1 55.45 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAAATTGATTTTAGTTATTACTACTAACCACCTTTCTTAGTTTCATAGGGTA:1 - chr2L 3346247 3' - pogo 21 1 52.48 TTCATCCAAATATCTCCAANAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGC:1 - chrX 11025523 3' - hopper 52 1 71.29 CCCACATTTTTTAAAAATTGTTTGATATTTATTCATAATTTTATTACTCGCCCTAAAGCAAACAAATAAATCGGGCAAATTGTATGCAAAACAAAATATTA:1 - chr3R 27106645 3' + INE-1 374 1 58.42 AGATATGAACGGAGCCCAANATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGG:1 + chr2L 4063751 3' - roo 39 2 68.32 CCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTACTATTATTGTTGTTGCTTTTCTGTTTTGTTTGCCAGC:1 + chrX 4508474 3' + 1360 3196 1 63.37 TATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCG:1 + chr3L 3540183 3' - mdg3 5291 2 73.27 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCCAAAAAGACACAGGCGCGCAACTAT:1 + chrX 21009390 3' - hopper 49 1 72.28 TTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTACCTGCTTT:1 - chr3L 6023292 3' + hopper 1371 1 66.34 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGACCTGTGTGAATTGGAGGTGGCACGATATAGATTTTATTGCGATGCTATCGATATT:1 + chr2R 9693387 3' + P-element 2868 1 58.42 TGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATTGTCTAGAAGGTTGATGGGCACGTAGTTTGTTGCGATATTTTTCCA:1 - chr3R 5362458 3' - G2 2932 1 72.28 AATTGGTCCTTCGAGCCGGATAACCGGAAGTGCGTTTCGTATAAGTTCTCGAAAGTTTTTGGCCAACTCTTCTCTACCGGCTATCGGTTAAGAGTCAACAG:1 + chr2L 16229322 3' + 3S18 366 1 70.30 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTCGCGCCAAGGAGAG:1 + chr3R 29287575 3' + hobo 2923 1 61.05 GAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGAAAATGCCAGGACTACAAATACGGCTTCGCTGGGGCGGCATTCACATTCCCATT:1 - chr2R 6918562 3' + accord 7364 2 59.41 AGCATACTGAATCTCTATTNCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTATATATTTAAAAATGTTAATAAGCATTAGTTT:1 - chr2R 19088969 3' + Tabor 440 2 67.33 GACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGTTGTCAATTCGTTCCAGTCGCTTATCCACC:1 + chr3R 21884228 3' + mdg3 5451 2 71.29 GCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGAACTACACATTTTTTCGATACTCCGTCTTAATGTTATCGTTGTGGCAGG:1 - chr3R 28958853 3' - accord 185 3 76.54 AAATGAATCGAGAGCGATANATTATATTTAGGATTTTGAATGCGGACTTAAATGATTTCTGAAACATTTCTGTAACGTACATTGGGTGATTGACGTCGGCT:1 + chr2L 8620221 3' + roo 66 2 70.30 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTT:1 - chr3L 25059059 3' - mdg1 7054 2 63.37 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCAGCTAAAATCACTCAATCAG:1 - chr3R 27116743 3' - P-element 54 1 23.76 TTCTTCGGCACTAATTTAACCAACGAATTTAAAAAATTTTTATTTTCTCCGCGACTTAGACTTTGTCAATGATTTTACAGGCCAAATGTACTCCATGTCCA:1 - chr3R 18599117 3' - HMS-Beagle2 423 1 66.34 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTCAAGAAGGATTTCGAAAAAACGAAAACATAAAGTAAAGATAATTAAGGGCAATAATAGGTAAGG:1 - chr2R 10956881 3' - copia 4882 2 64.36 TTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGG:1 + chr2R 16185114 3' - 17.6 6947 1 60.40 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAAC:1 - chr3R 21365504 3' - P-element 35 1 43.43 GTTGAGCAGCTATCCAGGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTGGGCACTGTTTTCCGGTGGGTGGTGGAAATTT:1 - chr2L 12393395 3' + R1A1-element 4949 1 64.00 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTTGGCATCGAGCGCTTTTCCAGAATTTGAGCC:1 + chr3R 6034031 3' + roo 393 1 63.64 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGAATAGAGTTTCTGGCTTTGTCGCGTATATTCGTGAATTTATGGCTCCCTCGTCTTAATGAGA:1 + chr3R 13353286 3' - 1360 16 1 61.39 TAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATGCACGTGGCCAGGATGCAGGACACGTAGCCCGAAAAAGTTGACATAAATCTGCATAAAAT:1 - chr3L 20868593 3' + F-element 4634 1 70.30 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAGTGTGTTTATGCGTTGGTAAATTAAATTTGAAACGCAACG:1 + chr2L 7666195 3' + roo 399 1 70.30 TATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTAT:1 - chr3R 14860141 3' + BS 5076 1 54.46 CCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGACAAGCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCAGAGAAAAATATTGCATACTTTTCAGCTTGCT:1 - chrX 17262306 3' + X-element 4476 1 95.05 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATCTCTATCTGCTCCGAAGGCATTCTGAGTGGAAATGC:1 + chr2L 2833920 3' - roo 40 2 66.34 ATTTTATTTTTAACGAAATCAGTCGTTTCTGCCATTATTGTGACCCCTTCCTTCGGCTTCGAAATCAAACCATTAAAAACAAGCAAAAAACTATTAAAAAG:1 - chr3R 26400839 3' - hobo 476 1 64.36 TTTGAGACTTTATTAACTANATCAGAAGTTTTGGAATGCTAATTAACTACAGTATATATATTTTCCATATGTTTGTGAGCAATATAAATCATAGTTCAAGG:1 + chr3L 14818787 3' + mdg1 392 2 50.50 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAG:1 + chr2L 17730512 3' - pogo 31 1 59.41 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCGCTTGACGCTACAGCTATTCTTAGCATTCCTTTGGCC:1 + chr3L 21970869 3' - pogo 37 1 62.38 CTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCCCCATTCCAAATGGTGTCAAGTTCTAGCCCCCCATTCCCCATTCCCATTGCCACCCCCAGCACACAGACACACGCA:1 - chr2R 12016601 3' + Doc3-element 432 1 54.46 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAAACTATTC:1 - chr2L 16139119 3' + copia 5085 2 63.37 TCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAAACAAAAATTTA:1 - chrX 8480353 3' + Cr1a 4384 1 82.00 GGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTTTCCCACCAAAATAAATACCTCGCAACGAGCTTTACGTCACAGGCCTGCGAAAGTGTGAGCTCAATA:1 - chr2R 16613916 3' - roo 8848 2 63.37 CTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAAAGGGAACAACATTTAAATATTTTTCAATTTCTGTCCTGATGGAATT:1 - chr3L 15039460 3' + Stalker4 7333 4 58.42 TCCCGCACAAGCGATCCCGGTGCCTTATCAGCGTTTGATGTACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTAAACTTGATTTCGTTTGTTTGACTTTTTCATAACATAA:1 - chrX 18545130 3' + accord2 7176 1 79.21 ATTTGTACACATTATAATTAAGGAACAGATCCATTAGGATCCGAAATCCCAGGGGTCAGAACCCGATGCAGCCTATCGCCATCAGCTGGAGGCGCCTCTGA:1 - chr3L 11837728 3' + G5A 2738 1 54.46 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATAAATAGAAGTAAATGCGTTCCCACCATTCGTTATCTATTTTCCGAACCCTAAACAAACACCATCGAGTG:1 - chr3L 3209147 3' - roo 6 2 71.29 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGTCGTTGAAAAAGTCCGCGAAAAGTGGCTAGGACCATGAGGAATGGCCTCAT:1 - chr2R 12457910 3' - HMS-Beagle 19 2 56.00 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCGCCGTTCCTGTTGGCCATTGATTTATTAGGTTCCGCCGTG:2 - chr2R 6847236 3' - mdg1 8 2 71.29 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAATCTAGTTGTAGGTTTTTATGACTCTTTTATTTTAATGTTTAAATGTGCAGGAGTAA:1 - chr2L 7175547 3' - blood 18 2 61.39 ACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAACCAACAATAAACTTCTCGACTCTGCCCGATCCT:1 - chrX 519259 3' + Quasimodo 229 2 77.23 AGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTT:2 + chrX 706056 3' + Juan 14 1 79.21 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATAAACCCAATACTTAGCTCCTGCTGAGCCACGTTCGCTTTCAGT:1 + chr3L 171239 3' + 1360 3355 1 64.36 CTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAGATTGTCTTGGAAACAAAGTTCAATTCATTTTGAATATCCCCCCACAAATCCTTAATGATCATTATAAATTAGGCA:1 - chrX 11016938 3' + roo 409 1 46.53 GAAATTTAAAAGCTGGAATCCTTTGTCCAGGATTTGGATTTTGACTTCCATAACTTGTAGAGTAAATTGGTGTGACCAAAAACATCCATATTGCTTGGAAA:1 + chr3L 22752615 3' + FB 38 1 68.32 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGT:1 - chrX 19034137 3' - hopper 35 1 78.75 TTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGCGTGCGTGTGTGCCAGTGTTTGTTTGTTTGTTGGCA:1 + chr3R 24767880 3' - P-element 13 1 64.36 AGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGAAAAAATCGATGTACAACTTATGCA:1 + chr3R 7869208 3' + 297 382 2 67.33 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAAGCATTC:1 - chr3L 1586723 3' - Tirant 35 2 61.39 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATGAGAAAATGCAAAGGGAGAACTACTACAAACTACATT:1 + chrX 13126268 3' - mdg1 7078 2 65.35 TATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAGACTATTACATGGGCTAGTCATTGATGGATTAGGTGAGTAATGCCTACATATCCAATCGCACTCCATGGCTGG:1 + chr3L 9569772 3' - jockey 4976 1 72.28 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACGAATATATTTGCTTTGTCTCGGTTCTTTGCATACTGCCATCTCGCTTCGACTCTGG:1 - chr2R 17392597 3' + opus 7486 2 64.36 ATTAAATTAATTTAAATTAATTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGGTTATCTTATAGTCGGT:1 - chr2R 5883586 3' - HeT-A 378 1 40.59 TTAATAAGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATCCATTAATAGTTAATTAATAAATTGCCAAAGCCAATTACTATCGCA:1 + chrX 21060375 3' - 412 32 2 53.47 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGT:1 + chr3R 9088629 3' - hopper 5 2 61.64 GATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAGAAAGAAAAATAATCTCGATTGTAAAGGCATCTTGAGGAATTCGT:1 - chr2R 24550663 3' + jockey 4968 1 56.44 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCGCCGTTCCTGTTGGCCATTGATTTATTAGGTTCCGCCG:1 - chr2R 6847238 3' - mdg1 7045 2 71.43 TCGTGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGGATTAGGCCAATAAAATTATCAATGCCAAGTTTAACAGGTCCTATATCTAGGTTCGTTTTCTCAGATGCCACGA:1 - chr3L 19803232 3' - Chouto 31 1 77.23 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTNAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACTCAGTTGCAAAATTTTATTTGTGTA:1 - chr3R 26849228 3' + 297 347 2 79.21 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCTTGTGGCCTTTGTGCACTTCTTCTTCATCT:1 - chrX 13126184 3' + mdg1 412 2 63.37 GGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTATTTAGTTTGCAAATGCCGGCAAACTTCAATTTACGCGAATTTGGATCGG:1 - chr3R 11554226 3' - R2-element 282 1 59.41 TATCTTGCCGATGCAGCTANCTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTGTTGCTTTTCATTTCAGCTCTCACGGACCAAAAGACTTGGGA:1 + chrX 2530570 3' - pogo 28 1 57.43 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAG:1 + chrX 15546204 3' - blood 7056 2 68.32 ACGGACTTGTGTTCTTAAAAGGCAGTTCATCATTACAATACCCTTCACCAAAGGTATTCTACCTGGTAGCCAGAATTTGAAAACAAAATATATCTATATCT:1 + chr3L 8518610 3' + 412 7532 2 54.46 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCATTAGTGTGTGTGTCTGTGTGCCT:1 - chr3R 17059172 3' + hopper 1365 1 75.25 GTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTTAAATGACGCCCCT:1 - chr3L 25059046 3' - mdg1 7041 2 76.24 AGAACGGAGAAGGATATGTGAAGGGTCAAGATGCCCCGTCGAGATGGCTAACGCCAAAGCTGAGCCCAGAAAGTTGCGGACTTCGGTGATGTTCTCTGGCT:1 - chr2R 4877744 3' + gypsy8 4479 1 68.32 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTTAATCGGTTTATGGTGCACGA:1 - chr3R 5135476 3' + 297 6924 2 76.24 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTAAAAAATATTTTGGCAAACGAATTTTTAAAAATA:1 - chr3R 15578972 3' + pogo 2062 1 77.23 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAATATTCCAGGCTAATCGCAAGACAAAAGCC:1 - chr3R 23640985 3' - 297 6621 2 73.00 CTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCC:2 + chr2L 19642358 3' - Quasimodo 53 2 79.21 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCATTCTTAGTCTTATCAAATCGT:1 - chr3L 14222480 3' + roo 9019 2 80.20 GCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCCGTGGGAACTAAAAATCCATTTACGCAATACAA:1 - chr3L 22251470 3' + I-element 154 1 67.33 TAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGCATGACATTGTAATCTATACGCGTTTTAGTATACTCACGGTT:1 + chr3L 17793235 3' - Tabor 7322 2 64.36 ATTGTTAAATAATTTAAATTGTTCTTTTCATAAAAATCATCCTTTCGAAATGCGTGTGAATATTTTTCTGAGAAATCACATTTGCTTGTCAGCTGCAGCAG:1 - chr3L 18022327 3' + HeT-A 5807 1 66.34 CTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTAAAAGCTTATCGCGGCCGGCAAGTGACC:1 - chr3R 2117382 3' - 1360 2966 1 76.67 GCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAGGGGCTT:1 + chr2R 15788636 3' + Transpac 5188 2 61.39 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTCATTGGTGAATAAAGAAAGTCAGATTTTTC:1 - chr3L 15037927 3' - roo 8708 2 72.28 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAA:1 - chr3R 10087820 3' + roo 9042 1 53.47 GTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGTCGAGCTCCAGCAGAGTGTACATCGTGATATCCCGCTACGTATCGCTCTGTTCG:1 + chr3L 9178232 3' + invader4 117 2 63.37 CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCAGACTAATTAAATTAATTGCCCCTGCGTAGCCTGAC:1 + chr2R 23780072 3' + mdg1 382 2 62.38 TGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGTTCAT:1 + chr3R 25370529 3' + BS 5047 1 70.30 CATTTTTGTAGAATTGGTGTATTTCACATTTAAAATACGTACGTATCAATATAGTTCACATTGAGTGGGTGCTTTCAAATTTGATGGCTCTTTCTGCATTT:1 + chr3R 27649364 3' - transib3 2802 1 64.36 CATACACACACACATACACACAAACAGACACACACACACAGCAAACTGGCAACAAACAGGCGGCAGTCAAATAGCCAAAAACTTATAAACACTCTGTGGGC:1 - chr3L 10383968 3' + accord 7101 2 69.31 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTAACATCACCCGACGACAGAACAAGACGCATTTGATTTTGTCCAATCT:1 - chrX 8038605 3' - 297 18 2 62.38 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTTTTTTATTTATAAATAAAGATTTTTCAAGCACAATCTGACCC:1 - chrX 7797653 3' - roo 8696 2 63.37 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGCGGCAGGCAAAATTGAGCAAAGATGCCAGAACGTAACATTAAAATAA:1 - chr2L 10792013 3' - 412 7081 2 52.48 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATTTTCGAAT:1 + chr2L 5927003 3' - pogo 28 1 57.58 AGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGT:1 - chr2R 7546277 3' + hopper 59 1 71.29 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACTTTACCCAAAAACACAATTGAATAATGATAATTTCACACGTACTTTTCG:2 - chr2L 7666098 3' - roo 26 2 53.47 TCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTATTATAATTATGCTGGCATCTTCACAGATGTTGT:1 + chrX 8727941 3' - X-element 19 1 59.60 GTATTGATTCATCGCTTCTNAATAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGTTCATAGTCATAAAACATTAAATTTCTTTCAGT:1 + chr3R 25370557 3' + BS 5075 1 56.44 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTC:1 + chr2R 22856587 3' + 1360 3351 1 68.32 TTATGTTTCATACACTGAGCCAATTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTAACTACTCCCCCTTCAAGATTACGGGAAGCAGGAAACTTGTAATGATCGCGGG:1 - chrX 9059776 3' - Gypsy6A_LTR 31 1 72.28 GAGTACCGAGTGTTTATCGNGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCC:1 + chr3R 29287560 3' + hobo 2902 1 62.38 GGGTGCCAAATCTGGGTCTTGGCATGCGACAGCCAAATAAGGATCTGCTTCGGCATGCATGAAGTGGTGGCTTCGTACTCAGGTGACCGACCGGCTGGGCC:1 + chr3R 29416305 3' + X-element 4242 1 62.38 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACTGTTGCGCTTGAAACCGGCCGCTACGCCTGCGCACGCGTCTGCCGTTGCGACGA:1 - chrX 1135292 3' + P-element 2871 1 62.63 AATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGCTCTGATTAGAGAGCAAAAAATAACA:1 - chr2R 13383524 3' + gypsy5 366 2 72.16 TTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGTTCGTATTGCGAGTATGGTATGGTCTGAAGGAAAA:1 - 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hobo 3 1 80.20 GTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGCCGGCTTCCC:2 + chr3L 13569792 3' + invader3 232 2 67.33 CTGAACCTTCTAGCTTCTATAGTTCGTGAGATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACGGACAGGCGGGTAGTCAAACGGACAGATTGACTTAAAATCTCA:1 + chr2L 22751803 3' - INE-1 161 1 61.39 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTAATGTCC:1 + chrX 13146971 3' - roo 44 2 69.31 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCGAGATCATCAAGACAGAGGATGGCTACACCAGCGCCTACGAGGGAGCAGATGG:1 - chr2R 11259558 3' + hobo 2922 1 54.84 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAATACCTTCTAAACTTATGAACTTTGAGAACACCATTATTTTCTGCCAGTGTTTTT:1 + chrX 8316391 3' - hobo 21 1 56.44 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCTTGTGGCCTTTG:1 - chrX 13126202 3' + mdg1 396 2 49.49 TTAGAATATTAACTTCTGTNAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATG:1 - chr3L 3540114 3' + mdg3 5487 2 68.32 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGTCGTTGAAAAAGTCCGCGAAAAGTGGCTAGGACCATGAGGAATGGCCTCATGGAC:1 - 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transib2 234 1 70.30 ATTTGTTCTATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGAAGGACGAGCAGAACAAGAAGCATTCGCCTGTGGGCAAGTTTCG:1 + chr3R 15784344 3' - G2 149 1 54.46 CTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGCGAGACGGAAACTGGGTACAGTACGTCAACGTGCTGTTCATTGACAATCCCGTGGGATCGGG:1 - chr2L 15902043 3' - F-element 4540 1 65.35 TGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAATAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAG:1 - chr2L 22121350 3' + I-element 5339 1 72.28 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAGTGTGTTTATGCGTTGGTA:1 + chr2L 7666174 3' + roo 9041 1 56.44 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATACTGCAAAGTTTTTAGCCCGAGAGGAGAAAGCGACCCCAGCCGCCAAACCCCTGACAAAATCACTTTTTGAAAAACT:1 - chr3R 26597306 3' + mdg3 247 1 78.22 GCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATTGCTGTGCACATTGCTATAGATAATTTAAAGTGC:1 + chr2R 9631779 3' - F-element 29 1 57.43 TTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGTTTGCCACAGGA:1 + chr3R 13739753 3' + Burdock 234 2 58.42 TCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAATCGAAAGCAACTAATTAATTGCCTATGCT:1 + chr3L 16724120 3' - diver 6053 2 71.29 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAGA:1 + chr3L 2176376 3' + roo 9037 1 59.41 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGGCGCAGCGATTGACGATTGGCGACTGAAATCAAAGTCGCCAAATCGAAC:1 + chr2L 8709383 3' + P-element 2861 1 53.47 TATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTGCTGCCGCTTGGCATTAACTGCCTACGCATATT:2 - chr2L 4134835 3' - Quasimodo 46 2 66.34 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTTGAATTGCGACCAGAGATTTGAGATTTGAGCGTGTGCAAATGGCTGCGGCAGAGACAA:1 - chr2L 10898378 3' - jockey 4687 1 63.37 GATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTCCCCATTGACTCCGGCTCAGTTATAACCAGTTGGGAGGTTTTAGTTTGGGGGGCC:1 + chr2R 18723124 3' + HMS-Beagle 229 2 62.38 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATATACAGGCCAGAAATCATCGAGTGAGGAACTCGGCGACAAGATCCGGAAACTGAAA:1 - chr3R 18550515 3' - pogo 15 1 47.52 GTCGTTCCGGTGCAGTCGGNTTTGACTGCATACTCGAATATGTGTTTCTTCTAGTATAATAACTTTATCTTCATTAGTCACTGCGCCTTGCAGAAATATTT:1 + chr3L 25323888 3' - Doc3-element 4569 1 68.32 TATCAGGATTGGGTTTGCTAAGAACCCTCTAGAGTTAGTGTTGTTAAATATGTCGTGTGGATGTACGTGGGCGAAAATCAATAACAAAATCTTCGAAAAG:1 - chrX 2559606 3' - I-element 5118 1 54.00 AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTTATTTAATAAAGGAAAAAGTCGACGAGATGTCAGGTCAGGCCACGC:1 + chr3L 5440342 3' + blood 7332 1 54.46 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCAAAATATACATGACCATGTGAACGAACGATGTCCCATGCACTGCAATTTGTGCAAAGCTGCATTTGCT:1 + chr3L 22930401 3' + roo 403 1 73.27 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCCTTGTGCGTGAGCACAATTATTCAATATTTCCCCTGAACGGCATCTTTGGCCG:1 - chr2R 13763165 3' + roo 401 1 64.29 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTT:1 - chr3L 25059080 3' - mdg1 37 2 63.37 AATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGGATGAAGGTGGAGTTGGAGATGGAGATGGAGATGGAAG:1 - chr3R 27356562 3' + jockey 4828 1 62.38 TTCTGTGAACACGTCCACTNAATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGCGGAGCTGTGGCTCTGGGAGAAAGGCAAACAGAAGTGATGTAAAAATATGCG:1 + chr3R 12199835 3' - jockey 29 1 54.55 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTG:1 + chr3L 18418890 3' - hobo 47 1 69.31 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTGTGCTTAACTTGGAGCTAAAAGTCTATAAAA:1 - chrX 734892 3' + Tabor 7309 2 69.31 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCCTGCCAGCGCGCTGGCGAAAGTGATGGTCCTTGTGTTGCATACTTTTA:1 + chr2L 10166061 3' - jockey 33 1 52.48 TGTAGAACTAGAAAAAGAAGAACTATTATAATCTAATATAATTTATTCTTATATCTTTTATTTCTGAGGACAGTCGGGACTATACCAATTGATAATGTCGT:1 + chr2R 4514938 3' + transib2 2579 1 59.41 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAACTCTGATACTGGGAAACTCTCTCAATCACCT:1 + chr3L 25876130 3' + copia 211 2 69.31 AACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAA:1 - chr3L 25232775 3' + accord2 165 2 59.41 TAAGTAATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCAGCTCTTGCCGGGAACGCCGTGCCATCATCATCCGGCACCACGTTGGCTTCCATTTAAGTGGCTTTCAC:1 - chr3R 20409580 3' + invader2 65 2 78.22 CGATTTTGTGCGGAGCACGNTAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAG:1 - 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chr2R 11259588 3' + hobo 2889 1 75.00 AAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGCATATAAGCCGTATCTATAAACAAAGCGAAAACCTTTGCCAAATAAAT:1 + chr3L 16563289 3' - 3S18 5794 2 51.00 GACGGGTATAAGAAATGAAGGGAAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTGGCCTGACTGAAAAGGACTGGCACGCCCAGACA:1 - chrX 20361871 3' - hobo 2649 1 65.35 TCTTGGTTACTTATGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGGAAATTAAATGATTACTTAGATTCAATTCGTACATGTACATAATAGAAGAGGTATCTTT:1 - chr3L 3019608 3' - jockey 4900 1 67.33 CAAATAAATAGTTTAAAATTGTCTTCAGGCTGCAAAGAAAAGCTCGCGTCTCTCAACCTCAGATTCGTGTTAACAAACAGCGGAAAGTCCCGAAGTTGGGC:1 - chr3L 6544670 3' + HeT-A 124 1 61.39 TAACAAATAGCGGCTAAGANCAATGTAACTTATAACTAAGTCAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCACGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACAT:1 + chr2R 1234688 3' + invader2 4771 1 57.43 TGCGCTGACGCACAAAATCNCGAAGTGAATAAATAATATTTTAATGGCAGCAATCAAAGTTTTAATTAAACGCTTAAAGAGTTGTGTGATGCACACATGTG:1 + chrX 10982264 3' + invader4 283 2 69.31 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACTCGACTCGAATCGCCGCCGCTTGTTATTCTGGATTTCC:1 - chr3R 10488680 3' - roo 37 2 61.39 AGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGTATAGGTTTTGGTCTATAGTTTTTGCGCTATTATTCGCTGTACAAATGCTGGTATACTTAGTTAA:2 - chr3R 19505510 3' - mdg3 5256 1 67.33 AGAGCTTCCAACCACTTCTTTAGTTGGGTTACTGAGAATTGATTCCATTTAGTGTCAGGCATAGTGGGTAATGACACCCGCCCGCTCGTGTGCTCACCTTT:1 + chr2R 17845278 3' - invader3 364 1 74.26 GATGGTCGGCGAACGCATTGGCTTTCTGCTTCTCGACCCTACTTTTAGCTAATGGGATGGGATCGGATCGGATCGTATC:1 - chrX 6993459 3' - G7 32 1 62.03 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCAGCTTTTCCATCCGGCATTTATGTGAACCTAAAACTAAACCACATAGAGAG:1 + chr2L 8577347 3' - roo 8690 2 54.46 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGAGCGACTATAGCACCATGCGAAGCTTCCGATTTCATCATCCTTA:1 - chr2R 18171511 3' - P-element 30 1 48.51 TTTGTTACATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGTCGTGCGTGCGTATTATCAATATTGGCA:1 - chr3L 12860114 3' + X-element 4572 1 70.30 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAAT:1 - chr3L 9928535 3' + roo 9039 1 58.42 TTCGCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGTGCAACTCGACTTAAGCATTCTCTCTTGTTTTACATTTCAGTTTTTGTCAAATTTATTTCGCTGAT:1 + chrX 13120273 3' + INE-1 537 1 81.19 AAAGTCCCCCTTTTATATCTGTGGACAGAACAGGGGGGACAGTGCCCCCGTCACCAATCTCATTCAGCAACAACAGCAGGCACAACAAGTGCACCAGGGTA:1 - chr3R 24226076 3' + Rt1a 420 1 54.46 ACAATTATTTGTGCATCAGCTGCGGTGGTGACGATGCAGCATGACATGTTTGCCAAGTTCCAAATTAAATCAATTTAATAAGCTGTCAATAATGCAGAGTA:1 + chr2R 23111941 3' + jockey2 437 1 77.23 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGA:1 - chr3L 3650061 3' + mdg1 7417 2 73.33 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTGGCATTGTTATGTTTTTTCTCCCACACATAAAAAATGG:1 - chr3L 7307219 3' + hobo 2902 1 65.35 TTTGTAAAAAAAACAGGCCNAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAAAGCGAACCGTTGATCACGTTTGGCGCAGGCTTCC:1 - chr3L 6834932 3' - hopper 13 1 67.33 TAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGGGTAACCAACAACGCCTCCATGGAGGCAACAGCCTCCGCTAACGAGCTCGTGCAGCTCCGCGG:1 + chr2R 7763196 3' + F-element 4453 1 67.68 TTTTTTTTTACAAATATATTTTTAGCTTGGATAAACTTCTTCGGATTCATTTGCAACTCCTTAGTTTAATTCTAGCTTTTCCTAAAAGCTAAAAGATTAAT:1 - chr3R 29571357 3' + hopper 162 2 88.12 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATTTTATGTGTATTTATGTAAGTAA:1 + chr2L 17778102 3' + pogo 2052 1 80.20 CAAAGTGGTCTGATTTTAGACAAACATGGAAACAGATGTTAACTTTTGTTTCCATTCCCGGTATAGGTCTAAGCTGCAAGTTTATGCTTCTCTTCCTTTGA:1 + chr2R 2968970 3' + Cr1a 410 1 66.34 AGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACCAAGAAGCATGAGCGAGTGAATGGAAAAAGTAGCACACACCCACACATGCACTGAGAAAAATAGTGCC:1 - chr3L 10562481 3' + invader3 5193 2 64.36 GTGCTAGATCTCCCTGACAGGTATTAAGGTTATGCATAGAGCATGTAGTAGGGATTAATGGATAACAACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATATATAAAA:1 + chr2R 5719522 3' + G4 3702 1 78.22 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACCCAATTGCTTT:1 + chr3R 6034001 3' + roo 360 2 74.26 CGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTGGAGGAACCCTCGATTCTGAGCATGGCTGCCAGGTATCTCAAGAAACTCGAAGATGCCCGCCGTCGA:1 + chrX 7267700 3' + Ivk 361 1 65.35 TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGT:1 - chr3R 30553575 3' + 412 436 2 77.23 TGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGATCAATCAGCGC:1 + chr3R 15924671 3' - Quasimodo 32 2 70.30 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCAC:1 - chr2R 15788596 3' - Transpac 4972 2 73.27 AAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGATCTCGGGTTTGTTGCACGACGAGACAGT:1 + chr3R 10391265 3' + invader4 313 2 64.36 AAGATATTTTCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTCAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAG:1 + chr3R 10488722 3' + roo 9021 2 75.51 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATTTAACTAGCAACTCGGCT:1 - chrX 13146905 3' + roo 9050 2 57.00 CACGAACACACACACACACACGAACACACACACACACACGAACACACACGCACACACTGCGTATACGCAATTTATGTAATCAAAGCCATGGGGTAGCGC:1 + chrX 8395476 3' + accord 7026 2 71.72 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTCTTGAC:1 - chr3L 12241827 3' + roo 9029 1 71.00 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGTCTTTCGTTACCAGACTGAGACAAAGACAAACACAATC:1 + chr2L 10625736 3' - roo 8701 2 62.38 GCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATCGCAACCCGATCATCAGTTCGCAAGCCCTCCACCATAAACC:1 + chr3L 24761273 3' - 1360 48 1 69.31 AGAAATTCTTCTTAGGGTCTTCGTCTGTAGAGCCCGGATCCCGTGCTTTGCTGCTCCTTTTGCGCAGCCAAGTTTCTCAATACACGGTTTATTGAGGACAC:1 - chr4 713858 3' - jockey 4540 1 68.32 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATTGCTGTGCACATTGCTATAGATAATTTAAAGTGCCAAT:2 + chr2R 9631783 3' - F-element 25 1 61.39 AAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAAT:1 - chrX 23280904 3' + roo 368 1 63.37 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGAATGAGGCACAGAGAAATAATAAATAAACTACAGTTCATGT:1 - chr3L 13374668 3' + Transpac 5222 2 72.28 CAGCAGAAGCGACAGAGCTCACAGTCTGTAATGCCAATCTTATGCAAATGACAGCTGCAGGAGTTCGAGAAGCACCAGAATGAAATTAGTTCAGACTACAG:1 - chr3R 19580174 3' - baggins 5195 1 51.49 TCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGTTTAATCGCCTCCAACTGGCTACCAGTGACTTGT:1 + chr3L 11929326 3' - copia 4913 2 70.30 CGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGGCATAGGACCAACATTTGGAAGACTCCATCCGCACAAATACCACCAATTTCGGGCGATGAGTACGGAAA:1 - chrX 18527530 3' + Quasimodo 6959 2 68.32 CGAGTAAAGTCTTCTTATTNGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTTTCTATGCTGAGGAGTTGCCTGAAAACCCATATCCGTGAACTTTTGC:1 - chr3L 2022214 3' + roo 399 1 73.27 AAAAAAAAAAAGGAAAAAGGGAGGGGGCAGAAAAGAAAAAAAAACAGAGGGGGGACCAGTACGGCAACATGTGTAGTATTTAAAA:1 - chrX 12534923 3' + Doc2-element 232 1 90.59 CGCACAAGTCTTTAAGAAAGGGGAAAAGGCACAAAGGTCGAGGACAGACCAAATATCATCCTCTCACCGTGCTGGTGGATTCGGCCGTGGCTCAAGGTCTC:1 - chr3R 21404887 3' + Rt1b 165 1 76.24 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACTTGTAATGTATTCTGCTTTTG:1 + chr3L 25059170 3' + mdg1 417 2 75.76 GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGCATCATGTCCGCCCCTTCAAAATAATAAAGGTATAATGAAAGTATGCAATAAGAAAGTTTCGAG:1 - chrX 15255328 3' - Tabor 6847 2 67.71 TTGTTTAATTGTGTCTTCGTTTATTTTTCTTGTTGCCTGAAATATTTACTACCGCCCCCTCATTTGTGCCAGTGTAAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2R 19630952 3' - invader3 5028 1 68.37 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATCATTCTTAGTCTTATCAAATCGTTCGGCGACGTGTATAGTT:1 - chr3L 14222462 3' + roo 9037 1 62.38 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTTTCATCATAAAATCATGCACAATGGCAATGATGACATT:1 + chr2L 8622832 3' + 297 6944 2 60.40 TTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGGAGTGTATGTTGATATTATGCTGGAGCAATATTCTAACAGTGTGGACGCACCAACTTCTTCGGCAA:1 - chr3R 3850021 3' - Idefix 100 2 59.60 CTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATAAATATATATATAGGGAATGGAGCAGAATACGACCAACCGCAGTCAAGATGAATTACAATTCT:1 + chr2R 19102252 3' + opus 492 2 73.27 GTCCGAGGATCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCC:1 - chr3L 17181467 3' - jockey 4713 1 63.37 CTCTGCCAGATGGGTGGTTGGCTTTGACAGTATTCGCTGAATAAATATACATATGCGTGTACAGCGACGCCTTCGAGGTCCTGACCTCCAAAGTTTTTGGC:1 - chr3R 26701428 3' - G2 429 1 80.20 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTCACCTTACTAAATATCAATAAAAATATTATTTTTTTTA:2 + chr3R 9278403 3' + roo 9047 1 57.43 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTATTTACCTACTATTAGCACCGATTTTTCTAAGTGCCCCAAGCTAACCCG:1 - chr3L 20584015 3' + pogo 2077 1 57.43 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTGTTGCTTTTCATTTCAGCTCTCACGGACCAAAAGACTTGGGAT:1 + chrX 2530571 3' - pogo 27 1 57.43 GTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAATAATAAACACAAGTAATAATAATAATAACACGGCTTACAACCGACCATTTTGGGGTGACCATTCGAATGA:1 + chrX 12130332 3' - 3S18 5771 2 74.26 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATCAATAACAATGCGAATTACGGGGCAATAGTTGAGCGGTCGCTTCATAAAAACCAG:1 - chr3R 12767264 3' - blood 21 2 58.42 ATAAATCATAAATAAATAAATCATATTTTTTTAAAACATAAAGTCGCTGTTCGAGGTCCCCTAATAAGCGAACAAAGTTCTTGACACGCTTTGATATGCCA:2 + chr3R 29259506 3' + G3 342 1 64.36 AAAGTAATATAAAGAACACNAAAATGCATTACAATTATTACATAAGATAGAGACTCCAGATGTTGGAATATGACTATGAAATAGTATACAAGAAGGGCTCC:1 - chr3R 1849148 3' + Tabor 7304 2 58.42 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTT:2 - chr3R 10741078 3' + 1360 3374 1 63.37 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGCCTGTGGGTAGGTTAATAAAATGTTGTATTTTCCACTACG:1 + chr2R 8087103 3' - flea 31 2 59.41 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACCCTCGTCTTCGCTCGCACTCAAATGGAAATA:1 - chr3L 20354020 3' + 412 7500 2 63.37 AAGTGGCTGCATACTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAACGGTAACGATGCGGAATTGGGACAGCCTCTT:1 - chr2R 5374159 3' + 1360 3346 1 69.31 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTCCCCCAAGGACGTGCATTATTTAGCAGG:1 - chr2R 24278027 3' - 412 7102 2 73.27 TTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAAATACGAGTAGTTACGCCGCTCTTCATTATCCGTTTACAGCAATTTTGCGCTGCGTTTCGTCTTTAAGTAAACA:1 - chrX 725191 3' + INE-1 502 1 74.26 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATAATAATCATTTTATGTGCATGTTGTG:1 + chr3R 20332909 3' + jockey 4944 1 73.27 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACAATAATTCGTGGAAGCTCTTTGAAGCGATGGTTTCACAGCCATTGTTGAAATTTACAATTGCG:1 - chr3L 22930286 3' - roo 8676 2 67.33 AGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAAACCTTTTCTTGTTTCAAATGGCCTGGTTTTTTTATAATATTTGCTTAAATTCCGCA:1 - chr3R 7513902 3' - diver 5909 2 54.46 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCTAAATCGCACAATCAAAAATAGTTGTTTTCACAAGCGGAGAATATGAAATAATTCAGAGG:1 + chr3L 5710333 3' - Transpac 11 2 67.33 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTTAAATGACG:1 - chr3L 25059051 3' - mdg1 7046 2 71.29 AGGGTGGAAGAAGGAGCCCCCATGGACTACACTGATGCTCGTAATTCCCTCGTTATTGTTGCCTCCTGTTGCCTGGTTGCCCGTTTGCCCGGTTCCCCGGA:1 - chr3R 10506122 3' + Rt1b 4905 1 57.43 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAATACTCAAAATATTTGTTTTAGATA:1 + chr3L 6033573 3' + 412 439 2 77.23 AAGAATGTTAAATTTTAAGCTTAGAAAGGAAGGAAAAACATATAAGGACATTAAAAAACTCTTGAAAAACCCATTTAAAATTAATAAAAACATTTTATAAT:1 + chr3R 15617316 3' + HB 383 1 60.40 GGCGCTCACTTACATAATCTGTGTGTGTGTGTGTGGAAAAGTTTATTGCTTATGAGGAGGAAAAGCTTGGACCTCCTTGTTGGCCCTGGATAAAGCCCG:1 + chr2L 12970611 3' - gypsy3 440 1 77.78 AAAATTTTAATTTAATTTTTAAGCACTCGCAACGATTACGCGTAATTCAATCGAAATGAATGGGCAGGAACGAAGGGAAGTCGGTAGTCATGGACTGGCCT:1 + chr3R 18833110 3' - 1360 3045 1 69.31 ATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACTCTCATACACCCATCCTTAACATACCAATTTATCATCCTCGACCGCTTTTGTTATT:1 - chr2L 7596148 3' + mdg3 5296 2 75.25 AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTGCACCCATTGTTTGCTGCCGCACATGCTTATATTCG:1 + chr2R 13653436 3' - F-element 20 1 64.36 TCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGCAAATATGTGGTTTCATCCTAAATGGAGTAC:1 - chr3R 10110780 3' + Doc 4443 1 69.31 TTTTTTTTTTACTCTACTGTATCCCTGGTACCACTAACTTTCCACCCTAGAAAGACGTTTCAAAAGAACAACTACAGCCAACAGGACACAATAAGGACGCG:1 - chr2R 21920890 3' + Circe 81 1 81.19 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTTTTATTCTAGGGGCTTTGGTACTACCTTGTCGCAGTTCTTCTAAAAATGTAAATGTAAAGCTAAGCTTTTGATAAGCT:1 - chrX 17494609 3' - 1360 19 1 58.00 TGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGAACGGATTTGTTCCCTACGGCAGCATTATCAATCAGGAAATCACGGCCGTTGCCGAAG:1 - chr2R 11259370 3' - hobo 2564 1 61.22 TTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAAGGACCAATCAAATCTCTTATT:2 - chr3R 4971372 3' - F-element 13 1 75.25 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAGGGGCTTGGCTTTGGCTTC:1 + chr2R 15788648 3' + Transpac 282 2 51.00 GCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGCTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGAGTATTCAATATTCAATATG:1 + chrX 9626631 3' - F-element 4481 1 78.00 AACGAGTAAAGTCTTCTTANTTGGGATTTTACACTGCCTTTTTAAACCAAATTACTTTTAAAAGTGTTTGAATCGAGTTAAAATATTCGAGGGGAATGAGA:1 + chr3L 8036458 3' + roo 397 1 61.39 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGAAAGGGCTGAGAACATTTAAGTTAAACCGATAAGCTAGTAAAATTGTATGAGAA:1 + chr2R 13763265 3' - roo 8686 2 51.49 GCTGTTGTTGTTGGAGGTANCGGGGCTTCTGTCGGGCGCCGAGAGATCGCGATAGTTCTTATAGCCAACGGCCACCAGGATGGTCAGAGCTCCGACCAAGA:1 + chr2R 18857807 3' - F-element 412 1 68.32 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTCGTGGTTTCGATGTT:1 + chr2L 20328781 3' + opus 474 2 55.67 GGCGAGGGATCTGCACCATATATTTAATTAATTGGCGCTCAACTAGCGGGAAATACGCACCCGTCCATATCATACATAATAAACAAAATAATTACAGA:1 - chr3L 27396714 3' + springer 372 2 58.16 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATACAAAAACAGACACAAGGGTAAACACCAGCACACACACGCTGTACATATGTGTTTGAGTGAAA:2 + chr2R 23116285 3' + jockey 4979 1 56.44 TGTTTAACGTTATTTTTGTNGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGTTCAAATTAATTAAATTTGTCTTTAAACATTCACCGTTCTTTCATCAAAATTATGG:1 - chr3R 4474160 3' - copia 21 2 58.42 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGTAAATTGGGGAATTCTAATCCACAAAGAATGTGAGGGATGCCC:1 + chr3R 5691017 3' - FB 34 1 60.40 CAACAATCATTGCCTTATTAATTTTCCAAGTGTACAGGACGTGTAGGATGTATCCCCTTATGTAGATGCATATGAGCTTGAGACGTCTGCGGTGGTTGGT:1 - chr3R 27803437 3' - 1360 443 1 80.00 GAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAGCTACAATAATTCTCTCCTTTTTTATTGCATTTTATGT:1 + chr3L 2999911 3' + jockey 4798 1 78.22 ATTTTTATTAAATAAAATAAATTTATTACAATTACTGGGCAACTTAAAGAGCAACAGAGTTGTGCAAGATGACCTTTGTTTGGAACTACAATAATTGAAGA:1 + chr3R 27476029 3' - TAHRE 72 2 71.29 GTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAATGGACAACCGACGCCTGGAAGTAGGCTGCAATAAGCCATA:1 + chr2L 17998326 3' + BS 5058 1 57.43 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAAAGTTTACAGTGCAGAGAGTACGACAGTCCTGCGCACAAGTATACGTAACAAATGGC:1 - chr2R 12252851 3' - jockey 4779 1 43.56 TTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCAGTCATACAAAAAAATAACACAAATTCGTCAAAAATCAAAATCGAATCACACAAAAATAATAGAATCCATT:1 + chr3L 18419067 3' + hobo 2646 1 76.00 TTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGATAAAAGATGATTTAAATTATAGAATAC:1 - chr3L 27357537 3' + mdg1 7442 2 59.41 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATA:1 - chr3L 3540127 3' + mdg3 5474 2 55.45 TACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGT:1 + chr3L 15099644 3' - G4 3807 1 41.58 GTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATG:2 + chr3L 25232906 3' - GATE 37 2 50.50 CCGTGCAGCTTGAACCAAAAGATGTTCGTTGTGATTCCACGCCCCATGTTTTTCACAATTTTCCACCGTGTTTATCTGCTTAACTGCGGCTTATCCGCAGC:1 + chrX 14987147 3' + hopper 480 1 64.36 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGNTGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAAGCATTCAGCAATCTTTCTGCGAAACGCTCGCG:1 - chr3L 1586697 3' - Tirant 9 2 72.28 TAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTGCATCCCATCCCATTTCCCATTCGTTTCGTTCCAT:1 + chr3R 30553647 3' - 412 4 2 75.25 ATGAGTGTTCATCCTACCTCATTACCAAAATTAGTAATAGCATATAAATTACCCAAGGGCCAGGCGGTTTGAAGAGCAGAGTACTCCATAGAGTTATGCAA:1 - chr3L 13569704 3' - invader3 5186 1 78.22 TAAGACGATGCAACAGCACACACTTCAAGAGCATCGATGGCTTTTTTAAAGGGACACATTTTTCAGAGACTTGACTGTGGCCTGGAGCAAATTTCGAATAC:1 - chrX 15044935 3' + mariner2 464 1 43.56 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAA:1 - chr3R 21365497 3' - P-element 30 1 49.50 TAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGATATTATAGATACAACTTTCTAATTGCAAGCCTTAAGACATTGTGGCAAAAACGGTTTTATAAACAAAAACAG:1 + chr3R 27131999 3' - copia 4872 2 74.00 GAATACTCCCCCTCTGCTCTCCAATACCCCATGATCCCCTGGTAGCAGAGCAAGGTTCCCTTGGCTGTGGTTTCGCTAGATAGTAGATAGGGACAGTAGGA:1 + chr3R 9201036 3' - R2-element 20 1 46.53 CTAATGGGAGTTCATCATTACAATACTCAAAATATTTGTTTTAGATAAGAACAAGATAAGGGTATGTCCAACATAAAAAACATAATTAGTTACAATTCAGA:1 + chr3L 6033627 3' + 412 7546 2 75.25 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAGCTTTGACAATCAGGA:2 + chr3L 3757422 3' + roo 9051 2 59.41 TTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCAT:1 - chr2R 7546271 3' + hopper 65 1 65.35 AATGTATAATTTAGAAAATATATGACATAAAGCGTTTGACCATCGCTTACAACTAAATATTATCAAATAAACACATTATTATTATTATTGTAAATAAAATA:1 - chr3L 15414426 3' + FB 251 1 68.32 TTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAGGGACTGCAGGACTACAGGACTGC:1 - chr2R 23516952 3' + invader3 5443 2 56.44 GATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAAATGCACTAACCGCTTCCGTTTTTTGAAAAGCAACTGAACTCCAATATGGCGGCAG:2 + chr3R 20696561 3' - jockey 9 1 76.24 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAATCGAGATTATAAGGCGTCATAAAAACAACAAAACAACTGGGCGGGGCAATTTATTCAAAGAACTTGCGGAAAT:1 + chr2R 24550740 3' - jockey 4766 1 68.32 CAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCTCCTCCTCCTCCTTCATCACCACCAACCAAGTGAAGAAAAAGCCAGCTAGACAGCAAACAAACCG:1 + chrX 8889861 3' + R2-element 3545 1 41.00 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATGGCCAAAGTTGGTG:1 + chr3R 12767350 3' + blood 351 2 52.48 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGTGATTTTGACCAAGGAGGGATGGCAATTTATCACTTTAGAATGTTGAGCA:1 - chr3R 12321375 3' - jockey 4677 1 69.31 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCAGACCGTCGCGACGGCGATGAGCAAACAACAGACGCAGCTGAC:1 + chr3R 12329695 3' + hopper 1408 2 70.30 TCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACTTCGACAGGTCTTGGATAGCTCATTAGTGTGGGTATGCTGGTCATGCAAATTGTACGACAACTAATGG:1 + chr3R 23162677 3' - R1A1-element 5017 1 55.45 AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATTGCTGTGCACATTGCTATAGATAATTTAAAGTGCCAATCTT:1 + chr2R 9631786 3' - F-element 22 1 64.36 AATTACAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATCAACGAAGTTTTAACTGCAAGAATATTACAAAAGAAGAAATGTATGTCATAGTTGCGTGAT:1 + chr3R 20477234 3' + Bica 4869 1 55.45 CATTCCCCAAATCCGCTGGNTCAGCAGATTCGCGACAACACAGAGCCACCGCCGCGCCAGAAACGTTTGACTCAACAGCCGCCAGCCGCCATGACCTTTAA:1 + chr2L 22143661 3' + gypsy5 7136 2 57.43 TAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAG:1 - chrX 8027456 3' + Juan 4162 1 78.00 AGTGGCTGGGTTGGGCCACCCAAAAACGTCACTATATATATAAATATATATCGCAGACAAAGTATATAGAACATGTATTTT:1 - chr2L 5419802 3' - 297 12 2 60.49 CACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATATCACAGAGGAAAAGTTGCTGAAGCACCTGATCTTT:1 - chr3R 23534005 3' - 412 170 2 65.35 GAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATGCCTTTAAGTGACACTTGCCAGGAGGTTTTGTATTCC:1 - chr2L 10637218 3' + Stalker2 363 2 63.37 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATTTTAACCCTTTTGTTTTA:1 + chr3L 12303425 3' + blood 7334 1 82.18 TTTCTCTTGTTTTTTTTTTCTTAATTTCCAATGAACTTTAAAAGCTCTATATAAA:1 - chrX 8508755 3' - Porto1 169 1 76.36 ACAAAAACTCAACGAGTAANGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTGTGTCCGAATAGTGTGGAGCGGTGCCCGATGGCCGAAGGGTA:1 - chr3R 6033948 3' + roo 387 2 47.52 AAAAATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGTGGCTTGTGGGCGTTAGAGTGGTCGCAGCGTTTCCGGGGGTGGTCTGGTCTGGAGGCCGTTCAG:1 + chr3L 21270368 3' - INE-1 257 1 67.33 GCTGGCAGTACCCCAAAGCTGTATGTCATAAGTCAACACGGGCTTTAGTATAGCTTTGTATAAACAAACAATATTCGCACTCCACGCGGATTGGGCATTAT:1 + chr3L 26350087 3' - G4 3443 1 64.36 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATACCATTACCTCATTATGTAATTTGCTGTATCTGCACCTTCTAATTGT:1 - chr3R 17481997 3' - copia 4898 2 53.00 AATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTAT:1 + chr2L 23295860 3' - micropia 4990 2 59.41 CGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAAGTTTTATGGAGTTTTTCTCGCTGGGCCCCTTTTGA:1 - chr3R 12063721 3' + 412 7533 2 65.35 ATACTGCCAACCATCCGGATGACGGACAACCGGTGGAGCGGCGATCCTTGTTAAATCGATAAACTTTGTTTAGTGCGCGGAAACAACAAGAAGTAGTCACC:1 + chrX 7191275 3' + G5A 176 1 56.44 TATGGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTATTTCACACATAATTTGCATGCCAGTTGGTTTTAACGTTTTCCTTCCAACTTGA:1 + chr2L 8962410 3' - Ivk 5284 1 55.45 TATATATTCCTGATCAGGATCAAGCCGAATTTTTTAATTTTTTCTCATTTTATTCGATATTTTGCGTTTGTTTATTATTGGTTAAGGTGTAGTTTCCAGAT:1 - chrX 21129003 3' + INE-1 81 1 66.34 AGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATATATATATGTGTATACTATATGTGCCCGCTGAAAGCGAGGAGCCAAGAAA:1 - chrX 11262806 3' + invader1 3989 2 54.46 ATCGTGTTGTCCCTTTAATACCGGAAAAATATAAGTCGTTTGAGTACATACGACTTCCTGTGCTTGCTGTGCGGCGAATTGGAGCGCGTGGGCGACCTCG:1 + chrX 2078859 3' - Transib-N1_DM 178 1 62.00 TAATTATACCATTAGCTTTNATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATTAATTAAATCTTTCTAAAAAATCGTTCTAT:2 + chr3L 15125927 3' + Juan 4162 1 79.21 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGA:1 + chr2L 20045801 3' + roo 9037 1 62.00 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTACGCTGGGTGACCTCTCTTTCTATAATTCTTGCGGCATGTGTATGTATTTTTGAACCAAAGTAAGGGTCGTTCACTTGGC:1 + chr3L 5389064 3' + blood 7179 4 68.00 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTTCCGAGAACTGAGACGACAA:1 - chr3R 26252696 3' - 412 55 2 76.24 TGATATATAGTACCCCTACAATCCTTACCTAAGTTCACAGGTGAAATAACACAATATGTAGGCTGAGAGAAGCGGCAGAAGTGAGAAAGTTA:1 - chr3L 23773449 3' + invader2 247 1 83.70 ATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATCTGTCTTAAAATAGAAAATGAA:1 + chr2L 4134880 3' + Quasimodo 7320 2 77.23 TGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACTAACAACAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTGCATGTGATACAAATAATCCAAAATACAC:2 - chrX 22689527 3' + 1731 295 1 59.41 TGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAGGTCAAAATTAAGGGTTTTTTGCTTAATAAAGTTCCTTAGTTAAGTTAAGAATTCATAGAACAATTGTACTTA:1 + chrX 21100638 3' - S-element 1686 1 58.42 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATATATTAAGTACATTCATATTTCAACTTATAAATAAAATAAAGTTTCGATCT:1 - chrX 14172984 3' - 412 7078 2 54.46 GATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATGGTTTCTGACTTGGCTCGTGTGTGCTTCCCCTTTAACGTC:1 - chr2L 1340398 3' + hopper 352 1 73.74 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATGTTAATTGGGTTAGTTATTGAAATGAAAAGCCCTAAACGGATTTGTTCTAATAATTTTAACATT:1 - chr2L 21086006 3' + roo 398 1 69.31 AAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGTGAAAACTTGAAACGTGTTCAGAGCTACGTGGTGCGGTTATCTTTCTCTCTG:1 + chr2L 20237702 3' + hobo 487 1 56.44 AATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATATATATATAAGCACGCATTTGCCTAAGTCAAAT:1 + chr2R 21433203 3' + HMS-Beagle2 7153 2 75.25 TGGATTGACAAACACAAAATAAAAAGTCGGGGCGCAAAAAAAAAAACTAGAAAATACTGATACTCTGAAGTGAAGAAGGACCGACCAGGCGACAGAAA:1 - chrX 13350587 3' - Cr1a 45 1 64.29 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTTTTTTATTTATAAATAAAGATTTTTCAAGCACAATCTGACCCATTTTTACACCATCTAGT:1 - chrX 7797635 3' - roo 8678 2 52.48 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGCCGGGTTGCTTTTGG:1 - chr2R 6850450 3' + roo 9028 1 70.30 GGCTTTCCGCTGCCAGTCATTCTTGTCCCAGCGTTTCCTTCTTTCCTTGTTTCTATATTTGATCCAGCAATTCATTGCTAAGTTCGAGAATCGATTGTCAC:1 - chrX 14660083 3' - gypsy 96 2 67.33 CTCACTCTCTCGCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTACCCCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCGCATGAAAAATGGGTTTCCTTTTAGCTGAAATTGAA:1 + chr2L 13871840 3' + Cr1a 294 1 57.43 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCATTTTCGGTGTGAATCATTTAATATGATTTTTTCGAGTGCAT:1 + chr3R 17971716 3' - 412 32 2 57.00 CACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCCTCTTTTCGAACCGTCTGGAACCGGCCAGGGAC:1 + chr2L 16560408 3' + G2 2787 1 66.67 TAGCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATCAGGAAGGGGCGGCGGAAAAGGGGCGGGACTGCAGTTTAAATGCCAA:1 + chr2L 7159991 3' + R2-element 3352 1 53.47 TTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGAGAATCGCCTTGAGGGGCTTGGCTTTGGC:1 + chr2R 15788645 3' + Transpac 5197 2 52.48 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATAAAGTTTTTATTATCATAATAAACCGAATAACAAGCTATAAAATTAATAGGT:2 - chr3R 17003289 3' - pogo 19 1 64.36 GGTTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCAATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGCGGAGCTGTGGCTCTGGGAGA:1 + chr3R 12199806 3' - jockey 63 1 74.26 TCGCCGCACCTCCGTGTTGGCTGTCATCCGGATAGTTGGTAGATAGTGGGTGTTCAGCGTATAGCTAGCTCCCAGACAGCAAACGAATTCAGTCAGACAT:1 + chr3R 2821100 3' - G5A 199 1 63.00 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTGTGTGGTGAGCATGTATTCGGTGGCGCCAGG:1 + chr3R 17059214 3' - hopper 41 1 67.33 ATTTAAATGCATTTGGTCGTGATGGGTGTACGGCCCCAGTCTCCCCAGACTACCTTAGTCTTAGTTACAGTCTTGGGTATTTTTTTATTTACATATTTTTT:1 - chr2L 20242078 3' + S2 333 1 53.47 AAATAAAATCAGTTTCTTANAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATTTC:1 - chr2L 13093780 3' + roo 9032 1 65.35 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAATATCCAATAATTAAGCACTTCCGCAGGGAAATTGGTTTTTAATTGA:1 + chr3L 12241887 3' - roo 29 2 58.42 AAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTTTCCGGTTAATTTCCCATCAT:1 + chrX 983394 3' - Juan 3810 1 72.28 GTGTAAAGAAAGATCACCTTGGTGATGATGGGCACCATCACGCTGCTAAAGATAGTTATAAAACTGCGTGATGTCCAACTGAAAGCCACGAGTCAAGTTGG:1 + chr3L 14282682 3' - I-element 5021 1 51.49 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTATATTTAAAAAAAAATAATTGAAATGTGCACATGAACTTATAGATG:1 + chr3L 10701781 3' + roo 9040 1 60.40 GGAGCCCAAAATTGTAAGTNTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTATCAT:1 + chr2L 21086099 3' - roo 8693 2 55.45 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCATCCGTAGTTTTCGTTTCCG:1 - chr3L 10474135 3' - copia 4896 2 55.45 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACCTAAGAAGATTGAATTTGAAATAAATTAAAGAGCTGAACACTTTCAATTGAAAATAGAGTCT:1 + chr3R 29608866 3' - roo 8677 2 67.33 TTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTCTGCACTTTAAGCACTGCCACTCTCCACTTTAAATATTTACTTAATTATAAATATTCAATGCCTTATGTGC:1 - chr3R 9278300 3' - roo 8663 1 81.05 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTGTTCCCGAACTGCATATACATA:1 - chr3R 24976755 3' + opus 459 2 80.22 GTGGACGTAGAGTGCGAGTNGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCGAGATCATCAAGACAGAGGATGGCTACACCAGCGCCTACGAGGGAGCAGATGGTATATCTC:1 - chr2R 11259550 3' + hobo 2922 1 58.42 AAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCATATATCTGCCACAAAGTCATGAAACTTGAGGTCATCTGCGTAACACGCTGATTGGTCTCGTGCCTCCACATTT:1 - chr2R 5010088 3' + Porto1 4436 1 71.29 TATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATGTGTAATAATACTTTAAATGCTACGAACAAATTTCGTATATTTCTTTCAGGTGCACACACATATAGCAA:1 - chr3L 21151886 3' - jockey 4848 1 46.53 CTACCAGTGGGTGACTTATCTGGAGTTGGGGTTTATTCCACTAAACCTTGTTTTGAGGATCATATGAAAGTCTGATTGAGAAACTTCAACATTGCGAATGC:1 - chr2L 9830719 3' - Idefix 166 2 73.27 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCAT:2 - chrX 4277479 3' + roo 359 2 75.25 AGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACATAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGACCTATGTTGGCGTTGATGGTTGGCGGGTTTGAATGTGATG:1 - chr3L 10399881 3' + INE-1 175 1 63.54 AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTATCTTTACGTCCATTTCTTTTCTCTGGCTTTATTTTTATAGCATTCTTCGCTTCAATTTCGTTTTGCTCGGCACC:1 - chr3L 3644172 3' + Tirant 8497 2 77.23 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGTCATAAGGTC:1 - chr3L 3757337 3' - roo 8691 2 58.42 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATACATATATATGTATGTATATATATGTCAGATATGAAAGACAAAAA:1 + chrX 17030081 3' - flea 25 2 62.38 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACTCTTATGCGGTATCTAAGTCGAATCTAATATT:1 - chr2L 16597424 3' + roo 9029 1 68.32 GAAGGAACTGAACGATTCCTAATGCATAATAATAAATAGAAAGCTGAAAGCGGCAATGGAACCTGAAACGATATGGCTGAGGGATAGGAAAAGCGGCAGCT:1 + chr3L 468966 3' + G5A 2807 1 71.29 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAACAATACTGGTAACTCTGTTCATC:1 - chr2R 20312605 3' - 1360 51 1 77.23 GTAAAGTTGTGGCTATATCGATTGCATTACTTTTTGCAATAAATTCAAGTCGTTTGTTTTGACGCCCCACATCTTGTGTGTAAAATCCCCCATGGTCGCAA:1 + chrX 8325810 3' + flea 372 1 78.22 GTAAAAAAAACAGGCCAAAAGCCCCATAGTGCACAGCGGCAGCAGCACTTAAGTCTAATTAAAATGCTGCCCCCTAATTAATTAAACAAATTTTTGGGGCA:1 - chr3L 1998791 3' - hopper 10 2 69.31 ATGCAGCTAAGCGAATTATNCTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTTGCTCTCCTAATCGGCGAATCTTATTCACTTTCA:1 + chrX 21217602 3' - pogo 2 1 74.49 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTT:2 - chr3R 19589925 3' - BS 5023 1 50.50 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTGATCGATTAGGA:1 - chrX 19334595 3' - roo 8706 2 68.32 TACTTCGGTAAGCTTCGGCNTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCACGTCGTAAAGTGCGTCTCTCTCTTGCACTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chrX 9023555 3' - P-element 32 1 47.52 TTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAGGTTTGTTGTTAGCTAACCCAGGCACTTTAAAATTCCTAAACTTCAAATTGAATTCGGTCAATAGAGCATGGAAT:1 - chr3R 5763241 3' - Stalker4 326 4 73.27 TTCTTTTCCCTTTTTTTTTTGTCTGTCACATTAGCGACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGGGTTGTTGTAATGAAAAT:1 - chrX 7480760 3' - Doc2-element 231 2 63.37 CTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGCATATTCATGGAACAACAACTAACACAATTAGGCG:1 - chr3R 23908695 3' + R1A1-element 20 1 64.65 GAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGCCGGCTTCCCCTCAAAAAGGAAGCGAGC:2 + chr3L 13569810 3' + invader3 250 2 51.49 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCACAAAATTGCCAAAC:1 + chr3L 6658238 3' + hopper 1395 1 58.16 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAACAGAATGCTTCTGACAACAATTTGCGGTGTTGGGAAAAACCATTTGGC:1 + chr3R 12333788 3' - P-element 25 1 52.48 ATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATTACCC:1 - chr3R 22869394 3' + Bari1 1664 1 66.34 TTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTATTAACACCAAGGTTGCGGGCTGTTTTTTAAGCCTTTTGCCTAATCAAAAAATGTGG:1 - chr3L 8667153 3' - Doc 4460 1 56.44 CAGAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTACCCTGGGTCATCCATGGGGTCAT:1 - chr2R 14349141 3' + mdg3 193 2 74.26 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTATCAAAATATTTTTATGTTTTTCTTATGCACAGAAATAAAA:1 + chr3L 3596739 3' - copia 4905 2 60.40 GTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTCATCTTTTCTAACTTCCAGGCCTTCGTCG:1 - chr3R 12042051 3' - P-element 458 1 29.70 AAAAAAAATAAAAATAAAAAAACAAAACGATTATAGAATGTATCTCGCAGATT:1 + chr3L 10316743 3' - hopper 148 111 67.92 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCA:1 + chr3L 6658224 3' + hopper 1378 1 63.37 CTGAGTAAAGGGTATCTAATAGTAGAGAAAGTATCGACTATAGCGTTCTCTCTTGTTTAGTTGTATAGGCGATGTCAATGAAGAGACCAAGATTGGGTCGG:1 + chr2L 5594728 3' + INE-1 547 1 76.24 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAAGGACCAAT:1 - chr3R 4971385 3' - F-element 26 1 62.38 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGGAGAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTTGCCTTTTTGCTAAACAGTCCGCGGAAAA:2 - chr2R 21747523 3' - mdg1 23 2 53.47 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGTTACATTTTCCTGCCTAATTGGTGT:1 + chr3R 1292537 3' + opus 7456 2 77.00 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTAATTACGTAATAAGGAACCTTTT:1 - chr3L 6033546 3' - 412 7105 2 77.23 AACGTGGGAACGTGACGATNGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAAACAAGCATTGAACAAAAAACTCAAGAAGCAACACAAACAGGCGGCTCAAT:1 - chr3R 22818506 3' - Idefix 7053 2 60.40 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTAAACAAAAATTTGCGTACAGTCAAGTAAACAA:1 - chrX 15800904 3' + roo 9030 1 70.30 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAAACTCTGATTGCATTAACCGACGAGCTAGTGGCCATGCCCTGAAAAGTATG:2 + chr2R 15652338 3' + jockey 4975 1 50.50 AAGGCAGATGTATACTGAAGACTTATACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAATTCATATGAAAAGACATGCATACAGAGTTTATAGCCGGACCGAAAAT:1 - chr2R 4634762 3' + Bica 84 1 58.42 GCGAACCGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATAATCAATTAATAGTTATCACCTCGAAATAGC:1 + chr3R 11583022 3' + 1360 134 1 73.27 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACAAACAGATAAAGGCCAGCGCCTGCATTTTGGTGGCAGTGGCGGCGTGGGGCGTGGCAAACAGCCTGATTT:1 + chr3R 11321106 3' - hobo 6 1 73.27 ACAAAAAAAAAAATGAAAAAGAAATTT:1 - chrX 16194541 3' + Doc2-element 230 1 85.19 TTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGCATATTATTTATACTCTTATACTTGAGTCCTATTCGAGTGCC:1 - chrX 1706042 3' - Juan 4083 1 58.42 GTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGCAGCATTCGTTTATCTTTGGCAGCATTTTGTATATATAAGCCACCGGATAATTGTGTCC:1 - chr3R 11057597 3' + 297 6636 2 65.35 TCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACCAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACA:1 + chrX 23108308 3' - BS3 1440 1 58.42 TAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGGGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 5160 1 54.46 TAAATGACCAATATAATTATGATAATCGTTGTCAACCCTAGAGCACCCTAGACCACCCTACTTCACTCCTTCGGTGCCGTTGCTGTTGGCTTTATAATAAA:1 - chr2L 6222562 3' - rooA 7160 1 64.36 CCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTATTGGCTAC:1 - chr3R 4973105 3' + 1360 8 2 45.54 CGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTT:1 + chrX 176174 3' + pogo 2084 1 86.79 TTAATACTTTTATAGTTTAATTGTATCCCTTTCGGGCATGATCTCTTCGTCTTGCTTTATAAGCGAATTGTGTTCATTCAAATTTAAATCTGATTTCTAG:1 + chr2R 15230359 3' - Porto1 4550 1 84.00 TCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTCAGCTCGGTTCCGCTACAATGCACGCTATTTACTGGATTCCATGAAGTATTCGCGGGAGGAACCCAGATAAAGGT:1 + chr2R 9408266 3' - FB 10 1 65.35 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTGCTCGCATTTTCCCAGCTGCCTGCC:1 - chr2R 7838987 3' - pogo 48 1 76.24 ATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTCAAGTGGTTTTCGGTTTCCTATTGATTTATGAACTTTTCTCAGGTTAATCGTTTCCTACTTTCGGTATTTT:1 + chr2L 18199803 3' + Ivk 5374 1 73.27 TGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTGATAATTGCAGTGGAAAA:1 + chr3R 22494171 3' + 297 356 2 77.23 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAACTAAACACTTATCAATAGCGGCACTACTCAAAAACATACACGACTTTCCATATAAAAATATATACCC:1 + chr3R 27929003 3' - mdg1 11 2 68.32 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAGTCAGCTCGCAG:1 + chr3R 7626441 3' - hobo 39 1 64.36 TAGGAGGTATTAATTTTTGNAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAAAGCGAACCGTTGATCACGT:1 - chr3L 6834947 3' - hopper 28 1 52.48 AATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTAGTAACAACACCAAAAGCAACAACAATAACAACAACAAACCAATCTTGCTGAAGGCCAAACACCAACGG:1 + chr3L 10454161 3' - I-element 221 1 65.00 TTCGGCTGTCAGTTTAGAACTAAGTAATACAAAGAAAGAAAGCTTAACAAAATTGAGAAAAACCACCAAAAAAGCCAACAA:1 - chr2R 10393301 3' - Chouto 132 1 58.02 CTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTAAGTTTGGATCAGTCTTTATTTGTAAGCTGAATCGGAATCTGCGGGTGAACATCGACAATGC:1 - chr3L 19350652 3' + Cr1a 3989 1 67.33 AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTACAGCGTATGAGTGATTTTTATGGCATTTTTATTTGGTCCGTGGGACGTACGCCTCACTATAAGTATATG:1 - chr2R 20718802 3' - BS 5002 1 69.31 CGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCCGACCCAGTATGATTTTCC:1 + chr2R 22553124 3' - 1360 44 1 80.46 AGTCGCGCTGACGTTACTGCGGCCGCGTCCGGTCTTATCGTGGAGCTGCATCTTCGTTTGAAATTGTTGCTGCCTGCGCCACTTGCCACGCACAAGAGGAT:1 + chr3L 5634069 3' - gypsy4 6624 2 56.44 AGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGATAGAGCTACACCTGCATTGGATGG:1 - chr2R 18723019 3' - HMS-Beagle 12 2 67.33 CGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGATCTCGGGTTTGTTGCACG:1 + chr3R 10391255 3' + invader4 3062 2 54.46 GTTACATACTTTTCAACGAATCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAAAAATATACTGACAGAATTTATAGACTGGTAGACCTTTATATATATATGCCTTT:1 - chr2R 5296781 3' - INE-1 15 1 77.23 AAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGATTTTATAGCTCAGTTTTGTCTTTAAATTTCAAACAAATTCCCTGCGATAG:1 + chr2R 22051560 3' + Tabor 485 2 77.32 CATTAACGTAAGGGGAGTACACTAGATGATTAAGTCTTAGGGATTGGCTATTAACTAGTATGGTTGATTAGGTTTAGT:1 - chr3L 893381 3' - G2 2991 1 37.18 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAG:1 + chr3R 7869175 3' + 297 352 2 73.47 GAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGGTTCCCTGTTTATTAAAGCATTTCTTACGCATC:1 + chrX 21253945 3' + invader3 5421 2 67.33 TTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTACTTATTATAGTATAATATCAAATATATTAGTAG:1 + chr3L 20411892 3' + roo 410 1 79.21 GCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACTGTCATTGTGCATAAAATTCCGATATAAA:1 + chr2R 17459215 3' - Transpac 4960 2 70.30 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTCTGCGCCAAAAAGAAGCATTTGCAAGGGAAATTCTTAGGTTCTTTACTTTC:1 - chr2R 8682325 3' - pogo 20 1 57.43 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGTGCGCCAGATCCTTAATCCCGCACG:1 + chr3L 13295267 3' + hopper 1365 1 73.27 TTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACTTGTA:1 + chr3L 25059154 3' + mdg1 400 2 59.00 AGGTTGAGATTCGGCATACAGATTCTAGAGACATAGACGCAGCGCAAGTAAGCAAGTAAGTCAGAAACATTTTCATTTCCATTTCCAGTCAGACAACTGCT:1 - chr3R 7607829 3' + INE-1 175 1 55.45 GCATACTTGTGAAAAACACNTTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCA:1 + chrX 11025569 3' + hopper 1380 1 62.38 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTCATTGGTGAATAAAGAAAGTCAG:2 - chr3L 15037934 3' - roo 8715 2 79.21 ATCTATCGTATCTCTGTCTNCAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATTTCAACACAAAACCGTTTGGATCGGTGGATCGGTGGATCAGTGTG:1 - chr3L 395195 3' + Circe 92 1 66.32 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTT:1 - chr3L 17181440 3' - jockey 4686 1 56.44 CGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTGCGAGAGACCAGGGTTAAAAACAACAAAAGG:1 + chr3R 19203925 3' - Doc 323 1 68.32 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAAGAACGTATTTAAAAAAATAGTTGTTACATTAAAAT:1 + chr3R 6947378 3' - I-element 43 1 62.38 AACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTCCACCCGCAACAGCTTTATA:1 - chr3R 26090538 3' + Transpac 160 2 80.20 CTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATAATATATATATCTATCGATATCCCAGAAAAA:1 - chr2L 9778708 3' - Quasimodo 47 2 80.20 AATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTTGTAGTAAATGTCATAGATGATGCGCAGGATGCGTTGCACATTCTCCTGCGACGGCTT:1 - chr2L 16678784 3' + P-element 2728 1 64.36 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAACATACTATACAAAATTATATGGATAATGCATAATAGCTAAAACT:1 + chr3L 3209243 3' + roo 9041 1 57.43 CGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATACAATTTAGTCATTCAGTTTGTTTTATAAAAATGTTGTATTTTTTCTAATTTTA:1 - chrX 14981715 3' + INE-1 144 1 65.26 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCAGTTTACTAGACTACAAAAGTAAACAGCACGCCACAAATTCCAAGTAAAAGAAAAGCAAACTTAGCCAGC:1 + chr3L 14222555 3' - roo 8670 2 73.27 CTGGTTAACTCCAGGGAAATTAGTGACAAATTTATCAAAGTGACTTCTTTACCTGGCTTATGCATTATTAAGCGCAAACTGCACCGCCGCTGCCATCTATA:1 + chr3R 8172051 3' + Ivk 468 1 62.38 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATACACCAGTCTGTGGAGAACTTGTGTTCGCATTTATCCGTTCAACTCTTTTTACTG:1 - chr3R 19198497 3' + hobo 2929 1 65.56 CGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTGCAGGTGTGCATACCTGTATTCGTATACTAGTACTCTTATTTGCTACAATTTATAAAA:1 - chrX 1124964 3' - mdg3 5380 2 63.37 GATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCT:1 + chrX 983368 3' - Juan 3836 1 54.46 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTTG:1 - chrX 17029988 3' + flea 4998 2 55.21 CATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTTCGTTCTTTTTTGTACACATACATAATTAACAAACATTTCATTGACTGGCTTAAATGACACACATGC:1 - chr3R 12916450 3' + rover 7066 2 54.00 TTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTCCCGTTGCGTCTGTAAACGTTATACAGTCTCCCAACATTTTACATTTCATTATCAAAT:1 - chr3L 18797117 3' - 17.6 81 2 65.62 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTACAAAGGTTTAGTCATCCAGT:2 - chr3L 20411811 3' - roo 8717 2 78.22 ATACTAATATAAATACATACATTTTTGTGTTCTTTAAGACACCTTTGTGATTATATAAATCCCATTCCAACTATAAATCGAGAACTAACAATATAAATAAA:1 + chrX 19088904 3' - 1731 4415 1 57.43 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGGTTGCTTTTGGTTC:1 - chr2R 6850447 3' + roo 9035 1 65.98 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTCACCTTACTAAATATCAATAAAAATATTATTTTTTTTATAAGCATATCT:1 + chr3R 9278414 3' + roo 395 1 67.33 AGGCCTACTTTTCAAGCGGATGTTCGGTTATTAAACCACAGCGTGCATTTCGGAGGCAAGTTTAGTTATAGCAGGACGGACATGGCAAAATTGAATCTGAT:1 - chrX 22701914 3' + mariner2 171 1 53.47 ATTTCAATAAAAGTAATATNAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTGTGCTTAACTTGGAGCT:1 - chrX 734906 3' + Tabor 7295 2 55.45 GTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTAAGCTGGAGTTAAGTCAATGAAATACCA:1 + chr3R 19447589 3' + roo 103 2 72.28 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGGTTAAACTACATCAAAATGTTCTATTTTCAT:1 - chr2L 14341849 3' - copia 46 2 67.33 CGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTAGAGCCCCCCAGTTAGTGCGCAGGATTCGCAATTGCCCACTTTTTA:1 + chr3L 12410381 3' - jockey 4988 1 55.45 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGAGCAAACGATCACCTGCGCTTGTGTGCGTGCGTGTGTGCCAGTGTTTGTTTGTTTGTTGGCACTTCAAGCAC:1 + chr3R 24767890 3' - P-element 3 2 74.26 ATAGCAACAATAATAATAACAATGCAGTTGTTGATTACACCCACCAGGCTGTTGACCAAACTATTCTCGTGCGCCTGTTGTTGTTGCGCCACCGCAGAGGC:1 + chr3L 7825797 3' + mdg1 7055 4 74.26 CAAAGACACTAGAATAATAATATTCTAGGGTCTTTGCTCGCACCGTAAAAGCCGTGTGCAAAGAGCGCCTTGAAATGTAACAACAAAAAGTCAAGCTTATT:1 + chr3R 30387123 3' - Tc3 310 1 58.42 TTTTTTTATTTGTTTTTTTTTTGGCTGTATCTTTTGCTGCTGGAGCCATTTTAAAGGAAAGAAGAAAGTTTTGCTCC:1 - chr3R 25721842 3' + hopper 148 112 79.22 CCTTCTAGCTTTTATAGTTGCTGAGCAGCACGCTCTAGGCACATTTGCCATGTTTAGAATTAAGACCTCAGATACTTGAGAAGCTCCAAAAGCCCAAACAA:1 - chr3L 394163 3' - INE-1 156 1 79.21 AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGATTATTTATGAGACCCATTAATGGGCAGGTTGTCAGCAGCTCTATTCATCTTGGGGCATACT:1 - chr2R 16609400 3' - jockey 4775 1 63.37 ATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCAAAACTATGTAAATCTCTATGGCAACCATGACCCAGTTTTTTAATGATAAGTAATAAGC:1 + chr3L 4579134 3' + pogo 2012 1 71.29 TCTGCAGAGTGGCGAGTCGATCAGTCGATAAGTTTCTCTTACCGGATGGGCTCCTCAGGTCGGAAAGGGGACAAAGTGCACTTGCATTGCTCATCATGTTG:1 - chr3R 25133709 3' - mdg3 5392 2 70.30 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAATAATAATAGAACATTTTGATTAAAGTGTATATGTGGAAA:1 - chr3R 12944679 3' + roo 9036 1 66.34 TACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACATAAATGCATTACAATTATTACATCTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGG:1 - chrX 21668015 3' + Tabor 7283 2 61.39 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATAT:1 + chr3R 11052156 3' + blood 7345 2 73.00 GATGGGCCGCAGGTCATTTTCTGTATGCATAAAATTTGGATGGGTGGAAGAATTTTTGTACTCAATTAACATTATTCAATTTATA:1 - chr3R 12589175 3' - hobo 2734 1 67.06 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATT:2 - chrX 13146922 3' + roo 9032 1 65.35 TTTTGTTAAAAAAAAGAGCATTACTTACAAATATTAACAAAATGACATTGTATGCGAGATGCACTTATGGCCGGCCGCCCGGCAAATTGTTGTTTACAGCT:1 + chr2R 19950976 3' + Circe 470 1 56.44 ACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTTATTAATTCTCATAAAAAAATTGGTTAGTCTGGCCAAATAAGTCAAGGCAGAACTAAAATAAATAGCAACA:1 - chr3R 21588967 3' + flea 5011 2 75.25 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTCTACCTCTTATAGTACATACAGGCCTATG:1 + chr2R 5143485 3' + 1360 3342 1 96.04 TATACTTTTTAATATTGTAAGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATGCCCACAGTGCAAACCGCTCTTCACACGGCAGCGTTTCGAACGAAACTGTT:1 - chr3R 24847011 3' + diver2 44 2 68.32 TATTCGTAGCTTGAAAGAANCACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGAAAGATGTGTTAATATGAACTTATTTTCGTGTACGATACTATTT:1 - chr3R 19987405 3' - Doc 36 1 56.57 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGGGCAACGGCAACGGATCGTCAAGTGTAATCCGA:1 - chr3L 3650013 3' + mdg1 7454 2 73.27 GCCACGGCGAAAAAATCGTGTACCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCGTAGACCTTATCAGTCACGAAAAGAC:1 - chr3R 24542045 3' - 1360 48 1 73.96 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCGCCGTTCCTGTTGGCCATTGATTTATTAG:1 - chr2R 6847247 3' - mdg1 19 2 60.40 ACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGGCGTAGTAACCGAATTGGAGTTCAATCGGACAAATAGAGTTATA:1 - chr2L 713283 3' + Stalker4 7032 4 57.43 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCAGACGAAATGTTTCCGCTCCAATGAGCTGCTGAAATATGAGCG:1 - chr2L 1783301 3' + roo 9047 1 55.32 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCAGCTAAAATCACTCAATCAGCTGTTGCCTATCGATGAGCGGCGACTATCGATTGGGTAGGCTATC:1 - chr3R 27116698 3' - P-element 9 2 66.34 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTACCCTGGGTCATCCATGGGGTCATCGGCAGTAACCGCCACGACTTTGAGGACAAAAGCCAAAAGCAC:1 - chr2R 14349099 3' + mdg3 5488 2 64.36 GTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATTCGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCATCGTGTCGACATTCATCAAGTCGACGGTTATTCT:1 + chr3L 18321304 3' - 1360 210 1 65.35 TACAACCGCGTTCGACAAGNGCTAGTCGAAGACTGATTTACTACGCTCTTATTTGTTGCTTAACTGGCAACAGGCAGGCCCTTCTTCCGCAGTTGACATCT:1 - chrX 21183955 3' - Juan 15 1 63.37 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAGAGCGAGTGAGATTTAAGCCCGAACAATA:1 + chr3L 2176403 3' + roo 401 1 71.29 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACACACCCTCACATGGCAACTGCATATTGGTTGCTGCTTT:1 - chr3L 10363823 3' + P-element 2849 1 41.58 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTGTATGGGCCAACTAACGCTACCTTTACC:1 - chr3L 13785381 3' - pogo 42 1 71.00 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGGCAATAAGTAAGAAATAAATGAAACCTCAAATAAATGGCAAT:1 + chr2R 11941072 3' - 297 27 2 60.40 AGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCA:1 + chr3R 25086145 3' + Bari1 1655 1 77.23 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTTCGATATTCATTGCTAATCCTTACATGTAGTTGAT:2 + chr2L 9260394 3' + 297 360 2 64.36 ACCCGCTCACGCTCTGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCTATAAACGGTACTGCTGCACAGGTCATAACAAAACAAACAGACGAGGAATGCATGT:1 + chr3R 29504590 3' + F-element 476 1 71.29 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTGGCATTGTTATGTTTTCTCTCCCACACATAAAAAATGGGGGAAATTGTAGGTAGCTCG:1 - chr3L 7307199 3' + hobo 2928 1 66.32 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCGAGATCATCAAGACAGAGGATGGCTACACCAGCGCCTACGAGGGAGCAGATGGTATATCTCGCAACGAGGAGGCTT:1 - chr2R 11259535 3' + hobo 2937 1 73.27 TCTTGTGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTTATTACACAGTTATTTAATCGAAGCCATT:1 + chr2R 15624926 3' + copia 393 1 71.29 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACTTCATTCACCATCCCCGCTAGGTCAGAATTCAGGACGCAGGACTCGCTTCTCCTT:1 + chr3R 26252751 3' + 412 7523 2 54.46 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAATAATCGTTTATAAATGATAAATTAATATGGGAAACAAATTGTATGGGCGGTCGATAGCTCCG:1 - chr3L 7099565 3' - roo 14 2 64.36 GCCTCATTAAGTGCAGACCGCATAAATGCTATTATAATATTTATACTTACACAAATAAATATTGTCTAAGACCTTAACCAAAATTTATAACCTTGCG:1 - chrX 22576296 3' + Burdock 6325 2 65.98 TATTAATTTTTCACACGTCGCAGAGTCGTTAGCATCAGATCCCGATATTTGTGAGCTTTGCATGGCAACCACACATGCTCCATTATCCTGTTCACTGCCTC:1 + chr2L 21145766 3' - 1360 428 1 77.23 ATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATAGGA:2 + chr2R 16185127 3' - 17.6 7 2 73.27 AGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTTGAGCGGATTGGTAGGGGGTATATATGTATGGCGTATATATGGGCCACATAGGGGTACTA:1 - chrX 15194295 3' - F-element 441 1 67.33 GAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCCACTCATGTTTTGTCGCTTAATTTTAATGG:1 + chr3L 5479075 3' + 3S18 6088 2 56.38 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATTTTTGAGCCTTTGAGCAATTGTTCGTT:1 - chr3L 5710255 3' + Transpac 5184 2 73.27 GTTGTTTTTGAGTGAAGAGAGCTGACGCTCGTCTTGTTCACGCTGACGCTGCTCACGAATTATGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTAGTGATTTATTT:1 - chrX 23155934 3' - Doc4-element 48 1 82.18 TATCTTTCTGCGCGCCTAAAAAAATAAAGCCTTCGCGTCTTTTTTTTTCCCCGATATACACTGCAAAGTTCGTTCGCTGCCCGATTGATCAAAATGTTCAT:1 + chrX 16467866 3' - Gypsy12A_LTR 496 1 60.40 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACATATTTGCATGCTAAGATTTCTTGAAGTGACAGAGTTGAGTTCGTTATTACC:1 - chrX 19369827 3' + roo 9017 2 63.27 ATTTCCAAATAAAATTAGTNTCTTACAAAATCTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAGATTGTCTTGGAAACAAAGTTCAATTCA:1 - chrX 11017004 3' + roo 9026 1 68.69 CAAATTGAACGAAATTGGATGTTCGAACCAAGCAATATAAAATGCATGTACAATGATGAAGAGTTTTACAAGCACTGTATTTGCACCGGCAACCATACAGC:1 - chr2L 22224487 3' - GATE 391 1 74.26 TCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTGTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCC:1 + chr2R 2994309 3' - gypsy8 4766 2 45.54 CACAGTCACCTCGTTGTCACCTCTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAGTGCGGCTCATAGCGGCCGAGAATGGCCTGGACATCGGCGTCCACCGTGGCCAGCT:1 - chr3L 16776107 3' - Chouto 314 2 55.45 TATGTGCCATAGTATAAGAGCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCAAGAAAAATAAGAAAAGTCAATATAAAGTTAT:1 + chr2R 2338914 3' + Quasimodo 8 2 69.31 CAAAGACACTAGAATAACANGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAAT:1 + chr2R 19502068 3' + 1360 1 2 63.37 CAACTTAAAACGGACTTGTNTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCGCGTAACAAGTGTCA:1 + chrX 9413873 3' + 412 470 2 52.63 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTC:1 + chr2L 20367349 3' - Doc 48 1 69.07 GTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAATCAATAAAGAGATTTAAAATTTACAAGTACTCGTGTGTGCACAGCAAACACATGTTATGTACAT:1 + chr3L 20317896 3' - 3S18 12 2 65.35 CGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTG:1 + chr2L 8959961 3' + Ivk 5326 1 76.24 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTGAATTTAGGGCGTTTCCTGAGCTCATTAAAGTCACGTCGT:1 - chr3L 7300496 3' - Doc 40 1 63.00 CAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGACTTATGTGCGACATTAGCGCGACGTTCTTTGCTTAATTACGTAAAGTTTTTCGGGGCCGCAGTC:1 + chr2L 15381352 3' + pogo 43 1 70.30 CTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGATTTTCGTTTTGTTTGCTTATTTTA:1 - chr3R 23333125 3' - 1360 3265 1 85.15 TATTATTTAAACTATCCAGTACCTTGAAATTTTGCTTTATACTAATAAATGTATAGGTCAAACCTATTCAGTTGAGACAAAAAAAAAATGAATGAATTGAA:1 + chr3L 2401764 3' + Tc3 1467 1 52.48 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTGATATAACATAAAAGCTATGTACCCACTTTAATCAATTAAATAAAGTGGTGTCAAG:1 - chr2L 20128834 3' + hobo 2933 1 60.23 AGGCTGGGGGCCCGGGAAANAATTATCCCAGTCGATAACCGCATCGTGAATATGTTCGAGTGTGTGGATATGAATAAACATGGTGGCCCGCGAGTAATGTG:1 - 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chr3L 3757313 3' - roo 3 2 76.24 CTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTCGGCGATTTGGCAGCCGCGATGGAAGAAATACTCGACCATGTCGAAGAAG:1 + chr3R 23942823 3' - jockey 4728 1 54.46 ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTCATTTTAATTGATGTTTATTTAAAAACTAGTTGTGTTTTGCGGA:1 - chr2R 5772449 3' - HMS-Beagle 28 2 58.42 CTACTGATTGTGAAGAGGAAGACGGGTTTGAATTATACAATATTGAAATTATAATTAATTAAAAATCAAAAGATGCGCAAATCAAAAGTAGTGTAAATACC:1 - chrX 5225828 3' - hopper 226 1 61.39 TTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATTTCTTTTCTACTATCAGAGCTATCTTTAAG:2 - chr2R 14997859 3' + McClintock 437 2 70.30 GAGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATCTCGGACTTCAGGATAGCCACGGGTTCACGTTCGGGATCTACGGGAAGAGCG:1 + chr2R 11259638 3' - hobo 14 1 60.00 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAAGTATCATCTTAAAGAGATTTGCAGCTTAGCGGCCGCATG:1 + chr3R 12876403 3' + hopper 1410 2 74.26 GATTACCCTATCTCGCACAGATCACGGCCGACCTGGGCATCATCCTGGATGACAGCAACAAGCGAAAATTAGTGTGTGGCGTTACCAGCAGTTCCCCCGCC:1 - chr2L 11514304 3' - Chouto 85 1 76.24 CGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACAAGGAAATGGCTGATATGAGAAATGTCAAATTTGGG:1 + chr3R 24085363 3' - invader3 43 2 65.35 CAAATTTGGGTGGGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTATTTTGATCTGAGCTTGATTGTTCTATATCACTGTTGGTGATATTATTTATTTTTATTCGAGG:1 - chr3L 25471447 3' - I-element 4895 1 63.37 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGA:1 - chr3L 20049642 3' - jockey 4810 1 71.29 TTCTCATTCTCTTTCATACACCACTACACAGACACTGTGGTGAGTTTTACCGGACTCCATCAGTCCTGTGTTTGCCTGCCTCGCTCTTCTTCTACCCGCTT:1 + chr2R 13384955 3' - invader5 197 2 56.44 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTTCT:1 + chrX 11967087 3' + copia 5076 2 73.27 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATAAGAAATATTTTATCGTAACTAACAAGCTATCTTCTTAGATCAATATCCGCGATTCCATATCGAC:1 + chr3R 17482098 3' + copia 245 1 60.40 GTTAAGGGTTTTTTGTTTAATTAAACTCATTTTTTTTATAAAATTGAATTAAACAATATTTATTTTATGTTTCGAATTTGTATATATAATACGTATTCATA:1 + chr2R 21723742 3' + S-element 65 1 70.30 TCTATCGATATCCCAGAAANATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCGCACTAGCTGAGTAATTACGACTAGTAAGTAAAAAGTCCTTGTAACAAAAGAAACT:1 + chr3R 4278249 3' + INE-1 501 1 58.42 GTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATTAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACAGAGTTATATTTGTGCGCGTATGGTCAGGGACAGGTG:1 + chr3R 1838842 3' - Cr1a 4104 1 63.37 AAAAATGAGAAAAAAAAATAAAAAAAAAATAAAAAAATACAAATAAAAATAAATTCTCTTCGTTGGTCTGTCCTTTAACAAGTAGGAATTTTTAATAA:1 - chrX 21413031 3' - INE-1 472 1 68.37 TTGTGTGAGTAAAAACAAGNGACGAGAACGCGTATATGTGTGTGTGTCTCTTCTTTTTGGGTGTAAATATCAGGGTCATGGTTATAAAATTAAACATTTGA:1 - chr3L 19087404 3' - 1360 3244 1 63.37 TCAGGATCAATAGCGGAGTCGAATGAAGGATTCTAATTCGGTGTAAGTCCAGTTTTATGTATTATGTATTGATTGCTAAAATACTACATAAAATCTTAAAC:1 + chr2L 12286075 3' + INE-1 94 1 64.36 TCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATATGCTCAACGTTGTGGAAAATCTATTCGTGTGCTAGTGCTCGGAGTT:1 - chrX 2330155 3' - F-element 4325 1 55.45 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTTGC:1 - chr3L 17181438 3' - jockey 4684 1 58.42 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCGCTTGACGCTACAGCTATTCTTAGCATTCCTTTGGCCTACTTGGCGTATGCGTG:1 + chr3L 21970886 3' - pogo 20 1 59.41 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCTCATTACTCATAACTGAAGGCTTTG:1 - chr3R 27131922 3' + copia 5074 2 79.00 CGTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTTGTGATTCTGCGCCCTTACGAGTTCATCTGCTTGCTGTCTTCGGCCACTGCTTCCAGCATCCGATGGTGAACA:1 - chr2L 8431949 3' + hopper 481 1 76.24 TGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTATGTATGTCACTGCGTATTGCTGA:1 + chrX 18326257 3' - Doc 199 1 61.39 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACAATAAGAGTAACAACAATGCCCA:1 + chr3R 7139288 3' + pogo 2051 1 80.20 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTACCTGCTTTTCCTGCTTTG:1 - chr3L 6023282 3' + hopper 1381 1 56.44 TCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACACCAAACATTGTGTTTACATGCGTCAAGTAATTCT:1 + chr3R 9259219 3' + hobo 39 1 66.34 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTAATTACGTAATAAGGAACCTTTTTATTCATTCCATACAAGAAAATACC:1 - chr3L 6033521 3' - 412 7080 2 53.47 TGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATAAGAAAATAATATATAGAACTTTCTACACATTTCAAGAATCGCGAAATATTTTGATTAATGGA:1 + chr3L 13001090 3' - invader3 5201 2 64.36 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACT:2 + chr3L 27357632 3' - mdg1 7059 2 58.42 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTATATATTTAAAAATGTTAATAAGCATTAGTTTCAAGTTAGT:1 - chr2R 19088960 3' + Tabor 449 2 61.39 ATATTTTAAATGTTAAAAACATTTCATTCTTATTTTTCAATTTTATACTTTTTCCCAAATTACAAAAAAAATCTCTCAATTTAATAGTATCTGCGGAGTTT:2 - chr3L 2299531 3' - gypsy3 491 1 59.41 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTCATTGGTGAATAAAGAAAGTCAGATTTTTCTCAGTGATTAAGACACGAAAGCAAGACGTAAACA:1 - chr3L 15037893 3' - roo 8674 2 69.31 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGGCGGGG:1 - chrX 11025504 3' - hopper 33 1 60.40 GCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCATTTTGTGCATCTCAAATGTAATCAACGAAAGCCGA:1 + chr3R 28655497 3' + Cr1a 161 1 73.27 TGTTTTTTTTTTTCATTTATTTGTTTATTTTTTGAGTATTTTCATAGCACAATTTTTGTACAGTATATGGTTTTGTAGCTAGCGAAAAAAAGTAAACAAAC:1 - chr3L 8938398 3' - gypsy7 5008 2 82.18 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGNTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAAAGGTCCTTGAAAAT:1 + chr3L 18418909 3' - hobo 28 1 51.49 CCGTGTGGACTTATGGCATACAGCTCTGGGGTACTGCCGGCACCTCAAATATTGAGATTCTACAACGCCACAAATAGCAAACGGACAACGAAAATGGGCAA:1 + chr3R 5444215 3' + G4 3424 1 65.35 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCAAACCCGTTTATCGCTCGGCATAAATAATTGATGTTTAATATGCGCCTGGCATTTAACGTT:2 + chr3L 13895444 3' - hobo 15 1 62.38 TATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGGGCAACGGCAACGGATCGTCAAGTGTAATCCGAGCAA:1 - chr3L 3650009 3' + mdg1 7458 2 77.23 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCCCCAACCCCCACAGACTTTCCATCTCAGGTT:1 + chr2L 12511593 3' + copia 5079 2 69.31 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTGTTT:1 + chr3L 2022298 3' - roo 40 2 67.33 ACTGATCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTAACTTGTATGTATACAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAATATATATGTGTGTATATGTGTAATTCAAATGTATGATGT:1 + chr2R 3822167 3' - Gypsy6A_LTR 9 1 68.32 ATGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCT:1 + chr2L 20328766 3' + opus 458 2 69.39 AGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGTTCCGCTACCCAGCGACTTG:1 + chr3L 11383334 3' + mdg3 80 2 80.20 CGTAAATTGAGTGACTTTCAGCTGATCGTGATTTCCGCGGATGGCCTAGACCTCAGCTTGAGTTTTACGCTCTCTTTCGTCATCCTGTTAAGGCTGGCTCT:1 + chrX 3685590 3' + Gypsy12A_LTR 186 1 65.35 CACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCAAAATTTTCCAGTGCTGCT:1 + chrX 10044839 3' + Quasimodo 46 2 81.19 ATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATATGAAGGCAGCCAGGCAGGACGTGGTTGACTTCAATTAATGTTTTG:1 + chrX 9342392 3' + Burdock 6364 2 55.45 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTTCCAGACATGTGTATATGTGTGTGTAAGGTCCTTTATACGTATGTGTGTGTGCGTATTCTTTG:1 - chr3L 5259492 3' + 412 7480 2 70.30 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGCTATCATTACATATATATAAATTTTCTTGTTA:1 + chrX 16457581 3' + blood 7320 1 68.32 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGAGCGAACGCCAAATGGAAATTGTTG:1 - chr2L 17994161 3' + roo 357 2 72.28 CGTTAAGTGGATGTCTCTTNCCGACAGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCATCCAAACTCATTATCCGCTCAGGGATGAGCGGACATTATGAAA:1 - chr3R 3847094 3' + P-element 2856 1 48.51 ACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGTTCTCAGCGTGCAGTAAAATGGGATTTTCAT:1 + chr3L 2842448 3' + 1360 3227 1 80.20 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTG:1 + chr2L 18248038 3' - blood 47 2 76.24 ATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATATTATAATATAATTATCAAATAGTGTTGTAAAACGAAAAACT:1 - chr3L 19089611 3' - invader1 35 2 63.37 CGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGTGCTGAAAATTACTTTCGACTTTGTCGGCCAAACGCGATTTATTTTGATTAATTCGC:1 - chr2R 8526322 3' - I-element 21 1 61.39 ATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAGATGACCCATTTGTAAAGTGCAAAAAGTTGTAAAGTTTTAAATAAAAAGTTT:1 - chrX 22426165 3' + 1731 4602 1 56.44 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTAATGTCCCC:2 + chrX 13146973 3' - roo 42 2 67.33 AAAATAGCTGAAATATATCAAATTTCGCGTACTGTCTACTACTTAATAAAAAAGTTTGAATAAATTAAAAATAAACTAAAACTATACAATACAAAAATAAA:1 + chr2L 6968879 3' + Bari1 457 1 57.43 CCCATCCCTCCTACAAGCCAAACAAGACATATTTAATCACACATATATGTTGCCTCATATACATACATATAAGCACCCTCACACAACGACACCGATACTAT:1 + chr3R 20794360 3' + I-element 5060 1 69.31 TTCTTTTCCCTTTTTTTTTTGTCTGTCACATTAGCGACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGGGTTGTTGTAATGAAAA:1 - chrX 7480761 3' - Doc2-element 231 2 63.00 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTGTATGGGCCAACTAACGCTACCTTTACCGACTGCG:1 - chr3L 13785374 3' - pogo 36 1 64.36 TAGTCTGGAATACAAAGTANTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCCAGTCCCATTTCGATCCTTTGGTTGTTAGGCAGGTGTTCTCCTCATTTCTCCCCGC:1 + chr2R 19866388 3' + Doc2-element 4314 1 61.39 GGCAGCGCCCCTCGGTCGTTTGGGTGGGAGATGTTACCGTAGGACTTGTCTGCACGTCATTATGAACGCCGGGATGGGTATCTCGACCTGGTCCAAAGCCA:1 + chr3L 20164094 3' + Cr1a 4411 1 74.26 CGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCACTGATGGCGCTTTACTCCCGTATGGG:1 + chr3R 23124601 3' + diver2 118 2 71.28 TCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAACTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTAGATTCGCTGAATTGTATGGCGACA:1 - chr2L 21918333 3' + R1A1-element 465 1 75.25 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTGTTACATGTAATTAATTTCAAATTATTTATACATGAACGCCCAGACAGTGCAAGCTGA:1 + chr2L 19681504 3' - hopper 13 1 66.34 CACCTGTTGTCGCTGTTTANAATTCCCAAATCAAATCGGCATTATAATCAATATTAATTACACAATGTGACAGATGTGATGGAAATAGATACAACA:1 + chr3L 16680236 3' - blood 477 1 62.50 CGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCTCGACAGAATTTCTGGAATGCAAAGAGTCGCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGTG:1 + chrX 21852436 3' - invader4 2835 2 68.32 AATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGC:1 - chrX 4166386 3' - I-element 5328 1 61.39 ACGTGTGAAAAATTAATAAGTCGTTTTTGCTTGTCCTATAATTTTTCCTGTTTTCGCCTTACTTTGCGGTGCTTTCCTCGCTGCTTTCCTCTACTTTGCTT:1 - chr3R 25692424 3' + 1360 432 1 79.21 GAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTT:1 + chr3R 10736119 3' - McClintock 26 2 58.42 TAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAG:1 + chr2L 12866942 3' - mdg1 44 2 69.31 TTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGATACTTCTTCTTCTAAGTATCTTATAAGTACTCAAG:1 + chr2R 15788002 3' - Ivk 5270 1 70.30 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCGGCAGCAGCACTTAATTCTAATTAAAATGCTGCCCC:1 - chr3L 1998819 3' + hopper 1378 1 60.00 CCAAAATGGACGATAAAATCATCCTGAACGACTTTAGCAAAATTGTCATAATTAAATACACTTTGAAAATGGCATTTGTAAGTGCCAACCCACTCGACAGA:1 + chr2R 19515344 3' + mdg3 291 1 77.23 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAGGCAGCACCAAAAAAATAGGTTGAACATATGTGGTGTGTGTGTGTGGAA:1 + chr2R 18766278 3' - hobo 28 1 54.46 TAGTTAAATTCAAAATACAATTTACAAAAGTTTTTGACATTATGCCAAAAAACAGGGAATCTGGCCCAGTGTGCACTGGAAGGAATCGCTGTCTCTCTTTC:1 - chr3R 447130 3' - transib3 52 1 65.35 TATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAGGGGCTTGGCTTTGGCTTCAGCTCATGCACACTGGACACTTG:1 + chr2R 15788671 3' + Transpac 311 1 78.72 TGCGCTCTTTGTTGATTTGTTGGTATAAGAAGGTTCGTTGGGTTTTGGAGGGCCCCCTGTTCCGATGGCAGGTGAACTAGTGTCACAAATATTTGTGTCAA:1 - chrX 17202944 3' - F-element 352 1 62.38 TTCATACATTTACACATCANATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTTCGTGGCTGTCGAATGGTTTTGCGGCCCAGTG:1 + chr2R 19560218 3' + Tirant 360 2 64.65 ACTATGTCTCATATTTCGAGGGGCATAGTTCTGTTACTTTTGATACTTTTGATAAGGCTGCCGGTGCAGGCACTTTGGGGAGGCTCTTAGAGGGTGGGTTT:1 + chr2L 21215371 3' - BS 4971 1 77.23 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGTGTACATTTTCACATATGAATAGTATTTAGTTTTCTCTGC:1 + chr3R 11608016 3' + 1360 3354 1 62.38 GCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATATCTAATATAGAACATATAAAGCTCAGAGGTATTTAAACTTAATCGTAAATATACAAAACGGTTCTTAAATA:1 + chr2L 11478779 3' - opus 113 3 75.25 TGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTTAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCA:1 + chr3R 23947648 3' - Tirant 9 2 67.33 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAA:1 - chr3R 10110431 3' - Doc 42 1 63.37 AAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGATGCGCGAACAGCAAAAATTAGTCATTATGCAAATGTGCAATTC:1 + chr2R 21495773 3' + roo 8730 2 56.44 GATTGATTATCCATTTCAAATTTTATTCTTTTGCGATCTTTTTTTTAAGTTCTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATACTTTTAATCAACTAGCACTCATT:1 - chr3L 27411750 3' + hopper2 1356 2 74.26 AATAAAACAATTAAATTTAATTTTCAATATACATACATACATAGCCCGTCTGCGCGGCAGTTGCAAACAGGAACTCTGGCAAGGGCAAAAAACAACAATGC:1 + chr2R 15043279 3' + TAHRE 63 2 72.28 GTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAGATGTAGTTTCGTTTTATTGATACCCC:1 + chrX 11032234 3' - invader3 42 2 74.73 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAA:1 - chr3R 10087826 3' + roo 9036 1 57.43 TTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTGTGTGTGTGAGTGCTAAAGTTTTTTTTTCCTTCCTTGCTTCAATTTTTTGTGAATTAT:1 + chr2L 7042887 3' - Doc 4441 1 56.44 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGCACTCTCTGTTACTCAGCACACACACCCTGTGA:1 + chr3R 18399240 3' - P-element 42 1 40.59 TTGCCGACGGGACCACCTTNTGTTATTTCATCATGCTTCCCACCGAACAAGTGGGTTTCATTGTCCAACATTCACACGACCAGCAAATCCATCCATCCATA:1 - chr2R 21040835 3' + P-element 2873 1 59.41 TCAACCATCGGCAAACAAGGGGAAAACCCTTCGGCTACAGAACCTAGATATGGCGGCAATTAAGTTTCATCGCAAACTATTTGCCACCGTCGGCTTACCC:1 + chr2R 75852 3' + X-element 469 1 61.00 AACCATAGACCCAAAAATATTAACATACCGCAGGCCTTGACTGCGAGAAATGTCGCAAGAGAGTTTTCGGTGGTGGTTGTCTCCATTTGGGTTTGGGCAAA:1 - chr3R 24368738 3' + baggins 401 1 65.35 TACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGTTTGCCACAGGA:1 + chr3R 13739753 3' + Burdock 235 2 59.00 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGAATAGAGTTTCTGGCTTTGTCGCGTATATTCGTGAATTTATGGCTCCCTCGTCTT:1 + chr3R 13353279 3' - 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chrX 18790056 3' + F-element 405 1 81.00 ACACGTCGGCGATCGAATTGATTAGTCTAGAAATTGATTAGCACTAGATTAGCACTAGAAATTGAGATGGAAATGGAATGGGCA:1 - chr3L 17140591 3' - F-element 10 1 39.29 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATCATTCGTTCTGAACTCCCAGCTATTTTCCGAGTTAGCTAAC:1 - chr3L 7168321 3' - Doc 35 1 56.70 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTCTGTCTGTGTGTTTTCTTCTGACATGTGTAAATTTGATAGGCGGTATAAAAACATGCCGAAAAGCGAAACCCGAGAC:1 - chrX 3587544 3' - accord 7029 2 60.40 TCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTTTAAAAA:2 + chr3L 10474197 3' + copia 212 2 72.28 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCTATTATAGACAGACGCAAACACGTATATTCACACTGTGCATAAATGATTAATGATCTGTGTCCTGGCCG:1 + chr2L 7668610 3' + roo 9064 1 62.38 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTCTTTATATTTCAGTTTGTTTACAGAATGCGTGTCAGCCATAATATTTACTTTTATCCCAATT:1 - chr2R 17644848 3' - mdg3 16 2 57.43 CACACCTATGCTTGCCATAGGTGCCTTGGAATTGAAGCCCGATAACGATAGCTGTGCGACAAAATCGAAAGCATCAGTGTGCCCGTGAGTTTCGCCTCTAG:1 + chr2L 10306888 3' + R1-2 486 1 72.28 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGTGTTTGGCAGACATGGGCAAGGC:1 + chr3R 17053150 3' - hopper 14 1 65.35 GATCCCCCTGAAGTTTAATGCACTGTATAAATGCCAAAATTTTATTGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGCGTTTTGGCCAACCTCAAAATTTTCGCTT:1 - chr3L 21781585 3' - baggins 5359 1 71.29 GAATCGCAAACGGTTGATCNAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGGTAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGAGCAGCGAACACGATCATGGACATCATT:1 + chr2L 12967765 3' + Bica 485 1 71.29 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGAATATAGTCTTATCATCCAGGGCCTTCAGCTCCTCCTCGTC:1 - chrX 4706875 3' - P-element 31 1 36.63 CAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATGGGGCTTCCCTGGGGTCGCCGGGCAATTTAAATACAAACCCCCTTGATATCCCCCCTTCACTACCCCCCTTTGGGCC:1 - chr3R 9206114 3' + R2-element 3585 5 41.58 ATTTTAACAAACAAATTTAAAAAACTTTCAAGTTATAATAGTCAGGGCTGCTCATTAACACAGAAACACCAGCACAGCAAACACACACTTGCAAATATGTA:1 - chr3R 26642411 3' + 1360 3003 1 55.45 GCATTGTGCAAAGTACTCGNGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTA:1 - chrX 21217525 3' + pogo 2080 1 67.65 GAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCCACTGCACCTGGAACCATGGTTCGCCCAACGGCTAA:1 - chr3L 6749121 3' - roo 172 2 69.31 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTTAATCGGTTTATGGTGCACGAGTAATTGAATTTCG:1 - chr3R 5135462 3' + 297 360 2 61.22 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGTTAAGACTGCCACTTCGATGGAGGAAGCGAAAGTAAATGT:1 + chr2R 19840262 3' + roo 9037 1 57.43 ACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTT:1 + chr2L 12882783 3' + hopper 1361 1 75.25 TCCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTATGTATGTCACTGCGTATTGCTGATAAGTTCTAT:1 + chrX 18326267 3' - Doc 189 1 71.29 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCAAAACAAATTAAACTAATAATAGGAAGC:1 + chr3L 7099660 3' + roo 390 2 58.33 TCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATAGCTTAGGATCGAAAGCTAAAGTGATGTACATTTTAGACTGTTCAATTATTAAATAACCTTA:1 - chr2R 6779753 3' + 17.6 7405 2 64.36 CAGCGCATCATGCTAAACCACCTGTTTTCAGTTTCCGCAGCCAAGTCGATCTCATATGACATTTCACCTGCTCACCAGTTCCTGTTGCCGTCAGCCCCCGG:1 - chr3L 14363840 3' + Chimpo 3900 1 73.27 GTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCAC:1 + chr2R 5674730 3' + S-element 1686 1 54.00 ATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGCAGTCGTCGAGAAAAATAGAT:1 - 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F-element 344 1 61.00 AAAAGAAATAATCATGCCAAATGTACTCATTAATTTTATATCCTAATATGGGCCTTCTGGGATGTCCACCGGCCAATGCCCGGCTGCGTCAACACCACCGA:1 - chrX 16842102 3' + transib3 2690 1 52.48 ATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGACGCGGCGCGACGCTTGACGCCGTGCTTGCTTGTATACTGTTAAGTTCTGTTCAATTCAGTTGAAT:1 + chrY 1076850 3' + INE-1 80 1 61.39 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGTTTAATCGCCTCCAACTGGCTACCAGTG:1 + chr3L 11929320 3' - copia 50 2 76.24 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACATAATGAACTGCATATACTTAGGTAACAAACGAATTTTCCTATAATTTTAAATTACGGTTTTAATGTCTATCG:1 - chr3R 19949273 3' + mdg1 7452 2 63.37 AAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAGAAA:1 - chr3R 12329625 3' - hopper 56 1 78.22 TCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCCAAGGCAACATCGTGGGTCTTAAGAGTACCAACGCCGTGATACTGGCCACTGACTCGAAGGAATACGAAATGT:1 - chr2R 23244674 3' + Rt1b 4768 1 73.27 AACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGA:1 - chr2R 6438342 3' + Stalker4 383 1 55.45 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCATCCAAACTCATTATCCGC:1 - chr3R 3847119 3' + P-element 2831 1 23.76 CATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGCGTAGTTTTCCATATGACTGGTCTGGGAATTTTGTGACGTGTGTGCCACTGCTAATGTATATCCT:1 - chr2L 17222590 3' - Porto1 322 1 64.36 TGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGGAGACATCACCATTCTGAAATCCAAACTATGAGCTGCGTTTTGTTTGCCTGTCACAACACGAGGCCCCTGT:1 - chr3L 10043542 3' - G6 1884 1 68.32 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAAATTGATTTTAGTTATTACTACTA:1 - chr2L 3346273 3' - pogo 43 1 77.32 ACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCCCAAAATGTTTCCGTAGAGTTATCCGTCAGGGATTC:1 + chrX 15014160 3' + hobo 133 1 68.32 CCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCGAGTACTATGTGCTAGTGCTAGTGTTTGTACTGAAAAT:1 + chr2L 3696821 3' + mdg3 188 2 62.38 TGTCCGATGATTTGTTTAGNGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGCGCTT:1 + chr2L 12808231 3' - Tirant 33 2 54.46 CGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCCATGCCATTCATTTTATCCACCCATTACTCACTCACCCCACAAATCGAGTTTATGCGATTGGC:1 + chrX 12674564 3' + micropia 5185 1 66.34 CAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCATACCTCATTATCTTCTTGTCATATCAGCTATATCTATA:1 - 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micropia 266 2 64.36 AAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTACCTGCTTTTCCTGCTTTGACGGC:1 - chr3L 6023277 3' + hopper 1391 1 54.17 CAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTG:2 + chr2R 14997910 3' - McClintock 5993 2 73.27 AAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACC:1 - chrX 21667995 3' + Tabor 7315 2 60.67 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCAACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCAGAAGTGCATTGCGAACACCTGCAGTCACTCCTCCGCAGTTGGGCC:1 - chrX 12768241 3' - FB 32 1 53.47 GTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAAGTATTGGCAATCACCATAAATTGTCACAACTGATATCCTAG:1 - chrX 7619521 3' + R2-element 3367 1 59.41 TAACACATCCGAGTTGAACAAAGACTAAGAGAAATGTGCAAAAATATCAACAGTGTAGGGTTGGCAGTTTTGTGCCTTTAAGATTACAGTTTGCATTTTGT:1 - chr3L 13434348 3' + HMS-Beagle 6626 1 74.26 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCCCAGTGGCCACATAAATATGAGCTCGAA:1 - chrX 5467624 3' - 412 7093 2 69.89 ATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCATACAACGCGGCGTATGCGCAATGCCTGTCCACTATTCCGCTGGCCTTGCCCCGTCATAATGAAGCATAATG:1 + chr3R 15950022 3' - P-element 259 1 77.23 AAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATATTTGTCTGTGTGTTGGTGAGAAGCCAGCTGCCACTCAGCG:1 - chr3L 5241120 3' + Ivk 5343 1 62.38 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCAGCTAAAATCACTCAATCAGCTGTTGCCTATCGAT:1 - chr3R 27116728 3' - P-element 23 1 45.88 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGGGATTTCAGTTTCATCATGGCCAGATCGTGTCGCATGGTGTAGTCATTGTAGGCCGCC:1 + chr3L 7542020 3' - roo 18 2 62.38 CAATTACAGAGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAAAATGTTCAATCATATCACCGTGTCCCGAACCCAATTCCACTTGCCCCAGTTG:1 - chr3R 24415194 3' + Q-element 105 2 72.28 AACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACGTCCTTCTTTTCCTTCAAGTGGTTCAGCATGCCCATTTGGATGTC:1 - chr2R 8883790 3' + Doc 492 1 55.45 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTAAGTTATTTCATCATGGCAGCGCTGTAAACAATAAAATCAAATTAATTATGGCCAAAT:1 - chrX 16671066 3' - P-element 33 1 43.75 GGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCAACTTGACAGCAAATTTGGCGCTC:1 + chr2L 10053698 3' - F-element 4496 1 76.24 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGATAAAAG:1 - chr3L 27357558 3' + mdg1 383 2 58.42 CGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGCATAACATTTTGTCCGGAAATGGGCATGGCCTAATCATCTTCGAAGAGGTTTCTGGTTTCGTTAT:1 - chr2L 14220128 3' + springer 371 2 66.34 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTA:1 - chr3L 19349940 3' + 1360 3364 1 54.46 GGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCCAGTGGTTAAAACTCTGCAAATGCTTAATTTATTGAAAAATAAAA:1 - chr3L 9553636 3' + R1A1-element 5014 1 65.35 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTCTTGAC:1 - chr3L 12241827 3' + roo 9028 1 71.29 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATC:1 - chr2R 17963250 3' - blood 7062 2 79.21 CGGGACCACCTTATGTTATNTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCAGAGAGAGCGGGTGGTTGGGTTGCCGTTGGTCAGGGGAG:1 - chr3L 16891074 3' + P-element 2880 2 68.75 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAGGCAGCACCAAAAAAATAGGTTGAACATATGTG:1 + chr2R 18766262 3' - hobo 44 1 70.30 TTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTATTTCAGCTTAACTCTAG:1 - chr3L 15125889 3' - Juan 3774 1 58.42 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCCAGGTGGCTGATTCTCTAGGGGGATTC:1 - chrX 19034090 3' - hopper 7 2 69.70 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATGGAAAAGTTTTAAGGCAGGAGAAAAACAGGGAGGAGGAGGGGTTATGTACCATCCTTGCCAGATTGACA:1 + chr3R 8765635 3' - roo 8670 2 71.29 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCGAT:1 + chr3L 25345156 3' - Doc 41 1 58.42 TCTCTCTCTCTCTCTCTTACTCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCAATCGCTTTATATCATTTGCGATTTATTGAA:1 - chrX 8323864 3' + blood 7181 2 69.62 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTTTATTTTTATTATTATTAATCTTTTTCCTATTGGTTTTATTATTATTTTTATTATTATTGTATTATTATTATTT:1 - chr3R 17452834 3' - mdg1 7068 2 72.28 AATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACCAGTACACTTGAATAAGCCGACTAGTATATTGCTTCGACCGCAATCCTTTCAAAATGGATCCTTCTTTA:1 - chr2R 10353246 3' + blood 371 2 36.63 GGGTTCTGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATTCCTCAAGGAGGCGGAGGGTGCGACTAACGAAGCGCAACAATTTCGTCGTTCGTGGGCCG:1 + chr3L 3981581 3' - baggins 5312 1 66.34 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAAATTTTCGTACCAAAGTGCCACAAATAATTTAGCACTCG:1 - chr2L 6362846 3' - 412 7087 2 59.41 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCTACTGTGGCATGCCCCGCCCCCTTTATAATTTTT:1 - chr3L 19861788 3' + 1360 3347 1 69.31 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAATAATCGTTTATAAATGATAAATTAATATGGGAAAC:1 - chr3L 7099592 3' - roo 41 2 74.26 AGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTAC:2 + chr3R 1977614 3' + micropia 418 2 60.40 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGTTT:1 + chr2R 672817 3' - F-element 58 1 73.27 AGTTAAATATTTTTTATTTTTTTTATATTAAGTCCTTCTAAAACTATTTTAAGCATAAGCTTTCGCTATTATTTTGACCGCGAGTGTACGCACAGATGCGC:1 - chrX 14153687 3' - McClintock 6367 2 67.33 CAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCCAACTCCTATTCCTACCAGC:1 + chr2L 197333 3' + F-element 304 1 77.32 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGGCAATAAGTAAGAAATAAATGAAACCTCAAATAAATGGCAATTCATTTAAAAT:1 + chr2R 11941083 3' - 297 16 2 66.34 AATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACACACACGCACACACATGCACTGCTTAGATAATAAGTTATTTAGCGTAAAAAGAAAATGA:1 - chr3R 8485871 3' + Doc 212 1 62.00 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGAAACACACTCACACACACACACACACAC:1 + chr2L 768921 3' - hobo 48 1 74.26 ATTAGTTCGACTCATAAATNAAACAACAATTTTACTATATACACATTCATGTGTACATAGCTACCCAATTTACCCCCAGCTCGACAATTACGGCAAAATGA:1 - chr2L 3978414 3' + 297 6960 2 65.35 AAAGGTGGCCTGACGGCTGNACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATTTTTAGTTGAGCTCTAG:1 - chrX 7157289 3' + blood 7334 1 81.00 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTC:1 + chr2L 20328767 3' + opus 483 2 60.81 TACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATAACGGGTCGGTTTGGTTTCGTTTAATCGCCTCGCCGCGTCCGCTACGTGCTCCAAACTCC:1 - chrX 19464390 3' - Quasimodo 431 2 64.36 AACAAAAATAACTCCTACCTTTCATTCACCAGACACACACCCATACACACACAAGACATGAAGGTTCACCGAATATCTGGAATTTGGGGGCTTTCTTTTGT:1 - chr3L 16159587 3' + Porto1 262 1 72.28 GGCAAAAAGGTCACAAAACAACCAAGCAGCACAATCAGAGTCAGCAGCATCATCCCGATCTCAGCTACACCACGGACTACTCCTCCAGCAGTCCGGCTCCG:1 + chr3L 1594767 3' + S2 1281 1 74.26 GATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCGCGCTACTATCGTGCTCCCGAGATCATACTGGGCCTGCCCTTCTGTGAGGCGATCGATATGTGG:1 + chr3L 570475 3' - R1A1-element 4981 1 67.33 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTCTTATTCTAGTGTCTTTGGTTACACGATAGGGCTTTTTATCCCGT:1 - chr2R 3877803 3' + 1360 3336 1 79.21 GTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTGTATCGCTTGTGCATTGTATATATTTACATTCCTCTAAATATATAGCTTCTTGCGCATTT:1 - chr2L 12242335 3' - F-element 4459 1 71.29 GCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAAT:2 - chrX 7292690 3' - 3S18 52 2 72.28 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAAACTGTTGCGCTTGAAACCGGCCGCTACGCCTGCGCACGCGTCTGCCGTTGCGACGAGCA:1 - chrX 1135289 3' + P-element 2872 1 64.36 AGACCACTTTGCACGAAAACACAAGATCAAAACCAATATGAAGGGCCTAGGGTTTTTTTTTTAAAGAGGCGATTAGCATGTCGTTTGAATCTATTTTCATT:1 - chr2R 6546634 3' - Cr1a 399 1 66.34 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAATCAATTTATGAGCGGCCTGC:1 - chr3R 7469956 3' - Doc 41 1 57.43 CCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCAATTGAGTTTGGTGACTTTTTTGTCTTTTGAATAAG:1 - chr3L 18335273 3' - Bica 488 1 64.36 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACTCGACTCGAATCGCCGCCGCTTGTTATTCTGGATTTCCCCCCCGTCCTGACCAAATGAAATCGAACCGG:1 - chr3R 10488649 3' - roo 8670 2 73.27 ACCACCTTATGTTATTTCANCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAAACTCTGGCCTTATATGCAGAGCCAACTCTCAACTTTGGTCGAGACATCATCA:1 + chr2R 21040947 3' + P-element 2884 2 75.25 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGGTTTAGAATACGAATATTATTAACTATTCGATATCTAACATGCATATTTGACTCAAATGGAAGTAAC:1 + chr2R 21351404 3' - mdg1 10 2 69.31 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTTCGATATTCATTGCTAATCCTTACATGTAGTTGATTCGGCACTTGTAAGCTAAGACGAAAAATT:2 + chr2L 9260423 3' + 297 389 2 72.28 ATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGAAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGGTATGTGTAAAAAAAGCAATATCATT:1 + chrX 4319508 3' + Bica 17 1 72.00 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAATATTCCTAAACTAACTTTGTGTTTTGATTTTGTCATTTTTAGGTAAGT:1 - chr3L 13772993 3' - pogo 23 1 56.44 CCCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGTTCATAG:1 + chr3R 25370531 3' + BS 5049 1 66.34 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTT:1 - chrX 14317410 3' - 1360 66 1 76.24 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAATACCTTCTAAACTTATGAACTTTGAGAACA:1 + chrX 8316367 3' - hobo 45 1 71.29 TCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGC:1 - chr2R 19560170 3' - Tirant 8154 2 70.30 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCGA:1 - chr3R 29608772 3' + roo 9046 1 57.43 GTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATCTGGGGATCTCCAGGCTTGTTTGCACTTTGGCAGCCGCTCACACAAGGACTAAC:1 - chr2R 8311286 3' - opus 19 2 60.40 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTGTAGGCTGTCATGTTAACATGGGAGAAAGCTTTCTCCGCTGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGTGCGCCTGA:1 - chr3L 14594086 3' + hobo 2934 1 72.28 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTACCCCTTTCACCGCAGAACGAAACCAGCGAGGATGAGGTGCCCCCCATCG:1 + chrX 17858064 3' + P-element 2862 1 50.00 TAATAAAAATAATAATAATAATGTTGCAAAGGAAAATTTATGAAGGAATTAAGCGAAGGCTACCAAGTTAGACATTTGCCGGTTGGGCAATATTTGTTTTG:1 - chr3R 10522022 3' + mdg1 7068 2 70.30 CCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCGTTCTGACAACATGTCAACAGCAGTTTGATGAGTATAGTGTGATCTAATAATTAAATGACGAACTTTGACTAC:1 + chrX 4393181 3' - invader2 4670 1 76.24 CAGCCTTTAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCTATCTGCGCTGTATGTATATCCTATTTCAGTTTGCCATGCATACTTGCAATCTCTGATGCCACAATG:1 - chr2R 10014764 3' - flea 4762 1 77.00 ATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAACTAAACACTTATCAATAGCGGCACTACTCAAAA:1 + chr3R 27928969 3' - mdg1 45 2 67.33 ATCAAACGTCCTCGTGTGCTAGTAATCCCTTTATAACGATCAGCGTTATTAATTCATTAAGTTATTCTCAACTTATTCCTCAATAAAATCTCCTTCACTAC:1 + chr3L 27397835 3' - invader1 3573 1 67.33 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGTGTTTCCACTGTATTTGCTTTACTGTTGTTGTAATTAGTTTT:1 + chrX 19308229 3' + P-element 2881 2 61.33 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 11967085 3' + copia 237 1 63.77 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAGTCAGCTCGCAGCGTTAGTTT:1 + chr3R 7626450 3' - hobo 30 1 55.45 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATACCTTTTCTCACCACACAACTGAGTGA:1 - chr3L 14589095 3' - hobo 41 1 48.51 TATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGAGCGAGTGTGTTTGTGTGTATCTTCTGCCGAGATATTGTTTATGCAAGAAGCTCTGCCGGATGTGCCCCCATATGGC:1 + chr3L 9185211 3' - accord 7030 4 55.45 TGCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCTTGTGTGGCGCTCAGTGGGTGGCAGTTGCGTTTAGTGTGTGGTGGTCTTAGCGG:1 - chr2R 22279278 3' - accord 7032 2 79.21 CGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAAAAGAGGAAAAGGACTCAAGACAGCGATA:1 - chr2L 11863647 3' - micropia 194 2 82.18 GACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGAGGGTCCCTCCACTGGCTGGCTGCACATGGTGATTGAATTTAAAATGGACAGCGGCGAAAAAGGGCA:1 + chr2R 24278100 3' + 412 482 2 65.35 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACGAAACCAAAGCAAACCAAACCGAGCCAAACGAAACGTTGGAAAAACTTTTGGCGCCCCGGCA:1 + chr3L 17186894 3' - Tirant 9 2 71.13 AATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATTACCCCTTTCTCTCAGTGTACGGCTAAAATTTCCAG:1 - chr3R 22869363 3' + Bari1 1690 1 60.40 GGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAATCACTGTGTCTAAGTTAGCGCACCTGAAACTGCATA:1 - chr3L 15452840 3' - accord 6 2 69.31 CCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCAACTGTCCACGGGTGTGAAGCTTTTAGCGGAATTGTCTGCGGCATGAGTGTGTGTGTGTGCAATGTGCAC:1 + chr3R 28440580 3' - hobo 185 1 78.22 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTTTTCATACGGCTGCAATTTTAATATTTCTGC:1 + chr2L 23350505 3' - F-element 55 1 70.30 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAAATTGCTCAGCAGCCAAATAATCTACTCTCTGCATAAAATTTCT:1 - chr2L 7778814 3' + roo 9045 1 57.00 GATTCATTTACATAAGATANGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTG:1 - chrX 19334606 3' - roo 53 2 78.22 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGCTGTTAAG:1 + chr2L 18248058 3' - blood 27 2 56.44 GAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTTCTGTCAGCGGCAGCAATTGTGCCTCTTATGCCACCCATCCCCAACACCCACT:1 + chr2R 6918656 3' - accord 20 2 59.41 TATCTGTAATCTTGACTCTTTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTCTAACTTTTTATACCCGTTACAGGGTAAAAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGATAAAA:1 + chr3R 14437796 3' + Cr1a 4228 1 49.50 GATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTCCTCGCATTTCTAAAGTTTTATATTTGCTTAAACAATT:1 - chr2L 19642304 3' + Quasimodo 7336 2 61.39 TCACACGTCGGCGATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGTTTTTTTTTGGGATTATGATTTTTATTCACATTGTGATTAATTTTTACA:1 + chr2L 11889380 3' - F-element 12 1 55.45 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTC:1 - chr3R 25021689 3' + roo 9028 1 71.29 CCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAAAAATGGGCAAAAATGAAAGTCATTACACGGTGACAAAATAGGTGTACCAATTCACGTTTTTAATGTGCTGT:1 + chr3L 12128940 3' + G2 136 1 72.28 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATCTGGATAGATAAAACGCGGGGGAAAGGG:1 + chr2L 20612013 3' - 297 6615 2 77.23 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAACTAAACACTTATCAATAGCGGCACTACTCAAAAACATACACGACTTTCCATAT:1 + chr3R 27928989 3' - mdg1 25 2 54.46 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTAAAATGATTACTAAATTGATATCAGATTGGCAGATAAT:1 + chr3R 19949360 3' - mdg1 7077 2 64.36 ATGTCTCTTGCCGACGGGANCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCGCACAACGGGCAGGTGTGCGAGCGAGAGGGTGCGGACGTGAGAGAGGGCGGGTGC:1 - chrX 4707828 3' + P-element 2866 1 58.42 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCTTCATCTCTTG:1 - chr3R 27495647 3' + 412 7514 2 53.47 TTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAGGGACTGCAGGACTACAGGACTGCA:1 - chr2R 23516951 3' + invader3 258 2 56.44 TAGAATATAAAATAAAATAATATTTCCTTAATTTTTTTGATTTTTTCCCAAAACTAAAGACACCAAATCTAATGTATTTCCTTGCGAGACCTTTGATT:1 - chr3L 10295021 3' - transib1 1901 1 84.69 ACAAAAAAAAAGAAAAAATAAAACAAAACAAAGCTGCAAAAAATCGACAGAACAAACAAAACAAAAAAGCGAATGGCAAATGGCAAATACCGAGCTCTCT:1 + chr2L 2096268 3' + gypsy7 5005 1 68.00 CGGACGATCGGTCGTAGCCNTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAATTACGGTGCA:1 - chr2L 23390356 3' - gypsy6 22 2 56.47 TTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGCCCATTTCCATTTTGCCCCAAACTTGCTTAATTGGTTCTGCTTTCGATACAGGCAGCACAC:1 - chr3R 13331396 3' + transib2 2810 1 65.35 ACCAACATCCAAGAAGAAATTGCCATCATAACACTTTACAATTATCACATTCACACAGATAATCCACACACAGACTACAACATCTACAACAAATACCATTC:1 - chr4 1081165 3' + mariner2 665 1 74.26 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAAACTATTCGGCCAAATTTTAAAACA:2 - chr2L 16139102 3' + copia 233 1 57.43 AAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATT:2 - chr3R 22869398 3' + Bari1 1660 1 70.30 AATAAATTAAAAAATTAATTAAATCTTTCTAAAAAATCGTTCTATAACCTTTTTTGAAATCAAAAAAGTACTGATCCTCGCTTTTCCGCGTTCCAACTGCT:1 + chr3L 15125983 3' + HeT-A 12 1 80.20 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAAAGCGAACCG:1 - chr3L 6834957 3' - hopper 38 1 58.42 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAACGTTTTATGGAG:1 - chr3R 12063745 3' + 412 7509 2 64.36 GACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGATCTCGGGTTTGTTGCACGACGAGACAGTTGCTAAACCCCCGCA:1 + chr3R 10391280 3' + invader4 328 1 79.21 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGTAGTTACAAAATACATTTAATACAAGTTTTA:1 + chr3R 25581089 3' + pogo 2059 1 65.35 TTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCATTGGCTAATCAACTCTAACCTAAAAAAAAAAACTTAGGGAGAACAGACAGTATT:1 - chr3L 25255899 3' + Burdock 316 1 76.24 AATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCTGCGCAATGGCTACATAAACCTGAA:1 + chr3R 15707561 3' + Doc 4429 1 75.25 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCAT:1 - chr3R 7869118 3' - 297 6612 2 57.00 AGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTGGTGGGGGTGGTGGATGGCTGGATGGGTTGTTAGCGGAACAAAGCTGCA:1 - chr2L 15213103 3' - 17.6 226 2 57.43 TATGTCCACATGACTCTCTTAGACAGCGGCGCTCTCGCTGCCAAAGTTAAGTCATAAGAGGATAAATCAGAAGTGTGGGTTTCGAATAGCTGGCGAATAGC:1 - chr3L 6767847 3' + Tabor 207 2 58.42 CGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGAAGTCCAATGCCGGAGGAGCACTTGGTAGCGTGGGATTAG:1 + chr3L 6754426 3' + R1A1-element 5085 1 60.40 GAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGCGACAAGATATTTTTGTACCACCGAGACATATCGATATATTCGATATGAAAATGCGAGACCCTAAATCAAG:1 + chr2L 3029207 3' + invader1 3723 2 71.29 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGTGTGTTTTTTTGTTCGGCCAACTTCAATG:1 + chrX 19334640 3' + roo 9026 1 72.28 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGCTTTATATATACCGCTCACCGGCTAATCTTCAATTATTTTATC:1 - chrX 19196242 3' - pogo 29 1 59.41 TCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAAGCTTACAGCAGCCAAACAGCTG:1 - chrX 2839137 3' + Doc 459 1 78.22 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTAAACTTCACATTAAAACCTTTTCA:1 - chr2L 9045400 3' + jockey 4979 1 61.39 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAA:1 - chr3L 25272564 3' - 1360 79 1 66.34 CTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATGTTACGCAGGTACAGTGAGCAAAGGACATTAGAATTCTGTACAGAAAACAAAAGTATTTAGAAAAAATGACATAA:1 - chr2L 7937213 3' - jockey 4522 1 70.30 GCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGCTCAACAGAAGAAAGCCAGAGCAGTTGCATTATCACTGCTTGAA:1 - chrX 19166393 3' - R1A1-element 252 1 56.44 GTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGCTCTGACTGGCAACTTTGCCAGACTATTT:1 + chr2R 14997954 3' - McClintock 5951 1 79.21 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTTGAT:1 - chrX 17029986 3' + flea 236 2 54.46 AAAAACTCAACGAGTAAAGNCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAAATTGTGCACA:1 - chr3R 10087810 3' + roo 389 2 59.41 TACATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGATGATGGAAAAGCGAAAGCTTAACAAAACCAGCGACGCGAACGACGTAAGTAGCTTCTTGCTTAAGCCGCAGTTC:1 - chr2R 17010857 3' + 297 268 2 80.20 CCTCTAGACCTTCTTAGAAAACCCAATCCAGATAATATACAAAAACTCATTCTTTTCCTAAAAAAAAAAACAAGTGAATTTATCGATACTACTTTTTAAA:1 - chr3L 17813800 3' + I-element 5106 1 70.00 GAGCGGTCTATCACCCATAACTCGACAAGTTTACCATTGCCAATAACTCATAGGGGAATGATAGTCAATAAATAATTCATATATTTTGCTAAAACTGCACA:1 - chr3L 6592108 3' + Doc2-element 396 1 62.38 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGTTACATTTTCCTGCCTAATTGGTGT:1 + chr3R 1292537 3' + opus 452 2 77.23 TGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGGCCATGCATGAACCAAATTGATTCACTTAACGCTACACGCCATTATTCTGCCAATGT:1 + chr3L 6657415 3' - hopper 122 1 58.42 CAAAAAATAAAAAAAAAAACAAATCACAATTAATAAACTATGTATGAAAACTAGTTAAACAAAAAAACAGTGTGCAGTTTTCGTTTGTTAGATAAACATT:1 + chrX 3708581 3' + gypsy7 5009 7 89.00 CTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGCATGAGAAATATTTTATAGCCTTTTAAGTTGAAGTTGTTAACCCTAAAAACGTTATGTTTGCTGGA:1 + chr3L 6248387 3' + pogo 1932 1 70.30 GGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAATGTGACAAATTAAATGCCAAAACATCAAAAGGCAAACACAGCACGTGTGTTCAG:1 - chrX 9918663 3' + jockey 4700 1 57.00 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAATCACAATTTAAT:1 - chr3L 9928524 3' + roo 387 2 54.46 CAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATA:1 + chr3R 14860187 3' - BS 5049 1 78.22 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGTTCTCTGATTCGTATGTCACTGTGCTCTGCAAGGGTGTG:1 + chr3L 8268199 3' + hobo 2900 1 66.30 TATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATGGTTGGTACGACAGTA:1 - chr2L 14793479 3' - Stalker2 20 2 59.41 TATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTTGTTTACACATTTCGGAGCAGGACATAAGAGGCATGACAAAACACACGAGACAAGCAAACAAAGCACGCC:1 + chr3R 6136989 3' + Doc 81 1 74.26 ATTAAATTTAATGAGTACTAGATAGCTACAGGGTTTTGCATTGGTTGCAATATTTTCCTGGAATTCAGAATGCTAAGAATATAGGTAGTAAGCATTGTGAA:1 - chr2L 22975447 3' - Ivk 5330 1 71.29 TATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTCAATTTGATGAAACTAGTAGTCACTGCATAGAATTCCATAACACACATTAGTTTTTATG:1 + chr3R 31022021 3' + Ivk 5361 1 63.37 CCGCGACTTCTGTGAACACNTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCCTGCCAGCGCGCTGGCGAAAGTGATGGTCCTTGTGTTGCATACTT:1 + chr2L 10166058 3' - jockey 36 1 50.50 GTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGACAGTTGGTAG:2 + chr2L 15531860 3' - Stalker2 34 2 59.41 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCATTTTCGGTGTGAATCATTTAATATGAT:1 + chr3R 17971702 3' - 412 7100 2 71.29 GGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTAAGCATCTGAGCGGCCTAA:1 - chr2R 10372136 3' - mdg3 56 2 78.22 GAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACATGCCCCAGTTGATAAACAAACTTCAAACTCCAATCTCAGCACCGTCT:1 + chrX 21932993 3' + Stalker2 376 2 51.02 GGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGTTATGAAGTTAAAAAGTAAAGAAGCGAACACGAAACTTGTTCATACAACAACACTGACGTCATCCCAGC:1 + chr3R 9704551 3' + invader3 5371 2 71.29 ACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCATTGGTGCCACGCCTAC:1 - chrX 21667977 3' + Tabor 7321 2 69.31 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTAGATGTATTTGATTCTGGCCTAAAATCCCAATGGCCAG:1 + chr2L 19678178 3' - flea 32 2 64.36 AGCTGGACGGCATTCAACCTTTAGTTTTTTTGGGAAATGCATAAATTTCTTGCTAAAGGATCTCTGAAACTGAAACCCAACCATAGAGGCACAAAGCTTGA:1 + chr3L 16977625 3' - Bari2 729 1 79.21 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATCGCCGTACTTAAATCACTTTC:1 - chr2R 22051458 3' - Tabor 6866 2 50.50 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGATTTTATAGC:1 + chr2R 22051519 3' + Tabor 7279 2 67.33 TACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTCGCAAGTAGATGCCCCCAACGG:1 + chr2R 6779859 3' - 17.6 6940 1 68.00 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAGAGCGAGTGAGATTTAAGCCCGAACAATAGATGA:1 + chr3L 2176408 3' + roo 406 1 76.24 TATGTCCAGAGAAACATCAGACGAGTTCAATATTTAAGTTTTTAGAAATTCATTTTTTTTAATTCATGGTGCTGACTCGTAATTAATAACAATATTTATAA:1 - chr2R 4774809 3' - Gypsy12A_LTR 1889 1 76.24 AGAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACTTTCGAAGATCTTATTCTTTTTGCTGTGCACCAATGTAAAAAAGGCTGCGAAAAGTTCTTCAATGAAGG:1 - chr3L 4565446 3' + copia 248 1 70.30 ATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTTTGCCAAAATAAACATAATCAAGCCTCTTTCGGGCCACCATAGATCCCCGGTGT:1 - chr2R 6130589 3' - 17.6 7374 2 67.33 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAACTGGATTATTTATATGAAAAAATCTATTTACCCAACATAAGAATAGTTCCGAAGACTTTCAT:1 - chr3L 20758916 3' + flea 246 2 71.29 TCAGCATTGACCACAGCTGNAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTTGAATTGCGACCAGAGATTTGAGATTTGAGCGTGTGCAAA:1 - chr2L 10898396 3' - jockey 4704 1 57.00 TGTGTGTGTGTAAGTATATNTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTAATTAAGAGATATTAATTCATGTGAACCAAAACCATTTAG:1 + chrX 7036734 3' - Quasimodo 28 2 60.00 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGT:1 - chr3R 8765551 3' + roo 9038 1 66.30 GTATAATGGCGACTGAACCGTGTCGGGACAAAACTTTGCAGAAAACTATGTACTCTTTCCGGGAGACCATAGAGCTGTAAAAGTACTTTTTGTTTTTTTTT:1 + chr3R 14846741 3' - mariner2 116 1 70.30 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAGTGTGTTTATGCGTTGG:2 + chr2L 7666172 3' + roo 9039 1 58.42 TTAGCGTCCAGGTTATGAGAGGCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCAGTACAGAGCATGGCAATGGTAATCGGTGTATGGCCGATGTTGAAAGGATTGTG:1 - chrX 10154757 3' + R2-element 3272 1 58.42 ATGATGAATTCGCATATTTAGTAAAGAAAGTACAGTTCTCCGGTTTTTAGATAAGTGCTATTTACAGAACTCACATGCTGGGGTCACTAGATTGCCAGACG:1 - chr2R 1954538 3' - mdg1 7200 2 60.40 ACCAAAGACACTAGAATAATAATATTCTAGGGTCTTTGCTCGCACCGTAAAAGCCGTGTGCAAAGAGCGCCTTGAAATGTAACAACAAAAAGTCAAGCTTA:1 + chr3R 30387121 3' - Tc3 312 1 56.44 GGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATA:1 - chr3R 23020820 3' + INE-1 572 1 55.45 AACCTTCAAGTGGAAAATAAGTTAAAGTTTCGAGTTTGGTTTTCCCAATCGGCTTCTCACACACATAACAGCGGCCCAAGCCAAAAAGTTCAAGATGAAGA:1 + chr3R 10648614 3' + 297 454 1 57.43 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATCCATTAATAGTTAATTAATAAATT:1 + chrX 21060353 3' - 412 7107 2 77.23 CTTAATATTATTATAGATAGTAATATCTATTCATGGTGTAGTATAGTGTATTCATTCATATAGTAGTATTCATAATATTTTCCCTCAGTGCACAACAGTAA:1 + chr2L 3588601 3' + Tc3 279 1 72.28 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACG:1 - chr2R 15788560 3' - Transpac 4930 2 67.37 CAATCAGTAGAGTCTGAAGNATTTTTATCAGGTTCAAATTCGCAAAATAGAACAACATACATATCTTAGGAACAACACAAAATGGCAAAGTCCTAATGTCA:1 + chrX 8617958 3' + hopper 238 1 63.37 GTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTCCCTCTAATCGATGGTAGCTTAATTTAATAGTCCATGAAGTAGCCGACAAACGGTAGCCA:1 - chr3R 29559876 3' - Tirant 490 1 63.37 TATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACTTGTAATGTATTCTGCTTTTGGTAAT:1 + chr3L 25059175 3' + mdg1 420 2 79.21 CGGGGGCTCCTTGGTACATGAGAACATGAGAACAAGAGACATAGTTTTCATAAATTTTAGTTTCCCAAACATTTTTGTTTTGCAAATATTTTATCATCACT:1 - chr3R 18518076 3' + jockey 4560 1 60.40 AATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGCCGCTGCTTTTGCTCCTCTGCTGCGTGGCACAAAAACCCGTTTTTTGATGCCTGCTCTAAAAA:1 + chr3R 11017886 3' + McClintock 5988 2 70.30 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTGTATGGGCCAACTAACGCTACCTTTACCGACTGCGGTCAGTGGGTTGGCAAA:1 - chr3L 13785357 3' - pogo 19 1 58.42 GTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAAAGAATCGAGTCCGGGTGCTCCGCTACGCATTCACCGTGTGTTCCTTAA:1 + chrX 23068467 3' - G2 2908 1 54.46 GCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATAAATCCCCATAACTTGCCACGAAAATATATGAAAATATTATATAAATCTTACAGGCAGCC:1 + chr3L 10587827 3' + R1A1-element 5316 1 65.35 CTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATGTTATATTTATGATCTCTAAATATTAAGCAATAAAGTTGTATAGCTGTCGAAAAGCT:1 - chr3L 7953092 3' + Idefix 86 2 60.61 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATC:1 - chr3R 10087842 3' + roo 356 2 73.27 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCACCTCACATCACCCACATCCA:1 - chr3R 13739675 3' - Burdock 6150 2 56.25 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAGCAATGGCTAAATAGTTTTGCATTCGATAACAAAAGCCGCTCCTCC:1 + chr3L 12438072 3' - I-element 33 1 58.42 CCGCGACTATCAGATACCCGTTACTCGTAAAGCAAAAGGGTATACTATTATAGATTCGTTGAAAAGTATGTGTCAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATA:1 - chr3R 4947766 3' - INE-1 553 1 83.17 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCCCACCGAACAAGTGGGTTTCATTGTCCAACATTCACACGACCAGCAAATCCATCCA:1 - chr2R 21040841 3' + P-element 2867 1 53.47 TTATTTAATTATCTAGCTAATTTTTTTAAAAAATCGTATCATAATCATATCATCTCGGTTTTAAGTCCTGGCTAAACCGCTTAGGCACCTGTCCAGATG:1 - chr2L 5284389 3' - HeT-A 24 1 47.47 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTGAATGGCAAATGTTTTCCCTTAACACAATTTATGGTCCAAATATTCTTTATAGCTTTGACCTATACTTG:1 - chr2R 12525564 3' - mdg1 7045 2 49.50 TCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGAAGTGTGTGTATGTGTTTATTTAAATGGGGTTTCGACTGGACAAGTGTGGGGGACGGAGGACTCCTTCAGCA:1 - chr3R 25160378 3' - Idefix 99 2 75.25 TGTTCAGGCGTCGGAGGGAAATAGGGTTCAAATGTAAACAAACGAACTAAAAAGTTATATACATTTACAATAAGATACAAATAAGAAAGTGATAATCATAG:1 + chr3R 12837176 3' - G5A 2668 1 69.31 TGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTGCTTACTCTTCCTTTTATGCGGAGCGGATGCGGTTCTGTATTGTTAAGTGGCACCGTTGTTTGGATCGTGGATC:1 + chr3R 1848507 3' + Cr1a 192 1 63.54 TAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTA:2 + chr3L 8039391 3' + hopper2 1556 1 76.24 ATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTGGCTGAGATCAAACTTCGTCTTGTTAAAGTT:1 - chr3L 3596643 3' + copia 255 1 74.26 GTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTATATAACATGAATACATTTTCATTCGCCTTATTTCTGCATAT:1 - chr2L 13422249 3' - F-element 4351 1 58.42 ATGTAACAGGCACAAGGAAGCGTTTCCGCGCATATTAAGTATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGTCGAGTCGAACAAAGACCTTGGGAAAATGGAGAA:1 - chr2L 20922745 3' + INE-1 30 1 75.25 TCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATGAATTTGTATTCAACATTTTGATAAATGTCCTAACATTGGGACGCCGAGCACAAGCTCAGC:1 + chr2L 14793578 3' + Stalker2 389 2 64.36 TCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATCGCCGTACTTAAATCAC:1 - chr2R 22051462 3' - Tabor 31 2 52.48 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATAAAGGCTTCGTGGGGCGTCTACTCGATTATTAGCCCCGATGCCTTGTGGTTATAAATTCAAA:1 - chr2L 20567805 3' - 297 6597 2 60.40 TTCTTATTATTTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGTTTCATCGATTTCATCGTGGAGCCCAGCATGGGCG:1 - chr2L 11817665 3' - invader4 422 1 65.00 GGAGGGAAACATTATCGTAAGGGGAGTACATCGAATGTACTTGGCGAGGAATGAGTTAGATTTGGCTGAAAGCCATAAGGAATCGGTGGGGAAATTCTGCT:1 + chr3L 21775864 3' - G2 3000 1 59.41 CTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGGCGTCATAAAGAACACAATGACGCCGAAATTAGGTGGAAACAAA:1 - chr3R 8701394 3' - R2-element 3333 1 56.44 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTTGCAGCACAATGAGCAACAGTCAACACAAGA:2 + chr3R 23338356 3' + roo 396 1 64.36 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCGCACAACGGGCAGGTGTGCGAGCGAGAGGGTGCGGACGTGAGAGAGGGCGG:1 - chrX 4707832 3' + P-element 2864 1 55.56 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTCTTTAGAGTGTTATCATTTGTGTCTTGTGTCTTGTGCTGCATGCCACTGTCGTCATTCAATGTTGTCAAAAATT:1 + chr3L 17701627 3' + roo 408 1 68.32 AAAAGAAAAACAAAAAAATTATGTTCGATATCAATTTCGCGTGGACACATGCCAAGAGACACGCAACGCCACCAAAAACCGAATAATGATTATGCATATCA:1 - chrX 5018622 3' - Tc3 86 1 75.25 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATGAATATATGAGCTAAGTAGTTTTTTTGGACTCCATTCCCTACTTTGAAAGCAAAAACTATCACCTTGGATGG:1 - chrX 22734015 3' - copia 4873 2 57.43 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTAAACAAAAATTTGCGTACAGTCAAGTAAACAATTAACAATTAGAAGTGATTTTCTTTAAGCTTTGGCG:1 - chrX 15800868 3' + roo 403 1 73.27 AGGCATCACAACTATTCAGTAGGTGTGTGTGTGGGAACATAAAGAAATACGCGGTACTACTGGTAAGTTGTCTAATGGCAATTGGCCATTTGCCGCATTCA:1 - chrX 9205471 3' + diver 228 1 78.22 TTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTATTTCAGCTTAACTCTAGAT:1 - chr3L 15125887 3' - Juan 3771 1 56.00 ATAATAATAATAATAACAACAACAAGCGGGGCGGTGGACCCTCAGCTTTGATTATGTGCAGTTTGTTGCCAATGGGCACGGATACGGCTGG:1 + chr2R 14864045 3' + mdg1 7058 4 67.03 CCAGCATCCGAAGTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr3R 846555 3' - Chouto 51 1 78.00 TCGACCCGTGCCGAGAGCATGCCACGCTGGGGTCCGGGAAAAAAAAAAATTTCAAAATCAAATAATAATAACCTAATAAACCTAATATTTAGCGACCGCAA:1 - chr2L 23076602 3' + baggins 231 1 60.40 CAAAAAACAAATGAAATTCNTGAAGCTGTGGCGCATACAAGTAAGGAGAGGGAAATATTTAAATCGAAGTTGGTGCGGTTTCGAACTTCTTAAATCATTCG:1 + chr3R 19733845 3' + pogo 478 1 70.30 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGTGATTTTGACCAAGGAGGGATGGCAATTTATCACT:1 - chr3R 12321390 3' - jockey 4692 1 54.46 AGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTGTAATTTTTTATTTTAATTCTATTCTTTTGGAGCAATTTGGTTTTT:1 - chrX 3724523 3' - P-element 2742 1 46.53 AGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTCATCATTCGAACATATCCGCTAAAAAGATTGCAAACTATTTGGGAACTGACCAACATTGGTTTTGTGTGCAGGTGAT:1 + chrX 3445076 3' - BS3 1425 1 74.26 CCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGTATGTAGCATATCCCCTTCCGTTTTTTGGTTTCGTGGTTTGCCAGTTTAAATGGAAA:1 - chr2R 19102139 3' - opus 13 2 66.34 GTCCGAGGATCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCC:1 - chr3L 17181468 3' - jockey 4713 1 64.00 TTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCATCTCTAAAATCAAAATGATTTACTTTTATAATTTTTTTTTGTGGCTCCCTTGAATGATGGC:2 + chr3R 10914194 3' - F-element 90 1 58.42 GTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGCATATTGAAAAGCCTTCGAAACACGATATTAGCGTGAATAATTATTCATATTCATTATGGCCATT:1 + chr2L 14220236 3' - springer 7150 2 66.34 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTGAATGGCAAATGTTTTCCCTTAACACAATTTATGGTCCAAATATTCTTTATAGCTTTGAC:2 - chr2R 12525573 3' - mdg1 16 2 41.58 CCTTCAACTTAAAACGGACNTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCGCGTAACAAGTGTCACG:1 + chrX 9413875 3' + 412 7519 2 51.49 TTTACGACAAGCCGGGAACGCTGAGTATTCTTCGTATAGTATAGTATTCTTCGCCCGCCACCCCACGGGACGACTGTTTGAGCTTAG:1 + chrY 342876 3' - Rt1b 4873 1 79.31 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATACTCGTACACACACACCCCAGAAGGCGTTGTGTCCAGCATGTAC:1 + chr2R 8311372 3' + opus 7478 2 54.74 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTATTTTAAGAGATTTAAAATTATGAAATATTGTAAAAAACACGAAACTCTTTT:1 + chr3L 15037993 3' + roo 386 2 53.47 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAATAATAATAGAACATTTTGATTAAAGTGTATA:1 - chr3R 12944687 3' + roo 9028 1 74.26 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGTACCATCATGGCGTTAGTTTTTCGCAATGAACGAAAAACCTAAAAAAAAATAAAATCGTAGAT:1 + chr2L 20128932 3' - hobo 12 1 61.39 ATTTAAAGGAAGGAGCACGNGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAGGGACTGCAGGACTACAGGACTG:1 - chr2R 23516953 3' + invader3 5442 2 55.45 TCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGAACTTAGTGTGGTGGGTGCCTTTGCCGCCTACCGGGTGGTGGTATTTCTGCTGGTGGCACTGCT:1 + chr2R 21722552 3' - mdg1 7357 2 57.14 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTAATTACGTAATAAGGAACCTTTTT:1 - chr3L 6033545 3' - 412 7081 2 69.23 GAGTTCTGATAAAAGAAAATTAGGCTGTATATTATCAGGACACTAGCGATTCGAGTCGCGATTCTCTGCCTATCCGATGTTTTAATATCTTGACCCATTCC:1 + chrX 21585907 3' + mariner2 876 1 84.16 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGTGGGAATTAAAAGAAAAATGCATATAAAGTGTTGCATTTGCAGTTGCTCCT:1 - chr3L 10119297 3' - Doc 56 1 51.00 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTTT:1 - chr3R 17971671 3' + 412 438 2 79.21 TGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATGTGCGTACACAATACATGAGTATATATATATTCAT:1 - chr2L 15823725 3' - 1360 3239 1 63.08 TCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAAGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCACATAGAAGAATATATCATCCTGACTGA:1 - chr3R 12659017 3' + X-element 4470 1 72.28 TTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTCCTCGCATTTCTAAAGTTTTATATTTGCTTAAACAA:2 - chr2L 19642306 3' + Quasimodo 7334 2 63.37 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAAAACTGGATGCACAGTGCAAGCTATCGATTTCTCCAGTAAATCGCTGATATCGATGGTTA:1 - chr2L 16680002 3' - P-element 10 2 70.30 TAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTCCCCATTGACTCCGGCTCAGTTATAACCAG:2 + chr2R 18723099 3' + HMS-Beagle 204 2 72.28 GTAGAAGTAGCAGCCTACTACAGTATGTTTCTTGGTTTTTAATTACAACAAATTCGACTTGTTATGCCAAAAAGTTAGCAGGGATTCCAGGGCACGTACGC:1 + chr3R 26597438 3' - mdg3 5253 1 80.20 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCACAGGCAGCCAACTAAAGAAATGGGACATCGAGCACTCGTACTGGAATATGCAGA:1 + chr2L 11481887 3' + roo 332 2 66.34 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCTTGTAATATCGAAATCAATGAGATT:1 + chr2L 9045455 3' - jockey 59 1 75.25 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATATGCAATCAAATAATAGTTTTATGCCAGGCAT:1 + chr3R 19198564 3' - hobo 42 1 69.31 CCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTTTTTAGGAGGTCATTGTTGGACGAAAGTAGAG:1 - chr3L 1659736 3' - roo 248 2 78.22 GAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7292 2 55.56 ATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGTGAAAAACGATTTCGAAAGCTGCACTTGACCAGACAGTATTTGAATAGGCGTCCGATTGTAAGCAGTTACA:1 + chrX 2964344 3' + Bica 408 1 78.22 ACATGCATAAATTTCTTGTTAACTAAATGGTAATTATAAAATTTCCATTTTTCCCTTTGCTGATTGTGCGGTTTCGATAAGAATGCAACTGCAGTTGCACT:1 + chr2R 18942619 3' - Bari2 695 1 59.41 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAATATCCAATAATTAAGCACTTCCGCAGGGAAATTGGTTTTTAATTGAAATGCGGAGCAGT:1 + chr3L 12241900 3' - roo 16 2 63.37 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCACAGATTCTTTGAGCTCTGTAAATTGGGGAATTCTAATCCACAA:1 + chr3R 5690999 3' - FB 34 1 68.67 TGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGGCTTCATTAGCATAAGTAGATGCGAAAATC:1 - chr2R 9905340 3' + mdg3 5477 2 59.41 AAGGAAGAGGGTAGAAGGANCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCT:1 - chrX 21087566 3' - mdg3 5263 1 64.36 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACA:1 - chr3R 8765554 3' + roo 9026 1 72.28 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCCAAC:1 - chr3R 8765544 3' + roo 9036 1 62.38 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTAAAAACCACAAGCGAAATTGCCTGAGGGTAAAAATCCCCAAAA:1 + chrX 7996436 3' + hobo 2930 1 61.33 CGATCCCGAAAAGGGACATGGAAAAATGGCTTCCTATTTCTTAGAAGGTCTGTACCTGTATGAAGGATAGTGAAGG:1 + chr2R 5515629 3' - HB 63 1 52.63 TTACAAACGCAGACTGCGGCGTCTTACAAACGCAGACACAAAAACCTCTGTATAAATTTAAA:1 + chr2R 17826118 3' + rooA 220 2 53.23 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGACTTCCCCCGCTTGAAGGCGTGGGCAAACTCATTTT:1 - chr2R 5720463 3' + pogo 2063 1 63.37 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGATAAACCCAATACTTAGCTCCTGCTGAGCCACGTTCGCTTTCAGTTTTTGAGGTAGGCCTACTTATAGG:1 + chr3L 171263 3' + 1360 3382 2 70.41 TTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTATTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGT:1 + chr4 1294992 3' - F-element 89 1 49.50 TGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCAGCAAGTCGTAAAAAGGACTCGACATGAATTTTATTTTTAGGCCTTGTCCTTTTTTGTTGTTTCCCGTTTC:1 + chrX 22786882 3' + INE-1 563 1 69.31 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGAAACCATATTTCCTCAACCTCATGATGTTACG:1 + chr3R 27056443 3' - jockey 35 1 50.00 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCGATGCCGTGT:1 - chr3R 29608764 3' + roo 391 2 65.35 GTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTATGTATGTCACTGCGTATTG:2 + chrX 18326253 3' - Doc 203 1 57.43 TTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAA:1 + chr2L 19642372 3' - Quasimodo 39 4 65.35 AACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGTTTTTTAATTG:1 + chr2R 672825 3' - F-element 49 1 65.00 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGTGTTTGGCAGACATGGGCA:1 + chr3R 17053146 3' - hopper 18 1 61.39 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGCTTCACTCAGTCGAACACTCT:1 - chr3L 12241831 3' + roo 9024 2 75.25 CTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGAGAGAGTGTGTGTGTGCTGAAGAGTTAATTGAATCGGCAGAGGCAACAGATAA:1 - chr2R 11646097 3' - Doc 413 1 60.22 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAATGTGCAGGCACAAAACGTACAAATCAGGCAGCTAGCACTGAAATTCTTTGGGGAATTGTTTCCGCT:2 - chr3L 18762041 3' + pogo 2097 1 75.25 AGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTTATACGGACAGACTGACATGGCCAGTTGGACTCGCGCTTTATCCTGATCAAGAATATATATACTTTTTATG:1 + chr3L 20451811 3' - INE-1 150 1 94.06 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAATACCTTCTAAACTTATGAACTTTGAGAACACCATTATTTTCTGCCAGTGT:1 + chrX 8316387 3' - hobo 25 1 52.48 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTTATAAAATCGATGAATAGCATTT:1 - chrX 17104418 3' - 297 50 2 83.17 ATAATCCAAAATGGACGATAAAATCATCCTGAACGACTTTTCGCTGACAACCCTAAAAGATTGGCTACTTTTTGCTGGCCTTCTTTTTTGTGCTAATACAT:1 + chr2L 3699964 3' + mdg3 286 1 67.33 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAAGAACAACAATTAACTTTCTTCAACAGCTGCG:1 - chr2L 17244992 3' + copia 233 1 54.46 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTGCGCCACACATATCTCTGCGTTGTGTGTTGTTTATACAA:1 - chr2L 10199000 3' - I-element 37 1 57.43 GAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTATATATATCACTCTCCAGCTGCGTTTTATTGTTTTTTTACCATATTTTT:1 + chr3R 22558387 3' - 297 6595 2 52.13 TGCATACTTGTGAAAAACACATCATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCAC:1 + chr3L 6658225 3' + hopper 1379 1 61.39 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTTAATTGACCTTGTGTGTGCG:1 + chr3L 9928618 3' - roo 17 2 62.38 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGTCAACTGAGTGACATTCTTCATTTTGAAATTTATGGTGCGTTATTCCGCAATATGT:2 - chr2L 16153346 3' - Doc 26 1 58.42 TCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTCAAAGGCCAAATGAATATGAAAAACTTAAAGAGAAAA:1 - chr2L 23067934 3' + mdg3 5294 2 63.37 GCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCTCTTCACTCATCTCTAAAATCAAAATGATTTACTTTT:1 + chr3R 10914159 3' - F-element 123 1 71.29 GTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGCACTTTCGGAGGTCCTGTCGCTGCTGTGATATTTCATATTTCACATTCATG:1 + chr3R 22994445 3' + blood 7253 2 56.84 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAAT:1 - chr3L 1586743 3' - Tirant 55 2 81.19 TGATCAGGATGACTAGCCGAGTCGAGCTGACCATCTCCTTCTGTCTGTCCGTATGACGTCGAGATCTCGGGAACTATAAGACCATAGAGGTATTCTTCTAG:1 - chr2L 22036436 3' + INE-1 91 1 74.26 AATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCG:1 - chrX 21087584 3' - mdg3 5281 2 54.46 TTGTCCCAGATCCCATTTTAGCATTAGCGGCTACGATGTTATCCCTGCCACGCCCACTGCCACTGACACTCCCCCTCCCCATCTCCATACCATCACGACAG:1 + chr3R 10914623 3' + G2 383 1 58.42 CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCGCTTGCTTCAAAGCGCTCACTAAATCAGAA:1 - chr3L 8252205 3' - copia 4917 2 70.30 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATTCTATACTTCGACTGTGCTAGCTATTTGTGCTAAAATACTCGAGTTCTTGACCTCCTCAAATAA:1 + chrX 3370200 3' + S-element 1707 1 70.30 AGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAATGGGATATCTTTCGCTTGCTCAGC:2 - chr3L 18677336 3' + F-element 4454 1 76.24 CTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGTTTTTTGTGACTTACTTAAGGGAGAACAGCACCAGCTAGCTATTCAACCAATAAATGTATAAGGAATT:1 - chr2L 3408592 3' - G-element 10 1 67.33 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCGTAGTGTCCTAGAACTTTAGTACTCTATGTCTGTACATATCTTGTTTAGTAAGCTGATCTCTCT:1 + chr2L 8176489 3' - 1360 15 1 64.36 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCGATTTTCTTC:1 + chr3L 25345163 3' - Doc 33 1 51.00 TACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCAACTAGATGCAATAACTGCTTCGGAATTGACCATTT:1 + chr2R 4579708 3' + Chouto 451 1 65.35 ATTTATTTTATGTTATTAACTATTTGCTTCTCTAAAATCAAGTGATTTTATACGGAGATCGATGGTGCAGGAAATATGCCTGGTCAGAGCTCAATGAAATC:1 - chr2L 7278148 3' - Doc3-element 71 1 63.37 CGGGTTAGCTGAACCCAACATGCTCTTAATAACTTGTATTACATAAAAGAACAGACAGATAGTACTTTTGACATCAGTTTTGAAACGGTGGTGGTAGGTG:1 + chr3R 21706262 3' + Stalker4 302 4 45.00 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAA:1 + chr3R 9224395 3' + pogo 2058 1 74.00 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTTATGGCAGGCAT:1 - chr2R 9870960 3' + roo 399 1 69.31 ACACGTAATTATTATTATTATTTACTACTATTAAAAATCTTTGGGAAAGTTTCATGCAGATAGCTTTAAAACTAAGAAGAGTTTGCTTATCGATTCCAATA:1 - chr3L 22256198 3' - invader6 4391 1 81.19 GAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTCTGTACATCGGTACTGTGCTCATATCTCGAATGCAATATGCCAAGATGAT:1 + chr2L 20367398 3' - Doc 3 1 75.25 CTGAGTCATACCAGTAGTTAAAATGAGAAAAACAATATATGGCGGGCCGTAAGAGTCGCACACACACTTATGGCCACTAACAAATCAT:1 - chrX 21229730 3' + transib2 2676 1 78.41 TGGACGTAGAGTGCGAGTGNCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTTGCGATGTAGGCTTACGAGGGTGGTTGGTGCTTGGGGG:1 - chr3L 14623909 3' + hobo 2923 1 61.39 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAAA:1 + chr2L 18655197 3' - Doc 49 1 65.35 CTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGCCCTTTCTCCATCGCACCGAAACTAGCGGTTGTTTTATTTGTTTTAACTTTTGT:1 - chrX 9224632 3' + jockey 4685 1 58.42 CAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTGGTACTCGGGATGGGTGCCGGCAGCAGGGTAGCCTCCAGTTGCTTGCTCAACAGCTCCCGCTGCTGATTCTC:1 - chr3R 29812654 3' - X-element 4409 1 78.22 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGTTCGCTCAA:2 + chr3R 9088637 3' - hopper 25 1 52.48 TATTGCAACCATTTATTTGNAATTATATAGCTTAGGATGGAAAGCTAAAGTGATGTACATTTTAGACTGTTCAATTATTAAATAACATTAACCTAAACAGC:1 - chr2R 6779742 3' + 17.6 489 2 71.29 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTC:1 + chr3R 21365541 3' + P-element 2831 1 25.74 ACTAAAAATAGATTTTGTTTCCTTGATTATCTCAAACAAATCCTAGTAGTTCCGGCATTCAATGGGCAAAAATTCAGCCGCAACTCGATGACCATAACGTA:1 - chrX 17505576 3' - jockey 120 1 43.56 GAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGATATTAAGCAGACCGATCCTAGAGCAAGTTTGTTGATCTATGTTGCCACGCCCACTCTAAC:1 + chr4 71479 3' + INE-1 141 1 77.23 AAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGCTTAAAAGGCCATTTAATGAAATCTTCTACCTAATCTTTAAGTTAGTAATTAATGTAATC:1 - chr3L 16563203 3' + 3S18 6089 2 60.40 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGTAGAATTAGTTGAAAATGTATAAACAGATTGAAGAAATTTGTATCTCTAGTTTAAAG:1 - chr3L 5478988 3' - 3S18 21 2 59.41 TTTTTATTTATATGATCAATTTTCTTTAAGAAAATAATTGATAAAGGACGATATATGAACATACAAAATGTATCCTATCGCTTTTGAAAACTATGAATCAA:1 + chr2R 16484813 3' - transib2 88 1 64.36 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCCAGTTTTAGCCCACTGTTACTGTCGTTATCGTTGGCTTG:1 - chrX 21229281 3' - transib2 34 1 59.41 GTGTTCATGTGTGAACAATNTGTTTTTTATTTATAAATAAAGATTTTTCAAGCACAATCTGACCCATTTTTACACCATCTAGTAACTGAAAACATCCCAGG:1 - chrX 7797617 3' - roo 8660 1 70.30 GTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGGCTATCAAAAAGTTGATGTCGCTAGTGATGTGGGCGAACTTCATTTCCAGTTCTT:1 + chr2L 6955150 3' - accord 216 2 64.21 TAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGCATAGTTCTGTTACTTTTGATACTTTTGATAAGGCTGCCGGTGCAGGCACTTTGGGGA:1 + chr2L 21215351 3' - BS 4991 1 57.43 AAGTAAACTTAAGACCACCCTATGTTTTAGTTATGAAGTATATCCGAAAAACAAAAGACCCCCTCCCTGCCCGTTGTTTCGTTTGATTTCTGTTTGCCCCG:1 - chr3R 29646865 3' + mdg1 7135 2 63.37 ATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTATAGACGCTAAGAGAGGGTATTTTTTTTTATTAATTTGTTCCCTCTGTCTGTGATTCCAACT:1 + chrX 13498656 3' + Tc1-2 1276 1 75.25 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCTTGT:1 - chrX 13126210 3' + mdg1 386 2 58.42 GCTGAAAATTTTCAAAAAAAAAAGATAAACAATTTCGAGTAGGAGGGAGTGCAATATAACACGCCTATTAATAGACAATCGAGAATATTTGGCATGGTAAT:1 + chr3L 7611915 3' + TART-A 13399 1 80.20 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATGAGCCGAAGTCAGCTAAATG:1 + chr3R 3847136 3' - P-element 55 1 25.25 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATTTCTCTTTATCTTTTCT:1 - chr2L 13093766 3' + roo 9046 1 53.47 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGTAAAAATTGGCTT:1 + chr2L 7175619 3' + blood 7351 2 66.67 GGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTCGATTCATTTTAAATTGTAG:1 + chr3R 15790148 3' - flea 4704 1 41.00 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAACACAAATGGAACCATCCAAAA:2 + chr2R 8682392 3' + pogo 2052 1 77.23 CGGCCAAAATATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACAATACTATACATTTGTACATACATACAGAGAGGA:1 - chr3R 19216357 3' - 1360 44 1 69.31 TGACTCGGTCTCGATTCTGTCTCTGTGTTTGTTTCCAAACTGGAAACAAACACAGAGAGAGAGAGAGAGGGACGGAAAAAGCCTGTTTGTATAATGTGGGG:1 - chr3L 18186964 3' + Stalker 417 1 40.59 AGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCGGCAATGTCCGGCCGAAAAAGTATGCATTCAATGCGTTTCACAAGCTAAA:1 - chr2R 19101909 3' + opus 486 2 71.29 TCACCACAGAGTACGGGGCNTACTAAAGTCACTAGAGGAAGAGATAGAAAGAGACGGGGCAACGCTTGGTAGTAATTGGAGCGCGGCAATTAAGAGCCAAA:1 - chr3R 5314359 3' + baggins 4965 1 65.35 TGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAACGTCTCGTAAATAGTAGAGATACGACAA:1 + chr3L 15373458 3' + F-element 490 1 75.25 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTT:1 - chr3R 7869134 3' - 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hobo 164 1 59.41 GAACGGCAGGACACAACAAGTCCTCTTTAAAAATAGTTTATCTTGTATTTTCCTAAGGTGACATCCTCCTTGAATGGAATTGACACAATGTATCGCCCATC:1 - chr3R 19445002 3' + Q-element 420 2 50.50 CCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGAAAACTTCTGCGACCAAAGTTGAGGCCAGAAACTTTGGTAAATGATACAG:1 + chr2L 19642815 3' + Quasimodo 213 2 57.00 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCCTATCGCAAACTAAAGTATATTTTAGCAGCGTTTGCGGAATTTTT:1 + chr2L 16680095 3' + P-element 2862 1 55.56 CAATAAAAGTAATATAAAGGACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTCAGCTGCTCTGCTCGCCTTTGAAGTTTCATTTTTTCATTTTGCTACCAGC:1 - chrX 22789312 3' + Tabor 7299 2 51.49 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTAAACAAAAATTTGCGTACAGT:1 - chrX 15800915 3' + roo 355 2 81.19 CACGACTATAGCGTTCTCTCTTGTTGAAGCTGATCCTGTAAATTAAAACTAGTATTAATATTTGGTATTAGCTGTGCATATAAAGAGTATGGCATAATATT:1 + chr3L 19528103 3' + INE-1 577 1 62.38 CGACCAACAACACAACAAACAAAGCGAAAAAAAAAAATCATGCAAAGCAATTTAAGCCAGAAAAGGGTGTCACATGTGCCAAATGACTTTTGCGT:1 + chr2L 5396043 3' + gypsy4 477 1 72.63 CGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGTGAAGACAAGCGTTGAACAGCGAACAATTAAAGTAGTTACT:2 - chr2L 1051931 3' + flea 4803 2 59.41 GTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTTTCCGGTTAATTTCCCATCATCTTATT:1 + chrX 983400 3' - Juan 3804 1 78.22 CTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGAAGTATACTGGAATAAGGAGGTATATATGATTTTGTATGGTCTAACTCTTGAAAAACCCATTTAAAATTAATAAAA:1 + chr3R 15617304 3' - Cr1a 3992 1 59.41 AACTTGCACCGTAACTCAAACGTCGACCATTACCACCACCACGACCACCACCAACACCACCTCCACCACTGCAATCCGCAATCCACTCGCTCGCTTACAC:1 - chr2L 8175396 3' - R1A1-element 5053 1 50.00 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAAT:1 + chrX 19034163 3' + hopper 1364 1 74.26 ACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACATTTCACATAACTATATAAATAAAATGTACAGGAGAGCTAGAAGAAGCAGAGTCCCAGAAAAGTTTTATATT:1 - chr2R 16893241 3' + Transpac 289 2 50.50 CGCTAGGTGGTTGGGGTGCNTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACAACAGACGTCCACATACCAGCAGCAACTT:1 + chr2L 12241532 3' - F-element 4465 1 70.30 TTTGAAGATTGATCGCACCGTTTTGCGATGCTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGTCAGGTATATACTTAATTTCCATTCTTTGTTAGCCACCGCAGTCGCC:1 - chr2L 1248296 3' - Gypsy6A_LTR 394 1 53.47 GATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATCTGTCGTAATTAAAACGCGCCCTCTGCGACATCGCCTCAACTG:1 + chrX 15263493 3' - invader3 5232 2 60.00 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAAAGGTAACGTAATAA:2 - chr2L 20560332 3' - F-element 41 1 53.47 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCC:1 + chr2L 20045796 3' + roo 9031 1 67.33 TTTGAATTGTGAAAATTGACAGAAAGAGTTAAACAAATTGCAGCGCAAACAGTGTCTTCATAGCAAACTCTGAGTATATTTTTAATTATGGAAAAACA:1 - chr2L 6277511 3' + transib4 183 1 87.76 CCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACATCGGGCAGCATCAGAATCGAGGGGGAAATACTT:1 + chr2L 21822938 3' + I-element 4881 1 66.34 AGAGACTAACAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAGCTAACTAAATATCATTTTATGTTTTCTGGTTTTAAGGTTTAGCATATGTGTGGTTTAGTATAACT:1 + chr3R 27565416 3' - Doc3-element 4674 1 56.44 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCTCATTACTCATAACTGAAGGCTTTGACCGTA:1 - chr3R 27131916 3' + copia 5079 2 73.27 AAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATGGGCTATAAGATTTATGCGGAGGGAGTAAAGTGACACGGAGAAATGACATGCA:1 - chr3L 20050664 3' - jockey 4864 1 56.44 ACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATAGGAACTTATATATTTTGTACACATTGTGATGCCCGTAGATTTCCATGCTGCCATTGCGCTGCAGGAAT:1 + chr2L 7996042 3' + gypsy 435 2 52.48 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTT:1 - chr3R 29608791 3' + roo 9027 1 70.30 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAAGTTCAAGTTCTA:1 + chr3R 11052171 3' + blood 347 2 58.42 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGGTTTAGAATACGAATATTATTAACTATTCGATATCTAACATGCAT:1 + chr2R 21351382 3' - mdg1 32 2 54.46 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGTCAACTGAGTGACATTCTTCATTTTGAAATTTATGGTGCGTTATTCCGCA:1 - chr2L 16153352 3' - Doc 32 1 52.48 CTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTAAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTA:1 + chr3R 1977616 3' + micropia 5410 2 56.25 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTAAACAAAAATTTGCGTACAGTCAAGTAAACAATTAACAATTAGAAGTGATTTTCTTTAAG:1 - chrX 15800876 3' + roo 395 1 65.35 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATGGCATTTGATTATCAAGTGTTTTGAGATACTCCT:1 + chr2L 15898806 3' - F-element 56 1 70.30 AACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGCATGAGGCACAGAGAAATAATAAATA:1 - chr3L 13374683 3' + Transpac 288 2 56.44 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGCACGTTTAATGCCTCCACAAAAGCAGAGGGAAAAATAATACTTAAATAAGGAGG:1 + chr3L 3650118 3' - mdg1 23 2 56.44 CCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTC:1 + chr3L 23678136 3' - Osvaldo 16 2 72.28 CTTTATTCTTTTGATCTTAGCTTAAGACAAACAAATCGTATTTGTACTGCCCTTTTGTTTACATTATTTCGGGAACGAGATCTCCCGCTTGGGATATTGAT:1 - chr4 970229 3' - 297 289 2 48.51 CGAGGCAGCTAAGCGAATTNTACTGTACATATTTCAGGGTATTTTGCGATTCTTTACAGTTGGCCGGCTTTCTAGTACTTTCGCATAGTATCAGTTTAATT:1 - chrX 17883597 3' + pogo 2097 1 73.27 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTTTCGCAATCAGCCATTTCCTCCAGTGTTGTCAATTCA:2 - chrX 8334277 3' + flea 240 2 65.35 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGC:1 + chrX 11025553 3' + hopper 1390 1 69.33 AAAATAAAATCATATTAAAATATATATGAAAGAAGTGGAAGTGGACAAAAAAAATCCAAATGTTATTCTCTGTGTACCTGCCTGTACTGCAAAAGTCAAA:1 - chr2L 4086693 3' - transib1 1888 1 64.00 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTACTTTTTAGAAGCCGGCTGCTAGACTACTTATGGTAAAATTGCATTAG:1 - chr2L 2833854 3' + roo 9045 1 54.46 TGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCACTGTGTTGTGTTGTGTTTCCTTTGCCTTTGCCCTCTGAG:1 - chr3L 14924698 3' + gypsy4 418 2 60.00 GAACCAAAGACACTAGAATAATAGAAAGAATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTACGAACCCTGACACGAGAAAGATGATAAGCAAGGCAGGGCATTTTGCT:1 + chr3R 7451617 3' - Tc3 314 2 48.51 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCT:1 - chr2L 17730434 3' + pogo 2074 1 52.48 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAATCTAGTTGTAGGTTTTTATGACTCTTTTATTTTAATGTTTAAATGTGCAGGAGTAATTTCCTTTTCG:1 - chr2L 7175536 3' - blood 7 2 72.28 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTTTATGCTAGT:2 - chr3R 7869096 3' - 297 10 2 70.30 ATATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGGTGGCTAATTTCAGCACGAGTGCCTTACTCTTTGGACCAACTTCAAAGTCACTGCCAAACATGTGGGGCAG:1 + chr3R 19430223 3' - 3S18 367 2 71.29 CCTGAGATCTCGACGTTCANACGGACAGGCGGACAATGGTCAAATGCGATGTAGCCGGAATTGCGTGAGCGGTTTTGAGCGGATTTTAAATATGGCCATAA:1 + chr2R 20610748 3' - INE-1 137 1 67.33 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCT:1 - chr2L 9045431 3' + jockey 4948 1 70.30 TTCTGGGATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATTATAGAAAAAAGTAAAGTTTGTTCAAAAGTGAGGGCGGCTTATCCTCCGTATTAGTGCTAAATGTAA:1 + chr3R 4737241 3' - INE-1 497 1 74.26 CAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCACCACCACCTCCTCCGATTCCCCCGGAAAACACCTGGCCCCAACGCATGCATTG:1 + chr2R 20302718 3' + Doc2-element 392 1 58.59 CACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACCTACTTAAATATGTCGAAAAGTGTGTCATCGAAGCGAGAGCGAAAGAGAGTGCAGGAGAGAGTAGAAGCTGCG:1 - chr3R 24767764 3' + P-element 2886 2 76.24 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTTTAAACACGTAGCCTGGGGAAAAAAAGCCCTGACTGAACGACGGTGAAGAGTCAA:1 - chr2R 19641830 3' + I-element 5335 1 58.42 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGCATGTATATGTTTTTCGAAAATGTTAATAATGCTTAGTTTATATTTAAGCAATTA:1 + chr2R 9699894 3' + Transpac 5215 2 63.37 AATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTTAATATCTTTATTCGTTTATTTGACTCAATTTCGGTTTACGTGTATAACAATTTGTAGCATTCA:1 - chrX 13368112 3' + accord2 127 2 69.31 GCTTACGCGAAGCGAGGCTNTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTAATATATAATTTTGAAGTAGTGCAGTAACTG:1 - chr3R 18790088 3' - I-element 46 1 75.25 CACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATTTCCCGCATTTCGCCATTGTTGGTCACGCTTCGGATTCATGAT:1 - chr2L 4998026 3' - 1360 58 1 57.43 AGATCGGCACGGCTATTGATCCTGATTAAGAATGTAGTAAAGAATATAGTTAAGAATCCACTAAAAGTTAATTCACTTAATGCATTACTCAATACTTTTCG:1 + chr2L 5608696 3' - INE-1 97 1 75.25 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCAGAATACAAAACTTACTAACCAAGAAGTTGGCCACCTAGCTGGCATAAGATCCTTGGAAAGCCTTCAGCTC:1 - chr3L 12859276 3' - 1360 20 1 32.67 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGTAGGTGTTTGGCAAAGAAATTTAAATTCGACTCACGTACTACGAAATAACCAATAAATAAAT:1 - chr3L 11828982 3' - Transpac 3 2 39.60 GGTGTGGCCGCGGTACCCGTGCGGAAAATGAATAAAAGAAAGCCCCTTGGCGCTGCATAAAAAATGTGAAAAACT:1 - chr3L 9572790 3' + Cr1a 4440 1 72.00 TAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTATGTATGTCACTGCGTATTGCTGATAAGTTCTATTTC:1 + chrX 18326270 3' - Doc 186 1 74.26 CTGCATTTTTAAGTTACCTNCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTAAAAAATATTTTGGCAAACGAATTT:1 - chr3R 15578981 3' + pogo 2053 1 79.21 TTCAATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACAACATAATGGGCAGAAATCGAAGTGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTCAATTTGACTT:1 + chr4 924104 3' - HB 1477 1 72.28 AGCTTCCCCCCCCTCCTCACTCCTTATCAACTTTGGAGAAGATGGACTGGCAGACCCCACCGCGCTAAAGATGCCGCCCAGCCCCATTCGCTGCATGACTG:1 + chr2L 8005003 3' + G6 281 1 62.38 ATAGTTTCCTTGACTGTTTGTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTCGTTTCCTCGCACGCTCTGCTTTCTGCTTTCTCAGTCTGCTAAATTTGTTGTGTC:1 + chr2R 15781578 3' - Porto1 4411 1 51.49 AAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAGAGGCTGTGTGGAAAGCCACTGGCTTTTATACATTTTTCATGATAAATGGGAGTATATTCTATGAGCGGATTAA:1 + chr3L 18186425 3' - blood 7179 2 62.38 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAGCCAATTAAATTGTTTTCGCCAT:1 - chr3L 13190116 3' + roo 9016 2 80.20 GATATAAAAACAAATTTAAGAGATCAGAAACTTAGCTACTTATGACTGATCTATTCATACGTACAAATCGAAAAGGTAAACAAGCCACAATGGAGCTTGAT:1 - chr2R 24070785 3' + Tc3 1582 1 68.32 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTAAACTTCACAT:1 - chr2L 9045413 3' + jockey 4966 1 52.48 ATTTTTCTGGAATATCAATAGATATTGCGGAATAAAATAAGAACAAAACTAAAAAAGCTTTTGGCTCAGAGACCTCTCAATAGGCAAGAATTATATTCCTT:1 + chr3L 6329134 3' - INE-1 501 1 54.46 CTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAG:1 - chrX 20361969 3' + hopper 1385 1 56.00 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACATTTAAGTGCAGCACTTGAAAAAGTACTTAATTAATGCCATAAATCCG:1 + chrX 9454887 3' - roo 8691 2 54.46 GGATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCGCGTAATCTGAAATGGAATAGTAAGAAGGTAAAAGGAAGCGAAAGGATGTTCAGGTGACAAAGATGTCAGTG:1 - chr3L 19028491 3' - accord 7031 3 47.52 CTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAA:1 - 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mdg1 7301 2 67.68 TCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTCGCAAGTA:1 + chr2R 6779845 3' - 17.6 6955 1 57.43 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCAACTCAAGTGCACTCTTAGCTCGACAACT:1 - chr2R 9649170 3' + roo 9041 1 56.44 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCA:3 - chr2R 15788588 3' - Transpac 4964 2 65.35 AGCGAGAGGGATGTGGTGTCAGAAAGGGACGGCTAAAGGCCTGGCCATTGCCTTGCCAAACAATAATGCAATTTTTCCTACCAGCAACGTCATTATCGTCA:1 - chr2L 9321955 3' - ZAM 150 2 59.41 ATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTATACAGTTTTGTATCATTAC:1 + chr3L 20604761 3' + roo 8624 1 84.16 AATAATTTTGAAAGGACAAATAAAAGTGTGCCAAATTTTAAAAGTTTTCCACCACAAACAGCTGCCTGACACTGAAAGTATTCAAAGACTAAATCTTAG:1 + chr2L 134674 3' + P-element 2509 1 59.60 CCAGATTTGGGGAATTGCAGCCGAATCTAATTATAAACGTATCCAGGTGATACAAACTGACGCGATAAAACTGCATTAACAGTCCCTGGTTGTCCGATTTA:1 + chr3L 27058291 3' + Helena 1083 1 55.45 GCTGATGGCCTTAACCCCGGCTTGAGTTTCCGTTATATTTCTTTTCCCTCTTTCTTTCACCTGGATCGTGTGATTCGATTAATGATCATTACAAATTACAC:1 - chrX 13944858 3' + Gypsy12A_LTR 222 1 64.36 AGAAAAACAAAAAAAAAATAAAAATGCCCTCTTTTTTTGTTGACAAATTCACACAAATTAGCCGCTGCGAGTAGTGCACCCGTTTCGGCATCCATATTTTC:1 + chrX 3276068 3' + Doc2-element 221 2 76.24 TAGGGAGGTCATGAGGGTGNTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTATAATTTTCGGAGCTCTGTGCTGTCAAAAAAATA:1 + chr2R 10670070 3' - jockey 4760 1 79.21 TGATCAGGATCAATAGACGAGTCAATCTGATCATGTCCGTCTGTCTTTACGTCCATATAAGCGTTGTTATTTCAGGAACTATAGAAGCTAGAAGGTTGAGA:1 - chr2R 1751256 3' + INE-1 91 1 68.32 TGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAATAACCTAGCTTAAAGTGTGCCTAATTT:1 - chr2L 3699390 3' + mdg3 5483 2 61.39 GACGGGACCACCTTATGTTNTTTCATCATGGGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCAGAGAGAGCGGGTGGTTGGGTTGCCGTTGGTCAGGGG:1 - chr3L 16891076 3' - P-element 9 2 65.62 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATG:1 + chr3R 8582605 3' + roo 9033 1 61.39 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTCGCGCCAAGGAGAG:1 + chr3R 29287575 3' + hobo 2931 1 66.67 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATGAGAAAATGCAAAGGGAGAACTACTACAAACTACATTTGGTTATATATGGTTATCTGG:1 + chrX 13126289 3' - mdg1 7057 2 59.41 TCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAAAAACAAGCACAGCAAAGTTCAACA:1 - chr2R 17459170 3' + Transpac 5181 2 73.27 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATGTTAATTGGGTTAGTTATTGAAATGAAAAGCCCTAAACGGATTTGTTCTAATAATTTTAACATTTTAGAT:3 - chr2L 21086000 3' + roo 404 1 75.25 AAATATATTTTAGTGGGTAGAGGACAACACTGCTCCCAGGAAAAAAGAATGTTAAGTTAGGAAAACCAAAAGACAAAACAAAATGCTAAATCTAAATTTCA:1 + chr3R 15957624 3' + HB 339 1 62.38 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGACAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCA:1 + chrY 2720337 3' + 297 346 2 79.21 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAGGCAGCACCAAAAAAATAGGTTGAACATATGTGGTGTGTGTGTGTGGAAAACTAA:1 + chr2R 18766284 3' - hobo 22 1 53.47 AAATATGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGGCCCGATGCTGGGGTCACCACTGAGAGCTTATGGGCGTGGCAGATGAGCGTGCGTGGCCATTGC:1 - chrX 22754872 3' - Gypsy6A_LTR 95 1 56.44 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTCAAGCTTTG:1 + chr3L 3757412 3' + roo 9041 1 62.38 TATTCGTAGCTTGAAAGAAGCACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATCATTCGTTCTGAACTCCCAGCTATTTTCCGAGTTAGCTAACCAT:1 - chr3L 7168318 3' - Doc 36 1 53.47 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAATAGAAAAAAAATAAAATCTTTAACATAAGTTGCTGTTATCTGTATGATATAG:1 + chr2R 15099202 3' + jockey 4965 1 59.41 ACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATGAATTTGTATTCAACATTTTGA:1 + chr2L 14793539 3' + Stalker2 7599 2 75.00 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCTAGATGCCGATGCATGTTGGCAATGCGAGTCGTAAAACCTCGTCTAAGTTCAGTACCTTTTTAGTTGT:1 - chr2R 19840172 3' - roo 8672 2 70.30 AACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACG:2 - chr2L 18213144 3' + hopper 1394 1 58.00 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAATGAGGAGAGTTGAAACTCTCTGCAGACTTGCCTTATTTGGCTGCATACTGTAGGGCGC:2 + chr2R 12252910 3' + jockey 4977 1 42.57 AATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTTCCGAGAACTGAGACGACAATGGCGACGACATAAATATCAACGGCACGTCATGTGGCGTCGAGGAGGAAGTG:1 - chr3R 26252644 3' - 412 3 2 76.24 TAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATT:1 - chr2L 3699422 3' + mdg3 212 2 65.91 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCAAACCCGTTTATCGCTCGGCATAAAT:1 + chr3L 13895409 3' - hobo 48 1 71.72 AGATTTTTAGATATTTATATTATACTTGTTGACAGGGACATCTACATTTCATTTCATACGACTATTGAGTTACAAAAATTTCTTTTTTCATACTAAAACCC:1 - chr3R 17519388 3' - gypsy10 406 1 86.14 ACCATGGGTTTATGGCGTGATGCTAGGGAAGATCCATATTTGCTCGGCTGTATTTTTGTAGCTTTGGCATATTCCGTTACAGCGCG:1 + chr3L 25218315 3' + gtwin 7099 2 55.81 ATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAAAAAAAAGGCTGCATATTTAAGAAGCAGTAAAAAAGAAAAG:1 - chr2L 15220203 3' - invader4 2789 2 59.41 GTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGTTTTTTGTGACTTACTTAAGGGAGAACAGCACCAGCTAGCTATTCAACCAATAAATGTATAAGGAA:1 - chr2L 3408594 3' - G-element 12 1 65.35 CCAAGCTAAAGGACAGATCNAAAATAGAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATA:1 - chr2L 3699433 3' + mdg3 5440 2 78.22 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAATGGCCCA:1 + chr2L 20045809 3' + roo 9044 1 55.45 CGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGGGTCCTGTGTCCAGCGCACAGCAGGTGGTTTTCA:1 + chr2L 5493439 3' - 17.6 416 2 66.34 TTTTATCTATTTTATTTTATTTTATTTTTTATCAGAATAAACTTGAAGGCAGAACTCTGCCAAGGCGTGTAAAAGTCGCGTCCTGATGCCTTTTTCTACGT:1 - chr3R 25932707 3' - F-element 89 2 69.31 GGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATATACATGTTTATTTAAAAGTCACTTGTTTTACGAATGACTGGGCAATTTT:1 - chr3L 9925231 3' - roo 173 2 58.42 TATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATCAATATATACTTTGAAGTCTGTGCTTTGAAGGCTTTCAGTACTTGAGTCCCACCAGCAACTTC:1 - chr2L 10101798 3' + Quasimodo 7358 2 71.29 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATTTTTTACGCCCGAGTTTAAAATTTAATAGCATACTTTTTGGGGCAAAATTT:2 - chr2R 12812257 3' - jockey 31 1 54.46 TATCTTGCCGATGCAGCTATCTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTGTTATCAATCCACAATCCATGTAACACCAATACTCCTTCTTCA:1 + chr3L 7345422 3' - pogo 28 1 52.48 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTC:1 - chr3R 27495658 3' + 412 7503 2 64.36 GAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAGATACATATATAGATACACATGTGCTTATAGATAGATAGATACATTTCGGTTTGGAGAGTAGCGATTGTGCGTCAC:2 - chr3R 10391148 3' - invader4 2763 2 76.24 ACCTTCGAGATCGAAGGGAGGAGACTGATTGGCCAGTACGACCCAGGGTTCTTTTCAGGCTTTCCAGGAAAATGTTTTCAGCCTCTGGCAGGCAGAGTGTC:1 + chr2L 2527101 3' - BS3 450 1 67.33 TCGCCAACATAGCCGCGAACAGGCCACTAGGGCTGAACGGGCTACCTGCCAGCGGGGTAGCTTTCCCTCGGGTCGCAGGCATTCTTCAATTTCTTGTGATT:1 - chr2R 19974336 3' - Rt1b 4713 1 64.36 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGCATACTTTT:1 - chr3L 21144039 3' - jockey 31 1 54.46 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAAAGCGAACCGTTGATCACGTTTGGCGCAGGCTTC:1 - chr3L 6834933 3' - hopper 3 2 74.44 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCATTGCTCAAACATTGTATCTTCCGAACCAAAATAGTGCTGCATACTTTTCGGGATATGTCTTATTCAATGTAA:1 + chr3R 5595038 3' + 1360 3380 2 69.70 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTGGCATTGTTATGTTTTCTCTCCCACACATAAAAAATGG:1 - chr3L 7307219 3' + hobo 2912 1 61.54 AAAACAAACAAGAAGAAAANAAAACCAAAAAAATGGGTAACAATGCGTTATTAACAACAAACAAAGAATAGTTGGCTTTTTCTAGCAGAAGAAGATAATAC:1 + chr3L 15450310 3' + mdg3 5092 1 73.27 TCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTACTTATTATAGTATAATATCAAATATATT:1 + chr3L 20411887 3' + roo 411 1 78.95 ACCTCCAACAACAACAGCTNGAGATAGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGACTACCTGGCGCTATCCTGATCCCGACTCAGCCTGAAAGTTTAAGCGAATTA:1 + chr3L 21860356 3' + F-element 416 1 53.47 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCTAGATGCCGATGCATGTTGG:1 - chr2R 19840220 3' - roo 56 2 80.20 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGT:1 - chr3R 8765551 3' + roo 9029 1 69.31 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCCTTGTGCGTGAGCACAATTATTCAATATT:1 - chr2R 13763189 3' + roo 9037 1 58.42 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTG:1 + chrX 22574692 3' + 297 345 2 77.23 CGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTAGTTTTAGTTCAACGGAAAGGC:1 - chr3R 5594952 3' + 1360 3169 1 83.00 CACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGAGAAAAAGCAGCAGCGGCAGCAGGGCAAGAGTGCGAAAGGGGCAGAGGGTGGAGAGGGAAAA:1 + chr3R 21616229 3' - micropia 163 2 67.33 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAAGAACAACAATTAACTTTCTTCAACAGCT:1 - chr2L 17244995 3' + copia 230 1 51.49 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCG:1 + chr3R 14193956 3' + pogo 2054 1 74.26 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATGGCCAA:1 + chr3R 12767342 3' + blood 345 2 59.60 GAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTCTAGATCTAACTATGAGCTGCATGACCCAACAATATTAATTAAGTTATTGAAGTGGAAAAAAAGCCGCAA:1 + chr3L 24809325 3' + Cr1a 4128 1 57.00 CGTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTACCTTACTATACTTATATGTCTATCAACTTTTTAA:1 - chr3L 19249691 3' - Transpac 45 2 74.26 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGTTAGTGCGGAGTGGTCGGGAGTCGCGAGGCGACGAACATGTTCGCTGCTCTGGGAATC:1 + chrX 1135388 3' - P-element 14 1 64.65 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATT:1 + chr2L 20367348 3' - Doc 53 1 71.29 TTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAAT:1 - chr3R 4357555 3' + Tc3 1665 1 70.30 TGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATA:1 + chrX 18326224 3' - Doc 232 1 69.31 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTCCTTCGACTACTTGTGG:1 - chr2L 8622758 3' - 297 6607 2 63.27 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTTTCATCATAAAATCATGCACAATG:2 + chr2L 8622818 3' + 297 349 2 74.26 AATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATTTTTAGCAATCACAAAACAACAAAAATAGTTACATCATT:1 + chr2R 19965790 3' + flea 223 2 62.38 TGTTTATTTTACTTTTTTTTTTGGTCCCTGGCTCGAGGTGACGCCCGGACTGCTGCTTTGGCTGCCGGACCGACTGCTGCATCATCTAA:1 + chr3L 20545094 3' - Doc2-element 252 1 56.18 TTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCA:1 - chrX 4166380 3' - I-element 5322 1 55.45 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACAATAAGAGTAACAACAATGCCCAATCGACATAATCATAGCGTGGGAAATTCGTTACACTCCAGCA:1 + chr3R 7139330 3' + pogo 2094 1 72.00 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTC:1 + chr2L 18213219 3' - hopper 36 1 61.39 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATACACCAGTCTGTGGAGAACTTGTGTTCGCATTTATCCGTTCAACTCTTTTTACTGCCACATCCTTCTCACTCTA:1 - chr3R 19198478 3' + hobo 2937 1 77.23 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGATTGAGTTGATAGGCCATAGGAAATTATTTGTTATTCTCTTTTTCCCAGAACTTTTAGCCCACCTCAAGA:1 + chr3L 12112428 3' + 1360 3384 2 74.26 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATT:1 + chr2R 9631746 3' - F-element 61 1 83.00 TTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTTAAACTTTTAAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTA:1 + chr2R 25286853 3' - TAHRE 68 1 59.41 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCT:1 - chr2L 18213172 3' - hopper 50 1 73.27 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTTGACGCATGCAAACATGTTTGTATGTGTGTGTGTGTGCGTGTGCGAATCGGGTCATGCACTCACAC:1 + chr3L 13374788 3' - Transpac 4926 2 73.27 TACTTTAAGATGCGATTCTNATGTCACCTATTTAAACCGAAACACATGACGAGCGATCGCGATAATCGCACCGCTGGGGATGTGGATGTGGATGTGGATG:1 + chr2L 2185131 3' + roo 318 2 66.00 TTTTTTATTTTATTTTATATATCCTTTTTAGCATACCATGTAAAAAGATACTTAAAAGAAAAAAAAAGAATATAAAAACAAAAATAATATAATACCTTGCT:1 - chr2R 24674188 3' + transib1 1904 1 66.34 TTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAAATTCCAATTTAGGCGTTCATTTAGGAGTAATGAATGTTTGCGCAAAGCCCAATACCA:1 - chr2L 14761944 3' + mdg1 7442 2 60.40 TTTATATAAAATAATAAATTAAACACATCACAACCTAAAAAAATAACGCAAAATAATATTCTTATAAATAAAATTCCCGCATATTGGGCGCGTGAGCCAGT:1 + chrX 5379090 3' + HeT-A 340 1 28.71 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTGCGTTCAAGCTAGTTCAAAACTAACACCTTTACCCCGATAAACCACAGAGGCCAAGAAAGAGGAGGAGAAGCCA:1 - chr2R 22856495 3' + 1360 3388 2 56.44 GAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAA:1 - chr2R 6438344 3' + Stalker 381 4 53.47 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTGTTACATGTAATTAATTTCAAATTATTTATACATGAACGCCCAGACAGTGCAAGCTGAAAAAGCAG:1 + chr2L 19681512 3' + hopper 1410 2 74.26 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGTTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTAAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAA:1 + chr2R 10670029 3' - jockey 4785 1 58.82 TTTACTATTTAACTCGTTATCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGTCCTGGTTGGATACACTTAAAACAAACA:1 - chr2L 22234947 3' - Bica 214 1 75.25 AAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTTTTATTAGTGTACGAAATAAACAAAAGTTTAAGTTTGTTGTCCAAAAGTCGAACATTTTGCATTCGTCCGTT:1 + chr3R 7514007 3' + diver 219 1 67.33 TTAATAATTATGTTTACAATATAAGATAATTAAAGAATGTATTAAAAACCGTCGCTGGTTTTGACAAACGCAAAAATAAATTGGAACACACTTCGCTTT:1 + chr2R 4350405 3' - Cr1a 101 1 71.72 GTGTTCTCAATTGGTGGCANATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCAATTTGTTGTTTACCCTCTTTCGGTTTT:1 - chrX 15546130 3' + blood 7375 2 65.35 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGTC:1 + chr3L 3757404 3' + roo 9033 1 68.32 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGAGGCATTTCGAGGCGATCGCGAGATTTTC:1 - chr3R 18399198 3' + P-element 2841 1 33.66 CTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGGCAGAAAGGGATGCCACGGAAAATT:1 - chr2L 12808177 3' + Tirant 350 2 76.24 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGG:2 - chr3R 21365501 3' - P-element 34 1 45.54 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTTTTAGCCCATTAGCAGCAGTTAAAGACCTTT:1 - chr3R 17971642 3' + 412 467 2 50.50 CTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTAT:1 + chr3L 3540202 3' - mdg3 5286 2 54.46 TATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACATAACACCTGCTTAAAGAGCCGCAAAAAGAAAAGAAAAACGCAAAGCCAGAAAGATACAAT:1 + chr2R 8177784 3' + mdg1 402 2 55.45 TCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGTGACAAAACTTGGCCTGCGGTTGCTCATCCACGCCGG:1 - chr2L 11723186 3' + Quasimodo 243 2 50.00 GAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGCCAGGGGCGACTGTCAGTCAACTTATTCCGGTCAATGTGTTTTATTTTC:1 - chr2L 15914511 3' + 412 399 2 51.49 TGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCATGAGTGAGGAGTGCACTGCGAAAAATG:1 + chrX 4264397 3' - mdg3 47 2 69.31 ATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTGATCGATTAGGAACTAGGTTAAGAGAAATTTGAACAAATCGAATACTTTTTACA:1 - chrX 19334553 3' - roo 8664 1 80.20 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATGCACATATATACATATCTGCTCCAACTATATTTCTATTGATCCAGCTATCCAGCCCCCAGAGCTTGGGAATA:1 + chr2R 21351075 3' + opus 499 1 35.64 TAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACTAAAATTATACAAAATAAGCAAATTGCAATGACATGGATTAAATGGC:1 - chr3R 19996546 3' + Burdock 229 2 55.45 ATTTAGAAAAGAAAAAAAACAAAATGTAAATATTGATAATGGTTTATAATCTTGATTCATTTTTTTAGTTACATATACAGTTCTTAGACCAGCAAAGCAG:1 - chr2R 20950443 3' + transib2 2637 1 86.00 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGCACTCTCTGTTACTCAG:1 + chr3R 18399224 3' - P-element 58 1 24.75 TGGACGTAGAGTGCGAGTGNCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTAGAGTGTAAATATGGCAGAATATCCTAGTGAGCTTGAGCGTAGGCATACAGAAGG:1 + chrX 5219774 3' + hobo 2923 1 63.54 TGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCTTATCTGACACAGAAGATGTATTGGTATTTAAGTCAATGTTTTTGTGCCAGACTGTTC:1 + chr2R 6727928 3' - I-element 4889 1 58.42 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTTTTTATGATCTTTCCAATATCCTGCTCTCGAT:1 - chrX 2237019 3' - roo 8730 2 68.32 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGTTCGCTCAACGGCAGAAGCGTGTGCCCTCCG:1 + chr3R 9088659 3' + hopper 1412 2 74.26 CATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTTACACTTTTTCCGGCAAAGAGAAAAAATTGGGATAATTTAACTGGAACATTACAGTTAAAGAAGTTA:1 - chrX 7802250 3' - R1A1-element 5177 1 75.25 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTG:1 - chr4 158193 3' - Tirant 8132 2 55.45 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACTGTATTTTACCATCACAAACTATTTTGCAAAGAAGCCAATAAGGAGCTTGGTTGCCTTG:1 + chr2L 12866969 3' - mdg1 7055 2 63.37 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTGATTAATAAGCTGGGGAGGGCAATACTTCCCACAATAATATTTGGAAAGTTGTACTACATTT:1 + chr3R 4474258 3' + copia 242 1 65.35 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAAAGGCAGTTCATCATTACAATACCCTTCACCAAAGGTATTCTACCTGGTAGCCAGAA:1 + chr2L 10792077 3' + 412 453 2 59.41 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTTTTAGCCCATTAGCAGCAGTTAAAGAACTTTATTTCTAGTGTATT:1 - chr3R 17971628 3' + 412 481 2 66.34 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTCCCGAACATTGCAGCCCTGGGTGCAAGCGCTTG:1 + chr3R 21365573 3' + P-element 2863 1 57.43 TAATTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGTAACTTCACGAAGCATTAATACACGTACATCATATGCATATACATATATGTATCAAGCATGTAAAGGTCTCGG:2 - chrX 13590512 3' - gypsy7 5012 1 81.19 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAATATTCCTAAACTAACTTTGTGTTTTGATTTTGTCATTTTTAGGTAAGTAACAATCGCATTTCAAATGG:1 - chr3L 13772973 3' - pogo 3 1 74.26 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAATATCCAATAATTAAGCACTTCCGCAGGGAAATTGGTTTTTAATTGAAATGCG:1 + chr3L 12241893 3' - roo 8687 2 56.44 TTCTTATTTTTTTTTTTAAATTATCTTTTTAAAATACTTAGCTAATTACATTTTCATATAACAGCTGTTTCAAATGTAACTGTTCAACCTTCTAATCGATT:1 + chr3L 3814106 3' - TART-C 11098 1 89.11 TTATTAATAAATAAAATAAAATATCCATAAATCAAGCGTTCTGATCTTTAGAAAGCATCAAAATCACCAACAGTAAGGTAAGATAACGCAAAGTGCTAATA:1 + chr2R 13540342 3' + G7 1145 1 71.29 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGGTTTTTTGGCTCTCGGTTG:1 + chr2L 4063769 3' - roo 21 2 58.42 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGCGTTGCCTCGAGCGCTTGGCTGGAA:1 - chr2R 19560134 3' - Tirant 8118 2 70.30 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCGGTCTACTTTGGCAAATGTGTT:1 - chr3L 7541960 3' + roo 9043 1 74.67 CTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTAATTAAGAGATATTAATTCATGTGAACCAAAACCATTTAGAGTTGTTCAACTGTACTTCTTGCCG:1 + chrX 7036759 3' - Quasimodo 4 2 76.24 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGT:1 + chr3L 9928586 3' - roo 8713 2 80.20 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATT:1 + chr2L 5926996 3' - pogo 37 1 65.35 TGATTTTTAGGTCTCTGTGTACGTTTTCGATTCCGATGGCACAAAACAAACGCATCTTCCCAAGGACATGCGGATGGAAAGTGGGTGAGACTGGG:1 - chr3L 11859186 3' - Doc 4412 1 76.84 GTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCTTTTCAATAGTATTTCACTTATTAACCTTATC:1 + chrX 12216876 3' - F-element 4579 1 71.29 GCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATGAAACACTGGAAATAAAAGCTAAG:1 - chr2R 9950130 3' - 3S18 5817 2 74.26 AATATAAACATTTAATAATNTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATT:1 + chr3L 19339399 3' - Tc1 58 1 72.28 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCGTATTTTTGTGTAGTTTCTCTTTTCCCAATTTATATATTCCACTTAAAAAATAC:1 - chr3R 27907614 3' + mdg3 224 2 53.47 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAAGTTTTATGGAGTTTTT:1 - chr3R 12063740 3' + 412 7514 2 61.39 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCTACACACACAGAAACACACTTAAAGCGCGC:1 - chr3R 17053072 3' + hopper 1374 2 64.36 TTTATTTGGCGTTCACTTCACTCATCTCTAAAATCAAAATGATTTACTTTTATAATTTTTTTTTGTGGCTCCCTTGAATGATGGCATTTCAGTGGTGATGC:1 + chr3R 10914210 3' - F-element 74 1 74.26 TTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGGAATATTATCTTTATCATCAATTATATGGGGTCCAACCTTTCCACCTCGAAGGTTTAAATTATTTTTTTTC:1 - chr3L 2748985 3' + Circe 7048 1 65.35 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGAGCAGTGCATTAGTGTGTGTGTCTGTG:1 - chr3R 17059177 3' + hopper 1383 1 73.08 GGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGAACAGTTGAATAAAGAACCTCATAAAGAGCAGAAGCTCTTCTCTTGTTACTTAAAGTGTACTTTAGCAA:1 - chr3R 1330102 3' + Stalker 303 4 80.20 CACAACACCACACACACACACACACACACACACACTAGCGCACA:1 + chr3R 25466528 3' + gypsy3 419 1 72.73 TGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGCATCGTGTCCGCCCCTTCAAAATAATAAAGGTATAATGAAAGTATGCAATAAGAAAG:1 - chrX 15255335 3' - Tabor 6859 2 59.41 AAGACCTTAATGACACATGGGAAAAAGGCATCCCGAGACTCAAAGTCAACCCGAAGAGCCCAAGAAAAGATAGGGCGGAAAACGTGTTGGCCAGGTCAAGA:1 - chr3R 12774654 3' + baggins 5089 1 78.22 AATATTTGTATTTCGGGAGNGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGTAGAGTTCTTCGACTGTTGTTTATTAATTACAACAGTATGTCTATACCAT:1 - chr3R 4279372 3' - 297 213 2 58.42 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGGCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCAATATCCGTCATAGCATTTAACTTAAATAACG:1 + chr2L 13093830 3' - roo 43 2 68.32 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTGGCTGAGATCAAACTTCGTCTTGT:1 - chr3L 3596650 3' + copia 248 1 69.31 GACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTTGGTGGGTGGCGTTTTCCCAGCAGAGACACACACAGGACACAGGACACAG:1 + chrX 19543438 3' - F-element 4499 1 51.49 AATGGAAAAATAATGCAGANATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTGTAATTAGTGTTCGAAATGT:1 - chr3R 5993132 3' - pogo 47 1 78.35 TTTTTGTTTTTTTTGTTTTATAGTGCGGCTCCGGTGCTGGTCTCGGCTTTAATGTGAACATCTCATGGTCTGGGGCAGTGGTGCCGACTGCGTTCGTC:1 + chrX 13267395 3' - HMS-Beagle2 482 3 76.53 AATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCACCCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTTCACTAACAAATGTCTACAAAGTACACTTAAA:1 - chr3R 20094467 3' + Max-element 250 2 68.32 TCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTTGTATTGTGTAATTGCCAGTATAAGGAGACATCAATGAA:1 + chrX 4399616 3' - I-element 3 1 78.22 ACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGCATATTATTTATACTCTTATACTTGAGTCCTATTCGAGTGCCCCGTGCAGTATGCTTTTTTAATTGTC:2 - chrX 1706016 3' - Juan 4057 1 65.35 GCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCACATGTCGACGGTCGCACTTGCACCACCGGATGGGCATATAA:1 + chr2L 13565810 3' - hobo 2745 1 57.43 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCAAAACAAATTAAACTAATAATAG:2 + chr3L 7099655 3' + roo 9043 1 58.42 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGTCTCATTGTCAATGTCGCCTTAAATTATGCCACAAAAAATGGGGCTGGGTGGCGGAAAATA:2 + chr3L 6023368 3' - hopper 14 1 65.35 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTTGTATT:1 + chrX 4399583 3' - I-element 32 1 64.95 TTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCAAGTT:1 - chr3R 6769706 3' - mdg1 38 2 62.38 TAAGCTTAATATAAAGTAGCCCGTCTTCTGAAGCAGCGCTCACGGCAGAACGCTGACATTGCGCAAGCACACGCTCTCGTGGGTGTGCAATGACAACGGAG:1 - chr2R 19392485 3' - gypsy4 178 2 70.30 CATAATGACGTGCAAGTGCAAATAAAACAAAAGAAACAAAAAAAAAAGAGAAAAAAACGGATGGGGGAAACAGAGAAATCATAAAAACGCCGGCACCAGCG:1 - chr3R 14654753 3' - accord2 7278 1 66.34 CATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACAC:1 - chr3R 19589939 3' - BS 5037 1 64.36 GCCATCTTGCGGCCAGCTACAAATTGTATCCTTTCTCTATTAGCTGTTTATTTTTGCAATGGCTTAGCTTCTGTTGTCTAGCTTGTGTCGTATTTTATGAA:1 - chr3R 13870139 3' - flea 4541 1 75.25 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAGAGCGTAGTAACGGCAGCGCAGAGAAGAGAGTTTGGAGAG:1 + chrX 21184026 3' + Juan 4177 1 53.54 AGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGTGAAAACGCTGTGCACTCAATCGGTTTGCAGCTTTGCCGTACTGTTCGATTAAAAACTTTTAAATTAGAG:1 - chr3R 6759600 3' + Bica 4852 1 74.26 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGAAACCATATTTCCTCAACCTCATGATGTTACGATGAAAATAAGTTGTAATAG:1 + chr3R 27056463 3' - jockey 16 1 67.33 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCACTTTACCAACAACGAGTTTATAATTGTTTGATTT:2 - chr3L 12468219 3' - jockey 4714 1 61.39 CGTGTTCGCGGATTTCTCTACCCAACTTCCTCCCCCAAAGACCCCGTTGTGCCCGGACTAACCTGCCAAAAACCCCGCCTCCTACATCTCAAGTGTGTGGA:1 + chr3L 10959462 3' - Gypsy12A_LTR 1965 1 79.21 TGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTATGTGATTAACTTTTTATCAAATCTGTTCAGGGCAGCCAGCTCCTAGAG:1 + chr3R 15577030 3' + pogo 19 1 52.48 AAAAAACGTAAAAATCAACNAATGCCGTCTTTAATTGCATTTTTATTCGCCATCCCCAGTTTTGGCAATTAATCAAAGTACAAAGTAGGTTTGTTCCTGTT:1 + chr2L 20130255 3' + hobo 2518 1 65.35 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACGACTTAAAGGTAGTTTGTTATAATATTTT:1 + chr2L 13186309 3' + pogo 2064 1 72.34 CCGGTTGAGTGTCCGATGANTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAA:1 - chr2R 19560165 3' - Tirant 8149 2 64.36 TACTCTCCCTTTTGTGCGTNGTTCGCAGGGCTGTATGGTGTTGTTTTTTGCATGTTTTCAGATAGTAAATTGATGTTACAATTGTGTGAGCCTGGAATATA:1 - chr2R 5581945 3' + Cr1a 218 1 53.47 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTCATTTAAATTCCTTGCCTTCTCGTTGTCCAGCAAATTATTTTAATTGT:1 + chr3R 14580369 3' + blood 349 2 51.49 ACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAACGTATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTACTTTAGTACCGGGTATAAAAA:1 + chr2R 4321749 3' - INE-1 91 1 74.26 CACCACTTGCTAAATGTACAAATAGTTGGAACTGGGCGGCGGTGGTGGCTTAGTCACCATGCTGGTGTACGACCAAGGCATCTGGTTGCGCAGCTCTTCGC:2 - chr3L 2649954 3' + hopper2 1271 2 66.34 AGTTTCTGATCTCTTAAATTTGTTTTTATATCATTTTTTAGGCTATCAATAACTTAGAAAAAAATAAATGCAATCTTAGTTGTATTAGTTCTAATGTAATT:1 + chr2L 23066978 3' - Tc3 1592 1 69.31 AGAGACGAACGAAAAATACGCGTTCTTTCGAATTGCTATCCAGTTTATATAGTGTGAAGAAATATAAATCAGTGTAGTAAGAAAACATATTTTTTATAGCG:1 + chr3L 23082630 3' - Doc4-element 69 1 57.43 TTCGTATTTTGTTGGTTGTGCGTGTTTTGCGTCGAACCTAATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGTAATATTTGCCTTGCCAGGTGGTAGTCGTAGTCGTC:1 + chr2R 16407041 3' - Bica 4641 1 74.26 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAG:1 + chr3L 25059141 3' + mdg1 7424 2 60.40 GTGCAGCCATAAGCATTGGTGAGCAAGACTGCTATCGTTTGCATTCTGCAGGGGAATTGGGGAGAGAAAGTGCAAGGGAAAACACGGAACAGGATCAAAAG:1 + chr3R 9117878 3' - Doc3-element 392 1 54.46 GTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCTCGGCCATTATCGGTTATGATTAGCCGGG:1 - chr3L 20887258 3' + 412 183 2 71.29 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCA:1 - chrX 21087569 3' - mdg3 5266 1 61.39 AAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTATATTAGGGTGGAGTCCGAATGGAGGTGATTTTACCCGGTGAACTTACCCTGGACTTTCTGGGATATACGGTGCTCGAG:1 + chr2R 12362388 3' + Circe 7146 1 61.39 AATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAGAAAGA:1 - chr3R 12329623 3' - hopper 54 1 76.24 ATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCC:1 + chrX 22386756 3' - hobo 88 1 67.35 AATGTAACCATAATAGGTTCAAGACCATTATGACATACGGGAAAAACACCGTGCGCATTTTGACTGTCCGTCCATCTAACATCCATTCGAGATCTAACAGC:1 - chr2R 4330675 3' + baggins 5069 1 65.35 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGTCAACTGAGTGACATTCTTCATTTTGAA:1 - chr2L 16153374 3' - Doc 54 1 73.27 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATCTATGTGTGTTAACAAGTTTAATCAA:1 + chr2L 10143680 3' - jockey 59 1 77.23 TTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACAAATAAATTTAAATACTAATAATAATAAAAAGTAATACACGCACAACACTCACACATACGCACGTATA:1 - chr3R 8201942 3' + jockey 4885 1 73.00 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCACCGATAAATGACTGGCGACAGACGACACTGGGGG:1 + chr3L 17942685 3' + copia 247 1 63.37 GGAAGAAAAGAAAACTAAAAAATAGCAGAATGGTGAATAATCAGAGGGATTAAAAAACGAGTCGCGGCCGTCGACGCACGATAAATGGTCGTGATCCGAGA:1 - chrX 21560972 3' + mdg3 5102 1 77.23 AGGGAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACGCACACATTTAAATC:1 + chr3L 3540226 3' - mdg3 5262 1 67.33 GGAGGTATTAATTTTTGTANAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGTGT:1 + chr3R 17053130 3' - hopper 26 1 59.14 AAAACAACATCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGAGCGAAAAATATGGTGTAGAGAGAAATATAGCTAAACGGAGATAAAAAATGTTTTT:1 - chr2L 16561674 3' - Cr1a 243 1 60.40 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTTAA:4 - chr3L 25059057 3' - mdg1 14 2 65.35 CTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGTTCTCAGCGTGAGCGAGAGGAAAAACTGTTGGTGCATGCAATTCTTCTGCC:1 - chr3L 14224497 3' + 1360 3247 1 70.30 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTCCTTCGACTACTTGTGGCTCTTC:1 - chr2L 8622752 3' - 297 6604 2 60.40 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGACCCCGCCCACTCACAATAACAGTAGTATTTTTAT:1 + chr2L 1500842 3' - hopper 38 1 61.39 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGCTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTTGCTCTCCTAATCGGCGAATCT:1 + chrX 21217590 3' - pogo 15 1 59.60 CGAAGCGAGGCTTTAGACTNAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTAATATATAATTTTGAAGTAGTGCAGTAACTGGTG:1 - 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chr2R 14962933 3' - Rt1b 5123 1 76.24 GGTAACGGTGCGTGCGCAAAGAGGACTCACCGTGAATTAACGGCACAATATGAGGACCTTGTACCCGAGCGGGCCACAGCACAAAAGTTTATTACAGTTTG:1 + chr3R 18529225 3' + gypsy8 233 2 72.28 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGTGTTACCACTGTATTTGCTTTACTGTTGTTGTAATTAGTTTTGTCGTCG:1 + chrX 19308236 3' - P-element 25 1 54.46 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAATCACAATTTAATTAG:2 - chr3L 9928521 3' + roo 390 2 57.43 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTAGCTTTTGTGTGCCGAAATAAAAGT:1 - chr2R 18733699 3' + copia 234 1 52.48 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACCAGTACACTTGAATAAGCCGACTAGTATATTGCTTCGACCGCAATCCTTTCAAAATGGATCCTTCTTTAA:1 - chr2R 10353245 3' + blood 7384 2 37.62 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGTCACACTGGGCAGGCTTGCCAATTTCAAGA:1 - chr2R 9693320 3' + P-element 2845 1 36.36 GAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCACACACACATACACACATGACCAGAACACAACCCAACCAACCCAGCACCGCATTTTAGCCCACATTCAAA:1 - chrX 7184944 3' + F-element 4442 1 74.26 GTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCATATCGTTAGTCGAATAATTAAAAAAAAACAATAAAAATGTTCAATTGGCAAACAACTCCTTAGTTTGCTGGAAAC:1 - chr3L 20540401 3' + Rt1b 5111 1 62.38 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCGGGTTGTCCATAAAAATTTAATCAAAGCAGCACCATTCCGTAGTGCAAACTTTG:1 - chr2L 17998250 3' - BS 17 1 48.48 TCTCTGGTTCGACTAGGCGTTGTCGTTCGAACCATGGCAATAGGATTCCCGACATGATTCACACAATAATTTCCTTTCTTTGATTTATTCCCTTTTCGTTG:1 - chr2L 8338394 3' - gypsy9 4946 1 64.36 TTATAACAAGAATAATAATAATATGTTGGCAGCATAATGCACAAACATTCTGCCATTTATATACGCCAGCCAAAGAAGGTGAGGCGCTTACTTAATTGCTT:1 - chr2L 18177360 3' + mdg1 7068 2 74.26 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTTTTAGCCCATTAGCAGC:2 - chr3R 17971656 3' + 412 7506 2 64.36 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTAACAACTCGAAGCGGTATCAACCGGTTTGCATTTGTTCA:1 - chr2L 12459679 3' - blood 38 2 62.38 CCAACCTTTAGTCGCCTTTTACGACTAGCCGGGAACGATGAGGTAGAATTCTTCGCCCAGGGGAAAACCCACCCCGATCCCATTATTCTGGCTTTGCCAAT:1 + chr3R 5724668 3' - Rt1b 4890 1 57.43 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCA:1 - chr3R 29608778 3' + roo 9040 1 57.43 TGTTATTATATCTTAAATTAGTTAATATCTAATTTCCTAACTAATTTCTGGCCTGTTATCCTTGTTCGTCCTTTTTGGCATGCCAAATGCCTGCAAAACA:1 + chr3R 22228238 3' - I-element 5254 1 57.00 TACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTCTGAAACTAGTGCTATACCTAACCAACTAACTAATTTGAAATTTTAGCATCTATTGTATTTGCTA:1 + chr3R 21849735 3' + S-element 1706 1 67.33 AGTATCGTGGTGGCTGTGGNTGGTACCCATCATGCTCGACGTTTGAGTTACTTTGAATTGAATGCAGCATCCTTGAGGTTTTCTGCTACACTGGATT:1 - chr2R 12017173 3' + R1A1-element 4997 1 51.55 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGAGCGACTATAGCACCATGCGAAGCTTCCGATTTCATCATCCTTATGAGCGGCTATAAAAGCAAAGACTCTG:1 - chr2R 18171484 3' + P-element 2884 2 75.25 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGAAAGATGTGTTAATATGAACTTATTTT:1 - chr3R 19987422 3' - Doc 47 1 73.12 ATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCAGCGGCTAGCTCAGAGAGTTGGTGCGTTCGTCCCACCCAAATT:1 + chr2R 4311933 3' - Quasimodo 436 2 56.79 ATTTTAATGCTCCTTTCATTTTTTGATTCCTAGGTAACAAGATAGCATAAAAATAATTTGAAAACATTTTTACTAGTGAACTTACTCAACAATCTGTCAGA:1 - chr3L 27383072 3' + transib4 58 1 76.24 CGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCATTCCACAGCGAAATGTGTGCGATTTGCGGTTCGTTATTGAATATTTG:1 - chr2L 3979373 3' - 297 6781 2 55.00 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGGTTGCTTTTGGTTCGGCCTGGTTGATT:1 - chr2R 6850434 3' + roo 9044 1 54.46 GGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAAGGCTTCGCCTTTTATTCATTCATACATAGGTTCTTATCATCCGCCGCCAGTCAAGGGAAAAGTAAAAA:1 - chr3L 1646950 3' - rooA 7555 2 82.18 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTGCGTTGGCATTTATAGCTCAGTCCAGGAAGGACTCCTCCAC:1 + chr3L 13773952 3' - roo 20 2 54.65 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATAAGATAGAGACTCCAGATGTTGGAATATGACTATGAAATAGTATACAAGAAGGGCTCCTTGA:1 - chr3R 1849144 3' + Tabor 7308 2 62.38 ATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGCGTGCAATGGAAACGGTAGTGCCAGTCAGAATGGATACGAGGGCACCAAACAGGA:1 + chr2R 17404285 3' - roo 8664 1 63.00 ACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACTCAAAACGTAGCACTTGCAAAATCAGAGCAAAGCAGTTCAGTTCGGGATGGTCCCTCGCTGCCAT:1 - chr3R 18171335 3' + R1A1-element 5319 1 74.26 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTGATTAATAAGCTGGGGAGGGCAATA:1 + chr3R 4474221 3' + copia 205 2 78.22 TGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTTAATCGGTTTATGGTGCACGAGTAATTGAATTTC:1 - chr3R 5135463 3' + 297 6937 2 63.37 AACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCCGGCGACAACGAAACGAAAATCGCTGCGCA:1 - chr2R 19894287 3' + Stalker 6785 2 70.30 TTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTA:1 + chr3L 19339420 3' - Tc1 35 1 54.46 GGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAAACTTATTTATCATAGATTT:1 + chr3R 11151921 3' - mdg3 5254 1 75.25 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGACAGTTGGTAGCCTCAATTTGATTCGCA:1 + chr2L 15531877 3' - Stalker2 17 2 62.38 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGACACTTATTCGCACTTATTATTGCTC:1 + chr3R 10087872 3' - roo 51 2 79.21 TTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTCGCAA:1 + chr2R 6779842 3' - 17.6 6958 1 60.40 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAA:1 - chr2L 16139126 3' + copia 210 2 70.00 AACATTTCTGATAATTCCTTAACAGGTTTTCCCAAATGGTGATTATAAAAAATCTGTTGAACTACTTCAAAACATAGCCGTGGCCAAGTTCGCGTTCACAA:1 - chr2R 23472390 3' - S2 473 1 72.28 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTGCAACGGCGGCTAAA:1 - chrX 4277447 3' + roo 392 2 68.32 AGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCTCACACTGAACAAATTAGGCTGCTGTTCA:1 - chrX 9733345 3' - Cr1a 357 1 58.18 AATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACTACCAAAATACCGTACAGAGTAGTATTAGTATTAGTAGTA:1 - chrX 12085032 3' + Stalker3T 294 1 76.24 GGGGGGCTTGGGAGCGGGGACACAGCATTATCATTAATATGATGAAGCGGGGGGCATTCGAGAGCGAAATAAAAGTGTTATTTGAATTGGCATGGCAG:1 + chr3L 17170611 3' + Rt1b 4738 1 56.12 AAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATTACCCCTTTCTC:2 - chr3R 22869387 3' + Bari1 1671 1 59.41 CTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGATCTATTGGTCAGACACGAGATGATGCAGCATATAACTATTCCATCTTGAATAGAAGGTTGTTTGTTTCCA:1 - chr3L 4009394 3' + mdg3 250 1 70.21 GTCCAGGGAATTCTTTTTTTTTTATAGTTTTCAGTAAGGCATATGCACAAGGGAAGGACTCGACGTCTATATCGTTGGATATTCCGGATACTAAGTTGGTT:1 + chr3L 6167536 3' - G4 10 1 84.16 TATTTCATTTTTTATAAAGTCGTATACATCGCGCAATGGTTACATTTTTTACAGATAAAACTATAAACTTTGTAAAGAGCAAAGCATTCTCTCAGTGTACC:1 + chr2R 16725214 3' - Tc1-2 379 1 65.35 ACCCCGACTCCAGCATCGAGATGACGATACCCAAGCCTTGCTGTATTTCGGCATCTGGAACTGATTCAATAAGTAGAGCGGGCTATGTACCAACTGCACCG:1 + chr3R 4704127 3' + gypsy4 6498 1 74.26 CGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAAACATTTTATTAATAATCGAGTAATCCAGGTTTTG:1 + chr3R 25086189 3' + Bari1 1699 1 71.29 CTTGTGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTAGAGTCCTGGGAGCTTCTGCGTTGGGAATTGGGGAGTCCTCGAAGCAAATTATTATTCATTGC:1 - chr3L 22510589 3' - G2 73 1 66.00 CCACGCAGTCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCACCTCCATCACCAGCTTTTTCTTCGTCTCCATGGGTTCATAATTTTGAGTTTGCTTGTGAAATTGT:1 + chr2R 22445219 3' - baggins 5239 1 66.34 TTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAAATATCTTCTCCGGCTGCATTTTCCTCATTTTCCCGTACTTTTCTCCATTTTTTT:1 - chrX 12214381 3' + 17.6 305 2 67.33 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCACTTTACCAACAACGAGTTTATAATTGTTTGATTTGTGTGCGCGCATAGTGTGCATGTGGTTGTCCCGC:1 - chr3L 12468185 3' - jockey 4680 1 71.29 ACTGGACCTGCCATATAGATTTACAAATAGATAAAAATATGTCAATTTGTATTGGCCAAAGGTCGGGGTGGAAGCAAGGTAGAAAAATGTTGGGTATATGC:1 - chr3L 10124254 3' + G3 4471 1 62.38 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTG:1 + chr3L 12634210 3' - BS 5043 1 74.26 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGAAAAACAAGAAAATGCTAAAATCGTTGAAAAAGAGTTTCTGGCAGAAGAGTGAGATCATC:1 - chrX 8503091 3' - roo 8679 2 45.54 ATCGCTTCTAAATAAATAANTAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGTTCATAGTCATAAAACATTAAATTTCTTTCAGTGCAAAGGCTG:1 + chr3R 25370567 3' + BS 5085 1 66.34 TCGCACTTATTGCAAGCATNCGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAAGCAATTCAAATGCCGCACTTGCA:1 + chrX 12906556 3' + P-element 2836 1 28.71 AGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATAAATATTAATTACTATTTTCCAACATTAATTACCTCT:1 + chrX 14173052 3' + 412 7506 2 63.37 ACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAACTTAATATCGGTTTAAAGTGGTTTAGCAATAAGGAGTCTAGACTAGCGAGTTTATCCTTGCTGGGCT:1 - chr3L 22511126 3' + G2 3048 1 68.32 CTGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGATTATTTATGAGACCCATTAATGGGCAGGTTGTCAGCAGCTCTATTCATCTTGGGGCATACTTTCGGGCCGAGCACA:1 - chr2R 16609385 3' - jockey 4760 1 78.22 TGAAAACATCCAAAGAGACNTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCACACCTCGGTAATTCGATATTAATCTCTAA:1 + chr2R 1144177 3' + F-element 4381 1 70.30 TAATTATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTACTTAAAGTGTTATTATCAATAGTATTTGTATTTTTGCCT:1 - chr2R 6940988 3' + gypsy4 396 1 70.30 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAG:1 + chr2R 22856589 3' + 1360 3355 1 67.68 AGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATGTTACGCAGGTACAGTGAGCAAAGGACATTAGAATTCTGTACAGAAAA:1 - chr2L 7937240 3' - jockey 4549 1 52.48 CAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCAAGTGCACAAAAAGAATCAGAATGACGCTACCGAACGAAAGTATATAATCTTCGTCAGTCCATG:1 + chr4 282168 3' + rooA 7331 2 67.33 AAACTTTAAAAAACAAAAAAAAAAGAAAACTGTCTTTTGATGTCTTTTGTTAAATGTTGTAACATTCTTTCAATGTTG:1 - chrX 1763048 3' + TART-C 11096 2 83.33 GGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGGGCGTTCATTGTGGTCGCTTTTCATGTGTCGCAATCTCTATTAAGGGAACTACATT:1 - chr2R 14576496 3' - gypsy5 6951 2 68.13 TCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCTGTTTACAGACTCTTTGGGGCGATATTTA:1 + chr3R 14584505 3' - invader4 2996 2 71.29 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACTCGACTCGAATCGCCGCCGCTTGTTATTCTGGATTTCCCCCCCGTCCTGACCAAATGAAATCGAAC:1 - chr3R 10488652 3' - roo 6 2 72.45 AAATTATAAATTACAACAGTGTGGATTGGTTGGGGGGGCGGTAGAAACCTGGTCATAAAACACGCCCTGTTGCTTT:1 + chr2L 6276109 3' + copia 259 1 73.68 CCGGCAGACACTGCAGATTTGCGTGGCCGCTACGAATATGAGATCGCAACAATGTGTTCAGTTTCATGTGCCATTAACTGGCTCAAGCCGCTGCGATTGAT:1 - chr3L 3969361 3' + gypsy2 6584 2 62.38 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGAGTAGATTTCTCTCATACCATTCTGATTTACATTATGACAAATGAAAATAATACAAAT:1 + chr3R 15579061 3' - pogo 8 1 69.31 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATA:1 - chr2R 12473058 3' - Doc 37 1 60.40 TGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATCGCCGTACTT:1 - chr2R 22051469 3' - Tabor 6877 2 59.41 TTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCAATTTGTTGTTTACCCTCTTTCGGTTTTC:1 - chrX 15546129 3' + blood 366 2 67.68 AGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGATTGAATTTTCGAAGTGAATACTACTTCCTTTTCAGTGCATAAAACATATCTG:1 - 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mdg1 14 2 42.57 CATGCACACACACACACACACACACAGACAGGCGGGGGTAAATCGCACAAAGATACAGCATGATTGTGTAAGTAAACATGGGGGCCATGTGTTTTTGTGCA:1 - chrX 6147575 3' + accord 7026 2 76.24 AATGAGTTTAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGCCTTTCTCATCTGCTAAACGGAAACACTTTCCCCAGCCTTTGTGCT:1 + chrX 20806824 3' - rooA 7570 2 59.41 GTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCATCTCTAAAATCAAAATGATTTACTTTTTTAATTTTTTTTTGTGGCTCCCTTGAATGATGGCATTTCAGTGG:1 + chr3R 10914204 3' - F-element 80 1 66.34 AGACGAACCTCAGCGAAGGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTTAAAAAAATTCAACAACAAACTAAACTCTTAA:1 - chr2L 9808138 3' + gypsy 7388 2 62.22 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAAATAACAGCGACTAAGGCTAATTTATGTACAAACAAG:1 - chrX 12472537 3' + pogo 2065 1 64.36 TACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATTAAATTAAATATGACTAAAAACAACTATAATGAA:1 + chr2R 18188349 3' + Juan 4168 1 72.28 GACTATATTTCGGGTGTTTNGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCACCTCACATCACCCACATCCAAAATGCGGTGCTGTTACCCAT:1 - chr3R 13739654 3' - Burdock 6150 2 65.35 AACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATGAATTTGTATTCAACATTTTGATAAATGTC:1 + chr2L 14793547 3' + Stalker2 7607 2 67.00 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGATCTATTGGTCAGACACGAGATGATGCAGCATATAACTATTCCATCTTGAATAGAAG:1 - 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chr3R 6991884 3' + Dm88 4267 1 61.39 CCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGTAACAATAAAGACACTCATAATAGCGCTCCGTGAGTAACTTAGTGTTTACATGAAGAAGGCTGA:1 + chr3L 180438 3' + F-element 4219 1 67.33 CCCTCGATATATGCACATACTACAGTTAACAACTCGAAGCGGTATCAACCGGTTTGCATTTGTTCAAAGCGGTTGCTAATGGCCTTTTGTATTTTTTGAGT:1 - chr2L 12459644 3' - blood 7014 2 74.26 CTTTAAATATATTCGTGTTNATGTGTGAACAGCTAATATCCAATAATTAAGCACTTCCGCAGGGAAATTGGTTTTTAATTGAAATGCGGAGCAGTGTGA:1 + chr3L 12241904 3' - roo 10 2 68.69 GATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAATGCGAAAAAAAACAAAAATTTATTATCAATTCCAAATGGTT:1 + chr2R 3550650 3' + Doc2-element 4717 1 70.30 AGGGCCACCCTTGGAGTTCTCTGGTTTTTAGCTCTATATCTCGTGTCCTGCCCCACCCCCCATTTTTTTCCTGTCCGATCTGTTTTTTGTGATTTGGTTGA:1 - chrX 7996349 3' - hobo 2 1 70.30 AGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTTCACTAACAAATGTCTACAAAGTACACTTAAAAACCCTTGATAGGACATGCTATTCTGTTTTTTCCTTAATAAATAA:1 - chr3R 20094422 3' + Max-element 8530 2 73.27 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGGCCA:1 + chr3L 5241163 3' - Ivk 44 1 71.29 CAAAACAACAAAAAAAAAACTAAAGGTTGCATTAAATCCTGTTTTTGATCAATTTAGAACAATATATCATCAAATCTTTATTCTTTTTAAATACTTTCAGG:1 + chr2R 18789300 3' - Tc3 87 1 77.23 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAGGCAGCACCAAAAAAATAGGTTGAACATATG:1 + chr2R 18766260 3' - hobo 45 1 72.00 ACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAAGCACAGAAGCAATCATTAAAAGTCACTGGCAAATTTAGGCGACTCATTTTGCACGGATT:1 + chr2R 6609974 3' + jockey 4597 1 62.38 TAATAATAATATTAATGTTAATTATTACAATCTACTATAGCCTTAATTTAGATTAACCAGCCCTCTTTTGCGAGACGTTAATTTCGTTCTATTCATTCTCA:1 + chrX 7374246 3' + mdg1 7080 2 64.36 CATATAAAAGATAAAACCANACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATT:1 - chr3R 19589922 3' - BS 5020 1 51.49 CCGACCCGTTAGATCACTTGAGAACATTGAGATCACCTGAGAGCGACAATATAGCGATCTCCACGGCGTTCTGCACTCAACACAACTTCCTGCACCTTATT:1 + chr3L 25485069 3' + mariner2 337 1 73.27 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAAACTAATGGCCAAGTTTAGAAATTACAACCCGAACAGAATT:1 + chr3R 28621083 3' + 1360 3355 1 63.37 TCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATGAGCAAAGCCAGATGGATAGCATTC:1 + chrX 2841825 3' - hopper 48 1 73.27 TCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAGTAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCTCCGTAGCCTATTGTATACTACAATATATTTAATTTTGTTAAGTA:1 - chr2L 3813588 3' + Ivk 5265 1 57.43 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGGATGTAGACGCGTTAGCAGAAGTTTCGTTTCCTTTGTGACTCAAAGACAGAACTGAAC:1 - chr3R 6266280 3' + roo 9055 2 62.38 ACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATCGCCGTACTTAAATCACTTTCTCGTATAAATATTCTT:2 - chr2R 22051442 3' - Tabor 6850 2 66.34 TAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAAAAATGAGGAAAAGCGGTTTCCCAACTTTAAAACGCAACACTTGTCGCGCCCACGGC:1 - chr3R 14141689 3' - 297 6881 2 51.49 CATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGCATTTTTCTTGTTTTTAACTAATGTCGCGGATCGATAATTGTAATCGA:1 + chr3L 24402221 3' + INE-1 535 1 59.41 CTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACTTAACCCAGAAATCTTTCTTCATTTTTTGGATAAGTCTCCACCTATCCAAATTTCCGATTTTTTCATCT:1 - chr3R 19447800 3' + Quasimodo 7084 2 75.25 TTTGTTTTATTTTTTTTATTTTGGTCTTTTTTTGTTATTTTTTTCTCTCTCCCAGAAAACATGCGAAATGCGCATTAGTCGCTAGGTGGTAGTTAGGATCT:1 + chr2L 5408955 3' - F-element 4686 3 76.24 TAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATAGCTTAGGATCGAAAGCTAAAGTGATGTACATTTTAGACTGTTCAATTATTAAATA:1 - chr2R 6779759 3' + 17.6 473 2 59.00 GAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTGGGGTTAAGAGGTGCGTGTTCAATCGATGCATTGCATTCTTCAGTAGCTTTTAATTGTCTTTCGGAAG:1 - chr3L 22820099 3' - F-element 4494 1 68.32 CAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACCTACCAACTCATCCTCCTCCTCCGAACTTTATTTGACCTAACCAGTAGAAACGT:1 - chr3R 16295044 3' + I-element 4999 1 56.44 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTGTTCCCGAACTGCATATACATATATTAACGTGCGTGTGCGCCTCCCTCTTGT:1 - chr3R 24976725 3' + opus 7482 2 60.40 GTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGGATTTGGGTAAACAACCAA:1 + chr2L 21403564 3' - G5A 2435 2 64.36 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAAACCGTATGCATTATACAATATATGCCCACATCGGTTGCGCCAGTGTATATATTTTGAAATTTAA:1 + chrX 12472630 3' - pogo 7 1 77.23 ATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCAAAAAGAAAAATAAGAGCGACATGTGTTTGAGATGAAGT:1 - chr2L 1068626 3' + FB 969 2 68.32 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAGAGGTGGATGAGCGGGAAAATTGATATGC:1 + chr2R 19061296 3' - roo 8690 2 53.47 GAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCAATTGAAAAGCCACCAAACATGCGAATCAATCTGCTGATGGGCTAG:1 - chr3R 10110392 3' - Doc 3 1 74.26 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAGCTATGAAGCTCAGCTTGTTTGTGCAGTTTAGCCGCGGAAATGTA:1 - chr2R 6107727 3' + roo 9041 1 58.00 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAGCAATGGCTAAATAGTTTTGCATTCGATAACA:1 + chr3L 12438058 3' - I-element 47 1 72.28 TGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGAAGCAGATAGTTGAGTTGGGCCAATGCC:1 - chrX 6093545 3' - Doc 4548 1 72.28 CAGTGTGTAATCAGTTTCTTGACAAACTGTACATGTATTCTTAATCAGGATAACTAGCCCAGGAGGACTGTCAATGTCAGGCCAGTCGCGAAATGTCAGTC:1 - chr3R 14594097 3' + S-element 1708 2 64.36 ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGTCGTTGAAAAAGTCCGCGAAAAGTGGCTAGGACCATGAGGAAT:1 - chr2R 12457918 3' - HMS-Beagle 6824 2 55.45 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGGCATTTTTTATTTACATATATATAATATAAT:1 + chr2L 21976754 3' + roo 9028 1 77.23 CGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTA:1 + chr3R 1977616 3' + micropia 420 2 58.42 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTTTTAAAAAAATATTTATTTTGTATTTAGTA:1 - chr3R 26317933 3' - roo 46 2 74.26 TTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTATTGCCATTAGGAGGAACCCCTTCAAT:1 - chr2R 18188294 3' - Juan 4040 1 63.37 TTGCTCTTATGTACTTAACTTTGGCAGCGAGAGCGCCGCTGTCTAAGAGAGTCATGTGGGCGAAATCTCGCGTTATGTGGTGGCAATGGTTAATGGAGCAA:1 + chr3L 8567787 3' - Tabor 7088 2 58.42 TAGAACTTGCTATTCGTAGNTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGCATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGC:1 - chr2R 12473067 3' - Doc 46 1 66.34 TTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCAGCTAAAATCACTCAATCAGCTGTTGCCTATCGATGAGCGGCGAC:2 - chr3R 27116718 3' - P-element 29 1 46.53 GTAACGAAATAAATTGATCGAAGGCAAAGTTCCATTAGTGATGGCAGGAGA:1 - chr3L 23748790 3' - Gypsy12A_LTR 2251 1 52.94 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGTCATA:1 - chr3L 3757342 3' - roo 8696 2 63.37 TGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACTAACAACAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTGCATGTGATACAAATAATCCAAAATACACATTACA:1 - chrX 22689521 3' + 1731 301 1 65.35 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATTTAACTAGCAACTCGGCTATGG:1 - chrX 13146901 3' + roo 9053 2 60.40 ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACAAAAAGAAAAGCTTGGGAGTACACACATAGCTTCCC:1 + chr2L 17079922 3' - jockey 4782 1 73.27 ACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATGCCCCATCCAGTAAACTAATACACTGATTAAATTGGATTC:1 - chr3L 11627705 3' + mdg3 5286 2 66.34 GATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTTTCTTCTTGTTTTTAATTTAATTTATTTTCCACCTACTTTGGTTGCCAGTGTCTGGAGGAGCAGTGAAA:1 - chr3L 10006619 3' + INE-1 564 1 63.64 TGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACTGAGTCGAGAGAAAGTCATGCATAAAACATA:1 - chr2R 12812085 3' + jockey 4705 1 69.31 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGCAATGCAGCCGCTAAATGTGTGCAATTCACCACTTGAGAA:1 + chr3L 10363882 3' - P-element 33 1 47.52 AACTAACAAAAATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGATAAAAATATTATCCGAAAGGGTGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATA:1 - chr2R 16731986 3' + Dm88 4280 1 57.43 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCTTTAAAGCCAAAAAATGTTAAACATAGTGACTGTTTGGTCAAATGCAGAACGGCACAGTTAT:1 + chr3L 2022324 3' - roo 8678 2 66.34 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAATTGGGATTTTACAGTTATGTTAATTGGGTTAGTTATTGAAATGAAAAGCCCTAAACGGATTTGTTCTAATAAT:1 - chr2L 21086015 3' + roo 9052 2 60.40 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTCCTTCGACTACTTGTGGCTCTTCGAGGTCCCTGCAAC:1 - chr2L 8622738 3' - 297 6590 2 71.29 CTTCTAGCTTTTCTAGTTTCTGAGCTCTCGACGTTCATACGGCCAGGCTGGAATGACTTTCCACACTTCCTATAACCTTGCCTTGTTGAACTAACAAA:1 + chr2L 7859135 3' - INE-1 155 1 59.18 CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGCTTCCTTCCTGCAACGTCCTGCCATGAGCTTGAGTCCTTCTGCACACTTGGGATCCAGGTTGAAG:1 - chr2R 17138670 3' - 3S18 9 2 70.00 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTGGATTGGTTGGGGGGGCGGTAGAAACCTGGTCATAAAGCACGCCCTGTTGCTTT:1 + chr2L 6276109 3' + copia 236 1 58.59 ATTTAGTGTTTTGTGTAAANAGTTTCTTGAGAGTCTCAAAAGTGTGTAACTTTGAATTTGTTTTTTATTTTCTTGTTTATTTAATATTTTTAATTT:1 - chr3L 25851221 3' + S-element 1492 1 89.58 AAAGGTGGCCTGACGGCTGNACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAAATATTGGTTTATTACAATTTGGCAGAAATTAATTGCCTGT:1 + chr2L 7175607 3' + blood 7334 1 79.21 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCCACGAGCCAGAAGTAAAGTTTATATTGTCGACGTTTTTATTGATATCGTAAAATTTGCAA:1 - 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chr2R 15788549 3' - Transpac 4924 2 75.00 GTTATCGTAAATAGAATGACTTTCAGCTGATCGTGATTTCCGCCAATGGCCTAGACCCCGGCTTGAGTTTCATCCACTTGCTCGGAATTTTAGCTAAGTAA:1 - chrX 22819714 3' + Gypsy12A_LTR 181 1 68.32 GTACCCCAAAGCTGTATGCCATAAGTCCACACGGGCTTTATTATAGCTTTGTATAAACGGACTTTCGGCTGCCAACGGGATCAATTCGATTTTGGCCAAGC:1 + chr3L 6582326 3' - G4 3436 1 62.38 AAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATATAAGGTAAAATAACTATTATTAATATTATTATTAGTGTGAGTAGGACCTAATTATGTAGTAAAAAATTTAAA:1 + chr2L 259003 3' - Cr1a 4343 1 76.24 CTTACAAAAACTCAACGAGNAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCAAAACAAATTAAACTAATAATAGGAAG:1 + chr3L 7099659 3' + roo 9047 1 54.46 AACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATACGTTCTTACCACATCATGTGACTTAATGTCCGGGATTTGCATTTTCAACACTTCCATTTT:1 - chr3R 6947310 3' + I-element 5343 1 66.34 TTATGAGTTAATTCAAACCCCAACGGACATACATATATGGACAAACGGACAATACCAATTTTGCGGCGAAATGGCGGGCAGACAGCTTAACTTCGAGCAGC:1 - chrX 1990742 3' + P-element 2732 1 77.23 GATGTCTCTTGCCGACGGGNCCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCCCACCGAACAAGTGGGTTTCATTGTCCAACATTCACACGACCAGCAAATCCATC:1 - chr2R 21040843 3' + P-element 2865 1 51.49 TGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGGAGGACTTGGGGATTCCGAGCCGGAGCCCGA:1 - chr2R 8190989 3' - F-element 4585 1 69.00 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATCTGTCTTAAAATAGAAAATGAACATAAGGCGCACATTTGGCATATTTTATGAGGATATATAAT:1 + chr2L 4134921 3' + Quasimodo 7361 2 73.27 TCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAGTGGTGCTGGGCGGAAAATTAAAATT:1 - chr3L 11006306 3' + 1360 3337 1 80.20 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGATTATTTATGAGACCCATTAATGGGCAG:1 - chr2R 16609434 3' - jockey 4809 1 74.26 TTTAATATAAGGCCTTTTTATTACCAATAACTAGGAAAGCGATGCATTTAAATGTAAACAAAATAAATAACGCTTATAAAACTTTATGCTCAGTGTACCAT:1 - chr2L 11940605 3' + S2 1652 1 79.21 AGTCCGAGGGTCAGCATTGNCCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCACTTTACCAACAACGAGTTTATAATTGTTTGATTT:1 - chr3L 12468219 3' - jockey 4714 1 60.40 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTGACAGAATATGTTCTTTAAAAGTGATGAGGTTTTGTGTTGTTAAATGTAACGATT:1 + chr3R 16601514 3' - roo 19 2 76.24 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATGGCCAAAGTTGGTGCTACGCTTGGGAT:1 + chr3R 12767363 3' + blood 375 2 73.33 AAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAAACATTTTATTAATAAT:1 + chr3R 25086171 3' + Bari1 1681 1 53.47 GACTCGCTATCTAGAACTAACTGTACCAAAAGCAAAAGCCCCTAGTTAACCCGTCTGAGGCCACATTTTATTTGCCACCTAGTCTAACCCCCTCTTCCAGT:1 - chrX 6134653 3' + accord 301 2 80.20 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTTGCGATGTAGGCTTACG:1 - chr3L 14623930 3' + hobo 2902 1 61.39 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTATTTCAGGGAAAATACAGTCACTTAACTTAGTTGACTTTAAT:1 + chr3R 31190844 3' - pogo 29 1 58.42 ATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGA:1 - chr3L 27356089 3' + Tc3 1673 1 64.36 ATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATTCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACGAAGATACATCCATCCTGG:1 - chr2R 15788542 3' - Transpac 4918 1 79.21 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAGAAATCGAAGAGCTTCATTCGTA:1 + chr3R 8582637 3' + roo 402 1 72.28 CTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGGGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTATGGGGCTTTAAAATAATCAATATATTCAAGGTATGTGTACAAG:1 - chr3R 26766535 3' + mdg3 5390 2 55.45 GAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAAAATTATTTCCCCGTTAAATGCTTGAATATAAAATGACTGCCTC:1 + chrX 22383363 3' - invader1 3620 2 37.62 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTGATTGGGGAAAAGTGTAATAATTTGTGGGTGGTTAGTTGTTTTTGGGTTCTTTCTTCTTCC:1 + chr3L 14216648 3' + roo 9037 1 47.52 CATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGAATACATCTCGTTGTTTAAAGGGCGCTGCGATTGACCAGCAATGCTGGCT:1 + chr3L 21146841 3' + 17.6 6 2 54.46 AAACAAAAAAAAAACAAGGAAAAAACAGGAGAAGAAGGTGTGAAAGGTTGGTAAGGAAATGCGGTCATCCCAAAAGTAATATTTTGCTTATTTTTT:1 + chrX 16250874 3' + transib2 2642 1 53.12 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATTTATTGTACTACGTGAATGTCAAGTGTG:1 - chr2L 20684287 3' - I-element 46 1 75.25 TGATGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAAAAAAAATAAAATAAACGTTTTTGAATATTTTTGGAGTATTTTTTT:1 - chr3L 2936147 3' - accord2 7361 1 74.26 TTTTACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTTTTTTTTTAGCGGAAATGGGAGTACGAACCTGTATTGATATTAACCAC:1 + chr2R 18296089 3' + S-element 1703 1 60.67 CCGACGTCTGAAAAGAATACATCCACATGAACTCCTTACACGTAAGATAGCATAATCTCTTCACGGTACATTTGCACAATTGAAATAAGGAACTCGAACTA:1 + chr2R 3176048 3' + G5A 2676 1 73.27 GTTGCCAGATCAAAACATATAAAGCTTATTTAAATTATAACGTAATTTCAACAATCTTTATCGAAAATAAAAACATAACTGCACTGAGAGCTTGAATGGAA:1 - chr2L 21957334 3' - Copia1_DM 32 1 59.41 ATTCAATATCTATTACACTNAGCTATTACTTATTACATATTACACAGCCACGAAGTGGGCTTAAGACCCACACTCACAGGACCAGCTCTGCGGCTGATTGA:1 - chr2L 15531783 3' + Stalker2 7629 2 56.44 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAG:1 + chr2R 19061268 3' - roo 54 2 79.21 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGATATGACAGCATTTTTCCTTCGCAGTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGG:1 + chrX 15903347 3' - Transpac 12 2 46.53 ACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAACGTCGACACCGGTGGTTGGGATGCACTTGC:1 + chr2L 1017735 3' - blood 476 1 69.31 AACAGTTAGTTTAAGTTCCAATTAAGCGATCAACATCAACTAGAACTTTAACAATGATTATTCATTTATATGTGTATCACTCGTCAAGATTCCTTATCAAA:1 + chr2L 21581137 3' - Bari2 190 1 52.48 TTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGCCTGTGGGTAGGTTAATAAAATGTTGTATTTTCCACTACGAAAGATCTCTGATCAATTC:1 + chr2R 8087122 3' - flea 12 2 67.33 GTTCGTATTGGCGATCTTCGTTTAATTTTTTGCTCGTCTCCGTTTTTTCGTTTGCCCTGTCGCTCCAGACGTCCCATCTAACTCTATATCTGTACATCTGC:1 + chr2R 15304784 3' + accord2 142 2 55.45 TAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTTCACGACCCACATCCTGACCCGCTCTCCGCGTTTCCCGCTCTCCATTGTGGGCAGCCCTCGAGGTTTCACGCTCCG:1 + chr3R 20771036 3' + Tc1-2 96 1 82.18 GTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCTAAATCGCACAATCAAAAATAGTTGTTTTCACAAGCGGAGAATATGAAATAATTCAGAGGTATTCATATT:1 + chr3L 5710343 3' - Transpac 4920 2 77.23 TACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGCATAACATTTTGTCCGGAAATGGGCATGGCCTAATCATCT:1 - chr2L 14220153 3' + springer 7483 4 60.40 ATATACTAATGGACGTCTCAGCTTGCTGGCCCTT:1 + chr3R 19450201 3' + roo 8622 1 88.24 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATATTTAATTGATAAAGCAGAAAGACATTCGTAAAGCGGAGGCTGGTCGTCTCTCAGCGAT:1 + chr3R 17003394 3' + pogo 2089 1 66.34 CATTATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGGGAAAATTGTTCACAA:1 + chr3R 433139 3' + 1731 4598 1 50.50 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCTTGTTGTATGATTTCAAAAGCGATGTAATA:1 + chr2L 6362906 3' + 412 449 2 70.30 CTTTTGTGATTGTTCTGAGCATTTTTTTTTTTGTTTTGCTTAATTATAAAACTGAGTTTTGTTTTAATTGGATCCCGGGGGTTTTCGTGGCCAATTCAAT:1 - chrX 12980556 3' - Porto1 4344 1 38.00 TTCAGGTGCGTTTTGGCAGCGATTCCGTACACCTGTGTGGCTCTCCTTCGTCCATTCCGTTGATATTCCCAGCTCTTATCGCTGCTGGCCTTTC:1 - chr3L 1962739 3' - jockey2 2929 1 62.77 AACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCTTCATCTCTTGCTCTTTGGAATTTGGGG:1 - chr3R 27495630 3' + 412 478 2 64.36 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGTGTTTGGCAGACATGGGCAAGGCAATGCAACTGA:1 + chr3R 17053161 3' + hopper 1412 2 76.24 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAGATTGTTTTCAGCAAATGCATTACTATTGTCTGTATTTATGTGGTGCTAGCTCGCT:1 + chrX 15800977 3' - roo 8682 2 62.38 ATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAAC:1 - chrX 4166394 3' - I-element 5336 1 69.31 GATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAAATGCACTAACCGCTTCCGTTTTTTGAAAAGCAACGGAACTCCA:1 + chr3R 20696549 3' - jockey 9 1 70.79 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAGCAGTCAACAAAGGTTTTTACCCAGAAAATTAGGG:1 + chrX 10451522 3' + hobo 2901 1 63.92 TTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTTACAAAGACATCTCCAATTTACATATCAACAGCAATATGCTAAATGTGGCCAGCACCTGGA:1 - chr2L 1858040 3' - invader4 2625 1 68.32 TGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGTCCGGCAATTTCCACTGTTTTTTACGACCTTTTATGGCAGGACATTCTCAGCAAATTGAA:1 - chr2L 2061151 3' - Max-element 65 2 61.62 GTTTTATGTTCTCTTGGTGTTATACAAACTAGTGAAATCTTTAAAATTTCTTTGGTTTTCTAAATTAAACTTGATAATTTATTTTTATTTCGTTAGATTTT:1 + chrX 18007806 3' - I-element 455 1 49.50 TATTTAATATAAATACAATACTTTCCGTTTTTTAAAAAGAATTTAAATCAATTAAAGCCAAATAAAAATTAAATGTAAAATACATTGTAAAAACTGCATTA:1 + chr3R 18433619 3' - Bari1 1397 1 87.13 CCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTAATGTTATTGTTATATTGTCGCTCGGTGGTGAGAGCCAAAAAGACATATATAAGCCCCATCCTACAAGTATTCCACG:1 + chr2L 20778038 3' - hopper 939 1 76.24 GGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACCGAATCTGCTAAATTTCACACACCACTTCGTGTGAAAATAAACCGAATTTAAATTTAGATACTGCGTGGGC:1 - chr3L 11929242 3' + copia 251 1 72.28 CGCTGGCGTATCCGGCAGCGCAGCTACGCAGCTTAGCCTAAGACGAAAGATATTTTGTAACACCCACATCGATGTGGAAATCACAAGTACACAAAGAAATC:1 + chr2L 7931971 3' + 412 301 2 62.38 ATACTTCAAATTTGCATACTTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTG:1 + chr2L 12882789 3' + hopper 1367 1 69.31 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTACACCATATACACTATATACACACACAAACGCACTGAGAATATATATGTAATATTGTTATTCTCGTTTT:1 - chrX 5219672 3' - hobo 7 1 70.30 TGATGGTTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCAATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGCGGAGCTGTGGCTCTGG:1 + chr3R 12199802 3' - jockey 67 1 78.22 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATC:1 - chr3R 23638114 3' + pogo 2054 1 81.19 AGAGAAATTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTAACATCCACATCTGCAATTTTTGGGTTTTGCGATTTGGTTTGTTTTGGTTTGATTTATTCAAAGCTCC:1 - chr2L 14134522 3' - I-element 468 1 55.45 CACACACACACACACACATCCATAAGGCTGTGCGCATTTCCGCATGTCACACACTTGGGCGAAATGTAATTAAAACTTGCCATGCAAGTCTGCGTCTGAG:1 - chr3R 26399957 3' + accord 7032 2 70.00 TTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGATAGAGCTACACCTGCATTGGATGGTTCTG:1 - chr2R 18723014 3' - HMS-Beagle 7 2 72.28 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCC:1 - chr2R 15788582 3' - Transpac 39 2 59.41 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTACCTTACTATACTTATATGTCTATCAACTTTTTAATGCCAATTAGTGT:1 - chr3L 19249678 3' - Transpac 4951 2 63.37 TTTGAAATCGCTGGATCTTNCTTCTATGTGCTGTGCAGCAAATACATTTGTTTTTAATAATATATTTTATACTAGTATACTAGATTCCTTGAAAAGTAT:1 - chr2L 22211546 3' - G2 2709 1 65.66 AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGG:2 - chrX 21668013 3' + Tabor 7306 2 51.25 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTGCGCCACACATATCTCTGCGTTGTG:1 - chr2L 10199014 3' - I-element 51 1 71.29 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAATAATAATAGAACATTTTGATTAAAGTGTATATGT:1 - chr3R 12944684 3' + roo 9031 1 71.29 AGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCCCGCCAATATACCGAGTTGTGTGAAAAGGGGCAGTTGCTTTGGGCTGG:1 + chr3L 22044047 3' - R2-element 3374 1 54.46 CTAGAAGACGATTTTCGGGCCGATATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATTTTCTGCATCGAGACATCAAGTGCTCGAACATTTTAATGAACAACAGGTGGG:1 + chr3L 21520774 3' - 1360 3193 1 55.45 AAGGAAGTTCTCGCCCAAATAGGGTCAGCCGAGGGCGTGGAGTGTGGAAAGTCACTCGAAGAGCACCATCTACAGCCGCAGTTTTCTGTGCCAAAGTTTTT:1 + chr2R 8984574 3' + springer 7079 1 66.34 CAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCATATCGCATTTTATCAAACATAAACACACACTCACAAAC:1 - chr3R 29287502 3' - hobo 35 1 62.38 ATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAGTTATAAGTAATTTAACGCACTTAACCATATCGTATACAAA:1 - chr2L 8619083 3' + Idefix 7064 2 74.26 TATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTTATTGATTTTCGGCCAGGAGTGTGTTGAGCTGTGGTGGTGACACTTTAAAAAGGG:1 + chr3L 12632433 3' + BS 5029 1 60.40 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGACATTTGCTTGCCAGGCTCAAAGGAAACCATATTTCCTCAACCTCATGATGTTACGA:1 + chr3R 27056444 3' - jockey 35 1 50.50 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAA:1 - chr2L 20560351 3' - F-element 60 1 72.28 CATCGTCCTGGCATGGAGTCCACCAAGTCCTGCCATTTGTGTTATTATGTGTTTTGTCCATTAGCAGCACTTTTGTCGGGTTTTTGTTCAATTAGCAGTTG:1 - chr3R 4833126 3' - Tc1 1290 1 68.32 TTATTATTATTATTAAATTATTCTGTATAAAAATTATGTACTTTGGAATTAATTGTTTTATTTTTCCGTTTCTATCCTAAACATATCGATTTATATCCTTA:1 - chr2L 10534442 3' - invader3 5054 1 84.16 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACA:1 - chr2R 4673555 3' + Quasimodo 7361 2 72.00 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCACTCCGGAAGCGGGAGCAATT:1 - chr2R 23519244 3' - jockey 4814 1 76.24 GCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTCACAGTGTGGCTGATGATCGATTGCGAT:1 - chr3R 28621034 3' - 1360 48 1 76.24 GTGTGACAATAAGTAAATCTTATAATCAATACTTAACTTAGATGGAAAAAATTCTAGTGTGGAGAGACAATTTTGGCACCTCAAGAATCAATTAAAAATAA:1 + chrX 20385199 3' - G4 3808 1 77.23 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAGTCTAGAAATTGATTAGCACTAGATTAGCACTAGAAATTGAGATGGAAATGGAATG:1 - chr3L 17140595 3' - F-element 31 1 51.49 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAACAAGTAAACTTATGGAAAAAACTATAAAAGTGGCAATTACAGTGTCTTTAACGCGGCTGATCGCAGG:1 + chr2L 22197300 3' + roo 401 1 73.27 ATTTCAGCAGCCGCCGCAGNAACCACAACCAAAGGAAGCCAACGAATCGAAACGGAAGAGCCGAGGAAAAGGGTTTGAGTTTCCCTGACTTATAAAACATT:1 - chr2R 9470938 3' + Max-element 263 2 70.30 GTTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGTGCTATTAAAAATTTATATAAATACAAACTAATGAAAGTGCTGCCAAAGCTCAATTGGAAAAAATAGTTTAATTAG:1 + chr2L 8621881 3' - 297 493 1 77.23 TTTTTCTTGCATATCGATAGATATTAGGGAATAAAATGAGAAAGAATTTTAAAATTGTTCAAAAGTGTGTTCGTAGTTGTGTGGCGCCATCTGTAGGTAGG:1 + chr2R 20884535 3' - INE-1 500 1 68.32 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATTACCCCTTTTTGTGCATAGATTTTCCATCTTGTT:1 + chrX 9775043 3' + 412 449 2 68.32 CATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGACTAACGAACTTACGTGCCGCTCCTCGGTGACAACAATCAGATGATTATC:1 - chrX 15185136 3' + I-element 309 1 58.42 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTTATAAAATCGATGAATAGCATTTATTACATACATATGGCTTTAACGATCATTTGCAGGCTCTCACACAATC:1 - chrX 17104370 3' - 297 6583 2 78.22 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACATAATGAACTGCATATACTTAGGTAACAAACGAATTTTCCTATAATTTTAAATTACGGTTTT:1 - chr3R 19949284 3' + mdg1 403 2 53.47 CATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAGGTGTGTGTGTGGGAACATAAAGAAATACGCGGTACTACTGGTAAGTTGTCTAATG:1 - chrX 9205495 3' + diver 204 1 56.44 CAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGATGCACAATCTATGCAGTAAACTTTATAATAAACAGTATTGTACTTGTTTGTTTGCTATTAGTTAAAGAAC:1 - chrX 18372605 3' - FB 667 2 72.28 AAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTAATGAGCCATCTGTGGTCGTCTAATCCATCGCGAACTCATGCGA:1 + chr2R 9531603 3' - diver2 4667 2 57.43 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCCGTCGTAAAACTGCTTAAAGTTCCGCATTAAGCTTGTGGTTCG:1 + chr3R 9088632 3' - hopper 30 1 55.45 GCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAAAGATACTTAAGATAAGCTTAGCTACGATAC:1 - chr3L 7666088 3' - Circe 7365 1 74.26 CTGTTATGCAGAACTAAACNTTAGTCAATTATAAATGCATGCATTTGGGGTGGAGAATTGGGGACACGGCAAATGACATCGGCGACAAGAAAGATGACCTG:1 - chrX 2087276 3' + Transib-N1_DM 397 1 55.45 TTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATACATCTGTCTACTTCTAGACTCCGAAACCCAAAATTTTGTAGTGCACTTTCAAACATCTGAAACC:1 - chrY 424972 3' + McClintock 469 2 65.35 GAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTGATTTAACGGTTTTCGGGTCTCTTGTATTACATTCTCAAAACTACTTTCGGCAGAATGATGAGTA:1 + chr3L 24356104 3' - Doc 4645 1 66.34 TGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAATGGACAACCGACGCCTGGAAGTAGGCTGCAATAAGCCATAAATATATATGA:1 + chr2L 17998337 3' + BS 5079 1 57.14 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAATCAATTTATGAGCGGCCTGCCTTATT:1 - chr3R 7469950 3' - Doc 35 1 51.49 GTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGC:1 + chr3R 14860189 3' - BS 5047 1 76.24 GAAGAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTGTGAGCCTCGACATTGATTTATATTCGTTATTTG:1 - chr3R 24085315 3' + invader3 5421 2 64.36 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAA:1 + chr3R 7626429 3' - hobo 50 1 76.00 AACCTCGAACGCACGCAACNATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGTGCAGGGGGCACCAAAATATAATCCATGCGGCT:1 + chr2L 10607955 3' + HMS-Beagle 6646 1 66.34 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCTTCATC:1 - chr3R 27495652 3' + 412 7511 2 57.58 TGTCATTAGAGTATTCATTTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCATTTTATTATATATAAGTCCATATGCTATAC:1 + chr3L 12109666 3' + 1360 408 1 70.30 TTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAAAAACGTTGCCTACTTCCCTGCGCATAATTATGTTG:1 - chr3L 20049593 3' - jockey 4761 1 77.23 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGG:1 - chrX 21668009 3' + Tabor 450 2 57.43 GAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACGTTCGAAAACCACGTCTGCAGATGG:1 - chr2R 9905369 3' + mdg3 196 2 73.27 TTTCACAATTCTGAAAATCCAGTGAAGAAAAAATGTCGTTTCCTGGTGGAGCGTTTTTCGGTACCTACCTTCGTCTGCAGTGGCGGGG:1 + chr2R 23191123 3' - mdg3 494 1 67.05 TAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTT:1 - chrX 14317416 3' - 1360 52 1 69.31 AGCTGTGATAAATAAAAGAAAATTCTATGGATATTAGCTGTAACTTTTCTCCTCATTAGTCAGTACCAAAAAGAAGAATAGCTTCTACCAACAATTTCAAT:1 + chr2R 21903077 3' + gypsy4 432 2 58.42 GCTTGGCGGCGGTTATGCTCGCCATGATTTTACGATTTAGGATTTACATTGTGTTAGAATTAGTTTGTGGCAAGTACAATTTTTGGATATTTTTG:1 + chr3R 28536939 3' - TART-B 10322 1 84.21 AAAGTGAATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAAAGTTAAAAAACTCATATTTTAGTGGAAGATTCGGTTGCCTTTACCTAGTTTCTGCACTG:1 + chr3L 21159312 3' + HB 290 1 65.35 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATAACTGATAATTGTTCCAATTTTTCAACTGTTCTATCGAGGTGGAATGTACATAAACCATTCTAT:1 - chr3R 11916527 3' - roo 9 2 70.30 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTGTATGGGCCAACTAACGCTACCTTTACCGACTGCGGTCAGTGGGTTGGC:1 - chr3L 13785360 3' - pogo 22 1 55.45 TTTTTATTTTATTTTATTTGCTATGCAATTAAATTTTGCTATTCAAACGAGAGCAGTTGGCGACCCAAATCTGAACAGAGTTTCGCCAGAATATATGTCCA:1 + chr3L 18255383 3' + transib1 1900 1 74.26 GGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAAGTTAAGGCTACTTTCAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCAAATTTAAACTTTGTATTTTGCC:1 + chr3L 23866745 3' + 1360 46 1 72.28 GTGTATGTTGTATTGGGGTNTATATGTTGTAAGTGCGGTGATATGGTGTGAAAAACAAAACTATATCGAAAATTAACAACTTTCGCACGACTTTTGTTGTT:1 + chr3R 30282754 3' - Idefix 65 2 72.28 TGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAAGCATT:1 - chr3L 1586724 3' - Tirant 8133 2 56.04 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAAATAAATTCAATCCCACATGAGATTAGCAACAAG:1 + chrX 12389110 3' + I-element 5309 1 67.00 TCGCTTTTGGGTTCTTAAGATTAGGAGAAGATTCAAAGAGAGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAACGAATTCTTGAATAGAAAC:1 + chrX 22969924 3' - 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chr2L 9045424 3' + jockey 4955 1 63.37 GTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCCAACTTTATTAGATACTTTATCAGATAGTTCGAATTCATCTAGTCACAACTG:1 + chr2R 16661178 3' + I-element 5015 1 54.55 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATTTAATTCACCTCAAACATTTCCAGCGTTTAATTGG:1 - chrX 12389068 3' - I-element 41 1 66.00 CAAGAGAGATTGCTATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGCCTCTAAATGCTCGTTGTCAGCTGTCCGCGCATTTCCTTTGAAATTTGTCGAACTCAAAATAG:1 + chr3L 2815225 3' - INE-1 578 1 68.32 GAAGTCGTCCCCGGATTCAATGGTCTTAGATGGTTGTTGCCGTCTCCACACCGGCAAAGGCTCCAAACGGTTGTACAAATGGCATAATTATGGG:1 - chr2L 12596197 3' - gypsy10 5604 1 63.83 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTCTTGTATGAAGGTCGAGAAGGTCTCAGGAACTATAATAGCTAGAAGGTTG:1 - chr2R 1751259 3' - 297 8 2 67.78 TTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTATATAACATGAATACATTTTCATTCGCCT:1 - chr2L 13422262 3' - F-element 4364 1 71.29 TGTGTTAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGCTGTGCATGTGAGAGATTTGTATGGAAATTGGCGCAAAATACGCCCAAAACTGTGTTTATTACAATGTGTGG:1 + chr2R 18714941 3' - accord 7036 2 77.23 GTTCCCCGACTATCAGATACCCTTACTACGCTAATTCGCTTGGCAAAAAGTTTTTTGGCAAATCGATAGAAACTTAAGCGACTAAAAAAATTATGGAAAAA:1 - chr2R 15007928 3' - INE-1 556 1 53.47 TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGC:1 + chr3L 8039414 3' + hopper 1386 1 54.46 TATGGATAACATCATTTTTGATTTAACAAAACATACCATTCGCGTGTAACTGTAATTGAACTCTTTGTTTTAATAGTGTCTAAATACTTGTGACCACTCGT:1 - chr2R 4709943 3' - Tc1-2 1486 1 75.25 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCAAAACAAATTAAACTAATAATAGGAAGCGTTTTTCACG:1 + chr3L 7099670 3' + roo 395 1 63.37 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGA:1 + chr3L 20411837 3' + roo 354 2 79.21 TGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCC:1 - chr2R 18723046 3' - HMS-Beagle 39 2 67.33 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATGGCCAAAGTTGGTGCTACGCTTGGGAT:1 + chr3R 12767363 3' + blood 7382 2 69.47 TTTTCGCATGGTGCCAATTNATCATAGCCTAAAGTAGATGTCAAGCGAAGATCATTAAGGATTTACCAACAGAAGAGGCAGTATCTAAAGTAGG:1 - chr2L 4131745 3' - 1360 270 1 67.02 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAATCAATTTATGA:1 - chr3R 7469965 3' - Doc 43 1 63.83 TTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAAGAAATTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 27899550 3' + 297 457 1 81.08 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAATGCCGATCAGATGCGGAGTGGAAAATTATACGAA:1 + chr2R 12812321 3' + jockey 4950 1 68.32 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGGGGTAGACACGTTTCCCATTTAAGTTGATGCAATTTCTCAAT:1 - chr3L 18418841 3' + hobo 2905 1 56.44 CAAAAACTCAACGAGTAAANTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAATAATAATAGAACATTTTGATTAAAGTGTATATGTGGAAATATATTAATAGTTAG:1 - chr3R 12944664 3' + roo 388 2 62.38 AAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAATGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTCAAAGCAATAGCAATAGATTAAACC:1 + chr2L 1699433 3' - Cr1a 4052 1 72.28 TGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAATATTCCAGGCTAATCGCAAGACAAAAGCCACAGCTTTTCACACCTT:1 - chr3R 23640968 3' - 297 24 2 56.44 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCCAGGTGGCTGATTCTCTAGGGGGATTCAAGAAA:1 - chrX 19034084 3' + hopper 1412 2 74.26 TATTATAATTATTATTAATGTTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGCACGTTTAATGCCTCCACAAAAGCAGAG:1 + chr3L 3650092 3' - mdg1 49 2 69.31 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCCAACATGTCAGGGGAGTTCCCATTCTCCATTCTT:1 - chr3R 8765514 3' + roo 403 1 73.27 AAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTAGCATG:1 - chrX 20885950 3' - Ivk 5356 1 69.31 TCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGGGATATGTATGTATGTCACTGCGTATTGCTGATAAGTTCTATTTCCTCC:1 + chrX 18326274 3' - Doc 182 1 78.22 AGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACACACACATTTAAATCCGAT:1 + chr3L 3540230 3' - mdg3 5258 1 73.27 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAAACTCTGATTGCATTAACCGACGAGCTAGTGGCCATGCCCTG:1 + chr2R 15652329 3' + jockey 4966 1 59.41 CGTGGCTGCTTAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGTACTGCCCTGACTTTCAGCAAATACTGACTTTTT:1 + chrX 17494678 3' + 1360 3347 1 68.32 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAAAGGTCCTTGAAAATCCAGATTCCAAATTCAGAGAGTGCGTG:1 + chr3L 18418936 3' - hobo 1 1 78.22 GACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAATTGCGGAAAAATTAATAATAATGCAAATAAAAAAAAAGAATTGTAA:1 - chrX 7874194 3' + Transpac 5202 2 53.47 TTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTTTAATGACCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGC:1 - chrY 652807 3' + Stalker4 409 1 73.00 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGACTTCCCCCGCTTGAAGGCGTGGGCAAAC:1 - chr2R 5720470 3' + pogo 2056 1 70.30 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAATATATTTTTAAATATTAAAATCAAAAAATTTGGAACCCTATATT:1 + chr3L 20584086 3' - pogo 27 1 60.40 TTCGCGTATACAGGGTGTCNCGTTCCCAAACAAGCATATAAGCCGTATCTATAAACAAAGCGAAAACCTTTGCCAAATAAATGTTGTGGAAATTTTCCAGT:1 + chr3L 16563308 3' - 3S18 11 2 69.31 ATACAGCTCTGTGGTACTGCCAGCAACTCAAATATTGAGATTTTACAACGCTACCAATGAAAAATATTAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATA:1 - chr2R 4774741 3' + G4 3441 1 77.23 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGAGAAAGGTCTTCAATCTAAACAAAGTTTTACCGGGAAAAAGATGTTCATCAA:1 + chr2L 3699482 3' - mdg3 26 2 55.45 GTTCAAATTTGTTCAGTATGTGTTTGTTTATGTTGTTGTGTTAGTATGTATTATTTGTGTTTGTTCTTCTCGTTTTTTGTCTTTTTTTCATTTCCAAATCT:1 + chrX 4338198 3' - 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chr2L 5257996 3' - 17.6 7262 4 58.42 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCACTCCGGAAGCGGGAGCAATTGATGGCCCATCGGAAGGCCAAATCGAATGGGTAAATGTGGTCGTCAGA:1 - chr2R 23519196 3' - jockey 4765 1 73.00 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTCCCCATTGACTCCGGCTCAGTTATAACCAGTTGGGAGGT:1 + chr2R 18723108 3' + HMS-Beagle 213 2 63.37 AAAACAAAAAAAAAAAGGAGAAAAATACAAAAATGCAGAAATGGCAAATGTAAAACAAAAACGGCTAAAAGCGAAATGCGATGCAAAAGGGAAGGAGAAGA:2 + chrX 12747813 3' + Doc2-element 246 2 79.21 CTCACACCCAACAATTTAGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCACTCTTCTGTAATTTATTAAGCACGTTGACGAC:1 - chr3L 1840701 3' + hobo 38 1 67.33 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGTGGG:1 - chr3R 25021662 3' + roo 392 2 63.37 TCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAA:1 - chr2L 9045427 3' + jockey 4952 1 66.34 AAGAAAACTTATTCGAATATGGAGCCAAAGCCGACTGCACCGTGAAGAAGGGAAAGCCCGAGCTCAGGAAGAAGGTGAGTGTGGTGCCCAGTGCTCCGGCT:1 + chr2R 22854864 3' + Doc3-element 4542 1 63.37 ATCTACAATGATTTAAAATAAGGAACTGAGAACTGAAATAAGGAACTGACAACCAAATGTCTTAATTTATTCATAACTTTTTATATATGTTTATTAGACTG:1 - chr2L 18928233 3' - Cr1a 4142 1 58.42 GAGTAGTGGGTATCTGATAGTCTCGACTTATGCCTTTGTGAGCTTTTAGCCTATTGCAACACTTGCATATTTAATTGCAAGCCTTAAAAGCAAAACGTGCT:1 - chr2L 3181988 3' + INE-1 549 1 84.16 CAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGCATATTGAAAAGCCTTCGAAACACGATATTA:1 + chr2L 14220202 3' - springer 7184 2 73.27 TTACAAAAACTCAACGAGTNAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAAC:1 - chr3R 25021669 3' + roo 9048 2 56.44 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCT:1 - chr3R 10087832 3' + roo 9030 1 63.37 AGATCGAGTTTTCTTATTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCATCTATAAAACAGTAGTCGACTCTAAAAGTTACTGGGTAGAGTTAGAAAAGAAA:1 + chr3R 19449411 3' - Q-element 353 2 56.44 GCAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAATTTGCTTGGCTGCTAAAAATGTTTGGGAAGCGCTAATCAGCCGCATAAATTTCCGAATCTCCGTGTGT:1 - chr2L 2470147 3' - Ivk 255 1 76.24 AAGTTAATCAGCCTCAGCCACATTAACCGGGCTGTAGCAACAAAACAAGTGCTTGTGAAGCAAATCCTTGCCGATAAGATGAATGTT:1 + chr2R 4131834 3' + gypsy2 486 1 62.07 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAAAACAATAGGCCACAGCAGTGAGCTTGGAAGAGGCCAAACCTTATGCTGATATTCCGG:1 + chr3R 10434962 3' - 1360 19 1 56.44 AGAACTCGACGTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATTTTATA:1 + chrX 21587716 3' - INE-1 133 1 75.25 AGGGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGTGTGGGTACACATACTTTTTGCAAACCAGCTGTATCTTCATCCCTTCAGCCGGCTAATCTTGC:1 + chrX 15287943 3' - hobo 15 1 60.40 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGATTATTTATGAGACCCATTAATGGGCAGGTTGTCAGCAGCTCTATTCATCTTGGGGCATACTTTCGG:1 - chr2R 16609395 3' - jockey 4765 1 71.88 TAAGAAGATTTGACTGCTCTCTTTGAATCTTCTCTTAATCATAAGAATCCAAGAGCAAAGCTCTCCCGAAATACGAATATGAAAAAAACGATCTCGATCAG:1 + chr3R 20891008 3' + 297 155 2 77.23 TTTACATTATTTTCATTTCCTAGTACTTTTTCCAAGTGCTTCCTAATCCACACAACGAGCCACAGGAGGACGACTGGAGTCGCTTTTGGCCAATTCGAACC:1 - chr3R 27206651 3' + Cr1a 4327 1 68.32 TTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTTACTCTAGCGCTTTAGGGATTTTAGTTTTTTTTTATGAGTATTTAGTTCAAAATTCTTCATG:1 - chrX 668910 3' - Bica 473 1 62.38 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGTATGTAGCATATCCCCTTCCGTTTTTTGGTTTCGTGGTTTGCCAGT:1 - chr2R 19102150 3' - opus 24 4 61.39 AAAATGTTCTCACAGATAATAGATAAATTTACTTAACTTACTATTATTGAACCAATTTGAAAAGAGGATATCTTAAGGATAAGGATATCCAGGATGAACAC:1 - chr3R 13937965 3' - Juan 44 1 44.55 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTGTTTGAAACACTTGATTAGCGGCGATGATTGAACGGTTATTCGTAAA:1 + chr2L 17994215 3' - roo 27 2 53.47 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATA:1 + chr3L 23456279 3' + 1360 3382 2 68.32 CAGATTCGAAGCCGCAGGTGACATTGAATTCCATTCTGCCACCCAACCACCAAGCTGGCTATCCACCTCTGCTTTTGGCCATTGTTTTGTACCGGGCTCGA:1 + chr2R 17346160 3' + R2-element 3144 1 60.40 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAAC:1 - chr2L 17730451 3' + pogo 2058 1 69.00 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATT:1 + chrX 15546207 3' - blood 7053 2 65.35 CGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGACGCCTGCTGCGACGCTGCCGACGCCCACACTTGAAGTGATTTTCGGTAATGTGAGGTTGGAATATTTC:1 - chrX 17125893 3' + HMS-Beagle2 150 2 66.34 GTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTTTCCAGTGCTCGGTAGCATTCTTTTCAGCT:1 + chr2L 11712880 3' - Quasimodo 40 2 72.28 AATGTATGACTAAGAGTAANGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATT:1 + chr3L 3540207 3' - mdg3 5281 2 50.50 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTTGCGATGTAGGCTTACGAGGGGGGTTGGTGCTTGGGGG:1 - chr3L 14623909 3' + hobo 2926 1 61.22 TACGCTTTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTACCAAACCTCGCCGATGACTGGCCACC:1 - chr2R 9308731 3' + 1360 3293 1 77.89 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAATTCGAACATGCTCGAATGGCATCCAATGACAACCTGTTGTC:1 - chr2L 19854051 3' + roo 397 1 73.27 TTTACTATTCCTCTTCTCCCTTTTTTTTTTTAAATGCTTTTGGACGCGCATAATTGTTATATGAAGTGAATAGCAGCTACTTTTCTATTAGAACAATTTT:1 - chrX 5013203 3' - Bica 350 1 79.00 TTAATATTATTATTATTATNGTTCTAGCGAAAAAATTAATATTGCGGAACAAAATATTGAGTGTTTGTTTATATCGATGAAGTCAAGGTTTTGCGGAAGTG:1 + chrX 13121819 3' - mdg1 35 2 74.26 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGAGACAAGCACTTTTCCCTTTCCCATTCGCTTACATTGTCCCCAAAAATTC:1 + chr3L 13190170 3' - roo 8685 2 53.54 GCATATGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGCGTCGTATGGGTGAGAGAATGCGCCCAAGTGGCTTGAAATCTTCAGCGGGG:1 + chr2L 2732033 3' - accord 185 2 70.51 CTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAATTAATTTCTCCGCTCTCGTTAAAAAGTGCTCTTTATTTTGTATATGATGTGTGTATGTGCTTCCA:1 - chr2L 5419421 3' + 297 285 2 74.75 GGAGATTTCATCAGCGACTTGTGGGATTCCAAGTTCCCTGTCCGTGCTGAGCCCCACGGGTCTACGCCTGTTCTCGATTTCTAGCCAGGACAAGGTGGAGG:1 - chr2L 21214580 3' - G6 1764 1 69.31 GATATATTGACATAAAAATNTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGGAATGAAGGTTCCCTTACCTGAACGGATGACA:1 + chr3R 13331476 3' - transib2 39 1 63.37 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGAAAATGCTG:1 - chr3R 9088562 3' + hopper 1382 1 55.45 GAGTAGATTAGTCCAATATNCTACACCACCATTAATCTTTATTATCTTTATTAATACAAATATTATGTATGCCGACGGATTTAACTGTCTGGCTTTGTAGA:1 + chr3L 26741467 3' - Stalker4 4 4 58.42 TGATAGGTGGGGGCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCTTCATTTACCATTTCGGGATATTCGTTTTTGCATCTCGTTCCTGGGCATCAAAGTAGTAAATGT:1 - chr3R 7951080 3' - G4 155 1 67.33 AATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGCCCAGTCTCGGAAACTTAACAGGTTGGAAACGTGTTGCTTTAATTTCGGACCGACATGCAGAT:1 + chr3R 16136112 3' + F-element 4332 1 64.36 ATATGAACGGAGCCCAAAANTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTCATTGGTGAATAAAGAAAGTCAGATTTTTCTCAGTGA:1 - chr3L 15037920 3' - roo 37 2 64.36 AAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAGTCTGCCAGATCATTACACCCCTGGAACTCCCACCCTGACTACCCCCTAATACTTAAAAAAAA:1 - chrX 10677590 3' + Bica 426 1 62.89 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAATCAATTTATGAGCGGCCTGCCTTATTT:2 - chr3R 7469949 3' - Doc 34 1 50.50 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTT:1 + chr3L 20411842 3' + roo 9023 2 74.26 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTAT:1 + chr3R 12767336 3' + blood 7349 2 66.34 TAATTTATGAAAAAAAAACAGGATTTAAAAGTTGACGCTCCCATTAGAGCACCTCCTGGTCAAGATATTGACATAGGCATAAGCACCAAACCCTACTCATA:1 + chr2L 7707346 3' - hopper 18 1 72.28 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTCCACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTCGCGCC:1 + chr3R 29287567 3' + hobo 2909 1 56.44 TAAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCTCAAACACACACACACATGTGCG:1 - chrX 22749051 3' + Tirant 8458 2 76.24 ACCAGTTTCTTACAAAAACNCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAGCTATGAAGCTCAGCTTGTTTGTGCAGTTTAGCCGCGGAAAT:1 - chr2R 6107730 3' + roo 9039 1 59.60 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATTCATGCTCATAGGGGGTAAGAAAAGT:1 - chr3R 13353221 3' + 1360 3339 1 76.24 TCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAATGAATAATAAAAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAAGGTGTTTTTTTTTGTTAATGTATCCTGACATTTATCGATGA:1 + chrX 6960191 3' + G5A 2804 1 66.34 GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAACTGATTGGTAAAAGGATCTTTC:1 + chr3R 5348705 3' - copia 54 2 79.21 GAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAAGAAAGAGATTGTGAAGTTATTTATGCATCAGCAAACAAAGGAAAAGAAA:1 + chr3R 24086135 3' + invader3 186 2 72.28 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCACCACACACAAACACACGCACACATAAGCAACCACTCAGTTACCAACACTTTGACAGGGA:1 - chr2R 23671760 3' + hobo 2923 1 65.00 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATTTCGG:1 - chr2R 17963242 3' - blood 7054 2 71.29 CTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTA:1 + chrX 18326222 3' - Doc 234 1 71.29 AACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATATAAACTATATATACATACTAAACTAAGTATGTATGGTGTCCGCTGGCCAAGAATCGATTTGAGCT:1 - chr3L 20220447 3' + I-element 5343 1 69.31 CCTCGATATATGCACATACTACAAAATAATCTAGTTGTAGGTTTTTATGACTCTTTTATTTTAATGTTTAAATGTGCAGGAGTAATTTCCTTTTCGTCATC:1 - chr2L 7175531 3' - blood 7013 2 77.23 ATAAGGTCCCCCTTGACGAGAGCCGGGATATGATGATGATCTAAAATCGTTTTGGTTGTTCGTTCGTTTTTAAGTATTTTATTGTTGTTGACATTGGCAAT:1 - chr2R 8637123 3' + BS3 1589 1 58.42 TTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACATAACACCTGCTTAAAGAGCCGCAAAAAGAAAAGAAAAACGCAAAGCCAGAAAGATACAA:1 + chr2R 8177783 3' + mdg1 7439 2 54.46 GTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTAAGTCAATTTCGCATCATGACACTGGAAACAAATATAGGAGATCTATTTAATTCTTTATTTTGTGAATAGA:1 + chr3R 22869478 3' - Bari1 5 1 73.27 CCTGAGCCTCTGCTTAAGCACCAGAACGGTGAGAGGATGATATTTGGTCTGTCCGCGACCTTTGTGACTTTTCTTTTCTTCCCGCAGCAACTGTTTCGCTC:1 - chr3R 9081009 3' - Rt1b 238 1 76.24 CTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTAAAGGCACGAGTCTGTTGGCATTCCTT:1 - chr3L 107859 3' - F-element 4510 1 74.26 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCGCTTGACGCTACAGCTATTCTTAGCATTCCTTTGG:1 + chr3L 21970867 3' - pogo 37 1 63.64 AAAATTCTAGACGCAGTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGTCATTGATTGGGTCCCTTCTGTATCTGGCGATGACGACTC:1 + chr2R 5831838 3' - springer 475 1 60.00 ATTTGCATGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTAGCTGAAGACATTTATTTTGCGCTTAATTTTTTGTGCCATTCATTTTGCCCCTAGGCTTTCCATAAAATGCA:1 + chr3R 15733104 3' + Gypsy6A_LTR 113 1 71.29 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAGGCAGCACCAAAAAAATAGGTTGAACAT:1 + chr2R 18766257 3' - hobo 49 1 75.25 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAAGTTTTATGGAG:1 - chr3R 12063745 3' + 412 459 2 65.31 GCACCTTATATTTAATTAATTTGCATAACATTTTGTCCGGAAATGGGCATGGCCTAATCATCTTCGAAGAGGTTTCTGGTTTCGTTATGCATGGGAGATGT:1 - chr2L 14220115 3' + springer 7521 1 79.21 AAAAAAAGAAAAAAAAAAATGGGGCTTCGCTGGTGTCGCCGTGCAATTTAAATACATACCTCCTTGATATCCTCCCTTCACTACCCCACTTTGGGCCTTGC:1 - chr3R 9206110 3' - hopper 141 1 65.35 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATAAAATGATTATGACGATTATGCGAAGCTCCC:1 - chr3R 20332886 3' - jockey 4717 1 68.32 TGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGGGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCT:1 + chr2R 14997917 3' - McClintock 32 2 63.64 AGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTTTTATTAGTGTACGAAATAAACAAAAGTTTAAGTTTGTTGTCCAAAAGTCGAACATTTTGCATTCGTCCGTTGA:1 + chr3R 7514009 3' + diver 221 1 69.31 AAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATACAAAAAAAAGAAACACTCAGCTCTTCCAAGAACTAATTTCGCGTGCTCTCAATTTGGCGAGCGGAAATGCCA:1 - chr3R 16826773 3' + I-element 96 1 77.23 ACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGAATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGT:1 - chrX 20361982 3' + hopper 1395 1 62.34 GTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGG:1 + chr3L 23678128 3' - Osvaldo 24 1 72.28 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAATGTGCAGGCACAAAACGTACAAATCAGGCAGCTAGCACTGAAATTCTTTGGGG:1 - chr3L 18762054 3' + pogo 2084 1 62.38 TCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAGTTCCGCAATGAATTAGTTTTAAAGAACATTTAATTGAAGACA:1 - chr3L 18943817 3' + Bica 4543 1 57.43 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTA:2 - chr2R 9871003 3' + roo 357 2 76.24 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCATTCCCAGAACAAAAACGAAAAACAGAGAAGCACAAAAAAAAA:1 + chr3L 11141473 3' - 1360 35 1 58.42 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTACC:1 - chr3L 6023298 3' + hopper 1365 1 72.28 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACACTTTAAAACCTAATAGATATGAGTATATCAA:1 - chr2L 4063678 3' + roo 9051 2 57.43 CTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGGACTTACCATCGAGTGGAGCTGCTTACTTGGCCTTTTTTGCA:1 - chr3R 25947824 3' + F-element 248 1 63.37 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAGTGGCAGCCACGGCGACAGCAACGAT:1 + chr3R 10488763 3' + roo 9059 1 67.33 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGAACAATTATTAACAGTTTTTGATTTTACAACTTTAAAAT:2 + chr3R 15920717 3' - BS 5072 1 62.38 TTACTTTAATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCT:1 + chr2L 22224555 3' + Rt1c 5392 1 65.35 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTACCAGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTACCAGTGTGTTTGTAACCCACCTTACAAACTT:1 - chr2R 8177685 3' - mdg1 15 2 62.38 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTCTGTACATCGGTACTGTGCTCATATCTCGAA:1 + chr2L 20367379 3' - Doc 22 1 56.44 TGACCCCGCAATAAGCAAAATGCAGAACACCGGAGATTGTTTGCCGCACACACCGGTCGACTCAACTCCGAAAATTACGAATGTTTTGCGCAGCGTTAACA:1 + chr2R 6261210 3' + Chimpo 212 1 62.38 ATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAAAACTTAAGGAAATG:1 - chrX 983316 3' + Juan 4182 1 59.41 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCCTCCCTAATTGCCACCTTTAAAGCGTTTATTTA:1 + chr2R 7546314 3' - hopper 38 1 63.37 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTCATGC:2 + chr3R 23543005 3' - 412 7099 2 74.26 TATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGCAACTGCCGCTGCTTCAAGGGCTACGTCCGGAATCGGGAGCGATGCGAGGCGGTCTGCG:1 - chr2L 13968642 3' - diver 5932 2 63.37 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAAC:1 - chr3R 25021669 3' + roo 9048 2 56.44 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAAATGCATGAATAAATA:1 + chr2L 12958960 3' - roo 53 2 82.18 TGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAAAGTAGGAAAAAGTGAGAAAAGCCGTCTGAGAACACGAAGCTGCACTGGAAAAAAAA:1 + chr3L 3541264 3' + mdg3 184 2 60.40 ATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGA:1 + chr2R 2529355 3' + 1360 3374 1 39.60 TTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCATCCGTAGTTTTCGTTTCCGGTTCCGACTGGTTTTGCA:1 - chr3L 10474117 3' - copia 9 2 70.30 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTGCA:1 - chrX 4277459 3' + roo 9043 1 56.44 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGGCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCAGTACTTCCATTTAACAGGGA:1 + chr3L 7307256 3' - hobo 56 1 75.25 CCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGCCTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACACTAGAATTGAGTTTAAATATACAGACAACCAGGAG:1 + chr3R 28565319 3' + 412 7509 2 56.38 ACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTGAATTTATTCAGGCCAGGTCAATCAATCGGGATAAAAAGCGTAGTATAATTTTCGGAGCTCTGTGCTGTCAA:2 + chr2R 10670063 3' - jockey 4767 1 72.28 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTATCATAATATTAGAGCTAAGATAAGAATTCATTGAAATTGGTATATGGTTATATAGCTCTTCTTTA:1 - chr2L 11712792 3' + Quasimodo 7361 2 73.27 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACCTCAAGCACGTCGGTCGATCAATATTTGGCCAGCGGCGAGGATTTATGCCAGCTCATTTGACT:1 - chr3R 7626359 3' + hobo 2930 1 71.29 GACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAATACCTGCTACTACTGCTGCTCCGGATCGCCGTGTGATCGACACGG:1 + chr2R 7156408 3' + Doc 473 1 60.40 CGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACTGCTTTAAATATTCCTGTACGTATAGAGAAACCTAGTTGCAAATACTGGGTGTTTCCAA:1 + chr3R 7627432 3' + hobo 61 1 60.40 ATTCCGAGGAATTTCGATAATCAAACGGTAATCAGTTGCCTTAATATGCTAGCTCTTTAGCTTTAGATATTTCAATAAAAATGTTATATAATCATTCTGAA:1 + chrX 14931442 3' + S2 262 1 69.31 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGGGCAACAACGCAACCAAGCATTTCGCACTGTTCCCGCT:1 - chr3R 6961071 3' - 412 38 2 62.38 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATCTTCTGTGTATTCTGATTGTATTTAAATGCTG:1 - chr2L 11478688 3' + opus 455 2 72.28 ATTATTATTGTTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGCTGAAAATATTCCATGTCTATGTTTTTATAGACCCCAACACAT:1 + chr3R 13913074 3' - mdg1 7065 2 52.08 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCTTTATCGCCTCCTCGCTCTTGAGAGTCAATAG:2 + chr2R 22856623 3' + 1360 3387 2 77.23 TTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATTTTCAGCACACAGGGCGTATGCGTAACGCAGTCGAGGCGGCGCAAGGGGGCGGCCCCAAA:1 + chr2R 8526409 3' + I-element 5338 1 62.38 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAGATTGTTTTCAGCAAATGCAT:1 + chrX 15800942 3' - roo 8717 2 81.19 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTG:1 + chr3L 10474189 3' + copia 204 2 80.20 ACTACTTGCTTATACTATTTCAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATTGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTACTTTAT:1 + chrX 14974616 3' - Doc2-element 185 1 76.24 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAAT:1 - chr3R 7869122 3' - 297 36 2 61.39 TCTGATAGGTGACGTCCCCCATTCACCAAACATTTCGTAAACCGATTTCTGGCCTTTTATGAGGGCGAGGGCGTCTCACTTTTGCTGCCCATATGCTCATC:1 - chr2L 17755800 3' - mariner2 759 1 56.44 CAACACGCACACTTATACGAGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTGTTTTTTTTTTTACGTTACTCGCTCTGAAAACTTTCCTTTCAAATAAGTTTTTCTTTGG:1 + chr2R 16456424 3' + 1360 3217 1 64.36 CAGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCTTGTTGTATGATTTCAAATGCGTTGTAATATTATGCTATGTTTT:1 + chr2L 6362920 3' + 412 7532 2 51.76 ACATGATCGACTCGGCTATTGATCCTGACCAAAAATATATATATTCTTTATATGGTCGGGCATTTTCTACGCCTCCTTAGCTTATCTGCGACCGACATGTG:1 + chr2L 390614 3' - INE-1 100 1 61.39 TCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGACGAGTCACGCAAGCGGCGGAAGCAAAGTAAAAAGTATATGAAAAA:1 + chrX 4068070 3' - R1A1-element 5083 1 56.12 GTCGTGCCAACCCAATACGCATGACTTACAATCTAAGTGGATGCGTCACAGCGACAAGAACAACGGAATGGGAACAACGGATGGTAATGGTATCTTATGTG:1 + chr2R 11228857 3' + Q-element 693 1 66.34 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAATCGATTTTGTTAATGAAAACGAAGGAGAACTTCAAGGAGAAGGCCACCCAGGGGATCGGGTGTCGAT:1 - chr2R 19061194 3' + roo 404 1 74.26 ATTAATAATAATAATAATATGTACTGCTCACCTATTGATAGCAAGCGCAAATTCTAACTATAGGCAATACTACTCCTCTGTACTAATTACTATATATCTAG:1 + chr3L 12856995 3' + mdg1 7090 2 67.33 TTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTTTTCGTGCGCACTTCGGGCCAAACTCAAGTGGGGCTTTGAAATGGCC:1 + chrX 4166455 3' + I-element 5338 1 61.39 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTACGCATTTGGCACGAAAATGACTTGGGGAAAGTGAACAAATAA:1 - chr3L 20049628 3' - jockey 4796 1 57.43 GATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAAACCTTTTCTTGTTTCAAATGGCCTGGTTT:1 - chr3R 7513928 3' - diver 48 2 70.30 CGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTCCACTAGCTGAGTACCGGTCCCAAATACGCTGCTCGAACTGAAGATCCATTTTATAAAACAATTTTATGATTT:1 - chr3L 24006625 3' + baggins 5144 1 72.28 ATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCCTTGGATATGGCCAGGTGAGTCACTCCTGTGCGAGTCCTGCGAGTCCTGTGC:1 + chrX 15263282 3' - roo 8770 2 61.39 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGTGTAGATTTCTCTCATACCATTCTGATTTACATTATGA:1 + chr3R 15579041 3' - pogo 28 1 54.46 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGCATAGACTAACTGAACGAAAGCTGAAGTTGTCCCGCCTCCAA:1 - chr3L 13773887 3' + roo 9039 1 57.43 AGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACTTTACCCAAAAACACAAT:1 - chr2L 7666129 3' - roo 8681 2 68.85 TATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAGGGGCTTGGCTTTGGCTTCAGCTCATGCACACTGGACACTTGTGAGTTG:1 + chr2R 15788678 3' + Transpac 311 1 80.20 TAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTGCTGCCTGCTTCCTCTTGTGAGTTTATGCTCTCTCTTAGCCTTTTCTCTTTC:1 + chr3R 1849002 3' + Cr1a 165 1 53.47 TTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAACTGGATTATTTATATGAAAAAATCTATTTACCCAA:1 - chr3L 20758943 3' + flea 4978 2 64.36 CATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAAAGAGGGCGGCATTTCAGCTTTAGCTTGGCCATA:1 + chrX 6515300 3' - R2-element 3238 1 66.34 AGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGATATTATAGATACAACTTTCTAATTGCAAGCCTTAAGACATTGTGGCAAAAACGGTTTTATAAACAAAAACAGCA:1 + chr3R 27132001 3' - copia 2 2 75.25 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCATGAGTGAGGAGTGCACTGCGAAAAATGCTTG:1 + chrX 4264401 3' - mdg3 43 2 65.35 TTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCGAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTTATTTTATATCTGTAAAATTCTGTAATATTCTGTATTGTGTAT:1 + chr2R 11967385 3' - jockey 102 1 59.41 GGTGCATTGCTCAAAAACANGTAATTTAAGTGCACACTTTTGCAGGCATGGAGCATTATAACTCAGACTGTGAGCCGGATTACTTGAGGCAACG:1 + chrX 12195796 3' + roo 121 2 68.09 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCGTATTTTTGTGTAGTTTCTCTTTTCCCAATTTATATATTCCACTTAAAAAATACGTT:1 - chr3R 27907611 3' + mdg3 5479 2 56.44 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGTTTTTCGTGAATCATGGCCTTCGGTTGAGCTTGGTTTTTTGGCTCTCG:1 + chr2L 4063765 3' - roo 8689 2 55.45 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCGATTTTCTTCTCC:1 + chr3L 25345166 3' - Doc 31 1 52.48 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGACATGAGGGTGGTGAAAAAGTTTACAGTGCAGAGAGTACGACAGTCCTGCGCACAAGTATACGTAACAAATGGC:1 - chr2R 12252851 3' - jockey 4779 1 41.58 CCGTTACTCAGCTAGTGGGAATGCGAACGTGAAATTTCATAATGTCATTCCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTTTGGGCAAAGACACTAGAATA:1 - chr3L 7319861 3' - INE-1 536 1 62.38 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTTGCTCTCCTAATCGGCG:1 + chrX 21217585 3' - pogo 22 1 55.45 TACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTCCATTAGAGTTCCTTGCTATAAAATTATATGGTAATTAACCATTTCAA:1 - chr3R 14185666 3' + pogo 1720 1 57.43 TAGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTCGGTGGTTTTGAATATCGCGCAGGGGGTATGTTGTTGGTTGGGAGGGCTTTAGGCTCGGTTAGGCTGATCAGAT:1 - chr3L 23005128 3' + INE-1 578 1 72.28 GTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGTTAAGCTATCGCCGTACTTAAATCACTTTCTCG:1 - chr2R 22051455 3' - Tabor 6863 2 51.49 ATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGATTCACAGCGAAATAAGTTGAATAACATGTGAATTAAGGCGCAAAGCCAGAAGTATTTG:1 - chr2L 2727147 3' - mdg1 7359 2 66.67 GATTGCGGGTCCGAGCTTTAAACGTGGTCTTGGATGTCGTGAGTGGCATTGTCGGAAGGCAAGTAAAATTTTACGATTTTGAAGAATCATGCTTGATCA:1 - chr2R 16235934 3' - Idefix 7073 2 76.77 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACAAATACCATGAATTTGCATTGCACACTTGCATCTTTTGG:2 + chr3R 3256035 3' - roo 8700 2 64.36 GTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTACTTGCATCCCTCACCACCTACCCAACACTTGGCAC:1 - chr2L 12870611 3' - mdg1 71 2 65.35 TTGTTTTAAAAATTATGATNTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTATTTCAGCTTAACTCTAG:1 - chr3L 15125889 3' - Juan 3774 1 57.43 ACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGACAGTTGGTAGCCTCAAT:1 + chr2L 15531867 3' - Stalker2 7275 2 52.48 ACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGACCTATGCCAGCAGCCACCTGTCTGGATCGTTCCGAAAAAGCAAGAGTTAC:1 - chr3L 27285034 3' + roo 8593 1 53.47 CTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGTTCATAGTCATAAAACATTA:1 + chr3R 25370544 3' + BS 5062 1 55.45 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAACATACAAATACATAAGAATTAATATAACCCTTTCAGCCAAGT:1 + chr2L 19114607 3' - S-element 31 2 61.39 TAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCCGAGGGAGTCGAGGGCATTGAGCATCAGGAA:1 - chr2R 7725691 3' - BS 5016 1 70.97 TTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGGTAG:1 + chr3L 22349289 3' + BS 5046 1 72.00 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATACCAATCCCCATATCTCTCTCTCTCTTTCTCGCTCTAGAAATATAAACTAAACATTTTCTGCCTTTTT:1 - chrX 4937522 3' - Doc 22 1 61.39 TTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTGGTAAAGATAGTTCATCAGTTTAAATACTGAACTAACC:1 - chr2R 18296013 3' + S-element 1680 2 63.37 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAATCGATTTTGTTAATGAAAACGAAGGAGAACTTCAAGGAGAAGG:2 - chr2R 19061218 3' + roo 9043 1 55.45 GTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTAAAGTTATAAATGTAAACTTTTATTTTCTTTTTACAACT:1 - chr3R 30075597 3' + jockey 4802 1 69.31 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACAAAAAGAAAAGCTTGG:1 + chr2L 17079902 3' - jockey 4802 1 53.47 GAATTTTAAAAATATATATAAATATTTTACACGTTTTTATTAATATTATTAGCACACAATTTTACATCACAACTATATACATCTCCACAGCCCCACTTACA:1 + chr2R 15256222 3' - copia 4666 1 74.26 AATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTGGCTGAGATCAAACTTCGTCTTGTTAATGT:1 - chr3L 3596644 3' + copia 254 1 75.25 GCTTCCTTCTCCCTGTTACATACTTTTAATTTGATGTCCATTTGATGTGCTTTGGCAACAACTTTTATTTAATTTCTCTATTTCGCATATATCTACTAGTA:1 - chr2L 22082378 3' - INE-1 29 1 75.25 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAAGCATTCAGCAATCTTTCTGCGAAACGCTCGC:1 - chr3L 1586698 3' - Tirant 10 2 71.29 ACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAGATGACCCATTTGTAAAGTGCAAAAAGTTGTAAAGTTTTAAATAAAAAGTTTGTGAAATTTCGCAAGTTTT:1 - chrX 22426146 3' + 1731 309 2 74.26 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGATTGAACAACATTTTTAGAATGATTAAGTTCGTTATGGT:1 - chr2L 12511544 3' - copia 4907 2 63.37 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGA:1 - chr3R 8765565 3' + roo 408 1 62.22 CCACTTCGCCTGACTCTGGTGAAATTCAACGCGGCAACAGCGCAGGCACCGTTTTCCAGCACTATTTTCTGTATTTTGATTTAGGGACTAACGCGCTCTTT:1 - chr2L 588051 3' + Chimpo 265 1 57.43 TCTTCTAGTTCTACATTATAAATTTCCGAATCTGAACAACTGGAATCAGAATGTGAATCAGGTTTAATTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTACG:1 + chr3L 16260408 3' - transib2 2572 1 68.32 GCAAGACGGTGCGATCTATCTTTAGTTAATTTATACATGTCGGAGATGCATTCTTATTAGCGTCGTTAATATTTAATCATTTATTTCACTGTTCACTCCTC:1 + chr2L 23390442 3' + Gypsy6A_LTR 390 1 69.31 GTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGAAGGAAGCTTAGCTTAGCGGAATCCGACTATGGGATACTCTGTACTCA:1 + chr2L 20027399 3' - 17.6 164 2 52.48 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCTCGAATAGAGAAAAG:1 + chr3L 8039429 3' + hopper 1405 2 68.04 ACTCTTCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTCTTTGCTGTTGTTTTTGGATGCACATAAACTGCACTTTTTGCTCTCACTCTCTCGCTCTTCCGCTCTTTC:1 + chr2L 18847060 3' + Cr1a 219 1 84.16 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGTTCGT:1 - chr3R 30553568 3' + 412 7496 2 70.30 CAATTTATTTTGCCTTTGATTACATAGTATGCAATATGTAGGTACAATAATTTGAATTTTTTCAAACATTGATTGGAAATCCACATATACAGATGGTTGTT:1 + chr2R 14210038 3' - TAHRE 10375 1 60.40 AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATACAAATATAAATAATACTGTGTCAGTTGGAAGTGAAAATTTACACATGTAAATAACG:1 - chrX 23035722 3' - HMS-Beagle2 18 2 61.39 ATTGCACTCTTTGTTTAATTATCAATACTTTACTTCTTTATTTGACTGTACTATGAACAGCATAGCCCGGTAGTGTGCGTAGCCATAATGTTTTTGCCATC:1 + chr4 219122 3' - Tc1-2 92 1 73.27 TGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGTAGTCATTCACATAAGCCCGCCTCATTAACGCTGACATTCAGAACTGGCAGAAAGGAAA:1 - chr2R 14714504 3' + R1A1-element 323 1 56.44 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTGTTCACACATCAAATTA:1 - chrX 2841768 3' + hopper 1387 1 53.47 ACCGCTTGTTTTTAATTCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCTAAAGGATTGGCGTGACTTGTTTGCTTAAAATACCGCAGCTGTGGAAAATTTAACCCCAG:1 - chr2L 17287865 3' - R1A1-element 112 1 64.36 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTCCCGAACATTGCAGCCCTGGGTGCAAGCGCTTGATCTGGCAACTC:1 + chr3R 21365585 3' + P-element 2875 1 69.31 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACAC:2 + chr2L 17730499 3' - pogo 44 1 72.28 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATAAAAACAAACAATCACAAAAAAATAAAACGAAACGAGAGCATATAACAT:1 - chrX 19782442 3' + jockey 4960 1 65.98 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCAGACTAATTAAATTAATTGC:1 + chr2R 23780056 3' + mdg1 366 2 78.22 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGATTTTATAGCTCAGTTTTGTCTTTAAATTTCAAACAAA:1 + chr2R 22051547 3' + Tabor 7314 2 65.96 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCTATTATTGGTTGAAATTGGGTTATTATCTAATGGCAGCACTTTATAGCTTTT:1 - chr3R 8582535 3' - roo 8688 2 53.47 TGTATAAGATGAAAACGGAGGAGTAAACAACTGGCACCTGCAGCGGCGTCTTCAAATTTCCTTTGCCCGGATAGTTTGTCAAGGTTCGGGAGATGGCATGA:1 + chr2L 12808942 3' + Tirant 222 2 80.20 ATAATAATAATAATACAAATAATAATATTAATACCAACAGCCGAATGCTAGCATAAAACGTTGCCCAAAAATGAAACGGGTTTCATTTCGATTTGATCAAA:1 - chr2R 12542367 3' + mdg1 38 2 79.21 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACCGAATCTGCTAAATTTCACACACCACTTCGTGTG:1 - chr3L 11929279 3' + copia 248 1 63.37 TTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATG:1 - chr2R 7546270 3' + hopper 78 1 59.55 CTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGTTTTGCAGTGCATGTGCGTTCACATAAGTTGGCCAAGCTGTTGGGCTGCTTGTGGTCGG:1 + chr3L 14897748 3' - Quasimodo 7171 2 71.28 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGTGTGTTTTAACTTCGACTTCCGCACCTGTCATTTCTCTTTATCTTTTCTCACTTTT:1 - chr2L 13093759 3' + roo 9053 2 60.40 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCTAGATGCCGATGCATGTTGGCAATGCGAGTCGTAAAACCTCGTCTAAGTTC:1 - chr2R 19840189 3' - roo 25 2 53.47 AGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCAT:1 + chr3L 19349998 3' - 1360 3227 1 50.50 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTA:1 - chr3L 9928555 3' + roo 355 2 78.22 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGCTTTTTGTACTGTGCA:1 - chrX 4277459 3' + roo 9044 1 57.00 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCT:2 - chr3L 6023305 3' + hopper 1358 1 79.21 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCCTAGTGCACTGGCCTACAAATTAGATTTTCATTTGAGTTT:1 - chr2L 18213029 3' - hopper 43 1 68.37 AATTAAACTTATTTAATAAATCAATTAATTTTATTTAATAAAACTAAACTCCTGTATATAACCAAAAATTCTGAAATCTTATGGATGCAATGAAAATAATA:1 + chrX 15095271 3' + HeT-A 356 1 57.43 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTGCACTACTCACATATGTACACTTCAAAAATAATTAAAGTATTTAATAATAAGCGAAGTCAGT:1 - chr3L 21518961 3' - 1360 15 1 62.38 ATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCAAATAATAACCAAATAAAACAAAAGGATACACTGTTCTGTTAAGGATTATTCTTCTTATCTGAAGTGTGGGTTT:1 + chrX 4277563 3' - roo 8664 1 79.21 ACCTACACACACACACACACACTATGTAATCGTTCATTCATCGAAGTGAATTTTACACATAGCTTGGAAATAAAAATTGATCAAGTCAAGACATCAGCATC:1 - chrX 10029458 3' + accord 7100 2 47.52 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTGCTATGTACAACGAATTAACACATTTTGCAGTTTGGTGGGG:1 - chrX 10451470 3' - hobo 36 1 71.29 AATAAAAAGAAAGTAAAATAAAAAATAATGTTAAAATTTTTATGTAATATCATTTTCACAAAAGGATTTAGATATTTAAGATAAATTACCCTCCAAAGCGT:1 - chr3R 19294759 3' + F-element 4672 1 29.70 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAAT:1 + chr2R 10956949 3' + copia 5073 2 76.24 GGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTAACACTTACTTGGAATATAAAAAATACTATTATAGAACAAGATTGCCAAGAAATAAATAAAAATGTAACAAT:1 + chr2R 12507488 3' + Copia1_DM 172 1 69.00 TTGTTGCCAGCCTTCAACCTTACTCCATGTTACATGTATATGTAGATGTATTTGATTCTGGCCTAAAATCCCAATGGCCAGCTAA:1 + chr2L 19678182 3' - flea 4769 2 58.82 TATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAGGTGTGTGTGTGGGAACATAAAGAAATACGCGGTACTACTGG:1 - chrX 9205509 3' + diver 191 2 57.00 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTG:1 + chrX 15546196 3' - blood 7064 2 76.24 GTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTATTTTTATCTCTCAGACTGCCAATGGCATACACTTGCGTTCCACGAGGGCGCAACGTAAA:1 - chrX 10536480 3' - mdg3 226 2 74.26 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAATATTCCAGGCTAATCGCAAGACAAAAGCCACAGCTTTTCAC:2 - chr3R 23640973 3' - 297 6609 2 61.00 CTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGCTCGCCGTTATTATTATTATTATTATTATCGGGCACCAACATATGCCCGTAATTAAA:1 - chr3L 17186788 3' + Tirant 382 2 60.40 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTT:1 - chrX 21087565 3' - mdg3 5262 1 65.35 AGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAA:1 + chr3L 25232904 3' - GATE 35 2 52.58 GTGTGAGTAAAAACAAAAGACGAGCAAGCGTACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGGTGTGCAAAGGGGTGTGGGGGTCATATGCCAGTGCG:1 - chr2L 18771795 3' - 1360 3242 1 74.23 CATATATACACGTATAAACATATATTTTAAATTAGCACTTGAACCTAGCCTAGCCTAGCCTAGCCTAATGGAGCCTAAGATCTCTAAGATTCGAATGGGTG:1 + chrX 10060392 3' + ZAM 8158 2 60.40 ACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGCTTAAAAGGCCATTTAATGAAATCTTCTACCTAATCTTTAAGTTAGTAATTAATGTAATCAGTTGAA:1 - chr3L 16563196 3' + 3S18 6096 2 67.33 TTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATACAAATATAAATAATACTGTGTCAGTTGGAAGTGAAAATTTACACATGTAAAT:1 - chrX 23035726 3' - HMS-Beagle2 22 2 57.43 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTAATATATAATTTTGAAGTAGTGCAGTAACTGGTGTGTATGAATATCCGCTTTGAGTGA:1 - chr3R 18790061 3' - I-element 19 1 60.40 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACTGTGTAAT:1 + chr3L 27357639 3' - mdg1 14 2 65.35 CAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGGCCACAAAAATAAACAA:1 + chr3L 5241176 3' - Ivk 30 1 58.00 AATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATGCAGACGCTGGGCTTGATTTCTGCCGAT:1 - chr2R 4500877 3' - springer 7182 2 70.30 TAAATAAAAATAAATATTTGAAAAATGTTTTCAAGTCAAAAAAAAAATTGTTTCTTAACAAATAAAATATTGTTTGTTTGCCTGATAAGTTGTTGCATATC:1 - chr3R 17522291 3' + G7 1152 1 35.64 ACGGTACATAATCGTCTTTTACGCTTTATGCGTTGTGTAAGTGGCCGATTTTTAGCTCACCTGGCTGACACTGGCACTGCCCACCTCCGGATCCTCCCTC:1 - chr3R 16514137 3' + S2 286 1 54.00 TATTTTTTTTTTTCTTAAATTTACCTACTTTTCCATGTCAAATATGCGTAAGGCAATTACCTTAGCACAACACATTTATGACAAAGGTCGTCAATGGTTTT:1 + chrX 8998988 3' - TART-C 11097 1 52.48 AGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTTCCGCATCAAACCCTACATGTCACCATATTTGTTTTCGCGTCAATTTTGATTTATGTGT:1 - chr2R 6608522 3' - INE-1 562 1 63.37 GTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGGAGACATCACCATTCTGAAATCCAAACTATGAGCTGCGTTTTGTTTGCCTGTCACAA:1 - chr3L 10043556 3' - G6 1898 1 54.46 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTGCTTTGAAAGCGATGTTCTTCGGTTAATTGTGAGTGACAACTCACTCACTAACTCTGCTGGCAAAC:1 + chrX 16671150 3' + P-element 2879 2 70.30 AGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATGGTTGGTACGACAGTATTCAAATTA:1 - chr2L 14793470 3' - Stalker2 11 2 68.32 CTAAAATAAATAATTATTCCATATAGTTTGCTACTTATAGTAATCTTGTACTTAATAAACTTGTGCAACCTAAAATAAATTAATCAACAATACAATTT:1 - chr2R 14553736 3' + Doc 155 1 75.51 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGAAGGAATGAAGGTTCCCTTACCTGAACGGAT:1 + chr3R 13331472 3' - transib2 43 1 68.32 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTGCTATGTACAACGAATTAACACATTTTGCAGT:1 - chrX 10451479 3' - hobo 45 1 80.20 GTTGTAGTTTTTAGAACTTNCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAATCAA:1 - chr3R 7469972 3' - Doc 57 1 72.28 ATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGAGGATGCGAGTAACTTTGAACCAGGTTGCTATGTAGGTCGC:1 - chr3R 19982139 3' + Doc 197 1 60.00 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTCCCCCAAGGACGTGCATTATTTAGCA:1 - chr2R 24278029 3' - 412 7100 2 74.23 CAAGTAGGAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACAAAGTTGCAACAAACCAACGAACTTAATAACCGTATATCTATACACCATGTATCTATTTCGAAA:1 + chrX 5383005 3' + ZAM 58 2 52.48 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCAT:1 + chr3R 23338324 3' + roo 9028 1 67.00 CAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGGCAACAAAAATAAACAACTACGCTCACAGATA:1 + chr3L 5241191 3' - Ivk 16 1 61.39 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAGCGCTGTAAACAATAAAATCAAATTAATTATGGCCAAATAAATCACTGGCATCCCAACTCGGGGGGCA:1 - chrX 16671037 3' - P-element 9 2 70.30 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTCCCGAACATTGCAGCCCTGGGTGCAAGCGCTTGA:1 + chr3R 21365574 3' - P-element 22 1 59.00 TAATAAACCAATATATGCCACCAATTGCTACTTTTTTGAATGCAGACAGAGAAATGGTGGTATTTAATTTTTATATATATACTTTCAAACAATTTAAAGAA:1 + chr3R 11048768 3' - blood 375 2 77.23 CAATTCGTAAAATAAACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTTTCAGACTATTTACATTTTAAATTGGATTTTTATTATTTTAACTATTGTATT:1 - chr3L 22110284 3' + diver2 4824 2 60.22 TACATATTGAGGGTAGATANACTACAATCCTCCTTGAATGGAAATGACACAATGTATCGCCCATCTGAATCTTTTTTTGTCGTTTTGATAAATTTATTTTC:1 - chr3R 19444966 3' - Stalker3T 5 1 97.03 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGTATGTAGCATATCCCCTTCCGTTTTTTGGTTTCGTGGTTTGCCAGTT:1 - chr2R 19102149 3' - opus 7026 2 60.40 GTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTTGACGCATGCAAACATGTTTGTATGTGTGTGTGTGTGCGTGTGCGAATCGGGTCATGCACTCACACACACTC:1 + chr3L 13374794 3' - Transpac 4920 2 79.21 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACACTATATCTCCGTTTATGCGTGATCGATTAGGAACTA:1 - chrX 19334591 3' - roo 8689 2 59.09 CTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTGGGTTAAATTCTGAAGATTGCCCTTATATCTTAGGTAGGCGTAGCTGGGCTTCCTTTGTTTCACTGGCAAACTGGC:1 - chr3R 14400354 3' + baggins 5019 1 50.50 CACTACTCCAAACTGCGTCTAGAATTTTATCTTCTATGGAAATTTGAAATATTTGTATATTCGTTCAGATTGCTGTTTATTTTTGCTTTAATGAATTCCCA:1 - chr3L 2529018 3' + springer 469 1 78.22 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAACAATTGAAATGTCATGCAATAAATCTACCCCACACA:1 - chrX 22593156 3' + 1360 3351 1 65.35 GTACCCAAGAACAGCAAAGTGAATTCATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCCAAGTCTATTATATCAACTACAATGGCCACGATGTCGCCGTGC:1 - chrX 16699729 3' + Stalker3T 263 1 80.20 GAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTCGATGTGTGAAATTAAAAAATTTTGCGAT:1 + chr3R 14334800 3' - X-element 4452 1 71.29 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCGGCAGCAGCACTTAAGTCTAATTAAAATGCTGCCCCCTAATTAATTAAACAAATTTTTGGGGCAAA:1 - chr3L 1998789 3' + hopper 1407 2 71.29 TGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGC:1 - chrX 21668023 3' + Tabor 436 2 71.29 CATACAGCGAGCACAATCACAGATTCTGACAACCATCACGAAAAGATCAATCCGCGGGAGCACTGGCTGGACTATGCCGATAAAAAGTACGACCGCCAGTT:1 + chrX 3877109 3' + F-element 4318 1 58.42 CCGATAATAGGATAAAGTATATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCTTGCATCTTATTTATTTTGCTCACTACTAATGATTTTCAGATTGTGGT:1 + chr3L 25678245 3' - Cr1a 4212 1 60.40 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGCACCGTCCATTGAATC:1 + chr2R 6850502 3' - roo 8702 2 69.31 TCCAAATATCTCCAATAGTNTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTAAGGAACACTGATGCTGCTTTGTGGT:1 - chr2R 24555640 3' - hopper 48 1 72.28 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACGAAACCAAAGCAAACCAAACCGAGCCAAACGAAACGTTGGAAAAACTTTTGGCGCCCCGGCAACGGAGACG:1 + chr3L 17186903 3' - Tirant 4 2 77.23 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATTGTATGGGCCAACTAACGCTACCTTTACCGACTGCGGTCAGTGGGTTGGCAA:1 - chr3L 13785358 3' - pogo 20 1 57.43 AATTTATTCAGTGTTTAATTTATTTCGGAGTTGATCCTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGTGTATA:1 + chrX 8403650 3' + McClintock 347 2 80.20 AAACTCAAACATAAACTTGNCTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAAGAACAA:1 - chr2L 17245017 3' + copia 208 2 71.29 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCA:1 + chr3L 7099633 3' + roo 357 2 78.22 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATACATAAAGAAGAGCCACCTGACTATAAAGATTAGATTATGAAAT:1 - chr3L 25504382 3' + copia 257 1 55.45 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCACGTGCACTTCATGAGTGTTT:1 - chrX 21009357 3' - hopper 51 1 74.26 TAAATTAACATAATTAAAAAAAAGCTTGGATTGTTAATGGAACTGATATGGCTTAGACTTTTTGGCAGTGCTGTTATGACTCCGCCTGCAGTTTCTCCCTT:1 + chr2L 3923125 3' + HB 319 1 78.22 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCACACATACGCACAGTTAGGATCTTTACCAAACAGAATGGCACGTACTGGGGATTTTCGGAGGGG:1 - chrX 15287841 3' + hobo 2934 1 67.74 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTTTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTA:2 - chr2R 5214953 3' - F-element 25 1 57.43 ACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTACCTATGTACACATGGGTATATATTTTGTGTAGGCCCACCTACGCAATGCAATTAAGCCAACTCAATTAA:1 + chr2R 10014888 3' + flea 5011 2 75.25 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAAAGGTCCTTGAAAATCCAGA:1 + chr3L 18418914 3' - hobo 23 1 56.44 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCGCACAACGGGCAGGTGTGCGAGCGAGAGGGGGCGGACGTGAGAGAGGGCGGGTGCACA:1 - chrX 4707825 3' + P-element 2869 1 59.41 AAAAAGAAAAAATAAAACAAAACAAAGCTGCAAAAAATCGACAGAACAAACAAAACAAAAAAGCGAATGGCAAATGGCAAATACCGAGCTCTCTTGGCTTA:1 + chr2L 2096275 3' + gypsy7 5011 1 79.21 GATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAGCTGGGAAAAGGGTGCAATATACGGAGCAGGGGTTTGGGGCACAGCCATT:1 + chr2L 6827330 3' - Ivk 102 1 59.41 TATGTATGTATATACTATGTATGTATGTATGTATATCTATATATTTACTAAGTGCTATTATACCTTAATACACTTTGAGCCGAGAAATCGATTTAGACTCA:1 - chrX 9442884 3' - INE-1 61 1 69.31 TCATAAGGTCCCCCTTGACGAGAGCCGGGATATGATGATGATCTAAAATTCTTTCTCAAGACGTTCAATATGAAATGGAGTCATCCGTCATTACTTAAAAG:1 + chr2L 4618184 3' + BS3 1587 1 55.45 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATATATCTCGGTCAGGTGTGGCACAGCCATCG:1 + chrX 12992792 3' + I-element 5308 1 69.31 ACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAATTCCAGACACAA:2 - chr3L 16282372 3' - gypsy5 42 2 63.37 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTACCCCTTTCACCGCAGAACGAAACCAGCGAGGATGAGG:1 + chrX 17858052 3' + P-element 2849 1 37.62 AAAAAGCTAACTATAGTTAGCCAGGAAACCAGAAACTTGGGCAACTGCACCTTGGATGTTCCAAATTAAGGGCGAATGCGTTAATTATTTCCCCCATTGTC:1 + chrX 10828492 3' + X-element 4622 1 77.23 TATATATATATATATACATATTTAAAAATATAGTTAATTAGAGAACAGAGTTTCTTTATCACCTAAACTATAATCGAGTCTTGGAAAACAAAATAGTTGGA:1 - chr3L 5127383 3' - G3 4506 1 77.23 TTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGTACAACAGCATACAAGAAGGTAGCTCACCGGTGGAACTAAGGCTG:1 - chr3R 21039292 3' + 297 410 1 55.45 GAAGAAGCATACGATCATATCCCCCTTAGCAACTAAGTAGCCTCGCAAAGTAATGCTGACGCGCCATAATGGAGTTCAGCACTCTATGCTGAGACCGTTCG:1 + chr2R 1276185 3' + invader3 52 2 78.22 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCAGAAA:2 - chr2L 5926945 3' + pogo 2053 1 73.27 GCAAAAAGGTCACCAAAAAACCGAGCAGCTGCTTTCCATCTGCATGATTTACATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCATAATGAAAATAAATTGTATTTT:1 - chr3R 13629865 3' + S2 1282 1 75.25 GGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAGGGACTGCAGGACTACAGGACTGCAGGACTGCAC:2 + chr3R 4845051 3' + invader3 267 2 66.34 ACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGTGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACCCAATGCAAGGCTAATTCTTCGTGAAGCAGCCGCACTTG:1 - chr2L 97928 3' + F-element 205 1 61.39 ATAACAACAATAATACTAATAATCTTAATGTTTCAATTAGAGAAAAAGTATGTAAATTGAAGGCGAAGTGGCTTTGGTCTGAAGGCATCATGGAATAAT:1 - chr3R 20305569 3' + mdg1 7067 2 25.25 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGTTATATAAATTAAATTGCGCGCCCAAAACAAATTAAACTAATAATAGGAAGC:1 + chr3L 7099660 3' + roo 385 2 55.45 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATAGTAATATACAATAGTAGTATTAATATAGTGGTAAATCAAAAACC:1 + chr2R 19089024 3' - Tabor 33 2 57.43 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGGTGAATATTTTTGACAAATTACTTAAATTACTTACG:1 + chr2R 11030567 3' - F-element 64 1 74.26 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGAGCGGATAACTCGCCGTACAGCCGCAAAGCGAACCGT:1 - chr3L 6834956 3' - hopper 37 1 57.43 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGCGTTGCCTC:1 - chr2R 19560150 3' - Tirant 20 2 58.51 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTCTGCACTTTAAGCACTGCCACTCTCCACTTTAA:1 - chr3R 9278338 3' - roo 8707 2 72.28 AAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCGTAGTGTCCTAGAACTTTAGTACTCTATGTCTGTACATATC:1 + chr2L 8176466 3' - 1360 38 1 63.37 ATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACACATGCCCCTGTCCTAGGCTTTCTC:2 - chr2L 15567118 3' - 17.6 49 1 75.25 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGGTGAATATCATTGTG:1 + chr2R 5772520 3' + HMS-Beagle 7007 4 66.34 CGATGTCTCTTGTTCTCATNTACCAAGGAGCCCCCGCCAAATATACCAACCGGCTCGGAAATCATACCAAACTGCATATGAGGTGGCATACTTTTAGGCAC:1 - chr3L 15955047 3' - jockey 4574 1 61.39 AGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAATGAAACCGAATCCTGCCTATGGCAT:1 - chrX 7292666 3' - 3S18 5793 2 51.49 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTTAGGGGTAAAACATGCAACATTTTGCGATGTAGGCTTACGAGGGGGGTTGGTGCTTGGGGG:1 - chr3L 14623909 3' + hobo 2937 1 65.52 CGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCATACTGTGTGTTTTTCTTTTCTGCGTTTT:1 - chrX 2898503 3' - roo 8835 2 70.30 ACAGAAAAAGAAAAAAAAGGAATATGAATGGAATGGAATGGATGACAGGTGACAATTTTAGCCAAACTTTTACGACCCTCGATGGGCGGGTTCTATGTGTG:1 + chr2L 14273486 3' + Doc2-element 225 1 58.42 GTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGGCGGACGCAGTATGCGGATGGTGATTGAGGTGATGGAGCGGCGACAGCTGACGCAGCTCGGCCACCTCCGACT:1 + chrX 6786353 3' - Ivk 5054 1 73.27 CATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAGAGCGTAGTAACGGCAGCGCAGAGAAGAGAGTTTGGAGAGACAGAGTCTGTAAAGAG:1 + chrX 21184043 3' + Juan 4192 1 58.42 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGAAATTGAATTTATCACATGTTATGCGT:1 - chr2R 17420843 3' + pogo 2055 1 73.27 ATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTTGATGTGGAACAAGCTCATTAAA:1 - chrX 17029967 3' + flea 255 1 73.27 GCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACACGTTGCTACAACTGCGGCTCTAATGAACAC:1 + chr3R 3497663 3' - invader2 4952 2 71.29 CACGTTGTCGGCGGCTTCCTTTGCGTCTCTGCTCGCGCACCTTCTCCAACAGCCTGGAAATGGCCATGTGCTCCTGGCTGCTCTGCTTGGTATCGGAATGC:1 + chr2R 24412539 3' - G-element 486 1 67.33 AGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATGTCTAAGTACGAAATGTAATCAAAGATCGAGAA:1 - chr3R 2171155 3' + G5 4785 1 73.27 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAAAACCTAACTTATAAACGACATAGAAAAAATCTTGGTAATTTTGGGAACAAATTTTTTTGGTATAAT:1 - chr3L 13987161 3' + pogo 2095 1 73.27 AAAATCTTAATTATTTTAATTGCAATGCAATCATCAATGCCTGGGCCCCGAATATAATGCCTGCCATTAAGTGTGAATGGGAATGCTGGGCAAACAATCGC:2 - chr2R 17983575 3' - TLD2_LTR 100 1 79.21 ATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAACCTGTTTGCAGATATGCTCTATAGTTATTATCACTATGTCATACTAAAATGTTATTTAAATATACTGATGAACTTCTAA:1 - chrX 21097391 3' + Tc3 317 1 68.32 TAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCCACTCATGTTT:1 + chr3L 5479056 3' + 3S18 6062 2 72.28 GAAGAAACGAATTTACATTGTATATATTAGGGTATTGGTTATAATTATTTCCTTGGAAATTATTATTAAAATTGTGTCGGTTATTATTATAATTCCACTGG:1 - chr3L 25801572 3' - 1360 3156 1 71.29 AAAGTCTTCTTATTTGGGANTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGGGATGGTTACCCTACTTATTATAGTATAATATCAAATATAT:1 + chr3L 20411886 3' + roo 404 1 73.27 AAAAATAACAAAATAATTATGTAGTCCCTTTAAACAGCAATAAAGTGGGAAATTGCAGCGCATAAATCTCTGTCGCCGAACTGTCATGGGAATAGTTATG:1 - chr2L 3156174 3' + gypsy11 3939 1 73.00 TTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCAACAACAAAAACTGCCTTAATCGAACTATTGCAACCTAAGTAAAGTAAATT:2 - chrX 21458508 3' - transib2 2468 1 61.39 AGTGAAGGGAACCCCAAATAAAAAGCAACATTGCCAAATGTCGCTCGCTTTTGCTGACGTTGCTCGCTATCTCCTTCCCAGGAAACTTGCACTCCAATCTC:1 + chr2L 12278552 3' + F-element 74 1 74.26 AAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCTGTGGCAGCTCCTCCCTCCCATCTTCCCAGCGTGCCACGCCCCCTCTTTATGTCGTACAAGCGGCAACA:1 + chr3R 12336433 3' + P-element 326 1 73.00 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTGCTCGCATTTTCCCAGCTGCCTGCCAGTTTGGGTACACAAATTATTTCATTAGACTCACACC:2 - chr2R 7838950 3' - pogo 11 1 68.32 CTTAAATCATTATAGATCTAGCTATGAGTAGAAGAAGCAGCTGGATTTTCGAGGGGAGCAACAGAGACAGACAATACGACTGAATGACGTGCTGACGCCTC:1 + chr2L 14401952 3' + Cr1a 4147 1 67.33 ATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATAGTAATATACAATAGTAGTATTAATATAGTGGTAAATCAAAAACCTAACTTCTAAATATCTTTAA:1 + chr2R 19089044 3' - Tabor 13 2 58.42 ATATATTTACATGTTTACATATACGAACATCCAAAGCAAAGGTATGTACACATTCAGTACTAACTTATTATTATTCGATTTATCTTATATTTATAGAACAA:1 + chr2R 17700884 3' - G3 4507 1 57.43 GCAGTTAAAAAAGGAAAGTTCCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCTGCTCCCCGGACTCCACATACTTTCATTGAAAGAATATATTATTAAAAAATATTTT:1 + chr3L 25802110 3' + Gypsy6A_LTR 270 1 64.36 GAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAAGCATCATGTTATTCTAGGATCTTTGGTTCAGCGCTCTGTGCTGAGACCGTTCGG:1 + chr2R 1276186 3' - 1360 50 1 74.00 AGTAGTGTTGTTTAACGTTNTTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCATCCGTAGTTTTCGTTTC:1 - chr3L 10474137 3' - copia 4898 2 56.44 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGAAAAA:1 + chr3R 7869188 3' + 297 362 2 61.39 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATGCCGAGTTCTGCAAATTAAAATCGAATCGAATCA:1 - chr3R 10110437 3' - Doc 47 1 69.00 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTAGCTCCGTTCTCCGAAGAGAGAGAGTGAACGAAGAGAGCGCAGGAAGAGAGTTCCAGGAAATCG:1 + chr2R 18171599 3' - P-element 12 1 66.34 CTTAAAATGATTCTTAGAGNTAACAAAGACTCGCAGCTGCCACGCAAATATTCTGTGTTTGTCCTTTCACTGCTGCAGTAATCCTTCAAATCCTGCTCTAT:1 + chr2L 10001284 3' - Gypsy6A_LTR 140 1 59.41 CAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCA:1 - chrX 7292693 3' - 3S18 51 2 74.23 CAAGAAATTGTTTGCACAATGAAAATAAATTATATTAGCCATCCTTTGTATCACTATTTTCATTTTGTAATAGATAACCATAAAAGTTCAAAAGTTTTTTA:1 + chr2R 4950007 3' + S2 9 2 73.27 AAACAAGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACGCAATCCAGATAACAACAACTACAACAACTGTAATATAAACTCGCCTAAACA:1 - chr3L 9158222 3' + I-element 5079 1 66.34 AATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGGTG:1 + chr2R 5772508 3' + HMS-Beagle 199 2 78.22 ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAATAATAAACACAAGTAATAATAATAATAA:1 - chr3R 10582088 3' - 3S18 5813 2 70.30 AAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGC:1 + chr3L 13569783 3' + invader3 223 2 75.25 CCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGACGCCTGCTGCTCCTGCTGCTGTTTATTTTTGTG:1 - chr2R 21434086 3' + HMS-Beagle2 7030 2 72.46 ACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTCAAAGCTGA:1 - chrX 4166373 3' - I-element 5315 1 51.49 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCA:1 - chr3L 19349933 3' + 1360 3371 1 57.43 GTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTAATCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCAATAGATATAGATTATAAAAAAAA:1 - chr2L 20716880 3' - INE-1 556 1 77.23 TGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTCTTTATATTTCAGTTTGTTTGCAGAATGCGTGTCAGCCATAATATTTACTT:1 - chr2R 17644859 3' - mdg3 5279 2 47.52 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGCCCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTATCATTTACGATCGACACACTTTCCCAT:1 + chr2L 21086122 3' - roo 6 2 71.29 TGGGTGCGTTCTCTGCAGGNGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCCTGGGCAATTTGCAGAGTGCGCTGTCACGATTAATAACGCTGTCATAATAACACTTTTC:1 + chr2L 4619989 3' - G2 2915 1 63.37 ATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTTCTTCTTGTACGTTTTTTGACGTTGAATACGAAATAGCAGCAAGCTATTGCAACTTTAGGATTGG:1 + chr3L 4556266 3' + copia 95 2 53.47 ACCAGACCCCAAAGATCATCGTTATTATTGGGTTTGGCTTCAGAGACCTTTTTTTCACGTCCTACCTGGCCAGGGTACGGGCTTGGTTCAGCTTGAAATCC:1 - chr3R 4849026 3' - Tc1 1221 1 61.39 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGAGATACGCTTTACTCGTCTAGTTTTAGTTCAACGGAAAGGCATCTTCTAAAGCAAACTCGTGGT:2 - chr3R 5594929 3' - 1360 11 1 66.34 ATGATCTCTGAAGGTAAAACCTACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCGGAAGTGGAAGCGGATGTAGTGGAAATTCAGGAGCAGAAAGAGGAGCAGCGATCGA:1 + chr3L 21436756 3' + Tc1 410 1 56.44 CCGGGACTGCCAATCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGCGAGGCTGGCGAATTGAAACCGTGCGGGCTGCTACTCGTTACCGAGGTGGAACCACT:1 - chrX 4084155 3' - Rt1a 4913 2 61.00 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGTTGTCAATTCGTTCCAGTCGCTTATCCACCTTGTGCATTAGAATGA:1 + chr3R 21884244 3' + mdg3 215 2 55.45 CTCTCCAAGTGGATTTATCACCCTCTTCCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCCGAAGTTCCGGCGCAATCGCACCACCTTCAGTCCGGAGCAGCTGGATGA:1 - chr3L 12423544 3' + gypsy3 6858 2 52.48 GTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGCATATTATTTATACTCTTATACTTGAGTCCTATTCGAGTGCCCCGTGCAGTATGCTTTTTT:1 - chrX 1706023 3' - Juan 4062 1 52.53 TAATTCAGCAAACGCAATCAAAATGCGGAATCAAAACAAAAAAAAAGAAATGCTCAGAACACACACAAAACTCAAGTGGCGCGAAAATTCGAGGCACAGTT:1 + chr2R 13769899 3' + Porto1 4321 1 63.37 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCATATATGTACATACACACTTCTAGATTCCTTCG:2 - chr2L 8622769 3' - 297 40 2 77.23 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACACAA:1 + chr3L 20354075 3' - 412 32 2 55.45 CCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAATCAATTTCGGCCCTATGTCATTTATGACTTGCATTCCATACTACCGATTT:1 - chr2R 17963202 3' - blood 7014 2 74.26 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAATCTAGTTGTAGGTTTTTATGACTCTTTTATTTTAAT:1 - chr2L 7175567 3' - blood 7049 2 60.40 TACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGCGAATAACGCGTACGACACTGTGATCCTGGCAAAGACAAGGAAA:1 + chr3L 26386292 3' + HMS-Beagle2 297 2 72.00 ATATAAATTAATAAAAATAAATGGTCCCACTGTATTAAAGTGGAAGAGCATGATGTAGCCATCACTTGAGCCCCAAGTTCAGGATGCGAACGGGGTTTTTG:1 - chr3L 14243848 3' + transib3 2677 1 57.43 TTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTCGATGTGTGAAATTAAAAAATTTTGCGATGCAAATTGGCATTGCCAAAATTGTCTAGCC:1 + chr3R 14334830 3' - X-element 4422 1 58.42 AAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGCAGCATTCGTTTATCTTTCAATTTTTGATGGTTCTCTTTCATAAATTTA:1 - chr3R 19449729 3' + 297 45 2 69.31 AAGCATACGTTAAGTGGATNTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTACCCCTTTCACCGCAGAACGAAACCAGCGAGGATGAGG:1 + chrX 17858052 3' + P-element 2849 1 37.62 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAGAGGGCGATATCACAAAATTGCCAAACCGGCAC:1 + chr3L 6658244 3' + hopper 1398 1 62.38 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAGGCAGCACCAAAAAAATAGGTTGAACATATGTGGTGTGTGTGTGTGGAAAACTAATGACAGGCACACAAGCCAGAA:1 + chr2R 18766305 3' - hobo 1 1 72.28 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGCTTCAGTGGTCGAAAGTTTGTTACCGAACT:2 + chr3R 31422702 3' - F-element 61 1 69.31 GAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTTTCAACATTTTTTAAGTCAATTCTTTAAGATTTTCACTATAAGGGTCCTTCAATTTCGTGAAA:1 + chr2L 12885757 3' - hopper 1028 1 69.31 TTTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATAATGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTAAATAAATCACGTACAAGGCCAAGGCGCATTAG:1 - chr2L 3275955 3' - invader2 284 1 74.00 ATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGACTGCGGCTGGCCCATTAACTAAACAAAA:1 + chr2R 24138572 3' - Quasimodo 7203 2 75.25 TAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCATCATGAAAGGCAGCAAGGGAAGCAAACAAACACATTGTCTTTCAATATCCCGCCAAATGTTTACGTTAT:1 - chr2R 20205088 3' + hobo 492 1 74.26 GGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCACCTGCTCCTCCTGATCCCCCTGCTCCACCTCGATTTGGCTT:1 + chr3L 18158875 3' - G2 2877 1 63.86 TAAGTTGCCGCATGGGTAANAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTAAA:1 - chr2L 9045421 3' + jockey 4958 1 59.41 ATATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATCCTAGTAAGTCCTGGTGAATATGTTAACTCGACCTTCGAGTGTGA:1 + chr2L 14762030 3' - mdg1 29 2 53.47 ACAAGAGAGAATTCTATAGTCGAGTTCCCCGATTATCAGATACCCGCTATTCAGCTAGTGGGAAATGCTTACAGCTCCCAGCCAATTAAATGACTTATCTT:1 - chr3R 13392318 3' - INE-1 579 1 65.35 ATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTGAAAACCTGTGAAAATTAGTGCGAAAATGGATC:1 + chrX 5377387 3' + Bica 4907 1 67.00 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCTAGATGCCGATGCATGTTGGCAATGCGA:1 - chr2R 19840212 3' - roo 34 2 67.82 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTGAATGGCAAATGTTTTCCCTTAACACAATTTATGGTCCAAATATTCTTTATAGCTTT:1 - chr2R 12525576 3' - mdg1 7057 2 44.55 CAAGATGTTAGAGAATCAANTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGATAGAGCTACACCTGCATTGGA:1 - chr2R 18723022 3' - HMS-Beagle 6810 2 65.00 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACACTAGAATTGAGTTTAAATATACAGACAAC:2 + chr3R 28565313 3' + 412 443 2 67.33 TAAATACTTTGTATATTTTTTTGTAGATTTTCTTCTTAAGAATTATTGATAAAAGCATGGAAGTATTTATATACAATTTAAATATATTTTCTGGGAGTTCG:1 + chr4 971866 3' - Cr1a 171 1 62.38 AATTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTGTCTTAAACTAGTTGAAGTGCTAAATAAATAAACTACTTACTATATAGTTTTATAA:1 + chr3R 27169503 3' + 412 7525 2 55.45 AATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAAACATTTTATTAATAATCGAGTAATC:1 + chr3R 25086180 3' + Bari1 1690 1 62.38 ATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACCTTAAAGAATGGAAAATCCTAGAGGAACAACCAAGTCTAATCTGTTTTTCAAACGTC:1 - chr3R 10439871 3' + Quasimodo 406 2 63.37 TCGAAGGACCAAAATGTTGGGGGGTGGGGAGGTGGTGTGGTGGTTGGGGATCCACCAGTTCCACGATCGTTGGCATGTGGCAGAGAGGTAGAAAACTGGAA:1 + chr2R 11490571 3' - GATE 265 1 73.27 GGCTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCTTGTAATATCGAAATCAATGAGATTCGTAATTCTGTCGCTGATTACTAAAG:1 + chr2L 9045481 3' - jockey 32 1 53.47 AAGAAAAAAAAAAACCTTAAAAAGCAGCATTGCAAAAGAAGCAGTAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGCAACACGAATTCTTTTACCCTAAATAAT:1 - chrX 4081070 3' - Tc1 1468 1 63.00 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTTGAACACAATCCAGAACCCGC:2 + chr3R 23638189 3' - pogo 19 1 60.40 GTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCTACGTCTACTGCATTGAAAGGTGGTTGTGTGGGCAAACACAGACTTCAAAGCTGTGGA:1 + chr3L 2993568 3' + flea 493 1 62.38 TGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTCCATCTCAATCAAAAGTGTAATTTCCTTCTCGAAGCC:1 + chr3L 8267204 3' - hobo 447 1 66.34 TCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTGATTAATAAGCTGGGGAGGGCAATACTTCCCA:1 + chr3R 4474228 3' + copia 212 2 71.29 ACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTCTTCACCACTCCGCGGTCTGGAGGAATTAGCCGCAACAACAAACAAT:2 - chr2L 23506320 3' + Max-element 8321 2 71.29 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGAATATAGTCGATATGACCGATCGGGGGATTCAGTCTCCTCGCGATGCTCTGGCGTTGATCT:1 + chrX 4707926 3' + P-element 2876 1 68.32 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAATACCTTCTAAACTTATGAACTTTGAGAACACCATTATTTTCTGCCAGTGTTTTTAAGAAT:1 + chrX 8316397 3' - hobo 15 1 62.38 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCAAAATATACATGACCATGTGAACGAACGATGTCCCATGCACTGCA:1 + chr3L 22930378 3' + roo 9043 1 57.43 TATATACCTACGTTAAGCTTGGCGCTGCATTTTTCGGCAGTCTGTCCGGCCAATTGCAGAACACACAGAGATATTCGCAGATACAGTGAAGATTCACTAAG:1 - chr2R 15135021 3' + diver2 162 2 56.44 AACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTTCAATTCTATTAACCGGGGAAACCCACATCGCTGTGGAAATATGCGCTGGAAATATTGATATCACGTACTGTT:1 + chr3R 26765202 3' + mdg3 245 2 73.27 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAATTGATAGCACACACACACACACACACACACACACACAGTAATGGCCACAAAATTAGCAATACGAAAATTTG:1 - chr3L 8039324 3' - hopper 5 2 59.60 TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGG:1 - chrX 21668008 3' + Tabor 451 2 56.44 CTTCCTTCTGCCTTTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATAACCTTTTACCATACAAGTATCGGTTATAAAAACAACTAAAAATGGGGATGGAGGCTGGG:2 - chrX 21175653 3' - INE-1 28 1 69.31 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATAATAATCATTTTATGTGCATGTTGTGTGGCATACTT:1 + chr3R 20332919 3' + jockey 4954 1 63.37 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCAAATAATAACCAAATAAAACAAAAGGATACACTGTTCT:1 + chrX 4277527 3' - roo 8700 2 63.37 GTATGTAAGGGTATACATGACTACCTTACTATACTTATATGTCTATCAACTTTTTAATGCCAATTAGTGTAAATATTCATTAAATCAGCCCGTATTTGAGC:1 - chr3L 19249647 3' - Transpac 1 2 78.22 GTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGTATAGGTTTTGGTCTATAGTTTTTGCGCTATTATTCGCTGTACAAATGCTGGTATACTTAGTTAATTA:1 - chr3R 19505507 3' - mdg3 5253 1 70.30 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATT:1 - chr3R 19449955 3' + roo 9049 2 74.26 TAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGGCCCCCGTTCTGAGCCATCCAAGATAGAAAATTGCCGCCCTGCGGAGCAAGTGAGAGAGTTT:1 + chr2R 23859829 3' + jockey 4686 1 63.37 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATTCATGCTCATAGGGGGGAAGAAAAGTACACT:1 - chr3R 13353216 3' + 1360 3344 1 71.29 TATTATTATTATTATTATTAGTAATTAATTTTTGCAAATAAATTTATCTTAGGAATTTAAGTTCTCTCGTTTCACTTCGTGTCACGAACGCATCCTCAGAA:1 - chr3L 10942588 3' - mdg1 7066 10 81.19 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTTATTGTTTGCAAAAGTTTTCACCTT:1 + chr3R 17660527 3' + roo 356 2 77.23 CAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATCTAAACCACTTTTCAATAAGACATTATAGCCAGAAAATCAAGATTTTCTCTGCTTTTTAGAT:1 - chr2R 14054339 3' - hobo 2700 1 69.31 AGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACTTTTATTGCTTTGTCAGCGATTTGAGGAAGAGGAAGAGAACCGCAAATTATGAATTATACACTTGAA:1 - chrX 10975650 3' + Bica 410 1 73.27 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAATATTCCAGGCTAATCGCAAGACAAAAGCCACAGCTTTTCACACCTTTAATC:1 - chr3R 23640963 3' - 297 19 2 59.41 GTGTGTGTGTGTGTGTGTTCGTCGGTGTGCTTACGTGTGCATTGGTAGTGGTGGTGGTGGGAGTGAGAGAGAGAATGAGCGATCTTGATTATATAGAATCT:1 - chrX 19129395 3' - accord 7027 2 58.42 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACATTTTTCCTTTTGCTTCTACATTACATATATCTTACAGCT:1 - chrX 13126213 3' + mdg1 383 2 61.39 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGGGAAAAATCCTGCCCACCTCACATCACCCACATCCAAAATGCG:1 - chr3R 13739668 3' - Burdock 6164 2 52.48 TAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGGATGTTTTCATTCTTCAGACGCCACCAAGACGCAAAAAGGCCCTAAGCTG:1 + chr2L 17995434 3' + roo 8811 2 65.85 ACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCAACCCAGCGCGGTACCGTTAGTTCAC:1 - chr4 249256 3' - 1360 45 1 73.96 TTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTTCTAGAGGTGCTGTTAAAACGAAATTAATTTAACTTTTACTCTTAATTTTTTGTA:1 - chr2L 2226428 3' - I-element 106 1 61.39 ACATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAAC:1 + chr3R 11151872 3' - mdg3 5303 2 73.27 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTGCACCC:1 + chr2R 13653406 3' - F-element 48 1 58.59 AGTCGGGGAACTTGACTATAGCATTCTGTCTTGTTTTTCAATTGAAACGAAATGCCTGTCCAGCTGCTCCTTGTCGGTTATGTGGTGTG:1 - chr3L 27092077 3' + INE-1 567 1 42.70 CAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCAAGACGAGATAAGGCAAAAATGAAGGGAAAGGGATGCA:1 + chr2L 11176305 3' + opus 322 2 62.38 TTTTTTATTTTTTTTTATAATTCATTTAATTAA:1 + chr3R 5063938 3' - HMS-Beagle2 479 5 69.70 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGC:1 - chr2L 9045425 3' + jockey 4954 1 64.36 TTATTGTAAAATATTAATTATTTGAATTTAATCAGTGTAATGTTGTTGAGATTGATTTAGATTTCATAAAATTAAATTGTGTGCATTGTATAAATGATACA:1 - chr3L 8071613 3' - TLD2_LTR 107 1 57.43 TGGGATTCCAAGTTCCCTATGTATGGCGACATTCTCCTATTTTAGCACATTCTGTACCAATCTTTTGTGTTTGTCATAATCCAATTATCATCAGCACATCA:1 + chr3R 15053643 3' - G6 1743 1 66.34 AATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGCCCCAGCCAAACACTTAATTC:1 - chr3R 9106329 3' + P-element 2711 1 26.73 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAAGTATCA:1 + chr3R 12876370 3' + hopper 1378 1 64.36 TTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTCATGCTATCCTGCTTTCCGACGGGTCCTTGCCAGCTTTTAAGC:1 + chr3R 23543043 3' - 412 8 2 71.29 GGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAATTCCAGACACAAACCCGGCCCAAACACGCGACAATTGTTGCAACAATAA:2 - chr3L 16282335 3' - gypsy5 6944 2 77.23 AATTTAAATTTTACAATTTTTAAGATACGATATTCAAGTCTTGCCCCACAGCTTGTCCAGAAACGTGTGATACCAAAGGAAAGCCCAATTGTACTTTGATA:1 + chr3L 15407992 3' - 1360 3037 1 60.40 ATTATACCACAAAATCTGAAAACAAAACAGGCAATTGTTTGCCAAAAACATTAAAACCTTTATTTGGAAATTACACATAAACATATTGCAAAAGCTGCATG:1 + chr3L 18389176 3' + I-element 5177 1 69.31 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCCAACATGCCAGG:1 - chr3R 8765536 3' + roo 390 2 51.09 CACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGGCACTTGTTTCTAAGCCTTCTCTCATCAATTAAACGCTCAGGCGTACGTTCGAG:1 - chr3L 6393469 3' + P-element 56 1 61.39 CCAACTGCGTTTTGAGACTNTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACACCTTGTGACCAAACCACATGCTACAACCCATCAATTAGCA:1 - chr2R 21351320 3' + mdg1 382 2 58.42 CACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAAGTTCAA:1 + chr3R 11052165 3' + blood 7353 2 64.36 GCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATTTTCCACACACATACAGACTTCTG:1 - chr3L 5415365 3' + I-element 5306 1 82.18 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAATAATCGTTTATAAATGATAAATTAATATGGGAAACAAATTGTATGGGCGGTCGATAG:1 - chr3L 7099570 3' - roo 8683 2 61.39 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAACATACTATACAAAATTATATGGATAATGCATGATAG:1 + chr3L 3209235 3' + roo 9033 1 65.35 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTAAACAAAAATTTGCGTACAGTCAAG:1 - chrX 15800911 3' + roo 9027 1 76.29 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTGCAATGGTTTTATGCTAGTTTGT:1 - chr3R 7869092 3' - 297 6 2 72.28 TATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTTTAAACACGTAGCCTGGGGAAAAAAAGCCCTGAC:1 - chr2R 19641851 3' + I-element 5314 1 67.33 TTTCACTCGTTCTTTTTTTTTTTCGTGGACAGAACTTTCAGCTCACTACAAACTATTTCCGTTTGCCAAGTACAAGCCCCAAAAAAA:1 - chr3L 20553507 3' - Porto1 169 1 91.95 CTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCACAGCCCAGGAGCAACCCGATCCACAGCCAGAACCAGACACCCATCGAGAT:1 + chrX 1624502 3' + F-element 278 1 58.42 TTTTTTCTTTTCTTTCTCCTTTTCTTTTTTCTTTTTTCCTTCTTTTTTTTTTGGGGGGGAAGAGGCATTTTGTCAAAGCTTCGTGGGTGGAAAAA:1 + chrX 4519348 3' - Doc2-element 240 1 70.53 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAATAATCGTTTATAAATGATAAATTAATATG:1 - chr3L 7099598 3' - roo 8711 2 80.20 AATTTAAAAGGTTTTAAAATTATATACAACTCTGTTAATAGCAATATTTATAATATATTCTTATTCTTAAAGTCCGAGCATTAAATTAAATTTATATGTAT:1 + chr3L 11917536 3' + 1360 3016 1 92.08 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATTTAACTAGCAACTCGGCTATGGAGCTGCC:1 - chrX 13146894 3' + roo 397 1 67.33 CGGAGTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGAAGATTATTCGCGAGTGTCGCAATGTGGGAAACAGCGCAGTAGCTGCTGCTCTAGAATTGGA:1 - chr2R 14598509 3' - Max-element 8366 1 75.28 TTCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAA:1 + chr3R 10488733 3' + roo 9029 1 67.33 CACTATGTGCAACGCAACTGCTACCACTGACTACTTCAGCTTAGTTTTGGTGGCTGCATGACCCAACAGTCTATTAGCAGCCTGGGATTCTGGAAATAAAA:1 + chr2L 22216559 3' - diver2 4614 2 54.46 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTTGAATTGCGACCAGAGATTTGAGATTTGAGCGTGTGCAAATGGCTGCGG:1 - chr2L 10898387 3' - jockey 4692 1 56.70 AATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAG:1 + chr3L 19339423 3' - Tc1 27 1 54.17 TTCCACAGAGCTATTGATTCCTCGGACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAATATCGATGAAACAAGGCAGGAATGGGGGTGTGTGAACCACCCA:1 - chr3L 13197804 3' + transib2 2376 1 57.43 TTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAATGAGGAGAGTTGAAACTCTCTGCAGACTTGCCTTATT:1 + chr2R 12252889 3' + jockey 4957 1 63.00 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGT:1 - chrX 20361966 3' + hopper 1388 1 53.00 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTATAAGGTATATTCGTTGCCAAGTATGTAACAGGTATT:1 - chr2L 22112994 3' + 1360 3336 1 62.38 CATAGCCCGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGCCCACTAATGTATACACTATAATATATAATTACAAGAACTTAAAAAAATTATCTTATT:1 - chr3L 26719156 3' - Tc1-2 32 1 69.31 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTCCCCAAGAGGTGTTCTCCACCTGCCACCCCCATTTGCAGCACAATGAGCAACAGTCAACACAAGAGGCATCCATG:1 + chr3R 23338366 3' + roo 406 1 74.26 TGATCTTTTAAATATACGAATTAACTTAACCAAACTAACTCTTTTGAAAATATTGATAATTTCGGGACTTTACGTCGAACAAAACGGTGACCTCACAAATT:1 + chr2L 16374234 3' - HB 296 1 78.22 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGGAATAATGCCCTTATCAAAAAACGCGGCAAGG:1 - chrX 19308175 3' + P-element 2843 1 35.64 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGGAGAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTTGCCTTTTTGCTAAACAGTCC:1 - chr2R 21747531 3' - mdg1 31 2 52.48 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTCTTTAGAGTGTTATCATTTGT:1 + chr3L 17701581 3' + roo 354 2 78.22 ATTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTTTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTCTTACATCCAGTCCCTCTACTTTGAACAGGCTATTTAG:1 + chrX 16543604 3' - INE-1 91 1 63.37 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTACCAAATCTACCAATAATTC:1 - chr4 311232 3' + 1360 3334 1 80.20 GGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGCTTTTAGCCCGCATTTTCCCCCATTCACCAAACCATCCCCATTTCCACGGCGCTGAAAACGTGTCAAATGGAG:1 + chr2L 2306155 3' - Doc2-element 4413 1 78.22 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCACAGGGTGGAGAAATATTCTTAAGAATTACCAAACACTATAATAAAATAAGTGAAG:1 + chr3R 4575511 3' - 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chr3R 7869104 3' - 297 6599 2 62.38 AGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGCTTACAACTTGAAATTTGCATTTTTGCAAATTATTTAGATATTCCTACAATATCTATTGCTACTGCACTTGCCTT:1 - chr3L 14624019 3' + hobo 204 1 57.43 GACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGATGCCAATTAATAATTGAACAGCGAAAAAATAAATAAAATTTTTGTATTGTTATATCCTC:1 + chr2R 19592230 3' + invader4 2706 1 67.33 ACCCGAATTTTGCGCAACCAGCGCCGAGGTCGACGAGAGGAGTTTGGAGAGGTGTATGTGAAGAATCGAGATGCCACGTCAAGATGCTAAACGAAAGGGTC:1 + chr2R 2746724 3' - R1A1-element 5068 1 78.22 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAG:1 + chr2R 19061268 3' - roo 8717 2 79.00 ACTCCCTTAGAGAAGTTTANTATTTTATGTTCACTTGCTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGGTTGTTGCTGTTGTTGTTGGAAGCGTGCTGTGGTGAAGCGTTT:1 + chrX 19780112 3' - I-element 476 1 65.35 AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATGCATACAGAACAACCATAACCACAAGA:1 + chrX 6481071 3' + jockey 4940 1 76.24 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGC:1 + chrX 9413853 3' + 412 444 2 72.28 TGTGTGTGTGTGTGTATGTGCGATGCATGGGTGTGTGTGTGTGTGGCTTATATAAATAATTTTTTGTTTGGATATAAAAAAAAAATTATATTGATATTGAG:1 + chrX 15374983 3' + Stalker 445 1 62.38 CTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTG:1 - chrX 20361973 3' + hopper 1385 1 58.33 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAATATTCCAGGCTAATCGCAAGACAAAAGCCACAGCTTTTCACAC:1 - chr3R 23640971 3' - 297 27 2 59.41 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCA:1 + chr3L 3757398 3' + roo 9027 1 74.26 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCGGAACACGTTGTTAGCCCGGCTCCTCGATCCCCCAATTATCCATG:2 + chr3R 14194000 3' + pogo 2098 1 72.28 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCAATATCCGTCATAGCATTTAACTTAAATAA:1 + chr2L 13093828 3' - roo 8709 2 72.28 ATAAATAAATAAAATAAAATATGCAGCCCGAAAGCTTTAAAAAACAACCAAAATAAAA:1 + chr3R 20093311 3' + G7 1147 1 89.66 CGACGAAGCGCGTTTAATTTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTTAAACTTTTAAACTTTGCTT:1 + chr3R 25578890 3' - TAHRE 87 1 49.50 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAA:1 - chr3R 25021682 3' + roo 9035 1 64.36 GTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTGATCAGTCAGTCGGGAGTTGTGCAGCCGGTAGATCGTTGCTCCAGGATTTCAAGGCAGATTTG:1 - chr2R 18761014 3' - hobo 306 1 66.34 TATTTTCCTTTTTCTTTTGCTTCTTACGGCCATTGGTTGCGTCATCAGAAGATTTATCATCGGCGATTTTGTTTTTGGTAACACTGAGAGCCTTTGGCTCA:1 + chr3L 5498474 3' - Doc2-element 248 1 38.61 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACACCTTGTGACCAAACCACATGCTACAACCCATCAATTAGCAG:1 - chr2R 21351319 3' + mdg1 7421 2 58.42 TCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACTGTCATTGTGCATAAAATTCCGATATAAACCCTGTAGAACAA:1 + chr2R 17459228 3' - Transpac 4947 2 57.43 AAATTGTGTGCCAAAAAATNGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGGGGCAATGCTCCTTTGTTTCAGTTTGCCATTTGGCTGGA:1 - chr3R 11607956 3' - 1360 36 1 59.41 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAATAAATCATCAGTGCCACGAAAATG:1 + chrX 15546240 3' - blood 7020 2 70.30 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAAGAACGTATTTATAAAAATAGTTGTTACATTAAAATAGTAA:1 + chr3R 6947383 3' - I-element 38 1 57.43 TATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGACTTCGTCAAAGCCTACTTCGTTGCCGGAAGG:1 + chr3L 24761900 3' + 1360 3118 1 72.28 GGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATAAGTGGCGTCATGTGGCTTGCAGTTAATTACGGTGCAATTG:1 - 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chr3R 19987399 3' - Doc 32 1 52.48 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGCTGTTAAG:1 + chr2L 18248058 3' - blood 26 2 56.00 CGACTTTAACAGCTGTTATTATAACGGTGAACTGTTAAATTAACTTATGCGGGCAAAACAAACTAATAAGAAAGTACGTGCGAATAATTTTACAAA:1 + chr2R 17200800 3' + hopper 1269 1 61.46 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACAAAAAGAAAAGCTTGGGAGTACACACATA:1 + chr2L 17079915 3' - jockey 4789 1 66.34 ATGTAATATTAATTATTAATTACATTGTAATGGCAGTGGGATAGCTGATGCCAAACTCGCCTGCATCTGGTTTGATCTGAGATCGTTTTTTATCTTTTGAC:1 + chrX 19076543 3' + Tc3 261 1 60.40 TTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAA:1 - chrX 23280892 3' + roo 380 2 53.47 CGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCATCTTCCATAGTCTGAGCAGCGGT:1 + chr3L 7166666 3' + Doc 264 1 77.55 GTAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTGTGTCCGGCTTCCTGTATGCCGTCCCCTGTCGACGTGCC:1 - chr3L 13295192 3' + hopper 1407 2 71.29 ACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGCAGCCTTTGCTACGACTCACTCTTTCCCGCTTACTCGCTCTGTGGCTATAT:1 - chrX 6132949 3' + invader4 2701 1 49.50 AAATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGT:1 + chr3R 846258 3' + Stalker 89 4 76.24 TAAATAAATAAAATAAATAAAAATAATATTTTTAAAAATCGAATGTGCTTGTAATTTCCTTTTTGGAAATATATTGATTTTAAAATGACATACATATTTGC:1 - chr3L 10513219 3' + HeT-A 1 1 64.36 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGGTCTCTGGGTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTTGCGATGTAGGCTTACGAGGG:1 - chr3L 14623926 3' + hobo 2925 1 48.78 ATCTAAAATCAGACTACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAACTGCTAAAAGAACCGCAAGAGAGCAGTCATACGTGGATTAGTCATG:1 + chr3L 3083145 3' - Cr1a 409 1 78.00 AACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTATTGCCATTAGGAGGAACCCCTTCAATTGACCTAA:1 - chr2R 18188286 3' - Juan 4032 1 71.29 GAAGGTTGAGATTCAGTATACAGATTCGAGAGACAAATTCATTTGTGGTGGTCCGGTTAAGATTTGGCATTACTTGGTATTACTACTTTGGTATTGCTT:1 - chr2L 22189448 3' + INE-1 173 1 68.69 GATATCCACGGCGTTCTGCGCGCAAACACCCATCTGCCCTTGGACTCTCCAATCGCGTTCTGTGAGAAGAATTCCCGATGTCATACCTGACGGAGATGGAA:1 + chr2R 5200871 3' + mariner2 390 1 73.27 GGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTAATATATAATTTTGAAGTAGTGCAGTAACTGGTGTGTATGAATATC:1 - chr3R 18790073 3' - I-element 31 1 61.39 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTGTGTGCGTCCGTGTGTTTGGCAGA:2 + chr3R 17053138 3' - hopper 26 1 55.45 AGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGAATAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAAAAGCTTAATTAAGTGAAGTTTCATTCGAGCTC:1 + chr2R 4339520 3' + G5A 2795 1 80.20 TCTAAGAACTCCAACATTGTAATACACATACATATTCACTGTTAGTTTATTTATTTCCAACGATTTTACTTACATTGAATGCCTTTATACCCAGCTGCTCC:1 - chr2L 10483399 3' + ZAM 250 2 54.46 CTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGCGGTTACCCATTAAACAATAGCATGGCATTTTTTGCTGCTAAGTAATGCAATTTCCTCGTTAATTGCGAAGTTG:1 + chrX 5189525 3' - F-element 4485 1 75.25 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATGCTTAGGAATATTTTGCCTGAATCTTGCGATCTATCTTACAGATGCCA:1 - chr3L 7345330 3' + pogo 2077 1 54.46 CCTTTTTTAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAGAAAGGAAATTTTTTTTTGTTTTCTTTTTGCATTATACATTTTGTTTAAAATACGG:1 + chr3R 14681341 3' - Stalker 6824 2 67.33 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCATCTTGGCCAGCTCG:1 + chrX 19034203 3' - hopper 9 2 69.70 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATCTTTCTTTTAATAGATAAATAATTTGGTAATCATTGTA:2 + chr3R 20420986 3' + blood 340 2 61.39 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAGGGCTAAAACATGCAACATTTTGCGATGTAGGCTTACGAGGG:1 - chr3L 14623926 3' + hobo 2915 1 53.26 AGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCACCT:1 - chr3R 13739692 3' - Burdock 6188 2 76.24 TTAATTTATTTCGGAGTTGATCCTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGG:1 - chr3L 5651635 3' + McClintock 361 2 66.34 TTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGATTGAGCCATTTATGTGGCCC:1 - chr3R 20918713 3' + R1A1-element 158 1 78.79 TAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATGGCAAAATTTGCGGCAAAGCAGTGACGGGAGTAAAATTAATACAATAATAATAATTTTGAAATTACA:1 + chr3R 30217978 3' + P-element 128 1 28.71 TCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCGAAACATGCTACATTTTGTACCGT:1 - chr3R 7805680 3' + F-element 221 1 79.21 TCTTCAGACGTCGGAGGAAAATAGGGTCGACTAGATTATTCGCCGACGTGTTCGGGTGCGCGATCCTCCGTTGGAGCTGCGGATTTGCTCAAGCACTCGCT:1 + chrX 2427882 3' - G5A 2668 1 57.43 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAAATAACAGCGACTAAGGCTAATTTATGTACAAACAAGGTG:2 - chrX 12472534 3' + pogo 2068 1 61.39 AACTTTCAGCGTTGATCTTNGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATTTCTTTTCTACTATCAGAGCTATCTT:1 - chr2R 14997863 3' + McClintock 433 2 73.27 GACGGTAAATTAATTAAAANTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATACGGTTTTTGGGCGTTATAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAACAAACTTGCGCT:1 - chr2R 5296379 3' - Cr1a 3987 1 52.48 GTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCGAAGTACTTAAGTGGAGCATAGCCCCATGTAGATGACCACCAGACTGGGACTGAGATGGCTGCAGAAATTAGTTG:1 - chr2L 16049110 3' + R1A1-element 259 1 79.21 CAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGGCACTAAAACATTTGTAAATGTTGCAAAG:1 + chr3R 12876365 3' + hopper2 1566 2 68.32 TTTGTTAATTCAACAATGAAATAACGAAATACGAATTAGAAACAACAAAGCAACCAAATCTAACAACATACAAAGCGGAGAGCATTTCGAGAACAACAAAT:1 - chrX 16147047 3' + Tc1-2 1478 1 81.19 GAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAAT:1 + chr3L 17667614 3' + P-element 2518 1 23.76 ATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGATTATTTACCTCACGGAAATCTGAGAATTCGTACAAAGGCGAGCCGCGGCTGCTTCTATT:1 - chr2L 19114516 3' + S-element 1702 1 65.35 AGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGGCTTGCGTGCAATTGTATGGGTGCCTTCATTCATGGCAGCCGGTAAAAAAAAGCTAAAAGCGAAATT:1 - chr3R 21948838 3' + baggins 5134 1 74.44 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGACTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGGTTGCTTTTGGTTCGGCCTGG:1 - chr2R 6850440 3' + roo 9038 1 58.42 GTATAACAATATTTATTATNTATTAAGGAAGACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTTTTAGTCATATAAAAACGATTGAAAACAAACAACTAT:1 - chr2R 18188319 3' - Juan 4062 1 59.18 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAA:3 + chr3R 7626429 3' - hobo 51 1 76.24 CAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTCTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCATATCATAAAATTTTAATTGAATTCTGACATTTTACC:1 + chr2L 17140975 3' + R1A1-element 217 1 62.38 GATTGGTAGCGTTGTAGAATATCCATATTTGAGTTGCTGGGTGACCCGACAGTAACCTTTCGAAAACCCATCTCCTTTGTTCAGTCCAATCACAATGATGG:1 + chr2R 5532322 3' - G4 3478 1 65.35 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTTAATCGGTTTATGGTGCACGAGTAATTGAATT:1 - chr3R 5135465 3' + 297 6935 2 65.35 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGTCACATACTACAGTATGCGGCAGGCAAAATTGAGCAAAGATGCCAGA:1 - chr2L 10792030 3' - 412 7083 2 61.63 GACAGAAGCCCCGCTACCTGCAACAACAACAGCTGGAGATATATTTTTCGATATGGCAGCTGAACACGTACACCACCTCAAAGTTGAACACCAAATTTCGT:1 - chr2R 5214639 3' + F-element 401 1 68.32 GTCAGCCCGACGGCTGCTTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGACCACCCGCTCCCATTCGTGCCCATTCCCAAG:1 + chr3R 6961122 3' + 412 450 2 67.33 AGCAATTTTGGACGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCCAGTTCTCGTTACGTTAATAATTTTACTAAACAC:1 - chr3R 20974428 3' + 1360 3323 1 64.36 CTTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTAACATTATTTTCTCCTGGGAGCAGTGCTGTCCTCTACCCACGATTTTTTGTCCTCCTATGTAATTCAAATG:1 + chr2L 21903942 3' - HB 393 1 71.28 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGCGTGTGTTTGGTCTTCATCTTAGCTCGGCACAGGGTTGCTCTTTTGCTTGCCAAGGATAAGAAGA:1 - chrX 14651061 3' + P-element 2876 1 68.32 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTGTTTGAAACACTTGATTAGCGGCGATGATTGAACGGTTATTCGTAAATTGAAAGCAGTGTTCTTTGATG:1 + chr2L 17994237 3' - roo 8669 2 74.26 GAGAGAGATGACAATGTGGCACACTCCAGTGTGTATAGACATTAGATAATATGATGAAAGGGATATCCTCGGCGAGAAGGAAATGTGGTTTCGTCTTACAA:1 - chr3R 15685480 3' + invader4 2922 2 57.43 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATTTTTTACGCCCGAGTTTAAAATTTAATAGCATACTTTTTGGGGCAAAATTTAAGACATTCGACT:1 - chr2R 12812244 3' - jockey 18 1 67.33 CAGTAGACTAATCTTATACNCTGTAATATTGTAAGTGAGTAGAGTGAGAGAACAAAATGCCAATACACATACAGACTACAAAATGCCAAAAACAATATTTG:1 + chrX 20105925 3' + diver2 30 2 59.41 CTGGTGTGCGGACGATCAGNCCGGTTAACTTAGTTAACTTGCATATTGAAAAGCCTTCGAAACACGATATTAGCGTGAATAATTATTCATATTCATTATGG:1 + chr2L 14220231 3' - springer 18 2 61.39 AAATATATATATATGTATATATACATAAGCTGGAATCGGCAAAACAGAGTTGGATGAAAAATCAAACTTCGACTCATTTAAGAGAAGAATTAAT:1 + chr2R 14698024 3' + G3 4505 1 52.13 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTGGCTCTCAAATTGAATTGTTTGATTTGCCTCAGCAAGGAGTTTTAAGCATTGCGCCATATTGTA:1 + chr3R 19449529 3' - hobo 11 1 68.32 AGGAATTATAAAAGCTAGAAAGTTAAGATTAAGCATGCATGCTCTGGAAGGCTGTGCTGGGTATTGCTGTTGGACGCTGGACGAGATAAGGATCCATGGG:1 - chr3R 6255224 3' + INE-1 156 1 56.00 TACAACTGATTTTTCCAACNTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACCCAAGATTATGGCCAAAATATGCGAGAC:1 + chrX 20418079 3' - flea 401 1 71.29 AAAATTAAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGAAAAAAACATAATTATCATGGTA:1 + chrX 8958616 3' + Doc 4698 1 73.49 TTTGGTCCAGTGTCTCGGCNGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTGGTTTGTGGACCATCGCCATTGTGTGATGGTCCCCACTCCTCACCTTGATGTTGCG:1 - chrX 2038211 3' + hobo 353 1 53.47 CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACGTACAAC:1 + chrX 11025585 3' + hopper 1396 1 60.40 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAATATTCCTAAACTAACTTTGTGTTTTGATTTTGTCATTTTTAGGTAA:1 - chr3L 13772995 3' - pogo 23 1 55.56 ATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAATTGCGGTATTCATTGCGTGAATGGGTGATTTTATTACTTGCGAACA:1 + chr3R 28898596 3' - G2 2971 1 54.46 TGGTCATATCTCTTGACACTTCGGCACTAGGCCGCTGCAATCGTACTTATCTGTAGTTGCCACTTATGCTTTTCCTTCGAATGACGCTTGCATTTTCCG:1 - chrX 7303338 3' - rooA 133 2 69.70 TGGATATTGATAATTTAGATTTAGGATTTATTAGAAAGATTTGAAACATAAGCCAACCTATTTCAGCTTAACTCTAGATGACCTTTTGT:1 - chr3L 15125877 3' - Juan 3750 1 70.79 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGGGGCAGTGCTCCTTTGTTTCAGTTTGCCATTTGGCTGGAGATACATAAGTGTAAGTGAA:1 - chr3R 11607936 3' - 1360 16 1 62.38 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTTGA:1 - chrX 17029987 3' + flea 235 2 53.47 GGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAAAAAGGAAGAGCGGCAAATAAAACGTGTTGCTTTTTACAACCATTTTGTATGGCAATTTG:1 - chr3R 29954457 3' - FB 735 2 66.00 TAATAATAAACAATCTTACATACATGTACCTATGTACACATGGGTATATATTTTGTGTAGGCCCACCTACGCAATGCAATTAAGCCAACTCAATTAATTAG:1 + chr2R 10014892 3' + flea 256 1 79.21 ACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTGACTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGACAAAGTGAGGCACAGCAGTAGAAAGAGAGGCAC:1 + chr3L 8005903 3' - hobo 2747 1 41.58 TGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCA:1 + chrX 983357 3' - Juan 3847 1 65.35 AAAAAAAAAATAAAAAAAAAAATGGCGAGAAAACAAACCTCGATGGCTC:1 - chrX 13815291 3' - hopper 146 102 91.84 AAAAAAAAATTAAAAAAAAAATTTAAAAAAAAATAAAAAAAAAGCATCTTGCAGCAACATTAAAAAATGAAAAATGTTGAAAA:1 - chrX 4411121 3' - hopper 143 6 48.19 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGCACCGT:1 + chr2R 6850492 3' - roo 48 2 79.21 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTTTGACACATATCAATTGATCTAGATTAAAGCTGTCAGTACCGTTTT:1 + chr3R 26175813 3' - P-element 73 1 67.86 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTAATTTGGGATTTTACAGTCTTTGGCTGTCGACATTGCAGGATGTAAGGATCAGCCGGCGAA:1 + chr2L 20045802 3' + roo 9037 1 61.39 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATTCTTATAAAAGCTTATATCCTGAAGCTG:1 + chr3L 13773060 3' + pogo 2056 1 72.00 ATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAGCTTCACTATTTGCGTTGTTAAGTGCCTTCGTGATTTTGAG:1 - chr3R 7760066 3' - R2-element 3472 1 59.41 AAATACAATTTACAAAAGTTTTTGACATTATGCCAAAAAACAGGGAATCTGGCCCAGTGTGCACTGGAAGGAATCGCTGTCTCTCTTTCTGTTTTTGTTCG:1 - chr3R 447118 3' - transib3 40 1 55.45 TCAACGAGTAAAGTCTTCTNATTTGGGATTTTACAGAATCATTCTTAGTCTTATCAAATCGTTCGGCGACGTGTATAGTTAAGGTGCCCTTGTCAAAGCTT:1 - chr3L 14222441 3' + roo 9058 2 64.36 TTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCGCGTAACAAGTGTCACGGTGGTTTCTTGTCTCTTTCTGCCT:1 + chrX 9413899 3' + 412 7543 2 75.25 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAA:4 + chr2L 19642366 3' - Quasimodo 45 2 71.29 GCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATATAACAAGGCCCAATTTGTCTTAAAGCTTAAGAA:1 + chr2L 17288570 3' - X-element 4625 1 73.27 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCATGTAAATTCCCTCGAAAACAGAAGATAAAAAGAGATAGGTGGGAAA:1 + chr3R 9224436 3' + pogo 2098 1 76.24 GGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACT:1 + chr3L 19339431 3' - Tc1 24 1 59.41 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATAGTATTCTTCAAAAGGATTAATGGTAATTGAACTTGGTTTTTAAACGATCGCAATTAATGCGTGCA:1 - chrX 2530435 3' + pogo 2098 1 74.26 TGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAGGTAATTAAGTAAATTTGGGATAATGTAGCCAG:1 + chr3L 19249734 3' + Transpac 5183 2 70.30 ACTGCGGCGTCTTACAAGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACGTTGTATTTTGAGAGAGAGCAAGGAACGCGCATGCAGCATGCGTCGGCCACG:1 - chr3R 4422934 3' + rooA 7467 2 60.00 TTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCT:2 - chrX 20885966 3' - Ivk 5372 1 53.47 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCAAAATATACATGACCATGTGAACGAACGATGTCCCATGCACTGCA:1 + chr3L 22930378 3' + roo 9044 1 57.00 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGTTAATCGGTTTATGGTGCACGAGTAAT:1 - chr3R 5135471 3' + 297 6934 2 69.79 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTGGATTGGTTGGGGGGGCGGTAGAAACCTGGTCATAAAGCACGCCCTGTTGCTTTTGTTG:1 + chr2L 6276114 3' + copia 239 1 62.38 AAAACCAAATCTATTACATCTACTACATCTATACCTATTACTTTTTAAAACTATTACACTAGAACTCGCCAAAACACTCGAAACAAAATATATATCAAAGT:1 - chr3L 9782479 3' + Stalker 7230 4 72.28 TCACGCTCTGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCTATAAACGGTACTGCTGCACCAAATTACTGCAATTAACCGGGGCCACTCGATTACTTTTGTT:1 + chr2R 20394394 3' + F-element 482 1 58.42 GATGCCACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGAGATGGAAGTCGGCCACGCCTCCAGTGGTCCTGTTGGCCC:1 - chr3R 13938329 3' - G2 467 1 59.77 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGTTCAAATTAATTAAATTTGTCTTTAAACATTCACCGTTCTTTCATCAAAATTATGGT:1 - chr3R 4474159 3' - copia 20 2 59.41 CCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCAATCAGCAGCAGAAGCCCTCTACGCCGCCTCTGCAGC:1 - chr2R 6933772 3' - R2-element 3281 1 62.63 TTTGCTGATAAGAGTTTTGNGCTTACGCGAAGCGAGGCATGGTTAACCCGCTTGGGTGGCTCTTTGTTGAACCACTGATTGAAGCGGCCCAATCG:1 + chrX 7958045 3' - I-element 66 1 65.26 TAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACTTTTGAAAATTAGTTTGGTTGGTGAACCAAACTGGAGGGTGGGTGCTCCAGACGTTGTTCT:1 - chr3L 14403310 3' + jockey 4735 1 59.41 TTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAA:1 - chr2R 4673560 3' + Quasimodo 7355 2 66.34 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTA:1 + chr3L 18418893 3' - hobo 44 1 66.34 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTGCGTTGGCATTTATAGCTCAGTCCAGGAAGGACTCCTCCACAGTG:1 + chr3L 13773956 3' - roo 8694 2 57.00 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCGAGTTATGCGCCGTTC:1 - chr2R 6847269 3' - mdg1 10 2 55.71 AAAGGTGGGCAAACGAATTTATTTATTTTTAAGAGTGGACAAACGAAAAAAACTAATTTGAAAGGGGAAGGTGTTCGGTTCGGTTTGGTTTGGTTTGGTTT:1 - chrX 9549542 3' - FB 614 3 65.35 TATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGC:1 - chr2R 15788574 3' - Transpac 31 2 51.49 AATGGAAGTGGCTGGTTTGNACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGGCAATAAGTAAGAAATAAATGAAACCTCAAATAAATGGCAATTCATTTAAA:1 + chr2R 11941081 3' - 297 18 2 64.36 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGGGGCAGTGCTCCTTTGTTTCAGTTTGCCA:1 - chr3R 11607966 3' - 1360 46 1 71.29 GAAAGTGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGGTCTTAATTGCCAGCTCACGTTTCGGCTC:1 + chr2L 7948776 3' - Tirant 8346 2 73.75 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACATTCATGTGTACATAGCTACCCAATTTACCCCCAGCTCGACAATT:1 - chr2L 3978426 3' + 297 6948 2 59.41 AGTTAACGATTATAATAAAAGCATGAAGTGTCCGTGGCCAAGTTTTTGACCATAGTGTATTGGATAGCAGCGACCTATGTTTTGGCCGATGTATATTCAGC:1 - chr2L 22196662 3' + Stalker4 461 1 59.41 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTC:2 - chrX 13146930 3' + roo 9024 2 73.27 GAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCAAGAACAACAATTAAATTTCTTCAACAGCTGCGTCGCATTCTTAAT:1 - chr2L 17244979 3' + copia 252 1 69.47 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATGTATATGTAAACAATGATGGTCATGGCAGCGCGATAACACATG:1 - chr2L 21708344 3' - 297 22 2 64.00 ATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATAGCTTATAAGCTGACTGGATAAAGTGGAATTTTAAAGAGTAGTCTACTCGTGTTTATCA:1 - chr2L 8716968 3' - hopper 373 1 66.34 ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGTGTTTAAGTATTGAACAATGATAAGCTATCGCCGTA:1 - chr2R 22051472 3' - Tabor 6880 2 62.38 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTT:1 + chr3L 9928599 3' - roo 8700 2 67.33 CATACTTAAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGGAGCGGTATAGAG:1 + chr3L 6658212 3' + hopper 1366 1 72.28 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGCGCATCAATAAAAAGATCGCTCCGCTGGGCATTCAAATTGTTTGTTTGATAAGC:1 - chr2L 16358162 3' - hobo 24 1 53.47 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTAATCTTAAACCTTAGGCATAATGAGTGTTTGGTTTTATCAAGTAGTTTACGAAATAAAC:2 + chr2R 10353333 3' - blood 17 2 60.40 CAAAAATGACTTGTTGGGTATGTGATAGAATGGTGCATACATGTGTGGACTGCAAAGGGAGAATCGTGGTCAAAAGTGCTAATCCAGCTTGCAATTGCAGG:1 - chr2R 24113668 3' + Cr1a 499 1 75.25 GTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAACGTTTTGTTAATTAATTCCAAAACGTTCGATTT:1 - chr2L 4136533 3' - Quasimodo 7156 2 72.28 TGCAGCCACGTGGTATGTGCTCGCAACAGCTGACTTTAACAGCTGTTATTATAATGATGCAGCTAATTAACATTTTGGCTTGGGCTTGCAATCAGAAACCA:1 - chr3L 8044055 3' + hopper2 1432 1 67.33 TTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTACAGCGTATGAGTGATTTTTATGGCATTTTTATTTGGTCCGTGGGACG:1 - chr2R 20718824 3' - BS 5024 1 52.48 TAAAAAAAACAGGCCAAATNCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCTCGAATAGAGAAAAGCTATT:1 + chr3L 8039434 3' + hopper 1406 2 70.30 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATGAGCCGAAGTCAGCTAAATGGCCGACGCTCACCGATTTTTTCTCGCATGATCTCT:1 + chr3R 3847171 3' - P-element 22 1 59.41 GCCCGACGGCTACCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTTTGGCCGTTTTTGCCTGTTT:1 - chr3R 23542957 3' + 412 454 2 62.38 ATAATTACCGCATTTAGAANTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCTAAATAATTCGGTTGCGAGCAAA:1 - chrX 20419141 3' + flea 206 2 75.25 TCACACGTCGGCGATCGAATTAATACGATTAAATAGATAAAATTTTGTGTTGTTTTTTAATTGCTTTTCATAACAAAATAACATCACTTCAATCATAAGAT:1 + chr2R 672863 3' - F-element 12 1 74.26 TCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACAAGGAAATGGCTGATATGAGAAATGTCAAATTTGG:1 + chr3R 24085362 3' - invader3 5230 2 66.34 TGAATCTCAACCTTCAAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACATGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTC:1 - chr4 836650 3' - INE-1 166 1 91.09 GCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCACTTGCAAGAAGTATGCAGCCAATTTTGATCGCAGATGAATAAAAGTTATC:1 + chr2R 7677946 3' + Doc3-element 4486 1 59.41 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCCACGAAAAC:1 - chrX 21217506 3' + pogo 2076 1 56.04 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGGTTTCCTTCGACCATTGAGCCGATCTCGTTATGATTAGCCCATAGTGGGTGGAGTTGGGCGATT:1 - chr3R 22891067 3' + opus 450 2 78.02 AAATTAAATTTAATTATTTAAATTTGGTTATATGTAAAGGCTACAAATGAATAAAATATTAAGTATGTAGGGATGACCCACCTTGAATGCCTGCTGGTGTC:1 - chr3R 24242525 3' + TAHRE 48 1 66.34 ATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATGCGTTACTCACATATCTC:1 - chr2R 7546253 3' + hopper 83 1 47.52 CTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGTTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGGGCGTTCATTGTGGTCGCTTTTCATGTGTCGCAATCTCTAT:1 - chr2R 14576511 3' - gypsy5 37 2 57.43 GGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCAACATGAAATCAAATCAGAAATTCCAGACACAAACCCGGCCCAAACACGCGACAATTGTTGCA:1 - chr3L 16282342 3' - gypsy5 6951 2 70.30 CTCACTAATCATGTGAGGATTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAGGGATAACTCCTTCGATATATTCCAAT:1 + chr3L 12634257 3' - BS 4996 1 76.24 TGACAGCCTAGAATCTCATCCTAATAGTCTAGCTAGACGACTAAGTATCGCAGCCACAGCTTATGAATGCCACTCTGGGCGGTTCGTTCAGCGACCAGAAA:1 + chr3R 31784961 3' + jockey2 3089 1 54.46 AAAACAGGCCAAATGCCCCNTAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCCTTGCTACCTGCTTTTCCTGCTTTGACGGCAATTGTTTGCCCATTGCTGCATAA:1 - chr3L 6023253 3' + hopper 1411 2 75.25 TCTTGCAAGAGGATTTGGATGCGGACAATGGAACACTGAATGCCCTGCGGGTGCTGCACACGTTGAACAGGCGCGATGGTTTACCGCCTGGACGAAAGCCC:1 - chrX 13687833 3' - Doc3-element 4524 1 61.39 CGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCCAACAGCCATCCACAACTGGCACGGCGATGTCCG:1 + chr3R 28852885 3' - jockey 430 1 66.34 ACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCATACACAGCTTTAAACTACTGTTTGTGCCCACTGTGCAACGTTGCGGGCTCATGAAATACACTAAAAAATACCAAG:1 + chr2L 7530900 3' + Quasimodo 332 2 72.28 AACGTTATTTTTGTAGGTTNAATAGTATATTCCAACAATTATCAAAATATTTTTATGTTTTTCTTATGCACAGAAATAAAATAAGTGTATTGAAAAAAATT:1 + chr3L 3596759 3' - copia 4885 2 59.41 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGTATAGGTTTTGGTCTATAGTTTTTGCGCTATTATT:1 - chr3R 19505540 3' - mdg3 5286 2 57.43 GCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATGTAGTCAGCGGCATGCACCATTAAAATGTATACGACAGTTCGTTAGTTTGTTGCTCTGTCGTA:1 - chr2L 16084815 3' + Transpac 4912 1 66.34 TTAATCTTAAATGTTCAATAAACGAATTAAAAAAAAACTCTTTAAAGTCGAGCAGCAGCTAAAAATAGAGGCCAACATAAATCGGGATTTACACTAATTAC:1 + chr3L 13875436 3' + Rt1c 5407 1 52.48 GAATAGTATATTCCAACACTGCATAAATAAATGAAAATGCTACAGTTCAAAACGGACCATAGTTTAAGTCTTAGTTATTTTTCCACCTACGACTAAAGTTG:1 + chr2L 16139215 3' - copia 4866 1 80.20 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAGGGGCTTGGCTTTGGCTTCAGCTCATG:1 + chr2R 15788656 3' + Transpac 5210 2 59.60 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGACCACCCGCTCCCATTCGTGCCCATTCCCAAGTTGCCAGCGCCCATTGCCTCCCCACCTTCGAGAACTGCCGA:1 + chr3R 6961163 3' + 412 7544 2 74.26 ACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGAAAATGCCAGGACTACAAATACGGCTTC:1 - chr2R 6918588 3' + accord 492 2 71.29 TGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAACCTTTTTAAAAAATGTATATAAAACATTCAACATAGACATGGAATGGAATCCTA:1 + chr2R 22134267 3' + opus 481 2 60.40 TTAATTGCGCTGTTATGTTNCTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGG:1 + chr3L 22349286 3' + BS 5042 1 74.26 TATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTTTCCAGTCCCAGATGTCTTTCTATTCTCAGCTGACGTCCCCAACCATTTGTGTGCC:1 + chr2L 19100999 3' - Quasimodo 14 2 53.47 TGTTTATCTAAAATCAGACCACTGTGCACGGAAACACAAAATCAAAACTTTTCAATTGCGCGTTGTTGGTAGCTAAGCAAACTTCTAAATACCTGATGCAT:1 + chrX 10616733 3' - Cr1a 414 1 55.45 CTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTCAGCTGCTCTGCTCGCCTTTGAAGTTTCATTTTTTC:1 - chrX 22789326 3' + Tabor 7285 2 65.35 CTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGAGTGTCATAGGCCTCAAACATAGATTTAATAAAAAAGAAAGCTAGCTTATACACAC:1 - chr2R 3938464 3' + rooA 7334 2 77.23 GGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTCTTGTTCGGTTTTTTTTTTCCAATGCAAATTTTTGACTAGTTGC:1 + chrX 2746894 3' + Circe 7204 1 63.37 ATGCAACTAAGTGTTGCTGNGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTG:1 + chr2L 18248042 3' - blood 43 2 71.29 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAGT:1 + chr3R 10488739 3' + roo 9035 1 63.37 CAAGATGCGTAACGGCCATNCATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATTTTGAGAGAA:1 + chr3R 10741136 3' - 1360 3371 1 46.53 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGGTTAAGCATTTGGGGCGTTTAAGTCAAATAATGCCACTCACAATTAATCAAGATCTGCCA:1 + chr3L 11755774 3' - roo 8680 2 58.42 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGATTGAATTTTCGAAGTGAATACTACTTCCTTTTCAGTGCATAAAACATATCTG:1 - chr2L 20328696 3' - opus 7024 2 58.42 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGAAAACTAAAAGCATGACCTCG:1 + chr3R 14409667 3' + pogo 2049 1 79.21 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAAAGTTCAGCAATTGATATCGAAATCAATTTAT:1 - chr3R 7469967 3' - Doc 52 1 68.32 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAATCTAGTTGTAGGTTTTTATGACTCTTTTATTT:1 - chr2L 7175571 3' - blood 7053 2 64.36 TATAATGCAAAAAAATACATTCTAGCTCTTTTAACTTCTCTTGAAATTTTTCGGACGGCTTAATAAGTCCGCCGTGAGACACCAATATTTCAATTTTTTTT:1 + chr3L 7170743 3' - P-element 2479 1 21.78 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTCGTCTAGCTCCCTTTTCAATTTCGACGACACATCCTGTGCTTCCCTTAG:1 + chr3L 19541382 3' + P-element 2877 2 55.45 TTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAA:1 + chr3L 19350027 3' - 1360 3198 1 60.40 TCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAAAAGGGAATCTTGTGGTGCGGATTGGTAAACTGGGCTTCTTCTTCCGCGCCTTCAGCATGGCGTGGCGATCCGTG:1 - chr3R 5554166 3' - G5A 2670 1 81.44 TATGAATTTTTATGGGCTGAAGCCGTGCACACGTGCTGCCAAAGCAAGCAAAATAAAAGCGTTAAAACCCGAAAGCAAAACAAA:1 - chr2L 5342363 3' - frogger 2001 1 67.86 AAAGTGCCAACGCTGTATANATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTGTTGGCTGAACTTCGCTAAATGTATTTTTTTA:1 - chr2R 6919279 3' + accord 6922 2 67.33 CCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATAT:1 + chr2R 3760468 3' - accord 40 2 65.00 GTTCGCATTCACATTAGCTGAGTAACGGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTGGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCT:1 - chrX 10445565 3' + INE-1 530 1 66.34 ATAATTATAAGTGTATTAAATAGATACATAAGATAAGAGTACATGTGCAGATATATGTATGTACGTACGTGCGATACTATATCTGTAGAACACGCTAATAT:1 + chr2R 16639275 3' + transib3 2623 1 65.35 CATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAACACACAACGTGACTGTTTACGATTGATTGATCAAATTATAAGCATGGATT:1 + chr2L 19417154 3' - BS 5020 1 49.50 ATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATTGGCCTACGAACAACCGCTGCGAGCTATTATTAACTTTATGCCGGAGGAGAGTGCCTACGATATTTTAGTGC:1 + chr2L 14329303 3' + 412 7102 2 78.22 ATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGG:1 - chr2L 23295818 3' + micropia 5413 2 70.83 GCTGTGCCCAAACTACCACNAATCACCCCACCAACGGCGGCCGTCACTTCACTCCACCGTCGGACTCCGATTCCAAGGAGAGTTCCGTCGAGCGGGAGCTG:1 - chrX 13751801 3' + HMS-Beagle 6694 1 73.27 AAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATT:1 - chrX 20885956 3' - Ivk 5362 1 63.37 AAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACCATATGTAGTCTAAGATTTTCAAACACGACGCTTTTCTTTCCTCTTGAAAACCCCTCGATGAA:3 - chr3R 7783717 3' - rover 6961 2 70.30 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAAATTGTGCACATTTCTGAAATG:2 - chr3R 10087799 3' + roo 9063 1 70.30 TTATATATATGTAGAGTAGNGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGACAGTTGGTAGCCTCAATTT:1 + chr2L 15531869 3' - Stalker2 25 2 54.46 TATAGATAAGGAGTACCCCCGTATGTTGGCGGGGCAGGAACTCTACGACTGTACGCTCAGGTGGTCGTAAAAAGGCGCTACTCGTGACAACAATAAGACTA:1 - chr3R 2157041 3' + Rt1a 4775 1 74.26 ATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGCTC:1 - chrX 4166381 3' - I-element 5290 1 64.71 CCCTCTCTCATGCTCTCCCTCTTCTTCTCGGGATGTCCTTCCTCCAGTTTCTGTTGCTTCTTCAGATGGGCATTGAGATTAATGGCCGACTTGGATTTG:1 - chrX 9040103 3' - Bica 6 1 76.77 TAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGCATAAATAAATGAAAATGCTACAGTTCAAAACGGACCATAGTTTAAGTCTTGGTTATTT:1 + chr2L 16139194 3' - copia 4872 2 72.09 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGGAGAGGGTGCCCCAAAGTTAACTTTTGCCTTTTTGCTAAACAGTCCGCGGAAAAGTTTGCCGGCAACA:2 - chr2R 21747509 3' - mdg1 7047 2 65.35 AGTGTACCCTCGATATATGNACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGCTGTTAAGCTTTAAAAATGTCGGCGG:1 + chr2L 18248076 3' - blood 9 2 70.30 AAAAACTCACCAACAAAAACAACAATACCGCTAGCCCGGGCTGTTTCTCCTCAATAAACTCAATCTTAAGTGGTTTTGTAAACTGGGGGGGAACTCCTTGT:1 + chr3L 2081362 3' + I-element 125 1 64.36 TTTGTAATAAAGAATTCATTATTATTCTCATTTCACACCTCCAACGTAATCTTCGTAACTCCAGCAATTATACCTAATCTTGAGAAGGAAGA:1 + chr3R 1271907 3' - accord2 7512 2 59.78 CGCATTTAAATAAATAATAAAAGCCCTAGCTATACATATATTGTCTCATATCAAATATTTCAAGTATTATAATTTCAATTATAAAATAATTTATTAAAATT:1 + chrX 10068445 3' + BS 5087 1 43.56 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCATATGAAGTACTGTCCCACACCGACCTATTATTTCT:1 - chr3L 21148058 3' - jockey 4780 1 64.36 TTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCACTCTGCCCTTCTAGTTTTAAGCCCAGTAACG:1 + chr2L 10956764 3' - I-element 406 1 69.31 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTGTTGCTTTTCATTTCAGCTCTCACG:1 + chrX 2530553 3' - pogo 44 1 75.00 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAAATGCATGAATAAATACACACGAGATGAAACAAATG:1 + chr2L 12958980 3' - roo 8697 2 62.38 GTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGACATTAAAAGTTGCAGCTAGAAATTCAAAACCAACGCCAGCGGCCAAGTGTTTCTAGTTTTTCTCTTAGCCC:1 - chr3L 7261660 3' + roo 9065 1 67.33 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTAAACAAAAATTTGCGTACAGTCAAGTAAACAATTAACAATTAGAAGTGATTTTCTTTAAGCTT:1 - chrX 15800873 3' + roo 398 1 68.32 TTGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGC:1 - chr3R 7869144 3' - 297 6639 2 82.18 GTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATAATCCAAGAGCAATCTTCATCTTCATTGTCACAAGCACTCGGTGATACGCAGAGAAAGCTCGCATTTTGTTCCCA:1 - chrX 11025105 3' + hopper 188 1 74.26 ATAAATTAAAATTTATAATAAATCCCATGTTCTCCTTGTCGCTCAGATACTTATAATACTGATGGATGCCAGAAACAACAGGCAGATAGCCCTCGATCTT:1 - chr2L 15899864 3' - INE-1 429 1 68.00 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCAGACCGTCGCGACGGCGATGAGCAAACAACAGACGCAGCTGACCACTCC:1 + chr3R 12329701 3' + hopper 1414 2 76.24 CGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCGCTTGTACTTTTGACTGTTAATTAAGCACTTGGTGTTCGATCAATGTTTGATACG:1 + chr3L 22736985 3' - G-element 26 1 54.46 TGACAAGTTCTACATCATCAGCATTCATGGCCCCAATACACCGAAATGATTTATATATACGAAATATGAATGAATGATTATGTGGGATTTTCCTAAGTATT:1 + chr3R 7863670 3' + Chimpo 4039 1 76.24 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCTGCATCGGCAACTGTGGAACTCACAAACATACAAACATGCAAAGGAAAT:1 - chr2R 20908120 3' + jockey 4914 1 54.46 AAAATTATCACAAGCGGTTTCCTTTAGCTCACTTAAAACGAATATAGGGCATTTTATCTTCGGCTCTCACAAGCCAATAAAAAATCGGTCGAAAGAGCGAT:1 + chr3L 11431943 3' - mdg1 489 1 68.32 AAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAAGCAACTACCTTCAATTACTATTACCCCTTTCTCTCAGTGTACGGCTAAAATTTCCAGGCTTGTGTATTGATTTG:1 - chr3R 22869346 3' + Bari1 1707 1 77.23 AAATAAAATGCCCAAAACAAAAGAGTTAACAGTTATCGTGCGGGCTATTGTACGAGGAGATGGAGTCGGTGCAACTGGACTGGATGCAAT:1 + chr3L 23724189 3' + Bari1 372 1 68.89 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGCGTGTGTTTGGTCTTCATCTTAGCTCGGCACAGGG:1 - chrX 14651091 3' + P-element 2848 1 39.39 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGAAATTGAATTTATCACATGTTATGCGTTTGCACATGTAGTGG:1 - chr2R 17420828 3' + pogo 2072 1 57.58 TGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATACAAATATAAATAATACTGTGTCAGTTGGAAGTGAAAATTTAC:1 - chrX 23035736 3' - HMS-Beagle2 6915 2 55.45 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAAATTG:2 - chr3R 10087816 3' + roo 9046 1 53.47 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCTAGATGCCGATGCATGTTGGCAATGCGAGTCGTAAAACCTCGTCTAAGTTCAGTAC:1 - chr2R 19840184 3' - roo 19 2 59.00 CTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGCGATCCACTCAAGAGGGAACCCAATCCAACAGACATTAACATATCGTAAATACCACACATGCAGTTGGT:1 + chrX 19261762 3' + Quasimodo 6970 2 73.00 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTTTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGG:1 - chr2R 5214981 3' - F-element 53 1 67.33 TTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGTAGAATTAGTTGAAAATGTATAAACAGATTGAAGAAATTTGTATCTCTAGTTTAAAGTGGAATT:1 - chr3L 5478981 3' - 3S18 5779 2 64.36 ATACGTTAAGTGGATGTCTNTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCGAACGAAGAAAGCGCGCTGTGCTGCAGAGAGAGCGGG:1 - chr3L 16891101 3' + P-element 2853 1 40.62 ACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGCATAAAACGTGTAAATGTGCAAATGACATAACGAGTACGAGTCTGCGC:1 - chrX 19219347 3' + Doc 4416 1 56.44 GCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATC:1 - chr3R 4357558 3' + Tc3 1662 1 73.27 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTACTGGTCCGTCCGCCTGTCTGCTTTATGCGAGTTTGTTGTTAAACCATCACAAAATAATGGAGAGAGAATA:1 - chr2L 19681392 3' + hopper 1407 2 71.29 GGATCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAGAGGTGGATGAGCGGGAAAATTGATA:1 + chr2R 19061293 3' - roo 29 2 52.48 TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTTTTCGTGCGCACTTCGGGCCAAACTCAA:1 + chrX 4166436 3' + I-element 5319 1 61.39 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCGTATGTCACTGTGCTCTGCAAG:2 + chr3L 8268193 3' + hobo 2899 1 73.56 CTATGATTAAACGGCTCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGCGGGAGGGAAGCAGGAGGGTGCTGGATCGGGGAAGGAG:1 - chr2R 11449476 3' - F-element 4556 1 64.58 CAAGTGTTACATGGGTCACTACATTCAGGCGAACTGCAACGGTGTAACTAGCTGAACCAGTGGTAAGAACTCAAAGAGACGGGTAACCCAGCGGTAACTAA:1 - chr2R 2110249 3' + mariner2 270 1 65.35 GACAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAGCAAAACAAAGTAGGAAAACAACCAGTCAGACTTAATGGGATAGCAAAGGGCTGGTCTG:1 + chrX 14985312 3' - S-element 280 1 63.37 ATCGATAGAAATTTACAAGACTAATGAGGAGAAATAATGAGGTATGAGGAAAAATACCAAAACAAAAAATATTACGAGTACAACCTATTCAACAGGAGACA:1 + chr2L 16243677 3' - INE-1 300 1 69.31 TACACGGCATCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACGGGACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGGA:1 - chr3L 16047627 3' + Cr1a 4406 1 57.43 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAAATGCATGAATAAATACACACGAGCTGAA:1 + chr2L 12958973 3' - roo 8704 2 69.31 CTGCTGGTGTTGCTGCTGCTGGTGCTGCTGGTGTTGCTGCGGAGGGGGGGATGGAGGGTCAGCGAGGGGTCACTGTCAGGAGTGGAGG:1 - chrX 5755993 3' - TART-B 151 2 54.55 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGTGATTTTGACCAAGGAGGGATGGCAATTTATCACTTTAGAATGTTGAG:1 - chr3R 12321377 3' - jockey 4679 1 67.33 CTATTGGTTCCGACAGAAGNCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGTGGGTCAGTGAACGAGGCCAGTGAATCGGATGGTGCTGG:1 + chrX 2668316 3' + F-element 390 1 58.00 AGTAGCACCCGCACACAAANTTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTGGCTCTCAAATTGAATTGTTTGATT:1 + chr3R 19449490 3' - hobo 50 1 78.22 TCAACGTCTACAGAGTCTCTCCCATTTTACAGTTTTTTTTTTCTGACGTCTTTCTTCAGCTTTAAGTTACAGATTAGCATCCTTTGGTCGCCTTTGAATAA:1 - chrX 15357065 3' - 412 7423 2 74.26 AGGGGAGTACATCTAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTCTTAGGGATTGGCTATGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTT:1 - chrY 1428633 3' - G2 2981 1 54.46 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATATTGTTTTCCACAATTCGATTAGAAAA:1 + chr3L 9910418 3' - 297 6620 2 74.26 TTTTTTTTAAGTTCTAACACTTTGAAAGTTATGCAACGCAACACACACACATACACTCGCAAACAGAGCCACACAGAGTCTGAGCTCGGCTTTCGGCTTTT:1 + chr3L 5612218 3' + hopper2 1394 1 73.27 CATTTTCCCTGAGCATGCCGGTAAAAATAGTAGACAGAGCGTGTTGGGGTGCACGATCATCTGGACTCCAGATGGGCAGCACACGTTCCCAGTGGTTGGGG:1 + chr2R 24411326 3' + Circe 7373 1 54.46 ATTTAAAGTCTAAGAACTTGTAAATTGAAGGACATATTTTGTCAAATTTACAAAGCATGCGCAGTTCACACAAATATGTTGGGCTTTGAGCTCGAGTACAA:1 - chr3R 13801100 3' - 1360 234 1 56.44 GATTACCTCAAACAATCTCACCCAGAAACACATACGCGCCACCCACAGAACACAGCCACATCTGTACACTAACACTTACAGAGAGTTGCATGCCCCAAAAA:1 - chr3R 21789156 3' + I-element 4887 1 80.20 ATGCTTCTTCGTATGCTTCNTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATCTGTCGTAATTAAAACGCGCCCTCTGCGACATCGCCTCAACTGTCATCCG:1 + chrX 15263500 3' - invader3 28 4 52.48 TTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACG:1 + chrX 983342 3' - Juan 3862 1 80.20 TCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATCTGGCAACTGAGCACTCTTGCACTATTGCGCTCAACCTGTATATTTACTATGTTTTAAGGTTAA:1 + chr2L 20284222 3' + blood 209 2 69.31 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAATTATAATATTAAAATATTGTTTAGAAACTTAAGTAACTAAGA:1 + chr3L 10621716 3' - 412 36 2 64.36 TATACATGTATGTATATGCTGTCCCGTTATCAGCCTATATGCAATCTATATACACATATACAAATGTATATAAAGTTCTATGTAATCCGTAATCCAACTTC:1 - chrX 4530467 3' - INE-1 65 1 78.22 TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGAGAAAGGTCTTCAATCTAAACAAAGTTTTACCGGGAAAA:1 + chr2L 3699469 3' - mdg3 5291 2 60.40 TTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATAGGAGTGTGTATATAGCGAAAAGTGCGGGCGAAGGCAATGG:1 + chr2L 14035597 3' + flea 225 2 58.42 TCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAATTACAGGTG:2 + chr2R 10956957 3' + copia 5081 2 68.32 TATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATGGTTGGTACGACAGTATT:1 - chr2L 14793477 3' - Stalker2 18 2 61.39 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCGGCAAGTCCAATCATTAAATGAGCAAATGCTTTAAATGCCACTAGGTAGAGCTATAAGATGCGTGG:1 + chr3L 1998907 3' + hopper 1408 2 69.31 TTTCTTTTTTTTTGTTTTTAAATGTTTATAGTTGCTGATGTTTCGTGAGTAGCGGTTATTTCATGCCCCCACATCGTACATGTATCTAGGTATATTCGTG:1 - chr2L 13914385 3' - gypsy7 4998 3 63.00 GGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTATTCTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTGGGTTTTCTCTAGTTGGTTTTTGATGCAGAAG:1 + chr3R 20400761 3' - mdg3 5167 1 73.27 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCG:1 + chr3L 25345154 3' - Doc 43 1 60.40 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATTACCCCTTTTTGTGCATAGATTTTCCATCTTGTTCTT:1 + chrX 9775046 3' + 412 452 2 65.35 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAGAGGTGGATGAGCGGGAAAATTGATATGCCGAGTGCGA:1 + chr2R 19061305 3' - roo 17 2 62.38 GAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCCATTTAGACGGTTCCTATTGCTGGCATTATCGCGACTGCGAGATCTTGAT:1 - chrX 10031934 3' + copia 100 2 53.47 TTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAAGAATGAAGTTGAAAAGGCTTGGTCTGTCAAGTACGTCAGTGTTAACATAATACACTGAGATTCAT:1 + chr4 74350 3' - 3S18 5776 2 68.32 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCAGAGGGCAAAAAAATCGAAGCGTTTGACATGTGGCCAACATGTCAGG:1 - chr3R 8765536 3' + roo 9050 2 54.74 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGAAACCGGAAAATATTTATTTTCAT:1 + chr3R 9224391 3' + pogo 2053 1 78.22 TTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAATATGCATATGTCAATTAATCTAAAATTCACTATAAAATCGAAACTAGTCGGGTATTTTTTCAAGTGCAGGGTT:1 + chrX 20886066 3' + Ivk 5376 1 64.36 TATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGTTTCTGTCACCCCTCTTCAAATTATGTTGAAAAAATTAATCAAAACTCCTTTAAATGGTTTATGTCAACACGA:1 + chr2L 9214682 3' - invader3 5227 2 73.27 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACCTTGAAATGTCCTGAGGGGAGAGGTGGATGAGCGGGAA:1 + chr2R 19061285 3' - roo 8668 2 63.24 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAGGGCAACTGATTAAGAGTGACTAATTACAGGTGATAAAGCTTGGGATGAGGAGCTCT:1 + chr2R 10956981 3' + copia 236 1 59.41 TAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGAAAAAATCGATGGACAACTTATGCAAATGTTGAAGG:1 + chr3R 7869219 3' + 297 393 2 76.24 ACAAATTTAACTCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTAGCACTTTTACAACTAGTTTTCATTT:1 + chr3R 19303165 3' - Doc3-element 4593 1 73.47 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGCAGCAACCCACAATCAACTGACCAAACCCAAACTATTCGGCCAAATTTTAAAACAAAC:1 - chr2L 16139099 3' + copia 236 1 60.40 TTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGGCCACAGTGCAATGGCTTATTGACTAATTTTTTTTT:1 - chrX 21468647 3' + transib2 2810 1 62.90 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAGTCAGCTCGCAGCGTTAGTTTGTC:1 + chr3R 7626453 3' - hobo 27 1 53.47 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTACCCCTTTCACCGCAGAACGAAACCAGCGAGGATGAGGTGCCCCCCATCGACCTGCTGTGGATCTCGG:1 + chrX 17858082 3' + P-element 2880 2 68.00 CTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAG:1 + chr2R 15788630 3' + Transpac 263 2 67.33 ACATAATCCACCAACACTACCTAAATCCAAGTTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTAACTCTTGGCAATACAGGTAACCAGTGGGGCTCGCGATC:1 - chr2L 4592040 3' + I-element 4966 1 61.39 GACCAAACAAATATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACACACATCTAATTTACGGACACTGGAGCAAACTATAAATTTGCTTGGACAATTTCGCCA:1 + chr3R 23694626 3' + I-element 4926 1 69.00 TAAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACCCAAATCATATATCTGCCACAAAGTCATGAAACTTGAGGTCATCTGCGTAACACGCTGATTGGTC:1 - 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chrX 21422110 3' - INE-1 319 1 58.00 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATCGCTAGTGGCATTTGCGTAGGGCTAATGGCTGTAAAAAAAAAGATAATAGTA:1 - chr2R 18432052 3' - 412 22 2 57.43 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTG:1 - chr3R 29608787 3' + roo 9032 1 66.00 GATCAATAGCCGAGTTGATCTGGCAAGAGGTGACCCTCCTATATTCACGGGGAAGGGGTGTTTTGCCAGCGAGAGGTTTGTCTGTCCAACTTTTGCGTACC:1 + chrX 1144831 3' + INE-1 98 1 78.22 GACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAAGGATGAGTTGCCCGTTTCCTACCGGCAGTTTATCTACCTGAACTCTGGTTACCTGTCCGAT:1 + chrX 13230180 3' + invader4 172 2 66.34 GTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATGCAGACGCTGGGCTTGATTTCTGCCGATTTACTTCC:1 - chr2R 4500869 3' - springer 37 2 62.38 GGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCCACTCATGTTTTGTCGCTTAATTTTAATGGCTT:1 + chr3L 5479078 3' + 3S18 342 1 71.79 TCCCTTATGTTAAAAAAGAAATAGCAAAACATAGTAAAAAAAAACGATAGCGAAAATATTTTGAGCTACTCCAAAACTGTGTGCATGTCAAACTGTCAAAC:1 - chr2R 9446042 3' + G4 3571 1 66.34 TTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATGCGTTACTCACATATCTCAATTGGTGTCGCTTGTCTGCTCACATTT:1 - 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pogo 35 1 62.38 CAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATGCTATGTTGATGTTGAATTTTGCAGGGAAAATGCGC:1 + chr2L 17331028 3' - Stalker2 379 2 71.29 CTTATAAGCTGCACCCGGAAAGTTTTGGGATAATTTGGTTATCGTGGCCTAGACCTCCGCTTGAGTTTTCGTTTTATTAAACGTTCAACTTGAAGTCGCGC:1 + chr2L 8505401 3' + Gypsy12A_LTR 144 1 77.23 ACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTACAGTCTTGTCGTTGGCTCCTCAATGGCAAGACTGATATGCAAATTGCGACGGAAAATGGAAAAGCCGAG:1 + chr2L 20398179 3' - Rt1b 5033 1 48.51 GCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGGGAAACAATTTCATAGGACATACATATACGTACATATAACAAAGGCTCTA:1 - chr3L 5651584 3' - blood 7195 2 64.00 TTTGGACCACCCAAATACGNCACTATATGGGCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTTTATGCTAGTTTGTAAC:1 - chr3R 7869089 3' - 297 3 2 73.27 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGATTGAACAACATTTTTAGAATGATTAAGTTC:1 - chr2L 12511552 3' - copia 46 2 71.29 GGGTGCTTGAATCTAACTGNCTAGCTACTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTGTATTTGTGTTAGTTTTATTTCTGGCCCTTGT:1 + chr3L 9118827 3' - 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roo 8718 2 77.23 GATTCATTTACATAAGATANGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATGGAGTCCTAGAAGTCTAGGCAG:1 + chr3R 6266343 3' - roo 8717 2 77.23 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGAGTGCTGAAACAATTATTGACAATTC:1 - chr2R 11941014 3' + 297 6926 2 75.25 AGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGCCGGCTTCCCCTCAAAAAGGAAGAGAGCCAAGCTGGAATA:1 + chr3L 13569822 3' + invader3 262 2 61.39 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAAGTAATTTAAAAGCAAATTCTTTGCTCTTGTTCTTATCT:1 - chrX 12739292 3' - jockey 4796 1 65.35 CAGTTCCCCAGAGTTCTGTTCCATTCGTCCATATTGCTATTTTATTATGTAATTATAGTTTTGAGTGTTAACACTGAAGCCGCCTTAATAATGTCCGGCTG:1 + chr2R 12563128 3' - Porto1 4278 1 68.32 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGNTGCAGTTCTCTGGTACTGGCATTGTTATGTTTTCTCTCCCACACATAAAAAATGGGGGAAATTGTAGGTAGCTCGTCGCTT:1 - chr3L 7307193 3' + hobo 2928 1 68.32 AACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGATGAGAGGGCTCAGAGATTGCTTTATCCAGCGAATGTCGACTTAAGTTCTCTGCCACCAGA:1 + chr3L 16420920 3' - rover 7082 2 66.34 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCCTCCCTAATTGCCACCTTTAAAGCGTTTATTTAATTAATAGATAAGGATAACGTTGAT:1 + chr2R 7546339 3' - hopper 13 1 66.34 AGCAAAATTCTGTTGCTTTTGCTTACACAAGCCTTTCGTGCTCGTACAGCTTCTGGGTTATTTATGTATATATTTTTGGAAGTTGACAACAACGAATTTAA:1 - chr2L 5248385 3' - Copia1_DM 4246 1 70.30 AAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAATCCCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAAAATCAGTTGTACATAAGTATTTTGCAGTATTCAGCTAC:1 - chrX 7379761 3' + Q-element 91 2 65.35 ACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCGTCCTTACCCCAACCTATCTACCCTTGCCACTTGACTATAAAGATGTGTAAAACTACATCTTATCT:1 - chrX 19615920 3' + G2 2928 1 70.30 AGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTTTGTAGTGATTTGATGGCCTTGTTTACGATAATAACACCGTCAAGATCCTTT:1 - chr3R 24162742 3' - F-element 452 1 60.40 CCTGCACAGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAAATACAAGCACAATAAAAGGGTCTTAACAAAAAACCAAACGCAGCGATGTATCTAGA:1 + chr3R 4581989 3' + X-element 4355 1 66.34 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTG:1 - chr3R 30553573 3' + 412 7491 2 75.25 GGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCATCCGTAGTTTTCGTTTCCGGTTCCGACTGGTTTTGCATCTTGCAG:1 - chr3L 10474109 3' - copia 4870 2 78.22 ATATAAATATACAAATACCCAAAAAAAACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGAAAAGCAAAGCGTACTTGCCGTTAATA:1 - chr2R 24499222 3' + Stalker4 7047 4 73.20 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCGGCGCCCTCGGTCGGTTGGTCGGGAGGGGTGGCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAA:1 - chr3R 1135320 3' - 1360 15 1 96.74 GATGCTGGTGTTGCTGCTGGTGCTGCTGGTGCTGCTGCTGTTGTAACGCTAGGATCGAACTGCTATTGCTGGAGTAACTGTAAAATAATAAAAATAATACG:1 + chr3R 23533002 3' - TART-B 152 2 77.23 ATGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTCAATGTAGTTTCATTTTTAAAACCTTATTCTAACCGTTTTACAAAAATGATTGTTAAAGGAA:1 + chr3L 12998812 3' - invader3 278 1 63.37 TATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTGACTCAATAACTTTCTCTTCTGCAC:1 + chr3L 18398284 3' + hobo 232 1 75.25 TTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATTGACCCTCTTATTTGCCGTCCGGTGGGTCACCGGTTGACCATATTTGCTAGTCACCACCAACAT:1 - chr2L 12127282 3' - I-element 372 1 67.33 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCAGTTCACTTCCGCTGGCCACTTTAATTACGGGCAAGAGGCGAAGCCTAAGCCAAGCG:1 + chr2R 6107809 3' - roo 18 2 62.00 CTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTG:1 - chr2R 4673591 3' + Quasimodo 7325 2 77.00 AATTGATTTCGCCCCGAAAATTGCCTTCTTGCACAAGTACGCACGCATACACACTCGATTATTGAATTAACAGACAAGCCTGTGAGAATGGCAAACAGAG:1 - chrX 6136067 3' + 1360 3184 1 76.00 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATGGAAAAGTTTTAAGGCAGGAGAAAAACAGGGAGGAGGAGGGGTTATGTACCATCCTTGCCAGATTGAC:1 + chr3R 8765634 3' - roo 7 2 70.30 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTATCATTTACGATCGACACACTT:1 + chr2L 21086116 3' - roo 11 2 68.00 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATGCATACAGAACAACCATAACCACAAGAATTTCGGCCAATTTTCGGT:1 + chrX 6481090 3' + jockey 4959 1 57.43 ACCTTATATTTAATTAATTTATATATCTCATCCGTTAAGAAACGGCGATAGCTTCTTCTTTACTGGAGAAACTGTCGACGTAGTCTTCCATGTAGTGATAC:1 + chr2R 4500968 3' + springer 7523 1 81.19 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCAAACATTTTTGAATTCAAATTTGTCCAACAGGTTCCGATGGATGTTGACGAATGTCGCCG:1 + chr3L 163301 3' - mdg1 7054 2 63.37 AACTTGACTATAGCATTCTNTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCT:1 - chr3R 23020817 3' + INE-1 575 1 53.47 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGAATAGAGTTTCTGGCTTTGTCGCGTATATTCGTGAATTTATGGCTCCCTCGTCTTAATGAG:1 + chr3R 13353285 3' - 1360 16 1 61.00 AAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGTAGATGCCTCAAGATAGGTGGGAGTGGG:1 + chr3R 23395383 3' - 17.6 7111 2 72.28 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACAAGTGGCGGAAATGCGTTTAACACGTAGCCCATCGCGTAACAAG:1 + chrX 9413868 3' + 412 7513 2 57.00 TTGTTTTGTTTACTCTCCCNTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTTTTTGGTGTTGTTTTTTTGCACTGTGCACCATTCCATTGCCGTGGAGCTAGAACATGGA:1 + chr2R 10556668 3' + Cr1a 208 1 73.27 AAAAAAAAGAAAAAAAAAATGGGGCTTCGCTGGTGTCGCCGTGCAATTTAAATACATACCTCCTTGATATCCTCCCTTCACTACCCCACTTTGGGCCTTGC:1 - chr3R 9206110 3' - hopper 141 1 64.36 ATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACATAACAAAACACACTTTAGTTGGTTTCGATTTGTTTTCCTTTTTT:1 - chr3R 31932719 3' + McClintock 122 2 55.45 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCTAAATCGCACAATCAAAAATAGTTGTTTTCACAAGCGGAGA:1 + chr3L 5710314 3' - Transpac 4949 2 54.46 TTATGTCTGGTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCGCATGGGTACTGATGATGCTGATGTCCATTCAGTGTGCTTTTACCGTGTCTGTGGACGAGGA:1 - chr2L 8932888 3' - Quasimodo 7017 2 52.48 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTACGTAACATTTTGAGGAATTCACAAAATGCGGCTAAAAACGCAACAATTACCTCACAAATACGAAATCT:1 - chr3L 20520655 3' + P-element 2881 2 73.27 GTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATTTATATTGATTATGGGTGATCGTCAACAAGAGCAGTGGACACCCAATAAACCTGTCCAAAA:1 + chr2R 9905437 3' - mdg3 5253 1 74.71 CAGAGGAACCCCCCGTTACCTGCAACCTAAGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTGCATAACATTTTGTCCGGAAATGGG:1 - chr2L 14220169 3' + springer 330 2 74.26 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAAT:1 + chrY 2720353 3' + 297 362 2 65.35 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCGTAGGGGCGTACTGTGTGGGCTAAAATGCCAATATAAT:1 - chrX 10286150 3' + roo 9036 1 61.39 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGT:1 + chr3L 18418888 3' - hobo 48 1 71.00 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAATGAAACCGAATCCTGCCTATGGCATTTGCGCT:1 - chrX 7292659 3' - 3S18 21 2 58.42 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGAGCGACTATAGCACCATGCGA:1 - chr2R 18171534 3' + P-element 2834 1 25.74 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACGTACAACGCTGCGTATGCGCATTA:1 + chrX 11025602 3' - hopper 2 2 77.23 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACTAATTAAGAGGACTGAATGTCCGTTTTTGAGGAAA:1 + chr2R 21153769 3' + pogo 2064 1 64.36 TTTGTCCCGACACGGTTCAGTCGCCATCTTTATCTCGTCCAGAGTTGTCCAGAAATTGAGAGTCTGTTTTCCAAACATCTCCACATTTGGCACGACCGAAG:1 - chrX 4835918 3' + mariner2 106 1 74.26 ATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAGCTATGAAGCTCAGCTTGTTTGTGCAGTTTA:1 - chr2R 6107741 3' + roo 9026 1 72.28 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAA:1 + chr2L 18655196 3' - Doc 50 1 66.34 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATGTTAATTGGGTTAGTTATTGAAATGAAAAGCCCTAAACGGATTTGTTCTAA:2 - chr2L 21086019 3' + roo 385 2 56.44 TAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCGCCACCCCCTCTCCCAAATGT:1 - chr2L 4924538 3' - hobo 27 1 68.06 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAGTGGCAGCC:1 + chr3R 10488746 3' + roo 9042 1 57.43 GATCATAATTTTTAAAACAATTTTTAATCCAATATTAACTAAATGGGTCACTGAGATGTCACCAAATATCCAAATGTATCCAAATGTACCCCAGCTTAATT:1 - chr3L 17283496 3' + Juan 3776 1 44.55 ACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGAGAGCCCAGGAATTAGTCTGGAAATAAATG:1 - chr3R 10740191 3' - McClintock 6095 2 76.24 ACGCCCTAAAACCGCCAAAATCTGTTAAAAATTCTGCTTCCACAGAGTCAATAAAAAATCCTTGAGGGTCATTGATCACCTGCTGCCTCATCAGAGCATAA:1 + chr2L 22196478 3' + INE-1 345 1 68.32 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCNCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGT:1 - chr3L 19274814 3' + transib2 2778 1 62.38 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCATTTTCGGTGTGAATCATTTAATATGATTTTTTCGAGTGCATCTAAGTA:1 + chr3R 17971723 3' - 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chr3L 26376568 3' - gypsy7 311 1 78.22 TGCTAGAAGACGATTTTCGGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAATTGAATTTTGTTGACAGTACATAGAGTGCAAATATTCTCCATAGTTGCACG:1 + chr2L 15643613 3' - 1360 3195 1 57.73 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTATGTCAGCGTGCGCTTCGTCACTACTT:1 - chr3R 5506789 3' + pogo 2057 1 72.00 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATTATTGCACACTCACATGCACACACCGTTGAGTGGAAAGAATC:1 + chr2L 18255602 3' + blood 7336 1 62.38 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCTCGAATAGAGA:1 + chr3L 8039425 3' - hopper 18 1 61.39 ACTTTTCCAAAATATTCCTNGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAAGGAAGGGGATGTGGAATGTCAGTTGCTCACACGCTGAGCAACTGACCCTCCAGG:1 + chrX 11057646 3' - hopper 99 1 62.38 ATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGTTTAATCGCCTCCAACTGGCTACCAGTGACTTGTCGTCATCCATGCCACCCGCCAGCATCCTGAGCAG:1 + chr3L 11929360 3' - copia 4879 2 69.31 TAATTAATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACGGTAGCTAAAATCGCCCGCTAGTGAAATTGCAACAAACTTAAAGCGCTTACAGCGGAAAGATTCAG:1 - chr4 49301 3' + 1360 2948 1 43.56 CGGGAGCTTGATGGTGCAGGGTTTGCTGAAAGGTGTGGCCGGTCTGGGGTTGGGGGCTCCTCGGCAGCAGGAAGCCGGCCATTCGGGG:1 - chr2R 7586865 3' - G2 27 1 60.23 TGATATCATACTGAATCTCNATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGATTTTA:1 + chr2R 22051515 3' + Tabor 7275 2 70.30 AAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGCCGCCCACCGTGCGGAATGCTTTCAGCGCCATTGGGGCACGCGCTTCCAGCCATATATCTCCATCG:1 + chr2R 14284671 3' - diver 5900 2 66.34 ATTGTCAGATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTTATAGAGATGTAGCTCGATTTCGTGTACTTACCGATTTTTGTCACCGCGTCCGTCGTCACAG:1 - chr2R 4154730 3' + GATE 424 1 62.38 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATATATTTACAACAAAATCAAATACAAACAACAACAATATTCTGAGGCAATTT:1 + chr2L 8826083 3' + roo 8986 2 60.40 TCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAGCAGAGAAAACAATAAAGAACCCAACC:1 - chr3R 9378806 3' - Doc 352 1 78.22 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATTTACTCCTTTTTTTTTCATCAGACATAGACTGCTACTTCAA:1 - chr2L 13186246 3' - pogo 29 1 60.40 GTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCT:2 + chr3R 10736139 3' - McClintock 5958 2 72.28 GTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 7 1 61.39 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAA:1 + chr3L 9928595 3' - roo 8704 2 71.29 TATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTATAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAGCTATGAAGCTCAGCTTGTTTGTGCAGTTT:1 - chr2R 6107742 3' + roo 361 2 71.29 CGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCGCTTTGCACTTTTCCACCATTCACTTTCTTTGCCCGCGAAAGGGGCAAAAATAATCCGAGT:1 - chrX 1970354 3' - gypsy4 481 1 54.00 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACA:1 + chr3L 3540212 3' - mdg3 5276 2 55.45 ATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAATGTCAAAAATAACATTTTCTTCAGTGAGTGAGGCCAACGATGTAGAGTCATAGCTGCATCATGAGTTT:1 - chr2R 5677110 3' - S-element 64 1 71.29 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTTT:1 - chr3R 19449953 3' + roo 400 1 64.36 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATGAGCCGAAGTCAGCTAAATGGCCGACGCTCACCGATTTTTTCTCGCATGATCTCTACGTA:1 + chr3R 3847176 3' - P-element 13 1 67.01 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATAAGACGAAATCCCATTGAAGGCAACGGGGCGT:1 + chr2R 7839032 3' + pogo 2058 1 68.32 AGGGGAGAAGGAGCAGCCTACTACATGTTTAAACTCTCTAATTATTATGCGTAGTCAATCTTAATAAAAGACCCAAGAAATGTGACACCAAAAATGCATTA:1 - chr2L 6251634 3' - mdg3 5256 1 76.24 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCTTCGTCACCGTAACCTAATCCGAAACAAGAGGG:1 - chr3R 25021662 3' + roo 406 1 71.26 CACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCTCCGCCCCCTTCAACCGCTGCCCCCTTTGCGGTTTGGTTCGGG:1 + chr2L 13603000 3' + Max-element 8521 2 59.41 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGCATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAAAAAAGTGGAAAATCATAAACAACAAACA:1 - chr3R 14193889 3' - pogo 13 1 61.96 GTTTTCTGTCTTTAGTTTCAAAACTCATCAGAACGCGCGCCGCATGCAAATGTGGGTGGGGCCCCGCCGCCTCAGTATCCTTCAGACTGTCCTACGGCCGT:1 - chr2R 8418688 3' + gypsy4 6771 2 70.30 AAGCTAAAAGGTTGAGATTCAGCATACCGGTTCTAGAGACAAAGCCGCATTTTTCCGCATCCTTTAGCGTTTATATACTTTTCAAGCAGAAATCTCGCCAA:1 + chr2L 3080006 3' + INE-1 167 1 59.41 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTTCGTGGCTGTCGAATGGTTTTGCGGCCCAGTGGAGTGGATTCTTATCC:1 + chr2R 19560234 3' + Tirant 8481 2 54.46 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAATGTTTGAGTTTGCACATTGAAGAAATAAATGAAACAAGAGTGCAGAGCCAAGAGGAAGTG:1 - chr2L 14262782 3' - pogo 11 1 66.34 CACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAATCCTAAAGTCGAAAGTGCCGAATCACGCACATGGAGACATGGAAAAGCGGAGA:1 + chrX 10903062 3' + Idefix 351 2 61.39 TCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAAAAAAAAGGCTGCATATTTAAGAAGCAGTAAAAAAGAAAAGTTTATCAT:1 - chr2L 15220195 3' - invader4 2781 2 51.49 AATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAACTTTAGTAATCAGCGACAGAATTACGAATCTCATTGATTTCGATA:1 - chr2L 9045458 3' - jockey 4851 1 58.42 TCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAACTTTATATCGCTTAGTTTTCGATAGTTATTCGATTCGCATGC:1 - chrX 16671943 3' + P-element 2793 1 51.49 TGAAGAGGAATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGAGGAAAAGAAGAATCCATAGTACTGTAAAAACAATTCACTTAAAAATAAAACTTTTTCGGATCTAC:1 + chr2L 57875 3' - Q-element 56 2 67.33 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTGCACTACTCACATATGTACACTTCAAAAATAATTAAAGTATTTAATAATAAGCGAAGTCAGTAGGTAATTAGA:1 - chr3L 21518950 3' - 1360 4 2 73.27 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTATATTTAAAAAAAAATAATT:1 + chr3L 5060752 3' + roo 9015 2 86.00 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTGGCTCTCAAATTGAATTGTTTGAT:1 + chr3R 19449489 3' - hobo 51 1 80.20 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATACGGTTAAACTTGTAGAAACACTTTAAAACCTAATA:1 - chr2L 4063694 3' + roo 9035 1 60.40 CTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGATATTAAGCAGACCGATCCTAGAGCAAGTTTGTTGATCTATGTTGCCACGCCCACTCTAACGTCCACAAAC:1 + chr2R 1764015 3' + INE-1 153 1 71.72 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATAGAAAATATTAATGCGAAAACCCTTTATATTAAGTTCAAGTTCTAGATATAACTAATTCTT:1 + chr3R 11052187 3' + blood 7375 2 64.36 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGTCATAAGGTCTTT:1 - chr3L 3757334 3' - roo 24 2 55.45 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAAACTCTGGCCTTATATGCAGAG:1 + chr2R 21040916 3' - P-element 34 1 46.53 AATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTGAGTGTGTGCGGATGGGGCTCGATAAGAGGGCGTGGGCGAAAGAGGCGCAAGGGGCGCAGGGGGCGTGTGAG:1 - chr2L 6186429 3' - HeT-A 5974 1 69.31 TGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGTTTAAACTCTCTAATTATTATGCGTAGTCAATCTTAA:1 - chr2L 6251671 3' - mdg3 41 2 61.39 TATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAAAACTTAAGGAAATGACCCAGAGATATGA:1 - chrX 983302 3' + Juan 4196 1 54.46 GCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAA:1 - chr3R 4971393 3' - F-element 34 1 54.46 GCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACAT:1 + chr3L 19350031 3' - 1360 3194 1 64.36 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACTT:1 - chr3L 25272555 3' - 1360 70 1 59.41 CGTCGAGATCTCAGGCACTNTAAAAGCTTGAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTTTAAAGACGCGGCGCAAACTTCCCCCAAACTTCCTAAAACATACACA:1 - chr2R 5185204 3' + INE-1 144 1 69.31 TTGAGTGCTTGTGTCCGCAATTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTATTGTCTTTGGAGCAGTCAGCTCATGGATCCGCAT:1 + chr2R 20312379 3' + 1360 462 1 73.27 CAAAAACCAAAAAATTATAGAAGATTATTTTGTAGAATTTTATAGATAATGTGGTATCTTATATGAAATAAAATGGCTTGTATGTTGTCCAGCTATTTTT:1 + chr2L 11749745 3' - Tc3 82 1 71.00 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAAGTAATTTAAAAGCAAATTCTTTGCTCTTGTTCT:1 - chrX 12739297 3' - jockey 4801 1 70.30 TACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTGCGAAGGAGTAAAAACTTTGATATATATGCATTAA:1 - chr3L 15452876 3' - accord 42 2 65.35 CCAAAGAAAAACTCAAAAAAGAAAGCTTTGGGCACTTTTTCTTCATTACCCCCATCTTGCAAATTCTTTAAAACTGTTTCTAGTTACACAACGCATATAAT:1 + chrX 12625006 3' - Tc3 45 1 73.27 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACAATACTATACATTTGTACATACATACAGAGAGGACACTTCAAGCTGGGG:1 - chr3R 19216342 3' - 1360 29 1 56.44 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAA:1 + chr3R 8582599 3' + roo 9027 1 67.33 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTTATACCAGAATGGTGCTTTTTTCATGTGAGAATTTTACAATATGCACTTTTAG:1 - chr3L 19647235 3' + pogo 2082 1 60.00 TTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGA:1 + chr3L 19274884 3' + transib2 2802 1 54.46 CATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATGTAATATATATACTATATATATATATATACGG:1 - chr3L 10798070 3' + flea 4975 2 82.18 ATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATACAAGGGAACGCATTAAATTAATTTTAATTTTAGATCGCTGAATAAATGATATGTAT:1 + chr2L 5602131 3' + Juan 4157 1 56.44 CCTACACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGGCACGGGAACGGGAACGGGCACGGAGGCTGCAAAGTCTGGATGGGGGATCTGAGGACAATAAAGCCATATTG:1 + chr3L 2034383 3' + BS3 1426 1 71.29 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGCTTTATATATACCGCTCACCGGCTAATCTTCAATTATTTTATCCGGCAAATGGATGGTCACTTTT:1 - chrX 19196220 3' - pogo 7 1 67.33 TTTGAGCGATCTTGCATCACATAGAGCGTCTTTTTCACTTTCGGATTGAATCACAAAATCGATTTCGGATTACACAGAGAGTGCGCGAGTTACCATAACAG:1 + chr3L 23455998 3' - F-element 136 1 67.33 TGAAGCTGGCATTTTTATGGGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGACGCTCCACATCTTCCTTTTTTATTTCGCATTTTCATTTTC:1 + chr2L 14668891 3' + 1731 4450 1 73.27 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTGGAGGCCTTTAAAAATGCAGAAGACAACACTCAATTCGTACGCCGTCATTCGTAATTAAAACGAACCAC:1 - chr2R 14652165 3' - jockey 4746 1 79.21 TAGTATATAAACATTAAGTCATTTTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTAGTTTGAAAAATAAAGCCCTTTGCAGCGGCAGGGGAAAAATGCAGAAACCAG:1 - chr3L 9790830 3' + invader2 4909 2 57.43 AAAAGTAGTCTACTATAATAAGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCTGGGCGTGGCAGCGGCCACAATTAGAGCAAGTGCATCGGTAGTTC:1 + chrX 665032 3' - Cr1a 3972 1 55.45 CAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCCGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCAGTGGACCAAAGCCAAAGCAATTACGGACTCAG:1 + chr3R 12784272 3' - Bica 96 1 67.00 CCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTGCGAAACTAAAGCTAAGTGAATTCATTATCTAATGGCCACCAAAATAATTTCCAGCGTTTC:1 - chrX 20584708 3' + R1A1-element 5156 1 69.31 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGTCTTTCGTTACCAGACTGAGACAAAGACAAACACAATCAAAAGGACTTGGTCG:1 + chr2L 10625751 3' - roo 22 2 57.43 CTCCAATATGAGCCACAAAGATGCGCTCATGTCTATCCAAGTGCCACAAACAACACACCAAAAACACATCTACACACTTACCAAATGAAAAAAAAAACAC:1 - chr2R 17530211 3' + G2 54 1 51.00 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTACAAAGGTTTAGTCATCCAGTCATAATCATAACGTTATCATAGATATATGAAATATAGTACCGC:1 - chr3L 20411768 3' - roo 8674 2 67.33 CTCGATATATGCACATACTACAGTGTAATCTTAAACCTTAGGCATAATGAGTGTTTGGTTTTATCAAGTAGTTTACGAAATAAACGTCAAATACTTAACTC:1 + chr2R 10353349 3' - blood 7012 2 76.24 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGC:1 + chr3R 8582595 3' + roo 359 2 71.29 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACAATAAGAGTAACAACAATGCCCAATCGACATAATCATAGCGTGGGAAATTCGT:1 + chr3R 7139318 3' + pogo 2081 1 59.41 ATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTACCAAAATTAGTAATAGCATATAAATTA:1 - chr3L 13569754 3' - invader3 5236 2 71.29 TTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTGCGTTCAAGCTAGTTCAAAACTAACACCTTTACCCCGATAAACCACAGAGGCCAAGAAAGAGGAGGAGAAGCCACA:1 - chr2R 22856493 3' + Tc3 312 1 63.37 TGAGCACGGCCCGCTCGGGTACAAGACCCAACTTCTGGGCCCTTGGCCAGCTCGATTCTAAGGTCCAGCGCGGTACGGTTAGTTCACGGCCTCTCCGCTTT:1 + chr3L 23933487 3' - gypsy8 293 1 67.33 ATGCAATACCAACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTTATGTTACTCTTACATTTTCGCATTCTCCCTTCTTTCGTGTAAACACA:1 + chr2L 8403016 3' - invader1 3842 2 56.44 ATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGGCGTAGACACGGAAGAGCTCTCGTGGTCCATAAATGCAATCAACCACTCCAGAGTCCAAGAACAAAAGCAGACG:1 - chr2L 7638282 3' + R2-element 235 1 52.48 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAGTGTATTTTATTTCAGACTTTCCACAAAACTTAATTTACATTCTGTTAAACGC:1 + chr3L 19647332 3' - pogo 19 1 61.39 AAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTACGTTCGACGCAAAAAGGCGAACTATTGTCGTCTAATACCGCAGCGACAGCCCG:1 - chr3L 12302504 3' + Bica 4580 1 60.20 GCACACGATCTGCGCGAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGACTGAAAGTACATACTGCGAACTGTGG:1 - chr2R 11994003 3' - jockey 91 1 71.29 GAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGATGAAATGAAATCAAGTCGAGAACTGCGAACTGG:1 - chr3L 15037064 3' + invader2 465 1 67.33 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATGGAAAAGTTTTAAGGCAGGAGAAAA:1 + chr3R 8765591 3' - roo 50 2 80.20 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTATATATTTAAAAATGTTAATAAGCATTAGTTTCAA:1 - chr2R 19088966 3' + Tabor 7282 2 67.33 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTTTGGCCGTTTTTGCCTGTTTGTTGCCTTGGATGTTTTGGCCA:2 - chr3R 23542935 3' + 412 476 2 61.39 TTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACCAGTACACTTGAATAAGCCGACTAGTATATTGCTTCGACCGCAATCCTTTCAAAATGGATCCTT:1 - chr2R 10353251 3' + blood 7378 2 39.60 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTCACCTTACTAAATATCAATAAAAATATTATTTTTTTTATAAGCATATCTAG:2 + chr3R 9278416 3' + roo 397 1 69.31 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTTTAGCTCTATATCTCGTGTCCTGCCCCACCCCCCATTTTTTTCCTG:1 - chrX 7996377 3' - hobo 22 1 48.94 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGGCATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAG:1 + chr3L 25345142 3' - Doc 54 1 70.00 AGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGCATTTTTATTTAGCGCATAAGTGCAGCCAGAGAGGCAATCTAGTTTTTCCTCGCCGCTTCCTCAATG:1 - chr2R 6783537 3' - 17.6 223 2 73.27 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAATCGATTTTGTTAATGAAAACGAAGTTCATTGACCATTCCGTTCCCGCAAGTTTCTAGGCTCTAT:1 + chr2R 12407106 3' + roo 405 1 49.48 TTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACCGAATCTGCTAAATTTCACAC:1 - chr3L 11929292 3' + copia 235 1 76.24 AAAGAAAATGAAACAAAAAAAAAAACAAACAACAAATCAAATCTAATGGAACCTAAGTTAAGTGTAAATAAAATAGTTGTTAACAAATCACAAAA:1 + chrX 8431465 3' + Doc2-element 219 1 56.84 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCGAGACAATACACATTTGCCTACTTCTAGGCGCCATTTCGTAGGCTCGAATAGAGGAAAGCTATTTTCCGAGA:1 + chr3L 8039442 3' + hopper 1414 2 76.24 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCCCCAACCCCCACAGACTTTCCATCTCAGGTTGCCTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTCCAC:1 + chr2L 12511620 3' + copia 237 1 62.38 CACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACGGAACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGGAC:1 - chr3L 16047626 3' + Cr1a 4408 1 57.00 AATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGTTTGCCACAGGACTCGTTCTGTG:2 + chr3R 13739764 3' + Burdock 245 2 69.31 TATAGTCGGAAAACTCGACTATAGCATTCTTGTTTTCCCTAAACATTTTGAGTTCACATAAAATAGGAGGCATTACCGACTTGCTCCCAATTCTAGAAAAT:1 - chr3R 4129086 3' + INE-1 564 1 63.37 CTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGAGTGTATGTATCTGCATGAACGGGAGTGTGTTTATGCGTTGGTAAATTAAATTTGAAACG:1 + chr2L 7666190 3' + roo 394 1 65.35 TTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAAATCCTGAAAAAATCGAGCCAAGCCCTTGCAAGTCTGCAGAGCATTTGGCAATCATTATCCAAGCC:1 - chr2L 15568161 3' - Doc 4680 1 70.30 AGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCCGCCCACATATCATCAATTCCGTGCCAT:1 + chr2R 14576558 3' + gypsy5 7299 2 78.22 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTGTAGGCTGTCATGTTAACATGGGAGAAAGCTTTCTCC:1 - chr3L 14594121 3' + hobo 2901 1 62.63 CTTGGTACAGTCTGTACCAAAACGTCTGCAAAAGCTGCAGTGGCTTTCGGCTGGGTATATCTTCTTAAAATTATTTTTCTTTATCTCACATCATTCATATT:1 - chr4 805773 3' + Tc1-2 1309 1 71.29 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTAAAAACAAAATGGCCAACAATCCGGCCGGAAGTTGTGCGTTGCCTCGAGCGCTTGGCTGGAAC:3 - chr2R 19560133 3' - Tirant 10 2 71.29 ATTATTCTTTTGTTTTTTTTTTTGTCTGCCACTAGTCTACATATGTATTGCTATTCAAATGTGAGTGGCATTGTAGGTTTCGCCCTGCCAAATGGCCAGCT:1 + chr3L 9646102 3' - gypsy11 3934 1 80.20 AATATATTCGTGTTCATGTNTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGGCAAATTTAATTGACCTTGTGTGTGCGAAATATTTTTGA:1 + chr3L 9928630 3' - roo 5 2 74.26 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGT:1 - chr3L 25059077 3' - mdg1 7072 2 60.40 ATTATTAATATTATTATCATAATTAGGTTGAGTAAGGAAGAGCTCTATACTGTCCTCTGCCCTGCTGGTAGTCTGAAATACGATTATTATGTTGATTTGCT:1 - chr2R 965379 3' - mdg1 7077 2 75.25 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTA:1 - chr3R 10741088 3' + 1360 3364 1 54.46 ATATTATTAAAAAAAAAATGAATTGGTTGAATGTGGCCTTTTATTTAAATAGTTATCAGTTATCTGAAAAATAAACGATTATCTGGCGGGGAATATCTTTC:2 - chr2L 1443236 3' - hopper 157 1 74.26 CGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGTACAACAACCACACAAAATACCGAATATAAAGTAGGGTGGGGTGTACTT:1 + chr2L 18249758 3' + blood 423 1 56.44 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGG:2 - chrX 21668006 3' + Tabor 7293 2 54.00 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTAATCTTAAACCTTAGGCATAATGAGTGTTTGGTTTTATCAAGTAGTTTACGA:1 + chr2R 10353326 3' - blood 16 2 58.06 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGTTGTCAATTCGTTCCAGTCGCTTATCCACCTTGTGCATTAGAATGAATGCCTCTGGGAAGTGACCCA:1 + chr3R 21884265 3' + mdg3 5488 2 68.32 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATCAATAACAATGCGAATTACGGGGCAATAGTTGAGCGGTCGCTTCATAAAAACCAGATGTTAATATTT:2 - chr3R 12767252 3' - blood 7020 2 70.30 TTTAGACATGTACCTAAATTATAAAAACAAATAAATAATAATACAAAAACACGAACTCAGCATACCATAACTGTCTTTTATCGAAACTAACACGCACATAG:1 - chr3L 27262302 3' + mariner2 811 1 71.29 CATCTTGCGTCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTATGTCCTGGCGTTCTTGCGTTCTGGTGTGGATGGCTCGTGGCCGACATCCTT:1 + chr3L 9993399 3' + 1360 423 1 54.46 ATTATATAAGTTCCAATAGNTCCAGAGTTATTTGCCCGATTGTGTTGAAGTATTGGACATTTTATGTTATTGTTTATTGATTTGACCCATTTGGAGTGTTG:1 - chr3L 3642553 3' - gypsy 7447 2 76.24 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCCATTTCCATGTAGTTGGTCTCCCACGTCACTCCGATTTTCGAATGACCCATTGTGAAGCTCTCACGCC:1 + chr2L 5927027 3' - pogo 2 1 67.01 GTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAATGGACAACCGACGCCTGGAAGTAGGCTGCAATAAG:1 + chr2L 17998321 3' + BS 5053 1 62.38 TTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACAGATTGATGGTGACTCGCACACCTTGTGCCCCTCGTTGA:1 + chr3R 30075827 3' + jockey 4665 1 61.39 AAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCGGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCCAC:1 - chr3L 19274778 3' - transib2 5 1 72.28 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAAAAACAAGCACAGCAAAGTTCAACAACTTCTAC:1 - chr2R 17459162 3' + Transpac 270 2 65.35 CACGTCCACTCGATTGCTCNTCTCCCAAGCGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAAATGCACTAACCGCTTCCGTTTTTTGAAAAGCAACTGAACTCCAA:1 + chr3R 20696550 3' - jockey 20 1 65.35 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCATCTCTAAAATCAAAATGATTTACTTTTATAATTTTTTTTTGTGGCTCCCTTGAATGATGGCATTT:2 + chr3R 10914198 3' - F-element 86 1 62.38 GAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATCTTCTGTGTATTCTGATTGTATTTAAATGCTGCAAAATTGTTTAGAATAATTAATTTTCACAG:1 - chr2L 11478657 3' + opus 7490 2 68.00 CCAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTACAAAAAAACCAAACCAAACACCACACCACACCAGCAATATGAAACCCAGAAAATCCATATATGTT:1 - chr2R 16329069 3' + accord2 7435 1 62.38 TGTTAAAAAAAAAACAACAAAAATTTCCTTAACTAGAAAACATAACGAAATCTACCAACTAGCTTTTAAAGTAAATTGAAGTTTTACACCTAAT:1 - chr3R 30737909 3' + gypsy11 3930 1 72.34 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAATACCTTCTAAACTTATGAACTTTGAGAA:3 + chrX 8316365 3' - hobo 47 1 73.27 GTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCATCTGCACGAATCTATTTATGTATGCTATTATACGTATAAGTTTTTCTATACTGGAATA:1 - chr3R 19446664 3' - F-element 4402 1 65.35 GTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGAATTGCGTGTTTGATCGTCGCTGATTTGCCCTGCTCCTCG:1 - chr2R 10463095 3' - 1360 210 1 60.40 GGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATAC:1 + chr3L 3540204 3' - mdg3 5283 2 52.00 ATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCCCTCGAAAATATATTCAAATTGCAAATTTGTTCACGTAA:1 - chr3L 20353118 3' - 412 415 2 61.39 ACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCA:1 - chrX 3431859 3' - Ivk 5314 1 63.37 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAA:1 - chr3L 9928540 3' + roo 9034 1 63.37 GATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTT:1 + chr3R 10736141 3' - McClintock 4 2 74.26 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAATACCTTCTAAACTTATGAACTTTGAGAACACCATTATTTTCTGCCAGTGTTTTTAAGAATGTAATTGC:1 + chrX 8316405 3' - hobo 7 1 70.30 ATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCCATCGGTTTTTGGCGAAGCATTTTGCTTTCCTGTTATAAGACAGTTCCGTTTTCGATGATCAATATAT:1 + chr2L 21775348 3' - Transpac 255 2 72.28 AATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACCATATGTAGTCTAAGATTTTCAAACACGACGCTTTTCTTTACTCTT:1 - chr3R 7783734 3' - rover 27 2 57.43 TCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGTGTGCGTGTGCTATACACAAATATATCGCTATCAATTTATTTATAAATATTTTCCCAGTTAAGTGTCACCG:1 - chr2R 18920098 3' - accord 7031 2 66.34 TTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGTACAACA:1 + chr2L 17079887 3' - jockey 4817 1 61.39 GATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTGAGTGGGCGCAGCAGCAGCAACAACAAAAACAAACAAGAC:1 - chr3L 685195 3' - P-element 2753 1 42.57 TGATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAA:1 + chr2L 18248035 3' - blood 50 2 77.23 ATATTAAGTAATAATTAATAATTATATAAGTAATTTCAATAAACGAATTTCTATTTCACACAAGTGGAATCTTAGAATTGTTTAACTTGCACGACATCCAC:1 - chr3R 7157887 3' - Tc3 265 1 78.22 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATGTATGTTTGTGTGTATGTGAATGTTCACTGGATCCGACAATCAATGAGCGTCGAGAGGCATAA:1 + chr2L 3978528 3' - 297 6586 2 75.25 CAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACTAATACCTTATATTCTTTCCACTAAAC:1 - chr2L 13538202 3' - roo 8819 2 73.27 CCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTTTCGTGGGCCGATCGCGATCATTAGGAAGTC:1 - chr3R 14583692 3' + R1A1-element 4930 1 74.26 CCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTACCCCTTTCACCGCAGAACGAAACCAGCGAGGATGAGGTGCCCCCCATCGACCTGCTGTGGATCTCGGGCAGCG:1 + chrX 17858088 3' - P-element 2 2 73.27 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGTGTACATTTTCACATATGAATAGTATTTAGTTTTCTCTGCGGGCCATTGACTGA:1 + chr3R 11608030 3' + 1360 3368 1 58.42 CATTAATTGTTCTTAATTTGATAGTTAGAAATTGGAACAAAAAAATGGAGGTAAGTAAAGGAGTTAAATATTTTGAATAAATGATTAAATGATTTAGACCT:1 + chr3R 30029862 3' + invader4 2668 1 47.52 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTTTCATCATAAAATCATGCACAATGG:1 + chr2L 8622819 3' + 297 6932 2 73.00 GCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATGAAACACTGGAAATAAAAGCTAAGAACAGCAAATAGAAGACAACCGGTTCTCAAGAGATTTCACGCGT:1 - chr2R 9950086 3' - 3S18 8 2 69.31 AAAGTCTAGTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGTTTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAATACGTTCACATATAA:1 - chr4 989047 3' + GATE 8427 2 57.43 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGCACGTTTAATGCCTCCACAAAAGCAGAGGGAAAAATAATA:1 + chr3L 3650104 3' - mdg1 7075 2 59.41 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCTCATTACTCATAACTGAAGGCTTTGACCGTAATTCTCAGTCGTC:1 - chr3R 27131903 3' + copia 223 1 60.40 TATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCGTTCACACAAGCTGAGTAGGCTAGAAGGTCCGACAGACAGACAGACAGTGAATTAGAACGCGCGGAGG:1 + chr2R 2109985 3' + INE-1 509 1 54.46 GAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGC:1 + chr3R 10391227 3' + invader4 275 2 76.24 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGT:1 - chr3R 30553572 3' + 412 439 2 74.26 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGTAGTTACAAAATACATTTAATACAAGTTTTAGGGAATGCAATTTT:1 + chr3R 25581103 3' + pogo 2073 1 51.49 GCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATAAAATGAAAAGAAGCCAGAAGAAGAATGAGG:1 - chr3L 13374702 3' + Transpac 269 2 75.25 ATATTCTTGATCAGGGTCAATAGCCAAGTCGATCTAGCTTTTATAGTTCCCGAGATCGAGACGTTCATACGGACAGACGGGCATGGCCAGATCGACTCGGC:1 + chr4 1008928 3' + INE-1 84 1 68.32 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAAAGGTCCTTGAAAATCCAGATTCCAAATTCAGAGAGTGCG:1 + chr3L 18418934 3' - hobo 3 1 76.24 ACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGTTGCCTTAAGCT:1 + chr3R 1844867 3' - Cr1a 109 1 76.24 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGATCAATCAGCGCTGAACAA:2 + chr3R 15924678 3' - Quasimodo 25 2 63.37 ATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGG:1 + chr3R 14860200 3' - BS 5036 1 65.35 TTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTAGCATAGTCTATCTAAATTACCTAAATACAAACTTTAATCCTTACAGACAAACCTC:1 + chr3R 20094528 3' - Max-element 8256 2 58.42 GATCTCAGGAACTATAAGAACTAGGATGTTGTGATTAAGCATACAGATTTTAAAGACATAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGCCTCAGTCTTTTGTTCTGCGA:1 - chrX 17233994 3' + INE-1 150 1 73.27 ATAAAGGGTGACTTGTTCGNGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAATCAATAAAGAGATTTAAAATTTACAAGTACTCGTGTGTGCACAGCAAACA:1 + chr3L 20317882 3' - 3S18 5791 2 53.47 ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGTGGCGCTACTTACTGCGTAATT:1 - chr3R 8980005 3' + transib2 2772 1 75.25 ACTCTGTAAGGGACATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTCAAGAATAGGGNNCATCTAGAGACTCGAATCCTAAAGACGATTTCCCAAAA:1 + chr2R 5030163 3' - Cr1a 4173 1 53.68 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACACTTTATACCATCCCACTGGCCAAACAGAACTTTTGGCCA:1 - chr2L 6276031 3' - copia 4906 2 60.40 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATAACTGATAATTGTTCCAATTTTTCAACTGTTCTATCGAGGTGGAATGTACATAAACCATTCTATGATC:1 - chr3R 11916523 3' - roo 5 2 74.26 GTAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTATGTACCAAATAAACCAAAGAGGCCAACTCCTGCGTTTGTGTTTTATTTAAATAAGAGGACTTATAGTA:1 + chrY 2346868 3' - Cr1a 4310 1 68.37 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCGGGCCGTCTGATCGCCCGTGTTCCGATTCCACGATTCTTTCTCACT:1 - chrX 15024371 3' + P-element 2857 1 49.50 GAACAATGAATCAAAACGANATACGGTCACAGCGACAATGTGAACAAGACATAGCCATGCTGTGGATTTCAACATAAACAATGCATAAATCCGAAAGATAC:1 - chr3R 14012903 3' + Doc 208 1 54.46 TTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCATCTGGCCTCCGGATTGACACATGGTGGCTGAGGTTTTTT:1 + chr2R 9109390 3' + F-element 4246 1 67.33 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACACCTTGTGACCAAACCACATGCTACAACCCATCAATTAGAAGCACACAGACTCACCTTTCTTCTCCAAT:1 - chr2R 21351292 3' + mdg1 410 2 72.28 CTTTATTCTTTTGATCTCAGCTAGAGACAAAAATCTTTCTTATACAGTTTGGCCCAATATCGCCCACCATAGGAAAAAGCATGGAAGTATTTATATACAAT:1 + chr4 971842 3' - 297 289 2 64.36 TTTTATTTATTTATTTTATTGTATCCAACAAAAAATTGAGTGAGACCGTATAATTAATCGCGGAATTCTTCGTTTCATACATTTTATAAGCCGCGTAGTAA:1 - chr3R 26168554 3' - Juan 4215 2 77.23 AATCATAAAACTCAAACATNAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATATCGATGACAACGTCGGCGGCA:1 - chr2L 17245024 3' + copia 5070 2 78.22 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTGTCTTAAACTAGTTGAAGTGCTAAATAAATAAACTACTTACTATATA:1 + chr3R 27169494 3' + 412 463 2 52.48 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAAGGTTGATACTTAAAAGATAAACATTGCTGTGCACATTGC:1 + chr2R 9631760 3' - 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roo 175 2 78.22 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATGCATACAGAACAACCATAACCACAAGAATTTCGGCCAATTT:1 + chrX 6481085 3' + jockey 4954 1 62.38 ACAGGGGGGCTTGGGAGCGGGGACACAGCATTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGTCGATCCAAGGCAACATCGTGGGTCTTAAGAGTACCAA:1 - chr2R 23244715 3' + Rt1b 4735 1 62.38 CGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCACAACGCGGCGTATACGCAACGCTAGTCACAAGCAATGGGCGACAATGCCTAAGTGGCATGTAAATG:1 + chr3R 28753626 3' + F-element 227 1 70.30 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACGAAGATACATCCA:3 - chr2R 15788548 3' - Transpac 4924 2 75.25 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCG:1 - chr3R 29608773 3' + roo 385 2 58.16 ATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCAGATTCGAGTGGTGCTCCAGCATATGGGCCTGGTGCAG:1 + chr3L 7062484 3' - R1A1-element 5239 1 55.26 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCAGAAAACGAAGTGAAAGGAT:1 - chr2L 5926930 3' + pogo 2068 1 58.42 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTACCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAAGCTCCTCTGGCTGTTTTTGG:2 - chr3R 23542973 3' + 412 7491 2 78.22 CGGACGTGAAAAAAAAGGTTTTTGAAGCCAAACCCAATAATAACGATGATCTTTGGGGTCTGGTCAAGGATCCAACTAAAACCGAAAGATTGATTAACTGT:1 - chr3L 14582746 3' + Tc1 1179 1 73.27 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATATATGTACTATGCACATACATATGTACTATCTGTGTGGG:1 + chrX 3356306 3' - hobo 37 1 68.32 AAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAAAAAAAAGGCTGCATATTTAAGAAGCAGTAAAAAAGAAAAGTTTAT:1 - chr2L 15220198 3' - invader4 25 2 54.46 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATTTTAACCCTTTTGTTTTATTGATAATATTCTGTACTGATATGAATGGAAAA:1 + chr3L 12303458 3' + blood 7367 2 52.48 GCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGAAATGTTGATAAAAATGGGCACTGCCACTTGCAGCGTGTTGCGAGATTGTAGACTCGCTTTTATTTAT:1 - chr2L 17677682 3' + Tirant 8500 2 69.31 CTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCTCGCATTTTGTTTGTTTATTCTGCCGTCCCATTGCGACTTATGTGGGCGATGACCGGCG:1 + chr3L 11859153 3' + Doc 4262 1 61.39 TCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCAACTCTAGCTACACAATAAAAAATTGTGCACATTTCTG:1 - chr3R 10087804 3' + roo 9058 1 65.35 TAAAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGCGTTGTGCCAAAAATTCAGCAGCGATGG:1 + chr2L 13480722 3' + hobo 199 1 78.22 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATATACAGGTA:1 + chr3L 15033371 3' - I-element 30 1 52.48 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCCTTACTCCCCGCACCATTCAATGTTGC:1 + chr2L 12882836 3' + hopper 1414 2 76.24 AACTTGCTATTCGTAGCTTNAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGAAAGATGTGTTGATATGAACTTATTTTCGTGTACGATAC:1 - chr3R 19987410 3' - Doc 43 1 62.38 GTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTAATTAAGAGATATTAATTCATGTGAACCAAAACCATTTAGAGTTGTTCAACTGTACTTCTTGC:1 + chrX 7036757 3' - Quasimodo 6 2 74.26 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAATCTTCATCATCAGT:1 + chr3L 3757403 3' + roo 9032 1 69.31 GAGCGTCTCTTTCGCTTTCAATATTTATATGGCACACAATAATACTAGAATTGAAAGAGTAAAGAGCGGGCAAAAAATACAAATCTATGAAGATTTGGAAG:1 - chr2L 3814773 3' - Doc2-element 105 1 76.24 AACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGTGGTACCGG:1 - chr3L 16792540 3' - Chimpo 4026 1 54.17 ACTATAAAATTTAATTTATTTTCCACTTGAGGTTCTTTTTTTCGGATACTTTTTGTATCCTACCGACTGCTTTGTGATTCCGTTATTTTACACTGAACTAT:1 - chr3L 27284307 3' - 297 467 1 69.31 TGTGTGTATTTTGCTGCTTTTTTTTAATAGTTTCCTTGACTGTGTGTATTTATCTATATATGTATACCCAGCTATATGTGCACATCCTTTCGAGGTGGATT:1 - chr3R 24085865 3' - Porto1 4437 1 60.40 TTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTAATGGGGAATATTCATATGTTTTTTGCACTCGTTTACAAAAGTTATAAATGATA:1 + chr3R 8967546 3' - 1360 3164 1 64.36 CACATCAGCCTGGGCAGCANCTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCAGGCCATCTTTTGAGTTACAATGATG:1 + chr3L 15452915 3' + accord 7331 2 73.27 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTGCTTTGAAAGCGATGTTCTTCGGTTAATTGTGAGTGACAACTCACTCACTAACTC:1 + chrX 16671139 3' + P-element 2869 1 61.00 TGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAAACATTTTATTAATAATCGAGTAATCCAGGTTTTGAGTTT:1 + chr3R 25086194 3' + Bari1 1704 1 76.24 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTTGATG:1 - chrX 17029985 3' + flea 5009 2 63.64 TGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACGTAGAAAGATAAACACCAAAGAAACCTGTTCAGCGAGAGCTATTATTACCCCAATATTTGGTGTTC:1 - chr3R 27138367 3' + copia 58 2 68.32 CACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTGTGAGCCTCGACATTGATTTATATTCGTTATTTGGGTTTATTTATTTGCGATTTTGTTTTTATCAAATAC:1 - chr3R 24085279 3' + invader3 5457 2 72.28 TGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAAGAGCTCA:1 + chr2L 19642379 3' - Quasimodo 28 2 59.41 GTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTGCTGTGTCCTCCTTTGATTGCCTACTAATCCTGGACATCGATGCTCGGGCGACAATCGA:1 + chr2L 3616847 3' - roo 8800 2 65.35 GCCAATGTATGGCCGTTACACAACTTTGTTGTTATAGTGACTTTGTTCGAAAGTGTTCTTTGGACTTCGTTTGAACTTTGGTTTCGTATCAGTTTCCTTTA:1 + chr2L 22361387 3' + 1360 3366 1 51.49 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAATGTTCACTTCATGCCCACTT:1 + chr2L 20620048 3' - roo 8717 2 81.19 CACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGAAGACATATTTACACACTACA:1 - chr2L 14342286 3' + copia 73 2 79.21 CCAAGCAAAACAAAAAATGTTAAACAACTATTTACGAAGCGAGCAGAAGTCCAAAAGCAAAAATCCAACGAAAACAAATTATTTTTAAAAGAAACTCAGAA:1 + chr3R 13425826 3' + TART-B 10338 1 67.33 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGCTTATTAGCTATAAAGCTG:1 + chr2R 16614291 3' - roo 8720 2 83.17 CGCATGGGTAACAGTGCGTNGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAGATATTACAAGGTGTGCAATAAATCCCTCCTTTAAGCTAAACTTCACAT:1 - chr2L 9045413 3' + jockey 4966 1 51.49 GTTGATGCGATAGTAACCCTATTCAATTCTTAAATCTCCTGATCAACAGCATCAGTGATCAATGCCATTACGTTCGTACTGGTTACTAAACCAAAGCTGCG:1 + chr2R 4321997 3' + rover 393 1 71.29 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTGCTGCCGCTTGGCATTAACTGCCTACGCATATTCGTAGTATGTATATGCCAG:1 - chr2L 4134816 3' - Quasimodo 23 2 57.43 TATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTTTGGTTGCATAAAAATGGCTCAATTTACTTTAAATCCGTTTGCTATTTTTGC:1 - chr2R 11032483 3' - F-element 309 1 66.67 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCGGGCCGTCTGATCGCCCGTGTTCCGATTCCACGATTC:1 - chrX 15024380 3' + P-element 2848 1 40.59 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAAATGCACTAA:1 + chr3R 20696515 3' - jockey 56 1 67.33 ATATATACATATATATATATTTAACAGAGCTTTTGTTTTTCTCCCGCGCC:1 + chr3L 10915108 3' - G3 4505 1 88.00 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTCTATGGAATATCTAGTAGTTTTGAAAGCAGCAGCCTGAGTCGCTTTCCTCAAATTCCGGATTCAA:1 + chrX 17883722 3' - pogo 7 1 74.26 CTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAAATATAATATAATATAGACTATATATAATATAATATTCTCTAGACCTACGATTTGTTATA:1 - chr2R 10983556 3' + HMS-Beagle 7028 2 63.37 ACGGGTATCTGATAGTGGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTATTGTTTTGTCTAAGTGTGGTTCTGTTGTAGTTTTTATTATGACTTGCAACTGTGCGCT:1 - chr3L 18238519 3' + INE-1 554 1 63.37 CAAAGACACTAGAATAACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGTCTCAACTGTGTCGATTTATAGTTCCCCGATATCGAAACTCGTCATAAAGTGTAAATGTATT:1 - chr2R 5783628 3' - 1360 3388 2 61.39 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCGTGAAAGATGTCTTTATAATTCTATAATTCGCAATAACCTAGCTTAAAGTGTGCCTAATTTGAAAAGTCT:1 - chr2L 3699381 3' + mdg3 5492 2 70.30 CACAGCAATCACGATATCTACTGCAACTGCACCTTTAGCAACAAAAACTACAACAACAACTGCAACAGAAGAACCAACTCTTCAAACCCTTGGTTAACACC:1 - chr3R 834360 3' + Doc3-element 493 1 67.33 TAAAATATAAAAAAATATAATGTCTTACACGTTCTCTTTTTCATAGCTCCTACTCCATCAAGAGAGCCAGATCCCCTCTTACTTTGGCCATTTAAGCA:1 - chr3R 12025718 3' + transib4 2281 1 61.22 TTCTTACACGTCCCTTCTTCATCATATTCTCAAATGTCTATACACACTGGCGTGCGCCCCGGCAAGACCCCGCTCATCCCACGCACCCAATGGCAGAGCTC:1 + chr3L 24059006 3' - invader4 2975 2 59.41 ATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTCACTTCCAATTAAACCAATATTTTTGGCTTATCCTAGGGTCGTGCT:1 + chrX 16978629 3' - Dm88 88 2 57.43 TACATACGGCTTTTTTAATAGTACCCATTTGAAATCGACTTCTTAGTCGTTGTGCCAATAACTGGAAATTATCGTAAGAATAAACAAGTTGTAAGCTCTTC:1 - chr2R 20868499 3' - Bari2 928 1 49.50 AAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGAACGATAAATAAAT:1 + chr3L 19339395 3' - Tc1 62 1 78.22 TATATATATATATACAAATATATATTTCGACACCGATCACACACACACACACTTACTGGCTGACACACACTGTAAACACATCCGTACATACATGCATATT:1 + chr3R 11477481 3' + Stalker 88 4 64.00 ATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTATCCATCAAAATGGGACTTGCCT:1 - chr3R 15924585 3' + Quasimodo 7347 2 60.40 AATCAAAGAGACCAACTCCTGCCTTTGTTCTTTTCTTATATATATGTTTACTGGTTCGTGGAACTGCAGCAACCGTCTTCATTCTATCCTTATTTAACCAA:1 - chr3L 20702277 3' + invader2 200 2 77.23 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTATTTCAGGGAAAATACAGTCACTTAACT:1 + chr3R 31190830 3' - pogo 43 1 72.28 ATCTATTCATCCTCACACANTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATTT:1 - chr2R 4260432 3' - micropia 5133 2 81.19 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAATACTCAAAATATTTGTTTTAGATAAGAACAAGATAAGGGTATGTCCAACA:1 + chr3L 6033599 3' + 412 465 2 51.49 TCGACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTGTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTG:1 + chr2R 2994303 3' - gypsy8 4772 2 46.53 AAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCCCACC:1 - chr3R 13739693 3' - Burdock 53 2 77.23 AGTCAGAACATAATACTCTGTAACGGTCATGTAACTCATAGTTAGATCTACAATGCTTTAAGGTAAGGGGGAAAATAGAGAGCTCGGAAATGCGTTCCGGG:1 + chr2L 1283956 3' - Cr1a 4187 1 69.31 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACTTTACCCAAAAACACAATTGAATAATGATAATTTCACACGTA:1 - chr2L 7666105 3' - roo 33 2 58.42 ATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGTAAGGGTCTCAAGTCCTTGGGAAAGTTGGCTTA:1 - chr2R 15925346 3' - Quasimodo 7114 2 67.33 TAAGAAAGGAAATATAAATNATAAATTACAACAGTTTCTTAGTTGATTTTTTAAAATGATATGTAACAAAGGTATTTAAATATAATAAGGAAACTAAATT:1 - chr3R 5348639 3' + copia 244 1 69.00 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCATACCTATAGCTACTGTACTCCCGAACAT:1 + chr3R 21365549 3' + P-element 2841 1 34.34 AAAGAGCAAAGACATGAGCACAAACATTTTCACTGCTAGCAATGGGAATTTTCAATTTTTCTCCTGAACTCGCACTGATTCACATCCCCAAGTTATTTAAT:1 + chr2L 847598 3' + hobo 2601 1 67.33 ATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTAATACGAACACACAAAGATAAAATGTTTTTTCCA:1 + chr4 194788 3' + Quasimodo 7337 2 66.32 AGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAGGGACTGCAGGACTACAGGACTGCAGGACTGCA:1 + chr3R 4845050 3' + invader3 266 2 65.35 TCTTTAAAGATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCCTTGTTAAATCAGCTGGCATTGGGCAAAAACCAGCGGAACGAACACAATCAGGCAAATACATAT:1 + chrX 11017078 3' - roo 11 2 64.36 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAAATAACAGCGACTAAGGCTAA:1 - chrX 12472553 3' + pogo 2049 1 80.20 TGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGTGACTTTAAACGGGCCAGACGATATCGAAATCAAATTCAGACGCTTGAATTTTTGCTCAAATCGGAATCGGTGCGGTAC:1 - chr3R 11329420 3' + Stalker 447 1 70.30 GACAACAAGGTCCGAGTCGTTACAGTGAAGACTGCTCACGGATTATACAAACGCCCAATTGCAGTCAGTGCGTGTATGCCTCGTTTTATTGTTATGAATTA:1 + chr3R 27903053 3' + 3S18 5653 1 61.39 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATG:3 - chrX 4277478 3' + roo 9024 2 74.26 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACATTCATGTGTACATAGCTACCCAATTTACCCCCAGCTCTGACTACGTATCGAAAAATGTAA:1 + chr2L 3971539 3' + 297 6964 2 46.53 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAAATCGATTTTGTTAATGAAAACGA:1 - chr2R 19061239 3' + roo 358 2 76.24 CCGAAGATATTTTCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAG:1 + chr3R 10488722 3' + roo 354 2 78.22 AAAAACTCAACGAGTAAAGNCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACTATTTTAGCCATGTTTGTGTATTTCAATTTACATTGGACTAATTGAACTCGACAA:1 + chrX 8503189 3' + roo 389 2 55.45 TTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTGAAGGAAAATGAAAATTCCATAGGAACTTAACTTGAA:1 - chrX 4794453 3' + copia 129 2 63.37 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTTTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGG:1 + chr2L 12882786 3' + hopper 1364 1 72.28 TACATGCTCAGGAGTCTGTTCCTTCCTGCAATGCCAATCGTGGTGCGTAAAGTTCGTGTAGTACAGCCAAAAGTTGTATTTGGTGCCCGGTAGGGTGCGTG:1 - chrX 11664884 3' - baggins 5276 1 66.34 TGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTTTTCAAATCAGTGAACAATGACGACAGCTCAGCACCAACACTACACCGTTGAGGTGGGGGACACCAA:1 - chr2L 10249161 3' - Doc2-element 4738 1 60.40 ATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAATGAAACCGAATCCTG:2 - chrX 7292676 3' - 3S18 5803 2 58.42 TAAGCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGACCGATGGCCGATGTTGCTGCTGGTGTCTCTGACCCCG:1 - chr3L 17542927 3' - R1A1-element 255 1 61.22 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAACCTTTTTAAAAAATGTATATAAAACATTCAACATAGACATGGAATG:1 + chr2R 22134259 3' + opus 473 2 58.42 ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCATGCTACAGCACTAGCTGTACTGCTTGCAAATCTTACATTCTCAAGCAATTCTCCAAAAATATAATGAATACGAACG:1 + chr2R 10352424 3' + blood 7330 1 75.25 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGTCCGTCTGCCGTCGGCGATATATG:1 + chr3L 699787 3' - P-element 25 1 39.47 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACACATAGAGAGCATAATAGCCGGGATGCCCGACTTTCCCCC:1 - chr3L 2176313 3' - roo 8699 2 60.40 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTT:1 + chr2R 13653397 3' - F-element 58 1 68.00 GGACGTGTTTTTAACAGAGCTCCAGTTAATATCGAAGTGTAAGTGCAAAAAAAAAGAAAAGAAAATGCATGGACGGACACTAAGTGATTCGCA:1 - chr2L 2329029 3' + Porto1 22 1 66.67 GAAGCTGTTGACCGCTTGCNATTCCGCAATTAGCTTATATTGTGGTAACCAGATCCATGAACACGCGCTTCTTCCTCAACGGACAAAATCCTCCGCCTGG:1 - chr2L 10982959 3' - Rt1c 5226 1 77.00 GGACAGACGGACATGGCTAGATTGACTTTGCTATTGATTTTTTTGCAGCTACAGAAAACTGTAGCAGATTATAGTTTCGGGCTCAGCGCTTTGACACACTA:1 - chr2L 22718016 3' - INE-1 115 1 78.22 TGAGTATGTACCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTAACGAGTTACAAAATTAACCTACAAAATCATGA:1 + chr2L 13567645 3' - hobo 495 1 65.35 TATGCTATTTTATTTAATTNTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAAGAACATTCCGGCTTTTGGCTATTCAACATTGTTTTCCATTACGGACTA:1 - chrX 9774982 3' - 412 28 2 50.50 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGAGGAAATGTGGTGAGGGGCGGGG:1 - 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I-element 25 1 72.28 TCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCTAAAGCGAAGCGGTATGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACTAAAACACGTCGACATTTGTGTAGGACGCAGG:1 + chr3L 7307712 3' + hobo 174 1 73.00 AGTTTTGGGTGGTTTTAGGACGTTAGAGTGGGTTAACAGACTTGAGCCATATTTCAGCATCGCCCTTAAGTTTGTAGAGAATCACCGACCTTGAAATTTTT:1 + chr3R 1268514 3' - INE-1 346 1 58.42 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATAATTGATATTTCAATGGAGCCGCACCGTCCATTGAATCTGCAATCT:1 + chr2R 6850510 3' - roo 28 2 60.61 TACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACAAGACGGAAACACGAGTCATAAATTAAATACCAACAGCGAAAATTACCTATCCAACGGCGACTCGAAA:1 + chr3R 22496481 3' + Tirant 441 1 71.29 CGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCACTCCCTCTCCGCTGCCTGCTGGCCTACTAAGGAACCAATGCAATCTGTAAAGAAAAATATTTAAATAATATAT:1 + chrX 17246483 3' + GATE 40 2 70.30 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGTATTGGCACAGAAAGCACAGCTCGGTCCTTTCTGTGCCCAGCAATTCGATGCCGTGTATGTAG:1 - chr3R 29608758 3' + roo 397 1 71.29 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCA:1 + chr3L 25059145 3' + mdg1 7428 2 56.44 TTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTAC:1 + chrX 11025575 3' + hopper 1386 1 57.43 AATCATAAATAAATAAATCATATTTTTTTAAAACATAAAGTCGCTGTTCGAGGTCCCCTAATAAGCGAACAAAGTTCTTGACACGCTTTGATATGCCACAT:1 + chr3R 29259509 3' + G3 345 1 67.33 GTGCCAAATCAAAGAGAATCTTAACATCCAGATCGTCTCTATGCCGAATCTGGCCAAGATCGAGAGCTTCCTGAAGGATGTCAGCTACCGGGAGACGATCG:1 - 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roo 22 2 57.00 ATGTCCATTACGTTGATTCTTATAATAGTAAAGTTCTCTTTTAATTTTAGAATTAAGATAGGCAGCATTGGCAATATCCTCTCCGTGTTTGTCTTCTTTAG:1 + chr3L 9645071 3' - G4 253 1 67.33 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAATGAGGAGAGTTGAAACTCTCTGCAGACTTGCCTTATTTGG:1 + chr2R 12252892 3' + jockey 4959 1 60.40 GAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCTATCTTTAGTTAATTTATACATGTCGGAGATGCATTCTTATT:1 + chr2L 23390399 3' + Gypsy6A_LTR 348 1 77.00 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGGTTGCTTTTGGTTCGGCCT:1 - chr2R 6850442 3' + roo 9039 1 61.22 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAAATTGATTTTAGTTATTACTACTAACCACCTTTCTTAGTTTCATAGGGTAT:1 - chr2L 3346246 3' - pogo 20 1 52.48 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATA:1 + chr3L 23456277 3' - 1360 9 2 66.34 TTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAATATGCATATGTCAATTAATCTAAAATTCACTATAAAATCGAAACTAGTCGGGTATTTTTTCAAGTGCAGGGT:1 + chrX 20886065 3' + Ivk 5375 1 63.37 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTAACATCACCCGACGACAGAACAAGAC:1 - 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chr4 219083 3' + 1360 3090 1 51.49 TTCTTGATCAGGATCAATANCCGAGTCGACGCGGCGCGACGCTTGACGCCGTGCTTGCTTGTATACTGTTAAGTTCTGTTCAATTCAGTTGAATTCTTTTT:1 + chrY 1076857 3' + INE-1 87 1 68.32 TGAATGTGTTTATATGTTTTTCTACACCCTTCTATAACTACACTCTATACTCTAACAAAGGTATATCGGACAATGAAATCAGTTGGCCTAAAACCACTAAT:2 + chr2L 8750867 3' - HB 415 1 47.52 CAGCGTCCACGCAAACATGCTGTGTTTGCCGGCTGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTACCTTGCACATGTATTATTCTTGAATTTTTTTTTT:1 - chr3R 3269644 3' - Gypsy6A_LTR 107 1 64.65 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCGGGCCGTCTGATCGCCCGTGTTCCGATTCTTATTCTTTATCTGCTCTTTCACCGGCTAGT:1 + chrX 15023044 3' + P-element 2875 1 40.21 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAAATAAAAGCGACTAAGGCTAATTTA:1 - chrX 12472549 3' + pogo 2053 1 76.24 TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTTCAATTCTATTAACCGGGTCTATTACAACAGTAGACGTCATGAGCTATGGGGCTTTAAAATAATCAATATAT:1 - chr3R 26766553 3' + mdg3 244 2 63.37 TAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGTAGAATTAGTTGAAAATGTATAAACAGATTGAAGA:1 - chr3L 5479010 3' - 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flea 4797 2 72.28 TATCAATTTATTTCGTTACACGTTACACTGCCAGGCCACCTTTCTCCAGGACGCGCGGTTCTTCGCTTCCGCCATCTGCAGTTCTTCCTGCCTCTGCCTCT:2 + chrX 21175419 3' + Gypsy12A_LTR 2254 1 89.11 ATCCGCAGTACCCGGGTAAGGCTAACTAGACCGGGCGGACGCCACTTACCCGGACTCCCCGACCAATAGCAATATTGAAAGTTAGCCGTTAGTTCATGGAC:1 + chr2R 14539761 3' - baggins 331 1 58.42 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGCAATTAGAAATGTTTCTTTCTGTGTACATATATTTTTGCA:1 + chr3R 30553615 3' - 412 7089 2 59.41 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATAC:1 - chr2R 15788568 3' - Transpac 4944 2 55.45 TTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACAATAATTCGAACATAAATGTACAAAATGGTTTAATTGTCAT:1 + chrX 734975 3' - Tabor 35 2 57.43 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTACAAGCACATAAACACAAATACATACTAATATGTGTGTTGGGCTGCTCCATTTCGGGATAAAAAGGA:1 + chr3L 14594201 3' - hobo 10 1 68.32 TGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGTTGTGGTTATTGCGTCGCCATCTCACTCTTGCCCCATCCCAACCCCTAAGGTCCCCAACATATTCCAATGC:1 - chrX 7089432 3' + 1360 435 1 76.24 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCTAAAATGTTGTGCCATAGTGGCCGCATAGTTGTTGCACCCAT:1 + chr2R 13653408 3' - F-element 46 1 56.57 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATAGGAATGCTAATTAACTACAATAAAACATTTTGATGGAGCGATAGATTTATGTATATAG:1 - chr3R 13913013 3' + mdg1 389 2 59.14 AATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATTGGGTTACGTAAGCCCATATCTTTTATGATACCAAAAACATCAT:1 - chr2L 21735006 3' - 17.6 6953 1 57.43 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTTTTGGAATGCTAATTAACTACAGTATATATATTTTCCATATGTTTGTGAGCAATATAAATCATAGTTCAA:1 + chr3L 14818785 3' + mdg1 390 2 53.47 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGTGGAGTACGCATTCTAAACGAAACAATCATAATCGAACTGATCATCAAT:1 - chr3R 3255965 3' + roo 9045 1 52.48 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGACACACAGCTGGACGAAGAACTAGAAGCAAGCGGAGGCGTG:1 + chrX 22593218 3' - 1360 34 1 61.39 AAAGAAATAAAATAAAATATTATATAGAAAGAAAAAAAAAA:1 + chr2L 11417649 3' + G7 1149 1 68.29 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTCACCTTACTAAATATCAATAAAAATAT:1 + chr3R 9278392 3' + roo 9036 1 62.38 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAATAAATCATCAGTGCCAC:1 + chrX 15546233 3' - blood 7026 2 64.00 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAGCTACAGTAAATTCCAATTTAGGCGTTCATTTAGGAGTA:1 - chr2L 14761972 3' + mdg1 377 2 66.00 ATTAACATTAATATTATTATTATATTATTTCGTAGACAAGTAATTCCATAAAATCGTTATAAGAATTGAACTTCAAAATGCCTATAATCACTGTTTTGTTT:2 - chrX 7374074 3' - mdg1 42 2 56.44 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTACCCTTTTAAAAGCCACATTGTCCCAGCTCCATCCGTAGTTTTCGTTT:2 - chr3L 10474138 3' - copia 4899 2 58.42 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCCAGGTGGCTGATTCT:1 - chrX 19034102 3' - hopper 21 1 56.44 AAATAAAGCGAAAACTAAGCCCGCAAAATTATCTAATGGTGCTGATCAAGAATATATATATATACATCATGTCCATCGTTTTACCTGTTAGATACTTTTCT:1 + chr3R 4501912 3' + Fw2 36 1 65.35 ATATATATATAAGGGATAANGCACAAATAAATTAAAAAAAATTAAATTAAATATGACTAAAAACAACTATAATGAAAAAAAATTTCAAAATTTGCAAATTA:1 + chr2R 18188374 3' + Juan 4193 1 50.50 ACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTCACCGCCGATGCACTTTGAATTAACACAG:1 - chr2R 6420471 3' - Stalker2 43 2 67.71 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTACTTTTTAGAAGCCGGCTGCTAGACTACTTATGGTAAAA:1 - 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copia 4942 2 75.25 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATTAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTGGGCAACGGCAACGGAT:1 - chr3L 3650030 3' + mdg1 403 2 56.70 ATGCACTTACTAGCATGTTAGGATTCAGTATGATTTCGAAGCCGAAACTAACAATCAATTCCAGGCATTTCCATTCGTTTAGAAAGCGTTTAAGACTTGTA:1 - chr3R 23114365 3' + hobo 401 1 61.39 AGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGAGTTTAAGTTAAAATCAGAAAAACCCAAACTAAAGAGCGGC:1 - chrX 4166383 3' - I-element 5325 1 58.42 TTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAAATCAACTTCAATCCGCAGGAGATTGACAGACGAGAGAGAGAGTTCTTCTGCTTCCGCACGCAAACTGACTGAG:1 + chr3L 2279795 3' - 1360 419 1 73.27 GGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACACTAGAATTGAGTTTAAATATACAGACAACCAGGAGCGGCGCACGGAG:1 + chr3R 28565331 3' + 412 461 2 49.50 GAAAAAAAAAAAGATAAATAAAACTACACGAAATTTATTGAAATGCCCACCAAACATCACCAATATGTCAGAGCGGATTTCAATTTCACACACTTGGCTAG:1 - chrX 14691206 3' + Doc2-element 250 3 60.40 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTC:2 + chr2L 20328767 3' + opus 475 2 64.63 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCGATTAGATATGAGTATTT:1 - chr3R 11052100 3' - blood 32 2 61.39 CAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCGGTTCCTTAAAAACATTAGGTTCGAACAATTCCCACATCAT:1 - chr3L 13776308 3' + pogo 1919 1 65.35 TAAAAATAAATAAATATTTTCCATACCTTTTCAACGAATCTAGTACACCCTTTTACTCTACAAGTAACGGGTATAATAAATAAAATTTCTCGGTCTTTAAT:1 + chr2R 5185460 3' + mariner2 832 1 73.27 CAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTATCATAATATTAGAGCTAAGATAAGAATTCATTGAAATTGGTAT:1 - chr2L 11712814 3' + Quasimodo 7339 2 58.42 TCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGTAGCTGTTTGCATGAGCATTTTTTGATTTAGTGGCAATTTCGTGTGGCAAAAATTGCCGTGTGCCCCAAGG:1 + chr2R 21797731 3' - Porto1 327 1 73.27 ATGGAAAATCTATTAAAATGACTTATATTTCACTCGTAAATTTCAACAAAGATTTTTTTTGCGTGTACGATGAATGGAGTCGAAAGAAAGGGTGCAAAAGC:1 + chrX 22694473 3' + Burdock 250 2 73.27 CGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATAAGATCGACGTACAAAGTATATATACAATATATATCCATA:1 - chrX 9745408 3' - FB 37 1 61.39 AAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATGAAAAGTGAATTAAAAAGAAGAAACCATTAATGGGAGCGAAAGTTTTTATAGTTTCCCTAAT:2 + chr3R 19450746 3' + Burdock 244 2 64.36 ATCGCTCCGCGAGGTGAACAGCAAACACTTCGGCTTGATCTTGTGTCCGGTACGGGGATCTACACACCAGCAGACGAGTCCGGTCCTGGAACATTGCCGCG:1 + chr3R 27590432 3' - BS3 89 1 65.35 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGACACTTATTCGCACTTATTATTGCTCTATGCGTTTTGCCT:1 + chr3R 10087886 3' - roo 8701 2 65.35 TTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTATTTGTAGTTTTGCTCGGCATTTTATGACCTTGAGCAAATGTTGCATTTGTATTTGCCTTTT:1 + chrX 7089300 3' + pogo 277 1 71.29 GCACACACACACATACACATATAGATATGCATGGAACTGGGTGATACGCACACTTACACTCACACAAACAAACACATAAGCATAGCTTTGTTCTGCTTTTG:1 - chrX 15403414 3' + accord 183 2 55.45 TATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATAGTCTTCTATACTATGGCAATAAAACGTATTGGGTTATGCAAAATGGATAAATTGAATTTA:1 + chrX 22689621 3' - 1731 4330 2 58.42 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGAGAATTATACTGTATAAGGACTCTCGCTGACACACGCGGCAA:1 - chr3R 14193917 3' - pogo 50 1 73.27 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTCGCAAAGCGGTGAAATCAACTTTATCA:2 - chr3R 10087841 3' + roo 9022 2 72.00 TCTACATTTGACTTTATTTTGTCTTTAACAAGGGGAAGTTCCATGTCTTTGTGGATGTCATGATTACATCTCTGCAAGGAGTTTCAATTACCAATCCATGT:1 + chr2L 10609669 3' - G3 4353 1 65.35 GGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCACTCCGGAAGCGGGAGCAATTGATGGCCCATCGGAAGGCCAAATCGAATGGGTAAATGTGG:1 - chr2R 23519204 3' - jockey 4774 1 64.36 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAGATGTATATATTTAAATAAAATGCCCCCGCTTC:1 + chr2R 21962693 3' - 297 38 2 73.27 TTGTAGTTGACTTTTTTGTTTCTTGCTCTGCGCTAAGCTTCACTAAATCCTTCTGTCGCGTTAAATCTTCTTGCACTTTAGATTCA:1 + chr3L 5095418 3' + Tc1-2 1391 1 68.60 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGG:1 - chr2R 6850460 3' + roo 9018 2 80.20 AGGAGGTATTAATTTTTGTNAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTC:1 + chr2L 18213228 3' - hopper 27 1 52.48 GCTTAAGTACTTTGTGCAAGCAATTTCTTGACAGTGTCGAATCTGTGCAAACTTGCATTTCTCGTTATTCTGCTTTCTATTTTGCACCTAGATTGTTTCTT:1 + chr2L 2917586 3' + S2 1489 1 57.43 TAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATTAAACAGGCTGTTTCGATGTTAGGT:1 + chr3R 25370525 3' + BS 5043 1 74.26 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCTACTGTGGCATGCCCCGCCCCCTTTATAATTTTTCACCGG:1 - chr3L 19861782 3' + 1360 3353 1 63.37 GTAAAATAAAATAAATAAATAAATAAATAAAATATCTTTAATTGACACGAAAAATCTTTCATGAATATGGACAGCTGTCATTCAAAAAAGACTCTTTGAAC:1 - chr3L 16075051 3' + Doc3-element 77 1 65.35 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACGCTTTTTGAAACCAATAGGTATTTTACCGATCTGCTTATTATCTTA:1 - chr3R 27169421 3' - 412 30 2 58.42 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATACAACAAGGAAGAAAAGCGAAAA:1 - chr2L 18248002 3' + blood 7339 1 76.24 TGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGATAGAGCTACACC:1 - chr2R 18723031 3' - HMS-Beagle 24 2 55.45 TATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGAGTGAATGTGTCTACGTGAATGCCA:1 - chr2L 17552879 3' - F-element 138 1 75.25 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGAGATTTTGA:1 - chr3R 12321416 3' - jockey 4710 1 67.74 TGCTAGGAAAACTGACCACAAACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCCCAATTGGTCCACCCGAAATTGTTCAAATGCCT:1 - chr3L 15557999 3' + R2-element 3514 1 67.33 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTTATTAGGTGTTCTGTTTGATTTGTTTACCGTTCACTCTTCTCTTAGTTTATAGCGTTGGCCTATCCTA:1 + chr2R 19475319 3' - 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G4 3825 1 61.39 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGA:1 + chr3L 12634219 3' - BS 5034 1 65.35 AATTGGGCGTTTGTATAATCCGTGAGCAGTCTTTACTTTAGCCACTCGGACCTTATCATCATTCCCCTTATGCACCTTTTCCACCTTTCCTAAAGGCCATC:1 - chr3R 19447985 3' - 3S18 5691 1 71.29 ATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAAACACTTCTGCCTCTGCATTTTCATATCGCTAGTTAAAATTAGTTT:1 + chr3L 9150736 3' - Burdock 6386 2 54.46 AGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTAGCATGGCCACT:1 - chrX 20885944 3' - Ivk 5350 1 75.25 ACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTTCAATTCTACTGGTTAACACTTTGGGGTTAACCAGTAGAATTGAAAAACAATGAGTCGCGAAATTGGGCGT:1 - chr3R 5504506 3' - pogo 1817 1 57.43 CCGCTCAAGATAGGCAGATNTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGAGGTATGTGTACCGTCCCAAATTAGTTTATCTTTTGATTTAAATTCCAATTAG:1 + chrX 10438938 3' + roo 8900 2 55.45 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGAGATACGGGGAATGAAACGCCGTTG:1 + chr2R 9649222 3' - roo 8670 2 58.93 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGAGCGACTATAGCACCATGCGAAGCTTCCGATTTCATCATCCTTATGAGCGGCTATAAAA:1 - 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Doc2-element 234 1 52.58 GTGCTCGCTGAATGATGTATATAACATGAATACATTTTCATTCGCCTTATTTCTGCATATAAATAACCATTTTTCTCAAAGTCTCATTTACTTGGTTAATG:1 - chr2L 13422208 3' - F-element 4310 2 79.21 CGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAGACTATTACATGGGCTAGTCATTGATGGATTAGGTGAGTAATGCCTACATATCCAATCGC:1 + chr3L 9569759 3' - jockey 4988 1 60.00 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAACTCGCTTTTTTCGTGCGCACTT:1 + chrX 4166422 3' + I-element 5305 1 75.25 CGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACGGAGAATACACGATGTGCCCCATTCGAAAGCCTCGATCTGATATTTGAAAAACTTGTTAGTTTACAATATA:1 - chr3L 18074967 3' + Tirant 31 2 74.26 ATCACAATTACGTTTTTGTNTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGG:1 - chr3L 21144068 3' - jockey 61 1 77.23 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTATTTCAGGGAAAATACAGTCACTTAACTTAGTTGACTTTAATCACAAGAAATTACTTGACATGGTGCA:1 + chr3R 31190870 3' - pogo 3 1 75.25 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATC:1 - 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chr2L 21774552 3' + Doc2-element 4592 1 47.52 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGTATCTGGCAAGTATTAAGGAGACGACAAAGG:1 + chr3L 3881039 3' - blood 45 2 70.30 AATCACGATATATACTGCAACTGCACCTTTAGCACAACAACTGCAACAACAACTGCAACAGCATCAACATCAACTATCCACTTTGGCTTTCTCACGCAAC:1 + chr4 693778 3' + Doc3-element 499 1 77.00 CTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGTAAAATATGTTTTAATTAAAAGAAAAGTTTTATGGAGTTTTTCTCGCTGGGCCCCTTTTGAGCGCTTGCTGAT:1 - chr3R 12063709 3' + 412 7545 2 77.23 ACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTTCGTGGCTGTCGAATGGTTTTGCGGCCCAGT:1 + chr2R 19560217 3' + Tirant 8464 2 67.33 AGGGCTTTAGTATAGCTTTGCATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTTTTTAGATTTTCTGCCAAGGTATTGTTCTTCAATTTGCAAGGAAAACAATATTTT:1 + chr2R 8484153 3' - G4 3405 1 56.44 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCTAACTGTGAACAACATTAAATGAGA:1 - chr3L 12112354 3' - 1360 52 1 78.22 ACGTGGTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTCATTTAAATTCCTTGCCTTCTCGTTGTCCAGCAAATTATTTTAATTGTTTACAAACGATC:1 + chr3R 14580381 3' + blood 361 2 62.38 ACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTAT:1 - 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chrX 22513853 3' - transib4 242 1 73.27 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCAGGGGCGCCACTTTGTATGGGCGTG:1 + chr3R 17053115 3' - hopper 49 1 78.22 GTGCATGCTAGGAAAACTGACTATATAAATAAAACCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTT:1 + chrX 23280916 3' + R2-element 3509 1 76.24 CCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAA:1 - chr2R 6438341 3' + Stalker4 385 1 57.00 AAATTAGTTTCTTACAAAANCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGTTAAGACTGCCACTTCGATGGAGGAAGCGAAAGTAAATGT:1 + chr2R 19840262 3' + roo 9037 1 56.44 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTGTGTCCGGCTTCC:1 - chr3L 13295218 3' - hopper 32 1 57.58 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTTTCATCATAAAATCATGCACAATGGC:1 + chr2L 8622820 3' + 297 351 2 72.28 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAATATTCAATTCAATTCA:1 - chr2L 2157854 3' - Doc 36 1 27.72 ACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGA:2 + chrX 22386761 3' - hobo 86 1 63.37 TGGTTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCAATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGCGGAGCTGTGGCTCTGGGAG:1 + chr3R 12199805 3' - jockey 64 1 75.25 CGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTTAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCTATCTGCGCTGTATGTATATCCTATTTCAGTTTGCCATGCATACTTG:1 - chr2R 10014784 3' - flea 4783 2 56.44 ATGCCAAAGAAATCGAATTNTGGACCACAGTGCACTGGCCAGTGTCTATGGGCCATCAGACATCAGACATCAGACA:1 - chrX 13439321 3' + transib2 2813 1 57.89 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGTCGATGACAACGTCGGCGGCAAGAACAACAATTAACTTTCTTCAACAGC:1 - chr2L 17244996 3' + copia 229 1 51.49 ATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCAGCTGACCCAATCGCATTCCTCCGTGCTT:1 + chr3L 20450929 3' - invader4 60 2 65.35 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCAGAA:1 - chr2L 5926946 3' + pogo 2052 1 74.26 TTTTATATATATTATTCAACTTTGTAAAGAGGAACTTTTAGTTTATATAAAAATGTTCATTAGCACAGAGTTTTCTAAATGTTTTTTCAATTATCACCTAA:1 - 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Stalker2 7298 2 75.25 ATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGGTTCCCTGTTTATTAAAGCATTTCTTACGCATCAT:1 + chrX 21253947 3' + invader3 237 2 65.35 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAATATGCCGCATCGCCAAATGATCCAAATGATCCTGCTGTCAACAAAACCT:1 - chrX 7788592 3' - 412 27 2 52.48 ATGTAATAAAGCCAATGAACTGTTTCTCTTGGCTTTGATGAAGATTGCAGAACCTTCTTTGGCGATGTTACTTAGATGAAGAACGTGGACTAGATTACGAA:1 - chr2L 20119699 3' + Dm88 42 2 72.28 TTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATAATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATAACAATAATTTGCGCAAAAAATAAAACGCTCAAAATTCGATGGGTA:1 + chrX 5035546 3' - FB 958 3 56.44 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAATTCGAACATGCTCGAATGGCATCCAATGACAACCTGTTGTCA:1 - chr2L 19854050 3' + roo 398 1 74.26 AGCGGCAATTTTAACAAACAAATTTAAGTAACAAATTGGCTGGCAAGAGAATTAATAACCTAGTTGTTTTAAGAGGAATTGGTGACAATGTAGTTAAGAGC:1 - chr3L 25556485 3' + 1360 2996 1 77.23 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAATGTGCAGGCACAAAACGTACAAATCAGGCAGCTAG:1 - chr3L 18762072 3' + pogo 2066 1 62.38 TAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAACGAGAGTACCAAGAAACGGATCGAGA:1 - chr3R 21884194 3' - mdg3 5304 2 74.26 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTAT:1 - chr2R 12473050 3' - Doc 29 1 52.48 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAATTTATATTATTTTCAACAATCAAGTGGGTGGAAAAATGCTGTTAAG:1 + chr2L 18248058 3' - blood 25 2 55.56 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATAGGAATGCTAATTAACTACAATAAAACATTTTGATGGAGCGATAGATTTATGTATATAGGGA:1 - chr3R 13913010 3' + mdg1 7422 2 59.41 TTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCATACGAAACATTTTATTAATAATCGAGTAATCCAGG:1 + chr3R 25086184 3' + Bari1 1694 1 66.34 GCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACTCGCATGCACCACAACAAAATTCGCCGGCAAATGCGGCGCGCAGTATGCAAA:1 + chr3L 18560229 3' - R2-element 3360 1 56.44 TTACTTTTCTTCTCTTTAATGAAGAAAAGAGTTTACTTATGCCAATGCCTGCAGAGCCTTGCTGTATCATCAGTTTCTGGATGGAAATGGAGACAAAACAC:1 + chr3L 12805454 3' - invader2 4741 1 75.25 CTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCGATATATATGTGCCAACATGAGTAGGAGCAATGGAATTACACAGTAGCTGTAAGGACCAATCAAATCTCTTAT:2 - chr3R 4971373 3' - F-element 14 1 74.26 CAAGCCCTCCAACGTAATCTTCCTAATTCAGTGTTCATAGGCCGACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:2 + chr3L 11720529 3' + gypsy 7352 2 56.44 TCTCTAAATTGTCGGCTATACCAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCATTTGGCTTTGGCCAGCCTAAAACTTCATATTCATAACATACACGGCCGA:1 - chrX 15426721 3' + Q-element 119 2 55.45 AGAGTTATATTGAGGGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGACAGTTGGTAGCCTCAATTTGATTCGCAAGCGCAGAA:1 + chr2L 15531886 3' - Stalker2 7256 2 71.29 TTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAG:1 + chr3L 19339421 3' - Tc1 34 1 53.47 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTGTGTCC:1 - chr3L 13295225 3' - hopper 41 1 65.35 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTATTTACCTACTATTAGCACCGATTTTTCTAAGTGCCCCAAGCTAACCCGAAATG:1 - chr3L 20584010 3' + pogo 2082 1 52.48 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTA:1 - chr3R 19449447 3' + hobo 2902 1 58.42 TTGTGAGCCGAAGCAGGTAGAGAGGGAGAGCAAGAACAGCGGTTATCGCAGGGGCATGGCCCCATGTTAAGTTCTCCTCTCGTTGGTAAATGCCACTAAAA:1 + chr3L 7299694 3' - Doc 397 1 68.32 AAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGTTTGCCACAGGACTCGTTCTGTGCGTGCCACG:1 + chr3R 13739773 3' + Burdock 254 2 78.22 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTCTGCGCCAAAAAGAAGCATTTGCAAGGGAAATTCTTAG:1 - chr2R 8682338 3' - pogo 33 1 62.38 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAAATATATTTTTAAATATTAAAATCAAAAAATTTGGAAC:1 + chr3L 20584078 3' - pogo 35 1 68.32 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCATAATTGATTGAGACTTTAAACATTTAACGAAGTTTGCTCAGTACATAATAT:1 - chr2R 6848412 3' + mdg1 7379 2 57.43 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACTGGAACTGGTACGAGACTCGCACAACGACTTGCTGGATATTTTCAATTAATAGTACGCGTTCT:1 - chr2L 5029876 3' - I-element 49 1 72.28 AATGTTGAGATTCAGCATACAGATTATAGATAGACATAGATTATACATCCTCTCAAGTGCCACGCAGACAATTCGACTAAAACAGTCTCACCCACACGTT:1 + chr2R 4408380 3' + INE-1 174 1 57.00 TTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACT:1 - 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gtwin 7349 2 69.31 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCATATAGCCAAGTGGTCGGTCCGGGCTCAAC:1 + chr2L 5419866 3' + 297 354 2 73.27 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATAAACGACCATAAACACAATTGC:1 + chr3R 6033998 3' + roo 405 1 57.41 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGCTGGCGGAGGGTTATCC:1 - chr3L 6023306 3' + hopper 1357 1 80.20 TGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAAAT:1 + chrX 3431981 3' + G7 1145 1 77.23 AAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACCACACTGCCAAACAAAGGAATCGAGCAGGAGTCCAGAGCAGC:1 + chrX 1488185 3' + I-element 4910 1 58.00 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTTGATGTGGAACAAGC:1 - chrX 17029975 3' + flea 5006 2 65.35 ATAATTAAATTAATAATAACCAAAAATGGGGACACCTGTAGAGGCGATTCTGGGGGTCCCTTGTCCACGAATATATTGTTTCCTTCCAATAAAAGTTATGA:1 + chr2R 17454494 3' + flea 233 2 81.19 CTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATGCAATTGCTATGGGGCTTGGCCCAGTCGGGCTCCCGATGTCCGGCGTTCTGTGTCCACTGGC:1 - chr2L 6780721 3' - X-element 4412 1 69.31 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGGTTCTTGGCGAGGCCAAATTTATGTGTGTTTAAGCAACGAAGACCGTT:1 + chr3L 13785454 3' + pogo 2074 1 58.42 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCGGATTGCAATTAGTGCGGATCAAAAAGTTAGTCAATTTC:1 + chr3R 6143785 3' - Doc 43 1 63.37 TAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGATAGAGCTACACCTGCATTG:1 - chr2R 18723024 3' - HMS-Beagle 6 2 70.00 TTCAGCCTTACTCCATGTTACATATACATATATTATCAATCGGACTTATTTGTTGGATGATTTACCATGTACATATATAATACTCGATCACACAGACTTCC:1 + chrX 20419229 3' - flea 4757 1 78.22 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAGTGGCAGCCACGG:1 + chr3R 10488750 3' + roo 392 2 59.78 ATACTTTATATATTTGTTTAAATCGGATTTAATCGGAGCGAAAAAAAAAACACGACCGCCCGCTTTTCCGTCCACTTTTCCGTACCACCACCCACTTGTAG:1 + chr3L 20747387 3' - Cr1a 168 1 43.56 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTGAATTTAGGGCGTTTCCTGAGCTCATTAAA:1 - chr3L 7300506 3' - Doc 38 1 69.32 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTACTGCAAAAAATATTGTGCAACTTGTTTAAAAAGAACTTCTAATGAAGAGATATA:2 + chr3L 10474219 3' + copia 234 1 57.43 GGAACTATAAAAGCTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTATAGATAGACATAGATAGTATACGAAGGGGACGGGGGGACACTTTGCCATTATTGATAT:1 - chrX 3035535 3' + INE-1 157 1 61.39 GCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTTAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCTATCTGCGCTGTATGTATATCCTATTTCAGTTTGCCATGCATACTTGCAAT:1 - chr2R 10014780 3' - flea 4779 2 60.40 GCGCAGAACGCCGTGGATATCGCAATGATAACGATTTCACAGCTTCAATGTTCTGAGGTGATCTTATGGCCAGAGGCACGCCCACGTCTTCTTAAGGGCCC:1 + chr3R 13950022 3' - mariner2 389 1 68.32 CAGCCGAAGGACCTTATCATAAGGTCCCCCTTGACGAGAGCCGGGATATGATGATGATCATAAATCCGTTTTTATTAAATGTTAAATTTGTCAATCAACTA:1 - chr2R 5614753 3' + BS3 1571 1 61.39 GAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTAGGGATTGGAGCACAAATTCCATTCA:1 + chr3R 25086149 3' + Bari1 1659 1 73.27 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGCCATGGGAACTGGGGAGCTATCCCCGCATTCTCG:1 - chr2L 13566488 3' - hobo 44 1 65.35 CACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCAAGATCCGCAGCTGTGTAACCTATAATACTGGTTGCGTTGAGGGTGTTGTCGTTAAACCAGTGG:1 - chr3R 25400295 3' - accord 329 2 66.34 GGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGTATATAGAACAAGCTGTTTTTGTTGCATTAACATGTATATCAAATCCGAAAGCATT:1 + chr3R 15053497 3' - G6 1883 1 65.35 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAGAAAGATGTCCTGTCATTATGCGAATTATGAGTGGGATAAAAGGCATTAAA:1 - chr3R 12329578 3' + hopper 1407 2 69.00 GGTGATATGATTGATCTACAAAGGTGCTTGAATTCAAACCCATTTTTTCAACAGCCGGTGGCTTCCTAGTCGTGTATCCAGGCACCGCCCAATCCGCAGGA:1 - chr3L 7040023 3' - Q-element 182 2 72.28 GAATTTATTCAGTGTTTAATTTATTTCGGAGTTGATCCTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGTGTAT:1 + chrX 8403649 3' + McClintock 6298 2 81.19 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTAGATGTATTTGATTCTGGCCTAAAATCCCAATGGCCAGC:1 + chr2L 19678179 3' - flea 4788 2 63.37 CGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTTCTGTCAGCGGCAGCAATTGTGCCTCTTATGCC:1 + chr2R 6918636 3' - accord 39 2 68.00 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAACGGTAACGATGCGGAATTGGGACAGCCTCTTCTACGTGGAAAGCGCGGGT:1 - chr2R 5374140 3' + 1360 3365 1 53.47 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGC:1 - chr2L 17730435 3' + pogo 2074 1 53.00 CTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAGGGATAACTCCTTCGATATATTCCAAT:1 + chr3L 12634257 3' - BS 4996 1 76.24 TGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAGCATATAAGCCGTATCTATAAACAAAGCGAAAACCTTTGCCAAATAAATGTTGTGGAAATTTTCCAGTGG:1 + chr3L 16563310 3' - 3S18 9 2 71.29 ATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGGTCACTGGCACACTTTCACCAGTAAGCATAGACTCATCTAGAA:1 - chr4 137982 3' - Porto1 4237 1 56.18 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACAAATACCATGAATTTGCATTGCACACTTGCATCTTTTGGCGTC:1 + chr3R 3256039 3' - roo 32 2 60.40 GTCGATCAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTATGTATATCTTAGTGATGTATTTATTTGCGGAGTAGTAGAAAATGGAATTACAAAAAGGTTTATCAATA:1 + chr3L 11362334 3' - mdg3 5377 2 72.28 TTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTAGTGGCTAATGAATGTCTGCATAATTGGAAATA:1 - chrX 3261583 3' + roo 8698 2 67.33 GTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATTTTATAAGGTTCAGAG:2 + chrX 21587726 3' - INE-1 123 1 60.40 CTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTCGCGCAAGCACTTCGCCTTTTGTCCTGCGAATTGGCTCACTCGCCAGTTTGAAGTTTTACTA:1 + chr3L 21323971 3' + I-element 251 1 64.36 TGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAACGGTAACGATGCGGAATTGGGACAGCCTCTTCTACGTGGAAAGCGCGGGTTGTGAGACAT:1 - chr2R 5374130 3' + 1360 3375 1 63.37 TCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCATTCGAAAAAAAGGCAGAAAACTAGAAAACTAAACAGAGCACAACAAAATAG:1 + chr2R 9010107 3' + F-element 468 1 54.46 TGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGCCTCGTCCTTATTGGCTCGTCCTGGCTTATATGCATATGAGCCAAATGCAAATTTATCCAGCCGTATACGTT:1 - chr2R 9634137 3' - F-element 278 1 77.00 GGCATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTAGTCGAATTATTGGTTTTTCCTGAAGTGTACAGTTCCGTATAAAATACGGA:1 + chr3R 5506858 3' + pogo 2079 1 57.43 GTGCACTGAATTTAAGTGTNTACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCAGCTAAAATCACTCAATCAGCT:1 - chr3R 27116741 3' - P-element 52 1 25.74 CTAAAGTTTGTAGTGAACGAACGGGGCTCCAAGCAATTTACAAATTATTTTCGTCCACTACAAACTTTAGACGATGATAATTACTGTTTGCCTACAAAAAG:1 - chr2R 11202248 3' - Juan 251 1 66.34 GAAGAGATGAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACTCGTAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAATTAAAGTGCCATCATTCCCACACTCGCTCCATAAACT:1 + chr2L 7174218 3' + invader1 293 2 60.40 TATTTTATTTATTTAAAAAGTTCTAAGCTATCAAATTATGACTTAAGTAATGATTAAGATATATGTAAATATACTGACTATTCATTTATATAAAAACATAA:1 - chr2R 23618449 3' - G7 1141 1 60.40 TTATGTATGTGTGTGTGTANGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTAATTAAGAGATATTAATTCATGTGAACCAAAACC:1 + chrX 7036728 3' - Quasimodo 39 2 65.35 CTAATGGGAGTTCATCATTACACTACCAATAATAAGAAGGAAGACCTCTGGACTGTCTGGAACCTCATAATTTTTACACTGCAGAAAACTGCCGAAGAATT:1 - chrX 21669992 3' + 412 493 2 77.23 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGTTTCAATACTTTCACCTTA:1 + chr3R 9278372 3' + roo 352 2 82.18 GGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGACTTGGCCGATGACTTGGCACTGATAATGGCT:1 - chr3L 10110943 3' + roo 44 2 73.27 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTAAAACAAATAAAAAAATTGTTCTTACTGG:1 - chr3L 16546790 3' + pogo 2057 1 80.20 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGTGCCGGAG:1 + chr2L 18213243 3' + hopper 1408 2 70.83 AGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGACAAGCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCAAATTTCCAGAATGCCATGTACAGCTGGATCC:1 + chr2R 14080819 3' + pogo 1800 1 71.29 CTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGATAGAGCTAC:1 - chr2R 18723034 3' - HMS-Beagle 6823 2 55.45 CACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCTTCTTCTCTGGCGAATCTTTCGTACTCCTCTTGATCTCTTTTATCGAGTTCCCCGCTCACATCTGCTTCT:1 - chr3R 5629891 3' + Quasimodo 214 2 71.29 TAGTCGGCTTAACTTCTCTGTTCCAAGTAGATTTGAATGTAAAAAGAAGAAAACGAATGTAAGCAATTTTATCATACTTAAAATAAGTAAGTAACCATTTC:1 - chr2R 19699744 3' + Cr1a 4090 1 71.29 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCAATTTGTTGTT:1 - chrX 15546147 3' + blood 346 2 55.45 ACCAACCAGGACTTTGGCAGTCTAAGATTCGGAGCAATCCGATCAATCCGTTGAACGGAAGGAGTGGCATCGTATCTCTTCTAGAAAACTGAGATGTGG:1 - chr2L 22201059 3' + baggins 5030 1 72.73 TTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGCGGAGCTGTGGCTCTGGGAGAAAGGCAAACAGAAGTGATGTAAAAATATGCGTTGCATACTTTGCAGCGCCAATG:1 + chr3R 12199858 3' - jockey 7 1 77.00 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGTGTTACCACTGTATTTGCTTTACTG:1 + chrX 19308212 3' - P-element 49 1 30.69 ACTCGCAGCGTCCACGCAAACATGCTGTGTTTGCCGGCTGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTACCTTGCACATGTATTATTCTTGAATTTTTTT:1 - chr3R 3269647 3' - Gypsy6A_LTR 112 1 60.40 TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAG:1 - chr2L 18213151 3' + hopper 1386 1 52.48 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAACATACTATACAAAATTATATGGATAATG:2 + chr3L 3209227 3' + roo 9025 2 71.29 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTCAAGCGGAACGAAGCGGTATCGAGAGGGCGATATCACAAAATTGCCA:1 + chr3L 6658235 3' + hopper 1399 1 54.95 ACTAGAATAACAAGATGCGNAACGGCCATACATTGGTTAAAAAAGCCCCTAAACAATCGCACCTAGAGGCCAAGTAGGTATATAGTACATACACAGTATAG:1 + chr2R 11247965 3' + 1360 8 2 66.34 TTTTTTTATTTTTTTAAATTTAGAATTCCATATTATATGAATAGTACTTTTTAAGTAGTTGATGCAGGTTTGTTTTTATAACAACCCATCAAGGATCAGT:1 - chr3L 18038301 3' - TART-C 11096 3 71.00 CATCAGGGTTCTCGGCACTCACCCCACAAATATGCATACGAGTAACAGTAATTTGCAGCTCCGCTGGCTATTCATCAGAAGCTGCAGCTGAATT:1 - chr3R 24972466 3' - opus 7479 2 81.91 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGCGGCTCGGTATTTGTAACTGTCTTGAAATAAT:1 - chr2L 20330317 3' + opus 7486 2 45.00 CAAAAAAAAATAAAATAAAATCAAAAAAAAAAACAAAGCTCTGGTCCACGTTCTACGTGATTTATTTGCTGGCTCAATTGAATTGTTTTGGAGTGTACCCA:1 - chr3L 12558778 3' - transib1 1899 1 48.51 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACTTATACCACAATTTTATCGAGTAAGCCGCAAAACTAGTAAACAGT:1 + chrX 5475463 3' - 412 7082 2 55.45 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGCGCATCAATAAAAAGATCGCTCCGCTGGGCATTCAAATTGTTTGTTTGAT:1 - chr2L 16358166 3' - hobo 28 1 49.50 TGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATTTTTCGCCATGCGGGCAGCTTGAAGAGCTCTCGACCTTATCAAACCACTCG:1 - chr3R 23739355 3' - Quasimodo 60 2 67.33 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTGTTATCAATCCACAATCCATGTAACACCAATACTCC:2 + chr3L 7345415 3' - pogo 35 1 61.39 ATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGAC:1 - chrX 15263450 3' + invader3 5431 2 75.64 AAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACATAAAATAATTAAGCCAACTT:1 + chrX 15593447 3' + F-element 4392 1 79.21 GTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGCATATTGAAAAGCCTTCGAAACACGATATTAGCGTGAATAA:1 + chr2L 14220212 3' - springer 7174 2 63.37 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGAAAGATAAAAAAAAAACATGCAAATGTCAGCGGGGGAATTGGTGTTTT:1 - chr3R 23338266 3' - roo 8693 2 61.39 ATCGATAGAAATATAGAAGACTAATACAAAAATCAAAAAATATCAAATCATTTTTCAAAAGTGTTCGGTGGCACATCGGTGGCGCTCGTCGCAGAAAAGGC:1 + chr2L 20426237 3' - INE-1 300 1 63.37 GTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTGACGGCCCAGCGAATGGCATACGGCCGAGCTGCGATGGCATGCTAT:1 + chr3L 10595330 3' - 3S18 317 2 56.44 ACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTCAGCAGCTGGTGCGATTGTGAGTGCGGGTTCTTCCGCTTCATTGCGCTTCGGCGTGCT:1 + chr2L 22809200 3' - X-element 34 1 69.31 ATTTATTAGAGTTATTTTACATTATTTCATTTTCGATAATATTGAGAACCTTATTGTCCCCTGTGTCCTCCACAGTGGTTAATATTTTGGAACTGTTGGAA:1 - chr3R 19445721 3' + Cr1a 4312 1 75.25 GCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTTAATTTTAGTGACAAAAATCTTTTTTATA:1 + chr3L 27334668 3' - 297 332 2 77.23 ATATTATTATTGATAGTAATATTTTGAAATATAAATAAACAGTAGCAGCTCATAAATTTTTGTTATGCACACGTTATATGTAGTGTGCATGCTAAGGTTAC:1 + chr3L 387510 3' + Tc3 283 1 49.50 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATACAGTACAATATCACTGGTTGCT:1 - chr3R 25021694 3' + roo 9033 1 73.63 TCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTCATG:1 - chrX 7247060 3' + accord 7220 2 53.03 TATTATTATTATTGTTATTNTTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTAT:1 - chr3L 25059071 3' - mdg1 28 2 53.47 TGATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCTTTACCGGGCTAACAATTGGTTCTTAACAACTATTCTACCAGATCCTGAAGGAAAAATGA:1 + chrX 20340807 3' + Ivk 128 1 57.43 TTCTGAAGCATAGCTCCGTTTATTTTATAGTTAGACTTGTATCAGTTGTAAAACTCGAGTGATTCTTAACGGTTACTTTAAAATACAATACAACAAACAAA:1 - chrX 7997670 3' - gypsy11 4379 2 66.34 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGTGTGAGTGGGGCGGGCGCCAAGGAGACCAAAGGCAAAACGGTAT:1 + chr2R 18751121 3' - hobo 79 1 63.37 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATAAGAAATATTTTATCGTAACTAACAAGCTATCTTCTTAGATCA:1 + chr3R 17482076 3' + copia 257 1 59.41 AGCTGTTTGTTCAAGCAAAATTGCCGCAAAACTTCTACTCAACTTTGTGATTCTGTTAAAAAGCGGCGTGGCAAAGTGGAGTGGACTGGG:1 + chr3L 1085115 3' + transib3 178 1 66.67 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTAAAAAATATTTTGGCAAACGAATTTTTAAAAATAC:1 - 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pogo 42 1 71.29 CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAATGAAACCGAATCCTGCCTATGGCATTTGCGCTGATACAAAAGA:1 - chrX 7292648 3' - 3S18 5774 2 70.00 TTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAATGAGGAGAGTTGAAACTCTCTGCAGACTTGCCTTATTTGGCTG:1 + chr2R 12252895 3' + jockey 4962 1 57.43 TTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAGATAAATAAAATTACAAGGTGACAGCAGCAGCATGGAGGACGG:1 + chr2L 12349450 3' + mdg1 7012 2 59.18 CATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGATATTTTCCCGTACCACACCCGCTAAATAATGCACTTGGGAAATTAATTTCC:1 - chr2L 18219889 3' - Doc2-element 4512 1 59.41 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTCTTGTATGAAGGTCGAGAAGGTCTCAGGAACTATAATAGCTAG:1 + chrX 14317594 3' - 297 6598 2 58.70 TTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAATTACTGCGTTATGGTTAATGGTATTTTATAGG:1 + chrX 18326226 3' - Doc 230 1 67.33 ATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCGGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATAT:1 + chr2L 22224563 3' + Rt1c 5400 1 55.45 TCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCCGTCAGTGTTCGCAAGTCCATGTTGTACTTTTTCCGAACGTTTGTTTTTCCTGCGCCTCATAAATGC:1 + chr3L 13096658 3' - 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chr2R 12812248 3' - jockey 22 1 64.36 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCGTGGGCACTACCTCCTTTGGGCATTA:1 + chr3R 22238720 3' + hobo 2887 1 78.22 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAATTCGAACATGCTCGAATGGCATCCAATGACAACC:1 - chr2L 19854058 3' + roo 9054 2 67.00 TAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAGGTGCTGGGTGTGTGTGTGTGTGGCTGCAACGTAAGTAGTAACTGCTGTACTCGTGTAAC:1 + chr2R 8179878 3' - mdg1 138 2 63.64 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAACCCAGCGCGGTACCGTTAGTTCACG:1 - chr4 249255 3' + 1360 3340 1 75.25 AAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTACCTTGATATTTCAGTTCTAAATGCACGAATTTGGTTAATCCTTGAAGTTATAT:1 + chr3R 7726769 3' - roo 8936 2 54.46 ACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGAAAATGCCAGGACTACAAATACGGCTTCGCTGGGGCGGCA:1 - chr2R 6918576 3' + accord 7350 2 60.40 TTTTGTTTTATTTTTTTTATTTTGGTCTTTTTTTGTTATTTTTTTCTCTCTCCCAGAAAACATGCGAAATGCGCATTAGTCGCTAGGTGGTAGTTAGGATC:1 + chr2L 5408954 3' - F-element 4687 3 76.24 TACTAGTGTACATCTCAGCTTGCTTGCCCTT:1 + chr3R 19450201 3' + roo 8625 1 87.10 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGTCCTCCATGTCCTCGGCGCTGTAAGAGTTCCATTTTTATGC:1 + chr2L 12808227 3' - Tirant 8144 2 59.41 ACTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATCGCAACCCGATC:1 + chr3L 24761244 3' - 1360 77 1 59.41 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCC:1 - chr2R 15788598 3' - Transpac 4974 2 75.25 TTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTGGATTGGTTGGGGGGGCGGTAGAAACCTGGTCATAAAGCACGCCCTGTTGCT:1 + chr2L 6276107 3' + copia 232 1 55.45 ACGTACATTTTGTATTTGCTGAAGGCTGGACATATTGATTTGGTATTTTTTGGGTACTTCTTCTGTATTCTTTATCCTGTCAAATCATTATACCCGTTACT:1 + chr2L 23034175 3' + invader5 33 2 69.31 CTATGCACAGCGCCAATTGGTTAAGTTTGTTGTTTTTTTTTTCTTTTAATTCTATGTGTGACACAGGTTACACTTTTTTTATAGTGTGTTCAGTAAATAT:1 - chr3L 26697310 3' - gypsy7 5038 1 61.00 CAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACACAATAACACGCAGCAGCCACACGCAGTTGGCTGAATAAACAAAACGACATCAGACACC:1 + chr3L 15760282 3' + 1360 3181 1 66.34 TACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATATATATATAAGCACGCATTTGCCTAAGTCAAATAAA:1 + chr2R 21433206 3' + HMS-Beagle2 7156 2 72.28 TATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGGATCCAATTGCGACTGTGGCATTTATAGTGTGCTTAACTTGGAGCTAAAAGTCTATAAAAA:1 - 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P-element 15 1 63.92 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGAGATTGAATTTGAATATCGAAATGATTCTGTACATCGG:1 + chr2L 20367359 3' - Doc 42 1 60.40 GGACCTGGTGGACTCCAAGCCAAGTATTTTTTCATTGTCCAGATGGGACAAGCAGTTTCACAACCCGATTTCGGTAGCCGAACCACGAAAAAAGAAAACAA:1 - chr3L 22823729 3' + Tc1 1282 1 65.35 TACCACGTGGCTGCTTTGCGCGCAAAATTTGATTCCAACTTGGCAACATGATACGAATGCACCCCGAACTCTAAAATGGGGGATGACAAATGCCATCGGTG:1 + chr3R 13957475 3' - hopper 1232 1 68.32 TATATTGGTATATATATATTTATATATTGATTGACAAGCAATTGTTTCTCCATACATTCTCCATACCATCCATTTCTTTTACCCCCCTAAATTTCAT:1 - chr3L 5622495 3' - Stalker4 7044 4 67.01 TAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATGGCATTTGATTATCAAGTGTTTTGAGATACTCCTGGGTCGGGAAAGTGATGTGAAAATGATTGAAAT:1 + chr2L 15898839 3' - F-element 23 1 70.30 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTCATTAGCTTAAGTGTGAAAAATTGGCCTAAAAAATGTGCGTACAAGAAATCGAAGAGCTTCATTCG:1 + chr3R 8582635 3' + roo 400 1 70.30 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATGCTTAGGAATATTTTGCCTGAAT:1 - chr3L 7345363 3' + pogo 2052 1 75.25 AACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATCCTCTTCTCTTCTGCTGTCAATTTGGCACTCCTCCACTTAACAATGCAAAGTGGGGAAGCTCGTAAAATGTCGG:1 + chrX 7996704 3' - 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X-element 11 1 59.41 AAAGAATTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGTAAAACCAAGGCAAAGTCGAAGTTGTAAATCACTTTGT:1 - chr3L 20659077 3' + I-element 293 1 62.38 GAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGTTTCGTGTGCCTTATCGATCTACAGGAGGACTTCCGCCACTATGTCAAGCGCTCTTTCCTG:1 + chr3L 4866024 3' - accord 7120 2 56.44 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTGTGTCCGAATAGTGTGGAGCGGTGCCCGATGGCCGAAGGGTAATAAAAATAATAATTA:3 - chr3R 6033932 3' - roo 16 2 63.37 AAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACAAAAAAATGTAAAGCAGTCCGTAGCCTGTGCC:1 - chr2L 11730640 3' + 1360 3272 1 75.25 GTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCCACCAGAACATTCGCGGAATCATTGCTA:1 + chr2L 9231298 3' - X-element 59 1 73.27 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCATAAATAAGTGCATTAACGCCATTTGAATTCTGCAGAAAAAATATTAAGCAGCTTATTCGGATTTTGATTTCTTA:1 + chr2L 18655233 3' - Doc 13 1 67.33 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTCTCTATTGTTGTACCCGATACCTATTACCCATTAAAGGGGTAT:1 + chr2R 5720533 3' - pogo 44 1 51.49 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTTAGTTAAAGAATTGGTTTTTAGCCCATTAGCAGCAGTT:1 - chr3R 17971652 3' + 412 457 2 60.40 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATTTGTGAGAAGCCAAAGGGGGGGAATGCCACATTTTTTGACACTTGGCCAA:1 - chr3L 10408486 3' - roo 39 2 61.39 ACGCAATTGGACCAAAGAAAGAGAACAAAATGTGAGAAAGATTTTTTAAACCTATTCAGTTGAGCGGCATGAGACCGTCCTTCGAGGTACGCGGAGCGGCT:1 + chr3L 22544036 3' - Tc3 56 1 68.32 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGTCGTATCTGTATCTCAGATGTTGGCTGACTG:1 - chr3R 16241191 3' + Tirant 353 2 71.29 ACTTCCCCAATGCCGCAACCAACAACAAATTAAAAACAAACCCACCAAATCACCGCCAAAATAAAACCACACCCACTCTCATTTCCGTTTTGTTAA:1 - chr2L 6573842 3' + Doc4-element 184 1 71.88 AACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATTAAAAACCGTTCAAATGGTGAATATCATTGTGAACG:1 + chr2R 5772524 3' + HMS-Beagle 7012 2 62.00 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAGTAATGGATAAGCCGCATTCGAAGCAATTAATTATCAGTGTTTT:1 + chr3L 3242734 3' - diver 5921 2 55.45 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGGCGGGGG:1 - chrX 11025503 3' - hopper 30 1 51.52 CACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGGCTGGTCTGAAAAATGAGGGAGTTGATCAAGTGCTTGAAGAATGGATAGGAGCCCACGGC:1 - chr3R 10046220 3' - 1360 163 1 68.32 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTGTCTTAAACTAGTTGAAGTGCTAAATA:1 + chr3R 27169474 3' + 412 443 2 72.28 TGCACGCTGAAAAATTTAGATTTTGTGTGGGCGCATGCAAAAAACCACACCAAACAGCTGAGCAGCAGATCACCGGGAACAATAAACATGGGAAAGTAGGC:1 - chr2L 8867275 3' - Cr1a 327 1 57.43 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGCTGAAAATATTCCATGTCTATGTTTTTATAGACCCCAACACATTGTCCTTCTAACGTTT:2 + chr3R 13913090 3' - mdg1 16 2 55.45 TTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAAATCGGATTAGCAATATAATAGATATTTCAGTGATATTTCGTTTAAAGTTTGGGTTGAAGTTCCAT:1 - chrX 11018335 3' + copia 4990 2 72.28 AAACATACCTTGACCTTTATGTTCCATTTTATTTGTAGATATTTGGATACGTGGTGTATTTTTATAAAACAGCCTAACAGCCAGTGATTTTCAATGATGAT:1 - chr3R 7621503 3' - transib3 276 1 63.37 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAATATTTCGAGTGAGAAATGGTGGGGGATTGTGAAGAGGATTTGTTGGCTGAGATCAAACTTCG:1 - chr3L 3596656 3' + copia 242 1 63.37 TACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTACCGAACCAAAATATATACACGTACGACTCGTG:1 + chr3R 21299025 3' + P-element 2629 1 48.15 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACATTTAAGTGCAGCACTTGAAAAAGTACTTAATTAATGCCATAAATCCGCCGA:1 + chrX 9454891 3' - roo 23 2 57.43 AAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGCACTCCGTATTCGTTTTCGATTCCTATTTTTATTTCGTTAAAACATTTATTTGATTTGCGTAATTTAATTTGCA:1 - chr3L 5429301 3' + 1360 383 1 77.23 ATTGGCGCCCAACTAGCGGGCATACCCACCCGCCCACATCATACAGAACATGTAAGTGGGCTCGCTGGCTGGTTAAAATATGAACTCCACCTTTCACTTGC:1 + chr2L 9083939 3' + gypsy6 405 1 66.34 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACTTTACCCAAAAACACAATTGAATAATGATAATTTCACACGTACTTTTCGGGGCGAATA:1 - chr2L 7666089 3' - roo 17 2 62.38 GAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATCTATAAAGTGTCCAGAGTTGTCAAGCGTCAGTGAGATCTCGGGTTTGTTGCACGA:1 + chr3R 10391256 3' + invader4 309 2 58.33 CCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAAAA:1 + chr2R 4659351 3' - S-element 1459 1 48.51 GCCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGATAAAAGAAAATTAGGCTGTATATTATCAGGACACTAGCGATTCGAGTCGCGATTCTCTGCCTATCC:1 + chrX 21585881 3' + mariner2 857 1 87.23 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCTAAATCGCACAATCAAAAATAGTTGTTTTCACAAGCGGAGAATATG:1 + chr3L 5710319 3' - Transpac 4944 2 55.45 TCTTAATATTGCATTTGCACATACTACAATACACATACAACAAACACAAAAATCATAAAAAAAAATTTGTTTTTGAAAATAAAACGTATAAATA:1 + chr3R 12063829 3' - 412 7 2 69.15 GGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAAATATTTTAGAATATTAGAAAATTCTATAGAGATAACCATGTTCTGTAGGTATATCTATCTGCTATCGGTACT:1 - chr3R 18237611 3' + Juan 4206 1 65.35 TTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCAGCCGGACAAACTCTACAACATCAACAGAATCCGAGCGTTTAAAGATGTTCCCTT:1 - chr2L 8449327 3' + Idefix 7042 2 60.40 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGCACACGAACTCTTAGTTTACGAACACGAA:1 + chr3L 6964786 3' - P-element 48 1 31.68 AAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGCCGGCTTCCCCTCAAAAAGGAAGCGAGCCAAGCTGGAA:1 + chr3L 13569820 3' + invader3 260 2 61.39 TACATTTCAACATCGCTCTATCTCGCTTGATACATGCTGGTCCGAACTCACCACCACATACACACGCATCATATCAAGTACGCGGATATGCGAACGGTAGT:1 - chr3L 13533713 3' - invader6 4739 2 58.42 GTAACGACTCGGACCTTGTTGTCAGATTCCGTCCGGAGGTCACAAAAGTTTCATCTCCAGTTGTGGACAGGCGGAGCAGTGCTCGGAAT:1 - chr3L 16560907 3' - 3S18 5654 1 75.28 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCA:1 - chr3R 21365513 3' - P-element 46 1 33.66 ATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATACATCTGTCTACTTCTAGACTCCGAAACCCAAAATTTTGTAGT:1 - chrY 424994 3' + McClintock 6399 2 60.40 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAACTGGATTATTTATATGAAAAAATCTATTTACCCAACATAAGAATAGTTCCGAAG:1 - chr3L 20758924 3' + flea 4997 2 63.37 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATTTACTCCTTTTTTTTTCATCAGACATAGACTGCTACTTCAAAGGCCAAATGGACTTTGGTG:1 - chr2L 13186226 3' - pogo 6 1 72.45 CAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAAGTCTAACACACCAGAAAGAAGTACGGTGCAATCAATACAAGA:1 - chr2R 4727552 3' + Bica 457 1 59.41 AATCGTGCATGCCATCCAAGGACTTTAGATGGTATCTTTAGAGGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAAAAATAAAAAAACACACACACACAGAACATG:1 - chr2L 4352076 3' + Rt1a 5010 1 76.24 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTAAACAAAAATTTGCGTACAGTCAAGTAAACAATTAACAAT:1 - chrX 15800896 3' + roo 9039 1 62.00 TTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCAATTATTCGATATGTGGTAGAATTTTCTTGTTGTAT:1 + chrX 5178441 3' + P-element 2769 1 42.57 AGATTTGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATTACGTAATATATCTAGTCAATGACTAGATCTCAATATACTAGTTCTCAATATTAATATTGT:1 + chr2L 15863377 3' - Stalker 6849 2 75.25 ACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCAACTGGTTTGGGGGTTAGTTGGAATCGGGTAGGGTGCGGTTGGGTGTGGGGATCTTGGCG:1 + chr2L 13575699 3' - G6 1951 1 65.00 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGGGGTAGACACGTTTCCCATTTAAGTTGATGCAATTTCTCAATTGG:1 - chr3L 18418838 3' + hobo 2908 1 53.47 TGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGCTGAATATTTGATACCACTCCCGACAATTCCGCCTCCGATCCTATCAGT:1 + chr3R 3702591 3' - Doc 4300 1 57.43 TTTACTGATGTCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACGATTATTACAGCATATTTCATTCACTGCTCGCTGG:1 + chrX 15255394 3' + Tabor 431 2 76.24 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTACTTTTTAGAAGCCGGCTGCTAGACTACTTATGGTAAAATTGCATTAGAAACATCATTGATGGGATG:1 - chr2L 2833835 3' + roo 401 1 70.30 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGCAGATTGTCTTGGAAACAAAGTTCAA:1 - chrX 11017008 3' + roo 356 2 75.25 ACCATATATAGTATATATATTCTTGATCAGTTTCAAGCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTAGACTATGGCATTCTCTCTTGTTT:1 - chr2R 3143645 3' + INE-1 58 1 59.41 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTAAGTTTATATATTTAAAGTATATATATTTTTGATGGAATATATATTTTGGACGATTTGGCCAAGCCGATACC:1 - chr3R 7764917 3' - 297 1 2 77.23 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAACAGAATGCTTCTGACAACAATTTGCGGTGTT:1 + chr3R 12333771 3' - P-element 42 1 37.62 CTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATAGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATAAAATGATTATGACGATTAT:1 - chr3R 20332897 3' - jockey 4728 1 77.23 GATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATATATATGGAGTACGTGTATGGCTTGTAATCGGATTATTCGG:1 + chr3R 25750232 3' + micropia 427 2 59.60 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTCAGGGTATTTTGCGATTCTTTACAGTT:1 - chrX 17883637 3' + pogo 2057 1 70.30 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAAATTGATTTTAGTTATTACTACTAACCACCTTTCTTAGTTTCATAG:1 - chr2L 3346251 3' - pogo 25 1 56.44 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGT:1 + chr2L 18213208 3' - hopper 47 1 72.28 TTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATCTACAGCCCGTTTCACATTGTTTGGCTCGGCAGACGCTTAATTGGG:1 - chrX 11032184 3' + invader3 5432 2 54.46 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACATAATGAACTGCATATACTTAGGTAACAAACGAATTTTCCTATAATTTTAAATTACGGTTTTAATGTCTAT:2 - chr3R 19949275 3' + mdg1 412 2 61.39 CAAAAGACGGGCTACTTTATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTCAGTTTTAAGAACTCATCTGAACGCACCTCGGTAGTCAACGCCGTTGTTCAGCTTTAC:1 - chr2R 20977215 3' + gypsy4 6740 2 67.33 TATTAATAAACAAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAGAATTGCAAA:1 - chrX 5770149 3' + Rt1a 5074 5 91.07 CAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATAATAATAATAAGTGCTGGAGCAATTTTCTAAACAGCAGCCGCTGGCAGTTTGTAACGCTGCTTAGCT:1 - chr2R 13915238 3' + mdg1 7074 2 68.32 ATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTAGC:2 - chrX 20885953 3' - Ivk 5359 1 66.34 CTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTCAATTTGATGAAACTAGTAGTCACTGCATAGAATT:1 + chr3R 31021997 3' + Ivk 5337 1 67.33 TATTAATATTATTATTATTNTTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATGAGAAAATGCAAAGGGAGAACTACTACAAACTACATTTGG:1 + chrX 13126271 3' - mdg1 7075 2 61.39 TAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATATATATGGAGTACGTGTATGGCTTGTAATCGG:1 + chr3R 25750223 3' + micropia 417 2 68.00 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGGAAGTTAACAAATTATCATGTTCCATGGGGC:1 - chrX 4277474 3' + roo 9028 1 70.30 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGAGGCATTTCGAGGCGATCGCGAGATTTTCGAACCGAAGTCGCGGCAGCGAGTGCCAAATTTAAACG:1 - chr3R 18399161 3' + P-element 2878 2 70.30 GGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACTGCACAGCTCTGTGCATCCTTAATTAAGCGCAGAGCGGGAT:1 + chr2L 2535447 3' - blood 7322 1 59.41 GAAAAATGATATAAAAACAAATAAACCACCTCGGATGTAAGAGGCAGATACAGTATCTCCTCCGCCAGCCTAGACACTAGCACCAGCGAAGCAGAAACTA:1 - chr2L 16347719 3' + Tc3 1575 1 78.00 ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTATCATAATATTAGAGCTAAGATAAGAATTCATTGAAATTGGTATATGGTTATATAGCTCTTCTT:1 - chr2L 11712794 3' + Quasimodo 7359 2 71.29 GCAGAGTAAGTAATAAGAATGTATTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGATGAGCATACGTTCATATGTTAGTCTTCGTAATCTGCTTATGAATCTTACTATC:1 + chr3L 23083413 3' - Gypsy6A_LTR 233 1 52.48 ATTTGGGTGGGATTGTTTGAGCTAATCGCATGTGTGTGAGGTATTCGCATTAATTGATTGGTATGCATAGACACAACTCTTACAGTAATGGAATGGATAAA:1 - chr3R 2554934 3' - I-element 4892 1 62.38 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCTTTTATGCCAGATTTAAAAACTAAGGGCTTACTTTAATATAAAAGCTAGCATCTCGCTTAAAGCGCTG:1 - chr3L 11755658 3' + roo 402 1 60.00 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAACTGGATTATTTATATGAAAAAATCTATTTACCCAACATAAGA:1 - chr3L 20758936 3' + flea 226 2 57.43 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTCTGATGGAAAATCTTAATAATGTGTGAAGGG:1 + chr3L 9928592 3' - roo 8707 2 74.26 TGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTGCGTTCAAGCTAGTTCAAAACTAACACCTTTACCCCGATAAACCACAGAGGCCAAGAAAGAGGAGGAGAAGCCACAG:1 - chr2R 22856492 3' - Tc3 240 1 64.36 ACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAACAAATTATAAGTGCAAAGCTAATTATAGAACTCAGAATATTTTGAGCAATTGTGCGCTGAGGA:1 - chrX 14519665 3' + gypsy4 306 1 51.49 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGATCTTGTTCTTGTTCTGGTGCTGGACTGCGTAGACCGTTATCTTCTTACAT:1 - chr3L 25883749 3' - Doc 31 1 51.49 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATA:1 - chr2R 15788562 3' - Transpac 4938 2 61.39 CAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTCATGGAACAGCAAATTTAACTCAAAT:1 - chrX 7292690 3' - 3S18 51 2 72.00 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAA:1 - chr3L 3540134 3' + mdg3 5467 2 54.46 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGTCAGCAGACAAAATTCTGCTTCGGTTGCCACAGGATCCCGCTTTCCCCTTACTCCCCGCACC:1 + chr2L 12882824 3' + hopper 1402 1 64.36 GTGTTTAGAAAGGAAAAATTTTTTTTGAAATTGATTTTTCTTATTAATTATTAGCTTAACTTAATATGCCATTATTTAATTTCATTTTTGTTTAAAATCAT:1 + chr3L 17059018 3' - Stalker 6768 2 54.46 CGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATACATCTGTCTACTTCTAGACTCCGAAACCCAAAATTTT:1 - chrY 424999 3' + McClintock 442 2 65.35 AATACAAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCCATCTGGACATACGGCTGTGAACCGGCCGAATTCGAGAGATCTTTCGCAAACGAGGCAATCGAT:1 - chr2R 15823463 3' + Doc2-element 4322 1 59.41 AATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACCTACATACGTACATATAACAACTTATGAATCTCAATCTGA:1 + chrX 9205568 3' - diver 5927 2 62.38 TGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTCAGG:1 - chr2L 23372502 3' - gtwin 6917 2 78.22 CTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGGTTGCTTTTGGTTCGGCCTGGTTGATTTTGGAC:1 - chr2R 6850428 3' + roo 394 1 61.70 GTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGTATGTTTTTAATATGTGCGCCATGTATTGACGGGGTAAATAAATTGAAGAATTTAACGACGTAAACAAAAAT:1 + chr4 211315 3' + INE-1 145 1 74.26 TTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCAGATTTTGATGCGCCGGCACTTA:1 - chrX 1401424 3' + P-element 2645 1 27.72 CCTGCGAAACACCGGTGTAATCGTGTTGGCGGATTGCCCTACCCTACCTATGACCACTTTCCTTCCGTTCTTGCTACGACTTCAGTGCACAGTTTAATTG:1 - chr3R 16399736 3' - Gypsy12A_LTR 1986 1 64.00 AGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGCCGGCTTCCCCTCAAAAAG:1 + chr3L 13569801 3' + invader3 5427 2 58.42 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCA:1 + chr3R 7626425 3' - hobo 45 1 78.02 AAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATTAGAGGAAGAAGATCTACAGGAGATTTCATTAT:1 - chr2R 15651554 3' + jockey 4585 1 67.33 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTTGATGGGATG:1 + chr3R 20905485 3' + pogo 2087 1 65.35 AATCCGAATCAGAATCTGAATCTAAATCTCAAGTGGGAGCTCTTTTCGTGCGACCGTTGCGCTGCAGCCCCCCGTAAAGAGCCAGTCCATCGAACTCCTCG:1 + chr3R 24142583 3' - transib2 2532 1 71.29 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGTATCTGCTGTACTTTCAACCCAA:1 - chr2R 9649192 3' + roo 356 2 78.00 CTCGCAGCGTCCACGCAAACATGCTGTGTTTGCCGGCTGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTACCTTGCACATGTATTATTCTTGAATTTTTTTT:1 - chr3R 3269646 3' - Gypsy6A_LTR 111 1 61.39 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCGGAACAC:1 + chr3R 14193962 3' + pogo 2063 1 67.35 ATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTATGTACATATGTATATTCAAAAAAAAATTTAAACTACTGGATGCACCATTATATTTTTTTTTA:1 + chrX 23035824 3' + HMS-Beagle2 7186 2 75.00 TTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGCTGAAGATGCAGCTGACCTTGTGCCGAATCTGTGCGCCGAGTCCAA:1 + chrX 13145921 3' + opus 7409 2 54.46 GACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTCTTAAGCTCATCCCATGCACTTTTTTGCATTTTTAAAGCCCATATAG:1 + chr3L 13185020 3' + roo 269 2 53.47 CAAAAAAAAACAAAAAAAAACAAAACGCACAGGCGGATGGATGATGAGCGCGTCAAGTGGTTGCGTTCTGTGTGTTTTTACTGTGGCTTTTGTGGCATTTG:1 - chr3L 3781873 3' + R2-element 3585 7 55.45 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACATGAATGTGGGCGGGGCACGTCTCACTGATTAATTGCAGTTTGGTTTTAAGAATTGTTACTGGTTAG:3 + chr2L 17677804 3' - Tirant 8115 2 73.27 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCACTTTACCAACAACGAGTTTATAATTGTTTGATTTGTGTGCGCGCATAGTGTGCATGTGGTTGTCCCGCTCT:1 - chr3L 12468182 3' - jockey 4677 1 74.26 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATGTTAATTGGGTTAGTTATTGA:1 - chr2L 21086049 3' + roo 354 2 80.20 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCTCTCAGATACGTCGCTCTTGAAAATTCGAACATACTCGAATGGCATCCAATGACAACCTGT:1 - chr2L 19854055 3' + roo 394 1 68.00 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAACAGGGTGGAGAAATATTCTTAAGAATTACCAAAAACTATAA:1 + chr3R 4575497 3' - 1360 31 1 59.79 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGGCCCATAAAATGAAGACAGGTGATCTCGGTGATCGGTG:1 - chr3L 3650046 3' + mdg1 7421 2 61.39 TAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACA:1 + chr2L 23373495 3' + Tc1-2 1575 1 72.28 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACACA:1 + chr3L 20354074 3' - 412 7086 2 56.44 TCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATACGATCCATCCACACAGTACAGTACAGTACAGTGCAGTACGGGGCCCGCCCGTCCCCGAACTTGTTCGTCAAATC:1 - chrX 2462001 3' - FB 2 1 75.25 AAATTTCAGCAGTCGCCGCAGCACCCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTTCACTAACAAATGTCTACAAAGTACACTTAAAAACCCTTGATA:1 - chr3R 20094456 3' + Max-element 261 2 56.44 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAACAATTGAAATGTCATGCAATAAATCTACCCCACACATACGCACCATGGGATGCAAACACGC:1 - chrX 22593131 3' + 1360 3376 1 64.36 GTGTGGATCAGGACCAGGTNGTTTGGGTCCGCAAAGAAAGCCGAAGAGAGTCGCCAAACGACCAGCTGATCGGTCGGTTAACTGCAGCTCAGTCTTCGTCG:1 + chr3L 14427525 3' - Chouto 411 1 76.24 ATACAATAAAAGCAAAATTAAAGTAAAATTAAATTGCAAATGAAAAAGAAGGTGGTATTCTTAGAGAGTTGGGTACTTCTTAAAACTTGTACACAAAGCT:1 - chr3L 7031457 3' + HeT-A 324 1 52.00 TTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTCATTTCAGTTTACTCTTTCATTCATTTTCATTACATTTCAAAAAGTGCTGGGAGAGCGCATTTTCTCAAG:1 - chrX 15025760 3' - P-element 417 1 76.24 AAATGTGTGGGCGTGAAAGTTTTAGGGGGTTTGTGGGCGTGGCCAAAATGTTTTATGTTTGTACGAGGGGGGGGGAAGGAAGTGTGG:1 + chrX 10456539 3' - INE-1 246 1 64.37 CATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGAATAGAGTTTCTGGCTTTGTCGCGTATATTCGTGAATTTATGGCTCCCTCGTCTTAATGAGAG:1 + chr3R 13353287 3' - 1360 15 1 62.38 ATAACAATCTTATTCTTAACTGTTGGGTACATCCGGAAATGGCTGTCAGTTGCATAGCATCTGTGTGTCTGTATTAGTAGGTTAGTCGTCGTCCTTCACGT:1 - chr2L 4139534 3' - Idefix 112 2 69.31 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCACATAGTGCACCGTCTCATTGTCAATGTCGCCTTAAATTATGCCACAAAAAAT:1 + chr3L 6023347 3' - hopper 15 1 55.56 TTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCATGGTGGAAACAGCCATTAACGCACACACATGCAAAAGAAAAGCGCTCACAC:1 + chr2L 4787857 3' - 412 456 2 59.41 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGGCATTTTTTATTTACATATATATAATATAATATATGCAAAATAGCAACAAGTCTGGTTGTAC:1 - chr2R 16614227 3' + roo 396 1 60.40 CACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGTCATTTTCATAAACATTACGAGATAAGCCCGACGCCCGCTCACTTCTCCCTCTTTGTCCCCTCCTTC:1 - chr3R 21612849 3' + S-element 1706 1 69.31 ATAATAATAATTATAATTAATAATAATTACCCCCACCATCTGCAGTAATTGTCCGGGACATGGTGCAAATGCCGCCGCCGCCCTCGAACGCCCCCACATCG:2 + chr3R 31612013 3' + gypsy9 293 2 77.23 CGCTAAAGAGGATAACACAGTAAGAGAAAAAAGCTTTTGGGTACCGCGACAAAAAGAGGCAGACACAGTGCATTGACTTTATTACA:1 - chr2L 20120407 3' - Dm88 4467 2 90.70 AGTTTTAAATTTTTCTTAAAATTCATCAAAAGCTTCGATTTGCACCAGGCACCATTGCAACCGTTTAATAATTGCTAATGCCTTGCCGTAATTTTCATGGC:1 + chr2L 6229123 3' + Penelope 334 1 66.34 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGTTTTCTAACACGG:1 - chr3R 21365481 3' + P-element 2873 1 65.35 ACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTACTTAATGCCGTTTTTTGTGTGCCACTCATGTTTTGTCGCTTAATTTTAATGGCTT:1 + chr3L 5479078 3' + 3S18 6096 2 62.92 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAGTCTAAGTTTAAAAAGAAAAAAAAATTAATAAAAGTAAATATAATAACGATAGTTCCACTCCAGAGCAT:1 - chr2R 4466227 3' - roo 6 2 73.00 AATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTCACCGCCGATGCACTTTGAATTAACACAGCGTCTCC:1 - chr2R 6420464 3' - Stalker2 7289 2 62.38 ATAGCGGAGCTCTAGTGGTCCCGGGGTCAAGAGGGGCTGGCAGCCTTGTCCATTGCCTGTCACGTCTGGGATTTGCTAAGGCTGAGAAAAAGAGGCGTTAA:1 - chr3L 6270927 3' + mariner2 60 1 65.35 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTC:1 - chr3L 9928552 3' + roo 358 2 75.25 CAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGACAATGAATTTCGTTTAAAGTAC:1 - chr2R 9699826 3' - Transpac 52 2 78.22 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGACCGCATCCATTACTCAAATTTTATTAAACATCC:1 + chr2L 126538 3' - Doc 46 1 70.30 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTACTTTGTCTAAATAGGGGTTGCTAATAGGTAACTGAAGCTCTTTTTAATTAGAAGATGTTCTCAGACCTAAAT:1 - chrX 9454785 3' + roo 405 1 75.25 TGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAGATTATATAAAAATCTGGAATAAGAGAATTTTGAAGAGATGTTGTTTACTCGACAGTCACCATAGAATCACCGGCT:1 + chr3L 15788524 3' + opus 496 2 66.34 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCACACACACATTTAAATCCG:1 + chr3L 3540228 3' - mdg3 5260 1 71.29 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAGTGTATTTTATTTCAGACTTTCCACAA:1 + chr3L 19647306 3' - pogo 45 1 79.21 CCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGGAGCCAGCGTACCCGGGATGGCGAACTAAACGCAGCCGAGGAGCAAAAGGAATCTAGTAAAATAGTAAACTTTTT:1 - chr3L 22510920 3' - G2 187 1 76.24 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCACAGCGGGCCCGAAGATAAGCCGTTGAAGCTTAAATTTATGCTAATT:1 - chr2R 23780007 3' - mdg1 7067 2 52.48 TTTTGGCCGCAGGTGTACCGGCTTTAAACCTAGCAACAATACCAGCCCAGACCTTAATATCATTGAAAACGTTTGGGCTTTTATTAAAAACTAACGAACT:1 + chr3R 19134950 3' - Bari1 439 1 57.00 ACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGGTAGTGGGTAGTGCGCGTAC:1 + chr3L 22349305 3' + BS 5061 1 56.44 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGCGGCAACTGGAAAACTGGCAACTTCATTATTATT:1 + chr3L 8252245 3' + copia 246 1 65.35 CACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTGACCTTTAACTCCCAGTTTAAATGAACTCGTCCTTCTTTTTACATTTATCAC:1 + chrX 16321426 3' + Tirant 407 1 56.44 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTGTAAAAAAGGCAAGCAAATGTGACATTTGTGTAGCCTACTCTT:1 - chr3R 27056387 3' + jockey 4954 1 64.36 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCCGAATCCATGAATATGCTCTATTTAATGGAAAGGTAAC:1 - chr2L 20560339 3' - F-element 48 1 60.40 AGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGTTCATCTCAGCCCACACACTTCG:1 - chr3L 10505201 3' + G2 2608 1 77.23 AAAAGAGCAAGACGAGCGCCGACTCTCTTTGCAGTGGAACAATGCATACTTCACCGTCGATTTGACTCCGTTTTCCGTTTCGCATTGGCAAGTGCAATCGA:1 - chr2R 20721363 3' + Doc3-element 253 1 60.40 CAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTCTAAGCCAAAGGTGCAAGCGCGAGAGTACAAGATAGTGTGATTGCGAGGGGGGATATTTTA:1 + chr2R 4748910 3' - 1360 256 1 68.32 TCTGCATCCAAATTAGCTGAGTTATACAAAATATCACGTAAAACTGTGTACAATTAGGTAAAAAAAAAGGACATTGGGTGGAAATTGTGGGGCTATTGTGC:1 - chrX 3638007 3' + Bari2 324 1 76.24 CGGTGCAACAGCACCCACTTCAAGAGCTGCTAATAGCTGGCAACTTTTGAGTTGAGATTGCGATTGCGTGAATGCTTTCAGACTTTCAGACTTCCCGACGT:1 + chr3R 31320500 3' + mariner2 469 1 78.22 TACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGACTTGGAACAGGACTGAAAGGAGCCGCCGTTGATGTGCGCAGTG:1 + chr3R 16361358 3' - Quasimodo 453 2 56.00 TGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTAAGTCAATTTCGCATCATGACACTGGAA:1 + chr3R 22869435 3' - Bari1 48 1 73.27 TCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCTCAATCATCTCCATTTTAACCTCTTGTT:1 - chr2L 8439466 3' + R2-element 3507 1 72.28 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTATATTTAAAAAAAAATAATTGAA:1 - chrX 5045278 3' + roo 9018 2 83.00 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATCTGGGGATCTCCAGGCTTGTTTGCACTTTGG:1 - chr2R 8311309 3' - opus 42 4 70.30 AAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGCCACAAATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCACACT:1 - chrX 23291022 3' + R1A1-element 5140 1 64.36 TAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACTCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGGAAAGGGAAAGGCACGAGTTCACATC:1 - chr2R 25203245 3' - 1360 3256 1 70.79 TCGGCATGTGGCTGGCTAGNTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAGGTCAGGTCGGGCCAGTCGAACAAAGATTTAAACAAATTTAATAACAC:1 - chr3R 31635116 3' - Tirant 156 2 56.00 GGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCCATAGTTTGTTTCATTCTGCTATTCCATACCACCGGATTCGAGCACGGCCATATTGT:1 - chr2R 22475903 3' - Ivk 5024 1 62.38 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTACACCATATACACTATATACACACACAAACGCACTGAGAATATATATGTAATATTGTTATT:1 - chrX 5219680 3' - hobo 15 1 62.38 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAGCCATTGCATGTTGTTAATAATTTTA:1 - chr3L 12438030 3' + I-element 5308 1 70.30 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGCTATTATTGGTTGAAATTGGGTTATTGTCTAATGGCAG:1 - chr3R 8582550 3' - roo 8703 2 66.34 AAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCCAGTTTTAGCCCACTGTTACTGTCGTTATCGTTGGCTTGGTCGGAATA:1 - chrX 21229272 3' - transib2 25 1 52.48 TCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATACAACAAGGAAGAAAAGCGAAAATTTCTTATTTCCATTTCTGTGGCTTATTTCGCTTTAGCCC:1 - chr2L 18247962 3' + blood 7379 2 68.32 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCATACTCGTTTCAAAGTACCTGCGTATCCATTTATTTAAAATGACAAACCTTTGCGATTCTTCATTGCCTACTTTTT:1 + chr2L 7937315 3' + jockey 4984 1 55.45 CCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCACACAGTCGCTGACACGGACACAAACACACGCACGCAAAGGGCACGCATCCAGGATATTCAAAATGCAG:1 + chr3R 8381227 3' + GATE 46 2 69.31 TAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCAATGAACCGAACGGTGTGATCACCAAATACAGTCTTTACAC:1 - chr3L 7166178 3' + Doc 4440 1 57.89 TTTAATTGTTCTTAATATTNCATAGGCACATACTACATTGGAGCTCTCGACTGCAATTGCAACTCTCATGCTATCCTGCTTTCCGACGGGTCCTTGCCAGC:1 + chr3R 23543035 3' - 412 16 2 63.37 AGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGA:1 + chr3L 3540184 3' - mdg3 5284 2 65.43 TAATAATAATAATTGTGAAATTCACTACCAGCATCATTTTTGAAAATTCCAAATTGAAAGTCGGTCCAAGCTGGCTTGTTTACAGTGTTTCAATTCTACTT:1 - chr2R 7704954 3' + P-element 2502 1 72.28 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGCGGCAGGCAAAATTGAGCAAAGATGCCAGAACGT:1 - chr2L 10792026 3' - 412 41 2 65.35 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTGTAAAAAAGGCAAGCAAATGTGACATTTGTGTA:1 - chr3R 27056397 3' + jockey 4944 1 74.26 AACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGATATTAAGCAGACCGATCCTAGAGCAAGTTTGTTGATCTATGTTGCCACGCCCACTCTAACG:1 + chr4 71480 3' + INE-1 142 1 77.23 AAGCAAGTACTCGACTTGCNACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTTTAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGTCTGTCATATAATTATGATTATTTGC:1 + chr3L 10786870 3' + R1A1-element 5161 1 69.31 GAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCACTCT:1 + chr2L 22245933 3' + INE-1 148 1 49.49 ATTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCACACCATTTCATTCACTCGTGCGCATTCAAATTGGTAGTATG:1 - chr2L 15088729 3' - 17.6 7190 2 58.42 ATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGGGA:1 + chr3R 433126 3' + 1731 4585 1 63.37 TCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGCGACTGCCTCGAAAATTGAATTCTAATGGAGTTGTCGCCAGTCCCGTT:1 + chrX 14651152 3' - P-element 28 1 51.49 AGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAAAGTTATAAATGTAAACTTTTATTTTCTTTTTACAACTTTAGGTATAAAT:1 - chr3R 30075585 3' + jockey 4629 1 51.49 CTCTAACACACCATTTATGACAACCCGATCGAACCTCACTCAGCTAAGGGCCAGGCTGTTCTCCGTTTTGTTCGAGATTCTTAGATGATGCGGACCCGGTT:1 + chr3R 24629460 3' - invader4 144 2 58.42 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACTATGCAAAAACGACCACCACTAGAAATTGTAATCTTTCACTA:1 + chr2L 21086095 3' - roo 33 2 60.40 ATCTCTTCGCAGGTTGAAGTGGTACTTATCAGGACCACTAGTCGAGTTGCTTTATTGTAAATTTCTATAGCTATCATTAAAAATGAATTAAAAAGTTATTA:1 - chr3R 2137422 3' - I-element 6 1 73.27 ATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGCAACAAGGCGGCACATGGGTGGCTCATCATTGCTGATTGTCGGTGCTCAGAGGCGACTTTTGACCC:1 - chr2L 259869 3' - F-element 4432 1 69.31 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGGCTTAATATCGAAAATCCATTTACACCGCGCGTCATACTTTTAAGCATATGCTTAA:1 + chr2L 19854151 3' - roo 8685 2 59.41 GGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTAATCTGATGGGTAAGTAGCTTAAGTATAGCTAAAGTAAAGTATAAAGGATTGGCTACTGGAGCGTTGT:1 + chr2L 20928779 3' + INE-1 572 1 72.28 TTCCCCGACTAACAGATACCCGTTGCTCAGCTAGTGTGAAAACAGGATGAGGGGCATCGATCCAGCAGCAGCTGACAACACATGTTCCATTGATTTGTGAG:1 - chr3R 17984479 3' - INE-1 555 1 69.31 TAACAATAATATTTATAATAATAAATAGTAATTTGCGCTTTAAGCAATTGATCTTAAACTTTTTTGTTAGGAATCCCATTTTTTACTGATCGAGATTCTTC:1 + chr2L 7588332 3' + mdg1 7080 2 70.30 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATATAGATCCTTGTTTCCTGGGGATATTCTCCTTAATAT:1 + chr3L 4009485 3' - mdg3 5288 2 64.29 CCACCAGAAATCATTCAAATGTAAGCTTGCGAATTTGATATAAAGATAAAGATGAAGAACGAAAACTTTAACAATAAATGTCATAACATCGCTCACAAAAC:1 + chr2R 5240878 3' - hopper 287 1 67.33 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGTCTTATTAGAAACATTAATAATTCATTCACATTCATTGTCATAAGGTCTTTTTAGTTTACTTTGTCTTTA:1 - chr3L 3757315 3' - roo 5 2 74.26 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTCAGGGTATTTTGCGATTCTTTACAGTTGGC:1 - chrX 17883634 3' + pogo 2060 1 67.33 TATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAAAAGGTATATTCGTTGCCAAGTATGTAACAGGTATTTAGTGACGTATTTTTGCGCCACCCACACTGGCCAATT:1 - chr2L 21715736 3' + 1360 3373 1 72.28 CATCGCACTGCTATTTTATTGAACACNNTTGTATTGTATNTATCAACTTTCGATTGGTGTATCAATCGTNACGGTCTTACAGGCCNAGCCGATTTTTATTA:1 - chr2L 21705242 3' + HB 1422 1 93.07 CCCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATA:1 + chr2R 12185379 3' - accord 55 2 79.21 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATAC:1 - chr3R 29487012 3' - pogo 27 1 60.40 TTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTAACTACTCCCCCTTCAAGATTACGGCCGTCCTCGGCTGGTCCTAATTTTTAATTGTATTTGCCTGACGTGTTATAA:1 + chr3L 5259585 3' - Gypsy6A_LTR 8 1 71.29 ACCCGTTCAGGAAGAGCTCCCGATTTTCGAGATCCCCCACCCCGGAATTCGCTGGAAACCCCAATGCCGATCCCCTCGTGCTTCCAGCAATTTTAAGCGCA:1 + chrX 8206799 3' + Rt1b 423 1 65.35 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTTGCCTTGGCTGTCCAGGAAATCCACACACGTCAGCCCCCAGATCCGCAGATACCAGATACGAAGAT:1 - chr2R 15788555 3' - Transpac 4931 2 68.32 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTAATGTCCCCACATTAACAGAAATTTCGACTTGGCTCTGCGGTTCTAATGA:1 + chrX 13147014 3' - roo 8665 2 78.22 AACCACGGTTTTCGGGCTTCCATTCATATTTAATGACATTGGATACCATTTTGGCAATAATTGGGAAGACAGCACTGTAGAAAAAAGGGGGCAATATGATC:1 + chr2R 6991319 3' - HB 489 1 55.45 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGTGCGGCCTTACCTCATGAAAATGTCCTGTGTCCGGCTTCCTGTATGCCGTCCCCTGTCGACG:1 - chr3L 13295196 3' + hopper 1403 2 67.33 AGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCAATCAATAAAGAGATTTAAAATTTACAAGTACTCGTG:1 + chr3L 20317867 3' - 3S18 5806 2 62.38 TGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTTAAAGATTTATATAACTTGTCTGC:1 - chrX 2679191 3' - accord 7085 2 76.24 CAGAGCAGAGGCTCTGAGCTCCAAAACCAAATCTATTACATCTACTACATCTATATCTATTCCATTTTTAAAACTATTACAGTCCATAAAAATCTGAAGAG:1 + chrX 21237576 3' + Stalker4 7315 4 76.24 CAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCTAAGCCGGTTACGAAATCAACTCTTATATTACTCATATAATTTTG:1 + chr3R 23820760 3' - roo 155 2 55.45 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATCTTAAATCCACAACACACGCCTCTAATGTCCCCACATTAACA:1 + chrX 13146982 3' - roo 8697 2 58.42 CGGAAGGCCCTATCAACCTNCCACATAACTAGGTAATTAAGTAAATTTGGGATAATGTAGCCAGAAATCTTCTTAAGAAAAATATGTAAATACACATGTAA:1 + chr3L 19249771 3' + Transpac 5220 2 66.34 TCATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACTTGAAAATTTATATGGATAATCGATAGGACGGATCGAGCCAATATTTGGTAAT:1 - chr2R 13037249 3' + copia 232 1 46.53 TTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAATTTGGCTACCATATTTCTTGGTAATCCCCAGACGCAAATCTACTTTGCACATTCCTCTAATTAAATCCAAG:1 - chr3L 3345101 3' - FB 5 1 70.00 GATGACAATAGGTCTGCATNTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTCGATTCATTTTAAATTGTAGCA:1 + chr3R 15790150 3' - flea 4703 1 42.57 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGAAAATGGCCACTGAAATGGAAATTCAATTTGAAAATGCTGCAGACACG:1 - chr3R 9088554 3' + hopper 1390 1 54.46 CAGGAGAAAATAATGTTAATTCTTAAGCTAAGAAAGCGCTGGAAAAGAATACAGCGGAAATTTATTTAAAGGTAAATAGAACCGACAAAACGCGAAACAAG:1 - chr2R 24508735 3' + HB 375 1 68.32 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGCAGCCAAAAGTTTTTAGTTCCGTGGCAACCACGTGCGTCTTTTGTTTCCTTTTTTTCTTCTCTTGCGATT:1 + chr2L 16683797 3' + P-element 2881 2 71.29 ATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCGCTATTTCGTAAATGCAGTTCTCAAAA:1 - chr3L 6091876 3' + Cr1a 4287 1 74.26 TCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACAGTGACGCGTTGAATAAATACAAAATCATTAAAGCATTCAGCA:1 - chr3L 1586719 3' - Tirant 8138 2 57.43 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACTATTTTAGCCATGTTTGTGTATTT:1 + chrX 8503158 3' + roo 357 2 80.20 CAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACTAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACATAAACCAAATGGAATGGCAACAAGCTGAAAAGGATAATGAATAAGAGAG:1 + chrX 9960514 3' + Doc 75 1 58.42 TATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATTTATATTGATTATGGGTGATCGTCAACAAGAGCAGTGGACACCCAAT:1 + chr2R 9905423 3' - mdg3 5281 2 56.44 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTAATTAAATGCTTTGGCTTGAAAGAAAAGTTGTTCTAATTTAATTGGACGTTTTGTTTGCACACG:1 + chr3R 22349566 3' - pogo 10 1 70.30 ATTCAACCTACAAAAATAANGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATGAATAATTTATGTGCGTCTCTTATGATT:1 + chr2L 11362783 3' + copia 15 2 71.29 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAACAAAGAGCGGGAGAAAGCTCTTGAAGAGCAGTGAAAATAGCAAAGAGCG:1 - chr3R 14580292 3' - blood 28 2 53.47 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCAATTGAATATACAAATATTTATATAAAAACTTTGAACATATCCTTTAGCCGGTTGTCCACTCAAT:1 + chr2L 10790778 3' - 412 59 2 63.37 ACATCCATATGTCCATATTGGTTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTGTATAACAGCACCTTGTAGTCCAAACCATGTGCTATAGGCCAAAACTCTTGAC:1 - chrX 9460445 3' - Doc4-element 2592 1 73.27 GGAGCAGCCTACTACAATTGGGTCTGGGAGAGGGTTTGGTCTATAGTTTTTGCGCTATTATTCGCTGTACAAATGCTGGTATACTTAGTTAA:1 - chr3R 19505510 3' - mdg3 5247 1 59.78 ATCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATAGTCCTATTTATTTCGATATCAATCTTAAGATTGCTATATACAGGTAAATAAAATAATCCTATCTCCAACAATCAC:1 + chr3L 15033400 3' - I-element 1 1 78.22 CGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATTTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGAGTGCGGTTGTCTGTCTGCATGTATGCCACTTTACTTGCCCC:1 - chr3L 17332212 3' - McClintock 6083 2 58.42 ATTCAAACGTAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTACAATTTATGTGCATTTTCTCAGTGTAA:1 + chr2R 19090687 3' + Stalker2 7602 2 73.27 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAATTATAATATTAAAATATTGTTTAGAAA:1 + chr3L 10621701 3' - 412 51 2 79.21 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGCCTTGTTGACAATTTAATTTAATGTTTTCGTTTTACCGACCATTTGTTAAT:1 + chrX 7157341 3' - blood 7036 2 49.50 CACACGTCGGCGATCGAATTGATTAGTCTAGAAATTGATTAGCACTAGATTAGCACTAGAAATTGAGATGGAAATGGAATGGGCAAGAAAAGAGTAT:1 - chr3L 17140579 3' - F-element 11 1 46.39 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATTTTCAGCACACAGGGCGT:1 + chr2R 8526367 3' + I-element 5296 1 84.16 AAAAAAAAATAATGGGAAAAAACTGTGTAGCCCATTGTGTTGTTCTTGTTATTTATGCGCAAGCACAATATGTGAGCAAAGATTAATTTTCTTTTATTTCC:1 - chr2L 8230769 3' + Tc3 138 1 89.11 GGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTGATTTTAGCATATGTGTTGTTCGTCATAGGTGTATATTATTTTGAAAAAAATAGGGTAAGTA:1 - chr3R 30553530 3' + 412 481 2 66.34 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGACCATCTTAAAACCGGTAAATCGTTTTCTAACACG:1 - chr3R 21365482 3' + P-element 2872 1 64.36 GTTATGAAAAAAGGAAATTATCCTGCCGCACCCTGTATTTATACGAATACTAAACTCTCACTATTCACCACCATATTGAGAGTTGCTGAGTAAGAGAGACA:1 + chr2R 2942803 3' + mariner2 878 1 61.39 CCGAGAACCCTGATGCAAGGGGAACTTGCGTTAACTTACATATACTCGTACACACACACCCCAGAAGGCGTTGTGTCCAGCATGTACGAGTGATATATAG:1 + chr2R 8311385 3' + opus 7486 2 64.00 CATTTGCCGACGACACAGCGATTTTAAGTCGATCCAAATGTCCTACTTTGATTGACGACTTGGTAACATAAAAGCTTTCTATACTAATTTTTTGTTTTAAC:1 - chr2R 4235544 3' + Fw3 2945 1 62.38 TTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATA:1 + chr3R 11151875 3' - mdg3 48 2 72.28 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGCTCGTTTGTCTTGGCCAAATAAATTTCCTGTCATTTAACTAGCA:1 - chrX 13146913 3' + roo 9041 1 57.43 AACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr2L 20360641 3' - micropia 4975 2 61.86 AAATCGAAACTCCTAACTGAAACTGAGGCTGTCATACCATTATTTTTTTAAGTTTCAACTTGAAAGAAGCTTGTATATTGCATATGAATATAAATATCCTT:1 - chrX 5642592 3' - Transib5 239 1 60.40 TCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGTTTTTTAAAGTGCATTGCAGACGTTGCAAAGCTCTCGCTGCATCTCTTGCTGCAGTCTCTCTTTTAACCCA:1 - chr3L 5635279 3' - I-element 169 1 70.30 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGGCACATTCCCATTACACTCCCTTCGCAACGAAACTCCCCTCG:1 + chr3R 29287563 3' + hobo 2934 1 61.11 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATATATTTTGCAATAAGTAAGAAATAAATGAAACCTCAAATA:1 + chr2R 11941063 3' - 297 6602 2 59.30 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGTCAACTGAGTGACATTCTTCATTTTGAAATTTATGGTGCGTTATTCCGCAATATGTTC:1 - chr2L 16153344 3' - Doc 22 1 61.62 TTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCGCGACGTTTATACGGACGGACAGGGTCAGAACGCCTTGCCTCCGTTGTCCTGTATGCTCCTTG:1 - chr2R 5209484 3' - INE-1 166 1 70.30 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTATATATATATAATATACCCAATGATATACACGAGAAATCAAATTAA:1 - chr2L 6569159 3' - 297 14 2 63.74 ATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTAGATGTATTTGATTCTGGCCTAAA:1 + chr2L 19678164 3' - flea 46 2 78.22 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTGGTTAGGTGCACATGTAGTAATGTGCCTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGTTGATGTG:1 - chrX 17029983 3' + flea 239 2 57.43 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAAGCAATAGAAAAGAACGAGATGAAAGGGAAGTAGAGGAGAAACTTTAAATT:2 + chr2R 18733785 3' - copia 26 2 54.46 TGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGATCAATCA:1 + chr3R 15924667 3' - Quasimodo 36 2 74.26 TTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATATATATGGAGTACGTGTATGGCTTGTAATCG:1 + chr3R 25750222 3' + micropia 415 2 70.30 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGTTGTCAATTCGTTCCAGTCGCTTATCCACCTTGTGCATTAGAATGAATGCCTCTGGGAAG:1 + chr3R 21884258 3' + mdg3 5481 2 61.39 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATAACTAGTGTAGATTTCTCTCATACCATTCTGATTTACATTATGACAAATGAAAATAATACAAATGGACTA:1 + chr3R 15579067 3' - pogo 2 1 77.23 TTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTACCGAAAATCGTTTCGTGTGTTCCACTCAAGCATGGCGGTAGACTTTTCCCACGTCCCAACGCC:1 + chr3R 7718279 3' + 1360 3172 1 69.32 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAGAAAGATGTCCTGTCATTATGCGAATTATGAGTGGGATAAAAGGC:2 - chr3R 12329584 3' - hopper 15 1 62.38 TTAACTTTCACTTGGGGATAGTGTTTGTGATTAATGCCCTCGTAAGTTTGTTGCTGGGCTGATGAAAACGCTTGCGGCTGGCATT:1 - chr3L 499448 3' - Doc 4606 1 69.41 TAACAAGTAAAAGAAAAGCAAAACTTAATCAAAGTAGATTTTTTTTAAATAGCAAAGTAAAGCTTTAAAAAAAGTTGTTTTATATAAGGAACATTTTTGCA:1 - chr2L 11199851 3' + HeT-A 318 1 80.20 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGAGTGTAAGATGAGTTAATT:1 + chr2R 20312629 3' + 1360 3334 1 81.00 TTTAGGATTTGGTATGGCCNCCCTTGTTCCCTCATGGTCATCTCCAGATCCAAAAAGGTGATGGCGGACATCAGAATCCGTTCACTGTACGCAGATCCTGT:1 - chr3R 12033523 3' - Tc3 1424 1 73.27 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTTCAAGCGAATATAATAAGTTTTAATTCTTTA:1 - chr3L 20755357 3' + I-element 5309 1 67.33 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAGAAAGATGTCCTGTCATTATGCGAATT:1 - 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mdg3 5131 1 77.23 TCTTGCCGACGGGACCACCNTATGTTATTTCATCATGGTACGTGCCTTGTATCACTTGCCGTATAATTCGTTGTTTTTGTTTTTGCCAGTCAAGCAAAGCA:1 + chr3L 19896623 3' + P-element 2871 1 63.37 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATGGCCATCCTGCTATTTAGCCATGTTTTGTTTGGTTTTGTGCTTTGGCTGCAGTTTGAGCACTGCCATTCTCT:1 + chr2L 13566570 3' + hobo 2936 1 79.00 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTGGCTCTCAAATTGAATTGTTTGATTTGCCTCAGCAAGGAGGTTTAAGCATT:1 + chr3R 19449516 3' - hobo 22 1 54.55 CTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGCTGTGCAAAATCATGCAAATCCCGAAACAAACAATTTTAGCCAGGAAGCGGCAGACTGGGGTTGCAAGTTGT:1 - chr3L 22392822 3' - Rt1b 4928 1 78.22 TCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTTCAACTTCTGATTATTTTTAAGCAACAA:1 + chr2L 10185549 3' - P-element 408 1 30.69 ATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCCGCGGGCGGAGTCCACCTATGCACACATCATTATTATTATGTG:1 + chr3L 7300833 3' - Doc 4422 1 55.81 TTGCTCTCCAGCATTGGAGNGGCCCAACAATTACTCACAGGAGCGCAGAATGCGCGCCAAATGAAAGAGTGCAGCATTGCCAGCATCGAGCAAAATGCCCC:1 - chrX 18410244 3' + Porto1 357 1 60.40 ATAATAATAATAATAATATTCACTGAATCGTTGCGTTAACCAAACGAAATGGCTGAGGCGGAGGGAGGCTCCGAGCAGGATGATGTTTCATTCCTGAGAAC:1 + chr2R 8862988 3' + mdg1 7073 4 73.27 TGATCAGAGCGCGCTTCACCAAATTTCACCGCAAAATTGCGACCCTTGAGGAAGGTCTTCAGAAACCTTTAAACGTCATTTGATCATTAGTCATGCTAATT:1 - chrX 18532471 3' - G7 468 1 64.36 GTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTGTGCACCTATTCTCTCCCACCCACTCCCCCCGAAATGCACAGACAGATTGTAAAATGCATCTTAATATA:1 + chr3R 31751071 3' + Cr1a 255 1 55.45 TCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTCAATTTATGACAGCTAATTTGATTTTATAGCTCAGTTTTGTCTT:1 + chr2R 22051532 3' + Tabor 453 2 54.46 AGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTTAAAAATCTTGCCTTTGGGCGTCTGTTGTTTCCTCTTCTACAGAATTTTGT:1 + chrX 5081580 3' - Rt1b 5095 1 57.43 AGAAAGAAAGAAAAAAAATAGGGGAAAAAATCGGAAAAATAAGGCGACTGCCAAGGCATACTGCGAAAGTGTTGTCGGTTAGTTAACTTGTTATAATAATT:1 + chr2R 12598018 3' + transib2 2429 1 55.45 CGCTGAGCCTGCAGATTTCATCAGCGACTTGTGAGACGGTGAAGCGGACTCCGTACGTGACGGTGCGCCAGGATACGGGTGCCAGCACGGAGAGCAAGGAC:1 - chr2R 15266036 3' - G6 1774 1 76.24 ATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAACAGAACTATGGAGCCCGAGCCCAAAAGCATGCTGCACC:1 - chr2L 21215287 3' + BS 5056 1 59.41 GCCTACGCAGAGGCCTAAGAAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCACACCCGTGAACTATCTTGTCACCGTAGTGCGTATCAGC:1 + chr2R 5064993 3' - roo 292 2 65.35 AATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATGCGTTAC:1 - chr2R 7546264 3' + hopper 72 1 58.42 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACAATAAGAGTAACAACAATGCCCAATCGACATAATCA:1 + chr3R 7139301 3' + pogo 2064 1 67.33 CTTAAGCCTCACCTCATCGTCACGTTCCCAAGTTCAAAGCTAATGACGAGAAGCCCCTGACTGGCCGCTGAAAAGGAAGCGGTGGTGGCATCGATGGGTTG:1 + chr2L 12861165 3' + Idefix 7041 2 73.27 ACCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCAGGTTTGGCATTTCTCTT:1 - chr3L 2022260 3' + roo 352 2 78.22 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTACAAAGGTTTAGTCATCCAGTCATAATCATAACGTTA:2 - chr3L 20411795 3' - roo 8701 2 62.38 AGTGAGAACGCGCGGTCAAGTGGGAAATAACAAACAGTGACTGCGTCGGCGGCGGCGGCTGTTGTGACGACAGCGTCAGCGGCAACGGAGGCTGTGG:1 + chr3R 3382150 3' + gypsy8 447 1 45.36 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTG:1 - chr3R 7869139 3' - 297 6632 2 77.78 TTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCGAAAATAGCATAAAAACGTGCTGAATATCAGTGTAGTTACGTGTGCATC:1 - chr3L 8525934 3' + pogo 1900 1 57.43 AAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAATTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGAGACGCTATCCAGAAGCTTTTGATCTG:1 + chr2L 6855698 3' + I-element 270 1 73.27 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGCCAAGAGATTCACTCAGTCGAACACTCTTGACATC:1 - chr3L 12241824 3' + roo 403 1 57.58 TAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATGTAAACAGGTACATAAGCAGCCAGTTCCAGGTATTTGCCACATGGGGCATCAACAGAGGGTTCCCAAGG:1 + chr2L 20567922 3' + 297 393 2 80.20 TAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCGGCGAGTCATCGAGTGGCATCGAGCTGGGCACTAAGGACTCCATGGATTTCATGGACT:1 - chrX 5228106 3' - pogo 1712 1 64.36 AGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGTGATCTTAAGTCCTATTTGCGTGCCCATCGTCCCGAGG:1 - chr3R 21575418 3' + invader4 168 2 60.82 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCG:1 - chrX 11025510 3' - hopper 30 1 55.43 TATTAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTCAACAAGCCAACAGCCAACAAAAGTACTTAAAACAATCAAACATTGC:1 - chr3L 6330063 3' + pogo 333 1 53.47 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGAAAGGGCTGAGAACATTTAAGT:1 + chr2R 13763233 3' - roo 54 2 81.19 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATGGCCAAAGTTGGTGCTACGCTTGGG:1 + chr3R 12767361 3' + blood 7382 2 68.82 TGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATAAGGAGGAGGTTTTGCGTCTGACTAGCTGACTATCTGCGATTTGCTCTGACTGGCAACTTTGCCAGAC:1 + chr2R 14997949 3' - McClintock 2 2 76.24 AGAGTAGAGTTATAGTGAGNGTAGATACACTACAGCTGACAATTTCCAGCTCAAATATGCAAATTACCGACAGTTGGTAGCCTCAATTTGATTCGCAA:1 + chr2L 15531878 3' - Stalker2 7261 2 65.31 ACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGTAATTGGAGTTCGAATGACTCTTATGGCCTGACAATTATCTCCAGCGAT:1 + chr3R 16691777 3' + R1A1-element 4967 1 51.49 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCTAAACCAAATGTTTCCCCATACCAAACGTGGTGTGGGTCCCAATGGGGTCAAAGGCAAGTGC:1 + chr3L 14624008 3' - hobo 14 1 62.00 AAAATTTAAATTAAAAACTTAATGCAGATATACATACATACATATATATACTACTAAAACCAAATAGCCATGATCCTCTTTTCGAACGCGTTTCAAATGCA:1 + chr3L 11233613 3' + 1360 3047 1 65.35 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACCTCAAGCACGTCGGTCGATCAATATTTGGCCAGCGGCGAGGATTTATG:1 - chr3R 7626374 3' + hobo 2915 1 56.44 CAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGCGAGTGTGAGCCATGGTGTGCATTGTTGATGTTCTTGCCGCACTCGCAGGCCTAGAAAT:1 - chr2L 18093312 3' + Doc 284 1 64.36 TATATTTAAGAGGATAATAAATGATGGACGGCCCTTAGAGATTTCTTCTACAAAGGTGTGGAAGTTTGATCTTGTTTCTTTTGTTATTTGCCGAACGAGGG:1 - chr2L 21151913 3' + HB 302 1 78.22 TTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCAACACCTACCAAGAAACGACAATCGCCTTGAGGGGCTTGGCTTTGGCTT:1 + chr2R 15788647 3' + Transpac 5199 2 50.50 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTTTTAACG:1 - chr3R 10741072 3' + 1360 3380 2 69.31 ATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCAGGATAGCAGATTGCGGGAATAGGGAAGCCAGGC:1 - chr2L 19643692 3' - Quasimodo 7191 2 75.25 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAATAATCACAATTTAATTAGTTGCGAACATTT:1 - chr3L 9928509 3' + roo 402 1 69.31 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTAGCTTATACAATTTTATTGCAGCTGTTGTTCGCCGTTGAGTTTTTCGATATGCGGTAATC:1 - chrX 12906493 3' - P-element 16 1 63.37 CGGGCTGACATATATTTATTCAAAAGAAGAAATTCATATATATGTATATACATATATGTATGTAAGTATGTACATATCCGTCGGGCCACGCAGTCTGGCAT:1 + chrX 5561798 3' - 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chr2L 7666112 3' - roo 8704 2 63.37 TGGCATATATTGGTTTATTACAACACCAGTACACTTGAATAAGCCGACTAGTATATTGCTTCGACCGCAATCCTTTCAAAATGGATCCTTCTTTAAGCATC:1 - chr2R 10353240 3' + blood 7389 2 42.57 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTAGTGGCGACTTCCTTGTGCGTGAGCACAATTATTCAATATTTCCC:1 - chr2R 13763185 3' + roo 9043 1 55.56 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTACCAGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTACCAGTGTGTTTGTAACCCACCTTACAAACTTGTTTGT:1 - chr2R 8177679 3' - mdg1 9 2 68.32 TTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGATAAAAGAAAATTAGGCTGTATATTATCAGGACACTAGCGATTCGAGTCGCGATTCTCTGCCTATC:1 + chrX 21585880 3' + mariner2 849 1 88.12 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGAGATACGGGGACTGAAACGCCGTTGACAGCGGAAGTTTTTTGTTTCTCCGATTTTTTCCA:1 + chr2R 9649257 3' - roo 16 2 64.36 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAACTGGATTATTTATATGAAAAAATCTATTTACCCAACATAAGAATAGTTCCGAAGA:1 - chr3L 20758923 3' + flea 239 2 64.36 TCTAAGTTAGTCTAGTTTTNTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATGTGTGGCGCACGTTCGGCCGCGATTAAGAAATCTT:1 + chr2L 10199043 3' + I-element 5321 1 61.46 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATGCGCAAAACTACTGAAAAATTATAGAC:1 - chr3R 21365515 3' - P-element 48 1 31.68 GATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCCAAGTCAAAGTGCTCCAGCCG:1 - chr2R 6847284 3' - mdg1 55 2 80.00 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTGTGCTGATGCAGATGCATT:1 + chr3R 19216388 3' + 1360 3347 1 79.31 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTACACCATATACACTATATACACACACAAACGCACTGAGAATATATATGTAATATTGTTATTCTCGTTTTTTGG:1 - chrX 5219668 3' - hobo 3 1 74.26 GATGTTGTTGTTGGCACATCCGGTCTTGGATGGAACGCCCATGTGGGATGCTATTTGCGGCGGTGGTTGCTGAACTCCTCCTTGTTGTTGCTGCTGCTTGG:1 + chr2R 3920774 3' - gypsy10 5699 2 70.30 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTAATATATAATTTTGAAGTAGTGCAGTAACTGGTGTGTATGAATATCCGCTTTGAGTGAAA:1 - chr3R 18790059 3' - I-element 17 1 62.38 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCATTCTTTTTGAAAATTTTTAAAATTCGATTAGATATGAGTAT:1 - chr3R 11052102 3' - blood 7045 2 63.37 AAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCCAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGCAATAAATAAAACAAGTGGCAGCCACGGCGACAGCAACGATATTTGGTGA:1 + chr3R 10488772 3' + roo 9068 1 76.24 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTACACCATATACACTATATACACACACAAACGCACTGAGAATATATATGTAAT:1 + chr4 75988 3' - hobo 24 1 53.47 GTACACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAGTCTGACTGCCTTAACGTTATTATTATTT:1 + chr3L 6630130 3' + 1360 182 1 72.28 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAATAAAT:1 + chrX 15546221 3' - blood 7039 2 51.49 AGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACAACAATATTTTGTTGTATTTACACCTCATATATTGA:1 - chr3L 17188603 3' + Tirant 8409 2 65.35 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATTTTATGTGTATTTATGTAAGTAACAATATTATATTTGGCTTTCCTTCGCAC:1 + chr2L 17778129 3' + pogo 2080 1 52.48 TTGTTTATTGTTTGCCTCTACTAAAAAAAAAAACTAGTTACAGACTATTTACATATATCTATAATAATTTCATGGGAGTTAACTGCCTTAATATAAATCAA:1 - chr3L 11829206 3' - hopper2 1301 1 66.34 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAAAAATATACAAAATATTTTC:1 - chr3L 10701736 3' - roo 8710 2 95.60 GAATTAATCGCGAGGCTGCAAGACATCCCAACGGCAGTTCGGGGCGATTGTCCACCGGAGCACCCCCAGAAATTTTTTTTCCATTATTGCTATGAACTGCG:1 - chrX 18170656 3' + mdg3 389 1 71.29 CTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAAAGTTTACAGTGCAGAGAGTACGACAGTCCTGCGCACAAGTATACGTAACAAATG:1 - 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Doc 45 1 67.33 ATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATAGTCTTCTATACTATGGCAATAAAACGTATTGGGTTATGCA:1 + chrX 22689601 3' - 1731 4350 2 60.40 TGATAAAATCATAACTTATGGTCTAAAAAAATATTTTTTAAATGTAGTAAGAACATGTTTATAATTTGACGTCATTTTAACAACACCAAAACACCAACATC:1 + chr3L 19204302 3' - Transib5 2750 1 67.33 AAATGTAGCATTTAAATTTAAAGTAATATTATATTGTATATATATTTCAGATTAACGTAGCAATATTGCAGAGATTGAATGGCTACAAGCCATTCCTGTAT:1 - chr2L 1341706 3' - TART-A 13186 1 67.33 TGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTCGCATTTGCCTGCGGAAAAGCGAAGAG:1 + chr2L 19642375 3' - Quasimodo 32 2 61.39 TGTTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCGTAAGGAACTCGTGGAAAAAAGCTGCAAAATTGCAGGTGGTTCGCAGATCTGCCTTGGCAAGGTAACTAGATAGCTT:1 - chrX 10445939 3' - G5A 416 1 72.28 ATTGAATAGCTCAGAGCGTNTGTTACGTGTGAATCGTTTTATTTGAATGAATAAACTCGACATAAAATATCGCAAGTCTTGCACCATGGAGCAGTCTTGCA:1 - chr3R 5224979 3' - Stalker2 366 2 56.44 CATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTCATGACTCTTCGACATATATATTTATATACGAGCTCCTTAACTGGCAGCTACTCAGTTAGTGGTG:1 - chr3L 18122300 3' + invader1 3982 2 56.44 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAAACTGTGACTGTCTCTCTCTGTGT:2 + chr2L 18213226 3' - 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chrX 11032197 3' + invader3 234 2 67.00 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAATACCTACCCTCCTTCTTTTTCTCTTCCGCCGCCTTCTCAGCCTTTATCGCCTCC:1 + chr2R 22856603 3' + 1360 3367 1 57.43 TAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTGCCGTCCTGCCGCTTTCCGCCTGATCGTCCTACTTCGCATCCTGCTCCTTCTGGGCATGGCAC:1 - chr3L 21161766 3' + F-element 4482 1 72.28 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATATGCAATCAAATAATAGTTTTATGCCAGGCATTCTGCTGTCCAAATCCTTAGACAGGA:1 + chr3R 19198590 3' - hobo 16 1 67.33 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAAT:2 + chrX 21668054 3' - Tabor 6892 2 76.24 AATAAATCGTAAAACTAAATTAAACTAAATATCCAACATCATATAAATACAACTCAAAACGTCATAAAAAGAAAACTGAGAAGGTGTTGGAGTTGGGGCGC:1 - chr2L 18468836 3' + Juan 3740 1 74.26 ATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATATATAAAAATATATCGCAGACAAAGTATATAGAACA:1 - chr2L 5419810 3' - 297 20 2 64.20 TAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAATTTCCTTAATGTCCTTTTGGCCGGCTTCCCCTCAAA:1 + chr3L 13569798 3' + invader3 238 2 61.39 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGAAAGATGTGTTAATATGAACTTATTTTCGTGTACGATACTATTTG:1 - 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roo 20 2 60.40 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTTGTA:1 + chrX 4399581 3' - I-element 38 1 68.32 TCTTGCTGATGCAGTTGAATTTTAATGAAACTTTTTCTATTTTCCACTATAATTCTTGCATTCAATTTGGCATGAAATGGTCGAATTCGAAGGGCGAGTGA:1 - chr2L 1593520 3' - rover 6869 1 50.50 AATTAAGTTTTGCCAAAATAATACGAATACGACATAGATTCAGATACGGGTTACAGATTACAGATTTAAAACAGCACACAGAAATGCTGGTGCCGTCCTAC:1 - chr3L 2595268 3' - 17.6 7336 2 77.23 TAAAAGAAAAGAATAAACCTGAAGATCAGCCTGACAAGTAGTATATAAACCGAAACGGGCTCAAACGAACAATCAAAGGGACGACAACAGAAATGCGTTGG:1 - chr3R 20099017 3' + Bica 129 1 54.46 ATATTATTATATATACTTATATACTTATATTTAAATTTAAAAAAAAACAGCCTATGTTCCTAATATGTTGGCCTTGTCTGTGCATCTACATGTGTGTCTTT:1 - chr2L 5459912 3' - Dm88 22 3 56.44 TCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTCATGACTCTTCGACATATATATTTATATACGAGCTCCTTAACTGGCAGCTACTCA:1 - chr3L 18122310 3' + invader1 3972 2 66.34 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACCCTCTCCCAGCCTTTCAGAAAG:1 + chr3R 7626430 3' - 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chr3R 1835338 3' + transib3 2840 1 65.35 AAGACTGTGGAATGCCGAATGTGACCGCATCCATTACTCAAATTTTATTAAACATCCAACATCAACAACGGACAACTAATAAACAAAGCAACGTGTGACCA:1 + chr2L 4721156 3' - Doc 2 1 63.37 CACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATCATTCGTTCTGAACTCCCAGCTATTTTCCGAGTTAGCTAACCATTTCTTCATATCACGCATA:1 - chr3L 7168300 3' - Doc 8 1 70.33 GCCCAACAATTAAAACCGATTTGCCATTTTGCCCGATGATTTAGACGATCTGCCAAATTCTGACAAGTCATGCTACGCTCGTGTGATTTATAAGGTCTTTG:1 + chr3L 119430 3' + Fw2 124 1 63.37 AAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAGGGACTGCAGGACTACAGGACTGCAGGACTGC:1 + chr3R 4845049 3' + invader3 265 2 64.36 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGGGGAGGAATGAGAAAGATGTCCTGTCATTATGCGAATTATGAGTGGGATAAAAGGCATTAAACAGTTCA:2 - chr3R 12329571 3' + hopper 1413 2 75.25 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAAC:2 + chr3L 27357631 3' - mdg1 7060 2 57.43 TATTTAGGTAAGATCAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGATTTGCTCAAAGATGAAATAATGATATGTGGCAATGGCAA:1 + chr2L 16416234 3' + blood 7254 2 61.39 CTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCTTCATCTCTTGCTCTTTGGAATTTGGGGTTTTTA:1 - 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G2 289 1 58.42 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTAACTAGTGGTGAACTATATTGTTACAGCAGTAAATAAATA:1 - chr3L 20882786 3' - 412 33 2 56.44 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTGTTATCAAGGCTTTCTAGCATGATCTATCTTAA:1 - chr3R 17781556 3' - pogo 39 1 65.35 ATGTGGTCTTATACTATGGNACATATGCTACTATATATATACATATAGACAGAGAGGAATTAATTGCTGGAACTCAACTTTCAGCACTAGCTCTAAGCAGC:1 + chr2L 10101912 3' - Quasimodo 11 2 67.33 GAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGCACACCCCAACAGCCTAGCAAGGACTCGGCTCTGCTGTGGGCACATGCGCAGCATTTTCGGCTTCC:1 + chr2R 13079636 3' + jockey 4636 1 56.44 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATGCCATAATTGGAAGAACATCAGAAAACGAAGTGAAAGGATTTTGTAAATT:1 - chr2L 5926920 3' + pogo 2078 1 54.46 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATC:2 + chr3L 25345149 3' - Doc 48 1 65.35 ATTTTATTTTATTTTATTTNTTTCTCTTCTTCGCTATTCTTTTTGCTCAAGACGCACGCGAAACGCACACGACGACGAGGAGACCCAATAATTTTGTAAT:1 + chrX 4464697 3' + transib1 1900 1 65.00 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATAGATCCTTCTTTAAGGACAGACCCTTCTGG:1 + chr3L 20411846 3' + roo 9027 1 70.30 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGAAAGTTTTCTCTAGTGCAAACCAAAAAAAAAAGAAAAGAAAACGGAAAA:1 - chr2L 7941685 3' - 412 7080 2 55.45 ACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTTTAAACACGTAGCCTGGGGAAAAAAAGCCCTGACTGAACGACGGTGAAGAGTCAAATGGAAAAG:1 - chr2R 19641821 3' + I-element 5344 1 67.33 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATATCCCTGTCCACCTATTAGTGTATATAGTATGCAATTTGTTGT:1 - chrX 15546148 3' + blood 7357 2 56.44 CATTGAAACTACTATGCGACAATCTGAGCGCCTCGAGTATTGCCAAGAAGACGATCACGCAAGCCTCGATCGGTTAAATGTATTGGAGGAATG:1 - chrX 11549762 3' - frogger 448 1 53.76 TGGAGTCAACCAGGTCCTGGCACTGTTTTGGGGCTATTTTACTCCAGAACTCCTTAATTACAAACTGCAAGATATCAATTGACGAGATTTGCTTATCACAT:1 - chr2R 8114496 3' - Tc1 1277 1 59.41 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATCCTCTAATTTGGCCAGCAGCAG:3 + chr3R 12329654 3' + hopper 1367 1 71.29 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACAGACGGTGAAAAATCCTGCACACCTCACATCACCCACATCCAAAA:1 - chr3R 13739672 3' - Burdock 6168 2 54.46 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAATAGTTATTCACTCACCTAATTACAAAGTTTTCTTAGTTCTCTGCATTGT:1 - chr2L 2167966 3' + roo 9045 1 52.48 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTAACAACTCGAAGCGGTATCAACCGGT:1 - chr2L 12459692 3' - blood 51 2 75.25 GGAAGGAGCACGTGTATTCNTTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGAGGGACTGCAGGACTACAGGACTGAAG:1 - chr2R 23516950 3' + invader3 5449 2 58.76 AAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTACCTT:1 + chr2L 22150639 3' - S-element 32 2 82.18 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGTTAAAGCTCTATGGAAGCCAGTGGGTTAGAGATTCGTGATGAATAAATCATCAGTGCCACG:1 + chrX 15546234 3' - blood 7026 2 64.36 GAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGCTTGCAAGGGAAGGGAAAATGGGAAAGAACTAGGCCAGTGTCCTGAGCAAAACAAGAAGCAGTCAACC:1 - chr3R 14527365 3' - accord 7031 2 89.11 TGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGTAATTCATTATTTTTGATACTGTATCGATTTATCATTTTTTTT:1 + chrX 3642127 3' - G2 3057 1 57.43 TTATTATTGTTATTATTATNGTTATTATGTACGTATATACTACAATACTATATACTATATATATAGAGCGTGTTGGTTTCTATTCGTTTGCTATTTTTT:1 - chr3L 14818710 3' - mdg1 23 2 52.53 AGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTG:1 - chrX 15263444 3' + invader3 5414 2 75.25 TTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTATCAGAGTGCCCCTGCCTCCTCGTTTGTCTCTTGTTTTCTCTCCGTTTTATTATTATTTTTTTCTTTCT:1 - chr2R 21418733 3' - I-element 397 1 73.27 CTTTCACTTGGCGATAGTTTTTTTAGAGCAGCCGCGGCACTCTCCTGGTCCAGCGAGCTCGATAATTAGGCGGTCAACATAAGTAACATGGAGATATAGAT:1 + chr3L 19091053 3' - Doc 4602 1 54.46 CTATTTCACAATTTATTTTCACAATCTTTAATTAAGTTATGCGCACTTTTTAATTGCTCATTTCATTCGGATGCGTGCACAGTGGAAGCACAAAGATTTTA:1 - chr2R 15724368 3' - copia 330 1 54.46 CGATGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCACCTTATTTGGGATTTTACAATTGCATGTCCACTCAAAGAGTCGGGT:1 - chr2R 6850459 3' + roo 9019 2 77.23 GATCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAAATTCGTTAAGAGCCAAGTGATTTTGACCAAGGAGGGA:1 - chr3R 12321405 3' - jockey 4706 1 57.00 CTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTAGAATAAAATATGATTATGAAATGATTATTATAATTATGCTGGCATCTT:1 + chrX 8727929 3' - X-element 33 1 49.50 GCATGTGCGCGCTGGGTGACCAGGATACGAATCTTCTTGGACAGGAACTCGTTGAGACACCGATCCAGGAGCATC:1 - chr3R 29167973 3' + gypsy10 5798 2 78.67 CATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCCACCTTTCAACTCTTTCCTCCCCATTCAATTGCCGCTTTCCGAGAATTTCATCTACAATAACTCCAACTTCCTCTT:1 - chr3R 29288574 3' + hobo 2654 1 73.27 AGAGGGTACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCATTCAACTGTGCGGGCGGCGGGCGGTGGTAATAGCC:1 - chr2R 9179597 3' + Quasimodo 7012 2 65.35 GTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATAAGTATATATACATATAAGCTTACCGGAAAAATGTCCGTTGTTCCATGGAGGCAAAGTTAAT:1 - chrX 5475370 3' + 412 7542 2 68.09 ACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCATATTTCATCACTTATACAAATTTGTACTCATCGCCTGTTTTGCCCAGTGTAATACTCCCT:1 + chr3L 7305978 3' + hobo 2620 1 61.39 CAGCAGGAGAAGGTTACCATCGCTAAGATTAGAGATGGATATGCCGCCATGGCCATCCTGACCACTGGCCAATTGGCGGCCTAAGCGAGCCAATTGCTGGC:1 + chrX 11083854 3' - Ivk 449 1 61.39 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATACTCGTTTCAAAGTACCTGCGTATCCATTTATTTAA:1 + chr2L 7937277 3' + jockey 4946 1 65.35 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATCAATAACAATGCGAATTACGGGGCAATAGTTGA:1 - chr3R 12767286 3' - blood 34 2 64.13 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATGTCAGTGCGAGCATAATATTTACTCAAAATTCCTCAAA:1 - chr3L 9928539 3' + roo 9035 1 62.38 GAAAACCATTATTATGAAATAACACTCAATCTCATATACTTGCATCGAATTTAACGCCGAATTTCTTTAATTTTCCAAGCCATAAAAGACAATCGCTCGAA:1 - chr3L 13129255 3' - transib4 2307 1 71.29 ATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAA:1 + chrX 21087676 3' + mdg3 234 2 58.42 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGCGGCAACTGGAAAACTGGCAACTTCATTATTAT:3 + chr3L 8252244 3' + copia 245 1 66.34 GTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCAT:1 - chrX 21667992 3' + Tabor 468 2 57.00 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTAAAATGATTACTAAATTGATATCAGATTGGCAGATAATAGCAAATTGAATAAAAATT:1 + chr3R 19949379 3' - mdg1 7058 2 59.41 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGATACCCTGGGAGATCAAAGGACTACTGCTACTCTCCTCACTGGTCGCCTCCACATTC:1 + chr3R 25679132 3' - jockey 4686 1 51.49 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATATGCAATCAAATAATAGTTTTATGCCAG:1 + chr3R 19198560 3' - hobo 46 1 73.27 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAAATAATATAATTAAGCAACTTTCACCCTAGAATTTGTATTGTGT:1 + chrX 4399587 3' - I-element 32 1 62.38 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTT:1 + chr2L 10832334 3' - Doc 28 1 57.43 GCAGCTGTGGTCAATGATGACATTAAATTGCCGCTACGGCCGAAAAAAAATGCAGAAAAAACATCGGAAAAGGGCTAAGAGCTGAGTTGGTAACCAGGCCA:1 + chr2L 9047440 3' + jockey 4706 1 84.16 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAAAAGGTATATTCGTTGCCAAGTATGTAACAGGTATT:1 - chr2L 22112994 3' + 1360 3336 1 62.38 CATATATTGGTTTATTACATGTGCTGCAAATAGTGTATAGATAGTGAATTGTATCGCGTGCTCAATTTGCACTACAATCGCAATAACCACATTGAGGTATG:1 + chr3R 11391657 3' + blood 380 1 62.38 TCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAGATTTATTTATTGCGCATACGACGCGTTGCCCGA:1 - chrX 15263439 3' + invader3 233 2 70.30 CTGGGGAGGGAGGAGTTACCACAGTCACCACACCCCCAAATCAGCAGAACAAAACACTTCGATGTTCTTCTTCCTCTTCCTAATTTATATCTTGC:1 - chr2R 14481444 3' + Tirant 8097 1 48.42 AGATAAAATGACCAACTGCNTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATAGGAATGCTAATTAACTACAATAAAACATTTTGATGGAGCGATAGATTT:1 - chr3R 13913023 3' + mdg1 371 2 71.29 TATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATAG:1 + chr2R 16185125 3' - 17.6 8 2 72.00 ATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAAAAGGTATATTCGTTGCC:1 - chr2L 22113012 3' + 1360 3287 1 61.39 TTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCAGGACACCCCTGCTCCATTTTAGCCGTTG:1 - chrX 2841784 3' + hopper 1371 1 69.31 ACACCAACACACACACACACACACGCACACACGGAGTCTTTCCCTGGTTCTTTGCCTGGTTCCGTTTTGCATTTTGATTGTTTTTTATGAGTGAGTGTGAG:1 - chr2R 16395159 3' + gypsy3 420 1 46.53 AAGATAAAACCAAACCTCTNACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGCATAGTTCTGTTACTTTTGATACTTTTGATAAGGC:1 + chr2L 21215328 3' - BS 5013 1 64.00 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATATATCTCGGTCAGGTGTGGCACAGCCATCGATTCTAATCGAATTTCGGCGTCTC:1 + chrX 12992816 3' + I-element 5332 1 53.47 GCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTAGATAAGAAGACCTCTTTGACACACATCAGTAATGAATGGCTTTATGCCTTTAAACTCACTTTTCACACAGTTATTCA:1 + chr3L 5710608 3' + Transpac 4998 2 67.33 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTGCGTTGGCATTTATAGCTCAGTCCAGGA:1 + chr3L 13773939 3' - roo 48 2 74.26 GAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTAGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGAAACGTCTCCACACTATAGTAGCCGCG:1 + chrX 20422576 3' + flea 4859 1 71.29 TGGAAAGACACAGACGTCCNCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACACAGACAAATAATAAATAAATCTACTGCAGGCCACAAAAATAAACAACTACG:1 + chr3L 5241181 3' - Ivk 26 1 53.47 AAAAAAAAAACCTTCCATTTTACTAGTGTGTTCAATTTCCTTAAATAATACATTTTAAATTATCTGAAATTCAAAGTTAAGCATAATATTTTTGATCCTAC:1 - chr2L 4736868 3' - Tc1 1464 1 79.21 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTGCGTTGGCATTTATAGCTCAGTCCAGGAAGGACTCCTCCACAGTGGAAGGGGA:1 + chr3L 13773964 3' - roo 8684 2 56.12 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTGAATTTAGGGCGTTTCCTGAGCTCATTAAAGTCACGTCGTCAACAAG:1 - chr3L 7300489 3' - Doc 34 1 56.44 CCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAACATGTTCACGATTAGCTTAATTAACCAATAAGATTTGAGAATTCAAAGGTGATGGCAAGGTA:1 - chr3L 6132390 3' - Cr1a 4046 1 66.67 ATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTGCGTTGCCGGGCTCCTAAATATCGACAATCAATGACAGTCACTTGTCCTGCAAAATTAGATTTAC:1 - chr2L 21800576 3' + mdg3 229 2 71.29 TGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAAATAGGTAAACTAAAGGTTATTCAAAAATGGTAGCAATG:1 - chr2L 14793494 3' - Stalker2 7283 2 58.42 TCTGATGAAATTGTAATATNGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCCTCCACTACCACGCCATTATCGCCATGAATCACCAGGGTGTTGTTAG:1 - chrX 12327951 3' + invader4 2811 2 54.46 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGGGGTTGCTCACGAGAATAGTTCGAGAACTTTCGACTT:1 - chr3R 21297319 3' + P-element 2850 1 43.56 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGTGCGCCAGACCAAATTACAAGGGATCGAAGACGAG:1 - chr3L 13294362 3' + hopper 1375 1 63.37 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGGTGAATATTTTTGACAAATTACTTAAATTACTTACGAGCGAAAT:1 + chr2R 11030575 3' - F-element 56 1 66.34 ATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATGTAAGAACGATAAGATTGTAAACCAAGATTCGGTTTAAGAAGCTCGTCCGATCCGTGATACT:1 + chrX 16006294 3' + invader4 3074 2 65.35 ATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGGTGGGTCTGCCATGATTGTTGGTTAAGGTCTTGAGCCCGGAGCTATCTATCAGTGTTATACCTAAAAGAGC:1 + chr2L 12818861 3' - I-element 208 1 72.28 GAAAAGTCGCTAACACATATTTATATGTGATAAAACCTTATCACAAGATAACCGAAACCAAAACGAGAAAAACACGGCACAGATATTTGAGTGCTATCATG:1 + chr3R 19106838 3' + Porto1 104 1 51.49 CCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATGCCGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAAAGTTCGCACTTCCATAGTGGTTATTATAGAACTCGGGAGATTTC:1 - chr2R 12473030 3' - Doc 9 1 64.36 TCAATAAAAATACTTTTTTNTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATCTGAGGACCAGAAAGCTAGTAGATGGAGTTGAATCGCTT:1 - chr2R 10452919 3' + Quasimodo 7338 2 60.40 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTGATGTCAGCTGAATGTTTCCTGAACCGGAACA:1 + chr3R 14193961 3' + pogo 2060 1 69.00 AATCTACTAAAATGATAATTTGTATCCCGGGGTTTCCTACCATTTTGCCCCGCTCTCATTCCCAGTGTTTGCCACAGGACTCGTTCTGTGCGTGCCACGTA:1 + chr3R 13739775 3' + Burdock 256 1 80.20 AAACAACAATACCGCTAGCCCGGGCTCAAGACCTTAACCAACAATCATAGACCCCCCCAAGCACCCCAGTGATTCCACCGATCCTGATGCTCACTTCTCCA:1 + chr3L 8326116 3' + I-element 141 1 52.48 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATGGAGACCTAGAAGTCTAGGCAGAATT:1 + chr3R 6266347 3' - roo 46 2 73.47 AATAATAATAACAATAAAAATATAATAAAATGATATTATGTTTCATCATAGTTCGTAGTAATATTTTTCAGTCTTGACTTACCTCGCTCGATCGCCCCTT:1 - chr2L 14853263 3' + mdg1 7063 2 73.00 ATATTTCTCAAAAAACCGCAAACGCACATAGAGACTACATGATATGAGCTAAGAATTGAACTAATGAACTGAGCTTAATTTAATAATATA:1 + chr3L 17861502 3' + hopper2 1112 1 67.78 CGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCAAGGTCCCACCCTCCGGCTCATCTGCCGATCCTACTCACCGGAAGACTTTTGTCGTCGGGAAAACGA:1 + chr2R 9865130 3' - roo 8951 2 60.40 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATCTCGGACTTCAGGATAGCCACGGGTTC:1 + chr2R 11259613 3' - hobo 50 1 71.29 GCAACGTCTCTGCCGACGGCCTCTCTGCCGGCGCAGACGGATTGCATTTGGCTAGCTTGGACTCTTCTAGACCAAGATTCGTATGGGGCTTTTTGCTCATG:1 + chrX 739586 3' + Tabor 272 2 75.25 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATTGATACTTTTTAATAACTGCAA:1 + chr3L 3757389 3' + roo 9018 2 81.19 CATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAATCTTTAGCGAAGTTTACCCAAATTTCTAC:1 + chr2R 16491290 3' + F-element 4315 1 71.29 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGCCTTGTTGACAATTTAATTTAATGTTTTCGT:1 + chr2R 12234753 3' - blood 7056 2 69.31 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAGACGCCCAACAACTGACACCACCCCCGTTCAGTCTGGCGATTCCACGTT:1 - chr3L 699733 3' + P-element 2861 1 54.46 AACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTACCTATGTACACATGGGTATATATTTTGTGTAGGCCCACCTACGCAATGCAATTAAGCCAACTCAATTA:1 + chr2R 10014887 3' + flea 5010 2 74.26 AAATATTAATTTGCTTCATCCGATTTGGTATACTCCCATCTCTGCTGATAGCTGAAATCCGTAAATTGAACGTATTCAACTGATGACCTTATATGGGGGAG:1 + chr2R 4898789 3' + Gypsy12A_LTR 2057 1 75.25 CTCTCTCTCTCTCTTACAAAAAATTACTATTAAAAAGAAACAACAAATATTTTCTTAACAATTATATACTTAGTAGTTTCTCCCACTCCAGCATAACTATT:1 - chr2L 8451874 3' - 1360 98 1 90.10 TGGACGTAGAGTGCGAGTGNCGGGCTGCAGTTCTCTGATATACACCAGTCTGTGGAGAACTTGTGTTCGCATTTATCCGTTCAACTCTTTTTACTGCCACA:1 - chr3R 19198492 3' + hobo 2923 1 63.37 GCGTAGCTGTCCCCCATTAACGCTAAATAACGTCCAGTCACTTTTAGAGTCGACTACTGTTTTATAGATGCAGTTCGCCGCTTTATCTGGCTTTAGAGGCT:1 - chr3R 19449347 3' + Doc4-element 2370 1 65.35 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAAATCCTTAAAGTTCCCTTTTATTTTACATATT:1 + chr3R 17781613 3' + pogo 2061 1 71.29 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTGATAATTGCAG:1 + chr3R 22494164 3' + 297 6930 2 74.26 AGTCTAGGATTCTGAGAATCATTACTGGAGCTCCATGGTATCTTCTTTTTCGTAAAGACAAATCCACTCGAGTTACCGCGCCAAACTTGTGTCTGCGCCCA:1 + chr3R 1522162 3' + Doc3-element 4388 1 59.41 TTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAAGAATTGTTGATTTTTTGTATATCAAAAAGAGAAAGCTAAAATATATAAT:1 + chr3R 26317993 3' + roo 9045 1 57.43 GAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAAGGACTTTACGATAATAAATACGGATACTTAAGCTCAAGTAGCGAAACAAAATCAGCATAAAGTG:1 + chr3R 21378522 3' + mdg1 72 2 71.29 ACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTAGCATAGTCTATCTAAATTACCTAAATACAAACTTTAATCCTTACAGACAAACCTCAT:1 + chr3R 20094530 3' - Max-element 19 2 60.40 TGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGTTTTTTGTGACTTACTTAAGGGAGAACAGCACCAGCTAGCTATTCAACCAATAAATGTATAAGGAATTT:1 - chr2L 3408591 3' - G-element 9 1 68.32 CCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAAACCGGTCAGACAGCCATTGGTATGGACGGG:1 + chr2R 14849025 3' - flea 4706 1 65.35 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATCAGCGTTACCTGTTGTGGGGGCACATAACACAAACCATTTCCATC:1 - chr2L 1071995 3' - FB 33 1 58.42 AATATATGTATGTATATATATATATGTATGTATGTATGCATGCATAAAAGACAAAGGTACGAGGGCCGACAATTTAATG:1 - chrX 8988028 3' + 1731 4410 1 60.76 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTATTTTGCTTTTTTAGCCAGAATTTCTTTAGACCCAAAGA:1 + chr3L 2176376 3' + roo 9047 1 60.44 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACTCGACTCGAATCGCCGCCGCTTGTTATTCTGGATTTCCCCCCCCGTCCTGACCAAATGAAATCGAACCG:1 - chr3R 10488650 3' - roo 8669 2 72.00 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTCTTTGTCCACCGTCTCTCAATTGCCGCTAACCGAGTGATGCTATCTTGACGCACAGTTTTAAATGGA:1 - chr2L 23313646 3' + S-element 1708 2 73.27 GATCGAGACGTTCATACGGACAGACGAACATGGCCACATCGACTCGGTTAGATCAAGAATATATATACTTTATATAGTAGAAAACGATTCCTTCTGTCTGT:1 + chr4 626590 3' - INE-1 132 1 77.23 CTATCAGATACCCGCTATTCAGCAAGTGCTTCGAATGCCAGAGCTATCTGTGCGCCAATTGTGTAACTGCTCATGAGTTCATGCACTGCTTCAACGGACAC:1 + chr2L 19168775 3' - INE-1 547 1 76.24 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGGCAACTGAGTGACATTCTTCATTTTGAAATTTATGGTGCGTTATTCCGCAATATGTTCCATGG:1 - chr2L 16153339 3' - Doc 16 1 63.27 CTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGAGTCAAGTTCTGGTGGAGAATCCGCTGACGAGATGGTAACCTACAACAACAACCAGCAGCTC:1 + chr3R 15796859 3' - gypsy4 6489 1 65.35 TCGGAGGGATCCGAAAAGCATAAATTGTTCCTATCTACGAGGGGGCCATCGACGGCCACGAGGCGGGCGAGGGTCAGGGCGATGACTACGGCTACG:1 + chr3R 27113122 3' + R1A1-element 5332 1 64.58 CTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTTTTTTATGATAAATTAAATTATCGATTTATACGTTAATTTCACCTCATGT:1 - chr2L 16851708 3' + HMS-Beagle 7020 2 57.43 GCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATATAACAACACTTTGTGCGGCGGGGCCAAATTATATGGCACAGCCGTCCGTCG:1 - chr3R 18703748 3' - jockey 4961 1 67.02 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGATGAGATTGAAATCGATCGGAAAT:1 - chr2R 17963251 3' - blood 7063 2 80.20 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTAGATGTGTTTGATTCTGGCCTAAAATCCCAATGGCCAGC:1 + chr2L 19678179 3' - flea 31 2 60.40 CCGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGATCTTAACTTATATGATATCTAATATAGAACATATAAAGCTCAGAGGTATTTA:1 + chr2L 11478743 3' - opus 7039 4 70.30 GTTTTTCGGGATTTCGGGTCCGAGCATTGAACGTGGGTGGCTGGCTTTAAGGCAATAGCATGGAGTGCAATTGTGAACTTTTTCTATAGCCATAAAGTGA:1 - chr3L 9220902 3' - Idefix 265 2 68.00 ATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTATGATTATTAAATATACCATGCATTTTAAAAGTGTCT:1 + chr3L 4671322 3' - I-element 479 1 63.37 AAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACAAGGGACTTTTCTCCGAGTGCGTTCGAAGCCAATATCCATT:1 - chr3R 26765067 3' - mdg3 5249 1 79.21 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAAATTGATTTTAGTTATTACTACTA:1 - chr2L 3346273 3' - pogo 47 1 78.22 AACACACACACACACACACAGTAGTGGCAAGGCGCCGCAATTAACCGAACCCAAAACTAAAAAAAAAAATATATAAAGAGTGGAAAACTAGGGAAACAATA:1 - chrX 12212458 3' + accord 7030 3 57.43 TGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGGAACTCGCGCGTGTGTGTGTGTGCACATGGGCAGTAAATCTAATCCGAAGTATATCTAAGTGTTTT:1 + chr2R 9209509 3' - Tirant 21 2 60.40 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTGCGTTGGCATTTATAGCTCAGTC:2 + chr3L 13773934 3' - roo 8717 2 79.21 CCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTTTTGTTGGCCACGTTTCACTCGGATGTTCTTGCCGTTATTGTTGTTGTTGCGTTTTCATT:1 + chrX 20972723 3' - R2-element 265 1 68.32 GCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGGCGAGCTGACGTCAATTTTTACCTTGCAGAGCGGGCACATGAGCAAAATGCGGGTGCACTGTTCGCAGACA:1 - chrX 2709638 3' - 1360 164 1 72.28 TTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGATTATTTATGAGACCCATTAATGGGCAGGTTGTCAGCAGCTCTATTCATCTTGGGGCATACTTTCGGGCCGAGCAC:1 - chr2R 16609386 3' - jockey 4761 1 77.23 AGCGGCAAAGTGGAGCCTCGATGTCGACAACGCAAATCCTTGATAACATATGAACATGACTGGAGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTC:1 + chr2R 4577093 3' + Chouto 6244 1 55.45 CATGAATGCTGATGATGTANAACTTGTCATCAACCCGGCGAATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACA:1 - chr3L 16792555 3' - Chimpo 4046 1 61.39 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTACCAAAATAAAAATATAACAAA:1 - chrX 23280919 3' + roo 9017 2 78.22 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCGATCGACGAGACGGTAGCTTTAGAGCTAAACGAACTGCCATCCGGTAAA:1 + chrX 15024444 3' - P-element 27 1 53.47 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAAACCGTATGCATTATACAATATATGCCCACATCG:1 + chrX 12472599 3' - pogo 25 1 67.05 TAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGG:1 + chrX 11025552 3' + hopper 1363 1 78.22 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGATGTTGGTTAGGGTTAAGGGTTAAAGCTTTGTTTGCTCTCCTAAT:1 + chrX 21217580 3' - pogo 19 1 54.84 GATGCAAGTGGAACTTGCGNTAACTTACATGTCTTTAATCTGTATGTATGCCTCTTGTGGCTC:1 + chr2L 20328767 3' + opus 7497 2 60.32 ATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTTGCTGTTTTCGTGGGCAATCTCCTTTTGGATCC:1 - chr2L 3663760 3' - Bica 94 1 67.33 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACCGAATCTGCTAAATTTCACACACCACTTCGTGTGAAAATAAACCGAATTTAAATTTAGATACTGC:1 - chr3L 11929248 3' + copia 245 1 66.34 TTCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGTTCCCGTTGATTTCCGTTTTAGGGGGGGTGTGTTTCGGACTGGTTTGC:1 - chr2R 613188 3' + 17.6 7263 2 67.33 TTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCATGCCCCATAGTGCACTGTCTACATTGACGTGTGTCTGCATGCGTTACTCACA:1 - chr2R 7546259 3' + hopper 77 1 53.47 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGGGCGTTGGTCAAATAATAAAAGCATCATCGTAATCGTATAATAATCATTTTATGTGCATGTTGTG:1 + chr3R 20332909 3' + jockey 4944 1 67.33 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGACTTCCCCCGCTTGAAGGCGTGGGC:2 - chr2R 5720474 3' + pogo 2052 1 74.26 GAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCAGCAAGCGACACGATTTCCTTGTAAGAAGACATTAATCGCTCAATCGC:1 + chr4 186546 3' + Quasimodo 270 2 52.48 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACTTCATTCACCATCCCCGCTAGGTCAGAATTCAGGACGCAGGACTCGCTTCTCC:1 + chr3R 26252749 3' + 412 7521 2 52.48 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACGCACCGTTGCAACTGTATGTATGTATATATATTTATGAGACCACAAACAACTTGATGTGTATTCA:1 - chrX 4792051 3' + copia 242 1 62.38 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAATATTCCTAAACTAACTTTGTGTTTTGATTTTGTCATTTTTAGGTAAGTAACAATCGCAT:1 - chr3L 13772982 3' - pogo 12 1 67.33 ATATACCCCTTATCTTAAATGATTATAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTCCAAATACCCAATGAATCTCGACTTTTTCACCGCGATTTCGACCGGT:1 + chr2R 7371330 3' + Cr1a 4134 1 54.46 TAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACCATATGTAGTCTAAGATTTTCAAACACGACGCTTTTCTTTCCTCTTGAAAACCC:1 - chr3R 7783726 3' - rover 6970 2 61.39 AGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACGAATTTATAGGGGAACTGAATGGC:1 - chr3L 3540112 3' + mdg3 237 2 68.32 TATCTAAAATCAGACTACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAACTGTTAAAAGAACCGCAAGAGAGCAGTCATACGTGGATTAGTCATG:1 + chr3L 3083145 3' - Cr1a 410 1 80.20 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATTCTTATAAAAGCTTATATCCTGAA:2 + chr3L 13773056 3' + pogo 2051 1 76.24 TAGGCTGTTGGGGTGTAAATTTCCAAACAATGCGCAACTTTGTGCTGTCCACATCAAAAAGTGTGGGTGTTTGGGACTGGGAACTTTTCCTGGTGACCATG:1 + chr3L 9907457 3' - jockey 4666 1 79.21 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAACAAAGAGCGGGAGAAAGCTCTTGAAGAGCAGTG:1 - chr3R 14580308 3' - blood 44 2 69.31 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACT:1 + chr3R 11151891 3' - mdg3 5284 2 56.44 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAAATATTTTAGAATATTAGAAAATTCTATAGAGATAACCA:1 - chr3R 18237645 3' + Juan 4172 1 60.40 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGAAATATCGATTTAATTTCATTTACTGCCAAAA:1 + chr3L 18762132 3' - pogo 41 1 71.29 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATCATTCGTTCTGAACTCCCAGCTATTT:1 - chr3L 7168336 3' - Doc 54 1 73.27 CGGAGGCAACGCATAAATGAGAGACGCCTACAAAACGAAGCTTCACTAATGAGAGTTCGCCGGCTCGTTGACAGATGCATTGGCGCGGATTAAGAATGTGC:1 - chr2R 6216480 3' + rooA 7186 1 77.23 CAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCAACACAATCCACTGCGGTAAGTTCCGGAGTTGGCAGCAGTTCCTGTGGCTCCCC:1 - chr4 964936 3' + F-element 260 1 71.43 TCCACCCTCGATCACGGACNTAACTCGCGCGCTCTCAAACACACACACACATGTGCGTCTTTTAAAATTCCTTCGATAAACGACATTTAGGGGCTATTCTA:1 - chr2R 9209398 3' + Tirant 8502 2 71.29 CTATATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACATGTGATCCATTCCTTTGACTCCATTTATATACATAAAACCAAACACCTCTAACCACC:1 + chr2L 22328012 3' + TAHRE 10328 1 62.38 GATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAAGCGACAATGTAAACATGGAAAAAAAATCATTATTCGTCACAAAAGTTAATATCAGAACTTTTATGTGTT:1 + chr2L 12959285 3' + roo 81 2 75.25 TTTAATTAAATACGTTATTTTTTTAGCATCCCATGTAGCTGGCGAAAATCAAATATTCTTTAAAGTCAATCACTTAGTTATGACAATTAAAATTAAATATG:1 + chr3L 10537300 3' + copia 4839 1 67.33 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTAGCTTT:1 - chr2L 7487739 3' + copia 5084 2 65.35 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATTCATGCTCATAGGGGGTAAGAAAAGTACACTTAGAGAGTTTTTTATGTAGTACAAGCCTTGAATGGTATTG:2 - chr3R 13353176 3' - 1360 5 2 74.26 CGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAACAGATTAGGGCACAATAAGTCGAGCTCTCAACTTCTTCATCTCTTGCTCTTTGGAATTTGGGGTT:1 - chr3R 27495628 3' + 412 480 2 66.34 TAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCAGAACGCGCCCCACTTTCCATTCCCATCGAATGTCAAAAATTAAACGAAGCAATAAATTACGG:1 + chrX 3584691 3' + gypsy4 192 2 55.45 ATAAAGTCGTGAAACTATTNCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTATGTACTGTACACACAAACGGAATTTGAAGACGATGAATCAAGTTTGGAA:1 + chrX 3153426 3' + 297 305 2 57.43 TTATTCTTTTGATCTTAGCTTAAGACAAACAAATCGTATTTGTACTGCCCTTTTGTTTACATTATTTCGGGAACGAGATCTCCCGCTTGGGATATTGATT:1 - chr4 970228 3' - 297 287 2 50.00 CGTAGGCCACGGATTTCCCCCTGGCTTTTACGGATGGAGGTCTGTTGCGCCTCGTGTTACATTGGTGGCGTCATTTATATTTATATGCCACTTGCTCTCAA:1 + chr4 137039 3' - Rt1b 301 1 66.34 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTAATCTTAAACCTTAGGCATAATGAGTGTTTGGTTTTATCAA:1 + chr2R 10353315 3' - blood 35 2 60.40 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTATCATTATTATGGCTATTTTCGGGTTTTTATGGCCAAAGTTGGTGCTACGCTTG:2 + chr3R 12767359 3' + blood 360 2 61.39 TGTCCACGAGCGCAACGAANACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 8 1 61.39 CTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTGGTCGGCATTACGTATACGCCGTGTTGTCAGCAATTAAAGGCGAACTCAGCGAACAGCTGTCGTTGCCATTCGTGT:1 + chr2L 16673450 3' - P-element 378 1 79.21 TTTTTTTAAAATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTGGATTACCTTTTCGCCCTTGAGTGTGGGCACCGCCTCACGCAGGTT:1 + chr3L 19263434 3' - transib2 2627 1 52.48 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTATGTCAGCGTGCGCTTCGTCACTACTTTAAACGCTGAGAAAATCTAAAGC:1 + chr3R 5509395 3' + pogo 2079 1 49.50 TGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACTGAAGAATTAGCATTTGCCTGCG:1 + chr2L 19642362 3' - Quasimodo 26 2 70.73 AATTTAAATTTATTTTTAAACATGCTTTCCTCGCACGCATGTATTCGATTGTCATGCATTCTTTTGGTATAAGTTCTAGAATTATACATGTGAACAGGCAA:1 - chr3L 9824302 3' - 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